JP2018525357A5

JP2018525357A5 -

Info

Publication number: JP2018525357A5
Application number: JP2018502647A
Authority: JP
Filing date: 2016-07-22
Publication date: 2019-09-05

Claims

１）共通塩基配列および長さ；
２）骨格結合の共通パターン；および
３）骨格キラル中心の共通パターン；
によって特徴づけられる特定のオリゴヌクレオチドタイプのオリゴヌクレオチドを含む、キラル制御されたオリゴヌクレオチド組成物であって、
前記組成物は、同じ塩基配列および長さを有するオリゴヌクレオチドの実質的にラセミの調製物に比べて、前記特定のオリゴヌクレオチドタイプのオリゴヌクレオチドに関して濃縮されるという点でキラル制御された
組成物。
請求項１に記載の組成物であって，
１）共通塩基配列および長さ；
２）骨格結合の共通パターン；および
３）骨格キラル中心の共通パターン
によって特徴づけられる特定のオリゴヌクレオチドタイプのオリゴヌクレオチドを含む、キラル制御されたオリゴヌクレオチド組成物であって、
前記組成物は、同じ塩基配列および長さを有するオリゴヌクレオチドの実質的にラセミの調製物に比べて、前記特定のオリゴヌクレオチドタイプのオリゴヌクレオチドに関して濃縮されるという点でキラル制御され，
前記オリゴヌクレオチドは変異ハンチンチン遺伝子を標的にし、かつ前記長さは約１０〜約５０個のヌクレオチドであり、前記骨格結合は、少なくとも１つのホスホロチオエートを含み、かつ骨格キラル中心の前記パターンは、少なくとも１つのＲｐキラル中心および少なくとも１つのＳｐキラル中心を含む
組成物。
請求項１又は２に記載の組成物であって、
前記オリゴヌクレオチドが、１つまたは複数の翼領域および共通コア領域を含み：
各翼領域が独立して、２塩基以上の長さを有し、かつ独立して任意選択で、１個または複数のキラルなインターヌクレオチド結合を含み；かつ
前記コア領域が独立して、２塩基以上の長さを有し、かつ独立して、１個または複数のキラルなインターヌクレオチド結合を含む、
組成物。
請求項１〜３のいずれか1項に記載の組成物であって、
前記オリゴヌクレオチドタイプのオリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの翼領域およびコア領域を含み：
各翼領域が独立して、２塩基以上の長さを有し、かつ独立して任意選択で、１個または複数のキラルなインターヌクレオチド結合を含み；
前記コア領域が独立して、２塩基以上の長さを有し、かつ独立して、１個または複数のキラルなインターヌクレオチド結合を含み；かつ
翼領域内の少なくとも１つのヌクレオチドが、前記コア領域の少なくとも１つのヌクレオチドとは異なり、前記差異が：
１）骨格結合；
２）骨格キラル中心のパターン；
３）糖修飾
のうちの１つまたは複数である、
組成物。
請求項１〜４のいずれか1項に記載の組成物であって、
同じオリゴヌクレオチドタイプのオリゴヌクレオチドが、同一の構造を有する、
組成物。
請求項１〜５のいずれか1項に記載の組成物であって、前記オリゴヌクレオチドが、１個または複数の天然のホスフェート結合（

）および１個または複数のホスホロチオエート結合を含む、
組成物。
請求項１〜６のいずれか1項に記載の組成物であって、
前記オリゴヌクレオチドが、翼−コア−翼の構造を含む、
組成物。
請求項１〜７のいずれか1項に記載の組成物であって、
翼が、キラルなインターヌクレオチド結合および天然のホスフェート結合（

）を含む、
組成物。
請求項１〜８のいずれか1項に記載の組成物であって、
前記コアが、１個または複数のホスホロチオエート結合を含む、
組成物。
請求項１〜９のいずれか1項に記載の組成物であって、それぞれの翼が独立に修飾糖部分を含む、
組成物。
請求項１０に記載の組成物であって、
前記修飾糖部分が２’−修飾を有する、
組成物。
請求項１０に記載の組成物であって、前記修飾糖部分が二環式糖修飾を含む、
組成物。
請求項１０に記載の組成物であって、
前記修飾糖部分が、２’−ＯＲ^１（式中、Ｒ^１は、任意選択で置換されたＣ_１−６アルキルである。）である２’−修飾を含む、
組成物。
請求項１０に記載の組成物であって、前記修飾糖部分が、２’−ＭＯＥである２’−修飾を含む、
組成物。
請求項１０に記載の組成物であって、
前記修飾糖部分が、２’−ＯＭｅである２’−修飾を含む、
組成物。
請求項１〜１５のいずれか1項に記載の組成物であって、
前記コア領域は（Ｓｐ）_ｔ（Ｒｐ）_ｎ（Ｓｐ）_ｍ（式中、ｔは１〜１０であり、ｎは１であり、ｍは２〜５０である）を含む骨格キラル中心のパターンを有する、
組成物。
請求項６に記載の組成物であって，
前記オリゴヌクレオチドが、ＳＳＲ、ＲＳＳ、ＳＳＲＳＳ、ＳＳＲＳＳＲ、ＲＳＳＳＲＳＲＲＲＳ、ＲＳＳＳＳＳＳＳＳＳ、ＳＲＲＳＲＳＳＳＳＲ、ＳＲＳＲＳＳＲＳＳＲ、ＲＲＲＳＳＳＲＳＳＳ、ＲＲＲＳＲＳＳＲＳＲ、ＲＲＳＳＳＲＳＲＳＲ、ＳＲＳＳＳＲＳＳＳＳ、ＳＳＲＲＳＳＲＳＲＳ、ＳＳＳＳＳＳＲＲＳＳ、ＲＲＲＳＳＲＲＲＳＲ、ＲＲＲＲＳＳＳＳＲＳ、ＳＲＲＳＲＲＲＲＲＲ、ＲＳＳＲＳＳＲＲＲＲ、ＲＳＲＲＳＲＲＳＲＲ、ＲＲＳＲＳＳＲＳＲＳ、ＳＳＲＲＲＲＲＳＲＲ、ＲＳＲＲＳＲＳＳＳＲ、ＲＲＳＳＲＳＲＲＲＲ、ＲＲＳＲＳＲＲＳＳＳ、ＲＲＳＲＳＳＳＲＲＲ、ＲＳＲＲＲＲＳＲＳＲ、ＳＳＲＳＳＳＲＲＲＳ、ＲＳＳＲＳＲＳＲＳＲ、ＲＳＲＳＲＳＳＲＳＳ、ＲＲＲＳＳＲＲＳＲＳ、ＳＲＲＳＳＲＲＳＲＳ、ＲＲＲＲＳＲＳＲＲＲまたはＳＳＳＳＲＲＲＲＳＲを含む骨格キラル中心のパターンを含む、
組成物。
請求項１〜１７のいずれか1項に記載の組成物であって、
前記共通塩基配列が、ハンチンチン病と関連する一塩基多型（ＳＮＰ）と相補的である配列を含む、
組成物。
請求項１〜１８のいずれか1項に記載の組成物であって、前記一塩基多型が、ｒｓ３６２３０７、ｒｓ７６８５６８６、ｒｓ３６２２６８、ｒｓ２５３０５９５、ｒｓ３６２３３１およびｒｓ３６２３０６から選択される、
組成物。
請求項１〜１９のいずれか1項に記載の組成物であって、
前記オリゴヌクレオチドが、変異ハンチンチン遺伝子ｍＲＮＡのＲＮａｓｅＨ媒介切断に関与できる、組成物。
請求項１に記載の組成物であって、
前記オリゴヌクレオチドが、表Ｎ１Ａ、表Ｎ２Ａ、表Ｎ３Ａ、表Ｎ４Ａおよび表８から選択される構造を有する、
組成物。
請求項１に記載の組成物であって、
前記オリゴヌクレオチドが、ｍＧ^＊ＳｍＧｍＣｍＡｍＣ^＊ＳＡ^＊ＳＡ^＊ＳＧ^＊ＳＧ^＊ＳＧ^＊ＳＣ^＊ＳＡ^＊ＳＣ^＊ＲＡ^＊ＳＧ^＊ＳｍＡｍＣｍＵｍＵ^＊ＳｍＣ、又はその薬学的に許容される塩を含み、
ここで、^＊ＳはＳｐホスホロチオエート結合を表し、
^＊ＲはＲｐホスホロチオエート結合を表し、
ｍは、塩基を含むヌクレオシドへの２’−ＯＭｅ修飾を表す組成物。
請求項１に記載の組成物であって、前記塩基配列、骨格結合のパターン、および／又は骨格キラル中心のパターンは、請求項２２に記載の塩基配列、骨格結合のパターン、および／又は骨格キラル中心のパターンを含むか、のみからなる、組成物。
オリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドは、請求項１〜２３のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドである、オリゴヌクレオチド。
請求項２４に記載のオリゴヌクレオチドであって、
前記オリゴヌクレオチドが、ｍＧ^＊ＳｍＧｍＣｍＡｍＣ^＊ＳＡ^＊ＳＡ^＊ＳＧ^＊ＳＧ^＊ＳＧ^＊ＳＣ^＊ＳＡ^＊ＳＣ^＊ＲＡ^＊ＳＧ^＊ＳｍＡｍＣｍＵｍＵ^＊ＳｍＣ、又はその薬学的に許容される塩を含み、
ここで、^＊ＳはＳｐホスホロチオエート結合を表し、
^＊ＲはＲｐホスホロチオエート結合を表し、
ｍは、塩基を含むヌクレオシドへの２’−ＯＭｅ修飾を表す、オリゴヌクレオチド。
請求項２５に記載のオリゴヌクレオチドであって、
前記オリゴヌクレオチドはナトリウム塩である、オリゴヌクレオチド。
医薬組成物であって、
有効量の請求項２４〜２６のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチドと、
薬学的に許容される希釈剤、薬学的に許容される賦形剤、及び薬学的に許容される担体から選ばれる少なくとも一つの薬学的に許容される不活性原料を含む、医薬組成物。
請求項１〜２７のいずれか１項に記載の組成物であって、人工脳脊髄液をさらに含む組成物。
請求項１〜２８のいずれか1項に記載の組成物であって、
前記組成物中の前記オリゴヌクレオチドの少なくとも約５０％が、前記共通塩基配列および長さ、骨格結合の前記共通パターンおよび骨格キラル中心の前記共通パターンを有する、組成物。
核酸高分子の制御された切断のための方法であって：
ヌクレオチド配列が標的配列を含む核酸高分子と、請求項１〜２９のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド組成物とを接触させるステップを含む
方法。
標的配列を含む塩基配列を有する核酸の切断のための方法であって：
標的配列を含む塩基配列を有する核酸と、請求項２〜２３のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド組成物とを接触させるステップを含み、
前記共通塩基配列は、前記核酸内の前記標的配列に対して相補的である配列であるか、前記核酸内の前記標的配列に対して相補的である配列を含む、方法。
対象のハンチントン病を予防かつ／または治療するための方法であって、
有効量の請求項１から３１のいずれかに記載の組成物又はオリゴヌクレオチドを前記対象に投与する工程を含む方法。
請求項１〜３２のいずれか1項に記載の方法であって、疾患を惹き起こすアレルからの発現が選択的に抑圧される、方法。
実施形態１〜６０６から選択される、
オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオチド組成物または方法。