JP2662351B2 - Nanbvの診断用薬およびワクチン - Google Patents
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の流行を処置するための材料および方法に関する。さら
に詳しくは,本発明は,診断用DNA断片,診断用タン
パク,診断用抗体,そしてNANB型肝炎の病因因子
(すなわち,C型肝炎ウイルス)に対する防御抗原およ
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487.引用される特許 米国特許第4,341.761号 米国特許第4,399,121号 米国特許第4,427,783号 米国特許第4,444,887号 米国特許第4,466,917号 米国特許第4,472,500号 米国特許第4,491,632号 米国特許第4,493,890号背景技術 非A非B型肝炎(NANBH)は,伝染性の疾患である
か,あるいはウイルスが誘発すると考えられている疾患
群およびウイルスに関連する他の形態の肝臓疾患とは区
別し得る疾患群に属する。これらの疾患には,周知の肝
炎ウイルス(すなわち,A型肝炎ウイルス(HAV),
B型肝炎ウイルス(HBV),Δ型肝炎ウイレス(HD
V),およびサイトメガロウイルス(CMV)またはエ
プスタイン−バーウイルス(EBV))により引き起こ
される疾患が包含される。NANBHは輸血した個体に
おいて初めて同定された。ヒトからチンパンジーへの伝
染およびチンパンジー間における一連の継代は,NAN
BHが1種または複数種の伝染性感染因子によるという
証拠を与える。しかしながら,NANBHの原因である
伝染性因子はまだ同定されておらず,疾患の原因となる
因子の数も知られていない。
3つの型があると示唆される:つまり,飲料水媒介の流
行型;血液または注射針に関連する型;および散発(集
団獲得(community acquired))型
の3つの型である。しかしながら,NANBHの原因と
なり得る因子の数は知られていない。
は,他のウイルスマーカーを排除することにより,まず
行われてきた。推定されるNANBV抗原および抗体を
検出するために用いられる方法には,寒天ゲル拡散法,
対向免疫電気泳動法,免疫蛍光顕微鏡法,免疫電子顕微
鏡法,放射性免疫検定法,および酵素結合免疫吸着検定
法がある。しかしながら,これらの検定法はいずれも,
NANBHに関する診断検査として用いるのに充分感度
が高く,特異的であり,かつ再現性があるとは示されて
いない。
抗体系の同一性または特異性に関しては,明確ではな
く,しかも−致することはなかった。これは,その少な
くとも一部は,以下のことが原因である:つまり,個体
におけるHBVの前感染またはNANBVとの同時感
染;HBVに関連する溶解性の粒子状抗原の周知の複雑
さ;および肝臓細胞のゲノムへのHBV DNAの組込
みである。さらに,NANBHが1種より多くの病原体
により引き起こされる可能性,およびNANBHが誤診
されてきた可能性がある。また,血漿学的な検定法によ
り,NANBH患者の血清中に何が検出されるかは不明
であった。寒天ゲル拡散法および対向免疫電気泳動法に
よれば,血清検体間に時々生じる自動免疫反応または非
特異的なタンパク相互作用は検出されるが,特異的なN
ANBV抗原−抗体反応は示されないと考えられてき
た。免疫蛍光法,酵素結合免疫吸着検定法,および放射
性免疫検定法によれば,NANBH患者の血清中,なら
びに他の肝臓疾患および非肝臓疾患を有する患者におい
ても,しばしば存在するリウマチ因子様物質が低レベル
で検出されるようである。検出された反応性のいくつか
は,宿主により定まる細胞質抗原に対して抗体を表現し
得る。
在する。例えば,Prince(1983),Feis
toneおよびHoofnagle(1984),そし
てOverby(1985,1986,1987)によ
る総説,ならびにIwarson(1987)による論
文を参照にされたい。しかしなから,これらの候補がN
ANBHの病因因子に相当するという証拠はない。
で汚染された血液または血液製剤をスクリーニングしか
つ同定するための感度が高く特異的な方法が非常に要求
されている。輸血後肝炎(PTH)は輸血された患者の
約10%において発生する。この場合,90%までがN
ANBHである。この疾患における大きな問題は,しば
しば慢性的な肝臓損傷へ進行することである(25〜5
5%)。
NANBHの感染あるいは個体が緊密に接触することに
より起こるNANBHの感染を予防するために,NAN
BVに関する核酸,抗原,および抗体を検出する信頼性
の高い診断手段および予診手段が必要とされている。さ
らに,この疾患を予防および/または処置するための効
果的なワクチンおよび免疫療法剤も必要とされている。
C型肝炎ウイルス(HCV)の単離および特徴付けに関
する。さらに詳しくは,本発明は,HCVゲノムの部分
的なcDNA複製物群を提供する。これらのcDNA複
製物は,以下の新規な工程を包含する方法により単離さ
れた:つまり,これまでに単離も特徴付けもされていな
いウイルス因子のゲノムから誘導される新しく合成され
た抗原を検出するために,NANBH患者の血清で感染
した組織中の粒子状因子から調製されたcDNAライブ
ラリー由来の発見産物をスクリーニングする工程;およ
び非感染個体に比べて感染個体の血清とのみ免疫学的に
反応する産物を生産するクローンを選択する工程であ
る。
を利用したHCVゲノムの性質,およびHCV cDN
A内に含まれる配列情報に関する研究は,HCVがフラ
ビウイルスまたはフラビ様ウイルスであることを示唆し
ている。
は,試料中のウイルスの存在を診断するためのプローブ
として,および天然に存在するウイルスの変異型を単離
するためのプローブとして有用である。これらのcDN
Aを用いれば,HCVゲノム内にコードされているHC
V抗原の有効なポリペプチド配列を調製し,診断検査に
おける標準または試薬として,および/またはワクチン
の成分として有用なポリペプチドを生産することができ
る。これらのポリペプチド配列内に含まれるHCVエピ
トープに対する抗体は,ポリクローナル抗体およびモノ
ウローナル抗体のいずれもが,診断検査に,治療薬とし
て,抗ウイルス剤のスクリーニングに,そしてこれらの
cDNAから誘導されるNANBV因子の単離に有用で
ある。さらに,これらのcDNAから誘導されるプロー
ブを利用することにより,HCVゲノムの他の部分を単
離し,かつ配列決定することができる。従って,NAN
BHの診断および/または処置,予防および治療の両方
に有用な追加のプローブおよびポリペプチドが提供され
る。
のいくつかの局面は以下のとおりである:精製されたH
CVポリヌクレオチド;組換えHCVポリヌクレオチ
ド;HCVゲノムまたはHCV cDNAに由来する配
列を有する組換えポリヌクレオチド;HCVのエピトー
プをコードする組換えポリヌクレオチド;上記の組換え
ポリヌクレオチドのいずれかを有する組換えベクター;
およびこれらベクターのいずれかで形質転換された宿主
細胞。
HCVゲノムまたはHCV cDNAに由来するDNA
のオープンリーディングフレーム(ORF)を有する組
換え発現系であって,該ORFが所望の宿主と適合し得
る制御配列に対して作動可能なように連結されている,
組換え発現系;該組換え発現系で形質転換された細胞;
および該形質転換細胞により生産されるポリペプチド。
ある:精製されたHCV;該精製HCVに由来するポリ
ペプチドの調製物;精製されたHCVポリペプチド;お
よびHCVに含まれるエピトープと免疫学的に同一であ
るとみなし得るエピトープを有する精製されたポリペプ
チド。
えHCVポリペプチド;HCVゲノムまたはHCV c
DNAに由来する配列を有する組換えポリペプチド;H
CVエピトープを有する組換えポリペプチド;およびH
CVポリペプチドを有する融合ポリペプチド。本発明に
は以下のものも包含される:HCVエピトープに対する
モノクローナル抗体;およびHCVエピトープに対する
ポリクローナル抗体の精製された調製物。本発明の他の
局面は,HCV感染に対して免疫原性の粒子であって,
真核生物宿主内で生産される場合に粒子を形成し得るア
ミノ酸配列を有する非HCVポリペプチドと,HCVエ
ピトープを有する粒子である。
るポリヌクレオチドプローブである。キットに関する本
発明の局面は以下のようなキットである:HCVに由来
するポリヌクレオチドの存在について試料を分析するた
めのキットであって,適当な容器内に,約8個またはそ
れ以上のヌクレオチドからなるHCV由来のヌクレオチ
ド配列を含むポリヌクレオチドプローブを有するキッ
ト;HCV抗原の存在について試料を分析するためのキ
ットであって,適当な容器内に,検出されるべきHCV
抗原に対する抗体を有するキット;HCV抗原に対する
抗体の存在について試料を分析するためのキットであっ
て,適当な容器内に,HCV抗原に存在するHCVエピ
トープを含むポリペプチドを有するキットである。
た,HCVエピトープを有するポリペプチド;および固
体担体に付着させた,HCVエピトープに対する抗体で
ある。
法である:HCVエピトープを含むポリペプチドを生産
する方法であって,HCVエピトープを含むポリペプチ
ドをコードする配列を含む発現ベクターで形質転換させ
た宿主細胞を,該ポリペプチドを発現させる条件下でイ
ンキュベートすること,を包含する生産方法;およびこ
の方法により生産された,HCVエピトープを含むポリ
ペプチド。
る:試料中のHCV核酸を検出する方法であって,該試
料の核酸を,HCVポリヌクレオチドに対するプローブ
と,該プローブと該試料由来のHCV核酸との間にポリ
ヌクレオチド二本鎖を形成する条件下で反応させるこ
と;および核プローブを含むポリヌクレオチド二本鎖を
検出すること,を包含する検出方法。
る。これらの免疫学的検定法には,以下のような工程を
包含するHCV抗原を検出するための免疫学的検定法が
包含される:HCV抗原を含んでいる疑いのある試料
を,検出されるべきHCV抗原に対するプローブ抗体と
共に,抗原−抗体複合体を形成する条件下でインキュベ
ートすること;および該プローブ抗体を含む抗原−抗体
複合体を検出すること。以下の工程を包含するHCV抗
原に対する抗体を検出するための免疫学的検定法:抗H
CV抗体を含んでいる疑いのある試料を,HCVのエピ
トープを含むプローブポリペプチドと共に,抗体一抗原
複合体を形成する条件下でインキュベートすること;お
よび該プローブ抗原を含む抗体−抗原複合体を検出する
こと。
V感染を処置するためのワクチンであって,HCVエピ
トープを含む免疫原性ペプチド,不活性化されたHCV
調製物,または弱毒化されたHCV調製物を含有するワ
クチン。
織培養増殖細胞である。
る抗体を生産する方法であって,HCVエピトープを含
む単離された免疫原性ポリペプチドを,免疫反応を生ず
るのに充分な量で個体に投与することを包含する生産方
法である。
因子のゲノムに由来するcDNAを単離する方法であっ
て,該方法は以下の工程(a)〜(f)を包含する:
(a)該感染因子に感染した組織から単離された核酸か
ら調製されたcDNAライブラリーを含む発現ベクター
で形質転換させた宿主細胞を用意し,該cDNAにコー
ドされたポリペプチドを発現する条件下で該宿主細胞を
増殖させること;(b)該cDNAの発現産物を,該感
染因子に感染した個体の抗体含有身体構成部分と,免疫
反応を起こす条件下で反応させ,その結果として形成さ
れる抗体−抗原複合体を検出すること;(c)該工程
(b)の抗体−抗原複合体を形成するポリペプチドを発
現する宿主細胞を,個々のクローンとして増殖する条件
下で増殖させ,該クローンを単離すること;(d)該工
程(c)のクローン由来の細胞を,該cDNA内にコー
ドされたポリペプチドを発現する条件下で増殖させ,該
発現産物を,該工程(a)の個体以外の個体であって該
感染因子に感染している個体の抗体含有身体構成部分お
よび該感染因子に感染していない対照個体と反応させ,
その結果として形成される抗体一抗原複合体を検出する
こと;(e)感染した個体および感染している疑いのあ
る個体の抗体含有身体構成部分から抗体−抗原複合体を
形成するが,対照個体の該部分からは抗体−抗原複合体
を形成しないポリペプチドを発現する宿主細胞を,個々
のクローンとして増殖する条件下で増殖させ,該クロー
ンを単離すること;および(f)該工程(e)の宿主細
胞クローンからcDNAを単離すること。
us)」という用語は,非A非B型肝炎(NANBH)
の従来知られていなかった病原因子に対して,この分野
の研究者が保留していた用語である。従って,本願で用
いる場合,「C型肝炎ウイルス(HCV)という用語は
NANBHの病原因子を意味し,またこのNANBH
は,以前にはNANBVおよび/またはBB−NANB
Vと呼ばれていたものである。本願では,HCV,NA
NBVおよびBB−NANBVという用語を互換性のあ
る語として使用する。この用語法を拡張して,以前はN
ANB肝炎(NANBH)と呼んでいたHCVによって
発病する疾患をC型肝炎と呼ぶ。本願では,NANBH
とC型肝炎という用語を互換性のある語として使用して
もよい。
合,NANBHを発病させるウイルス種および弱毒化さ
れたウイルス株または後者由来の欠損干渉粒子を意味す
る。後に述べるように,HCVゲノムは,RNAで構成
されている。RNAを含有するウイルスの偶発変異率が
比較的高いということが知られており,すなわち約10
−3〜10−4/ヌクレオチドであると報告されている
〔フィールズとナイプ(Fields and Kni
pe)1986年〕。それ故,後に述べるHCV種の中
には,多くのウイルス株がある。本願記載の組成物と方
法によって,種々の関連ウイルス株の増殖,同定,検出
および単離を行うことができる。さらに各種ウイルス株
に対する診断薬とワクチンを製造することができ,また
薬理学的用途の抗ウイルス剤を,HCVの複製を阻害す
るということによりスクリーニングすることができる。
由来のものであり, このウイルス株は以後CDC/H
CV1と呼ぶが,ウイルス分離学者がこの種に属する他
のウイルス株を同定するのに充分なものである。本願に
記載するように,本願の発明者らは,HCVがフラビウ
イルス(Flaviirus)またはフラビ様ウイルス
(Flavi−like virus)であることを発
見した。フラビウイルス粒子の形態と組成は公知であ
り,ブリントン(Brinton.1986年)が考察
している。形態については,一般にフラビウイルス類
は,脂質二重層で覆われた中心ヌクレオカプシドを有し
ている。ビリオンは球形で直径が約40〜50nmであ
る。そのコアは直径が約25〜30nmである。ビリオ
ンのエンベロープの外面には,直径が約2nmの端末ノ
ブ(terminal knob)を有する約5〜10
nm長の突起を有する。
れるHCVゲノム内のエピトープと免疫学的に同定可能
なエピトープをコードするが,このエピトープは本願に
記載のcDNA内にコードされることが好ましい。この
エピトープは,他の公知のフラビウイルス類と比較した
場合,HCVに特有のものである。このエピトープの独
自性は,HCVとの免疫学的反応性と,他のフラビウイ
ルス種との免疫学的反応性の欠如とによって決定するこ
とができる。免疫学的反応性を決定する方法は当該技術
分野では公知であり,例えば,放射性免疫検定法,EL
ISA法,血球凝集反応法などがあり,分析技術の適切
ないくつかの例を本願に示す。
同定する際に,単独もしくは組合わせて,下記のパラメ
ータを利用することができる。HCV株は,進化論的に
関連しているので,ヌクレオチドレベルでのゲノムの全
相同性は,約40%以上であり,好ましくは約60%以
上で,さらに好ましくは約80%以上であり,さらに少
なくとも約13のヌクレオチドの対応する連続配列があ
ると考えられる。推定上のHCV株のゲノム配列とCD
C/CH1 HCVのcDNA配列との同一性は,当該
技術分野で公知の技術によって決定することができる。
例えば,推定上のHCV由来のポリヌクレオチドの配列
情報と,本願に記載のHCV cDNA配列とを直接比
較することによって決定することができる。また例え
ば,相同領域間の安定な二本鎖を形成する条件下(例え
ば,S1消化の前に用いられる条件)でポリヌクレオチ
ドをハイブリダイゼーションし,次いで一本鎖に特異的
なヌクアーゼの一種もしくは複数種で切断し,次に切断
によって生成した断片の大きさを測定することによって
決定することができる。
上のHCV株は,ポリペプチドのレベルの,その相同性
によって同定可能である。一般にHCV株は,ポリペプ
チドのレベルで,約40%以上相同であり,好ましくは
約60%以上,さらに好ましくは80%以上相同であ
る。アミノ酸配列の相同性を決定する技術は,当該技術
分野で知られている。例えば,アミノ酸配列を直接決定
して,本願に示した配列と比較することができる。また
例えば,推定上のHCVのゲノム物質のヌクレオチド配
列を決定してもよく(通常,cDNA中間体を介し
て),これにコードされているアミノ酸配列は決定可能
で,対応する領域を比較することができる。
(例えば,HCV cDNA,特に第1〜46図に例示
した配列)か,またはHCVゲノム「由来」のポリヌク
レオチドは,少なくとも約6個の対応するヌクレオチド
配列からなり,好ましくは少なくとも約8個のヌクレオ
チド,さらに好ましくは少なくとも約10〜12個のヌ
クレオチド,さらに好ましくは少なくとも約15〜20
個のヌクレオチドの配列からなる対応するポリヌクレオ
チド配列を意味する。つまり,これらのヌクレオチド
は,指定されたヌクレオチド配列の領域に相同か,また
は相補的である。上記ポリヌクレオチドが誘導される領
域の配列は,HCVゲノムに特有の配列に相同または相
補的であるのが好ましい。一つの配列がHCVゲノムに
特有のものであるか否かは当業者に公知の技術で決定す
ることができる。例えば,その配列を,データバンク,
例えばジーンバンク(genebank)の配列と比較
して,未感染の宿主または他の生物に存在するか否かを
決定する。またその配列は,公知の配列を有する他のウ
イルス因子,すなわち,肝炎,例えば,HAV,HBV
およびHDVを誘発することが知られているウイルス因
子,ならびにフラビウイルス科のウイルス(Fravi
viridae)の他のメンバーと比較することもでき
る。また,誘導された配列が他の配列と一致しているか
または一致していないかは,適切な厳密条件下でハイブ
リダイゼーションさせることによって決定することがで
きる。核酸の配列の相補性を決定するためのハイブリダ
イゼーション技術は,当該技術分野で公知であり,後に
検討する。例えば,マニアチスら(maniatis
et al,1982年)の文献を参照せよ。さらにハ
イブリダイゼーションによって形成された,不適正な二
本鎖のポリヌクレオチドも公知の方法で決定することが
でき,この方法には,例えば,S1のようなヌクレアー
ゼによって,二本鎖のポリヌクレオチドの一本鎖領域を
特異的に切断する方法がある。代表的なDNA配列が
「誘導される」領域は,例えば,特異的なエピトープを
コードする領域および転写されない領域および/または
翻訳されない領域を含むが,これに限定されるものでは
ない。
も,提示されたヌクレオチド配列が物理的に誘導される
とは限らず,いずれの方法で生成されていてもよい。例
えば,化学合成法,DNA複製法,逆転写法または転写
法が挙げられ,これらの方法は,ポリヌクレオチドが誘
導される一種もしくは複数の領域内の塩基配列が提供す
る情報に基づいて実施される。さらに,指定された配列
の領域に対応する領域の組合わせは,当該技術分野で公
知の方法で改変され,意図する用途に合致させることが
できる。
第1〜46図に示す配列)またはHCVゲノム「から誘
導された」ポリペプチドもしくはアミノ酸配列は,上記
の配列にコードされているポリペプチドのアミノ酸配列
もしくはその一部分の配列(少なくとも3〜5のアミノ
酸,好ましくは少なくとも8〜10のアミノ酸,さらに
好ましくは少なくとも11〜15のアミノ酸で構成され
た部分)と同じアミノ酸配列を有するポリペプチド,ま
たは上記の配列にコードされているポリペプチドと免疫
学的に同定しうるポリペプチドを意味する。
ポリペプチドは,指定された核酸配列(例えば第1〜3
4図に示す配列),またはHCVゲノムから必らずしも
翻訳される必要はなく,例えば化学合成法もしくは組換
え体発現系の発現もしくは変異HCVからの単離を含む
いずれの方法でも生成され得る。
ド」という用語は,ゲノム,cDNA,半合成もしくは
合成の起源のポリヌクレオチドを意味し,その起源もし
くは操作によって,(1)天然もしくはライブラリーの
形態でポリヌクレオチドが連結しているポリヌクレオチ
ドの全体もしくは一部分と連結していないもの,および
/または(2)天然にポリヌクレオチドが連結している
ポリヌクレオチド以外のポリヌクレオチドに連結されて
いるのを意味する。
用語は,任意の長さを持ったポリマー形態のヌクレオチ
ド(リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチ
ド)を意味する。この用語は,分子の一次構造のみを意
味する。したがって,この用語には,二本鎖DNAと一
本鎖DNA,および二本鎖と一本鎖のRNAが含まれ
る。またこの用語には,例えばメチル化反応および/ま
たはキャッピングによって修飾された形態のポリヌクレ
オチドと,未修飾のポリヌクレオチドが含まれる。
有するHCV」という用語は,そのHCVが指定された
DNAの配列と相同もしくは相補的な関係にあるポリヌ
クレオチド配列をもっていることを意味し,cDNAに
対する相同性もしくは相補性の程度は,約50%以上,
好ましくは少なくとも約70%,さらに好ましくは少な
くとも約90%である。対応する配列は,長さが,少な
くとも約70のヌクレオチド,好ましくは少なくとも約
80のヌクレオチド,さらに好ましくは少なくとも約9
0のヌクレオチドである。HCVの配列とcDNAとの
対応は,当該技術分野で公知の方法で決定することがで
き,例えば配列された物質と記載されたcDNAとを直
接比較すること,またはハイブリダイゼーションし,一
本鎖ヌクレアーゼで切断し,切断により生成した断片の
大きさを測定するという方法がある。
という用語は,HCVゲノムもしくはその断片を意味
し,この断片は,本質的に遊離の形態で,すなわち,ウ
イルスのポリヌクレオチドが自然に連結されているポリ
ヌクレオチドの約50%未満,好ましくは約70%未
満,さらに好ましくは約90%未満を含有している。ウ
イルス粒子からウイルスポリヌクレオチドを精製する方
法は,当該技術分野で知られており,例えば,ウイルス
粒子をカオトロピック剤で破壊する方法,およびイオン
交換クロマトグラフィー,アフィニティークロマトグラ
フィー,および密度による遠心沈降法によってポリヌク
レオチドとポリペプチドを分離する方法がある。
う用語は,HCVポリペプチドもしくはその断片を意味
し,その断片は,本質的に遊離の形態で,ウイルスポリ
ペプチドが天然に連結されている細胞成分の,約50%
未満,好ましくは約70%未満,さらに好ましくは約9
0%未満を含有している。ウイルスポリペプチドを精製
する技術は当該技術で公知であり,この技術の例につい
ては後に考察する。
は高等真核細胞系を示す「組換え体宿主細胞」,「宿主
細胞」,「細胞」,「細胞系」,「細胞培養物」などの
用語は,組換え体ベクターもしくは他の転移DNAの受
容体として使用可能か,または使用されてきた細胞を意
味し,トランスフェクトされた元の細胞の後代が含まれ
る。単一の親細胞の後代は,偶発的または計画的な変異
によって,形態またはゲノムもしくは全DNAの相補性
が元の親細胞と,必らずしも完全に同一ではない。所望
のペプチドをコードするヌクレオチド配列が存在するよ
うな適切な性質によって特徴づけられ,親細胞に充分類
似している親細胞の後代は,上記定義の意味する後代に
含まれ,上記用語で扱われる。
えばプラスミド,染色体,ウイルスが含まれ,細胞内で
ポリヌクレオチドの複製の自律的な単位として挙動し,
すなわち自ら制御しながら複製を行うことができる。
セグメントが結合しているレプリコンであって,複製を
行い,および/または結合しているセグメントを発現す
る。
ド配列を意味し,この配列が連結している,コード配列
を発現するのに必要なものである。このような制御配列
の性質は,宿主の生物によって異なり,このような制御
配列には,原核細胞内では一般に,プロモーター,リボ
ソーム結合部位およびターミネーターが含まれ,真核細
胞内では一般に,プロモーター,ターミネーターおよび
ある場合にはエンハンサーが含まれる。「制御配列」と
いう用語は,最小限発現に必要なすべての要素を包含
し,さらに発現に有利な追加の要素,例えばリーダー配
列を包含し得る。
上記のような要素が,意図した方法で機能しうるような
関係に並置されていることを意味する。コード配列に
「作動可能に連結された」制御配列は,制御配列に適合
した条件下でコード配列の発現が達成されるように,連
結される。
ドをコードするポリヌクレオチド配列の領域であり,こ
の領域は,コード配列の一部またはコード配列全体を意
味する。
下に置かれた場合に,mRNAに転写され,および/ま
たはポリペプチドに翻訳されるポリヌクレオチド配列で
ある。コード配列の境界は,5’末端の翻訳開始コドン
と,3’末端の翻訳停止コドンによって決定される。コ
ード配列は,mRNA,cDNAおよび組換え体ポリヌ
クレオチド配列を包含するが,これらに限定されるもの
ではない。
は,指定されたポリペプチド(通常はHCVタンパク)
内に存在し,かつそのタンパクに特有であるエピトープ
およびポリペプチドが存在することを意味する。免疫学
的な同一性は,抗体の結合および/または結合における
競争によって決定されるが,この技術は当業者には知ら
れていることであり,後述する。エピトープの独自性
も,エピトープをコードするポリヌクレオチド配列につ
いて,公知のデータバンク(例えば,ジーンバンク)を
コンピュータで調査し,他の公知のタンパクとアミノ酸
配列を比較することによって決定することができる。
は,ポリペプチドの抗原決定基を意味し,エピトープ
は,エピトープに特有の立体配置で3個のアミノ酸を含
有し得るが,エピトープは,一般に少なくとも5個のこ
のようなアミノ酸で構成され,より一般的には少なくと
も8〜10個のこのようなアミノ酸で構成されている。
アミノ酸の立体配置の決定法は,当該技術分野では公知
であり,例えば,X線結晶構造解析および二次元核磁気
共鳴法がある。
的なエピトープが抗体を認識することによって,抗体と
結合する場合,抗体と「免疫学的に反応性がある」。免
疫学的反応性は,抗体結合反応,特に抗体結合反応の速
度論,および/または抗体が指向しているエピトープを
含有する公知のポリペプチドを,競争者として用いる結
合競争法によって決定される。ポリペプチドが抗体と免
疫学的に反応性であるか否かを決定する方法は,当該技
術分野で公知である。
含有する免疫原性を有するポリペプチド」という用語に
は,自然に発生するHCVポリペプチドもしくはその断
片,および他の手段(例えば,化学合成法または組換え
体生物内でのポリペプチドの発現)によって調製される
ポリペプチドが包含される。
の分子鎖を意味し,特定の長さの生産物を意味しない。
したがってポリペプチドの定義には,ペプチド,オリゴ
ペプチドおよびタンパクが包含される。またこの用語
は,ポリペプチドの発現後修飾物,例えば,グリコシル
化物,アシル化物,リン酸化物などを意味しない。
外因性ポリヌクレオチドを宿主細胞に挿入することを意
味し,挿入法はどんな方法でもよく,例えば,直接取込
み法,形質導入法またはf−交配法がある。外因性ポリ
ヌクレオチドは,組込まれていないベクター,例えば,
プラスミドとして保持されるか,または代わりに宿主ゲ
ノムに組込れてもよい。
および/または治療を意味する。
動物,特に哺乳動物種のメンバーを意味し,家畜,競技
用動物,霊長動物およびヒトを含むが,これに限定され
るものではない。
リペプチドをコードする配列を含有している。また「負
鎖」は,「正鎖」の配列を相補する配列を含有してい
る。
は,RNAまたはDNAにかかわらず,一本鎖のゲノム
であり,ウイルスのポリペプチドをコードする。正鎖の
RNAウイルスの例としては,トガウイルス科ウイルス
(Togaviridae),コロナウイルス科ウイル
ス(Coronaviridae),レトロウイルス科
ウイルス(Retroviridae),ピコルナウイ
ルス科ウイルス(Picorna−viridae)お
よびカリチウイルス科ウイルス(Caliciviri
dae)がある。またフラビウイルス科ウイルスも含ま
れるが,これは以前にトガウイルス科に分類されていた
〔フィールドとナイプの文献(1986年)を参照〕。
は,問題の抗体の起源である個体の身体の成分を意味す
る。抗体を含有する身体成分は,当該技術分野で知られ
ており,例えば,血漿,血清,脊髄液,リンパ液,呼吸
器官と腸管と尿生殖器管の外部セクション(secti
on),涙,唾液,乳,白血球および骨髄腫細胞が含ま
れるが,これに限定されるものではない。
イルスが通常連結されている細胞構成要素および感染組
織中に存在する他の種のウイルスから単離されたHCV
の製剤を意味する。ウイルスを単離する技術は,当業者
には知られており,例えば,遠心分離法およびアフィニ
ティークロマトグラフィーが含まれるが,精製HCVの
製法については後述する。
分野で既知である分子生物学,微生物学,組み換えDN
A,および免疫学の従来の手法が採用される。このよう
な手法は,文献中に充分に説明されている。例えば,次
の文献を参照されたい:Manistis,Fitsc
hおよびSambrook,MOLECULAR CL
ONING;A LABORATIRY MANUAL
(1982);DNA CLONING,I巻およびI
I巻(D.N Glover編集,1985);OLI
GONUCLEOTIDE SYNTHESIS(M.
J.Gait編集,1984);NUCLEIC AC
ID HYBRIDIZATION(B.D. Ham
esおよびS.J.Higgins編集,1984);
TRANSCRIPTION AND TRANSLA
TION (B.D.HamesおよびS.J.Hig
gins編集,1984);ANIMALCELL C
ULTURE(R.I.Freshney編集,198
6);IMMOBILIZED CELLS AND
ENZYHES(IRL Press,1986);
B.Perbal,A PRACTICAL GUID
E TO MOLECULAR CLONING(19
84);METHODS INENZYMOLOGYの
シリーズ(Academic Press,In
c.):GENE TRANSFER VECTORS
FOR MAMMALIAN CELLS(J.H.
MillerおよびM.P.Calos編集,198
7,Cold Spring Harbor Labo
ratory);Methods in Enzymo
logy Vol.154およびVol.155(それ
ぞれWuおよびGrossman;Wu編集),May
erおよびWalker編集(1987);IMMUN
OCHEMICAL METHODS IN CELL
AND MOLECULAR BIOLOGY(Ac
ademic Press,London),Scop
es,(1987);PROTEIN PURIFIC
ATION:PRINCIPLES AND PRAC
TCE,Second Edition(Spring
er−Verlag,N.Y.),およびHANDBO
OK OF EXPERIMENTAL IMMUNO
LOGY,I〜IV巻(D.M.WeirおよびC.
C. Blackwell編,1986)。
願および公報は参考文献としてここに取り入れられてい
る。
感染チンバンジーの血漿中に存在する核酸配列由来のc
DNAライブラリーから単離されたヌクレオチド配列と
非常に相同なヌクレオチド配列群の供給により可能とな
る。このヌクレオチド配列群はヒトあるいはチンパンジ
ーの起源ではない。なぜなら,このヌクレオチド配列群
は,非感染個体から得られるヒトおよびチンパンジーの
ゲノムDNAのいずれにもハイブリダイズせず,この配
列群のヌクレオチドはHCV感染したチンパンジーの肝
臓および血漿にのみ存在し,そして,この配列は遺伝子
バンクには存在しないからである。さらに,この配列群
は,HBVゲノム内に含有される配列に有意な相同性を
示さない。
のある配列は,およそ50個のアミノ酸のポリペプチド
をコードする1つの連続的なオープンリーディングフレ
ーム(ORF)を有する。HCV感染者から得られた血
清にはこのポリペプチドに結合する抗体が含有されてい
る一方,非感染者から得られた血清には,このポリペプ
チドに対する抗体が含有されない。最終的に非感染チン
パンジーから得られた血清には,このポリペプチドに対
する抗体が含有されないが,この抗体は,急性NANB
Hに感染したチンパンジーにおいて誘導される。さら
に,このポリペプチドに対する抗体はHAVおよびHB
Vに感染したチンパンジーおよびヒトにおいては検出さ
れない。これらの基準によると,この配列はウイルスの
配列に対するcDNAであり,このウイルスにより生
じ,NANBHと関連する配列である。このcDNA配
列を第1図に示す。後述のように,クローン5−1−1
におけるcDNA配列は,単離された他のcDNA(さ
らに28個の塩基対を含有する)とは異なる。
ーン5−1−1におけるcDNAの断片と同等な合成配
列をプローブとして用い,単離された)との複合配列を
第3図に示す。クローン81におけるcDNA由来の合
成配列を用いて単離されたcDNA群の構成要素を第5
図に示し,クローン81の配列とこの配列との複合配列
を第6図に示す。cDNA群の他の構成要素は,クロー
ン14i,11b,7f,7e,8h,33c,40
b,37b,35,36,81,32,33b,25
c,14c,8f,33f,および33g,および39
cに存在する配列を含み,これらは,IV.A節で詳細
に説明される。これらクローン中のcDNA複合配列は
IV.A.18節で詳細に説明されており,第29〜3
4図に示される。cDNA複合配列はひとつの連続した
ORFを含有し,従って,ポリタンパクをコードしてい
ることが示される。このデータは,後に考察されるよう
に,HCVがフラビウイルスあるいはフラビ様ウイルス
であるという示唆と一致する。
群が入手可能となるため,DNAプローブの構築および
ポリペプチドを得ることが可能となる。上記ポリペプチ
ドは,HCV感染によるNANBHの診断において,そ
して,供血者,供給された血液および血液産物が感染し
ているか否かについてスクリーニングすることにおい
て,有用である。例えば,この配列から,約8〜10個
あるいはそれより長いヌクレオチドを有するDNAオリ
ゴマーを合成することが可能である。このDNAオリゴ
マーは,例えばウイルスを保有している疑いがある被験
者血清におけるウイルスゲノムの存在を検出するため
の,あるいは供給された血液についてウイルスの存在の
有無をスクリーニングするための,ハイブリダイゼーシ
ョンプローブとして,有用である。cDNA配列の群に
よりまた,NANBHにおいて生じる抗体の存在を検出
する診断用試薬として有用なHCVに特異的なポリペプ
チドの設計および産生が可能となる。cDNA由来の精
製ポリペプチドに対する抗体は感染個体および血液中の
ウイルス抗原を検出するためにも用いられ得る。
Vに対するワクチンとしてそして抗体産生のためにも用
いられ得る,ポリペプチドの設計および調製が可能とな
る。そしてこのポリペプチドは,次に,HCV疾患に対
する保護および/またはHCV感染個体の治療に用いら
れ得る。
ムを,より特徴づけることを可能にする。これらの配列
から得られたポリヌクレオチドプローブは,重複してい
る付加的なcDNA配列についてcDNAライブラリー
をスクリーニングするために用いられ得,このcDNA
配列はさらに,重複している別の配列を得るためにも用
いられ得る。ゲノムが分割されており,そのセグメント
が共通配列を欠いている限り,この手法はゲノム全体の
配列を得るために用いられ得る。しかし,ゲノムが分割
されているならば,ゲノムの他のセグメントは,ここで
述べられているcDNAクローンを単離するために用い
られたλ−gt11の血清学的なスクリーニング工程を
繰り返すことより,あるいは,精製HCV粒子からのゲ
ノムを単離することにより得られ得る。
リペプチド,そして,これらペプチドに対する抗体もま
た,BB−NANBV因子の単離および同定に有用であ
る。例えば,cDNA由来のポリペプチドに含まれるH
CVエピトープに対する抗体は,アフィニティークロマ
トグラフィーをもとにした工程で,ウイルスを単離する
ために用いられ得る。あるいは,この抗体は他の手法に
より単離されたウイルス粒子を同定するために用いられ
得る。単離されたウイルス粒子のウイルス抗原およびゲ
ノム物質が,さらに特徴づけられ得る。
よって得られる情報により,およびHCV抗原がさらに
特徴づけられ,ゲノムが特徴づけられることにより,付
加的なプローブおよびポリペプチド,そして抗体の設計
および合成が可能となる。これらは,HCV誘発NAN
BHの診断,予防,および治療に,そして感染血液およ
び血液関連産物のスクリーニングに用いられ得る。
およびcDNA群が誘導されるゲノム由来のポリヌクレ
オチドが利用可能であることにより,HCVの生物的性
質を明らかにするにあたり主として用いられる組織培養
系の発達が可能となった。このことにより,HCV複
製,あるいはHCV感染を選択的に阻害する抗ウイルス
化合物に基づいた新しい治療法が開発され得る。
るために用いられる本法は新規であり,次のような今ま
でに特徴づけられていない因子の同定および/または単
離に適用され得る。上記因子はゲノムを含有し,ウイル
ス,ウィロイド,細菌類,菌類,および寄生虫によって
引き起こされる疾患を包含するさまざまな疾患に関連す
る因子である。この方法ではcDNAライブラリーが,
感染個体から得られる感染組織中に存在する核酸から,
調製された。このライブラリーは,cDNAをコードす
るポリペプチドを発現し得るベクター中に調製された。
ベクターを含む宿主細胞のクローンは,病因因子のポリ
ペプチドの免疫反応性断片を発現し,これは,推定され
る因子に以前に感染した別の個体由来の抗体含有体成分
を有するこのライブラリーの発現産物を免疫学的にスク
リーニングすることによって選択される。免疫学的なス
クリーニング法における工程は,次の工程を包含してい
た;:ベクターを含むcDNAの発現産物と,二次的に
感染した個体の抗体含有体成分とを相互作用させる工
程;および発現産物と二次感染個体の抗体との間の抗原
−抗体複合配列の形成を検出する工程。単離されたクロ
ーンはさらに次のようにして免疫学的にスクリーニング
される:発現産物を,推定される因子に感染した他の個
体および推定される因子に感染していない対照の個体の
抗体含有体成分と相互に作用させること,および,感染
個体由来の抗体との抗原−抗体複合配列の形成を検出す
ること。そして,感染個体および該因子に感染している
疑いのある個体由来の抗体と免疫学的に反応するが,対
照の個体由来のものとは反応しないポリペプチドをコー
ドするcDNA含有ベクターが,単離される。cDNA
ライブラリーの構築および免疫学的なスクリーニングに
用いた感染個体は同種である必要はない。
して該発現産物に対する抗体は,病因因子の特徴づけお
よび/または捕捉に有用である。さらに,詳細に後述す
るように,この方法は,HCVゲノム由来のcDNA群
を単離するために,好適に利用される。
ウイルスを高力価で,つまり少なくとも106チンパン
ジー感染量/ml(chimp infections
doses/ml;CID/ml)を有する血清を,
ウイルス粒子を単離するために用いた。そして,このウ
イルス粒子から単離した核酸を,ウイルスゲノムに対す
るcDNAライブラリーの構築においてテンプレートと
して用いた。推定HCV粒子の単離およびλ−gt11
におけるcDNAライブラリーの構築のための手順は,
IV.A.1節で考察されている。λ−gt11は,β
−ガラクトシダーゼを有する融合ポリペプチドとして挿
入cDNAを発現するために,そして,特定の抗原に対
して生じた特異的な抗血清で多数の組み換え体ファージ
をスクリーニングするために,特に開発されたベクター
である。およその平均サイズが200塩基対のcDNA
を有するcDNAプールからのλ−gt11cDNAラ
イブラリーが以前にNANB肝炎にかかつたことのある
患者由来の血清に特異的に結合し得るようなコードされ
たエピトープについてスクリーニングされた。Huyn
h,T.V.ら(1985)。約106個のファージガ
スクリーニングされ,5個の陽性ファージが同定,精製
され,次に,HCV因子に以前に感染した異なるヒトお
よびチンパンジーから得た血清に対する結合の特異性が
テストされた。このファージの1つである5−1−1
が,テストしたヒト血清8個のうちの5個と結合した。
7個の正常血清はこのような結合を示さなかったので,
この結合は以前にNANB肝炎にかかった患者由来の血
清に選択的であるらしい。
NA配列が,決定され,それは第1図に示される。この
クローン化されたcDNAによってコードされたポリペ
プチドは,融合ポリペプチドのN末端β−ガラクトシダ
ーゼ部分として同一の翻訳枠内にあり,その配列は,該
ヌクレオチド配列の上に示される。従って,翻訳ORF
は,NANB肝炎に感染した患者由来の血清によって特
別に認識されるエピトープをコードする。
Aが利用できるため,ウイルスゲノムに対するcDNA
の付加的な断片および/または他の断片を有する他のク
ローンを単離することが可能となる。前出のλ−gt1
1 cDNAライブラリーは,クローン化された5−1
−1 cDNA配列由来の合成ポリヌクレオチドを用い
てスクリーニングされた。このスクリーニングにより,
81,1−2, および91として同定された3個の他
のクローンが得られた。これらのクローン内にあるcD
NAが配列決定された。IV.A.3節およびIV.
A.4節を参照されたい。4個の独立したクローン間の
相同性を第2図に示す。第2図では相同性が縦線により
示されている。クローン5−1−1,81,および91
において独特のヌクレオチド配列を小文字で示す。
び91における組換え体ファージにクローン化されたc
DNAは,相同性が高く,わずかに2個の領域において
異なるにすぎない。第一に,クローン1−2の67番目
のヌクレオチドはチミジンである一方,他の3個のクロ
ーンは,この位置にシチジンを有する。しかし,この置
き変えにより,コードされたアミノ酸の性質は変化しな
い。
ーン5−1−1が,他のクローンには存在しないような
28の塩基対を5’末端に有していることである。この
特別な配列はクローニングにより5’末端に人工的に形
成されたものである。クローニングにより5’末端に形
成される人工的な配列は,通常,cDNA法の生成物中
に観察される。
5’領域および3’領域由来の合成配列は,クローン8
1 cDNAと重複するλ−gt11のNANBVcD
NAライブラリー由来のcDNAのスクリーニングおよ
び単離に用いられた(IV.A.5節)。クローン36
およびクローン32の中にそれぞれ存在する得られたc
DNA配列は,第5図および第7図に示される。
た合成ポリヌクレオチドは,クローン36cDNAに重
複するλ−gt11 NANBV cDNAライブラリ
ーからcDNAをスクリーニングし単離するのに用いら
れた(IV.A.8節)。合成ポリヌクレオチドプロー
ブにハイブリダイズする組換えファージ含有cDNAの
精製クローンはクローン35と命名され,このクローン
の中に含まれるNANBH cDNA配列は第8図に示
される。
ることによって,上流および下流にHCV cDNAの
付加的な配列を有するクローンが得られた。これらクロ
ーンの単離はIV.A節で後述する。
V cDNAのヌクレオチド配列の分析により,複合c
DNAがひとつの長い連続したORFを有することが示
される。第29〜34図に,これらのクローンからの複
合DNA配列を,それによりコードされた推定されるH
CVポリペプチドとともに,示す。
歴史的に興味深い。得られた配列(およびその相補配
列)は本発明により提供され,その配列あるいはその部
分的な配列は合成法を用いて,あるいは,合成法と,こ
こに記載したのと同様の方法を用いた部分配列を得る方
法とを組み合わせて,調製される。
してクローン5−1−1,81,1−2および91から
複製されるλ−gt11株は,American Ty
peCulture Collection(ATC
C),12301 Parklawn Dr., Ro
ckville,Maryland 20852,に,
ブダペスト条約により寄託されており,次の受託番号を
有する。
寄託物を利用することに関する制限はすべて最終的に取
り除かれる。そして上記命名された寄託物は,37CF
R1.14および35USC 1.22によりコミッシ
ョナーによって権利を与えられた上記出願が係属してい
る間は,入手可能である。さらに,その寄託物は,寄託
日から30年間,あるいは寄託物の最終要求から5年
間;あるいは,米国特許の有効である期間のいずれか長
い方の期間の間,維持される。これらの寄託物およびこ
こで述べられている寄託物は便宜のためにのみ寄託され
たものであり,ここでの記載された内容により本発明を
実施することを意図していない。すべての寄託物におけ
るHCV cDNA配列は,参考として,ここに述べら
れている。
重複cDNA配列を単離することによりゲノムを「ウォ
ーキング(Walking)」する上記記載により,全
HCVゲノムに対するcDNAを単離し得る方法が提供
される。しかし,本明細書で提供される情報が与えられ
たとしても,これらのcDNAを単離する他の方法は当
業者には自明である。そのような方法のいくつかはこの
後のIV.A節で述べられる。
フラグメントの調製 第1〜46図のcDNA配列を利用して,後述のように
単離されたcDNA配列であっても,これらの図のcD
NA配列であっても,このようなcDNA配列を利用し
得るため,いずれかの鎖においてコードされているポリ
ペプチドの抗原的に活性な領域をコードする発現ベクタ
ーの構築が可能となる。これらの抗原的に活性な領域は
コートまたはエンベロープ(外被)抗原,あるいはコア
抗原由来であり得,それには例えば,ポリヌクレオチド
結合タンパク,ポリヌクレオチドポリメラーゼ,および
ウイルス粒子の複製および/または構築(assemb
ly)に必要とされる他のウイルス性タンパクが包含さ
れる。所望のポリペプチドをコードするフラグメントは
従来の制限消化を用いてあるいは合成法により,cDN
Aクローンから誘導され,例えばタンパクβ−ガラクト
シダーゼあるいはスーパーオキサイドジスムターゼ(S
OD)(好ましくはSOD)のような融合配列の一部を
有するベクター中に連結される。SODの融合配列を有
するポリペプチドの産生に有用な方法およびベクター
は,1986年10月1日に公開されたヨーロッパ特許
出願公開番号第0196056号に記載されている。S
ODおよびHCVポリペプチドの融合ポリペプチドをコ
ードするベクター(つまりNANB5−1−1’NAN
B81およびC100−3;HCV cDNAの複合配
列中にコードされている)は,それぞれIV.B.1,
IV.B.2,およびIV.B.4節に記載されてい
る。どちらのセンス鎖においても,オープンリーディン
グフレームを有するHCV cDNAの所望の部分は,
成熟タンパクあるいは融合タンパクのような組換えポリ
ペプチドとして得られる。あるいは,このcDNAにコ
ードされるポリペプチドは,化学合成により供給され得
る。
は,融合型であっても成熟型であっても,分泌を可能に
するシグナル配列を有していてもいなくても,適当な宿
主に適した発現ベクターに組み込まれ得る。真核生物お
よび原核生物の両宿主が,組換えポリペプチドを形成す
るために現在用いられている。より一般的な制御系およ
び宿主細胞系を,後述のIV.A節にまとめて示す。こ
のポリペプチドは,次に,溶解した細胞あるいは培地か
ら単離され,実際の使用に必要な程度にまで精製され
る。精製には,当該分野で公知の手法が用いられ得,そ
れには例えば,塩分画,イオン交換樹脂でのクロマトグ
ラフィー,アフィニティクロマトグラフィー,遠心分離
などがある。例えば,Methods in Enzy
mologyの種々のタンパク精製法を参照されたい。
このようなポリペプチドは,診断用として用いられ得る
か,あるいは抗体を中和するようなポリペプチドはワク
チンに処方され得る。これらのポリペプチドに対して生
じた抗体もまた,診断薬として,あるいは受動免疫治療
に用いられ得る。さらに,後述のII.J節で考察する
ように,これらポリペプチドに対する抗体は,HCV粒
子の単離および同定に有用である。
ら単離され得る。このビリオンは,組織培養物中のHC
V感染細胞,あるいは感染宿主中で増殖し得る。
びキャリアーとの結合 ポリペプチドの抗原性領域は,通常は比較的小さく,代
表的には8〜10個あるいはそれを下まわる長さのアミ
ノ酸である。せいぜい5個のアミノ酸フラグメントが抗
原性領域を特徴づけている。これらのセグメントは,H
CV抗原領域に対応する。従って,このHCVのcDN
Aを基本的に用いると,HCVポリペプチドの短いセグ
メントをコードするDNAは,融合タンパクとして,あ
るいは単離ポリペプチドとして,組換え手法により発現
させることができる。さらに,短いアミノ酸配列は,化
学合成で都合よく得ることができる。合成ポリペプチド
が正しいエピトープを提供するために正しく形成されて
いるが,小さすぎて免疫原性がない場合には,このポリ
ペプチドは,適当なキャリアーと結合させることができ
る。
当該分野では公知であり,それにはPierce Co
mpany,Rockford,Illinoisから
入手されるN−サクシイミジル−3−(2−ピリジルチ
オ)プロピオネート(SPDP)およびサクシイミジル
4−(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カ
ルボネート(SMCC)を用いてジスルフィド結合を形
成する方法が包含される(もしこのペプチドがスルフヒ
ドリル基を欠いていれば,システイン残基を付加するこ
とにより,この方法が用いられ得る)。これらの試薬
は,その試薬自身とあるタンパクのペプチドのシステイ
ン残基との間のジスルフィド結合,およびリジンのε−
アミノ,あるいはその他の遊離のアミノ基によるアミド
結合を生成する。このようなさまざまなジスルフィド/
アミド形成試薬は公知である。例えば,Immun.R
ev.(1982)62:185を参照されたい。他の
二官能性カップリング試薬は,ジスルフィド結合よりむ
しろチオエーテルを形成する。これらのチオ−エーテル
生成試薬の多くは市販されており,それには6−マレイ
ミドカプロン酸,2−ブロモ酢酸,2−ヨード酢酸,4
−(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カル
ボン酸などの反応性エステルが包含される。このカルボ
キシル基は,そのカルボキシル基とコハク酸イミドと
を,あるいは1−ヒドロキシル−2−ニトロ−4−スル
ホン酸ナトリウム塩とを組み合わせることによって活性
化される。上述の化合物の名称は,それが全てであるこ
とを意味せず,その化合物の修飾物もまた明らかに用い
られ得る。
して有害な抗体の産生を誘導しないものであれば,いず
れのキャリアーもが用いられ得る。適当なキャリアー
は,典型的には,大きく,ゆっくり代謝される高分子物
質であり,それには例えば,タンパク;ラテックス機能
付与セファロース,アガロース,セルロース,セルロー
スビーズなどの多糖体;ポリグルタミン酸,ポリリジン
などのような重合アミノ酸;アミノ酸共重合体;および
不活性ウイルス粒子がある(例えば,II.D節を参照
のこと)。特に有用なタンパク基質には,血清アルブミ
ン,キーホールリンペットヘモシアニン,免疫グロブリ
ン分子,サイログロブリン,オボアルブミン,テタヌス
毒素,および当業者に公知の他のタンパクがある。
ブリッド粒子免疫原の調製 HCVのエピトープの免疫原性はまた,粒子形成タンパ
ク(例えば,B型肝炎の表面抗原と結合するタンパク)
と融合もしくは結合させた哺乳動物の系あるいは酵母の
系で調製することによって増強される。NANBVエピ
トープガ粒子形成タンパクコード配列に直接結合してい
る構築物は,HCVエピトープに関して免疫原性のハイ
ブリッドを産生する。さらに,調製したすべてのベクタ
ーはHBVに特異的なエピトープを有し,例えばプレS
ペプチドのように異なる度合の免疫原性を有する。この
ように,HCV配列を有する粒子形成タンパクから構築
される粒子は,HCVおよびHBVに関して免疫原性で
ある。
erevisiae(Valenzuelaら,(19
82)),および例えば哺乳動物細胞(Valenzu
ela,P.ら,(1984))において形成され,結
合して粒子となることが示されている。このような粒子
の形成は,単量体のサブユニットの免疫原性を増強する
ことが示されてきた。この構築物はまた,HBSAgの
免疫的に優性なエピトープを有し,それはプレ表面(プ
レS)領域の55アミノ酸を含有する(Neurath
ら,(1984))。 酵母中に発現され得るプレS−
HBSAg粒子の構築物は,ヨーロッパ特許出願公開第
174,444号(1986年3月19日公開)に開示
されている。酵母の発現のための異種ウイルス配列を有
するハイブリッドは,ヨーロッパ特許出願公開第17
5,261号(1966年3月26日公開)に開示され
ている。これらの出願の出願人は本出願人と同一であ
り,参考としてここに取り入れられている。
ロ葉酸還元酵素ベクターを用いてチャイニーズハムスタ
ー卵巣(CHO)細胞のような哺乳動物細胞中で発現さ
せることができる(Michelleら(198
4))。
列の部分は,HCVエピトープをコードするコドンで置
き換えられ得る。この置き換えにおいては,酵母あるい
は哺乳動物中で免疫原性粒子を形成する単位の集合を媒
介するために必要とされない部分は削除され得,このよ
うにして,HCVエピトープと競合する部分から付加的
なHBV抗原部位が除去される。
チドおよび第1〜46図のcDNA配列由来の免疫原性
ポリペプチド,あるいはこれらが対応するHCVゲノム
由来の免疫原性ポリペプチドの1種あるいはそれ以上か
ら調製される。HCVおよびフラビウイルスの間に観察
される相同性は,ワクチンとして最も有効でありそうな
ポリペプチドと,それらがコードされているゲノム領域
に関する情報を提供する。フラビウイルスゲノムの一般
的な構造は,Riceら(1986)により考察されて
いる。こフラビウイルスのゲノムRNAは,ウイルス特
異的mRNA種のみであると考えられ,これは,3つの
ウイルスの構造タンパク(つまり,C,MおよびE),
そして,2つの大きな非構造タンパク(NV4およびN
V5)およびより小さな非構造タンパクの複合体の対に
翻訳される。フラビウイルスの主要な中和エピトープ
は,E(外被:envelope)タンパクに属するこ
とは公知である(Roehrig(1986))。対応
するHCV E遺伝子およびポリペプチドをコードする
領域は,フラビウイルスに対する相同性に基づいて,予
想され得る。このように,ワクチンは,HCVEのエピ
トープを有する組換えポリペプチドを含有し得る。これ
らのポリペプチドは,細菌,酵母,あるいは哺乳動物細
胞において発現するか,あるいは,ウイルス調製物から
単離され得る。他の構造タンパクもまた,保護抗HCV
抗体を生じるエピトープを有し得ることが予期される。
このように,E,C,およびMのエピトープを有するポ
リペプチドもまた,単独であるいは組み合わせて,HC
Vワクチン中で用いられ得る。
1)で免疫すると黄熱病から保護されることが示されて
いる(Schlesingerら(1986))。たと
え,その免疫により中和抗体が生じないとしてもこのこ
とは正しい。このように,特に,このタンパクはフラビ
ウイルスの間で高い度合で保持されるらしいので,HC
V NS1もまた,HCVの感染に対して保護作用を有
するようである。さらに,たとえ非構造タンパクが中和
抗体の産生を行わないとしても,非構造タンパクは,ウ
イルスの病原性に対して保護作用を提供し得ることもま
た示される。
価のワクチンは1あるいはそれ以上の構造タンパク,お
よび/または1あるいはそれ以上の非構造タンパクを含
有し得る。これらのワクチンは,例えば,組換えHCV
ポリペプチドおよび/またはビリオンから単離されたポ
リペプチドを含有し得る。さらに,ワクチンにおける不
活性化HCVの使用を可能にする。不活性化は,ウイル
ス溶解物の調製によるか,あるいはフラビウイルスの不
活性化を引き起こす当該分野で公知の他の方法(例え
ば,有機溶媒あるいは界面活性剤での処理,あるいはホ
ルマリンでの処理)により行われ得る。さらに,ワクチ
ンはまた,弱毒化HCV株からも調製され得る。弱毒化
HCV株の調製は,後述される。
かは高度に保持された領域を有することは公知であり,
従って,いくつかの免疫学的交差反応性がHCVと他の
フラビウイルスとの間に予想される。フラビウイルスと
HCVとの共有のエピトープは,これら病原因子によっ
て引き起こされる1あるいはそれ以上の障害に対する保
護抗体を生じる可能性がある。このように,この認識に
基づく多目的ワクチンを設計することができる。
含有するワクチンの調製は,当業者に公知である。代表
的には,このようなワクチンは,液体溶液あるいは懸濁
液のいずれかとして,注射できるように調製される。注
射の前に液体に溶解あるいは懸濁させるのに適当な固形
物の形態としても調製され得る。この調製物はまた,乳
化することもでき,あるいは,リポソームにカプセル化
されるタンパクであってもよい。この活性免疫原性成分
は,薬学的に受容され得,この活性成分と適合性のある
賦形剤としばしば混合される。適当な賦形剤としては,
例えば,水,生理食塩水,デキストロース,グリセロー
ル,エタノールなど,およびこれらの組み合わせがあ
る。さらに必要に応じて,このワクチンには少量の補助
物質が含有され得,それには,補湿剤あるいは乳化剤,
pH緩衝剤,および/またはこのワクチンの効果を増強
するアジュバントがある。効果的なアジュバントの例と
しては,次の物質があり,そしてこれらには阻定されな
い:水酸化アルミニウム,N−アセチル−ムラミル−L
−スレオニル−D−イソグルタミン(thr−MD
P),N−アセチル−ノル−ムラミル−L−アラニル−
D−イソグルタミン(CGP 11637,nor−M
DPとする),N−アセチルムラミル−L−アラニル−
D−イソグルタミニル−L−アラニン−2−(1’−
2’−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ヒドロキ
シホスホリルオキシ)−エチルアミン(CGP1983
5A,NTP−PEとする),およびRIBI。上記R
IBIは細菌から抽出される3つの成分,モノホスホリ
ル脂質A,トレハロースジミコール酸,および細胞壁骨
格成分(NPL+TDN+CWS),を,2%スクアレ
ン/トゥイーン80乳液中に含んでいる。アジュバント
の効果は,HCV抗原配列を有する免疫原性ポリペプチ
ドに対する抗体の量を測定することによって決定され得
る。このポリペプチドは,種々のアジュバントを含むワ
クチン中のこのポリペプチドを投与することにより生じ
る。
投与され,その形態は,例えば,皮下注射であっても筋
肉注射であってもよい。他の投与形態に適当な処方には
座薬があり,場合によっては経口処方もある。座薬とし
て従来のバインダーおよび担体か用いられ得,それには
例えばポリアルキレングリコールあるいはトリグリセリ
ドがある。このような座薬は,活性成分を0.5%〜1
0%,好ましくは1%〜2%の範囲で含有する混合物か
ら形成される。経口処方物には,通常使用される賦形剤
が含有され,そのような賦形剤には例えば,製剤グレー
ドのマンニトール,ラクトース,デンプン,ステアリン
酸マグネシウム,サッカリンナトリウム,セルロース,
炭酸マグネシウムなどがある。これらの組成物は,溶
液,懸濁液,錠剤,丸剤,カプセル剤,放出を維持する
ような処方,あるいは粉剤の形態を有し,活性成分を1
0%〜95%,好ましくは25%〜70%の割合で含有
する。
形で,ワクチンに処方され得る。薬学的に受容され得る
塩には,酸付加塩(ペプチドの遊離のアミノ基により形
成される)が包含され,この塩は,無機酸(例えば,塩
酸あるいはリン酸)あるいは有機酸(例えば酢酸,シュ
ウ酸,酒石酸,マレイン酸など)を用いて形成される。
遊離のカルボキシル基により形成される塩は,無機塩基
(例えば,水酸化ナトリウム,水酸化カリウム,アンモ
ニア,水酸化カルシウム,あるいは水酸化鉄)および有
機塩基(例えば,イソプロピルアミン,トリメチルアミ
ン,2−エチルアミノエタノール,ヒスチジン,プロカ
インなど)からも誘導され得る。
効果および/または治療効果が得られる量で,投与され
る。投与される量は,一般に1回の投与あたり抗原が5
μg〜250μgであり,この投与量は治療される個
体,該個体の免疫系の抗体合成能,および所望する保護
の度合に依存する。投与に必要とされる活性成分の正確
な量は,医師の判断によるものであり,それぞれの個体
に特有であり得る。
れるか,あるいは好ましくは複数回の投与計画で与えら
れ得る。複数回の投与計画では,最初のワクチン投与
は,1〜10回に分けて行なわれ,第2回目の投与では
免疫応答維持もしくは強化するために第1回目とは別に
所定の間隔をおいて引き続いて1〜4ケ月投与され,そ
して必要であれば数ケ月後にさらに引続き投与が行なわ
れる。この投与形態はまた,少なくとも部分的には,個
人の必要量によって決定され,医師の判断による。
クチンは,他の免疫調整因子,例えば免疫グロブリンと
組み合わせて投与され得る。
の調製 上述のようにして調製される免疫原性のポリペプチド
は,ポリクローナル,および,モノクローナルの両抗体
を生産するのに用いられる。ポリクローナル抗体が所望
であれば,選択される哺乳動物(例えば,マウス,ウサ
ギ,ヤギ,ウマなど)はHCVエピトープを有する免疫
原性ポリペプチドを用いて免疫される。免疫された動物
から得られる血清は回収され,公知の方法によって処理
される。
抗体を有する血清が他の抗原に対する抗体を含んでいる
場合には,このポリクローナル抗体は免疫アフィニティ
ークロマトグラフィーによって精製され得る。ポリクロ
ーナルな抗血清を産生し,処理する手法は,当該分野で
は公知であり,例えばMayerおよびWalker
(1987)を参照されたい。
じめHCVに感染させておいた哺乳動物から単離され得
る。感染個体の血清から得られるHCVエピトープに対
する抗体を精製する方法の例は,V.E.節で述べられ
ており,これは,アフィニティークロマトグラフィーに
基づき,SODとcDNAクローン5−1−1内にコー
ドされたポリペプチドとの融合ポリペプチドを利用する
方法である。
抗体もまた,当業者により容易に生産され得る。ハイブ
リドーマによってモノクローナル抗体を作成する一般的
な方法は公知である。永久増殖性の抗体産生細胞系は細
胞融合によって作成することができ,さらに,腫瘍原性
DNAを用いたBリンパ球の直接形質転換,あるいはE
pstein−Barrウイルスを用いたトランスフェ
クションのような他の手法によってもまた作成すること
ができる。例えば,M.Schreierら(198
0);Hammerlingら(1981);Kenn
ettら(1980)の文献を参照されたい。さらに,
米国特許No.4,341,761;No.4,39
9,121;No.4,427,783;No.4,4
44,887;No.4,466,917;No.4,
472,500;No.4,491,632;およびN
o.4,493,890もまた,参照されたい。HCV
エピトープに対して産生されるモノクローナル抗体のパ
ネルは,種々の目的(例えばアイソタイプ,エピトープ
親和性など)に応じてスクリーニングされ得る。
体は,HCVエピトープに対して形成され,特に診断に
おいて有用であり,中和抗体は受動免疫治療に有用であ
る。特にモノクローナル抗体は抗イディオタイプの抗体
を生じさせるために用いられ得る。
護が望まれる感染因子の抗原の「内的イメージ(int
ernal image)」を伴う免疫グロブリンであ
る。例えば,Nisonoff,A.ら(1985)お
よびDreesmanら(1985)を参照されたい。
手法は,当該分野で公知である。例えば,Grzych
(1985), MacNamaraら(1984),
およびUytdehaagら(1985)を参照れた
い。これらの抗イディオタイプ抗体は,NANBHの治
療,およびHCV抗原の免疫原性領域を解明するのにも
有用である。
ーブおよびキット 単離されたHCV cDNAの開示部分(第1〜46図
に示される部分を包含する)を基本として用いて,約8
個あるいはそれ以上のヌクレオチドを有するオリゴマー
が切断あるいは合成によって調製され得る。このオリゴ
マーは,HCVゲノムとハイブリダイズし,このウイル
ス性因子の同定,さらにこのウイルス性ゲノムの特徴づ
け,および疾患個体のウイルスの検出に有用である。H
CVポリヌクレオチドプローブ(天然あるいは誘導され
た)は,ハイブリダイゼーションによって独特のウイル
ス配列を検出し得る長さである。6〜8個のヌクレオチ
ドが,その機能を果たし得る長さであるが,10〜12
個のヌクレオチド配列が好適であり,約20のヌクレオ
チドが最も好適であると考えられる。好ましくは,これ
ら配列は,異種性を欠いている領域由来である。これら
プローブは自動化オリゴヌクレオチド合成法を含む,定
型的な方法を用いて調製され得る。有用なプローブに
は,例えば,本明細書で開示されたクローン5−1−1
および付加的なクローン,そして,cDNAライブラリ
ーをプローブする際に有用な後述の種々のオリゴマーが
ある。HCVゲノムのどの独特な部分の相補鎖も充分使
用され得る。フラグメントの長さが長くなるにつれ完全
に相補性を有する必要はなくなるのであるが,プローブ
として使用するには完全な相補性が望まれる。
るには,血液あるいは血清のような分析されるべき生物
学的試料は,必要であれば,そこに含有されている核酸
を抽出するために処理される。この試料から得られた核
酸は,ゲル電気泳動あるいは他のサイズ分離手段にかけ
られ得る。あるいは,この核酸試料は,サイズ分離を行
うことなくドットプロットされ得る。次にこのプローブ
は標識化される。プローブを標識するための適当な標識
物,および方法は当該分野では公知であり,それには例
えば,ニックトランスレーションあるいはキナーゼ処理
で取り込まれた放射性標識物,ビオチン螢光プローブ,
および化学発光プローブが含まれる。試料から抽出され
た核酸は,次に,適当な厳密さのハイブリダイゼーショ
ン条件下で,標識されたプローブと共に処理される。
補的に作成され得る。従って,偽陽性を防ぐために,通
常,厳密性の高い条件が望まれる。しかし,プローブが
異種性を欠くウイルスゲノム領域と相補性を有する場合
のみに,厳密性の高い条件が使用される。ハイブリダイ
ゼーションの厳密さは,ハイブリダイゼーションおよび
洗浄工程中の多くの因子(温度,イオン強度,時間の長
さおよびホルムアルデヒドの濃度を含む)により決定さ
れる。これらの因子は,例えばManiatis,T
(1982)により概説されている。
体の血清中に比較的低レベル(つまり,1mlあたり約
102〜103個の配列)で,存在する。このレベルは
ハイブリダイゼーションアッセイにおいて増幅手法が用
いられることが必要であり得ることを示している。その
ような手法は当該分野では公知である。例えばEnzo
Biochemical Corporationの
「Bio−Bridge」システムでは,DNAプロー
ブに未修飾の3’−ポリ−dTテールを付加するため
に,末端デオキシヌクレオチドトランスフェラーゼを用
いている。ポリdTテールを付加したプローブは標的と
なるヌクレオチド配列にハイブリダイズされ,ついで,
ビオチン修飾ポリAにハイブリダイズされる。PCT出
願84/03520およびEPA124221には次の
ような方法のDNAハイブリダイゼーションアッセイが
記述されている:(1)被分析物を,酵素標識オリゴヌ
クレオチドに相補的な単鎖DNAプローブにアニールす
る;および(2)得られたテールが付加された二本鎖を
酵素標識オリゴヌクレオチドにハイブリダイズさせる。
EPA20451は次のような方法のDNAハイブリダ
イゼーションアッセイが記述されている。この方法で
は,分析物であるDNAを,例えば,ポリdTテールの
ようなテールを有するプローブと接触させ,次に増幅鎖
と接触させる。この増幅鎖は,プローブのテールとハイ
ブリダイズするポリA配列のような配列を有し,複数の
標識鎖を結合することが可能である。特に望ましい方法
では,まず血清中標的HCV配列が約10,000倍,
つまり約106配列/mlとなるように,標的HCV配
列の増幅が行われる。これは,例えば,Saikiら
(1986)の方法によって行なわれ得る。この増幅さ
れた配列は,ハイブリダイゼーションアッセイ法を用い
て検出され得る。このハイブリダイゼーションアッセイ
法は,本願出願人による係属中の米国出願(1987年
10月15日出願;代理人のDocket No.23
00−0171)中に記載されており,これは,参考文
献としてここに取り入れられている。106/mlのレ
ベルで配列を検出するこのハイブリダイゼーションアッ
セイ法では,単鎖の分析すべき核酸に結合し,多数の単
鎖標識オリゴヌクレオチドにも結合する核酸多量体を利
用する。標識されたポリヌクレオチドプローブを用い
る,適当な溶液相のサンドイッチアッセイ,およびプロ
ーブの調製法は,1987年6月16日に公開された本
願出願人によるEPO 225,807に記載されてお
り,これを参考文献としてここに取り入れる。
ることができる。診断用キットは,プローブDNAを有
し,このプローブDNAは標識されているか,あるいは
このプローブDNAは標識されておらず,標識用の成分
がキット中に入っている。このキットにはまた,特定の
ハイブリダイゼーションのプロトコルに必要な他の試薬
および材料(例えば,標準品,およびこのテストを行な
うための指示書)が適当に包装されて含まれる。
ット HCV抗体を含有する血清と免疫的に反応するポリペプ
チド,およびこれらのポリペプチドのHCV特異的エピ
トープに対して生じる抗体は,イムノアッセイにおい
て,例えば血液または血清試料を包含する生物学的試料
におけるHCV抗体の存在,あるいはウイルスおよび/
またはウイルス抗原の存在を検出するために有用であ
る。上記HCV抗体は,例えば,IV.A節で記載され
たクローン由来であり,あるいは,このクローン内にコ
ードされ,そしてそれらの複合体である。上記HCV特
異的エピトープに対して生じる抗体については,例え
ば,IV.E節を参照されたい。このイムノアッセイの
設計は多くの変更を行うことが可能であり,これらアッ
セイの多様性については当該分野では既知である。例え
ば,このイムノアッセイでは,1種のウイルス抗原が利
用され得る。このウイルス抗原は,例えば,IV.A節
で記載のHCV cDNAを有するクローンのいずれか
由来のポリペプチド,あるいはこれらクローンのcDN
A由来の複合cDNA由来のポリペプチド,あるいはこ
れらのクローンのcDNAが誘導されるHCVゲノム由
来のポリペプチドである。あるいは,このイムノアッセ
イには,これらの源由来のウイルス抗原の組合せが用い
られ得る。例えば,ウイルスのエピトープに対する1種
のモノクローナル抗体,ひとつのウイルスの抗原に対す
るモノクローナル抗体の組み合わせ,異なるウイルス抗
原に対する複数のモノクローナル抗体,同一のウイルス
抗原に対するポリクローナル抗体,あるいは異なるウイ
ルス抗原に対するポリクローナル抗体が使用され得る。
プロトコルは,例えば,競合分析法,直接分析法,ある
いはサンドイッチタイプ分析法を基本とすることができ
る。このプロトコルではまた,固体支持体を用いるか,
あるいはこのプロトコルは,免疫沈澱法であり得る。ほ
とんどのアッセイは標識化抗体あるいはポリペプチドの
使用を含む。この標識物には例えば,螢光分子,化学発
光分子,放射性分子あるいは染色分子がある。このプロ
ーブからのシグナルを増幅するアッセイもまた公知であ
る。その例としては,ビオチンおよびアビジンを利用す
るアッセイ,および酵素標識および酵素媒介イムノアッ
セイ(例えば,ELISAアッセイ)がある。
リオンの構造タンパクに対する診断用エピトープの位置
の推定が可能となる。C, プレM,MおよびEドメイ
ンはすべて,ウイルス抗原を検出するために,特に診断
用に,有意な可能性のあるエピトープを含有していると
考えられる。同様に,非構造タンパクのドメインは,重
要な診断用エピトープ(例えば,推定のポリメラーゼを
コードするNS5;および推定の補体結合抗原をコード
するNS1)を有することが予想される。これらの特異
的ドメイン由来のエピトープを有する組換えポリペプチ
ドあるいはウイルスのポリペプチドは,感染血液提供お
よび感染患者におけるウイルス杭体の検出に有用であ
る。
する抗体がNANBHによって引き起これるHCV患者
および感染血液提供者のウイルス抗原を検出するイムノ
アッセイにおいて用いられ得る。さらに,これら抗体は
急性期のドナーおよび患者を検定するのに非常に有用で
ある。
有するキットが,適切な材料を適当な容器中に包装する
ことによって得られる。この適切な材料には,HCVエ
ピトープを有する本発明のポリペプチド,あるいはHC
Vエピトープに対する抗体,およびアッセイの遂行に用
いられる他の試薬および物質,さらにアッセイの指示書
のセットを含む。
Aのプローブを用いた,HCVゲノム,ビリオンおよび
ウイルス抗源の他の特性決定 IV.A.節に記載したクローンのHCV cDNA配
列の情報は,第1図〜第46図に示すように,HCVゲ
ノムの配列とHCV因子の同定と単離とについての情報
をさらに得るために用いられ得,その結果,ゲノムの性
質,ウイルス粒子の構造,およびウイルスが有する抗原
の性質を含めたウイルスの特性決定の助けになる。さら
に,この情報によって,付加的なポリヌクレオチドプロ
ーブ,HCVゲノム由来のポリペプチド,およびHCV
が原因のNANBHの診断および/または治療に有用な
HCVエピトープに対応する抗体が得られるようにな
る。
V.A節に記載されたクローンのcDNAの起源である
HCVゲノムの未確定領域由来の他のcDNA配列を単
離するためのプローブを設計するのに有用である。例え
ば,約8個またはそれ以上,好ましくは20個またはそ
れ以上のヌクレオチドの配列を有する標識化プローブ
は,第1,第3,第6,第9〜10,第15〜17およ
び第40〜46図に示すHCV cDNA配列の群の
5’末端または3’末端に近い領域由来のものであり,
HCV cDNAライブラリーから重複cDNA配列を
単離するのに用いられ得る。上記クローンのcDNAと
重複するこれらの配列は,上記クローンのcDNAの起
源でないゲノムの領域由来の配列も含んでいるが,I
V.A節に記載のクローンのcDNAと必らずしも重複
しない,他の重複断片を同定するためのプローブを合成
するのに利用することができる。HCVゲノムが切断さ
れ,そのセグメントが共通の配列を欠いていなければ,
ウイルスゲノム由来の重複cDNAを単離する技術を利
用して,全ウイルスゲノムの配列を決定することができ
る。これとは異なり,ゲノムが切断されていて共通配列
を欠いている場合は,ゲノムの配列は,IV.A節に記
載したクローンの単離および配列決定の技術を用い,ク
ローン5−1−1を単離するのに用いたのと同様に,λ
gt11 HCVライブラリーを血清学的にスクリーニ
ングし,cDNA単離物の配列を決定し,単離されたc
DNAを利用して重複断片を単離することによって,決
定することができる。あるいは,ゲノムセグメントの特
性決定は,精製されたHCV粒子から単離されたウイル
スゲノムで行うことができる。HCV粒子を精製し,精
製中の粒子を検出する方法は後述する。ポリヌクレオチ
ドのゲノムのウイルス粒子からの単離工程は,当該技術
分野では公知であり,利用される一方法を実施例IV.
A.1.に示す。単離されたゲノムのセグメントは,次
に,クローン化され配列決定され得る。このように,こ
こで提供される情報によって,その性質にかかわりな
く,HCVゲノムをクローン化し配列を決定することが
できる。
当該技術分野では公知であり,すでに記載し,あるいは
後で述べられる。λgt11内にHCV cDNAライ
ブラリーを構築する方法は,IV・A・節ですでに述べ
られている。しかし,核酸プローブでスクリーニングす
るのに有用なcDNAライブラリーもまた,当該技術分
野で公知の他のベクター内,例えばλgt10〔ヒュイ
ンら(Huynh et al),1985年〕内で構
築することができる。第1〜46図のcDNA由来のプ
ローブ,およびこれらcDNA由来のポリヌクレオチド
から合成されたプローブによって検出された,HCV由
来のcDNAは,単離されたポリヌクレオチドを,適当
な制限酵素で切断することによって,クローンから単離
し,配列を決定することができる。例えば,クローン5
−1−1中のHCV cDNAと重複するHCV cD
NAの単離と配列決定とに使用される手法については,
IV.A.3節およびIV.A.4節を;クローン81
中のHCV cDNAと重複するHCV cDNAの単
離と配列決定とについては,IV.A.5〜IV.A.
7節を;そして,他のクローン(クローン36)および
クローン81と重複するクローンの単離と配列決定とに
ついては,IV.A.8節およびIV.A.9節を参照
されたい。
情報は,ウイルスゲノム内の相同領域と異なる領域とを
決定するのに有用であり,このことにより,異なる種類
のゲノムおよび/または欠陥粒子(defective
particles)の集団の存在を示すことができ
る。II.G.節に記載の手法を利用して,HCVの単
離(後述する)中に,生物学的試料中のHCV,HCV
抗原またはHCV核酸を検出することはまた,ハイブリ
ダイゼーションプローブを設計するのに有用である。さ
らに,重複cDNAは,クローン5−1−1,36,8
1,91および1−2内ならびにIV.A.節に記載の
他のクローン内にコードされているポリペプチドをコー
ドするHCVゲノム由来のポリペプチドの発現ベクター
を作製するのに利用できる。HCVエピトープを有する
これらのポリペプチドを作製する技術と,ポリペプチド
に含有されているHCVエピトープに対応する抗体とそ
の用途に関する技術とは,クローン5−1−1,32,
35,36,1−2,81および91に含まれるNAN
BV cDNA配列由来のポリペプチドについて記載さ
れ,すでに検討されまた後にも検討される技術と類似す
る。
81,91,1−2およびIV.A.節に記載の他のク
ローンに含まれているcDNA配列の群内に,HCVに
特有のものと考えられるエピトープを含有する抗原がコ
ードされている。つまり,これらの抗原に対する抗体が
HAVもしくはHBVに感染した個体に欠けており,そ
してHCVに感染していない個体に欠けている(IV.
B.節に示す血清学的データ参照)。さらに,これらの
cDNAの配列情報と,HAV,HBV,HDVの配列
および遺伝子バンクのゲノム配列とを比較すると,これ
らのcDNAと上記の起源のポリヌクレオチドの配列と
には最小の相同性が存在することが示されている。この
ように,これらクローンのcDNA内にコードされてい
る抗原に対する抗体は,感染した個体から単離したBB
−NANBV粒子を同定するのに用いることができる。
さらに,この抗体は,NANBH因子の単離にも有用で
ある。
た個体由来の血清または細胞培養物から,以下のような
当該技術分野で公知の方法で単離することができる。公
知の方法としては,例えば,沈降法もしくは排除法のよ
うなサイズ識別に基づく方法;密度勾配による超遠心分
離法のような密度に基づく方法;ポリエチレングリコー
ルのような試薬による沈澱法;またはアニオンもしくは
カチオン交換物質,疎水性によって結合する物質のよう
な種々の物質およびアフィニティカラムのカラムによる
クロマトグラフィー法がある。この分離工程中に,HC
Vの存在は次のような方法で検出できる。すなわち,先
に述べたHCV cDNA由来のプローブを用いて,抽
出されたゲノムをハイブリダイゼーション分析する方
法;または第1〜46図に示すcDNA配列の群内にコ
ードされたHCV抗原に対する抗体および先に述べた重
複HCV cDNA配列内にコードされたHCV抗原に
対する抗体をプローブとして用いる免疫検定法(II.
I.節参照)がある。抗体はモノクローナル抗体であっ
てもポリクローナル抗体であってもよく,免疫検定法に
これら抗体を使用する前に精製することが望ましい。ク
ローン5−1−1内にコードされた抗原に対するポリク
ローナル抗体の精製法は,IV.E.節に記載されてい
るが,類似の精製法を,他のHCV抗原に対する抗体に
利用することができる。
ドされたHCV抗原とに対する抗体は,固体の支持体に
固定されており,免疫アフィニティクロマトグラフィー
によるHCVの単離に有用である。免疫アフィニティク
ロマトグラフィーの手法は,当該技術分野で知られてお
り,例えば,抗体を固体の支持体に固定しその免疫選択
活性を保持する方法がある。この方法には,抗体が支持
体に吸着されている方法〔例えば,カースタック(Ku
rstak)のENZYME IMMUNODIAGN
OSIS,31〜37頁参照〕および抗体が支持体と共
有結合されている方法がある。一般に,これらの方法
は,抗原を固体支持体に共有結合させて使用する方法と
同様であり,それはII.C.節に概略記載されている
が,スペーサー茎が二官能性のカップリング試薬に含ま
れ,抗体の抗原と結合する部位が近づきやすいようにな
っている。
べた第1〜46図に示すHCV cDNA配列の群およ
び重複HCV cDNA配列由来のポリヌクレオチドを
プローブとして利用する核酸ハイブリダイゼーション法
によって検出および/または確認される。この場合,画
分は,ウイルス粒子の崩壊を起こすような条件下で,例
えば,キレート試薬の存在下およびII.H.節にも記
載したハイブリダイゼーション法によって検出されるウ
イルス核酸の存在下で,界面活性剤によって処理され
る。単離された粒子がHCVを誘発する因子であるとい
うことは,単離されたウイルス粒子をチンパンジーに感
染させ,次いでNANBHの徴候が感染によるものであ
るか否かを決定することによって確認することができ
る。
粒子は,さらに特性決定される。そのゲノム核酸が精製
された。このゲノム核酸がRNaseに対して感受性で
DNase Iに感受性でないことから,そのウイルス
がRNAゲノムで構成されていることが明らかである
(後述のIV.C.2.節参照)。そのゲノム核酸のス
トランドの状態(strandedness)および円
形性(circu larity)であるか非円形性で
あるかということは,公知の技術,例えばそれを電子顕
微鏡により視覚化すること,密度勾配により移動させる
こと,および沈降特性を調べることによって測定され
る。捕捉されたHCVゲノムがHCV cDNAの負の
フトランドとハイブリダイズすることから,HCVは正
のストランドのRNAゲノムを含むことが明らかである
(IV.H.1節参照)。このような手法は,例えば,
METHODS IN ENZYMOLOGYに記載さ
れている。さらに,精製された核酸は,クローン化さ
れ,公知の方法(例えば,ゲノム物質はRNAなので逆
転写法)によって配列を決定することができる。例え
ば,マニアティス(1982年),およびグローバー
(Glover)(1985年)の文献を参照された
い。ウイルス粒子由来の核酸を利用すれば,それが切断
されていてもいなくても,全ゲノムの配列を決定するこ
とができる。
29〜34図参照)の連続ORF内にコードされたポリ
ペプチドの相同性の試験を行うと,HCVポリペプチド
が,フラビウイス(flaviviruses)の保存
された領域内の対応するタンパクと相同性のある領域を
有することが示される。この具体例は,IV.H.3.
節に示されている。この知見には,多くの重要な効果が
ある。第1に,この情報は,HCVが正のストランゲノ
ムを有し,その大きさが約10,000ヌクレオチドで
あることを示す試験結果とともに,HCVがフラビウイ
ルスかまたはフラビ様ウイルスであることを示唆してい
ると考えて矛盾しない。一般に,フラビウイルスのビリ
オンとゲノムとは,比較的変化しない構造と組織を有
し,このことは公知である。ライスら(Rice et
al)(1986年),およびブリントン エム エー
(Brinton M.A.),(1988年)を参照
されたい。従って,ポリペプチドC.プレM/Mおよび
Eをコードする構造遺伝子は,クローン14iの上流の
遺伝子の5’末端に位置し得る。さらに,他のフラビウ
イルスと比較することによって,これらのタンパクをコ
ードする配列の正確な位置を予想することができる。
離は,本明細書に示した多くの方法により達成され得,
そのことは,当業者に自明である。例えば,ゲノム“ウ
ォーキング法(genome“Walking”tec
hnique)が,クローン14i内のゲノムの5’側
にありそのクローンと重複する他の配列を単離するのに
用いられ得るが,この方法によって,付加的な配列の単
離が行われる。この手法は,後述のIV.A.節で十分
に述べられている。例えば,フラビウイルスは,保存さ
れたエピトープと保存された核酸配列の領域とを有する
ことが知られている。保存された配列を含むポリヌクレ
オチドは,HCVゲノムを捕捉するプローブとして用い
て,それを単離することができる。さらに,これらの保
存された配列は,第25図に示すHCV cDNA由来
の配列とともに,ポリメラーゼの連鎖反応の技術を用い
て,クローン14iの配列の上流のゲノム配列を増幅す
る系に使用するプライマーを設計するのに利用される。
この例は後述される。
が単離され得る。その形態と大きさは,例えば電子顕微
鏡によって決定され得る。コート抗原もしくはエンベロ
ープ抗原のような特異的なウイルスポリペプチド抗原,
または核酸結合タンパク,コア抗原のような内部抗原,
およびポリヌクレオチドポリメラーゼの同定と位置決定
とは,例えば,抗原が大きなもしくは小さなウイルス成
分として存在するか否かを測定すること,および単離さ
れたcDNA内にプローブとしてコードされた特異的抗
原に対する抗体を利用すること,によって行なわれ得
る。この情報は,ワクチンを設計するのに有用である。
例えば,ワクチン調製物に外部抗原を含有させることが
好ましい。多価ワクチン(multivalent v
accine)は,例えばEのような構造タンパクをコ
ードするゲノム由来のポリペプチド,および例えば非構
造ポリペプチドもしくは構造ポリペプチドのような,ゲ
ノムの別の部分由来のポリペプチドで構成されていても
よい。
物モデル系 HCVがフラビウイルスもしくはフラビ様ウイルスであ
るという示唆によって,HCV増殖法についての情報が
提供される。“フラビ様”という用語は,そのウイルス
が,フラビウイルスの公知の保存された領域に対して有
意の相同性を示し,そして,そのゲノムの大部分が単一
のORFであることを意味する。フラビウイルスの培養
法は,当業者に公知である〔例えば,ブリントン(19
86年)およびストラー,ブイ(Stollar,
V.)(1980年)の総論を参照されたい〕。一般
に,HCVを培養するのに適切な細胞もしくは細胞とし
ては,フラビウイルスの複製を維持することが知られて
いるもの,例えば次のものがある:サル腎臓細胞系(例
えば,MK2,VERO);ブタの腎臓細胞系(例え
ば,PS);ベビーハムスターの腎臓細胞系(例えば,
BHK);ネズミマクロファージ細胞系(例えば,P3
88D1,MK1,Mm1);ヒトマクロファージ細胞
系(例えば,U−937);ヒト末梢白血球;ヒトの付
着性単球;肝細胞もしくは肝細胞系(例えば,HUH
7,HEPG2);胚もしくは胚細胞系(例えば,ニワ
トリの胚繊維芽細胞);または無脊椎動物由来の細胞
系。 上記無脊椎動物由来の細胞系として好ましいのは
昆虫由来のもの(例えば,ショウジョウバエの細胞系)
であり,さらに好ましいのは節足動物由来のもので,例
えば蚊の細胞系〔例えば,A.アルボピクツス(A.A
lbopictus),イーデス イージプチー(Ae
des aegypti),クーテックス トリテニオ
リンクス(Cutex tritaeniorhync
hus)〕もしくはダニ細胞系〔例えば,RML−14
ダーマセンター パルマペルツス(Dermacen
tor parumapertus)〕である。
せてもよいし,あるいは肝細胞培養物を感染した個体
(例えば,ヒトもしくはチンパンジー)の肝臓から得て
もよい。後者の場合は,生体内で感染した細胞が生体外
で継代された例である。さらに,種々の永久増殖細胞化
法を,肝細胞培養物由来の細胞系を得るために用いるこ
とができる。例えば,一次肝臓培養物(肝細胞集団の集
積の前後)は,種々の細胞と融合され,安定性を保持す
る。例えば,永久的または半永久的細胞系を創製するた
めに,培養物を,形質転換ウイルスに感染させるか,ま
たは形質転換遺伝子でトランスフェクトさせる。さら
に,例えば,肝臓培養物中の細胞は,融合されて,確立
された細胞系(例えば,HepG2)となり得る。細胞
融合法は,当該技術分野で既知であり,例えば,ポリエ
チレングリコール,センダイウイルスおよびエプスタイ
ン−バールウイルスのような融合因子が使用される。
ルスもしくはフラビ様ウイルスである。従って,細胞系
のHCV感染は,おそらく,細胞をフラビウイルスに感
染させる当該技術分野で公知の方法によって達成するこ
とができる。これらの方法には,例えば,細胞内にウイ
ルスが侵入しうる条件下で,細胞をウイルス調製物とと
もにインキュベートする方法がある。さらに,細胞を単
離されたウイルスポリヌクレオチドでトランスフェクト
することによってウイルスの産生物を得ることができ
る。トガウイルス(Togavirus)およびフラビ
ウイルスのRNAが,種々の脊椎動物の細胞系〔フェフ
ァーコーン(Pfefferkorn)およびシャピロ
(Shapiro),1974年〕および蚊細胞系〔ペ
レーグ(peleg),1969年〕に感染性であるこ
とが知られている。組織培養細胞を,RNA二本鎖,正
のストランドのRNAおよびDNA(cDNAを含む)
でトランスフェクトする方法は,当該技術分野では公知
であり,例えば,エレクトロポーレーション法(ele
ctroporation),およびDEAE−デキス
トラン(DEAE−Dextran)もしくはリン酸カ
ルシウムによる沈降法を用いる手法がある。HCV R
NAの多くの起源を,完全ゲノムに対応するHCV c
DNAの転写を生体外で行うことによって得ることがで
きる。この物質もしくはクローン化されたHCV cD
NAを用いたトランスフェクションによって,ウイルス
が複製されそしてウイルスが生体外で増殖するようにな
るはずである。
ス複製に使用できるが,フラビウイルスが動物系に存在
するということは,当業者には公知である〔例えば,モ
ナース(Monath)による総説(1986年)参
照〕。従って,HCVの複製は,チンパンジーで起こる
だけでなく,例えば,マーモセットやサックリングマウ
スでも起こる。
スクリーニング HCVの細胞培養物と動物モデル系とを利用することに
よって,HCVの複製を阻害する抗ウイルス剤,特に優
先的に細胞を生育・増殖させる一方でウイルスの複製を
阻害する抗ウイルス剤をスクリーニングすることができ
る。これらのスクリーニング法は,当業者には知られて
いる。一般に,抗ウイルス剤は,ウイルスの複製を維持
する細胞培養系でウイルスの複製を阻害する効果と,動
物モデル系での感染性もしくはウイルス病原性を阻害す
る効果(および低レベルの毒性)について種々の濃度で
試験される。
出するためのここに記載された方法と組成物は,ウイル
ス複製に対する抗ウイルス剤の効果を検出する方法とし
て,細胞プラーク検定法もしくはID50検定法の代わ
りにこれらの方法よりもおそらく高感度の方法を提供す
ることから,抗ウイルス剤のスクリーニングに有用であ
る。例えば,ここに記載したHCVポリヌクレオチドプ
ローブは,細胞培養で産生されたウイルス核酸を定量す
るのに利用できる。このことは,例えば感染した細胞の
核酸と標識したHCVポリヌクレオチドプローブとのハ
イブリダイゼーションまたは競合ハイブリダイゼーショ
ンによって達成することができた。例えば,また抗HC
V抗体は,本明細書に記載の免疫検定法を利用して細胞
培養物中のHCV抗原を同定および定量するのに利用で
きる。さらに,感染細胞の培養物中のHCV抗原を競合
検定法で定量することは望ましいことであるから,本明
細書に記載したHCV cDNA内にコードされたポリ
ペプチドは,これらの競合検定法に有用である。一般
に,HCV cDNA由来の組換え体HCVポリペプチ
ドに標識化し,この標識化ポリペプチドとHCVポリペ
プチドとの結合が細胞培養系内に産生された抗原によっ
て阻害されるのを監視する。さらに,これらの方法は,
HCVが細胞系内で細胞死を起こすことなく複製できる
場合,特に有用である。
デル系を利用して弱毒化されたHCV株を単離すること
ができる。これらの株は,ワクチン用もしくはウイルス
抗原単離用に適している。弱毒化ウイルス株は,細胞培
養および/または動物モデルでの複数の継代の後に単離
可能である。感染した細胞もしくは固体の弱毒化株の検
出は,当該技術分野で公知の方法で達成できる。それに
は,例えば,HCVにコードされたひとつまたはそれ以
上のエピトープに対する抗体をプローブとして用いるこ
と,あるいは,少なくとも約8個のヌクレオチドのHC
V配列を含むポリヌクレオチドをプローブとして用いる
ことが包含される。その代わりにあるいはそれに加え
て,弱毒化株は,本明細書に記載のHCVのゲノム情報
と,組換え技術を利用して構築することができる。一般
に,例えば病原に関連するポリペプチドをコードするが
ウイルスの複製は可能であるようなゲノム領域を除去す
ることを試みることができる。さらに,このゲノム構築
によって,HCVに対する抗体の中和を起こさせるエピ
トープの発現が可能になる。次いで,変化させたゲノム
は,HCV複製が可能な細胞と,ウイルス複製が可能な
条件下で増殖する細胞を形質転換するのに利用できる。
弱毒化HCV株は,ワクチン製造のみならずウイルス抗
原の商業的生産ソースとしても有用である。その理由
は,これらウイルスの処理が,ウイルス生産を行う従業
員に対してそれほど厳重な保護対策をとらなくてもよい
からである。
調製とプロービング,クローンの配列決定,発現ベクタ
ーの構築,細胞の形質転換,ラジオイムノアッセイおよ
びELISA検定法のような免疫検定の実施,培地での
細胞の培養などに用いられる一般的な方法は,当該技術
分野で公知であり,これらの方法を記載した実験室のマ
ニュアルを入手することができる。しかし,一般的な指
針として,上記の方法およびこれを実施するのに有用な
材料を現在入手できるいくつかの出所を以下に述べる。
る適切な制御配列が用いられた場合に,所望のコード配
列の発現に用いることができる。原核細胞宿主のうち,
エシェリヒア コリ(E. coli)が最も汎用され
る。原核細胞の発現制御配列には,必要に応じてオペレ
ーター部分を有するプロモーター,およびリボソーム結
合部位が含まれている。原核細胞の宿主に適合するトラ
ンスファーベクターは,通常,例えば次のようなものに
由来する。つまリ,アンピシリンおよびテトラサイクリ
ンに対する耐性を与えるオペロンを有するプラスミドで
あるpBR322および抗生物質耐性のマーカーを与え
る配列を有する種々のpUCベクター由来である。これ
らのマーカーは,適宜選択することによって,好適な形
質転換細胞を得るのに利用できる。通常用いられる原核
細胞の制御配列には,β−ラクタマーゼ(ベニシリナー
ゼ)およびラクトースプロモーター系〔チャンら(Ch
ang etal),1977年〕,トリプトファン
(trp)プロモーター系〔ゴーデルら(Goedde
l etal),1980年〕およびλ由来PLプロモ
ーターおよびN 遺伝子リボソーム結合部位〔シマタケ
ら(Shimatake et al), 1981
年〕,およびtrpおよびlacUV5 プロモーター
の配列由来のハイブリツドtac プロモーター〔ド
ボールら(De Boer et al),1983
年〕がある。上記の系は,特にE. coliに適合す
る。必要であれば,バシラスもしくはシュードモナス属
の菌株のような他の原核宿主を,対応する制御配列とと
もに用いてもよい。
哺乳動物の細胞がある。サッカロミセス セレビシエ
(Saccharomyces cerevisia
e)およびサッカロミセス カールスベルゲンシス(S
accharomyces carlsbergens
is)が最も普通に用いられる酵母宿主であり,便利な
真菌宿主である。酵母に適合するベクターは,栄養要求
突然変異体に原栄養性を与えるかまたは野生型菌株に重
金属に対する耐性を与えることによって成功裏に形質転
換された形質転換体を選択することができるようにする
マーカーを保有する。酵母に適合するベクターとして
は,2ミクロンの複製起源〔ブローチら(Broach
et al),1983年〕,CEN3およびARS
1の組み合わせ,または確実に複製を行わせる他の手段
(例えば,適切なフラグメントを宿主細胞のゲノムに組
込ませるような配列を採用することができる。酵母ベク
ターの制御配列は,当該技術分野で公知であり,解糖酵
素合成のプロモーター〔ヘスら(Hess et a
l),1968年;ホーランドら(Holland e
tal),1978年〕を含み,このようなプロモータ
ーには,3−ホスホグリセリン酸キナーゼ〔ハイツマン
(Hitzeman),1980年〕に対するプロモー
ターが含まれる。ターミネーターには,例えばエノラー
ゼ遺伝子由来のターミネーター〔ホーランド(Holl
and),1981年〕が含まれ得る。特に有用な制御
系は,グリセルアルデヒド3−リン酸脱水素酵素(GA
PDH)プロモーターもしくはアルコール脱水素酵素
(ADH)調節性プロモーター,GAPDH由来のター
ミネーター,および分泌が所望の場合には,酵母α因子
由来のリーダー配列を含む系である。さらに,作動可能
に連結されている転写調節領域および転写開始領域は,
野生型生物に本来関係しないものであってもよい。これ
らの系については,欧州特許公開第120,551号
(1984年10月3日公開);同第116,201号
(1984年8月22日公開);および同第164,5
56号)(1985年12月18日公開)に詳細に記載
されており,これらはすべて本発明の出願人によるもの
であり,本願に引用文献として記載する。
の細胞系は当該技術分野で知られており,the Am
erican Type Culture Colle
ction(ATCC)から入手可能な多くの永久増殖
化細胞系がある。それには,Hela細胞,チャイニー
ズハムスター卵巣(CHO)細胞,ベビーハムスター腎
臓(BHK)細胞および多くの他の細胞系がある。哺乳
類の細胞に対する適切なプロモーターも当該技術分野で
は公知であり,それには,シミアンウイルス40(Si
mian Virus)(SV40)〔フィアース(F
iers),1978年〕,ラウス肉腫ウイルス(RS
V),アデノウイルス (ADV)およびウシ乳頭腫ウ
イルス(BPV)由来のプロモーターのようなウイルス
プロモーターが含まれる。哺乳類細胞はまた,ターミネ
ーター配列およびポリA付加配列を必要とし,発現を増
大させるエンハンサー配列も含まれ,そして,遺伝子の
増幅を引き起こす配列も望ましい。これらの配列は当該
技術分野で公知である。哺乳類の細胞で複製させるのに
適切なベクターには,ウイルスレプリコン,またはNA
NBVエピトープをコードする適当な配列を宿主ゲノム
に確実に組込む配列が含まれる。
知のいずれの方法によっても行なわれ得る。それには例
えば,ポリヌクレオチドをウイルスにパッケージング
し,次いでそのウイルスを宿主細胞に形質導入する方法
およびポリヌクレオチドを直接取込む方法がある。使用
される形質転換法は,形質転換すべき宿主に依存する。
例えば,E. coli宿主細胞を,BB−NANBV
配列を有するλgt11で形質転換することが後述の実
施例の項で述べられている。直接取込み法による細菌の
形質転換には,一般に,塩化カルシウムまたは塩化ルビ
ジウムによる処理が用いられる〔コーヘン(Cohe
n),1972年;マニアティス,1982年〕。直接
取込み法による酵母の形質転換は,ヒネンら(Hinn
en et al),1978年,の方法を用いて行わ
れ得る。直接取込み法による哺乳類の形質転換は,グラ
ハム(Graham)およびファン デル エブ(Va
nderEb)1978年,のリン酸カルシウム沈澱法
またはこの方法の種々の公知の改変法を用いて行われ得
る。
られる。部位特異的なDNAの切断が,適切な制御酵素
を用い,これら市販の酵素のメーカーによって一般に規
定されている条件下で処理することによって,実施され
る。一般に,約1μgのプラスミドもしくはDNA配列
は,約20μlの緩衝溶液中で1単位の酵素を用いて3
7℃の条件下で1〜2時間インキュベートすることによ
り切断される。制限酵素とともにインキュベートした
後,タンパクを,フェノール/クロロホルムによって抽
出して除去し,エタノールで沈澱させてDNAが回収さ
れる。切断断片は,Methods in Enzym
ology,65巻,499〜560頁,1980年,
に記載された一般的な方法に従って,ポリアクリルアミ
ドもしくはアガロースゲルを用いた電気泳動法により分
離することができる。
在する適当なデオキシヌクレオチドトリホスフェート
(dNTP)の存在下で,E. coli DNAポリ
メラーセI(クレノー)を用いて平滑末端とされ得る。
S1ヌクレアーゼによる処理も行なわれ得,一本鎖DN
A部分の加水分解が行われる。
準の緩衝液および温度条件下で連結反応が行われる。粘
着末端の連結には,平滑末端の連結よりも,ATPおよ
びリガーゼの必要量が少い。ベクター断片が連結混合物
の一部として用いられる場合には,ベクター断片は,細
菌アルカリホスファターゼ(BAP)または子ウシ腸ア
ルカリホスファターゼで処理され,5’末端のリン酸を
除去して,ベクターの再連結を防止することが多い。あ
るいは,不必要な断片の制限酵素による切断を利用して
連結を防止するのに利用することができる。
切なクローニング宿主に形質転換され,次いで,例え
ば,抗生物質耐性によって成功裏に形質転換された形質
転換体が選択され,そして正しい構築物がスクリーニン
グされる。
(1984年)が発表した自動オリゴヌクレオチド合成
装置を用いて調製され得る。必要に応じて,合成DNA
鎖は,反応の標準条件を用いて,32P−ATPの存在
下,ポリヌクレオチドキナーゼで処理することによって
32Pで標識化され得る。
単離されたものも含めて,公知の方法で修飾することが
できる。そのような方法としては,例えば,ゾラー(Z
oller)(1982年)が発表した部位特異的変異
誘発法がある。概略を述べると,修飾すべきDNAを,
一本鎖配列としてファージにパッケージングし,次にプ
ライマーとして,修飾すべきDNAの部分に相補的であ
り,それ自体の配列内に所望の修飾が含まれている合成
オリゴヌクレオチドを用いて,DNAポリメラーゼで二
本鎖DNAに変換する。得られた二本鎖DNAは,ファ
ージを保持する宿主細菌に形質転換される。形質転換さ
れた細菌の培養物(ファージの各鎖の複製物を含む)
は,寒天にプレートされてプラークが得られる。理論的
には,新しいプラークの50%が,変異した配列を有す
るファージを含有し,残りの50%はもとの配列を有す
る。プラークのレプリカは,正しいストランドとハイブ
リダイゼーション可能であり,かつ未修飾の配列とはハ
イブリダイゼーションを行わない温度および条件下で,
標識化された合成プローブとハイブリダイゼーションを
行なう。ハイブリダイゼーションにより同定された配列
は,回収されクローン化される。
ゼーション DNAライブラリーは,グリンスタイン(Grunst
ein)およびホッグネス(Hogness)(197
5年)の方法を用いてプローブ化され得る。簡単にのべ
れば,この方法においては,プローブ化されるべきDN
Aは,ニトロセルロースフィルタ上に固定され,変性さ
れ,そして,0〜50%ホルムアミド,0.75M N
aCl,75mM クエン酸ナトリウム,各々0.02
%(wt/v)のウシ血清アルブミン,ポリビニルピロ
リドンおよびフィコール,50mMリン酸ナトリウム
(pH6.5),0.1%SDS,そして100μg/
mlキャリヤーの変性DNAを含有する緩衝液で,プレ
ハイブリダイゼーションが行われる。緩衝液中のホルム
アミドの濃度(%),およびプレハイブリダイゼーショ
ンおよびこれに続くハイブリダイゼーション工程の時間
と温度条件は,必要とされる厳密さに依存する。厳密さ
がそれほど必要ではない条件下でのオリゴマーのプロー
ブは,一般に,ホルムアミドが低い濃度であり,低温お
よび長いハイブリダイゼーションの時間で用いられる。
cDNAもしくはゲソムの配列由来のような30もしく
は40を越えるヌクレオチドを有するプローブを用いる
ときには,−般に,例えば,約40〜42℃のような高
温,および50%ホルムアミドのような高濃度が採用さ
れる。プレハイブリダイゼーションに続いて,5’末端
32Pで標識したオリゴヌクレオチドプローブを緩衝液
に添加し,この混合物中で,ハイブリダイゼーションの
条件下にて,上記フィルターをインキュベートする。洗
浄後,処理されたフィルターをオートラジオグラフィー
に付すとハイブリダイズしたプローブの位置が示され
る。もとの寒天プレート上の,対応する位置のDNAを
所望のDNAの起源として利用する。
定 常套手段により,ベクターを構築する際には,連結混合
物を用いてE. coli HB101株もしくは他の
適当な宿主を形質転換し,成功裏に形質転換された形質
転換体は,抗生物質耐性もしくは他のマーカーによって
選択される。次に,得られた形質転換体から,プラスミ
ドが,クレウェルら(Clewellet al.)
(1969年)の方法により調製され,通常,さらに,
クロラムフェニコールによる増幅(クレウェル,197
2年)が行なわれる。そのDNAは,単離され,通常,
制限酵素分析法および/または配列決定法により分析さ
れる。配列決定は,サンガー(Sanger)ら(19
77)の,そしてさらにメシング(Messing)ら
により述べられた(1981年),ジデオキシ法,ある
いはマキシムらの方法(1980年)により実施され得
る。GCに富んだ領域において時おり観察されるバンド
コンプレッションの問題は,バールら(Barr et
al)(1986年)の方法に従って,T−デアゾグ
アノシン(deazo−guanosine)を用いる
ことによって克服された。
定法(ELISA法) ELISA法は,抗原もしくは抗体のいずれかの濃度を
測定するのに利用され得る。この方法は,酵素と,抗原
もしくは抗体との結合に依存し,定量の標識として,結
合した酵素の活性を用いる。抗体を測定するには,既知
の抗原を固相(例えば,マイクロプレートまたはプラス
チック製カップ)に固定し,被検血清の希釈物とともに
インキュベートし,洗浄し,酵素で標識した抗免疫グロ
ブリンとともにインキュベートし,再び洗浄する。標識
化するために好適な酵素は,当該技術分野で公知であ
り,例えば,西洋ワサビベルオキシダーゼがある。固相
に結合した酵素活性は,特異的な基質を添加し,そして
生成物の生成または基質の利用率を比色法で測定するこ
とによって測定される。結合した酵素の活性は,結合し
た抗体の量の一次関数である。
固相に固定し,抗原を含む被検物質を添加し,インキュ
ベートした後,固相を洗浄し,第2の酵素で標識した抗
体を添加する。洗浄後,基質を添加し,次いで酵素活性
を比色法で測定し,抗原濃度に換算する。
の実施例は説明のみを目的として提供するのであって,
本発明の範囲を制限するものではない。本発明の開示内
容を考慮すると,特許請求の範囲内の多くの実施態様が
当業者に明らかである。例ば,IV.A.節に述べる方
法は,もし望まれるならば繰り返し得るが,特にその必
要はない。なぜなら,本発明により提供される情報に基
づいた所望のヌクレオチド配列の構築のための技術が使
用可能であるためである。発現はE. coliで例示
されているが,III.A.節でより十分に述べたよう
な他の系も使用され得る。ゲノム構造に由来する付加的
なエピトープも生産され得,以下に述べるように抗体を
生産するのに用いられる。
および配列決定 IV.A.1HCV cNAD調製 NANB因子の原材料は,慢性NANBHのチンバンジ
ーから得た血漿プールであった。このチンパンジーは,
プールしたヒト血清由来の第8因子濃縮物混入バッチ中
のHCVで感染させて得られる別の慢性NANBのチン
パンジー由来の血液で,実験的に感染させられている。
このチンパンジーの血漿プールは,高レベルのアラニン
アミノトランスフェラーゼ活性(この活性はHCV感染
による肝障害に起因する)を有する多くの個体の血漿試
料を合わせて調製されたものである。静脈注射により投
与されたこの血清プールの10−6倍希釈液の1ml
は,別のチンパンジーにNANBHを引き起こしたの
で,そのCIDは少なくとも106/mlである。つま
り,高いウィルス感染力価を有する。
リーを,以下のようにして調製した。まず,ウィルス粒
子を血漿から単離した。血漿の90mlを50mMトリ
ス−HCl(pH8.0),1mM EDTA,100
mM Naclを含有する溶液310mlで希釈した。
細胞破砕物を,15,000×gで20分間,20℃に
て遠心分離することにより除去した。次いで,得られた
上清液中のウイルス粒子を,ベックマンSW28ロータ
ーで28,000rpm,5時間,20℃にて遠心分離
することによりペレットとした。ウィルスゲノムを遊離
させるために,ベレットを1%ドデシル硫酸ナトリウム
(SDS),10mM EDTA,10mM トリス−
HCl(pH7.5),および2mg/mlのプロテイ
ナーゼKを含有する溶液15mlに懸濁し,その後45
℃にて90分間インキュベートすることにより粒子を破
砕した。キャリアーとして0.8μgのMS2バクテリ
オファージRNAを添加し,フェノール:クロロホルム
の1:1混合液(フェノールは0.5Mトリス−HCl
(pH7.5),0.1%(v/v)β−メルカプトエ
タノール,0.1%(w/v)ヒドロキシキノリンで飽
和させたもの)で上記混合液を4回抽出し,その後クロ
ロホルムで2回抽出することにより核酸を単離した。
2.5倍容積の無水エタノールで−20℃にて一晩沈澱
させるのに先立って,水層を1−ブタノールで濃縮し
た。ベックマンSW41ローターで40,000rp
m,90分間,4℃にて遠心分離することにより核酸を
回収し,0.05%(v/v)ジエチルピロカーボネー
ト処理およびオートクレーブ処理してある水に溶解し
た。
を,17.5mM CH3HgOHで変性させた。この
変性させた核酸を鋳型として用いてcDNAを合成し,
Huynh(1985)により記載されている方法を用
いてファージλ−gt11のEcoRI部位にクローン
化した。ただし,逆転写酵素によりcDNA第一鎖を合
成する間,ランダムプライマーをオリゴ(dT)12−
18で置き換えた(Taylorら(1976))。得
られた24鎖cDNAをセファロースCL−4Bカラム
でサイズに従って分画し;平均サイズ約400,30
0,200,および100塩基対の溶出された物質を,
それぞれcDNAプール1,2,3,および4とした。
プール3のcDNAから,λ−gt11 cDNAライ
ブラリーを作成した。
NAライブラリーを,以前にNANBHにかかったこと
のある患者由来の血清と特異的に結合できるエピトープ
についてスクリーニングした。結合ヒト抗体を125I
で放射性標識したヒツジ抗−ヒトIg抗血清を用いて検
出したことを除いては,Huynhら(1985)の方
法を用い,約106個のファージを患者血清を用いてス
クリーニングした。5個の陽性ファージが同定され,精
製された。次いで、この5個の陽性ファージを,同様の
方法を用いて,以前NANBH因子に感染したことのあ
る8人の異なるヒト由来の血清との結合の特異性につい
て試験した。4個のファージが,たった一人のヒト(つ
まリ,ファージライブラリーの最初のスクリーニングに
用いられたヒト)の血清と免疫学的に反応するポリペプ
チドをコードしていた。5番目のファージ(5−1−
1)は,8種の試験した血清のうち5種と免疫学的に反
応するポリペプチドをコードしていた。さらに,このペ
プチドは,7人の正常な血液提供者由来の血清と免疫学
的に反応しなかった。それゆえ,クローン5−1−1
は,NANBの患者由来の血清により免疫学的に特異的
に認識されるポリペプチドをコードすることがわかる。
1におけるHCV cDNAの配列,および該配列内に
コードされるポリペプチドの配列 組換え体ファージ5−1−1のcDNAを,Sange
rら(1977)の方法により配列決定した。本質的に
は,cDNAをEcoRIで切断し,ゲル電気泳動を用
いてサイズ分画することにより単離した。EcoRI切
断フラグメントをM13ベクターであるmp18および
mp19にサブクローン化し(Messing(198
3)),Sangerら(1977)のジデオキシ鎖終
止法を用いて配列決定した。得られた配列を第1図に示
す。
は,HCV cDNAでコードされ,該ポリペプチドが
融合しているN−末端のβ−ガラクトシダーゼ部分と同
じ翻訳フレーム内にある。IV.A.節で示したよう
に,5−1−1の翻訳オープンリーディングフレーム
(ORF)は,NANBHに感染した患者およびチンパ
ンジー由来の血清により特異的に認識されるエピトープ
をコードする。
NAにオーバーラップするHCV cDNAの単離 クローン5−1−1のcDNAにオーバーラップするH
CV cDNAを,第1図に示すようなクローン5−1
−1のHCV cDNAの配列由来の合成ポリヌクレオ
チドを用いて,IV.A.1.節で記述したのと同様に
作成したλ−gt11ライブラリーをスクリーニングす
ることにより得た。スクリーニングに用いたポリヌクレ
オチドの配列は,次のようであった: 5’−TCC CTT GCT CGA TGT ACG GTA AG T GCT GAG AGC ACT CTT CCA TCT CAT CG A ACT CTC GGT AGA GGA CTT CCC TGT CA G GT−3’。
いて,λ−gt11ライブラリーをこのプローブでスク
リーニングした。約50,000個のクローンのうち1
個のクローンが,このプローブとハイブリダイズした。
合成プローブとハイブリダイズしたcDNAを有する3
個のクローンに,81,1−2,および91と番号をつ
けた。
NAにオーバーラップするHCV cDNAのヌクレオ
チド配列 クローン81,1−2,および91の3つのcDNAの
ヌクレオチド配列は,IV.A.2.節で述べたのと本
質的に同様にして決定した。これらのクローンの配列
は,ファージ5−1−1のHCV cDNA配列に関連
しており,第2図で示される。第2図は,検出されたH
CVエピトープをコードする鎖を示しており,ヌクレオ
チド配列における相同性が配列間の垂直線により示され
ている。
は,オーバーラップ領域で高い相同性を有する(第2図
を参照のこと)。 しかし,2つの領域には相違があ
る。クローン1−2の67番目のヌクレオチドはチミジ
ンであるが,他の3つのクローンはこの位置にシチジン
残基を有する。しかし,この位置をCまたはTのいずれ
かが占める場合,同じアミノ酸がコードされるというこ
とは注意すべきである。
の3つのクローンには存在しない28塩基対を有するこ
とである。これらの塩基対は,5−1−1のcDNA配
列の開始部分に存在し,小文字で示されている。後述の
IV.D.節で論じるラジオイムノアッセイのデータに
基づくと,HCVエピトープはこの28bp領域でコー
ドされ得るということが可能である。
1−1の28塩基対が存在しないということは,これら
のクローンのcDNAは欠損したHCVゲノムから得ら
れたということを意味し得る;あるいは,28bp領域
はクローン5−1−1の末端が人工的に変化したもので
あり得る。
列における小文字の配列は,単にこれらの配列が他のc
DNAで見い出されていないことを示す。なぜならば,
これらの領域にオーバーラップするcDNAはまだ単離
されていないからである。
び91のオーバーラップしているcDNA由来のHCV
cDNA複合配列を,第3図に示す。しかし,この図
では,クローン5−1−1に特有の28塩基対は省略さ
れている。この図は,複合HCV cDNAのORF内
にコードされるポリペプチドの配列も示す。
オーバーラップするHCV cDNAの単離 クローン81 cDNAの配列の上流にあり,該配列と
オーバーラップするHCV cDNA配列の単離を,以
下のようにして行った。IV.A.1.節に記述したよ
うにして調製したλ−gt11 cDNAライブラリー
を,クローン81の5’末端配列と相同性を有する合成
ポリヌクレオチドプローブとハイブリダイズさせること
によりスクリーニングした。クローン81の配列を第4
図に示す。スクリーニングに用いた合成ポリヌクレオチ
ドの配列は,次のようであった: 5’CTG TCA GGT ATG ATT GCC GGC TTC CCG GAC 3’ 方法は,Huynh(1985)に記載されているのと
本質的に同じであったが,厳密な条件下でライブラリー
のフィルターを2回洗浄した。すなわち,5×SSC,
0.1%SDS中で55℃にてそれぞれ30分間洗浄を
行った。約50,000個のクローンのうち1個のクロ
ーンがこのプローブとハイブリダイズした。この配列と
ハイブリダイズしたcDNAを有する陽性組換え体ファ
ージを単離・精製した。このファージにクローン36と
いう番号を付けた。
ーラップする下流cDNA配列を,上流cDNA配列の
単離に用いたのと同様の方法を用いて単離した。ただ
し,合成オリゴヌクレオチドプローブをクローン81の
3’末端と相同性を有するように調製した。スクリーニ
ングに用いた合成ポリヌクレオチドの配列は,次のよう
であった: 5’TTT GGC TAG TGG TTA GTG GGC TGG TGA CAG 3’ この後者の配列とハイブリダイズしたcDNAを有する
陽性組換え体ファージを単離・精製し,クローン32と
いう番号を付けた。
DNAのヌクレオチド配列 クローン36のcDNAのヌクレオチド配列は,本質的
にIV.A.2.節に記述したようにして決定した。こ
のcDNAの二本鎖配列,クローン81のHCV cD
NAとオーバーラップする該cDNAの領域,およびO
RFによりコードされるポリペプチドを第5図に示す。
コードされるHCV抗原と同じ翻訳フレーム内にある。
このように,組合せて,クローン36および81におけ
るORFは大きなHCV抗原の一部を表すポリペプチド
をコードする。この推定HCVポリペプチドの配列,な
らびに該配列をコードする二本鎖DNA配列(クローン
36および81のHCV cDNAの結合ORF由来)
を第6図に示す。
DNAのヌクレオチド配列 クローン32のcDNAのヌクレオチド配列は,クロー
ン5−1−1の配列についてIV.A.2.節で記述し
たのと本質的に同様にして決定した。配列のデータは,
クローン32組換え体ファージのcDNAが,二つの異
なる材料原由来であることを示した。
ノム由来の418ヌクレオチドを有し;他のフラグメン
トはバクテリオファージMS2ゲノム由来の172ヌク
レオチドを有していた。このバクテリオファージMS2
ゲノムは,λ−gt11血漿cDNAライブラリーの調
製の間キャリアーとして用いたものである。
2のcDNAの配列を,第7図に示す。クローン81の
配列とオーバーラップする配列の領域,およびORFに
よりコードされるポリペプチドもこの図に示す。この配
列は,クローン81によりコードされるHCV抗原と同
じ翻訳フレーム内にある一つの連続したORFを有す
る。
オーバーラップするHCV cDNAの単離 クローン36 cDNAの配列の上流にあり,該配列と
オーバーラップするHCV cDNA配列の単離を,ク
ローン81のcDNAとオーバーラップする配列につい
てIV.A.5.節に記述したようにして行った。ただ
し,合成ポリヌクレオチドはクローン36の5’領域に
基づいたものであった。スクリーニングに用いた合成ポ
リヌクレオチドは,次のようであった: 5’AAG CCA CCG TGT GCG CTA GGG CTC AAG CCC 3’ 約50,000個のクローンのうち1個のクローンが,
このプローブとハイブリダイズした。この配列とハイブ
リダイズしたcDNAを有する組換え体ファージを単離
・精製したクローンを,クローン35と命名した。
DNAのヌクレオチド配列 クローン35のcDNAのヌクレオチド配列は,本質的
にIV.A.2.節で記述したようにして決定した。こ
の配列,クローン36のcDNA配列とオーバーラップ
した該配列の領域,および該配列においてコードされる
推定ポリペプチドを,第8図に示す。
ORFを有する。このORFは,クローン36,クロー
ン81,およびクローン32によりコードされるのと同
じ翻訳フレーム内で,一つのポリペプチドをコードす
る。第9〜10図は,クローン35,36,81,およ
び32にわたって延びている長く連続したORFの配列
を,該配列でコードされる推定HCVポリペプチドと共
に示す。この配列は,この結合配列は,同じλ−gt1
1 cDNAライブラリー由来の他の独立したcDNA
クローンを用いて確認されている。
にオーバーラップするHCV cDNAの単離 クローン35 cDNAの配列の上流にあり,該配列と
オーバーラップするHCV cDNA配列の単離を,ク
ローン36のcDNAとオーバーラップする配列につい
てIV.A.8.節に記述したようにして行った。ただ
し,合成ポリヌクレオチドはクローン35の5’領域に
基づいたものであった。スクリーニングに用いた合成ポ
リヌクレオチドは,次のようであった: 5’CAG GAT GCT GTC TCC CGC ACT CA A CGT 3’ 約50,000個のクローンのうち1個のクローンが,
このプローブとハイブリダイズした。この配列とハイブ
リダイズしたcDNAを有する組換え体ファージを単離
・精製したクローンを,クローン37bと命名した。
のヌクレオチド配列 クローン37bのcDNAのヌクレオチド配列は,本質
的にIV.A.2.節で記述したようにして決定した。
この配列,クローン35のcDNAの配列にオーバーラ
ップする該配列の領域,および該配列においてコードさ
れる推定ポリペプチドを,第11図に示す。
Tであるが,クローン37bの対応するヌクレオチドは
Aである。IV.A.10.節に記述した,クローン3
7bを単離した工程の間に単離された他の3つの独立し
たクローン由来のcDNAも,配列決定されている。こ
れらのクローン由来のcDNAも,この位置にAを有す
る。このように,クローン35の5’末端のTは,クロ
ーニング工程の人工産物であり得る。しばしばcDNA
分子の5’末端に人工的に変化したものが生じるという
ことは,公知である。
プしているクローン35,36,81および32にわた
って延びているORFにおいてコードされるポリペプチ
ドの続きであるポリペプチドをコードする,一つの連続
的なORFを有する。
にオーバーラップするHCV cDNAの単離 クローン32の下流のHCV cDNA配列の単離は,
以下のようにして行った。まず,クローンclaを,ク
ローン32のHCV cDNA配列のヌクレオチド配列
に基づいた合成ハイブリダイゼーションプローブを用い
て単離した。方法は,本質的にIV.A.5.節に記述
したとおりであった。ただし,合成プローブの配列は次
のようであった。 5’AGT GCA GTG GAT GAA CCG GCT GAT AGC CTT 3’。
用いて,別の合成ヌクレオチドを合成した。この合成ヌ
クレオチドは次の配列を有していた: 5’TCC TGA GGC GAC TGC ACC AGT GGA TAA GCT 3’。
てを用いたλ−gt11ライブラリーのスクリーニング
は,約50,000個の陽性コロニーのうち1個のコロ
ニーをもたらした。このプローブとハイブリダイズした
クローンを単離・精製し,クローン33bと命名した。
cDNAのヌクレオチド配列 クローン33bのcDNAのヌクレオチド配列は,本質
的にIV.A.2.節で記述したようにして決定した。
この配列,クローン32のcDNAの配列とオーバーラ
ップする該配列の領域,および該配列においてコードさ
れる推定ポリペプチドを,第12図に示す。
プしているクローン37b,35,36,81および3
2のORFの延長である,−つの連続的なORFを有す
る。クローン33bでコードされるポリペプチドは,こ
れらのオーバーラップしているクローンの延長されたO
RFでコードされるのと同じ翻訳フレーム内にある。
Aおよびクローン33bのcDNAにオーバーラップす
るHCV cDNAの単離 クローン37bおよびクローン33bのcDNAにオー
バーラップするHCVcDNAを単離するために,これ
らのクローンのcDNA由来の次の合成オリゴヌクレオ
チドプローブを用い,本質的にIV.A.3.節に記述
した方法を用いて,λ−gt11ライブラリーをスクリ
ーニングした。それぞれ,クローン37bおよび33b
の配列にオーバーラップするHCV cDNA配列を有
するコロニーを検出するためのプローブは,次のようで
あった: 5’CAG GAT GCT GTC TCC CGC ACT CA A CGT C 3’ および 5’TCC TGA GGC GAC TGC ACC AGT GG A TAA GCT 3’ 約50,000個のクローンのうち1個のクローンが,
それぞれのプローブを用いて検出された。クローン37
bのcDNAの上流にあり,該cDNAにオーバーラッ
プするcDNAを有するクローンを,クローン40bと
命名した。クローン33bのcDNAの下流にあり,該
cDNAにオーバーラップするcDNAを有するクロー
ンを,クローン25cと命名した。
ローン25cのHCV cDNAのヌクレオチド配列 クローン40bおよびクローン25cのcDNAのヌク
レオチド配列は,IV.A.2.節で記述述したのと本
質的に同様にして決定した。40bおよび25cの配
列,クローン37bおよび33bのcDNAにオーバー
ラップする該配列の領域,およびそこでコードされる推
定ポリペプチドを,第13図(クローン40b)および
第14図(クローン25c)に示す。
はGである。しかし,IV.A.14.節で記述した,
クローン40bを単離した工程の間に単離された他の独
立した5個のクローン由来のcDNAも配列決定されて
いる。これらのクローン由来のcDNAもまた,この位
置にTを有する。このように,Gはクローニングの結果
人工的に変化したものであることを意味し得る(IV.
A.11.節の考察を参照のこと)。
が,クローンcla(配列は示していない),およびク
ローン33bの領域の配列はTCAである。この違いは
また,クローン5−1−1の28個の過剰の5’末端ヌ
クレオチドのように,クローニングの人工産物を意味し
得る。
明らかに,以前に配列決定したクローンの連続的なOR
Fの延長であるORFを有する。クローン40b,37
b,35,36,81,32,33b,および25cに
わたって延びているORFのヌクレオチド配列,および
該配列においてコードされる推定ポリペプチドのアミノ
酸配列を,第15〜17図に示す。この図では,可能性
のある人工的に変化したものは配列から省かれており,
その代わりに,オーバーラップする複数のクローンの非
5’末端領域の対応する配列が示されている。
よび32のcDNAからの複合HCVcDNAの調製 複合HCV cDNAであるC100は,以下のように
して構築した。まず,クローン36,81,および32
由来のcDNAをEcoR Iを用いて切り出した。各
クローン由来のcDNAのEcoR Iフラグメント
を,ベクターpGEM3−blue(Promega
Biotec)のEcoR I部位に個々にクローン化
した。クローン36,81,および32由来のcDNA
を有する得られた組換え体ベクターを,それぞれpGE
M3−blue/36,pGEM3−blue/81,
およびpGEM3−blue/32と命名した。適当な
方向性を有するpGEM3−blue/81組換え体を
NaeIおよびNarIで切断し,大きい(約2850
bp)フラグメントを精製した。そしてこのフラグメン
トを,pGEM3−blue/36から得た小さな(約
570bp)NaeI/NarI制限フラグメント精製
物と連結した。このクローン36および81由来のcD
NAの複合配列を,これらのクローンのオーバーラップ
しているcDNAに含まれる,連続的なHCV ORF
を有する他のpGEM3−blueベクターを作成する
のに用いた。次いで,約680bpのフラグメントを切
り離すために,この新しいプラスミドをPvuIIおよ
びEcoR Iで切断した。次いで,このフラグメント
を適当な方向性を有するpGEM3−blue/32プ
ラスミドから単離した小さな(580bp)PvuII
/EcoR Iフラグメントと連結した。そして,クロ
ーン36,81,および32由来の複合cDNAを,I
V.B.1.節に記述されているベクターpSODcf
1をEcoR Iで直線化させたものに連結し,これを
細菌においてクローン5−1−1を発現するのに用い
た。複合HCV cDNAの約1270bpのEcoR
Iフラグメント(C100)を有する組換え体を選択
し,プラスミド由来のcDNAをEcoR Iで切断
し,精製した。
b,7f,7e,8h,33c,14c,8f,33
f,33g,および39cのHCV cDNAの単離お
よびヌクレオチド配列 クローン14i,11b,7f,7e,8h,33c,
14c,8f,33f,33g,および39cのHCV
cDNAを,IV.A.1.節に記述したHCV c
DNAのλ−gt11ライブラリー由来のオーバーラッ
プしたcDNAフラグメントを単離する方法により単離
した。使用した方法は,IV.A.3.節に記述したの
と本質的に同様であった。ただし,使用したプローブ
は,最後に単離したクローンのヌクレオチド配列の,複
合HCV配列の5’末端および3’末端から設計された
ものである。以下に記述するプローブとハイブリダイズ
するクローンの頻度は,それぞれの場合で約50,00
0個につき1個であった。
c,14c,8f,33f,33g,および39cのH
CV cDNAのヌクレオチド配列は,本質的にIV.
A.2.節に記述したのと同様にして決定した。ただ
し,クローン5−1−1から単離したcDNAの代わり
にこれらのファージから切り出したcDNAを用いた。
レオチド配列に基づいたハイブリダイゼーションプロー
ブを用いて単離した。クローン40bのヌクレオチド配
列は,第13図に示されている。33cを単離するのに
用いたプローブのヌクレオチド配列は,次のようであっ
た: 5’ATC AGG ACC GGG GTG AGA ACA ATT ACC ACT 3’。
およびクローン40bのHCV cDNA配列とのオー
バーラップを,第18図に示す。この図は,該配列でコ
ードされるアミノ酸も示す。
オチド配列に基づいたプローブを用いて単離した。この
プローブのヌクレオチド配列は,次のようであった: 5’AGA GAC AAC CAT GAG GTC CCC GGT GTT C 3’。
およびクローン33cのHCV cDNAの配列とのオ
ーバーラップ,ならびに該配列でコードされるアミノ酸
を,第19図に示す。
チド配列に基づいたプローブを用いて単離した。このプ
ローブのヌクレオチド配列は,次のようであった: 5’TCG GAC CTT TAC CTG GTC ACG AG G CAC 3’。
クローン8hとのオーバーラップ,および該配列でコー
ドされるアミノ酸を,第20図に示す。
レオチド配列に基づいたプローブを用いて単離した。ク
ローン25cの配列を第14図に示す。クローン14c
の単離に用いたプローブは,次の配列を有していた: 5’ACC TTC CCC ATT AAT GCC TAC ACC ACG GGC3’。
列,該配列のクローン25cのHCVcDNAの配列と
のオーバーラップ,および該配列でコードされるアミノ
酸を,第21図に示す。
オチド配列に基づいたプローブを用いて単離した。この
プローブのヌクレオチド配列は,次のようであった: 5’TCC ATC TCT CAA GGC AAC TTG CAC CGC TAA 3’。
該配列のクローン14cのHCV cDNAの配列との
オーバーラップ,および該配列でコードされるアミノ酸
を,第22図に示す。
るヌクレオチド配列に基づいたプローブを用いて単離し
た。このプローブのヌクレオチド配列は,次のようであ
った: 5’TCC ATG GCT GTC CGC TTC CAC CTC CAA AGT 3’。
列,該配列のクローン8fのHCV cDNAの配列と
のオーバーラップ,および該配列でコードされるアミノ
酸を,第23図に示す。
レオチド配列に基づいたプローブを用いて単離した。こ
のプローブのヌクレオチド配列は,次のようであった: 5’GCG ACA ATA CGA CAA CAT CCT CTG AGC CCG 3’。
列,該配列のクローン33fのHCVcDNAの配列と
のオーバーラップ,および該配列でコードされるアミノ
酸を,第24図に示す。
チド配列に基づいたプローブを用いて単離した。このプ
ローブのヌクレオチド配列は,次のようであった: 5’AGC AGA CAA GGG GCC TCC TAG GGT GCA TAA T 3’。
該配列のクローン7eとのオーバーラップ,および該配
列でコードされるアミノ酸を,第25図に示す。
基づいたプローブを用いて単離した。このプローブのヌ
クレオチド配列は,次のようであった: 5’CAC CTA TGT TTA TAA CCA TCT CAC TCC TCT 3’。
列,骸配列のクローン7fとのオーバーラップ,および
該配列でコードされるアミノ酸を,第26図に示す。
レオチド配列に基づいたプローブを用いて単離した。こ
のプローブのヌクレオチド配列は,次のようであった: 5’CTC TGT CAC CAT ATT ACA AGC GCT ATA TCA 3’。
列,該配列の11bとのオーバーラップ,および該配列
でコードされるアミノ酸を,第27図に示す。
レオチド配列に基づいたプローブを用いて単離した。こ
のプローブのヌクレオチド配列は,次のようであった: 5’CTC GTT GCT ACG TCA CCA CAA TTT GGT GTA 3’。
列,該配列のクローン33gとのオーバーラップ,およ
び該配列でコードされるアミノ酸を,第28図に示す。
る単離クローン由来の複合HCV cDNA配列 複合HCV cDNA配列を作成するために,前述の単
離クローンのHCVcDNA配列を並べた。5’から
3’の方向に並べた単離クローンは:14i,7f,7
e,8h,33c,40b,37b,35,36,8
1,32,33b,25c,14c,8f,33f,3
3gおよび39cである。
配列,および該配列でコードされるアミノ酸を,第29
〜34図に示す。
の異質性が考慮されている。クローン33cは,クロー
ン40bおよび37cのcDNAとオーバーラップする
800塩基対のHCV cDNAを有する。クローン3
3cにおいては,他の5つのオーバーラツプしているク
ローンと同様に,789番目のヌクレオチドはGであ
る。しかし,クローン37bにおいては(IV.A.1
1.節を参照のこと),対応するヌクレオチドはAであ
る。この配列の違いは,該配列でそれぞれGまたはAに
対してコードされるアミノ酸は,CYSまたはTYRの
いずれかであるという明らかな異質性をもたらす。この
異質性は,タンパクの折りたたみに関する重要な分枝を
有し得る。
のヌクレオチド残基はTである。しかし,以下に示すよ
うに,クローン7eの対応する残基はAであり;さら
に,この位置のAは,他の3つのオーバーラップしてい
る単離クローンでも見い出される。このように,クロー
ン8hのT残基は,クローニングの人工的な変化を意味
し得る。それゆえ,第29〜34図では,この位置の残
基はAとされる。
端ヌクレオチドはGである。しかし,クローン33fお
よび他の2つのオーバーラップするクローンの対応する
残基はTである。それゆえ,第29〜34図では,この
位置の残基はTとされる。
末端配列はTTGCである。しかし,クローン33gお
び他の2つのオーバーラップするクローンの対応する配
列はATTCである。それゆえ,第29〜34図では,
対応する領域はATTCで示される。
目のヌクレオチド残基はTである。しかし,クローン3
3fおよび他の2つのオーバーラップするクローンの対
応する残基はAである。それゆえ,第29〜34図で
は,対応する残基はAで示される。
しかし,クローン11bおよび他の3つのクローンの対
応するジヌクレオチドはTAである。それゆえ,第29
〜34図では,TA残基が示されている。
で考察している。
NAが一つの大きなORFを有することが示される。こ
のことは,ウイルスのゲノムが,翻訳と同時に,または
その後プロセッシングされる大きなポリペプチドに翻訳
されるということを示唆する。
f,19g,26g,および15eのHCV cDNA
の単離およびヌクレオチド配列 クローン12f,35f,19g,26g,および15
eのHCV cDNAを,本質的にIV.A.17.節
に記述した方法により単離した。ただし,プローブは以
下に示すようであった。クローンがこのプローブとハイ
ブリダイズする頻度は,それぞれの場合で約50,00
0個につき1個であった。これらのクローンのHCV
cDNAのヌクレオチド配列は,本質的にIV.A.
2.節に記述したようにして決定した。ただし,クロー
ン5−1−1から単離したcDNAの代わりに,指示し
たクローン由来のcDNAを用いた。
のcDNAを有するクローン12fの単離は,クローン
14iのヌクレオチド配列に基づいたハイブリダイゼー
ションプローブを用いて行った。このプローブのヌクレ
オチド配列は,次のようであった: 5’TGC TTG TGG ATG ATG CTA CTC ATA TCC CAA 3’。
該配列のクローン14iとのオーバーラップ,および該
配列でコードされるアミノ酸を,第35図に示す。
cDNAを有するクローン35fの単離は,クローン3
9cのヌクレオチド配列に基づいたハイブリダイゼーシ
ョンプローブを用いて行った。このプローブのヌクレオ
チド配列は,次のようであった: 5’AGC AGC GGC GTC AAA AGT GAA GGC TAA CTT 3’。
39cの配列とのオーバーラップ,および該配列でコー
ドされるアミノ酸を,第36図に示す。
の3’配列に基づいたハイブリダイゼーションプローブ
を用いて行った。このプローブのヌクレオチド配列は,
次のようであった: 5’TTC TCG TAT GAT ACC CGC TGC TTT GAC TCC 3’。
配列のクローン35fの配列とのオーバーラップ,およ
び該配列でコードされるアミノ酸を,第37図に示す。
の3’配列に基づいたハイブリダイゼーションプローブ
を用いて行った。このプローブのヌクレオチド配列は,
次のようであった: 5’TGT GTG GCG ACG ACT TAG TCG TTA TCT GTG 3’。
該配列のクローン19gの配列とのオーバーラップ,お
よび該配列でコードされるアミノ酸を,第38図に示
す。
配列に基づいたハイブリダイゼーションプローブを用い
て単離した。このプローブのヌクレオチド配列は,次の
ようであった: 5’CAC ACT CCA GTC AAT TCC TGG CTA GGC AAC 3’。
該配列のクローン26gの配列とのオーバーラップ,お
よび該配列でコードされるアミノ酸を,第39図に示
す。
節で記述した期間および条件でATCCに寄託されてお
り,以下の受託番号が授与されている。
CV cDNA配列を作成するのに並べられている。
5’から3’の方向に並べられた単離クローンは:12
f,14i,7f,7e,8h,33c,40b,37
b,35,36,81,32,33b,25c,14
c,8f,33f,33g,39c,35f,19g,
26g,および15eである。
配列,および該配列でコードされるアミノ酸を,第40
〜46図に示す。
cDNA配列上流のcDNA配列を単離する別の方法 上流の配列の逆転写を開始させるために,クローン12
fのHCV cDNA由来の第40〜46図の5’HC
V配列のほとんどに基づいて,逆転写酵素の小さな合成
オリゴヌクレオチドプライマーを合成し,HCVゲノム
RNA中の対応する配列に結合させるのに用いる。プラ
イマー配列はクローン12fの既知の5’末端配列に近
いが,プライマー配列上流のプローブ配列の設計を許容
するのに十分に下流である。プライミングおよびクロー
ニングの公知の標準法が用いられる。得られたcDNA
ライブラリーは,プライミング部位(クローン12fの
明らかにされた配列から推定される)の上流の配列を用
いてスクリーニングされる。HCVゲノムRNAは,N
ANBHのチンパンジー由来の血漿または肝臓試料,ま
たはNANBHのヒト由来の類似の試料のいずれかから
得られる。
領域から配列を単離するための,尾部付加(taili
ng)を利用した別の方法 HCV RNAゲノムの5’最末端配列を単離するため
に,逆転写の初回cDNA生成物(これは,鋳型RNA
により二本鎖とされる)を,オリゴCで尾部付加処理す
る。これは,この生成物をCTP存在下でターミナルト
ランスフェラーゼとインキュベートすることにより行わ
れる。cDNAの第一鎖の相補鎖を生成させる第2回の
cDNA合成は,逆転写酵素反応のプライマーとしてオ
リゴGを用いて行われる。ゲノムHCV RNAの材料
源は,IV.A.20.節で記述したのと同様である。
ターミナルトランスフェラーゼを用いた尾部付加処理,
および逆転写酵素反応のための方法は,Maniati
sら(1982)と同様である。次いで,cDNA生成
物をクローン化し,スクリーニングし,そして配列決定
する。
領域から配列を単離するための,尾部付加を利用した別
の方法 この方法は,フラビウイルスのRNAのcDNAをクロ
ーニングするために以前に使用された方法に基づいてい
る。この方法では,RNAは,3’末端の二次構造を除
去するために変性条件に置かれる。そして,その後rA
TPを基質として用い,ポリAポリメラーゼで尾部付加
処理される。ポリAを尾部付加処理したRNAの逆転写
は,オリゴdTをプライマーとして用い,逆転写酵素に
より触媒される。cDNAの第2鎖を合成し,cDNA
生成物をクローン化し,スクリーニングし,そして配列
決定する。
トを有するλ−gt11 HCV cDNAライブラリ
ーの作成 λ−gt11ライブラリーを作成し,スクリーニングす
るのに用いた方法は,IV.A.1.節に記述したのと
本質的に同様である。ただし,ライブラリーはセファロ
ースCL−4Bカラムから溶出した大きなサイズのcD
NAのプールから作成した。
リゴマーを用いたHCVcDNAライブラリーの作成 新しいHCV cDNAライブラリーは,IV.A.
1.節に記述した感染チンパンジーの血漿プール由来の
RNAから,ならびにこの感染動物の肝臓由来のポリA
+RNA画分から調製されている。cDNAは,Gub
lerおよびHoffman(1983)により記述さ
れているのと本質的に同様にして構築した。ただし,最
初のcDNA鎖合成のためのプライマーは,前述のHC
Vゲノムの配列に基づいた二つの合成オリゴマーであっ
た。クロン11bおよび7eの配列に基づいたプライマ
ーは,それぞれ, 5’CTG GCT TGA AGA ATC 3’ および 5’AGT TAG GCT GGT GAT TAT
GC 3’ であった。得られたcDNAは,λバクテリオファージ
ベクターにクローン化し,配列が第40〜46図のHC
V配列に基づいた種々の他の合成オリゴマーを用いてス
クリーニングした。
るポリペプチドの発現および発現された生成物のHCV
誘導抗原としての同定 IV.B.1.クローン5−1−1においてコードされ
るポリペプチドの発現 クローン5−1−1においてコードされるHCVポリペ
プチド(IV.A.2.節を参照のこと,前出)を,ス
ーパーオキシドジスムターゼ(SOD)との融合ポリペ
プチドとして発現させた。これは,以下のように,クロ
ーン5−1−1のcDNAインサートを発現ベクターp
SODcf1(Steimerら(1986))にサブ
クローン化することにより行った。
をBamH IおよびEcoR Iで処理し,これらの
制限酵素により作られる直線状のDNAに以下のリンカ
ーを結合させた: 5’GAT CCT GGA ATT CTG ATA A 3’ 3’ GA CCT TAA GAC TAT TTT AA 5’ クローニングの後,インサートを有するプラスミドを単
離した。
R Iで切断した。クローン5−1−1のHCV cD
NAインサートをEcoR Iで切断し,このEcoR
I直線化プラスミドDNAに連結した。このDNA混
合物を,E.coli D1210株(Sadlerら
(1980))を形質転換するのに用いた。第1図に示
した,ORFの発現について正しい方向性を有する5−
1−1 cDNAでの組換え体は,制限酵素切断地図作
製およびヌクレオチド配列決定により同定した。
により,1個のクローン由来の組換え体細菌が,SOD
−NANB5−1−1ポリペプチドを発現するように誘
導された。
ドされるポリペプチドの発現 クローン81に含まれるHCV cDNAを,SOD−
NANB81融合ポリペプチドとして発現させた。この
融合ポリペプチドをコードするベクターを調製するため
の方法は,SOD−NANB5−1−1をコードするベ
クターを作製するのに用いたのと類似の方法であった。
ただし,HCV cDNAの材料源はクローン81であ
り,これはIV.A.3節で記述したように単離され,
cDNA配列がIV.A.4節で記述したように決定さ
れたものである。クローン81のHCV cDNAのヌ
クレオチド配列,および該配列でコードされるポリペプ
チドの推定アミノ酸配列を,第4図に示す。
トをEcoR Iで切断し,リンカー(IV.B.1.
節を参照のこと)を有し,かつEcoR Iでの処理に
より直線化されたpSODcf1に連結した。このDN
A混合物を,E.coliD1210株を形質転換する
のに用いた。第4図に示されるORFの発現について正
しい方向でクローン81 HCV cDNAを有する組
換え体を,制限酵素切断地図作製およびヌクレオチド配
列決定により同定した。
により,1個のクローンからの組換え体細菌が,SOD
−NANB81ポリペプチドを発現するように誘導され
た。
てHCVおよびNANBH関連抗原としてコードされる
ポリペプチドの同定 クローン5−1−1のHCV cDNA内にコードされ
るポリペプチドを,NANBHに感染したチンパンジー
およびヒトの血清が融合ポリペプチドSOD−NANB
5−1−1と免疫学的に反応することを証明することに
より,NANBH関連抗原として同定した。このSOD
−NANB5−1−1は,そのN末端にスーパーオキサ
イドジスムターゼを,そしてそのC末端にフレーム内
(in−frame)の5−1−1抗原を有する。この
同定は,以下のような“ウェスタン”ブロッティング法
(Towbinら(1979))により行った。
ANB5−1−1をコードする発現ベクターで形質転換
した細菌の組換え体株を,IPTGの存在下で生育させ
ることにより融合ポリペプチドを発現するように誘導し
た。全部の細菌溶解物を,Laemmli(1970)
に従って,SDS存在下でポリアクリルアミドゲルに通
して電気泳動を行った。分離されたペプチドは,ニトロ
セルロースフィルターに移した(Towbinら(19
79))。次いで,このフィルターを細片に切断し,こ
の細片を異なるチンパンジーおよびヒトの血清と個々に
インキュベートした。結合した抗体は,IV.A.1.
節に記述したように,125I−標識ヒツジ抗ヒトIg
と共にさらにインキュベートすることにより検出した。
血清の特徴付け,およびオートラジオグラフィーを行っ
た細片の写真に示される結果を,第47〜48図に示
す。ポリペプチドを含むニトロセルロース細片を,急性
NANBH(ハッチンソン株)感染(レーン1−1
6),A型肝炎感染(レーン17−24),およびB型
肝炎感染(レーン34−44)の間の異なった時期にお
けるチンパンジーから得た血清とインキュベートした。
レーン25および45は,陽性の対照を示す。該対照で
は,免疫ブロットを,λ−gt11 cDNAライブラ
リーのオリジナルスクリーニングにおいて組換え体クロ
ーン5−1−1を同定するのに用いた(IV.A.1.
節を参照のこと)患者由来の血清とインキュベートし
た。
ける目視しうるバンドは,抗体がSOD融合ポリペプチ
ドのNANB5−1−1部分に結合していることを示
す。これらの抗体は,単独のSODとの結合を示さな
い。なぜならば,単独のSODもこれらの試料における
陰性の対照として含まれており,SOD−NANB
5−1 −1融合ポリペプチドよりも有意に速く移動する
バンドとして現れるからである。
のチンパンジーの血清試料中の抗体の結合を示し;この
血清は,NANBHに感染する直前およびその後の急性
感染の期間中に得たものである。図からわかるように,
SOD−NANB5−1−1ポリペプチドと免疫学的に
反応する抗体は,感染性のHCV接種材料の投与前およ
び感染の急性期の早い時期に得た血清試料には存在しな
かった。ところが,4匹の動物は全て,急性期後期また
はその後の時期に,最終的にこのポリペプチドに対する
循環抗体を誘導した。番号3および4のチンパンジーの
場合の免疫ブロットで観察される付加的なバンドは,宿
主の細菌タンパクに結合したバックグラウンドによるも
のであった。
血清で得られた結果とは対照的に,融合ポリペプチドの
NANB5−1−1部分に対する抗体の発生は,HAV
に感染した4匹のチンパンジーまたはHBVに感染した
3匹のチンパンジーでは観察されなかった。これらの場
合における唯一の結合は,HCVに感染した試料でも生
じる,宿主の細菌タンパクに結合したバックグラウンド
であった。
徴付け,およびオートラジオグラフを行った細片の写真
に示される結果を,第49〜50図に示す。ポリペプチ
ドを含むニトロセルロース細片を,NANBH(レーン
1−21),HAV(レーン33−40),およびHB
V(レーン41−49)に感染している間の異なった時
期におけるヒトから得た血清とインキュベートした。レ
ーン25および50は,陽性の対照を示す。該対照で
は,免疫ブロットを,前述のλ−gt11ライブラリー
のオリジナルスクリーニングで用いた患者由来の血清と
インキュベートした。レーン22−24および26−3
2は,血清を“正常な”血液提供者から得た,“非感染
の”対照を示す。
t11ライブラリーをスクリーニングするのに用いた血
清を含む9人のNANBH患者由来の血清は,融合ポリ
ペプチドのNANB5−1−1部分に対する抗体を含有
していた。NANBHの3人の患者由来の血清は,これ
らの抗体を含有しなかった。これらの患者に抗NANB
5−1−1抗体が将来発生する可能性はある。異なった
NANBV因子に起因するこの反応の欠如が,非反応血
清を採取した個体に病気を引き起こし得ることもまた,
可能である。
Vに感染した多くの患者由来の血清が抗NANB
5−1−1抗体を含有していないこと,およびこれらの
抗体は“正常な”対照由来の血清にも存在しないことも
示す。あるHAV患者(レーン36)は抗NANB
5−1−1抗体を有するように見えるが,この患者は以
前にHCVに感染していたということが可能である。な
ぜならば,NANBHの発生率は非常に高く,しばしば
潜在性であるからである。
BVに感染した患者および動物由来の血清により特異的
に認識されるエピトープを,クローン5−1−1のcD
NAがコードすることを示している。さらに,cDNA
は霊長類のゲノム由来ではないらしい。クローン5−1
−1またはクローン81から作製されたハイブリダイゼ
ーションプローブは,唯一のシングルコピー遺伝子が検
出され得る条件下で,非感染個体由来の対照のヒトおよ
びチンパンジーのゲノムDNAの“サザン”ブロットに
ハイブリダイズしなかッた。これらのプローブはまた,
対照のウシのゲノムDNAのサザンブロットにもハイブ
リダイズしなかった。
32の複合HCV cDNAにおいてコードされるポリ
ペプチドの発現 クローン36,81および32にわたるORFでコード
されるHCVポリペプチドを,SODとの融合ポリペプ
チドとして発現させた。これは,複合cDNAであるC
100をヒトのスーパーオキサイドジスムターゼ遺伝子
を有する発現カセットに挿入すること,発現カセットを
酵母の発現ベクターに挿入すること,および酵母でポリ
ペプチドを発現させることにより行った。
C100 cDNAを有する発現カセットを,約127
0bpのEcoR IフラグメントをベクターpS3−
56(pS356とも呼ばれる)のEcoR I部位に
挿入することにより構築し,プラスミドpS3−56
C100を作製した。C100の構築は,前述のIV.
A.16節に記述されている。
3−56は,ヒトのスーパーオキサイドジスムターゼ遺
伝子上流のADH2/GAPDHハイブリッド酵母プロ
モーター,および下流のGAPDH転写終結信号を含む
発現カセットを有する。これらの制御要素およびスーパ
ーオキサイドジスムターゼ遺伝子を有する同様のカセッ
トは,Cousensら(1987),および本発明の
出願人による同時係属のヨーロッパ特許出願第196,
056号(1986年10月1日公開)に記載されてい
る。しかしながら,pS3−56のカセットはCous
ensら(1987)のカセットとは異なる。pS3−
56のカセットには,異種のプロインシュリン遺伝子お
よび免疫グロブリンのヒンジが欠失しており,かつスー
パーオキサイドジスムターゼのgln154にEcoR
I部位を有するアダプター配列が続いている。このア
ダプターの配列は次のようである: 5’−AAT TTG GGA ATT CCA TAA TGA G − 3’ AC CCT TAA GGT ATT ACT CAG CT。
クターから発現する場合には,次のアミノ酸配列を有す
るオリゴペプチドリンカーを介してスーパーオキサイド
ジスムターゼに融合するポリペプチドを生じる,異種配
列の挿入を可能にしている: −asn−leu−gly−ile−arg−。
とに1988年4月29日にアメリカンタイプカルチャ
ーコレクション(ATCC),12301 Parkl
awn Dr.,Rockville,Marylan
d 20853に寄託されており,受託番号第6768
3号が与えられている。寄託物を入手し得る期間および
寄託物の入手方法,ならびに寄託物の保持については,
NANBV−cDNAを有する株についてII.A.節
で明記したのと同様である。この寄託は便宜のみを意図
しており,本明細書の記述により本発明を実施するため
のものではない。この寄託物を,参照としてここに引用
する。
トを有する組換え体を単離した後,C100 cDNA
を有する発現カセットをpS3−56C100からBa
mHIで切り出し,このカセットを有する約3400b
pのフラグメントを単離・精製した。次いで,このフラ
グメントを酵母ベクターpAB24のBamH I部位
に挿入した。
AB24は,複製のための完全な2μ配列[Broac
h(1981)]およびpBR322配列を有する酵母
シャトルベクターである。このプラスミドは,プラスミ
ドYEp24[Botsteinら(1979)]由来
の酵母URA3遺伝子,およびプラスミドpC1/1由
来の酵母LEU2d遺伝子も有する。EPO公開第11
6,201号公報。プラスミドpAB24は,部分的な
2μ配列を除去するためにYEp24をEcoR Iで
消化し,このベクターを再連結することにより構築し
た。得られたプラスミドYEP24deltaRIを,
Cla Iで切断することにより直線化し,Cla I
で直線化されている完全な2μプラスミドと連結した。
次いで,得られたプラスミドpCBouをXba Iで
切断し,8605bpのベクターフラグメントをゲルで
単離した。この単離されたXba Iフラグメントを,
pC1/1から単離されたLEU2d遺伝子を有する4
460bpのXba Iフラグメントと連結した。この
LEU2d遺伝子の方向は,URA3遺伝子と同じ方向
である。発現の挿入は,pBR322配列の唯一のBa
mH I部位であった。従って,テトラサイクリンに対
する細菌の抵抗性についての遺伝子を阻止している。
換え体プラスミドpAB24C100−3を,酵母JS
C 308株およびその他の株に導入した。細胞をHi
nnenら(1978)により記載されているように形
質転換し,ura−選択プレートにプレーティングし
た。単一のコロニーをleu−選択培地に接種し,飽和
状態となるまで増殖させた。この培養物は,1%グルコ
ースを含有するYEPで生育させることにより,SOD
−C100ポリペプチド(C100−3と呼ぶ)を発現
するように誘導された。
組み込まれている遺伝子型がMAT@,leu2,ur
a3(del)DM15(GAP/ADR1)である。
JSC 308においては,正の活性化遺伝子産物AD
R1の過剰な発現は,発現された異種タンパクがADH
2 UAS調節システムにより合成される場合には,過
度の抑制解除(hyperderepression)
(ADR1野生型対照に関連する)と,そのようなタン
パクの非常に高い収量とをもたらす。酵母JSC 30
8株の構築は,係属中の米国特許出願番号(代理人Do
cketNo.2300−0229)に開示されてお
り,この特許出願を本願と同時に出願し,これを参照文
献としてここに引用する。JSC 308の試料は,ブ
タペスト条約の下に1988年5月5日に,ATCCに
寄託されており,受託番号第20879号が与えられて
いる。寄託物を入手し得る期間および寄託物の入手方
法,ならびに寄託物の保持については,HCV cDN
Aを有する株についてII.A.節で明記したのと同じ
である。
全なC100−3融合ポリペプチドは,アミノ末端にヒ
トSODの154個のアミノ酸と,EcoR I部位を
有する合成アダプター由来の5個のアミノ酸残基と,C
100 cDNA由来の363個のアミノ酸残基と,ク
ローン32のHCV cDNAに隣接したMS2ヌクレ
オチド配列由来の5個のカルボキシ末端アミノ酸とを有
するはずである。(IV.A.7.節を参照のこと)。
SODの最後から2つ目のAla残基で始まる,このポ
リペプチドのカルボキシ末端の推定アミノ酸配列を,第
52〜53図に示す。このポリペプチドのこの部分をコ
ードするヌクレオチド配列も同様に示す。
ポリペプチドのNANBH関連抗原としての同定 酵母JSC 308株内のプラスミドpAB24C10
0−3から発現するC100−3融合ポリペプチドを,
サイズについて特徴付けした。そして,C100内にコ
ードされるポリペプチドを,その慢性NANBHのヒト
由来の血清との免疫学的反応性によりNANBH−関連
抗原として同定した。
るC100−3ポリペプチドは,以下のようにして分析
した。酵母JSC 308細胞をpAB24またはpA
B24C100−3で形質転換し,外来プラスミドがコ
ードするポリペプチドを発現するように誘導した。培養
物(OD650nmが約20)1ml中の誘導酵母細胞
を10,000rpmで1分間遠心分離することにより
ペレットとし,それらを2容量の溶液および1容量のガ
ラスビーズ(直径0.2ミリミクロン)とともに激しく
渦巻攪拌(10×1分)することにより細胞溶解させ
た。この溶液は,50mMトリス−HCl(pH8.
0),1mM EDTA,1mMフェニルメチルスルホ
ニルフルオリド(PMSF),および1μg/mlペプ
スタチンを含有していた。C100−3ポリペプチドを
含有する細胞溶解物中の不溶性物質を,遠心分離(1
0,000rpm,5分間)により集め,Laemml
iのSDS試料緩衝液中で5分間煮沸することにより溶
解させた。〔Laemmli(1970)を参照のこ
と〕。誘導された酵母培養物0.3ml中の量に相当す
る量のポリペプチドを,Laemmli(1970)に
従い,SDS存在下で10%ポリアクリルアミドゲルに
より電気泳動を行った。タンパク標準物質を一緒にゲル
電気泳動した。発現されたポリペプチドを含有するゲル
は,クマシーブリリアントブルーで染色するか,または
pAB24およびpAB24C100−3から発現され
たポリペプチドの免疫学的反応性を決定するために慢性
NANBHの患者由来の血清を用いて,IV.B.2.
節で記述したような“ウェスタン”ブロットに供した。
ポリペプチドをクマシーブリリアントブルーで染色し
た。pAB24で形質転換したJSC308由来の不溶
性ポリペプチド,およびpAB24C100−3で形質
転換したJSCの異なる二つのコロニー由来の不溶性ポ
リペプチドを,それぞれレーン1(pAB24),なら
びにレーン2および3に示す。レーン2および3とレー
ン1との比較は,pAB24C100−3で形質転換し
たJSC 308由来の分子量が約54,000ダルト
ンに相当するポリペプチドの,誘導された発現を示す。
このポリペプチドは,pAB24で形質転換したJSC
308では誘導されない。このポリペプチドを矢印で
示す。
1)またはpAB24C100−3(レーン2)で形質
転換したJSC 308で発現される,不溶性ポリペプ
チドのウェスタンブロットの結果を示す。pAB24か
ら発現されるポリペプチドは,NANBHのヒト由来の
血清と免疫学的な反応性を示さなかった。しかしなが
ら,矢印で示したように,pAB24C100−3で形
質転換したJSC 308は,ヒトNANBH血清と免
疫学的に反応する約54,000ダルトンのポリペプチ
ドを発現した。レーン2の,免疫学的に反応性のあるそ
の他のポリペプチドは,この約54,000ダルトンの
ポリペプチドの分解産物および/または凝集物であり得
る。
−3の精製 N末端にSODを,そしてC末端にフレーム内(in−
frame)のC100 HCV−ポリペプチドを有す
る融合ポリペプチドC100−3を,ポリペプチドが発
現された宿主酵母細胞抽出物の不溶性画分を分別抽出す
ることにより精製した。
B.4.節に記述したように,pAB24C100−3
で形質転換した酵母JSC 308株で発現させた。次
いで,酵母細胞をホモジナイズすることにより溶解さ
せ,溶解物中の不溶性物質をpH12.0で抽出した。
そして,残った不溶性画分中のC100−3を,SDS
を含有する緩衝液に可溶化した。
ら(1984)に従って調製した。20mMトリスHC
l(pH8.0),1mMジチオスレイトール,および
1mMフェニルメチルスルホニルフルオリド(PMS
F)を含有する溶液(緩衝液A)中に,33%細胞(v
/v)の割合で,酵母細胞懸濁液を調製した。この懸濁
液の所定量(15ml)を等量のガラスビーズ(直径
0.45−0.50mm)と混合し,この混合物をSu
per Mixer(Lab Line Instru
ments,Inc.)の最高速度で8分間渦巻攪拌し
た。このホモジネートおよびガラスビーズを分離し,も
との細胞沈澱物と同様に,ガラスビーズを等量の緩衝液
Aで3回洗浄した。洗浄液とホモジネートとを合わせた
後,ホモジネートを7,000×gで15分間,4℃で
遠心分離し,ペレットをもとの細胞沈澱物の2倍量に相
当する量の緩衝液Aに再懸濁し,7,000×gで15
分間遠心分離して物質を再びペレットとすることによ
り,溶解物中の不溶性物質を得た。この洗浄工程を3回
繰り返した。
してpH 12.0で抽出した。ペレットを0.5M
NaCl,1mM EDTAを含有する緩衝液に懸濁し
た。ここで,懸濁液の容量は,もとの細胞沈澱物の1.
8倍量に相当した。懸濁液のpHは,0.2容量の0.
4Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH12.0)を添加す
ることにより調整した。混合した後,懸濁液を7,00
0×gで15分間,4℃で遠心分離し,上清を除去し
た。この抽出を2回繰り返した。抽出したペレットは,
もとの細胞沈澱物の2倍量に相当する懸濁液量を用い,
該ペレットを0.5M NaCl,1mM EDTAに
懸濁し,次いで7,000×gで15分間,4℃で遠心
分離することにより洗浄した。
チドは,SDSで処理することにより可溶化した。この
ペレットをもとの細胞沈澱物の容量の0.9容量に相当
する量の緩衝液Aに懸濁し,0.1容量の2%SDSを
添加した。懸濁液を混合した後,7,000×gで15
分間,4℃で遠心分離した。得られたペレットをSDS
で3回以上抽出した。C100−3を含有する,得られ
た上清をプールした。
ジネートの不溶性画分から10倍以上精製され,ポリペ
プチドの回収率は50%以上を越える。
mmli(1970)に従い,ポリアクリルアミドゲル
電気泳動により分析した。この分析に基づくと,ポリペ
プチドはその純度が80%を越え,見かけの分子量約5
4,000ダルトンを有していた。
イズする,感染個体のRNAの同定 IV.C.1.HCV cDNAにハイブリダイズす
る,NANBHのチンパンジーの肝臓内のRNAの同定 以下のように,NANBHのチンパンジーの肝臓由来の
RNAは,ノーザンブロットによりクローン81に含有
されるHCV cDNAとハイブリダイズする種類のR
NAを含有することが示された。
ンジーの肝臓の生検材料から単離した(IV.A.1.
節を参照のこと)。これには,哺乳動物細胞からの全R
NAの単離,ならびに該RNAのポリA+画分およびポ
リA−画分への分離についてManiatisら(19
82)に記載された技術を用いた。これらのRNA画分
を,ホルムアルデヒド/アガロースゲル(1% w/
v)での電気泳動に供し,ニトロセルロース膜に移し
た。(Maniatisら(1982))。ニトロセル
ロースフィルターを,クローン81由来の放射性標識H
CV cDNA(インサートのヌクレオチド配列につい
ては,第4図を参照のこと)とハイブリダイズさせた。
放射性標識プローブを調製するために,クローン81か
ら単離したHCV cDNAインサートを,DNAポリ
メラーゼIを用いたニックトランスレーション(Man
iatisら(1982))により32Pで放射性標識
した。ハイブリダイゼーションは,10%(w/v)デ
キストランスルフェート,50%(w/v)脱イオン化
ホルムアミド,750mM NaCl,75mMクエン
酸ナトリウム,20mM Na2HPO4(pH6.
5),0.1%SDS,0.02%(w/v)ウシ血清
アルブミン(BSA),0.02%(w/v)フィコー
ルー400,0.02%(w/v)ポリビニルピロリド
ン,100μg/mlの超音波処理および変性処理によ
りせん断したサケ精子DNA,および106CPM/m
lのニックトランスレーションしたcDNAプローブを
含有する溶液中で18時間,42℃で行った。
ジオグラフを,第55図に示す。レーン1は,32P−
標識した制限フラグメントマーカーを含有する。レーン
2−4は,以下のようなチンパンジー肝臓のRNAを含
有する:レーン2は,30μgの全RNAを含有し;レ
ーン3は,30μgのポリA−RNAを含有し;そして
レーン4は,20μgのポリA+RNAを含有する。第
55図に示すように,NANBHのチンパンジーの肝臓
は,HCV cDNAプローブにハイブリダイズし,か
つ約5000ヌクレオチドから約11,000ヌクレオ
チドの大きさと考えられる,ポリA+RNA分子関連の
異種集団を含有する。HCV cDNAにハイブリダイ
ズするこのRNAは,細菌ゲノムおよび/または細菌ゲ
ノムの特異的転写物を意味し得る。
は,HCVは一つのRNAゲノムを有するという示唆と
一致する。
HCV由来RNAの同定 IV.A.1.節で記述したように,核酸を,高力価の
チンパンジーNANBH血漿から単離した粒子から抽出
した。単離した核酸の一定量(もとの血漿の1mlに相
当する)を,20μlの50mMHepes(pH
7.5),1mmEDTAおよび16μg/ml酵母可
溶性RNAに再懸濁した。試料は,5分間煮沸した後,
直ちに凍結することにより変性させ,RNase A
(5μl;25mM EDTA溶液,40mMHepe
s(pH 7.5)に0.1mg/ml RNase
Aを含有する)またはDNase I(5μl;10m
MMgCl2,25mM Hepes(pH 7.5)
中に1単位のDNaseIを含有する)で処理した。対
照の試料は,酵素なしでインキュベートした。インキュ
ベーションの後,2μg/ml酵母可溶性RNAを含有
する230μlの氷冷2×SSCを添加し,試料をニト
ロセルロースフィルターで濾過した。このフィルター
を,ニックトランスレーションにより32P−標識した
クローン81由来のcDNAプローブとハイブリダイズ
させた。第56図は,このフィルターのオートラジオグ
ラフを示す。ハイブリダイゼーションのシグナルは,D
Nase処理試料および対照試料(それぞれ,レーン2
および1)で検出されたが,RNaseで処理した試料
(レーン3)では検出されなかった。このように,RN
ase A処理により粒子から単離した核酸が分解さ
れ,DNase処理は何の影響もなかったので,この証
拠により,HCVゲノムがRNAにより構成されるとい
うことが強く示唆される。
ンジーから得られる肝臓および血漿試料におけるHCV
核酸配列由来の増幅HCV核酸配列の検出 NANBHを有するチンパンジーの肝臓および血漿中に
存在するHCV核酸,および対照のチンパンジーにおけ
るHCV核酸は, 基本的にSaikiら(1986)
が記述したポリメラーゼ鎖反応(PCR)の手法を用い
て増幅された。このプライマーオリゴヌクレオチドは,
クローン81,あるいはクローン36および37におけ
るHCV cDNA由来であった。この増幅された配列
は,適当なcDNAオリゴマー(これは,2つのプライ
マーの間の領域を有するが2つのプライマーを含まな
い)をプローブとして用い,ゲル電気泳動およびサザン
ブロッティングによって検出された。
むRNA試料は,NANBHを保有する3匹のチンパン
ジーおよび2匹の対照のチンパンジーの肝臓の生体試料
から単離された。RNA画分の単離は,IV.C.1節
に記載したグアニジウムチオシアネート法により行なっ
た。
もまた,2匹のNANBH保有チンパンジーおよび1匹
の対照チンパンジー,さらに対照のチンパンジーから得
られる貯留した血漿から単離された。1匹の感染チンパ
ンジーは,106と同等かそれを越えるCID/mlを
有し,他の感染チンパンジーは,105と同等かそれを
越えるCID/mlを有する。
した。血漿の0.1mlのもしくは0.01mlを10
μg/mlのポリアデニル酸を含有するTENB/プロ
ティナーゼK/SDS溶液(0.05M Tris−H
Cl,pH8.0,0.001M EDTA,0.1M
NaCl,1mg/mlプロテイナーゼK,および
0.5% SDS)で最終体積が1.0mlになるよう
に希釈し,37℃にて60分間インキュベートした。こ
のプロテイナーゼKによる分解の後,フェノール飽和T
E(10.0mM Tris−HCl,pH8.0,1
mM EDTA)を用いた抽出により,脱タンパクし
た。遠心分離によりフェノール層を分離し,0.1%の
SDSを含むTENBで再抽出した。それぞれの抽出で
得られる水相をプールし,等容量のフェノール/クロロ
ホルム/イソアミルアルコール〔1:1(99:2)〕
溶液で2度抽出し,その後等容量のクロロホルム/イソ
アミルアルコール(99:1)の混液を用いて,2度抽
出した。遠心分離により相分離し,水相を,酢酸ナトリ
ウムの最終濃度が0.2Mとなるようにし,エタノール
を2倍量添加することにより核酸を沈澱させた。沈澱し
た核酸は,SW41のローターで38Kにて4℃で60
分間超遠心分離を行なうことにより回収した。
漿およびプールされた対照の血漿のどちらか一方を,C
homcyzskiおよびSacchi(1987)の
方法により,50μgのポリA担体を用いて抽出した。
この方法では,酸グアニジウムチオシアナート(aci
d guanidinium thiocyanat
e)抽出を使用する。RNAを,エッペンドルフ マ
イ,クロフュージ中で,4℃にて10分間,10,00
0RPMにて遠心分離することにより回収した。
るcDNAの合成に先立って,プロテイナーゼK/SD
S/フェノール法によって血漿から抽出された核酸は,
さらにSおよびSエルチップ−R(S Elutip−
R)カラムに結合させ,このカラムから溶出させること
により精製した。それに続く工程は製造者の指示により
行なった。
Aは,上述のように調製された核酸(全核酸または全R
NA)から誘導された。エタノール沈澱に続き,沈澱し
た核酸を乾燥し,蒸留水処理したDEPCに再懸濁し
た。核酸の2次構造を,試料を65℃にて10分間加温
することによって引き離し,そして,速やかに試料を氷
で冷却した。cDNAは,肝臓,あるいは10〜100
μlの血漿から抽出された核酸(あるいはRNA)から
得られる総チンパンジーRNA 1〜3μgを用いて合
成された。この合成は逆転写酵素を利用し,製造者BR
Lによって詳細に述べられているプロトコールを用い,
25μlの反応液中で行われた。cDNA合成用のプラ
イマーは,後述のPCR反応でもまた利用されているプ
ライマーであった。cDNA合成のすべての反応混合物
には,RNAase阻害剤であるRNASINTM(F
isher/Promega)を23U含有していた。
cDNA合成に続き,この反応混合物を水で希釈し,1
0分間煮沸し,氷上ですばやく冷却した。
Aの添加を除いては,製造者(Cetus−Perki
n−Elmer)の指示に従って行なった。この反応
は,最終容量が100μlとなるように行なわれた。こ
のPCRは,37℃,72℃,および94℃の条件下
で,35サイクルにわたって行なわれた。
応プライマーは,クローン81,クローン36,あるい
はクローン37bのいずれかにおけるHCV cDNA
配列から得られた。(クローン81,36および37b
のHCV cDNA配列は,第4図,第5図および第1
1図にそれぞれ示されている。)クローン81由来の2
個の16量体プライマーの配列は次のとりである: 5’CAA TCA TAC CTG ACA G 3’ および 5’GAT AAC CTC TGC CTG A 3’。
列は次のとおりである: 5’GCA TGT CAT GAT GTA T 3’。
配列は次のとおりである: 5’ACA ATA CGT GTG TCA C 3’。
の対は,クローン81由来の2つの16量体プライマー
対;あるいはクローン36由来の16量体プライマーと
クローン37b由来の16量体プライマーとの対のいず
れによっても構成される。
カリゲル電気泳動にかけサザンブロッティングを行い,
プライマーと重複しないHCV cDNA領域由来の
32P標識内部のオリゴヌクレオチドプローブにより増
幅されたHCV−cDNA配列を検出することによって
分析された。このPCR反応混合物をフェノール/クロ
ロホルムで抽出し,核酸を,塩およびエタノールを用い
て水相から沈澱さた。沈澱させた核酸を遠心分離で回収
し,蒸留水に溶解させた。試料の一部は,1.8%アル
カリアガロースゲルで電気泳動を行った。60,108
および161のヌクレオチド長の一本鎖DNAを,分子
量マーカーとして,同時に電気泳動にかけた。電気泳動
後,このゲル中のDNAを,Biorad Zeta
ProbeTM紙に移した。プレハイブリダイゼーショ
ンおよびハイブリダイゼーション,および洗浄条件は,
製造者(Biorad)によって規定される条件に従っ
た。
リダイゼーション検出に用いられたプローブは次のとお
りである。PCRプライマーの対がクローン81由来で
あるときには,2つのプライマーの配列の間の領域に位
置する配列に対応する配列を有する108量体であっ
た。このPCRプライマー対がクローン36および37
b由来であるとき,このプローブはクローン35由来
の,ニック翻訳されたHCV cDNA挿入物であっ
た。このプライマーはクローン37挿入物の155〜1
70ヌクレオチドおよびクローン36挿入物の206〜
268ヌクレオチド由来である。クローン35における
HCV cDNA挿入物の3’末端は,クローン36の
挿入物の1〜186のヌクレオチドと重複しており,そ
して,クローン35挿入物の5’末端はクローン37b
の挿入物の207〜269ヌクレオチドと重複する。
(第5,第8,および第11図を比較されたい。)この
ように,クローン35中のcDNAの挿入物は,クロー
ン36および37b由来のプライマーの配列間の領域部
分にまでおよび,これらプライマーを含む増幅配列のた
めのプローブとして有用である。
ーおよびプローブの両セットを利用する上記方法に従っ
て行なった。3匹のNANBH保有チンパンジーの肝臓
由来のRNAは,予期されるサイズの増幅配列(81お
よび36および37bにおいて,それぞれ161および
586ヌクレオチド)については,ハイブリダイゼーシ
ョンの結果が陽性であり,他方,対照のチンパンジーに
ついては,ハイブリダイゼーションの結果が陰性であっ
た。この実験を3回繰りかえしたところ同じ結果が得ら
れた。
もまた,クローン81由来のプライマーおよびプローブ
を利用する上記方法により行なわれた。この血漿は,2
匹のNANBH保有チンパンジー由来の血漿,対照のチ
ンパンジー由来の血漿,そして対照のチンパンジーから
得られるプールされた血漿である。両NANBH血漿
は,核酸/RNAを有し,PCR増幅アッセイで陽性の
結果が得られ,他方,両対照血漿は陰性の結果が得られ
た。これらの結果は数回繰り返して得られた。
抗体を検出するためのラジオイムノアッセイ HCV抗原に対する抗体を検出する固相ラジオイムノア
ッセイは,TsuおよびHerzenberg(198
0)の方法を基にして開発された。マイクロタイタープ
レート(Immulon 2,Removawells
trips)をHCVエピトープを有する精製ポリペプ
チドで被覆する。この被覆プレートは,HCVエピトー
プに対する抗体を有する疑いのあるヒト血清試料,ある
いは適当な対照試料とともにインキュベートされる。イ
ンキュベートを行なう間に,抗体が存在するのであれ
ば,該抗体は固相抗原に免疫学的に結合する。非結合物
質を除去し,そしてこのマイクロタイタープレートを洗
浄後,ヒト抗体−NANBV抗原複合体は,125I標
識ヒツジ抗ヒト免疫グロブリンとともにインキュベート
することによって検出される。結合しなかった標識抗体
を吸引によって除去し,そしてプレートを洗浄する。個
々のウェルの放射能が測定される。結合ヒト抗HCV抗
体の量はウェル中の放射能に比例する。
NANB5−1−1の精製 IV.B.1.節に記載の組換え体細菌中で発現する融
合ポリペプチドSOD−NANB5−1−1は,組換え
体E. coliから,尿素で細胞抽出物を分画抽出す
ることによって,次いで,次のように陰イオンおよび陽
イオン交換カラムでのクロマトグラフィーにかけること
によって精製された。
を,0.01M トリス−HCl,pH8.0,を含有
する10mlの20%(W/V)シュークロース中に再
懸濁し,0.4mlの0.5M EDTA,pH8.
0,を添加した。0℃にて5分後,この混合物を4,0
00×gにて10分間遠心分離した。得られたペレット
を0.05M トリス−HCL,pH8.0,1mMフ
ェニルメチルスルホニルフルオライド(PMSF)およ
びペプスタチンA 1μgを含有する10mlの25%
(W/V)シュークロース液に懸濁させ,次いで,0.
5mlのリゾチーム(10mg/ml)を添加し,0℃
で10分間インキュベートした。0.05M トリス−
HCl,pH8.0,1mM EDTA中に1%(V/
V)のトリトンX−100を含む溶液10mlを添加
後,この混合液を,時々振盪しながらひきつづき0℃に
て10分間インキュベートした。得られた粘稠な溶液
を,20ゲージの滅菌皮下注射針を6回通すことによ
り,ホモジナイズし,13,000×gにて25分間遠
心分離した。ペレット化した物質を,0.01M トリ
ス−HCl (pH8.0)5mlに懸濁させ,この懸
濁液を,4,000×gにて10分間遠心分離した。S
OD−NANB5−1−1融合タンパクを含有するペレ
ットを,0.02M トリス−HCl(pH8.0),
1mMジチオスレイトール(緩衝液A)中に6M尿素を
含む溶液5mlに溶解させ,緩衝液Aで平衡化したQ−
セファロースファースト フローカラムにかけた。ポリ
ペプチドは,緩衝液AのNaCl中0.0〜0.3Mの
リニアグラジエントで溶出した。溶出後,各画分を,S
ODの存在下,ポリアクリルアミドゲル電気泳動にかけ
て分析し,SOD−NANB5−1−1の含量を決定し
た。このポリペプチドを含有する画分をプールし,0.
02Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH6.0),1mM
ジオチスレイトール,に6M尿素を含む緩衝液(緩衝液
B)に対して透析した。この透析試料を,緩衝液Bで平
衡化したS−セファロース ファースト フローカラム
にかけ,ポリペプチドを緩衝液B中でNaCl0.0〜
0.3Mのリニアグラジエントで溶出させた。この画分
を,ポリアクリルアミドゲル電気泳動で分析し,SOD
−NANB5−1−1の存在を調べ,適当な画分をプー
ルした。このSOD−NANB5−1−1ポリペプチド
の最終調製物を,SDSの存在下で,ポリアクリルアミ
ド電気泳動にかけて調べた。この分析によれば,この調
製物は,80%を越える純度であった。
NANB81の精製 IV.B.2.節で記載の組換え体細菌中で発現した融
合ポリペプチドSOD−NANB81は,組換え体E.
coliから,尿素を用いた細胞抽出物の分画抽出に
より,次いで,融合ポリペプチドSOD−NANB
5−1−1を単離するために記載された工程(IV.
D.1.節を参照されたい)を用いて,陰イオンおよび
陽イオン交換カラムクロマトグラフィーを行なうことに
より精製された。
調製物は,SDSの存在下でポリアクリルアミドゲル電
気泳動によって調べられた。この分析によれば,この調
製物は50%を越える純度であった。
によるHCVエピトープに対する抗体の検出 NANBHを有すると診断された32人の患者から得ら
れる血清試料を,ラジオイムノアッセイ(RIA)によ
って分析し,融合ポリペプチドSOD−NANB
5−1−1およびSOD−NANB81中に存在するH
CVエピトープに対する抗体が検出されるか否か決定し
た。
NB5−1−1あるいはSOD−NANB81(それぞ
れ,IV.D.1節およびIV.D.2節に従って,部
分精製されている)で被覆した。この分析は,次のよう
にして行なわれた。
0.075 M NaCl(BBS)中 に0.1〜
0.5μgのSOD−NANB5−1−1あるいはSO
D−NANB81を含む100μlを,マイクロタイタ
ープレート(DynatechImmulon 2 R
emovawell Strips)の各ウェルに添加
した。このプレートを湿潤チャンバー内で4℃にて一晩
インキュベートし,その後,このタンパク溶液を除去
し,0.02% トリトンX−100を含有するBBS
(BBST)で3度このウェルを洗浄した。非特異的な
結合を防ぐために,このウェルを牛血清アルブミン(B
SA)で被覆した。この操作は,BSAを5mg/ml
の割合でBBSに溶解させた溶液100μl添加し,次
いで,室温で1時間インキュベートすることによって行
なった。このインキュベートの後,BSA溶液を除去し
た。被覆されたウェル中のポリペプチドを血清と反応さ
せ,該血清含有ウェルを37℃にて1時間インキュベー
トした。上記血清との反応は,10mg/ml BSA
を含有する含0.01Mリン酸ナトリウム緩衝液,pH
7.2 0.15M NaCl(PBS)中に1:10
0の割合に希釈された血清試料100μlを添加するこ
とにより行なった。インキュベートの後,この血清試料
を吸引除去し,このウェルをBBSTで5回洗浄した。
この融合ポリペプチドに結合した抗NANB5−1−1
およびNANB81は,125I標識F’(ab)2ヒ
ツジ抗ヒトIgGをこの被覆ウェルに結合させることに
より,決定された。標識プローブ(比活性5〜20μC
i/μg)100μlを各ウェルに添加し,このプレー
トを,37℃にて1時間インキュベートした。次いで,
過剰のプローブを吸引除去し,BBSTで5回洗浄し
た。各ウェルに結合した放射能の量を,γ線を検出する
カウンターでカウントし決定した。
5−1−1および抗NANB81の検出結果を,表1お
よび表2に示す。
BHを保有していると診断された患者から得られた32
の血清のうち19が,SOD−NANB5−1−1およ
びSOD−NANB81に存在するHCVエピトープに
対する抗体について陽性であった。
−NANB5−1−1およびSOD−NANB81と同
様に免疫学的に反応性を有しているわけではなかった。
No.1の患者から得られた血清試料は,SOD−NA
NB81に対しては陽性であったがSOD−NANB
5−1−1に対しては陽性ではなかった。No.10,
15および17の患者から得られた血清試料はSOD−
NANB5−1−1に対しては陽性であったが,SOD
−NANB81に対しては陽性ではなかった。No.
3,8,11および12の患者から得られた血清試料は
SOD−NANB5−1−1およびSOD−NANB
81の両融合ポリペプチドと同程度に反応するが,これ
に対してNo.2,4,7および9の患者から得られる
血清試料においては,SOD−NANB81に対するよ
りもSOD−NANB5−1−1に対する反応の方が,
2〜3倍反応性が高かった。これらの結果によりNAN
B5−1−1およびNANB81が少なくとも3個の異
なるエピトープを有し得ることが示唆される。つまり,
各ポリペプチドが少なくとも1個の独特のエピトープを
有し,そして,2個のポリペプチドが少なくとも1個の
エピトープを共有していることが可能である。
RIAの特異性 NANBHについての固相RIAの特異性は,HAVあ
るいはHBVに感染した患者から得られる血清および対
照個体から得られる血清の分析を行なうことにより試験
された。部分精製されたSOD−NANB5−1−1お
よびSOD−NANB81を使用する分析は,実施例I
V.D.3節に記載した方法により行なわれた。但し,
血清は,HAVあるいはHBVを有しているとあらかじ
め診断された患者から得られた血清であるか,あるいは
血液バンクの提血者である個体から得られた血清であ
る。HAVおよびHBV感染患者からの血清についての
結果を表1および表2に示す。HAV感染患者から得ら
れた11個の血清試料,およびHBV感染患者から得ら
れた20個の血清試料を用いて,RIAにより試験が行
なわれた。表1および表2に示すように,これら血清の
いずれもがBB−NANBVエピトープを有する融合ポ
リペプチドとの陽性の免疫反応を行わなかった。
が,対照個体から得られる血清の免疫学的反応性を決定
するために用いられた。正常血液提供者集団から得られ
る230個の血清検体のかち,2個だけがRIAにおい
て陽性反応を示した(データは示されていない)。これ
ら血清サンプルの源である2人の血液提供者は,以前に
HCVにさらされた可能性がある。
けるNANB5−1−1の反応性 2人の患者および4匹のチンパンジーのNANBH感染
進行中における抗NANB5−1−1抗体の存在が,I
V.D.3節に記載されたRIA法を用いて追跡され
た。さらに,感染チンパンジーにおいて,HAVおよび
HBVの感染進行中における抗NANB5−1−1抗体
の有無を決定するためにRIAが用いられた。
果により,チンパンジーおよびヒトにおいては,抗NA
NB5−1−1抗体は,NANBH感染の急性症状の発
現に従って検出された。抗NANB5−1−1抗体は,
HAVあるいはHBVに感染したチンパンジーから得ら
れる血清試料では検出されなかった。このように,抗N
ANB5−1−1抗体は,個体がHCVにさらされたこ
とを示すマーカーとしての働きを有する。
リクローナル血清抗体の精製 SOD−NANB5−1−1ポリペプチドと,NANB
Hの患者由来の血清試料中の抗体との特異的な免疫学的
反応性に基づいて,NANB5−1−1中のエピトープ
と免疫学的に反応する血清抗体の精製法が開発された。
この方法はアフィニティークロマトグラフィーを利用す
る方法である。精製されたSOD−NANB5−1−1
ポリペプチド(IV.D.1.節参照)を,不溶性の支
持体に結合させたが,その結合は,固定されたポリペプ
チドが,NANB5−1−1に対する抗体の親和性を保
持するような結合である。血清試料中の抗体は,マトリ
ックスに結合したポリペプチドに吸収される。洗浄し
て,非特異的に結合した物質と未結合の物質を除去した
後,pHの変更および/またはカオトロピック試薬(例
えば尿素)によって,結合した抗体を,これが結合して
いるSOD−HCVポリペプチドから脱離させる。
るニトロセルロース膜を下記のようにして調製した。ニ
トロセルロースの膜〔2.1cmのザルトリウス(Sa
rtorius),微細孔の径:0.2μm〕を,BB
Sで3分間ずつ3回洗浄した。精製した製剤を,BBS
中,室温で2時間かまたは4℃で一夜インキュベートす
ることによってSOD−NANB5−1−1を上記の膜
に結合させた。未結合の抗原を含有する溶液を除去し,
フィルターをBBSで3分間ずつ3回洗浄した。膜に残
っている活性部位を,5mg/mlのBSA溶液ととも
に30分間インキュベートすることにより,BSAでブ
ロックした。得られた膜を,BBSで5回,蒸留水で3
回洗浄して,過剰のBSAを除去した。ウイルス抗原と
BSAを含有する膜を,次に,0.05Mの塩酸グリシ
ン(pH2.5),0.10MNaCl(Gly HC
l)で15分間処理し,次いでPBSで3分間ずつ3回
洗浄した。
融合ポリペプチドを含有する膜を,2時間インキュベー
トすることによって,ポリクローナル抗NANB
5−1−1抗体を単離した。インキュベーション後,フ
ィルターをBBSで5回,蒸留水で2回洗浄した。次い
で結合している抗体を,各フィルターから,GlyHC
lを5回,3分間ずつ用いて溶離した。各溶離液を,
2.0MトリスHCl緩衝液(pH8.0)の入ってい
る試験管に集めて,溶離液のpHを8.0に調整した。
アフィニティークロマトグラフィーで処理した後の抗N
ANB5−1−1抗体の回収率は約50%である。
ース膜は,結合容量はそれほど減少することなしに数回
使用することができる。膜を再使用するには,抗体を溶
離した後,膜をBBSで3回3分間ずつ洗浄する。次い
でBBS中,4℃で貯蔵する。
CV抗体を用いて感染血漿からHCV粒子を捕獲する方
法;捕獲された粒子中の核酸のHCV cDNAへのハ
イブリダイゼーション IV.F.1.ヒトポリクローナル抗−HCV抗体を用
いて感染血漿からHCV粒子を捕獲する方法 NANBHに感染したチンパンジーの感染性血漿中に存
在するタンパク−核酸複合体を,ポリスチレンビーズに
結合させた精製ヒトポリクローナル抗HCV抗体を用い
て精製した。
は,クローン5−1−1にコードされたSOD−HCV
ポリペプチドを用いて,NANBHに感染したヒト由来
の血清から精製した。精製法はIV.E.節に記載の方
法を用いた。
チレンビーズ(直径1/4”, 鏡面仕上げ,Prec
ision Plastic Ball Co.,シカ
ゴ,イリノイ)に,各々,室温で一夜,1mlの抗体
〔ホウ酸緩衝食塩水(pH8.5)中1μg/ml〕と
ともにインキュベートすることによって結合させた。一
夜インキュベーションした後に,ビーズを,TBST
(50mMトリスHClpH8.0緩衝液,150mM
Nacl,0.05%(V/V)Tween20)で
1回洗浄し,次に10mg/ml BSAを含有するリ
ン酸緩衝食塩水(PBS)で洗浄した。
疫グロブリンと取替えること以外は,同様にして対照の
ビーズを調製した。
抗体を用いて,NANBHに感染したチンパンジーの血
漿から,HCVを次のようにして捕獲した。使用した,
NANBHに感染したチンバンジーの血漿についてはI
V.A.1.節に記載してある。NANBVに感染した
チンパンジーの血漿の一部(1ml)を,抗NANB
5−1−1抗体または対照の免疫グロブリンでコートし
た5個のビーズの各々と,37℃で3時間インキュベー
トした。得られたビーズをTBSTで3回洗浄した。
NANBV−cDNAへのハイブリダイゼーション 抗NANB5−1−1抗体によって捕獲された粒子から
遊離した核酸成分を,クローン81由来のHCV cD
NAとハイブダイゼーションさせて分析した。
て,HCV粒子をNANBHに感染したチンパンジーの
血清から捕獲した。該粒子から核酸を遊離させるため
に,洗浄したビーズを,プロテイナーゼK(1mg/m
l),10mMトリスHClpH7.5緩衝液,10m
M EDTA,0.25%(W/V)SDS,10μg
/mlの可溶性酵母RNAを含有する溶液の0.2ml
/ビーズとともに,37℃で60分間インキュベート
し,次いで上澄み溶液を取出した。この上澄み液をフェ
ノールとクロロホルムで抽出し,次いで核酸をエタノー
ルで,一夜−20℃にて沈殿させた。この核酸の沈殿
を,遠心分離して集め,乾燥し,50mMHepes,
pH7.5に溶解させた。抗NANB5−1−1抗体で
コートされたビーズから得た試料および全ヒト免疫グロ
ブリンを含有する対照ビーズで得た試料からの可溶性核
酸の二つの部分をニトロセルロースフィルターに吸い取
らせた。これらのフィルターを,クローン81中の精製
HCV cDNA断片で作製した,32Pで標識し,ニ
ックトランスレーションを行ったプローブとハイブッド
させた。プローブ調製法およびハイブリダイゼーション
法は,IV.C.1.節に記載してある。
ズによって捕獲された粒子由来の核酸を含有するプロー
ブされたフィルターのオートラジオグラフを第57図に
示す。抗NANB5−1−1抗体を用いて得た抽出物
(A,A)から,対照の抗体抽出物(A,A)および対
照の酵母RNA(B,B)に比べて明確なハイブリダイ
ゼーションシグナルを得た。精製クローン81 cDN
A断片の1pg,5pgおよび10pgからなる標準物
をそれぞれC1−3に示す。
体によってNANBH血漿から捕獲された粒子が,クロ
ーン81内のHCV cDNAとハイブリダイゼーショ
ンする核酸を含有することを示し,その結果これらのク
ローン中のcDNAは,NANBHの病原体から誘導さ
れるという別の証拠を提供している。
5−1−1抗体との免疫学的反応性 C100−3融合ポリペプチドと抗NANB5−1−1
抗体との免疫学的反応性を,放射性免疫検定法によって
測定したが,この検定法では,固相に結合した抗原が,
精製抗NANB5−1−1抗体に投与され,生成した抗
原抗体複合物が,12Iで標識したヒツジ抗ヒト抗体で
検出された。C100−3ポリペプチドの免疫学的反応
性を,SOD−NANB5−1−1抗原のそれと比較し
た。
B.5.節とIV.B.6.節にそれぞれ記載したのと
同様にして合成し精製した。融合ポリペプチドSOD−
NANB5−1−1をIV.B.1.節とIV.D.
1.節にそれぞれ記載したのと同様にして合成し精製し
た。精製抗NANB5−1−1抗体を,IV.E.節に
記載したのと同様にして得た。
H8.3),0.075M NaCl(BBS)中,種
々の量の精製C100−3抗原を含有する100μlの
アリコットを,マイクロタイタープレート(Dynat
ech Immulon2Removawell St
rips)の各ウェルに添加した。このプレートを加湿
チャンバー内で,一夜4℃にてインキュペートした。次
いでタンパク溶液を除き,ウェルを0.02%のTri
ton X−100含有のBBS(BBST)で3回洗
浄した。非特異的結合を防止するために,5mg/ml
のBSAを含有するBBS溶液を100μl添加するこ
とによって,ウェルをBSAでコートし,次いで室温で
1時間インキュベートした後,過剰のBSA溶液を除去
した。ウェル当り1μgの抗体を添加することによっ
て,コートされたウェル内のポリペプチドを,精製抗N
ANB5−1−1抗体と反応させ,次いでその試料を3
7℃で1時間インキュベートした。インキュベートした
後,過剰の溶液を吸引によって除去し,ウェルをBBS
Tで5回洗浄した。12Iで標識したF’(ab)2ヒ
ツジ抗ヒトIgGを,コートされたウェルに結合させる
ことによって,融合ポリペプチドに結合した抗NANB
5−1−1を測定した。標識したプローブ(比放射能:
5〜20μCi/mg)の100μlずつを各ウェルに
添加し,そのプローブを37℃で1時間インキュベート
し,過剰のプローブを吸引で除去し,BBSTで5回洗
浄した。各ウェルに結合した放射能の量は,γ線を検出
するカウンターで計数することによって測定した。
免疫学的反応性を,NANB5−1−1の精製抗体との
免疫学的反応性と比較した結果を表5に示す。
C100−3ポリペプチドのC100の部分内のエピト
ープを認識するということを示している。したがってN
ANB5−1−1とC100は共通のエピトープをもっ
ている。これらの結果は,このNANBVエピトープを
コードするcDNA配列が,クローン5−1−1とクロ
ーン81の両者に存在する配列であるということを示唆
している。
randedness)の特性決定 抗NANB5−1−1抗体でコートしたポリスチレンビ
ーズに捕獲された粒子から核酸の画分を単離し,次に単
離した核酸が,HCV cDNAの正鎖および/または
負鎖とハイブリダイゼーションするか否かを測定するこ
とによって,HCVゲノムをそのストランドの状態につ
いて特性決定した。
免疫学的に精製した抗NANB5−1−1抗体でコート
したポリスチレンビーズを用いて,HCVに感染したチ
ンパンジーの血漿から,粒子を捕獲した。粒子の核酸成
分を,IV.F.2.節に記載した方法を用いて遊離さ
せた。3mlの高力価血漿と当量の単離されたゲノム核
酸のアリコットを,ニトロセルロースフィルターに吸い
取らせた。対照として,クローン81由来の変性HCV
cDNA(2pg)のアリコットを同じフィルターに
吸い取らせた。そのフィルターを,HCV cDNAか
らクローン化された一本鎖DNAの,正鎖または負鎖の
32Pで標識した混合物でプローブした。なお該cDN
Aは,クローン40b,81および25cから切り出さ
れたものである。
25cからHCV cDNAを切り出し,そのcDNA
断片をN13ベクターのmp18とmp19内でクロー
ン化することによって,一本鎖のプローブを得た〔メシ
ング(Messing)1983年〕。そのM13クロ
ーンの塩基配列を決定し,そのクローンがHCV cD
NA由来のDNAの正鎖もしくは負鎖をもっているかど
うかを決定した。塩基配列の決定は,サンガーら(Sa
nger et al)(1977年)のジデオキシチ
ェーンターミネーション法で行った。
ムの一部を含有する二重のフィルターの各セットを,H
CV cDNA由来の正鎖または負鎖のプローブとハイ
ブリダイゼーションさせた。第58〜60図は,NAN
BVゲノムを,クローン81,40bおよび25c由来
のプローブの混合物でプローブして得たオートラジオグ
ラフを示す。この混合物は,ハイブリダイゼーション検
定法の感度を増大させるために用いた。パネルIの試料
を,正鎖プローブの混合物とハイブリダイゼーションさ
せた。パネルIIの試料を,負鎖のプローブ混合物でハ
イブリダイゼーションさせることによってプローブし
た。免疫ブロット法に付したパネルの試料を表6に示
す。
負鎖のDNAプローブだけが,単離されたHCVゲノム
とハイブリダイゼーションする。この結果は,ゲノムが
RNaseには感受性であるがDNaseには感受性で
ないという結果(IV.C.2.節参照)と併せて,N
ANBVのゲノムが正鎖のRNAであることを示唆して
いる。
物理化学的性質に関する他の実験室のデータは,HCV
がフラビウイルス科に属する可能性があることを示して
いる。しかし,HCVが,新種のウイルス因子に相当す
る可能性も無視できなかった。
クローン81由来のHCV cDNAとハイブリダイゼ
ーションする捕獲粒子の塩基配列の検出法 捕獲粒子のRNAを,IV.H.1.節に記載したのと
同様にして得た。クローン81由来のHCV cDNA
とハイブリダイゼーションする塩基配列の分析を,第I
V.C.3節に記載したのと同様にしてPCR増幅法を
利用して行ったが,ハイブリダイゼーションプローブは
クローン81 cDNA塩基配列由来のキナーゼで活性
化されたオリゴヌクレオチドを用いた。試験結果は,増
幅された塩基配列がクローン81由来のHCV cDN
Aプローブとハイブリダイゼーションすることを示し
た。
(MNWWVDl)の非構造タンパクと,39Cに結合
されたクローン14iのORFによってコードされるH
CVポリペプチドとの間の相同性 39Cによって結合されたクローン14iのHCV c
DNAは,第29〜34図に示すように一つの連続OR
Fを含有している。これにコードされたポリペプチド
を,デング熱フラビウイルス(MNWVDl)の非構造
ポリペプチドの領域との配列相同性について分析した。
この分析は,デイホッフ(Dayhoff)のタンパク
データベースを用い,コンピュータで行った。結果を第
61図に示すが,図中,記号(:)は厳密な相同性を示
し,記号(.)は塩基配列が若干置換されていることを
示し,ダッシュ記号は,最大の相同性を得るため塩基配
列中に挿入されたスペースを示す。この図から分かるよ
うに,HCV cDNAにコードされた塩基配列と,デ
ング熱フラビウイルス非構造タンパクとの間には有意な
相同性がある。第61図に示す相同性に加えて,cDN
Aの3’末端の領域にコードされたポリペプチドセグメ
ントには,分析した結果,デング熱ポリメラーゼの塩基
配列と相同性の塩基配列が含まれていた。RNA依存性
RNAポリメラーゼに対して必須であると考えられる標
準的なGly−Asp−Asp(GDD)配列が,HC
V cDNAにコードされたポリペプチドに含まれ,そ
の位置がデング熱2ウイルス内の位置と一致していると
いうことは重要なことである(データは記載していな
い)。
BHに感染した組織内には検出できない 2種の研究結果は,HCV−DNAが,NANBHに感
染した個体由来の組織内には検出できないことを示唆し
ている。これらの結果は,IV.C.とIV.H.1.
とIV.H.2.の各節に記載した結果と併せて,HC
VがDNAを含有するウイルスではなく,その複製には
cDNAを含まないという証拠を提供している。
なHCV−DNA(もしくはHCV−cDNA)を含有
しているか否かを決定するために,この起源から単離し
たDNAの制限酵素による断片をサザンブロット法に付
して,ブロット物を32Pで標識したHCV cDNA
でプローブした。上記の標識したHCVcDNAは,感
染チンパンジーの肝臓由来のブロットされたDNAとハ
イブリダイゼーションをしないという結果を示した。ま
た同じ標識HCV cDNAは,正常なチンパンジーの
肝臓由来の対照のブロットされたDNAともハイブリダ
イゼーションをしなかった。これに対して,陽性対照に
おいては,β−インターフェロン遺伝子の標識したプロ
ーブが,制御酵素で切断したヒト胎盤DNAのサザンブ
ロット法に付したものと強くハイブリダイゼーションし
た。これらの系は,標識したプローブで検出すべき遺伝
子の単一コピーを検出するために設計された。
の肝臓からDNAを単離した。対照のDNAを,未感染
のチンパンジー肝臓とヒト胎盤から単離した。DNAの
抽出は,基本的にはマニアティスら(1982年)の方
法によって行い,そのDNA試料は,単離工程中,RN
Aseで処理した。
て,EcoRI,NboIまたはHincII(12μ
g)で処理した。切断したDNAを1%中性寒天ゲルで
電気泳動し,ニトロセルロース上にサザンブロットし,
次いでブロットされた物質は,適当なニックトランスレ
ーションされたプローブcDNAとハイブリダイゼーシ
ョンした(3×10cpm/mlのハイブリダイゼーシ
ョンミックス)。感染チンパンジーの肝臓と正常な肝臓
由来のDNAは,クローン36と81由来の32Pで標
識したHCV cDNAとハイブリダイゼーションし,
またヒト胎盤由来のDNAはβ−インターフェロン遺伝
子由来の32Pで標識したDNAとハイブリダイゼーシ
ョンした。ハイブリダイゼーション後,ブロットしたも
のを,厳密条件下,すなわち,0.1×SSCと0.1
%SDSを含む溶液を用い65℃で洗浄した。
ートンら(Houghton etal)(1981
年)が記述しているのと同様にして調製した。
の肝臓内に検出できるか否かを決定するために,DNA
をその組織から単離し,プライマーとクローン81のH
CV cDNA由来のプローブポリヌクレオチドを用い
て,PCR増幅検出法に付した。陰性対照は,未感染H
epG2組織の培養細胞と,未感染と思われるヒト胎盤
とから単離したDNA試料を用いた。陽性対照は,陰性
対照にクローン81由来のHCV cDNA挿入物の比
較的少ない既知量(250分子)を添加した試料を用い
た。
ーの同じ肝臓から単離したRNA画分が,HCV−cD
NAプローブに対して相補的な配列をもっていることを
確認するために,PCR増幅検出法を,単離したRNA
試料にも用いた。
節に記載の方法で単離し,RNAは,チャーギンら(C
hirgwin et al)(1981年)が記述し
ているのと同様にして抽出した。
の肝臓,未感染のHepG2細胞およびヒト胎盤から単
離した。各DNAの1μgをメーカーの説明書にしたが
ってHindIIIで切断した。逆転写酵素工程を省略
したことを除いて,IV.C.3節に記載と基本的に同
様にして,上記の切断試料を,PCR増幅法に付し,増
幅したHCV cDNAを検出した。PCRプライマー
とプローブは,HCVcDNAクローン81由来のもの
であり,IV.C.3.節に記載されている。増幅する
前に,陽性対照については,各DNA の試料1μg
は,クローン81から単離したHCV cDNA挿入物
の250分子を添加することによって「スパイク」され
た。
パンジーの肝臓から単離したRNAに存在しているか否
かを決定するために,0.4μgの全RNAを含有する
試料を,陰性対照試料のいくつかから逆転写酵素の工程
を省略すること以外は,IV.C.3.節に記載したの
と同様の増幅法に付した。PCRプライマーとプローブ
は,上記の記載と同様に,HCV cDNAクローン8
1由来のものであった。
補的な増幅された配列は,感染チンパンジーの肝臓由来
のDNA中には検出できず,また陰性対照にも検出でき
なかった。これとは異なり,感染チンパンジーの肝臓由
来のDNAを含む試料が増幅される前にHCV cDN
Aでスパイクされた場合,クローン81の配列がすべて
の陽性対照の試料に検出された。さらに,RNAの研究
では,増幅されたHCV cDNAクローン81の配列
が,逆転写酵素を用いた時にのみ検出されたが,これ
は,この結果がDNA汚染が原因でないことを強く示唆
している。
ンパンジー由来の肝細胞が,HCVDNAを全く含有し
ないか,または検出不可能な濃度で含有していることを
示している。スパイク法の研究によれば,HCV DN
Aが存在する場合,それは0.06コピー/肝細胞より
はるかに低い濃度である。これに対し,同じ肝臓試料由
来の全RNAのHCV配列は,PCR法によって容易に
検出された。
0−3を用いる,HCV感染のELISA法による決定 全試料を,HCV c100−3 ELISA法を用い
て検定した。この検定法は,HCV c100−3抗原
(IV.B.5節に記載したのと同様にして合成し精製
した)と,マウスモノクローナル抗ヒトIgGのホース
ラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)複合体とを利
用する。
レートを次のようにして調製した。コーティング緩衝液
(50mM ホウ酸ナトリウム,pH9.0)の21m
l/プレート,BSA(25μg/ml)およびc10
0−3(2.50μg/ml)を含有する溶液を,Re
moveawell Immulon Iプレート(D
ynatech Corp.)に添加する直前に調製し
た。5分間混合後,上記溶液0.2ml/ウェルをプレ
ートに添加した。プレートをカバーし2時間37℃でイ
ンキュベートし,次いで溶液を吸引して除去した。ウェ
ルを400μlの洗浄緩衝液〔100mMリン酸ナトリ
ウム(pH7.4),140mM塩化ナトリウム,0.
1%(W/V)カゼイン,1%(W/V)Triton
X−100,0.01%(W/V)Thimeros
al〕で1回洗浄した。洗浄液を除いた後,後コート溶
液200μl/ウェル(10mMリン酸ナトリウム(p
H7.2),150mM塩化ナトリウム,0.1%(W
/V)カゼインおよび2mMフッ化フニルメチルスルホ
ニル(PMSF)〕を添加し,プレートをゆるくカバー
して蒸発を防止し,室温で30分間放置した。次にウェ
ルから吸引して溶液を除き,保存加熱せずに一夜凍結乾
燥した。得られたプレートを,密封したアルミニウムパ
ウチ内に2〜8℃で貯蔵する。
の血清試料または対照試料を,200μlの試料希釈剤
〔100mMリン酸ナトリウム(pH7.4),500
mM塩化ナトリウム,1mMEDTA,0.1%(W/
V)カゼイン,0.015%(W/V)Therosa
l),1%(W/V)Triton X−100,10
0μg/ml酵母エキス〕の入ったウェルに添加した。
プレートを密封し,37℃で2時間インキュベートし,
その後溶液を吸引して除き,400μlの洗浄緩衝液
〔0.05%のTween20を含有するリン酸緩衝食
塩水(PBS)〕でウェルを洗浄した。洗浄したウェル
を,200μlのマウス抗ヒトIgG−HRP複合体を
含有する,オルト複合体希釈剤〔10mMリン酸ナトリ
ウム(pH7.2),150mM塩化ナトリウム,50
%(V/V)胎仔ウシ血清,1%(V/V)熱処理ウマ
血清,1mMK3Fe(CN)60.05%(W/V)
Tween20,0.02%(W/V)Thimero
sal〕の溶液で処理した。37℃で1時間処理を行
い,溶液を吸引によって除去し,ウェルを洗浄緩衝液で
洗い,緩衝液を吸引で除去した。結合した酵素接合体の
量を測定するために,200μlの基質溶液(10mg
の0−フェニレンジアミン二塩酸塩/5mlの展開剤溶
液)を添加した。展開剤溶液は,リン酸によってpH
5.1に調節された50mMのクエン酸ナトリウムと,
0.6μl/mlの30%H2O2を含有している。基
質溶液が入ったプレートを,暗所内で,30分間室温で
インキュベートし,反応は50μl/mlの4N硫酸を
添加して停止させ,ODを測定した。
原を利用するマイクロタイタープレートのスクリーニン
グELISA法が高い特異性を有することを示す。この
ことは,初期反応率が約1%で,反復反応率が任意のド
ナーについて約0.5%であることによって証明されて
いる。この検定法は,感染の急性期後および疾患の慢性
期の両方における免疫応答を検出することができる。さ
らに,この検定法は,NANBHに対する代理試験につ
いてマイナスの評価をされているいくつかの試料を検出
することができる。なおこれらの試料は,NANBHの
病歴を持つ個体またはNANBH伝染に関係があるドナ
ー由来のものである。
る。
HCVの感染 任意のドナーから得た1,056試料(新鮮な血清)
を,Irwin Memorial Blood Ba
nd(米国,カリフォルニア州,サンフランシスコ)か
ら得た。これらの試料によって得た試験結果を,OD値
の分布を示すヒストグラムにまとめる。(第62図)。
第62図から分かるように,4試料が3より大きい値を
示し,1試料が1と3の間,5試料が0.4と1の間,
および残りの1,046試料が0.4より小さい値を示
し,これらの試料の90%以上が0.1より小さい。
果を表7に示す。平均値+5標準偏差に等しいカットオ
フ値を用いた場合,1,056試料中の10試料(0.
95%)が最初反応性であった。これらの試料中5試料
(0.47%)は,前記のELISA法を用いて2回目
の検定を行ったところ繰り返し反応性を示した。また表
7は,繰り返し反応性を示した各試料に対してALTお
よび抗HBd状態を示している。特に興味深いのは,繰
り返し反応性であった5試料全部が,NANBHに対す
る両代理試験で陰性であり,一方HCV ELISA法
法では陽性であったということである。
100−3を用いたELISA法により試験した。これ
らのチンパンジーのうち4匹には,疾患管理センター
(the Centers for DiseaseC
ontrol)のDaniel Bradley博士と
共同して確立された方法に従って,第VIII因子の汚
染バッチに由来するNANBH(お くは,ハッチンソ
ン(Hutchinson)株であると推測される)を
感染させた。対照として,他の4匹のチンパンジーには
HAVを,そして3匹にはHBVを感染させた。血清試
料は,感染後の様々な時期に採取した。
れているが,ハッチンソン株のNANBHに感染させた
すべてのチンパンジーにおいて実証された抗体の血清転
換を示している。感染の急性期(ALTレベルが有意に
上昇し,続いて正常レベルに戻ることから示される)の
後は,HCV c100−3に対する抗体がNANBH
に感染させた4匹のチンパンジーのうち4匹の血清中で
検出し得るようになった。これら試料は,すでにIV.
B.3節で考察したように,ウェスタン(Wester
n)分析および放射性免疫検定法(RIA)により陽性
であることが示されている。これとは対照的に,HAV
またはHBVに感染させた対照のチンパンジーはELI
SA法における反応性を示した。
BHキャリアから得られた保証感染性血清 コードされたパネルは,22個の独自の試料から構成さ
れていた。ただし,これらの試料は,各々につき二重検
定を行うので,合計で44個であった。これらの試料
は,慢性NANBHキャリアから得た保証感染性血清,
関係供血者から得た感染性血清,および急性NANBH
患者から得た感染性血清からのものであった。さらに,
非常に由来が明確な陰性対照群,および他の疾患対照群
からも試料を得た。このパネルは,国立衛生研究所(N
ational Institutes of Hea
lth,Bethesda,Maryland)のHe
alth and Human Service部の
H,Alter博士から提供された。このパネルは,数
年前にAlter博士により構築され,推定NANBH
検定の適合パネルとして,Alter博士により使用さ
れてきた。
し,その結果を評価するためにAlter博士に送付し
た。評価の結果を表10に示す。この表には,二重検定
の一方の組の結果が示されているが,二重検定試料の各
々について同じ値が得られた。
において感染性であると証明された6個の血清は非常に
陽性であった。7番目の感染性血清は,急性NANBH
の場合の試料に対応しており,このELISAにおいて
反応性ではなかった。正常ALTレベルを有し,かつチ
ンパンジーでの研究結果が不明確であった関係供血者か
ら得た試料は,上記の分析において反応性ではなかっ
た。急性NANBHの1個体から得た3個の他の一連の
試料も反応性ではなかった。非常に由来が明確な陰性対
照群からの全ての試料は,少なくとも10回の献血で肝
炎の疑いがなかった供血者から得たものであるが,上記
のELISAにおいて反応性ではなかった。最後に,検
査試料のうち4個は,他人により開発された推定NAN
BH検定において陽性であると以前は評価されていた
が,これらの分析では確定できなかった。これらの4個
の試料は上記のHCV ELISA法では陰性と判定さ
れた。
のNANBH 前記のコードされたパネルは,輸血に関連するNANB
Hについて供血者および受血者が明確な10事例からな
り,試料の合計は188であった。各事例は,受血者に
対する数人またはすべての供血者の試料,およびこの受
血者から得た(輸血後,3カ月,6カ月,および12カ
月目に採血した)一連の試料からなるものであった。ま
た,輸血前に予め受血者から採血された血液試料も含ま
れていた。コードされたパネルは,NIHのH.Alt
er博士により提供されたものであり,結果は評価を行
うために同博士へ送付した。
LISA法により,輸血に関連するNANBHの10事
例のうち9事例において,抗体血清転換が検出されたこ
とを示している。事例4の試料(血清転換か全く検出さ
れなかった)は,前記ELISA法において,一貫して
反応性に乏しかった。10個の受血者試料のうち2個
は,輸血後3カ月で反応性があった。12ヵ月では,事
例4を除いて,すべての試料が反応性であった。さら
に,少なくとも1人の抗体陽性供血者が10事例のうち
7事例に見い出され,事例10には2人の陽性供血者が
存在した。また,事例10では,輸血前に採血した受血
者の血液はHCV抗体について陽性であった。この受血
者から得た1ヵ月目の採血試料は反応性レベルの境界線
まで低下したが,4ヵ月および10ヵ月目の採血試料で
は陽性レベルにまで上昇した。一般に,S/COが0.
4であれば,陽性であると考えられる。従って,この事
例では,個体が事前にHCV感染していたことを示して
いる。
べての試料に対するALTおよびHBcの状態を表12
に要約する。この表から明らかなように,供血者試料の
1/8は,代理マーカーに対しては陰性であったが,H
CV抗体ELISA法では反応性であった。他方,受血
者試料(輸血後12ヵ月まで引き続き採血された)は,
高いALTを有するか,または抗HBcが陽性である
か,あるいはその両方であった。
おけるHCV感染の決定 高危険率グループから得られた試料は,HCV c10
0−3抗原に対する反応性を決定するELISA法を用
いてモニターされた。これらの試料は,Gary Te
gtmeier博士(Community Blood
Bank,Kansas City)から得られた。
結果を表13に要約する。
も高い試料は,血友病者から得られる(76%)。さら
に,ALTが上昇し,抗HBcについて陽性の個体から
得られた試料は,51%が反応性であると評価された
が,この値は,臨床データから予想される値と一致して
おり,このグループ内にはNANBHが流行していた。
HCVに対する抗体の発生率は,ALTが高いだけの供
血者,B型肝炎コアに対する抗体について陽性であるだ
けの供血者,そして任意の志願供血者に比べてALTが
高いか,あるいは抗コア抗体を有するということ以外の
理由で拒否された供血者においても高かった。
LISA法における第2抗体として抗IgGまたは抗I
gMモノクローナル抗体あるいはポリクローナル抗体を
用いた比較研究 抗IgGモノクローナル複合体を用いたELISA法の
測定感度は,抗IgMモノクローナル複合体を用いる
か,あるいはこれら両者をH鎖およびL鎖の両方に特異
的であると報告されたポリクローナル抗血清で置き換え
ることにより得られる測定感度と比較された。以下の研
究が行われた。
た一連の試料 NANB血清転換者の3つの事例から得られた一連の試
料を,HCV c100−3 ELISA法で研究し
た。このELISA法では,酵素複合体に抗IgGモノ
クローナル抗体だけを用いるか,または抗IgMモノク
ローナル抗体と組合わせて用いるか,あるいはポリクロ
ーナル抗血清を用いた。これらの試料は,Cladd
Stevens博士(N.Y.Blood Cente
r,N.Y.C.,N.Y.)により提供された。試料
の歴史を表14に示す。
を用いて得られた結果を表15に示す。これらのデータ
は,事例1,2,および3の各試料1−4,2−8,お
よび3−5において,最初に強い反応性が検出されるこ
とを示している。
gM複合体の組合わせを用いて得られた結果を表16に
示す。抗IgMに対する抗IgGの3つの異なる割合で
試験した;抗IgGの希釈率1:10,000は終始一
定であった。抗IgMモノクローナル複合体の試験され
た希釈率は,1:30,000,1:60,000,お
よび1:120,000であった。これらのデータは,
抗IgGだけを用いた研究と同様に,試料1−4,2−
8,および3−5において,最初の強い反応性が検出さ
れることを示している。
1:10,000),またはTagoポリクローナル複
合体(希釈率1:80,000),あるいはJacks
onポリクローナル複合体(希釈率1:80,000)
を用いたELISA法で得られた結果を表17に示す。
これらのデータは,3種類の形態をすべて用いると,試
料1−4,2−8,および3−5において,最初の強い
反応性が検出されることを示している:Tagoのポリ
クローナル抗体は最も低いシグナルを与えた。
らかとなる)疾患の急性期後の同時期に,3種類の形態
により,反応性の試料が検出されることを示している。
また,これらの結果は,抗IgGモノクローナルー酵素
複合体を用いたHCV c100.3 ELISA法の
感度が,該酵素複合体について試験された他の形態と同
等またはそれ以上であることを示している。
得られた試料 任意抽出の供血者から得られた試料(IV.I.1.節
参照)を,HCV感染について,HCV c100−3
ELISA法によりスクリーニングした。このとき,
抗体−酵素複合体は,抗IgGモノクローム複合体また
はポリクローナル複合体のいずれかであった。スクリー
ニングされた試料の総数は,ポリクローナル複合体およ
びモノクローナル複合体に対して,それぞれ1077個
および1056個であった。スクリーニング結果の要約
を表18に示す。また,試料の分布を第63図のヒスト
グラムに示す。
が1.5を超えるような試料を除いて行った。すなわ
ち,ポリクローナル複合体を利用した場合の計算には1
073個のOD値を用い,抗IgGモノクローナル複合
体を利用した場合の計算には1051個のOD値を用い
た。表15から明らかなように,ポリクローナル複合体
を用いた場合には,平均値が0.0493から0.09
31にシフトし,標準偏差は0.074から0.093
3に増加した。また,これらの結果は,x+5SDとい
う基準を用いて分析のカットオフ値を定義すれば,EL
ISA法におけるポリクローナル酵素複合体の形態が,
より高いカットオフ値を必要とすることを示している。
このことは,モノクローナル系に比べて分析特異性が低
いことを示している。さらに,第63図のヒストグラム
から明らかなように,抗IgGモノクローナル複合体を
用いたELISA法で任意抽出の供血者をスクリーニン
グした場合には,市販のポリクローナル標識を用いた分
析に比べて,陰性および陽性の結果の分布間が大きく分
離する。
おけるHCV血清転換の検出 高いALT値に基づくとNANBH保持の疑いがある
が,HAVおよびHBV試験においては陰性である患者
から得られた血清を,HCV c100−3抗原をマイ
クロタイタープレートのスクリーニング抗原として用い
たこと以外は実質的にIV.D.節で述べたように,R
IA法を用いてスクリーニングした。表19に示された
結果から明らかなように,RIAにより,陽性試料が高
い割合で検出された。
者におけるHCV血清転換の検出 明白でない(すなわち,輸血,静脈注射による薬剤使
用,乱婚などが危険因子として同定されない)100人
のNANBH患者から得た血清は,M.Alter博士
(the Center for Disease C
ontrol)およびJ.Dieustag博士(Ha
rvard University)から提供された。
これらの試料を,HCV c100−3抗原をマイクロ
タイタープレートに付着させるスクリーニング用抗原と
して用いたこと以外は実質的にIV.D.節で述べたよ
うに,RIA法を用いてスクリーニングした。得られた
結果は,100個の血清試料のうち55個の試料が,H
CV c100−3抗原と免疫学的に反応する抗体を有
することを示した。
もまた,HCVにより引き起こされることを示唆してい
る。また,HCVがフラビウィルス属(その大部分は節
足動物により伝染する)と関係のあることがここで示さ
れているので,「集団獲得型」の場合におけるHCVの
伝染もまた,節足動物による伝染に起因することが示唆
される。 IV.L.NANBHの伝染に関係のある供血者のHC
V抗体および代用マーカーの発生率の比較 NANBH陽性の疑いのある供血者から輸血され,NA
NBHとなった受血者が,抗HCV抗体陽性に血清転換
するかどうかを決定し得る見込みがある研究を実施し
た。NANBH感染のマーカーとして現在使われている
代用マーカー(すなわち,高いALT値および抗コア抗
体の存在)の異常について供血者を試験した。さらに,
抗HCV抗体の存在についても供血者を試験した。抗H
CV抗体の存在は,IV.K.節で述べた放射性免疫検
定法を用いて決定した。この研究の結果を表20に示
す。この表には以下の項目が示されている:患者の番号
(第1列);患者の血清中における抗HCV抗体の存在
(第2列);患者の輸血回数,各輸血は異なる供血者に
よるものである(第3列);供血者の血清中における抗
HCV抗体の存在(第4列);そして,供血者の代用マ
ーカーの異常(第5列)(NT,すなわち…試験してい
ないことを意味する)(ALTは高いトランスアミナー
ゼであり,抗HBcは抗コア抗体である)。
供血者を検出するのに,代用マーカー試験より正確であ
ることを示している。NANBHの症状を示す10人の
患者のうち9人を試験したところ,抗HCV抗体血清転
換に関して陽性であった。陽性の疑いのある11人の供
血者のうち(NANBHキャリアである疑いのある2人
の別々の個体から輸血されたのは患者6であるが),9
人は抗HCV抗体に関して陽性であり,1人は陽性の境
界線上であり,(患者1に対する供血者は)不明確であ
った。これに対し,高ALT試験を用いると,10人の
供血者のうち6人が陰性であり,抗コア抗体試験を用い
ると,10人の供血者のうち5人が陰性であった。しか
しながら,非常に重要なことは,3つの場合(患者8,
患者9,および患者10に対する供血者の場合)におい
て,ALT試験および抗HBc試験の結果が一致しなか
ったことである。
保存領域から誘導されたPCRおよびプライマーを利用
したHCV cDNA配列のクローニングの増幅 HCVがフラビウイルスまたはフラビ様ウイルスである
ことを示唆している上記の結果は,PCR技術と,フラ
ビウイルスの保存アミノ酸配列をコードする領域から誘
導されたプライマーとを利用して,特徴付けられていな
いHCV cDNA配列をクローニングすることを可能
にする。一般に,プライマーの一方は定義されたHCV
ゲノム配列から誘導され,配列決定されていないHCV
ポリヌクレオチド領域に隣接する他方のプライマーはフ
ラビウイルスゲノムの保存領域から誘導される。フラビ
ウイルスゲノムは,フラビウイルスゲノムの5’側領域
にコードされるNS1ポリペプチドおよびEポリペプチ
ド内に保存配列を有することが知られている。これらの
領域をコードする対応配列は,第29〜34図に示すH
CV cDNA配列の上流にある。従って,HCVゲノ
ムのこの領域から誘導されたcDNA配列を単離するに
は,これらのフラビウイルスポリペプチド内の保存配列
から誘導される上流プライマーが設計される。下流プラ
イマーはHCV cDNAの既知部分の上流側端部から
誘導される。
スプローブと,対応するHCVゲノム配列との間には不
一致が存在し得る。従って,Lee(1988)により
述べられた方法と同様の方法を用いる。Leeの方法
は,アミノ酸配列の逆転写産物に相補的な混合オリゴヌ
クレオチドプライマーを利用する;混合プライマーの配
列は保存アミノ酸配列に関するすべてのコドン縮重を考
慮したものである。
2,4(D−2,4),日本脳炎(JEV),黄熱病
(YF),および西ナイルウイルス(WN)を包含する
数種のフラビウイルスに見い出されるアミノ酸相同性に
基づいて生じたものである。最も上流の保存配列から誘
導されたプライマー混合物(5’−1)はアミノ酸配列
gly−trp−glyに基づいており,このアミノ酸
配列は,D−2P JEV,YE,およびWNのEタン
パク中に見い出される保存配列asp−arg−gly
−trp−gly−aspNの一部である。次のプライ
マー混合物(5’−2)はEタンパク中にある下流保存
配列phe−asp−gly−asp−ser−tyr
−ileu−phe−gly−asp−ser−tyr
−ileuに基づいており,phe−gly−aspか
ら誘導される;保存配列は,D−2,JEV,YE,お
よびWNに存在する。第3のプライマー混合物(5’−
3)はアミノ酸配列arg−ser−cysに基づいて
おり,このアミノ酸配列は,D−2,D−4,JEV,
YF,およびWNのNS1タンパク中にある保存配列c
ys−cys−arg−ser−cysの一部である。
5’−3中で混合物を形成する各プライマーを第64図
に示す。保存領域から誘導された様々な配列に加えて,
各混合物中の各プライマーもまた,制限酵素HindI
II,Mbo I,およびEcoR Iに対す部位をコ
ードする配列を含む5’末端の定常領域を有する。
ン5hのヌクレオチド配列から誘導されており,この配
列はクローン14iおよび11bの配列と重複する配列
を有するHCV cDNAを含む。ssc5h20Aの
配列は, 5’GTA ATA TGG TGA CAG AGT CA 3’ である。他方のプライマーssc5h34Aもまた,使
用し得る。このプライマーはクローン5hの配列から誘
導され,さらに制限酵素部位を形成する5’末端のヌク
レオチドを有する。従って,クローニングが容易にな
る。ssc5h34Aの配列は, 5’GAT CTC TAG AGA AAT CAA TAT GGT GAC AGA GTC A 3’ である。
べられたPCR反応は,cDNAの鋳型が,IV.C.
2.節で述べたようにHCV感染したチンパンジーの肝
臓から単離されたRNAであるか,あるいはIV.A節
で述べたようにHCV感染したチンパンジー血清から単
離されたウイルス粒子から単離されたRNAであること
以外は,実質的にLeeら(1988)が述べたように
して行われる。さらに,アニール条件は第1回目の増幅
ではあまり厳密でなくてもよい(0.6MNaCl,お
よび25℃)。なぜなら,HCV配列とアニールするプ
ライマー部分は,わずか9個のヌクレオチドであり,不
一致が存在し得るからである。また,ssc5h34A
を用いた場合には,HCVゲノムから誘導されなかった
付加配列はプライマー−鋳型ハイブリッドを不安定化す
る傾向がある。第1回目の増幅後は,アニール条件は非
常に厳密である(0.066MNaCl,および32℃
〜37℃)。なぜなら,増幅される配列は,この段階で
は,プライマーに相補的な領域またはプライマーの重複
部分である領域を有するからである。さらに,最初の1
0サイクルの増幅は,クレノー酵素Iを用い,この酵素
に適したPCR条件下で実施される。これらのサイクル
が完了した後,試料を抽出し,Cetus/Perki
n−Elmerにより供給されているキット指示書に従
って,Tagポリメラーゼで処理する。
は,クローン5hから誘導されたプローブを用いたハイ
ブリダイゼーションにより検出される。このプローブ
は,プライマーを誘導するのに用いた配列の上流にある
配列から誘導されるが,プライマーを誘導したクローン
5hの配列とは重複しない。このプローブの配列は, 5’CCC AGC GGC GTA CGC GCT GGA CAC GGA GGT GGC CGC GTC GTG TGG CGG TGT TGT TCT CGT CGG GTT GAT GGC GC 3’ である。
上の用途を有する。これらの用途のいくつかは次のとお
りである。HCV cDNAは,試料中のHCV核酸を
検出するためのプローブの設計に用いられる。cDNA
から誘導されたプローブは,例えば化学的な合成反応に
おいてHCV核酸を検出するのに用いられる。これらの
プローブはまた,培養細胞系または動物モデル系におい
てウイルスの複製を阻害する際に抗ウイルス剤の効果を
決定するためのスクリーニングプログラムに用いられ
る。HCVポリヌクレオチドプローブは,ヒトにおいて
ウイルス核酸を検出するのにも有用であり,従ってヒト
におけるHCV感染の診断薬の主成分として役立ち得
る。
DNAは,HCVのエピトープを有するポリペプチドを
合成するための情報および手段を提供する。これらのポ
リペプチドはHCV抗原に対する抗体を検出するのに有
用である。HCV感染に対する一連の免疫検定法は,H
CVエピトープを有する組換え体ポリペプチドに基づく
ものである。これらの免疫検定法は,ここで説明されて
おり,NANBHを誘発するHCVを診断したり,HC
Vにより引き起こされる伝染性肝炎について血液銀行に
おける供血者をスクリーニングしたり,また伝染性の供
血者に由来する汚染された血液を検出したりする産業上
の用途が見い出される。ウイルス抗原はまた,動物モデ
ル系における抗ウイルス剤の効力をモニターするのにも
有用である。さらに,ここに開示されたHCV cDN
Aから誘導されたポリペプチドは,HCV感染を処置す
るためのワクチンとして有用である。
チドは,上述の用途の他にも,抗HCV抗体を生じさせ
るのにも有用である。従って,これらのペプチドは抗H
CVワクチンに使用され得る。しかしながら,HCVポ
リペプチドで免疫した結果,生産される抗体もまた,試
料中のウイルス抗原の存在を検出するのに有用である。
従って,これらのペプチドは,化学系におけるHCVポ
リペプチドの生産を分析するために用いられ得る。抗H
CV抗体はまた,抗ウイルス剤が組織培養系で試験され
るスクリーニングプログラムにおいて,これらの抗ウイ
ルス剤の効力をモニターするのに用いられる。これらの
抗HCV抗体はまた,受動免疫療法や,供血者および受
血者の両方においてウイルス抗原を検出することによ
り,NANBHを引き起こすHCVを診断するのにも用
いられる。抗HCV抗体の他の重要な用途には,ウイル
スおよびウイルスポリペプチドを精製するためのアフィ
ニティークロマトグラフィーにおける使用がある。精製
されたウイルスおよびウイルスポリペプチドの調製物は
ワクチンに用いられ得る。しかしながら,精製されたウ
イルスはまた,HCVを複製する細胞培養系の開発に有
用である。
は多くの用途を有する。これらの細胞培養系は,通常は
力価の低いウイルスであるHCVの比較的大規模な生産
に用いられ得る。これらの培養系はまた,このウイルス
の分子生物学的な解明にも有用であり,抗ウイルス剤の
開発をもたらす。これらの細胞培養系はまた,抗ウイル
ス剤の効力をスクリーニングする際にも有用である。さ
らに,HCV許容性の細胞培養系は,弱毒化したHCV
株の生産に有用である。
リペプチドは,天然物であっても組換え体であっても,
キットに組み込まれ得る。
る方法は,個体の感染組織から誘導されたcDNAライ
ブラリーを発現ベクター中に調製すること,および非感
染個体ではなく他の感染個体に由来する抗体含有身体構
成成分中の抗体と免疫学的に反応する発現産物を生産す
るクローンを選択することを包含する。この方法は,ゲ
ノム成分からなる,これまで特徴付けられていない他の
疾患関連因子から誘導されたcDNAの単離にも適用で
きる。この方法により,次には,これらの因子が単離さ
れ,かつ特徴付けられ,またこれらの他の疾患関連因子
に対する診断用の薬剤およびワクチンがもたらされ得
る。
挿入物の二本鎖ヌクレオチド配列,およびこの配列内に
コードされたポリペプチドの推定アミノ酸配列を示す。
1の重複HCV cDNA配列の相同性を示す。
由来するHCV cDNAの複合配列,およびこの配列
内にコードされたアミノ酸配列を示す。
の二本鎖ヌクレオチド配列,およびこの配列内にコード
されたポリペプチドの推定アミノ酸配列を示す。
Aと重複するクローン36のHCV cDNA配列,お
よびこの配列内にコードされたポリペプチド配列を示
す。
結合ORF,およびこのORF内にコードされたポリペ
プチドを示す。
2のHCV cDNA配列,およびこの配列にコードさ
れたポリペプチドを示す。
5のHCV cDNA配列,およびこの配列内にコード
されたポリペプチドを示す。
V cDNAの結合ORF,およびこのORF内にコー
ドされたポリペプチドを示す。
37bのHCV cDNA配列,およびこの配列内にコ
ードされたポリペプチドを示す。
33bのHCV cDNA配列,およびこの配列内にコ
ードされたポリペプチドを示す。
ン40bのHCV配列,およびこの配列内にコードされ
たポリペプチドを示す。
ン25cのHCV cDNA配列,およびこの配列内に
コードされたポリペプチドを示す。
1,32,33b,および25cの広がるORFのヌク
レオチド配列,およびこの配列内にコードされたポリペ
プチドを示す。
複するクローン33cのHCVcDNA配列,およびこ
の配列内にコードされたアミノ酸を示す。
ン8hのHCV cDNA配列,およびこの配列内にコ
ードされたアミノ酸を示す。
7eのHCV cDNA配列,およびこの配列内にコー
ドされたアミノ酸を示す。
ン14cのHCV cDNA配列,およびこの配列内に
コードされたアミノ酸を示す。
ン8fのHCV cDNA配列,およびこの配列内にコ
ードされたアミノ酸を示す。
33fのHCV cDNA配列,およびこの配列内にコ
ードされたアミノ酸を示す。
ン33gのHCV cDNA配列,およびこの配列内に
コードされたアミノ酸を示す。
7fのHCV cDNA配列,およびこの配列内にコー
ドされたアミノ酸を示す。
11bのHCV cDNA配列,およびこの配列内にコ
ードされたアミノ酸を示す。
ン14iのHCV cDNA配列,およびこの配列内に
コードされたアミノ酸を示す。
ン39cのHCV cDNA配列,およびこの配列内に
コードされたアミノ酸を示す。
h,33c,40b,37b,35,36,81,3
2,33b,25c,14c,8f,33f,および3
3gの整列したcDNAに由来する複合HCV cDN
A配列を示す。さらに,この誘導された配列の拡張OR
F内にコードされたポリペプチドのアミノ酸配列が示さ
れている。
ン12fのHCV cDNA配列,およびこの配列内に
コードされたアミノ酸を示す。
ン35fのHCV cDNA配列,およびこの配列内に
コードされたアミノ酸を示す。
ン19gのHCV cDNA配列,およびこの配列内に
コードされたアミノ酸を示す。
ン26gの配列,およびこの配列内にコードされたアミ
ノ酸を示す。
ン15eの配列,およびこの配列内にコードされたアミ
ノ酸を示す。
方向に整列させることにより誘導された複合cDNAの
配列を示す;さらに,この連続ORF内にコードされた
アミノ酸を示す。
染したチンパンジー由来のチンパンジー血清を用いた融
合タンパクSOD−NANB5−1−1のウェスタンブ
ロットの写真である。
由来の血清,および対照のヒト由来の血清を用いた融合
タンバクSOD−NANB5−1−1のウェスタンブロ
ットの写真である。
である。
ル末端の推定アミノ酸配列,およびこの配列をコードす
るヌクレオチドを示す。
定する,クーマシーブルーで染色されたポリアクリルア
ミドゲルの写真である。Bは,NANBVに感染したヒ
トに由来する血清を用いたC100−3のウェスタンブ
ロットを示す。
肝臓から単離され,クローン81のBB−NANBV
cDNAでプローブされたRNAのノーザンブロットの
オートラジオグラフを示す。
され,クローン81のBB−NANBV cDNAでプ
ローブされたNANBV核酸のオートラジオグラフを示
す。
得たNANBV粒子から抽出され,クローン81由来の
32P標識化NANBV cDNAでプローブされた核
酸のオートラジオグラフを示す。
導された32P標識化(+)鎖および(−)鎖DNAプ
ローブでプローブされた,単離NANBV核酸を有する
フィルターのオートラジオグラフを示す。
ドと,デング熱フラビウイルス由来のNSタンパクとの
相同性を示す。
ドと,デング熱フラビウイルス由来のNSタンパクとの
相同性を示す。
任意抽出試料におけるHCV感染の分布ヒストグラムを
示す。
酵素結合体の2つの形態を用いた,任意抽出試料におけ
るHCV感染の分布ヒストグラムを示す。
ら誘導されたプライマー混合物の配列を示す。
る,クローンk9−1中のHCVcDNA配列およびそ
れにコードされるアミノ酸を示す。
にわたる並列したクローンに由来する複合cDNAの配
列,および連続するORF中にコードされるアミノ配列
を示す。
Claims (6)
- 【請求項1】 イムノアッセイキットを調製する方法で
あって、以下の工程:少なくとも8個のアミノ酸の連続する配列を含む ポリペ
プチドを合成する工程、ここで、該少なくとも8個のア
ミノ酸の連続する配列は少なくとも一つの部位を有し、
該部位は、該少なくとも8個のアミノ酸の連続する配列
からなる配列中においても該ポリペプチド中においても
C型肝炎ウイルスに対する抗体によって結合され得、そ
して、該少なくとも8個のアミノ酸の連続する配列は以
下のアミノ酸配列から得られる: 【化1】 【化2】 【化3】 および、 該ポリペプチド、および該ポリペプチドを含む抗原抗体
複合体の存在を検出する試薬を、適当な容器に包装する
工程; を包含する方法。 - 【請求項2】 前記ポリペプチドが、 (1)前記少なくとも8個のアミノ酸の連続する配列を
コードするポリヌクレオチドを提供すること; (2)コード配列として該ポリヌクレオチドを用いて、
組換えDNAベクターを調製すること; (3)該ベクターによって、宿主細胞を形質転換するこ
と;および (4)該コード配列の発現が可能な条件下で、該形質転
換された宿主細胞をインキュベートすること; によって、合成される、請求項1に記載の方法。 - 【請求項3】 前記ポリペプチドが、化学的に合成され
る、請求項1に記載の方法。 - 【請求項4】 前記ポリペプチドを固体支持体に固定化
する工程をさらに包含する、請求項1から3のいずれか
に記載の方法。 - 【請求項5】 前記試薬が標識されている、請求項1か
ら4のいずれかに記載の方法。 - 【請求項6】 前記イムノアッセイキットが、改良され
た輸血用ヒト血液または血漿供給物の調製における使用
に適する、請求項1に記載の方法。
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