JP2019010110A - パーキンソン病の治療のためのaadcポリヌクレオチド - Google Patents

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Abstract

【課題】パーキンソン病の治療のためのAADCをコードするポリヌクレオチドを提供する。【解決手段】AAVベクターゲノムは、a)130ヌクレオチド長の5’逆方向末端反復(ITR)、b)特定の配列をコードするヌクレオチドを含む、AADC配列領域、および、c)119ヌクレオチド長の3’逆方向末端反復(ITR)を、上記の順に含み、これを必要とする対象におけるAADCタンパク質のレベルを増加させる方法に使用する。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
この出願は、2014年11月5日に出願されたパーキンソン病の治療のためのAADCポリヌクレオチドと題された米国仮特許出願第62/075,298号、2015年5月1日に出願されたパーキンソン病の治療のためのAADCポリヌクレオチドと題された米国仮特許出願第62/155,692号、2015年7月31日に提出されたパーキンソン病の治療のためのAADCポリヌクレオチドと題する米国仮特許出願第62/199,578号、2015年10月19日に出願されたパーキンソン病の治療のためのAADCポリヌクレオチドと題する米国仮特許出願第62/243,537号の仮出願の権利を主張しており、その各々の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
配列表の参照
本出願は、電子フォーマットの配列表と共に提出されている。配列表ファイル(1010PCTSEQLST.txt)は、2015年11月5日に作成され、178,144バイトのサイズである。配列表の電子フォーマットの情報は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
発明の分野
本発明は、パーキンソン病の治療に使用するための組成物、特に核酸分子、例えばAADCをコードするポリヌクレオチドに関する。いくつかの実施形態では、そのようなAADCポリヌクレオチドは、組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)によってまたはその中にコードされ得る。
芳香族L−アミノ酸デカルボキシラーゼ(AADC)は、ドーパミンおよびセロトニンの合成を担うホモ二量体のピリドキサールリン酸依存性酵素である。コードされたタンパク質は、ドーパミンに対するL−3,4−ジヒドロキシフェニルアラニン(L−DOPAまたはレボドパ)の、セロトニンに対するL−5−ヒドロキシトリプトファンの、またトリプタミンに体するL−トリプトファンの脱カルボキシル化を触媒する。この遺伝子の欠損は、芳香族L−アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損(AADCD)の原因であり、これは神経伝達物質の代謝における先天性異常であり、セロトニンとカテコールアミン双方の欠乏をもたらし、重度の運動機能および自律神経機能不全をもたらす。
パーキンソン病(PD)は、CNS(CNS)の進行性の神経変性疾患であり、感覚および運動に症状を引き起こす。ドーパミン置換(すなわち、レボドパ)は、PDにおける運動障害の標準的な薬物療法であった。しかしながら、ドーパミン療法の利点は、時間の経過と共に効果が薄れてくる。その原因の一部は、ドーパミン生成細胞の進行性の死およびそれに対応するAADC活性の喪失である。さらに、高用量のドーパミンの全身投与により、中脳辺縁系のドーパミン作動性刺激に起因する、運動能力の変動、ジスキネジー、および幻覚などの副作用が併発する。ドーパミン作動能を回復し、副作用を最小限に抑えるための1つのストラテジーは、CNSの標的領域にAADCを直接投与する遺伝子治療を使用することである。
アデノ随伴ウイルス(AAV)は、その長期間の遺伝子発現、ヘルパーウイルスなしには自律的に複製できないこと、分裂および非潜在細胞を形質導入する能力、および野生型感染からの病原性の欠如という性質を有しているため、遺伝子治療のための魅力的なベクターとして注目され始めている(例えば、Hadaczek et al. Mol. Ther. 18(8), 1458−1461, Aug. 2010を参照せよ)。AAVは、ディペンドウイルス属に属するヘルパー依存性DNAパルボウイルスである。
本発明は、そのような改良された核酸構築物、例えばポリヌクレオチドを提供し、これを、パーキンソン病の治療における遺伝子治療の目的で、全長AADCタンパク質をコードするドーパカルボキシラーゼ(「DDC」)遺伝子配列からなるAAV由来ベクターと共に使用する。
本明細書中に記載されている核酸構築物は、少なくとも5’−ITRおよび3’−ITRからなり、その各々または両方が、約1個のDDC遺伝子配列に位置するAAVに由来し得る。さらに、当該核酸構築物は、遺伝子発現およびクローン選択のために必要とされる付加的な成分をも含む。
本明細書には、AADCポリヌクレオチドの設計、調製、製造および/または処方のための組成物、方法、プロセス、キットおよびデバイスが記載されている。
いくつかの実施形態において、そのようなAADCポリヌクレオチドは、プラスミドまたはベクターまたは組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)によってコードされるか、またはそれらに含まれ得る。
本発明の様々な実施形態の詳細は、以下の説明に記載されている。本発明のその他の特徴、目的および利点は、説明および特許請求の範囲から明らかになるであろう。
発明の組成物
本発明によれば、AADCポリヌクレオチドは、単独で、または追加の核酸配列(群)と組み合わせて機能し、AADCタンパク質をコードするように提供されている。本明細書中では、「AADCポリヌクレオチド」という語は、AADCタンパク質をコードする任意の核酸ポリマーを意味し、AADCタンパク質がベクター、プラスミドまたは翻訳可能な構築物中に存在する場合、そのようなAADCタンパク質を細胞、組織、器官または生物中で発現させる。
AADCポリヌクレオチドは、細胞内でプロセシングされる前駆体分子を含む。AADCポリヌクレオチドまたはそのプロセシングされた形態を、細胞に投与するためのプラスミド、ベクター、ゲノムまたは他の核酸発現ベクターでコードしてもよい。
いくつかの実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、AAVウイルスゲノムの成分として設計され、細胞内で処理されるAAVウイルス粒子にパッケージングされ、野生型AADCタンパク質を産生する。
本明細書中では、野生型AADCタンパク質という語は、天然に存在するアイソフォームまたはDDC遺伝子由来の変異体のいずれかであり得る。AADCの異なるアイソフォームをコードする複数の選択的にスプライシングされた転写物変異体が同定されている。具体的には、DDC遺伝子は、6つの異なるアイソフォームをコードする7つの転写変異体を産生する。DDC転写物変異体1および2の双方が、AADCアイソフォーム1をコードする。いくつかの実施形態では、AADCポリヌクレオチドはDDC転写物変異体2をコードし、それによって天然のAADCアイソフォーム1(NCBI参照配列:NP_000781.1)をコードする。この配列は次の通りである:MNASEFRRRGKEMVDYVANYMEGIEGRQVYPDVEPGYLRPLIPAAAPQEPDTFEDIINDVEKIIMPGVTHWHSPYFFAYFPTASSYPAMLADMLCGAIGCIGFSWAASPACTELETVMMDWLGKMLELPKAFLNEKAGEGGGVIQGSASEATLVALLAARTKVIHRLQAASPELTQAAIMEKLVAYSSDQAHSSVERAGLIGGVKLKAIPSDGNFAMRASALQEALERDKAAGLIPFFMVATLGTTTCCSFDNLLEVGPICNKEDIWLHVDAAYAGSAFICPEFRHLLNGVEFADSFNFNPHKWLLVNFDCSAMWVKKRTDLTGAFRLDPTYLKHSHQDSGLITDYRHWQIPLGRRFRSLKMWFVFRMYGVKGLQAYIRKHVQLSHEFESLVRQDPRFEICVEVILGLVCFRLKGSNKVNEALLQRINSAKKIHLVPCHLRDKFVLRFAICSRTVESAHVQRAWEHIKELAADVLRAERE(配列番号1)。
本発明のAADCポリヌクレオチドを操作して、AADCポリヌクレオチド構築物を作製するために組み立てられたモジュール要素および/または配列モチーフを含むようにすることができる。
AADCポリヌクレオチド構築物
本発明によれば、AADCポリヌクレオチドが提供される。そのようなポリヌクレオチドは、AADCタンパク質の1つまたはそれ以上のアイソフォームまたは変異体をコードする連結ヌクレオシドの領域からなる核酸ポリマーからなる。
いくつかの実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、AADCタンパク質をコードするコドン最適化転写物からなる。
いくつかの実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、AADCタンパク質の1つまたはそれ以上の野生型アイソフォームまたは変異体をコードする配列領域からなる。そのようなポリヌクレオチドはまた、以下のいずれか1つまたはそれ以上をコードする配列領域からなっていてもよい:5’ITR、サイトメガロウイルス(CMV)エンハンサー、CMVプロモーター、ie1エキソン1、ie1イントロン1、hbBグロビンイントロン2、hBグロビンエキソン3、5’UTR、3’UTR、hGHポリ(A)シグナルおよび/または3’ITR。このような配列領域は、本明細書に教示されているか、または当該分野で公知の配列領域のいずれかであり得る。
いくつかの実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、配列番号2〜23のいずれかの配列からなる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、配列番号2〜23のいずれかに対してパーセント同一性を有する配列からなる。AADCポリヌクレオチドは、配列番号2〜23のいずれかに対して、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、あるいは100%の同一性を有し得る。AADCポリヌクレオチドは、配列番号2〜23のいずれかに対して、1〜10%、10〜20%、30〜40%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜99%、50〜100% 60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜99%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜99%、70〜100%、80〜85% 80〜90%、80〜95%、80〜99%、80〜100%、90〜95%、90〜99%、または90〜100%の同一性を有し得る。非限定的な一例として、AADCポリヌクレオチドは、配列番号6,7,8,9,17,18,19,20,21,22および23のいずれかと80%の同一性を有する配列からなる。別の非限定的な一例として、AADCポリヌクレオチドは、配列番号6,7,8,9,17,18,19,20,21,22および23のいずれかと85%の同一性を有する配列からなる。別の非限定的な一例として、AADCポリヌクレオチドは、配列番号6,7,8,9,17,18,19,20,21,22および23のいずれかと90%の同一性を有する配列からなる。別の非限定的な一例として、AADCポリヌクレオチドは、配列番号6,7,8,9,17,18,19,20,21,22および23のいずれかと95%の同一性を有する配列からなる。別の非限定的な一例として、AADCポリヌクレオチドは、配列番号6,7,8,9,17,18,19,20,21,22および23のいずれかと99%の同一性を有する配列からなる。
いくつかの実施形態では、AADCコード領域は1440ヌクレオチドの長さである。そのようなAADCポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチドの全部または一部にわたってコドン最適化され得る。
いくつかの実施形態では、AADCコード領域は1443ヌクレオチドの長さである。そのような場合、追加のコドンがポリヌクレオチドの3’末端に存在してもよい。
いくつかの実施形態では、AADCコード領域は1449ヌクレオチドの長さである。そのような場合、追加のコドンがポリヌクレオチドの3’末端に存在してもよい。
いくつかの実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、配列番号6〜9,17〜23のいずれかからなるが、5’ITRおよび/または3’ITRを欠いている。そのようなポリヌクレオチドは、プラスミドまたはベクターに組み込まれ、コードされたAADCタンパク質を発現させるために利用され得る。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、昆虫細胞(例えば、Sf9細胞)において産生され得る。
一実施形態において、AADCポリヌクレオチドは、トリプルトランスフェクションを用いて産生され得る。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、AADC mRNA、少なくとも1つの5’ITRおよび少なくとも1つの3’UTRのコドン最適化オープンリーディングフレームからなり、ここでは、1つまたはそれ以上の5’ITRがプロモーター領域の5’末端に位置してもよく、1つまたはそれ以上の3’ITRがポリ(A)シグナルの3’末端に位置していてもよい。AADC mRNAは、プロモーター領域、5’非翻訳領域(UTR)、3’UTR、およびポリ(A)シグナルからなり得る。プロモーター領域は、エンハンサー要素、プロモーター要素、第1エキソン領域、第1イントロン領域、第2イントロン領域、および第2エキソン領域を含み得るが、これらに限定されない。非限定的な一例として、エンハンサーエレメントおよびプロモーターエレメントはCMV由来である。別の非限定的な一例として、第1エキソン領域は、ie1エキソン1またはその断片であり、第1イントロン領域は、ie1イントロン1またはその断片であり、第2イントロン領域は、hbBグロビンイントロン2またはその断片であり、第2エキソン領域は、hbBグロビンエキソン3またはその断片である。さらに別の非限定的な一例として、ポリ(A)シグナルは、ヒト成長ホルモンに由来する。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、アデノ随伴ウイルス(AAV)に由来し得るプラスミドまたはベクターでコードされる。AAVは組換えAAVウイルスであってもよく、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAV−DJ、およびAAV−DJ8の(これらに限定されない)キャプシド血清型からなり得る。非限定的な一例として、組換えAAVウイルスのキャプシドはAAV2である。非限定的な一例として、組換えAAVウイルスのキャプシドはAAVrh10である。非限定的な一例として、組換えAAVウイルスのキャプシドはAAV9(hu14)である。非限定的な一例として、組換えAAVウイルスのキャプシドはAAV−DJである。非限定的な一例として、組換えAAVウイルスのキャプシドはAAV9.47である。非限定的な一例として、組換えAAVウイルスのキャプシドはAAV−DJ8である。
プロモーター
当業者は、標的細胞が、種特異的、誘導性、組織特異的または細胞周期特異的なプロモーターを含むがこれらに限定されるものではない特異的なプロモーターを必要とすることを認識するであろう(Parr et al., Nat Med.3:1145−9 (1997);この内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
一実施形態では、プロモーターは、AADCポリヌクレオチドに対して効率的であると考えられるプロモーターである。
一実施形態では、プロモーターは、標的とされる細胞に対して効率的であると考えられるプロモーターである。
一実施形態では、プロモーターは、標的組織(神経系組織を含むが、これに限定されるものではない)において、ある期間中ペイロードの発現を提供する弱いプロモーターである。発現は、1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、11時間、12時間、15時間後、16時間後、17時間後、18時間後、19時間後、20時間後、21時間後、22時間後、23時間後、1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、10日、11日、12日、13日、2週間、15日、16日、17日、18日、19日、20日、3週間、22日、23日、24日、27日、28日、29日、30日、31日、1ヶ月、2ヶ月、3ヶ月、4ヶ月、5ヶ月、6ヶ月、7ヶ月、8ヶ月、9ヶ月、11ヶ月、1年、13ヶ月、14ヶ月、15ヶ月、16ヶ月、17ヶ月、18ヶ月、19ヶ月、20ヶ月、21ヶ月、22ヶ月、23ヶ月、2年、3年、4年、6年、7年、8年、9年、10年、または10年以上の期間、持続する。発現は、1〜5時間、1〜12時間、1〜2日、1〜5日、1〜2週間、1〜3週間、1〜4週間、1〜2ヶ月、1〜4ヶ月、1 6〜6ヶ月、3〜6ヶ月、3〜9ヶ月、4〜8ヶ月、6〜12ヶ月、1〜2年、1〜5年、2〜5年、3〜6年、3〜8、4〜8年、または5〜10年の期間、持続する。非限定的な一例として、プロモーターは、神経組織におけるペイロードの持続的発現のための弱いプロモーターである。別の非限定的な一例として、プロモーターは、神経系組織(ニューロン組織およびグリア組織を含むが、それらに限定されない)における持続的なフラタキシン発現を発現する弱いプロモーターである。
一実施形態では、FRDAプロモーターは、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用される。
一実施形態では、ペイロードの第1エキソンの約5kb上流に位置する領域が存在する。非限定的な一例として、FRDAプロモーターを用いた発現を可能にするために、フラタキシン遺伝子の第1エキソンの約4.9kb上流に位置する17bp領域が存在する(例えば、Puspasari et al. Long Range Regulation of Human FXN Gene Expression, PLOS ONE, 2011を参照せよ;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
一実施形態では、プロモーターは、1kb未満のプロモーターであってよい。プロモーターは、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、あるいは800以上の長さであってよい。プロモーターは、200〜300,200〜400,200〜500,200〜600,200〜700,200〜800,300〜400,300〜500,300〜600,300〜700,300〜800、400〜500,400〜600,400〜700,400〜800,500〜600,500〜700,600〜800,600〜700,600〜800,700〜800の長さであってよい。
一実施形態では、プロモーターは、CMVおよびCBAを含むがこれらに限定されない2つあるいはそれ以上の構成要素の組み合わせであってよい。各構成要素は、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800または800以上の長さであってよい。各構成要素は、200−300、200−400、200−500、200−600、200−700、200−800、300−400、300−500、300−600、300−700、300−800、400−500、400−600、400−700、400−800、500−600、500−700、500−800、600−700、600−800、700−800の長さを有することができる。非限定的な一例として、プロモーターは、382ヌクレオチドのCMVエンハンサー配列と260ヌクレオチドのCBAプロモーター配列との組み合わせである。
一実施形態では、少なくとも1つのエレメントを本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用し、導入遺伝子標的特異性および発現を増強することができる(例えば、Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and
Expression in Gene Therapy, 2015を参照せよ;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。導入遺伝子標的特異性および発現を増強するエレメントの非限定的な例には、プロモーター、内在性miRNA、転写後調節エレメント(PRE)、ポリアデニル化(PolyA)シグナル配列および上流エンハンサー(USE)、CMVエンハンサーおよびイントロンがある。
一実施形態では、少なくとも1つのエレメントを本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用し、導入遺伝子標的特異性および発現を増強することができる(例えば、Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and
Expression in Gene Therapy, 2015を参照せよ;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。一実施形態では、少なくとも1つのエレメントを本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用し、導入遺伝子標的特異性および発現を増強することができる(例えば、Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and Expression in
Gene Therapy, 2015を参照せよ;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。ほとんどの組織において発現を促進するプロモーターには、ヒト伸長因子1α−サブユニット(EF1α)、最初期サイトメガロウイルス(CMV)、ニワトリβ−アクチン(CBA)およびその誘導体CAG、βグルクロニダーゼ GUSB)、またはユビキチンC(UBC)がある。組織特異的発現要素を使用して、発現をニューロン、星状細胞、または希突起膠細胞に制限するために使用することができる特定の細胞型(神経系プロモーターを含むがこれに限定されない)に発現を制限することができる。ニューロンに対する組織特異的発現エレメントの非限定的な例には、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)、血小板由来成長因子(PDGF)、血小板由来成長因子B鎖(PDGF−β)、シナプシン(Syn)、メチル−CpG結合タンパク質2(MeCP2)、CaMKII、mGluR2、NFL、NFH、nβ2、PPE、EnkおよびEAAT2プロモーターが挙げられる。星状細胞に対する組織特異的発現エレメントの非限定的な例には、グリア線維性酸性タンパク質(GFAP)およびEAAT2プロモーターが挙げられる。希突起膠細胞に対する組織特異的発現エレメントの非限定的な例には、ミエリン塩基性タンパク質(MBP)プロモーターが挙げられる。
一実施形態では、ユビキタスプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。ユビキタスプロモーターの非限定的な例には、CMV、CBA(誘導体CAG、CBhなどを含む)、EF−1α、PGK、UBC、GUSB(hGBp)、およびUCOE(HNRPA2B1−CBX3のプロモーター)が挙げられる。Yuら (Molecular Pain 2011, 7:63;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)は、レンチウイルスベクターを用いて、ラットDRG細胞および一次DRG細胞におけるCAG、EFIα、PGKおよびUBCプロモーター下でのeGFPの発現を評価し、UBCが他の3つのプロモーターよりも弱い発現しか示さず、すべてのプロモーターについて見られたグリア発現がわずか10〜12%であったことを見いだした。Soderblomら(E. Neuro 2015;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)は、運動皮質に注入後のAAV8におけるCMVおよびUBCプロモーターによるeGFPの発現、およびCMVプロモーターによるAAV2におけるeGFPの発現を評価した。UBCまたはEFIαプロモーターを含むプラスミドの鼻腔内投与は、CMVプロモーターによる発現よりも長く持続した気道発現を示した(例えば、Gill et al., Gene Therapy 2001, Vol. 8, 1539−1546を参照せよ;この内容は、その全体が参照により本明細書に組み入れられる)。Husainら(Gene Therapy 2009;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)は、hGUSBプロモーター、HSV−1LATプロモーター、およびNSEプロモーターを用いてHβH構築物を評価し、HβH構築物がマウスの脳におけるNSEよりも弱い発現を示したことを見いだした。PassiniおよびWolfe(J. Virol. 2001,
12382−12392;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)は、新生児マウスにおける脳室内注射後のHβHベクターの長期効果を評価し、持続的発現が少なくとも1年間あったことを見いだした。Xu ら(Gene Therapy 2001, 8, 1323−1332;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)は、CMV−lacZ、CMV−luc、EF、GFAP、hENK、nAChR、PPE、PPE + wpre、NSE(0.3kb)、NSE(1.8kb)、およびNSE(1.8kb + wpre)に比較して、NF−LおよびNF−Hプロモーターを使用した場合に、すべての脳領域において発現が低いことを見いだした。Xuらは、プロモーター活性の降順が、NSE(1.8kb)、EF、NSE(0.3kb)、GFAP、CMV、hENK、PPE、NFLおよびNFHであることを見出した。NFLは650ヌクレオチドのプロモーターであり、NFHは920ヌクレオチドのプロモーターであり、いずれも肝臓には存在しないが、NFHは感覚固有受容体ニューロン、脳および脊髄に豊富であり、NFHは心臓に存在する。Scn8aは、DRG、脊髄、および脳に広く発現する470ヌクレオチドのプロモーターであり、海馬ニューロンおよび小脳プルキンエ細胞、皮質、視床および視床下部に特に高い発現が見られる (例えば、Drews et al. 2007 およびRaymond et al. 2004を参照せよ;これらの各々の内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
一実施形態において、UBCプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用してよい。UBCプロモーターは、300〜350ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な一例として、UBCプロモーターは332ヌクレオチドの長さである。
一実施形態において、GUSBプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドと共に使用してよい。GUSBプロモーターは、350〜400ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、GUSBプロモーターは378ヌクレオチドの長さである。非限定的な一例として、構築物は、AAV−プロモーター−CMV/グロビンイントロンhFXN−RBGであってよく、この構築物では、AAVが自己相補的であってよく、AAVがDJ血清型であってよい。
一実施形態では、NFLプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用してよい。NFLプロモーターは、600〜700ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な一例として、NFLプロモーターは650ヌクレオチドの長さである。非限定的な一例として、構築物は、AAV−プロモーター−CMV/グロビンイントロンhFXN−RBGであってよく、この構築物では、AAVが自己相補的であってよく、AAVがDJ血清型であってよい。
一実施形態では、NFHプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。前記NFHプロモーターは、900〜950ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な一例として、NFHプロモーターは920ヌクレオチドの長さである。非限定的な一例として、構築物は、AAV−プロモーター−CMV/グロビンイントロンhFXN−RBGであってよく、この構築物では、AAVが自己相補的であってよく、AAVがDJ血清型であってよい。
一実施形態では、scn8aプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。scn8aプロモーターは、450〜500ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な一例として、scn8aプロモーターは470ヌクレオチドの長さである。非限定的な一例として、構築物は、AAV−プロモーター−CMV/グロビンイントロンhFXN−RBGであってよく、この構築物では、AAVが自己相補的であってよく、AAVがDJ血清型であってよい。
一実施形態では、FXNプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。
一実施形態では、PGKプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。
一実施形態では、CBAプロモートを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。
一実施形態では、CMVプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。
一実施形態では、肝臓または骨格筋プロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。肝臓プロモーターの非限定的な例には、hAATおよびTBGが挙げられる。骨格筋プロモーターの非限定的な例には、Desmin、MCKおよびC5−12が挙げられる。
一実施形態では、エンハンサーエレメント、プロモーターおよび/または5’UTRイントロンを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。エンハンサーはCMVエンハンサーであってよいが、これに限定されず;プロモーターはCMV、CBA、UBC、GUSB、NSE、サナプシン、MeCP2、およびGFAPプロモーターであってよいが、これに限定されず;また5’UTR/イントロンは、SV40およびCBA−MVMであってよいが、これらに限定されない。非限定的な例として、組み合わせて使用されるエンハンサー、プロモーターおよび/またはイントロンには以下が挙げられる:(1)CMVエンハンサー、CMVプロモーター、SV40 5’UTRイントロン;(2)CMVエンハンサー、CBAプロモーター、SV40 5’UTRイントロン;(3)CMVエンハンサー、CBAプロモーター、CBA−MVM 5’UTRイントロン;(4)UBCプロモーター;(5)GUSBプロモーター;(6)NSEプロモーター;(7)シノプシンプロモーター;(8)MeCP2プロモーターおよび(9)GFAPプロモーター。
一実施形態では、操作されたプロモーターを、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用することができる。
イントロン
一実施形態では、少なくとも1つのエレメントを本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用し、導入遺伝子標的特異性および発現を増強することができる(例えば、Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and
Expression in Gene Therapy, 2015を参照せよ;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。一実施形態では、少なくとも1つのエレメントを本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドとともに使用し、イントロンなどの導入遺伝子標的特異性および発現を増強することができる(例えば、Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and Expression in Gene Therapy, 2015を参照せよ;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。イントロンの非限定的な例には、MVM(67〜97 bps)、F.IX短縮イントロン1(300 bps)、βグロビンSD/免疫グロブリン重鎖スプライスアクセプター(250 bps)、アデノウイルススプライスドナー/免疫グロブリンスプライスアクセプター(500 bps)、SV40晩期スプライスドナー/スプライスアクセプター(19S/16S)(180bps)、およびハイブリッドアデノウイルススプライスドナー/IgGスプライスアクセプター(230bps)が挙げられる。
一実施形態では、イントロンは100〜500ヌクレオチドの長さを有し得る。イントロンは、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490または500の長さを有し得る。イントロンは、80〜100、80〜120、80〜140、80〜160、80〜180、80〜200、80〜250、80〜300、80〜350、80〜400、80〜450、80〜500、200〜300、200〜400、200〜500、300〜400、300〜500または400〜500の長さを有し得る。
細胞への導入
本発明のAADCポリヌクレオチドは、様々なアプローチのいずれかを用いて宿主細胞に導入することができる。AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターによる感染を行うことができる。適切なウイルスベクターの例には、複製欠損レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ベクター、およびレンチウイルスベクターが挙げられる。
本発明によれば、治療および/または診断に使用するためのウイルスベクターは、目的の核酸ペイロードまたは カーゴの形質導入に必要な最小構成要素まで蒸留または還元されたウイルスからなる。
このようにして、ウイルスベクターは特異的投与のための媒体として設計され、そのようなウイルスベクターは野生型ウイルスに見られる有害な複製および/または組み込みの特徴を欠いている。
本明細書中では、「ベクター」という語は、本発明のポリヌクレオチドなどの異種分子を輸送するか、形質導入するか、あるいはそれらの異種分子の担体として作用する任意の分子または部分を意味する。「ウイルスベクター」という語は、目的のペイロード分子をコードするかまたは目的のペイロード分子からなる1つまたはそれ以上のポリヌクレオチド領域をからなるベクターを意味し、その例には、導入遺伝子、ポリペプチドまたはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが挙げられる。本発明のウイルスベクターは、組み換えにより産生され、アデノ随伴ウイルス(AAV)親または参照配列に基づくものであってもよい。本発明において有用であり得る血清型は、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAV−DJとAAV−DJ8.から生じるあらゆるものが挙げられる。
一実施形態において、本発明において有用であり得る血清型は、AAV−DJ8であり得る。AAV−DJ8のアミノ酸配列は、ヘパリン結合ドメイン(HBD)を除去するために、2つまたはそれ以上の突然変異を含んでいてよい。非限定的な一例として、米国特許第7,588,772号(この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に配列番号1として記載されているAAV−DJ配列は、以下に示す2つの突然変異からなっていてよい:(1)アミノ酸587のアルギニン(R;arg)がグルタミン(Q;gln)に変わっているR587Q、および(2)アミノ酸590のアルギニン(R;arg)がスレオニン(T;thr)に変わっているR590T。別の非限定的な一例として、当該AAV−DJ配列は、以下に示す3つの突然変異からなっていてよい:(1)アミノ酸406のリシン(K;lys)がアルギニン(R;arg)に変わっているK406R、(2) アミノ酸587のアルギニン(R;arg)がグルタミン(Q;gln)に変わっているR587Q、(3)アミノ酸590のアルギニン(R;arg)がスレオニン(T;thr)に変わっているR590T。
AAVベクターはまた、自己相補的AAVベクター(scAAV)からなっていてよい。scAAVベクターは、双方のDNA鎖を含み、それらが共にアニーリングし、二本鎖DNAを形成する。第二鎖合成をスキップすることにより、scAAVは細胞内での迅速な発現を可能にする。
医薬組成物
投与されるペイロード(例えば、AADCコード配列)からなる、本明細書に記載されている医薬組成物(例えば、AAVなどのウイルスなどのコードプラスミドまたは発現ベクターを含むポリヌクレオチド)の記載は、主にヒトへの投与に適した医薬組成物に関するものであり、そのような組成物は、一般に、他の動物(例えば、ヒト以外の動物、例えば、ヒト以外の哺乳動物)への投与に適している。医薬組成物を種々の動物への投与に適したものにするために、ヒトへの投与に適した医薬組成物の改変はよく理解されており、通常の熟練した獣医学の薬理学者は、もし実験を行なうとすれば、単に通常の実験でこのような改変を設計および/または実施することができる。当該医薬組成物の投与が企図される対象には、ヒトおよび/または他の霊長類;ウシ、ブタ、ウマ、ヒツジ、ネコ、イヌ、マウスおよび/またはラットのような商業的に関連する哺乳動物を含む哺乳類;および/または家禽、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、および/またはシチメンチョウのような商業的に関連する鳥類を含むが、それらに限定されない。
いくつかの実施形態では、組成物は、ヒト、ヒトの患者、または対象に投与される。本開示の目的においては、「有効成分」という語句は、一般に、ペイロードを担持するウイルスベクター、または本明細書に記載のウイルスベクターによって投与されるポリヌクレオチドペイロード分子のいずれかを指す。
本明細書に記載された医薬組成物の製剤は、薬理学の分野において既知または今後開発される任意の方法によって調製することができる。一般に、そのような調製方法は、活性成分を賦形剤および/または1つまたはそれ以上の他の補助成分と会合させる工程を包含し、必要であればおよび/または望ましい場合には、生成物を所望の単回投与単位または複数回投与単位に、分割し、成形し、および/または包装する工程をも包含する。
本発明による医薬組成物中の活性成分、薬学的に許容される賦形剤および/または任意の追加の成分の相対量は、処置される対象の同一性、サイズおよび/または状態に依存して変化し、さらに 組成物が投与されるルートに依存して変化する。
一実施形態では、医薬組成物は、AAVキャプシドおよびAAVベクターゲノムからなる組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターからなる。AAVベクターゲノムは、本明細書に記載の少なくとも1つのAADCポリヌクレオチドを含んでもよく、その例には、配列番号6,7,8,9,17,18,19,20,21,22および23、あるいはそれらに対して少なくとも95%の同一性を有する変異体が含まれるがそれらに限定されない。医薬組成物中の組換えAAVベクターの少なくとも70%は、AAVベクターゲノムを含む。
製剤化
それらをコードするAADCポリヌクレオチドまたはウイルスベクターは、以下の目的のために1つあるいはそれ以上の賦形剤を用いて、製剤化される:(1)安定性を高める;(2)細胞トランスフェクションまたは形質導入を高める;(3)持続放出または遅延放出を可能にする;(4)生体内分布を変化させる(例えば、ウイルスベクターを特定の組織または細胞型に標的化する)。
本発明の製剤には、限定することなく、生理食塩水、リピドイド、リポソーム、脂質ナノ粒子、ポリマー、リポプレックス、コア−シェルナノ粒子、ペプチド、タンパク質、ウイルスベクターでトランスフェクションした細胞(例えば、対象への移植のための細胞)、ナノ粒子模倣物、およびそれらの組み合わせを含めてよい。さらに、本発明のウイルスベクターは、自己組織化核酸ナノ粒子を用いて製剤化してよい。
本明細書に記載された医薬組成物の製剤は、薬理学の分野において既知または今後開発される任意の方法によって調製することができる。一般に、そのような調製方法は、有効成分を賦形剤および/または1つまたはそれ以上の他の補助成分と会合させる工程を含む。
本開示による医薬組成物は、バルクで、単一の単位用量として、および/または複数の単一単位用量として調製、包装および/または販売されてよい。本明細書では、「単位用量」という語は、所定量の活性成分からなる医薬組成物の個別の量を指す。活性成分の量は、一般的に、対象に投与されるであろう活性成分の用量および/またはこのような用量の特定のニーズを満たす一部分(例えば、そのような用量の半分または三分の一)に等しい。
本開示による医薬組成物中の活性成分、薬学的に許容される賦形剤および/または任意の追加の成分の相対量は、処置される対象の同一性、サイズおよび/または状態に依存して変化し、さらに組成物が投与されるルートに依存して変化する。例えば、組成物は、0.1%〜99%(w/w)の有効成分からなっていてよい。一例として、組成物は、0.1%〜100%(例えば、0.5〜50%、1〜30%、5〜80%、少なくとも80%(w/w))の活性成分からなっていてよい。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の製剤は、少なくとも1個のペイロード分子(例えば1個のAADCポリヌクレオチド)を含んでいてよい。非限定的な一例として、製剤は、1個、2個、3個、4個、または5個のAADCポリヌクレオチドペイロード分子を含んでいてよい。
いくつかの実施形態において、薬学的に許容される賦形剤は、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%純粋であってよい。いくつかの実施形態において、賦形剤は、ヒトおよび獣医学のための使用が承認されている。いくつかの実施形態において、賦形剤は、米国食品医薬品局によって承認されている。いくつかの実施形態において、賦形剤は、医薬グレードのものである。いくつかの実施形態において、賦形剤は、米国薬局方(USP)、欧州薬局方(EP)、英国薬局方および/または国際薬局方の基準を満たす。
本明細書では、賦形剤は、所望の特定の剤形に適したものである限り、任意のおよび全ての溶媒、分散媒、希釈剤、または他の液体ビヒクル、分散または懸濁助剤、界面活性剤、等張剤、増粘剤または乳化剤、防腐剤などを含むが、これらに限定されない。医薬組成物を調製するための様々な賦形剤および組成物を調製するための技術は、当該分野で公知である(Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21st Edition, A. R. Gennaro, Lippincott, Williams & Wilkins, Baltimore, MD, 2006を参照せよ;その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。任意の従来の賦形剤媒体が、任意の望ましくない生物学的効果を生じさせることによって、あるいは医薬組成物の他の成分(群)と有害に相互作用することによって、ある物質またはその誘導体と不適合でない限りにおいては、従来の賦形剤媒体の使用は、本開示の範囲内で考えられてよい。
希釈剤の例には、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、リン酸カルシウム、リン酸二カルシウム、硫酸カルシウム、リン酸水素カルシウム、リン酸ナトリウム乳糖、ショ糖、セルロース、微晶質セルロース、カオリン、マンニトール、ソルビトール、イノシトール、塩化ナトリウム、乾燥デンプン、コーンスターチ、粉末糖等、および/またはそれらの組み合わせが含まれるが、それらに限定されない。
一実施形態において、AADCポリヌクレオチドは、投与前にヒドロゲル中で製剤化してよい。ヒドロゲルは、水分含量が多いため、天然組織に類似した柔軟性を有する。
別の実施形態において、AADCポリヌクレオチド製剤の投与の前に、ヒドロゲルを対象に投与してよい。非限定的な一例として、ヒドロゲルの投与部位は、AADCポリヌクレオチド製剤の投与部位から、3インチ以内(例えば、2.9、2.8、2.7、2.6、2.5、2.4、2.3、2.2、2.1、2.0、1.9、1.8、1.7、1.6、1.5、1.4、1.3、1.2、1.1、1.0、0.9、0.8、0.7、0.6、0.5、0.4、0.3、0.2、0.1あるいは0.1インチ未満)であってよい。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドは、生食水中で投与してよい。非限定的な一例として、製剤は、0.001%プルロン酸(F−68)を含むリン酸緩衝食塩水(PBS)であってもよい。さらに、製剤は滅菌されていてもよい。
不活性成分
いくつかの実施形態では、AADCポリヌクレオチド製剤は、不活性成分である少なくとも1つの賦形剤を含み得る。本明細書中では、「不活性成分」という語は、製剤に含まれる1つ以上の不活性薬剤を指す。いくつかの実施形態では、本発明の処方物において使用され得る不活性成分の全てまたは一部は、米国食品医薬品局(FDA)によって承認されているか、あるいは承認されていない。
本明細書に開示されるAADCポリヌクレオチドを保有するウイルスベクターの製剤は、カチオンまたはアニオンを含み得る。一実施形態では、製剤は、限定されないが、Zn2+、Ca2+、Cu2+、Mg+およびそれらの組み合わせなどの金属カチオンを含む。非限定的な一例として、製剤は、金属陽イオンと複合体を形成したポリマーおよびAADCポリヌクレオチドを含み得る(米国特許第6,265,389号および第6,555,525号を参照せよ;それぞれその全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
投与
本発明のAADCポリヌクレオチドを含むウイルスベクターは、任意の経路によって投与され、治療上有効な結果もたらす。これらには、以下が含まれるが、これらに限定されない:硬膜外(硬膜内)、口腔(口を介す)、経皮的、経皮、脳内(大脳に)、脳室内(脳室に)、皮下(皮膚の下)、経鼻投与(鼻を通じて)、静脈内(静脈内)、静脈内ボーラス、点滴、動脈内(動脈内)、くも膜下腔内(脊柱管内)、子宮内、脊髄内(尾骨内)、大槽内(大槽内の小脳髄腔内)、椎間板内(脊柱管内)、硬膜内(または硬膜下)、髄膜内(髄膜内)、脊髄内(脊柱内)、髄腔内(脳脊髄軸の任意のレベルの脳脊髄液内)、胸腔内(胸腔内)、線条体(線条体、尾状核および/または被殻内)、尾骨ブロック、神経ブロック、または脊髄が挙げられる。特定の実施形態では、組成物は、それらが血液脳関門、血管関門またはその他の上皮障壁を通過するように投与してよい。一実施形態では、投与経路のための製剤は、少なくとも1つの不活性成分を含んでいてよい。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドを含むウイルスベクターは、右被殻および/または左対象被殻に投与してよい。投与は、被殻の1つまたはそれ以上の部位(例えば2つの部位、3つの部位、4つの部位、または4つ以上の部位を含むが、これらに限定されない)で行なってよい。非限定的な一例として、本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、左被殻の2つの部位および右被殻の2つの部位に投与される。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターの製剤の対象への投与は、対象の被殻(例えば、左および/または右の被殻)の適用範囲を提供する。一態様では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターの投与は、対象の左および/または右の被殻に、少なくとも8%、9%、10%、13%、14%、15%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%以上の適用範囲を提供する。非限定的な一例として、適用範囲は少なくとも20%である。非限定的な一例として、適用範囲は少なくとも40%である。別の態様では、AADCポリヌクレオチドを含むウイルスベクターの投与は、対象の左および/または右の被殻の表面積の少なくとも8%、9%、10%、13%、14%、15%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%または95%以上の適用範囲を提供する。非限定的な一例として、全適用範囲は少なくとも20%である。非限定的な一例として、全適用範囲は少なくとも40%である。さらに別の態様では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターの投与は、対象の左および/または右の被殻に対し、または対象の左および/または右の被殻の全表面積に対し、10〜40%、20〜40%、20〜30%、20〜35%、20〜50%、30〜40%、35〜40%、30〜60%、40〜70%、50〜80%または60〜90%の適用範囲を提供する。
一実施形態において、本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターの製剤の対象への投与は、対象の後部被殻(例えば、左および/または右の後部被殻)の適用範囲を提供する。一態様では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターの投与は、対象の左および/または右の後部被殻の少なくとも10%、15%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%または95%以上の適用範囲を提供する。非限定的な一例として、適用範囲は少なくとも20%である。非限定的な一例として、適用範囲は少なくとも40%である。一態様では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターの投与は、対象の左および/または右の後部被殻の表面積の少なくとも10%、15%、20%、21%、22% 、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%または95%以上の適用範囲を提供する。非限定的な一例として、全適用範囲は少なくとも20% である。非限定的な一例として、全適用範囲は少なくとも40%である。さらに別の態様では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターの投与は、対象の左および/または右の後部被殻に対し、または対象の左および/または右被殻の全表面積に対して、10〜40%、20〜50%、30〜60%、40〜70%、50〜80%または60〜90%の適用範囲を提供する。
一実施形態では、対象に、本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、黒質緻密部(SNpc)および腹側被蓋領域(VTA)に、あるいは線条体内に(尾状核および被殻に)または視床下部核(STN)に、バイラテラル注入を介して、安全に投与され得る。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドは、各被殻へのカテーテルの急性両側留置を用いて投与され得る。その留置は、当技術分野で知られているか、または本明細書に記載されている磁気共鳴画像(MRI)ガイド下の定位神経外科手技を使用して行なうことができる。さらに、ガドリニウム系の造影剤(例えば、PROHANCE(登録商標))を含むがそれに限定されない造影剤を製剤に使用して、製剤の分布をモニターし、確認することができる。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドをからなるウイルスベクターを、被殻(例えば、後交連被殻)へのバイラテラル定位CED補助ステップ注入により、対象に投与し得る。
一実施形態では、本発明によるウイルスベクター医薬組成物のCNSの細胞(例えば、実質)への投与は、[VG/時間=mL/時間*VG/mL]によって定義される投与速度からなり、ここで、VGはウイルスゲノムであり、VG/mLは組成物の濃度であり、mL/時間は長期間注入の速度である。
一実施形態では、本発明によるウイルスベクター医薬組成物のCNSの細胞(例えば、実質)への投与は、最高で1mLの注入からなる。一実施形態において、本発明によるウイルスベクター医薬組成物のCNSの細胞(例えば、実質)への投与は、0.001、0.002、0.003、0.004、0.005、0.010、0.015、0.020、0.025、0.030、0.040、0.050、0.060、0.070、0.080、0.090、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8または0.9mLである。
一実施形態において、本発明によるウイルスベクター医薬組成物のCNSの細胞(例えば、実質)への投与は、約1mL〜約120mLの間の注入からなる。一実施形態では、本発明によるウイルスベクター医薬組成物のCNSの細胞(例えば、実質)への投与は、0.1、1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119または120mLの注入からなる。一実施形態では、CNSの細胞(例えば、実質)へのAAV粒子の投与は、少なくとも3mLの注入からなる。一実施形態では、CNSの細胞(例えば、実質)へのAAV粒子の投与は、3mLの注入からなる。一実施形態では、CNSの細胞(例えば、実質)へのAAV粒子の投与は、少なくとも10mLの注入からなる。一実施形態では、CNSの細胞(例えば、実質)へのAAV粒子の投与は、少なくとも10mLの注入から構成されている。
一実施形態では、対象のCNS(例えば、実質)の細胞に投与されるウイルスベクター医薬組成物の容量は、50μl、100μl、200μl、300μl、400μl、500μl、600μl 700μl、800μl、900μl、1000μl、1100μl、1200μl、1300μl、1400μl、1500μl、1600μl、1700μl、1800μl、1900μl、2000μlまたは2000μl以上である。
一実施形態では、対象の脳の両半球の領域に投与されるウイルスベクター医薬組成物の容量は、50μl、100μl、200μl、300μl、400μl、500μl、600μl、700μl 900μl、1000μl、1100μl、1200μl、1300μl、1400μl、1500μl、1600μl、1700μl、1800μl、1900μl、2000μl、または2000μl以上である。非限定的な一例として、両方の半球の領域に投与される用量は、200μlである。別の非限定的な一例として、両方の半球の領域に送達される用量は、900ulである。さらに別の非限定的な一例として、両方の半球の領域に投与される容量は、1800μlである。
一実施形態では、対象の脳の両半球の被殻に投与されるウイルスベクター医薬組成物の容量は、50μl、100μl、200μl、300μl、400μl、450μl、500μl、600μl 700μl、800μl、900μl、1000μl、1100μl、1200μl、1300μl、1400μl、1500μl、1600μl、1700μl、1800μl、1900μl、2000μl、または2000μl以上である。非限定的な一例として、両半球の被殻に投与される容積は100μlである。別の非限定的な一例として、両半球の被殻に投与される体積は200μlである。非限定的な一例として、両半球の被殻に投与される容積は300μlである。別の非限定的な一例として、両半球の被殻に投与される容積は450μlである。別の非限定的な一例として、両半球の被殻に投与される容積は900ulである。さらに別の非限定的な一例として、両半球の被殻に投与される容積は、1800ulである。
非限定的な一例として、一個体の対象に投与される総容量は、一つまたはそれ以上の投与部位(例えば、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、あるいは5つ以上の投与部位)の間で分割される。非限定的な一例として、総容量は、左被殻への投与と右被殻への投与の間で分割される。別の非限定的な一例として、総容量は、左右の被殻の各々への2つの投与部位の間で分割される。
一実施形態において、ウイルスベクター医薬組成物は、有窓針を用いて投与される。有窓針の非限定的な例は、米国特許第8,333,734号、第7,135,010号、第7,575,572号、第7,699,852号、第4,411,657号、第6,890,319号、第6,613,026号、第6,726,659号、第6,565,572号、第6,520,949号、第6,382,212号、第5,848,996号、第5,759,179号、第5,674,267号、第5,588,960号、第5,484,401号、第5,199,441号、第5,012,818号、第4,474,569号、第3,766,907号、第3,552,394号に記載されており、その各々の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
一実施形態では、組成物は、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドからなり、AADCポリヌクレオチドは、AAVウイルス粒子中にパッケージングされたAAVウイルスゲノムの成分である。組成物中で、AADCポリヌクレオチド(本明細書では空のキャプシドとも呼ばれる)を含まないAAVウイルス粒子に対する、AADCポリヌクレオチド(本明細書中ではAADC粒子とも呼ばれる)を含むAAVウイルス粒子のパーセント(%)比は、0:100、1:99、0:90、15:85、25:75、30:70、50:50、70:30、85:15、90:10、99:1、または100:0である。非限定的な一例として、空のキャプシドに対するAADC粒子のパーセント比は50:50である。別の非限定的な一例として、空のカプシドに対するAADC粒子のパーセント比は70:30である。別の非限定的な一例として、空のキャプシドに対するAADC粒子のパーセント比は85:15である。別の非限定的な一例として、空のキャプシドに対するAADC粒子のパーセント比は100:0である。
一実施形態では、本明細書に記載の組成物は、少なくとも1,5,10,15,20,25,30,35,40,45,50,51,52,53,54,55,60,65,70,75,80,81,82,83,84,85,86,87,88,89,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99、または99%を越えるAADC粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は少なくとも50%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、組成物は少なくとも52%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、組成物は少なくとも58%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、組成物は少なくとも70%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、組成物は少なくとも83%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、組成物は少なくとも85%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、組成物は少なくとも99%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、組成物は100%AADC粒子からなる。
一実施形態では、本明細書に記載の組成物は、1〜10%、10〜20%、30〜40%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜99%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜99%、70〜100%、80〜85%、80〜90%、80〜95%、80〜99%、80〜100%、90〜95%、90〜99%、または90〜100%のAADC粒子からなる。非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は50〜100%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は50〜60%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は80〜99%のAADC粒子からなる。別の非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は80〜90%のAADC粒子からなる。非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は80〜95%のAADC粒子からなる。非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は80〜85%のAADC粒子からなる。
一実施形態では、本明細書に記載の組成物は、組成物の全重量に基づいて、1,5,10,15,20,25,30,35,40,45,50,51,52,53,54,55,60,65,70,75,80,81,82,83,84,85,86,87,88,89,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99または100%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は50%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は45%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は40%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は35%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は30%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は25%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は20%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は15%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は10%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は5%未満の空の粒子からなる。非限定的な一例として、組成物は1%未満の空の粒子からなる。
本明細書に記載の組成物では、1〜10%、10〜20%、30〜40%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜99%、50〜100%、60〜70% 60〜80%、60〜90%、60〜99%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜99%、70〜100%、80〜85%、80〜90%、80〜95%、80〜99%、80〜100%、90〜95%、90〜99%または90〜100%の空の粒子からなる。非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は30〜40%の空の粒子からなる。別の非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は30〜50%の空の粒子からなる。別の非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は30〜60%の空の粒子からなる。別の非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は30〜70%の空の粒子からなる。非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は30〜80%の空の粒子からなる。非限定的な一例として、本明細書に記載の組成物は30〜90%の空の粒子からなる。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドは、レボドパ療法も受けている対象に投与してよい。非限定的な一例として、対象は、レボドパ療法に対する肯定的な応答を示し、PDの少なくとも1つの症状が軽減される。別の非限定的な一例として、対象は、対象が経験するPDの症状が安定している場合に、レボドパ療法に対する応答を示していてもよい。さらに別の非限定的な一例として、対象は、対象が経験するPDの症状が高まっている場合に、レボドパ療法に対する否定的な応答を示していてもよい。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドに先立って対象に投与されるレボドパの用量は、1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25、または25mg/kgを超える量である。非限定的な一例として、その用量は3mg/kgである。別の非限定的な一例として、その用量は10mg/kgである。さらに別の非限定的な市例として、その用量は20mg/kgである。レボドパに対する対象の応答(例えば、行動応答)は、AADCポリヌクレオチドの投与前に評価する。さらに、AADCポリヌクレオチドの投与後に、対象にレボドパを再度投与してもよい(例えば、AADCポリヌクレオチドの投与後、1週間、2週間、3週間、1ヶ月、2ヶ月、3ヶ月、4ヶ月、5ヶ月、6ヶ月、8カ月、9カ月、10カ月、11カ月、1年、または1年以上)。行動反応を再評価し、初期応答と比較して、AADCポリヌクレオチドの効果を判断することができる。対象には、1%,2%,3%,4%,5%,6%,7%,8%,9%,10%,15%,20%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,55%,60%,65%,70%,75%,80%,85%,90%,95%,99%or100%の行動改善が見られる。
一実施形態において、レボドパは、AADCポリヌクレオチドの投与後に複数回投与してよい。レボドパは、反復スケジュール(例えば、5日ごと、1週間毎、10日毎、15日毎、30日毎、月1回、2ヶ月毎、3ヶ月毎、4ヶ月毎、5ヶ月毎、6ヶ月毎、7ヶ月毎、8ヶ月毎、9ヶ月ごと、10ヶ月毎、11ヶ月毎、または毎年)、または症状が現れた時に、投与してよい。非限定的な一例として、AADCポリヌクレオチドの投与の3年後に、対象の被殻の注入領域内の線条体ニューロンの1〜10%、5〜15%、10〜20%、15〜30%、20〜40%、25〜50%、30%〜50%、40〜50%、40〜60%、50〜70%、50〜80%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜90%、70〜80%、70〜90%、75〜90%、80〜90%、90〜100%がAADC免疫反応性である。非限定的な一例として、AADCポリヌクレオチドの投与6年後に、対象の被殻の注入領域内の線条体ニューロンの1〜10%、5〜15%、10〜20%、15〜30%、20〜40%、25〜50% 30〜50%、40〜50%、40〜60%、50〜70%、50〜80%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜90%、70〜80%、70〜90%、75〜90%、80〜90%、90〜100%がAADC免疫反応性である。非限定的な一例として、AADCポリヌクレオチドの投与9年後に、対象の被殻の注入領域内の線条体ニューロンの、1〜10%、5〜15%、10〜20%、15〜30%、20〜40%、25〜50% 30〜50%、40〜50%、40〜60%、50〜70%、50〜80%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜90%、70〜80%、70〜90%、75〜90%、80〜90%、90〜100%がAADC免疫反応性である。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与することができる対象は、レボドパ療法に対する文書化された応答を有するが、医学的に不応性の変動を有し、良好な外科的候補と考えられる。対象が良好な外科的候補者であるかどうかの判定は、その対象をPDに関し治療している医師、またはAADCポリヌクレオチドを投与する医師により下され、その場合に、医師は、AADCポリヌクレオチドの投与に必要とされる外科的介入について、患者の全体的なリスクに対する利益の比を考慮する。
一実施形態では、対象の一領域の実質における分布容積の、対象の一領域の注入容積に対する比は、0.1,0.2,0.3,0.4,0.5,0.6,0.7,0.8,0.9,1.0,1.1,1.2,1.3,1.4,1.5,1.6,1.7,1.8,1.9,2.0,2.1,2.2,2.3,2.4,2.5,2.6,2.7,2.8,2.9,3.0,3.1,3.2,3.3,3.4,3.5,3.6,3.7,3.8,3.9,4.0,4.1,4.2,4.3,4.4,4.5,4.6,4.7,4.8,4.9,5.0,5.1,5.2,5.3,5.4,5.5,5.6,5.7,5.8,5.9,6.0、または6.0以上である。非限定的な一例として、実質の分布容積対注入容積の比は、尾状核において1.6であった。非限定的な一例として、実質の分布容積対注入容積の比は、被殻において3.1であった。非限定的な一例として、被殻におけるAADCポリヌクレオチドの分布は、注入される容積の2〜3倍であり得る。
投薬
本発明は、本発明によるウイルスベクターおよびそのAADCポリヌクレオチドペイロードまたは複合体を、それを必要とする対象に投与することからなる方法を提供する。ウイルスベクターの医薬用、造影用、診断用、または予防用の組成物は、疾患、障害、および/または状態(例えば、作業記憶障害に関連する疾患、障害、および/または状態)を予防、治療、診断または造影するのに有効な任意の量および投与経路を用いて、対象に投与することができる。正確な必要量は、対象の動物種、年齢、および一般的な状態、疾患の重篤度、特定の組成物、その投与様式、その活性様式などに依存して、対象によって異なるであろう。本発明による組成物は、典型的には、投与の容易さおよび投与量の均一性のために、単位剤形で処方される。しかし、本発明の組成物の1日総使用量は、健全な医学的判断の範囲内で主治医によって決定され得ることが理解されるであろう。特定の患者に対し治療上有効な、予防的に有効な、または適切な造影用の用量レベルは、以下を含む多様な要因に依存している:治療対象の障害および当該障害の重篤度;使用される特定の化合物の活性;使用される特定の組成物;患者の年齢、体重、全般的な健康状態、性別および食事;投与時間、投与経路、および使用される特定のポリヌクレオチドペイロードの排泄速度;治療の持続時間;使用される特定の化合物と組み合わせてまたは同時に使用される薬物;医学分野でよく知られている同様の要因。
ある実施形態では、本発明のウイルスベクター医薬組成物は、対象の体重に比して1日当たり、約0.0001mg/kg〜約100mg/kg、約0.001mg/kg〜約0.05mg/kg、約0.005mg/kg〜約0.05mg/kg、約0.001mg/kg〜約0.005mg/kg、約0.05mg/kg〜約0.5mg/kg、約0.01mg/kg〜約50mg/kg、約0.1mg/kg〜約40mg/kg、約0.5mg/kg〜約30mg/kg、約0.01mg/kg〜約10mg/kg、約0.1mg/kg〜約10mg/kg、または約1mg/kg〜約25mg/kgを投与するのに十分なAADCポリヌクレオチド用量レベルで、1日1回または複数回投与することにより、所望の治療効果、診断効果、予防効果または造影効果を得ることができる。所望のAADCポリヌクレオチド用量は、1日に3回、1日に2回、1日に1回投与してよく、または24時間内にその用量は、1回、2回、3回、または3回より多く投与してよい。ある実施形態では、所望のAADCポリヌクレオチド用量は、複数の投与(例えば、2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14、またはそれ以上の投与)を行なって投与してよい。複数の投与を行なう場合、本明細書に記載されているような分割投与計画を使用することができる。本明細書で使用される「分割投与量」という語は、単回単位用量または総用量の分割を意味し、例えば単一単位用量を2回あるいはそれ以上に分割することを意味する。本明細書で使用される「単一単位用量」という語は、一用量/一回の投与/単一の経路/単一の接触点すなわち単回投与イベントで投与される任意のポリヌクレオチド治療剤の用量を意味する。本明細書中で使用される「1日総投与量」という語は、24時間に投与または処方される量である。それは単一単位用量として投与することができる。一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、分割用量で対象に投与される。それらは、緩衝液中でのみ、または本明細書に記載の製剤中で処方することができる。
一実施形態では、本発明によるウイルスベクター医薬組成物のCNSの細胞(例えば、実質)への投与は、約1x10 VG/mLおよび約1x1016 VG/mLの総濃度からなる。いくつかの実施形態において、投与は、以下の組成物濃度からなる:1x10、2x10、3x10、4x10、5x10、6x10、7x10、8x10、9x10、1x10、2x10、3x10、4x10、5x10、6x10、7x10、8x10、9x10、1x10、2x10、3x10、4x10、5x10、6x10、7x10、8x10、9x10、1x10、2x10、3x10、4x10、5x10、6x10、7x10、8x10、9x10、1x1010、2x1010、3x1010、4x1010、5x1010、6x1010、7x1010、8x1010、9x1010、1x1011、1.8x1011、2x1011、3x1011、4x1011、5x1011、5.5x1011、6x1011、7x1011、8x1011、9x1011、0.8x1012、0.83x1012、1x1012、1.1x1012、1.2x1012、1.3x1012、1.4x1012、1.5x1012、1.6x1012、1.7x1012、1.8x1012、1.9x1012、2x1012、2.1x1012、2.2x1012、2.3x1012、2.4x1012、2.5x1012、2.6x1012、2.7x1012、2.8x1012、2.9x1012、3x1012、3.1x1012、3.2x1012、3.3x1012、3.4x1012、3.5x1012、3.6x1012、3.7x1012、3.8x1012、3.9x1012、4x1012、4.1x1012、4.2x1012、4.3x1012、4.4x1012、4.5x1012、4.6x1012、4.7x1012、4.8x1012、4.9x1012、5x1012、6x1012、7x1012、8x1012、9x1012、1x1013、2x1013、3x1013、4x1013、5x1013、6x1013、7x1013、8x1013、9x1013、1x1014、2x1014、3x1014、4x1014、5x1014、6x1014、7x1014、8x1014、9x1014、1x1015、2x1015、3x1015、4x1015、5x1015、6x1015、7x1015、8x1015、9x1015、あるいは1x1016 VG/mL。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、1x1013 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、3x1012 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、1.1x1012 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、3.7x1012 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、8x1011 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、2.6x1012 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、4.9x1012 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、0.8x1012 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、0.83x1012 VG/mLである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、バイアルに含まれ得る最大最終用量である。
一実施形態では、本発明によるウイルスベクター医薬組成物のCNSの細胞(例えば、実質)への投与は、対象1個体当たりの全濃度が約1x10 VGと約1x1016 VGの間である。いくつかの実施形態において、投与は、以下の組成物濃度からなる:対象一個体当たり、約1x10、2x10、3x10、4x10、5x10、6x10、7x10、8x10、9x10、1x10、2x10、3x10、4x10、5x10、6x10、7x10、8x10、9x10、1x10、2x10、3x10、4x10、5x10、6x10、7x10、8x10、9x10、1x10、2x10、3x10、4x10、5x10、6x10、7x10、8x10、9x10、1x1010、1.5x1010、2x1010、3x1010、4x1010、5x1010、6x1010、7x1010、8x1010、9x1010、1x1011、1.3x1011、2x1011、2.1x1011、2.2x1011、2.3x1011、2.4x1011、2.5x1011、2.6x1011、2.7x1011、2.8x1011、2.9x1011、3x1011、4x1011、5x1011、5.4x1011、6x1011、7x1011、7.1x1011、7.2x1011、7.3x1011、7.4x1011、7.5x1011、7.6x1011、7.7x1011、7.8x1011、7.9x1011、8x1011、9x1011、9.4x1011、1x1012、1.1 x1012、1.2x1012、1.3x1012、1.4x1012、1.5x1012、1.6x1012、1.7x1012、1.8x1012、1.9x1012、2x1012、2.3x1012、2.4x1012、3x1012、4x1012、4.1x1012、4.2x1012、4.3x1012、4.4x1012、4.5x1012、4.6x1012、4.7x1012、4.8x1012、4.9x1012、5x1012、6x1012、7x1012、8x1012、8.1x1012、8.2x1012、8.3x1012、8.4x1012、8.5x1012、8.6x1012、8.7x1012、8.8 x1012、8.9x1012、9x1012、1x1013、2x1013、3x1013、4x1013、5x1013、6x1013、7x1013、8x1013、9x1013、1x1014、2x1014、3x1014、4x1014、5x1014、6x1014、7x1014、8x1014、9x1014、1x1015、2x1015、3x1015、4x1015、5x1015、6x1015、7x1015、8x1015、9x1015、あるいは1x1016 VGである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、1x1013 VGである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、3x1012 VGである。非限定的な一例として、対象に投与される組成物は、対象一個体当たり、3x1011 VGの濃度を有する。非限定的な一例として、対象に投与される組成物は、対象一個体当たり、約9x1011 VGの濃度を有する。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、2.3x1011 VGである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、7.2x1011 VGである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、7.5x1011 VGである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、1.4x1012 VGである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、4.8x1012 VGである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、8.8x1012 VGである。一実施形態では、組成物中のウイルスベクターの濃度は、対象一個体当たり、2.3x1012 VGである。
一実施形態では、用量、投与経路および/または投与量の有効性は、PET造影、L−DOPAチャレンジ試験などの本明細書に記載の様々な方法(例えば、Forsayeth et al. 2006, Mol. 14(4): 571−577)、UPDRSスコア、および患者ダイアリー)を含むがそれらに限定されない方法を用いて、評価することができる。非限定的な一例として、対象は、AADCポリヌクレオチド組成物の投与後に、ジスキネジーが軽減するか、あるいはジスキネジーが軽減する期間が出現する。別の非限定的な一例として、対象は、限られた運動性およびジスキネジーを含む、パーキンソン病関連症状が軽減する。さらに別の非限定的な一例として、対象は、薬剤に対する肯定的反応が示されない期間(オフ時間)および運動症状の変動において改善を示す。改善は、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または90%以上において見られる。改善は、数分間(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55分間または55分間以上)、数時間(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23時間、または24時間以上)、数週間(1、2、3、4、5、6、7週間、または7週間以上)、数ヶ月間(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11カ月間、または11カ月間以上)、または数年間(例えば、1、2、3、4、5、6,7,8,9年間、または9年間以上)続く。
一実施形態では、本明細書に記載のウイルスベクターの投与のための対象の選択、および/または用量、投与経路および/または投与量の有効性は、血管周囲腔(PVS;別名、Virchow−Robin腔)の画像化を用いて評価することができる。血管周囲腔は、脳実質の中まで突き通って、脳脊髄液(CSF)/間質液で満たされていることから、細動脈および小静脈を取り囲んでいる。血管周囲腔は、中脳、BGおよび中枢半腱に共通して存在する。理論に縛られることを望むものではないが、血管周囲腔は代謝産物の正常なクリアランスに寄与する可能性があり、パーキンソン病を含む認知能の低下およびいくつかの疾患状態と関連している。血管周囲腔の大きさは通常、正常であるが、多くの疾患状態でその大きさが増大することがある。Potterら(Potter et al. Cerebrovasc Dis. 2015 Jan;39(4): 224−231;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)は、全範囲の血管周囲腔を研究し、基底核、中央半球および中脳血管周囲腔を格付けした、格付け方法を開発した。Potterらは、Mac およびLullichら(Mac and Lullich et al. J Neurol Neurosurg Psychiatry.
2004 Nov;75(11):1519−23;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)が使用したPVSの頻度と範囲を使用し、Potterらは、基底核および中央半球血管周囲腔を、以下の5つに格付けした:0(なし)、1(1−10)、2(11−20)、3(21−40)および4(>40)。さらに、中脳血管周囲腔を、以下の2つに格付けした:0(眼に見えない)または1(眼に見える)。Potterらによる評価システムのユーザーガイドは、以下のウェブサイトに掲載されている:www.sbirc.ed.ac.uk/documents/epvs−rating−scale−user−guide.pdf.
一実施形態では、本明細書に記載のウイルスベクターの投与のための対象の選択、および/または用量、投与経路および/または投与量の有効性は、[18F]FDOPAを含むがそれに限定されない神経画像バイオマーカーの陽電子放射断層撮影(PET)測定値を用いて評価することができる。[18F]FDOPAのような神経画像バイオマーカーは、疾患に冒された個体を同定するために使用することができ、および/または臨床症状の発症前に黒質線条体欠損を検出するために使用することができる。さらに、陽電子放射断層撮影(PET)に基づく基準を使用して、その黒質線条体ニューロンの完全性(例えば、異常、正常または不確実な黒質線条体ニューロンの完全性)に基づいて、対象を分類することができる(Rachette et al. Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet. 2006 Apr 5;141B(3): 245−249;この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドの用量を投与することができる対象は、進行したPDを有し、依然としてレボドパ療法に応答するが、対象はまた、医学的に難治性の運動合併症(例えば、投薬の調節および最適化にもかかわらず、レボドパおよび他のドーパミン作動性療法の間に生じる重篤な運動症状の変動)を有する対象である。対象は、当技術分野で公知の方法によって決定される神経外科的処置を受けることができる程度に健康である個体である。非限定的な一例として、対象は深部脳刺激(DBS)の選択基準を満たしている個体である。対象は、69歳未満の特発性PDを有し、レボドパに対する反応が明白であり、薬物不応症(例えば、運動変動および/またはジスキネジー)を有し、および/または認知機能障害がほとんどまたは全くない個体である。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドの用量を投与することができる対象はまた、認知症または認知障害を患う個体である。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドの用量を投与することができる対象は、以前に同一のまたは同様の治療剤で治療されている個体である。別の実施形態では、対象は、パーキンソン病の症状を軽減することがわかっている治療薬で治療されている個体である。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドの用量を投与することができる対象は、標準的な医学的治療から十分な恩恵を受けることができなかった個体である。非限定的な一例として、対象は治療に応答しなかった個体である。別の非限定的な一例として、対象は治療にもかかわらず残存する障害を有する個体である。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドの用量を投与することができる対象は、用量の有効性を決定するために神経伝達物質分析物のレベルを評価するための試験を受けることができる個体である。非限定的な一例として、CSF神経伝達物質、血漿AADC活性および/または尿VLAを分析する。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドの用量を投与することができる対象は、治療過程で対象の経過をモニターするために、ビデオテープまたは記録される。
組み合わせ
AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、1つまたはそれ以上の他の治療剤、予防剤、診断剤または造影剤と組み合わせて使用することができる。「〜と組み合わせて」とは、薬剤を同時に投与しなければならないこと、および/または共に投与するように処方しなければならないことを暗示することを意図するものではない。尤も、これらの投与方法は本開示の範囲内である。組成物は、1つまたはそれ以上の他の所望の治療または医療処置と同時に、その前に、またはその後に投与することができる。一般に、各薬剤は、その薬剤について決定された用量および/または時間スケジュールで投与される。いくつかの実施形態では、本開示は、医薬組成物、予防組成物、診断組成物または画像形成組成物を、その生物学的利用能を改善し、その代謝を低減および/または修飾し、その排泄を阻害し、および/または身体内の分布を改変する薬剤と組み合わせて投与することができる。
投与
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、欧州特許出願EP1857552(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているAAVビリオンの投与方法を用いて投与または提供することができる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、欧州特許出願第EP2678433号(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているAAVベクターを用いてタンパク質を投与する方法を用いて投与または提供することができる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、米国特許第5858351号(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているAAVベクターを使用してDNA分子を投与する方法を用いて投与または提供することができる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、米国特許第6211163号(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載の血流にDNAを投与するための方法を用いて投与または提供することができる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、米国特許第6325998号(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているAAVビリオンを投与するための方法を用いて投与または提供することができる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、米国特許第7588757号(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているペルロードをCNSに投与する方法を用いて投与または提供することができる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、米国特許第8283151号(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されたペイロードを投与するための方法を用いて投与または提供することができる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、国際特許公開第WO2001089583号(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載のグルタミン酸デカルボキシラーゼ(GAD)投与ベクターを使用してペイロードを投与する方法を用いて投与または提供することができる。
一実施形態では、AADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、国際特許公開第WO2012057363号(この内容はその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているペイロードを神経細胞に投与するための方法を用いて投与または提供することができる。
本明細書に記載のウイルスベクターの医薬組成物は、バイオアベイラビリティ、治療許容域および/または分布容積の1つまたはそれ以上によって特徴付けられる。
バイオアベイラビリティ
本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、本明細書に記載の投与/製剤剤またはビヒクルを含む組成物に処方される場合は、本明細書に記載の投与剤を欠いている組成物と比較して、バイオアベイラビリティの増加を示す可能性がある。本明細書で使用する「バイオアベイラビリティ」という語は、対象に投与される特定の薬剤の所定量の全身利用可能性を指す。バイオアベイラビリティは、化合物の哺乳動物への投与後の無変化体の化合物の曲線下面積(AUC)または最大血清または血漿濃度(Cmax) を測定することによって評価することができる。AUCは、横軸(X軸)に沿った時間に対する縦軸(Y軸)に沿って、化合物の血清または血漿濃度をプロットした曲線下面積を定量するものである。一般に、特定の化合物のAUCは、当業者に公知であり、G.
S. Banker, Modern Pharmaceutics, Drugs and the Pharmaceutical Sciences, v. 72, Marcel Dekker, New York, Inc., 1996(この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載されている方法により計算することができる。
max値とは、対象への化合物の投与後に対象の血清または血漿中で観察される化合物の最大濃度を指す。特定の化合物のCmax値は、当業者に公知の方法を用いて測定することができる。本明細書で使用される「バイオアベイラビリティの増加」または「薬物動態の改善」という語句は、対象における本発明のウイルスベクターの全身利用可能性(AUC、Cmax、またはCminにより測定する)を増加させ得る作用を指す。いくつかの実施形態では、このような作用は、本明細書に記載の1つあるいはそれ以上の投与剤との同時投与からなる。いくつかの実施形態では、ウイルスベクターのバイオアベイラビリティは、少なくとも約2%、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25% 約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70 少なくとも約75重量%、少なくとも約80重量%、少なくとも約85重量%、少なくとも約90重量%、少なくとも約95重量%、または約100重量%である。
治療許容域
本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、本明細書に記載されているような1つまたはそれ以上の投与剤と共に処方される場合、本明細書に記載の1つまたはそれ以上の投与剤なしで投与されたウイルスベクターの治療許容域と比較して、化合物および/または組成物の投与の治療許容域の増加を示し得る。本明細書で使用される「治療許容域」という語は、治療効果を引き出す可能性が高い、血漿濃度の範囲、または作用部位における治療活性物質のレベルの範囲を指す。いくつかの実施形態では、ウイルスベクターが製剤中で投与された場合に、治療許容域は、少なくとも約2%、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35% 、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または約100%高まる。
分布容積
本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターは、本明細書に記載されているような1つまたはそれ以上の投与剤と共に処方された場合に、本明細書に記載の1つまたはそれ以上の投与剤を欠いている製剤と比較して、改善された分布容積(Vdist)(例えば、分布容積が減少するか、または標的化する)を示し得る。Vdistは、血液または血漿中の薬剤の濃度に対する、体内の同一薬剤の量を指す。本明細書で使用される「分布容積」という語は、血液または血漿中の濃度と同じ濃度で、体内の薬剤の総量を含有するであろう流体容積を指す:Vdistは、体内の薬剤の量を、血液または血漿中の薬剤の濃度で除したものに等しい。例えば、所定の薬剤の用量が10mgで、血漿濃度が10 mg/Lである場合は、分布容積は1リットルになる。分布容積は、薬剤が血管外組織に存在する程度を反映している。分布容積が大量である場合は、血漿タンパク質と比較して、薬剤が組織成分に結合する傾向を反映している。臨床現場では、Vdistは、定常状態の濃度を達成するための負荷量を決定するために使用されることがある。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つまたはそれ以上の投与剤と同時投与された場合の本発明のウイルスベクター組成物の分布容積は、少なくとも約2%、少なくとも約5%、少なくとも約10% 約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55 少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、減少する。
キットとデバイス
本発明は、本発明の方法を簡便および/または効果的に実施するための様々なキットを提供する。典型的に、キットは、ユーザが対象の複数回の治療を行い、および/または複数回の実験を行うのに十分な量および/または数の成分からなる。
キットは、本発明のAADCベクター、AADC構築物、AADCポリヌクレオチド、またはAADCポリペプチドのいずれかによりなる。いくつかの実施形態では、キットは、本発明の化合物および/または組成物を作製および/または合成するための試薬および/または指示書をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、キットは、1つまたはそれ以上のバッファも含み得る。いくつかの実施形態において、本発明のキットは、タンパク質または核酸アレイまたはライブラリを作製するための成分を含み得るので、例えば、固体支持体を含み得る。
いくつかの実施形態では、キット成分は、水性媒体または凍結乾燥形態のいずれかで包装され得る。キットの容器手段は、一般に、少なくとも1つのバイアル、試験管、フラスコ、ボトル、シリンジまたはその他の容器手段を含み、その中に構成要素を配置し、好ましくは適切に分注する。複数のキット成分がある場合(標識試薬と標識は一緒に包装されてもよい)、キットは一般に第2、第3またはその他の追加の容器を含み、その中に追加の成分を別々に配置し得る。いくつかの実施形態では、キットはまた、滅菌した薬学的に許容される緩衝液および/またはその他の希釈剤を収容するための第2の容器手段からなり得る。いくつかの実施形態では、成分の様々な組み合わせを1つまたはそれ以上のバイアルに含めてよい。本発明のキットはまた、典型的には、本発明の化合物および/または組成物を収用する手段(例えば、商業的販売用に密閉された、タンパク質、核酸、およびその他の試薬を収用する容器)を含み得る。そのような容器は、所望のバイアルが保持される注入またはブロー成形されたプラスチック容器を含み得る。
いくつかの実施形態において、キット構成要素は、1つおよび/またはそれ以上の液体溶液で提供される。いくつかの実施形態では、液体溶液は水溶液であり、滅菌水溶液が特に好ましい。いくつかの実施形態において、キット成分は、乾燥粉末として提供され得る。試薬および/または成分が乾燥粉末として提供される場合は、そのような粉末は、適切な量の溶媒の添加によって再構成され得る。いくつかの実施形態では、溶媒は、別の容器手段で提供され得ることが想定される。いくつかの実施形態において、標識色素は、乾燥粉末として提供される。いくつかの実施形態では、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、120、120、130、140、150、160、170、180、190、200、300、400、500、600、700、800、900、1000マイクログラムの乾燥色素、または少なくともまたは最大限で、それらの量の乾燥色素が、本発明のキットで提供される。そのような実施形態では、次に、DMSOなどの任意の適切な溶媒に色素を再懸濁させることができる。
いくつかの実施形態では、キットは、キット構成要素の使用法、およびキットに含まれていないその他の試薬の使用法に関する説明書を含み得る。説明書は、実施可能な変形を含み得る。
デバイス
いくつかの実施形態では、本発明のAADC化合物および/またはAADC組成物を、デバイスと組み合わせるか、デバイス上にコーティングするか、またはデバイス中に埋め込むことができる。デバイスは、ステント、ポンプ、および/またはその他の移植可能な治療デバイスを含み得るが、これに限定されない。さらに、AADC化合物および/またはAADC組成物は、対象が深部静脈血栓症(DVT)の可能性を低下させるための圧縮装置など(これに限定されない)の圧縮装置を使用している場合でも、対象に投与され得る。
本発明は、1つまたはそれ以上のAADCポリヌクレオチドペイロード分子をコードするウイルスベクターを組み込むことができる装置を提供する。これらの装置は、ヒト患者のようなそれを必要とする対象に直ちに投与され得るウイルスベクターを安定な製剤中に含む。
投与のための装置を使用して、本明細書に教示される単回投与、複数回投与または分割投与計画に従って、本発明のAADCポリヌクレオチドからなるウイルスベクターを投与することができる。
細胞、器官および組織への複数投与のための当技術分野で公知の方法およびデバイスを、本発明の実施形態として本明細書に開示された方法および組成物と組み合わせて使用することが考えられる。これらには、例えば、複数の針を有する方法及びデバイス、ルーメン又はカテーテルなどを使用するハイブリッドデバイス、並びに熱/電流/放射線駆動メカニズムを利用するデバイスが含まれる。
いくつかの実施形態では、本発明のAADC化合物および/またはAADC組成物は、ステント、チューブ、カテーテル、パイプ、ストロー、針および/ またはダクトを含むがそれらに限定されないデバイスを用いて投与し得る。これらのデバイスを使用する方法は、本明細書に記載されており、当該技術分野において公知である。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、画像誘導療法を一体化した投与系、およびレーザ、MRgFUS、内視鏡およびロボット外科手術デバイスを含むがこれらに限定されない造影を一体化した投与系を使って、対象に投与することができる。
一実施形態において、本発明のAADCポリヌクレオチドは、MRI Interventions, Inc.製のCLEARPOINT(登録商標)神経介入システムを用いて、対象に投与することができる。CLEARPOINT(登録商標)神経介入システムは、単独で、または本明細書に記載の他の投与方法およびデバイスのいずれかと組み合わせて使用することができる。CLEARPOINT(登録商標)神経介入システムは、神経学的処置の計画と操作を行なう場合に、器具またはデバイスの配置と操作において定位指針を提供するのに役立つ。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、Renishaw PLC製のNEUROMATE(登録商標)定位固定ロボットシステムを用いて対象に投与することができる。NEUROMATE(登録商標)システムは、単独で、または本明細書に記載の他の投与方法およびデバイスのいずれかと組み合わせて使用することができる。非限定的な一例として、NEUROMATE(登録商標)システムは、ヘッドホルダ、CT画像ローカライザ、フレームアタッチメント、遠隔制御およびソフトウェアと共に使用され得る。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドはElekta AB製のElekta MICRODRIVE(商標)デバイスを用いて、対象に投与することができる。MICRODRIVE(商標)デバイスは、単独で、または本明細書に記載のその他の投与方法およびデバイスのいずれかと組み合わせて使用することができる。非限定的な一例として、MICRODRIVE(商標)デバイスを使用し、電極(例えば、微小電極記録(MER)、マクロ刺激および深部脳刺激(DBS)電極の埋め込み)、カテーテルの埋め込み、チューブまたはDBS電極の埋め込みの位置決めを行い、クロスヘアおよびA−Pホルダーを使用して、位置、生検、注射および吸引、脳損傷、内視鏡ガイダンス、およびGAMMA KNIFE(登録商標)放射線手術を検証する。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、MONTERIS(登録商標) Medical, Inc.製のAXIIIS(登録商標)定位固定ミニフレームを用いて対象に投与することができる。AXIIIS(登録商標)定位固定ミニフレームは、単独で、または本明細書に記載のその他の投与方法およびデバイスのいずれかと組み合わせて使用することができる。AXIIIS(登録商標)定位ミニフレームは、レーザー凝固、生検、カテーテル配置、電極インプラント、内視鏡検査、血塊排出のために使用される軌道整列デバイスである。ミニフレームは、360度のインタフェースが可能であり、簡単な調整で複数の頭蓋内標的へのアクセスを提供する。さらに、ミニフレームはMRIと互換性がある。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、Integra LifeSciences Corporation製のINTEGRA(商標) CRW(登録商標)システムを用いて、対象に投与することができる。The INTEGRA(商標)
CRW(登録商標)システムは、単独で、または本明細書に記載のその他の投与方法およびデバイスのいずれかと組み合わせて使用することができる。CRW(登録商標)システムは、定位手術、顕微手術、カテーテル挿入および生検などを含むがこれらに限定されない様々な用途に使用することができる。CRW(登録商標)システムは、システムを使用するオペレーターに、正確性を提供するように設計されている(例えば、親指固定ネジ、バーニアスケーリング、二重ボルト固定、および一体構造)。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、Stereotaxis, Inc.製のEPOCH(登録商標)ソリューションシステムを用いて対象に投与することができる。このEPOCH(登録商標)ソリューションシステムは、NIOBE(登録商標)ES磁気ナビゲーションシステム、VDRIVE(登録商標)ロボットナビゲーションシステム、および/またはODYSSEY(登録商標)情報ソリューション(すべてStereotaxis, Inc.製)を含み得る。EPOCH(登録商標)ソリューションシステムは、単独で、または本明細書に記載のその他の投与方法およびデバイスのいずれかと組み合わせて使用することができる。非限定的な一例として、NIOBE(登録商標)ES磁気ナビゲーションシステムを使用して、対象に正確に接触することができる。別の非限定的な一例として、NIOBE(登録商標)ES磁気システムをVDRIVE(登録商標)ロボットナビゲーションシステムとともに使用して、正確な動きと安定性を提供することができる。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、NeuroStationワークステーションを使用して、対象に投与することができる。このNeuroStationワークステーションは、フレームレスの定位方法を使用しており、手術計画、生検、頭蓋切開、内視鏡、術中超音波および放射線療法などを含むがこれらに限定されない用途に画像ガイドを提供することができる。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、ロボット定位固定システムを使用して対象に投与することができ、ロボット定位固定システムの例には、米国特許第5,078,140号に記載されているデバイスが含まれるがこれに限定されるものではない(この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。当該でバイスのロボットアームを使用して、処置を行うために使用する手術器具またはその他の器具を正確に配置することができる。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、自動投与システムを使用して対象に投与することができ、自動投与システムの例には、米国特許第5,865,744号に記載されているデバイスが含まれるがこれに限定されるものではない(この内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。投与システムによって収集された画像に基づいて、コンピュータは、針の配置を特定の対象のための適切な深さに調整する。
一実施形態では、本発明のAADCポリヌクレオチドは、投与中に同時に、および/または投与前の期間に、および/または投与後の期間に、圧縮装置(例えば、対象の深部静脈血栓症(DVT)の可能性を低減させる圧縮装置などを含むがこれに限定されない)を使用している対象に、投与することができる。圧縮装置は、対象へのAADCポリヌクレオチドの投与の、少なくとも5分前、15分前、30分前、45分前、1時間前、2時間前、3時間前、4時間前、5時間前、6時間前、7時間前、8時間前に投与し得る。圧縮装置は、対象へのAADCポリヌクレオチドの投与の、15分後、30分後、45分後、1時間後、2時間後、3時間後、4時間後、5時間後、6時間後、7時間後、8時間後、9時間後、10時間後、11時間後、12時間後、15時間後、16時間後、17時間後、18時間後、19時間後、20時間後、21時間後、22時間後、23時間後、1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、1週間後、2週間後、3週間後または1ヶ月後に投与し得る。非限定的な一例として、圧縮装置は、AADCポリヌクレオチドの投与プロシージャ中に同時に使用される。別の非限定的な一例として、圧縮装置は、AADCポリヌクレオチドの投与前に使用される。別の非限定的な一例として、圧縮装置は、AADCポリヌクレオチドの投与後に使用される。別の非限定的な一例として、圧縮装置は、AADCポリヌクレオチドの投与前、投与中、および投与後に使用される。
圧縮装置の非限定的な例には、ActiveCare +S.F.T.間欠圧縮装置、ActiveCare +S.F.T空気圧縮装置、DVTliteのVenowave、KCIシステム圧縮ポンプ、Aircast VenaFlowシステム、SCD Express Compression SystemまたはBio Compression Systems, Inc.製の空気圧圧縮治療装置(ポンプのモデルは、例えば、モデルSC−2004、モデルSC−2004−FC、モデルSC−3004、モデルSC−3004−FC、モデルSC−2008、モデルSC−2008−DL、モデルSC−3008−T、BioCryoシステム、モデルIC−BAP−DL multi−flo DVT combo IC_1545−DLから選択し、ポンプと共に使用される衣類は、4チャンバー、8チャンバー、BioCryo、Multi−FloまたはBioArterialの衣類であってよい)。
CNS疾患
本発明のポリヌクレオチドは、異常なまたは望ましくない標的発現によって特徴付けられる任意の疾患または障害の治療、予防、または改善に使用することができる。一実施形態では、本発明は、パーキンソン病の治療に用いる組成物、特に核酸分子(例えばAADCをコードするポリヌクレオチド)に関する。
いくつかの実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、ペイロード、すなわちAADCが代替のペイロードのために交換される、異常なまたは望ましくない標的発現によって特徴付けられる任意の疾患または障害の治療、予防または改善において使用され得る。
本開示は、ヒト対象を含む哺乳動物対象における疾患、障害および/または状態を治療するための方法を提供し、本開示は、本明細書に記載のウイルス粒子(すなわち、ウイルスゲノムまたは「VG」;例えば、AAV、AAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノム)のいずれかを対象に投与すること、あるいは前記AAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムからなる粒子を対象に投与すること、あるいは医薬組成物を含む上記の組成物のいずれかを対象に投与することからなる。
一実施形態において、疾患、障害および/または状態とは、神経学的な疾患、障害および/または状態である。CNS疾患は、脳のあらゆる構成要素(大脳半球、脳幹、脳幹、および小脳を含む)または脊髄に影響を及ぼす疾患であり得る。
いくつかの実施形態では、本発明のウイルス粒子を、CNSにおける遺伝子産物のレベルまたは機能を調節することができる治療用製品である機能性ペイロードの投与を介して、使用し、神経変性、神経筋疾患、リソソーム病、外傷、骨髄損傷、疼痛(神経因性疼痛を含む)、神経系の癌、脱髄疾患、神経系の自己免疫疾患、神経毒性症候群、睡眠障害、遺伝的脳障害および発生性CNS障害により特徴付けられる神経変性疾患および/または疾患または障害を治療することができる。機能的なペイロードは、遺伝子産物を必要としている対象において、遺伝子産物の異常なレベルおよび/または機能から生じる症状(例えば、タンパク質の欠如または欠損)を緩和または軽減し得る;または、遺伝子産物を必要としている対象において、CNS障害に益をもたらす。
非限定的な一例として、本発明のウイルス粒子によって投与される治療用生成物には、増殖および栄養因子、サイトカイン、ホルモン、神経伝達物質、酵素、抗アポトーシス因子、血管新生因子、および「運動ニューロンの生存」タンパク質(SMN)などの病理学的障害において突然変異されることが知られている任意のタンパク質;本明細書に記載のCNS疾患のいずれかに治療上の関心を有するタンパク質をコードするメッセンジャーRNAを標的とするアンチセンスRNAまたはRNAi;遺伝子サイレンシングおよび転写後のCNSにおける遺伝子発現の調節において機能するマイクロRNA(例えば、脳特異的Mir−128a、Adlakha and Saini, Molecular cancer, 2014, 13:33を参照せよ)が含まれるが、これらに限定されない。例えば、スーパーオキシドジスムターゼ酵素を標的とするRNAiは、ALSの治療のために、本発明のウイルス粒子によってパッケージングされ得る。
成長因子および栄養因子には、脳由来成長因子(BDNF)、上皮成長因子(EGF)、塩基性線維芽細胞成長因子(bFGF)、毛様体神経栄養因子(CNTF)、コルチコトロピン放出因子(CRF)、グリア細胞株由来増殖因子(GDNF)、インスリン様増殖因子−1(IGF−1)、神経成長因子(NGF)、ニューロトロフィン−3(NT−3)、ニューロトロフィン−4(NT−4)、および血管内皮増殖因子(VEGF)が含まれるが、これらに限定されない。サイトカインには、インターロイキン−10(IL−10)、インターロイキン−6、インターロイキン−8、ケモカインCXCL12(SDF−1)、TGF−ベータ、および成長および分化因子(GDF−1/10)が含まれる。
いくつかの実施形態では、神経学的障害には、アルツハイマー病(AD);筋萎縮性側索硬化症(ALS);クロイツフェルト−ヤコブ病(CJD);ハンチントン病(HD);フリードライヒ運動失調(FA);パーキンソン病(PD);多系統萎縮症(MSA);脊髄性筋萎縮症(SMA)、多発性硬化症(MS);原発性進行性失語症;進行性核上麻痺(PSP);痴呆;脳腫瘍、変性神経疾患、脳炎、てんかん、神経変性を引き起こす遺伝的脳障害、網膜色素変性(RP)、頭部および脳の奇形、水頭症、脳卒中、プリオン病、幼児期ニューロン性セロイド脂漏症(INCL)(リソソーム酵素パルミトイルタンパク質チオエステラーゼ−1(PPT1)の欠乏により引き起こされる、子供の神経変性疾患)などが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、本発明のウイルス粒子は、CNSの成長および発達の障害、すなわち神経発達障害に関連する疾患を治療するために使用することができる。いくつかの局面において、そのような神経発達障害は、以下を含むが、それらに限定されない遺伝的突然変異に起因し得る:脆弱X症候群(FMR1遺伝子の変異に起因する)、ダウン症候群(第21染色体のトリソミーに起因する)、レット症候群、ウィリアムズ症候群、アンジェルマン症候群、スミス−マゲニス症候群、ATR−X症候群、バース症候群免疫機能不全および/または幼児期の感染症(例えば、シデナム舞踏病)、統合失調症、先天性トキソプラズマ症、先天性風疹症候群、代謝障害(例えば真性糖尿病およびフェニルケトン尿症)、栄養障害および/または脳外傷、自閉症および自閉スペクトラム症。
いくつかの実施形態において、本発明のウイルス粒子は、以下を含むがそれらに限定されないCNS中の腫瘍を治療するために使用することができる:聴神経腫瘍、星状細胞腫(グレードI、II、IIIおよびIV)、脊索腫、CNSリンパ腫、頭蓋咽頭腫、神経膠腫(脳幹グリオーマ、上衣細胞腫、視神経神経膠腫、副甲状腺腫など)、髄芽細胞腫、髄膜腫、転移性脳腫瘍、希突起神経膠腫、下垂体腫瘍、原始神経外胚葉(PNET、およびシュワン細胞腫。
いくつかの実施形態において、神経学的障害は、CNSに神経学的起源を有する運動および/または感覚症状を伴う機能的神経学的障害であり得る。非限定的な例として、機能的な神経学的障害は、慢性疼痛、発作、発語障害、不随意運動、および睡眠障害であり得る。
いくつかの実施形態において、神経学的障害は、以下を含むがこれらに限定されない白質障害(CNSの神経線維に影響を及ぼす疾患群)であり得る:ペリツェウス−メルツバッハー病、基底核および小脳の萎縮を伴うミエリン形成不全、Aicardi−Goutieres症候群、皮質嚢胞を伴う大脳半球性白質脳症、先天性筋ジストロフィー、筋緊張性ジストロフィー、ウィルソン病、ロウ症候群、シェーグレン−ラーソン症候群、PIBDまたはテイ症候群、コケイン病、勃起性黄斑変性症、ツェルウィガー症候群、新生児副腎白質ジストロフィー、幼児期レムサム病、ゼルウィガー様症候群、偽ゼルウィガー症候群、偽新生児副腎白質ジストロフィー、二機能性タンパク質欠損症、X連鎖副腎白質ジストロフィーおよび副腎脊髄神経症、レムサム病。
いくつかの実施形態では、神経学的障害は、CNSの細胞が代謝産物を分解することができないことによって引き起こされる、以下含むがこれらに限定されないリソソーム蓄積障害(LSD)であり得る:ニーマン−ピック病(酸性スフィンゴミエリナーゼ(ASM)の遺伝的欠損に起因するLSD;異染性白質萎縮症(MLD)(グリア細胞およびニューロンにおけるスルファチドの蓄積を特徴とするLSD、アリールスルファターゼA(ARSA)の遺伝的欠損に起因する);グロボイド細胞白質萎縮症(GLD)(ガラクトシルセラミダーゼの突然変異によって引き起こされるLSD);ファブリー病(αガラクトシダーゼA(GLA)遺伝子の突然変異によって引き起こされるLSD);ゴーシェ病(β−グルコセレブロシダーゼ(GBA)遺伝子の突然変異によって引き起こされる);GM1 / GM2ガングリオシドーシス;ムコ多糖症障害;ポンペ病;ニューロンセロイドリポフスチノーシス。
一実施形態において、神経学的疾患、障害および/または状態は、パーキンソン病である。一実施形態において、パーキンソン病を治療するために使用されるポリヌクレオチドは、配列番号6〜9および17〜23を含むがそれらに限定されない配列番号2〜23のいずれか1つを含み、これらの配列内では、ペイロードが、AADCまたはパーキンソン病を治療するための当該分野で公知の任意のその他のペイロードによって置換されている。非限定的な一例として、当該状態は初期のパーキンソン病である。別の非限定的な一例として、当該状態は末期のパーキンソン病である。
一実施形態では、対象は、統一パーキンソン病評価尺度において、最大得点の約100点に対し約30点、最大得点の約100点に対し約10点、最大得点の約100点に対し約20点と評価されたヒト患者である。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物による治療の前5年間に、パーキンソン病と診断されている。非限定的な一例として、対象は、本明細書に記載の組成物による治療の前、1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、7週間、8週間、1カ月、2カ月、3カ月、4ヶ月、5ヶ月、6ヶ月、7ヶ月、8ヶ月、9ヶ月、10ヶ月、11ヶ月、12ヶ月、13ヶ月、14ヶ月、15ヶ月、16ヶ月、17ヶ月、18ヶ月、1年、2年、3年、4年、または5年未満の期間に、パーキンソン病と診断されている。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物での治療の前、5年から10年の期間にパーキンソン病と診断されている。非限定的な一例として、対象は、本明細書に記載の組成物での治療の前、5年、5.5年,6年,6.5年,7年,7.5年,8年、8.5年、9年、9.5年、または10年間に、パーキンソン病診断されている。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物での治療の前、10年以上の期間に、パーキンソン病と診断されている。非限定的な一例として、対象は、本明細書に記載の組成物での治療の前、10.5年、11年、11.5年、12年、12.5年、13年、13.5年、14年、14.5年、15年、15.5年、16年、16.5年、17年、17.5年、18年、18.5年、19年、19.5年、20年、20.5年、21年、21.5年、22年、22.5年、23年、23.5年、24年、または24年以上の期間に、パーキンソン病と診断されている。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物の投与前に、振戦および運動などの運動症状の変化があった。振戦の非限定的な一例としては、片側または両側における軽度の振戦、両側または正中線における中程度の振戦または難治性の振戦が挙げられる。運動の非限定的な例には、軽度の運動緩慢、中程度の運動緩慢、重度の運動緩和、および朝に見られる無動が含まれる。
一実施形態では、対象は、バランス障害、正反射性障害、重大なバランス障害、または転倒などを含むがこれらに限定されない、バランスの変化を有する。
一実施形態では、対象は、生活の質が低下している。非限定的な一例として、被験者は、日常生活の活動への制限など、生活の質に中程度の影響がある。別の非限定的な一例として、対象は、疾患により生活の質が低下している。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物の投与前に、非運動症状の変化があった。非限定的な一例として、対象は、本明細書に記載の組成物の投与前に、軽度から中程度の認知障害があった。別の非限定的な一例として、対象は、幻覚などの行動障害も含み得る認知症のような顕著な認知障害がある。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物の投与前に、1つまたはそれ以上のドーパミン作動性薬物の投与を受けて、変動が制限される満足のいく反応を呈していた。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物の投与前に、1つまたはそれ以上のドーパミン作動性薬物の投与を受けて、軽度から中程度の身体障害を引き起こす運動症状の変動があった。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物の投与前に、重篤な障害を引き起こす「すり減り現象」および/またはレボドパ誘発性ジスキネジーからなる医学的に不応性の運動症状の変動があった。
一実施形態では、対象は、以下を含むがそれらに限定されないパーキンソン病に関連する軽度の症状がある:過去5年間に認知障害があると診断されていない;1つまたはそれ以上のドーパミン作動性薬物の投与を受けて、変動が制限される満足のいく反応を呈していた;片側または両側における振戦が軽度である;生活の質がほとんど影響を受けていない;および/またはバランス障害がない。
一実施形態では、対象は、以下を含むがそれらに限定されないパーキンソン病に関連する中程度の症状がある:軽度から中等度の認知障害;バランス障害の最初の兆候;1つまたはそれ以上のドーパミン作動性薬物の投与を受けながらも、過去5〜10年以内に診断された、軽度から中程度の身体障害を引き起こす運動症状の変動;両側または正中線における中程度の振戦;中程度の運動緩徐;および/または日常生活の活動に制限がいくらかある。
一実施形態では、対象は、以下を含むがそれらに限定されないパーキンソン病に関連する進行した症状がある:10年以上前にパーキンソン病と診断されている;著しい身体障害を引き起こす、中程度の難治性運動障害のすり減り現象および/またはレボドパ誘発性ジスキネジー;難治性振戦;重度のバランス障害および/または転倒;重度の認知障害(例えば、行動障害を伴うまたは伴わない認知症);重度の運動緩徐;疾患により生活の質が著しく低下している;および/または朝に見られる無動症。
一実施形態において、対象は、運動障害専門医(MDS)のもとに送られているが、深部脳刺激を受けていない。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載の組成物と組み合わせて、DUOPA(商標)を使用している。非限定的な一例として、対象は、DUOPA(商標)のみを使用して、その治療が功を奏している。非限定的な一例として、対象は、DUOPA(商標)のみを使用して、その治療が功を奏しているか、あるいはある程度功を奏している。
別の実施形態において、神経学的疾患、障害、および/または状態は、フリードライヒ失調症である。一実施形態では、フリードライヒ失調症の治療に使用されるポリヌクレオチドは、配列番号:6〜9および17〜23を含むがこれらに限定されるものではない配列番号2〜23のいずれか1つからなり、これらの配列では、ペイロードが、Frataxinに、またはFriedreich運動失調症を治療するための当該技術分野で知られているその他の任意のペイロードによって置き換えられる。
別の実施形態において、神経学的疾患、障害および/または状態は、筋萎縮性側索硬化症(ALS)である。一実施形態では、筋萎縮性側索硬化症(ALS)の治療に使用されるポリヌクレオチドは、配列番号:6〜9および17〜23を含むがこれらに限定されるものではない配列番号2〜23のいずれか1つからなり、これらの配列では、ペイロードが、SOD1のshRNA、miRNA、siRNA、RNAiに、または筋萎縮性側索硬化症(ALS)を治療するための当該技術分野で知られているその他の任意のペイロードによって置き換えられる。
別の実施形態において、神経学的疾患、障害および/または状態は、ハンチントン病である。一実施形態では、ハンチントン病の治療に使用されるポリヌクレオチドは、配列番号:6〜9および17〜23を含むがこれらに限定されるものではない配列番号2〜23のいずれか1つからなり、これらの配列では、ペイロードが、HttのshRNA、miRNA、siRNA、RNAiに、またはハンチントン病を治療するための当該技術分野で知られているその他の任意のペイロードによって置き換えられる。
別の実施形態において、神経学的疾患、障害または状態は、脊髄性筋萎縮症(SMA)である。一実施形態では、脊髄性筋萎縮症(SMA)の治療に使用されるポリヌクレオチドは、配列番号:6〜9および17〜23を含むがこれらに限定されるものではない配列番号2〜23のいずれか1つからなり、これらの配列では、ペイロードが、SMNに、または脊髄性筋萎縮症(SMA)を治療するための当該技術分野で知られているその他の任意のペイロードによって置き換えられる。
概日リズムと睡眠−覚醒サイクル
概日リズムとは、24時間周期に従う傾向がある身体的、精神的および行動的な変動を指す。概日リズムは、睡眠−覚醒サイクル、ホルモン放出、体温、およびその他の身体機能に影響を及ぼし得る。概日リズムの変動は、睡眠障害(例えば、不眠症)、うつ病、双極性障害、季節性情動障害、肥満および糖尿病などを含むがこれらに限定されない状態および/または障害引き起こす可能性がある。
一実施形態では、本明細書に記載されるAADCポリヌクレオチドは、不眠症を治療するために使用することができる。
睡眠−覚醒サイクルは、睡眠の期間および覚醒の期間からなる。一般に、24時間の時間帯では、睡眠の総時間は覚醒の総時間よりも短い。非限定的な一例として、睡眠−覚醒サイクルは、7〜9時間の睡眠と15〜17時間の覚醒状態からなる。非限定的な一例として、睡眠−覚醒サイクルは、8時間の睡眠および16時間の覚醒からなる。非限定的な一例として、睡眠−覚醒サイクルは8−10時間の睡眠および14−16時間の覚醒からなる。
一実施形態では、対象の睡眠覚醒サイクルは、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを対象に投与することによって改善される。
一実施形態では、対象の睡眠−覚醒サイクルは、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを対象に投与することによって調節される。非限定的な一例として、調節とは、夜間により多くの睡眠が起こるようにし、日中により少ない睡眠が起こるようにする時間帯の矯正を指す。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与された対象の睡眠覚醒サイクルは、AADCポリヌクレオチドの投与前の対象の睡眠覚醒サイクルと比較して、改善する。非限定的な一例として、対象は、睡眠期間が増加し、覚醒期間が減少している。別の非限定的な一例として、対象は、睡眠期間が減少し、覚醒期間が増加している。
一実施形態では、本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与された対象の睡眠−覚醒サイクルは、AADCポリヌクレオチドの投与前の対象の睡眠−覚醒サイクルと比較して、調節される。非限定的な一例として、睡眠期間の長さおよび覚醒期間の長さは、少なくとも2日間、ほぼ同じ(例えば、+/− 1時間)である。別の非限定的な一例として、24時間内の睡眠期間および覚醒時間の長さは、過去24時間内で、10分以内、15分以内、20分以内、25分以内、30分以内、35分以内、40分以内、45分以内、50分以内、55分以内、1時間以内、1.5時間以内、または2時間以内である。
一実施形態では、対象が24時間以内に経験する急速眼球運動(REM)睡眠の量は、対象に本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与した後に、変化する。レム睡眠は、激しい脳活動によって特徴づけられる睡眠の活動期と一般的に考えられており、レム睡眠では脳波が速く、非同期である。成人では、平均で、1日の総睡眠期間の約20〜25%がレム睡眠である。非限定的な一例として、レム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上減少している。非限定的な一例として、レム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25%
20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%減少している。非限定的な一例として、レム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上増加している。非限定的な一例として、レム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%増加している。
一実施形態では、対象が24時間以内に経験するノンレム(NREM)睡眠の量は、対象に本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドが投与された後に、変化する。ノンレム睡眠は、EEGによって測定される脳波がより遅くなり、より大きな振幅を有するので、一般に、生理学的活動の低下により特徴付けられる。ノンレム睡眠には、4つの段階がある:ステージ1は、入眠期、すなわち覚醒から睡眠に移行する時であり、このステージでは脳波および筋肉活動が遅くなる;ステージ2は、軽睡眠期であり、このステージでは目の動きが止まり、時折急激な脳波の高まり(紡錘波と呼ばれることもある)を伴いながら、脳波が遅くなる;ステージ3およびステージ4(総称して、低速波睡眠と呼ぶ)は、より小さく速い脳波が点在する低速の脳波(デルタ波)の存在を特徴とし、目の動きはない。成人では、平均で、1日の総睡眠期間の約75〜80%がノンレム睡眠であり、一日の睡眠時間の約半分がステージ2のノンレム睡眠である。
一実施形態では、対象が経験するノンレム睡眠の量は、対象が本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与された後に、変化する。非限定的な一例として、ノンレム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上減少している。非限定的な一例として、ノンレム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%減少している。非限定的な一例として、ノンレム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上増加している。非限定的な一例として、ノンレム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%増加している。
一実施形態では、対象が経験するステージ1のノンレム睡眠の量は、対象が本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与された後に、変化する。非限定的な一例として、ステージ1のノンレム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上減少している。非限定的な一例として、ステージ1のノンレム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%減少している。非限定的な一例として、ステージ1のノンレム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上増加している。非限定的な一例として、ステージ1のノンレム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%増加している。
一実施形態では、対象が経験するステージ2のノンレム睡眠の量は、対象が本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与された後に、変化する。非限定的な一例として、ステージ2のノンレム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上減少している。非限定的な一例として、ステージ2のノンレム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%減少している。非限定的な一例として、ステージ2のノンレム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上増加している。非限定的な一例として、ステージ2のノンレム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%増加している。
一実施形態では、対象が経験するステージ3および4のノンレム睡眠の量は、対象が本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与された後に、変化する。非限定的な一例として、ステージ3および4のノンレム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上減少している。非限定的な一例として、ステージ3および4のノンレム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%減少している。非限定的な一例として、ステージ3および4のノンレム睡眠の量は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12% 、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、または65%以上増加している。非限定的な一例として、ステージ3および4のノンレム睡眠の量は、1〜10%、5〜10%、5〜15%、10〜15%、15〜20%、15〜25%、20〜25% 20〜30%、25〜30%、25〜35%、30〜35%、30〜40%、35〜40%、40〜50%、または40〜60%増加している。
一実施形態では、ノンレム睡眠およびレム睡眠のサイクルの期間は、対象が本明細書に記載のAADCポリヌクレオチドを投与された後、対象においてより一貫している。一般的に、ノンレム睡眠およびレム睡眠のサイクルは、毎晩90〜110分毎に4〜6回交互に変わる。
定義
本明細書中の様々な箇所において、本開示の化合物の置換基は、群でまたは範囲で開示される。本開示が、そのような群および範囲の構成員のそれぞれおよび全てのサブコンビネーションを含むことが、特に意図されている。
約:本明細書で使用されている「約」という語は、列挙された値の+/− 10%を意味する。
活動/活性:本明細書で使用されている「活動」という語は、物事が起こっているかまたは行われている状態を指す。本明細書に記載の組成物は活性を有し、この活性は1つまたはそれ以上の生物学的事象に関与する。
アデノ随伴ウイルス:本明細書中で使用されている「アデノ随伴ウイルス」または「AAV」という語は、それに由来する任意の粒子、配列、遺伝子、タンパク質または成分からなる依存ウイルス属の構成員を指す。本明細書で使用されている「AAV粒子」という語は、キャプシドおよびポリヌクレオチドからなる。AAV粒子は、本明細書に記載されているかまたは当該分野で公知の任意の血清型(血清型の組み合わせを含む;(すなわち、「シュードタイピング」化したAAV)に由来するものであってもよく、または種々のゲノム(例えば、一本鎖または自己相補性)に由来するものであってもよい。さらに、AAV粒子は、複製欠陥および/または標的化されていてもよい。
併用投与:本明細書中で使用されている「組み合わせて投与される」または「併用投与」という語句は、2つまたはそれ以上の薬剤(例えば、AAV)を、同時またはある間隔内で対象に投与し、患者に対する各薬剤の効果の重なりが存在し得るように、および/または対象がある時点で同時に両方に曝露されているようにすることを意味する。いくつかの実施形態において、それらの薬剤は、薬剤投与間隔が約60分、30分、15分、10分、5分、または1分以内に、または1つまたはそれ以上のその他の薬剤の少なくとも1回の用量の約24時間、12時間、6時間、3時間以内に投与される。いくつかの実施形態では、投与は、重複する投与計画で行なう。本明細書で使用されている 「投薬計画」という語は、時間的に間隔を空けた複数の用量を指す。そのような用量は、規則的な間隔で行なうか、または投与における1つまたはそれ以上の中断を含み得る。いくつかの実施形態において、薬剤の投与は、短い間隔をあけて行なわれるので、コンビナトリアル(例えば、相乗)効果が達成される。
改善:本明細書で使用されている「改善」または「改善する」という語は、状態または疾患の少なくとも1つの指標の重篤度を軽減することを指す。例えば、神経変性障害の文脈において、改善には、ニューロン損失の減少が含まれる。
動物:本明細書で使用されている「動物」という語は、動物界の任意の構成員を指す。いくつかの実施形態では、「動物」とは、任意の発達段階のヒトを指す。いくつかの実施形態において、「動物」とは、任意の発生段階における非ヒト動物を指す。ある実施形態では、非ヒト動物は、哺乳動物(例えば、げっ歯類、マウス、ラット、ウサギ、サル、イヌ、ネコ、ヒツジ、ウシ、またはブタ)である。いくつかの実施形態では、動物には、哺乳動物、鳥類、爬虫類、両生類、魚類、および虫類が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、動物は、トランスジェニック動物、遺伝子操作された動物、またはクローンである。
アンチセンス鎖:本明細書中で使用されているsiRNA分子の「アンチセンス鎖」または「第1鎖」または「ガイド鎖」という語は、約10〜50ヌクレオチドの部分に実質的に相補的な鎖を指し、例えば、サイレンシングの標的となる遺伝子のmRNAの約15〜30,16〜25,18〜23または19〜22ヌクレオチドである。アンチセンス鎖または第1の鎖は、標的特異的サイレンシングを導くために所望の標的mRNA配列に十分相補的な配列を有し、例えば、RNAiの機構またはプロセスによって所望の標的mRNAの破壊を引き起こすのに十分な相補性を有する。
約:本明細書で使用されている「約」または「約」という語は、関心のもたれている1つまたはそれ以上の値に適用される場合に、記載された基準値に類似する値を指す。ある実施形態において、「約」または「約」という語は、別段の記載がない限り、または文脈から明らかでない限り(そのような数が可能な値の100%を超える場合を除いて)、25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、あるいは記載された基準値のいずれかの方向(より大きいか、より小さい)を指す。
と関連した:本明細書中で使用されている「と関連した」、「共役した」、「連結された」、「付着した」および「係留された」という語は、2つまたはそれ以上の部分に関して使用される場合、以下を意味する:当該部分が、直接的にまたは連結剤として機能する1つまたはそれ以上の追加の部分を介して、相互に物理的に会合しているかまたは結合して、当該部分が条件(当該構造が使用される、例えば、生理学的条件)の下で物理的に結合したままであるように、十分に安定した構造を形成する。「関連」は、厳密に直接共有化学結合によるものである必要はない。この語はまた、「関連する」存在が物理的に結合したままであるように、イオン結合または水素結合またはハイブリダイゼーションに基づく結合が十分に安定していることを示唆し得る。
二官能性の:本明細書中で使用されている「二官能性の」という語は、少なくとも2つの官能を有し、またはそれらを維持する任意の物質、分子、または部分を指す。これらの官能は、同じ結果または異なる結果に影響を与える可能性がある。官能を生成する構造は、同じであっても異なっていてもよい。
生物学的に活性がある:本明細書で使用されている「生物学的に活性がある」という語は、生体系および/または生物体において活性を有する任意の物質(例えば、AAV)の特性を指す。例えば、生物に投与された場合に、その生物に生物学的作用を及ぼす物質は、生物学的に活性であると考えられる。特定の実施形態では、本発明のポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチドの一部でも生物学的に活性であるかまたは生物学的に関連すると考えられる活性を模倣する場合、生物学的に活性であると考えられ得る。
生物系:本明細書中で使用されている「生物系」というは、器官、組織、細胞、細胞内成分、タンパク質、核酸、分子(生体分子を含むが、これに限定されない)を指し、これらは、協調して機能し、細胞膜、細胞コンパートメント、細胞、組織、器官、臓器系、多細胞生物、または任意の生物学的存在内で、特定の生物学的作業を行う。いくつかの実施形態では、生体系は、細胞内および/または細胞外の細胞シグナル伝達生体分子からなる細胞シグナル伝達経路である。いくつかの実施形態において、生物学的系は、細胞外/細胞マトリックスおよび/または細胞ニッチ内の成長因子シグナル伝達事象からなる。
生体分子:本明細書で使用されている「生体分子」という語は、アミノ酸ベース、核酸ベース、炭水化物ベースまたは脂質ベースなどの任意の天然分子である。
相補的な、または実質的に相補的な:本明細書中で使用されているように、「相補的な」という語は、相互に塩基対を形成するポリヌクレオチドの能力を指す。塩基対は、典型的には、逆平行ポリヌクレオチド鎖中のヌクレオチド単位間の水素結合によって形成される。相補的ポリヌクレオチド鎖は、ワトソン−クリック様式(例えば、AからT、AからU、CからG)、または二重鎖の形成を可能にするその他の任意の様式で、塩基対を形成することができる。当業者が認識しているように、DNAでなくRNAを用いる場合、チミンではなくウラシルがアデノシンに相補的であると考えられる塩基である。しかし、Uが本発明の文脈において示される場合、特に断らない限り、Tを置換する能力が示唆されている。完全な相補性または100%相補性は、1つのポリヌクレオチド鎖の各ヌクレオチド単位が第2のポリヌクレオチド鎖のヌクレオチド単位と水素結合を形成し得る状況を指す。完全な相補性よりも低いというのは、2本の鎖のヌクレオチド単位の一部が、すべてではないが互いに水素結合を形成し得る状況を指す。例えば、2つの20merについて、各鎖上の2つの塩基対が相互に水素結合を形成し得る場合のみ、ポリヌクレオチド鎖は10%の相補性を示す。同じ例において、各鎖上の18個の塩基対が相互に水素結合を形成することができる場合、ポリヌクレオチド鎖は90%の相補性を示す。本明細書で使用されている「実質的に相補的」という語は、siRNAが、所望の標的mRNAと結合し、標的mRNAのRNAサイレンシングを引き起こすのに十分な配列(例えば、アンチセンス鎖中に)を有することを意味する。
化合物:本明細書中で使用されている「化合物」という語は、固有の化学物質を指す。いくつかの実施形態では、特定の化合物は、1つまたはそれ以上の異性体または同位体形態(立体異性体、幾何異性体、および同位体を含むが、これらに限定されない)で存在し得る。いくつかの実施形態では、化合物は、このような形態のうち一つの形態で提供または利用される。いくつかの実施形態では、化合物は、2つまたはそれ以上のこのような形態の混合物(立体異性体のラセミ混合物を含むが、これに限定されない)として、提供または利用される。当業者は、いくつかの化合物が、そのような異なる形態で存在し、異なる特性および/または活性(生物学的活性を含むが、これに限定されない)を示すことを理解する。そのような場合、本発明に従って使用するための化合物の特定の形態を選択または回避することは、当業者の通常の技術の範囲内である。例えば、非対称的に置換された炭素原子を含む化合物は、光学活性体またはラセミ体で単離することができる。光学的に活性な形態を光学活性出発物質から調製する方法に関する方法は、ラセミ混合物の分割または立体選択的合成など、当技術分野で公知である。オレフィンの多くの幾何異性体、C=N二重結合などもまた、本明細書に記載の化合物中に存在することができ、このような安定した異性体は全て、本開示において考慮される。本開示の化合物のシスおよびトランス幾何異性体が記載され、異性体の混合物として、または分離された異性体として単離され得る。
本開示の化合物は、互変異性体も含む。互変異性体は、単結合が隣接する二重結合と交換され、それに付随してプロトンが移動することに起因する。互変異性体は、同じ実験式および全電荷を有する異性体プロトン化状態であるプロトン互変異性体を含む。
本開示の化合物はまた、中間化合物または最終化合物中に存在する原子の同位体の全てを含む。「同位体」は、原子番号は同じであるが、核内の異なる数の中性子から生じる異なる質量数を有する原子を指す。例えば、水素の同位体には、トリチウムおよび重水素がある。
本開示の化合物および塩は、通常の方法によって、溶媒分子または水分子と組み合わせて、溶媒和物および水和物を形成することにより、調製することができる。
保存された:本明細書中で使用されている「保存された」という語は、比較対象の2つまたはそれ以上の配列の同じ位置において、それぞれ改変されていない状態で発生するポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列のヌクレオチドまたはアミノ酸残基を指す。比較的保存されているヌクレオチドまたはアミノ酸は、配列中のその他の場所に現れるヌクレオチドまたはアミノ酸に比べて、多くの関連配列の間で保存されているものである。
いくつかの実施形態では、2つまたはそれ以上の配列は、相互に100%同一である場合に、「完全に保存されている」と言う。いくつかの実施形態において、2つまたはそれ以上の配列は、それらが少なくとも70%同一、少なくとも80%同一、少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一である場合に、「高度に保存されている」と言う。いくつかの実施形態では、2つまたはそれ以上の配列は、それらが約70%同一、約80%同一、約90%同一、約95%、約98%、または約99%同一である場合に、「高度に保存されている」と言う。いくつかの実施形態では、2つまたはそれ以上の配列は、それらが少なくとも30%同一、少なくとも40%同一、少なくとも50%同一、少なくとも60%同一、少なくとも70%同一、80%同一、少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一である場合に、「保存されている」と言う。いくつかの実施形態では、2つまたはそれ以上の配列は、それらが約30%同一、約40%同一、約50%同一、約60%同一、約70%同一、約80%同一、約90% %同一、約95%同一、約98%同一、または約99%同一である場合に、「保存されている」と言う。配列の保存は、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの全長に適用され得るか、またはその一部、領域、または特徴に適用され得る。
一実施形態では、保存された配列は隣接していない。隣接する整列の間隙が配列間に存在する場合に、当業者は、いかに整列を達成するか、また、挿入または欠失が存在するにもかかわらず、対応する残基をいかに整列させるかを理解することができる。
一実施形態では、保存された配列は隣接していない。隣接する整列の間隙が配列間に存在する場合に、当業者は、いかに整列を達成するか、また、挿入または欠失が存在するにもかかわらず、対応する残基をいかに整列させるかを理解することができる。
投与:本明細書中で使用されているように、「投与」とは、パルボウイルスなどの化合物(例えば、AAVおよび/またはAAVの化合物、物質、存在、部分、カーゴまたはペイロード)を、標的に投与する行為または様式を指す。そのような標的は、細胞、組織、臓器、生物、または系(生物学的または産生的)であり得る。
投与剤:本明細書中で使用されている「投与剤」という語は、ポリヌクレオチドおよび/または1つまたはそれ以上の物質のin vivoおよび/またはin vitroでの投与を、少なくとも部分的に促進する薬剤あるいは物質(例えば、ウイルス粒子または発現ベクターなどの本発明の化合物および/または組成物を含むが、これに限定されない)を標的細胞に投与することを指す。
不安定化した:本明細書中で使用されている「不安定な」、「不安定化する」または「不安定化した領域」という語は、同じ領域または同じ分子の開始型、基準型、野生型、または未変性型に比べて、安定性の低い領域または分子を指す。
検出可能な標識:本明細書中で使用されている「検出可能な標識」という語は、他の存在に結合させる、組み込ませる、または会合させる1つまたはそれ以上のマーカー、シグナル、または部分を指し、これらのマーカー、シグナル、または部分は、放射線、蛍光、化学発光、酵素活性、吸光度免疫学的検出などを含む当技術分野で公知の方法によって容易に検出される。検出可能な標識には、放射性同位体、発蛍光団、発色団、酵素、色素、金属イオン、リガンド(例えば、ビオチン、アビジン、ストレプトアビジンおよびハプテン)、量子ドットなどがある。検出可能な標識は、それらが結合、組み込み、または会合している存在の任意の位置に配置することができる。例えば、ペプチドまたはタンパク質に結合し、組み込まれ、または会合される場合、それらは、アミノ酸、ペプチド、またはタンパク質内にあってもよく、またはN−またはC−末端に位置してもよい。
投薬計画:本明細書で使用されている「投薬計画」は、治療、予防、または緩和ケアの投与スケジュールまたは医師により決定された投薬計画である。
有効量:本明細書で使用されている薬剤の「有効量」という語は、本明細書に記載された化合物の投与により、ある疾患の1つまたはそれ以上の症状の治癒、軽減、緩和、または改善において、有益なまたは望ましい結果をもたらすのに十分な量を指し、臨床結果および「有効量」は、従って、それが適用されている状況に依存して変化する。例えば、パーキンソン病を治療する薬剤を投与する状況において、薬剤の有効量は、例えば、薬剤を投与しなかった場合に得られた応答と比較して、本明細書で定義するパーキンソン病の治療を達成するのに十分な量である。
カプセル化する:本明細書で使用されている「カプセル化する」という語は、封入、包囲または封入することを意味する。
遺伝子操作された:本明細書で使用されてように、実施形態が、出発点の分子、野生型の分子、または天然の分子から、構造的にまたは化学的に、変化した特徴または性質を有するようにデザインされる場合に、当該実施形態は「遺伝子操作された」と言う。したがって、遺伝子操作された薬剤または存在は、そのデザインおよび/または生産が人間の手による行為を含むものである。
エピトープ:本明細書中で使用されている「エピトープ」という語は、生体分子と相互作用することができる分子上の表面または領域を指す。例えば、タンパク質は、抗体(例えば、生体分子)と、相互作用する1つまたはそれ以上のアミノ酸(例えば、エピトープ)を含み得る。いくつかの実施形態では、タンパク質またはタンパク質モジュールに言及する場合に、エピトープは、アミノ酸の直線的な伸長または折りたたまれたアミノ酸鎖によって形成される三次元構造からなり得る。
発現:本明細書中で使用されている核酸配列の「発現」という語は、以下の事象の1つまたはそれ以上を指す:(1)DNA配列から(例えば、転写により)RNA鋳型を産生すること;(2) RNA転写産物を、(例えば、スプライシング、編集、5’キャップ形成、および/または3’末端プロセシングにより)プロセシングすること;(3)RNAを、ポリペプチドまたはタンパク質へ翻訳すること;(4)ポリペプチドまたはタンパク質を折り畳むこと;(5)ポリペプチドまたはタンパク質を翻訳後修飾すること。
特徴:本明細書で使用されている「特徴」という語は、特質、特性、または特有の要素を指す。
製剤:本明細書で使用されている「製剤」という語は、本開示の少なくとも1つのポリヌクレオチドおよび/または化合物および/または組成物(例えば、ベクター、AAV粒子など)、さらに投与剤を含む。
断片:本明細書で使用されている「断片」という語は、全体の連続部分を指す。例えば、タンパク質の断片は、培養細胞から単離された全長タンパク質を消化することによって得られるポリペプチドからなる。いくつかの実施形態では、あるタンパク質の一つの断片は、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、150、200、250個、またはそれ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ある抗体の断片は、酵素消化に供される抗体の部分を含むか、またはそのまま合成される。
機能性:本明細書中で使用されている「機能的」生物学的分子という語は、それが特徴付けられる特性および/または活性を示す構造を有するか、またはそのような形態にある生体分子および/または存在である。
遺伝子発現:「遺伝子発現」という語は、核酸配列が首尾よく転写され、そしてほとんどの場合翻訳されてタンパク質またはペプチドを産生するプロセスを指す。分かりやすく言えば、「遺伝子発現」の測定を参照する場合、これは、測定値が転写の核酸産物(例えば、RNAまたはmRNA)由来であるか、あるいは翻訳のアミノ酸産物(例えば、ポリペプチドまたはペプチド)由来であることを意味すると理解されるべきである。RNA、mRNA、ポリペプチドおよびペプチドの量またはレベルを測定する方法は、当技術分野で周知である。
相同性:本明細書中で使用されている「相同性」という語は、ポリマー分子間の全体的な関連性を指し、例えば、核酸分子間((e.g.,DNA分子および/またはRNA分子)および/またはポリペプチド分子間の関連性を指す。いくつかの実施形態では、ポリマー分子は、その配列が少なくとも25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、または99%同一であるかまたは類似している場合に、互いに「相同性」を有すると考えられる。「相同性を有する」という語は、必然的に、少なくとも2つの配列(ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの配列)の間の比較を指す。本発明によれば、2つのポリヌクレオチド配列がコードするポリペプチドが、少なくとも約20アミノ酸の少なくとも1つのストレッチについて、少なくとも約50%、60%、70%、80%、90%、95%、またはさらには99%である場合に、これらのポリヌクレオチド配列は相同性を有すると考えられる。いくつかの実施形態では、相同性を有するポリヌクレオチド配列は、少なくとも4〜5個の一意的に特定されるアミノ酸のストレッチをコードする能力によって特徴付けられる。長さが60ヌクレオチド未満のポリヌクレオチド配列の場合、相同性は、典型的には、少なくとも4−5個の一意的に特定されるアミノ酸のストレッチをコードする能力によって決定される。本発明によれば、2つのタンパク質が、少なくとも約20アミノ酸の少なくとも1つのストレッチについて、少なくとも約50%、60%、70%、80%または90%同一である場合に、これらのタンパク質配列は相同であるとみなされる。多くの態様において、相同性を有するタンパク質は、少なくとも3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,25,30,35,40,45,50またはそれ以上のアミノ酸の、少なくとも1つの短いストレッチにわたって、程度の大きい全体的な相同性および高度の相同性を示す。多くの実施形態では、相同性を有するタンパク質は1つまたはそれ以上の特徴的配列要素を共有する。本明細書中で使用されている「特徴的配列エレメント」という語は、関連するタンパク質に存在するモチーフを指す。いくつかの実施形態では、そのようなモチーフの存在は、特定の活性(例えば、生物学的活性)と相関する。
同一性:本明細書中で使用されている「同一性」という語は、ポリマー分子間の全体的な関連性を指し、例えば、オリゴヌクレオチド分子間およびまたはポリヌクレオチド分子間(例えば、DNA分子および/またはRNA分子などの)および/またはポリペプチド分子の間の全体的な関連性を指す。例えば、2つのポリヌクレオチド配列のパーセント同一性の計算は、最適な比較目的のために2つの配列を整列させることによって行うことができる(例えば、第1および第2の核酸配列の一方または両方にギャップを導入し、最適な整列を達成することができ、非同一配列は比較目的について無視することができる)。特定の実施形態では、比較目的のために整列された配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または100%である。次いで、対応するヌクレオチド位置のヌクレオチドを比較する。第1の配列中の位置が、第2の配列中の対応する位置と同じヌクレオチドによって占有される場合、当該分子はその位置で同一である。2つの配列間のパーセント同一性は、2つの配列の最適な整列のために導入される必要があるギャップの数および各ギャップの長さを考慮に入れた、当該配列によって共有される同一位置の数の関数である。2つの配列間の配列の比較および同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを使用して達成することができる。例えば、2つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、以下に記載されるような方法を用いて決定され得る:Computational Molecular Biology,
Lesk, A. M., ed., Oxford University Press, New York, 1988;Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith, D. W., ed., Academic Press, New York, 1993;Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G., Academic Press, 1987;Computer Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A. M., and Griffin, H. G., eds., Humana Press, New Jersey, 1994;and Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. and Devereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991;これらの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。例えば、2つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、例えば、Meyers and Millerのアルゴリズム(CABIOS、1989,4:11−17)を用いて決定することができ、これは、PAM120加重残基表、ギャップ長ペナルティ=12およびギャップペナルティ=4を用いてALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれている。あるいは、2つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、NWSgapdna.CMPマトリックスを使用するGCGソフトウェアパッケージのGAPプログラムを使用して決定することができる。配列間のパーセント同一性を決定するために一般的に用いられる方法には、Carillo, H., and Lipman, D.,
SIAM J Applied Math., 48:1073 (1988)(この全体が参照により本明細書に組み込まれる)に開示されているものが含まれるが、これらに限定されない。同一性を決定する技法は、広く入手可能なコンピュータプログラムにまとめられている。2つの配列間の相同性を決定するためのコンピュータソフトウェアの例には、GCGプログラムパッケージ、Devereux, J., et al., Nucleic Acids Research, 12(1), 387 (1984)), BLASTP, BLASTN, and FASTA Altschul, S. F. et al., J. Molec. Biol., 215, 403 (1990))が挙げられるが、これらに限定されない。
遺伝子の発現を阻害する:本明細書において、「遺伝子の発現を阻害する」という句は、遺伝子の発現産物の量を減少させることを意味する。発現産物は、遺伝子(例えば、mRNA)から転写されたRNAまたは遺伝子から転写されたmRNAから翻訳されたポリペプチドであってもよい。典型的には、mRNAレベルの低下は、そこから翻訳されるポリペプチドのレベルの低下をもたらす。発現レベルは、mRNAまたはタンパク質を測定するための標準的な技術を用いて決定することができる。
In vitro:本明細書中で使用されている「in vitro」という語は、生物(例えば、動物、植物、または微生物)内ではなく、人工的な環境で起こる事象を指し、その例には、例えば、試験管または反応容器中、細胞培養中、ペトリ皿中などがある。
In vivo:本明細書中で使用されている「in vivo」という語は、生物(例えば、動物、植物、または微生物、あるいはそれらの細胞または組織)内で起こる事象を指す。
単離された:本明細書で使用されている「単離された」という語は、「分離した」と同義語であるが、分離が人間の手によって実行されたという推定を含む。一実施形態では、単離された物質または存在は、それが以前に結合していた成分の少なくとも一部から分離されたものである(天然あるいは実験的な設定にかかわらず)。単離された物質は、それらが結合していた物質に関して、様々なレベルの純度を有し得る。単離された物質および/または存在は、それらが最初に結合していたその他のコンポーネントの少なくとも約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、またはそれ以上から分離している。いくつかの実施形態において、単離された薬剤は、約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97% 98%、約99%、または約99%以上純粋である。本明細書中で使用されているように、物質が実質的にその他の成分を含まない場合に、その物質は「純粋」である。
実質的に単離された:「実質的に単離された」とは、化合物が、それが形成または検出された環境から実質的に分離されることを意味する。部分的な分離には、例えば、本開示の化合物において豊化された組成物が含まれる。実質的な分離には、本開示の化合物またはその塩の重量で、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または 少なくとも約99重量%を含む組成物が含まれる。化合物およびその塩を単離するための方法は、当技術分野では日常的に行なわれている作業である。いくつかの実施形態では、物質または存在の単離には、化学的会合および/または結合の破壊が含まれる。いくつかの実施形態では、単離は、単離された物質または存在が以前に結合された成分からの分離のみを含み、そのような破壊を含まない。
修飾された:本明細書で使用されている「修飾された」という語は、親または参照の分子または存在と比較して、本発明の分子または存在の変化した状態または構造を指す。分子は、化学的、構造的、および機能的に多くの態様で修飾することができる。いくつかの実施形態では、本開示の化合物および/または組成物は、非天然アミノ酸または非天然ヌクレオチドの導入によって修飾される。
突然変異:本明細書中で使用されている「突然変異」という語は、変化および/または改変を指す。いくつかの実施形態において、突然変異は、タンパク質(ペプチドおよびポリペプチドを含む)および/または核酸(ポリ核酸を含む)の変化および/または改変であり得る。いくつかの実施形態において、突然変異は、タンパク質および/または核酸配列の変化および/または改変からなる。このような変化および/または変化は、1つまたはそれ以上のアミノ酸(タンパク質および/またはペプチドの場合)および/またはヌクレオチド(核酸および/またはポリ核酸の場合)の付加、置換、および/または欠失からなる。突然変異がアミノ酸および/またはヌクレオチドの付加および/または置換からなる実施形態において、このような付加および/または置換は、1つまたはそれ以上のアミノ酸および/またはヌクレオチド残基からなり、修飾されたアミノ酸および/またはヌクレオチドを含み得る。
天然起源の:本明細書で使用されている「天然に存在する」という語句は、人工的援助または人間の手による介入なしに自然界に存在することを意味する。
非ヒト脊椎動物:本明細書で使用されている「非ヒト脊椎動物」という語句は、野生および家畜種を含むホモ・サピエンスを除くすべての脊椎動物を含む。非ヒト脊椎動物の例には、アルパカ、バンテン、バイソン、ラクダ、ネコ、ウシ、シカ、イヌ、ロバ、ガヤル、ヤギ、モルモット、ウマ、ラマ、ラバ、ブタ、ウサギ、トナカイ、ヒツジ、水牛、ヤクなどの哺乳類が含まれるが、それらに限定されない。
核酸:本明細書で使用されている「核酸」、「ポリヌクレオチド」および「オリゴヌクレオチド」という語は、ポリデオキシリボヌクレオチド(2−デオキシ−D−リボースを含む)からなるか;またはポリリボヌクレオチド(D−リボースを含む)からなるか;またはプリンまたはピリミジン塩基のNグリコシドであるかまたは修飾されたプリンもしくはピリミジン塩基である任意の他のタイプのポリヌクレオチドからなる、任意の核酸ポリマーを指す。「核酸」という語、「ポリヌクレオチド」という語、および「オリゴヌクレオチド」という語の間には、その長さに意図された区別はなく、これらの用語は互換的に使用される。これらの語は、分子の一次構造のみを指す。したがって、これらの語は、二本鎖および一本鎖DNA、ならびに二本鎖および一本鎖RNAを含む。
オフターゲット:本明細書中で使用されている「オフターゲット」という語は、1つまたはそれ以上の標的、遺伝子および/または細胞転写産物に対する任意の意図しない効果を指す。
オープンリーディングフレーム:本明細書で使用されている「オープンリーディングフレーム」または「ORF」という語は、所与のリーディングフレームにおける終止コドンを含まない配列を指す。
作動可能に連結された:本明細書中で使用されている「作動可能に連結された」という語句は、2つまたはそれ以上の分子、構築物、転写物、存在、部分などの間の機能的連結を指す。
粒子:本明細書で使用されている「粒子」という語は、少なくとも2つの成分(タンパク質キャプシドと、キャプシド内に封入されたポリヌクレオチド配列)からなるウイルスである。
患者:本明細書中で使用されている「患者」という語は、治療を求めているか治療の必要性があるか、治療を必要としているか、治療を受けているか、治療を受けている治療を受けるであろう対象、あるいは、例えばパーキンソン病のような、特定の疾患または状態について訓練された専門家によって医療を受けている対象を指す。
ペイロード:本明細書中で使用されている「ペイロード」という語は、ウイルスゲノムまたはそのようなポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチド領域の発現産物によってコードされる1つまたはそれ以上のポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチド領域を指し、それらには例えば、導入遺伝子、ポリペプチドまたはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、または調節核酸もしくは調節核酸がある。
ペイロード構築物:本明細書中で使用されている「ペイロード構築物」という語は、逆方向末端反復(ITR)配列によって片側または両側に隣接するペイロードをコードするかまたはそれからなる1つまたはそれ以上のポリヌクレオチド領域を指す。ペイロード構築物は、ウイルス産生細胞に複製されて、ウイルスゲノムを生成する鋳型である。
ペイロード構築ベクター:本明細書中で使用されている「ペイロード構築ベクター」という語は、ペイロード構築物をコードするかまたはそれからなるベクター、および細菌細胞における複製および発現のための調節領域である。
ペイロード構築発現ベクター:本明細書中で使用されている「ペイロード構築物発現ベクター」という語は、ペイロード構築物をコードするかまたはそれからなるベクターであり、このベクターはさらに、ウイルス複製細胞におけるウイルス発現のための成分をコードするかまたはそれからなる1つまたはそれ以上のポリヌクレオチド領域からなる。
ペプチド:本明細書中で使用されている「ペプチド」という語は、50アミノ酸の長さ未満(例えば、約5、10、15、20、25、30、35、40、45、または50アミノ酸の長さ)である。
薬学的に許容される:「薬学的に許容される」という語句は、「薬学的に許容される」という句は、本明細書では、健全な医学的判断の範囲内で、ヒトおよび動物の組織と接触して使用するのに適しており、合理的な利益/リスク比に見合う、過剰な毒性、刺激、アレルギー反応、または他の問題または合併症なしに投与することができる化合物、材料、組成物および/または剤形を指す。
薬学的に許容される賦形剤:本明細書で使用されている「薬学的に許容される賦形剤」という語は、医薬組成物中に存在する化合物および/または活性薬剤以外の任意の成分(例えば、本明細書に記載の成分)であって、対象(例えば患者)において実質的に非毒性で非炎症性であるという性質を有する成分を指す。いくつかの実施形態において、薬学的に許容される賦形剤は、活性薬剤を懸濁および/または溶解することができるビヒクルである。賦形剤の例には、抗癒着防止剤、抗酸化剤、結合剤、コーティング剤、圧縮助剤、崩壊剤、染料(色)、皮膚軟化剤、乳化剤、充填剤(希釈剤)、フィルム形成剤またはコーティング、風味剤、香料、流動化剤(流動促進剤) 、滑沢剤、保存剤、印刷インキ、吸着剤、懸濁剤または分散剤、甘味料、および水和水がある。賦形剤の例には、以下が含まれるが、それらに限定されるものではない:ブチル化ヒドロキシトルエン(BHT)、炭酸カルシウム、リン酸カルシウム(二塩基性)、ステアリン酸カルシウム、クロスカルメロース、架橋ポリビニルピロリドン、クエン酸、クロスポビドン、システイン、エチルセルロース、ゼラチン、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ラクトース、ステアリン酸マグネシウム、マルチトール、マンニトール、メチオニン、メチルセルロース、メチルパラベン、微晶質セルロース、ポリエチレングリコール、ポリビニルピロリドン、ポビドン、アルファ化デンプン、プロピルパラベン、パルミチン酸レチニル、シェラック、二酸化ケイ素、カルボキシメチルセルロースナトリウム、クエン酸ナトリウム、グリコール酸ナトリウムデンプン、ソルビトール、デンプン(トウモロコシ)、ステアリン酸、スクロース、タルク、二酸化チタン、ビタミンA、ビタミンE、ビタミンC、およびキシリトール。
薬学的に許容される塩:本明細書に記載の化合物の薬学的に許容される塩。本明細書中で使用されている、「薬学的に許容される塩」という語は、開示された化合物の誘導体または形態を指し、それらの化合物の誘導体または形態では、親化合物が、既存の酸部分または塩基部分をその塩形態(例えば、遊離塩基を適切な有機酸と反応させることにより発生させる)に変換することにより、修飾されている。薬学的に許容される塩の例としては、アミンのような塩基性残基の無機または有機酸塩;カルボン酸などの酸性残基のアルカリまたは有機塩;等が含まれるが、それらに限定されるものではない。代表的な酸付加塩の例としては、酢酸塩、酢酸、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩、樟脳スルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、グルコヘプタン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプトン酸塩、ヘキサン酸塩、臭化水素酸塩、塩酸塩、ヨウ化水素酸塩、2−ヒドロキシエタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3−フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが挙げられる。代表的なアルカリまたはアルカリ土類金属塩の例には、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなど、ならびに非毒性のアンモニウム、第四級アンモニウム、およびアミンカチオンがあり、それらの例には、アンモニウム、テトラメチルアンモニウム、テトラエチルアンモニウム、メチルアミン、ジメチルアミン、トリメチルアミン、トリエチルアミン、エチルアミンなどが挙げられるが、これらに限定されない。本開示の薬学的に許容される塩には、例えば非毒性無機または有機酸から形成される親化合物の従来の非毒性塩が含まれる。いくつかの実施形態では、本開示の薬学的に許容される塩は、従来の化学的方法によって塩基性部分または酸性部分を含む親化合物から調製された合成塩であってよい。一般に、このような塩は、これらの化合物の遊離酸または塩基形態を、適切な塩基または酸の化学量論量と、水中または有機溶媒中で、またはその2種の混合物中で反応させることによって調製することができる。一般に、エーテル、酢酸エチル、エタノール、イソプロパノールまたはアセトニトリルのような非水性媒体が好ましい。適切な塩のリストは、以下の文献に見られる:Remington’s Pharmaceutical Sciences, 17th ed., Mack Publishing Company, Easton, Pa., 1985, p. 1418, Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use, P.H. Stahl and C.G. Wermuth (eds.), Wiley−VCH, 2008, and Berge et al., Journal of Pharmaceutical Science, 66, 1−19 (1977);これらはそれぞれ参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
薬学的に許容される溶媒和物:本明細書で使用されている「薬学的に許容される溶媒和物」という語は、適切な溶媒の分子が結晶格子に組み込まれている本発明の化合物の結晶形を指す。適切な溶媒は、投与される投与量で生理学的に許容される。例えば、溶媒和物は、有機溶媒、水、またはそれらの混合物を含む溶液からの結晶化、再結晶化、または沈殿によって調製することができる。適切な溶媒の例には、エタノール、水(例えば、一水和物、二水和物および三水和物)、N−メチルピロリジノン(NMP)、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N,N’−ジメチルホルムアミド(DMF)、N,N’−ジメチルアセトアミド(DMAC)、1,3−ジメチル−2−イミダゾリジノン(DMEU)、1,3−ジメチル−3,4,5,6−テトラヒドロ−2−(1H)−ピリミジノン(DMPU) アセトニトリル(ACN)、プロピレングリコール、酢酸エチル、ベンジルアルコール、2−ピロリドン、安息香酸ベンジル等が挙げられる。水が溶媒である場合、溶媒和物は「水和物」と呼ばれる。いくつかの実施形態では、溶媒和物に組み込まれる溶媒は、溶媒和物が投与される(例えば、医薬組成物の単位投与形態で)生物にとって生理学的に許容されるタイプであるか、またはそのようなレベルである。
薬物動態学:本明細書中で使用されている「薬物動態学」という語は、分子または化合物の任意の1つまたはそれ以上の特性を指し、そのような特性は、生体に投与される物質の結果予測の決定に関連する。薬物動態は、吸収、分布、代謝および排泄の程度および速度を含むいくつかの領域に分けられる。これは一般に、以下を表すADMEという略語で呼ばれている:(A)吸収(Absorption)とは、物質が血液循環に入る過程を指す;(D)(Distribution)分布とは、身体の体液および組織全体に物質が分散または拡散することを指す;(M)代謝(Metabolism)(または生物変換)(Biotransformation)とは、親化合物の娘代謝物への不可逆的変換を指す;(E)排泄(Excretion)(または排除)(Elimination)とは、物質が身体から排除されることを指す。まれに、一部の薬物は、体組織に不可逆的に蓄積することがある。
物理化学的:本明細書中で使用されている「物理化学的」という語は、物理的および/または化学的性質を意味するかまたはそれに関連していることを指す。
予防する:本明細書中で使用されている「予防する」という語は、例えばパーキンソン病などの、感染症、疾患、障害および/または状態の発症を部分的にまたは完全に遅延させること;特定の感染症、疾患、障害および/または状態の1つまたはそれ以上の症状、特徴、または臨床症状の発症を部分的にまたは完全に遅延させること;特定の感染症、疾患、障害および/または状態の1つまたはそれ以上の症状、特徴、または出現の発症を部分的にまたは完全に遅延させること;特定の感染症、疾患、障害および/または状態の進行を部分的にまたは完全に遅延させること;および/または、感染症、疾患、障害および/または状態に関連した病理を発症するリスクを低下させる。
プロドラッグ:本開示は、本明細書に記載の化合物のプロドラッグも含む。本明細書中で使用されている「プロドラッグ」という語は、それが化学的または物理的変化により治療剤として作用することが予測される形態の任意の物質、分子または存在をいう。プロドラッグは、何らかの方法で共有結合または隔離され、哺乳動物対象に投与する前に、投与中に、または投与後に活性薬物部分を放出するかまたは活性薬物部分に変換され得る。プロドラッグの調製および使用は、T. Higuchi and V. Stella,
“Pro−drugs as Novel Delivery Systems,” Vol. 14 of the A.C.S. Symposium Series、およびBioreversible Carriers in Drug Design,
ed. Edward B. Roche, American Pharmaceutical Association and Pergamon Press, 1987(これらは双方ともその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
増殖する:本明細書中で使用されている 「増殖する」という語は、増殖、拡大、複製または増加することを意味し、または増殖、拡大、複製または増加することを引き起こすことを意味する。「増殖性」とは増殖能力を有することを意味する。「抗増殖性」とは、増殖特性に対抗する特性、または反対の特性を有することを意味する。
予防法:本明細書中で使用されている「予防法」という語は、疾患の広がりを防ぐために使用される治療または治療経過を指す。
予防措置:本明細書において、「予防措置」とは、健康を維持し、疾患の広がりを防ぐためにとられる措置を指す。
目的のタンパク質:本明細書中で使用されている語「目的のタンパク質」または「所望のタンパク質」という語には、本明細書で提供されるものおよびそのフラグメント、突然変異体、改変体、および改変が含まれる。
精製された:本明細書で使用する「精製する」、「精製された」、「精製」とは、望ましくない成分、材料の脱脂、混和または不完全なものから実質的に純粋または異物がない状態にすることを意味する。「精製された」とは、純粋な状態を指す。「精製」とは、純粋なものを作製する過程を指す。
領域:本明細書で使用されている「領域」という語は、ゾーンまたは一般領域を指す。いくつかの実施形態では、タンパク質またはタンパク質モジュールの文脈では、領域は、タンパク質またはタンパク質モジュールに沿ったアミノ酸の直鎖配列からなるか、あるいは3次元領域、エピトープおよび/またはエピトープのクラスターからなり得る。いくつかの実施形態では、領域は末端領域からなる。本明細書中で使用されている 「末端領域」という語は、所定の作用物質の末端に位置する領域を指す。タンパク質の文脈では、末端領域はN末端および/またはC末端からなり得る。N末端は、遊離アミノ基を有するアミノ酸からなるタンパク質の末端を指す。C末端は、遊離カルボキシル基を有するアミノ酸からなるタンパク質の末端を指す。したがって、N末端領域および/またはC末端領域は、N末端および/またはC末端ならびにその周囲のアミノ酸からなり得る。いくつかの実施形態では、N末端領域および/またはC末端領域は、約3アミノ酸〜約30アミノ酸、約5アミノ酸〜約40アミノ酸、約10アミノ酸〜約50アミノ酸、約20アミノ酸〜約100個のアミノ酸、および/または少なくとも100個のアミノ酸からなる。いくつかの実施形態では、N末端領域は、N末端を含むがC末端を含まないアミノ酸の任意の長さからなり得る。いくつかの実施形態では、C末端領域は、C末端を含むがN末端を含まないアミノ酸の任意の長さからなり得る。
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドの文脈では、領域は、ポリヌクレオチドに沿った核酸の線状配列からなり得るか、または三次元領域、二次構造、または三次構造からなり得る。いくつかの実施形態では、領域は末端領域からなる。本明細書中で使用されている「末端領域」という語は、所定の作用物質の末端に位置する領域を指す。ポリヌクレオチドの文脈では、末端領域は5’末端および3’末端からなり得る。5’末端は、遊離リン酸基を有する核酸からなるポリヌクレオチドの末端を指す。3’末端は、遊離ヒドロキシル基を有する核酸からなるポリヌクレオチドの末端を指す。したがって、5’領域および3’領域は、5’末端および3’末端ならびにその周囲の核酸からなり得る。いくつかの実施形態では、5’末端領域および3’末端領域は、約9個の核酸〜約90個の核酸、約15個の核酸〜約120個の核酸、約30個の核酸〜約150個の核酸、約60個の核酸〜約300個の核酸、および/または少なくとも300個の核酸からなる。いくつかの実施形態では、5’領域は、5’末端を含むが3’末端を含まない核酸の任意の長さからなり得る。いくつかの実施形態では、3’領域は、3’末端を含むが5’末端を含まない核酸の任意の長さからなり得る。
RNAまたはRNA分子:本明細書で使用されている「RNA」または「RNA分子」または「リボ核酸分子」という語は、リボヌクレオチドのポリマーを指し、「DNA」または「DNA分子」または「デオキシリボ核酸分子」という語は、デオキシリボヌクレオチドのポリマーを指す。DNAおよびRNAは、例えば、DNA複製およびDNAの転写によって、それぞれ天然に合成することができ、また化学的に合成することもできる。DNAおよびRNAは、一本鎖(すなわち、それぞれssRNAまたはssDNA)または複数鎖(例えば、二本鎖、すなわちdsRNAおよびdsDNA)であり得る。本明細書で使用されている「mRNA」または「メッセンジャーRNA」という語は、1つまたはそれ以上のポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードする一本鎖RNAを指す。
RNA干渉:本明細書で使用されている「RNA干渉」または「RNAi」という語は、対応するタンパク質コード遺伝子の発現の阻害または干渉または「サイレンシング」をもたらすRNA分子によって媒介される配列特異的調節機構を指す。
試料:本明細書で使用されている「試料」という語は、供給源から採取されたアリコート、サブセット、または部分、および/または分析または処理のために提供されるアリコート、サブセット、または部分を指す。いくつかの実施形態では、試料は、組織、細胞または構成要素部分などの生物学的供給源に由来するものである(例えば、血液、粘液、リンパ液、滑液、脳脊髄液、唾液、羊水、羊水、尿、膣液および精液を含むがこれに限定されない体液)。いくつかの実施形態では、試料は、全生物またはその組織、細胞もしくは構成部分のサブセット、またはその断片もしくは一部分から調製されたホモジネート、溶解物または抽出物であってもよく、それらの例には、血漿、血清、脊髄液、リンパ液、皮膚の外部切片、呼吸器系/腸管系/泌尿生殖系の管、涙、唾液、乳、血液細胞、腫瘍または器官が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、試料は、タンパク質または核酸分子などの細胞成分を含み得る栄養培地またはゲルなどの培地であるか、またはそれらからなる。いくつかの実施形態では、「一次」試料は、供給源のアリコートである。いくつかの実施形態では、一次試料は、分析またはその他の用途に使用する試料を調製するための一つまたはそれ以上の処理(例えば、分離、精製など)工程に付される。
自己相補性ウイルス粒子:本明細書で使用されている「自己相補性ウイルス粒子」という語は、少なくとも2つの成分、つまり、タンパク質キャプシドおよび当該キャプシド内に封入された自己相補的ゲノムをコードするポリヌクレオチド配列からなる粒子である。
センス鎖:本明細書中で使用されているsiRNA分子の「センス鎖」または「第2鎖」または「パッセンジャー鎖」という語は、アンチセンス鎖または第1鎖に相補的な鎖を指す。siRNA分子のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、二本鎖構造を形成するようにハイブリダイズされる。本明細書中で使用される場合、「siRNA二本鎖」は、サイレンシングの標的となる遺伝子のmRNAの約10〜50ヌクレオチドの部分に十分な相補性を有するsiRNA鎖、およびsiRNA鎖と二本鎖を形成するのに十分な相補性を有するsiRNA鎖を含む。
信号シーケンス:本明細書中で使用されている「シグナル配列」という語は、輸送または局在を指示することができる配列を指す。
単一単位用量:本明細書で使用されている「単一単位用量」という語は、1回の用量/1回の投与/単一の投与経路/単一の接触点(すなわち単一の投与事象)で投与される任意の治療剤の用量を指す。いくつかの実施形態では、単一単位用量が別個の剤形(例えば、錠剤、カプセル、パッチ、充填済みの注射器、バイアルなど)として提供される。
類似性:本明細書中で使用されている「類似性」という語は、例えば、ポリヌクレオチド分子間(例えば、DNA分子および/またはRNA分子など)および/またはポリペプチド分子間などのポリマー分子間の全体的な関連性を指す。パーセント類似性の計算が当技術分野で理解されるような保存的置換を考慮に入れていることを除いて、パーセント同一性の計算と同じ方法で、ポリマー分子の相互のパーセント類似性の計算を行うことができる。
小/短鎖干渉RNA:本明細書中で使用されている「小/短鎖干渉RNA」または「siRNA」という語は、RNAiを指向または仲介することができる約5から60の間のヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)からなるRNA分子(またはRNA類似体)を指す。好ましくは、siRNA分子は、約15から30の間のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体、より好ましくは約16から25の間のヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、さらにより好ましくは約18から23の間のヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)の間、さらにより好ましくは約19から22の間のヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)(例えば、19,20,21、または22ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体)からなる。「短い」siRNAという語は、5〜23ヌクレオチド、好ましくは21ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、例えば19,20,21または22ヌクレオチドからなるsiRNAを指す。「長い」siRNAという語は、24〜60ヌクレオチド、好ましくは約24〜25ヌクレオチド、例えば23,24,25、または26ヌクレオチドからなるsiRNAを指す。短いsiRNAは、場合によっては、より短いsiRNAがRNAiを媒介する能力を保持するならば、19ヌクレオチド未満(例えば、16,17または18ヌクレオチド、または5ヌクレオチド未満)からなり得る。同様に、より長いsiRNAが、RNAi媒介する能力を保持する限り、または短いsiRNAへのさらなるプロセシング(例えば、酵素プロセシング)で欠いている翻訳抑制を保持する限り、長いsiRNAは、いくつかの例では、26を超えるヌクレオチド(例えば、27、28、29、30、35、40、45、50、55、またはさらには60ヌクレオチド)を含み得る。siRNAは、一本鎖RNA分子(ss−siRNA)または二本鎖RNA分子(ds−siRNA)であり得、これらは、siRNA二重鎖と呼ばれる二本鎖構造を形成するようにハイブリダイズされたセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む。
分割用量:本明細書で使用されている「分割用量」は、単一単位用量または1日総用量を2回またはそれ以上の用量に分割することを指す。
安定した:本明細書中で使用されている「安定した」という語は、反応混合物から有用な程度の純度まで単離しても破壊されない程十分に頑強であり、好ましくは有効な治療剤に処方することができる化合物または存在を指す。
安定化された:明細書中で使用されている「安定化する」、「安定化された」、「安定化された領域」は、安定した状態にする、または安定した状態になることを指す。いくつかの実施形態において、安定性は、絶対値に比較して測定される。いくつかの実施形態において、安定性は、参照化合物または存在に比較して測定される。
対象:本明細書中で使用されている「対象」または「患者」という語は、例えば、実験、診断、予防および/または治療の目的で、本発明による組成物を投与する任意の生体を指す。典型的な対象には、動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、非ヒト霊長類、およびヒトなどの哺乳類)および/または植物が含まれる。いくつかの実施形態では、対象は、乳児、新生児、または12歳未満の小児であり得る。いくつかの実施形態では、対象は、子宮内に居ることもあり得る。
実質的に:本明細書中で使用されている「実質的に」という語は、関心の持たれている特徴または特性の全体またはほぼ全体的な範囲または程度を示す定性的条件を指す。生物学的技術における当業者は、生物学的および化学的現象が、完了する、完全に進む、および/または絶対的な結果を達成あるかまたは回避することは極めてまれであることを、理解しているであろう。したがって、「実質的に」という語は、本明細書では、多くの生物学的および化学的現象に特有である完全性の潜在的な欠如を表すために使用されている。
実質的に等しい:用量間の時間差に関連して本明細書で使用されているこの語は、プラスマイナス2%を意味する。
実質的に同時に:複数の用量に関連して本明細書で使用されているこの語は、典型的には約2秒以内を意味する。
〜に罹患している:疾患、障害および/または状態「に罹患している」個体は、例えばパーキンソン病のような疾患、障害および/または状態の1つまたはそれ以上の症状を有すると診断されているか、またはそれらを呈している。
〜に罹患しやすい:疾患、障害および/または状態「に罹患しやすい」個体は、疾患、障害および/または状態を有する診断されていないか、および/または疾患、障害および/または状態の症状を示していないが、疾患またはその症状を発症する傾向を有する。いくつかの実施形態では、疾患、障害および/または状態(例えば、癌)に罹患しやすい個体は、以下の1つまたはそれ以上によって特徴付けられ得る:(1)疾患、障害および/または状態の発症に関連する遺伝子変異;(2)疾患、障害および/または状態の発症に関連する遺伝的多型;(3)疾患、障害および/または状態に関連するタンパク質および/または核酸の発現および/または活性の増加および/または低下;(4)疾患、障害および/または状態の発症に関連する習慣および/またはライフスタイル;(5)疾患、障害および/または状態の家族歴;および(6)疾患、障害、および/または状態の発症に関連する微生物への曝露および/または感染。いくつかの実施形態では、疾患、障害および/または状態に罹患しやすい個体は、疾患、障害および/または状態を発症する。いくつかの実施形態では、疾患、障害および/または状態に罹りやすい個体は、疾患、障害および/または状態を発症しない。
徐放:本明細書で使用されている「徐放」という語は、特定の期間にわたる放出速度に適合する医薬組成物または化合物放出プロファイルを指す。
合成された:「合成された」という語は、人間の手によって生み出された、調製された、および/または製造されたことを意味する。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドまたはその他の分子の合成は、化学的または酵素的であってもよい。
標的設定:本明細書中で使用されている「標的設定」という語は、標的核酸にハイブリダイズし所望の効果を誘導する核酸配列の設計および選択のプロセスを意味する。
標的細胞:本明細書中で使用されている「標的細胞」という語は、関心のもたれている任意の1つまたはそれ以上の細胞を指す。このような細胞は、in vitro、in vivo、in situ、または生物の組織または臓器に存在する。このような生物は、動物、好ましくは哺乳動物、より好ましくはヒト、最も好ましくは患者である。
治療薬:「治療剤」という語は、対象に投与された場合に、治療的、診断的および/または予防的効果を有し、および/または所望の生物学的および/または薬理学的効果を引き出す任意の薬剤を指す。
治療有効量:本明細書中で使用されている「治療有効量」という語は、疾患、障害、および/または状態に罹患しているかまたは罹患しやすい対象に投与された場合に、例えば、パーキンソン病などの感染症、疾患、障害および/または状態の発症を治療、症状改善、診断、予防、および/または遅延させるのに十分である投与薬剤(例えば、核酸、薬物、治療剤、診断剤、予防剤 など)の量を指す。いくつかの実施形態において、治療有効量は、単位用量で提供される。いくつかの実施形態では、治療有効量は、複数の投与量からなる投与計画で投与される。当業者は、いくつかの実施形態において、単位剤形が、そのような投与計画の一部として投与された場合に有効量からなっているのであれば、特定の薬剤または存在の治療有効量からなると考えられることを理解しているであろう。
治療上有効な転帰:本明細書中で使用されている「治療的に有効な転帰」という語は、感染、疾患、障害および/または状態に罹患しているかまたは感染、疾患、障害および/または状態に罹患しやすい対象において、感染症、疾患、障害および/または状態を治療、改善、診断、予防、および/またはその発症を遅延させるに十分である転帰を意味する。
一日の用量の総量:本明細書中で使用される「1日総投与量」という語は、24時間に投与または処方される量である。それは単一単位用量として投与することができる。
トランスフェクション:本明細書中で使用されている「トランスフェクション」という語は、外因性核酸を細胞に導入する方法を指す。トランスフェクションの方法には、化学的方法、物理的処理およびカチオン性脂質または混合物が含まれるが、これらに限定されない。
治療する:本明細書で使用されている「治療する」という語は、特定の感染症の1つまたはそれ以上の症状または特徴の部分的または完全な緩和、改良、改善、軽減、発症の遅延、進行の阻害、重症度の軽減、および/または発生率 の減少を指す。例えば、癌を「治療する」とは、腫瘍の生存、成長および/または拡散を阻害することを指す。治療は、疾患、障害および/または状態の徴候を示していない対象、および/または疾患、障害および/または状態の初期徴候のみを示している対象に対し、例えばパーキンソン病のような疾患、障害、および/または状態に関連する病理を発症するリスクを低下させる目的で、投与する。
修飾されていない:本明細書中で使用されている「修飾されていない」という語は、いずれかの方法で変更される前の任意の物質、化合物、または分子を指す。修飾されていない型は、必ずしもそうであるとは限らないが、生体分子または存在の野生型または天然形態を指す場合がある。分子または存在は一連の修飾を受け、それによって各修飾された物質、化合物、分子または存在は、その後の修飾のための「修飾されていない」出発分子として供される。
ベクター:本明細書中で使用されている「ベクター」という語は、異種分子の運搬体として輸送、形質導入、またはその他の方法で作用する任意の分子または部分を指す。本開示のベクターは、組換え的に産生することができ、アデノ随伴ウイルス(AAV)親または参照配列に基づいているか、および/またはそれらからなり得る。そのような親AAV配列または参照AAV配列は、エンジニアリングベクターの元の配列、第2の配列、第3の配列または後続の配列として機能し得る。非限定的な例において、このような親AAV配列または参照AAV配列は、以下の配列のいずれか1つまたはそれ以上からなり得る:ポリペプチドまたはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列(この配列は野生型であってもよく、野生型から修飾されていてもよく、またこの配列は、タンパク質、タンパク質ドメイン、またはタンパク質の1つまたはそれ以上のサブユニットの完全長または部分配列をコードし得る);調節核酸または制御核酸をからなるポリヌクレオチド(この配列は野生型であってもよく、または野生型から修飾されていてもよい);および導入遺伝子(野生型配列から修飾されていてもいなくてもよい)。これらのAAV配列は、(核酸レベルでは)1つまたはそれ以上のコドンの「ドナー」配列として、(ポリペプチドレベルでは)アミノ酸として、(核酸レベルでは)1つまたはそれ以上のコドンの「アクセプター」配列として、または(ポリペプチドレベルでは)アミノ酸として機能する。
ウイルス構築ベクター:本明細書で使用されている「ウイルス構築ベクター」という語は、Repおよび/またはCapタンパク質をコードするか、またはそれらからなる1つまたはそれ以上のポリヌクレオチド領域からなるベクターを指す。
ウイルス構築発現ベクター:本明細書中で使用されている「ウイルス構築物発現ベクター」という語は、Repおよび/またはCapをコードするかまたはそれらからなる1つまたはそれ以上のポリヌクレオチド領域からなるベクターを指し、このポリヌクレオチド領域はさらに、ウイルス複製細胞においてウイルス発現のための成分をコードするかまたはそれらからなる1つまたはそれ以上のポリヌクレオチド領域からなる。
ウイルスゲノム:本明細書で使用されている「ウイルスゲノム」という語は、少なくとも1つの逆方向末端反復(ITR)、少なくとも1つの制御配列、および少なくとも1つのペイロードをコードするポリヌクレオチドを指す。ウイルスゲノムは、ペイロード構築物発現ベクターからのペイロード構築物の複製によって誘導される。ウイルスゲノムは、ペイロード構築物の少なくとも1コピーをコードする。
同等のものおよび適用範囲
当業者であれば、本明細書に記載された本発明による特定の実施形態について多くの同等のものを認識するか、またはルーチンの実験のみを用いて確認することができるであろう。本発明の範囲は、上記の説明に限定されるように意図されているのではなく、添付の特許請求の範囲に記載されている。
特許請求の範囲において、「a」、「an」および「the」などの不定冠詞は、文脈からその逆であることあるいは明らかに示されていない限り、1つまたはそれ以上のものを意味する。ある群の1つまたはそれ以上の構成員の間に「or」を含む請求項または説明は、文脈からその逆であることあるいは明らかに示されていない限り、群の構成員の1つ、1つ以上、またはすべてが所与の製品またはプロセスに存在しているか、使用されているか、または関連している場合に、満たされているとみなされる:本発明は、群の構成員の1つだけが所与の製品またはプロセスに存在しているか、使用されているか、または関連している実施形態を含む。本発明は、群の構成員の1つ以上またはすべてが所与の製品またはプロセスに存在しているか、使用されているか、または関連している実施形態を含む。
「〜からなる(comprising)」という語は、開かれていることを意図しており、追加の要素またはステップを含めることを許可するが、追加の要素またはステップを含めることを必要とはしていないことにも留意されたい。「〜からなる(comprising)」という語が本明細書で使用される場合、「から構成されている(consisting of)」という語もこのように包含され、明示される。
別途定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。方法および材料は、本開示での使用のために本明細書に記載されており、当技術分野で公知の他の適切な方法および材料も使用することができる。
範囲が与えられている場合、エンドポイントが含まれる。さらに、別途示されない限り、あるいは文脈および当業者の理解から明白でない限り、範囲として表される値は、本発明の多様な実施形態において記載された範囲内の任意の特定の値または部分範囲、当該範囲の下限の単位の10分の1までと想定される(文脈上明確に別途指示されている場合を除く)と理解されるべきである。
さらに、先行技術に含まれる本発明の特定の実施形態はすべて、特許請求の範囲のいずれか1つまたはそれ以上から明白に除外され得ることが理解されるべきである。そのような実施形態は、当業者に知られているとみなされるので、除外が明示的に本明細書に記載されていなくても除外されてよい。本発明の組成物の特定の実施形態(例えば、それによってコードされる任意の核酸またはタンパク質、任意の生産方法、任意の使用方法など)は、先行技術の存在に関連しているか否かにかかわらず、何らかの理由で、1つまたはそれ以上の請求項から除外されることがある。
引用文献に明示的に記載されていない場合でも、すべての出典(例えば、参考文献、出版物、データベース、データベースエントリー、およびここに引用された先行技術)は、参照により本出願に組み込まれる。引用された出典と本出願に矛盾する記述がある場合は、本出願の記述が優先するものとする。
セクションおよび表の見出しは、限定することを意図していない。
(実施例)
実施例1:AADCポリヌクレオチドの設計
AADCポリヌクレオチドは、少なくとも、AADCタンパク質をコードする核酸配列からなるように設計される。
設計された配列は、操作されるか、合成されるか、またはプラスミドまたはベクターに挿入されて、細胞または生物に投与される。適切なプラスミドまたはベクターは、標的細胞に形質導入またはトランスフェクトするものである。
アデノ随伴ウイルスベクター(AAV)、ウイルス粒子またはウイルス全体を使用することができる。
投与により、疾患の病因(この場合はパーキンソン病)を変化させるAADCタンパク質を産生するAADCポリヌクレオチドのプロセシングが起こる。
非限定的な一例において、本発明のAADCポリヌクレオチドを含有するプラスミドを表1に示す。表中のこれらのAADCポリヌクレオチドは、Fastbackプラスミドに含まれ、CMVプロモーターを有し、AADCをコードする。いくつかの実施形態において、AADCタンパク質mRNAのオープンリーディングフレームは、コドン最適化されている(例えば、codop)。

実施例2:AADCポリヌクレオチド:ITRからITRまで
AAVウイルスベクターにおける使用に適したAADCポリヌクレオチドは、表2のものを含む。
表2に記載されているものは、表1のITRからITRまでの配列である。

実施例3:ITRからITRまでの親配列との比較
AADCポリヌクレオチドは、表3および表4に従って設計される。記載されている開始および停止位置は、表2に記載のITRからITRまでのAADCポリヌクレオチドと比較している。

実施例4:AADCポリヌクレオチドの設計
AADCポリヌクレオチドは、少なくとも、AADCタンパク質をコードする核酸配列からなるように設計される。
設計された配列は、操作されるか、合成されるか、またはプラスミドまたはベクターに挿入されて、細胞または生物に投与される。適切なプラスミドまたはベクターは、標的細胞に形質導入またはトランスフェクトするものである。
アデノ随伴ウイルスベクター(AAV)、ウイルス粒子またはウイルス全体を使用することができる。
投与により、疾患の病因(この場合はパーキンソン病)を変化させるAADCタンパク質を産生するAADCポリヌクレオチドのプロセシングが起こる。
非限定的な一例において、本発明のAADCポリヌクレオチドを含有するプラスミドを表6に示す。表中のこれらのAADCポリヌクレオチドは、Fastbackプラスミドに含まれ、CMVプロモーターを有し、AADCをコードする。いくつかの実施形態において、AADCタンパク質mRNAのオープンリーディングフレームは、コドン最適化されている(例えば、codop)。

表7に記載されているものは、表6のITRからITRまでの配列である。

実施例5:遺伝子治療を目的とした患者へのAADCポリヌクレオチド組成物の投与
AADCポリヌクレオチド含有組換えAAVベクター組成物を、パーキンソン病を有しており治療に適格であると特定された患者の黒質、特に黒質緻密部(SNpc)、および腹側被蓋領域(VTA)に、当該分野で公知の方法により注入した。
本明細書に記載の方法における使用が考えられる投与方法の1つは、AADCポリヌクレオチド含有AAVベクター組成物のリアルタイム対流増強投与(RCD)である。この投与法では、ガドテリドール(磁気共鳴(MR)造影剤)とT1またはT2磁気共鳴画像(MRI)の同時注入によって、その後のAADC遺伝子発現の領域を予測することができる。Richardson, et al., 2011に記載されているように、カニューレの配置と最初の注入液分布の精度は、トレーサー剤のその後の分布を大きく変えることなく、生理食塩水の注入によって、安全に決定することができる(Richardson, et al., 2011, Neurosurgery, 69(1):154−163)。T2 RCDにより、損傷していない脳内での実質内の対流強化投与の検出をすることができ、ウイルスベクター注入後の導入遺伝子のその後の分布を予測することができる。対象は、生理食塩水注入/T2獲得を受け、その後直ちに被殻および脳幹にガドテリドール注入/T1獲得が行われる。分布量と空間パターンが分析される。視床における交互のT2/T1獲得下で、ガドテリドールおよびAAVでコードされたAADCを同時注入し、高強度領域をその後のトランスジーン発現領域と比較する。輸液量に対する分布容積の比は、生理食塩水とガドテリドールRCDとの間で同様であると予想される。空間的な重なりは、T2画像とT1画像との間に良好に相関するはずである。第2注入液は、第1注入液と同様の時空間的パターンに従い、標的外分布を形成する前に標的領域を満たす。AADC発現の領域は、RCDの間に観察されたT1およびT2の高強度の領域とよく相関するはずである(Richardson, et al., 2011,
Neurosurgery, 69(1):154−163)。
巨大分子の脳実質への対流増強投与(CED)は、20年以上前から知られている。CEDは、圧力勾配を使用して、脳実質内のバルク流(すなわち標的構造に直接配置されたカニューレを介して溶液を注入することによって駆動される間質液内の巨大分子の対流)を生成することを意味する語である。この方法により、治療薬を、血液脳関門を迂回し、単純拡散を超えることにより、大量の脳組織全体に均一に分布させることができる (Richardson, et al., 2011, Stereotact. Funct. Neurosurg. 89:141−151)。
Salegioらは、近年、齧歯類およびNHPのCNS内に、ミセル(15nmまでのサイズ)、AAV(約20〜25nm)およびリポソーム(約65nmまで)を含む様々なサイズのナノ粒子の分布を実証した(Salegio et al., 2014,
Frontiers in Neuroanatomy, vol. 8, article 9: pp. 1−8)。単純な注射は血管周囲系に関与することができず、特殊な注入カニューレが必要とされる。この特殊な注入カニューレは、カニューレの先端に一定の圧力を加えることができるので、間質静水圧を超えて、注入液が組織に流出する。単純な針は著しい逆流を引き起こす。従って、この傾向に対抗するために、逆流防止カニューレが開発されている。MRIガイド下の対流強化注入のためのプラットフォームの出現により、血管周囲流れのメカニズムの理解がさらに精緻化され、リポソームの血管周囲分布が時間的に直線的であり、有髄領域では曲線の傾きが増加し、注入の停止が分布容積のさらなる拡大を妨げることが実証された(Richardson, et al, 2011, Stereotact. 89:141−151;Salegio et al, 2014, Frontiers in Neuroanatomy, vol.
8, article 9: pp. 1−8)。
実質内へのrAAV注射は、ロバストであるが比較的局所的な形質導入をもたらすことが知られている。そのような局所投与法は、パーキンソン病のような特定の解剖学的領域または解剖学的回路に局在する神経病理に起因する神経学的障害の遺伝子治療を試みる場合に有利である。しかしながら、より広範囲のCNS形質導入を必要とする治療では、実質内注射は実用的ではない。先天性代謝異常および/または単一遺伝子欠損に起因する神経障害、または脊髄の運動ニューロンに影響を及ぼす神経障害の治療には、大部分の脳または脊髄の形質導入がそれぞれ必要となることがある。ベクターに対する低侵襲性トランス−BBB投与法の開発は、極めて重要な試みである。様々な能動輸送機構(恐らくは受容体媒介)と相互作用して、BBBを横切ってタンパク質を運ぶことが知られている分子を使用しようとする数多くの試みが行なわれているが、その結果報告は多様である。多数のAAV血清型が利用可能であると仮定すると、1つ以上の血清型は、AAVキャプシドをBBBを横切って輸送することができる細胞進入受容体に結合し得る(Manfredsson, et al., 2009, “AAV9: a potential blood-brain barrier buster.” Molecular Therapy 17(3):403−405)。
ベクトルおよび定位注入
AADCポリヌクレオチドを外科的に投与するために定位的手法を使用することができる。AADC欠乏症の個体はエピネフリンとノルエピネフリンを欠くが、これらの患者については手術中に安定した血圧と心拍数を維持すべきである。術後のコンピュータ断層撮影(CT)またはMRIスキャンには顕著な脳内出血はないはずである。MRIスキャン像で、針管は、黒質緻密部(SNpc)および腹側被蓋領域(VTA)へ正確に配置されていなければならない。患者は手術後約1週間で病院から退院する(Hwu, W.L., et al., 2012. Gene therapy for aromatic L−amino acid decarboxylase deficiency.
Sci. Transl. Med. Vol. 4, 134ra61)。
治療を受ける対象には、AAVベクター組成物ベクターが、バイラテラル注入を介して黒質緻密部(SNpc)および腹側被蓋領域(VTA)に、あるいは腔内(尾状核および被殻に)、または視床下部核(STN)に、安全に投与される。この投与には、例えば、臨床適用のために特別に設計されたFDA認可のSMARTFLOW(登録商標)神経心室カニューレ(SurgiVision, Inc.製)をオプションとして使用することができ、さらにCLEARPOINT(登録商標)システムを利用して(またはこれを利用せずに)、脳神経外科医が脳における治療薬の投与を、標的設定し観察するのを補助することもできる(例えば、以下を参照せよ:San Sebastian, et al., 2014, Mol. Methods Clin. Dev. 3: 14049;例えば、以下を参照せよ:Feng and Maguire−Zeiss, 2010, CNS Drugs 24(3):177−192)。
例えば、手術中に、2つの標的点が、黒質緻密部(SNpc)および腹側被蓋領域(VTA)において決定される。これらの標的点は、背側方向に互いに十分に離れており、磁気共鳴画像上で同定される。1つの穿頭孔を、頭蓋骨の各側にトレパニングし、この穿頭孔を通して、ベクターを2軌道の挿入経路を介して、2つの標的点に注入する。AAVベクター含有溶液は、1.5×1012ベクターゲノム/mlの濃度に調製され、1標的点あたり50μlの溶液が1μl/分の速度で注入される。各患者は、AAVベクター構築物の3×1011ベク−ターゲノムを受け取る。
AAV2に対する中和抗体力価は、種々の血清希釈物中のβ−ガラクトシダーゼを発現するAAV2ベクターの5×10ベクターゲノム/細胞で形質導入されたHEK293細胞におけるβ−ガラクトシダーゼ活性を測定することによって決定される。
PET
黒質におけるAADC発現レベルは、外科手術の6日前および遺伝子導入の1ヶ月から6ヶ月後に、FMTを用いたPETイメージングで評価される。全ての患者は、PETの18時間前にドーパミン作動薬の服用を中止し、FMT注射の1時間前にカルビドパ2.5mg/kgを経口服用する。続いて、生理食塩水中に溶解した0.12mCi/kgの濃度のFMTを前胸静脈に注入し、90分の動的獲得配列を得る。PETおよび磁気共鳴イメージングデータを、フュージョン処理プログラム(オランダ国アムステルダムのPhilips 社製のSyntegra)に共記載し、融合画像を生成する。黒質線条体経路に描きだされた、関心の持たれている体積内の放射能は、トレーサー注射の80〜90分後に計算される。基準値から24週までの黒質線条体路FMT取り込みの変化を、黒質と線条体の放射能比を用いて評価する。
統計分析
基準値および遺伝子導入後6ヶ月後の値を、スチューデントのt検定(ペア分析)を用いて比較する。両側p値<0.05を使って、有意差を示す。Bonferroni補正によりP値を補正した2方向分散分析を、レボドパに対する短期間の応答に用いる(例えば、以下を参照せよ:Muramatsu, et al., 2010, “A phase I study of aromatic L−amino acid decarboxylase gene therapy for Parkinson’s disease.” 18:1731−1735)。
パーキンソン病患者の脳に、リアルタイム画像誘導注入を用いて、AAVベクター組成物をバイラテラル投与した場合の安全性および忍容性は、手術後9か月までモニターすることができる。標的領域(黒質緻密部(SNpc)および腹側被蓋領域(VTA))および線条体内の広範なAADCタンパク質分布の広範な網羅範囲を、なんら副作用を誘発することなく達成しなければならない。
成長と運動能力における変化:遺伝子移入治療後1年以内に、患者は体重が増え、運動スコアの改善を示すはずである。体重を、遺伝子導入後3〜6ヶ月で測定する。全ての患者は、最初は、アルバータ乳幼児運動発達検査法(Alberta Infant Motor Scale、略してAIMS)の素点がゼロで、ピーボディ運動発達検査法、第2版(Peabody Developmental Motor Scale, Second Edition、略してPDMS−II)の素点が非常に低いはずである。遺伝子導入後、全ての患者は、これらの2つの尺度における素点が連続的な増加を示す。これはそれらの運動機能が改善したことを示す。乳幼児の包括的発達目録(The Comprehensive Developmental Inventory for Infants and Toddlers、略してCDIIT) は、認知と運動発達の双方を網羅している。全ての患者は、遺伝子移入前のCDIIT素点が低く、その後の素点が上昇するが、これは運動機能および認知機能の改善を示す。
遺伝子導入後の主観的改善
定量化が困難な症状を文書化するために、患者の配偶者、保護者または介護者に対し、研究の最後にアンケートに記入するように求める。眼球上転発作の症状は緩和すべきであり、眼球偏位や睡眠障害は、例えば、遺伝子治療後に残る可能性がある眼球上転発作の軽度の症状である。対象は、感情的安定性の増加、および/または発汗および温熱(外気温が高い時の一般的な症状である体温不安定性)の改善が見られることがある。遺伝子導入の前または後の24時間ホルターモニタリングによって評価される心拍変動の検出可能な異常はないはずである。遺伝子治療の前に、寝たきりで自発的な動きがほとんど見られない患者は、遺伝子導入の1〜2週間後に重度の眼瞼下垂(上まぶたの垂れ下がり)の改善を示す。以前の研究によれば、ジスキネジーが遺伝子導入の1ヶ月後に起こることがあるが、ジスキネジーの軽減が観察された後すぐに運動発達が始まるはずである(Hwu, W.L., et al., 2012. 4, 134ra61)。対象は、遺伝子移入の3ヶ月後に首のすわりが強まり、6〜9ヶ月後に支えを当てて座れるようになり、13ヶ月後に腹臥位に座れるようになり、さらに16ヶ月後におもちゃを持ったり、支えがあれば立てるようになる。抗AAV2抗体は、遺伝子治療前の患者において陰性であるが、その力価は遺伝子導入後にわずかに増加し得る。
PETスキャンおよびCSF分析
治療を受けた患者について、PETスキャンとCSF解析を完了させる。遺伝子導入から6ヵ月後、PETスキャンにより、合併(右および左)治療部位における基準値に比べて、6−[18F] フルオロドーパ(FDOPA)の摂取が増加していることが示されるはずである。CSF分析により、ホモバニリン酸(HVA、ドーパミンの代謝産物)および5−ヒドロキシインドール酢酸(HIAA、セロトニンの代謝産物)のレベルの増加が明らかにされる。しかし、L−DOPAおよび3−O−メチルドーパのレベルは上昇したままである(Hwu, W.L., et al., 2012)。
実施例6:AADCポリヌクレオチドの投与
AADCポリヌクレオチド含有組換えAAVベクター組成物を、実施例5に記載の投与方法を用いて、パーキンソン病を有する患者の被殻に注入する。用量、患者数、および容積を表8に概説する。

研究の過程で、パーキンソン病と診断されたヒト患者におけるAADCポリヌクレオチド含有組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター組成物の注入の安全性および忍容性が評価される。患者は、術前に、また術後は月1回6ヶ月間にわたって、複数の尺度を用いて評価される。評価尺度には、グローバルジストニア尺度(Global Dystonia Scale [sic]、略してGDS)(以下を参照せよ:Comella,
et al., 2003, Movement Disorders, 18(3):303−312)、L−DOPAチャレンジテスト、UPDRSスコア、運動状態日記、ラボテストなどがある。患者の介護者は、1日を30分単位で分けた日記を使用して、入院前の4日間および入院後6ヶ月間の移動能力 を記録する。患者の介護者は、被験者の状態を、睡眠、不動、煩わしいジスキネジーを伴わない移動能力、または煩わしいジスキネジーを伴った移動能力という各カテゴリーに評価するように訓練される。これらの各カテゴリーの合計時間数が計算され、基準値と6ヶ月のスコアの差が群間で比較される。レボドパに対する短期間の反応が、ベースライン時と遺伝子導入後6ヶ月後に評価される;被験者は、ドーパミン作動薬を中止してから20時間後に、経口的に100mgのレボドパを服用し、25mgのベンズラジドを併用服用した。GDSおよび血漿レボドパ濃度に基づく運動症状を、ベースライン時およびレボドパ摂取の30分後、1,2,3および4時間後に評価する(例えば、以下を参照せよ:Muramatsu, et al.,
2010, “A phase I study of aromatic L−amino acid decarboxylase gene therapy for Parkinson’s disease.”)。
実施例7:AADCポリヌクレオチドのIn Vivo投与
2つのAADCポリヌクレオチド含有組換えAAVベクター組成物(プラスミド配列番号:10および12;ITR から ITR までの配列番号:17および19)、対照、および参照を、ラットに、バイラテラル線条体内(10ul/側)経路で、2x1012vg/mlの用量レベルで投与した。ラット線条体におけるAADCの発現は、4週間および8週間後にELISAによって測定した。注入部位間の可変投与に起因とする、動物間および脳半球間に変動が見られた。双方の構築物ともAADCを発現したが、phAADC_3k構築物(プラスミド配列番号12;ITRからITRまでの配列番号19)は、参照構築物と比較して、発現が最高で200%まで増加した。
実施例8:AADCポリヌクレオチドの用量反応研究
AADCポリヌクレオチド含有組換えAAVベクター(プラスミド配列番号10;ITRからITRまでの配列番号17)の組成物(1x1011 vg/ml から 1x1013 vg/mlまでの範囲の5種の異なる用量レベルで)と、対照とを6−OHDA病変ラットに投与する。低用量レボドパ投与に対する行動的応答は、組成物の投与の前後(第3週および第4週)に定量化される。投与後5週間で、剖検を行い、AADC酵素活性をex vivo 線条体組織アッセイで測定し、脳におけるAADCの分布を免疫組織化学(IHC)染色によって判定する。
実施例9:線条体内形質導入に及ぼす空粒子の影響
成熟ラット(n = 6)に、完全ベクター粒子:空ベクター粒子の比率を変化させて投与した:完全ベクター粒子の比率がそれぞれ0%、50%、85%、または99%。AADCポリヌクレオチド含有組換えAAVベクター(プラスミド配列番号17)を一定用量および容量(5μlおよび1×10vg)で、線条体内に投与した。ラットを投与後4週間で評価した。ベクター用量が低かった場合は、AADCベクター発現は限られていた。粒子の分布容積を表9(ELISA)に示し、AADC発現の線条体内レベルを表10(組織学)に示す。

分布はすべてのグループで同等であった。ベクター用量が比較的低かった場合は、AADC発現が限られていた。空の粒子が>30%あった場合に、AADC発現レベルを低下させる傾向もあった。
本発明は、記載された幾つかの実施形態に関して、ある程度の長さで、ある程度の特殊性を以て説明されているが、本発明は、そのような特殊性、実施形態、または任意の特定の実施形態に限定されるように意図されておらず、本発明は、添付の特許請求の範囲を参照して解釈されるべきである。その理由は、先行技術を考慮してそのような請求の範囲を可能な限り広く解釈するためであり、また本発明の意図する範囲を効果的に包含するためである。
本明細書で言及された全ての刊行物、特許出願、特許およびその他の参考文献は、その全体が参照により組み込まれる。矛盾する場合、定義を含む本明細書が支配する。さらに、セクション見出し、材料、方法、および実施例は、例示的なものに過ぎず、限定することを意図するものではない。

Claims (57)

  1. AAVベクターゲノムであって、
    a)130ヌクレオチド長の5’逆方向末端反復(ITR)、
    b)配列番号1の配列をコードするヌクレオチド配列を含む、AADC配列領域、および、
    c)119ヌクレオチド長の3’逆方向末端反復(ITR)を、
    上記の順に含む、AAVベクターゲノム。
  2. 前記5’ITRおよび前記3’ITRがAAV2に由来する、請求項1に記載のAAVベクターゲノム。
  3. 前記5’ITRが、配列番号6のヌクレオチド1〜130からなるヌクレオチド配列からなる、請求項1または2に記載のAAVベクターゲノム。
  4. 前記5’ITRが、配列番号6のヌクレオチド1〜130に少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列からなる、請求項1または2に記載のAAVベクターゲノム。
  5. 前記3’ITRが、配列番号6のヌクレオチド3417〜3535からなるヌクレオチド配列からなる、請求項1〜4のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  6. 前記3’ITRが、配列番号6のヌクレオチド3417〜3535に少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列からなる、請求項1〜4のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  7. 前記AAVベクターゲノムが、サイトメガロウイルス(CMV)遺伝子由来のCMV配列領域を含み、前記CMV配列領域が、エンハンサー領域とプロモーター領域とを含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  8. 前記CMV配列領域が、配列番号6のヌクレオチド263〜769からなるヌクレオチド配列を含む、請求項7に記載のAAVベクターゲノム。
  9. 前記CMV配列領域が、配列番号6のヌクレオチド263〜769からなるヌクレオチド配列からなる、請求項7に記載のAAVベクターゲノム。
  10. 前記CMV配列領域が、配列番号6のヌクレオチド263〜769に少なくとも98%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、請求項7に記載のAAVベクターゲノム。
  11. 前記CMV配列領域が、配列番号6のヌクレオチド263〜769に少なくとも98%の配列同一性を有するヌクレオチド配列からなる、請求項7に記載のAAVベクターゲノム。
  12. 前記CMVエンハンサー領域が、配列番号6のヌクレオチド263〜566からなるヌクレオチド配列を含む、請求項7〜11のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  13. 前記CMVエンハンサー領域が、配列番号6のヌクレオチド263〜566からなるヌクレオチド配列からなる、請求項7〜11のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  14. 前記CMVエンハンサー領域が、配列番号6のヌクレオチド263〜566に少なくとも98%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、請求項7〜11のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  15. 前記CMVエンハンサー領域が、配列番号6のヌクレオチド263〜566に少なくとも98%の配列同一性を有するヌクレオチド配列からなる、請求項7〜11のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  16. 前記CMVプロモーター領域が、配列番号6のヌクレオチド567〜769からなるヌクレオチド配列を含む、請求項7〜15のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  17. 前記CMVプロモーター領域が、配列番号6のヌクレオチド567〜769からなるヌクレオチド配列からなる、請求項7〜15のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  18. 前記CMVプロモーター領域が、配列番号6のヌクレオチド567〜769に少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、請求項7〜15のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  19. 前記CMVプロモーター領域が、配列番号6のヌクレオチド567〜769に少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列からなる、請求項7〜15のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  20. 前記CMV配列領域が、507ヌクレオチド長である、請求項7〜19のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  21. 前記AAVベクターゲノムが、即時型初期1(IE1)遺伝子由来のIE1配列領域を含む、請求項1〜20のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  22. 前記IE1配列領域が、IE1エキソン1由来のヌクレオチド配列を含む、請求項21に記載のAAVベクターゲノム。
  23. 前記IE1配列領域が、IE1イントロン1またはその断片由来のヌクレオチド配列を含む、請求項22に記載のAAVベクターゲノム。
  24. 前記IE1配列領域が、配列番号6のヌクレオチド784〜949からなるヌクレオチド配列を含む、請求項21〜23のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  25. 前記IE1配列領域が、配列番号6のヌクレオチド784〜949からなるヌクレオチド配列からなる、請求項21〜23のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  26. 前記IE1配列領域が、配列番号6のヌクレオチド784〜949に少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、請求項21〜23のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  27. 前記IE1配列領域が、配列番号6のヌクレオチド784〜949に少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列からなる、請求項21〜23のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  28. 前記IE1配列領域が、166ヌクレオチド長である、請求項21〜27のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  29. 前記AAVベクターゲノムが、ヒトβグロビン(HB)遺伝子由来のHB配列領域を含む、請求項1〜28のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  30. 前記HB配列領域が、HBイントロン2由来のヌクレオチド配列を含む、請求項29に記載のAAVベクターゲノム。
  31. 前記HB配列領域が、HBエキソン3由来のヌクレオチド配列を含む、請求項30に記載のAAVベクターゲノム。
  32. 前記HB配列領域が、配列番号6のヌクレオチド950〜1349からなるヌクレオチド配列を含む、請求項29〜31のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  33. 前記HB配列領域が、配列番号6のヌクレオチド950〜1349からなるヌクレオチド配列からなる、請求項29〜31のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  34. 前記HB配列領域が、配列番号6のヌクレオチド950〜1349に少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、請求項29〜31のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  35. 前記HB配列領域が、配列番号6のヌクレオチド950〜1349に少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列からなる、請求項29〜31のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  36. 前記HB配列領域が、400ヌクレオチド長である、請求項29〜35のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  37. 前記AAVベクターゲノムが、ヒト成長ホルモン(hGH)遺伝子由来のポリ(A)シグナル配列領域を含む、請求項1〜36のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  38. 前記ポリ(A)シグナル配列領域が、配列番号6のヌクレオチド2841〜3317からなるヌクレオチド配列を含む、請求項37に記載のAAVベクターゲノム。
  39. 前記ポリ(A)シグナル配列領域が、配列番号6のヌクレオチド2841〜3317からなるヌクレオチド配列からなる、請求項37に記載のAAVベクターゲノム。
  40. 前記ポリ(A)シグナル配列領域が、配列番号6のヌクレオチド2841〜3317に少なくとも98%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、請求項37に記載のAAVベクターゲノム。
  41. 前記ポリ(A)シグナル配列領域が、配列番号6のヌクレオチド2841〜3317に少なくとも98%の配列同一性を有するヌクレオチド配列からなる、請求項37に記載のAAVベクターゲノム。
  42. 前記ポリ(A)シグナル配列領域が477ヌクレオチド長である、請求項37〜41のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノム。
  43. 前記AAVベクターゲノムは、配列番号6の配列、またはこの配列に少なくとも98%の配列同一性を有するバリアントを含む、請求項1に記載のAAVベクターゲノム。
  44. 請求項1〜43のいずれか一項に記載のAAVベクターゲノムを含む、組換えAAVウイルス。
  45. AAV2、AAV1、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAV−DJ、およびAAV−DJ8からなる群より選択されたキャプシド血清型を含む、請求項44に記載の組換えAAVウイルス。
  46. 前記キャプシド血清型がAAV2である、請求項45に記載の組換えAAVウイルス。
  47. 請求項44〜46のいずれか一項に記載の組換えAAVウイルスを含む医薬組成物。
  48. 組換えAAVベクターの少なくとも70%が前記AAVベクターゲノムを含む、請求項47に記載の医薬組成物。
  49. それを必要とする対象におけるジスキネジーの期間を短縮する方法に使用するための、請求項47または48に記載の医薬組成物。
  50. 対象がパーキンソン病を有する、請求項49に記載の医薬組成物。
  51. それを必要とする対象の睡眠覚醒サイクルを改善する方法に使用するための、請求項47または48に記載の医薬組成物。
  52. 対象がパーキンソン病を有する、請求項51に記載の医薬組成物。
  53. それを必要とする対象の睡眠障害の治療に使用するための、請求項47または48に記載の医薬組成物。
  54. 前記睡眠障害が不眠症である、請求項53に記載の医薬組成物。
  55. 対象がパーキンソン病を有する、請求項53または54に記載の医薬組成物。
  56. それを必要とする対象におけるAADCタンパク質のレベルを増加させる方法に使用するための、請求項47または48に記載の医薬組成物。
  57. 対象がパーキンソン病を有する、請求項56に記載の医薬組成物。
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