JPH06233670A - 温度制御を用いたポリメラーゼ連鎖反応の自動実施装置 - Google Patents

温度制御を用いたポリメラーゼ連鎖反応の自動実施装置

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JPH06233670A
JPH06233670A JP3340025A JP34002591A JPH06233670A JP H06233670 A JPH06233670 A JP H06233670A JP 3340025 A JP3340025 A JP 3340025A JP 34002591 A JP34002591 A JP 34002591A JP H06233670 A JPH06233670 A JP H06233670A
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カーメロ モッサ アルバート
Lisa May Goven
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ウイリアムズ フェントン
Timothy M Woudenberg
エム.ウッデンバーグ ティモシー
Margries Marcel
マーグリーズ マーセル
P Ragusa Robert
ピー.ラグサ ロバート
Richard Rees
リース リチャード
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Abstract

(57)【要約】 【目的】 試料ブロックを用いてマイクロタイタートレ
ー内で極めて正確なポリメラーゼ連鎖反応を実施する機
器を提供する。 【構成】 試料ブロックは局所的に熱バランスと対称性
とを保つようになっている。コンピュータにより制御さ
れる、3つの領域を有するフィルムヒータと、同様にコ
ンピュータにより制御されブロック中を流れる冷却剤の
流れを調節するランプ冷却ソレノイド弁とが試料ブロッ
ク温度の制御に用いられる。微少な温度制御には一定の
バイアス冷却が用いられる。また、試料温度は実測では
なく計算により求められる。加熱されたカバーはプラス
チックキャップを変形させ、試料管を嵌合し、熱的に隔
離するのに必要な最小限の力を与える。個々の試料管に
自由度を与えるための使い捨てのプラスチックマイクロ
タイタートレーが使用される。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、ポリメラーゼ連鎖反応
(以後PCRという)を実施するためのコンピュータ制
御の計器の分野に関する。より詳しくは、本発明は、多
数の試料についてポリメラーゼ連鎖反応を同時に実施し
て、各試料についての結果を非常に高い精度で得ること
ができる自動化計器に関する。この高い精度は、なかで
も、いわゆる「定量的PCR」を実施する可能性を提供
する。
【0002】
【従来の技術】PCRプロセスを使用してDNA(デオ
キシリボース核酸)を増幅するために、特別に構成した
液状反応混合物を、いくつかの異なる温度のインキュベ
ーション期間を含むPCRプロトコルを通してサイクル
することが必要である。反応混合物は種々の成分、例え
ば、増幅すべきDNAおよび少なくとも2つのプライマ
ーから構成され、前記プライマーは増幅すべきDNAの
伸長産生物をつくることができるように、試料のDNA
に対する十分に相補的であるように予め決定される。反
応混合物は、種々の酵素および/または他の試料、なら
びにいくつかのデオキシリボヌクレオシドトリホスフェ
ート、例えば、dATP,dCTP,dGTPおよびd
TTPを包含する。一般に、プライマーはオリゴヌクレ
オチドであり、核酸の鎖に対する相補的であるプライマ
ーの伸長産生物の合成を誘発する条件下に、すなわち、
ヌクレオチドおよび誘発因子、例えば、熱安定性DNA
ポリメラーゼの存在下に適当な温度およびpHにおいて、
配置したとき、合成の開始点として作用することができ
る。
【0003】ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、主と
して非常に簡単でありそして要求される設備のコストが
比較的低いので、遺伝的分析に現象的に有望な技術であ
ることが証明されている。PCRに対して重要なこと
は、サーモサイクリングの概念である。すなわち、DN
Aを溶融し、短いプライマーを生ずる一本鎖に対してア
ニーリングし、そしてそれらのプライマーを伸長して二
本鎖のDNAの新しいコピーをつくる、交互する工程で
ある。サーモサイクリングにおいて、PCR混合物をD
NAを溶融するための高い温度(>90℃)から、プラ
イマーのアニーリングおよび伸長のためのより低い温度
(40℃〜70℃)に反復してサイクリングする。PC
Rにおいて要求されるサーモサイクリングを実施するた
めの最初の商業的システムであるパーキン−エルマー・
セツス・DNA・サーマル・サイクラー(Perkin-Elmer
Cetus DNA Thermal Cycler )は、1987年に導入さ
れた。
【0004】PCRのための応用は、現在、基本的な研
究から、多数の同様な増幅工程を日常的に実施する応用
へと動きつつある。これらの応用範囲は、診断の研究、
生物製剤学的開発、遺伝子の分析、および環境的試験を
包含する。これらの応用範囲におけるユーザは、高い処
理量、迅速な回転時間、およひ再現性ある結果を提供す
る高性能のPCRシステムから利益を受けるであろう。
また、これらの応用範囲におけるユーザは、試料対試
料、実験対実験、実験室対実験室、および計器対計器か
らの再現性を保証されるにちがいない。
【0005】例えば、ヒトのゲノムのプロジェクトにお
ける物理学的マッピングのプロセスは、配列標的部位
(STS)を利用することによって、大きく簡素化する
ことができる。STSは、PCRにより容易に増幅さ
れ、そして染色体上の位置を同定する短くかつ独特な配
列である。このような部位を検査してゲノムの地図を作
ることは、世界中を通じて再現性をもって実施すること
ができるプロトコルを使用して、短い時間で、多数の試
料を増幅することを必要とする。
【0006】PCRの試料の数が増加するにつれて、増
幅工程を試料の調製および増幅後の分析と統合すること
がいっそう重要となる。試料の容器は急速なサーマルサ
イクリングを可能とするばかりでなく、かつまた溶媒抽
出および遠心等の操作のための自動化された取り扱いを
可能としなくてはならない。容器は絶えず小さい体積で
働いて、試薬のコストを減少する。
【0007】一般に、PCRのサーマルサイクリングは
異なる温度における少なくとも2回のインキュベーショ
ンを含む。これらのインキュベーションの一方は、プラ
イマーのハイブリダイゼーションおよび触媒されたプラ
イマーの伸長反応用のものである。他方のインキュベー
ションは変性、すなわち、二本鎖の伸長産生物を次のハ
イブリダイゼーションおよび伸長インキュベーション間
隔において使用するための、一本鎖の鋳型に分離するた
めのものである。PCRの詳細、PCRに必要な温度サ
イクルおよび反応条件、ならびにこの反応の実施に必要
な種々の試薬および酵素は、米国特許第4,683,2
02号、米国特許第4,683,195号、EPO公報
258,017号および4,889,818号(Tag
ポリメラーゼ酵素の特許)およびすべての他のPCRの
特許(出願人、セツス・コーポレーション)に記載され
ている。
【0008】PCRの目的は、最初に供給した小さい体
積の「種子」DNAと同一の、DNAを大きい体積で調
製することである。この反応は、DNAの鎖をコピー
し、次いで引き続くサイクルにおいてコピーを使用して
他のコピーを発生することを包含する。理想的な条件下
に、各サイクルは存在するDNAの量を2倍にし、これ
により幾何学的進行において、反応混合物の中に存在す
る体積の「標的」または「種子」のDNAの鎖を生ず
る。
【0009】典型的なPCRの温度サイクルにおいて、
反応混合物を各インキュベーション温度に規定した時間
の間正確に保持すること、および同一のサイクルまたは
同様なサイクルを多数回反復することが必要である。典
型的なPCRプログラムを94℃の試料温度で開始して
30秒間保持して、反応混合物を変性する。次いで、反
応混合物の温度を37℃に下げ、そして1分間保持して
プライマーをハイブリダイゼーションさせる。次に、反
応混合物の温度を50℃〜72℃の範囲の温度に上げ、
ここでそれを2分間保持して伸長産生物の合成を促進す
る。これは1サイクルを完結する。次いで、前のサイク
ルにおいて形成する伸長産生物の鎖の分離のために、反
応混合物の温度を94℃に上げることによって、次のP
CRサイクルを開始する(変性)。典型的には、サイク
ルは25〜30回反復する。
【0010】一般に、試料温度を次の温度にサイクルに
おいて、いくつかの理由で出来るだけ迅速に変化するこ
とが望ましい。第1に、化学的反応はその段階の各々に
ついて最適な温度を有する。こうして、最適でない温度
における消費時間が少ないことは、よりよい化学的結果
が達成されることを意味する。他の理由は、各インキュ
ベーション温度に到達後、各インキュベーション温度に
反応混合物を保持する時間を最小することが必要である
ということである。これらの最小のインキュベーション
時間は、サイクルの完結に要する「床」または最小時間
を確立する。試料のインキュベーション時間の間の遷移
時間は、この最小サイクル時間に付加される時間であ
る。サイクルの数はかなり大きいであるので、この追加
の時間は増幅の完結に要する合計の時間を不必要に長く
する。
【0011】
【発明が解決しようとする課題】いくつかの従来の自動
化されたPCRの計器において、反応混合物はキャップ
で閉じた、使い捨てプラスチック管の中に貯蔵された。
このような管のための典型的な試料の体積はほぼ100
μlであった。典型的には、このような計器は試料のD
NAを充填した多数のこのような管を使用し、そして反
応混合物は金属のブロック中の試料のウェル(wel
l)と呼ぶ孔に挿入された。PCRプロセスを実施する
ために、PCRプロトコルのファイルにおいてユーザに
より特定された規定した温度および時間に従い、金属ブ
ロックの温度を制御した。次いで、コンピュータおよび
関連するエレクトロニクスは、時間、温度およびサイク
ルの数など規定するPCRプロトコルのファイル中のユ
ーザの供給したデータに従い、金属ブロックの温度を制
御した。しかしながら、これらの先行技術の計器におい
て、すべての試料が正確に同一の温度サイクルを経験し
たわけではなかった。これらの先行技術の計器におい
て、試料温度における誤差は金属の試料ブロック内の場
所対場所の温度の不均一性、すなわち、ブロックの金属
内に存在する温度勾配により発生し、これによりある試
料はサイクルの特定の時間において他の試料と異なる温
度を有した。さらに、熱を試料ブロックから試料に移す
ときの遅延が存在したが、遅延はすべての試料について
同一ではなかった。PCRプロセスを首尾よくかつ効率
よく実施するために、かついわゆる「定量的」PCRを
可能とするために、これらの温度の遅延および温度の誤
差は大きい程度に最小としなくてはならない。
【0012】試料の液体の熱の出入りのための時間の遅
延を最小にしそして金属ブロック上の種々の点における
温度勾配または温度の不均一性のための温度の誤差を最
小にするという問題は、試料を含有する領域の大きさが
大きくなるとき、とくに重大となる。工業的に標準のマ
イクロタイタープレートのフォーマットの中に配置され
た96の試料管を収容するために十分に大きい金属ブロ
ックを有することは、PCR計器にとって高度に望まし
い属性である。
【0013】マイクロタイタープレートは、生化学およ
びバイオテクノロジーの分野において多数の小さい試料
を取り扱い、処理しそして分析するために、広く使用さ
れている手段である。典型的には、マイクロタイタープ
レートは、3+5/8インチ(9.2cm)幅および5イ
ンチ(12.7cm)長さであり、そして9mmの中央に8
ウェル×12ウェルの長方形の列の中に96の同一の試
料ウェルを含有するトレーである。マイクロタイタープ
レートは広範な種類の材料、形状および体積の試料ウェ
ルで入手可能であり、それらは多数の異なる使用につい
て最適化され、すべてのマイクロタイタープレートは同
一の全体の外側寸法および9mmの中央に同一の8×12
のウェルの列を有する。この標準のマイクロタイタープ
レートのフォーマットにおける試料の取り扱い、処理お
よび分析を自動化するための、広範な種類の装置は入手
可能である。
【0014】一般に、マイクロタイタープレートは、射
出成形または真空成形されたプラスチックであり、そし
て安価であり、使い捨て可能であると考えられる。交差
汚染から生ずる法律上の責任および使用後のマイクロタ
イタープレートの洗浄および乾燥の困難のために、使い
捨て可能性は極めて望ましい。したがって、マイクロタ
イタープレートのフォーマットで配置されている96ま
での試料について同時にPCR反応を実施できること
は、PCR計器について極めて望ましい特性である。
【0015】もちろん、9mmの中央上の8×12ウェル
の列の96試料を加熱および冷却するために必要な金属
ブロックの大きさは、かなり大きい。この大きい面積の
ブロックは、一般に0〜100℃の温度範囲に試料間の
温度の変動についての許容度を非常に小さくしてこのよ
うなブロックを非常に急速に加熱および冷却できるPC
R計器の設計について、多数の対抗する工業的問題をつ
くる。これらの問題はいくつかの原因から生ずる。第1
に、ブロックの大きい熱的質量は、ブロックの温度を操
作範囲内で大きい速度で上下させることを困難とさせ
る。第2に、種々の装置、例えば、冷却後の供給および
抜き出しのためにマニホールド、ブロックの支持取り付
け点、および関連する他の周辺装置にブロックを取り付
ける必要性は、許容可能な限界を越えた温度勾配がブロ
ックを横切って存在させる可能性をつくる。
【0016】また、多数の試料の急速な、正確な温度サ
イクルを必要とするPCR反応または他の反応の自動化
実施のための、サーマルサイクリングの設計における要
件の間に、多数の他の衝害が存在する。例えば、金属ブ
ロックの温度を急速に変化させるために、大量の熱を短
い時間で試料ブロックから出入りさせなくてはならな
い。熱は電気抵抗ヒータからか、あるいは加熱された流
体をブロックと接触させて流すことによって添加するこ
とができる。熱は冷却された流体をブロックと接触させ
て流すことによって急速に除去できる。しかしながら、
これらの手段により、試料の間で温度の不均一性を生じ
る温度勾配を形成するような、ブロック中の場所対場所
で大きい温度差をつくらないで、金属ブロックに大量の
加熱を出入りさせることは不可能であるように思われ
る。
【0017】熱の添加または除去の停止後でさえ、ブロ
ック中の種々の点において貯蔵された熱がより冷たい領
域に移動して温度勾配を排除しなくてはならない距離の
平方にほぼ比例する時間の間、温度勾配は持続すること
ができる。こうして、金属ブロックをより多くの試料を
収容するためにより大きく作るとき、温度変化がより大
きい寸法を横切って存在する温度勾配を引き起こした
後、ブロックの中に存在する温度勾配が消滅するために
要する時間は顕著に長くなる場合がある。これは、すべ
ての試料の間で正確な温度の均一性を維持しながら、試
料ブロックの温度を急速にサイクルする困難を増加させ
る。
【0018】温度勾配を消散させるに要する時間に起因
して、ブロック中の大きい距離にわたって存在する温度
勾配の発生を防止するために、高い性能のPCR計器の
設計において、重要な必要性が発生した。他の必要性
は、金属部分またはブロックに取り付けられた他の周辺
装置の間の機械境界を横切って熱が移動するという要件
を、出来るだけ非常に多く、回避することである。ジョ
イントを横切ってすべての場所で高い温度伝導性を均一
に保証する方法で、金属部分を接合することは困難であ
る。熱伝導性の不均一性は望ましくない温度勾配を発生
するであろう。
【0019】
【課題を解決するための手段】本発明によれば、試料ブ
ロック中の試料温度の変化と反応混合物中の温度変化と
の間の遅延を減少するための、薄い壁の試料管が開示さ
れる。2つの異なる大きさの試料管を開示するが、各々
は試料ブロック中の合致する円錐形のくぼみの中に嵌合
する薄壁の円錐形区画を有する。典型的には、縦軸に関
して17°の角度をもつ円錐を使用して、試料ブロック
の中への管のジャミングを防止するが、すべりばめを可
能とする。他の形状および角度も、本発明を実施するた
めに十分であろう。
【0020】また、試料ブロック以外の、例えば、液体
浴、オーブンなどの、他の型の熱交換器を使用すること
ができる。しかしながら、何らかの熱交換器と接触する
試料管の区画の壁厚さは、PCRのサイクリングの熱的
ストレスおよび通常の使用のストレスに十分に耐えられ
る範囲内で、出来るだけ薄くあるべきである。典型的に
は、試料管はオートクレーブ処理可能なポリプロピレ
ン、例えば、0.009〜0.012インチ±0.00
1インチ(0.23〜0.30mm±0.03mm)の範囲
の円錐形区画の壁厚さをもつHimont PD701
から作られる。より好ましくは、壁厚さは0.012イ
ンチ(0.30mm)である。
【0021】好ましい実施態様において、試料管は、ま
た、円錐形区画と接合する、より薄い壁の円筒形区画を
有する。この円錐形区画はもとの反応混合物またはPC
Rプロセス後に添加できる試薬を含有する。図51に示
す試験管は、他のPCRシステムにおける適合性のため
の薄い壁を除外して、工業的に標準の形状を有する。図
15の試料管は、ここに開示するシステムとともに使用
できる、短い管である。薄い壁の試料管の使用が好まし
いシステム環境の他の実施態様を以下に要約する。
【0022】非常に急速な温度サイクルのPCRプロト
コルの実施の間に、マイクロタイタープレートのフォー
マットにおいて配置された非常に大きい数の試料につい
て、非常に正確な温度制御を達成する新規な方法および
装置をさらに開示する。本発明の教示は、試料ブロッ
ク、試料管および支持の取り付け、加熱および冷却装
置、制御エレクトロニクスおよびソフトウェアについて
の新規な構造、新規なユーザのインタフェースおよびP
CRプロトコルを実施するために前記装置を使用する新
規な方法を包含する。
【0023】ここに開示される装置は、多数の試料を横
切って温度制御の非常に緊密な許容度で96までの試料
についてPCR遺伝子増幅を実施するように設計され
る。すなわち、すべての試料は、異なる試料を含有する
異なるウェルの間の温度差を非常に小さくすると同時
に、温度が上下する。これはポリメラーゼ連鎖反応のサ
イクルを通じて真実である。また、この装置は、各試料
ウェル中の蒸発および凝縮のプロセスの制御により、反
応混合物の濃度を非常に厳密に制御することができる。
さらに、この装置は、試料ウェルの間の交差汚染を実質
的になくして、各々が異なるドナーからの100μlの
96までの試料を処理することができる。
【0024】本発明は、標準の96ウェルのマイクロタ
イタープレートのフォーマットにおいてアルミニウムの
試料ブロックを加熱および冷却して試料を熱的にサイク
リングし、その結果、急速なサーマルサイクリング速
度、制御しない変化する周囲温度および他の操作条件、
例えば、電力ラインの電圧および冷却液温度にかかわら
ず、きわめてすぐれた試料対試料の均一性が存在する新
規な方法を包含する。
【0025】また、本発明は、各試料管が加熱されたカ
バーからの下降する圧力下に試料ブロックと最良の嵌合
を見いだすために十分な個々の動きの自由度を有すると
ともに、サーマルサイクリングのためのDNAを含有す
る96までの個々の試料管を収容する、使い捨てプラス
チック96ウェルのマイクロタイタープレートのための
新規な構成を包含する。各管の最良の嵌合を可能とする
ことによって、試料ブロックの金属と試料管およびマイ
クロタイタープレートの構造のプラスチックとの間の熱
的膨張および収縮の速度の差が、使い捨てマイクロタイ
タープレートの構造において、試料管の中心対中心の距
離に関して、試料ブロック中のウェルの相対的中心対中
心の寸法を変化させる場合でさえ、マイクロタイタープ
レートの設計は試料ブロック対各試料管の高くかつ均一
な熱伝導性を提供する。
【0026】さらに、本発明は、処理されている試料の
温度を直接測定しないで、これらの温度を連続的に計算
しかつ表示する能力を有した、PCR計器を制御する新
規な方法および装置を包含する。これらの計算された温
度を使用して、試料が各標記インキュベーション温度に
ついて所定の温度の許容度のバンド内に保持される時間
を制御する。この制御システムは、また、試料ブロック
に熱的に連結した3ゾーンのヒータを制御し、そして試
料ブロック中の方向的に交錯したランプ冷却チャンネル
を通して流体の流れをゲート(gate)し、流体の流
れは、試料ブロックを通る冷却液の一定のバイアス冷却
流と組み合ったとき、ユーザが特定する標的温度への急
速な温度変化およびその温度における正確な温度制御を
達成する設備を提供する。3ゾーンのヒータを制御する
方法および装置は、なかでも、3ゾーンのヒータの種々
のゾーンへ供給すべき電気的エネルギーの量を計算する
とき、ライン電圧、ブロック温度、冷却液温度および周
囲温度を考慮する。このヒータは、試料ブロックのへり
または「ガードバンド」の下で別々に制御することがで
き、こうして試料ブロックのへりへ取り付けられた周辺
装置を通る周囲への過剰の熱損失を補償できるようにす
る、ゾーンを有する。これは温度勾配の形成を防止す
る。
【0027】さらに、本発明は、試料をそれらの沸点付
近の温度においてインキュベーションするとき、反応混
合物からの溶媒の損失を防止する新規な方法および装置
を包含する。加熱された定盤は試料管の上部をカバー
し、そして個々のキャップと接触し、これらのキャップ
は各試料管に気密シールを提供する。定盤からの熱は各
試料管およびキャップの上部を凝縮点より上の温度に加
熱するので、試料管内で凝縮および還流は起こらない。
凝縮は比較的大きい熱移動を表す。なぜなら、蒸発熱に
等しい量の熱が水蒸気の凝縮に消費されるからである。
これは、凝縮が均一に起こらない場合、試料対試料の大
きい温度の変動を引き起こすことがある。加熱された定
盤は、試料管中の凝縮の発生を防止し、これによりこの
潜在的な温度誤差源を最小にする。加熱された定盤の使
用は、また、試薬の消費を減少する。
【0028】すべての試料管を温度制御した試料ブロッ
クの中にしっかりプレスして、各管について均一なブロ
ック対管の熱伝導を確立しかつ維持するために必要な、
実験的に決定した最小の下向きの力を越える下向きの力
を各試料管を提供する。熱伝導のこの均一性は、管対管
の長さ、直径、角度または他の寸法の誤差の変動に無関
係に確立され、これらはそうでなければある試料管を他
の試料管より対応する試料ウェルの中によりきっちりと
嵌合させる。
【0029】加熱された定盤は、各キャップのプラスチ
ックを軟化するが、キャップの弾性に完全に破壊しな
い。こうして、最小の限界の下向きの力を、管対管の管
の高さの差にかかわらず、各管に連続的に加える。ここ
に記載するPCR計器は、2倍またはそれ以上サイクル
時間を減少し、そしてPCR体積を20uhまで試薬の
コストを下げるが、工業規格との適合性を残す。
【0030】
【実施例】図1を参照すると、本発明の教示に従いPC
Rを実施するためのコンピュータ制御の計器の1つの実
施態様の主要なシステム成分のブロック線図が示されて
いる。増幅すべきDNAまたはRNAを含む試料混合物
を温度プログラム可能な試料ブロック12の中に配置
し、そして加熱されたカバー14でカバーする。
【0031】ユーザは、キーボードおよびディスプレイ
を含む端末16を経て、所望のPCRプロトコルの時間
および温度のパラメーターを定めるデータを供給する。
キーボードおよびディスプレイはバス18を経て制御コ
ンピュータ20(以後中央処理装置またはCPUと呼
ぶ)に連結する。この中央処理装置20は、下に記載す
る制御プログラム、所望のPCRプロトコルおよび下に
記載するある種の較正定数を記憶する記憶装置を包含す
る。制御プログラムはCPU20が試料ブロック12の
温度サイクリングを制御するようにさせそしてユーザの
インタフェースを実施し、そしてユーザのインタフェー
スはある種のディスプレイをユーザに提供し、そしてユ
ーザにより端末16のキーボードを経て入力されたデー
タを受けとる。
【0032】好ましい実施態様において、中央処理装置
20はカスタム設計される。エレクトロニクスのブロッ
ク線図は以下でより詳細に論ずる。他の実施態様におい
て、計器の種々のヒータおよび他の電気−機械的システ
ムを制御しそして種々のセンサーを読む中央処理装置2
0および関連する周辺エレクトロニクスは、任意の汎用
コンピュータ、例えば、適当なプログラムによるパーソ
ナルコンピュータまたはマイクロコンピュータである。
試料10を試料ブロック12の中に配置されたキャップ
付き使い捨て管の中に貯蔵し、そして加熱されたカバー
14により周囲空気から隔離し、そして加熱されたカバ
ー14は下に記載するプラスチックの使い捨てトレーと
接触して、試料管が内部に存在する加熱された箱体を形
成する。加熱されたカバーは、なかでも、試料管内の蒸
発、凝縮および還流により、試料混合物を出入りする望
ましくない熱移動を減少する働きをする。それは、ま
た、キャップの内側を乾燥に保持し、これにより管から
キャップを取ったとき、エアゾールの形成を防止するこ
とによって、交差汚染の機会を減少する。加熱されたカ
バーを試料管のキャップと接触させ、そしてそれらをほ
ぼ104℃または反応混合物の種々の成分の凝縮点より
上に加熱して保持する。
【0033】中央処理装置20は、加熱されたカバー1
4の温度を感知しそしてその中の電気抵抗ヒータを制御
してカバー14を所定の温度に維持するために、適当な
エレクトロニクスを包含する。加熱されたカバー14の
温度の感知およびその中の抵抗ヒータの制御は、温度セ
ンサー(図示せず)およびバス22を経て達成される。
【0034】冷却液制御システム24は、冷却された冷
却液、例えば、自動車のアンチフリーズおよび水の混合
物を、試料ブロック12中のバイアス冷却チャンネル
(図示せず)を通して、入力管26および出力管28を
経て、連続的に循環させる。冷却液制御システム24
は、また、試料ブロック12中のより高い体積のランプ
冷却流体の流路(図示せず)を通る流体の流れを制御す
る。ランプ冷却チャンネルを使用して、試料ブロック1
2を通して大きい体積の冷却された冷却液を比較的高い
流速で送ることによって、試料ブロック12の温度を急
速な変化させる。ランプ冷却冷却液は試料ブロック12
に管30を通して入り、そして管32を通して試料ブロ
ック12から出る。冷却液制御システムの詳細は図46
に示されている。冷却液制御システムは、制御システム
のエレクトロニクスおよびソフトウェアの説明において
以下でより詳細に論ずる。
【0035】典型的には、試料ブロック12の冷却に使
用する冷却液は、主として水とエチレングリコールとの
混合物から成る。冷却液は熱交換器34により冷却さ
れ、そして熱交換器34は試料ブロック12から熱を抽
出した冷却液を入力管36から受けとる。熱交換器34
は、冷却装置40から入力管38を経て圧縮された液体
のフレオン冷却剤を受けとる。この冷却装置40はコン
プレッサー(図示せず)、ファン42およびフィン管加
熱ラジエーター44を包含する。冷却装置40は、管4
6を経て熱交換器34から受けとったフレオンガスを圧
縮する。気体のフレオンはフィン管凝縮器44において
冷却されそして液体に凝縮される。液体のフレオンの存
在は、絞り弁式毛管47によりフィン管凝縮器中のその
蒸気圧より上に維持される。この毛管の出力は管38を
経て熱交換器34の入力に連結される。熱交換器におい
て、フレオンの圧力はフレオンの蒸気圧より下に低下
し、そしてフレオンが膨張する。この膨張プロセスにお
いて、熱は熱交換器中を循環する加温された冷却液から
吸収され、そしてこの熱はフレオンに移動し、これによ
りフレオンは沸騰するようになる。次いで、加温された
フレオンは熱交換器から管16を経て抽出され、そして
圧縮されそして再びフィン管凝縮器44を通して循環さ
れる。ファン42はフィン管凝縮器44を通して矢印4
8で示すように空気を流して、フレオン中の熱を管46
から周囲の空気と交換させる。冷却装置40は30℃に
おいて400ワットの熱および10℃において100ワ
ットの熱を冷却液から抽出して、本発明の教示に従い急
速な温度のサイクルを支持することができる。
【0036】好ましい実施態様において、図1の装置は
ハウジング(図示せず)内に囲まれている。周囲の空気
へ追い出された熱48はハウジング内に保持され、冷却
された冷却液またはフレオンを1つの場所から他の場所
に運ぶ種々の管上に起こる凝縮の蒸発を促進する。凝縮
は、装置またはエレクトロニクスの回路の構成において
使用した金属の腐食を引き起こすことがあり、したがっ
て除去すべきものである。囲いの内側の熱48は、凝縮
の蒸発を促進して腐食を防止する。
【0037】その熱をフレオンと交換した後、冷却液は
熱交換器34を管50を経て出て、冷却液制御システム
に再び入り、ここで端末16を経てユーザが入れたデー
タにより定められるPCRサイクルの急速な冷却部分の
間、冷却液は必要に応じて試料ブロックへゲートされ
る。上記のように、PCRプロトコルは少なくとも2つ
の異なる温度およびしばしば3つの異なる温度における
インキュベーションを包含する。典型的なPCRサイク
ルは図11に示されており、ここで変性インキュベーシ
ョン170は94℃付近の温度において実施し、ハイブ
リダイゼーションインキュベーション122は室温付近
の温度(25℃〜37℃)において実施し、そして伸長
インキュベーション174は50℃付近の温度において
実施する。これらの温度は十分に異なり、したがって、
すべての試料の反応混合物の温度を1つの温度から他の
温度に急速に動かす手段を準備しなくてはならない。ラ
ンプ冷却システムは、試料ブロック12の温度を高い温
度の変性インキュベーションからより低い温度のハイブ
リダイゼーションインキュベーションおよび伸長インキ
ュベーションの温度に急速に低下させる手段である。典
型的には、冷却液の温度は10〜20℃の範囲である。
冷却液が20℃であるとき、それは約400ワットの熱
を試料ブロックから送り出すことができる。典型的に
は、ランプ冷却チャンネルの寸法、冷却液の温度および
冷却液の流速は、5〜6℃/秒のピーク冷却が操作範囲
の高い端(100℃)付近において達成され、かつ2.
5℃/秒の平均の冷却速度が試料ブロックの温度を94
℃から37℃にするとき達成されるようにセットする。
【0038】ランプ冷却システムは、ある実施態様にお
いて、試料ブロックの温度を標的のインキュベーション
温度にまたはその付近に維持するために使用できる。し
かしながら、好ましい実施態様において、標的インキュ
ベーション温度を維持するための下向き試料ブロック1
2の小さい温度変化はバイアス冷却システムにより実施
される。
【0039】図46に示すように、ポンプ41は濾過貯
留槽39(130mlの容量)から1/2インチ管を経て
冷却液を絶えず送り、そしてそれを1/2インチ管を経
て分岐47へ送る。ポンプ41は冷却液をパイプ45に
1〜1.3ガロン/分の一定の流速で供給する。分岐4
7において、管45中の流れの部分はバイアス冷却チャ
ンネル49を通して一定の流れとして転向する。管45
中の流れの他の部分は、絞り弁51を通して出力管38
に転向する。絞り弁51はこのシステムにおいて十分な
圧力を維持し、こうしてバス54を経るCPU20の制
御下に2状態のソレノイド作動弁55の入力53におい
て正の圧力が存在する。ランプ冷却は急速な下向きの温
度変化の実行に望むとき、CPU20はソレノイド作動
弁55を開放し、冷却液をランプ冷却チャンネル57を
通して流れさせる。8つのランプ冷却チャンネルが存在
するので、各ランプ冷却チャンネルを通る流量は約1/
8ガロン/分である。バイアス冷却チャンネルを通る流
量は、その大きく制限された断面積のために、非常に少
ない。
【0040】バイアス冷却システムは、試料ブロック1
2中のバイアス冷却チャンネル49を通して冷却された
冷却液の小さい一定の流れを提供する。これは試料ブロ
ック12から一定の小さい熱損失を引き起こし、これは
マルチゾーンヒータ156により補償され、マルチゾー
ンヒータ156は試料ブロックの温度を安定した値に維
持すべきインキュベーションセグメントのために試料ブ
ロック12に熱的に連結されている。バイアス冷却の流
れにより引き起こされる一定の小さい熱損失は、小さい
温度のための温度の上下の比例的制御を制御システムに
実行させる。これが意味するように、両者の加熱および
冷却を制御された予測可能な小さい速度で温度サーボシ
ステムは利用して、ブロック温度の誤差を補正してブロ
ック温度が信頼性をもって、ユーザが入れたPCR温度
のプロフィルをたどるようにする。別法はフィルムヒー
タへの電力をカットオフし、そしてブロック温度が高す
ぎたとき、試料ブロックが熱を放射および対流により周
囲に放出するようにさせることである。これは、定量的
PCRサイクリングのための厳密な温度制御の規格を満
足するためには遅すぎそして予測不可能である。
【0041】このマルチゾーンヒータ156は図1にお
いてCPU20によりバス52を経て制御され、そして
試料ブロック12の温度をより低いインキュベーション
温度からより高いインキュベーション温度に急速に上昇
させる手段であり、そしてバイアス冷却を補償しそして
インキュベーションの間の温度のトラッキングおよび制
御の間、温度誤差を上方に補正する手段である。
【0042】他の実施態様において、バイアス冷却は排
除するか、あるいは他の手段、例えば、試料ブロックの
金属の中に形成された冷却ファンまたは冷却フィン、ペ
ルチエ接合または絶えず循環する水道水により供給する
ことができる。しかしながら、これらの他の実施態様に
おいて、温度勾配が試料ブロックの中につくられないよ
うに注意しなくてはならない。温度勾配はある試料の温
度を他の試料の温度からそらせ、これによりある試料に
おけるPCR増幅の結果を他の試料のそれと異ならせ
る。好ましい実施態様において、バイアス冷却はブロッ
ク温度と冷却液温度との間の差に比例する。
【0043】CPU20は、図1において試料ブロック
12の金属の温度を温度センサー21および52を経て
感知することによって、冷却液制御システムにおいて循
環冷却液の温度をバス54および温度センサーを経て感
知することによって、試料ブロック12の温度を制御す
る。冷却液のための温度センサーは図46において61
に示されている。CPUは、また、図1においてシステ
ムのハウジング内の内部の周囲空気の温度を周囲空気温
度センサー56により感知する。さらに、CPU20は
ライン58上の入力電力のためのライン電圧を感知63
を経て感知する。データのすべてのこれらの項目は、所
望のPCRプロトコル、例えば、インキュベーションの
ための標的の温度および時間を定めるユーザが入れたデ
ータの項目と一緒に、より詳細に後述する制御プログラ
ムにより使用される。この制御プログラムは、マルチゾ
ーン試料ブロックフィルムヒータ156の種々のゾーン
へバス52を経て加える電力の量を計算し、そして冷却
液制御システム24においてソレノイド作動弁55を開
閉する冷却液制御信号をバス54を経て発生して、試料
ブロックの温度がユーザが入れたデータにより定められ
るPCRブロトコルに従うようにさせる。
【0044】図2を参照すると、試料ブロック12の上
面図が存在する。試料ブロック12の目的は、薄い壁の
試料管の列のための機械的支持および熱交換要素を提供
することであり、ここで各試料管中の試料の液体と試料
ブロック12の中に形成されたバイアス冷却チャンネル
およびバイアス冷却チャンネルの中を流れる冷却液との
間で熱が交換される。試料ウェルの種々のものの間で大
きい温度勾配をつくらないでこの熱交換機能を提供し、
こうして列中のすべての試料混合物が、空間的に分離さ
れていてさえ、同一PCRサイクルを経験するようにさ
せるのは、試料ブロック12の機能である。ここに記載
するPCR計器の全体の目的は、複数の試料について試
料液体の温度を非常に厳密に制御し、こうしていずれの
試料液体の温度も他の試料ウェル中のいずれの他の試料
液体の温度とPCRサイクルのいずれの点においても感
知しうるほど(ほぼ±0.5℃)変化しないようにする
ことである。
【0045】「定量的」PCRと呼ばれるPCR技術の
出現するブランチが存在する。この技術において、この
目的は標的DNAの量をサイクル毎に正確に2倍にする
ことによってPCR増幅を出来るだけ正確に実施するこ
とである。サイクル毎の正確な2倍は達成が困難である
か、あるいは不可能であるが、厳密な温度制御は役に立
つ。
【0046】多数の誤差源が存在し、これらのために、
PCRサイクルはサイクルの間の標的DNA(以後DN
AはまたRNAを呼ぶと理解すべきである)の量を正確
に2倍にすることができないことがある。例えば、ある
PCR増幅において、このプロセスは標的DNAの単一
の細胞を使用して開始する。この単一の細胞が試料管の
壁に粘着しそして最初の数サイクルにおいて増幅すると
き、容易に起こりうる誤差は生ずる。
【0047】誤差の他の型は、「外来」標的DNAを攻
撃する外来ヌクレアーゼが反応混合物の中に入ることで
ある。すべての細胞は、細胞中で解放される外来DNA
を攻撃する非特異的ヌクレアーゼを有する。これが起こ
るとき、それは複製プロセスを妨害するか、あるいは停
止させる。こうして、1滴の唾液またはふけの粒子また
は他の試料混合物からの物質が試料混合物の中に偶発的
に入る場合、これらの細胞中のヌクレアーゼ物質標的D
NAを攻撃しそして増幅プロセスにおいて誤差を生ず
る。すべてのこのような交差汚染源を排除することは高
度に望ましい。
【0048】他の誤差源は、異なる試料の多重性の種々
のものの間のように、試料混合物の温度の制御が不正確
さである。例えば、すべての試料が伸長インキュベーシ
ョンのために適切なアニーリング温度(通常50〜60
℃の範囲のユーザが選択した温度)を有するように正確
に制御されない場合、DNAのある種の形態は適切に伸
長されないであろう。これが起こる理由は、温度が低す
ぎる場合、伸長プロセスにおいて使用するプライマーが
誤ったDNAにアニーリングすることである。アニーリ
ング温度が高すぎる場合、プライマーは標的DNAにま
ったくアニーリングしないであろう。
【0049】PCR増幅が診断試験、例えば、HIV抗
体、肝炎、または遺伝病、例えば、鎌状赤血球貧血など
の存在についての診断試験の一部分であるとき、PCR
増幅プロセスの実施の結果を不正確に容易に想像するこ
とができる。このような診断試験における誤った陽性ま
たは誤った陰性の結果は、不幸をもたらす人為的または
法律的結果を有することがある。したがって、ここに記
載するPCR計器の設計の目的は、これらの起こりうる
誤差源、例えば、交差汚染または劣った温度制御の出来
るだけ多くを排除すると同時に、工業的に標準の96ウ
ェルのマイクロタイタープレートのフォーマットと適合
する計器を提供することである。この計器は柔軟な方法
で簡単なユーザのインタフェースを使用してPCRを急
速に実施しなくてはならない。
【0050】好ましい実施態様において、試料ブロック
12は比較的純粋であるが、腐食抵抗性のアルミニウ
ム、例えば、6061アルミニウム合金から機械加工す
る。アルミニウムの充実ブロックからブロック構造を機
械加工すると、熱的により均質な構造が生ずる。鋳造し
たアルミニウム構造体は、非常に厳密な所望の温度制御
の規格を満足するために必要なほど、熱的に均質である
傾向はない。
【0051】試料ブロック12は、このブロックの熱的
質量は低く保持されているので、急速な温度変化を行う
ことができる。これは多数の冷却通路、試料ウェル、み
ぞおよび他のねじ孔または非ねじ孔をブロックの中に形
成することによって実施される。これらの孔のいくつか
を使用して、ブロックを支持体に取り付けそして外部の
装置、例えば、マニホールドおよびこぼれトレーを取り
付ける。
【0052】試料ブロックの構造の「ハニカム」性質を
最もよく理解するために、ブロックを平面図で示す図2
ならびに試料ブロックの正面図および断面図を示す図3
〜図8を同時に参照する。例えば、図3は図2の線3−
3′の視点から取った冷却チャンネルの位置を示す正面
図である。反対側から見た、試料ブロック12の溶媒は
同一である。図4は図2の線4−4′の斜視からの試料
ブロック12のへりの正面図である。図5は図2の線5
−5′の斜視からの試料ブロック12のへりの正面図で
ある。図6は図2の線6−6′に沿って取った試料ブロ
ック12の断面図である。図7は図2の線7−7′に沿
って取った試料ブロック12の断面図である。図8は図
2の線8−8′に沿って取った試料ブロック12の断面
図である。
【0053】試料ブロック12の上部表面は、円錐形試
料ウェルの8×12列が孔開けされており、66および
68のウェルは典型的である。各試料ウェルの円錐形の
形状は図8に最もよく示されている。各試料ウェルのウ
ェルは17°の角度で孔開けされていて、各試料管の円
錐形区画の角度と合致している。これは図8において直
径DW を有するパイロット孔を孔開けすることによって
実施される。次いで、17°のカウンターシンクを使用
して円錐形壁67を形成する。
【0054】各試料ウェルの底は、試料管の先端の浸透
深さを越える深さを有する溜70を含む。溜70はパイ
ロット孔によりつくられ、そして試料管が対応する試料
ウェルの中に配置されるとき、試料管より下に小さい開
いた空間を提供する。この溜は、試料ウェルの壁への各
試料管の緊密な嵌合を妨害せずに、液体、例えば、ウェ
ル壁上に形成する凝縮物が存在するための空間を提供す
る。この緊密な嵌合は、ウェル壁から試料液体への熱伝
導性を各試料管について均一かつ高くすることを保証す
る。1つの管についてゆるい嵌合を引き起こすウェル中
の汚染は、列を横切る熱伝導性のこの均一性を破壊する
であろう。すなわち、試料ウェル中の試料管の配置に関
係する圧力で液体は実質的に圧縮されないので、溜70
が存在しない場合、試料ウェルの底中の液体の存在はそ
の試料ウェル中の試料管の完全な配置を妨害することが
ある。さらに、溜70はある空間を提供し、この空間に
おいて、溜70の中に存在する液体の気相は高い温度の
インキュベーションの間に膨張し、こうして溜70が存
在しない場合存在であろうこのような膨張の大きい力が
試料管に加えられて試料ウェルとの同一高さの接触から
管は押して分離されることはない。
【0055】実験において、各試料管はその対応する試
料ウェルと同一高さで接触することが重要であること、
そしてある最小の限界の力を各試料管に加えて、試料ウ
ェルの壁と反応混合物との間の熱伝導性を列を通じて均
一に保持されることが発見された。この最小の限界の配
置力は、図15に力のベクトルFとして示されており、
そして1つの試料管の壁を通る熱伝導性がブロック中の
どこかに位置する他の試料管を通る熱伝導性と異なるの
を防止するための、主要な因子である。最小の限界の配
置力Fは30gであり、そして好ましい力のレベルは5
0〜100gである。
【0056】試料ウェルの列は、図2、図6および図8
において最もよく見られるように、2つの機能を有する
みぞ78により実質的に完全に取り囲まれている。主な
機能は試料ブロックの中央区域からブロックのへりへの
熱伝導性を減少することである。みぞ78は試料ブロッ
クの厚さを約2/3通して延びる。このみぞは、支持ピ
ン、マニホールドなどのブロックへの必要な機械的接続
により引き起こされる、回避不可能な熱勾配の作用を最
小とする。第2機能は熱的質量を試料ブロック12から
除去して、試料ブロック12の温度をより急速に変更
し、そして「ガードバンド」と呼ぶへり領域におけるウ
ェルの列をシミュレーションすることである。図2にお
ける点80および82の間のみぞ78の部分により除去
される金属の量は、8つの試料ウェル83〜90の隣接
する列により除去される金属の量に実質的に等しいよう
に設計される。この目的は、ガードバンドの熱的質量を
隣接する「局所的ゾーン」、下により完全に説明する用
語、の熱的質量に合致させることである。
【0057】図3、図6および図8をとくに参照する
と、試料ブロック12の金属の中に形成された、種々の
バイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャンネルの
数および相対的位置が示されている。9つのバイアス冷
却チャンネル91〜99が存在する。同様に、8つのラ
ンプ冷却チャンネル100〜107が存在する。これら
のバイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャンネル
の各々は試料ブロックのアルミニウムを通してガン孔開
けされる。ガン孔開け法はよく知られており、そして試
料ブロック12の底表面110に出来るだけ近く存在す
る長い非常に真っすぐな孔を開ける能力を提供する。ガ
ン孔開け法は真っすぐな孔を開けるので、この方法はバ
イアス冷却チャンネルまたはランプ冷却チャンネルが、
孔開けの間にそれることおよび試料ブロックの底表面1
10を貫くことを防止するか、あるいは他の冷却チャン
ネルに対する相対的位置の変動を防止する。このような
誤った位置は、局所的ゾーンの「局所的バランス」また
は「局所的対称性」を覆すことによって、望ましくない
温度勾配を引き起こすことがある。これらの概念は以下
で説明するが、それらを実行する概念および構造は、異
なる試料ウェルの間のように過度の温度誤差をつくらな
いで、96までの試料の急速な温度サイクリングを達成
するために重要であることを理解すべきである。
【0058】バイアス冷却チャンネル91〜99は、好
ましい実施態様においてシリコーンゴムでライニングし
て、バイアス冷却チャンネルの壁を横切る熱伝導を減少
する。バイアス冷却チャンネル中の壁を横切る熱伝導を
低下して、マルチゾーンヒータ156をオフにしそして
試料ブロック12からの熱損失が主としてバイアス冷却
チャンネルを通るとき、試料ブロック12の急速過ぎる
温度変化を防止することは好ましい。これは、試料ブロ
ックの温度が所望の標的インキュベーション温度よりわ
ずかにずれ、そして制御システムが試料ブロックの温度
をユーザが特定したインキュベーション温度に下げて戻
すとき、制御プロセスが実施される間の場合である。こ
の場合における冷却速度が速すぎると、制御システムの
サーボフィードバックループが応答することができる前
に、所望のインキュベーションのオーバーシュートを引
き起こすことがあるが、「制御されたオーバーシュー
ト」は下に記載するように使用されるであろう。ブロッ
ク温度のサーボフィードバックループは刺激に対する反
応について時間定数を有するので、加熱および冷却の量
および試料ブロックの生ずる温度変化速度を制御し、こ
うして制御システムが温度誤差に対して応答できるより
速い速度で、試料ブロックの温度を変化させないことに
よって、オーバーシュートを最小にすることが望まし
い。
【0059】好ましい実施態様において、バイアス冷却
チャンネルは直径4mmであり、そしてシリコーンゴムの
管は1mmの内径および1.5mmの壁厚さを有する。これ
は、ブロックが操作範囲の高い端、すなわち、約100
℃であるとき、ほぼ0.2℃/秒のバイアス冷却速度を
与え、そして試料ブロック12が操作範囲の下端の温度
であるとき、ほぼ0.1℃/秒のバイアス冷却速度を与
える。図1における冷却液制御システム24は、バイア
ス冷却チャンネルにおいて、ランプ冷却チャンネル10
0〜107を通る冷却液の流速のほぼ1/20〜1/3
0倍の冷却液の流速を生ずる。バイアス冷却チャンネル
およびランプ冷却チャンネルは同一大きさ、すなわち、
4mmの直径であり、そして試料ブロック12を通して完
全に延びている。
【0060】バイアス冷却チャンネルは、その端にフッ
クをもつ剛性なワイヤをバイアス冷却チャンネルの中に
挿入しそしてそれを4mmよりわずかに大きい外径を有す
るシリコーンゴム管の端の孔を通してフッキングするこ
とによってライニングされる。次いで、ワイヤ中のフッ
キングをシリコーンゴム管中の孔を通して配置し、そし
てシリコーンゴム管をバイアス冷却チャンネルを通して
引き、そして試料ブロック12の端表面と同一平面に切
る。
【0061】ねじ孔108〜114を使用して、冷却液
のマニホールドを試料ブロック12の各側にボルト止め
する。ブロックの各端にボルト止めされた冷却液のマニ
ホールドが存在する。これらの2つのマニホールドを図
1において冷却チャンネル26,28,30および31
に連結され、そしてマニホールドと試料ブロックの金属
との間に介在するガスケット材料(図示せず)により試
料ブロック12に添付されている。このガスケットは冷
却液の漏れを防止し、そして試料ブロック12とヒート
シンクを表すマニホールドとの間の熱伝導を制限する。
前述の目的を実行する任意のガスケット材料は本発明の
実施のために十分である。
【0062】みぞ78の位置に対するバイアス冷却チャ
ンネルおよびランプ冷却チャンネルの位置は、図6の断
面図において最もよく見られる。試料ウェルの位置に対
するバイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャンネ
ルの位置は、図8の断面図において最もよく見られる。
バイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャンネル
は、一般に、試料ウェルの先端の位置の間に介在する。
さらに、図8から明らかなように、バイアス冷却チャン
ネルおよびランプ冷却チャンネル、例えば、チャンネル
106および97は、1または2以上の試料ウェルの壁
の危険な浸透なしに、ポジティブのZ方向に非常に遠く
動くことができない。同様に、冷却チャンネルは、試料
ブロック12の底表面116を浸透する可能性をつくら
ないで、ネガティブのz方向に非常に遠く動くことがで
きない。明瞭のため、バイアス冷却チャンネルおよびラ
ンプ冷却チャンネルの位置は、試料ウェルおよび他の構
造の位置に関して、図2に隠れた線で示されていない。
しかしながら、試料ウェルのすべてのカラムの間にバイ
アス冷却チャンネルまたはランプ冷却チャンネルが存在
する。
【0063】図2を参照すると、孔118,119,1
20および121にねじ山を形成し、そしてそれらの孔
を使用して、試料ブロック12の中に形成する種々の孔
およびみぞを機械加工するために使用する機械に試料ブ
ロック12を取り付ける。図2、図4および図5におい
て、孔124,125,126および127を使用し
て、下にさらに詳細に記載する図9に示す支持ブラケッ
トに試料ブロック12を取り付ける。はがねのボルトは
この支持ブラケットを通してねじ孔124〜127の中
に延びて、試料ブロック12の機械的支持を提供する。
これらのはがねのボルトは、また、ヒートシンクまたは
熱源を表し、これらは熱的質量を試料ブロック12に添
加し、そして試料ブロック12と取り囲む環境との間の
熱的エネルギーの移動のための追加の通路を提供する。
これらの支持ピンおよびマニホールドは、これらの周辺
構造体に対して前後して移動する熱的エネルギーがこれ
らの試料の温度に影響を与えるのを防止するためのガー
ドバンドのための必要性をつくるとき、2つの重要な因
子である。
【0064】図5を参照すると、孔128,130およ
び132は集積回路の温度センサー(図示せず)のため
の取り付け孔であり、この温度センサーは孔128を通
して試料ブロックの中に挿入され、そしてねじ孔130
および132へ締結されるボルトによりそれに固定され
る。孔128の浸透程度およびみぞ78および試料ウェ
ルの隣接する列の相対的位置は、図2に最もよく示され
ている。
【0065】図2を参照すると、孔134〜143はス
ピルカラー147を取り付けるために使用する取り付け
孔である(図示せず)。このスピルカラー147は図1
9に示されており、図19は加熱された定盤14、すべ
りカバー316およびレッドスクリューアセンブリ31
2の構造を詳細に示す。スピルカラーの目的は、試料管
からこぼれた液体が腐食を引き起こす絶縁のケーシング
の内側に入るのを防止することである。
【0066】図9を参照すると、試料ブロック12のた
めの支持システムおよびマルチゾーンヒータ156の形
状の断面図が示されている。試料ブロック12は4つの
ボルトにより支持され、それらのうちのボルト146は
典型的である。これらの4つのボルトははがね支持ブラ
ケット148の直立部材を通過する。2つの大きいコイ
ルばね150および152は、支持ブラケット148の
水平部分とはがね圧力板154との間で圧縮されてい
る。ばね150および152は、試料ブロック12の底
にフィルムヒータ156を圧縮するボジティブZ作用方
向にほぼ300ポンド/平方インチを供給するために十
分に圧縮されている。この3層のフィルムヒータは、マ
ルチゾーンフィルムヒータ156、シリコーンゴムのパ
ッド158およびエポキシ樹脂フォームの層160から
構成されている。好ましい実施態様において、フィルム
ヒータ156は3つの別々の制御可能なゾーンを有す
る。フィルムヒータの目的は、図1においてCPU20
の制御下に試料ブロック12に熱を供給することであ
る。シリコーンゴムのパッドの目的は、フィルムヒータ
層156から下の構造体への熱伝導を低下することであ
る。これらの下の構造体はヒートシンクおよび熱源とし
て働き、それらの間で望ましくない熱エネルギーを試料
ブロック12から出入りさせることができる。シリコー
ンゴムのパッド158は、いくつかのフィルムヒータは
ニクロム線を有しそして完全に平らであることができる
ので、フィルムヒータ156中の表面の不規則性を補償
するという追加の機能を有する。
【0067】はがね板154およびエポキシ樹脂フォー
ム160の目的は、ばね150および152からの力を
シリコーンゴムのパッド158およびマルチゾーンのフ
ィルムヒータ156に伝えて、フィルムヒータを出来る
だけ同一平面の嵌合で試料ブロックの底表面に圧縮する
ことである。エポキシ樹脂フォームは剛性であって、ば
ねの力の下に破壊しないが、すぐれた絶縁体でありそし
て低い熱的質量を有する、すなわち、密でない構造であ
るべきである。1つの実施態様において、フォーム16
0は商標ECKOフォームで製造されている。他の実施
態様において、他の構造体をシリコーンゴム層158お
よび/またはエポキシ樹脂フォーム層160の代わりに
使用することができる。例えば、剛性のハネカム構造
体、例えば、航空機の構成に使用する構造体を圧力板1
54とフィルムヒータ156との間にそれらの間に絶縁
層を配置させて配置することができる。層158および
160のためにどんな構造体を使用しても、構造体は試
料ブロック12が加熱されている間にそのブロックから
実質的な量の熱を吸収してはならず、そして試料ブロッ
ク12が冷却されている間に、そのブロックに実質的な
量を移動させてはならない。しかしながら、その取り囲
む構造体からのブロックの完全な隔離は事実上不可能で
ある。試料ブロック12と接触して、試料ブロックをそ
の環境から出来るだけ多く隔離して、そのブロックの熱
的質量を最小しかつ試料ブロックおよびその中に貯蔵さ
れた試料混合物の急速な温度変化を可能とする、別の構
造体を設計するための努力をすべきである。
【0068】試料ブロックの温度の正確な制御は、図9
におけるマルチゾーンフィルムヒータ156により試料
ブロックへ供給される熱の量を制御することによって、
図1においてCPU20により達成される。フィルムヒ
ータはパルス幅の変調の変更された形を使用して推進さ
れる。第1に、電力ラインからの120ボルトの波形を
整流して、同一極性のハーフサイクルのみを保存する。
次いで、各ハーフサイクルの部分をフィルムヒータの適
当なゾーンにゲートし、フィルムヒータの種々のゾーン
へ加えられる各ハーフサイクルの百分率はCPU20に
より制御される。
【0069】図10はフィルムヒータ156についての
電力制御の概念の1つの実施態様を示す。図10は供給
ライン電圧の電圧波形の線図である。ネガティブハーフ
サイクル162を排除する整流が起こる。ポジティブハ
ーフサイクルのみが残り、そのハーフサイクル164は
典型的である。次いで、CPU20およびその関連する
周辺電子回路は、フィルムヒータ156の種々のゾーン
へ加えられる各ハーフサイクルの部分を、各ゾーンにつ
いて下に記載する方程式に基づいて各ゾーンについて計
算した電力レベルに従い、加える各ハーフサイクルの部
分を選択することによって制御する。すなわち、分割線
166は時間軸に沿って前後に動いて、各ゾーンについ
て特別の方程式において関係づけられる因子の数に基づ
いて、フィルムヒータへの電力の量を制御する。ポジテ
ィブのハーフサイクル164の下の斜線区域は、分割線
166の示した位置についてフィルムヒータ156へ加
えられた量を表す。分割線166が右に動くとき、より
多くの電力がフィルムヒータへ加えられ、そして試料ブ
ロック12はより熱くなる。分割線が時間軸に沿って左
に動くとき、斜線区域はより小さくなり、そしてより少
ない電力がフィルムヒータに加えられる。CPU20お
よびその関連するソフトウェアおよび周辺回路がブロッ
ク12の温度を制御する方法を、より詳細に下に記載す
る。
【0070】フィルムヒータへ供給される電力の量は、
0から600ワットに連続的変化することができる。他
の実施態様において、フィルムヒータ156へ供給され
る電力の量は、他の機構、例えば、DCフィルムヒータ
を通る電流またはそれに加えられる電圧等のコンピュー
タ制御を使用して、あるいは下に記載する交差スイッチ
機構により制御することができる。
【0071】他の実施態様において、試料ブロック12
の加熱制御は、試料ブロック12の金属を通して形成さ
れる加熱制御チャンネルを通してゲートされる、熱い気
体または液体の流速および/または温度について実施す
ることができる。もちろん、このような他の実施態様に
おいて、ブロック中の試料ウェルの数を減少しなくては
ならないであろう。なぜなら、図2〜図8に示す試料ブ
ロック12中の追加の加熱チャンネルのための余地が存
在しないからである。このような他の実施態様は、例え
ば、すべての他のウェルを除去して試料ブロック中の加
熱チャンネルのための余地をつくる場合、96ウェルの
マイクロタイタープレートのフォーマットと適合性であ
ることができる。これは適合性をこのようなマイクロタ
イタープレートの寸法に関してのみ提供し、そして96
の異なる試料の同時の処理に関して提供しない。これら
の他の実施態様において局所的バランスおよび局所的対
称性を保存するために注意しなくてはならない。
【0072】ここに記載する実施態様において、フィル
ムヒータを経てブロックに供給できる最大の電力は11
00ワットである。この制限はブロック/ヒータのイン
タフェースの熱伝導性から生ずる。実験において、フィ
ルムヒータ156へのほぼ1100ワットより多い供給
は装置の自己破壊をしばしば引き起こすことが発見され
た。
【0073】ブロック温度を標的のインキュベーション
温度またはその付近への加熱または冷却のための典型的
な電力は、±50ワットの範囲内である。図11を参照
すると、典型的なPCRプロトコルの時間対温度のプロ
ットが示されている。ブロック温度の大きい下向きの変
化は、冷却された冷却液をランプ冷却チャンネルを通し
てゲートすると同時に図1において温度センサー21に
より試料ブロックの温度をモニターすることによって達
成される。典型的には、これらの下向きの温度変化は、
ランプの間に変性インキュベーション170後ハイブリ
ダイゼーションインキュベーション172の温度に対し
て実施される。典型的には、ユーザは、ランプのレグお
よびインキュベーションのレグの間の円形の交差により
記号化されたチェックポイントの温度/時間の平面上の
位置をCPU20に対して記載するために、1つの方法
または他の方法において、温度および時間を定めること
によってプロトコルを特定しなくてはならない。一般
に、インキュベーションのレグは参照数字170,17
2および174でマークし、そしてランプは参照番号1
76,178および180でマークする。一般に、イン
キュベーションの間隔は単一の温度において実施される
が、別の実施態様において、それらは含まれるPCRサ
イクルの特定の部分を実施するために許容されうる温度
範囲内の異なる温度に対して、段階的であるか、あるい
は連続的に勾配をなすことができる。すなわち、変性イ
ンキュベーション170は図11に示すように1つの温
度において実施する必要はないが、変性のために許容さ
れうる温度範囲内の複数の異なる温度のいずれにおいて
も実施することができる。ある実施態様において、ユー
ザはランプセグメント176,178および180の長
さを特定することができる。他の実施態様において、ユ
ーザは各インキュベーション間隔の1または2以上の温
度および期間のみを特定することができ、次いで計器は
1つのインキュベーションの完結および他のインキュベ
ーションの開始のときインキュベーション時間の間に出
来るだけ急速に試料ブロックの温度を動かす。好ましい
実施態様において、ユーザは、また、各サイクルするた
めの異なるか、あるいはすべてのサイクルについて自動
的に増加する温度および/またはインキュベーション時
間を有することができる。
【0074】95℃の変性インキュベーションから35
℃のハイブリダイゼーションインキュベーションへの転
移の間のランプ冷却の平均電力は、典型的には1キロワ
ットより大きい。これは、ブロック温度が操作範囲の高
い端にあるとき、ほぼ4〜6℃/秒、そしてブロック温
度が操作範囲の低い端であるとき、ほぼ2℃/秒の試料
ブロックの温度変化を生ずる。一般に、ランプ冷却のた
めに出来るだけ高い冷却速度を有することが望ましい。
【0075】ランプ冷却の間に試料ブロックから非常に
多くの熱が除去されるので、ランプ冷却チャンネルの1
つの端から他の端への試料ブロックを横切る温度勾配が
発生することがある。これを防止しかつこれらの型の温
度勾配を最小とするために、ランプ冷却チャンネルは方
向的に交錯している。すなわち、図3において、ランプ
冷却チャンネル100,102,104および106を
通る冷却液の流れの方向は、これらのランプ冷却チャン
ネルの孔の内側においてxで記号化されたページの中に
入る。交錯するランプ冷却チャンネル101,103,
105および107中のランプ冷却の液体の流れは、こ
れらのランプ冷却チャンネルの孔の中心における単一の
点により記号化されたページの中から外に出る。ランプ
冷却チャンネルを通るこの交錯+高い流速は、そうでな
ければ非交錯の流れのパターンまたはより低い流速を使
用して起こることがある温度勾配を最小にする。なぜな
ら、チャンネルの熱い端と冷たい端との間の距離はより
小さくなるからである。より遅い流速は移動の最初のイ
ンチなどにおけるブロックから取られる熱の大部分また
はすべてを生じ、これはブロックの入力側はブロックの
出力側より低い温度であるであろうことを意味する。高
い流速はチャンネルに沿った温度勾配を最小にする。交
錯は1つの方向に走るチャンネルの熱い端がチャンネル
の冷たい端の間で「サンドイッチ」にされ、ここで流れ
が反対方向であることを意味する。これはチャンネルの
長さより小さい距離である。こうして、温度勾配を排除
するために熱が移動しなくてはならない距離が減少する
ので、温度勾配は減少される。これは、ランプチャンネ
ルがある試料を異なって加熱するが、他の試料をそのよ
うに加熱しない時間を有する前に急速に排除しなくては
ならないランプチャンネル中の冷却のために、形成する
温度勾配を引き起こす。交錯しないと、試料ブロックの
1つの側は他の側よりほぼ1℃熱いであろう。交錯は、
ほぼ15秒より小さい時間を生ずる温度勾配を消散す
る。
【0076】ブロックに添加またはそれから除去される
熱の量を推定するために、CPU20は図1における温
度センサー21を使用してブロック温度を測定し、そし
て図1におけるバス54に連結された図46における温
度センサー61により冷却液の温度を測定する。周囲空
気の温度は、また、図1における温度センサー56によ
り測定し、そしてバス52上でフィルムヒータに加えら
れる電力を制御する電力ラインは、また、測定される。
試料ブロックから周囲へのおよび試料ブロックから冷却
液への熱伝導は、システムの制御パラメータをセットす
るためにインキュベーションプロセスの間になした測定
の結果、CPU20へ知らされる。
【0077】試料の集団のすぐれた温度の均一性のため
に、ブロックは、一定温度において、正味の出入りする
熱の流れをもつことができない。しかしながら、温度勾
配は試料ブロック内で起こることがあり、熱いスポット
からブロックの境界関係してゼロの正味の熱移動を有す
る冷たいスポットへの熱の局所的流れから生ずる。例え
ば、1つの端で加熱されそして他の端において冷却され
る材料のスラブは、ブロックの中への熱の流れがゼロで
ある場合、一定の平均温度にある。しかしながら、この
場合において、有意の温度の不均一性、すなわち、温度
勾配は、熱いへりから冷たいへりへの次のために、スラ
ブ内で確立されることがある。ブロックのへりの加熱お
よび冷却が停止されるとき、熱いへりから冷たいへりへ
の熱の流れはこの温度勾配を究極的に消散し、そしてブ
ロックは熱の流れの開始のときの熱い温度と冷たい温度
との間の平均である均一な温度に全体を通じて到達す
る。
【0078】長さLの断面区域Aのスラブは均一な熱伝
導性を有しそして、熱源から熱の入る束Qinはヒートシ
ンクへの熱の出る流れQout と合致するので、スラブが
一定の平均温度に保持される場合、熱の流れから生ずる
定常状態の温度は、次の通りである: (1)デルタT=(Qin・L)/(A・K) ここで、 デルタT=温度勾配、 L=熱的通路の長さ、 A=熱的通路の面積、 K=通路を通る熱伝導性、である。
【0079】一般に、均一な熱伝導性の物質内で、温度
勾配は熱の流れ/単位面積に比例して確立される。こう
して、熱の流れおよび温度の不均一性は緊密に連結され
る。実際には、出入りする熱の流れが存在させないで試
料ブロックの温度を制御することは不可能である。冷た
いバイアス制御の冷却は、ブロック温度を安定な値に維
持するためにバイアス冷却チャンネルを通して流れる冷
却液により除去される熱をバランスさせるために、スト
リップヒータからの多少の熱の流入を必要とする。これ
らの条件下に均一な試料ブロックの温度に対して重要な
ことは、熱源とヒートシンクの「局所的バランス」およ
び「局所的対称性」を静力学的にかつ動力学的に有し、
そして熱いスポットから冷たいスポットへの熱の流れが
短い距離にわたって起こるように配置された、形状寸法
である。
【0080】簡単に述べると、「静止の局所的バラン
ス」の概念は、合計の熱入力が合計の熱出力に等しい一
定温度のブロックにおいて、明確な局所的領域内で、す
べての熱源がヒートシンクによりブロックを出入りする
熱の流れで完全にバランスされるように熱源およびヒー
トシンクが配置されていることを意味する。したがっ
て、各局所的領域は、隔離されると、一定温度に維持さ
れるであろう。
【0081】「静止の局所的対称性」の概念は、局所的
領域内で一定温度について、熱源の質量中心がヒートシ
ンクの質量中心と一致することを意味する。そうでない
場合、各局所的領域内で、各局所的領域を横切る温度勾
配は存在することができ、これは隣接する局所的領域に
おける温度勾配を添加し、これにより単一の局所的領域
の大きさの2倍である勾配を試料ブロックを横切って引
き起こす。なぜなら、各局所的領域内の局所的バランス
を通してさえ局所的対称性の欠如が存在するからであ
る。局所的バランスおよび局所的対称性の概念は、試料
ブロックの温度が、例えば、インキュベーション間隔の
間に、一定レベルに維持されている、静止の温度バラン
スの達成に対して重要である。
【0082】試料ブロック中の急速な温度変化が起こっ
ている動力学的場合について、各局所的領域の熱的質量
または容量は重要になる。なぜなら、各局所的領域にそ
の温度を変化するために流入しなくてはならない熱の量
はその領域の熱的質量に比例するからである。したがっ
て、静止の局所的バランスの概念は、局所的領域が合計
の熱源およびヒートシンクのx%を含む場合、それはま
た「動力学的局所的バランス」が存在するために熱的質
量のx%を含まなくてはならないことを必要とすること
によって、動力学的場合に拡張することができる。同様
に、「動力学的局所的対称性」は、熱容量の質量中心が
動力学的熱源およびヒートシンクの質量中心と一致する
ことを必要とする。簡単な用語でこれが意味すること
は、試料ブロックの熱的質量がその金属であり、そして
各局所的ゾーン内の金属の合計の質量が同一であるよう
に、試料ブロックの機械加工が対称であるかつバランス
されることである。さらに、各局所的ゾーンにおける金
属の質量中心は動力学的熱源およびヒートシンクの質量
中心と一致すべきである。こうして、マルチゾーンヒー
タの質量中心、すなわち、その幾何学的中心、およびラ
ンプ冷却チャンネルの幾何学的中心は一致しなくてはな
らない。図2〜図9の研究から、静力学的および動力学
的の局所的バランスおよび局所的対称性の両者が試料ブ
ロック12の中に存在することは、後述の説明から理解
されるであろう。
【0083】図12は、本発明の教示に従う試料ブロッ
ク12の設計のための並列する2つの局所的領域を示
す。図12において、2つの局所的領域200および2
02の境界はダッシュ線204,206および208で
マークされている。図12は、ガードバンドの中に存在
しない各局所的領域が、次の構成成分から構成されてい
ることを示す。すなわち、試料ウェルの2つの列;ヒー
タの合計の面積の1/8倍であるフォイルヒータ156
の部分;1つのランプ冷却チャンネル、例えば、ランプ
冷却チャンネル210および212;および、1つのバ
イアス冷却チャンネルである。局所的対称性を保存する
ために、各局所的領域はそのランプ冷却チャンネル上に
中心が存在し、そして各境界においてバイアス冷却チャ
ンネル上で1/2を有する。例えば、局所的領域200
はランプ冷却チャンネル210の上に中心を有し、そし
てバイアス冷却チャンネル214および216は、それ
ぞれ、局所的領域の境界204および206により切ら
れている。こうして、ランプ冷却チャンネルの質量中心
(その中心)は、バイアス冷却チャンネルの質量中心
(局所的領域の中心)および各局所的領域に連結するフ
ィルムヒータ部分の質量中心と一致する。CPU20が
フィルムヒータ156を推進して、ランプ冷却チャンネ
ルおよびバイアス冷却チャンネルにより除去されている
熱エネルギーの量に等しい熱エネルギーの量を入力する
とき、静力学的局所的バランスは存在するであろう。9
6の試料混合物が存在するブロックの中心部分の各局所
的領域は、全体の試料ブロックの合計の熱的質量のほぼ
1/8を含有し、ランプ冷却チャンネルの合計の数の1
/8を含有しそしてバイアス冷却チャンネルの合計の数
の1/8を含有するので、各局所的領域について動力学
的局所的バランスが存在する。各局所的領域の金属の質
量中心は、水平的に、局所的領域の下に横たわるフィル
ムヒータ部分の中心;ランプ冷却チャンネルの中心;お
よび、2つの半分のバイアス冷却チャンネルの質量中
心;と一致するので、動力学的局所的対称性は各線形回
帰について存在する。
【0084】静力学的および動力学的の局所的バランス
および局所的対称性として特徴づけられるこれらの物理
学的性質により、試料ブロックは、集団中のすべての試
料を、先行技術のサーマルサイクラーより非常にいっそ
う均一に加熱および冷却する。図2を参照すると、局所
的領域の境界の平面図が鎖線217〜225により示さ
れている。図2を見ると明らかなように、96の試料ウ
ェルの中央領域は境界218〜224により境界される
6つの隣接する領域に分割されている。さらに、2つの
ガードバンドおよび局所的領域が各へりに添加されてい
る。最もネガティブのx座標を有するへりの局所的領域
(局所的領域は時にはまた局所的ゾーンと呼ぶ)は、境
界線217および218により境界されている。最もポ
ジティブのx座標を有するへりの局所的領域は、境界線
224および225により境界されている。各局所的領
域は試料ウェルのカラムを含有しないが、ウェルのカラ
ムシミュレーションするみぞ78を含有することが認め
られる。みぞ78の深さおよび幅は、ウェルのカラムと
同一の金属質量を除去し、これにより動力学的局所的対
称性を多少保存ように設計されている。したがって、へ
りの局所的ゾーン試料ブロックの中央部分における6つ
の局所的ゾーンと熱的質量が異なる(それらは、また、
外部の接続、例えば、マニホールドおよび支持ピンによ
り追加の熱的質量を有する)。この差は、へりの局所的
ゾーンまたはガードバンドを前記マルチゾーンヒータの
別々に制御可能なゾーンで加熱し、こうしてブロックの
中央ゾーンより多くのエネルギーをガードバンドの中に
入れることができるようにして、説明される。
【0085】ブロックの各へりにおける局所的領域は、
6つの中央に位置する局所的領域の熱的性質に近似する
が、それと正確に合致しない。へりの局所的領域は、試
料ブロック12の周辺の回りを走るガードバンドを完結
するので、「ガードバンド」領域と呼ぶ。このガードバ
ンドの目的は、試料ブロック12に機械的に添付しなく
てはならない支持ピン、マニホールド、ドリップカラー
および他の装置のようなものによって、ブロックへの機
械的接続部の中に本来埋め込まれる、制御されないヒー
トシンクおよび熱源から、96の試料ウェルを含有する
試料ブロックの中央部分をある程度熱的に絶縁すること
である。例えば、図2において、試料ブロックのへりの
表面228および230は、ランプ冷却チャンネルおよ
びバイアス冷却チャンネルを出入りする冷却液を運ぶプ
ラスチックのマニホールドを取り付けて有する。へり2
28および230に沿ったガードバンドは、へり228
および230に対して並列でありかつそれに最も近くに
存在するスロット78の部分から成る。みぞ78の深さ
は、みぞの底がバイアス冷却チャンネルおよびランプ冷
却チャンネルの周辺に、それらを実際に交差させないで
可能であるように、密接するような深さである。この深
さと結合するみぞ78の幅は、図2における点82およ
び232の間のスロット78により除去される金属の体
積が、試料ウェル234で出発しそして試料ウェル83
で終わる試料ウェルの隣接する列により除去される金属
の体積にほぼ等しいような幅である。また、試料ウェル
の周期的パターンが各方向においてウェルの1つの列ま
たはカラムにより延長される場合、このような試料ウェ
ルの追加の列が存在する所に、ブロックの回りのスロッ
ト78はほぼ位置する。
【0086】支持接続が試料ブロックについて作られて
いるへり250および252に沿って、ガードバンドの
局所的領域は、スロット78の部分に加えて、全長のい
くつかの冷却チャンネルを含有する。図3を参照する
と、これらは次のものを含む:隣接する局所的領域の隣
接する1/2のバイアス冷却チャンネルとともに没入し
て全体のバイアス冷却チャンネルを形成するバイアス冷
却チャンネルの1/2(例えば、92);ランプ冷却チ
ャンネル(例えば、100);および全体のバイアス冷
却チャンネル(例えば、91)。へり250におけるへ
りの局所的領域について、これらの冷却チャンネルは1
07,198および99である。
【0087】ガードバンドにおける全体のバイアス冷却
チャンネルは、ブロックのへりから内方にわずかに変位
している。これらの全体のバイアス冷却チャンネルを使
用する理由は、「半分の」冷却チャンネルの構成が実際
的ではないことである。バイアス冷却チャンネルはこの
ような厚い壁をもつゴムのライニングを必要とするの
で、「半分の」バイアス冷却チャンネルのライニングを
通る孔を信頼性をもって開いて保持することは困難であ
ろう。へりの局所的領域におけるこの非対称性はへりの
ガードバンドの局所的領域から冷却液へ熱の小さい過剰
の損失を引き起こすが、それは試料ウェルを含有する試
料ブロックの中央領域から十分に離れているので、試料
温度の不均一性へのその寄与は小さい。また、この小さ
い非対称性の温度の影響を予測可能であるので、この作
用は各ガードバンドの下でマルチゾーンヒータシステム
の別々に制御可能なゾーンを使用することによってさら
に最小にすることができる。
【0088】図13を参照すると、図9におけるフィル
ムヒータ層156内に3つの別々に制御されるゾーンが
存在する。これらの別々に制御されるゾーンは、支持ブ
ラケット148に連結された試料ブロック12の露出し
たへりにガードバンドの下に位置する、へりのヒータの
ゾーンを含む。冷却液のマニホールドに取り付けられた
へり228および230のためのガードバンドの下に位
置する、別々に制御されるマニホールドのヒータゾーン
が、また、存在する。最後に、試料ウェルの下に横たわ
る中央ヒータゾーンが存在する。これらのゾーンの各々
に加えられる電力は、CPU20および制御ソフトウェ
アにより別々に制御される。
【0089】フィルムヒータ156は、金属合金、例え
ば、インコネル(登録商標)の薄い板をエッチングする
ことによって形成された、導電体のパターンから構成さ
れる。選択した金属合金は、高い電気抵抗およびすぐれ
た耐熱性を有すべきである。そのようにエッチングされ
た導電体のパターンは、電気絶縁性ポリマー材料、例え
ば、カプトン(登録商標)の薄いシートの間に結合され
る。電気抵抗加熱要素を絶縁するためにどの材料を使用
しても、この材料は高温に対する抵抗、高い静電強さお
よびすぐれた機械的安定性をもたなくてはならない。
【0090】フィルムヒータの中央ゾーン254は、ガ
ードバンドの内側の試料ブロックの中央部分とほぼ同一
の寸法を有する。中央部分254は均一な電力密度を試
料ウェル区域に供給する。へりヒータ領域256および
258は、へりガードバンドとほぼ同一の幅を有する
が、それほど長くない。
【0091】マニホールドのヒータ領域260および2
62は、図2においてへり228および230について
のガードバンドの下に横たわる。マニホールドのヒータ
ゾーン260および262は、電気的に一緒に接続し
て、1つの別々に制御可能なヒータゾーンを形成する。
また、されたヒータ区画256および258は電気的に
一緒に連結して、第2の別々に制御可能なヒータゾーン
を形成する。第3の別々に制御可能なヒータゾーンは中
央区画254である。これらの3つの別々に制御可能な
ヒータゾーンの各々は別の電気リード線を有し、そして
各ゾーンは別のマイクロプロセッサまたは好ましい実施
態様において実施されるような共有されるCPU20で
実行することができる、別の制御アルゴリズムにより制
御される。
【0092】へりヒータゾーン256および258は、
支持ブラケットへの熱損失を補償するために推進され
る。この熱損失は、試料ブロック12とそれを取り囲む
周囲空気との間の温度差に対して比例する。へりヒータ
ゾーン256および258は、また、試料ブロックから
ブロックの各へりにおける完全なバイアス冷却チャンネ
ルへの過剰の熱損失を補償する。この熱損失は、試料ブ
ロック12とこれらのバイアス冷却チャンネルを通して
流れる冷却液との間の温度差に対して比例する。
【0093】マニホールドのヒータ区画260および2
62は、また、試料ブロック12のへりに取り付けられ
た、図13におけるプラスチックの冷却液マニホールド
266および268への熱損失を補償するために推進さ
れる。マニホールドのヒータ区画260および262の
ための電力は、試料ブロックと冷却液との間の温度差に
主として、そして試料ブロックと周囲空気との間の温度
差に少ない程度に、比例する熱損失を補償する。
【0094】実際的理由で、中央のヒータ区画254の
上に横たわる試料ウェルを包含する局所的領域の熱的質
量と、ガードバンドの局所的領域の熱的質量と合致させ
ることは不可能である。例えば、プラスチックの冷却液
マニホールド266および268はガードバンドから離
れる方向に熱を伝えるばかりでなく、かつまたある量の
熱的質量をそれらが取り付けられたガードバンドの局所
的領域に添加する。その結果、急速なブロック温度が変
化する間に、ガードバンドの温度の上下の速度は試料ウ
ェルの局所的領域のそれに正確に合致しない。これはガ
ードバンドと試料ウェルとの間の動力学的温度勾配を発
生し、これは大きくさせると、許容されうるより長い時
間持続することがあるであろう。この温度勾配の作用
は、ブロック温度の変化速度に対しておおよそ比例し、
そしてブロック温度の変化速度に対して比例する速度で
各ガードバンドの局所的ゾーンから熱を添加または除去
することによって最小にされる。
【0095】ガードバンドのゾーンについての比例定数
は、システムの設計の比較的安定な性質であり、そして
プロトタイプについての加工の測定値により決定され
る。比例定数についての値は、方程式(3)〜(5)の
項の定義に関して下に記載する。これらの方程式は、別
の実施態様における、それぞれ、マニホールドヒータゾ
ーンに加えられる電力の量、ヒータゾーンのへりおよび
中央ゾーンを決定する。好ましい実施態様において使用
する方程式は、ソフトウェア(方程式(46)〜(4
8)、区域により分布された電力)の説明において下に
記載する。 (3)Pm =Am P+KM1(TBLK −TAMB )+K
M2(TBLK −TCOOL)+KM3(dtBLK /dt) ここで、 Pm =マニホールドヒータゾーン260および262に
供給された電力、 Am =マニホールドヒータゾーンの領域 P=ブロック温度をPCR熱サイクルのプロトコルにお
いて任意の特定の時間において所望の温度に止まらせる
か、あるいはそれに動かせるために必要な電力、 KM1=0ワット/°Kに等しい、マニホールドを通る周
囲への過剰の熱損失を補償するために実験的に決定した
比例定数、 KM2=0.4ワット/°Kに等しい、冷却液への過剰の
熱損失を補償するために実験的に決定した比例定数、 KM3=66.6ワット−秒/°Kに等しい、プラスチッ
クのマニホールドなどにより引き起こされるマニホール
ドのへりのガードバンドの追加の熱的質量を補償するた
めの余分の電力を提供する実験的に決定した比例定数、 TBLK =試料ブロック12の温度、 TAMB =周囲空気の温度、 TCOOL=冷却液の温度、 dtBLK /dt=試料ブロックの温度変化/単位時間、 (4)PE =AE P+KE1(TBLK −TAMB )+K
E2(TBLK −TCOOL)+KM3(dtBLK /dt) ここで、 PE =へりヒータゾーンに加えるべき電力、 AE =へりヒータゾーンの領域、 KE1=0.5ワット/°Kに等しい、マニホールドを通
る周囲への過剰の熱損失を補償するために実験的に決定
した比例定数、 KE2=0.15ワット/°Kに等しい、冷却液への過剰
の熱損失を補償するために実験的に決定した比例定数、 KE3=15.4ワット−秒/°Kに等しい、支持ピンお
よびブラケット、温度センサーなどへの試料ブロック1
2の取り付けにより引き起こされる露出されたガードバ
ンドの追加の熱的質量を補償するための余分の電力を提
供する実験的に決定した比例定数、 (5) PC =AC P ここで、 PC =マルチゾーンヒータの中央ゾーン254に加える
べき電力、 AC =中央ゾーン254の領域。
【0096】方程式(3)〜(5)の各々において、電
力の項Pは変数であり、これは図1においてCPU20
により実行される制御アルゴリズムの部分により計算さ
れ、この部分はユーザが定めた設定点を読みそして、次
に、ユーザが記憶装置に記憶させた時間および温度の設
定点により定められるPCR温度のプロトコルを実行す
るために適切な温度に試料ブロック温度を止まらせる
か、あるいはそれにさせるために何を実施するかを決定
する。設定点を読みそして電力密度を計算する方法は、
下に詳細に記載する。
【0097】図1のCPU20により実行される制御ア
ルゴリズムは、図1および図9において温度センサー2
1および図1においてバス52を経て、試料ブロックの
温度を感知する。この温度を異ならせて、試料ブロック
12の温度変化速度を推進する。次いで、CPUは図1
において温度センサー56を経て周囲空気の温度を測定
し、そして図46に示す冷却液制御システム24中の温
度センサー61を経て冷却液の温度を測定する。次い
で、CPU20は実行されているPCRプロトコルの特
定のセグメントに相当する電力ファクターを計算し、そ
して3つの計算を方程式(3),(4)および(5)に
従い、すべての測定した温度、比例定数(これらは持久
記憶装置に記憶される)、制御プログラムおよび種々の
ヒータゾーンの区域の特定の相互作用についての電力フ
ァクターP(これらは持久記憶装置に記憶される)を差
し込むことによってなされる。電力ファクターは、ブロ
ック温度をその電流レベルから設定点を経てユーザが特
定した温度レベルに動かすために必要な合計の電力であ
る。加熱および冷却を制御するためにCPUが実施する
計算についてのさらに詳細は、制御ソフトウェア「PI
Dタスク」の説明において下に記載する。
【0098】ヒータ156の3つのゾーンの各に加える
べき要求される電力を計算した後、いくつかの実施態様
において各ゾーンへ加えるべき入力電力の各ハーフサイ
クルの比率に関する、他の計算を行う。下に記載する好
ましい実施態様において、計算のモードは、200ミリ
秒の試料の期間の間に起こるハーフサイクルの合計の数
のどれだけ多くのハーフサイクルを各ゾーンに加えるべ
きかである。このプロセスは、図47および図48、お
よび制御ソフトウェアの「PIDタスク」の説明に関し
て下に記載する。図10に示す別の実施態様において、
コンピュータは各ゾーンについて図10における分割線
166の位置を計算する。この計算を実施した後、適当
な制御信号を発生して、マルチゾーンヒータ156につ
いて電力供給を適当なスイッチさせて、各について計算
した量の電力を各ゾーンに加えるようにする。
【0099】他の実施態様において、全体の試料ブロッ
クに均一な電力密度を供給する単一のフィルムヒータ、
およびガードバンドについて個々に1つのみのゾーンを
もつ1または2つのマルチゾーンヒータを使用して、マ
ルチゾーンヒータを実行することができる。これらの追
加のヒータを、全体の試料ブロックをカバーする単一の
フィルムヒータの上に重ねる。このような実施態様にお
いて、ガードバンドの損失の構成に必要な電力のみを追
加のヒータゾーンに加える。
【0100】方程式(3)〜(5)における電力ファク
ターPは、ユーザが特定した設定点およびランプ時間に
基づくPCR温度プロトコル上の種々の点についてCP
U20により計算される。しかしながら、前述のゾーン
ヒータの最大の電力供給能力に基づいて制限が付与され
る。方程式(3)〜(5)中の比例定数は、すぐれた温
度の均一性のためのガードバンドにおける過剰の熱損失
を適切に補償するために、適切にセットしなくてはなら
ない。
【0101】図17を参照すると、ブロック温度の段階
的変化に応答して、試料ブロックの温度を実質的に低い
温度からほぼ94℃の変性インキュベーションの標的温
度に向けて上昇させる、複数の異なる試料について計算
した試料温度の間の差のグラフが示されている。図17
は、マルチゾーンヒータ156が方程式(3)〜(5)
について項の定義において前述の比例定数を使用して適
切に管理されるとき、計算した試料液体の温度を示す。
図17のグラフを誘導するために使用した種々のウェル
は、単一の文字および数の組み合わせがその上に示され
ている。図2を示す8×12のウェル列は、文字を付し
たカラムおよび番号を付した列によりコード化されてい
る。こうして、例えば、試料ウェル90はまた試料ウェ
ルA12と表示されているが、試料ウェル89はまた試
料ウェルB12と表示されている。同様に、試料ウェル
68はまた試料ウェルD6などと表示されている。ここ
に記載する温度勾配を排除に対する全体の熱的設計をも
つため、ウェル温度は互いのほぼ0.5℃範囲内にある
温度に漸近的に落着くことが理解されるであろう。
【0102】上の記載は試料ブロックの温度を均一に制
御し、そして急速に変化させることができる方法を説明
する。しかしながら、PCRプロセスにおいて、プログ
ラミングすべきであるのは試料反応混合物の温度であっ
て、ブロック温度ではない。本発明の教示に従う好まし
い実施態様において、ユーザは試料液体それ自体につい
ての標的温度の順序を特定し、そしてPCRプロセスに
おける各段階についてこれらの標的温度の各々における
試料液体のためのインキュベーション時間を特定する。
次いで、CPU20は試料ブロックの温度を管理して試
料の反応混合物を特定した標的インキュベーション温度
にし、そして試料混合物をそれらの標的温度に特定した
時間の間保持する。CPU20により実行されるユーザ
のインタフェースのコードは、このプロセスのすべての
段階において、端末16のディスプレー上に現在の計算
した試料液体の温度を表示する。
【0103】実際の測定した試料温度を表示する困難
は、反応混合物の実際の温度の測定が温度測定プローブ
をその中に挿入することを必要とすることである。プロ
ーブの熱的質量はそれを配置したウェルの温度を有意に
変更することがある。なぜなら、任意の特定のウェル中
の試料の反応混合物はしばしば体積がわずかに100μ
lであるからである。こうして、反応混合物の中への温
度プローブの単なる挿入は、反応混合物と付近の混合物
との間に温度勾配を存在させることがある。温度センサ
ーの余分な熱的質量はそれを浸漬した反応混合物の温度
を、小さい熱的質量を有する他のウェル中の反応混合物
の温度から、低下させるので、誤差は温度を測定しよう
と単に試みることによって増幅を生ずることができる。
【0104】したがって、ここに記載する計器は既知の
因子、例えば、ブロック温度の履歴およびシステムの熱
的時間の定数から試料温度を計算し、そしてディスプレ
ー上にこの試料温度を表示する。試料管を試料ウェルの
中に少なくとも最小の限界力Fで下にプレスする場合、
好ましい実施態様において使用した試料管の大きさおよ
び形状およびほぼ100μlの試料体積について、熱的
に推進される対流は試料の反応混合物内で起こりそして
このシステムは熱的に単一の時間一定の直線のシステム
の熱的に類似して作用することが、ここに記載するシス
テムについて実験的に発見された。実験において、各試
料管はほぼ50gの力ですぐれたウェル−壁−対−流体
の熱伝導性についてウェル対ウェルについて押し下げな
くてはならないことが示された。下に記載する加熱され
た定盤を各試料管上に約100gの力で押し下げるよう
に設計される。図15において力ベクトルFで記号化さ
れた、この最小の力は、試料ブロックにおける変形試料
管と種々の試料ウェルとの間のような外部の寸法のわず
かの差に無関係に、すべての試料管がすべりばめおよび
同一平面の嵌合を各管について保証し、均一な熱伝導性
を保証するために十分な力で押し下げされることを確保
するために必要である。対応する試料ウェルにおいてゆ
るい嵌合のある試料管および緊密な嵌合のある試料管を
有する設計は、熱伝導性が不均一であるために、すべて
の管について厳密な温度制御を達成することができない
であろう。不十分なレベルの力Fは、図14に286で
示すようにブロック温度の段階的変化に対する試料液体
の温度の応答を生ずる。適切なレベルの力Fは282に
示す温度の応答を生ずる。
【0105】本発明の教示に従い構成された装置により
達成される結果は、各試料混合物の温度が新しい温度へ
の転移の間に、あたかも試料が物理的よく混合されるよ
うに、挙動することである。事実、各試料混合物の中に
引き起こされた対流のために、各試料管中の試料の反応
混合物はより混合されている。驚くべき結果は、全体の
システムの熱的挙動が、ブロック温度と試料温度との間
の差の減衰の半減期の約1.44倍である9秒の単一の
時間定数をもつ、電気RC回路に似るということであ
る。50mlの試料を充填したジェネアンプ(登録商標)
の試料管は、約23秒の時間定数を有する。換言する
と、試料ブロックの温度の上方の変化の間、反応混合物
の温度は、電圧源Vの電圧出力の段階的変化に応答す
る、図16Dに示すような直列のRC電気回路中のコン
デンサC上の電圧の上昇に似たように作用する。これら
の概念を説明するために、ブロック温度の段階的変化に
対する試料液体の異なる応答を示す図14および試料ウ
ェル/試料管の組み合わせを通る断面を示す図15を参
照する。実験において、試料液体276の体積がほぼ1
00μlであり、そしてメニスカス278が試料ブロッ
ク12の上部表面280より下に位置するような寸法を
管がもち、そして試料管を試料ウェルの中に押し下げる
力Fが少なくとも30gであるとき、図15に示すシス
テムの熱的時間定数τ(タウ)は0.009インチ
(0.23mm)(寸法A)の円錐形区画における試料管
壁厚さについてほぼ9秒であることが発見された。ま
た、実験において、3つの条件について、熱的時間定数
τは試料管の切頭体(円錐)についての壁厚さの0.0
01インチ毎について約1秒だけ変化であることが発見
された。ここで述べる壁の薄い試料管は、20〜100
マイクロタイターの試料を収容する際に、約5〜14秒
の熱時間定数を有することがわかっている。より厚い管
壁は、試料ブロックの温度の変化と試料液体温度の生ず
る変化との間の、より長い時間定数およびより多い遅れ
を生ずることが発見された。
【0106】数学的に、試料ブロックの温度変化に対す
る試料液体温度の熱的応答について式は、次の通りであ
る: (6) Tsample=ΔT(1−e-t/ τ) ここで、 Tsample=試料液体の温度、 ΔT=試料ブロック12の温度と試料液体の温度との間
の温度差、 t=経過時間、 τ=システムの熱的時間定数、または試料ウェルの壁か
ら試料液体への熱伝導性で割った試料の熱容量。
【0107】図14において、曲線282は、試料管を
押し下げる力Fが十分に高いとき、試料ブロック温度の
理論的段階的変化に対するこの指数の温度の応答を表
す。試料ブロックの温度の段階的変化は関数284とし
て示されており、時間T1 において開始する温度の急速
な上昇が存在する。試料液体の温度は段階的変化に応答
して指数的に増加し、そして最終の試料ブロック温度に
慚近的に近付く方法に注意すべきである。簡単に前述し
たように、曲線286は、図15における下向きの配置
力Fが試料管の円錐と試料ウェルの壁290との間の同
一平面のすべりばめを引き起こすために不十分であると
きの、熱的応答を表す。一般に、力Fが30gより小さ
い場合、曲線286の熱的応答は生ずるであろう。図1
5は明瞭のために試料管の円錐と試料ウェルの壁との間
の空気の小さい層を示すが、空気はすぐれた絶縁体であ
りそしてこのシステムの熱的時間定数を実質的に増加す
るであろうので、これは所望の場合の正確に反対であ
る。
【0108】熱的時間定数τは直列のRC回路における
RC時間定数に類似し、ここでRは試料ウェルの壁と試
料液体との間の熱的抵抗に相当し、そしてCは試料液体
の熱容量である。熱的抵抗は、単位ワット−秒/°Kで
表される熱伝導性の逆数である。図15において試料液
体の中に示す対流の流れ292のために、反応混合物中
のすべての場所で、試料液体は同一温度に非常に近くに
あり、そしてブロックと試料との間の熱の流れは試料ブ
ロックと試料の反応混合物との間の温度差に非常に近く
に比例する。比例定数は、試料ブロック12中の試料ウ
ェルの壁と反応混合物との間の熱伝導性である。異なる
試料体積または異なる管、すなわち、異なる壁厚さまた
は材料について、熱的時間定数は異なる。このような場
合において、ユーザはPCRプロトコルの彼の規格の一
部分として、試料の体積または管の型を入れることがで
き、そして機械は試料温度を計算するとき使用する正し
い熱的時間定数を自動的に見るであろう。ある実施態様
において、ユーザは実際の時間定数を入れることがで
き、そして機械は試料温度の温度の計算にそれを使用す
るであろう。
【0109】熱的時間定数を出来るだけ小さく保持する
ために、試料管の円錐形壁は出来るだけ薄くあるべきで
ある。好ましい実施態様において、これらの円錐形壁は
0.009インチ(0.23mm)の厚さであるが、試料
管の円筒形部分の壁は0.030(0.76mm)の厚さ
である。試料管の円錐形の形状は、試料混合物の体積に
関して、試料ウェルの壁の金属との接触表面積を比較的
大きくする。
【0110】試料管の成形は、4つの試料管が各射出で
成形されるような、「常温ランナー」システムおよび4
つのキャビティを使用して実施される。成形されたプラ
スチックは、残りのプラスチックが試料管の先端と試料
ウェルの先端との間のキャビティ291の中に突起する
ように、試料管の円錐の先端で射出される。これは残部
のプラスチックが管とウェルとの間の同一平面の嵌合を
妨害するのを防止する。0.030インチ(0.76m
m)の最小限界を残部のプラスチックの大きさに置く。
【0111】種々の実施態様において、各々が異なる利
点をもつ3つの異なる等級のポリプロピレンを使用でき
る。好ましいポリプロピレンはヒモント(Himon
t)からのPD701である。なぜなら、それはオート
クレーブ処理可能であるからである。しかしながら、こ
のプラスチックは低いメルトインデックスをもつので、
成形が困難である。このプラスチックは35のメルトイ
ンデックスおよび9の分子密度を有する。PD701は
ばりを残す傾向があり、そして多少斑点がある品質の部
分をつくるが、現在実施されているように円錐形区画の
先端における代わりに、成形物の厚い壁の部分に射出成
形した場合、よりよく働く。一般に、成形容易のために
高いメルトインデックスを有するが、すぐれた強さ維持
しかつ260°Kにおけるオートクレーブ処理の熱スト
レスの下でひび割れまたは割れを防止するために、ま
た、高い分子密度を有することが望ましい。他のプラス
チック、アメリカン・ヘスヒト(American Hoescht)か
らのPPW1780は、75のメルトインデックスおよ
び9の分子密度を有し、そしてオートクレーブ処理可能
である。ある実施態様において使用できる他のプラスチ
ックはヒモント(Himont)444である。このプ
ラスチックはオートクレーブ処理可能ではなく、そして
他の方法で滅菌することが必要である。
【0112】他の実施態様において、溶融したプラスチ
ックの温度が型のちょうどゲートまで制御される場合、
管は「ホットランナー」または「ホットノズル」システ
ムを使用して成形できる。また、ある実施態様におい
て、多数のゲートを使用できる。しかしながら、これら
の技術のいずれも、充填の時間において、現在使用する
「常温ランナー」システムよりすぐれることが実験的に
証明された。
【0113】このシステムは単一の時間定数のRC回路
のように熱的に作用するという事実は重要結果である。
なぜなら、それは試料ブロックから試料の反応混合物へ
の熱伝導性は既知でありかつ均一である場合、試料混合
物の熱的応答は既知でありかつ均一であることを意味す
るからである。試料の反応混合物の熱容量は既知であり
かつ一定であるので、試料の反応混合物の温度はブロッ
ク温度の経時的に測定した履歴のみを使用して正確に計
算することができる。これは試料温度を測定する必要性
を排除し、これにより無視できない熱的質量をもつプロ
ーブを試料ウェルの中に入れて試料温度を直接測定し、
これによりプロービングしたウェル中の試料の熱的質量
を変化させる誤差および困難を排除する。
【0114】この計算を行うアルゴリズムは、単一の温
度定数の直列のRC電気回路のようにシステムの熱的挙
動を作る。このモデルは、液体試料の熱容量/試料ブロ
ックから試料の反応混合物への熱伝導性の比を使用す
る。試料の反応混合物の熱容量は、低い比熱×液体の質
量に等しい。耐熱性は1/試料ブロックから試料管壁を
通る液体反応混合物への熱伝導性に等しい。熱容量/熱
伝導性の比は一致した単位で表すとき、それは時間の次
元を有する。固定した試料体積および試料の組成、それ
らの両者はすべての試料ウェルにおいて同一である、お
よび固定した熱伝導性について、その比は、また、すべ
ての試料ウェルについて一定であり、そしてそのシステ
ムの熱的時間定数と呼ばれる。それは、ブロック温度の
急激な段階的変化後、試料温度がブロック温度の36.
8%以内に来るために要する時間である。
【0115】システムのインパルスの応答が知られてい
る場合、フィルターまたは他の直線のシステムの出力応
答を計算することができるということを支持する、電子
回路の分析において使用される数学的理論が存在する。
このインパルスの応答は、また、移動関数として知られ
ている。直列RC回路の場合において、インパルスの応
答は図16Aに示すように指数関数である。図16Aの
応答を生ずるインパルスの刺激は図16Bに示されてい
る通りである。このような直線のシステムの出力応答は
入力信号のたたみ込みおよび重み関数を計算することに
よって決定することができ、ここで重み関数は時間を逆
転したシステムのインパルス応答である、ことを前述の
数学的理論的は支持する。たたみ込みはそうでなければ
連続加重平均として知られているが、たたみ込みは初期
に小さい段階的大きさをもつ微分積分学における1つの
概念であるが、連続加重平均明確な段階的大きさ、すな
わち、多数の試料を有する。図16Dに示す直列RC回
路のインパルス応答は次のようなものである。すなわ
ち、電圧発生器Vの電圧が図16Bに示すような電圧の
スパイクで急激に上下するとき、コンデンサーC上の電
圧は図16Aにおいて294におけるピークに上昇し、
このピークは図16Bに示すインパルスのピーク電圧に
等しく、次いで指数的に減衰して定常状態の電圧V1
戻る。生ずる重み関数は、図16Cにおいて385に示
すように時間で回転する図16Aのインパルス応答であ
る。
【0116】近似の温度の段階的変化についての試料ブ
ロック12の温度の典型的な温度履歴を示す仮説の曲線
387は、図16C上に重ねられている。また、5つの
試料時間T1 〜T5 の温度が図16上に重ねられてい
る。本発明の教示に従い、これらの時間T1 〜T5 の各
1つをその特定の時間における重み関数の値を掛け、次
いですべてのそれらの積を合計し、そして5で割ること
によって、試料温度は計算される。熱的システムが単一
の温度定数の直線回路のように作用するという事実は、
この複雑な熱的システムについての熱的熱移動の考慮の
複雑さに基づく、驚くべき結果である。
【0117】1つの実施態様において、試料温度の計算
は、ブロック温度センサーおよび試料液体への異なる熱
的通路長さにより引き起こされる輸送遅れを説明する短
い遅延により調節される。計算した試料温度は、図1に
示す端末16上のユーザの情報のために表示される。図
17において、96ウェルの試料ブロックを通る6つの
異なるウェルの広がりについて、ハイブリダイゼーショ
ン/伸長温度範囲における比較的低い温度から変性のた
めのほぼ96℃の比較的高い温度への試料ブロック温度
の段階的変化についての温度応答の結果が示されてい
る。図17のグラフが示すように、システムが図16D
に示す直列RC回路に好ましくは類似する場合、試料温
度における予測された指数の上昇の間にすぐれた一致が
存在し、そしてまた、温度応答のきわめてすぐれた温度
応答の均一性が存在し、ここでこの研究において使用し
た6つの試料ウェルの温度は、互いに非常に密接する温
度においておよびほぼ0.5℃の幅である変性温度の
「許容されうる」バンドにおいて漸近的に安定する。
【0118】1つの実施態様において、最も最近のブロ
ック温度の試料を連続加重平均について使用したが、他
の実施態様において、異なる数の温度履歴試料を使用す
ることができる。理論的に予測された結果とのすぐれた
一致は、熱的対流の流れが試料液体をよく混合し、これ
によりこのシステムを直線方式で作用させるという事実
から由来する。
【0119】96ウェルの列を通る種々のウェルの広が
りにおける試料温度の間の均一性は、試料ブロック構造
における動力学的および静力学的局所的バランスおよび
局所的対称性ならびにここに詳細に記載する他の熱的設
計因子から生ずる。しかしながら、急速な温度変化の
間、ユーザが各試料ウェルに同一質量の試料液体を入れ
る場合にのみ、すべての試料ウェルは互いに0.5℃以
内の温度を有するであろうことに注意すべきである。異
なるウェルにおいて質量が等しくないとき、定常状態
で、条件が不変であり、急速な変化の間のみにおいて温
度は等しくなくなることはない。各ウェル中の試料液体
の質量は、各試料の熱容量の決定において優性因子であ
り、したがって、その特定の試料ウェルについて熱的時
間定数において優性因子である。
【0120】すべての試料ウェル中の試料液体を一致し
て上下の温度サイクルにかけ、そして標的温度を互いに
非常に近くに、すなわち、わずかに0.5℃の幅である
許容度のバンドにおいて安定化する能力、また、図15
における力Fに依存するに注意すべきである。この力
は、同様な質量の試料液体を充填したすべての試料ウェ
ルの熱的時間定数が同一の温度定数を有する前に、最小
の限界の力を越えなくてはならない。最小の限界の力
は、ここに記載する試料管および試料ウェルの形状につ
いて30gであることが実験的に決定された。より高い
レベルの精度について、図15における最小の限界の力
Fは、前述したように安全性の追加の限界について少な
くとも50g、好ましくは少なくとも100gであるこ
とが確立された。
【0121】試料ウェルの温度の熱的均一性の重要性
は、図18を参照すると理解することができる。この図
面は、DNAのある種のセグメントの増幅の1つの例に
ついての、PCRサイクルにおいて発生したDNAの量
と変性間隔の間実際の試料温度との間の関係を示す。9
3℃および95℃の温度の間の関数298の傾斜は、こ
の特定のDNAのセグメントおよびプライマーについて
ほぼ8%/℃である。図18は増幅により発生したDN
Aの量に関係する曲線の一般の形状を示すが、この曲線
の形状の詳細はプライマーおよびDNA標的の各異なる
場合とともに変化する。97℃以上の変性のための温度
は一般に熱く、そして増加する変性温度について増幅を
減少させる。95℃および97℃の間の温度は一般にち
ょうど正しい。
【0122】図18が例示するように、ほぼ93℃の変
性温度で安定化するこの特定のDNA標的およびプライ
マーの組み合わせを含有する試料ウェルは、94℃で変
性したウェルより8%少ない典型的なPCRプロトコル
の過程で発生したDNAを有するように思われる。同様
に、95℃の変性温度で安定化するこの混合物の試料液
体は、94℃の変性温度で安定化する試料ウェル中で発
生したより8%多いその中で発生したDNAを有するよ
うに思われる。この性質のすべての曲線は同一の一般形
状を有するので、試料温度の均一性を有することは重要
である。
【0123】前述したようにして計算した試料温度は、
ヒータおよびランプ冷却チャンネルを通して流れ制御
し、そして種々の標的温度に試料が保持される長さを決
定する制御アルゴリズムにより使用される。制御アルゴ
リズムは、これらの時間を使用して、ユーザが入れた各
インキュベーション期間についての所望の時間と比較す
る。時間が合致するとき、制御アルゴリズムは次のイン
キュベーションについてユーザが定めた標的温度に向か
う試料ブロックを加熱または冷却するために適当な工程
を取る。
【0124】計算した試料温度は設定点、すなわち、ユ
ーザがプログラミングしたインキュベーション温度の1
℃内であるとき、制御プログラムはタイマを始動させ
る。このタイマをプリセットして、セットした数をカウ
ントダウンして、実施されているインキュベーションに
ついてユーザが特定した間隔をタイムアウトすることが
できる。計算した試料温度が1℃内にあるとき、タイマ
は始動してプリセットしたカウントからカウントダウン
する。タイマがゼロカウントに到達するとき、信号は活
性化され、これによりCPUはPCRプロトコルの次の
セグメントを実行する作用をする。特定された間隔の時
間を定める方法は、本発明を実施する目的について十分
である。
【0125】典型的には、特定の標的温度付近の許容度
のバンドは±0.5℃である。いったん標的温度に到達
すると、コンピュータはバイアス冷却チャンネルおよび
フィルムヒータを使用して試料ブロックを標的温度を保
持し、こうしてすべての試料は特定した間隔についての
標的温度の近くに止まる。よく働くとここに記載する熱
的システムについて、試料ブロックから各試料への熱伝
導性は既知であり、そして非常に密接な許容度内に均一
である。そうでなければ、タイマが始動するとき、すべ
ての試料は標的温度の特定した許容度のバンド内にある
わけではなく、そしてすべての試料が標的温度において
同一のインキュベーション間隔を経験するわけではな
い。
【0126】また、この熱的システムがよく働くために
は、すべての試料管は周囲環境における変動から隔離し
なくてはならない。すなわち、ある試料管をドラフトに
より冷却し、一方物理的に異なる位置における他の試料
管が同一冷却作用を経験しないようにすることは望まし
くない。すぐれた均一性について、すべての試料の温度
を試料ブロックの温度によってのみ決定することは高度
に望ましい。
【0127】周囲からの管の隔離、および試料管を押し
下げる最小の限界の力Fを加えることは、試料管および
試料ブロックの上の加熱されたカバーにより達成され
る。試料液体は温度制御の金属ブロックの中に緊密にプ
レスした試料管の中に存在させ、緊密にキャップをし、
メニスカスを温度制御の金属ブロックの表面よりかなり
下にしてさえ、試料はなお対流により上方に熱を失う。
有意には、試料が非常に熱い(変性温度が典型的には試
料液体の沸点付近にある)とき、試料液体は水蒸気の還
流により非常に有意な量の熱を失う。このプロセスにお
いて、水は熱い試料液体の表面から蒸発し、そしてキャ
ップの内壁および試料ブロックの上部表面より上の試料
管のより冷たい上部の上に凝縮する。比較的大きい体積
の試料が存在する場合、凝縮は続き、そして凝縮物は蓄
積しそして試料管の壁を下に流れて反応混合物の中に入
る。この「還流」プロセスは還流される水の1g当たり
約2300ジュールの熱を運ぶ。このプロセスは100
μlの反応混合物の表面温度を数度低下させ、これによ
り反応の効率を大きく減少する。
【0128】反応混合物が少ない、例えば、20μlで
ありそして試料管が試料ブロックの上部表面より上で比
較的大きい表面積を有する場合、反応混合物中の水の有
意の分画は蒸発することができる。次いで、この水は試
料管の上の部分の内側で凝縮し、そしてサイクルの高い
温度の部分の残部の間に、表面張力によりそこに止まる
ことができる。これは残りの反応混合物をそのように濃
縮することができるので、反応は障害されるか、あるい
は完全に失敗する。
【0129】先行技術のPCR熱的サイクルにおいて、
この還流の問題は反応混合物の上に油または溶融した蝋
の層を配置することによって処理された。この油または
蝋の不混和性層は水性反応混合物上に浮き、そして急速
な蒸発を防止した。しかしながら、油の添加に労力を要
し、これは処理のコストを上昇させる。さらに、油の存
在は処理および分析の後の工程を妨害し、そして試料の
汚染の可能性をつくった。事実、工業銘柄の鉱油は、過
去において、ユーザに未知の油中の汚染因子の未知の存
在により試料を汚染することが知られている。
【0130】油のオーバーレイの必要性は排除され、そ
して熱損失および蒸発による反応混合物の濃縮および還
流により引き起こされる予測されない熱的作用の問題
は、本発明の教示に従い、試料管の上の部分がその中に
突起する試料より上の体積を取り囲み、そしてこの体積
を上から加熱されたカバー(これは時には、また、定盤
と呼ぶ)により加熱することによって回避される。
【0131】図19を参照すると、試料管を取り囲みそ
してそれに下向きの力を加えて、図15において最小の
限界力Fを供給する、構造体の断面図が示されている。
加熱された定盤14をレッドスクリュー312に連結さ
れていて、矢印314で示す軸に沿ってレッドスクリュ
ー312の回転で上下に動く。レッドスクリューはすべ
りカバー316中の開口を通してねじ込められ、そして
ノブ318により回転する。定盤314はコンピュータ
20により制御される抵抗ヒータ(図示せず)により水
の沸点以上の温度に加熱される。
【0132】すべりカバー316はレール320および
322上をY軸に沿って前後にすべる。カバー316は
垂直側317および319を含みそして、また、試料ブ
ロック12および試料管を囲むX−Z平面(図示せず)
に対して平行な垂直側を含む。この構造は試料管(それ
らの管324および326は典型的である)にドラフト
が作用するのを実質的に防止する。
【0133】図20は、すべりカバーが後退位置にあっ
て試料ブロックへのアクセスを可能とする、すべりカバ
ー316および試料ブロック12の斜視図である。すべ
りカバー316は長方形の箱の蓋に類似し、ここで垂直
壁328は除去されてすべりカバー316を試料ブロッ
ク12の上にすべらせる部分330を有する。すべりカ
バーは、図20においてY軸に沿って、そのカバーが試
料ブロック12の上の中央にくるまで動く。次いで、ユ
ーザはノブ318をある方向に回して、ノブ318上の
マーク332が飾り板336上のマーク334と一直線
上になるまで、加熱された定盤14を下げる。ある実施
態様において、飾り板336はすべりカバー316の上
部表面に永久的に添付することができ、こうして異なる
大きさの試料を使用するとき、インデックスマーク33
4は異なる位置に配置することができる。換言すると、
より高い試料管を使用する場合、加熱された定盤14は
図15における最小の限界力Fを加えるほど多く下げる
必要はない。使用において、ユーザはスクリュー318
をねじって、インデックスマークが一直線になるまで、
定盤14を低下させる。次いで、ユーザは最小の限界力
Fが各試料管に加えられたことを知る。
【0134】図15および図19を一緒に参照すると、
図19における加熱された定盤14を下げる前に、各試
料管のためのプラスチックキャップ338はプラスチッ
クトレー340(図19)の壁の上部のレベルより上の
約0.5mmまで粘着し、そしてプラスチックトレー34
0は9mmの中心上でゆるい8×12列ですべての試料管
を保持する。試料ウェルの列は100μlの容量の96
本までのマイクロアンプ(登録商標)のPCR管または
0.4mlの容量の48本までのより大きいジェネアンプ
(登録商標)を保持することができる。このトレーは下
においてより詳細に論じられる。トレー340は試料管
のための8×12の列を有する平らな表面を有する。こ
の平らな表面は図15および図19の水平線として示さ
れており、この水平線は図19において試料管324お
よび326と交差する。トレー340は、また、4つの
垂直壁を有し、それらのうちの2つは図19に342お
よび344で示されている。これらの垂直壁の上部のレ
ベルは、図15に346で示されており、参考平面を定
める長方形の箱を確立する。
【0135】図15において最もよく見られるように、
すべての試料管のキャップ338はこの参照平面346
より上にある小さい量だきえ突起し、その量はキャップ
338を加熱された定盤14により軟化および変形し、
そして参照平面346のレベルに下方に「押しつぶす」
ように設計される。好ましい実施態様において、加熱さ
れた定盤14は図1におけるCPU20および定盤14
中の抵抗ヒータ(図示せず)に連結したバス22により
105℃の温度に保持される。好ましい実施態様におい
て、図19におけるノブ318およびレッドスクリュー
312は、加熱された定盤14が下降しそしてキャップ
338の上部と接触するまで、回転される。好ましい実
施態様において、試料管のためのキャップ338はポリ
プロピレンから作られる。これらのキャップは加熱され
た定盤14と接触するようになった短い時間で軟化す
る。キャップは軟化するにつれて、変形するが、それら
の弾性のすべてを失うことはない。キャップと接触後、
定盤は参照平面346上で配置されるまでさらに下降す
る。これはそれ以上の下降はキャップ338を変形し、
そして少なくとも50gの最小の限界力Fで各試料管を
押し下げて、各試料管を試料ウェルの中にしっかり配置
させる。キャップ338が参照平面346より上に突起
する量、および加熱された定盤14が参照平面346の
上に静止するときの変形および残留弾性の量は、少なく
とも50g、好ましくは100gの最小の限界力Fがす
べての試料管について達成され、次いで加熱された定盤
14が参照平面346のレベルの下降した後存在するよ
うに、設計される。
【0136】加熱された定盤14およびトレー340の
4つの垂直壁および平らな表面は、定盤14がトレーの
上部へり346と接触するとき、加熱され、シールされ
た隔室を形成する。トレー340のプラスチックは比較
的劣った熱伝導性を有する。実験において、加熱された
定盤14とキャップ338との接触および、比較的劣っ
た熱伝導性を有する材料の壁による試料ブロック12の
上部レベル2870より上に突起する試料管288の部
分の隔離は、有益な結果を有することが発見された。こ
の構造体により、管およびキャップの上の部分全体は、
管およびキャップの内側表面上に凝縮物がほとんどまた
はまったく形成しないように十分に高い温度にされる。
なぜなら、加熱された定盤は水の沸点より上の温度に保
持されるからである。これは、図15における試料液体
276がその沸点付近の温度に熱されるときでさえ、真
実である。これは試料混合物276の上部の上に浮く不
混和性物質、例えば、油または蝋の層の必要性を排除
し、これによりPCR反応に関係する労働の量を減少
し、そして試料の起こりうる汚染の1つの源を排除す
る。
【0137】実験において、加熱されたカバーの非常に
高い温度およびその試料ブロック12への密接性にかか
わらず、高い温度および低い温度の間の正確なかつ急速
なサイクルの試料ブロック12の能力への影響がほとん
どないことが発見された。加熱された定盤14は前述の
還流プロセスにより試料の冷却を防止する。なぜなら、
それはキャップの温度を水の沸点より上に保持し、これ
によりキャップの内側を乾燥して保持するからである。
これは、また、キャップが管から除去されたとき、エア
ゾールの形成を防止する。
【0138】他の実施態様において、図15における最
小の許容されうる下向きの力Fを存在する試料管の数に
無関係に各個々の試料に加えることができ、そして凝縮
および還流および対流冷却を防止する手段は、本発明を
実施する目的に十分であろう。この下向きの力Fの適用
および還流および望ましくない試料液体の濃縮を防止す
る熱の使用の両者は、好ましい実施態様において実施す
るのと同一のシステムにより必ずしも実施する必要はな
い。
【0139】試料管はそれらの高さの数千分の1インチ
だけ変化することができる。さらに、試料管のためのキ
ャップは、また、高さが数千分の1インチだけ変化する
ことができる。また、試料ブロック12中の各円錐形試
料ウェルは同一深さに正確に孔開けすることができな
く、そして試料ブロック中の各円錐形試料ウェルはわず
かに異なる直径および角度に孔開けすることができる。
こうして、キャップをした管の集団は試料ブロックの中
に配置して対応する試料ウェルの中に静止させるとき、
キャップの上部はすべてが同一高さである必要はないで
あろう。この高さについて最も悪い不一致は最も高い管
から最も低い管で0.5mm程度に多くあることができる
であろう。
【0140】完全に平らな非加熱定盤14をそれがそれ
自身の位置を自由に見いだすように取り付け、これをこ
のようなキャップの列の上に押し下げた場合、それはま
ず3つの一番高い管と接触するであろう。それ以上の圧
力を加えそして一番高い管が多少圧縮されるとき、定盤
はより低い管のあるキャップと接触し始めるであろう。
管およびキャップのアセンブリーがしなやかでないかぎ
り、一番短い管が少なくとも接触する前に、一番高い管
は損傷を受けるという、明確な可能性が存在する。ある
いは、すべての高い管を十分に圧縮して一番短い管を接
触させるために必要な力は、装置にそれを加えるのに大
きすぎることがある。いずれの場合においても、1また
は2以上の短い管はまったくプレスされないか、あるい
はその管の熱的時間定数がすべての他の管の熱的時間定
数に等しいことを保証するために不十分な力で押し下げ
られることがある。これは試料ブロック中のすべての管
について同一のPCRサイクルの達成を失敗させるであ
ろう。なぜなら、異なる熱的時間定数をもつ管は他の管
と歩調をそろえないであろうからである。定盤を加熱し
そしてキャップを軟化すると、これらの危険は、1つの
因子として管の高さを異ならせる製作の許容度の誤差を
排除することによって、排除される。
【0141】他の実施態様において、全体の加熱された
定盤14はしなやかなゴム層でカバーされる。加熱され
た定盤上のしなやかなゴムは高さ許容度の問題を解決す
るが、また、加熱された定盤から管のキャップへの熱の
流れを遅延させる熱的絶縁層として作用するであろう。
さらに、高温度における長時間の使用では、ほとんどの
ゴム材料は劣化するか、あるいは堅くなる。したがっ
て、加熱された定盤の表面は金属および熱のすぐれた伝
導体であることが望ましい。
【0142】他の別の実施態様において、96の個々の
ばねを定盤に取り付けて、各ばねが単一の試料管を押し
下げるようにすることができる。これは複雑でありかつ
費用のかかる解決法であり、そして機械的精確さをもっ
て定盤を管の列の上に整列させることが必要であり、こ
の達成は困難または面倒である。好ましい実施態様にお
ける各試料管についての必要な個々のコンプライアンス
はプラスチックキャップの使用により供給され、これら
のキャップは定盤からの力の下で予測可能な方法でつぶ
れるが、つぶれたときでさえ、各試料管をそのウェルの
中にしっかり静止させて保持するために適切な下向きの
力Fをなお発揮する。
【0143】図15に示す試料管のキャップ338にお
いて、表面350はぎざぎざ、ばりおよびカットを含ま
ず、こうして試料管288の内側壁352とハーメチッ
クシールを提供できるようにすべきである。好ましい実
施態様において、キャップの材料はポリプロピレンであ
る。適当な材料は前述のヒモント(Himont)によ
り製作されたヴァルティク(Valtec)HH−44
4またはPD701ポリプロピレンまたはアメリカン・
ヘスヒト(American Heoscht)によりPPW1780で
あることができる。好ましい実施態様において、キャッ
プのドーム部分についての壁厚さは0.130±0.0
05インチ(3.30±0.12mm)である。好ましい
実施態様において、肩部分356の厚さは0.025イ
ンチ(0.64mm)であり、そしてキャップのドーム形
部分の幅は0.0203インチ(0.52mm)である。
【0144】図15における最小の限界力Fをすべての
試料管に加え、そしてキャップおよび試料管の上の部分
を凝縮および還流を防止するために十分な高い温度に加
熱させる、キャップの材料および形状は、本発明を実施
する目的に十分であろう。ドーム形のキャップ338は
キャップの変形を促進する薄い壁を有する。加熱された
定盤は高い温度に保持されるので、ドーム形のキャップ
の壁厚さは射出成形により容易に製造されるために十分
に厚くあることができる。なぜなら、管の高さの差を説
明するために必要なコンプライアンスは室温において不
必要であるからである。
【0145】定盤は本発明の教示に従い94℃〜110
℃の温度に保持することができるが、水の沸点は100
℃であるので、100℃〜110℃の範囲は還流の防止
に好ましい。この温度範囲において、キャップは1mm程
度に多く容易につぶれるためにちょうど十分に軟化する
ことが実験的に発見された。研究において、使用するポ
リプロピレンの弾性は、これらの温度においてさえ、つ
ぶれが完全には非弾性的でないようなものであることが
示された。すなわち、加熱された定盤はキャップの永久
的変形を引き起こすが、キャップの材料は、それらの室
温の弾性率の有意に十分な部分をなお保持するので、最
小の限界力Fは各試料管に加えられる。さらに、キャッ
プの軟化のために、試料ブロックの中にいかに多くの管
が存在するかに無関係に、過度の力を使用しないで、加
熱された定盤はそれと接触するすべてのキャップを一様
な高さにする。
【0146】キャップの温度はPCRサイクル全体の間
に水の沸点より上であるので、各キャップの内側表面は
完全に乾燥して止まる。こうして、PCRプロセスの終
わりにおいて、試料を試料ブロックから取り出す前に室
温に冷却し、各試料管上のキャップを開く場合、交差汚
染を生じうる試料管の内容のエーロゾルの噴霧が発生す
る可能性は存在しない。なぜなら、シールを破壊したと
き、管のシールに対するキャップに液体が存在しないか
らである。
【0147】これはきわめて有利である。なぜなら、増
幅した生成物のDNAを含有するエアゾールの小さい粒
子は実験室を汚染し、そして他の源、例えば、他の患者
からの試料を含有する試料管の中に入り、これにより非
常に面倒である誤った陽性または陰性の診断結果を多分
引き起こすからである。PCR増幅プロセスのユーザ
は、他の試料を汚染しうるエアゾールの発生に極めて関
心をもつ。
【0148】使い捨てプラスチック製品のシステムを使
用して個々の試料管を8×12列に変換し、この8×1
2列はマイクロタイタープレートのフォーマットの実験
室の装置と適合性であるが、十分な個々の動きの自由度
を維持して、システムの成分の熱膨張の種々の速度の差
を補償する。熱的にしなやかなキャップの関係は試料ブ
ロック、およびキャップを所定位置にもつ2本の試料管
の断面図である図21Aにおいて最もよく見られ、そし
て試料管はプラスチックの96ウェルのマイクロタイタ
ートレーおよびリテイナーの1つの実施態様の組み合わ
せにより所定位置に保持されている。図21Bは、シス
テムの種々の使い捨てプラスチック製品のほとんどの構
造および相互作用を示す、別の好ましい実施態様であ
る。長方形のプラスチックの96ウェルのマイクロタイ
タープレートのトレー342は試料ブロック12の表面
上に静止する。フレーム342の上部へり342は、キ
ャップ(その1例はキャップ364である)の高さより
ほぼ0.5インチ(12.7mm)短い高さを有する。キ
ャップ付き管のすべてはフレーム342のへり346よ
り高く突起する。フレーム342は、下向きに延びるう
ね366がその全長を通してガードバンドみぞ78の中
に延びる。しかしながら、フレーム342はギャップ
(図示せず)を有し、このギャップは図2に平面図で示
しそして図7に断面図で示す温度センサーのためのみぞ
78中のギャップに相当する。前述の参照平面346は
フレーム342の上部により確立される。この参照平面
が加熱された定盤と相互作用する方法は次の通りであ
る。図20におけるノブ318をねじ込んでインデック
スマーク332および334に合致させて増幅実験を開
始する前に、目盛り定めプロセスを実施して図20にお
ける飾り板336上のマークの位置を決めた。この目盛
り定めは図21におけるフレーム342を試料ブロック
の位置に配置することによって開始する。しかしなが
ら、フレーム342は空であるか、あるいはその中の管
は所定位置にキャップをもたないであろう。次いで、ノ
ブ318をねじ下げて、加熱された定盤14をフレーム
342の上部へり346とその周辺全体の回りにしっか
り接触させる。ノブ38を十分にねじ下げて加熱された
定盤を参照平面346上に静止させそしてフレーム34
2を試料ブロックの上部表面280に対してしっかりプ
レスしたとき、好ましい実施態様の回転可能な飾り板3
36を回転させて、飾り板上のインデックスマーク33
4をノブ318上のインデックスマークと一致させる。
次いで、ノブ318を反時計回りに回転して定盤14を
上昇させ、そして図19におけるカバー316をネガテ
ィブY方向にすべらせて、フレーム342および試料ブ
ロック12のカバーを取る。次いで、試料混合物を充填
したキャップ付き試料管をフレーム342中の所定位置
に配置することができる。次いで、加熱されたカバー3
16を試料ブロックの上に配置し戻し、そしてノブ31
8を時計回り回転して加熱された定盤14を下げて、ノ
ブ上のインデックスマーク332を前述したように位置
決めしたインデックスマーク334と一致させる。すべ
ての管を最小の力Fでしっかり静止させるというこの保
証が適用された。インデックスマークの使用はユーザに
簡単な、評価可能なタスクを実施させる。
【0149】わずかの試料管のみが所定位置に存在する
場合、インデックスマーク332および334を一致さ
せるために、小さい量のトルクを必要とするだけであ
る。しかしながら、多数の管が存在する場合、インデッ
クスマークを一致させるために、ノブ318上により多
くのトルクを必要とするであろう。なぜなら、各管はキ
ャップが変形するとき加熱された定盤14の下向きの動
き抵抗するからである。しかしながら、インデックスマ
ーク332および334が整列したとき、加熱された定
盤はもう一度フレーム342の上部へり346に対して
緊密に配置され、そしてすべての管はそれに加えられた
最小の限界力Fを有するであろうことを、ユーザは保証
される。これが事実上保証するように、すべての管の熱
的時間定数は実質的に同一である。
【0150】他の実施態様において、インデックスマー
ク332および334を省略し、そしてノブ318をそ
れがそれ以上回転しなくなるまで単に回転することがで
きる。加熱された定盤14が上部へりまたは参照平面3
46に到達し、そしてプラスチックフレーム342が加
熱された定盤14のそれ以上の下向きの動きを停止させ
たとき、上の状態は起こる。明らかなように、この実施
態様において、および前述のインデックスマークの実施
態様において、フレーム342のプラスチックは、それ
が加熱された定盤14と接触するとき、フレーム342
のプラスチックの変形を防止するために十分に高い溶融
温度を有するであろう。好ましい実施態様において、フ
レーム342のプラスチックは0.05インチ(1.2
7mm)の壁厚さをもつセラニーズナイロン1503であ
る。
【0151】前述のシステムの利点は、異なる高さを有
するフレーム342を単に使用することによって、異な
る高さの試料管を使用できるということである。フレー
ム342は、それと管が試料ブロックの中に配置されて
いるとき、キャップされた管の先端の平面よりほぼ0.
5mm短い高さを有すべきである。好ましい実施態様にお
いて、2つの異なる管高さを使用する。図19において
加熱された定盤14を推進させるレッドスクリュー31
2の動きの範囲は、使用すべき試料管のすべての異なる
大きさについて十分でなくてはならない。もちろん、特
定のPCR処理サイクルの間、すべての管は同一高さで
なくてはならない。
【0152】前述のシステムは、試料ブロックにおいて
均一な温度、ブロックから試料への均一な熱伝導性、お
よび周囲環境の変動性からの管の絶縁を提供する。96
までの任意の数の試料管はマイクロタイタープレートの
フォーマットで配列することができる。このシステム
は、非常に多数の試料についての正確な温度制御を提供
し、そして任意の試料の温度を実際に測定しないで、す
べての試料についての試料温度の視的指示を提供する。
【0153】PCR反応のために容器として、先行技術
において、マイクロ遠心器のために本来設計されたポリ
プロピレン管が普通に使用されてきている。この先行技
術の管は円筒形の断面を有し、その上部は気密シールを
つくるスナップ式キャップにより閉じられていた。この
先行技術の管は、ほぼ17°の夾角をもつ円錐台形から
なる底区画を有した。
【0154】このような円錐形試料管を同一夾角をもつ
円錐形キャビティを有する試料ブロックの試料ウェルの
中に押し下げ、そしてこの管中の試料混合物が円錐形体
積内にかつ試料ブロックより下に完全に横たわるとき、
ブロックと液体との間の熱伝導は列を通る試料温度のす
ぐれた均一性について適切に予測可能にすることができ
る。試料ブロックと試料混合物との間の熱伝導の適切な
制御を達成するために、円錐形管および試料ウェルの夾
角は密接に合致しなくてはならず、そして管およびウェ
ルの円錐形表面はなめらかでありかつ平らな関係で一緒
に保持されなくてはならない。さらに、最小の限界力F
を各試料管に加えて各管を試料ウェルの中に緊密にプレ
スし、こうして熱的サイクリング、例えば、図15にお
いて空間291の中に捕捉された液体からの水蒸気の形
成の間、なんらかの理由で試料管が上昇またはゆるくな
らないようにしなくてはならない。最後に、各管に同一
量の試料液体を充填しなくてはならない。上に列挙した
条件が満足される場合、試料ブロックと各管中の試料液
体との間の熱伝導性は、図15における円錐形プラスチ
ック壁368、および円錐形試料管壁の内側表面370
における試料液体の境界層(図示せず)の伝導性によ
り、主として決定されるであろう。
【0155】プラスチック管壁の熱伝導性はそれらの厚
さにより決定され、そしてそれらの厚さは管製造の射出
成形法により密接にコントロールすることができる。試
料管中の試料液体は事実上同一の熱的性質を有する。実
験により、および計算により、成形した96ウェルのワ
ンピース型マイクロタイタープレートはPCRについて
限界的にのみ可能であることが発見された。なぜなら、
アルミニウムとプラスチックとの間の熱膨張係数は、列
を横切る試料液体への熱伝導性の均一性を破壊しうる寸
法変化に導くからである。すなわち、このようなワンピ
ース型プレート中の各ウェルはプレート表面を通して各
他のウェルに円錐形されるので、ウェル間の距離はプレ
ートの初期の製造時に決定されるが、プレートのプラス
チックは有意に異なる熱膨張係数を有するので温度変化
とともに変化する。また、金属の試料ブロック12中の
試料ウェル間の距離は試料ブロックの温度に依存する。
なぜなら、アルミニウムは、また、プラスチックの熱膨
張係数と異なる、有意の熱膨張係数を有するからであ
る。すぐれた熱伝導性を有するためには、96ウェルの
ワンピース型マイクロタイタープレート中の各試料ウェ
ルは、すべての温度において試料ブロック中の対応する
ウェルにおいてほとんど完全に適合するであろう。試料
ブロックの温度は非常に広い範囲の温度にわたって変化
するので、試料ブロック中の試料ウェルの間の距離はP
CRサイクルの間にサイクル的に変化する。プラスチッ
クおよびアルミニウムの熱膨張係数は実質的に異なるの
で、試料ブロック中のウェルの分離距離はプラスチック
の96ウェルのワンピース型マイクロタイタープレート
の試料ウェル間の距離についてより変化する温度にわた
って異なるように変化する。
【0156】こうして、PCR温度範囲にわたる試料管
と対応する試料ウェルとの間の完全な適合のための重要
な基準として、96ウェルの列中の各試料管は個々に自
由に横方向に動くことが必要であり、そして試料ウェル
の壁を平らな接触を行うためにどんな量が必要であって
も、各管は個々に自由に押し下げられなくてはならな
い。
【0157】本発明において使用する試料管は先行技術
のマイクロ遠心器管と異なり、試料管の円錐の切頭部分
の壁厚さは試料液体に出入りする熱移動を速くするため
に非常に薄い。これらの上の部分は円錐形部分より厚い
壁厚さを有する。図15において、円筒形部分288の
壁厚さは一般に0.030インチ(0.76mm)である
が、円錐形壁368の壁厚さは0.009インチ(0.
23mm)である。薄い部分は射出成形プロセスにおいて
厚い部分より速く冷却するので、薄い部分が冷却する前
に完全な成形物を得ることが重要である。
【0158】試料管の材料は化学的にPCR反応と適合
性でなくてはならない。ガラスはPCRの適合性材料で
はない。なぜなら、DNAはガラスに粘着し、そして剥
離せず、PCR増幅を妨害するからである。好ましく
は、オートクレーブ処理可能なポリプロピレンを使用す
る。これらの型の適当なポリプロピレンは上に識別した
通りである。あるプラスチックは、プラスチックからの
ガス発生のためにあるいはプラスチック壁へのDNAが
粘着するために、PCRプロセスと適合性ではない。ポ
リプロピレンはこの時点において最もよく知られている
プラスチックのクラスである。
【0159】普通の射出成形技術および射出成形のため
に型製造技術は、本発明を実施する目的に十分であろ
う。円錐形の試料管の使用は、実質的にすべての製造の
許容度の誤差を高さの誤差、すなわち、試料管を試料ウ
ェルの中に配置させたとき、キャップの先端対試料ブロ
ックの上部の高さの管毎の変動性に転換する。例えば、
試料管壁の角度についての角度の誤差は、管を試料ブロ
ックの中に配置したとき、高さの誤差に変換される。な
ぜなら、管壁の角度と試料ウェル壁の角度は一致しない
からである。同様に、円錐の寸法の直径の誤差は、ま
た、高さの誤差に変換される。なぜなら、管の円筒形部
分はより深く侵入するか、あるいは適切な寸法の管ほど
多く侵入しないからである。
【0160】列を横切る熱伝導性のすぐれた均一性のた
めに、試料管と試料ウェルとの間のすぐれた適合は、熱
膨張速度の差に無関係に、0〜100℃の完全な温度範
囲にわたって、すべての96ウェルについて存在しなく
てはならないであろう。また、96の試料管の各々は非
常に高い程度に均一である寸法および壁厚さをもつ壁を
もたなくてはならない。試料混合物を保持すべき各試料
管は取り外し可能な気密キャップを装備すべきであり、
そしてこのキャップは気密シールをつくり、この混合物
がその沸点にその付近にあるとき、反応混合物からの水
蒸気の損失を防止し、こうして試料混合物の体積が減少
しないようにする。すべてのこれらの因子は組み合わっ
て、すべての96ウェルについて均一な熱伝導性を達成
する方法における、96の個々の試料ウェルをもつワン
ピースのマイクロタイタープレートの製造を困難とす
る。
【0161】各試料管について必要な個々の横方向およ
び垂直方向の自由度を提供する構造は、本発明を実施す
る目的に十分であろう。本発明の好ましい実施態様の教
示に従い、すべての前述の要件は4ピースの使い捨てプ
ラスチックシステムの使用により達成された。このシス
テムは、異なる熱膨張速度を補償するために必要なすべ
ての方向における十分な自由度を各試料管に与えそし
て、しかも、工業的標準の96ウェルのマイクロタイタ
ープレートを使用して作業する大きさである他の実験室
の装置との適合性およびユーザの便利さのために、96
ウェルのマイクロタイタープレートのフォーマットで9
6までの試料管を保持する。マルチピースの使い捨てプ
ラスチックシステムは製造の許容度の誤差およびPCR
熱サイクルの間に直面する広い温度範囲にわたる異なる
熱膨張速度に対して非常に許容性である。
【0162】図21Aおよび21Bは、異なる熱膨張速
度を説明する十分な自由度で試料ウェルの中に複数の試
料管を保持するように組み立てられた、4ピースのプラ
スチックシステムの成分の大部分の別の実施態様を断面
図で示す。図45は、使い捨てプラスチックマイクロタ
イタープレートのエムレーションシステムのすべての部
分を分解図で示す。この図面は、すべての試料管が8×
12のマイクロタイタープレートのフォーマットの96
ウェルの列でゆるく保持して、部分を通して適合してマ
イクロタイタープレートを形成する方法を示す。図22
は、図21Aおよび21Bに部分的に断面図で示されて
いる、本発明の教示に従うマイクロタイタープレートの
フレーム342の平面図を示す。図23はフレーム34
2の底平面図を示す。図24は図22の線24−24′
から取ったフレーム342の端面図である。図25は図
22の線25−25′から取ったフレーム342の端面
図である。図26は図22の線26−26′から取った
フレーム342の断面図である。図27は図22の線2
7−27′から取ったフレーム342の断面図である。
図28は図22の線28−28′から取ったフレーム3
42の側面図であり、部分的に切断して下に記載するリ
テイナーがフレーム342にクリップする位置を詳細に
示す。
【0163】図21A,21Bおよび22〜28を一緒
に参照すると、フレーム342は水平のプラスチックプ
レート372から構成され、ここで標準のマイクロタイ
タープレートのフォーマットで9mmの中央に間隔を置い
て96の孔が形成されている。8つの行A〜Hおよび1
2の列1〜12が存在する。行D、列7における孔37
4はこれらの孔の典型である。フレーム342中の各孔
の中に、円錐形試料管、例えば、図15に示す試料管3
76が存在する。各試料管はそれが配置されている孔よ
り直径が約0.7mmだけ小さいので、孔中のゆるい嵌合
が存在する。これは図21Aおよび21Bにおいて、典
型的な孔の内側へり378とその中に配置された試料管
の側壁380との間の距離を観察することによって最も
よく理解される。図21Aおよび21B中の参照数字3
82は、試料管376の円筒形部分の外側壁から、ま
た、間隔を置いて位置する孔の対向するへりを示す。
【0164】各試料管は図15,21Aおよび21Bに
384で示された肩を有する。この肩は各試料管の円筒
形部分288の全周囲の回りに成形される。この肩38
4の直径は十分に大きいので、それはフレーム342中
の孔を通過せず、しかも付近の孔の中の隣接する管の肩
に接触するほど大きくない。いったんすべての管がフレ
ーム中のそれらの孔の中に配置されると、プラスチック
リテイナー386(図21Aおよび21Bおよび図45
に最もよく示されている)はフレーム342中の開口の
中に嵌合される。このリテイナーの目的はすべての管を
所定位置に配置し、こうしてそれらはフレーム342の
中から外に落下または押し出されることができず、また
フレーム342中のゆるい適合を妨害しない。各試料管
がある程度垂直に上下した後、管の肩384がリテイナ
ー386またはフレーム342に直面するように、リテ
イナー386は大きさが決定されかつフレーム342に
適合する。こうして、フレームおよびリテイナーは、連
結されると、96までの試料管をマイクロタイタープレ
ートのフォーマットに提供するが、図15においてすべ
ての管が最小の限界力Fの影響下にすべての温度におい
てその最良の嵌合を自由に見いだすように、十分な水平
および垂直の自由度を提供する。
【0165】試料管および肩のより明瞭な外観は図29
および30を参照すると得ることができる。図29およ
び30は、それぞれ、典型的な試料管の肩部分の側面図
および部分的上部断面である。プラスチックのドーム形
キャップ、例えば、下に詳細に記載するキャップは、図
29に示す試料管の中に挿入し、そして試料管の上部の
内側壁390とハーメチックシールを形成する。試料管
の内側壁の中に形成されたうね392は、ドーム形キャ
ップについてストップとして作用して、それ以上の侵入
を防止する。通常、ドーム形キャップはウェブにより接
続されるストリップとなる。
【0166】図31はウェブ394により接続されそし
てタブ396で終わる3つのキャップを側面図で示す。
このタブは単一の引きによりキャップの列全体を除去す
るのを促進する。通常、ウェブ394は試料管の上部表
面398上に位置し、そしてキャップが試料管の中にさ
らに侵入するのを防止する。各キャップはキャップと試
料管の内側壁との間にハーメチックシールを形成するう
ね400を含む。図32は12の接続されたキャップの
典型的なストリップ中の3つのキャップの上面図を示
す。
【0167】リテイナーのより詳細な理解のために、図
33〜37を参照する。図33はプラスチックのリテイ
ナーの上面図である。図34は図33の線34−34′
に沿って取ったリテイナーの側面図である。図35は図
33の線35−35′に沿って取ったリテイナーの端面
図である。図36は図33の線36−36′に沿って取
ったリテイナーの断面図である。図37は図33の線3
7−37′に沿って取ったリテイナーの断面図である。
【0168】図33〜37を一緒に参照すると、リテイ
ナー386は垂直壁404により取り囲まれた単一の水
平のプラスチック平面402から構成されている。平面
402はその中に形成され、4孔/群の24群に分割さ
れた、8×12列の96孔を有する。これらの群は平面
402の中に形成されたうね、例えば、うね406およ
び408により区画されている。各孔、それらのうちの
孔410は典型的である、は直径Dを有し、この直径D
は図29における直径D1 より大きく、そして直径D2
より小さい。これにより、リテイナーは試料管がフレー
ム342の中に配置された後、試料管の上をすべること
ができるが、肩384は大き過ぎて孔410を通過でき
ないので、試料管がフレームから落下するのを防止す
る。
【0169】リテイナーはフレーム342の中に、図3
4および36に示すプラスチックタブ414により嵌合
する。これらのプラスチックタブは、図23に示すよう
に、フレーム中のスロット416および418を通して
押される。2つのプラスチックタブが存在し、各々はリ
テイナーの長いへり上に存在する。これらの2つのプラ
スチックのタブは図33に414Aおよび414Bとし
て示されている。
【0170】図22〜28のフレーム342は、その中
に配置された96までの試料管をもちそして所定位置に
嵌合されたリテイナー386をもち、単一の単位、例え
ば、図21Aおよび21Bに示すような単位を形成し、
これはPCR処理のために試料ブロック12の中に配置
することができる。処理後、フレーム342を試料ブロ
ックの中から外に持ち上げることによって、すべての管
を同時に取り出すことができる。便利さおよび貯蔵のた
めに、試料管およびリテイナーを所定位置にしてフレー
ム342を、ベースと呼ぶ他のプラスチック成分の中に
挿入することができる。ベースは標準の96ウェルのマ
イクロタイタープレートの外側寸法およびフットプリン
ト(footprint)を有し、そして図38〜44
に示されている。図38はベース420の上面図である
が、図39はベースの底面図である。図40は図38の
線40−40′に沿って取ったベースの側面図である。
図41は図38の線41−41′に沿って取ったベース
の端面図である。図42は図38の線42−42′に沿
って取ったベースの断面図である。図43は図38の線
43−43′に沿って取ったベースの断面図である。図
44は図38の線44−44′に沿って取ったベースの
断面図である。
【0171】ベース420はプラスチックの平らな平面
422を含み、ここで傾斜したへりをもつ8×12列の
孔が形成されている。フレーム342がベースの中に位
置しているとき、試料管の底がベース中の円錐形孔の中
に嵌合するような、寸法および間隔をこれらの孔は有
し、こうしてフレーム342を試料ブロックに取り付け
るとき、試料管が保持されるのと同一のフレーム342
に対する関係で試料管は保持されている。孔424はベ
ースの中に形成された96の孔の典型であり、そして図
38,44および43に示されている。個々の試料管
は、トレーとリテイナーとの間にゆるく捕捉されている
が、フレームがベースの中に挿入されているとき、しっ
かり位置し、そして不動となる。典型的な試料管424
がベースの中に嵌合される方法は図44に示されてい
る。
【0172】換言すると、フレーム、試料管およびリテ
イナーがベース420の中に位置するとき、全体のアセ
ンブリーは工業的に標準の96ウェルのマイクロタイタ
ープレートの正確な機能的同等のものとなり、そしてそ
れ以上の処理のために96ウェルの工業的に標準のマイ
クロタイタープレートのための事実上任意の自動化ピペ
ッティングまたはサンプリングのシステムの中に配置す
ることができる。
【0173】試料管は必要な試薬および増幅すべきDN
Aで充填した後、試料管にキャップすることができる。
図31および32に示すキャップのストリップの他の実
施態様において、8×12列でキャップを接続するしな
やかなウェブをもつ96キャップのマット全体を使用す
ることができる。これはウェブは、図31に394で示
されており、十分にしなやかであり、こうしてキャップ
は試料管が小さい動きを妨害されないようにしなくては
ならず、これらの試料管はすべての温度において試料管
の円錐形壁の中に完全に嵌合しなくてはならない。
【0174】管、キャップのフレーム、リテイナーおよ
びベースのアセンブリーは、管の充填後、サーマルサイ
クラーに入れる。そこで、フレーム、キャップ付き管お
よびリテイナーのプレートはベースから1単位として取
り出される。次いで、この単位を試料ブロック12の中
に配置して、図21Aおよび21Bに示すアセンブリー
を作り、管は試料ブロック中の円錐形壁の中にゆるく保
持されている。図21に示すように、フレーム342は
ガードバンドの上部表面上に位置する。好ましい実施態
様において、うね366はガードバンドのみぞ78の中
に下向きに延びるが、これは必須ではない。
【0175】次に、加熱されたカバーは試料の上にすべ
り、そして加熱された定盤を前述したようにスクリュー
で下げて、フレーム342の上部へり346と接触させ
る。図19における加熱された定盤14がキャップ接触
した後、数秒以内で、キャップは軟化し、そして図19
におけるレッドスクリュー312からの下向きの圧力下
に降伏する。次いで、ノブ318を回転して、図20に
おけるインデックスマーク332および334を合致さ
せ、これはすべての試料管を試料ブロックの中に、少な
くとも最小の限界力Fおよび加熱された定盤14の間の
すべての空気ギャップで、緊密にプレスさせ、試料ブロ
ックおよびフレーム342の上部へり346は緊密に閉
じる。ここで、試料管は完全に閉じ、制御された環境の
中にあり、そして温度の正確なサイクリングを開始する
ことができる。
【0176】PCRプロトコルの終わりにおいて、加熱
された定盤14は上方に、試料管から離れる方向に動
き、加熱されたカバー316は道からはずれすべってフ
レーム342および試料管を露出する。次いで、フレー
ム、試料管およびキャップを取り出し、そして空のベー
スの中に再配置し、そしてキャップを除去することがで
きる。各キャップまたはキャップのひもを引き、リテイ
ナーは管をトレーの中から外に出ないように保持する。
ベースの中に形成したリブ(図38〜44に示されてい
ない)は、図33に示すリテイナータブ414Aおよび
414Bと接触してリテイナーを所定位置にスナップし
て保持し、こうしてキャップの除去により管に加えられ
た力がリテイナー366を変位させないようにする。
【0177】明らかなように、フレーム342は、必要
に応じて、96より少ない管とともに使用することがで
きる。また、リテイナー386は、必要に応じて、スナ
ップを分離することによって、除去することができる。
一度に数本の管を使用し、そしてこれらの管を個々に取
り扱とき、試料ブロック上にリテイナーを使用しない
で、空のフレーム342を配置することができる。次い
で、ユーザは「試験管のラック」としてベースを使用
し、そしてその中に小さい数の管をセットする。次い
で、管は手動で充填し、そして個々のキャップをするこ
とができる。次いで、管を試料ブロック中のウェルの中
に個々に入れ、加熱されたカバーを閉じ、そして加熱さ
れた定盤14をスクリューで下げて、マークを合致させ
る。次いで、PCRサイクルを開始できる。サイクリン
グが完結したとき、カバー316を除去し、そして試料
管を有効なベースの中に個々に配置する。リテイナーは
この型の使用において不必要である。
【0178】図47および図48を参照すると、図1に
おいてCPUブロック10により表される制御システム
の好ましい実施態様のブロック線図が示される。図47
及び図48の制御エレクトロニクスの目的は、なかで
も、所望のプロトコルを定めるユーザの入力データを受
けとりかつ記憶し、種々の温度センサーを読み、試料温
度を計算し、計算した試料温度をユーザが定めたPCR
プロトコルにより定められた所望の温度と比較し、電力
ラインの電圧をモニターし、そしてフィルムヒータゾー
ンおよびランプ冷却弁を制御して、ユーザが定めたPC
Rプロトコルを実施することである。
【0179】マイクロプロセッサ(以後CPUという)
450は、下に記載しそしてソースコードの形で付録C
に記載されている制御プログラムを実行する。好ましい
実施態様において、CPU450は「OKI CMOS
8085」である。CPUはアドレスバス452を推
進し、これにより図47及び図48における他の回路要
素の種々のものがアドレスされる。CPUは、また、デ
ータバス452を推進し、これによりデータは図47及
び図48における他の回路要素の種々のものに伝えられ
る。
【0180】付録Cの制御プログラムおよびあるシステ
ム定数はEPROM456に記憶される。ユーザが入れ
たデータおよびシステム定数および導入プロセスの間に
測定された特性(下に記載する導入プログラムの実行)
はバッテリーバックアップRAM458に記憶される。
システムクロック/カレンダー460は、制御ソフトウ
ェアの説明において下に記載する、PCRの実行および
電力故障の間の事象の履歴を記録する目的で、データお
よび時間の情報をCPU450に供給する。
【0181】アドレスデコーダー462はアドレスバス
452からのアドレスを受けとりそしてデコードし、そ
してチップ選択バス464上の適当なチップ選択ライン
を活性化する。ユーザはディスプレイ468上のCPU
により表示される情報に応答してキーボード466を経
てPCRプロトコルを入れる。ユーザとCPU450と
の間の2ウェイ連絡は、制御ソフトウェアの説明のユー
ザのインタフェースの節において以下で詳細に記載す
る。キーボードインタフェース回路470はユーザのキ
ーボードを、データバス454を経てCPUにより読ま
れるデータに変換する。
【0182】プログラム可能な間隔タイマー472およ
び474の各々はカウンターを備え、これらのカウンタ
ーはCPU450により計算されたカウントを負荷され
て、電力が種々のフィルムヒータゾーンに加えられる間
隔を制御する。割り込み制御装置476は、割り込み要
求をCPU450に200ミリ秒毎に送って、制御ソフ
トウェアの説明において以下で記載するPIDタスクを
CPU450に実行させる。このタスクは温度センサー
を読みそして加熱または冷却の電力を計算して試料温度
を現在のレベルから、ユーザが望むレベルに動かし、こ
れはそのPCRプロトコルにおける時点のために実行さ
れる。
【0183】UART478は、RAM480に記憶さ
れたデータをプリンタに出力できるように「RS23
2」インタフェース回路480にサービスする。制御ソ
フトウェアは各PCRランのレコードを維持し、これは
実際に実行されたPCRプロトコルがユーザが望むPC
Rプロトコル対応したというユーザの評価の目的のため
のランの間に、種々の時間に存在した実際の温度に関し
て実施される。さらに、特定のPCRプロトコルの間に
望む特定の時間および温度を定めるユーザが入れたデー
タが記憶される。すべてのこのデータおよび他のデータ
は、CPU450により同様によく読まれ、そしてUA
RT478を経てRS232ポートに連結されたプリン
タに出力される。RS232インタフェースは、また、
外部のコンピュータに試験の目的でアドレスおよびデー
タバスの制御をさせる。
【0184】周辺インタフェースチップ(以後PICと
いう)482は、4入力/出力レジスタのプログラム可
能なセットとして働く。パワーアップにおいて、CPU
450はアドレスデコーダー462およびチップ選択バ
ス464を経てPIC482を選択する。次いで、CP
UはPICへのデータワードをデータバス454を経て
書いて、どのレジスタを出力ポートおよび入力ポートに
すべきかに関して、PIC482をプログラミングす
る。引き続いて、CPU450は出力レジスタを使用し
て、プログラム可能なアレイ論理チップ(PAL)48
4の内部の論理状態を制御するために、データバス45
4を経てCPUによりその中に書かれたデータワードを
記憶する。
【0185】PAL484は、複数の入力信号および複
数の出力信号を有する状態装置である。PALは一般に
ある数の異なる状態を有する論理の列を含有する。各状
態は入力における論理状態の列またはベクトルにより定
められ、そして各状態は出力の論理状態の異なる列また
はベクトルを生ずる。CPU450,PIC482,P
AL484および下において定義するいくつかの他の回
路は、共働してPAL484からの種々の出力信号の異
なる状態を発生する。これらの異なる状態および関連す
る出力信号は、以下に記載するように図47及び図48
に示すエレクトロニクスの作動を制御するものである。
【0186】12ビットのアナログディジタル(A/
D)コンバータ486は、ライン488および490上
のアナログ電圧をデータバス454上のディジタル信号
に変換する。これらはCPUによりA/Dコンバータの
ためのアドレスを発生し、こうしてA/Dコンバータの
チップ選択入力に連結したバス464上にチップ選択信
号が活性となりそしてコンバータを活性化するようにす
ることによって読まれる。ライン488および490上
のアナログ信号は、2つのマルチプレクサ492および
494の出力ラインである。マルチプレクサ492は4
つの入力ポートを有し、各々は2つの信号ラインを有す
る。これらのポートの各々はシステムにおける4つの温
度センサーの1つに連結されている。第1のポートは試
料ブロックの温度センサーに連結されている。第2およ
び第3のポートは、それぞれ、冷却液および周囲の温度
センサーに連結されており、そして第4ポートは加熱さ
れたカバーの温度センサーに連結されている。これらの
温度センサーの各1つのための典型的な回路は図49に
示されている。2,000オームの抵抗器496は、ノ
ード497において、バス接続ライン(図示せず)を経
て図47及び図48における調整された+15ボルト電
力供給498を受けとる。この+15DC信号のリバー
スはゼンナーダイオード500をバイアスする。リバー
スバイアス電流およびゼンナーダイオードを横切る電圧
低下は温度の関数である。ダイオードを横切る電圧低下
は、ライン502および504を経てマルチプレクサ2
92に入力される。各温度センサーはマルチプレクサ2
92への同様な接続を有する。
【0187】マルチプレクサ494は、また、入力ポー
トを有するが、3つのみが接続されている。第1入力ポ
ートは較正電圧発生器506に連結されている。この揮
発性発生器は、2つの精確に制御された電圧レベルをマ
ルチプレクサの入力部に出力し、そして非常に熱的に安
定である。すなわち、電圧源506により参照電圧の出
力は、少なくとも温度とともに、ごくわずかにドリフト
する。この電圧は時間毎にCPU450により読まれ、
そして、この参照電圧が下に記載する導入プロセスの実
行の間に測定された既知の温度において有したレベルを
表す、記憶された定数と比較される。参照電圧が測定さ
れたレベルからドリフトしそして導入プロセスの間に記
憶された場合、種々の温度およびライン電圧を感知する
ための使用した他の電子回路が、また、ドリフトし、そ
してそれらの出力を調節し、相応して温度測定プロセス
にわたって非常に正確な制御を維持することをCPU4
50は知る。
【0188】マルチプレクサ494への他の入力は、ラ
イン510を経てRMS対DCコンバータ回路512へ
連結される。この回路はステップダウントランス516
に連結された入力514を有し、そしてAC電力入力5
18にそのとき存在するライン電圧に対して比例するA
C電圧を入力514において受けとる。RMS対DCコ
ンバータ回路512はAC電圧を整流し、そしてそれを
平均して、ライン518上のAC入力電圧に対して、ま
た、比例するDC電圧をライン510上に発生する。
【0189】4つの光学的に連結されたトライアックド
ライバー530,532,534および536は、PA
L論理484から制御バス538を経て制御信号を受け
とる。トライアックドライバー530,532および5
34の各々は、3つのフィルムヒータゾーンの1つへの
電力を制御する。これらのヒータゾーンはブロック25
4,260/262および256/258(図13にお
いて使用したのと同一の参照数字)により表される。ト
ライアックドライバー536は、ブロック544により
表される加熱されたカバーへの電力を熱的カットアウト
スイッチ546を経て制御する。フィルムヒータのヒー
タゾーンはブロック熱的カットアウトスイッチ548に
より保護される。熱的カットアウトスイッチの目的は、
不安定な間隔の間放置されているトライアックドライバ
ーに導く破壊の場合において、加熱されたカバー上にフ
ィルムヒータ/試料ブロックの溶融を防止することであ
る。このような事象が起こった場合、熱的カットアウト
スイッチは過度に熱い状態を検出し、そしてライン55
2または554上のトライアックを遮断する。
【0190】フィルムヒータの主なヒータゾーンは36
0ワットの定格であるが、マニホールドおよびへりのヒ
ータゾーンは、それぞれ、180ワットおよび170ワ
ットの定格である。トライアックドライバーは「モトロ
ーラ MAC 15A1015アンプトライアック」で
ある。各ヒータゾーンは2つの電気的絶縁された区画に
分割され、各々は1/2の電力を消散する。2つの半分
は150ボルトのRMSより低いライン電圧518につ
いて並列に接続されている。これより大きいライン電圧
について、2つの半分は直列に接続されている。これら
の別の接続は「パーソナリティ」プラグ550を通して
達成される。
【0191】フィルムヒータゾーンのためのAC電力供
給はライン559であり、そして加熱されたカバーのた
めのAC供給はライン560を経る。ゼロ交差検出器5
66は、ライン518上のAC電力の各ゼロ交差におい
てライン568上にパルスを放射することによって、バ
イアスシステムのタイミングを提供する。ゼロ交差検出
器はアナロググラウンドに対して参照される「ナショナ
ル LM 311N」であり、そして25mVのヒステリ
シスを有する。ゼロ交差検出器はトランス516からそ
の入力をとり、そしてトランス516は0〜240ボル
トのACのAC入力信号について0〜5.52ボルトの
出力AC信号を出力する。
【0192】電力トランス570はAC電力をポンプ4
1に供給し、そしてポンプ41はランプ冷却チャンネル
およびバイアス冷却チャンネルを通して冷却液を送る。
冷却装置40は、また、そのAC電力をトランス570
からパーソナリティプラグ550の他の部分を経て受け
とる。トランス550は、また、3つの調整された電力
供給572,498および574および1つの非調整電
力供給576に電力を供給する。
【0193】温度を測定する正確な目的のために、較正
電圧発生器506は1系列の非常に精確な薄いフィルム
の超低温度のドリフト20Kohmの抵抗器(図47及
び図48には示さない)を使用する。これらの同一の超
低ドリフト抵抗を使用して、アナログ増幅器578のゲ
インをセットし、そしてアナログ増幅器578はディジ
タル値への変換前に選択した温度センサーからの出力電
圧を増幅する。これらの抵抗器はわずかに5ppm /℃ド
リフトするだけである。
【0194】すべての温度センサーは、それらを(それ
らが温度を測定する構造体から分離されている)をまず
安定な攪拌された油の温度記憶の浴の中に40℃におい
て配置し、そしてマルチプレクサ492への入力におい
て実際のオプチクス電圧を測定することによって較正さ
れる。次いで、温度センサーを95℃の温度の浴の中に
配置し、そしてそれらの出力電圧を再び同一点において
測定する。較正電圧発生器494の出力電圧は、また、
マルチプレクサ494の入力において測定される。各温
度について、温度センサーの出力の各と較正電圧発生器
506により発生した電圧から生ずるディジタル出力と
の間のA/Dコンバータからのディジタル出力の差を測
定する。次いで、温度変化について各々を較正するため
の各温度センサーのために較正定数を較正することがで
きる。
【0195】次いで、試料ブロックの温度センサーをそ
れ以上の較正手順にかける。この手順は試料ブロックを
2つの異なる温度に推進することを包含する。各温度レ
ベルにおいて、16の異なる試料ウェル中のブロックの
実際の温度は、16のRTD熱電対のプローブを使用し
て0.02℃内で測定する。次いで、ブロックの温度に
ついての平均のプロフィルを発生させ、そしてA/Dコ
ンバータ464の出力は試料ブロック中のその場所にお
いてブロック温度センサーを使用して測定する。これは
両者の温度レベルにおいて実施する。RTDプローブで
測定した実際のブロック温度およびブロック温度センサ
ーのためのA/D出力について、それ以上の較正ファク
ターを計算することができる。そのように発生した温度
の較正はバッテリーバックアップRAM458の中に記
憶される。いったんこれらの較正ファクターがシステム
のために決定されると、システムは較正の時に存在する
電気的特性から認めうるほどドリフトしないことが重要
である。したがって、低いドリフトの回路を選択し、そ
して超低ドリフト抵抗器を使用することが重要である。
【0196】CPU450が試料ブロック温度を制御す
る方法は、制御プログラムについて下に記載する選択を
参照することによって最もよく理解することができる。
しかしながら、図47及び図48の電子回路が制御ソフ
トウェアと共働してPCRプロトコルを実施する方法を
例示するために、次を考慮する。ゼロ交差検出器566
は出力バス568の中に2つの出力を有する。これらの
出力の1つは、ゼロ電圧参照を横切るAC信号の各ポジ
ティブに行く転移についてネガティブに行くパルスを放
射する。他のものはゼロ参照電圧レベルを横切るAC信
号の各ポジティブに行く転移についてネガティブパルス
を放射する。これらの2つのパルス、典型的には580
で示す、は1つの完全なサイクルまたは2つのハーフサ
イクルを定める。それは200ミリ秒の試料の期間を定
めるバス568上のパルスのトレインである。米国にお
けるような60サイクル/秒のACについて、200ミ
リ秒は24のハーフサイクルを含有する。
【0197】典型的なシステム期間は図50に示す。図
50中の各「チック」マークは1つのハーフサイクルを
表す。各200ミリ秒の試料期間の間、CPU450は
ユーザが定めた設定点またはインキュベーション温度に
試料ブロック温度を維持するために、あるいはPCRプ
ロトコルの時間ラインにおいて特定の試料期間が存在す
る場所に依存する新しい温度にブロック温度が動かすた
めに、必要な加熱または冷却の電力を計算している。各
フィルムヒータゾーンにおいて必要な電力のマットは、
各ヒータゾーンを次の200ミリ秒の試料期間の間に止
まるハーフサイクルに変換される。これらの計算を実施
する現在の試料期間の終わり直前に、CPU450はプ
ログラム可能な間隔タイマ(PIT)472中の4タイ
マの各々をアドレスする。各タイマに、CPUはハーフ
サイクルの数を表す「現在の」カウントを構成するデー
タを書き、そのタイマに関連する次の試料期間の中に止
まる。図50において、このデータは次の試料期間の開
始時間592に直前間隔590の間にタイマに対して書
かれる。94℃の変性温度までの急速なランプが、時間
592と594との間の試料の間隔を包含する間隔につ
いてのユーザの設定点データにより要求されると仮定す
る。したがって、フィルムヒータはその期間のほとんど
についてオンであろう。中央のゾーンヒータが試料期間
の間の3つのハーフサイクルを除外してすべてについて
オンであると仮定する。この場合において、CPU45
0は、間隔590の間の中央のゾーンヒータに関連する
PIT472中のカウンターの中に3を書く。この書く
操作は自動的にタイマに、中央のゾーンヒータを制御す
るバス592の特定の制御ライン上の「シャットオフ」
信号を発生させる。この「シャットオフ」信号はPAL
484に、中央のゾーンに関連するバス538中の信号
ラインの特定の1つ上に「シャットオフ」信号を発生さ
せる。次いで、トライアックドライバー530は次のゼ
ロ交差、すなわち、時間592においてシャットオフす
る。PITはライン594上のポジティブゴーイングパ
ルスのパルスのトレーンをPAL484から受けとる。
これらのパルスはPAL484による2ラインバス56
8上でゼロ交差パルスの、PAL484によりすべての
ゼロ交差パルス上のポジティブゴーイングパルスおよび
単一のライン、すなわち、ライン594上のすべてのゼ
ロ交差においてポジティブゴーイングパルスへの翻訳で
ある。中央フィルムヒータゾーンに関連するPIT47
2中のタイマは、そのクロックとしてライン594上の
ハーフサイクルマーキングパルスを使用して3のその現
在のカウントからカウントダウンを開始する。第3ハー
フサイクルの終わりにおいて、このタイマは0に到達
し、そしてバス592上のその出力信号が状態を変化す
るようにさせる。このオフからオンへの状態の転移は図
50に596で示されている。この転移はPAL484
に伝えられ、これによりPAL484はバス538上の
適当な出力信号の状態を変化させて、第3ゼロ交差でト
ライアックドライバー530をオンにスイッチする。好
ましい実施態様におけるようにゼロ交差でトライアック
をオンにスイッチすることによって、インジケータ(フ
ィルムヒータの導体)を通して流れる高い電流のオフの
スイッチングは回避されることに注意すべきである。こ
れはラジオ周波数のインターフェレンスまたは他のノイ
ズの発生を最小にする。各ハーフサイクルの位置を要求
される電力の計算量に従いフィルムヒータにスイッチす
る技術は、また、別の実施態様として働くが、この技術
により発生するノイズのために好ましくないことに注意
すべきである。
【0198】PIT472および474の他のタイマ
は、同様な方法において、働いて、他のヒータゾーンお
よび加熱されたカバーへ加えられる電力をCPUにより
計算された電力に従い管理する。ランプ冷却は周辺イン
タフェース482を通して直接CPU450により制御
される。各試料期間の間に実施された加熱/冷却電力の
計算がランプ冷却電力を必要とすることを示したとき、
CPU450は周辺インタフェース制御装置(PIC)
482をアドレスする。次いで、データワードは適当な
レジスタの中に書かれて出力ライン600を高く推進す
る。この出力ラインは1対の単安定マルチバイブレータ
602および604をトリガし、これにより各マルチバ
イブレータは、それぞれ、ライン606および608上
の単一のパルスを放射する。これらのパルスの各々は、
ちょうど1アンペアおよびほぼ100ミリ秒のパルス期
間の下でピーク電流を有する。これらのパルスの目的
は、ランプ冷却流れを急速にオンにすることが非常に困
難であるランプ冷却チャンネルを通る流れを制御するソ
レノイド弁コイルを推進させることである。ライン60
6上のパルスは、ドライバー610に、ソレノイド作動
弁の1つのソレノイドコイルの1つの側に連結されたラ
イン612を接地させる。コイル614の他方の端末は
電力供給576からの+24ボルトのDCで電力供給
「レール」616に連結されている。ワンショット60
2は1つの方向の流れのためのランプ冷却ソレノイド作
動弁を制御し、そしてワンショット604は反対方向の
流れのためのランプ冷却ソレノイド作動弁を制御する。
【0199】同時に、ライン600上のRCOOL信号
の活性化はドライバー618を活性化する。このドライ
バーは電流制限抵抗620を通してライン612を接地
させる。この電流制限抵抗の値は、ライン622を通し
て流れる電流がソレノイド弁614を開かせて保持する
ために必要な保持電流に少なくとも等しいような値であ
る。ソレノイドコイルは、ソレノイド作動弁をオンする
ために大きい電流を必要とするが、弁を開かせて保持す
るためには実質的に少ない電流を必要とするという特性
を有する。ライン606上の100ミリ秒のパルスが止
んだとき、保持電流のために抵抗器620およびドライ
バー618を通る接地接続のみを残して、ライン612
を直接接地させる。
【0200】ソレノイド弁614は1/2ランプ冷却
管、すなわち、試料ブロックを通して1つの方向に冷却
液を運ぶ管、のみにおいて試料ブロックを通るランプ冷
却冷却液の流れを制御する。他のソレノイド作動弁62
4は、対向する方向で試料ブロックを通る冷却液の流れ
を制御する。この弁は、ドライバー626および62
8、ワンショット604およびライン608により、ソ
レノイド作動弁614と正確に同一の方法で駆動され
る。
【0201】ランプ冷却の必要性は試料期間毎に1回評
価される。ブロック温度を測定しそしてそれをランプ冷
却がもはや必要ではない所望のブロック温度と比較する
ことによって、制御ソフトウェアのPIDタスクが決定
されたとき、ライン600上のRCOOL信号が不活性
化される。これは、CPU450により、PIC482
をアドレスし、そしてライン600に連結されたPIC
482中のレジスタ中の適当なビットの状態を逆転する
データをそれに書き込むことによって実施される。
【0202】PIT474は、また、2つの他のタイマ
を有し、これらは20Hzの割り込みおよび加熱LED加
熱を計時し、加熱LEDは試料ブロックが熱くそして接
触に危険であるときを視的指示を与える。システムは、
また、ビーパーワンショット630およびビーパー63
2を含んで、不正確なキーストロークがなされたときを
ユーザに警告する。
【0203】プログラム可能な割り込み制御装置476
を使用して、レベル1−テスト;レベル2−20Hz;レ
ベル3−トランスミット・レディ;レベル4−レシーブ
・レディ;レベル5−キーボード・割り込み;レベル6
−メインヒータ・ターンオン;および、レベル7−AC
ラインのゼロ交差からなる7の割り込みを検出する。プ
ログラム可能な割り込み制御装置482は、マルチプレ
クサ492および494を制御するための4つの出力
(図示せず)を有する。これらの信号「MUX1 E
N」および「MUX2 EN」は、マルチプレクサ49
2および494の一方または双方を使用可能とするが、
信号「MUV0およびMUV1は増幅器578への入力
にどのチャンネルを選択するかを制御する。これらの信
号は、2つのマルチプレクサからの1つのチャンネルの
みを任意の1つの時間に選択できるように管理される。
【0204】「RLTRIG*」信号は、CPUがクラ
ッシする場合PAL484への信号「TIMEOUT
EN*」の活性化を経てヒータを無能化するヒータのタ
イムアウトワンショット632をリセットする。すなわ
ち、ワンショット632は、すべてのヒータゾーンを無
能化する信号「TIMEOUT EN*」をそれが活性
化する前に、各トリガ後、それが待つ前以て決定した間
隔を有する。CPU450はルーチンを周期的に実行
し、これはPIC482をアドレスしそしてデータを適
当なレジスタに書き込んで、ライン634上の信号を活
性化してワンショット632をトリガする。CPU45
0がなんらかの理由で「クラッシ」しそしてこのルーチ
ンを実行しない場合、タイルアウトワンショット632
はすべてのヒータゾーンを無能化する。
【0205】PIC482は、また、加熱されたカバー
および試料ブロックのヒータを無能化するための出力
「COVHTR EN*」および「BLKHTREN
*」(図示せず)を有する。これらの信号の両者は低く
活性化し、そしてそれらはバス636を経るPAL48
4へ出力される。PIC482は、また、信号「BEE
P」および「BEEPCLR*」をバス640上に出力
してビーパーワンショット630を制御する。
【0206】PIC482は、また、信号「MEMI」
(図示せず)を出力し、この信号はEPROM456の
高いアドレス区画とバッテリーRAM458の低いアド
レスとの間のページをスイッチするために使用される。
2つの他の信号「PAGESEL0」および「PAGE
SEL1」(図示せず)は出力されて、EPROM4
56中の4つの16Kページの間を選択する。
【0207】4つの温度センサーは、10mV/°Kのゼ
ンナー電圧/温度依存性をもつナショナル LM 13
5ゼンナーダイオード型のセンサーである。ゼンナーダ
イオードは20Kの抵抗器496を通して調整された電
力供給498から推進される。ゼンナーを通る電流は、
0℃〜100℃の操作範囲にわたってほぼ560μA〜
615μAの間で変化する。ゼンナーそれ自体の加熱
は、同一範囲にわたって1.68mW〜2.10mWの間で
変化する。
【0208】マルチプレクサ492および494はDG
409アナログスイッチである。ライン488および4
90上の電圧は、Vout =3*Vin−7.5の移動関数
をもつAD625KN計器増幅器により増幅される。0
℃〜100℃にわたって2.73〜3.73のゼンナー
温度センサーの出力で、増幅器578の出力は0.60
ボルト〜3.69ボルトであり、これはA/D入力範囲
内にきっちり入る。
【0209】高度に精確なシステムの実施に対する重要
なことは、すぐれた精度および周囲温度の変化によるド
リフトが低いことである。これらの目標の両者は、精確
な電圧参照源、すなわち、較正電圧発生器506を使用
し、そして、温度センサーの出力およびライン510上
のACライン電圧をモニターするために使用されるのと
同一のエレクトロニクスのチェインを通るその出力を連
続的にモニターすることによって達成される。
【0210】較正電圧発生器506はライン650およ
び652上に2つの精確な電圧を出力する。一方の電圧
は3.75ボルトであり、そして他方は3.125ボル
トである。これらの電圧は、抵抗器間の0.05%の合
致および抵抗器間の5ppm /℃の温度ドリフトをもつ、
1ストリングの超低ドリフトの統合された薄いフィルム
の抵抗器を使用して、調整された供給電圧を分割するこ
とによって得られる。較正電圧発生器は、また、A/D
コンバータ参照電圧について−5ボルトおよび計器増幅
器オフセットについて−7.5ボルトを発生する。これ
らの2つの電圧はライン(図示せず)によりA/D48
6および増幅器578に伝えられる。これらの負の電圧
は、同一薄いフィルムの参照電圧のネットワークおよび
OP27GZオペアンプ(図示せず)を使用して発生さ
れる。操作増幅器578のためのゲイン設定抵抗器は、
また、超低ドリフトの薄いフィルムの統合された合致抵
抗器である。
【0211】制御ファームウェア、制御エレクトロニク
スおよびブロックの設計は、PCRプロトコルのウェル
対ウェルおよび計器対計器の輸送性が可能であるように
設計される。高い処理の実験室は、実験室の人員の広い
スペクトルについて使用容易でありそして必要とする訓
練が最小である計器から利益を得る。本発明のためのソ
フトウェアは、複雑なPCRサーモサイクリングのプロ
トコルを取り扱うと同時にプログラムが容易であるよう
に開発された。さらに、それは電力の中断の間の試料の
統合性を保証するような安全装置をもって提供され、そ
して安全な記憶装置の中に各ランの詳細な事象を書き込
むことができる。
【0212】システムが適切に作動していることを保証
するために、図54〜図57に示したパワーアップ自己
検査を完結した後、本発明のユーザのインタフェース
は、ファイルを実行し、つくりまたは編集し、またはユ
ーティリティファンクションをアクセスするようにユー
ザを招待する、簡単なトップレベルのメニューを提供す
る。プログラミングの技能は要求されない。なぜなら、
前以て存在する不足のファイルは個別化した時間および
温度を使用して編集し、次いで後の使用のために記憶装
置に記憶することができるからである。ファイルは、通
常、所望の温度を保持するか、あるいはサーモサイクリ
ングするための命令の組から成る。複雑なプログラムは
ファイルを一緒にリンクしてある方法を形成することに
よってつくられる。普通に使用されるファイル、例え
ば、サーモサイクル後の4℃インキュベーションは、他
のユーザにより、記憶され、そして方法に組み込むこと
ができる。新しい型のファイル、AUTOファイルは、
パラメータの制御にいくつかの型の変化のどれが各サイ
クル:時間の増加(オートセグメントの伸長、収率の増
大するため)、時間の減少、または温度の増加または減
少、を起こすかを特定できるようにする、PCRサイク
リングのプログラムである。最高の制御の精度および最
も信頼性がある方法の転移のために、温度は0.1℃に
安定であり、そして時間は最も近い秒にプログラミング
される。本発明は、ランの間の1または2以上の設定点
で特定したサイクルにおける試薬の添加および管の取り
出しのための、計画を立てたPAUSEをプログラミン
グする能力を有する。
【0213】本発明のシステムは、各ランのための50
0の記録履歴を記憶する能力を有する。この特徴によ
り、各サイクルにおいて個々のステップを概観し、そし
て不規則性に関する特別の状態または誤まったメッセー
ジをフラッグすることができる。オプショナルのプリン
タを使用して、本発明はファイルおよび方法のパラメー
タ、時間/日付のスタンプをもつラン−時間時間/温度
のデータ、形状のパラメータ、および分類されたファイ
ルのディクショナリーのハードコピーのドキュメンテー
ションを提供する。
【0214】再現性あるサーモサイクリングを保証する
ために、計算した試料の温度は各サイクルのランプおよ
び保持セグメントの間に表示される。セットした温度よ
り1°低い温度を通常使用してランプ−時間および保持
−時間のクロックをトリガするが、これはユーザにより
変更されることができる。管の型および体積についての
適切な時間を使用すると、試料は、常に、長いまたは短
いインキュベーション時間がプログラミングされるかど
うかに無関係に、同一精度で所望の温度に到達する。ユ
ーザは変性されたプライマーの特殊化されたアニーリン
グの要件、または非常にGCに富んだ標的のための非常
に短い(1〜5秒)高度の変性についてゆっくりしたラ
ンプをプログラミングすることができる。知能の欠乏は
2および3温度のPCRサイクルについて前以てプログ
ラミングされる。
【0215】診断テストをアクセスして、加熱および冷
却のシステムの状態をチェックすることができる。なぜ
なら、ソフトウェアはPass/Failのレポートを
与えるからである。さらに、システム実行のプログラム
は包括的なサブシステムの評価を実施し、そして要約の
状態のレポートを発生する。制御ファームウェアは、以
下に列挙するいくつかのセクションから構成される: − 診断 − 較正 − 導入 − 実時間オペレーション − システムを管理する9つの優先化タスク − スタートアップシーケンス − ユーザのインタフェース ファームウェアの種々のセクションを、テキスト的な記
述、擬似符号または両者で記述する。
【0216】ファームウェアの特徴は、次の通りであ
る: 1.平均試料ブロック温度を+/−0.1℃に管理しな
らびに試料ブロック中のウェルの間のような温度の不均
一性を+/−0.5℃内に維持する制御システム。 2.ライン電圧の変動およびエレクトロニック温度ドリ
フトを測定および補償する温度制御システム。
【0217】3.システムの成分が働いているかどうか
を決定する広範なパワーアップ診断。 4.加熱および冷却のシステムが適切に働いているかを
評価する導入プログラムにおける包括的な診断。 5.オペレーターのメニューへの依存性を最小にして計
器のオペレーションを可能とするメニュー推進システム
を使用する、論理および有機化されたユーザのインタフ
ェース。
【0218】6.17までのPCRプロトコルをリンク
しそしてそれらを1つの方法として記憶する能力。 7.150までのPCRプロトコルおよび方法をユーザ
のインタフェースの中に記憶する能力。 8.シーケンスタスクの一部分として前のランの500
までの事象をレコードする履歴ファイル。
【0219】9.最大の温度の精度および制御のために
ランの開始の反応体積および管の大きさ型をユーザのイ
ンタフェースの一部分として定めそしてPIDタスクに
おけるタウ(管の時間定数)を変更する能力。 10.電力破壊から回復したとき、システムは試料ブロ
ックを4℃に推進して、試料隔室の中に負荷できる試料
を救う。アナライザーは、また、シーケンスタスクの一
部分として電力破壊の期間をレポートする。
【0220】11.履歴ファイルの内容、「ラン時間」
パラメータおよび記憶されたPCRプロトコルのパラメ
ータをプリントタスクのパラメータとしてプリントする
能力。 下に記載する診断のいくつかのレベルが存在する:1系
列のパワーアップテストは、計器がオンにされる毎に、
自動的に実施する。それらはユーザの介在なしにハード
ウェアのクリティカル領域を評価する。成分の故障を検
出するテストを再び実行することができる。テストが2
回失敗した場合、エラーのメッセージは表示され、そし
てキーボードは電子的にロックされて、ユーザが続ける
のを防止する。
【0221】次の領域をテストする:プログラム可能な
周辺インタフェース装置、バッテリーRAM装置、バッ
テリーRAM検査合計、EPROM装置、プログラム可
能なインタフェースタイマ装置、クロック/カレンダー
装置、プログラム可能なインタフェース制御装置、アナ
ログ対ディジタルセクション、温度センサー、適切な構
成プラグの検証。
【0222】1系列のサービスオンリー診断は、製造業
者の場所における最後のテスターにおよび「隠れた」キ
ーストロークシーケンス(すなわち、カスタマーに未知
の)によるフィールドサービスエンジニアーにとって利
用可能である。テストの多くは、99回まで連続的に実
行することができる以外、診断を開始するときのテスト
と同一である。
【0223】次の領域をテストする:プログラム可能な
周辺インタフェース装置、バッテリーRAM装置、バッ
テリーRAM検査合計、EPROM装置、プログラム可
能なインタフェースタイマ装置、クロック/カレンダー
装置、プログラム可能なインタフェース制御装置、アナ
ログ対ディジタルセクション、RS−232セクショ
ン、ディスプレイセクション、キーボード、ビーパー、
ランプ冷却弁、EPROM不一致のチェック、ファーム
ウェアのバージョンレベル、バッテリーRAM検査合計
および初期化、自動開始プログラムフラッグ、較正フラ
ッグのクリア、加熱されたカバーヒータおよび制御回
路、へりヒータおよび制御回路、製造のヒータおよび制
御回路、中央ヒータおよび制御回路、試料ブロックの熱
的カットオフテスト、加熱されたカバーの熱的カットオ
フテスト。
【0224】ユーザの診断を、また、使用して急速な冷
却および加熱のランプの検証および加熱および冷却シス
テムの広範な確証を実施することができる。これらの診
断、また、使用して、前のランにおいて起こった事象の
順次のレコードである、履歴ファイルを見ることができ
る。レコードは、時間、温度、設定点の数、サイクルの
数、プログラムの数および状態のメッセージを含有す
る。
【0225】遠隔診断を使用して、RS−232ポート
を経る外部のコンピュータからのシステムを制御するこ
とができる。制御はサービスの診断および計器の較正の
みに限定される。種々のプライマー、例えば、ヒータの
抵抗などを決定するための較正を実施する。較正スクリ
ーンに対してアクセスは、「隠れた」キーのシーケンス
(すなわち、カスタマーに未知である)により限定され
る。次のパラメータを較正する:構成プラグは、冷却装
置、試料ブロックヒータ、冷却液ポンプおよび適切な電
圧および周波数(100V/50Hz、100/60Hz、
120/60Hz、220/50Hzまたは230/50H
z)のための電力供給を再配線するモジュールである。
ユーザは導入した構成プラグの型を入力する。ファーム
ウェアはこの情報を使用して試料ブロックのヒータの同
等の抵抗を計算する。パワーアップすると、システムは
選択した構成プラグが電流ラインの電圧および周波数と
一致することを検証する。
【0226】ヒータの抵抗は、供給されるヒータ電力の
正確な較正を実施できるように、較正プロセスにおいて
決定しなくてはならない。ユーザは6つの試料ブロック
ヒータ(2つの主ヒータ、2つのマニホールドヒータお
よび2つのへりヒータ)の実際の抵抗を入力する。構成
プラグはヒータを220〜230VACオペレーション
について直列におよび100〜120VACオペレーシ
ョンについて並列に配線する。ファームウェアは、次の
式により3つのヒータの各々の同等の抵抗を計算する: (7)100〜120VACについて:Req=(R1
2 )/R1 +R2 (8)220〜230VACについて:Req=R1 +R
2 同等の抵抗を使用して試料ブロックへの加熱電力の正確
な量を誘導する(電力=電圧2 ×抵抗)。
【0227】A/D回路の較正は、温度が正確に測定で
きるようにするために必要である。これは2つのテスト
点の電圧(CPUボード上のTP6およびTP7)を測
定し、そして測定した電圧を入力することによって実施
される。各電圧におけるA/Dの出力は2点の検量線の
基礎を形成する。これらの電圧は5ボルトの精度の源か
ら誘導され、そして正確でありそして温度依存性であ
る。各ランの開始において、これらの電圧は温度のため
の電子的ドリフトを測定するシステムにより読まれる。
なぜなら、A/D出力の変化はアナログチェイン(マル
チプレクサ、アナログ増幅およびA/Dコンバータ)に
おける温度依存性のためからである。
【0228】4つの温度センサー(試料ブロック、周
囲、冷却液および加熱されたカバー)の較正は、正確な
温度測定について実施される。計器の中への導入の前
に、周囲、冷却液および加熱されたカバーの温度センサ
ーは水浴の中に配置され、ここでそれらの出力は記録さ
れる(YYYYmVにおけるXX.X℃)。次いで、これ
らの値をシステムに入力する。これらの領域における温
度の精度はクリティカルではないので、1点の検量線を
使用する。
【0229】試料ブロックのセンサーを計器中で較正す
る。15の正確な温度プローブの列は、好ましい実施態
様において試料ブロックの中に戦略的に配置する。温度
プローブの出力を集め、そしてコンピュータにより平均
する。ファームウェアはブロックに40℃に行くように
命令する。短い安定化期間後、15プローブにより読ま
れるものとして平均のブロック温度を入力する。この手
順を95℃において反復して2点の検量線を形成する。
【0230】AC対DCライン電圧のサンプリング回路
の較正は、2つの所定のAG入力電圧についてのAC対
DC回路の出力をシステムに入力し、2点の検量線を形
成することによって実施する。回路の出力は要求される
範囲(90〜260VAC)にわたって非直線であり、
したがって各端において2点(100および120、2
20および240VAC)を必要とし、そして電流入力
電圧に基づいて1セットを使用する。
【0231】AC電圧の正確な測定値は正確な量の電力
を試料ブロックへ供給するために必要である(電力=電
2 ×抵抗)。導入プログラムは、冷却および加熱シス
テムの広範なテストを実施する診断道具である。導入の
測定値および計算値は、冷却コンダクタンス、10℃お
よび18℃におけるランプ冷却コンダクタンス、10℃
および20℃における冷却電力、試料ブロックの熱的お
よび冷却液の容量および試料ブロックのセンサー遅れを
制御する。導入の目的は3倍である: 1.限界のまたは故障の成分を暴露する。
【0232】2.測定された値のいくつかをバッテリー
バックアップRAMの中に記憶されたシステム定数とし
て使用して、所定の計器についての制御システムを最適
化する。 3.経時的加熱および冷却システムの規模縮小を測定す
る。 システムを輸送する前に、導入を実行しそして、また、
使用前にまたは主要な成分が置換されたときはいつで
も、実行すべきである。導入プログラムは、また、ユー
ザの診断の下でユーザにより実行することができる。
【0233】ヒータのピングテストは、ヒータが電流ラ
イン電圧のために適切に構成されることを検証する(す
なわち、90〜132VACについて並列および208
〜264VACについて直列)。ファームウェアは1バ
ーストの電力を試料ブロックに供給し、次いで10秒の
時間期間にわたる温度上昇をモニターする。温度上昇が
特定したランプ速度のウインドーの外側にある場合、ヒ
ータは電流ライン電圧について不正確に配線され、そし
て導入プロセスは停止される。
【0234】制御冷却コンダクタンステストは試料ブロ
ックを横切る制御冷却パッセージへの熱コンダクタンス
ccを測定する。このテストはまず試料ブロック温度を
60℃に推進し(ランプ弁を閉じる)、次いでブロック
を60℃に30秒の時間期間にわたって維持するために
要求されるヒータ電力を積分する。積分された電力を間
隔にわたるブロック温度と冷却液温度との間の差の合計
で割る。 (9)Kcc=Σヒータ電力(60℃)/Σ(ブロック−
冷却液温度) 典型的な値は1.40〜1.55ワット/℃である。低
いKccはライナーの詰まりを示す。高いKccは完全に閉
じていないランプ弁、ライナーの直径の外側への冷却液
の漏れ、またはシフトしたライナーのためであることが
ある。ブロックの熱容量(Blk Cp)テストは、ま
ずブロックを35℃に制御し、次いで最大電力をヒータ
へ20秒間加えることによって、試料ブロックの熱容量
を測定する。試料ブロックの熱容量は、積分された電力
/ブロック温度の差に等しい。精度を増加するために、
バイアス冷却の電力の作用は増加された電力から減ず
る。 (10)Blk Cp=ランプ時間*(ヒータ−制御冷
却電力)/Δ温度 ここで、 ランプ時間=20秒、 ヒータ電力=500ワット、 制御冷却=(Σブロック−冷却液温度)*Kcc Δ温度=TBlockt=20−TBlockt=0 Blk Cpの典型的な値は540ワット−秒/℃±3
0である。正常のKcc値を仮定するとき、ブロックの熱
容量の増加は熱的負荷、例えば、フォームのバッキング
中の湿気、試料ブロックの回りの絶縁損失、またはヒー
タ電力の減少、例えば、6のヒータゾーンの1つの故障
またはヒータゾーンを推進する電子回路の故障、または
不正確さまたは不正確に配線されている電圧構成モジュ
ールのためである。
【0235】冷却テストは10℃および18℃における
システム冷却出力(ワット)を測定する。所定の温度に
おけるシステム冷却電力または冷却出力は、その温度に
おける熱的負荷の合計に等しい。主な成分は次の通りで
ある:1.所定の温度にブロックを維持するために要求
される加熱電力、2.システムの回りに冷却液を循環さ
せるために使用するポンプが消散する電力、および3.
周囲への冷却液ライン中の損失。電力パラメータは、冷
却液の温度を10℃または18℃に制御し、そして32
秒の間隔にわたって一定の冷却液温度に維持するために
加えられる積分することによって測定させる。ブロック
温度と冷却液温度との間の差は、また、積分して周囲温
度への損失をクリアする。 (11)冷却温度=Σ加熱電力+ポンプ電力+(Kam
b*Σ(blk−cooltemp)) ここで、 加熱電力=冷却液を10℃または18℃に32秒の時間
にわたって維持するために要求される加熱電力の合計、 ポンプ電力=循環ポンプ、12ワット、 Kamb=周囲へのコンダクタンス、20ワット/℃、 blk−cool temp=32秒の時間にわたるブ
ロックおよび冷却液温度の差の合計。
【0236】冷却電力のための典型的な値は、10℃に
おいて230ワット±40および18℃において370
ワット±30である。低い冷却電力は、ファン通路の障
害、欠陥のあるファン、または冷却装置の限界のまたは
故障のためである。それは、また、電圧構成プラグの配
線の誤まりであることがある。ランプ冷却コンダクタン
ス(Kc )テストは、10℃および18℃における試料
ブロックを横切るランプおよび制御冷却通路への熱コン
ダクタンスを測定する。このテストは、まず冷却液温度
を10℃または18℃において制御し、次いで、30秒
の時間の間隔にわたって、所定の温度に冷却液を維持す
るために要求される加熱電力/その時間にわたるブロッ
ク温度および冷却液温度の差を積分することによって実
施される。 (12)Kc =Σ加熱電力/Σ(ブロック−冷却液温
度) Kc について典型的な値は10℃において28ワット/
℃±10℃および18℃において31ワット/℃±3で
ある。低いKc は閉じたまたは障害されたランプ弁、キ
ンクした冷却液管、弱いポンプまたは硬水/プレストン
(登録商標)混合物のためであることがある。
【0237】センサー遅れテストは、まずブロック温度
を35℃に制御し、次いで500ワットのヒータ電力を
2秒間加え、そしてブロックを1℃上昇するために要求
される時間を測定することによって、ブロックセンサー
遅れを測定する。典型的な値は13〜16単位であり、
ここで各単位は200ミリ秒に等しい。遅いまたは長い
センサー遅れは、センサーとブロックとの間の劣った界
面、例えば、熱的グリースの欠如、センサーのキャビテ
ィの劣った機械加工またはセンサーの故障のためである
ことがある。
【0238】残りの導入テストは現在導入プログラムに
より実行されるが、それらは計算された値であるか、あ
るいは多数の変数をもつので、それらの結果が問題の源
を正確に決定しない関数であるという事実のために、制
限された診断の目的を有する。導入プログラムは18℃
と10℃との間のランプ冷却コンダクタンス(Sc )の
勾配を計算する。それはコンダクタンス曲線の直線性の
測度である。それは、また、0℃におけるランプ冷却コ
ンダクタンスを概算するために使用する。典型的な値は
0.40±0.2である。値の広がりは、それがちょう
ど近似値であるという事実を証明する。 (13)Sc =(Kc 18°−Kc 10°)/(1
8℃−10℃) 導入プログラムは、また、冷却コンダクタンスKc0を計
算する。Kc0は0℃における冷却コンダクタンスは10
℃における実際のコンダクタンスから外挿される。典型
的な値は23ワット/℃±5である。使用した式は次の
通りである: (14)Kc0=Kc 10−(Sc*10℃) 導入プログラムは、また、冷却液容量(Cool C
p)を計算し、この冷却液容量は全体の冷却液の流れ
(冷却液、ポンピングライン、熱交換器、および弁)の
熱容量の近似値である。冷却容量は、冷却液の中に熱を
送る成分−冷却液から熱を除去する成分に等しい。これ
らの成分を測定しそして計算するために使用した機械は
複雑であり、そして源コードの説明のセクションにおい
て詳細に記載する。この測定において、冷却液は10℃
において安定化されることができる。最大ヒータ電力を
128秒間試料ブロックに加える。 (15)Cool Cp=加熱源−冷却液源 (16)Cool Cp=加熱電力+ポンプ電力+Ka
mp*(ΣTamp−ΣTcool) − Block Cp*(Tblockt=0 −Tblo
ckt=128 ) − Tblockt=0 とTblockt=128 との間の平
均冷却電力 { }内に囲まれた文字は源コードにおいて使用した可
変の名前を示す。ヒータピンテスト擬似コード :ヒータピンテストは、ヒ
ータが電流ライン電圧のために適切に配線されているこ
とを検証する。
【0239】試料ブロックおよび冷却液を既知のおよび
安定な点にする。 ランプ冷却弁をオンにする ブロックおよび冷却液が5℃以下になるのを待つ ランプ冷却弁をオフにする ブロック温度の低下を10秒の時間間隔にわたって測定
することによって、制御冷却の冷却効果を測定する。測
定を行う前に安定化のために10秒待つ。 10秒待つ temp1=ブロック温度 10秒待つ temp2=ブロック温度 {tempa}=temp2−temp1 実際に測定したライン電圧を含有する変数{ライン電
圧}を検査する。190Vより大きいライン電圧につい
て75ワットで、あるいは140Vより小さい場合30
0ワットでヒータをパルスする。 ({ライン電圧}>190V)の場合、75ワットをヒ
ータに供給する そのほかに300ワットをヒータに供給する 10秒の時間の期間にわたる時間上昇を測定する。この
結果は0.01°/秒の平均の熱速度である。 temp1=ブロック温度 10秒待つ temp2=ブロック温度 {tempb}=temp2−temp1 制御冷却効果から平均加熱速度{tempb}を減じて
真の加熱速度を計算する。 (17)heat rate={tempb}−{te
mpa} heat rateを評価する。220〜230Vにつ
いて、加熱速度は0.30°/秒より小さくあるべきで
ある。100〜120Vについて、加熱速度は0.30
°/秒より大きくあるべきである。(ライン電圧=22
0Vおよびheat rate>0.30°/秒)であ
る場合、 エラー−>120について配線されたヒータ ロックアップキーボード (ライン電圧=120Vおよびheat rate<
0.30°/秒)である場合、 エラー−>220について配線されたヒータ ロックアップキーボードKCCテスト擬似コード :このテストはKccとしてまた
知られている制御冷却を測定する。
【0240】Kccは60℃のブロック温度において測定
した。ブロックを60℃に推進する ブロック温度を60℃に300秒間を維持する 30秒の時間の期間にわたって試料ブロックのヒータに
加えられている電力を積分する。ブロック温度を制御冷
却バイアスで維持するために要求される電力を測定およ
び積分する。 {dt sum}=0 (デルタ温度の合計) {main pwr sum}=0(主ヒータ電力の合計) {aux pwr sum}=0 (補助ヒータの電力の合計) (カウント=1〜30) { {dt sum}={dt sum}+(ブロック温度−冷却液温度) 1秒待つ 主ヒータおよび補助ヒータに加えられる電力を蓄積す
る。実際のコードはPID制御タスクにあり、したがっ
て200ミリ秒毎に合計する。 {main pwr sum }={main pwr sum }+{actual power } {aux pwr sum }={aux pwr sum }+{aux1 actual}+{aux2 actual} } 電力の合計を温度の合計で割ることによってコンダクタ
ンスを計算する。単位は10mV/℃であることに注意す
る。 (18) Kcc=({main pwr sum }+{aux pw
r sum })/{dt sum }BLOCK CPテスト擬似コード :このテストは試料
ブロックの熱容量を測定する。ブロックを35℃に推進
する ブロック温度を35℃に5秒間を制御し、そして初期温
度を制御する。 initial temp=ブロック温度 最大電力をヒータに20秒間供給し、その間ブロック温
度対冷却液温度の差ならびにヒータ電力を合計する。 500ワットを推進する {dt sum}=0 (カウント=1〜20秒) { {dt sum}={dt sum}+(ブロック温度−冷却液温度) 1秒待つ } (19)delta temp=ブロック温度−ini
tial temp ランプの間に起こる制御冷却のための冷却電力のジュー
ルを計算する。 (20)cool joule=制御冷却コンダクタン
ス(Kcc)*{dt sum} 主ヒータおよび制御冷却からブロックへ加えられる合計
のジュールを計算する。間隔にわたる温度変化で割って
熱容量を計算する。 (21)Block Cp=ランプ時間*(ヒータ電力
−cool joule)/delta temp ここで:ランプ時間=20秒 ヒータ電力=500ワットCOOL PWR 10 :このテストは冷却電力を10
℃で測定する。冷却液温度を10℃で制御し、そして1
20秒間安定化する。 この時点において、冷却液は10℃に120秒間あり、
そして安定化された。32秒にわたって、120℃の冷
却液温度を維持するために加えていた電力を積分する。 主ヒータおよび補助ヒータ加えた電力を蓄積する。実際
のコードは制御タスクにある。
【0241】 {main pwr sum }={main pwr sum }+actual power {aux pwr sum }={aux pwr sum }+aux1 actual+aux2 actu al delta temp sum =delta temp sum +(周囲温度−冷却液温度) 1秒待つ } 積分間隔の間に冷却液質量に添加されたエネルギーのジ
ュール数を計算する。「(冷却液温度−cool in
it)」は積分間隔の間の冷却液温度の変化である。5
50は冷却液のCp(ジュール)であり、こうして積は
ジュールである。それは冷却液に添加され余分の熱を表
し、これは冷却液を積分間隔の間に設定点からドリフト
させる。このエラーは冷却液電力の計算前に加えられた
合計の熱から減ずる。 (22)cool init=(冷却液温度−cool
init*550J 主電力の合計を補助ヒータの合計に添加して、32秒で
消散したジュールを得る。32で割って平均ジュール/
秒を得る。 (23) {main pwr sum }=({main pwr su
m }+{aux pwr sum }−cool init)/32 すべての冷却電力成分を合計することによって、10℃
における冷却電力を計算する。 (24)Power10 ℃=main power sum +PUMP PWR+(K AMB * delta te mp sum) ここで: {main pwr sum}=間隔にわたるヒータ電
力の合計 PUMP PWR=12ワット、冷却液を計算するポン
プ delta temp sum=間隔にわたる周囲−冷
却液合計 K AMB=20ワット/K、冷却から周囲への熱的コ
ンダクタンスKC 10テスト擬似コード :このテストはランプ冷却
コンダクタンスを10℃で測定する。
【0242】冷却液温度を10℃±0.5に制御し、そ
してそれを10秒間安定化する。この時点において、冷
却液は設定点にあり、そして制御されている。30秒の
時間間隔にわたって、冷却液温度を10℃に維持するた
めにヒータに加えられている電力を積分する。ブロック
温度を冷却液温度との間の差を合計する。 主ヒータおよび補助ヒータに加えられる電力を蓄積す
る。実際のコードはPID制御タスクにある。
【0243】 {main pwr sum }={main pwr sum }+actual power {aux pwr sum }={aux pwr sum }+aux1 actual+aux2 actu al {dt sum }={dt sum }+(ブロック温度−冷却液温度) 1秒待つ } 合計期間にわたってブロックに供給されたエネルギー
(ジュール)を計算する。単位は0.1ワットである。 (25){main pwr sum }={main pwr sum }
+{aux pwr sum } 電力合計をブロック温度−冷却液温度の合計で割って、
ランプ冷却コンダクタンス(100mW/K)を得る。 (26)Kc 10={main pwr sum}/
{dt sum}COOL PWRテスト擬似コード :このテストは冷却
電力を18℃で測定する。
【0244】試料ブロックおよび冷却液を既知の安定な
点にする。冷却液温度を18℃で制御し、そして128
秒間安定化する。 カウント=128 (カウント!=0)の間に実施する { (冷却液温度=18℃±0.5)の場合、カウント=カウント−1 そのほかに カウント=120 1秒待つ } この時点において、冷却液は18℃に120秒間あり、
そして安定化した。32秒にわたって、18℃の冷却液
温度を維持するために加えられる電力を積分する。 主ヒータおよび補助ヒータに加えられる電力を蓄積す
る。実際のコードは制御タスクにある。
【0245】 {main pwr sum }={main pwr sum }+actual power {aux pwr sum }={aux pwr sum }+aux1 actual+aux2 ac tual delta temp sum =delta temp sum +(周囲温度−冷却液温度) 1秒待つ } 積分間隔の間に冷却液質量に添加されたエネルギーのジ
ュール数を計算する。「(冷却液温度−cool in
it)」は積分間隔の間の冷却液温度の変化である。5
50は冷却液のCp(ジュール)であり、こうして積は
ジュールである。それは冷却液に添加され余分の熱を表
し、これは冷却液を積分間隔の間に設定点からドリフト
させる。このエラーは冷却液電力の計算前に加えられた
合計の熱から減ずる。 (27)cool init=(冷却液温度−cool
init)*550J 主電力の合計を補助ヒータの合計に添加して、32秒で
消散したジュールを得る。32で割って平均ジュール/
秒を得る。 (28) {main pwr sum }=({main pwr su
m }+{aux pwr sum }−cool init)/32 すべての冷却電力成分を合計することによって、18℃
における冷却電力を計算する。 (29)Power18 ℃=main power sum +PUMP PWR
+(K AMB * delta temp sum) ここで: {main pwr sum}=間隔にわたるヒータ電
力の合計 PUMP PWR=12ワット、冷却液を計算するポン
プ delta temp sum=間隔にわたる周囲−冷
却液合計 K AMB=20ワット/K、冷却から周囲への熱的コ
ンダクタンスKC 18テスト擬似コード :このテストはランプ冷却
コンダクタンスを18℃で測定する。
【0246】冷却液温度を18℃±0.5に制御し、そ
してそれを10秒間安定化する。この時点において、冷
却液は設定点にあり、そして制御されている。30秒の
時間間隔にわたって、冷却液温度を18℃に維持するた
めにヒータに加えられている電力を積分する。ブロック
温度を冷却液温度との間の差を合計する。 主ヒータおよび補助ヒータに加えられる電力を蓄積す
る。実際のコードは制御タスクにある。
【0247】 {main pwr sum }={main pwr sum }+actual power {aux pwr sum }={aux pwr sum }+aux1 actual+aux2 actu al {dt sum }={dt sum }+(ブロック温度−冷却液温度) 1秒待つ } 合計期間にわたってブロックに供給されたエネルギー
(ジュール)を計算する。単位は0.1ワットである。 (30){main pwr sum }={main pwr sum }
+{aux pwr sum } 電力合計をブロック温度−冷却液温度の合計で割って、
ランプ冷却コンダクタンス(100mW/K)を得る。 (31)Kc 18={main pwr sum}/
{dt sum}SENLAGテスト擬似コード :このテストは試料ブロ
ックのセンサー遅れを測定する。
【0248】ブロックを25℃に推進する。±0.2℃
内に20秒間保持し、次いでブロック温度をレコードす
る。 {tempa}=ブロック温度 500ワットの電力を試料ブロックに供給する。次の2
秒間500ワットの電力を加え、そしてブロック温度を
1℃増加するためのループを通る繰り返しの量をカウン
トする。各ループの繰り返しを200ミリ秒毎に実行
し、したがって実際のセンサー遅れはカウント*200
ミリ秒に等しい。 secs=0 カウント=0 (TRUE)の間に実施する { (secs>=2秒)の場合、ヒータを遮断する (ブロック温度−tempa>1.0℃)の場合、ループの間に出る カウント=カウント+1 } センサー遅れ=カウント の間に実施する冷却液Cpテスト擬似コード :このテストはシステム全
体の冷却液容量を計算する。冷却液温度を10℃±0.
5に安定化する。メッセージをPID制御タスクに送っ
て冷却液温度をその現在の値(約10℃)から18℃に
ランプする。冷却液が12℃を横切るを待って、冷却液
CPランプが常に同一温度で開始し、そして明瞭に開始
されたランピングを有するようにする。初期周囲および
ブロック温度に注意する。 次の2分間、冷却液温度が18℃にランピングする間、
冷却液温度および周囲温度と冷却液温度との間の差を合
計する。 (32){cool sum}=cool temp
sum+冷却液温度 (33){temp sum}=周囲−冷却液温度 2分の期間にわたる温度変化を計算する。 (34){blk delta}=ブロック温度−{b
lk delta} (35){h2o delta}=冷却液温度−{h2
delta} KChill、すなわち、10℃〜20℃の冷却液範囲
にわたる冷却液温度をもつ冷却電力の変化速度を計算す
る。単位はワット/10℃であることに注意する。 (36)KChill=(18℃における冷却電力−1
0℃における冷却電力) ランプ冷却コンダクタンス対18℃〜10℃の温度範囲
の勾配であるScを計算する。単位はワット/10℃/
10℃である。 (37)Sc=(Kc 18−Kc810)/8 Kc 0、0℃に外挿したランプ冷却コンダクタンス、
を計算する。 (38)Kc 0=Kc 10−(Sc*10) Cp Cool、冷却液のCp、を次の式により計算す
る: (39)Cp Cool=(HEATPOWER*128 +PUMP PWR *128 −Pwr 0℃*128 −Block Cp*blk delta + K AMB *temp sum −KChill*cool temp sum)/h2o delta ここで、 HEATOPOWER=500W、ブロックを加温し、
こうして冷却液を加熱するために加えたヒータ電力。熱
間隔は128秒であったので、それに128を掛ける、 PUMP PWR=12W、冷却液を循環させるポンプ
の電力×128秒、 Pwr 0℃=0℃における冷却電力×128秒、 Block Cp=試料ブロックの熱容量、 blk delta=熱間隔にわたるブロック温度の変
化、 K AMB=20ワット/K、冷却から周囲への熱的コ
ンダクタンス、 temp sum=間隔にわたる周囲温度−冷却液温度
の1回/秒の合計、 h2o delta=加熱(ほぼ6℃)の間隔にわたる
冷却液温度の変化、 KChill=冷却電力対冷却液温度の勾配、 cool sum=加熱間隔にわたる、冷却液温度、1
回/秒、の合計。実時間オペレーションシステム−CRETIN CRETINは、タスクと呼ぶ他のソフトウェアのモジ
ュールへシステムサービスを提供するスタンドアロン、
マルチタスキングのカーネルである。タスクはInte
l8085アセンブラーの中に書き込まれたある時間ク
リティカル領域をもつ「C」ランゲージで書き込まれ
る。各タスクはプライオリティレベルを有し、そして独
立のファンクションを提供する。CRETINは、スタ
ートアップ診断が首尾よく実行された後の、低い記憶お
よびランにある。CRETINはタスクのスケジューリ
ングを取り扱い、そして一度に1タスク/ランのみを可
能とする。CRETINは、すべてのハードウェアの割
り込みを受けとり、こうして適切な割り込みが受けとら
れたとき、待つタスクを実行させる。CRETINは実
時間クロックを提供して、タスクがタイムド事象を待つ
か、あるいは既知の間隔の間ポーズすることができるよ
うにする。CRETINは、また、メッセージノードの
システムを通るインタータスクのコミュニケーションを
提供する。ファームウェアは、下にプライオリティの順
序で下に簡単に記載する9つのタスクから構成されてい
る。引き続くセクションは各タスクをより詳細に記載す
る。
【0249】1.制御タスク(PID)は試料ブロック
温度を制御する。 2.キーボードタスクはキーパッドからのキーボードの
入力を処理する。 3.タイマのタスクは半分の第2ハードウェアの割り込
みを待ち、次いでウェイクアップメッセージを両者のシ
ーケンスおよびディスプレイタスクに送る。 4.シーケンスのタスクはユーザのプログラムを実行す
る。
【0250】5.ポーズのタスクは、プログラムが実行
されているとき、プログラミングした、キーパッドのポ
ーズを取り扱う。 6.ディスプレイのタスクは実時間で表示を更新する。 7.プリンタのタスクはRS−232のポートのコミュ
ニケーションおよびプリントを取り扱う。
【0251】8.LEDタスクは加熱LEDを推進す
る。それは、また、導入を実行しているとき、冷却液温
度の制御に使用される。 9.リンクのタスクはキーストロークをシミュレーショ
ンすることによってある方法を一緒にリンクされるファ
イルを開始する。ブロック温度制御プログラム(PID) 比例整数部差分(PID)タスクは、絶対試料ブロック
温度を0.1℃に制御しならびに、より多くの加熱電力
をブロックの周辺に加えてガードバンドのへりを通る損
失を補償することによって、試料ブロック温度の不均一
性(TNU、最も熱いウェルの温度−最も冷たいウェル
の温度として定義される)を±0.5℃に制御する。P
IDのタスクは、また、加熱されたカバーの温度をより
少ない精度に制御する。このタスクは5回/秒を実行
し、そして最高のプライオリティを有する。
【0252】試料ブロックへ供給される加熱電力または
冷却電力の量は、記憶装置に記憶されたユーザが特定し
た試料温度、設定点と呼ぶ、と現在の試料温度の間の差
または「誤差」から誘導される。この方式は標準のルー
プ制御の実施を可能とする。現在の誤差に直接比例する
フィルムヒータへの電力の寄与、すなわち、比例成分、
(設定点の温度−試料ブロック温度)に加えて、計算し
た電力トランスは、また、静止の誤差(設定点の温度−
ブロック温度<0.5℃)に近くなる働きをする整数項
を組み込む。この成分は整数成分と呼ぶ。整数項を回避
するために、整数への蓄積または「ウィンドアップ」の
寄与は設定点の温度付近の小さいバンドに制限される。
比例および整数成分のゲインは、注意して選択されそし
てテストされる。なぜなら、ブロックセンサーおよび試
料管に関連する温度定数は、システムの位相の限界をき
びしく制限し、こうしてループの不安定性についての可
能性をつくるからである。比例項のゲインは下の方程式
(46)におけるPであり、そして整数項のゲインは下
の方程式(48)におけるKiである。
【0253】PIDタスクは「制御されたオーバーシュ
ートのアルゴリズム」を使用し、ここで試料温度がその
所望の温度に出来るだけ急速に到達するように、ブロッ
ク温度はしばしばその最後の定常状態にオーバーシュー
トする。オーバーシュートのアルゴリズムの使用は、制
御された方法でブロック温度をオーバーシュートさせる
が、試料温度をオーバーシュートさせない。これは電力
を節約し、そしてPCR計器において新しいと信じられ
る。所望のランプ速度を達成するために試料ブロックの
すべてのヒータへ供給される合計の電力は、次の式によ
り与えられる: (40)電力=(CP/rmp rate)+バイアス ここで、 CP=ブロックの熱的質量 バイアス=バイアスまたは制御冷却電力 rmp rate=Tfinal +Tinitial /所望のラン
プ速度 この電力は安全性のために加熱電力500ワットの最大
にクランプされる。タスクの繰り返し毎に(200毎
に)、システムは次のアルゴリズムに基づいて加熱また
はランプ冷却電力(必要に応じて)を供給する。
【0254】制御システムは計算された試料温度により
推進される。試料温度は、試料ブロックのウェルの1つ
(以後「ブロック」)の中に配置された薄い壁のプラス
チック試料管中の液体の平均温度として定義される。シ
ステム(試料温度およびその内容)の温度定数は型およ
び体積の関数である。ランの開始において、ユーザは管
の型および反応体積の量を入力する。システムは生ずる
温度定数(τまたはtau)を計算する。マイクロアン
プ(登録商標)管および100μlの反応体積につい
て、tauはほぼ9秒である。 (41)Tblk-new =Tblk +Power*(200ms
/CP) (42)Tsamp-new=Tsamp+(Tblk-new −Tsamp
*200ms/tau ここで、 Tblk-new =現在のブロック温度 Tblk =200ミリ秒前のブロック温度 Power=ブロックに供給した電力 CP=ブロックの熱的質量 Tsamp-new=現在の試料温度 Tsamp=200ミリ秒前の試料温度 tau=センサーの遅れについて調節した、試料管の熱
的時間定数(約1.5) エラーの信号または温度は、単に、次の通りである: (43)エラー=設定点−Tampl-new 閉じたループのシステムとして、正しい作用(加熱また
は冷却電力)を現在のエラーの部分を閉じる。下の方程
式(45)において、Fは1つの試料期間において閉じ
るエラー信号のフラクションである。 (44)Tsamp-new=Tsamp+F*(SP−Tsamp) ここで、SP=ユーザの設定点の温度 システムにおける大きい遅れ(長い管の温度定数)のた
めに、フラクションのFは下にセットされる。式(4
2)および(44)を組み合わせると:次の式が得られ
る: (45)Tsamp-new=Tsamp+(Tblk-new −Tsamp
*.2/tau=Tsamp+F*(SP−Tsamp) 式(41)および(45)を組み合わせ、そして項P
(比例項のゲイン)を加えて、ブロック温度の振動を制
限し、そしてシステムの安定性を改良すると、次の式が
得られる: (46)Pwr=CP*P/T*((SP−Tsamp)*
F*Tau/T+Tsamp−Tblk ) ここで、 P=比例項のゲイン、 T=0.2秒の試料期間(200ミリ秒)、そして P/T=好ましい実施態様において1。 方程式(46)は、ガードバンドなどを通して周囲への
損失なしに、ブロック温度をある所望の温度に動かすた
めに必要な電力(Pwr)を与える、理論的方程式であ
る。
【0255】いったんブロックを推進するために必要な
電力が方程式(46)を経て決定されると、この電力は
3つのヒータゾーンの面積によりこれらのゾーンの各々
に供給される電力に分割される。次いで、マニホールド
への損失は決定され、そしてこれらの損失を補償するた
めに十分な大きさを有する電力項はマニホールドのヒー
タゾーンへ供給すべき電力量に加えられる。同様に、ブ
ロックの支持ピン、ブロック温度センサーおよび周囲へ
の電力損失を補償するために十分な他の電力項は、へり
ヒータゾーンへ供給すべき電力に加えられる。これらの
追加の項およびゾーンの面積により電力の分割は、方程
式(46)を前述の方程式(3),(4)および(5)
に変換する。
【0256】方程式(46)は、試料ブロックに対して
要求される加熱または冷却電力を決定する好ましい実施
態様により使用される式である。計算された試料温度が
「整数バンド」、標的温度(SP)付近の±0.5℃、
内にあるとき、比例項のゲインは残りのエラーを閉じる
ためには小さ過ぎる。したがって、整数項を比例項に加
えて、小さいエラーを閉じる。整数項は整数項の外側で
無能化して、大きいエラー信号が蓄積するのを防止す
る。「整数バンド」の内側のアルゴリズムは、次の通り
である: (47)Int sum(新しい)=Int sum
(old)+(SP−Tsamp) (48)pwr adj=Ki*Int sum(新し
い) ここで、 Int sum=SPとTSAMP温度との間の試料期間の
合計、 Ki=整数ゲイン(好ましい実施態様において51
2)。 いったん加熱電力が計算されると、制御ソフトウェア
は、図13における3つのヒータゾーン254,262
および256に、好ましい実施態様において面積に基づ
いて電力を分布させる。へり加熱はブロック温度と周囲
温度との間の差に基づいて追加の電力を受けとる。同様
に、マニホールドのヒータはブロック温度と冷却液温度
との間の差に基づいて追加の電力を受けとる。PID擬似コード システムのパワーアップまたはリセットのとき、 ランプ冷却をオフにする すべてのヒータをオフにする ヒータの抵抗を計算する フォエバー命令(do forever)−200ミリ
秒毎に実行する (ブロック温度>105)の場合、 ヒータをオフにする ランプ弁をオンにする エラーメッセージを表示する ライン電圧{linevolts}を読む 冷却液センサーを読みそして温度{h2otemp}に
変換する 周囲センサーを読みそして温度{ambtemp}に変
換する 加熱されたカバーのセンサーを読みそして温度{cvr
temp}に変換する 試料ブロックのセンサーを読みそして温度{blkte
mp}に変換する。コードのこの部分は、また、温度安
定性電圧参照を読み、そしてこの電圧を計器の較正の間
に決定された参照電圧と比較する。不一致が存在する場
合、エレクトロニクスはドリフトしそして温度センサー
からの読みを相応して調節して、正確な温度の読みを得
る。低パスディジタルフィルターを使用して表示された
試料温度{tubetenths}または獲得温度を計
算する。 (49)tubetenths=TTn-1 +(TBn
TTn-1 )*T/tau ここで、 TTn-1 =最後の試料温度{tubetenths}、 TBn =現在のブロックセンサー温度{blktent
hs}、 T=試料間隔(秒)=200ミリ秒、 tau=tau tube{cf tau}−tauセ
ンサー{cf tau} 方程式(49)は、上の方程式(6)としてが与えられ
た計算した試料温度を定義する指数のタイラー級数を表
す。試料ブロックより下のフォームのバッキングの温
度、仮想質量として知られている{phantenth
s}、を計算する。仮想質量の温度を使用して、仮想質
量を出入りする熱の流れを説明するブロックへ供給され
る電力を調節する。この温度はソフトウェアにおいて実
施される低パルディジタルフィルターを使用して計算さ
れる。 (50)phantenths=TTn-1 +(TBn
TTn-1 )*T/tau ここで、 TTn-1 =最後の仮想質量の温度{phantenth
s}、 TBn =現在のブロックセンサー温度{blktent
hs}、 T=試料間隔(秒)=200ミリ秒、 taufoam=フォームブロックのtau=30秒。
【0257】試料温度のエラー(試料温度と設定点温度
との間の差)(abs tube err)を計算する。 ランプ方向{fast ramp}=UP RAMPま
たはDN RAMPを決定する (試料温度が設定点(SP)のERR内にある)場合、 PIDは速い転移モードではない。{fast ram
p}=OFF ここでERR=「整数バンド」、すなわち、標的または
設定点温度を取り囲む温度の幅。どれだけ多くの熱がバ
イアス冷却チャンネルへ損失されているかを決定する制
御冷却電力{cool ctrl}を計算する。
【0258】現在のランプ冷却電力{cool ram
p}を計算する {cool brkpt}を計算する。ここで、{co
ol brkpt}は、ランプを制御冷却に下向きのラ
ンプでいつ転移させるかを決定するために使用する冷却
電力である。それはブロック温度および冷却液温度の関
数である。制御冷却電力{cool ctrl}および
ランプ冷却電力{cool ramp}のすべては、C
PUが下向きの温度のランプを制御するために、すなわ
ち、ランプ冷却のソレノイド作動弁をどれだけ長く開い
て保持するかを計算するために、知らなくてはならない
ファクターである。制御冷却電力は、(定数+回路)×
ブロックからバイアス冷却チャンネルへの熱的コンダク
タンスに等しい。同様に、ランプ冷却電力は、ブロック
温度と冷却液温度との間の差×ブロックからランプ冷却
コンダクタンスへの熱的コンダクタンスに等しい。冷却
ブレークポイントは、定数×ブロックと冷却液との間の
温度差に等しい。
【0259】ブロック温度をその現在の温度から所望の
設定点(SP)温度へ動かすために必要な加熱または冷
却電力{int pwr}を計算する。 (51){int pwr}=KP*CP*〔(SP−
SAMP)*{cf kd}+Ts−TBLK 〕 ここで、 KP=比例ゲイン=方程式(46)中のP/T=好まし
い実施態様においてほぼ1、 CP=ブロックの熱的質量、 SP=温度の設定点、 TSAMP=試料温度、 TBLK =ブロック温度、 cf kd=tau*Kd /delta t、ここでt
auは方程式(49)において使用したのと同一のta
uであり、そしてKd は付録Cに記載する定数であり、
そしてdelta tは200ミリ秒の試料期間であ
る。 (試料温度が設定点の{cf iband}内にある)
場合、試料エラーを積分する{i sum} そのほかに (52){i sum=0}をクリアする。 整数項電力を計算する。 (53)整数項={i sum}*定数{cf ter
m} 整数項を電力に加える。 (54){int pwr}={int pwr}+整
数項 電力を調節して、仮想質量の作用(フォームのバッキン
グ)のための加熱負荷を、まず仮想質量の電力を見いだ
し、次いでそれを電力{int pwr}に加えること
によって補償する。仮想質量の電力{phant pw
r}を、次の式により計算する: (55)phant pwr=C*(blktenhs
−phantenthes)/10 ここで、 C=フォームのバッキングの熱的質量(1.0W/
K)。 ヒータ電力を調節する {int pwr}={int pwr}+{phat
pwr}試料ブロックからそれを通して流れる冷却液
を有するマニホールドのへりの中への損失を補償する、
マニホールドのヒータにおいて必要な電力を計算する。
システムが下向きのランプである場合、{aux1
ower}=0であることに注意する。マニホールドゾ
ーンの要求される電力を下に記載する: (57){aux1 power}=K1*(TBLK
AMB )+K2*(TBLK −TCOOL)+K5*(dT/
dt) ここで、 K1=係数{cf 1coeff} K2=係数{cf 2coeff} K5=係数{cf 5coeff} dT/dt=ランプ速度 TBLK =ブロック温度、 TAMB =周囲温度、 TCOOL=冷却液温度。
【0260】試料ブロックのへりから周囲への損失を補
償するであろう、へりヒータにおいて必要な電力{au
x2 power}を計算する。下向きランプである場
合、{aux2 power}=0であることに注意す
る。へりゾーンの要求される電力を下に記載する: (58){aux2 power}=K3*(TBLK
AMB )+K4*(TBLK −TCOOL)+K6*(dT/
dt) ここで、 K3=係数{cf 3coeff} K4=係数{cf 4coeff} K6=係数{cf 6coeff} dT/dt=ランプ速度 TBLK =ブロック温度、 TAMB =周囲温度、 TCOOL=冷却液温度。
【0261】マニホールド電力{aux1 powe
r}およびへりヒータ電力{aux2 power}の寄
与を消去して、主ヒータおよびクーラにより供給されな
くてはならない合計の電力を得る。 (59){int pwr}={int power}
−{aux1 power}−{aux2 powe
r} ランプ冷却を加えるべきかどうかを決定する。{coo
brkpt}をランプ冷却から制御冷却へのブレー
クポイントとして使用する。 (int pwr<cool brkptおよび下向き
ランプを実施して)設定点温度より非常に高くてランプ
冷却を必要とする場合、ランプ弁をオンにする そのほかにランプ弁をオフにし、そしてバイアス冷却に
依存する この時点において、{int pwr}は合計のヒータ
電力を含有し、そして{aux1 power}および
{aux2 power}はブロックからへりへの損失
を含有する。補助ヒータへ供給される電力は、2つの成
分から構成される:aux powerおよびint
power。電力は{int pwr}を主ヒータおよ
び補助ヒータに面積に依存して分配する。
【0262】total pwr=int pwr int pwr=total pwr*66% aux1 power=total pwr*20%+
aux1 power aux2 power=total pwr*14%+
aux2 power 各端ゾーンおよび適当な量の電力をヒータへ送るための
制御ループの繰り返しについて実施すべきトライアック
のためのハーフサイクルの数を計算する。このループは
1/5秒毎に1回実行し、したがって、60Hzにおいて
120/5=24ハーフサイクルまたは50Hzにおいて
100/5=20ハーフサイクルが存在する。ハーフサ
イクルの数は要求される電力{int pwr}、現在
のライン電圧{linevolts}およびヒータ抵抗
の関数である。正確な必要な電力は各ループに供給され
ないことがあるので、残部を計算して{delta
ower}最後のループから含まれるもののトラックを
保持する。 (60)int pwr=int pwr+delta
power 1/2サイクルの数を計算してトライアックをオンに保
持する。indexはトライアックをオンに保持するた
めのサイクル取り付けられたに等しい。 (61)index=電力*主ヒータohm*〔20ま
たは24〕/linevoltsの平方、ここで方程式
(61)は各ヒータゾーンについて1回実施し、そして
「電力」は主ヒータについてint pwrであり、マ
ニホールドのヒータゾーンについてaux1 pwrで
あり、そしてへりのヒータゾーンについてaux2
wrである。供給された実際の電力の量を計算する。 (62)actual power=linevolt
sの平方*index/主ヒータ抵抗 次の時に添加すべき残部を計算する。 (63)delta power=int pwr−a
ctual power {aux1 pwr}および{aux2 pwr}を方
程式(60)の中に代入することによって主ヒータにつ
いて記載したのと同一の技術を使用して、へりおよびマ
ニホールドのヒータのための1/2サイクルの数を計算
する。主、マニホールドおよびへりのトライアックを制
御するカウンターの中に計算したカウントを負荷する。
加熱されたカバーのセンサーに気を付ける。加熱された
カバーが100℃より低いとき、加熱されたカバーのカ
ウンターが50ワットの電力を供給するように負荷す
る。試料温度に気を付ける。それが50℃より高い場
合、HOT LEDをオンにしてユーザがそれに触れな
いように警告する。フォエバーループの終わり。キーボードタスク キーボードタスクの目的は、ユーザがキーパッドのキー
をプレスし、キーを現在の状態について有効なキースト
ロークのリストと比較し、有効なキーに関連するコマン
ド機能を実行し、そして新しい状態に変化するために待
つことである。無効なキーストロークはビープで指示さ
れ、そして無視される。このタスクは状態が推進したユ
ーザのインタフェースの心臓である。それは「状態推
進」である。なぜなら、取られる動作はユーザのインタ
フェースの現在の状態に依存するからである。キーボードタスクの擬似コード キーボードタスクの変数を初期化する。
【0263】カーソルをオフにする。(導入フラッグが
セットされない)場合、導入プログラムを実行する。メ
ッセージをピッド(pid)タスクに送って加熱された
カバーをオンにする。(ユーザがプログラムを実行して
いる間に電力が故障した)場合、電力がオフになる分数
を計算しそして表示する。
【0264】電力故障状態のレコードを履歴ファイルに
書き込む。あるメッセージをシーケンスタスクに送って
4℃のソーキングを開始する。履歴ファイルを概観する
オプションをユーザに与える。(ユーザが履歴ファイル
を概観することを要求する)場合、履歴ファイルのディ
スプレイに行く。
【0265】トップレベルのスクリーンを表示する。 フォエバーの命令 このタスクがキーパッドからのハードウェアの割り込み
を待つシステムにメッセージを送る。
【0266】この割り込みがレシーブされるまで、スリ
ープ(sleep)に行く。起きたとき、キーをキーパ
ッドから取りそしてデコードする。現在の状態のために
有効なキーのリストを得る。キーを有効なキーと比較す
る。(キーがこの状態に有効である)場合、「動作」お
よびこのキーのための次の状態の情報を獲得する。
【0267】この状態のための「動作」(コマンド機
能)を実行する。次の状態に行く。そのほかに無効のキ
ーのためのビーパーをビープする。フォエバーループの
終わり。タイマタスクのオーバービュー タイマタスクの目的は、1/2秒毎にシーケンスおよび
実時間表示タスクをウェイクアップすることである。ク
ロック/カレンダー装置により発生された半分のハード
ウェアの割り込みを受けとる毎に、タイマタスクはシス
テム(CRETIN)に要求してそれをウェイクする。
次いで、タイマタスクは引き続いて2ウェイクアップメ
ッセージを、それぞれ、シーケンスタスクにおよび実時
間ディスプレイに送る。この中間のタスクは必要であ
る。なぜなら、CRETINは割り込み当たり1タスク
のみをサービスし、こうしてより高いプライオリティタ
スク(シーケンスタスク)のみを実行するからである。タイマタスクの擬似コード フェエバーの命令 クロック/カレンダー装置からハードウェアの割り込み
のために待つメッセージをシステムに送る。
【0268】この割り込みをレシーブするまでスリープ
する。アウェイク(awake)したとき、メッセージ
をシーケンスおよび実時間ディスプレイタスクに送る。
フォエバーループを終わる。シーケンスタスクのオーバービュー シーケンスタスクの目的は、ユーザが定めたプログラム
の内容を実行する。それはランプおよび保持セグメント
から成る、サイクル中の各設定点を通して順次にステッ
プし、そして設定点の温度のメッセージをピッドタスク
に送り、ピッドタスクは引き続いて試料ブロックの温度
を制御する。各セグメントの終わりにおいて、それは実
時間ディスプレイタスクにディスプレイをスイッチする
メッセージおよびセグメントのルーチンの情報をプリン
トするメッセージをプリンタタスクを送る。ユーザはキ
ーパッド上のPAUSEキーを押して実行しているプロ
グラムをポーズし、次いでSTARTキーを押してプロ
グラムを再開する。ユーザはSTOPキーを押してプロ
グラムを早期にアボートすることができる。このタスク
は、タイマタスクによりアウェイクされるとき、1/2
秒毎に実行する。シーケンスタスクの擬似コード フォエバーの命令 シーケンスタスクの変数を初期化する。
【0269】ユーザがSTARTキーを押すか、あるい
はメニューから選択したキーボードからのメッセージ、
あるいはある方法における次のプログラムが実行のため
に準備されたリンクタスクからのメッセージを待つ。こ
のメッセージがレシーブさるまでスリープする。アウェ
イクしたとき、アナログ回路におけるドリフトを説明す
るADC較正の読みを更新する。
【0270】(4℃の電力故障のソークシーケンスを開
始しない)場合、PEタイトルライシ、システム時間お
よび日付、プログラム構成パラメータ、プログラムの型
およびその数をプリントするメッセージをプリンタへ送
る。(HOLDプログラムを開始する)場合、{hol
tp}に保持する温度を得る。
【0271】{hold time}の間保持する秒数
を得る。(3℃より大きくランピングダウンしそして
{hold tp}>45℃)である場合、中間の設定
点を配置する。最後の設定点{hold time}を
配置する。(保持時間{hold time}をカウン
トダウンする)間、タイマタスクからの1/2秒のウェ
イクアップメッセージを待つ。
【0272】ブロックセンサーを開いていることまたは
ショートについてチェックする。(キーボードタスクが
PAUSEキーを検出した)場合、現在の試料温度の設
定点を配置する。ポーズタスクをウェイクアップするメ
ッセージを送る。ポーズタスクによりアウェイクされる
まで、スリープする。
【0273】(中間の設定点が配置された)場合、最終
の設定点を配置する。(設定点温度が周囲温度より下で
ありそして4分より長い間存在する)場合、加熱された
カバーをオフにすることをピッドタスクに伝えるフラッ
グをセットする。1/2秒の保持時間のカウンター{s
tore time}を増加する。
【0274】中間の設定点に到達する前に保持時間が経
過した場合、最後の設定点を再び配置する−これは正し
い設定点が履歴ファイルに書き込まれることを保証す
る。データレコードを履歴ファイルに書き込む。HOL
D情報をプリントするメッセージをプリンタタスクに送
る。HOLDプログラムの終わりそのほかに(CYCL
Eプログラムを開始する)場合、計器のランプ時間およ
びユーザがプログラミングしたランプおよび保持時間を
考慮して、サイクルにおいて合計の秒数{sec in
run}を加える。
【0275】サイクルにおける秒数をプログラム中のサ
イクル数{num cyc}を掛けることによって、プ
ログラム中の合計の秒数を得る。合計の{sec in
run}={sec in run}/サイクル*
{num cyc}。(サイクル{num cyc}の
数をカウントダウンする)間、設定点の数{num
eg}をカウントダウンする)間、ランプ時間{ram
time}を得る。
【0276】最終の設定点温度{t final}を得
る。保持時間{local time}を得る。ランプ
セグメントの情報を表示するメッセージを実時間ディス
プレイタスクに送る。(ユーザがランプ時間をプログラ
ミングした)場合、プログラミングしたランプ時間と実
際のランプ時間との間のエラー{ramp err}を
次のようにして計算する。この方程式は実験データに基
づく。 {ramp err}=prog ramp rate
*15+0.5(アップランプ) {ramp err}=prog ramp rate
*6+1.0(ダウンランプ) ここで、 prog ramp rate=(abs(Tf
c )−1)/{ramp time} Tf =設定点温度{t final}、 Tc =現在のブロック温度{blktemp}、 abs=式の絶対値。 注:「−1」は設定点の1℃以内でクロックが開始する
ので存在する。 新しいramp time=古い{ramp tim
e}−{ramp err} (新しいramp time>古い{ramp tim
e})である場合、新しいramp time=古い
{ramp time} そのほかに 新しいramp time=0。 (試料時間がユーザの構成した設定点のtime{cf
dev}内にない)間、タイマタスクからの1/2秒
のウェイクアップを待つ。
【0277】新しいランプ設定点を毎秒配置する。その
ほかに(3℃より大きいランピングダウンおよび{t
final}>45℃)の場合、中間の設定点を配置す
る。(試料温度がユーザが構成した設定点のtime
{cf clk dev}内にない)間、1/2秒のウ
ェイクアップを待つ。
【0278】1/2秒のランプ時間のカウンターを増加
する。ブロックセンサーをオープンまたはショートをチ
ェックする。(キーボードのタスクがPAUSEキーを
検出した)場合、現在の試料時間の設定点を配置する。
ポーズタスクをウェイクアップするメッセージを送る。
【0279】ポーズタスクによりアウェイクされるま
で、スリープする。ポーズ前の設定点を配置する。最終
の設定点を配置する。(試料温度がユーザが構成した設
定点のtime{cf clk dev}内にない)
間、1/2秒のウェイクアップを待つ。
【0280】1/2秒のランプ時間のカウンターを増加
する。ブロックセンサーをオープンまたはショートをチ
ェックする。(キーボードのタスクがPAUSEキーを
検出した)場合、現在の試料時間の設定点を配置する。
ポーズタスクをウェイクアップするメッセージを送る。
【0281】ポーズタスクによりアウェイクされるま
で、スリープする。ポーズ前の設定点を配置する。ラン
プの情報をプリントするメッセージをプリンタタスクに
送る。ランプセグメントの信号の終わりに対してビーパ
ーをビープする。ランプセグメントの情報を表示するメ
ッセージを実時間ディスプレイタスクに送る。
【0282】(保持時間をカウントダウンする)間、タ
イマタスクからの1/2秒のウェイクアップメッセージ
を待つ。1/2秒のランプ時間のカウンターを増加す
る。ブロックセンサーをオープンまたはショートをチェ
ックする。(キーボードのタスクがPAUSEキーを検
出した)場合、現在の試料時間の設定点を配置する。
【0283】ポーズタスクをウェイクアップするメッセ
ージを送る。ポーズタスクによりアウェイクされるま
で、スリープする。ポーズ前の設定点を配置する。デー
タのレコードを履歴ファイルに書き込む。保持の情報を
プリントするメッセージをプリンタタスクに送る。
【0284】(最終の設定点温度がユーザの構成可能な
{cf temp dev}より大きい)場合、エラー
のレコードを履歴ファイルに書き込む。プログラム可能
なポーズをチェックする。次のセグメントに行く。サイ
クルのメッセージの終わりをプリントするメッセージを
プリンタタスクに送る。
【0285】次のサイクルに行く。CYCLEのプログ
ラムの終わり。そのほかに(AUTO−CYCLEプロ
グラムを開始する)場合、増分のランプ時間とプログラ
ム可能な量の各サイクルにより自動的に増加または減少
することができるユーザがプログラミングした保持時間
とを考慮して、各プログラム{secs in ru
n}の中に合計の数を加える。
【0286】(サイクルの数{num cyc}をカウ
ントダウンする)間、最終の設定点温度{t fina
l}を得る。保持時間{time hold}を得る。
ユーザが設定点温度および/または保持時間の自動的増
加または減少をプログラミングしたかどうかをチェック
し、そしてそれに応じてそれらを調節する。
【0287】温度の自動的増加または減少が設定点を0
℃以下または99.9℃以上にする)場合、エラーのレ
コードを履歴ファイルに書き込む。設定点は0℃または
99.9℃でキャップ(cap)される。ランプセグメ
ントの情報を表示するメッセージを実時間ディスプレイ
タスクに送る。
【0288】(3℃より大きいランピングダウンおよび
{t final}>45℃)の場合、中間の設定点を
配置する。(試料温度がユーザが構成した設定点のte
mp{cf clk dev}内にない)間、1/2秒
のウェイクアップを待つ。1/2秒のランプ時間のカウ
ンターを増加する。
【0289】ブロックセンサーをオープンまたはショー
トをチェックする。(キーボードのタスクがPAUSE
キーを検出した)場合、現在の試料時間の設定点を配置
する。ポーズタスクをウェイクアップするメッセージを
送る。ポーズタスクによりアウェイクされるまで、スリ
ープする。
【0290】ポーズ前の設定点を配置する。最終の設定
点を配置する。(試料温度がユーザが構成した設定点の
temp{cf clk dev}内にない)間、1/
2秒のウェイクアップを待つ。1/2秒のランプ時間の
カウンターを増加する。
【0291】ブロックセンサーをオープンまたはショー
トをチェックする。(キーボードのタスクがPAUSE
キーを検出した)場合、現在の試料時間の設定点を配置
する。ポーズタスクをウェイクアップするメッセージを
送る。ポーズタスクによりアウェイクされるまで、スリ
ープする。
【0292】ポーズ前の設定点を配置する。ランプの情
報をプリントするメッセージをプリンタタスクに送る。
ランプセグメントの信号の終わりに対してビーパーをビ
ープする。ランプセグメントの情報を表示するメッセー
ジを実時間ディスプレイタスクに送る。
【0293】(保持時間をカウントダウンする)間、タ
イマタスクからの1/2秒のウェイクアップメッセージ
を待つ。1/2秒のランプ時間のカウンターを増加す
る。ブロックセンサーをオープンまたはショートをチェ
ックする。(キーボードのタスクがPAUSEキーを検
出した)場合、現在の試料時間の設定点を配置する。
【0294】ポーズタスクをウェイクアップするメッセ
ージを送る。ポーズタスクによりアウェイクされるま
で、スリープする。ポーズ前の設定点を配置する。デー
タのレコードを履歴ファイルに書き込む。保持の情報を
プリントするメッセージをプリンタタスクに送る。
【0295】(最終の設定点温度がユーザの構成可能な
{cf temp dev}より大きい)場合、エラー
のレコードを履歴ファイルに書き込む。プログラム可能
なポーズをチェックする。次のセグメントに行く。サイ
クルのメッセージの終わりをプリントするメッセージを
プリンタタスクに送る。
【0296】次のサイクルに行く。AUTO−CYCL
Eのプログラムの終わり。そのほかに(POWER F
AILUREを開始する)場合、4℃の設定点を配置す
る。
【0297】ピッドタスクが加熱されたカバーをシャッ
トオフするように、フラッグ{subamb hol
d}をセットする。フォエバーを命令する。タイマタス
クからの1/2秒のウェイクアップメッセージを待つ。
1/2秒の保持時間を増加する。フォエバーループを終
わる。電力故障の終わり。履歴ファイルに実行終わりの
状態のレコードを書き込む。
【0298】(方法を実行している)場合、リンクタス
クが次のプログラムの実行を開始するメッセージをシー
ケンスタスクを送ることを知るように、フラッグ{we
ired flag}をセットするそのほかにユーザの
インタフェースをアイドル状態の表示に戻す。フォエバ
ーループの終わり。ポーズタスクのオーバービュー ボーズタスクの目的は、ユーザがCYCLEプログラム
の中にプログラミングするポーズあるいはユーザがキー
パッド上のPAUSEキーを押すときのポーズを取り扱
うことである。
【0299】CYCLEプログラムを実行する間シーケ
ンスがプログラミングしたタスクに直面するとき、ポー
ズタスクは、引き続いて、ユーザがポーズするように要
求した時間の減少を連続的に表示するメッセージを実時
間ディスプレイタスクに送る。ポーズの時間を計ると
き、ポーズタスクはシーケンスタスクをアウェイクし、
次いでスリーブするメッセージを送る。ユーザはキーパ
ッド上のSTARTキーを押すことによってプログラム
を早期に再開することができるが、あるいはSTOPキ
ーを押すことによってプログラムをアボートすることが
できる。
【0300】プログラムが実行されている間キーボード
タスクがPAUSEキーを検出したとき、それはフラッ
グ{pause flag}をセットし、次いでシーケ
ンスタスクがそれを肯定するのを待つ。シーケンスタス
クはこのフラッグのセットを見るとき、それは肯定応答
メッセージをキーボードタスクに送り、次いでそれ自体
スリープする。キーボードタスクがこのメッセージを受
けとるとき、それはポーズタスクをアウェイクする。ポ
ーズタスクは連続的にディスプレイしかつプログラムが
ポーズする時間の量を増加するメッセージを実時間ディ
スプレイタスクに送る。タイマは、構成のセクションに
おいてユーザがセットしたポーズ時間の限界に到達する
ときをタイムアウトする。ユーザは、キーパッド上のS
TARTキーを押すことによってプログラムを再開する
か、あるいはスパイクを押すことによってプログラムを
アボートすることができる。ボーズタスクの擬似コード フォエバーを命令する キーパッドのポーズを示すキーボードタスクからのメッ
セージ、あるいはユーザのプログラミングしたポーズを
示すシーケンスからのメッセージを待つ。
【0301】メッセージが受けとられるまでスリープす
る。アウェイクしたとき、示したポーズの型についての
フラッグをチェックする。(それがプログラミングした
ポーズである)場合、タイマがカウントアップするポー
ズを表示するメッセージを実時間ディスプレイタスクに
送る。そのほかにタイマがカウントダウンするポーズを
表示するメッセージを実時間ディスプレイタスクに送
る。(タイムアウトカウンターをカウントダウンする)
間、このタスクを1/2秒間持続するメッセージをシス
テムに送る。ポーズの情報をプリンタタスクに送る。
(それはプログラミングしたポーズである)場合、ポー
ズはタイムアウトされているので、シーケンスタスクを
ウェイクアップするメッセージを送る。
【0302】ポーズの表示を中止するメッセージを実時
間ディスプレイタスクに送る。実行するプログラムの表
示を再開するメッセージを実時間ディスプレイタスクに
送る。そのほかに(それがキーパッドのポーズである)
場合、ポーズはタイムアウトされており、そしてプログ
ラムはアボートされなくてはならないので、シーケンス
タスクを中止するメッセージをシステムに送りそしてそ
れをそのFOEVERループのトップに送り戻さなくて
はならない。
【0303】(プログラムの実行がHOLDプログラム
であった)場合、保持情報をプリントするメッセージを
プリンタタスクに送る。状態のレコードを履歴ファイル
に書き込む。ユーザのインタフェースをそのアイドル状
態に戻す。アボートのメッセージを表示する。フォエバ
ーのループの終わり。ディスプレイタスクのオーバービュー 実時間ディスプレイタスクの目的は、温度、タイマ、セ
ンサーの読み、ADCチャンネルの読み、および1/2
秒毎に更新することが必要である他のパラメーターを表
示することである。ディスプレイタスクの擬似コード :ディスプレイタスク
の変数を初期化する。 フォエバーを命令する 1/2秒毎にタイマタクスからのメッセージを待つ。
【0304】メッセージが受けとられるまでスリープす
る。アウェイクしたとき、他のタスクがディスプレイの
パラメーターのリストまたは現在の更新を中止するフラ
ッグを送ったかどうかをチェックする。1/2秒のフラ
ッグ{half sec}をトグルする。(ディスプレ
イのパラメーターのリストが存在する)場合、誰もがデ
ィスプレイを更新しないように信号をセットする。
【0305】カーソルをオフにする。(パラメーターの
リストを通してステップする)間、(それが時間のパラ
メーターである)場合、時間をディスプレイする。(1
/2秒のフラッグ{half sec}がセットされ
る)場合、時間変数を増加または減少する。
【0306】そのほかに(それが小数である)場合、小
数を表示する。(それが整数である)場合、整数を表示
する。そのほかに(それがADCチャンネルのリードア
ウトである)場合、ADCチャンネルからのカウントを
読む。
【0307】(それをmVとし表示することが必要であ
る)場合、カウントをmVに変換する。その値を表示す
る。そのほかに(それが電力のディスプレイである)場
合、電力をワットで表示する。
【0308】そのほかに(それが残った時間のパラメー
ターである)場合、秒を時間の1/10に変換する。残
った時間を1/10時間で表示する。(1/2秒のフラ
ッグ{half sec}をセットする)場合、秒の変
数を減少する。
【0309】(カーソルがオンであった)場合、それを
オンにし戻す。現在のシステム時間をバッテリーRAM
に記憶する。信号をクリアしてディスプレイを解放す
る。フォエバーのループの終わり。プリンタタスクのオーバービュー プリンタの目的は、実行時間を取り扱うことである。そ
れは低いプライオリティのタスクであり、そして他の時
間のクリティカルタスクを干渉しない。プリンタタスクの擬似コード フォエバーの命令 プリントを望むメッセージを他のタスクから待つ。
【0310】メッセージを受けとるまでスリープする。
アウェイクしたとき、広域変数の局所的比例定数をプリ
ントする。プリンタの肯定メッセージを配置する。(状
態またはエラーのメッセージをプリントすることが必要
である)場合、現在の履歴レコードの中に含まれている
情報をプリントする。
【0311】そのほかに(ページヘッダをプリントする
ことが必要である)場合、プログラムの型およびその数
をプリントする。そのほかに(プログラムの構成パラメ
ーターをプリントすることが必要である)場合、クロッ
クを開始する設定点からの管の型、反応値および試料温
度の誘導をプリントする。
【0312】そのほかに(サイクルの情報の終わりをプ
リントすることが必要である)場合、終わりの時間およ
び温度をプリントする。そのほかに(セグメントの情報
をプリントすることが必要である)場合、ランプおよび
保持セグメントの場合をプリントする。
【0313】そのほかに(ポーズの状態のメッセージを
プリントすることが必要である)場合、ポーズした時間
および温度をプリントする。フォエバーのループの終わ
り。LEDタスクのオーバービュー LEDタスクの目的は、「加熱」LEDの照明が主ヒー
タに加えた電力を反映するようにさせることである。こ
れは毎秒1回実行する低いプライオリティが存在する。LEDタスクの擬似コード :LEDタスクの変数を初期
化する。 フォエバーの命令 このタスクを毎秒をウェイクするメッセージをシステム
に送る。
【0314】スリープする。アウェイクしたとき、次の
ようにして主ヒータに加えた電力を反映する値をPIC
タイマAのカウンター2に負荷する: カウンターに値={K htled}*{ht le
d}を負荷する ここで、{K htled}は加熱LEDをパルスする
時間を計算するための定数であり、そして15200/
500に等しい。15200は14.4KHz のPICの
クロックよりわずかに大きく、そしてこれはLEDを絶
えずオンに保持するためにタイマに負荷する値である。
500は主ヒータの電力である。
【0315】{ht led}は0〜500の値であ
り、そして主ヒータに加えたワットに等しくなる。 フォエバーのループの終わりリンクタスクのオーバービュー リンクタスクの目的は、キュパッド上のSTARTキー
を押すユーザをシミュレーションすることである。ユー
ザの介在なしに1つずつ(方法におけるように)プログ
ラムを実行できるように、このタスクは必要である。リ
ンクタスクはシーケンスタスクをウェイクアップし、そ
してSTARTキーが押されたように、それは次のプロ
グラムを実行を開始する。リンクタスクの擬似コード :リンクタスクの変数を初期
化する。 フォエバーの命令 (フラッグ{weird flag}はセットであり、
そしてそれがその方法における第1ファイルではない)
場合、ウェイクアップのメッセージをシーケンスタスク
に送る。フォエバーのループの終わり。スタートアップシーケンス パワーアップシーケンス 計器への電力がオンにされるか、あるいはソフトウェア
がRESETを命令するとき、次のシーケンスが起こ
る。注:以下の数はフローチャート上の数である(図5
4〜図57参照)。
【0316】1.RS−232プリンタポートの中から
外にCtrl−G(10進法の7)の文字を転送する。
RS−232ポートを少なくとも1秒間ポーリングしそ
してCtrl−Gがレシーブされる場合、外部のコンピ
ュータをポートに取り付け、そしてパワーアップシーケ
ンスの間のすべてのコミュニケーションをキーパッドか
らRS−232ポートに再び向けると仮定する。Ctr
l−Gがレシーブされない場合、パワーアップシーケン
スは正常として連続する。
【0317】2.MOREキーが押されたかどうかをチ
ェックする。押された場合、サービスオンリーのハード
ウェアの診断に行く。 3.次の3テストはオーディオ/ビジュアルチェックで
あり、そしてエラーをレポートすることができない:
1)ビーパーはビープする、2)キーボード上の熱い、
冷却、および加熱LEDはフラッシする、3)ディスプ
レイの各絵素は輝く。著者権および計器のIDスクリー
ンは、パワーアップ診断の実行として表示される。
【0318】4.パワーアップ診断の1つにおいてエラ
ーが起こると、破壊した成分の名前は表示され、そして
サービスオンリーのハードウェアの診断へのアクセスを
獲得するコード「MORE999」を除外して、キーパ
ッドはロックされる。 5.PPI−Bのチャンネル0をチェックして、自動化
テストビットを低く引かれるかどうかを見る。そうであ
る場合、UARTテストを実行する。テストがパスする
場合、ビープを連続的にビープする。
【0319】6.CRETINオペレーションシステム
をスタートし、このシステムは引き続いてプライオリテ
ィレベルにより各タスクをスタートする。 7.バッテリーRAM中のフラッグをチェックして、計
器が較正されたかどうかを見る。そうでない場合、エラ
ーメッセージを表示し、そしてサービスオンリーの較正
テストへのアクセスを獲得するコード「MORE99
9」を除外して、キーパッドをロックする。
【0320】8.電圧およびラインの周波数を測定する
テストを実行し、そして計器を較正している間選択した
構成プラグと両者のこれらの値が合致するかどうかを見
る。合致しない場合、エラーメッセージを表示し、そし
てサービスオンリーの構成テストへのアクセスを獲得す
るコード「MORE999」を除外して、キーパッドを
ロックする。
【0321】9.導入セクションにおいて記載したよう
にヒータピングテストを実施する。ヒータは誤って配線
されている場合、エラーメッセージを表示し、そしてサ
ービスオンリーの較正テストへのアクセスを獲得するコ
ード「MORE999」を除外して、キーパッドをロッ
クする。 10.バッテリーRAM中のフラッグをチェックして、
計器が導入されたかどうかを見る。そうでない場合、エ
ラーメッセージを表示し、そして導入ルーチンへのアク
セスを獲得するコード「MORE999」を除外して、
キーパッドをロックする。
【0322】11.遠隔モードでない場合、バッテリー
RAM中のフラッグをチェックして、計器が実行されて
いる間に電力の故障が存在したかどうかを見る。そうで
ある場合、4℃のソークを開始しそして電力がオフにな
っていた時間の量を表示する。電力が消耗したとき、ど
れだけ長く実行されたかを正確に告げる履歴ファイルを
見たいかどうかをユーザに要求する。ユーザがyesを
選択する場合、ユーザの診断に直接行く。
【0323】12.ビーパーをビープし、そして遠隔モ
ードフラッグをクリアし、こうしてすべてのコミュニケ
ーションはここでキーパッドを通して戻される。 13.バッテリーRAMをチェックして、自動的に開始
されたテストプログラムを製作が欲するかどうかをみ
る。そうである場合、プログラムの実行を開始し、そし
てそれが実施されたのち計器をリセットする。
【0324】14.トップレベルのユーザのインタフェ
ースのスクリーンをディスプレイする。 図51を参照すると、商標MAXIAMPで市販されて
いる大きい体積の薄い壁の反応管の断面図である。この
管PCR反応に有用であり、ここで合計の体積を200
μlより大きくする反応混合物に、試薬または他の物質
を添加することが必要である。図51に示されているよ
り大きい管は、Himont PDポリプロピレンまた
はValtec HH−444ポリプロピレンから作ら
れており、そして試料ブロックと接触する薄い壁を有す
る。選択した材料は何であっても、DNAおよびPCR
反応混合物の他の成分と適合性であって、例えば、標的
DNAを壁に粘着させることによって処理するPCR反
応を障害せずそして複製しないようにする。ガラスは一
般にすぐれた選択物ではない。なぜなら、DNAはガラ
ス管の壁に粘着することが知られているからである。図
51中の寸法Aは典型的には0.012±0.001イ
ンチ(0.30±0.03mm)であり、そして管の縦軸
に関する壁の角度は典型的には17°である。17°壁
の角度の利点は、下向きの力が試料ブロックとすぐれた
熱的接触し、管は試料ウェル中で閉塞しないということ
である。薄い壁の利点は、それが試料ブロックの温度変
化と反応混合物の温度の対応する変化との間の遅延を最
小にすることである。これが意味するように、ユーザが
変性セグメントにおいて反応混合物を94℃の1℃内に
5秒間止まらせ、そしてこれらのパラメーターでプログ
ラミングしようとする場合ユーザは5秒の変性間隔を獲
得し、ここで時間遅れはより厚い壁をもつ普通の管を使
用する場合より少ない。短いソーク間隔、例えば、5秒
のソーク間隔をプログラミングし、そして正確にプログ
ラミングした時間の間プログラミングした温度における
ソークを獲得することができるという、この実施の特性
は、計算した試料温度を使用してタイマを制御すること
によって可能である。ここに記載するシステムにおい
て、計算した試料温度がプログラミングしたソーク温度
に到達するまで、インキュベーションまたはソークの間
隔を時間決定するタイマはスタートしない。
【0325】さらに、薄い壁の試料管を使用するとき、
試料混合物が標的温度の1℃内にするのに、この試料管
は先行技術のマイクロ遠心器と比較して、約1/2〜2
/3の時間を要するのみであり、そしてこれは図51に
示す背の高いMAXIAMP登録商標管および図15に
示すそれより小さい薄い壁のMICROAMP登録商標
管の両者では真実である。
【0326】MAXIAMP管およびMICROAMP
の壁厚さは、適切な構造の強さと一致するできるだけ薄
いように製作プロセスにおいて緊密に制御される。典型
的な、ポリプロピレンについて、これはどこでも0.0
09〜0.012インチ(0.23〜0.30mm)であ
る。新しい場合、ポリプロピレンより強いよりエキゾチ
ックな材料を使用してPCR反応速度を大きくするとい
う利点を達成し、適切な強さが維持されてすぐれた熱的
接続を保証する下向きの力および通常の使用の他のスト
レスに耐える限り、壁厚さはなお薄くあることができ
る。1.12インチ(28.4mm)の高さ(図51にお
いて寸法B)および0.780インチ(19.8mm)の
寸法Cおよび0.395インチ(10.0mm)の上の区
画の壁厚さ(Dの寸法)では、MAXIAMP管の時間
定数はほぼ14秒であるが、これは充填時間のように正
確に測定されなかった。図15に示すより短い管のため
のMICROAMP管の時間定数は、典型的には、0.
009インチ±0.001インチ(0.23±0.03
mm)の円錐形区画における管壁厚さで、ほぼ9.5秒で
ある。
【0327】図52はより薄い壁のMICROAMP管
の使用の結果を示す。標的温度の同様な速度増加の達成
は薄い壁のMAXIAMP管の使用から生ずるであろ
う。図52を参照すると、MICROAMP管中の計算
した試料温度についての相対的インキュベーション温度
対72℃の出発温度から94℃の標的変性温度の1℃内
の温度に到達するための先行技術管についての時間のグ
ラフが示されている。図52において、100μlの試
料が各管の中に存在した。開いた箱によりマークされた
データ点をもつ曲線は、9.5秒の応答時間および0.
009インチ(0.23mm)の壁厚さをもつMICRO
AMP管についての計算した試料温度応答である。×に
よりマークされたデータ点をもつ曲線は、先行技術の
0.030インチ(0.76mm)の壁厚さをもつ厚い壁
のマイクロ遠心器管中の100μlの試料について計算
した試料温度を表す。このグラフが示すように、薄い壁
のMICROAMP管はほぼ36秒以内で94℃の標的
ソーク温度の1℃内の計算した温度に到達するが、先行
技術管は約73秒を要する。これは重要である。なぜな
ら、ソーク温度に実質的に到達するまで、タイマをスタ
ートさせない計器において、先行技術の管は、ことに各
PCRサイクルが少なくとも2つのランプおよびソーク
を有し、そして一般に実施する非常に多数のサイクルが
存在するという事実に照らして考慮したとき、全体のプ
ロセシング時間を実質的に増加することがあるからであ
る。実際の試料温度に無関係にブロック/浴/炉温度に
基づいてそれらの時間をスタートするシステムにおい
て、ブロック/浴/炉温度の変化と試料混合物の温度変
化との間のこれらの長い遅延は重大なマイナスの結果を
有することがある。問題は、長い遅延を反応混合物がソ
ークのためにプログラミングした温度に実際にある時間
にカットできることである。最近のPCRプロセスにお
いて普通であるように非常に短いソークについて、加熱
/冷却システムをスタートして反応混合物の温度を変化
させようとする前に、反応混合物はプログラミングした
ソーク温度に決して到達することができない。
【0328】図51は、プラスチックウェブ625によ
りMACIAMP試料管に接続されたポリプロピレンの
キャップを示す。キャップの外径Eおよび管の上の区画
の内径は0.002インチ(0.05mm)および0.0
05インチ(0.13mm)の間の締り嵌めのための大き
さである。管の内側表面654は、ばり、切り目および
引っ掻き傷が存在せず、こうしてキャップとの緊密なシ
ールを形成できるようにすべきである。
【0329】図53は、管651、キャップ650およ
びウェブ652の平面図を示す。肩656はキャップが
管の中に深く押し込まれるのを防止し、そして加熱され
た定盤と接触させるための試料管の上部へりより上のキ
ャップ十分な突起を可能とする。これは、また、十分な
管の変形を可能とし、こうして図15における最小の許
容されうる力Fはキャップの変形により加えることがで
きる。
【0330】好ましい実施態様において、管およびキャ
ップは、15分までの間126℃までの温度でオートク
レーブ処理可能であるHimont PD701ポリプ
ロピレンから作られる。これにより、この使い捨て管を
使用前に滅菌することができる。キャップは加熱された
定盤をもつ機械の中の使用のとき永久的に変形するの
で、管はただ1回の使用のために設計される。
【0331】MICROAMP管のためのキャップは8
または12キャップの接続へりストリップで入手可能で
あり、各キャップは番号を付されているか、あるいは個
々のキャップに分割されている。キャップの単一の列を
使用することができそして列は必要に応じた小さい数に
容易に短くすることができるか、あるいは個々のキャッ
プをストリップから切り取ることができる。MAXIA
MP管のためのキャップは図5に示されているように取
り付けられるか、あるいは分離された個々のキャップで
ある。
【0332】MICROAMP管上の混合を可能とする
ポス−PCR試薬の添加のための最小体積は、MAXI
AMP管について500μlまでである。温度の限界は
−70℃〜126℃である。応答時間は試料の値に依存
する。ブロックが急激に温度を変化させたとき、応答は
新しい温度の37%以内に試料がなる時間として測定さ
れる。典型的な応答時間は、50μlの充填について
7.0秒であり、そして20μlの充填について5.0
秒である。付録A ユーザのインタフェース ユーザのインタフェースのGeneAmpのPCRシス
テム9600の目的は、PCRを実施するプログラムを
開発しそして実行することである。
【0333】入手可能な3つの型のプログラムが存在す
る。HOLDプログラムは、セットした量の時間につい
て保持されるか、あるいは無限量の時間について保持さ
れそしてSTOPキーにより停止される単一の設定点か
ら成る。CYCLEプログラムは時間決定したランプお
よびプログラム可能なポーズの特徴を添加する。これは
プログラムは9までの設定点および99までのサイクル
を可能とする。AYTOプログラムにより、ユーザは設
定点の時間および/または温度をサイクル毎に固定した
量で増加または減少することができる。このプログラム
は、また、9までの設定点および99までのサイクルを
可能とする。METHODプログラムは、17の保持、
サイクルまたはオートプログラムを一緒にリンクする方
法を提供する。
【0334】合計150のプログラムを1〜150の範
囲の数で記憶することができる。プログラムをつくり、
記憶し、保護し、プリントし、または消去することがで
きる。記憶されたプログラムのディレクトリを見るか、
あるいはプリントすることができる。
【0335】
【表1】 RUN:プログラムのディスプレイからプログラムの実
行をスタートか、あるいはプログラミングしたまたはキ
ーパッドのpusを再スタートする。 MORE:ランタイムのディスプレイをトグルしそし
て、また、サービスオンリーファンクッションをアクセ
スする(コード999による場合)。
【0336】BACK:同一のスクリーン内の前のフィ
ールドに動かす。現在第1フィールドに位置している場
合、それは前のスクリーンに動く。 STEP:次のスクリーン中の第1フィールドに下に動
く。 PAUSE:マニュアル割り込みのためにポーズしたタ
イムアウトをスタートする。
【0337】OPTION:メニューの項目を通してカ
ーソルを左右に動かし(一番左のオプションへローリン
グオーバーする)か、あるいはYES/NOの応答をト
グルする。 STOP:実行しているプログラムをアボートするか、
あるいはユーザのインタフェースにおいて1レベル上に
動かす。
【0338】CE:無効の入力をクリアする。 ENTER:現在の数の入力を受け取り、メニューの項
目を受け取り、YES/NOの応答を受け取るか、ある
いはディスプレイの次のフィールドにスキップする。数
の入力がディスプレイの最後である場合、ENTERは
次のディスプレイにステップする。
【0339】普通のシステム9600のディスプレイ
【0340】
【表2】 Prog HOLD,CYCL,AUTOまたはMETHである #### プログラム#(1〜150)またはそれがまだ記憶されない場合? ?? Msg Dne,Error,Abortまたはブランク Temp 現在の試料温度 Menu 入手可能なオプション
【0341】
【表3】 Action 「xx.x℃において保持」または「xx.x℃にランプ」 Temp 現在の試料温度 Timer 保持またはランプ時間をカウントダウンするか、あるいはF OREVERの保持時間までカウントアップする Prog/Cyc HOLDファイルについて「Prog xxx」である CYCLまたはAUTOファイルは「Cycle xx」で ある−カウントアップ
【0342】
【表4】 Setpt 現在の設定点#(1〜9)−カウントアップ Tot Cyc 現在のプログラムにおけるサイクルの合計の#(1〜99) Timer プログラムにおける残りの時間(時間)−カウントダウン Prog 現在のプログラム#(1〜150)
【0343】
【表5】 Prog HOLD,CYCL,AUTOまたはMETHである #### プログラム#(1〜150)またはそれがまだ記憶されない場合? ?? Msg Done,Error,Abortまたはブランク Temp 現在の試料温度 Timer 構成可能なポーズ時間−カウントダウントップレベルのユーザのインタフェース
【0344】
【表6】 プログラムはCRATEのディスプレイ中のプログラム
の型を選択することによってつくる。ユーザは編集すべ
きプログラムの最初のディスプレイに直接行く。記憶さ
れたプログラムを、RUN,EDITまたはプログラム
ディスプレイから数1〜150を入力することによって
検索する。RUNディスプレイから有効なプログラムの
数の入力はランを自動的に開始する。EDITまたはプ
ログラムのディスプレイから有効な数を入力すると、編
集すべきプログラムの最初にディスプレイされる。
【0345】STOP(スクリーンを下に動かす)また
はBACK(前のフィールドに動く)またはENTER
(次のフィールドに動く)を押すことによって、プログ
ラムを編集する。UN−STORE−PRINT−H
OMEメニューのRUNを選択するか、あるいはキーパ
ッド上のRUNキーを押すことによって、プログラムを
実行する。
【0346】
【表7】 OPTIONキーはMICRO(MicroAmp管)
からTHIN(薄い壁のGeneAmp管)に管の型を
トグルする。ユーザが特別の管を構成した場合、OTH
ERのオプションを添加する。異なる反応体積を入力す
ることができる。これらのパラメータはこのプログラム
とともに記憶される。ENTERはこれらの値を受け取
る。
【0347】
【表8】 ユーザがランタイムプリンタのオンを構成し、そしてサ
イクル、オートまたは方法のプログラムを実行している
場合、次のプリンタの選択を与えられる。CYCLEは
サイクルが完結したときのみメッセージをプリントす
る。SETPOINTはすべての設定点(ランプ/保持
時間および温度)についてのランタイムのデータをプリ
ントする。
【0348】
【表9】 ユーザがランタイムプリンタのオンを構成し、そして保
持のプログラムを実行している場合、次のプリンタの選
択を与えられる。
【0349】
【表10】 加熱されたカバーが100℃以下である場合、次のスク
リーンが表示される。加熱されたカバーが100℃に到
達したとき、ユーザがこのディスプレイをオンにしたと
き、ランは自動的に開始する。ユーザがSTOPを打っ
た場合、ランはマニュアルで再スタートしなくてはなら
ない。プログラムをセーブしないでRUN−STORE
−PRINT−OMEメニューにおいてHOMEを受
け取ると、スクリーンが表示される。
【0350】
【表11】 保持プログラム
【0351】
【表12】 ユーザは無限のソークまたは時間限定した保持の間を選
択することができる。
【0352】
【表13】 ビーパーは1秒毎に1回音を出す。保持プログラム−ランタイムの表示
【0353】
【表14】 保持プログラム−ランタイムのプリントアウト PE Cetus GeneAmp PCRシステム9600 Ver xx. x 1990年11月14日 xx:xx AM 管の型:MICRO 反応体積:100μl 開始クロック 設定点のx.x℃ 以内 HOLDプログラム#xxx HOLDプログラム:xx.x℃ xxx:xx 実際:xx.x℃ xxx :xxまたは HOLDプログラム:xx.x℃ FOREVER 実際:xx.x℃ xx x:xx HOLDプログラム#xxx−ランの完結 1990年11月14日 xx:x x AMサイクルのプログラム
【0354】
【表15】 不履行は3である。これはこのプログラムにおける設定
点の数を決定する。1〜9の設定点が許される。
【0355】
【表16】 上で入力した設定点の数は、どれだけ多くの設定点の編
集の表示されるかを決定する。ユーザは各設定点のラン
プおよび保持時間を入力することができる。試料温度が
設定点のユーザが構成可能である温度内に入るとき、保
持タイマはスタートされるであろう。
【0356】
【表17】 ユーザがポーズを欲しない場合、次の3つの表示がスキ
ップされる。1〜99サイクルは可能である。
【0357】
【表18】 設定点の数について0を入力することは、ユーザがポー
ズを望まないことを意味し、したがって次の2つの表示
がスキップされる。
【0358】
【表19】 サイクルの数は上で入力した合計の数に限定される。
【0359】
【表20】 不履行のポーズ時間はユーザの構成の中にセットされ
る。サイクルのプログラム−ランタイムのディスプレイ
【0360】
【表21】 サイクルのプログラム−ランタイムのプリントアウト PE Cetus GeneAmp PCRシステム9600 Ver xx. x 1990年11月14日 xx:xx AM 管の型:MICRO 反応体積:100μl 開始クロック 設定点のx.x℃ 以内 CYCLプログラム#xxx CYCL#xx Setpt#x RAMPプログラム:xx.x℃ xx:xx 実際:xx .x℃ xx:xx HOLDプログラム:xx.x℃ xx:xx 実際:xx.x℃ xx:x x ・ ・ (9までの設定点) ・ ・ ・ (99までの設定点) ・ CYCLプログラム#xxx−ランの完結 1990年11月14日 xx:x x AM CYCLプログラム#xxx−ユーザのアボート 1990年11月14日 x x:xx AM(アボートの場合のみ)オートプログラム
【0361】
【表22】 不履行は3である。これはこのプログラムにおける設定
点の数を決定する。1〜9の設定点が許される。
【0362】
【表23】 上で入力した設定点の数は、どれだけ多くの設定点の編
集の表示されるかを決定する。ランプ時間が与えられな
いと、計器は出来るだけ速くランプする。試料温度が設
定点のユーザが構成可能である温度内に入るとき、保持
タイマはスタートされるであろう。
【0363】
【表24】 ユーザがサイクル毎に時間および/または温度の増加ま
たは減少しようとする場合、次の表示が与えられる。
【0364】
【表25】 OPTIONキーは矢印を上に(サイクル毎の増加)ま
たは下に(サイクル毎に減少)トグルする。減少を可能
とする最大時間は設定点の保持時間に限定される。
【0365】
【表26】 99までのサイクルが許される。オートプログラム−ランタイムのディスプレイ
【0366】
【表27】 オートのプログラム−ランタイムのプリントアウト PE Cetus GeneAmp PCRシステム9600 Ver xx. x 1990年11月14日 xx:xx AM 管の型:MICRO 反応体積:100μl 開始クロック 設定点のx.x℃ 以内 AUTOプログラム#xxx CYCL#xx Setpt#x RAMPプログラム:xx.x℃ xx:xx 実際:xx .x℃ xx:xx HOLDプログラム:xx.x℃ xx:xx 実際:xx.x℃ xx:x x ・ ・ (9までの設定点) ・ ・ ・ (99までの設定点) ・ CYCLプログラム#xxx−ランの完結 1990年11月12日 xx:x x AM CYCLプログラム#xxx−ユーザのアボート 1990年11月12日 x x:xx AM(アボートの場合のみ)方法のプログラム
【0367】
【表28】 17までのプログラムをある方法においてリンクするこ
とができる。ユーザが存在しないプログラム#を入力し
ようとする場合、メッセージ「プログラムは存在しな
い」が表示される。ユーザが他の方法を入力しようとす
る場合、メッセージ「方法をリンクすることができな
い」が表示される。
【0368】
【表29】 方法のプログラム−ランタイム RUNTIME,MOREおよびPAUSEの表示は、
現在実行されているプログラムのものであろう。実行さ
れているプログラムがある方法においてリンクされると
き、2つの追加のMORE表示が与えられる。
【0369】
【表30】 現在実行されているプログラムの数はフラッシするであ
ろう。
【0370】
【表31】 方法のプログラム−ランタイムのプリントアウト PE Cetus GeneAmp PCRシステム9600 Ver xx. x 1990年11月14日 xx:xx AM 管の型:MICRO 反応体積:100μl 開始クロック 設定点のx.x℃ 以内 METHODのプログラム#xxx −すべてのリンクされたプログラム のデータに先行する METHODのプログラム#xxx −方法の完結−すべてのリンクした プログラムデータに従う方法のプログラム−プリント
【0371】
【表32】 METHOD この方法においてリンクした各プログラ
ムのヘッダをプリントする。 PROGRA DATA この方法においてリンクした
各プログラムのヘッダおよび内容をプリントする。プログラムの記憶 STOREがRUN−TORE−PRINT−HOM
Eメニューから選択されるとき、プログラムを記憶する
ルーチンはファイルならびに方法についてと同一であ
る。プログラムを保護することによって、プログラムが
ユーザの数を知らないでオーバーライトするか、あるい
は消去されることがないことが保証される。他のユーザ
は彼らの方法において保護されたファイルを見、編集、
実行し、そしてリンクすることができるが、記憶された
バージョンを変更することができるであろう。
【0372】
【表33】 xxxは1〜150の最初の利用可能なプログラムであ
る。
【0373】
【表34】 ユーザは保護されたプログラムの#を入力した。正しい
ユーザの#はこのプログラムをオーバーライトするため
に入力されなくてはならない。
【0374】
【表35】 誤ったユーザの#が入力された。このディスプレイは5
秒間止まった後、前のものに戻る。ユーザは正しい#を
入力するために3回のチャンスが与えられる。
【0375】
【表36】 ユーザがある方法においてリンクされたプログラムをオ
ーバーライトしようとする場合、ユーザは警告されそし
て連続するか、あるいはしないオプションを与えられ
る。
【0376】
【表37】 ユーザが他の方法においてリンクされたプログラムをオ
ーバーライトしようとする場合、エラーの方法が与えら
れる。
【0377】
【表38】 ユーザはプログラムを保護しならびに前に保護されたプ
ログラムを脱保護するチャンスを与えられる。
【0378】
【表39】 ユーザはプログラムを保護し、したがってユーザ#を入
力しなくてはならない。利用可能なスロットの中にプロ
グラムを記憶できる状態にある。プログラムが保護され
る場合のみ、ユーザ#は現れる。
【0379】
【表40】 存在するプログラムをオーバーライトできる状態にあ
る。プログラムが保護される場合のみ、ユーザ#は現れ
る。実用性のファンクション
【0380】
【表41】 DIRは、それらのプログラムの数、ユーザの数または
プログラムの型により、記憶されたプログラムのディレ
クトリをユーザが見るか、あるいはプリントできるよう
にする。 CONFIGは、特別の必要性に計器の使用をユーザが
調整できるようにさせる。
【0381】DIAGは、ランタイムの問題を診断しそ
して計器の性能を評価する手段をユーザに提供する。D
ELは、プログラムの数、ユーザの数またはプログラム
の型により記憶されたプログラムをユーザが消去できる
ようにする。実用性−ディレクトリ
【0382】
【表42】 プログラム数によるディレクトリ
【0383】
【表43】 プログラムは所定の数でスタートする数の順序で記載さ
れるであろう。STEPキーおよびBACKキーをディ
レクトリ表示を通して動く。ビーパーは記載したプログ
ラムの開始または終わりにおいて音を発する。
【0384】
【表44】 STOPはユーザに上の表示に戻るようにさせる。プログラムタイプによるディレクトリ
【0385】
【表45】 プログラムの数は、選択した型のプログラムについて記
載されるであろう。
【0386】
【表46】 ユーザ数によるディレクトリ
【0387】
【表47】 所定のユーザの数の下に記憶されたすべてのプログラム
は記載されるであろう。
【0388】
【表48】 ディレクトリプリント
【0389】
【表49】 ユーザはディレクトリが上で見られたのと同一の方法で
記載されるディレクトリのハードコピーを得ることがで
きる。実用性−ユーザの構成
【0390】
【表50】 ファイルの構成は、メニューからEDITを受け取る
か、あるいはSTEPキーを押すことによって編集する
ことができる。PRINTはこのファイルの内容をプリ
ントする。
【0391】
【表51】 ユーザはシステムの時間および日付をセットすることが
できる。
【0392】
【表52】 ランタイムのプリンタがONである場合、ユーザは各ラ
ンのスタートとしてプリンタのオプションで促進され
る。ランタイムのビーパーがONである場合、プログラ
ムを実行する間ビーパーは各セグメントの終わり(シー
ケンスのランプまたは保持部分後)音を出す。
【0393】
【表53】 この時間は、プログラムがアボート前にポーズすること
ができる時間の最大量を表す。これはキーパッドのみに
関する。
【0394】
【表54】 この時間は、実際の試料温度がエラーがフラッグされる
前に設定点から変化できる度数を表す。
【0395】
【表55】 この設定点は、常に存在する制御の冷却電力をバランス
するために有用である。試料温度は、計器がアイドルで
あるときはいつでも、アイドル状態に維持される。
【0396】
【表56】 実行するプログラムのセグメントを時間決定するクロッ
クは、それが試料温度のこの温度内を獲得するとき、ト
リガされるように構成することができる。通常の値は
1.0℃である。
【0397】
【表57】 ユーザがMicroAmpまたは薄い壁のGeneAm
pの管以外の異なる型を使用しようとする場合、ユーザ
はYESに対してこのオプションをセットし、そして少
なくとも3対の反対体積および管の時間定数のデータを
入力しなくてはならない。この曲線を使用して、ランの
開始のときユーザが入力した反応体積に依存して、各ラ
ンについて正しいタウ(管の時間定数)を外挿すること
ができる。
【0398】
【表58】 ユーザが「特別の管」をYESにセットした場合、3組
のスクリーンが与える。実用性−消去
【0399】
【表59】 プログラムによる消去
【0400】
【表60】 すべてのプログラム(ファイルおよび方法)は数により
消去することができる。
【0401】
【表61】 プログラムはそれをある方法においてリンクした場合消
去することができない。
【0402】
【表62】 ユーザは保護されたプログラムの#を入力した。正しい
ユーザの#を入力して、このプログラムを消去しなくて
はならない。
【0403】
【表63】 誤ったユーザの#が入力された。この表示が5秒間止ま
った後、前の表示に戻る。ユーザには正しい#を入力す
る3回のチャンスを与えられる。
【0404】
【表64】 プログラムの消去状態。ユーザ#はプログラムが保護さ
れたとき現われる。ユーザによる消去
【0405】
【表65】 所定のユーザの数が与えられた後、プログラムを消去す
ることができる。
【0406】
【表66】 所望のユーザの#でプログラムが存在しない場合、次の
メッセージが表示される。
【0407】
【表67】 プログラムがある方法においてリンクされる場合、プロ
グラムを消去することができる。STEPキーリンクし
たプログラムのリストを通してサイクルするであろう。
【0408】
【表68】 リンクしたプログラムのリストは、どの方法でプログラ
ムをリンクしたかを示すであろう。
【0409】
【表69】 これはリンクされていない所定のユーザの#のすべての
プログラムを消去しないであろう。全消去
【0410】
【表70】 これは保護された方法でリンクされない、すべての保護
されてないプログラムを消去するであろう。実用性−ユーザの診断 診断テストを実行している間、STOPキーはユーザを
トップレベルの診断スクリーンにユーザを常に戻し、そ
してテストの数および名前を次のテストに自動的に増加
する。これは有効な診断を通るサイクリングをマニュア
ルに促進する。
【0411】
【表71】 ユーザは診断を実行する数を入力することができるか、
あるいはSTEPまたはBACKキーを使用して有効な
テストを通してサイクリングすることができる。STE
PまたはBACKキーを押す毎に、テストの数は増減さ
れ、そして関連するテストの名前が表示される。この特
徴は、ユーザが各テストに関連する数を記憶する必要性
を排除する。履歴ファイルのレビュー
【0412】
【表72】 履歴ファイルは、500までの最近のランのレコードを
記憶することができる、バッテリーRAM中の循環バッ
ファである。バッファが充満されているとき、最も古い
入力はオーバーライトされるであろう。バッファは自動
的にクリアされた後、プログラムは実行される。
【0413】
【表73】 履歴ファイルのヘッダはファイル中の現在のレコードの
数(「nnn」)を表示する。ALLはすべてのレコー
ドを見る。ATARTは状態のレコードのみを見る。E
RRORSはエラーのメッセージをもつレコードのみを
見る。PRNTは履歴ファイルのすべてまたは一部分を
プリントする。レコードの2つの型は、1)プログラム
についての情報を与える状態のレコードおよびプログラ
ムにおいて各保持およびランプセグメントについての情
報を与えるデータのレコードである。保持プログラムは
1つの保持セグメントとして処理され、そしてデータの
レコードはファイルが終わるとき記憶されるであろう。
数百の入力(50サイクル×6設定点=350入力)が
存在できるので、ファイルを通る2方向の動きが要求さ
れる。ほとんどのプログラムはPCRプログラムは3ま
たは6設定点および40以下のであろうことに注意す
る。入力は通常逆の順序で外観され、こうして見られる
レコードは書き込まれた最後のレコードであろう。ユー
ザが見るべきレコードの型を選択した場合、STEPま
たはBACKは選択した型の1回の入力によりバッファ
を上下するであろう。STEPまたはBACKの前にあ
る数を置くことによって、第2ラインを「スキップ#x
xx入力」で置換する。ユーザはある数を入力し、そし
てENTERを押してその値を受け取り、そして入力の
数はスキップされ、前進(STEP)または後進(BA
CK)する。STEPまたはBACKの前にRNUキー
を配置することによって、ユーザは選択した型の最大の
レコード#(最新のレコード)またはレコード#1(最
も古いレコード)に急速に動くことができる。STOP
は外観モードを停止し、そしてファイルのヘッダを表示
する。状態のレコード
【0414】
【表74】 「ffff」はHOLD,CYCLまたはAUTOであ
る。「xxx」はプログラムの数である。「/mmm」
はリンクしたプログラムについての方法の数、そのほか
にである。「nnn」はレコードの数である。「メッセ
ージ」は次の1つである。 状態のメッセージ 管の型:xxxx ランにおいて使用した試料管の型 反応体積:xxxμl 反応において使用した反応体積 Clkスタートw/x.x℃ 保持クロックは設定点のこの温度内でスター トする スタートxx/xx/xx ランのスタートの時間および日付 xx:xx 終わりxx/xx/xx:xx ランの終わりの時間および日付 方法の完結 方法にリンクしたすべてのプログラムは完結 する ポーズxx:xx,xx.x℃ プログラムはこの温度においてこの時間の間 ポーズした 致命的なスタートのメッセージ センサーのエラー センサーは1列で10回の悪い読みを有した 電力の故障xxx.x時間 電力はこの量の時間の間オフであった ユーザのアボート ユーザはSTOPキーをランの間に押す ポーズ キーパッドのポーズはその構成可能な時間限 界に到達した。 致命的な設定点のエラー 計算した量の時間以内に設定点に到達しない 場合、プログラムをアボートするための要件 である。開始ランプ温度(0℃〜100℃、 10℃の増分)対終了のランプ温度(同一軸 のラベリング)の10×10のルックアップ テーブルは、TC2が任意の所定量の度でラ ンプを上下するために要する平均時間であろ う。設定点が次のようにして計算した量の時 間で到達しない場合、ファイルはアボートさ れるであろう。 プログラム可能なランプ時間+(2*ルックアップテー
ブルの値)+10分データのレコード 「f」はHOLD,CYCLまたはAUTOである「x
xx」はプログラムの数である
【0415】
【表75】 「/mmm」はリンクしたプログラムそのほかにブラン
クについての方法の数である 「ddd.d」は設定点の温度である 「nnn」はレコードの数である 「yy」はサイクル数である 「z」は設定点の数である 「mmm.ss」は設定点の時間である サイクルおよび設定点の数のファイルは保持プログラム
のために省略されるであろう。データエラーのレコード
【0416】
【表76】 「ddd.d」は終わりの設定点の時間である 「nnn」はレコード数である 「yy」はサイクル数である 「z」は設定点の数である 「mmm.ss」は設定点の時間である 「メッセージ」は、次のように非致命的エラーを示す: 非致命的エラーのメッセージ ステップのエラー 設定点は計算した時間で到達しなか
った: プログラム可能なランプ時間+(2*ルックアップテー
ブルの値) プログラムのエラー 設定点の温度または時間の自動的
プログラムの自動的増加/減少は、保持時間をネガティ
ブに進行させるか、あるいは時間を0.1〜100℃の
中から外に進行させる。
【0417】温度のエラー セグメントの終わりにおい
て、設定点の温度は+/−ユーザの構成量でドリフトし
た。保持プログラムについて、サイクルおよび設定点の
フィールドは省略されるであろう。履歴ファイルをプリントする 履歴ファイルのヘッダのメニューを通して、履歴ファイ
ルのプリントのルーチンにアクセスする。OPTION
のキーはオプションを通してカーソルをサイクルする。
【0418】
【表77】 PRNTがプリントスクリーンを表示している位置にカ
ーソルがあるとき、ENTERキーを押す:
【0419】
【表78】 ALL ファイル中のすべてのレコードをプリントする STAT 状態のレコードのみをプリントする ERRORS エラーのメッセージをもつレコードのみ
をプリントする プリントのオプションの1つが選択されるとき、次のス
クリーンが表示される:
【0420】
【表79】 第1(最も最近)のプログラム数は不履行のプログラム
であろう。ユーザはプリントを開始すべきプログラムの
数を変化させることができる。プリントの間、次のスク
リーンが表示される:
【0421】
【表80】 プリントの終わりにおいて、プリントの履歴のメニュー
が再び表示される。ヒータのテスト
【0422】
【表81】 ヒータのテストは、その温度が35℃から65℃に上昇
するとき試料ブロックの加熱速度を計算する。それがブ
ロック温度を35℃に戻すとき、次のスクリーンが表示
される。
【0423】
【表82】 温度が安定化したとき、すべてのヒータは全電力のオン
にされる。ここで表示は「60℃に行く」を読み、そし
てブロック温度はそれが50℃を通過した後20秒間モ
ニターされる。20秒後、合格または不合格のメッセー
ジが表示される。
【0424】
【表83】 冷却テスト
【0425】
【表84】 冷却テストは、試料ブロックの温度が35℃から15℃
に低下するとき、試料ブロックの冷却速度を計算する。
それがブロック温度を35℃にさせるとき、次のスクリ
ーンが表示される。
【0426】
【表85】 温度が安定化されるとき、冷却はオンである。ここで
「15℃に行く」を読み、そしてブロック温度はそれが
25℃を通過した後20秒間モニターされる。20秒
間、合格または不合格のメッセージが表示される。
【0427】
【表86】
【図面の簡単な説明】
【図1】本発明の教示に従うサーマルサイクラーのブロ
ック線図である。
【図2】本発明の教示に従う試料ブロックの平面図であ
る。
【図3】バイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャ
ンネルを示す試料ブロックの側面図である。
【図4】試料ブロックの端面図である。
【図5】試料ブロックの端面図である。
【図6】図2中の切線6−6′に沿って取った試料ブロ
ックの断面図である。
【図7】図2中の切線7−7′に沿って取った試料ブロ
ックの断面図である。
【図8】図2中の切線8−8′に沿って取った試料ブロ
ックの断面図である。
【図9】3ゾーンのフィルムヒータおよびブロック支持
体とのアセンブリー後、試料ブロックの構造の断面、側
面図である。
【図10】3ゾーンのフィルムヒータに対して電力制御
の形態を示す電力ライン電圧のグラフである。
【図11】典型的な3インキュベーションPCRプロト
コルを示す温度のグラフである。
【図12】局所的ゾーンの概念を示す試料ブロックの断
面図である。
【図13】3ゾーンのヒータの平面図である。
【図14】低すぎる試料管配置力Fのτの作用を示す、
試料温度対時間のグラフである。
【図15】試料ブロックの中に配置された試料管および
キャップの断面図である。
【図16】(A)RC回路のインパルスの応答のグラフ
である。(B)インパルス励起パルスのグラフである。
(C)ブロックの熱インパルスの応答および温度履歴の
回旋が計算した試料温度を与える方法を示すグラフであ
る。(D)試料ブロック/試料管システムの熱的応答の
電気的アナログを示す。
【図17】3ゾーンのヒータの制御に使用する方程式に
ついての比例定数が適切にセットされるとき、6つの異
なる試料のすべての計算した温度が標的温度上で互いに
約0.5℃以内へ収束する仕方を示す。
【図18】変性標的温度が発生したDNAの量に影響を
与える方法を示すグラフである。
【図19】スライドカバーおよび加熱された定盤の断面
図である。
【図20】スライドカバー、試料ブロックおよび加熱さ
れた定盤の下降に使用したノブの斜視図である。
【図21】(A)試料ブロック上に配置されたときの、
フレーム、リテイナー、試料管およびキャップの1つの
実施態様のアセンブリーの断面図である。(B)試料ブ
ロック上に配置されたときの、フレーム、リテイナー、
試料管およびキャップの好ましい実施態様のアセンブリ
ーの断面図である。
【図22】マイクロタイタープレートについてのプラス
チックの使い捨てフレームの上、平面図である。
【図23】フレームの底、平面図である。
【図24】フレームの端、側面図である。
【図25】フレームの他の端、側面図である。
【図26】図22における切線26−26′に沿って取
ったフレームの断面図である。
【図27】図22における切線27−27′に沿って取
ったフレームの断面図である。
【図28】フレームのへりの側面図および部分断面図で
ある。
【図29】好ましい試料管の断面図である。
【図30】試料管の上部の断面図である。
【図31】キャップのストリップの部分の側面図であ
る。
【図32】キャップのストリップの一部分の上面図であ
る。
【図33】96ウェルのマイクロタイタートレーのプラ
スチックの使い捨てリテイナー部分の上、平面図であ
る。
【図34】リテイナーの部分的区画の側面図である。
【図35】リテイナーの端、側面図である。
【図36】図33における切線36−36′に沿って取
ったリテイナーの断面図である。
【図37】図33における切線37−37′に沿って取
ったリテイナーの断面図である。
【図38】96ウェルのマイクロタイタートレーのプラ
スチックの使い捨て支持体のベースの平面図である。
【図39】ベースの底平面図である。
【図40】ベースの側面図である。
【図41】ベースの端側面図である。
【図42】図38において切線42−42′に沿って取
った支持体のベースの断面図である。
【図43】図38において切線43−43′に沿って取
った支持体のベースの断面図である。
【図44】図38において切線44−44′に沿って取
った支持体のベースの断面図である。
【図45】いくつかの試料管およびキャップが所定位置
にあるマイクロタイタートレーからなる、プラスチック
の使い捨て物品の分解斜視図である。
【図46】図1における冷却液制御システム24の線図
である。
【図47】本発明に従う制御エレクトロニクスのブロッ
ク線図である。
【図48】本発明に従う制御エレクトロニクスのブロッ
ク線図である。
【図49】本発明に従う制御エレクトロニクスのブロッ
ク線図である。
【図50】典型的な試料期間の時間ライン線図である。
【図51】商品名MAXIAMPで市販されている、高
い薄い壁の試料管の側面断面図である。
【図52】薄い壁の試料管および薄い壁の先行技術の管
の間の応答時間の差を示すグラフである。
【図53】試料管およびキャップの平面図である。
【図54】パワーアップ試験順序のフローチャートであ
る。
【図55】パワーアップ試験順序のフローチャートであ
る。
【図56】パワーアップ試験順序のフローチャートであ
る。
【図57】パワーアップ試験順序のフローチャートであ
る。
【符号の説明】
1〜7…カラム 10…試料 12…試料ブロック 14…加熱されたカバー 16…端末 18,22…バス 20…制御コンピュータ 24…冷却液制御システム 26…入力管 28…出力管 30,32…管 34…熱交換器 36…入力管 38…出力管 39…溜 40…冷却装置 41…ポンプ 42…ファン 44…フィン管凝縮器 45,46…管 47…分岐交差 48…熱 49…バイアス冷却チャンネル 50…管 51…レストリクター 52,54…バス 53…入力 55…2状態のソレノイド作動弁 56…周囲空気温度センサー 57…ランプ冷却チャンネル 58…ライン 61…温度センサー 63…センサー 67…円錐形壁 68…試料ウェル 70…溜 78…みぞ、スロット 82…点 83,89,90…試料ウェル 91,93,95,97,99…冷却チャンネル 100〜107…ランプ冷却チャンネル 116…底面 122…ハイブリダイゼーションインキュベーション 128,130,132…孔 130,132…ねじ孔 134〜143…孔 146…ボルト 147…スピルカラー 148…はがね支持ブラケット 150,152…コイルばね 154…はがね圧力板 156…マルチゾーン試料ブロックフィルムヒータ 158…シリコーンゴムのパッド 160…エポキシ樹脂フォームの層 162…ネガティブのハーフサイクル 164…ポジティブのハーブサイクル 166…分割線 170…変性インキュベーション 172…ハイブリダイゼーションインキュベーション 174…伸長インキュベーション 198…冷却チャンネル 200,202…局所的領域 228,230…へりの表面 234…試料ウェル 250,252…へり 254…中央ゾーン 256,258…へりヒータ領域 260,262…マニホールドヒータ領域 266,268…プラスチック冷却液マニホールド 276…試料混合物 282…温度応答曲線 288…試料管 292…対流の流れ 294…ピーク 312…レッドスクリューアセンブリー 316…すべりカバー 318…ノブ 320,322…レール 324,326…試料管 332,334…インデックスマーク 336…飾り板 338…プラスチックキャップ 340…プラスチックトレー 342…マイクロタイタープレートのフレーム 346…上部のへり 368…円錐形プラスチック壁 372…水平のプラスチックプレート 376…試料管 378…内側へり 382…孔の対向するへり 386…リテイナー 394…ウェブ 396…タブ 402…単一の水平のプラスチック平面 410…孔 414…プラスチックタブ 416,418…スロット 420…ベース 424…典型的な試料管 450…マイクロプロセッサ 452…アドレスバス 454…データバス 456…EPROM 458…バッテリーバックアップRAM 460…システムクロック/カレンダー 462…アドレスデコーダー 464…チップセレクトバス 466…キーボード 468…ディスプレイ 470…キーボードインタフェース回路 472,474…プログラム可能な間隔タイマ 476…割込みコントローラー 478…UART 480…RAM 482…プログラム可能な割り込み制御装置(PIC) 484…プログラム可能なアレイ論理チップ(PAL) 486…12ビットのアナログ対ディジタルコンバータ
ー(A/D) 492,494…マルチプレクサ 496…2,000オームの抵抗器 498…+15ボルトの調整された電力供給 500…ゼンナーダイオード 506…較正電圧発生器 512…RMS対DCコンバーター回路 516…ステップ−ダウントランス 530,532,534,536…光学的に連結された
トライアックドライバー 538…制御バス 546,548…熱的カットアウトスイッチ 550…「パーソナリティ」プラグ 566…ゼロ交差検出器 568…2ラインバス 570…電力トランス 572,574…調整された電力供給 576…非調整電力供給 578…アナログ増幅器 590…間隔 592…開始時間 594…時間 600…出力ライン 602,604…単安定マルチバイブレータ 614…ソレノイドコイル 616…電力供給「レール」 620…電流制限抵抗器 624…ソレノイド作動弁 632…タイムアウトワンショット 650…ポリプロピレンのキャップ 652…プラスチックウェブ
─────────────────────────────────────────────────────
【手続補正書】
【提出日】平成4年2月29日
【手続補正1】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正内容】
【書類名】 明細書
【発明の名称】 温度制御を用いたポリメラーゼ連鎖反
応の自動実施装置
【特許請求の範囲】
【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、ポリメラーゼ連鎖反応
(以後PCRという)を実施するためのコンピュータ制
御の機器の分野に関する。より詳しくは、本発明は、多
数の試料についてポリメラーゼ連鎖反応を同時に実施し
て、各試料についての結果を非常に高い精度で得ること
ができる自動化機器に関する。この高い精度は、なかで
も、いわゆる「定量的PCR」を実施する可能性を提供
する。
【0002】
【従来の技術】PCRプロセスを使用してDNA(デオ
キシリボース核酸)を増幅するために、特別に構成した
液状反応混合物を、いくつかの異なる温度のインキュベ
ーション期間を含むPCRプロトコルを通してサイクル
することが必要である。反応混合物は種々の成分、例え
ば、増幅すべきDNAおよび少なくとも2つのプライマ
ーから構成され、前記プライマーは増幅すべきDNAの
伸長産生物をつくることができるように、試料のDNA
に対し十分に相補的であるように所定の方法で選択され
る。反応混合物は、種々の酵素および/または他の試
薬、ならびにいくつかのデオキシリボヌクレオシドトリ
ホスフェート、例えば、dATP,dCTP,dGTP
およびdTTPを包含する。一般に、プライマーはオリ
ゴヌクレオチドであり、核酸の鎖に対し相補的であるプ
ライマーの伸長産生物の合成を誘発する条件下に、すな
わち、ヌクレオチドおよび誘発因子、例えば、熱安定性
DNAポリメラーゼの存在下に適当な温度およびpHにお
いて、配置したとき、合成の開始点として作用すること
ができる。
【0003】ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、主と
して非常に簡単でありそして要求される設備のコストが
比較的低いので、遺伝的分析に現象的に有望な技術であ
ることが証明されている。PCRに対して重要なこと
は、サーモサイクリングの概念である。すなわち、DN
Aを溶融し、短いプライマーを一本鎖が得られるようア
ニーリングし、そしてそれらのプライマーを伸長して二
本鎖のDNAの新しいコピーをつくるという交互にする
工程である。サーモサイクリングにおいて、PCR混合
物はDNAを溶融するための高い温度(>90℃)か
ら、プライマーのアニーリングおよび伸長のためのより
低い温度(40℃〜70℃)に反復してサイクリングさ
れる。PCRにおいて要求されるサーモサイクリングを
実施するための最初の商業的システムであるパーキン−
エルマー・シータス・DNA・サーマル・サイクラー
(Perkin-Elmer Cetus DNA Thermal Cycler )は、19
87年に導入された。
【0004】PCRのための応用は、現在、基本的な研
究から、多数の同様な増幅工程を日常的に実施する応用
へと動きつつある。これらの応用範囲は、診断の研究、
生物製剤学的開発、遺伝子の分析、および環境的試験を
包含する。これらの応用範囲におけるユーザは、高い処
理量、迅速な回転時間、およひ再現性ある結果を提供す
る高性能のPCRシステムから利益を受けるであろう。
また、これらの応用範囲におけるユーザは、試料対試
料、実験対実験、実験室対実験室、および計器対計器か
らの再現性を保証されるにちがいない。
【0005】例えば、ヒトのゲノムのプロジェクトにお
ける物理学的マッピングのプロセスは、配列標的部位
(STS)を利用することによって、大きく簡素化する
ことができる。STSは、PCRにより容易に増幅さ
れ、そして染色体上の位置を同定する短くかつ独特な配
列である。このような部位を検査してゲノムの地図を作
ることは、世界中を通じて再現性をもって実施すること
ができるプロトコルを使用して、短い時間で、多数の試
料を増幅することを必要とする。
【0006】PCRの試料の数が増加するにつれて、増
幅工程を試料の調製および増幅後の分析と統合すること
がいっそう重要となる。試料の容器は急速なサーマルサ
イクリングを可能とするばかりでなく、かつまた溶媒抽
出および遠心分離等の操作のための自動化された取り扱
いを可能としなくてはならない。容器は絶えず小さい体
積で働いて、試薬のコストを減少する。
【0007】一般に、PCRのサーマルサイクリングは
異なる温度における少なくとも2回のインキュベーショ
ンを含む。これらのインキュベーションの一方は、プラ
イマーの雑種形成および触媒されたプライマーの伸長反
応用のものである。他方のインキュベーションは変性、
すなわち、二本鎖の伸長産生物を次の雑種形成および伸
長インキュベーション間隔において使用するための、一
本鎖の型に分離するためのものである。PCRの詳細、
PCRに必要な温度サイクルおよび反応条件、ならびに
この反応の実施に必要な種々の試薬および酵素は、米国
特許第4,683,202号、米国特許第4,683,
195号、EPO公報258,017号および4,88
9,818号(Tagポリメラーゼ酵素の特許)および
すべての他のPCRの特許(出願人、シータス・コーポ
レーション)に記載されている。
【0008】PCRの目的は、最初に供給した小さい体
積の「種子」DNAと同一の、DNAを大きい体積で調
製することである。この反応は、DNAの鎖をコピー
し、次いで引き続くサイクルにおいてコピーを使用して
他のコピーを発生することを包含する。理想的な条件下
に、各サイクルは存在するDNAの量を2倍にし、これ
により幾何学的進行において、反応混合物の中に存在す
る体積の「標的」または「種子」のDNAの鎖のコピー
を生ずる。
【0009】典型的なPCRの温度サイクルにおいて、
反応混合物を各インキュベーション温度に規定した時間
の間正確に保持すること、および同一のサイクルまたは
同様なサイクルを多数回反復することが必要である。典
型的なPCRプログラムを94℃の試料温度で開始して
30秒間保持して、反応混合物を変性する。次いで、反
応混合物の温度を37℃に下げ、そして1分間保持して
プライマーを雑種形成させる。次に、反応混合物の温度
を50℃〜72℃の範囲の温度に上げ、ここでそれを2
分間保持して伸長産生物の合成を促進する。これは1サ
イクルを完結する。次いで、前のサイクルにおいて形成
する伸長産生物の鎖の分離のために、反応混合物の温度
を94℃に上げることによって、次のPCRサイクルを
開始する(変性)。典型的には、サイクルは25〜30
回反復する。
【0010】一般に、試料温度をサイクルにおいて、い
くつかの理由で出来るだけ次の温度に迅速に変化するこ
とが望ましい。第1に、化学的反応はその段階の各々に
ついて最適な温度を有する。したがって、最適でない温
度における消費時間が少ないことは、よりよい化学的結
果が達成されることを意味する。他の理由は、各インキ
ュベーション温度に到達後、各インキュベーション温度
に反応混合物を保持する時間を最小することが必要であ
るということである。これらの最小のインキュベーショ
ン時間は、サイクルの完結に要する「床」または最小時
間を確立する。試料のインキュベーション時間の間の遷
移時間は、この最小サイクル時間に付加される時間であ
る。サイクルの数はかなり大きいので、この追加の時間
は増幅の完結に要する合計の時間を不必要に長くする。
【0011】
【発明が解決しようとする課題】いくつかの従来の自動
化されたPCRの計器においては、反応混合物はキャッ
プで閉じた、使い捨てプラスチック管の中に貯蔵されて
いた。このような管のための典型的な試料の体積はほぼ
100μlであった。典型的には、このような計器は試
料のDNAを充填した多数のこのような管を使用し、そ
して反応混合物は金属のブロック中の試料のウェル(w
ell)と呼ぶ孔に挿入されていた。PCRプロセスを
実施するために、PCRプロトコルのファイルにおいて
ユーザにより特定された規定した温度および時間に従
い、金属ブロックの温度を制御する。次いで、コンピュ
ータおよび関連するエレクトロニクスは、時間、温度お
よびサイクルの数などを規定するPCRプロトコルのフ
ァイル中のユーザの供給したデータに従い、金属ブロッ
クの温度の変化にしたがって、種々の管の中の試料も同
様の温度変化をさせる。しかしながら、これらの先行技
術の計器において、すべての試料が正確に同一の温度サ
イクルを経験したわけではなかった。これらの先行技術
の計器において、試料温度における誤差は金属の試料ブ
ロック内の場所対場所の温度の不均一性、すなわち、ブ
ロックの金属内に存在する温度勾配により発生し、これ
によりある試料はサイクルの特定の時間において他の試
料と異なる温度を有していた。さらに、熱を試料ブロッ
クから試料に伝えるときの遅延が存在したが、遅延はす
べての試料について同一ではなかった。PCRプロセス
を首尾よくかつ効率よく実施するために、かついわゆる
「定量的」PCRを可能とするために、これらの温度の
遅延および温度の誤差は大きい程度に最小としなくては
ならない。
【0012】試料の液体の熱の出入りのための時間の遅
延を最小にしそして金属ブロック上の種々の点における
温度勾配または温度の不均一性のための温度の誤差を最
小にするという問題は、試料を含有する領域の大きさが
大きくなるとき、とくに重大となる。工業的に標準のマ
イクロタイタープレートのフォーマットの中に配置され
た96の試料管を収容するために十分に大きい金属ブロ
ックを有することは、PCR計器にとって高度に望まし
い属性である。マイクロタイタープレートは、生化学お
よびバイオテクノロジーの分野において多数の小さい試
料を取り扱い、処理しそして分析するために、広く使用
されている手段である。典型的には、マイクロタイター
プレートは、3+5/8インチ(9.2cm)幅および5
インチ(12.7cm)長さであり、そして9mmの中央に
8ウェル×12ウェルの長方形の列の中に96の同一の
試料ウェルを含有するトレーである。マイクロタイター
プレートは広範な種類の材料、形状および体積の試料ウ
ェルで入手可能であり、それらは多数の異なる使用につ
いて最適化されているが、すべてのマイクロタイタープ
レートは同一の全体の外側寸法および9mmの中央に同一
の8×12のウェルの列を有する。この標準のマイクロ
タイタープレートのフォーマットにおける試料の取り扱
い、処理および分析を自動化するための、広範な種類の
装置は入手可能である。
【0013】一般に、マイクロタイタープレートは、射
出成形または真空成形されたプラスチックで作られ、そ
して安価であり、使い捨て可能であると考えられる。相
互汚染から生ずる法律上の責任および使用後のマイクロ
タイタープレートの洗浄および乾燥の困難のために、使
い捨て可能性は極めて望ましい。したがって、マイクロ
タイタープレートのフォーマットで配置されている96
までの試料について同時にPCR反応を実施できること
は、PCR計器について極めて望ましい特性である。
【0014】もちろん、9mmの中央上の8×12ウェル
の列の96試料を加熱および冷却するために必要な金属
ブロックの大きさは、かなり大きい。この大きい面積の
ブロックは、一般に0〜100℃の温度範囲に試料間の
温度の変動についての許容度を非常に小さくしてこのよ
うなブロックを非常に急速に加熱および冷却できるPC
R計器の設計について、多数の対応すべき工業的問題を
生じる。これらの問題はいくつかの原因から生ずる。第
1に、ブロックの大きい熱的質量は、ブロックの温度を
操作範囲内で大きい速度で上下させることを困難とさせ
る。第2に、種々の装置、例えば、冷却液の供給および
抜き出しのためにマニホールド、ブロックの支持取り付
け点、および関連する他の周辺装置にブロックを取り付
ける必要性は、許容可能な限界を越えた温度勾配がブロ
ックを横切って存在する可能性が生じる。
【0015】また、多数の試料の急速な、正確な温度サ
イクルを必要とするPCR反応または他の反応の自動化
実施のための、サーマルサイクリング装置の設計におけ
る要件の間に、多数の他の衝害が存在する。例えば、金
属ブロックの温度を急速に変化させるために、大量の熱
を短い時間で試料ブロックから出入りさせなくてはなら
ない。熱は電気抵抗ヒータからか、あるいは加熱された
流体をブロックと接触させて流すことによって添加する
ことができる。熱は冷却された流体をブロックと接触さ
せて流すことによって急速に除去できる。しかしなが
ら、これらの手段により、試料の間で温度の不均一性を
生じる温度勾配を形成するようなブロック中の場所対場
所で大きい温度差をつくらないで、金属ブロックに大量
の加熱を迅速に出入りさせることは不可能であるように
思われる。
【0016】熱の添加または除去の終了後でさえ、ブロ
ック中の種々の点において貯蔵された熱がより冷たい領
域に移動して温度勾配を排除しなくてはならない距離の
平方にほぼ比例する時間の間、温度勾配は持続すること
ができる。こうして、金属ブロックをより多くの試料を
収容するためにより大きく作るとき、温度変化がより大
きい寸法のブロックを横切って存在する温度勾配を引き
起こした後ブロックの中に存在する温度勾配が消滅する
ために要する時間は顕著に長くなる場合がある。これ
は、すべての試料の間で正確な温度の均一性を維持しな
がら、試料ブロックの温度を急速にサイクルする困難を
増加させる。温度勾配を消散させるに要する時間に起因
して、ブロック中の大きい距離にわたって存在する温度
勾配の発生を防止するために、高い性能のPCR計器の
設計において、重要な必要性が発生した。他の必要性
は、金属部分またはブロックに取り付けられた他の周辺
装置の間の機械的境界を横切って熱が移動するという要
件を、出来るだけ非常に多く、回避することである。接
合部を横切ってすべての場所で高い温度伝導性を均一に
保証する方法で、金属部分を接合することは困難であ
る。熱伝導性の不均一性は望ましくない温度勾配を発生
するであろう。
【0017】
【課題を解決するための手段】本発明によれば、試料ブ
ロック中の試料温度の変化と反応混合物中の対応する温
度変化との間の遅延を減少するための、薄い壁の試料管
が開示される。2つの異なる大きさの試料管を開示する
が、各々は試料ブロック中の合致する円錐形のくぼみの
中に嵌合する薄壁の円錐形区画を有する。典型的には、
縦軸に関して17°の角度をもつ円錐を使用して、試料
ブロックの中への管のジャミングを防止するが、すべり
ばめを可能とする。他の形状および角度も、本発明を実
施するために十分であろう。また、試料ブロック以外
の、例えば、液体浴、オーブンなどの、他の型の熱交換
器を使用することができる。しかしながら、何らかの熱
交換器と接触する試料管の部分の壁厚さは、PCRのサ
イクリングの熱的応力および通常の使用の応力に十分に
耐えられる範囲内で、出来るだけ薄くあるべきである。
典型的には、試料管はオートクレーブ処理可能なポリプ
ロピレン、例えば、0.009〜0.012インチ±
0.001インチ(0.23〜0.30mm±0.03m
m)の範囲の円錐形部分の壁厚さをもつHimont
PD701から作られる。より好ましくは、壁厚さは
0.012インチ(0.30mm)である。
【0018】好ましい実施態様において、試料管は、ま
た、円錐形部分と接合する、より薄い壁の円筒形部分を
有する。この円錐形部分はもとの反応混合物またはPC
Rプロセス後に添加できる試薬を含有する。図51に示
す試料管は、他のPCRシステムにおける適合性のため
の薄い壁を除いて、工業的に標準の形状を有する。図1
5の試料管は、ここに開示するシステムとともに使用で
きる、短い管である。薄い壁の試料管の使用が好ましい
システム環境の他の実施態様を以下に要約する。非常に
急速な温度サイクルのPCRプロトコルの実施の間に、
マイクロタイタープレートのフォーマットにおいて配置
された非常に大きい数の試料について、非常に正確な温
度制御を達成する新規な方法および装置をさらに開示す
る。本発明の教示は、試料ブロック、試料管および支持
の取り付け、加熱および冷却装置、制御エレクトロニク
スおよびソフトウェアについての新規な構造、新規なユ
ーザのインタフェースおよびPCRプロトコルを実施す
るために前記装置を使用する新規な方法を包含する。
【0019】ここに開示される装置は、多数の試料を横
切って温度制御の非常に緊密な許容度で96までの試料
についてPCR遺伝子増幅を実施するように設計され
る。すなわち、すべての試料は、異なる試料を含有する
異なるウェルの間の温度差を非常に小さくして同時に温
度が上下する。これはポリメラーゼ連鎖反応のサイクル
を通じて真実である。また、この装置は、各試料ウェル
中の蒸発および凝縮のプロセスの制御により、反応混合
物の濃度を非常に厳密に制御することができる。さら
に、この装置は、試料ウェルの間の相互汚染を実質的に
なくして、各々が異なるドナー源からの100μlの9
6までの試料を処理することができる。本発明は、標準
の96ウェルのマイクロタイタープレートのフォーマッ
トにおいてアルミニウムの試料ブロックを加熱および冷
却して試料を熱的にサイクリングし、その結果、急速な
サーマルサイクリング速度、制御しない変化する周囲温
度および他の操作条件、例えば、電力ラインの電圧およ
び冷却液温度にかかわらず、きわめてすぐれた試料対試
料の均一性が存在する新規な方法を包含する。
【0020】また、本発明は、各試料管が加熱されたカ
バーからの下降する圧力下に試料ブロックと最良の嵌合
を見いだすために十分な個々の動きの自由度を有すると
ともに、サーマルサイクリングのためのDNAを含有す
る96までの個々の試料管を収容する、使い捨てプラス
チック96ウェルのマイクロタイタープレートのための
新規な構成を包含する。各管の最良の嵌合を可能とする
ことによって、試料ブロックの金属と試料管およびマイ
クロタイタープレートの構造のプラスチックとの間の熱
的膨張および収縮の速度の差が、使い捨てマイクロタイ
タープレートの構造において、試料管の中心対中心の距
離に関して、試料ブロック中のウェルの相対的中心対中
心の寸法を変化させる場合でさえ、マイクロタイタープ
レートの構造は試料ブロック対各試料管の高くかつ均一
な熱伝導性を提供する。
【0021】さらに、本発明は、処理されている試料の
温度を直接測定しないで、これらの温度を連続的に計算
しかつ表示する能力を有した、PCR計器を制御する新
規な方法および装置を包含する。これらの計算された温
度を使用して、試料が各標記インキュベーション温度に
ついて所定の温度の許容度の帯域内に保持される時間を
制御する。この制御システムは、また、試料ブロックに
熱的に連結した3ゾーンのヒータを制御し、そして試料
ブロック中の方向的に交錯したランプ冷却チャンネルを
通して流体の流れをゲート(gate)し、流体の流れ
は、試料ブロックを通る冷却液の一定のバイアス冷却流
と組み合ったとき、ユーザが特定する標的温度への急速
な温度変化およびその温度における正確な温度制御を達
成する設備を提供する。3ゾーンのヒータを制御する方
法および装置は、なかでも、3ゾーンのヒータの種々の
ゾーンへ供給すべき電気的エネルギーの量を計算すると
き、ライン電圧、ブロック温度、冷却液温度および周囲
温度を考慮する装置を含んでいる。このヒータは、試料
ブロックのへりまたは「ガードバンド」の下で別々に制
御することができ、こうして試料ブロックのへりへ取り
付けられた周辺装置を通る周囲への過剰の熱損失を補償
できるようにする、ゾーンを有する。これは温度勾配の
形成を防止する。
【0022】さらに、本発明は、試料をそれらの沸点付
近の温度においてインキュベーションするとき、反応混
合物からの溶媒の損失を防止する新規な方法および装置
を包含する。加熱された定盤は試料管の上部をカバー
し、そして個々のキャップと接触し、これらのキャップ
は各試料管に気密シールを提供する。定盤からの熱は各
試料管およびキャップの上部を凝縮点より上の温度に加
熱するので、試料管内で凝縮および還流は起こらない。
凝縮は比較的大きい熱移動を表す。なぜなら、蒸発熱に
等しい量の熱が水蒸気の凝縮に消費されるからである。
これは、凝縮が均一に起こらない場合、試料から試料へ
の大きい温度の変動を引き起こすことがある。加熱され
た定盤は、試料管中の凝縮の発生を防止し、これにより
この潜在的な温度誤差源を最小にする。加熱された定盤
の使用は、また、試薬の消費を減少する。
【0023】さらに、加熱された定盤は、すべての試料
管を温度制御した試料ブロックの中にしっかり押し込ん
で各管について均一なブロック対管の熱伝導を確立しか
つ維持するために必要な、実験的に決定した最小の下向
きの力を越える下向きの力を各試料管に与える。熱伝導
のこの均一性は、管対管の長さ、直径、角度または他の
寸法の誤差の変動に無関係に確立され、これらはそうで
なければある試料管を他の試料管より対応する試料ウェ
ルの中によりきっちりと嵌合させる。加熱された定盤
は、各キャップのプラスチックを軟化するが、キャップ
の弾性を完全には破壊しない。こうして、最小の限界の
下向きの力を、管対管の管の高さの差にかかわらず、各
管に連続的に加える。ここに記載するPCR計器は、2
倍またはそれ以上サイクル時間を減少し、そしてPCR
体積を20uhまで試薬のコストを下げるが、工業規格
0.5mlのマイクロ遠心分離器管との適合性を残す。
【0024】
【実施例】図1を参照すると、本発明の教示に従いPC
Rを実施するためのコンピュータ制御の計器の1つの実
施態様の主要なシステム要素のブロック線図が示されて
いる。増幅すべきDNAまたはRNAを含む試料混合物
を温度プログラムされた試料ブロック12の中に配置
し、そして加熱されたカバー14でカバーする。ユーザ
は、キーボードおよびディスプレイを含む端子16を経
て、所望のPCRプロトコルの時間および温度のパラメ
ーターを定めるデータを供給する。キーボードおよびデ
ィスプレイはバス18を経て制御コンピュータ20(以
後中央処理装置またはCPUと呼ぶ)に連結する。この
中央処理装置20は、下に記載する制御プログラム、所
望のPCRプロトコルおよび以下に記載するある種の較
正定数を蓄積する記憶装置を包含する。制御プログラム
はCPU20が試料ブロック12の温度サイクリングを
制御するようにさせそしてユーザのインタフェースを実
施し、そしてユーザのインタフェースはある種のディス
プレイをユーザに提供し、そしてユーザにより端子16
のキーボードを経て入力されたデータを受けとる。
【0025】好ましい実施態様において、中央処理装置
20は特注設計される。エレクトロニクスのブロック線
図は以下でより詳細に論ずる。他の実施態様において、
計器の種々のヒータおよび他の電気−機械的システムを
制御しそして種々のセンサーを読む中央処理装置20お
よび関連する周辺エレクトロニクスは、任意の汎用コン
ピュータ、例えば、適当なプログラムによるパーソナル
コンピュータまたはマイクロコンピュータである。試料
10を試料ブロック12の中に配置されたキャップ付き
使い捨て管の中に貯蔵し、そして加熱されたカバー14
により周囲空気から隔離し、そして加熱されたカバー1
4は以下に記載するプラスチックの使い捨てトレーと接
触して、試料管が内部に存在する加熱された箱体を形成
する。加熱されたカバーは、なかでも、試料管内の蒸
発、凝縮および還流により、試料混合物を出入りする望
ましくない熱移動を減少する働きをする。それは、ま
た、キャップの内側を乾燥に保持し、これにより管から
キャップを取ったとき、エアゾールの形成を防止するこ
とによって、相互汚染の機会を減少する。加熱されたカ
バーを試料管のキャップと接触させ、そしてそれらをほ
ぼ104℃または反応混合物の種々の成分の凝縮点より
上に加熱して保持する。
【0026】中央処理装置20は、加熱されたカバー1
4の温度を感知しそしてその中の電気抵抗ヒータを制御
してカバー14を所定の温度に維持するために、適当な
エレクトロニクスを包含する。加熱されたカバー14の
温度の感知およびその中の抵抗ヒータの制御は、温度セ
ンサー(図示せず)およびバス22を経て達成される。
冷却液制御システム24は、冷却された冷却液、例え
ば、自動車の不凍液と水の混合物を、試料ブロック12
中のバイアス冷却チャンネル(図示せず)を通して、入
力管26および出力管28を経て、連続的に循環させ
る。冷却液制御システム24は、また、試料ブロック1
2中のより高い体積のランプ冷却流体の流路(図示せ
ず)を通る流体の流れを制御する。ランプ冷却チャンネ
ルを使用して、試料ブロック12を通して大きい体積の
冷却された冷却液を比較的高い流速で送ることによっ
て、試料ブロック12の温度を急速に変化させる。ラン
プ冷却用冷却液は試料ブロック12に管30を通して入
り、そして管32を通して試料ブロック12から出る。
冷却液制御システムの詳細は図46に示されている。冷
却液制御システムは、制御システムのエレクトロニクス
およびソフトウェアの説明において以下でより詳細に論
ずる。
【0027】典型的には、試料ブロック12の冷却に使
用する冷却液は、主として水とエチレングリコールとの
混合物から成る。冷却液は熱交換器34により冷却さ
れ、そして熱交換器34は試料ブロック12から熱を抽
出した冷却液を入力管36から受けとる。熱交換器34
は、冷却装置40から入力管38を経て圧縮された液体
のフレオン冷却剤を受けとる。この冷却装置40はコン
プレッサー(図示せず)、ファン42およびフィン管加
熱ラジエーター44を包含する。冷却装置40は、管4
6を経て熱交換器34から受けとったフレオンガスを圧
縮する。気体のフレオンはフィン管凝縮器44において
冷却されそして液体に凝縮される。液体のフレオンの存
在は、絞り弁式毛管47によりフィン管凝縮器中のその
蒸気圧より上に維持される。この毛管の出力は管38を
経て熱交換器34の入力部に連結される。熱交換器にお
いて、フレオンの圧力はフレオンの蒸気圧より下に低下
し、そしてフレオンが膨張する。この膨張工程におい
て、熱は熱交換器中を循環する加温された冷却液から吸
収され、そしてこの熱はフレオンに移動し、これにより
フレオンは沸騰するようになる。次いで、加温されたフ
レオンは熱交換器から管16を経て抽出され、そして圧
縮されそして再びフィン管凝縮器44を通して循環され
る。ファン42はフィン管凝縮器44を通して矢印48
で示すように空気を流して、フレオン中の熱を管46か
ら周囲の空気と交換させる。冷却装置40は30℃にお
いて400ワットの熱および10℃において100ワッ
トの熱を冷却液から抽出して、本発明の教示に従い急速
な温度のサイクルを支持することができる。
【0028】好ましい実施態様において、図1の装置は
ハウジング(図示せず)内に囲まれている。周囲の空気
へ追い出された熱48はハウジング内に保持され、冷却
された冷却液またはフレオンを1つの場所から他の場所
に運ぶ種々の管上に起こる凝縮の蒸発を促進する。凝縮
は、装置またはエレクトロニクスの回路の構成において
使用した金属の腐食を引き起こすことがあり、したがっ
て除去すべきものである。囲いの内側の熱48の放出
は、凝縮の蒸発を促進して腐食を防止する。
【0029】その熱をフレオンと交換した後、冷却液は
熱交換器34を管50を経て出て、冷却液制御システム
に再び入り、ここで端子16を経てユーザが入れたデー
タにより定められるPCRサイクルの急速な冷却部分の
間、冷却液は必要に応じて試料ブロックへゲートされ
る。上記のように、PCRプロトコルは少なくとも2つ
の異なる温度およびしばしば3つの異なる温度における
インキュベーションを包含する。典型的なPCRサイク
ルは図11に示されており、ここで変性インキュベーシ
ョン170は94℃付近の温度において実施し、ハイブ
リダイゼーションインキュベーション122は室温付近
の温度(25℃〜37℃)において実施し、そして伸長
インキュベーション174は50℃付近の温度において
実施する。これらの温度は十分に異なり、したがって、
すべての試料の反応混合物の温度を1つの温度から他の
温度に急速に動かす手段を準備しなくてはならない。ラ
ンプ冷却システムは、試料ブロック12の温度を高い温
度の変性インキュベーションからより低い温度のハイブ
リダイゼーションインキュベーションおよび伸長インキ
ュベーションの温度に急速に低下させる手段である。典
型的には、冷却液の温度は10〜20℃の範囲である。
冷却液が20℃であるとき、それは約400ワットの熱
を試料ブロックから送り出すことができる。典型的に
は、ランプ冷却チャンネルの寸法、冷却液の温度および
冷却液の流速は、5〜6℃/秒のピーク冷却が操作範囲
の高い端(100℃)付近において達成され、かつ2.
5℃/秒の平均の冷却速度が試料ブロックの温度を94
℃から37℃にするとき達成されるようにセットする。
【0030】ランプ冷却システムは、ある実施態様にお
いて、試料ブロックの温度を標的のインキュベーション
温度にまたはその付近に維持するために使用できる。し
かしながら、好ましい実施態様において、標的インキュ
ベーション温度を維持するための下向き試料ブロック1
2の小さい温度変化はバイアス冷却システムにより実施
される。
【0031】図46に示すように、ポンプ41は濾過貯
留槽39(130mlの容量)から1/2インチ管を経て
冷却液を絶えず送り、そしてそれを1/2インチ管を経
て分岐部47へ送る。ポンプ41は冷却液をパイプ45
に1〜1.3ガロン/分の一定の流速で供給する。分岐
部47において、管45中の流れの部分はバイアス冷却
チャンネル49を通して一定の流れとして転向する。管
45中の流れの他の部分は、絞り弁51を通して出力管
38に転向する。絞り弁51はこのシステムにおいて十
分な圧力を維持し、こうしてバス54を経るCPU20
の制御下に2状態のソレノイド作動弁55の入力53に
おいて正の圧力が存在する。ランプ冷却の急速な下向き
の温度変化の実行が望ましいとき、CPU20はソレノ
イド作動弁55を開放し、冷却液をランプ冷却チャンネ
ル57を通して流れさせる。8つのランプ冷却チャンネ
ルが存在するので、各ランプ冷却チャンネルを通る流量
は約1/8ガロン/分である。バイアス冷却チャンネル
を通る流量は、その大きく制限された断面積のために、
非常に少ない。
【0032】バイアス冷却システムは、試料ブロック1
2中のバイアス冷却チャンネル49を通して冷却された
冷却液の小さい一定の流れを提供する。これは試料ブロ
ック12から一定の小さい熱損失を引き起こし、これは
マルチゾーンヒータ156により補償され、マルチゾー
ンヒータ156は試料ブロックの温度を安定した値に維
持すべきインキュベーションセグメントのために試料ブ
ロック12に熱的に連結されている。バイアス冷却の流
れにより引き起こされる一定の小さい熱損失は、小さい
温度のための温度の上下の比例的制御を制御システムに
実行させる。これが意味するように、両者の加熱および
冷却を、制御された予測可能な小さい速度で温度サーボ
システムは利用して、ブロック温度の誤差を補正してブ
ロック温度が信頼性をもって、ユーザが入れたPCR温
度のプロフィルをたどるようにする。別の方法はフィル
ムヒータへの電力をカットオフし、そしてブロック温度
が高すぎたとき、試料ブロックが熱を放射および対流に
より周囲に放出するようにさせることである。これは、
定量的PCRサイクリングのための厳密な温度制御の規
格を満足するためには遅すぎそして予測不可能である。
【0033】このマルチゾーンヒータ156は図1にお
いてCPU20によりバス52を経て制御され、そして
試料ブロック12の温度をより低いインキュベーション
温度からより高いインキュベーション温度に急速に上昇
させる手段であり、そしてバイアス冷却を補償しそして
インキュベーションの間の温度のトラッキング(追跡)
および制御の間、温度誤差を上方に補正する手段であ
る。他の実施態様において、バイアス冷却は使用しない
ようにしても良く、あるいは他の手段、例えば、試料ブ
ロックの金属の中に形成された冷却ファンまたは冷却フ
ィン、ペルチエ接合または絶えず循環する水道水により
供給することができる。しかしながら、これらの他の実
施態様において、温度勾配が試料ブロックの中に生じな
いように注意しなくてはならない。温度勾配はある試料
の温度を他の試料と異なる温度にし、これによりある試
料におけるPCR増幅の結果を他の試料のそれと異なら
せる。好ましい実施態様において、バイアス冷却はブロ
ック温度と冷却液温度との間の差に比例する。
【0034】CPU20は、図1において試料ブロック
12の金属の温度を温度センサー21およびバス52を
介して検知することによって、及び循環冷却液の温度を
バス54および冷却液制御システムの温度センサーを介
して感知することによって、試料ブロック12の温度を
制御する。冷却液のための温度センサーは図46におい
て61に示されている。CPUは、また、図1において
システムのハウジングの内部の周囲空気の温度を周囲空
気温度センサー56により感知する。さらに、CPU2
0はライン58の入力電力のライン電圧をセンサー63
を介して感知する。データのすべてのこれらの項目は、
所望のPCRプロトコル、例えば、インキュベーション
のための目標温度および時間を定めるためにユーザが入
力するデータの項目と一緒に、より詳細に後述する制御
プログラムにより使用される。この制御プログラムは、
マルチゾーン試料ブロックフィルムヒータ156の種々
のゾーンへバス52を経て加える電力の量を計算し、そ
して冷却液制御システム24においてソレノイド作動弁
55を開閉する冷却液制御信号をバス54を経て発生し
て、試料ブロックの温度が、ユーザが入力したデータに
より定められるPCRブロトコルに従うようにさせる。
【0035】図2を参照すると、試料ブロック12の上
面図が示されている。試料ブロック12の目的は、薄い
壁の試料管の列のための機械的支持および熱交換部材を
提供することであり、ここで各試料管中の試料の液体と
試料ブロック12の中に形成されたバイアス冷却チャン
ネルおよびバイアス冷却チャンネルの中を流れる冷却液
との間で熱が交換される。更に、試料ウェルの種々のも
のの間で大きい温度勾配をつくらないでこの熱交換機能
を提供し、列中のすべての試料混合物が、空間的に分離
されていても、同一PCRサイクルを経験するようにさ
せることは、試料ブロック12の果すべき機能の一つで
ある。ここに記載するPCR計器の全体の目的は、複数
の試料について試料液体の温度を非常に厳密に制御し、
こうしていずれの試料液体の温度も他の試料ウェル中の
いずれの他の試料液体の温度とPCRサイクルのいずれ
の点においても感知しうるほど(ほぼ±0.5℃)差が
生じないようにすることである。
【0036】「定量的」PCRと呼ばれるPCR技術の
分野が存在する。この技術において、この目的は標的D
NAの量をサイクル毎に正確に2倍にすることによって
PCR増幅を出来るだけ正確に実施することである。サ
イクル毎の正確な倍増は達成が困難であるか、あるいは
不可能であるが、厳密な温度制御はこれを達成する上で
役に立つ。多数の誤差源が存在し、これらのために、P
CRサイクルはサイクルの間の標的DNA(以後“DN
A”はまた“RNA”を意味すると理解されたい)の量
を正確に2倍にすることができないことがある。例え
ば、あるPCR増幅において、このプロセスは標的DN
Aの単一の細胞を使用して開始する。この単一の細胞が
試料管の壁に粘着しそして最初の数サイクルで増幅しな
いようなとき、この誤差は容易に生じ得る。
【0037】誤差の他の型は、「外来」標的DNAを攻
撃する外来ヌクレアーゼが反応混合物の中に入ることで
ある。すべての細胞は、細胞中で遊離した外来DNAを
攻撃する非特異的ヌクレアーゼを有する。これが起こる
とき、それは複製プロセスを妨害するか、あるいは停止
させる。こうして、1滴の唾液またはふけの粒子または
他の試料混合物からの物質が試料混合物の中に偶発的に
入る場合、これらの細胞中のヌクレアーゼ物質は標的D
NAを攻撃しそして増幅プロセスにおいて誤差を生ず
る。すべてのこのような交差汚染源を排除することは高
度に望ましい。他の誤差源は、試料の種類が多様である
場合に生じる、試料混合物の温度制御の不正確さであ
る。例えば、すべての試料が伸長インキュベーションの
ために適切なアニーリング温度(通常50〜60℃の範
囲のユーザが選択した温度)を有するように正確に制御
されない場合、DNAのある種の形態は適切に伸長され
ないであろう。これが起こる理由は、温度が低すぎる場
合、伸長プロセスにおいて使用するプライマーが誤った
DNAにアニーリングすることである。アニーリング温
度が高すぎる場合、プライマーは標的DNAにまったく
アニーリングしない。
【0038】PCR増幅が診断試験、例えば、HIV抗
体、肝炎、または遺伝病、例えば、鎌状赤血球貧血など
の存在についての診断試験の一部分であるとき、PCR
増幅プロセスを不正確に実施した結果を容易に想像する
ことができる。このような診断試験における誤った陽性
または誤った陰性の結果は、個人的または法律的に破滅
的な結果を生じることがある。したがって、ここに記載
するPCR装置の設計の目的は、これらの起こりうる誤
差源、例えば、交差汚染または劣悪な温度制御の出来る
だけ多くを排除すると同時に、工業的に標準の96ウェ
ルのマイクロタイタープレートのフォーマットと適合す
る装置を提供することである。この装置は簡単なユーザ
のインタフェースを使用して柔軟にPCRを高速で実施
できるものでなくてはならない。好ましい実施態様にお
いて、試料ブロック12は比較的純度の高い、腐食抵抗
性のアルミニウム、例えば、6061アルミニウム合金
から機械加工する。アルミニウムの中実ブロックからブ
ロック構造を機械加工すると、熱的により均質な構造が
生ずる。鋳造したアルミニウム構造体は、非常に厳密な
所望の温度制御の規格を満足するために必要なほど、熱
的に均質にはなりにくい。
【0039】試料ブロック12の熱的質量は小さくされ
ているので、急速な温度変化を行うことができる。これ
は多数の冷却通路、試料ウェル、みぞおよび他のねじ孔
または非ねじ孔をブロックの中に形成することによって
実施される。これらの孔のいくつかを使用して、ブロッ
クを支持体に取り付けそして外部の装置、例えば、マニ
ホールドおよびこぼれトレーを取り付ける。試料ブロッ
クの構造の「ハニカム」性質を最もよく理解するため
に、ブロックを平面図で示す図2ならびに試料ブロック
の正面図および断面図を示す図3〜図8を同時に参照す
る。例えば、図3は図2の線3−3′から見た冷却チャ
ンネルの位置を示す側面図である。反対側から見た、試
料ブロック12の側面図は同一である。図4は図2の線
4−4′から見た試料ブロック12のへりの側面図であ
る。図5は図2の線5−5′から見た試料ブロック12
のへりの側面図である。図6は図2の線6−6′に沿っ
た試料ブロック12の断面図である。図7は図2の線7
−7′に沿った試料ブロック12の断面図である。図8
は図2の線8−8′に沿った試料ブロック12の断面図
である。
【0040】試料ブロック12の上部表面は、66と6
8とで代表的に示した円錐形試料ウェルの8×12列が
孔開けされている。各試料ウェルの円錐形の形状は図8
に最もよく示されている。各試料ウェルのウェルは17
°の角度で孔開けされていて、各試料管の円錐形部分の
角度と合致している。これは図8において直径DW を有
するパイロット孔を孔開けすることによって形成され
る。次いで、17°のカウンターシンクを使用して円錐
形壁67を形成する。
【0041】各試料ウェルの底は、試料管の先端の浸透
深さを越える深さを有する溜70を含む。溜70はパイ
ロット孔によりつくられ、そして試料管が対応する試料
ウェルの中に配置されるとき、試料管より下に小さい開
いた空間を提供する。この溜は、試料ウェルの壁への各
試料管の緊密な嵌合を妨害せずに、液体、例えば、ウェ
ル壁上に形成する凝縮物が存在するための空間を提供す
る。この緊密な嵌合は、ウェル壁から試料液体への熱伝
導性を各試料管について均一かつ高くすることを保証す
るために必要である。1つの管についてゆるい嵌合を引
き起こすウェル中の汚染は、列を横切る熱伝導性のこの
均一性を破壊するであろう。すなわち、試料ウェル中の
試料管の嵌合に要する圧力では液体は実質的に圧縮され
ないので、溜70が存在しない場合、試料ウェルの底中
に液体が存在するとその試料ウェル中の試料管は完全に
嵌合できなくなることがある。さらに、溜70はある空
間を提供し、この空間において、溜70の中に存在する
液体の気相は高い温度のインキュベーションの間に膨張
できるが、もし溜70が存在しない場合には膨張による
大きい力が試料管に加えられて試料ウェルとの均一な接
触から管が押し出されてしまう恐れがある。
【0042】実験から、各試料管はその対応する試料ウ
ェルと均一に接触することが重要であること、そしてあ
る最小の限界の力を各試料管に加えて、試料ウェルの壁
と反応混合物との間の熱伝導性を列を通じて均一に保持
する必要があることが発見された。この最小の限界の嵌
合力は、図15に力のベクトルFとして示されており、
そして1つの試料管の壁を通る熱伝導率がブロック中の
どこかに位置する他の試料管を通る熱伝導率と異なるの
を防止するための、主要な因子である。最小の限界の嵌
合力Fは30gであり、そして好ましい力のレベルは5
0〜100gである。
【0043】試料ウェルの列は、図2、図6および図8
において最もよく示されるように、2つの機能を有する
みぞ78により実質的に完全に取り囲まれている。この
みぞ78の主な機能は試料ブロックの中央区域からブロ
ックのへりへの熱伝導を減少することである。みぞ78
は試料ブロックの厚さの約2/3にわたって延設されて
いる。このみぞは、支持ピン、マニホールドなどのブロ
ックへの必要な機械的接続により引き起こされる、回避
不可能な熱勾配の作用を最小とする。第2の機能は熱的
質量を試料ブロック12から除去して、試料ブロック1
2の温度をより急速に変更可能とし、そして「ガードバ
ンド」と呼ぶへり領域におけるウェルの列をシミュレー
トすることである。図2における点80および82の間
のみぞ78の部分により除去される金属の量は、8つの
試料ウェル83〜90の隣接する列により除去される金
属の量に実質的に等しいように設計される。この目的
は、ガードバンドの熱的質量を隣接する以下に説明する
「局所的ゾーン」、の熱的質量に合致させることであ
る。
【0044】図3、図6および図8を参照すると、試料
ブロック12の金属の中に形成された、種々のバイアス
冷却チャンネルおよびランプ冷却チャンネルの数および
相対的位置が示されている。9つのバイアス冷却チャン
ネル91〜99が存在する。同様に、8つのランプ冷却
チャンネル100〜107が存在する。これらのバイア
ス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャンネルの各々は
試料ブロックのアルミニウムにガン孔開けされる。ガン
孔開け法はよく知られており、試料ブロック12の底表
面110の出来るだけ近くに長い非常に真っすぐな孔を
開けることができる。ガン孔開け法は真っすぐな孔を開
けるので、この方法はバイアス冷却チャンネルまたはラ
ンプ冷却チャンネルが、孔開けの間にそれることおよび
試料ブロックの底表面110を貫通することを防止した
り、あるいは他の冷却チャンネルに対する相対的位置の
変動を防止する上で好ましい。このような位置の誤差
は、局所的ゾーンの「局所的バランス」または「局所的
対称性」を覆すことによって、望ましくない温度勾配を
引き起こすことがある。これらの概念は以下で説明する
が、これらの概念と、この概念を実現する構造は、異な
る試料ウェルの間のように過度の温度誤差をつくらない
で、96までの試料の急速な温度サイクリングを達成す
るために重要であることを理解すべきである。
【0045】バイアス冷却チャンネル91〜99は、好
ましい実施態様においてシリコーンゴムでライニングし
て、バイアス冷却チャンネルの壁を横切る熱伝達率を低
下させる。バイアス冷却チャンネル中の壁を横切る熱伝
達率を低下させることは、マルチゾーンヒータ156を
オフにしそして試料ブロック12からの熱損失が主とし
てバイアス冷却チャンネルによるときに、試料ブロック
12の急速過ぎる温度変化を防止する上で好ましい。こ
れは、試料ブロックの温度が所望の標的インキュベーシ
ョン温度よりわずかに上昇し、そして制御システムが試
料ブロックの温度をユーザが特定したインキュベーショ
ン温度まで戻す場合の制御過程で生じる。「制御された
オーバーシュート」は以下に記載するように使用されて
いるが、この場合における冷却速度が速すぎると、制御
システムのサーボフィードバックループが応答すること
ができる前に、所望のインキュベーション温度に対して
オーバーシュートを引き起こすことがある。ブロック温
度のサーボフィードバックループは外乱に対する応答の
時定数を有するので、加熱および冷却の量および試料ブ
ロックの生ずる温度変化速度を制御し、制御システムが
温度誤差に対して応答できるより速い速度で、試料ブロ
ックの温度を変化させないことによって、オーバーシュ
ートを最小にすることが望ましい。
【0046】好ましい実施態様において、バイアス冷却
チャンネルは直径4mmであり、そしてシリコーンゴムの
管は1mmの内径および1.5mmの壁厚さを有する。これ
は、ブロックが作動上限温度、すなわち、約100℃で
あるとき、ほぼ0.2℃/秒のバイアス冷却速度を与
え、そして試料ブロック12が作動下限温度であると
き、ほぼ0.1℃/秒のバイアス冷却速度を与える。図
1における冷却液制御システム24は、バイアス冷却チ
ャンネル内に、ランプ冷却チャンネル100〜107を
通る冷却液の流速のほぼ1/20〜1/30倍の冷却液
の流速を生じさせる。バイアス冷却チャンネルおよびラ
ンプ冷却チャンネルは同一サイズ、すなわち、4mmの直
径であり、そして試料ブロック12全体にわたって延設
されている。バイアス冷却チャンネルは、その端にフッ
クをもつ剛性なワイヤをバイアス冷却チャンネルの中に
挿入しそしてそれを4mmよりわずかに大きい外径を有す
るシリコーンゴム管の端の孔を通してフッキングするこ
とによってライニングされる。次いで、ワイヤ中のフッ
キングをシリコーンゴム管中の孔を通し、そしてシリコ
ーンゴム管をバイアス冷却チャンネルを通して引き、そ
して試料ブロック12の端表面と同一平面になるように
切断する。
【0047】ねじ孔108〜114は、冷却液のマニホ
ールドを試料ブロック12の各側にボルト止めするのに
使用される。冷却液のマニホールドはブロックの両端に
ボルト止めされる。これらの2つのマニホールドを図1
において冷却チャンネル26,28,30および31に
連結され、マニホールドと試料ブロックの金属との間に
挿入したガスケット材(図示せず)を介して試料ブロッ
ク12に取付けられている。このガスケットは冷却液の
漏れを防止し、試料ブロック12とヒートシンクを代表
するマニホールドとの間の熱伝導を制限する。前述の目
的に合った任意のガスケットであれば本発明の実施のた
めに十分である。
【0048】みぞ78の位置に対するバイアス冷却チャ
ンネルおよびランプ冷却チャンネルの位置は、図6の断
面図において最もよく示されている。試料ウェルの位置
に対するバイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャ
ンネルの位置は、図8の断面図において最もよく示され
ている。バイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャ
ンネルは、一般に、隣接した試料ウェルの先端の間の位
置に介在する。さらに、図8から明らかなように、バイ
アス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャンネル、例え
ば、チャンネル106および97は、1または2以上の
試料ウェルの壁を貫通することなしには、図の正のZ方
向に大きく外れることはできない。同様に、冷却チャン
ネルは、試料ブロック12の底表面116を貫通するこ
となしには負のz方向に大きく外れることはできない。
明瞭のため、バイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却
チャンネルの、試料ウェルおよび他の構造物の位置に対
する相対位置は図2に示されていない。しかしながら、
試料ウェルのすべてのカラムの間にバイアス冷却チャン
ネルまたはランプ冷却チャンネルが存在する。
【0049】図2を参照すると、孔118,119,1
20および121にねじ山を形成し、そしてそれらの孔
を使用して、試料ブロック12の中に形成する種々の孔
およびみぞを機械加工するために使用する機械に試料ブ
ロック12を取り付ける。図2、図4および図5におい
て、孔124,125,126および127を使用し
て、以下に詳細に記載する、図9に示す支持ブラケット
に試料ブロック12を取り付ける。鋼製のボルトはこの
支持ブラケットを通してねじ孔124〜127の中に延
びて、試料ブロック12を機械的に支持する。これらの
鋼製のボルトは、ヒートシンクまたはヒートソースにな
るとともに、熱的質量を試料ブロック12に付加し、そ
して試料ブロック12と周囲の環境との間の熱的エネル
ギーの移動のための付加的通路を提供する。これらの支
持ピンおよびマニホールドは、これらの周辺構造体を通
して伝達される熱的エネルギーが試料の温度に影響を与
えるのを防止するためにガードバンドが必要となる2つ
の重要な因子である。図5を参照すると、孔128,1
30および132は集積回路の温度センサー(図示せ
ず)のための取り付け孔であり、この温度センサーは孔
128を通して試料ブロックの中に挿入され、そしてね
じ孔130および132へ締結されるボルトにより固定
される。孔128の深さおよびみぞ78および試料ウェ
ルの隣接する列との相対的位置は、図2に最もよく示さ
れている。
【0050】図2を参照すると、孔134〜143はス
ピルカラー147(図示せず)を取り付けるために使用
する取り付け孔である。このスピルカラー147は図1
9に示されており、図19は加熱された定盤14、すべ
りカバー316および案内ねじアセンブリ312の構造
を詳細に示す。スピルカラーの目的は、試料管からこぼ
れた液体が機器ケーシングの内側に侵入して腐食を生じ
るのを防止することである。
【0051】図9を参照すると、試料ブロック12のた
めの支持システムおよびマルチゾーンヒータ156の構
造の断面図が示されている。試料ブロック12は4つの
ボルトにより支持され、それらをボルト146で代表し
て示している。これらの4つのボルトは鋼製支持ブラケ
ット148の直立部材を貫通している。2つの大きいコ
イルばね150および152は、支持ブラケット148
の水平部分と鋼製圧力板154との間で圧縮されてい
る。ばね150および152は、試料ブロック12の底
にフィルムヒータ156を圧着するために正のZ方向に
約300ポンド/平方インチの力を供給するように十分
に圧縮されている。この3層のフィルムヒータは、マル
チゾーンフィルムヒータ156、シリコーンゴムのパッ
ド158およびエポキシ樹脂フォームの層160から構
成されている。好ましい実施例において、フィルムヒー
タ156は3つの別々の制御可能なゾーンを有する。フ
ィルムヒータの目的は、図1においてCPU20の制御
下に試料ブロック12に熱を供給することである。シリ
コーンゴムのパッドの目的は、フィルムヒータ層156
から下の構造体への熱伝導率を低減することである。こ
れらの下部構造体はヒートシンクおよびヒートソースと
して働くため、これらの間で望ましくない熱エネルギー
が試料ブロック12から出入りする可能性があるからで
ある。シリコーンゴムのパッド158は、いくつかのフ
ィルムヒータはニクロム線を有するため完全に平らでは
ない場合があるので、フィルムヒータ156の表面の不
規則性を補償するという追加の機能を有する。
【0052】鋼製板154およびエポキシ樹脂フォーム
160の目的は、ばね150および152からの力をシ
リコーンゴムのパッド158およびマルチゾーンフィル
ムヒータ156に伝えて、フィルムヒータを出来るだけ
試料ブロックの底表面に密着するように押圧することで
ある。エポキシ樹脂フォームは剛性であって、ばねの力
の下に破壊しないように剛性を有するとともに、すぐれ
た絶縁体であり、熱的質量が小さい、すなわち、密でな
い構造であるべきである。1つの実施例において、フォ
ーム160は商標ECKOフォームで製造されている。
他の実施態様において、他の構造体をシリコーンゴム層
158および/またはエポキシ樹脂フォーム層160の
代わりに使用することができる。例えば、剛性のハネカ
ム構造体、例えば、航空機の構成に使用する構造体を圧
力板154とフィルムヒータ156との間にそれらの間
に絶縁層を配置させて使用することができる。層158
および160のためにどんな構造体を使用しても、構造
体は試料ブロック12が加熱されている間にそのブロッ
クから多量の熱を吸収してはならず、そして試料ブロッ
ク12が冷却されている間に、そのブロックに多量の熱
を与えてはならない。しかしながら、周囲構造体からの
ブロックの完全な隔離は事実上不可能である。試料ブロ
ック12と接触して、試料ブロックを周囲から出来るだ
け完全に隔離して、ブロック12の熱的質量を最小に
し、かつ試料ブロックおよびその中に格納された試料混
合物の急速な温度変化を可能とする、他の構造体を設計
するための努力をすべきである。
【0053】試料ブロックの温度の正確な制御は、図9
におけるマルチゾーンフィルムヒータ156により試料
ブロックへ供給される熱の量を制御することによって、
図1においてCPU20により達成される。フィルムヒ
ータはパルス幅変調法の改良した方法を用いて駆動され
る。第1に、電力ラインからの120ボルトの波形を整
流して、同一極性の半波のみを保存する。次いで、各半
波部分をフィルムヒータの適当なゾーンに入力し、フィ
ルムヒータの種々のゾーンへ加えられる各ハーフサイク
ルの割合をCPU20により制御する。
【0054】図10はフィルムヒータ156についての
電力制御の概念の1つの実施例を示す。図10は供給ラ
イン電圧の電圧波形図である。ネガティブハーフサイク
ル162を排除する整流が起こる。参照番号164で例
示するポジティブハーフサイクルのみが残る。次いで、
CPU20およびその関連する周辺電子回路は、フィル
ムヒータ156の種々のゾーンへ加えられる各ハーフサ
イクルの部分を、各ゾーンについて下に記載する式に基
づいて各ゾーンについて計算した電力レベルに従い、加
える各ハーフサイクルの部分を選択することによって制
御する。すなわち、図10の分割線166は、各ゾーン
について特別の式中の多数の因子に基づいて、フィルム
ヒータへの電力の量を制御するために時間軸に沿って前
後に移動せしめられる。ポジティブハーフサイクル16
4の下の斜線区域は、分割線166の示した位置につい
てフィルムヒータ156へ加えられた電力を表す。分割
線166が右に動くとき、より多くの電力がフィルムヒ
ータへ加えられ、そして試料ブロック12はより高温に
なる。分割線が時間軸に沿って左に動くとき、斜線区域
はより小さくなり、そしてより少ない電力がフィルムヒ
ータに加えられる。CPU20およびその関連するソフ
トウェアおよび周辺回路がブロック12の温度を制御す
る方法を、より詳細に以下に記載する。
【0055】フィルムヒータへ供給される電力は、0か
ら600ワットに連続的に変化させることができる。他
の実施例において、フィルムヒータ156へ供給される
電力は、他の方法、例えば、DCフィルムヒータを通る
電流またはそれに加えられる電圧等のコンピュータ制御
を使用して、あるいは下に記載するゼロ交差スイッチン
グ法により制御することができる。他の実施態様におい
て、試料ブロック12の加熱制御は、試料ブロック12
の金属内に形成される加熱制御チャンネルを通して流さ
れる、高温気体または液体の流速および/または温度を
制御することにより行うことができる。もちろん、この
ような他の実施例においては、ブロック中の試料ウェル
の数を低減しなくてはならないであろう。なぜなら、図
2〜図8に示す試料ブロック12中には追加の加熱チャ
ンネルのための余地が存在しないからである。このよう
な他の実施例は、例えば、もしすべての他のウェルを除
去して試料ブロック中に加熱チャンネルのための余地を
つくるなら、96ウェルのマイクロタイタープレートの
フォーマットに適合させることができる。これはこのよ
うなマイクロタイタープレートの寸法に関してのみ適合
するだけであり、96の異なる試料の同時処理に関して
は適合しない。これらの他の実施例において局所的バラ
ンスおよび局所的対称性を保存するために注意しなくて
はならない。
【0056】ここに記載する実施例において、フィルム
ヒータを経てブロックに供給できる最大の電力は110
0ワットである。この制限はブロック/ヒータの接続部
の熱伝導性から生ずる。実験において、フィルムヒータ
156への約1100ワットより多い電力供給は装置の
自己破壊をしばしば生じることが発見された。
【0057】ブロック温度を標的のインキュベーション
温度またはその付近への加熱または冷却のための電力
は、典型的には±50ワットの範囲内である。図11を
参照すると、典型的なPCRプロトコルの時間対温度の
関係が示されている。ブロック温度の大きい下向きの変
化は、冷却された冷却液をランプ冷却チャンネルを通し
て入力すると同時に図1において温度センサー21によ
り試料ブロックの温度をモニターすることによって達成
される。典型的には、この急速な下向きの温度変化は、
変性インキュベーション170とハイブリダイゼーショ
ンインキュベーション172の温度との間の温度変下時
に行われる。典型的には、ユーザは、図の、傾斜温度線
のレグおよびインキュベーションのレグの間の円形の交
差により示したチェックポイントの温度/時間の平面上
の位置をCPU20に対して記述するために、1つの方
法または他の方法において、温度および時間を定めるこ
とによってプロトコルを特定しなくてはならない。図
に、インキュベーションのレグを参照数字170,17
2および174で、ランプは参照番号176,178お
よび180でそれぞれ示している。一般に、インキュベ
ーションの間隔は単一の温度において実施されるが、別
の実施態様において、それらは含まれるPCRサイクル
の特定の部分を実施するために許容されうる温度範囲内
の異なる温度に段階的、あるいは連続的に変化するよう
にすることができる。すなわち、変性インキュベーショ
ン170は図11に示すように1つの温度において実施
する必要はないが、変性のために許容されうる温度範囲
内の複数の異なる温度のいずれにおいても実施すること
ができる。ある実施例においては、ユーザはランプセグ
メント176,178および180の長さを指定するこ
とができる。他の実施例においては、ユーザは各インキ
ュベーション間隔の1または2以上の温度および期間の
みを指定することができ、装置は1つのインキュベーシ
ョンの完了後他のインキュベーションの開始までの間に
出来るだけ急速に試料ブロックの温度を変化させる。好
ましい実施例において、ユーザは、また、各サイクル毎
に異なるか、あるいはすべてのサイクルについて自動的
に増加する温度および/またはインキュベーション時間
を設定することができる。
【0058】95℃の変性インキュベーションから35
℃のハイブリダイゼーションインキュベーションへの転
移の間のランプ冷却の平均電力は、典型的には1キロワ
ットより大きい。これは、ブロック温度が操作範囲の高
い端にあるとき、ほぼ4〜6℃/秒、そしてブロック温
度が操作範囲の下限であるとき、ほぼ2℃/秒の試料ブ
ロックの温度変化を生ずる。一般に、ランプ冷却のため
に出来るだけ高い冷却速度を有することが望ましい。
【0059】ランプ冷却の間に試料ブロックから非常に
多くの熱が除去されるので、ランプ冷却チャンネルの1
端から他端へ試料ブロックを横切る温度勾配が発生する
ことがある。これを防止しかつこれらの型の温度勾配を
最小にするために、ランプ冷却チャンネルは方向的に交
錯している。すなわち、図3において、ランプ冷却チャ
ンネル100,102,104および106を通る冷却
液の流れの方向は、これらのランプ冷却チャンネルの孔
の内側においてxで記号化されたように紙面の中へ向
う。交錯するランプ冷却チャンネル101,103,1
05および107中のランプ冷却液の流れは、これらの
ランプ冷却チャンネルの孔の中心にある単一点により記
号化されたように紙面から外に出る。この交錯+ランプ
冷却チャンネルを通る高い流速は、そうでなければ非交
錯の流れのパターンまたはより低い流速を使用した場合
に発生することがある温度勾配を最小にする。なぜな
ら、チャンネルの熱い端と冷たい端との間の距離がより
短かくなるからである。流速が遅いと熱のほとんどまた
は全部が移動の最初の数インチのところでブロックから
奪われることになる。これはブロックの入力側はブロッ
クの出力側より低い温度になることを意味する。早い流
速はチャンネルに沿った温度勾配を最小にする。交錯は
1つの方向に走るチャンネルの熱い端が流れが反対方向
となるチャンネルの複数の冷たい端間で「サンドイッ
チ」にされることを意味する。これはチャンネルの長さ
より短かい距離である。こうして、温度勾配を排除する
ために熱が移動しなくてはならない距離が縮少するの
で、温度勾配は減少する。これは、ランプチャンネルが
ある試料を他の試料と区別して加熱する前に、ランプチ
ャンネル中の冷却により生じるいかなる温度勾配をも急
速に解消する。交錯しないと、試料ブロックの1側は他
側よりほぼ1℃熱いであろう。交錯は、ほぼ15秒未満
のいかなる温度勾配をも消滅させる。
【0060】ブロックに添加またはそれから除去される
熱量を推定するために、CPU20は図1の温度センサ
ー21を使用してブロック温度を測定し、そして図1の
バス54に連結された図46の温度センサー61により
冷却液の温度を測定する。周囲空気の温度は、また、図
1の温度センサー56により測定し、そしてバス52上
でフィルムヒータに加えられる電力を制御する電力ライ
ンの電圧は、また、測定する。試料ブロックから周囲、
および試料ブロックから冷却液への熱伝導は、システム
の制御パラメータをセットするために初期化プロセス中
の測定結果としてCPU20へ知らされる。
【0061】試料集団の温度の均一性を良好にするため
に、ブロックは、定常温度にして、正味熱の流れを出入
りさせない。しかしながら、熱いスポットから、ブロッ
クの境界に関して正味熱の移動がゼロである冷たいスポ
ットへ流れる熱の局所的流れにより生ずる温度勾配が試
料ブロック内で起こることがある。例えば、1端で加熱
されそして他端で冷却されるスラブ材は、ブロックへ流
れる熱流がゼロである場合、定常の平均温度にある。し
かしながら、この状態で、相当に不均一な温度、すなわ
ち、温度勾配が、熱いへりから冷たいへりへ流れる熱流
により、スラブ内で形成されることがある。ブロックの
へりの加熱および冷却が停止されるとき、熱いへりから
冷たいへりへ流れる熱流はこの温度勾配を結果的に消去
し、そしてブロックは熱流開始時の熱い温度と冷たい温
度との間の平均である均一な温度に達する。
【0062】長さLの断面区域Aのスラブが均一な熱伝
導率Kを有しそして、熱源から入る熱流Qinが熱吸収部
へ出る熱流Qout と一致することにより、スラブが定常
平均温度に保持される場合、熱の流れから生ずる定常状
態の温度プロフィルは、次の通りである: (1)デルタT=(Qin・L)/(A・K) ここで、 デルタT=温度勾配、 L=熱通路の長さ、 A=熱通路の面積、 K=熱通路を通る熱伝導率、である。
【0063】一般に、均一な熱伝導性の物質内で、温度
勾配は熱の流れ/単位面積に比例する。こうして、熱の
流れと温度のばらつきは緊密にリンクされる。実際に
は、熱流を出入りさせないで試料ブロックの温度を制御
することは不可能である。冷たいバイアス制御による冷
却は、ストリップヒータからの多少の熱の流入を必要と
し、バイアス冷却チャンネルを流れる冷却液により除去
される熱のバランスを保ってブロック温度を安定な値に
維持する。これらの条件下で試料ブロックの温度を均一
にする鍵は、熱源と熱吸収部の「局所的バランス」と
「局所的対称性」とを静的かつ動的に有し、そして熱い
スポットから冷たいスポットへの熱の流れが短い距離で
のみ生じるように配置された幾何学配置にある。
【0064】簡単に述べると、「静的局所的バランス」
の概念は、全熱入力が全熱出力に等しい定常温度のブロ
ックにおいて、明確な局所的領域内で、すべての熱源が
熱吸収部によりブロックを出入りする熱の流れで完全に
そのバランスを維持するように熱源および熱吸収部が配
置されていることを意味する。したがって、各局所的領
域は、隔離されると、定常温度に維持されるであろう。
「静的局所的対称」の概念は、局所的領域内で定常温度
について、熱源の質量中心が熱吸収部の質量中心と一致
することを意味する。そうでない場合、各局所的領域内
で、各局所的領域にわたって温度勾配が生じ、これが隣
接する局所的領域の温度勾配に加わり、これにより各局
所的領域内の局所的バランスが保たれていても局所的対
称性の欠如から単一の局所的領域の大きさの2倍の勾配
が試料ブロックに生じる。局所的バランスおよび局所的
対称性の概念は、試料ブロックの温度が、例えば、イン
キュベーションのインターバル中に、定常レベルに維持
される静的温度バランスを達成するために重要である。
【0065】試料ブロック内で急速な温度変化が起こっ
ている動的場合について、各局所的領域の熱的質量また
は熱容量は重要になる。なぜなら、各局所的領域にその
温度を変化するために流入しなくてはならない熱の量は
その領域の熱的質量に比例するからである。したがっ
て、静的局所的バランスの概念は、局所的領域が熱源お
よびヒートシンクとの合計のx%を含む場合には「動的
局所的バランス」が存在するために熱的質量のx%をも
含むことを要件として、動的場合に敷衍できる。同様
に、「動的局所的対称性」は、熱容量の中心が動的熱源
および熱吸収部の熱的質量の中心と一致することを必要
とする。簡単な用語でこれが意味することは、試料ブロ
ックの熱的質量がその金属であり、そして各局所的ゾー
ン内の金属の合計質量が同一であるように、試料ブロッ
クの機械加工が対称かつそのバランスがとれていること
である。さらに、各局所的ゾーンにおける金属の質量中
心は動的熱源および熱吸収部の質量中心と一致すべきで
ある。こうして、マルチゾーンヒータ156の質量中
心、すなわち、その幾何学的中心、およびバイアスなら
びにランプ冷却チャンネルの幾何学的中心は一致しなく
てはならない。図2〜図9の研究から、静的および動的
の局所的バランスおよび局所的対称性の両者が試料ブロ
ック12に存在することは、後述の説明から理解される
であろう。
【0066】図12は、本発明の教示に従う試料ブロッ
ク12の設計のための並列する2つの局所的領域を示
す。図12において、2つの局所的領域200および2
02の境界は鎖線204,206および208で示され
ている。図12は、ガードバンドの中に存在しない各局
所的領域が、次の構成成分から構成されていることを示
す。すなわち、試料ウェルの2つの列;ヒータの合計面
積の1/8倍であるフォイルヒータ156の部分;1つ
のランプ冷却チャンネル、例えば、ランプ冷却チャンネ
ル210および212;および、1つのバイアス冷却チ
ャンネルである。局所的対称性を保持するために、各局
所的領域はそのランプ冷却チャンネル上に中心が存在
し、そして各境界においてバイアス冷却チャンネル上で
1/2を占める。例えば、局所的領域200はランプ冷
却チャンネル210の上に中心を有し、そしてバイアス
冷却チャンネル214および216は、それぞれ、局所
的領域の境界204および206により区切られてい
る。こうして、ランプ冷却チャンネルの質量中心(その
中心)は、バイアス冷却チャンネルの質量中心(局所的
領域の中心)および各局所的領域に連結するフィルムヒ
ータ部分の質量中心と(水平に)一致する。CPU20
がフィルムヒータ156を駆動して、ランプ冷却チャン
ネルおよびバイアス冷却チャンネルにより除去されてい
る熱エネルギーの量に等しい熱エネルギーの量を入力す
るとき、静的局所的バランスが各局所的領域に保たれ
る。96の試料混合物が存在するブロックの中心部分の
各局所的領域が全体の試料ブロックの総熱的質量のほぼ
1/8を含み、ランプ冷却チャンネルの合計数の1/8
を含みかつバイアス冷却チャンネルの合計数の1/8を
含むので、各局所的領域について動的局所的バランスは
保持される。各局所的領域の金属の質量中心が、局所的
領域の下にあるフィルムヒータ部分の中心、ランプ冷却
チャンネルの中心および、2つの1/2長のバイアス冷
却チャンネルの質量中心と水平的に一致するので、動的
局所的対称性は各線形回帰について成立する。
【0067】静的および動的局所的バランスおよび局所
的対称性として特徴づけられるこれらの物理学的性質に
より、試料ブロックは、集団中のすべての試料を、先行
技術の熱循環系より更にいっそう均一に加熱および冷却
する。図2は、局所的領域の境界の平面図を鎖線217
〜225により示す。図2から明らかなように、96の
試料ウェルの中央領域は境界218〜224により画さ
れた6つの隣接する領域に分割されている。さらに、2
つのガードバンドおよび局所的領域が各へりに付加され
ている。最もネガティブのx座標を有するへりの局所的
領域(局所的領域は時にはまた局所的ゾーンと呼ぶ)
は、境界線217および218により画されている。最
もポジティブのx座標を有するへりの局所的領域は、境
界線224および225により画されている。各局所的
領域は試料ウェルのカラムを含まないが、ウェルのカラ
ムシミュレーションするみぞ78を含む。みぞ78の深
さおよび幅は、ウェルのカラムと同一の金属質量を除去
し、これにより動的局所的対称性を多少保持ように設計
されている。したがって、へりの局所的ゾーンでは試料
ブロックの中央部分における6つの局所的ゾーンと熱的
質量が異なる(この領域は、また、外部の接続部材、例
えば、マニホールドおよび支持ピンにより付加的熱的質
量を有する)。この差は、へりの局所的ゾーンまたはガ
ードバンドを前記マルチゾーンヒータの別々に制御可能
なゾーンと共に加熱してブロックの中央ゾーンより多く
のエネルギーをガードバンドへ送ることにより是正され
る。
【0068】ブロックの各へりにおける局所的領域は、
6つの中央に位置する局所的領域の熱的性質と正確でな
いが略近似する。へりの局所的領域は、試料ブロック1
2の周辺の回りのガードバンドを完全にするので、「ガ
ードバンド」領域と呼ぶ。このガードバンドの目的は、
試料ブロック12に機械的に固定される支持ピン、マニ
ホールド、ドリップカラーおよび他の装置等によってブ
ロックへ機械的接続により本来的に埋め込まれる、制御
されない熱吸収部および熱源から96の試料ウェルを含
む試料ブロックの中央部分をある程度熱的に絶縁するこ
とである。例えば、図2において、試料ブロックのへり
の表面228および230へ、ランプ冷却チャンネルお
よびバイアス冷却チャンネルを出入りする冷却液を運ぶ
プラスチックのマニホールドを取り付ける。へり228
および230に沿ったガードバンドは、へり228およ
び230に対して並列かつそれに最も接近するスロット
78の部分で構成する。みぞ78の深さは、みぞの底が
バイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャンネルの
周辺に、それらを実際に交差させないで可能な限り密接
するようにする。この深さに関係するみぞ78の幅は、
図2の点82および232の間のスロット78により除
去される金属の体積が、試料ウェル234で初まり試料
ウェル83で終わる試料ウェルの隣接列により除去され
る金属の体積にほぼ等しいようにする。また、試料ウェ
ルの周期的パターンがウェルの1つの列またはカラムに
より各方向へ延びる場合には、試料ウェルのかゝる付加
列が存在する所へブロックの回りのスロット78を設置
する。
【0069】支持接続部が試料ブロックに形成されてい
るへり250および252に沿って、ガードバンドの局
所的領域は、スロット78の一部に加えて、いくつかの
冷却チャンネルの全長を含む。図3を参照すると、上記
ガードバンドの局所的領域は次のものを含む:隣接する
局所的領域の隣接する1/2のバイアス冷却チャンネル
と共に全長のバイアス冷却チャンネルを形成するバイア
ス冷却チャンネルの1/2(例えば、92);ランプ冷
却チャンネル(例えば、100);および全長のバイア
ス冷却チャンネル(例えば、91)。へり250のへり
の局所的領域にとして、これらの冷却チャンネルは10
7,198および99で示されている。ガードバンドに
おける全長のバイアス冷却チャンネルは、ブロックのへ
りから内方にわずかに変位している。これらの全長のバ
イアス冷却チャンネルを使用する理由は、「半分の」冷
却チャンネルの構成が実際的ではないことである。バイ
アス冷却チャンネルはこのような厚い壁をもつゴムのラ
イニングを必要とするので、「半分の」バイアス冷却チ
ャンネルのライニングを通る孔を信頼性をもって開放し
ておくことは困難であろう。へりの局所的領域における
この非対称性はへりのガードバンドの局所的領域から冷
却液へ熱の小さい過剰損失を引き起こすが、それは試料
ウェルを含む試料ブロックの中央領域から十分に離れて
いるので、試料温度の不均一性への寄与は小さい。ま
た、この小さい非対称性の温度の影響を予測できるの
で、この作用は各ガードバンドの下でマルチゾーンヒー
タシステムの分離制御可能ゾーンを使用することによっ
てさらに最小にすることができる。
【0070】図13を参照すると、図9のフィルムヒー
タ層156内で別々に制御される3つのゾーンが存在す
る。これらの別々に制御されるゾーンは、支持ブラケッ
ト148に連結される試料ブロック12の露出したへり
でガードバンドの下に位置する、へりのヒータのゾーン
を含む。ここには、また、冷却液のマニホールドに取り
付けられるへり228および230のためにガードバン
ドの下に位置する、別々に制御されるマニホールドのヒ
ータゾーンが存在する。最後に、試料ウェルの下には中
央ヒータゾーンが存在する。これらのゾーンの各々に加
えられる電力は、CPU20および制御ソフトウェアに
より別々に制御される。フィルムヒータ156は、金属
合金、例えば、インコネル(登録商標)の薄い板をエッ
チングすることによって形成された、導電体のパターン
から構成される。選択される金属合金は、高い電気抵抗
および良好な耐熱性を有すべきである。そのようにエッ
チングされた導電体のパターンは、電気絶縁性ポリマー
材料、例えば、カプトン(登録商標)の薄いシート間に
結合される。電気抵抗加熱要素を絶縁するためにいかな
る材料が使用されても、この材料は高温に対する抵抗、
高い静電強さおよび良好な機械的安定性をもつものでな
ければならない。
【0071】フィルムヒータの中央ゾーン254は、ガ
ードバンドの内側の試料ブロックの中央部分とほぼ同一
の寸法を有する。中央部分254は均一な電力密度を試
料ウェル区域に供給する。へりヒータ領域256および
258は、へりガードバンドとほぼ同一の幅を有する
が、それほど長くない。マニホールドのヒータ領域26
0および262は、図2のへり228および230につ
いてのガードバンドの下に横たわる。マニホールドのヒ
ータゾーン260および262は、電気的に一緒に接続
して、1つの別々に制御可能なヒータゾーンを形成す
る。また、へりヒータ区画256および258は電気的
に一緒に連結して、第2の別々に制御可能なヒータゾー
ンを形成する。第3の別々に制御可能なヒータゾーンは
中央区画254である。これらの3つの別々に制御可能
なヒータゾーンの各々は別の電気リード線を有し、そし
て各ゾーンは別のマイクロプロセッサまたは好ましい実
施態様において実施されるような共有のCPU20で実
行することができる、別の制御アルゴリズムにより制御
される。
【0072】支持ブラケットへの熱損失を補償するため
にへりヒータゾーン256および258を駆動させる。
この熱損失は、試料ブロック12とそれを取り囲む周囲
空気との間の温度差に比例する。へりヒータゾーン25
6および258は、また、試料ブロックからブロックの
各へりにおける完全なバイアス冷却チャンネルへの過剰
の熱損失を補償する。この熱損失は、試料ブロック12
とこれらのバイアス冷却チャンネルを通して流れる冷却
液との間の温度差に比例する。マニホールドのヒータ区
画260および262は、また、試料ブロック12のへ
りに取り付けられた、図13のプラスチックの冷却液マ
ニホールド266および268への熱損失を補償するた
めに駆動する。マニホールドのヒータ区画260および
262のための電力は、試料ブロックと冷却液との間の
温度差に主として比例し、かつ試料ブロックと周囲空気
との間の温度差に若干比例する熱損失を補償する。
【0073】実際的理由で、中央のヒータ区画254の
上に横たわる試料ウェルを包む局所的領域の熱的質量
と、ガードバンドの局所的領域の熱的質量と合致させる
ことは不可能である。例えば、プラスチックの冷却液マ
ニホールド266および268はガードバンドから離れ
る方向に熱を伝えるばかりでなく、ある量の熱的質量を
それらが取り付けられたガードバンドの局所的領域にも
加える。その結果、急速なブロックの温度変化の間に、
ガードバンドの温度の上下速度は試料ウェルの局所的領
域のそれに正確に合致しない。これはガードバンドと試
料ウェルとの間の動的温度勾配を発生させ、これが大き
くなると、許容できないほど長時間持続することにな
る。この温度勾配の作用は、ブロック温度の変化速度に
おおよそ比例し、そしてブロック温度の変化速度に比例
する速度で各ガードバンドの局所的ゾーンから熱を付加
または除去することによって最小にされる。
【0074】ガードバンドのゾーンヒータの比例係数
は、その装置の設計の比較的安定な性質であり、プロト
タイプについての工学的測定値により決定される。比例
係数についての値は、方程式(3)〜(5)の項の定義
と関係して下に記載する。これらの方程式は、別の実施
態様における、それぞれ、マニホールドヒータゾーン、
ヒータゾーンのへりおよび中央ゾーンに加えられる電力
の量を決定する。好ましい実施態様において使用する方
程式は、ソフトウェア(方程式(46)〜(48)、区
域ごとに分配される電力)の説明において下に記載す
る。 (3)Pm =Am P+KM1(TBLK −TAMB )+K
M2(TBLK −TCOOL)+KM3(dtBLK /dt) ここで、 Pm =マニホールドヒータゾーン260および262に
供給された電力、 Am =マニホールドヒータゾーンの領域 P=ブロック温度をPCR熱サイクルのプロトコルにお
いて任意の特定の時間で所望の温度に停止させるか、あ
るいは移動させるために必要な電力、 KM1=0ワット/°Kに等しい、マニホールドを通る周
囲への過剰の熱損失を補償するために実験的に決定した
比例定数、 KM2=0.4ワット/°Kに等しい、冷却液への過剰の
熱損失を補償するために実験的に決定した比例定数、 KM3=66.6ワット−秒/°Kに等しい、プラスチッ
クのマニホールドなどにより引き起こされるマニホール
ドのへりのガードバンドの追加の熱的質量を補償するた
めの余分の電力を提供する実験的に決定した比例定数、 TBLK =試料ブロック12の温度、 TAMB =周囲空気の温度、 TCOOL=冷却液の温度、 dtBLK /dt=試料ブロックの温度変化/単位時間、 (4)PE =AE P+KE1(TBLK −TAMB )+K
E2(TBLK −TCOOL)+KE3(dtBLK /dt) ここで、 PE =へりヒータゾーンに加えるべき電力、 AE =へりヒータゾーンの領域、 KE1=0.5ワット/°Kに等しい、マニホールドを通
る周囲への過剰の熱損失を補償するために実験的に決定
した比例定数、 KE2=0.15ワット/°Kに等しい、冷却液への過剰
の熱損失を補償するために実験的に決定した比例定数、 KE3=15.4ワット−秒/°Kに等しい、支持ピンお
よびブラケット、温度センサーなどへの試料ブロック1
2の取り付けにより引き起こされる露出されたガードバ
ンドの追加の熱的質量を補償するための余分の電力を提
供する実験的に決定した比例定数、 (5) PC =AC P ここで、 PC =マルチゾーンヒータの中央ゾーン254に加える
べき電力、 AC =中央ゾーン254の領域。
【0075】方程式(3)〜(5)の各々において、電
力Pは変数であり、これは図1においてCPU20によ
り実行される制御アルゴリズムの部分により計算され、
この部分はユーザが定めた設定点を読みそして、次に、
ユーザが記憶装置に記憶させた時間および温度の設定点
により定められるPCR温度のプロトコルを実行するた
めに試料ブロック温度を適切な温度で維持するか、ある
いはそれに合致させるために何を実施するかを決定す
る。設定点を読みそして電力密度を計算する方法は、下
に詳細に記載する。
【0076】図1のCPU20により実行される制御ア
ルゴリズムは、図1および図9の温度センサー21およ
び図1のバス52を経て、試料ブロックの温度を感知す
る。この温度を変化させて、試料ブロック12の温度変
化速度を誘導する。次いで、CPUは図1の温度センサ
ー56を経て周囲空気の温度を測定し、そして図46に
示す冷却液制御システム24中の温度センサー61を経
て冷却液の温度を測定する。次いで、CPU20は実行
されているPCRプロトコルの特定のセグメントに相当
する電力ファクターを算定し、かつ方程式(3),
(4)および(5)に従い、測定した温度、比例定数
(これらは持久記憶装置に保存される)、制御プログラ
ムと種々のヒータゾーンの区域との特定相互作用につい
ての電力ファクターP(これらは持久記憶装置に保存さ
れる)をすべて代入して3つの計算をする。電力ファク
ターは、ブロック温度をその電流レベルから、設定点を
経てユーザが特定した温度レベルに動かすために必要な
合計電力である。加熱および冷却を制御するためにCP
Uが実行する計算についての詳細は、制御ソフトウェア
「PIDタスク」の説明において下に記載する。
【0077】ヒータ156の3つのゾーンの各に加える
ために必要とされる電力を計算した後、いくつかの実施
態様において各ゾーンへ加えるべき入力電力の各ハーフ
サイクルの比率に関する、他の計算を行う。下に記載す
る好ましい実施態様において、計算のモードは、200
ミリ秒の試料期間の間に生じるハーフサイクルの合計数
のうちのどれだけのハーフサイクルを各ゾーンに加える
べきかである。このプロセスは、図47Aおよび図47
B(以下、図47と言う)、および制御ソフトウェアの
「PIDタスク」の説明に関して下に記載する。図10
に示す別の実施態様において、コンピュータは各ゾーン
について図10における分割線166の位置を計算す
る。この計算を実行した後、適当な制御信号を発生し
て、マルチゾーンヒータ156に電力を供給し、適当に
スイッチを転換させて、計算量の電力を各ゾーンに加え
るようにする。
【0078】他の実施態様において、全体の試料ブロッ
クに均一な電力密度を供給する単一のフィルムヒータ、
およびガードバンドについて個々に単一のゾーンをもつ
1または2つのフィルムヒータを付加的に使用して、マ
ルチゾーンヒータを実行させることができる。これらの
追加のヒータは、全体の試料ブロックをカバーする単一
のフィルムヒータの上に重ねる。このような実施態様に
おいて、ガードバンドの損失の構成に必要な電力のみを
追加のヒータゾーンに加える。方程式(3)〜(5)に
おける電力ファクターPは、ユーザが特定した設定点お
よびランプ時間に基づくPCR温度プロトコル上の種々
の点についてCPU20により計算される。しかしなが
ら、前述のゾーンヒータの最大の電力供給能力に基づく
制限がある。方程式(3)〜(5)中の比例定数は、良
好な温度の均一性のためのガードバンドにおける過剰の
熱損失を適切に補償するために、適切にセットされなけ
ればならない。
【0079】図17は、試料ブロックの温度を実質的に
低い温度からほぼ94℃の変性インキュベーションの標
的温度に向けて上昇させるために、ブロック温度の段階
的変化に応答して複数の異なる試料について計算した試
料温度の間の差を表すグラフを示す。図17は、マルチ
ゾーンヒータ156が方程式(3)〜(5)の項で定義
された前述の比例定数を使用して適切に管理されたとき
の計算された試料液体温度を示す。図17のグラフを誘
導するために使用した種々のウェルは、単一の文字およ
び数の組み合わせにより示されている。図2を表す8×
12のウェル列は、文字を付したカラムおよび番号を付
した列によりコード化される。こうして、例えば、試料
ウェル90はまた試料ウェルA12と表示され、試料ウ
ェル89はまた試料ウェルB12と表示される。同様
に、試料ウェル68は試料ウェルD6などと表示され
る。ここに記載された全熱的設計は温度勾配を除去する
ことから、ウェル温度は互いのほぼ0.5℃範囲内の温
度に漸近的に落着くことが理解されるであろう。
【0080】上記説明は試料ブロックの温度がどのよう
にして均一に制御され、そして急激に変化せしめられる
かを示したものである。しかしながら、PCRプロセス
において、プログラミングすべきであるのは試料反応混
合物の温度であって、試料ブロックの温度ではない。本
発明の教示に従う好ましい実施態様において、ユーザは
試料液体それ自体についての一連の標的温度を特定し、
そしてPCRプロセスにおける各段階におけるこれらの
標的温度の各々における試料液体のためのインキュベー
ション(定温放置)時間を特定する。そこで、CPU2
0は試料ブロックの温度を管理して試料の反応混合物を
特定された標的温度にし、そして試料混合物をそれらの
標的温度に特定したインキュベーション時間の間保持す
る。CPU20により実行されるユーザのインタフェー
スのコードは、このプロセスのすべての段階において、
端末16のディスプレー上に現在の計算した試料液体の
温度を表示する。
【0081】反応混合物の実際の温度の測定は温度測定
プローブをその中に挿入することを必要とするので、実
際の測定した試料温度を表示するのは困難である。プロ
ーブの熱量はそれを配置したウェルの温度をかなり変え
ることがある。なぜなら、あらゆるウェル中の試料の反
応混合物の体積は多くの場合に100μlほどであるか
らである。こうして、反応混合物の中への温度プローブ
の単なる挿入は、反応混合物と付近の混合物との間に温
度勾配を生じさせる。温度センサーの余分な熱量はそれ
を浸漬した反応混合物の温度を、他のウェル中の小さい
熱量を有する反応混合物の温度から、低下させるので、
温度を測定しようと試みるだけで大きな誤差が生じる。
【0082】したがって、ここに説明する装置は、既知
の因子、例えば、ブロック温度の履歴およびシステムの
熱的時間の定数から試料温度を計算し、そしてディスプ
レー上に試料温度を表示する。ここで説明する装置で
は、試料管を試料ウェルの中に少なくとも最小の限界力
Fで下に押圧すると、好ましい実施態様において使用し
た試料管の大きさおよび形状およびほぼ100μlの試
料体積について、試料の反応混合物内で熱の対流が起こ
り、そしてこの装置は単一の時定数の直線のシステムの
ように熱的に作用することが、実験的に発見された。実
験によれば、すぐれたウェル壁対流体の熱伝導性を得る
ためにウェル毎に各試料管をほぼ50gの力で押し下げ
なくてはならないことが分った。後述の加熱された定盤
は各試料管を約100gの力で押し下げるように設計さ
れたものである。図15に力ベクトルFで示されたこの
最小の力は、種々の試料間や試料ブロック内の種々の試
料ウェルにわずかな外形寸法の差がある無しにかかわら
ず、各試料管が均一な熱伝導性を保証されるようにすべ
ての試料管がきちんと同一面上で嵌まるように十分な力
で押し下げされることを確保するために必要である。対
応する試料ウェルに対してゆるく嵌合される試料管およ
びきつく嵌合される試料管を有する設計は、熱伝導性が
不均一であるために、すべての試料管について厳密な温
度制御を達成することができないであろう。不十分なレ
ベルの力Fは、試料ブロックの温度のステップ状変化に
対する試料液体の温度の応答が図14に286で示すよ
うなものになる結果となる。適切なレベルの力Fは28
2に示す温度の応答を生ずるようになる。
【0083】本発明の教示に従い構成された装置により
達成される結果は、各試料混合物の温度が新しい温度へ
転移する間に、あたかも試料が物理的によく混合される
ように試料混合が挙動することである。事実、各試料混
合物の中に引き起こされた対流のために、各試料管中の
試料の反応混合物はよく混合される。驚くべき結果は、
全体のシステムの熱的挙動が、ブロック温度と試料温度
との間の差の減衰の半減期の約1.44倍である9秒の
単一の時定数をもつ電気RC回路に似るということであ
る。50mlの試料を充填したジェネアンプ(登録商標)
の試料管は、約23秒の時定数を有する。換言すると、
試料ブロックの温度の上向きの変化の間、反応混合物の
温度は、図16(D)に示すような電源Vの電圧出力の
ステップ状変化に応答する、直列のRC電気回路中のコ
ンデンサCの電圧の上昇に似たように作用する。
【0084】これらの概念を説明するために、ブロック
温度のステップ状変化に対する試料液体の異なる応答を
示す図14および試料ウェル/試料管の組み合わせを通
る断面を示す図15を参照する。実験において、試料液
体276の体積がほぼ100μlであり、そしてメニス
カス278が試料ブロック12の上部表面280より下
に位置するような寸法を試料管がもち、そして試料管を
試料ウェルの中に押し下げる力Fが少なくとも30gで
あるとき、図15に示す装置の熱的時定数τ(タウ)
は、試料管の円錐形区画における試料管壁厚が0.00
9インチ(0.23mm)(寸法A)の場合にほぼ9秒で
あることが分った。また、実験において、上記条件につ
いて、熱的時定数τは試料管の円錐形区画の壁厚がの
0.001インチ変る毎に約1秒変化することが分っ
た。ここで述べる壁の薄い試料管は、20から100μ
lの試料を収容するもので約5から14秒の熱的時定数
を有することがわかっている。試料管の壁が大きいほ
ど、時定数は大きくなり、試料ブロックの温度の変化と
試料液体温度の変化との間の遅れが大きくなることが分
った。
【0085】数学的に、試料ブロックの温度変化に対す
る試料液体温度の熱的応答の関係は次の式で表わされ
る。 (6) Tsample=ΔT(1−e-t/ τ) ここで、 Tsample=試料液体の温度、 ΔT=試料ブロック12の温度と試料液体の温度との間
の温度差、 t=経過時間、 τ=装置の熱的時定数、または試料ウェルの壁から試料
液体への熱伝導性で割った試料の熱容量。
【0086】図14において、曲線282は、試料管を
押し下げる力Fが十分に高いとき、試料ブロック温度の
理論的ステップ状変化に対する指数関数的な温度の応答
を表す。試料ブロックの温度のステップ状変化は関数2
84として示されており、時間T1 において開始する温
度の急速な上昇が存在する。留意すべきは試料液体の温
度はステップ状変化に応答して指数関数的に増加し、そ
して最終の試料ブロック温度に慚近的に近付く様子であ
る。簡単に前述したように、曲線286は、図15にお
ける下向きの配置力Fが試料管の円錐形区画と試料ウェ
ルの壁290との間のきちんとした同一面上の配置をも
たらすのに不十分であるときの、熱的応答を表す。一般
に、力Fが30gより小さい場合、曲線286の熱的応
答は生ずるであろう。図15は明瞭のために試料管の円
錐形区画と試料ウェルの壁との間に空気の小さい層があ
るように示されているが、正確にはその反対とするのが
望ましい。というのは、空気はすぐれた断熱材であり、
そして装置の熱的時定数を実質的に増加するであろうか
らである。
【0087】熱的時定数τは直列のRC回路におけるR
C時定数に類似し、ここでRは試料ウェルの壁と試料液
体との間の熱的抵抗に相当し、そしてCは試料液体の熱
容量に相当する。熱的抵抗は、単位ワット°秒/°Kで
表される熱伝導性の逆数である。図15において試料液
体の中に示す対流の流れ292のために、反応混合物中
のすべての場所で、試料液体はほとんど同一温度に近く
なり、そして試料ブロックと試料との間の熱の流れは試
料ブロックと試料の反応混合物との間の温度差に非常に
密接に比例する。比例定数は、試料ブロック12中の試
料ウェルの壁と反応混合物との間の熱伝導性である。異
なる試料体積または異なる試料管、すなわち、異なる壁
厚または材料について、熱的時定数は異なる。このよう
な場合において、ユーザはPCRプロトコルの仕様の一
部分として、試料の体積または試料管のタイプを入力す
ることができ、すると、装置は試料温度の計算に使用す
るために正しい熱的時定数を自動的に求めるであろう。
ある実施態様において、ユーザは実際の時定数を入れる
ことができ、そして装置は試料温度の温度の計算にそれ
を使用するであろう。
【0088】熱的時定数を出来るだけ小さく保持するた
めに、試料管の円錐形壁は出来るだけ薄くあるべきであ
る。好ましい実施態様において、これらの円錐形壁は
0.009インチ(0.23mm)の厚さであるが、試料
管の円筒形部分の壁は0.030(0.76mm)の厚さ
である。試料管の円錐形の形状は、試料混合物の体積に
関して、試料ウェルの壁の金属との接触表面積を比較的
大きくする。試料管の成形は、4つの試料管が各射出で
成形されるような、「常温ランナー」システムおよび4
つのキャビティを使用して実施される。溶融プラスチッ
クは試料管の円錐形区画の先端部に位置する部分から射
出され、残余のプラスチックが試料管の先端と試料ウェ
ルの先端との間のキャビティ291の中に突出するよう
にする。これは残余のプラスチックが試料管とウェルと
の間の同一面配置を妨たげるのを防止する。残余プラス
チックの大きさは0.030インチ(0.76mm)を最
大とする。
【0089】種々の実施態様において、各々が異なる利
点をもつ3つの異なる等級のポリプロピレンを使用でき
る。好ましいポリプロピレンはヒモント(Himon
t)からのPD701である。なぜなら、それはオート
クレーブ処理可能であるからである。しかしながら、こ
のプラスチックは低いメルトインデックスをもつので、
成形が困難である。このプラスチックは35のメルトイ
ンデックスおよび9の分子密度を有する。PD701は
ばりを残す傾向があり、そして多少斑点がある品質の部
分をつくるが、現在実施されているように円錐形区画の
先端における代わりに、成形物の厚い壁の部分に射出成
形した場合、よりよく働く。一般に、成形容易のために
高いメルトインデックスを有するが、すぐれた強さを維
持しかつ260°Kにおけるオートクレーブ処理の熱応
力の下でひび割れまたは割れを防止するために、また、
高い分子密度を有することが望ましい。他のプラスチッ
ク、アメリカン・ヘスヒト(American Hoescht)からの
PPW1780は、75のメルトインデックスおよび9
の分子密度を有し、そしてオートクレーブ処理可能であ
る。ある実施態様において使用できる他のプラスチック
はヒモント(Himont)444である。このプラス
チックはオートクレーブ処理可能ではなく、そして他の
方法で滅菌することが必要である。
【0090】他の実施態様において、試料管は、溶融プ
ラスチックの温度が型のちょうどゲートまで制御される
「ホットランナー」または「ホットノズル」システムを
使用して成形できる。また、ある実施態様において、多
数のゲートを使用できる。しかしながら、これらの技術
のいずれも、充填の時間において、現在使用する「常温
ランナー」システムよりすぐれるとは言えないことが実
験的に証明された。本発明の装置が単一の時定数のRC
回路のように熱的に作用するという事実は重要なことで
ある。なぜなら、試料ブロックから試料の反応混合物へ
の熱伝導性が既知でありかつ均一であるとすると、上記
事実は試料混合物の熱的応答が既知でありかつ均一であ
ることを意味するからである。試料の反応混合物の熱容
量は既知でありかつ一定であるので、試料の反応混合物
の温度は試料ブロック温度の経時的に測定した履歴のみ
を使用して正確に計算することができる。これは試料温
度を測定する必要性を排除し、これにより無視できない
熱量をもつプローブを試料ウェルの中に入れて試料温度
を直接測定し、これによりプローブを挿入したウェル中
の試料の熱量を変化させる誤差および困難を排除する。
【0091】この計算を行うアルゴリズムは、単一の時
定数の直列のRC電気回路にちなんで装置の熱的挙動を
モデル化したものである。このモデルは、液体試料の熱
容量と試料ブロックから試料の反応混合物への熱伝導性
の比を使用する。試料の反応混合物の熱容量は、低い比
熱×液体の質量に等しい。熱的抵抗は1/試料ブロック
から試料管壁を通る液体反応混合物への熱伝導性に等し
い。熱容量/熱伝導性の比は一致した単位で表すとき、
それは時間の次元を有する。試料の体積および試料の組
成が一定であってすべての試料ウェルにおいて同一であ
り、および熱伝導性が一定であると、上記比はすべての
試料ウェルについても一定であり、そして装置の熱的時
定数と呼ばれる。それは、ブロック温度の急激なステッ
プ状の変化後、試料温度がブロック温度の36.8%以
内に来るために要する時間である。
【0092】装置のインパルス応答が知られている場
合、フィルターまたは他の直線システムの出力応答を計
算することができるという、電子回路の分析において使
用される数学的理論が存在する。このインパルス応答
は、また、伝達関数として知られている。直列RC回路
の場合において、インパルス応答は図16(A)に示す
ように指数関数である。図16(A)の応答を生ずるイ
ンパルスの刺激は図16(B)に示されている通りであ
る。この数学的理論では、このような直線のシステムの
出力応答は入力信号のたたみ込みおよび重み関数を計算
することによって決定することができるとされており、
ここで重み関数は時間を逆転したシステムのインパルス
応答である。たたみ込みは別名連続加重平均として知ら
れている。ただし、たたみ込みは無限に小さい階段状の
大きさをもつ微分積分学における概念であるが、連続加
重平均は離散的な階段状の大きさ、すなわち、多数の試
料を有する。図16(D)に示す直列RC回路のインパ
ルス応答は次のようなものである。すなわち、電圧発生
器Vの電圧が図16(B)に示すような電圧のスパイク
で急激に上下するとき、コンデンサーCの電圧は図16
(A)においてピーク294に急激に上昇し、このピー
クは図16(B)に示すインパルスのピーク電圧に等し
く、次いで指数関数的に減衰して定常状態の電圧V1
戻る。生ずる重み関数は、図16(C)において385
で示されるように、図16(A)のインパルス応答の時
間を逆転したものである。
【0093】図16(C)には、試料ブロック12の凡
そのステップ状の温度変化を示す典型的な温度履歴を示
す仮定の曲線387が示されている。また、図16
(C)には、5つのサンプリング時間T1 〜T5 が示さ
れている。本発明の教示に従い、試料温度は、これらの
時間T1 〜T5 の各々における温度とその特定の時間に
おける重み関数の値を掛け、次いですべてのそれらの積
を合計し、そして5で割ることによって、計算される。
熱的システムが単一の時定数の直線回路のように作用す
るという事実は、この複雑な熱的システムについての熱
伝達の考慮の複雑さに見て、驚くべき結果である。
【0094】1つの実施態様において、試料温度の計算
は、ブロック温度センサーおよび試料液体への異なる熱
的通路長さにより引き起こされる輸送遅れを説明する短
い遅延により調節される。計算した試料温度は、図1に
示す端末16上のユーザの情報のために表示される。図
17は、96ウェルの試料ブロックの中に散在する6つ
の異なるウェルについて、ハイブリダイゼーション/伸
長温度範囲における比較的低い温度から変性のためのほ
ぼ96℃の比較的高い温度への試料ブロック温度のステ
ップ状変化の際の温度応答の結果を示している。図17
のグラフは、システムが図16(D)に示す直列RC回
路に完全に類似する場合には試料温度が予測された指数
関数的な上昇と一致することを示しており、そしてま
た、ここでこの研究において使用した6つの試料ウェル
が互いに非常に密接した漸近的な温度で且つ変性温度の
許容範囲である0.5℃の範囲内の温度に設定された場
合においてきわめてすぐれた温度応答の均一性が存在す
ることを示している。
【0095】1つの実施態様においては10個の最も最
近のブロック温度の試料が連続加重平均について使用さ
れたが、他の実施態様においては異なる数の温度履歴試
料を使用することができる。理論的に予測された結果と
のすぐれた一致は、熱的対流の流れが試料液体をよく混
合し、これによりこのシステムを直線的特徴で作用させ
るという事実から由来する。96ウェルの試料ブロック
の中に散在する種々のウェルの試料温度間の均一性は、
試料ブロック構造における動力学的および静力学的局所
的バランスおよび局所的対称性ならびにここに詳細に記
載する他の熱的設計因子から生ずる。しかしながら、ユ
ーザが各試料ウェルに同一質量の試料液体を注意深く入
れる場合にのみ、急速な温度変化の間にすべての試料ウ
ェルは互いに0.5℃以内の温度を有するであろうこと
に注意すべきである。異なるウェルにおいて質量が等し
くないとき、条件の変化のない定常状態では温度の不均
一さはなく、温度の変動は急速な変化の間においてのみ
生じる。各ウェル中の試料液体の質量は、各試料の熱容
量の決定において主要な因子であり、したがって、その
特定の試料ウェルについて熱的時定数についても主要な
因子である。
【0096】留意すべきは、すべての試料ウェル中の試
料液体を同時的に上の温度又は下の温度に周期的に変化
させ、そして標的温度に対して互いに非常に接近した、
すなわち、わずかに0.5℃の幅である許容範囲内の温
度で安定化させる能力は、図15における力Fに依存す
ることである。この力Fは、同様な質量の試料液体を充
填したすべての試料ウェルの熱的時定数が同一の熱的時
定数を有する前に、最小の限界値を越えるものでなくて
はならない。最小の限界値は、ここに記載する試料管お
よび試料ウェルの形状について30gであることが実験
的に決定された。より高いレベルの精度について、図1
5における最小の限界の力Fは、前述したように安全性
の追加の限界について少なくとも50g、好ましくは少
なくとも100gであることが確立された。
【0097】試料ウェルの温度の熱的均一性の重要性
は、図18を参照すると理解することができる。この図
面は、DNAのある種のセグメントの増幅の1つの例に
ついての、PCRサイクルにおいて発生したDNAの量
と変性間隔の間の実際の試料温度との間の関係を示す。
93℃および95℃の温度の間の関数298の傾斜は、
この特定のDNAのセグメントおよびプライマーについ
てほぼ8%/℃である。図18は増幅により発生したD
NAの量に関係する曲線の一般の形状を示すが、この曲
線の形状の詳細はプライマーおよびDNA標的の各異な
る場合とともに変化する。97℃以上の変性のための温
度は一般に熱すぎ、そして増加する変性温度が上昇する
と増幅が減少する結果になる。95℃および97℃の間
の温度は一般にちょうど正しい。図18が例示するよう
に、ほぼ93℃の変性温度で安定化するこの特定のDN
A標的およびプライマーの組み合わせを含有する試料ウ
ェルは、94℃で変性したウェルより8%少ない典型的
なPCRプロトコルの過程で発生したDNAを有するよ
うに思われる。同様に、95℃の変性温度で安定化する
この混合物の試料液体は、94℃の変性温度で安定化す
る試料ウェル中で発生したより8%多いその中で発生し
たDNAを有するように思われる。この性質のすべての
曲線は同一の一般形状を有するので、試料温度の均一性
を有することは重要である。
【0098】前述したようにして計算した試料温度は、
ヒータおよびランプ冷却チャンネルを通る流れを制御
し、そして種々の標的温度に試料が保持されるべき間の
長さを決定する制御アルゴリズムにより使用される。制
御アルゴリズムは、これらの時間を使用して、ユーザが
入れた各インキュベーション期間についての所望の時間
と比較する。時間が合致するとき、制御アルゴリズムは
次のインキュベーションについてユーザが定めた標的温
度に向かって試料ブロックを加熱または冷却するために
適当な処置を取る。計算した試料温度は設定点、すなわ
ち、ユーザがプログラミングしたインキュベーション温
度の1℃内であるとき、制御プログラムはタイマを始動
させる。このタイマはある数をカウントダウンするよう
に設定され、この数は実施されるインキュベーションの
ためにユーザによって特定された時間間隔をタイムアウ
トするように設定される。計算した試料温度が1℃内に
あるとき、タイマは始動してプリセットしたカウントか
らカウントダウンする。タイマがゼロカウントに到達す
るとき、信号は活性化され、これによりCPUはPCR
プロトコルの次のセグメントを実行する作用をする。本
発明を実施するために特定の間隔の時間を定める測定す
るあらゆる方法を採用できる。
【0099】典型的には、許容範囲は特定の標的温度±
0.5℃の範囲である。いったん標的温度に到達する
と、コンピュータはバイアス冷却チャンネルおよびフィ
ルムヒータを使用して試料ブロックを標的温度に保持
し、こうしてすべての試料は特定した時間間隔だけ標的
温度の近くに維持される。ここに記載する作用の優れた
熱的システムについては、試料ブロックから各試料への
熱伝導性は既知であり、そして非常に密接な許容範囲内
で均一である。そうでなければ、タイマが始動すると
き、すべての試料は標的温度の特定した許容範囲内にあ
るわけではなく、そしてすべての試料が標的温度におい
て同一のインキュベーション間隔を経験するわけではな
い。また、この熱的システムがよく働くためには、すべ
ての試料管は周囲環境における変動から隔離しなくては
ならない。すなわち、ある試料管をドラフトにより冷却
し、一方物理的に異なる位置における他の試料管が同一
冷却作用を経験しないようにすることは望ましくない。
すぐれた均一性について、すべての試料の温度を試料ブ
ロックの温度によってのみ決定することは高度に望まし
い。
【0100】周囲からの管の隔離、および試料管を押し
下げる最小の限界の力Fを加えることは、試料管および
試料ブロックの上の加熱されたカバーにより達成され
る。試料液体は、温度制御された金属ブロックの中に緊
密に押圧保持された試料管の中にあり、この試料管が緊
密にキャップをされ、その中のメニスカスが温度制御さ
れた金属ブロックの表面よりかなり下にある場合でさ
え、試料はなお対流により上方に熱を失う。有意には、
試料が非常に熱い(変性温度が典型的には試料液体の沸
点付近にある)とき、試料液体は水蒸気の還流によりか
なりの量の熱を失う。このプロセスにおいて、水は熱い
試料液体の表面から蒸発し、そしてキャップの内壁およ
び試料ブロックの上部表面より上の試料管のより冷たい
上部の上に凝縮する。比較的大きい体積の試料が存在す
る場合、凝縮は続き、そして凝縮物は蓄積しそして試料
管の壁を下に流れて反応混合物の中に入る。この「還
流」プロセスは還流される水の1g当たり約2300ジ
ュールの熱を運ぶ。このプロセスは100μlの反応混
合物の表面温度を数度低下させ、これにより反応の効率
を大きく減少する。
【0101】反応混合物が少ない、例えば、20μlで
ありそして試料管が試料ブロックの上部表面より上で比
較的大きい表面積を有する場合、反応混合物中の水のか
なりの部分は蒸発することができる。次いで、この水は
試料管の上の部分の内側で凝縮し、そしてサイクルの高
い温度の部分の残の時間の間に、表面張力によりそこに
止まることができる。これは残りの反応混合物をそのよ
うに濃縮することができるので、反応は障害されるか、
あるいは完全に失敗する。先行技術のPCR熱的サイク
ルにおいては、この還流の問題は反応混合物の上に油ま
たは溶融した蝋の層を配置することによって処理されて
いた。この油または蝋の不混和性層は水性反応混合物上
に浮き、そして急速な蒸発を防止した。しかしながら、
油の添加に労力を要し、これは処理のコストを上昇させ
る。さらに、油の存在はその後の処理および分析の工程
を妨害し、そして試料の汚染の可能性をつくった。事
実、工業用等級の鉱油は、過去において、未知の油中の
汚染因子により試料を汚染していたが、そのような汚染
因子はユーザには未知であった。
【0102】本発明によれば、油の上層添加の必要性は
排除され、そして熱損失および蒸発による反応混合物の
濃縮および還流により引き起こされる予測されない熱的
作用の問題は、加熱カバーにより、試料ブロックの上方
の試料管の上の部分が突出する空間部を取り囲み、そし
てこの空間部を上から加熱することによって回避され
る。この加熱カバーをここでは定盤と呼ぶこともある。
図19を参照すると、試料管を取り囲みそしてそれに下
向きの力を加えて、図15において最小の限界力Fを供
給する、構造体の断面図が示されている。加熱された定
盤14はリードスクリュー312に連結されていて、矢
印314で示す軸に沿ってリードスクリュー312の回
転で上下に動くようになっている。リードスクリュー3
12はすべりカバー316中の開口を通してねじ込めら
れ、そしてノブ318により回転される。定盤314は
コンピュータ20により制御される抵抗ヒータ(図示せ
ず)により水の沸点以上の温度に加熱される。
【0103】すべりカバー316はレール320および
322上をY軸に沿って前後にすべる。すべりカバー3
16は垂直側317および319を含み、そして、試料
ブロック12および試料管を囲むX−Z平面(図示せ
ず)に対して平行な垂直側を含む。この構造は試料管
(試料管324および326が典型的に示されている)
にドラフトが作用するのを実質的に防止する。
【0104】図20は、すべりカバー316が後退位置
にあって試料ブロックへのアクセスを可能とする、すべ
りカバー316および試料ブロック12の斜視図であ
る。すべりカバー316は長方形の箱の蓋に類似し、こ
こで垂直壁328は除去されてすべりカバー316を試
料ブロック12の上にすべらせる部分330を有する。
すべりカバーは、図20においてY軸に沿って、そのカ
バーが試料ブロック12の上の中央にくるまで動く。次
いで、ユーザはノブ318をある方向に回して、ノブ3
18上のマーク332が飾り板336上のマーク334
と一直線上になるまで、加熱された定盤14を下げる。
ある実施態様において、飾り板336はすべりカバー3
16の上部表面に永久的に添付することができ、こうし
て異なる大きさの試料を使用するとき、インデックスマ
ーク334は異なる位置に配置することができる。換言
すると、より高い試料管を使用する場合、加熱された定
盤14は図15における最小の限界力Fを加えるほど多
く下げる必要はない。使用において、ユーザはスクリュ
ー318をねじって、インデックスマークが一直線にな
るまで、定盤14を低下させる。次いで、ユーザは最小
の限界力Fが各試料管に加えられたことを知る。
【0105】図15および図19を合わせて参照する
と、図19に示す加熱された定盤14を下げる前に、各
試料管のためのプラスチックキャップ338はプラスチ
ックトレー340(図19)の壁の上端レベルから上方
約0.5mmまで突出する。このプラスチックトレー34
0は、9mmの中心間隔でゆるい8×12の配列にすべて
の試料管を保持する。試料ウェルのこの配列は、100
μlの容量の96本までのマイクロアンプ(登録商標)
のPCR管、または0.4mlの容量の48本までのより
大きいジェネアンプ(登録商標)を保持することができ
る。このプラスチックトレーについて、以下でさらに詳
述する。プラスチックトレー340は、試料管のための
8×12の配列を有する平らな表面を有する。この平ら
な表面は図15および図19の水平線として示されてお
り、この水平線は図19において試料管324および3
26と交差する。プラスチックトレー340は、また、
4つの垂直壁を有し、それらのうちの2つは図19に3
42および344で示されている。これらの垂直壁の上
端レベルは、図15に346で示されており、基準面を
規定する長方形の箱を形成する。
【0106】図15に最もよく示されるように、すべて
の試料管のキャップ338はこの基準面346の上方へ
わずかに突起し、それによりキャップ338が、加熱さ
れた定盤14によって軟化および変形され、かつ基準面
346のレベルより下方へ「押しつぶされる」ようにな
っている。好ましい実施例において、加熱された定盤1
4は、図1におけるCPU20および定盤14中の抵抗
ヒータ(図示せず)に連結したバス22により、105
℃の温度に保持される。好ましい実施例において、図1
9におけるノブ318および親ねじ312は、加熱され
た定盤14が下降してキャップ338の上部と接触する
まで、回転される。好ましい実施例において、試料管の
ためのキャップ338はポリプロピレンから作られる。
これらのキャップは、加熱された定盤14と接触した直
後に軟化する。キャップは軟化するにつれて変形する
が、それらの弾性のすべてを失うことはない。キャップ
と接触後、定盤は基準面346上に配置されるまでさら
に下降する。この下降は、キャップ338を変形し、そ
して少なくとも50gの最小の限界力Fで各試料管を押
し下げて、各試料管を試料ウェルの中にしっかり配置さ
せる。キャップ338が基準面346の上方へ突出する
量、および加熱された定盤14が基準面346上に静止
するときの変形および残留弾性の量は、少なくとも50
g、好ましくは100gの最小の限界力Fが、加熱され
た定盤14が基準面346のレベルまで下降した後に存
在するすべての試料管について達成されるように、設計
される。
【0107】加熱された定盤14およびトレー340の
4つの垂直壁および平らな表面は、定盤14がトレーの
上部へりすなわち基準面346と接触するとき、加熱か
つシールされた隔室を形成する。トレー340のプラス
チックは比較的劣った熱伝導性を有する。加熱された定
盤14とキャップ338との接触、および、試料ブロッ
ク12の上部レベル280の上方へ突出する試料管28
8の部分を、比較的劣った熱伝導性を有する材料の壁に
よって隔離することは、有益な結果を有することが実験
的にわかっている。この構造により、管およびキャップ
の上方部分全体は、管およびキャップの内側表面上に凝
縮物がほとんどまたはまったく生じないような十分に高
い温度を付与される。なぜなら、加熱された定盤は水の
沸点より高い温度に保持されるからである。これは、図
15における試料液体276が水の沸点付近の温度に加
熱されるときも同様である。これにより、試料液体混合
物276の頂面上に浮く油やワックス等の不混和性物質
の層が不要となり、PCR反応に含まれる労働量が減少
し、そして起こりうる試料汚染の1つの要因が排除され
る。
【0108】加熱されたカバーの非常に高い温度および
その試料ブロック12への密接性にかかわらず、高温部
と低温部との間の正確かつ急速な循環に対して試料ブロ
ック12の能力への影響がほとんどないことが実験的に
わかっている。加熱された定盤14は前述の還流プロセ
スにより試料の冷却を防止する。なぜなら、この還流プ
ロセスは、キャップの温度を水の沸点より高温に保持
し、それによりキャップの内側を乾燥して保持するから
である。定盤14はまた、キャップを管から除去したと
きに、エアゾールの形成を防止する。他の実施例におい
て、図15における許容しうる最小の下向きの力Fを、
存在する試料管の数に無関係に各個々の試料管に加える
ことができ、かつ凝縮、還流、および対流冷却を防止可
能なあらゆる手段が本発明を実施するために十分有効で
あろう。この下向きの力Fの適用、並びに還流および望
ましくない試料液体の濃縮を防止する熱の使用は、好ま
しい実施例において実施するのと同一のシステムにより
必ずしも実施する必要はない。
【0109】試料管はその全高を数千分の1インチだけ
変えることができる。さらに、試料管のキャップも、そ
の高さを数千分の1インチだけ変えることができる。ま
た、試料ブロック12中の円錐形試料ウェルの各々は、
正確な同一深さに孔開けする必要がなく、また、わずか
に異なる直径および角度に孔開けすることができる。し
たがって、キャップを付けた管群を試料ブロック内に配
置して対応する試料ウェル内に設置するとき、キャップ
の上端部はすべてが同一高さである必要はない。キャッ
プ上端の最大限の高さずれは、最も高い管と最も低い管
との間で0.5mm程度であればよい。
【0110】それ自体が自由に位置決めできるように取
り付けられた完全に平らな非加熱定盤14を、上記のキ
ャップの配列上に押し下げた場合、この定盤はまず最も
背が高い3つの最長の管と接触する。さらに圧力を加え
てこれらの最長の管が多少圧縮されると、定盤はより低
い短尺管のキャップと接触し始める。管およびキャップ
の組体が柔軟でない場合には、最短の管に接触する前
に、最長の管が損傷を受ける可能性を有することは明ら
かである。あるいは、すべての長尺管を十分に圧縮して
最短の管に接触するために必要な力は、それを加えるこ
とが装置にとって大きすぎる場合がある。いずれの場合
においても、1つまたは複数の短尺管はまったく押圧さ
れないか、または不十分な力で押し下げられることにな
り、その短尺管の熱時間定数を他のすべての管の熱時間
定数に等しくしてしまう。これは、試料ブロック中のす
べての管について同一のPCRサイクルの達成を失敗さ
せるであろう。なぜなら、異なる熱時間定数をもつ管
は、他の管と歩調をそろえないからである。定盤を加熱
しキャップを軟化すると、1つの要因として管の高さを
異ならせる製造上の許容誤差が排除され、したがって上
記の問題点が排除される。
【0111】他の実施例において、全体の加熱された定
盤14は柔軟なゴム層でカバーされる。加熱された定盤
上の柔軟なゴムは高さ許容度の問題を解決するととも
に、加熱された定盤から管のキャップへの熱の流れを遅
延させる熱的絶縁層として作用する。さらに、高温度に
おける長時間の使用では、ほとんどのゴム材料は劣化す
るか、あるいは堅くなる。したがって、加熱された定盤
の表面は、熱のすぐれた熱伝導体である金属からなるこ
とが望ましい。さらに他の実施例において、96個の個
別のばねを定盤に取り付けて、各ばねがそれぞれ1つの
試料管を押し下げるようにすることができる。これは複
雑かつ費用のかかる解決法であり、また機械的精確さを
もって定盤を管の配列の上に整列させることが必要なの
で困難かつ面倒である。好ましい実施例における各試料
管についての必要な個々のコンプライアンスは、プラス
チックキャップの使用により与えられる。これらのキャ
ップは定盤による力の下で予測可能な方法でつぶれる
が、つぶれたときでさえ、各試料管をそのウェルの中に
しっかり静止させて保持するために適切な下向きの力F
をなお発揮する。
【0112】図15に示す試料管のキャップ338にお
いて、表面350はぎざぎざ、ばり、および切込みを含
まず、それにより試料管288の内側壁352との間に
気密シールを提供できるようにする。好ましい実施例に
おいて、キャップの材料はポリプロピレンである。適当
な材料は、前述のヒモント(Himont)により製作
されたヴァルティク(Valtec)HH−444また
はPD701ポリプロピレン、またはアメリカン・ヘス
ヒト(American Heoscht)によるPPW1780であ
る。好ましい実施例において、キャップのドーム部分に
ついての壁厚さは0.130±0.005インチ(3.
30±0.12mm)である。好ましい実施例において、
肩部356の厚さは0.025インチ(0.64mm)で
あり、キャップのドーム形部分の幅は0.203インチ
(0.52mm)である。
【0113】図15における最小の限界力Fをすべての
試料管に加えることができ、かつキャップと試料管の上
方部分とを、凝縮および還流を防止するに十分な高温に
加熱させることができるようなあらゆる材料および形状
を有するキャップが、本発明の実施を可能とする。ドー
ム形のキャップ338は、キャップの変形を促進する薄
い壁を有する。加熱された定盤は高い温度に保持される
ので、ドーム形のキャップの壁厚さを射出成形によって
容易に製造される程度に十分に厚くすることができる。
なぜなら、管の高さの差を考慮するために必要なコンプ
ライアンスは、室温において不必要なためである。定盤
は、本発明に従って94℃〜110℃の温度に保持する
ことができるが、水の沸点は100℃であるので、10
0℃〜110℃の範囲は還流の防止に好ましい。この温
度範囲において、キャップは1mm程度に容易につぶれる
のに十分なだけ軟化することが実験的にわかっている。
使用するポリプロピレンの弾力性は、これらの温度にお
いてさえつぶれを完全には非弾性的でなくするものであ
ることを実験が示している。すなわち、加熱された定盤
はキャップの永久的変形を引き起こすが、キャップの材
料は、それらの室温における弾性率の有効な部分をなお
保持するので、最小の限界力Fが各試料管に加えられ
る。さらに、加熱された定盤は、試料ブロックの中にあ
る管の個数に無関係に、キャップの軟化によって過度の
力を用いることなく、接触するすべてのキャップを一様
な高さにする。
【0114】キャップの温度はPCRサイクル全体の間
に水の沸点より高温であるので、各キャップの内側表面
は完全な乾燥状態を維持する。したがって、PCRプロ
セスの最終段階で、試料を、試料ブロックから取り出す
前に室温に冷却する場合や、各試料管上のキャップを開
く場合に、交差汚染を生じうる試料管の内容物のエーロ
ゾル状噴霧が発生する可能性はない。なぜなら、シール
を破壊したとき、管シールに対するキャップに液体が存
在しないからである。
【0115】これはきわめて有利である。なぜなら、増
幅した生成物のDNAを含有するエアゾールの小さい粒
子は実験室を汚染し、そして例えば他の患者等の収集源
からの試料を含有する試料管の中に入り、それにより非
常に面倒な陽性または陰性の誤診断結果を引き起こすか
らである。PCR増幅プロセスのユーザは、他の試料を
汚染しうるエアゾールの発生がないことに極めて関心が
ある。
【0116】使い捨てプラスチック要素を使った装置を
使用して、個々の試料管を8×12の配列に変換する。
この8×12の配列は、マイクロタイタープレートのフ
ォーマットを有する実験室装置に適合し、また、十分な
個々の動きの自由度を維持してこの装置の構成要素の多
様な熱膨張速度の差を補正する。この装置の台に対する
熱的に柔軟なキャップの関係は、試料ブロック、および
キャップを所定位置にもつ2本の試料管の断面図である
図21Aにおいて最もよく見られる。図示の試料管は、
プラスチック製の96個のウェルを有するマイクロタイ
タートレーとリテイナーとの1つの実施例の組み合わせ
により、所定位置に保持されている。図21Bは、別の
好ましい実施例であり、上記装置の種々の使い捨てプラ
スチック要素の構造および相互作用を示す。長方形のプ
ラスチック製96ウェルマイクロタイタープレートのト
レーのフレーム342は、試料ブロック12の表面上に
載置される。フレーム342の上部へり346(前述の
基準面346と同義)は、キャップ(その1例をキャッ
プ364で示す)の高さよりほぼ0.5インチ(12.
7mm)短い高さを有する。キャップ付き管のすべては、
フレーム342のへり346より高く突出する。フレー
ム342の下向きに延びるうね366は、その全長を通
してガードバンドみぞ78の中に延びる。しかしなが
ら、フレーム342はギャップ(図示せず)を有し、こ
のギャップは図2に平面図でかつ図7に断面図で示す温
度センサー用の、みぞ78内のギャップに相当する。
【0117】前述の基準面346はフレーム342の上
部へりにより形成される。この基準面が、加熱された定
盤と相互作用する方法は次の通りである。図20に示す
ノブ318をねじ込んでインデックスマーク332およ
び334に合致させて増幅実験を開始する前に、目盛り
決めプロセスを実施して図20に示す飾り板336上の
インデックスマークの位置を決める。この目盛り決め
は、図21に示すフレーム342を試料ブロックの位置
に配置することによって開始する。しかしながら、フレ
ーム342は空であるか、あるいはその中の管は所定位
置にキャップをもたない。次いで、ノブ318をねじ下
げて、加熱された定盤14をフレーム342の上部へり
346とその周辺全体の周囲にしっかり接触させる。ノ
ブ318を十分にねじ下げて、加熱された定盤を基準面
346上に載置しかつフレーム342を試料ブロックの
上部表面280に対して強く押圧したとき、好ましい実
施例における回転可能な飾り板336を回転させて、飾
り板上のインデックスマーク334をノブ318上のイ
ンデックスマークと合致させる。次いで、ノブ318を
反時計回りに回転して定盤14を上昇させ、そして図1
9に示すカバー316を負方向(Y方向)にすべらせ
て、フレーム342および試料ブロック12を開放す
る。次いで、試料混合物を充填したキャップ付き試料管
をフレーム342中の所定位置に配置する。次に、加熱
されたカバー316を試料ブロックの上に戻して配置
し、ノブ318を時計回りに回転して加熱された定盤1
4を下げて、ノブ上のインデックスマーク332を前述
のように位置決めしたインデックスマーク334と合致
させる。これによりすべての管は、加えられる最小の力
Fによって確実に設置されることとなる。インデックス
マークの使用は、ユーザに簡単かつ評価可能な作業を実
施させる。
【0118】わずかの試料管のみが所定位置に存在する
場合、各インデックスマーク332および334を合致
させるために、小量のトルクを必要とするだけである。
しかしながら、多数の管が存在する場合、各インデック
スマークを合致させるためには、ノブ318に対してよ
り大きなトルクを必要とする。なぜなら、各管は、キャ
ップが変形するとき加熱された定盤14の下向きの動き
に抵抗を生じるからである。しかしながらユーザは、各
インデックスマーク332および334が整列したと
き、加熱された定盤が再びフレーム342の上部へり3
46に対して緊密に配置され、かつすべての管がそれに
加えられた最小の限界力Fを有することを知る。これに
より、すべての管の熱時間定数は実質的に同一であるこ
とが事実上保証される。
【0119】他の実施例において、インデックスマーク
332および334を省略し、ノブ318をそれ以上回
転しなくなるまで単に回転する方法も可能である。この
ような状態は、加熱された定盤14が上部へりすなわち
基準面346に到達して、プラスチック製のフレーム3
42が加熱された定盤14のそれ以上の下向きの動きを
停止させたときに生じる。この実施例、および好ましく
は前述のインデックスマークの実施例において、フレー
ム342のプラスチック材は、加熱された定盤14と接
触するとき、それ自体の変形を防止するために十分に高
い溶融温度を有することが明らかである。好ましい実施
例において、フレーム342のプラスチック材は0.0
5インチ(1.27mm)の壁厚さをもつセラニーズナイ
ロン1503である。
【0120】前述の装置の利点は、異なる高さを有する
フレーム342を使用することのみによって、異なる高
さの試料管を使用できることにある。フレーム342
は、それ自体と管とが試料ブロック内に配置されている
とき、キャップされた管の先端面より約0.5mm低い高
さを有すべきである。好ましい実施例において、2つの
異なる管高さを使用する。加熱された定盤14を推進さ
せる親ねじ312(図19)の動作範囲は、使用される
試料管のすべての異なる高さについて十分なものでなけ
ればならない。もちろん、特定のPCR処理サイクルの
間、すべての管は同一高さでなければならない。
【0121】前述の装置は、試料ブロックにおける均一
な温度、ブロックから試料への均一な熱伝導性、および
周囲環境の変動性からの管の絶縁をもたらす。96個ま
での任意の個数の試料管は、マイクロタイタープレート
のフォーマットに基づいて配列することができる。この
装置は、非常に多数の試料に対する正確な温度制御、及
び任意の試料の温度を実際に測定せずに、すべての試料
に対する試料温度の視的指示を可能とする。PCR反応
のための容器として、従来技術においては、マイクロ遠
心器のために本来設計されたポリプロピレン管が一般に
使用されている。従来技術におけるこの管は円筒形の断
面を有し、その上部は気密シールをつくるスナップ式キ
ャップにより閉じられる。この管は、約17°の夾角を
もつ円錐台形からなる底部領域を有する。
【0122】このような円錐形試料管を、同一夾角を有
する円錐形キャビティを備えた試料ブロックの試料ウェ
ル内に押し下げ、そしてこの管内の試料混合物が円錐形
容積内でかつ試料ブロックの下方位置に完全に配置され
るとき、ブロックと液体との間の熱伝導は、上記配列に
亙る試料温度のすぐれた均一性によって、適切に予測す
ることができる。試料ブロックと試料混合物との間の熱
伝導の適切な制御を達成するために、円錐形の管および
試料ウェルの夾角は密接に合致する必要があり、そして
管およびウェルの円錐形表面は、なめらかでかつ相互に
同一面的な関係に保持されなければならない。さらに、
最小の限界力Fを各試料管に加えて各管を試料ウェル内
へ緊密に押圧し、それにより例えば図15に示す空間2
91内に捕捉された液体からの水蒸気の形成等の熱循環
の間、いかなる原因によっても試料管が上昇せず、また
はゆるくならないようにする必要がある。そして、各管
に同一量の試料液体を充填しなくてはならない。上に列
挙した条件が満足される場合、試料ブロックと各管中の
試料液体との間の熱伝導性は、図15に示す円錐形プラ
スチック壁368、および円錐形試料管壁の内側表面3
70における試料液体の境界層(図示せず)の伝導性に
より、主として決定される。
【0123】プラスチック管壁の熱伝導性はそれらの厚
さにより決定され、そしてそれらの厚さは管製造の射出
成形法により密接にコントロールすることができる。試
料管内の試料液体は事実上同一の熱的性質を有する。実
験および計算により、96ウェルの一体成型マイクロタ
イタープレートは、PCRに対して限界的にのみ適合す
ることがわかっている。なぜなら、アルミニウムとプラ
スチックとの間の熱膨張係数の差は、配列を横切る試料
液体への熱伝導性の均一性を破壊しうる寸法変化を生ず
るからである。すなわち、このような一体成型プレート
内の各ウェルはプレート表面を通して他のウェルに連結
されるので、各ウェル間の距離は、プレートの初期の製
造時に決定されるが、プレートのプラスチック材が有意
な熱膨張係数を有するために温度変化とともに変化す
る。また、金属の試料ブロック12内の試料ウェル間の
距離は、試料ブロックの温度に依存する。なぜなら、ア
ルミニウムは、プラスチックの熱膨張係数と異なる有意
の熱膨張係数を有するからである。すぐれた熱伝導性を
有するために、96ウェルの一体成型マイクロタイター
プレート内の各試料ウェルは、すべての温度において試
料ブロック内の対応するウェルにほぼ完全に適合する。
試料ブロックの温度は極めて広範囲にわたって変化する
ので、試料ブロック内の各試料ウェル間の距離はPCR
サイクルの間にサイクル的に変化する。プラスチックお
よびアルミニウムの熱膨張係数は実質的に異なるので、
試料ブロック内の各ウェルの分離距離は、プラスチック
製の96ウェルの一体成型マイクロタイタープレートに
おける各試料ウェル間の距離に比べ、温度変化に応じて
異なって変動する。
【0124】このように、PCR温度範囲にわたる試料
管と対応する試料ウェルとの間の完全な適合のための重
要な基準として、96ウェルの配列内の各試料管は個々
に自由に横方向に動くことが必要であり、そして試料ウ
ェルの壁と同一面的接触を行うために必要な量に応じ
て、各管が個々に自由に押し下げられることが必要であ
る。本発明において使用する試料管は、従来技術による
マイクロ遠心管と異なり、試料液体に出入りする熱移動
を速くするために試料管の円錐の切頭部分の壁厚さが非
常に薄い。これらの管の上方部分は、円錐形部分より厚
い壁厚さを有する。図15において、円筒形部分288
の壁厚さは一般に0.030インチ(0.76mm)であ
るが、円錐形壁368の壁厚さは0.009インチ
(0.23mm)である。薄い部分は射出成形工程におい
て厚い部分より速く冷却するので、薄い部分が冷却する
前に完全な成形物を得ることが重要である。
【0125】試料管の材料は化学的にPCR反応と適合
性を有する必要がある。ガラスはPCRの適合性材料で
はない。なぜなら、DNAはガラスに粘着し、かつ剥離
せず、PCR増幅を妨害するからである。好ましくは、
オートクレーブ処理可能なポリプロピレンを使用する。
適切な3タイプのポリプロピレンは、上述した通りであ
る。ある種のプラスチックは、プラスチックからのガス
発生あるいはプラスチック壁へのDNAの粘着のため
に、PCRプロセスと適合性ではない。ポリプロピレン
は現時点において最もよく知られているクラスのプラス
チックである。従来一般的な射出成形技術および射出成
形のための型製造技術は、本発明を実施する目的に十分
であろう。円錐形の試料管の使用は、実質的にすべての
製造の許容誤差を、高さの誤差、すなわち試料管を試料
ウェル内に配置したときの、キャップの先端と試料ブロ
ックの上部との高さの各管毎の変動性に転換する。例え
ば、試料管壁の角度に関する角度誤差は、管を試料ブロ
ック内に配置したとき、管壁の角度と試料ウェル壁の角
度が一致しないために、高さの誤差に変換される。同様
に、円錐の寸法における直径の誤差は、管の円筒形部分
が、適切な寸法の管より深く侵入するかしないかのいず
れかを示すので、高さの誤差に変換される。
【0126】配列を横切る熱伝導性の高度な均一性を得
るために、試料管と試料ウェルとの間のすぐれた整合
は、熱膨張速度の差に無関係に、0〜100℃の全温度
範囲にわたって、96個のウェルのすべてに対して形成
されなければならない。また、96個の試料管の各々は
極めて高度に均一な寸法および壁厚さを有する壁を備え
なければならない。試料混合物を保持する各試料管は取
り外し可能な気密キャップを装備すべきである。このキ
ャップは気密シールをつくり、反応混合物が沸点又はそ
の近辺にあるとき、反応混合物からの水蒸気の損失を防
止し、それにより試料混合物の体積の減少を防止する。
これらすべての要因の組み合せにより、全96ウェルに
対して均一な熱伝導性を達成するように96個の個別の
試料ウェルをもつ一体成型のマイクロタイタープレート
を製造することが極めて困難となる。
【0127】各試料管について必要な個々の横方向およ
び垂直方向の自由度をもたらすあらゆる構造が、本発明
を実施するために十分に適合する。本発明の好ましい実
施例に従い、前述のすべての要件は4ピースの使い捨て
プラスチック製装置の使用により達成される。この装置
は、異なる熱膨張速度を補正するために必要なすべての
方向における十分な自由度を各試料管に与え、しかも、
工業規準の96ウェルのマイクロタイタープレートを使
用して作業するように寸法を決められた他の実験室装置
との適合性、およびユーザの便利さのために、96ウェ
ルのマイクロタイタープレートのフォーマットにおいて
96個までの試料管を保持するものである。マルチピー
スの使い捨てプラスチック製装置は、製造の許容誤差お
よびPCR熱サイクルの間に直面する広い温度範囲にわ
たる異なる熱膨張速度に対して、極めて大きな許容性を
有する。
【0128】図21は、4ピースのプラスチック製装置
の大部分の構成要素の別の実施態様を断面図で示すもの
であり、この装置は、異なる熱膨張速度を考慮するため
の十分な動作自由度で試料ウェル内に複数の試料管を保
持するように組み立てられる。図45は、使い捨てプラ
スチック製マイクロタイタープレートの模範装置の全部
分を分解図で示す。この図面は、すべての試料管を8×
12のマイクロタイタープレートのフォーマットにおけ
る96個のウェル配列にゆるく保持した状態でマイクロ
タイタープレートを形成するために、各部分を組合せる
方法を示す。図22は、図21に部分断面図で示された
本発明によるマイクロタイタープレートのフレーム34
2の平面図である。図23はフレーム342の底面図で
ある。図24は図22の線24−24′から見たフレー
ム342の端面図である。図25は図22の線25−2
5′から見たフレーム342の端面図である。図26は
図22の線26−26′に沿ったフレーム342の断面
図である。図27は図22の線27−27′に沿ったフ
レーム342の断面図である。図28は図22の線28
−28′から見たフレーム342の部分切欠き側面図で
あり、後述するリテイナーがフレーム342をクリップ
する状態を詳細に示す。
【0129】図21〜図28を合わせて参照すると、フ
レーム342は水平のプラスチックプレート372を備
え、このプレート372上にマイクロタイタープレート
の規準フォーマットで9mmの中心間間隔を置いて96個
の孔が形成される。8個の行A〜Hおよび12個の列1
〜12が存在する。行D、列7における孔374はこれ
らの孔の典型である。フレーム342の各孔内に、円錐
形試料管、例えば、図15に示す試料管376が配置さ
れる。各試料管はそれを配置する孔より直径が約0.7
mmだけ小さいので、孔内でのゆるい嵌合が形成される。
これは図21(A)および(B)において最も理解され
るように、典型的な孔の内側へり378とその中に配置
された試料管の側壁380との間の距離として示され
る。図21(A)および(B)中の参照番号382は、
試料管376の円筒形部分の外側壁から間隔を置いて位
置する孔の対向へりを示す。
【0130】各試料管は図15、図21(A)および
(B)に示した肩384を有する。肩384は各試料管
の円筒形部分288の全周囲に形成される。肩384の
直径は、フレーム342の各孔を通過しないほどに十分
に大きく、しかも隣接する孔内の隣接する管の肩に接触
するほどには大きくない。すべての管をフレーム内の各
孔の中に配置すると、次にプラスチックリテイナー38
6(図21および図45に最もよく示されている)をフ
レーム342の開口内に嵌合される。このリテイナーの
目的は、すべての管がフレーム342内から外に落下ま
たは押し出されず、かつそれらのフレーム342内での
ゆるい嵌合を妨害しないように、それらすべての管を所
定位置に配置することにある。リテイナー386は、管
の肩384がリテイナー386またはフレーム342に
当接する前に各試料管がある程度鉛直方向へ上下移動す
るように、寸法が決定されかつフレーム342に嵌合さ
れる。このように、フレームおよびリテイナーは相互に
連結されたときに、96個までの試料管にマイクロタイ
タープレートのフォーマットを提供するとともに、各管
が図15に示す最小の限界力Fの影響下ですべての温度
においてその最良の嵌合状態を自由に見いだすように、
水平および垂直方向への十分な自由度を提供する。
【0131】図29および図30を参照すると、試料管
および肩のより明瞭な外観が示される。図29および図
30は、それぞれ、典型的な試料管の肩部分の側面図お
よび部分的上部断面図である。例えば以下で詳述するよ
うなプラスチック製のドーム形キャップは、図29に示
す試料管内へ挿入され、試料管の上部の内側壁390に
対して気密シールを形成する。試料管の内側壁に形成さ
れたうね392は、ドーム形キャップのストッパーとし
て作用して、必要以上の侵入を防止する。通常、ドーム
形キャップはウェブによって接続されたストリップ状の
ものである。図31はウェブ394により接続されそし
てタブ396で終わる3つのキャップの側面図である。
このタブは単一の引きによりキャップの列全体を除去す
るのに役立つ。通常、ウェブ394は試料管の上部表面
398上に位置し、そしてキャップが試料管の中にさら
に侵入するのを防止する。各キャップはキャップと試料
管の内側壁との間にハーメチックシールを形成するうね
400を含む。図32は12の接続されたキャップの典
型的なストリップ中の3つのキャップの上面を示す。
【0132】リテイナーのより詳細な理解のために、図
33〜37を参照する。図33はプラスチックのリテイ
ナーの上面図である。図34は図33の線34−34′
に沿うリテイナーの側面図である。図35は図33の線
35−35′に沿うリテイナーの端面図である。図36
は図33の線36−36′に沿うリテイナーの断面図で
ある。図37は図33の線37−37′に沿うリテイナ
ーの断面図である。図33〜37を参照すると、リテイ
ナー386は垂直壁404により取り囲まれた単一の水
平のプラスチック平面402から構成されている。平面
402はその中に形成され、4孔/群の24群に分割さ
れた、8×12列の96孔を有する。これらの群は平面
402の中に形成されたうね、例えば、うね406およ
び408により区画されている。各孔、それらのうちの
典型的である孔410は、直径Dを有し、この直径Dは
図29における直径D1 より大きく、そして直径D2
り小さい。これにより、リテイナーは試料管がフレーム
342の中に配置された後、試料管の上をすべることが
できる。しかし、肩384が大き過ぎて孔410を通過
できないので、試料管はフレームから落下できない。
【0133】リテイナーはフレーム342の中に、図3
4および36に示すプラスチックタブ414により嵌合
する。これらのプラスチックタブは、図23に示すよう
に、フレーム中のスロット416および418を貫通す
る。2つのプラスチックタブ414が存在し、各々はリ
テイナーの長いへり上に存在する。これらの2つのプラ
スチックのタブは図33に414Aおよび414Bとし
て示されている。
【0134】図22〜28のフレーム342は、その中
に配置された96の試料管及び所定位置に嵌合されたリ
テイナー386を備え、単一の単位、例えば、図21A
および21Bに示すような単位を形成し、これはPCR
処理のために試料ブロック12の中に配置することがで
きる。処理後、フレーム342を試料ブロックの中から
外に持ち上げることによって、すべての管を同時に取り
出すことができる。便利さおよび貯蔵のために、試料管
およびリテイナーを所定位置にしてフレーム342を、
ベースと呼ぶ他のプラスチック成分の中に挿入すること
ができる。ベースは標準の96ウェルのマイクロタイタ
ープレートの外側寸法およびフットプリント(foot
print)を有し、それは図38〜44に示されてい
る。図38はベース420の上面図であるが、図39は
ベースの底面図である。図40は図38の線40−4
0′に沿うベースの側面図である。図41は図38の線
41−41′に沿うベースの端面図である。図42は図
38の線42−42′に沿うベースの断面図である。図
43は図38の線43−43′に沿うベースの断面図で
ある。図44は図38の線44−44′に沿うベースの
断面図である。
【0135】ベース420は傾斜したへりをもつ8×1
2列の孔が形成されているプラスチックの平らな平面4
22を含む。フレーム342がベースの中に位置してい
るとき、試料管の底がベース中の円錐形孔の中に嵌合す
るような、寸法および間隔をこれらの孔は有し、フレー
ム342を試料ブロックに取り付けるとき、試料管が保
持されるのと同一のフレーム342に対する関係で試料
管は保持されている。孔424はベースの中に形成され
た96の孔の典型であり、それは図38,44および4
3に示されている。個々の試料管は、トレーとリテイナ
ーとの間にゆるく捕捉されているが、フレームがベース
の中に挿入されているとき、しっかり位置し、不動とな
る。典型的な試料管424がベースの中に嵌合される形
式は図44に示されている。換言すると、フレーム、試
料管およびリテイナーがベース420の中に位置すると
き、それ全体は工業的に標準の96ウェルのマイクロタ
イタープレートと機能的に同等のものとなり、それは、
それ以上の処理のために96ウェルの工業的に標準のマ
イクロタイタープレートのための事実上任意の自動化ピ
ペッティングまたはサンプリングのシステムの中に配置
され得る。
【0136】試料管は必要な試薬および増幅すべきDN
Aで充填した後、試料管にキャップすることができる。
図31および32に示すキャップ片の他の実施態様にお
いて、8×12列でキャップを接続するしなやかなウェ
ブをもつ96のキャップのマット全体を使用することが
できる。これはウェブは、図31に394で示されてお
り、十分にしなやかであり、キャップは試料管が小さい
動きを妨害されないようにしなくてはならず、これらの
試料管はすべての温度において試料管の円錐形壁の中に
完全に嵌合しなくてはならない。管、キャップのフレー
ム、リテイナーおよびベースのアセンブリーは、管の充
填後、サーマルサイクラーに入れる。そこで、フレー
ム、キャップ付き管およびリテイナーのプレートはベー
スから1単位として取り出される。次いで、この単位を
試料ブロック12の中に配置して、図21Aおよび21
Bに示すアセンブリーを作り、管は試料ブロック中の円
錐形壁の中にゆるく保持されている。図21に示すよう
に、フレーム342はガードバンドの上部表面上に位置
する。好ましい実施態様において、うね366はガード
バンドのみぞ78の中に下向きに延びるが、これは必須
ではない。
【0137】次に、加熱されたカバーは試料の上にすべ
らせ、加熱した定盤を前述したようにスクリューで下げ
て、フレーム342の上部へり346と接触させる。図
19における加熱された定盤14がキャップ接触した
後、数秒以内で、キャップは軟化し、そして図19にお
けるレッドスクリュー312からの下向きの圧力下に降
伏する。次いで、ノブ318を回転して、図20におけ
るインデックスマーク332および334を合致させ、
これはすべての試料管を試料ブロックの中に、少なくと
も最小の限界力Fおよび加熱された定盤14の間のすべ
ての空気ギャップで、緊密にプレスさせ、試料ブロック
およびフレーム342の上部へり346は緊密に閉じ
る。ここで、試料管は完全に閉じ、制御された環境の中
にあり、そして温度の正確なサイクリングを開始するこ
とができる。
【0138】PCRプロトコルの終わりにおいて、加熱
された定盤14は上方に、試料管から離れる方向に動
き、加熱されたカバー316は道からはずれすべってフ
レーム342および試料管を露出する。次いで、フレー
ム、試料管およびキャップを取り出して空のベースの中
に再配置すると、キャップを除去することができる。各
キャップまたはキャップのひもを引き、リテイナーは管
をトレーの中から外に出ないように保持する。ベースの
中に形成したリブ(図38〜44に示されていない)
は、図33に示すリテイナータブ414Aおよび414
Bと接触してリテイナーを所定位置にスナップ式に保持
し、こうしてキャップの除去により管に加えられた力が
リテイナー366を変位させないようにする。
【0139】明らかなように、フレーム342は、必要
に応じて、96より少ない管とともに使用することがで
きる。また、リテイナー386は、必要に応じて、上記
スナップを分離することによって、除去することができ
る。一度に数本の管を使用し、そしてこれらの管を個々
に取り扱うとき、試料ブロック上にリテイナーを使用し
ないで、空のフレーム342を配置することができる。
次いで、ユーザは「試験管のラック」としてベースを使
用し、そしてその中に小さい数の管をセットする。次い
で、管は手動で充填し、そして個々のキャップをするこ
とができる。次いで、管を試料ブロック中のウェルの中
に個別に入れ、加熱されたカバーを閉じ、そして加熱さ
れた定盤14をスクリューで下げて、マークを合致させ
る。次いで、PCRサイクルを開始できる。サイクリン
グが完結したとき、カバー316を除去し、そして試料
管を有効なベースの中に個々に配置する。リテイナーは
この型の使用において不必要である。
【0140】図47および図48を参照すると、図1に
おいてCPUブロック10により表わされる制御システ
ムの好ましい実施態様のブロック線図が示される。図4
7及び図48の制御エレクトロニクスの目的は、なかで
も、所望のプロトコルを定めるユーザの入力データを受
けとりかつ記憶し、種々の温度センサーを読み、試料温
度を計算し、計算した試料温度をユーザが定めたPCR
プロトコルにより定められた所望の温度と比較し、電力
ラインの電圧をモニターし、そしてフィルムヒータゾー
ンおよびランプ冷却弁を制御して、ユーザが定めたPC
Rプロトコルを実施することである。マイクロプロセッ
サ(以後CPUという)450は、後述するソースコー
ドの形で付録Cに記載されている制御プログラムを実行
する。好ましい実施態様において、CPU450は「O
KI CMOS 8085」である。CPUはアドレス
バス452を推進し、これにより図47及び図48にお
ける他の回路要素の種々のものがアドレスされる。CP
Uは、また、データバス452を推進し、これによりデ
ータは図47及び図48における他の回路要素の種々の
ものに伝えられる。
【0141】付録Cの制御プログラムおよびあるシステ
ム定数はEPROM456に記憶される。ユーザが入れ
たデータおよびシステム定数および導入プロセスの間に
測定された特性(下に記載する導入プログラムの実行)
はバッテリーバックアップRAM458に記憶される。
システムクロック/カレンダー460は、制御ソフトウ
ェアの説明において下に記載する、PCRの実行および
電力故障の間の事象の履歴を記録する目的で、データお
よび時間の情報をCPU450に供給する。アドレスデ
コーダー462はアドレスバス452からのアドレスを
受けとりそしてデコードし、そしてチップ選択バス46
4上の適当なチップ選択ラインを活性化する。ユーザは
ディスプレイ468上のCPUにより表示される情報に
応答してキーボード466を経てPCRプロトコルを入
れる。ユーザとCPU450との間の2ウェイ連絡は、
制御ソフトウェアの説明のユーザのインタフェースの節
において以下で詳細に記載する。キーボードインタフェ
ース回路470はユーザのキーボードを、データバス4
54を経てCPUにより読まれるデータに変換する。
【0142】プログラム可能な間隔タイマー472およ
び474の各々はカウンターを備え、これらのカウンタ
ーはCPU450により計算されたカウントを負荷され
て、電力が種々のフィルムヒータゾーンに加えられる間
隔を制御する。割り込み制御装置476は、割り込み要
求をCPU450に200ミリ秒毎に送って、制御ソフ
トウェアの説明において以下で記載するPIDタスクを
CPU450に実行させる。このタスクは温度センサー
を読みそして加熱または冷却の電力を計算して試料温度
を現在のレベルから、ユーザが望むレベルに動かし、こ
れはそのPCRプロトコルにおける時点のために実行さ
れる。UART478は、RAM480に記憶されたデ
ータをプリンタに出力できるように「RS232」イン
タフェース回路480を実行させる。制御ソフトウェア
は各PCRの作動のレコードを維持し、これは実際に実
行されたPCRプロトコルがユーザが望むPCRプロト
コルに対応したというユーザの評価の目的のための作動
の間に、種々の時間に存在した実際の温度に関して実施
される。さらに、特定のPCRプロトコルの間に望む特
定の時間および温度を定めるユーザが入れたデータが記
憶される。すべてのこのデータおよび他のデータは、C
PU450により同様によく読まれ、そしてUART4
78を経てRS232ポートに連結されたプリンタに出
力される。RS232インタフェースは、また、外部の
コンピュータに試験の目的でアドレスおよびデータバス
の制御をさせる。
【0143】周辺インタフェースチップ(以後PICと
いう)482は、4入力/出力レジスタのプログラム可
能なセットとして働く。パワーアップにおいて、CPU
450はアドレスデコーダー462およびチップ選択バ
ス464を経てPIC482を選択する。次いで、CP
UはPICへのデータワードをデータバス454を経て
書いて、どのレジスタを出力ポートおよび入力ポートに
すべきかに関して、PIC482をプログラミングす
る。引き続いて、CPU450は出力レジスタを使用し
て、プログラム可能なアレイ論理チップ(PAL)48
4の内部の論理状態を制御するために、データバス45
4を経てCPUによりその中に書かれたデータワードを
記憶する。PAL484は、複数の入力信号および複数
の出力信号を有する状態装置である。PALは一般にあ
る数の異なる状態を有する論理の列を有する。各状態は
入力における論理状態の列またはベクトルにより定めら
れ、そして各状態は出力の論理状態の異なる列またはベ
クトルを生ずる。CPU450,PIC482,PAL
484および下記において定義するいくつかの他の回路
は、共働してPAL484からの種々の出力信号の異な
る状態を発生する。これらの異なる状態および関連する
出力信号は、以下に記載するように図47及び図48に
示すエレクトロニクスの作動を制御するものである。
【0144】12ビットのアナログディジタル(A/
D)コンバータ486は、ライン488および490上
のアナログ電圧をデータバス454上のディジタル信号
に変換する。これらはCPUによりA/Dコンバータの
ためのアドレスを発生し、こうしてA/Dコンバータの
チップ選択入力に連結したバス464上にチップ選択信
号が活性となりそしてコンバータを活性化するようにす
ることによって読まれる。ライン488および490上
のアナログ信号は、2つのマルチプレクサ492および
494の出力ラインである。マルチプレクサ492は4
つの入力ポートを有し、各々は2つの信号ラインを有す
る。これらのポートの各々はシステムにおける4つの温
度センサーの1つに連結されている。第1のポートは試
料ブロックの温度センサーに連結されている。第2およ
び第3のポートは、それぞれ、冷却液および周囲の温度
センサーに連結されており、そして第4ポートは加熱さ
れたカバーの温度センサーに連結されている。これらの
温度センサーの各1つのための典型的な回路は図49に
示されている。20,000オームの抵抗器496は、
ノード497において、バス接続ライン(図示せず)を
経て図47及び図48における調整された+15ボルト
電力供給498を受けとる。この+15DC信号のリバ
ースはゼンナーダイオード500をバイアスする。リバ
ースバイアス電流およびゼンナーダイオードを横切る電
圧低下は温度の関数である。ダイオードを横切る電圧低
下は、ライン502および504を経てマルチプレクサ
292に入力される。各温度センサーはマルチプレクサ
292への同様な接続を有する。
【0145】マルチプレクサ494は、また、入力ポー
トを有するが、3つのみが接続されている。第1入力ポ
ートは較正電圧発生器506に連結されている。この揮
発性発生器は、2つの正確に制御された電圧レベルをマ
ルチプレクサの入力部に出力し、非常に熱的に安定して
いる。すなわち、電圧源506により参照電圧の出力
は、少なくとも温度とともに、ごくわずかにドリフトす
る。この電圧は時間毎にCPU450により読まれ、そ
して、この参照電圧が下に記載する導入プロセスの実行
の間に測定された既知の温度において有したレベルを表
す、記憶された定数と比較される。参照電圧が測定され
たレベルからドリフトし導入プロセスの間に記憶された
場合、種々の温度およびライン電圧を感知するための使
用した他の電子回路が、ドリフトし、そしてそれらの出
力を調節し、相応して温度測定プロセスにわたって非常
に正確な制御を維持することをCPU450は知る。マ
ルチプレクサ494への他の入力は、ライン510を経
てRMS対DCコンバータ回路512へ連結される。こ
の回路はステップダウントランス516に連結された入
力514を有し、そしてAC電圧入力518にそのとき
存在するライン電圧に比例するAC電圧を入力514に
おいて受けとる。RMS対DCコンバータ回路512は
AC電圧を整流し、そしてそれを平均して、ライン51
8上のAC入力電圧に対して、また、比例するDC電圧
をライン510上に発生する。
【0146】4つの光学的に連結されたトライアックド
ライバー530,532,534および536は、PA
L論理484から制御バス538を経て制御信号を受け
とる。トライアックドライバー530,532および5
34の各々は、3つのフィルムヒータゾーンの1つへの
電力を制御する。これらのヒータゾーンはブロック25
4,260/262および256/258(図13にお
いて使用したのと同一の参照数字)により表わされる。
トライアックドライバー536は、ブロック544によ
り表わされる加熱されたカバーへの電力を熱的カットア
ウトスイッチ546を経て制御する。フィルムヒータの
ヒータゾーンはブロック熱的カットアウトスイッチ54
8により保護される。熱的カットアウトスイッチの目的
は、不安定な間隔の間放置されているトライアックドラ
イバーに導く破壊の場合において、加熱されたカバー上
のフィルムヒータ/試料ブロックの溶融を防止すること
である。このような事象が起こった場合、熱的カットア
ウトスイッチは過度に熱い状態を検出し、そしてライン
552または554上のトライアックを遮断する。
【0147】フィルムヒータの主なヒータゾーンは36
0ワットの定格であるが、マニホールドおよびへりのヒ
ータゾーンは、それぞれ、180ワットおよび170ワ
ットの定格である。トライアックドライバーは「モトロ
ーラ MAC 15A1015アンプトライアック」で
ある。各ヒータゾーンは2つの電気的絶縁された区画に
分割され、各々は1/2の電力を消費する。2つの半分
は150ボルトのRMSより低いライン電圧518につ
いて並列に接続されている。これより大きいライン電圧
について、2つの半分は直列に接続されている。これら
の別の接続は「パーソナリティ」プラグ550を通して
達成される。フィルムヒータゾーンのためのAC電力供
給はライン559であり、加熱されたカバーのためのA
C供給はライン560を経る。ゼロ交差検出器566
は、ライン518上のAC電力の各ゼロ交差においてラ
イン568上にパルスを放射することによって、バイア
スシステムのタイミングを提供する。ゼロ交差検出器は
アナロググラウンドに対して参照される「ナショナル
LM 311N」であり、そして25mVのヒステリシス
を有する。ゼロ交差検出器はトランス516からその入
力をとり、そしてトランス516は0〜240ボルトの
ACのAC入力信号について0〜5.52ボルトの出力
AC信号を出力する。
【0148】電力トランス570はAC電力をポンプ4
1に供給し、そしてポンプ41はランプ冷却チャンネル
およびバイアス冷却チャンネルを通して冷却液を送る。
冷却装置40は、また、そのAC電力をトランス570
からパーソナリティプラグ550の他の部分を経て受け
とる。トランス550は、また、3つの調整された電力
供給572,498および574および1つの非調整電
力供給576に電力を供給する。温度を測定する正確な
目的のために、較正電圧発生器506は1系列の非常に
正確な薄いフィルムの超低温度のドリフト20Kohm
の抵抗器(図47及び図48には示さない)を使用す
る。これらの同一の超低ドリフト抵抗を使用して、アナ
ログ増幅器578のゲインをセットし、そしてアナログ
増幅器578はディジタル値への変換前に選択した温度
センサーからの出力電圧を増幅する。これらの抵抗器は
わずかに5ppm /℃ドリフトするだけである。
【0149】すべての温度センサーは、それらを(それ
らが温度を測定する構造体から分離されている)をまず
40℃に温度制御された安定な攪拌された油の浴の中に
配置し、そしてマルチプレクサ492への入力において
実際のオプチクス電圧を測定することによって較正され
る。次いで、温度センサーを95℃の温度の浴の中に配
置し、そしてそれらの出力電圧を再び同一点において測
定する。較正電圧発生器494の出力電圧は、また、マ
ルチプレクサ494の入力において測定される。各温度
について、温度センサーの出力の各と較正電圧発生器5
06により発生した電圧から生ずるディジタル出力との
間のA/Dコンバータからのディジタル出力の差を測定
する。次いで、温度変化について各々を較正するための
各温度センサーのために較正定数を較正することができ
る。
【0150】次いで、試料ブロックの温度センサーを次
の較正手順にかける。この手順は試料ブロックを2つの
異なる温度に推進することを包含する。各温度レベルに
おいて、16の異なる試料ウェル中のブロックの実際の
温度は、16のRTD熱電対のプローブを使用して0.
02℃内で測定する。次いで、ブロックの温度について
の平均のプロフィルを発生させ、そしてA/Dコンバー
タ464の出力は試料ブロック中のその場所においてブ
ロック温度センサーを使用して測定する。これは両者の
温度レベルにおいて実施する。RTDプローブで測定し
た実際のブロック温度およびブロック温度センサーのた
めのA/D出力について、それ以上の較正ファクターを
計算することができる。そのように発生した温度の較正
はバッテリーバックアップRAM458の中に記憶され
る。いったんこれらの較正ファクターがシステムのため
に決定されると、システムは較正の時に存在する電気的
特性から認めうるほどドリフトしないことが重要であ
る。したがって、低いドリフトの回路を選択し、そして
超低ドリフト抵抗器を使用することが重要である。
【0151】CPU450が試料ブロック温度を制御す
る方法は、制御プログラムについて下に記載する選択を
参照することによって最もよく理解することができる。
しかしながら、図47及び図48の電子回路が制御ソフ
トウェアと共働してPCRプロトコルを実施する方法を
例示するために、次のことを考慮する。ゼロ交差検出器
566は出力バス568の中に2つの出力を有する。こ
れらの出力の1つは、ゼロ電圧参照を横切るAC信号の
各ポジティブに行く転移についてネガティブに行くパル
スを放射する。他のものはゼロ参照電圧レベルを横切る
AC信号の各ポジティブに行く転移についてネガティブ
パルスを放射する。典型的には580で示すこれらの2
つのパルスは1つの完全なサイクルまたは2つのハーフ
サイクルを定める。それは200ミリ秒の試料の期間を
定めるバス568上のパルスのトレインである。米国に
おけるような60サイクル/秒のACについて、200
ミリ秒は24のハーフサイクルを含有する。
【0152】典型的なシステム期間は図50に示す。図
50中の各「チック」マークは1つのハーフサイクルを
表す。各200ミリ秒の試料期間の間、CPU450は
ユーザが定めた設定点またはインキュベーション温度に
試料ブロック温度を維持するために、あるいはPCRプ
ロトコルの時間ラインにおいて特定の試料期間が存在す
る場所に依存する新しい温度にブロック温度が動かすた
めに、必要な加熱または冷却の電力を計算している。各
フィルムヒータゾーンにおいて必要な電力のマットは、
各ヒータゾーンを次の200ミリ秒の試料期間の間に止
まるハーフサイクルに変換される。これらの計算を実施
する現在の試料期間の終了直前に、CPU450はプロ
グラム可能な間隔タイマ(PIT)472中の4タイマ
の各々をアドレスする。各タイマに、CPUはハーフサ
イクルの数を表す「現在の」カウントを構成するデータ
を書き、タイマに関連するヒーターゾーンは次の試料期
間の中にない。図50において、このデータは次の試料
期間の開始時間592に先立つ直前間隔590の間にタ
イマに対して書き込まれる。94℃の変性温度までの急
速なランプが、時間592と594との間の試料的間隔
を包含する間隔でユーザの設定点データにより要求され
ると仮定する。したがって、フィルムヒータはその期間
のほとんどについてオンであろう。中央のゾーンヒータ
が試料期間の間の3つのハーフサイクルを除外してすべ
てについてオンであると仮定する。この場合において、
CPU450は、間隔590の間の中央のゾーンヒータ
に関連するPIT472中のカウンターの中に3を書
く。この書く操作は自動的にタイマに、中央のゾーンヒ
ータを制御するバス592の特定の制御ライン上の「シ
ャットオフ」信号を発生させる。この「シャットオフ」
信号はPAL484に、中央のゾーンに関連するバス5
38中の信号ラインの特定の1つ上に「シャットオフ」
信号を発生させる。次いで、トライアックドライバー5
30は次のゼロ交差、すなわち、時間592においてシ
ャットオフする。PITはライン594上のポジティブ
ゴーイングパルスのパルスのトレーンをPAL484か
ら受けとる。これらのパルスはPAL484による2ラ
インバス568上でゼロ交差パルスの、PAL484に
よりすべてのゼロ交差パルス上のポジティブゴーイング
パルスおよび単一のライン、すなわち、ライン594上
のすべてのゼロ交差においてポジティブゴーイングパル
スへの翻訳である。中央フィルムヒータゾーンに関連す
るPIT472中のタイマは、そのクロックとしてライ
ン594上のハーフサイクルマーキングパルスを使用し
てその現在の3のカウントからカウントダウンを開始す
る。第3ハーフサイクルの終わりにおいて、このタイマ
は0に到達し、そしてバス592上のその出力信号が状
態を変化するようにさせる。このオフからオンへの状態
の転移は図50に596で示されている。この転移はP
AL484に伝えられ、これによりPAL484はバス
538上の適当な出力信号の状態を変化させて、第3ゼ
ロ交差でトライアックドライバー530をオンにスイッ
チする。好ましい実施態様におけるようにゼロ交差でト
ライアックをオンにスイッチすることによって、インジ
ケータ(フィルムヒータの導体)を通して流れる高い電
流のオフのスイッチングは回避されることに注意すべき
である。これはラジオ周波数のインターフェレンスまた
は他のノイズの発生を最小にする。各ハーフサイクルの
位置を要求する電力の計算量に従いフィルムヒータにス
イッチする技術は、また、別の実施態様として機能し得
るが、この技術により発生するノイズのために好ましく
ないことに注意すべきである。
【0153】PIT472および474の他のタイマ
は、他のヒータゾーンおよび加熱されたカバーへ加えら
れる電力をCPUにより計算された電力に従い同様な方
法で管理する。ランプ冷却は周辺インタフェース482
を通して直接CPU450により制御される。各試料期
間の間に実施された加熱/冷却電力の計算がランプ冷却
電力を必要とすることを示したとき、CPU450は周
辺インタフェース制御装置(PIC)482をアドレス
する。次いで、データワードは適当なレジスタの中に書
かれて出力ライン600を高く推進する。この出力ライ
ンは1対の単安定マルチバイブレータ602および60
4をトリガし、これにより各マルチバイブレータは、そ
れぞれ、ライン606および608上の単一のパルスを
放射する。これらのパルスの各々は、ちょうど1アンペ
アおよびほぼ100ミリ秒のパルス期間の下でピーク電
流を有する。これらのパルスの目的は、ランプ冷却流れ
を急速にオンにすることが非常に困難であるランプ冷却
チャンネルを通る流れを制御するソレノイド弁コイルを
推進させることである。ライン606上のパルスは、ド
ライバー610に、ソレノイド作動弁の1つのソレノイ
ドコイルの1つの側に連結されたライン612を接地さ
せる。コイル614の他方の端末は電力供給576から
の+24ボルトのDCで電力供給「レール」616に連
結されている。ワンショット602は1つの方向の流れ
のためのランプ冷却ソレノイド作動弁を制御し、そして
ワンショット604は反対方向の流れのためのランプ冷
却ソレノイド作動弁を制御する。
【0154】同時に、ライン600上のRCOOL信号
の活性化はドライバー618を活性化する。このドライ
バーは電流制限抵抗620を通してライン612を接地
させる。この電流制限抵抗の値は、ライン622を通し
て流れる電流がソレノイド弁614を開かせて保持する
ために必要な保持電流に少なくとも等しいような値であ
る。ソレノイドコイルは、ソレノイド作動弁をオンする
ために大きい電流を必要とするが、弁を開かせて保持す
るためには実質的に少ない電流を必要とするという特性
を有する。ライン606上の100ミリ秒のパルスが止
んだとき、保持電流のために抵抗器620およびドライ
バー618を通る接地接続のみを残して、ライン612
を直接接地させる。ソレノイド弁614は1/2ランプ
冷却管、すなわち、試料ブロックを通して1つの方向に
冷却液を運ぶ管、のみにおいて試料ブロックを通るラン
プ冷却冷却液の流れを制御する。他のソレノイド作動弁
624は、対向する方向で試料ブロックを通る冷却液の
流れを制御する。この弁は、ドライバー626および6
28、ワンショット604およびライン608により、
ソレノイド作動弁614と全く同一の方法で駆動され
る。
【0155】ランプ冷却の必要性は試料期間毎に1回評
価される。ブロック温度を測定しそしてそれをランプ冷
却がもはや必要ではない所望のブロック温度と比較する
ことによって、制御ソフトウェアのPIDタスクが決定
されたとき、ライン600上のRCOOL信号が不活性
化される。これは、CPU450により、PIC482
をアドレスし、そしてライン600に連結されたPIC
482中のレジスタ中の適当なビットの状態を逆転する
データをそれに書き込むことによって実施される。PI
T474は、2つの他のタイマを有し、これらは20Hz
の割り込みおよび加熱LEDを計時し、加熱LEDは試
料ブロックが熱く接触すると危険であるときに視的指示
を与える。システムは、また、ビーパーワンショット6
30およびビーパー632を含んで、不正確なキースト
ロークがなされたときにユーザに警告する。
【0156】プログラム可能な割り込み制御装置476
を使用して、レベル1−テスト;レベル2−20Hz;レ
ベル3−トランスミット・レディ;レベル4−レシーブ
・レディ;レベル5−キーボード・割り込み;レベル6
−メインヒータ・ターンオン;および、レベル7−AC
ラインのゼロ交差からなる7の割り込みを検出する。プ
ログラム可能な割り込み制御装置482は、マルチプレ
クサ492および494を制御するための4つの出力
(図示せず)を有する。これらの信号「MUX1 E
N」および「MUX2 EN」は、マルチプレクサ49
2および494の一方または双方を使用可能とするが、
信号「MUV0およびMUV1は増幅器578への入力
にどのチャンネルを選択するかを制御する。これらの信
号は、2つのマルチプレクサからの1つのチャンネルの
みを任意の1つの時間に選択できるように管理される。
【0157】「RLTRIG*」信号は、CPUが暴走
する場合PAL484への信号「TIMEOUT EN
*」動作させてヒータの使用を禁止するヒータのタイム
アウトワンショット632をリセットする。すなわち、
ワンショット632は、所定の間隔を有し、該間隔は、
各トリガ後、ワンショット632がすべてのヒータゾー
ンの使用を禁止する信号「TIMEOUT EN*」を
動作させる前に待機する時間である。CPU450はル
ーチンを周期的に実行し、これはPIC482をアドレ
スし、そしてデータを適当なレジスタに書き込んで、ラ
イン634上の信号を動作してワンショット632をト
リガする。CPU450がなんらかの理由で「暴走」
し、そしてこのルーチンを実行しない場合、タイムアウ
トワンショット632はすべてのヒータゾーンの使用を
禁止する。
【0158】PIC482は、また、加熱されたカバー
およびサンプルブロックヒータを使用可能にするための
出力COVHTR EN*およびBLKHTREN*
(図示せず)を有する。これら両信号は低く活性化し、
そしてCPU450により制御される。それらはバス6
36を経てPAL484へ出力される。PIC482
は、また、信号BEEPおよびBEEPCLR*をバス
640に出力してビーパーワンショット630を制御す
る。PIC482は、また、信号MEM1(図示せず)
を出力し、この信号はEPROM456の高いアドレス
区画とバッテリーRAM458の低いアドレスとの間の
ページをスイッチするために使用される。2つの他の信
号PAGE SEL0、およびPAGE SEL1(図
示せず)は、EPROM456中の4つの16Kページ
の間を選択する出力である。
【0159】4つの温度センサーは、10mV/゜Kのゼ
ナー電圧/温度依存性を有するナショナル LM 13
5ゼナーダイオード型のセンサーである。ゼナーダイオ
ードは、20Kの抵抗器496により調整された電力供
給498により動作する。ゼナーを通る電流は、0℃〜
100℃の操作範囲にわたってほぼ560μA〜615
μAの間で変化する。ゼナーそれ自体の加熱は、同一の
操作範囲にわたって1.68mW〜2.10mWの間で変化
する。伝送制御装置(マルチプレクサ)492および4
94は、DG409アナログスイッチである。ライン4
88および490上の電圧は、Vout =3*Vin−7.
5の伝達関数を有するAD625KN計器増幅器により
増幅される。A/D変換器486は、0Vから5Vの入
力範囲を有するAD7672である0℃〜100℃にわ
たって2.73〜3.73のゼナー温度センサーの出力
で、増幅器578の出力は0.60ボルト〜3.69ボ
ルトであり、これはA/D変換器の入力範囲内に入る。
【0160】高度に精確なシステムを実施する上で重要
なことは、すぐれた精度および周囲温度の変化によるド
リフト量が少ないことである。これらの両者は、精密な
電圧基準源、すなわち、較正電圧発生器506を使用
し、そして、温度センサーの出力、およびライン510
上のACライン電圧をモニターするために使用される同
一のエレクトロニクスの連鎖を通る出力を連続的にモニ
ターすることによって達成される。
【0161】較正電圧発生器506は、ライン650お
よび652上に2つの精密な電圧を出力する。一方の電
圧は3.75ボルトであり、そして他方は3.125ボ
ルトである。これらの電圧は、抵抗器間の0.05%の
合致および抵抗器間の5ppm/℃の温度ドリフト量を有
する、一連の一体化された薄膜超低ドリフト抵抗器を使
用して、調整された供給電圧を分割することによって得
られる。較正電圧発生器は、また、A/Dコンバータ基
準電圧に対して−5ボルト、計器増幅器オフセットに対
し−7.5ボルトを発生する。これらの2つの電圧は、
ライン(図示せず)によりA/D486、および増幅器
578に伝えられる。これらの負の電圧は、同一薄膜基
準抵抗器のネットワークとOP27GZオペアンプ(図
示せず)を使用して発生される。操作増幅器578のた
めのゲイン設定抵抗器は、また一体化された超低ドリフ
ト薄膜整合抵抗器である。
【0162】制御ファームウェア、制御エレクトロニク
スおよびブロックの設計は、PCRプロトコルのウェル
対ウェル、および計器対計器の輸送性が可能であるよう
に設計される。処理能力の高い実験室は、実験室の広い
範囲の人員に使用容易であり、かつ必要とする訓練が最
小である計器を使用している。本発明のためのソフトウ
ェアは、複雑なPCRサーモサイクリングのプロトコル
を取り扱うと同時に、プログラムが容易であるように開
発された。さらに、それは電力の中断の間の試料の統合
性を保証するような安全装置をもって提供され、そして
安全な記憶装置の中に各ランの詳細な事象を書き込むこ
とができる。
【0163】システムが適切に作動していることを保証
するために、図54〜図57に示したパワーアップ自己
検査を完結した後、本発明のユーザインタフェースは、
ファイルを実行し、作成しまたは編集し、或いはユーテ
ィリティファンクションをアクセスするようにユーザを
案内する、簡単なトップレベルのメニューを提供する。
プログラミングの技能は要求されない。なぜなら、前以
て存在する不足のファイルは個別化した時間および温度
を使用して編集し、次いで後の使用のために記憶装置に
記憶することができるからである。ファイル保護システ
ムが許可なくプログラムを変更させることを防止するフ
ァイルは、通常、所望の温度を保持するか、あるいはサ
ーモサイクリングするための一連の命令から成る。複雑
なプログラムは、ファイルを一緒にリンクしてある方法
を形成することによってつくられる。共通に使用される
ファイル、例えば、サーモサイクル後の4℃保温培養
(インキュベーション)は、他のユーザにより作成され
た方法に、記憶され、そして組み込むことができる。新
しい型のファイル、AUTOファイルはPCRサイクリ
ングプログラムであり、パラメータを制御するいくつか
の型の変化、つまり時間の増加(オートセグメントの伸
長、収率の増大するため)、時間の減少、または温度の
増加または減少が各サイクルを起こすかを特定できるよ
うになっている。最高の制御精度および最も信頼性があ
る方法の転送のために、温度は0.1℃で安定してお
り、そして時間は最も近い秒にプログラミングされる。
本発明は1回の実行中に1つまたは2つ以上の設定点に
おいて、特定したサイクルにおける試薬の添加および管
の取り出しのための、定期的PAUSEをプログラミン
グする能力を有する。
【0164】本発明のシステムは、各実行について50
0の記録履歴を記憶する能力を有する。この特徴によ
り、各サイクルにおいて個々のステップを見直し、そし
て不規則性に関する特別の状態または誤まったメッセー
ジを知らせることができる。オプショナルのプリンタを
使用して、本発明はファイルおよび方法のパラメータ、
時間/日付のスタンプを有する実行時間、時間/温度の
データ、形状パラメータ、および分類されたファイルの
記録のハードコピーを提供する。
【0165】再現性あるサーモサイクリングを保証する
ために、演算された試料の温度は各サイクルのランプ制
御期間および保持制御期間の間に表示される。セットし
た温度より1度低い温度を通常使用してランプ時間およ
び保持時間のクロックをトリガするが、これはユーザに
より変更することができる。管の型および体積について
の適切な時間を使用すると、長いまたは短い保温培養時
間がプログラミングされるかどうかに無関係に、試料
は、常に、同一精度で所望の温度に到達する。ユーザは
変性されたプライマープールの特殊化されたアニーリン
グの要件、または非常にGCに富んだ標的のための非常
に短い(1〜5秒)高温の変性についてゆっくりしたラ
ンプをプログラミングすることができる。情報(インテ
リジェント)の欠乏は2および3温度のPCRサイクル
について前以てプログラミングされる。
【0166】診断試験をアクセスして、加熱および冷却
のシステムの状態をチェックすることができる。なぜな
ら、ソフトウェアが成功/失敗を表示するからである。
さらに、システム実行のプログラムは、包括的なサブシ
ステムの評価を実施し、そして簡単に状態を表示する。
制御ファームウェアは、以下に列挙するいくつかのセク
ションから構成される: − 診断 − 較正 − 導入(インストール) − 実時間運用システム − システムを管理する9つの序列化されたタスク − 起動シーケンス − ユーザインタフェース ファームウェアの種々のセクションを、原文通りの記
述、擬似コードまたは両者で記述する。
【0167】ファームウェアの特徴は、次の通りであ
る: 1.試料ブロック平均温度を+/−0.1℃に管理する
と共に試料ブロック中のウェルの間の温度の不均一性を
+/−0.5℃内に維持する制御システム。 2.ライン電圧の変動、並びに電子温度ドリフト量を測
定し、補償する温度制御システム。 3.システムの各要素が作動しているか否かを、決定す
る広範なパワーアップ診断。 4.加熱および冷却のシステムが適切に動作しているか
否かを評価する、導入(インストール)プログラムにお
ける包括的な診断。 5.オペレーターのマニュアルの使用を最小にして計器
の操作を可能とするメニューシステムを使用する、論
理、および編成されたユーザのインタフェース。 6.17までのPCRプロトコルをリンクして、それら
を1つの方法として記憶する能力。 7.150までのPCRプロトコル、および方法をユー
ザのインタフェースの中に記憶する能力。 8.シーケンスタスクの一部分として前回の実行の50
0までの事象をレコードする履歴ファイル。
【0168】9.最高温度の精度、および制御のため
に、実行開始の反応体積および管の寸法、型をユーザの
インタフェースの一部分として決定し、PIDタスクに
おけるタウ(管の時間定数)を変更する能力。 10.停電から回復するまで、システムは試料ブロック
を4℃に維持して、試料隔室の中に入れる試料を保管す
る。アナライザーは、また、シーケンスタスクの一部分
として停電の期間を表示する。 11.履歴ファイルの内容、「実行時間」パラメータ、
および記憶されたPCRプロトコルのパラメータをプリ
ントタスクの一部としてプリントする能力。 下に記載する診断のいくつかのレベルが存在する:一連
のパワーアップ試験は、計器がオンにされる毎に、自動
的に実施される。それらはユーザの介在なしにハードウ
ェアのクリティカル領域を評価する。成分の故障を検出
するテストを再び実行することができる。テストが2回
失敗した場合、エラーのメッセージは表示され、そして
キーボードは電子的にロックされて、ユーザが続けるの
を防止する。
【0169】次の領域を試験する プログラム可能な周辺インタフェース装置 バッテリーRAM装置 バッテリーRAM検査合計 EPROM装置 プログラム可能なインタフェースタイマ装置 クロック/カレンダー装置 プログラム可能な遮断制御装置 アナログ対ディジタルセクション 温度センサー 適切な構成プラグの検証
【0170】一連のサービスオンリー診断は、製造業者
の場所における最後のテスターに、あるいは「隠れた」
キーストロークシーケンス(すなわち、カスタマーに未
知の)によりフィールドサービスエンジニアにとって利
用可能である。試験の多くは、99回まで連続的に実行
することができる以外、診断を開始するときの試験と同
一である。
【0171】次の領域を試験する プログラム可能な周辺インタフェース装置 バッテリーRAM装置 バッテリーRAM検査合計 EPROM装置 プログラム可能なインタフェースタイマ装置 クロック/カレンダー装置 プログラム可能な遮断制御装置 アナログ対ディジタルセクション RS−232セクション ディスプレイセクション キーボード ビーパー 除冷弁 EPROM不一致のチェック ファームウェアのバージョンレベル バッテリーRAM検査合計および初期化 自動開始プログラムフラッグ 較正フラッグのクリア 加熱されたカバーヒータおよび制御回路 端部ヒータおよび制御回路 マニホールドヒータおよび制御回路 中央ヒータおよび制御回路 試料ブロックの熱的カットオフ試験 加熱されたカバーの熱的カットオフ試験
【0172】ユーザの診断を使用して急速な冷却、加熱
ランプの検証、および加熱、冷却システムの広範な検証
を実施することができる。これらの診断により、前回の
実行において生じた事象の順次記録である履歴ファイル
を検査することができる。該記録は、時間、温度、設定
点の数、サイクルの数、プログラムの数および状態のメ
ッセージを包含する。
【0173】遠隔診断により、RS−232ポートを介
して外部のコンピュータからシステムを制御することが
できる。該制御は、サービスの診断と計器の較正のみに
限定される。種々のパラメータ、例えば、ヒータの抵抗
等を決定するための校正を実施する。較正スクリーンに
対するアクセスは、「隠れた」キーシーケンス(すなわ
ち、カスタマーに未知である)により制限定される。次
のパラメータを較正する:構成プラグは、冷却装置と、
試料ブロックヒータと、冷却液ポンプと、適切な電圧、
周波数(100V/50Hz,100/60Hz,120/
60Hz,220/50Hzまたは230/50Hz)の電源
とを再配線するモジュールである。ユーザは、導入した
構成プラグの型を入力する。ファームウェアは、この情
報を使用して試料ブロックのヒータの等価抵抗を演算す
る。パワーアップに際し該システムは、選択された構成
プラグが電流ラインの電圧および周波数と一致している
ことを検証する。
【0174】ヒータの抵抗は、供給されるヒータ電力を
正確に演算できるように、校正プロセスにおいて決定し
なくてはならない。ユーザは6つの試料ブロックヒータ
(2つの主ヒータ、2つのマニホールドヒータおよび2
つの端部ヒータ)の実際の抵抗値を入力する。構成プラ
グは、ヒータを220/230VACオペレーションに
ついて直列に、そして100〜120VACオペレーシ
ョンについて並列に配線する。ファームウェアは、次の
式により3つのヒータの各々の同等の抵抗を演算する: (7)100〜120VACについて:Req=(R1
2 )/R1 +R2 (8)220〜230VACについて:Req=R1 +R
2 等価抵抗を使用して試料ブロックへの正確な加熱電力を
導く(電力=電圧2 ×抵抗)。
【0175】A/D回路の校正は、温度を正確に測定で
きるようにするために必要である。該校正は2つの試験
点の電圧(CPUボード上のTP6およびTP7)を測
定し、そして測定された電圧を入力することによって実
施される。各電圧におけるA/Dの出力は2点の校正曲
線の基礎をなす。これらの電圧は、5ボルトの精密電源
から導かれ、正確であり、そして温度依存性がある。各
実行の開始において、これらの電圧は温度による電子的
ドリフトを測定するシステムにより読まれる。なぜな
ら、A/D出力の変化はアナログチェイン(マルチプレ
クサ、アナログ増幅およびA/Dコンバータ)における
温度依存性を有するからである。4つの温度センサー
(試料ブロック、周囲、冷却液および加熱されたカバ
ー)の校正は、正確な温度測定について実施される。計
器の中へ設置する前に、周囲、冷却液および加熱された
カバーの温度センサーは水浴の中に配置され、ここでそ
れらの出力は記録される(YYYYmVにおけるXX.X
℃)。次いで、これらの値をシステムに入力する。これ
らの領域における温度の精度は重大ではないので、1点
の校正曲線を使用する。
【0176】試料ブロックのセンサーを計器中で校正す
る。15の正確な温度プローブの配列は、好ましい実施
態様において試料ブロックの中に計画的に配置する。温
度プローブの出力を集め、そしてコンピュータにより平
均する。ファームウェアはブロックが40℃となるよう
に指令を出す。短い安定化期間後、15のプローブによ
り測定された温度の平均のブロック温度を入力する。こ
の手順を95℃において反復して2点の校正曲線を形成
する。AC対DCライン電圧のサンプリング回路の校正
は、2点の校正曲線を形成する2つの所定のAC入力電
圧についてのAC対DC回路の出力をシステムに入力す
ることによって実施される。回路の出力は要求される範
囲(90〜260VAC)にわたって非線型であり、し
たがって各端(100,120,220,240VA
C)において2点を必要とするが、電流入力電圧に基づ
いて1セットを使用する。
【0177】AC電圧の正確な測定値は、正確な電力を
試料ブロックへ供給するために必要である(電力=電圧
2 ×抵抗)。導入プログラムは、冷却および加熱システ
ムの広範な試験を実施する診断道具である。導入プログ
ラムの測定値および演算値は、冷却熱伝導係数、10℃
および18℃における除冷熱伝導係数、10℃および2
0℃における冷却電力、試料ブロックの熱容量と、冷却
液の容量、および試料ブロックのセンサー遅れを制御す
る。導入プログラムの目的は以下の3点である。 1.限界の或いは故障の成分を明らかにする。 2.測定された値のいくつかをバッテリーバックアップ
RAMの中に記憶されたシステム定数として使用して、
所定の計器についての制御システムを最適化する。 3.経時的加熱および冷却システムの規模縮小を測定す
る。
【0178】システムを輸送する前に、導入プログラム
を実行すると共に、使用前に、或いは主要な成分が置換
されたときはいつでも実行すべきである。導入プログラ
ムは、また、ユーザの診断の下でユーザにより実行可能
である。ヒータのピング試験により、ヒータが電流ライ
ン電圧に対して適切に構成されることを検証する(すな
わち、90〜132VACについて並列および208〜
264VACについて直列)。ファームウェアは1バー
ストの電力を試料ブロックに供給し、次いで10秒間の
温度上昇をモニターする。温度上昇が特定したランプ速
度のウインドー外にあるならば、ヒータは電流ライン電
圧について不正確に配線されており、導入プロセスは停
止される。
【0179】制御冷却熱伝導係数試験は試料ブロックを
横切る制御冷却パッセージへの熱伝導係数KCCを測定す
る。この試験はまず試料ブロック温度を60℃とし(除
冷弁を閉じる)、次いでブロックを30秒間60℃に維
持するために要求されるヒータ電力を積分する。積分さ
れた電力を前記時間間隔におけるブロック温度と冷却液
温度との間の差の合計で割る。 (9)KCC=Σヒータ電力(60℃)/Σ(ブロック冷
却液温度) 典型的な値は1.40〜1.55ワット/℃である。低
いKCCは内張の閉塞を示す。高いKCCは、完全に閉じて
いない除冷弁、内張の外側への冷却液の漏れ、または内
張が外れているためであることが考えられる。
【0180】ブロックの熱容量(Blk Cp)試験
は、まずブロックを35℃に制御し、次いで最大電力を
ヒータへ20秒間加えることにより、試料ブロックの熱
容量を測定して実施される。試料ブロックの熱容量は、
積分された電力/ブロック温度の差に等しい。精度を増
加するために、バイアス冷却の電力の作用は増加された
電力から減ずる。 (10)ブロックの熱容量=ランプ時間*(ヒータ電力
−制御冷却電力)/Δ温度 ここで、 ランプ時間=20秒、 ヒータ電力=500ワット、 制御冷却電力=(Σブロック温度−冷却液温度)*KCC Δ温度=ブロック温度t=20−ブロック温度t=0 ブロックの熱容量の典型的な値は540ワット秒/℃±
30である。正常のK CC値の場合、ブロックの熱容量の
増加は例えば、フォームのバッキング中の湿気、試料ブ
ロックの回りの絶縁損失、またはヒータ電力の減少等の
熱的負荷の増加のためであり、前記ヒータ電力の減少
は、例えば、6個のヒータゾーンの1つの故障、ヒータ
ゾーンを推進する電子回路の故障、或いは不正確さ、不
正確に配線されている電圧構成モジュール等による。
【0181】冷却テストは、10℃および18℃におけ
るシステム冷却出力(ワット)を測定する。所定の温度
におけるシステム冷却電力または冷却出力は、その温度
における熱的負荷の合計に等しい。主な成分は次の通り
である。1.所定の温度にブロックを維持するために要
求される加熱電力、2.システムの回りに冷却液を循環
させるために使用されるポンプが放散する動力、および
3.冷却液ラインにおける周囲への損失。電力パラメー
タは、冷却液の温度を10℃または18℃に制御し、そ
して32秒間にわたって一定の冷却液温度に維持するた
めに加えられる電力を積分することによって測定させ
る。ブロック温度と冷却液温度との間の差を積分して周
囲温度への損失を演算する。 (11)冷却温度=Σ加熱電力+ポンプ動力+(周囲へ
の熱伝導係数*Σ(ブロックの温度−冷却液の温度)) ここで、 加熱電力=冷却液を10℃または18℃に32秒の時間
にわたって維持するために要求される加熱電力の合計 ポンプ動力=循環ポンプの動力であって12ワット 周囲への熱伝導係数=20ワット/℃ Σ(ブロックの温度−冷却液の温度)=32秒の時間に
わたるブロックおよび冷却液温度の差の合計
【0182】冷却電力のための典型的な値は、10℃に
おいて230ワット±40および18℃において370
ワット±30である。低い冷却電力は、ファン通路の障
害、欠陥のあるファン、または冷却装置の限界、或いは
故障のためである。それは、また、電圧構成プラグの誤
配線であることがある。除冷熱伝導係数(Kc )試験
は、10℃および18℃における試験ブロックを横切る
除冷経路および制御冷却経路への熱伝導係数の測定によ
り実施される。このテストは、まず冷却液温度を10℃
または18℃に制御し、次いで、30秒間所定の温度に
冷却液を維持するために要求される加熱電力をその時間
にわたるブロック温度および冷却液温度の差を積分した
値で除することによって実施される。 (12)除冷熱伝導係数(Kc )=Σ加熱電力/Σ(ブ
ロック温度−冷却液温度) Kc について典型的な値は、10℃において28ワット
/℃±10℃、18℃において31ワット/℃±3℃で
ある。Kc の値が小さいときは、除冷弁が閉じられてい
る場合や閉塞している場合、冷却液管に障害がある場
合、ポンプが小さい場合、あるいは硬水にプレストン
(登録商標)が混合されている場合が考えられる。
【0183】センサー遅れ試験は、まずブロック温度を
35℃に制御し、次いで500ワットのヒータ電力を2
秒間加え、そしてブロックを1℃上昇するために要求さ
れる時間を測定することによって、ブロックセンサー遅
れを測定する。典型的な値は13〜16単位てあり、こ
こで各単位は200ミリ秒に等しい。遅いまたは長いセ
ンサー遅れは、センサーとブロックとの間接触不良、例
えば、熱的グリースの欠如、センサー用に備えられた空
洞の劣った機械加工またはセンサーの故障のためである
ことがある。
【0184】残りの導入試験は一般的に導入プログラム
により実行されるがそれらの診断目的は制限される。と
言うのはそれらは、計算された値であるか、あるいは多
数の変数を有する関数であるため、それらの結果が問題
の根源を正確に決定しない関数であるためである。導入
プログラムは18℃と10℃との間の除冷熱伝導係数の
勾配(Sc )を計算する。それは熱伝導係数曲線の直線
性の測定である。それは、また、0℃における除冷熱伝
導係数を概算するために使用する。典型的な値は0.4
0±0.2である。値の広がりは、それが正に近似値で
あることを証明している。 (13)Sc =(Kc 18゜−Kc 10゜)/(18℃
−10℃) 導入プログラムは、また、冷却熱伝導係数(Kc0)を計
算する。Kc0は0℃における冷却熱伝導係数であり、1
0℃における実際のコンダクタンスから外挿される。典
型的な値は23ワット/℃±5である。使用した式は次
の通りである: (14)Kc0=Kc10゜−(Sc*10℃) 導入プログラムは、また、冷却液熱容量(Cool C
p)を計算し、この冷却液熱容量は、冷却液の全経路
(冷却液、ポンピングライン、熱交換器、および弁)の
熱容量の近似値である。冷却容量は、冷却液の中に熱を
送る成分から冷却液から熱を除去する成分を減じた値に
等しい。これらの成分を測定し、そして計算するために
使用される機械は複雑であり、そしてソースコードの説
明のセクションにおいて詳細に記載する。この測定にお
いて、冷却液は10℃において安定化している。最大ヒ
ータ電力を128秒間試料ブロックに加える。 (15)冷却液の熱容量=加熱源−冷却液源 (16)冷却液の熱容量=加熱電力+ポンプ動力+周囲
への熱伝導係数*(Σ周囲温度−Σ冷却液温度) −ブロックの熱容量*(ブロック温度t=0 −ブロック温
t=128 ) −ブロック温度t=0 とブロック温度t=128 との間の平均
冷却電力
【0185】ヒータピング試験擬似コード:ヒータピン
グ試験は、ヒータが電流ライン電圧のために適切に配線
されていることを検証する。試料ブロックおよび冷却液
を既知で安定な点にする。除冷弁をオンにする。ブロッ
クと冷却液が5℃以下になるのを待つ除冷弁をオフにす
るブロック温度の低下を10秒測定することによって、
制御冷却の冷却効果を測定する。測定を行う前に安定さ
せるために10秒待つ。 wait 10 seconds temp1=block temperature wait 10 seconds temp2=block temperature {tempa}=temp2−temp1 実際に測定したライン電圧を含有する変数{linev
olts}を検査する。190Vより大きいライン電圧
について75ワットで、あるいは140Vより小さい場
合300ワットでヒータをパルスする。 if({linevolts}>190 Volts)then deliver 75 watts to heater else deliver 300 watts to heater 10秒間時間上昇を測定する。この結果は0.01゜/
秒の平均の加熱速度である。 temp1=block temperature wait 10 seconds temp2=block temperature {tempb}=temp2−temp1 制御冷却効果から平均加熱速度{tempb}を減じて
真の加熱速度を計算する。 (17)heat rate={tempb}−{te
mpa} heat rateを評価する。220〜230Vにつ
いて、加熱速度は0.30゜/秒より小さくなければな
らない。100〜120Vについて、加熱速度は0.3
0秒より大きくなければならない。 if(linevoltage=220V and heat rate> 0.30゜/second)then Error−>Heaters wired for 120 Lock up keyboard if(linevoltage=120V and heat rate< 0.30゜/second)then Error−>Heaters wired for 220 Lock up keyboardKCC試験擬似コード :この試験はKCCとしても知られ
ている制御冷却コンダクタンスを測定する。
【0186】KCCを60℃のブロック温度において測定
される。ブロックを60℃に加熱。ブロック温度を60
℃に300秒間維持。試料ブロックのヒータへの印加電
力を30秒間積分。ブロック温度を制御冷却バイアスで
維持するために要求される電力を測定しかつ積分。 {dt sum} =0(デルタ温度の合計) {main pwr sum}=0(主ヒータ電力の合計) {aux pwr sum} =0(補助ヒータの電力の合計) for(count=1 to 30) { {dt sum}={dt sum}+(block temperatu re−coolant temperature) wait 1 sec 主ヒータおよび補助ヒータへの印加電力を積算。実際の
コードはPID制御タスクにあり、200ミリ秒毎に合
計がされる。 {main pwr sum}={main pwr sum}+{auc ual power} {aux pwr sum}={aux pwr sum}+{aux1 actual}+{aux2 actual} } 電力の合計値を温度の合計で割ることによってコンダク
タンスを計算。単位は10mW/℃であることに注意。 (18)KCC=({main pwr sum}+{a
ux pwr sum})/{dt sum}BLOCK CP試験擬似コード :このテストは試料ブ
ロックの熱容量を測定するものである。ブロックを35
℃に加熱。ブロック温度を35℃に5秒間を制御し、そ
して初期温度を記憶。 initial temp=ブロック温度 最大電力をヒータに20秒間通電し、その間ブロック温
度対冷却液温度の差ならびにヒータ電力を合計。 500ワット付与 {dt sum}=0 for(count=1 to 20 seconds) { {dt sum}={dt sum}+(block tempera ture−coolant temperature) wait 1 second } (19)delta temp=block temp
erature−initial temp ランプ制御の間の冷却制御系に基づく冷却電力のジュー
ル熱を算出。 (20)cool joule=control co
oling conductance(KCC)*{dt
sum} 主ヒータおよび冷却制御系からブロックへ加えられる全
ジュール熱を算出。インターバル間での温度変化で割算
することで容量を算出。 (21)Block Cp=ramptime*(he
ater power−cool joule)/de
lta temp ここで:ramptime=20秒 heater power=500ワット
【0187】COOL PWR 10:このテストは
却電力を10度で測定するものである。冷却液温度を1
0℃に制御し、かつ120秒間安定化とせよ。 count=120 do while(count!=0) { if(coolant temperature=10±0.5℃) then count=count−1 else count=120 wait 1 second } この時点において、冷却液は120秒の間10℃に維持
され、安定化が得られた。32秒にわたって、10℃の
冷却液温度を維持するための印加電力を積分。 {cool init} =coolant temperatu re {main pwr sum} =0 {aux pwr sum} =0 {delta temp sum}=0 for(count=1 to 32) { 主ヒータおよび補助ヒータ加えた電力を積算。実際のコ
ードは制御タスクにある。 {main pwr sum}={main pwr sum}+actu al power {aux pwr sum} ={aux pwr sum}+aux1 actual+aux2 actual delta temp sum=delta temp sum+(amb ient temp−coolant t emp) wait 1 second }
【0188】積分間隔の間に冷却液質量に印加されたエ
ネルギーのジュール数を計算。「(coolant t
emp−cool init)」は積分インターバル間
の冷却液温度の変化である。550はジュールで表わし
た冷却液のCpであり、従って積はジュールで表わされ
る。この積は冷却液に添加される余剰の熱を表し、この
余剰の熱が冷却液を積分インターバル間に設定点からド
リフトせしめる。この誤差は冷却電力の計算前に加えら
れた熱の合計から減算される。 (22)cool init=(coolant te
mp−cool init)*550J 主電力の合計を補助ヒータの合計に添加して、32秒間
に失われるジュール熱を得る。32で割って毎秒の平均
ジュール熱を得る。 (23){main pwr sum}=({main
pwr sum}+{aux pwr sum}−c
ool init)/32 すべての冷却電力成分を合計することによって、10℃
における冷却電力を計算する。 (24)Power10℃=main power su
m+PUMP PWR+(K AMB*delta
emp sum) ここで: {main pwr sum}=インターバル間でのヒ
ータ電力の合計 PUMP PWR=12ワット(冷却液の循環用のポン
プ) delta temp sum=summation
of amb−coolant over inter
val K AMB=20ワット/K(冷却系から周囲への熱コ
ンダクタンス)
【0189】KC 10テスト擬似コード:このテスト
は10℃でのランプ制御冷却コンダクタンスを計測する
ものである。冷却液温度を10℃±0.5に制御し、こ
の状態を10秒間安定化。この時点において、冷却液は
設定点をとり、この点に制御される。30秒の時間間隔
にわたって、冷却液温度を10℃に維持するためにヒー
タに加えられている電力を積分。ブロック温度と冷却液
温度との間の差を合計。 主ヒータおよび補助ヒータに加えられる電力を積算。実
際のコードはPID制御タスクにあり。
【0190】 {main pwr sum}={main pwr sum}+aucu al power {aux pwr sum}={aux pwr sum}+aux1 a ctual+aux2 actual {dt sum}={dt sum}+(block temperatu re−coolant temp) wait 1 second } 積算期間にわたってブロックに供給されたエネルギー
(ジュール)を計算する。単位は0.1ワットである。 (25){main pwr sum}={main
pwr sum}+{aux pwr sum} ブロックによる電力合計を冷却液温度の合計で割って、
ランプ制御冷却コンダクタンス(100mW/K)を得
る。 (26)Kc 10={main pwr sum}/
{dt sum}
【0191】COOL PWRテスト擬似コード:この
テストは冷却電力を18℃で測定するものである。試料
ブロックおよび冷却液を既知の安定な点にする。冷却液
温度を18℃に制御し、この状態を128秒間安定に保
つ。 count=128 do while(count!=0) { if(coolant temperature=18℃±0.5)t hen count=count−1 else count=120 wait 1 second } この時点において、冷却液は18℃に120秒間維持さ
れ、安定化された。32秒にわたって、18℃の冷却液
温度を維持するために加えられる電力を積分。 {cool init} =coolant temperatu re {main pwr sum} =0 {aux pwr sum} =0 {delta temp sum}=0 for(count=1 to 32) { 主ヒータおよび補助ヒータ加えられる電力を積算。実際
のコードは制御タスクにある。
【0192】 {main pwr sum}={main pwr sum}+actu al power {aux pwr sum} ={aux pwr sum}+aux1 actual+aux2 actual delta temp sum=delta temp sum+(amb ient temp−coolant temp) wait 1 second } 積分間隔の間に冷却液質量に添加されたエネルギーのジ
ュール数を計算する。「(coolant temp−
cool init)」は積分インターバル間の冷却液
温度の変化である。550は冷却液のCp(ジュール)
であり、従ってこの積はジュールを表わす。この積は冷
却液に添加され余剰の熱を表し、これは冷却液を積分イ
ンターバル間に設定点からドリフトさせる。この誤差は
冷却液電力の計算前に加えられた合計の熱から減算され
る。 (27)cool init=(coolant te
mp−cool init)*550J 主電力の合計を補助ヒータの合計に加算して、32秒で
失われたジュール熱を得る。32で割って毎秒の平均ジ
ュールを得る。 (28){main pwr sum}=({main
pwr sum}+{aux pwr sum}−c
ool init)/32 すべての冷却電力成分を合計することによって、18℃
における冷却電力を計算。 (29)Power18℃=main power su
m+PUMP PWR+(K AMB*delta
emp sum) ここで: {main pwr sum}=インターバルでのヒー
タ電力の合計 PUMP PWR=12ワット、冷却液循環用ポンプ delta temp sum=インターバル間でのa
mb−coolantの合計 K AMB=20ワット/K(冷却系から周囲への熱的
コンダクタンス)
【0193】KC 18テスト擬似コード:このテスト
はランプ冷却コンダクタンスを18℃で測定するもので
ある。冷却液温度を18℃±0.5に制御し、この状態
を10秒間安定とする。この時点において、冷却液は設
定点にあり、この点に制御される。30秒の時間インタ
ーバルにわたって、冷却液温度を18℃に維持するため
にヒータに加えられている電力を積分。ブロック温度と
冷却液温度との間の差を合計。
【0194】主ヒータおよび補助ヒータに加えられる電
力を積算。実際のコードは制御タスクにあり。 {main pwr sum}={main pwr sum}+aucu al power {aux pwr sum}={aux pwr sum}+aux1 a ctual+aux2 actual {dt sum}={dt sum}+(block temperatu re−coolant temp) wait 1 second } 合計期間にわたってブロックに供給されたエネルギー
(ジュール)を計算する。単位は0.1ワットである。 (30){main pwr sum}={main
pwr sum}+{aux pwr sum} 電力合計をブロック温度−冷却液温度の合計で割って、
ランプ制御冷却コンダクタンス(100mW/K)を得
る。 (31)Kc 18={main pwr sum}/
{dt sum}SENLAGテスト擬似コード :このテストは試料ブロ
ックの検出遅れを測定する。
【0195】ブロックを25℃する。±0.2℃内に2
0秒間保持し、次いでブロック温度を記憶。 {tempa}=block temperature 500ワットの電力を試料ブロックに供給。次の2秒間
500ワットの電力を加え、そしてブロック温度を1℃
増加するためのループを取る繰り返しの量をカウントす
る。各ループの繰り返しを200ミリ秒毎に実行し、そ
の結果実際の検出遅れはcount×200ミリ秒に等
しくなる。 secs=0 count=0 do while(TRUE) { if(secs>=2 seconds)then shut heaters off if(block temperature−tempa>1.0℃) then exit while loop count=count+1 } end do while sensor lag=count冷却液CPテスト擬似コード :このテストはシステム全
体の冷却液容量を計算する。冷却液温度を10℃±0.
5に安定化せよ。メッセージをPID制御タスクに送
り、冷却液温度をその現在の値(約10℃)から18℃
にまで直線的に変化させる。冷却液が12℃を横切るの
を待機することで、冷却液のCPの直線傾斜的変化を常
に同一温度で開始させ、傾斜特性の開始を明瞭とさせ
る。初期周囲およびブロック温度に注意。 do with(coolant temperature<12℃) { wait 1 second } {blk delta}=block temperature {h2o delta}=coolant temperature 次の2分間、冷却液温度が18℃にまで直線的に変化す
る間、冷却液温度および周囲温度と冷却液温度との間の
差を合計。 {temp sum}=0 {cool sum}=0 for(count 1 to 128 seconds) { (32){cool sum}=cool temp sum+coolant temperature. (33){temp sum}=ambient−coolant tempe rature wait 1 second count=count+ } 2分の期間にわたる温度変化を計算。 (34){blk delta}=block tem
perature−{blk delta} (35){h2o delta}=coolant t
emperature−{h2o delta} KChill、すなわち、10℃〜20℃の冷却液範囲
にわたる冷却液温度をもつ冷却電力の変化速度を計算す
る。単位はワット/10℃であることに注意。 (36)KChill=(Chiller Pwr @
18℃−Chiller Pwr @ 10℃) ランプ冷却コンダクタンス対18℃と10℃の温度範囲
の勾配であるScを計算する。単位はワット/10℃/
10℃である。 (37)Sc=(Kc 18−Kc810)/8 ランプ冷却コンダクタンスの0℃での外挿値であるKc
0、を計算。 (38)Kc 0=Kc 10−(Sc*10) 冷却液のCpであるCp Coolを次の式により計算
する: (39)Cp Cool=(HEATPOWER*128+PUMP PWR* 128 −Pwr 0℃*128 −Block Cp*blk delta +K AMB*temp sum −KChill*cool temp sum)/h 2o delta} ここで、 HEATPOWER=500W(ブロックを加温し冷却
液を加熱するために印加される電力。熱間隔は128秒
であったので、それに128を掛算する) PUMP PWR=12W(冷却液を循環させるポンプ
の電力×128秒) Pwr 0℃=0℃における冷却電力×128秒、 Block Cp=試料ブロックの熱容量、 blk delta=加熱インターバル間のブロック温
度の変化、 K AMB=20ワット/K(冷却系から周囲への熱的
コンダクタンス)、 temp sum=そのインターバルでの周囲温度−冷
却液温度の1回/秒の合計、 h2o delta=加熱(ほぼ6℃)の間隔にわたる
冷却液温度の変化、 KChill=冷却電力対冷却液温度の勾配、 cool sum=加熱間隔にわたる、冷却液温度、1
回/秒、の合計。実時間オペレーションシステム−CRETIN CRETINは、タスクと呼ぶ他のソフトウェアのモジ
ュールへシステムサービスを提供するスタンドアロン、
マルチタスキングのカーネルである。タスクはInte
l8085アセンブラーの中に書き込まれたある時間ク
リティカル領域をもつ「C」ランゲージで書き込まれ
る。各タスクはプライオリティレベルを有し、そして独
立のファンクションを提供する。CRETINは、スタ
ートアップ診断が首尾よく実行された後の、低い記憶お
よびランにある。CRETINはタスクのスケジューリ
ングを取り扱い、そして一度に1タスク/ランのみを可
能とする。CRETINは、すべてのハードウェアの割
り込みを受けとり、こうして適切な割り込みが受けとら
れたとき、待つタスクを実行させる。CRETINは実
時間クロックを提供して、タスクがタイムド事象を待つ
か、あるいは既知の間隔の間ポーズすることができるよ
うにする。CRETINは、また、メッセージノードの
システムを通るタスク間コミュニケーションのコミュニ
ケーションを提供する。ファームウェアは、下記にプラ
イオリティの順序で以下に簡単に記載する9つのタスク
から構成されている。引き続くセクションは各タスクを
より詳細に記載する。
【0196】1.制御タスク(PID)は試料ブロック
温度を制御する。 2.キーボードタスクはキーパッドからのキーボードの
入力を処理する。 3.タイマのタスクは半分の第2ハードウェアの割り込
みを待ち、次いでウェイクアップメッセージを両者のシ
ーケンスおよびディスプレイタスクに送る。 4.シーケンスのタスクはユーザのプログラムを実行す
る。
【0197】5.ポーズのタスクは、プログラムが実行
されているとき、プログラミングした、キーパッドのポ
ーズを取り扱う。 6.ディスプレイのタスクは実時間で表示を更新する。 7.プリンタのタスクはRS−232のポートのコミュ
ニケーションおよびプリントを取り扱う。
【0198】8.LEDタスクは加熱LEDを推進す
る。それは、また、導入を実行しているとき、冷却液温
度の制御に使用される。 9.リンクのタスクはキーストロークをシュミレーショ
ンすることによってある方法を一緒にリンクされるファ
イルを開始する。ブロック温度制御プログラム(PIDタスク) 比例整数部差分(PID)タスクは、絶対試料ブロック
温度を0.1℃対応に制御しならびに、より多くの加熱
電力をブロックの周辺に加えてガードバンドのへりを通
る損失を補償することによって、試料ブロック温度の不
均一性(TNU、最も熱いウェルの温度−最も冷たいウ
ェルの温度として定義される)を±0.5℃に制御す
る。PIDのタスクは、また、加熱されたカバーの温度
をより少ない精度に制御する。このタスクは5回/秒を
実行し、そして最高のプライオリティを有する。
【0199】試料ブロックへ供給される加熱電力または
冷却電力の量は、記憶装置に記憶されたユーザが特定し
た試料温度、設定点と呼ぶ、及び現時点の計算されたサ
ンプル温度と現在の試料温度の間の差または「誤差」か
ら誘導される。この方式は標準のループ制御の実施を可
能とする。現在の誤差に直接比例するフィルムヒータへ
の電力の寄与、すなわち、比例成分、(設定点の温度−
試料ブロック温度)に加えて、計算した電力トランス
は、また、静止の誤差(設定点の温度−ブロック温度<
0.5℃)に近くなる働きをする整数項を組み込む。こ
の成分は整数成分と呼ぶ。整数項の累積又は「ウィンド
アップ」を回避するために、整数の寄与は設定点の温度
付近の小さいバンドに制限される。比例および整数成分
のゲインは、注意して選択されそしてテストされる。な
ぜなら、ブロックセンサーおよび試料管に関連する時定
数は、システムの位相の余裕をきびしく制限し、よって
ループの不安定性についてのポテンシャルをつくりだす
からである。比例項のゲインは下記の方程式(46)に
おけるPであり、そして整数項のゲインは下記の方程式
(48)におけるKiである。
【0200】PIDタスクは「制御されたオーバーシュ
ートのアルゴリズム」を使用し、ここで試料温度がその
所望の温度に出来るだけ急速に到達するように、ブロッ
ク温度はしばしばその最後の定常状態にオーバーシュー
トする。オーバーシュートのアルゴリズムの使用は、制
御された方法でブロック温度をオーバーシュートさせる
が、試料温度をオーバーシュートさせない。これは電力
を節約し、そしてPCR計器において新しいと信じられ
る。所望のランプ速度を達成するために試料ブロックの
すべてのヒータへ供給される合計の電力は、次の式によ
り与えられる: (40)電力=(CP/rmp rate)+バイアス ここで、 CP=ブロックの熱的質量 バイアス=バイアスまたは制御冷却電力 rmp rate=Tfinal +Tinitial /所望のラン
プ速度 この電力は安全性のために加熱電力500ワットの最大
にクランプされる。
【0201】タスクの繰り返し毎に(200毎に)、シ
ステムは次のアルゴリズムに基づいて加熱またはランプ
冷却電力(必要に応じて)を供給する。制御システムは
計算された試料温度により駆動される。試料温度は、試
料ブロックのウェルの1つ(以後「ブロック」)の中に
配置された薄い壁のプラスチック試料管中の液体の平均
温度として定義される。システム(試料管およびその内
容)の時定数は管の型および体積の関数である。ランの
開始において、ユーザは管の型および反応体積の量を入
力する。システムは生ずる時定数(τまたはtau)を
計算する。マイクロアンプ(登録商標)管および100
μlの反応体積について、タウ(tau)はほぼ9秒で
ある。 (41)Tblk-new =Tblk +Power*(200ms
/CP) (42)Tsamp-new=Tsamp+(Tblk-new −Tsamp
*200ms/tau ここで、 Tblk-new =現在のブロック温度 Tblk =200ミリ秒前のブロック温度 Power=ブロックに供給した電力 CP=ブロックの熱的質量 Tsamp-new=現在の試料温度 Tsamp=200ミリ秒前の試料温度 tau=センサーの遅れについて調節した、試料管の熱
的時間定数(約1.5) エラーの信号または温度は、単に、次に通りである: (43)エラー=設定点−Tsamp-new 閉じたループのシステムとして、正しい作用(加熱また
は冷却電力)は現在のエラーの部分を閉じる。以下の方
程式(45)において、Fは1つの試料期間(200m
s)において閉じるエラー信号のフラクションである。 (44)Tsamp-new=Tsamp+F*(SP−Tsamp) ここで、SP=ユーザの設定点の温度 システムにおける大きい遅れ(長い管の時定数)のため
に、フラクションのFは下にセットされる。式(42)
および(44)を組み合わせると: (45)Tsamp-new=Tsamp+(Tblk-new −Tsamp
*.2/tau=Tsamp+F*(SP−Tsamp) 式(41)および(45)を組み合わせ、そして項P
(比例項のゲイン)を加えて、ブロック温度の振動を制
限し、そしてシステムの安定性を改良すると: (46)Pwr=CP*P/T*((SP−Tsamp)*
F*tau/T+Tsamp−Tblk ) ここで、 P=比例項のゲイン、 T=0.2秒(200ミリ秒)の試料期間、そして P/T=好ましい実施態様において1。 方程式(46)は、ガードバンドなどを通して周囲への
損失なしに、ブロック温度をある所望の温度に動かすた
めに必要な電力(Pwr)を与える、理論的方程式であ
る。
【0202】いったんブロックを駆動するために必要な
電力が方程式(46)により決定されると、この電力は
これらのゾーンの領域によって3つのヒータゾーンの各
々に供給される電力に分割される。次いで、マニホール
ドへの損失が決定され、そしてこれらの損失を補償する
ために十分な大きさを有する電力項はマニホールドのヒ
ータゾーンへ供給すべき電力量へ加えられる。同様に、
ブロックの支持ピン、ブロック温度センサーおよび周囲
への電力損失を補償するために十分な他の電力項は、へ
りヒータゾーンへ供給すべき電力に加えられる。これら
の追加の項およびゾーン領域による電力の分割は、方程
式(46)を前述の方程式(3),(4)および(5)
に変換する。
【0203】方程式(46)は、試料ブロックに対して
要求される加熱または冷却電力を決定するために制御シ
ステムの好ましい実施態様により使用される式である。
計算された試料温度が「整数バンド」、例えば標的温度
(SP)付近の±0.5℃、内にあるとき、比例項のゲ
インは残りのエラーを閉じるためには小さ過ぎる。した
がって、整数項を比例項に加えて、小さいエラーを閉じ
る。整数項は整数項の外側で無能化して、大きいエラー
信号が蓄積するのを防止する。「整数バンド」の内側の
アルゴリズムは、次の通りである: (47)Int sum(new)=Int sum
(old)+(SP−Tsa mp) (48)pwr adj=Ki*Int sum(ne
w) ここで、 Int sum=SPとTSAMP温度との間の試料期間の
合計、 Ki=整数ゲイン(好ましい実施態様において51
2)。 いったん加熱電力が計算されると、制御ソフトウェアは
好ましい実施態様に基づいて図13における3つのフィ
ルムヒータゾーン254,262および256に、電力
を分布させる。へりヒータはブロック温度と周囲温度と
の間の差に基づいて追加の電力を受けとる。同様に、マ
ニホールドのヒータはブロック温度と冷却液温度との間
の差に基づいて追加の電力を受けとる。PID擬似コード システムのパワーアップまたはリセットのとき、 ランプ冷却をオフにする すべてのヒータをオフにする ヒータの抵抗を計算する フェエバー命令(do forever)−200ミリ
秒毎に実行する (ブロック温度>105)の場合、 ヒータをオフにする ランプ弁をオンにする エラーメッセージを表示する ライン電圧(linevolts)を読む 冷却液センサーを読みそして温度{h2otemp}に
変換する 周囲センサーを読みそして温度{ambtemp}に変
換する 加熱されたカバーのセンサーを読みそして温度{cvr
temp}に変換する試料ブロックのセンサーを読みそ
して温度{blktemp}に変換する。コードのこの
部分は、また、温度安定基準電圧を読み、そしてこの電
圧を計器の較正の間に決定された基準電圧と比較する。
不一致が存在する場合、エレクトロニクスはドリフトし
そして温度センサーからの電圧の読みは正確な温度の読
みに従って調整される。試料温度{tubetenth
s}若しくはローパスディジタルフィルターを使用して
表示された獲得温度を計算する。 (49)tubetenths=TTn-1 +(TBn
TTn-1 )*T/tauここで、 TTn-1 =最後の試料温度{tubetenths}、 TBn =現在のブロックセンサー温度{blktent
hs}、 T=試料間隔(秒)=200ミリ秒、 tau=tau管{cf tau}−tauセンサー
{cf lag} 方程式(49)は、上の方程式(6)としてが与えられ
た計算した試料温度を定義する指数のテイラー級数展開
の最初の項を表す。試料ブロックより下のフォームのバ
ッキングの温度、仮想質量として知られている{pha
ntenths}、を計算する。仮想質量の温度を使用
して、仮想質量を出入りする熱の流れを説明するブロッ
クへ供給される電力を調節する。この温度はソフトウェ
アにおいて実施されるローパスディジタルフィルターを
使用して計算される。 (50)phantenths=TTn-1 +(TBn
TTn-1 )*T/tau ここで、 TTn-1 =最後の仮想質量の温度{phantenth
s}、 TBn =現在のブロックセンサー温度{blktent
hs}、 T=試料間隔(秒)=200ミリ秒、 taufoam=フォームブロックのtau=30秒。
【0204】試料温度のエラー(試料温度と設定点温度
との間の差)(abs tube err)を計算する。 ランプ方向{fast ramp}=UP RAMPま
たはDN RAMPを決定する (試料温度が設定点(SP)のERR内にある)場合、 PIDは速い転移モードではない。{fast ram
p}=OFF ここでERR=「整数バンド」、すなわち、標的または
設定点温度を取り囲むエラーバンドの温度の幅。 どれだけ多くの熱がバイアス冷却チャンネルへ損失され
ているかを決定する現在の制御冷却電力{cool
trl}を計算する。
【0205】現在のランプ冷却電力{cool ram
p}を計算する {cool brkpt}を計算する。ここで、{co
ol brkpt}は、冷却液を下向きランプへ制御す
るためにランプから転移する時を決定するために使用す
る冷却電力である。それはブロック温度および冷却液温
度の関数である。制御冷却電力{cool ctrl}
およびランプ冷却電力{cool ramp}のすべて
は、CPUが下向きの温度のランプを制御するために、
すなわち、ランプ冷却のソレノイド作動弁をどれだけ長
く開いて保持するかを計算するために、知らなくてはな
らないファクターである。制御冷却電力は、定数+冷却
温度×ブロックからバイアス冷却チャンネルへの熱的コ
ンダクタンスに等しい。同様に、ランプ冷却電力は、ブ
ロック温度と冷却液温度×ブロックからランプ冷却チャ
ネルへの熱的コンダクタンスとの間の差に等しい。冷却
ブレークポイントは、定数×ブロックと冷却液との間の
温度差に等しい。
【0206】ブロック温度をその現在の温度から所望の
設定点(SP)温度へ動かすために必要な加熱または冷
却電力{int pwr}を計算する。 (51){int pwr}=KP*CP*〔(SP−
SAMP)*{cf kd}+Ts−TBLK 〕 ここで、 KP=比例ゲイン=方程式(46)中のP/T=好まし
い実施態様においてほぼ1、 CP=ブロックの熱的質量、 SP=温度の設定点、 TSAMP=試料温度、 TBLK =ブロック温度、 cf kd=Tau*Kd /delta t、ここでt
auは方程式(49)において使用したのと同一のta
uであり、そしてKd は定数であり、そしてDelta
tは200ミリ秒の試料期間である。 (試料温度が設定点の{cf iband}内にある)
場合、試料エラーを積分する{i sum} さもなければ (52){i sum=0}をクリアする。 整数項電力を計算する。 (53)整数項={i sum}*定数{cf ter
m} 整数項を電力に加える。 (54){int pwr}={int pwr}+整
数項 電力を調節して、仮想質量の作用(フォームのバッキン
グ)により加熱負荷を、まず仮想質量の電力を見いだ
し、次いでそれを電力{int pwr}に加えること
によって補償する。仮想質量の電力{phant pw
r}を、次の式により計算する: (55)phant pwr=C*(blktenth
s−phantenths)/10 ここで、 C=フォームのバッキングの熱的質量(1.0W/
K)。 ヒータ電力を調節する {int pwr}={int pwr}+{phan
pwr} 試料ブロックからそれを通して流れる冷却液を有するマ
ニホールドのへりへの損失を補償するマニホールドのヒ
ータ{aux1 power}において必要な電力を計
算する。システムが下向きのランプである場合、{au
x1 power}=0であることに注意する。マニホ
ールドゾーンの要求される電力を下に記載する: (57){aux1 power}=K1*(TBLK
AMB )+K2*(TBL K −TCOOL)+K5*(dT/
dt) ここで、 K1=係数{cf 1coeff} K2=係数{cf 2coeff} K5=係数{cf 5coeff} dT/dt=ランプ速度 TBLK =ブロック温度、 TAMB =周囲温度、 TCOOL=冷却液温度。
【0207】試料ブロックのへりから周囲への損失を補
償するであろう、へりヒータにおいて必要な電力{au
x2 power}を計算する。下向きランプである場
合、{aux2 power}=0であることに注意す
る。へりゾーンの要求される電力を下に記載する: (58){aux2 power}=K3*(TBLK
AMB )+K4*(TBL K −TCOOL)+K6*(dT/
dt) ここで、 K3=係数{cf 3coeff} K4=係数{cf 4coeff} K6=係数{cf 6coeff} dT/dt=ランプ速度 TBLK =ブロック温度、 TAMB =周囲温度、 TCOOL=冷却液温度。
【0208】マニホールド電力{aux1 powe
r}およびへりヒータ電力{aux2 power}の寄
与を消去して、主ヒータおよびクーラにより供給されな
くてはならない合計の電力を得る。 (59){int pwr}={int power}
−{aux1 power}−{aux2 powe
r} ランプ冷却を加えるべきかどうかを決定する。{coo
brkpt}をランプ冷却から制御冷却へのブレー
クポイントとして使用する。(int pwr<coo
brkptおよび下向きランプを実施して)なら
ば、ブロック温度がランプ冷却で必要とされる設定点温
度より非常に高いかどうかを決めるために、ランプ弁を
オンにする さもなければ ランプ弁をオフにし、そしてバイパス冷却に依存する この時点において、{int pwr}は合計のヒータ
電力を含有し、そして{aux1 power}および
{aux2 power}はブロックからへりへの損失
を含有する。補助ヒータへ供給される電力は、2つの成
分から構成される:aux powerおよびint
power。電力は{int pwr}を主ヒータおよ
び補助ヒータに面積に依存して分配する。
【0209】total pwr=int pwr int pwr=total pwr*66% aux1 power=total pwr*20%+
aux1 power aux2 power=total pwr*14%+
aux2 power 各端ゾーンおよび適当な量の電力をヒータへ送るための
制御ループの繰り返しのための指示を行なうトライアッ
クのためのハーフサイクルの数を計算する。このループ
は1/5秒毎に1回実行し、したがって、60Hzにおい
て120/5=24ハーフサイクルまたは50Hzにおい
て100/5=20ハーフサイクルが存在する。ハーフ
サイクルの数は要求される電力{int pwr}、現
在のライン電圧{linevolts}およびヒータ抵
抗の関数である。正確な必要な電力は各ループに供給さ
れないかもしれないので、残部を計算して{delta
power}最後のループから含まれるもののトラック
を保持する。 (60)int pwr=int pwr+delta
power トライアックをオンに保持する1/2サイクルの数を計
算する。indexはトライアックをオンに保持するた
めのサイクル数に等しい。 (61)index=電力*主ヒータオーム*〔20ま
たは24〕/linevoltsの平方、ここで方程式
(61)は各ヒータゾーンについて1回実施し、そして
主ヒータゾーンについて「電力」=int pwrであ
り、マニホールドのヒータゾーンについてaux1
wrであり、そしてへりのヒータゾーンについてaux
pwrである。供給された実際の電力の量を計算す
る。 (62)actual power=linevolt
sの平方*index/主ヒータ抵抗 次の時に添加すべき残部を計算する。 (63)delta power=int pwr−a
ctual power{aux1 pwr}および
{aux2 pwr}を方程式(60)の中に代入する
ことによって主ヒータについて記載したのと同一の技術
を使用して、へりおよびマニホールドのヒータのための
1/2サイクルの数を計算する。
【0210】主、マニホールドおよびへりのトライアッ
クを制御するカウンターの中に計算したカウントを負荷
する。加熱されたカバーのセンサーを見る。加熱された
カバーが100℃より低いとき、加熱されたカバーのカ
ウンターが50ワットの電力を供給するように負荷す
る。試料温度を見る。それが50℃より高い場合、HO
T LEDをオンにしてユーザがそれに触れないよう警
告する。フォエバーループの終わり。キーボードタスク キーボードタスクの目的は、ユーザがキーパッドのキー
をプレスするのを待ち、キーを現在の状態について有効
なキーストロークのリストと比較し、有効なキーに関連
するコマンド機能を実行し、そして新しい状態に変化す
ることである。無効なキーストロークはビープで指示さ
れ、そして無視される。このタスクはユーザインターフ
ェイスによって駆動される状態の心臓部である。それは
「駆動される状態」である。なぜなら、取られる動作は
ユーザのインタフェースの現在の状態に依存するからで
ある。キーボードタスクの擬似コード キーボードタスクの変数を初期化する。
【0211】カーソルをオフにする。(導入フラッグが
セットされない)場合、導入プログラムを実行する。メ
ッセージをピッド(pid)タスクに送って加熱された
カバーをオンにする。(ユーザがプログラムを実行して
いる間に電力が故障した)場合、電力がオフになる分数
を計算しそして表示する。
【0212】電力故障状態のレコードを履歴ファイルに
書き込む。あるメッセージをシーケンスタスクに送って
4℃のソーキングを開始する。履歴ファイルを概観する
オプションをユーザに与える。(ユーザが履歴ファイル
を概観することを要求する)場合、履歴ファイルのディ
スプレイに行く。
【0213】トップレベルのスクリーンを表示する。 フォエバーの命令 このタスクがキーパッドからのハードウェアの割り込み
を待つシステムにメッセージを送る。この割り込みがレ
シーブされるまで、スリープ(sleep)に行く。起
きたとき、キーパッドからのキーを読み取りそしてデコ
ードする。現在の状態にとって有効なキーのリストを得
る。キーを有効なキーと比較する。(キーがこの状態で
有効である)場合、「アクション」およびこのキーのた
めの次の状態の情報を獲得する。
【0214】この状態のための「アクション」(コマン
ド機能)を実行する。次の状態に行く。さもなければ無
効のキーのためのビーパーをビープする。フォエバール
ープの終わり。タイマタスクのオーバービュー タイマタスクの目的は、1/2秒毎にシーケンスおよび
実時間表示タスクを起動することである。クロック/カ
レンダー装置により発生された1/2秒のハードウェア
の割り込みを受けとる毎に、タイマタスクはシステム
(CRETIN)にその起動を要求する。次いで、タイ
マタスクは引き続いて2ウェイクアップメッセージを、
それぞれ、シーケンスタスクにおよび実時間ディスプレ
イに送る。この中間のタスクは必要である。なぜなら、
CRETINは割り込み当たり1タスクのみをサービス
し、こうしてより高いプライオリティタスク(シーケン
スタスク)のみを実行するからである。タイマタスクの擬似コード フォエバーの命令 クロック/カレンダー装置からハードウェアの割り込み
のために待つメッセージをシステムに送る。
【0215】この割り込みをレシーブするまでスリープ
する。起動(awake)されたとき、メッセージをシ
ーケンスおよび実時間ディスプレイタスクに送る。フォ
エバーループを終わる。シーケンスタスクのオーバービュー シーケンスタスクの目的は、ユーザが定めたプログラム
の内容を実行することである。それはランプおよび保持
セグメントから成る、サイクル中の各設定点を通して順
次にステップし、そして設定点の温度のメッセージをピ
ッドタスクに送り、ピッドタスクは引き続いて試料ブロ
ックの温度を制御する。各セグメントの終わりにおい
て、それは実時間ディスプレイタスクにディスプレイを
スイッチするメッセージおよびセグメントのルーチンの
情報をプリントするメッセージをプリンタタスク
る。ユーザはキーパッド上のPAUSEキーを押して実
行しているプログラムをポーズし、次いでSTARTキ
ーを押してプログラムを再開する。ユーザはSTOPキ
ーを押してプログラムを早期にアボートすることができ
る。このタスクは、タイマタスクによりアウェイクされ
るとき、1/2秒毎に実行する。シーケンスタスクの擬似コード フォエバーの命令 シーケンスタスクの変数を初期化する。
【0216】ユーザがSTARTキーを押すか、あるい
はメニューからSTARTを選択したというキーボード
タスクからのメッセージ、あるいはある方法における次
のプログラムが実行のために準備されたというリンクタ
スクからのメッセージを待つ。このメッセージがレシー
ブさるまでスリープする。アウェイクしたとき、アナ
ログ回路におけるドリフトの原因となるADC較正の読
みを更新する。(4℃の電力故障のソークシーケンスを
開始しない)場合、PEタイトルライ、システム時間
および日付、プログラム構成パラメータ、プログラムの
型およびその数をプリントするメッセージをプリンタ
スクへ送る。(HOLDプログラムを開始する)場合、
{hold tp}に保持する温度を得る。
【0217】{hold time}の間保持する秒数
を得る。(3℃より大きくランピングダウンしそして
{hold tp}>45℃)である場合、中間の設定
点を配置する。最後の設定点{hold time}を
配置する。(保持時間{hold time}をカウン
トダウンする)間、タイマタスクからの1/2秒のウェ
イクアップメッセージを待つ。
【0218】ブロックセンサーを開いていることまたは
ショートについてチェックする。 (キーボードタスクがPAUSEキーを検出した)場
合、現在の試料温度の設定点を配置する。ポーズタスク
をウェイクアップするメッセージを送る。ポーズタスク
によりアウェイクされるまで、スリープする。プリポー
ズ設定点を配置する。(中間の設定点が配置された)場
合、最終の設定点を配置する。(設定点温度が周囲温度
より下でありそして4分より長い間存在する)場合、加
熱されたカバーをオフにすることをピッドタスクに伝え
るフラッグをセットする。1/2秒の保持時間のカウン
ター{store time}を増加する。
【0219】中間の設定点に到達する前に保持時間が経
過した場合、最後の設定点を再び配置する−これは正し
い設定点が履歴ファイルに書き込まれることを保証す
る。データレコードを履歴ファイルに書き込む。HOL
D情報をプリントするメッセージをプリンタタスクに送
る。 HOLDプログラムの終わり そのほかに(CYCLEプログラムを開始する)場合、
計器のランプ時間およびユーザがプログラミングしたラ
ンプおよび保持時間を考慮して、サイクルにおいて合計
の数{sec in run}を加える。サイクルにお
ける秒数プログラム中のサイクル数{num cy
c}を掛けることによって、プログラム中の合計の秒
数を得る。合計の{sec in run}={sec
in run}/サイクル*{num cyc}。
(サイクルの数{num cyc}をカウントダウンす
る)間、設定点の数{num seg}をカウントダウ
ンする)間、ランプ時間{ramp time}を得
る。
【0220】最終の設定点温度{t final}を得
る。保持時間{local time}を得る。ランプ
セグメントの情報を表示するメッセージを実時間ディス
プレイタスクに送る。(ユーザがランプ時間をプログラ
ミングした)場合、プログラミングしたランプ時間と実
際のランプ時間との間のエラー{ramp err}を
次のようにして計算する。この方程式は実験データに基
づく。 {ramp err}=prog ramp rate
*15+0.5(アップランプ) {ramp err}=prog ramp rate
*6+1.0(ダウンランプ) ここで、 prog ramp rate=(abs(Tf
c )−1)/{ramp time} Tf =設定点温度{t final}、 Tc =現在のブロック温度{blktemp}、 abs=式の絶対値。 注:「−1」は設定点の1℃以内でクロックが開始する
ので存在する。 新しいramp time=古い{ramp tim
e}−{ramp err} (新しいramp time>古い{ramp tim
e})である場合、新しいramp time=古い
{ramp time} そのほかに新しいramp time=0。 (試料温度がユーザの構成した設定点の温度{cf
lk dev}内にない)間、タイマタスクからの1/
2秒のウェイクアップを待つ。
【0221】新しいランプ設定点を毎秒配置する。その
ほかに(3℃より大きいランピングダウンおよび{t
final}>45℃)の場合、中間の設定点を配置す
る。(試料温度がユーザが構成した設定点の温度{cf
clk dev}内にない)間、タイマタスクからの
1/2秒のウェイクアップメッセージを待つ。1/2秒
のランプ時間のカウンターを増加する。ブロックセンサ
オープンまたはショートをチェックする。(キーボ
ドタスクがPAUSEキーを検出した)場合、現在の
試料温度の設定点を配置する。ポーズタスクをウェイク
アップするメッセージを送る。
【0222】ポーズタスクによりアウェイクされるま
で、スリープする。ポーズ前の設定点を配置する。最終
の設定点を配置する。(試料温度がユーザが構成した設
定点の温度{cf clk dev}内にない)間、
イマタスクからの1/2秒のウェイクアップメッセージ
を待つ。1/2秒のランプ時間のカウンターを増加す
る。ブロックセンサーオープンまたはショートをチェ
ックする。(キーボードタスクがPAUSEキーを検出
した)場合、現在の試料温度の設定点を配置する。ポー
ズタスクをウェイクアップするメッセージを送る。
【0223】ポーズタスクによりアウェイクされるま
で、スリープする。ポーズ前の設定点を配置する。ラン
プの情報をプリントするメッセージをプリンタタスクに
送る。ランプセグメントの信号の終わりに対してビーパ
ーをビープする。ランプセグメントの情報を表示するメ
ッセージを実時間ディスプレイタスクに送る。(保持時
間をカウントダウンする)間、タイマタスクからの1/
2秒のウェイクアップメッセージを待つ。1/2秒の
時間のカウンターを増加する。ブロックセンサー
ープンまたはショートをチェックする。(キーボードタ
スクがPAUSEキーを検出した)場合、現在の試料
の設定点を配置する。
【0224】ポーズタスクをウェイクアップするメッセ
ージを送る。ポーズタスクによりアウェイクされるま
で、スリープする。ポーズ前の設定点を配置する。デー
タのレコードを履歴ファイルに書き込む。保持の情報を
プリントするメッセージをプリンタタスクに送る。(最
終の設定点温度がユーザの構成可能な{cf tem
dev}より大きい)場合、エラーのレコードを履
歴ファイルに書き込む。プログラムされたポーズをチェ
ックする。次のセグメントに行く。サイクルのメッセー
ジの終わりをプリントするメッセージをプリンタタスク
に送る。
【0225】次のサイクルに行く。CYCLEのプログ
ラムの終わり。そのほかに(AUTO−CYCLEプロ
グラムを開始する)場合、計器のランプ時間とプログラ
ム可能な量の各サイクルにより自動的に増加または減少
することができるユーザがプログラミングした保持時間
とを考慮して、各プログラムの中に合計の秒数{sec
in run}を加える。(サイクルの数{num
cyc}をカウントダウンする)間、(設定点の数
{num seg}をカウントダウンする)間、最終の
設定点温度{t final}を得る。保持時間{ti
me hold}を得る。ユーザが設定点温度および/
または保持時間の自動的増加または減少をプログラミン
グしたかどうかをチェックし、そしてそれに応じてそれ
らを調節する。
【0226】温度の自動的増加または減少が設定点を0
℃以下または99.9℃以上にする)場合、エラーのレ
コードを履歴ファイルに書き込む。設定点は0℃または
99.9℃でキャップ(cap)される。ランプセグメ
ントの情報を表示するメッセージを実時間ディスプレイ
タスクに送る。(3℃より大きいランピングダウンおよ
び{t final}>45℃)の場合、中間の設定点
を配置する。(試料温度がユーザが構成した設定点の温
度{cf clk dev}内にない)間、タイマタス
クからの1/2秒のウェイクアップメッセージを待つ。
1/2秒のランプ時間のカウンターを増加する。
【0227】ブロックセンサーオープンまたはショー
トをチェックする。(キーボードタスクがPAUSEキ
ーを検出した)場合、現在の試料温度の設定点を配置す
る。ポーズタスクをウェイクアップするメッセージを送
る。ポーズタスクによりアウェイクされるまで、スリー
プする。ポーズ前の設定点を配置する。最終の設定点を
配置する。(試料温度がユーザが構成した設定点の温度
{cf clk dev}内にない)間、タイマタスク
からの1/2秒のウェイクアップメッセージを待つ。1
/2秒のランプ時間のカウンターを増加する。
【0228】ブロックセンサーオープンまたはショー
トをチェックする。(キーボードタスクがPAUSEキ
ーを検出した)場合、現在の試料温度の設定点を配置す
る。ポーズタスクをウェイクアップするメッセージを送
る。ポーズタスクによりアウェイクされるまで、スリー
プする。ポーズ前の設定点を配置する。ランプセグメン
情報をプリントするメッセージをプリンタタスクに送
る。グメントのランプ部分の信号の終わりに対してビ
ーパーをビープする。保持セグメントの情報を表示する
メッセージを実時間ディスプレイタスクに送る。
【0229】(保持時間をカウントダウンする)間、タ
イマタスクからの1/2秒のウェイクアップメッセージ
を待つ。1/2秒の保持時間のカウンターを増加する。
ブロックセンサーオープンまたはショートをチェック
する。(キーボードタスクがPAUSEキーを検出し
た)場合、現在の試料温度の設定点を配置する。ポーズ
タスクをウェイクアップするメッセージを送る。ポーズ
タスクによりアウェイクされるまで、スリープする。ポ
ーズ前の設定点を配置する。データのレコードを履歴フ
ァイルに書き込む。保持の情報をプリントするメッセー
ジをプリンタタスクに送る。
【0230】(最終の設定点温度がユーザの構成可能な
{cf temp dev}より大きい)場合、エラ
ーのレコードを履歴ファイルに書き込のセグメン
トに行く。サイクルのメッセージの終わりをプリントす
るメッセージをプリンタタスクに送る。次のサイクルに
行く。AUTO−CYCLEのプログラムの終わり。そ
のほかに(POWER FAILUREシーケンスを開
始する)場合、4℃の設定点を配置する。
【0231】ピッドタスクが加熱されたカバーをシャッ
トオフするように、フラッグ{subamb hol
d}をセットする。フォエバーを命令する。タイマタス
クからの1/2秒のウェイクアップメッセージを待つ。
1/2秒の保持時間を増加する。フォエバーループを終
わる。電力故障シーケンスの終わり。履歴ファイルに実
行終わりの状態のレコードを書き込む。
【0232】(方法を実行している)場合、リンクタス
クが次のプログラムの実行を開始するメッセージをシー
ケンスタスクを送ることを知るように、フラッグ{we
ird flag}をセットするそのほかにユーザのイ
ンタフェースをアイドル状態の表示に戻す。フォエバー
ループの終わり。ポーズタスクのオーバービュー ポーズタスクの目的は、ユーザがCYCLEプログラム
の中にプログラミングするポーズあるいはユーザがキー
パッド上のPAUSEキーを押すときのポーズを取り扱
うことである。
【0233】CYCLEプログラムを実行する間シーケ
ンスタスクがプログラミングしたタスクに直面すると
き、シーケンスタスクはスリープに行きまたポーズタス
クをアウェイクする。ポーズタスクは、引き続いて、ユ
ーザがポーズするように要求した時間を連続的に表示
ディクリメントするメッセージを実時間ディスプレイタ
スクに送る。ポーズタイマがタイムアウトするとき、ポ
ーズタスクはシーケンスタスクをアウェイクするメッセ
ージを送り、次いでスリープへ行く。ユーザはキッパッ
ド上のSTARTキーを押すことによってプログラムを
早期に再開することができるが、あるいはSTOPキー
を押すことによってプログラムを早期にアボートするこ
とができる。
【0234】プログラムが実行されている間キーボード
タスクがPAUSEキーを検出したとき、それはフラッ
グ{pause flag}をセットし、次いでシーケ
ンスタスクがそれを肯定するのを待つ。シーケンスタス
クはこのフラッグのセットを見るとき、それは肯定応答
メッセージをキーボードタスクに送り戻し、次いでそれ
自体スリープする。キーボードタスクがこのメッセージ
を受けとるとき、それはポーズタスクをアウェイク(起
動)する。ポーズタスクはプログラムがポーズする時間
の量を連続的にディスプレイしかつ増加するメッセージ
を実時間ディスプレイタスクに送る。タイマは、構成の
セクションにおいてユーザがセットしたポーズ時間の限
界に到達するときタイムアウトする。ユーザは、キー
パッド上のSTARTキーを押すことによってプログラ
ムを再開するか、あるいはSTOPを押すことによって
プログラムをアボートすることができる。ポーズタスクの擬似コード フォエバーを命令する キーパッドのポーズを示すキーボードタスクからのメッ
セージ、あるいはユーザのプログラミングしたポーズを
示すシーケンスタスクからのメッセージを待つ。
【0235】メッセージが受けとられるまでスリープす
る。アウェイクしたとき、示したポーズの型についての
フラッグをチェックする。(それがプログラミングした
ポーズである)場合、ポーズタイマがカウントアップす
を表示するメッセージを実時間ディスプレイタスク
に送る。そのほかにポーズタイマがカウントダウンする
を表示するメッセージを実時間ディスプレイタスクに
送る。(タイムアウトカウンターをカウントダウンす
る)間、このタスクを1/2秒間持続するメッセージを
システムに送る。ポーズの情報をプリントするメッセー
ジをプリンタタスクに送る。(それはプログラミングし
たポーズである)場合、ポーズはタイムアウトされてい
るので、シーケンスタスクをウェイクアップするメッセ
ージを送る。
【0236】ポーズの表示を中止するメッセージを実時
間ディスプレイタスクに送る。実行するプログラムの表
示を再開するメッセージを実時間ディスプレイタスクに
送る。そのほかに(それがキーパッドのポーズである)
場合、ポーズはタイムアウトされており、そしてプログ
ラムはアボートされなくてはならないので、シーケンス
タスクを中止するメッセージをシステムに送りそしてそ
れをそのFOEVERループのトップに送り戻
【0237】(プログラムの実行がHOLDプログラム
であった)場合、保持情報をプリントするメッセージを
プリンタタスクに送る。状態のレコードを履歴ファイル
に書き込む。ユーザのインタフェースをそのアイドル状
態に戻す。アボートのメッセージを表示する。フォエバ
ーのループの終わり。ディスプレイタスクのオーバービュー 実時間ディスプレイタスクの目的は、温度、タイマ、セ
ンサーの読み、ADCチャンネルの読み、および1/2
秒毎に規則的に更新することが必要である他のパラメー
ターを表示することである。ディスプレイタスクの擬似コード :ディスプレイタスク
の変数を初期化する。フォエバーを命令する1/2秒毎
にタイマタスクからのメッセージを待つ。
【0238】メッセージが受けとられるまでスリープす
る。アウェイクしたとき、他のタスクがディスプレイの
パラメーターのリストまたは現在の更新を中止するフラ
ッグを送ったかどうかをチェックする。1/2秒のフラ
ッグ{half sec}をトグルする。(ディスプレ
イのパラメーターのリストが存在する)場合、誰もがデ
ィスプレイを更新しないように信号をセットする。カー
ソルをオフにする。(パラメーターのリストを通してス
テップする)間、(それが時間のパラメーターである)
場合、時間をディスプレイする。(1/2秒のフラッグ
{half sec}がセットされる)場合、時間変数
を増加または減少する。
【0239】そのほかに(それが小数である)場合、小
数を表示する。そのほかに(それが整数である)場合、
整数を表示する。そのほかに(それがADCチャンネル
のリードアウトである)場合、ADCチャンネルからの
カウントを読む。(それをmVと表示することが必要であ
る)場合、カウントをmVに変換する。その値を表示す
る。そのほかに(それが電力のディスプレイである)場
合、電力をワットで表示する。
【0240】そのほかに(それが残った時間のパラメー
ターである)場合、秒を時間の1/10に変換する。残
った時間を1/10時間で表示する。(1/2秒のフラ
ッグ{half sec}をセットする)場合、秒の変
数を減少する。
【0241】(カーソルがオンであった)場合、それを
オンにし戻す。現在のシステム時間をバッテリーRAM
に記憶する。信号をクリアしてディスプレイを解放す
る。フォエバーのループの終わり。プリンタタスクのオーバービュー プリンタタスクの目的は、実行時間のプリントを取り扱
うことである。それは低いプライオリティのタスクであ
り、そして他の時間的にクリティカルであるタスクを干
渉してはならない。プリンタタスクの擬似コード フォエバーの命令 プリントを望むメッセージを他のタスクから待つ。
【0242】メッセージを受けとるまでスリープする。
アウェイク(起動)したとき、広域変数の局所的なコピ
をプリントする。プリンタの肯定メッセージを配置す
る。(状態またはエラーのメッセージをプリントするこ
とが必要である)場合、現在の履歴レコードの中に含ま
れている情報をプリントする。そのほかに(ページヘッ
ダをプリントすることが必要である)場合、プログラム
の型およびその数をプリントする。そのほかに(プログ
ラムの構成パラメーターをプリントすることが必要であ
る)場合、クロックを開始する設定点からの管の型、反
体積および試料温度の誘導をプリントする。
【0243】そのほかに(サイクルの情報の終わりをプ
リントすることが必要である)場合、終わりの時間およ
び温度をプリントする。そのほかに(セグメントの情報
をプリントすることが必要である)場合、ランプまたは
保持セグメントの情報をプリントする。
【0244】そのほかに(ポーズの状態のメッセージを
プリントすることが必要である)場合、ポーズした時間
および温度をプリントする。フォエバーのループの終わ
り。LEDタスクのオーバービュー LEDタスクの目的は、「加熱」LEDの照明が主ヒー
タに加えた電力を反映するようにさせることである。こ
れは毎秒1回行する低いプライオリティのタスクであ
LEDタスクの擬似コード :LEDタスクの変数を初期
化する。 フォエバーの命令 このタスクを毎秒ウェイクするメッセージをシステムに
送る。
【0245】スリープする。アウェイクしたとき、次の
ようにして主ヒータに加えた電力を反映する値をPIC
タイマAのカウンター2に負荷する: カウンターに値={K htled}*{ht le
d}を負荷する ここで、{K htled}は加熱LEDをパルスする
時間を計算するための定数であり、そして15200/
500に等しい。15200は14.4KHz のPICの
クロックよりわずかに大きく、そしてこれはLEDを絶
えずオンに保持するためにタイマに負荷する値である。
500は主ヒータの電力である。
【0246】{ht led}は0〜500の値であ
り、そして主ヒータに加えたワットに等しくなる。 フォエバーのループの終わりリンクタスクのオーバービュー リンクタスクの目的は、キーパッド上のSTARTキー
を押すユーザをシミュレーションすることである。ユー
ザの介在なしに1つずつ(方法におけるように)プログ
ラムを実行できるように、このタスクは必要である。リ
ンクタスクはシーケンスタスクをウェイクアップし、そ
してSTARTキーが押されたように、それは次のプロ
グラムを実行を開始する。リンクタスクの擬似コード :リンクタスクの変数を初期
化する。 フォエバーの命令 (フラッグ{weird flag}セットされ、そ
してそれがその方法における初めての報告ではない)場
合、ウェイクアップのメッセージをシーケンスタスクに
送る。フォエバーのループの終わり。スタートアップシーケンス パワーアップシーケンス 計器への電力がオンにされるか、あるいはソフトウェア
がRESETを命令するとき、次のシーケンスが起こ
る。注:以下の数はフローチャート上の数である(図5
4〜図57参照)。
【0247】1.RS−232プリンタポートの中から
外にCtrl−G(10進法の7)の文字を転送する。
RS−232ポートを少なくとも1秒間ポーリングしそ
してCtrl−Gがレシーブされる場合、外部のコンピ
ュータをポートに取り付け、そしてパワーアップシーケ
ンスの間のすべてのコミュニケーションをキーパッドか
らRS−232ポートに再び向けると仮定する。Ctr
l−Gがレシーブされない場合、パワーアップシーケン
スは正常として続する。 2.MOREキーが押されたかどうかをチェックする。
押された場合、サービスオンリーのハードウェアの診断
直行する。 3.次の3テストはオーディオ/ビジュアルチェックで
あり、そしてエラーをレポートすることができない:
1)ビーパーはビープする、2)キーボード上の熱い、
冷却、および加熱LEDはフラッシュする、3)ディス
プレイの各絵素は輝く。著者権および計器のIDスクリ
ーンは、パワーアップ診断実行されるとき表示され
る。
【0248】4.パワーアップ診断の1つにおいてエラ
ーが起こると、破壊した成分の名前は表示され、そして
サービスオンリーのハードウェアの診断へのアクセスを
獲得するコード「MORE999」を除外して、キーパ
ッドはロックされる。 5.PPI−B装置のチャンネル0をチェックして、自
動化テストビットがローであるかどうかを見る。そうで
ある場合、UARTテストを実行する。テストがパスす
る場合、ビーパーを連続的にビープする。 6.CRETINオペレーティングシステムをスタート
し、このシステムは引き続いてプライオリティレベルに
より各タスクをスタートする。 7.バッテリーRAM中のフラッグをチェックして、計
器が較正されたかどうかを見る。そうでない場合、エラ
ーメッセージを表示し、そしてサービスオンリーの較正
テストへのアクセスを獲得するコード「MORE99
9」を除外して、キーパッドをロックする。
【0249】8.電圧およびラインの周波数を測定する
テストを実行し、そして計器を較正している間選択した
構成プラグと両者のこれらの値が合致するかどうかを見
る。合致しない場合、エラーメッセージを表示し、そし
てサービスオンリーの較正テストへのアクセスを獲得す
るコード「MORE999」を除外して、キーパッドを
ロックする。 9.導入セクションにおいて記載したようにヒータピン
グテストを実施する。ヒータ誤って配線されている場
合、エラーメッセージを表示し、そしてサービスオンリ
ーの較正テストへのアクセスを獲得するコード「MOR
E999」を除外して、キーパッドをロックする。 10.バッテリーRAM中のフラッグをチェックして、
計器が導入されたかどうかを見る。そうでない場合、エ
ラーメッセージを表示し、そして導入ルーチンへのアク
セスを獲得するコード「MORE999」を除外して、
キーパッドをロックする。
【0250】11.遠隔モードでない場合、バッテリー
RAM中のフラッグをチェックして、計器が実行されて
いる間に電力の故障が存在したかどうかを見る。そうで
ある場合、4℃のソークを開始しそして電力がオフにな
っていた時間の量を表示する。電力が消耗したとき、ど
れだけ長く実行されたかを正確に告げる履歴ファイルを
見たいかどうかをユーザに質問する。ユーザがyesを
選択する場合、ユーザの診断に直接行く。 12.ビーパーをビープし、そして遠隔モードフラッグ
をクリアし、こうしてすべてのコミュニケーションはこ
こでキーパッドを通して戻される。 13.バッテリーRAMをチェックして、自動的に開始
されたテストプログラムを製作が欲するかどうかをみ
る。そうである場合、プログラムの実行を開始し、そし
てそれが実施されたのち計器をリセットする。
【0251】14.トップレベルのユーザのインタフェ
ースのスクリーンをディスプレイする。 図51を参照すると、商標MAXIAMPで市販されて
いる大きい体積の薄い壁の反応管の断面図である。この
は、PCR反応に有用であり、ここで合計の体積を2
00μlより大きくする反応混合物に、試薬または他の
物質を添加することが必要である。図51に示されてい
るより大きい管は、Himont PD701ポリプロ
ピレンまたはValtec HH−444ポリプロピレ
ンから作られており、そして試料ブロックと接触する薄
い壁を有する。選択した材料は何であっても、DNAお
よびPCR反応混合物の他の成分と適合性がなければな
らず、例えば、標的DNAを壁に粘着させることによっ
て処理するPCR反応を障害せずそして複製しないよう
にする。ガラスは一般にすぐれた選択物ではない。なぜ
なら、DNAはガラス管の壁に粘着することが知られて
いるからである。図51中の寸法Aは典型的には0.0
12±0.001インチ(0.30±0.03mm)であ
り、そして管の縦軸に関する壁の角度は典型的には17
゜である。17゜壁の角度の利点は、下向きの力が試
料ブロックとすぐれた熱的接触を誘発する間、管は試料
ウェル中で閉塞しないということである。薄い壁の利点
は、それが試料ブロックの温度変化と反応混合物の温度
の対応する変化との間の遅延を最小にすることである。
これが意味するように、ユーザが変性セグメントにおい
て反応混合物を94℃の1℃内に5秒間止まらせ、そし
てこれらのパラメーターでプログラミングしようとする
場合ユーザは5秒の変性間隔を獲得し、ここで時間遅れ
はより厚い壁をもつ普通の管を使用する場合より少な
い。短いソーク間隔、例えば、5秒のソーク間隔をプロ
グラミングし、そして正確にプログラミングした時間の
間プログラミングした温度におけるソークを獲得するこ
とができるという、この性能特性は、計算した試料温度
を使用してタイマを制御することによって可能である。
ここに記載するシステムにおいて、計算した試料温度が
プログラミングしたソーク温度に到達するまで、インキ
ュベーションまたはソークの間隔を計時するタイマはス
タートしない。
【0252】さらに、薄い壁の試料壁を使用するとき、
試料混合物が標的温度の1℃内にするのに、この試料管
は先行技術の厚い壁のマイクロ遠心器と比較して、約1
/2〜2/3の時間を要するのみであり、そしてこれは
図51に示す背の高いMAXIAMP登録商標管お
よび図15に示すそれより小さい薄い壁のMICROA
MP登録商標管の両者について言える
【0253】MAXIAMP管およびMICROAMP
の壁厚さは、適切な構造の強さと一致するできるだけ薄
ものとなるように製作プロセスにおいて緊密に制御さ
れる。典型的には、ポリプロピレンについて、これはど
こでも0.009〜0.012インチ(0.23〜0.
30mm)である。新しくてポリプロピレンより強いより
特殊な材料を使用してPCR反応速度を大きくするとい
う利点を達成すれば、適切な強さが維持されてすぐれた
熱的接続を保証する下向きの力および通常の使用の他の
ストレスに耐える限り、壁厚さはなお薄くることがで
きる。1.12インチ(28.4mm)の高さ(図51に
おいて寸法B)および0.780インチ(19.8mm)
の寸法Cおよび0.395インチ(10.0mm)の上
断面の壁厚さ(Dの寸法)では、MAXIAMP管の
数はほぼ14秒であるが、これは充填時間のように正
確に測定されなかった。図15に示すより短い管のため
のMICROAMP管の時定数は、典型的には、0.0
09インチ±0.001インチ(0.23±0.03m
m)の円錐形断面における管壁厚さで、ほぼ9.5秒で
ある。
【0254】図52はより薄い壁のMICROAMP管
の使用の結果を示す。標的温度の同様な速度増加の達成
は薄い壁のMAXIAMP管の使用から生ずるであろ
う。図52を参照すると、MICROAMP管中の計算
した試料温度についての相対的インキュベーション温度
付72℃の出発温度から94℃の標的変性温度の1℃内
の温度に到達するための先行技術管についての時間のグ
ラフが示されている。図52において、100μlの試
料が各管の中に存在した。開いた箱によりマークされた
データ点をもつ曲線は、9.5秒の応答時間および0.
009インチ(0.23mm)の壁厚さをもつMICRO
AMP管についての計算した試料温度応答である。×に
よりマークされたデータ点をもつ曲線は、先行技術の
0.030インチ(0.76mm)の壁厚さをもつ厚い壁
のマイクロ遠心器管中の100μlの試料について計算
した試料温度を表す。このグラフが示すように、薄い壁
のMICROAMP管はほぼ36秒以内で94℃の標的
ソーク温度の1℃内の計算した温度に到達するが、先行
技術管は約73秒を要する。これは重要である。なぜ
なら、ソーク温度に実質的に到達するまで、タイマをス
タートさせない計器において、先行技術の管は、ことに
各PCRサイクルが少なくとも2つのランプおよびソー
クを有し、そして一般に実施する非常に多数のサイクル
が存在するという事実に照らして考慮したとき、全体の
処理時間を実質的に増加することがあるからである。実
際の試料温度に無関係にブロック/浴/炉温度に基づい
てそれらの時間をスタートするシステムにおいて、ブロ
ック/浴/炉温度の変化と試料混合物の温度変化との間
のこれらの長い遅延は重大なマイナスの結果を有するこ
とがある。問題は、反応混合物がソークのためにプログ
ラミングした温度に実際にある時間に長い遅延が干渉
きることである。最近のPCRプロセスにおいて普通で
あるように非常に短いソークについて、加熱/冷却シス
テムをスタートして反応混合物の温度を変化させようと
する前に、反応混合物はプログラミングしたソーク温度
に決して到達することができない。
【0255】図51は、プラスチックウェブ652によ
りMAXIAMP試料管に接続されたポリプロピレンの
キャップ650を示す。キャップの外径Eおよび管の上
部断面の内径は0.002インチ(0.05mm)およ
び0.005インチ(0.13mm)の間の締め嵌めのた
めの大きさである。管の内側表面654は、ばり、切り
目および引っ掻き傷が存在せず、こうしてキャップとの
緊密なシールを形成できるようにすべきである。図53
は、管651、キャップ650およびウェブ652の平
面図を示す。肩656はキャップが管の中に深く押し込
まれるのを防止し、そして加熱された定盤と接触させる
ため試料管の上部へりより上キャップ十分
出るのを可能とする。これは、また、十分な管の変形を
可能とし、こうして図15における最小の許容されうる
力Fはキャップの変形により加えることができる。
【0256】好ましい実施態様において、管およびキャ
ップは、15分までの間126℃までの温度でオートク
レーブ処理可能であるHimont PD701ポリプ
ロピレンから作られる。これにより、この使い捨て管を
使用前に滅菌することができる。キャップは加熱された
定盤をもつ機械の中使用するとき永久的に変形するの
で、管はただ1回の使用のために設計される。MICR
OAMP管のためのキャップは8または12キャップの
接続へりストリップで入手可能であり、各キャップは番
号を付されているか、あるいは個々のキャップに分割さ
れている。キャップの単一の列を使用することができそ
して列は必要に応じた小さい数に容易に短くすることが
できるか、あるいは個々のキャップをストリップから切
り取ることができる。MAXIAMP管のためのキャッ
プは図5に示されているように取り付けられるか、あ
るいは分離された個々のキャップである。
【0257】MICROAMP管上の混合を可能とする
ポス−PCR試薬の添加のための最体積は、200
μlでありMAXIAMP管について500μlまでで
ある。温度の限界は−70℃〜126℃である。応答時
間は試料の体積に依存する。ブロックが急激に温度を変
化させたとき、応答は新しい温度の37%以内に試料が
なる時間として測定される。典型的な応答時間は、50
μlの充填について7.0秒であり、そして20μlの
充填について5.0秒である。付録A ユーザのインタフェース ユーザのインタフェースのGeneAmpのPCRシス
テム9600の目的は、PCRを実施するプログラムを
開発しそして実行することである。
【0258】入手可能な下記の3つの型のプログラムが
存在する。1つ目のホールド(HOLD)プログラム
は、セットした量の時間に対して保持されるか、あるい
は無限量の時間に対して保持されそしてSTOPキーに
より停止される単一の設定点から成る。2つ目のサイク
ル(CYCLE)プログラムは、時間設定がなされたラ
ンプ応答およびプログラム可能なポーズ(休止)の特徴
を付加する。このプログラムは9までの設定点および9
9までのサイクルを可能とする。3つ目のオート(AU
TO)プログラムにより、ユーザは設定点の時間および
/または温度をサイクル毎に固定した量で増加または減
少させることができる。このプログラムは、また、9ま
での設定点および99までのサイクルを可能とする。方
法(METHOD)プログラムは、上記のホールド、サ
イクルまたはオートプログラム17まで一緒にリンクす
る方法を提供する。合計150のプログラムを1〜15
0の範囲の数で記憶することができる。プログラムをつ
くり、記憶し、保護し、プリントし、または消去するこ
とができる。記憶されたプログラムのディレクトリを見
るか、あるいはプリントすることができる。
【0259】
【表1】
【0260】RUN:プログラムのディスプレイからプ
ログラムの実行を開始するか、あるいはプログラミング
による休止またはキーパッド操作による休止を再スター
トする。 MORE:ランタイムのディスプレイをトグルしそし
て、また、サービスオンリーファンクションをアクセス
する(コード999が後に続く場合)。 BACK:同一のスクリーン内の前のフィールドに動か
す。現在のフィールドが第1フィールドに位置している
場合、そのフィールドは前のスクリーンに移動する。
【0261】STEP:次のスクリーン中の第1フィー
ルドに向かって下方に移動する。 PAUSE:マニュアル割り込みのためにポーズ(休
止)したタイムアウトをスタートする。 OPTION:メニューの項目を捜しながらカーソルを
左から右に動かす(一番左のオプションに戻る)か、あ
るいはYES/NOの応答をトグルする。
【0262】STOP:実行しているプログラムを打ち
切るか、あるいはユーザのインタフェースにおいて1レ
ベル上に動かす。 CE:無効の数値入力をクリアする。 ENTER:現在の数値入力を受け取り、メニューの項
目を受け取り、YES/NOの応答を受け取るか、ある
いはディスプレイの次のフィールドにスキップする。数
値入力がディスプレイの最後である場合、ENTERに
より次のディスプレイにステップする。一般のシステム9600のディスプレイ
【0263】
【表2】
【0264】 Prog HOLD,CYCL(CYCLEの略),AUTOまたはNETH( METHODの略) ### プログラム#(1〜150)、またはそれがまだ記憶されていない場 合は??? Msg Done,Error,Abortまたはブランク Temp 現在の試料温度 Menu 入手可能なオプション
【0265】
【表3】
【0266】 Action 「xx.x℃において保持」または「xx.x℃にランプ応 答」 Temp 現在の試料温度 Timer 保持またはランプ応答時間をカウントダウンするか、あるい はFOREVERの保持時間までカウントアップする Prog/Cyc HOLDフィルムに対して「Prog xxx」CYCLま たはAUTOファイルに対して「Cycle xx」−カウ ントアップ
【0267】
【表4】
【0268】 Setpt 現在の設定点#(1〜9)−カウントアップ Tot Cyc 現在のプログラムにおけるサイクルの合計#(1〜99) Timer プログラムにおける残りの時間( hrsで表示)−カウントダウ ン Prog 現在のプログラム#(1〜150)
【0269】
【表5】
【0270】 Prog HOLD,CYCL,AUTOまたはMETH ### プログラム#(1〜150)、またはそれがまだ記憶されていない 場合は??? Msg Done,Error,Abortまたはブランク Temp 現在の試料温度 Timer 構成可能なポーズ時間−カウントダウントップレベルのユーザのインタフェース
【0271】
【表6】
【0272】プログラムはCREATEのディスプレイ
中のプログラムの型を選択することによってつくる。ユ
ーザは編集すべきプログラムの最初のディスプレイに直
接行く。記憶されたプログラムを、RUN,EDITま
たはプログラムのディスプレイから番号1〜150のい
ずれかを入力することによって検索する。RUNディス
プレイの状態で有効なプログラムの番号を入力すると、
プログラムの実行が自動的に開始する。EDITまたは
プログラムのディスプレイの状態で有効な番号を入力す
ると、編集すべきプログラムの最初の部分のディスプレ
イが現れる。
【0273】STEP(スクリーンを下方に動かす)ま
たはBACK(前のフィールドに動く)またはENTE
R(次のフィールドに動く)を押すことによって、プロ
グラムを編集する。UN−STORE−PRINT−
HOMEメニューのRUNを選択するか、あるいはキー
パッド上のRUNキーを押すことによって、プログラム
を実行する。ユーザは、上記各プログラム実行に要求さ
れる2つのパラメータを最初に入力する。
【0274】
【表7】
【0275】OPTIONキーはMICRO(Micr
oAmp管)からTHIN(薄い壁のGeneAmp
管)に管の型をトグルする。ユーザが特別の管を構成し
た場合、OTHERのオプションが追加される。異なる
反応体積を入力することができる。これらのパラメータ
はこのプログラムとともに記憶される。ENTERはこ
れらの値を受け取る。
【0276】
【表8】
【0277】ユーザがランタイムのプリンタをオンの状
態にし、そしてサイクル、オートまたは方法のプログラ
ムを実行している場合、次のプリンタの選択が提示され
る。CYCLEは、サイクルが完結したときのみメッセ
ージをプリントする。SETPOINTは、すべての設
定点(ランプ応答/保持時間および温度)についてのラ
ンタイムのデータをプリントする。
【0278】
【表9】
【0279】ユーザがランタイムのプリンタをオンの状
態にし、そして保持のプログラムを実行している場合、
次のプリンタの選択が提示される。
【0280】
【表10】
【0281】加熱されたカバーが100℃以下である場
合、次のスクリーンが表示される。ユーザがこの表示さ
れたディスプレイを監視していれば、加熱されたカバー
が100℃に到達したときにプログラム実行は自動的に
開始する。ユーザがプログラムのディスプレイに戻すた
めにSTOPを打った場合、プログラム実行はマニュア
ルで再スタートしなくてはならない。プログラムをセー
ブ(Save)しない状態でRUN−STORE−PR
INT−OMEメニューにおけるMOREを受け取る
と、次のスクリーンが表示される。
【0282】
【表11】 ホールドプログラム
【0283】
【表12】
【0284】ユーザは無限のソーク(Soak)または
時間限定した保持のいずれかを選択することができる。
【0285】
【表13】
【0286】ビーパーは1秒毎に1回音を出す。ホールドプログラム−ランタイムの表示
【0287】
【表14】
【0288】 ホールドプログラム−ランタイムのプリントアウト PE Cetus GeneAmp PCRシステム9600 Ver xx. x 1990年11月14日 xx:xx AM 管の型:MICRO 反応体積:100μl 開始クロック 設定点のx.x℃ 以内 HOLDプログラム#xxx HOLDプログラム:xx.x℃ xxx:xx 実際:xx.x℃ xxx :xxまたは HOLDプログラム:xx.x℃ FOREVER 実際:xx.x℃ xx x:xx HOLDプログラム#xxx−プログラム実行の完結 1990年11月14日 xx:xx AMサイクルプログラム
【0289】
【表15】
【0290】ディフォルト(不履行)は3である。これ
はこのプログラムにおける設定点の数を決定する。1〜
9の設定点が許される。
【0291】
【表16】
【0292】上で入力した設定点の数により、どれだけ
多くの設定点の編集の表示がなされるかが決定される。
ユーザは各設定点についてのランプ応答時間および保持
時間を入力することができる。ユーザが設定点を構成す
ることが可能な温度範囲内に試料温度が到達したとき
に、保持タイマがスタートするであろう。
【0293】
【表17】
【0294】ユーザがポーズを必要としない場合、次の
3つのディスプレイがスキップされる。1〜99サイク
ルが可能である。
【0295】
【表18】
【0296】設定点の数について0を入力することは、
ユーザがポーズを必要としないことを意味し、したがっ
て次の2つのディスプレイがスキップされる。
【0297】
【表19】
【0298】サイクルの数は上で入力した合計の数に限
定される。
【0299】
【表20】
【0300】ディフォルトのポーズ時間はユーザの構成
の中にセットされる。サイクルプログラム−ランタイムのディスプレイ
【0301】
【表21】
【0302】 サイクルプログラム−ランタイムのプリントアウト PE Cetus GeneAmp PCRシステム9600 Ver xx. x 1990年11月14日 xx:xx AM 管の型:MICRO 反応体積:100μl 開始クロック 設定点のx.x℃ 以内 CYCLプログラム#xxx CYCL#xx Setpt#x RAMPプログラム:xx.x℃ xx:xx 実際:xx .x℃ xx:xx HOLDプログラム:xx.x℃ xx:xx 実際:xx.x℃ xx:x x ・ ・ (9までの設定点) ・ ・ ・ (99までのサイクル) ・ CYCLプログラム#xxx−プログラム実行の完結 1990年11月14日 xx:xx AM CYCLプログラム#xxx−ユーザのアボート(打ち切り)1990年11月 14日 xx:xx AM(打ち切りの場合のみ)オートプログラム
【0303】
【表22】
【0304】ディフォルトは3である。このディフォル
トはこのプログラムにおける設定点の数を決定する。1
〜9の設定点が許される。
【0305】
【表23】
【0306】上で入力した設定点の数により、どれだけ
多くの設定点の編集の表示がなされるかが決定される。
ランプ応答時間が与えられないと、計器は出来る限り速
くランプ応答する。ユーザが設定点を構成することが可
能な温度範囲内に試料温度が到達したときに、保持タイ
マがスタートする。
【0307】
【表24】
【0308】ユーザがサイクル毎に時間および/または
温度を増加または減少させようとする場合、次の表示が
与えられる。
【0309】
【表25】
【0310】OPTIONキーは矢印を上方に(サイク
ル毎に増加)または下方に(サイクル毎に減少)トグル
する。減少を可能とする最大時間は設定点の保持時間に
限定される。
【0311】
【表26】
【0312】99までのサイクルが許される。オートプログラム−ランタイムのディスプレイ
【0313】
【表27】
【0314】 オートプログラム−ランタイムのプリントアウト PE Cetus GeneAmp PCRシステム9600 Ver xx. x 1990年11月14日 xx:xx AM 管の型:MICRO 反応体積:100μl 開始クロック 設定点のx.x℃ 以内 AUTOプログラム#xxx CYCL#xx Setpt#x RAMPプログラム:xx.x℃ xx:xx 実際:xx .x℃ xx:xx HOLDプログラム:xx.x℃ xx:xx 実際:xx.x℃ xx:x x ・ ・ (9までの設定点) ・ ・ ・ (99までの設定点) ・ CYCLプログラム#xxx−プログラム実行の完結 1990年11月12日 xx:xx AM CYCLプログラム#xxx−ユーザの打ち切り 1990年11月12日 x x:xx AM(打ち切りの場合のみ)方法プログラム
【0315】
【表28】
【0316】17までのプログラムをある方法において
リンクすることができる。ユーザが、存在しないプログ
ラム#を入力しようとする場合、メッセージ「プログラ
ムは存在しない」が表示される。ユーザが他の方法でリ
ンクしようとする場合、メッセージ「この方法でリンク
することができない」が表示される。
【0317】
【表29】
【0318】方法プログラム−ランタイムの表示 RUNTIME,MOREおよびPAUSEの表示は、
現在実行されているプログラムのものであろう。実行さ
れているプログラムがある方法においてリンクされると
き、2つの付加的なMOREのディスプレイが与えられ
る。
【0319】
【表30】
【0320】現在実行されているプログラムの数が一時
的に表示されるであろう。
【0321】
【表31】
【0322】 方法プログラム−ランタイムのプリントアウト PE Cetus GeneAmp PCRシステム9600 Ver xx. x 1990年11月14日 xx:xx AM 管の型:MICRO 反応体積:100μl 開始クロック 設定点のx.x℃ 以内 METHODプログラム#xxx −すべてのリンクされたプログラムの データに先行する METHODプログラム#xxx −方法の完結−すべてのリンクしたプ ログラムデータに従う方法プログラム−プリント
【0323】
【表32】
【0324】METHOD この方法においてリンクし
た各プログラムのヘッダをプリントする。 PROGRAM DATA この方法においてリンクし
た各プログラムのヘッダおよびその内容をプリントす
る。プログラムの記憶 STOREがRUN−TORE−PRINT−HOM
Eメニューから選択されるとき、プログラムを記憶する
ルーチンはファイルならびに方法について同一である。
プログラムを保護することによって、このプログラムが
ユーザの番号を認識しないために勝手に重ね書きされた
り消去されたりすることができないようにユーザが保証
されるであろう。他のユーザは彼らの方法において上記
の保護されたファイルを見、編集、実行し、そしてリン
クすることができるが、記憶されたバージョンを変更す
ることはできないであろう。
【0325】
【表33】
【0326】xxxは1〜150の最初の利用可能なプ
ログラムである。
【0327】
【表34】
【0328】ユーザは保護されたプログラムの#を入力
した。正しいユーザの#はこのプログラムを重ね書きす
るために入力されなくてはならない。
【0329】
【表35】
【0330】誤ったユーザの#が入力された。このディ
スプレイは5秒間止まった後、前のものに戻る。ユーザ
は正しい#を入力するために3回のチャンスが与えられ
る。
【0331】
【表36】
【0332】ユーザがある方法においてリンクされたプ
ログラムを重ね書きしようとする場合、ユーザは警告さ
れ、そして、上記動作を続けた行うか否かの選択が提示
される。
【0333】
【表37】
【0334】ユーザが他の方法においてリンクされたプ
ログラムを重ね書きしようとする場合、エラーメッセー
ジが与えられる。
【0335】
【表38】
【0336】ユーザは、プログラムを保護しならびに前
に保護されたプログラムを無保護にするチャンスを与え
られる。
【0337】
【表39】
【0338】ユーザがプログラムを保護したい場合、ユ
ーザ#を入力しなくてはならない。利用可能なスロット
の中にプログラムを記憶できる状態にある。プログラム
が保護される場合のみ、ユーザ#が現れる。
【0339】
【表40】
【0340】存在するプログラムを重ね書きすることが
できる状態にある。プログラムが保護される場合のみ、
ユーザ#が現れる。ユティリティファンクション
【0341】
【表41】
【0342】DIRは、それらのプログラムの数、ユー
ザの数またはプログラムの型の何れかにより、記憶され
たプログラムのディレクトリをユーザが見るか、あるい
はプリントできるようにする。CONFIGは、特別の
必要性に計器の使用をユーザが調整できるようにさせ
る。DIAGは、ランタイムの問題を診断しそして計器
の性能を確認する手段をユーザに提供する。DELは、
プログラムの数、ユーザの数またはプログラムの型によ
り記憶されたプログラムをユーザが消去できるようにす
る。ユティリティ−ディレクトリ
【0343】
【表42】
【0344】プログラム数によるディレクトリ
【0345】
【表43】
【0346】プログラムは所定の数でスタートする数の
順序で記載される。STEPキーおよびBACKキーは
ディレクトリ表示中動く。ビーパーは記載するプログラ
ムの開始または終わりにおいて音を発する。
【0347】
【表44】
【0348】STOPはユーザに上の表示に戻るように
させる。プログラムタイプによるディレクトリ
【0349】
【表45】
【0350】プログラムの数は、選択した型のプログラ
ムについて記載される。
【0351】
【表46】
【0352】ユーザ数によるディレクトリ
【0353】
【表47】
【0354】所定のユーザの数の下に記憶されたすべて
のプログラムは記載されるであろう。
【0355】
【表48】
【0356】ディレクトリプリント
【0357】
【表49】
【0358】ユーザはディレクトリが前で見られた同一
の方法で記載されるディレクトリのハードコピーを得る
ことができる。ユティリティ−ユーザの構成
【0359】
【表50】
【0360】ファイルの構成は、メニューからEDIT
を受け取るか、あるいはSTEPキーを押すことによっ
て編集することができる。PRINTはこのファイルの
内容をプリントする。
【0361】
【表51】
【0362】ユーザはシステムの時間および日付をセッ
トすることができる。
【0363】
【表52】
【0364】ランタイムのプリンタがオンである場合、
ユーザは各ランのスタートとしてプリンタのオプション
で促進される。ランタイムのビーパーがオンである場
合、プログラムを実行する間ビーパーは各セグメントの
終わり(シーケンスのランプ(ramp)またはシーケ
ンスの部分を保持した後)に音を出す。
【0365】
【表53】
【0366】この時間は、プログラムがアボートする前
にポーズすることができる時間の最大量を表す。これは
キーパッドのポーズのみに関する。
【0367】
【表54】
【0368】この時間は、エラーがフラッグされる前に
実際の試料温度が設定点から変化できる度数を表す。
【0369】
【表55】
【0370】この設定点は、常に存在する制御の冷却電
力をバランスするために有用である。試料温度は、計器
が使用されていないときはいつでも、アイドル状態設定
点に維持される。
【0371】
【表56】
【0372】実行中のプログラムの保持されたセグメン
トの時間を計るクロックは、試料温度のこの温度内を得
るとき、トリガされるように構成することができる。名
目上の値は1.0℃である。
【0373】
【表57】
【0374】ユーザがMicroAmpまたは薄い壁の
GeneAmpの管以外の異なる型の管を使用しようと
する場合、ユーザはYESに対してこのオプションをセ
ットし、そして少なくとも3対の反応体積および管の時
定数のデータを入力しなくてはならない。この曲線を使
用して、実行の開始のときユーザが入力した反応体積に
依存するこの特別な管を使用して、各ランについて正し
いタウ(管の時定数)を外挿することができる。
【0375】
【表58】
【0376】ユーザが「特別の管」をYESにセットし
た場合、この3組のスクリーンが与えられる。実用性−消去
【0377】
【表59】
【0378】プログラムによる消去
【0379】
【表60】
【0380】すべてのプログラム(ファイルおよび方
法)は数により消去することができる。
【0381】
【表61】
【0382】プログラムはある方法においてリンクした
場合消去することができない。
【0383】
【表62】
【0384】ユーザは保護されたプログラムの#を入力
した。正しいユーザの#はこのプログラムを消去するた
め入力されねばならない。
【0385】
【表63】
【0386】誤ったユーザの#が入力された。この表示
は5秒間止まった後、前の表示に戻る。ユーザは正しい
#を入力する3回のチャンスを与えられる。
【0387】
【表64】
【0388】プログラムの消去準備。ユーザ#はプログ
ラムが保護されたときのみ現われる。 ユーザによる消去
【0389】
【表65】
【0390】所定のユーザの数が与えられた後、プログ
ラムを消去することができる。
【0391】
【表66】
【0392】所定のユーザの#を有するプログラムが存
在しない場合、次のメッセージが表示される。
【0393】
【表67】
【0394】プログラムがある方法においてリンクされ
る場合、プログラムを消去することができない。STE
Pキーは、リンクしたプログラムのリストを通してサイ
クルする。
【0395】
【表68】
【0396】リンクしたプログラムのリストは、どの方
法でプログラムをリンクしたかを示す。
【0397】
【表69】
【0398】これはリンクされていない所定のユーザの
#の下ですべてのプログラムを消去する。全消去
【0399】
【表70】
【0400】これは保護された方法でリンクされない、
すべての保護されてないプログラムを消去する。ユティリティ−ユーザの診断 診断テストを実行している間、STOPキーはユーザを
トップレベルの診断スクリーンにユーザを常に戻し、そ
してテストの数および名前を次のテストに自動的に増加
する。これは有効な診断を通してマニュアルサイクリン
グを促進する。
【0401】
【表71】
【0402】ユーザは実行するため診断の数を入力する
ことができるか、あるいは有効なテストを通して、サイ
クリングするためSTEPまたはBACKキーを使用で
きる。STEPまたはBACKキーを押す毎に、テスト
の数は増減され、そして関連するテストの名前が表示さ
れる。この特徴は、ユーザが各テストに関連する数を記
憶する必要性を排除する。履歴ファイルのレビュー
【0403】
【表72】
【0404】履歴ファイルは、500までの最近の実行
のレコードを記憶することができる、バッテリーRAM
中の循環バッファである。バッファが充満されていると
き、最も古い入力はオーバーライトされる。バッファは
プログラムは実行された後自動的にクリアされる。
【0405】
【表73】
【0406】履歴ファイルのヘッダはファイル中の現在
のレコードの数(「nnn」)を表示する。ALLはす
べてのレコードを見る。STARTは状態のレコードの
みを見る。ERRORSはエラーのメッセージをもつレ
コードのみを見る。PRNTは履歴ファイルのすべてま
たは一部分をプリントする。レコードの2つの型は、
(1)プログラムについての情報を与える状態のレコー
ドおよび(2)プログラムにおいて各保持およびランプ
セグメントについての情報を与えるデータのレコードで
ある。保持プログラムは1つの保持セグメントとして処
理され、そしてデータのレコードはファイルが終わると
き記憶される。数百の入力(50サイクル×6設定点=
350入力)が存在できるので、ファイルを通る双方向
の動作が要求される。ほとんどのPCRプログラムは3
または6設定点および40サイクル以下のであることは
重要である。入力は通常逆の順序で概観され、こうして
最初に見られるレコードは書き込まれた最後のレコード
である。ユーザが見るべきレコードの型を選択した場
合、STEPまたはBACKは選択した型の1回の入力
によりバッファを上下する。前述のSTEPまたはBA
CKとある数とによって、第2ラインを「スキップ#x
xx入力」で置換する。ユーザはある数を入力し、そし
てENTERを押してその値を受け取り、そして入力の
数はスキップされ、前進(STEP)または後進(BA
CK)する。前述のSTEPまたはBACKとRNUキ
ーとによって、ユーザは選択した型の最大のレコード#
(最新のレコード)またはレコード#1(最も古いレコ
ード)に急速に移ることができる。STOPは外観モー
ドを停止し、そしてファイルのヘッダを表示する。ステータスのレコード
【0407】
【表74】
【0408】「ffff」はHOLD、CYCLまたは
AUTOである。「xxx」はプログラムの数である。
「/mmm」はリンクしたプログラムについての方法の
数、さもなければブランクである。「nnn」はレコー
ドの数である。「メッセージ」は次の1つである。 ステータスのメッセージ 管の型:xxxx 実行において使用した試料管の型 反応体積:xxxμL 実行において使用した反応体積 Clkスタートw/inx.x℃ 保持クロックは設定点のこの温度内でスタ ートする スタートxx/xx/xx 実行のスタートの時間および日付 xx:xx 終わりxx/xx/xx 実行の終わりの時間および日付 xx:xx 方法の完結 方法にリンクしたすべてのプログラムは完 結される ポーズxx:xx,xx.x℃ プログラムはこの温度においてこの時間の 間ポーズした 致命的なステータスのメッセージ センサーのエラー センサーは1列で10回の悪い読みをした 電力の故障xxx.x時間 電力はこの時間の間オフであった ユーザのアボート ユーザはSTOPキーを実行の間に押す ポーズ タイムアウトxx:xx キーパッドのポーズは、その構成可能な時 間限界に到達した。 致命的な設定点のエラー 計算した時間以内に設定点に到達しない場 合、プログラムをアボートするための要件 であるか。開始ランプ温度(10℃の増分 に対して0℃〜100℃)対終了のランプ 温度(同一軸のラベリング)である10× 10のルックアップテーブルは、TC2が 任意の所定量の度でランプを上下するため に要する平均時間を保持する。設定点が次 のようにして計算した時間に到達しない場 合、ファイルはアボートされる。 プログラムされたランプ時間+(2*ルックアップテー
ブルの値)+10分データのレコード 「f」はHOLD、CYCLまたはAUTOである 「xxx」はプログラムの数である
【0409】
【表75】
【0410】「/mmm」はリンクされたプログラムに
対する方法の数であり、さもなければブランク 「ddd.d」は最終の設定点の温度である 「nnn」はレコードの数である 「yy」はサイクル数である 「z」は設定点の数である 「mmm.ss」は設定点の時間である サイクルおよび設定点の数の分野は保持プログラムのた
めに省略される。データエラーのレコード
【0411】
【表76】
【0412】「ddd.d」は終わりの設定点の温度で
ある 「nnn」はレコード数である 「yy」はサイクル数である 「z」は設定点の数である 「mmm:ss」は設定点の時間である 「message」は、次のように非致命的エラーを示
す: 非致命的エラーのメッセージ ステップのエラー 設定点は計算した時間で到達しなか
った: プログラム可能なランプ時間+(2*ルックアップテー
ブルの値) プログラムのエラー 設定点の温度または時間の自動的
プログラムの自動的増加/減少は、保持時間を負とさせ
るか、あるいは時間を0.1〜100℃の中から外とす
る。
【0413】温度のエラー セグメントの終わりにおい
て、設定点の温度はユーザの構成量を+/−にドリフト
した。保持プログラムについて、サイクルおよび設定点
のフィールドは省略される。履歴ファイルをプリントする 履歴ファイルのヘッダのメニューを通して、履歴ファイ
ルのプリントのルーチンにアクセスする。OPTION
のキーはオプションを通してカーソルをサイクルする。
【0414】
【表77】
【0415】PRNTがプリントスクリーンを表示して
いる下でカーソルが位置づけられるとき、ENTERキ
ーを押す:
【0416】
【表78】
【0417】 ALL ファイル中のすべてのレコードをプリントする STAT ステータスレコードのみをプリントする ERRORS エラーのメッセージをもつレコードのみ
をプリントする プリントのオプションの1つが選択されるとき、次のス
クリーンが表示される:
【0418】
【表79】
【0419】第1(最も最近)のプログラム数は不履行
のプログラムである。ユーザはプリントを開始すべきプ
ログラムの数を変化させることができる。プリントの
間、次のスクリーンが表示される:
【0420】
【表80】
【0421】プリントの終わりにおいて、プリントの履
歴のメニューが再び表示される。ヒータのテスト
【0422】
【表81】
【0423】ヒータのテストは、その温度が35℃から
65℃に上昇するとき試料ブロックの加熱率を計算す
る。試料ブロックがブロック温度を35℃に戻すとき、
次のスクリーンが表示される。
【0424】
【表82】
【0425】温度が安定化したとき、すべてのヒータは
全電力をオンにされる。ここで表示は「60℃に行く」
を読み、そしてブロック温度はブロック温度が50℃を
通過した後20秒間モニターされる。20秒後、合格ま
たは不合格のメッセージが表示される。
【0426】
【表83】
【0427】冷却テスト
【0428】
【表84】
【0429】冷却テストは、試料ブロックの温度が35
℃から15℃に低下するとき、試料ブロックの冷却率を
計算する。試料ブロックがブロック温度を35℃にさせ
るとき、次のスクリーンが表示される。
【0430】
【表85】
【0431】温度が安定化されるとき、冷却器はオンで
ある。ここで表示に「15℃に行く」が読まれ、そして
ブロック温度は試料ブロックが25℃を通過した後20
秒間モニターされる。20秒間、合格または不合格のメ
ッセージが表示される。
【0432】
【表86】
【図面の簡単な説明】
【図1】本発明の教示に従う熱サイクル装置のブロック
線図である。
【図2】本発明の教示に従う試料ブロックの平面図であ
る。
【図3】バイアス冷却チャンネルおよびランプ冷却チャ
ンネルを示す試料ブロックの側面図である。
【図4】試料ブロックの端面図である。
【図5】試料ブロックの端面図である。
【図6】図2中の切線6−6′に沿った試料ブロックの
断面図である。
【図7】図2中の切線7−7′に沿った試料ブロックの
断面図である。
【図8】図2中の切線8−8′に沿った試料ブロックの
断面図である。
【図9】3ゾーンのフィルムヒータとブロック支持体と
の組立て後の試料ブロックの構造の側断面図である。
【図10】3ゾーンのフィルムヒータに対する電力制御
の形態を示す電力ライン電圧のグラフである。
【図11】典型的な3インキュベーションPCRプロト
コルを示す温度のグラフである。
【図12】局所的ゾーンの概念を示す試料ブロックの断
面図である。
【図13】3ゾーンのヒータの平面図である。
【図14】低すぎる試料管配置力Fのτの作用を示す、
試料温度対時間のグラフである。
【図15】試料ブロックの中に配置された試料管および
キャップの断面図である。
【図16】(A)RC回路のインパルスの応答のグラフ
である。(B)インパルス励起パルスのグラフである。
(C)ブロックの熱インパルスの応答および温度履歴の
くりこみが計算した試料温度を与える方法を示すグラフ
である。(D)試料ブロック/試料管システムの熱的応
答の電気的アナログを示す。
【図17】3ゾーンのヒータの制御に使用する方程式に
ついての比例定数が適切にセットされるとき、6つの異
なる試料のすべての計算した温度が標的温度上で互いに
約0.5℃以内へ収束する仕方を示す。
【図18】変性標的温度が発生したDNAの量に影響を
与える方法を示すグラフである。
【図19】スライドカバーおよび加熱された定盤の断面
図である。
【図20】スライドカバー、試料ブロックおよび加熱さ
れた定盤の下降に使用するノブの斜視図である。
【図21】(A)試料ブロック上に配置されたときの、
フレーム、リテイナー、試料管およびキャップの1つの
実施態様のアセンブリーの断面図である。(B)試料ブ
ロック上に配置されたときの、フレーム、リテイナー、
試料管およびキャップの好ましい実施態様のアセンブリ
ーの断面図である。
【図22】マイクロタイタープレートについてのプラス
チックの使い捨てフレームの頂面図である。
【図23】フレームの底面図である。
【図24】フレームの端面図である。
【図25】フレームの他の端面図である。
【図26】図22における切線26−26′に沿ったフ
レームの断面図である。
【図27】図22における切線27−27′に沿ったフ
レームの断面図である。
【図28】フレームのへりの正面図および部分断面図で
ある。
【図29】好ましい試料管の断面図である。
【図30】試料管の上部の断面図である。
【図31】キャップのストリップの部分の正面図であ
る。
【図32】キャップのストリップの一部分の頂面図であ
る。
【図33】96ウェルのマイクロタイタートレーのプラ
スチックの使い捨てリテイナー部分の頂面図である。
【図34】リテイナーの部分切断側面図である。
【図35】リテイナーの端面図である。
【図36】図33における切線36−36′に沿ったリ
テイナーの断面図である。
【図37】図33における切線37−37′に沿ったリ
テイナーの断面図である。
【図38】96ウェルのマイクロタイタートレーのプラ
スチックの使い捨て支持体のベースの平面図である。
【図39】ベースの底面図である。
【図40】ベースの側面図である。
【図41】ベースの端面図である。
【図42】図38において切線42−42′に沿った支
持体のベースの断面図である。
【図43】図38において切線43−43′に沿った支
持体のベースの断面図である。
【図44】図38において切線44−44′に沿った支
持体のベースの断面図である。
【図45】いくつかの試料管およびキャップが所定位置
にあるマイクロタイタートレーからなる、プラスチック
の使い捨て物品の分解斜視図である。
【図46】図1における冷却液制御システム24の線図
である。
【図47】本発明に従う制御エレクトロニクスのブロッ
ク線図である。
【図48】本発明に従う制御エレクトロニクスのブロッ
ク線図である。
【図49】典型的なツェナー温度センサの概略図であ
る。
【図50】典型的な試料期間の時間ライン線図である。
【図51】商品名MAXIAMPで市販されている、高
い薄い壁の試料管の側断面図である。
【図52】薄い壁の試料管および厚い壁の先行技術の管
の間の応答時間の差を示すグラフである。
【図53】試料管およびキャップの平面図である。
【図54】パワーアップ試験順序のフローチャートであ
る。
【図55】パワーアップ試験順序のフローチャートであ
る。
【図56】パワーアップ試験順序のフローチャートであ
る。
【図57】パワーアップ試験順序のフローチャートであ
る。
【符号の説明】 1〜7…カラム 10…試料 12…試料ブロック 14…加熱されたカバー 16…端末 18,22…バス 20…制御コンピュータ 24…冷却液制御システム 26…入力管 28…出力管 30,32…管 34…熱交換器 36…入力管 38…出力管 39…溜 40…冷却装置 41…ポンプ 42…ファン 44…フィン管凝縮器 45,46…管 47…分岐交差 48…熱 49…バイアス冷却チャンネル 50…管 51…レストリクター 52,54…バス 53…入力 55…2状態のソレノイド作動弁 56…周囲空気温度センサー 57…ランプ冷却チャンネル 58…ライン 61…温度センサー 63…センサー 67…円錐形壁 68…試料ウェル 70…溜 78…みぞ、スロット 82…点 83,89,90…試料ウェル 91,93,95,97,99…冷却チャンネル 100〜107…ランプ冷却チャンネル 116…底面 122…ハイブリダイゼーションインキュベーション 128,130,132…孔 130,132…ねじ孔 134〜143…孔 146…ボルト 147…スピルカラー 148…はがね支持ブラケット 150,152…コイルばね 154…はがね圧力板 156…マルチゾーン試料ブロックフィルムヒータ 158…シリコーンゴムのパッド 160…エポキシ樹脂フォームの層 162…ネガティブのハーフサイクル 164…ポジティブのハーフサイクル 166…分割線 170…変性インキュベーション 172…ハイブリダイゼーションインキュベーション 174…伸長インキュベーション 198…冷却チャンネル 200,202…局所的領域 228,230…へりの表面 234…試料ウェル 250,252…へり 254…中央ゾーン 256,258…へりヒータ領域 260,262…マニホールドヒータ領域 266,268…プラスチック冷却液マニホールド 276…試料混合物 282…温度応答曲線 288…試料管 292…対流の流れ 294…ピーク 312…親ねじ 316…すべりカバー 318…ノブ 320,322…レール 324,326…試料管 332,334…インデックスマーク 336…飾り板 338…プラスチックキャップ 340…プラスチックトレー 342…マイクロタイタープレートのフレーム 346…上部のへり 368…円錐形プラスチック壁 372…水平のプラスチックプレート 376…試料管 378…内側へり 382…孔の対向するへり 386…リテイナー 394…ウェブ 396…タブ 402…単一の水平のプラスチック平面 410…孔 414…プラスチックタブ 416,418…スロット 420…ベース 424…典型的な試料管 450…マイクロプロセッサ 452…アドレスバス 454…データバス 456…EPROM 458…バッテリーバックアップRAM 460…システムクロック/カレンダー 462…アドレスデコーダー 464…チップセレクトバス 466…キーボード 468…ディスプレイ 470…キーボードインタフェース回路 472,474…プログラム可能な間隔タイマ 476…割込みコントローラー 478…UART 480…RAM 482…プログラム可能な割り込み制御装置(PIC) 484…プログラム可能なアレイ論理チップ(PAL) 486…12ビットのアナログ対ディジタルコンバータ
ー(A/D) 492,494…マルチプレクサ 496…2,000オームの抵抗器 498…+15ボルトの調整された電力供給 500…ゼンナーダイオード 506…較正電圧発生器 512…RMS対DCコンバーター回路 516…ステップ−ダウントランス 530,532,534,536…光学的に連結された
トライアックドライバー 538…制御バス 546,548…熱的カットアウトスイッチ 550…「パーソナリティ」プラグ 566…ゼロ交差検出器 568…2ラインバス 570…電力トランス 572,574…調整された電力供給 576…非調整電力供給 578…アナログ増幅器 590…間隔 592…開始時間 594…時間 600…出力ライン 602,604…単安定マルチバイブレータ 614…ソレノイドコイル 616…電力供給「レール」 620…電流制限抵抗器 624…ソレノイド作動弁 632…タイムアウトワンショット 650…ポリプロピレンのキャップ 652…プラスチックウェブ ■する。
【0022】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 ジョン ギルドナー アトウッド アメリカ合衆国,コネチカット 06896, ウエストレッディング,ライムキルン ロ ード 149 (72)発明者 フェントン ウイリアムズ アメリカ合衆国,コネチカット 06804, ブルックフィールド,ストニー ヒル ビ レッジ 72 (72)発明者 ティモシー エム.ウッデンバーグ アメリカ合衆国,コネチカット 06801, ベセル,ノールウッド ドライブ 72 (72)発明者 マーセル マーグリーズ アメリカ合衆国,ニューヨーク 10583, スカーズダル,ファーラガット ロード 27 (72)発明者 ロバート ピー.ラグサ アメリカ合衆国,コネチカット 06470, ニュートン,ウィレイ ランド 3 (72)発明者 リチャード リース アメリカ合衆国,カリフォルニア 94707, バークレイ,アラメダ 1136

Claims (8)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 所定量の液体試料混合物を収容した少な
    くとも1つの試料管内におけるポリメラーゼ連鎖反応
    の、制御装置付自動遂行装置であって、 a)前記少なくとも1つの試料管用の少なくとも1つの
    ウェルを備えた試料ブロック、 b)所定時間に亙る前記試料ブロックの温度の関数とし
    て前記液体試料混合物の温度を決定する手段を備えたコ
    ンピュータ、 c)前記試料ブロックの温度を変化させるために前記コ
    ンピュータによって制御される加熱及び冷却手段、及
    び、 d)前記試料ブロックへ熱的に連結され、前記所定時間
    に亙る該試料ブロックの温度を前記コンピュータへ送る
    ブロック温度センサ、を具備した装置。
  2. 【請求項2】 所定量の液体試料混合物を収容した少な
    くとも1つの試料管内におけるポリメラーゼ連鎖反応
    の、コンピュータ、前記少なくとも1つの試料管用の少
    なくとも1つのウェルを備えた試料ブロック、該試料ブ
    ロックへ熱的に連結されるブロック温度センサ、及び前
    記試料ブロックの温度を変化させるために前記コンピュ
    ータによって制御される加熱及び冷却手段、を備えたコ
    ンピュータ制御式熱循環装置による自動遂行を、コンピ
    ュータ制御するための方法であって、 前記コンピュータは、 a)所定の時刻における前記試料ブロックの温度を読む
    ステップ、 b)所定時間に亙る前記試料ブロックの温度の関数とし
    て前記液体試料混合物の温度を決定するステップ、及
    び、 c)前記液体試料混合物の温度の関数として前記加熱及
    び冷却手段を制御するステップ、を含む方法。
  3. 【請求項3】 ポリメラーゼ連鎖反応の自動遂行に適し
    た熱循環装置であって、 a)主頂面及び主底面を備えた金属製試料ブロック、 b)前記主頂面に形成される相互に離間した試料ウェル
    群の配列、 c)前記試料ブロックが35〜100℃の範囲内の温度
    にあるときに、外熱の供給がない限り少なくとも0.1
    ℃/秒の率で該試料ブロックを一様に冷却するのに充分
    な速度で、該試料ブロックに付与されるバイアス冷却、
    及び、 d)コンピュータに応答して、前記バイアス冷却よりも
    高い割合で前記試料ブロックの温度を一様に昇温できる
    コンピュータ制御可能な加熱手段、を具備し、コンピュ
    ータの制御下で前記試料ウェルの配列を、35〜100
    ℃の範囲において±0.5℃の許容誤差で一定温度に維
    持可能な熱循環装置。
  4. 【請求項4】 ポリメラーゼ連鎖反応の迅速自動遂行に
    適した熱循環装置であって、 a)主頂面及び主底面を備えた低熱体からなる熱的に均
    質な金属製試料ブロックであって、上面の中心領域に配
    置され、工業規格のマイクロタイタープレートのフォー
    マットに適合する中心間間隔を有した試料ウェル群の8
    ×12の長方形配列と、該配列を包囲し、かつ前記中心
    領域の熱特性と類似の熱特性を有する保護帯からなる周
    縁領域とを備えた試料ブロック、 b)前記試料ブロックが35〜100℃の範囲内の温度
    にあるときに、外熱の供給がない限り少なくとも0.1
    ℃/秒の率で該試料ブロックを一様に冷却するのに充分
    なバイアス冷却速度で、該試料ブロックを常に冷却する
    バイアス冷却装置、 c)複数の反応サイクルを決定する時間及び温度に関し
    たユーザデータを受け取りかつ記憶するコンピュータシ
    ステム、 d)該コンピュータシステムに制御され、前記試料ブロ
    ックを、100℃から少なくとも4℃/秒、及び40℃
    から少なくとも2℃/秒の傾斜冷却速度で選択的に冷却
    する傾斜冷却装置、 e)前記コンピュータシステムに制御され、前記試料ブ
    ロックの中心領域用の加熱ゾーンと前記保護帯用の加熱
    ゾーンとを備え、前記試料ブロックを35〜100℃の
    範囲内で一定温度に維持するのに必要な熱を供給可能
    で、かつ前記試料ブロックに傾斜加熱を供給可能な多ゾ
    ーン加熱装置、 f)前記試料ブロック上で鉛直に変位可能なプレスカバ
    ー、及び、 g)該カバーを昇降させ、かつ少なくとも300gの抵
    抗力に対抗して該カバーの鉛直位置を保持するカバー変
    位手段、を具備し、前記試料ウェルの配列を、35〜1
    00℃の範囲において±0.5℃の許容誤差で一定温度
    に維持可能な熱循環装置。
  5. 【請求項5】 上端で開放する円筒形の上方部分とそこ
    から下方へ延びて閉鎖するテーパ状の下方部分とを備
    え、円形断面を有し、かつ前記上方部分の前記開放端の
    下方位置で前記上方部分から外側へ延びる包囲肩部を備
    えた所定構造のマイクロタイター試料管を96個まで非
    拘束に保持する2ピース構造のプラスチック製ホルダで
    あって、 a)1ピースのトレーは、 i)工業規格のマイクロタイタープレートに適合する8
    ×12の長方形配列に96個の穴を備え、これらの穴
    が、前記試料管の前記上方部分の外径よりわずかに大き
    くかつ前記肩部の外径より小さい径を有する平坦かつ水
    平なプレート部分と、 ii) 該プレート部分を完全に包囲し、前記穴の1つに置
    かれた試料管の高さよりも高い位置まで上方へ延びる第
    1のトレー直立側壁と、 iii) 前記プレート部分を包囲し、前記穴の1つに置か
    れた試料管の上方部分のほぼ底部まで下方へ延びる第2
    のトレー直立側壁とを具備し、 b)前記トレー内に置かれた全ての試料管に亙って前記
    トレーの内部に着脱自在に係合する1ピースのリテーナ
    は、 i)工業規格のマイクロタイタープレートに適合する8
    ×12の長方形配列に96個の穴を備え、これらの穴
    が、前記試料管の前記上方部分の外径より僅かに大きく
    かつ前記肩部の外径より小さい径を有する平坦かつ水平
    なリテーナプレート部分と、 ii) 該リテーナプレート部分を包囲して該リテーナプレ
    ート部分から上方へ延びるリテーナ直立側壁とを具備
    し、 前記リテーナが前記トレーの内部に係合するとき、前記
    リテーナプレート部分は、前記トレー内に置かれた試料
    管の肩部の僅かに上方に位置し、前記第1のトレー直立
    側壁は前記リテーナ直立側壁とほぼ同一高さにあり、そ
    れにより前記トレー内に置かれた試料管は、鉛直方向及
    び横方向のいずれにも非拘束に保持されるホルダ。
  6. 【請求項6】 それぞれに内表面を有する相互に離間し
    た試料ウェル群の配列を備える金属製試料ブロックを具
    備し、前記試料ウェル群が、上端縁を有するマイクロタ
    イタープレート内に配置されかつそれぞれに試料混合物
    を収容する1つ以上の有蓋試料管を備え、前記マイクロ
    タイタープレートが前記試料ブロック上に設置される、
    ポリメラーゼ連鎖反応の遂行に適した熱循環装置内で、
    前記有蓋試料管を包囲するカバーであって、 平坦かつ水平な矩形部分、該矩形部分の周縁部に沿って
    下方へ突出するスカート部分、及び前記矩形部分の少な
    くとも下面を加熱する装置を具備し、 前記試料管の蓋の頂部が、前記カバーに加わる熱及び下
    向きの力によって変形するとき、前記試料管に接触し、
    かつ前記試料ブロック上の前記マイクロタイタープレー
    ト及び試料管を包囲するように寸法決めされたカバー。
  7. 【請求項7】 試料混合物を収容する少なくとも1つの
    プラスチック製有蓋試料管を配置する試料ウェルを備え
    た、ポリメラーゼ連鎖反応の遂行に適した熱循環装置に
    おいて、 前記少なくとも1つの試料管と前記との間に密な接触を
    与える被熱カバーを具備した装置。
  8. 【請求項8】 略円錐形の第1壁部と略円筒形の第2壁
    部とを具備し、前記第1壁部はその外面の略全体に亙り
    熱交換器の対応形状部分に接触するよう構成され、かつ
    前記第1壁部は前記第2壁部よりも実質的に薄い壁断面
    を有する使い捨て反応容器。
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