CN113564187A - 基于aav的抗血管生成基因递送系统及其用途 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及涉及编码血管抑素的核酸分子、包含该核酸分子的转基因表达盒以及包含该转基因表达盒的基因递送系统。本发明的转基因表达盒可用于治疗各种以新生血管为主要病理机制的视网膜疾病以及多种癌症。

Description

基于AAV的抗血管生成基因递送系统及其用途
技术领域
本公开涉及编码血管抑素的核酸分子、包含该核酸分子的转基因表达盒以及包含该转基因表达盒的基因递送系统。
背景技术
病理性新生血管在大量视网膜疾病中出现,并每年在全世界影响数百万人。例如,全球大约有3000万人,尤其是60岁以上的人患有与年龄有关的黄斑变性(AMD),这是导致老年人失明的主要原因(Klein R,Peto T等,Am J Ophthalmol(2004)137(3):486-95;Friedman DS,O’Colmain BJ等,Arch Ophthalmol(2004)122(4):564-72;AI-Zamil WM等,Clin Interv Aging(2017):28860733)。AMD的特征是在多种因素作用下造成进行性视网膜损伤。其中,有一种严重的AMD被称为湿性AMD,脉络膜新生血管(CNV)逐渐在整个视网膜中扩展,由于血管壁的脆弱性,其内部内容物易于渗漏,这进一步破坏了视网膜结构的完整性并阻碍了视觉功能。糖尿病性视网膜病(DR)和早产儿视网膜病(ROP)中也普遍存在类似的新生血管问题,即新生血管出血和瘢痕形成分别发生在糖尿病人和新生儿身上。
此外,在肿瘤发生期间会引起过度的新生血管生成,以促进向癌细胞供应氧气和营养。第一,可以从预先存在的血管网络诱发新血管形成并浸润肿瘤组织;第二,肿瘤细胞可以募集内皮祖细胞形成次级脉管系统;第三,肿瘤细胞在预先存在的血管周围聚集并以管状方式组织内皮细胞来产生新的脉管系统(Jain RK,Science(2005)307(5706):58-62;Carmeliet P等,Nature(2011)473(7347):298-307;Majidpoor J等,Cell Oncol.2021)。
上述病理情况表明了抗血管生成在治疗视网膜疾病和癌症中的重要性。血管内皮生长因子(VEGF)是引发这些疾病中新生血管生长的关键因素。抗VEGF的方法已引起了广泛关注。内皮抑素是由胶原蛋白XVIII的C端产生的20kD片段,血管抑素是由纤溶酶原的蛋白水解裂解产生的含有Kringle结构域的蛋白质。它们都表现出优异的抗血管生成活性并拮抗VEGF的生物学作用。在过去的十年中,这两种血管生成抑制剂已被广泛应用于视网膜病变和癌症治疗中来抑制新生血管形成(O’Reilly MS等,Cell(1994)79(2):315-28;O’Reilly MS等,Cell(1997)88(2):277-85;专利号US 9707304 B2和US 2004/0156828 A1)。因此,为了实现对视网膜疾病和癌症更好的治疗效果,还期望获得表达水平更高的内皮抑素编码序列和血管抑素编码序列。
腺相关病毒(AAV,adeno-associated virus)具有低致病性以及在各种器官组织中长期稳定表达蛋白的能力,这些特性使AAV在基因治疗领域具有明显的优势,适用于递送治疗性基因。然而,野生型AAV血清型通常广谱地感染哺乳动物的多个组织/器官,具有广泛的组织靶向性,导致基因传递到脱靶的组织,从而加剧了不良反应。AAV颗粒的衣壳蛋白不仅在复制过程中调节AAV的装配,而且还促进病毒与质膜上的受体相互作用并进入靶细胞。研究显示,AAV载体的组织亲嗜性及细胞转化效率主要由其衣壳决定。鉴于此,为了实现更好的治疗效果,期望对AAV衣壳蛋白进行合适的改造,获得具有器官(例如眼部)特异性的AAV载体。
此外,由于反复注射会给患者带来诸多不便和痛苦,血管生成抑制剂的多次重复给药是不期望的。因此,期望获得可以同时递送两种以上血管生成抑制剂的基因递送系统。
发明内容
为了解决上述技术问题,在第一方面,本公开提供一种编码血管抑素的核酸分子,其核苷酸序列与SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18所示的核苷酸序列具有至少80%的同一性,优选具有至少85%、90%、95%、99%或100%的同一性。
在一个实施方式中,核酸分子包含SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18所示的核苷酸序列。在一个优选实施方式中,核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18所示。
本公开的编码血管抑素的核酸分子包含经密码子优化的人源或鼠源血管抑素编码核酸序列,与未经密码子优化的原始人源或鼠源血管抑素编码核酸序列相比具有更高的血管抑素表达水平。
在第二方面,本公开提供一种编码内皮抑素的核酸分子,其核苷酸序列与SEQ IDNO:15或SEQ ID NO:17所示的核苷酸序列具有至少80%的同一性,优选具有至少85%、90%、95%、99%或100%的同一性。
在一个实施方式中,核酸分子包含SEQ ID NO:15或SEQ ID NO:17所示的核苷酸序列。在一个优选实施方式中,核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:15或SEQ ID NO:17所示。
本公开的编码内皮抑素的核酸分子包含经密码子优化的人源或鼠源内皮抑素编码核酸序列,与未经密码子优化的原始人源或鼠源内皮抑素编码核酸序列相比具有更高的内皮抑素表达水平。
在第三方面,本公开提供一种转基因表达盒,其包括:启动子、根据第一方面所述的核酸分子、bGH polyA。
在一个实施方式中,启动子选自:CB启动子、CAG启动子、EF1启动子、泛素启动子、T7启动子、SV40启动子、VP16、VP64启动子、Tuj1启动子、GFAP启动子、波形蛋白启动子、RPE65启动子、VMD2启动子、突触蛋白启动子、VGAT启动子、DAT启动子、TH启动子和骨钙蛋白启动子;优选地,所述启动子为CB启动子。
在一个实施方式中,转基因表达盒还包括:信号肽,例如SP信号肽、ALB信号肽和PLS信号肽;和/或位于两端的两个ITR,所述两个ITR各自独立地为正常ITR或缩短ITR肽。
在一个实施方式中,编码内皮抑素的核苷酸序列和/或编码血管抑素的核苷酸序列带有寡肽标签,例如Flag、6×His、2×HA和Myc。
在一个优选实施方式中,转基因表达盒还包括:编码一种或多种治疗性蛋白质的核苷酸序列,所述治疗性蛋白质不同于血管抑素;优选地,所述治疗性蛋白质为具有抗血管生成作用的蛋白质;更优选地,所述治疗性蛋白质为内皮抑素,例如由根据第二方面的编码血管抑素的核酸分子编码的内皮抑素。
在一个优选实施方式中,转基因表达盒还包括连接序列。在一个优选实施方式中,连接序列为Furin蛋白酶序列+连接肽+2A序列,例如P2A、T2A或F2A。使用这样的连接序列可以更好地分开两种以上蛋白质(例如内皮抑素和血管抑素)的表达和分泌。
在一个实施方式中,转基因表达盒的核苷酸序列如SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:11所示。
在第四方面,本公开提供一种基因递送系统,其包括:根据第三方面所述的转基因表达盒和AAV衣壳蛋白。
在一个实施方式中,上述AAV衣壳蛋白为天然AAV衣壳蛋白或人工改造的AAV衣壳蛋白。在一个优选实施方式中,上述AAV选自:AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11,AAV12、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAV-DJ9、AAVrh8、AAVrh8R和AAVrh10。
在一个实施方式中,上述AAV衣壳蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:14所示。
本公开的转基因表达盒和基因递送系统可以表达更高水平的抗血管生成蛋白(内皮抑素和/或血管抑素),可以实现对视网膜疾病和癌症更好的治疗效果。此外,在转基因表达盒包括编码内皮抑素的核苷酸序列和编码血管抑素的核苷酸序列的情况下,本公开的基因递送系统可以实现两种以上血管生成抑制剂的同时递送。
在第五方面,本公开提供根据第三方面所述的转基因表达盒或根据第四方面所述的基因递送系统在制备用于治疗疾病的药物中的应用,所述疾病以新生血管为主要病理机制或诱发因素。
在第六方面,本公开提供一种药物,其包含:根据第三方面所述的转基因表达盒或根据第四方面所述的基因递送系统;以及赋形剂。在一个实施方式中,药物用于治疗以新生血管为主要病理机制或诱发因素的疾病。
在一个实施方式中,疾病为视网膜疾病或癌症,例如老年视网膜黄斑病变、糖尿病视网膜病变,以及其他由强光引起的视网膜损伤;肺癌、肝癌、肾癌、甲状腺癌、前列腺癌、肾癌、乳腺癌、结肠直肠癌、子宫颈癌、白血病、淋巴瘤、黑素瘤和成胶质细胞瘤。
在第七方面,本公开提供一种治疗视网膜疾病或癌症的方法,包括向有需要的受试者施用治疗有效量的根据第九方面所述的药物。
在一个实施方式中,药物通过全身途径或局部途径施用,例如静脉内施用、肌内施用、皮下施用、经口施用、局部接触、腹膜内施用和病灶内施用。在一个优选实施方式中,药物局部施用于眼睛,例如通过玻璃体内注射、视网膜下注射或脉络膜上注射。
在第八方面,本公开提供一种改造的AAV衣壳蛋白,其中,所述AAV衣壳蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:14所示。
在第九方面,本公开提供一种核酸分子,其编码根据第八方面所述的AAV衣壳蛋白。在一个实施方式中,核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:13所示。
本公开的上述改造的AAV衣壳蛋白可用于生产新型AAV载体,从而开展针对新型AAV载体的相关研究或可用于疾病治疗。包装该改造的AAV衣壳蛋白的新型AAV载体具有良好的视网膜组织靶向性,有更低的毒副作用和更好的安全性潜力,可应用于眼部相关疾病的预防、诊断和治疗。
因此,在第十方面,本公开提供一种AAV载体,其包含根据第八方面所述的AAV衣壳蛋白。
在一个实施方式中,AAV载体还包含外源多核苷酸,所述外源多核苷酸包含编码治疗性蛋白质的核苷酸序列。在一个实施方式中,治疗性蛋白质为具有抗血管生成作用的蛋白质。在一个实施方式中,治疗性蛋白质为内皮抑素和/或血管抑素。
在一个实施方式中,外源多核苷酸包含编码内皮抑素的核苷酸序列;优选地,所述核苷酸序列如SEQ ID NO:15或SEQ ID NO:17所示。
在一个实施方式中,外源多核苷酸包含编码血管抑素的核苷酸序列;优选地,所述核苷酸序列如SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18所示。
附图说明
图1A示出了AAV5、AAV8、AAV9、AAVH15、AAVXL32和AAVT13在小鼠视网膜的GFP信号的图像。
图1B示出了图1A所示的GFP信号荧光图像的3D重构。GCL:神经节细胞层;IPL:内部丛状层;INL:内核层;OPL:外丛状层;ONL:外核层;RPE:视网膜色素上皮。
图1C示出了不同AAV血清型相对于AAV5的相对GFP荧光信号强度。n=4只小鼠/组,***p<0.001。
图2显示了用AAV8、AAV9、AAVH15和AAVT13转导的小鼠的视网膜切片。GFP、DAPI和视锥细胞标记(S-视蛋白)/RPE标记(RPE65)被显示。到达感光层的GFP信号由白色箭头指示。
图3A是B36、B110和B111表达盒的示意图。
图3B显示了B110和B111表达盒在HEK293和Huh7培养基上清中内皮抑素和血管抑素的表达和分泌的蛋白质印迹结果图。编码GFP的质粒用作对照。
图3C显示了B110表达盒(包含密码子优化的人源内皮抑素和人源血管抑素编码序列)和B111表达盒(包含密码子优化的鼠源内皮抑素和鼠源血管抑素编码序列)与原始未经密码子优化的人源或鼠源内皮抑素编码核酸序列相比的表达水平。左图:蛋白质印迹结果图。右图:相对表达水平的定量统计;n=3,***p<0.001,t检验。
图3D显示了B110表达盒(包含密码子优化的人源内皮抑素和人源血管抑素编码序列)和B111表达盒(包含密码子优化的鼠源内皮抑素和鼠源血管抑素编码序列)与原始未经密码子优化的人源或鼠源血管抑素编码核酸序列相比的表达水平。左图:蛋白质印迹结果图。右图:相对表达水平的定量统计;n=3,***p<0.001,t检验。
图4A显示了含有GFP的AAVH15(下文称为H15-GFP)以感染复数(MOI)为1×105、1×104和1×103vg/细胞的比例转导HUVEC,病毒感染3天后拍摄的图像。上图:GFP荧光;下图:明场。比例尺:100μm。
图4B显示了定量GFP阳性HUVEC细胞的百分比。
图4C显示了来自MOI为1×105vg/细胞的、由H15-GFP、H15-B110(AAVH15包装B110表达盒)和H15-B111(AAVH15包装B111表达盒)感染的HUVEC的条件培养基的蛋白质印迹分析。
图4D显示了H15-GFP、H15-B36(AAVH15包装B36表达盒)、H15-B110和H15-B111颗粒以1×105和1×104vg/细胞的MOI感染HUVEC的拍摄图像。比例尺:200μm。
图4E显示了HUVEC成管的定量(每单位面积(mm2)的管长)。n=5个细胞孔。**p<0.01,***p<0.001,t检验。
图4F显示了HUVEC成管的定量(每单位面积(mm2)的分支点数)。n=5个细胞孔。**p<0.01,***p<0.001,t检验。
图5A显示了激光诱导新生血管形成的小鼠模型图。向C57BL/6小鼠玻璃体内注射2×1010vg/眼的AAV颗粒,该颗粒具有H15衣壳且包装了B36、B110或B111表达盒(分别称为激光-B36、激光-B110、激光-B111)。病毒注射后14天,对小鼠进行激光诱导的CNV模型治疗,再过12天后,进行荧光素血管造影(FFA)和免疫荧光(IF)。
图5B显示了激光诱导的新生血管形成和瘢痕。上图:荧光素血管造影。下图:激光诱发的病灶。比例尺:1毫米。
图5C显示了视网膜切片染色的荧光图像,显示了活化的视网膜星形胶质细胞和Müller细胞(GFAP)和血管(IB4)。GFAP白色箭头:CNV簇;IB4白色箭头:与CNV簇相关的GFAP阳性胶质细胞膜。比例尺:100μm。
图5D显示了激光诱导的CNV簇绒面积的定量。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,n=5眼/组,单向方差分析。
图5E显示了激光诱导的CNV簇绒数量的定量。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,n=5眼/组,单向方差分析。
图5F显示了激光诱导的病灶大小。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,n=5眼/组,单向方差分析。
图5G显示了通过GFP阳性神经胶质膜面积与总视野面积之比计算的神经胶质膜覆盖率%。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,n=5眼/组,单向方差分析。
图6A显示了激光诱导新生血管形成的小鼠模型图。向C57BL/6小鼠玻璃体内注射2×109vg/眼的AAV颗粒,该AAV颗粒以AAVT13为衣壳且包装了B36、B110或B111表达盒(分别称为激光-B36、激光-B110、激光-B111)。病毒注射14天后,对小鼠进行激光诱导的CNV模型,再过12天后,进行荧光素血管造影(FFA)。
图6B显示了激光诱导的新生血管形成和瘢痕。上图:荧光素血管造影。下图:激光诱发的病灶。比例尺:1毫米。
图6C显示了新生血管形成的定量。*p<0.05,**p<0.01,n=7只眼/组。
图6D显示了激光诱导的病变面积的定量。*p<0.05,**p<0.01,n=7只眼/组。
图7A显示了小鼠中的肿瘤移植流程图。
图7B显示了在细胞植入和AAV治疗后第21天的代表性肿瘤图像。虚线圆圈标出了右前肢下方的肿瘤位置。
图7C显示肿瘤大小的定量结果。通过公式V=0.5×L×W2计算肿瘤体积。V:肿瘤体积;L:肿瘤长度;W:肿瘤宽度。***p<0.001,n=3只小鼠/组。两向方差分析。
图8显示编码AAVH15衣壳蛋白的核酸序列(SEQ ID NO:1)。
图9显示AAVH15衣壳蛋白的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)。
图10显示编码AAVT13衣壳蛋白的核酸序列(SEQ ID NO:3)。
图11显示AAVT13衣壳蛋白的氨基酸序列(SEQ ID NO:4)。
图12显示CB启动子的核苷酸序列(SEQ ID NO:5)。
图13显示bGH POLYA的核苷酸序列(SEQ ID NO:6)。
图14显示B36表达盒的核苷酸序列(SEQ ID NO:7)。
图15显示B36表达盒的蛋白产物的氨基酸序列(SEQ ID NO:8)。
图16显示B110表达盒的核苷酸序列(SEQ ID NO:9)。
图17显示B110表达盒的蛋白产物的氨基酸序列(SEQ ID NO:10)。
图18显示B111表达盒的核苷酸序列(SEQ ID NO:11)。
图19显示B111表达盒的蛋白产物的氨基酸序列(SEQ ID NO:12)。
图20显示编码AAVXL32衣壳蛋白的核酸序列(SEQ ID NO:13)。
图21显示AAVXL32衣壳蛋白的氨基酸序列(SEQ ID NO:14)。
图22显示密码子优化的人源内皮抑素编码核酸序列(SEQ ID NO:15)。
图23显示密码子优化的人源血管抑素编码核酸序列(SEQ ID NO:16)。
图24显示密码子优化的鼠源内皮抑素编码核酸序列(SEQ ID NO:17)。
图25显示密码子优化的鼠源血管抑素编码核酸序列(SEQ ID NO:18)。
图26显示原始(未经密码子优化的)人源内皮抑素编码核酸序列(SEQ ID NO:19)。
图27显示原始(未经密码子优化的)人源血管抑素编码核酸序列(SEQ ID NO:20)。
图28显示原始(未经密码子优化的)鼠源内皮抑素编码核酸序列(SEQ ID NO:21)。
图29显示原始(未经密码子优化的)鼠源血管抑素编码核酸序列(SEQ ID NO:22)。
具体实施方式
除非另有定义,否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本公开所属领域的普通技术人员的通常理解相同的含义。
除非另有说明,否则本文列出的核酸或多核苷酸序列是单链形式,方向是从5'至3',从左至右。本文提供的核苷酸和氨基酸采用IUPACIUB生化命名委员会建议的格式,对于氨基酸采用单字母代码或三字母代码。
除非另有说明,“多核苷酸”是“核酸”的同义词,指任何长度的核苷酸的聚合形式,包括脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸,它们的混合序列或类似物。多核苷酸可以包括修饰的核苷酸,例如甲基化或限制的核苷酸和核苷酸类似物。
在本文中,术语“包含”、“具有”、“包括”和“含有”应被解释为开放式术语(即意味着“包括但不限于”)。
在本文中,术语“患者”和“受试者”可互换使用并且以其常规意义使用,指患有或容易患有可通过施用本公开的药物进行预防或治疗的病症的生物体,并且包括人和非人动物(例如,啮齿动物或其他哺乳动物)。
在一个实施方式中,受试者是非人动物(例如,黑猩猩和其他猿和猴物种;农场动物,如牛、绵羊、猪、山羊和马;家养哺乳动物,例如狗和猫;实验动物包括啮齿类动物,如小鼠、大鼠和豚鼠;禽类,包括家禽、野禽和猎禽,如鸡、火鸡和其他鸡类、鸭、鹅等)。在一个实施方式中,受试者是哺乳动物。在一个实施方式中,受试者是人。
在本文中,术语“治疗”包括:(1)抑制病状、疾病或者病症,即,阻止、减少或者延迟疾病的发展或其复发或者其至少一种临床或者亚临床症状的发展;或者(2)缓解疾病,即,引起病状、疾病或者病症或者其临床或者亚临床症状中的至少一种消退。
在本文中,术语“治疗有效量”指产生施用它要达到的治疗效果的剂量。例如,适用于治疗眼部疾病的药物的治疗有效量可为能够预防或改善与该眼部疾病相关的一种或多种症状的量。
在本文中,术语“改善”指与疾病有关的症状的改善,并且可以指至少一种衡量或定量该症状的参数的改善。
在本文中,术语“预防”病状、疾病或者病症包括:预防、延迟或者减少受试者中发展的病状、疾病或者病症的至少一种临床或者亚临床症状出现的发生率和/或可能性,该受试者可能患有或易患该病状、疾病或者病症但尚未经历或者表现出该病状、疾病或者病症的临床或亚临床症状。
在本文中,术语“局部施用”或“局部途径”是指具有局部作用的给药。
在本文中,术语“转导”、“转染”和“转化”是指将外源核酸递送到宿主细胞中,然后多核苷酸产物的转录和翻译的过程,该过程包括使用重组病毒将外源多核苷酸引入宿主细胞。
在本文中,术语“基因送递”指的是将外源多核苷酸引入细胞来进行基因传递,包括靶向、结合、摄取、转运、复制子整合和表达。
在本文中,术语“基因表达”或“表达”是指基因转录、翻译和翻译后修饰产生基因的RNA或蛋白产物的过程。
在本文中,术语“感染”是指包含多核苷酸组分的病毒或病毒颗粒将多核苷酸递送至细胞中并产生其RNA和蛋白质产物的过程,也可指病毒在宿主细胞中的复制过程。
在本文中,术语“靶向”是指病毒优先进入一些细胞或组织,然后进一步在细胞中表达病毒基因组或重组转基因携带的序列。
在本文中,术语“载体”指封装多核苷酸的一个或一系列大分子,其促进多核苷酸在体外或体内递送至靶细胞。载体的种类包括但不限于质粒、病毒载体、脂质体和其他基因递送载体。待递送的多核苷酸有时被称为“表达盒”或“转基因盒”,其可以包含但不限于某些蛋白质或合成多肽(其可以增强、抑制、削弱、保护、触发或预防某些生物学和生理功能)的编码序列、疫苗开发中感兴趣的编码序列(例如表达适于在哺乳动物中引发免疫应答的蛋白质、多肽或肽的多核苷酸)、RNAi材料的编码序列(例如,shRNA、siRNA、反义寡核苷酸)或可选的生物标记。
在本文中,术语“寡肽”是指通过肽键连接的少于20个氨基酸的聚合物。术语“多肽”和“蛋白质”在本文中同义地是指由20个以上的氨基酸组成的聚合物。这些术语还涵盖合成或人工氨基酸聚合物。
在本文中,术语“表达盒”、“转基因盒”和“转基因表达盒”可互换地使用,指编码特定蛋白质、多肽或RNAi元件的多核苷酸片段,其可以克隆到质粒载体中。
在一些实施方式中,“盒”也可以包装到AAV颗粒中并用作病毒基因组以将转基因产物递送到靶细胞中。“盒”还可以包括其他调控元件,例如特异性启动子/增强子、polyA、调控内含子等,以增强或减弱转基因产物的表达。
在一个实施方式中,除了编码蛋白质产物的序列外,转基因盒还包含许多调控元件以使转基因包装到病毒中,例如145bp的正常ITR、长度大约100bp的缩短ITR。在一些实施方式中,转基因盒还包含用于控制蛋白质产物表达的多核苷酸元件,例如复制起点、聚腺苷酸化信号、内部核糖体进入位点(IRES)或2A信号(例如P2A、T2A、F2A)、启动子和增强子(例如,具有脊椎动物β-肌动蛋白、β-球蛋白或β-球蛋白调节元件的CMV启动子或其他杂种CMV启动子(称为CB和CAG启动子)、EF1启动子、缺氧响应元件、泛素启动子、T7启动子、SV40启动子、VP16或VP64启动子)。启动子和增强子可以被化学药品或激素(例如强力霉素或他莫昔芬)激活,以确保在特定时间点的进行基因表达。此外,启动子和增强子可以是天然或人工或嵌合序列,即原核或真核序列。
在一些优选实施方式中,用于基因表达的诱导型调控元件可以是组织或器官特异性启动子或增强子,其包括但不限于:对各种类型的视网膜细胞具有特异性的启动子,例如,神经节细胞特异性启动子(例如,Tuj1启动子)、星形胶质细胞和Müller细胞特异性启动子(例如GFAP或波形蛋白启动子)和视网膜色素上皮特异性启动子(例如RPE65或VMD2启动子);多种类型的眼神经元的特异性启动子(例如突触蛋白、VGAT、DAT、TH启动子);以及成骨细胞谱系的特异性启动子(例如骨钙蛋白启动子)、肝、胰、脾和肺癌细胞特异性启动子。
在本文中,术语“反向末端重复(ITR)”包括形成发夹结构并用作顺式元件以介导病毒复制、包装和整合的任何AAV病毒末端重复或合成序列。本文的ITR包括但不限于来自1-11型AAV(禽类AAV、牛AAV、犬AAV、马AAV和绵羊AAV的末端重复序列)。此外,AAV末端重复序列不必具有天然末端重复序列,只要该末端重复序列可用于病毒复制、包装和整合即可。
在本文中,术语“顺式元件”是指包装在AAV颗粒中并在靶细胞中表达以产生具有治疗作用的蛋白质产物的转基因盒。
在本文中,术语“密码子优化”是指从其天然形式修饰的多核苷酸序列。这样的修饰导致一个或多个碱基对的差异,其相应的氨基酸序列中有或没有改变,可能增强或抑制基因的表达和/或对修饰的多核苷酸序列的细胞应答。
本领域技术人员已知,AAV衣壳蛋白含有VP1、VP2和VP3蛋白,VP2和VP3蛋白在VP1蛋白内部的起始密码子处经历转录和翻译过程,即,VP1序列包含VP2和VP3序列。本公开提供了AAV衣壳的VP1蛋白的氨基酸序列。
在一个实施方式中,AAV衣壳蛋白可以为任何AAV血清型衣壳蛋白,包括天然AAV衣壳蛋白(例如,天然的1-11型AAV、禽AAV、牛AAV、犬AAV、马AAV和绵羊AAV的衣壳蛋白)和其他人工改造的AAV衣壳蛋白(例如,人工改造的1-11型AAV、禽AAV、牛AAV、犬AAV、马AAV和绵羊AAV的衣壳蛋白)。不同AAV血清型的基因组序列、ITR序列、Rep和Cap蛋白在本领域内是已知的。这些序列可以在文献或在公共数据库查找,例如GenBank数据库。
在一个实施方式中,本公开提供了具有抗血管生成作用的治疗工具,可以用于治疗具有相关病理机制的多种疾病,包括但不限于:新生血管性视网膜病变(例如,AMD,ROP,DR)和强光或其他原因引起的眼损伤。此外,本公开的治疗工具还可以治疗发生血管生成促进肿瘤生长和转移的多种类型癌症,例如肺癌、肝癌、肾癌、甲状腺癌、前列腺癌、肾癌、乳腺癌、结肠直肠癌、子宫颈癌、白血病、淋巴瘤、黑素瘤和成胶质细胞瘤。
在一个实施方式中,治疗工具(例如转基因表达盒)的蛋白产物包括具有抗血管生成作用的蛋白质,例如但不限于,Aflibercept、重组VEGF可溶性受体(由RengeronPharmaceuticals生产,可以抑制新血管形成)、抗VEGF抗体(例如贝伐单抗、雷珠单抗和布洛珠单抗)、其他抗血管生成蛋白或多肽(例如内皮抑素、血管抑素、血小板因子4、色素上皮衍生因子)、成纤维细胞生长因子(FGF)抑制剂、金属蛋白酶抑制剂BB94。
在一个实施方式中,治疗工具(例如转基因表达盒)的蛋白质产物还包括具有抗肿瘤的抗体,例如抗PD-1抗体(例如,Nivolumab、Pembrolizumab、Cemiplimab)和PD-L1抗体(例如,Avelumab、Atezolizumab)、抗CTLA-4抗体(例如Ipilimumab)、抗CGRP抗体(例如Fremanezumab、Galcanezumab、Erenumab)、抗HER2抗体(例如Trastuzumab、Pertuzumab)和抗EGFR抗体(例如Cetuximab、Panitumumab、Necitumumab)。
在一些实施方式中,与野生型(WT)血清型相比,具有AAVH15衣壳蛋白(SEQ ID NO:2)的AAV病毒颗粒表现出更加高效的视网膜转导效率,适用于表达抗血管生成蛋白的基因的传递。
在一些实施方式中,与WT血清型相比,具有AAVT13衣壳蛋白(SEQ ID NO:4)的AAV病毒颗粒表现出更加高效的视网膜转导效率,适用于表达抗血管生成蛋白的基因的传递。
在一些实施方式中,与野生型(WT)血清型相比,具有AAVXL32衣壳蛋白(SEQ IDNO:14)的AAV病毒颗粒表现出更加高效的视网膜转导效率,适用于表达抗血管生成蛋白的基因的传递。
在一个实施方式中,编码血管生成抑制剂的转基因表达盒包括CB启动子序列(SEQID NO:5)、bGH聚腺苷酸化(polyA)序列(SEQ ID NO:6)和密码子优化的人源内皮抑素序列(SEQ ID NO:15),该密码子优化的人源内皮抑素序列带有N末端的ALB信号肽和编码序列内的插入内含子以增强蛋白质表达,如此形成B36表达盒(SEQ ID NO:7)。B36表达盒的两侧是一个正常的ITR和一个缩短的ITR,以实现将B36表达盒作为自互补AAV载体包装到AAV颗粒中。
在一个实施方式中,编码血管生成抑制剂的转基因表达盒包括CB启动子序列(SEQID NO:5)、bGH polyA序列(SEQ ID NO:6)、具有N末端SP信号肽的密码子优化的人源内皮抑素和密码子优化的人源血管抑素序列(SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16),这两种蛋白质的编码序列通过Furin蛋白酶序列(Lys-Arg-Lys-Arg-Arg)+连接肽(Ser-Gly-Ser-Gly)+F2A序列连接,如此形成B110表达盒(SEQ ID NO:9)。B110表达盒还包含两个ITR,其可使表达盒作为单链AAV载体包装到AAV病毒颗粒中。
在一个实施方式中,编码血管生成抑制剂的转基因表达盒包括CB启动子序列(SEQID NO:5)、bGH polyA序列(SEQ ID NO:6)、具有N末端PLS信号肽的密码子优化的鼠源内皮抑素和密码子优化的鼠源血管抑素序列(SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18),这两种蛋白质的编码序列通过Furin蛋白酶序列(Lys-Arg-Lys-Arg-Arg)+连接肽(Ser-Gly-Ser-Gly)+P2A序列连接,如此形成B111表达盒(SEQ ID NO:11)。B111表达盒还包含两个ITR,其可使表达盒作为单链AAV载体包装到AAV病毒颗粒中。
在一些实施方式中,通过HEK293细胞的三质粒(质粒1:顺式元件质粒;质粒2:AAVRep/Cap质粒;质粒3:辅助质粒)转染来生产抗血管生成AAV颗粒。
在一个实施方式中,为了产生具有治疗功能的AAV颗粒,按如下进行HEK293细胞的三质粒转染:质粒1:具有ITR的顺式元件质粒(例如,B36、B110和B111表达盒);质粒2:具有衣壳蛋白(例如,AAVH15、AAVT13和AAVXL32衣壳蛋白)编码序列的AAV Rep/Cap质粒;质粒3:具有腺病毒成分的辅助质粒,其能够促进AAV病毒体的复制、组装和包装。在一个实施方式中,将HEK293细胞产生的AAV颗粒通过亲和层析和碘克沙醇密度梯度超速离心进行纯化(Xiao X等,J Virol(1998)72(3):2224-32)。
本领域技术人员可以使用已知的标准方法来生产重组和合成的多肽或其蛋白质、设计核酸序列、生产转化细胞、构建重组AAV突变体、改造衣壳蛋白质、包装表达AAV Rep和/或Cap序列的载体,以及瞬时或稳定转染包装细胞。这些技术是本领域技术人员已知的。参见例如,分子克隆(MOLECULAR CLONING):实验室手册(A LABORATORY MANUAL),第二版,(冷泉港,纽约州,1989年)。
在一些实施方式中,本公开的基因递送系统用于辅助细胞移植治疗。具体地,具有转基因的AAV颗粒可用于体外转导各种类型的细胞以产生表达蛋白质产物的稳定细胞系,然后可将其体内引入以用于治疗目的。细胞的类型包括但不限于内皮细胞、成肌细胞、成纤维细胞、星形胶质细胞、Müller细胞、少突胶质细胞、小胶质细胞、杆状细胞和视锥细胞、神经元、造血干细胞、单核细胞、粒细胞、淋巴细胞、破骨细胞和巨噬细胞。
在一个实施方式中,用于移植的细胞是受试者的自体细胞,其允许体外培养。将细胞引入或移植到受试者中的原理和技术是本领域技术人员已知的。
在一个实施方式中,从HEK293细胞的培养基和裂解物中收获AAV颗粒。纯化方法例如亲和色谱、离子交换色谱、氯化铯和碘克沙醇梯度超速离心。与AAV生产和纯化有关的化学物质或试剂包括但不限于:用于细胞培养的化学物质或试剂(例如,细胞培养基的成分,包括牛、马、山羊、鸡或其他脊椎动物血清、谷氨酰胺、葡萄糖、蔗糖、丙酮酸纳、酚红;抗生素,例如青霉素、卡那霉素、链霉素、四环素);用于细胞裂解、多核苷酸沉淀或超速离心的化学物质或试剂(例如Triton X-100、NP-40、脱氧胆酸钠、十二烷基硫酸钠、溴化多米芬、钠十二烷基水杨酸酯、氯化钠、氯化镁、氯化钙、氯化钡、硝酸盐、氯化钾、氯化铵、过硫酸铵、硫酸铵、PEG-20、PEG-40、PEG-400、PEG-2000、PEG-6000、PEG-8000、PEG-20000、Tris-HCl、Tris-乙酸盐、氯化锰、磷酸盐、碳酸氢盐、氯化铯、甲醇、乙醇、甘油、碘克沙醇、异丙醇、丁醇、安息香酶、DNase I、RNase);亲和柱材料(例如AAVX亲和树脂、硫酸肝素蛋白聚糖和粘蛋白树脂、与AAV特异性抗体相关的其他材料);离子交换色谱材料和洗涤缓冲液中包含的酸、碱和有机物(例如盐酸、硫酸、乙酸、甲酸、硝酸、尿素、丙酮、氯仿、乙腈、三氟乙酸、氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化钡、氢氧化铵、Tris碱或其他有机胺、泊洛沙姆188、吐温20、吐温40、吐温80、盐酸胍)。
在一个实施方式中,转基因盒编码的蛋白质产物连接寡肽标签(例如,Flag、6×His、2×HA、Myc),其有助于蛋白质产物的纯化。本领域技术人员理解与蛋白质纯化有关的技术和程序。简而言之,将转基因质粒转染到真核细胞(例如,HEK293和CHO细胞)中,然后通过亲和层析来收集目标蛋白。例如,Flag-M2树脂珠通常用于特异性吸引Flag标记的蛋白,然后用3×Flag可溶性寡肽洗脱。也可以使用次氮基三乙酸镍(Ni-NTA)柱可逆地结合,然后专门纯化6×His标记的蛋白。
在一个实施方式中,本公开的AAV载体可以装载外源多核苷酸用于将基因递送到靶细胞中。因此,本公开的AAV载体可用于在体外或体内将核酸递送至细胞。
在一个实施方式中,由AAV载体递送的外源多核苷酸编码充当报告子的多肽(即报告蛋白)。报告蛋白用于指示被AAV成功感染的细胞。这些报告蛋白包括但不限于绿色荧光蛋白(GFP)、β-半乳糖苷酶、碱性磷酸酶、荧光素酶和氯霉素乙酰转移酶。
在一个实施方式中,由AAV载体递送到靶细胞的外源多核苷酸编码用于治疗用途的天然蛋白质,所述天然蛋白质经密码子优化或未经密码子优化。
在一个实施方式中,由AAV载体递送到靶细胞的外源多核苷酸编码合成多肽。
在一个实施方式中,本公开的AAV载体或转基因表达盒或基因递送系统被制成药物制剂(例如,注射剂、片剂、胶囊剂、散剂、滴眼剂)施用于人或其他哺乳动物。该药物制剂还包含其他成分,例如药物辅料、水溶性或有机溶剂(例如水、甘油、乙醇、甲醇、异丙醇、氯仿、苯酚或聚乙二醇)、盐(例如氯化钠、氯化钾、磷酸盐、乙酸盐、碳酸氢盐、Tris-HCl和Tris-乙酸盐)、延缓溶解试剂(例如石蜡)、表面活性剂、抗微生物剂、脂质体、脂质复合物、免疫抑制剂(例如可的松、泼尼松、环孢霉素)、非甾体抗炎药(NSAID,例如阿司匹林、布洛芬、对乙酰氨基酚)微球、硬质基质、半固体载体、纳米球或纳米颗粒。此外,药物制剂可以通过吸入、全身或局部(例如,静脉内、皮下、眼内、玻璃体内、视网膜下、脉络膜上、肠胃外、肌内、脑室内、口服、腹膜内和鞘内)的给药方式以单剂量或多剂量递送。
在一个实施方式中,本公开提供了一种药物,其包含本公开的AAV载体或转基因表达盒或基因递送系统和赋形剂。本公开的药物可用于体外转导细胞或体内转导哺乳动物(例如啮齿动物、灵长类动物和人类),从而治疗各种疾病,例如眼部疾病。
在本文中,眼部疾病选自:视网膜的遗传性营养不良、青光眼、青光眼神经病变、年龄相关性黄斑变性、屈光不正、干眼症、眼部炎症的遗传性营养不良、眼部炎症、葡萄膜炎、眼眶炎症、白内障、过敏性结膜炎、糖尿病视网膜病变、黄斑水肿、角膜水肿、圆锥角膜、增生性玻璃体视网膜病变(纤维化)、视网膜周围纤维化、中心性浆液性脉络膜视网膜病变、玻璃体视网膜病变、玻璃体黄斑牵引和玻璃体出血。在一个实施方式中,眼部疾病涉及眼睛和/或视觉功能的退化。
在一个实施方式中,治疗眼部疾病是指改善接受治疗的患者的视敏度、对比度视力、色觉以及视野。
下面结合附图和实施例对本公开作进一步详细的说明。以下实施例仅用于说明本公开而不用于限制本公开的范围。实施例中未注明具体条件的实验方法,系按照本领域已知的常规条件,或按照制造厂商所建议的条件进行操作。
实施例
实施例1:AAVH15、AAVXL32和AAVT13的视网膜亲和性
通过将AAV8的VP1、VP2(氨基酸1-203)的N末端区域替换为AAV5(氨基酸1-192)的N-末端区域(带有点突变位点G257R)并连接到AAV5衣壳蛋白序列上,构建AAVT13衣壳(SEQID NO:4)。进行DNA shuffling实验,构建AAVH15衣壳蛋白(SEQ ID NO:2)和AAVXL32衣壳蛋白(SEQ ID NO:14)。
以WT血清型AAV5、8和9作为对照,在C57BL/6小鼠的玻璃体腔注射能够表达GFP蛋白的AAV颗粒,来研究改良的AAV血清型(AAVH15、AAVXL32和AAVT13)的视网膜亲和性。以2×109vg/眼的剂量,向C57BL/6小鼠玻璃体内注射带有GFP基因的各AAV血清型,注射后3周拍摄的GFP信号的图像如图1A所示。以2×109vg/眼的剂量,向C57BL/6小鼠玻璃体内注射带有GFP基因的AAV颗粒。注射后3周,将视网膜横截面取出进行免疫荧光染色,结果如图2所示。
结果显示,AAVH15和AAVT13组的视网膜GFP荧光水平显著高于AAV5、8、9组(图1A),高约10-12倍(图1C,***p<0.001,n=4眼/组)。AAVXL32组的视网膜GFP荧光水平也明显高于AAV5、8、9组(图1A),高约5倍(图1C,***p<0.001,n=4眼/组)。由此可见,与野生型AAV相比,AAVH15、AAVXL32和AAVT13具有显著增加的视网膜亲和性和转导效率。
此外,尽管采用玻璃体内给药,但改良的血清型AAVH15和AAVT13仍能够扩散到感光层甚至视网膜色素上皮层(RPE)(图1B和图2),显著优于AAV5、8、9。由此可见,血清型AAVH15和AAVT13具有更强的视网膜亲和性,能够将基因递送到视网膜各层。
实施例2:密码子优化的人源和鼠源内皮抑素编码核酸序列的表达
在本实施例中,发明人比较了含密码子优化的内皮抑素编码核酸序列的B110和B111与由未经密码子优化的内皮抑素编码核酸序列构建的质粒(同样携带Flag和HA标签)的蛋白表达能力。
用B110和B111质粒转染HEK293细胞,然后用蛋白质印迹法检测细胞裂解液中内皮抑素的表达。未经密码子优化的人源和鼠源内皮抑素构入质粒作为对照组(原始人源,原始鼠源)。定量统计每组相对于原始人源组的内皮抑素蛋白表达。
如图3C所示,B110和B111表达盒的内皮抑素蛋白表达水平显著高于未经密码子优化的对照组。蛋白相对表达水平的定量统计结果显示,B110和B111表达盒的内皮抑素蛋白表达水平与未经密码子优化的序列相比有4-6倍提升(图3C,右图)。上述结果表明,本公开的密码子优化的人源和鼠源内皮抑素编码核酸序列与原始自然蛋白编码序列相比在表达上具有显著优势。
实施例3:密码子优化的人源和鼠源血管抑素编码核酸序列的表达
在本实施例中,发明人比较了含密码子优化的血管抑素编码核酸序列的B110和B111与由未经密码子优化的血管抑素编码核酸序列构建的质粒(同样携带Flag和HA标签)的蛋白表达能力。
用B110和B111质粒转染HEK293细胞,然后用蛋白质印迹法检测细胞裂解液中血管抑素的表达。未经密码子优化的人源和鼠源血管抑素构入质粒作为对照组(原始人源,原始鼠源)。定量统计每组相对于原始人源组的血管抑素蛋白表达。
如图3D所示,B110和B111表达盒的血管抑素蛋白表达水平显著高于未经密码子优化的对照组。蛋白相对表达水平的定量统计结果显示,B110和B111表达盒的血管抑素蛋白表达水平与未经密码子优化的序列相比升高了约4倍(图3D,右图)。上述结果表明,本公开的密码子优化的人源和鼠源血管抑素编码核酸序列与原始自然蛋白编码序列相比在表达上具有显著优势。
实施例4:表达内皮抑素和血管抑素的新型转基因表达盒
为了使抗血管生成多肽更稳定地表达,使用了自互补和单链AAV。如图3A所示,通过将ALB信号肽添加到密码子优化的人源内皮抑素序列的N端并在其内部插入内含子来构建B36转基因盒,该密码子优化的人源内皮抑素序列增强了内皮抑素蛋白的表达和分泌。CB启动子用于促进蛋白质表达,bGH polyA序列用于停止mRNA转录。B36转基因盒的两侧是一个正常的ITR和一个缩短的ITR,从而该表达盒能够作为自互补的AAV载体包装到AAV颗粒中。
此外,还设计了可同时表达内皮抑素和血管抑素并将它们同时释放出细胞的单链AAV转基因表达盒B110和B111。如图3A所示,B110盒包括:两个正常的ITR序列、CB启动子(SEQ ID NO:5)、密码子优化的人源内皮抑素序列(SEQ ID NO:15)、密码子优化的人源血管抑素序列(SEQ ID NO:16)和bGH polyA尾巴(SEQ ID NO:6)。SP信号肽用于控制内皮抑素和血管抑素的分泌到细胞外。两种蛋白质的编码序列通过包含Furin蛋白酶序列(KRKRR)+接头(SGSG)+F2A序列的接头连接,以在翻译过程中更好地分开表达内皮抑素和血管抑素。此外,在内皮抑素和血管抑素上带有Flag标签和2×HA标签,由此可以基于标签依赖性亲和层析制备和纯化内皮抑素和血管抑素。例如,可以使用商业化的Flag M2磁珠(Sigma-Aldrich,货号M8823)进行Flag标记蛋白的纯化。
类似地,以与B110相似的方式构建了B111表达盒,区别在于使用密码子优化的鼠源内皮抑素(SEQ ID NO:17)和密码子优化的鼠源血管抑制素(SEQ ID NO:18),并且为了更好地分开两种蛋白质的表达和分泌,用P2A替代F2A。
将B110和B111质粒转染到HEK293细胞和Huh7细胞。48小时后,用蛋白质印迹法检测内皮抑素蛋白和血管抑素蛋白在培养基中的表达水平。结果如图3B所示,B110和B111表达盒均实现了显著的内皮抑素蛋白和血管抑素蛋白的表达。由此可见,通过转染B110和B111质粒成功地表达和分泌了内皮抑素和血管抑素,B110和B111表达盒实现了这两种蛋白质的同时稳定表达。
实施例5:新型AAV介导的抗新生血管蛋白的递送对HUVEC成管的抑制作用
通过三质粒转染B36、B110、B111顺式元件质粒、AAVH15衣壳质粒和腺病毒辅助质粒以及0.2-5mg/ml PEI,开始抗血管生成AAV颗粒的生产过程,并使用细胞培养基体积四分之一的10-35g/L CDM4溶液终止。转染40-80小时后裂解HEK293细胞,然后除去多核苷酸。在4000-15000rpm下离心15-45分钟。将具有AAV颗粒的上清液在AAVX亲和柱中上样,然后进行洗脱。将洗脱的AAV颗粒进行碘克沙醇梯度超速离心,浓缩至一定体积以备使用。
测试了AAVH15在HUVEC细胞中的转导效率。根据GFP蛋白的表达情况可知,在MOI为1×105vg/细胞的情况下,约87%的HUVEC细胞被AAVHH15感染;在MOI为1×104vg/细胞的情况下,AAV的细胞转导比率下降至45.8%(图4A和图4B)。当MOI降低至1×103vg/细胞时,约10.9%的HUVEC细胞显示出明显的GFP荧光信号。
如图4C所示,AAVH15转导的HUVEC细胞成功地将内皮抑素和血管抑素释放到条件培养基中。
用携带B36、B110和B111表达盒(分别称为H15-B36、H15-B110和H15-B111)的AAVH15以MOI为1×105和1×104vg/细胞感染HUVEC细胞。收获细胞并将其转移至铺有Matrigel的24孔板中预孵育45分钟进行成管,6小时后拍摄图像,结果如图4D所示。通过Image J分析每单位面积(mm2)的管长和分支点数。结果显示,与对照组(H15-GFP)相比,H15-B36、H15-B110和H15-B111感染的细胞的管长和分支点数均显著减少(图4E和图4F)。上述结果表明H15-B36、H15-B110和H15-B111病毒载体可以抑制HUVEC成管。
实施例6:AAV介导的内皮抑素和血管抑素的表达抑制视网膜新生血管形成和神经 胶质细胞增生
将2×1010vg/眼的AAV颗粒玻璃体内注射入C57BL/6小鼠体内,AAV颗粒具有H15衣壳且包装了B36、B110或B111表达盒(分别称为激光-B36、激光-B110、激光-B111)。如图5A所示,在病毒注射14天后,对小鼠进行激光诱导的CNV模型,然后在另外12天后进行荧光素血管造影(FFA)和免疫荧光(IF)。
结果显示,在AAVH15介导的内皮抑素和血管抑素处理后,激光诱导的CNV簇的尺寸减少了约75%(图5B和图5D所示),并且CNV簇的数量也减少了(图5B和图5E)。同时,AAVH15介导的新生血管抑制作用加速了激光诱导的病变的恢复。激光诱导的视网膜损伤12天后,与未治疗的对照组(激光模型)相比,不同治疗组的病灶体积减少了约50-75%(图5B和图5F)。为了进一步研究细胞机制,将视网膜与血管标记物IB4和视网膜胶质细胞标记物GFAP共染色。在健康的视网膜中,血管周围有星形胶质细胞或Müller细胞,显示出清晰的网络(图5C)。激光诱导的损伤后,包括星形胶质细胞和Müller细胞在内的活化的视网膜神经胶质积聚,形成与CNV簇紧密亲和的神经胶质瘢痕膜,而AAVH15介导的内皮抑素和血管抑素的释放显著改善了视网膜情况。如图5G所示,胶质细胞膜覆盖的面积从29.9%急剧下降至12%左右(***p<0.001),表明抑制了胶质细胞的增生。由此可见,通过AAV(其具有H15衣壳且包装了B36、B110或B111表达盒)的治疗可以减轻新生血管形成和视网膜神经胶质增生。
此外,还研究了低剂量AAV颗粒的治疗效果。向C57BL/6小鼠玻璃体内注射2×109vg/眼的AAV颗粒(带有AAVT13衣壳且包装B36、B110和B111转基因表达盒)。如图6A所示,在病毒注射14天后,对小鼠进行激光诱导的CNV模型,然后在另外12天后进行荧光素血管造影(FFA)和免疫荧光(IF)。
结果表明,如图6B至图6D所示,与未治疗的对照组(激光模型)相比,在B36和B111治疗组中观察到更小的CNV簇和激光诱发的病灶(*p<0.05,**p<0.01,n=7眼/组),表明在低剂量下通过AAVT13介导的内皮抑素和血管抑素的表达改善了新生血管形成和病变诱导的疤痕。
实施例7:AAV介导的内皮抑素和血管抑素表达对肿瘤生长的抑制作用
为了研究AAV基因递送系统对癌症治疗的作用,在具有Foxn1基因突变的全身性T细胞和部分B细胞缺陷的CByJ.Cg-Foxn1nu/J的小鼠皮下注射Hepa1-6鼠肝癌细胞,以及带有B36和B111转基因盒的AAVH15(H15-B36和H15-B111)。如图7A所示,将培养皿中生长的Hepa1-6细胞(ATCC CRL-1830)用0.05%胰蛋白酶消化,以800rpm离心5分钟,然后重悬于PBS中进行小鼠注射。向CByJ.Cg-Foxn1nu/J小鼠(Jackson实验室库存号000711)皮下注射2×106个Hepa1-6细胞和1×1011vg的AAVH15(分别包装B36和B111表达盒)的混合物。在植入后7、14和21天测量肿瘤大小。注射Hepa1-6细胞和编码GFP的AAV(AAVH15)的小鼠作为对照。
如图7B和图7C中所观察到的,在癌细胞植入和H15-B36和H15-B111治疗后的第14天,与对照小鼠相比,B36和B111治疗组的肿瘤体积已经显著减小。在治疗后的第21天,B36和B111治疗组的平均肿瘤体积分别为211.3和75.9mm2,小于对照组(平均肿瘤体积为2240mm2)的十分之一。上述结果表明,AAVH15介导的内皮抑素和血管抑素表达对肿瘤生长具有显著抑制作用。
虽然通过参照本公开的某些优选实施方式,已经对本公开进行了图示和描述,但本领域的普通技术人员应该明白,以上内容是结合具体的实施方式对本公开所作的进一步详细说明,不能认定本公开的具体实施只局限于这些说明。本领域技术人员可以在形式上和细节上对其作各种改变,包括做出若干简单推演或替换,而不偏离本公开的精神和范围。
序列表
<110> 上海信致医药科技有限公司
<120> 基于AAV的抗血管生成基因递送系统及其用途
<130> PCNCNN218532G
<160> 22
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 2214
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> AAVH15编码序列
<400> 1
atggctgccg atggttatct tccagattgg ctcgaggaca acctctctga gggcattcgc 60
gagtggtggg acctgaaacc tggagccccg aaacccaaag ccaaccagca aaagcaggac 120
aacggccggg gtctggtgct tcctggctac aagtacctcg gacccttcaa cggactcgac 180
aagggggagc cggtcaacgc agcagacgcg gcggccctcg agcacgacaa ggcctacgac 240
cagcagctca aagcgggtga caatccgtac ctgcggtata accacgccga cgccgagttt 300
caggagcgtc tgcaagaaga tacgtctttt gggggcaacc tcgggcgagc agtcttccag 360
gccaagaaga gggttctcga accttttggt ctggttgagg aaggtgctaa gacggctcct 420
ggaaagaaac gtccggtaga gcagtcgcca caagagccag actcctcctc gggcatcggc 480
aagacaggcc agcagcccgc taaaaagaga ctcaattttg gtcagactgg cgactcagag 540
tcagtcccag accctcaacc tctcggagaa cctccagcaa cccccgctgc tgtgggacct 600
actacaatgg ctacaggcag tggcgcacca atggcagaca ataacgaggg tgccgacgga 660
gtgggtaatg cctcaggaaa ttggcattgc gattccacat ggctgggcga cagagtcatc 720
accaccagca cccgaacatg ggccctgccc acctacaaca accacctcta caagcaaatc 780
tccaacagca catctggagg atcttcaaat gacaacgcct acttcggcta cagcaccccc 840
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ctcatcaaca acaattgggg attccggccc aagagactca acttcaaact cttcaacatc 960
caagtcaagg aggtcacgac gaatgacggc gttacgacca tcgctaataa ccttaccagc 1020
acggttcaag tcttctcgga ctcggagtac cagttgccgt acgtcctcgg ctctgcgcac 1080
cagggctgcc tccctccgtt cccggcggac gtgttcatga ttccgcaata cggctacctg 1140
acgctcaaca atggcagcca ggcagtggga cggtcatcct tttactgcct ggaatatttc 1200
ccatcgcaga tgctgagaac gggcaacaac tttaccttca gctacacctt cgaggacgtg 1260
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gtcatgattt ttggaaaaga gagcgccgga gcttcaaaca ctgcattgga caatgtcatg 1680
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agcgtggaga ttgaatggga gctgcagaaa gaaaacagca agcgctggaa tcccgaagtg 2100
cagtacacat ccaattatgc aaaatctgcc aacgttgatt ttactgtgga caacaatgga 2160
ctttatactg agcctcgccc cattggcacc cgttacctca cccgtcccct gtaa 2214
<210> 2
<211> 737
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> AAVH15氨基酸序列
<400> 2
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Asn Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Glu Trp Trp Asp Leu Lys Pro Gly Ala Pro Lys Pro
20 25 30
Lys Ala Asn Gln Gln Lys Gln Asp Asn Gly Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Phe Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Gln Gln Leu Lys Ala Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Arg Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Gln Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Val Leu Glu Pro
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Phe Gly Leu Val Glu Glu Gly Ala Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
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Pro Val Glu Gln Ser Pro Gln Glu Pro Asp Ser Ser Ser Gly Ile Gly
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Lys Thr Gly Gln Gln Pro Ala Lys Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln Thr
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Gly Asp Ser Glu Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Leu Gly Glu Pro Pro
180 185 190
Ala Thr Pro Ala Ala Val Gly Pro Thr Thr Met Ala Thr Gly Ser Gly
195 200 205
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210 215 220
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225 230 235 240
Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His Leu
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Pro Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro
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Ser Arg Gly Ser Pro Ala Gly Met Ser Val Gln Pro Lys Asn Trp Leu
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Pro Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys Thr Lys Thr Asp
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Leu
<210> 3
<211> 2205
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> AAVT13编码序列
<400> 3
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<210> 4
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<223> AAVT13氨基酸序列
<400> 4
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Thr Gly Thr Tyr Asn Leu Gln Glu Ile Val Pro Gly Ser Val Trp Met
595 600 605
Glu Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro Glu
610 615 620
Thr Gly Ala His Phe His Pro Ser Pro Ala Met Gly Gly Phe Gly Leu
625 630 635 640
Lys His Pro Pro Pro Met Met Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val Pro Gly
645 650 655
Asn Ile Thr Ser Phe Ser Asp Val Pro Val Ser Ser Phe Ile Thr Gln
660 665 670
Tyr Ser Thr Gly Gln Val Thr Val Glu Met Glu Trp Glu Leu Lys Lys
675 680 685
Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile Gln Tyr Thr Asn Asn Tyr
690 695 700
Asn Asp Pro Gln Phe Val Asp Phe Ala Pro Asp Ser Thr Gly Glu Tyr
705 710 715 720
Arg Thr Thr Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Pro Leu
725 730 735
<210> 5
<211> 772
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CB启动子核苷酸序列
<400> 5
acgcgtggta cctctggtcg ttacataact tacggtaaat ggcccgcctg gctgaccgcc 60
caacgacccc gcccattgac gtcaataatg acgtatgttc ccatagtaac gccaataggg 120
actttccatt gacgtcaatg ggtggagtat ttacggtaaa ctgcccactt ggcagtacat 180
caagtgtatc atatgccaag tacgccccct attgacgtca atgacggtaa atggcccgcc 240
tggcattatg cccagtacat gaccttatgg gactttccta cttggcagta catctactcg 300
aggccacgtt ctgcttcact ctccccatct cccccccctc cccaccccca attttgtatt 360
tatttatttt ttaattattt tgtgcagcga tgggggcggg gggggggggg gggggggcgc 420
gcgccaggcg gggcggggcg gggcgagggg cggggcgggg cgaggcggag aggtgcggcg 480
gcagccaatc agagcggcgc gctccgaaag tttcctttta tggcgaggcg gcggcggcgg 540
cggccctata aaaagcgaag cgcgcggcgg gcgggagcgg gatcagccac cgcggtggcg 600
gccctagagt cgatcgagga actgaaaaac cagaaagtta actggtaagt ttagtctttt 660
tgtcttttat ttcaggtccc ggatccggtg gtggtgcaaa tcaaagaact gctcctcagt 720
ggatgttgcc tttacttcta ggcctgtacg gaagtgttac ttctgctcta aa 772
<210> 6
<211> 208
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> bGH POLYA核苷酸序列
<400> 6
ctgtgccttc tagttgccag ccatctgttg tttgcccctc ccccgtgcct tccttgaccc 60
tggaaggtgc cactcccact gtcctttcct aataaaatga ggaaattgca tcgcattgtc 120
tgagtaggtg tcattctatt ctggggggtg gggtggggca ggacagcaag ggggaggatt 180
gggaagacaa tagcaggcat gctgggga 208
<210> 7
<211> 2142
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> B36表达盒的核苷酸序列
<400> 7
ctgcgcgctc gctcgctcac tgaggccgcc cgggcaaagc ccgggcgtcg ggcgaccttt 60
ggtcgcccgg cctcagtgag cgagcgagcg cgcagagagg gagtggaatt cacgcgtggt 120
acgatctgaa ttcggtacaa ttcacgcgtg gtacctctgg tcgttacata acttacggta 180
aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac cccgcccatt gacgtcaata atgacgtatg 240
ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca atgggtggag tatttacggt 300
aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc aagtacgccc cctattgacg 360
tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta catgacctta tgggactttc 420
ctacttggca gtacatctac tcgaggccac gttctgcttc actctcccca tctccccccc 480
ctccccaccc ccaattttgt atttatttat tttttaatta ttttgtgcag cgatgggggc 540
gggggggggg gggggggggg cgcgcgccag gcggggcggg gcggggcgag gggcggggcg 600
gggcgaggcg gagaggtgcg gcggcagcca atcagagcgg cgcgctccga aagtttcctt 660
ttatggcgag gcggcggcgg cggcggccct ataaaaagcg aagcgcgcgg cgggcgggag 720
cgggatcagc caccgcggtg gcggccctag agtcgatcga ggaactgaaa aaccagaaag 780
ttaactggta agtttagtct ttttgtcttt tatttcaggt cccggatccg gtggtggtgc 840
aaatcaaaga actgctcctc agtggatgtt gcctttactt ctaggcctgt acggaagtgt 900
tacttctgct ctaaaagctg cggaattgta cccgcggccg atccaccggt gccaccatga 960
aatgggtcac ctttatcagc ctgctgttcc tgttcagcag cgcctacagc cacagccaca 1020
gagacttcca gcctgtgctg catctggtgg ccctgaactc tccactgagt ggtggcatga 1080
gaggcatcag aggggctgac ttccagtgct tccagcaggt gagtatctca gggatccaga 1140
catggggata tgggaggtgc ctctgatccc agggctcact gtgggtctct ctgttcacag 1200
gccagagctg ttggactggc tggaaccttc agagccttcc tgagcagcag actgcaggac 1260
ctgtacagca ttgtcagaag ggcagacaga gctgctgtgc ccattgtgaa cctgaaggat 1320
gaactgctgt tccctagctg ggaagccctg ttctctggct ctgagggacc tctgaaacct 1380
ggggccagaa tcttcagctt tgatggcaag gatgtgctga gacaccccac ctggcctcag 1440
aaatctgtgt ggcatggctc tgaccccaat ggcagaaggc tgacagagtc ctactgtgaa 1500
acttggagaa cagaggcccc atctgccaca ggccaggcca gttcacttct tggaggtaga 1560
ctgctgggcc agtctgcagc ctcttgtcac catgcctaca ttgtgctgtg cattgagaac 1620
agcttcatga cagccagcaa gtgaaagctt atcaggtgag tggcgggccc tgagctgggg 1680
ggcgggggtg ttggctctgg aggctgggtc tgagcgtaat tttgcacccc cgcgtccctg 1740
caggataccg tcgactagag ctcgctgatc agcctcgact gtgccttcta gttgccagcc 1800
atctgttgtt tgcccctccc ccgtgccttc cttgaccctg gaaggtgcca ctcccactgt 1860
cctttcctaa taaaatgagg aaattgcatc gcattgtctg agtaggtgtc attctattct 1920
ggggggtggg gtggggcagg acagcaaggg ggaggattgg gaagacaata gcaggcatgc 1980
tggggagaga tcgatctagg aacccctagt gatggagttg gccactccct ctctgcgcgc 2040
tcgctcgctc actgaggccg cccgggcaaa gcccgggcgt cgggcgacct ttggtcgccc 2100
ggcctcagtg agcgagcgag cgcgcagaga gggagtggcc aa 2142
<210> 8
<211> 201
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> B36蛋白产物氨基酸序列
<400> 8
Met Lys Trp Val Thr Phe Ile Ser Leu Leu Phe Leu Phe Ser Ser Ala
1 5 10 15
Tyr Ser His Ser His Arg Asp Phe Gln Pro Val Leu His Leu Val Ala
20 25 30
Leu Asn Ser Pro Leu Ser Gly Gly Met Arg Gly Ile Arg Gly Ala Asp
35 40 45
Phe Gln Cys Phe Gln Gln Ala Arg Ala Val Gly Leu Ala Gly Thr Phe
50 55 60
Arg Ala Phe Leu Ser Ser Arg Leu Gln Asp Leu Tyr Ser Ile Val Arg
65 70 75 80
Arg Ala Asp Arg Ala Ala Val Pro Ile Val Asn Leu Lys Asp Glu Leu
85 90 95
Leu Phe Pro Ser Trp Glu Ala Leu Phe Ser Gly Ser Glu Gly Pro Leu
100 105 110
Lys Pro Gly Ala Arg Ile Phe Ser Phe Asp Gly Lys Asp Val Leu Arg
115 120 125
His Pro Thr Trp Pro Gln Lys Ser Val Trp His Gly Ser Asp Pro Asn
130 135 140
Gly Arg Arg Leu Thr Glu Ser Tyr Cys Glu Thr Trp Arg Thr Glu Ala
145 150 155 160
Pro Ser Ala Thr Gly Gln Ala Ser Ser Leu Leu Gly Gly Arg Leu Leu
165 170 175
Gly Gln Ser Ala Ala Ser Cys His His Ala Tyr Ile Val Leu Cys Ile
180 185 190
Glu Asn Ser Phe Met Thr Ala Ser Lys
195 200
<210> 9
<211> 3450
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> B110表达盒的核苷酸序列
<400> 9
ctgcgcgctc gctcgctcac tgaggccgcc cgggcaaagc ccgggcgtcg ggcgaccttt 60
ggtcgcccgg cctcagtgag cgagcgagcg cgcagagagg gagtggccaa ctccatcact 120
aggggttcct tgtagttaat gattaacccg ccatgctact tatctacgta gccatgctct 180
aggaagatcg gaattctcta gaacgcgtgg tacctctggt cgttacataa cttacggtaa 240
atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc ccgcccattg acgtcaataa tgacgtatgt 300
tcccatagta acgccaatag ggactttcca ttgacgtcaa tgggtggagt atttacggta 360
aactgcccac ttggcagtac atcaagtgta tcatatgcca agtacgcccc ctattgacgt 420
caatgacggt aaatggcccg cctggcatta tgcccagtac atgaccttat gggactttcc 480
tacttggcag tacatctact cgaggccacg ttctgcttca ctctccccat ctcccccccc 540
tccccacccc caattttgta tttatttatt ttttaattat tttgtgcagc gatgggggcg 600
gggggggggg gggggcgcgc gccaggcggg gcggggcggg gcgaggggcg gggcggggcg 660
aggcggaaag gtgcggcggc agccaatcaa agcggcgcgc tccgaaagtt tccttttatg 720
gcaaggcggc ggcggcggcg gccctataaa aagcaaaccg cgcggcgggc gggagcggga 780
tcagccaccg cggtggcggc ctaaagtcga cgaggaactg aaaaaccaga aagttaactg 840
gtaagttaag tctttttgtc ttttatttca ggtcccggat ccggtggtgg tgcaaatcaa 900
agaactgctc ctcagtggat gttgccttta cttctaggcc tgtacggaag tgttacttct 960
gctctaaaag ctgcggaatt gtacccgcgg ccggccgcca ccatgtggtg gcgtctgtgg 1020
tggctgctgt tgctgctgct tctgctgtgg cctatggtct gggctgacta caaagacgat 1080
gacgacaagc acagccacag agacttccag cctgtgctgc atctggtggc cctgaactct 1140
ccactgagtg gtggcatgag aggcatcaga ggggctgact tccagtgctt ccagcaggcc 1200
agagctgttg gactggctgg aaccttcaga gccttcctga gcagcagact gcaggacctg 1260
tacagcattg tcagaagggc agacagagct gctgtgccca ttgtgaacct gaaggatgaa 1320
ctgctgttcc ctagctggga agccctgttc tctggctctg agggacctct gaaacctggg 1380
gccagaatct tcagctttga tggcaaggat gtgctgagac accccacctg gcctcagaaa 1440
tctgtgtggc atggctctga ccccaatggc agaaggctga cagagtccta ctgtgaaact 1500
tggagaacag aggccccatc tgccacaggc caggccagtt cacttcttgg aggtagactg 1560
ctgggccagt ctgcagcctc ttgtcaccat gcctacattg tgctgtgcat tgagaacagc 1620
ttcatgacag ccagcaagag aaagcggaga agcggatctg gcgcccctgt gaaacagacc 1680
ctgaacttcg acctgctgaa gctggctggc gacgtggaaa gcaaccctgg acctatgtgg 1740
tggcggctct ggtggttgtt gctccttctc ctgctgctct ggcccatggt ttgggccaac 1800
cggaagtcca gcatcatcat ccgcatgcgc gacgtggtgc tgttcgagaa gaaggtgtac 1860
ctgagcgagt gcaagaccgg caacggcaag aactacagag gcaccatgag caagaccaag 1920
aacggcatca cctgtcagaa gtggtccagc acaagccctc acagacccag attcagcccc 1980
gccacacatc caagcgaagg cctggaagag aactactgca gaaaccccga caacgaccct 2040
caaggccctt ggtgctacac caccgatcct gagaagagat acgactactg cgacatcctg 2100
gaatgcgaag aggaatgcat gcactgcagc ggcgagaact acgacggcaa gatctccaag 2160
accatgagcg gactggaatg ccaggcttgg gacagccagt ctcctcacgc tcacggctac 2220
atccccagca agttccccaa caagaacctg aagaagaatt actgtcggaa ccccgaccgc 2280
gagctgaggc cttggtgttt taccacagat ccaaacaagc gctgggagct gtgcgacatc 2340
cccagatgca caacccctcc acctagcagc ggccctacct accaatgtct gaaaggcacc 2400
ggcgagaatt accggggcaa tgtggctgtg accgtgtccg gccatacctg ccaacattgg 2460
agcgcccaga cacctcacac acacaacaga acccctgaga acttcccctg caagaatctg 2520
gacgaaaact actgtaggaa tcccgatggc aagagggccc catggtgtca caccaccaac 2580
agccaagtcc gctgggagta ctgcaagatc cccagctgtg atagcagccc cgtgtctaca 2640
gaacagctgg cccctacagc tcctcctgag ctgacacctg tggtgcagga ttgctatcac 2700
ggcgacggcc agtcctatag aggcacaagc agcaccacca caaccggcaa gaagtgccag 2760
agctggtcct ccatgacacc ccaccggcac cagaaaaccc cagaaaacta ccccaatgcc 2820
ggcctgacca tgaactattg ccggaatcct gacgccgaca aaggcccctg gtgtttcaca 2880
actgacccca gcgtcagatg ggaatactgt aatctgaaga agtgcagcgg caccgaggcc 2940
tctgttgttg ctcctcctcc ttacccatac gatgttcctg actatgcggg ctatccctat 3000
gacgtcccgg actatgcata aatgcacttc gaattaaacc gctgatcagc ctcgactgtg 3060
ccttctagtt gccagccatc tgttgtttgc ccctcccccg tgccttcctt gaccctggaa 3120
ggtgccactc ccactgtcct ttcctaataa aatgaggaaa ttgcatcgca ttgtctgagt 3180
aggtgtcatt ctattctggg gggtggggtg gggcaggaca gcaaggggga ggattgggaa 3240
gacaatagca ggcatgctgg ggactcgagt agataagtag catggcgggt taatcattaa 3300
ctacaaggaa cccctagtga tggagttggc cactccctct ctgcgcgctc gctcgctcac 3360
tgaggccggg cgaccaaagg tcgcccgacg cccgggcttt gcccgggcgg cctcagtgag 3420
cgagcgagcg cgcagcctta attaacctaa 3450
<210> 10
<211> 672
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> B110蛋白产物氨基酸序列
<400> 10
Met Trp Trp Arg Leu Trp Trp Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Trp
1 5 10 15
Pro Met Val Trp Ala Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys His Ser His
20 25 30
Arg Asp Phe Gln Pro Val Leu His Leu Val Ala Leu Asn Ser Pro Leu
35 40 45
Ser Gly Gly Met Arg Gly Ile Arg Gly Ala Asp Phe Gln Cys Phe Gln
50 55 60
Gln Ala Arg Ala Val Gly Leu Ala Gly Thr Phe Arg Ala Phe Leu Ser
65 70 75 80
Ser Arg Leu Gln Asp Leu Tyr Ser Ile Val Arg Arg Ala Asp Arg Ala
85 90 95
Ala Val Pro Ile Val Asn Leu Lys Asp Glu Leu Leu Phe Pro Ser Trp
100 105 110
Glu Ala Leu Phe Ser Gly Ser Glu Gly Pro Leu Lys Pro Gly Ala Arg
115 120 125
Ile Phe Ser Phe Asp Gly Lys Asp Val Leu Arg His Pro Thr Trp Pro
130 135 140
Gln Lys Ser Val Trp His Gly Ser Asp Pro Asn Gly Arg Arg Leu Thr
145 150 155 160
Glu Ser Tyr Cys Glu Thr Trp Arg Thr Glu Ala Pro Ser Ala Thr Gly
165 170 175
Gln Ala Ser Ser Leu Leu Gly Gly Arg Leu Leu Gly Gln Ser Ala Ala
180 185 190
Ser Cys His His Ala Tyr Ile Val Leu Cys Ile Glu Asn Ser Phe Met
195 200 205
Thr Ala Ser Lys Arg Lys Arg Arg Ser Gly Ser Gly Ala Pro Val Lys
210 215 220
Gln Thr Leu Asn Phe Asp Leu Leu Lys Leu Ala Gly Asp Val Glu Ser
225 230 235 240
Asn Pro Gly Pro Met Trp Trp Arg Leu Trp Trp Leu Leu Leu Leu Leu
245 250 255
Leu Leu Leu Trp Pro Met Val Trp Ala Asn Arg Lys Ser Ser Ile Ile
260 265 270
Ile Arg Met Arg Asp Val Val Leu Phe Glu Lys Lys Val Tyr Leu Ser
275 280 285
Glu Cys Lys Thr Gly Asn Gly Lys Asn Tyr Arg Gly Thr Met Ser Lys
290 295 300
Thr Lys Asn Gly Ile Thr Cys Gln Lys Trp Ser Ser Thr Ser Pro His
305 310 315 320
Arg Pro Arg Phe Ser Pro Ala Thr His Pro Ser Glu Gly Leu Glu Glu
325 330 335
Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Pro Gln Gly Pro Trp Cys Tyr
340 345 350
Thr Thr Asp Pro Glu Lys Arg Tyr Asp Tyr Cys Asp Ile Leu Glu Cys
355 360 365
Glu Glu Glu Cys Met His Cys Ser Gly Glu Asn Tyr Asp Gly Lys Ile
370 375 380
Ser Lys Thr Met Ser Gly Leu Glu Cys Gln Ala Trp Asp Ser Gln Ser
385 390 395 400
Pro His Ala His Gly Tyr Ile Pro Ser Lys Phe Pro Asn Lys Asn Leu
405 410 415
Lys Lys Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Arg Glu Leu Arg Pro Trp Cys
420 425 430
Phe Thr Thr Asp Pro Asn Lys Arg Trp Glu Leu Cys Asp Ile Pro Arg
435 440 445
Cys Thr Thr Pro Pro Pro Ser Ser Gly Pro Thr Tyr Gln Cys Leu Lys
450 455 460
Gly Thr Gly Glu Asn Tyr Arg Gly Asn Val Ala Val Thr Val Ser Gly
465 470 475 480
His Thr Cys Gln His Trp Ser Ala Gln Thr Pro His Thr His Asn Arg
485 490 495
Thr Pro Glu Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Asp Glu Asn Tyr Cys Arg
500 505 510
Asn Pro Asp Gly Lys Arg Ala Pro Trp Cys His Thr Thr Asn Ser Gln
515 520 525
Val Arg Trp Glu Tyr Cys Lys Ile Pro Ser Cys Asp Ser Ser Pro Val
530 535 540
Ser Thr Glu Gln Leu Ala Pro Thr Ala Pro Pro Glu Leu Thr Pro Val
545 550 555 560
Val Gln Asp Cys Tyr His Gly Asp Gly Gln Ser Tyr Arg Gly Thr Ser
565 570 575
Ser Thr Thr Thr Thr Gly Lys Lys Cys Gln Ser Trp Ser Ser Met Thr
580 585 590
Pro His Arg His Gln Lys Thr Pro Glu Asn Tyr Pro Asn Ala Gly Leu
595 600 605
Thr Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Ala Asp Lys Gly Pro Trp Cys
610 615 620
Phe Thr Thr Asp Pro Ser Val Arg Trp Glu Tyr Cys Asn Leu Lys Lys
625 630 635 640
Cys Ser Gly Thr Glu Ala Ser Val Val Ala Pro Pro Pro Tyr Pro Tyr
645 650 655
Asp Val Pro Asp Tyr Ala Gly Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala
660 665 670
<210> 11
<211> 3255
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> B111表达盒的核苷酸序列
<400> 11
ctgcgcgctc gctcgctcac tgaggccgcc cgggcaaagc ccgggcgtcg ggcgaccttt 60
ggtcgcccgg cctcagtgag cgagcgagcg cgcagagagg gagtggccaa ctccatcact 120
aggggttcct tgtagttaat gattaacccg ccatgctact tatctacgta gccatgctct 180
aggaagatcg gaattctcta gaacgcgtgg tacctctggt cgttacataa cttacggtaa 240
atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc ccgcccattg acgtcaataa tgacgtatgt 300
tcccatagta acgccaatag ggactttcca ttgacgtcaa tgggtggagt atttacggta 360
aactgcccac ttggcagtac atcaagtgta tcatatgcca agtacgcccc ctattgacgt 420
caatgacggt aaatggcccg cctggcatta tgcccagtac atgaccttat gggactttcc 480
tacttggcag tacatctact cgaggccacg ttctgcttca ctctccccat ctcccccccc 540
tccccacccc caattttgta tttatttatt ttttaattat tttgtgcagc gatgggggcg 600
gggggggggg gggggcgcgc gccaggcggg gcggggcggg gcgaggggcg gggcggggcg 660
aggcggaaag gtgcggcggc agccaatcaa agcggcgcgc tccgaaagtt tccttttatg 720
gcaaggcggc ggcggcggcg gccctataaa aagcaaaccg cgcggcgggc gggagcggga 780
tcagccaccg cggtggcggc ctaaagtcga cgaggaactg aaaaaccaga aagttaactg 840
gtaagttaag tctttttgtc ttttatttca ggtcccggat ccggtggtgg tgcaaatcaa 900
agaactgctc ctcagtggat gttgccttta cttctaggcc tgtacggaag tgttacttct 960
gctctaaaag ctgcggaatt gtacccgcgg ccggccgcca ccatgtctgc acttctgatc 1020
ctagctcttg ttggagctgc agttgctgac tacaaagacg atgacgacaa gcacacccac 1080
caggatttcc agcctgtgct gcatctggtg gccctgaaca cacctctgtc tggcggcatg 1140
agaggcatca gaggcgccga cttccagtgt ttccagcagg ctagagctgt gggcctgagc 1200
ggaaccttca gagccttcct gtctagcaga ctgcaggacc tgtacagcat cgtgcggaga 1260
gccgatagag gcagcgtgcc aatcgtgaac ctgaaggacg aggtgctgag ccctagctgg 1320
gactctctgt ttagcggctc tcagggacag ctgcagcctg gcgctagaat cttcagcttc 1380
gacggcaggg acgtgctgag acatcctgcc tggcctcaga aatctgtgtg gcacggctct 1440
gatcctagcg gcagacggct gatggaaagc tactgcgaga catggcggac cgagacaaca 1500
ggcgctacag gacaggcaag ctctctgctg agtggcagac tgctggaaca gaaggccgcc 1560
agctgtcaca acagctacat cgtgctgtgc atcgagaaca gcttcatgac cagcttcagc 1620
aagagaaagc ggagaagcgg atctggcgcc acgaacttct ctctgttaaa gcaagcagga 1680
gacgtggaag aaaaccccgg tccgatgtct gcacttctga tcctagctct tgttggagct 1740
gcagttgctg tgtacctgag cgagtgcaag acaggcatcg gcaacggcta cagaggcacc 1800
atgagcagga caaagtctgg cgtggcctgt cagaagtggg gcgctacatt tcctcacgtg 1860
cccaactaca gccccagcac acaccctaac gaaggcctgg aagagaacta ctgcagaaac 1920
cccgacaacg acgagcaagg cccttggtgc tacaccaccg atcctgacaa gagatacgac 1980
tactgcaaca tccccgagtg cgaagaggaa tgcatgtact gcagcggcga gaagtacgag 2040
ggcaagatca gcaagaccat gagcggcctg gattgtcagg cctgggactc tcagtctcct 2100
cacgctcacg gctacatccc cgctaagttc cccagcaaga acctgaagat gaattactgt 2160
aggaaccctg acggcgagcc cagaccatgg tgcttcacaa cagaccccac caagagatgg 2220
gagtactgtg acatccccag atgcaccaca cctccaccac ctccatctcc aacctaccag 2280
tgcctgaaag gcagaggcga gaactaccgg ggcacagtgt ctgtgaccgt gtctggcaag 2340
acatgccagc gttggagcga gcagacaccc cacagacaca atagaacccc tgagaacttc 2400
ccctgcaaaa acctcgagga aaactactgc cgcaatccag acggcgagac agccccatgg 2460
tgttatacca cagacagcca gctgcgctgg gagtattgcg agatccctag ctgcgagagc 2520
agcgcctctc ctgaccagag cgattcttct gtgcctcctg aggaacagac acccgtggtg 2580
caagagtgct accagtctga cggccagagc tacaggggca caagcagcac aaccatcacc 2640
ggcaagaagt gccagagctg ggccgctatg ttccctcacc ggcactctaa gacacccgag 2700
aactttccag acgccggcct cgagatgaac tattgccgga atcctgatgg cgacaaaggc 2760
ccctggtacc catacgatgt tcctgactat gcgggctatc cctatgacgt cccggactat 2820
gcataaatgc acttcgaatt aaaccgctga tcagcctcga ctgtgccttc tagttgccag 2880
ccatctgttg tttgcccctc ccccgtgcct tccttgaccc tggaaggtgc cactcccact 2940
gtcctttcct aataaaatga ggaaattgca tcgcattgtc tgagtaggtg tcattctatt 3000
ctggggggtg gggtggggca ggacagcaag ggggaggatt gggaagacaa tagcaggcat 3060
gctggggact cgagtagata agtagcatgg cgggttaatc attaactaca aggaacccct 3120
agtgatggag ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgggcgacc 3180
aaaggtcgcc cgacgcccgg gctttgcccg ggcggcctca gtgagcgagc gagcgcgcag 3240
ccttaattaa cctaa 3255
<210> 12
<211> 607
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> B111蛋白产物氨基酸序列
<400> 12
Met Ser Ala Leu Leu Ile Leu Ala Leu Val Gly Ala Ala Val Ala Asp
1 5 10 15
Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys His Thr His Gln Asp Phe Gln Pro Val
20 25 30
Leu His Leu Val Ala Leu Asn Thr Pro Leu Ser Gly Gly Met Arg Gly
35 40 45
Ile Arg Gly Ala Asp Phe Gln Cys Phe Gln Gln Ala Arg Ala Val Gly
50 55 60
Leu Ser Gly Thr Phe Arg Ala Phe Leu Ser Ser Arg Leu Gln Asp Leu
65 70 75 80
Tyr Ser Ile Val Arg Arg Ala Asp Arg Gly Ser Val Pro Ile Val Asn
85 90 95
Leu Lys Asp Glu Val Leu Ser Pro Ser Trp Asp Ser Leu Phe Ser Gly
100 105 110
Ser Gln Gly Gln Leu Gln Pro Gly Ala Arg Ile Phe Ser Phe Asp Gly
115 120 125
Arg Asp Val Leu Arg His Pro Ala Trp Pro Gln Lys Ser Val Trp His
130 135 140
Gly Ser Asp Pro Ser Gly Arg Arg Leu Met Glu Ser Tyr Cys Glu Thr
145 150 155 160
Trp Arg Thr Glu Thr Thr Gly Ala Thr Gly Gln Ala Ser Ser Leu Leu
165 170 175
Ser Gly Arg Leu Leu Glu Gln Lys Ala Ala Ser Cys His Asn Ser Tyr
180 185 190
Ile Val Leu Cys Ile Glu Asn Ser Phe Met Thr Ser Phe Ser Lys Arg
195 200 205
Lys Arg Arg Ser Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln
210 215 220
Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Ser Ala Leu Leu Ile
225 230 235 240
Leu Ala Leu Val Gly Ala Ala Val Ala Val Tyr Leu Ser Glu Cys Lys
245 250 255
Thr Gly Ile Gly Asn Gly Tyr Arg Gly Thr Met Ser Arg Thr Lys Ser
260 265 270
Gly Val Ala Cys Gln Lys Trp Gly Ala Thr Phe Pro His Val Pro Asn
275 280 285
Tyr Ser Pro Ser Thr His Pro Asn Glu Gly Leu Glu Glu Asn Tyr Cys
290 295 300
Arg Asn Pro Asp Asn Asp Glu Gln Gly Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp
305 310 315 320
Pro Asp Lys Arg Tyr Asp Tyr Cys Asn Ile Pro Glu Cys Glu Glu Glu
325 330 335
Cys Met Tyr Cys Ser Gly Glu Lys Tyr Glu Gly Lys Ile Ser Lys Thr
340 345 350
Met Ser Gly Leu Asp Cys Gln Ala Trp Asp Ser Gln Ser Pro His Ala
355 360 365
His Gly Tyr Ile Pro Ala Lys Phe Pro Ser Lys Asn Leu Lys Met Asn
370 375 380
Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Glu Pro Arg Pro Trp Cys Phe Thr Thr
385 390 395 400
Asp Pro Thr Lys Arg Trp Glu Tyr Cys Asp Ile Pro Arg Cys Thr Thr
405 410 415
Pro Pro Pro Pro Pro Ser Pro Thr Tyr Gln Cys Leu Lys Gly Arg Gly
420 425 430
Glu Asn Tyr Arg Gly Thr Val Ser Val Thr Val Ser Gly Lys Thr Cys
435 440 445
Gln Arg Trp Ser Glu Gln Thr Pro His Arg His Asn Arg Thr Pro Glu
450 455 460
Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Glu Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp
465 470 475 480
Gly Glu Thr Ala Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Ser Gln Leu Arg Trp
485 490 495
Glu Tyr Cys Glu Ile Pro Ser Cys Glu Ser Ser Ala Ser Pro Asp Gln
500 505 510
Ser Asp Ser Ser Val Pro Pro Glu Glu Gln Thr Pro Val Val Gln Glu
515 520 525
Cys Tyr Gln Ser Asp Gly Gln Ser Tyr Arg Gly Thr Ser Ser Thr Thr
530 535 540
Ile Thr Gly Lys Lys Cys Gln Ser Trp Ala Ala Met Phe Pro His Arg
545 550 555 560
His Ser Lys Thr Pro Glu Asn Phe Pro Asp Ala Gly Leu Glu Met Asn
565 570 575
Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Asp Lys Gly Pro Trp Tyr Pro Tyr Asp
580 585 590
Val Pro Asp Tyr Ala Gly Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala
595 600 605
<210> 13
<211> 2214
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> AAVXL32编码序列
<400> 13
atggctgccg atggttatct tccagattgg ctcgaggaca acctctctga gggcattcgc 60
gagtggtggg cgctgaaacc tggagccccg aagcccaaag ccaaccagca aaagcaggac 120
gacggccggg gtctggtgct tcctggctac aagtacctcg gacccttcaa cggactcgac 180
aagggggagc ccgtcaacgc ggcggacgca gcggccctcg agcacgacaa ggcctacgac 240
cagcagctgc aggcgggtga caatccgtac ctgcggtata accacgccga cgccgagttt 300
caggagcgtc tgcaagaaga tacgtctttt gggggcaacc tcgggcgagc agtcttccag 360
gccaagaagc gggttctcga acctctcggt ctggttgagg aaggcgctaa gacggctcct 420
ggaaagaaga gaccggtaga gccatcaccc cagcgttctc cagactcctc tacgggcatc 480
ggcaagaaag gccaacagcc cgccagaaaa agactcaatt ttggtcagac tggcgactca 540
gagtcagttc cagaccctca acctctcgga gaacctccag cagcgccctc tggtgtggga 600
cctaatacaa tggcttcagg cggtggcgca ccaatggcag acaataacga aggcgccgac 660
ggagtgggta atgcctcagg aaattggcat tgcgattcca catggctggg cgacagagtc 720
atcaccacca gcacccgaac atgggccttg cccacctata acaaccacct ctacaagcaa 780
atctccagtg cttcaacggg ggccagcaac gacaaccact acttcggcta cagcaccccc 840
tgggggtatt ttgatttcaa cagattccac tgccatttct caccacgtga ctggcagcga 900
ctcatcaaca acaattgggg attccggccc aagagactca acttcaagct cttcaacatc 960
caagtcaagg aggtcacgac gaatgatggc gtcacgacca tcgctaataa ccttaccagc 1020
acggttcaag tcttctcgga ctcggagtac cagttgccgt acgtcctcgg ctctgcgcac 1080
cagggctgcc tccctccgtt cccggcggac gtgttcatga ttccgcaata cggctacctg 1140
acgctcaaca atggcagcca agccgtggga cgttcatcct tttactgcct ggaatatttc 1200
ccttctcaga tgctgagaac gggcaacaac tttaccttca gctacacctt tgaggaagtg 1260
cctttccaca gcagctacgc gcacagccag agcctggacc ggctgatgaa tcctctcatc 1320
gaccagtacc tgtattacct gaacagaact cagaatcagt ccggaagtgc ccaaaacaag 1380
gacttgctgt ttagccgtgg gtctccagct ggcatgtctg ttcagcccaa aaactggcta 1440
cctggaccct gttaccggca gcagcgcgtt tctaaaacaa aaacagacaa caacaacagc 1500
aactttacct ggactggtgc ttcaaaatat aacctcaatg ggcgtgaatc catcatcaac 1560
cctggcactg ctatggcctc acacaaagac gacaaagaca agttctttcc catgagcggt 1620
gtcatgattt ttggaaagga gagcgccgga gcttcaaaca ctgcattgga caatgtcatg 1680
atcacagacg aagaggaaat caaagccact aaccccgtgg ccaccgaaag atttgggact 1740
gtggcagtca atctccagag cagcagcaca gaccctgcga ccggagatgt gcatgttatg 1800
ggagccttac ctggaatggt gtggcaagac agagacgtat acctgcaggg tcctatttgg 1860
gccaaaattc ctcacacgga tggacacttt cacccgtctc ctctcatggg cggctttgga 1920
cttaagcacc cgcctcctca gatcctcatc aaaaacacgc ctgttcctgc gaatcctccg 1980
gcagagtttt cggctacaaa gtttgcttca ttcatcaccc agtattccac aggacaagtg 2040
agcgtggaga ttgaatggga gctgcagaaa gaaaacagca aacgctggaa tcccgaagtg 2100
cagtatacat ctaactatgc aaaatctgcc aacgttgatt ttactgtgga caacaatgga 2160
ctttatactg agcctcgccc cattggcacc cgttacctca cccgtcccct gtaa 2214
<210> 14
<211> 737
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> AAVXL32氨基酸序列
<400> 14
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Asn Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Glu Trp Trp Ala Leu Lys Pro Gly Ala Pro Lys Pro
20 25 30
Lys Ala Asn Gln Gln Lys Gln Asp Asp Gly Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Phe Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Gln Gln Leu Gln Ala Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Arg Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Gln Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Val Leu Glu Pro
115 120 125
Leu Gly Leu Val Glu Glu Gly Ala Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
130 135 140
Pro Val Glu Pro Ser Pro Gln Arg Ser Pro Asp Ser Ser Thr Gly Ile
145 150 155 160
Gly Lys Lys Gly Gln Gln Pro Ala Arg Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln
165 170 175
Thr Gly Asp Ser Glu Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Leu Gly Glu Pro
180 185 190
Pro Ala Ala Pro Ser Gly Val Gly Pro Asn Thr Met Ala Ser Gly Gly
195 200 205
Gly Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala Asp Gly Val Gly Asn
210 215 220
Ala Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp Leu Gly Asp Arg Val
225 230 235 240
Ile Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His
245 250 255
Leu Tyr Lys Gln Ile Ser Ser Ala Ser Thr Gly Ala Ser Asn Asp Asn
260 265 270
His Tyr Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe Asp Phe Asn Arg
275 280 285
Phe His Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg Leu Ile Asn Asn
290 295 300
Asn Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys Leu Phe Asn Ile
305 310 315 320
Gln Val Lys Glu Val Thr Thr Asn Asp Gly Val Thr Thr Ile Ala Asn
325 330 335
Asn Leu Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Ser Asp Ser Glu Tyr Gln Leu
340 345 350
Pro Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro
355 360 365
Ala Asp Val Phe Met Ile Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn Asn
370 375 380
Gly Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe
385 390 395 400
Pro Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Thr Phe Ser Tyr Thr
405 410 415
Phe Glu Glu Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu
420 425 430
Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Asn
435 440 445
Arg Thr Gln Asn Gln Ser Gly Ser Ala Gln Asn Lys Asp Leu Leu Phe
450 455 460
Ser Arg Gly Ser Pro Ala Gly Met Ser Val Gln Pro Lys Asn Trp Leu
465 470 475 480
Pro Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys Thr Lys Thr Asp
485 490 495
Asn Asn Asn Ser Asn Phe Thr Trp Thr Gly Ala Ser Lys Tyr Asn Leu
500 505 510
Asn Gly Arg Glu Ser Ile Ile Asn Pro Gly Thr Ala Met Ala Ser His
515 520 525
Lys Asp Asp Lys Asp Lys Phe Phe Pro Met Ser Gly Val Met Ile Phe
530 535 540
Gly Lys Glu Ser Ala Gly Ala Ser Asn Thr Ala Leu Asp Asn Val Met
545 550 555 560
Ile Thr Asp Glu Glu Glu Ile Lys Ala Thr Asn Pro Val Ala Thr Glu
565 570 575
Arg Phe Gly Thr Val Ala Val Asn Leu Gln Ser Ser Ser Thr Asp Pro
580 585 590
Ala Thr Gly Asp Val His Val Met Gly Ala Leu Pro Gly Met Val Trp
595 600 605
Gln Asp Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro
610 615 620
His Thr Asp Gly His Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe Gly
625 630 635 640
Leu Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val Pro
645 650 655
Ala Asn Pro Pro Ala Glu Phe Ser Ala Thr Lys Phe Ala Ser Phe Ile
660 665 670
Thr Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu Leu
675 680 685
Gln Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Val Gln Tyr Thr Ser
690 695 700
Asn Tyr Ala Lys Ser Ala Asn Val Asp Phe Thr Val Asp Asn Asn Gly
705 710 715 720
Leu Tyr Thr Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Pro
725 730 735
Leu
<210> 15
<211> 549
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 密码子优化的人源内皮抑素编码核酸序列
<400> 15
cacagccaca gagacttcca gcctgtgctg catctggtgg ccctgaactc tccactgagt 60
ggtggcatga gaggcatcag aggggctgac ttccagtgct tccagcaggc cagagctgtt 120
ggactggctg gaaccttcag agccttcctg agcagcagac tgcaggacct gtacagcatt 180
gtcagaaggg cagacagagc tgctgtgccc attgtgaacc tgaaggatga actgctgttc 240
cctagctggg aagccctgtt ctctggctct gagggacctc tgaaacctgg ggccagaatc 300
ttcagctttg atggcaagga tgtgctgaga caccccacct ggcctcagaa atctgtgtgg 360
catggctctg accccaatgg cagaaggctg acagagtcct actgtgaaac ttggagaaca 420
gaggccccat ctgccacagg ccaggccagt tcacttcttg gaggtagact gctgggccag 480
tctgcagcct cttgtcacca tgcctacatt gtgctgtgca ttgagaacag cttcatgaca 540
gccagcaag 549
<210> 16
<211> 1164
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 密码子优化的人源血管抑素编码核酸序列
<400> 16
aaccggaagt ccagcatcat catccgcatg cgcgacgtgg tgctgttcga gaagaaggtg 60
tacctgagcg agtgcaagac cggcaacggc aagaactaca gaggcaccat gagcaagacc 120
aagaacggca tcacctgtca gaagtggtcc agcacaagcc ctcacagacc cagattcagc 180
cccgccacac atccaagcga aggcctggaa gagaactact gcagaaaccc cgacaacgac 240
cctcaaggcc cttggtgcta caccaccgat cctgagaaga gatacgacta ctgcgacatc 300
ctggaatgcg aagaggaatg catgcactgc agcggcgaga actacgacgg caagatctcc 360
aagaccatga gcggactgga atgccaggct tgggacagcc agtctcctca cgctcacggc 420
tacatcccca gcaagttccc caacaagaac ctgaagaaga attactgtcg gaaccccgac 480
cgcgagctga ggccttggtg ttttaccaca gatccaaaca agcgctggga gctgtgcgac 540
atccccagat gcacaacccc tccacctagc agcggcccta cctaccaatg tctgaaaggc 600
accggcgaga attaccgggg caatgtggct gtgaccgtgt ccggccatac ctgccaacat 660
tggagcgccc agacacctca cacacacaac agaacccctg agaacttccc ctgcaagaat 720
ctggacgaaa actactgtag gaatcccgat ggcaagaggg ccccatggtg tcacaccacc 780
aacagccaag tccgctggga gtactgcaag atccccagct gtgatagcag ccccgtgtct 840
acagaacagc tggcccctac agctcctcct gagctgacac ctgtggtgca ggattgctat 900
cacggcgacg gccagtccta tagaggcaca agcagcacca ccacaaccgg caagaagtgc 960
cagagctggt cctccatgac accccaccgg caccagaaaa ccccagaaaa ctaccccaat 1020
gccggcctga ccatgaacta ttgccggaat cctgacgccg acaaaggccc ctggtgtttc 1080
acaactgacc ccagcgtcag atgggaatac tgtaatctga agaagtgcag cggcaccgag 1140
gcctctgttg ttgctcctcc tcct 1164
<210> 17
<211> 552
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 密码子优化的鼠源内皮抑素编码核酸序列
<400> 17
cacacccacc aggatttcca gcctgtgctg catctggtgg ccctgaacac acctctgtct 60
ggcggcatga gaggcatcag aggcgccgac ttccagtgtt tccagcaggc tagagctgtg 120
ggcctgagcg gaaccttcag agccttcctg tctagcagac tgcaggacct gtacagcatc 180
gtgcggagag ccgatagagg cagcgtgcca atcgtgaacc tgaaggacga ggtgctgagc 240
cctagctggg actctctgtt tagcggctct cagggacagc tgcagcctgg cgctagaatc 300
ttcagcttcg acggcaggga cgtgctgaga catcctgcct ggcctcagaa atctgtgtgg 360
cacggctctg atcctagcgg cagacggctg atggaaagct actgcgagac atggcggacc 420
gagacaacag gcgctacagg acaggcaagc tctctgctga gtggcagact gctggaacag 480
aaggccgcca gctgtcacaa cagctacatc gtgctgtgca tcgagaacag cttcatgacc 540
agcttcagca ag 552
<210> 18
<211> 1017
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 密码子优化的鼠源血管抑素编码核酸序列
<400> 18
gtgtacctga gcgagtgcaa gacaggcatc ggcaacggct acagaggcac catgagcagg 60
acaaagtctg gcgtggcctg tcagaagtgg ggcgctacat ttcctcacgt gcccaactac 120
agccccagca cacaccctaa cgaaggcctg gaagagaact actgcagaaa ccccgacaac 180
gacgagcaag gcccttggtg ctacaccacc gatcctgaca agagatacga ctactgcaac 240
atccccgagt gcgaagagga atgcatgtac tgcagcggcg agaagtacga gggcaagatc 300
agcaagacca tgagcggcct ggattgtcag gcctgggact ctcagtctcc tcacgctcac 360
ggctacatcc ccgctaagtt ccccagcaag aacctgaaga tgaattactg taggaaccct 420
gacggcgagc ccagaccatg gtgcttcaca acagacccca ccaagagatg ggagtactgt 480
gacatcccca gatgcaccac acctccacca cctccatctc caacctacca gtgcctgaaa 540
ggcagaggcg agaactaccg gggcacagtg tctgtgaccg tgtctggcaa gacatgccag 600
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aacctcgagg aaaactactg ccgcaatcca gacggcgaga cagccccatg gtgttatacc 720
acagacagcc agctgcgctg ggagtattgc gagatcccta gctgcgagag cagcgcctct 780
cctgaccaga gcgattcttc tgtgcctcct gaggaacaga cacccgtggt gcaagagtgc 840
taccagtctg acggccagag ctacaggggc acaagcagca caaccatcac cggcaagaag 900
tgccagagct gggccgctat gttccctcac cggcactcta agacacccga gaactttcca 960
gacgccggcc tcgagatgaa ctattgccgg aatcctgatg gcgacaaagg cccctgg 1017
<210> 19
<211> 549
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 原始(未经密码子优化的)人源内皮抑素编码核酸序列
<400> 19
cacagccacc gcgacttcca gccggtgctc cacctggttg cgctcaacag ccccctgtca 60
ggcggcatgc ggggcatccg cggggccgac ttccagtgct tccagcaggc gcgggccgtg 120
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ttctcctttg acggcaagga cgtcctgagg caccccacct ggccccagaa gagcgtgtgg 360
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gaggctccct cggccacggg ccaggcctcc tcgctgctgg ggggcaggct cctggggcag 480
agtgccgcga gctgccatca cgcctacatc gtgctctgca ttgagaacag cttcatgact 540
gcctccaag 549
<210> 20
<211> 1164
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 原始(未经密码子优化的)人源血管抑素编码核酸序列
<400> 20
aacaggaagt cctccataat cattaggatg agagatgtag ttttatttga aaagaaagtg 60
tatctctcag agtgcaagac tgggaatgga aagaactaca gagggacgat gtccaaaaca 120
aaaaatggca tcacctgtca aaaatggagt tccacttctc cccacagacc tagattctca 180
cctgctacac acccctcaga gggactggag gagaactact gcaggaatcc agacaacgat 240
ccgcaggggc cctggtgcta tactactgat ccagaaaaga gatatgacta ctgcgacatt 300
cttgagtgtg aagaggaatg tatgcattgc agtggagaaa actatgacgg caaaatttcc 360
aagaccatgt ctggactgga atgccaggcc tgggactctc agagcccaca cgctcatgga 420
tacattcctt ccaaatttcc aaacaagaac ctgaagaaga attactgtcg taaccccgat 480
agggagctgc ggccttggtg tttcaccacc gaccccaaca agcgctggga actttgtgac 540
atcccccgct gcacaacacc tccaccatct tctggtccca cctaccagtg tctgaaggga 600
acaggtgaaa actatcgcgg gaatgtggct gttaccgtgt ccgggcacac ctgtcagcac 660
tggagtgcac agacccctca cacacataac aggacaccag aaaacttccc ctgcaaaaat 720
ttggatgaaa actactgccg caatcctgac ggaaaaaggg ccccatggtg ccatacaacc 780
aacagccaag tgcggtggga gtactgtaag ataccgtcct gtgactcctc cccagtatcc 840
acggaacaat tggctcccac agcaccacct gagctaaccc ctgtggtcca ggactgctac 900
catggtgatg gacagagcta ccgaggcaca tcctccacca ccaccacagg aaagaagtgt 960
cagtcttggt catctatgac accacaccgg caccagaaga ccccagaaaa ctacccaaat 1020
gctggcctga caatgaacta ctgcaggaat ccagatgccg ataaaggccc ctggtgtttt 1080
accacagacc ccagcgtcag gtgggagtac tgcaacctga aaaaatgctc aggaacagaa 1140
gcgagtgttg tagcacctcc gcct 1164
<210> 21
<211> 552
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 原始(未经密码子优化的)鼠源内皮抑素编码核酸序列
<400> 21
catactcatc aggactttca gccagtgctc cacctggtgg cactgaacac ccccctgtct 60
ggaggcatgc gtggtatccg tggagcagat ttccagtgct tccagcaagc ccgagccgtg 120
gggctgtcgg gcaccttccg ggctttcctg tcctctaggc tgcaggatct ctatagcatc 180
gtgcgccgtg ctgaccgggg gtctgtgccc atcgtcaacc tgaaggacga ggtgctatct 240
cccagctggg actccctgtt ttctggctcc cagggtcaac tgcaacccgg ggcccgcatc 300
ttttcttttg acggcagaga tgtcctgaga cacccagcct ggccgcagaa gagcgtatgg 360
cacggctcgg accccagtgg gcggaggctg atggagagtt actgtgagac atggcgaact 420
gaaactactg gggctacagg tcaggcctcc tccctgctgt caggcaggct cctggaacag 480
aaagctgcga gctgccacaa cagctacatc gtcctgtgca ttgagaatag cttcatgacc 540
tctttctcca aa 552
<210> 22
<211> 1017
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 原始(未经密码子优化的)鼠源血管抑素编码核酸序列
<400> 22
gtgtatctgt cagaatgtaa gaccggcatc ggcaacggct acagaggaac catgtccagg 60
acaaagagtg gtgttgcctg tcaaaagtgg ggtgccacgt tcccccacgt acccaactac 120
tctcccagta cacatcccaa tgagggacta gaagagaact actgtaggaa cccagacaat 180
gatgaacaag ggccttggtg ctacactaca gatccggaca agagatatga ctactgcaac 240
attcctgaat gtgaagagga atgcatgtac tgcagtggag aaaagtatga gggcaaaatc 300
tccaagacca tgtctggact tgactgccag gcctgggatt ctcagagccc acatgctcat 360
ggatacatcc ctgccaaatt tccaagcaag aacctgaaga tgaattattg ccacaaccct 420
gacggggagc caaggccctg gtgcttcaca acagacccca ccaaacgctg ggaatactgt 480
gacatccccc gctgcacaac acccccgccc ccacccagcc caacctacca atgtctgaaa 540
ggaagaggtg aaaattaccg agggaccgtg tctgtcaccg tgtctgggaa aacctgtcag 600
cgctggagtg agcaaacccc tcataggcac aacaggacac cagaaaattt cccctgcaaa 660
aatctggaag agaactactg ccggaaccca gatggagaaa ctgctccctg gtgctatacc 720
actgacagcc agctgaggtg ggagtactgt gagattccat cctgcgagtc ctcagcatca 780
ccagaccagt cagattcctc agttccacca gaggagcaaa cacctgtggt ccaggaatgc 840
taccagagcg atgggcagag ctatcggggt acatcgtcca ctaccatcac agggaagaag 900
tgccagtcct gggcagctat gtttccacac aggcattcga agaccccaga gaacttccca 960
gatgctggct tggagatgaa ctactgcagg aacccggatg gtgacaaggg cccttgg 1017

Claims (16)

1.编码血管抑素的核酸分子,其核苷酸序列与SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18所示的核苷酸序列具有至少80%的同一性,优选具有至少85%、90%、95%、99%或100%的同一性。
2.根据权利要求1所述的核酸分子,其中,所述核酸分子包含SEQ ID NO:16或SEQ IDNO:18所示的核苷酸序列,优选地,所述核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:16或SEQ IDNO:18所示。
3.转基因表达盒,其包括:启动子、权利要求1或2所述的核酸分子、bGH polyA。
4.根据权利要求3所述的转基因表达盒,其中,所述启动子选自:CB启动子、CAG启动子、EF1启动子、泛素启动子、T7启动子、SV40启动子、VP16、VP64启动子、Tuj1启动子、GFAP启动子、波形蛋白启动子、RPE65启动子、VMD2启动子、突触蛋白启动子、VGAT启动子、DAT启动子、TH启动子和骨钙蛋白启动子;优选地,所述启动子为CB启动子。
5.根据权利要求3或4所述的转基因表达盒,其中,所述转基因表达盒还包括:信号肽,例如SP信号肽、ALB信号肽和PLS信号肽;和/或位于两端的两个ITR,所述两个ITR各自独立地为正常ITR或缩短ITR肽。
6.根据权利要求3至5中任一项所述的转基因表达盒,其中,所述核酸分子带有寡肽标签,例如Flag、6×His、2×HA和Myc。
7.根据权利要求3至6中任一项所述的转基因表达盒,其中,所述转基因表达盒还包括:编码一种或多种治疗性蛋白质的核苷酸序列,所述治疗性蛋白质不同于血管抑素;优选地,所述治疗性蛋白质为具有抗血管生成作用的蛋白质;更优选地,所述治疗性蛋白质为内皮抑素。
8.根据权利要求7所述的转基因表达盒,其中,所述转基因表达盒还包括连接序列;优选地,所述连接序列为Furin蛋白酶序列+连接肽+2A序列,例如P2A、T2A或F2A。
9.根据权利要求7或8所述的转基因表达盒,其中,编码内皮抑素的核苷酸序列如SEQID NO:15或SEQ ID NO:17所示。
10.根据权利要求7至9中任一项所述的转基因表达盒,其中,所述转基因表达盒的核苷酸序列如SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:11所示。
11.基因递送系统,其包括:权利要求3至10中任一项所述的转基因表达盒和AAV衣壳蛋白。
12.根据权利要求11所述的基因递送系统,其中,所述AAV衣壳蛋白为天然AAV衣壳蛋白或人工改造的AAV衣壳蛋白;优选地,所述AAV选自:AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11,AAV12、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAV-DJ9、AAVrh8、AAVrh8R和AAVrh10。
13.根据权利要求11或12所述的基因递送系统,其中,所述AAV衣壳蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:14所示。
14.权利要求11至13中任一项所述的基因递送系统在制备用于治疗疾病的药物中的应用,所述疾病以新生血管为主要病理机制或诱发因素。
15.药物,其包含:权利要求1或2所述的核酸分子、权利要求3至10中任一项所述的转基因表达盒或权利要求11至14中任一项所述的基因递送系统,以及赋形剂;优选地,所述药物用于治疗以新生血管为主要病理机制或诱发因素的疾病;优选地,所述疾病为视网膜疾病或癌症,例如老年视网膜黄斑病变、糖尿病视网膜病变,以及其他由强光引起的视网膜损伤;肺癌、肝癌、肾癌、甲状腺癌、前列腺癌、肾癌、乳腺癌、结肠直肠癌、子宫颈癌、白血病、淋巴瘤、黑素瘤和成胶质细胞瘤。
16.根据权利要求15所述的药物,其中,所述药物通过全身途径或局部途径施用,例如静脉内施用、肌内施用、皮下施用、经口施用、局部接触、腹膜内施用和病灶内施用,优选局部施用于眼睛,例如通过玻璃体内注射、视网膜下注射或脉络膜上注射。
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