JP2020195380A - 細胞免疫療法のための方法および組成物 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2014年4月10日に出願された米国仮特許出願61/977,751号、2014年4月30日に出願された米国仮特許出願61/986,479号、2014年10月2日に出願された米国仮特許出願62/058,973号、2014年12月5日に出願された米国仮特許出願62/088,363号、2014年12月9日に出願された米国仮特許出願62/089,730号および2014年12月11日に出願された米国仮特許出願62/090,845号に係る優先権を主張するものである。前記出願の開示は、参照によりその全体が明示的に本明細書に組み込まれる。
本願は電子形式の配列表とともに出願されたものである。この配列表は、SCRI-065WO_SEQUENCE_LISTING.TXTのファイル名で2014年4月1日に作成された114kbのファイルとして提供されたものである。この電子形式の配列表に記載された情報は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
リガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、ポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチドを含み、
該リガンドが、がんまたは腫瘍細胞上で発現されている分子であることを特徴とするキメラ受容体の核酸配列、ならびに/または
該核酸配列によってコードされるキメラ受容体に関する。
いくつかの実施形態において、前記スペーサーは、前記リガンド結合ドメインと前記膜貫通ドメインとをつないでおり、すなわち前記リガンド結合ドメインと前記膜貫通ドメインとを隔てている。いくつかの実施形態においては、前記ポリペプチドスペーサーはヒンジ領域を含み、該ヒンジ領域としては、たとえば抗体分子に由来するヒンジ領域、たとえばアミノ酸配列X1PPX2Pを含むヒンジ領域が挙げられる。このようなヒンジ領域は他のアミノ酸配列に連結されていてもよく、該他のアミノ酸配列としては、1つ以上の抗体定常領域が挙げられ、たとえばIg FcのCH2領域およびCH3の領域が挙げられ、たとえば、Ig FcのCH3領域のみからなる配列が挙げられるが、これらに限定されない。驚くべきことに、スペーサー領域の長さを個々の標的分子に応じてカスタマイズすることによって、腫瘍または標的細胞の認識を向上することができ、かつ/またはエフェクター機能を向上することができ、かつ/または(特にインビボにおける)前記受容体を発現する細胞の持続を向上することができることが分かった。
免疫応答を付与かつ/または増強するための遺伝子改変CD8+発現細胞傷害性Tリンパ球製剤、および/または遺伝子改変ヘルパーTリンパ球製剤を含み、
前記細胞傷害性Tリンパ球製剤がCD8+発現T細胞を含み、該CD8+発現T細胞が、前記疾患または障害に関連するリガンドに結合するリガンド結合ドメイン、カスタマイズされたスペーサー領域、膜貫通ドメイン、およびT細胞受容体またはその他の受容体の細胞内シグナル伝達ドメイン(たとえば共刺激ドメインなど)を含むキメラ受容体を発現すること、
前記ヘルパーTリンパ球製剤がCD4+発現T細胞を含み、該CD4+発現T細胞が、前記疾患または障害に関連する前記リガンドを標的としかつ/または該リガンドに特異的な抗体可変ドメイン、カスタマイズされたスペーサー領域、膜貫通ドメイン、および1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含むキメラ受容体を発現することを特徴とする組成物を提供する。
一実施形態は、遺伝子改変ヘルパーTリンパ球製剤を含み、
該ヘルパーTリンパ球製剤がキメラ受容体を有するCD4+発現T細胞を含み、該キメラ受容体が、リガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、ポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチドおよび1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチドを含むこと、
前記リガンドが、腫瘍持異抗原、腫瘍標的抗原、またはリンパ球による認識および/もしくは排除を媒介するのに適切な標的細胞集団に発現しているその他の分子であること、
前記ポリペプチドスペーサーがカスタマイズされた長さを有すること、
前記スペーサーによって、T細胞の増殖、インビボでの細胞活動および/またはサイトカイン産生が対照キメラ受容体よりも増強されることを特徴とする。
いくつかの実施形態においては、リガンド結合ドメインは、抗体またはその抗原結合フラグメントを含み、該抗体またはその抗原結合フラグメントは、正常細胞よりも腫瘍細胞において見出されることが多いCD171のエピトープを標的とし、かつ/またはこのエピトープに特異的に結合することができる。別の実施形態においては、スペーサー領域は短い細胞外スペーサーを含む。いくつかの実施形態においては、シグナル伝達ドメインは、単一のシグナル伝達ドメインを含んでおり、その他のシグナル伝達ドメインは含んでいない。
細胞性免疫応答を誘導し、かつ抗原反応性のキメラ受容体を発現する、該キメラ受容体により改変された腫瘍特異的または腫瘍標的なCD8+発現細胞傷害性Tリンパ球製剤を得ること、および/または
改変ナイーブヘルパーT細胞または改変メモリーCD4+発現ヘルパーT細胞を得ることを含み、
前記遺伝子組換え細胞傷害性Tリンパ球製剤が、リガンド結合ドメイン、カスタマイズされた長さを有するポリペプチドスペーサー、膜貫通ドメインおよび1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含むキメラ受容体を有するCD8+発現T細胞を含むこと、
前記リガンドが、腫瘍持異抗原、腫瘍標的抗原、またはリンパ球による認識および排除を媒介するのに適切な標的細胞集団に発現しているその他の分子であること、
前記スペーサーによって、T細胞の増殖、インビボでの細胞活動および/またはサイトカイン産生が対照キメラ受容体よりも増強されること、
前記遺伝子組換えヘルパーTリンパ球製剤が、リガンド結合ドメイン、カスタマイズされた長さをする最適化されたポリペプチドスペーサー、膜貫通ドメイン、および1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含むキメラ受容体を有するCD4+発現細胞を含むこと、ならびに
前記リガンドが、腫瘍持異抗原、腫瘍標的抗原、またはリンパ球による認識および排除を媒介するのに適切な標的細胞集団に発現しているその他の分子であることを特徴とする方法に関する。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、リガンド結合ドメインは、抗体またはその抗原結合フラグメントを含み、該抗体またはその抗原結合フラグメントは、正常細胞よりも腫瘍細胞において見出されることが多いCD171のエピトープを標的とし、かつ/またはこのエピトープと特異的に結合する。別の実施形態においては、スペーサー領域は短い細胞外スペーサーを含み、該スペーサー領域は、たとえば、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)であり、たとえば、15アミノ酸長、14アミノ酸長、13アミノ酸長もしくは12アミノ酸長であり、または11アミノ酸長、10アミノ酸長、9アミノ酸長、8アミノ酸長、7アミノ酸長、6アミノ酸長、5アミノ酸長、4アミノ酸長、3アミノ酸長もしくは2アミノ酸長であり、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さを有する。いくつかの実施形態においては、シグナル伝達ドメインは、単一のシグナル伝達ドメインを含んでおり、その他のシグナル伝達ドメインは含んでいない。
いくつかの実施形態では、前記核酸は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)前記リガンド結合ドメインと膜貫通ドメインとをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含み、
免疫細胞集団において前記キメラ受容体を発現させることによって、該免疫細胞の経時生存率および/または経時持続性が向上すること、ならびに
CD171を発現する腫瘍を有する対象に投与すると、CD171と接触し、かつ/または、前記ポリペプチドスペーサーよりも長いポリペプチドスペーサーを有する対照キメラ受容体を発現させた場合よりも増強された治療効果が発揮されることを特徴とする。
いくつかの実施形態においては、前記経時生存率の上昇および/または前記経時持続性の向上が、前記キメラ受容体を発現する細胞をCD171発現細胞に複数回、連続して暴露させることを含むインビトロでのストレステストアッセイで測定される抗原誘導細胞死が相対的に低下することを含み、かつ/または前記経時生存率の上昇および/または前記経時持続性の向上が、CD171を発現する腫瘍を有する対象に投与した後にインビボにおける細胞の持続性が向上することを含み、かつ/または前記長いポリペプチドスペーサーが、少なくとも2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍または10倍の長さを有する。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、200アミノ酸長、150アミノ酸長、100アミノ酸長、50アミノ酸長もしくは20アミノ酸長もしくはこれらのアミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含むキメラ受容体の核酸配列に関する。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含むキメラ受容体の核酸配列が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択されるCD8+T細胞傷害性リンパ球、またはCD45RO+、CD62L+およびCD8+のセントラルメモリーT細胞を含み、前記組成物は別の宿主細胞をさらに含み、該宿主細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+のセントラルメモリーT細胞であるか、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球であるか、あるいはCD45RA+、CD62L+、CD4+、およびCD45RO−のナイーブCD4+T細胞である。
a)長さの異なるキメラ受容体をコードする複数の核酸を含む、キメラ受容体をコードする核酸のライブラリーを提供すること;
b)単離された個別のTリンパ球集団に前記複数の核酸のそれぞれを導入し、各Tリンパ球集団をインビトロで増殖させること;
c)腫瘍を有する動物モデルに各遺伝子改変Tリンパ球集団を投与し、各遺伝子改変Tリンパ球集団が抗腫瘍効果を有するかどうかを判定すること;ならびに
d)抗腫瘍効果を示すキメラ受容体をコードする核酸を選択すること
を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターは単離されたキメラ受容体核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記方法は、前記キメラ受容体をコードする選択された前記核酸を宿主細胞に導入することをさらに含む。
a)CD45RA−、CD45RO+およびCD62L+の表現型を有するリンパ球集団に核酸または発現ベクターを導入すること;ならびに
b)抗CD3および/または抗CD28と少なくとも1つの恒常性サイトカインとの存在下において、前記リンパ球を、細胞移入における使用に十分な数に達するまで培養すること
を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターは、単離されたキメラ受容体核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記リンパ球はCD8+またはCD4+である。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。いくつかの実施形態においては、薬学的に許容される添加剤中に宿主細胞を含む前記組成物が提供される。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターは単離されたキメラ受容体核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択されるCD8+T細胞傷害性リンパ球、またはCD45RO+、CD62L+およびCD8+のセントラルメモリーT細胞を含み、前記組成物は別の宿主細胞をさらに含み、該宿主細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+のセントラルメモリーT細胞であるか、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球であるか、またはCD45RA+、CD62L+、CD4+、およびCD45RO−のナイーブCD4+T細胞である。いくつかの実施形態においては、前記がんは神経芽腫である。いくつかの実施形態においては、前記固形腫瘍は、乳がん、脳がん、大腸がん、腎臓がん、膵臓がんおよび卵巣がんからなる群から選択される。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。いくつかの実施形態においては、薬学的に許容される添加剤中に宿主細胞を含む前記組成物が提供される。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターは単離されたキメラ受容体核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的とし、かつ/またCD171と結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択されるCD8+T細胞傷害性リンパ球、またはCD45RO+、CD62L+およびCD8+のセントラルメモリーT細胞を含み、前記組成物は別の宿主細胞をさらに含み、該宿主細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+のセントラルメモリーT細胞であるか、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球であるか、あるいはCD45RA+、CD62L+、CD4+、およびCD45RO−のナイーブCD4+T細胞である。いくつかの実施形態においては、前記がんは神経芽腫である。いくつかの実施形態においては、前記腫瘍は、乳がん、脳がん、大腸がん、腎臓がん、膵臓がんおよび卵巣がんからなる群から選択される。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーを提供することによって、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強される。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーを提供することによって、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強される。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーを提供することによって、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強される。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
いくつかの実施形態において、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。前記組成物の実施形態のいくつかにおいては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞またはバルクCD8+T細胞から実質的になるCD8+細胞集団、またはこれらの細胞のいずれかが濃縮されたCD8+細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞集団は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+のCD8+セントラルメモリーT細胞から実質的になるか、またはこの細胞が濃縮されたものである。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球から実質的になるCD4+細胞集団、またはこれらの細胞から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球が濃縮されたCD4+細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD4+細胞集団は、実質的にCD45RA+、CD62L+、CD4+、およびCD45RO−のナイーブCD4+T細胞からなるか、この細胞が濃縮されたものである。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は、発現ベクターを含む宿主細胞を含む。いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターはキメラ受容体の核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。前記組成物の実施形態のいくつかにおいては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞またはバルクCD8+T細胞から実質的になるCD8+細胞集団、またはこれらの細胞のいずれかが濃縮されたCD8+細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞集団は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+のCD8+セントラルメモリーT細胞から実質的になるか、またはこの細胞が濃縮されたものである。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球から実質的になるCD4+細胞集団、またはこれらの細胞から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球が濃縮されたCD4+細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD4+細胞集団は、実質的にCD45RA+、CD62L+、CD4+、および/またはCD45RO−のナイーブCD4+T細胞からなるか、この細胞が濃縮されたものである。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は宿主細胞を含み、該宿主細胞は、CD8+T細胞傷害性リンパ球、またはCD45RO+、CD62L+および/もしくはCD8+のセントラルメモリーT細胞であるCD8+細胞傷害性Tリンパ球であり、前記組成物は別の宿主細胞をさらに含み、該宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球、またはCD45RA+、CD62L+、CD4+、および/もしくはCD45RO−のナイーブCD4+T細胞であるCD4+ヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。
いくつかの実施形態においては、前記方法は、
a)ライブラリーに含まれる複数の核酸がそれぞれキメラ受容体をコードし、各核酸によってコードされたキメラ受容体の長さがそれぞれ異なる核酸ライブラリーを提供すること、
b)個別のTリンパ球集団に前記複数の核酸のそれぞれを導入し、各Tリンパ球集団をインビトロで増殖させて、複数の遺伝子改変Tリンパ球集団を得ること、
c)腫瘍を有する動物モデルに各遺伝子改変Tリンパ球集団を投与し、抗腫瘍効果の測定値を評価すること、ならびに
d)インビトロおよび/または動物モデルにおいて抗腫瘍効果を示すキメラ受容体をコードする核酸を選択すること
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記複数の核酸は発現ベクターをコードする。いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターはキメラ受容体の核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記方法は、前記キメラ受容体をコードする選択された前記核酸を宿主細胞に導入することをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
複数の核酸を含み、各核酸によってコードされるキメラ受容体の長さがそれぞれ異なり、各キメラ受容体が前記抗原を標的とし、かつ/または該抗原に特異的に結合することを特徴とする複数の細胞集団と、抗原を発現するドナー細胞とを連続して複数回インキュベートすること、
前記複数の細胞集団のそれぞれの増殖、活性化、および/または生存を評価すること、ならびに
前記評価に基づいてキメラ受容体を選択することを含む方法が提供される。
いくつかの実施形態において、前記連続した複数回のインキュベーションは、少なくとも3回のインキュベーションを含み、各回のインキュベーション後に前記細胞集団を回収する。いくつかの実施形態においては、前記評価は、前記連続した複数回のインキュベーションを行った後に、各集団における細胞の生存、生存数または生存率(%)を検出することによって行い、別の複数の細胞集団よりも生存、生存数または生存率(%)が増加している集団によって発現されるキメラ受容体が選択される。いくつかの実施形態においては、前記複数の細胞集団と前記抗原を発現する細胞とのインキュベーションにおける、各回のインキュベーション開始時の比率は1:1である。いくつかの実施形態においては、様々な長さの前記複数のキメラ受容体は、様々な長さのスペーサーを含み、各スペーサーは、キメラ受容体の抗原結合ドメインと膜貫通ドメインとをつないでおり;かつ/または様々な長さの前記複数のキメラ受容体は、細胞内共刺激ドメインの数が異なるキメラ受容体を含み、各細胞内ドメインはそれぞれ別の天然の共刺激分子に由来している。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
CD45RA−、CD45RO+および/またはCD62L+の表現型を有するリンパ球集団に前記核酸または前記発現ベクターを導入すること;ならびに
抗CD3および/または抗CD28と少なくとも1つの恒常性サイトカインとの存在下において、前記リンパ球を、細胞移入における使用に十分な数に達するまで培養すること
を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、上述したように、前記宿主細胞は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、上述したように、前記発現ベクターはキメラ受容体の核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記リンパ球はCD8+またはCD4+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、組成物は宿主細胞を含む。いくつかの実施形態においては、本明細書に記載したように、前記組成物は、発現ベクターを含む宿主細胞を含む。いくつかの実施形態においては、本明細書に記載したように、前記発現ベクターはキメラ受容体の核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。前記組成物の実施形態のいくつかにおいては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞またはバルクCD8+T細胞から実質的になるCD8+細胞集団、またはこれらの細胞のいずれかが濃縮されたCD8+細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞集団は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+のCD8+セントラルメモリーT細胞から実質的になるか、またはこの細胞が濃縮されたものである。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球から実質的になるCD4+細胞集団、またはこれらの細胞から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球が濃縮されたCD4+細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD4+細胞集団は、実質的にCD45RA+、CD62L+、CD4+、およびCD45RO−のナイーブCD4+T細胞からなるか、この細胞が濃縮されたものである。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+およびCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は、薬学的に許容される添加剤中に宿主細胞を含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、組成物は宿主細胞を含む。いくつかの実施形態においては、前記組成物は、発現ベクターを含む宿主細胞を含む。いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターはキメラ受容体の核酸配列を含む。
いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を特異的標的としかつ/またはCD171に特異的に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、
b)100アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)の長さを有し、前記リガンド結合ドメインと前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをつなぐポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、ならびに
c)前記キメラ受容体の膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド、および前記キメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはアミノ酸配列X1PPX2Pを含み、ここで、X1およびX2はそれぞれ独立して任意のアミノ酸である。いくつかの実施形態においては、X1および/またはX2はシステインである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長未満(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長もしくは15アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号17)、ERKCCVECPPCP(配列番号18)、ELKTPLGDTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)3(配列番号19)、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)を含むか、実質的にこれらの配列のいずれかからなるか、これらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、ESKYGPPCPSCP(配列番号20)、ESKYGPPCPPCP(配列番号21)、YGPPCPPCP(配列番号51)、KYGPPCPPCP(配列番号52)、またはEVVKYGPPCPPCP(配列番号53)からなるか、実質的にこれらの配列のいずれかからなる。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、別の共刺激分子の細胞内領域を含んでおらず、かつ/または、CD27、CD28、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2CおよびB7−H3からなる群から選択される分子の細胞内シグナル伝達領域を含んでおらず、かつ/またはCD28の細胞内シグナル伝達領域を含んでいない。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はCD8+T細胞傷害性リンパ球である。前記組成物の実施形態のいくつかにおいては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞またはバルクCD8+T細胞から実質的になるCD8+細胞集団、またはこれらの細胞のいずれかが濃縮されたCD8+細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞集団は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+のCD8+セントラルメモリーT細胞から実質的になるか、またはこの細胞が濃縮されたものである。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球から実質的になるCD4+細胞集団、またはこれらの細胞から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球が濃縮されたCD4+細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD4+細胞集団は、実質的にCD45RA+、CD62L+、CD4+、および/またはCD45RO−のナイーブCD4+T細胞からなるか、この細胞が濃縮されたものである。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は、薬学的に許容される添加剤をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は造血幹細胞である。
たとえば、いくつかの実施形態において、対照のキメラ受容体は、長さまたは配列が異なるスペーサーを有すること以外は、目的とする受容体と同一であり、たとえば、目的とするキメラ受容体のスペーサーよりも、対照のキメラ受容体のスペーサーが長く、たとえば、目的とするキメラ受容体のスペーサーのアミノ酸長の少なくとも2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍または10倍であることが挙げられる。
いくつかの実施形態において、本発明の方法は、
スペーサー領域のみが異なる複数のキメラ受容体核酸配列を提供すること、
各キメラ受容体核酸配列を個別のTリンパ球集団に導入すること、
前記個別のリンパ球集団をインビトロで増殖させること、
各リンパ球集団を、腫瘍を有する動物に導入して、T細胞において発現させたときの各キメラ受容体の抗腫瘍作用を測定すること、および
他のキメラ受容体により改変された他の個別のリンパ球集団と比較して抗腫瘍作用を提供するキメラ受容体を選択すること
を含む。
あるいは、上記単一または複数の遺伝子をT細胞に導入することによって、たとえば、インビボにおいてネガティブセレクションにより除去されるように該T細胞を改変することができ、それによって免疫療法の安全性を向上または改善することができる。このような方法は、Lupton S. D. et al., Mol. and Cell Biol., 11:6 (1991);およびRiddell et al., Human Gene Therapy 3:319-338 (1992)に記載されている。さらに、LuptonらによるPCT/US91/08442およびPCT/US94/05601も参照されたいが、これらの文献では、ドミナントポジティブ型の選択マーカーとネガティブ選択マーカーとを融合させた選択可能な二機能性融合遺伝子の使用について述べられている(これらの文献は参照によってその全体が本明細書に明示的に組み込まれる)。このような二機能性融合遺伝子の使用は、公知の技術(たとえば、Riddellらに付与された米国特許第6,040,177号の14〜17段落を参照されたい)、または本明細書の記載を元に当業者によって容易に理解されうる上記技術の変法によって実施することができる。
いくつかの実施形態において、本発明の方法は、
スペーサー領域のみが異なる複数のキメラ受容体核酸配列を提供すること、
各キメラ受容体核酸配列を個別のTリンパ球集団に導入すること、
前記個別のリンパ球集団をインビトロで増殖させること、
腫瘍を有する動物に各リンパ球集団を導入して、キメラ受容体で改変された各T細胞の抗腫瘍作用を測定すること、および
他のキメラ受容体で改変されたT細胞により改変された他の個別のリンパ球集団と比較して抗腫瘍作用を提供するキメラ受容体を選択すること
を含む。
CD171分子は神経芽腫などの様々なヒト悪性腫瘍において発現されるが、CD171分子を標的とすることができ、かつ/またはCD171分子に特異的なキメラ受容体をいくつか構築した。これらのCD171特異的/標的キメラ受容体は、CD171特異的かつ/または標的scFVから設計したが、元となったこれらのscFVは、CD171上のエピトープであるCE7に特異的に結合し、かつ様々な長さの細胞外スペーサードメインを含むものであった。Ce7scFv-IgG4hinge-CH2-CH3-CD28tm/4-1BB-ζ-T2A-EGFRt-epHIV7(長い構築物)の配列(配列番号54)を図5および図6に示す。CE7scFv-IgG4hinge-CH3-CD28tm/4-1BB-ζ-T2A-EGFRt-epHIV7(中程度の長さの構築物)の配列(配列番号55)を図7および図8に示す。CE7scFv-IgG4hinge-CD28tm/4-1BB-ζ-T2A-EGFRt-epHIV7(短い構築物)の配列(配列番号56)を図9および図10に示す。2つの共刺激ドメインを有する構築物である、CE7scFv-IgG4hinge-CD28tm/cyto-4-1BB-ζ-T2A-EGFRt-epHIV7の配列(配列番号57)を図11および図12に示す。CD171に特異的であり、かつ/またはCD171を標的とする各キメラ受容体を発現するT細胞が、CD171を発現する神経芽腫をインビトロで認識する能力、および免疫不全マウスに移植された神経芽腫の腫瘍細胞を排除する能力を分析した。
研究プロトコルに対するインフォームドコンセントを書面にて得た後、健常ドナーおよび患者から末梢血単核細胞(PBMC)を採取した。
SK-N-BE2神経芽腫細胞株(Be2)をAmerican Type Culture Collectionから得た。過去の報告に従って(Pelloquin F, Lamelin JP, Lenoir GM. In vitro cell dev biol 1986; 22(12):689-694)、EBVにより形質転換されたTMLCLをPBMCから作製した。
標識抗CD4 mAb、標識抗CD8 mAb、標識抗CD28 mAb、標識抗CD45RA mAb、標識抗CD62L mAbおよびアイソタイプを一致させたコントロール(BD Biosciences)を使用して、PBMCおよび細胞株を染色した。セントラルメモリーT細胞は、免疫磁気ビーズを使用して、CD8+T細胞を単離し、得られたCD8+細胞集団からCD45RA細胞を除去することによってPBMCから単離した。CD45RAが除去されたCD8+細胞は、図1に示すように、免疫磁気ビーズを使用してCD62L細胞を濃縮した。CD171特異的/標的キメラ受容体の表面発現は、ポリクローナルヤギ抗マウスIgG抗体(Fab特異的)(Jackson ImmunoResearch)を使用して分析した。フロー分析はFACSCanto(登録商標)にて行い、ソーティングおよび精製はFACSAria II(登録商標)(Becton Dickinson)にて行い、データ分析はFlowJo(登録商標)ソフトウエア(Treestar)を使用して行った。
CD171特異的かつ/または標的キメラ受容体は、CE7(CD171) mAbのVL鎖セグメントおよびVH鎖セグメントを使用して構築した(CE7の可変領域の配列は、図5、図7、図9および図11に示す)。各scFvは、IgG4-Fc(Uniprotデータベース:P01861;表2)に由来するスペーサードメインに連結されており、このスペーサードメインは、「ヒンジ−CH2−CH3」配列(長いスペーサー:229アミノ酸長)、「ヒンジ−CH3」配列(中程度の長さのスペーサー:119アミノ酸長)または「ヒンジ」のみの配列(短いスペーサー:12アミノ酸長)のいずれかを含んでいた(表6)。これらのスペーサーはいずれも、天然型IgG4-Fcタンパク質の108番目のアミノ酸に相当するヒンジドメイン内の位置にS→P置換を有し、かつヒトCD28(Uniprot:P10747、表3)由来の膜貫通ドメイン(27アミノ酸長)とシグナル伝達モジュールとに連結されており、このシグナル伝達モジュールは、(i)ヒト4-1BB(Uniprot:Q07011、表4)の細胞内ドメイン(42アミノ酸長)に連結され、かつ天然型のCD28タンパク質(表3)の186〜187番目にLL→GGの置換を有する、ヒトCD28の細胞内ドメイン(41アミノ酸長)を含むか、あるいは(ii)ヒト4-1BBの細胞内ドメインを単独で含み、これらのいずれかを含む各シグナル伝達モジュールはヒトCD3ζのアイソフォーム3(Uniprot:P20963、表5)の細胞内ドメイン(112アミノ酸長)に連結されていた。前記構築物は、T2Aリボソームスキップ要素(表1)およびtEGFR配列(表1)をキメラ受容体の下流にコードしていた。各導入遺伝子をコードするヒトコドン最適化ヌクレオチド配列を合成し(Life Technologies)、epHIV7レンチウイルスベクターにクローニングした。
正常なドナーのPBMCからCD8+CD45RO-CD62L+セントラルメモリーT細胞(TCM)をソートし(図1参照)、抗CD3/CD28ビーズ(Life Technologies)で活性化し、3日目に1μg/mLのポリブレン(Millipore)を添加したレンチウイルス上清(MOI=3)を加え800×g、32℃で45分間遠心分離して活性化させて形質導入した。最終濃度が50U/mLとなるように組換えヒトIL−2を添加した、10%ヒト血清および2mM L−グルタミンを含むRPMI(CTL培地)中で前記T細胞を増殖させた。ビオチン標識抗EGFR mAb(ImClone Systems)およびストレプトアビジンビーズ(Miltenyi)を使用して免疫磁気選択を行うことにより、各T細胞株のtEGFR+サブセットを濃縮した。
標的細胞(Be2細胞またはTML CL)を51Cr(PerkinElmer)で標識し、次いで洗浄することによって得られた標的細胞(1〜2×103個/ウェル)を、キメラ受容体で改変されたエフェクターT細胞とともに様々なエフェクター:標的比(E:T)において三連でインキュベートした。4時間のインキュベーションを行って細胞を特異的に溶解させた後、上清を回収してγ放射線を測定し、標準的な計算式を使用して細胞傷害性を算出した。サイトカインの分泌の分析においては、5×104個のT細胞と標的細胞とを、30:1、10:1、3:1または1:1のE:T比で三連のウェルに播種し、IFN−γ、TNF−αおよびIL−2をさらに添加し、24時間インキュベーションし、回収した上清をELISAまたはマルチプレックスサイトカイン免疫アッセイ(Luminex)で測定した。
6〜8週齢の雌性NOD.Cg-Prkdcscid II2rgtm1Wjl/SzJ(NSG)マウスをJackson Laboratoryから入手するか、自家繁殖させた。0.2×106個の神経芽腫由来腫瘍細胞をマウスに頭蓋内注射し、7日後、2×106個のキメラ受容体保有改変T細胞または対照T細胞をマウスに頭蓋内注射した。バイオルミネセンスイメージングにより腫瘍の成長を画像化するため、PBSに再懸濁したルシフェリン基質(Caliper Life Sciences)をマウスに注射した(15μg/g体重)。マウスをイソフルランで麻酔し、Xenogen IVIS画像化システム(Caliper)をsmall binning modeまたはmedium binning modeおよび1秒〜1分間の取得時間の条件で使用して、ルシフェリン注射の15分後に画像化を行い、サチュレーションを起こしていない画像を得た。Living Imageソフトウェア(Caliper)を使用してルシフェラーゼの活性を分析し、目的領域内(全身を含む)で光量子束を分析した。
Prism Software(GraphPad(登録商標))を使用して統計解析を行った。対応のある両側検定として、95%の信頼区間でスチューデントのt検定を行い、p<0.05のp値を有する結果を有意と見なした。生存の統計解析をログランク検定により行い、p<0.05のp値を有する結果を有意と見なした。
CE7 scFvを使用して、CD171特異的かつ/または標的キメラ受容体を設計できることが報告されている(Park J et al. Molecular Therapy 2007, April 15(4):825-33)。このキメラ受容体は、インビトロにおいて、CD171発現腫瘍に対する特異的認識、および/またはCD171発現腫瘍の標的化を可能とするが、スペーサードメインを調整することによって、腫瘍認識およびT細胞のシグナル伝達が向上すると仮定された。これを踏まえて、「ヒンジ−CH2−CH3」バリアント(229アミノ酸長、長いスペーサー)、「ヒンジ−CH3」バリアント(119アミノ酸長、中程度の長さのスペーサー)および「ヒンジ単独」バリアント(12アミノ酸長、短いスペーサー)から選択されるスペーサードメインを有するキメラ受容体を構築した。これらの新規受容体に含まれていたCE7 scFv、4-1BBシグナル伝達モジュールおよびCD3ζシグナル伝達モジュールは同じものであった。導入遺伝子カセットは末端切断型EGFR(tEGFR)を含んでおり、tEGFRは、キメラ受容体で改変されたT細胞を形質導入し、選択し、かつインビボで追跡するためのマーカーとして機能する。
長いスペーサーを有するCD171特異的/標的キメラ受容体で改変されたT細胞によって発揮された優れたインビトロ活性が、インビボにおいても向上または改善された抗腫瘍活性として発揮されるかどうかは確認されていなかった。この疑問を解消するため、頭蓋内注射によって神経芽腫細胞を免疫不全NSGマウス群に接種した7日後に、短いスペーサー、中程度の長さのスペーサーまたは長いスペーサーを有するCD171特異的キメラ受容体発現CD8+T細胞を頭蓋内注射によって単回投与することによってマウスを治療した。対照マウスはtEGFR発現T細胞により治療するか、あるいは治療を実施しなかった。治療を行わなかったNSG/NBマウスは、腫瘍を接種してから約4週間で神経芽腫を発症し、安楽死を余儀なくされた(図2E、右パネル)。
長いスペーサードメインを有するCD171特異的/標的キメラ受容体発現T細胞のインビボにおける抗腫瘍活性が低かったことを説明する潜在的機構を明らかにするため、インビボではこのT細胞は腫瘍細胞によって効率的に活性化されなかったという可能性、あるいは、これとは逆に、インビボではこのT細胞は活性化誘導細胞死によって殺傷されたという可能性を検討した。
CD171分子は神経芽腫などの様々なヒト悪性腫瘍において発現されるが、CD171分子を標的とすることができるキメラ受容体、またはCD171分子に特異的なキメラ受容体をいくつか構築した。これらのCD171特異的/標的キメラ受容体は、CD171特異的かつ/または標的scFVから設計したが、元となったこれらのscFVは、CD171上のエピトープであるCE7に特異的に結合し、かつ短い細胞外スペーサードメインを含むものであった。作製した構築物のうち1つは、CD3ζドメインに連結された共刺激ドメイン4-1BBを含有し(4-1BB)、もう一方の構築物は、CD3ζに連結された4-1BBとCD28cytoとを含む二重共刺激ドメインを含有していた(CD28cyto)。2つの共刺激ドメインを有する構築物であるCE7scFv-IgG4hinge-CD28tm/cyto-4-1BB-ζ-T2A-EGFRt-epHIV7の配列を図11および図12に示す。CE7scFv-IgG4hinge-CD28tm/4-1BB-ζ-T2A-EGFRt-epHIV7(短い構築物)の配列を図9および図10に示す。CD171に特異的な各キメラ受容体を発現するT細胞が、CD171を発現する神経芽腫をインビトロで認識する能力、および免疫不全マウスに移植された神経芽腫の腫瘍細胞を排除する能力を分析した。
研究プロトコルに対するインフォームドコンセントを書面にて得た後、健常ドナーおよび患者から末梢血単核細胞(PBMC)を採取した。
SK-N-BE2神経芽腫細胞株(Be2)をAmerican Type Culture Collectionから得た。過去の報告に従って(Pelloquin F, Lamelin JP, Lenoir GM. In vitro cell dev biol 1986; 22(12):689-694)、EBVにより形質転換されたTMLCLをPBMCから作製した。
標識抗CD4 mAb、標識抗CD8 mAb、標識抗CD28 mAb、標識抗CD45RA mAb、標識抗CD62L mAbおよびアイソタイプを一致させたコントロール(BD Biosciences)を使用して、PBMCおよび細胞株を染色した。セントラルメモリーT細胞は、免疫磁気ビーズを使用して、CD8+T細胞を単離し、得られたCD8+細胞集団からCD45RA細胞を除去することによってPBMCから単離した。CD45RAが除去されたCD8+細胞は、図1に示すように、免疫磁気ビーズを使用してCD62L細胞を濃縮した。CD171特異的/標的キメラ受容体の表面発現は、ポリクローナルヤギ抗マウスIgG抗体(Fab特異的)(Jackson ImmunoResearch)を使用して分析した。フロー分析はFACSCanto(登録商標)にて行い、ソーティングおよび精製はFACSAria II(登録商標)(Becton Dickinson)にて行い、データ分析はFlowJo(登録商標)ソフトウエア(Treestar)を使用して行った。
CD171特異的かつ/または標的キメラ受容体は、CE7(CD171) mAbのVL鎖セグメントおよびVH鎖セグメントを使用して構築した(CE7の可変領域の配列は、図5、図7、図9および図11に示す)。各scFvは、IgG4-Fc(Uniprotデータベース:P01861;表2)に由来するスペーサードメインに連結されており、このスペーサードメインは、「ヒンジ−CH2−CH3」配列(長いスペーサー:229アミノ酸長)、「ヒンジ−CH3」配列(中程度の長さのスペーサー:119アミノ酸長)または「ヒンジ」のみの配列(短いスペーサー:12アミノ酸長)のいずれかを含んでいた(表6)。これらのスペーサーはいずれも、天然型IgG4-Fcタンパク質の108番目のアミノ酸に相当するヒンジドメイン内の位置にS→P置換を有し、かつヒトCD28(Uniprot:P10747、表3)由来の膜貫通ドメイン(27アミノ酸長)とシグナル伝達モジュールとに連結されており、このシグナル伝達モジュールは、(i)ヒト4-1BB(Uniprot:Q07011、表4)の細胞内ドメイン(42アミノ酸長)に連結され、かつ天然型のCD28タンパク質(表3)の186〜187番目にLL→GGの置換を有する、ヒトCD28の細胞内ドメイン(41アミノ酸長)を含むか、あるいは(ii)ヒト4-1BBの細胞内ドメインを単独で含み、これらのいずれかを含む各シグナル伝達モジュールはヒトCD3ζのアイソフォーム3(Uniprot:P20963、表5)の細胞内ドメイン(112アミノ酸長)に連結されていた。構築物のうち1つは、ヒト4−1BB(Unioprot:Q07011、配列番号15)の細胞内ドメイン(42アミノ酸長)を含む共刺激シグナル伝達モジュールを含んでおり、このヒト4−1BBの細胞内ドメインは、さらにヒトCD3ζのアイソフォーム3(Uniprot:P20963、配列番号16)の細胞内ドメイン(112アミノ酸長)に連結されていた。作製された構築物はいずれも、T2Aリボソームスキップ要素(配列番号8)およびtEGFR配列(配列番号9)をキメラ受容体の下流にコードしていた。各導入遺伝子をコードするヒトコドン最適化ヌクレオチド配列を合成し(Life Technologies)、epHIV7レンチウイルスベクターにクローニングした。tEGFRをコードするレンチウイルスまたはCD171特異的/標的キメラ受容体は、パッケージングベクター(pCHGP-2、pCMV-Rev2およびpCMV-G)、ならびにCalphos(登録商標)トランスフェクション試薬(Clontech)を用いて、293T細胞において産生させた。
正常なドナーのPBMCからCD8+CD45RO-CD62L+セントラルメモリーT細胞(TCM)をソートし(図1参照)、抗CD3/CD28ビーズ(Life Technologies)で活性化し、3日目に1μg/mLのポリブレン(Millipore)を添加したレンチウイルス上清(MOI=3)を加え800×g、32℃で45分間遠心分離して活性化させて形質導入した。最終濃度が50U/mLとなるように組換えヒトIL−2を添加し、さらに最終濃度が10ng/μlとなるようにIL−15を添加した、10%ヒト血清および2mM L−グルタミンを含むRPMI(CTL培地)中で前記T細胞を増殖させた。ビオチン標識抗EGFR mAb(ImClone Systems)およびストレプトアビジンビーズ(Miltenyi)を使用して免疫磁気選択を行うことにより、各T細胞株のtEGFR+サブセットを濃縮した。
標的細胞(Be2細胞またはTML CL)を51Cr(PerkinElmer)で標識し、次いで洗浄することによって得られた標的細胞(1〜2×103個/ウェル)を、キメラ受容体で改変されたエフェクターT細胞とともに、様々なエフェクター:標的比(E:T)において三連でインキュベートした。4時間のインキュベーションを行って細胞を特異的に溶解させた後、上清を回収してγ放射線を測定し、標準的な計算式を使用して細胞傷害性を算出した。サイトカインの分泌の分析においては、5×104個のT細胞と標的細胞とを、30:1、10:1、3:1または1:1のE:T比で三連のウェルに播種し、IFN−γ、TNF−αおよびIL−2をさらに添加し、24時間インキュベーションし、回収した上清をELISAまたはマルチプレックスサイトカイン免疫アッセイ(Luminex)で測定した。
6〜8週齢の雌性のNOD.Cg-Prkdcscid II2rgtm1Wjl/SzJ(NSG)マウスをJackson Laboratoryから入手するか、自家繁殖させた。0.2×106個の神経芽腫由来腫瘍細胞をマウスに頭蓋内注射し、2×106個のキメラ受容体保有改変T細胞または対照T細胞をマウスに頭蓋内注射した。バイオルミネセンスイメージングにより腫瘍の成長を画像化するため、PBSに再懸濁したルシフェリン基質(Caliper Life Sciences)をマウスに注射した(15μg/g体重)。マウスをイソフルランで麻酔し、Xenogen IVIS画像化システム(Caliper)をsmall binning modeまたはmedium binning modeおよび1秒〜1分間の取得時間の条件で使用して、ルシフェリン注射の15分後に画像化を行い、サチュレーションを起こしていない画像を得た。Living Imageソフトウェア(Caliper)を使用してルシフェラーゼの活性を分析し、目的領域内(全身を含む)で光量子束を分析した。
Prism Software(GraphPad(登録商標))を使用して統計解析を行った。対応のある両側検定として、95%の信頼区間でスチューデントのt検定を行い、p<0.05のp値を有する結果を有意と見なした。生存の統計解析をログランク検定により行い、p<0.05のp値を有する結果を有意と見なした。
様々な共刺激ドメインを含むCD171特異的/標的キメラ受容体またはtEGFR対照ベクターを、精製されたCD8+TCMに形質導入した。各キメラ受容体の表面発現をF(ab)特異的抗体による染色によって確認した(図4A)。4-1BBを単一の共刺激ドメインとして含む構築物(パネル2)およびCD28cyto/4-1BBを共刺激ドメインとして含む構築物(パネル3)において、F(ab)およびEGFRtは同程度の発現を示した。各CD171特異的/標的キメラ受容体を発現するように改変されたCD8+T細胞をインビトロでの機能について分析したところ、これらの受容体はいずれも、CD171を天然に発現するBe2細胞を特異的に溶解したが、対照としてのTML CLを認識しなかったことが示された(図4B)。CD28cyto/4-1BB共刺激ドメインを有するCD171特異的/標的キメラ受容体を発現するT細胞の方がより強力な細胞溶解活性を有していた。Be2細胞による刺激に応答したサイトカインの産生の定量分析では、各CD171特異的/標的キメラ受容体を発現するT細胞はいずれも、IFN−γを産生することが示された。細胞傷害性アッセイで認められたように、CD28cyto/4-1BB共刺激ドメインを有する構築物は、腫瘍を認識してサイトカインの分泌を媒介する機能に優れていた(図4C)。
CD28cyto/4-1BB共刺激ドメインを有するCD171特異的/標的キメラ受容体で改変されたT細胞によって発揮された優れたインビトロ活性が、インビボにおいても向上または改善された抗腫瘍活性として発揮されるかどうかは確認されていなかった。この疑問を解消するため、頭蓋内注射によって神経芽腫細胞を免疫不全NSGマウス群に接種した7日後に、短いスペーサー、中程度の長さのスペーサーまたは長いスペーサーを有するCD171特異的かつ/または標的キメラ受容体発現CD8+T細胞を頭蓋内注射によって単回投与することによってマウスを治療した。対照マウスはtEGFR発現T細胞により治療するか、あるいは治療を実施しなかった。治療を行わなかったNSG/NBマウスは、腫瘍を接種してから約4週間で神経芽腫を発症し、安楽死を余儀なくされた(図4D)。
CD28cyto/4-1BB共刺激ドメインを有するCD171特異的/標的キメラ受容体発現T細胞の抗腫瘍活性がインビボにおいて低下することを説明する潜在的機構を解明することを試みた。インビボではこのT細胞は腫瘍細胞によって効率的に活性化されなかったという可能性、あるいは、これとは逆に、インビボではこのT細胞は活性化誘導細胞死によって殺傷されたという可能性を検討した。
インビトロおよびインビボにおいて細胞外スペーサーの長さおよび細胞内シグナル伝達ドメインがCD171標的CARの能力に及ぼす影響を評価した。インビトロでは、腫瘍細胞に連続して複数回暴露させる新規のCAR T細胞ストレステストと、標準的な分析法とを使用して、細胞傷害性、サイトカインの分泌、活性化状態および細胞死を分析することによって、細胞外スペーサーの長さおよび細胞内シグナル伝達ドメインの影響を評価した。各実験は、複数のドナーに由来するT細胞を使用して複数回実施し、最終的な分析では、集めたデータを用いるか、あるいは、試料を2回以上の反復測定した典型的な実験を行った。インビボ実験では、生体イメージングによる抗腫瘍活性の分析、生存期間の測定および免疫組織化学分析を行った。マウスを用いた実験では、1群あたり少なくとも2匹のマウスが含まれるように設定した。外れ値はすべてデータ分析に含んだ。
CE7(抗CD171)IgG2モノクローナル抗体由来のVLセグメントおよびVHセグメントが(G4S)3ペプチドを介して連結されたscFvを使用して、CD171特異的かつ/または標的CARを以下のように構築した。まず、前記scFvをコドン最適化し、次いで、12アミノ酸長(短いスペーサー(SS)/「ヒンジのみ」)、119アミノ酸長(中程度の長さのスペーサー(MS)/「ヒンジ−CH3」)または229アミノ酸長(長いスペーサー(LS)/「ヒンジ−CH2−CH3」)に基づくヒトIgG4-Fc由来可変長スペーサードメインに連結させた。これらのスペーサーはいずれも、IgG4-Fcタンパク質の108番目のアミノ酸に相当するヒンジドメイン内の位置にS→P置換を有し、かつ、ヒトCD28の膜貫通ドメインとシグナル伝達モジュールとに連結されており、このシグナル伝達モジュールは、(i)4−1BBの細胞内ドメインのみ(2G CAR)、または(ii)CD28(変異型)の細胞内ドメインおよび4−1BBの細胞内ドメイン(3G CAR)を含み、これらのいずれかを含む各シグナル伝達モジュールは、自体のカルボキシル末端においてヒトCD3ζの細胞内ドメインに融合されていた。構築物の作製に使用されたCD28細胞内ドメインの一部は、天然型CD28タンパク質の186〜187番目に位置するLL→GGの置換を含んでいた。CARバリアントをコードするcDNAクローンを、下流に位置するT2Aリボソームスキップ要素および末端切断型EGF受容体(EGFRt)と連結させ、epHIV7レンチウイルスベクターにクローニングし、CD171-CARレンチウイルスを293T細胞において産生させた。
製造者の説明書に従ってRNeasy Minikit(Qiagen)を使用して、T細胞から総RNAを抽出した。First Strand Kit(Life Technologies)を使用して逆転写を行うことによって、cDNAを合成した。FasLに対するリアルタイムプライマー(IDT)およびCFX96リアルタイム検出システム(Biorad)とを使用して、特定の遺伝子のRNAを定量した。アクチンをハウスキーピング遺伝子として使用した。CFX Managerソフトウェアバージョン3.0を使用してデータを分析した。
ウエスタンブロット(WB)を実施するため、T細胞を回収し、PBSで2回洗浄し、プロテアーゼ阻害剤(Millipore)中で溶解した。製造者の説明書に従って、SDS/PAGEを行い、抗CD247(CD3−ζ、BD Biosciences)を使用してウエスタンブロットを行うことによってタンパク質を分析した。Odyssey Infrared Imagerを使用してシグナルを検出し、Odyssey v2.0ソフトウエア(LI-COR)を使用してバンドの強度を定量した。
イムノフェノタイピングは、CD4、CD8、CD27、CD28、CD45RA、CD45RO、CD62L、およびCCR7のそれぞれに対する蛍光標識mAb(Biolegend)を用いて行った。L1CAMの細胞表面発現は、蛍光標識mAb(クローン014、Sino Biological)を使用して分析した。EGFRtの発現は、ビオチン化セツキシマブ(Bristol-Myers-Squibb)と蛍光標識ストレプトアビジン二次試薬とを使用して分析した。活性化と活性化誘導細胞死(AICD)を評価するため、CD25、CD69、CD137、CD178(Fasリガンド)およびCD95(Fas)のそれぞれに対する蛍光標識mAb(いずれもBiolegend)を使用した。カスパーゼ3の活性は、製造者のプロトコルに従ってCaspGlow(eBioscience)を使用して測定した。LSRFortessa(BD Biosciences)を用いてフロー分析を行い、FlowJoソフトウエア(Treestar)を使用してデータを分析した。
Seattle Children’s Research Instituteの施設内審査委員会によって承認された研究プロトコル(SCRI IRB#13795)に従ったインフォームドコンセントを書面にて得た後、健常ドナーからヘパリン添加全血サンプルを得た。フィコール(GE Healthcare Life Sciences)を使用した標準的なプロトコルによって末梢血単核細胞(PBMC)を単離し、製造者の説明書に従って免疫磁気マイクロビーズ(Miltenyi Biotec)を使用することによってCD8+CD45RO+CD62L+セントラルメモリーT細胞(TCM)を単離した。まず、CD8 T細胞単離キットおよびCD45RAビーズを使用したネガティブ選択によってCD8+CD45RO+細胞を得て、次いでCD62L細胞を濃縮し、ビーズ:細胞=3:1の比率で抗CD3/CD28ビーズ(Life Technologies、Thermo Fisher Scientific)を使用して細胞を活性化し、3日目に1mg/mLの硫酸プロタミン(APP Pharmaceuticals)を添加したレンチウイルス上清(感染多重度[MOI]=5)を加えて800×g、32℃で30分間遠心分離することによって形質導入した。最終濃度が50U/mlとなるように組換えヒトインターロイキン(IL)−2(Chiron Corporation)を添加し、さらに10ng/μlのIL−15(Miltenyi Biotec)を添加した、10%熱不活化ウシ胎児血清(Atlas, Fort Collins, CO)および2mmol/LのL−グルタミン(Cellgro)を含有するRPMI(Cellgro)中でT細胞を増殖させた。ビオチン標識アービタックス(Bristol-Myers-Squibb)およびストレプトアビジンマイクロビーズ(Miltenyi)を用いた免疫磁気選択によって、各T細胞株のEGFRt+サブセットを濃縮した。迅速培養プロトコルを使用してCD171 CAR T細胞およびMock対照T細胞を増殖させた(インビボアッセイに使用するT細胞はS1R2D14で凍結し、注射を実施する当日に解凍した)。
NB細胞株(Be2およびSK-N-DZ)をAmerican Type Culture Collection(ATCC)から入手した。ホタルルシフェラーゼ(ffLuc)遺伝子を含むレンチウイルスで形質導入し、GFP陽性細胞のソーティングにより精製して、Be2 GFP-ffLuc_epHIV7およびSK-N-DZ GFP-ffLuc_epHIV7を得た。これらの細胞株をさらにCD19t-2A-IL2_pHIV7で形質導入し、CD19t細胞のソーティングにより精製して、IL−2分泌性神経芽腫細胞株を作製した。NB細胞株はいずれも、10%熱不活化ウシ胎児血清および2mmol/L L−グルタミンを添加したDMEM(Cellgro)中で培養した。EBVにより形質転換されたリンパ芽球様細胞株(TMLCL)と、OKT3 mAbに由来する膜固定型CD3ε特異的scFvを発現するTMLCL(TMLCL-OKT3)は、10%熱不活化ウシ胎児血清および2mmol/L L−グルタミンを添加したRPMI1640中で培養した。
1×106個のエフェクター細胞と標的細胞とを4〜8分間にわたって共培養した後、7-Plex T cell receptor signaling kit(Millipore)に従って細胞を処理し、Erk/MAPキナーゼ1/2の活性を測定した。Pierce BCAプロテインアッセイキット(Thermo Scientific)を使用してタンパク質濃度を測定した。
クロム放出アッセイによる細胞傷害性の測定
標的細胞を51Cr(Perkin Elmer)で標識し、次いで洗浄することによって得られた標的細胞(5×103個/ウェル)を、T細胞(S1R2D12-14)とともに、様々なエフェクター:標的比(E:T)において三連でインキュベートした。4時間インキュベートした後、上清を回収し、Top Count NTX(Perkin Elmer)を使用してγ放射線を計測し、過去の報告に従って特異的な溶解を算出した。
GFP-ffLuc_epHIV7を含むNB細胞株をエフェクター細胞とともにE:T比=5:1で共培養した。前記と同様にして、1回目、2回目または3回目にわたってエフェクター細胞と腫瘍細胞とを接触させた。T細胞と接触させた後に生存していた腫瘍細胞数を評価するため、D−ルシフェリンを加え、5分後にIVIS Spectrum imaging System(Perkin Elmer)を使用して神経芽腫(NB)細胞からのバイオフォトンシグナルを測定した。
5×105個のT細胞(S1R2D12-14)を刺激細胞とともにE:T比=2:1で播種し、24時間培養した。Bio-plexサイトカインアッセイおよびBioplex-200システム(Bio-rad Laboratories)を使用して、上清中のIFN−γ、TNF−αおよびIL−2を測定した。
連続して起こる抗原との遭遇を模倣するため、接着性標的細胞と新たに解凍した非接着性エフェクター細胞との共培養をE:T比=1:1で行った。24時間後(1回目)および48時間後(2回目)に、Guava ViaCount Assay(Millipore)を使用してT細胞の生存率を評価し、非接着性エフェクター細胞を別の培地に移し、新しく用意した接着性標的細胞とともにE:T比=1:1で培養した。1回目、2回目および3回目(72時間)の培養後、T細胞を回収し、死細胞除去キット(Miltenyi)で処理して、さらに分析を行った。
マウスを屠殺した後、脳を摘出し、10%中性緩衝ホルマリン(Thermo)中で24時間固定し、処理し、パラフィン包埋し、5μmの切片に薄切した。Diva decloaker RTU(Biocare Medical)を使用して抗原の賦活化を行った。各一次抗体をブロッキング緩衝液で希釈することによって、1:100希釈したラットモノクローナル抗ヒトCD3(クローンCD3-12、AbD Serotec/Bio-rad)、1:200希釈したマウスモノクローナル抗ヒトKi67(クローンMIB-1、Dako)、1:100希釈したウサギポリクローナル抗ヒト切断型カスパーゼ−3(Biocare Medical)、1:200希釈したウサギポリクローナル抗ヒトグランザイムB(Covance)を調製し、切片を各一次抗体とともに4℃で一晩インキュベートした。0.2%BSAを含むPBSで1:500に希釈した二次抗体(Life Technologies)とともに切片を室温で2時間インキュベートした。
SCRI IACUCによって承認されたプロトコルに従って、NSGマウス腫瘍モデルにおける実験を行った。
NOD.Cg-PrkdcscidII2rgtm1Wjl/SzJ[NOD scid gamma(NSG)]成熟雄性マウスをJackson Laboratoryから入手するか、自家繁殖させた。0日目に、ブレグマから横へ2mm、前方向に0.5mmの位置、かつ硬膜から2.5mmの深さにおいて、IL-2分泌性ffLuc発現Be2腫瘍細胞またはSK-N-DZ腫瘍細胞2×105個をマウスの頭蓋内に注射(i.c.)した。次いで、7日後(治療応答モデル)または14日後(ストレ試験モデル)に、CAR改変CD8+TE(CM)2×106個をマウスに腫瘍内注射した。ストレステストモデルにおいては、T細胞注射の3日後にマウスを安楽死させ、脳を摘出し、免疫組織化学(IHC)分析を行った。腫瘍成長の生物発光イメージングでは、D−ルシフェリン(Perkin Elmer)(4.29mg/マウス)をマウスに腹腔内注射(i.p.)した。D−ルシフェリンを注射した15分後にマウスをイソフルランで麻酔し、IVIS Spectrum Imaging System(Perkin Elmer)を使用して画像化を行った。Living Imageソフトウェア Version 4.3(Perkin Elmer)を使用してルシフェラーゼの活性を分析し、目的領域内で光量子束を分析した。
Prism Software(GraphPad)を使用して統計解析を行った。図の凡例に示したように、データは平均値±SDまたは±SEMで示す。対応のない両側検定として、95%の信頼区間でスチューデントのt検定を行い、0.05未満のp値を有する結果を有意と見なした。生存の統計解析をログランク検定により行い、0.05未満のp値を有する結果を有意と見なした。
CAR発現T細胞と腫瘍細胞との間における生物物理学的なシナプスは、腫瘍細胞の表面の標的分子上のエピトープの位置から腫瘍細胞の細胞膜までの距離によって左右される。生物学的に活性なCARを作製するためには、CARの細胞外スペーサーの長さを調節して、機能的なシグナル伝達シナプスを形成させることが重要であると仮定した。CD171特異的かつ/または標的CARの細胞外スペーサーの長さによる影響を評価するため、ヒトIgG4のモジュールドメインを使用することによって、一連のスペーサーとして、「長いスペーサー(LS)」IgG4のヒンジ−CH2−CH3、「中程度の長さのスペーサー(MS)」IgG4のヒンジ−CH3の融合ドメイン、および「短いスペーサー(SS)」IgG4のヒンジを構築した。各スペーサーバリアントはCD28の膜貫通ドメインに融合されており、このCD28膜貫通ドメインは、第二世代(2G)の4−1BB:ζの細胞内ドメインに融合されており、この4−1BB:ζの細胞内ドメインは、T2Aリボソームスキップペプチドを介して細胞表面EGFRtタグに連結されていた(図13A)。精製されたCD8+CD45RO+CD62L+セントラルメモリー前駆細胞を免疫磁気選択することによって、スペーサーバリアントを有する一連のヒトCD8+セントラルメモリー由来2G-CAR+/EGFRt+エフェクターT細胞株(TE(CM))を作製した(図19Aおよび図19B)。レンチウイルスを形質導入したTE(CM)を増殖させた後、免疫磁気選択によってセツキシマブ陽性細胞を選択することによって、EGFRtの発現量が均一なTE(CM)株を濃縮した(18)。マウスF(ab)およびEGFRに特異的な抗体を使用したフローサイトメトリー染色によって、各CARスペーサーバリアントの表面発現レベルが同程度であることが確認され、ウエスタンブロットを用いて各T細胞株のCD3ζを検出することによって定量されたタンパク質の発現量が同程度であることが確認された(図13Bおよび図13C)。
インビトロアッセイにおいて見られたCARシグナル伝達の有効性と、インビボにおける治療活性との関連性を明らかにするため、確立されたヒトNB異種移植片を大脳半球に定位移植したNSGマウスにおける養子移入実験を行った(図14A)。驚くべきことに、2G−CAR(LS)の腫瘍内注射により治療したBe2腫瘍移植マウスは治療活性を何ら示さず、腫瘍接種の約3週間後に安楽死せざるを得なかった(図14Bおよび図14C)。これとは対照的に、2G-CAR(SS)CAR CD8+TE(CM)で治療したマウスでは腫瘍のバイオフォトニックシグナルが低下し、かつ生存期間が延長され、2G−CAR(MS)バリアントで治療したマウスでは中程度のシグナルの低下および生存期間の延長が見られた(p=0.001;これらの種々の群における生存期間の中間値:LS=20日、Mock=21日、MS=59.5日、SS=76日)。SK-N-DZ腫瘍移植マウスは、SS>MS>LSの順位の腫瘍応答性を示し、2G-CAR(SS)CD8+TE(CM)で治療したマウスでは一定しない腫瘍の排除および100%の生存が見られた(図20Cおよび図20D)。移植腫瘍に直接注射された2G−CAR(LS)リダイレクトCTLは良好な結果を示せなかったが、グランザイムBおよびKi67を発現する移入T細胞の腫瘍内密度は養子移入後の早期(3日目)のIHC分析から変化しなかったことから、2G−CAR(LS)リダイレクトCTLによるこの不良な結果は、養子移入後に生存することができず、移入部位で活性化されなかったためとは考えにくい(図14D〜図14G)。統計学的に有意ではなかったが(p=0.34)、活性化型カスパーゼ3が検出された2G-CAR(LS)CD8+TE(CM)の頻度は、2G-CAR(SS)CD8+TE(CM)の12.1倍であった。これらのデータから、細胞外スペーサーのサイズに左右されるCARリダイレクトT細胞のインビトロでの抗腫瘍作用とインビボでの抗腫瘍治療活性との間には予想外の不整合があることが分かった。
4時間クロム放出アッセイ(CRA)におけるインビトロでの細胞溶解性の活性化では、CAR媒介性シグナル伝達の継続期間が限定されていたが、インビボ腫瘍モデルでは、腫瘍を根絶するためには活性化を繰り返し行うことが必要であると仮定した。したがって、特定のCAR構築物がインビトロ測定において良好なシグナル伝達作用を示したとしても、インビボでは優れたシグナル伝達能を示さないかもしれないと考えた。インビトロにおいて連続した繰り返し刺激を再現するため、CAR T細胞と腫瘍細胞とを共培養した「ストレステスト」アッセイを考案した。このアッセイでは、各培養における生存T細胞:腫瘍細胞の比は1:1の一定比率に維持したまま、24時間毎にCAR T細胞を回収し、腫瘍細胞が播種された培養ディッシュへの移動を繰り返し行う(図15A)。Be2は、ホタルルシフェラーゼを発現するように改変されており、連続した3回の移動において腫瘍細胞の殺傷を培養と同時に追跡するために利用した。種々の2G−CARスペーサーバリアント細胞株を繰り返し活性化させると、それぞれ同様に3回目に抗腫瘍活性が消失した(図15B)。さらに、各スペーサーバリアントを発現するエフェクター細胞を各回の培養後にフローサイトメトリー測定により分析すると、2G-CAR(LS)CD8+TE(CM)は、2G-CAR(SS)CD8+TE(CM)よりも、活性化マーカーであるCD25およびCD69を発現する細胞の頻度が高かったことが示された(1回目:79.4%対46.8%、p=0.007;2回目:74.0%対47.6%;3回目:65.7%対42.1%、p=0.037)(図15C)。
第三世代のCARでは、2つの共刺激性細胞内ドメインモジュールとCD3−ζ活性化モジュールとが連結されており、第三世代のCARは、細胞溶解性の強度およびサイトカイン産生レベルを、第二世代のCARよりも増強することが報告されている。CD28の細胞内ドメインを2G 4-1BB:ζの細胞内ドメインに付加することによって、CD171特異的かつ/または標的3G−CARを構築した(図16A)。2G-CAR(SS)または3G-CAR(SS)の発現レベルが同等なCD8+TE(CM)を、精製されたTCM前駆細胞からの免疫磁気選択によって得た(図16Bおよび図16C)。腫瘍に接触させた3G-CAR(SS)CD8+TE(CM)は、第二世代のCAR(SS)CD8+TE(CM)の8.4倍のCD137発現誘導(p<0.0001)(図16D)、1.3倍のBe2標的細胞溶解活性(エフェクター細胞:標的細胞比=1:10、p=0.0001)(図16E)、ならびに5.1倍のIL−2分泌および2.5倍のTNF−α分泌(p<0.0001およびp=0.003)(図16F)を示した。
1.)一般に用いられている機能的アッセイでは、最も高い機能活性を示す構築物を選択することに焦点が当てられていることから、このような機能的アッセイを使用すると、誤った構築物候補を選択してしまう可能性がある。
2.)CARによりリダイレクトされたエフェクターCTLの作用の調節には上限があり、それを超えてしまうと、CARによる反復誘導が起こり、それによって増強されたAICDによってエフェクター作用が打ち消されてしまう。
これらの結果から、短いスペーサーを有する、CD171特異的かつ/または標的CARを、再発した神経芽腫/難治性の神経芽腫を有する小児における第I相試験にて評価すべきだと考える。
いくつかの実施形態では、キメラ受容体の核酸配列が提供される。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドを標的とすることができかつ/または該リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは15アミノ酸長以下である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は宿主細胞を含み、該宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択されるCD8+T細胞傷害性リンパ球、またはCD45RO+、CD62L+および/もしくはCD8+のセントラルメモリーT細胞であるCD8+細胞傷害性Tリンパ球であり、前記組成物は別の宿主細胞をさらに含み、該宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球、またはCD45RA+、CD62L+、CD4+、および/もしくはCD45RO−のナイーブCD4+T細胞であるCD4+ヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。
いくつかの実施形態においては、インビトロにおいて宿主細胞を製造する前記方法は、
a)長さの異なるキメラ受容体をコードする複数の核酸を含む、キメラ受容体をコードする核酸のライブラリーを提供すること;
b)単離された個別のTリンパ球集団に前記複数の核酸のそれぞれを導入し、各Tリンパ球集団をインビトロで増殖させること;
c)腫瘍を有する動物モデルに各遺伝子改変Tリンパ球集団を投与し、各遺伝子改変Tリンパ球集団が抗腫瘍効果を有するかどうかを判定すること;ならびに
d)インビトロおよび/または動物モデルにおいて抗腫瘍効果を提供するキメラ受容体をコードする核酸を選択すること
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、単離されたキメラ受容体核酸配列を含む前記発現ベクターが提供される。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつCD45RO−である。いくつかの実施形態では、キメラ受容体をコードする前記核酸は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターは、単離されたキメラ受容体核酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記方法は、前記キメラ受容体をコードする選択された前記核酸を宿主細胞に導入することをさらに含む。
いくつかの実施形態においては、該方法は、
a)CD45RA−、CD45RO+および/またはCD62L+の表現型を有するリンパ球集団にキメラ受容体核酸配列または発現ベクターを導入すること;ならびに
b)抗CD3および/または抗CD28と少なくとも1つの恒常性サイトカインとの存在下において、細胞移入に使用するのに十分な数に達するまで前記リンパ球を培養すること
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、単離されたキメラ受容体核酸配列を含む前記発現ベクターが提供される。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記発現ベクターは、単離されたキメラ受容体核酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは15アミノ酸長以下である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記リンパ球はCD8+またはCD4+である。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は宿主細胞を含み、該宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択されるCD8+T細胞傷害性リンパ球、またはCD45RO+、CD62L+および/もしくはCD8+のセントラルメモリーT細胞であるCD8+細胞傷害性Tリンパ球であり、前記組成物は別の宿主細胞をさらに含み、該宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球、またはCD45RA+、CD62L+、CD4+、および/もしくはCD45RO−のナイーブCD4+T細胞であるCD4+ヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、単離されたキメラ受容体核酸配列を含む前記発現ベクターが提供される。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記がんは神経芽腫である。いくつかの実施形態においては、前記固形腫瘍は、大腸がん、腎臓がん、膵臓がんおよび卵巣がんからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は、薬学的に許容される添加剤中に宿主細胞を含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は発現ベクターを含む。いくつかの実施形態においては、単離されたキメラ受容体核酸配列を含む前記発現ベクターが提供される。
いくつかの実施形態では、前記キメラ受容体の核酸配列は、
a)CD171を標的としかつ/またはCD171に結合するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)前記リガンドに特異的であり、かつ特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含む。
いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは一本鎖可変フラグメントである。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、15アミノ酸長以下(かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上)である。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーは、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサー領域は、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ受容体の核酸配列は、マーカー配列をコードする核酸をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD8+細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO+、CD62L+および/またはCD8+である。いくつかの実施形態においては、前記宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記CD4+ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞は、CD45RA+、CD62L+および/もしくはCD4+であり、かつ/またはCD45RO−である。いくつかの実施形態においては、前記組成物は宿主細胞を含み、該宿主細胞は、ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択されるCD8+T細胞傷害性リンパ球、またはCD45RO+、CD62L+および/もしくはCD8+のセントラルメモリーT細胞であるCD8+細胞傷害性Tリンパ球であり、前記組成物は別の宿主細胞をさらに含み、該宿主細胞は、ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球、またはCD45RA+、CD62L+、CD4+、および/もしくはCD45RO−のナイーブCD4+T細胞であるCD4+ヘルパーリンパ球である。いくつかの実施形態においては、前記がんは神経芽腫である。いくつかの実施形態においては、前記固形腫瘍は、大腸がん、腎臓がん、膵臓がんおよび卵巣がんからなる群から選択される。
表 1 典型的な配列
表 2
典型的な配列 Uniprot P0861 IgG4-Fc (配列番号13)
表 3
典型的な配列/Uniprot P10747 CD28(配列番号14)
表 4
典型的な配列/Uniprot Q07011 4-1BB(配列番号15)
表 5
典型的な配列/Uniprot P20963ヒトCD3ζアイソフォーム3 (配列番号16)
表 6 典型的なヒンジ領域配列
ヒト IgG1 EPKSCDKTHTCPPCP (配列番号17)
ヒト IgG2 ERKCCVECPPCP (配列番号18)
ヒト IgG3 ELKTPLGDTHTCPRCP (EPKSCDTPPPCPRCP)3 (配列番号19)
ヒト IgG4 ESKYGPPCPSCP (配列番号20)
改変ヒト IgG4 ESKYGPPCPPCP (配列番号21)
改変ヒト IgG4 YGPPCPPCP (配列番号51)
改変ヒト IgG4 KYGPPCPPCP (配列番号52)
改変ヒト IgG4 EVVKYGPPCPPCP (配列番号53)
表 7
中程度の長さのスペーサー IgG4ヒンジ-CH3 (配列番号 37)
長いスペーサー IgG4ヒンジ-CH2-CH3 (配列番号 58)
表 8
短いスペーサー (配列番号 21)
ヒンジスペーサー
ESKYGPPCPPCP
中程度の長さのスペーサー (配列番号 59)
ヒンジスペーサー
Claims (31)
- キメラ受容体の核酸配列であって、
a)CD171と結合かつ/または相互作用するリガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド;
b)特定の長さを有する最適化されたポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド;
c)膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチド;および
d)細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチド
を含むキメラ受容体の核酸配列。 - 前記リガンド結合ドメインが抗体フラグメントである、請求項1に記載のキメラ受容体の核酸配列。
- 前記リガンド結合ドメインが一本鎖可変フラグメントである、請求項2に記載のキメラ受容体の核酸配列。
- 前記スペーサーが、15アミノ酸長以下であり、かつ1アミノ酸長以上または2アミノ酸長以上である、請求項1〜4のいずれか一項に記載のキメラ受容体の核酸配列。
- 前記スペーサーが、アミノ酸配列X1PPX2Pを含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載のキメラ受容体の核酸配列。
- 前記スペーサー領域が、ヒト抗体のヒンジ領域の一部を含む、請求項5に記載のキメラ受容体の核酸配列。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、4−1BB、OX−40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、LFA−1、CD2、CD7、NKG2C、B7−H3およびこれらの組み合わせからなる群から選択される共刺激ドメインと、CD3ζ全体またはその一部とを含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載のキメラ受容体の核酸配列。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζの一部と4−1BBの一部とを含む、請求項7に記載のキメラ受容体の核酸配列。
- マーカー配列をコードする核酸をさらに含む、請求項1〜8のいずれか一項に記載のキメラ受容体の核酸配列。
- 請求項1〜9のいずれか一項に記載のキメラ受容体の核酸配列によってコードされるキメラ受容体ポリペプチド。
- 請求項1〜9のいずれか一項に記載の単離されたキメラ受容体の核酸配列を含む発現ベクター。
- 請求項11に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
- ナイーブCD8+T細胞、セントラルメモリーCD8+T細胞、エフェクターメモリーCD8+T細胞およびバルクCD8+T細胞からなる群から選択される細胞傷害性CD8+Tリンパ球である、請求項12に記載の宿主細胞。
- 前記細胞傷害性CD8+Tリンパ球がセントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞がCD45RO+、CD62L+およびCD8+である、請求項13に記載の宿主細胞。
- ナイーブCD4+T細胞、セントラルメモリーCD4+T細胞、エフェクターメモリーCD4+T細胞およびバルクCD4+T細胞からなる群から選択されるCD4+Tヘルパーリンパ球である、請求項12に記載の宿主細胞。
- 前記CD4+ヘルパーリンパ球がナイーブCD4+T細胞であり、該ナイーブCD4+T細胞が、CD45RA+、CD62L+およびCD4+であり、かつCD45RO−である、請求項15に記載の宿主細胞。
- 薬学的に許容される添加剤中に、請求項12〜16および31〜31のいずれか一項に記載の宿主細胞を含む組成物。
- 請求項13または14に記載の宿主細胞と請求項15または16に記載の宿主細胞とを含む組成物。
- 請求項12〜16、30および31のいずれか一項に記載の宿主細胞を製造する方法であって、
a)長さの異なるキメラ受容体をコードする複数の核酸を含む、請求項1〜9および11のいずれか一項に記載のキメラ受容体をコードする核酸のライブラリーを提供すること;b)単離された個別のTリンパ球集団に前記複数の核酸のそれぞれを導入し、各Tリンパ球集団をインビトロで増殖させること;
c)腫瘍を有する動物モデルに各遺伝子改変Tリンパ球集団を投与し、各遺伝子改変Tリンパ球集団が抗腫瘍応答を有するかどうかを判定すること;ならびに
d)抗腫瘍応答を示すキメラ受容体をコードする核酸を選択すること
を含む方法。 - 前記キメラ受容体をコードする選択された前記核酸を宿主細胞に導入することをさらに含む、請求項19に記載の方法。
- 請求項12〜16、30および31のいずれか一項に記載の宿主細胞を製造する方法であって、
a)CD45RA−、CD45RO+およびCD62L+の表現型を有するリンパ球集団に請求項1〜9のいずれか一項に記載の核酸配列または請求項11に記載の発現ベクターを導入すること;ならびに
b)抗CD3および/または抗CD28と少なくとも1つの恒常性サイトカインとの存在下において、前記リンパ球を、細胞移入における使用に十分な数に達するまで培養することを含む方法。 - 前記リンパ球が、CD8+またはCD4+である、請求項19〜21のいずれか一項に記載の方法。
- CD171を発現しているがんまたは固形腫瘍の治療または抑制における、請求項12〜16、30および31のいずれか一項に記載の宿主細胞または請求項17もしくは18に記載の組成物の使用。
- 前記がんが神経芽腫である、請求項23に記載の使用。
- 前記固形腫瘍が、乳がん、脳がん、大腸がん、腎臓がん、膵臓がんおよび卵巣がんからなる群から選択される、請求項23に記載の使用。
- がんまたは腫瘍を有する対象において細胞免疫療法を行う方法であって、請求項17もしくは18に記載の組成物または請求項12〜16に記載の宿主細胞を該対象に投与することを含む方法。
- 前記がんが神経芽腫である、請求項26に記載の方法。
- 前記腫瘍が、乳がん、脳がん、大腸がん、腎臓がん、膵臓がんおよび卵巣がんからなる群から選択される、請求項26に記載の方法。
- 前記リガンドに応答したT細胞の増殖および/またはサイトカインの産生が対照のキメラ受容体よりも増強するように前記スペーサーが最適化されている、請求項1に記載の方法。
- T細胞前駆細胞である、請求項12に記載の宿主細胞。
- 造血幹細胞である、請求項12に記載の宿主細胞。
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