JP2005504508A5 - - Google Patents
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Description
迅速かつ明確な微生物の特定が、産業、医療、環境、品質、及び研究上の様々な理由から望まれている。伝統的には、微生物学の研究室が標本の直接検査及び培養を通して感染症の病原体を特定する機能を果たしてきた。１９８０年代中期から、研究者は分子生物学技術の実践的な有用性を繰り返し実証してき、その多くは臨床診断アッセイの基礎となっている。これら技術のなかには、核酸ハイブリダイゼーション分析、制限酵素分析、遺伝子配列分析、及び核酸の分離及び精製が含まれる（例えば、J. Sambrook, E. F. Fritsch, and T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd, Ed., Cold Spring
Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989）。これら方法は、一般に、時間がかかり、長々としている。もう１つの選択肢は、使用する隣接プライマーに基づいて特定の標的ＤＮＡ配列を増幅する、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）又は他の増幅法である。最終的に、検出とデータ分析により、ハイブリダイゼーション事象が分析結果へ変換される。
Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989）。これら方法は、一般に、時間がかかり、長々としている。もう１つの選択肢は、使用する隣接プライマーに基づいて特定の標的ＤＮＡ配列を増幅する、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）又は他の増幅法である。最終的に、検出とデータ分析により、ハイブリダイゼーション事象が分析結果へ変換される。
本発明の１つの態様は、未知の生物学的物質を特定する方法であって、前記方法は、（ａ）該生物学的物質からの核酸を、該核酸の配列へハイブリダイズしかつ可変核酸配列に隣接している少なくとも１対のオリゴヌクレオチドプライマーと接触させる工程；（ｂ）増幅産物を産生するために該可変核酸配列を増幅する工程；（ｃ）該増幅産物の分子量を決定する工程；及び、（ｄ）該分子量を、複数の既知生物について工程（ａ）〜（ｃ）を行うことによって得られる増幅産物の１又はそれを越える分子量と比較する工程であって１つの合致が該未知の生物学的物質を特定する工程を含んでなる。この好ましい態様の１つの側面においては、該少なくとも１対のオリゴヌクレオチドプライマーはハイブリダイズする配列は高度に保存されている。好ましくは、該増幅工程はポリメラーゼ連鎖反応を含む。また、該増幅工程は、リガーゼ連鎖反応又は鎖追出増幅 (strand displacement amplification) を含む。この好ましい態様の１つの側面においては、該生物学的物質は、細菌、ウイルス、細胞、又は胞子である。有利には、該核酸はリボソームＲＮＡである。もう１つの側面においては、該核酸はＲＮアーゼＰ又はＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼをコードする。好ましくは、該増幅産物は分子量決定に先立ってイオン化される。本方法は、さらに、該生物学的物質から核酸を単離する工程を、該少なくとも１対のオリゴヌクレオチドプライマーに該核酸を接触させる工程に先立って含むことができる。本方法は、異なるオリゴヌクレオチドプライマー対を使用して工程（ａ）〜（ｄ）を行って、その結果を、工程（ｄ）におけるものとは異なる複数の既知生物について工程（ａ）〜（ｃ）を行うことによって得られる増幅産物の１又はそれを越える分子量と比較する工程をさらに含むことができる。好ましくは、該１又はそれを越える分子量が分子量のデータベースに含有される。この好ましい態様のもう１つの側面においては、該増幅産物が、エレクトロスプレーイオン化、マトリックス介助レーザーデソープション、又は高速原子衝突によりイオン化される。有利には、該分子量が質量スペクトル法により決定される。好ましくは、該質量スペクトル法は、フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量スペクトル法（ＦＴ−ＩＣＲ−ＭＳ）、イオントラップ、四重極、磁気セクター、飛行時間型（ＴＯＦ）、Ｑ−ＴＯＦ、又は三重の四重極である。本方法は、アデノシン、チミジン、グアノシン、又はシチジンとは異なる分子量を有する、アデニン、チミジン、グアノシン、又はシチジンの類似体の存在下で、工程（ｂ）を行うことをさらに含むことができる。１つの側面においては、該オリゴヌクレオチドプライマーは、該プライマー内の各トリプレットの１及び２位に塩基類似体又は代替塩基を含み、該塩基類似体又は代替塩基は、天然塩基に比較して高められた親和性でその相補体へ結合する。好ましくは、該プライマーは、該プライマー内の各トリプレットの３位にユニバーサル塩基を含む。該塩基類似体又は代替塩基は、２，６−ジアミノプリン、プロピンＴ、プロピンＧ、フェノキサジン類、及びＧ−クランプであり得る。好ましくは、該ユニバーサル塩基は、イノシン、グアニジン、ウリジン、５−ニトロインドール、３−ニトロピロール、ｄＰ若しくはｄＫ、又は１−（２−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシル）−イミダゾール−４−カルボキサミドである。
本発明のもう１つの態様は、未知の生物学的物質を特定する方法であって、（ａ）該生物学的物質からの核酸を、該核酸の配列へハイブリダイズしかつ可変核酸配列に隣接している少なくとも１対のオリゴヌクレオチドプライマーと接触させる工程；（ｂ）増幅産物を産生するために該可変核酸配列を増幅する工程；（ｃ）該増幅産物の塩基組成を決定する工程；及び、（ｄ）該塩基組成を、複数の既知生物について工程（ａ）〜（ｃ）を行うことによって得られる増幅産物の１又はそれを越える塩基組成と比較する工程であって１つの合致が該未知の生物学的物質を特定する工程を含んでなる。この好ましい態様の１つの側面においては、該少なくとも１対のオリゴヌクレオチドプライマーはハイブリダイズする配列が高度に保存されている。好ましくは、該増幅工程はポリメラーゼ連鎖反応を含む。また、該増幅工程は、リガーゼ連鎖反応又は鎖追出増幅を含む。この好ましい態様の１つの側面においては、該生物学的物質は、細菌、ウイルス、細胞、又は胞子である。有利には、該核酸はリボソームＲＮＡである。もう１つの側面においては、該核酸はＲＮアーゼＰ又はＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼをコードする。好ましくは、該増幅産物は分子量決定に先立ってイオン化される。本方法は、さらに、該生物学的物質から核酸を単離する工程を、該少なくとも１対のオリゴヌクレオチドプライマーに該核酸を接触させる工程に先立って含むことができる。本方法は、異なるオリゴヌクレオチドプライマー対を使用して工程（ａ）〜（ｄ）を行って、その結果を、工程（ｄ）におけるものとは異なる複数の既知生物について工程（ａ）〜（ｃ）を行うことによって得られる増幅産物の１又はそれを越える塩基組成シグネチャーと比較する工程をさらに含むことができる。好ましくは、該１又はそれを越える塩基組成は塩基組成のデータベースに含有される。この好ましい態様のもう１つの側面においては、該増幅産物は、エレクトロスプレーイオン化、マトリックス介助レーザーデソープション、又は高速原子衝突によりイオン化される。有利には、該分子量は質量スペクトル法により決定される。好ましくは、該質量スペクトル法は、フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量スペクトル法（ＦＴ−ＩＣＲ−ＭＳ）、イオントラップ、四重極、磁気セクター、飛行時間型（ＴＯＦ）、Ｑ−ＴＯＦ、又は三重の四重極である。本方法は、アデノシン、チミジン、グアノシン、又はシチジンとは異なる分子量を有する、アデニン、チミジン、グアノシン、又はシチジンの類似体の存在下で工程（ｂ）を行う工程をさらに含むことができる。１つの側面においては、該オリゴヌクレオチドプライマーは、該プライマー内の各トリプレットの１及び２位に塩基類似体又は代替塩基を含み、該塩基類似体又は代替塩基は、天然塩基に比較して高められた親和性でその相補体へ結合する。好ましくは、該プライマーは、該プライマー内の各トリプレットの３位にユニバーサル塩基を含む。該塩基類似体又は代替塩基は、２，６−ジアミノプリン、プロピンＴ、プロピンＧ、フェノキサジン類、及びＧ−クランプであり得る。好ましくは、該ユニバーサル塩基は、イノシン、グアニジン、ウリジン、５−ニトロインドール、３−ニトロピロール、ｄＰ、又はｄＫ、又は１−（２−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシル）−イミダゾール−４−カルボキサミドである。
【００１１】
本発明は、ある個体において単ヌクレオチド多型性を検出する方法を提供し、前記方法は、（ａ）該個体から核酸を単離する工程；（ｂ）該潜在多型性を含んでなる領域に隣接している該核酸の領域へハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプライマーに該核酸を接触させる工程；（ｃ）増幅産物を産生するために該領域を増幅する工程；（ｄ）該増幅産物の分子量を決定する工程；及び（ｅ）該分子量を、該多型性を有することが分かっている個体における該領域の分子量と比較する工程であって該分子量が同一であるなら該個体が該多型性を有する工程を含んでなる。
この好ましい態様の１つの側面においては、該プライマーは高度保存配列へハイブリダイズする。好ましくは、該多型性はある疾患に関連している。他のやり方では、該多型性は血液型抗原である。好ましい態様の１つの側面においては、該増幅工程はポリメラーゼ連鎖反応である。また、該増幅工程は、リガーゼ連鎖反応又は鎖追出増幅である。好ましくは、該増幅産物は質量決定に先立ってイオン化される。１つの側面においては、該増幅産物は、エレクトロスプレーイオン化、マトリックス介助レーザーデソープション、又は高速原子衝突によりイオン化される。有利には、該分子量は質量スペクトル法により決定される。好ましくは、該質量スペクトル法は、フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量スペクトル法（ＦＴ−ＩＣＲ−ＭＳ）、イオントラップ、四重極、磁気セクター、飛行時間型（ＴＯＦ）、Ｑ−ＴＯＦ、及び三重の四重極である。
【発明の詳細な説明】
本発明は、ある個体において単ヌクレオチド多型性を検出する方法を提供し、前記方法は、（ａ）該個体から核酸を単離する工程；（ｂ）該潜在多型性を含んでなる領域に隣接している該核酸の領域へハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプライマーに該核酸を接触させる工程；（ｃ）増幅産物を産生するために該領域を増幅する工程；（ｄ）該増幅産物の分子量を決定する工程；及び（ｅ）該分子量を、該多型性を有することが分かっている個体における該領域の分子量と比較する工程であって該分子量が同一であるなら該個体が該多型性を有する工程を含んでなる。
この好ましい態様の１つの側面においては、該プライマーは高度保存配列へハイブリダイズする。好ましくは、該多型性はある疾患に関連している。他のやり方では、該多型性は血液型抗原である。好ましい態様の１つの側面においては、該増幅工程はポリメラーゼ連鎖反応である。また、該増幅工程は、リガーゼ連鎖反応又は鎖追出増幅である。好ましくは、該増幅産物は質量決定に先立ってイオン化される。１つの側面においては、該増幅産物は、エレクトロスプレーイオン化、マトリックス介助レーザーデソープション、又は高速原子衝突によりイオン化される。有利には、該分子量は質量スペクトル法により決定される。好ましくは、該質量スペクトル法は、フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量スペクトル法（ＦＴ−ＩＣＲ−ＭＳ）、イオントラップ、四重極、磁気セクター、飛行時間型（ＴＯＦ）、Ｑ−ＴＯＦ、及び三重の四重極である。
【発明の詳細な説明】
本発明の文脈において、「生物学的物質」は、生きているか若しくは死んでいるあらゆる生物、又はそのような生物に由来する核酸である。生物学的物質の例には、細胞（ヒト臨床サンプル、細菌細胞、及び他の病原体を含むがこれらに限定されない）、ウイルス、毒素遺伝子、及び生体調節化合物が含まれるがこれらに限定されない。サンプルは、生きていても死んでいても、又は植物状態（例えば、植物性の細菌又は胞子）でもよく、被包化されていても生物工学処理されたものでもよい。
本明細書に使用される「塩基組成シグネチャー」（ＢＣＳ）は、標的遺伝子と供給源生物をユニークに特定する核酸配列の選択されたフラグメントからの正確な塩基組成である。ＢＣＳは、特定遺伝子の特有の索引と考えることができる。
本明細書に使用される「識別力のあるプライマー」は、介在する可変領域に隣接している配列領域へ結合するプライマーである。好ましい態様においては、可変領域に隣接しているこれら配列領域は、異なる生物学的物質の種間で高度に保存されている。例えば、この配列領域は、すべてのバチルス種の間で高度に保存されていることができる。「高度に保存されている」という用語は、この配列領域が、約８０〜１００％、より好ましくは約９０〜１００％、そして最も好ましくは約９５〜１００％の同一性を示すことを意味する。１６Ｓ及び２３ＳｒＲＮＡの領域を増幅する識別力のあるプライマーの例を図１Ａ〜１Ｉに示す。１６ＳｒＲＮＡ中の典型的なプライマー増幅領域を図２に示す。矢印は、１６ＳｒＲＮＡドメインＩＩＩ中の可変領域に隣接している高度に保存された領域へ結合するプライマーを表す。この増幅領域は、「１１００〜１１８８」の下にあるステムループ構造である。
本明細書に使用される「塩基組成シグネチャー」（ＢＣＳ）は、標的遺伝子と供給源生物をユニークに特定する核酸配列の選択されたフラグメントからの正確な塩基組成である。ＢＣＳは、特定遺伝子の特有の索引と考えることができる。
本明細書に使用される「識別力のあるプライマー」は、介在する可変領域に隣接している配列領域へ結合するプライマーである。好ましい態様においては、可変領域に隣接しているこれら配列領域は、異なる生物学的物質の種間で高度に保存されている。例えば、この配列領域は、すべてのバチルス種の間で高度に保存されていることができる。「高度に保存されている」という用語は、この配列領域が、約８０〜１００％、より好ましくは約９０〜１００％、そして最も好ましくは約９５〜１００％の同一性を示すことを意味する。１６Ｓ及び２３ＳｒＲＮＡの領域を増幅する識別力のあるプライマーの例を図１Ａ〜１Ｉに示す。１６ＳｒＲＮＡ中の典型的なプライマー増幅領域を図２に示す。矢印は、１６ＳｒＲＮＡドメインＩＩＩ中の可変領域に隣接している高度に保存された領域へ結合するプライマーを表す。この増幅領域は、「１１００〜１１８８」の下にあるステムループ構造である。
本明細書に使用される「合致」は、統計的に有意な確率上の判定若しくは結果を意味する。
本発明の検出法の１つの主たる利点は、それらプライマーが、特定の細菌種や、バチルス又はストレプトマイセスのような属にさえ特異的である必要がないことである。むしろ、それらプライマーは、本明細書に記載の種を含むがそれらに限定されない数百の細菌種にわたって高度に保存された領域を認識する。このように、望まれる細菌を特定するために同一のプライマー対を使用することが可能であるのは、それが、単一の種に特異的であるか、又はいくつかの細菌種に共通した可変領域に隣接している保存領域へ結合し、介在配列の核酸増幅とその分子量及び塩基組成の決定を可能にするからである。例えば、１６Ｓ＿９７１〜１０６２、１６Ｓ＿１２２８〜１３１０、及び１６Ｓ＿１１００〜１１８８領域は、約９００種の細菌において９８〜９９％保存されている（１６Ｓ＝１６ＳｒＲＮＡ、数字は、ヌクレオチドの位置を示す）。本発明の１つの態様においては、本方法に使用されるプライマーが、１又はそれを越えるこれら領域又はその部分へ結合する。
本発明は、非ＰＣＲバイオマス検出モード、好ましくは高解像ＭＳと、保存領域へハイブリダイズしかつ（諸）生物学的物質をユニークに特定する可変領域を纏めて扱う「識別力のあるプライマー」を使用する核酸増幅ベースのＢＣＳ技術との組み合わせを提供する。ＰＣＲの使用が好ましいが、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）及び鎖追出増幅（ＳＤＡ）を含む他の核酸増幅技術も使用可能である。高解像ＭＳ技術は、高度に騒乱した環境にあるバックグラウンドスペクトル線からの、生物学的物質スペクトル線の分離を可能にする。次いで、その解像されたスペクトル線をＢＣＳへ翻訳し、１又はそれを越える既知ＢＣＳのスペクトルに対して合致させる最大確度検出アルゴリズムへこれを入力する。好ましくは、この生物学的物質ＢＣＳスペクトルを、膨大な数の生物学的物質からの１又はそれを越えるＢＣＳのデータベースに対して合致させる。好ましくは、このマッチングは、最大確度検出アルゴリズムを使用してなされる。
本発明の検出法の１つの主たる利点は、それらプライマーが、特定の細菌種や、バチルス又はストレプトマイセスのような属にさえ特異的である必要がないことである。むしろ、それらプライマーは、本明細書に記載の種を含むがそれらに限定されない数百の細菌種にわたって高度に保存された領域を認識する。このように、望まれる細菌を特定するために同一のプライマー対を使用することが可能であるのは、それが、単一の種に特異的であるか、又はいくつかの細菌種に共通した可変領域に隣接している保存領域へ結合し、介在配列の核酸増幅とその分子量及び塩基組成の決定を可能にするからである。例えば、１６Ｓ＿９７１〜１０６２、１６Ｓ＿１２２８〜１３１０、及び１６Ｓ＿１１００〜１１８８領域は、約９００種の細菌において９８〜９９％保存されている（１６Ｓ＝１６ＳｒＲＮＡ、数字は、ヌクレオチドの位置を示す）。本発明の１つの態様においては、本方法に使用されるプライマーが、１又はそれを越えるこれら領域又はその部分へ結合する。
本発明は、非ＰＣＲバイオマス検出モード、好ましくは高解像ＭＳと、保存領域へハイブリダイズしかつ（諸）生物学的物質をユニークに特定する可変領域を纏めて扱う「識別力のあるプライマー」を使用する核酸増幅ベースのＢＣＳ技術との組み合わせを提供する。ＰＣＲの使用が好ましいが、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）及び鎖追出増幅（ＳＤＡ）を含む他の核酸増幅技術も使用可能である。高解像ＭＳ技術は、高度に騒乱した環境にあるバックグラウンドスペクトル線からの、生物学的物質スペクトル線の分離を可能にする。次いで、その解像されたスペクトル線をＢＣＳへ翻訳し、１又はそれを越える既知ＢＣＳのスペクトルに対して合致させる最大確度検出アルゴリズムへこれを入力する。好ましくは、この生物学的物質ＢＣＳスペクトルを、膨大な数の生物学的物質からの１又はそれを越えるＢＣＳのデータベースに対して合致させる。好ましくは、このマッチングは、最大確度検出アルゴリズムを使用してなされる。
好ましい態様においては、塩基組成シグネチャーが、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、好ましくは多重ＰＣＲ、及び質量スペクトル（ＭＳ）法を使用して、大量並行方式で定量的に測定される。ＭＳによる生物学的物質の検出には十分量の核酸が存在しなければならない。大量の精製された核酸又はそのフラグメントを調製するための多種多様な技術が当業者によく知られている。ＰＣＲには、増幅すべき（諸）標的配列に隣接している領域へ結合するオリゴヌクレオチドプライマーの１又はそれを越える対が必要とされる。これらプライマーはＤＮＡの異なる鎖の合成を始動させ、一方のプライマーから他方のプライマーへの方向で合成が起こる。プライマー、増幅すべきＤＮＡ、熱安定性ＤＮＡポリメラーゼ（例、Ｔａｑポリメラーゼ）、４種のデオキシヌクレオチド三リン酸、及び緩衝液が組み合わされてＤＮＡ合成が始まる。この溶液を加熱によって変性してから、冷却して新たに追加されるプライマーをアニールさせ、別のラウンドのＤＮＡ合成が続く。典型的には、このプロセスを約３０サイクル繰り返して、標的配列の増幅をもたらす。
１つの態様においては、標的遺伝子が、（＋）鎖ＲＮＡウイルスによりコードされるＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ若しくはヘリカーゼ、又は（−）鎖ＲＮＡウイルスからのＲＮＡポリメラーゼである。（＋）鎖ＲＮＡウイルスは二本鎖ＲＮＡであり、ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼと鋳型としてのポジティブ鎖を使用するＲＮＡ指向性ＲＮＡ合成により複製する。ヘリカーゼはＲＮＡ二重鎖を巻き戻して、一本鎖ＲＮＡの複製を可能にする。これらウイルスには、ピコナウイルス科（例、ポリオウイルス、コクサッキーウイルス、エコーウイルス）、トガウイルス科（例、アルファウイルス、フラビウイルス、ルビウイルス）、アレナウイルス科（例、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス、ラッサ熱ウイルス）、コロナウイルス科（例、ヒト呼吸器ウイルス）、及びＡ型肝炎ウイルスが含まれる。これらタンパク質をコードする遺伝子は、可変領域と、その可変領域に隣接している高度に保存された領域を含む。
好ましい態様においては、（諸）生物学的物質から産生されるＰＣＲ産物の検出スキームは３つの特徴を取込む。第一に、この技術は、複数の（概して約６〜１０）ＰＣＲ産物を同時に検出して差別化する。第二に、この技術は、可能なプライマー部位から生物学的物質をユニークに特定するＢＣＳを提供する。最後に、この検出技術は、迅速で、多数のＰＣＲ反応が並行して実行されることができる。
好ましい態様においては、（諸）生物学的物質から産生されるＰＣＲ産物の検出スキームは３つの特徴を取込む。第一に、この技術は、複数の（概して約６〜１０）ＰＣＲ産物を同時に検出して差別化する。第二に、この技術は、可能なプライマー部位から生物学的物質をユニークに特定するＢＣＳを提供する。最後に、この検出技術は、迅速で、多数のＰＣＲ反応が並行して実行されることができる。
１つの態様においては、多数のコア遺伝子からのシグナルを測定することによって各生物を「三角にする」戦略を使用して、偽陰性及び偽陽性のシグナルを抑え、原型又はハイブリッド、又は他のやり方で工学処理された生物学的物質の再構築を可能にする。多数のコア遺伝子の特定の後で、核酸配列データベースからのアライメントを創出する。次いで、保存及び変異の領域についてこのアライメントを分析し、可変領域に隣接している潜在的なプライマー結合部位を特定する。次に、特定のゲノム差異（即ち、塩基組成）に基づいて生物を識別するシグネチャー分析のための増幅標的領域を選択する。例えば、B. anthracis ゲノムから予測されるシグネチャーの不存在下での、B. anthracis に典型的な３つの部分の毒素遺伝子（Bowen, J. E. 及び C. P. Quinn, J. Appl. MIcrobiol. 1999, 87, 270-278）のシグネチャーの検出は、遺伝子工学事象を示唆するであろう。
本方法は、単ヌクレオチド多型性（ＳＮＰ）又は多ヌクレオチド多型性を迅速かつ正確に検出するためにも使用できる。ＳＮＰは、一つの個体から別の固体へ異なるゲノム中の単一の塩基対部位として定義される。この差異は、欠失、挿入又は置換のいずれかとして表現することができ、しばしば疾患状態に関連する。それらは１００〜１０００塩基対ごとに起こるので、ＳＮＰは、ヒトゲノム中で最も頻繁に束縛された (bound) タイプの遺
伝マーカーである。
本方法は、単ヌクレオチド多型性（ＳＮＰ）又は多ヌクレオチド多型性を迅速かつ正確に検出するためにも使用できる。ＳＮＰは、一つの個体から別の固体へ異なるゲノム中の単一の塩基対部位として定義される。この差異は、欠失、挿入又は置換のいずれかとして表現することができ、しばしば疾患状態に関連する。それらは１００〜１０００塩基対ごとに起こるので、ＳＮＰは、ヒトゲノム中で最も頻繁に束縛された (bound) タイプの遺
伝マーカーである。
【００３５】
例えば、鎌状赤血球貧血は、グルタミン酸残基ではなくバリンをコードするＡ−Ｔ転位から生じる。オリゴヌクレオチドプライマーを、それらがＳＮＰ部位に隣接しているある配列へ結合するように設計してから、ヌクレオチド増幅とその増幅産物の質量決定をすることができる。鎌状赤血球貧血を有さない個体から生じる産物の分子量は、その疾患を有する個体からの産物のそれとは異なるので、この方法は、２つの個体を識別するために使用できる。このように、本方法は、個体中の既知ＳＮＰを検出し、それによりある疾患又は状態への高められた感受性を診断するか又は判定するために使用することができる。
１つの態様においては、個体から血液を採取し、末梢血液単核細胞（ＰＢＭＣ）を単離し、ＳＮＰ領域に隣接している既知配列に基づいた適切なプライマーを使用して、好ましくはハイスループットスクリーニング方法において、１又はそれを越えるＳＮＰについて同時に試験する。National Center for Biotechnology Information は公衆に利用可能なＳＮＰのデータベース（www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/）を保持している。
本発明の方法は、血液型判定にも使用できる。Ａ，Ｂ又はＯ血液型をコードする遺伝子は、４つの単ヌクレオチド多型性により異なることができる。この遺伝子が配列：ＣＧＴＧＧＴＧＡＣＣＣＴＴ（配列番号５）を含有すればＡ抗原が生じる。この遺伝子が配列：ＣＧＴＣＧＴＣＡＣＣＧＣＴＡ（配列番号６）を含有すればＢ抗原が生じる。この遺伝子が配列：ＣＧＴＧＧＴ−ＡＣＣＣＣＴＴ（配列番号７）を含有すれば血液型Ｏが生じる（「−」は欠失を示す）。これら配列は、これら領域に隣接している単一プライマー対を設計してから、増幅と質量決定を行うことにより識別することができる。
本発明をその好ましい態様のいくつかに従って具体的に記載してきたが、以下の実施例
は、本発明を例示するためだけのもので、本発明を限定するものではない。
【実施例】
例えば、鎌状赤血球貧血は、グルタミン酸残基ではなくバリンをコードするＡ−Ｔ転位から生じる。オリゴヌクレオチドプライマーを、それらがＳＮＰ部位に隣接しているある配列へ結合するように設計してから、ヌクレオチド増幅とその増幅産物の質量決定をすることができる。鎌状赤血球貧血を有さない個体から生じる産物の分子量は、その疾患を有する個体からの産物のそれとは異なるので、この方法は、２つの個体を識別するために使用できる。このように、本方法は、個体中の既知ＳＮＰを検出し、それによりある疾患又は状態への高められた感受性を診断するか又は判定するために使用することができる。
１つの態様においては、個体から血液を採取し、末梢血液単核細胞（ＰＢＭＣ）を単離し、ＳＮＰ領域に隣接している既知配列に基づいた適切なプライマーを使用して、好ましくはハイスループットスクリーニング方法において、１又はそれを越えるＳＮＰについて同時に試験する。National Center for Biotechnology Information は公衆に利用可能なＳＮＰのデータベース（www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/）を保持している。
本発明の方法は、血液型判定にも使用できる。Ａ，Ｂ又はＯ血液型をコードする遺伝子は、４つの単ヌクレオチド多型性により異なることができる。この遺伝子が配列：ＣＧＴＧＧＴＧＡＣＣＣＴＴ（配列番号５）を含有すればＡ抗原が生じる。この遺伝子が配列：ＣＧＴＣＧＴＣＡＣＣＧＣＴＡ（配列番号６）を含有すればＢ抗原が生じる。この遺伝子が配列：ＣＧＴＧＧＴ−ＡＣＣＣＣＴＴ（配列番号７）を含有すれば血液型Ｏが生じる（「−」は欠失を示す）。これら配列は、これら領域に隣接している単一プライマー対を設計してから、増幅と質量決定を行うことにより識別することができる。
本発明をその好ましい態様のいくつかに従って具体的に記載してきたが、以下の実施例
は、本発明を例示するためだけのもので、本発明を限定するものではない。
【実施例】
Claims (3)
- 未知の生物学的物質（bioagent）を特定する方法であって：
ａ）前記生物学的物質からの核酸を、前記核酸の諸配列へハイブリダイズする少なくとも１対のオリゴヌクレオチドプライマーに接触させる工程であって、前記諸配列が該生物学的物質の可変核酸配列に隣接している工程；
ｂ）増幅産物を産生するために前記可変核酸配列を増幅する工程；
ｃ）前記増幅産物の分子量を決定する工程；及び
ｄ）前記分子量を、複数の既知生物について工程ａ）〜ｃ）を行うことによって得られる増幅産物の１又はそれを越える分子量と比較する工程であって１つの合致が前記未知の生物学的物質を特定する工程
を含んでなる方法。 - 未知の生物学的物質を特定する方法であって：
ａ）前記生物学的物質からの核酸を、可変核酸配列に隣接している、前記核酸の諸配列へハイブリダイズする少なくとも１対のオリゴヌクレオチドプライマーに接触させる工程；
ｂ）増幅産物を産生するために前記可変核酸配列を増幅する工程；
ｃ）前記増幅産物の塩基組成を決定する工程；及び
ｄ）前記塩基組成を、複数の既知生物について工程ａ）〜ｃ）を行うことによって得られる増幅産物の１又はそれを越える塩基組成と比較する工程であって１つの合致が前記未知の生物学的物質を特定する工程
を含んでなる方法。 - ある個体において単ヌクレオチド多型性を検出する方法であって：
ａ）前記個体から核酸を単離する工程；
ｂ）前記潜在多型性を含んでなる領域に隣接している前記核酸の領域へハイブリダイズする諸オリゴヌクレオチドプライマーに前記核酸を接触させる工程；
ｃ）増幅産物を産生するために前記領域を増幅する工程；
ｄ）前記増幅産物の分子量を決定する工程；及び
ｅ）前記分子量を、前記多型性を有することが分かっている個体における前記領域の分子量と比較する工程であって前記分子量が同一であるならば前記個体が前記多型性を有する工程
を含んでなる方法。
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|---|---|---|---|---|
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| US20030027135A1 (en) | 2001-03-02 | 2003-02-06 | Ecker David J. | Method for rapid detection and identification of bioagents |
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| CA2348042A1 (en) | 2001-06-04 | 2002-12-04 | Ann Huletsky | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
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| US7217510B2 (en) * | 2001-06-26 | 2007-05-15 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for providing bacterial bioagent characterizing information |
| AU2003279664A1 (en) * | 2002-11-15 | 2004-06-15 | Biotage Ab | A method for inter-species differentiation and identification of a gram-positive bacteria |
| CA2508726A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-07-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for rapid identification of pathogens in humans and animals |
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| US7964343B2 (en) * | 2003-05-13 | 2011-06-21 | Ibis Biosciences, Inc. | Method for rapid purification of nucleic acids for subsequent analysis by mass spectrometry by solution capture |
| WO2005034855A2 (en) * | 2003-09-05 | 2005-04-21 | The General Hospital Corporation | Photodynamic inactivation of bacterial spores |
| US8546082B2 (en) | 2003-09-11 | 2013-10-01 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
| US20100129811A1 (en) * | 2003-09-11 | 2010-05-27 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of pseudomonas aeruginosa |
| US20120122103A1 (en) * | 2003-09-11 | 2012-05-17 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of bacteria |
| US8097416B2 (en) | 2003-09-11 | 2012-01-17 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
| US20060240412A1 (en) * | 2003-09-11 | 2006-10-26 | Hall Thomas A | Compositions for use in identification of adenoviruses |
| US20100035239A1 (en) * | 2003-09-11 | 2010-02-11 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of bacteria |
| US20080138808A1 (en) * | 2003-09-11 | 2008-06-12 | Hall Thomas A | Methods for identification of sepsis-causing bacteria |
| US20050142584A1 (en) * | 2003-10-01 | 2005-06-30 | Willson Richard C. | Microbial identification based on the overall composition of characteristic oligonucleotides |
| US7309410B2 (en) | 2003-12-03 | 2007-12-18 | Palo Alto Research Center Incorporated | Traveling wave grids and algorithms for biomolecule separation, transport and focusing |
| US7163611B2 (en) * | 2003-12-03 | 2007-01-16 | Palo Alto Research Center Incorporated | Concentration and focusing of bio-agents and micron-sized particles using traveling wave grids |
| CA2560521C (en) * | 2004-02-18 | 2012-01-03 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of bacteria |
| US7666592B2 (en) * | 2004-02-18 | 2010-02-23 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for concurrent identification and quantification of an unknown bioagent |
| US8119336B2 (en) * | 2004-03-03 | 2012-02-21 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of alphaviruses |
| US20060057603A1 (en) * | 2004-03-11 | 2006-03-16 | The Regents Of The University Of California | Detecting Bacillus anthracis |
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| US20050266411A1 (en) * | 2004-05-25 | 2005-12-01 | Hofstadler Steven A | Methods for rapid forensic analysis of mitochondrial DNA |
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| US7888011B2 (en) * | 2004-10-18 | 2011-02-15 | U.S. Genomics, Inc. | Methods for isolation of nucleic acids from prokaryotic spores |
| US20070003996A1 (en) * | 2005-02-09 | 2007-01-04 | Hitt Ben A | Identification of bacteria and spores |
| US20060205040A1 (en) * | 2005-03-03 | 2006-09-14 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of adventitious viruses |
| US8084207B2 (en) * | 2005-03-03 | 2011-12-27 | Ibis Bioscience, Inc. | Compositions for use in identification of papillomavirus |
| CA2605021A1 (en) * | 2005-04-13 | 2007-08-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of adenoviruses |
| US8026084B2 (en) * | 2005-07-21 | 2011-09-27 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid identification and quantitation of nucleic acid variants |
| US11834720B2 (en) * | 2005-10-11 | 2023-12-05 | Geneohm Sciences, Inc. | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) of MREJ types xi to xx |
| GB0601302D0 (en) * | 2006-01-23 | 2006-03-01 | Semikhodskii Andrei | Diagnostic methods and apparatus |
| EP2010679A2 (en) * | 2006-04-06 | 2009-01-07 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for the use in identification of fungi |
| US8455184B2 (en) * | 2006-04-18 | 2013-06-04 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Air Force | Differential multiplexing with pattern recognition |
| US8679741B2 (en) * | 2006-05-31 | 2014-03-25 | Sequenom, Inc. | Methods and compositions for the extraction and amplification of nucleic acid from a sample |
| CA2655269A1 (en) * | 2006-06-16 | 2007-12-21 | Sequenom, Inc. | Methods and compositions for the amplification, detection and quantification of nucleic acid from a sample |
| US9149473B2 (en) * | 2006-09-14 | 2015-10-06 | Ibis Biosciences, Inc. | Targeted whole genome amplification method for identification of pathogens |
| US7902345B2 (en) | 2006-12-05 | 2011-03-08 | Sequenom, Inc. | Detection and quantification of biomolecules using mass spectrometry |
| US8076104B2 (en) * | 2007-01-25 | 2011-12-13 | Rogan Peter K | Rapid and comprehensive identification of prokaryotic organisms |
| JP5680304B2 (ja) * | 2007-02-23 | 2015-03-04 | アイビス バイオサイエンシズ インコーポレイティッド | 迅速な法医学的ｄｎａ分析法 |
| WO2008118809A1 (en) * | 2007-03-23 | 2008-10-02 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of mixed populations of bioagents |
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| US8527207B2 (en) * | 2007-05-15 | 2013-09-03 | Peter K. Rogan | Accurate identification of organisms based on individual information content |
| US20100291544A1 (en) * | 2007-05-25 | 2010-11-18 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of strains of hepatitis c virus |
| US8465951B2 (en) | 2007-06-01 | 2013-06-18 | Council Of Scientific & Industrial Research | Method for simultaneous detection and discrimination of bacterial, fungal, parasitic and viral infections of eye and central nervous system |
| WO2008151023A2 (en) | 2007-06-01 | 2008-12-11 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods and compositions for multiple displacement amplification of nucleic acids |
| US20110045456A1 (en) * | 2007-06-14 | 2011-02-24 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of adventitious contaminant viruses |
| WO2009017902A2 (en) * | 2007-06-22 | 2009-02-05 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions and methods for identification of subspecies characteristics of mycobacterium tuberculosis |
| US7964843B2 (en) | 2008-07-18 | 2011-06-21 | The George Washington University | Three-dimensional molecular imaging by infrared laser ablation electrospray ionization mass spectrometry |
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| US20110097704A1 (en) * | 2008-01-29 | 2011-04-28 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of picornaviruses |
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| WO2010033627A2 (en) * | 2008-09-16 | 2010-03-25 | Ibis Biosciences, Inc. | Sample processing units, systems, and related methods |
| US20110200985A1 (en) * | 2008-10-02 | 2011-08-18 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of herpesviruses |
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| US20110183346A1 (en) * | 2008-10-03 | 2011-07-28 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of neisseria, chlamydia, and/or chlamydophila bacteria |
| WO2010039848A2 (en) * | 2008-10-03 | 2010-04-08 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of streptococcus pneumoniae |
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| WO2010039763A2 (en) * | 2008-10-03 | 2010-04-08 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of antibiotic-resistant bacteria |
| WO2010080616A1 (en) * | 2008-12-19 | 2010-07-15 | Abbott Laboratories | Molecular assay for diagnosis of malaria |
| US20110207143A1 (en) * | 2008-12-19 | 2011-08-25 | Abbott Laboratories | Diagnostic test for mutations in codons 12-13 of human k-ras |
| DE102009007266B4 (de) * | 2009-02-03 | 2012-04-19 | Bruker Daltonik Gmbh | Massenspektrometrische Identifizierung von Mikroorganismen in komplexen Proben |
| GB2510520B (en) * | 2009-02-03 | 2014-11-05 | Bruker Daltonik Gmbh | Mass spectrometric identification of microorganisms in complex samples |
| WO2010093943A1 (en) | 2009-02-12 | 2010-08-19 | Ibis Biosciences, Inc. | Ionization probe assemblies |
| US9719083B2 (en) | 2009-03-08 | 2017-08-01 | Ibis Biosciences, Inc. | Bioagent detection methods |
| WO2010107946A2 (en) * | 2009-03-18 | 2010-09-23 | Sequenom, Inc. | Use of thermostable endonucleases for generating reporter molecules |
| WO2010114842A1 (en) | 2009-03-30 | 2010-10-07 | Ibis Biosciences, Inc. | Bioagent detection systems, devices, and methods |
| EP3514244B1 (en) | 2009-04-03 | 2021-07-07 | Sequenom, Inc. | Nucleic acid preparation methods |
| EP2454000A4 (en) | 2009-07-17 | 2016-08-10 | Ibis Biosciences Inc | SYSTEMS FOR IDENTIFYING BIOLOGICAL SUBSTANCES |
| US8950604B2 (en) * | 2009-07-17 | 2015-02-10 | Ibis Biosciences, Inc. | Lift and mount apparatus |
| US9416409B2 (en) | 2009-07-31 | 2016-08-16 | Ibis Biosciences, Inc. | Capture primers and capture sequence linked solid supports for molecular diagnostic tests |
| EP3098325A1 (en) | 2009-08-06 | 2016-11-30 | Ibis Biosciences, Inc. | Non-mass determined base compositions for nucleic acid detection |
| US20110065111A1 (en) * | 2009-08-31 | 2011-03-17 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions For Use In Genotyping Of Klebsiella Pneumoniae |
| WO2011041695A1 (en) * | 2009-10-02 | 2011-04-07 | Ibis Biosciences, Inc. | Determination of methylation status of polynucleotides |
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| EP2545183B1 (en) | 2010-03-10 | 2017-04-19 | Ibis Biosciences, Inc. | Production of single-stranded circular nucleic acid |
| WO2011115840A2 (en) * | 2010-03-14 | 2011-09-22 | Ibis Biosciences, Inc. | Parasite detection via endosymbiont detection |
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| JP5808398B2 (ja) | 2010-06-02 | 2015-11-10 | ジョンズ ホプキンズ ユニバーシティＪｏｈｎｓ Ｈｏｐｋｉｎｓ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ | 微生物の薬物耐性を判定するシステムおよび方法 |
| CA2835942C (en) | 2011-05-19 | 2019-01-22 | Sequenom, Inc. | Products and processes for multiplex nucleic acid identification |
| HUE036963T2 (hu) * | 2011-06-15 | 2018-08-28 | Grifols Therapeutics Inc | Eljárások, kompozíciók és készletek humán immundeficiencia vírus (HIV) meghatározásához |
| US8829426B2 (en) | 2011-07-14 | 2014-09-09 | The George Washington University | Plume collimation for laser ablation electrospray ionization mass spectrometry |
| EP2753629B1 (en) | 2011-09-06 | 2016-10-19 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for detecting lyme disease |
| WO2013036187A1 (en) * | 2011-09-07 | 2013-03-14 | Alpha Biotech Ab | Determination of bacterial infections of the genus rickettsia and possibly borrelia, in patients exhibiting symptoms of disease and being blood donors |
| CA2847943C (en) * | 2011-09-23 | 2017-08-29 | F.Hoffmann-La Roche Ag | Use of g-clamp for improved allele-specific pcr |
| WO2013096799A1 (en) | 2011-12-22 | 2013-06-27 | Ibis Biosciences, Inc. | Systems and methods for isolating nucleic acids from cellular samples |
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| US9732387B2 (en) | 2012-04-03 | 2017-08-15 | The Regents Of The University Of Michigan | Biomarker associated with irritable bowel syndrome and Crohn's disease |
| CN104937390B (zh) | 2012-09-26 | 2018-09-21 | 艾比斯生物科学公司 | 用于微流体装置的拭子接口 |
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| CN103344695B (zh) * | 2013-06-18 | 2015-06-10 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 | 钩端螺旋体快速质谱检测试剂盒 |
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| RU2580412C1 (ru) * | 2015-02-02 | 2016-04-10 | Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Национальный исследовательский Томский политехнический университет" | Способ количественного определения т-2 токсина методом дифференциальной вольтамперометрии |
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| CN107787371B (zh) | 2015-04-24 | 2022-02-01 | 基纳生物技术有限公司 | 检测和定量次要变体的并行式方法 |
| WO2018089978A1 (en) * | 2016-11-14 | 2018-05-17 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Nucleic acid quantification compositions and methods |
| CN107085034A (zh) * | 2017-04-19 | 2017-08-22 | 中国人民解放军第三〇二医院 | Maldi‑tof‑ms鉴定宋内志贺菌 |
| CN108048540B (zh) * | 2018-01-03 | 2021-06-08 | 北京毅新博创生物科技有限公司 | 制备检测霍乱弧菌分型的指纹图谱库的方法 |
| CN107988341B (zh) * | 2018-01-03 | 2019-04-23 | 北京毅新博创生物科技有限公司 | 质谱鉴定霍乱弧菌分型的方法及产品 |
| JP7378712B2 (ja) * | 2019-08-07 | 2023-11-14 | 学校法人常翔学園 | 異種移植用材料の病原体感染を検査する方法、検査キット及び病原体感染が評価された異種移植用材料製品の作成方法 |
| CN112861170B (zh) * | 2020-08-03 | 2023-03-31 | 德能森智能科技（成都）有限公司 | 一种保护隐私的智慧园区管理系统 |
| CN113219115A (zh) * | 2021-05-18 | 2021-08-06 | 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) | 一种基于maldi-tof ms的蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌快速鉴定方法 |
| WO2023077489A1 (zh) * | 2021-11-06 | 2023-05-11 | 江汉大学 | 一种鼠疫杆菌的mnp标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用 |
Family Cites Families (427)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4075475A (en) | 1976-05-03 | 1978-02-21 | Chemetron Corporation | Programmed thermal degradation-mass spectrometry analysis method facilitating identification of a biological specimen |
| US5288611A (en) | 1983-01-10 | 1994-02-22 | Gen-Probe Incorporated | Method for detecting, identifying, and quantitating organisms and viruses |
| JPS60501339A (ja) * | 1983-01-10 | 1985-08-22 | ジエン−プロ−ブ インコ−ポレィテッド | 生物を検出、同定又は定量する方法およびキット |
| US5601984A (en) | 1983-01-10 | 1997-02-11 | Gen-Probe Incorporated | Method for detecting, the presense or amount of a taxonomic group of organisms using specific R-RNA subsequences as probes |
| US4965188A (en) | 1986-08-22 | 1990-10-23 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme |
| US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
| US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
| WO1988003957A1 (en) | 1986-11-24 | 1988-06-02 | Gen-Probe Incorporated | Nucleic acid probes for detection and/or quantitation of non-viral organisms |
| JP2862547B2 (ja) | 1987-03-02 | 1999-03-03 | ジエン―プローブ・インコーポレイテツド | 核酸精製、分離及びハイブリダイゼーション用ポリカチオン性支持体 |
| US5188963A (en) | 1989-11-17 | 1993-02-23 | Gene Tec Corporation | Device for processing biological specimens for analysis of nucleic acids |
| US5270030A (en) | 1988-12-29 | 1993-12-14 | Bio-Technology General Corp. | Fibrin binding domain polypeptide and method of producing |
| US5198543A (en) | 1989-03-24 | 1993-03-30 | Consejo Superior Investigaciones Cientificas | PHI29 DNA polymerase |
| IE81145B1 (en) * | 1989-04-20 | 2000-05-03 | Thomas Gerard Barry | Generation of specific probes for target nucleotide sequences |
| WO1990015157A1 (en) | 1989-05-31 | 1990-12-13 | Gene-Trak Systems | Universal eubacteria nucleic acid probes and methods |
| US5219727A (en) | 1989-08-21 | 1993-06-15 | Hoffmann-Laroche Inc. | Quantitation of nucleic acids using the polymerase chain reaction |
| US5192659A (en) | 1989-08-25 | 1993-03-09 | Genetype Ag | Intron sequence analysis method for detection of adjacent and remote locus alleles as haplotypes |
| US5213961A (en) | 1989-08-31 | 1993-05-25 | Brigham And Women's Hospital | Accurate quantitation of RNA and DNA by competetitive polymerase chain reaction |
| US6001588A (en) | 1990-01-10 | 1999-12-14 | Hsc Research Development Corporation | Introns and exons of the cystic fibrosis gene and mutations thereof |
| US5770029A (en) | 1996-07-30 | 1998-06-23 | Soane Biosciences | Integrated electrophoretic microdevices |
| US5143905A (en) | 1990-05-03 | 1992-09-01 | The Regents Of The University Of California | Method and means for extending the host range of insecticidal proteins |
| US5015845A (en) | 1990-06-01 | 1991-05-14 | Vestec Corporation | Electrospray method for mass spectrometry |
| US5712125A (en) | 1990-07-24 | 1998-01-27 | Cemv Bioteknik Ab | Competitive PCR for quantitation of DNA |
| DE4030262A1 (de) | 1990-09-25 | 1992-03-26 | Suedzucker Ag | Verfahren zur herstellung von rhamnose aus rhamnolipiden |
| NL9002259A (nl) * | 1990-10-17 | 1992-05-18 | Eurodiagnostics B V | Werkwijze voor het bepalen van een genotype door het vergelijken van de nucleotidensequentie van leden van een genfamilie, alsmede kit voor het opsporen van genetische variaties. |
| WO1992009703A1 (en) | 1990-11-26 | 1992-06-11 | Cbr Laboratories, Inc. | Testing for spirochetal nucleic acid sequences in samples |
| US5072115A (en) | 1990-12-14 | 1991-12-10 | Finnigan Corporation | Interpretation of mass spectra of multiply charged ions of mixtures |
| WO1992013629A1 (en) | 1991-01-31 | 1992-08-20 | Wayne State University | A method for analyzing an organic sample |
| US5866429A (en) | 1991-04-03 | 1999-02-02 | Bloch; Will | Precision and accuracy of anion-exchange separation of nucleic acids |
| US5472843A (en) | 1991-04-25 | 1995-12-05 | Gen-Probe Incorporated | Nucleic acid probes to Haemophilus influenzae |
| US5213796A (en) | 1991-05-06 | 1993-05-25 | Dana Farber Cancer Institute | Assay for polyomavirus in humans and uses thereof |
| US6055487A (en) | 1991-07-30 | 2000-04-25 | Margery; Keith S. | Interactive remote sample analysis system |
| ES2125268T3 (es) | 1991-07-31 | 1999-03-01 | Hoffmann La Roche | Metodos y reactivos para detectar bacterias en liquido cefalorraquideo. |
| DE69233285T2 (de) | 1991-08-02 | 2004-11-25 | bioMérieux B.V. | Quantifikation von Nukleinsäuren |
| PT787807E (pt) | 1991-08-27 | 2003-08-29 | Hoffmann La Roche | Iniciadores e sondas para a deteccao da hepatite c |
| AU2580892A (en) | 1991-09-05 | 1993-04-05 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Determination of oligonucleotides for therapeutics, diagnostics and research reagents |
| CA2121696C (en) | 1991-10-23 | 2003-07-08 | James R. Lupski | Fingerprinting bacterial strains using repetitive dna sequence amplification |
| FR2683827B1 (fr) | 1991-11-15 | 1994-03-04 | Institut Nal Sante Recherc Medic | Procede de determination de la quantite d'un fragment d'adn d'interet par une methode d'amplification enzymatique. |
| US5484908A (en) * | 1991-11-26 | 1996-01-16 | Gilead Sciences, Inc. | Oligonucleotides containing 5-propynyl pyrimidines |
| EP0637965B1 (en) * | 1991-11-26 | 2002-10-16 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified pyrimidines |
| TW393513B (en) * | 1991-11-26 | 2000-06-11 | Isis Pharmaceuticals Inc | Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified pyrimidines |
| US6235887B1 (en) | 1991-11-26 | 2001-05-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Enhanced triple-helix and double-helix formation directed by oligonucleotides containing modified pyrimidines |
| IL103935A0 (en) | 1991-12-04 | 1993-05-13 | Du Pont | Method for the identification of microorganisms by the utilization of directed and arbitrary dna amplification |
| EP0746857A4 (en) | 1992-03-13 | 2001-01-03 | Thermomicroscopes Corp | SCANNING PROBE MICROSCOPE |
| US5981176A (en) * | 1992-06-17 | 1999-11-09 | City Of Hope | Method of detecting and discriminating between nucleic acid sequences |
| US6303297B1 (en) | 1992-07-17 | 2001-10-16 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Database for storage and analysis of full-length sequences |
| FR2694754B1 (fr) | 1992-08-12 | 1994-09-16 | Bio Merieux | Fragments d'ADN de mycobactéries, amorces d'amplification, sondes d'hybridation, réactifs et procédé de détection de détection de mycobactéries. |
| ATE211654T1 (de) | 1992-09-16 | 2002-01-15 | Univ Tennessee Res Corp | Antigene des hybriden m-proteins und träger für gruppe a streptokokkenimpfstoff |
| WO1994009156A1 (en) | 1992-10-08 | 1994-04-28 | The Regents Of The University Of California | Pcr assays to determine the presence and concentration of a target |
| US5503980A (en) * | 1992-11-06 | 1996-04-02 | Trustees Of Boston University | Positional sequencing by hybridization |
| US6436635B1 (en) * | 1992-11-06 | 2002-08-20 | Boston University | Solid phase sequencing of double-stranded nucleic acids |
| US6372424B1 (en) * | 1995-08-30 | 2002-04-16 | Third Wave Technologies, Inc | Rapid detection and identification of pathogens |
| US5605798A (en) | 1993-01-07 | 1997-02-25 | Sequenom, Inc. | DNA diagnostic based on mass spectrometry |
| US6194144B1 (en) * | 1993-01-07 | 2001-02-27 | Sequenom, Inc. | DNA sequencing by mass spectrometry |
| ATE267877T1 (de) * | 1993-01-07 | 2004-06-15 | Sequenom Inc | Dns - sequenzierung durch massenspektronomie |
| FR2701961B1 (fr) | 1993-02-24 | 1995-04-21 | Bio Merieux | Procédé de destabilisation d'une structure secondaire intracaténaire d'un polynucléotide simple brin, et de capture dudit nucléotide. |
| JPH08507926A (ja) | 1993-03-19 | 1996-08-27 | シーケノム・インコーポレーテツド | エキソヌクレアーゼ分解を介した質量分析法によるｄｎａ配列決定 |
| US6074823A (en) * | 1993-03-19 | 2000-06-13 | Sequenom, Inc. | DNA sequencing by mass spectrometry via exonuclease degradation |
| US5639606A (en) | 1993-04-06 | 1997-06-17 | The University Of Rochester | Method for quantitative measurement of gene expression using multiplex competitive reverse transcriptase-polymerase chain reaction |
| US6323041B1 (en) | 1993-06-11 | 2001-11-27 | Pfizer Inc. | Screening novel human phosphodiesterase IV isozymes for compounds which modify their enzymatic activity |
| JPH0775585A (ja) | 1993-06-14 | 1995-03-20 | Immuno Japan:Kk | Ｃ型肝炎ウイルス関連オリゴヌクレオチドならびにｃ型肝炎 ウイルス遺伝子型判定方法 |
| US5830853A (en) | 1994-06-23 | 1998-11-03 | Astra Aktiebolag | Systemic administration of a therapeutic preparation |
| US6001584A (en) | 1993-07-19 | 1999-12-14 | The Regents Of The University Of California | Oncoprotein protein kinase |
| AU7551594A (en) | 1993-07-29 | 1995-02-28 | MURASHIGE, Kate H. | Method for recognition of the nucleotide sequence of a purified dna segment |
| GB9315847D0 (en) * | 1993-07-30 | 1993-09-15 | Isis Innovation | Tag reagent and assay method |
| US5527675A (en) * | 1993-08-20 | 1996-06-18 | Millipore Corporation | Method for degradation and sequencing of polymers which sequentially eliminate terminal residues |
| AU7679394A (en) | 1993-09-03 | 1995-03-22 | Duke University | A method of nucleic acid sequencing |
| US6376178B1 (en) * | 1993-09-03 | 2002-04-23 | Duke University | Method of nucleic acid sequencing |
| US5484909A (en) * | 1993-09-10 | 1996-01-16 | Amoco Corporation | Nucleic acid probes for the detection of bacteria of the genera Pediococcus and Lactobacillus and methods for the detection of the bacterial agents causing spoilage of beer |
| US5502177A (en) * | 1993-09-17 | 1996-03-26 | Gilead Sciences, Inc. | Pyrimidine derivatives for labeled binding partners |
| WO1995011996A1 (en) | 1993-10-27 | 1995-05-04 | Cornell Research Foundation, Inc. | Detection assay for listeria and erwinia microorganisms |
| US5504327A (en) | 1993-11-04 | 1996-04-02 | Hv Ops, Inc. (H-Nu) | Electrospray ionization source and method for mass spectrometric analysis |
| DE4338119A1 (de) | 1993-11-08 | 1995-05-11 | Bayer Ag | Spezifische Gensonden und Verfahren zum quantitativen Nachweis von methicillinresistenten Staphylococcen |
| NL9301957A (nl) | 1993-11-11 | 1995-06-01 | U Gene Research Bv | Werkwijze voor het identificeren van micro-organismen, en daarvoor bruikbare hulpmiddelen. |
| US5928905A (en) | 1995-04-18 | 1999-07-27 | Glaxo Group Limited | End-complementary polymerase reaction |
| JP3396942B2 (ja) | 1994-02-21 | 2003-04-14 | 三菱化学株式会社 | 芳香族ポリカーボネートの製造方法 |
| US5849492A (en) | 1994-02-28 | 1998-12-15 | Phylogenetix Laboratories, Inc. | Method for rapid identification of prokaryotic and eukaryotic organisms |
| DE4444229C2 (de) | 1994-03-10 | 1996-07-25 | Bruker Franzen Analytik Gmbh | Verfahren und Vorrichtungen zur Elektrosprüh-Ionisierung für speichernde Massenspektometer |
| US5608217A (en) | 1994-03-10 | 1997-03-04 | Bruker-Franzen Analytik Gmbh | Electrospraying method for mass spectrometric analysis |
| US5976798A (en) | 1994-03-30 | 1999-11-02 | Mitokor | Methods for detecting mitochondrial mutations diagnostic for Alzheimer's disease and methods for determining heteroplasmy of mitochondrial nucleic acid |
| AU7242994A (en) | 1994-05-20 | 1995-12-18 | United States Of America, As Represented By The Secretary Of The Army, The | Model for testing immunogenicity of peptides |
| US5814442A (en) | 1994-06-10 | 1998-09-29 | Georgetown University | Internally controlled virion nucleic acid amplification reaction for quantitation of virion and virion nucleic acid |
| DE4421901A1 (de) | 1994-06-23 | 1996-01-04 | Bayer Ag | Ein DNA-Schnelltest zum Nachweis von chinolonresistenten Staphylococcus aureus Erregern in klinischem Probenmaterial |
| US5541405A (en) | 1994-07-27 | 1996-07-30 | Parker-Hannifin Corporation | Method and device for continuous pattern sensing using fiber optics |
| GB9417211D0 (en) | 1994-08-25 | 1994-10-12 | Solicitor For The Affairs Of H | Nucleotide sequencing method |
| US6001564A (en) | 1994-09-12 | 1999-12-14 | Infectio Diagnostic, Inc. | Species specific and universal DNA probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial pathogens and associated antibiotic resistance genes from clinical specimens for routine diagnosis in microbiology laboratories |
| US20020055101A1 (en) | 1995-09-11 | 2002-05-09 | Michel G. Bergeron | Specific and universal probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial pathogens and antibiotic resistance genes from clinical specimens for routine diagnosis in microbiology laboratories |
| CA2118048C (en) | 1994-09-30 | 2003-04-08 | James W. Schumm | Multiplex amplification of short tandem repeat loci |
| US5753489A (en) | 1994-11-10 | 1998-05-19 | Immuno Ag | Method for producing viruses and vaccines in serum-free culture |
| US5654141A (en) | 1994-11-18 | 1997-08-05 | Thomas Jefferson University | Amplification based detection of bacterial infection |
| KR100399813B1 (ko) | 1994-12-14 | 2004-06-09 | 가부시키가이샤 니콘 | 노광장치 |
| US6180339B1 (en) | 1995-01-13 | 2001-01-30 | Bayer Corporation | Nucleic acid probes for the detection and identification of fungi |
| US5763169A (en) | 1995-01-13 | 1998-06-09 | Chiron Diagnostics Corporation | Nucleic acid probes for the detection and identification of fungi |
| US5707802A (en) | 1995-01-13 | 1998-01-13 | Ciba Corning Diagnostics Corp. | Nucleic acid probes for the detection and identification of fungi |
| US5702895A (en) | 1995-01-19 | 1997-12-30 | Wakunaga Seiyaku Kabushiki Kaisha | Method and kit for detecting methicillin-resistant Staphylococcus aureus |
| US5484808A (en) | 1995-02-09 | 1996-01-16 | Eli Lilly And Company | Methods of inhibiting cell-cell adhesion |
| GB9504598D0 (en) * | 1995-03-03 | 1995-04-26 | Imp Cancer Res Tech | Method of nucleic acid analysis |
| US6428955B1 (en) * | 1995-03-17 | 2002-08-06 | Sequenom, Inc. | DNA diagnostics based on mass spectrometry |
| JPH11503611A (ja) | 1995-04-11 | 1999-03-30 | トラスティーズ・オブ・ボストン・ユニバーシティ | 生体高分子の固相配列決定法 |
| US5932220A (en) | 1995-05-08 | 1999-08-03 | Board Of Regents University Of Texas System | Diagnostic tests for a new spirochete, Borrelia lonestari sp. nov. |
| US5625184A (en) * | 1995-05-19 | 1997-04-29 | Perseptive Biosystems, Inc. | Time-of-flight mass spectrometry analysis of biomolecules |
| US5830655A (en) * | 1995-05-22 | 1998-11-03 | Sri International | Oligonucleotide sizing using cleavable primers |
| US5700642A (en) | 1995-05-22 | 1997-12-23 | Sri International | Oligonucleotide sizing using immobilized cleavable primers |
| US5630653A (en) * | 1995-06-02 | 1997-05-20 | Polka; John G. | Wheel cover mounting bracket |
| EP0837933A4 (en) | 1995-06-07 | 2003-05-21 | Commw Scient Ind Res Org | OPTIMIZED MINIZYMES AND MINIRIBOZYMES AND THE USE THEREOF |
| US5856174A (en) | 1995-06-29 | 1999-01-05 | Affymetrix, Inc. | Integrated nucleic acid diagnostic device |
| US6218529B1 (en) | 1995-07-31 | 2001-04-17 | Urocor, Inc. | Biomarkers and targets for diagnosis, prognosis and management of prostate, breast and bladder cancer |
| US6146854A (en) | 1995-08-31 | 2000-11-14 | Sequenom, Inc. | Filtration processes, kits and devices for isolating plasmids |
| US5994066A (en) | 1995-09-11 | 1999-11-30 | Infectio Diagnostic, Inc. | Species-specific and universal DNA probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial pathogens and associated antibiotic resistance genes from clinical specimens for routine diagnosis in microbiology laboratories |
| US5869242A (en) * | 1995-09-18 | 1999-02-09 | Myriad Genetics, Inc. | Mass spectrometry to assess DNA sequence polymorphisms |
| US5727202A (en) | 1995-10-18 | 1998-03-10 | Palm Computing, Inc. | Method and apparatus for synchronizing information on two different computer systems |
| US5871697A (en) * | 1995-10-24 | 1999-02-16 | Curagen Corporation | Method and apparatus for identifying, classifying, or quantifying DNA sequences in a sample without sequencing |
| US5972693A (en) | 1995-10-24 | 1999-10-26 | Curagen Corporation | Apparatus for identifying, classifying, or quantifying DNA sequences in a sample without sequencing |
| US5716825A (en) * | 1995-11-01 | 1998-02-10 | Hewlett Packard Company | Integrated nucleic acid analysis system for MALDI-TOF MS |
| US6312893B1 (en) * | 1996-01-23 | 2001-11-06 | Qiagen Genomics, Inc. | Methods and compositions for determining the sequence of nucleic acid molecules |
| GB9602028D0 (en) | 1996-02-01 | 1996-04-03 | Amersham Int Plc | Nucleoside analogues |
| US6852487B1 (en) | 1996-02-09 | 2005-02-08 | Cornell Research Foundation, Inc. | Detection of nucleic acid sequence differences using the ligase detection reaction with addressable arrays |
| CA2248084A1 (en) * | 1996-03-04 | 1997-09-12 | Genetrace Systems, Inc. | Methods of screening nucleic acids using mass spectrometry |
| AU2217597A (en) | 1996-03-18 | 1997-10-22 | Sequenom, Inc. | Dna sequencing by mass spectrometry |
| DE69718752T2 (de) | 1996-03-20 | 2003-12-24 | Bio Merieux, Marcy L'etoile | Isolierung von nukleinsäure |
| JP3365198B2 (ja) | 1996-03-21 | 2003-01-08 | ミノルタ株式会社 | 画像形成装置 |
| US5745751A (en) | 1996-04-12 | 1998-04-28 | Nelson; Robert W. | Civil site information system |
| US6214555B1 (en) | 1996-05-01 | 2001-04-10 | Visible Genetics Inc. | Method compositions and kit for detection |
| US5928906A (en) * | 1996-05-09 | 1999-07-27 | Sequenom, Inc. | Process for direct sequencing during template amplification |
| CA2257866A1 (en) | 1996-06-10 | 1997-12-18 | University Of Utah Research Foundation | Rapid, accurate identification of dna sequence variants by electrospray mass spectrometry |
| AU4042597A (en) | 1996-07-19 | 1998-02-10 | Hybridon, Inc. | Method for sequencing nucleic acids using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry |
| US6563025B1 (en) | 1996-07-26 | 2003-05-13 | Board Of Trustees Of The University Of Illinois | Nucleotide sequences encoding anthranilate synthase |
| US5831046A (en) | 1996-08-05 | 1998-11-03 | Prolinx, Incorporated | Boronic acid-contaning nucleic acid monomers |
| DE19633436A1 (de) * | 1996-08-20 | 1998-02-26 | Boehringer Mannheim Gmbh | Verfahren zum Nachweis von Nukleinsäuren unter Ermittlung der Masse |
| US5777324A (en) * | 1996-09-19 | 1998-07-07 | Sequenom, Inc. | Method and apparatus for maldi analysis |
| US5965363A (en) * | 1996-09-19 | 1999-10-12 | Genetrace Systems Inc. | Methods of preparing nucleic acids for mass spectrometric analysis |
| AU4591697A (en) | 1996-09-19 | 1998-04-14 | Genetrace Systems, Inc. | Methods of preparing nucleic acids for mass spectrometric analysis |
| US6361940B1 (en) * | 1996-09-24 | 2002-03-26 | Qiagen Genomics, Inc. | Compositions and methods for enhancing hybridization and priming specificity |
| US5864137A (en) * | 1996-10-01 | 1999-01-26 | Genetrace Systems, Inc. | Mass spectrometer |
| GB9620769D0 (en) | 1996-10-04 | 1996-11-20 | Brax Genomics Ltd | Nucleic acid sequencing |
| US5885775A (en) | 1996-10-04 | 1999-03-23 | Perseptive Biosystems, Inc. | Methods for determining sequences information in polynucleotides using mass spectrometry |
| US6110710A (en) | 1996-10-15 | 2000-08-29 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services | Sequence modification of oligonucleotide primers to manipulate non-templated nucleotide addition |
| US6140053A (en) * | 1996-11-06 | 2000-10-31 | Sequenom, Inc. | DNA sequencing by mass spectrometry via exonuclease degradation |
| US20030129589A1 (en) | 1996-11-06 | 2003-07-10 | Hubert Koster | Dna diagnostics based on mass spectrometry |
| US5900481A (en) | 1996-11-06 | 1999-05-04 | Sequenom, Inc. | Bead linkers for immobilizing nucleic acids to solid supports |
| US6024925A (en) | 1997-01-23 | 2000-02-15 | Sequenom, Inc. | Systems and methods for preparing low volume analyte array elements |
| US6133436A (en) | 1996-11-06 | 2000-10-17 | Sequenom, Inc. | Beads bound to a solid support and to nucleic acids |
| DE19782096T1 (de) | 1996-11-06 | 2000-03-23 | Sequenom Inc | Immobiliserung von Nucleinsäuren in hoher Dichte |
| US7285422B1 (en) | 1997-01-23 | 2007-10-23 | Sequenom, Inc. | Systems and methods for preparing and analyzing low volume analyte array elements |
| WO1998021066A1 (de) | 1996-11-12 | 1998-05-22 | Hp-Chemie Pelzer Research And Development Ltd. | Wiederverwertbares teppichbodenformteil |
| US6060246A (en) | 1996-11-15 | 2000-05-09 | Avi Biopharma, Inc. | Reagent and method for isolation and detection of selected nucleic acid sequences |
| CA2273097A1 (en) | 1996-11-28 | 1998-06-04 | New Japan Chemical Co., Ltd. | Sugar compounds, gelling agents, gelling agent compositions, processes for the preparation of them, and gel compositions |
| US5822824A (en) | 1996-12-03 | 1998-10-20 | Dion; William D. | Mountable washing device |
| JP2001524808A (ja) | 1996-12-10 | 2001-12-04 | ジーントレイス・システムズ・インコーポレイテッド | 放出可能な不揮発性の質量標識分子 |
| US5981190A (en) | 1997-01-08 | 1999-11-09 | Ontogeny, Inc. | Analysis of gene expression, methods and reagents therefor |
| US6046005A (en) * | 1997-01-15 | 2000-04-04 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Nucleic acid sequencing with solid phase capturable terminators comprising a cleavable linking group |
| US5876936A (en) * | 1997-01-15 | 1999-03-02 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Nucleic acid sequencing with solid phase capturable terminators |
| JP3884087B2 (ja) | 1997-01-15 | 2007-02-21 | イクスツィリオン ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング ウント コンパニー コマンディトゲゼルシャフト | 質量標識結合ハイブリダイゼーションプローブ |
| WO1998035057A1 (en) | 1997-02-06 | 1998-08-13 | The National University Of Singapore | Diagnosis of plasmodium infection by analysis of extrachromosomal genetic material |
| US5858062A (en) * | 1997-02-10 | 1999-01-12 | Litton Systems, Inc. | Oxygen concentrator |
| US6727061B2 (en) | 1997-02-20 | 2004-04-27 | Cabtec, Inc. | Methods for identifying species or Shigella and E. coli using operon sequence analysis |
| US5828062A (en) | 1997-03-03 | 1998-10-27 | Waters Investments Limited | Ionization electrospray apparatus for mass spectrometry |
| US6553317B1 (en) | 1997-03-05 | 2003-04-22 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Relational database and system for storing information relating to biomolecular sequences and reagents |
| DE19710166C1 (de) | 1997-03-12 | 1998-12-10 | Bruker Franzen Analytik Gmbh | Zwei-Schritt-Verfahren der DNA-Amplifikation für MALDI-TOF-Messungen |
| AU6553498A (en) | 1997-03-14 | 1998-09-29 | Hybridon, Inc. | Method for sequencing of modified nucleic acids using electrospray ionization-fourier transform mass spectrometry |
| US5849497A (en) | 1997-04-03 | 1998-12-15 | The Research Foundation Of State University Of New York | Specific inhibition of the polymerase chain reaction using a non-extendable oligonucleotide blocker |
| US6018713A (en) | 1997-04-09 | 2000-01-25 | Coli; Robert D. | Integrated system and method for ordering and cumulative results reporting of medical tests |
| DE19717085C2 (de) | 1997-04-23 | 1999-06-17 | Bruker Daltonik Gmbh | Verfahren und Geräte für extrem schnelle DNA-Vervielfachung durch Polymerase-Kettenreaktionen (PCR) |
| US20010039263A1 (en) | 1997-05-02 | 2001-11-08 | Max-Delbruck-Centrum Fur Molekulare Medizin | Chimeric oligonucleotides and the use thereof |
| US6054278A (en) * | 1997-05-05 | 2000-04-25 | The Perkin-Elmer Corporation | Ribosomal RNA gene polymorphism based microorganism identification |
| WO1998054571A1 (en) | 1997-05-28 | 1998-12-03 | The Walter And Eliza Hall Institute Of Medical Research | Nucleic acid diagnostics based on mass spectrometry or mass separation and base specific cleavage |
| US6159681A (en) | 1997-05-28 | 2000-12-12 | Syntrix Biochip, Inc. | Light-mediated method and apparatus for the regional analysis of biologic material |
| WO1998054751A1 (en) | 1997-05-30 | 1998-12-03 | Genetrace Systems, Inc. | Volatile matrices for matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry |
| US6061686A (en) | 1997-06-26 | 2000-05-09 | Digital Equipment Corporation | Updating a copy of a remote document stored in a local computer system |
| PT990047E (pt) | 1997-07-22 | 2003-10-31 | Qiagen Genomics Inc | Metodos e composicoes para a analise de acidos nucleicos por espectroscopia de massa. |
| DE19732086C2 (de) | 1997-07-25 | 2002-11-21 | Univ Leipzig | Verfahren zur quantitativen Bestimmung von Eubakterien |
| US6207370B1 (en) | 1997-09-02 | 2001-03-27 | Sequenom, Inc. | Diagnostics based on mass spectrometric detection of translated target polypeptides |
| GB9719044D0 (en) | 1997-09-08 | 1997-11-12 | Inst Of Ophthalmology | Assay |
| US6090558A (en) * | 1997-09-19 | 2000-07-18 | Genetrace Systems, Inc. | DNA typing by mass spectrometry with polymorphic DNA repeat markers |
| US6063031A (en) | 1997-10-14 | 2000-05-16 | Assurance Medical, Inc. | Diagnosis and treatment of tissue with instruments |
| US6111096A (en) | 1997-10-31 | 2000-08-29 | Bbi Bioseq, Inc. | Nucleic acid isolation and purification |
| JP3423597B2 (ja) | 1997-11-05 | 2003-07-07 | 三井農林株式会社 | 細菌の同定方法 |
| US6028183A (en) * | 1997-11-07 | 2000-02-22 | Gilead Sciences, Inc. | Pyrimidine derivatives and oligonucleotides containing same |
| US6007992A (en) | 1997-11-10 | 1999-12-28 | Gilead Sciences, Inc. | Pyrimidine derivatives for labeled binding partners |
| DE59804008D1 (de) | 1997-12-05 | 2002-06-06 | Max Planck Gesellschaft | Verfahren zur identifikation von nucleinsäuren durch matrix-assistierte laser desorptions/ionisations massenspektrometrie |
| US6914137B2 (en) | 1997-12-06 | 2005-07-05 | Dna Research Innovations Limited | Isolation of nucleic acids |
| US6268131B1 (en) * | 1997-12-15 | 2001-07-31 | Sequenom, Inc. | Mass spectrometric methods for sequencing nucleic acids |
| US20030096232A1 (en) | 1997-12-19 | 2003-05-22 | Kris Richard M. | High throughput assay system |
| US6458533B1 (en) * | 1997-12-19 | 2002-10-01 | High Throughput Genomics, Inc. | High throughput assay system for monitoring ESTs |
| GB9815166D0 (en) * | 1998-07-13 | 1998-09-09 | Brax Genomics Ltd | Compounds for mass spectrometry |
| JP3793342B2 (ja) | 1997-12-26 | 2006-07-05 | ソニーケミカル株式会社 | アクリル系エマルジョン、及び粘着テープ |
| DE19802905C2 (de) | 1998-01-27 | 2001-11-08 | Bruker Daltonik Gmbh | Verfahren zur bevorzugten Herstellung nur eines Stranges selektierten Genmaterials für massenspektrometrische Messungen |
| US6428956B1 (en) | 1998-03-02 | 2002-08-06 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Mass spectrometric methods for biomolecular screening |
| JP2002505866A (ja) * | 1998-03-10 | 2002-02-26 | ラージ・スケール・プローティオーミックス・コーポレイション | 微生物の検出および特性付与 |
| US6391551B1 (en) * | 1998-03-13 | 2002-05-21 | Promega Corporation | Detection of nucleic acid hybrids |
| US6270974B1 (en) * | 1998-03-13 | 2001-08-07 | Promega Corporation | Exogenous nucleic acid detection |
| US6312902B1 (en) * | 1998-03-13 | 2001-11-06 | Promega Corporation | Nucleic acid detection |
| US6270973B1 (en) * | 1998-03-13 | 2001-08-07 | Promega Corporation | Multiplex method for nucleic acid detection |
| US6268146B1 (en) * | 1998-03-13 | 2001-07-31 | Promega Corporation | Analytical methods and materials for nucleic acid detection |
| US6277578B1 (en) * | 1998-03-13 | 2001-08-21 | Promega Corporation | Deploymerization method for nucleic acid detection of an amplified nucleic acid target |
| US6235480B1 (en) * | 1998-03-13 | 2001-05-22 | Promega Corporation | Detection of nucleic acid hybrids |
| US6261769B1 (en) | 1998-03-31 | 2001-07-17 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture | Intergenic spacer target sequence for detecting and distinguishing Chlamydial species or strains |
| US20030228597A1 (en) | 1998-04-13 | 2003-12-11 | Cowsert Lex M. | Identification of genetic targets for modulation by oligonucleotides and generation of oligonucleotides for gene modulation |
| US7321828B2 (en) | 1998-04-13 | 2008-01-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | System of components for preparing oligonucleotides |
| US6223186B1 (en) | 1998-05-04 | 2001-04-24 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | System and method for a precompiled database for biomolecular sequence information |
| US6723564B2 (en) * | 1998-05-07 | 2004-04-20 | Sequenom, Inc. | IR MALDI mass spectrometry of nucleic acids using liquid matrices |
| US6221587B1 (en) | 1998-05-12 | 2001-04-24 | Isis Pharmceuticals, Inc. | Identification of molecular interaction sites in RNA for novel drug discovery |
| DE19822108A1 (de) | 1998-05-12 | 2000-02-03 | Schering Ag | Verfahren zur Detektion von Mikroorganismen in Produkten, insbesondere in Arzneimitteln und Kosmetika |
| DE19922161A1 (de) | 1998-05-18 | 1999-12-09 | Fraunhofer Ges Forschung | Anti-Haft-Beschichtung und Verfahren zu ihrer Herstellung |
| US6468743B1 (en) | 1998-05-18 | 2002-10-22 | Conagra Grocery Products Company | PCR techniques for detecting microbial contaminants in foodstuffs |
| US6104028A (en) * | 1998-05-29 | 2000-08-15 | Genetrace Systems Inc. | Volatile matrices for matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry |
| DE19824280B4 (de) | 1998-05-29 | 2004-08-19 | Bruker Daltonik Gmbh | Mutationsanalyse mittels Massenspektrometrie |
| GB2339905A (en) | 1998-06-24 | 2000-02-09 | Bruker Daltonik Gmbh | Use of mass-specrometry for detection of mutations |
| ATE440963T1 (de) | 1998-07-02 | 2009-09-15 | Gen Probe Inc | Molekulare fackeln |
| US6218118B1 (en) * | 1998-07-09 | 2001-04-17 | Agilent Technologies, Inc. | Method and mixture reagents for analyzing the nucleotide sequence of nucleic acids by mass spectrometry |
| US6074831A (en) | 1998-07-09 | 2000-06-13 | Agilent Technologies, Inc. | Partitioning of polymorphic DNAs |
| US6432651B1 (en) * | 1998-07-10 | 2002-08-13 | Cetek Corporation | Method to detect and analyze tight-binding ligands in complex biological samples using capillary electrophoresis and mass spectrometry |
| US6605433B1 (en) | 1998-08-20 | 2003-08-12 | The Johns Hopkins University | Mitochondrial dosimeter |
| US6146144A (en) * | 1998-09-29 | 2000-11-14 | Fowler; Ernest R. | Rug hooking kit and method for handicapped |
| US6610492B1 (en) | 1998-10-01 | 2003-08-26 | Variagenics, Inc. | Base-modified nucleotides and cleavage of polynucleotides incorporating them |
| AU6412799A (en) * | 1998-10-05 | 2000-04-26 | Mosaic Technologies | Reverse displacement assay for detection of nucleic acid sequences |
| IT1303330B1 (it) | 1998-11-05 | 2000-11-06 | Ilpea Ind Spa | Guarnizione per frogoriferi con controporta sagomata. |
| DE19852167C2 (de) | 1998-11-12 | 2000-12-14 | Bruker Saxonia Analytik Gmbh | Einfache SNP-Analyse mittels Massenspektrometrie |
| JP2002537761A (ja) | 1998-11-24 | 2002-11-12 | リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ ミネソタ | トランスジェニック循環内皮細胞 |
| US6994962B1 (en) | 1998-12-09 | 2006-02-07 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods of identifying point mutations in a genome |
| DE19859723A1 (de) | 1998-12-23 | 2000-06-29 | Henkel Kgaa | Mittel zum Färben von keratinhaltigen Fasern |
| US6503718B2 (en) | 1999-01-10 | 2003-01-07 | Exact Sciences Corporation | Methods for detecting mutations using primer extension for detecting disease |
| US6638714B1 (en) | 1999-02-03 | 2003-10-28 | Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. | Oligonucleotide primers for efficient detection of hepatitis C virus (HCV) and methods of use thereof |
| US6153389A (en) * | 1999-02-22 | 2000-11-28 | Haarer; Brian K. | DNA additives as a mechanism for unambiguously marking biological samples |
| EP1035219A1 (en) | 1999-02-25 | 2000-09-13 | Universiteit Gent | Gastric helicobacter 16 S rDNA sequences from cattle and pigs and their use for detection and typing of Helicobacter strains |
| DE19910592A1 (de) | 1999-03-10 | 2000-09-14 | Volkswagen Ag | Rückhaltevorrichtung |
| US6436640B1 (en) * | 1999-03-18 | 2002-08-20 | Exiqon A/S | Use of LNA in mass spectrometry |
| US6613509B1 (en) * | 1999-03-22 | 2003-09-02 | Regents Of The University Of California | Determination of base (nucleotide) composition in DNA oligomers by mass spectrometry |
| CA2370656A1 (en) | 1999-04-21 | 2000-10-26 | Mitchell T. Gore | Magnetic dna extraction kit for plants |
| US6140067A (en) | 1999-04-30 | 2000-10-31 | Mitokor | Indicators of altered mitochondrial function in predictive methods for determining risk of type 2 diabetes mellitus |
| US6649351B2 (en) * | 1999-04-30 | 2003-11-18 | Aclara Biosciences, Inc. | Methods for detecting a plurality of analytes by mass spectrometry |
| AU778230B2 (en) | 1999-05-03 | 2004-11-25 | Gen-Probe Incorporated | Polynucleotide matrix-based method of identifying microorganisms |
| US20020086289A1 (en) | 1999-06-15 | 2002-07-04 | Don Straus | Genomic profiling: a rapid method for testing a complex biological sample for the presence of many types of organisms |
| MXPA02000192A (es) | 1999-06-30 | 2004-08-12 | Corixa Corp | Composiciones y metodos para la terapia y diagnostico de cancer de pulmon. |
| AU5371099A (en) | 1999-07-22 | 2001-02-13 | Artus Gesellschaft Fur Molekularbiologische Diagnostik Und Entwicklung Mbh | Method for the species-specific detection of organisms |
| US6723505B1 (en) | 1999-08-13 | 2004-04-20 | Nye Colifast As | Method for identification of the indicators of contamination in liquid samples |
| US6266144B1 (en) | 1999-08-26 | 2001-07-24 | Taiwan Semiconductor Manufacturing Company | Stepper and scanner new exposure sequence with intra-field correction |
| DE19943374A1 (de) | 1999-09-10 | 2001-03-29 | Max Planck Gesellschaft | Verfahren zum Anbinden von Nukleinsäuren an eine Festphase |
| US7005274B1 (en) | 1999-09-15 | 2006-02-28 | Migenix Corp. | Methods and compositions for diagnosing and treating arthritic disorders and regulating bone mass |
| WO2001023608A2 (en) | 1999-09-27 | 2001-04-05 | Merck Sharp & Dohme De Espana, S.A.E. | Hybridization probes which specifically detect strains of the genera microbispora, microtetraspora, nonomuria and planobispora |
| EP2322666A3 (en) | 1999-09-28 | 2011-08-10 | Geneohm Sciences Canada, Inc. | Highly conserved gene and its use to generate species-specific, genus-specific, family-specific, group-specific and universal nucleic acid probes for microorganisms. |
| US6296188B1 (en) | 1999-10-01 | 2001-10-02 | Perfect Plastic Printing Corporation | Transparent/translucent financial transaction card including an infrared light filter |
| CA2387035A1 (en) * | 1999-10-13 | 2001-04-19 | Sequenom, Inc. | Methods for generating databases and databases for identifying polymorphic genetic markers |
| US6787302B2 (en) | 1999-10-25 | 2004-09-07 | Genprime, Inc. | Method and apparatus for prokaryotic and eukaryotic cell quantitation |
| EP1228244A4 (en) | 1999-11-04 | 2005-02-09 | California Inst Of Techn | METHODS AND DEVICES FOR ANALYZING POLYNUCLEOTIDE SEQUENCES |
| US6286146B1 (en) | 1999-11-15 | 2001-09-11 | Debra Rocker | Method of wearing weighted training vest while listening to audio equipment |
| US6856914B1 (en) | 1999-11-19 | 2005-02-15 | The University Of British Columbia | Method, apparatus, media and signals for identifying associated cell signaling proteins |
| EP1268764A2 (fr) | 1999-11-29 | 2003-01-02 | Aventis Pharma S.A. | Procede d'obtention d'acides nucleiques a partir d'un echantillon de l'environnement |
| US6608190B1 (en) * | 1999-12-16 | 2003-08-19 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Nucleic acid fragments for the identification of bacteria in industrial wastewater bioreactors |
| US6936414B2 (en) | 1999-12-22 | 2005-08-30 | Abbott Laboratories | Nucleic acid isolation method and kit |
| AU3246601A (en) * | 1999-12-29 | 2001-07-16 | Keygene N.V. | Method for generating oligonucleotides, in particular for the detection of amplified restriction fragments obtained using AFLP |
| SE0000061D0 (sv) | 2000-01-10 | 2000-01-10 | Bjoern Herrmann | A method for detection of pathogenic organisms |
| WO2001051661A2 (en) * | 2000-01-13 | 2001-07-19 | Amsterdam Support Diagnostics B.V. | A universal nucleic acid amplification system for nucleic acids in a sample |
| AU2001228223A1 (en) | 2000-01-24 | 2001-07-31 | Sanjay Chadha | Hand-held personal computing device with microdisplay |
| US20020009727A1 (en) | 2000-02-02 | 2002-01-24 | Schultz Gary A. | Detection of single nucleotide polymorphisms |
| CA2298181C (en) | 2000-02-02 | 2006-09-19 | Dayan Burke Goodnough | Non-targeted complex sample analysis |
| US6453244B1 (en) | 2000-02-10 | 2002-09-17 | Stanford University | Detection of polymorphisms by denaturing high-performance liquid chromatography |
| RU2286711C2 (ru) | 2000-02-14 | 2006-11-10 | Фёрст Опинион Корпорэйшн | Система и способ автоматической диагностики |
| US6393367B1 (en) | 2000-02-19 | 2002-05-21 | Proteometrics, Llc | Method for evaluating the quality of comparisons between experimental and theoretical mass data |
| DE10015797B4 (de) | 2000-03-26 | 2006-02-02 | Bruker Daltonik Gmbh | Multiplex-Analyse von DNA-Gemischen mittels photolytisch ablesbarer DNA-Chips |
| DE10015262A1 (de) | 2000-03-28 | 2001-10-04 | Basf Ag | Papierstreichmassen, enthaltend Bindemittel mit Makromonomeren |
| US6713258B2 (en) | 2000-03-29 | 2004-03-30 | Center For The Application Of Molecular Biology To International Agriculture (Cambia) | Methods for genotyping by hybridization analysis |
| EP1313879A2 (en) | 2000-04-10 | 2003-05-28 | Matthew Ashby | Methods for the survey and genetic analysis of populations |
| US6475736B1 (en) * | 2000-05-23 | 2002-11-05 | Variagenics, Inc. | Methods for genetic analysis of DNA using biased amplification of polymorphic sites |
| US6716634B1 (en) | 2000-05-31 | 2004-04-06 | Agilent Technologies, Inc. | Increasing ionization efficiency in mass spectrometry |
| US6507837B1 (en) | 2000-06-08 | 2003-01-14 | Hyperphrase Technologies, Llc | Tiered and content based database searching |
| US20020177552A1 (en) | 2000-06-09 | 2002-11-28 | Corixa Corporation | Compositions and methods for the therapy and diagnosis of colon cancer |
| EP1373561B1 (en) * | 2000-06-13 | 2009-02-18 | The Trustees of Boston University | Use of mass-matched nucleotides in the analysis of oligonucleotide mixtures and in highly multiplexed nucleic acid sequencing |
| EP1170379A1 (en) * | 2000-06-30 | 2002-01-09 | Centre National de Genotypage | Sample generation for genotyping by mass spectrometry |
| FR2811321A1 (fr) | 2000-07-04 | 2002-01-11 | Bio Merieux | Amplificateur d'une region ribonucleique cible d'un arn ribosomal 16s ou adn pour un tel arn d'une espece eubacterienne et detection de telles especes |
| US6504021B2 (en) | 2000-07-05 | 2003-01-07 | Edge Biosystems, Inc. | Ion exchange method for DNA purification |
| BR0112163A (pt) | 2000-07-06 | 2004-02-10 | Bio Merieux | Processos de controle da qualidade microbiológica de um meio aquoso ambiental, kit de detecção microbiológica de um microorganismo presente em uma amostra e processo de produção e/ou desinfecção de um lìquido |
| US6783939B2 (en) | 2000-07-07 | 2004-08-31 | Alphavax, Inc. | Alphavirus vectors and virosomes with modified HIV genes for use in vaccines |
| US6811977B2 (en) * | 2000-07-27 | 2004-11-02 | California Institute Of Technology | Rapid, quantitative method for the mass spectrometric analysis of nucleic acids for gene expression and genotyping |
| AUPQ909000A0 (en) | 2000-07-28 | 2000-08-24 | University Of Sydney, The | A method of detecting microorganisms |
| GB0021286D0 (en) | 2000-08-30 | 2000-10-18 | Gemini Genomics Ab | Identification of drug metabolic capacity |
| US20030190635A1 (en) | 2002-02-20 | 2003-10-09 | Mcswiggen James A. | RNA interference mediated treatment of Alzheimer's disease using short interfering RNA |
| US20040005555A1 (en) * | 2000-08-31 | 2004-01-08 | Rothman Richard E. | Molecular diagnosis of bactermia |
| US20020120408A1 (en) * | 2000-09-06 | 2002-08-29 | Kreiswirth Barry N. | System and method for tracking and controlling infections |
| US7349808B1 (en) | 2000-09-06 | 2008-03-25 | Egenomics, Inc. | System and method for tracking and controlling infections |
| US6813615B1 (en) | 2000-09-06 | 2004-11-02 | Cellomics, Inc. | Method and system for interpreting and validating experimental data with automated reasoning |
| AU2001288762A1 (en) | 2000-09-08 | 2002-03-22 | Large Scale Proteomics Corporation | Detection and characterization of microorganisms |
| SE0003286D0 (sv) | 2000-09-15 | 2000-09-15 | Ulf Gyllensten | Method and kit for human identification |
| AU2356002A (en) | 2000-09-25 | 2002-04-02 | Polymun Scient Immunbio Forsch | Live vaccine and method of manufacture |
| AU2001296650A1 (en) | 2000-10-05 | 2002-04-15 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Seven-transmembrane (7tm) receptors and uses thereof |
| US6996472B2 (en) | 2000-10-10 | 2006-02-07 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Drift compensation method for fingerprint spectra |
| WO2002031747A1 (en) | 2000-10-13 | 2002-04-18 | Irm Llc | High throughput processing system and method of using |
| CA2426824A1 (en) | 2000-10-24 | 2002-07-25 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Direct multiplex characterization of genomic dna |
| US6906316B2 (en) | 2000-10-27 | 2005-06-14 | Fuji Electric Co., Ltd. | Semiconductor device module |
| US6682889B1 (en) * | 2000-11-08 | 2004-01-27 | Becton, Dickinson And Company | Amplification and detection of organisms of the Chlamydiaceae family |
| JPWO2002050307A1 (ja) | 2000-12-12 | 2004-04-22 | 中外製薬株式会社 | 質量分析を利用してｄｎａの多型を検出する方法 |
| US6800289B2 (en) | 2000-12-21 | 2004-10-05 | Her Majesty The Queen In Right Of Canada, As Represented By The Minister Of National Defence | Strain of the western equine encephalitis virus |
| US6586584B2 (en) | 2001-01-29 | 2003-07-01 | Becton, Dickinson And Company | Sequences and methods for detection of Hepatitis C virus |
| DE10108453B4 (de) | 2001-02-22 | 2005-10-20 | Bruker Daltonik Gmbh | Massenspektrometrische Mutationsanalyse mit photolytisch spaltbaren Primern |
| AU2002237124B2 (en) | 2001-02-28 | 2008-03-06 | Chondrogene Inc. | Compositions and methods relating to osteoarthritis |
| AU2002305941A1 (en) | 2001-03-01 | 2002-09-19 | The Johns Hopkins University | Quantitative assay for the simultaneous detection and speciation of bacterial infections |
| US7666588B2 (en) | 2001-03-02 | 2010-02-23 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid forensic analysis of mitochondrial DNA and characterization of mitochondrial DNA heteroplasmy |
| US7718354B2 (en) | 2001-03-02 | 2010-05-18 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid identification of pathogens in humans and animals |
| US20040121313A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Methods for rapid detection and identification of bioagents in organs for transplantation |
| US7226739B2 (en) | 2001-03-02 | 2007-06-05 | Isis Pharmaceuticals, Inc | Methods for rapid detection and identification of bioagents in epidemiological and forensic investigations |
| US20030027135A1 (en) | 2001-03-02 | 2003-02-06 | Ecker David J. | Method for rapid detection and identification of bioagents |
| US20040121314A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Methods for rapid detection and identification of bioagents in containers |
| US20040121310A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Methods for rapid detection and identification of bioagents in forensic studies |
| AU2003298030B2 (en) | 2001-03-02 | 2009-12-10 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid identification of pathogens in humans and animals |
| US20040038206A1 (en) * | 2001-03-14 | 2004-02-26 | Jia Zhang | Method for high throughput assay of genetic analysis |
| US20030104410A1 (en) | 2001-03-16 | 2003-06-05 | Affymetrix, Inc. | Human microarray |
| DK1423400T4 (da) | 2001-03-19 | 2013-09-02 | Harvard College | Evolution af hidtil ukendt molekylfunktion |
| JP4927309B2 (ja) | 2001-03-28 | 2012-05-09 | カウンスィル オブ サイエンティフィック アンド インダストリアル リサーチ | 野生生物同定のための普遍的プライマー |
| US7630836B2 (en) | 2001-05-30 | 2009-12-08 | The Kitasato Institute | Polynucleotides |
| CA2348042A1 (en) | 2001-06-04 | 2002-12-04 | Ann Huletsky | Sequences for detection and identification of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
| US20020187477A1 (en) * | 2001-06-06 | 2002-12-12 | Hong Xue | Method for detecting single nucleotide polymorphisms (SNPs) and point mutations |
| ES2311613T3 (es) | 2001-06-06 | 2009-02-16 | Dsm Ip Assets B.V. | Produccion mejorada de isoprenoides. |
| GB0113908D0 (en) | 2001-06-07 | 2001-08-01 | Univ London | Designing degenerate PCR primers |
| GB0113907D0 (en) | 2001-06-07 | 2001-08-01 | Univ London | Virus detection using degenerate PCR primers |
| US20020187490A1 (en) | 2001-06-07 | 2002-12-12 | Michigan State University | Microbial identification chip based on DNA-DNA hybridization |
| US7217510B2 (en) | 2001-06-26 | 2007-05-15 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for providing bacterial bioagent characterizing information |
| US8073627B2 (en) | 2001-06-26 | 2011-12-06 | Ibis Biosciences, Inc. | System for indentification of pathogens |
| DE10132147B4 (de) | 2001-07-03 | 2004-04-15 | Universität Leipzig | Verfahren zur schnellen quantitativen Bestimmung von Eu-Bakterien |
| GB0117054D0 (en) | 2001-07-12 | 2001-09-05 | Plant Bioscience Ltd | Methods and means for modification of plant characteristics |
| EP1407051B1 (en) | 2001-07-19 | 2006-04-12 | Infectio Diagnostic (I.D.I.) INC. | Universal method and composition for the rapid lysis of cells for the release of nucleic acids and their detection |
| US20040191769A1 (en) | 2001-07-24 | 2004-09-30 | Transgenomic, Inc. | Methods, compositions, and kits for mutation detection in mitochondrial DNA |
| WO2003012074A2 (en) | 2001-07-30 | 2003-02-13 | Den Kgl. Veterinær- Og Landbohøjskole | Bacterial strains belonging to lactobacillus species and their use in food and feed industry |
| US7115385B2 (en) | 2001-08-02 | 2006-10-03 | North Carolina State University | Media and methods for cultivation of microorganisms |
| AT411174B (de) | 2001-08-09 | 2003-10-27 | Lambda Labor Fuer Molekularbio | Verfahren und chip zur analyse von nukleinsäuren |
| US20030039976A1 (en) * | 2001-08-14 | 2003-02-27 | Haff Lawrence A. | Methods for base counting |
| US20040175715A1 (en) | 2001-08-21 | 2004-09-09 | Burgoyne Leigh A. | Method and device for simultaneously molecularly cloning and polylocus profiling of genomes or genomes mixtures |
| US7105296B2 (en) | 2001-08-29 | 2006-09-12 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Genes encoding Baeyer-Villiger monooxygenases |
| US7049286B2 (en) | 2001-08-30 | 2006-05-23 | Diatos, S.A. | Insulin conjugates and methods of use thereof |
| EP1446412B1 (en) | 2001-09-04 | 2012-03-07 | Exiqon A/S | Novel lna compositions and uses thereof |
| US20040101809A1 (en) | 2001-09-21 | 2004-05-27 | Weiss Ervin I | Device, method and materials for mobilizing substances into dentinal tubules in root canal treatment |
| DE10150121B4 (de) | 2001-10-11 | 2005-12-01 | Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin | Echtzeitdetektion von DNA-Amplifikationsprodukten |
| US6977148B2 (en) | 2001-10-15 | 2005-12-20 | Qiagen Gmbh | Multiple displacement amplification |
| US7297485B2 (en) | 2001-10-15 | 2007-11-20 | Qiagen Gmbh | Method for nucleic acid amplification that results in low amplification bias |
| US20040029129A1 (en) | 2001-10-25 | 2004-02-12 | Liangsu Wang | Identification of essential genes in microorganisms |
| DE10152821B4 (de) | 2001-10-25 | 2006-11-16 | Bruker Daltonik Gmbh | Massenspektren ohne elektronisches Rauschen |
| EP1308506A1 (en) | 2001-11-06 | 2003-05-07 | Eidgenössische Technische Hochschule Zürich | Mixtures of Propionibacterium jensenii and Lactobacillus sp. with antimicrobial activities for use as a natural preservation system |
| PL222683B1 (pl) | 2001-11-13 | 2016-08-31 | Univ Pennsylvania | Rekombinowane wirusy stowarzyszone z adenowirusem (AAV), sposoby ich wytwarzania, pakująca komórka gospodarza, kompozycja zawierająca wirus, zastosowanie wirusa, wyizolowane wirusy AAV, białka,sztuczne białka kapsydu, cząsteczki, komórki gospodarza, sposoby dostarczania transgenu, sposób identyfikacji serotypu, zestaw diagnostyczny, sposób izolacji nowych wirusów, rekombinowana komórka |
| ES2337665T3 (es) * | 2001-11-15 | 2010-04-28 | Whatman, Inc. | Procedimientos y materiales para detectar material genetico. |
| US20040023209A1 (en) | 2001-11-28 | 2004-02-05 | Jon Jonasson | Method for identifying microorganisms based on sequencing gene fragments |
| JP3692067B2 (ja) | 2001-11-30 | 2005-09-07 | 株式会社東芝 | 銅のｃｍｐ用研磨スラリーおよびそれを用いた半導体装置の製造方法 |
| US20030148284A1 (en) * | 2001-12-17 | 2003-08-07 | Vision Todd J. | Solid phase detection of nucleic acid molecules |
| TW509116U (en) | 2001-12-18 | 2002-11-01 | Ind Tech Res Inst | Device for clipping and tightening spindle of honing and milling machine |
| US20030175709A1 (en) | 2001-12-20 | 2003-09-18 | Murphy George L. | Method and system for depleting rRNA populations |
| US7468185B2 (en) | 2001-12-21 | 2008-12-23 | Pfizer Inc. | Vaccine for periodontal disease |
| KR100444230B1 (ko) | 2001-12-27 | 2004-08-16 | 삼성전기주식회사 | 내환원성 유전체 자기 조성물 |
| WO2003060163A2 (en) | 2001-12-28 | 2003-07-24 | Keygene N.V. | Discrimination and detection of target nucleotide sequences using mass spectrometry |
| DE60219132T2 (de) | 2002-02-01 | 2007-12-13 | Bruker Daltonik Gmbh | Mutationsanalyse mittels PCR und Massenspektrometrie |
| CN1202204C (zh) | 2002-02-27 | 2005-05-18 | 财团法人工业技术研究院 | 红光有机电激发光化合物及用其制成的组件和装置 |
| KR100600988B1 (ko) | 2002-03-13 | 2006-07-13 | 주식회사 엘지생명과학 | Ｄｎａ 면역화에서 인플루엔자 ｎｐ 유전자 ｄｎａ를 함께투여하여 면역반응을 증가시키는 방법 |
| US7024370B2 (en) | 2002-03-26 | 2006-04-04 | P) Cis, Inc. | Methods and apparatus for early detection of health-related events in a population |
| US6897027B2 (en) | 2002-03-27 | 2005-05-24 | Decode Genetics Ehf. | Method for desalting nucleic acids |
| AU2003269809A1 (en) | 2002-04-01 | 2003-12-12 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Method for rapid detection and identification of viral bioagents |
| US7539579B2 (en) | 2002-04-09 | 2009-05-26 | Beattie Kenneth L | Oligonucleotide probes for genosensor chips |
| JP2004000200A (ja) | 2002-04-19 | 2004-01-08 | Menicon Co Ltd | 微生物の検出方法 |
| FR2838740A1 (fr) | 2002-04-22 | 2003-10-24 | Centre Nat Rech Scient | Oligonucleotides issus des sequences codant pour la composante de surface des proteines d'enveloppe des ptlv et leurs utilisations |
| GB0209812D0 (en) | 2002-04-30 | 2002-06-05 | Renovo Ltd | Genetic testing |
| DE10222632B4 (de) | 2002-05-17 | 2006-03-09 | Con Cipio Gmbh | Mikrosatellitenmarker für genetische Analysen und zur Unterscheidung von Rosen |
| US6906319B2 (en) | 2002-05-17 | 2005-06-14 | Micromass Uk Limited | Mass spectrometer |
| EP1365031A1 (en) | 2002-05-21 | 2003-11-26 | MTM Laboratories AG | Method for detection of somatic mutations using mass spectometry |
| US20030220844A1 (en) * | 2002-05-24 | 2003-11-27 | Marnellos Georgios E. | Method and system for purchasing genetic data |
| AU2003237249A1 (en) | 2002-05-24 | 2003-12-12 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides having modified nucleoside units |
| NZ536874A (en) | 2002-05-29 | 2005-03-24 | Aresa Biodetection Aps | Reporter system for plants |
| GB0212666D0 (en) | 2002-05-31 | 2002-07-10 | Secr Defence | Immunogenic sequences |
| WO2003104410A2 (en) | 2002-06-07 | 2003-12-18 | Incyte Corporation | Enzymes |
| WO2003106635A2 (en) | 2002-06-13 | 2003-12-24 | Regulome Corp | Functional sites |
| KR100484144B1 (ko) | 2002-06-20 | 2005-04-18 | 삼성전자주식회사 | 원격 관리 서버 및 원격 관리 방법 |
| WO2004003511A2 (en) | 2002-07-01 | 2004-01-08 | Wayne State University | Methods and compositions for the identification of antibiotics that are not susceptible to antibiotic resistance |
| AU2003254093A1 (en) | 2002-07-19 | 2004-02-09 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for mass spectrometry analysis utilizing an integrated microfluidics sample platform |
| US6916483B2 (en) * | 2002-07-22 | 2005-07-12 | Biodynamics, Llc | Bioabsorbable plugs containing drugs |
| GB0217434D0 (en) | 2002-07-27 | 2002-09-04 | Royal Vetinary College | Biological material |
| US20040022764A1 (en) | 2002-07-31 | 2004-02-05 | Hanan Polansky | Inhibition of microcompetition with a foreign polynucleotide as treatment of chronic disease |
| US7172868B2 (en) | 2002-08-01 | 2007-02-06 | The Regents Of The University Of California | Nucleotide sequences specific to Francisella tularensis and methods for the detection of Francisella tularensis |
| US20040038385A1 (en) * | 2002-08-26 | 2004-02-26 | Langlois Richard G. | System for autonomous monitoring of bioagents |
| AU2003270397B2 (en) | 2002-09-06 | 2009-07-16 | Trustees Of Boston University | Quantification of gene expression |
| US20040110138A1 (en) | 2002-11-01 | 2004-06-10 | University Of Ottawa | Method for the detection of multiple genetic targets |
| US20060257871A1 (en) | 2002-11-12 | 2006-11-16 | Franck Chaubron | One step real-time rt pcr kits for the universal detection of organisms in industrial products |
| US7250496B2 (en) | 2002-11-14 | 2007-07-31 | Rosetta Genomics Ltd. | Bioinformatically detectable group of novel regulatory genes and uses thereof |
| ATE459727T1 (de) | 2002-11-15 | 2010-03-15 | Gen Probe Inc | Test und zusammensetzungen zum nachweis von bacillus-anthracis-nukleinsäure |
| US6680476B1 (en) | 2002-11-22 | 2004-01-20 | Agilent Technologies, Inc. | Summed time-of-flight mass spectrometry utilizing thresholding to reduce noise |
| CA2508726A1 (en) | 2002-12-06 | 2004-07-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for rapid identification of pathogens in humans and animals |
| JP2004201679A (ja) | 2002-12-10 | 2004-07-22 | Kao Corp | Ｐｃｒ法によるフゾバクテリウム・ニュークレタム菌の検出用プライマー及びその検出方法 |
| US20040117354A1 (en) | 2002-12-16 | 2004-06-17 | Azzaro Steven Hector | Process for tagging and measuring quality |
| US20040121340A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Secondary structure defining database and methods for determining identity and geographic origin of an unknown bioagent associated with host versus graft and graft versus host rejections thereby |
| US20040122857A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Secondary structure defining database and methods for determining identity and geographic origin of an unknown bioagent in forensic studies thereby |
| US20040121312A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Methods for rapid detection and identification of the absence of bioagents |
| US20040122598A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Secondary structure defining database and methods for determining identity and geographic origin of an unknown bioagent in food products and cosmetics thereby |
| US20040121315A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Secondary structure defining database and methods for determining identity and geographic origin of an unknown bioagent in containers thereby |
| US20040121329A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Ecker David J. | Secondary structure defining database and methods for determining identity and geographic origin of an unknown bioagent in blood, bodily fluids, and bodily tissues thereby |
| US9487823B2 (en) | 2002-12-20 | 2016-11-08 | Qiagen Gmbh | Nucleic acid amplification |
| JP2004201641A (ja) | 2002-12-26 | 2004-07-22 | Mitsubishi Kagaku Bio-Clinical Laboratories Inc | 真菌検出方法 |
| US20040170981A1 (en) | 2003-02-10 | 2004-09-02 | Mckenney Keith | Real-time polymerase chain reaction using large target amplicons |
| US20040170954A1 (en) | 2003-02-10 | 2004-09-02 | Mckenney Keith | Pathogen inactivation assay |
| US20040185438A1 (en) | 2003-03-10 | 2004-09-23 | Ecker David J. | Methods of detection and notification of bioagent contamination |
| US20050065813A1 (en) | 2003-03-11 | 2005-03-24 | Mishelevich David J. | Online medical evaluation system |
| US8046171B2 (en) | 2003-04-18 | 2011-10-25 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods and apparatus for genetic evaluation |
| CA2523490A1 (en) | 2003-04-25 | 2004-11-11 | Sequenom, Inc. | Fragmentation-based methods and systems for de novo sequencing |
| US8057993B2 (en) | 2003-04-26 | 2011-11-15 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for identification of coronaviruses |
| WO2005009202A2 (en) | 2003-05-12 | 2005-02-03 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Automatic identification of bioagents |
| US8158354B2 (en) | 2003-05-13 | 2012-04-17 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid purification of nucleic acids for subsequent analysis by mass spectrometry by solution capture |
| US7964343B2 (en) | 2003-05-13 | 2011-06-21 | Ibis Biosciences, Inc. | Method for rapid purification of nucleic acids for subsequent analysis by mass spectrometry by solution capture |
| EP1644520B1 (en) | 2003-07-03 | 2007-09-19 | Danmarks og Gronlands Geologiske Undersogelse | Method for selective detection of a target nucleic acid |
| WO2005017173A1 (en) | 2003-07-29 | 2005-02-24 | Sigma Aldrich Co. | Methods and compositions for amplification of dna |
| JP4304292B2 (ja) | 2003-07-30 | 2009-07-29 | 日本電気株式会社 | 移動通信システム、移動通信端末及びそれに用いるパワーコントロール方法並びにそのプログラム |
| KR100632429B1 (ko) | 2003-08-01 | 2006-10-09 | 프로테온 주식회사 | 프라이머 특이성 유무에 의한 멀티플렉스 역전사 중합효소연쇄반응을 이용한 재조합 독감 바이러스의 스크리닝 방법 |
| US20120122103A1 (en) | 2003-09-11 | 2012-05-17 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of bacteria |
| US20060240412A1 (en) | 2003-09-11 | 2006-10-26 | Hall Thomas A | Compositions for use in identification of adenoviruses |
| US20050142584A1 (en) | 2003-10-01 | 2005-06-30 | Willson Richard C. | Microbial identification based on the overall composition of characteristic oligonucleotides |
| WO2005036369A2 (en) | 2003-10-09 | 2005-04-21 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Database for microbial investigations |
| FR2861743B1 (fr) | 2003-11-04 | 2007-10-19 | Univ Aix Marseille Ii | Identification moleculaire des bacteries du genre corynebacterium |
| JP3861871B2 (ja) | 2003-11-26 | 2006-12-27 | サンケン電気株式会社 | スイッチング電源装置 |
| US20050250125A1 (en) | 2003-12-19 | 2005-11-10 | Novakoff James L | Method for conducting pharmacogenomics-based studies |
| CA2791798C (en) | 2004-02-10 | 2016-08-16 | F. Hoffmann-La Roche Ag | New primers and probes for the detection of parvovirus b19 |
| CA2560521C (en) | 2004-02-18 | 2012-01-03 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of bacteria |
| US7666592B2 (en) | 2004-02-18 | 2010-02-23 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for concurrent identification and quantification of an unknown bioagent |
| US8119336B2 (en) | 2004-03-03 | 2012-02-21 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of alphaviruses |
| US7312036B2 (en) | 2004-03-22 | 2007-12-25 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of viral hemorrhagic fever viruses |
| US20050266411A1 (en) | 2004-05-25 | 2005-12-01 | Hofstadler Steven A | Methods for rapid forensic analysis of mitochondrial DNA |
| WO2006135400A2 (en) | 2004-08-24 | 2006-12-21 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for rapid identification of recombinant organisms |
| US7627437B2 (en) | 2005-01-14 | 2009-12-01 | Idaho Research Foundation | Categorization of microbial communities |
| DE102005008583B4 (de) | 2005-02-24 | 2007-10-25 | Johannes-Gutenberg-Universität Mainz | Verfahren zur Typisierung eines Individuums mittels short tandem repeat (STR)-Loci der genomischen DNA |
| US20060205040A1 (en) | 2005-03-03 | 2006-09-14 | Rangarajan Sampath | Compositions for use in identification of adventitious viruses |
| CA2605021A1 (en) | 2005-04-13 | 2007-08-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of adenoviruses |
| WO2006116127A2 (en) | 2005-04-21 | 2006-11-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for use in identification of bacteria |
| US8026084B2 (en) | 2005-07-21 | 2011-09-27 | Ibis Biosciences, Inc. | Methods for rapid identification and quantitation of nucleic acid variants |
| US20070026435A1 (en) | 2005-07-28 | 2007-02-01 | Polysciences, Inc. | Hydroxysilane functionalized magnetic particles and nucleic acid separation method |
| JP5680304B2 (ja) | 2007-02-23 | 2015-03-04 | アイビス バイオサイエンシズ インコーポレイティッド | 迅速な法医学的ｄｎａ分析法 |
| WO2008118809A1 (en) | 2007-03-23 | 2008-10-02 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for use in identification of mixed populations of bioagents |
| JP5067239B2 (ja) | 2008-03-28 | 2012-11-07 | 富士通株式会社 | ケーブルマネージメント装置および電子機器装置 |
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