KR102376863B1 - 메소텔린 결합 단백질 - Google Patents

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브라이언 디 레몬
리챠드 제이 오스틴
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하푼 테라퓨틱스, 인크.
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Abstract

본원에서 MSLN 결합 단백질로서, 친화도가 개선되고, 메소텔린을 발현하는 암세포의 T 세포 의존성 사멸을 매개하는 능력이 개선된 MLSN 결합 단백질을 개시한다. 또한, 본원에 개시된 결합 단백질을 포함하는 약학 조성물 및 상기 제제의 사용 방법을 제공한다.

Description

메소텔린 결합 단백질
상호 참고
본 출원은 2017년 5월 12일에 출원된 미국 가출원 제62/505,719호 및 2018년 4월 13일에 출원된 제62/657,417호의 이익을 주장하며, 이들 각각은 그 전문으로 본원에 참고로 포함된다.
서열 목록
본 출원은 ASCII 형식으로 전자 제출된 서열 목록을 포함하며, 이로써 그 전문으로 참고로 포함된다. 상기 ASCII 사본은 2018년 5월 11일에 작성하여 47517-719 _601_SL.txt로 명명하며, 크기는 145,039 바이트이다.
참고에 의한 포함
본 명세서에서 언급된 모든 간행물, 특허, 및 특허 출원은 각각의 개별 간행물, 특허, 또는 특허 출원이 구체적이고 개별적으로 참고로 포함된다고 나타낸 것과 같은 정도로 그리고 그 전문으로 개시된 것과 같은 정도로 본원에 참고로 포함된다.
본 발명은 MSLN의 발현과 관련된 적응증을 진단하고 치료하는데 사용될 수 있는 메소텔린(MSLN: mesothelin) 결합 단백질을 제공한다. 메소텔린(MSLN)은 GPI-연결된 막 결합된 종양 항원이며, MSLN은 난소암, 췌장암, 폐암 및 삼중 음성 유방암 및 중피종에서 과발현된다. MSLN의 정상 조직 발현은 흉막강, 위심강, 및 복막강을 감싸는 단일 중피 세포층에 제한된다. MSLN의 과발현은 폐 선암종 및 삼중 음성 유방암에서의 불량한 예후와 관련이 있다. MSLN은 면역 독소, 백신, 항체 약물 접합체 및 CAR-T 세포를 비롯한 수많은 요법에 대한 암 항원으로서 사용되어왔다. 임상 효능의 초기 징후는 표적으로서 MSLN을 확인했지만, MSLN 발현 암을 치료하기 위해 효능이 개선된 요법이 필요하다.
발명의 요약
일 실시양태는 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질로서, 서열 번호 41, 42, 43, 또는 44와 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 하나 이상의 보존된 영역을 포함하는 단백질을 제공한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 41과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 42와 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 43과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 44와 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 (i) 서열 번호 41에 상응하는 아미노산의 스트레치; (ii) 서열 번호 42에 상응하는 아미노산의 스트레치; (iii) 서열 번호 43에 상응하는 아미노산의 스트레치, 및 (iv) 서열 번호 44에 상응하는 아미노산의 스트레치를 포함한다.
일 실시양태는 하기 식을 포함하는 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질을 제공한다:
f1-r1-f2-r2-f3-r3-f4
식에서, r1은 서열 번호 51과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하고; r2는 서열 번호 52와 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하고; r3은 서열 번호 53과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하고; f1, f2, f3 및 f4는 프레임워크(framework) 잔기이다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 1 내지 29, 30 내지 40, 58, 및 60 내지 62로 이루어진 군으로부터 선택된 서열과 80% 이상 동일한 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 결합 단백질의 인간화를 초래하는 하나 이상의 변형을 포함한다. 일부 실시양태에서, 변형은 아미노산 잔기의 치환, 첨가 또는 결실을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 111개 아미노산 내지 124개 아미노산을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 비인간 공급원으로부터 유래한 VHH 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 라마 VHH 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 에피토프는 서열 번호 57의 아미노산 잔기 296 내지 390을 포함하는 영역 I, 서열 번호 57의 아미노산 잔기 391 내지 486을 포함하는 영역 II, 또는 서열 번호 57의 아미노산 잔기 487 내지 598을 포함하는 영역 III에 위치한다.
일 실시양태는 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질로서, 서열 번호 45, 46, 47, 48, 49, 또는 50과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 하나 이상의 보존된 영역을 포함하는 단백질을 제공한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 45와 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 46과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 47과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 48과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 49와 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 50과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 서열을 포함하는 보존된 영역을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 (i) 서열 번호 45에 상응하는 아미노산의 스트레치, (ii) 서열 번호 46에 상응하는 아미노산의 스트레치, (iii) 서열 번호 47에 상응하는 아미노산의 스트레치, (iv) 서열 번호 48에 상응하는 아미노산의 스트레치, (v) 서열 번호 49에 상응하는 아미노산의 스트레치, 및 (vi) 서열 번호 50에 상응하는 아미노산의 스트레치를 포함한다.
일 실시양태는 하기 식을 포함하는 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질을 제공한다:
f1-r1-f2-r2-f3-r3-f4
식에서, r1은 서열 번호 54와 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하고; r2는 서열 번호 55와 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하고; r3은 서열 번호 56과 동일하거나 이에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하고; f1, f2, f3 및 f4는 프레임워크 잔기이다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 30 내지 40, 58, 및 60 내지 62로 이루어진 군으로부터 선택된 서열과 80% 이상 동일한 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 111개 아미노산 내지 119개 아미노산을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 비인간 공급원으로부터 유래한 VHH 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 라마 VHH 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 57로서 제시된 서열을 포함하는 인간 메소텔린 단백질에 결합한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 메소텔린의 에피토프에 결합하고, 상기 에피토프는 서열 번호 57의 아미노산 잔기 296 내지 390을 포함하는 영역 I, 서열 번호 57의 아미노산 잔기 391 내지 486을 포함하는 영역 II, 또는 서열 번호 57의 아미노산 잔기 487 내지 598을 포함하는 영역 III에 위치한다. 일부 실시양태에서, 상기 결합 단백질은 키메라 항체, 또는 인간화 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 결합 단백질은 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 결합 단백질은 인간화 단일 도메인 항체이다.
일 실시양태는 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질로서, 서열 번호 51 내지 56, 및 63 내지 179로부터 선택된 하나 이상의 CDR을 포함하는 단백질을 제공한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 51, 54, 및 63 내지 101 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 CDR1을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 52, 55, 및 102 내지 140 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 CDR2를 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 53, 56, 및 141 내지 179 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 CDR3을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 180 내지 218 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 프레임워크 영역 1(f1)을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 219 내지 257 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 프레임워크 영역 2(f2)를 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 258 내지 296 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 프레임워크 영역 3(f3)을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 297 내지 335 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 프레임워크 영역 4(f4)를 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 단백질은 서열 번호 1 내지 40, 및 58 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함한다.
일 실시양태는 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 제공한다. 추가의 실시양태는 상기 실시양태의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터를 제공한다. 추가 실시양태는 상기 실시양태에 따른 벡터로 형질전환된 숙주 세포를 제공한다.
일 실시양태는 (i) 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 폴리뉴클레오티드, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 벡터, 또는 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 숙주, 및 (ii) 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 약학 조성물을 제공한다.
추가의 실시양태는 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질의 제조 방법으로서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질을 코딩하는 핵산 서열을 포함하는 벡터로 형질전환 또는 형질감염된 숙주를 메소텔린 결합 단백질의 발현을 허용하는 조건하에서 배양하는 단계 및 배양물로부터 생성된 단백질을 회수 및 정제하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.
일 실시양태는 증식성 질환, 또는 종양성 질환의 치료 또는 개선 방법으로서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 메소텔린 결합 단백질을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 일부 실시양태에서, 대상체는 인간이다. 일부 실시양태에서, 방법은 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질과 조합된 작용제의 투여를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질은 메소텔린을 발현하는 종양 세포에 선택적으로 결합한다. 일부 실시양태에서, 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질은 메소텔린을 발현하는 종양 세포의 T 세포 사멸을 매개한다. 일부 실시양태에서, 종양성 질환은 고형 종양 질환을 포함한다. 일부 실시양태에서, 고형 종양 질환은 중피종, 폐암, 위암, 난소암, 또는 삼중 음성 유방암을 포함한다. 일부 실시양태에서, 고형 종양 질환은 전이성이다.
본 발명의 신규 특징은 첨부된 청구 범위에 구체적으로 설명되어있다. 본 발명의 특징 및 이점은 본 발명의 원리가 이용되는 예시적인 실시양태, 및 수반되는 도면을 설명하는 다음의 상세한 설명을 참조하여 더 잘 이해될 것이다.
[도 1]은 표적 단백질 MSLN을 발현하는 OVCAR8 세포를 사멸시키는 데 있어 본 발명에 따른 항-MSLN 결합 단백질을 함유하는 예시적인 MSLN 표적화 삼중 특이적 분자(2A2 및 2A4)의 효과를 보여준다.
[도 2]는 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 5명의 공여자(공여자 02; 공여자 86; 공여자 41; 공여자 81; 및 공여자 35)로부터의 T 세포를 지시하여 Caov3 세포를 사멸시킴을 보여준다. 도면은 또한 대조군 삼중 특이적 단백질(GFP TriTAC)이 5명의 공여자(공여자 02; 공여자 86; 공여자 41; 공여자 81; 및 공여자 35)로부터의 T 세포를 지시하여 Caov3 세포를 사멸시키지 못했음을 보여준다.
[도 3]은 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 5명의 공여자(공여자 02; 공여자 86; 공여자 41; 공여자 81; 및 공여자 35)로부터의 T 세포를 지시하여 OVCAR3 세포를 사멸시킴을 보여준다. 도면은 또한 대조군 삼중 특이적 단백질(GFP TriTAC)이 5명의 공여자(공여자 02; 공여자 86; 공여자 41; 공여자 81; 및 공여자 35)로부터의 T 세포를 지시하여 OVCAR3 세포를 사멸시키지 못했음을 보여준다.
[도 4]는 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 건강한 공여자로부터의 T 세포를 지시하여 MSLN을 발현하는 세포(OVCAR3 세포; Caov4 세포; OVCAR3 세포; 및 OVCAR8 세포)를 사멸시킬 수 있었음을 보여준다. 도면은 또한 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 건강한 공여자로부터의 T 세포를 지시하여 MSLN을 발현하지 않는 세포(MDAPCa2b 세포; 및 NCI-H510A 세포)를 사멸시킬 수 없었음을 보여준다.
[도 5]는 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 시노몰구스(cynomolgus) 원숭이로부터의 T 세포를 지시하여 인간 난소암 세포(OVCAR3 세포; Caov3 세포)를 사멸시킬 수 있었음을 보여준다. 도면은 또한 대조군 삼중 특이적 단백질(GFP TriTAC)이 시노몰구스 원숭이로부터의 T 세포를 지시하여 인간 난소암 세포주(OVCAR3 세포; Caov3 세포)를 사멸시킬 수 없었음을 보여준다.
[도 6]은 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 인간 혈청 알부민(HSA: human serum albumin)의 존재 또는 부재하에 T 세포에 의한 MSLN 발현 NCI-H2052 중피종 세포의 사멸을 지시할 수 있었음을 보여준다.
[도 7]은 MSLN-발현 Caov4 세포의 존재하에서, T 세포로부터의 TNF-α의 분비에 의해 입증된 바와 같이, 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 4명의 건강한 공여자(공여자 2; 공여자 86; 공여자 35; 및 공여자 81)로부터의 T 세포를 활성화시킬 수 있었음을 보여준다.
[도 8]은 MSLN-발현 OVCAR8 세포의 존재하에서, T 세포 상에서 CD69 발현의 활성화에 의해 입증된 바와 같이, 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 4명의 건강한 공여자(공여자 2; 공여자 86; 공여자 35; 및 공여자 81)로부터의 T 세포를 활성화시킬 수 있었음을 보여준다.
[도 9]는 MSLN 발현 세포주 또는 MSLN 비-발현 세포주에 대한 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질의 결합을 보여준다. [도 9a]는 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질에 결합된 MSLN 발현 세포(Caov3 세포-좌측 상단 패널; Caov4 세포-우측 상단 패널; OVCAR3 세포-좌측 하단 패널; OVCAR8 세포-우측 하단 패널)와의 결합을 나타내고; [도 9a]는 동일한 세포주에 대한 대조군 삼중 특이적 단백질(GFP TriTAC)의 결합이 없음을 추가로 보여준다. [도 9b]는 MSLN 비-발현 세포주(MDCA2b 세포-좌측 패널; NCI-H510A 세포-우측 패널)에 대한 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질 및 GFP TriTAC 둘 다의 결합이 없음을 나타낸다.
[도 10]은 4명의 건강한 공여자(공여자 2-좌측 상단 패널; 공여자 35-우측 상단 패널; 공여자 41-좌측 하단 패널; 공여자 81-우측 하단 패널)로부터의 T 세포에 대한 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질의 결합을 보여준다.
[도 11]은 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질이 MSLN 발현 NCI-H292 세포로 이식된 NCG 마우스에서 종양 성장을 억제할 수 있었음을 보여준다.
[도 12]는 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질의 약동학적 프로파일을 보여준다. 2마리의 시노몰구스 원숭이에 주사한 후 다양한 시점에서 본 발명의 예시적인 MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 삼중 특이적 MSLN 표적 항원 결합 단백질의 혈청 중 수준을 플롯에 나타낸다.
본 발명의 바람직한 실시양태를 본원에서 보여주고 설명하였지만, 이러한 실시양태는 단지 예로서 제공된다는 것은 당업자에게 명백할 것이다. 이제 당업자는 본 발명을 벗어나지 않고서 다수의 변형, 변경 및 치환을 생각해 낼 것이다. 본 발명을 실시하는 데 있어 본원에 기재된 본 발명의 실시양태에 대한 다양한 대안이 사용될 수 있음을 이해해야 한다. 다음의 청구 범위는 본 발명의 범위를 정의하고 이로써 이들 청구 범위의 범위 내의 방법 및 구조 및 이들의 등가물이 포함되는 것으로 의도된다.
특정 정의
본원에서 사용되는 용어는 특정한 경우만을 설명하기 위한 것이며 제한적인 것으로 의도되는 것은 아니다. 본원에서 사용되는 바와 같이, 단수 형태 "하나의(a, an, 및 the)"는 문맥상 달리 명백하게 지시하지 않는 한, 복수의 표현을 또한 포함한다. 또한, 용어 "포함하는(including)", "포함하다(includes)", "갖는(having)", "갖다(has)", "가진(with)", 또는 이의 변형이 상세한 설명 및/또는 청구 범위에서 사용될 경우, 상기 용어는 용어 "포함하는(comprising)"과 유사한 방식으로 포괄적인 것으로 의도된다.
용어 "약" 또는 "대략"은 당업자에 의해 결정된 특정 값에 대해 허용 가능한 오차 범위 내를 의미하며, 이는 값이 측정 또는 결정되는 방법, 예를 들어, 측정 시스템의 한계에 따라 결정될 것이다. 예를 들어, "약"은 주어진 값에서 실시당 1 또는 1 초과의 표준 편차 내를 의미할 수 있다. 특정 값이 출원 및 청구 범위에 기술되는 경우, 달리 언급되지 않는 한 용어 "약"은 특정 값에 대해 허용 가능한 오차 범위를 의미하는 것으로 가정되어야 한다.
용어 "개체", "환자" 또는 "대상체"는 호환적으로 사용된다. 상기 어떤 용어도 의료 종사자(예를 들어, 의사, 공인 간호사, 임상 간호사, 의료 보조자, 잡역부 또는 호스피스 근무자)의 감독(예를 들어, 지속적 또는 간헐적)에 의해 특징지어지는 장소를 필요로 하거나 이에 제한되지 않는다.
용어 "프레임워크" 또는 "FR 잔기(또는 영역)"는 본원에 정의된 CDR 또는 초가변 영역 잔기 이외의 가변 도메인 잔기를 지칭한다. "인간 컨센서스 프레임워크"는 인간 면역글로불린 VL 또는 VH 프레임워크 서열의 선택에서 가장 흔하게 발생하는 아미노산 잔기를 나타내는 프레임워크이다.
본원에서 사용되는 "가변 영역" 또는 "가변 도메인"은 가변 도메인의 특정 부분이 항체마다 서열이 광범위하게 상이하다는 사실을 의미하고, 이의 특정 항원에 대해 각 특정 항체의 결합 및 특이성에 사용된다. 그러나 가변성은 항체의 가변 도메인에 걸쳐 고르게 분포되지는 않는다. 경쇄 및 중쇄 가변 도메인 둘 다에서 상보성 결정 영역(CDR: complementarity-determining region) 또는 초가변 영역이라 불리는 3개의 세그먼트에 집중되어있다. 가변 도메인의 보다 고도로 보존된 부분을 프레임워크(FR)라 한다. 고유 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인은 각각, β-시트 배열을 주로 채택하는 4개의 FR 영역을 포함하고, 이는 β-시트 구조를 연결하고, 경우에 따라 β-시트 구조의 일부를 형성하는 루프를 형성하는 3개의 CDR에 의해 연결된다. 각 쇄의 CDR은 FR 영역에 의해 서로 근접하게 유지되고 다른 쇄의 CDR과 함께 항체의 항원 결합 부위의 형성에 기여한다(문헌[Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, National Institute of Health, Bethesda, Md. (1991)] 참조). 불변 도메인은 항체를 항원에 결합시키는 데 직접 관여하지는 않지만, 항체 의존성 세포 독성에 항체를 참여시키는 것과 같은 다양한 이펙터 기능을 나타낸다. "카바트에서와 같은 가변 도메인 잔기 넘버링" 또는 "카바트에서와 같은 아미노산 위치 넘버링" 및 그 변형은 문헌[Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed., Public Health Service, National Institute of Health, Bethesda, Md. (1991)]의 항체 모음집의 중쇄 가변 도메인 또는 경쇄 가변 도메인에 사용되는 넘버링 시스템을 지칭한다. 이 넘버링 시스템을 사용하여, 실제 선형 아미노산 서열은 가변 도메인의 FR 또는 CDR의 단축 또는 삽입에 상응하는 더 적거나 추가적인 아미노산을 함유할 수 있다. 예를 들어, 중쇄 가변 도메인은 H2의 잔기 52 뒤에 단일 아미노산 삽입(카바트에 따른 잔기 52a) 및 중쇄 FR 잔기 82 뒤에 삽입된 잔기(예를 들어, 카바트에 따른 잔기 82a, 82b, 및 82c 등)를 포함할 수 있다. 잔기의 카바트 넘버링은 항체 서열의 상동성 영역에서 "표준" 카바트 넘버링된 서열과 정렬함으로써 주어진 항체에 대해 결정될 수 있다. 본 발명의 CDR이 카바트 넘버링 규칙에 반드시 상응하는 것으로 의도되지는 않는다.
본원에서 사용되는 바와 같이, 서열과 관련하여 용어 "퍼센트(%) 아미노산 서열 동일성"은 서열을 정렬하고, 최대 퍼센트 서열 동일성을 달성하기 위해 필요한 경우 갭을 도입하고, 임의의 보존적 치환을 서열 동일성의 일부로서 고려하지 않은 후, 특정 서열의 아미노산 잔기와 동일한 후보 서열 내 아미노산 잔기의 퍼센트로 정의된다. 퍼센트 아미노산 서열 동일성을 결정하기 위한 정렬은 당 업계 내에 있는 다양한 방법, 예를 들어, EMBOSS MATCHER, EMBOSS WATER, EMBOSS STRETCHER, EMBOSS NEEDLE, EMBOSS LALIGN, BLAST, BLAST-2, ALIGN 또는 Megalign(DNASTAR) 소프트웨어와 같은 공개적으로 이용 가능한 컴퓨터 소프트웨어를 사용하여 수행될 수 있다. 당업자는 비교되는 전장 서열에 걸쳐 최대 정렬을 달성하는데 필요한 임의의 알고리즘을 포함하여 정렬을 측정하기 위한 적절한 파라미터를 결정할 수 있다.
본원에 사용되는 "제거 반감기"는 문헌[Goodman and Gillman's The Pharmaceutical Basis of Therapeutics 21-25 (Alfred Goodman Gilman, Louis S. Goodman, and Alfred Gilman, eds., 6th ed. 1980)]에 기술된 바와 같이 일반적인 의미로 사용된다. 간략하게, 이 용어는 약물 제거의 시간 경과에 대한 정량적 척도를 포함하는 것으로 의도된다. 약물 농도는 일반적으로 제거 과정의 포화에 필요한 농도에 근접하지 않기 때문에 대부분의 약물의 제거는 지수로 나타낸다(즉, 1차 동역학을 따름). 지수 과정의 속도는 단위 시간당 분율 변화를 나타내는 속도 상수 k 또는 과정의 50% 완료에 필요한 시간인 반감기 t1/2로 표현될 수 있다. 이 두 상수의 단위는 각각 시간-1 및 시간이다. 반응의 1차 속도 상수와 반감기는 단순하게 연관되며(k×t1/2=0.693) 이에 따라 호환될 수 있다. 1차 제거 동역학은 단위 시간당 약물의 일정한 분율이 상실됨을 나타내기 때문에, 약물 농도 대 시간의 로그의 플롯은 초기 분포 단계 이후(즉, 약물 흡수 및 분포가 완료된 후) 항상 선형이다. 이러한 그래프로부터 약물 제거 반감기를 정확하게 결정할 수 있다.
본원에 사용되는 용어 "결합 친화도"는 결합 표적에 대한 본 발명에 기재된 단백질의 친화도를 지칭하고, "Kd" 값을 사용하여 수치로 표현된다. 둘 이상의 단백질이 그들의 결합 표적에 대해 유사한 결합 친화도를 갖는 것으로 나타나는 경우, 각각의 단백질의 그들의 결합 표적에 대한 결합의 Kd 값은 서로 ± 2배 내에 있다. 둘 이상의 단백질이 단일 결합 표적에 대해 유사한 결합 친화도를 갖는 것으로 나타나는 경우, 각각의 단백질의 상기 단백질의 상기 단일 결합 표적에 대한 결합의 Kd 값은 서로 ± 2배 내에 있다. 단백질이 둘 이상의 표적에 유사한 결합 친화도로 결합하는 것으로 나타나는 경우, 상기 단백질의 둘 이상의 표적에 대한 결합의 Kd 값은 서로 ± 2배 내에 있다. 일반적으로, 더 높은 Kd 값은 더 약한 결합에 해당한다. 일부 실시양태에서, "Kd"는 바이오코어(BIAcore)™-2000 또는 바이오코어™-3000(BIAcore, Inc., 뉴저지주 피스카타웨이 소재)을 사용하여 방사성 표지된 항원 결합 분석(RIA) 또는 표면 플라스몬 공명 분석에 의해 측정된다. 특정 실시양태에서, "온-레이트(on-rate)" 또는 "결합의 속도" 또는 "결합 속도" 또는 "kon" 및 "오프-레이트(off-rate)" 또는 "해리의 속도" 또는 "해리 속도" 또는 "koff"는 또한 바이오코어™-2000 또는 바이오코어™-3000(BIAcore, Inc., 뉴저지주 피스카타웨이 소재)을 사용하여 표면 플라스몬 공명 기술로 결정된다. 추가의 실시양태에서, "Kd", "kon", 및 "koff"는 옥텟® 시스템(OCTET® Systems(Pall Life Sciences)을 사용하여 측정한다. 옥텟® 시스템을 사용하여 결합 친화도를 측정하는 예시적인 방법에서, 리간드, 예를 들어 비오티닐화 인간 또는 시노몰구스 MSLN을 옥텟® 스트렙타비딘 모세관 센서 팁 표면에 고정시킨 후, 약 20 내지 50 μg/ml 인간 또는 시노몰구스 MSLN 단백질을 사용하여 제조사의 설명서에 따라 스트렙타비딘 팁을 활성화시킨다. 또한, 차단제로서 PBS/카제인 용액을 넣는다. 결합 동역학 측정을 위해, MSLN 결합 단백질 변이체를 약 10 ng/mL 내지 약 100 ㎍/mL, 약 50 ng/mL 내지 약 5 μg/mL, 또는 약 2 ng/mL 내지 약 20 μg/mL의 농도로 넣는다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단일 도메인 단백질은 약 2 ng/mL 내지 약 20 ㎍/mL 범위의 농도로 사용된다. 음성 대조군, 결합 단백질이 없는 분석 완충액의 경우 완전한 해리가 관찰된다. 결합 반응의 동역학 파라미터는 적절한 툴, 예를 들어 포르테바이오(ForteBio) 소프트웨어를 사용하여 결정된다.
본원에서 MSLN 결합 단백질, 약학 조성물뿐만 아니라 상기 MSL\N 결합 단백질을 제조하기 위한 핵산, 재조합 발현 벡터, 및 숙주 세포를 제공한다. 질환, 병태 및 장애의 예방 및/또는 치료에 개시된 MSLN 결합 단백질을 사용하는 방법을 또한 제공한다. MSLN 결합 단백질은 MSLN에 특이적으로 결합할 수 있다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 추가 도메인, 예를 들어 CD3 결합 도메인 및 알부민 결합 도메인을 포함한다.
종양성 질환에서의 메소텔린 ( MSLN ) 및 그의 역할
본원에서 메소텔린 결합 단백질이 고려된다. 메소텔린은 복막, 흉막 및 심낭 체강의 중피 내벽 세포의 표면에 존재하는 당 단백질이다. 메소텔린 유전자(MSLN)는 세포 표면에 존재하는 글리코실-포스파티딜이노시톨-고정 당 단백질인 메소텔린이라 불리는 40kDa 단백질로 프로세싱되는 71 킬로달톤(kDa) 전구 단백질을 코딩한다(Chang, et al, Proc Natl Acad Sci USA (1996) 93:136-40). 메소텔린 cDNA는 HPC-Y5 세포주로부터 제조된 라이브러리로부터 클로닝되었다(Kojima et al. (1995) J. Biol. Chem. 270:21984-21990). cDNA는 또한 중피종을 인식하는 단클론 항체 K1을 사용하여 클로닝되었다(Chang and Pastan (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:136-40). 메소텔린은 정상 인간 조직에서의 발현이 흉막, 심낭 및 복막과 같은 체강을 감싸는 중피 세포에 제한되는 분화 항원이다. 메소텔린은 또한 중피종, 췌장 선암종, 난소암, 위 및 폐 선암종을 비롯한 여러 가지 상이한 인간 암에서 고도로 발현된다(Hassan, et al., Eur J Cancer (2008) 44:46-53) (Ordonez, Am J Surg Pathol (2003) 27:1418-28; Ho, et al., Clin Cancer Res (2007) 13:1571-5). 메소텔린은 양성 췌장 조직에서는 드물고 약한 발현을 보이면서 대부분의 원발성 췌장 선암종에서는 과발현된다(Argani P, et al. Clin Cancer Res. 2001; 7(12):3862-3868). 상피 악성 흉막 중피종(MPM: malignant pleural mesothelioma)은 보편적으로 메소텔린을 발현하는 반면 육종양 MPM은 메소텔린을 발현하지 않을 가능성이 높다. 대부분의 장액성 상피 난소 암종, 및 관련된 원발성 복막 암종은 메소텔린을 발현한다.
메소텔린은 또한 고유 막 결합된 형태와 비교하여 단백질의 가용성 형태로서 종양 세포로부터 방출된다(Hellstrom, et al., Cancer Epidemiol Biomarkers Prev (2006) 15:1014-20; Ho, et al., Cancer Epidemiol Biomarkers Prev (2006) 15:1751). 구조적으로, 메소텔린은 60 kDa 전구체 폴리펩티드로서 세포 표면에서 발현되며, 이는 31 kDa의 방출되는 성분(MPF에 상응) 및 40 kDa 막 결합된 성분으로 단백질 분해로 프로세싱된다(Hassan et al. (2004) Clin. Cancer. Res. 10:3937-3942). 메소텔린은 이전에 난소암 항원으로 확인된 종양 세포 표면에 존재하는 뮤신 유사 당 단백질인 CA125(MUC-16이라고도 알려짐)와 상호작용하는 것으로 나타났다. 또한, 막-결합 메소텔린에 대한 CA125의 결합은 이형 세포 부착을 매개하고, CA125와 메소텔린은 진행된 단계의 난소 선암종에서 동시-발현된다(Rump, A. et al. (2004) J. Biol. Chem. 279:9190-9198). 복막의 내벽에서 메소텔린의 발현은 난소암의 선호되는 전이 형성 부위와 상관관계가 있고, 메소텔린-CA125 결합은 난소 종양의 복막 전이를 촉진하는 것으로 생각된다(Gubbels, J. A. et al. (2006) Mol. Cancer. 5:50).
메소텔린은 난소암에서의 자연 면역 반응의 표적이며, 암 면역 요법의 표적으로 제안되어왔다(Bracci L, et al. Clin Cancer Res. 2007; 13(2 Pt 1):644-653; Moschella F, et al. Cancer Res. 2011; 71(10):3528-3539; Gross G, et al. FASEB J. 1992; 6(15):3370-3378; Sadelain M, et al. Nat Rev Cancer. 2003; 3(1):35-45; Muul L M, et al. Blood. 2003; 101(7):2563-2569; Yee C, et al. Proc Natl Acad Sci USA. 2002; 99(25):16168-16173). 췌장암 환자에서 메소텔린 특이적 CTL의 존재는 전체 생존과 상관관계가 있다(Thomas A M, et al. J Exp Med. 2004; 200:297-306). 또한, 파스탄(Pastan)과 공동 연구자들은 면역 독소에 접합된 항-메소텔린 항체의 가용성 항체 단편을 사용하여 메소텔린 양성 종양을 가진 암 환자를 치료하였다. 이 접근법은 췌장암에서 적절한 안전성과 일부 임상 활성을 보여 주었다(Hassan R, et al. Cancer Immun. 2007; 7:20 및 Hassan R, et al. Clin Cancer Res. 2007; 13(17):5144-5149). 난소암에서, 이 치료 전략은 복수의 완전 용해(complete resolution)도 나타낸 두 번째 환자에서 RECIST 기준에 의해 하나의 소 반응(minor response) 및 안정된 질환을 일으켰다.
일부 메소텔린 양성 암 환자의 혈액에서 미량의 메소텔린이 검출될 수 있기 때문에 메소텔린은 또한 특정 유형의 암의 진단 및 예후에 대한 마커로 사용될 수 있다(Cristaudo et al., Clin. Cancer Res. 13:5076-5081, 2007). 메소텔린은 카르 복실 말단에서의 결실을 통해 또는 막 결합 형태로부터의 단백질 분해 절단에 의해 혈청으로 방출될 수 있는 것으로 보고되었다(Hassan et al., Clin. Cancer Res. 10:3937-3942, 2004). 석면에 노출된 근로자들 사이에서 악성 중피종이 발생하기 몇 년 전에 가용성 형태의 메소텔린의 증가를 발견할 수 있었다(Creaney and Robinson, Hematol. Oncol. Clin. North Am. 19:1025-1040, 2005). 또한, 난소암, 췌장암, 및 폐암 환자는 혈청에서 가용성 메소텔린이 상승하였다(Cristaudo et al., Clin. Cancer Res. 13:5076-5081, 2007; Hassan et al., Clin. Cancer Res. 12:447-453, 2006; Croso et al., Cancer Detect. Prev. 30:180-187, 2006). 따라서, 메소텔린은 질환 예방 또는 치료 방법을 위한 적절한 표적이며, 메소텔린에 특이적인 효과적인 항체가 필요하다.
세포 표면 성숙 메소텔린은 3개의 별개의 도메인, 즉 영역 I(잔기 296 내지 390을 포함함), II(잔기 391 내지 486을 포함함), 및 III(잔기 487 내지 598을 포함함)을 포함하는 것으로 나타났다(Tang et al., A human single-domain antibody elicits potent antitumor activity by targeting an epitope in mesothelin close to the cancer cell surface, Mol. Can. Therapeutics, 12(4): 416-426, 2013).
치료적 중재를 위해 메소텔린에 대해 생성된 첫 번째 항체는 메소텔린과 CA-125 사이의 상호 작용을 방해하도록 설계되었다. 파지 디스플레이는 Fv SS를 확인하였으며, 이는 친화도 최적화되었고, 메소텔린을 표적화하는 재조합 면역 독소, SS1P를 생성하는데 사용되었다. SS1을 또한 사용하는 MORAb-009 항체 아마툭시맙은 영역 I 내에 메소텔린의 아미노 말단 64개 아미노산에서 비선형 에피토프를 인식한다. SS1 Fv는 또한 키메라 항원 수용체-조작된 T 세포를 생성하는데 사용되었다. 최근에, 메소텔린 단백질의 다른 영역을 인식하는 새로운 항-메소텔린 항체가 보고되었다.
난소암, 췌장암, 중피종, 폐암, 위암, 및 삼중 음성 유방암과 같은 메소텔린의 과다 발현과 관련된 고형 종양 질환의 치료를 위해 이용 가능한 추가의 옵션이 여전히 필요하다. 본 발명은 특정 실시양태에서, 종양 표적 세포의 표면 상 MSLN에 특이적으로 결합하는 단일 도메인 단백질을 제공한다.
메소텔린 결합 단백질
본원에서 특정 실시양태에서, MSLM 단백질의 에피토프에 결합하는 결합 단백질, 예를 들어 항-MSLN 단일 도메인 항체 또는 항체 변이체를 제공한다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 서열 번호 57의 서열을 포함하는 단백질에 결합한다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 서열 번호 57과 비교하여 절두된 서열을 포함하는 단백질에 결합한다.
일부 실시양태에서, 본원에 개시된 MSLN 결합 단백질은 전장의 메소텔린을 인식한다. 특정 경우에, 본원에 개시된 MSLN 결합 도메인은 메소텔린의 영역 I(서열 번호 57의 아미노산 잔기 296 내지 390을 포함함), 영역 II(서열 번호 57의 아미노산 잔기 391 내지 486을 포함함), 또는 영역 III(서열 번호 57의 아미노산 잔기 487 내지 598을 포함함) 내 에피토프를 인식한다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 메소텔린의 영역 I, II 또는 III 외부에 위치한 에피토프를 인식하고 이에 결합할 수 있는 것으로 고려된다. 또 다른 실시양태에서, MORAb-009 항체와 상이한 에피토프를 인식하고 이에 결합하는 MSLN 결합 단백질이 개시된다.
일부 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 추가 면역글로불린 도메인을 포함하는 다중 도메인 단백질 내에서 발현된다. 이러한 다중 도메인 단백질은 면역 독소-기반 종양 성장 억제 및 항체 의존성 세포 독성(ADCC)의 유도를 통해 작용할 수 있다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질을 함유하는 다중 도메인 단백질은 보체 의존성 세포 독성(CDC) 활성을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질을 함유하는 다중 도메인 단백질은 메소텔린을 발현하는 암세포에 대해 ADCC 및 CDC 활성 둘 모두를 나타낸다.
또한, 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질을 함유하는 다중 도메인 단백질이 CDC를 통해 작용하는 경우, MLSN 결합 단백질은 세포 표면에 근접한 메소텔린 단백질의 C-말단에서 입체 형태적 에피토프를 인식할 수 있다. 일부 실시양태에서, 메소텔린 단백질은 서열 번호 57에 제시된 서열을 포함하고, C-말단은 아미노산 잔기 539 내지 588을 포함한다.
일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 항-MSLN 항체 또는 항체 변이체이다. 본원에 사용되는 용어 "항체 변이체"는 본원에 기재된 항체의 변이체 및 유도체를 지칭한다. 특정 실시양태에서, 본원에 기재된 항-MSLN 항체의 아미노산 서열 변이체가 고려된다. 예를 들어, 특정 실시양태에서, 본원에 기재된 항-MSLN 항체의 아미노산 서열 변이체는 항체의 결합 친화도 및/또는 다른 생물학적 특성을 개선하는 것으로 고려된다. 아미노산 변이체를 제조하는 예시적인 방법은 항체를 코딩하는 뉴클레오티드 서열에 적절한 변형의 도입, 또는 펩티드 합성을 포함하지만, 이에 제한되지는 않는다. 이러한 변형은 예를 들어 항체의 아미노산 서열 내에 잔기의 결실, 및/또는 삽입 및/또는 치환을 포함한다.
최종 구조물이 원하는 특성, 예를 들어 항원-결합을 갖는다면, 최종 구조물에 도달하도록 결실, 삽입, 및 치환의 임의의 조합이 이루어질 수 있다. 특정 실시양태에서, 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 항체 변이체가 제공된다. 치환 돌연변이 유발을 위한 관심 부위는 CDR 및 프레임워크 영역을 포함한다. 이러한 치환의 예는 하기에 기술된다. 아미노산 치환은 관심 항체에 도입될 수 있고, 생성물은 원하는 활성, 예를 들어 유지/개선된 항원 결합, 감소한 면역원성, 또는 개선된 항체 의존성 세포 매개 세포 독성(ADCC) 또는 보체 의존성 세포 독성(CDC)에 대해 스크리닝될 수 있다. 항체 변이체를 제조하기 위해 보존적 및 비보존적 아미노산 치환 둘 모두가 고려된다.
변이 항-MSLN 항체를 생성하기 위한 치환의 다른 예에서, 모 항체의 하나 이상의 초가변 영역 잔기가 치환된다. 일반적으로, 그 후 변이체는 모 항체와 비교하여 원하는 특성의 개선, 예를 들어 친화도 증가, 친화도 감소, 면역원성 감소, 결합의 pH 의존성 증가에 기초하여 선택된다. 예를 들어, 친화도 성숙 변이 항체는 예를 들어 파지 디스플레이 기반 친화도 성숙 기술, 예를 들어 본원에 기재되거나 당해 분야에 공지된 기술을 사용하여 생성될 수 있다.
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 MSLN 결합 단백질은 메소텔린에 특이적인 단일 도메인 항체, 예를 들어 중쇄 가변 도메인(VH), 라마 유래 sdAb의 가변 도메인(VHH), 펩티드, 리간드 또는 소분자 실체이다. 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 MSLN 결합 단백질의 메소텔린 결합 도메인은 단클론 항체, 다클론 항체, 재조합 항체, 인간 항체, 인간화 항체로부터의 도메인을 포함하는, 그러나 이에 제한되지 않는 메소텔린에 결합하는 임의의 도메인이다. 특정 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 단일 도메인 항체이다. 다른 실시양태에서, MSLN 결합 단백질 펩티드이다. 추가의 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 소분자이다.
일반적으로, 본원에서 가장 넓은 의미로 사용되는 단일 도메인 항체라는 용어는 특정 생물학적 공급원 또는 특정 제조 방법에 제한되지 않음에 유의해야 한다. 단일 도메인 항체는 상보성 결정 영역이 단일 도메인 폴리펩티드의 일부인 항체이다. 예는 중쇄 항체, 경쇄가 본래 결여된 항체, 통상적인 4쇄 항체로부터 유래한 단일 도메인 항체, 조작된 항체 및 항체로부터 유래한 것 이외의 단일 도메인 스캐폴드를 포함하지만, 이에 제한되지는 않는다. 단일 도메인 항체는 당 업계의 임의의 것, 또는 미래의 임의의 단일 도메인 항체일 수 있다. 단일 도메인 항체는 마우스, 인간, 낙타, 라마, 염소, 토끼, 소를 포함하는, 그러나 이에 제한되지 않는 임의의 종으로부터 유래할 수 있다. 예를 들어, 일부 실시양태에서, 본 발명의 단일 도메인 항체는 다음에 의해서 수득된다: (1) 자연 발생 중쇄 항체의 VHH 도메인을 단리함으로써; (2) 자연 발생 VHH 도메인을 코딩하는 뉴클레오티드 서열의 발현에 의해; (3) 자연 발생 VHH 도메인의 "인간화" 또는 이러한 인간화된 VHH 도메인을 코딩하는 핵산의 발현에 의해; (4) 임의의 동물 종, 특히 인간과 같은 포유동물 종으로부터의 자연 발생 VH 도메인의 "낙타화"에 의해, 또는 이러한 낙타화된 VH 도메인을 코딩하는 핵산의 발현에 의해; (5) "도메인 항체" 또는 "Dab"의 "낙타화", 또는 이러한 낙타화된 VH 도메인을 코딩하는 핵산의 발현에 의해; (6) 단백질, 폴리펩티드 또는 다른 아미노산 서열을 제조하기 위한 합성 또는 반합성 기술을 사용함으로써; (7) 당해 분야에 공지된 핵산 합성 기술을 사용하여 단일 도메인 항체를 코딩하는 핵산을 제조한 다음, 이렇게 수득한 핵산의 발현에 의해; 및/또는 (8) 전술한 것 중 하나 이상의 임의의 조합에 의해.
일 실시양태에서, 단일 도메인 항체는 MSLN에 대한 자연 발생 중쇄 항체의 VHH 도메인에 상응한다. 본원에 추가로 기재되는 바와 같이, 이러한 VHH 서열은 일반적으로 라마 종을 MSLN으로 적절하게 면역화함으로써(즉, MSLN에 대한 면역 반응 및/또는 중쇄 항체를 발생시키기 위해), 상기 라마의 적합한 생물학적 샘플(예를 들어, 혈액 샘플, 혈청 샘플 또는 B 세포 샘플)을 수득함으로써, 그리고 당해 분야에 공지된 임의의 적합한 기술을 사용하여 상기 샘플로부터 출발하여 MSLN에 대한 VHH 서열을 생성함으로써 생성되거나 수득할 수 있다.
다른 실시양태에서, MSLN에 대한 이러한 자연 발생 VHH 도메인은 낙타과 VHH 서열의 나이브(na
Figure 112019128059661-pct00001
ve) 라이브러리로부터, 예를 들어 MSLN 또는 그의 적어도 일부, 단편, 항원 결정기 또는 에피토프를 사용하여 당해 분야에 공지된 하나 이상의 스크리닝 기술을 사용하여 상기 라이브러리를 스크리닝함으로써, 수득된다. 이러한 라이브러리 및 기술은 예를 들어 WO 99/37681, WO 01/90190, WO 03/025020 및 WO 03/035694에 기재되어있다. 대안적으로, 예를 들어 WO 00/43507에 기재된 바와 같이 무작위 돌연변이 유발 및/또는 CDR 셔플링과 같은 기술에 의해 나이브 VHH 라이브러리로부터 수득한 VHH 라이브러리와 같은 나이브 VHH 라이브러리로부터 유래한 개선된 합성 또는 반합성 라이브러리가 사용된다.
추가의 실시양태에서, MSLN에 대한 VHH 서열을 수득하기 위한 또 다른 기술은 중쇄 항체를 발현할 수 있는 (즉, MSLN에 대한 면역 반응 및/또는 중쇄 항체를 유도하도록) 형질전환 포유동물을 적절히 면역화하는 단계, 상기 형질전환 포유동물로부터의 적합한 생물학적 샘플(예를 들어, 혈액 샘플, 혈청 샘플 또는 B 세포의 샘플)을 수득한 후, 당해 분야에 공지된 임의의 적합한 기술을 사용하여 상기 샘플로부터 출발하여, MSLN에 대한 VHH 서열을 생성하는 단계를 포함한다. 예를 들어, 이러한 목적으로, WO 02/085945 및 WO 04/049794에 기재된 중쇄 항체 발현 래트 또는 마우스 및 추가 방법 및 기술이 사용될 수 있다.
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 MSLN 항체는 자연 발생 VHH 도메인의 아미노산 서열에 상응하지만 "인간화된", 즉 상기 자연 발생 VHH 서열의 아미노산 서열(및 특히 프레임워크 서열)에서 하나 이상의 아미노산 잔기를 인간으로부터의 통상적인 4쇄 항체의 VH 도메인 내 상응하는 위치(들)에서 발생하는 하나 이상의 아미노산 잔기(예를 들어, 상기 지시된 바와 같이)로 대체함으로써 인간화된, 아미노산 서열을 갖는 단일 도메인 항체를 포함한다. 이는 예를 들어, 본원에서 추가의 설명에 기초하여, 당업자에게 명백한 당해 분야에 공지된 방식으로 수행될 수 있다. 또한, 본 발명의 이러한 인간화된 항-MSLN 단일 도메인 항체는 그 자체로 공지된 임의의 적합한 방식으로(즉, 상기 (1) 내지 (8)에 지시된 바와 같이) 수득되고 따라서 출발 물질로서 자연 발생 VHH 도메인을 포함하는 폴리펩티드를 사용하여 수득한 폴리펩티드에 엄격하게 제한되지는 않음에 유의해야 한다. 일부 추가의 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 단일 도메인 항-MSLN 항체는 자연 발생 VH 도메인의 아미노산 서열에 상응하지만 "낙타화된", 즉 통상적인 4쇄 항체의 자연 발생 VH 도메인의 아미노산 서열 내 하나 이상의 아미노산 잔기를 경쇄 항체의 VHH 도메인에서 상응하는 위치(들)에서 발생하는 하나 이상의 아미노산 잔기로 대체함으로써 낙타화된, 아미노산 서열을 갖는 단일 도메인 항체를 포함한다. 이러한 "낙타화" 치환은 바람직하게 VH-VL 계면, 및/또는 소위 낙타과 대표 특징 잔기를 형성하고/거나 그에 존재하는 아미노산 위치에 삽입된다(예를 들어, WO 94/04678 및 문헌[Davies and Riechmann (1994 and 1996)] 참조). 바람직하게는, 낙타화된 단일 도메인을 생성 또는 설계하기 위한 출발 물질 또는 출발점으로서 사용되는 VH 서열은 바람직하게는 포유동물로부터의 VH 서열, 더 바람직하게는 VH3 서열과 같은 인간의 VH 서열이다. 그러나 특정 실시양태에서, 본 발명의 이러한 낙타화된 항-MSLN 단일 도메인 항체는 당해 분야에 공지된 임의의 적합한 방식으로(즉, 상기 (1) 내지 (8)에 나타낸 바와 같이) 수득되고 따라서 출발 물질로서 자연 발생 VH 도메인을 포함하는 폴리펩티드를 사용하여 수득한 폴리펩티드에 엄격히 제한되지는 않는다는 것에 유의해야 한다. 예를 들어, 본원에 추가로 기술된 바와 같이, "인간화" 및 "낙타화"는 자연 발생 VHH 도메인 또는 VH 도메인을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 각각 제공한 다음, 새로운 뉴클레오티드 서열이 "인간화된" 또는 "낙타화된" 단일 도메인 항체를 각각 코딩하는 방식으로 상기 뉴클레오티드 서열 내 하나 이상의 코돈을 변화시킴으로써 수행된다. 이어서, 이 핵산은 본 발명의 원하는 항-MSLN 단일 도메인 항체를 제공하도록 발현될 수 있다. 대안적으로, 다른 실시양태에서, 자연 발생 VHH 도메인 또는 VH 도메인의 아미노산 서열에 각각 기초하여, 본 발명의 목적하는 인간화 또는 낙타화된 항-MSLN 단일 도메인 항체의 아미노산 서열이 각각 설계된 후 펩티드 합성을 위해 공지된 기술을 사용하여 데 노보(de novo) 합성된다. 일부 실시양태에서, 자연 발생 VHH 도메인 또는 VH 도메인의 아미노산 서열 또는 뉴클레오티드 서열에 각각 기초하여, 본 발명의 목적하는 인간화 또는 낙타화된 항-MSLN 단일 도메인 항체를 코딩하는 뉴클레오티드 서열이 각각 설계된 후 핵산 합성을 위해 공지된 기술을 사용하여 데 노보 합성되고, 그 후 이렇게 수득한 핵산은 본 발명의 목적하는 항-MSLN 단일 도메인 항체를 제공하기 위해 공지된 발현 기술을 사용하여 발현된다.
자연 발생 VH 서열 또는 VHH 서열로부터 출발하여 본 발명의 항-MSLN 단일 도메인 항체 및/또는 이를 코딩하는 핵산을 수득하기 위한 다른 적합한 방법 및 기술은 예를 들어 본 발명의 항-MSLN 단일 도메인 항체 또는 이를 코딩하는 뉴클레오티드 서열 또는 핵산을 제공하기 위해서 적합한 방식으로 하나 이상의 자연 발생 VH 서열의 하나 이상의 부분(예를 들어, 하나 이상의 프레임워크(FR) 서열 및/또는 상보성 결정 영역(CDR) 서열), 하나 이상의 자연 발생 VHH 서열의 하나 이상의 부분(예를 들어, 하나 이상의 FR 서열 또는 CDR 서열), 및/또는 하나 이상의 합성 또는 반합성 서열을 조합하는 단계를 포함한다.
일부 실시양태에서 MSLN 결합 단백질은 상당히 작고, 일부 실시양태에서 25 kD 이하, 20 kD 이하, 15 kD 이하, 또는 10 kD 이하인 것으로 고려된다. 특정한 경우에, MSLN 결합 단백질은 펩티드 또는 소분자 실체인 경우 5 kD 이하이다.
일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 중쇄 가변 상보성 결정 영역 CDR1, 중쇄 가변 CDR2, 중쇄 가변 CDR3, 경쇄 가변 CDR1, 경쇄 가변 CDR2, 및 경쇄 가변 CDR3을 포함하는 항-MSLN 특이적 항체이다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 단클론 항체, 다클론 항체, 재조합 항체, 인간 항체, 인간화 항체, 또는 항원 결합 단편으로부터의 도메인, 예를 들어 단일 도메인 항체(sdAb), Fab, Fab', F(ab)2, 및 Fv 단편, 하나 이상의 CDR로 구성된 단편, 단쇄 항체(예를 들어, 단쇄 Fv 단편(scFv)), 이황화 안정화(dsFv) Fv 단편, 이종 접합체 항체(예를 들어, 이중 특이적 항체), pFv 단편, 중쇄 단량체 또는 이량체, 경쇄 단량체 또는 이량체, 및 하나의 중쇄와 하나의 경쇄로 이루어진 이량체를 포함하는, 그러나 이에 제한되지 않는, MSLN에 결합하는 임의의 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 항-MSLN 단일 도메인 항체는 중쇄 가변 상보성 결정 영역(CDR), CDR1, CDR2 및 CDR3을 포함한다.
일부 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 하기 식으로 표시되는 바와 같이, 3개의 상보성 결정 영역/서열에 의해 중단된 4개의 프레임워크 영역/서열(f1-f4)로 구성된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드이다: f1-r1-f2-r2-f3-r3-f4, 여기서 r1, r2, 및 r3은 각각 상보성 결정 영역 CDR1, CDR2, 및 CDR3이고, f1, f2, f3, 및 f4는 프레임워크 잔기이다. 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 프레임워크 잔기는 예를 들어 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 또는 94개의 아미노산 잔기를 포함하고, 상보성 결정 영역은 예를 들어 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 또는 36개의 아미노산 잔기를 포함한다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 서열 번호 1 내지 40으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, CDR1은 서열 번호 51에 제시된 아미노산 서열 또는 서열 번호 51에서 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개의 아미노산 치환을 갖는 변이체를 포함한다. 일부 실시양태에서, CDR2는 서열 번호 52에 제시된 서열 또는 서열 번호 52에서 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개의 아미노산 치환을 갖는 변이체를 포함한다. 일부 실시양태에서, CDR3은 서열 번호 53에 제시된 서열 또는 서열 번호 53에서 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 아미노산 치환을 갖는 변이체를 포함한다.
일부 실시양태에서, CDR1은 서열 번호 54에 제시된 아미노산 서열 또는 서열 번호 54에서 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개의 아미노산 치환을 갖는 변이체를 포함한다. 일부 실시양태에서, CDR2는 서열 번호 55에 제시된 서열 또는 서열 번호 55에서 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10개의 아미노산 치환을 갖는 변이체를 포함한다. 일부 실시양태에서, CDR3은 서열 번호 56에 제시된 서열 또는 서열 번호 56에서 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개의 아미노산 치환을 갖는 변이체를 포함한다.
특정 예에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 하나 이상의 보존된 영역을 포함한다. 보존된 영역은 서열 번호 41 내지 50에 제시된 서열, 또는 상기 서열에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 변이체를 포함한다. 예시적인 실시양태는 서열 번호 41 내지 44로부터 선택된 하나 이상의 보존된 영역, 또는 상기 서열에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 변이체를 포함하는 MSLN 결합 단백질을 포함한다. 일부 경우에, MSLN 결합 단백질은 (i) 서열 번호 41에 상응하는 아미노산의 스트레치, (ii) 서열 번호 42에 상응하는 아미노산의 스트레치, (iii) 서열 번호 43에 상응하는 아미노산의 스트레치, 및 (iv) 서열 번호 44에 상응하는 아미노산의 스트레치를 포함한다.
추가의 예시적인 실시양태는 서열 번호 45 내지 50으로부터 선택된 하나 이상의 보존된 영역, 또는 상기 서열에 대해 하나 이상의 아미노산 잔기 치환을 포함하는 변이체를 포함하는 MSLN 결합 단백질을 포함한다. 일부 경우에, MSLN 결합 단백질은 (i) 서열 번호 45에 상응하는 아미노산의 스트레치, (ii) 서열 번호 46에 상응하는 아미노산의 스트레치, (iii) 서열 번호 47에 상응하는 아미노산의 스트레치, (iv) 서열 번호 48에 상응하는 아미노산의 스트레치, (v) 서열 번호 49에 상응하는 아미노산의 스트레치, 및 (vi) 서열 번호 50에 상응하는 아미노산의 스트레치를 포함한다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 1 내지 29, 58, 및 60 내지 62로부터 선택된 아미노산 서열과 적어도 약 75%, 약 76%, 약 77%, 약 78%, 약 79%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99%, 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 30 내지 40 58, 및 60 내지 62로부터 선택된 아미노산 서열과 적어도 약 75%, 약 76%, 약 77%, 약 78%, 약 79%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99%, 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 상보성 결정 영역은 서열 번호 51, 또는 서열 번호 54에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99%, 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 상보성 결정 영역은 서열 번호 52, 또는 서열 번호 55에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99%, 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 상보성 결정 영역은 서열 번호 53, 또는 서열 번호 56에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99%, 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 상보성 결정 영역 1(CDR1)은 서열 번호 63 내지 101 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 상보성 결정 영역 2(CDR2)는 서열 번호 102 내지 140 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 상보성 결정 영역 3(CDR3)은 서열 번호 141 내지 179 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 프레임워크 영역 1(f1)은 서열 번호 180 내지 218 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 프레임워크 영역 1(f1)는 서열 번호 219 내지 257 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 프레임워크 영역 2(f2)는 서열 번호 258 내지 296 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 또는 약 100% 동일하다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질의 프레임워크 영역 3(f3)은 서열 번호 297 내지 335 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열과 적어도 약 10%, 약 20%, 약 30%, 약 40%, 약 50%, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 81%, 약 82%, 약 83%, 약 84%, 약 85%, 약 86%, 약 87%, 약 88%, 약 89%, 약 90%, 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 99% 또는 약 100% 동일하다.
일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 1의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 2의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 3 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 4의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 5의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 6의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 7의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 8의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 9의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 10의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 11의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 12의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 13의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 14의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 15의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 16의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 17의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질 A는 서열 번호 18의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 19의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 20의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 21의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 22의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 23의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 24의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 25의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 26의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 27의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 28의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 28의 서열을 포함하는 단일 도메인 항체이다.
일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 30의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 31의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 32의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 33의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 34의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 35의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 36의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 37의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 38의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 39의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 40의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 58 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 60의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 61의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 MSLN 결합 단백질은 서열 번호 62의 서열을 포함하는 인간화 단일 도메인 항체이다.
일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 인간 및 시노몰구스 메소텔린과 교차 반응성이다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 인간 메소텔린에 특이적이다. 특정 실시양태에서, 본원에 개시된 MSLN 결합 단백질은 인간 Kd(hKd)로 인간 메소텔린에 결합한다. 특정 실시양태에서, 본원에 개시된 MSLN 결합 단백질은 시노 Kd(cKd)로 시노몰구스 메소텔린에 결합한다. 특정 실시양태에서, 본원에 개시된 MSLN 결합 단백질은 시노몰구스 메소텔린 및 인간 메소텔린 둘 다에 각각 시노 Kd(cKd) 및 인간 Kd(hKd)로 결합한다. 일부 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 유사한 결합 친화도(즉, hKd 및 cKd 값이 ± 10% 넘게 차이가 나지 않음)로 인간 및 시노몰구스 메소텔린에 결합한다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 500 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 450 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 400 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 350 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 300 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 250 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 200 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 150 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 100 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.1 nM 내지 약 90 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.2 nM 내지 약 80 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.3 nM 내지 약 70 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.4 nM 내지 약 50 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.5 nM 내지 약 30 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.6 nM 내지 약 10 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.7 nM 내지 약 8 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.8 nM 내지 약 6 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 0.9 nM 내지 약 4 nM의 범위이다. 일부 실시양태에서, hKd 및 cKd는 약 1 nM 내지 약 2 nM의 범위이다.
일부 실시양태에서, 임의의 상기 MSLN 결합 단백질(예를 들어, 서열 번호 1 내지 40, 및 58)의 항-MSLN 단일 도메인 항체)은 정제 용이성을 위해 친화성 펩티드 태그가 부착된다. 일부 실시양태에서, 친화성 펩티드 태그는 6X-his로도 지칭되는 6개의 연속 히스티딘 잔기이다.
특정 실시양태에서, 본 발명에 따른 MSLN 결합 단백질은 MSLN 표적화 삼중 특이적 단백질에 혼입될 수 있다. 일부 예에서, 삼중 특이적 결합 단백질은 본 발명에 따른 CD3 결합 도메인, 인간 혈청 알부민(HSA) 결합 도메인 및 항-MSLN 결합 도메인을 포함한다. 일부 경우에, 삼중 특이적 결합 단백질은 MSLN-HSA-CD3 방향으로 상기 기재된 도메인을 포함한다.
특정 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 가용성 메소텔린보다 막 결합 메소텔린에 우선적으로 결합한다. 막 결합 메소텔린은 메소텔린을 발현하는 세포의 세포막 표면 내에 또는 상에 메소텔린이 존재함을 의미한다. 가용성 메소텔린은 메소텔린을 발현하거나 발현했던 세포의 세포막 표면 내에 또는 상에 더 이상 존재하지 않는 메소텔린을 의미한다. 특정 경우에, 가용성 메소텔린은 대상체의 혈액 및/또는 림프 순환에 존재한다. 일 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 가용성 메소텔린에 비해 막-결합 메소텔린에 적어도 5배, 10배, 15배, 20배, 25배, 30배, 40배, 50배, 100배, 500배, 또는 1000배 더 잘 결합한다. 일 실시양태에서, 본 발명의 항원 결합 단백질은 가용성 메소텔린에 비해 막에 결합된 메소텔린에 30배 더 우선적으로 결합한다. 가용성 MSLN에 비해 막 결합 MSLN에 대한 항원 결합 단백질의 우선적인 결합을 결정하는 것은 당 업계에 잘 알려진 분석법을 사용하여 쉽게 결정할 수 있다.
키메라 항원 수용체(CAR: chimeric antigen receptor)로의 통합
본 발명의 MSLN 결합 단백질, 예를 들어 항-MSLN 단일 도메인 항체는, 특정 예에서, 키메라 항원 수용체(CAR)에 통합될 수 있다. 조작된 면역 이펙터 세포, 예를 들어 T 세포 또는 NK 세포는 본원에 기재된 바와 같은 항-MSLN 단일 도메인 항체를 포함하는 CAR을 발현시키는 데 사용될 수 있다. 일 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 항-MSLN 단일 도메인 항체를 포함하는 CAR은 힌지 영역을 통해 막 횡단 도메인, 및 추가의 보조 자극 도메인, 예를 들어 OX40, CD27, CD28, CD5, ICAM-1, LFA-1(CD11a/CD18), ICOS(CD278), 또는 4-1BB로부터 수득한 기능성 신호 전달 도메인에 연결된다. 일부 실시양태에서, CAR은 세포 내 신호 전달 도메인, 예를 들어 4-1BB 및/또는 CD3 제타를 코딩하는 서열을 추가로 포함한다.
종양 성장 감소 특성
특정 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 메소텔린을 발현하는 종양 세포를 갖는 대상체에게 투여될 때 생체 내 종양 세포의 성장을 감소시킨다. 종양 세포의 성장 감소의 측정은 당 업계에 널리 공지된 다수의 상이한 방법론에 의해 결정될 수 있다. 비제한적 예는 종양 치수의 직접적인 측정, 절제된 종양 질량의 측정 및 대조 대상체와의 비교, 향상된 분석을 위해 동위 원소 또는 발광 분자(예를 들어, 루시퍼라아제)를 사용하거나 사용하지 않을 수 있는 영상화 기술(예를 들어, CT 또는 MRI)을 통한 측정 등을 포함한다. 특정 실시양태에서, 본 발명의 항원 결합제의 투여는 대조 항원 결합제와 비교하여 종양 세포의 생체 내 성장을 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 100% 감소시키며 종양 성장의 약 100% 감소는 종양의 완전 반응 및 소멸을 나타낸다. 추가의 실시양태에서, 본 발명의 항원 결합제의 투여는 대조 항원 결합제와 비교하여 종양 세포의 생체 내 성장을 약 50 내지 100%, 약 75 내지 100% 또는 약 90 내지 100% 감소시킨다. 추가의 실시양태에서, 본 발명의 항원 결합제의 투여는 대조 항원 결합제와 비교하여 종양 세포의 생체 내 성장을 약 50 내지 60%, 약 60 내지 70%, 약 70 내지 80%, 약 80 내지 90%, 또는 약 90 내지 100% 감소시킨다.
MSLN 결합 단백질 변형
본원에 기재된 MSLN 결합 단백질은 (i) 아미노산이 유전자 암호에 의해 코딩된 것이 아닌 아미노산 잔기로 치환된, (ii) 성숙 폴리펩티드가 폴리에틸렌 글리콜과 같은 다른 화합물과 융합된, 또는 (iii) 리더 또는 분비 서열, 또는 면역원성 도메인을 차단하기 위한 서열 및/또는 단백질의 정제를 위한 서열과 같이 추가 아미노산이 단백질에 융합된, 유도체 또는 유사체를 포함한다.
전형적인 변형은 아세틸화, 아실화, ADP-리보실화, 아미드화, 플라빈의 공유적 부착, 헴 모이어티의 공유적 부착, 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 유도체의 공유적 부착, 지질 또는 지질 유도체의 공유적 부착, 포스파티딜이노시톨의 공유적 부착, 가교결합, 고리화, 이황화 결합 형성, 탈메틸화, 공유적 가교의 형성, 시스틴의 형성, 피로글루타메이트의 형성, 포르밀화, 감마 카르복실화, 글리코실화, GPI 앵커 형성, 히드록실화, 요오드화, 메틸화, 미리스틸화, 산화, 단백질 분해 프로세싱, 인산화, 프레닐화, 라세미화, 셀레노일화, 황산화, 단백질에 아미노산의 전달 RNA 매개된 첨가, 예를 들어 아르기닐화, 및 유비퀴틴화를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
펩티드 골격, 아미노산 측쇄, 및 아미노 또는 카르복실 말단을 포함하여 본원에 기재된 MSLN 결합 단백질의 어느 곳에서든지 변형이 이루어진다. MSLN 결합 단백질 변형에 유용한 특정의 일반적인 펩티드 변형은 글리코실화, 지질 부착, 황산화, 글루탐산 잔기의 감마-카르복실화, 히드록실화, 공유적 변형에 의한 아미노 또는 카르복실기 또는 둘 다의 차단, 및 ADP-리보실화를 포함한다.
MSLN 결합 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 MSLN 결합 단백질 코딩하는 폴리뉴클레오티드 분자가 또한 제공된다. 일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 분자는 DNA 구조물로서 제공된다. 다른 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드 분자는 전령 RNA 전사체로서 제공된다.
폴리뉴클레오티드 분자는 공지된 방법에 의해, 예를 들어 적합한 프로모터, 및 경우에 따라 적합한 전사 종결 인자에 작동 가능하게 연결된 항-MSLN 결합 단백질을 코딩하는 유전자들을 결합시키고, 이를 박테리아 또는 다른 적절한 발현 시스템, 예를 들어 CHO 세포에서 발현시킴으로써 제작된다.
일부 실시양태에서, 폴리뉴클레오티드는 벡터, 바람직하게는 발현 벡터에 삽입되며, 이는 추가 실시양태를 나타낸다. 이 재조합 벡터는 공지된 방법에 따라 제작될 수 있다. 특히 관심 있는 벡터는 플라스미드, 파지미드, 파지 유도체, 바이러스(예를 들어, 레트로바이러스, 아데노바이러스, 아데노 관련 바이러스, 헤르페스 바이러스, 렌티바이러스 등), 및 코스미드를 포함한다.
기재된 MSLN 결합 단백질의 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 함유하고 발현시키기 위해 다양한 발현 벡터/숙주 시스템이 이용될 수 있다. 발현 벡터의 예는 이. 콜라이(E.coli)에서의 발현을 위한 pSKK(Le Gall et al., J Immunol Methods. (2004) 285(1):111-27), 포유동물에서의 발현을 위한 pcDNA5(Invitrogen), 피키아핑크™ 효소 발현 시스템(PICHIAPINK™ Yeast Expression Systems(Invitrogen), 배큐번스™ 배큘로바이러스 발현 시스템(BACUVANCE™ Baculovirus Expression System(GenScript)이다.
따라서, 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 MSLN 결합 단백질은 상기 기재된 바와 같은 단백질을 코딩하는 벡터를 숙주 세포 내로 도입하고 단백질 도메인이 발현되는 조건하에서 상기 숙주 세포를 배양함으로써 생성되고, 단리될 수 있으며, 경우에 따라 추가로 정제될 수 있다.
약학 조성물
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 MSLN 결합 단백질, MSLN 결합 단백질의 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터 또는 이 벡터에 의해 형질전환된 숙주 세포 및 하나 이상의 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 약학 조성물이 또한 제공된다. 용어 "약학적으로 허용 가능한 담체"는 성분의 생물학적 활성의 효과를 방해하지 않고 투여되는 환자에게 독성이 없는 임의의 담체를 포함하지만, 이에 제한되지는 않는다. 적합한 약학적 담체의 예는 당 업계에 잘 알려져 있으며 포스페이트 완충 식염수 용액, 물, 오일/물 에멀젼과 같은 에멀젼, 다양한 유형의 습윤제, 멸균 용액 등을 포함한다. 이러한 담체는 통상적인 방법에 의해 제제화될 수 있고 적절한 용량으로 대상체에게 투여된다. 바람직하게는, 조성물은 멸균된다. 이들 조성물은 또한 보존제, 유화제 및 분산제와 같은 보조제를 함유할 수 있다. 다양한 항균제 및 항진균제를 포함시킴으로써 미생물의 작용을 방지할 수 있다. 추가의 실시양태는 동결 건조된 형태로 포장되거나 수성 매질에 포장된 상기 기재된 하나 이상의 MSLN 결합 단백질, 예를 들어 항-MSLN 단일 도메인 항체 또는 이의 항원 결합 부위를 제공한다.
약학 조성물의 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 MSLN 결합 단백질은 나노 입자에 캡슐화된다. 일부 실시양태에서, 나노 입자는 풀러렌, 액정, 리포솜, 양자점, 초상자성 나노 입자, 덴드리머, 또는 나노로드이다. 약학 조성물의 다른 실시양태에서, MSLN 결합 단백질은 리포솜에 부착된다. 일부 경우에, MSLN 결합 단백질은 리포솜의 표면에 접합된다. 일부 경우에, MSLN 결합 단백질은 리포솜의 껍질 내에 캡슐화된다. 일부 경우에, 리포솜은 양이온성 리포솜이다.
본원에 기재된 MSLN 결합 단백질은 의약으로서 사용하기 위해 고려된다. 투여는 다양한 방법, 예를 들어 정맥 내, 복강 내, 피하, 근육 내, 국소 또는 피내 투여에 의해 수행된다. 일부 실시양태에서, 투여 경로는 요법의 종류 및 약학 조성물에 함유된 화합물의 종류에 의존한다. 투여 요법은 주치의 및 기타 임상적 요인에 의해 결정될 것이다. 한 환자의 복용량은 환자의 체형, 신체 표면적, 나이, 성별, 투여할 특정 화합물, 투여 시간 및 경로, 요법의 종류, 일반적인 건강 및 동시에 투여할 기타 약물을 포함한 여러 요인에 따라 달라진다. "유효량"은 질환의 경과 및 중증도에 영향을 미쳐서 그의 병리의 감소 또는 완화를 초래하기에 충분한 활성 성분의 양을 지칭하며 공지된 방법을 사용하여 결정될 수 있다.
일부 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합제는 주 1회 빈도로 최대 10 mg/kg의 투여량으로 투여된다. 일부 경우에, 투여량은 약 1 ng/kg 내지 약 10 mg/kg의 범위이다. 일부 실시양태에서, 용량은 약 1 ng/kg 내지 약 10 ng/kg, 약 5 ng/kg 내지 약 15 ng/kg, 약 12 ng/kg 내지 약 20 ng/kg, 약 18 ng/kg 내지 약 30 ng/kg, 약 25 ng/kg 내지 약 50 ng/kg, 약 35 ng/kg 내지 약 60 ng/kg, 약 45 ng/kg 내지 약 70 ng/kg, 약 65 ng/kg 내지 약 85 ng/kg, 약 80 ng/kg 내지 약 1 μg/kg, 약 0.5 μg/kg 내지 약 5 μg/kg, 약 2 μg/kg 내지 약 10 μg/kg, 약 7 μg/kg 내지 약 15 μg/kg, 약 12 μg/kg 내지 약 25 μg/kg, 약 20 μg/kg 내지 약 50 μg/kg, 약 35 μg/kg 내지 약 70 μg/kg, 약 45 μg/kg 내지 약 80 μg/kg, 약 65 μg/kg 내지 약 90 μg/kg, 약 85 μg/kg 내지 약 0.1 mg/kg, 약 0.095 mg/kg 내지 약 10 mg/kg이다. 일부 경우에, 투여량은 약 0.1 mg/kg 내지 약 0.2 mg/kg; 약 0.25 mg/kg 내지 약 0.5 mg/kg, 약 0.45 mg/kg 내지 약 1 mg/kg, 약 0.75 mg/kg 내지 약 3 mg/kg, 약 2.5 mg/kg 내지 약 4 mg/kg, 약 3.5 mg/kg 내지 약 5 mg/kg, 약 4.5 mg/kg 내지 약 6 mg/kg, 약 5.5 mg/kg 내지 약 7 mg/kg, 약 6.5 mg/kg 내지 약 8 mg/kg, 약 7.5 mg/kg 내지 약 9 mg/kg, 또는 약 8.5 mg/kg 내지 약 10 mg/kg이다. 일부 실시양태에서, 투여 빈도는 대략 매일보다 적게, 격일, 1일 1회 미만, 주 2회, 매주, 7일에 1회, 2주에 1회, 2주에 1회, 3주에 1회, 4주에 1회, 또는 1개월에 1회이다. 일부 경우에, 투여 빈도는 매주이다. 일부 경우에, 투여 빈도는 매주이고 투여량은 최대 10 mg/kg이다. 일부 경우에, 투여 기간은 약 1일 내지 약 4주 이상이다.
치료 방법
또한, 일부 실시양태에서, 면역계의 자극을 필요로 하는 개체의 면역계를 자극하기 위한 방법 및 용도로서, 본원에 기재된 바와 같은 MSLN 결합 단백질의 투여를 포함하는 방법 및 용도가 본원에 제공된다. 일부 경우에, 본원에 기재된 MSLN 결합 단백질의 투여는 표적 항원을 발현하는 세포에 대한 세포 독성을 유도 및/또는 유지한다. 일부 경우에, 표적 항원을 발현하는 세포는 암 또는 종양 세포, 바이러스 감염 세포, 박테리아 감염 세포, 자가 반응성 T 또는 B 세포, 손상된 적혈구, 동맥 플라크, 또는 섬유성 조직이다.
표적 항원과 관련된 질환, 장애 또는 병태를 치료하기 위한 방법 및 용도로서, 이를 필요로 하는 개체에게 본원에 기재된 MSLN 결합 단백질 또는 MSLN 결합 단백질을 포함하는 다중 특이적 결합 단백질을 투여하는 단계를 포함하는 방법 및 용도가 본원에서 또한 제공된다. 표적 항원과 관련된 질환, 장애 또는 병태는 바이러스 감염, 박테리아 감염, 자가 면역 질환, 이식 거부, 죽상 동맥 경화증, 또는 섬유증을 포함하지만, 이에 제한되지는 않는다. 다른 실시양태에서, 표적 항원과 관련된 질환, 장애 또는 병태는 증식성 질환, 종양성 질환, 염증성 질환, 면역 장애, 자가 면역 질환, 감염성 질환, 바이러스성 질환, 알레르기 반응, 기생충 반응, 이식편 대 숙주 질환 또는 숙주 대 이식편 질환이다. 일 실시양태에서, 표적 항원과 관련된 질환, 장애 또는 병태는 암이다. 본 발명의 MSLN 결합 단백질, 및 이들을 사용하는 방법에 의해 치료, 예방 또는 관리될 수 있는 암은 상피 세포 기원의 암을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 이러한 암의 예는 다음을 포함한다: 백혈병, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 급성 백혈병, 급성 림프구성 백혈병, 급성 골수구성 백혈병, 예를 들어 골수 모세포성, 전골수구성, 골수단핵구성, 단핵구성, 및 적백혈성 백혈병 및 골수 이형성 증후군; 만성 백혈병, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 만성 골수구성(과립구성) 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 털세포 백혈병; 진성 적혈구 증가증; 림프종, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 호지킨 병, 비호지킨 병; 다발성 골수종, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 무증상 다발성 골수종, 비분비성 골수종, 골경화성 골수종, 형질 세포 백혈병, 고립 형질 세포종 및 골수 외 형질 세포종; 발덴스트롬 마크로글로불린 혈증; 의미불명의 단세포군 감마글로불린 병증; 양성 단세포군 감마글로불린 병증; 중쇄병; 뼈 및 결합 조직 육종, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음), 뼈 육종, 골육종, 연골 육종, 유잉 육종, 악성 거대 세포 종양, 뼈의 섬유육종, 척색종, 골막 육종, 연조직 육종, 혈관 육종(angiosarcoma/hemangiosarcoma), 섬유육종, 카포시 육종, 평활근 육종, 지방 육종, 림프관 육종, 신경초종, 횡문근 육종, 활액 육종; 뇌종양, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 신경 교종, 성상 세포종, 뇌간 신경 교종, 상의 세포종, 핍지교종, 비신경 교종, 청신경초종, 두개인두종, 수모세포종, 수막종, 송과체종, 송과체 모세포종, 원발성 뇌 림프종; 관암종, 선암종, 소엽(소세포) 암종, 관내 암종, 수질성 유방암, 점액성 유방암, 관상 유방암, 유두 유방암, 파제트병, 및 염증성 유방암을 포함하는(그러나 이에 제한되지는 않음) 유방암; 부신암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 갈색 세포종 및 부신피질 암종; 갑상선암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 유두 또는 소포 갑상선암, 갑상선 수질암 및 역형성 갑상선암; 췌장암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 인슐린종, 가스트린종, 글루카곤종, 비포마, 소마토스타틴-분비 종양 및 카르시노이드 또는 도세포 종양; 뇌하수체 암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 쿠싱병, 프롤락틴-분비 종양, 말단비대증, 및 요붕증; 안암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 홍채 흑색종, 맥락막 흑색종 및 모양체 흑색종과 같은 안구 흑색종, 및 망막 모세포종; 질암, 예를 들어 편평 세포 암종, 선암종 및 흑색종; 외음부암, 예를 들어 편평 세포 암종, 흑색종, 선암종, 기저 세포 암종, 육종 및 파제트병; 자궁 경부암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 편평 세포 암종 및 선암종; 자궁암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 자궁 내막 암종, 및 자궁 육종; 난소암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 난소 상피 암종, 경계선 종양, 생식 세포 종양, 및 간질 종양; 식도암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 편평 세포암, 선암종, 선양 낭포 암종, 점막 표피양 암종, 선편평세포 암종, 육종, 흑색종, 형질세포종, 우상 암종, 및 귀리 세포(소세포) 암종; 위암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 선암종, 진균양(폴립모양), 궤양, 표면 확산, 미만 확산, 악성 림프종, 지방 육종, 섬유육종, 및 암육종; 결장암; 직장암; 간암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 간세포 암종 및 간모세포종; 선암종과 같은 담낭암; 유두, 결정, 및 미만성과 같은(그러나 이에 제한되지는 않음) 담관암; 폐암, 예를 들어 비소세포 폐암, 편평 세포 암종(표피양 암종), 선암종, 대세포 암종 및 소세포 폐암; 고환암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음), 생식계 종양, 정상피종, 역형성, 전형적(원형), 정모세포성, 비정상피종, 태생기 암종, 기형종 암종, 융모암(난황 낭종), 전립선암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음), 전립선 상피 내 신생물, 선암종, 평활근 육종, 및 횡문근 육종; 음경암; 구강암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 편평 세포 암종; 기저 암; 침샘암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 선암종, 점막 표피양 암종, 및 선양 낭포 암종; 인두암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 편평세포암, 및 우상; 피부암 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 기저 세포 암종, 편평 세포 암종 및 흑색종, 표면 확산 흑색종, 결절 흑색종, 악성 흑색점 흑색종, 말단 흑자 흑색종; 신장암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 신세포 암종, 선암종, 부신종, 섬유육종, 이행 세포암(신우 및/또는 요관); 윌름스 종양; 방광암, 예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 이행 세포 암종, 편평세포암, 선암종, 암종. 또한, 암은 점액육종, 골원성 육종, 내피육종, 림프관 내피육종, 중피종, 활막종, 혈관 모세포종, 상피 암종, 낭선암종, 기관지 유래 암종, 땀샘 암종, 피지선 암종, 유두 암종 및 유두 선암종을 포함한다(상기 장애의 리뷰를 위해, 문헌[Fishman et al., 1985, Medicine, 2d Ed., J.B. Lippincott Co., Philadelphia and Murphy et al., 1997, Informed Decisions: The Complete Book of Cancer Diagnosis, Treatment, and Recovery, Viking Penguin, Penguin Books U.S.A., Inc., United States of America] 참조).
본 발명의 MSLN 결합 단백질은 또한 다음을 포함하는(그러나 이에 제한되지 않는) 다양한 암 또는 다른 비정상적 증식성 질환의 치료 또는 예방에 유용하다: 방광, 유방, 결장, 신장, 간, 폐, 난소, 췌장, 위, 자궁 경부, 갑상선 및 피부의 암종을 포함하는 암종; 편평 세포 암종 포함; 백혈병, 급성 림프구성 백혈병, 급성 림프모구성 백혈병, B 세포 림프종, T 세포 림프종, 버킷 림프종을 포함하는 림프계의 조혈 종양; 급성 및 만성 골수성 백혈병 및 전골수구성 백혈병을 포함하는 골수계의 조혈 종양; 섬유육종 및 횡문근 육종을 포함하는 간엽 기원의 종양; 흑색종, 정상피종, 기형암종, 신경모세포종 및 신경 교종을 포함하는 기타 종양; 성상 세포종, 신경모세포종, 신경 교종, 및 쉬반종을 포함하는 중추 및 말초 신경계의 종양; 섬유육종, 횡문근 육종, 및 골육종을 포함하는 간엽 기원의 종양; 및 흑색종, 색소성 건피증, 각화상피 종양, 정상피종, 갑상선 소포암 및 기형암종을 포함하는 기타 암. 아폽토시스에서의 이상에 의해 야기된 암이 본 발명의 방법 및 조성물에 의해 치료될 것으로 또한 고려된다. 이러한 암은 소포성 림프종, p53 돌연변이에 의한 암종, 유방, 전립선 및 난소의 호르몬 의존성 종양, 및 가족성 선종성 용종증, 및 골수이형성 증후군과 같은 전암성 병변을 포함할 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다. 특정 실시양태에서, 악성 또는 이상 증식성 변화(예를 들어, 화생 및 이형성), 또는 과증식성 장애가 피부, 폐, 결장, 유방, 전립선, 방광, 신장, 췌장, 난소, 또는 자궁에서 치료 또는 예방된다. 다른 특정 실시양태에서, 육종, 흑색종, 또는 백혈병이 치료 또는 예방된다.
본원에 사용되는 바와 같이, 일부 실시양태에서, "치료" 또는 "치료하는" 또는 "치료된"은 목적이 바람직하지 않은 생리학적 병태, 장애 또는 질환을 늦추거나(감소시키거나) 유익하거나 바람직한 임상 결과를 얻는 치료적 처치를 지칭한다. 본원에 기재된 목적을 위해, 유익하거나 바람직한 임상 결과는 증상의 완화; 병태, 장애 또는 질환의 정도의 감소; 병태, 장애 또는 질환의 상태의 안정화(즉, 악화되지 않음); 병태, 장애 또는 질환의 발병 지연 또는 진행 지연; 병태, 장애 또는 질환 상태의 개선; 및 병태, 장애 또는 질환의 감지할 수 있거나 감지할 수 없는 완화(부분 또는 전체). 또는 향상 또는 개선을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 치료는 과도한 수준의 부작용 없이 임상적으로 유의한 반응을 이끌어내는 것을 포함한다. 치료는 또한 치료를 받지 않을 경우 예상되는 생존과 비교하여 생존을 연장시키는 것을 포함한다. 다른 실시양태에서, "치료" 또는 "치료하는" 또는 "치료된"은 예방 조치를 지칭하며, 여기서 목적은, 예를 들어 질환에 걸리기 쉬운 사람(예를 들어, 유방암과 같은 질환에 대한 유전적 마커를 갖는 개체)에서, 바람직하지 않은 생리학적 병태, 장애 또는 질환의 발병을 지연시키거나 중증도를 감소시키는 것이다.
본원에 기재된 방법의 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 MSLN 결합 단백질은 특정 질환, 장애 또는 병태의 치료를 위한 작용제와 조합하여 투여된다. 작용제는 항체, 소분자(예를 들어, 화학치료제), 호르몬(스테로이드, 펩티드 등)을 포함하는 요법, 방사선 요법(γ-선, X-선, 및/또는 방사성 동위 원소의 지시된 전달, 마이크로파, UV 방사선 등), 유전자 요법(예를 들어, 안티센스, 레트로바이러스 요법 등) 및 다른 면역 요법을 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 MSLN 결합 단백질은 항설사제, 항구토제, 진통제, 오피오이드 및/또는 비스테로이드성 소염제와 조합하여 투여된다. 일부 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 MSLN 결합 단백질은 항암제와 조합하여 투여된다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 약학 조성물 및 제형 및 키트를 포함하여 본 발명의 다양한 실시양태에서 사용될 수 있는 항암제의 비제한적인 예는 아시비신; 아클라루비신; 아코다졸 히드로클로라이드; 아크로닌; 아도젤레신; 알데스류킨; 알트레타민; 암보마이신; 아메만트론 아세테이트; 아미노글루테티미드; 암사크린; 아나스트로졸; 안트라마이신; 아스파라기나아제; 아스퍼린; 아자시티딘; 아제테파; 아조토마이신; 바티마스타트; 벤조데파; 비칼루타미드; 비산트렌 히드로클로라이드; 비스나피드 디메실레이트; 비젤레신; 블레오마이신 술페이트; 브레퀴나르 나트륨; 브로피리민; 부술판; 칵티노마이신; 칼루스테론; 카라세미드; 카르베티머; 카르보플라틴; 카르무스틴; 카루비신 히드로클로라이드; 카젤레신; 세데핀골; 클로람부실; 시롤레마이신; 시스플라틴; 클라드리빈; 크리스나톨 메실레이트; 시클로포스파미드; 시타라빈; 다카르바진; 닥티노마이신; 다우노루비신 히드로클로라이드; 데시타빈; 덱소마플라틴; 데 자구아닌; 데자구아닌 메실레이트; 디아지쿠온; 도세탁셀; 독소루비신; 독소루비신 히드로클로라이드; 드롤록시펜; 드롤록시펜 시트레이트; 드로모스타놀론 프로피오 네이트; 두아조마이신; 에다트렉세이트; 에플로르니틴 히드로클로라이드; 엘사미트 루신; 엔로플라틴; 엔프로메이트; 에피프로피딘; 에피루비신 히드로클로라이드; 에르불로졸; 에소루비신 히드로클로라이드; 에스트라무스틴; 에스트라무스틴 포스페이트 나트륨; 에타니다졸; 에토포시드; 에토포시드 포스페이트; 에토프린; 파드로졸 히드로클로라이드; 파자라빈; 펜레티니드; 플록수리딘; 플루다라빈 포스페이트; 플루오로우라실; 플루로시타빈; 포스퀴돈; 포스트리에신 나트륨; 젬시타빈; 젬시타빈 히드로클로라이드; 히드록시 우레아; 이다루비신 히드로클로라이드; 이포스파미드; 일모포신; 인터루킨 II(재조합 인터루킨 II 또는 rIL2 포함), 인터페론 알파-2a; 인터페론 알파-2b; 인터페론 알파-n1 인터페론 알파-n3; 인터페론 베타-1a; 인터페론 감마-1b; 이프로플라틴; 이리노테칸 히드로클로라이드; 란레오티드 아세테이트; 레트로졸; 류프롤리드 아세테이트; 리아로졸 히드로클로라이드; 로메트렉솔 나트륨; 로무스틴; 로속산트론 히드로클로라이드; 마소프로콜; 메이탄신; 메클로레타민 히드로클로라이드; 메게스트롤 아세테이트; 멜렌게스트롤 아세테이트; 멜팔란; 메노가릴; 머르캅토퓨린; 메토트렉세이트; 메토트렉세이트 나트륨; 메토프린; 메투레데파; 미틴도미드; 미토카르신; 미토크로민; 미토길린; 미토말신; 미토마이신; 미토스퍼; 미토테인; 미톡산트론 히드로클로라이드; 미코페놀산; 노코다졸; 노갈라 마이신; 오르마플라틴; 옥시수란; 파클리탁셀; 페가스파르가제; 펠리 오마이신; 펜타무스틴; 페플로마이신 술페이트; 퍼포스파미드; 피보브로만; 피포 술판; 피록산트론 히드로클로라이드; 플리카마이신; 플로메스탄; 포피머 나트륨; 포르피로마이신; 프레드니무스틴; 프로카르바진 히드로클로라이드; 푸로마이신; 푸로마이신 히드로클로라이드; 피라조푸린; 리보프린; 로글레티미드; 사핀골; 사핀골 히드로클로라이드; 세무스틴; 심트라젠; 스파르포세이트 나트륨; 스파르소마이신; 스피로게르마늄 히드로클로라이드; 스피로무스틴; 스피로플라틴; 스트렙토니그린; 스트렙토조신; 술로페누르; 탈리소마이신; 테코갈란 나트륨; 테가푸르; 텔록산트론 히드로클로라이드; 테모포르핀; 테니포시드; 테록시론; 테스토락톤; 티아미프린; 티오구아닌; 티오테파; 티아조푸린; 티라파자민; 토레미펜 시트레이트; 트레스톨론 아세테이트; 트리시리빈 포스페이트; 트리메트렉세이트; 트리메트렉세이트 글루코로네이트; 트리토렐린; 튜불로졸 히드로클로라이드; 우라실 머스타드; 우레데파; 바프레오티드; 베르테포르핀; 빈블라스틴 술페이트; 빈크리스틴 술페이트; 빈데 신; 빈데신 술페이트; 비네피딘 술페이트; 빈글리시네이트 술페이트; 빈레우로신 술페이트; 비노렐빈 타르트레이트; 빈졸리딘 술페이트; 빈졸리딘 술페이트; 보로졸; 제니플라틴; 지노스타틴; 조루비신 히드로클로라이드를 포함한다. 항암제의 다른 예는 20-에피-1,25 디히드록시비타민 D3; 5-에티닐우라실; 아비라테론; 아클라루비신; 아실풀벤; 아데시페놀; 아도젤레신; 알데스류킨; ALL-TK 길항제; 알트레타민; 암바무스틴; 아미독스; 아미포스틴; 아미노레불린산; 암루비신; 암사크린; 아나그렐리드; 아나스트로졸; 안드로그라폴리드; 혈관 신생 억제제; 길항제 D; 길항제 G; 안타렐릭스; 등쪽화 차단 형태 발생 단백질-1; 항안드로겐, 전립선 암종; 항에스트로겐; 안티네오플라스톤; 안티센스 올리고뉴클레오티드; 아피디콜린 글리시네이트; 아폽토시스 유전자 조절제; 아폽토시스 조절제; 아푸린산; ara-CDP-DL-PTBA; 아르기닌 데아미나아제; 아술라크린; 아타메스탄; 아트리무스틴; 악시나스타틴 1; 악시나스타틴 2; 악시나스타틴 3; 아자세트론; 아자톡신; 아자티로신; 바카틴 III 유도체; 발라놀; 바티마스타트; BCR/ABL 길항제; 벤조클로린; 벤조일 스타우로스포린; 베타 락탐 유도체; 베타-알레틴; 베타클라마이신 B; 베툴린산; bFGF 억제제; 비칼루타미드; 비산트렌; 비스아지리디닐스페르민; 비스나피드; 비스트라텐 A; 비젤레신; 브레플레이트; 브로피리민; 부도티테인; 부티오닌 술폭시민; 칼시포트리올; 칼포스틴 C; 캄프토테신 유도체; 카나리폭스 IL-2; 카페시타빈; 카르복사미드-아미노-트리아졸; 카르복사미도트리아졸; 카레스트(CaRest) M3; CARN 700; 연골 유래 억제제; 카르젤레신; 카제인 키나아제 억제제(ICOS); 카스타노스페르민; 세크로핀 B; 세트로렐릭스; 클로린; 클로로퀴녹살린 술폰아미드; 시카프로스트; 시스-포르피린; 클라드리빈; 클로미펜 유사체; 클로트리마졸; 콜리 스마이신 A; 콜리스마이신 B; 콤브레타스타틴 A4; 콤브레타스타틴 유사체; 코나게 닌; 크람베시딘 816; 크리스나톨; 크립토피신 8; 크립토피신 A 유도체; 큐라신 A; 시클로펜탄트라퀴논; 시클로플라탐; 시페마이신; 시타라빈 옥포스페이트; 세포 용해 인자; 시토스타틴; 다클리시맙; 데시타빈; 데히드로디뎀닌 B; 데슬로렐린; 덱사메타손; 덱시포스파미드; 덱사라족산; 덱스베라파밀; 디아지쿠온; 디뎀닌 B; 디독스; 디에틸노르스페르민; 디히드로-5-아자시티딘; 디히드로탁솔, 9-; 디옥사마이신; 디페닐 스피로무스틴; 도세탁셀; 도코사놀; 돌라세트론; 독시플루리딘; 드롤 록시펜; 드로나비놀; 듀오카르마이신 SA; 엡셀렌; 에코무스틴; 에델포신; 에드레콜로맙; 에플로르니틴; 엘레멘; 에미테푸르; 에피루비신; 에프리스테리드; 에스트라무스틴 유사체; 에스트로겐 작용제; 에스트로겐 길항제; 에타니다졸; 에토포시드 포스페이트; 엑세메스탄; 페드로졸; 파자라빈; 펜레티니드; 필그라스팀; 피나스테리드; 플라보피리돌; 플레젤라스틴; 플루스테론; 플루다라빈; 플루오로다우노루니신 히드로클로라이드; 포르페니멕스; 포르메스탄; 포스트리에신; 포테무스틴; 가돌리늄 텍사피린; 질산갈륨; 갈로시타빈; 가니렐릭스; 젤라티나아제 억제제; 젬시타빈; 글루타티온 억제제; 헵술팜; 헤레굴린; 헥사메틸렌 비스아세트아미드; 하이퍼리신; 이반드론산; 이다루비신; 이독시펜; 이드라만톤; 일모포신; 일로마스타트; 이미다조아크리돈; 이미퀴모드; 면역 자극 펩티드; 인슐린 유사 성장 인자-I 수용체 억제제; 인터페론 작용제; 인터페론; 인터루킨; 아이오벤구안; 요오도독소루비신; 이포메아놀, 4-; 이로플락트; 이르소글라딘; 이소벤가졸; 이소호모할리콘드린 B; 이타세트론; 자스플라키놀리드; 카할랄리드 F; 라멜라린-N 트리아세테이트; 란레오티드; 레이나마이신; 레노그라스팀; 렌티난 술페이트; 렙톨스타틴; 레트로졸; 백혈병 억제 인자; 백혈구 알파 인터페론; 류프롤리드 + 에스트로겐 + 프로게스테론; 류프로렐린; 레바미솔; 리아로졸; 선형 폴리아민 유사체; 친유성 이당류 펩티드; 친유성 백금 화합물; 리소클리나미드 7; 로바플라틴; 롬브리신; 로메트렉솔; 로니다민; 로속산트론; HMG-CoA 환원 효소 억제제(예를 들어(그러나 이에 제한되지는 않음) 로바스타틴, 프라바스타틴, 플루바스타틴, 스타틴, 심바스타틴, 및 아토르바스타틴); 록소리빈; 루르토테칸; 루테튬 텍사피린; 리소필린; 용해성 펩티드; 마이탄신; 만노스타틴 A; 마리마스타트; 마소프로콜; 마스핀; 마트릴리신 억제제; 매트릭스 메탈로프로테이나아제 억제제; 메노가릴; 메르바론; 메테렐린; 메티오나아제; 메토클로프라미드; MIF 억제제; 미페프리스톤; 밀테포신; 미리모스팀; 불일치된 이중 가닥 RNA; 미토구아존; 미톨락톨; 미토마이신 유사체; 미토나피드; 미토톡신 섬유아세포 성장 인자-사포린; 미톡산트론; 모파로텐; 몰그라모스팀; 단클론 항체, 인간 융모성 고나도트로핀; 모노포스포릴 지질 A + 미오박테리움 세포벽 sk; 모피다몰; 다중 약제 내성 유전자 억제제; 다중 종양 억제제 1 기반 요법; 머스타드 항암제; 미카페록시드 B; 미코박테리아 세포벽 추출물; 미리아포론; N-아세틸디날린; N-치환된 벤즈아미드; 나파렐린; 나그레스팁; 날록손 + 펜타조신; 나파빈; 나프터핀; 나르토그라스팀; 네다플라틴; 네모루비신; 네리드론산; 중성 엔도 펩티다아제; 닐루타미드; 니사마이신; 산화질소 조절제; 니트록시드 항산화제; 니트룰린; O6-벤질구아닌; 옥트레오티드; 오키세논; 올리고뉴클레오티드; 오나프리스톤; 온단세트론; 온단세트론; 오라신; 경구 사이토카인 유도제; 오르마플라틴; 오스테론; 옥살리플라틴; 옥사우노마이신; 파클리탁셀; 파클리탁셀 유사체; 파클리탁셀 유도체; 팔라우아민; 팔미토일리족신; 파미드론산; 파낙시트리올; 파노미펜; 파라박틴; 파젤립틴; 페가스파르가제; 펠데신; 펜토산 폴리술페이트 나트륨; 펜토스타틴; 펜트로졸; 퍼플루브론; 퍼포스파미드; 페릴릴 알코올; 페나지노마이신; 페닐아세테이트; 포스파타아제 억제제; 피시바닐; 필로카르핀 히드로클로라이드; 피라 루비신; 피리트렉심; 플라세틴 A; 플라세틴 B; 플라스미노겐 활성화제 억제제; 백금 착물; 백금 화합물; 백금-트리아민 착물; 포르피머 나트륨; 포르피로마이신; 프레드니손; 프로필 비스-아크리돈; 프로스타글란딘 J2; 프로테아좀 억제제; 단백질 A 기반 면역 조절제; 단백질 키나아제 C 억제제; 단백질 키나아제 C 억제제, 미세 조류; 단백질 티로신 포스파타아제 억제제; 퓨린 뉴클레오시드 포스포릴라아제 억제제; 퍼푸린; 피라졸로 아크리딘; 피리독실화된 헤모글로빈 폴리옥시에틸렌 접합체; raf 길항제; 랄티트렉세드; 라모세트론; ras 파르네실 단백질 트랜스퍼라아제 억제제; ras 억제제; ras-GAP 억제제; 레텔립틴 탈메틸화; 레늄 Re 186 에티드로네이트; 리족신; 리보자임; RII 레티나미드; 로글레티미드; 로히투킨; 로무르티드; 로퀴니멕스; 루비지논 B1; 루복실; 사핀골; 사인토핀; SarCNU; 사르코피톨 A; 사르그라모스팀; Sdi 1 모방체; 세무스틴; 노화 유도 억제제 1; 센스 올리고뉴클레오티드; 신호 전달 억제제; 신호 전달 조절제; 단쇄 항원 결합 단백질; 시조피란; 소부족산; 나트륨 보로카프테이트; 나트륨 페닐아세테이트; 솔베롤; 소마토메딘 결합 단백질; 소네르민; 스파르포스산; 스피카마이신 D; 스피로무스틴; 스플레노펜틴; 스폰지스타틴 1; 스쿠알라민; 줄기세포 억제제; 줄기세포 분열 억제제; 스티피아미드; 스트로멜리신 억제제; 술피노신; 초활성 혈관 활성 장 펩티드 길항제; 수라디스타; 수라민; 스웨인소닌; 합성 글리코사미노글리칸; 탈리무스틴; 타목시펜 메티오다이드; 타우로무스틴; 타자로텐; 테코갈란 나트륨; 테가푸르; 텔루라피릴리움; 텔로머라제 억제제; 테모포르핀; 테모졸로미드; 테니포시드; 테트라클로로데카옥시드; 테트라조민; 탈리블라스틴; 티오코랄린; 트롬보포이에틴; 트롬보포이에틴 모방 체; 티말파신; 티모포이에틴 수용체 작용제; 티모트리난; 갑상선 자극 호르몬; 주석 에틸 에티오퍼푸린; 티라파자민; 티타노센 비클로라이드; 톱센틴; 토레미펜; 전능성 줄기세포 인자; 번역 억제제; 트레티노인; 트리아세틸우리딘; 트리시리빈; 트리메트렉세이트; 트리토렐린; 트로피세트론; 투로스테리드; 티로신 키나아제 억제제; 티르포스틴; UBC 억제제; 우베니멕스; 비뇨 생식동 유래 성장 억제 인자; 유로키나제 수용체 길항제; 바프레오티드; 바리올린 B; 벡터 시스템, 적혈구 유전자 요법; 벨라레솔; 베라민; 베르딘; 베르테포르핀; 비노렐빈; 빈살틴; 비탁신(Vitaxin)® 174 ; 보로졸; 자노테론; 제니플라틴; 질라스코르브; 및 지노스타틴 스티말라머를 포함하지만 이에 제한되지는 않는다. 추가 항암제는 5-플루오로우라실과 류코보린이다. 이들 두 작용제는 탈리도미드 및 토포이소머라제 억제제를 사용하는 방법에 사용될 때 특히 유용하다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 MSLN 결합 단백질은 젬시타빈과 조합하여 사용된다.
일부 실시양태에서, 본원에 기재된 바와 같은 MSLN 결합 단백질은 수술 전, 중 또는 후에 투여된다.
메소텔린 발현의 검출 방법 및 메소텔린 관련 암의 진단 방법
본 발명의 다른 실시양태에 따르면, 시험관 내 또는 생체 내 메소텔린의 발현을 검출하기 위한 키트가 제공된다. 키트는 상기 MSLN 결합 단백질(예를 들어, 표지된 항-MSLN 단일 도메인 항체 또는 이의 항원 결합 단편), 및 표지를 검출하기 위한 하나 이상의 화합물을 포함한다. 일부 실시양태에서, 표지는 형광 표지, 효소 표지, 방사성 표지, 핵자기 공명 활성 표지, 발광 표지, 및 발색단 표지로 이루어진 군으로부터 선택된다.
일부 경우에, 메소텔린 발현은 생물학적 샘플에서 검출된다. 샘플은 생검, 부검, 및 병리학적 표본으로부터의 조직을 포함하는, 그러나 이에 제한되지 않는 임의의 샘플일 수 있다. 생물학적 샘플은 또한 조직 절편, 예를 들어 조직학적 목적을 위해 취한 냉동 절편을 포함한다. 생물학적 샘플은 체액, 예를 들어 혈액, 혈청, 혈장, 가래, 척수액 또는 소변을 추가로 포함한다. 생물학적 샘플은 전형적으로 인간 또는 비인간 영장류와 같은 포유동물로부터 얻어진다.
일 실시양태에서, 대상체로부터의 샘플을 본원에 개시된 바와 같은 항-MSLN 단일 도메인 항체와 접촉시키고 샘플에 대한 단일 도메인 항체의 결합을 검출함으로써 대상체가 암을 갖는지 여부를 결정하는 방법이 제공된다. 대조군 샘플에 대한 항체의 결합과 비교하여 샘플에 대한 항체의 결합의 증가는 대상체가 암을 갖는 것으로 식별한다.
다른 실시양태에서, 암으로 진단된 대상체로부터의 샘플을 본원에 개시된 바와 같은 항-MSLN 단일 도메인 항체와 접촉시키고 항체의 결합을 검출함으로써 대상체에서 암의 진단을 확인하는 방법이 제공된다. 대조군 샘플에 대한 항체의 결합과 비교하여 샘플에 대한 항체의 결합의 증가는 대상체에서 암의 진단을 확인해준다.
개시된 방법의 일부 예에서, 삼중 특이적 단백질의 단일 도메인 항체는 직접 표지된다.
일부 예에서, 방법은 단일 도메인 항체에 특이적으로 결합하는 제2 항체를 샘플과 접촉시키는 단계; 및 제2 항체의 결합을 검출하는 단계를 추가로 포함한다. 대조군 샘플에 대한 제2 항체의 결합과 비교하여 샘플에 대한 제2 항체의 결합의 증가는 대상체에서 암을 검출하거나 대상체에서 암의 진단을 확인한다.
일부 경우에, 암은 중피종, 전립선암, 폐암, 위암, 편평 세포 암종, 췌장암, 담관암종, 삼중 음성 유방암 또는 난소암, 또는 메소텔린을 발현하는 임의의 다른 유형의 암이다.
일부 예에서, 대조군 샘플은 암이 없는 대상체의 샘플이다. 특정 경우에, 샘플은 혈액 또는 조직 샘플이다.
일부 경우에, 메소텔린에 결합하는(예를 들어 특이적으로 결합하는) 항체는 검출 가능한 표지로 직접 표지된다. 다른 실시양태에서, 메소텔린에 결합하는(예를 들어, 특이적으로 결합하는) 항체(제1 항체)는 표지되지 않으며, 메소텔린에 특이적으로 결합하는 항체에 결합할 수 있는 제2 항체 또는 다른 분자는 표지된다. 제2 항체는 제1 항체의 특정 종 및 부류에 특이적으로 결합할 수 있도록 선택된다. 예를 들어, 제1 항체가 라마 IgG인 경우, 2차 항체는 항-라마-IgG 일 수 있다. 항체에 결합할 수 있는 다른 분자는 단백질 A 및 단백질 G를 제한 없이 포함하며, 이들 둘 다 상업적으로 이용 가능하다. 항체 또는 2차 항체에 적합한 표지는 상기 기재되어 있으며, 다양한 효소, 보결 분자단, 형광 물질, 발광 물질, 자성 물질 및 방사성 물질을 포함한다. 적합한 효소의 비제한적 예는 서양 고추냉이 페록시다아제, 알칼리 포스파타아제, 베타-갈락토시다아제, 또는 아세틸콜린에스테라아제를 포함한다. 적합한 보결 분자단의 비제한적인 예는 스트렙타비딘/비오틴 및 아비딘/비오틴을 포함한다. 적합한 형광 물질의 비제한적인 예는 움벨리페론, 플루오레세인, 플루오레세인 이소티오시아네이트, 로다민, 디클로로트리아지닐아민 플루오레세인, 단실 클로라이드 또는 피코에리트린을 포함한다. 비제한적인 예시적인 발광 물질은 루미놀이고; 비제한적인 예시적인 자성제는 가돌리늄이고, 비제한적인 예시적인 방사성 표지는 125I, 131I, 35S 또는 3H를 포함한다.
대안적인 실시양태에서, 메소텔린은 검출 가능한 물질로 표지된 메소텔린 표준 물질 및 메소텔린에 특이적으로 결합하는 비표지된 항체를 이용하는 경쟁 면역 분석법에 의해 생물학적 샘플에서 분석될 수 있다. 본 분석에서, 생물학적 샘플, 표지된 메소텔린 표준 및 메소텔린에 특이적으로 결합하는 항체가 결합되고 비표지된 항체에 결합된 표지된 메소텔린 표준의 양이 결정된다. 생물학적 샘플에서 메소텔린의 양은 메소텔린에 특이적으로 결합하는 항체에 결합된 표지된 메소텔린 표준의 양에 반비례한다.
본원에 개시된 면역 분석 및 방법은 많은 목적에 사용될 수 있다. 일 실시양태에서, 메소텔린에 특이적으로 결합하는 항체는 세포 배양물 내 세포에서 메소텔린의 생산을 검출하는데 사용될 수 있다. 다른 실시양태에서, 항체는 생물학적 샘플, 예를 들어 조직 샘플, 또는 혈액 또는 혈청 샘플에서 메소텔린의 양을 검출하는데 사용될 수 있다. 일부 예에서, 메소텔린은 세포 표면 메소텔린이다. 다른 예에서, 메소텔린은 가용성 메소텔린(예를 들어, 세포 배양 상등액 내 메소텔린 또는 혈액 또는 혈청 샘플과 같은 체액 샘플 내 가용성 메소텔린)이다.
일 실시양태에서, 혈액 샘플 또는 조직 샘플과 같은 생물학적 샘플에서 메소텔린을 검출하기 위한 키트가 제공된다. 예를 들어, 대상체에서 암 진단을 확인하기 위해 조직학적 검사를 위한 조직 샘플을 얻기 위해 생검을 수행할 수 있다. 대안적으로, 가용성 메소텔린 단백질 또는 단편의 존재를 검출하기 위해 혈액 샘플을 얻을 수 있다. 폴리펩티드를 검출하기 위한 키트는 전형적으로 메소텔린에 특이적으로 결합하는, 본 발명에 따른 단일 도메인 항체를 포함할 것이다. 일부 실시양태에서, scFv 단편, VH 도메인, 또는 Fab와 같은 항체 단편이 키트에 포함된다. 추가의 실시양태에서, 항체는 (예를 들어, 형광, 방사성 또는 효소 표지로) 표지된다.
일 실시양태에서, 키트는 메소텔린에 결합하는 항체의 사용 방법을 개시하는 설명 자료를 포함한다. 설명 자료는 전자 형태(예를 들어, 컴퓨터 디스켓 또는 콤팩트디스크)로 작성되거나 시각적(예를 들어 비디오 파일)일 수 있다. 키트는 또한 키트가 설계된 특정 적용을 용이하게 하기 위해 추가 구성 요소를 포함할 수 있다. 따라서, 예를 들어, 키트는 표지(예를 들어, 효소 표지용 효소 기질, 형광 표지를 검출하기 위한 필터 세트, 2차 항체와 같은 적절한 2차 표지 등)을 검출하는 수단을 추가로 포함할 수 있다. 키트는 특정 방법의 실시에 일상적으로 사용되는 완충제 및 다른 시약을 추가로 포함할 수 있다. 이러한 키트 및 적절한 내용은 당업자에게 잘 알려져 있다.
일 실시양태에서, 진단 키트는 면역 분석을 포함한다. 면역 분석의 세부 사항은 사용된 특정 형식에 따라 달라질 수 있지만, 생물학적 샘플에서 메소텔린을 검출하는 방법은 일반적으로 생물학적 샘플을 메소텔린 폴리펩티드에 특이적으로 반응하는 항체와 면역학적 반응 조건하에서 접촉시키는 단계를 포함한다. 항체는 면역학적 반응 조건하에서 특이적으로 결합하여 면역 복합체를 형성하고, 면역 복합체(결합된 항체)의 존재가 직접 또는 간접적으로 검출된다.
세포 표면 마커의 존재 또는 부재를 결정하는 방법은 당 업계에 잘 알려져 있다. 예를 들어, 항체는 효소, 자성 비드, 콜로이드성 자성 비드, 합텐, 플루오로크롬, 금속 화합물, 방사성 화합물 또는 약물을 포함하는, 그러나 이에 제한되지 않는 다른 화합물에 접합될 수 있다. 항체는 또한 방사성 면역 분석(RIA: radioimmunoassay), ELISA, 또는 면역 조직 화학 분석과 같은, 그러나 이에 제한되지 않는 면역 분석에 사용될 수 있다. 항체는 또한 형광 활성화 세포 분류(FACS: fluorescence activated cell sorting)에 사용될 수 있다. FACS는 세포를 분리 또는 분류하기 위해 다른 더 정교한 수준의 검출 중에서 다수의 컬러 통로, 로우 앵글 및 둔각 광 산란 검출 통로, 및 임피던스 통로를 사용한다(미국 특허 제5,061,620호 참조). 본원에 개시된 바와 같이 메소텔린에 결합하는 임의의 단일 도메인 항체가 이들 분석에 사용될 수 있다. 따라서, 항체는 ELISA, RIA, FACS, 조직 면역 조직 화학, 웨스턴 블롯 또는 면역 침전을 포함하는, 그러나 이에 제한되지 않는 통상적인 면역 분석에 사용될 수 있다.
실시예
아래의 실시예는 본 발명의 범위를 제한하지 않으면서 기재된 실시양태를 추가로 예시한다.
실시예 1 : 메소텔린을 발현하는 암세포의 T 세포 사멸을 매개하는 본 발명의 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체의 능력
예시적인 항-MSLN 단일 도메인 항체 서열을 Expi293 세포(Invitrogen)에 형질감염시킨다. 형질감염된 Expi293 세포로부터의 조건화된 배지 중 예시 항-MSLN 항체의 양을 단백질 A 팁이 구비된 옥텟 기기를 사용하고 표준 곡선으로서 대조군 항-MSLN 항체를 사용하여 정량한다.
TDCC 분석(T 세포 의존성 세포 독성 분석)에 조건화된 배지의 적정을 추가하여 항-MSLN 단일 도메인 항체가 T 세포와 메소텔린 발현 난소암 세포주인 OVCAR8 사이에 시냅스를 형성할 수 있는 지를 평가한다. 48시간 후에 OVCAR8 세포의 생존도를 측정한다. 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체는 T 세포 사멸을 매개하는 것으로 보인다.
또한, 예시 항체는 메소텔린을 발현하지 않는 LNCaP 세포의 T 세포 사멸을 매개하지 않기 때문에 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체의 TDCC 활성은 메소텔린 발현 세포에 특이적으로 보인다.
실시예 2: 본 발명에 따른 MSLN 결합 도메인을 함유하는 여러 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질의 결합 및 세포 독성 활성의 평가 방법
단백질 생산
본 발명에 따른 MSLN 결합 단백질을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 분자의 서열을 리더 서열이 선행되고 6x 히스티딘 태그가 뒤따르는 포유동물 발현 벡터 pCDNA 3.4(Invitrogen)에 클로닝하였다. Expi293F 세포(Life Technologies A14527)를 Expi 293 배지 중 0.2 내지 8 x 1e6 세포/mL로 최적 성장 플라스크(Optimum Growth Flask)(Thomson)에서 현탁액으로 유지시켰다. 정제된 플라스미드 DNA를 Expi293 발현 시스템 키트(Expi293 Expression System Kit, Life Technologies, A14635) 프로토콜에 따라 Expi293 세포에 형질감염시키고, 형질감염 후 4 내지 6일 동안 유지시켰다. 형질감염된 Expi293 세포로부터의 조건화된 배지 중 시험되는 예시적인 삼중 특이적 단백질의 양을 단백질 A 팁이 구비된 옥텟 기기를 사용하고 표준 곡선을 위한 대조군 삼중 특이적 단백질을 사용하여 정량하였다.
세포 독성 분석
인간 T 세포 의존성 세포 독성(TDCC: T-cell dependent cellular cytotoxicity) 분석을 사용하여 T 세포를 지시하여 종양 세포를 사멸시키는, 삼중 특이적 분자를 포함한 T 세포 인게이저(engager)의 능력을 측정하였다(Nazarian et al. 2015. J Biomol Screen. 20:519-27). 본 분석에서, T 세포 및 표적 암 세포주 세포를 384 웰 플레이트에서 10:1 비로 함께 혼합하고, 다양한 양의 시험되는 삼중 특이적 단백질을 첨가한다. 종양 세포주는 루시퍼라제 단백질을 발현하도록 조작한다. 48시간 후, 남아있는 생존 종양 세포를 정량하기 위해, 스테디-글로® 발광 분석(Steady-Glo® Luminescent Assay)(Promega)을 사용하였다.
본 연구에서, TDCC 분석(T 세포 의존성 세포 독성 분석)에 조건화된 배지의 적정을 추가하여 항-MSLN 단일 도메인 항체가 T 세포와 메소텔린 발현 난소암 세포주인 OVCAR8 사이에 시냅스를 형성할 수 있는 지를 평가하였다. 48시간 후에 OVCAR8 세포의 생존도를 측정하였다. 삼중 특이적 단백질은 T 세포 사멸을 매개하는 것으로 나타났다. [도 1]은 시험 삼중 특이적 단백질 2A2 및 2A4를 사용한 예시 세포 생존도 분석을 보여준다. 여러 다른 시험 삼중 특이적 단백질의 TDCC 활성에 대한 EC50은 하기 표 1에 열거한다.
[표 1]
Figure 112019128059661-pct00002
또한, 시험되는 삼중 특이적 단백질이 메소텔린을 발현하지 않는 LNCaP 세포의 T 세포 사멸을 매개하지 않았기 때문에 시험되는 MSLN 표적화 삼중 특이적 단백질의 TDCC 활성은 메소텔린 발현 세포에 특이적이었음이 관찰되었다. 삼중 특이적 단백질 2A2, 11F3, 9H2, 5C2, 10B3, 2F4, 5F2, 7F1, 2F4, 5H1, 3B4, 및 7H2는 특히 LnCaP 세포와 TDCC 활성을 전혀 나타내지 않았다.
실시예 3 : 본 발명의 예시 항- MSLN 단일 도메인 항체의 ADCC 활성
본 연구는 본 발명의 예시적인 항체와 같은 서열 변형 또는 치환을 갖지 않는 비교 라마 항-MSLN 항체와 비교하여 ADCC를 매개하는 본 발명의 예시적인 항-MSLN 단일 도메인 항체의 능력을 결정하는 것에 관한 것이다. 두 항체는 모두 추가 면역글로불린 도메인을 포함하는 다중 도메인 단백질로서 발현시킨다.
재료
공여자에서 백혈구 성분 분리 채집하고, 밀테니 오토맥스 프로 음성 선별 시스템(Milteni AutoMacs Pro negative selection system)을 사용하여 셀 퓨리피케이션 그룹(Cell Purification Group)의 류코팩(leukopak)으로부터 NK 세포를 단리한다. NK 세포를 4℃에서 로커 상에서 하룻밤 동안 유지시킨 후, ADCC 분석에 사용하기 위해 완전 RPMI에서 세척하고, 계수하고 4x 106 세포/mL로 재현탁시킨다.
표적: 메소텔린 발현에 기초하여 종양 세포 표적을 선택한다. 표적을 세척하고 계수한다. 6x 106개 표적을 완전한 RPMI에 재현탁시키고 37℃, 5% CO2에서 최종 농도 10 μM의 칼세인(Sigma # C1359-00UL CALCEIN AM 4 MM IN ANHYDROUS DMSO)으로 40분 동안 표지한다. 세포를 PBS에서 2회 세척하고, 완전 RPMI에 재현탁시키고, 37℃, 5% CO2에서 2시간 동안 인큐베이션한다. 표지 후, ADCC 분석에 사용하기 위해, 표적 세포를 완전 RPMI에서 세척하고, 재계수하고 0.2x 106 세포/mL로 재현탁시킨다.
방법
96 웰 둥근 바닥 조직 배양 플레이트(Corning 3799)에서 ADCC 분석을 수행한다. 시험 단백질을 10% FCS를 함유하는 완전 RPMI 1000 ㎕에 10 ㎕를 옮겨(1:10 희석) 20 μg/mL에서 0.0002 μg/mL로 적정한다. 1000개 세포를 포함하는 50 ㎕의 칼세인 표지된 표적을 첨가한다. 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체 또는 비교 항체를 함유하는 다양한 농도의 다중 도메인 단백질과 표적 세포를 4℃에서 40분 동안 인큐베이션한 다음, 1000개 세포를 포함하는 50 ㎕의 NK 세포 이펙터를 첨가한다(10:1 E:T 비율). 배양물을 37℃에서 4시간 동안 인큐베이션한 다음, 상등액을 뽑아 왈락 빅터 II 1420 멀티라벨 HTS 계수기(Wallac Victor II 1420 Multilabel HTS counter)에서 485 내지 535 nm에서 형광도를 측정함으로써 칼세인 방출에 대해 분석한다. 100%의 용해 값은 6개 웰의 표지된 표적을 아이게팔(Igepal) 630 세제(웰당 3 ㎕)로 용해시켜 결정하고 자발적 용해 값은 표적 단독으로부터의 상등액 중 형광도를 측정하여 결정한다.
통계 분석
특이적 용해율(%)은 (샘플의 형광도)-(자발적 용해의 형광도)/(100% 용해-자발적 용해의 형광도)로 정의된다. 자발적 용해는 표적만을 함유하는 웰로 결정하고 100% 용해는 표적을 아이게팔 CA 630 세제로 용해시킨 웰에서 결정한다. 원자료를 특이적 용해율(%)을 계산하는 식이 내장된 엑셀(Excel) 스프레드시트에 입력하고 생성된 값을 그래픽 프로그램(그래프패드 프리즘(GraphPad Prism))으로 옮겨 자료를 곡선 맞춤 그래프로 변환시킨다. 그래프패드에서 후속 분석(선형 회귀 계산)을 수행하여 EC50 값을 얻는다.
결과 및 고찰
비교 항-MSLN 항체를 함유하는 다중 도메인 단백질과 인큐베이션된 웰의 이펙터 NK 세포는 칼세인-표지된 표적 세포의 사멸을 매개할 수 없지만, 본 발명의 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체를 함유하는 다중 도메인 단백질이 있는 웰의 이펙터 세포는 특이적 용해 활성(특이적 용해율(%))에 의해 측정된 바와 같이 항체 의존성 세포 독성을 매개할 수 있다.
결론
본 발명의 예시적인 항-MSLN 단일 도메인 항체는 서열 치환, 변형 또는 인간화가 없는 비교 라마 항-MSLN 단일 도메인 항체보다 메소텔린을 발현하는 표적 세포의 상당히 높은 수준의 사멸을 매개한다.
실시예 4 : 본 발명의 예시 항- MSLN 단일 도메인 항체의 CDC 활성
본 발명에 따른 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체의 암세포에 대한 항-종양 활성을 평가하기 위해서, 보체 공급원으로서 인간 혈청의 존재하에서 A431/H9 및 NCI-H226 세포 모델에서 세포 독성 활성을 시험한다. 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체는 추가의 면역글로불린 도메인을 함유하는 다중 도메인 단백질로서 발현시킨다. 본 발명의 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체를 함유하는 다중 도메인 단백질은 약 40%의 A431/H9 및 30% 초과의 NCI-H226 중피종 세포주를 사멸시킴으로써 강력한 CDC 활성을 발휘하고, 메소텔린 음성 A431 세포주에 대해서 활성을 나타내지 않는 것으로 보인다. 본 발명의 예시적인 항체와 같은 서열 변형 또는 치환을 갖지 않는 비교 라마 항-MSLN 항체는 동일한 농도에서 활성을 나타내지 않는다.
예시 항-MSLN 단일 도메인 항체의 항종양 활성에서 보체의 역할을 분석하기 위해, 유세포 분석법을 이용하여 리툭시맙, 오파투무맙 및 다른 항-CD20 치료 mAb의 특성화를 위한 잘 확립된 프로토콜에 따라 항-메소텔린 인간 mAb와 반응시킨 암세포에 대한 C1q 결합을 결정한다(Pawluczkowycz et al., J Immunol 183:749-758, 2009; Li et al., Cancer Res 68:2400-2408, 2008). MORAb-009와 같이, 세포 표면 메소텔린(세포 표면으로부터 멀리 떨어짐)의 영역 I에 특이적인 HN1 인간 mAb는 메소텔린 발현 암세포에 대해 어떠한 CDC 활성도 나타내지 않았다고 이전에 밝혀졌다(Ho et al., Int J Cancer 128:2020-2030, 2011).
그러나 C1q 보체는 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체의 존재하에서 A431/H9 또는 NCI-H226 세포에 결합하는 것으로 보인다. 대조적으로, 비교 라마 항-MSLN 항체의 존재하에서 C1q 결합은 발견되지 않는다. 또한, 암세포에 대한 C1q의 결합은 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체의 세포 결합과 용량-반응 방식으로 관련된다. 이들 결과는 예시 항-MSLN 단일 도메인 항체가 비교 라마 항-MSLN 항체에 비해 개선된 CDC 활성을 나타냄을 입증한다.
본 발명의 바람직한 실시양태를 본원에서 보여주고 설명하였지만, 이러한 실시양태는 단지 예로서 제공된다는 것은 당업자에게 명백할 것이다. 이제 당업자는 본 발명을 벗어나지 않고서 다수의 변형, 변경 및 치환을 생각해 낼 것이다. 본 발명을 실시하는 데 있어 본원에 기재된 본 발명의 실시양태에 대한 다양한 대안이 사용될 수 있음을 이해해야 한다. 다음의 청구 범위는 본 발명의 범위를 정의하고 이로써 이들 청구 범위 및 이들의 등가물의 범위 내의 방법 및 구조가 포함되는 것으로 의도된다.
실시예 5: 본 발명에 따른 MSLN 결합 도메인( MH6T )을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질은 T 세포를 지시하여 MSLN 발현 난소암 세포를 사멸시킨다
인간 T 세포 의존성 세포 독성(TDCC) 분석을 사용하여 T 세포를 지시하여 종양 세포를 사멸시키는 삼중 특이적 분자를 포함하는 T 세포 인게이저의 능력을 측정하였다(Nazarian et al. 2015. J Biomol Screen. 20:519-27). 본 분석에 사용된 Caov3 세포는 루시퍼라제를 발현하도록 조작하였다. 5명의 상이한 건강한 공여자(공여자 02, 공여자 86, 공여자 41, 공여자 81, 및 공여자 34)로부터의 T 세포와 표적 암세포 Caov3을 함께 혼합하고, MSLN 결합 도메인(MH6T)(서열 번호 58)을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질을 다양한 양으로 첨가하고 혼합물을 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. Caov3 세포와 T 세포를 또한 GFP를 표적화하는 대조군 삼중 특이적 분자 GFP TriTAC(서열 번호 59)와 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. 48시간 후, 남아 있는 생존 종양 세포를 발광 분석에 의해 정량하였다.
MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질은 5명의 모든 건강한 공여자로부터의 T 세포를 지시하여 표적 암세포 Caov3을 사멸시킬 수 있었던 반면([도 2]에 도시된 바와 같음), 대조군 GFP TriTAC 분자는 5명의 건강한 공여자로부터의 T 세포를 지시하여 Caov3 세포를 사멸시킬 수 없었음(역시 [도 2]에 도시됨)이 관찰되었다.
OVCAR3 세포를 사용하여 상기 기술된 바와 동일한 프로토콜을 사용하는 추가 분석을 수행하였다. MSLN 결합 도메인(MH6T)을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질은 5명의 모든 건강한 공여자로부터의 T 세포를 지시하여 표적 암세포 OVCAR3을 사멸시킬 수 있었던 반면([도 3]에 도시된 바와 같음), 대조군 GFP TriTAC 분자는 5명의 건강한 공여자로부터의 T 세포를 지시하여 OVCAR3 세포를 사멸시킬 수 없었음(역시 [도 3]에 도시됨)이 관찰되었다.
MSLN 발현 표적 세포의 사멸에 대한 EC50 값은 하기 표 II에 열거한다.
[표 II]
Figure 112019128059661-pct00003
실시예 6: 본 발명에 따른 MSLN 결합 도메인( MH6T )을 함유하는 MSLN 표적 화 삼중 특이적 항원 결합 단백질은 T 세포를 지시하여 MSLN을 발현하는 세포를 사멸시키지만 MSLN을 발현하지 않는 세포를 사멸시키지 못한다
본 분석에서, 건강한 공여자로부터의 T 세포를 MSLN을 발현하는 표적 암세포(Caov3 세포, Caov4 세포, OVCAR3 세포, 및 OVCAR8 세포) 또는 MSLN을 발현하지 않는 표적 암세포(NCI-H510A 세포, MDAPCa2b 세포)와 인큐베이션하였다. 본 연구에 사용된 각각의 표적 세포는 루시퍼라제를 발현하도록 조작하였다. MSLN 결합 도메인(MH6T)(서열 번호 58)을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질을 다양한 양으로 T 세포와 상기 열거된 표적 암세포의 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. 48시간 후, 남아 있는 생존 표적 암세포를 발광 분석을 사용하여 정량하였다.
MH6T 도메인을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질은 T 세포를 지시하여 MSLN 발현 표적 암세포(즉, Caov3, Caov4, OVCAR3, 및 OVCAR8 세포)를 사멸시킬 수 있었음([도 4] 도시된 바와 같음)이 관찰되었다. 그러나 MH6T 도메인을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질은 T 세포를 지시하여 MSLN 비발현 표적 암세포(MDAPCa2b 및 NCI-H510A 세포)를 사멸시킬 수 없었으며, 이는 역시 [도 4]에 도시된다.
MSLN 발현 암세포의 사멸에 대한 EC50 값은 하기 표 III에 열거한다.
[표 III]
Figure 112019128059661-pct00004
실시예 7: 본 발명에 따른 MSLN 결합 단백질( MH6T )을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질은 시노몰구스 원숭이로부터의 T 세포를 지 시하 여 인간 난소암 세포주를 사멸시켰다
본 분석에서, 시노몰구스 원숭이 공여자로부터의 말초 혈액 단핵 세포(PBMC: peripheral blood mononuclear cell; T 세포는 PBMC의 성분임)를 MSLN을 발현하는 표적 암세포(CaOV3 세포 및 OVCAR3 세포)와 혼합하고 다양한 양의 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인(서열 번호 58) 함유)을 혼합물에 첨가하고, 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. 동시에, 상기와 같이 시노몰구스 PBMC와 MSLN 발현 세포의 혼합물을 GFP를 표적화하는 다양한 양의 대조군 TriTAC 분자 GFP TriTAC(서열 번호 59)와 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. 본 분석에 사용된 표적 암세포는 루시퍼라제를 발현하도록 조작하였다. 48시간 후, 남아 있는 생존 표적 세포를 발광 분석을 사용하여 정량하였다.
MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)은 효율적으로 시노몰구스 PBMC를 지시하여 MSLN 발현 세포(즉, Caov3 및 OVCAR)를 사멸시킬 수 있었던 반면([도 5]에 도시된 바와 같음), 대조군 GFP TriTAC 분자는 시노몰구스 PBMC를 지시하여 세포를 사멸시킬 수 없었음([도 5]에 도시됨)이 관찰되었다. MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 EC50 값은 OVCAR3 세포의 경우 2.9 pM이었고 Caov3 세포의 경우 3.0 pM이었으며, 이는 표 II에 나타난 바와 같이, 인간 T 세포에서 관찰된 EC50 값과 크게 다르지 않았다.
실시예 8: MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질( MH6T 도메인 함유)은 인간 혈청 알부민의 존재 또는 부재하에 T 세포에 의한 MSLN 발현 NCI-H2052 중피종 세포의 사멸을 지시하였다
본 연구의 목적은 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인(서열 번호 58) 함유)의 인간 혈청 알부민(HSA)에 대한 결합이 T 세포를 지시하여 MSLN 발현 세포를 사멸시키는 단백질의 능력에 영향을 미치는지를 평가하는 것이었다. 본 연구에 사용된 NCI-H2052 중피종 세포는 루시퍼라제를 발현하도록 조작하였다. 건강한 공여자로부터의 T 세포와 MSLN 발현 세포(NCI-H2052)를 혼합하고, 다양한 양의 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)을 혼합물에 첨가하였다. HSA의 존재 또는 부재하에 혼합물을 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. NCI-H2052 세포와 T 세포의 혼합물을 또한 HSA의 존재 또는 부재하에 GFP를 표적화하는 대조군 삼중 특이적 분자 GFP TriTAC(서열 번호 59)와 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. 48시간 후, 남아 있는 생존 표적 세포를 발광 분석을 사용하여 정량하였다.
MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)은 HSA의 존재 또는 부재하에 효율적으로 T 세포를 지시하여 NCI-H2052 세포를 사멸시킬 수 있었던 반면([도 6]에 도시된 바와 같음), 대조군 GFP TriTAC 분자는 그렇게 할 수 없었음(역시 [도 6]에 도시됨)이 관찰되었다. 또한, HSA의 존재하에, 세포 사멸에 대한 EC50 값이 약 3.2 배 증가하였음이 관찰되었다(표 IV에 나타낸 바와 같음).
추가 MSLN 발현 세포주와 함께 15 mg/ml HSA의 존재 또는 부재하에 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)로 추가의 TDCC 분석을 수행하였고 EC50 값은 표 IV에 제시한다.
[표 IV]
Figure 112019128059661-pct00005
실시예 9: 4명의 상이한 공여자로부터의 T 세포는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질( MH6T 도메인 함유) 및 MSLN 발현 Caov4 세포의 존재하에서 TNF-α를 분비한다
본 분석에 사용된 표적 암세포 CaOv4는 루시퍼라제를 발현하도록 조작하였다. 본 분석에서, 4명의 상이한 건강한 공여자(공여자 02, 공여자 86, 공여자 35, 및 공여자 81)로부터의 T 세포와 Caov4 세포를 함께 혼합하고, 다양한 양의 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인(서열 번호 58) 함유)을 첨가하고 혼합물을 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. Caov4 세포와 T 세포를 또한 GFP를 표적화하는 대조군 삼중 특이적 분자인 GFP TriTAC(서열 번호 59)와 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. 48시간에 TDCC 분석으로부터 조건화된 배지를 수집한 후, 발광 분석을 사용하여 표적 암세포 생존도를 측정하였다. 알파리사 분석 키트(AlphaLISA assay kit)(Perkin Elmer)를 사용하여 조건화된 배지에서 TNF-α의 농도를 측정하였다.
TNF-α는 [도 7]에 도시된 바와 같이 Caov4 세포 및 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 존재하에 배지에 분비되지만 Caov4 세포 및 대조군 GFP TriTAC 분자의 존재하에서는 분비되지 않았음이 관찰되었다.
또한, MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 존재하에서는 4명의 모든 건강한 공여자로부터의 T 세포에 의한 효율적인 사멸이 관찰되었으나, 대조군 GFP TriTAC 분자의 존재하에서는 그러지 못했다. 추가 MSLN 발현 세포주(Caov3 세포, OVCAR3 세포, 및 OVCAR8 세포)에 대해 TDCC 분석을 또한 수행하였고 유사한 TNF-α 발현이 관찰되었다. TNF-α의 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유) 유도된 발현에 대한 EC50 값은 표 V에 제시한다. 그러나 MSLN을 발현하지 않는 암세포(NCI-H510A 세포, 또는 MDAPCa2b 세포)를 사용하여 분석을 수행하였을 경우, MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유) 지시된 TNF-α의 분비는 관찰되지 않았다(자료 미제시). 따라서, 본 연구는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)이 MSLN 발현 표적 암세포의 존재하에서 T 세포를 활성화시킬 수 있었음을 입증하였다.
[표 V]
Figure 112019128059661-pct00006
실시예 10: MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질( MH6T 도메인 함유) 및 MSLN 발현 OVCAR8 세포의 존재하에 4명의 상이한 공여자로부터의 T 세포 상에서 CD69 발현의 활성화
본 분석에 사용된 OVCAR8 세포는 루시퍼라제를 발현하도록 조작하였다. 본 분석에서, 4명의 상이한 건강한 공여자(공여자 02, 공여자 86, 공여자 35, 및 공여자 81)로부터의 T 세포와 OVCAR8 세포를 함께 혼합하고 다양한 양의 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인(서열 번호 58) 함유)을 첨가하고 혼합물을 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. OVCAR8 세포와 T 세포를 또한 GFP를 표적화하는 대조군 삼중 특이적 분자인 GFP TriTAC(서열 번호 59)와 37℃에서 48시간 동안 인큐베이션하였다. 48시간 후, T 세포를 수집하고, T 세포 상에서 CD69 발현을 유세포 분석에 의해 측정하였다.
CD69 발현은 [도 8]에 도시된 바와 같이, OVCAR8 세포 및 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 존재하에서 4명의 모든 건강한 공여자로부터의 T 세포 상에서 검출되었으나 음성 대조군 GFP TriTAC 및 OVCAR8 세포의 존재하에서는 그러지 않았다. 또한, 추가 MSLN 발현 세포(Caov3 세포, OVCAR3 세포, 및 OVCAR8 세포)에 대해 TDCC 분석을 실시하였고 유사한 CD69 발현이 관찰되었다. Caov3 세포 및 OVCAR8 세포에서 CD69의 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유) 유도된 활성화에 대한 EC50 값은 표 VI에 제시한다.
[표 VI]
Figure 112019128059661-pct00007
MSLN을 발현하지 않는 암세포(NCI-H510A 세포, 또는 MDAPCa2b 세포)를 사용하여 분석을 수행하였을 경우, CD69의 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유) 유도된 활성화는 관찰되지 않았다(데이터 미제시). 따라서, 본 연구는 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)이 MSLN 발현 표적 암세포의 존재하에서 T 세포를 활성화시킬 수 있었음을 입증하였다.
실시예 11: MSLN 발현/ 비발현 세포주에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유) 결합의 측정
본 연구를 위해, MSLN을 발현하는 특정 표적 암세포(Caov3 세포, CaOV4 세포, OVCAR3 세포, 및 OVCAR8 세포) 및 MSLN을 발현하지 않는 특정 암세포(MDAPCa2b 세포 및 NCI-H510A 세포)를 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인(서열 번호 58) 함유) 또는 대조군 GFP TriTAC 분자(서열 번호 59)와 인큐베이션하였다. 인큐베이션 후, 세포를 세척하여 결합되지 않은 MH6T 또는 GFP TriTAC 분자를 제거하고, TriTAC 분자 내 항-알부민 도메인을 인식할 수 있는, 알렉사 플루오르(Alexa Fluor) 647에 접합된 2차 항체와 추가로 인큐베이션하였다. MSLN 발현 또는 MSLN 비발현 세포에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유) 또는 GFP TriTAC의 결합을은 유세포 분석에 의해 측정하였다.
[도 9a]에 나타난 바와 같이 MSLN을 발현하는 세포주(Caov3, Caov4, OVCAR3 및 OVCAR8)에 대한 MSLN 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6 도메인 함유)의 강력한 결합이 관찰되었으며(좌측 상단 패널은 Caov3 세포에 대한 MH6T 도메인을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 표적 항원 결합 단백질의 결합을 나타내고; 우측 상단 패널은 Caov4 세포에 대한 MH6T 도메인을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 표적 항원 결합 단백질의 결합을 나타내고; 좌측 하단 패널은 OVCAR3 세포에 대한 MH6T 도메인을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 표적 항원 결합 단백질의 결합을 나타내고; 우측 하단 패널은 OVCAR8 세포에 대한 MH6T 도메인을 함유하는 MSLN 표적화 삼중 특이적 표적 항원 결합 단백질의 결합을 나타냄); [도 9b]에 나타난 바와 같이, MSLN을 발현하지 않는 세포주에서는 결합이 관찰되지 않았다(좌측 패널은 MDAPCa2b 세포에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 결합이 없음을 나타내고 우측 패널은 NCI-H510A 세포에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 결합이 없음을 나타냄). 또한, [도 9a] 및 [도 9b] 둘 다에 나타난 바와 같이, 어떤 세포 유형도 GFP TriTAC 분자와 인큐베이션하였을 때 결합이 관찰되지 않았다.
실시예 12: 공여자로부터의 T 세포에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유) 결합의 측정
본 연구를 위해, 4명의 건강한 공여자로부터의 T 세포를 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인(서열 번호 58) 함유) 또는 음성 대조군으로서 완충액과 인큐베이션하였다. 인큐베이션 후, 세포를 세척하여 결합되지 않은 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)을 제거하고, MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유) 내 항-알부민 도메인을 인식할 수 있는, 알렉사 플루오르 647 접합된 2차 항체와 추가로 인큐베이션하였다. 결합을 유세포 분석에 의해 측정하였다.
[도 10]에 도시된 바와 같이, MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)로 처리된 4명의 모든 공여자로부터의 T 세포에서 강력한 결합이 관찰되었다(좌측 상단 패널은 공여자 2로부터의 T 세포에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 결합을 나타내고; 우측 상단 패널은 공여자 35로부터의 T 세포에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 결합을 나타내고; 좌측 하단 패널은 공여자 41로부터의 T 세포에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 결합을 나타내고; 우측 하단 패널은 공여자 81로부터의 T 세포에 대한 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 결합을 나타냄).
실시예 13: MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질( MH6T 도메인 함유)로 처리된 마우스에서 종양 성장의 억제
본 연구를 위해, 107개의 NCI-H292 세포 및 107개의 인간 PBMC를 두 그룹의 NCG 마우스(그룹당 8마리 마우스)의 피하에 공동 이식하였다. 5일 후, 한 그룹의 마우스에는 0.25 mg/kg의 용량으로 10일(제5일에서 제14일) 동안 매일 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인(서열 번호 58) 함유)을 주사하였고; 다른 그룹의 마우스에는 비히클 대조군을 주사하였다. 며칠마다 종양 부피를 측정하고 제36일에 연구를 종료하였다. [도 11]에 나타난 바와 같이, 비히클 대조군으로 주사한 마우스와 비교하여 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)을 주사한 마우스에서 종양 성장의 현저한 억제가 관찰되었다.
실시예 12: 시노몰구스 원숭이에서 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 약동학
본 연구를 위해, 2마리의 시노몰구스 원숭이에게 10mg/kg 용량의 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인(서열 번호 58) 함유)을 정맥 내 주사하고, 주사 후 다양한 시점에 혈청 샘플을 수집하였다. 전기 화학 발광 분석에서 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)을 인식하는 항-이디오타입 항체를 사용하여 혈청 중 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 양을 측정하였다. [도 12]는 다양한 시점에서의 혈청 중 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)수준에 대한 플롯을 보여준다. 이어서, 데이터를 사용하여 표 VII에 제공된 바와 같이 MSLN 표적화 삼중 특이적 항원 결합 단백질(MH6T 도메인 함유)의 약동학적 특성을 계산하였다.
[표 VII]
Figure 112019128059661-pct00008
Figure 112019128059661-pct00009
Figure 112019128059661-pct00010
Figure 112019128059661-pct00011
Figure 112019128059661-pct00012
Figure 112019128059661-pct00013
Figure 112019128059661-pct00014
Figure 112019128059661-pct00015
Figure 112019128059661-pct00016
Figure 112019128059661-pct00017
Figure 112019128059661-pct00018
Figure 112019128059661-pct00019
Figure 112019128059661-pct00020
Figure 112019128059661-pct00021
Figure 112019128059661-pct00022
Figure 112019128059661-pct00023
Figure 112019128059661-pct00024
Figure 112019128059661-pct00025
Figure 112019128059661-pct00026
Figure 112019128059661-pct00027
SEQUENCE LISTING <110> HARPOON THERAPEUTICS, INC. <120> MESOTHELIN BINDING PROTEINS <130> 47517-719.601 <140> <141> <150> 62/657,417 <151> 2018-04-13 <150> 62/505,719 <151> 2017-05-12 <160> 336 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 110 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 1 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Val Arg 20 25 30 Gly Met Ala Trp Tyr Arg Gln Ala Gly Asn Asn Arg Ala Leu Val Ala 35 40 45 Thr Met Asn Pro Asp Gly Phe Pro Asn Tyr Ala Asp Ala Val Lys Gly 50 55 60 Arg Phe Thr Ile Ser Trp Asp Ile Ala Glu Asn Thr Val Tyr Leu Gln 65 70 75 80 Met Asn Ser Leu Asn Ser Glu Asp Thr Thr Val Tyr Tyr Cys Asn Ser 85 90 95 Gly Pro Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser 100 105 110 <210> 2 <211> 123 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 2 Gln 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Synthetic polypeptide <400> 36 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Ser Ile Arg 20 25 30 Ala Met Arg Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Leu Val 35 40 45 Ala Val Ile Tyr Gly Ser Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ala Val Lys Gly 50 55 60 Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln 65 70 75 80 Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Asn Ala 85 90 95 Asp Thr Ile Gly Thr Ala Arg Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val 100 105 110 Thr Val Ser Ser Gly Gly 115 <210> 37 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 37 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Ser Ile Arg 20 25 30 Ala Met Arg Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ser Val Ile Tyr Gly Ser Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ala Val Lys Gly 50 55 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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 39 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Ser Thr Ile Asp 20 25 30 Thr Met Tyr Trp His Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Leu Val 35 40 45 Ala Tyr Val Thr Ser Arg Gly Thr Ser Asn Val Ala Asp Ser Val Lys 50 55 60 Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu 65 70 75 80 Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ser 85 90 95 Val Arg Thr Thr Ser Tyr Pro Val Asp Phe Trp Gly Gln Gly Thr Leu 100 105 110 Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 40 <211> 117 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 40 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Ser Thr Ile Asp 20 25 30 Thr Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ser Tyr Val Thr Ser Arg Gly Thr 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51 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 51 Gly Arg Thr Phe Ser Val Arg Gly Met Ala 1 5 10 <210> 52 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 52 Ile Asn Ser Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Gly 1 5 10 <210> 53 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 53 Asn Ala Gly Gly Gly Pro Leu Gly Ser Arg 1 5 10 <210> 54 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 54 Gly Gly Asp Trp Ser Ala Asn Phe Met Tyr 1 5 10 <210> 55 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 55 Ile Ser Ser Gly Gly Ser Thr Asn Val Arg 1 5 10 <210> 56 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 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Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 72 Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe Gly Met Ser 1 5 10 <210> 73 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 73 Gly Leu Thr Tyr Ser Ile Val Ala Val Gly 1 5 10 <210> 74 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 74 Gly Leu Thr Phe Gly Val Tyr Gly Met Glu 1 5 10 <210> 75 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 75 Thr Thr Ser Ser Ile Asn Ser Met Ser 1 5 <210> 76 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 76 Gly Arg Thr Leu Ser Arg Tyr Ala Met Gly 1 5 10 <210> 77 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 77 Gly Ser Ile Phe Ser Pro Asn Ala Met Ile 1 5 10 <210> 78 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 78 Gly Ala Thr Ser Ala Ile Thr Asn Leu Gly 1 5 10 <210> 79 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 79 Gly Ser Thr Phe Arg Ile Arg Val Met Arg 1 5 10 <210> 80 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 80 Gly Asp Thr Ser Lys Phe Lys Ala Val Gly 1 5 10 <210> 81 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 81 Gly Ser Thr Phe Gly Asn Lys Pro Met Gly 1 5 10 <210> 82 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 82 Gly Ser Thr Ser Ser Ile Asn Thr Met Tyr 1 5 10 <210> 83 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 83 Gly Arg Thr Asp Arg Ile 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peptide <400> 89 Gly Arg Thr Ser Thr Ile Asp Thr Met Tyr 1 5 10 <210> 90 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 90 Gly Ser Thr Ser Ser Ile Asn Thr Met Tyr 1 5 10 <210> 91 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 91 Gly Gly Asp Trp Ser Ala Asn Phe Met Tyr 1 5 10 <210> 92 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 92 Gly Gly Asp Trp Ser Ala Asn Phe Met Tyr 1 5 10 <210> 93 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 93 Gly Ser Thr Ser Ser Ile Asn Thr Met Tyr 1 5 10 <210> 94 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 94 Gly Ser Thr Ser Ser Ile Asn Thr Met Tyr 1 5 10 <210> 95 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 95 Gly Ser Thr Ser Ser Ile Asn Thr Met Tyr 1 5 10 <210> 96 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 96 Gly Ser Thr Phe Ser Ile Arg Ala Met Arg 1 5 10 <210> 97 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 97 Gly Ser Thr Phe Ser Ile Arg Ala Met Arg 1 5 10 <210> 98 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 98 Gly Ser Thr Phe Ser Ile Arg Ala Met Arg 1 5 10 <210> 99 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 99 Gly Arg Thr Ser Thr Ile Asp Thr Met Tyr 1 5 10 <210> 100 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 100 Gly Arg Thr Ser Thr Ile Asp Thr Met Tyr 1 5 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Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 110 Phe Val Ser Lys Asp Gly Lys Arg Ile Leu Tyr Leu Asp Ser Val Arg 1 5 10 15 Gly Arg Phe Thr 20 <210> 111 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 111 Ser Ile Ser Gly Ser Gly Ser Asp Thr Leu Tyr Ala Asp Ser Val Lys 1 5 10 15 Gly Arg Phe Thr 20 <210> 112 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 112 Asp Ile Ser Pro Val Gly Asn Thr Asn Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly 1 5 10 15 Arg Phe Thr <210> 113 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 113 Ser His Thr Ser Thr Gly Tyr Val Tyr Tyr Arg Asp Ser Val Lys Gly 1 5 10 15 Arg Phe Thr <210> 114 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 114 Val Ile Thr Asp Arg Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Asp Ser 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Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 119 Trp Ile Asn Asn Ser Gly Val Gly Asn Thr Ala Glu Ser Val Lys Gly 1 5 10 15 Arg Phe Thr <210> 120 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 120 Val Ile Ser Ser Asp Gly Gly Ser Thr Arg Tyr Ala Ala Leu Val Lys 1 5 10 15 Gly Arg Phe Thr 20 <210> 121 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 121 Phe Ile Ser Ser Gly Gly Ser Thr Asn Val Arg Asp Ser Val Lys Gly 1 5 10 15 Arg Phe Ser <210> 122 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 122 Thr Ile Ser Asn Arg Gly Thr Ser Asn Tyr Ala Asn Ser Val Lys Gly 1 5 10 15 Arg Phe Thr <210> 123 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 123 Thr Ile Thr Lys Gly Gly Thr Thr Asp Tyr Ala Asp Ser Val Asp Gly 1 5 10 15 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Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 165 Ile Ala Asp Trp Arg Gly Tyr 1 5 <210> 166 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 166 Asp Thr Ile Gly Thr Ala Arg Asp Tyr 1 5 <210> 167 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 167 Arg Thr Thr Ser Tyr Pro Val Asp Phe 1 5 <210> 168 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 168 Tyr Ile Pro Tyr Gly Gly Thr Leu His Asp Phe 1 5 10 <210> 169 <211> 3 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 169 Ala Ser Tyr 1 <210> 170 <211> 3 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 170 Ala Ser Tyr 1 <210> 171 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: 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Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 182 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Phe Ser 20 25 <210> 183 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 183 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser 20 25 <210> 184 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 184 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 185 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 185 Gln Val Arg Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 186 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 186 Gln Val Arg Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Glu 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 187 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 187 Gln Val Gln Pro Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Val Ser 20 25 <210> 188 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 188 Gln Val Gln Pro Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Val Ser 20 25 <210> 189 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 189 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Asn 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 190 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 190 Gln Val Gln Ile Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser 20 25 <210> 191 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 191 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Thr Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 192 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 192 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 193 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 193 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 194 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 194 Gln Val Gln Leu Gly Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 195 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 195 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Pro Ser Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 196 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 196 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 197 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 197 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Glu 1 5 10 15 Ser Arg Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser 20 25 <210> 198 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 198 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 199 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 199 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 200 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 200 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser 20 25 <210> 201 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 201 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Arg Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser 20 25 <210> 202 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 202 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 203 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 203 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 204 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 204 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Thr Ser 20 25 <210> 205 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 205 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Thr Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 206 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 206 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser 20 25 <210> 207 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 207 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 208 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 208 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 209 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 209 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 210 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 210 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 211 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 211 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 212 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 212 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 213 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 213 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 214 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 214 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 215 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 215 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 216 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 216 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser 20 25 <210> 217 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 217 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 218 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 218 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 219 <211> 13 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 219 Trp Tyr Arg Gln Ala Gly Asn Asn Arg Ala Leu Val Ala 1 5 10 <210> 220 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 220 Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gln Arg Glu Leu Val Ala 1 5 10 <210> 221 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 221 Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gln Arg Thr Val Val Ala 1 5 10 <210> 222 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 222 Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Leu Val Ala 1 5 10 <210> 223 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 223 Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gln Arg Glu Leu Val Ala 1 5 10 <210> 224 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 224 Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Ser Lys Gln Arg Glu Trp Val Ala 1 5 10 <210> 225 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 225 Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gln Arg Glu Leu Val Ala 1 5 10 <210> 226 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 226 Trp Tyr Arg Gln Ala Ser Gly Lys Glu Arg Glu Ser Val Ala 1 5 10 <210> 227 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 227 Trp Tyr Arg Gln Ala Ser Gly Lys Glu Arg Glu Ser Val Ala 1 5 10 <210> 228 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 228 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Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 254 Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser 1 5 10 <210> 255 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 255 Trp His Arg Gln Ala Pro Gly Asn Glu Arg Glu Leu Val Ala 1 5 10 <210> 256 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 256 Trp His Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Leu Val Ala 1 5 10 <210> 257 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 257 Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser 1 5 10 <210> 258 <211> 29 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 258 Ile Ser Trp Asp Ile Ala Glu Asn Thr Val Tyr Leu Gln Met Asn Ser 1 5 10 15 Leu Asn Ser Glu Asp Thr Thr Val Tyr Tyr Cys Asn Ser 20 25 <210> 259 <211> 29 <212> PRT <213> 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Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 274 Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Asn 1 5 10 15 Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Asn Ala 20 25 <210> 275 <211> 29 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 275 Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gln Met Asn Arg 1 5 10 15 Leu Thr Pro Glu Asp Thr Asp Val Tyr Tyr Cys Arg Phe 20 25 <210> 276 <211> 29 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 276 Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gln Met Glu Ser 1 5 10 15 Leu Val Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Asn Ala 20 25 <210> 277 <211> 29 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 277 Val Ser Arg Asp Ser Ala Lys Asn Ile Val Tyr Leu Gln Met Asn Ser 1 5 10 15 Leu Thr Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Asn Thr 20 25 <210> 278 <211> 29 <212> PRT 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Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 293 Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser 1 5 10 15 Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Asn Ala 20 25 <210> 294 <211> 29 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 294 Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser 1 5 10 15 Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ser Val 20 25 <210> 295 <211> 29 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 295 Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser 1 5 10 15 Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ser Val 20 25 <210> 296 <211> 29 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 296 Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser 1 5 10 15 Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ser Val 20 25 <210> 297 <211> 11 <212> PRT 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peptide <400> 313 Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 314 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 314 Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 315 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 315 Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 316 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 316 Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 317 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 317 Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 318 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 318 Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 319 <211> 11 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Synthetic peptide <400> 324 Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 325 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 325 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 326 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 326 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 327 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 327 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 328 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 328 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 329 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 329 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 330 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Claims (68)

  1. 하기 식을 포함하는 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질:
    f1-r1-f2-r2-f3-r3-f4
    상기 식에서, r1은 CDR1이고; r2는 CDR2이고; r3은 CDR3이며; f1, f2, f3 및 f4는 프레임워크 잔기이고, 여기서:
    (i) CDR1은 서열 GSTFSIRAMR(서열 번호 88)을 포함하고, CDR2는 서열 VIYGSSTYYADAVKGRFT(서열 번호 127)를 포함하고, CDR3은 서열 DTIGTARDY(서열 번호 166)를 포함하거나;
    (ii) CDR1은 서열 GRTSTIDTMY(서열 번호 89)를 포함하고, CDR2는 YVTSRGTSNVADSVKGRFT(서열 번호 128)를 포함하고, CDR3은 서열 RTTSYPVDF(서열 번호 167)를 포함하거나;
    (iii) CDR1은 서열 GSTSSINTMY(서열 번호 82)를 포함하고, CDR2는 서열 FISSGGSTNVRDSVKGRFT(서열 번호 132)를 포함하고, CDR3은 서열 YIPYGGTLHDF(서열 번호 164)를 포함하거나;
    (iv) CDR1은 서열 GGDWSANFMY(서열 번호 54)를 포함하고, CDR2는 서열 RISGRGVVDYVESVKGRFT(서열 번호 130)를 포함하고, CDR3은 서열 ASY(서열 번호 169)를 포함하거나;
    (v) CDR1은 서열 GSTFRIRVMR(서열 번호 79)을 포함하고, CDR2는 서열 VISGSSTYYADSVKGRFT(서열 번호 118)를 포함하고, CDR3은 서열 DDSGIARDY(서열 번호 157)를 포함한다.
  2. 제1항에 있어서, 상기 단백질은 메소텔린의 에피토프에 결합하고, 상기 에피토프는 서열 번호 57의 아미노산 잔기 296-390을 포함하는 영역 I, 서열 번호 57의 아미노산 잔기 391-486을 포함하는 영역 II, 또는 서열 번호 57의 아미노산 잔기 487-598을 포함하는 영역 III에 위치하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  3. 제1항에 있어서, 상기 단백질은 서열 번호 17, 26, 27, 32-40, 58 및 60-62 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  4. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 17에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  5. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 26에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  6. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 27에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  7. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 32에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  8. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 33에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  9. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 34에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  10. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 35에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  11. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 36에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  12. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 37에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  13. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 38에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  14. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 39에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  15. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 40에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  16. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 58에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  17. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 60에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  18. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 61에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  19. 제3항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 62에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  20. 제1항에 있어서, CDR1은 서열 GSTFSIRAMR(서열 번호 88)을 포함하고, CDR2는 서열 VIYGSSTYYADAVKGRFT(서열 번호 127)를 포함하고, CDR3은 서열 DTIGTARDY(서열 번호 166)를 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  21. 제1항에 있어서, f1은 서열 번호 196, 205, 및 208-218 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  22. 제1항에 있어서, f2는 서열 번호 235, 244 및 247-257 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  23. 제1항에 있어서, f3은 서열 번호 274, 283, 및 286-296 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  24. 제1항에 있어서, f4는 서열 번호 313, 322, 및 325-335 중 어느 하나에 제시된 서열을 포함하는 것인 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  25. 서열 번호 17, 26, 27, 32-40, 및 60-62 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  26. 서열 번호 58에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질.
  27. 제1항 내지 제26항 중 어느 한 항의 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질을 포함하는, 증식성 질환 또는 종양성 질환의 치료 또는 개선을 필요로 하는 대상체에서 증식성 질환 또는 종양성 질환의 치료 또는 개선을 위한 약학 조성물로서, 증식성 질환 또는 종양성 질환은 메소텔린을 발현하는 것인 약학 조성물.
  28. 제27항에 있어서, 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질은 최대 10 mg/kg의 용량으로 대상체에게 투여하기 위해 제형화되는 것인 약학 조성물.
  29. 제28항에 있어서, 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질은 주 1회, 주 2회, 격일, 또는 3주마다 대상체에게 투여되도록 제형화되는 것인 약학 조성물.
  30. 제27항에 있어서, 대상체는 인간인 약학 조성물.
  31. 제27항에 있어서, 작용제와 조합하여 투여하기 위해 제형화되는 것인 약학 조성물로서, 작용제는 항설사제, 항구토제, 진통제, 오피오이드, 비스테로이드성 소염제, 또는 항암제를 포함하는 것인 약학 조성물.
  32. 제27항에 있어서, 대상체에게 투여될 때 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질은 메소텔린을 발현하는 종양 세포에 선택적으로 결합하는 것인 약학 조성물.
  33. 제32항에 있어서, 대상체에게 투여될 때 단일 도메인 메소텔린 결합 단백질은 메소텔린을 발현하는 종양 세포의 T 세포 사멸을 매개하는 것인 약학 조성물.
  34. 제33항에 있어서, 종양성 질환은 고형 종양 질환을 포함하는 것인 약학 조성물.
  35. 제34항에 있어서, 고형 종양 질환은 중피종, 폐암, 위암, 난소암, 또는 삼중 음성 유방암을 포함하는 것인 약학 조성물.
  36. 제35항에 있어서, 고형 종양 질환은 전이성인 약학 조성물.
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