CN114681443B - 含腈的抗病毒化合物 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及式I"化合物其中R、R1、R2、R3、p、q和q’如本文所定义,包含所述化合物的药物组合物,通过给予治疗有效量的所述化合物在患者中治疗冠状病毒感染比如COVID‑19的方法,和用所述化合物抑制或预防冠状病毒比如SARS‑CoV‑2复制的方法。

Description

含腈的抗病毒化合物
本申请是母案为中国发明专利申请202180003440.0的分案申请。
发明背景
本发明涉及抑制病毒复制活性的化合物和方法,其包括使SARS-Cov-2相关的3C样("3CL")蛋白酶与治疗有效量的SARS-Cov-2相关的3C样蛋白酶抑制剂接触。本发明也涉及通过给有此需要的患者施用治疗有效量的SARS-Cov-2相关的3C样蛋白酶抑制剂来治疗患者中的冠状病毒疾病2019("COVID-19")的方法。本发明进一步涉及治疗患者中的COVID-19的方法,所述方法包括给有此需要的患者施用药物组合物,其包含治疗有效量的SARS-Cov-2相关的3C样蛋白酶抑制剂。
到2020年中,COVID-19的爆发已蔓延到全球许多国家,已确认数百万人被感染,并导致数十万人死亡。COVID-19的病原体已被确定为一种新型冠状病毒,已被命名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2("SARS-CoV-2")。SARS-CoV-2的基因组序列被发现属于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚属。Lu,R.等人.The Lancet,395,10224,565-574;2020年1月29日上线。发现SARS-CoV-2的序列与2018年在中国东部舟山采集的两种蝙蝠来源的SARS样冠状病毒bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21具有88%的同源性。还发现SARS-CoV-2与严重急性呼吸综合征冠状病毒("SARS-CoV")(2002-2003年SARS爆发的病原体)有约79%的同源性,与中东呼吸综合征冠状病毒("MERS-CoV")(2012年起源于中东的呼吸道病毒爆发的病原体)有约50%的同源性。根据最近对SARS-CoV-2的103个测序基因组的分析,已经提出SARS-CoV-2可分为两大类型(L型和S型),S型是祖先型,L型已经从S型演变。Lu,J.;Cui,J.etal.On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2;National ScienceReview,7(6),2020年6月,1012-1023,http://doi.org/10.1093/nsr/nwaa036。S和L型可以仅由位于8,782(orf1ab:T8517C,同义)和28,144(ORF8:C251T,S84L)的两个紧密连接的SNP明确定义。在分析的103个基因组中,大约70%属于L型,大约30%属于S型。尚不清楚L型从S型的演变是发生在人类身上还是通过人畜共患病中间体发生的,但似乎L型比S型更具侵略性,在SARS-CoV-2爆发后不久人类试图控制疫情的干预可能使L型和S型的相对丰度发生了变化。所提出的SARS-CoV-2的S和L亚型的发现增加了个体可能依次感染单个亚型或同时感染两种亚型的可能性。鉴于这种不断演变的威胁,本领域迫切需要有效治疗COVID-19和抑制SARS-CoV-2冠状病毒复制的方法。
最近的证据清楚地表明,新出现的冠状病毒SARS-CoV-2,即COVID-19(疾病控制中心,CDC)的病原体,已经获得了人际传播的能力,导致病毒在社区传播。SARS-CoV-2突起蛋白受体结合结构域("RBD")的序列,包括其直接接触血管紧张素转化酶2受体ACE2的受体结合基序(RBM),与SARS-CoV的RBD和RBM相似,强烈表明SARS-CoV-2使用ACE2作为其受体。SARS-CoV-2RBM中的几个关键残基(特别是Gln493)提供了与人类ACE2的良好相互作用,这与SARS-CoV-2感染人类细胞的能力一致。SARS-CoV-2的RBM中的其它几个关键残基(特别是Asn501)与结合人类ACE2兼容,但并不理想,这表明SARS-CoV-2在一定程度上利用ACE2结合进行人际传播。
冠状病毒的复制和转录功能由所谓的"复制酶"基因编码(Ziebuhr,J.,Snijder,E.J.,和Gorbalenya,A.E.;Virus-encoded proteinases and proteolytic processingin the Nidovirales.J.Gen.Virol.2000,81,853-879;和Fehr,A.R.;Perlman,S.;Coronaviruses:An Overview of Their Replication and Pathogenesis Methods MolBiol.2015;1282:1-23.doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1),它由两个重叠的多蛋白组成,这些多蛋白被病毒蛋白酶广泛加工。冠状病毒主要或"3C样"蛋白酶在11个保守的域间连接处处理C-近端区域(Ziebuhr、Snijder、Gorbalenya,2000和Fehr、Perlman等人,2015)。"3C样"蛋白酶的名称来源于冠状病毒酶与众所周知的小核糖核酸病毒3C蛋白酶之间存在某些相似之处。这些包括底物偏好、使用半胱氨酸作为催化中的活性位点亲核物质,以及它们推定的整体多肽折叠的相似性。与SARS-CoV 3CL蛋白酶(登记号YP_009725301.1)相比,发现SARS-CoV-2 3CL蛋白酶序列(登记号YP_009725301.1)具有96.08%的同源性。Xu,J.;Zhao,S.;Teng,T.;Abdalla,A.E.;Zhu,W.;Xie,L.;Wang,Y.;Guo,X.;SystematicComparison of Two Animal-to-Human Transmitted Human Coronaviruses:SARS-CoV-2and SARS-CoV;Viruses 2020,12,244;doi:10.3390/v12020244。最近Hilgenfeld及其同事发表了SARS-CoV-2冠状病毒主蛋白酶(3CL)的高分辨率X射线结构Zhang,L.;Lin,D.;Sun,X.;Rox,K.;Hilgenfeld,R.;X-ray Structure of Main Protease of the NovelCoronavirus SARS-CoV-2Enables Design ofα-Ketoamide Inhibitors;bioRxiv预印doi:https://doi.org/10.1101/2020.02.17.952879。结构表明,比较SARS-CoV-2和SARS-CoV的3CL蛋白酶时存在差异。在SARS-CoV而非SARS-CoV-2 3CL蛋白酶二聚体中,两个结构域III之间存在极性相互作用,涉及每个原聚体残基Thr285的侧链羟基之间的氢键,并由Ile286和Thr2852侧链之间的疏水性接触支持。与SARS-CoV 3CL中的相同残基相比,在SARS-CoV-2 3CL中,苏氨酸被丙氨酸取代,异亮氨酸被亮氨酸取代。在SARS-CoV-2 3CL蛋白酶中观察到的Thr285Ala置换使两个结构域III彼此靠近一些(分子A和B中残基285的Cα原子之间的距离在SARS-CoV 3CL蛋白酶中为/>在SARS-CoV-2 3CL蛋白酶中为/>两个结构域III的质心之间的距离从/>缩小到/>)。在SARS-CoV-2 3CL的活性位点,Cys145和His41形成一个催化二联体,当它与氢键结合至His41的埋藏水分子一起整合时,可以认为构成了SARS-CoV-2 3CL蛋白酶的催化三联体。鉴于SARS-CoV-2的持续传播已导致当前全球范围内的COVID-19爆发,因此需要有新的方法来抑制SARS-CoV-2病毒复制和治疗患者的COVID-19。
发明概要
本发明提供了新的化合物,其在抑制或预防SARS-Cov-2病毒复制中起作用,且因而可用于治疗COVID-19。本发明也提供了包含所述化合物的药物组合物和通过施用本发明的化合物或包含本发明的化合物的药物组合物来治疗COVID-19和抑制SARS-Cov-2病毒复制的方法。应理解下文的每个治疗方法实施方式还能够表达为相应的用途类型实施方式。比如说,在实施方式E1至E30、E45至E46、E50、E50a、E59至E68和E80至E83任何当中描述的任何化合物、或其药学上可接受的盐或溶剂化物或水合物,或者化合物、溶剂化物或水合物的药学上可接受的盐能够用于用作药物或另选地用于实施方式E36至E41、E47至E49、E52至E58a、E69至E74、E77至E79、E85至E93和E95至E98任何当中描述的治疗方法中。
E1是下文E45或E59的化合物,具有式I
或其药学上可接受的盐;其中R1选自C1-C6烷基,其任选用氰基或用1至5个氟取代;C2-C6炔基;和(C3-C6环烷基)-C1-C3烷基,其任选用1至2个选自三氟甲基和C1-C3烷基的取代基或用1至5个氟取代;R2是氢或者R2和R1与它们附着至的氮和碳原子一起是任选用1至4个R2a取代的吡咯烷或哌啶环;R2a在每次出现时独立地选自氟,任选用1至3个氟取代的C1-C6烷基和任选用1至3个氟取代的C1-C6烷氧基;或两个R2a基团在连接至相邻碳且与它们附着至的碳一起的情况下是稠合C3-C6环烷基,其任选用1至4个R2b取代;或两个R2a基团在连接至相同碳且与它们附着至的碳一起的情况下是螺C3-C6环烷基,其任选用1至4个R2b取代;R2b在每次出现时独立地选自氟,任选用1至3个氟取代的C1-C3烷基,和任选用1至3个氟取代的C1-C3烷氧基;R3选自C1-C8烷基,C1-C8烷氧基,(C1-C6烷氧基)-C1-C6烷基,C2-C6炔基,C2-C6炔氧基,C3-C12环烷基,其任选与5-至6-元杂芳基或苯基稠合,(C3-C12环烷基)-C1-C6烷基,C3-C12环烷氧基,(C3-C12环烷氧基)-C1-C6烷基,4-至12-元杂环烷基,其任选与5-至6-元杂芳基或苯基稠合且其中所述杂环烷基包含1至4个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,(4-至12-元杂环烷基)-C1-C6烷基,其中所述杂环烷基部分包含1至4个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,C6-C10芳基,其任选与C4-C6环烷基或4-至7-元杂环烷基稠合,(C6-C10芳基)-C1-C6烷基,包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子的5-至10-元杂芳基,其任选与C5-C6环烷基稠合;(5-至10-元杂芳基)-C1-C6烷基,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子;(C6-C10芳基)-(5-至10-元杂芳基)-,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子,(5-至10-元杂芳基氧基)-C1-C6烷基,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子;(5-至6-元杂芳基)-(5-至6-元杂芳基)-,其中各杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;(4-至7-元杂环烷基)-(5-至6-元杂芳基)-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子且所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;(5-至6-元杂芳基)-(4-至7-元杂环烷基)-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子且所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;其中各R3基团任选用1至5个R4取代;R4在每次出现时独立地选自氧代,卤代,羟基,氰基,苯基,苄基,氨基,任选用1至5个氟取代的(C1-C6烷基)氨基,任选用1至10个氟取代的二(C1-C6烷基)氨基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷氧基,任选用1至5个氟取代的C1-C3烷氧基-C1-C3烷基,任选用1至3个氟或C1-C3烷基取代的C3-C6环烷基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-C(O)NH-,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-S(O)2NH-,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-C(O)-,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-S(O)n-;和
n在每次出现时独立地选自0、1和2。
E2是E1,E45和E59中任一种的化合物,其中R1选自(CH3)2CHCH2-,(CH3)3CCH2-,氰基甲基,2-氰基乙基,2,2-二氟乙基,2,2,2-三氟乙基,3,3-二氟丙基,3,3,3-三氟丙基,3,3,3-三氟-2-甲基丙基,环丙基甲基,(2,2-二氟环丙基)甲基,[1-(三氟甲基)环丙基]甲基,(2-甲基环丙基)甲基,(3,3-二氟环丁基)甲基,环戊基甲基和丙炔基;和R2是氢;或其药学上可接受的盐。
E3是E1,E45和E59中任一种的化合物,其中R2和R1与它们附着至的氮和碳原子一起是任选用1至4个R2a取代的吡咯烷或哌啶环;或其药学上可接受的盐。
E4是E1,E45,E59和E3中任一种的化合物,其中R2a在每次出现时独立地选自氟,甲基,异丙基,三氟甲基和叔丁氧基;或两个R2a基团在连接至相邻碳且与它们附着至的碳一起的情况下是任选用1至4个R2b取代的稠合环戊烷或环丙烷;或两个R2a基团在连接至相同碳且与它们附着至的碳一起的情况下是任选用1至4个R2b取代的螺环丙烷环;或其药学上可接受的盐。
E5是E1,E3,E4,E45和E59的化合物,其中R2b在每次出现时独立地选自氟,甲基和甲氧基;或其药学上可接受的盐。
E6是E1,E2,E45和E59中任一种的化合物,选自式Ia至Ig
或其药学上可接受的盐。
E7是E1,E3,E4,E45和E59中任一种的化合物,选自式Ih至Ik
或其药学上可接受的盐。
E8是E1,E3,E4,E7,E45和E59中任一种的化合物,选自
或其药学上可接受的盐。
E9是E1,E3,E4,E7,E8,E45和E59中任一种的化合物,其中R3选自C1-C6烷基和(C3-C6环烷基)-C1-C3烷基;其各自用1至4个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E10是E1,E3,E4,E7至E9,E45和E59中任一种的化合物,其中R3选自(CH3)2CHCH(R4)-,(CH3)3CCH(R4)-和(环己基)CH(R4)-;或其药学上可接受的盐。
E11是E1,E3,E4,E7至E10,E45和E59中任一种的化合物,选自
或其药学上可接受的盐。
E12是E1,E3,E4,E7至E11,E45和E59中任一种的化合物,其中R4选自任选用1至5个氟取代的(C1-C6烷基)氨基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-C(O)NH-,和任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-S(O)2NH-;或其药学上可接受的盐。
E13是E1,E3,E4,E7至E12,E45和E59中任一种的化合物,其中R4选自CF3C(O)NH-,CF3S(O)2NH-,CH3C(O)NH-,CH3CH2C(O)NH-和CF3CH2NH-;或其药学上可接受的盐。
E14是E1,E3,E4,E7至E13,E45和E59中任一种的化合物,其中R4是CF3C(O)NH-或CF3S(O)2NH-;或其药学上可接受的盐。
E15是E1至E8,E45和E59中任一种的化合物,其中R3是4-至12-元杂环烷基,其任选与5-至6-元杂芳基或苯基稠合且其中所述杂环烷基包含1至4个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,或是(4-至12-元杂环烷基)-C1-C6烷基,其中所述杂环烷基部分包含1至4个独立选自N、O和S(O)n的杂原子;它们各自任选用1至5个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E16是E1至E8,E15,E45和E59中任一种的化合物,其中R3中的4-至12-元杂环烷基部分选自氮杂环丁烷基,吡咯烷基,哌啶基,哌嗪基,吗啉基,氧杂环丁烷基,四氢呋喃基,吡喃基,2-氧代-1,3-噁唑烷基,氧杂二环[2.2.1]庚基,1-氧杂-8-氮杂螺[4.5]癸基,1,1-二氧化-1,2-噻唑烷基和1,1-二氧化-1,2-噻嗪烷基;其各自任选用1至3个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E17是E1至E8,E45和E59中任一种的化合物,其中R3选自苯基,苄基,苯乙基,包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子的5-至10-元杂芳基;(5-至10-元杂芳基)-C1-C6烷基,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子;和(5-至10-元杂芳基氧基)-C1-C6烷基,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子;其各自任选用1至5个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E18是E1至E8,E17,E45和E59中任一种的化合物,其中R3中的5-至10-元杂芳基部分选自咪唑基,吡唑基,噁唑基,异噁唑基,噻唑基,异噻唑基,噁二唑基,三唑基,吡啶基,嘧啶基,吡嗪基,哒嗪基,吲哚基,苯并咪唑基,吡啶并吡咯基,喹啉基,喹喔啉基,苯并三唑基,咪唑并[1,2-a]吡啶基,咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑基,4H-呋喃并[3,2-b]吡咯基,4H-噻吩并[3,2-b]吡咯基,[1,2,4]三唑并[1,5-a]嘧啶基,[1,2,3]三唑并[1,5-a]吡啶基和萘啶基;其各自任选用1至4个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E19是E1至E8,E17至E18,E45和E59中任一种的化合物其中R3是吲哚基;其任选用1至4个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E20是E1至E8,E17至E19,E45和E59中任一种的化合物,其中R3是吲哚-2-基;其任选用1至4个R4取代;和R4在每次出现时独立地选自氟,氯,溴,羟基,甲基,乙基,丙基,异丙基,1-甲基丙基,丁基,叔丁基,乙酰基,甲氧基,乙氧基,丙氧基,丁氧基,三氟甲基,三氟甲氧基,环己基和二乙基氨基;或其药学上可接受的盐。
E21是E1,E2,E6,E9至E10,E12至E20,E45和E59中任一种的化合物,具有下式:
或其药学上可接受的盐。
E22是E1,E2,E6,E9至E10,E12至E21,E45和E59中任一种的化合物,其中R3选自1H-吲哚-2-基,7-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-基,4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-基,4-甲氧基-1H-吲哚-2-基,4-(三氟甲氧基)-1H-吲哚-2-基,6-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-基,4-甲氧基-3,6,7-三(三氟甲基)-1H-吲哚-2-基,3-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-基和3,5-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-基;或其药学上可接受的盐。
E23是E1至E8,E21,E45和E59中任一种的化合物,其中R3是C1-C6烷氧基;或其药学上可接受的盐。
E24是E1至E8,E21,E23,E45和E59中任一种的化合物,其中R3选自甲氧基,乙氧基和丙-2-氧基;或其药学上可接受的盐。
E25是E1至E8,E21,E45和E59中任一种的化合物,其中R3选自任选与5-至6-元杂芳基或苯基稠合的C3-C12环烷基,(C3-C12环烷基)-C1-C6烷基,C3-C12环烷氧基和(C3-C12环烷氧基)-C1-C6烷基;其各自任选用1至3个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E26是E1至E8,E21,E25,E45和E59中任一种的化合物,其中R3选自环丙基,环丁基,环戊基,环己基,1-(环己基氧基)乙基,环己氧基甲基,环丙基甲基,环丙基乙基,环丁基甲基,环丁基乙基,环戊基甲基,环戊基乙基,环己基甲基和环己基乙基;其各自任选用1至3个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E27是E1至E8,E17,E45和E59中任一种的化合物,其中R3选自苯基,苄基和苯乙基,其各自任选用1至3个R4取代;或其药学上可接受的盐。
E28是E1至E8,E17,E27,E45和E59中任一种的化合物,其中R4选自氟,氯,二甲基氨基,三氟甲基,CF3C(O)NH-和CF3S(O)2NH-;或其药学上可接受的盐。
E29是E1,E45和E59中任一种的化合物,选自:
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-{(2R)-2-(二甲基氨基)-2-[4-(三氟甲基)苯基]乙酰基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-{(2R)-2-(二甲基氨基)-2-[3-(三氟甲基)苯基]乙酰基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3,6,7-三(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-(三氟甲氧基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-(三氟甲氧基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3,5-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5,7-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3,5,7-三(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3,7-二(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
7-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
6-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
4-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
4,6-二氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
7-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
6-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
4-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5,7-二氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
4,6-二氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基-5-(三氟甲基)咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[4-甲基-2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-5-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[5-甲基-2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N2-[(4-溴-1-乙基-3-甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-L-亮氨酰胺;
N2-[(4-氯-1,3-二甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-L-亮氨酰胺;
3-乙酰基-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3R)-2,5-二氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-羟基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-羟基-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(3,3-二氟环丁基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N2-[(反式-4-氰基环己基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N2-[(反式-4-氰基环己基)羰基]-N-{(1R)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[2-(环己基氧基)丙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[环己基(甲氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[环己基(甲氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(2S)-2-(二甲基氨基)-2-苯基乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-(吡咯烷-1-基乙酰基)-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(2R)-2-(二甲基氨基)-2-苯基乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N2-[(4-氯-1,3-二甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3,7-二(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3,5-二(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3,6-二(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(环己基羰基)-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(环己基羰基)-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-[(丙-2-基氧基)乙酰基]-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(环己基氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-(4,4,4-三氟-3-甲基丁酰基)-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
N2-[(4-溴-1-乙基-3-甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(2,6-二氯苯甲酰基)-4-甲基-L-亮氨酰胺;
(2S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4,4-二甲基-1-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺;
(2S,4S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-{3-甲基-N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-5-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(2S)-2-(二甲基氨基)-2-苯基乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N2-[(反式-4-氰基环己基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N2-[(反式-4-氰基环己基)羰基]-N-{(1R)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1R)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[2-(环己基氧基)丙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
(2S,4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
5-(丁烷-2-基)-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(4,5-二氯-1H-咪唑-2-基)羰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(4,5-二氯-1H-吡唑-3-基)羰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-2,3-二甲基-4H-呋喃并[3,2-b]吡咯-5-甲酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-(三氟甲基)-1H-苯并咪唑-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-甲氧基-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-2-甲酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-氟-1H-苯并咪唑-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[3-(丙-2-基)-1H-吡唑-5-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-氟-1H-苯并咪唑-2-甲酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-苯并咪唑-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5,6-二氟-1H-苯并咪唑-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4H-噻吩并[3,2-b]吡咯-5-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[3-(2-甲基丙基)-1H-吡唑-5-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N2-{[4-(3-氯苯基)-1H-咪唑-2-基]羰基}-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N2-[(3-叔丁基-1H-吡唑-5-基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
6-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-苯并咪唑-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-甲基-1H-苯并咪唑-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-甲酰胺;
4,6-二氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-苯并咪唑-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-(1-甲基环丙基)-4-(三氟甲基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-2-甲酰胺;
N2-{[5-(2-氯苯基)-4-氟-1H-吡唑-3-基]羰基}-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-2-甲基-4H-噻吩并[3,2-b]吡咯-5-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-{[3-(4-甲氧基苯基)-1H-吡唑-5-基]羰基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-{[3-(2-甲氧基苯基)-1H-吡唑-5-基]羰基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-{[4-(4-甲氧基苯基)-1H-咪唑-2-基]羰基}-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[3-(4-甲基苯基)-1H-吡唑-5-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
7-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
7-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
(2S,4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-[3-甲基-N-(甲磺酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
(2S,4S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
(2S,4S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
(2S,4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
5-[(2S)-丁烷-2-基]-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3',3',3'-三氟-N-(三氟乙酰基)-L-异亮氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{(2S)-2-环己基-2-[(三氟乙酰基)氨基]乙酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{(2S)-2-环戊基-2-[(三氟乙酰基)氨基]乙酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[4-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-亮氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{(2S)-2-(4,4-二氟环己基)-2-[(三氟乙酰基)氨基]乙酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环戊基-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环己基-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-亮氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[6,6-二氟-N-(三氟乙酰基)-L-正亮氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-{(2S)-4,4,4-三氟-2-[(三氟乙酰基)氨基]丁酰基}-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-氟-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{(2S)-2-环丙基-2-[(三氟乙酰基)氨基]乙酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-(3,3-二氟环丁基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-O-(三氟甲基)-L-丝氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-{(2S)-2-苯基-2-[(三氟乙酰基)氨基]乙酰基}-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-苯基丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3,5-二氟-N-(三氟乙酰基)-L-苯基丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-3-(三氟甲基)-L-苯基丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(2,2,2-三氟乙基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(2S,4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-{(2S)-3-甲基-2-[(三氟乙酰基)氨基]丁基}哌啶-2-甲酰胺;
(2S,4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-{(2S)-3-甲基-2-[(2,2,2-三氟乙基)氨基]丁基}哌啶-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(3,3,3-三氟丙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-(N-丙酰基-L-缬氨酰基)-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(2S,4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-[N-(2,2,2-三氟乙基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
N2-[(4-氯-1-乙基-3-甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-L-亮氨酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-乙基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-环己基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3,5-二甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-叔丁基-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-(丙-2-基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-乙基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-乙基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-乙基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
4-丁氧基-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-(三氟甲氧基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-(二乙基氨基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
4-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
6-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-丙氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-氟-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-氟-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4,5-二甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-[(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)羰基]-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(乙氧基羰基)-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(乙氧基羰基)-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噁唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[3-(三氟甲基)-1,2-噻唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[3-(三氟甲基)-1,2-噁唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-5,5,5-三氟-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-基]羰基}-L-正缬氨酰胺;
(4S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-5,5,5-三氟-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-5,5,5-三氟-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-3-环戊基-1-氧代丙-2-基]-2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[5-(三氟甲基)-1,2-噻唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[5-(三氟甲基)-1,2-噁唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噁唑-5-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-5-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-5,5,5-三氟-4-甲基-N2-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-{[(2S)-2-甲基四氢呋喃-2-基]羰基}-L-亮氨酰胺;
N-[(2S,4R)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S,4S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-3-环戊基-1-氧代丙-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5,7-二氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-乙基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-环己基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-氯-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3,5-二甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-叔丁基-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-(丙-2-基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-(丙-2-基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-乙基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-乙基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-乙基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
4-丁氧基-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-(三氟甲氧基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-(二乙基氨基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
4-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
6-溴-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-丙氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-氟-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-氟-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4,5-二甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-(丁烷-2-基)-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-(丙-2-基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-甲基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-6-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
5-(丁烷-2-基)-N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(2R)-2-环己基-2-甲氧基乙酰基]-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(2R)-2-(环己基氧基)丙酰基]-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-(4,4,4-三氟-3-甲基丁酰基)-L-亮氨酰胺;
N2-[(反式-4-氰基环己基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(1-乙基-4-甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(环己基羰基)-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(环己基氧基)乙酰基]-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(3,3-二氟环丁基)乙酰基]-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(丙-2-基氧基)乙酰基]-L-亮氨酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑-2-甲酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(2R)-2-环己基-2-甲氧基乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(1-乙基-4-甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺;
N2-[2-氯-4-(甲磺酰基)苯甲酰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-L-亮氨酰胺;
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(2,6-二氯苯甲酰基)-L-亮氨酰胺;
(1R,2S,5S)-3-[N-(叔丁基磺酰基)-3-甲基-L-缬氨酰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-3-{[(3R)-1-苄基-5-氧代吡咯烷-3-基]羰基}-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-{[(3R)-5-氧代-1-苯基吡咯烷-3-基]羰基}-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-3-{[(3R)-1-叔丁基-5-氧代吡咯烷-3-基]羰基}-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[(3-甲基咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑-2-基)羰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-{[2-(三氟甲基)-1,3-噻唑-4-基]羰基}-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-3-环丙基-1-氧代丙-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;和
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-3-环丙基-1-氧代丙-2-基]-1H-吲哚-2-甲酰胺;
或其药学上可接受的盐。
E30是E1,E45和E59中任一种的化合物,选自:
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺;
(2S,4S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
(2S,4S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{(2S)-2-环己基-2-[(三氟乙酰基)氨基]乙酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(2S,4S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-1-{3-甲基-N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺;
3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺;和(2S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4,4-二甲基-1-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]哌啶-2-甲酰胺;
或其药学上可接受的盐。
E31是药物组合物,包含治疗有效量的E1至E30中任一种的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载体。
E32是E31的药物组合物,其中组合物呈静脉内、皮下、吸入或口服剂型的形式。
E33是E31或E32的药物组合物,其中组合物呈口服剂型。
E34是E31至E33中任一种的药物组合物,还包含额外治疗剂。
E35是E31至E34中任一种的药物组合物,其中所述药物组合物还包含地塞米松,阿奇霉素和瑞德西韦中的一种或多种。
E36是在患者中治疗冠状病毒感染的方法,所述方法包括向有需要的患者给予治疗有效量的E1至E30中任一种的化合物或其药学上可接受的盐。
E37是E36的方法,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E38是在患者中治疗冠状病毒感染的方法,所述方法包括向有需要的患者给予E31至E35中任一种的药物组合物。
E39是E38的方法,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E40是抑制或预防SARS-CoV-2病毒复制的方法,包括将SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶与治疗有效量的E1至E30中任一种的化合物或其药学上可接受的盐接触。
E41是在患者中抑制或预防SARS-CoV-2病毒复制的方法,包括向需要抑制或预防SARS-CoV-2病毒复制的患者给予治疗有效量的E1至E30中任一种的化合物或其药学上可接受的盐。
E42是E1至E30中任一种的化合物或其药学上可接受的盐用于治疗冠状病毒感染的用途。
E43是E42的用途,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E44是E1至E30中任一种的化合物或其药学上可接受的盐用于制备药物的用途,所述药物用于治疗冠状病毒感染。
E44a是E44的用途,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E45是式I'化合物
或其药学上可接受的盐;其中R在每次出现时独立地是羟基或氧代;p是0、1或2;R1选自C1-C6烷基,其任选用氰基或用1至5个氟取代;C2-C6炔基;和(C3-C6环烷基)-C1-C3烷基,其任选用1至2个选自三氟甲基和C1-C3烷基的取代基或用1至5个氟取代;R2是氢或者R2和R1与它们附着至的氮和碳原子一起是任选用1至4个R2a取代的吡咯烷或哌啶环;R2a在每次出现时独立地选自氟,羟基,任选用1至3个氟取代的C1-C6烷基和任选用1至3个氟取代的C1-C6烷氧基;或两个R2a基团在连接至相邻碳且与它们附着至的碳一起的情况下是稠合C3-C6环烷基,其任选用1至4个R2b取代;或两个R2a基团在连接至相同碳且与它们附着至的碳一起的情况下是螺C3-C6环烷基,其任选用1至4个R2b取代;R2b在每次出现时独立地选自氟,羟基,任选独立地用1至3个氟或羟基取代的C1-C3烷基和任选独立地用1至3个氟或羟基取代的C1-C3烷氧基;R3选自C1-C8烷基,C1-C8烷氧基,(C1-C6烷氧基)-C1-C6烷基,C2-C6炔基,C2-C6炔氧基,C3-C12环烷基,其任选与5-至6-元杂芳基或苯基稠合,(C3-C12环烷基)-C1-C6烷基,C3-C12环烷氧基,(C3-C12环烷氧基)-C1-C6烷基,4-至12-元杂环烷基,其任选与5-至6-元杂芳基或苯基稠合且其中所述杂环烷基包含1至4个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,(4-至12-元杂环烷基)-C1-C6烷基,其中所述杂环烷基部分包含1至4个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,C6-C10芳基,其任选与C4-C6环烷基或4-至7-元杂环烷基稠合,(C6-C10芳基)-C1-C6烷基,包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子的5-至10-元杂芳基,其任选与C5-C6环烷基稠合;(5-至10-元杂芳基)-C1-C6烷基,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子;(C6-C10芳基)-(5-至10-元杂芳基)-,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子,(5-至10-元杂芳基氧基)-C1-C6烷基,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子;(5-至6-元杂芳基)-(5-至6-元杂芳基)-,其中各杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;(4-至7-元杂环烷基)-(5-至6-元杂芳基)-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子且所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;(5-至6-元杂芳基)-(4-至7-元杂环烷基)-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子且所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;其中各R3基团任选用1至5个R4取代;R4在每次出现时独立地选自氧代,卤代,羟基,氰基,苯基,苄基,氨基,任选用1至5个氟取代的(C1-C6烷基)氨基,任选用1至10个氟取代的二(C1-C6烷基)氨基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷氧基,任选用1至5个氟取代的C1-C3烷氧基-C1-C3烷基,任选用1至3个氟或C1-C3烷基取代的C3-C6环烷基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-C(O)NH-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-OC(O)NH-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-NHC(O)NH-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-S(O)2NH-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-C(O)-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-S(O)n-;R5选自苯基,苯氧基,C3-C6环烷基,C3-C6环烷氧基,4-至7-元杂环烷基-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,和5-至6-元杂芳基-,其中所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;其中各R5任选独立地用1至3个卤代,C1-C3烷基和C1-C3烷氧基取代;并且n在每次出现时独立地选自0、1和2。
E46是化合物,其选自(2S,4R)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺;(2R,4S)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺;3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺;(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(甲基氨基甲酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3,3-二甲基-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸甲酯;和N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺;或其药学上可接受的盐。
E47是在患者中治疗冠状病毒感染的方法,所述方法包括向有需要的患者给予治疗有效量的E45和E46中任一种的化合物或其药学上可接受的盐。
E48是E47的方法,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E49是在患者中治疗冠状病毒感染的方法,所述方法包括给予治疗有效量的E1至E30和E45至E46中任一种的化合物或其药学上可接受的盐,其中给予额外治疗剂并且所述额外治疗剂选自瑞德西韦,galidesivir,法匹拉韦/阿韦法韦,molnupiravir,AT-527,AT-301,BLD-2660,法维拉韦,卡莫司他,SLV213,恩曲他滨/替诺福韦,克来夫定,达塞曲匹,波普瑞韦,ABX464,地塞米松,氢化可的松,恢复期血浆,凝溶胶蛋白(Rhu-p65N),regdanvimab(Regkirova),ravulizumab(Ultomiris),VIR-7831/VIR-7832,BRII-196/BRII-198,COVI-AMG/COVI DROPS(STI-2020),bamlanivimab(LY-CoV555),mavrilimab,leronlimab(PRO140),AZD7442,lenzilumab,英利昔单抗,阿达木单抗,JS 016,STI-1499(COVIGUARD),lanadelumab(Takhzyro),卡那奴单抗(Ilaris),gimsilumab,otilimab,casirivimab/imdevimab(REGN-Cov2),MK-7110(CD24Fc/SACCOVID),肝素,阿哌沙班,托珠单抗(Actemra),sarilumab(Kevzara),二甲磺酸apilimod,DNL758,DC402234,PB1046,达格列净,abivertinib,ATR-002,bemcentinib,acalabrutinib,baricitinib,tofacitinib,洛呲莫德,法莫替丁,利托那韦,氯硝柳胺和二脒那嗪。
E50是化合物(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐。
E50a是化合物(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。
E51是药物组合物,包含治疗有效量的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体。
E51a是药物组合物,包含治疗有效量的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺以及药学上可接受的载体。
E52是在患者中治疗冠状病毒感染的方法,所述方法包括向需要治疗的患者给予治疗有效量的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐。
E52a是在患者中治疗冠状病毒感染的方法,所述方法包括向需要治疗的患者给予治疗有效量的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。
E53是E52的方法,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E53a是E52a的方法,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E54是E52或E53的方法,其中口服给予(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐。
E54a是E52a或E53a的方法,其中口服给予(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。
E55是E54的方法,其中每天给予50mg至1500mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐。
E55a是E54a的方法,其中每天给予50mg至1500mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。
E56是E55的方法,其中每天三次给予380mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐。
E56a是E55a的方法,其中每天三次给予380mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐。
E57是E55的方法,其中作为口服悬浮液、胶囊或片剂每天给予50mg至1500mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐。
E57a是E55a的方法,其中作为口服悬浮液、胶囊或片剂每天给予50mg至1500mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其药学上可接受的盐。
E58是E57的方法,其中给予片剂。
E58a是E57a的方法,其中给予片剂。
E59是式I"化合物
或其溶剂化物或水合物,或所述化合物、其溶剂化物或水合物的药学上可接受的盐;
其中
R在每次出现时独立地是羟基或氧代;
q和q’各自独立地选自0、1和2;
p是0、1或2;
R1选自C1-C6烷基,其任选用氰基或用1至5个氟取代;C2-C6炔基;和(C3-C6环烷基)-C1-C3烷基,其任选用1至2个选自三氟甲基和C1-C3烷基的取代基或用1至5个氟取代;
R2是氢或者R2和R1与它们附着至的氮和碳原子一起是任选用1至4个R2a取代的吡咯烷或哌啶环;
R2a在每次出现时独立地选自氟,羟基,任选用1至3个氟取代的C1-C6烷基和任选用1至3个氟取代的C1-C6烷氧基;或两个R2a基团在连接至相邻碳且与它们附着至的碳一起的情况下是稠合C3-C6环烷基,其任选用1至4个R2b取代;或两个R2a基团在连接至相同碳且与它们附着至的碳一起的情况下是螺C3-C6环烷基,其任选用1至4个R2b取代;
R2b在每次出现时独立地选自氟,羟基,任选独立地用1至3个氟或羟基取代的C1-C3烷基和任选独立地用1至3个氟或羟基取代的C1-C3烷氧基;
R3选自C1-C8烷基,C1-C8烷氧基,(C1-C6烷氧基)-C1-C6烷基,C2-C6炔基,C2-C6炔氧基,C3-C12环烷基,其任选与5-至6-元杂芳基或苯基稠合,(C3-C12环烷基)-C1-C6烷基,C3-C12环烷氧基,(C3-C12环烷氧基)-C1-C6烷基,4-至12-元杂环烷基,其任选与5-至6-元杂芳基或苯基稠合且其中所述杂环烷基包含1至4个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,(4-至12-元杂环烷基)-C1-C6烷基,其中所述杂环烷基部分包含1至4个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,C6-C10芳基,其任选与C4-C6环烷基或4-至7-元杂环烷基稠合,(C6-C10芳基)-C1-C6烷基,包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子的5-至10-元杂芳基,其任选与C5-C6环烷基稠合;(5-至10-元杂芳基)-C1-C6烷基,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子;(C6-C10芳基)-(5-至10-元杂芳基)-,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子,(5-至10-元杂芳基氧基)-C1-C6烷基,其中所述杂芳基部分包含1至5个独立选自N、O和S的杂原子;(5-至6-元杂芳基)-(5-至6-元杂芳基)-,其中各杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;(4-至7-元杂环烷基)-(5-至6-元杂芳基)-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子且所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;(5-至6-元杂芳基)-(4-至7-元杂环烷基)-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子且所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;其中各R3基团任选用1至5个R4取代;
R4在每次出现时独立地选自氧代,卤代,羟基,氰基,苯基,苄基,氨基,任选用1至5个氟取代的(C1-C6烷基)氨基,任选用1至10个氟取代的二(C1-C6烷基)氨基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基,(5-至6-元杂芳基)氨基-,其中所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;(4-至7-元杂环烷基)氨基-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷氧基,任选用1至5个氟取代的C1-C3烷氧基-C1-C3烷基,任选用1至3个氟或C1-C3烷基取代的C3-C6环烷基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-C(O)NH-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-OC(O)NH-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-NHC(O)NH-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-S(O)2NH-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-C(O)-,任选用1至5个氟或用1个R5取代的C1-C6烷基-S(O)n-;
R5选自苯基,苯氧基,C3-C6环烷基,C3-C6环烷氧基,4-至7-元杂环烷基-,其中所述杂环烷基部分包含1至3个独立选自N、O和S(O)n的杂原子,和5-至6-元杂芳基-,其中所述杂芳基部分包含1至4个独立选自N、O和S的杂原子;其中各R5任选独立地用1至3个卤代,C1-C3烷基和C1-C3烷氧基取代;和
n在每次出现时独立地选自0、1和2。
E60是E59的化合物,其是(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其溶剂化物或水合物,或者所述化合物、溶剂化物或水合物的药学上可接受的盐。
E61是具有下述结构的化合物(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺:
或其溶剂化物或水合物。
E62是E61的化合物,其是结晶的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。
E63是E62的化合物,其是结晶的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,固体形式1。
E64是E62的化合物,其是结晶的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,固体形式4。
E65是E61的化合物,其是无定形的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。
E66是E61的化合物,其是(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物。
E67是E66的化合物,其是结晶的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物。
E68是E67的化合物,其是结晶的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物,固体形式2。
E69是在患者中治疗冠状病毒感染的方法,所述方法包括向需要治疗的患者给予治疗有效量的根据E61至E68中任一种的化合物。
E70是E69的方法,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E71是E70的方法,其中也向患者给予利托那韦。
E72是E71的方法,其中口服给予患者E61至E68中任一种的化合物和利托那韦。
E73是E72的方法,其中给予约10mg至约1500mg每天的E61至E68中任一种的化合物和约10mg至约1000mg每天的利托那韦。
E74是E73的方法,其中每天两次给予患者各自约50mg的E61至E68中任一种的化合物和约100mg的利托那韦。
E75是药物组合物,包含治疗有效量的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其溶剂化物或水合物,或者所述化合物、溶剂化物或水合物的药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载体。
E75a是药物组合物,包含治疗有效量的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;或其溶剂化物或水合物,以及药学上可接受的载体。
E76是E75a的药物组合物,包含根据E62至E68中任一种的化合物。
E77是E69或E70的方法,其中每天两次口服给予患者约100mg,150mg,200mg,250mg,300mg,350mg,400mg,450mg,500mg,550mg,600mg,650mg,700mg或750mg的根据E61至E68中任一种的化合物。
E78是E77的方法,其中向患者每天两次口服共同给予利托那韦。
E79是E78的方法,其中向患者每天两次共同给予约300mg的根据E61至E68中任一种的化合物和约100mg的利托那韦。
E80是E63的化合物,其通过下述表征:化学位移在-73.3±0.1ppm的19F峰和化学位移在31.0±0.1ppm,27.9±0.1ppm和178.9±0.2ppm的13C峰。
E81是E64的化合物,其通过选自下述的一个或多个峰表征:化学位移在-73.6±0.1ppm的19F峰和在26.9±0.1ppm,21.6±0.1ppm和41.5±0.1ppm的13C峰。
E82是具有下述结构的化合物N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺:
或其溶剂化物或水合物。
E83是E82的化合物,其是N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺。
E84是药物组合物,包含治疗有效量的N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺;或其溶剂化物或水合物,以及药学上可接受的载体。
E85是在患者中治疗冠状病毒感染的方法,所述方法包括向需要治疗的患者给予治疗有效量的E82或E83的化合物。
E86是E85的方法,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E87是E85或E86的方法,其中给予10mg至1500mg每天的E82或E83的化合物。
E88是E85至E87中任一种的方法,其中口服给予所述化合物。
E89是E88的方法,其中每天两次给予200mg的所述化合物。
E90是靶向SARS-CoV-2抑制的方法,E1至E30,E45至E46,E50,E50a,E59至E68和E80至E83中任一种的化合物充当治疗由SARS-CoV-2相关病毒感染引起的适应症的手段。
E91是鉴定细胞或病毒途径的方法,通过给予E1至E30,E45至E46,E50,E50a,E59至E68和E80至E83中任一种的SARS-CoV-2蛋白酶抑制剂化合物干扰所述途径的成员起作用能用于治疗由SARS-CoV-2感染引起的适应症。
E92是用E1至E30,E45至E46,E50,E50a,E59至E68和E80至E83中任一种的SARS-CoV-2蛋白酶抑制剂化合物作为工具来理解其它SARS-CoV-2抑制剂的作用机理的方法。
E93是用E1至E30,E45至E46,E50,E50a,E59至E68和E80至E83中任一种的SARS-CoV-2 3C样蛋白酶抑制剂化合物进行用于监测基因上调或下调的基因谱实验的方法,其意图是鉴定用于治疗由SARS-CoV-2感染比如COVID-19引起的适应症的抑制剂。
E94是用于在哺乳动物中治疗COVID-19的药物组合物,含有有效治疗COVID-19的量的E1至E30,E45至E46,E50,E50a,E59至E68和E80至E83中任一种的SARS-CoV-2 3C样蛋白酶抑制剂化合物,以及药学上可接受的载体。
E95是在患者中治疗MERS的方法,所述方法包括向有需要的患者给予治疗有效量的E1至E30,E45至E46,E50,E50a,E59至E68和E80至E83中任一种的化合物。
E96是在患者中治疗MERS的方法,所述方法包括向有需要的患者给予E31至E35,E51,E51a,E75,E75a,E84和E94中任一种的药物组合物。
E97是抑制或预防MERS病毒复制的方法,包括将SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶与治疗有效量的E1至E30,45-46,50,50a,59-68和80-83中任一种的化合物接触。
E98是在患者中抑制或预防MERS病毒复制的方法,包括向需要抑制或预防MERS病毒复制的患者给予治疗有效量的E1至E30,45-46,50,50a,59-68和80-83中任一种的化合物。
E99是E1至E30,45-46,50,50a,59-68和80-83中任一种的化合物用于治疗冠状病毒感染的用途。
E100是E99的用途,其中冠状病毒感染是COVID-19。
E101是E1至E30,45-46,50,50a,59-68和80-83中任一种的化合物用于制备药物的用途。
E102是实施方式E1至E30中任一种的化合物或其药学上可接受的盐,用于用作药物。
E103是实施方式E1至E30中任一种的化合物或其药学上可接受的盐,用于治疗方法中,其中所述方法描述于实施方式E36至E41中的任一种。
附图说明
图1:13,甲基叔丁基醚溶剂化物固体形式2的粉末X射线衍射图谱,来自"实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的备择合成;产生固体形式2"。
图2:13,甲基叔丁基醚溶剂化物固体形式2的粉末X射线衍射图谱,来自"实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的第二备择合成;产生固体形式2"。
图3:实施例13固体形式1的粉末X射线衍射图谱,来自"实施例13的重结晶;产生固体形式1"。
图4:实施例13固体形式1的单晶X射线结构测定。用50%概率的位移参数绘制的ORTEP图。
图5:下述的重叠图:获自实施例13固体形式1的粉末图,其来自"实施例13的重结晶;产生固体形式1"(图3);和经由Mercury软件产生的计算粉末图,其来自形式1的解析X射线单晶数据(参见"实施例13固体形式1的单晶X射线结构测定")。
图6:实施例13固体形式4的粉末X射线衍射图谱,来自"实施例13的备择重结晶;产生固体形式4"。
图7:实施例13固体形式4的单晶X射线结构测定。用50%概率的位移参数绘制的ORTEP图。
图8:下述的重叠图:获自实施例13固体形式4的粉末图,其来自"实施例13的备择重结晶;产生固体形式4"(图6);和经由Mercury软件产生的计算粉末图,其来自形式4的解析X射线单晶数据(参见"实施例13固体形式4的单晶X射线结构测定")。
图9:实施例13固体形式5的粉末X射线衍射图谱,来自实施例96。
图10:中间体C16,HCl盐的粉末X射线衍射图谱。
图11:中间体C91的粉末X射线衍射图谱。
图12:中间体C91的单晶X射线结构测定。用50%概率的位移参数绘制的ORTEP图。
图13:中间体C92的粉末X射线衍射图谱。
图14:中间体C42的粉末X射线衍射图谱。
图15:中间体C42的单晶X射线结构测定。用50%概率的位移参数绘制的ORTEP图。
发明详述
出于本文所述和要求保护的本发明的目的,以下术语定义如下:
本文中使用的术语"包含"和"包括"以其开放的、非限制性的含义使用。除非另有说明,本文所用的术语"治疗"是指逆转、减轻、预防该术语针对的障碍或病况或所述障碍或病况的一种或多种症状或者抑制其进展。在治疗COVID-19的方法中,应理解COVID-19是通过SARS-CoV-2病毒感染在患者中引起的疾病。SARS-CoV-2病毒应理解为涵盖最初发现的病毒品系以及出现的突变型品系比如但不限于比如B.1.1.7(UK变种),B.1.351(南非变种),P.1(巴西变种)和B.1.427/B.1.429(加利福尼亚变种)的品系。如本文中使用的,除非另有说明,术语"治疗"表示治疗的行为,如在上文刚定义的"治疗"。
术语"患者"是指温血动物例如豚鼠,小鼠,大鼠,沙鼠,猫,兔,犬,牛,山羊,绵羊,马,猴,黑猩猩和人类。关于治疗COVID-19,本发明的方法对治疗人类患者特别有用。
术语"药学上可接受的"意指物质或组合物必须在化学上和/或毒理学上与形成配制剂的其它成分和/或用其治疗的哺乳动物相容。
术语"治疗有效量"意指本发明化合物的量,其(i)治疗或预防特定疾病、病况或障碍,(ii)减弱、改善或消除特定疾病、病况或障碍的一种或多种症状,或(iii)预防或延缓本文描述的特定疾病、病况或障碍的一种或多种症状的发作。
术语"烷基"如本文所用是指直链或支链饱和烃基取代基(即从烃移除氢得到的取代基);在一种实施方式中含有1至8个碳原子,在又一种实施方式中含有1至6个碳原子和在还又一种实施方式中含有1至3个碳原子。所述取代基的非限制性实例包括甲基,乙基,丙基(包括正丙基和异丙基),丁基(包括正丁基,异丁基,仲丁基和叔丁基),戊基,异戊基,己基,庚基,辛基等。在又一实施方式中含有1至3个碳且由甲基,乙基,正丙基和异丙基组成。
术语"炔基"如本文所用是指含有碳-碳三键的直链或支链饱和烃基取代基(即从含三键的烃移除氢得到的取代基);在一种实施方式中含有2至6个碳原子。所述取代基的非限制性实例包括丙-2-炔-1-基,丁-3-炔-1-基,戊-4-炔-1-基和己-5-炔-1-基。
术语"烷氧基"是指连接至氧残基的直链或支链饱和烃基取代基(即从烃醇除去OH氢得到的取代基);在一种实施方式中含有1至6个碳原子。所述取代基的非限制性实例包括甲氧基,乙氧基,丙氧基(包括正丙氧基和异丙氧基),丁氧基(包括正丁氧基,异丁氧基,仲丁氧基和叔丁氧基),戊氧基,己氧基等。在又一实施方式中具有1至3个碳且由甲氧基,乙氧基,正丙氧基和异丙氧基组成。连接至烷基的烷氧基称为烷氧基烷基。烷氧基烷基的实例是甲氧基甲基。
术语"炔氧基"是指连接至氧残基的含有碳-碳三键的直链或支链饱和烃基取代基(即从含三键的烃醇除去OH氢得到的取代基);在一种实施方式中含有3至6个碳原子。所述取代基的非限制性实例包括丙炔基氧基,丁炔基氧基和戊炔基氧基等。
在某些情况下,烃基取代基(即烷基、环烷基等)中的碳原子数通过前缀"Cx-Cy-"或"Cx-y"指出,其中x是取代基中的最小碳原子数而y是最大碳原子数。从而,例如"C1-C8烷基"或"C1-8烷基"是指含有1至8个碳原子的烷基取代基,"C1-C6烷基"或"C1-6烷基"是指含有1至6个碳原子的烷基取代基,"C1-C3烷基"或"C1-3烷基"是指含有1至3碳原子的烷基取代基。进一步举例说明,C3-C6环烷基或C3-6-环烷基是指含有3至6个碳环原子的饱和环烷基。
术语"环烷基"是指从饱和碳环分子例如具有3至7个碳原子的饱和碳环分子除去氢获得的碳环取代基。术语"环烷基"包括单环饱和碳环。术语"C3-C7环烷基"意指3-至7-元环系的残基,其包括基团环丙基,环丁基,环戊基,环己基和环庚基。术语"C3-C6环烷基"意指3-至6-元环系的残基,其包括基团环丙基,环丁基,环戊基和环己基。环烷基还能够是双环或螺环的碳环。例如,术语"C3-C12环烷基"包括单环的碳环以及双环的和螺环的环烷基部分比如联环戊烷,联环己基,联环庚基,联环辛基,联环壬基,螺戊基,螺己基,螺庚基,螺辛基和螺壬基。
术语"C3-C6环烷氧基"是指连接至氧残基的3-至6-元环烷基。实例包括环丙氧基,环丁氧基,环戊氧基和环己氧基。
术语"芳基"是指碳环芳族系统。术语"C6-C10芳基"是指具有3至10个原子的碳环芳族系统并且包括苯基和萘基。
在某些情况下,含有一个或多个杂原子的环状取代基(即杂芳基或杂环烷基)中的原子数通过前缀"x-至y-元"指出,其中x是形成所述取代基的环状部分的最小原子数而y是最大原子数。从而,例如"4-至6-元杂环烷基"是指杂环烷基,在杂环烷基的环状部分中含有4至6个原子,包括1至3个杂原子。类似地,短语"5-至6-元杂芳基"是指在杂芳基的环状部分中含有5至6个原子的杂芳基,和"5-至10-元杂芳基"是指在杂芳基的环状部分中含有5至10个原子的杂芳基,各自包括一个或多个杂原子。另外,短语"5-元杂芳基"和"6-元杂芳基"分别指五元杂芳族环系和六元杂芳族环系。这些环系中存在的杂原子选自N,O和S。
术语"羟基"或"羟基团"是指-OH。在与又一术语组合的情况下,前缀"羟基"指出该前缀所连接的取代基用一个或多个羟基取代基取代。携带连接一个或多个羟基取代基的碳的化合物包括例如醇,烯醇和酚。术语氰基和腈是指-CN基团。术语"氧代"意指氧,其通过双键连接至碳(即在R4是氧代的情况下则R4与其附着至的碳一起是C=O部分)。
术语"卤代"或"卤素"是指氟(其可以描述为-F),氯(其可以描述为-Cl),溴(其可以描述为-Br),或碘(其可以描述为-I)。
术语"杂环烷基"是指从饱和或部分饱和的环结构除去氢获得的取代基,所述结构含有指定原子数的总和比如4至6个环原子或4至12个原子,其中环原子中至少一个是杂原子(即氧、氮或硫),而其余环原子独立地选自碳、氧、氮和硫。硫可以被氧化[也即S(O)或S(O)2]或未被氧化。在具有杂环烷基取代基的基团中,结合至所述基团的杂环烷基取代基的环原子可以是氮杂原子,或可以是环碳原子。类似地,如果杂环烷基取代基又用基团或取代基取代,则所述基团或取代基可以结合至氮杂原子,或可以结合至环碳原子。应理解杂环基团可以是单环,双环,多环或螺环。
术语"杂芳基"是指含有指定的环原子数的芳族环结构,其中环原子中至少一个是杂原子(也即氧、氮或硫),而其余环原子独立地选自碳、氧、氮和硫。杂芳基取代基的实例包括6-元杂芳基取代基比如吡啶基,吡嗪基,嘧啶基,和哒嗪基;和5-元杂芳基取代基比如三唑基,咪唑基,呋喃基,噻吩基,吡唑基,吡咯基,噁唑基,异噁唑基,噻唑基,1,2,3-,1,2,4-,1,2,5-,或1,3,4-噁二唑基和异噻唑基。杂芳基还能够是双环杂芳族基团比如吲哚基,苯并呋喃基,苯并噻吩基,苯并咪唑基,苯并噻唑基,苯并噁唑基,苯并异噁唑基,噁唑并吡啶基,咪唑并吡啶基,咪唑并嘧啶基等。在具有杂芳基取代基的基团中,结合至所述基团杂芳基取代基的环原子可以是杂原子之一,或可以是环碳原子。类似地,如果杂芳基取代基又用基团或取代基取代,则所述基团或取代基可以结合至杂原子之一,或可以结合至环碳原子。术语"杂芳基"也包括吡啶基N-氧化物和含有吡啶N-氧化物环的基团。此外,杂芳基可以含有氧代基团比如吡啶酮基团中存在的那种。其它实例包括呋喃基,噻吩基,噁唑基,噻唑基,咪唑基,吡唑基,三唑基,四唑基,异噁唑基,异噻唑基,噁二唑基,噻二唑基,吡啶基,哒嗪基,嘧啶基,吡嗪基,吡啶-2(1H)-酮基,哒嗪-2(1H)-酮基,嘧啶-2(1H)-酮基,吡嗪-2(1H)-酮基,咪唑并[1,2-a]吡啶基,和吡唑并[1,5-a]吡啶基。杂芳基能够如本文所定义被进一步取代。
单环杂芳基和杂环烷基的实例包括呋喃基,二氢呋喃基,四氢呋喃基,噻吩基,二氢噻吩基,四氢噻吩基,吡咯基,异吡咯基,吡咯啉基,吡咯烷基,咪唑基,异咪唑基,咪唑啉基,咪唑烷基,吡唑基,吡唑啉基,吡唑烷基,三唑基,四唑基,二硫杂环戊二烯基,氧硫杂环戊二烯基,噁唑基,异噁唑基,噻唑基,异噻唑基,噻唑啉基,异噻唑啉基,噻唑烷基,异噻唑烷基,硫杂噁二唑基,噁噻唑基,噁二唑基(包括噁二唑基,1,2,4-噁二唑基,1,2,5-噁二唑基或1,3,4-噁二唑基),吡喃基(包括1,2-吡喃基或1,4-吡喃基),二氢吡喃基,吡啶基,哌啶基,二嗪基(包括哒嗪基,嘧啶基,哌嗪基,三嗪基(包括s-三嗪基,as-三嗪基和v-三嗪基),噁嗪基(包括2H-1,2-噁嗪基,6H-1,3-噁嗪基或2H-1,4-噁嗪基),异噁嗪基(包括邻-异噁嗪基或对-异噁嗪基),噁唑烷基,异噁唑烷基,氧杂噻嗪基(包括1,2,5-氧杂噻嗪基或1,2,6-氧杂噻嗪基),噁二嗪基(包括2H-1,2,4-噁二嗪基或2H-1,2,5-噁二嗪基),和吗啉基。
术语"杂芳基"还能够在如此指定的情况下包括具有两个环的环系,其中所述环可以是稠合的且其中一个环是芳族而另一个环并不完全是共轭芳族系统的一部分(即杂芳族环能够稠合至环烷基或杂环烷基环)。所述环系的非限制性实例包括5,6,7,8-四氢异喹啉基,5,6,7,8-四氢喹啉基,6,7-二氢-5H-环戊二烯并[b]吡啶基,6,7-二氢-5H-环戊二烯并[c]吡啶基,1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑基,2,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑基,5,6-二氢-4H-吡咯并[1,2-b]吡唑基,6,7-二氢-5H-吡咯并[1,2-b][1,2,4]三唑基,5,6,7,8-四氢-[1,2,4]三唑并[1,5-a]吡啶基,4,5,6,7-四氢吡唑并[1,5-a]吡啶基,4,5,6,7-四氢-1H-吲唑基和4,5,6,7-四氢-2H-吲唑基。应理解如果碳环或杂环部分可以通过不同的环原子键合或者连接至指定底物,但未表示具体附着点,那么期望全部可能的点,无论是通过碳原子还是例如三价氮原子。例如,术语"吡啶基"意指2-、3-或4-吡啶基,术语"噻吩基"意指2-或3-噻吩基等。
如果取代基被描述为"独立地"具有超过一个变量,那么取代基的每个实例独立于可用变量列表中的其它实例进行选择。因此,每个取代基可以与其它取代基相同或不同。
如果取代基被描述为"独立地选自"组,那么取代基的每个实例彼此独立地选择。因此,每个取代基可以与其它取代基相同或不同。
本文中使用的术语式I、式I'或式I"在下文中可以被称作"本发明化合物"、"本发明"和"式I、式I'或式I"化合物"。这样的术语也定义为包括式I、式I'和式I"化合物的所有形式,包括其水合物、溶剂化物、异构体、结晶性和非结晶形式、同晶型物、多晶型物和代谢物。例如,本发明的化合物或其药学上可接受的盐可以以未溶剂化和溶剂化形式存在。当溶剂或水紧密结合时,复合物将具有明确的化学计量学,与湿度无关。但是,当溶剂或水弱结合时(如在通道溶剂化物和吸湿性化合物中),水/溶剂含量将取决于湿度和干燥条件。在这样的情况下,非化学计量学将是常态。
本发明的化合物可以作为笼形包合物或其它复合物存在。在本发明范围内包括复合物比如笼形包合物、药物-主体包合络合物,其中药物和主体以化学计量的或非化学计量的量存在。还包括本发明化合物的含有两种或更多种有机和/或无机组分的复合物,其可以呈化学计量的或非化学计量的量。所得复合物可以是离子化的、部分离子化的或非离子化的。关于这样的复合物的综述,参见Haleblian的J.Pharm.Sci.,64(8),1269-1288(August1975)。
本发明的化合物具有不对称的碳原子。在本文中可以使用实线实线楔形/>或虚线楔形/>描绘本发明的化合物的碳-碳键。用实线描绘不对称碳原子的键意指,包括在该碳原子处的所有可能的立体异构体(例如,特定的对映异构体、外消旋混合物等)。用实线或虚线楔形描绘与不对称碳原子的键意味着表示,仅意图包括所示的立体异构体。式I、式I'和式I"化合物可能含有超过一个不对称的碳原子。在那些化合物中,用实线描绘与不对称碳原子的键意味着表示,意图包括所有可能的立体异构体。例如,除非另外说明,式I、式I'和式I"化合物意图可以作为对映异构体和非对映异构体存在,或作为外消旋体及其混合物存在。用实线描绘与式I、式I'和式I"化合物中的一个或多个不对称碳原子的键以及用实线或虚线楔形描绘相同化合物中与其它不对称碳原子的键意味着表示,存在非对映异构体的混合物。
式I、I'和I"的立体异构体包括本发明的化合物的顺式和反式异构体、光学异构体比如R和S对映异构体、非对映异构体、几何异构体、旋转异构体、构象异构体和互变异构体,包括表现出超过一种类型的异构现象的化合物;及其混合物(比如外消旋体和非对映体对)。还包括酸加成或碱加成盐,其中抗衡离子是光学活性的,例如,D-乳酸盐或L-赖氨酸,或外消旋的,例如,DL-酒石酸盐或DL-精氨酸。
当任何外消旋体结晶时,两种不同类型的晶体是可能的。第一类是上文所述的外消旋化合物(真外消旋体),其中产生一种均质形式的晶体,其含有等摩尔量的两种对映异构体。第二类是外消旋混合物或聚集物(conglomerate),其中两种形式的晶体以等摩尔量产生,各自包含单一对映异构体。
本发明化合物比如式I、I'和I"的那些可以存在互变异构现象;这样的互变异构体也被视作本发明的化合物。所有这样的互变异构形式及其混合物被包括在式I、I'和I"化合物的范围内。互变异构体作为在溶液中的互变异构集合的混合物存在。在固体形式中,通常一种互变异构体占优势。尽管可能描述一种互变异构体,本发明包括式I、I'和I"化合物的所有互变异构体及其盐。
除非另有说明,本文所用的短语"药学上可接受的盐"包括可存在于本文所述化合物中的酸性或碱性基团的盐。本发明方法中使用的实质上为碱性的化合物能够与各种无机和有机酸形成多种盐。可用于制备此类碱性化合物的药学上可接受的酸加成盐的酸是那些形成无毒酸加成盐的酸,所述盐即含有药理学上可接受的阴离子的盐,比如乙酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、碳酸氢盐、硫酸氢盐、酒石酸氢盐、硼酸盐、溴化物、依地酸钙、樟脑磺酸盐、碳酸盐、氯化物、克拉维酸盐、柠檬酸盐、二盐酸盐、依地酸盐、乙二磺酸盐(edislyate)、依托酸盐(estolate)、乙磺酸盐、乙基琥珀酸盐、富马酸盐、葡庚糖酸盐、葡萄糖酸盐、谷氨酸盐、己基间苯二酚盐(hexylresorcinate)、哈胺(hydrabamine)、氢溴酸盐、盐酸盐、碘化物、羟乙基磺酸盐、乳酸盐、乳糖酸盐、月桂酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、扁桃酸盐、甲磺酸盐、甲基硫酸盐、粘酸盐、萘磺酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、扑酸盐(双羟萘酸盐)、棕榈酸盐、泛酸盐、磷酸盐/二磷酸盐、聚半乳糖醛酸盐(polygalacturonate)、水杨酸盐、硬脂酸盐、次醋酸盐、琥珀酸盐、鞣酸盐、酒石酸盐、8-氯茶碱盐、甲苯磺酸盐、triethiodode和戊酸盐。
关于本发明方法中使用的本发明的化合物,如果化合物也以互变异构形式存在,则本发明涉及那些互变异构体以及所有此类互变异构体及其混合物的用途。
本发明也包括化合物和用同位素标记的化合物治疗冠状病毒感染比如COVID-19的方法和抑制SARS-CoV-2的方法,所述同位素标记的化合物与本文所述的那些相同,但一个或多个原子被其原子质量或质量数与通常在自然界中发现的原子质量或质量数不同的原子替换。可并入本发明化合物的同位素的例子包括氢、碳、氮、氧、磷、氟和氯的同位素,分别例如2H、3H、13C、14C、15N、18O、17O、31P、32P、35S、18F和36Cl。含有上述同位素和/或其它原子的同位素的本发明的化合物、其前药,以及所述化合物或所述前药的药学上可接受的盐,均在本发明的范围内。本发明的某些同位素标记的化合物,例如掺入放射性同位素如3H和14C的那些,可用于药物和/或底物组织分布测定。氚化(即3H)和碳-14(即14C)同位素是特别优选的,因为它们易于制备和可检测。此外,用更重的同位素(例如氘,即2H)取代可以提供某些治疗优势,因为代谢稳定性更高,例如增加体内半衰期或减少剂量需求,因此在某些情况下可能是优选的。在本发明的方法中使用的同位素标记的化合物及其前药通常可以通过用容易获得的同位素标记的试剂代替非同位素标记的试剂来进行本领域公开的化合物的制备程序来制备。
本发明还包括使用药物组合物的方法和通过施用本发明化合物的前药来治疗冠状病毒感染比如COVID-19感染的方法。具有游离氨基、酰氨基或羟基的化合物可以转化为前药。前药包括这样的化合物,其中氨基酸残基或两个或更多个(例如,两个、三个或四个)氨基酸残基的多肽链通过酯键共价连接至用于本发明方法的化合物的羟基。氨基酸残基包括、但不限于通常由三个字母符号指定的20个天然存在的氨基酸,并且还包括4-羟脯氨酸、羟赖氨酸、锁链素、异锁链素、3-甲基组氨酸、正缬氨酸(norvalin)、β-丙氨酸、γ-氨基丁酸、瓜氨酸、高半胱氨酸、高丝氨酸、鸟氨酸和甲硫氨酸砜。还包括其它类型的前药。例如,如Advanced Drug Delivery Reviews,1996,19,115中所述,可以使用包括、但不限于半琥珀酸酯、磷酸酯、二甲基氨基乙酸酯和磷酰氧基甲氧基羰基的基团来衍生游离羟基。还包括羟基和氨基的氨基甲酸酯前药,以及羟基的碳酸酯前药、磺酸酯和硫酸酯。也包括羟基衍生为(酰氧基)甲基和(酰氧基)乙基醚,其中酰基可以是烷基酯,任选被包括、但不限于醚、胺和羧酸官能团的基团取代,或者其中酰基是如上所述的氨基酸酯。这种类型的前药描述于J.Med.Chem.,1996,29,10。游离胺也可以衍生为酰胺、磺酰胺或膦酰胺。所有这些前药部分都可以引入包括、但不限于醚、胺和羧酸官能团的基团。
本发明的化合物也可以与其它药物组合用在本发明的方法中。例如,将本发明的SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂和干扰素(如干扰素α)或聚乙二醇化干扰素(如PEG-Intron或Pegasus)施用于SARS-CoV-2冠状病毒感染患者(即COVID-19患者),可能比单独施用干扰素、聚乙二醇化干扰素或SARS-CoV-2冠状病毒抑制剂提供更大的临床益处。可以用在本发明的方法中的其它额外药剂包括地塞米松、阿奇霉素和瑞德西韦。更大的临床益处的例子可能包括COVID-19症状的大幅减少、症状缓解的时间更快、肺部病理减少、患者体内SARS-CoV-2冠状病毒的数量(病毒载量)大幅减少,以及死亡率降低。
SARS-CoV-2冠状病毒感染表达p-糖蛋白的细胞。本发明的一些SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂是p-糖蛋白底物。抑制SARS-CoV-2冠状病毒的化合物(也是p-糖蛋白底物)可以与p-糖蛋白抑制剂一起施用。p-糖蛋白抑制剂的例子是维拉帕米、长春碱、酮康唑、奈非那韦、利托那韦或环孢菌素。p-糖蛋白抑制剂通过抑制本发明的SARS-CoV-2冠状病毒抑制剂外流出细胞而起作用。抑制基于p-糖蛋白的外流将防止SARS-CoV-2冠状病毒抑制剂由于p-糖蛋白外流而降低细胞内浓度。抑制p-糖蛋白外流将导致SARS-CoV-2冠状病毒抑制剂的细胞内浓度较高。用本发明的SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂和p-糖蛋白抑制剂对感染SARS-CoV-2冠状病毒的患者施用可通过增加SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂的细胞内浓度来降低达到有效剂量所需的SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂的量。
可用于增加哺乳动物对本发明化合物的暴露的药剂包括可充当细胞色素P450(CYP450)酶的至少一种同种型的抑制剂的那些。可能被有益抑制的CYP450同工型包括、但不限于CYP1A2、CYP2D6、CYP2C9、CYP2C19和CYP3A4。本发明方法中使用的化合物包括可以是CYP3A4底物并被CYP3A4代谢的化合物。向感染SARS-CoV-2冠状病毒的患者施用为CYP3A4底物的SARS-CoV-2冠状病毒抑制剂(例如SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂)和CYP3A4抑制剂(例如利托那韦、奈非那韦或地拉韦定),将通过CYP3A4减少SARS-Cov-2冠状病毒抑制剂的代谢。这将导致SARS-CoV-2冠状病毒抑制剂的清除率降低并增加SARS-Cov-2冠状病毒抑制剂的血浆浓度。清除率降低和血浆浓度升高可能导致SARS-CoV-2冠状病毒抑制剂的有效剂量较低。
可在本发明的方法中与SARS-CoV-2抑制剂组合使用的其它治疗剂包括以下:
PLpro抑制剂:阿匹莫德、EIDD-2801、利巴韦林、伐昔洛韦、β-胸苷、阿司帕坦、氧烯洛尔、多西环素、醋奋乃静、碘普胺、核黄素、瑞普特罗、2,2′-环胞苷、氯霉素、氯苯甘油氨酯、左羟丙哌嗪、头孢孟多、氟尿苷、替吉环素、培美曲塞、L(+)-抗坏血酸、谷胱甘肽、橙皮素、腺苷蛋氨酸、马索罗酚、异维A酸、丹曲林、柳氮磺吡啶抗细菌药、水飞蓟宾、尼卡地平、西地那非、桔梗皂苷、白杨素、新橙皮苷、黄芩苷、Sugetriol-3,9-二乙酸酯、(-)-表没食子儿茶素没食子酸酯、Phaitanthrin D、2-(3,4-二羟基苯基)-2-[[2-(3,4-二羟基苯基)-3,4-二氢-5,7-二羟基-2H-1-苯并吡喃-3-基]氧基]-3,4-二氢-2H-1-苯并吡喃-3,4,5,7-四醇、2,2-二(3-吲哚基)-3-吲哚酮、(S)-(1S,2R,4aS,5R,8aS)-1-甲酰氨基-1,4a-二甲基-6-亚甲基-5-((E)-2-(2-氧代-2,5-二氢呋喃-3-基)乙烯基)十氢萘-2-基-2-氨基-3-苯基丙酸酯、白皮杉醇(Piceatannol)、迷迭香酸和木兰醇。
3CLpro抑制剂:赖甲环素、氯己定、阿夫唑嗪、西司他丁、法莫替丁、阿米三嗪、普罗加胺、奈帕芬胺(Nepafenac)、卡维地洛、氨普那韦、替吉环素、孟鲁司特、胭脂红酸、含羞草氨酸、黄素、叶黄素、头孢匹胺、非奈西林、坎沙曲、尼卡地平、戊酸雌二醇、吡格列酮、考尼伐坦、替米沙坦、多西环素、土霉素、5-((R)-1,2-二硫杂环戊烷-3-基)戊酸(1S,2R,4aS,5R,8aS)-1-甲酰氨基-1,4a-二甲基-6-亚甲基-5-((E)-2-(2-氧代-2,5-二氢呋喃-3-基)乙烯基)十氢萘-2-基酯、Betulonal、白杨素-7-O-β-葡萄糖醛酸苷、穿心莲内酯苷、2-硝基苯甲酸(1S,2R,4aS,5R,8aS)-1-甲酰氨基-1,4a-二甲基-6-亚甲基-5-((E)-2-(2-氧代-2,5-二氢呋喃-3-基)乙烯基)十氢萘-2-基酯、2β-羟基-3,4-裂环-木栓烷内酯-27-酸(S)-(1S,2R,4aS,5R,8aS)-1-甲酰氨基-1,4a-二甲基-6-亚甲基-5-((E)-2-(2-氧代-2,5-二氢呋喃-3-基)乙烯基)十氢萘-2-基-2-氨基-3-苯基丙酸酯、Isodecortinol、啤酒甾醇、橙皮苷、新橙皮苷、Andrograpanin、苯甲酸2-((1R,5R,6R,8aS)-6-羟基-5-(羟基甲基)-5,8a-二甲基-2-亚甲基十氢萘-1-基)乙酯、大波斯菊苷(Cosmosiin)、Cleistocaltone A,2,2-二(3-吲哚基)-3-吲哚酮、Biorobin、格尼迪木素、Phyllaemblinol、3,3′-二-O-没食子酸茶黄素酯、迷迭香酸、Kouitchenside I、齐墩果酸、豆甾-5-烯-3-醇、脱乙酰基centapicrin和Berchemol。
RdRp抑制剂:伐昔洛韦、氯己定、头孢布烯、非诺特罗、氟达拉滨、伊曲康唑、头孢呋辛、阿托伐醌、鹅去氧胆酸、色甘酸、泮库溴铵、可的松、替勃龙、新生霉素、水飞蓟宾、伊达比星溴隐亭、地芬诺酯、苄基青霉噻唑G(Benzylpenicilloyl G)、达比加群酯、Betulonal、格尼迪木素、2β,30β-二羟基-3,4-裂环-木栓烷内酯-27-内酯,14-脱氧-11,12-二脱氢穿心莲内酯、Gniditrin、3,3′-二-O-没食子酸茶黄素酯、(R)-((1R,5aS,6R,9aS)-1,5a-二甲基-7-亚甲基-3-氧代-6-((E)-2-(2-氧代-2,5-二氢呋喃-3-基)乙烯基)十氢-1H-苯并[c]氮杂环庚三烯-1-基)甲基2-氨基-3-苯基丙酸酯、2β-羟基-3,4-裂环-木栓烷内酯-27-酸、2-(3,4-二羟基苯基)-2-[[2-(3,4-二羟基苯基)-3,4-二氢-5,7-二羟基-2H-1-苯并吡喃-3-基]氧基]-3,4-二氢-2H-1-苯并吡喃-3,4,5,7-四醇、Phyllaemblicin B、14-羟基香附烯酮(14-hydroxycyperotundone)、穿心莲内酯苷、2-((1R,5R,6R,8aS)-6-羟基-5-(羟基甲基)-5,8a-二甲基-2-亚甲基十氢萘-1-基)乙基苯甲酸酯、穿心莲内酯、Sugetriol-3,9-二乙酸酯、黄芩苷、5-((R)-1,2-二硫杂环戊烷-3-基)戊酸(1S,2R,4aS,5R,8aS)-1-甲酰氨基-1,4a-二甲基-6-亚甲基-5-((E)-2-(2-氧代-2,5-二氢呋喃-3-基)乙烯基)十氢萘-2-基酯、1,7-二羟基-3-甲氧基呫吨酮、1,2,6-三甲氧基-8-[(6-O-β-D-吡喃木糖基-β-D-吡喃葡萄糖基)氧基]-9H-呫吨-9-酮,和1,8-二羟基-6-甲氧基-2-[(6-O-β-D-吡喃木糖基-β-D-吡喃葡萄糖基)氧基]-9H-呫吨-9-酮、8-(β-D-吡喃葡萄糖基氧基)-1,3,5-三羟基-9H-呫吨-9-酮。
可以用在本发明的方法中的另外的治疗剂包括地奥司明、橙皮苷、MK-3207、维奈托克、双氢麦角汀、勃拉嗪、R428、Ditercalinium、依托泊苷、替尼泊苷、UK-432097、伊立替康、Lumacaftor、维帕他韦、Eluxadoline、Ledipasvir、洛匹那韦/利托那韦+利巴韦林、Alferon和泼尼松。可用在本发明的方法中的其它额外药剂包括地塞米松、阿奇霉素和瑞德西韦以及波普瑞韦、尤米诺韦和法维拉韦。
可以用在本发明的方法中的其它额外药剂包括命名为11r、13a和13b的α-酮酰胺化合物,如下所示,如在Zhang,L.;Lin,D.;Sun,X.;Rox,K.;Hilgenfeld,R.;X-rayStructure of Main Protease of the Novel Coronavirus SARS-CoV-2Enables Designofα-Ketoamide Inhibitors;bioRxiv preprint doi:https://doi.org/10.1101/2020.02.17.952879中描述的
可以用在本发明的方法中的其它药剂包括RIG 1途径活化剂比如在美国专利号9,884,876中描述的那些。
其它额外治疗剂包括蛋白酶抑制剂比如描述于Dai W,Zhang B,Jiang X-M,etal.Structure-based design of antiviral drug candidates targeting the SARS-CoV-2 main protease.Science.2020;368(6497):1331-1335的那些,包括化合物比如下文所示的化合物和指定为DC402234的化合物
本发明的又一实施方式是在患者中治疗COVID-19的方法,其中除了给予本发明化合物(即式I、I’或I"化合物或其溶剂化物或水合物或者所述化合物或其溶剂化物或水合物的药学上可接受的盐)之外,还给予额外的试剂并且所述额外的试剂选自抗病毒剂比如瑞德西韦,galidesivir,法匹拉韦/阿韦法韦,molnupiravir(MK-4482/EIDD 2801),AT-527,AT-301,BLD-2660,法维拉韦,卡莫司他,SLV213恩曲他滨/替诺福韦,克来夫定,达塞曲匹,波普瑞韦和ABX464,糖皮质激素类比如地塞米松和氢化可的松,恢复期血浆,重组人血浆比如凝溶胶蛋白(Rhu-p65N),单克隆抗体比如regdanvimab(Regkirova),ravulizumab(Ultomiris),VIR-7831/VIR-7832,BRII-196/BRII-198,COVI-AMG/COVI DROPS(STI-2020),bamlanivimab(LY-CoV555),mavrilimab,leronlimab(PRO140),AZD7442,lenzilumab,英利昔单抗,阿达木单抗,JS 016,STI-1499(COVIGUARD),lanadelumab(Takhzyro),卡那奴单抗(Ilaris),gimsilumab和otilimab,抗体混合物比如casirivimab/imdevimab(REGN-Cov2),重组融合蛋白质比如MK-7110(CD24Fc/SACCOVID),抗凝剂比如肝素和阿哌沙班,IL-6受体激动剂比如托珠单抗(Actemra)和sarilumab(Kevzara),PIKfyve抑制剂比如二甲磺酸apilimod,RIPK1抑制剂比如DNL758,DC402234,VIP受体激动剂比如PB1046,SGLT2抑制剂比如达格列净,TYK抑制剂比如abivertinib,激酶抑制剂比如ATR-002,bemcentinib,acalabrutinib,洛呲莫德,baricitinib和tofacitinib,H2阻断剂比如法莫替丁,驱蠕虫剂比如氯硝柳胺,弗林蛋白酶抑制剂比如二脒那嗪。
术语"SARS-Cov-2抑制剂"是指本文描述的任何SARS-CoV-2相关的冠状病毒3C样蛋白酶抑制剂化合物或其药学上可接受的盐、水合物、前药、活性代谢物或溶剂化物,或以任何方式抑制SARS-CoV-2的复制的化合物。
术语"干扰或预防"细胞中SARS-CoV-2相关的冠状病毒("SARS-CoV-2")病毒复制是指,与未用本发明化合物处理的细胞相比,在用本发明化合物处理的细胞中减少SARS-CoV-2复制或子代病毒所需SARS-CoV-2组分的产生。确定SARS-CoV-2病毒复制是否减少的简单而方便的检测包括ELISA检测受试者血液中抗SARS-CoV-2抗体的存在、缺失或减少(Nasoff等人,PNAS 88:5462-5466,1991),RT-PCR(Yu,等人,in Viral Hepatitis andLiver Disease 574-577,Nishioka,Suzuki and Mishiro(Eds.);Springer-Verlag,Tokyo,1994年)。这样的方法是本领域普通技术人员众所周知的。可替换地,可以分离转导和感染的"对照"细胞的总RNA,并通过斑点印迹或RNA印迹进行分析,并用SARS-CoV-2特异性DNA进行探测,以确定SARS-CoV-2复制是否减少。可替换地,SARS-CoV-2蛋白表达的减少也可以作为抑制SARS-CoV-2复制的指标。与对照细胞相比,SARS-CoV-2复制减少超过50%通常可以量化对SARS-CoV-2复制的预防。
如果本发明方法中使用的SARS-CoV-2抑制剂化合物是碱,则可以通过本领域已知的任何合适的方法制备所需的盐,包括用以下酸处理游离碱:无机酸(比如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸等),或有机酸(比如乙酸、马来酸、琥珀酸、扁桃酸、富马酸、丙二酸、丙酮酸、草酸、羟乙酸、水杨酸、吡喃糖苷酸(比如葡糖醛酸或半乳糖醛酸)、α-羟酸(比如柠檬酸或酒石酸)、氨基酸(比如天冬氨酸或谷氨酸)、芳香酸(比如苯甲酸或肉桂酸)、磺酸(比如对甲苯磺酸或乙磺酸)等。
如果本发明方法中使用的SARS-CoV-2抑制剂化合物是酸,则可以通过本领域已知的任何合适的方法制备所需的盐,包括用无机或有机碱(例如胺(伯胺、仲胺或叔胺))、碱金属氢氧化物或碱土金属氢氧化物处理游离酸。合适的盐的说明性实例包括衍生自氨基酸(例如甘氨酸和精氨酸)、氨、伯胺、仲胺、叔胺和环胺(例如哌啶、吗啉和哌嗪)的有机盐,以及衍生自钠、钙、钾、镁、锰、铁、铜、锌、铝和锂的无机盐。
在SARS-CoV-2抑制剂化合物、前药、盐或溶剂化物为固体的情况下,本领域技术人员理解,本发明方法中使用的化合物、前药、盐和溶剂化物可以以不同的多晶型物或晶体形式存在,所有这些都意图在本发明和特定分子式的范围内。此外,本发明方法中使用的化合物、盐、前药和溶剂化物可以作为互变异构体存在,所有这些都在本发明的广泛范围内。
增溶剂也可以与本发明的化合物一起使用以增加化合物在水的生理上可接受的溶液中的溶解度。这些增溶剂包括环糊精、丙二醇、二乙基乙酰胺、聚乙二醇、吐温、乙醇和胶束形成剂。提供的增溶剂是环糊精,特别是β环糊精,且尤其是羟丙基β环糊精和磺丁基醚β环糊精。
在某些情况下,在本发明的方法中使用的SARS-CoV-2抑制剂化合物、盐、前药和溶剂化物可以具有手性中心。当手性中心存在时,化合物、盐、前药和溶剂化物可以作为单一立体异构体、外消旋体和/或对映异构体和/或非对映异构体的混合物存在。所有这些单一的立体异构体、外消旋体和它们的混合物都在本发明的广泛范围内。
如本领域技术人员通常理解的,光学纯的化合物是对映体纯的化合物。本文中使用的术语"光学纯"旨在表示包含至少足够活性的化合物。优选地,产生具有所需药理学纯的本发明化合物的光学纯量的单一对映异构体包含至少90%的单一异构体(80%对映异构体过量),更优选地至少95%(90%e.e.),甚至更优选地至少97.5%(95%e.e.),和最优选地至少99%(98%e.e.)。
除非另有说明,否则本文所用的术语"治疗"意指逆转、减轻、抑制或预防这样的术语所适用的障碍或病况的进展、或这样的障碍或病况的一种或多种症状。除非另有说明,否则本文所用的术语"治疗"是指治疗(如上定义的"治疗")的行为。在本发明的一个优选实施方案中,"治疗"或"处理"是指至少减轻人的疾病病况,即通过抑制SARS-CoV-2 3C样蛋白酶的活性而减轻,该蛋白酶是SARS-CoV-2的主要蛋白酶,是COVID-19的病原体。对于患有COVID-19的患者,发烧、疲劳和干咳是该病的主要表现,而鼻塞、流鼻涕和其它上呼吸道症状很少见。北京市疾病预防控制中心表示,典型的COVID-19病例有一个逐步加重的过程。根据疾病的严重程度将COVID-19分为轻型、正常、重型和危重型National HealthCommission of the People’s Republic of China.Diagnosis and Treatment ofPneumonia Caused by 2019-nCoV(Trial Version 4).可在线获得:http://www.nhc.gov.cn/jkj/s3577/202002/573340613ab243b3a7f61df260551dd4/files/c791e5a7ea5149f680fdcb34dac0f54e.pdf:(1)轻度病例-轻度临床症状,胸部计算机断层扫描(CT)未发现肺炎;(2)正常病例--有发热、呼吸道症状、发现有肺炎影像学表现的患者;(3)重型病例--以下三种情况之一:呼吸窘迫、呼吸频率≥30次/分钟(静息状态,指氧饱和度≤93%)、动脉血氧分压(PaO2)/吸氧浓度(FiO2))≤300mmHg(1mm Hg=0.133kPa);(4)危重病例--以下三种情况之一:呼吸衰竭和需要机械通气、休克或其它需要重症监护病房的器官相关衰竭。目前的临床数据显示,大多数死亡发生在老年患者中。但是,在具有独特因素的年轻人中记录了严重病例,特别是那些患有慢性疾病的人,例如糖尿病或乙型肝炎。那些长期使用激素或免疫抑制剂和免疫功能下降的人很可能会受到严重感染。
减轻冠状病毒疾病病况例如COVID-19的治疗方法包括以任何常规可接受的方式使用一种或多种本发明化合物。根据本发明的某些优选实施方案,将本发明方法中使用的一种或多种化合物施用于有需要的哺乳动物,例如人。优选地,有此需要的哺乳动物感染了冠状病毒,例如COVID-19的病原体,即SARS-CoV-2。
本发明还包括预防方法,包括将有效量的本发明的SARS-CoV-2抑制剂或其药学上可接受的盐、前药、药学活性代谢物或溶剂化物施用于哺乳动物,例如处于SARS-CoV-2感染危险中的人。根据某些优选实施方案,将有效量的一种或多种本发明化合物或其药学上可接受的盐、前药、药学活性代谢物或溶剂化物施用于有感染SARS-CoV-2(COVID-19的病原体)风险的人。本发明的预防方法包括以任何常规可接受的方式使用本发明中的一种或多种化合物。
本发明方法中使用的某些化合物例如地塞米松、阿奇霉素和瑞德西韦是已知的并且可以通过本领域已知的方法制备。
最近的证据表明,新型冠状病毒SARS-Cov-2是COVID-19的病原体。SARS-CoV-2冠状病毒的核苷酸序列以及最近确定的L-和S-亚型最近已确定并公开可用。
抑制剂化合物作为SARS-CoV-2病毒活性抑制剂的活性可以通过本领域可用的任何合适方法测量,包括体内和体外测定。本发明化合物作为冠状病毒3C样蛋白酶活性(例如SARS-CoV-2冠状病毒的3C样蛋白酶)抑制剂的活性可以通过本领域技术人员已知的任何合适方法测量,包括体内和体外测定。用于活性测量的合适测定的例子包括本文所述的抗病毒细胞培养测定以及本文描述的抗蛋白酶测定,例如实验部分中描述的测定。
SARS-CoV-2抑制剂化合物及其药学上可接受的前药、盐、活性代谢物和溶剂化物的施用可根据本领域技术人员可获得的任何可接受的施用模式进行。合适的施用方式的说明性实例包括口服、鼻、肺、胃肠外、局部、静脉内、注射、透皮和直肠。优选口服、静脉内、皮下和经鼻递送。
SARS-CoV-2抑制剂可以任何合适的药物形式作为药物组合物施用。合适的药物形式包括固体、半固体、液体或冻干制剂,例如片剂、粉末、胶囊剂、栓剂、混悬剂、脂质体和气雾剂。SARS-CoV-2抑制剂可以使用多种方法中的任一种制备成溶液。例如,SARS-CoV-2抑制剂可以用酸(例如1M HCl)溶解,并用足量的5%右旋糖水溶液(D5W)稀释,以产生所需的SARS-Cov-2-抑制剂终浓度(例如,约15mM)。可替换地,可以使用含有约15mM HCl的D5W溶液来提供适当浓度的SARS-CoV-2抑制剂溶液。此外,SARS-Cov-2抑制剂可以使用例如羧甲基纤维素(CMC)的1%溶液制备为混悬剂。
制备药物组合物的合适药物形式的可接受方法是已知的或可由本领域技术人员常规确定。例如,药物制剂可以按照药物化学家的常规技术制备,包括以下步骤:例如混合、制粒和在需要时压制片剂形式,或混合、填充和适当时溶解成分,以得到用于静脉内、口服、胃肠外、局部、阴道内、鼻内、支气管内、眼内、耳内和/或直肠施用的所需产品。
一般来说,本发明化合物以有效治疗如本文描述的病况的量给予。本发明化合物通过任何适宜途径,以适应该途径的药物组合物形式,和以对希望治疗有效的剂量的给予。治疗医学病况的发展所需的化合物的治疗有效剂量由本领域普通技术人员用医学领域中熟悉的临床前和临床途径容易地确定。
本发明化合物可以口服给予。口服给药可以牵涉吞咽,从而化合物进入胃肠道,或者可以使用颊或舌下给药,由此化合物从口腔直接进入血流。
在又一实施方式中,本发明化合物还可以直接给予进入血流,进入肌肉或进入内脏器官。适宜的肠胃外给药手段包括静脉内,动脉内,腹腔内,鞘内,心/脑室内,尿道内,胸骨内,颅内,肌内和皮下。肠胃外给药的适宜装置包括针(包括显微针)注射器,无针注射器和输注技术。
在又一实施方式中,本发明化合物还可以局部给予皮肤或粘膜,也即皮肤或经皮给予。在又一实施方式中,本发明化合物还能够鼻内或通过吸入给予。在又一实施方式中,本发明化合物可以直肠或阴道给予。在又一实施方式中,本发明化合物还可以直接给予眼或耳。
化合物和/或含有化合物的组合物的给药方案基于各种因素,包括患者的类型,年龄,体重,性别和医学情况;病况的严重性;给药途径;和所用具体化合物的活性。从而给药方案可以宽泛地变化。约0.01mg至约100mg每千克体重每天量级的剂量水平用于治疗上文指出的病况。在一种实施方式中,本发明化合物的总日剂量(在单一或分开剂量中给予)一般是约0.01至约100mg/kg。在又一实施方式中,本发明化合物的总日剂量是约0.1至约50mg/kg,并且在又一实施方式中是约0.5至约30mg/kg(即mg本发明化合物每kg体重)。在一种实施方式中,剂量给药是0.01至10mg/kg/天。在又一实施方式中,剂量给药是0.1至1.0mg/kg/天。剂量单元组合物可以含有所述量或其约数以构成日剂量。在许多情况下,化合物给药将在一天中重复多次(一般不大于4次)。如果希望,一般可以用每天多次给药来增加总日剂量。
对于口服给药,组合物可以以片剂形式提供,其含有约0.01mg至约500mg的活性成分,或在又一实施方式中约1mg至约100mg的活性成分。对于经静脉内,剂量范围在恒定速率输注期间可以是约0.1至约10mg/kg/分。
根据本发明的适宜患者包括哺乳动物患者。根据本发明的哺乳动物包括但不限于犬,猫,牛,羊,马,羊,猪,啮齿类,兔类,灵长类等,并且涵盖子宫中的哺乳动物。在一种实施方式中,人类是适宜的患者。人类患者可以是任一性别和处于任何发育阶段。
在又一实施方式中,本发明包含一种或多种本发明化合物用于制备药物的用途,所述药物用于治疗本文所述的病况。
对于治疗上文所述的病况,本发明化合物能够作为化合物本身给予。另选地,药学上可接受的盐适于医学应用,原因是它们相对母体化合物更高的水溶解度。
在又一实施方式中,本发明包含药物组合物。所述药物组合物包含随药学上可接受的载体提供的本发明化合物。药学上可接受的载体涵盖向患者给药可接受的任何适宜剂型。载体能够是固体、液体或两者并且可以与化合物配制为单元剂量组合物例如片剂,其能够含有0.05%至95%重量的活性化合物。本发明化合物可以与适宜聚合物偶联为可靶向的药物载体。还能够存在其它药理学活性物质。
本发明化合物可以通过任何适宜途径,优选呈适应上述途径的药物组合物形式,和以对希望治疗有效的剂量给予。例如,活性化合物和组合物可以口服,直肠,经肠胃外或局部给予。
固体剂型的口服给药可以例如以离散单元比如硬或软胶囊,丸剂,扁囊剂,糖锭,或片剂存在,各自含有预先确定量的至少一种本发明化合物。在又一实施方式中,口服给药可以呈粉末或颗粒形式。在又一实施方式中,口服剂型是舌下形式例如糖锭。在所述固体剂型中,本发明化合物通常与一种或多种助剂组合。所述胶囊或片剂可以含有控释配制剂。在胶囊、片剂和丸剂的情况下,剂型也可以包含缓冲剂或可以用肠衣制备。
在又一实施方式中,口服给药可以呈液体剂型。用于口服给药的液体剂型包括例如药学上可接受的乳液,溶液,悬浮液,糖浆剂和酏剂,其含有本领域一般使用的惰性稀释剂(例如水)。所述组合物也可以包含助剂,比如润湿剂,乳化剂,助悬剂,调味剂(例如甜味剂)和/或芳香剂。
在又一实施方式中,本发明包含肠胃外剂型。"肠胃外给药"包括例如皮下注射,静脉内注射,腹腔内注射,肌内注射,胸骨内注射,和输注。可注射的制剂(例如无菌可注射水性或油性悬浮液)可以根据本领域已知用适宜的分散剂,润湿剂和/或助悬剂来配制。
在又一实施方式中,本发明包含局部剂型。"局部给药"包括例如经皮给药,比如经由透皮贴剂或电离子透入装置给药,眼内给药,或鼻内或吸入给药。用于局部给药的组合物也包括例如局部凝胶,喷雾剂,软膏剂和霜剂。局部配制剂可以包括增强活性成分通过皮肤或其它影响区域吸收或穿透的化合物。在本发明化合物通过透皮装置给予的情况下,将用储库和多孔膜类型的或固体基质变型的贴剂实现给药。用于该意图的典型配制剂包括凝胶,水凝胶,洗剂,溶液,霜剂,软膏剂,撒施粉末,敷料,泡沫,薄膜,皮肤贴剂,糯米纸囊剂(wafer),植入物,海绵,纤维,绷带和微乳剂。还可以使用脂质体。典型的载体包括醇,水,矿物油,液体凡士林,白凡士林,甘油,聚乙二醇和丙二醇。可以掺入穿透增强剂;参见例如Finnin和Morgan的J.Pharm.Sci.,88(10),955-958(1999年10月)。
适于局部给予眼的配制剂包括例如滴眼剂,其中本发明化合物溶解或悬浮于适宜载体中。适于眼或耳给药的典型配制剂可以呈等渗、pH-调节的无菌盐水中的微粒化悬浮液或溶液的滴剂形式。适于眼和耳给药的其它配制剂包括软膏剂,生物可降解的(例如可吸收的凝胶海绵、胶原)和非生物可降解的(例如有机硅)植入物,糯米纸囊剂,镜片和粒状或囊状系统比如泡囊(niosomes)或脂质体。聚合物比如交联聚丙烯酸,聚乙烯醇,透明质酸,纤维质聚合物,例如羟丙基甲基纤维素、羟乙基纤维素或甲基纤维素,或杂多糖聚合物,例如胶凝糖胶,可以与防腐剂比如苯扎氯铵一起掺入。所述配制剂还可以通过电离子透入递送。
对于鼻内给药或吸入给药,本发明活性化合物从患者挤压或泵送的泵喷雾容器作为溶液或悬浮液形式或者从使用适宜推进剂的加压容器或雾化器作为气雾剂喷雾形式方便地递送。适于鼻内给药的配制剂一般地以下述形式给予:来自干燥粉末吸入器的干燥粉末(单独,作为混合物例如与乳糖的干燥共混物,或作为混合的组分颗粒例如与磷脂比如磷脂酰胆碱混合),或者来自加压容器、泵、喷雾、雾化器(优选用电流体动力学产生细雾的雾化器)或喷洒器的气雾剂喷雾,用或不用适宜的推进剂比如1,1,1,2-四氟乙烷或1,1,1,2,3,3,3-七氟丙烷。对于鼻内使用,粉末可以包含生物粘附剂,例如脱乙酰壳多糖或环糊精。
在又一实施方式中,本发明包含直肠剂型。所述直肠剂型可以呈例如栓剂形式。可可油是传统栓剂基,但可以视情况使用各种备择对象。
还可以使用药物领域已知的其它载体物质和给药模式。本发明的药物组合物可以通过药剂学的任何熟知技术比如有效的配制和给药程序来制备。关于有效的配制和给药程序的上述考虑是本领域熟知的且描述于标准教材当中。药物配制在例如Hoover,John E.,Remington’s Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pennsylvania,1975;Liberman et al.,Eds.,Pharmaceutical Dosage Forms,Marcel Decker,New York,N.Y.,1980;和Kibbe et al.,Eds.,Handbook of Pharmaceutical Excipients(3rd Ed.),American Pharmaceutical Association,Washington,1999中有讨论。
本发明化合物能够单独或与其它治疗剂组合用于治疗各种病况或疾病状态。本发明化合物和其它治疗剂可以同时(在相同剂型中或在分开的剂型中)或依次给予。两种或更多种化合物可以同时、并发或依次给予。额外地,同时给药可以进行如下:在给药之前混合化合物,或者在相同的时间点但在不同的解剖学位点或用不同的给药途径给予化合物。短语"并发给药"、"共同给药"、"同时给药"和"同时地给予"意味着组合给予化合物。
本发明包括本发明化合物和一种或多种额外治疗剂的组合的用途。如果给予活性剂的组合,那么它们可以依次或同时地、在分开的剂型中给予或在单一剂型中组合给予。相应地,本发明也包括药物组合物,其包含一定量的:(a)包含本发明化合物或所述化合物的药学上可接受的盐的第一试剂;(b)第二治疗剂;和(c)药学上可接受的载体。
根据预期用途,本发明的药物组合物还可以包括合适的赋形剂、稀释剂、媒介物和载体,以及其它药物活性剂。药物组合物中可以使用固体或液体药学上可接受的载体、稀释剂、媒介物或赋形剂。示例性固体载体包括淀粉、乳糖、硫酸钙二水合物、石膏粉、蔗糖、滑石粉、明胶、果胶、阿拉伯胶、硬脂酸镁和硬脂酸。示例性的液体载体包括糖浆、花生油、橄榄油、盐水溶液和水。载体或稀释剂可以包括合适的缓释材料,例如单硬脂酸甘油酯或二硬脂酸甘油酯,单独使用或与蜡一起使用。当使用液体载体时,制剂可以是糖浆剂、酏剂、乳剂、软明胶胶囊、无菌可注射液体(例如溶液)或非水性或水性液体悬浮液的形式。
一剂药物组合物可以包含至少治疗有效量的SARS-CoV-2抑制剂,并且优选由一个或多个药物剂量单位组成。可以通过任何已知的或合适的施用剂量方法将选择的剂量施用于需要通过抑制SARS-CoV-2相关冠状病毒活性介导的治疗的哺乳动物,例如人类患者,所述施用剂量方法包括局部施用,例如作为软膏或霜剂;口服施用;直肠施用,例如作为栓剂;通过注射胃肠外施用;静脉内施用;或连续通过阴道内、鼻内、支气管内、耳内或眼内输注。
短语"治疗有效量"和"有效量"旨在表示当施用于需要治疗的哺乳动物时,足以对通过抑制SARS-CoV-2病毒复制而减轻的损伤或疾病病况进行有效治疗的本发明药剂的量。本发明的方法中使用的给定SARS-CoV-2抑制剂的将是治疗有效的量将根据比如特定的SARS-CoV-2抑制剂、疾病病况及其严重程度、有此需要的哺乳动物的身份和特征的因素而变化,其量可由本领域技术人员常规确定。
应当理解,用于本发明药物组合物中的SARS-CoV-2抑制剂的实际剂量将根据所用特定药剂的性质、配制的特定组合物、施用方式和特定部位,以及所治疗的宿主和病况来选择。本领域技术人员可以使用常规剂量测定试验确定一组给定条件的最佳剂量。对于口服施用,例如,可以采用的剂量为从约0.01至约1000mg/kg体重,优选地从约0.1至约500mg/kg体重,且甚至更优选地从约1至约500mg/kg体重,以适当的时间间隔重复治疗疗程。对于静脉内施用,可以使用至多为每天5克的剂量。静脉内施用可以在一天中间歇性进行,也可以在24小时内连续进行。
本文中使用的术语"细胞色素P450-抑制量"和"细胞色素P450酶活性-抑制量"是指,在存在降低细胞色素P450酶或特定细胞色素P450酶同种型的活性所需的化合物的情况下,这种化合物降低细胞色素P450酶或特定细胞色素P450酶同种型的活性所需的量。可以通过本领域普通技术人员已知的方法和本文所述的方法确定特定化合物是否降低细胞色素P450酶活性,以及这样做所需的此类化合物的量。
冠状病毒复制和转录所需的蛋白功能由所谓的"复制酶"基因编码。两个重叠的多聚蛋白从该基因翻译而来,并被病毒蛋白酶广泛加工。冠状病毒主要或"3C样蛋白酶"在11个保守的域间连接处加工C-近端区域。"3C样"蛋白酶的名称源于冠状病毒酶与众所周知的小核糖核酸病毒3C蛋白酶之间的某些相似之处。这些包括底物偏好、使用半胱氨酸作为催化中的活性位点亲核试剂,以及它们推定的整体多肽折叠的相似性。将SARS-Cov-2相关冠状病毒3C样蛋白酶的氨基酸序列与其它已知冠状病毒(如SARS-CoV)的氨基酸序列进行比较,表明氨基酸序列具有大约96%的共享同源性。
蛋白酶切割位点中底物的氨基酸从N到C末端编号如下:-P3-P2-P1-P1’-P2’-P3’,在P1和P1'残基之间发生切割(Schechter&Berger,1967)。底物特异性主要由P2、P1和P1'位置决定。冠状病毒主要蛋白酶切割位点特异性高度保守,需要P1处的谷氨酰胺和P1'处的小氨基酸(Journal of General Virology,83,pp.595-599(2002))。
根据在下面反应方案1-3中所述的方法,可以制备本发明化合物。
下文提供的方案进一步说明和举例本发明化合物和制备所述化合物的方法。应理解本发明范围并不以任何方式受下述实施例和制剂的范围限制。在下述实施例中,具有单个手性中心的分子可以作为单个对映体或外消旋混合物存在。具有两个或更多个手性中心的那些分子可以作为单个对映体,两个对映体的外消旋或者其它混合物,或作为非对映体的各种混合物存在。所述对映体,外消旋体和非对映体可以通过本领域技术人员已知的方法获得和/或分离。本领域技术人员将认识到某些合成操作可以使立构中心差向异构化或外消旋化,并且可以选择合成条件来促进或阻碍所述差向异构化或外消旋化。
方案1说明如显示的制备式I化合物的合成程序,其中将式1的N-BOC甲基酯(WO2005/113580)转化为式3伯酰胺(N-BOC是N-叔丁氧羰基)。这可以实现直接如下:例如在密封容器中在溶剂比如甲醇或乙醇中用氨(NH3)处理,例如任选在添加剂比如氯化钙(CaCl2)或二甲醇镁Mg(OMe)2存在下进行。
方案1
式1化合物向式3化合物的转化还可以通过先转化为式2羧酸(WO2005/113580)来进行。在该情况下,式2化合物可以用本领域技术人员熟知的方法转化为式3化合物。例如,式2化合物可以用试剂比如O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU)、氯甲酸异丁酯、1-[3-(二甲基氨基)丙基]-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(EDCI)和羟基苯并三唑(HOBt)或1,1’-碳酰二咪唑(CDI)处理,其任选在碱比如N,N-二异丙基乙胺(DIEA)、4-甲基吗啉(NMM)或三乙胺(TEA)存在下进行,随后在碱比如N,N-二异丙基乙胺、4-甲基吗啉或三乙胺存在下用作为气体或反应相容性溶剂中的溶液给予的NH3或用NH3的盐比如乙酸铵或氯化铵处理。适宜的溶剂包括但不限于二氯甲烷(CH2Cl2),N,N-二甲基甲酰胺(DMF),四氢呋喃(THF),或乙腈(CH3CN)。
式3化合物可以用本领域技术人员熟知引起所述脱保护的方法进行N-脱保护以提供式4胺。频繁地使用酸性试剂比如氯化氢,甲磺酸或三氟乙酸,一般在反应相容性溶剂比如CH2Cl2,1,4-二噁烷,1,2-二氯乙烷或CH3CN中使用。本领域技术人员将理解式4化合物将频繁地作为酸加成盐获得。式4化合物可以然后通过在适当条件下用式5的N-保护的氨基酸化合物处理转化为式6化合物。所述方法是本领域技术人员熟知的,并且通常可以选择标准肽偶联条件。
式6化合物可以用本领域技术人员熟知引起所述脱保护的方法进行N-脱保护以提供式7胺。频繁地使用酸性试剂比如氯化氢,甲磺酸或三氟乙酸,一般在反应相容性溶剂比如CH2Cl2,1,4-二噁烷,1,2-二氯乙烷或CH3CN中使用。本领域技术人员将理解式7化合物将频繁地作为酸加成盐获得。式7化合物可以然后通过在适当条件下用式8羧酸化合物处理转化为式9化合物。所述方法是本领域技术人员熟知的。例如,在X=氯原子的情况下,羧酸化合物称为酰氯并且反应在碱存在下进行以消耗作为反应副产物形成的氢卤酸HX。适宜碱的实例包括但不限于叔胺比如4-甲基吗啉,2,6-二甲基吡啶或N,N-二异丙基乙胺,或者无机碱比如氧化镁(MgO),碳酸钠(Na2CO3)或碳酸氢钾(KHCO3)。适宜的溶剂包括但不限于CH2Cl2,DMF,THF或CH3CN。在X=OH的情况下,常规地使用试剂或试剂组合来促进式8羧酸化合物的反应。本领域技术人员可以选择使用例如碳二亚胺试剂比如1-[3-(二甲基氨基)丙基]-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(EDCI)或N,N’-二环己基碳二亚胺(DCC),任选在辅助亲核物质比如羟基苯并三唑(HOBt)或2-羟基吡啶-N-氧化物(HOPO)存在下使用。此外,在X=OH的情况下,本领域技术人员可以选择使用适于形成混合羧酸/碳酸酐的试剂比如CDI、氯甲酸异丁酯或乙酯,频繁地在碱比如上文描述的那些存在下使用。适宜的溶剂包括但不限于CH2Cl2,THF,或CH3CN。在X=OH的情况下,本领域技术人员一般使用的又一途径是将式8羧酸化合物用羧酰氯例如Me3CCOCl在碱比如上文描述的那些存在下处理以产生式R3C(O)O(O)CCMe3的混合羧酸酐。适宜的溶剂包括但不限于CH2Cl2,THF或CH3CN。在许多情况下,可能使用所希望的式8羧酸化合物的对称酸酐来进行反应,任选地在碱比如上文描述的那些存在下进行,在该情况下X=O(O)CR3且式8羧酸化合物因此是R3C(O)O(O)CR3。适宜的溶剂包括但不限于CH2Cl2,THF或CH3CN。
式9化合物可以通过在本领域技术人员熟知的脱水条件下处理而转化为式I化合物。频繁地,该脱水步骤可以用过量的三氟乙酸酐或磷酰氯实现,一般在碱比如吡啶,N,N-二异丙基乙胺,4-甲基吗啉或三乙胺存在下进行。
本领域技术人员将知晓式5的N-BOC保护的氨基酸是化学文献中已知的,是可商购的,并且可以由本领域技术人员使用充分建立的N-保护氨基酸合成程序制备自相应的已知且可商购的氨基酸。类似地,本领域技术人员将理解式8羧酸化合物可以是化学文献中已知的,和/或是可商购的,和/或可以通过公开的方法或通过公开方法的类似方法制备。
本领域技术人员将理解方案1中的成键步骤可以按适当的考虑以不同的顺序进行,例如示于方案2中。
方案2
在方案2中,式3化合物通过在本领域技术人员熟知的脱水条件下处理转化为式10化合物。频繁地该脱水步骤可以用过量的三氟乙酸酐或磷酰氯实现,一般在碱比如吡啶,N,N-二异丙基乙胺,4-甲基吗啉或三乙胺存在下进行。式10化合物用本领域技术人员熟知引起所述脱保护的方法进行N-脱保护以提供式11胺。频繁地使用酸性试剂比如氯化氢,甲磺酸或三氟乙酸,一般在反应相容性溶剂比如CH2Cl2,1,4-二噁烷,1,2-二氯乙烷或CH3CN中使用。本领域技术人员将理解式11化合物将频繁地作为酸加成盐获得。式11化合物可以然后通过在适当条件下用式12化合物处理转化为式I化合物。所述方法是本领域技术人员熟知的,并且通常可以选择标准肽偶联条件。式12化合物是化学文献中格外熟知的,并且本领域技术人员可以选择用与化学文献中描述的那些类似的方法制备任何给定的式12化合物。
本领域技术人员将理解方案1和2的成键步骤可以按适当的考虑以进一步不同的顺序进行,例如示于方案3中。
方案3
在方案3,式4化合物可以然后通过在适当条件下用式12化合物处理转化为式9化合物。所述方法是本领域技术人员熟知的,并且通常可以选择标准肽偶联条件。式12化合物是化学文献中格外熟知的,并且本领域技术人员可以选择用与化学文献中描述的那些类似的方法制备任何给定的式12化合物。式9化合物然后通过在本领域技术人员熟知的脱水条件下处理转化为式I化合物。频繁地该脱水步骤可以用过量的三氟乙酸酐或磷酰氯实现,一般在碱比如吡啶,N,N-二异丙基乙胺,4-甲基吗啉或三乙胺存在下进行。
本领域技术人员将认识到可以按适当的考虑适用方案1、2和3中的成键步骤和官能团操作的进一步排列。在选择步骤顺序中的所述排列是化学文献中熟知的并且本领域技术人员如果希望可以参考化学文献的进一步指导。本领域技术人员将认识到可以进行保护基团和试剂的其它选择以进行各种不同的转化。
实施例
实验程序
下文举例说明本发明的各种化合物的合成。单独地或与本领域通常已知的技术组合地使用在这些实施例中举例说明的方法,可以制备在本发明范围内的额外化合物。在这些制备和实施例部分中的全部起始原料是商购可得的,或可以通过本领域已知的或如本文中所述的方法制备。
除非另外指出,在氮或氩气气氛下使用连续搅拌进行所有反应。当适当时,使用热枪在动态真空下干燥反应设备,并采用无水溶剂(Sure-SealTM产品来自Aldrich ChemicalCompany,Milwaukee,威斯康辛州或DriSolvTM产品来自EMD Chemicals,Gibbstown,NJ)。在某些情况下,使市售溶剂穿过填充了分子筛的柱,直到达到下述水QC标准:a)<100ppm的二氯甲烷、甲苯、N,N-二甲基甲酰胺和四氢呋喃;b)<180ppm的甲醇、乙醇、1,4-二氧杂环己烷和二异丙胺。对于非常敏感的反应,用金属钠、氢化钙或分子筛进一步处理溶剂,并且在即将使用前蒸馏。其它市售溶剂和试剂不经进一步纯化地使用。对于参照在其它实施例或方法中的程序的合成,反应条件(反应时间和温度)可以变化。通常将产品在真空下干燥,然后转移至进一步反应或进行生物学试验。/>
当指出时,使用Biotage Initiator或Personal Chemistry Emrys Optimizer微波通过微波辐射加热反应物。使用薄层色谱法(TLC)、液相色谱法-质谱法(LCMS)、高效液相色谱法(HPLC)和/或气相色谱法-质谱法(GCMS)分析监测反应进程。在具有荧光指示剂(254nm激发波长)的预包被的硅胶平板上进行TLC,并在紫外线下和/或用I2、KMnO4、CoCl2、磷钼酸和/或钼酸铵铈染料显影。在Agilent 1100Series仪器上获取LCMS数据,其具有LeapTechnologies自动采样器,Gemini C18柱,乙腈/水梯度,和三氟乙酸、甲酸或氢氧化铵调节剂。在100-1200Da以阳性和阴性离子模式使用Waters ZQ质谱仪扫描分析柱洗脱液。也使用其它类似的仪器。通常在Agilent 1100 Series仪器上获取HPLC数据,使用指示的柱、乙腈/水梯度、和三氟乙酸或氢氧化铵调节剂。使用具有HP 6890注射器、HP-1柱(12m x 0.2mm x0.33μm)和氦载气的Hewlett Packard 6890烘箱获取GCMS数据。使用电子电离,在HP 5973质量选择性检测器(扫描50-550Da)上分析样品。使用Isco CombiFlash Companion,AnaLogix IntelliFlash 280,Biotage SP1,或Biotage Isolera One仪器和预填充的IscoRediSep或Biotage Snap硅胶(silica)柱,通过中效液相色谱法(MPLC)进行纯化。通过手性超临界流体色谱法(SFC)进行手性纯化,通常使用Berger或Thar仪器;柱比如CHIRALPAK-AD、-AS、-IC、Chiralcel-OD或-OJ柱;和具有甲醇、乙醇、2-丙醇或乙腈的CO2混合物,其为单独的或使用三氟乙酸或丙烷-2-胺调节。使用紫外检测触发级分收集。对于合成,参考在其它实施例或方法中的程序,纯化可以变化:一般而言,选择用于洗脱液/梯度的溶剂和溶剂比以提供适当的Rf或保留时间。
从LCMS分析报告质谱法数据。通过大气压化学电离(APCI)、电喷射电离(ESI)、电子碰撞电离(EI)或电子散射电离(ES)源进行质谱法(MS)。将质子核磁性光谱法(1H NMR)化学位移以相对于四甲基硅烷的百万份数给出,并记录在300、400、500或600MHz Varian、Bruker或Jeol波谱仪上。以参照氘化溶剂残余峰(氯仿,7.26ppm;CD2HOD,3.31ppm;乙腈-d2,1.94ppm;二甲亚砜-d5,2.50ppm;DHO,4.79ppm)的百万份数(ppm,δ)表达化学位移。峰形状被描述如下:s,单峰;d,双峰;t,三重峰;q,四重峰;quin,五重峰;m,多重峰;br s,宽单峰;app,明显。通常如上所述在Berger分析仪器上获取分析SFC数据。使用1dm池子在PerkinElmer型343旋光计上获取旋光度数据。由Quantitative Technologies Inc.进行微分析,并且是在计算值的0.4%内。
除非另外指出,在室温(约23摄氏度)进行化学反应。
除非另外指出,商业得到所有反应物且不经进一步纯化地使用,或使用文献中已知的方法制备。
术语"浓缩"、"蒸发"和"在真空中浓缩"表示用小于60℃的浴温度在旋转蒸发器上在减压下除去溶剂。缩写"min"和"h"分别代表"分钟"和"小时"。术语"TLC"表示薄层色谱法,"室温或环境温度"是指18-25℃之间的温度,"GCMS"表示气相色谱法-质谱法,"LCMS"表示液相色谱法-质谱法,"UPLC"表示超效液相色谱法,"HPLC"表示高效液相色谱法,和"SFC"表示超临界流体色谱法。
可以在Parr振荡器中在增压氢气下进行氢化,或在Thales-nano H-Cube流式氢化设备中在全氢和1-2mL/min之间的流速在指定的温度进行。
使用在程序中指出的方法,测量HPLC、UPLC、LCMS、GCMS和SFC保留时间。
在某些实施例中,进行手性分离以分离本发明的某些化合物的对映异构体或非对映异构体(在一些实施例中,分离的对映异构体根据其洗脱顺序命名为ENT-1和ENT-2;类似地,分离的非对映异构体指定为DIAST-1和DIAST-2,根据它们的洗脱顺序)。在一些实施例中,使用旋光计测量对映异构体的旋光度。根据其观察到的旋光数据(或其比旋光数据),具有顺时针旋光的对映异构体被命名为(+)-对映异构体,且具有逆时针旋光的对映异构体被命名为(-)-对映异构体。外消旋的化合物通过绘制的或描述的立体化学的缺失来指示,或通过邻近结构的(±)的存在来指示;在该后一种情况下,指示的立体化学代表构成外消旋混合物的两种对映异构体中的仅一种。
使用由ACD/ChemSketch 2019.1.1,File Version C05H41,Build 110712(Advanced Chemistry Development,Inc.,Toronto,Ontario,加拿大)提供的命名约定,命名下面描述的化合物和中间体。由ACD/ChemSketch 2019.1.1提供的命名约定是本领域技术人员众所周知的,且据信由ACD/ChemSketch 2019.1.1提供的命名约定通常符合IUPAC(International Union for Pure and Applied Chemistry)有机化学命名推荐和CASIndex规则。
实施例1
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(1)
步骤1.合成(1R,2S,5S)-3-[N-(叔丁氧羰基)-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯(C1)。
将0℃的N-(叔丁氧羰基)-L-缬氨酸(69.7g,321mmol)的乙腈和N,N-二甲基甲酰胺(10:1,1.10L)混合物溶液用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;122g,321mmol),随后N,N-二异丙基乙胺(127mL,729mmol)处理。在反应混合物已搅拌5分钟之后,加入(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯盐酸盐(60.0g,292mmol),和在0℃继续搅拌1小时。反应混合物然后用柠檬酸水溶液(1N;50mL)和水(100mL)稀释,搅拌2分钟,和减压浓缩为初始体积的大约1/2。所得混合物在乙酸乙酯与水之间分配,水层用乙酸乙酯萃取三次。经合并的有机层然后用水洗涤三次和用饱和氯化钠水溶液洗涤一次,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物在最低量的乙酸乙酯中搅拌,然后过滤;不溶物质用乙酸乙酯洗涤直至其为白色。减压浓缩经合并的滤液然后进行硅胶色谱法(洗脱液:1:1乙酸乙酯/庚烷),提供C1,是黄色油状物。收率:109g,定量。LCMSm/z 369.3[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ5.08(d,J=9.6Hz,1H),4.45(s,1H),4.11(dd,J=9.7,7.8Hz,1H),3.95(d,AB四重峰的一半,J=10.1Hz,1H),3.86(dd,ABX体系的组成部分,J=10.2,4.8Hz,1H),3.74(s,3H),2.04-1.93(m,1H),1.50-1.41(m,2H),1.40(s,9H),1.04(s,3H),1.00(d,J=6.8Hz,3H),0.95(d,J=6.8Hz,3H),0.93(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-L-缬氨酰基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯,盐酸盐(C2)。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;15mL,60mmol)溶液加入0℃的C1(1.00g,2.71mmol)的乙酸乙酯(50mL)溶液。在0℃搅拌反应混合物2小时,然后加入额外的氯化氢1,4-二噁烷溶液(4M;10mL,40mmol),在0℃继续搅拌3小时,然后在室温下进行1小时。反应混合物然后用氯化氢的1,4-二噁烷(4M;10mL,40mmol)溶液和甲醇(15mL)处理,在室温下搅拌过夜。减压浓缩提供C2,是胶状物;该物质用于后续化学反应而不额外纯化,和假定反应定量。LCMS m/z 269.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.24(br s,3H),4.27(s,1H),3.81-3.61(m,3H),3.67(s,3H),2.21-2.06(m,1H),1.63-1.55(m,1H),1.49(d,AB四重峰的组成部分,J=7.6Hz,1H),1.09-0.88(m,12H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯(C3)。
将三乙胺(1.55mL,11.1mmol)加入0℃的C2(1.0g,3.3mmol)的二氯甲烷(37mL)溶液,随后在30分钟内滴加三氟乙酸酐(0.57mL,4.0mmol)。在0℃搅拌反应混合物30分钟,然后将其用二氯甲烷(100mL)稀释,用10%硫酸氢钾水溶液(50mL)和饱和氯化钠水溶液(30mL)依次洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C3,是浅黄色油状物。收率:1.2g,3.3mmol,定量。LCMS m/z 365.2[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.04(br d,J=8.8Hz,1H),4.54(dd,J=8.9,6.3Hz,1H),4.46(s,1H),3.91(dd,J=10.1,5.0Hz,1H),3.80-3.73(m,1H),3.76(s,3H),2.25-2.13(m,1H),1.55-1.47(m,2H),1.09-1.03(m,6H),0.94(d,J=6.8Hz,3H),0.92(s,3H)。
步骤4.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C4)。
将浓盐酸(0.57mL,6.6mmol)加入C3(1.25g,3.43mmol)的乙酸(40.8mL)和水(8.2mL)混合物溶液。反应混合物在55℃加热3天,然后将其在水(50mL)与乙酸乙酯(100mL)间分配。水层用乙酸乙酯(2x50mL)萃取,经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(50mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C4,是白色沫状物。收率:1.00g,2.85mmol,83%。LCMS m/z 351.2[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d),特征峰:δ4.56-4.44(m,2H),2.24-2.12(m,1H),[1.66(d,AB四重峰的组成部分,J=7.5Hz)和1.59-1.47(m),共2H],1.10-1.01(m,6H),0.96-0.91(m,6H)。
步骤5.合成{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酸叔丁酯(C5)。
将氨的甲醇(7.0M;150mL,1.0mol)溶液加入0℃的N-(叔丁氧羰基)-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯(5.00g,17.5mmol)的甲醇(25mL)溶液。在反应混合物在室温下已搅拌3天之后,将其减压浓缩;残余物依次用乙酸乙酯和庚烷混合物(1:1,4x50mL)随后庚烷(50mL)稀释和再浓缩,提供C5,是固体(5.27g,假定定量),其含有残余溶剂。一部分该物质用于下述步骤。LCMS m/z 216.2[(M-2-甲基丙-1-烯)+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.16-3.96(m,1H),3.40-3.27(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.55-2.42(m,1H),2.35(dddd,J=12.2,8.6,6.8,3.3Hz,1H),2.03(ddd,J=14.0,11.0,4.4Hz,1H),1.93-1.81(m,1H),1.74(ddd,J=14.2,10.1,4.3Hz,1H),1.45(s,9H)。
步骤6.合成{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基甲酸叔丁酯(C6)。
将2,6-二甲基吡啶(2mL,17mmol)和三氟乙酸酐(0.94mL,6.6mmol)加入0℃的C5(来自先前步骤;1.0g,≤3.3mmol)的二氯甲烷(12mL)溶液。在室温下搅拌反应混合物1.5小时,然后将其用盐酸(1M;30mL)和二氯甲烷(60mL)处理。有机层依次用饱和氯化钠水溶液(30mL)和饱和碳酸氢钠水溶液(30mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,和减压浓缩;硅胶上的色谱法(梯度:40%至100%乙酸乙酯/庚烷)提供C6,是固体。收率:737mg,2.91mmol,88%,2步。LCMS m/z 254.3[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.72(dd,J=9.3,6.8Hz,1H),3.39-3.27(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.57-2.46(m,1H),2.36(dddd,J=12.2,8.6,6.3,3.4Hz,1H),2.21(ddd,J=13.8,9.3,5.6Hz,1H),1.92-1.79(m,2H),1.47(s,9H)。
步骤7.合成(2S)-2-氨基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙腈,甲磺酸盐(C7)。
向C6(317mg,1.25mmol)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(3mL)溶液加入甲磺酸(81.2μL,1.25mmol)。在反应混合物在室温下已搅拌45分钟之后,将其减压浓缩,然后反复地分散于溶剂混合物中并再浓缩:乙腈和乙酸乙酯(1:1,2x10mL)随后乙酸乙酯和庚烷(1:1,2x10mL)。所得C7作为玻璃状物获得(423mg),经由1H和13C NMR分析其不含腈差向异构体。一部分该物质用于后续反应而不额外纯化。LCMS m/z 154.2[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.78(t,J=7.3Hz,1H),3.42-3.36(m,2H),2.82-2.68(m,1H),2.70(s,3H),2.50-2.39(m,1H),2.20(t,J=7.3Hz,1H),2.07-1.80(m,2H)。
步骤8.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(1)。
将C7(来自先前步骤;98.8mg,≤0.292mmol)和C4(100mg,0.285mmol)在乙腈(1.5mL)中的混合物冷却至0℃。加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU,97%;112mg,0.286mmol),随后是4-甲基吗啉(94.0μL,0.855mmol)的乙腈(0.5mL)溶液,将反应混合物在0℃搅拌大约2小时。然后将饱和碳酸氢钠水溶液(30mL)加入0℃反应混合物,随后是二氯甲烷(50mL),有机层用盐酸(1M;30mL)洗涤。经合并的水层用二氯甲烷(60mL)萃取,然后经合并的有机层在硫酸钠上干燥,减压浓缩,和进行硅胶色谱法(梯度:0%至20%甲醇/乙酸乙酯)。由于NMR和LCMS判断所得物质受产品的差向异构体污染,然后将其经由反相HPLC纯化(柱:Waters Sunfire C18,19x100mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:在8.54分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.46分钟;流速:25mL/分),提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(1)。收率:14.6mg,30.1μmol,11%。LCMS m/z 486.5[M+H]+。保留时间:2.33分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis C18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v)。梯度:在4.0分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.0分钟。流速:2mL/分)。
C4的备择合成
(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C4)
步骤1.合成(1R,2S,5S)-3-[N-(叔丁氧羰基)-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C8)。
将氢氧化锂水溶液(2.0M;436mL,872mmol)加入C1(107g,290mmol)的四氢呋喃(730mL)溶液。在所得混合物在室温下已搅拌大约2小时之后,将其用水和乙酸乙酯稀释,然后用1M氢氧化钠水溶液处理。水层用乙酸乙酯洗涤,经合并的有机层用1M氢氧化钠水溶液萃取三次,直至LCMS分析指出C8已完全从有机层除去。加入浓盐酸将经合并的水层酸化为pH 2,然后混合物用乙酸乙酯萃取三次。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和浓缩;残余物与庚烷研磨提供C8,是白色固体。收率:92.8g,262mmol,90%。LCMS m/z 355.3[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.32(s,1H),4.05(d,AB四重峰的一半,J=10.5Hz,1H),4.01(d,J=9.0Hz,1H),3.88(dd,ABX体系的组成部分,J=10.4,5.3Hz,1H),2.03-1.91(m,1H),1.57(dd,ABX体系的组成部分,J=7.5,5.2Hz,1H),1.50(d,AB四重峰的一半,J=7.5Hz,1H),1.41(s,9H),1.08(s,3H),0.99(d,J=6.8Hz,3H),0.97-0.94(m,6H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-L-缬氨酰基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸,盐酸盐(C9)。
向C8(82.8g,234mmol)的二氯甲烷(230mL)溶液加入氯化氢的1,4-二噁烷(4.0M;409mL,1.64mol)溶液。反应混合物在室温下搅拌过夜,然后将其减压浓缩,提供C9,是白色沫状物。该物质直接用于下述步骤。LCMS m/z 255.3[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.42(s,1H),4.05(d,J=4.8Hz,1H),3.89(dd,ABX体系的组成部分,J=10.5,5.2Hz,1H),3.74(d,AB四重峰的一半,J=10.5Hz,1H),2.36-2.25(m,1H),1.62(dd,ABX体系的组成部分,J=7.5,5.1Hz,1H),1.57(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.16(d,J=7.0Hz,3H),1.10(s,3H),1.04(d,J=6.9Hz,3H),1.01(s,3H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C4)。
将C9(来自先前步骤;≤234mmol)的甲醇(230mL)溶液冷却至0℃,用三乙胺(66.7mL,479mmol)处理,搅拌5分钟,然后缓慢加入三氟乙酸乙酯(36.1mL,303mmol)。在反应混合物在室温下已搅拌90分钟之后,将其减压浓缩。残余物用水、1M氢氧化钠水溶液和乙酸乙酯稀释,和所得有机层用1M氢氧化钠水溶液萃取两次。经合并的水层通过加入1M盐酸酸化至pH 2,然后用乙酸乙酯萃取三次。经合并的有机层用水和用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C4,是白色沫状物。收率:73.4g,210mmol,90%,2步。LCMS m/z 351.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.65(v br s,1H),9.82(d,J=7.7Hz,1H),4.16(dd,J=9.9,7.9Hz,1H),4.12(s,1H),3.86(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.81(dd,ABX体系的组成部分,J=10.5,5.0Hz,1H),2.18-2.05(m,1H),1.54(dd,ABX体系的组成部分,J=7.7,4.6Hz,1H),1.42(d,AB四重峰的一半,J=7.5Hz,1H),1.02(s,3H),0.95(d,J=6.7Hz,3H),0.89(d,J=6.6Hz,3H),0.84(s,3H)。
实施例1的备择合成
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(1)
步骤1.合成3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯,甲磺酸盐(C10)。
向N-(叔丁氧羰基)-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯(10.1g,35.3mmol)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(70mL)溶液加入甲磺酸(2.30mL,35.4mmol)。在反应混合物在室温下已搅拌70分钟之后,LCMS分析指出原料已转化为C10:LCMS m/z 187.2[M+H]+。减压浓缩反应混合物,将残余物在乙腈和乙酸乙酯混合物(1:1,2x20mL)中再溶解两次,随后减压浓缩。所得物质分散于乙腈和乙酸乙酯混合物(1:1,30mL),浓缩,然后在乙酸乙酯(2x40mL)中再溶解两次和浓缩。残余物与乙酸乙酯(60mL)研磨,提供C10。收率:9.87g,35.0mmol,99%。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.22(dd,J=9.7,3.6Hz,1H),3.86(s,3H),3.41-3.36(m,2H),2.84-2.74(m,1H),2.70(s,3H),2.41(dddd,J=12.3,8.6,5.1,3.6Hz,1H),2.25(ddd,J=15.1,4.5,3.6Hz,1H),1.98(ddd,J=15.1,9.6,9.6Hz,1H),1.87(dddd,J=12.6,10.9,9.2,9.2Hz,1H)。
步骤2.合成N-({(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-基}羰基)-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯(C11)。
向0℃的C10(2.76g,9.78mmol)和C4(3.43g,9.79mmol)的乙腈(40mL)溶液加入1-[3-(二甲基氨基)丙基]-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(1.88g,9.81mmol),随后滴加吡啶(2.37mL,29.3mmol)。在0℃搅拌反应混合物2.25小时,然后将其用盐酸(1M;50mL)处理和用乙酸乙酯(150mL)萃取。有机层依次用饱和氯化钠水溶液(50mL),饱和碳酸氢钠水溶液(50mL)和饱和氯化钠水溶液(50mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物分散于甲基叔丁基醚(30mL)和减压浓缩,所得玻璃状物与甲基叔丁基醚(50mL)在室温下搅拌过夜。在过滤之后,滤饼用甲基叔丁基醚(3x6mL)洗涤,提供C11,是固体,通过1H NMR分析其含有实质的残余甲基叔丁基醚。一部分该物质用于下述步骤。收率:3.74g;校正残余甲基叔丁基醚后:2.94g,5.67mmol,58%。LCMS m/z 519.5[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.55(dd,J=12.0,3.8Hz,1H),4.34(s,1H),4.29(d,J=9.6Hz,1H),3.97(d,J=3.1Hz,2H),3.74(s,3H),3.37-3.23(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.73-2.62(m,1H),2.32(dddd,J=12.4,8.8,6.7,2.4Hz,1H),2.21-2.10(m,2H),1.86-1.74(m,2H),1.60(dt,ABX2体系的组成部分,J=7.7,3.1Hz,1H),1.49(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.09(s,3H),1.02(d,J=6.9Hz,3H),0.99-0.95(m,6H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(C12)。
将氨的甲醇(7.0M;5mL,40mmol)溶液加入C11(来自先前步骤:205mg,0.311mmol)的甲醇(1mL)溶液。所得溶液在室温下搅拌1.5小时,然后将氨的甲醇(7.0M;5mL,40mmol)溶液再次加入,和继续搅拌过夜。反应混合物然后用相同量的氨/甲醇第三次处理;在额外8小时反应之后,将其减压浓缩。残余物依次用乙酸乙酯(2x20mL)以及乙酸乙酯和庚烷混合物(1:1,2x20mL)稀释和再浓缩。所得物质溶于二氯甲烷(50mL),用盐酸(1M;30mL)和用饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C12,是固体。收率:87mg,0.17mmol,55%。LCMS m/z 504.5[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.68(d,J=7.9Hz,<1H,不完全地与溶剂交换),4.44(ddd,J=11.9,7.9,4.0Hz,1H),4.37-4.26(m,2H),4.01(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.1Hz,1H),3.94(d,AB四重峰的一半,J=10.2Hz,1H),3.39-3.24(m,2H,假定的;大部分受溶剂峰掩蔽),2.72-2.62(m,1H),2.38-2.28(m,1H),2.21-2.08(m,2H),1.90-1.72(m,2H),1.58(dd,ABX体系的组成部分,J=7.5,5Hz,1H),1.54(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.08(s,3H),1.02(d,J=6.7Hz,3H),0.97(d,J=6.7Hz,3H),0.96(s,3H)。
步骤4.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(1)。
将N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;88.4mg,0.371mmol)加入C12(85.0mg,0.17mmol)的二氯甲烷(4.0mL)溶液,反应混合物在室温下搅拌。在3小时之后,再次加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;20mg,84μmol);30分钟后,反应混合物用乙酸乙酯(60mL)稀释,依次用盐酸(1M;30mL)、饱和碳酸氢钠水溶液(30mL)和饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物分散于庚烷和再浓缩,随后经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至5%甲醇/乙酸乙酯)。分离出(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(1),是固体。收率:35mg,72μmol,42%。LCMS m/z 486.5[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ5.04(dd,J=10.7,5.4Hz,1H),4.28(d,J=9.6Hz,1H),4.25(s,1H),4.03-3.94(m,2H),3.35-3.23(m,2H,假定的;大部分受溶剂峰掩蔽),2.72-2.62(m,1H),2.37-2.26(m,2H),2.19-2.08(m,1H),1.93-1.75(m,2H),1.64(ddd,J=7.6,4.2,2.1Hz,1H),1.41(d,J=7.6Hz,1H),1.09(s,3H),1.02(d,J=6.8Hz,3H),1.00-0.95(m,6H)。
实施例2
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-(吡咯烷-1-基乙酰基)-L-亮氨酰胺,三氟乙酸盐(2)
步骤1.合成4-甲基-L-亮氨酸苄酯,对-甲苯磺酸盐(C13)。
将4-甲基-L-亮氨酸(9.5g,65mmol),苄醇(28.3g,262mmol),和对-甲苯磺酸一水合物(14.9g,78.3mmol)的甲苯(200mL)悬浮液在回流下加热过夜;用Dean-Stark装置共沸除去产生的水。然后减压浓缩反应混合物,然后残余物用二乙醚(200mL)和乙酸乙酯(100mL)稀释。所得悬浮液搅拌1.5小时和过滤;滤饼用二乙醚洗涤,提供C13,是白色固体。收率:24.9g,61.1mmol,94%。LCMS m/z 236.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.30(brs,3H),7.47(d,J=8.1Hz,2H),7.44-7.36(m,5H),7.11(d,J=7.8Hz,2H),5.23(AB四重峰,JAB=12.3Hz,ΔνAB=13.7Hz,2H),4.02(dd,J=7.3,4.5Hz,1H),2.29(s,3H),1.81(dd,J=14.5,7.3Hz,1H),1.57(dd,J=14.5,4.6Hz,1H),0.90(s,9H)。
步骤2.合成4-甲基-N-(吡咯烷-1-基乙酰基)-L-亮氨酸苄酯(C14)。
将0℃的C13(800mg,1.96mmol)和吡咯烷-1-基乙酸(254mg,1.97mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(4mL)中的混合物用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;746mg,1.96mmol),随后4-甲基吗啉(0.496mL,4.51mmol)的二氯甲烷(1mL)溶液处理。在反应混合物在0℃已搅拌2小时之后,在0℃加入饱和碳酸氢钠水溶液(30mL);所得混合物用乙酸乙酯(2x60mL)萃取,经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。将经由硅胶色谱法纯化进行两次(梯度:0%至20%乙酸乙酯/庚烷,随后是用0%至10%乙酸乙酯/庚烷的第二色谱纯化),提供C14,是胶状物(761mg)。该物质直接用于下述步骤。LCMS m/z 347.4[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.40-7.29(m,5H),5.16(AB四重峰,JAB=12.2Hz,ΔνAB=11.1Hz,2H),4.56(dd,J=9.0,3.1Hz,1H),3.76(AB四重峰,JAB=15.6Hz,ΔνAB=13.6Hz,2H),3.17-3.06(m,4H),2.03-1.93(m,4H),1.81(dd,J=14.5,3.1Hz,1H),1.60(dd,J=14.5,9.0Hz,1H),0.95(s,9H)。
步骤3.合成4-甲基-N-(吡咯烷-1-基乙酰基)-L-亮氨酸(C15)。
向C14(来自先前步骤;760mg,≤1.96mmol)的甲醇(5mL)溶液加入钯/碳(76.0mg)。反应混合物在室温在氢下(50psi)下搅拌过夜,然后LCMS分析指出转化为C15:LCMS m/z257.4[M+H]+。反应混合物通过0.15μm滤器过滤两次,减压浓缩滤液。将残余物两次溶于乙酸乙酯和庚烷混合物(1:1,2x20mL),随后减压浓缩;这提供C15,是固体(646mg)。该物质的部分用于后续化学反应而不加进一步纯化。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.46(d,J=8.3Hz,1H),4.31(ddd,J=8.9,8.6,3.0Hz,1H),3.74-3.60(m,2H),3.00br(s,4H),1.90-1.79(m,4H),1.70(dd,ABX体系的组成部分,J=14.3,3.0Hz,1H),1.56(dd,ABX体系的组成部分,J=14.3,9.2Hz,1H),0.90(s,9H)。
步骤4.合成N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-(吡咯烷-1-基乙酰基)-L-亮氨酰胺,三氟乙酸盐(2)。
将C15(来自先前步骤;30mg,≤91μmol)和C7(来自实施例1步骤7;35.3mg,≤0.104mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(1mL)中的混合物冷却至0℃,用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU,97%;39.9mg,0.102mmol)、随后4-甲基吗啉(28.0μL,0.255mmol)的二氯甲烷(0.25mL)溶液处理。在反应混合物在0℃已搅拌约1.5小时之后,将其用饱和碳酸氢钠水溶液(3mL)在0℃稀释和用二氯甲烷(4x4mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层和经由反相HPLC纯化(柱:Waters Sunfire C18,19x100mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:在8.5分钟内5%至25%B,然后在0.5分钟内25%至95%乙腈,然后95%B持续1.0分钟;流速:25mL/分),提供N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-N2-(吡咯烷-1-基乙酰基)-L-亮氨酰胺,三氟乙酸盐(2),是胶状物。收率:8.1mg,16μmol,18%,3步。LCMS m/z392.6[M+H]+。保留时间:1.47分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis C18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v)。梯度:在4.0分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.0分钟。流速:2mL/分)。
实施例3
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(2,6-二氯苯甲酰基)-4-甲基-L-亮氨酰胺(3)
步骤1.合成3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺,甲磺酸盐,(C16)。
向C5(6.13g,≤19mmol)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(40mL)溶液加入甲磺酸(1.83g,19mmol)。在室温下搅拌反应混合物1小时,然后将其减压浓缩,再悬浮于甲苯和庚烷混合物,再一次浓缩,提供吸湿性的玻璃状物(7.47g)。将一部分该物质(6.47g)依次用下述稀释和再浓缩:二氯甲烷和乙醇混合物(2:3,2x50mL);乙酸乙酯和乙醇(2:3,50mL);乙酸乙酯,庚烷,和二氯甲烷(4:4:1,2x50mL)。所得物质溶于乙腈和水混合物(1:1,22mL)和冻干2天,提供C16,是玻璃状物。收率:3.23g,12.1mmol,73%,2步。LCMS m/z 172.2[M+H]+1HNMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.03(dd,J=9.1,4.6Hz,1H),3.43-3.35(m,2H),2.82-2.72(m,1H),2.71(s,3H),2.49-2.38(m,1H),2.12-1.96(m,2H),1.94-1.81(m,1H)。
步骤2.合成N-(叔丁氧羰基)-4-甲基-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C17)。
将0℃的C16(1.34g,5.02mmol)和N-(叔丁氧羰基)-4-甲基-L-亮氨酸(1.28g,5.22mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(7.0mL)溶液用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU,97%;2.04g,5.20mmol),随后4-甲基吗啉(1.43mL,13.0mmol)的二氯甲烷(3mL)溶液处理。在反应混合物在0℃已搅拌2.25小时之后,在0℃加盐酸(1M;30mL)将其猝灭然后用二氯甲烷(50mL)稀释。有机层用饱和碳酸氢钠水溶液(30mL)洗涤,经合并的水层用二氯甲烷(60mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和用庚烷悬浮/浓缩(3x10mL)。经由硅胶色谱法纯化残余物(梯度:0%至20%甲醇/乙酸乙酯)提供C17,是固体。收率:1.42g,3.56mmol,71%。LCMS m/z 399.4[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ6.83(d,J=7.4Hz,<1H,不完全地与溶剂交换),4.43(dd,J=11.2,4.2Hz,1H),4.11-4.05(m,1H),3.38-3.24(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.52-2.41(m,1H),2.40-2.30(m,1H),2.13(ddd,J=14.0,11.2,4.5Hz,1H),1.91-1.75(m,2H),1.71(dd,ABX体系的组成部分,J=14.4,3.2Hz,1H),1.51(dd,ABX体系的组成部分,J=14.4,9.3Hz,1H),1.45(s,9H),0.97(s,9H)。
步骤3.合成4-甲基-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺,甲磺酸盐(C18)。
将甲磺酸(32.6μL,0.502mmol)加入C17(200mg,0.502mmol)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(1.5mL)溶液。在室温下搅拌反应混合物40分钟,然后将其减压浓缩,溶于乙酸乙酯和再一次浓缩,提供C18,是固体(238mg)。绝大部分该物质用于下述步骤。LCMS m/z 299.4[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.53(dd,J=10.3,5.0Hz,1H),3.91(dd,J=7.6,5.5Hz,1H),3.41-3.27(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.70(s,3H),2.57-2.47(m,1H),2.41(dddd,J=12.0,8.6,7.0,3.2Hz,1H),2.15(ddd,J=14.0,10.3,5.0Hz,1H),2.01(dd,J=14.4,7.5Hz,1H),1.96-1.85(m,1H),1.78(ddd,J=14.1,9.1,5.0Hz,1H),1.59(dd,J=14.3,5.5Hz,1H),1.01(s,9H)。
步骤4.合成N-(2,6-二氯苯甲酰基)-4-甲基-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C19)。
将0℃的C18(来自先前步骤:234mg,≤0.49mmol)的二氯甲烷(2mL)悬浮液用三乙胺(170μL,1.2mmol)处理,随后滴加2,6-二氯苯甲酰氯(130mg,0.621mmol)的二氯甲烷(0.2mL)溶液。在室温下搅拌反应混合物1小时,然后将其用二氯甲烷(60mL)稀释,然后用盐酸(1M;30mL)随后饱和碳酸氢钠水溶液(30mL)洗涤。有机层在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和进行硅胶上的色谱法(梯度:0%至30%甲醇/乙酸乙酯),提供C19。收率:120mg,0.255mmol,52%,2步。LCMS m/z 471.4(观察到二氯同位素模式)[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.45(d,J=7.9Hz,<1H,不完全地与溶剂交换),7.45-7.35(m,3H),4.59(dd,J=7.8,4.5Hz,1H),4.52-4.44(m,1H),3.37-3.24(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.65-2.55(m,1H),2.37(dddd,J=12.5,8.8,6.6,2.8Hz,1H),2.19(ddd,J=13.9,11.3,4.5Hz,1H),1.91-1.72(m,3H),1.66(dd,ABX体系的组成部分,J=14.4,7.8Hz,1H),1.03(s,9H)。
步骤5.合成N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(2,6-二氯苯甲酰基)-4-甲基-L-亮氨酰胺(3)。
将C19(90mg,0.19mmol)和1H-咪唑(33.8mg,0.496mmol)的吡啶(1mL)溶液在乙腈/干冰浴(-35℃)中冷却。向其加入磷酰氯(0.100mL,1.07mmol),在-30℃至-20℃搅拌反应混合物。在30分钟之后,加入吡啶(2mL)促进搅拌;在1小时之后,出于相同原因加入二氯甲烷(2mL)。在反应2小时后再次加入磷酰氯(0.100mL,1.07mmol),在-30℃继续搅拌30分钟,然后反应混合物温热至0℃和搅拌额外40分钟。将其然后用盐酸(1M;30mL)处理和用二氯甲烷(2x60mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和进行硅胶色谱法(梯度:0%至15%甲醇/乙酸乙酯),提供固体(67mg)。将该物质与来自用C19(30mg,64μmol)进行的相似反应的产品(12mg)合并,两次分散于乙酸乙酯(2x3mL)随后减压浓缩。残余物与乙酸乙酯和庚烷混合物(1:3,4mL)在室温下搅拌40分钟和过滤;滤饼用乙酸乙酯和庚烷混合物(1:3,5x2mL)洗涤,提供N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-(2,6-二氯苯甲酰基)-4-甲基-L-亮氨酰胺(3),是固体。合并的收率:70mg,0.15mmol,59%。LCMSm/z 453.3(观察到二氯同位素模式)[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.45-7.34(m,3H),5.05(dd,J=10.7,5.4Hz,1H),4.56(dd,J=7.0,5.7Hz,1H),3.37-3.23(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.70-2.59(m,1H),2.42-2.29(m,2H),1.95-1.77(m,3H),1.67(dd,ABX体系的组成部分,J=14.4,7.0Hz,1H),1.04(s,9H)。
实施例4
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(4)
步骤1.合成L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯,盐酸盐(C20)。
将N-(叔丁氧羰基)-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯(参见Prior,A.M.等人,Bioorg.Med.Chem.Lett.2013,23,6317-6320;2.0g,5.0mmol)在甲醇(2mL)和氯化氢的乙酸乙酯(4M;20mL)溶液的混合物中的溶液在25℃搅拌1小时。减压浓缩提供C20,是白色固体(1.92g,假定定量)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ9.09-8.98(m,1H),8.39(br s,3H),7.69(s,1H),4.44-4.31(m,1H),3.22-3.07(m,2H),2.5-2.38(m,1H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.24-2.11(m,1H),2.11-1.99(m,1H),1.78-1.48(m,5H),0.92(d,J=6.5Hz,3H),0.89(d,J=6.5Hz,3H)。
步骤2.合成N-(4-甲氧基-1H-吲哚-2-羰基)-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯(C21)。
将O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;494mg,1.30mmol)和N,N-二异丙基乙胺(388mg,3.00mmol)加入0℃的C20(来自类似步骤1的小规模实验;336mg,≤0.840mmol)和4-甲氧基-1H-吲哚-2-羧酸(159mg,0.832mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(6mL)溶液。溶液在0℃搅拌1.5小时,然后将其倾至水/冰中(10mL)和用乙酸乙酯(3x10mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(洗脱液:10:1二氯甲烷/甲醇)提供C21,是黄色油状物。收率:380mg,0.804mmol,97%。LCMS m/z 473.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.59-11.53(m,1H),8.53(d,J=8.0Hz,1H),8.37(d,J=8.0Hz,1H),7.65(s,1H),7.37-7.33(m,1H),7.09(dd,J=8,8Hz,1H),7.00(d,AB四重峰的组成部分,J=8.2Hz,1H),6.50(d,J=7.6Hz,1H),4.56-4.47(m,1H),4.40-4.31(m,1H),3.88(s,3H),3.62(s,3H),3.18-3.05(m,2H),2.41-2.29(m,1H),2.15-2.03(m,2H),1.78-1.49(m,5H),0.93(d,J=6.3Hz,3H),0.89(d,J=6.4Hz,3H)。
步骤3.合成N-(4-甲氧基-1H-吲哚-2-羰基)-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸(C22)。
向搅拌的氯化钙(0.887g,7.99mmol)和氢氧化钠(0.168g,4.20mmol)在2-丙醇(7mL)和水(3mL)中的混合物加入C21(1.8g,3.8mmol)。在20℃搅拌反应混合物6小时,然后将其减压浓缩,用水稀释(4mL),加入1M盐酸调节至pH 4,和用乙酸乙酯(3x10mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(洗脱液:10:1:0.1二氯甲烷/甲醇/乙酸)提供C22,是黄色固体。收率:1.76g,3.84mmol,100%。LCMS m/z 459.2[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d),特征峰:δ6.51-6.43(m,1H),4.80-4.66(m,1H),4.60-4.45(m,1H),3.92(s,3H),3.36-3.18(m,2H),2.59-2.44(m,1H)。
备择步骤3.合成N-(4-甲氧基-1H-吲哚-2-羰基)-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸(C22)。
将C21(20mg,42μmol)的四氢呋喃(0.4mL)溶液用含有氢氧化锂的水溶液(14.2mg,0.593mmol)处理。在反应混合物在室温下已搅拌2.5小时之后,将其用乙酸乙酯稀释和用10%硫酸氢钾水溶液洗涤。有机层然后在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C22,是白色固体。收率:20mg,定量。LCMS m/z 459.2[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.27(s,1H),7.14(dd,ABX体系的组成部分,J=8,8Hz,1H),7.02(d,AB四重峰的组成部分,J=8.3Hz,1H),6.50(d,J=7.7Hz,1H),4.66(dd,J=9.0,5.9Hz,1H),4.52(dd,J=11.7,3.9Hz,1H),3.92(s,3H),3.30-3.18(m,2H),2.65-2.52(m,1H),2.38-2.26(m,1H),2.21(ddd,J=14.0,11.7,4.1Hz,1H),1.90-1.70(m,5H),1.02(d,J=6.3Hz,3H),0.99(d,J=6.3Hz,3H)。
步骤4.合成N-(4-甲氧基-1H-吲哚-2-羰基)-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C23)。
向0℃的C22(1.76g,3.84mmol)和氯化铵(0.246g,4.60mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(15mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;1.90g,5.00mmol)和N,N-二异丙基乙胺(1.49g,11.5mmol)。在反应混合物在0℃已搅拌1.5小时之后,用N,N-二异丙基乙胺(2.3g,18mmol)来调节pH至8。搅拌反应混合物额外30分钟,然后将其倾至盐酸(1M;20mL,20mmol)和冰的混合物中。所得混合物用乙酸乙酯(3x10mL)萃取;经合并的有机层依次用盐酸(1M;10mL)和饱和氯化钠水溶液(10mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和经由硅胶色谱法纯化(洗脱液:10:1二氯甲烷/甲醇),提供C23,是黄色固体。收率:1.09g,2.38mmol,62%。LCMS m/z 458.0[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.62-11.55(m,1H),8.42(d,J=7.9Hz,1H),8.04(d,J=8.4Hz,1H),7.60(br s,1H),7.38-7.26(m,2H),7.10(dd,ABX体系的组成部分,J=8,8Hz,1H),7.06(br s,1H),7.00(d,AB四重峰的组成部分,J=8.2Hz,1H),6.51(d,J=7.7Hz,1H),4.54-4.41(m,1H),4.34-4.22(m,1H),3.88(s,3H),3.17-3.01(m,2H),2.31-1.95(m,3H),1.76-1.45(m,5H),0.92(d,J=6.1Hz,3H),0.88(d,J=6.3Hz,3H)。
步骤5.合成N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(4)。
向0℃的C23(500mg,1.09mmol)和N,N-二异丙基乙胺(565mg,4.37mmol)在四氢呋喃(8mL)中的混合物加入2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三磷杂环己烷2,4,6-三氧化物(50%重量的乙酸乙酯溶液;2.78g,4.37mmol)。在反应混合物在50℃已搅拌3小时之后,将其减压浓缩,用水稀释(5mL),和用乙酸乙酯(3x5mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩;进行硅胶色谱法(洗脱液:10:1二氯甲烷/甲醇)随后反相HPLC纯化(柱:YMC-Actus Triart C18,50x250mm,7μm;流动相A:水,含有0.225%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:18%至58%B;流速:25mL/分),提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(4),是黄色固体。收率:130mg,0.296mmol,27%。LCMS m/z 440.2[M+H]+1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.58(br s,1H),8.90(d,J=8.0Hz,1H),8.47(d,J=7.7Hz,1H),7.71(br s,1H),7.38-7.35(m,1H),7.09(dd,ABX体系的组成部分,J=8,8Hz,1H),7.00(d,AB四重峰的组成部分,J=8.2Hz,1H),6.51(d,J=7.7Hz,1H),5.02-4.93(m,1H),4.49-4.40(m,1H),3.88(s,3H),3.19-3.05(m,2H),2.41-2.29(m,1H),2.20-2.06(m,2H),1.85-1.62(m,4H),1.58-1.47(m,1H),0.94(d,J=6.3Hz,3H),0.89(d,J=6.3Hz,3H)。
实施例4的备择合成
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(4)
步骤1.合成N-[(4-甲氧基-1H-吲哚-2-基)羰基]-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C23)。
将氨的甲醇(7.0M;21mL,150mmol)溶液加入C21(500mg,1.06mmol)的甲醇(2.0mL)溶液。在反应混合物在室温下已搅拌6小时之后,将氨的甲醇(7.0M;7.0mL,49mmol)溶液再次加入,继续搅拌过夜。将氨的甲醇(7.0M;7.0mL,49mmol)溶液再次加入,继续搅拌24小时,然后用氨的甲醇(7.0M;7.0mL,49mmol)溶液进行最终处理。再搅拌反应混合物多1天,此时将其减压浓缩。残余物与用C21(500mg,1.06mmol)进行的相似反应的产品(所分离的512mg中的350mg)合并,将混合物反复地溶于乙酸乙酯(5x10mL)和减压浓缩,提供C23(835mg)。该物质直接用于下述步骤。LCMS m/z 458.4[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.29(d,J=0.9Hz,1H),7.15(dd,ABX体系的组成部分,J=8,8Hz,1H),7.03(br d,AB四重峰的组成部分,J=8.3Hz,1H),6.51(d,J=7.7Hz,1H),4.59(dd,J=9.7,5.0Hz,1H),4.45(dd,J=11.3,4.2Hz,1H),3.93(s,3H),3.34-3.19(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.57-2.47(m,1H),2.31(dddd,J=12.6,8.5,6.8,2.8Hz,1H),2.15(ddd,J=14.0,11.4,4.6Hz,1H),1.88-1.67(m,5H),1.02(d,J=6.1Hz,3H),0.98(d,J=6.1Hz,3H)。
步骤2.合成N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(4)。
将C23(来自先前步骤;835mg,≤1.78mmol)和1H-咪唑(323mg,4.74mmol)的吡啶(4mL)和二氯甲烷(4mL)混合物溶液用乙腈/干冰浴冷却至-35℃,然后在5分钟内滴加磷酰氯(0.956mL,10.2mmol)。反应在-30℃至-20℃的温度搅拌约1.5小时,然后用盐酸(1M;50mL)处理和搅拌1小时。在用二氯甲烷(3x60mL)萃取之后,合并所得有机层,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物与来自不同批次的纯化的4(75mg,0.17mmol)合并和进行硅胶色谱法(梯度:0%至5%甲醇/乙酸乙酯),提供4,是固体(800mg)。该物质与来自用C23(161mg,0.352mmol)进行的相似反应的产品(80mg)合并;所得物质在二乙醚(25mL)中搅拌3天,然后将其过滤。滤饼用二乙醚和庚烷混合物(1:1,4x2mL)洗涤,提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(4),是固体。合并的收率:519mg,1.18mmol,大约50%,2步。LCMS m/z440.5[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.57(d,J=2.3Hz,1H),8.90(d,J=8.1Hz,1H),8.46(d,J=7.7Hz,1H),7.70(s,1H),7.37(d,J=2.3Hz,1H),7.10(dd,ABX体系的组成部分,J=8,8Hz,1H),7.00(d,AB四重峰的组成部分,J=8.2Hz,1H),6.51(d,J=7.7Hz,1H),5.03-4.92(m,1H),4.51-4.39(m,1H),3.88(s,3H),3.19-3.05(m,2H),2.42-2.30(m,1H),2.20-2.06(m,2H),1.80(ddd,J=13.2,9.3,6.7Hz,1H),1.75-1.63(m,3H),1.58-1.47(m,1H),0.94(d,J=6.2Hz,3H),0.89(d,J=6.2Hz,3H)。
实施例5和6
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺(5)和N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺(6)
向含有三氟甲烷亚磺酸锌(II)(98%,2.44mg,7.21μmol)的压力释放小瓶依次加入4(0.79mg,1.8μmol)的二甲亚砜(60μL)溶液,三氟乙酸(0.56μL,7.3μmol),和叔丁基过氧化氢(70%,在水中;1.25uL,9.03μmol)。将小瓶封盖和加热至50℃过夜,然后冷却反应混合物,用乙腈和1%甲酸水溶液稀释至大约2至3mL的体积。最终的溶剂组成使得所得混合物显得透明,一般是约20%至30%乙腈。对全部混合物进行反相HPLC(柱:Phenomenex LunaC18,10x250mm,10μm;流动相A:0.5%乙酸/水;流动相B:9:1乙腈/甲醇;梯度:15%B持续5分钟,然后在84分钟内15%至70%B线性梯度,然后在1分钟内70%至95%B,然后95%B持续9分钟;流速:2mL/min)。将洗脱物通过UV/VIS检测器然后以大约15:1在级分收集器与离子阱质谱之间裂分。每20秒收集级分,可能含有有关产品的那些通过UHPLC-UV-HRMS评价,随后合并。两种产品在大约71和75分钟洗脱。第一洗脱产品是5即{N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-3-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺},和第二洗脱产品是6即{N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺}。
5-收率:0.101mg,0.199μmol,11%。高分辨率MS m/z 508.2171[M+H]+;C24H29F3N5O4计算值,508.2172。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ12.22(br s,1H),9.01(d,J=7.6Hz,1H),8.96(d,J=7.9Hz,1H),7.73(s,1H),7.21(dd,J=8,8Hz,1H),7.08(d,J=8.2Hz,1H),6.69(d,J=7.8Hz,1H),5.03-4.95(m,1H),4.49-4.40(m,1H),3.87(s,3H),3.22-3.08(m,2H),2.43-2.34(m,1H),2.23-2.10(m,2H),1.82(ddd,J=13.7,9.3,6.8Hz,1H),1.78-1.66(m,2H),1.62(ddd,J=14.6,9.7,5.2Hz,1H),1.49(ddd,J=13.8,8.8,5.5Hz,1H),0.97-0.88(m,6H)。保留时间:8.43分钟(分析条件。柱:Phenomenex Kinetex XB-C18,2.1x100mm,2.6μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:5%B持续0.5分钟,然后在10.5分钟内5%至70%B,然后在2分钟内70%至95%B;流速:0.4mL/min)。
6-收率:14.7μg,0.029μmol,1.6%。高分辨率MS m/z 508.2178[M+H]+;C24H29F3N5O4的计算值,508.2172。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ11.47(br s,1H),9.00(d,J=7.9Hz,1H),8.79(d,J=7.8Hz,1H),7.70(s,1H),7.55(d,J=8.2Hz,1H),7.35(s,1H),6.72(d,J=8.3Hz,1H),5.02-4.94(m,1H),4.56-4.48(m,1H),3.97(s,3H),3.18-3.05(m,2H),2.39-2.30(m,1H),2.18-2.08(m,2H),1.86-1.77(m,1H),1.75-1.64(m,3H),1.61-1.52(m,1H),0.95(d,J=6.1Hz,3H),0.90(d,J=6.1Hz,3H)。保留时间:8.92分钟(分析条件等同于用于5的那些)。
实施例6的备择合成
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺(6)
/>
步骤1.合成三氟甲基化的4-甲氧基-1H-吲哚-2-羧酸(C24)。
将4-甲氧基-1H-吲哚-2-羧酸(100mg,0.523mmol)和三氟甲烷亚磺酸锌(II)(120mg,0.362mmol)的混合物用二甲亚砜(1.5mL)随后三氟乙酸(56μL,0.727mmol)处理。在反应混合物已冷却至0℃之后,加入叔丁基过氧化氢(70%,在水中;143μL,1.03mmol),在0℃继续搅拌20分钟,然后在室温下进行25分钟。反应混合物随后在52℃加热2小时,然后将其冷却至室温和以滴加方式用碳酸氢钠水溶液处理直至鼓泡停止。在所得混合物已在碳酸氢钠水溶液与乙酸乙酯间分配之后,水层用乙酸乙酯萃取一次和弃去有机层。水层然后用1M盐酸酸化至pH 7;加入乙酸乙酯,搅拌混合物并加入1M盐酸将pH调节至1。在两相混合物已搅拌10分钟之后,有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩。通过LCMS分析,残余物(115mg)含有原料和一-三氟甲基化产品的混合物,以及少量的二-三氟甲基化物质。将该混合物整体用于步骤4中。收率:115mg,<0.4mmol。LCMS m/z 189.8,257.8,325.8(次要)[M-H]-1H NMR(400MHz,甲醇-d4),三种主要组分的特征峰:δ7.07(brd,J=8.4Hz),7.02(br d,J=8.4Hz),6.81(d,J=7.8Hz),6.66(d,J=7.8Hz),6.51(d,J=7.7Hz),4.06(s,-OMe),3.93(s,-OMe),3.92(s,-OMe)。
步骤2.合成N-(叔丁氧羰基)-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C25)。
向0℃的N-(叔丁氧羰基)-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯(参见Prior,A.M.,等人,Bioorg.Med.Chem.Lett.2013,23,6317-6320;1.5g,3.8mmol)的甲醇(5mL)溶液加入氨的甲醇(7M;43mL,300mmol)溶液。在反应容器已封盖之后,反应混合物在室温下搅拌过夜。将氨的甲醇(7M;10.7mL,74.9mmol)溶液再次加入,和让反应在室温下继续3天,然后将其减压浓缩。残余物分散两次于二乙醚(40mL)和减压浓缩,提供C25,是白色固体。收率:1.46g,3.80mmol,定量。LCMS m/z 385.4[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.29-8.17(m,1H),7.23(br s,1H),5.64(br s,1H),5.32(br s,1H),5.02(d,J=6.1Hz,1H),4.50-4.38(m,1H),4.05(ddd,J=10.3,6.3,4.5Hz,1H),3.44-3.32(m,2H),2.51-2.35(m,2H),2.16-1.98(m,2H),1.97-1.83(m,1H),1.76-1.6(m,2H,假定的;部分受水峰掩蔽),1.49-1.39(m,1H),1.45(s,9H),0.94(d,J=6.4Hz,3H),0.94(d,J=6.3Hz,3H)。
步骤3.合成L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺,甲磺酸盐(C26)。
将甲磺酸(0.861mL,13.3mmol)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(5mL)溶液缓慢加至C25(5.1g,13mmol)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(43mL)溶液。在30分钟之后,LCMS分析指出转化为C26:LCMS m/z 285.3[M+H]+。减压浓缩反应混合物,然后分散于下述溶剂混合物和再浓缩:乙腈和乙酸乙酯混合物(1:1,2x20mL),然后乙酸乙酯和庚烷混合物,(1:1,2x20mL)。所得固体用乙腈和乙酸乙酯混合物共沸两次,然后用乙酸乙酯和庚烷混合物进行两次,提供C26,是白色固体(6.05g),通过1H NMR分析其保留溶剂。收率:假定的定量。1H NMR(600MHz,甲醇-d4)δ4.50(dd,J=10.7,4.9Hz,1H),3.91(dd,J=8.6,5.5Hz,1H),3.39-3.28(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.70(s,3H),2.53-2.46(m,1H),2.43-2.36(m,1H),2.14(ddd,J=14.0,10.7,5.0Hz,1H),1.95-1.86(m,1H),1.82-1.71(m,3H),1.70-1.64(m,1H),1.02(d,J=6.3Hz,3H),1.01(d,J=6.1Hz,3H)。
步骤4.合成N-{[4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-基]羰基}-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C27)。
将C24(来自步骤1;101mg,<0.35mmol)和C26(来自先前步骤;204mg,≤0.438mmol)的乙腈(1.7mL)和N,N-二甲基甲酰胺(1mL)溶液冷却至0℃和用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;163mg,0.429mmol)随后4-甲基吗啉(0.129mL,1.17mmol)处理。在0℃搅拌反应混合物40分钟,然后缓慢加入碳酸氢钠水溶液和冰的1:1混合物直至形成混浊沉淀。然后加入乙酸乙酯,将两相混合物搅拌5分钟。水层用乙酸乙酯萃取一次,经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩。将经由硅胶色谱法纯化进行两次(梯度#1:0%至10%甲醇/二氯甲烷;梯度#2:5%至10%甲醇/二氯甲烷),提供C27。该物质的区域化学由2D NMR实验确认。收率:19mg,36μmol,大约10%。LCMS m/z 526.5[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.53(br d,J=8.2Hz,1H),7.41(s,1H),6.68(d,J=8.3Hz,1H),4.60(dd,J=9.5,5.1Hz,1H),4.45(dd,J=11.4,4.2Hz,1H),4.01(s,3H),3.3-3.21(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.60-2.49(m,1H),2.36-2.26(m,1H),2.15(ddd,J=14.1,11.5,4.6Hz,1H),1.89-1.68(m,5H),1.03(d,J=6.1Hz,3H),0.99(d,J=6.2Hz,3H)。
步骤5.合成N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺(6)。
将N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;17.2mg,72.2μmol)加入C27(19mg,36μmol)的二氯甲烷(0.5mL)和乙腈(0.2mL)混合物溶液。在反应混合物在室温下已搅拌1小时之后,将其用乙酸乙酯稀释和用碳酸氢钠水溶液和冰1:1混合物洗涤。水层用乙酸乙酯萃取,经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,和通过填充硫酸镁的固相萃取柱。减压浓缩滤液提供残余物,其经由反相HPLC纯化(柱:Waters Sunfire C18,19x100mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:在8.5分钟内25%至65%B,然后在0.5分钟内65%至95%B,然后95%B持续1.0分钟;流速:25mL/分),提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-7-(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺(6)。收率:4.3mg,8.5μmol,24%。LCMS m/z 508.6[M+H]+。保留时间:2.83分钟(柱:WatersAtlantis C18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:在4.0分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.0分钟;流速:2mL/分)。
实施例7
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑-2-甲酰胺(7)
步骤1.合成N2-(叔丁氧羰基)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺(C28)。
将C17(560mg,1.41mmol)和1H-咪唑(249mg,3.65mmol)的吡啶(3mL)和二氯甲烷(3mL)混合物溶液用乙腈/干冰浴冷却至-35℃。在4分钟内滴加磷酰氯(0.74mL,7.94mmol),随后是额外的二氯甲烷(2mL),在-30℃至-20℃继续搅拌。在1小时之后,反应混合物用二氯甲烷(2mL)稀释。在大约1.5小时之后,加入盐酸(1M;30mL);所得混合物搅拌30分钟,然后用二氯甲烷(2x60mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C28,是固体。收率:492mg,1.29mmol,91%。LCMS m/z 381.4[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ5.03(dd,J=10.4,5.7Hz,1H),4.09(dd,J=8.7,4.2Hz,1H),3.39-3.25(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.64-2.52(m,1H),2.40-2.27(m,2H),1.97-1.78(m,2H),1.70(dd,ABX体系的组成部分,J=14.3,4.1Hz,1H),1.54(dd,ABX体系的组成部分,J=14.3,8.7Hz,1H),1.45(s,9H),1.00(s,9H)。
步骤2.合成N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑-2-甲酰胺(7)。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4.0M;0.3mL,1.2mmol)溶液加入C28(100mg,0.263mmol)的乙腈(1.5mL)和甲醇(1.0mL)混合物溶液。在室温下搅拌反应混合物30分钟,然后将其用4-甲基吗啉(0.144mL,1.31mmol)处理。在减压除去溶剂之后,将残余物两次再悬浮于二氯甲烷和庚烷混合物(1:1,2x10mL)和减压浓缩。将残余物与3-甲基咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑-2-羧酸(47.9mg,0.263mmol)/N,N-二甲基甲酰胺(3.3mL)合并,冷却至0℃,和用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;99.9mg,0.263mmol)随后4-甲基吗啉(72μL,0.655mmol)的二氯甲烷(0.2mL)溶液处理。在反应混合物在0℃已搅拌大约2小时之后,将其在0℃用盐酸(1M;30mL)处理,所得混合物用二氯甲烷(2x60mL)萃取。水层然后通过加入饱和碳酸氢钠水溶液碱化至pH 9,然后将其用二氯甲烷(3x60mL)萃取。经合并的有机层用饱和的氯化铵水溶液(50mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。该物质的1H NMR分析指出存在次要的差向异构体,推定产生自携带腈的中心处的部分外消旋化。主要产品用硅胶色谱法分离(梯度:0%至20%甲醇/乙酸乙酯),提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-甲基咪唑并[2,1-b][1,3]噻唑-2-甲酰胺(7),是固体。收率:56mg,0.13mmol,49%。LCMS m/z 445.4[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.73(d,J=1.6Hz,1H),7.37(d,J=1.6Hz,1H),5.04(dd,J=10.3,5.9Hz,1H),4.53(dd,J=7.8,5.0Hz,1H),3.36-3.24(m,2H;假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.70(s,3H),2.67-2.57(m,1H),2.38-2.27(m,2H),1.93(ddd,J=14.0,9.4,6.0Hz,1H),1.88-1.78(m,3H),1.03(s,9H)。
实施例8和9
N-{1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[环己基(甲氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺,DIAST-1(8)和N-{1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[环己基(甲氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺,DIAST-2(9)
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步骤1.合成N-{1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺(C29)。
向C28(114mg,0.300mmol)的乙腈(1mL)和甲醇(1mL)混合物溶液加入氯化氢的1,4-二噁烷(4M;0.4mL,1.6mmol)溶液。在室温下搅拌反应混合物30分钟,然后加入4-甲基吗啉(0.165mL,1.50mmol),使pH为7至8。在减压除去溶剂之后,将残余物两次分散于乙酸乙酯和庚烷混合物(1:1,2x10mL)和减压浓缩,提供C29,是固体(269mg);通过1H NMR分析,其由差向异构体的混合物组成,推定位于携带腈的中心,比例为2-3比1。一部分该物质用于下述步骤。LCMS m/z 281.3[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4),特征峰:δ[5.11(dd,J=8.8,7.3Hz,主要)和5.01(dd,J=6.5,6.5Hz,次要),共1H],[2.75-2.65(m,次要)和2.64-2.54(m,主要),共1H],2.48-2.38(m,1H),2.30-2.20(m,1H),2.06-1.83(m,3H),1.64(dd,J=14.1,4.8Hz,1H),[1.04(s,主要),1.01(s,次要),共9H]。
步骤2.合成N-{1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[环己基(甲氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺,DIAST-1(8)和N-{1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[环己基(甲氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺,DIAST-2(9)。
向0℃的C29(来自先前步骤;83.4mg,≤93μmol)和环己基(甲氧基)乙酸(17.2mg,99.9μmol)的N,N-二甲基甲酰胺(1mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;38.0mg,0.100mmol),随后4-甲基吗啉(30.8μL,0.280mmol)的二氯甲烷(0.2mL)溶液。在反应混合物在0℃已搅拌约2小时之后,将其用饱和碳酸氢钠水溶液(3mL)在0℃稀释,用二氯甲烷(4x4mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层;通过LCMS分析,残余物由两种组分组成,假定相应于在携带腈的中心处的两种差向异构体。这些非对映体经由反相HPLC分离(柱:Waters XBridge C18,19x100mm,5μm;流动相A:水;流动相B:乙腈;梯度:在8.54分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.46分钟;流速:25mL/分)。第一洗脱非对映体指定为8(N-{1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[环己基(甲氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺,DIAST-1),而第二洗脱非对映体指定为9(N-{1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[环己基(甲氧基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺,DIAST-2)。
8-收率:12.8mg,29.4μmol,32%,2步。LCMS m/z 435.6[M+H]+。保留时间:2.63分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis C18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v)。梯度:在4.0分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.0分钟。流速:2mL/分)。
9-收率:10mg,23.0μmol,25%,2步。LCMS m/z 435.6[M+H]+。保留时间:2.72分钟(分析条件等同于用于8的那些)。
实施例10
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(10)
步骤1.合成N-[(4-甲氧基-1H-吲哚-2-基)羰基]-4-甲基-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C30)。
向0℃的C18(200mg,≤0.46mmol)和4-甲氧基-1H-吲哚-2-羧酸(88.2mg,0.460mmol)的乙腈(2mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;175mg,0.460mmol),随后4-甲基吗啉(0.127mL,1.16mmol)的乙腈(0.2mL)溶液。在0℃搅拌反应混合物2.5小时,然后将其用饱和碳酸氢钠水溶液(30mL)在0℃稀释,然后用二氯甲烷(50mL)萃取。有机层用盐酸(1M;30mL)洗涤,水层用二氯甲烷(60mL)萃取。在经合并的有机层已在硫酸钠上干燥之后,过滤,和减压浓缩,残余物经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至30%甲醇/乙酸乙酯),提供C30,是固体。收率:148mg,0.314mmol,68%,2步。LCMS m/z 472.4[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.25(d,J=0.9Hz,1H),7.15(dd,J=8,8Hz,1H),7.03(br d,AB四重峰的组成部分,J=8.3Hz,1H),6.51(d,J=7.7Hz,1H),4.65(dd,J=9.2,3.4Hz,1H),4.44(dd,J=11.2,4.2Hz,1H),3.93(s,3H),3.29-3.15(m,2H),2.54-2.44(m,1H),2.29(dddd,J=12.6,8.6,7.0,2.7Hz,1H),2.14(ddd,J=14.0,11.2,4.6Hz,1H),1.89(dd,ABX体系的组成部分,J=14.5,3.4Hz,1H),1.85-1.74(m,3H),1.02(s,9H)。
步骤2.合成N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(10)。
将C30(143mg,0.303mmol)和1H-咪唑(53.7mg,0.789mmol)的吡啶(1mL)和二氯甲烷(1mL)混合物溶液在乙腈/干冰浴(-35℃)中冷却。在5分钟内滴加磷酰氯(0.159mL,1.71mmol),在-30℃至-20℃搅拌反应混合物2小时,然后将其用盐酸(1M;30mL)处理,搅拌20分钟,和用二氯甲烷(2x60mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶上的色谱法(梯度:0%至10%甲醇/乙酸乙酯)提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(10),是固体。收率:68mg,0.15mmol,50%。LCMS m/z 454.5[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.24(d,J=0.9Hz,1H),7.14(dd,J=8,8Hz,1H),7.02(br d,AB四重峰的组成部分,J=8.3Hz,1H),6.51(d,J=7.7Hz,1H),5.03(dd,J=10.1,6.0Hz,1H),4.64(dd,J=8.6,4.3Hz,1H),3.93(s,3H),3.30-3.17(m,2H),2.63-2.52(m,1H),2.37-2.21(m,2H),1.95-1.74(m,4H),1.03(s,9H)。
实施例11
N2-[(4-溴-1-乙基-3-甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺(11)
向0℃的C18(43.4mg,≤0.10mmol)和4-溴-1-乙基-3-甲基-1H-吡唑-5-羧酸(23.3mg,0.100mmol)的乙腈(1.0mL)浆料加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;38.0mg,0.100mmol),随后4-甲基吗啉(30μL,0.27mmol)的乙腈(0.2mL)溶液。在反应混合物在0℃已搅拌大约80分钟之后,加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;71.5mg,0.300mmol)和继续搅拌。在大约2.75小时之后,再次加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;71.5mg,0.300mmol),让反应进行1.5小时,然后将其用饱和碳酸氢钠水溶液(3mL)在0℃处理,用二氯甲烷(2x8mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层,然后溶于乙腈(4mL)和用Genevac蒸发仪再次浓缩,提供粗制产品(138mg)。一部分该物质(80mg)经由反相HPLC纯化(柱:Waters Sunfire C18,19x100mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:在8.54分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.46分钟;流速:25mL/分),提供N2-[(4-溴-1-乙基-3-甲基-1H-吡唑-5-基)羰基]-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-甲基-L-亮氨酰胺(11)。收率:24.7mg,49.8μmol,86%,2步。LCMS m/z495.5(观察到溴同位素模式)[M+H]+。保留时间:2.48分钟(分析条件。柱:Waters AtlantisC18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v)。梯度:在4.0分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.0分钟。流速:2mL/分)。
实施例12
N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(3,3-二氟环丁基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺(12)
步骤1.合成4-甲基-L-亮氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺,盐酸盐(C18,HCl盐)。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;1.7mL,6.8mmol)溶液加入C17(260mg,0.652mmol)的乙腈(3mL)溶液。在室温下搅拌反应混合物1.5小时,然后将其减压浓缩,然后反复地溶于二氯甲烷和庚烷混合物(1:1,3x10mL)和再浓缩,提供C18,HCl盐(242mg),是玻璃状物。一部分该物质用于下述步骤。LCMS m/z 299.3[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.53(dd,J=10.3,5.0Hz,1H),3.91(dd,J=7.5,5.4Hz,1H),3.41-3.26(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.57-2.47(m,1H),2.41(dddd,J=12.0,8.7,7.0,3.1Hz,1H),2.15(ddd,J=13.9,10.3,4.9Hz,1H),2.05-1.97(m,1H),1.97-1.85(m,1H),1.78(ddd,J=14.1,9.1,5.0Hz,1H),1.60(dd,J=14.3,5.4Hz,1H),1.01(s,9H)。
步骤2.合成N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(3,3-二氟环丁基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺(12)。
将C18,HCl盐(来自先前步骤;37.2mg,≤0.100mmol)和(3,3-二氟环丁基)乙酸(15.8mg,0.105mmol)的四氢呋喃(1.0mL)浆料用2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三磷杂环己烷2,4,6-三氧化物(50%重量乙酸乙酯溶液;65.5μL,0.110mmol)和4-甲基吗啉(27.5μL,0.250mmol)处理。在反应混合物已在室温下搅拌过夜之后,将其在50℃加热4.5小时,然后再次加入2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三磷杂环己烷2,4,6-三氧化物(50%重量乙酸乙酯溶液;2.2当量)和4-甲基吗啉(5当量)。在反应混合物在50℃已搅拌额外3天之后,将其用饱和碳酸氢钠水溶液(3mL)处理和用二氯甲烷(4x4mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层和经由反相HPLC纯化(柱:Waters XBridge C18,19x100mm,5μm;流动相A:水;流动相B:乙腈;梯度:在8.5分钟内20%至40%B,然后在0.5分钟内40%至95%B,然后95%B持续1.0分钟;流速:25mL/分),提供N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-N2-[(3,3-二氟环丁基)乙酰基]-4-甲基-L-亮氨酰胺(12)。收率:10.1mg,24.5μmol,24%,2步。LCMS m/z 413.5[M+H]+。保留时间:1.96分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis C18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v)。梯度:在4.0分钟内5%至95%B,然后95%B持续1.0分钟。流速:2mL/分)。
实施例13
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)
步骤1.合成(1R,2S,5S)-3-[N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯(C31)。
将O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;7.92g,20.8mmol)加入0℃的N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酸(4.38g,18.9mmol)和(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯,盐酸盐(3.9g,19mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(95mL)中的混合物。在反应混合物已搅拌5分钟之后,加入N,N-二异丙基乙胺(8.25mL,47.4mmol);在0℃继续搅拌2小时,然后加入柠檬酸水溶液(1N,20mL)和水(40mL)。所得混合物搅拌2分钟,然后用乙酸乙酯稀释(250mL)。有机层用水(3x150mL)和用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至100%乙酸乙酯/庚烷)提供C31,是油状物。收率:3.60g,9.41mmol,50%。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ6.42(d,J=9.7Hz,<1H;不完全地与溶剂交换),4.35(s,1H),4.21(d,J=9.7Hz,1H),4.02(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.91(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.3Hz,1H),3.73(s,3H),1.57(dd,ABX体系的组成部分,J=7.5,5.1Hz,1H),1.47(d,AB四重峰的一半,J=7.5Hz,1H),1.41(s,9H),1.07(s,3H),1.02(s,9H),0.93(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-3-[N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C32)。
将氢氧化锂水溶液(1.0M;14.7mmol,14.7mL)滴加至0℃的C31(3.60g,9.41mmol)的四氢呋喃和甲醇混合物(1:1,30mL)溶液。在反应混合物在0℃已搅拌1小时之后,将其温热至室温和搅拌1小时,然后LCMS分析指出转化为C32:LCMS m/z 367.3[M-H]-。加入1M盐酸调节为pH 3,此后将混合物用水稀释(30mL)。水层用乙酸乙酯(2x75mL)萃取,经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C32,是米白色固体。收率:3.10g,8.41mmol,89%。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ6.39(d,J=9.7Hz,大约0.5H;不完全地与溶剂交换),4.33(s,1H),[4.21(d,J=9.6Hz)和4.21(s),共1H],4.01(d,AB四重峰的一半,J=10.5Hz,1H),3.91(dd,ABX体系的组成部分,J=10.4,5.2Hz,1H),1.56(dd,ABX体系的组成部分,J=7.5,5.0Hz,1H),1.50(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.42(s,9H),1.07(s,3H),1.02(s,9H),0.93(s,3H)。
步骤3.合成{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3,3-二甲基-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸叔丁酯(C33)。
将0℃的C7(31.9mg,≤94μmol)和C32(34mg,92μmol)在乙腈(1mL)中的混合物用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU,97%;36.2mg,92.3μmol)、随后4-甲基吗啉(25μL,0.23mmol)的乙腈(0.25mL)溶液处理。在反应混合物在0℃已搅拌大约1小时之后,将其用饱和碳酸氢钠水溶液(3mL)在0℃稀释,用二氯甲烷(4x4mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层,提供C33,是胶状物(48mg)。绝大部分该物质用于下述步骤。LCMS m/z 504.6[M+H]+
步骤4.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)。
制备甲磺酸(60μL)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(940μL)储备溶液。向C33(来自先前步骤;47mg,≤90μmol)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(1mL)溶液加入一部分甲磺酸储备溶液(0.1mL;100μmol)。在反应混合物在室温下已搅拌1小时之后,将其减压浓缩,然后分散于下述溶剂混合物和再浓缩:乙腈和乙酸乙酯混合物(1:1,2x10mL),然后乙酸乙酯和庚烷混合物(1:1,2x10mL)。残余物溶于二氯甲烷(1mL)和用4-甲基吗啉(30.8μL,0.280mmol),随后三氟乙酸酐(0.143mL,1.01mmol)处理。在室温下搅拌反应混合物40分钟,然后将其用4-甲基吗啉(30.8μL,0.280mmol)随后三氟乙酸酐(0.143mL,1.01mmol)处理;在30分钟之后,再次加入4-甲基吗啉(30.8μL,0.280mmol),随后三氟乙酸酐(0.143mL,1.01mmol)。在搅拌额外15分钟之后,反应混合物用盐酸(1M;3mL)处理,所得混合物用二氯甲烷(3x4mL)萃取;减压浓缩经合并的有机层和用反相HPLC纯化(Waters Sunfire C18,19x100mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v)。梯度:在8.5分钟内20%至60%B,然后在0.5分钟内60%至95%B,然后95%B持续1分钟;流速:25mL/分),提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)。收率:7.5mg,15μmol,17%,2步。LCMS m/z 500.5[M+H]+。保留时间:2.66分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis dC18,4.6x50mm,5μm;流动相A:0.05%三氟乙酸/水(v/v);流动相B:0.05%三氟乙酸/乙腈(v/v);梯度:在4.0分钟内5.0%至95%B,然后95%B持续1.0分钟;流速:2mL/分)。
实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的备择合成;产生13,甲基叔丁基醚溶剂化物,固体形式2
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物),固体形式2
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步骤1.合成{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酸叔丁酯(C5)。
该实验以2个平行批次进行。将氨的甲醇(7M;2.4L,17mol)溶液加入N-(叔丁氧羰基)-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酸甲酯(600g,2.10mol)和在25℃搅拌反应混合物40小时。减压浓缩和合并2个批次提供C5,是黄色固体。合并的收率:1.10kg,4.05mol,96%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.63(br s,1H),7.29(br s,1H),7.01(br s,1H),6.89(d,J=8.5Hz,1H),3.96-3.85(m,1H),3.22-3.06(m,2H,假定的;部分受水峰掩蔽),2.28-2.08(m,2H),1.89(ddd,J=14.6,10.8,4.0Hz,1H),1.74-1.60(m,1H),1.56-1.43(m,1H),1.36(s,9H)。
步骤2.合成3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺,盐酸盐(C16,HCl盐)。
该实验以3个平行批次进行。向0℃的C5(840g,3.10mol)的二氯甲烷(2.0L)溶液加入氯化氢的1,4-二噁烷(4M;2L,8mol)溶液。在25℃搅拌反应混合物2小时,然后将其减压浓缩;合并3个批次提供C16,HCl盐,是白色固体。合并的收率:1.20kg,5.78mol,62%。MS m/z172.1[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.52-8.35(br s,3H),8.12(s,1H),7.95(s,1H),7.57(s,1H),3.88-3.76(m,1H),3.24-3.10(m,2H),2.59-2.5(m,1H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.35-2.24(m,1H),2.01(ddd,J=14.9,9.2,6.1Hz,1H),1.80-1.68(m,2H)。
将C16,HCl盐样品在2-丙醇中研磨1.5小时,然后将其经由过滤收集和用2-丙醇冲洗。收集的固体在高真空下干燥过夜,获得用于粉末X射线衍射研究的样品。该物质的粉末X射线衍射图谱提供于图10;特征峰列于表Q。
收集粉末X射线衍射数据
粉末X射线衍射分析用下述进行:Bruker AXS D4 Endeavor衍射仪,配有Cu辐射来源。分散狭缝设置于0.6mm而第二光学装置使用可变狭缝。衍射的辐射通过PSD-Lynx Eye检测器检测。X射线管电压和安培数分别设置为40kV和40mA。数据在Theta-2Theta测角仪中收集,Cu波长为3.0至40.0度2-Theta,用0.020度的步长和0.3秒的步时。样品通过将它们置于硅质低背景样品架制备并且在收集期间旋转。
粉末X射线衍射分析用下述进行:Bruker AXS D8高级衍射仪,配有Cu辐射来源。衍射的辐射通过具有机动狭缝的LYNXEYE_EX检测器检测。主要和次要装置均配有2.5Soller狭缝。X射线管电压和安培数分别设置于40kV和40mA。数据在Theta-Theta测角仪中以锁定耦合扫描收集,Cu K-α(平均)波长为3.0至40.0度2-Theta,增量0.02度,使用0.5秒每步的扫描速度。样品通过置于硅质低背景样品架制备。
数据用两种设备用Bruker DIFFRAC Plus软件收集,分析通过EVA DIFFRAC plus软件进行。PXRD数据文件在寻峰之前并不处理。用EVA软件中的寻峰算法,以阈值1选择的峰用来进行初步分峰。为了确保有效性,手工进行调节;视觉检查自动化分配的输出,将峰位置调节至峰最大值。一般选择相对强度≥3%的峰。一般地,不选择未解析的或与噪音一致的峰。与PXRD峰位置有关的典型误差在USP中描述为多至+/-0.2°2-Theta(USP-941)。
表Q.对C16,HCl盐选择的粉末X射线衍射峰
角(°2θ) 相对强度 角(°2θ) 相对强度
9.97 3 29.24 13
11.67 1 30.98 6
14.17 1 31.78 2
16.08 1 32.32 23
16.35 1 32.79 10
17.10 14 33.10 1
17.27 3 33.50 6
18.23 24 33.70 4
19.21 4 33.90 3
20.83 20 35.27 3
22.20 58 36.20 3
22.97 12 36.42 6
23.35 34 36.75 6
23.79 2 36.95 7
24.62 3 37.83 3
25.10 100 38.58 2
26.85 11 39.44 7
28.39 14 39.75 1
3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺盐酸盐,C16 HCl盐的备择合成
化合物C16,HCl盐的备择制备描述于下述反应方案。
在室温下向氨的甲醇(7.0M;100mL,725.4mmol)溶液加入(S)-2-氨基-3-((S)-2-氧代吡咯烷-3-基)丙酸甲酯4-甲基苯磺酸盐(20g,55.8mmol)和硫酸镁(6.7g,55.8mmol)。在室温下搅拌反应混合物7小时之后,向反应鼓泡氮1小时冲洗过量氨。随后,反应过滤通过C垫然后减压浓缩,所得(S)-2-氨基-3-((S)-2-氧代吡咯烷-3-基)丙酰胺4-甲基苯磺酸盐直接用于后续步骤而不加进一步纯化。向二甲基甲酰胺(50mL,647mmol)的溶液加入一部分(S)-2-氨基-3-((S)-2-氧代吡咯烷-3-基)丙酰胺4-甲基苯磺酸盐(10g,25.9mmol)和氯化氢的1,4-二噁烷(4.0M;19.4mL,77.7mmol)溶液。在室温下搅拌12小时之后,过滤浆料和用二甲基甲酰胺(15mL,190mmol)洗涤。所得固体在真空炉中在40℃干燥12小时,提供3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺盐酸盐,C16 HCl盐(2.7g,12.4mmol),是黄褐色固体(总收率48%)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-3-[N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯(C31)。
该实验以3个平行批次进行。向0℃的(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯,盐酸盐(237g,1.15mol)和N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酸(293g,1.27mol)的N,N-二甲基甲酰胺(400mL)和乙腈(3.6L)混合物溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;481g,1.26mol),随后滴加N,N-二异丙基乙胺(601mL,3.45mol)。反应混合物然后温热至25℃和搅拌16小时,然后将其倾至pH大约5的冰水(1L)和盐酸(0.5M;1L)混合物中,搅拌6分钟。所得混合物用乙酸乙酯(2L)萃取,有机层用水(2L)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物用硅胶色谱法纯化(梯度:0%至50%乙酸乙酯/石油醚),在合并3个批次后提供C31,是无色油状物。合并的收率:1.17kg,3.06mol,89%。LCMS m/z 383.3[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ5.10(d,J=10.2Hz,1H),4.46(s,1H),4.20(d,J=10.3Hz,1H),3.98(d,AB四重峰的一半,J=10.2Hz,1H),3.89-3.82(m,1H),3.74(s,3H),1.48-1.41(m,2H),1.38(s,9H),1.03(s,3H),1.01(s,9H),0.89(s,3H)。
步骤4.合成(1R,2S,5S)-3-[N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C32)。
该实验以3个平行批次进行。向C31(668g,1.75mol)的四氢呋喃(2.5L)溶液加入一水合氢氧化锂(220g,5.24mol)和水(500mL)。反应混合物在25℃已搅拌2小时之后,将其减压浓缩除去绝大多数四氢呋喃;然后加入1M盐酸将残余物调节至pH 2。所得混合物用乙酸乙酯(2x500mL)萃取,经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(500mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,在合并3个批次之后提供C32,是白色固体(2.0kg)。该物质直接用于下述步骤。LCMS m/z 313.2[(M-2-甲基丙-1-烯)+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ5.14(d,J=10.2Hz,1H),4.46(s,1H),4.24(d,J=10.2Hz,1H),4.06(d,AB四重峰的一半,J=10.5Hz,1H),3.82(dd,ABX体系的组成部分,J=10.5,5.5Hz,1H),1.75(d,J=7.7Hz,1H),1.49(dd,J=7.7,5.4Hz,1H),1.40(s,9H),1.06(s,3H),1.00(s,9H),0.89(s,3H)。
步骤5.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-(3-甲基-L-缬氨酰基)-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸,盐酸盐(C41)。
该实验以2个平行批次进行。将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;4.0L,16mol)溶液加入C32(来自先前步骤;1.00kg,≤2.62mol)的二氯甲烷(1.0L)溶液,反应混合物在25℃搅拌16小时。在50℃减压除去溶剂,在合并2个批次之后提供C41,是白色固体(1.8kg)。该物质直接用于下述步骤。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.42(s,1H),4.00(s,1H),3.94(dd,ABX体系的组成部分,J=10.7,5.4Hz,1H),3.80(d,AB四重峰的一半,J=10.7Hz,1H),1.62(dd,ABX体系的组成部分,J=7.7,5.2Hz,1H),1.56(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.15(s,9H),1.09(s,3H),1.03(s,3H)。
步骤6.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C42)。
该实验以3个平行批次进行。向0℃的C41(来自先前步骤;600g,≤1.75mol)的甲醇(2L)溶液加入三乙胺(1.64L,11.8mol),随后三氟乙酸乙酯(699g,4.92mol),然后让反应混合物温热至25℃,和搅拌16小时。将其然后在50℃减压浓缩,残余物用乙酸乙酯稀释(3L)和加入2M盐酸调节至pH 3至4。在用乙酸乙酯(1L)萃取水层之后,经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(3L)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。此时合并3个批次,用石油醚和乙酸乙酯混合物(5:1,3L)处理,和在25℃搅拌2小时。过滤提供C42,是白色固体。合并的收率:1.90kg,5.21mol,99%,3步。LCMS m/z 365.1[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.88(d,J=8.8Hz,<1H;不完全地交换),[4.60(d,J=8.9Hz)和4.59(s),共1H],4.35(s,1H),3.96(dd,ABX体系的组成部分,J=10.5,5.1Hz,1H),3.90(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),1.58(dd,ABX体系的组成部分,J=7.6,4.9Hz,1H),1.52(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.08(s,12H),0.92(s,3H)。
步骤7.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(C43)。
该实验以4个平行批次进行。将2-羟基吡啶1-氧化物(33.9g,305mmol)加入C42(445g,1.22mol)和C16,HCl盐(256g,1.23mol)的丁烷-2-酮(2.5L)溶液,将混合物冷却至0℃。然后加入N,N-二异丙基乙胺(638mL,3.66mol),随后滴加1-[3-(二甲基氨基)丙基]-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(351g,1.83mol)。在25℃搅拌反应混合物16小时,然后将其用乙酸乙酯稀释(1L)和用盐酸(1M;1.5L,1.5mol)和饱和氯化钠水溶液(1L)混合物处理。有机层用氢氧化钠水溶液(1M;1.5L,1.5mol)和饱和氯化钠水溶液(1L)混合物洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。合并4个批次提供C43,是白色固体(2.3kg)。合并的收率:2.1kg(校正残余乙酸乙酯),4.1mol,84%。LCMS m/z 518.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.41(br d,J=7.7Hz,1H),8.30(d,J=8.8Hz,1H),7.56(s,1H),7.32(br s,1H),7.04(br s,1H),4.43(br d,J=7.3Hz,1H),4.35-4.25(m,1H),4.28(s,1H),3.89(dd,J=10.3,5.5Hz,1H),3.67(d,J=10.4Hz,1H),3.17-3.09(m,1H),3.07-2.98(m,1H),2.46-2.35(m,1H),2.19-2.10(m,1H),1.99-1.89(m,1H),1.70-1.58(m,1H),1.55-1.44(m,2H),1.38(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.01(s,3H),0.98(s,9H),0.84(s,3H)。
步骤8.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物),固体形式2。
该实验以3个平行批次进行。将N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;552g,2.32mol)加入C43(600g,1.16mol)的乙酸乙酯(3L)溶液。在反应混合物在25℃已搅拌3小时之后,将其用额外的N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;27.6g,116mmol)处理和搅拌反应混合物1小时。将其然后过滤;滤饼用乙酸乙酯(2x500mL)洗涤,经合并的滤液依次用碳酸氢钠水溶液(1M;2L),饱和氯化钠水溶液(2L),盐酸(1M;2L),和饱和氯化钠水溶液(2L)洗涤。有机层然后在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物用乙酸乙酯和甲基叔丁基醚混合物(1:10,2.5L)处理和加热至50℃;在50℃搅拌1小时之后,将其冷却至25℃和搅拌2小时。固体经由过滤收集,在乙酸乙酯(8L)中合并3个批次和过滤通过硅胶(3.0kg);硅胶然后用乙酸乙酯(2x2L)洗涤。在经合并的洗脱物已减压浓缩之后,将残余物分散于乙酸乙酯(900mL)和甲基叔丁基醚(9L)。将该混合物加热至50℃持续1小时,冷却至25℃,和搅拌2小时。过滤提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物),是白色固体。该物质(指定为固体形式2)的粉末X射线衍射图谱提供于图1;特征峰列于表A。合并的收率:1.41kg,2.82mol,81%。LCMS m/z 500.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.42(d,J=8.4Hz,1H),9.03(d,J=8.6Hz,1H),7.68(s,1H),4.97(ddd,J=10.9,8.5,5.1Hz,1H),4.41(d,J=8.5Hz,1H),4.16(s,1H),3.91(dd,J=10.4,5.5Hz,1H),3.69(d,J=10.4Hz,1H),3.18-3.10(m,1H),3.08-2.99(m,1H),2.46-2.34(m,1H),2.20-2.03(m,2H),1.78-1.65(m,2H),1.57(dd,J=7.6,5.4Hz,1H),1.32(d,J=7.6Hz,1H),1.03(s,3H),0.98(s,9H),0.85(s,3H)。
收集粉末X射线衍射数据
粉末X射线衍射分析用下述进行:Bruker AXS D8 Endeavor衍射仪,配有Cu辐射来源(K-α平均)。分散狭缝设置于15mm连续光照。衍射的辐射通过PSD-Lynx Eye检测器检测,其检测器PSD开口设置于2.99度。X射线管电压和安培数分别设置为40kV和40mA。数据在Theta-Theta测角仪中收集,Cu波长为3.0至40.0度2-Theta,使用0.00998度的步长和1.0秒的步时。抗散射屏设置为固定距离1.5mm。样品在收集期间于15/分旋转。样品通过将它们置于硅质低背景样品架制备和在收集期间旋转。数据用Bruker DIFFRAC Plus软件收集,分析通过EVA DIFFRAC Plus软件进行。用EVA软件中的寻峰算法,以阈值1选择的峰用来进行初步分峰。为了确保有效性,手工进行调节;视觉检查自动化分配的输出,将峰位置调节至峰最大值。一般选择相对强度≥3%的峰。不选择未解析的或与噪音一致的峰。与PXRD峰位置有关的典型误差在USP中描述为多至+/-0.2°2-Theta(USP-941)。
表A.为13,甲基叔丁基醚溶剂化物(固体形式2)选择的粉末X射线衍射峰,其来自"实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的备择合成;产生13,甲基叔丁基醚溶剂化物,固体形式2"
(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C42)的备择合成。
实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的第二备择合成;产生13,甲基叔丁基醚溶剂化物,固体形式2
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物),固体形式2
将N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;392g,1.64mol)加入C43(415g,802mmol)的乙酸乙酯(2.0L)溶液。在25℃搅拌反应混合物3小时,然后再次加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;86.0g,361mmol)。在反应混合物已搅拌1小时之后,将其过滤,滤液依次用碳酸氢钠水溶液(1M;1.5L),饱和氯化钠水溶液(1.5L),盐酸(1M;1.5L),和饱和氯化钠水溶液(1.5L)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物用乙酸乙酯和甲基叔丁基醚混合物(1:10,2.5L)处理和加热至50℃;在50℃搅拌1小时之后,将其冷却至25℃和搅拌2小时。经由过滤收集固体提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物),是结晶的白色固体。该物质(指定为固体形式2)的粉末X射线衍射图谱提供于图2;特征峰列于表B。收率:338g,575mmol,72%。LCMS m/z 500.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.43(d,J=8.4Hz,1H),9.04(d,J=8.6Hz,1H),7.68(s,1H),4.97(ddd,J=10.9,8.5,5.0Hz,1H),4.41(d,J=8.5Hz,1H),4.15(s,1H),3.91(dd,ABX体系的组成部分,J=10.4,5.5Hz,1H),3.69(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.18-3.10(m,1H),3.08-2.98(m,1H),2.46-2.34(m,1H),2.20-2.02(m,2H),1.77-1.65(m,2H),1.57(dd,J=7.6,5.4Hz,1H),1.32(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.02(s,3H),0.98(s,9H),0.85(s,3H);甲基叔丁基醚峰:3.07(s,3H),1.10(s,9H)。
收集粉末X射线衍射数据的方法描述于实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的备择合成,步骤8。
表B.为13,甲基叔丁基醚溶剂化物(固体形式2)选择的粉末X射线衍射峰,其来自"实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的第二备择合成;产生13,甲基叔丁基醚溶剂化物,固体形式2"
实施例13的第三备择合成
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)
步骤1.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物)
在大约10分钟内将0℃的C42(90.5质量%,5.05g,12.5mmol)和C16,HCl盐(98.9质量%,3.12g,14.9mmol)在乙腈(50mL)中的混合物用2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三磷杂环己烷2,4,6-三氧化物(50%重量乙腈溶液;17mL,24.3mmol)处理。然后在大约15分钟内缓慢加入1-甲基-1H-咪唑(4.0mL,50.2mmol),在0℃搅拌反应混合物3.5小时,然后将其温热至25℃。一批加入2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三磷杂环己烷2,4,6-三氧化物(50%重量乙腈溶液;17mL,24.3mmol),和在45℃搅拌反应混合物16小时。此时将其冷却至25℃,然后在10分钟内用碳酸氢钠水溶液(1.14M;35mL,40mmol)处理。在加入乙酸乙酯(25mL)和足量水溶解所得固体之后,有机层用碳酸氢钠水溶液(1.14M;25mL,28mmol)洗涤两次。在有机层已用氯化钠水溶液(14%,2x20mL)洗涤之后,将其在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物与乙酸乙酯(2.1mL)混合,用甲基叔丁基醚(19mL)处理;所得浆料在50℃加热搅拌1小时,在1小时内冷却至25℃,在25℃保持1.5小时。固体经由过滤分离,用甲基叔丁基醚(2mL/g)洗涤,和在真空炉中在50℃干燥过夜,提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物),是结晶的白色固体。将该物质整体用于后续步骤。收率:3.71g,6.31mmol,50%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.40(d,J=8.4Hz,1H),9.02(d,J=8.6Hz,1H),7.66(s,1H),4.97(ddd,J=10.7,8.6,5.1Hz,1H),4.41(d,J=8.4Hz,1H),4.16(s,1H),3.91(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.5Hz,1H),3.69(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.18-3.10(m,1H),3.09-2.99(m,1H),2.46-2.35(m,1H),2.20-2.04(m,2H),1.78-1.64(m,2H),1.56(dd,J=7.4,5.6Hz,1H),1.32(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.03(s,3H),0.98(s,9H),0.85(s,3H);甲基叔丁基醚峰:3.07(s,3H),1.10(s,9H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)。
将乙酸丙-2-基酯(17mL)和庚烷(17mL)的混合物加至13,甲基叔丁基醚溶剂化物(来自先前步骤;3.41g,5.80mmol),在20℃进行搅拌过夜。然后在2小时内加入庚烷(17mL),混合物在室温下搅拌过夜。过滤所得浆料,收集的固体用乙酸丙-2-基酯(1.36mL)和庚烷(3.73mL)混合物洗涤,在50℃减压干燥,提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13),是结晶固体。该批次的一部分用作下文"实施例13的重结晶;产生固体形式1"中的晶种物质。收率:2.73g,5.46mmol,94%。
实施例13的重结晶;产生固体形式1
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13),固体形式1
将13,甲基叔丁基醚溶剂化物(来自"实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的备择合成;产生13,甲基叔丁基醚溶剂化物,固体形式2";60.1g,102mmol)和乙酸丙-2-基酯(480mL)的混合物加热至60℃。加入13的样品(晶种物质,来自实施例13的第三备择合成,步骤2;1.2g,2.4mmol);在10分钟之后,晶种物质仍为固体形式。在12小时内,将庚烷(360mL)缓慢加至搅拌的混合物。在4小时内引入额外的庚烷(360mL),搅拌所得混合物30分钟。将其然后以0.1度/分的速率冷却至20℃,然后将其搅拌过夜。经由过滤收集固体,和用乙酸丙-2-基酯(72mL)和庚烷(168mL)混合物洗涤。将其然后在50℃减压干燥,提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13),是白色结晶固体。该物质(指定为固体形式1)的粉末X射线衍射图谱提供于图3;特征峰列于表C。收率:47.8g,95.7mmol,94%。
收集粉末X射线衍射数据的方法描述于实施例13甲基叔丁基醚溶剂化物的备择合成,步骤8。
表C.为13固体形式1选择的粉末X射线衍射峰
实施例13固体形式1的单晶X射线结构测定
用乙酸乙酯和己烷对实施例13的样品进行经由扩散的结晶。让结晶容器在室温下放置,同时溶剂蒸发;在2.5个月之后,出现X射线品质的晶体。将这些晶体之一用于结构测定。单晶数据的ORTEP图示于图4。用Mercury软件来从解析的晶体结构计算粉末图谱;与"实施例13的重结晶;产生固体形式1"的衍射图谱比较将该物质鉴定为固体形式1(参见图5)。该计算数据的特征峰提供于表D。
表D.从"实施例13固体形式1的单晶X射线结构测定"计算的13固体形式1的粉末图谱数据
单晶X射线分析
数据收集在Bruker D8 Quest衍射仪上在室温进行。数据收集由omega和phi扫描组成。
用SHELX软件套装在正交类型空间群P212121中通过固有相位调整解结构。结构随后通过全矩阵最小二乘法精修。发现全部非氢原子并用各向异性位移参数精修。
从傅里叶差值地图发现位于氮上的氢原子并用约束的距离精修。将剩余氢原子置于计算位置并让其加载于它们的负载原子上。最终的精修包括全部氢原子的各向同性位移参数。
使用可能性方法的绝对结构分析(Hooft,2008)用PLATON(Spek)来进行。结果指出已正确赋予绝对结构。方法计算出正确赋予结构的可能性是100%。Hooft参数报告为-0.01,其esd(估计标准偏差)是(3),而Parson参数报告为-0.01,其esd是(2)。
最终的R-指数是3.3%。最终的差值傅里叶揭示并无缺失的或误置的电子密度。
有关的晶体,数据收集和精修信息概括于表E。原子坐标,键长,键角和位移参数列于表F-H。
软件和参考文献
SHELXTL,版本5.1,Bruker AXS,1997。
PLATON,A.L.Spek,J.Appl.Cryst.2003,36,7-13。
MERCURY,C.F.Macrae,P.R.Edington,P.McCabe,E.Pidcock,G.P.Shields,R.Taylor,M.Towler,和J.van de Streek,J.Appl.Cryst.2006,39,453-457。
OLEX2,O.V.Dolomanov,L.J.Bourhis,R.J.Gildea,J.A.K.Howard,和H.Puschmann,J.Appl.Cryst.2009,42,339-341。
R.W.W.Hooft,L.H.Straver,和A.L.Spek,J.Appl.Cryst.2008,41,96-103。
H.D.Flack,Acta Cryst.1983,A39,867-881。
表E.实施例13固体形式1的晶体数据和结构精修。
表F.实施例13固体形式1的原子坐标(x 104)和等价各向同性位移参数U(eq)定义为正交化Uij张量的迹的1/3。
/>
表G.实施例13固体形式1的键长和键角[°]。
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/>
/>
/>
用对称性转化来产生等价原子。
表H.实施例13固体形式1的各向异性位移参数各向异性位移因子指数呈下述形式:-2π2[h2 a*2U11+...+2h k a*b*U12]。
/>
实施例13化合物形式1和4的固态NMR分析在置入Bruker-BioSpin Avance III500MHz(1H频率)NMR光谱仪中的CPMAS探针上进行。使用15.0kHz的魔角旋转速率。形式1谱图在环境温度收集(不控温)和形式4谱图在15℃收集。
13C ssNMR谱图用质子去耦交叉极化魔角旋转(CPMAS)实验收集。在光谱采集期间施加80-100kHz的相位调节的质子去耦场。对于形式1和形式4,交叉极化接触时间设置为2ms和循环延迟设置为3.5秒。调节扫描数以获得适当的信噪比。13C化学位移数值范围用针对结晶金刚烷外标的13C CPMAS实验作参照,将其高场共振设置为29.5ppm。
19F ssNMR谱图用质子去耦魔角旋转(MAS)实验收集。在光谱采集期间施加80-100kHz的相位调节的质子去耦场。收集谱图的循环延迟对形式1设置为6秒而对形式4设置为5.25秒。调节扫描数以获得适当的信噪比。19F化学位移数值范围用针对三氟乙酸外标(50%/50%v/v,在H2O中)的19F MAS实验作参照,将其共振设置为-76.54ppm。
自动寻峰用Bruker-BioSpin TopSpin版本3.6软件进行。一般地,将4%相对强度的阈值用于初步选峰。视觉检查自动化寻峰的输出以确保有效性并且如果需要则手工进行调节。尽管本文报告具体固态NMR峰值,但这些峰值确实由于设备、样品和样品制备的差异而存在一个范围。这在固态NMR领域是通常的实践,原因是峰位置固有的变化。对于结晶固体,13C化学位移x-轴值的典型可变性是正负0.2ppm数量级,除非另有说明。19F化学位移x-轴值的可变性是正负0.1ppm数量级。本文报告的固态NMR峰高是相对强度。固态NMR强度能够取决于实验参数的实际设置和样品的热历史而变化。
实施例13,形式1的13C固态NMR如上文所述获得,并且确定实施例13,形式1的下述峰列表。13C化学位移值的可变性是±0.2ppm,除非另有指定。
获得实施例13化合物形式1的19F固态NMR并且确定化学位移在-73.3±0.1ppm的19F固态NMR峰值。
实施例13化合物形式1的特征峰是化学位移在-73.3±0.1ppm的19F峰和与之组合的化学位移在31.0±0.1ppm,27.9±0.1ppm和178.9±0.2ppm的13C峰。
实施例13的备择重结晶;产生固体形式4
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13),固体形式4
步骤1.从乙酸丙-2-基酯和庚烷重结晶(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)。
将乙酸丙-2-基酯(50mL)和庚烷(50mL)的混合物加至13,甲基叔丁基醚溶剂化物,固体形式2(来自"实施例13,甲基叔丁基醚溶剂化物的第二备择合成";10.02g,17.0mmol),将混合物在20℃和3500rpm搅拌过夜。然后缓慢加入庚烷(50mL),和继续搅拌30分钟,然后将混合物在30分钟内冷却至10℃。在搅拌额外的2小时之后,过滤浆料;滤饼用乙酸丙-2-基酯(4mL)和庚烷(16mL)混合物洗涤,随后在55℃减压干燥,提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13),是结晶固体。一部分该物质用于下述重结晶。收率:7.74g,15.5mmol,91%。
步骤2.从水重结晶(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)。
将13(来自先前步骤;1.0g,2.0mmol)在水(12mL)中的浆料在5℃搅拌21天,然后经由过滤收集固体。将其然后减压干燥10分钟和在纸上薄层中空气干燥20分钟,提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13),是白色结晶固体。该物质(指定为固体形式4)的粉末X射线衍射图谱提供于图6;特征峰列于表J。收率:755mg,1.51mmol,76%。收集粉末X射线衍射数据的方法描述于"实施例13,甲基叔丁基醚溶剂化物的备择合成",步骤8。
表J.对13固体形式4选择的粉末X射线衍射峰
实施例13固体形式4的单晶X射线结构测定
用乙酸乙酯和戊烷对实施例13的样品在室温进行经由扩散的结晶;将所得晶体之一用于单晶X射线结构测定。单晶数据的ORTEP图示于图7。用Mercury软件来从解析的晶体结构计算粉末图谱;与来自"实施例13的备择重结晶;产生固体形式4"的衍射图谱比较将该物质鉴定为固体形式4(参见图8)。该计算数据的特征峰提供于表K。
表K.从"实施例13固体形式4的单晶X射线结构测定"计算的13固体形式1的粉末图谱数据
单晶X射线分析
数据收集在Bruker D8 Venture衍射仪上在-100℃进行。数据收集由omega和phi扫描组成。
用SHELX软件套装在正交类别空间群P212121中通过固有相位调整解结构。结构随后通过全矩阵最小二乘法精修。发现全部非氢原子并用各向异性位移参数精修。
从傅里叶差值地图发现位于氮上的氢原子并用约束的距离精修。将剩余氢原子置于计算位置并让其加载于它们的负载原子上。最终的精修包括全部氢原子的各向同性位移参数。
使用可能性方法的绝对结构分析(Hooft,2008)用PLATON(Spek)进行。未确定绝对立体化学,原因是不符规格的Hooft/Parsons/Flack参数值和标准偏差。
最终的R-指数是6.3%。最终的差值傅里叶揭示并无缺失的或误置的电子密度。
有关的晶体,数据收集和精修信息概括于表L。原子坐标,键长,键角和位移参数列于表M-P。
软件和参考文献
SHELXTL,版本5.1,Bruker AXS,1997。
PLATON,A.L.Spek,J.Appl.Cryst.2003,36,7-13。
MERCURY,C.F.Macrae,P.R.Edington,P.McCabe,E.Pidcock,G.P.Shields,R.Taylor,M.Towler和J.van de Streek,J.Appl.Cryst.2006,39,453-457。
OLEX2,O.V.Dolomanov,L.J.Bourhis,R.J.Gildea,J.A.K.Howard和H.Puschmann,J.Appl.Cryst.2009,42,339-341。
R.W.W.Hooft,L.H.Straver和A.L.Spek,J.Appl.Cryst.2008,41,96-103。
H.D.Flack,Acta Cryst.1983,A39,867-881。
表L.实施例13固体形式4的晶体数据和结构精修。
表M.实施例13固体形式4的原子坐标(x 104)和等价各向同性位移参数U(eq)定义为正交化Uij张量的迹的1/3。/>
表N.实施例13固体形式4的键长和键角[°]。/>
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用对称性转化来产生等价原子。
表P.实施例13固体形式4的各向异性位移参数各向异性位移因子指数呈下述形式:-2π2[h2 a*2U11+...+2h k a*b*U12]。
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PF-07321332-00形式4的13C固态NMR峰列表。13C化学位移值的可变性是±0.2ppm,除非另有说明。
获得实施例13化合物形式4的19F固态NMR和确定相对强度100%的在-73.6±0.1的峰。
对于实施例13化合物形式4,鉴定6个特征峰:在-73.6±0.1ppm的19F化学位移和在26.9±0.1ppm,21.6±0.1ppm,41.5±0.2ppm,27.9±0.1ppm,和12.9±0.1的13C化学位移。化学位移在-73.6±0.1ppm的19F峰是实施例13化合物形式4的特征。在26.9±0.1ppm,21.6±0.1ppm和41.5±0.1ppm的13C峰各自是实施例13化合物形式4的特征峰。在与选自21.6ppm、26.9ppm和41.5ppm的13C峰和-73.6ppm的19F峰的一个或多个峰组合的情况下,在27.9ppm和12.9ppm的13C峰各自是实施例13化合物形式4的特征。
实施例13,甲基叔丁基醚溶剂化物的第四备择合成
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物)
向0℃的C43(5.0g,9.7mmol)的乙酸丙-2-基酯(7.6mL/g,38mL)浆料加入4-甲基吗啉(4.5当量;4.8mL,44mmol)。在1小时内经由定量给料泵向所得浆料加入三氟乙酸酐(2.25当量;3.1mL,22mmol)。在0℃搅拌至少1小时之后,将反应混合物温热至约20℃,用水(8mL/g,40mL)猝灭,和搅拌至少10分钟。在倾析之后,弃去底(含水)层和将水(8mL/g,40mL)加入有机层。在搅拌至少10分钟之后,分层,和弃去底(含水)层。减压浓缩有机层为大约4mL/g(约20mL),然后用氮打破真空和将溶液温热至大约50℃。将甲基叔丁基醚(12mL/g,60mL)在至少4小时内经由加料漏斗缓慢加入,将反应混合物在50℃保持至少1小时,随后在1小时内冷却至25℃。所得浆料在25℃保持过夜,然后过滤,依次用乙酸丙-2-基酯和甲基叔丁基醚混合物[1:3(v/v);2mL/g]和用甲基叔丁基醚(2mL/g,10mL)洗涤,和在滤器上干燥至少30分钟。固体然后转移入在50℃的真空炉和干燥至少8小时,提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物),是米白色固体。收率:3.4g,5.8mmol,60%。
实施例13,甲基叔丁基醚溶剂化物的第五备择合成
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物)
向室温的C43(4.0g,7.7mmol)的乙腈(10mL/g,40mL)浆料加入1-甲基-1H-咪唑(4.6当量;2.84mL,35.6mmol),将所得混合物温热至大约30℃。在至少6小时内用泵加入2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三磷杂环己烷2,4,6-三氧化物的溶液(50%重量乙腈溶液;2当量;10.8mL)。在反应混合物已搅拌至少10小时之后,将其冷却至25℃和仔细加入饱和碳酸氢钠水溶液(7mL/g,28mL)猝灭(放热和产气)。然后减压蒸除乙腈;向所得混合物加入乙酸乙酯(10mL/g,40mL)和额外的饱和碳酸氢钠水溶液(5mL/g,20mL)。在分相之后,弃去底(含水)层,有机层用饱和碳酸氢钠水溶液(3.5mL/g;14mL)洗涤。再次弃去水层,减压浓缩有机层至大约1mL/g(4mL)。加入甲基叔丁基醚(9mL/g;36mL),将所得溶液温热至50℃,快速获得浆料。该浆料在50℃保持至少30分钟,然后将其在1小时内冷却至25℃和在25℃保持至少8小时。浆料然后过滤,用乙酸乙酯和甲基叔丁基醚混合物[1:3(v/v);2mL/g]洗涤,然后用甲基叔丁基醚(2mL/g;8mL)洗涤。收集的固体在滤器上干燥至少30分钟,转移入在约50℃的真空炉,和干燥至少8小时,提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物(13,甲基叔丁基醚溶剂化物),是米白色固体。收率:2.9g,4.9mmol,64%。
实施例13化合物的配制剂实施例
配制(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺或其水合物或溶剂化物或者所述化合物、水合物或溶剂化物的药学上可接受的盐以制备用于口服给药的常规即释膜包衣片剂,其剂量的范围是100至250mg。例如,即释配制剂描述于"配制剂表"和包含常规的无活性赋形剂微晶纤维素和乳糖一水合物(稀释剂),交聚维酮(崩解剂),胶体二氧化硅(助流剂),和硬脂富马酸钠(润滑剂)。即释片剂用可商购的膜包衣配制剂包括Opadry白和Opadry粉来进行膜包衣。在膜包衣片剂中所用的全部赋形剂是全球可接受的且以有先例的水平存在。所提供的配制剂是即释片剂配制剂的实施例,并且因此本领域技术人员会能够使用可容易获得的惯例技术用备择的配制剂赋形剂来制备适宜的片剂和实现希望的片剂品质。
配制剂实施例:(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺的代表性包衣片剂配制剂
使用用于固体口服即释片剂的常规标准间歇过程制备(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(下文称为API)即释片剂。能用来制备(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺即释片剂的标准间歇过程的实例包括直接压缩,干法造粒和湿法造粒。另选地,能够使用连续操作制备过程。在压片之后,将片芯膜包衣。片剂膜包衣能够经由连续的包覆操作或用常规的间歇膜包衣过程来进行。
配制剂表:100mg、150mg和250mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺片剂配制剂
实施例14
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(14)
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步骤1.合成[(2S)-1-氨基-5,5,5-三氟-1-氧代戊烷-2-基]氨基甲酸9H-芴-9-基甲基酯(C34)。
将碳酸氢钠(4.8g,57mmol)加入5,5,5-三氟-L-正缬氨酰胺,盐酸盐(其用在J.E.Starrett,PCT Int.Appl.,2010107997,2010年9月23日中对其对映体描述的方法合成;4.0g,19mmol)和氯甲酸9H-芴-9-基甲基酯(Fmoc氯化物;10.2g,39.4mmol)的水(80mL)溶液。所得浆料在15℃至25℃搅拌24小时,然后将其在水与二氯甲烷之间分配。有机层依次用水和饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C34,是固体。收率:6.2g,16mmol,83%。LCMS m/z 393.1[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.9(d,2H),7.7(m,2H),7.5(d,1H),7.4(m,5H),7.1(br s,1H),4.3(m,3H),4.0(m,1H),2.2(m,2H),1.9(m,1H),1.7(m,1H)。
步骤2.合成N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-5,5,5-三氟-L-正缬氨酸(C35)。
向C34(6.2g,16mmol)的1,4-二噁烷(60mL)溶液加入盐酸(3M;10mL,30mmol),和在80℃搅拌反应混合物16小时。将其然后在水与二氯甲烷之间分配,有机层用水和用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物与石油醚研磨,提供C35,是固体。收率:5.5g,14mmol,88%。LCMS m/z 392.1[M-H]-1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.83(brs,1H),7.89(d,J=7.4Hz,2H),7.77-7.67(m,3H),7.46-7.38(m,2H),7.36-7.28(m,2H),4.38-4.28(m,2H),4.26-4.19(m,1H),4.06(ddd,J=9,9,4.9Hz,1H),2.43-2.15(m,2H),2.01-1.89(m,1H),1.89-1.75(m,1H)。
步骤3.合成N-[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]-5,5,5-三氟-L-正缬氨酸苄酯(C36)。
将C35(435mg,1.11mmol),苄基溴(0.263mL,2.21mmol),和碳酸氢钠(464mg,5.52mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(20mL)中的混合物在25℃搅拌15小时。在反应混合物已用水(30mL)稀释和用乙酸乙酯(3x30mL)萃取之后,经合并的有机层依次用饱和氯化钠水溶液和5%氯化锂水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至100%乙酸乙酯/石油醚)提供C36,是白色固体。收率:510mg,1.05mmol,95%。LCMS m/z506.1[M+Na+]。
步骤4.合成5,5,5-三氟-L-正缬氨酸苄酯(C37)。
将二乙胺(10mL)加入0℃的C36(510mg,1.05mmol)在乙腈(25mL)中的混合物。在反应混合物在20℃已搅拌2小时之后,将其减压浓缩;硅胶上的色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷)然后提供C37,是无色油状物。收率:250mg,0.957mmol,91%。LCMS m/z 302.9[M+CH3CN+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.42-7.32(m,5H),5.17(s,2H),3.50(dd,J=8.4,5.0Hz,1H),2.32-2.13(m,2H),2.01(dddd,J=13.7,10.8,5.2,5.2Hz,1H),1.76(dddd,J=13.6,10.8,8.4,5.3Hz,1H)。
步骤5.合成5,5,5-三氟-N-[(4-甲氧基-1H-吲哚-2-基)羰基]-L-正缬氨酸苄酯(C38)。
向0℃的C37(250mg,0.957mmol)和4-甲氧基-1H-吲哚-2-羧酸(220mg,1.15mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(10mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;437mg,1.15mmol),随后滴加4-甲基吗啉(194mg,1.92mmol)。在0℃至10℃继续搅拌1小时,然后反应混合物用水(20mL)和柠檬酸水溶液(20mL)稀释和用乙酸乙酯(3x20mL)萃取。经合并的有机层依次用饱和碳酸氢钠水溶液(30mL)、饱和氯化钠水溶液和氯化锂水溶液(5%,20mL)洗涤,然后在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物用硅胶色谱法纯化(梯度:0%至100%乙酸乙酯/石油醚),提供C38,是白色固体。收率:350mg,0.806mmol,84%。LCMS m/z 435.1[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ9.09(br s,1H),7.42-7.33(m,5H),7.23(dd,J=8,8Hz,1H),7.09(d,J=2.3Hz,1H),7.03(d,J=8.3Hz,1H),6.76(br d,J=7.6Hz,1H),6.53(d,J=7.8Hz,1H),5.25(AB四重峰,JAB=12.1Hz,ΔνAB=11.4Hz,2H),4.94-4.87(m,1H),3.96(s,3H),2.35-2.14(m,2H),2.14-1.96(m,2H)。
步骤6.合成5,5,5-三氟-N-[(4-甲氧基-1H-吲哚-2-基)羰基]-L-正缬氨酸(C39)。
将C38(350mg,0.806mmol)和钯/碳(10%,85.7mg,80.5μmol)在甲醇(10mL)中的混合物在20℃和15psi氢化16小时。反应混合物然后过滤,滤饼用甲醇(10mL)洗涤;减压浓缩经合并的滤液和进行硅胶色谱法(洗脱液:乙酸乙酯),提供C39,是白色固体。收率:270mg,0.784mmol,97%。LCMS m/z 345.0[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.62(br s,1H),8.61(d,J=7.9Hz,1H),7.32(d,J=2.2Hz,1H),7.11(dd,J=8,8Hz,1H),7.01(d,AB四重峰的一半,J=8.2Hz,1H),6.51(d,J=7.6Hz,1H),4.47(ddd,J=8.5,8.5,4.8Hz,1H),3.89(s,3H),2.5-2.27(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.12-1.92(m,2H)。
步骤7.合成5,5,5-三氟-N-[(4-甲氧基-1H-吲哚-2-基)羰基]-L-正缬氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C40)。
将0℃的C16(58.2mg,0.218mmol)和C39(75.0mg,0.218mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(4mL)中的混合物用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;99.4mg,0.261mmol)和4-甲基吗啉(44.1mg,0.436mmol)处理。在反应混合物在0℃已搅拌1小时之后,将其用水(20mL)和柠檬酸水溶液(1M;20mL)稀释,和用乙酸乙酯(3x30mL)萃取。经合并的有机层用饱和碳酸氢钠水溶液(20mL)和用饱和氯化钠水溶液(3x20mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶上的色谱法(洗脱液:10:1乙酸乙酯/甲醇)提供C40,是白色固体。收率:72mg,0.145mmol,66%。LCMS m/z 498.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.60(br s,1H),8.52(d,J=7.7Hz,1H),8.20(d,J=8.3Hz,1H),7.61(s,1H),7.42-7.33(m,2H),7.14-7.05(m,2H),7.00(d,AB四重峰的一半,J=8.2Hz,1H),6.51(d,J=7.7Hz,1H),4.58-4.46(m,1H),4.32-4.22(m,1H),3.89(s,3H),3.18-3.02(m,2H),2.45-2.21(m,3H),2.18-2.07(m,1H),2.06-1.88(m,3H),1.73-1.59(m,1H),1.59-1.48(m,1H)。
步骤8.合成N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(14)。
向C40(52mg,0.10mmol)在二氯甲烷(13mL)中的混合物加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;37mg,0.16mmol)。在室温下搅拌反应混合物1.5小时,然后再次加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;37mg,0.16mmol),和继续搅拌16小时。最终加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;24.9mg,0.105mmol),随后搅拌2小时,然后将反应混合物用水(20mL)稀释和用二氯甲烷(3x10mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(2x20mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩;制备型薄层色谱法(洗脱液:20:1乙酸乙酯/甲醇)提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(14),是白色固体。收率:17.4mg,36.3μmol,36%。将该物质与来自14的两次其它合成的纯化产品(3mg和4mg)合并和进行超临界流体色谱法[柱:ChiralTechnologies ChiralCel OD-H,30x250mm,5μm;流动相:7:3二氧化碳/(乙醇,含有0.1%氢氧化铵);流速:60mL/分],提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-5,5,5-三氟-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(14),是固体。收率:11.3mg,23.6μmol,46%,针对超临界流体色谱法。LCMS m/z 480.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.61(br s,1H),8.96(d,J=8.0Hz,1H),8.61(d,J=7.7Hz,1H),7.71(s,1H),7.37(d,J=2.2Hz,1H),7.11(dd,J=8,8Hz,1H),7.01(d,AB四重峰的一半,J=8.2Hz,1H),6.51(d,J=7.7Hz,1H),5.03-4.94(m,1H),4.51-4.43(m,1H),3.89(s,3H),3.19-3.07(m,2H),2.43-2.28(m,3H),2.20-2.08(m,2H),2.06-1.92(m,2H),1.86-1.76(m,1H),1.76-1.64(m,1H)。
实施例15,16,17,18和19
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(15),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(16),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(17),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5,7-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(18),和N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3,5-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(19)
在氩下将4(10.0mg,22.8μmol),十钨酸四正丁基铵(TBADT;3.78mg,1.14μmol)和N-氟-N-(苯基磺酰基)苯磺酰胺(8.61mg,27.3μmol)的混合物用乙腈(0.75mL),水(0.5mL)和三氟乙酸(1.74uL,22.6μmol)处理。反应小瓶然后密封,置于配有风扇的EvoluChemTM光氧化还原容器,用不可见光(PAR20-18W LG 365nm,100-240VAC)在25℃辐射16小时。向反应混合物加入磷酸钾水溶液(1M,pH 7.45;1mL),随后是交替的水和乙腈的等分试样以保持最终体积18mL的澄清溶液。将该混合物的等分试样(3mL)施加至已用甲醇(3mL)随后水(3mL)预调理的Biotage Isolute C18固相萃取柱。柱体用水(3mL)和用20%乙腈/20mM乙酸铵水溶液(3mL)洗涤,然后用乙腈(3mL)洗脱。在洗脱物已在真空离心机中蒸发之后,将残余物在1%甲酸水溶液和乙腈混合物中重构,并且合并为一共6mL。该溶液对半分开,对每一半进行反相HPLC(柱:Phenomenex Luna C18,10x250mm,10μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:15%B持续5分钟,然后在70分钟内15%至70%B,然后在15分钟内70%至95%B;流速:2mL/min)。每20秒收集级分,将来自两次分离的相似有关级分合并和浓缩。这些级分进一步经由反相HPLC纯化(柱:Agilent Polaris C18,4.6x250mm,5μm;流动相A:水,含有10mM乙酸铵;流动相B:乙腈;梯度:10%B持续5分钟,然后在35分钟内10%至35%B,然后在15分钟内35%至60%B,然后在9分钟内60%至95%B;流速:0.8mL/min)。每20秒收集级分,提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(15),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(16),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(17),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5,7-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(18),和N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4-甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3,5-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(19)。
15-第一分离,级分编号172-174;第二分离,级分编号136-137。收率:58μg,0.13μmol,0.6%。高分辨率MS m/z 458.2201[M+H]+;C23H29FN5O4的计算值,458.2204。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ12.05(br s,1H),8.93(d,J=7.9Hz,1H),8.51(d,J=7.6Hz,1H),7.70(s,1H),7.37(d,J=2.3Hz,1H),6.92(dd,J=10.8,8.6Hz,1H),6.42(dd,J=8.4,2.5Hz,1H),5.01-4.94(m,1H),4.50-4.43(m,1H),3.87(s,3H),3.18-3.07(m,2H),2.40-2.31(m,1H),2.19-2.08(m,2H),1.85-1.76(m,1H),1.76-1.64(m,3H),1.58-1.49(m,1H),0.94(d,J=6.3Hz,3H),0.89(d,J=6.3Hz,3H)。保留时间:7.90分钟(分析条件。柱:PhenomenexKinetex XB-C18,2.1x100mm,2.6μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:5%B持续0.5分钟,然后在10.5分钟内5%至70%B,然后在2分钟内70%至95%B;流速:0.4mL/min)。
16-第一分离,级分编号172-174;第二分离,级分编号138-139。收率:153μg,0.33μmol,1.4%。高分辨率MS m/z 458.2201[M+H]+;C23H29FN5O4的计算值,458.2204。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ11.73(br s,1H),8.95(d,J=8.0Hz,1H),8.61(d,J=7.7Hz,1H),7.70(s,1H),7.49(s,1H),7.09-7.03(m,2H),5.01-4.94(m,1H),4.51-4.43(m,1H),4.06(s,3H),3.18-3.07(m,2H),2.40-2.31(m,1H),2.19-2.08(m,2H),1.80(ddd,J=13.6,9.2,7.2Hz,1H),1.76-1.65(m,3H),1.58-1.50(m,1H),0.94(d,J=6.3Hz,3H),0.89(d,J=6.3Hz,3H)。保留时间:7.94分钟(分析条件等同于用于15的那些)。
17-第一分离,级分编号176-177;第二分离,级分编号141-142。收率:22μg,0.048μmol,0.21%。高分辨率MS m/z 458.2199[M+H]+;C23H29FN5O4的计算值,458.2204。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ11.45(s,1H),8.94(d,J=7.8Hz,1H),7.71(s,1H),7.62(br d,J=7.5Hz,1H),7.16(dd,J=8,8Hz,1H),6.95(br d,J=8.3Hz,1H),6.54(d,J=7.8Hz,1H),5.02-4.94(m,1H),4.54-4.46(m,1H),3.88(s,3H),3.19-3.07(m,2H),2.41-2.31(m,1H),2.20-2.08(m,2H),1.85-1.77(m,1H),1.76-1.63(m,3H),1.61-1.53(m,1H),0.94(d,J=6.3Hz,3H),0.91(d,J=6.3Hz,3H)。保留时间:8.06分钟(分析条件等同于用于15的那些)。
18-第一分离,级分编号180-181;第二分离,级分编号145。收率:17μg,0.036μmol,0.16%。高分辨率MS m/z 476.2100[M+H]+;C23H28F2N5O4的计算值,476.2109。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ12.23(s,1H),8.96(d,J=8.0Hz,1H),8.62(d,J=7.6Hz,1H),7.70(s,1H),7.52-7.48(m,1H),7.13(dd,J=11,11Hz,1H),5.02-4.94(m,1H),4.53-4.44(m,1H),4.01(s,3H),3.18-3.07(m,2H),2.38-2.30(m,1H),2.19-2.08(m,2H),1.81(ddd,J=13.6,9.1,7.0Hz,1H),1.76-1.65(m,3H),1.59-1.51(m,1H),0.95(d,J=6.2Hz,3H),0.90(d,J=6.3Hz,3H)。保留时间:8.20分钟(分析条件等同于用于15的那些)。
19-第一分离,级分编号185-187;第二分离,级分编号150-151。收率:35μg,0.074μmol,0.32%。高分辨率MS m/z 476.2107[M+H]+;C23H28F2N5O4的计算值,476.2109。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ11.64(s,1H),8.94(d,J=7.9Hz,1H),7.80(br d,J=7Hz,1H),7.71(s,1H),7.16(dd,ABX体系的组成部分,J=11.9,9.1Hz,1H),7.08(br d,AB四重峰的一半,J=8.5Hz,1H),5.02-4.94(m,1H),4.55-4.47(m,1H),3.99(s,3H),3.19-3.08(m,2H),2.41-2.32(m,1H),2.19-2.10(m,2H),1.81(ddd,J=13.7,9.0,7.2Hz,1H),1.77-1.63(m,3H),1.57(ddd,J=12.9,8.4,4.8Hz,1H),0.94(d,J=6.4Hz,3H),0.91(d,J=6.4Hz,3H)。保留时间:8.44分钟(分析条件等同于用于15的那些)。
实施例20,21,22和23
N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(20),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(21),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(22),和N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5,7-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(23)
在氩下将10(10.0mg,22.0μmol),十钨酸四正丁基铵(TBADT;3.66mg,1.10μmol)和N-氟-N-(苯基磺酰基)苯磺酰胺(8.34mg,26.4μmol)的混合物用乙腈(0.75mL),水(0.5mL)和三氟乙酸(1.69uL,21.9μmol)处理。反应小瓶然后密封,置于配有风扇的EvoluChemTM光氧化还原容器,用不可见光(PAR20-18W LG 365nm,100-240VAC)在25℃辐射16小时。向反应混合物加入磷酸钾水溶液(1M,pH 7.45;1mL),随后是交替的水和乙腈的等分试样以保持最终体积18mL的澄清溶液。将该混合物的等分试样(3mL)施加至已用甲醇(3mL)随后乙酸铵水溶液(10mM;3mL)预调理的Biotage Isolute C18固相萃取柱。柱体用乙酸铵水溶液(10mM;3mL)和用20%乙腈/20mM乙酸铵(3mL)洗涤,然后用乙腈(3mL)洗脱。在洗脱物已在真空离心机中蒸发之后,将残余物在1%甲酸水溶液和乙腈混合物中重构,并且合并为一共6mL。该溶液对半分开,对每一半进行反相HPLC(柱:Phenomenex Luna C18,10x250mm,10μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:15%B持续5分钟,然后在70分钟内15%至70%B,然后在15分钟内70%至95%B;流速:2mL/min)。每20秒收集级分,将来自两次分离的相似有关级分合并和浓缩。这些级分进一步经由反相HPLC纯化(柱:Agilent Polaris C18,4.6x250mm,5μm;流动相A:水,含有10mM乙酸铵;流动相B:乙腈;梯度:10%B持续5分钟,然后立即增加至20%B,然后在35分钟内20%至40%B,然后在15分钟内40%至60%B,然后在9分钟内60%至95%B;流速:0.8mL/min)。每20秒收集级分,提供N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-7-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(20),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(21),N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-3-氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(22),和N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-5,7-二氟-4-甲氧基-1H-吲哚-2-甲酰胺(23)。
20-第一分离,级分编号183-185;第二分离,级分编号150-151。收率:24μg,0.051μmol,0.23%。高分辨率MS m/z 472.2342[M+H]+;C24H31FN5O4的计算值,472.2360。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ12.05(br s,1H),8.91(d,J=8.0Hz,1H),8.52(d,J=8.0Hz,1H),7.69(s,1H),7.37-7.32(m,1H),6.92(dd,J=10.9,8.4Hz,1H),6.41(dd,J=8.5,2.7Hz,1H),5.00-4.93(m,1H),4.52(ddd,J=8.5,8.2,3.7Hz,1H),3.87(s,3H),3.17-3.05(m,2H),2.38-2.30(m,1H),2.18-2.06(m,2H),1.85-1.64(m,4H),0.94(s,9H)。保留时间:8.32分钟(分析条件。柱:Phenomenex Kinetex XB-C18,2.1x100mm,2.6μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:5%B持续0.5分钟,然后在10.5分钟内5%至70%B,然后在2分钟内70%至95%B;流速:0.4mL/分)。
21-第一分离,级分编号183-185;第二分离,级分编号152-153。收率:68μg,0.14μmol,0.64%。高分辨率MS m/z 472.2344[M+H]+;C24H31FN5O4的计算值,472.2360。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ11.72(br s,1H),8.91(d,J=8.1Hz,1H),8.59(d,J=8.0Hz,1H),7.69(s,1H),7.47(d,J=2.2Hz,1H),7.09-7.04(m,2H),5.00-4.93(m,1H),4.52(ddd,J=8.5,8.5,3.8Hz,1H),4.06(br s,3H),3.17-3.05(m,2H),2.39-2.31(m,1H),2.18-2.06(m,2H),1.84-1.77(m,1H),1.78(dd,J=13.9,9.0Hz,1H),1.74-1.64(m,2H),0.94(s,9H)。保留时间:8.34分钟(分析条件等同于用于20的那些)。
22-第一分离,级分编号187-188;第二分离,级分编号154。收率:5μg,0.011μmol,0.05%。高分辨率MS m/z 472.2354[M+H]+;C24H31FN5O4的计算值,472.2360。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ11.45(s,1H),8.91(d,J=7.9Hz,1H),7.70(s,1H),7.57(dd,J=8.2,3.6Hz,1H),7.15(dd,J=8,8Hz,1H),6.95(br d,J=8.3Hz,1H),6.54(d,J=7.8Hz,1H),5.00-4.94(m,1H),4.56-4.49(m,1H),3.88(s,3H),3.18-3.07(m,2H),2.40-2.32(m,1H),2.17-2.09(m,2H),1.84-1.77(m,1H),1.76-1.65(m,3H),0.95(s,9H)。保留时间:8.51分钟(分析条件等同于用于20的那些)。
23-第一分离,级分编号190-192;第二分离,级分编号156-157。收率:21μg,0.043μmol,0.19%。高分辨率MS m/z 490.2258[M+H]+;C24H30F2N5O4的计算值,490.2266。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ12.24(s,1H),8.95(d,J=8.0Hz,1H),8.64(d,J=8.0Hz,1H),7.69(s,1H),7.49-7.47(m,1H),7.13(dd,J=11.1,11.1Hz,1H),5.00-4.93(m,1H),4.54(ddd,J=8,8,4.1Hz,1H),4.00(s,3H),3.17-3.06(m,2H),2.38-2.30(m,1H),2.18-2.07(m,2H),1.85-1.65(m,4H),0.95(s,9H)。保留时间:8.65分钟(分析条件等同于用于20的那些)。
表1.实施例24-74的合成方法,结构和物理化学数据。
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1.在该情况下,C28用甲磺酸而不是氯化氢脱保护。
2.差向异构体实施例25和实施例26经由超临界流体色谱法分离(柱:ChiralTechnologies Chiralpak IB,21x250mm,5μm;流动相:9:1二氧化碳/甲醇;反压:120巴,流速:75mL/分)。第一洗脱非对映体指定为实施例25,而第二洗脱非对映体指定为实施例26。
3.分析型HPLC的条件。柱:Chiral Technologies Chiralpak IB,4.6x100mm,5μm;流动相:85:15二氧化碳/甲醇;反压:120巴;流速:1.5mL/分。
4.分析型HPLC的条件。柱:Waters Atlantis dC18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:5.0%至95%B,在4.0分钟内线性,然后95%B持续1.0分钟;流速:2mL/分。
5.实施例30在最终纯化之前的1H NMR:1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ7.48-7.42(m,2H),7.36-7.26(m,3H),4.90(dd,J=10.5,5.7Hz,1H),4.37(dd,J=7.7,4.9Hz,1H),3.69(s,1H),3.25(ddd,J=9.9,8.9,2.5Hz,1H),3.18(ddd,J=9.6,9.0,7.1Hz,1H),2.40-2.29(m,1H),2.20(s,6H),2.2-2.10(m,1H),2.09-1.99(m,1H),1.80-1.61(m,2H),1.73(dd,J=14.5,5.0Hz,1H),1.61(dd,J=14.4,7.8Hz,1H),0.95(s,9H)。
6.酰胺与适当羧酸的偶联用2,4,6-三丙基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三磷杂环己烷2,4,6-三氧化物进行。
7.实施例4(25μM)与人类细胞色素P450 3A5(4nmol)在含有氯化镁(3.3mM)和NADPH(1.3mM)的磷酸钾缓冲剂(100mM,pH 7.4;40mL)中温育。在保持于37℃的振摇水浴中进行温育0.75小时。加入等体积乙腈终止温育,然后将混合物在离心机中于1700x g旋转5分钟,减压离心上清液大约1.5小时。向该混合物加入甲酸(0.5mL),乙腈(0.5mL)和达到最终体积50mL的水,将所得混合物在离心机中于40000x g旋转30分钟。上清液进行反相HPLC(柱:Polaris C18,4.6x250mm;5μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:甲醇;梯度:15%B持续5分钟,然后在75分钟内15%至35%B,然后在10分钟内35%至95%B;流速:0.8mL/分)。每20秒收集级分。第一洗脱物质(不纯的实施例33)于54.7分钟洗脱,而实施例34于55.3分钟洗脱。不纯的实施例33再用反相HPLC纯化(柱:Phenomenex Kinetex XB-C18,2.1x100mm,2.6μm;流动相A:水,含有0.5%乙酸;流动相B:9:1乙腈/甲醇;梯度:10%B持续0.5分钟,然后在26.5分钟内10%至35%,然后在3分钟内35%至60%B;流速0.5mL/分);每15秒收集级分。在该系统中,实施例33具有12.7分钟的保留时间;额外的实施例34于13.5分钟洗脱。
8.所需的4-氯-1,3-二甲基-1H-吡唑-5-羧酸可以通过水解可商购的乙基酯制备。
9.反应混合物用乙腈和1%甲酸水溶液稀释至大约2mL的体积;最终的溶剂组成使得混合物显得透明,具有大约20%至30%乙腈含量。将该混合物的组分经由反相HPLC分离(柱:Phenomenex Luna C18,10x250mm,10μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:15%B持续5分钟,然后在70分钟内15%至70%B,然后在15分钟内70%至95%B;流速:2mL/分);每20秒收集级分。实施例37,38,39,40和41在下述保留时间洗脱。
实施例 保留时间(分)
37 64.9
38 68.4
39 72.1
40 73.5
41 74.2
10.分析型HPLC的条件。柱:Phenomenex Kinetex XB-C18,2.1x100mm,2.6μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:5%B持续0.5分钟,然后在10.5分钟内5%至70%B,然后在2分钟内70%至95%B;流速:0.4mL/min。
11.实施例41的区域化学并未严格确定;该实施例的其它可能结构是N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-5,6-二(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺和N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-6,7-二(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺。
12.反应混合物用描述于脚注9的条件纯化。实施例42于58.1分钟洗脱,而实施例43于59.2分钟洗脱。
13.反应混合物用乙腈(0.3mL)和1%甲酸水溶液(0.7mL)混合物稀释。离心所得混合物,上清液进行反相HPLC(柱:Phenomenex Luna C18,10x250mm,10μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:在5.0分钟内2%至10%B,然后在95分钟内10%至95%B;流速:2mL/分);每20秒收集级分。实施例46,47和48在下述保留时间洗脱。实施例5也从该反应在级分189-190中分离。
实施例 级分编号
46 207
47 225-226
48 231-232
14.分析型HPLC的条件。柱:Phenomenex Kinetex C18,2.1x50mm,1.7μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈,含有0.1%甲酸;梯度:5%B持续0.5分钟,然后在6.0分钟内5%至50%B,然后在1.5分钟内50%至80%B,然后在1.0分钟内80%至95%B;流速:0.4mL/min。
15.从该反应仅观察到指出的产品。
16.制备实施例4(5.56mg,12.7μmol)和三氟乙酸(4μL,50μL)的二甲亚砜(420μL)储备溶液。将该溶液的1/6用1,1-二氟乙烷亚磺酸钠1.3mg,8.5μmol),随后叔丁基过氧化氢(70%,在水中;1.4μL,10μmol)处理,在50℃加热过夜。反应混合物用乙腈和1%甲酸水溶液稀释至大约2-3mL的体积;最终溶剂组成使得混合物显得透明,具有大约20%至30%乙腈含量。将该混合物的组分经由反相HPLC分离(柱:Phenomenex Luna C18,10x250mm,10μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸;流动相B:乙腈;梯度:15%B持续5分钟,然后在70分钟内15%至40%B,然后在15分钟内40%至95%B;流速:2mL/分);每20秒收集级分。实施例74于68.6分钟洗脱。
实施例75和76
(2S,4R)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺和(2R,4S)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺[75(DIAST-1)和76(DIAST-2)
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步骤1.合成N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酸叔丁酯(C44)。
将三氟甲磺酸酐(8.88mL,52.8mmol)的二氯甲烷(10mL)溶液加入-78℃的L-缬氨酸叔丁酯,盐酸盐(10.0g,47.7mmol)和三乙胺(18.7mL,134mmol)的二氯甲烷(90mL)溶液。在-78℃搅拌反应混合物2小时,然后将其倾至水中和加入1M盐酸酸化至pH大约4。所得混合物用二氯甲烷萃取,有机层用碳酸氢钠水溶液和用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物与用L-缬氨酸叔丁酯盐酸盐(1.00g,4.77mmol;1.00g,4.77mmol)进行的两个相似反应的产品合并和经由硅胶上的色谱法纯化(梯度:0%至20%乙酸乙酯/石油醚),提供C44,是白色固体。合并的收率:14.0g,45.9mmol,80%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.92(d,J=8.8Hz,1H),3.68(dd,J=8.8,6.2Hz,1H),2.16-2.02(m,1H),1.43(s,9H),0.92(d,J=6.9Hz,3H),0.90(d,J=6.9Hz,3H)。
步骤2.合成N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酸(C45)。
向C44(14.0g,45.9mmol)的二氯甲烷(85mL)溶液加入三氟乙酸(85mL)。在室温下搅拌反应混合物3小时,然后将其减压浓缩;残余物用石油醚洗涤,提供C45,是白色固体。收率:10.9g,43.7mmol,95%。MS m/z 248.0[M-H]-1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.86(br d,J=8.3Hz,1H),3.79-3.71(m,1H),2.19-2.05(m,1H),0.93(d,J=6.8Hz,3H),0.90(d,J=6.8Hz,3H)。
步骤3.合成顺式-4-叔丁基哌啶-2-羧酸甲酯,盐酸盐(C46)。
向0℃的顺式-4-叔丁基哌啶-2-羧酸盐酸盐(参见R.T.Shuman等人,J.Org.Chem.1990,55,738-741;4.00g,18.0mmol)的甲醇(40mL)溶液加入亚硫酰氯(6.44g,54.1mmol)。在反应混合物在25℃已搅拌16小时之后,将其减压浓缩,提供C46,是米白色固体(4.50g)。一部分该物质用于下述步骤。LCMS m/z 200.0[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.46(br s,1H),9.09(br s,1H),4.11-3.96(m,1H),3.76(s,3H),3.4-3.21(m,1H,假定的;大部分受水峰掩蔽),2.93-2.77(m,1H),2.07(br d,J=10.8Hz,1H),1.75(br d,J=10.6Hz,1H),1.51-1.32(m,3H),0.84(s,9H)。
步骤4.合成(2S,4R)-4-叔丁基-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-羧酸甲酯和(2R,4S)-4-叔丁基-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-羧酸甲酯(C47)。
向25℃的C45(300mg,1.20mmol)和C46(来自先前步骤;341mg,≤1.36mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(3mL)中的混合物加入4-甲基吗啉(365mg,3.61mmol)。将所得混合物冷却至0℃,用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;549mg,1.44mmol)处理。在反应混合物已通氮1分钟之后,将其在25℃搅拌12小时。此时的LCMS分析指出存在C47:LCMS m/z 431.1[M+H]+。反应混合物在乙酸乙酯(20mL)与水(20mL)间分配,水层用乙酸乙酯(20mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(4x20mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至20%乙酸乙酯/石油醚)提供C47,是黄色胶状物。1H NMR分析确认其包括非对映体的混合物。收率:320mg,0.743mmol,62%。1HNMR(400MHz,氯仿-d)δ6.12-5.94(m,1H),[4.51(dd,J=11.7,6.3Hz)和4.32-4.18(m),共2H],[3.73(s)和3.71(s),共3H],[3.63-3.49(m)和3.48-3.39(m),共2H],2.18-1.93(m,2H),1.91-1.77(m,1H),1.63-1.37(m,2H),1.37-1.22(m,1H),1.13-1.04(m,3H),[0.94(d,J=6.8Hz)和0.91(d,J=6.8Hz),共3H],0.87(s,9H)。
步骤5.合成(2S,4R)-4-叔丁基-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-羧酸和(2R,4S)-4-叔丁基-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-羧酸(C48)。
将C47(314mg,0.729mmol)的甲醇(2mL)和四氢呋喃(2mL)混合物溶液用一水合氢氧化锂(91.8mg,2.19mmol)的水(1.4mL)溶液处理,反应混合物在25℃搅拌3小时。在减压除去溶剂之后,残余物用水稀释(10mL)和加入1M盐酸酸化至pH大约1。所得混合物用乙酸乙酯(2x20mL)萃取,和经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(15mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C48,是黄色玻璃状物。1H NMR分析确认其包括非对映体的混合物。收率:304mg,定量。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ[9.82(d,J=8.7Hz)和9.69(br d,J=8.8Hz),共1H],[4.28(dd,J=11.5,6.4Hz),4.24-4.14(m),和4.05-3.96(m),共2H],[3.80-3.69(m)和3.6-3.2(m,假定的;基本上受水峰掩蔽),共2H],2.06-1.90(m,2H),1.80-1.65(m,1H),1.41-1.17(m,3H),[0.96(d,J=6.8Hz)和0.93(d,J=6.5Hz),共3H],[0.89(d,J=6.9Hz)和0.86-0.80(m),共12H]。
步骤6.合成(2S,4R)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-4-叔丁基-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺和(2R,4S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-4-叔丁基-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺(C49)。
向25℃的C16(120mg,0.449mmol)和C48(144mg,0.346mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(3mL)中的混合物加入4-甲基吗啉(100mg,0.989mmol),然后将混合物冷却至0℃和用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;151mg,0.397mmol)处理。反应混合物通氮1分钟然后在25℃搅拌12小时。LCMS分析指出存在C49:LCMS m/z 570.3[M+H]+。反应混合物然后在乙酸乙酯(20mL)与水(20mL)间分配,水层用固体氯化钠饱和并用乙酸乙酯(5x20mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和进行硅胶色谱法(梯度:0%至15%甲醇/二氯甲烷),提供C49,是白色固体。通过1H NMR分析,该物质含有非对映体的混合物。收率:190mg,0.334mmol,96%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰,积分为近似值:δ[9.88(d,J=8.6Hz)和9.82-9.68(m),共1H],[8.12(d,J=8.8Hz)和8.09-7.98(m),共1H],[7.63(s)和7.57(s),共1H],[7.30(br s)和7.18(br s),共1H],[7.06(br s)和7.03(br s),共1H],[4.36(dd,J=12.0,6.1Hz)和4.32-4.08(m),共2H],2.26-2.05(m,2H),1.81-1.54(m,2H),1.53-1.30(m,2H),0.98-0.87(m,6H),0.86-0.76(m,9H)。
步骤7.合成(2S,4R)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺和(2R,4S)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺[75(DIAST-1)和76(DIAST-2)]。
将C49(190.0mg,0.334mmol)和N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;238mg,1.00mmol)在二氯甲烷(10mL)中的混合物在25℃搅拌2天,然后反应混合物用水稀释(20mL)和用二氯甲烷(2x20mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(10mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶上的色谱法(梯度:0%至8%甲醇/二氯甲烷)提供白色固体,其通过LCMS分析含有产品的大致3:1混合物:LCMS m/z 552.2[M+H]+和LCMS m/z 552.2[M+H]+。这些非对映体经由超临界流体色谱法分离[柱:ChiralTechnologies Chiralpak IG,30x250mm,10μm;流动相:3:1二氧化碳/(乙醇,含有0.1%氢氧化铵);流速:70mL/分]。作为白色固体分离的第一洗脱非对映体指定为75,而同样是白色固体的第二洗脱非对映体指定为76[(2S,4R)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺和(2R,4S)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺]。
75-收率:26.2mg,47.5μmol,14%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.87(d,J=8.8Hz,1H),8.87(d,J=8.4Hz,1H),7.70(s,1H),4.99-4.91(m,1H),4.24(dd,J=12.3,6.0Hz,1H),4.18(dd,J=8.3,8.3Hz,1H),3.88-3.78(m,1H),3.19-3.00(m,2H),2.46-2.35(m,1H),2.17-2.02(m,2H),1.99-1.85(m,2H),1.79-1.62(m,3H),1.50-1.36(m,2H),1.26-1.12(m,2H),0.97-0.87(m,6H),0.84(s,9H)。保留时间:1.30分钟(分析条件。柱:ChiralTechnologies Chiralpak IG-3,4.6x50mm,3μm;流动相A:二氧化碳;流动相B:乙醇,含有0.05%二乙胺;梯度:在2分钟内5%至40%B,然后40%B持续1.2分钟;流速:4mL/分;反压:1500psi)。
76-收率:8.8mg,16μmol,5%。LCMS m/z 552.3[M+H]+。通过1H NMR分析,76的该样品含有杂质。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰,积分为近似值:δ9.76(d,J=8.8Hz,1H),8.59(d,J=8.1Hz,1H),7.72(s,1H),5.02-4.90(m,1H),0.94-0.86(m,6H),0.82(s,9H)。保留时间:1.61分钟(分析条件等同于用于75的那些)。
实施例77
3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(77)
步骤1.合成(4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C50)。
向-30℃的(4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酸(429mg,1.51mmol)和C16,HCl盐(346mg,1.67mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(7.8mL)中的混合物加入N,N-二异丙基乙胺(0.791mL,4.54mmol),随后O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;633mg,1.66mmol)。让反应混合物在1小时内温热至0℃,然后将其用碳酸氢钠水溶液(30mL)稀释和用2-丁醇和二氯甲烷混合物(9:1,3x7mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层和经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至100%甲醇/二氯甲烷),提供C50,是米白色沫状物。通过1H NMR分析,该物质作为旋转异构体的混合物存在,并且含有衍生自所用试剂的杂质;一部分该样品用于下述步骤。收率:613mg,1.40mmol,93%。LCMS m/z 459.3[M+Na+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),仅特征产品峰:δ8.33-8.18(m,1H),[7.65(br s)和7.59(br s),共1H],[7.39(br s)和7.27br(s),共1H],7.05(br s,1H),4.38-4.28(m,1H),4.28-4.17(m,1H),3.46-3.36(m,1H),2.02-1.89(m,1H),1.80-1.45(m,2H),[1.39(s)和1.32(s),共9H]。
步骤2.合成N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C51)。
将C50(242mg,0.554mmol)和氯化氢的1,4-二噁烷(4M;2mL,8mmol)溶液的混合物在室温下搅拌5分钟,然后减压浓缩反应混合物除去溶剂和残余的氯化氢。所得脱保护的物质与N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酸(128mg,0.553mmol)和O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU:232mg,0.610mmol)/N,N-二甲基甲酰胺(2mL)合并,然后冷却至-30℃。加入N,N-二异丙基乙胺(0.290mL,1.66mmol),在1小时内将反应混合物温热至0℃。在加入碳酸氢钠水溶液之后,所得混合物用乙酸乙酯萃取三次;减压浓缩经合并的有机层和经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至30%甲醇/二氯甲烷),提供C51,是固体。收率:230mg,0.418mmol,75%。LCMS m/z 550.3[M+H]+
步骤3.合成3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(77)。
将C51(230mg,0.418mmol)和氯化氢的1,4-二噁烷(4M;2mL,8mmol)溶液的混合物在室温下搅拌5分钟,然后减压浓缩反应混合物除去溶剂和残余的氯化氢。所得脱保护的物质与三氟乙酸乙酯(595mg,4.19mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.219mL,1.26mmol)/甲醇(1.0mL)合并。在反应混合物在室温下已搅拌30分钟之后,再次加入三氟乙酸乙酯(60mg,0.422mmol),和继续搅拌30分钟。然后加入碳酸氢钠水溶液,和所得混合物用乙酸乙酯萃取三次。经合并的有机层在硫酸镁上干燥,过滤,减压浓缩,和溶于二氯甲烷(3mL)。向其加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸乙酯内盐(Burgess试剂;299mg,1.25mmol),和在室温下搅拌反应混合物2小时,然后将其用额外的N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;100mg,0.420mmol)处理,让其再搅拌30分钟。然后加入稀碳酸钠水溶液,混合物用乙酸乙酯萃取两次;经合并的有机层在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩。经由超临界流体色谱法纯化(柱:Princeton二硝基苯基,10x250mm,5μm;流动相:9:1二氧化碳/甲醇;反压:120巴;流速:80mL/分)提供物质,将其然后在庚烷(2.0mL)中在50℃制浆2小时,冷却至室温,经由过滤收集,提供3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(77),是固体。收率:64mg,0.121mmol,29%。LCMS m/z 528.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.46(d,J=8.4Hz,1H),9.05(d,J=8.6Hz,1H),7.67(s,1H),4.96(ddd,J=11.0,8.5,5.0Hz,1H),4.56(d,J=8.5Hz,1H),4.37(dd,J=7.5,7.5Hz,1H),3.98(dd,ABX体系的组成部分,J=11.2,7.5Hz,1H),3.92(dd,ABX体系的组成部分,J=11.3,4.8Hz,1H),3.46-3.35(m,1H),3.19-3.10(m,1H),3.09-3.00(m,1H),2.5-2.38(m,1H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.38-2.28(m,1H),2.21-2.04(m,3H),1.78-1.65(m,2H),0.99(s,9H)。
实施例78
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(甲基氨基甲酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(78)
步骤1.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-(3-甲基-L-缬氨酰基)-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯,盐酸盐(C52)。
向0℃的C31(1.00g,2.61mmol)的二氯甲烷(20mL)溶液滴加氯化氢的乙酸乙酯(4M;20mL,80mmol)溶液。在反应混合物已在25℃搅拌过夜之后,将其减压浓缩,提供C52,是白色胶状物。收率:700mg,2.20mmol,84%。LCMS m/z 283.1[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.22(br s,3H),4.25(s,1H),3.87-3.77(m,2H),3.72(d,AB四重峰的一半,J=10.8Hz,1H),3.67(s,3H),1.59(dd,ABX体系的组成部分,J=7.7,5.3Hz,1H),1.49(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.03(s,9H),1.02(s,3H),0.96(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(甲基氨基甲酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯(C53)。
向0℃的C52(320mg,1.00mmol)的二氯甲烷(6mL)溶液缓慢加入三乙胺(0.769mL,5.52mmol)和甲基氨基甲酰氯(188mg,2.01mmol)。让反应混合物温热至20℃和搅拌18小时,然后将其用饱和碳酸钠水溶液(5mL)滴加处理和用二氯甲烷(2x5mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(2x20mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷)提供C53,是浅黄色胶状物。收率:190mg,0.560mmol,56%。LCMS m/z 339.9[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.03(d,J=9.4Hz,1H),5.89(br q,J=5Hz,1H),4.20-4.14(m,2H),3.91(d,AB四重峰的一半,J=10.3Hz,1H),3.79(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.3Hz,1H),3.65(s,3H),3.17(d,J=5.3Hz,3H),1.55-1.49(m,1H),1.40(d,AB四重峰的一半,J=7.4Hz,1H),1.00(s,3H),0.92(s,9H),0.83(s,3H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(甲基氨基甲酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C54)。
向0℃的C53(190mg,0.560mmol)的四氢呋喃(2mL),水(4mL)和甲醇(1mL)混合物溶液加入一水合氢氧化锂(82.0mg,1.95mmol)。在反应混合物在20℃已搅拌2小时之后,将其用乙酸乙酯稀释(10mL);水层然后冷却至0℃至5℃和加入1M盐酸酸化至pH 2至3。含水混合物用乙酸乙酯(3x15mL)萃取,将这些合并的乙酸乙酯层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C54,是白色固体。收率:120mg,0.369mmol,66%。LCMS m/z 348.3[M+Na+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ6.04(d,J=9.6Hz,1H),5.89(d,J=4.7Hz,1H),4.17(d,J=9.6Hz,1H),4.09(s,1H),3.87(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.77(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.4Hz,1H),1.49(dd,ABX体系的组成部分,J=7.6,5.1Hz,1H),1.38(d,AB四重峰的一半,J=7.5Hz,1H),1.00(s,3H),0.92(s,9H),0.82(s,3H)。
步骤4.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(甲基氨基甲酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(C55)。
向0℃至5℃的C54(120mg,0.369mmol)和C16,HCl盐(75%,107mg,0.387mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(3.0mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;154mg,0.405mmol)和4-甲基吗啉(0.144mL,1.31mmol)。让反应混合物在1.5小时内从0℃温热至20℃之后,将其在20℃搅拌18小时,然后将其用水稀释和用固体硫酸钠处理至饱和。所得混合物用2-丙醇和氯仿混合物(1:4,3x20mL)萃取,经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至20%甲醇/二氯甲烷)提供C55(240mg),无色玻璃状物。一部分该物质用于下述步骤。LCMS m/z 479.2[M+H]+。通过1H NMR分析,该物质被衍生自HATU试剂的副产物污染。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),仅特征产品峰:δ8.21(d,J=8.7Hz,1H),7.53(br s,1H),7.29(br s,1H),7.03(br s,1H),6.02(d,J=9.6Hz,1H),5.86(q,J=4.6Hz,1H),4.31-4.23(m,1H),4.21(s,1H),4.15(d,J=9.6Hz,1H),2.18-2.08(m,1H),1.98-1.88(m,1H),1.68-1.55(m,1H),1.54-1.42(m,2H),1.34(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.01(s,3H),0.90(s,9H),0.84(s,3H)。
步骤5.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(甲基氨基甲酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(78)。
向C55(来自先前步骤;190mg,≤0.292mmol)的乙腈(12mL)溶液加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;303mg,1.26mmol)。在20℃搅拌反应混合物22小时,然后将其与用C55(来自先前步骤;50mg,≤77μmol)进行的相似反应合并。减压浓缩所得溶液,用水稀释(10mL),和用乙酸乙酯(3x10mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩;经由反相HPLC纯化(柱:Boston Prime C18,30x150mm,5μm;流动相A:0.225%甲酸/水;流动相B:乙腈;梯度:23%至46%B;流速:25mL/分)提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(甲基氨基甲酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(78),是白色固体。合并的收率:25mg,54μmol,15%,2步。LCMS m/z 461.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ8.96(d,J=8.6Hz,1H),7.65(s,1H),6.02(d,J=9.5Hz,1H),5.85(q,J=4.5Hz,1H),4.95(ddd,J=10.8,8.4,5.1Hz,1H),4.13(d,J=9.6Hz,1H),4.11(s,1H),3.88-3.79(m,2H),3.18-3.09(m,1H),3.07-2.98(m,1H),2.48-2.37(m,1H),2.20-2.02(m,2H),1.77-1.62(m,2H),1.56-1.50(m,1H),1.27(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.02(s,3H),0.89(s,9H),0.85(s,3H)。1H NMR(400MHz,氯仿-d),特征峰:δ8.12(d,J=7.6Hz,1H),5.78(br s,1H),5.04(brd,J=9.4Hz,1H),4.99-4.90(m,1H),4.57-4.49(m,1H),4.39(d,J=9.7Hz,1H),4.25(s,1H),4.01(d,AB四重峰的一半,J=10.2Hz,1H),3.93(br dd,ABX体系的组成部分,J=10.6,4.9Hz,1H),3.43-3.25(m,2H),2.71(d,J=4.8Hz,3H),2.61-2.50(m,1H),2.45-2.30(m,2H),2.03-1.93(m,1H),1.91-1.78(m,1H),1.05(s,3H),0.98(s,9H),0.91(s,3H)。
实施例79
{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3,3-二甲基-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸甲酯(79)
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步骤1.合成(1R,2S,5S)-3-[N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯(C56)。
向0℃的C52(370mg,1.16mmol)的二氯甲烷(6mL)溶液缓慢加入三乙胺(0.647mL,4.64mmol)和氯甲酸甲酯(335mg,3.55mmol)。在反应混合物在20℃已搅拌16小时之后,将其用饱和碳酸钠水溶液(5mL)滴加稀释和用二氯甲烷(2x20mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(2x20mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩;硅胶上的色谱法(梯度:0%至100%乙酸乙酯/石油醚)提供C56,是白色胶状物。收率:115mg,0.338mmol,29%。LCMSm/z 341.1[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ5.29(br d,J=9.6Hz,1H),4.46(s,1H),4.23(d,J=9.9Hz,1H),3.94-3.86(m,2H),3.74(s,3H),3.63(br s,3H),1.49-1.41(m,2H),1.04(s,3H),1.03(s,9H),0.91(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-3-[N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C57)。
向C56(115mg,0.338mmol)的甲醇(2.0mL),四氢呋喃(2.0mL)和水(2mL)混合物溶液加入一水合氢氧化锂(28.4mg,0.677mmol)。在室温下(22℃至25℃)搅拌反应混合物16小时,然后减压浓缩。含水残余物在水(5mL)与乙酸乙酯间(20mL)分配,然后弃去有机层和加入浓盐酸将水层调节至pH 1至2。所得混合物用乙酸乙酯萃取三次;经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C57,是无色胶状物。收率:100mg,0.306mmol,91%。LCMSm/z 327.2[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ5.42(d,J=9.9Hz,1H),4.46(s,1H),4.26(d,J=10.0Hz,1H),3.96(d,AB四重峰的一半,J=10.5Hz,1H),3.87(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.4Hz,1H),3.64(s,3H),1.68(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.50(dd,ABX体系的组成部分,J=7.6,5.3Hz,1H),1.06(s,3H),1.01(s,9H),0.91(s,3H)。
步骤3.合成{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3,3-二甲基-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸甲酯(C58)。
向0℃的C57(100mg,0.306mmol)和C16,HCl盐(75%,84.8mg,0.306mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(3mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;140mg,0.368mmol),随后滴加4-甲基吗啉(93mg,0.919mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(1mL)溶液。反应混合物然后温热至室温(25℃)和搅拌16小时,然后加入水(10mL)。在固体硫酸钠已加至饱和之后,所得混合物用氯仿和2-丙醇混合物(4:1,3x10mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和用硅胶色谱法纯化(梯度:0%至30%甲醇/二氯甲烷),提供C58,是白色固体。收率:93mg,0.19mmol,62%。LCMS m/z 480.0[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.30(br s,1H),7.18(br s,1H),5.98(br s,1H),5.64(br s,1H),5.58-5.42(m,1H),4.49-4.37(m,1H),4.29(d,J=10.0Hz,1H),4.23(s,1H),4.11(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.5Hz,1H),3.93(d,AB四重峰的一半,J=10.3Hz,1H),3.64(s,3H),3.43-3.29(m,2H),2.55-2.33(m,2H),2.15-1.81(m,3H),1.54-1.47(m,1H),1.45(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.03(s,3H),1.01(s,9H),0.88(s,3H)。
步骤4.合成{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3,3-二甲基-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸甲酯(79)。
向C58(93mg,0.19mmol)的二氯甲烷(5mL)悬浮液加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;139mg,0.583mmol),和在25℃搅拌反应混合物2小时。将其然后用水稀释(10mL)和用二氯甲烷(3x10mL)萃取;经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(2x10mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至100%乙酸乙酯/石油醚,随后0%至20%甲醇/二氯甲烷梯度)提供{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3,3-二甲基-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸甲酯(79),是白色固体。收率:7.0mg,15μmol,8%。LCMS m/z 462.2[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.13(br d,J=7.0Hz,1H),5.68(br s,1H),5.34(br d,J=9.9Hz,1H),4.95-4.85(m,1H),4.26(s,1H),4.23(d,J=10.0Hz,1H),3.94(dd,ABX体系的组成部分,J=10.1,4.5Hz,1H),3.88(d,AB四重峰的一半,J=10.3Hz,1H),3.63(s,3H),3.45-3.29(m,2H),2.62-2.50(m,1H),2.46-2.28(m,2H),2.02-1.93(m,1H),1.92-1.79(m,1H),1.6-1.49(m,2H,假定的;部分受水峰掩蔽),1.06(s,3H),0.98(s,9H),0.90(s,3H)。
实施例80
N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(80)
步骤1.合成(2S,4R)-4-(三氟甲基)吡咯烷-1,2-二羧酸2-苄基1-叔丁基酯(C59)。
将(4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酸(400mg,1.41mmol),苄基溴(0.335mL,2.82mmol)和碳酸氢钠(593mg,7.06mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(8mL)中的混合物在25℃搅拌15小时。在反应混合物已用水(30mL)稀释和用乙酸乙酯(3x30mL)萃取之后,经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液和用5%氯化锂水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至30%乙酸乙酯/石油醚)提供C59,是无色油状物。通过1HNMR分析,该物质作为旋转异构体的混合物存在。收率:355mg,0.951mmol,67%。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.44-7.28(m,5H),5.29-5.07(m,2H),[4.54(br d,J=8.6Hz)和4.40(brdd,J=8.5,2Hz),共1H],3.87-3.70(m,1H),[3.58(dd,J=11.2,7.4Hz)和3.49(dd,J=11.0,7.9Hz),共1H],3.13-2.95(m,1H),2.47-2.27(m,1H),2.25-2.11(m,1H),[1.46(s)和1.33(s),共9H]。
步骤2.合成(4R)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酸苄酯,盐酸盐(C60)。
向0℃的C59(200mg,0.536mmol)的乙酸乙酯(3mL)溶液加入氯化氢的乙酸乙酯(4M;6mL,24mmol)溶液。在反应混合物已在室温下(28℃)搅拌3小时之后,将其减压浓缩,提供C60,是白色固体;该物质直接用于下述步骤。LCMS m/z 274.0[M+H]+
步骤3.合成N-(叔丁氧羰基)-L-缬氨酰基-(4R)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酸苄酯(C61)。
将O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;277mg,0.728mmol)和4-甲基吗啉(184mg,1.82mmol)加入0℃的C60(来自先前步骤;≤0.536mmol)和N-(叔丁氧羰基)-L-缬氨酸(158mg,0.727mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(3mL)中的混合物。在0℃搅拌反应混合物1小时,然后将其倾至冰水(15mL)中和用乙酸乙酯(2x15mL)萃取。经合并的有机层依次用1M盐酸,饱和碳酸氢钠水溶液和饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至40%乙酸乙酯/石油醚)提供C61,是无色胶状物。收率:230mg,0.487mmol,91%,2步。LCMS m/z 495.0[M+Na+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d),特征峰:δ7.40-7.30(m,5H),5.17(AB四重峰,JAB=12.3Hz,ΔνAB=12.6Hz,2H),4.21(dd,J=9.3,6.8Hz,1H),4.00-3.86(m,2H),3.18-3.04(m,1H),2.36(ddd,ABXY体系的组成部分,J=13.5,9,9Hz,1H),2.20(ddd,ABXY体系的组成部分,J=13.4,7.4,3.5Hz,1H),2.05-1.94(m,1H),1.42(s,9H),0.98(d,J=6.7Hz,3H),0.91(d,J=6.8Hz,3H)。
步骤4.合成L-缬氨酰基-(4R)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酸苄酯,盐酸盐(C62)。
向0℃的C61(230mg,0.487mmol)的乙酸乙酯(2mL)溶液加入氯化氢的乙酸乙酯(4M;4mL,16mmol)溶液。在室温下(28℃)搅拌反应混合物1小时,然后LCMS分析指出转化为C62:LCMS m/z 373.1[M+H]+。减压浓缩反应混合物提供C62,是白色固体,其直接用于下述步骤。
步骤5.合成N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酸苄酯(C63)。
将三氟乙酸酐(154mg,0.733mmol)的二氯甲烷(0.5mL)溶液加入0℃的C62(来自先前步骤;≤0.487mmol)的二氯甲烷(3mL)悬浮液。在3分钟之后,滴加三乙胺(148mg,1.46mmol)的二氯甲烷(0.5mL)溶液,和在25℃继续搅拌3小时。在用二氯甲烷(5mL)稀释之后,反应混合物用饱和碳酸钠水溶液(10mL)和用饱和氯化钠水溶液(15mL)洗涤,干燥,过滤,和减压浓缩;硅胶色谱法(梯度:0%至30%乙酸乙酯/石油醚)提供C63,是无色油状物。收率:129mg,0.275mmol,56%,2步。LCMS m/z 491.2[M+Na+]。
步骤6.合成N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酸(C64)。
向28℃的C63(129mg,0.275mmol)的甲醇(3mL)溶液加入钯/碳(10%,29.3mg,27.5μmol),然后于15psi氢化混合物16小时。过滤提供滤饼,其用甲醇(10mL)洗涤;减压浓缩经合并的滤液,提供C64,是浅黄色固体。收率:80mg,0.21mmol,76%。LCMS m/z 401.0[M+Na+]。
步骤7.合成N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C65)。
将O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;88.5mg,0.233mmol)和4-甲基吗啉(64.2mg,0.635mmol)加入0℃的C64(80mg,0.21mmol)和C16(76.8mg,0.287mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(3mL)溶液。在反应混合物在0℃已搅拌2小时之后,将其用水(10mL)和柠檬酸水溶液(1M;10mL,10mmol)处理,然后用乙酸乙酯(3x10mL)萃取。经合并的有机层依次用饱和碳酸氢钠水溶液(15mL)和饱和氯化钠水溶液(15mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷)提供C65,是白色固体。收率:72mg,0.14mmol,67%。LCMS m/z 532.2[M+H]+
步骤8.合成N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(80)。
将N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;96.9mg,0.407mmol)加入C65(72mg,0.14mmol)在二氯甲烷(5mL)中的混合物,反应混合物在室温下搅拌过夜。在用水(15mL)稀释之后,混合物用二氯甲烷(3x15mL)萃取,经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(2x20mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷)提供N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(80),是白色固体。收率:30.9mg,60.2μmol,43%。LCMS m/z 536.1[M+Na+]。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ9.89(d,J=7.8Hz,1H),9.06(d,J=8.4Hz,1H),7.69(s,1H),4.96(ddd,J=10.6,8.4,5.5Hz,1H),4.38(dd,J=7.9,6.3Hz,1H),4.28(dd,J=9.8,7.8Hz,1H),4.07-3.94(m,2H),3.20-3.00(m,2H),2.5-2.41(m,1H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.38-2.28(m,1H),2.19-2.02(m,4H),1.78-1.61(m,2H),0.92(d,J=7Hz,3H),0.90(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例81-84
/>
实施例81:(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-5-羟基-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺
实施例82:(1R,2S,5S,6R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6-(羟基甲基)-6-甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺
实施例83:(1R,2S,5S,6S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6-(羟基甲基)-6-甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺
实施例84:(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-(羟基甲基)-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺
实施例81-84的化合物通过体外和体内两者的生物转化途径从(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(实施例13化合物)获得如下。在体外研究中,将(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺与小鼠、大鼠、仓鼠、兔、猴或人类肝微粒体(参见下表M1)或与大鼠、猴或人类肝细胞(参见下表M2)温育。另选地,在体内研究中将(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺给予大鼠和猴。获得大鼠血浆、尿和胆汁以及猴血浆的样品。所得代谢物然后用HPLC/MS分析,并且检测和获得所产生的实施例81-84氧化代谢物化合物。除了实施例81-84化合物之外,在体内研究中还观察到水解裂解产生的又一代谢物(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸。
表M1:得自肝微粒体的化合物
实施例 小鼠 大鼠 仓鼠 人类
81 +++ +++ +++ +++ +++ +++
82 + + + ++ t +
83 + + + + t +
84 + t - t t +
表M2:得自肝细胞的实施例81-84化合物
实施例 小鼠 大鼠 仓鼠
81 +++ +++ +++
82 + t t
83 t t t
84 + t -
表M3:在大鼠或猴中体内获得的实施例81-84化合物
实施例 大鼠血浆 大鼠尿 大鼠胆汁 猴血浆
81 + t t ++
82 t t t t
83 t - - t
84 + - - +
在表M1、M2和M3中使用的是下述缩写:-=未检测到;+=通过质谱和次要UV峰检测到;++=通过质谱和中等UV峰检测到;+++=通过质谱和主要UV峰检测到;t=痕量,仅通过质谱检测到
实施例82,83,84和81
(1R,2S,5S,6R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6-(羟基甲基)-6-甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(82),(1R,2S,5S,6S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6-(羟基甲基)-6-甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(83),(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-(羟基甲基)-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(84),和(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-5-羟基-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(81)
将实施例13(25μM)与人类肝微粒体(2mg/mL)在含有氯化镁(3.3mM)和NADPH(1.3mM)的磷酸钾缓冲液(100mM,pH 7.4;40mL)中合并。在保持于37℃的振摇水浴中进行温育55分钟。加入等体积乙腈终止反应,然后将混合物在离心机中于1800x g旋转5分钟,减压离心上清液大约1.5小时。向残余物加入甲酸(0.5mL)、乙腈(0.5mL)和水以达到最终体积50mL,将所得混合物在离心机中于40000x g旋转30分钟。用Jasco HPLC泵以1mL/min将上清液施加至HPLC柱(Polaris C18,4.6x250mm;5μm)。在施加之后,将柱移至耦连Thermo LTQ质谱和CTC Analytics级分收集器的Waters Acquity HPLC-UV系统并进行反相HPLC分离(流动相A:水,含有0.1%甲酸(v/v);流动相B:乙腈;梯度:2%持续5分钟,然后升至15%B随后在80分钟内15%至60%B,然后在5分钟内60%至95%B;流速:0.8mL/min)。每20秒收集级分,提供(1R,2S,5S,6R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6-(羟基甲基)-6-甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(82),(1R,2S,5S,6S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6-(羟基甲基)-6-甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(83),(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-(羟基甲基)-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(84),和(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-5-羟基-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(81)。
82-收率:60μg,0.12μmol,12%。高分辨率MS m/z 516.2424[M+H]+;C23H33F3N5O5的计算值,516.2434。1H NMR(600MHz,DMSO-d6),特征峰:δ9.42(br d,J=7.9Hz,1H),9.03(d,J=8.5Hz,1H),7.66(s,1H),5.01-4.93(m,1H),4.69-4.63(m,1H),4.43(d,J=8.3Hz,1H),4.15(s,1H),3.94(dd,ABX体系的组成部分,J=10.2,5.4Hz,1H),3.68(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.21-3.17(m,2H),3.17-3.11(m,1H),3.07-3.00(m,1H),1.69-1.65(m,1H),1.44(d,J=7.8Hz,1H),0.98(s,9H),0.84(s,3H)。
83-收率:30μg,0.058μmol,6%。高分辨率MS m/z 516.2425[M+H]+;C23H33F3N5O5的计算值,516.2434。1H NMR(600MHz,DMSO-d6),特征峰:δ9.37(d,J=7.0Hz,1H),9.04(d,J=8.5Hz,1H),7.65(s,1H),5.00-4.94(m,1H),4.54-4.49(m,1H),4.40(d,J=8.1Hz,1H),4.28(s,1H),3.93(dd,ABX体系的组成部分,J=10.2,5.8Hz,1H),3.74(d,AB四重峰的一半,J=10.6Hz,1H),3.3-3.20(m,1H,假定的;部分受水峰掩蔽),3.17-3.11(m,1H),3.07-3.00(m,1H),1.75-1.63(m,2H),1.38(d,AB四重峰的一半,J=7.3Hz,1H),1.06(s,3H),0.98(s,9H)。
84-收率:40μg,0.078μmol,8%。高分辨率MS m/z 516.2423[M+H]+;C23H33F3N5O5的计算值,516.2434。1H NMR(600MHz,DMSO-d6),特征峰:δ9.61-9.51(m,1H),9.00(d,J=8.3Hz,1H),7.68(s,1H),5.02-4.92(m,1H),4.51-4.43(m,1H),4.16(s,1H),3.92(br dd,J=10.0,5.6Hz,1H),3.78(d,J=10.6Hz,1H),3.51(d,J=10.1Hz,1H),3.18-3.10(m,1H),3.10-3.03(m,1H),1.73-1.67(m,2H),1.60-1.54(m,1H),1.31(d,J=7.6Hz,1H),1.03(s,3H),1.01(s,3H),0.88(br s,6H)。
81-收率:130μg,0.252μmol,25%。该物质经测定作为围绕吡咯烷酮的甲醇胺部分的立体异构体的互变混合物存在(参见实施例81和82)。高分辨率MS m/z 516.2428[M+H]+;C23H33F3N5O5的计算值,516.2434。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ[9.40(d,J=8.4Hz)和9.38(d,J=8.2Hz),共1H],[8.99(d,J=8.5Hz)和8.92(d,J=7.6Hz),共1H],[8.37(s)和8.25(s),共1H],[5.83(br s)和5.70(br s),共1H],5.04-4.92(m,2H),4.44-4.38(m,1H),[4.19(s)和4.15(s),共1H],3.91(dd,J=10.2,5.5Hz,1H),[3.69(d,J=10Hz)和3.68(d,J=10.2Hz),共1H],[2.65-2.57(m),2.43-2.30(m),和2.21-2.13(m),共2H],[2.08(ddd,J=13.7,8.4,6.2Hz),2.00-1.90(m),和1.87-1.79(m),共2H],[1.78-1.70(m)和1.51-1.44(m),共1H],1.60-1.53(m,1H),[1.32(d,J=7.6Hz)和1.29(d,J=7.6Hz),共1H],1.03(s,3H),[0.99(s)和0.98(s),共9H],[0.85(s)和0.84(s),共3H]。
实施例81和85
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-5-羟基-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(81)和(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-2,5-二氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(85)
将实施例13(1.0mg,2.0μmol)和十钨酸四正丁基铵(TBADT;0.33mg,0.10μmol)的混合物用乙腈(0.15mL)和盐酸(1.0M;0.05mL,50μmol)处理。将注射针(18号)通过小瓶的聚四氟乙烯盖插入,将可接触空气的反应混合物置于配有风扇的EvoluChemTM光氧化还原容器和用不可见光(PAR20-18W LG 365nm,100-240VAC)在25℃辐射16小时。向反应混合物加入磷酸钾水溶液(1M,pH 7.5;0.5mL),然后水(至大约6mL的体积),随后加入甲酸水溶液(1%,2mL)和足量乙腈以保持溶液。所得溶液对半分开并施加至两个5g Biotage Isolute C18固相萃取柱。柱体用乙酸铵水溶液(10mM;3mL)和用20%乙腈/10mM乙酸铵水溶液(3mL)洗涤,然后用乙腈(3mL)洗脱。用Genevac蒸发仪除去溶剂,将两份残余物在乙腈和1%甲酸水溶液混合物中重构并且合并为一共2mL的溶液。该物质进行反相HPLC(柱:Phenomenex LunaC18,10x250mm,10μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸(v/v);流动相B:乙腈;梯度:在5分钟内2%至15%B,然后在80分钟内15%至60%B,然后在5分钟内60%至95%B;流速:2mL/min)。每20秒收集级分;第一洗脱化合物是(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-5-羟基-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(81),而第二洗脱化合物是(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-2,5-二氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(85)。
81的收率:0.122mg,0.237μmol,12%。该物质经测定作为围绕吡咯烷酮的甲醇胺部分的立体异构体的互变混合物存在,并且在HPLC上作为双重峰洗脱。高分辨率MS m/z516.2413[M+H]+;C23H33F3N5O5的计算值,516.2434。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ9.44-9.34(m,1H),[8.99(d,J=8.5Hz)和8.92(d,J=7.6Hz),共1H],[8.37(s)和8.25(s),共1H],[5.83(br s)和5.70(br s),共1H],5.05-4.91(m,2H),4.44-4.37(m,1H),[4.19(s)和4.15(s),共1H],3.91(dd,J=10.3,5.5Hz,1H),[3.69(d,J=10.1Hz)和3.68(d,J=10.3Hz),共1H],[2.65-2.57(m),2.43-2.30(m),和2.17(ddd,J=14.9,10.7,4.7Hz),共2H],[2.08(ddd,J=14.1,8.5,6.2Hz),2.01-1.90(m),和1.83(ddd,J=13.7,10.1,5.7Hz),共2H],[1.78-1.70(m)和1.51-1.44(m),共1H],1.60-1.53(m,1H),[1.32(d,J=7.6Hz)和1.29(d,J=7.6Hz),共1H],1.03(s,3H),[0.99(s)和0.98(s),共9H],[0.85(s)和0.84(s),共3H]。保留时间:7.7分钟(分析条件。柱:Phenomenex Kinetex XB-C18,2.1x100mm,2.6μm;流动相A:水,含有0.1%甲酸(v/v);流动相B:乙腈;梯度:5%B持续0.5分钟,然后在10.5分钟内5%至70%B,然后在2分钟内70%至95%B;流速:0.4mL/分)。
85的收率:0.104mg,0.203μmol,10%。高分辨率MS m/z 514.2259[M+H]+;C23H31F3N5O5的计算值,514.2277。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ11.17(br s,1H),9.40(br s,1H),9.08(d,J=8.9Hz,1H),5.06-4.98(m,1H),4.42-4.36(m,1H),4.13(s,1H),3.91(dd,J=10.3,5.6Hz,1H),3.70(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.00-2.93(m,1H),2.60(dd,ABX体系的组成部分,J=18.0,5.9Hz,1H),2.46(dd,ABX体系的组成部分,J=18.1,9.1Hz,1H),2.25-2.18(m,1H),2.04-1.97(m,1H),1.60-1.55(m,1H),1.35(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.03(s,3H),0.95(s,9H),0.86(s,3H)。保留时间:8.3分钟(分析条件等同于用于81的那些)。
实施例86
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[5,5,5-三氟-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(86)
/>
步骤1.合成(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-羧酸叔丁酯(C66)。
向0℃的(1R,2S,5S)-3-(叔丁氧羰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(5.25g,20.6mmol),C16,HCl盐(4.70g,22.6mmol)和2-羟基吡啶1-氧化物(571mg,5.14mmol)的丁烷-2-酮(108mL)浆料加入N,N-二异丙基乙胺(7.97g,61.7mmol)随后1-[3-(二甲基氨基)丙基]-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(4.73g,24.7mmol)。在反应混合物在0℃已搅拌20分钟之后,将其逐渐温热至室温,然后在室温下搅拌过夜,然后LCMS分析指出存在C66:LCMS m/z 407.1[M-H]-。反应混合物用乙酸乙酯(100mL)稀释,和依次用下述洗涤:水(50mL)和饱和氯化钠水溶液(20mL)混合物,饱和氯化钠水溶液(70mL),盐酸(1M;50mL)和饱和氯化钠水溶液(20mL)混合物两次,和最终的饱和氯化钠水溶液(70mL)。各水层用乙酸乙酯(100mL)萃取,经合并的有机层在硫酸钠上干燥和过滤。收集的硫酸钠用乙酸乙酯(2x50mL)洗涤,和减压浓缩经合并的滤液,用庚烷(50mL)稀释,和减压浓缩,提供C66,是无色玻璃状物(6.69g)。通过1H NMR分析,存在一些溶剂;估计纯度为大约85%重量。1H NMR分析也指出该物质作为旋转异构体的混合物存在。收率,已对溶剂的存在进行调节:5.7g,14mmol,68%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ8.23-8.13(m,1H),[7.63(br s)和7.59(br s),共1H],[7.36(br s)和7.23(br s),共1H],7.08-7.00(m,1H),4.31-4.19(m,1H),[4.03(s)和3.99(s),共1H],[3.58(dd,J=10.8,4.6Hz)和3.49(dd,J=10.8,3.9Hz),共1H],[3.27(d,J=10.9Hz)和3.26(d,J=10.7Hz),共1H],3.22-3.00(m,2H),2.38-2.09(m,2H),1.79-1.43(m,2H),[1.36(s)和1.29(s),共9H],1.00(s,3H),0.89(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲磺酸盐(C67)。
将甲磺酸(0.920mL,14.2mmol)加入C66(大约85%重量,来自先前步骤;6.68g,14mmol)的1,1,1,3,3,3-六氟丙-2-醇(30mL)溶液。在室温下搅拌反应混合物3小时,然后将其减压浓缩。残余物依次分散于下述溶剂系统,随后再浓缩:乙腈/乙酸乙酯(1:1,2x10mL)和乙酸乙酯/庚烷(1:1,2x10mL),提供C67,是玻璃状物(7.18g)。一部分该物质用于下述步骤。LCMS m/z 309.3[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ4.51(dd,J=10.8,4.7Hz,1H),4.21(br s,1H),3.73(dd,J=12.4,6.3Hz,1H),3.41-3.22(m,3H),2.70(s,3H),2.58-2.47(m,1H),2.42-2.32(m,1H),2.16(ddd,J=14.0,10.8,4.8Hz,1H),1.97(br d,J=7.9Hz,1H),1.95-1.84(m,1H),1.84-1.75(m,2H),1.15(s,6H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[5,5,5-三氟-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(86)。
向2-[(叔丁氧羰基)氨基]-5,5,5-三氟戊酸(59.0mg,0.218mmol)的乙腈(0.60mL)和N,N-二甲基甲酰胺(0.40mL)混合物溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;82.7mg,0.218mmol)随后4-甲基吗啉(54.4μL,0.495mmol)。在反应混合物已搅拌20分钟之后,加入固体C67(来自先前步骤;100mg,≤0.19mmol)。让反应混合物搅拌1.5小时,然后将其在乙酸乙酯与饱和碳酸氢钠水溶液间分配。水层用乙酸乙酯萃取,经合并的有机层在硫酸镁上干燥,过滤,和用氮气流浓缩。残余物溶于二氯甲烷(0.70mL),用三氟乙酸(0.175mL)处理,和在室温下搅拌。在2小时之后,再次加入三氟乙酸(0.10mL);继续搅拌额外3小时,然后在氮气流下、然后在真空中浓缩反应混合物。该物质溶于二氯甲烷(0.75mL),在冰浴中冷却,和用三乙胺(54.8μL,0.393mmol)处理;滴加三氟乙酸酐(41.2μL,0.292mmol),在0℃搅拌反应混合物3小时。挥发物用Genevac蒸发仪除去,将残余物溶于二氯甲烷(0.90mL),用N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;132mg,0.554mmol)处理,在室温下搅拌2.5小时。反应混合物然后在氮气流下浓缩,用乙酸乙酯稀释,和用饱和碳酸氢钠水溶液洗涤。水层用乙酸乙酯萃取,经合并的有机层在硫酸镁上干燥,过滤,和在氮气流下浓缩。经由反相HPLC纯化(柱:Waters Sunfire C18,19x100mm,5μm;流动相A:0.05%三氟乙酸/水;流动相B:0.05%三氟乙酸/乙腈;梯度:在8.54分钟内5%至95%B,随后95%B持续1.46分钟;流速:25mL/分)提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[5,5,5-三氟-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(86)。收率:14mg,26μmol,14%,2步。LCMSm/z 540.6[M+H]+。保留时间:2.60分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis dC18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:5.0%至95%B,在4.0分钟内线性,然后95%B持续1.0分钟;流速:2mL/分)。
实施例87
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[(2S)-2-环己基-2-{[(三氟甲基)磺酰基]氨基}乙酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(87)
步骤1.合成(1R,2S,5S)-3-{(2S)-2-[(叔丁氧羰基)氨基]-2-环己基乙酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯(C68)。
向0℃(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯,盐酸盐(300mg,1.46mmol)和(2S)-[(叔丁氧羰基)氨基](环己基)乙酸(394mg,1.53mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(5mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;610mg,1.60mmol),随后滴加4-甲基吗啉(443mg,4.38mmol)。在0℃搅拌反应混合物10分钟,然后在室温下(20℃)进行2小时,然后将其倾至冰水(30mL)中和用乙酸乙酯(3x40mL)萃取。经合并的有机层依次用水(40mL)、盐酸(1M;40mL)、饱和碳酸氢钠水溶液(40mL)和饱和氯化钠水溶液洗涤,然后在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C68,是白色沫状物。收率:580mg,1.42mmol,97%。LCMS m/z 409.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.03(d,J=8.5Hz,1H),4.17(s,1H),4.00(d,J=10.4Hz,1H),3.88(dd,J=9,9Hz,1H),3.75(dd,J=10.3,5.3Hz,1H),3.64(s,3H),1.83-1.47(m,8H),1.46-1.28(m,2H),1.33(s,9H),1.18-1.06(m,3H),1.00(s,3H),0.86(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-3-[(2S)-2-氨基-2-环己基乙酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯,盐酸盐(C69)。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;15mL)溶液滴加至5℃的C68(580mg,1.42mmol)的1,4-二噁烷(3mL)溶液。在反应混合物已在室温下(20℃)搅拌1.5小时之后,将其减压浓缩。残余物与二氯甲烷共蒸,提供C69,是浅黄色沫状物(490mg),将其整体用于下述实验。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.22(br s,3H),4.26(s,1H),3.99-3.90(m,1H),3.76(dd,ABX体系的组成部分,J=10.7,5.1Hz,1H),3.71(d,AB四重峰的一半,J=10.6Hz,1H),3.66(s,3H),1.83-1.60(m,6H),1.59(dd,J=7.6,5.1Hz,1H),1.49(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.27-1.02(m,5H),1.03(s,3H),0.94(s,3H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-3-[(2S)-2-环己基-2-{[(三氟甲基)磺酰基]氨基}乙酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯(C70)。
向-10℃的C69(来自先前步骤;480mg,≤1.39mmol)的二氯甲烷(10mL)溶液加入N,N-二异丙基乙胺(630mg,4.87mmol),随后滴加三氟甲磺酸酐(0.328mL,1.95mmol)。在-10℃搅拌反应混合物1小时,然后在室温下(20℃)进行1小时,然后将其用饱和氯化钠水溶液(50mL)稀释和用二氯甲烷(3x30mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和经由硅胶色谱法纯化(洗脱液:1:4乙酸乙酯/石油醚),提供C70,是浅黄色油状物。收率:124mg,0.282mmol,20%,2步。LCMS m/z 441.1[M+H]+
步骤4.合成(1R,2S,5S)-3-[(2S)-2-环己基-2-{[(三氟甲基)磺酰基]氨基}乙酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C71)。
向C70(120mg,0.272mmol)的水(2mL),甲醇(2mL)和四氢呋喃(2mL)混合物溶液加入一水合氢氧化锂(28.6mg,0.682mmol)。在反应混合物已在室温下(20℃)搅拌18小时之后,LCMS指出反应完成:LCMS m/z 427.2[M+H]+。减压浓缩反应混合物除去有机溶剂。残余物用水稀释(5mL)然后加入1M盐酸酸化至pH 2至3;所得混合物用乙酸乙酯(2x30mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C71,是浅黄色固体。收率:92.0mg,0.216mmol,79%。
步骤5.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-3-[(2S)-2-环己基-2-{[(三氟甲基)磺酰基]氨基}乙酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(C72)。
向0℃的C71(92.0mg,0.216mmol)和C16,HCl盐(72%,68.8mg,0.238mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(3mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;98.4mg,0.259mmol),随后4-甲基吗啉(76.4mg,0.755mmol)。反应混合物然后在20℃搅拌2小时,然后将其倾至冰水(10mL)中和用氯仿和2-丙醇混合物(4:1,4x20mL)萃取。经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和经由硅胶上的色谱法纯化(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷),提供C72,是无色玻璃状物。收率:100mg,0.173mmol,80%。LCMS m/z580.2[M+H]+
步骤6.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[(2S)-2-环己基-2-{[(三氟甲基)磺酰基]氨基}乙酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(87)。
将三氟乙酸酐(47.1mg,0.224mmol)的二氯甲烷(1mL)溶液滴加至0℃的C72(100mg,0.173mmol)和吡啶(41.7μL,0.516mmol)的二氯甲烷(3mL)溶液。在混合物已在室温下(10℃至20℃)搅拌20小时之后,将其减压浓缩和再溶于二氯甲烷(3mL)。加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;103mg,0.432mmol),和在室温下(20℃)搅拌反应混合物20小时。将其然后用饱和氯化钠水溶液(10mL)稀释和用二氯甲烷(3x20mL)萃取;经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和进行超临界流体色谱法[柱:Chiral Technologies Chiralcel OD,30x250mm,10μm;流动相:4:1二氧化碳/(乙醇,含有0.1%氢氧化铵);流速:60mL/分]。含87的级分在40℃以下减压浓缩除去醇共溶剂。残余物用乙酸乙酯(50mL)和二氯甲烷(5mL)稀释和依次用盐酸(1M;20mL),饱和碳酸氢钠水溶液(20mL)和饱和氯化钠水溶液洗涤。所得有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩,随后与水(20mL)和乙腈(5mL)混合;冻干该混合物,提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[(2S)-2-环己基-2-{[(三氟甲基)磺酰基]氨基}乙酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(87),是白色固体。收率:27.6mg,49.1μmol,28%。LCMS m/z 562.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ9.93(d,J=8.3Hz,1H),9.10(d,J=8.7Hz,1H),7.70(s,1H),5.03-4.94(m,1H),4.15(s,1H),3.88-3.78(m,2H),3.55(d,J=10.2Hz,1H),3.20-3.11(m,1H),3.10-3.00(m,1H),2.19-2.08(m,1H),2.06-1.95(m,1H),1.85-1.53(m,9H),1.33(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.03(s,3H),0.89(s,3H)。
实施例88和89
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环丁基-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺和(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环丁基-N-(三氟乙酰基)-D-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(88和89)
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步骤1.合成{1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3-环丁基-1-氧代丙-2-基}氨基甲酸叔丁酯(C73)。
将0℃的C67(150mg,0.371mmol)和N-(叔丁氧羰基)-3-环丁基丙氨酸(99.2mg,0.408mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(3mL)溶液用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;169mg,0.444mmol)处理。然后滴加4-甲基吗啉(131mg,1.30mmol),然后让反应混合物温热至25℃和搅拌过夜。加入冰水(10mL),所得混合物用氯仿和2-丙醇混合物(4:1,4x20mL)萃取;经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。进行两次硅胶上的色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷),提供C73,是白色固体,其包含两种非对映体的混合物。收率:106mg,0.199mmol,54%。LCMS m/z 534.2[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ[8.59(d,J=5.5Hz)和7.85(d,J=7.7Hz),共1H],7.20-7.06(m,1H),[5.78(br s)和5.67(br s),共1H],[5.51(br s)和5.40br(s),共1H],5.22-5.12(m,1H),[4.49-4.39(m)和4.38-4.23(m),共3H],4.17-4.06(m,1H),[3.83(d,J=10.4Hz)和3.50(d,J=10.5Hz),共1H],3.42-3.28(m,2H),2.50-2.30(m,3H),2.23-2.00(m,4H),2.00-1.77(m,4H),1.73-1.44(m,5H),[1.40(s)和1.39(s),共9H],[1.07(s)和1.03(s),共3H],[0.98(s)和0.92(s),共3H]。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环丁基-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺和(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环丁基-N-(三氟乙酰基)-D-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺[88(DIAST-1)和89(DIAST-2)]。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;5mL,20mmol)溶液滴加至0℃的C73(106mg,0.199mmol)的二氯甲烷(5mL)溶液。在0℃搅拌反应混合物15分钟然后在25℃进行2小时,然后将其减压浓缩,提供脱保护的物质,是白色固体:LCMS m/z 434.2[M+H]+。将其溶于二氯甲烷(3mL),在冰浴中冷却,和用吡啶(79.9mg,1.01mmol)以及三氟乙酸酐(170mg,0.809mmol)的二氯甲烷(1.5mL)溶液处理。在20℃搅拌反应混合物20小时;然后加入吡啶(40.0mg,0.506mmol),在25℃继续搅拌又12小时。在用二氯甲烷(15mL)稀释之后,反应混合物依次用盐酸(1M;10mL)、饱和碳酸氢钠水溶液(3x10mL)和饱和氯化钠水溶液(10mL)洗涤,干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至20%甲醇/二氯甲烷)后接超临界流体色谱法[柱:Chiral Technologies Chiralpak IC,30x250mm,10μm;流动相:3:1二氧化碳/(甲醇,含有0.1%氢氧化铵);流速:70mL/分],提供分开的非对映体(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环丁基-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺和(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环丁基-N-(三氟乙酰基)-D-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。未确定哪种含有D-丙氨酰基构型和哪种含有L-丙氨酰基构型;第一洗脱非对映体指定为88,而第二洗脱非对映体指定为89。两者均作为白色固体获得。
88-收率:9.3mg,18.2μmol,9%,2步。LCMS m/z 512.1[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.75(br d,J=7.0Hz,1H),8.96(d,J=8.1Hz,1H),7.71(s,1H),5.00-4.90(m,1H),4.32-4.23(m,1H),4.13(s,1H),3.82(dd,ABX体系的组成部分,J=10.2,5.4Hz,1H),3.69(d,AB四重峰的一半,J=10.2Hz,1H),3.20-3.02(m,2H),2.44-2.28(m,2H),2.16-2.04(m,2H),2.04-1.91(m,2H),1.87-1.54(m,9H),1.32(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.03(s,3H),0.88(s,3H)。保留时间:2.78分钟(分析条件。柱:Chiral TechnologiesChiralpak IC-3,4.6x150mm,3μm;流动相A:二氧化碳;流动相B:甲醇,含有0.05%二乙胺(v/v);梯度:在5分钟内5%至40%B,然后40%B持续2.5分钟;反压:1500psi;流速:2.5mL/分)。
89-收率:23mg,45.0mmol,23%,2步。1H NMR分析指出该物质作为旋转异构体的混合物存在。LCMS m/z 512.1[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ[9.92br(s)和9.65(br s),共1H],[9.22(d,J=7.7Hz)和8.85(d,J=8.4Hz),共1H],[7.76(s)和7.67(s),共1H],[5.11-5.00(m)和4.98-4.87(m),共1H],[4.51(s)和4.07(s),共1H],[4.47-4.36(m)和4.09-4.00(m),共1H],[3.90(dd,J=10.2,5.3Hz)和3.60-3.45(m),共2H],3.21-3.00(m,2H),2.44-2.33(m,1H),2.28-1.98(m,3H),1.98-1.52(m,10H),[1.49-1.38(m)和1.32(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz),共2H],[1.04(s)和1.02(s),共3H],[0.93(s)和0.82(s),共3H]。保留时间:4.14分钟(分析条件等同于用于88的那些)。
实施例90
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-(吡啶-2-基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(90)
步骤1.合成[(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-1-氧代-3-(吡啶-2-基)丙-2-基]氨基甲酸叔丁酯(C74)。
向0℃的C67(250mg,0.618mmol)和N-(叔丁氧羰基)-3-吡啶-2-基-L-丙氨酸(198mg,0.744mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(2mL)溶液加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;282mg,0.742mmol),随后滴加4-甲基吗啉(188mg,1.86mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(1mL)溶液。反应混合物然后温热至20℃和搅拌2小时,然后将其用水稀释(10mL)和用乙酸乙酯(10mL)萃取。将固体硫酸钠加入水层直至实现饱和,然后水层用二氯甲烷和甲醇混合物(10:1,3x20mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层和经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷),提供C74,是黄色胶状物。收率:250mg,0.449mmol,73%。LCMS m/z 557.0[M+H]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4),特征峰:δ8.49(d,J=5.2Hz,1H),7.78-7.71(m,1H),7.35(d,J=7.8Hz,1H),7.30-7.25(m,1H),4.73(dd,J=8.5,5.2Hz,1H),4.40(dd,J=11.8,4.2Hz,1H),4.30(s,1H),4.01-3.90(m,1H),3.26(dd,J=14.2,5.6Hz,1H),2.94(dd,J=14.1,8.9Hz,1H),2.65-2.53(m,1H),2.37-2.25(m,1H),2.14-2.04(m,1H),1.91-1.78(m,2H),1.61-1.55(m,1H),1.53(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.34(s,9H),1.08(s,3H),1.00(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-[3-(吡啶-2-基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,盐酸盐(C75)。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;6mL)溶液加入0℃的C74(250mg,0.449mmol)的二氯甲烷(2mL)溶液,在20℃搅拌反应混合物5小时。LCMS分析指出转化为C75:LCMS m/z 457.1[M+H]+。减压除去溶剂提供C75,是黄色固体(250mg);一部分该物质直接用于下述步骤。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ8.81(br d,J=5.4Hz,1H),8.43(d,J=8.3Hz,1H),8.39-8.31(m,1H),7.90(d,J=8.0Hz,1H),7.87-7.81(m,1H),7.65(s,1H),7.43(br s,1H),7.06(brs,1H),4.77-4.67(m,1H),4.35(s,1H),4.32-4.23(m,1H),3.94-3.86(m,1H),3.80(d,AB四重峰的一半,J=10.6Hz,1H),3.36-3.25(m,1H),3.20-3.08(m,2H),2.35-2.23(m,1H),2.17-2.06(m,1H),2.01-1.90(m,1H),1.55-1.48(m,1H),1.43(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.04(s,3H),0.96(s,3H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-(吡啶-2-基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(90)。
向0℃的C75(来自先前步骤;175mg,≤0.314mmol)的二氯甲烷(6mL)溶液加入吡啶(197mg,2.49mmol),随后三氟乙酸酐(186mg,0.886mmol)的二氯甲烷(2mL)溶液。在反应混合物在20℃已搅拌2小时之后,将其用水稀释和用二氯甲烷和甲醇混合物(10:1,3x15mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层和进行硅胶色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷),随后超临界流体色谱法[柱:Chiral Technologies Chiralpak AS,30x250mm,10μm;流动相:3:1二氧化碳/(乙醇,含有0.1%氢氧化铵);流速:70mL/分],提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-(吡啶-2-基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(90),是白色固体。收率:25mg,46.8μmol,15%,2步。LCMS m/z 535.1[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.92(d,J=7.5Hz,1H),8.91(d,J=8.0Hz,1H),8.51(br d,J=5Hz,1H),7.75-7.68(m,2H),7.28(d,J=7.8Hz,1H),7.25(dd,J=7.3,5.1Hz,1H),5.00-4.88(m,2H),4.15(s,1H),3.86(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.4Hz,1H),3.70(d,AB四重峰的一半,J=10.3Hz,1H),3.21-3.04(m,4H),2.42-2.31(m,1H),2.18-2.04(m,2H),1.76(ddd,J=13.5,9.6,6.6Hz,1H),1.74-1.62(m,1H),1.62-1.53(m,1H),1.33(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.03(s,3H),0.89(s,3H)。
实施例91
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{N-[(4-氟苯氧基)乙酰基]-3-甲基-L-缬氨酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(91)
步骤1.合成{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3,3-二甲基-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸叔丁酯(C76)。
将C32(15.4g,41.8mmol)和C16,HCl盐(75%,11.6g,41.9mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(380mL)溶液冷却至-5℃至0℃。在-5℃至0℃向其加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;18.3g,48.1mmol)和4-甲基吗啉(12.7g,126mmol)。在反应混合物在0℃已搅拌1.5小时之后,将其倾至冰水(400mL)中,和所得混合物用乙酸乙酯(3x200mL)萃取。经合并的有机层依次用柠檬酸水溶液(1M;120mL)、饱和碳酸氢钠水溶液(120mL)和饱和氯化钠水溶液(3x60mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,与来自用C32(1.08g,2.93mmol)进行的相似反应的粗制产品合并。硅胶色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷)提供C76,是白色固体(9.80g)。经合并的水层用氯仿和2-丙醇混合物(4:1,3x100mL)萃取;浓缩这些合并的萃取物,随后进行硅胶色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷),提供额外的C76,是白色固体(2.3g)。合并的收率:12.1gm,23.2mmol,52%。LCMS m/z522.5[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.28(br d,J=5.9Hz,1H),7.20(br s,1H),5.71(brs,1H),5.38(br s,1H),5.10(br d,J=10.3Hz,1H),4.47-4.38(m,1H),4.28-4.20(m,2H),4.12(dd,ABX体系的组成部分,J=10.2,4.0Hz,1H),3.99(d,AB四重峰的一半,J=10.2Hz,1H),3.40-3.33(m,2H),2.53-2.35(m,2H),2.17-2.07(m,1H),2.00-1.81(m,2H),1.52-1.4(m,2H,假定的;大部分受水峰和叔丁基信号掩蔽),1.39(s,9H),1.02(s,3H),1.01(s,9H),0.88(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-(3-甲基-L-缬氨酰基)-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,盐酸盐(C77)。
向0℃的C76(12.1g,23.2mmol)的二氯甲烷(50mL)溶液加入氯化氢的1,4-二噁烷(4M;250mL)溶液。在反应混合物在20℃已搅拌2小时之后,将其过滤。滤饼与甲基叔丁基醚(250mL)搅拌18小时;过滤提供C77,是浅黄色/白色固体(10.89g)。LCMS m/z 422.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.38(d,J=9.0Hz,1H),8.19(br s,3H),7.57(br s,1H),7.41(brs,1H),7.04(br s,1H),4.35-4.27(m,1H),4.34(s,1H),3.85-3.72(m,2H),3.65(d,AB四重峰的一半,J=10.8Hz,1H),3.16-3.09(m,1H),3.05-2.95(m,1H),2.43-2.31(m,1H),2.17-2.04(m,1H),2.00-1.89(m,1H),1.71-1.42(m,3H),1.38(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.02(s,3H),1.02(s,9H),0.97(s,3H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-3-[N-(氯乙酰基)-3-甲基-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(C78)。
将三乙胺(2.21g,21.8mmol)加入0℃的C77(来自先前步骤;2.50g,≤5.33mmol)的二氯甲烷(100mL)溶液。将氯乙酰氯(1.23g,10.9mmol)的二氯甲烷(9mL)溶液滴加至反应混合物,和在0℃继续搅拌1小时。然后加水(50mL),所得混合物用氯仿和2-丙醇混合物(4:1,3x50mL)萃取;经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(50mL)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷)提供C78,是白色固体。收率:1.21g,2.43mmol,46%,2步。LCMS m/z 498.1(观察到氯同位素模式)[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.30-8.22(m,2H),7.54(br s,1H),7.30(br s,1H),7.03(br s,1H),4.35(d,J=8.9Hz,1H),4.29(ddd,J=12.1,8.7,3.4Hz,1H),4.24(s,1H),4.11(AB四重峰,JAB=12.4Hz,ΔνAB=14.3Hz,2H),3.86(dd,ABX体系的组成部分,J=10.2,5.4Hz,1H),3.72(d,AB四重峰的一半,J=10.3Hz,1H),3.18-3.08(m,1H),3.07-2.97(m,1H),2.48-2.36(m,1H),2.19-2.08(m,1H),1.99-1.88(m,1H),1.69-1.43(m,3H),1.37(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.01(s,3H),0.94(s,9H),0.84(s,3H)。
步骤4.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-3-{N-[(4-氟苯氧基)乙酰基]-3-甲基-L-缬氨酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(C79)。
将4-氟苯酚(49.5mg,0.442mmol)加入氟化铯(67.1mg,0.442mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(3mL)中的混合物,混合物在65℃搅拌1小时,然后加入C78(110.0mg,0.221mmol),和在65℃搅拌反应混合物8小时。将其然后与用C78(30mg,60μmol)进行的相似反应合并,倾至水中(10mL),和用乙酸乙酯(3x10mL)萃取。经合并的有机层依次用水(20mL)、盐酸(1M;10mL)、饱和碳酸钠水溶液(10mL)和饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷)提供C79,是白色玻璃状物。合并的收率:100mg,0.174mmol,62%。LCMS m/z 574.2[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.23(br d,J=6Hz,1H),7.19(br s,1H),7.04(br d,J=10.2Hz,1H),6.99(dd,J=9.2,8.0Hz,2H),6.85(dd,ABX体系的组成部分,J=9.1,4.2Hz,2H),5.78(br s,1H),5.46(br s,1H),4.65(d,J=9.8Hz,1H),4.52-4.38(m,3H),4.22(s,1H),4.14(dd,ABX体系的组成部分,J=10.3,5.3Hz,1H),3.93(d,AB四重峰的一半,J=10.3Hz,1H),3.41-3.32(m,2H),2.55-2.34(m,2H),2.14-2.05(m,1H),2.03-1.80(m,3H),1.03(s,3H),1.00(s,9H),0.86(s,3H)。
步骤5.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{N-[(4-氟苯氧基)乙酰基]-3-甲基-L-缬氨酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(91)。
将N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;125mg,0.524mmol)的二氯甲烷(2mL)溶液滴加至10℃(室温)的C79(100mg,0.174mmol)的二氯甲烷(4mL)溶液。在反应混合物在10℃已搅拌16小时之后,将其用水稀释(10mL)和用二氯甲烷(3x10mL)萃取。经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(2x10mL)洗涤和减压浓缩;进行硅胶色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷),随后超临界流体色谱法[柱:Chiral Technologies ChiralcelOD,30x250mm,10μm;流动相:4:1二氧化碳/(乙醇,含有0.1%氢氧化铵);流速:60mL/分],提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{N-[(4-氟苯氧基)乙酰基]-3-甲基-L-缬氨酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(91),是白色固体。收率:55mg,99.0μmol,57%。LCMS m/z 556.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.01(d,J=8.5Hz,1H),7.96(d,J=9.1Hz,1H),7.68(s,1H),7.13-7.04(m,2H),6.90-6.84(m,2H),4.97(ddd,J=10.9,8.5,5.1Hz,1H),4.61-4.50(m,2H),4.39(d,J=8.9Hz,1H),4.12(s,1H),3.87(dd,ABX体系的组成部分,J=10.4,5.5Hz,1H),3.73(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.19-3.09(m,1H),3.09-2.99(m,1H),2.47-2.36(m,1H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.21-2.02(m,2H),1.79-1.65(m,2H),1.53(dd,J=7.6,5.4Hz,1H),1.29(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.00(s,3H),0.93(s,9H),0.75(s,3H)。
实施例92
3-甲基-N-[(4-甲基苯基)乙酰基]-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(92)
将C51(68.0mg,0.12mmol)和氯化氢的1,4-二噁烷(4M;1mL,4mmol)溶液的混合物在室温下搅拌5分钟,然后减压浓缩反应混合物除去溶剂,然后进一步用高真空排空消除残余氯化氢。将(4-甲基苯基)乙酸(18.6mg,0.124mmol)加入残余物;将所得混合物溶于N,N-二甲基甲酰胺(1.0mL)和冷却至-30℃。在加入N,N-二异丙基乙胺(64.7μL,0.371mmol)、随后O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;61.2mg,0.161mmol)之后,将反应混合物在1小时内温热至室温和随后用碳酸氢钠水溶液处理。混合物用乙酸乙酯萃取5次,减压浓缩经合并的有机层。残余物然后溶于二氯甲烷(1mL),用N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;88.5mg,0.371mmol)处理,和在室温下搅拌1小时,然后反应混合物用稀碳酸钠水溶液处理和用乙酸乙酯萃取两次。经合并的有机层在硫酸镁上干燥,过滤,减压浓缩,和经由反相HPLC纯化(柱:Waters XBridge C18,19x100mm,5μm;流动相A:水;流动相B:乙腈;梯度:在8.5分钟内20%至60%B,然后在0.5分钟内60%至95%B,然后95%B持续1.0分钟;流速:25mL/分),提供3-甲基-N-[(4-甲基苯基)乙酰基]-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(92)。收率:20.7mg,36.7μmol,31%。LCMS m/z 564.8[M+H]+。保留时间:2.71分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis dC18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:5.0%至95%B,在4.0分钟内线性,然后95%B持续1.0分钟;流速:2mL/分)。
实施例93
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-(1H-吡唑-1-基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(93)
步骤1.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,盐酸盐(C67,HCl盐)。
向C66(9.97g,24.4mmol)的二氯甲烷(50mL)溶液加入氯化氢的1,4-二噁烷(4M;90mL)溶液。在室温下(25℃)搅拌反应混合物2小时,然后LCMS分析指出转化为C67:LCMS m/z 309.0[M+H]+。减压浓缩提供C67,HCl盐,是白色固体。收率:8.10g,23.5mmol,96%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.20-10.08(m,1H),8.93(d,J=8.0Hz,1H),8.86-8.71(m,1H),7.68(br s,1H),7.63(br s,1H),7.12(br s,1H),4.30(ddd,J=10.9,8.1,4.1Hz,1H),4.09-4.02(m,1H),3.63-3.53(m,1H,假定的;部分受水峰掩蔽),3.22-2.99(m,3H),2.34-2.22(m,1H),2.21-2.11(m,1H),2.01(ddd,J=13.6,11.1,3.6Hz,1H),1.80-1.66(m,3H),1.55(ddd,J=13.6,11.4,4.1Hz,1H),1.08(s,3H),1.05(s,3H)。
步骤2.合成[(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-1-氧代-3-(1H-吡唑-1-基)丙-2-基]氨基甲酸叔丁酯(C80)。
将0℃的C67,HCl盐(300mg,0.870mmol)和N-(叔丁氧羰基)-3-(1H-吡唑-1-基)-L-丙氨酸(222mg,0.870mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(10mL)溶液用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;430mg,1.13mmol)和4-甲基吗啉(264mg,2.61mmol)处理。在反应混合物在0℃已搅拌2小时之后,将其用水稀释(50mL)和用乙酸乙酯(20mL)萃取。然后加入固体硫酸钠饱和水层,用二氯甲烷和甲醇混合物(10:1,4x30mL)萃取。减压浓缩经合并的有机层和进行硅胶色谱法两次(梯度#1:0%至10%甲醇/二氯甲烷;梯度#2:0%至25%甲醇/二氯甲烷),提供C80,是鲜黄色固体。收率:340mg,0.623mmol,72%。LCMS m/z 546.1[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.29(br d,J=8.6Hz,1H),7.70-7.66(m,1H),7.64(s,1H),7.51(br s,1H),7.38(br d,J=8.2Hz,1H),7.15-7.06(m,2H),6.23-6.19(m,1H),4.53-4.43(m,1H),4.34-4.18(m,3H),4.17(s,1H),3.76(d,AB四重峰的一半,J=10.5Hz,1H),3.65(dd,ABX体系的组成部分,J=10.4,5.4Hz,1H),3.20-3.06(m,2H),2.36-2.24(m,1H),2.19-2.08(m,1H),2.02-1.90(m,1H),1.71-1.55(m,2H),1.53-1.46(m,1H),1.39(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.30(s,9H),1.01(s,3H),0.89(s,3H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-[3-(1H-吡唑-1-基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,盐酸盐(C81)。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;15mL)溶液加入0℃的C80(340mg,0.623mmol)的二氯甲烷(4mL)溶液。在反应混合物在20℃已搅拌1小时之后,将其过滤,滤饼用二氯甲烷(3x10mL)洗涤。减压浓缩经合并的滤液,提供C81,是白色固体。收率:244mg,0.506mmol,81%。LCMS m/z 446.0[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ8.57-8.48(m,3H),8.42(br d,J=8.6Hz,1H),7.81(d,J=2.3Hz,1H),7.65(br s,1H),7.58(d,J=1.9Hz,1H),7.35(br s,1H),7.09(br s,1H),6.27(dd,J=2,2Hz,1H),4.59(dd,ABX体系的组成部分,J=14.4,4.7Hz,1H),4.54-4.41(m,2H),4.36-4.25(m,1H),4.30(s,1H),3.66-3.60(m,1H),3.42-3.33(m,1H),3.21-3.03(m,2H),2.31-2.20(m,1H),2.18-2.06(m,1H),1.97(ddd,J=13.5,11.5,3.7Hz,1H),1.46(dd,ABX体系的组成部分,J=7.7,5.3Hz,1H),1.41(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.01(s,3H),0.92(s,3H)。
步骤4.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-(1H-吡唑-1-基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(93)。
将0℃的C81(120mg,0.249mmol)的二氯甲烷(6.0mL)溶液用吡啶(170mg,2.15mmol)处理,随后加入三氟乙酸酐(158mg,0.752mmol)的二氯甲烷(2.0mL)溶液。反应混合物然后温热至20℃和搅拌3小时,然后将其用水稀释(20mL)和用二氯甲烷(3x20mL)萃取。经合并的有机层用盐酸(1M;20mL)和用饱和氯化钠水溶液(2x20mL)洗涤,干燥,过滤,和减压浓缩。硅胶色谱法(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷),随后超临界流体色谱法[柱:ChiralTechnologies Chiralpak AD,30x250mm,10μm;流动相:4:1二氧化碳/(乙醇,含有0.1%氢氧化铵);流速:60mL/分],提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-(1H-吡唑-1-基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(93),是白色固体。收率:15.0mg,28.6μmol,11%。LCMS m/z 524.0[M+H]+1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ10.03(br s,1H),8.92(d,J=8.0Hz,1H),7.74(br s,1H),7.69(d,J=2.3Hz,1H),7.51(d,J=1.9Hz,1H),6.23(dd,J=2,2Hz,1H),5.01-4.93(m,1H),4.91-4.83(m,1H),4.49-4.39(m,2H),4.13(s,1H),3.73(dd,ABX体系的组成部分,J=10.4,5.4Hz,1H),3.60(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.21-3.09(m,2H),2.40-2.31(m,1H),2.20-2.10(m,2H),1.79(ddd,J=13.7,9.5,6.8Hz,1H),1.76-1.66(m,1H),1.56(dd,J=7.5,5.4Hz,1H),1.36(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.02(s,3H),0.85(s,3H)。
实施例94
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[(2S)-4,4-二氟-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)丁酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(94)
步骤1.合成{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-4,4-二氟-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸9H-芴-9-基甲基酯(C82)。
向0℃的C67(230mg,0.569mmol)和(2S)-2-{[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]氨基}-4,4-二氟丁酸(247mg,0.684mmol)的N,N-二甲基甲酰胺(5mL)溶液一批加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;281mg,0.739mmol);然后滴加4-甲基吗啉(173mg,1.71mmol)。在反应混合物在0℃已搅拌10分钟之后,将其温热至室温(20℃)和继续搅拌2小时,然后反应混合物倾至冰水(15mL)中和用乙酸乙酯(2x15mL)萃取。经合并的有机层依次用1M盐酸、饱和碳酸氢钠水溶液和饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤,减压浓缩,和经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至10%甲醇/二氯甲烷),提供C82,是白色固体。收率:245mg,0.376mmol,66%。LCMS m/z 652.5[M+H]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.86(br s,1H),7.74(d,J=7.6Hz,2H),7.58-7.51(m,2H),7.38(dd,J=7.4,7.4Hz,2H),7.33-7.25(m,2H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),7.08(br s,1H),6.49-6.32(m,1H),6.17-5.79(m,3H),4.78-4.67(m,1H),4.41-4.24(m,4H),4.22-4.07(m,2H),3.83(d,J=10.5Hz,1H),3.45-3.32(m,2H),2.62-2.36(m,3H),2.26-2.10(m,2H),1.99-1.83(m,2H),1.53(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.51-1.44(m,1H),1.03(s,3H),0.89(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-3-[(2S)-2-氨基-4,4-二氟丁酰基]-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(C83)。
向0℃的C82(195mg,0.299mmol)的二氯甲烷(3mL)悬浮液加入二乙胺(32.8mg,0.448mmol)的二氯甲烷(0.5mL)溶液。在30℃搅拌反应混合物16小时,然后将其与用C82(50mg,77μmol)进行的相似反应合并和减压浓缩。经由硅胶色谱法纯化[梯度:0%至10%(10:1甲醇和氢氧化铵混合物)/二氯甲烷]提供C83,是无色胶状物。合并的收率:149mg,0.347mmol,92%。LCMS m/z 452.3[M+Na+]。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.73(br d,J=5.3Hz,1H),7.11(br s,1H),6.03(tdd,J=56.8,6.2,3.0Hz,1H),5.64(br s,1H),5.28(br s,1H),4.35-4.27(m,1H),4.27(s,1H),4.11(dd,J=10.3,5.5Hz,1H),3.72(dd,J=9.3,4.1Hz,1H),3.61(d,J=10.3Hz,1H),3.41-3.35(m,2H),2.53-2.36(m,3H),2.20-2.11(m,1H),2.00-1.84(m,3H),1.6-1.45(m,2H,假定的;部分受水峰掩蔽),1.06(s,3H),0.94(s,3H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[(2S)-4,4-二氟-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)丁酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(94)。
向0℃的C83(99mg,0.23mmol)的二氯甲烷(4mL)溶液加入吡啶(146mg,1.85mmol)和三氟乙酸酐(194mg,0.924mmol)的二氯甲烷(2mL)溶液。在室温下(15℃)搅拌反应混合物20小时,用额外的吡啶(30mg,0.38mmol)处理,和在室温下搅拌(15℃)又16小时。将其然后在二氯甲烷(15mL)与盐酸(1M;15mL)间分配,有机层用饱和碳酸氢钠水溶液(15mL)和用饱和氯化钠水溶液(10mL)洗涤,干燥,过滤,和减压浓缩。残余物与来自用C83(50mg,0.12mmol)进行的相似反应的产品合并和用反相HPLC纯化(柱:Waters XBridge BEH C18,25x150mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%氢氧化铵(v/v);流动相B:乙腈;梯度:23%至63%B)。分离(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[(2S)-4,4-二氟-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)丁酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(94),是白色固体。合并的收率:28.8mg,56.8μmol,16%。LCMS m/z 508.0[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.01(br s,1H),8.96(d,J=8.0Hz,1H),7.72(s,1H),6.16(tt,J=55.9,4.6Hz,1H),4.99-4.90(m,1H),4.65-4.57(m,1H),4.14(s,1H),3.85(dd,ABX体系的组成部分,J=10.2,5.4Hz,1H),3.67(d,AB四重峰的一半,J=10.3Hz,1H),3.21-3.04(m,2H),2.42-2.19(m,3H),2.17-2.04(m,2H),1.83-1.64(m,2H),1.60(dd,J=7.6,5.3Hz,1H),1.35(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.03(s,3H),0.89(s,3H)。
实施例95
N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(95)
步骤1.合成(4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C50)。
将N,N-二异丙基乙胺(14.8mL,85.0mmol)加入-30℃的(4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酸(8.00g,28.2mmol),C16,HCl盐(6.45g,31.1mmol),和O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;11.8g,31.0mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(100mL)中的混合物。让反应混合物在1小时内温热至0℃,然后LCMS分析指出存在C50:LCMS m/z 437.3[M+H]+。加入碳酸氢钠水溶液(300mL),所得混合物用2-丙醇和二氯甲烷(1:4,5x100mL)混合物萃取;减压浓缩经合并的有机层和经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至100%甲醇/二氯甲烷),提供C50,是油状物。1H NMR分析指出该物质作为旋转异构体的混合物存在。收率:10.9g,25.0mmol,89%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ[8.28(d,J=8.5Hz)和8.22(d,J=8.2Hz),共1H],[7.64(s)和7.59(s),共1H],[7.38(br s)和7.27(brs),共1H],7.05(br s,1H),4.38-4.28(m,1H),4.28-4.17(m,1H),3.45-3.36(m,1H),3.12-3.00(m,1H),2.42-2.03(m,4H),2.02-1.89(m,1H),1.80-1.45(m,2H),[1.39(s)和1.32(s),共9H]。
步骤2.合成N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰基-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]-L-丙氨酰胺(C51)。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;80mL)溶液加入C50(7.00g,16.0mmol)的二氯甲烷(15mL)溶液。在反应混合物在室温下已搅拌5分钟之后,将其减压浓缩除去溶剂,和经由高真空排空消除残余氯化氢。将残余物与N-(叔丁氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酸(4.08g,17.6mmol)和O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;6.71g,17.6mmol)/N,N-二甲基甲酰胺(25mL)混合,冷却至-30℃,和用N,N-二异丙基乙胺(8.38mL,48.1mmol)处理。让反应混合物在1小时内温热至0℃,然后LCMS分析指出存在C51:LCMS m/z550.4[M+H]+。反应混合物然后用碳酸氢钠水溶液稀释和用二氯甲烷和2-丙醇的4:1混合物萃取三次。在经合并的有机层已减压浓缩之后,残余物经由硅胶色谱法纯化(梯度:0%至30%甲醇/二氯甲烷),提供C51,是固体。收率:3.95g,7.19mmol,45%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ8.28(d,J=8.8Hz,1H),7.55(s,1H),7.29(br s,1H),7.03(br s,1H),6.77(br d,J=9.1Hz,1H),4.52-4.43(m,1H),4.24(ddd,J=12.2,8.7,3.5Hz,1H),4.12(d,J=9.2Hz,1H),4.02-3.84(m,2H),3.16-3.08(m,1H),3.08-2.98(m,1H),2.50-2.37(m,1H),2.31-2.20(m,1H),2.19-2.05(m,2H),2.00-1.87(m,1H),1.69-1.55(m,1H),1.55-1.44(m,1H),1.36(s,9H),0.93(s,9H)。
步骤3.合成N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(95)。
将C51(230mg,0.418mmol)和氯化氢的1,4-二噁烷(4M;2mL,8mmol)溶液的混合物在室温下搅拌5分钟,然后减压浓缩反应混合物除去溶剂,然后用高真空进一步排空消除残余氯化氢。残余物溶于二氯甲烷(2mL),冷却至0℃,用N,N-二异丙基乙胺(0.219mL,1.26mmol)随后氯甲酸甲酯(59.3mg,0.628mmol)处理。在反应混合物在0℃已搅拌10分钟之后,将其用碳酸氢钠水溶液稀释和用二氯甲烷和2-丙醇的4:1混合物萃取三次;经合并的有机层在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩。残余物溶于二氯甲烷(3mL);在加入N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;299mg,1.25mmol)之后,在室温下搅拌反应混合物1小时。将其然后用稀碳酸钠水溶液处理和用乙酸乙酯萃取3次。经合并的有机层在硫酸镁上干燥,过滤,和经由硅胶上的色谱法纯化(梯度:50%至100%乙酸乙酯/庚烷)。所得物质在庚烷(4mL)中在50℃制浆2小时,冷却至室温,在室温下搅拌过夜;收集固体,提供N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺(95),是固体。收率:123mg,0.251mmol,60%。LCMS m/z490.4[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.02(d,J=8.6Hz,1H),7.65(s,1H),7.27(br d,J=8.7Hz,1H),4.94(ddd,J=11.1,8.5,5.0Hz,1H),4.36(dd,J=7.3,7.2Hz,1H),4.14(d,J=8.7Hz,1H),4.00-3.91(m,2H),3.52(s,3H),3.46-3.34(m,1H,假定的;部分受水峰掩蔽),3.18-2.98(m,2H),2.5-2.39(m,1H,假定的;部分受溶剂峰掩蔽),2.35-2.23(m,1H),2.22-2.01(m,3H),1.77-1.63(m,2H),0.94(s,9H)。
实施例96
(1R,2S,5S)-N-{(1R)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(96)和(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)固体形式5
向13,甲基叔丁基醚溶剂化物(来自"实施例13的备择合成,甲基叔丁基醚溶剂化物";15.0g,25.5mmol)的乙腈(80mL)溶液加入甲磺酸(6.4mL,99mmol)。在室温下搅拌反应混合物4小时,然后加入饱和碳酸氢钠水溶液(80mL)和饱和氯化钠水溶液(10mL)混合物将其碱化。所得混合物用二氯甲烷(2x100mL)萃取,经合并的有机层在硫酸钠上干燥,过滤,和减压浓缩。两种差向异构体的分离经由超临界流体色谱法进行(柱:Chiral TechnologiesChiralcel OX-H,30x250mm,5μm;流动相:9:1二氧化碳/2-丙醇;反压:100巴;流速:80mL/分)。回收第一洗脱物质(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(13)。通过粉末X射线衍射分析,该物质是无定形的;这指定为固体形式5。作为玻璃状物获得第二洗脱物质,将其溶于二氯甲烷,用庚烷处理,和减压浓缩,提供(1R,2S,5S)-N-{(1R)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(96),是固体。
回收的13-收率:6.00g,12.0mmol,47%。LCMS m/z 500.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.46-9.33(m,1H),9.01(d,J=8.5Hz,1H),7.66(s,1H),5.03-4.91(m,1H),4.46-4.37(m,1H),4.16(s,1H),3.97-3.86(m,1H),3.69(d,AB四重峰的一半,J=10.4Hz,1H),3.19-3.09(m,1H),3.09-2.98(m,1H),2.46-2.33(m,1H),2.21-2.03(m,2H),1.79-1.65(m,2H),1.61-1.53(m,1H),1.32(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.03(s,3H),0.98(s,9H),0.85(s,3H)。保留时间:3.93分钟(分析条件。柱:Chiral Technologies Chiralcel OX-H,4.6x250mm,5μm;流动相A:二氧化碳;流动相B:2-丙醇;梯度:5%B持续1.00分钟,随后在8.00分钟内5%至60%B;反压:120巴;流速:3.0mL/分)。该无定形物质的粉末X射线衍射图谱提供于图9。收集粉末X射线衍射数据的方法描述于"实施例13的备择合成,甲基叔丁基醚溶剂化物",步骤8。
96-收率:2.58g,5.16mmol,20%。LCMS m/z 500.3[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.42(d,J=8.4Hz,1H),9.06(d,J=7.6Hz,1H),7.79(s,1H),4.96-4.86(m,1H),4.41(d,J=8.7Hz,1H),4.20(s,1H),3.92(br dd,J=10.7,5.4Hz,1H),3.66(d,AB四重峰的一半,J=10.5Hz,1H),3.22-3.12(m,2H),2.43-2.31(m,1H),2.31-2.20(m,1H),2.16-2.04(m,1H),1.84-1.63(m,2H),1.57-1.49(m,1H),1.32(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.00(br s,12H),0.84(s,3H)。保留时间:4.20分钟(分析条件等同于上文用于回收的13的那些)。
实施例97
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,来自C86(DIAST-2)(97)
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步骤1.合成2-[(叔丁氧羰基)氨基]-3-(三氟甲基)戊酸(C84)。
将氢氧化钠水溶液(1M;1.48mL,1.48mmol)加入2-氨基-3-(三氟甲基)戊酸(Wang等人,J.Amer.Chem.Soc.2003,125,6900-6906;137mg,0.740mmol)的1,4-二噁烷(3mL)悬浮液,将所得混合物冷却至0℃。缓慢加入二碳酸二叔丁酯(0.204mL,0.888mmol),反应混合物然后在室温下搅拌过夜。在用乙酸乙酯稀释之后,反应混合物在冰浴中冷却然后加入1M硫酸氢钾水溶液酸化至pH 2。水层用乙酸乙酯萃取两次,经合并的有机层在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C84,是固体。该物质推定由4种非对映体混合物组成,还可能展示旋转异构体。收率:197mg,0.690mmol,93%。LCMS m/z 284.3[M-H]-1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ13.16(br s,1H),[7.29(d,主要,J=9.8Hz)和6.95-6.85(m,次要),共1H],[4.55(dd,主要,J=9.8,3.3Hz),4.46(br d,次要,J=9.1Hz),和4.40(dd,次要,J=9.4,4.5Hz),共1H],2.86-2.67(m,1H),1.71-1.47(m,2H),1.39(br s,9H),[0.98(t,次要,J=7.4Hz)和0.91(t,主要,J=7.5Hz),共3H]。
步骤2.合成{1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-1-氧代-3-(三氟甲基)戊烷-2-基}氨基甲酸叔丁酯,DIAST-1(C85)和{1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-1-氧代-3-(三氟甲基)戊烷-2-基}氨基甲酸叔丁酯,DIAST-2(C86)。
将0℃的C84(128mg,0.449mmol)的乙腈(2.7mL)和N,N-二甲基甲酰胺(1.5mL)混合物溶液用O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(HATU;176mg,0.463mmol)和4-甲基吗啉(0.116mL,1.06mmol)处理。在反应混合物在0℃已搅拌30分钟之后,加入固体C67(170mg,0.420mmol),继续搅拌2小时。反应混合物然后用乙酸乙酯和水稀释,用饱和碳酸氢钠水溶液洗涤。水层用乙酸乙酯萃取两次,经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩。所得油状物与庚烷两次共沸和与甲基叔丁基醚两次共沸,然后进行硅胶色谱法(梯度:0%至20%甲醇/二氯甲烷)。第一洗脱非对映体指定为C85,而第二洗脱非对映体指定为C86。
C85(DIAST-1)-收率:77.3mg,0.134mmol,32%。通过1H NMR分析,该物质包含异构体或旋转异构体的混合物。LCMS m/z 576.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰,积分为近似值:δ[8.35(d,J=7.9Hz)和8.16(d,J=8.5Hz),共1H],7.62-7.54(m,1H),7.41-7.18(m,2H),[7.02(br s)和6.98(br s),共1H],4.59-4.50(m,1H),4.29-4.13(m,2H),3.89(dd,J=10.4,5.4Hz,1H),3.44(d,J=10.4Hz,1H),3.20-3.04(m,2H),2.70-2.59(m,1H),2.43-2.31(m,1H),2.21-2.08(m,1H),1.99-1.88(m,1H),[1.38(s)和1.36(s),共9H],1.01(br s,3H),0.94-0.82(m,6H)。
C86(DIAST-2)-收率:87.8mg,0.153mmol,36%。通过1H NMR分析,该物质大致是单一异构体。LCMS m/z 576.2[M+H]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6),特征峰:δ8.27(d,J=8.6Hz,1H),7.59(s,1H),7.31(d,J=9.5Hz,1H),7.22(br s,1H),7.04(br s,1H),4.55(dd,J=9.5,5.9Hz,1H),4.30-4.17(m,1H),4.23(s,1H),3.79(dd,ABX体系的组成部分,J=10.1,5.2Hz,1H),3.71(d,AB四重峰的一半,J=10.1Hz,1H),3.09-2.99(m,1H),2.68-2.55(m,1H),2.42-2.30(m,1H),2.17-2.04(m,1H),1.97-1.86(m,1H),1.36(s,9H),1.02(s,3H),0.94-0.83(m,6H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,来自C86(DIAST-2)(C87)。
将C86(DIAST-2)(87.8mg,0.153mmol)的二氯甲烷(1mL)溶液用氯化氢的1,4-二噁烷(4M;0.381mL,1.52mmol)溶液处理。在反应混合物在室温下已搅拌40分钟之后,加入甲醇(0.5mL)改善溶解度。在又40分钟之后,将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;0.10mL,0.4mmol)溶液加入;30分钟后,LCMS分析指出完全除去保护基团:LCMS m/z 476.2[M+H]+。减压浓缩反应混合物和与庚烷共沸两次;残余物与二乙醚研磨两次,悬浮于二氯甲烷(1.2mL)和冷却至0℃。在加入三乙胺(42.4μL,0.304mmol)、随后三氟乙酸酐(47.9μL,0.339mmol)之后,在0℃搅拌反应混合物30分钟,然后将其从冰浴移除和在水与乙酸乙酯间分配。水层用乙酸乙酯萃取,经合并的有机层用饱和碳酸氢钠水溶液和用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸镁上干燥,过滤,减压浓缩,与甲基叔丁基醚共沸两次。通过1H NMR和LCMS分析,该物质含有C87和相应甲基酯的混合物(LCMS m/z 587.4[M+H]+)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),C87特征峰:δ8.31(d,J=8.7Hz,1H),7.59(s,1H),7.26(s,1H),7.05(s,1H),3.59(d,AB四重峰的一半,J=10.0Hz,1H),1.97-1.87(m,1H),1.40(d,AB四重峰的一半,J=7.6Hz,1H),1.03(s,3H),0.84(s,3H)。经由硅胶上的色谱法纯化(梯度:0%至20%甲醇/二氯甲烷),随后将所得油状物与庚烷共沸,随后与二乙醚和庚烷混合物共沸,提供C87,是白色固体。收率:17.9mg,31.3μmol,20%。LCMS m/z 572.0[M+H]+
步骤4.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,来自C86(DIAST-2)(97)。
将N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;18.8mg,78.9μmol)加入C87(18mg,31μmol)的乙酸乙酯(0.8mL)溶液。在反应混合物在室温下已搅拌1小时之后,再次加入一刮勺N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂)。继续搅拌2小时,然后过滤反应混合物,滤饼用乙酸乙酯冲洗。经合并的滤液用饱和碳酸氢钠水溶液洗涤,水层用乙酸乙酯萃取一次;经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩,提供粗制产品。1H NMR(600MHz,DMSO-d6),主要组分:δ9.90(d,J=8.8Hz,1H),8.85(d,J=8.1Hz,1H),7.56(br s,1H),4.97-4.89(m,2H),4.17(s,1H),3.89(dd,J=10.1,5.4Hz,1H),3.62(d,J=10.1Hz,1H),3.21-3.14(m,1H),3.12-3.06(m,1H),2.92-2.82(m,1H),2.43-2.35(m,1H),2.18-2.10(m,2H),1.78(ddd,J=13.6,9.6,6.0Hz,1H),1.75-1.66(m,2H),1.62-1.55(m,2H),1.35(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.04(s,3H),0.97-0.92(t,J=7.6Hz,3H),0.85(s,3H)。该物质经由反相HPLC纯化(柱:WatersSunfire C18,19x100mm,5μm;流动相A:0.05%三氟乙酸/水(v/v);流动相B:0.05%三氟乙酸/乙腈(v/v);梯度:在8.54分钟内5%至95%B,随后95%B持续1.46分钟;流速:25mL/分),提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,来自C86(DIAST-2)(97)。收率:8.3mg,15μmol,48%。LCMS m/z 554.6[M+H]+。保留时间:2.72分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis dC18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:5.0%至95%B,在4.0分钟内线性,然后95%B持续1.0分钟;流速:2mL/分)。
实施例98
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,来自C85(DIAST-1)(98)
步骤1.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-3-[2-氨基-3-(三氟甲基)戊酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,盐酸盐,来自C85(DIAST-1)(C88)。
将氯化氢的1,4-二噁烷(4M;0.336mL,1.34mmol)溶液加入C85(DIAST-1)(77.3mg,0.134mmol)的二氯甲烷(1mL)溶液。在反应混合物在室温下已搅拌40分钟之后,加入甲醇(0.5mL)改善溶解度。继续搅拌2小时,然后LCMS分析指出完成脱保护:LCMS m/z 476.2[M+H]+。减压浓缩反应混合物;残余物与庚烷共沸两次,然后与二乙醚研磨两次,提供C88,是白色固体。收率:54.5mg,0.106mmol,79%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),主要特征峰:δ8.53(brs,3H),8.36(d,J=8.5Hz,1H),7.61(s,1H),7.28(br s,1H),7.06(br s,1H),4.25(ddd,J=10.9,8.4,4.5Hz,1H),4.17(s,1H),4.08(dd,J=10.5,5.6Hz,1H),2.80-2.68(m,1H),2.37-2.26(m,1H),2.23-2.13(m,1H),2.05-1.96(m,1H),1.73-1.51(m,5H),1.44(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.04(s,3H),0.90(s,3H)。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-氨基-1-氧代-3-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]丙-2-基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,来自C85(DIAST-1)(C89)。
将0℃的C88(54.5mg,0.106mmol)的二氯甲烷(1mL)悬浮液用三乙胺(26μL,0.19mmol),随后三氟乙酸酐(19.5μL,29.1mg,0.138mmol)处理。在反应混合物在0℃已搅拌1小时10分钟之后,加入三氟乙酸酐(1当量);30分钟后,再次加入三氟乙酸酐(9.4μL,67μmol)。继续搅拌45分钟,然后LCMS分析指出完全转化为C89:LCMS m/z 572.4[M+H]+。反应混合物在水与乙酸乙酯间分配,水层用乙酸乙酯萃取。经合并的有机层依次用饱和碳酸氢钠水溶液和饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩,提供C89。收率:41.2mg,72.1μmol,68%。1H NMR(400MHz,DMSO-d6),主要组分,特征峰:δ10.04(d,J=9.3Hz,1H),8.23(d,J=8.5Hz,1H),7.58(s,1H),7.31(br s,1H),7.01(br s,1H),4.92-4.83(m,1H),4.23(s,1H),3.95(dd,J=10.2,5.5Hz,1H),2.98-2.86(m,1H),2.38-2.27(m,1H),1.90(ddd,J=13.5,11.2,4.0Hz,1H),1.39(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.02(s,3H),0.90(s,3H)。
步骤3.合成(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,来自C85(DIAST-1)(98)。
将N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂;42.7mg,0.179mmol)加入C89(41.0mg,71.7μmol)的乙酸乙酯(0.8mL)溶液。在反应混合物在室温下已搅拌1小时之后,加入一刮勺N-(三乙基铵基磺酰基)氨基甲酸甲酯内盐(Burgess试剂)。继续搅拌2小时,然后过滤反应混合物,滤饼用乙酸乙酯冲洗。经合并的滤液用饱和碳酸氢钠水溶液洗涤,水层用乙酸乙酯萃取;经合并的有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤,在硫酸镁上干燥,过滤,和减压浓缩,提供粗制产品。1H NMR(600MHz,DMSO-d6),主要组分,特征峰:δ10.12(d,J=9.1Hz,1H),8.99(d,J=8.1Hz,1H),7.70(s,1H),4.94(ddd,J=9.4,8.1,6.5Hz,1H),4.87(dd,J=9.0,9.0Hz,1H),4.11(s,1H),3.96(dd,J=10.2,5.6Hz,1H),3.52(d,J=10.0Hz,1H),3.18-3.07(m,2H),2.98-2.88(m,1H),2.40-2.33(m,1H),1.79-1.52(m,4H),1.61(dd,J=7.6,5.5Hz,1H),1.33(d,AB四重峰的一半,J=7.7Hz,1H),1.04(s,3H),0.91-0.86(m,6H)。
该物质经由反相HPLC纯化(柱:Waters Sunfire C18,19x100mm,5μm;流动相A:0.05%三氟乙酸/水;流动相B:0.05%三氟乙酸/乙腈;梯度:在8.54分钟内5%至95%B,随后95%B持续1.46分钟;流速:25mL/分)提供(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,来自C85(DIAST-1)(98)。收率:4.3mg,7.8μmol,11%。LCMS m/z 554.6[M+H]+。保留时间:2.80分钟(分析条件。柱:Waters Atlantis dC18,4.6x50mm,5μm;流动相A:水,含有0.05%三氟乙酸(v/v);流动相B:乙腈,含有0.05%三氟乙酸(v/v);梯度:5.0%至95%B,在4.0分钟内线性,然后95%B持续1.0分钟;流速:2mL/分)。
制备(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2,3-二羧酸3-叔丁基2-甲基酯(C90)
该制备C.Uyeda和J.Werth,Angew.Chem.Int.Ed.2018,57,13902-13906用报告的一般程序进行。向配有磁力搅拌条、回流冷凝器、温度计和氮入口的3-颈烧瓶加入溴化钴(II)(0.15当量;0.146g,0.667mmol),(1E,1'E)-1,1'-吡啶-2,6-二基双[N-(2-叔丁基苯基)乙亚胺](2-t-BuPDI;0.15当量;0.284g,0.667mmol)和四氢呋喃(11mL)。将粘稠绿色悬浮液在室温下搅拌过夜,和加入锌(2.4当量;0.70g,11mmol)和溴化锌(1.1当量;1.1g,4.9mmol)。在搅拌15分钟之后,反应混合物变为紫色和加入(2S)-2,5-二氢-1H-吡咯-1,2-二羧酸1-叔丁基2-甲基酯(1.0当量;1.0g,4.4mmol)的四氢呋喃(7.5mL)溶液和2,2-二氯丙烷(2.0当量;1.0g,8.8mmol)。在室温下搅拌反应混合物5天,然后将其过滤通过硅藻土垫和用四氢呋喃(10.8mL)冲洗。滤液与饱和氯化铵水溶液(3.5mL)和乙酸乙酯(9.5mL)合并;然后分开各层,水相用乙酸乙酯(8.4mL)萃取。经合并的有机萃取物用饱和碳酸氢钠水溶液(10.5mL)洗涤,在硫酸镁上干燥,过滤,和浓缩至干,提供(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2,3-二羧酸3-叔丁基2-甲基酯(C90),是黄色油状物。收率:0.90g,3.3mmol,75%。通过1H NMR分析,该物质作为两种氨基甲酸酯旋转异构体(~3:2比率)存在。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ4.20&4.09(2s,1H),3.74&3.75(2s,3H),3.68-3.60(m,1H),3.44&3.38(2d,J=10.9Hz,1H),1.43&1.38(2s,9H),1.38-1.34(m,2H),1.03&0.98&0.96(3s,6H)。ESI-MS(pos.)m/z(%)=255.1(12.5)[M-Me+H]+,214.1(100)[M-t-Bu+H]+,170.2(50)[M-Boc+H]+
C42的备择制备
(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C42)
/>
步骤1.合成3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酸(C91)。
将甲醇钠的甲醇(25重量%;28.5mL,124mmol)溶液加入3-甲基-L-缬氨酸(99%,15g,113mmol)的甲醇(30mL)溶液。然后加入三氟乙酸乙酯(130mmol)和在40℃搅拌反应混合物直至反应完成(大约2.5小时),然后将其冷却至20℃。在加入盐酸(1M;136ml,136mmol)之后,混合物用乙酸乙酯稀释(150mL)和分层。有机层用饱和氯化钠水溶液洗涤两次,在硫酸镁上干燥,和过滤。将庚烷加入滤液,然后溶液在50℃浓缩至5mL/g的体积。该程序进行两次;在第二次蒸馏之后,加入C91的晶种(50mg;参见下文)。所得固体经由过滤收集,用庚烷洗涤,在40℃干燥,提供C91,是米白色固体。收率:22.2g,97.7mmol,86%。
上文使用的晶种得自用3-甲基-L-缬氨酸进行的相似反应;在含C91的有机层已在硫酸镁上干燥和过滤之后,减压浓缩提供固体。一部分该固体用作晶种物质。
对得自以相同方式进行的反应的C91样品获得物理化学数据。HRMS-ESI+(m/z):[M+H]+C8H13F3NO3的计算值,228.0842;实测值,228.0842。观察到的主要离子是C8H11F3NNa2O3[M+Na+]:计算值,272.0481;实测值,272.0482。1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ13.05(s,1H),9.48(d,J=8.9Hz,1H),4.21(d,J=8.9Hz,1H),1.00(s,9H)。13C NMR(150.8MHz,DMSO-d6)δ170.9,156.6(q,2JCF=36.9Hz),115.8(q,1JCF=287.7Hz),61.0,33.6,26.5。C91的粉末X射线衍射图谱提供于图11;特征峰列于表R。
表R.对C91选择的粉末X射线衍射峰
角(°2-θ) 相对强度 角(°2-θ) 相对强度 角(°2-θ) 相对强度
9.7 27 28.1 4 37.7 1
11.8 6 28.7 2 38.2 2
12.6 3 28.9 5 38.7 2
13.2 20 29.7 4 39.3 3
14.7 28 29.9 4 39.6 1
15.6 69 30.3 10 40.0 1
17.2 4 30.8 3 40.5 5
17.9 2 31.0 1 40.7 3
18.3 2 31.3 1 40.9 3
19.5 100 32.6 3 41.5 1
20.0 14 33.5 2 41.8 1
20.4 2 34.0 1 42.4 3
21.5 22 34.2 2 43.1 1
23.2 8 34.7 3 44.2 1
23.3 11 36.2 2 44.8 1
23.8 6 36.4 3 45.7 1
25.2 1 36.7 2 45.9 3
25.4 17 37.1 1 46.4 1
25.7 2 37.2 2 47.0 1
26.6 7 37.4 1 47.3 2
26.7 6 37.6 3 49.5 2
用于X射线晶体学的晶体经由从乙酸乙酯和己烷重结晶获得,使用来自上文相同批次的晶种。C91的单晶数据的ORTEP图示于图12。
C91的单晶X射线结构测定
单晶X射线分析
数据收集在Bruker D8 Quest衍射仪上在-100℃进行。数据收集由omega和phi扫描组成。
用SHELX软件套装在四方类型手性空间群P41212中通过固有相位调整解结构。结构随后通过全矩阵最小二乘法精修。发现全部非氢原子并用各向异性位移参数精修。
从傅里叶差值地图发现位于氮和氧上的氢原子并用约束的距离精修。在O2(H2Z)和O3(H3Z)上的氢作为电荷共享并且各自精修为10.5占有率。将剩余氢原子置于计算位置并让其加载于它们的负载原子上。最终的精修包括全部氢原子的各向同性位移参数。
鉴定出在-CF3片段处比率~67/33的群体占有率无序并相应地建模。
使用可能性方法的绝对结构分析(Hooft,2008)用PLATON(Spek)来进行。结果指出已正确赋予绝对结构。方法计算出正确赋予结构的可能性是100%。Hooft参数报告为0.02,其esd(估计标准偏差)是(4),而Parson参数报告为0.02,其esd是(4)。
最终的R-指数是4.1%。最终的差值傅里叶揭示并无缺失的或误置的电子密度。
有关的晶体,数据收集和精修信息概括于表S。原子坐标,键长,键角和位移参数列于表T-V。
所用的软件和参考文献列表可以参考"实施例13固体形式1的单晶X射线结构测定"。
表S.C91的晶体数据和结构精修。
表T.C91的原子坐标(x 104)和等价各向同性位移参数U(eq)定义为正交化Uij张量的迹的1/3。/>
表U.C91的键长和键角[°]。
/>
/>
用对称性转化来产生等价原子。
表V.C91的各向异性位移参数各向异性位移因子指数呈下述形式:-2π2[h2 a*2U11+...+2h k a*b*U12]。
步骤2.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸锂(C92)。
将一水合氢氧化锂(29.0g,678mmol)加入(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯,盐酸盐(68.5g,333mmol)在四氢呋喃(950mL)和水(48mL)中的混合物。在25℃搅拌反应混合物直至水解完成,然后经由过滤收集固体,用5%水的四氢呋喃(400mL)溶液洗涤,在70℃减压干燥,提供C92,是白色至米白色固体。收率:47.6g,295mmol,89%。对得自以相同方式进行的反应的C92样品获得物理化学数据。
HRMS-ESI+(m/z):[M+H]+C8H14NO2的计算值,156.1019;实测值,156.1019。1H NMR(600MHz,D2O)δ3.23(d,J=1.1Hz,1H),3.09(dd,J=11.1,5.2Hz,1H),2.63(d,J=11.1Hz,1H),1.33-1.24(m,2H),0.86(s,2H),0.83(s,3H)。13C NMR(150.8MHz,D2O)δ182.7,62.3,45.6,35.5,30.0,25.8,19.3,12.7。C92的粉末X射线衍射图谱提供于图13;特征峰列于表W。
表W.对C92选择的粉末X射线衍射峰
角(°2-θ) 相对强度 角(°2-θ) 相对强度 角(°2-θ) 相对强度
5.1 4 20.2 6 30.2 4
6.0 100 20.8 19 30.5 2
7.3 17 21.4 2 31.4 18
8.7 3 21.9 4 32.2 5
10.2 6 22.3 16 32.6 22
12.1 20 22.8 7 33.8 3
12.7 2 23.8 3 34.3 3
13.7 2 24.5 9 35.2 3
15.3 15 24.8 3 35.9 10
15.7 6 25.5 21 36.7 4
16.7 78 26.2 5 37.4 4
17.2 8 26.5 4 37.8 4
18.0 3 28.4 10 39.0 2
18.8 95 29.0 10 39.2 1
19.5 14 29.5 4 39.8 1
步骤3.合成(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C42)。
将C91(1.29g,5.68mmol),4-(二甲基氨基)吡啶(0.60g,4.8mmol)和N,N-二异丙基乙胺(1.70mL,9.75mmol)在四氢呋喃(10mL)中的混合物用对-甲苯磺酰氯(0.99g,5.2mmol)处理。在反应混合物在20℃已搅拌2小时之后,加入C92(75.7质量%,1.00g,4.70mmol)和在20℃继续搅拌过夜。所得浆料与乙酸丙-2-基酯(10mL)混合和依次用柠檬酸水溶液(10%,10mL)和用水(10mL)洗涤。有机层然后浓缩,然后加入乙酸丙-2-基酯(5mL),随后从加料漏斗滴加庚烷(15mL)。固体经由过滤分离和减压干燥,提供(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C42),是白色固体。收率:1.2g。该化合物显示两组NMR信号。主要和次要组分别相应于叔酰胺的Z和E异构体,摩尔比是20:1。样品还含有相对C42摩尔比37%的乙酸异丙酯,显示于4.86、1.96和1.17ppm的1H共振,以及于169.7、66.9、21.5和21.0ppm的13C共振。1H和13C信号用对两者均设置为0ppm的TMS信号做参照。
HRMS-ESI+(m/z):[M+H]+C16H24F3N2O4的计算值,365.1683;实测值:365.1684。1HNMR(600MHz,DMSO-d6)δ主要:9.44(d,J=8.5Hz,1H),4.44(d,J=8.5Hz,1H),4.15(s,1H),3.85(dd,J=10.5,5.4Hz,1H),3.73(d,J=10.5Hz,1H),1.53(dd,J=7.6,5.3Hz,1H),1.43(d,J=7.6Hz,1H),1.01(s,3H),1.01(s,9H),0.83(s,3H);次要:9.11(d,J=9.4Hz,1H),4.53(s,1H),4.33(d,J=9.4Hz,1H),3.53(dd,J=12.5,5.3Hz,1H),3.41(d,J=12.5Hz,1H),1.55(d,J=7.5Hz,1H),1.41(dd,J=7.5,5.3Hz,1H),1.02(s,3H),0.97(s,3H),0.91(s,9H)。13C NMR(150.8MHz,DMSO-d6)δ主要:172.3,167.5,156.8(2JCF=37.0Hz),115.7(1JCF=287.7Hz),59.1,58.0,47.1,34.6,29.6,26.7,26.1,25.6,18.7,12.0;次要:172.3,168.1,155.9(2JCF=36.8Hz),115.8(1JCF=288.1Hz),59.9,57.3,46.4,36.2,32.1,26.2,26.0,24.4,19.0,12.7。C42的粉末X射线衍射图谱提供于图14;特征峰列于表X。
用于粉末X射线衍射工作和单晶X射线结构测定两者的结晶进行如下。将C42(2.96g)的乙醇(9mL)溶液在搅拌(3500rpm)下加热至40℃,然后在10分钟内加水(10.5mL)。然后在4小时内加入额外的水(16.5mL),将混合物冷却至10℃和搅拌过夜。在过滤之后,滤饼用水(6mL)洗涤和在50℃干燥,提供结晶的C42(2.6g)。
表X.对C42选择的粉末X射线衍射峰
C42的单晶数据的ORTEP图示于图15。
C42的单晶X射线结构测定
单晶X射线分析
数据收集在Bruker D8 Venture衍射仪上在室温下进行。数据收集由omega和phi扫描组成。应用每帧0.3度宽的特殊数据策略以便分区,由此消除任何TWIN和假对称性问题。
用SHELX软件套装在菱面体类型群R3中通过固有相位调整解结构。结构随后通过全矩阵最小二乘法精修。发现全部非氢原子并用各向异性位移参数精修。
从傅里叶差值地图发现位于氮和氧上的氢原子并用约束的距离精修。将剩余氢原子置于计算位置并让其加载于它们的负载原子上。最终的精修包括全部氢原子的各向同性位移参数。
使用可能性方法的绝对结构分析(Hooft,2008)用PLATON(Spek)来进行。结果指出已正确赋予绝对结构。方法计算出正确赋予结构的可能性是100%。Hooft参数报告为-0.08,其esd(估计标准偏差)为(7),而Parson参数报告为-0.09,其esd是(6)。
鉴定出在C1_F1_F2片段处比率78:22的群体位点无序并相应地处理。
最终的R-指数是5.8%。最终的差值傅里叶揭示并无缺失的或误置的电子密度。
有关的晶体,数据收集和精修信息概括于表Y中。原子坐标,键长,键角和位移参数列于表Z-BB。
所用的软件和参考文献列表可以参考"实施例13固体形式1的单晶X射线结构测定"。
表Y.C42的晶体数据和结构精修。
表Z.C42的原子坐标(x 104)和等价各向同性位移参数U(eq)定义为正交化Uij张量的迹的1/3。/>
表AA.C42的键长和键角[°]。
/>
/>
/>
用对称性转化来产生等价原子。
表BB.C42的各向异性位移参数各向异性位移因子指数呈下述形式:-2π2[h2 a*2U11+...+2h k a*b*U12]。
除了根据上文描述的方法制备(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸(C42)之外,所述化合物还能够如下文紧接显示的反应方案的描述制备。在步骤1中,首先将(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯盐酸盐在四氢呋喃和水混合物中用三乙胺处理以中和盐酸盐,随后将甲基酯用在四氢呋喃和水混合物中的氢氧化钠水解,提供(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸钠。
制备(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸钠
向适宜的容器加入四氢呋喃(30mL0),水(7.5mL),三乙胺(7.62mL,54.7mmol)和(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯盐酸盐(7.59g,36.9mmol)。混合物在25℃搅拌至少30分钟。停止搅拌并将各层分离。在分开的容器中,在40℃在搅拌下加入28w/w%氢氧化钠水溶液(4.19mL,38.3mmol)和四氢呋喃(71mL)。添加来自分离的含(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸甲酯的四氢呋喃溶液的有机层的25%,将溶液用(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸钠(0.1182g,0.7336mmol-预先制备自类似程序)接种。将混合物在40℃保持至少15分钟和缓慢地加入有机层的其余75%。混合物在搅拌下在40℃保持16小时,然后缓慢冷却至20℃并保持至少4h。所得固体(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸钠通过过滤分离,用由四氢呋喃(43mL)和水(2.25mL)组成的溶液洗涤。固体物质在70℃减压干燥,提供6.13g(93.8%)的(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸钠,是结晶固体。PXRD根据上文描述的方法测定。
对结晶的(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸钠选择的PXRD峰。
对(S)-3,3-二甲基-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)丁酸(C91)选择的PXRD峰
(S)-3,3-二甲基-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)丁酸(C91)的晶体数据和结构精修。
在步骤2中,然后在四氢呋喃中、在甲苯磺酰氯和二甲基氨基吡啶存在下将所得(1R,2S,5S)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-羧酸钠与(S)-3,3-二甲基-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)丁酸偶联。除去四氢呋喃并用乙酸异丙酯替换,随后用HCl/盐水处理,随后用水和庚烷后处理,提供C42。
结晶的C42通过PXRD表征并且鉴定出得自延长干燥或更高温度的又一形式。
对C42选择的PXRD峰-得自延长干燥时间或更高温度的晶型
对SARS-CoV-2感染的抗病毒活性
能够经由细胞存活率来评价化合物预防SARS-CoV-2冠状病毒诱导性细胞死亡或细胞病变作用的能力,其使用的测试模式用萤光素酶来测量细胞内ATP作为终点。简言之,将富集hACE2表达的VeroE6细胞用SARS-CoV-2(USA_WA1/2020)以感染复数0.002在BSL-3实验室中批量接种。然后将病毒接种的细胞以4,000个细胞/孔的密度加至准备测试的化合物板。在3天温育之后,即在未处理的、感染的对照条件下病毒诱导性细胞病变作用是95%的时间,用Cell Titer-Glo(Promega)根据生产商的方案来评价细胞存活率,这定量ATP水平。在未感染的细胞中平行地评价化合物的细胞毒性。试验化合物单独或在浓度2μM的P-糖蛋白(P-gp)抑制剂CP-100356存在下测试。包含CP-100356的目的是评价试验化合物是否从VeroE6细胞流出,其具有高水平的P-糖蛋白表达。基于各测试板上无病毒对照孔和含病毒对照孔的值来计算各浓度试验化合物的百分比效果。用4-参数对数模型从这些数据确定50%应答(EC50)值需要的浓度。在>3且最大剂量实现≥50%效果的情况下,将EC50曲线对Hill斜率3拟合。如果在大于30%效果检测到细胞毒性,则从EC50的确定中消去相应的浓度数据。
对于细胞毒性板,基于各测试板上仅含细胞的对照孔和含季铵盐的对照孔的值来计算各浓度试验化合物的百分比效果。CC50值用4-参数对数模型计算。TI则通过将CC50值除以EC50值来计算。
SARS-CoV-2冠状病毒3C蛋白酶FRET测试和分析
SARS-CoV-2的主要蛋白酶3CLpro的蛋白水解活性用连续荧光共振能量转移(FRET)测试来监测。所述SARS-CoV-2 3CLpro测试测量的是全长SARS-CoV-2 3CL蛋白酶裂解下述序列的合成荧光底物肽的活性:在共有肽上建模的Dabcyl-KTSAVLQ-SGFRKME-Edans(V.Grum-Tokars等人Evaluating the 3C-like protease activity of SARS-coronavirus:recommendations for standardized assays for drug discovery.VirusResearch 133(2008)63-73).裂解的Edans肽的荧光(激发340nm/发射490nm)用Flexstation读数器(Molecular Devices)上的荧光强度方案测量。荧光信号在SARS-CoV-23CLpro的有效抑制剂PF-835231的存在下降低。测试反应缓冲液含有20mM Tris-HCl(pH7.3),100nM NaCl,1mM EDTA和25μM肽底物。用15nM SARS-CoV-2 3CL蛋白酶的添加来引发酶反应,并且在23℃进行60分钟。百分比抑制或活性基于不含化合物的对照孔(0%抑制/100%活性)和对照化合物(100%抑制/0%活性)来计算。IC50值用四参数拟合模型用ABASE软件(IDBS)生成。用ABASE软件(IDBS)对Morrison公式拟合Ki值,其酶浓度参数固定为15nM,Km参数固定为14μM而底物浓度参数固定为25μM。
使用连续荧光共振能量转移测定,测量SARS-CoV-2冠状病毒3CL蛋白酶的蛋白水解活性。SARS-CoV-2 3CLpro FRET测定测量蛋白酶催化的TAMRA-SITSAVLQSGFRKMK-(DABCYL)-OH向TAMRA-SITSAVLQ和SGFRKMK(DABCYL)-OH的切割。使用TECAN SAFIRE荧光平板读数器历时10min测量切割的TAMRA(激发558nm/发射581nm)肽的荧光。典型反应溶液含有20mM HEPES(pH 7.0),1mM EDTA,4.0μM FRET底物,4%DMSO和0.005%吐温-20。通过加入25nM SARS 3CLpro(SARS冠状病毒完整基因组序列(NCBI登录号AY278741)的Urbani株的核苷酸序列9985-10902)开始测定。在0.001mM抑制剂水平一式两份地确定抑制百分比。使用以下方程式用非线性回归分析程序Kalidagraph分析数据:
FU=offset+(limit)(1-e-(kobs)t)
其中offset等于未切割肽底物的荧光信号,并且limit等于完全切割的肽底物的荧光。kobs是该反应的一阶速率常数,并在没有任何抑制剂的情况下代表底物的利用率。在含有不可逆抑制剂的酶启动反应中,并在计算的limit值小于理论最大limit的20%时,计算出的kobs代表冠状病毒3C蛋白酶的灭活速率。kobs相对于[I]的图的斜率(kobs/I)是抑制剂对酶的亲和力的量度。对于非常快的不可逆抑制剂,从仅一个或两个[I]的观测值计算kobs/I,而不是作为斜率。
表2.实施例1-84的生物学活性和IUPAC命名。
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1.未测定。
2.实施例41的区域化学并未严格确定;该实施例的其它可能结构是N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-5,6-二(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺和N-[(2S)-1-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基)-4,4-二甲基-1-氧代戊烷-2-基]-4-甲氧基-6,7-二(三氟甲基)-1H-吲哚-2-甲酰胺。
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺(实施例13化合物)在人类中的预测药代动力学参数
基于在三明治培养条件下的体外数据(并入来自人类肝微粒体的CLint和来自人类肝细胞的CL胆汁)的生理药代动力学(PBPK)建模,(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺的预测人血浆CL和Vss分别是5.9mL/min/kg和0.97L/kg,提供1.9小时的有效半衰期t1/2。基于得自(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺的体外研究的抗病毒抑制数据定义0.16μM的靶标Ceff(未结合的血浆浓度),所述研究用VeroE6细胞在P-gp抑制剂存在下进行(EC90值为0.156μM)或者在分化的正常人类支气管上皮(dNHBE)细胞测试中进行(EC90值为0.149μM)。设计每天口服给予三次(TID)剂量380mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺从而在Cmin涵盖0.16μM的有效未结合浓度。
上文所述的所有专利和出版物特此通过引用整体并入。虽然已经以各种优选实施方案和具体实施例的方式描述了本发明,但是本发明应当理解为不受前述详细描述限制,而是由所附权利要求及其等同方案定义。
序列表
<110> 辉瑞大药厂
<120> 含腈的抗病毒化合物
<130> PC072660A
<150> US 63/073,982
<151> 2020-09-03
<150> US 63/143,435
<151> 2021-01-29
<150> US 63/170,158
<151> 2021-04-02
<150> US 63/194,241
<151> 2021-05-28
<160> 2
<170> PatentIn版本3.5
<210> 1
<211> 306
<212> PRT
<213> 智人
<400> 1
Ser Gly Phe Arg Lys Met Ala Phe Pro Ser Gly Lys Val Glu Gly Cys
1 5 10 15
Met Val Gln Val Thr Cys Gly Thr Thr Thr Leu Asn Gly Leu Trp Leu
20 25 30
Asp Asp Val Val Tyr Cys Pro Arg His Val Ile Cys Thr Ser Glu Asp
35 40 45
Met Leu Asn Pro Asn Tyr Glu Asp Leu Leu Ile Arg Lys Ser Asn His
50 55 60
Asn Phe Leu Val Gln Ala Gly Asn Val Gln Leu Arg Val Ile Gly His
65 70 75 80
Ser Met Gln Asn Cys Val Leu Lys Leu Lys Val Asp Thr Ala Asn Pro
85 90 95
Lys Thr Pro Lys Tyr Lys Phe Val Arg Ile Gln Pro Gly Gln Thr Phe
100 105 110
Ser Val Leu Ala Cys Tyr Asn Gly Ser Pro Ser Gly Val Tyr Gln Cys
115 120 125
Ala Met Arg Pro Asn Phe Thr Ile Lys Gly Ser Phe Leu Asn Gly Ser
130 135 140
Cys Gly Ser Val Gly Phe Asn Ile Asp Tyr Asp Cys Val Ser Phe Cys
145 150 155 160
Tyr Met His His Met Glu Leu Pro Thr Gly Val His Ala Gly Thr Asp
165 170 175
Leu Glu Gly Asn Phe Tyr Gly Pro Phe Val Asp Arg Gln Thr Ala Gln
180 185 190
Ala Ala Gly Thr Asp Thr Thr Ile Thr Val Asn Val Leu Ala Trp Leu
195 200 205
Tyr Ala Ala Val Ile Asn Gly Asp Arg Trp Phe Leu Asn Arg Phe Thr
210 215 220
Thr Thr Leu Asn Asp Phe Asn Leu Val Ala Met Lys Tyr Asn Tyr Glu
225 230 235 240
Pro Leu Thr Gln Asp His Val Asp Ile Leu Gly Pro Leu Ser Ala Gln
245 250 255
Thr Gly Ile Ala Val Leu Asp Met Cys Ala Ser Leu Lys Glu Leu Leu
260 265 270
Gln Asn Gly Met Asn Gly Arg Thr Ile Leu Gly Ser Ala Leu Leu Glu
275 280 285
Asp Glu Phe Thr Pro Phe Asp Val Val Arg Gln Cys Ser Gly Val Thr
290 295 300
Phe Gln
305
<210> 2
<211> 306
<212> PRT
<213> 智人
<400> 2
Ser Gly Phe Arg Lys Met Ala Phe Pro Ser Gly Lys Val Glu Gly Cys
1 5 10 15
Met Val Gln Val Thr Cys Gly Thr Thr Thr Leu Asn Gly Leu Trp Leu
20 25 30
Asp Asp Val Val Tyr Cys Pro Arg His Val Ile Cys Thr Ser Glu Asp
35 40 45
Met Leu Asn Pro Asn Tyr Glu Asp Leu Leu Ile Arg Lys Ser Asn His
50 55 60
Asn Phe Leu Val Gln Ala Gly Asn Val Gln Leu Arg Val Ile Gly His
65 70 75 80
Ser Met Gln Asn Cys Val Leu Lys Leu Lys Val Asp Thr Ala Asn Pro
85 90 95
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100 105 110
Ser Val Leu Ala Cys Tyr Asn Gly Ser Pro Ser Gly Val Tyr Gln Cys
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Tyr Met His His Met Glu Leu Pro Thr Gly Val His Ala Gly Thr Asp
165 170 175
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275 280 285
Asp Glu Phe Thr Pro Phe Asp Val Val Arg Gln Cys Ser Gly Val Thr
290 295 300
Phe Gln
305

Claims (29)

1.选自下述的化合物:
其中R4选自任选用1至5个氟取代的(C1-C6烷基)氨基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-C(O)NH-,和任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-S(O)2NH-;
或其甲基叔丁基醚溶剂化物,或者所述化合物或甲基叔丁基醚溶剂化物的药学上可接受的盐。
2.权利要求1的化合物,其中R4选自CF3C(O)NH-,CF3S(O)2NH-,CH3C(O)NH-,CH3CH2C(O)NH-和CF3CH2NH-;或其甲基叔丁基醚溶剂化物,或者所述化合物或甲基叔丁基醚溶剂化物的药学上可接受的盐。
3.权利要求2的化合物,其中R4是CF3C(O)NH-或CF3S(O)2NH-;或其甲基叔丁基醚溶剂化物。
4.下述的化合物:
其中R4选自任选用1至5个氟取代的(C1-C6烷基)氨基,任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-C(O)NH-,和任选用1至5个氟取代的C1-C6烷基-S(O)2NH-;
或其甲基叔丁基醚溶剂化物,或者所述化合物或甲基叔丁基醚溶剂化物的药学上可接受的盐。
5.权利要求4的化合物,其中R4选自CF3S(O)2NH-,CH3C(O)NH-,CH3CH2C(O)NH-和CF3CH2NH-;或其甲基叔丁基醚溶剂化物,或者所述化合物或甲基叔丁基醚溶剂化物的药学上可接受的盐。
6.权利要求5的化合物,其中R4是或CF3S(O)2NH-;或其甲基叔丁基醚溶剂化物。
7.具有下述结构的化合物N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺:
或其甲基叔丁基醚溶剂化物。
8.化合物N-(甲氧羰基)-3-甲基-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺。
9.用于治疗冠状病毒感染的药物组合物,包含权利要求1至8中任一项的化合物或其甲基叔丁基醚溶剂化物以及药学上可接受的载体。
10.根据权利要求1至8中任一项的化合物或其甲基叔丁基醚溶剂化物用于制备药物的用途,所述药物用于在患者中治疗冠状病毒感染。
11.权利要求10的用途,其中冠状病毒感染是COVID-19。
12.权利要求11的用途,还包含利托那韦用于制备所述药物的用途。
13.权利要求12的用途,其中所述药物用于口服用途。
14.权利要求13的用途,其中所述药物包含10mg至1500mg的权利要求1至8中任一项的化合物或其甲基叔丁基醚溶剂化物和10mg至1000mg的利托那韦。
15.用于治疗冠状病毒感染的药物组合物,包含具有下述结构的化合物(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺:
或其甲基叔丁基醚溶剂化物以及药学上可接受的载体;其中所述药物组合物是口服剂型。
16.权利要求15的药物组合物,其中所述口服剂型是片剂、胶囊、糖锭、乳液、悬浮液、糖浆或溶液。
17.权利要求16的药物组合物,其包含10mg至1500mg的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。
18.权利要求17的药物组合物,其中所述药物组合物是片剂。
19.权利要求18的药物组合物,其中所述片剂是包衣的。
20.权利要求18的药物组合物,其中所述片剂包含结晶的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺。
21.权利要求18的药物组合物,其中所述片剂包含结晶的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺,甲基叔丁基醚溶剂化物。
22.选自下述的化合物:
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(2S,4R)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺;
(2R,4S)-4-叔丁基-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-1-{N-[(三氟甲基)磺酰基]-L-缬氨酰基}哌啶-2-甲酰胺;
3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(甲基氨基甲酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}氨基甲酰基)-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-3-基]-3,3-二甲基-1-氧代丁烷-2-基}氨基甲酸甲酯;
N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-5-羟基-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S,6R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6-(羟基甲基)-6-甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S,6S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6-(羟基甲基)-6-甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-(羟基甲基)-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3R)-2,5-二氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[5,5,5-三氟-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[(2S)-2-环己基-2-{[(三氟甲基)磺酰基]氨基}乙酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环丁基-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[3-环丁基-N-(三氟乙酰基)-D-丙氨酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-(吡啶-2-基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-{N-[(4-氟苯氧基)乙酰基]-3-甲基-L-缬氨酰基}-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
3-甲基-N-[(4-甲基苯基)乙酰基]-L-缬氨酰基-(4R)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-4-(三氟甲基)-L-脯氨酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-(1H-吡唑-1-基)-N-(三氟乙酰基)-L-丙氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-3-[(2S)-4,4-二氟-2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)丁酰基]-6,6-二甲基-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;和
(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[2-(2,2,2-三氟乙酰氨基)-3-(三氟甲基)戊酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺;
或其甲基叔丁基醚溶剂化物。
23.用于治疗冠状病毒感染的药物组合物,包含权利要求22的化合物或其甲基叔丁基醚溶剂化物以及药学上可接受的载体。
24.根据权利要求22的化合物或其甲基叔丁基醚溶剂化物用于制备药物的用途,所述药物用于在患者中治疗冠状病毒感染。
25.权利要求24的用途,其中冠状病毒感染是COVID-19。
26.一种用于治疗冠状病毒感染的组合,其包含:
具有下述结构的(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺:
利托那韦。
27.根据权利要求26的组合,其中所述(1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-氰基-2-[(3S)-2-氧代吡咯烷-3-基]乙基}-6,6-二甲基-3-[3-甲基-N-(三氟乙酰基)-L-缬氨酰基]-3-氮杂二环[3.1.0]己烷-2-甲酰胺和利托那韦在分开的剂型中。
28.根据权利要求26或27的组合,用于制备治疗冠状病毒感染的药物。
29.根据权利要求28的组合,其中冠状病毒感染是COVID-19。
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