JPH05130874A - ヒトC型肝炎ウイルスのcDNA、そのクローン及びこれらの利用法 - Google Patents

ヒトC型肝炎ウイルスのcDNA、そのクローン及びこれらの利用法

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JPH05130874A
JPH05130874A JP3318679A JP31867991A JPH05130874A JP H05130874 A JPH05130874 A JP H05130874A JP 3318679 A JP3318679 A JP 3318679A JP 31867991 A JP31867991 A JP 31867991A JP H05130874 A JPH05130874 A JP H05130874A
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ala
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JP3318679A
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Masatsune Kurono
昌庸 黒野
Takahiko Mitani
隆彦 三谷
Takahito Shiromori
孝仁 城森
Yuji Hayashi
祐二 林
Eiji Suzuki
栄二 鈴木
Kiichi Sawai
喜一 澤井
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Sanwa Kagaku Kenkyusho Co Ltd
Original Assignee
Sanwa Kagaku Kenkyusho Co Ltd
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    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2770/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
    • C12N2770/00011Details
    • C12N2770/24011Flaviviridae
    • C12N2770/24211Hepacivirus, e.g. hepatitis C virus, hepatitis G virus
    • C12N2770/24222New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Abstract

(57)【要約】 【目的】 ヒト C 型肝炎ウイルスの cDNA、そのクロー
ン及びこれらの利用法を提供する。 【構成】 確定診断された NANB 患者の肝臓組織由来の
RNA を鋳型として cDNAライブラリーを作製し、このラ
イブラリーを用い且つ既知の HCV 遺伝子をコードする
塩基配列の一部をプローブとして cDNA クローニングを
行い当該プローブと反応する幾つかのクローンを得、反
応したクローンをプローブとして更にクローニングを行
い、反応した複数個の塩基配列を決定し、最終的にはこ
れらのポジティブクローンを継ぎ合わせて 1 個の HCV
クローンとして確立する。このクローンは、配列表に示
される通り、約 9500 個のヌクレオチドを有している。 【効果】 この HCV クローンの塩基配列及びアミノ酸
配列を基に、プローブ及び抗原物質を作製し、これを用
いることよりヒト C 型肝炎の診断、HCV の検出、ワク
チンの開発を行うことができる。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明はヒト C 型肝炎ウイルス
(以下「HCV」と称する) の cDNA、そのクローン及びこ
れらの利用法に係る。
【0002】
【従来の技術】ヒト C 型肝炎は輸血に起因する肝炎の
90 -95% を占めており、治療法も未だ確立するに至って
いないのでその診断法、治療薬及び予防用のワクチンの
開発が強く要望されている。
【0003】近年に至り、米国のカイロン社がヒト非 A
非 B 型肝炎 (以下「NANB」と称する) ウイルスを感染
させたチンパンジーの肝臓由来の cDNA をクローン化
し、これをベクターλgt11 に組み込んだ大腸菌で発現
させた処、その産物が NANB 患者血清と反応することを
見い出した。最終的にはこれが約 9000 個のヌクレオチ
ドを有する 1 本鎖 RNA ウイルスであって、フラビウイ
ルスに近似するウイルスであることを発見し、これをHC
V と命名すると共に、その内の約 7000 個のヌクレオチ
ドからなる cDNA塩基配列を公表した [EP-03 18 216
(A)]。一方、日本人の NANB 患者から分離された HCV
の塩基配列については、これまで岡本等 ["The Japan j
ounal of Experimental Medicine", 60, 167 - 177(199
0)]、加藤等 ["Proceedings of the National Academy
of Sciences of theU.S.A.", 87, 9524 - 9528 (199
0)]、榎本等 ("Biochemical and biophysicalresearch
communications", 170, 1021- 1025 (1990)] の報告が
ある。これらの公表された配列を比較すると、塩基及び
アミノ酸レベルにおいてかなりの多様性のあることが認
められる。
【0004】上記のカイロン社は、HCV 遺伝子の一部を
用いて酵母で発現させたポリペプチドを抗原として、そ
れに反応するNANB患者血清中の抗体を検出する診断
キットを開発した。このキットによれば、疫学的には約
70% の確率で血清中の抗体を検出できる旨発表されて
いるが、未だその検出率において充分とは云えない。
【0005】以上の如く、HCV の塩基配列に関しては充
分な情報がないため、C 型肝炎に対する的確かつ正確な
診断法、治療法、輸血用血液の無害化処理及び予防用ワ
クチン開発も未だ確立するに至っていないのが実情であ
る。
【0006】
【発明が解決しようとする課題】これまで、HCV 遺伝子
の構造については、上記のように米国のカイロン社がNA
NB 感染チンパンジーの肝臓から、又岡本等、加藤等及
び榎本等が日本人のNANB 患者の血漿から HCV を分離し
て解析している。しかしながら、カイロン社のものはチ
ンパンジー由来のものであり、岡本等及び榎本等の報告
では一部分の配列しか明らかにされておらず、更に加藤
等の報告はほぼ全長をカバーする約9500 個のヌクレオ
チドからなるものではあるが、NANB 患者数人のプール
血清から RNA を抽出してcDNA を作製しており、単一の
クローンを得ているわけではない。従って、HCV はその
多様性故に単一のクローン間において正確に比較検討す
る必要があるが、現在迄このような研究に関する成果は
公表されていない。
【0007】HCV の塩基配列に関する情報不足及び HCV
遺伝子に多様性が存在することを考慮に入れると、C
型肝炎に対する的確かつ正確な診断法、治療法、輸血用
血液の無害化処理及び予防用ワクチンを開発するために
は、HCV の構造に関する更に多くの情報が必要とされ
る。従って本発明の課題は、これまで知られている HCV
とは異なる新たな HCV 株を見い出すことにある。
【0008】
【課題を解決するための手段及び作用】本発明者等は、
先ず確定診断された 1 名の NANB 患者由来の肝臓組織
及び血清からRNAを分離精製し、この精製RNAを鋳
型として既知の方法で cDNA ライブラリを作製した。こ
の cDNA ライブラリを基とし、既に金子等により明らか
にされている HCV 遺伝子をコードする塩基配列の一部
(特開平1 - 344876) をプローブとして cDNA クローニ
ングを行い、幾つかのクローンを得、最終的にはこれら
のクローンを継ぎ合わせて1個の HCV クローンとして
確立した。この HCV クローンは後記の配列表に示され
る通りの塩基配列及びアミノ酸配列を有していた。
【0009】このクローンは、ヒトの HCV の全塩基配
列を含むものであり、これまでに報告されているカイロ
ン社の HCV と比較する場合に塩基配列に関しては 22%
以上、アミノ酸配列に関しては 16% 以上異なっている
ので、従来のものとは明らかに異なる HCV クローン株
であることが判明した。
【0010】尚、二本鎖 DNA 断片の組み込まれるべき
ベクターに発現ベクターを選択して、本発明による遺伝
子を含む組換えベクターを作製し、このベクターを大腸
菌、酵母等の微生物や動物細胞に取り込ませ、該微生物
または動物細胞を培養すれば、HCV に起因する抗原物質
を大量に生産することができる。この産物を用いて患者
血液中に存在する抗 HCV 抗体量の測定が可能になり、H
CV に起因する肝炎、癌の進行程度、回復の程度を診断
することが可能となり、又キャリヤーの診断も可能とな
る。更に上記の抗原物質を用い、継代免疫等の手法によ
り弱毒化させることによりワクチン開発の途が開かれ、
また上記の産物を動物に免疫させることにより、抗体性
物質を産生させ、これを取得すれば治療薬や輸血用血液
の無害化処理剤を提供することができ、該抗体性物質を
モノクローン又はポリクローン化すれば治療薬としての
安定供給が可能となる。
【0011】
【実施例】次に、実施例に関連して本発明を更に詳細に
且つ具体的に説明する。
【0012】実施例 1 (A) NANB 患者からの RNA の分離精製と相補 DNAの合成 NANB 患者 (1 名) からの RNA の分離精製は特開平 1 -
163715 公報に記載の方法に従って行われた。これによ
り得られた精製 RNA に対して、ランダムヘキサマーを
プライマーとして逆転写酵素にて cDNA を合成した。更
に T4 DNA ポリメラーゼにより二本鎖 cDNA の合成を行
い、得られた DNA断片の両端を平滑化し、EcoRI リンカ
ーを付加し、EcoRI により消化処理した後に精製するこ
とにより所望の DNA 断片を得た。
【0013】(B) cDNA ライブラリの作製とクローニン
グ ベクターとしてファージベクターである λgt11 を選択
し、これを EcoRI にて切断し、上記 (A) にて得られ且
つ EcoRI 認識部位を両端に有する DNA 断片を挿入し、
in vitro パッケージング法により cDNA ライブラリー
を作製した。このcDNA ライブラリより、金子等によっ
て明らかにされている HCV 遺伝子をコードする塩基配
列の一部であり、約 240 個のヌクレオチドからなる DN
A (特開平 1 - 344876) をプローブとしてクローニング
を行い、このプローブと反応する幾つかのクローンを得
た。反応したこれらのクローンをプローブとして更にク
ローニングを重ねて、最終的には 13 個のクローンを選
択した。これらのクローンの塩基配列につきダイデオキ
シ法を用いて決定し、配列の一致する部分を重ね合わせ
ることにより 1 個のクローンとして確立した。その結
果、このクローンは約9500 個のヌクレオチドからなる
ものであることが明らかとなった。このクローンの全塩
基配列並びにこの塩基配列から翻訳可能なアミノ酸配列
は、後記の配列表に示されている。
【0014】実施例 2 (A) HCV 由来 DNA クローンの 5'-非翻訳領域を用い
る、ヒト C 型肝炎の遺伝子的診断法 NANB 患者と推定される患者の血清から、グアニジンチ
オシアネートを用いるチルグーイン等の方法 ["Biochem
istry", 18, 5294 - 5299 (1979)] により全 RNA を抽
出した。この RNA に関して、配列表に示した配列の一
部 (配列表における塩基番号の 7 番目から 26 番目迄
の配列と 310 番目から 334 番目迄の相補鎖配列) をプ
ライマーとして用い、逆転写酵素の存在下に 42℃ で 1
時間インキュベーションすることにより相補 DNA を合
成した。この相補 DNA を用い、金子等の方法 ["Jounal
of Clinical Microbiology", 27, 1930 - 1933 (198
9)]に従って PCR [ポリメラーゼ連鎖反応 (Polymerase
chain reaction)] を行った後に電気泳動させた。この
電気泳動の結果は図1に示されており、予想された約 3
10 塩基対長さのバンドの存在が確認された。このこと
は被験血清を提供した患者がヒト C型肝炎感患者である
ことを意味している。何故ならば、NANB 患者の血清由
来の RNAを用いた場合には上記のように予想された塩基
対長さ位置に PCR 産物由来のバンドが検出されるが、
健常人の血清由来の RNA を用いた場合には当該バンド
は検出されなかったからである。
【0015】
【発明の効果】本発明によれば、HCV 遺伝子をコードす
る塩基配列を有する一本鎖 DNA 及び該一本鎖DNAと
その相補一本鎖 DNAとからなる二本鎖 DNA が提供され
る。上記の一本鎖 DNA は、その一部をプローブとして
用いることにより遺伝子レベルでのヒト C 型肝炎の診
断に利用することができ、又二本鎖 DNA は制限酵素に
より切断することにより適宜の鎖長を有するものとなし
て構造と生理活性との相関究明等に利用することができ
る。
【0016】
【配列表】配列番号:1 配列の長さ:9405 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:cDNA to genomic RNA ハイポセティカル:No アンチセンス:No 起源 生物名:Hepatitis C Virus 単離クローン名:SK−1 組織の種類:肝臓細胞 GGCGACACTC CACCATAGAT CACTCCCCTG TGAGGAACTG CTGTCTTCAC 50 GACGAAAGCG TCTAGCCATG GCGTTAGTAT GACTGTCGTG CAGCCTGCAG 100 GACCCCCCCT CCCGGGAGAG CCATAGTGGT CTGCGGAACC GGTGAGTACA 150 CCGGAATTGC CAGGACGACC GGGTCCTTTC TTGGATCACC CCGCTCAATG 200 CCTGGAGATT TGGGCATGCC CCCGCGAGAC TGCTAGCCGA GTAGTGTTGG 250 GTCGCGAAAG GCCTTGTGGT ACTGCCTGAT AGGGTGCTTG CGAGTGCCCC 300 GGGAGGTCTC GTAGACCGTG CATC ATG AGC ACA AAT CCT AAA CCT CAA 348 Met Ser Thr Asn Pro Lys Pro Gln 1 5 AGA AAA ACC AAA CGT AAC ACC AAC CGC CGC CCA CAG GAC GTC AAG TTC 396 Arg Lys Thr Lys Arg Asn Thr Asn Arg Arg Pro Gln Asp Val Lys Phe 10 15 20 CCG GGC GGT GGC CAG ATC GTT GGT GGA GTT TAC CTG TTG CCG CGC AGG 444 Pro Gly Gly Gly Gln Ile Val Gly Gly Val Tyr Leu Leu Pro Arg Arg 25 30 35 40 GGC CCC AGG TTG GGT GTG CGC GCG ACT AGG AAG ACT TCC GAG CGG TCG 492 Gly Pro Arg Leu Gly Val Arg Ala Thr Arg Lys Thr Ser Glu Arg Ser 45 50 55 CAA CCT CGT GGA AGG CGA CAA CCT ATC CCC AAG GCT CGC CAG CCC GAG 540 Gln Pro Arg Gly Arg Arg Gln Pro Ile Pro Lys Ala Arg Gln Pro Glu 60 65 70 GGC AGG GCC TGG GCT CAG CCC GGG TAC CCT TGG CCC CCC TAT GGC AAT 588 Gly Arg Ala Trp Ala Gln Pro Gly Tyr Pro Trp Pro Pro Tyr Gly Asn 75 80 85 GAG GGT CTG GGG TGG GCA GGA TGG CTC CTG TCA CCC CGT GGC TCC CGG 636 Glu Gly Leu Gly Trp Ala Gly Trp Leu Leu Ser Pro Arg Gly Ser Arg 90 95 100 CCT AGT TGG GGC CCC ACG GAC CCC CGG CGT AGG TCG CGT AAT TTG GGT 684 Pro Ser Trp Gly Pro Thr Asp Pro Arg Arg Arg Ser Arg Asn Leu Gly 105 110 115 120 AAG GTC ATC GAT ACC CTC ACA TGC GGC TTC GCC GAC CTC ATG GGG TAC 732 Lys Val Ile Asp Thr Leu Thr Cys Gly Phe Ala Asp Leu Met Gly Tyr 125 130 135 ATT CCG CTC GTC GGC GCC CCC CTA GGA GGC GCT GCC AGG GCC CTG GCG 780 Ile Pro Leu Val Gly Ala Pro Leu Gly Gly Ala Ala Arg Ala Leu Ala 140 145 150 CAT GGC GTC CGG GTT CTG GAG GAC GGC GTG AAC TAC GCA ACA GGG AAT 828 His Gly Val Arg Val Leu Glu Asp Gly Val Asn Tyr Ala Thr Gly Asn 155 160 165 CTG CCC GGT TGC TCT TTC TCT ATC TTC CTC TTG GCT CTG CTG TCT TGT 876 Leu Pro Gly Cys Ser Phe Ser Ile Phe Leu Leu Ala Leu Leu Ser Cys 170 175 180 TTG ACC ATC CCA GCA TCC GCT TAT GAA GTG CGC AAC GTG TCC GGG TTG 924 Leu Thr Ile Pro Ala Ser Ala Tyr Glu Val Arg Asn Val Ser Gly Leu 185 190 195 200 TAC CAT GTC ACG AAC GAC TGC TCC AAC TCA AGT ATT GTG TAT GAG GCA 972 Tyr His Val Thr Asn Asp Cys Ser Asn Ser Ser Ile Val Tyr Glu Ala 205 210 215 GCG GAC TTG ATC ATG CAC ACC CCT GGG TGC GTG CCC TGC GTC CTG GAG 1020 Ala Asp Leu Ile Met His Thr Pro Gly Cys Val Pro Cys Val Leu Glu 220 225 230 GGA AAC TCC TCC CGT TGC TGG GTA GCG CTC ACT CTC ACG CTC GCG GCC 1068 Gly Asn Ser Ser Arg Cys Trp Val Ala Leu Thr Leu Thr Leu Ala Ala 235 240 245 AGG AAC AGC AGC ATC CCC ACT ACG ACA ATA CGA CGT CAC GTC GAC TTG 1116 Arg Asn Ser Ser Ile Pro Thr Thr Thr Ile Arg Arg His Val Asp Leu 250 255 260 CTC GTT GGG GCG GCT GCT TTC TGC TCC GCT ATG TAC GTG GGG GAT CTC 1164 Leu Val Gly Ala Ala Ala Phe Cys Ser Ala Met Tyr Val Gly Asp Leu 265 270 275 280 TGC GGA TCT GTT TTC CTC GTC TCC CAG CTA TTC ACC TTT TCA CCT CGC 1212 Cys Gly Ser Val Phe Leu Val Ser Gln Leu Phe Thr Phe Ser Pro Arg 285 290 295 CGG TAT GAG ACG GTA CAA GAC TGC AAT TGC TCA CTC TAT TCC GGC CAC 1260 Arg Tyr Glu Thr Val Gln Asp Cys Asn Cys Ser Leu Tyr Ser Gly His 300 305 310 GTA TCA GGT CAC CGC ATG GCC TGG GAT ATG ATG ATG AAC TGG TCG CCC 1308 Val Ser Gly His Arg Met Ala Trp Asp Met Met Met Asn Trp Ser Pro 315 320 325 ACA ACA GCC CTA GTG GTA TCG CAG CTA CTC CGG ATC CCA CAA GCC GTC 1356 Thr Thr Ala Leu Val Val Ser Gln Leu Leu Arg Ile Pro Gln Ala Val 330 335 340 GTG GAC ATG GTG GCG GGG GCC CAC TGG GGA GTC TTG GCA GGC CTC GCC 1404 Val Asp Met Val Ala Gly Ala His Trp Gly Val Leu Ala Gly Leu Ala 345 350 355 360 TAC TAT TCC ATG GTG GGG AAC TGG GCT AAG GTC TTG ATT GTG ATG CTA 1452 Tyr Tyr Ser Met Val Gly Asn Trp Ala Lys Val Leu Ile Val Met Leu 365 370 375 CTC TTT GCC GGC GTC GAC GGG AGA ACC CAA GTG ACG GGA GCA CAG GCA 1500 Leu Phe Ala Gly Val Asp Gly Arg Thr Gln Val Thr Gly Ala Gln Ala 380 385 390 GGC CAC ACC ACC AGT GGC CTT GCG TCC CTC TTC ACA CCA GGG CCG TCT 1548 Gly His Thr Thr Ser Gly Leu Ala Ser Leu Phe Thr Pro Gly Pro Ser 395 400 405 CAG AAA ATC CAG CTT GTA AAC TCT AAC GGC AGT CGG CAC ATC AAC AGA 1596 Gln Lys Ile Gln Leu Val Asn Ser Asn Gly Ser Arg His Ile Asn Arg 410 415 420 ACT GCC CTG AGT TGC AAC GAC TCC CTC AAA ACT GGC TTC CTT GCC GCG 1644 Thr Ala Leu Ser Cys Asn Asp Ser Leu Lys Thr Gly Phe Leu Ala Ala 425 430 435 440 CTG TTC TAC ACA CAT AAG TTC AAC GCG GCT GGA TGC CCG GAG CGC ATG 1692 Leu Phe Tyr Thr His Lys Phe Asn Ala Ala Gly Cys Pro Glu Arg Met 445 450 455 GCC AGC TGC TGC TCT ATT GAC ACG TTC GAC CAA GGG TGG GGT CCC ATC 1740 Ala Ser Cys Cys Ser Ile Asp Thr Phe Asp Gln Gly Trp Gly Pro Ile 460 465 470 ACC CAT GCT GAG TCT CGC AGC TCG GAC CAA AGG CCT TAC TGC TGG CAC 1788 Thr His Ala Glu Ser Arg Ser Ser Asp Gln Arg Pro Tyr Cys Trp His 475 480 485 TAC GCA CCT CAA CCG TGT GGT ATC GTG CCC GCG TTG CAG GTG TGC GGT 1836 Tyr Ala Pro Gln Pro Cys Gly Ile Val Pro Ala Leu Gln Val Cys Gly 490 495 500 CCA GTG TAT TGT TTC ACC CCA AGC CCT GTT GTA GTG GGG ACG ACC GAC 1884 Pro Val Tyr Cys Phe Thr Pro Ser Pro Val Val Val Gly Thr Thr Asp 505 510 515 520 CGT TTC GGC GTC CCC ACG TAT AAC TGG GGG GAC AAT GAG ACG GAC GTG 1932 Arg Phe Gly Val Pro Thr Tyr Asn Trp Gly Asp Asn Glu Thr Asp Val 525 530 535 CTA CTC CTC AAC AAC ACG CGG CCG CCG CAA GGA AAC TGG TTC GGC TGT 1980 Leu Leu Leu Asn Asn Thr Arg Pro Pro Gln Gly Asn Trp Phe Gly Cys 540 545 550 ACA TGG ATG AAC AGC ACC GGG TTC ACC AAG ACG TGC GGG GGC CCC CCG 2028 Thr Trp Met Asn Ser Thr Gly Phe Thr Lys Thr Cys Gly Gly Pro Pro 555 560 565 TGT AAT ATC GGG GGG GCC GGC AAC AAC ACC TTG ACC TGC CCC ACG GAT 2076 Cys Asn Ile Gly Gly Ala Gly Asn Asn Thr Leu Thr Cys Pro Thr Asp 570 575 580 TGC TTC CGG AAG CAC CCC GAG GCC ACT TAC ACC AAG TGC GGC TCG GGG 2124 Cys Phe Arg Lys His Pro Glu Ala Thr Tyr Thr Lys Cys Gly Ser Gly 585 590 595 600 CCT TGG TTG ACA CCT AGG TGC ATG GTT GAC TAC CCA TAC AGA CTT TGG 2172 Pro Trp Leu Thr Pro Arg Cys Met Val Asp Tyr Pro Tyr Arg Leu Trp 605 610 615 CAC TAC CCC TGC ACT TTC AAC TTT ACC ATC TTT AAG ATC AGG ATG TAT 2220 His Tyr Pro Cys Thr Phe Asn Phe Thr Ile Phe Lys Ile Arg Met Tyr 620 625 630 GTG GGG GGT GTG GAG CAC AGG CTC AAC GCA GCG TGC AAC TGG ACT CGA 2268 Val Gly Gly Val Glu His Arg Leu Asn Ala Ala Cys Asn Trp Thr Arg 635 640 645 GGA GAG CGT TGT AAC ATA GAG GAC AGG GAT AGG TCA GAG CTT AGC CCG 2316 Gly Glu Arg Cys Asn Ile Glu Asp Arg Asp Arg Ser Glu Leu Ser Pro 650 655 660 CTG CTA CTG TCT ACA ACG GAG TGG CAG ATA CTA CCC TGT TCC TTT ACC 2364 Leu Leu Leu Ser Thr Thr Glu Trp Gln Ile Leu Pro Cys Ser Phe Thr 665 670 675 680 ACC CTA CCA GCT CTG TCC ACT GGT TTG ATC CAC CTC CAT CAG AAC ATC 2412 Thr Leu Pro Ala Leu Ser Thr Gly Leu Ile His Leu His Gln Asn Ile 685 690 695 GTG GAC GTG CAA TAC CTG TAC GGT GTA GGG TCA GCA GTT GTC TCC ATT 2460 Val Asp Val Gln Tyr Leu Tyr Gly Val Gly Ser Ala Val Val Ser Ile 700 705 710 GTG ATC AAA TGG GAG TAC GTT CTG CTG CTC TTC CTC CTC CTG GCG GAC 2508 Val Ile Lys Trp Glu Tyr Val Leu Leu Leu Phe Leu Leu Leu Ala Asp 715 720 725 GCG CGC GTC TGC GCC TGC TTA TGG ATG ATG CTG CTG ATA GCC CAG GCT 2556 Ala Arg Val Cys Ala Cys Leu Trp Met Met Leu Leu Ile Ala Gln Ala 730 735 740 GAG GCC ACC TTA GAA AAC CTG GTG GTC CTC AAT TCT GCG TCC GTG GCC 2604 Glu Ala Thr Leu Glu Asn Leu Val Val Leu Asn Ser Ala Ser Val Ala 745 750 755 760 GGA GCG CAT GGC ATC CTC TCA TTT CTT GTG TTC TTC TGT GCA GCC TGG 2652 Gly Ala His Gly Ile Leu Ser Phe Leu Val Phe Phe Cys Ala Ala Trp 765 770 775 TAC ATC AAG GGC AGG CTG GTC CCT GGG GCG GCA TAT GCT TTA TAT GGC 2700 Tyr Ile Lys Gly Arg Leu Val Pro Gly Ala Ala Tyr Ala Leu Tyr Gly 780 785 790 GTG TGG CCG CTG CTC CTG CTC CTG TTG GCG TTA CCA CCA CGG GCA TAC 2748 Val Trp Pro Leu Leu Leu Leu Leu Leu Ala Leu Pro Pro Arg Ala Tyr 795 800 805 GCC ATG GAC CGG GAG ATG GCC GCA TCG TGC GGA GGC GCG GTT TTC GTA 2796 Ala Met Asp Arg Glu Met Ala Ala Ser Cys Gly Gly Ala Val Phe Val 810 815 820 GGT CTA GCA CTC TTG ACC TTG TCA CCA CAC TAT AAA GCA TTC CTC GCC 2844 Leu Thr Leu Ser Gly Leu Ala Leu Pro His Tyr Lys Ala Phe Leu Ala 825 830 835 840 AGG CTC ATA TGG TGG TTA CAA TAT TTT ATC ACC AGG GCT GAG GCG TGC 2892 Arg Leu Ile Trp Trp Leu Gln Tyr Phe Ile Thr Arg Ala Glu Ala Cys 845 850 855 TTG CAA GTG TGG GTC CCC CCT CTC AAC GCA CGG GGG GGC CGC GAT GCC 2940 Leu Gln Val Trp Val Pro Pro Leu Asn Ala Arg Gly Gly Arg Asp Ala 860 865 870 ATC ATC CTC CTC ACG TGC GCG GTC CAC TCA GAG CTA ATC TTT GAC ATC 2988 Ile Ile Leu Leu Thr Cys Ala Val His Ser Glu Leu Ile Phe Asp Ile 875 880 885 ACC AAA ATT CTG CTC GCC ATA CTA GGA CCG CTC ATG GTG CTC CAG GCT 3036 Thr Lys Ile Leu Leu Ala Ile Leu Gly Pro Leu Met Val Leu Gln Ala 890 895 900 GGC ATT ACT AGA GTG CCG TAC TTC GTG CGC GCT CAA GGG CTC ATA CGT 3084 Gly Ile Thr Arg Val Pro Tyr Phe Val Arg Ala Gln Gly Leu Ile Arg 905 910 915 920 GCA TGC ATG TTG GTG CGG AAG GTC GCT GGG GGC CAT TAT GTC CAA ATG 3132 Ala Cys Met Leu Val Arg Lys Val Ala Gly Gly 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GAG TCA ATT TAC CAA TGT TGT GAC TTG 8316 Glu Ser Asp Ile Arg Val Glu Glu Ser Ile Tyr Gln Cys Cys Asp Leu 2650 2655 2660 GCC CCC GAG GCC AGA CAG GTC ATA AGG TCG CTC ACG GAG CGG CTT TAT 8364 Ala Pro Glu Ala Arg Gln Val Ile Arg Ser Leu Thr Glu Arg Leu Tyr 2665 2670 2675 2680 ATC GGG GGC CCC CTG ACT AAT TCA AAA GGG CAG AAC TGC GGT TAT CGC 8412 Ile Gly Gly Pro Leu Thr Asn Ser Lys Gly Gln Asn Cys Gly Tyr Arg 2685 2690 2695 CGG TGC CGC GCC AGC GGT GTG CTG ACG ACT AAC TGC GGT AAT ACC CTC 8460 Arg Cys Arg Ala Ser Gly Val Leu Thr Thr Asn Cys Gly Asn Thr Leu 2700 2705 2710 ACA TGT TAC TTG AAG GCC TCT GCA GCC TGT CGA GCT GCA AAG CTC CAG 8508 Thr Cys Tyr Leu Lys Ala Ser Ala Ala Cys Arg Ala Ala Lys Leu Gln 2715 2720 2725 GAC TGC ACG ATG CTC GTG TGC GGA GAC GAC CTT GTC GTT ATC TGT GAA 8556 Asp Cys Thr Met Leu Val Cys Gly Asp Asp Leu Val Val Ile Cys Glu 2730 2735 2740 AGC GCG GGA ACC CAG GAG GAC GCG GCG AGC CTA CGA GTC TTC ACG GAG 8604 Ser Ala Gly Thr Gln Glu Asp Ala Ala Ser Leu Arg Val Phe Thr Glu 2745 2750 2755 2760 GCT ATG ACT AGG TAC TCT GCC CCC CCC GGG GAC CCG CCC CAA CCA GAA 8652 Ala Met Thr Arg Tyr Ser Ala Pro Pro Gly Asp Pro Pro Gln Pro Glu 2765 2770 2775 TAC GAC TTG GAG TTA ATA ACA TCA TGC TCC TCC AAC GTG TCG GTC GCG 8700 Tyr Asp Leu Glu Leu Ile Thr Ser Cys Ser Ser Asn Val Ser Val Ala 2780 2785 2790 CAC GAC GCA TCT GGC AAG CGG GTG TAC TAC CTC ACT CGC GAC CCC ACC 8748 His Asp Ala Ser Gly Lys Arg Val Tyr Tyr Leu Thr Arg Asp Pro Thr 2795 2800 2805 ACC CCC CTC GCG AGG GCA GCG TGG GAA ACA GTT AGA CAC ACT CCA GTA 8796 Thr Pro Leu Ala Arg Ala Ala Trp Glu Thr Val Arg His Thr Pro Val 2810 2815 2820 AAC TCC TGG CTA GGC AAC ATC ATC ATG TAC GCG CCC ACC CTG TGG GCA 8844 Asn Ser Trp Leu Gly Asn Ile Ile Met Tyr Ala Pro Thr Leu Trp Ala 2825 2830 2835 2840 AGG ATG ATT CTG ATG ACC CAC TTC TTC TCC ATC CTT CTA GCT CAG GAG 8892 Arg Met Ile Leu Met Thr His Phe Phe Ser Ile Leu Leu Ala Gln Glu 2845 2850 2855 CAA CTT GAA AAA GCC CTG GGT TGT CAG ATC TAC GGG GCC ACT TAC TTC 8940 Gln Leu Glu Lys Ala Leu Gly Cys Gln Ile Tyr Gly Ala Thr Tyr Phe 2860 2865 2870 ATT GAA CCA CTT GAC CTA CCT CAG ATC ATT GAA CGA CTC CAC GGT CTT 8988 Ile Glu Pro Leu Asp Leu Pro Gln Ile Ile Glu Arg Leu His Gly Leu 2875 2880 2885 AGC GCA TTT TCA CTC CAC AGT TAC TCT CCA GGT GAA ATC AAT AGG GTG 9036 Ser Ala Phe Ser Leu His Ser Tyr Ser Pro Gly Glu Ile Asn Arg Val 2890 2895 2900 GCT TCA TGC CTC AGG AAA CTT GGG GTA CCA CCC TTG CGA GTC TGG AGA 9084 Ala Ser Cys Leu Arg Lys Leu Gly Val Pro Pro Leu Arg Val Trp Arg 2905 2910 2915 2920 CAT CGG GCC AGA AGT GTC CGC GCT AAG CTA CTG TCC CAG GGG GGG AGG 9132 His Arg Ala Arg Ser Val Arg Ala Lys Leu Leu Ser Gln Gly Gly Arg 2925 2930 2935 GCC GCC ACT TGT GGC AAG TAC CTC TTC AAC TGG GCA GTG AAA ACC AAG 9180 Ala Ala Thr Cys Gly Lys Tyr Leu Phe Asn Trp Ala Val Lys Thr Lys 2940 2945 2950 CTT AAA CTC ACT CCA ATT CCG GCT GCG TCC AGA TTG GAC TTA TCC GGC 9228 Leu Lys Leu Thr Pro Ile Pro Ala Ala Ser Arg Leu Asp Leu Ser Gly 2955 2960 2965 TGG TTC GTT GCT GGT TAC AAT GGG GGA GAC ATA TAT CAC AGC CTG TCT 9276 Trp Phe Val Ala Gly Tyr Asn Gly Gly Asp Ile Tyr His Ser Leu Ser 2970 2975 2980 CGT GCC CGA CCC CGC TGG TTC ATG TGG TGC CTA CTC CTA CTT TCT GTA 9324 Arg Ala Arg Pro Arg Trp Phe Met Trp Cys Leu Leu Leu Leu Ser Val 2985 2990 2995 3000 GGG GTA GGC ATC TAC CTG CTC CCC AAC CGG TGA ACGGGGAGCT 9370 Gly Val Gly Ile Tyr Leu Leu Pro Asn Arg *** 3005 3010 AACCACTCCA GGCCAATAGG CCATTCCCTT TTTTT 9405
【図面の簡単な説明】
【図1】NANB肝炎であると確定診断された患者 3
名と、健常人 1 名の血清由来のRNA を鋳型とし、配列
表の 7 番目から26 番目迄及び 310 番目から 334 番目
迄の塩基配列のものをプライマーとして相補 DNA を合
成し、この相補 DNA を用いてポリメラーゼ連鎖反応を
行い、次いで電気泳動を行った結果を示す、電気泳動パ
ターンの模写図である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 G01N 33/576 Z 9015−2J (72)発明者 林 祐二 愛知県名古屋市東区東外堀町35番地 株式 会社三和化学研究所内 (72)発明者 鈴木 栄二 愛知県名古屋市東区東外堀町35番地 株式 会社三和化学研究所内 (72)発明者 澤井 喜一 愛知県名古屋市東区東外堀町35番地 株式 会社三和化学研究所内

Claims (5)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 ヒト C 型肝炎ウイルス遺伝子をコード
    する約 9500 個のヌクレオチドを有する一本鎖 DNA 又
    は該一本鎖 DNAとその相補一本鎖 DNA とからなる二本
    鎖 DNA。
  2. 【請求項2】 配列表に示される塩基配列を有している
    ことを特徴とする、請求項1に記載の、一本鎖 DNA 又
    は該一本鎖 DNA とその相補一本鎖 DNA とからなる二本
    鎖 DNA。
  3. 【請求項3】 請求項1に記載の cDNA の一部をプライ
    マーとして使用することを特徴とする、ポリメラーゼ連
    鎖反応法によるヒト C 型肝炎ウイルスの検出法並びに
    ヒト C 型肝炎の診断法。
  4. 【請求項4】 配列表に示されるアミノ酸配列を有して
    いることを特徴とする、cDNA クローン。
  5. 【請求項5】 配列表に示されているアミノ酸配列の一
    部を有している DNAを抗原として使用することを特徴と
    する、抗 C 型肝炎ウイルス抗体の検出法並びにヒト C
    型肝炎の診断法及びヒト C 型肝炎ワクチンの作製法。
JP3318679A 1991-11-07 1991-11-07 ヒトC型肝炎ウイルスのcDNA、そのクローン及びこれらの利用法 Pending JPH05130874A (ja)

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EP0541089A2 (en) 1993-05-12
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