JP6581238B2 - 植物における遺伝子調節のためのポリヌクレオチド分子 - Google Patents

植物における遺伝子調節のためのポリヌクレオチド分子 Download PDF

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Description

「関連出願の相互参照および配列表の組み込み」
本出願は、本明細書においてそれらの全体が参照によって組み込まれる2010年3月8日に提出された米国仮特許出願第61/311,762号、2010年5月28日に提出された第61/349,807号、および2010年9月10日に提出された第61/381,556号の優先権の利益を主張する。「38−21_56855_D.txt」と題するファイル中に含まれる配列表は、サイズが133キロバイトで(オペレーティングシステムMS−Windowsにおいて測定)、2011年3月7日に作成されたものであるが、本明細書とともに提出され、参照によって本明細書において組み込まれる。
植物において遺伝子を調節するためのポリヌクレオチド分子およびそのような分子を作製し、かつ使用するための方法が本明細書において開示される。
除草剤が、抵抗性の雑草を制御しないのは、とりわけ、雑草よりも低い除草剤抵抗性を有し得る除草剤抵抗性作物の畑においてそのような雑草が成長している場合、問題となる。除草剤抵抗性の雑草は、様々な作用様式により同定される。アカザにおいて除草剤標的タンパク質を産生する遺伝子の複数のコピーの選択に起因する抵抗性は、Gaines et al. (2010) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 107(3):1029−1034によって報告されている。ヤエムグラ、プリックリーレタス(prickly lettuce)、およびドクムギにおいて除草剤標的タンパク質を産生する遺伝子における突然変異に起因する抵抗性は、Baerson et al. (2002) Plant Physiol., 129(3):1265−1275; Preston et al. (2006) Pesticide Biochem. Physiol., 84(3):227−235;およびWakelin et al. (2006) Weed Res. (Oxford), 46(5):432−440によって報告されている。グリホサートの液胞隔離は、グリホサート抵抗性のヒメムカシヨモギにおいて観察されたメカニズムである;Ge et al. (2010) Pest Management Sci., 66:576−576を参照されたい。ヘアリーメヒシバ(hairy crabgrass)において除草剤を不活性な化学形に代謝する酵素の発現に起因する抵抗性は、Hidayat et al. (1997) Pesticide Biochem. Physiol., 57(2):137−146によって報告されている。Reddy et al. (2008) J. Agric. Food Chem., 56(6):2125−2130は、グリホサートにより処理された植物種におけるアミノメチルホスホン酸の蓄積を報告した。
本発明は、たとえば、遺伝子の浸透移行性の調節のためにRNAを提供することによって、植物における遺伝子を調節するためのポリヌクレオチド分子および方法を提供する。本発明の様々な態様は、植物細胞における内因性遺伝子および導入遺伝子ならびにポリヌクレオチド分子を調節するためのポリヌクレオチド分子および方法を提供する。本明細書において開示されるポリヌクレオチド、組成物、および方法は、植物有害生物または病原体の内因性遺伝子を調節するのに有用である。本発明の態様では、ポリヌクレオチド分子は、内因性遺伝子もしくは導入遺伝子またはそれらの転写RNAの浸透移行性の遺伝子サイレンシングを開始するために、生きている植物組織の中に浸透することができるまたは吸収され得る組成物中に提供される。本発明のいくつかの態様では、ポリヌクレオチド分子は、最終的に、植物細胞における標的内因性遺伝子または標的導入遺伝子から転写されるRNAに、植物細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができるRNAを植物に提供しまたは植物中の細胞においてそのRNAの生産を可能にし、それによって、標的遺伝子の調節、たとえば、標的遺伝子のサイレンシングまたは抑制を達成する。本発明の他の態様では、本明細書において開示されるポリヌクレオチド分子は、最終的に、植物の無脊椎有害生物またはウイルス病原体の細胞における標的遺伝子から転写されるRNAに、生理学的条件下でハイブリダイズすることができるRNAを植物に提供しまたは植物の細胞においてそのRNAの生産を可能にし、それによって、標的遺伝子の調節、たとえば、標的遺伝子のサイレンシングまたは抑制を達成するのにも有用である。いくつかの態様では、標的遺伝子のサイレンシングまたは抑制は、標的遺伝子の発現によってそれ自体影響を与えられるまたは調節される他の遺伝子のアップレギュレーションを導く。
本発明の組成物および方法は、Brodersen and Voinnet (2006), Trends Genetics, 22:268−280;Tomari and Zamore (2005) Genes & Dev., 19:517−529;Vaucheret (2006) Genes Dev., 20:759−771;Meins et al. (2005) Annu. Rev. Cell Dev. Biol., 21:297−318;およびJones−Rhoades et al. (2006) Annu. Rev. Plant Biol., 57:19−53による概説において全般的に記載されるように、RNA媒介性の遺伝子抑制に関与する、いくつかの天然細胞経路のうち1つまたは複数を通じて作用すると考えられる。RNA媒介性の遺伝子抑制は、一般に、単一のRNA分子内における分子内形成または2つのRNA分子の間における分子間形成による二本鎖RNA(dsRNA)中間体を含む。この長いdsRNAの中間体は、RNアーゼIIIファミリーのリボヌクレアーゼ(ダイサーまたはダイサー様リボヌクレアーゼ)により処理されて1つまたは複数の短い二本鎖RNAとなり、これらのうちの一方の鎖は、RNA誘導サイレンシング複合体(「RISC」)の中に組み込まれる。たとえば、siRNA経路には、長い二本鎖RNAの中間体を切断して、低分子干渉RNA(「siRNA」)としたものが含まれる。siRNAのサイズは、約19〜約25塩基対の範囲にあると考えられるが、植物における最も一般的なクラスのsiRNAには、21塩基対または24塩基対を有するものが含まれる。Hamilton et al. (2002) EMBO J., 21:4671−4679を参照されたい。本明細書において使用されるように、「オリゴヌクレオチド」は、遺伝子サイレンシングメカニズムにおいて処理された低分子RNA分子のサイズに類似する、18〜25ヌクレオチド長のポリヌクレオチド分子を意味する。本発明の様々な実施形態には、オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドまたは両方の混合物を含む組成物が含まれる。
本発明の態様は、遺伝子の浸透移行性の調節のために植物細胞中に一本鎖RNA分子;界面活性剤および植物細胞における内因性遺伝子の抑制のために一本鎖RNAを提供する植物致死剤を含む組成物を用いる除草剤処理;界面活性剤(たとえば有機シリコーン界面活性剤)および植物細胞における内因性遺伝子の抑制のためのオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチド分子を含む、植物表面上への局所的コーティング;(a)ポリヌクレオチドによる浸透に対する植物のコンディショニング剤および(b)ポリヌクレオチド分子を含む、植物における標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘発するために局所的に適用される組成物;ならびに(a)ポリヌクレオチド分子による浸透に対する植物のコンディショニング剤、(b)ポリヌクレオチド分子を含む組成物を用いる除草剤処理を提供するための組成物および方法を含む。任意選択で、これらの組成物は、非ヌクレオチド除草剤を含むことができる。
他の態様では、本発明は、除草剤抵抗性自生植物を制御する;遺伝子の浸透移行性の調節のために植物細胞中に一本鎖RNA分子を提供するための組成物を成長中の植物の組織に適用することによって植物の内因性遺伝子を調整することにより、逆遺伝学を調査する;植物へのポリヌクレオチドの局所的な適用を含む、標的遺伝子の浸透移行性のサイレンシングを誘発する;(a)ポリヌクレオチドによる浸透に対する植物のコンディショニングおよび(b)ポリヌクレオチドを植物に局所的に適用することによって、植物における標的遺伝子の浸透移行性のサイレンシングを誘発する;ポリヌクレオチド分子および該ポリヌクレオチド分子による浸透に対する植物のコンディショニング剤を含む、局所的に適用される組成物を生きている植物に局所的に適用することによって植物の内因性遺伝子を調整することにより、逆遺伝学を調査するための方法を提供する。
他の態様では、本発明は、内因性遺伝子を抑制するために植物に外因性DNAまたはRNAを提供し、外因性DNAは、植物の染色体の中に統合されず、外因性RNAは、植物の染色体の中に統合されるDNAから転写されず、内因性遺伝子は、植物へのポリヌクレオチドの局所的な適用によって抑制される。これらおよび本発明の他の態様は、以下の部においてより詳細に記載される。
配列番号1、パルマーアマランス(Palmer amaranth)EPSPSをコードするヌクレオチド配列を示す図である。 合成Pol III遺伝子のヌクレオチド配列である配列番号3を示す図である。 dsRNAにより処理したパルマーアマランス植物の罹病を示す図である。図3Aは、グリホサート処理の7日後の植物を示す。図3Bは、long dsRNA溶液で処理し、その後72時間後にグリホサート処理した界面活性剤処理植物を示す。図3Cは、短いdsRNA溶液で処理し、その後、72時間後にグリホサート処理した界面活性剤処理植物を示す。 dsRNA組成物により処理したベンサミアナタバコ植物の脱色を示す図である。 ベンサミアナタバコのフィトエン不飽和化酵素のヌクレオチド配列である配列番号2を示す図である。 実施例9において記載されるように、グリホサート抵抗性のパルマーアマランスの葉に浸透する5’−Alexa Fluor 488標識アンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号15)を示す図である。 実施例9において記載されるように、EPSPSに対するアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドにより処理したグリホサート抵抗性のパルマーアマランスの葉において測定されたEPSPS mRNAの結果を示す図である。棒グラフの棒は、#1〜#4の各処理(円で囲まれた番号により示され、各番号は表2に対応している)および対照(オオムギ種子タンパク質のアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号14)を浸透させ、グリホサートによりまたはグリホサートなしで処理した葉)についての反復実験を示す。 実施例9において記載されるように、EPSPSのアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドにより局所的に処理したグリホサート抵抗性のパルマーアマランスの葉において測定されたEPSPSタンパク質の結果を示す図である。各処理は、円で囲まれた番号によって示され、表2に対応する。 実施例9において記載されるように、2つの実験において、EPSPSのアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドにより処理したグリホサート抵抗性のパルマーアマランスの葉において測定されたシキミ酸蓄積の結果を示す図である。各処理は、円で囲まれた番号によって示され、表2に対応する。 ベンサミアナタバコのフィトエン不飽和化酵素のヌクレオチド配列を示す図である(配列番号2)。 実施例10において記載されるように、フィトエン合成酵素配列(配列番号16)に関して、アッセイしたオリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドの配列(表3を参照されたい)の位置を概略的に示す図である。 実施例10において記載されるように、緩衝液(「対照」)、配列番号2のヌクレオチド914〜1113から成るセグメントに対応するRNA配列を有する200塩基長dsRNAポリヌクレオチド(「200nt dsRNA」)、ならびに一本鎖DNAオリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドの組み合わせ(配列番号16、17、20、21、24、25、および26)(「ssDNAオリゴ」)により局所的に処理したベンサミアナタバコ植物葉の先端の脱色を示す図である。 緩衝液(対照)、200塩基長dsRNAポリヌクレオチド、およびssDNAオリゴヌクレオチドにより処理したベンサミアナタバコ植物から単離したRNAのノーザンブロット解析の結果を示す図である。200塩基長dsRNAポリヌクレオチドによる処理前に、一晩、暗中、4摂氏度で保つことによりトレスをかけた植物から単離したRNAもまた示す。 実施例10において記載されるように、ポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドの様々な組み合わせにより局所的に重複処理したベンサミアナタバコ植物葉の先端の脱色を示す図である(各番号は、表4に列挙される処理に対応する)。対照(表4における処理13)植物は、示さない。 実施例10において記載されるように、表5に列挙されるポリヌクレオチドで局所的に処理したベンサミアナタバコ植物葉の先端の脱色を示す図である。 PDS 21塩基長アンチセンスssDNA(配列番号34、「21nt PDSアンチセンス」)またはT7プロモーターを有していないあらかじめアッセイしたPDSアンチセンス22塩基長オリゴヌクレオチド(配列番号22および23)(「PDSアンチセンス」)による局所的な処理後にベンサミアナタバコ植物において観察された葉の先端の脱色を示す図である。実施例10において記載されるように、緩衝液のみまたはPDS 21塩基長センスssDNA(配列番号36、「21nt PDSセンス」)を用いた局所的処理の後には、葉の先端の脱色はほとんどまたはまったく目視観察されなかった。 実施例11において記載されるように、約71%の同一性(1252/1762)を示すパルマーアマランスおよびベンサミアナタバコPDS DNA配列のアライメントを示す図である。 実施例11において記載されるように、コーンルートワーム(corn root worm)遺伝子の260塩基対dsRNAにより局所的に処理したパルマーアマランス植物ではなく、678bpまたは198bpパルマーPDS dsRNAにより局所的に処理したパルマーアマランス植物において観察された葉の先端の脱色を示す図である。 実施例12において記載されるように、フィトエン不飽和化酵素の浸透移行性のサイレンシングを誘発するために、最初に界面活性剤溶液により、次いでssDNA PDSオリゴヌクレオチドにより局所的に処理したベンサミアナタバコ植物の葉の先端、茎、および花の脱色を示す図である。 実施例12において記載されるように、フィトエン不飽和化酵素の浸透移行性のサイレンシングを誘発するために、界面活性剤溶液によるコンディショニングありまたはなしで、ssDNA PDSオリゴヌクレオチドにより局所的に処理したベンサミアナタバコ植物の葉の先端、茎、および花の脱色示す図である。 実施例13において記載されるように、表6に列挙される条件で処理した異なるグリホサート抵抗性のパルマーアマランス系統に対するアッセイの結果を示す図である(反復実験当たり3つの植物)。写真は、グリホサート処理の7日後(実験1〜6)またはグリホサート処理の9日後(実験7〜9)に撮影したものである。 実施例14において記載されるように、EPSPS dsRNA処理パルマーアマランス植物に豊富に存在すると同定された2つの低分子RNAの位置を示す図であり、完全長EPSPS(配列番号40)の位置564〜588および743〜767のヌクレオチドを下線付きイタリック体として示した図である。EPSPS配列はまた、実施例1において記載されるように、4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子(下線付き非イタリック体)および3つの「長い」二本鎖RNAポリヌクレオチド(太字)の位置を示す。 実施例17において記載されるように、パルマーアマランス植物を界面活性剤で処理し、その後3つの適用量のうちの1つのdsRNAで処理し、その後除草剤で処理する結果を示す図である。 実施例17において記載されるように、畑から収集した種子から成長させたグリホサート抵抗性のパルマーアマランスに対して実施したアッセイ1の結果を示す図である。除草剤処理の8日および30日後の植物が示されている。 実施例18において記載されるように、脂肪アミン(tallowamine)界面活性剤および硫酸アンモニウムによるまたはトランスフェクション試薬によるパルマーアマランスの処理から得られた結果を示す図である。 実施例19において記載されるように、EPSPS dsRNAまたはEPSPS DNA/RNAハイブリッドのいずれかによるグリホサート抵抗性のパルマーアマランス植物の処理の結果を示す図である。 実施例20において記載されるように、EPSPS dsRNAまたはEPSPS ssDNAポリヌクレオチドのいずれかによるグリホサート抵抗性のパルマーアマランス植物の処理の結果を示す図である。上の写真は、除草剤噴霧の8日後に撮影されたものであり、下の(棒)グラフは、除草剤噴霧の8日後に採点したグリホサート外傷(GI)として結果を示したものである。 実施例21において記載されるように、パルマーEPSPS遺伝子の全コード配列ならびに5’および3’非翻訳領域の一部をそれぞれタイリング様式で網羅する、およそ250bpのDNAセグメントに対応する12のdsRNAポリヌクレオチドを示す図である。実施例1および図1に記載される4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子は、それぞれ、タイリングセグメント2、3、4、および8中に位置し、それらのセグメント内で明るい灰色の棒で示されている。 これらのタイリングセグメントから設計されたdsRNAまたは4つの「短い」dsRNA分子または緩衝液によるグリホサート抵抗性のパルマーアマランス植物の処理の結果を示す。 実施例22において記載されるように、グリホサート抵抗性のパルマーアマランス植物をグリホサートで処理し、その後1%のSilwet L−77を噴霧し、その後2%硫酸アンモニウム含有緩衝液中のEPSPS dsRNAを適用する処理の結果を示す図である。未処理(「UT」)対照植物は、除草剤またはdsRNAではなく、1%のSilwet L−77噴霧のみにより処理した。植物は、処理の16日後に写真撮影し、評価した。 実施例23において記載されるように、EPSPS dsRNAポリヌクレオチド、界面活性剤、硫酸アンモニウム、および除草剤の20×もしくは100×量を含有する組成物により、または界面活性剤、硫酸アンモニウム、および除草剤を含有する組成物により、高コピー数のグリホサート抵抗性のパルマーアマランスの野外個体群の処理の結果を示す図である。各処理について、1フィート×5フィートの2つの複製栽培地が処理された。 実施例24において記載されるように、処理の37、46、および60日後(上段から下段へ)の、植物当たり1ナノモルssDNAにより処理したレタス植物の脱色および死滅の進行を示す図である。 実施例24において記載されるように、ポリヌクレオチドによる局所的な処理の4日または12日後に観察された脱色によって証明されたレタス植物における浸透移行性のサイレンシングを示す図である。 4つの個別のアンチセンスssDNA(「HL287」、配列番号43;「HL288」、配列番号44;「HL289」、配列番号45;および「HL290」、配列番号46)または4つすべてを含む混合物による局所的な処理の4後に観察された脱色によって証明された浸透移行性のサイレンシングを示す図である。 実施例25において記載されるように、トマトフィトエン不飽和化酵素ポリヌクレオチドにより処理したトマト植物の葉(上段右側のパネル)および花(中段右側のパネル)の脱色を示す図である。図30はまた、PDSポリヌクレオチドにより処理したトマト植物の発育阻止をも示す(下段のパネル)。 実施例26において記載されるように、TIFポリヌクレオチドによる、EPSPSポリヌクレオチドの、低コピー数のパルマーアマランスにおけるグリホサート除草剤活性の増強を示すグラフであり、また、TIFポリヌクレオチド自体が除草剤活性を有することを示したグラフである。EPSPSポリヌクレオチド「1、3、4」は、図1でそれぞれ下線付きで提示したヌクレオチドであるが、位置14〜38(短いdsRNA−1)、345〜369(短いdsRNA−3)、および1105〜1129(短いdsRNA−4)でパルマーアマランスEPSPS遺伝子(配列番号1)から転写されるmRNAにハイブリダイズすることができるアンチセンス鎖を有する「短い」dsRNAを指す(実施例1を参照されたい)。EPSPS「5」は、IDT[5]に当てはまる(表11において記載される配列番号91〜92)。 実施例26において記載されるように、TIFポリヌクレオチドによる、EPSPSポリヌクレオチドの、高コピー数のパルマーアマランスにおけるグリホサート除草剤活性の増強およびTIFポリヌクレオチドが、それら自体、除草剤活性を有することを示す図である。EPSPSポリヌクレオチド「1、3、4」は、図1でそれぞれ下線付きで提示したヌクレオチドであるが、位置14〜38(短いdsRNA−1)、345〜369(短いdsRNA−3)、および1105〜1129(短いdsRNA−4)でパルマーアマランスEPSPS遺伝子(配列番号1)から転写されるmRNAにハイブリダイズすることができるアンチセンス鎖を有する「短い」dsRNAを指す(実施例1を参照されたい)。EPSPS「5」は、IDT[5]に当てはまる(表11に記載の配列番号91〜92)。 実施例28において記載されるように、非ポリヌクレオチド除草剤およびポリヌクレオチドの指定された組み合わせによる処理後のパルマーアマランスに対する除草剤効果を示すグラフである。 実施例30において記載されるように、ベンサミアナタバコPDS遺伝子座1プロモーター(配列番号319)およびPDS遺伝子座2プロモーター(配列番号320)のアライメントを示す図である。 実施例30において記載されるように、ベンサミアナタバコPDS遺伝子座1および遺伝子座2プロモーターならびにポリヌクレオチドの混合物によって標的にされる領域を概略的に示す図である。 実施例33において記載されるように、PDSアンチセンスポリヌクレオチド(図36A)、EPSPSアンチセンスポリヌクレオチド(図36B)、またはRuBisCOアンチセンスポリヌクレオチド(図36C)により処理した植物におけるベンサミアナタバコ植物の草高に対する効果を示すグラフである。 実施例34において記載されるように、内因性EPSPS遺伝子を標的にするdsRNAポリヌクレオチド(「EPSPS DNAオリゴ」)、または対照として緩衝液単独で局所的処理を行った場合のトウモロコシ(Gaspe)単子葉植物に対する効果を示す図である。 実施例35において記載されるように、グリホサート抵抗性のパルマーアマランス植物に対する除草剤活性に対するグリホサート対イオンの様々な効果を示す図である。 実施例35において記載されるように、EPSPSの33、36、または57コピーを含有するグリホサート抵抗性のパルマーアマランスに対するポリアミンスペルミン(「SPM」)およびスペルミジン(「SPMD」)または硫酸アンモニウム(「AMS」)の効果を示す図である。「fb 4X WM」は、「その後に続く、グリホサート(Roundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤の1ヘクタール当たり3360g酸相当量)による処理」を意味する。
特に明示されない限り、本明細書の本文における核酸配列は、左から右に読まれる場合、5’〜3’方向に示される。核酸配列は、指定されるように、DNAとしてまたはRNAとして提供されてもよく、当業者に知られているように、一方の開示は、必然的に他方を定める。用語が単数形で提供される場合、本発明者らはまた、該用語の複数形によって記載される本発明の態様をも企図する。「転写不可の」ポリヌクレオチドとは、ポリヌクレオチドが完全なポリメラーゼII転写単位を含まないことを意味する。本明細書で使用される「溶液」は、均一な混合物、ならびに懸濁液、コロイド、ミセル、および乳剤などのような不均一な混合物を指す。
(ポリヌクレオチド)
本明細書において使用される「ポリヌクレオチド」は、複数のヌクレオチドを含有する核酸分子を指し、一般に、「オリゴヌクレオチド」(18〜25ヌクレオチド長のポリヌクレオチド分子)および26以上のヌクレオチドのポリヌクレオチドの両方を指す。本発明の実施形態は、18〜25ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチド(たとえば18塩基長、19塩基長、20塩基長、21塩基長、22塩基長、23塩基長、24塩基長、もしくは25塩基長)または26以上ヌクレオチド長の中程度の長さのポリヌクレオチド(たとえば26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、約65、約70、約75、約80、約85、約90、約95、約100、約110、約120、約130、約140、約150、約160、約170、約180、約190、約200、約210、約220、約230、約240、約250、約260、約270、約280、約290、もしくは約300ヌクレオチドのポリヌクレオチド長)または約300超ヌクレオチド長の長鎖ポリヌクレオチド(たとえば、約300〜約400ヌクレオチド長、約400〜約500ヌクレオチド長、約500〜約600ヌクレオチド長、約600〜約700ヌクレオチド長、約700〜約800ヌクレオチド長、約800〜約900ヌクレオチド長、約900〜約1000ヌクレオチド長、約300〜約500ヌクレオチド長、約300〜約600ヌクレオチド長、約300〜約700ヌクレオチド長、約300〜約800ヌクレオチド長、約300〜約900ヌクレオチド長、または約1000ヌクレオチド長またはさらに約1000超ヌクレオチド長、たとえば、標的遺伝子のコード部分または非コード部分またはコード部分および非コード部分の両方を含む、最長は標的遺伝子の全長に至るまでのポリヌクレオチド)を含む組成物を含む。ポリヌクレオチドが二本鎖である場合、その長さは、塩基対に関して同様に記載することができる。
本発明の様々な実施形態において使用されるポリヌクレオチド組成物は、RNAもしくはDNAもしくはRNA/DNAハイブリッドを含むオリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオチドもしくは両方の混合物または化学的に修飾されたオリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオチドもしくはその混合物を含む組成物を含む。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、リボヌクレオチドおよびデオキシリボヌクレオチドの組み合わせ、たとえば、主としてリボヌクレオチドから成るが、1つもしくは複数の末端のデオキシリボヌクレオチドを有する合成ポリヌクレオチド、または主としてデオキシリボヌクレオチドから成るが、1つもしくは複数の末端のジデオキシリボヌクレオチドを有する合成ポリヌクレオチドであってもよい。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、イノシン、チオウリジン、またはプソイドウリジンなどのような非標準的なヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、化学的に修飾されたヌクレオチドを含む。化学的に修飾されたオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドの例は、当技術分野においてよく知られている;たとえばVerma and Eckstein (1998) Annu. Rev. Biochem., 67:99−134を参照されたい。たとえば、オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドの天然に発生するホスホジエステル主鎖は、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、またはメチルホスホネートヌクレオチド間連結修飾により部分的にまたは完全に修飾することができ、修飾ヌクレオシド塩基または修飾糖は、オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチド合成において使用することができ、オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドは、蛍光成分(たとえばフルオレセインもしくはローダミン)または他の標識(たとえばビオチン)により標識することができる。
ポリヌクレオチドは、一本鎖もしくは二本鎖RNAまたは一本鎖もしくは二本鎖DNAまたは二本鎖DNA/RNAハイブリッドまたはその修飾類似体とすることができ、オリゴヌクレオチド長以上のものとすることができる。本発明のさらに具体的な実施形態では、植物細胞中に一本鎖RNAを提供するポリヌクレオチドは、(a)一本鎖RNA分子、(b)自己ハイブリダイズして、二本鎖RNA分子を形成する一本鎖RNA分子、(c)二本鎖RNA分子、(d)一本鎖DNA分子、(e)自己ハイブリダイズして、二本鎖DNA分子を形成する一本鎖DNA分子、および(f)RNA分子に転写される修飾Pol III遺伝子を含む一本鎖DNA分子、(g)二本鎖DNA分子、(h)RNA分子に転写される修飾Pol III遺伝子を含む二本鎖DNA分子、(i)二本鎖ハイブリダイズRNA/DNA分子、またはその組み合わせから成る群から選択される。いくつかの実施形態では、これらのポリヌクレオチドは、化学的に修飾されたヌクレオチドまたは非標準的なヌクレオチドを含む。方法の実施形態では、ポリヌクレオチドは、分子内ハイブリダイゼーションによって形成される二本鎖DNA、分子間ハイブリダイゼーションによって形成される二本鎖DNA、分子内ハイブリダイゼーションによって形成される二本鎖RNA、または分子間ハイブリダイゼーションによって形成される二本鎖RNAを含む。一実施形態では、ポリヌクレオチドは、自己ハイブリダイズして、細胞の生理学的条件下で抑制標的遺伝子から転写されたRNAにハイブリダイズするであろう少なくとも1つのセグメントを含む、少なくとも部分的に二本鎖構造を有するヘアピン構造を形成する一本鎖DNAまたは一本鎖RNAを含む。いかなるメカニズムによっても拘束されることを意図しないが、そのようなポリヌクレオチドは、細胞の生理学的条件下で抑制標的遺伝子から転写されたRNAにハイブリダイズするであろう少なくとも1つのセグメントを有する一本鎖RNAを産生する、または産生するであろうと考えられている。その他の特定の実施形態では、ポリヌクレオチドは、プロモーター、一般に、植物において機能的なプロモーター、たとえばpol IIプロモーター、pol IIIプロモーター、pol IVプロモーター、またはpol Vプロモーターをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド組成物は、核酸分子と結合することが知られている対イオンまたは他の分子、たとえばテトラアルキルアンモニウムイオン、トリアルキルアンモニウムイオン、スルホニウムイオン、リチウムイオン、およびスペルミン、スペルミジン、またはプトレッシンなどのようなポリアミンと共に配合される。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド組成物は、非ポリヌクレオチド除草剤(たとえば、本明細書の中で「除草剤耐性タンパク質」と題した箇所で開示される化学的除草剤)と共に、または移送剤もしくは浸透性増強剤(「浸透性増強剤および処理」と題した箇所を参照されたい)と共に配合される。
ポリヌクレオチドは、植物における内因性遺伝子の浸透移行性の調節または抑制を誘発するように設計され、植物の内因性遺伝子の配列(コード配列もしくは非コード配列であり得る)または植物の内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有するように設計される。「本質的に同一である」または「本質的に相補的である」とは、ポリヌクレオチド(または二本鎖ポリヌクレオチドのうちの少なくとも一方の鎖)が、内因性遺伝子の調節または抑制を達成するために、植物の細胞における生理学的条件下で、内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAにハイブリダイズするように設計されることを意味する。
本発明において機能的な一本鎖ポリヌクレオチドの実施形態は、100%である必要はないが、少なくとも、遺伝子サイレンシングメカニズムによる切断を可能にするために、標的遺伝子から転写されるRNAへのハイブリダイゼーションを可能にし、植物細胞における生理学的条件下で二重鎖を形成するのに十分である配列相補性を有する。したがって、実施形態では、セグメントは、標的遺伝子または標的遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的であるように設計される。「本質的に同一である」とは、標的遺伝子または標的遺伝子から転写されるRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と比較した場合に、100%の配列同一性または少なくとも約83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99%の配列同一性を有することを意味し、「本質的に相補的である」とは、標的遺伝子または標的遺伝子から転写されるRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と比較した場合に、100%の配列相補性または少なくとも約83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99%の配列相補性を有することを意味する。本発明のいくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド分子は、所与の標的遺伝子の一つの対立遺伝子と100%の配列同一性または相補性を有するように設計され(たとえば、除草剤耐性タンパク質遺伝子、除草剤不活性化タンパク質遺伝子、ストレス応答遺伝子、または必須遺伝子のコードまたは非コード配列)、他の実施形態では、ポリヌクレオチド分子は、所与の標的遺伝子の複数の対立遺伝子と100%の配列同一性または相補性を有するように設計される。
本発明の一態様では、ポリヌクレオチドは、修飾RNAポリメラーゼIII遺伝子、たとえば、7SLシグナル認識粒子RNAもしくはU6スプライセオソームRNAを転写する遺伝子(Pol III遺伝子)または機能的Pol IIIプロモーター配列を含有するポリヌクレオチドである。一実施形態では、ポリヌクレオチドは、Pol III遺伝子によって本来転写されるDNA配列に取って代わる、調節用に同定された標的遺伝子のRNAに対応するセンスおよびアンチセンスDNAを含有する修飾Pol III遺伝子である。
本発明において有用なポリヌクレオチドは、典型的に、少なくとも1週間以上の処理植物が生存する間に、典型的には浸透移行性の様式で、遺伝子発現の制御または調節(たとえば抑制)を達成する。たとえば、本発明のポリヌクレオチド組成物を用いて植物の葉の処理を行った数日以内に、プライマリーsiRNAおよび推移的siRNA1(transitive siRNA)は、処理された葉の側方および上部にある他の葉ならびに先端の組織において検出することができる。
ポリヌクレオチドを作製するための方法は、当技術分野においてよく知られている。オリゴヌクレオチドの市販の調製物は、センス鎖の3’末端上に2つのデオキシリボヌクレオチドを提供することが多い。長いポリヌクレオチド分子は、市販で入手可能なキットから合成することができ、たとえばAmbion製キットはdsRNAに構築可能なRNA鎖を作製する細菌T7ポリメラーゼプロモーターをコードする、5’末端上にDNAをライゲーションする。その代わりに、dsRNA分子は、調節されたまたは欠損したRNアーゼIII酵素活性を有する細菌細胞において発現カセットから産生することができる。長いポリヌクレオチド分子はまた、複数のRNAまたはDNA断片から構築することもできる。いくつかの実施形態では、ReynoldsスコアおよびTuschlルールなどの設計パラメーターは、当技術分野において知られており、遺伝子サイレンシングにおいて有効なポリヌクレオチド配列を選択するのに使用される。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチド配列のランダム設計または経験的な選択は、遺伝子サイレンシングにおいて有効なポリヌクレオチド配列を選択するのに使用される。いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドの配列は、他の遺伝子の意図しないサイレンシングを最小限にするよう意図された植物のゲノムDNAに対してスクリーニングされる。
本発明のポリヌクレオチド組成物は、低濃度で、単独または他の成分と組み合わせて(たとえば界面活性剤、塩、および非ポリヌクレオチド除草剤)、混合の場合は同じ溶液かまたは別々に適用される溶液のいずれかによる、ポリヌクレオチド分子の溶液など、組成物において有用である。本発明の方法において有用となり得るポリヌクレオチド分子の濃度および適用量に上限はないが、効率性のためには、一般に、より低い有効濃度および適用量が求められるであろう。濃度は、植物の葉に適用される噴霧量を考慮して調節することができる。一実施形態では、25塩基長オリゴヌクレオチド分子を使用する草本の処理に有用なのは、植物あたり約1ナノモル、たとえば、植物あたり約0.05〜1ナノモルのオリゴヌクレオチド分子である。草本についての他の実施形態では、植物あたり約0.05〜約100ナノモルまたは約0.1〜約20ナノモルまたは約1ナノモル〜約10ナノモルのポリヌクレオチドが有用な範囲として含まれる。非常に大きな植物、木、またはつる植物は、相応して大量のポリヌクレオチドを必要としてもよい。複数のオリゴヌクレオチドに処理され得る長いdsRNA分子を使用する場合、より低い濃度を使用することができる。本発明の実施形態を示すための以下の実施例では、オリゴヌクレオチド分子に適用される場合の因子1×は、植物あたり0.8ナノモルのポリヌクレオチド分子、10×は、植物あたり8ナノモルのポリヌクレオチド分子、および100×は、植物あたり80ナノモルのポリヌクレオチド分子の処理を意味するために任意に使用される。たとえば、実施例23では、植物は、植物あたり、100×処理のEPSPS dsRNA(264マイクログラムまたは80のナノモル)を含む水溶液を用いて処理した。
(一本鎖RNA分子)
本発明は、植物細胞における遺伝子の浸透移行性の調節のために一本鎖RNAを提供するためのポリヌクレオチド分子を提供する。さらに具体的に、本発明はまた、標的遺伝子または標的遺伝子から転写されるRNAのいずれかにおける18以上の連続ヌクレオチド配列と本質的に同一または本質的に相補的であるヌクレオチド配列中にセグメントを有するポリヌクレオチド分子を植物へ局所的に適用することにより、植物における標的遺伝子の浸透移行性の調節(たとえば浸透移行性の抑制またはサイレンシング)を誘発し、それにより、組成物は植物の内部に浸透し、転写RNA、たとえばメッセンジャーRNAにハイブリダイズする一本鎖RNAの作用による標的遺伝子の浸透移行性の調節を誘発するための組成物および方法をも提供する。ポリヌクレオチド分子は、単一の該セグメント、複数の該セグメント、複数の異なる該セグメント、またはそれらの組み合わせを有する1つまたは複数のポリヌクレオチド分子であり得る。
(移送剤、浸透性増強剤、および処理)
本発明の組成物および方法は、植物細胞の中へポリヌクレオチド分子を浸透に対して、植物組織、たとえば葉、茎、根、花、または果実の表面をコンディショニングするための移送剤または浸透性増強剤および処理を含むことができる。植物細胞の中へのポリヌクレオチドの移送は、植物組織への、ポリヌクレオチド移送剤の事前または同時適用により促進することができる。いくつかの実施形態では、移送剤は、ポリヌクレオチド組成物の適用に続いて適用される。ポリヌクレオチド移送剤により、ポリヌクレオチドが、クチクラワックスバリア、気孔、および/または細胞壁もしくは膜バリアを通じて植物細胞の中へ移送される経路を可能にする。植物細胞の中への組成物が移送されるのを促進するために適した剤には、植物の外面の浸透性を増加させる、またはオリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオチドに対する植物細胞の浸透性を増加させる剤が含まれる。植物細胞の中への組成物移送を促進する該剤は、化学剤、物理剤、またはそれらの組み合わせを含む。コンディショニングのための化学剤は、(a)界面活性剤、(b)有機溶媒もしくは水溶液もしくは有機溶媒の水性混合物、(c)酸化剤、(e)酸、(f)塩基、(g)油、(h)酵素、またはそれらの組み合わせを含む。方法の実施形態は、任意選択で、インキュベーションステップ、中和ステップ(たとえば酸、塩基、もしくは酸化剤を中和するまたは酵素を不活性化する)、すすぎステップ、またはそれらの組み合わせを含むことができる。ポリヌクレオチド浸透に対する植物コンディショニング剤または処理の実施形態は、乳剤、逆乳剤、リポソーム、および他のミセル様組成物を含む。ポリヌクレオチド浸透に対する植物コンディショニング剤または処理の実施形態は、核酸分子と結合することが知られている対イオンまたは他の分子、たとえば無機アンモニウムイオン類、アルキルアンモニウムイオン類、リチウムイオン類、およびスペルミン、スペルミジン、またはプトレッシンなどポリアミン類、および他の陽イオン類を含む。ポリヌクレオチド浸透に対して植物をコンディショニングするのに有用な有機溶媒は、DMSO、DMF、ピリジン、N−ピロリジン、ヘキサメチルホスホルアミド、アセトニトリル、ジオキサン、ポリプロピレングリコール、その他の水混和性溶媒または非水性系でホスホヌクレオチドを溶解するその他の溶媒(合成反応において使用されるなど)を含む。天然由来油または界面活性剤もしくは乳化剤を有するもしくは有していない合成油を使用することができ、たとえば、植物源の油、作物油(www.herbicide.adjuvants.comで一般公開されている、9th Compendium of Herbicide Adjuvantsに列挙されているものなど)、たとえば、パラフィン系オイル類、ポリオール脂肪酸エステル類、またはポリエチレンイミンもしくはN−ピロリジンなどのアミドもしくはポリアミンで修飾された短鎖分子を有する油を使用することができる。
ポリヌクレオチド浸透に対する該植物コンディショニング剤は、任意の好都合な方法、たとえば、粉末、乳剤、懸濁液、または溶液で噴霧またはコーティングすることにより植物に適用される;同様に、ポリヌクレオチド分子は、任意の好都合な方法、たとえば、溶液、乳剤、または懸濁液を噴霧または塗布することにより植物に適用される。
有用な界面活性剤の例は、脂肪酸(脂肪または脂肪アミンまたはリン脂質など)のナトリウム塩またはリチウム塩および有機シリコーン界面活性剤を含む。他の有用な界面活性剤は、非イオン性有機シリコーン界面活性剤を含む有機シリコーン界面活性剤、たとえば、トリシロキサンエトキシレート界面活性剤またはポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマー(CAS番号27306−78−1およびEPA番号:CAL.REG.NO.5905−50073−AAを有するSilwet(登録商標)L−77界面活性剤として市販、現在、Momentive Performance Materials社,Albany, New Yorkから入手可能である)などのシリコーンポリエーテルコポリマーを含む。Silwet L−77界面活性剤が植物の葉または他の表面への噴霧前処理として使用される場合、約0.015〜約2重量パーセント(wt %)の範囲の濃度(たとえば約0.01、0.015、0.02、0.025、0.03、0.035、0.04、0.045、0.05、0.055、0.06、0.065、0.07、0.075、0.08、0.085、0.09、0.095、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.5wt %)が、表面上へ局所的に適用し、植物細胞の中へポリヌクレオチド分子を移送させるために、葉または他の植物表面を調製するのに効果的である。
有用な物理的作因として、(a)カーボランダム、コランダム、砂、方解石、軽石、ざくろ石、およびその他同種のものなどのような研磨剤、(b)カーボンナノチューブなどのナノ粒子、または(c)物理的力を含み得る。カーボンナノチューブは、Kam et al. (2004) J. Am. Chem. Soc., 126 (22):6850−6851、Liu et al. (2009) Nano Lett., 9(3):1007−1010、およびKhodakovskaya et al. (2009) ACS Nano, 3(10):3221−3227によって開示されている。物理的力作因として、加熱、冷却、陽圧の適用、または超音波処理が含まれ得る。方法の実施形態は、任意選択で、インキュベーションステップ、中和ステップ(たとえば酸、塩基、もしくは酸化剤を中和するまたは酵素を不活性化する)、すすぎステップ、またはそれらの組み合わせを含むことができる。本発明の方法にはさらに、特定の遺伝子のサイレンシングによる効果の増強を有するであろう他の作用剤の適用が含まれ得る。たとえば、ポリヌクレオチドが除草剤抵抗性を提供する遺伝子を調節するように設計される場合、その後除草剤を適用すると、除草剤効能に対して劇的な効果を有し得る。
ポリヌクレオチド浸透に対する植物実験用コンディショニング因には、たとえば、化学剤の適用、酵素処理、加熱もしくは冷却、陽圧もしくは陰圧を用いる処理、または超音波処理が含まれる。畑における植物のコンディショニング剤には、界面活性剤および塩など化学剤が含まれる。
(標的遺伝子および必須遺伝子)
本発明の組成物および方法は、植物細胞における内因性またはトランスジェニック標的遺伝子の発現を調整するのに有用である。様々な実施形態では、標的遺伝子は、コード(タンパク質コードもしくは翻訳可能)配列、非コード(翻訳不可能)配列、またはコードおよび非コード配列の両方を含む。本発明の組成物は、複数の遺伝子、または1つもしくは複数の遺伝子の複数のセグメントを標的にするように設計されたポリヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドを含むことができる。標的遺伝子は、標的遺伝子の複数の連続するセグメント、標的遺伝子の複数の非連続セグメント、標的遺伝子の複数の対立遺伝子、または1つもしくは複数の種由来の複数の標的遺伝子を含むことができる。標的遺伝子の例は、植物細胞において発現される内因性植物遺伝子および導入遺伝子を含む。標的遺伝子の他の例は、植物ウイルス病原体の内因性遺伝子または植物無脊椎有害生物の内因性遺伝子を含む。
標的遺伝子は、除草剤耐性タンパク質をコードする遺伝子、調節RNAを含む非コード配列、および細胞生命の維持または有機体の再生を支持するのに必要な必須遺伝子を含むことができる。必須遺伝子の実施形態は、DNAまたはRNA複製、遺伝子転写、RNA媒介性の遺伝子調節、タンパク質合成、エネルギー生産、および細胞分裂に関与する遺伝子を含む。必須遺伝子の概略の1つの例は、Zhang et al. (2004) Nucleic Acids Res., 32:D271−D272に記載されており、tubic.tju. edu.cn/deg/で入手可能である。バージョンDEG 5.4は、シロイヌナズナについての777の必須遺伝子を列挙している。必須遺伝子の例は、翻訳開始因子(TIF)およびリブロース−1,5−ビスリン酸カルボキシラーゼオキシゲナーゼ(RuBisCO)を含む。標的遺伝子は、転写因子をコードする遺伝子、ならびに、これらに限定されないが、アミノ酸、脂肪酸および他の脂質、糖および他の炭水化物、生物学的ポリマー、ならびにアルカロイド、テルペノイド、ポリケチド、非リボソームペプチドを含む2次代謝産物、ならびに混合性の生合成起源の2次代謝産物などの植物における分子の生合成または異化に関与する酵素をコードする遺伝子を含むことができる。
(組成物および方法)
本発明の一本鎖RNA分子は、RNAとして植物細胞に直接提供することができるか、または、たとえば、処理組成物におけるポリヌクレオチド分子が、標的遺伝子の転写物にハイブリダイズできる一本鎖RNAの生産を植物の細胞に引き起こす場合は間接的に提供することができる。多くの実施形態では、ポリヌクレオチド分子の組成物は、ポリヌクレオチド浸透に対する植物コンディショニング剤など、植物細胞中へのポリヌクレオチド分子移送を促進するための1つまたは複数の浸透性増強剤をさらに含む。本発明の態様では、方法は、ポリヌクレオチド組成物の1つまたは複数の適用、およびポリヌクレオチド浸透に対する植物コンディショニング用浸透性増強剤の1つまたは複数の適用を含む。浸透に対するコンディショニング剤が有機シリコーン界面活性剤である場合、ポリヌクレオチド分子の実施形態は、二本鎖RNAオリゴヌクレオチド、一本鎖RNAオリゴヌクレオチド、二本鎖RNAポリヌクレオチド、一本鎖RNAポリヌクレオチド、二本鎖DNAオリゴヌクレオチド、一本鎖DNAオリゴヌクレオチド、二本鎖DNAポリヌクレオチド、一本鎖DNAポリヌクレオチド、化学的に修飾されたRNAもしくはDNAオリゴヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド、またはそれらの混合物である。
本発明の態様は、植物における標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘発するための方法であって、(a)ポリヌクレオチド浸透に対する植物のコンディショニングおよび(b)植物へのポリヌクレオチド分子の局所的な適用を含み、ポリヌクレオチド分子は、アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで、標的遺伝子からクローニングされたか、またはそうでなければそれから同定された18以上の連続連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含み、それによって、ポリヌクレオチド分子は植物の内部に浸透し、標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘発する方法を提供する。コンディショニングおよびポリヌクレオチド適用は、別々にまたは単一のステップで実行することができる。コンディショニングおよびポリヌクレオチド適用を別々のステップで実行する場合、コンディショニングは、ポリヌクレオチド適用前でもまたは後でもよく、に数分、数時間、または数日以内に行い得る。いくつかの実施形態では、同じ植物に対して、複数のコンディショニングステップまたは複数のポリヌクレオチド分子適用を実行することができる。方法の実施形態では、セグメントは、(a)標的遺伝子のコード(つまりタンパク質コード)、(b)非コード、または(c)コード部分および非コード部分の両方からクローニングするかまたは同定することができる。非コード部分は、RNA調節配列(たとえばプロモーター、イントロン、5’もしくは3’非翻訳領域、およびマイクロRNA、トランス作用性siRNA、天然のアンチセンスsiRNA、および調節機能を有する他の低分子RNA)、または構造的もしくは酵素的機能を有するRNA(たとえばリボザイム、リボソームRNA、t−RNA、アプタマー、およびリボスイッチ)をコードするDNA(またはDNAによってコードされるRNA)を含む。
植物における標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘発するための方法の様々な実施形態では、標的遺伝子は、(a)植物の内因性遺伝子、(b)植物のウイルス病原体の内因性遺伝子、(c)植物の無脊椎有害生物の内因性遺伝子、(d)植物の無脊椎有害生物の共生生物の内因性遺伝子、または(e)トランスジェニック植物に挿入された人工の遺伝子である。標的遺伝子が植物に対して内因性である実施形態では、標的遺伝子は、(a)植物の成長もしくは生命の維持にとって必須である植物の内因性遺伝子であり、(b)植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードし、または(c)RNA調節分子に転写される。植物における標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘発するための方法の実施形態では、コンディショニングは、化学剤、摩耗、創傷、酵素処理、加熱もしくは冷却の適用、陽圧もしくは陰圧を用いる処理、超音波処理、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、コンディショニングは、有機シリコーン界面活性剤などの界面活性剤、たとえば、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマー(Silwet(登録商標)L−77界面活性剤として市販で入手可能)などのシリコーンポリエーテルコポリマーの適用を含む。方法の実施形態では、コンディショニングは、(a)界面活性剤、(b)有機溶媒または水溶液または有機溶媒の水性混合物、(c)ポリプロピレングリコールまたは水溶液またはポリプロピレングリコールの水性混合物、(d)ナノ粒子、(e)酸化剤、(f)酸もしくは塩基、または(g)油またはそれらの組み合わせの適用を含む。方法の実施形態は、任意選択で、インキュベーションステップ、中和ステップ(たとえば酸、塩基、もしくは酸化剤を中和するまたは酵素を不活性化する)、すすぎステップ、またはそれらの組み合わせを含むことができる。
本発明は、植物における標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘発するための局所的な組成物であって、(a)ポリヌクレオチド浸透に対する植物コンディショニング剤および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで、標的遺伝子のヌクレオチド配列と本質的に同一であるかまたは相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを有するポリヌクレオチド分子を含む局所的組成物を提供する。該組成物は、植物における内因性遺伝子を調整することによって逆遺伝学を調査するための方法を含む、本明細書において開示される様々な方法のために、また、雑草防除および自生植物防除の開示された方法の除草剤組成物として使用することができる。本発明の他の態様では、内因性遺伝子を抑制するための外因性DNAまたはRNAを含む植物が提供されるのであって、外因性DNAは、植物の染色体の中に統合されず、外因性RNAは、植物の染色体の中に統合されるDNAから転写されず、内因性遺伝子は、植物へのポリヌクレオチドの局所的な適用によって抑制される。その代わりに、外因性DNAまたはRNAは、植物有害生物または植物病の制御をもたらすように、有害生物または病原体への応答に関与する内因性植物遺伝子を抑制するよう設計され得る。該植物は、種子から成長させることができ、または切断、クローニング、または移植プロセスによって産生することができる(つまり種子から成長させない植物)。該植物は、条植え作物植物、果実、野菜、木、または観賞植物である。たとえば、本明細書において開示される本発明の実施形態では、植物は、条植え作物植物(たとえばトウモロコシ、ダイズ、綿、アブラナ、サトウダイコン、アルファルファ、サトウキビ、イネ、およびコムギ)または野菜(たとえばトマト、アマトウガラシ、トウガラシ、メロン、スイカ、キュウリ、ナス、カリフラワー、ブロッコリー、レタス、ホウレンソウ、タマネギ、エンドウ、ニンジン、トウモロコシ、ハクサイ、ニラ、ウイキョウ、ポンキン、カボチャもしくはヒョウタン、ラディッシュ、メキャベツ、オオブドウホオズキ、ソラマメ、ドライビーン、またはオクラ)または調理用の植物(たとえばバジル、パセリ、コーヒー、もしくは茶)または果実(たとえばリンゴ、セイヨウナシ、サクランボ、モモ、プラム、アプリコット、バナナ、オオバコ、食用のブドウ、ワイン用のブドウ、柑橘類、アボカド、マンゴー、もしくはベリー)または装飾用のもしくは商業利用のために成長させた木(たとえば果樹もしくは堅果のなる木)または観賞植物(たとえば装飾用の顕花植物もしくは低木もしくは芝草)である。切断、クローニング、または移植プロセスによって産生される植物(つまり種子から成長させない植物)の実施形態は、柑橘類、リンゴ、アボカド、トマト、ナス、キュウリ、メロン、スイカ、およびブドウならびに様々な観賞植物を含む果樹ならびに植物を含む。
(逆遺伝学調査法)
さらに他の態様では、本発明は、植物における内因性標的遺伝子を調節するまたは調整することによって、逆遺伝学の調査法を提供する。該方法には、植物細胞における遺伝子の浸透移行性調節のために、本発明の一本鎖RNAを(直接または間接的に)提供する組成物を成長中の植物の組織に適用することが含まれる。該方法の実施形態では、タンパク質をコードするメッセンジャーRNAまたは調節RNA遺伝子を本発明のポリヌクレオチドによって標的にし、たとえば、ポリヌクレオチドの局所的適用によって付与することができる形質を同定するために、植物の生存中少なくとも1週間は遺伝子の調整を可能とする。本方法は、ストレスまたは処理に対する植物による応答を同定するために、さらなるステップ、たとえば、除草剤相互作用を同定するために一連の化合物に植物を暴露するステップまたは非生物的ストレス(たとえば水不足ストレス、栄養素不足ストレス、熱ストレス、寒冷ストレス、塩分ストレス)もしくは生物的な処理(たとえば、昆虫もしくは線虫有害生物またはウイルス、真菌、細菌病原体による攻撃、または化学化合物もしくは生物学的処理への暴露)に植物を暴露するステップをさらに含むことができる。本発明の他の態様では、一時的に沈黙させた様々な遺伝子を有する植物のライブラリーは、該化合物との相互作用を同定するために、化合物のライブラリー(たとえば除草剤、植物ホルモン、サリチル酸などの内因性もしくは外因性防御誘導因子、またはハーピン、窒素、亜リン酸、カリウム、硫黄、カルシウム、マグネシウム、鉄、および亜鉛などのような植物栄養素を提供する分子の欠失)に対してスクリーニングされる。該スクリーニングにおける有用な植物の例として、オオホナガアオゲイトウおよびベンサミアナタバコが含まれる。
(導入遺伝子サイレンシング法)
本発明のさらに他の態様では、本方法は、植物において発現されている導入遺伝子を沈黙させ、したがって、植物性能に対する導入遺伝子の寄与または形質に対する効果の事象非依存性測定である陰性対照を提供する。陰性対照効果を付与するには、植物の生活環の期間に本発明のポリヌクレオチド分子による複数の連続処理を必要とする場合がある。
(特定の適用)
関連する態様では、本発明の組成物および方法はまた、成長期にまたは収穫後の環境において、培養条件、環境上もしくは非生物的もしくは生物的ストレス、または市場需要の変化に応じて所望の表現型を達成するために、成長中の植物細胞または植物全体における1つまたは複数の遺伝子を一時的に沈黙させるのにも有用である。たとえば、本発明の組成物および方法は、作物植物産物の所望の栄養組成物などの、所望の表現型を有する植物または植物産物を産生するために、生合成または異化遺伝子を一時的に抑制する、たとえば、ダイズもしくはアブラナもしくは他の脂肪種子における所望の脂肪酸プロファイルを達成するためにFAD2遺伝子を抑制する、またはより容易に消化できる飼料植物を提供するためにCOMTおよびCCOMTなどのリグニン生合成遺伝子を抑制するのに有用である。同様に、本発明の組成物および方法は、参照によって本明細書において組み込まれる米国特許出願公開第2009/0070898号において開示されるように、内因性miRNA、miRNA前駆物質、またはmiRNAデコイなどのマイクロRNA(miRNA)または内因性miRNAデコイなどのRNA調節分子を一時的に抑制するのに有用である。本発明の実施形態は、有害生物または病原体への応答に関与する内因性植物遺伝子を抑制し、したがって、植物有害生物または植物病の制御をもたらすのに有用である。本明細書において開示されるポリヌクレオチド、組成物、および送達方法は、たとえば、無脊椎動物の必須遺伝子または無脊椎有害生物の共生生物の遺伝子を標的にするDNAまたはRNA分子の、作物植物、野菜、または果樹に対する局所的噴霧の使用により、植物の無脊椎有害生物、たとえば、植物からRNAの摂取可能な鱗翅目または鞘翅目の有害生物の内因性標的遺伝子を抑制し、したがって、植物有害生物または有害生物誘発性疾患の制御をもたらすのにさらに有用である。本明細書において開示されるポリヌクレオチド、組成物、および送達方法は、たとえば、ウイルス遺伝子を標的にするDNAまたはRNA分子の、作物植物、野菜、または果樹に対する局所的抗ウイルス噴霧の使用により、ウイルス病原体の制御をもたらすのにさらに有用である。
(除草剤組成物および方法)
本発明の態様は、植物細胞における内因性遺伝子(複数可)から転写されるRNAに植物細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる、少なくとも1種類の一本鎖RNAを提供する植物致死剤としてポリヌクレオチド分子を含む液体除草剤組成物を提供する。いくつかの実施形態では、標的遺伝子は、除草剤に対する耐性を提供するタンパク質をコードするか、または植物の成長もしくは生命の維持にとって必須遺伝子をコードする。液体除草剤組成物は、浸透性増強剤、非ヌクレオチド除草剤、またはその組み合わせをさらに含むことができ、別々に適用される非ヌクレオチド除草剤および/または浸透性増強剤により多段階処理で使用することができる。液体除草剤組成物の一実施形態は、浸透性増強剤としての有機シリコーン界面活性剤、および標的遺伝子のサイレンシングを達成するために植物細胞における標的遺伝子から転写されるRNAに、植物細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる一本鎖RNAを植物の細胞に提供する植物致死剤としてのオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを含む液体である。一実施形態では、グリホサート抵抗性植物に対して有効な液体除草剤組成物は、Silwet(登録商標)L−77界面活性剤などのような有機シリコーン界面活性剤およびグリホサートに対する耐性を提供するEPSPSタンパク質をコードする内因性またはトランスジェニックEPSPS遺伝子のRNA転写物に、植物細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる一本鎖RNAを提供するためのポリヌクレオチド分子を含む。ポリヌクレオチド分子が、植物の生長または生命維持にとって必須である、内因性タンパク質または非タンパク質コードRNAをコード化するmRNAに、植物細胞における生理学的条件下でハイブリダイズするように、また、タンパク質の遺伝子サイレンシングおよび低下を達成するよう設計されている場合、ポリヌクレオチド分子は、植物致死剤、つまりヌクレオチド除草剤として機能することができる。ポリヌクレオチド分子を含む除草剤組成物は、成長中の植物の葉上へ局所的にコーティングするのに使用され得、または、たとえば、水耕法で成長させた植物もしくは鉢で成長させた植物の根もしくは切った茎上への適用するのに採用され得る。
本発明の態様は、浸透性増強剤、たとえば、有機シリコーン界面活性剤などの界面活性剤、および細胞における内因性植物遺伝子から転写されるRNAに、植物細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる一本鎖RNAを(直接または間接的に)提供するオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを含む、生きている植物の葉または他の表面上への局所的コーティングに適した組成物を提供する。一実施形態では、内因性植物遺伝子は、グリホサート、ジカンバ、またはスルホニル尿素などの除草剤に対する除草剤耐性を提供するタンパク質をコードする内因性植物遺伝子である。除草剤耐性を提供する該タンパク質の例は、下記の「除草剤耐性タンパク質」の箇所において開示される。
本発明の他の態様は、除草剤抵抗性作物植物の畑において、成長中の除草剤抵抗性自生植物を制御するための方法であって、自生植物の葉または他の表面上に、自生植物の細胞に対しまたは該細胞において、細胞における内因性遺伝子から転写されるRNAに、自生植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる一本鎖RNA分子を提供するまたはその産生を可能にする組成物を適用するステップを含み、内因性遺伝子は、(i)自生植物の成長または生命の維持にとって必須遺伝子である、(ii)自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードする、または(iii)RNA調節剤(たとえばプロモーター、またmiRNA前駆物質、miRNA、トランス作用性siRNA、ならびにアプタマーおよびリボスイッチなどの調節機能を有する他の非コードRNA)に転写される方法を提供する。自生植物の細胞に対しまたは該細胞において、細胞における内因性遺伝子から転写されるRNAに、自生植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる一本鎖RNA分子を提供するまたは産生を可能にする組成物は、(a)一本鎖RNA分子、(b)自己ハイブリダイズして、二本鎖RNA分子を形成する一本鎖RNA分子、(c)二本鎖RNA分子、(d)一本鎖DNA分子、(e)自己ハイブリダイズして、二本鎖DNA分子を形成する一本鎖DNA分子、および(f)RNA分子に転写される修飾Pol III遺伝子を含む一本鎖DNA分子、(g)二本鎖DNA分子、(h)RNA分子に転写される修飾Pol III遺伝子を含む二本鎖DNA分子、ならびに(i)二本鎖ハイブリダイズRNA/DNA分子から成る群から選択される、少なくとも1つのポリヌクレオチド分子を含む。自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードする、自生植物の内因性遺伝子のサイレンシングまたは抑制のための実施形態では、本方法には、タンパク質が抵抗性を提供する対象の除草剤を一定量自生植物に対して適用することが含がまれ得る。本発明の組成物および方法は、作物畑、たとえば、トウモロコシ、ダイズ、ワタ、アブラナ、サトウダイコン、アルファルファ、サトウキビ、イネ、コムギ、果実、および野菜作物などの除草剤抵抗性作物植物の畑において成長し得る除草剤耐性(抵抗性)の雑草または自生除草剤耐性(抵抗性)トランスジェニック植物を制御するのに有用である。いくつかの該実施形態では、雑草または自生植物は、アカザ(たとえばパルマーアマランス)および他のアマランス種、スギナモ(ヒメムカシヨモギ)、ウォーターヘンプ(waterhemp)、オオブタクサ、一般的なブタクサ、セイバンモロコシ、ヤエムグラ、ドクムギ、ヘアリーメヒシバ、プリックリーレタス、ベルベットリーフ、アルファルファ、トウモロコシ、ダイズ、アブラナ、ワタ、サトウダイコン、サトウキビ、イネ、またはコムギである。いくつかの該実施形態では、内因性遺伝子は、除草剤耐性を提供するタンパク質をコードし、該タンパク質の例は、本明細書の「除草剤耐性タンパク質」の箇所において開示される。その他の該実施形態では、一本鎖RNAは、他の植物ではなく特定の植物種における遺伝子を選択的に抑制し、その植物種の選択的な制御を可能にする。さらにその他の該実施形態では、非選択的一本鎖RNA分子は、複数の植物種における共通の遺伝子を抑制し、植物の群または分類群にわたってより広汎な制御を可能にする。さらに具体的な実施形態では、本方法には、RNA分子の標的であるタンパク質が抵抗性を提供し、RNA分子の作用により標的タンパク質の産生を低下させ、非ヌクレオチド除草剤の作用により生成されるタンパク質の機能を阻害することを通じて作用の二重モードを可能とする、タンパク質の抵抗性提供対象である非ヌクレオチド除草剤を一定量(たとえばグリホサート、ジカンバ、グルホシネート、またはスルホニル尿素)、雑草または自生植物に適用することがさらに含まれる。、除草剤は、ヌクレオチド組成物とは別のステップで(前もしくは後に)、または同時に適用することができる。いくつかの場合、従来の非ヌクレオチド除草剤と同時に、またはその前に、ポリヌクレオチド組成物を適用することにより、雑草または自生植物防除に相乗効果を提供する(つまり、併用効果は、別々処理による効果の合計よりも大きい)。
(除草剤耐性タンパク質)
除草剤耐性(抵抗性)を示す天然(非トランスジェニック)植物およびトランスジェニック植物は、除草剤耐性を担うタンパク質をコードする遺伝子、たとえば、耐性を提供する導入遺伝子、耐性または除草剤によって通常標的にされる内因性遺伝子の複数コピーを提供する突然変異内因性遺伝子を有することが多い。そのような植物の制御のための戦略は、除草剤耐性を付与するタンパク質をコードする遺伝子の発現を抑制または少なくとも低下させる剤を適用することである。除草剤に対する耐性を提供するタンパク質の例は、たとえば5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、グリホサートキシドレダクターゼ(GOX)、グリホサートデカルボキシラーゼ、グリホサートN−アセチルトランスフェラーゼ(GAT)、ジカンバモノオキシゲナーゼ、ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼ、2,2−ジクロロプロピオン酸デハロゲナーゼ、アセトヒドロキシ酸シンターゼ、アセト乳酸シンターゼ、ハロアリールニトリラーゼ、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、およびセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼを含む。
除草剤に耐性を与えるタンパク質をコードする核酸の例は、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS;たとえば米国特許第5,627,061号、第5,633,435号 RE39247、第6,040,497号、および第5,094,945号ならびにPCT国際特許出願公開WO04074443およびWO04009761を参照されたい)、グリホサートキシドレダクターゼ(GOX;米国特許第5,463,175号)、グリホサートデカルボキシラーゼ(PCT国際特許出願公開WO05003362、米国特許第7,405,347号、および米国特許出願公開第2004/0177399号)、グリホサートに対する耐性を与えるグリホサートN−アセチルトランスフェラーゼ(GAT;米国特許第7,714,188号);ジカンバなどオーキシン様除草剤に対する耐性を与えるジカンバモノオキシゲナーゼ(米国特許第7,105,724号);ホスフィノトリシンまたはグルホシネートに対する耐性を与えるホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼ(patまたはbar)(米国特許第5,646,024号);2,2−ジクロロプロピオン酸(ダラポン)に対する耐性を与える2,2−ジクロロプロピオン酸デハロゲナーゼ(PCT国際特許出願公開WO9927116);スルホニル尿素、イミダゾリノン、トリアゾールピリミジン、ピリミジルオキシベンゾエート、およびフタリドなどアセト乳酸シンターゼ阻害剤に対する耐性を与えるアセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(米国特許第6,225,105号);ブロモキシニルに対する耐性を与えるためのハロアリールニトリラーゼ(Bxn)(米国特許第4,810,648号);シクロヘキサンジオン(セトキシジム)およびアリールオキシフェノキシプロピオネート(ハロキシホップ)に対する耐性を与えるための修飾アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(米国特許第6,414,222号);スルホンアミド除草剤に対する耐性を与えるためのジヒドロプテロイン酸シンターゼ(sul I)(米国特許第5,719,046号);トリアジン系除草剤に対する耐性を与えるための32kDa光化学系IIポリペプチド(psbA)(Hirschberg et al., 1983, Science, 222:1346−1349);5−メチルトリプトファンアミドに対する耐性を与えるためのアントラニル酸シンターゼ(米国特許第4,581,847号);アミノエチルシステインに対する耐性を与えるためのジヒドロジピコリン酸シンターゼ(dap A)(PCT国際特許出願公開WO8911789);ノルフルラゾンなどのピリダジノン除草剤に対する耐性を与えるためのフィトエン不飽和化酵素(crtI)(日本特許JP06343473);イソキサフルトールなどのようなシクロプロピルイソオキサゾール除草剤に対する耐性を与えるためのヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ、4−ヒドロキシフェニル酢酸酸オキシダーゼ、および4−ヒドロキシフェニル酢酸1−ヒドロラーゼ(米国特許第7,304,209号)(米国特許第6,268,549号);プロトポルフィリノーゲンオキシダーゼ阻害剤に対する耐性を与えるのための修飾プロトポルフィリノーゲンオキシダーゼ I(protox)(米国特許第5939602号);アリールオキシアルカノエート成分を含有する除草剤に対する耐性を与えるためのアリールオキシアルカノエートジオキシゲナーゼ(AAD−1)(国際公開番号WO05107437);セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ(米国特許出願公開第2008/0155716号)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ(米国特許出願公開第2009/0018016号)を含む。該除草剤の例は、フェノキシオーキシン(2,4−Dおよびジクロルプロップなど)、ピリジルオキシオーキシン(フルロキシピルおよびトリクロピルなど)、アリールオキシフェノキシプロピオネート(AOPP)アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)阻害剤(ハロキシホップ、キザロホップ、およびジクロホップなど)、ならびに5−置換フェノキシ酢酸プロトポルフィリノーゲンオキシダーゼIX阻害剤(ピラフルフェンおよびフルミクロラックなど)を含む。本段落において引用される米国特許および特許出願公開において開示される除草剤耐性タンパク質をコードする核酸のヌクレオチド配列および除草剤耐性タンパク質の配列は、参照によって本明細書に組み込まれる。
本発明の態様は、植物に対して致死的となるレベルまたは少なくとも除草剤耐性を低下させるレベルで、該除草剤耐性タンパク質をコードするRNAにハイブリダイズするRNAを植物細胞に直接または間接的に提供するポリヌクレオチドおよび方法を提供する。除草剤耐性タンパク質をコードするDNAの配列縮重により、特定の植物において特に有効である、本発明での使用のためのポリヌクレオチドを設計することが可能である。多くの植物のDNAドメインを保存しているため、様々な植物に対して有効である、本発明での使用のためのポリヌクレオチドを設計することが可能である。
一実施形態では、ポリヌクレオチドは、除草剤活性の改善を提供することによって除草剤の活性を強化するために、対応する除草剤と混合される。一実施形態では、ポリヌクレオチドは、除草剤と別々にであるが、前処理または後処理として除草剤と組み合わせて利用される。実施形態では、有機シリコーン界面活性剤は、除草剤およびポリヌクレオチドと好都合に組み合わせられ、組成物が連続的な方法で適用される場合、一方または他方と組み合わせられる。温室設定の植物は、0.25MPa圧力で、決定された速度(たとえば140L/ha)で、試料溶液を送達するために、11001XRスプレーノズルを有するトラック噴霧器または実験用の噴霧器を使用して処理することができる。畑において、処理溶液は、0.25MPa噴霧圧で、カスタマイズされたシングルノズルアセンブリー(廃棄物を最小限にするために)を有する11015フラットファンスプレーノズルを有する、適切な比率の組成物を送達するために調整されたCO加圧バックパック噴霧器により適用することができ、シングルノズル噴霧器は、3〜12インチの高さの成長期植物の草冠上に60cmの有効な噴霧幅(spray swath)を提供する。
本開示において示される先の記載および実施例は、以下のローマ数字の項目において記載される態様および実施形態を含む本発明の主題を記載するが、これらに限定されない:(I)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチド、および少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含む方法。(II)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、局所的にコーティングされたもの以外の植物細胞において標的内因性遺伝子の発現を調節することを含む方法。(III)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチド、および少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、少なくとも1つの植物器官において、浸透移行的に標的内因性遺伝子の発現を調節することを含む方法。(IV)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチド、および少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、標的内因性遺伝子の抑制を誘発する方法。(V)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチド、および少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、成長中の植物または植物器官において所望の表現型を達成する方法。(VI)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、成長中の植物または植物器官において、酵素、構造タンパク質、または植物調節タンパク質の発現を抑制する方法。(VII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、植物致死剤である方法。(VIII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該標的内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質をコードする方法。(IX)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該標的内因性遺伝子は、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、およびセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼから成る群から選択される方法。(X)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該標的内因性遺伝子は、成長中の植物の成長の維持にとって必須のタンパク質をコードする方法。(XI)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該標的内因性遺伝子は、RuBisCO、翻訳開始因子、およびフィトエン不飽和化酵素から成る群から選択される方法。(XII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、標的内因性遺伝子は、除草剤に対する耐性を提供するタンパク質をコードする方法。(XIII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該標的内因性遺伝子は、スルホニル尿素およびイミダゾリノン除草剤に対する抵抗性を与える突然変異体アセト乳酸シンターゼ酵素またはアリールオキシフェノキシプロピオネート除草剤に対する抵抗性を与える突然変異体ACCaseをコードする方法。(XIV)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長
中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、第2の標的内因性遺伝子または第2の標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する第2のポリヌクレオチドをさらに含む方法。(XV)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物はさらに第2のポリヌクレオチドを含み、該第2ポリヌクレオチドは、第2の標的内因性遺伝子または第2の標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAの18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有し、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物または植物器官における内因性EPSPS遺伝子の18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一でありまたは本質的に相補的であり、該第2ポリヌクレオチドは、成長中の植物または植物器官における内因性翻訳開始因子遺伝子の18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である方法。(XVI)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該標的内因性遺伝子は、非コード配列、コード配列、または非コード配列およびコード配列の組み合わせである方法。(XVII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、成長中の植物の器官上にコーティングされる方法。(XVIII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、成長中の植物の葉、茎、種子、果実、または花上にコーティングされる方法。(XIX)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、標的内因性遺伝子の異なるセグメントまたはその少なくとも1つのポリヌクレオチド以外の標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する第2のポリヌクレオチドをさらに含む方法。(XX)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、成長中の該植物が田畑または温室にある方法。(XXI)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチドは成長中の植物の染色体の中に統合されない方法。(XXII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択される方法。(XXIII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該移送剤は、有機シリコーン界面活性剤および塩から成る群から選択される方法。(XXIV)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および塩から成る群から選択される方法。(XXV)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および塩から成る群から選択され、シリコーンポリエーテルコポリマーは、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマーである方法。(XXVI)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択され、該塩は、有機塩または無機塩である方法。(XXVII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該移送剤は、界面活性剤、有機アンモニウ
ム塩、および無機アンモニウム塩から成る群から選択される方法。(XXVIII)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該移送剤は、界面活性剤および硫酸アンモニウムから成る群から選択される方法。(XXIX)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択され、湿潤剤またはキレート剤をさらに含む方法。(XXX)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、噴霧装置によって成長中の植物または植物器官上にコーティングされる方法。(XXXI)成長中の植物または植物器官において標的内因性遺伝子の発現を調節するための方法であって、成長中の植物または植物器官上に、標的内因性遺伝子または標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAのいずれかにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび少なくとも1つのポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤から成るポリヌクレオチド組成物を局所的にコーティングし、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、標的内因性遺伝子の発現を調節することを含み、該ポリヌクレオチドは、ssDNA、dsDNA、1本鎖RNA、dsRNA、およびRNA/DNAハイブリッドから成る群から選択される方法。(XXXII)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化する方法。(XXXIII)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該内因性遺伝子は、除草剤標的遺伝子または除草剤非活性化遺伝子であるタンパク質を発現させる方法。(XXXIV)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該内因性遺伝子は、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、およびセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼから成る群から選択される除草剤標的遺伝子または除草剤非活性化遺伝子であるタンパク質を発現させる方法。(XXXV)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該ポリヌクレオチド組成物および除草剤は、別々にまたは同じ溶液において適用される方法。(XXXVI)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該ポリヌクレオチドは、ssDNA、dsDNA、1本鎖RNA、dsRNA、およびRNA/DNAハイブリッドから成る群から選択される方法。(XXXVII)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該ポリヌクレオチド組成物は、標的内因性遺伝子の異なるセグメントまたはその少なくとも1つのポリヌクレオチド以外の標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する第2のポリヌクレオチドをさらに含む方法。(XXXVIII)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該ポリヌクレオチド組成物は、それぞれ、標的内因性遺伝子の異なるセグメントまたはその少なくとも1つのポリヌクレオチド以外の標的内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAにおける18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補
的である配列を有する複数のポリヌクレオチドをさらに含む方法。(XXXIX)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択される方法。(XL)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該移送剤は、有機シリコーン界面活性剤および塩から成る群から選択される方法。(XLI)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および塩から成る群から選択される方法。(XLII)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および塩から成る群から選択され、シリコーンポリエーテルコポリマーは、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマーである方法。(XLIII)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択され、塩は、有機塩または無機塩である方法。(XLIV)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該移送剤は、界面活性剤、有機アンモニウム塩、および無機アンモニウム塩から成る群から選択される方法。(XLV)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、該移送剤は、界面活性剤および硫酸アンモニウムから成る群から選択される方法。(XLVI)成長中の植物において除草剤の活性を強化するための方法であって、(a)植物の内因性遺伝子における18以上の連続するヌクレオチドの配列と本質的に相補的である18以上の連続するヌクレオチドの配列と本質的に同一であるまたは本質的に相補的である配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドであって、該内因性遺伝子は、除草剤と相互作用するタンパク質を発現させる少なくとも1つのポリヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが成長中の植物の内部に浸透するのを可能にするための有効量の移送剤を含むポリヌクレオチド組成物を成長中の植物の表面上に局所的にコーティングすることならびに(b)成長中の植物に対して除草剤を適用することを含み、それによって、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、成長中の植物の内部に浸透し、内因性遺伝子の抑制を誘発し、それによって、成長中の植物における除草剤の活性を強化し、移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択され、該移送剤は、湿潤剤またはキレート剤をさらに含む方法。(XLVII)液体において、界面活性剤および少なくとも1つの植物致死剤を含む、成長中の植物の外面上への局所的なコーティングに適した除草剤組成物であって、該植物致死剤は、植物遺伝子の配列または植物遺伝子の転写RNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有するポリヌクレオチドを含み、ポリヌクレオチドは、植物遺伝子についてのプローブにハイブリダイズする低分子RNAの浸透移行性の産生を達成する改善物である。(XLVIII)液体において、非ポリヌクレオチド除草剤を含む除草剤組成物であって、該組成物は、植物遺伝子の配列または植物遺伝子の転写RNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有するポリヌクレオチドをさらに含む改善物である。(XLIX)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(L)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成り、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択される組成物。(LI)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成り、該移送剤は、有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成り、移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LIII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的であ
る配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成り、移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択され、シリコーンポリエーテルコポリマーは、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマー(Silwet(登録商標)L−77界面活性剤として入手可能)である組成物。(LIV)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)非ポリヌクレオチド除草剤分子をさらに含む、植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチドの移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LV)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、植物遺伝子は、除草剤耐性を提供するタンパク質をコードし、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、またはセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼである組成物。(LVI)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LVII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択される組成物。(LVIII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LIX)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LX)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択され、シリコーンポリエーテルコポリマーは、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマー(Silwet(登録商標)L−77界面活性剤として入手可能)である組成物。(LXI)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)非ポリヌクレオチド除草剤分子をさらに含む、植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LXII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、植物遺伝子は、除草剤耐性を提供するタンパク質をコードし、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、またはセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼである組成物。(LXIII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LXIV)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択される組成物。(LXV)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LXVI)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LXVII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの
溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択され、シリコーンポリエーテルコポリマーは、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマー(Silwet(登録商標)L−77界面活性剤として入手可能)である組成物。(LXVIII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)非ポリヌクレオチド除草剤分子をさらに含む、植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LXIX)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、植物遺伝子は、除草剤耐性を提供するタンパク質をコードし、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、またはセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼである組成物。(LXX)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LXXI)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択される組成物。(LXXII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LXXIII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LXXIV)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択され、シリコーンポリエーテルコポリマーは、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマー(Silwet(登録商標)L−77界面活性剤として入手可能)である組成物。(LXXV)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)非ポリヌクレオチド除草剤分子をさらに含む、植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LXXVI)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、植物遺伝子は、除草剤耐性を提供するタンパク質をコードし、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、またはセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼである組成物。(LXXVII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LXXVIII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、界面活性剤および塩から成る群から選択される組成物。(LXXIX)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LXXX)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機
シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択される組成物。(LXXXI)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、該移送剤は、シリコーンポリエーテルコポリマー有機シリコーン界面活性剤および無機塩から成る群から選択され、シリコーンポリエーテルコポリマーは、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマー(Silwet(登録商標)L−77界面活性剤として入手可能)である組成物。(LXXXII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)非ポリヌクレオチド除草剤分子をさらに含む、植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物。(LXXXIII)(a)植物の内因性遺伝子の配列または内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるまたは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物であって、植物遺伝子は、除草剤耐性を提供するタンパク質をコードし、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、またはセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼである組成物。(LXXXIV)除草剤抵抗性作物植物の畑において、成長中の標的除草剤抵抗性自生植物を選択的に制御するための方法であって、(i)自生植物の成長または生命の維持にとって必須遺伝子である、(ii)自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードする、または(iii)RNA調節剤に転写される内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAに、自生植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる浸透移行性一本鎖RNAを自生植物の細胞中に提供するポリヌクレオチドオリゴマーを含む組成物を自生植物の葉上に適用することを含む方法。(LXXXV)除草剤抵抗性作物植物の畑において、成長中の標的除草剤抵抗性自生植物を選択的に制御するための方法であって、(i)自生植物の成長または生命の維持にとって必須遺伝子である、(ii)自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードする、または(iii)RNA調節剤に転写される内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAに、自生植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる浸透移行性の一本鎖RNAを自生植物の細胞中に提供するポリヌクレオチドオリゴマーを含む組成物を自生植物の葉上に適用することを含み、該組成物は、界面活性剤ならびに一本鎖RNA、二本鎖RNA、一本鎖DNA、二本鎖DNA、および二本鎖ハイブリダイズRNA/DNAから成る群から選択されるオリゴマーを含み、オリゴマーは、内因性遺伝子のメッセンジャーRNAと本質的に同一であるまたは相補的である配列を有し、内因性遺伝子は、天然の遺伝子または組換え導入遺伝子である方法。(LXXXVI)除草剤抵抗性作物植物の畑において、成長中の標的除草剤抵抗性自生植物を選択的に制御するための方法であって、(i)自生植物の成長または生命の維持にとって必須遺伝子である、(ii)自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードする、または(iii)RNA調節剤に転写される内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAに、自生植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる浸透移行性の一本鎖RNAを自生植物の細胞中に提供するポリヌクレオチドオリゴマーを含む組成物を自生植物の葉上に適用することを含み、該自生植物は、アカザ、ベルベットリーフ、ウォーターヘンプ、プリックリーレタス、タンポポ、アルファルファ、トウモロコシ、ダイズ、アブラナ、ワタ、サトウダイコン、サトウキビ、コムギ、イネ、または野菜である方法。(LXXXVII)除草剤抵抗性作物植物の畑において、成長中の標的除草剤抵抗性自生植物を選択的に制御するための方法であって、(i)自生植物の成長または生命の維持にとって必須遺伝子である、(ii)自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードする、または(iii)RNA調節剤に転写される内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAに、自生植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる浸透移行性の一本鎖RNAを自生植物の細胞中に提供するポリヌクレオチドオリゴマーを含む組成物を自生植物の葉上に適用することを含み、該作物植物は、トウモロコシ、ダイズ、ワタ、アブラナ、サトウダイコン、アルファルファ、サトウキビ、イネ、コムギ、または果実もしくは野菜作物である方法。(LXXXVIII)除草剤抵抗性作物植物の畑において、成長中の標的除草剤抵抗性自生植物を選択的に制御するための方法であって、(i)自生植物の成長または生命の維持にとって必須遺伝子である、(ii)自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードする、または(iii)RNA調節剤に転写される内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAに、自生植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる浸透移行性の一本鎖RNAを自生植物の細胞中に提供するポリヌクレオチドオリゴマーを含む組成物を自生植物の葉上に適用することを含み、該内因性遺伝子は、自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードし、タンパク質は、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、またはセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼである方法。(LXXXIX)除草剤抵抗性作物植物の畑において、成長中の標的除草剤抵抗性自生植物を選択的に制御するための方法であって、(i)自生植物の成長または生命の維持にとって必須遺伝子である、(ii)自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードする、または(iii)RNA調節剤に転写される内因性遺伝子から転写されるメッセンジャーRNAに、自生植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる浸透移行性の一本鎖RNAを自生植物の細胞中に提供するポリヌクレオチドオリゴマーを含む組成物を自生植物の葉上に適用することを含み、該内因性遺伝子は、自生植物に対して除草剤抵抗性を提供するタンパク質をコードし、タンパク質は、5−エノイルピルビニルシキミ酸−3−ホスフェートシンターゼ(EPSPS)、アセトヒドロキシ酸シンターゼまたはアセト乳酸シンターゼ(ALS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、ジヒドロプテロイン酸シンターゼ、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、パラ−アミノ安息香酸シンターゼ、グルタミンシンターゼ(GS)、グルホシネート耐性グルタミンシンターゼ、1−デオキシ−D−キシルロース5‐リン酸(DOXP)シンターゼ、ジヒドロプテロイン酸(DHP)シンターゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、光化学系IIのD1タンパク質、モノオキシゲナーゼ、シトクロムP450、セルロースシンターゼ、ベータチューブリン、またはセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼであり、タンパク質が抵抗性を提供する対象の除草剤を一定量、自生植物に対して適用することをさらに含む方法。(XC)植物における内因性標的遺伝子を調整することによって、逆遺伝学を調査するための方法であって、(1)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(2)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(3)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖
RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(4)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(5)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物を成長中の植物の組織上に適用することを含む方法。(XCI)植物における内因性標的遺伝子を調整することによって、逆遺伝学を調査するための方法であって、(1)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(2)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(3)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(4)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(5)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物を成長中の植物の組織上に適用することを含み、該組成物は、植物の生存の間の少なくとも1週間の期間の間に標的遺伝子の修飾を達成する方法。(XCII)植物における内因性標的遺伝子を調整することによって、逆遺伝学を調査するための方法であって、(1)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(2)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(3)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(4)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(5)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物を成長中の植物の組織上に適用することを含み、該細胞において転写されるRNAは、タンパク質をコードするメッセンジャーRNAまたは調節RNAである方法。(XCIII)植物における内因性標的遺伝子を調整することによって、逆遺伝学を調査するための方法であって、(1)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(2)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(3)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(4)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(5)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物を成長中の植物の組織上に適用することを含み、除草剤相互作用を同定するために一連の化合物に植物を暴露することをさらに含む方法。(XCIV)植物における内因性遺伝子を調整することによって、逆遺伝学を調査するための方法であって、(1)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該
二本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(2)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖DNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖DNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖DNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(3)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(4)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可一本鎖RNAポリヌクレオチドの溶液であって、該一本鎖RNAポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ一本鎖RNAポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物または(5)(a)植物の内因性遺伝子の配列もしくは内因性遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一であるもしくは相補的である配列を有する転写不可二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドの溶液であって、該二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチドは、内因性遺伝子のサイレンシングを達成するために内因性遺伝子または内因性遺伝子から転写されるRNAに、植物の細胞における生理学的条件下でハイブリダイズすることができる溶液および(b)植物の表面から細胞の中へ二本鎖DNA/RNAハイブリッドポリヌクレオチド移送を促進するのに有効な移送剤から本質的に成る組成物を生きている植物の組織上に局所的に適用することを含む方法。(XCV)(a)ポリヌクレオチドオリゴマー浸透に対する植物コンディショニング剤および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで、植物の内因性遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含むポリヌクレオチドオリゴマーの水溶液を含む除草剤組成物であって、該内因性遺伝子は、化学的除草剤に対する抵抗性を植物に提供するタンパク質をコードするまたは必須遺伝子である除草剤組成物。(XCVI)(a)ポリヌクレオチドオリゴマー浸透に対する植物コンディショニング剤および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで、植物の内因性遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含むポリヌクレオチドオリゴマーの水溶液を含む除草剤組成物であって、該内因性遺伝子は、化学的除草剤に対する抵抗性を植物に提供するタンパク質をコードしまたは必須遺伝子であり、化学的除草剤をさらに含む除草剤組成物。(XCVII)(a)ポリヌクレオチドオリゴマー浸透に対する植物コンディショニング剤および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで、植物の内因性遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含むポリヌクレオチドオリゴマーの水溶液を含む除草剤組成物であって、該内因性遺伝子は、化学的除草剤に対する抵抗性を植物に提供するタンパク質をコードしまたは必須遺伝子であり、グリホサート、ジカンバ、ホスフィノトリシン、ブロモキシニル、イオキシニル、またはクロルスルフロン除草剤化合物を含む化学的除草剤をさらに含む除草剤組成物。(XCVIII)(a)ポリヌクレオチドオリゴマー浸透に対する植物コンディショニング剤および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで、植物の内因性遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含むポリヌクレオチドオリゴマーの水溶液を含む除草剤組成物であって、該内因性遺伝子は、化学的除草剤に対する抵抗性を植物に提供するタンパク質をコードしまたは必須遺伝子であり、グリホサート化合物、シリコーンポリエーテルコポリマー界面活性剤、およびポリヌクレオチドオリゴマーを含む化学的除草剤をさらに含む除草剤組成物。(XCIX)内因性遺伝子を抑制するための外因性DNAまたはRNAを含む植物であって、該外因性DNAは、植物の染色体の中に統合されず、該外因性RNAは、植物の染色体の中に統合されるDNAから転写されず、該内因性遺伝子は、植物が種子から発生した後に、植物へのポリヌクレオチドの局所的な適用によって抑制される植物。(C)植物細胞の外面へポリヌクレオチドを局所的に適用することにより植物細胞の内部にポリヌクレオチドを送達するための方法であって、有機シリコーン界面活性剤とポリヌクレオチドを組み合わせることを含む方法。(CI)植物細胞の外面へポリヌクレオチドを局所的に適用することにより植物細胞の内部にポリヌクレオチドを送達するための方法であって、有機シリコーン界面活性剤とポリヌクレオチドを組み合わせることを含み、有機シリコーン界面活性剤は、シリコーンポリエーテルコポリマーである方法。(CII)植物細胞の外面へポリヌクレオチドを局所的に適用することにより植物細胞の内部にポリヌクレオチドを送達するための方法であって、有機シリコーン界面活性剤とポリヌクレオチドを組み合わせることを含み、該有機シリコーン界面活性剤は、シリコーンポリエーテルコポリマーであり、シリコーンポリエーテルコポリマーは、ポリアルキレンオキシド修飾ヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマーである方法。(CIII)植物細胞の外面へポリヌクレオチドを局所的に適用することにより植物細胞の内部にポリヌクレオチドを送達するための方法であって、有機シリコーン界面活性剤および有機または無機塩とポリヌクレオチドを組み合わせることを含む方法。(CIV)植物細胞の外面へポリヌクレオチドを局所的に適用することにより植物細胞の内部にポリヌクレオチドを送達するための方法であって、有機シリコーン界面活性剤および有機または無機塩とポリヌクレオチドを組み合わせることを含み、該塩はアンモニウム塩である方法。(CV)植物細胞の外面へポリヌクレオチドを局所的に適用することにより植物細胞の内部にポリヌクレオチドを送達するための方法であって、有機シリコーン界面活性剤および有機または無機塩とポリヌクレオチドを組み合わせることを含み、該塩はアンモニウム塩であり、該アンモニウム塩は硫酸アンモニウムである方法。(CVI)植物細胞の外面へポリヌクレオチドを局所的に適用することにより植物細胞の内部にポリヌクレオチドを送達するための方法であって、有機シリコーン界面活性剤とポリヌクレオチドを組み合わせることを含み、該ポリヌクレオチド組成物は、噴霧装置によって成長中の植物または植物器官上にコーティングされる方法。
実施例1
本実施例は、除草剤耐性雑草の制御における本発明のポリヌクレオチド分子の有用性を説明する。グリホサート耐性パルマーアマランス(の遺伝子型は、除草剤処理においてグリホサート化合物により標的とされる5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)をコードする遺伝子の例えば4−100コピーを超える複数コピーを有すると同定された。
図1に示される配列番号1に関して、4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」dsRNA分子は、図1の下線付きのヌクレオチドに示される、位置14−38(短いdsRNA-1)、位置153−177(短いdsRNA-2)、345−369(短いdsRNA-3)および1105−1129(短いdsRNA-4)のパルマーアマランスEPSPS遺伝子から転写されるmRNAにハイブリダイズ可能なアンチセンス鎖と設計した。4つの設計された短いdsRNAは、Integrated DNA Technologies社(IDT)から購入した;dsRNAはアンチセンス鎖の3’末端に2つのヌクレオチドの突出を有し、センス鎖の3’末端に末端ヌクレオチドとして2つのデオキシヌクレオチドを有した。
配列番号1および図1に関して、3つの「長い」二本鎖RNAポリヌクレオチドは、図1の太字のヌクレオチドに示される、位置16−170(長いdsRNA-1)、451−722(長いdsRNA-2)および1109−1328(長いdsRNA-3)のパルマーアマランスEPSPS遺伝子から転写されるmRNAにハイブリダイズ可能な1つの鎖と設計した。3つの設計された長いdsRNAは、Ambion MEGAscript(登録商標)RNAiキット、Cat. No. 1626を用いて作製された。
EPSPSをコードする16コピーの内在性遺伝子を有するグリホサート耐性パルマーアマランスの植物性のクローン(Gaines、 et al.(2010)Proceedings of the National Academy of Sciences 107(3):1029-1034)を、3.5kg/立方メートルのOsmocote(登録商標)14-14-14成長促進剤を含むSunGro(登録商標)Redi-earth seedling mixを含む3.5平方インチのポットで、温室の中で、明期14時間および日中温度摂氏30度ならびに夜間温度摂氏20度で栽培した;必要に応じて植物に脱イオン化水を与えた。
葉の浸漬用の前処理界面活性剤溶液を、Silwet L-77ブランド有機シリコン界面活性剤を蒸留水で0.1%(v/v)に希釈することにより調製した。前処理5%(w/v)カーボランダム溶液を、2gのカーボランダム(400グリット)を40mlの蒸留水に混合することにより調整した。処理緩衝液を、DEPC水(Omega Bio-Tek)中、10mMリン酸ナトリウムおよび0.01%(v/v)Silwet L-77有機シリコン界面活性剤で調製し、pH6.8に調整した。短いdsRNA溶液を、4つの短いdsRNA(上記に同定した)の各々を当モル量、処理緩衝液中、1マイクロリットルあたり短いdsRNAを各々0.005ナノモルの濃度で調整した。長いdsRNA溶液を、3つの長いdsRNAの各々を当モル量、処理緩衝液中、1マイクロリットルあたり長いdsRNAを各々0.0006ナノモルの濃度で調整した。混合(短い/長い)dsRNA溶液を1マイクロリットルあたり4つの短いdsRNAの各々を0.005ナノモルおよび3つの長いdsRNAの各々を0.0006ナノモルで調製した。
dsRNA移送または浸透用の葉のコンディショニングのため、EPSPSをコードする16コピーの内在性遺伝子を有するグリホサート耐性パルマーアマランスの植物性のクローンをカーボランダム溶液または界面活性剤溶液で前処理した。カーボランダム溶液について、前処理の葉の剥離は、葉の上面の0.5mlのカーボランダム溶液を優しく擦りつけ、水で洗い流し、拭きとり乾燥させることで達成された。界面活性剤溶液前処理ついて、4つの完全に開いた成熟源の葉を界面活性剤溶液に浸漬し、乾燥させた。カーボランダム溶液または界面活性剤溶液による葉の前処理の後、条件付けられた葉を、緩衝液(対照として)または40マイクロリットルのdsRNA溶液(一植物あたり4枚の各葉に10マイクロリットルのdsRNA溶液を適用)で処理した。短いdsRNA溶液での処理は、約0.8ナノモルの短いdsRNA分子(各0.2ナノモルの短いdsRNA)を各々処理された植物に適用した。長いdsRNA溶液での処理は、約0.072ナノモルの長いdsRNA分子(各0.024ナノモルの長いdsRNA)を各々処理された植物に適用した。混合(短い/長い)dsRNA溶液での処理は、約0.8ナノモルの短いdsRNA分子および約0.072ナノモルの長いdsRNA分子を各々の処理された植物に適用した。対照以外は、dsRNA処理の直後、48時間後または72時間後に、すべての植物にグリホサート除草剤溶液(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧し、グリホサート処理後少なくとも7日後に評価した。
(結果)
6つの界面活性剤処理された対照植物(dsRNA分子未処理)はグリホサート処理に生存した。グリホサート処理後7日目の植物の写真については図3Aを参照。
4つのカーボランダム研磨剤処理された対照植物(dsRNA分子未処理)のうち2つは、グリホサート処理により枯れた。
混合(短い/長い)dsRNA溶液適用直後にグリホサート処理された6つの界面活性剤処理された植物は生存したが成長が阻害された。
混合(短い/長い)dsRNA溶液でのみ処理した、グリホサート未処理の6つの界面活性剤処理された植物は生存した。混合(短い/長い)dsRNA溶液で処理され続いてグリホサート処理された6つの界面活性剤処理された植物のうち5つは枯れた。
混合(短い/長い)dsRNA溶液の適用後48時間にグリホサート処理された6つの界面活性剤処理された植物のうち5つは枯れた。
混合(短い/長い)dsRNA溶液の適用後48時間でグリホサート処理された4つのカーボランダム処理された植物のうち3つは枯れた。
長いdsRNA溶液で処理され、続いて72時間後グリホサート処理された6つの界面活性剤処理された植物のうち5つは枯れた;図3Bを参照。短いdsRNA溶液で処理され、続いて72時間後グリホサート処理された6つの界面活性剤処理された植物のうち6つは枯れた;図3Cを参照。
実施例2
本実施例は、グリホサート除草剤感受性雑草の制御の改良ための本発明のポリヌクレオチド分子の有用性を説明する。実施例1で調整された混合(短い/長い)dsRNA溶液を、実施例1で使用された界面活性剤溶液で前処理されたグリホサート感受性のベルベットリーフ植物(2枚の葉に全量40マイクロリットルを適用)に適用した。対照植物を界面活性剤溶液で前処理後、緩衝液のみで処理した。dsRNA処理48時間後、植物を、グリホサート除草剤溶液(1ヘクタールあたり53g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド グリホサート除草剤)で処理した。植物の成長の観察(植物の背丈で測定された)により推定される時、緩衝液および除草剤で処理された対照植物と比較して、ポリヌクレオチド組成物および除草剤で処理された植物でグリホサート活性の2倍の上昇が観察された。ポリヌクレオチド組成物および除草剤で処理された植物は、深刻な成長阻害の状態で生存した;緩衝液および除草剤で処理された対照植物は、生存し、完全に回復した。同様の結果が、他のグリホサート除草剤感受性の雑草、つまり、グリホサート除草剤感受性のウォーターヘンプ(waterhemp)、アオビユ、オオブタクサ、トゲチシャ、タバコ、およびタンポポで得られた。
実施例3
本実施例は、トランスジェニックグリホサート耐性作物中の雑草を制御するための、本発明のポリヌクレオチド分子の有用性を説明する。細菌性のEPSPS(グリホサート耐性「クラスII」EPSPS遺伝子の説明のために米国特許第RE39,247号を参照)を発現する組み換えDNAを有するトランスジェニックアルファルファ、キャノーラ、トウモロコシ、ワタ、米、大豆、サトウキビ、サトウダイコン、および小麦の植物を、(a)実施例1で使用された界面活性剤溶液、(b)実施例1で調整された混合(短い/長い)dsRNA溶液、および(c)dsRNA処理後48時間にグリホサート除草剤溶液(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標))で処理した。30日後、すべてのトランスジェニックグリホサート耐性作物は生存し、成長阻害を示さない。
実施例4
本実施例は、本発明のポリヌクレオチド分子の除草剤除草剤としての有用性を説明する。2つのdsRNAポリヌクレオチド分子を、タバコ(ベンサミアナタバコ)のフィトエン不飽和化酵素をコードするmRNAの重複断片を標的とするように設計した。配列番号2および図5に関して、mRNAの192nt長(図5に太字で示される)および685nt長(図5に下線で示される)を標的とするdsRNAを、Ambion(登録商標)MEGAscript(登録商標)キットを用いて作製した。別々のdsRNA溶液を調製した。タバコ植物の葉を実施例1で調整された界面活性剤溶液で前処理し、その後、一植物あたり約0.6マイクロモルのdsRNAを適用してdsRNA溶液のいずれか一つで処理した。dsRNA処理後9日目に、フィトエン不飽和化酵素サイレンシングは、葉の先端における目に見える葉の退色から明らかであった;図4参照。dsRNAでの処理後15日目に、処理した植物の半分は枯れているように見え、植物の残りの半分は地上組織のほとんどが退色していた。ノザンブロット分析により、処理に使用されたdsRNAに対応するsiRNAの存在が示される。
実施例5
本実施例はさらに、本発明のポリヌクレオチド分子の除草性薬剤としての有用性を説明する。dsRNAオリゴヌクレオチド分子を以下の各植物のEPSPSをコードするRNAを標的とするように設計する。すなわち、ブタクサ(アンブロシア・アルテミシフォリア(Ambrosia artemisiifolia))、オオブタクサ(アンブロシア・トリフィダ(Ambrosia trifida))、ジョンソングラス(ソルガム・ハルペンス(Sorghum halepense))、アレチノギク(コニザ・ボナリエンシス(Conzya bonariensis))、サワーグラス(ジギタリア・インスラリス(Digitaria insularis))、リバーシードグラス(ウロコロア・パニコイデス(Urochloa panicoides))、トウダイグサ(エウフォルビア・へテロフィラ(Euphorbia heterophylla))、ワセビエ(エキノクロア・コロナ(Echinochloa colona))、シロザ(ケノポディウム・アルバム(Chenopodium album))、エノコログサ(セタリア・ヴィリディス(setaria viridis))、アワ(セタリア・イタリック(setaria italic))、イヌビエ(エキノコロア・クルス-ガリ(Echinochloa crus-galli))、メヒシバ(ジギタリア・サンギナリス(Digitaria sanguinalis))、オナモミ(キサンチウム・ストルマリウム(Xanthium strumarium))、ノスズメノテッポウ(アロペクラス・ミオスロイデス(Alopecurus myosuroides))、カラスムギ(アベナ・ファツア(Avena fatua))、エビスグサ(センナ・オブツシフォリア(Senna obtusifolia))、アサガオ(イポメア種(Ipomoea sp.))、セイヨウヒルガオ(コンボルブルス・アルベンシス(Convolvulus arvensis))、モロコシ(ソルガム・ビコロル(Sorghum bicolor))、ツユクサ(コメリナ(Commelina))、ムラサキツユクサ(トラデスカンチア種(Tradescantia sp.))、ドクムギ(ロリウム種(Lolium sp.))、オヒシバ(エレウシネ・インディカ(Eleusine indica))、ヒメムカシヨモギ(コニザ・カナデンシス(Conzya canadensis))、ヘラオオバコ(プランタゴ・ランセオラータ(Plantago lanceolata))、オオホナガアオゲイトウ(アマランサス・パルメリ(Amaranthus palmeri))、ヒユモドキ(アマランサス・ツバキュラタス(Amaranthus tuberculatus))、ヒメシロビユ(アマランサス・アルブス(Amaranthus albus))、ホソアオゲイトウ(アマランサス・ハイブリダス(Amaranthus hybridus))、アオビユ(アマランサス・レトロフレクサス(Amaranthus retroflexus))、ウォーターヘンプ(waterhemp)(アマランサス・ルディス/ツバキュラタス(Amaranthus rudis/tuberculatus))、ホナガイヌビユ(アマランサス・ビリディス(Amaranthus viridis))、トゥーンベリのアマランス(Thunberg's amaranth)(アマランサス・ツンベルギー(Amaranthus thumbergii))、ハリビユ(アマランサス・スピノシス(Amaranthus spinosis))、(アマランサス・ルブラ(Amaranthus rubra))、(アマランサス・リビダス(Amaranthus lividus))、アメリカビユ(アマランサス・グラエキザンス(Amaranthus graecizans))、ホナガアオゲイトウ(アマランサス・クロロスタッキス(Amaranthus chlorostachys))、イガホビユ(アマランサス・ポーウェリー(Amaranthus powellii))、アメリカビユ・イヌヒメシロビユ(アマランサス・ブリトイデス(Amaranthus blitoides))、ホウキギ(コチア・スコパリア(Kochia scoparia))、イガヤグルマギク(セントウレア・スティチアリス(Centaurea solstitialis))、およびイチビ(アブチロン・セオフラスチ(Abutilon theophrasti))である。植物の葉を実施例1のように調整された界面活性剤溶液で前処理し、一植物あたり約1ナノモルの処理で、dsRNA溶液により処理した。15日後、処理された植物は枯れている、枯れかけている、または成長が阻害される。
実施例6
本実施例はさらに、本発明のポリヌクレオチド分子の除草剤としての有用性を説明する。dsRNAオリゴヌクレオチド分子を、実施例5に記載の各々の植物のアセト乳酸合成酵素およびフィトエン不飽和化酵素をコードするRNAを標的とするように設計した。植物の葉を実施例1のように調整された界面活性剤溶液で前処理し、一植物あたり約1ナノモルの処理で、dsRNA溶液により処理した。15日後、処理された植物は枯れている、枯れかけている、または成長が阻害される。
実施例7
本実施例はさらに本発明のポリヌクレオチド分子の除草剤としての有用性を説明する。パルマーアマランスの以下の各々のタンパク質をコードするRNAを標的とするように設計された短いdsRNAオリゴヌクレオチドを提供するために実施例4の方法を繰り返した。すなわち、5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ、ジヒドロプテロイン酸合成酵素、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ、グルタミン合成酵素、D1タンパク質、翻訳開始因子(TIF)、リブロース-1、5-二リン酸カルボキシラーゼオキシゲナーゼ(RuBisCO)、およびDNA依存性ATP分解酵素(ddATPase)である。別々のグリホサート耐性パルマーアマランス植物の葉を、実施例1のように調整された界面活性剤溶液で処理し、および、一植物あたり1ナノモルの処理で、実施例1の様式で、各dsRNAオリゴヌクレオチド分子を別々に用いて処理する。30日後、処理された植物は枯れている、枯れかけている、または成長が阻害される。
実施例8
本実施例は、本発明の組成物および方法での合成Pol III遺伝子の使用の有用性を説明する。配列番号3および図2に関して、2コピーのRGCCCR要素(太字および下線)、配列「TCCCACATCG」(配列番号4、太字および下線)を有する上流の配列要素(USE)、TATAボックス(太字および下線)、「G」ヌクレオチド(太字および下線)、トランスジェニックトウモロコシ植物に発現される際にグリホサート除草剤に耐性を与えるEPSPSタンパク質(米国特許第RE39,247号参照)をコードする細菌性のDNAに対応するアンチセンスDNA(イタリック)、アンチセンスDNAに埋め込まれた「AAGATTAGCACGG」要素(配列番号5、太字および下線)、センスDNA(小文字)が後に続く「ACGCATAAAAT」要素(配列番号6、太字および下線)および「TTTTTT」終止要素(配列番号7、太字および下線)を含むdsDNA分子を提供するために、アラビドプシス・タリアナ(Arabidopsis thaliana)U6snRNA遺伝子由来の因子を使用して合成Pol III遺伝子を作製する。0.1重量%のSilwet L-77ブランド有機シリコン界面活性剤溶液およびdsDNA分子の複数コピーの溶液を、グリホサート耐性大豆植物の畑に成長する自生のグリホサート耐性トウモロコシ植物の葉に噴霧し、続いて7日後にRoundup WeatherMAX(登録商標)ブランドグリホサート除草剤で処理した。15日後、トウモロコシ植物は枯れており、大豆植物は、増殖している;界面活性剤およびグリホサート除草剤のみで処理された対照のグリホサート耐性トウモロコシ植物は増殖している。
実施例9
本実施例は本発明の一態様を説明する。本実施例では、ポリヌクレオチド分子を植物組織に適用し浸透させ、よって、浸透移行性の調節、つまり標的遺伝子(内在性のEPSPS)の発現抑制を誘導する。より詳細には、一本鎖DNA(ssDNA)オリゴヌクレオチドを含む組成物は、グリホサート耐性パルマーアマランス((アマランサス・パルメリ(Amaranthus palmeri))中の内在性EPSPSの発現を抑制した。
アンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドを、IDTSciTools software(idtdna.com/Scitools/Applications/Anti-sense/Anti-sense.aspxより入手可能)を用いて設計した。オリゴヌクレオチドには、表1に示されるように、アマランサス・パルメリ(Amaranthus palmeri)EPSPSにアンチセンスの4つのssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号8、9、10、および11)、アマランサス・パルメリ(Amaranthus palmeri)EPSPSにアンチセンスの2つの化学的に修飾された(ホスホロチオエート修飾)ssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号12および13)、制御遺伝子にアンチセンスの制御ssDNAオリゴヌクレオチド、大麦(ホルデウム・ウルガレ(Hordeum vulgare))種子タンパク質、GenBank ID X97636(配列番号14)、およびアマランサス・パルメリ(Amaranthus palmeri)EPSPSにアンチセンスの化学的に修飾された(Invitrogen社のAlexa Fluor 488での5’-標識化された)ssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号15)が含まれる。
Figure 0006581238
オリゴヌクレオチドの取り込みを、蛍光標識されたssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号15)で実証し、ssDNAオリゴヌクレオチドの葉の組織への浸透を確認した。グリホサート耐性パルマーアマランスの分離した葉の葉柄を蛍光標識されたssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号15)を含む200mMショ糖溶液に入れた。葉の画像を、葉柄を通じた取り込み後4時間から最大48時間まで、488nmのレーザーを装備したBio-Rad PharosFX imagerで撮った。200mMショ糖のみでインキュベーションされた葉を対照とした。蛍光標識されたssDNAオリゴヌクレオチドのわずかに時間依存的な維管束への取り込みが観察された(図6参照)。蛍光標識されたssDNAオリゴヌクレオチドは、処理後早くも8時間で、維管束の組織から細胞へ放出され、24時間と48時間で、葉の端での蓄積が確認され、蒸散効果が示唆された。
EPSPS抑制をグリホサート耐性パルマーアマランスのつんだ葉で葉柄取り込み技術を使用して実証した。グリホサート耐性パルマーアマランスのつんだ葉の葉柄を、表2に記載の処理に従って、オリゴヌクレオチドを含む200mMショ糖溶液に入れた。対照の葉をアンチセンスコントロール(配列番号14)で浸透させ、さらに50マイクログラム/mLのグリホサートと共に、またはなしで処理した。EPSPS mRNA、EPSPSタンパク質およびシキミ酸レベルを48時間のインキュベーションの後、測定した。EPSPS mRNAに対するアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドの効果を評価するために、葉の全RNAを単離し、EPSPSmRNAレベルを比較するために定量的リアルタイムRT-PCRを実施した。EPSPSタンパク質に対するアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドの効果を評価するために、葉の全可溶性タンパク質を単離し、SDS-PAGEで分離し、EPSPSタンパク質のレベルをトウモロコシEPSPS_TIPAに対する抗体を用いたウエスタンブロットにより測定した。EPSPS抑制の指標として、シキミ酸蓄積に対するアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドの効果を2つの実験で評価した:実験1では、オリゴヌクレオチド処理された葉を、さらに48時間、葉柄取り込みにより50マイクログラム/mLのグリホサートとインキュベーションした(対照の葉はアンチセンスコントロール(配列番号14)を浸透させ、さらに、50マイクログラム/mLのグリホサートと共にまたはなしで処理された);実験2では、リーフディスクアッセイをオリゴヌクレオチド処理された葉に実施し、シキミ酸レベルをHPLCで測定した(この場合の対照は、オリゴヌクレオチドで処理されないが、50マイクログラム/mLのグリホサートと共にインキュベーションされた葉である)。
Figure 0006581238
EPSPS mRNAの発現、EPSPSタンパク質レベルおよびシキミ酸レベルの結果を、各々、図7、8および9に示す。これらの結果は、アンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドでの処理が、標的遺伝子の転写(EPSPS mRNA)または植物組織の標的遺伝子によりコード化されるタンパク質(EPSPS)のレベルの減少により、浸透移行的に標的遺伝子を調節または抑制することを実証した。この特定の実験において、処理#1および#6は、シキミ酸蓄積の増加により明らかなように、EPSPS mRNAならびにタンパク質のレベルの抑制およびグリホサートの有効性を上げることにさらに効果的なようであった。これらの結果はまた、グリホサート耐性パルマーアマランスのEPSPS mRNAおよびタンパク質の抑制により、グリホサートの有効性が改良されたことも示す。
実施例10
本実施例は本発明の一態様を説明する。本実施例において、(a)ポリヌクレオチド浸透のための植物用コンディショニング剤および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで標的遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含むポリヌクレオチドを含む、植物の標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘導するための組成物を成長期植物に局所的に適用して処理した。さらに詳細には、タバコ(ベンサミアナタバコ)植物を、(a)ポリヌクレオチド浸透に対し植物をコンディショニングするために局所的に適用される界面活性剤溶液、および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで標的遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つの鎖を有する局所的に適用されるDNAオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを含む組成物で処理し、それにより標的遺伝子(フィトエン不飽和化酵素、「PDS」)の浸透移行性の調節または抑制が達成された。
使用した標的遺伝子は、図10に示されるように、ニコチナ・ベンタミアナ(ベンサミアナタバコ)のフィトエン不飽和化酵素(配列番号2)であった;配列番号2のヌクレオチド421−1120(図10の下線付き箇所)からなるセグメントを700-merのdsRNAポリヌクレオチド(「PDS 700-mer」)を設計するために使用し、配列番号2のヌクレオチド914−1113(図10の太字で下線付き箇所)からなるセグメントを200-merのdsRNAポリヌクレオチド(「PDS 200-mer」)を設計するために使用した。処理に使用される他のポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチの配列を表3に記載する。フィトエン合成酵素(配列番号2)配列に関連する、これらオリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドの配列の部位を図11に模式的に示す。トウモロコシの根切り虫(「CRW」)から取得した非植物配列、すなわち配列番号27、28、29、および30を非相同対照として使用した。いくつかのポリヌクレオチドには、バクテリオファージT7RNAポリメラーゼにより認識されるプロモーターであるT7プロモーター配列(表3で小文字により示される)が含まれた。
Figure 0006581238
Figure 0006581238
以下の工程を本実施例に記載されるすべてのアッセイに対して使用する。4週令のベンサミアナタバコ植物をすべてのアッセイに使用した。新たにddH2Oで作られた0.1%Silwet L-77溶液で植物を処理した。一植物あたり2枚の完全に開いた葉(1枚は子葉、1枚は本葉)を数秒間SilwetL-77溶液に浸漬し、ポリヌクレオチド組成物の適用前15−30分間乾燥させた。特段記載されない限りは各オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドの最終濃度は25マイクロM(0.01%Silwet L-77、5mMリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中)であった。20マイクロリットルの溶液を2枚の前処理された各葉の上面に適用し、各植物に全量40マイクロリットル(1nmolオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチド)を与えた。葉の退色を処理後3日目に観察した。
図12Aに、「PDSの200-mer」セグメント(配列番号2のヌクレオチド914−1113)に対応するRNA配列を含む200-merのdsRNAポリヌクレオチドおよび一本鎖DNAオリゴヌクレオチドとポリヌクレオチド(配列番号16、17、20、21、24、25、および26)の組み合わせを別々にタバコ植物に適用したアッセイの結果を説明する。200-merのdsRNAポリヌクレオチドを0.6マイクロMの濃度で適用した。葉の先端の退色がポリヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドでの局所処理後に観察され、標的フィトエン不飽和化酵素遺伝子の浸透移行性の調節または抑制を示唆した。
図12Bは、緩衝液(対照)、200-merのdsRNAポリヌクレオチド、およびssDNAオリゴヌクレオチドで処理されたベンサミアナタバコ植物から単離されたRNAのノザンブロット分析の結果を説明する。200-merのdsRNAポリヌクレオチドでの処理の前に、摂氏4度、一晩中暗闇で維持することによってストレスを与えた植物から単離されたRNAも示す。
図13は、ポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドの12の組み合わせに由来する効果を試験する別のアッセイにおいて、処理後12日目に観察された表現型を説明する(表4参照)。表4に処理後5日目の目視可能な植物の退色の観察および処理後7日目ならびに12日目に採取された葉緑素の測定の結果も列挙する。葉緑素の測定は、標的遺伝子フィトエン不飽和化酵素の抑制の指標であり、測定を先端領域の6点で行い、目視可能な退色した葉、または(目視可能な退色のない植物では)植物の相当箇所にある葉に着目した;より低い葉緑素測定値は、フィトエン不飽和化酵素の抑制を示唆する。これらの結果は、処理2、3、4、8、および11におけるオリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドの組み合わせが、処理された植物において標的遺伝子の浸透移行性調節(抑制)に効果的であったことを示す;処理1も、程度は低いが、標的遺伝子の浸透移行性調節(抑制)をもたらした。200-merのdsRNAポリヌクレオチドは、処理された植物において標的遺伝子の浸透移行性調節(抑制)にも効果的であった。
非相同的(トウモロコシの根切り虫)遺伝子由来のオリゴヌクレオチド(処理5および6)は標的フィトエン不飽和化酵素遺伝子を抑制しなかった。これらの結果は、センスおよびアンチセンス双方の一本鎖DNAオリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが、処理された植物において標的遺伝子の浸透移行性調節(抑制)に効果的であったことを実証する。この特定の実施例において、T7プロモーターを含むセンスオリゴヌクレオチド(処理1)はフィトエン不飽和化酵素遺伝子の弱い浸透移行性調節をもたらしたが、T7プロモーターを含まないセンスオリゴヌクレオチド(処理7)はフィトエン不飽和化酵素遺伝子を抑制しなかった。この特定の実施例において、T7プロモーターを含むアンチセンスオリゴヌクレオチド(処理2)およびT7プロモーターを含まないアンチセンスオリゴヌクレオチド(処理8)の両方は強い退色をもたらし、標的フィトエン不飽和化酵素遺伝子の強い浸透移行性調節を示唆した。.
Figure 0006581238
Figure 0006581238
Figure 0006581238
表5は、6つのポリヌクレオチドを示す:「PDSの700-mer」の最も5’側の40ヌクレオチド(配列番号2のヌクレオチド1081−1120)からなる40-merのセグメント(「PDSの40-merのセンスssDNA」、配列番号31)ならびに「PDSの40-merのセンスssDNA」配列(配列番号31)に基づき合成された4つのアンチセンス1本鎖DNAポリヌクレオチドおよび1つのセンス一本鎖DNAポリヌクレオチド。図14にポリヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドでタバコ植物を局所処理した結果を説明する。標的遺伝子フィトエン不飽和化酵素の浸透移行性の調節または抑制を示す葉の先端の強い退色が、PDSの21-merのアンチセンスssDNAおよびPDSの33-merのアンチセンスssDNAでの局所処理後ならびにPCR増幅およびカラム精製された700-merのdsRNAポリヌクレオチド(「PDSの700-merのdsRNA」)、先にアッセイされたT7プロモーターを含むPDSのアンチセンス22-merのオリゴヌクレオチド(配列番号20および21)(「PDST7アンチセンス」)、または、先にアッセイされたT7プロモーターを含まないPDSのアンチセンス22-merオリゴヌクレオチド(配列番号22および23)(「PDSアンチセンス」)での局所処理後に観察された。緩衝液のみ(「緩衝液」)での局所処理後、または熱変性(摂氏95度で5分、その後氷上保存)した700-merのdsRNAポリヌクレオチド(「加熱されたPDSの700-merのdsRNA」)、PDSの15-merのアンチセンスssDNA、またはPDSの18-merのアンチセンスssDNAでの局所処理後には、葉の先端の目視可能な退色は殆ど観察されなかったか、または、まったく観察されなかった。。
Figure 0006581238
別のアッセイの結果を図15に示す。標的遺伝子フィトエン不飽和化酵素の浸透移行性の調節または抑制を示唆する葉の先端の強い退色が、PDSの21-merのアンチセンスssDNA(配列番号34、「21ntのPDSのアンチセンス」)または以前にアッセイされたT7プロモーターを含まないPDSのアンチセンスの22-merのオリゴヌクレオチド(配列番号22および23)(「PDSアンチセンス」)での局所処理後に観察された。緩衝液のみ(「対照:緩衝液」)の局所処理後またはPDSの21-merのセンスssDNA(配列番号36、「21ntのPDSのセンス」)の局所処理後には、葉の先端の目視可能な退色はほとんど観察されなかったか、またはまったく観察されなかった。
実施例11
本実施例は、(a)ポリヌクレオチド浸透のための植物用コンディショニング剤および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで標的遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含むポリヌクレオチドを含む、植物の標的遺伝子の浸透移行性のサイレンシングを誘導するための組成物を成長期植物に局所的に適用する処理を説明する。さらに詳細には、本実施例は、ポリヌクレオチドの標的特異性(配列特異性)を実証する。
パルマーアマランスフィトエン不飽和化酵素(PDS)は、以下の配列を有する。すなわち、TCAATTTCATCTATTGGAAGTGATTTTTTGGGTCATTCTGTGAGAAATTTCAGTGTTAGTAAAGTTTATGGAGCAAAGCAAAGAAATGGGCACTGCCCTTTAAAGGTTGTTTGTATAGATTATCCTAGGCCAGAGCTTGAAAGTACATCCAATTTCTTGGAAGCCGCCTACTTATCTTCTACTTTTCGGAATTCGCCTCGTCCTCAGAAGCCATTAGAAGTTGTAATTGCTGGAGCAGGTTTGGCTGGTCTATCCACGGCAAAGTATTTAGCTGATGCAGGTCACAAACCCATATTGTTGGAAGCACGAGATGTTTTAGGAGGAAAGGTTGCAGCGTGGAAGGATGAGGATGGTGACTGGTATGAGACTGGGCTACATATATTCTTTGGGGCATATCCAAATGTCCAAAATCTATTTGGAGAACTTGGTATAAATGACCGACTGCAATGGAAGGAGCACTCTATGATTTTTGCAATGCCCAGCAAGCCCGGTGAATTCAGTCGCTTTGATTTTCCCGAAATCCTGCCTGCACCATTAAATGGCATATGGGCAATCCTAAGAAATAATGAAATGCTAACCTGGCCAGAAAAAATCAAGTTTGCCATTGGCTTGTTGCCTGCTATGGCAGGCGGACAGTCATATGTTGAAGCACAAGATGGTTTGAGTGTCCAAGAGTGGATGAGAAAACAAGGAGTACCCGATCGTGTAACTGATGATGTGTTTATTGCCATGTCAAAGGCACTGAACTTCATAAATCCCGATGAACTTTCAATGCAGTGCATCTTGATTGCTCTGAACCGATTCCTGCAGGAGAAACATGGTTCTAAGATGGCCTTCCTAGACGGAAACCCTCCAGAGAGGCTGTGCATGCCTATTGTTAAACACATCGAGTCACTAGGTGGTGAAGTTAAACTTAACTCTCGTATACAAAAGATTCAGTTGGACCAGAGTGGAAGCGTGAAGAGTTTTTTGCTAAATAACGGGAGGGAAATACGAGGAGATGCCTATGTTTTTGCCACCCCAGTTGACATCTTGAAGCTGTTACTACCTGATACTTGGAAGGAAATCTCATACTTCAAAAAACTTGAGAAATTAGTGGGCGTTCCTGTGATTAATGTTCACATATGGTTTGACAGAAAATTAAAGAATACATATGACCATCTACTCTTCAGCAGGAGTCCTCTTTTGAGTGTCTATGCTGATATGTCGGAGACATGCAAGGAATATAAGGATCCAAATAGATCCATGCTGGAATTGGTTTTTGCACCCGCGGAGGAATGGATTTCACGAAGCGACACTGATATTATAGAGGCAACAATGAAAGAGCTTGCCAAGCTTTTCCCGGATGAAATCGCTGCCGATGGAAGCAAGGCCAAGATCCTCAAATATCATGTCGTCAAAACTCCAAGGTCGGTTTATAAGACTGTACCGGATTGTGAACCTTGTCGGCCGCTGCAAAGATCACCAATAGAGGGTTTCTATTTAGCTGGTGATTACACAAAACAAAAATATTTGGCTTCTATGGAAGGTGCTGTCTTATCTGGGAAGCTTTGTGCACAGGCTATCGTACAGGATTATGATCTGCTGAGTTCTCGAGCACAAAGAGAATTGGCG(配列番号37)である。配列番号37の位置317−994(下線付き箇所として示される)のヌクレオチドによりコードされるRNAにハイブリダイズできるアンチセンス鎖を含む678塩基対のdsRNAポリヌクレオチドおよび配列番号37の位置797−994(イタリック体および下線付き箇所として示される)のヌクレオチドによりコードされるRNAにハイブリダイズできるアンチセンス鎖を含む198塩基対のdsRNAポリヌクレオチドを合成した。
ベンサミアナタバコフィトエン不飽和化酵素は、以下の配列を有する。すなわち、ATGCCCCAAATCGGACTTGTATCTGCTGTTAATTTGAGAGTCCAAGGTAATTCAGCTTATCTTTGGAGCTCGAGGTCTTCGTTGGGAACTGAAAGTCAAGATGTTTGCTTGCAAAGGAATTTGTTATGTTTTGGTAGTAGCGACTCCATGGGGCATAAGTTAAGGATTCGTACTCCAAGTGCCACGACCCGAAGATTGACAAAGGACTTTAATCCTTTAAAGGTAGTCTGCATTGATTATCCAAGACCAGAGCTAGACAATACAGTTAACTATTTGGAGGCGGCGTTATTATCATCATCGTTTCGTACTTCCTCACGCCCAACTAAACCATTGGAGATTGTTATTGCTGGTGCAGGTTTGGGTGGTTTGTCTACAGCAAAATATCTGGCAGATGCTGGTCACAAACCGATATTGCTGGAGGCAAGAGATGTCCTAGGTGGGAAGGTAGCTGCATGGAAAGATGATGATGGAGATTGGTACGAGACTGGGTTGCACATATTCTTTGGGGCTTACCCAAATATGCAGAACCTGTTTGGAGAACTAGGGATTGATGATCGGTTGCAGTGGAAGGAACATTCAATGATATTTGCGATGCCTAACAAGCCAGGGGAGTTCAGCCGCTTTGATTTTCCTGAAGCTCTTCCTGCGCCATTAAATGGAATTTTGGCCATACTAAAGAACAACGAAATGCTTACGTGGCCCGAGAAAGTCAAATTTGCTATTGGACTCTTGCCAGCAATGCTTGGAGGGCAATCTTATGTTGAAGCTCAAGACGGTTTAAGTGTTAAGGACTGGATGAGAAAGCAAGGTGTGCCTGATAGGGTGACAGATGAGGTGTTCATTGCCATGTCAAAGGCACTTAACTTCATAAACCCTGACGAGCTTTCGATGCAGTGCATTTTGATTGCTTTGAACAGATTTCTTCAGGAGAAACATGGTTCAAAAATGGCCTTTTTAGATGGTAACCCTCCTGAGAGACTTTGCATGCCGATTGTGGAACATATTGAGTCAAAAGGTGGCCAAGTCAGACTAAACTCACGAATAAAAAAGATCGAGCTGAATGAGGATGGAAGTGTCAAATGTTTTATACTGAATAATGGCAGTACAATTAAAGGAGATGCTTTTGTGTTTGCCACTCCAGTGGATATCTTGAAGCTTCTTTTGCCTGAAGACTGGAAAGAGATCCCATATTTCCAAAAGTTGGAGAAGCTAGTGGGAGTTCCTGTGATAAATGTCCATATATGGTTTGACAGAAAACTGAAGAACACATCTGATAATCTGCTCTTCAGCAGAAGCCCGTTGCTCAGTGTGTACGCTGACATGTCTGTTACATGTAAGGAATATTACAACCCCAATCAGTCTATGTTGGAATTGGTATTTGCACCCGCAGAAGAGTGGATAAATCGTAGTGACTCAGAAATTATTGATGCTACAATGAAGGAACTAGCGAAGCTTTTCCCTGATGAAATTTCGGCAGATCAGAGCAAAGCAAAAATATTGAAGTATCATGTTGTCAAAACCCCAAGGTCTGTTTATAAAACTGTGCCAGGTTGTGAACCCTGTCGGCCCTTGCAAAGATCCCCTATAGAGGGTTTTTATTTAGCTGGTGACTACACGAAACAGAAGTACTTGGCTTCAATGGAAGGTGCTGTCTTATCAGGAAAGCTTTGTGCACAAGCTATTGTACAGGATTACGAGTTACTTCTTGGCCGGAGCCAGAAGATGTTGGCAGAAGCAAGCGTAGTTAGCATAGTGAACTAA(配列番号38)である。配列番号38の位置421−1105(下線付き箇所として示される)のヌクレオチドにコードされるRNAにハイブリダイズできるアンチセンス鎖を含む685塩基対のdsRNAポリヌクレオチドおよび配列番号38の位置914−1105(イタリックおよび下線のテキストとして示される)のヌクレオチドにコードされるRNAにハイブリダイズできるアンチセンス鎖を含む192塩基対のdsRNAポリヌクレオチドを合成した。
パルマーアマランスとベンサミアナタバコPDSのDNA配列の配列比較をglobal pairwise alignment(stretcher)を使用して実施し、図16に図示する;この方法で、2つの配列は約71%の配列同一性を示した(1252/1762)。
16コピーのEPSPSを有し、5−8インチの高さのパルマーアマランス植物を新たにddH2Oで作製した0.1%Silwet L-77溶液で処理した。一植物あたり4枚の完全に開いた葉を数秒間Silwet L-77溶液に浸漬し、ポリヌクレオチド組成物の適用前30分−1時間、乾燥させた。それぞれのポリヌクレオチド溶液を678bpのPalmer PDSのdsRNA、198bpのPalmer PDSのdsRNA、685bpのベンサミアナタバコ(のPDS dsRNA、および192bpのベンサミアナタバコのPDS dsRNAのそれぞれに対して作製した(0.01%Silwet L-77、5mMリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中0.6マイクロモル濃度のポリヌクレオチド)。10マイクロリットルのポリヌクレオチド溶液(または対照としての緩衝液)を一植物あたり各4枚の前処理した葉の上面に適用し、各植物あたり全量40マイクロリットルを与えた。植物をグロースチャンバー中に維持し、葉の退色を処理後3日目に観察した。678bpのPalmer PDSのdsRNAまたは198bpのPalmer PDSのdsRNAで局所的に処理された植物は、葉の退色を示した(内在性のフィトエン不飽和化酵素のサイレンシングを示唆する)が、685bpのベンサミアナタバコのPDS dsRNAまたは192bpのベンサミアナタバコ(のPDS dsRNAで局所的に処理されたパルマーアマランス植物は葉の退色を示さなかった。この配列特異性は、本発明のポリヌクレオチド組成物および方法が、特異的な標的遺伝子配列を有する与えられた種または分類群の選択的制御に、例えば、同じ除草剤に耐性のある作物の畑に成長する除草剤耐性の自生植物を制御するのに有用であることが実証された。
別のアッセイにおいて、678bpのPalmer PDS dsRNA(ラベル付けされた「700ntのdsRNAのPDS」)または198bpのPalmer PDS dsRNA(ラベル付けされた200ntのdsRNA PDS))で局所的に処理されたパルマーアマランス植物は、葉の退色(内在性のフィトエン不飽和化酵素のサイレンシングを示す)を示したが、無脊椎動物の遺伝子の260塩基対のdsRNA遺伝子(トウモロコシの根切り虫ディアブロティカ・ビルジフェラ(Diabrotica virgifera)由来のラベル付けされた「260ntのdsRNA DV49」)で局所的に処理されたパルマーアマランス植物は、退色の表現型にはならず、内在性のフィトエン不飽和化酵素のサイレンシングがないことを示唆した(図17)。この配列特異性は、本発明のポリヌクレオチド組成物および方法が、与えられた種または分類群の選択的制御に有用であることを実証する。
実施例12
本実施例は、植物の標的遺伝子の浸透移行性のサイレンシングを誘導するために、アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで標的遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含む組成物の局所的適用の使用を説明する。詳細には、本実施例は、葉、茎および花を含む異なる植物組織中の浸透移行性サイレンシングを誘導するための、フィトエン不飽和化酵素(PDS)オリゴヌクレオチドでの単回処理の使用を実証する。
4週令のタバコ(ベンサミアナタバコ(植物をすべての処理で使用した。2枚の完全に開いた葉(1枚は子葉、1枚は本葉)を新たに作製した界面活性剤溶液(再蒸留水中0.1%Silwet L-77)に数秒間浸漬することにより条件付けし、15分間−30分間乾燥させた。ベンサミアナタバコ(フィトエン不飽和化酵素(配列番号2)の位置1099−1120のヌクレオチドに対応する配列GGCAGTACAATTAAAGGAGATG(配列番号39)を含む一本鎖DNA(ssDNA)22-merオリゴヌクレオチドの20マイクロリットルを、一植物あたり全量40マイクロリットル(1ナノモルのオリゴヌクレオチド)となるように、条件付けられた各葉の上面に、5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中0.01%Silwet L-77中の25マイクロモル濃度の溶液として適用した。対照植物をDNAオリゴヌクレオチドを含まないSilwet溶液で処理した。処理後3日目に植物を退色に関して観察した。ssDNAオリゴヌクレオチドで処理された植物の葉の先端、茎および花すべては退色を示し、PDSの浸透移行性サイレンシングを示唆した(図18A)。
対照植物およびssDNA処理された植物の双方の花に結実させた。種子を成熟した果実から回収し、重量を測定し、発芽させた。種子の重量は同じで(100種子あたり約11mg)、種子の形態はssDNA処理された植物も対照の植物も同じように見えた。対照の植物由来の果実あたりの種子の量および種子の発芽率(100個のうち95個の種子が発芽した)と比較して、ssDNA処理された植物由来の種子において、果実あたりに産生される種子の減少した量および発芽率の減少(100個のうち4個が発芽した)が観察された。
同様の工程を用いた別のアッセイで、タバコ植物を再蒸留水中の0.1%Silwet L-77への浸漬により条件付けし、15分−30分間乾燥させ、一植物あたり全量40マイクロリットル(1ナノモルのオリゴヌクレオチド)となるように、5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中0.01%Silwet L-77中の25マイクロモル濃度の溶液として、条件付けられた各葉の上面に適用されるPDS ssDNA 22-mer(配列番号39)で処理した。他の植物は界面活性剤処理で条件付けせず、5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中0.01%Silwet L-77中の25マイクロモル濃度の溶液としてまたは5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中の25マイクロモル濃度の溶液(界面活性剤なし)として、無針注射器での浸潤(図18Bに示す)または液滴の手での適用により葉の表面へ適用される(図18Bに示さない)1ナノモルのPDS ssDNA 22-mer(配列番号39)でのみ処理した。ネガティブ対照植物を、DNAオリゴヌクレオチドを含まないSilwet緩衝液で処理した。結果を図18Bに示す。PDS ssDNAの直接適用でのみ(Silwet L-77界面活性剤処理による条件付けなしに)処理されたすべての植物は、浸潤による適用であれ、手動による液滴適用であれ、PDSの浸透移行性サイレンシングを示唆する、葉の先端、茎および花の退色を示した。
実施例13
本実施例は、ポリヌクレオチド浸透のための植物用コンディショニング剤の使用を含む、浸透移行性サイレンシングの誘導のための方法および局所的に適用される組成物を説明する。より詳細には、本実施例は除草剤耐性パルマーアマランスを制御するための本発明のポリヌクレオチドの使用を説明する。
低コピー数(30未満)の5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)を有するパルマーアマランス植物は、EPSPSのサイレンシングのために設計されたdsRNAでの処理、続いてグリホサートでの処理に感受性がある(実施例1に詳細を参照)。しかしながら、高コピー数のEPSPS(つまり、コピー数30以上のEPSPS)を有するパルマーアマランス植物は、グリホサート処理に耐性があり、雑草耐性管理にとって課題である。例えば、実施例1に記載の処理と同様であるが、ここで、dsRNAの用量を最大10倍まで増加させる(つまり一植物あたり8ナノモルの実施例1に記載の短いdsRNA)か、または牛脂アミン界面活性剤と組み合わせた商標により保護されているグリホサート配合(「Roundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤」)を使用する処理を用いたグリホサート耐性高コピーのパルマーアマランスに対するあるアッセイでは(データは示さない)、グリホサート活性は改良された(植物の背丈として測定された植物の成長を観察することにより推定された)が、耐性植物は枯れなかった。
3つの異なるグリホサート耐性高コピーパルマーアマランス系統(一反復あたり3つの植物)を表6に記載の処理条件(ここで、dsRNA運搬体、透過処理またはコンディショニング剤および工程の順番を変化させた)を用いてdsRNAで処理した。結果を図19に示す。「4×」グリホサート単独での処理(つまり、1ヘクタールあたり840g酸当量である標準的な適用割合の4倍にあたる、1ヘクタールあたり3360g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤での処理)は、35コピー(実験3)または57コピー(実験6)のパルマーアマランスを枯らさなかった。
ある実験において1−3、表6)、0.1%牛脂アミン界面活性剤および10%グリセロール(実験2)を含む水溶性のdsRNA送達体中に2%硫酸アンモニウムを含むことで、4×グリホサート適用が続くdsRNAの10倍用量の有効性を改善した。グリホサート適用が続く10倍用量のdsRNAの改善された有効性はまた、硫酸アンモニウムが牛脂アミン界面活性剤なしでdsDNA送達体に含まれる際にも観察された(実験8)。
別の実験において(4−6、表6)、硫酸アンモニウムを含む送達体中のdsRNAを適用する前にSilwet L-77界面活性剤を適用することは効果的であったが、Silwet L-77界面活性剤を硫酸アンモニウムを含むdsRNA送達体のdsRNAと組み合わせることは効果的ではなかった。dsRNAでの処理後48時間でグリホサート(「Roundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤」)を適用する(実験2)よりも処理後72時間でグリホサート適用する(実験7)方が、効果が低かった。
Figure 0006581238
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*グリホサート(市販の「Roundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤」配合で、成分として、55:45の比率での牛脂アミン(16-18C)とココアミン(12-14C))のMON56151牛脂アミン界面活性剤混合物を含む担体中に660g/LのグリホサートK+塩が含まれる)に関しては、使用された量(1×=1ヘクタールあたり840g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤、4×=1ヘクタールあたり3360g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)およびdsRNAの適用後の時間が記載されている。
実施例14
本実施例は、ポリヌクレオチド浸透に対する植物用コンディショニング剤の使用を含む浸透移行性サイレンシングを誘導するための方法および局所的に適用される組成物を説明する。
低分子RNA配列決定を通じて同定された2つの低分子RNAは、実施例1に記載されるような4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子で処理されたパルマーアマランス植物中に大量に存在し、独特であることが見い出された。これら2つの低分子RNAは、それぞれ、図20(配列番号40)に示される配列を有する完全長のEPSPSのヌクレオチド位置743−764および566−585に位置づけられた。2つの25ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドサイズの「短い」dsRNA分子を、パルマーアマランスEPSPS遺伝子から転写される、図20記載の配列番号40(これには4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子(下線付き、非イタリック体箇所)および3つの「長い」二本鎖RNAポリヌクレオチド(実施例1に記載のような太字箇所)も示す)に下線のイタリック体のヌクレオチドによって示されるヌクレオチド位置743−767(「短いdsRNA-5」)および564−588(「短いdsRNA-6」)とハイブリダイズできるアンチセンス鎖と設計した。
4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子(実施例1に記載される)の混合物の適用に続いて、実施例1に記載される処理の手順を再現するグリホサートの適用により、16コピーのEPSPSを有する4つのパルマーアマランス植物のうち4つが枯れた。同じ処理手順を使用するが、短いdsRNA-5および短いdsRNA-6を共に適用することにより、4つのパルマーアマランス植物のうち枯れたのは0個であった。短いdsRNA-5および短いdsRNA-6のいずれか、もしくは、両方の、4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子(実施例1に記載される)の混合物への添加により、4つのパルマーアマランス植物のうち4つが枯れた。つまり、短いdsRNA-5および短いdsRNA-6の拮抗的な効果は観察されなかった。
実施例15
本実施例は、ポリヌクレオチド浸透に対する植物用コンディショニング剤の使用を含む浸透移行性サイレンシングを誘導するための方法および局所的に適用される組成物を説明する。さらに詳細には、本実施例はサリチル酸およびポリヌクレオチドの使用を説明する。
サリチル酸(SA)はタバコにおいてウイルス耐性を誘導する;例えばChivasa et al.(1997)Plant Cell, 19:547−557を参照。EPSPSの49または63コピーを有するグリホサート耐性パルマーアマランス植物を15ミリモル濃度のSAで前処理した。4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子(実施例1に記載される)の溶液をSAで処理後1、5、または24時間目に動で適用し、続いて72時間後、グリホサート(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧した。dsRNAおよびグリホサート活性(植物の背丈として測定される植物の成長を観察することにより推定される)の効果の改善はグリホサート処理後7日目にSA処理したいずれにも全く観察されなかった。
実施例16
本実施例は、ポリヌクレオチド浸透のための植物用コンディショニング剤の使用を含む浸透移行性サイレンシングを誘導するための方法および局所的に適用される組成物を説明する。さらに詳細には、本実施例はポリヌクレオチドおよび界面活性剤溶液の適用の順番およびタイミングの変化を説明する。
これらのアッセイを、以下の工程、すなわち、1)牛脂アミン界面活性剤およびグリセロールを含む溶液中のdsRNA(実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子の溶液)の適用;(2)1%Silwet L-77シリコン界面活性剤の適用;および(3)グリホサートの適用(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を含むプロトコールを使用して、高コピー数(56、63、または100コピー)のEPSPSを有するパルマーアマランス植物に実施した。ポリヌクレオチドの適用およびSilwetの適用のタイミングの間隔を、dsRNA溶液の適用後30分、1時間または2時間に適用されるSilwet噴霧で評価した。このセットのアッセイにおいて、Silwet溶液適用の3つの異なる時間すべては、同様の結果、つまり、牛脂アミン界面活性剤およびグリセロールのみを含む対照溶液で処理された対照の高コピー植物と比較して、dsRNA溶液で処理された高コピー植物のほとんどは成長が阻害された。
実施例17
本実施例は、ポリヌクレオチド浸透のための植物用コンディショニング剤の使用を含む浸透移行性サイレンシングを誘導するための方法および局所的に適用される組成物を説明する。さらに詳細には、本実施例は低容量噴霧による本発明のポリヌクレオチドの適用およびシリコン界面活性剤および硫酸アンモニウムの使用を説明する。
2%硫酸アンモニウムを含む溶液中のdsRNA溶液(実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子の溶液)を16コピーのEPSPSを有するパルマーアマランスに低容量噴霧により適用し、続いてグリホサート(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧し、パルマー・アマランス植物は枯れた。
一処理あたり6つのパルマーアマランス植物を、低容量噴霧を用いた3工程の手順で処理した。すなわち、(1)1%Silwet L-77を噴霧;(2)実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子当量を含むdsRNA溶液を2ミリリットルで、3つの用量(一植物あたり1×または0.8ナノモル、一植物あたり2×または1.6ナノモルもしくは一植物あたり4×または3.2ナノモル)のうち1つで噴霧;および(3)159リットル/エーカーの割合でグリホサート(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧した。グリホサート噴霧後9日目に4×(一植物あたり3.2ナノモル)dsRNAを噴霧された6つすべての植物は枯れ、2×(一植物あたり1.6ナノモル)dsRNAまたは1×(一植物あたり0.8ナノモル)dsRNAを噴霧された植物は成長が阻害された(図21A)。
いくつかのアッセイを、畑で回収した種子から栽培したグリホサート耐性パルマーアマランスに実施した。植物を以下に記載される様々なプロトコールで処理し、いくつかの植物ではdsRNA溶液で局所的に処理し、対照植物では緩衝液(dsRNA運搬体)で処理した;低容量噴霧により適用した。特に断りのない限り、dsRNA溶液は、緩衝液中、実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子を当量、「4×」用量(一植物あたり3.2ナノモル)で含んだ;緩衝液は、ジエチルピロカルボネート(DEPC)水(Omega Bio-Tek)中10ミリモル濃度のリン酸ナトリウムおよび0.01%(v/v)のSilwetL-77有機シリコン界面活性剤からなり、pH6.8に調整された;除草剤は159リットル/エーカーの割合で、1ヘクタールあたり840g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤で適用されるグリホサート除草剤であった。結果を表7に提供する。
アッセイ1および2:これらのアッセイを、既知のグリホサート耐性パルマーアマランス群落に位置する農地由来の土壌サンプルから入手された種子から栽培したグリホサート耐性パルマーアマランスに実施した。アッセイ1について、一処理あたり10個の植物を以下のように処理した:(1)1%Silwet L-77を噴霧;(2)2ミリリットルのdsRNA溶液を噴霧;および(3)グリホサートを噴霧。アッセイ2について、一処理あたり18の植物をアッセイ1と同じ手順を用いて処理した。
アッセイ3:本アッセイは異なる発生上のステージで適用された処理を比較し、Macon County、GAの土地由来のパルマーアマランスの種子から栽培した実生を用い、グリホサート耐性を選択した。緩衝液は2%硫酸アンモニウムを含んだ。一処理あたり12個の小さな(3葉期)または12の巨大な(5葉期)実生を以下のように処理した。すなわち、(1)1%Silwet L-77を噴霧;(2)2ミリリットルのdsRNA溶液を噴霧;(3)グリホサートを噴霧。本処理は巨大な実生と比較して小さな実生に対してより良い制御(より多くの植物を枯らす)をもたらした。処理後16日目にすべてのグリホサート耐性植物を枯らさなかったが、dsRNA処理は、緩衝液および除草剤での処理よりもより多くのグリホサート耐性植物を枯らし、または成長を阻害した。
アッセイ4および5:これらのアッセイはPemiscot、MOの農地由来の土壌の種子から栽培したパルマーアマランス植物を使用した。緩衝液は2%硫酸アンモニウムを含んだ。一処理あたり11個の小さな(3葉期)実生を以下のように処理した:(1)1%Silwet L-77を噴霧;(2)dsRNA溶液の2ミリリットルを噴霧;(3)グリホサートを噴霧。アッセイ5について、一処理あたり12個の植物をアッセイ4と同じ手順を用いて処理した。
アッセイ6:本アッセイでは、「Ivy2」農地由来の土壌の種子から栽培したパルマーアマランス植物を使用した。緩衝液は2%硫酸アンモニウムを含んだ。一処理あたり18個の小さな(3葉期)の実生を以下のように処理した。すなわち、(1)1%Silwet L-77を噴霧;(2)dsRNA溶液の2ミリリットルを手または噴霧により適用、;(3)グリホサートを噴霧した。本アッセイでは適用方法(手動滴下または噴霧)は同様の結果をもたらした。
アッセイ7:本アッセイにはグリホサート耐性のために選択され、またアッセイ1−6の植物よりもグリホサート耐性の強いF3種子から成長した3−4葉期のパルマーアマランスの実生を使用した。緩衝液は2%硫酸アンモニウムを含んだ。一処理あたり18個の植物を以下のように処理した。すなわち、(1)1%Silwet L-77を噴霧;(2)dsRNA溶液の2ミリリットルを噴霧;(3)グリホサートを噴霧した。
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実施例18
本実施例は、ポリヌクレオチド浸透のための植物用コンディショニング剤の使用を含む浸透移行性サイレンシングを誘導するための方法および局所的に適用される組成物を説明する。
これらのアッセイにおいて、dsRNA溶液は、0.2%牛脂アミン界面活性剤および2%硫酸アンモニウム(図22に「牛脂アミン/AMS」として同定される)か、または以下のトランスフェクション試薬の1つのいずれかを含む溶液で「10×」用量(一植物あたり8ナノモル)で、実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子当量を含んだ。トランスフェクション試薬は、(a)ポリアミン(JetPRIME(商標)、Polyplus-transfection SA、Illkirch、France)、(b)磁性ナノ粒子(SilenceMag、OZ Biosciences、Marseille、France)、(c)ペプチド(N-TER(商標)Nanoparticle、Sigma-Aldrich、St. Louis、MO)、(d)脂質(siPORT(商標)NeoFX(商標)、Ambion、Foster City、CA)、または(e)陽イオン脂質/ポリマー(TransIT(登録商標)、Mirus Bio、Madison、WI)である。植物を以下のように処理した。すなわち、(1)dsRNA溶液を手で適用;(2)1%Silwet L-77を噴霧;(3)1ヘクタールあたり840g酸当量で適用されるRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤を適用されるグリホサートを159リットル/エーカーの割合で噴霧。牛脂アミン界面活性剤/硫酸アンモニウム溶液中のdsRNAと使用される際、本プロトコールは35コピーのEPSPSを有するグリホサート耐性パルマーアマランスを枯らす。結果を図22に示す。植物の成長阻害または死滅は、ポリアミン(JetPRIME(商標))、ペプチド(N-TER(商標)Nanoparticle)、陽イオン脂質/ポリマー(TransIT(登録商標))、または牛脂アミン界面活性剤/硫酸アンモニウムを含む溶液中のdsRNAで処理された植物に観察された。
実施例19
本実施例は、植物の浸透移行性サイレンシングを誘導するために、局所的に適用されるポリヌクレオチドを含む組成物を用いる方法を説明する。さらに詳細には、本実施例は浸透移行性サイレンシングを誘導する異なるタイプのポリヌクレオチドの使用を記載する。
パルマーアマランスEPSPS遺伝子の位置14−38、位置153−177、345−369、および1105−1129(図1中、下線付きヌクレオチドにより示される)に対応するセンス一本鎖DNA(ssDNAs)およびアンチセンス一本鎖RNA(ssRNAs)をIntegrated DNA Technologies社より購入した。DNA/RNAハイブリッドを産生するため、センスssDNAおよびアンチセンスssRNAは、当モルの混合されたssDNAおよびsRNAを5分間、摂氏95度に熱し、1.5−2時間超でゆっくりと室温まで冷却することによりアニーリングさせた。
16-コピーのグリホサート耐性パルマーアマランス(植物を以下手順の使用によるアッセイで使用した。すなわち、(1)1%Silwet L-77を噴霧;(2)おのおのの植物の4枚の成熟した葉に全量0.8ナノモルのPalmerEPSPS dsRNA(実施例1に記載されるような)またはPalmerEPSPSDNA/RNAハイブリッドを手で適用、および(3)159リットル/エーカーの割合で、1ヘクタールあたり840g酸当量で適用されるRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤のグリホサートを噴霧するという手順である。
結果を図23に示す。除草剤噴霧後7日目に、6つのdsRNA処理された植物のうち4つは枯れており、残りの2つは枯れかけていた一方、DNA/RNAハイブリッドを噴霧された植物は、対照と比較して成長が阻害された(グリホサート損傷)。
実施例20
本実施例は、植物の浸透移行性サイレンシングを誘導するために、局所的に適用されるポリヌクレオチドを含む組成物を用いる方法を説明する。さらに詳細には、本実施例は浸透移行性サイレンシングを誘導する異なるタイプのポリヌクレオチドの使用を記載する。
16コピーのEPSPSを有するグリホサート耐性パルマーアマランス)植物を一処理あたり6つを本アッセイに使用した。植物の一処理あたり0.8ナノモル(「1×」)のdsRNA、10倍多い量(植物の一処理あたり8ナノモル、「10×」)のssDNAポリヌクレオチド(実施例19に記載される)および対照として緩衝液のみを、別々の植物に対し2%硫酸アンモニウムを含む緩衝液中手動で適用し、続いて48時間後、1ヘクタールあたり840g酸当量で適用されるRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤のグリホサートを159リットル/エーカーの割合で噴霧した。図24に結果を示す。緩衝液および除草剤のみで処理された植物と比較して、両方のポリヌクレオチド処理はパルマーアマランスのよりよい制御を与えた。10×ssDNA処理で処理された植物のうち、6つのうち2つは枯れ、残りの4つは30%成長が阻害された。1×dsRNA処理で処理された植物のうち、6つすべての植物はWM噴霧後8日目またはdsRNA処理後10日目までに枯れた。
実施例21
本実施例は、植物の浸透移行性サイレンシングを誘導するために、局所的に適用されるポリヌクレオチドを含む組成物を用いる方法を説明する。さらに詳細には、本実施例は植物に浸透移行性サイレンシングを誘導するためのポリヌクレオチド配列の選択を説明する。
各々約250bpで、配列番号41−52(表8)のEPSPSのタイリングされたDNA配列に対応する一本鎖を有する12個のdsRNAを、図25Aに示すように、パルマーアマランスのEPSPS遺伝子の全コーディング配列および5’ならびに3’の非翻訳領域の部分を網羅するように、タイリング様式で設計した。
Figure 0006581238
Figure 0006581238
Figure 0006581238
Figure 0006581238
実施例1および図1に記載される、4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子は、それぞれタイリングセグメント2、3、4、および8に位置し、それらのセグメント内の薄い灰色のバーとして示される。EcoRIおよびBamHIクローニング部位に挿入されたEPSPSポリヌクレオチドを有するpBR322ベクターを使用して、ポリヌクレオチドをインビトロ転写により合成した。プラスミドDNAをQiagen Maxi prep kitで単離し、EcoRIおよびBamHI制限酵素で切断した。切断されたDNA溶液を更なる精製なしに植物の処理に使用した。
16コピーのEPSPSを有するグリホサート耐性パルマーアマランス植物を以下のように処理した。すなわち、1%Silwet L-77を噴霧;(2)dsRNA溶液(12個のタイリングセグメントまたは実施例1に記載の4つの「短い」dsRNA分子から選択されたポリヌクレオチドを、植物あたり0.01ナノモルDNAの割合で含む)または対照として手動で緩衝液を適用;および(3)48時間後、1ヘクタールあたり840g酸当量で適用されるRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤のグリホサートを159リットル/エーカーの割合で噴霧した。処理された植物の地上の高さを除草剤処理後11日目に観察し、枯れているまたは枯れかけている植物に高さ0を割り当てた。結果は図25Bおよび25Cに示した。本アッセイにおいて、最も高い有効性を示したdsRNAポリヌクレオチドの組み合わせには、実施例1に記載の4つの「短い」dsRNA分子、タイリングセグメント2、5、8、ならびに11の組み合わせ、およびタイリングセグメント7、8ならびに9の組み合わせが含まれた。
実施例22
本実施例は、植物に浸透移行性サイレンシングを誘導するために局所的に適用されるポリヌクレオチドを含む組成物を用いる方法を説明する。さらに詳細には、本実施例は植物への除草剤の適用に続くポリヌクレオチドの局所適用を記載する。
あるアッセイでは、16コピーのEPSPSを有するグリホサート耐性パルマーアマランス植物に、1ヘクタールあたり840g酸当量で適用されるRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤のグリホサートを159リットル/エーカーの割合で噴霧した。除草剤適用後2時間または24時間で、1%Silwet L-77の噴霧により植物を処理した。Silwet処理後15分−20分に、2%硫酸アンモニウムを含む緩衝液中一植物あたり0.8ナノモル(「1×」)の実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子またはまたは2%硫酸アンモニウムを含む緩衝液の手での適用により植物を処理した。本アッセイでは、未処理(「UT」)の対照植物を1%Silwet L-77噴霧でのみ処理し、除草剤またはdsRNAでは処理しなかった。結果を図26に示す。本アッセイでは、1%Silwetの適用は、除草剤噴霧後2時間で適用される際には60%、除草剤噴霧後24時間で適用される際には20%グリホサート活性が改善した。本アッセイでは、1%Silwetに続くEPSPS dsRNAの適用は除草剤噴霧後2時間で適用される際少なくとも80%、除草剤噴霧後24時間で適用される際は20%、グリホサート活性が改善した。
別のアッセイでは、Macon、GAの農地由来の土壌中の種子から栽培したパルマーアマランスに、1ヘクタールあたり840g酸当量で適用されるRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤のグリホサートを159リットル/エーカーの割合で噴霧した。除草剤処理後3日目に、40の植物のうち9つが枯れ、3つが深刻に成長を阻害された。生存した植物には1%Silwet L-77を噴霧し、続いて一植物あたり8ナノモル(「10×」)の実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子または対照として緩衝液を手動で局所適用した。3日後、dsRNA処理した群のさらに3つの植物が枯れており、緩衝液処理した群のさらに2つの植物が枯れていた。この時点で(最初の除草剤処理後6日目およびSilwet/dsRNAまたは緩衝液処理後3日目)、各々の群の生存した植物の半分にグリホサートの2回目の適用を噴霧した(一回目の適用と同じ用量を適用した)。この2回目の除草剤処理後2週間で、残りのdsRNA処理された植物は80%の損傷を、残りの緩衝液処理された植物は40%の損傷を示した。
実施例23
本実施例は、植物の浸透移行性サイレンシングを誘導するために、局所的に適用されるポリヌクレオチドを含む組成物を用いる方法を説明する。さらに詳細には、本実施例は、除草剤耐性の雑草を制御するためのポリヌクレオチド、界面活性剤および除草剤を含む単一組成物の一工程局所適用を説明する。
本アッセイを非常に高コピー数のEPSPSを有することが知られているグリホサート耐性パルマーアマランス植物の野外個体群(本研究場由来の植物は、Gaines et al.(2010)Proc. Natl. Acad. Sci. USA、107:1029-1034により、5−160超コピー数のEPSPSを有することが報告されている)に対して実施した。本アッセイに使用されたポリヌクレオチドは実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」EPSPS dsRNA分子の等モル濃度混合物であった。
1フィート×5フィートの処理エリアの4−6インチの高さの植物に、単回処理で、1%SilwetL-77界面活性剤、2%硫酸アンモニウム、およびグリホサート(159リットル/エーカーの割合で、1ヘクタールあたり1682g酸当量を適用されるRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)も含む溶液中264マイクログラム(「100×」)または52.8マイクログラム(「20×」)のEPSPS dsRNAを噴霧した。比較のため、1フィート×5フィートの処理エリアの他の植物に、同じ割合で適用されるグリホサート(1%SilwetL-77界面活性剤および2%硫酸アンモニウムも含む溶液中)を噴霧した。
結果を図27に示す。Silwet L-77および硫酸アンモニウムも含む溶液中の(159リットル/エーカーの割合で、1ヘクタールあたり1682g酸当量を適用されるRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)グリホサートのみで処理した植物は、約70%制御(植物の死)であった。20×EPSPS dsRNAポリヌクレオチド、界面活性剤、硫酸アンモニウム、および除草剤を含む組成物を使用する一工程処理では、グリホサート耐性パルマーアマランスの約80−85%制御になり、これは、159リットル/エーカーの割合で、1ヘクタールあたり6720g酸当量を適用される、Roundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤のグリホサート(つまり、159リットル/エーカーの割合で、1ヘクタールあたり約840g酸当量である標準的適用割合の8倍のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧して得られた近似の制御割合である。100×EPSPS dsRNAポリヌクレオチド、界面活性剤、硫酸アンモニウム、および除草剤を含む組成物を使用した一工程処理はグリホサート耐性パルマーアマランスの約90−95%制御になり、これは、159リットル/エーカーの割合で、1ヘクタールあたり13440g酸当量を適用される、Roundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤のグリホサート(つまり、159リットル/エーカーの割合で、1ヘクタールあたり約840g酸当量である標準的適用割合の16倍のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧して得られる近似の制御割合である。
実施例24
本実施例は、標的遺伝子または標的遺伝子から転写されたRNA中の18以上の連続する核酸の配列に対し本質的に同一または本質的に相補的なヌクレオチド配列を有するセグメントを含むポリヌクレオチド分子を野菜に局所適用することにより、野菜植物の標的遺伝子の浸透移行性の調節を誘導するための方法(それにより分子が野菜植物の内部に浸透し、標的遺伝子の浸透移行性の調節を誘導する)を説明する。本実施例では、(a)ポリヌクレオチド浸透のための植物用コンディショニング剤(b)アンチセンスまたはセンス方向で標的遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメント含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含むポリヌクレオチドを含む、野菜または果物の作物の標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘導するための組成物を成長期野菜植物に局所的に適用して処理した。さらに詳細には、本実施例は、野菜作物、つまりレタス(ラクチュカ・サティバ(Lactuca sativa))のフィトエン不飽和化酵素(PDS)遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘導するために局所的に適用によるポリヌクレオチドの使用を実証した。
レタスPDSは、以下の配列を有する。すなわち、ATGTCTCTGTTTGGAAATGTTTCTGCCATTAACTCAAGTGGAAAGTGTATAGTAATGAATCTTTCAAGCACACAAATCACTTCAAGAGATTGTTTCAAGATTACCTCAGGGCAAAAAGATGTTTTGTCATTTGGATGCTGTGATGCTATGGGTAACAGATTGCAATTCCCAAGTGCTCGTTCTTTTACACCAAGATCAAAGAAGAATGTCTCCCCTCTAAAGGTAGTTTGTGTTGATTATCCAAGACCAGATCTTGATAACACATCTAATTTCTTGGAAGCTGCTCACTTGTCTTCAACCTTCAGAACTTCCCCACGCCCATCTAAGCCATTGAAGATTGTAATTGCTGGTGCAGGTTTAGCTGGTTTATCAACTGCTAAGTATTTAGCTGATGCAGGTCACAAGCCAATTTTACTAGAAGCAAGAGATGTTCTTGGTGGAAAGGTGGCAGCTTGGAAAGATGATGATGGAGATTGGTATGAGACAGGTTTACACATATTCTTTGGAGCTTACCCAAATGTACAAAATTTATTTGGAGAGCTAGGAATTAATGATAGATTACAGTGGAAGGAGCATTCTATGATATTTGCAATGCCAAATAAGCCTGGAGAATTTAGTAGGTTTGACTTCCCAGATGTTTTACCTGCACCATTGAATGGAATTTTTGCTATATTGAGGAACAATGAAATGCTGACGTGGCCTGAGAAAGTGAAGTTTGCAATTGGGCTGTTGCCTGCAATGTTAGGTGGACAGGCTTATGTTGAGGCCCAAGATGGGCTTAGTGTTCAGGACTGGATGAGAAAGCAAGGTATACCTGATCGAGTTACTACTGAAGTGTTTATTGCAATGTCAAAAGCATTAAACTTTATAAATCCAGATGAACTTTCAATGCAATGTATTCTCATTGCTCTAAACCGTTTTCTTCAGGAAAAGCATGGTTCCAAGATGGCATTTTTAGATGGGAGCCCACCAGAAAGACTTTGCAAGCCAATTGTTGACCACATCGAGTCACTCGGTGGCCAAGTCAGAGTCAACTCACGAATACAAAAAATTGAGTTAAACAAAGACGGAACTGTCCGGAACTTTCTATTGAGTGATGGGAATGTTCTAGAAGCTGATGCTTATGTTTTCGCTACCCCTGTTGACATTCTCAAGCTTCTTTTACCCGAAGAATGGAAACCAATTCCATATTTCAAAAAATTAGAGAAGTTAGTCGGTGTTCCTGTTATAAACGTTCATATATGGTTTGACAGAAAGCTGAAAAACACATATGATCACTTACTTTTCAGTAGGTCACCTCTGCTGAGTGTGTATGCTGACATGTCAGTGACATGTAAGGAATATTATGATCCGAATAAGTCAATGTTGGAGTTGGTTCTTGCTCCAGCTGAGGAATGGATTTCAAGAAGTGACACTGATATTATTGATGCAACAATGAGTGAACTTTCAAGGCTTTTTCCTGATGAAATTGCAGCTGATCAAAGTAAAGCAAAAATCTTGAAATATAAAGTTGTTAAAACACCAAGGTCTGTTTATAAAACTGTTCCAGATTGTGAACCATGTCGACCCCTACAAAGATCTCCAATTCAAGGATTTTATTTATCTGGTGATTATACTAAACAAAAGTATTTGGCTTCAATGGGGGGTGCTGTTTTATCTGGAAAAATTTGTGCACAAGCTATTTTACAAGATTATGAGATGCTTGCTACA(配列番号53)である。以下の配列を有する21−45ヌクレオチド長のポリヌクレオチド一本鎖DNAを合成した。すなわち、taatacgactcactatagggtttggagcttacccaaATGtac(「HL286」、センス方向、配列番号54)、taatacgactcactatagggaggccacgtcagcatttcattgttc(「HL287」、アンチセンス方向、配列番号55)、ccattcaATGgtgcaggtaaaac(「HL288」、アンチセンス方向、配列番号56)、catagaATGctccttccactg(「HL289」、アンチセンス方向、配列番号57)、およびcaaataaattttgtacatttgggtaagctccaa(「HL290」、アンチセンス方向、配列番号58)である。ssDNA溶液を5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中0.01%Silwet L-77中、5つすべてのポリヌクレオチドの当量混合物で作製した。
レタスの変種LS49「グリーンタワー(Green Tower)」を本アッセイに使用した。各植物の2枚の完全に開いた葉を、数秒間、新たに作製した再蒸留水溶液中0.1%Silwet L-77溶液に浸漬した。葉を15−30分間乾燥させた。その後、2枚のSilwet処理された葉の上面に20マイクロリットルのssDNA溶液を適用することにより各植物を処理した(一植物あたり全40マイクロリットル)。表9に使用されたアッセイの条件およびssDNAポリヌクレオチドで局所的に処理された植物の観察された退色を列挙する。図28は、一植物あたり1ナノモルのssDNAで処理されたレタス植物(先端から下端まで)の処理後37、46および60日目の退色の進行および死滅を示す。
Figure 0006581238
アッセイを一植物あたり2または4ナノモルのssDNAの適用で繰り返した。図29Aにポリヌクレオチドでの局所処理後4日目または12日目に観察される退色により証明される浸透移行性サイレンシングを示す。
アッセイはそれぞれのアンチセンスssDNA(「HL287」、配列番号55;「HL288」、配列番号56;「HL289」、配列番号57;および「HL290」、配列番号58)を用いて、一植物あたり8ナノモルのポリヌクレオチドの適用で繰り返された。ポジティブ制御植物を、おのおの2ナノモルの4つのそれぞれのアンチセンスssDNAsの混合物で処理し(一植物あたり全量で8ナノモルのポリヌクレオチドを適用した)、ネガティブ制御植物を、緩衝液のみで処理した。図29BはアンチセンスssDNAの局所処理後4日目に観察される退色により証明される浸透移行性サイレンシングを示す。
実施例25
本実施例は本発明の一態様を説明する。本実施例では、植物中の標的遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘導するために、(a)ポリヌクレオチド浸透のための植物用コンディショニング剤および(b)アンチセンスまたはセンス配向のいずれかで標的遺伝子の18以上の連続するヌクレオチドの少なくとも1つのセグメントを含む少なくとも1つのポリヌクレオチド鎖を含むポリヌクレオチドを含む局所的に適用される組成物で成長期植物を処理した。さらに詳細には、本実施例は野菜作物つまりトマト(ソヌラム・リコペルシカム(Solanum lycopersicum))のフィトエン不飽和化酵素(PDS)遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘導するための局所的に適用されるポリヌクレオチドの使用を実証した。
トマトPDSは、以下の配列を有する。すなわち、GGGTTTATCTCGCAAGTGTGGCTATGGTGGGACGTGTCAAATTTTGGATTGTAGCCAAACATGAGATTTGATTTAAAGGGAATTGGCCAAATCACCGAAAGCAGGCATCTTCATCATAAATTAGTTTGTTTATTTATACAGAATTATACGCTTTTACTAGTTATAGCATTCGGTATCTTTTTCTGGGTAACTGCCAAACCACCACAAATTTCAAGTTTCCATTTAACTCTTCAACTTCAACCCAACCAAATTTATTTGCTTAATTGTGCAGAACCACTCCCTATATCTTCTAGGTGCTTTCATTCGTTCCGAGTAAAATGCCTCAAATTGGACTTGTTTCTGCTGTTAACTTGAGAGTCCAAGGTAGTTCAGCTTATCTTTGGAGCTCGAGGTCGTCTTCTTTGGGAACTGAAAGTCGAGATGGTTGCTTGCAAAGGAATTCGTTATGTTTTGCTGGTAGCGAATCAATGGGTCATAAGTTAAAGATTCGTACTCCCCATGCCACGACCAGAAGATTGGTTAAGGACTTGGGGCCTTTAAAGGTCGTATGCATTGATTATCCAAGACCAGAGCTGGACAATACAGTTAACTATTTGGAGGCTGCATTTTTATCATCAACGTTCCGTGCTTCTCCGCGCCCAACTAAACCATTGGAGATTGTTATTGCTGGTGCAGGTTTGGGTGGTTTGTCTACAGCAAAATATTTGGCAGATGCTGGTCACAAACCGATACTGCTGGAGGCAAGGGATGTTCTAGGTGGAAAGGTAGCTGCATGGAAAGATGATGATGGAGATTGGTACGAGACTGGTTTGCATATATTCTTTGGGGCTTACCCAAATATTCAGAACCTGTTTGGAGAATTAGGGATTAACGATCGATTGCAATGGAAGGAACATTCAATGATATTTGCAATGCCAAGCAAGCCAGGAGAATTCAGCCGCTTTGATTTCTCCGAAGCTTTACCCGCTCCTTTAAATGGAATTTTAGCCATCTTAAAGAATAACGAAATGCTTACATGGCCAGAGAAAGTCAAATTTGCAATTGGACTCTTGCCAGCAATGCTTGGAGGGCAATCTTATGTTGAAGCTCAAGATGGGATAAGTGTTAAGGACTGGATGAGAAAGCAAGGTGTGCCGGACAGGGTGACAGATGAGGTGTTCATTGCTATGTCAAAGGCACTCAACTTTATAAACCCTGACGAACTTTCAATGCAGTGCATTTTGATCGCATTGAACAGGTTTCTTCAGGAGAAACATGGTTCAAAAATGGCCTTTTTAGATGGTAATCCTCCTGAGAGACTTTGCATGCCGATTGTTGAACACATTGAGTCAAAAGGTGGCCAAGTCAGACTGAACTCACGAATAAAAAAGATTGAGCTGAATGAGGATGGAAGTGTCAAGAGTTTTATACTGAGTGACGGTAGTGCAATCGAGGGAGATGCTTTTGTGTTTGCCGCTCCAGTGGATATTTTCAAGCTTCTATTGCCTGAAGACTGGAAAGAGATTCCATATTTCCAAAAGTTGGAGAAGTTAGTCGGAGTACCTGTGATAAATGTACATATATGGTTTGACAGAAAACTGAAGAACACATATGATCATTTGCTCTTCAGCAGAAGCTCACTGCTCAGTGTGTATGCTGACATGTCTGTTACATGTAAGGAATATTACAACCCCAATCAGTCTATGTTGGAATTGGTTTTTGCACCTGCAGAAGAGTGGATATCTCGCAGCGACTCAGAAATTATTGATGCAACGATGAAGGAACTAGCAACGCTTTTTCCTGATGAAATTTCAGCAGATCAAAGCAAAGCAAAAATATTGAAGTACCATGTTGTCAAAACTCCGAGGTCTGTTTATAAAACTGTGCCAGGTTGTGAACCCTGTCGGCCTTTACAAAGATCCCCAATAGAGGGGTTTTATTTAGCCGGTGACTACACGAAACAGAAATACTTGGCTTCAATGGAAGGCGCTGTCTTATCAGGAAAGCTTTGTGCTCAAGCTATTGTACAGGATTATGAGTTACTTGTTGGACGTAGCCAAAAGAAGTTGTCGGAAGCAAGCGTAGTTTAGCTTTGTGGTTATTATTTAGCTTCTGTACACTAAATTTATGATGCAAGAAGCGTTGTACACAACATATAGAAGAAGAGTGCGAGGTGAAGCAAGTAGGAGAAATGTTAGGAAAGCTCCTATACAAAAGGATGGCATGTTGAAGATTAGCATCTTTTTAATCCCAAGTTTAAATATAAAGCATATTTTATGTACCACTTTCTTTATCTGGGGTTTGTAATCCCTTTATATCTTTATGCAATCTTTACGTTAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGA(配列番号59)である。
配列TCGCAGCGACTCAGAAATTATTGATGCAACGATGAAGGAACTAGCAACGCTTTTTCCTGATGAAATTTCAGCAGATCAAAGCAAAGCAAAAATATTGAAGTACCATGTTGTCAAAACTCCGAGGTCTGTTTATAAAACTGTGCCAGGTTGTGAACCCTGTCGGCCTTTACAAAGATCCCCAATAGAGGGGTTTTATTTAG(配列番号60)(トマトPDS遺伝子配列(配列番号59)から転写されたmRNAの位置1724−1923のヌクレオチドに対応する)でコードされるRNAにハイブリダイズできるアンチセンス鎖を有する201ヌクレオチドのdsRNAポリヌクレオチドを、配列TAATACGACTCACTATAGGGTCGCAGCGACTCAGAAATTATTG(配列番号61、センスプライマー)およびTAATACGACTCACTATAGGGGTAAAGGCCGACAGGGTTCACAACC(配列番号62、アンチセンスプライマー)を含むオリゴヌクレオチドプライマーを使用してRTPCRにより合成した。2.5マイクロモル濃度のdsRNA溶液を5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中0.01%SilwetL-77中に201ヌクレオチドdsRNAポリヌクレオチド(配列番号60)で作製した。
3週令のトマト実生を以下のように処理した。2枚の完全に開いた葉を、数秒間、新たに作製した再蒸留水中0.1%Silwet L-77溶液に浸漬した。葉を30分−1時間乾燥させた。その後、2枚のSilwet処理された葉の上面に20マイクロリットルのssDNA溶液を適用することにより各植物を処理した(一植物あたり全40マイクロリットル)。対照植物を緩衝液で処理した。植物を観察のためにグロースチャンバー中に維持した。図30は局所処理後30日目にdsRNA処理された植物の退色により証明される標的遺伝子PDSの浸透移行性サイレンシングを示す。dsRNAで処理された植物は対照植物と比較して深刻に成長が阻害された。
実施例26
本実施例は、成長期植物の外面の局所コーティングに適当な除草性組成物の改良を説明し、植物致死性薬剤には、1つ以上の植物遺伝子の配列または植物遺伝子から転写されたDNAの配列に本質的に同一または相補的な配列を有するポリヌクレオチドが含まれる。ポリヌクレオチドは、局所のポリヌクレオチド適用を受けた植物の器官または組織以外の植物の器官または組織において植物遺伝子の浸透移行性抑制をもたらす。さらに詳細には、本実施例は、界面活性剤ならびに、パルマーアマランスの5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)遺伝子、転写開始因子(TIF)およびDNA依存性ATP分解酵素(ddATPase)を標的とする配列を有するポリヌクレオチドの組み合わせを含む、少なくとも1つの植物致死性薬剤から成る成長期植物の外面に局所的なコーティングするのに適当な除草性組成物を説明する。
除草性の組成物には、以下の21塩基対の二本鎖RNAポリヌクレオチドの少なくとも1つが含まれる:
(1)nDsRNA1:センス鎖CUACCAUCAACAAUGGUGUCC(配列番号63)およびアンチセンス鎖GGACACCAUUGUUGAUGGUAG(配列番号64)
(2)nDsRNA3:センス鎖gUCGACAACUUGCUGUAUAGU(配列番号65)およびアンチセンス鎖ACUAUACAGCAAGUUGUCGAC(配列番号66)
(3)nDsRNA4:センス鎖gGUCACCUGGACAGAGAAUAG(配列番号67)およびアンチセンス鎖CUAUUCUCUGUCCAGGUGACC(配列番号68)
(4)nDsNA5:センス鎖 AAUGCCAGAUGUUGCUAUGAC(配列番号69)およびアンチセンス鎖GUCAUAGCAACAUCUGGCAUU(配列番号70)
複数のポリヌクレオチドの混合物は、処理された植物の耐性の選択を妨げるために有利である。ある実施形態において、除草性組成物には配列番号63−70を有する上記のdsRNAポリヌクレオチドの4つすべての混合物が含まれる。別の実施形態では、除草性組成物には、dsRNA配列配列番号63−70の1つ以上に対応するデオキシリボヌクレオチド配列を含む一本鎖DNAポリヌクレオチドが含まれる。別の実施形態では、除草性組成物には1つ以上のdsRNA配列配列番号63−70に対応するヌクレオチド配列を含むRNA/DNAハイブリッドが含まれる。別の実施形態では、安定化のために、除草性組成物には2’水酸基がメチル化されるdsRNAポリヌクレオチドが含まれる。
除草性組成物には、Silwet L-77のような界面活性剤(または実施例36に提供される他の効果的な界面活性剤)が含まれる。任意選択的に、除草性組成物には、例えば植物内部へのポリヌクレオチド移送を強化する、ポリヌクレオチドの有効性を増強する、または非ポリヌクレオチド除草剤の除草性の活性を増強することによって除草能を改善するために、塩、キレート剤または吸湿剤(実施例35に提供されるような)のような1つ以上の添加剤が含まれ得る。
任意選択的に、除草性組成物には植物の複数の遺伝子を制御するように設計されたポリヌクレオチドが含まれる。ある実施形態では、除草性組成物には、第二の遺伝子の配列または第二の遺伝子から転写されるRNA配列と本質的に同等または相補的な配列を有するポリヌクレオチドが含まれ、ここで第二の遺伝子の制御により組成物の除草性活性の相乗的な増加がもたらされる。
ある実施形態では、除草性組成物には、パルマーアマランスの内在性5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)遺伝子の配列、または、内在性EPSPS遺伝子から転写されたRNAの配列に実質的に同一または相補的な配列を有するポリヌクレオチド、および、内在性のPalmer翻訳開始因子(TIF)遺伝子の配列または内在性のTIF遺伝子から転写されるRNAの配列と本質的に同一または相補的な配列を有するポリヌクレオチドが含まれる。翻訳開始因子(TIF)は、タンパク質合成の開始に必須で植物全体に発現される核コード化葉緑体タンパク質である。アラビドプシス・タリアナ(Arabidopsis thaliana)はAT1G17220.1という名称のオルソログを有する(ウエブサイトwww.arabidopsis.org/servlets/TairObject?type=locus&name=AT1G17220で一般公開されているデータベースThe Arabidopsis Information Resourceに記載され、GenBankアクセッション番号GI:186478573が割り当てられ、これは細菌性の翻訳開始因子2との類似性を有する葉緑体局在性タンパク質として同定された;本遺伝子の説明に関してMiura et al.(2007)Plant Cell, 19:1313-1328 も参照)。TIF配列はパルマーアマランス(アマランサスパルメリ(Amaranthus palmeri)))から同定された;あるTIF遺伝子は配列番号71の配列を有することが同定された。アマランサスパルメリの該TIF遺伝子抑制のためのポリヌクレオチドの例は表10に記載される。
Figure 0006581238
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ある実施形態において、除草性組成物には、配列番号63−70を有する上記のEPSPS dsRNAポリヌクレオチドのうち少なくとも2つを有する混合物、および表10に提供されるような、内在性のPalmer翻訳開始因子(TIF)遺伝子の配列または内在性のTIF遺伝子から転写されるRNA配列に本質的に同一または相補的な配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドも含まれる。特定の実施形態において、除草性組成物には、配列番号63−70を有する4つのEPSPS dsRNAポリヌクレオチドならびに以下のセンス配列およびアンチセンス配列を有する160塩基対のTIF二本鎖RNAポリヌクレオチドの混合物が含まれる。すなわち、UUCGAGUAAUGGGAAAUUGGAUAAUGUAGAGGAGAGGAAGAAGGUUAUUGAUUCAUUGGAUGAGGUAUUAGAAAAGGCCGAGAGAUUAGAAACGGCGAACUUACAAGCAGAUAAUAGAAAGGAUAGCACAAAUGUAAAUAAACCGUCUCCGAGUGUAAGU(配列番号73)のセンス配列およびACUUACACUCGGAGACGGUUUAUUUACAUUUGUGCUAUCCUUUCUAUUAUCUGCUUGUAAGUUCGCCGUUUCUAAUCUCUCGGCCUUUUCUAAUACCUCAUCCAAUGAAUCAAUAACCUUCUUCCUCUCCUCUACAUUAUCCAAUUUCCCAUUACUCGAA(配列番号74)のアンチセンス配列である。
いくつかの実施形態において、ポリヌクレオチドは複数の標的遺伝子を調節するために設計され、その結果、除草剤活性への相乗効果が生じる。例えば、除草剤活性に対する相乗的な効果は、翻訳開始因子(TIF)および5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)を抑制するように設計されたポリヌクレオチドでの植物の処理、続いて非ポリヌクレオチド除草剤グリホサートでの処理により得られた。
表11に記載のポリヌクレオチドを合成またはインビトロ転写により作製した。
Figure 0006581238
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ポリヌクレオチドの溶液を調整し、表12に記載のプロトコールを使用してパルマー・アマランス(Palmer amaranth)の葉に適用した。
Figure 0006581238
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表13に示されるようにポリヌクレオチドの組み合わせをテストした。
Figure 0006581238
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*複数コピー数が記載されている場合、処理された植物はコピー数の混合物であった。
**DAT=処理後の日数;「0%制御」は処理された植物と対照植物に違いが観察されなかったことを意味する;成長阻害%は[100-(試験植物の平均の高さ/対照植物の平均の高さ)*100]のように計算される。
アマランサスパルメリのTIF遺伝子の抑制のための二本鎖25-mer RNAポリヌクレオチド配列を、表14に記載されるように設計した。
Figure 0006581238
TIF 25-mer dsRNAポリヌクレオチドを高コピー(112)および低コピー(16)のEPSPSグリホサート耐性パルマー・アマランス(Palmer amaranth)双方に対して試験した。
11.5グラム/エーカーの4つの短いEPSPS dsRNA(実施例1に記載の短いdsRNA-1、短いdsRNA-3、短いdsRNA-4、およびIDT[5](表11に記載の配列番号91−92))ならびに5.8グラム/エーカーの1つのTIF dsRNAとの混合物で、または、5.8グラム/エーカーの各TIF 25mer dsRNAで、高コピー植物を処理した。ポリヌクレオチド溶液を2%硫酸アンモニウムおよび1%Silwet L-77を含む10ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液(pH6.8)に製剤した。ポリヌクレオチド処理後30分で、植物にグリホサート(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧、または噴霧しなかった。
0.23グラム/エーカーの4つの短いEPSPS dsRNA(実施例1に記載の短いdsRNA-1、短いdsRNA-3、短いdsRNA-4、およびIDT[5](表11に記載の配列番号91−92))ならびに5.8グラム/エーカーの1つのTIF dsRNAとの混合物で、または、5.8グラム/エーカーの各TIF 25mer dsRNAで低コピー植物を処理した。ポリヌクレオチド溶液を2%硫酸アンモニウムおよび1%Silwet L-77を含む10ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液(pH6.8)に製剤した。ポリヌクレオチド処理後30分で、植物にグリホサート(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧、または噴霧しなかった。
結果を図31および32に示し、TIFポリヌクレオチドがEPSPSポリヌクレオチドの活性を増強しTIFポリヌクレオチドが除草性の活性をそれ自身有することを示す。
実施例27
本発明の態様には、植物中の非ポリヌクレオチド除草剤活性を増強するためのポリヌクレオチド組成物および使用方法が含まれる。例えば、除草剤の標的遺伝子または除草剤の不活性化遺伝子またはストレス応答遺伝子またはそのような標的遺伝子の組み合わせを制御するように設計されたポリヌクレオチド組成物を、雑草または自生の植物に、非ポリヌクレオチド除草剤(典型的な通常の化学的除草剤)の適用と同時に、または、その後に、またはその前に適用し、非ポリヌクレオチド除草剤の活性を増強する。ポリヌクレオチド組成物と非ポリヌクレオチド除草剤(例えば、通常の化学的除草剤)の組み合わせは、相乗的な効果をもたらす。つまり組み合わせの除草性の効果は、ポリヌクレオチド組成物の除草性の効果と非ポリヌクレオチド除草剤の除草性の効果の合計よりも高い。
通常の化学的除草剤の例およびその対応する除草剤標的遺伝子を表15に提供する。
Figure 0006581238
通常の化学的除草剤およびその対応する除草剤の不活性化遺伝子の例を表16に提供する。
Figure 0006581238
実施例28
本実施例は、標的内在性遺伝子または標的内在性遺伝子から転写されたメッセンジャーRNAの18以上連続したヌクレオチド配列に本質的に同一もしくは本質的に相補的な配列を有するポリヌクレオチドを、成長期植物の葉に局所的にコーティング、それによりポリヌクレオチドが成長期植物の内部に浸透し標的内在性遺伝子の浸透移行性の調節を誘導することを含む、成長期植物中の標的内在性遺伝子の浸透移行性調節を誘導するための方法を説明する。
二本鎖RNAまたはアンチセンスssDNAポリヌクレオチドを、除草剤標的遺伝子5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)、フィトエン不飽和化酵素(PDS)、プロトポルフィリンIXオキシゲナーゼ(PPO)、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ(PAL)、ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ(HPPD)、アセチルコエンザイムAカルボキシラーゼ(ACCase)、アセト乳酸合成酵素(ALS)およびグルタミン合成酵素(GS)に対して設計した。各除草剤標的遺伝子に対して、0.5%SilwetL-77噴霧(10ガロン/エーカー)適用後10ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中2%硫酸アンモニウム中に8つのアンチセンスssDNAポリヌクレオチドの混合物を含む溶液を2.32g/エーカーの割合で適用した。試験されたポリヌクレオチドおよび結果の表現型の観察を表17に記載する。
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パルマー・アマランス(Palmer amaranth)に除草剤メソトリオン、ホメサフェン、およびアトラジンを組み合わせて使用する際の、酵素4-ヒドロキシフェニルピルビン酸(HPPD)およびプロトポルフィリノーゲン酸化酵素(PPO)、および転写開始因子(TIF)を標的とするssDNAポリヌクレオチドの除草性活性、およびその除草性の活性に対する効果を研究した。本実験で使用されるポリヌクレオチドは8つのHPPDアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号141−148)、8つのPPOアンチセンスオリゴヌクレオチド(配列番号125−132)、および8つのTIFアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド(配列番号75−82、実施例26を参照)であった。
グリホサート感受性のパルマーアマランス(アマランサスパルメリ)植物を3.5kg/立方メートルのOsmocote(登録商標)14-14-14成長促進剤を含むSunGro(登録商標)Redi-earth seedling mixを含む4平方インチのポット中、温室で、明期14時間および日中温度摂氏30度、夜間温度摂氏20度で栽培した;必要な際に植物に地下灌漑した。
10−15cmの高さの植物を手動で40マイクロリットル(4枚の完全に開いた成熟した葉を、各植物の葉あたり10マイクロリットルの溶液で処理した)の緩衝液-界面活性剤溶液(対照として;0.5%SilwetL-77および2%硫酸アンモニウム)または緩衝液-界面活性剤-ssDNAポリヌクレオチド混合物(HPPD、PPO、またはTIFを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの混合物)で前処理した。いくつかの植物を未処理のままにして対照として使用した。24時間後、未処理の植物、緩衝液-界面活性剤処理された植物および緩衝液-界面活性剤-ssDNA処理された植物を、9501Eノズルを装備し、1ヘクタールあたり93リットルの溶液(表18に示されるようなHPPD阻害剤、メソトリオン(1ガロンあたり4ポンドの活性成分;)、またはPPO阻害剤、ホメサフェン(1ガロンあたり2ポンドの活性成分)、または光化学系II阻害剤、アトラジン(90%活性成分)を含む)を送達するように較正したトラック噴霧器(track-sprayer)を用いて処理した。1%の濃縮作物油(crop oil concetrate)(COC)をすべての除草剤の処置に添加した。低い割合の各除草剤を(メソトリオン:推奨される現場の割合の1/8に相当する1エーカーあたり13g;ホメサフェン:推奨される現場の割合の1/22に相当する1エーカーあたり16gおよびアトラジン:推奨される現場の割合の1/8に相当する1エーカーあたり170g)オリゴヌクレオチド混合物による除草性の活性のいかなる改良も検出できるように使用した。
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植物の背丈を除草剤処理後4日目に決定した。1つの実験から一処理あたり4回の反復でデータを収集した。結果(緩衝液-界面活性剤溶液、ssDNA、および除草剤処理の組み合わせに影響を受けたパルマーアマランス植物の背丈として表現される)を表19および図33に示す。HPPDアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド、PPOアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドおよびTIFアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドで処理された植物は成長阻害を示し、それぞれ、125、153、および115mmを測定したが、一方で、緩衝液-界面活性剤(対照)で処理された植物は185mm(図33)を測定した。HPPDアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド、PPOアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド、およびTIFアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチドでの処理は、緩衝液-界面活性剤対照と比較して、それぞれ32%、18%、および38%成長減少を引き起こした。
緩衝液-界面活性剤、続いて除草剤で処理された植物および除草剤のみで処理された植物の背丈に大きな差は観察されなかった。HPPDアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド、続いてメソトリオンで処理された植物は、植物の成長において最大の減少を示し、背丈は100mmで、緩衝液-界面活性剤処理された植物と比較して46%の減少を測定した。PPOアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド、続いてホメサフェンで処理された植物は126mmで、緩衝液-界面活性剤処理された植物と比較して32%の減少を測定した。TIFアンチセンスssDNAオリゴヌクレオチド、続いてアトラジンで処理された植物は121mmで、緩衝液-界面活性剤処理された植物と比較して34%の減少を測定した。
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実施例29
本実施例は、試験された配列が観察可能な表現型に及ぼす効果を確認するために、異なる必須遺伝子に対して設計された二本鎖RNAポリヌクレオチドの試験された配列を説明する。各必須遺伝子について、0.5%Silwet L-77噴霧(10ガロン/エーカー)の適用後、2%硫酸アンモニウムの10ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8にdsRNAポリヌクレオチドを含む溶液を、一植物あたり240ピコモルの割合でパルマーアマランスに適用した。試験されたポリヌクレオチドおよびその結果として発生した表現型の観察を表20に列挙する。
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実施例30
本実施例は、特定の低い配列相同性領域を標的とするように設計されるポリヌクレオチド、および、例えば標的遺伝子の特定の対立遺伝子または特定の種の遺伝子を選択するために有用なポリヌクレオチドを説明する。非コード配列を標的とするように設計されたポリヌクレオチドは、遺伝子制御に関与する非コードRNAを制御するのに、例えば、RNAi制御経路においてプロセシングされてsiRNAになる非コードRNAの制御に有用である。図34にベンサミアナタバコPDS遺伝子座1プロモーター(配列番号319)およびPDS遺伝子座2プロモーター(配列番号320)の配列比較を示す。複数の転写開始点を含む遺伝子座1では、本配列比較で使用されるプロモーター配列は、最も5’の転写開始点を有する配列である。ベンサミアナタバコPDS1およびPDS2遺伝子はプロモーター領域には低い配列相同性しか有しないが、コーディング領域には高い配列相同性を有することが見い出された。
表21にPDS1およびPDS2プロモーターの異なる部分を標的とするように設計されたポリヌクレオチドを列挙する。
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表21に記載または図35に説明されるポリヌクレオチド(適用ポリヌクレオチド毎に1ナノモル/植物)の6つの異なる組み合わせを4週令のベンサミアナタバコ植物に実施例12に記載の手順と同様の工程を用いて試験した。ポリヌクレオチド溶液を5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム、pH6.8中0.01%(v/v)Silwet L-77および2%(w/v)硫酸アンモニウムに調整した。一植物あたり2枚の完全に開いた葉を新たにddH2Oで作製した0.1%SilwetL-77溶液に数秒間浸漬し、乾燥させた。約30分後、20マイクロリットルのポリヌクレオチド溶液を2枚の前処理した各葉に適用した。ポジティブ制御の植物をPDS1およびPDS2のコード領域の保存セグメントを標的とするDNAオリゴヌクレオチドで同様に処理した。ネガティブ制御の植物を、緑色蛍光タンパク質(GFP)を発現抑制するように設計されたDNAオリゴヌクレオチドで同様に処理した。PDS1またはPDS2プロモーター領域を標的とするように設計されたポリヌクレオチドの6つすべての組み合わせは、退色により証明されるように、処理された植物の浸透移行性サイレンシングを誘導した。約200bpでPDS1またはPDS2プロモーター領域を標的とするdsRNAまたはdsDNAポリヌクレオチドでの処理も、退色により証明されるように処理された植物の浸透移行性サイレンシングを誘導した。
表22に記載の以下の付加的なゲノム配列(プロモーターならびに転写されたイントロンおよびエクソン配列を含む)は、局所適用のためのポリヌクレオチドを設計する際に使用するために、アマランサス・パルメリ(Amaranthus palmeri)遺伝子に関して同定されたものである。
Figure 0006581238
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実施例31
本実施例は、複数の植物種において遺伝子発現を制御するポリヌクレオチド配列を説明する。異なる雑草種由来のEPSPS配列中の2ヶ所の非常によく保存された領域が同定され、表23に「領域1」および「領域2」配列として示された。
Figure 0006581238
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表24では、領域2のEPSPSコンセンサス配列、すなわち、TNGANGTcAAcATGAAcAAaATGCCaGATGTNGCNATGACNcTtGCNGTNGTTGC(配列番号263)のに基づき設計された21-、22-、24-、35-、45-、および55-merのdsRNAポリヌクレオチド配列を列挙する。
Figure 0006581238
EPSPSコンセンサスdsRNAポリヌクレオチドをインビトロ転写により合成し、未精製のRNA調製物として局所的に適用した。グリホサート耐性の雑草(16-コピーのパルマーアマランスおよびヒメムカシヨモギ)を6つそれぞれの(21-、22-、24-、35-、45-、55-mer)コンセンサス dsRNAで処理した。非-グリホサート耐性の雑草(ウォーターヘンプ(waterhemp)、エビスグサ、メヒシバ、アサガオ、シロザ、トウダイグサ)を3つそれぞれの短い(21-、22-、24-mer)コンセンサスdsRNAで処理した。ポリヌクレオチドでの処理後、グリホサート耐性の植物をグリホサート(1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)で処理し、非グリホサート耐性植物をグリホサート(1ヘクタールあたり105g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)で処理した。処理後7日目に、6つのEPSPS領域2コンセンサスdsRNAポリヌクレオチドすべてはグリホサート耐性パルマーアマランスの100%制御(枯れた植物)を与えることが見い出された;グリホサート単独で処理された対照のパルマーアマランスは枯れなかった。処理後7日目に、それぞれ試験された3つの短い(21-、22-、24-mer)EPSPS領域2コンセンサスdsRNAポリヌクレオチドは、それぞれ、ウォーターヘンプ(waterhemp)の95%、80%および65%制御を与えることが見い出された。グリホサートのみで処理されたウォーターヘンプ(waterhemp)植物は約40%制御(枯れた植物と損傷した植物を合わせた)を与えた。そして3つの短い(21-、22-、24-mer)コンセンサスdsRNAポリヌクレオチド全てを含む混合物はグリホサート単独とほぼ同じ制御を与えた。EPSPS領域2コンセンサスdsRNAポリヌクレオチドは、試験された他の雑草種(ヒメムカシヨモギ、エビスグサ、メヒシバ、アサガオ、シロザ、トウダイグサ)に観察可能な効果をもたらさなかった。
実施例32
本実施例は、所望の表現型をもたらすために、植物中の遺伝子を一時的に発現抑制するための局所ポリヌクレオチド処理の使用を説明する。植物組織中のポリフェノール酸化酵素の発現抑制は、切断または損傷をうけた植物組織の褐変を阻害し、褐変への耐性が所望の形質である果実および野菜の有用な形質でる。
表25に示される配列のアンチセンスDNAオリゴヌクレオチドを、レタス由来の3つのポリフェノール酸化酵素遺伝子(PPO1、PPO2、およびPPO3)を標的とするように設計した。下線付き箇所はアンチセンスポリヌクレオチドに含まれるT7配列を示す。
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3週令のレタス植物(変種SVR3603 L4)を以下のように処理した。各植物の2ヶ所の供給源の葉(より古く、成熟サイズの−60%の葉)を0.1%(v/v)Silwet-L-77で前処理し、乾燥させた(−15分間)。各葉に対して、5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム、pH6.8中0.01%(v/v)Silwet L-77および2%(w/v)硫酸アンモニウム溶液中のポリフェノール酸化酵素アンチセンスポリヌクレオチドの混合物を20マイクロリットル液滴として適用した。各植物を6.7ナノモルの3つの各ポリヌクレオチドHH07、HH09およびHH11(一植物あたり全量20ナノモル)で処理した。対照植物を、無関係のポリヌクレオチドHH02-05(フィトエン不飽和化酵素に対するアンチセンス)または緩衝液単独(5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム、pH6.8中0.01%(v/v)Silwet L-77および2%(w/v)硫酸アンモニウム)で処理した。
局所的なポリヌクレオチド処理後約3週間で、「未処理」のレタスの葉(つまり、局所的なポリヌクレオチドで処理されていない葉)を水中でレタスの結球から切断し5%エタノール中1.33ミリモル濃度のジャスモン酸メチルの入ったカップの中でインキュベーションした。中央の葉脈の褐変について葉を調べ、24時間毎に写真を撮った。サンプルを残りの植物から採取し、低分子RNAおよびmRNA分析のために凍結させた。
ポリフェノール酸化酵素アンチセンスポリヌクレオチドHH07、HH09、およびHH11で処理された植物は、ジャスモン酸メチル処理後、中央の葉脈の褐変に有意な低下を示した。対照としてHH02-05(フィトエン不飽和化酵素に対するアンチセンス)で処理された植物は、緩衝液処理された対照と比較して中央の葉脈の褐変に少しの低下を示した。
実施例33
本実施例は、成長期植物の外面の局所コーティングに適当な、界面活性剤および少なくとも1つの植物の致死性薬剤を含む除草性組成物を説明し、植物の致死性薬剤が植物遺伝子の配列または植物遺伝子の転写されたRNAの配列に対して本質的に同一または相補的な配列を有するポリヌクレオチド、植物遺伝子の浸透移行性抑制をもたらすポリヌクレオチドを含む改良を説明する。さらに詳細には、本実施例は、成長期植物の外面に局所コーティングするのに適当な、界面活性剤および少なくとも1つの植物の致死性薬剤を含む除草性の組成物を説明し、植物の致死性薬剤がベンサミアナタバコ由来の内在性フィトエン不飽和化酵素(PDS)、5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)、またはリブロース-1、5-二リン酸カルボキシラーゼオキシゲナーゼ(RuBisCO)遺伝子の抑制をもたらすポリヌクレオチドを含む改良を説明する。本実施例はまた、植物中、高度に発現する遺伝子(リブロース-1、5-二リン酸カルボキシラーゼオキシゲナーゼ)を抑制するために局所的に適用されるポリヌクレオチドの使用も説明する。
配列CATCTCCTTTAATTGTACTGC(配列番号34)を有するアンチセンスポリヌクレオチドは、以下のcDNA配列断片を有する、内在性のベンサミアナタバコフィトエン不飽和化酵素(PDS)遺伝子のために設計された。すなわち、
ATGCCCCAAATCGGACTTGTATCTGCTGTTAATTTGAGAGTCCAAGGTAATTCAGCTTATCTTTGGAGCTCGAGGTCTTCGTTGGGAACTGAAAGTCAAGATGTTTGCTTGCAAAGGAATTTGTTATGTTTTGGTAGTAGCGACTCCATGGGGCATAAGTTAAGGATTCGTACTCCAAGTGCCACGACCCGAAGATTGACAAAGGACTTTAATCCTTTAAAGGTAGTCTGCATTGATTATCCAAGACCAGAGCTAGACAATACAGTTAACTATTTGGAGGCGGCGTTATTATCATCATCGTTTCGTACTTCCTCACGCCCAACTAAACCATTGGAGATTGTTATTGCTGGTGCAGGTTTGGGTGGTTTGTCTACAGCAAAATATCTGGCAGATGCTGGTCACAAACCGATATTGCTGGAGGCAAGAGATGTCCTAGGTGGGAAGGTAGCTGCATGGAAAGATGATGATGGAGATTGGTACGAGACTGGGTTGCACATATTCTTTGGGGCTTACCCAAATATGCAGAACCTGTTTGGAGAACTAGGGATTGATGATCGGTTGCAGTGGAAGGAACATTCAATGATATTTGCGATGCCTAACAAGCCAGGGGAGTTCAGCCGCTTTGATTTTCCTGAAGCTCTTCCTGCGCCATTAAATGGAATTTTGGCCATACTAAAGAACAACGAAATGCTTACGTGGCCCGAGAAAGTCAAATTTGCTATTGGACTCTTGCCAGCAATGCTTGGAGGGCAATCTTATGTTGAAGCTCAAGACGGTTTAAGTGTTAAGGACTGGATGAGAAAGCAAGGTGTGCCTGATAGGGTGACAGATGAGGTGTTCATTGCCATGTCAAAGGCACTTAACTTCATAAACCCTGACGAGCTTTCGATGCAGTGCATTTTGATTGCTTTGAACAGATTTCTTCAGGAGAAACATGGTTCAAAAATGGCCTTTTTAGATGGTAACCCTCCTGAGAGACTTTGCATGCCGATTGTGGAACATATTGAGTCAAAAGGTGGCCAAGTCAGACTAAACTCACGAATAAAAAAGATCGAGCTGAATGAGGATGGAAGTGTCAAATGTTTTATACTGAATAATGGCAGTACAATTAAAGGAGATGCTTTTGTGTTTGCCACTCCAGTGGATATCTTGAAGCTTCTTTTGCCTGAAGACTGGAAAGAGATCCCATATTTCCAAAAGTTGGAGAAGCTAGTGGGAGTTCCTGTGATAAATGTCCATATATGGTTTGACAGAAAACTGAAGAACACATCTGATAATCTGCTCTTCAGCAGAAGCCCGTTGCTCAGTGTGTACGCTGACATGTCTGTTACATGTAAGGAATATTACAACCCCAATCAGTCTATGTTGGAATTGGTATTTGCACCCGCAGAAGAGTGGATAAATCGTAGTGACTCAGAAATTATTGATGCTACAATGAAGGAACTAGCGAAGCTTTTCCCTGATGAAATTTCGGCAGATCAGAGCAAAGCAAAAATATTGAAGTATCATGTTGTCAAAACCCCAAGGTCTGTTTATAAAACTGTGCCAGGTTGTGAACCCTGTCGGCCCTTGCAAAGATCCCCTATAGAGGGTTTTTATTTAGCTGGTGACTACACGAAACAGAAGTACTTGGCTTCAATGGAAGGTGCTGTCTTATCAGGAAAGCTTTGTGCACAAGCTATTGTACAGGATTACGAGTTACTTCTTGGCCGGAGCCAGAAGATGTTGGCAGAAGCAAGCGTAGTTAGCATAGTGAACTAA(配列番号38)である。配列CTGTGATCATCATATGTATCA(配列番号279)、CCTTAACTCTCCAGCTAGCAA(配列番号280)、CAGCCCGCAAATGTTTCATTC(配列番号281)、GCCGTCAATGGCCGCATTGCT(配列番号282)、TCCTTCCCTCAGAAAGGGCAG(配列番号283)およびTTGCCTCATGCTGCTAATCTG(配列番号284)を有するアンチセンスポリヌクレオチドは、内在性のベンサミアナタバコ5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)遺伝子のために、、ニコチアナ・ベンサミアナベンサミアナタバコEPSPScDNA配列に基づき設計された。すなわち、CTTATATGTGCTTAAGCCTAACGTGCACCCGGCCCCTTAACCCCAGCAGTTTTCAATCTACCTACCGTCTCTACCATTTTCTTCTAGTTGGTGAAAATTTCTAACTTTGAGAAAACAAGCCAAAGTTTTTGTTTCTAAGAACGCAAAATGAGTGAAATTTTTTGCAGCAATGGCACAGATTAGCAGCATGAGGCAAGGGATACAGACCCCTAATCTTAATTCCTATTTTCCTAAAACCCAAAAGGTTCCTCTTTTTTCGCATTCTATCTTCTTTGGATCAAAGAAAATAACCCAAAATTCAGCAAAATCTTTGTGGGTGTGTAAGAAAGATTCAGTTTTGAGGGTGGCAAAGTCACCTTTTAGGATTTGTGCATCAGTGGCCACTGCACAGAAGCCCAACGAGATTGTGCTGCAACCCATCAAAGATATATCAGGCACTGTTAAATTGCCTGGTTCTAAATCCCTTTCCAACCGTATTCTCCTTCTTGCTGCCCTTTCTGAGGGAAGGACTGTTGTTGACAATTTACTGAGTAGTGATGACATTCATTACATGCTTGGTGCGTTGAAAACACTTGGACTTCATGTAGAAGATGACAATGAAAACCAACGAGCAATTGTGGAAGGTTGTGGTGGGCAGTTTCCTGTCGGCGAGAAGTCTGAGGAAGAAATCCAACTATTCCTTGGAAATGCAGGAACAGCAATGCGGCCATTGACGGCAGCAGTTACTGTAGCTGGAGGACATTCAAGATATGTACTTGATGGAGTTCCTAGGATGAGAGAGAGACCGAT(配列番号285)、CACTGACGTTGGATTAGAGGTAGGCTCCTTATATGTGCTTAAGCCTAACGTGCAGCCGGCCCCCAACCCCAGCAGTTTTCAATCTACCTACCGTCTCTACCATTTTCTTATAGTAGTTGAAAATTTCTAACTTTGAGAAAACAAGCCAAAGTTTTGTTTCTAAGAACACAAAGGGAGTGAAATTTTTTGCAGCAATGGCACAGATTAGCAGCATGAGGCAAGGGATACAGACCCCTAATCTTAATTCCTATTTTCCTAAAACCCAAAAGGTTCCTCTTTTTTCGCATTCTATCTTCATTGGATCAAAGAAAATAACCCAAAATTCAGCAAAATCTTTGTGGGTGTGTAAGAAAGATTCAGTTTTGAGGGTGGCAAAGTCACCTTTTAGGATTTGTGCATCAGTGGCCACTGCACAGAAGCCTAACGAGATTGTGCTGCAACCTATCAAAGATATATCAGGCACTGTTAAATTACCTGGTTCTAAATCCCTTTCCAATCGTATTCTCCTTCTTGCTGCCCTTTCTGAGGGAAGGACTGTTGTTGACAATTTACTGAGTAGTGATGACATTCATTACATGCTTGGTGCATTGAAAACACTTGGACTTCATGTAGAAGATGACAATGAAAACCAACGAGCAATCGTAGAAGGTTGTGGTGGGCAGTTTCCTGTCGGCAAGAAGTCTGAGGAAGAAATCCAACTATTCCTTGGAAATGCAGGAACAGCAATGCGGCCATTGACGGCAGCAGTTACTGTAGCTGGTGGACATTCTAGATATGTACTTGATGGAGTTCCTAGGAT(配列番号286)、および
AAATTCTTGGTTCGAGGAGGTCAGAAGTACAAGTCTCCTGGAAAAGCATATGTTGAAGGAGATGCCTCAAGTGCTAGCTACTTTTTGGCGGGTGCAGCTGTCACAGGTGGAACTGTCACTGTTGAAGGTTGTGGAACAAGCAGTTTACAGGGGGATGTTAAGTTTGCTGAGGTCCTCGAAAAGATGGGGGCAGAAGTTACATGGACAGAGAACAGTGTCACGGTTAAAGGACCTCCAAGGAACTCTTCTGGAATGAAACATTTGCGGGCTGTTGACGTTAACATGAACAAAATGCCAGATGTTGCCATGACTCTTGCTGTAGTTGCACTTTTTGCTGATAGTCCTACTGCCATAAGAGATGTTGCTAGCTGGAGAGTTAAGGAAACTGAGCGGATGATTGCCATATGCACAGAACTTAGGAAGTTGGGTGCAACAGTTGTAGAAGGGCCAGACTACTGCATAATCACTCCACCTGAAAAGTTAAAAGTAGCGGAAATTGATACATATGATGATCACAGAATGGCCATGGCTTTCTCTCTTGCGGCTTGTGCTGATGTTCCAGTCACCATTAAGGACCCCGGTTGTACTCGCAAAACCTTCCCCAACTACTTTGACGTTCTCCAGCAGTATTCCAAGCATTAAACCACTTTCCATTAAGAATTTTGAAAAAGAGAGACTTTGACAACAATGGTGTCATACCGGAAGAGAAAAGCTTTGATCCAAGCTTTCAACTCCTTTTCATTTGTCATGTGATGATCATTGTATTTGTTGAAGTTGAGCTGCTTTTCTTTTGTCCAGAAGACATGTATGGATACTATTACTATATAGTTAAGGTGAACTCAGCA(配列番号287)に基づいて設計した。配列CCACATGGTCCAGTATCTGCC(AK195、RBCS_1-2-3-4、配列番号288)、CAAGCAAGGAACCCATCCATT(AK196、RBCS_1-2-3-4、配列番号289)、GGCCACACCTGCATGCATTGC(AK197、RBCS_1-2-3-4、配列番号290)、GTGTTCACGGTAGACAAATCC(AK198、RBCS_1-2、配列番号291)、TGCACTGCACTTGACGCACGT(AK199、RBCS_1-2、配列番号292)、AACTGATGCATTGCACTTGAC(AK200、RBCS_3-4、配列番号293)、CAAATCAGGAAGGTATGAGAG(AK201、RBCS_3-4、配列番号294)、およびTGTCAAGGTTTTGTTTCCTGG(AK202、RBCS_3-4、配列番号295)を有するアンチセンスポリヌクレオチドは、内在性のベンサミアナタバコリブロース-1,5-二リン酸カルボキシラーゼ オキシゲナーゼ(RuBisCO)遺伝子のために、ベンサミアナタバコ葉緑体のRuBisCO small chain 2A cDNA配列断片に基づき設計された。すなわち、
GCAATGGCTTCCTCAGTTCTTTCCTCAGCAGCAGTTGCCACCCGCAGCAATGTTGCTCAAGCTAACATGGTTGCACCTTTCACAGGTCTTAAGTCTGCTGCCTCATTCCCTGTTTCAAGAAAGCAAAACCTTGACATCACTTCCATTGCCAGCAACGGCGGAAGAGTGCAATGCATGCAGGTGTGGCCACCAATTAACATGAAGAAGTATGAGACTCTCTCATACCTTCCCGATTTGAGCCAGGAGCAATTGCTCTCCGAAATTGAGTACCTTTTGAAGAATGGATGGGTTCCTTGCTTGGAATTCGAGACTGAGAAAGGATTTGTCTACCGTGAACACCACAAGTCACCAGGATACTATGATGGCAGATACTGGACCATGTGGAAGCTACCTATGTTCGGATGCACTGATGCCACCCAAGTGTTGGCTGAGGTGGGAGAGGCGAAGAAGGAATACCCACAGGCCTGGGTCCGTATCATTGGATTTGACAACGTGCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATTGCCTCCAAGCCTGACGGCTAC(配列番号296)、
ACAATGGCTTCCTCAGTTCTTTCCTCAGCAGCAGTTGCCACCCGCAGCAATGTTGCTCAAGCTAACATGGTTGCACCTTTCACTGGTCTTAAGTCAGCTGCCTTTTTCCCTGTTTCAAGGAAGCAAAACCTTGACATCACTTCCATTGCCAGCAACGGCGGAAGAGTGCAATGCATGCAGGTGTGGCCACCAATTAACAAGAAGAAGTACGAGACTCTCTCATACCTTCCTGATCTGAGCGTGGAGCAATTGCTTAGCGAAATTGAGTACCTCTTGAAAAATGGATGGGTTCCTTGCTTGGAATTCGAGACTGAGCGCGGATTTGTCTACCGTGAACACCACAAGTCACCGGGATACTATGACGGCAGATACTGGACCATGTGGAAGTTGCCTATGTTCGGATGCACTGATGCCACCCAAGTGTTGGCCGAGGTGGAAGAGGCGAAGAAGGCATACCCACAGGCCTGGATCCGTATTATTGGATTCGACAACGTGCGTCAAGTGCAGTGCATCAGTTTCATTGCCTACAAGCCAGAAGGCTAC(配列番号297)、
CAAGCCAACATGGTTGCACCCTTCACTGGCCTCAAGTCCGCCTCCTCCTTCCCTGTTACCAGGAAACAAAACCTTGACATTACCTCCATTGCTAGCAATGGTGGAAGAGTTCAATGCATGCAGGTGTGGCCACCAATTAACATGAAGAAGTACGAGACACTCTCATACCTTCCTGATTTGAGCCAGGAGCAATTGCTTAGTGAAGTTGAGTACCTTTTGAAAAATGGATGGGTTCCTTGCTTGGAATTCGAGACTGAGCGTGGATTCGTCTACCGTGAACACCACAACTCACCAGGATACTACGATGGCAGATACTGGACCATGTGGAAGTTGCCCATGTTCGGGTGCACTGATGCCACTCAGGTGTTGGCTGAGGTCGAGGAGGCAAAGAAGGCTTACCCACAAGCCTGGGTTAGAATCATTGGATTCGACAACGTCCGTCAAGTGCAATGCATCAGTTTTATCGCCTCCAAGCCAGAAGGCTAC(配列番号298)、および
GGCTCAGTTATGTCCTCAGCTGCCGCTGTTTCCACCGGCGCCAATGCTGTTCAAGCCAGCATGGTCGCACCCTTCACTGGCCTCAAGGCCGCCTCCTCCTTCCCGGTTTCCAGGAAACAAAACCTTGACATTACTTCCATTGCTAGAAATGGTGGAAGAGTCCAATGCATGCAGGTGTGGCCGCCAATTAACAAGAAGAAGTACGAGACACTCTCATACCTTCCTGATTTGAGCGTGGAGCAATTGCTTAGCGAAATTGAGTACCTTTTGAAAAATGGATGGGTTCCTTGCTTGGAATTCGAGACTGAGCATGGATTCGTCTACCGTGAACACCACCACTCACCAGGATACTACGATGGCAGATACTGGACGATGTGGAAGTTGCCCATGTTCGGGTGCACCGATGCCACTCAGGTCTTGGCTGAGGTAGAGGAGGCCAAGAAGGCTTACCCACAAGCCTGGGTCAGAATCATTGGATTCGACAACGTCCGTCAAGTGCAATGCATCAGTTTCATCGCCTACAAGCCCGAAGGCTAT(配列番号299)に基いて設計した。
ベンサミアナタバコ植物を実施例12に記載された手順と同様の手順を用いて処理した。ポリヌクレオチド溶液(または、EPSPSおよびRuBisCOの場合には混合ポリヌクレオチド)を5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム、pH6.8中0.01%(v/v)Silwet L-77および2%(w/v)硫酸アンモニウム中に調製した。一植物あたり2枚の完全に開いた葉を、数秒間、新たにddH2Oで作製した0.1%Silwet L-77溶液に浸漬し、乾燥させた。約30分後、2枚の前処理された各葉のに20マイクロリットルのポリヌクレオチド溶液を適用した。PDSについては、5つの各植物が25ナノモルのPDSアンチセンスポリヌクレオチド(配列番号34)を受け、EPSPSについては、5つの各植物が50ナノモルの各々のEPSPSアンチセンスポリヌクレオチド(配列番号279−284)を受けた。RuBisCOについては、5つの各植物が50ナノモルの各RuBisCOアンチセンスポリヌクレオチド(配列番号288−295)を受けた。対の対照植物を緩衝液(5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム、pH6.8中0.01%(v/v)Silwet L-77および2%(w/v)硫酸アンモニウム)で処理した。処理後12日目(PDSおよびEPSPS)または10日目(RuBisCO)に植物の背丈として計測された結果を図36A−36Bに示す。PDSアンチセンスポリヌクレオチドで処理された植物は深刻な成長阻害(図36A)および退色を示した。EPSPSアンチセンスポリヌクレオチドで処理された植物は、深刻な成長阻害(図36B)および分裂組織ならびに茎組織に深刻な損傷を示した。RuBisCOアンチセンスポリヌクレオチドで処理された植物は深刻な成長阻害(図36C)および先端組織の奇形を示した。
植物の内在性のRNAiサイレンシング経路の成分のサイレンシング効果を研究するために、第2の実験が設計された。アルゴノート(AGO)タンパク質はRNAiサイレンシング過程の低分子RNAに結合するRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)の成分である。アルゴノートの抑制からRNAiサイレンシング過程起因の観察される表現型の効果を減少させることが期待し得る。配列GGAGGCAAAATACGAGCCTCA(HL510、配列番号300)、CACTAATCTTAATACCAAACT(HL511、配列番号301)、TATGGGTCATTAGCATAGGCATTAT(HL512、配列番号302)、TCTCAAGAATATCACGCTCCC(HL513、配列番号303)、CCCTTGGGGACGCTGGCAGGTCAC(HL514、配列番号304)、TAATACGACTCACTATAGGGGGAGAGAGCTAGATCTTTTG(HL515、配列番号305)、TAATACGACTCACTATAGGCACAGTATTTCTTCCTCCAACC(HL516、配列番号306)、TTGCTCATCTTAAATACATGT(HL517、配列番号307)、TCATCTTAAATACATGTTTTGTCA(HL518、配列番号308)、TTATCTTCAGGGATACATTAGC(HL519、配列番号309)、AATACTGCTTGCTCATCTTAAATA(HL520、配列番号310)、GACAATTCCAAGTTCAGTTTC(HL521、配列番号311)、CCGTTTTAGATCACCATAAAGAGA(HL522、配列番号312)、TTGTCTGGTAATATCACAATC(HL523、配列番号313)を有するAGO1アンチセンスポリヌクレオチドは、内在性のベンサミアナタバコ(アルゴノート-1(AGO1)遺伝子のために、2つのベンサミアナタバコAGO1-2部分cDNA配列に基づき設計された。すなわち、
ATGGTGAGGAAGAGGAGAACTGAGTTACCTGGTTCTGGTGAGAGCTCTGGGTCTCAAGAAACTGGCGGACAGGGTCGTGGCCAGCATCCACAGCAGCTGCACCAAGCTACCTCCCAGACTCCATATCAAACTGCAATGACTACTCAGCCAATACCTTATGCAAGACCAACTGAAACATCCTCCGAAGCTGGTTCCTCATCTCAGCCACCTGAGCAGGCAGCTCTACAAGTGACACAACAGTTCCAGCAACTTGCTTTGCAACAAGAAGCGGCTACAACGCAAGCAGTTCCACCTGCATCAAGCAAATTACTAAGGTTTCCCCTGCGTCCAGGGAAGGGGAGCAATGGTATGAGATGCATAGTCAAAGCCAATCACTTCTTCGCAGAGCTGCCTGACAAAGACTTGCACCAGTATGATGTCACAATTTCTCCAGAGGTGTCATCACGTGGCGTCAACCGTGCTGTCATGGCGCAACTGGTGAAGCTGTACCAAGAATCTCATCTTGGGAAGAGACTTCCAGCATATGATGGAAGGAAAAGTCTATACACTGCAGGGCCCCTTCCATTTGTTCAAAAAGACTTCAAAATAACTCTTATTGATGATGAGGATGGGCCTGGTGGTGCTAGAAGGGAAAGGGAATTTAAAGTTGTGATCAAATTGGCTGCCCGTGCTGATCTTCATCACTTGGGAATGTTTTTAGAAGGGAAACAGGCTGATGCACCTCAAGAGGCGCTTCAAGTTCTGGATATTGTTCTGCGTGAGTTGCCAACATCTAGGTTTTGTCCTGTGGGTCGTTCTTTCTATTCCCGTGATTTAGGGCGAAAGCAACCATTGGGTGAAGGTTTAGAAAGTTGGCGTGGGTTCTATCAAAGCATTCGCCCCACACAAATGGGCTTATCACTGAACATCGATATGTCTTCCACTGCATTCATTGAGCCACTGCCAGTCATTGATTTTGTGACACAGCTTCTGAACCGAGATGTGCCATCTAGACCACTGTCTGATGCTGGCCGTGTAAAGATAAAAAAAGCTCTGAGAGGTGTGAAGGTGGAGGTTACTCATCGTGGAAATATGCGGAGGAAGTACCGCATTTCGGGTTTAACATCTCAAGCAACAAGAGAGTTGACCTTCCCTGTTGATGAAAATGGTACAGTGAAATCTGTAATTGAGTATTTTCGAGAAACATATGGGTTTGTAATTCAGCATACTCAGTGGCCTTGTCTACAAGTTGGAAATCAGCAGAGACCTAATTACTTGCCAATGGAAGTCTGCAAGATTGTGGAGGGACAAAGGTACTCAAAGCGCTTGAATGAGAGACAGATTACTGCACTTCTGAAAGTGACCTGCCAGCGTCCCCAAGGGAGGGAGCGTGATATTCTTGAGACCGTACATCATAATGCCTATGCTAATGACCCATATGCCAAGGAGTTTGGTATTAAGATTAGTGACAAGTTGGCACAAGTTGAGGCTCGTATTTTGCCTCCACCTCGGCTTAAATATCATGATAACGGTCGAGAAAAGGACTGCCTGCCACAAGTTGGCCAATGGAATATGATGAATAAGAAAATGGTAAATGGAGGGACGGTGAACAATTGGATCTGCATAAACTTCTCTCGCAATGTGCAAGATAGTGTTGCTCATGGGTTTTGCTCTGAGCTTGCACAAATGTGCCAGATATCTGGCATGAATTTCAATCCAAATCCTGTTCTGCCACCTTCGAGTGCACGCCCTGATCAGGTCGAAAGAGTATTGAAAACTCGATTTCATGATGCTATGACTAAGTTGCAGCTGCATGGGAGAGAGCTTGATTTGCTAGTTGTCATCTTGCCAGACAATAATGGATCTCTTTATGGTGATCTGAAGCGCATTTGTGAGACTGAACTAGGAGTCGTCTCACAGTGCTGTTTGACAAAACATGTATTTAAGATGAGCAAACAGTATCTAGCCAATGTAGCGCTGAAAATCAATGTGAAGGTGGGAGGGAGAAACACTGTGCTTGTTGATGCAATATCGAGGCGAATTCCTCTTGTCAGCGACCGGCCTACCATCATTTTTGGTGCAGATGTCACCCACCCTCACCCTGGGGAGGACTCTAGCCCATCCATTGCCGCGGTGGTTGCTTCTCAAGATTGGCCTGAGATTACAAAGTATGCTGGTCTAGTTTCTGCTCAAGCCCATAGGCAAGAGCTTATTCAGGATCTGTACACGACTAGGCAAGATCCTGTTAAGGGGACAGTTGCTGGTGGAATGATTAAGGACTTACTTATATCCTTCCGAAGAGCTACTGGACAAAAGCCCCAGAGAATAATTTTCTATAGGGATGGTGTTAGTGAAGGACAATTTTATCAAGTGCTTCTGTTCGAACTTGATGCGATCCGCAAAGCATGTGCGTCTTTGGAGCCAAATTATCAGCCCCCAGTCACATTTGTTGTGGTTCAGAAACGACATCACACAAGGCTTTTTGCCAATAACCACCGTGACAGAAATGCAGTTGACAGGAGCGGGAACATTATACCTGGTACTGTTGTAGATTCAAAGATATGCCACCCGACAGAGTTTGATTTCTATCTTTGTAGCCATGCCGGCATACAGGGTACGAGCCGTCCAGCTCACTACCATGTTCTATGGGACGAGAACAAATTCACAGCCGATGCGCTGCAGTCTTTGACCAACAACCTCTGCTATACATATGCAAGGTGCACGCGTTCCGTCTCCATCGTTCCCCCTGCATATTATGCACATTTGGCAGCTTTCCGTGCTCGATTTTATATGGAGCCGGAGACATCTGACGGTGGTTCAGTAACAAGTGGGGCTGCTGGTGGCAGAGGGGGTGGTGCAGGAGCTGCTGGAAGGAACACCCGAGCCCCAAGTGCTGGTGCTGCTGTTAGACCTCTTCCTGCGCTCAAGGATAATGTGAAGAGGGTTATGTTCTACTGC(配列番号314)および
CACCTATCACTCTCTTTCTCTCTCTACAAACATATCGTGCCGTTTCTCTCTCGGCCTCTCTTCGTGTTTTAGGGCACCGTGGTGGTTGGTATCCAGGCGGCGGTTTTGAGTTATTACCATGGTGCGGAAGAAGAGGACTGATGTTCCTGGTGGTGCTGAGAGTTTTGAGTCCCATGAAACTGGAGGGGCACGAGGTGGTGCCCAACGCCCATCACAGCAGCAGCAACATCAGCATCAGCAAGGCGGAGGAAGAGGCTGGGCACCTCAGCATGGAGGACATGGTGGCCGTGGTGGTGGGGGAGCTCCACGTGGTGGAATGGCCCCTCAACAATCCTATGGTGGACCTCCTGAATACTACCAACAGGGCAGGGGAACTCAACAGTATCAACGAGGTGGAGGACAACCCCAGCGCCGTGGTGGCATGGGGGGCCGTGGGGCACGGCCACCAGTACCCGAGCTGCACCAAGCAACCCAGACTCCACATCAGCCTGTACCATATGGAAGACCATCAGAAACATACTCAGAGGCTGGTTCCTCGTCTCAGCCACCTGAACCAACGACACAGCAAGTGACTCAGCAATTCCAGCAACTTGTTGTGCAGCCAGAAGCAGCTGCAACCCAAGCAATACAACCAGCATCGAGCAAGTCGATGAGGTTTCCACTCCGGCCAGGAAAGGGTAGTACTGGTATTAGATGCATAGTTAAGGCCAATCACTTCTTTGCCGAGTTACCTGACAAAGATCTGCACCAGTATGATGTTTCAATTACTCCTGAGGTCGCCTCTCGGGGTGTCAACCGGGCCGTCATGGAGCAGCTGGTGAAGCTTTATAGAGAATCCCATCTTGGGAAGAGGCTTCCAGCCTATGACGGAAGAAAAAGTCTATACACAGCAGGGCCCCTCCCTTTTGTTCAAAAGGATTTTAAAATCACTCTAATTGATGATGATGATGGACCTGGTGGTGCTAGGAGGGAAAGAGAGTTTAAAGTTGTGATCAAGCTGGCGGCTCGTGCTGATCTTCATCACTTGGGGATGTTCTTACAAGGGAGACAGGCTGATGCACCGCAAGAAGCACTTCAGGTGCTGGATATTGTGCTACGTGAGTTGCCAACATCTAGGTATTGTCCTGTGGGCCGCTCTTTCTATTCCCCTCATTTAGGACGAAGACAACCACTGGGTGAAGGTTTAGAGAGCTGGCGTGGCTTCTATCAAAGTATTCGTCCTACACAGATGGGATTATCCCTGAATATTGATATGTCTTCCACGGCTTTCATTGAGCCACTGCCGATTATTGACTTCGTGAGCCAGCTTCTGAATCGGGATATCTCTTCTAGACCACTGTCTGATGCTGACCGCGTTAAGATAAAGAAGGCACTGAGAGGTGTAAAGGTGGGGGTCACTCATCGTGGAAATATGCGGAGGAAGTATCGCATTTCTGGCTTGACGTCTCAAGCAACAAGAGAGTTGACTTTTCCTGTCGATGAAAGGGGTACGATGAAAGCTGTTGTGGAATATTTTCGGGAAACCTATGGTTTTGTCATTCGGCATACCCAGTGGCCTTGTCTTCAAGTTGGAAATACGCAGAGGCCAAATTACTTGCCAATGGAAGTATGTAAGATTGTAGAGGGACAGAGATACTCAAAGCGCTTGAATGAGAGGCAGATAACAGCACTTCTAAAAGTGACCTGCCAACGTCCTCAAGAGAGAGAACGTGATATTCTTCAGACTGTTCATCACAATGCTTATGCTGATGACCCATATGCGAAGGAGTTTGGTATTAAGATCAGTGAGGAGCTTGCTCAAGTTGAGGCTCGCGTTTTGCCTGCACCTTGGCTTAAATACCATGATACAGGTCGAGAGAAAGACTGTCTGCCACAAGTGGGCCAGTGGAATATGATGAATAAGAAAATGGTTAATGGAGGAACAGTGAACAACTGGATCTGTGTAAACTTTTCTCGCAATGTGCAAGACACAGTTGCACGTGGATTTTGTTCCGAGCTTGCACAAATGTGCATGATATCCGGAATGAACTTCAATCCCAATCCTGTTCTACCACCAGTGAGTGCTCGCCCTGATCAAGTTGAGAGAGTCTTGAAAACTCGATTTCACGATGCTATGACAAAGTTGCAGCCAAATGGGAGAGAGCTAGATCTTTTGATTGTGATATTACCAGACAATAACGGCTCTCTTTATGGTGATCTAAAACGGATTTGTGAAACTGAACTTGGAATTGTCTCACAATGCTGCTTGACAAAACATGTATTTAAGATGAGCAAGCAGTATTTAGCTAATGTATCCCTGAAGATAAATGTGAAGGTTGGAGGAAGAAATACTGTGCTGGTTGATGCGCTCTCTAGACGAATTCCCCTTGTCAGCGACCGCCCAACTATCATTTTTGGTGCAGATGTCACCCATCCCCACCCTGGGGAGGATTCTAGCCCGTCAATTGCTGCGGTGGTTGCTTCTCAAGATTGGCCTGAAATTACAAAGTATGCTGGTTTGGTTTCTGCTCAAGCGCATAGGCAAGAGCTTATACAAGATCTGTACAAGACTTGGCAAGATCCAGTTAGAGGACCTGTGACTGGTGGCATGATAAAGGAATTACTTATTTCCTTCCGTCGAGCAACTGGACAGAAGCCGCAGAGAATTATATTCTACAGAGATGGTGTTAGTGAAGGACAATTTTACCAAGTTCTTCTTTTTGAACTTGATGCAATCCGCAAGGCATGTGCATCTTTAGAACCCAACTATCAGCCCCCGGTTACGTTTGTTGTGGTCCAGAAACGGCATCATACTAGGTTGTTTGCCAATAACCACCACGACAGAAATGCAGTTGATCGGAGTGGGAACATTTTGCCTGGTACCGTTGTAGATTCAAAGATATGCCACCCTACTGAATTTGATTTCTATCTCTGTAGCCATGCCGGCATACAGGGTACTAGCCGCCCAGCTCATTATCATGTTCTGTGGGATGAGAACAATTTTACTGCTGACGCCCTGCAGTCTTTGACTAACAATCTTTGCTATACATATGCTAGGTGTACTCGTTCTGTCTCCATTGTTCCACCAGCATATTATGCACATTTGGCAGCTTTCCGTGCTCGGTTTTACATGGAGCCAGAGACATCTGATAATGGATCAGTCACAAGCGCAGCTGCTTCAAACAGAGGAGGTTTAGGAGCTATGGGAAGGAGCACGCGAGCACCAGGTGCTGGTGCTGCTGTAAGGCCCCTTCCTGCTCTCAAGGAGAATGTTAAGAGGGTTATGTTTTATTGT(配列番号315)に基づき設計した。
ベンサミアナタバコ植物を実施例12に記載の手順と同様の手順を用いて処理した。ポリヌクレオチド溶液(AGO1の場合には混合ポリヌクレオチド)を5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム、pH6.8中0.01%(v/v)Silwet L-77および2%(w/v)硫酸アンモニウムに調整した。一植物あたり2枚の完全に開いた葉を、数秒間、新たにddH2Oで作製した0.1%Silwet L-77溶液に浸漬し、乾燥させた。約30分後、2枚の前処理された各葉に20マイクロリットルのポリヌクレオチド溶液を適用した。PDSについては、5つの各植物が25ナノモルのPDSアンチセンスポリヌクレオチド(配列番号34)を受け;AGO1については、5つの各植物が50ナノモルの14個各々のAGO1アンチセンスポリヌクレオチド(配列番号300−313)を受けた。PDSおよびAGOの併用処理については、5つの各植物が25ナノモルのPDSアンチセンスポリヌクレオチド(配列番号34)および50ナノモルの14個の各AGO1アンチセンスポリヌクレオチド(配列番号300−313)を別々の葉に適用された。対の対照植物を緩衝液(5ミリモル濃度のリン酸ナトリウム、pH6.8中0.01%(v/v)SilwetL-77および2%(w/v)硫酸アンモニウム)で処理した。AGO1アンチセンスポリヌクレオチドで処理された植物と緩衝液のみで処理された植物に違いは観察されなかった。PDSアンチセンスポリヌクレオチドで処理された植物は浸透移行性退色を示した。PDSアンチセンスポリヌクレオチドおよび別に適用されたAGO1アンチセンスポリヌクレオチドの両方で処理された植物は浸透移行性退色を示さず、このことはAGO1の抑制がサイレンシングシグナルの浸透移行性広がりを阻害したことを示唆する。
実施例34
本実施例は、成長期植物の葉に、標的内在遺伝子または標的内在遺伝子から転写されたメッセンジャーRNAの18以上の連続する配列に本質的に同一または本質的に相補的である配列を有するポリヌクレオチドを局所的にコーティングすることを含み、それにより、ポリヌクレオチドが該成長期植物の中へ浸透し、該標的内在遺伝子の浸透移行性サイレンシングを誘導することを含む、成長期植物の標的内在遺伝子の浸透移行性調節を誘導する方法を説明する。さらに詳細には、本実施例は、少なくとも一時的に内在性のジーアメイズ(Zea mays)5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)遺伝子の浸透移行性の調節を誘導するために、界面活性剤およびポリヌクレオチドを含む組成物の使用を説明する。
内在性のジーアメイズ5-エノイルピルビニルシキミ酸-3-リン酸合成酵素(EPSPS)遺伝子のゲノム配列は、以下のように同定された。すなわち、
ACCTACTTCCCCCTCGCCCCTCTCATGGTCTCTCTCGCGCCCAGATCTGCTACTAGACGGCACCGCTGCAGCGCGTCGTGTCGCGGGGGTTGGTGGCAGGCAGCGAGAGCTTGCCGTTCCTCTCTCTCAGTTGTCAGGTCCTAGGCTCACCTCACCGGCTCCCAGCCCGCTTCTATTTCTTCCTCCCCGACCCCGTGCAGGTGGCAGTCCAGTCCACGCCACCAACCGCGAGGCGAACCAAACCAACCCACTCTCCCCAACCCCGCGCGCCCAGGCCGCCCGCCCTACCAACCATCGGCGTCGGCAATGGCGGCCATGGCGACCAAGGCCGCCGCGGGCACCGTGTCGCTGGACCTCGCCGCGCCGCCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGTGCAGGCGGGTGCCGAGGAGATCGTGCTGCAGCCCATCAAGGAGATCTCCGGCACCGTCAAGCTGCCGGGGTCCAAGTCGCTTTCCAACCGGATCCTCCTGCTCGCCGCCCTGTCCGAGGTGAGCGATTTTGGTGCTTGCTGCGCTGCCCTGTCTCACTGCTACCTAAATGTTTTGCCTGTCGAATACCATGGATTCTCGGTGTAATCCATCTCACGATCAGATGCACCGCATGTCGCATGCCTAGCTCTCTCTAATTTGTCTAGTAGTTTGTATACGGATTAATATTGATAAATCGGTACCGCAAAAGCTAGGTGTAAATAAACACTAGAAAATTGGATGTTCCCCTATCGGCCTGTACTCGGCTACTCGTTCTTGTGATGGCATGCTGTCTCTTCTTGGTGTTTGGTGAACAACCTTATGAAATTTGGGCGCAAAGAACTCGCCCTCAAGGGTTGATCTTATGCCATCGTCATGATAAACAGTGGAGCACGGACGATCCTTTACGTTGTTTTTAACAAACTTTGTCAGAAAACTAGCATCATTAACTTCTTAATGACGATTTCACAACAAAAAAAGGTAACCTCGCTACTAACATAACAAAATACTTGTTGCTTATTAATTATATGTTTTTTAATCTTTGATCAGGGGACAACAGTGGTTGATAACCTGTTGAACAGTGAGGATGTCCACTACATGCTCGGGGCCTTGAGGACTCTTGGTCTCTCTGTCGAAGCGGACAAAGCTGCCAAAAGAGCTGTAGTTGTTGGCTGTGGTGGAAAGTTCCCAGTTGAGGATTCTAAAGAGGAAGTGCAGCTCTTCTTGGGGAATGCTGGAACTGCAATGCGGCCATTGACAGCAGCTGTTACTGCTGCTGGTGGAAATGCAACGTATGTTTCCTCTCTTTCTCTCTACAATACTTGCTGGAGTTAGTATGAAACCCATGGGTATGTCTAGTGGCTTATGGTGTATTGGTTTTTGAACTTCAGTTACGTGCTTGATGGAGTACCAAGAATGAGGGAGAGACCCATTGGCGACTTGGTTGTCGGATTGAAGCAGCTTGGTGCAGATGTTGATTGTTTCCTTGGCACTGACTGCCCACCTGTTCGTGTCAATGGAATCGGAGGGCTACCTGGTGGCAAGGTTAGCTACTAAGGGCCACATGTTACATTCTTCTGTAAATGGTACAACTATTGTCGAGCTTTTGCATTTGTAAGGAAAGCATTGATTGATCTGAATTTGATGCTACACCACAAAATATCCTACAAATGGTCATCCCTAACTAGCAAACAATGAAGTAATACTTGGCATGTGTTTATCAAATTAATTTCCATCTTCTGGGGCATTGCCTGTTTTCTAGTCTAATAGCATTTGTTTTTAGCATTAATTAGCTCTTACAATTGTTATGTTCTACAGGTCAAGCTGTCTGGCTCCATCAGCAGTCAGTACTTGAGTGCCTTGCTGATGGCTGCTCCTTTGGCTCTTGGGGATGTGGAGATTGAAATCATTGATAAATTAATCTCCATTCCCTACGTCGAAATGACATTGAGATTGATGGAGCGTTTTGGTGTGAAAGCAGAGCATTCTGATAGCTGGGACAGATTCTACATTAAGGGAGGTCAAAAATACAAGTAAGCTCTGTAATGTATTTCACTACTTTGATGCCAATGTTTCAGTTTTCAGTTTTCCAAACAGTCGCATCAATATTTGAATAGATGCACTGTAGAAAAAAAATCATTGCAGGGAAAAACTAGTACTGAGTATTTTGACTGTAAATTATTTTACCAGTCGGAATATAGTCAGTCTATTGGAGTCAAGAGCGTGAACCGAAATAGCCAGTTAATTATCCCATTATACAGAGGACAACCATGTATACTATTGAAACTTGGTTTATAAGAGAATCTAGGTAGCTGGACTCGTAGCTGCTTGGCATGGATACCTTCTTATCTTTAGGAAAAGACACTTGATTTTTTTTTTCTGTGGCCCTCTATGATGTGTGAACCTGCTTCTCTATTGCTTTAGAAGGATATATCTATGTCGTTATGCAACATGCTTCCCTTAGCCATTTGTACTGAAATCAGTTTCATAAGTTCGTTAGTGGTTCCCTAAACGAAACCTTGTTTTTCTTTGCAATCAACAGGTCCCCTAAAAATGCCTATGTTGAAGGTGATGCCTCAAGCGCAAGCTATTTCTTGGCTGGTGCTGCAATTACTGGAGGGACTGTGACTGTGGAAGGTTGTGGCACCACCAGTTTGCAGGTAAAGATTTCTTGGCTGGTGCTACAATAACTGCTTTTGTCTTTTTGGTTTCAGCATTGTTCTCAGAGTCACTAAATAACATTATCATCTGCAAATGTCAAATAGACATACTTAGGTGAATTCATGTAACCGTTTCCTTACAAATTTGCTGAAACCTCAGGGTGATGTGAAGTTTGCTGAGGTACTGGAGATGATGGGAGCGAAGGTTACATGGACCGAGACTAGCGTAACTGTTACTGGCCCACCGCGGGAGCCATTTGGGAGGAAACACCTCAAGGCGATTGATGTCAACATGAACAAGATGCCTGATGTCGCCATGACTCTTGCTGTGGTTGCCCTCTTTGCCGATGGCCCGACAGCCATCAGAGACGGTAAAACATTCTCAGCCCTACAACCATGCCTCTTCTACATCACTACTTGACAAGACTAAAAACTATTGGCTCGTTGGCAGTGGCTTCCTGGAGAGTAAAGGAGACCGAGAGGATGGTTGCGATCCGGACGGAGCTAACCAAGGTAAGGCTACATACTTCACATGTCTCACGTCGTCTTTCCATAGCTCGCTGCCTCTTAGCGGCTTGCCTGCGGTCGCTCCATCCTCGGTTGCTGTCTGTGTTTTCCACAGCTGGGAGCATCTGTTGAGGAAGGGCCGGACTACTGCATCATCACGCCGCCGGAGAAGCTGAACGTGACGGCGATCGACACGTACGACGACCACAGGATGGCCATGGCCTTCTCCCTTGCCGCCTGTGCCGAGGTCCCCGTGACCATCCGGGACCCTGGGTGCACCCGGAAGACCTTCCCCGACTACTTCGATGTGCTGAGCACTTTCGTCAAGAATTAATAAAGCGTGCGATACTACCACGCAGCTTGATTGAAGTGATAGGCTTGTGCTGAGGAAATACATTTCTTTTGTTCTGTTTTTTCTCTTTCACGGGATTAAGTTTTGAGTCTGTAACGTTAGTTGTTTGTAGCAAGTTTCTATTTCGGATCTTAAGTTTGTGCACTGTAAGCCAAATTTCATTTCAAGAGTGGTTCGTTGGAATAATAAGAATAATAAATTACGTTTCAGTGGCTGTCAAGCCTGCTGCTACGTTTTAGGAGATGGCATTAGACATTCATCATCAACAACAATAAAACCTTTTAGCCTCAAACAATAATAGTGAAGTTATTTTTTAGTCCTAAACAAGTTGCATTAGGATATAGTTAAAACACAAAAGAAGCTAAAGTTAGGGTTTAGACATGTGGATATTGTTTTCCAT(配列番号316)として同定され、5’非翻訳領域はヌクレオチド位置1−306に位置し、3’非翻訳領域はヌクレオチド位置3490−3907に位置する。EPSPScDNA配列は以下のように同定された。すなわち、
ACCTACTTCCCCCTCGCCCCTCTCATGGTCTCTCTCGCGCCCAGATCTGCTACTAGACGGCACCGCTGCAGCGCGTCGTGTCGCGGGGGTTGGTGGCAGGCAGCGAGAGCTTGCCGTTCCTCTCTCTCAGTTGTCAGGTCCTAGGCTCACCTCACCGGCTCCCAGCCCGCTTCTATTTCTTCCTCCCCGACCCCGTGCAGGTGGCAGTCCAGTCCACGCCACCAACCGCGAGGCGAACCAAACCAACCCACTCTCCCCAACCCCGCGCGCCCAGGCCGCCCGCCCTACCAACCATCGGCGTCGGCAATGGCGGCCATGGCGACCAAGGCCGCCGCGGGCACCGTGTCGCTGGACCTCGCCGCGCCGCCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGTGCAGGCGGGTGCCGAGGAGATCGTGCTGCAGCCCATCAAGGAGATCTCCGGCACCGTCAAGCTGCCGGGGTCCAAGTCGCTTTCCAACCGGATCCTCCTGCTCGCCGCCCTGTCCGAGGGGACAACAGTGGTTGATAACCTGTTGAACAGTGAGGATGTCCACTACATGCTCGGGGCCTTGAGGACTCTTGGTCTCTCTGTCGAAGCGGACAAAGCTGCCAAAAGAGCTGTAGTTGTTGGCTGTGGTGGAAAGTTCCCAGTTGAGGATTCTAAAGAGGAAGTGCAGCTCTTCTTGGGGAATGCTGGAACTGCAATGCGGCCATTGACAGCAGCTGTTACTGCTGCTGGTGGAAATGCAACTTACGTGCTTGATGGAGTACCAAGAATGAGGGAGAGACCCATTGGCGACTTGGTTGTCGGATTGAAGCAGCTTGGTGCAGATGTTGATTGTTTCCTTGGCACTGACTGCCCACCTGTTCGTGTCAATGGAATCGGAGGGCTACCTGGTGGCAAGGTCAAGCTGTCTGGCTCCATCAGCAGTCAGTACTTGAGTGCCTTGCTGATGGCTGCTCCTTTGGCTCTTGGGGATGTGGAGATTGAAATCATTGATAAATTAATCTCCATTCCCTACGTCGAAATGACATTGAGATTGATGGAGCGTTTTGGTGTGAAAGCAGAGCATTCTGATAGCTGGGACAGATTCTACATTAAGGGAGGTCAAAAATACAAGTCCCCTAAAAATGCCTATGTTGAAGGTGATGCCTCAAGCGCAAGCTATTTCTTGGCTGGTGCTGCAATTACTGGAGGGACTGTGACTGTGGAAGGTTGTGGCACCACCAGTTTGCAGGGTGATGTGAAGTTTGCTGAGGTACTGGAGATGATGGGAGCGAAGGTTACATGGACCGAGACTAGCGTAACTGTTACTGGCCCACCGCGGGAGCCATTTGGGAGGAAACACCTCAAGGCGATTGATGTCAACATGAACAAGATGCCTGATGTCGCCATGACTCTTGCTGTGGTTGCCCTCTTTGCCGATGGCCCGACAGCCATCAGAGACGTGGCTTCCTGGAGAGTAAAGGAGACCGAGAGGATGGTTGCGATCCGGACGGAGCTAACCAAGCTGGGAGCATCTGTTGAGGAAGGGCCGGACTACTGCATCATCACGCCGCCGGAGAAGCTGAACGTGACGGCGATCGACACGTACGACGACCACAGGATGGCCATGGCCTTCTCCCTTGCCGCCTGTGCCGAGGTCCCCGTGACCATCCGGGACCCTGGGTGCACCCGGAAGACCTTCCCCGACTACTTCGATGTGCTGAGCACTTTCGTCAAGAATTAATAAAGCGTGCGATACTACCACGCAGCTTGATTGAAGTGATAGGCTTGTGCTGAGGAAATACATTTCTTTTGTTCTGTTTTTTCTCTTTCACGGGATTAAGTTTTGAGTCTGTAACGTTAGTTGTTTGTAGCAAGTTTCTATTTCGGATCTTAAGTTTGTGCACTGTAAGCCAAATTTCATTTCAAGAGTGGTTCGTTGGAATAATAAGAATAATAAATTACGTTTCAGTGGCTGTCAAGCCTGCTGCTACGTTTTAGGAGATGGCATTAGACATTCATCATCAACAACAATAAAACCTTTTAGCCTCAAACAATAATAGTGAAGTTATTTTTTAGTCCTAAACAAGTTGCATTAGGATATAGTTAAAACACAAAAGAAGCTAAAGTTAGGGTTTAGACATGTGGATATTGTTTTCCAT(配列番号317)として同定された。240塩基対の二本鎖RNAポリヌクレオチドを、EPSPScDNA配列のヌクレオチド位置937−1176に位置する240ヌクレオチドセグメントに対応する以下のDNA配列に対応する一本鎖で設計した。すなわち、
TACTTGAGTGCCTTGCTGATGGCTGCTCCTTTGGCTCTTGGGGATGTGGAGATTGAAATCATTGATAAATTAATCTCCATTCCGTACGTCGAAATGACATTGAGATTGATGGAGCGTTTTGGTGTGAAAGCAGAGCATTCTGATAGCTGGGACAGATTCTACATTAAGGGAGGTCAAAAATACAAGTCCCCTAAAAATGCCTATGTTGAAGGTGATGCCTCAAGCGCAAGCTATTTCTTG(配列番号318)に対応する一本鎖で設計した。
ジーアメイズ(Gaspe)種子を発芽紙(germination paper)上に発芽させた。実生を4インチのポットに移し、生育箱で植物を栽培した。3つの17日令植物をポリヌクレオチドで局所処理し、3つの植物を対照として使用した。各植物のより低い位置にある2枚の葉に印をつけ、その後、0.1%Silwet L-77溶液に浸漬することにより前処理した。界面活性剤前処理後約30分で、2枚の前処理した葉の各々の上面に20マイクロリットルの処理溶液を適用した。処理溶液は、100マイクロリットルの2×緩衝液、90マイクロリットルの水、10マイクロリットルの4.6マイクログラム/マイクロリットルのEPSPS dsRNA溶液(配列番号318に対応する一本鎖を含む)の混合物から成った。2×緩衝液は200マイクロリットルの0.1%Silwet L-77、200マイクロリットルの50ミリモル濃度のリン酸ナトリウム、146マイクロリットルの34%リン酸アンモニウム、および454マイクロリットルの水の混合物であった。処理後8日目に、ポリヌクレオチド処理された3つの植物うち2つは、葉の先端に損傷を受けるかまたは枯れた状態で成長が阻害され(同様にEPSPSポリヌクレオチド処理されたベンサミアナタバコ植物に観察された表現型と類似)、一方、3つの対照植物は全て正常な成長および形態を有した(図37)。
実施例35
ポリヌクレオチド移送剤として、または既知のポリヌクレオチド移送剤の増強剤として、異なる物質(塩、キレート剤、吸湿剤およびポリアミンを含む)の効果を研究した。硫酸アンモニウムは、従来より、ポリヌクレオチドに対する植物の浸透性を増強することが示されてきた(例えば実施例13参照)。表26はグリホサート耐性パルマーアマランス植物に局所適用されたポリヌクレオチド(RNA)の1%Silwet L-77噴霧溶液に対する添加剤として、硫酸アンモニウムおよびEDTAの除草性活性(雑草制御/致死の割合として、および植物の背丈として示す)への効果を列挙する。この特定の実験において、0.004%エチレンジアミン四酢酸(EDTA)が、噴霧溶液中の2%硫酸アンモニウムと同様に作用し、ポリヌクレオチドの有効性を向上させし、グリホサートの除草性活性を増強することが見い出された。
Figure 0006581238
表27に、グリホサート耐性パルマーアマランス植物に局所的に適用されるポリヌクレオチド(RNA)の1%Silwet L-77噴霧溶液への添加物として、無機塩(塩化ナトリウム、硫酸ナトリウム、硫酸アンモニウム、塩化アンモニウム)ならびに有機塩(塩化テトラメチルアンモニウム、塩化テトラエチルアンモニウム、臭化テトラプロピルアンモニウムおよび臭化テトラブチルホスホニウム)を含む様々な塩の除草性活性に対する効果(雑草制御/致死の割合として、および植物の背丈として示す)を列挙する。この特定の実験において、塩化アンモニウムおよび臭化テトラブチルホスホニウムは、噴霧溶液中の硫酸アンモニウムと同様に作用し、ポリヌクレオチドの有効性を向上させ、グリホサートの除草性の活性を増強することが見い出された。
Figure 0006581238
表28に、グリホサート耐性パルマーアマランス植物に局所的に適用されたポリヌクレオチド(RNA)の除草性活性(雑草制御/致死の割合として、および植物の背丈として示す)に対する吸湿剤グリセリンの効果を列挙する。グリセリンが、ポリヌクレオチドの効果を向上させ、グリホサートの除草性活性を増強することが見い出された。
Figure 0006581238
図38に、グリホサート耐性パルマーアマランス植物に局所的に適用されたポリヌクレオチドの除草性活性に対する、様々なグリホサートの対イオンの効果(雑草制御/致死の割合として、および植物の背丈として示す)を示す。0.2%Roundup(登録商標)WeatherMax(登録商標)担体(牛脂アミン(16-18C)およびcocoamine(12-14C)が55:45の比率のMON56151牛脂アミン界面活性剤混合物)および1ヘクタールあたり1682g酸当量のグリホサート塩のうちの1つ;K+グリホサート、イソプロピルアンモニウム+グリホサートまたはモノエタノールアンモニウム+グリホサートを含む10ミリモル濃度のリン酸ナトリウム緩衝液、pH6.8中0.5%Silwet L-77、2%硫酸アンモニウム中のEPSPSポリヌクレオチドの混合物(IDT[1](配列番号83−84)、IDT[2](配列番号85−86)、IDT[3](配列番号87−88)およびIDT[4](配列番号89−90))を、16コピーのEPSPSを含む4−6インチのグリホサート耐性パルマーアマランスの3つの複製物に、ミリ(Milli)噴霧器で、215リットル/エーカーで適用した。植物の背丈をグリホサート処理後21日目に評価した。表29に結果(雑草制御/致死の百分率として、および植物の背丈として示す)を与える。グリホサートのイソプロピルアンモニウムおよびモノエタノールアンモニウム塩はカリウム塩と比較してより高い除草性活性をもたらした。
Figure 0006581238
グリホサート耐性パルマーアマランス植物に局所的に適用されたポリヌクレオチド(RNA)の除草性活性に対する、ポリアミンカチオンスペルミン(N,N’-ビス(3-アミノプロピル)ブタン-1,4-ジアミン)およびスペルミジン(N-(3-アミノプロピル)ブタン-1,4-ジアミン)の効果について研究した。ポリヌクレオチド溶液を、実施例1に記載の4つのオリゴヌクレオチドサイズの「短い」dsRNA分子の当量混合物を用いて調整した。該分子は、図1の下線付きヌクレオチドに示されるように、位置14−38(短いdsRNA-1)、位置153−177(短いdsRNA-2)、345−369(短いdsRNA-3)、および1105−1129(短いdsRNA-4)で、パルマーアマランスEPSPS遺伝子(配列番号1)から転写されたmRNAにハイブリダイズするように設計されたアンチセンス鎖を有し、dsRNAはアンチセンス鎖の3’末端に2つのヌクレオチド突出を有し、センス鎖の3’末端に末端ヌクレオチドとして2つのデオキシヌクレオチドを有する。dsRNAポリヌクレオチド溶液を10ミリモル濃度のリン酸ナトリウム(pH6.8)緩衝液中1もしくは10ミリモル濃度のスペルミンもしくはスペルミジンのいずれか、または2%硫酸アンモニウムで調整した。対照溶液(ポリヌクレオチドなし)を10ミリモル濃度のリン酸ナトリウム(pH6.8)緩衝液中1もしくは10ミリモル濃度のスペルミンもしくはスペルミジンのいずれか、または2%硫酸アンモニウムで調整した。グリホサート耐性パルマーアマランス植物(33、36、または57コピーのEPSPS)を1%Silwet L-77で前噴霧した。dsRNAポリヌクレオチド溶液(11.6グラム/エーカー)または緩衝液を、グリホサート耐性パルマーアマランス(の4枚のより低い位置にある完全に開いた葉にピペッティングにより液滴として適用した。ポリヌクレオチド処理後2日目に、植物にグリホサート(1ヘクタールあたり3360g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)を噴霧した。グリホサート処理後14日目に植物の写真を撮った。結果を図39に示す。dsRNAおよび10ミリモル濃度のスペルミンでの処理、それに続くグリホサート処理は、33コピーのEPSPSを含むグリホサート耐性パルマーアマランスを枯らし、36コピーのEPSPSを含むグリホサート耐性パルマーアマランスに深刻なダメージを与え、成長を阻害した。10mMスペルミジン単独での処理は、33-コピーのグリホサート耐性パルマーアマランスの成長を阻害した。.この特定の実験において、1または10ミリモル濃度のスペルミンもスペルミジンも、2%硫酸アンモニウムほど機能しなかった。
実施例36
ポリヌクレオチド移送剤として異なる界面活性剤の効果を、グリホサート耐性パルマーアマランスに適用されるポリヌクレオチド噴霧液で試験した。Break-Thru界面活性剤はEvonik Industries社から入手し、Silwet界面活性剤はMomentive社から入手した。噴霧溶液は、噴霧する当日に調整した。EPSPSポリヌクレオチド(IDT[1](配列番号83−84)、IDT[3](配列番号87−88)およびIDT[4](配列番号89−90))の混合物を、噴霧の15−50分前に噴霧溶液に添加し、挿し木から成長した1−4インチのグリホサート耐性(R-22)パルマーアマランス植物に、特注の低死容量の(「ミリ(Milli)」)噴霧器を用いて1−2ミリリットル適用した。10−225マイクログラムの全ポリヌクレオチドを各々の植物に適用したが、適用量は実験によった。典型的には23マイクログラムの全ポリヌクレオチドを一植物あたり適用した。処理された植物は、摂氏26.7/21.1度または摂氏29.4/21.1度のいずれかで、14/10時間温度、補足的な照光スケジュールにセットされた温室に入れた。2−3日後、植物を通常の噴霧器により(10ガロン/エーカー)グリホサート(「2×WmaX」または1ヘクタールあたり1682g酸当量のRoundup(登録商標)WeatherMAX(登録商標)ブランド除草剤)で噴霧し、温室に戻した。パルマーアマランスの未噴霧処理に対する制御(目に見える損傷)の量、植物の背丈、および写真撮影をグリホサート処理後最大21日目まで、異なる時間間隔で集めた。地上部の植物物質の新鮮重を最後に収集した。制御、背丈、新鮮重および目視可能な植物表現型の複合解析に基づき、各処理に0−3の総合的な植物損傷スコアを与えた。グリホサート単独処理による、観察された任意の損傷に対して、「3」は強い除草性活性、「2」は中程度活性、「1」は軽度活性、および「0」は、較正後に活性が観察されなかったことを示す。結果をは表30に示した。
異なる界面活性剤の物理的特性も研究し、表30に列挙した。EPSPSポリヌクレオチド(IDT[2](配列番号85−86)、0.09ミリグラム/ミリリットル)を追加、または追加しない、70ミリリットルの界面活性剤溶液(2%硫酸アンモニウムを含む0.5%界面活性剤水溶液、緩衝液(20ミリモル濃度リン酸カリウム、pH6.8))、を測定当日に調整した。動的表面張力を、環境室温(摂氏22−23度)で、表面寿命に対し表面張力をプロッティングする最大気泡圧力法を用いて、Krussbp100張力計で測定した。該装置は、自動的に表面を検出し、キャピラリーを10mmの深さまで沈めるようにセットされた。3つの表面寿命(約20、500および1250ms)に対する表面張力測定を記録した。表面張力の単位は1cmあたりのダインとし、1250ms間隔で静的表面張力の近似として報告した。また、20−500msの変化を動的表面張力の推定として報告した。界面活性剤に対する親水性親油性バランス(HLP)値は、界面活性剤の参考文献および製品情報から入手した。
Figure 0006581238

Claims (5)

  1. ランスジェニックグリホサート耐性植物を制御する方法であって、
    移送剤および、標的遺伝子または該標的遺伝子から転写されたRNA中の21以上の連続するヌクレオチドの配列に同一または相補的な配列を有する少なくとも1つのポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチド組成物を該トランスジェニック植物に局所的に適用することを含み、
    ここに、該トランスジェニックグリホサート耐性植物は、細菌性のEPSPS遺伝子を発現し、および
    該標的遺伝子は、該細菌性のEPSPS遺伝子であり、および
    該移送剤は、有機シリコーン界面活性剤および陽イオン脂質から選択され、該少なくとも1つのポリヌクレオチドが該トランスジェニック植物の内部に浸透するのを可能にすることを特徴とする前記方法
  2. 該少なくとも1つのポリヌクレオチドが、転写不可ポリヌクレオチドであることを特徴とする請求項に記載の方法。
  3. 該転写不可ポリヌクレオチドが、一本鎖RNA、二本鎖RNA、一本鎖DNA、二本鎖DNA、または二本鎖DNA/RNAハイブリッドであることを特徴とする請求項に記載の方法。
  4. 該有機シリコン界面活性剤が、シリコンポリエーテルコポリマーであることを特徴とする請求項に記載の方法。
  5. シリコンポリエーテルコポリマーが、ポリアルキレンオキシド修飾されたヘプタメチルトリシロキサンおよびアリルオキシポリプロピレングリコールメチルエーテルのコポリマー(Silwet(登録商標)L-77界面活性剤として入手可能)であることを特徴とする請求項に記載の方法
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