KR880003007A - 정제된 열안정성 효소 및 이를 사용한 핵산 서열의 증폭, 검출, 및/또는 클로닝 방법 - Google Patents
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Abstract
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Description
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음
제1도는 플라스미드 BSM13+내로 아클로닝된 ~4.5Kb HindⅢ 써머스 익퀘이티쿠스(Thermus aquaticus) DNA 삽입부를 함유하는 플라스미드 pFC 83의 제한부위 지도에 관한 도.
제2도는 플라스미드 BSM13+내로 아클로닝된 ~2.8Kb HindⅢ : Asp 718써머스 익퀘이티쿠스 DNA 삽입부를 함유하는 플라스미드 pFC 85의 제한부위지도에 관한 도.
Claims (32)
- 뉴클레오티드 트리포스페이트를 결합시켜 핵산주형 본쇄에 상보적인 핵산 본쇄를 형성하는데 촉매작용을 하는 정제된 열안정성 효소.
- 제1항에 있어서, DNA 폴리머라제인 효소.
- 제1항 또는 제2항에 있어서, 분자량이 약 86,000 내지 90,000달톤인 효소.
- 제3항에 있어서, 써머스 익퀘이티쿠스(Thermus aquaticus)로부터 분리된 효소.
- 제1항 내지 4항 중의 어느 한 항에 있어서, pH 6.4에서는 pH8.0에서 갖는 활성도의 적어도 50%의 활성도를 갖는 효소.
- 제1항 내지 5항 중의 어느 한 항에 있어서, 천연형태인 효소.
- 제2항의 효소를 암호화 하는 유전자.
- 제7항에 있어서, 써머스 익퀘이티쿠스의 제놈으로부터 클로닝된 유전자.
- 제8항에 있어서, 분자량이 약 86,000 내지 90,000달톤인 효소를 암호화 하는 유전자.
- 제8항에 있어서, 분자량이 약 60,000 내지 65,000달톤인 효소를 암호화 하는 유전자.
- 제9항에 있어서, 써머스 익퀘이티쿠스 또는 박테리오파지 CH35 : Taq #4-2의 약 3.5Kb BgⅠⅡ-Asp718(부분)제한 단편 내에 함유된 유전자.
- 제10항에 있어서, 써머스 익퀘이티쿠스의 제놈 또는 프라스미드 pFC 85의 약 2.8Kb HindⅡ- Asp718제한 단편내에 함유된 유전자.
- pFC85 또는 pFC83 중에서 선택된 플라스미드.
- 박테리오파지 CH35 : Taq #4-2.
- 하나 또는 그 이상의 비-이온성 중합세제를 함유하는 완충액 중에 제1항 내지 6항 중의 어느 한 항에 따르는 효소를 함유하는 안정성 효소 조성물.
- 제15항에 있어서, 세제가 각각 약 0.1% 내지 약 0.5% 용량/조성물 총용량의 농도로 존재하는 조성물.
- 제15항 내지 16항에 있어서, 세제가 폴리옥시에틸화된 솔비탄 모노라우레이트 및 에톡실화된 노닐페놀인 조성물.
- 제15항 내지 17항 중의 어느 한 항에 있어서, 완충액이 글리세롤, pH 8.0인 트리스-C1, 에킬렌디아민테트라이세트산, 디티오쓰리이톨 폴리옥시에틸화된 솔비탄 모노라우레이트, 에톡실화된 노닐페놀, 및 젤라틴을 함유하는 조성물.
- (a) 각각의 핵산 본쇄를 각각의 프라이머가 그이 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 촉진시키는 온도에서, 증폭될 상이한 특정 서열 각각에 대한 4개의 상이한 뉴클레도티드 트리포스페이트 및 1개의 올리고 뉴클레오티드 프라이머와 접촉시키고(여기에서, 각각의 프라이머는 각각의 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것으로 선정하여, 하나의 프라이머로 부터 합성된 연장 산물이 그의 상보물로부터 분리되는 경우에 다른 프라이머의 합성을 위한 주형으로 작용할 수 있도록 한다) ; (b) 각각의 핵산 본쇄를 단계 (a)와 동시에 또는 단계(a) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트를 결합시켜 각 핵산의 본쇄 각각에 대해 상보적인 프라이머 연장 산물을 생성하도록 하는 열안정성 효소와 접촉시키며 ; (c) 단계(b)에서 얻은 혼합물을, 효소의 활성을 증진시키고 증폭될 상이한 서열 각각에 대해 핵산 본쇄 주형 각각에 상보적인 프라이머 각각의 연장 산물을 합성하기에 효과적이지만 각 연장 산물이 그의 상보적인 본쇄 주형으로부터 분리될 만큼 높지 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로 부터 분리시켜 일-본쇄 분자를 생성시키기에 효과적이나, 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열시키며 ;(e) 단계(d)의 혼합물을, 각 프라이머가 단계(d)에서 생성된 일-본쇄 분자 각각과 하이브리화 되도록 하기에 효과적인 온도로 냉각시키고 ; (f) 단계(e)의 혼합물을, 효소의 활성을 증진시키고 증폭될 상이한 서열 각각에 대해 단계(d)에서 생성된 핵산 본쇄 주형 각각에 상보적인 각 프라이머의 연장산물을 합성하기에 효과적이나, 각 연장 산물이 그의 상보적인 본쇄 주형으로부터 분리될 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간 동안 유지시키며 ; 이때 단계(e) 및 (f)는 동시에 수행하거나 연속적으로 수행함을 특징으로 하여, 핵산 또는 핵산의 혼합물(여기에서, 핵산은 2-본쇄일 경우에 길이가 같거나 다른 별도의 상보적인 본쇄 2개로 이루어진다)에 함유된 특정 핵산 서열 적어도 하나를 증폭시키는 방법.
- (a) 각각의 핵산을 증폭될 각각의 상이한 서열에 대한 하나의 올리고 뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트의 존재하에서 각각의 핵산을 변성시키기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 가열하고(여기에서, 각각의 프라이머는 각각의 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것으로 선택하여 하나의 프라이머로부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우에 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 변성된 핵산을 각각의 프라이머가 이의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도로 냉각시키며 ; (c) 변성된 핵산을 단계(a) 또는 (b)와 동시에 또는 단계(a) 또는 (b) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트를 결합시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성시키는 열안정성 효소와 접촉시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을 열안정성 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 각각의 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성 시키기에 효과적이나 각각의 연장 산물을 이의 상보적인 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (e) 단계(d)의 혼합물을, 생성 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성하기에 효과적이나, 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열하며 ; (f) 단계(e)의 혼합물을 프라이머가 단계(e)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 시간동안, 효과적인 온도로 냉각시키고 ;(g) 단계(f)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 단계(f)에서 생성된 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각 연장 산물을 이의 상보본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서, 효과적인 시간동안 유지시키고 ; 여기에서 단계(f) 및 (g)는 동시에 수행하거나 연속적으로 수행함을 특징으로 하여, 핵산 또는 핵산의 혼합물(여기에서, 핵산은 길이가 동일하거나 상이한 두개의 상보적 본쇄로 이루어진다) 내에 함유된 적어도 하나의 특정 핵산 서열을 증폭시키는 방법.
- (a) 핵산 또는 핵산의 혼합물(여기에서, 핵산은 이 본쇄일 경우에 각각 길이가 같거나 다른 별도의 상보적 본쇄 2개로 이루어진다)를 함유하는 샘플을 각 프라이머가 그의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도에서, 검출할 각각의 상이한 특정 서열에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트와 접촉시키고(여기에서, 각각의 프라이머는 각 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것을 선정하여, 하나의 프라이머로부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우 다른 프라이머의 연장산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 상기 샘플을, 단계(a)와 동시에 또는 단계(a) 이후에, 뉴클레오티드 프리포스페이트의 결합을 촉진시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성하도록 하는 열안정성 효소와 접촉시키며 ; (c) 단계(b)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 검출할 각각의 상이한 서열에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장산물을 이의 상보 본쇄 주형으로 분리시킬 만큼 높지는 않은온도에서 효과적인 시간 동안 유지시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일보쇄 분자를 생성시키기에 효과적이나, 열안정성 효소를 비가역적으로 변경시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간 동안 가열시키며 ; (e) 단계(d)의 혼합물을 각 프라이머가 단계(d)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간 동안 냉각시키고 ;(f) 단계(e)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 검출될 각각의 상이한 서열에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간 동안 유지시켜, 존재하는 경우 특정 핵산 서열(들)을 정량 증폭시키며, 이 때 단계(e) 및 (f)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하고 ; (g) 단계(f)의 생성물에 언급한 서열 또는 이의 변형서열과 하이브리드화할 수 있는 검출될 각 서열에 대한 표지된 올리고뉴클레오티드 탐침을 가하며 ; (h) 언급한 하이브리드화의 발생 여부를 결정함을 특징으로 하여, 언급한 서열(들)을 함유하는 것으로 생각되는 언급한 샘플 중에서 적어도 하나의 특정 핵산 서열의 존재여부를 탐지하거나, 언급한 샘플 중에서 두개의 상이한 서열을 구별하는 방법.
- (a) 핵산 또는 핵산의 혼합물(여기에서, 핵산은 이-본쇄이다.)을 함유하는 샘플을 검출할 각각의 상이한 서열에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 사이한 뉴클레오티드 트리포스페이트의 존재하에 샘플 중의 각 핵산을 변성시키기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간 동안 가열하고(여기에서, 각각의 프라이머는 각각의 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것으로 선택하여, 하나의 프라이머로부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우에 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 변성된 핵산을 각각의 프라이머가 이의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하느 온도로 냉각 시키며 ; (c) 변성된 핵산을 단계(a) 또는 (b)와 동시에 또는 단계(a) 또는 (b) 이후에 뉴클레오티드 트리포스페이트를 결합시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성시키는 열안정성 효소와 접촉시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을 열안정성 효소의 활성을 촉진시키고 검출할 각각의 상이한 서열에 대해 각각의 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성 시키기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보적인 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (e) 단계(d)의 혼합물을 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성하기에 효과적이나, 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열하며 ; (f) 단계(e)의 혼합물을 각 프라이머가 단계(e)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 시간동안, 효과적인 온도로 냉각시키고 ;(g) 단계(f)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 검출할 각각의 상이한 서열에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서, 효과적인 시간동안 유사시켜, 존재한다면 특정 핵산 서열(들)을 정량 증폭시키고, 여기에서 단계(f) 및 (g)는 동시에 수행하거나 연속적으로 수행하며 ; (h) 단계(g)의 생성물에 언급한 서열 또는 이의 변형서열과 하이브리드화할수 있는 검출할 각 서열에 대한 표지된 올리고뉴클레오티드탐침을 가하고;(i) 언급한 하이브리드화의 발생여부를 결정함을 특징으로 하여, 언급합 서열(들)을 함유하는 것으로 생각되는 언급한 샘플 중에서 적어도 하나의 특정핵산 서열의 존재여부를 탐지하거나, 언급한 샘플 중에서 두개의 상이한 서열을 구별하는 방법.
- (a) 핵산 또는 핵산의 혼합물(여기에서 핵산은 이 본쇄일 경우에 길이가 같거나 다른 별도의 상보적 본쇄 2개로 이루어진다)을 함유하는 샘플을 각 프라이머가 그의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도에서 핵산서열의 변이체를 함유하는 것으로 여겨지는 각 핵산의 각 본쇄에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트와 접촉시키고(여기에서, 각각의 프라이머는 각 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것을 선정하여, 하나의 프라이머로부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 상기 샘플을, 단계(a)와 동시에 또는 단계(a) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트의 결합을 촉진시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성하도록 하는 열안정성 효소와 접촉시키며 ; (c) 단계(b)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 여겨지는 각각의 상이한 핵산에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일보쇄 분자를 생성시키기에 효과적이나, 열안정성 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열시키며 ; (e) 단계(d)의 혼합물을 각 프라이머가 단계(d)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 냉각시키고 ;(f) 단계(e)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 여겨지는 각각의 상이한 핵산에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성 하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키며, 이 때, 단계(d), (e) 및 (f)는 존재하는 경우 서열 변이체(들)을 함유하는 핵산이 검출가능하게 증폭되도록 충분한 회수로 반복하며, 단계(e) 및 (f)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하고 ; (g) 단계 (f)의 생성물을 세포막에 부착시키며, (h) 세포막을 하이브리드화 조건하에서 탐침의 서열이 증폭된 서열의 영역에 상보적인 경우에만 증폭된 핵산 서열과 하이브리드화할 수 있는 표지된 서열-특정 올리고뉴클레오티드 탐침으로 처리하고 ; (i) 탐침이 핵산 샘플 중의 증폭된 서열에 하이브리드화 되었는지의 여부를 탐지함을 특징으로 하여, 샘플 중에 함유된 하나 또는 그 이상의 핵산의 서열에서 적어도 하나의 뉴클레오티드가 변이되었는지의 여부를 탐지하는 방법.
- (a) 핵산(여기에서, 핵산은 각각 길이가 같거나 상이한 상보적 본쇄 2개로 이루어진다)을 함유하는 샘플을 핵산서열의 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각 핵산의 각 본쇄에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트의 존재하에서 각각의 핵산을 변성시키기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 가열하고(여기에서, 각각의 프라이머는 각각의 특정 핵산의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것으로 선택하여 하나의 프라이머부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우에 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 변성된 핵산을 각각의 프라이머가 이의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도로 냉각시키며 ; (c) 변성된 핵산을 단계(a) 또는 (b)와 동시에 또는 단계(a) 또는 (b) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트를 결합시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성시키는 열안정성 효소와 접촉시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을 열안정성 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각각의 상이한 핵산에 대해 각각의 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성시키기에 효과적이나, 각각의연장 산물을 이의 상보적인 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (e) 단계(d)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성하기에 효과적이나, 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열하며 ;(f) 단계(e)의 혼합물을 각 프라이머가 단계(e)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 시간동안, 효과적인 온도로 냉각시키고 ; (g) 단계(f)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각각의 상이한 핵산에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키며, 이 때 단계(e), (f) 및 (g)는 존재하는 경우 서열 변이체(들)을 함유하는 핵산이 검출가능하게 증폭되도록 충분한 회수로 반복하고, 단계(f) 및 (g)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하고 ; (h) 단계(g)의 생성물을 세포막에 부착시킨 다음 ; (i) 세포막을 하이브리드화 조건하에서 탐침의 서열이 증폭된 서열의 영역에 상보적인 경우에만 증촉된 핵산 서열과 하이브리드화할 수 있는 표지된 서열-특정 올리고뉴클레오티드 탐침으로 처리하고 ; (j) 탐침이 핵산 샘플 중의 증폭된 서열에 하이브리드화 되었는지의 여부를 탐지함을 특징으로 하여, 샘플 중에 함유된 하나 또는 그 이상의 핵산 서열에서 적어도 하나의 뉴클레오티드가 변이되었는지의 여부를 탐지하는 방법.
- (a) 핵산 또는 핵산의 혼합물(여기에서 핵산은 이 본쇄일 경우에 길이가 같거나 다른 별도의 상보적 본쇄 2개로 이루어진다)을 함유하는 샘플을 각 프라이머가 그의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도에서 핵산 서열의 변이체를 함유하는 것으로 기대되는 각 핵산의 각 본쇄에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트와 접촉시키고(여기에서, 각각의 프라이머는 각 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것을 선정하여, 하나의 프라이머로부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 상기 샘플을, 단계(a)와 동시에 또는 단계(a) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트의 결합을 촉진시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성하도록 하는 열안정성 효소와 접촉시키며 ; (c) 단계(b)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각각의 상이한 핵산에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일보쇄 분자를 생성시키기에 효과적이나, 열안정성 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열시키며 ; (e) 단계(d)의 혼합물을 각 프라이머가 단계(d)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 냉각시키고 ;(f) 단계(e)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각각의 상이한 핵산에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성 하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키며, 이 때, 단계(d), (e) 및 (f)는 존재하는 경우 서열 변이체(들)을 함유하는 핵산이 검출가능하게 증폭되도록 충분한 회수로 반복하고 적어도 하나의 프라이머 및/또는 4개의 뉴클레오티드 트리포스페이트 중 적어도 하나는 검출가능한 부위로 표지하며, 단계(e) 및 (f)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하고 ; (g) 세포막에 올리고뉴클레오티드의 서열이 증폭된 서열의 영역에 상보적인 경우에만 증폭된 핵산 서열과 하이브리드화할 수 있는 서열-특정 올리고뉴클레오티드를 부착시키고 ; (h) 세포막을 하이브리드화 조건하에서 단계(f)의 생성물로 처리한 다음 (i) 핵산 샘플 중의 증폭된 서열이 세포막에 부착된 올리고뉴클레오티드에 하이브리드화 되었는지의 여부를 탐지함을 특징으로 하여, 샘플 중에 함유된 하나 또는 그 이상의 핵산의 서열에서 적어도 하나의 뉴클레도티드가 변이되었는지의 여부를 탐지하는 방법
- (a) 핵산(여기에서, 핵산은 각각 길이가 같거나 상이한 상보적 본쇄 2개로 이루어진다)을 함유하는 샘플을 핵산서열의 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각 핵산의 각 본쇄에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트의 존재하에서 각각의 핵산을 변성시키기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 가열하고(여기에서, 각각의 프라이머는 각각의 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것으로 선택하여 하나의 프라이머부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우에 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 변성된 핵산을 각각의 프라이머가 이의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도로 냉각시키며 ; (c) 변성된 핵산을 단계(a) 또는 (b)와 동시에 또는 단계(a) 또는 (b) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트를 결합시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성시키는 열안정성 효소와 접촉시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을 열안정성 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각각의 상이한 핵산에 대해 각각의 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성시키기기에 효과적이나,각각의 연장 산물을 이의 상보적인 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (e) 단계(d)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성하기에 효과적이나, 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열하며 ; (f) 단계(e)의 반응혼합물을 각 프라이머가 단계(e)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 시간동안, 효관적인 온도로 냉각시키고 ;(g) 단계(f)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각각의 상이한 핵산에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키며, 이 때 단계(e), (f) 및 (g)는 존재하는 경우 서열 변이체(들)을 함유하는 핵산이 검출가능하게 증폭되도록 충분한 회수로 반복하고, 적어도 하나의 프라이머 및/또는 4개의 뉴클레오티드 트리포스테이트 중 적어도 하나는 탐지 가능한 잔기로 표지하며, 단계(f) 및 (g)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하고 ; (h)세포막에 올리고뉴클레오티드의 서열이 증폭된 서열의 영역에 상보적인 경우에만 증폭된 핵산 서열과 하이브리드화할 수 있는 서열-특정 올리고뉴클레오티드를 부착시키고 ; (i) 세포막을 하이브리드화 조건하에서 단계(g)의 생성물로 처리한 다음, (j) 핵산 샘플 중의 증폭된 서열이 세포막에 부착된 올리고뉴클레오티드에 하이브리드화 되었는지의 여부를 탐지함을 특징으로 하여, 샘플 중에 함유된 하나 또는 그 이상의 핵산 서열에서 적어도 하나의 뉴클레오티드가 변이되었는지의 여부를 탐지하는 방법.
- (a) 핵산(여기에서 핵산은 이 본쇄일 경우에 길이가 같거나 다른 별도의 상보적 본쇄 2개로 이루어진다)을 함유하는 샘플을 각 프라이머가 그의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도에서 핵산 서열의 변이체(들)를 함유하는 것으로 기대되는 각 핵산의 각 본쇄에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트와 접촉시키고(여기에서, 각각의 프라이머는 각 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것을 선정하여, 하나의 프라이머로부터 합성된 연장산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 상기 샘플을, 단계(a)와 동시에 또는 단계(a) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트의 결합을 촉진시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성하도록 하는 열안정성 효소와 접촉시키며 ; (c) 단계(b)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각각의 상이한 핵산에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성시키기에 효과적이나, 열안정성 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열시키며 ; (e) 단계(d)의 혼합물을 각 프라이머가 단계(d)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 냉각시키고 ;(f) 단계(e)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 언급한 변이체(들)을 함유하는 것으로 기대되는 각각의 상이한 핵산에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성 하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키며, 이 때, 단계(d), (e) 및 (f)는 존재하는 경우 서열 변이체(들)을 함유하는 핵산이 검출가능하게 증폭되도록 충분한 회수로 반복하고, 단계(e) 및 (f)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하며 ; (g) 세포막에 올리고뉴클레오티드의 서열이 증폭된 서열의 영역에 상보적인 경우에만 증폭된 핵산 서열과 하이브리드화할 수 있는 표지된 서열-특정 올리고뉴클레오티드를 부착시키고 ; (h) 세포막을 하이브리드화 조건하에서 단계(f)의 생성물로 처리한 다음 ; (i) 탐지될 탐침 및 변이체(들) 둘다가 제한효소에 의해 인지된 제한부위를 함유한다면 형성된 어떠한 하이브리드도 절단시킬 수 있는 제한효소로 단계(h)의 생성물을 처리하고 ; (j) 필요한 길이의 표지된 제한 단편이 하이브리드화가 일어났는지를 나타내는 제한 분해물 중에 존재하는지의 여부를 탐지함을 특징으로 하여 샘플 중에 함유된 하나 또는 그 이상의 핵산의 서열에서 적어도 하나의 뉴클레오티드가 변이되었는지의 여부를 탐지하는 방법
- (a) 각 핵산(여기에서, 핵산은 이 본쇄일 경우에 길이가 같거나 다른 별도의 상보적 본쇄 2개로 이루어지며 클로닝전에 정량 증폭된다)을 각 프라이머가 그의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도에서 증폭될 각각의 상이한 특정 서열에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이어 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트와 접촉시키고(여기에서, 각각의 프라이머는 각 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것을 선정하여, 하나의 프라이머로부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 각 핵산 본쇄를, 단계(a)와 동시에 또는 단계(a) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트의 결합을 촉진시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성하도록 하는 열안정성 효소와 접촉시키며 ; (c) 단계(b)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성시키기에 효과적이나, 열안정성 효과를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열시키며 ; (e) 단계(d)의 혼합물을 각 프라이머가 단계(d)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 냉각시키고 ;(f) 단계(e)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 단계(d)에서 생성된 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성 하기에 효과적이나, 각각의 연장 산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키며, 이 때, 단계(d), (e) 및 (f)는 서열(들)을 함유하는 핵산(들)이 검출 가능하게 증폭되도록 충분한 회수로 반복하고, 단계(e) 및 (f)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하고 ; (g) 단계(f)의 생성물에 언급한 각각의 제한부위에 대한 제한 효소를 가하여 제한분해물 중의 절단된 생성물을 수득하고 ; (h) 특정 서열을 함유하는 단계(g)의 절단된 생성물(들)을 하나 또는 그 이상의 클로닝벡터 내로 클로닝 되도록 연결함을 특징으로 하여 핵산 또는 핵산의 혼합물 내에 함유된 하나 또는 그 이상의 특정 핵산 서열을 클로닝벡터 내로 클로닝 시키는 방법
- (a) 각각의 핵산을 증폭될 각각의 상이한 서열에 대한 하나의 올리고 뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트의 존재하에서 각각의 핵산을 변성시키기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 가열하고(여기에서, 각각의 프라이머는 각각의 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것으로 선택하여 하나의 프라이머로부터 합성된 연장산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우에 다른 프라이머의 연장산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 하며, 증폭될 각 서열 또는 각 프라이머는 제한부위를 함유한다) ; (b) 변성된 핵산을 각각의 프라이머가 이의 상보적인 핵산본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도로 냉각시키며 ; (c) 변성된 핵산을 단계(a) 또는 (b)와 동시에 또는 단계(a) 또는 (b) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트를 결합시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성시키는 열안정성 효소와 접촉시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을 열안정성 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 각각의 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성시키기에 효과적이나 각각의 연장 산물을 이의 상보적인 본쇄주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (e) 단계(d)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성하기에 효과적이나, 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열하며 ; (f) 단계(e)의 혼합물을 프라이머가 단계(e)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 시간동안, 효과적인 온도로 냉각시키고 ;(g) 단계(f)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 단계(e)에서 생성된 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각 연장 산물을 이의 상보본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서, 효과적인 시간동안 유지시키고 이때, 단계(e), (f), (g)는 서열(들)을 함유하는 핵산(들)이 검출 가능하게 증폭되도록 충분한 회수로 반복하며, 단계(f) 및 (g)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하고 ; (h) 단계(g)의 생성물에 언급한 제한 부위에 대한 제한효소를 가하여 제한 분해물중의 절단된 생성물에 수득한 다음 ; (i) 특정 서열(들)을 함유하는 단계(h)의 절단된 생성물(들)을 선택 가능한 표식자를 함유하는 하나 또는 그 이상의 클로닝 벡터내로 틀로닝 되도록 연결함을 특징으로 하여, 핵산 또는 핵산의 혼합물(여기에서, 핵산(들)은 길이가 동일하거나 상이한 두개의 상보 본쇄로 이루어진다) 내에 함유된 적어도 하나의 특정 핵산 서열을 클로닝 벡터내로 클로닝시키는 방법.
- (a) 각각의 핵산(여기에서, 핵산은 이 본쇄일 경우에 길이가 같거나 다른 별도의 상보적 본쇄 2개로 이루어지며 클로닝전에 정량 증폭된다)을 각 프라이머가 그의 상보적인 핵산 본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도에서 증폭될 각각의 상이한 특정 서열에 대한 하나의 올리고뉴클레오티드 프라이어 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트와 접촉시키고(여기에서, 각각의 프라이머는 각 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것을 선정하여, 하나의 프라이머로부터 합성된 연장 산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우 다른 프라이머의 연장 산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 각 핵산 본쇄를, 단계(a)와 동시에 또는 단계(a) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트의 결합을 촉진시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성하도록 하는 열안정성 효소와 접촉시키며 ; (c) 단계(b)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각각의 연장산물을 이의 상보 본쇄 주형으로 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성시키기에 효과적이나, 열안정성 효과를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열시키며 ; (e) 단계(d)의 혼합물을 각 프라이머가 단계(d)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 냉각시키고 ;(f) 단계(e)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 단계(d)에서 생성된 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성 하기에 효과적이나, 각각의 연장산물을 이의 상보 본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키며, 이 때, 단계(d), (e) 및 (f)는 하나 또는 그 이상의 클로닝 벡터내로 평활말단 연결시키기 위한 서열(들)을 함유하는 핵산(들)이 효과적으로 증폭되도록 충분한 회수로 반복하고, 단계(e)및 (f)는 연속적으로 수행하거나 동시에 수행하며; (g) 단계 (f)로부터 수득된 클로닝 될 증폭된 특정 서열(들)을 리가제의 존재하에 하나 또는 그 이상의 언급된 벡터내로(여기에서, 언급한 증폭된 서열(들) 및 벡터(들)는 연결되기에 충분한 양으로 존재한다)연결시킴을 특징으로 하여, 핵산 또는 핵산의 혼합물 내에 함유된 하나 또는 그 이상의 특정 핵산 서열을 클로닝 벡터내로 클로닝 시키는 방법
- (a) 각각의 핵산을 증폭될 각각의 상이한 서열에 대한 하나의 올리고 뉴클레오티드 프라이머 및 4개의 상이한 뉴클레오티드 트리포스페이트의 존재하에서 각각의 핵산을 변성시키기에 효과적인 온도에서 효과적인 시간동안 가열하고(여기에서, 각각의 프라이머는 각각의 특정 서열의 상이한 본쇄에 실질적으로 상보적인 것으로 선택하여 하나의 프라이머로부터 합성된 연장산물이 이의 상보물로부터 분리될 경우에 다른 프라이머의 연장산물을 합성하기 위한 주형으로서 제공될 수 있도록 한다) ; (b) 변성된 핵산을 각각의 프라이머가 이의 상보적인 핵산본쇄와 하이브리드화 되도록 하는 온도로 냉각시키며 ; (c) 변성된 핵산을 단계(a) 또는 (b)와 동시에 또는 단계(a) 또는 (b) 이후에, 뉴클레오티드 트리포스페이트를 결합시켜 각 핵산의 각 본쇄에 상보적인 프라이머 연장 산물을 형성시키는 열안정성 효소와 접촉시키고 ; (d) 단계(c)의 혼합물을 열안정성 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 각각의 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성시키기에 효과적이나 각각의 연장 산물을 이의 상보적인 본쇄주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 유지시키고 ; (e) 단계(d)의 혼합물을, 프라이머 연장 산물을 이들이 합성되는 주형으로부터 분리시켜 일본쇄 분자를 생성하기에 효과적이나, 효소를 비가역적으로 변성시킬 만큼 높지는 않은 온도에서 효과적인 시간동안 가열하며 ; (f) 단계(e)의 혼합물을 프라이머가 단계(e)에서 생성된 그의 상보적인 일본쇄 분자와 하이브리드화 되도록 하기에 효과적인 시간동안, 효과적인 온도로 냉각시키고 ;(g) 단계(f)의 혼합물을 효소의 활성을 촉진시키고 증폭될 각각의 상이한 서열에 대해 단계(e)에서 생성된 각 핵산 본쇄 주형에 상보적인 각 프라이머의 연장 산물을 합성하기에 효과적이나, 각 연장 산물을 이의 상보본쇄 주형으로부터 분리시킬 만큼 높지는 않은 온도에서, 효과적인 시간동안 유지시키고 이때, 단계(e), (f), 및 (g)는 하나 또는 그 이상의 클로닝 벡터내로 평활 말단 연결시키기 위한 각 서열을 함유하는 핵산(들)이 검출 가능하게 증폭되도록 충분한 회수로 반복하며 단계(f) 및 (g)는 동시적으로 수행하거나 연속적으로 수행하고 ; (h) 단계(g)로부터 수득된 클로닝될 증폭된 특정 서열(들)을 리가제의 존재하에, 하나 또는 그 이상의 언급된 벡터내로(여기에서, 언급한 증폭된 서열(들) 및 벡터(들)는 연결되기에 충분한 양으로 존재한다)연결 시킴을 특징으로 하여, 핵산 또는 핵산의 혼합물 내에 함유된 적어도 하나의 특정 핵산 서열을 클로닝 벡터내로 클로닝 시키는 방법
- 핵산 또는 핵산의 혼합물로부터 제19항 또는 20항에 따르는 증폭방법에 의해 생성된 언급한 서열의 다수의 복제물을 함유하는 증폭된 핵산 서열.※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
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