JP7160807B2 - 筋ジストロフィーに対するエクソンスキッピングオリゴマーコンジュゲート - Google Patents

筋ジストロフィーに対するエクソンスキッピングオリゴマーコンジュゲート Download PDF

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Description

(関連情報)
本特許出願は、2016年12月19日に出願された米国仮特許出願第62/436,223号、2017年1月6日に出願された米国仮特許出願第62/443,484号、2017年3月30日に出願された米国仮特許出願第62/479,178号および2017年9月22日に出願された米国仮特許出願第62/562,146号の利益を主張するものである。上記参照仮特許出願の内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。
(本開示の分野)
本開示は、ヒトジストロフィン遺伝子のエクソン53スキッピングに適した新規なアンチセンスオリゴマーコンジュゲートおよびその医薬組成物に関する。本開示は、新規なアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを用いてエクソン53スキッピングを誘導する方法、エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象にジストロフィンを産生させる方法およびエクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象を治療する方法も提供する。
様々な異なるレベル(転写、スプライシング、安定性、翻訳)で遺伝子発現に影響を及ぼす一連の化学的性質を用いてアンチセンス技術が開発されている。その研究の多くが、多岐にわたる適応症の異常遺伝子または疾患関連遺伝子を修正または代償するアンチセンス化合物の使用に焦点を当てたものである。アンチセンス分子は遺伝子発現を特異的に阻害することが可能であり、このため、遺伝子発現のモジュレーターとしてのオリゴマーに関する研究努力の多くが標的遺伝子の発現またはシス作用エレメントの機能を阻害することに焦点を当てたものである。アンチセンスオリゴマーは通常、センス鎖(例えば、mRNA)または一部のウイルスRNA標的の場合はマイナス鎖のRNAに対するものである。特定の遺伝子をダウンレギュレートする所望の効果を得るには一般に、オリゴマーにより標的mRNAの崩壊、mRNAの翻訳阻止またはシス作用RNAエレメントの機能阻止を促進し、それにより標的タンパク質のde novo合成またはウイルスRNAの複製を効率的に妨害する。
しかし、目的が天然タンパク質の産生をアップレギュレートすることまたは翻訳の中途終止を誘導するナンセンス変異もしくはフレームシフト変異などの変異を代償することである場合、このような技術は有効ではない。このような場合、欠陥遺伝子の転写物が標的化分解も立体阻害も受けてはならず、このため、アンチセンスオリゴマーの化学的性質が標的mRNAの崩壊を促進することも、翻訳阻止を促進することもあってはならない。
様々な遺伝性疾患では、スプライシング過程で標的エクソンスキッピングの過程を介して最終的な遺伝子発現に対する変異の作用を調節することができる。スプライシング過程は複数の構成要素からなる複雑な機序により方向付けられ、この機序により、プレmRNAの隣接したエクソン・イントロン接合部が接近してイントロン末端でホスホジエステル結合が切断されたのち、一緒にスプライスされるエクソン同士の間で再編成が起こる。この複雑で精度の高い過程は、プレmRNA内にあり、のちにスプライシング反応に関与する様々な核内スプライシング因子が結合する準保存的RNAセグメントである、比較的短い配列モチーフにより媒介される。スプライシング機序がプレmRNAのプロセシングに関与するモチーフを読み取る、または認識する仕組みを変化させることにより、異なる形でスプライスされたmRNA分子を作製することが可能である。これまでに、ヒト遺伝子の大部分は正常な遺伝子発現の過程で選択的にスプライスされることが認められているが、それに関与する機序は明らかにされていない。Bennett et al.(米国特許第6,210,892号)は、標的RNAのRNAseH媒介性切断を誘導しないアンチセンスオリゴマー類似体を用いる野生型細胞内mRNAプロセシングのアンチセンス調節について記載している。これは、選択的スプライシングを受け特定のエクソンを欠くmRNAを作製することが可能であるという点で有用である(例えば、膜貫通ドメインをコードするエクソンを欠く可溶性TNFスーパーファミリー受容体の作製についてSazani,Kole et al.,2007により記載されているのを参照されたい)。
通常に機能するタンパク質がその変異により中途終止する場合、アンチセンス技術により一部の機能性タンパク質の産生を回復させる手段がスプライシング過程への介入により可能であり、また、一部の遺伝子から病原変異のあるエクソンを特異的に削除することができれば、天然タンパク質と同じ生物学的特性を有するか、エクソンにある変異によって引き起こされる疾患を改善できる程度の生物活性を有する短いタンパク質の産生が可能であることが示されている(例えば、Sierakowska,Sambade et al.,1996;Wilton,Lloyd et al.,1999;van Deutekom,Bremmer-Bout et al.,2001;Lu,Mann et al.,2003;Aartsma-Rus,Janson et al.,2004を参照されたい)。Kole et al.(米国特許第5,627,274号;同第5,916,808号;同第5,976,879号;および同第5,665,593号)には、標的プレmRNAの崩壊を促進しない修飾アンチセンスオリゴマー類似体を用いて異常なスプライシングを食い止める方法が開示されている。Bennett et al.(米国特許第6,210,892号)は、同じく標的RNAのRNAseH媒介性切断を誘導しないアンチセンスオリゴマー類似体を用いる野生型細胞内mRNAプロセシングのアンチセンス調節について記載している。
標的化エクソンスキッピングの過程は、エクソンおよびイントロンが多数存在する、エクソンの遺伝子構成に冗長性がある、または1つもしくは複数の特定のエクソンがなくてもタンパク質が機能することができる長い遺伝子に特に有用であると思われる。様々な遺伝子の変異を原因とする短縮に関連する遺伝性疾患の治療のために遺伝子プロセシングを再指令するこれまでの努力は、(1)スプライシング過程に関与するエレメントと全部もしくは一部が重複している;または(2)エレメントと十分に近い位置でプレmRNAに結合して、通常そのエレメントで起こる特定のスプライシング反応を媒介するスプライシング因子の結合および機能を阻害するアンチセンスオリゴマーの使用に焦点を当てたものである。
デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)は、タンパク質ジストロフィンの発現の欠陥を原因とするものである。このタンパク質をコードする遺伝子の中には、DNAの200万個を超えるヌクレオチドにわたって79のエクソンが散在している。エクソンのリーディングフレームが変化する、停止コドンが導入される、あるいはアウトオブフレームエクソン(複数可)の完全な除去または1つもしくは複数のエクソンの重複を特徴とするエクソン変異があれば、機能的ジストロフィンの産生が阻害されてDMDが起こる可能性がある。
比較的重症度の低い筋ジストロフィーであるベッカー型筋ジストロフィー(BMD)は、変異、通常1つまたは複数のエクソンの欠失によりジストロフィン転写物全体にわたって正しいリーディングフレームが生じるため、mRNAのタンパク質への翻訳が中途終止しない場合に起こることがわかっている。変異したジストロフィンプレmRNAのプロセシングで上流と下流のエクソンが連結されることにより正しい遺伝子のリーディングフレームが維持されれば、その結果として短い内部欠失があり一部の活性を保持するタンパク質をコードするmRNAが生じ、ベッカー型表現型となる。
長年、ジストロフィンタンパク質のリーディングフレームが変化しない1つまたは複数のエクソンの欠失があればBMD型表現型が生じるのに対し、フレームシフトを引き起こすエクソン欠失ではDMDが生じることが知られている(Monaco,Bertelson et al.,1988)。一般に、リーディングフレームが変化し、ひいては適切なタンパク質翻訳を妨げる点変異およびエクソン欠失を含めたジストロフィン変異があるとDMDが生じる。また、BMD患者およびDMD患者の一部には複数のエクソンにわたるエクソン欠失がみられることにも注目するべきである。
アンチセンスオリゴリボヌクレオチドによる変異ジストロフィンプレmRNAのスプライシングの調節がin vitroおよびin vivoの両方で報告されている(例えば、Matsuo,Masumura et al.,1991;Takeshima,Nishio et al.,1995;Pramono,Takeshima et al.,1996;Dunckley,Eperon et al.,1997;Dunckley,Manoharan et al.,1998;Wilton,Lloyd et al.,1999;Mann,Honeyman et al.,2002;Errington,Mann et al.,2003を参照されたい)。
プレmRNAの特定の領域、通常はエクソンを標的としてDMD遺伝子の変異のスキッピングを誘導し、それによりこれらのアウトオブフレーム変異をインフレームに戻して内部が短縮しているが機能的なジストロフィンタンパク質の産生を可能にするアンチセンスオリゴマーが特異的に設計されている。このようなアンチセンスオリゴマーは、完全にエクソンの内部(いわゆるエクソン内部配列)またはエクソンからイントロンの一部分にわたるスプライスドナーもしくはスプライスアクセプター接合部を標的とすることが知られている。
このようなDMDに対するアンチセンスオリゴマーの発見および開発がこれまでの研究の分野である。このような開発としては:(1)西オーストラリア大学およびSarepta Therapeutics社(本願の譲受人):国際公開第2006/000057号;国際公開第2010/048586号;国際公開第2011/057350号;国際公開第2014/100714号;国際公開第2014/153240号;国際公開第2014/153220号;(2)Academisch Ziekenhuis Leiden/Prosensa Technologies社(現BioMarin Pharmaceutical社):国際公開第02/24906号;国際公開第2004/083432号;国際公開第2004/083446号;国際公開第2006/112705号;国際公開第2007/133105号;国際公開第2009/139630号;国際公開第2009/054725号;国際公開第2010/050801号;国際公開第2010/050802号;国際公開第2010/123369号;国際公開第2013/112053号;国際公開第2014/007620号;(3)Carolinas Medical Center:国際公開第2012/109296号;(4)ロイヤルホロウェイ:特許ならびにその利益を主張する米国特許出願第61/096,073号および同第61/164,978号を含めた出願;例えば米国特許第8,084,601号および米国特許出願公開第2017-0204413号など(4)JCR Pharmaceuticals社およびMatsuo:米国特許第6,653,466号;特許ならびにその利益を主張する特開2000-125448号を含めた出願、例えば米国特許第6,653,467号など;特許ならびにその利益を主張する特開2000-256547号を含めた出願、例えば米国特許第6,727,355号など;国際公開第2004/048570号;(5)日本新薬社:国際公開第2012/029986号;国際公開第2013/100190号;国際公開第2015/137409号;国際公開第2015/194520号;ならびに(6)Association Institut de Myologie/ピエール・マリー・キュリー大学/ベルン大学/フランス国立科学研究センター/Synthena AG:国際公開第2010/115993号;国際公開第2013/053928号のものが挙げられる。
DMDに対する細胞透過性ペプチドとコンジュゲートしたアンチセンスオリゴマーの発見および開発も一研究分野となっている(国際公開第2010/048586号;Wu,B.et al.,The American Journal of Pathology,Vol.181(2):392-400,2012;Wu,R.et al.,Nucleic Acids Research,Vol.35(15):5182-5191,2007;Mulders,S.et al.,19th International Congress of the World Muscle Society,Poster Presentation Berlin,October 2014;Bestas,B.et al.,The Journal of Clinical Investigation,doi:10.1172/JCI76175,2014;Jearawiriyapaisarn,N.et al.,Molecular Therapy,Vol.16(9):1624-1629,2008;Jearawiriyapaisarn,N.et al.,Cardiovascular Research,Vol.85:444-453,2010;Moulton,H.M.et al.,Biochemical Society Transactions,Vol.35(4):826-828,2007;Yin,H.et al.,Molecular Therapy,Vol.19(7):1295-1303,2011;Abes,R.et al.,J.Pept.Sci.,Vol.14:455-460,2008;Lebleu,B.et al.,Advanced Drug Delivery Reviews,Vol.60:517-529,2008;McClorey,G.et al.,Gene Therapy,Vol.13:1373-1381,2006;Alter,J.et al.,Nature Medicine,Vol.12(2):175-177,2006;およびYoungblood,D.et al.,American Chemical Society,Bioconjugate Chem.,2007,18(1),pp50-60を参照されたい)。
細胞透過性ペプチド(CPP)、例えばアルギニンリッチペプチド輸送部分は、例えばCPPとコンジュゲートしたアンチセンスオリゴマーの細胞内への透過を増大させるのに効果的であると思われる。
このような努力にもかかわらず、ジストロフィンを産生させDMDを治療する治療法に潜在的に有用なエクソン53を標的とする改善されたアンチセンスオリゴマーならびにそれに対応する医薬組成物が依然として必要とされている。
米国特許第6,210,892号明細書 米国特許第5,627,274号明細書 米国特許第5,916,808号明細書 米国特許第5,976,879号明細書 米国特許第5,665,593号明細書 国際公開第2006/000057号 国際公開第2010/048586号 国際公開第2011/057350号 国際公開第2014/100714号 国際公開第2014/153240号 国際公開第2014/153220号 国際公開第2002/024906号 国際公開第2004/083432号 国際公開第2004/083446号 国際公開第2006/112705号 国際公開第2007/133105号 国際公開第2009/139630号 国際公開第2009/054725号 国際公開第2010/050801号 国際公開第2010/050802号 国際公開第2010/123369号 国際公開第2013/112053号 国際公開第2014/007620号 国際公開第2012/109296号 米国特許第8,084,601号明細書 米国特許出願公開第2017/0204413号明細書 米国特許第6,653,466号明細書 特開2000-125448号 米国特許第6,653,467号明細書 特開2000-256547号 米国特許第6,727,355号明細書 国際公開第2004/048570号 国際公開第2012/029986号 国際公開第2013/100190号 国際公開第2015/137409号 国際公開第2015/194520号 国際公開第2010/115993号 国際公開第2013/053928号
Wu,B.et al.,The American Journal of Pathology,Vol.181(2):392-400,2012 Wu,R.et al.,Nucleic Acids Research,Vol.35(15):5182-5191,2007 Mulders,S.et al.,19th International Congress of the World Muscle Society,Poster Presentation Berlin,October 2014 Bestas,B.et al.,The Journal of Clinical Investigation,doi:10.1172/JCI76175,2014 Jearawiriyapaisarn,N.et al.,Molecular Therapy,Vol.16(9):1624-1629,2008 Jearawiriyapaisarn,N.et al.,Cardiovascular Research,Vol.85:444-453,2010 Moulton,H.M.et al.,Biochemical Society Transactions,Vol.35(4):826-828,2007 Yin,H.et al.,Molecular Therapy,Vol.19(7):1295-1303,2011 Abes,R.et al.,J.Pept.Sci.,Vol.14:455-460,2008 Lebleu,B.et al.,Advanced Drug Delivery Reviews,Vol.60:517-529,2008 McClorey,G.et al.,Gene Therapy,Vol.13:1373-1381,2006 Alter,J.et al.,Nature Medicine,Vol.12(2):175-177,2006 Youngblood,D.et al.,American Chemical Society,Bioconjugate Chem.,2007,18(1),pp50-60
本明細書に提供されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、CPPとコンジュゲートしたアンチセンスオリゴマー部分を含む。一態様では、本開示は、
選択した標的と結合してヒトジストロフィン遺伝子にエクソンスキッピングを誘導することが可能な長さ25サブユニットのアンチセンスオリゴマーであって、アニーリング部位と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53標的領域に相補的な塩基の配列を含むアンチセンスオリゴマー;および
アンチセンスオリゴマーとリンカー部分によりコンジュゲートした細胞透過性ペプチド(CPP)
を含む、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを提供する。
いくつかの実施形態では、アニーリング部位はH53A(+36+60)である。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーの塩基はモルホリノ環構造と結合しており、モルホリノ環構造は、1つの環構造のモルホリノ窒素と、隣接する環構造の5’環外炭素とを連結する亜リン酸含有サブユニット間結合により連結されている。ある特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは6アルギニン単位(「R」)であり、リンカー部分はグリシンである。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、配列番号1と命名される塩基の配列を含む。
様々な態様では、本開示は、式(I):
Figure 0007160807000001

によるものであり得るアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を提供し、式中:
各Nuは、一緒になって標的化配列を形成する核酸塩基であり;
Tは:
Figure 0007160807000002

から選択される部分であり;
はC~Cアルキルであり;
標的化配列は、H53A(+36+60)と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53アニーリング部位に相補的である。
また別の態様では、本開示は、式(IV):
Figure 0007160807000003

のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を提供する。
また別の態様では、本開示は、式(IVA):
Figure 0007160807000004

のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを提供する。
また別の態様では、本開示は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートと薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物を提供する。いくつかの実施形態では、薬学的に許容される担体は、リン酸緩衝剤を含む生理食塩水である。
また別の態様では、本開示は、必要とする対象のデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)を治療する方法を提供し、ここでは、対象はエクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有し、方法は、対象に本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを投与することを含む。本開示は、必要とする対象のデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)の治療のための薬物の製造への本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの使用にも関するものであり、ここでは、対象はエクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する。
また別の態様では、本開示は、エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象にmRNAリーディングフレームを回復させてジストロフィン産生を誘導する方法であって、対象に本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを投与することを含む、方法を提供する。また別の態様では、本開示は、エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象において、mRNAプロセシング時にジストロフィンプレmRNAからエクソン53を排除する方法であって、対象に本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを投与することを含む、方法を提供する。また別の態様では、本開示は、エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象のジストロフィンプレmRNAのエクソン53を結合させる方法であって、対象に本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを投与することを含む、方法を提供する。
また別の態様では、本開示は、治療に使用する本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療に使用する本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、治療に使用する薬物の製造に使用する本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療のための薬物の製造に使用する本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを提供する。
また別の態様では、本開示は、必要とする対象のデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)を治療するためのキットも提供し、ここでは、対象はエクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有し、キットは、適切な容器に包装された少なくとも1つの本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートと、その使用のための指示とを含む。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
式(I)
Figure 0007160807000005


のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートであって、
式中、各Nuが、一緒になって標的化配列を形成する核酸塩基であり;
Tが、
Figure 0007160807000006


から選択される部分であり;
がC ~C アルキルであり;
前記標的化配列が、H53A(+36+60)と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53アニーリング部位に相補的である、
アンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
(項目2)
Nuがそれぞれ独立に、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)、アデニン(A)、5メチルシトシン(5mC)、ウラシル(U)およびヒポキサンチン(I)から選択される、項目1に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
(項目3)
前記標的化配列が配列番号1(5’-GTTGCCTCCGGTTCTGAAGGTGTTC-3’)であり、式中、各チミン(T)が必要に応じてウラシル(U)である、項目1に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
(項目4)
Tが
Figure 0007160807000007



であり、前記標的化配列が配列番号1(5’-GTTGCCTCCGGTTCTGAAGGTGTTC-3’)であり、式中、各チミン(T)が必要に応じてウラシル(U)である、項目1に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
(項目5)
Tが
Figure 0007160807000008



であり、前記標的化配列が配列番号1(5’-GTTGCCTCCGGTTCTGAAGGTGTTC-3’)である、項目1に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
(項目6)
式(II)
Figure 0007160807000009



のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートであって、
式中、1~25および5’~3’の各Nuが:
Figure 0007160807000010


であり、表中、Aが
Figure 0007160807000011



であり、Cが
Figure 0007160807000012



であり、Gが
Figure 0007160807000013



であり、Xがそれぞれ独立に
Figure 0007160807000014


である、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
(項目7)
各Xが
Figure 0007160807000015



である、項目6に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
(項目8)
前記アンチセンスオリゴマーが式(IIA)
Figure 0007160807000016


のものであり、式中、1~25および5’~3’の各Nuが:
Figure 0007160807000017


であり、表中、Aが
Figure 0007160807000018



であり、Cが
Figure 0007160807000019



であり、Gが
Figure 0007160807000020



であり、Xがそれぞれ独立に
Figure 0007160807000021


である、項目6に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
(項目9)
各Xが
Figure 0007160807000022



である、項目8に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
(項目10)
式(IV)
Figure 0007160807000023


のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
(項目11)
前記アンチセンスオリゴマーが式(IVA)
Figure 0007160807000024


のものである、項目9に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
(項目12)
項目1~11のいずれか1項に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
(項目13)
必要とする対象のデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)を治療する方法であって、前記対象が、エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有し、前記方法が、前記対象に項目1~11のいずれか1項に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを投与することを含む、方法。
(項目14)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週投与する、項目13に記載の方法。
(項目15)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に投与する、項目13に記載の方法。
(項目16)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に投与する、項目13に記載の方法。
(項目17)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月投与する、項目13に記載の方法。
(項目18)
エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象のmRNAリーディングフレームを回復させてジストロフィン産生を誘導する方法であって、前記対象に項目1~11のいずれか1項に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを投与することを含む、方法。
(項目19)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週投与する、項目18に記載の方法。
(項目20)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に投与する、項目18に記載の方法。
(項目21)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に投与する、項目18に記載の方法。
(項目22)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月投与する、項目18に記載の方法。
(項目23)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを約30mg/kgの用量で投与する、項目18~22のいずれか1項に記載の方法。
(項目24)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを約40mg/kgの用量で投与する、項目18~22のいずれか1項に記載の方法。
(項目25)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを約60mg/kgの用量で投与する、項目18~22のいずれか1項に記載の方法。
(項目26)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを約80mg/kgの用量で投与する、項目18~22のいずれか1項に記載の方法。
(項目27)
前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを約160mg/kgの用量で投与する、項目18~22のいずれか1項に記載の方法。
(項目28)
必要とする対象のデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)を治療する方法であって、前記対象が、エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有し、前記方法が、前記対象に項目12に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
(項目29)
エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象のmRNAリーディングフレームを回復させてジストロフィン産生を誘導する方法であって、前記対象に項目12に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
(項目30)
エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象において、mRNAプロセシング時にジストロフィンプレmRNAからエクソン53を排除する方法であって、前記対象に項目12に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
(項目31)
エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象のジストロフィンプレmRNAのエクソン53を結合させる方法であって、前記対象に項目12に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
上記およびその他の目的および特徴については、以下の本開示の詳細な説明を図面と併せて読めばさらに十全に理解されよう。
図1は、正常なジストロフィンプレmRNAおよび成熟mRNAのセクションを示す。 図2は、異常なジストロフィンプレmRNA(DMDの例)のセクションおよびそれによって生じる非機能性で不安定なジストロフィンを示す。 図3は、エクソン51をスキップし、プレmRNAの「インフレーム」リーディングを回復させるよう設計されたeteplirsenを示す。 図4は、処置から96時間後にRT-PCRにより測定した健常ヒト筋芽細胞での様々な濃度のPMO#1およびPPMO#1によるエクソン53スキッピングの割合の棒グラフである。エラーバーは平均±SDを表す。 図5A~図5Dは、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの四頭筋のジストロフィンタンパク質を測定したウエスタンブロット解析の様々な時点[7日後(5A)、30日後(5B)、60日後(5C)および90日後(5D)]を代表する画像である。 図5A~図5Dは、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの四頭筋のジストロフィンタンパク質を測定したウエスタンブロット解析の様々な時点[7日後(5A)、30日後(5B)、60日後(5C)および90日後(5D)]を代表する画像である。 図6Aは、ウエスタンブロット解析により求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの四頭筋に誘導された野生型ジストロフィンの割合を注射後90日間にわたって示す線グラフである。図6Bは、RT-PCRによって求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの四頭筋に誘導されたエクソン23スキッピングの割合を注射後90日間にわたって示す線グラフである。 図7A~図7Dは、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの横隔膜のジストロフィンタンパク質を測定したウエスタンブロット解析の様々な時点[7日後(7A)、30日後(7B)、60日後(7C)および90日後(7D)]を代表する画像である。 図7A~図7Dは、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの横隔膜のジストロフィンタンパク質を測定したウエスタンブロット解析の様々な時点[7日後(7A)、30日後(7B)、60日後(7C)および90日後(7D)]を代表する画像である。 図8Aは、ウエスタンブロット解析により求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの横隔膜に誘導された野生型ジストロフィンの割合を注射後90日間にわたって示す線グラフである。図8Bは、RT-PCRにより求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの横隔膜に誘導されたエクソン23スキッピングの割合を注射後90日間にわたって示す線グラフである。 図9A~図9Dは、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの心臓のジストロフィンタンパク質を測定したウエスタンブロット解析の様々な時点[7日後(9A)、30日後(9B)、60日後(9C)および90日後(9D)]を代表する画像である。 図9A~図9Dは、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの心臓のジストロフィンタンパク質を測定したウエスタンブロット解析の様々な時点[7日後(9A)、30日後(9B)、60日後(9C)および90日後(9D)]を代表する画像である。 図10Aは、ウエスタンブロット解析により求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの心臓に誘導された野生型ジストロフィンの割合を注射後90日間にわたって示す線グラフである。図10Bは、RT-PCRにより求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの心臓に誘導されたエクソン23スキッピングの割合を注射後90日間にわたって示す線グラフである。 図11は、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの左側四頭筋に誘導されたジストロフィンを示す免疫組織化学解析を示す。 図12A~図12Bは、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの心臓のジストロフィンタンパク質を測定した、様々な用量、すなわち、40mg/kg、80mg/kgおよび120mg/kgについてのウエスタンブロット解析の代表画像である。 図13は、様々な用量、すなわち、40mg/kg、80mg/kgおよび120mg/kgで注射してから30日後にウエスタンブロット解析により求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの心臓に誘導された野生型ジストロフィンの割合を示す棒グラフである。 図14A~図14Bは、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの横隔膜のジストロフィンタンパク質を測定した、様々な用量、すなわち、40mg/kg、80mg/kgおよび120mg/kgについてのウエスタンブロット解析の代表画像である。 図15は、様々な用量、すなわち、40mg/kg、80mg/kgおよび120mg/kgで注射してから30日後にウエスタンブロット解析により求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの横隔膜に誘導された野生型ジストロフィンの割合を示す棒グラフである。 図16A~図16Bは、様々な用量、すなわち、40mg/kg、80mg/kgおよび120mg/kgのPMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)で処置したmdxマウスの四頭筋のジストロフィンタンパク質を測定したウエスタンブロット解析の代表画像である。 図17は、様々な用量、すなわち、40mg/kg、80mg/kgおよび120mg/kgで注射してから30日後にウエスタンブロット解析により求めた、PMO(PMO4225)またはPPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの四頭筋に誘導された野生型ジストロフィンの割合を示す棒グラフである。 図18は、PMOの合成方法Bにより実施したカップリングサイクルを示す。 図18は、PMOの合成方法Bにより実施したカップリングサイクルを示す。 図18は、PMOの合成方法Bにより実施したカップリングサイクルを示す。 図18は、PMOの合成方法Bにより実施したカップリングサイクルを示す。 図19は、mdxマウスおよび野生型マウスにおいて、PPMO(PPMO4225)によってmdxマウスの横隔膜および心臓に誘導されるジストロフィンおよびラミニンを生理食塩水と比較して示す免疫組織化学解析を示す。 図20は、RT-PCRによって測定したときの、処置から96時間後の健常ヒト筋管での様々な濃度のPMO#1およびPPMO#1によるエクソン53スキッピングの割合の棒グラフである。エラーバーは平均±SDを表す。
(開示の詳細な説明)
本開示の諸実施形態は一般に、ヒトジストロフィン遺伝子にエクソンスキッピングを誘導するよう特異的に設計された改善されたアンチセンスオリゴマーコンジュゲートおよびその使用方法に関する。ジストロフィンは筋肉の機能に極めて重要な役割を果たしており、筋肉に関連する様々な疾患は変異型のジストロフィン遺伝子を特徴とする。このため、ある特定の実施形態では、本明細書に記載される改善されたアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、変異型のヒトジストロフィン遺伝子、例えばデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)およびベッカー型筋ジストロフィー(BMD)にみられる変異ジストロフィン遺伝子などにエクソンスキッピングを誘導するものである。
これらの変異ヒトジストロフィン遺伝子は、変異を原因とする異常なmRNAスプライシング事象により、欠陥のあるジストロフィンタンパク質を発現するか、測定可能なジストロフィンを全く発現しないようになり、このような病態が様々な形態の筋ジストロフィーを引き起こす。この病態を治療するため、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは変異ヒトジストロフィン遺伝子のプロセシング前のmRNAの選択した領域とハイブリダイズし、本来であれば異常にスプライスされるジストロフィンmRNAにエクソンスキッピングおよびディファレンシャルスプライシングを誘導し、それにより筋細胞に機能性ジストロフィンタンパク質をコードするmRNA転写物を産生させる。ある特定の実施形態では、得られるジストロフィンタンパク質は必ずしも「野生型」のジストロフィンであるわけではなく、むしろ短縮されているが、それでも機能型のジストロフィンである。
筋細胞内の機能性ジストロフィンタンパク質のレベルを増大させることにより、これらおよびそれに関連する実施形態は筋ジストロフィー、特に、異常なmRNAスプライシングに起因する欠陥ジストロフィンタンパク質の発現を特徴とするDMDおよびBMDなどの形態の筋ジストロフィーの予防および治療に有用である。本明細書に記載される特異的アンチセンスオリゴマーコンジュゲートはさらに、ジストロフィンエクソン特異的標的化が他のオリゴマーより改善されており、それにより、関連する形態の筋ジストロフィーの別の治療方法より重要性および実用性の面で優れた利点をもたらす。
したがって、本開示は、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートであって、
選択した標的と結合してヒトジストロフィン遺伝子にエクソンスキッピングを誘導することが可能な長さ25サブユニットのアンチセンスオリゴマーであって、アニーリング部位と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53標的領域に相補的な塩基の配列を含む、アンチセンスオリゴマー;および
アンチセンスオリゴマーとリンカー部分によりコンジュゲートした細胞透過性ペプチド(CPP)
を含む、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートに関する。
いくつかの実施形態では、アニーリング部位はH53A(+36+60)である。
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーの塩基はモルホリノ環構造と結合しており、モルホリノ環構造は、1つの環構造のモルホリノ窒素と、隣接する環構造の5’環外炭素とを連結する亜リン酸含有サブユニット間結合により連結されている。ある特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドはRであり、リンカー部分はグリシンである。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、配列番号1と命名される塩基配列を含み、式中、各チミン塩基(T)は必要に応じてウラシル塩基(U)である。
別途定義されない限り、本明細書で使用される技術用語および科学用語はいずれも、本開示が属する技術分野の当業者に一般に理解されるものと同じ意味を有する。本開示の実施または検証には、本明細書に記載されるものと類似した、または等価の任意の方法および材料を用いることができるが、好ましい方法および材料を記載する。本開示を目的として、これより以下の用語を定義する。
I.定義
「約」は、基準となる数量、レベル、値、数、頻度、割合、寸法、大きさ、量、重量または長さに対して30%、25%、20%、15%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%または1%だけばらつきのある数量、レベル、値、数、頻度、割合、寸法、大きさ、量、重量または長さを意味する。
本明細書で使用される「アルキル」という用語は、特に明記されない限り、飽和の直鎖または分岐鎖炭化水素を指す。ある特定の実施形態では、アルキル基は、第一級、第二級または第三級炭化水素である。ある特定の実施形態では、アルキル基は1~10個の炭素原子、すなわち、C~C10アルキルを含む。ある特定の実施形態では、アルキル基は1~6個の炭素原子、すなわち、C~Cアルキルを含む。ある特定の実施形態では、アルキル基は、メチル、CF、CCl、CFC1、CFCl、エチル、CHCF、CFCF、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、sec-ブチル、t-ブチル、ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、ヘキシル、イソヘキシル、3-メチルペンチル、2,2-ジメチルブチルおよび2,3-ジメチルブチルからなる群より選択される。この用語は、ハロゲン化アルキル基を含めた置換アルキル基および未置換アルキル基をともに包含する。ある特定の実施形態では、アルキル基はフッ素化アルキル基である。アルキル基を置換することができる部分の非限定的な例は、保護されていない、または必要に応じて、当業者に公知のように、例えば参照により本明細書に組み込まれるGreene,et al.,Protective Groups in Organic Synthesis,John Wiley and Sons,第2版,1991に教示されるように保護されている、ハロゲン(フルオロ、クロロ、ブロモまたはヨード)、ヒドロキシル、アミノ、アルキルアミノ、アリールアミノ、アルコキシ、アリールオキシ、ニトロ、シアノ、スルホン酸、硫酸、ホスホン酸、リン酸またはホスホネートからなる群より選択される。
本明細書で対象または患者に関して使用される「エクソン53スキッピングが可能である」は、ジストロフィン遺伝子に1つまたは複数の変異があり、その変異は、ジストロフィンプレmRNAのエクソン53をスキップしなければリーディングフレームがアウトオブフレームになり、それによりプレmRNAの翻訳が障害を受け、対象または患者が機能性または半機能性のジストロフィンを産生することができなくなるものである、対象および患者を包含するものとする。エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異の例としては、例えば、エクソン42~52、エクソン45~52、エクソン47~52、エクソン48~52、エクソン49~52、エクソン50~52またはエクソン52の欠失が挙げられる。ある患者がエクソンスキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有するかどうかの判定は、当業者の理解の範囲内に十分に収まるものである(例えば、Aartsma-Rus et al.,(2009)Hum Mutat.30:293-299,Gurvich et al.,Hum Mutat.2009;30(4)633-640およびFletcher et al.,(2010)Molecular Therapy 18(6)1218-1223を参照されたい)。
本明細書で使用される「オリゴマー」という用語は、サブユニット間結合によって連結した一続きのサブユニットを指す。ある特定の場合には、「オリゴマー」という用語は「アンチセンスオリゴマー」に関連して使用される。「アンチセンスオリゴマー」については、各サブユニットは:(i)リボース糖またはその誘導体;および(ii)それと結合した核酸塩基であって、サブユニット、サブユニット間結合またはその両方が天然に存在するものではないことを条件として、塩基対形成部分の順序がワトソン・クリック型塩基対形成により核酸(通常、RNA)内の標的配列に相補的な塩基配列を形成して標的配列内で核酸:オリゴマーヘテロ二本鎖を形成するような核酸塩基からなる。ある特定の実施形態では、アンチセンスオリゴマーはPMOである。他の実施形態では、アンチセンスオリゴマーは2’-O-メチルホスホロチオアートである。他の実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーは、ペプチド核酸(PNA)、ロックト核酸(LNA)または2’-O,4’-C-エチレン-架橋化核酸(ENA)などの架橋化核酸(BNA)である。本明細書にはさらなる例示的実施形態も記載する。
「相補的」および「相補性」という用語は、ワトソン・クリック型塩基対形成の法則により互いに関連し合う2つ以上のオリゴマー(すなわち、それぞれが核酸塩基配列を含む)を指す。例えば、核酸塩基配列「T-G-A(5’→3’)」は核酸塩基配列「A-C-T(3’→5’)」に相補的である。相補性は「部分的」なものであり得、この場合、所与の核酸塩基配列の全部に満たない数の核酸塩基が塩基対形成の法則に従って他の核酸塩基配列とマッチする。例えば、いくつかの実施形態では、所与の核酸塩基配列と他方の核酸塩基配列との間の相補性は、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%または約95%であり得る。あるいは、所与の核酸塩基配列と他方の核酸塩基配列との間に「全面的」または「完全」な(100%の)相補性が存在し、その例が続くこともある。核酸塩基配列間の相補性の高さは、配列間のハイブリダイゼーション効率および強さに大きな影響を及ぼす。
「有効量」および「治療有効量」という用語は、本明細書では互換的に使用され、単回投与として、または一連の投与の一部として哺乳動物対象に投与され、所望の治療効果を得るのに有効なアンチセンスオリゴマーなどの治療用化合物の量を指す。アンチセンスオリゴマーでは、この効果は通常、選択した標的配列の翻訳もしくは自然なスプライスプロセシングの阻害または臨床的に意義のある量のジストロフィン(統計的有意性)の産生によってもたらされる。
いくつかの実施形態では、有効量は、対象を治療する一定期間の間、アンチセンスオリゴマーを含む少なくとも10mg/kgまたは少なくとも20mg/kgの組成物である。いくつかの実施形態では、対象のジストロフィン陽性線維の数を正常の少なくとも20%まで増大させる有効量は、アンチセンスオリゴマーを含む少なくとも20mg/kgの組成物である。ある特定の実施形態では、患者の歩行距離を例えば6MWTで健常な同等者に対して20%の不足から安定化、維持または改善する有効量は、アンチセンスオリゴマーを含む10mg/kgまたは少なくとも20mg/kgの組成物である。様々な実施形態では、有効量は、少なくとも10mg/kg~約30mg/kg、少なくとも20mg/kg~約30mg/kg、約25mg/kg~約30mg/kgまたは約30mg/kg~約50mg/kgである。いくつかの実施形態では、有効量は、約10mg/kg、約20mg/kg、約30mg/kgまたは約50mg/kgである。別の態様では、有効量は、少なくとも24週間、少なくとも36週間または少なくとも48週間にわたって少なくとも約10mg/kg、約20mg/kg、約25mg/kg、約30mg/kgまたは約30mg/kg~約50mg/kgであり、それにより、対象のジストロフィン陽性線維の数が正常の少なくとも20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、約95%に増大し、患者の歩行距離が例えば6MWTで健常な同等者に対して20%の不足から安定化または改善する。いくつかの実施形態では、治療により患者のジストロフィン陽性線維の数が正常の20~60%または30~50%に増大する。
「増強する」もしくは「増強すること」、「増大させる」もしくは「増大させること」または「刺激する」もしくは「刺激すること」は一般に、1つまたは複数のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたは医薬組成物が、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートがない場合に、または対照化合物によって引き起こされる反応と比較して、細胞または対象の生理反応(すなわち、下流の作用)の増大を生じさせる、または引き起こすことができることを指す。生理反応の増大としては、当該技術分野での理解および本明細書の記載から明らかな反応の中でも特に、機能型ジストロフィンタンパク質の発現増大または筋組織のジストロフィンに関連する生物活性の増大を挙げ得る。筋機能の約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%または100%の増大または改善を含めた筋機能の増大も測定することができる。筋線維のジストロフィン発現の約1%、2%、5%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%または100%の増大を含めた機能性ジストロフィンを発現する筋線維の割合も測定することができる。例えば、線維の25~30%がジストロフィンを発現すれば、筋機能に約40%の改善が生じ得ることが示されている(例えば、DelloRusso et al.,Proc Natl Acad Sci USA 99:12979-12984,2002を参照されたい)。「増大した」または「増強された」量は通常、「統計的に有意な」量であり、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートがない場合に(薬剤の不在下で)または対照化合物によってもたらされる量の1.1倍、1.2倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍、40倍、50倍の、またはそれを上回る(例えば、500倍、1000倍、間のおよび1より大きいあらゆる整数および小数点、例えば、1.5、1.6、1.7、1.8などを含む)増大がこれに含まれ得る。
本明細書で使用される「機能」および「機能性」などの用語は、生物学的、酵素的または治療的機能を指す。
「機能性」ジストロフィンタンパク質は一般に、通常DMDまたはBMDを有する特定の対象に存在する変化型または「欠陥」型のジストロフィンタンパク質と比較して、筋ジストロフィーの別の特徴である進行性の筋組織分解を抑えるのに十分な生物活性を有するジストロフィンタンパク質を指す。ある特定の実施形態では、機能性ジストロフィンタンパク質は、当該技術分野で日常的な技術による測定で、野生型ジストロフィンのin vitroまたはin vivoの生物活性の約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または100%(間のあらゆる整数を含む)の生物活性を有し得る。一例として、筋管の大きさ、筋原線維の組織化(または組織崩壊)、収縮活動およびアセチルコリン受容体の自発的クラスター形成により筋培養物のジストロフィンによる活性をin vitroで測定することができる(例えば、Brown et al.,Journal of Cell Science.112:209-216,1999を参照されたい)。動物モデルも疾患の原因の研究に価値ある資源であり、ジストロフィンによる活性を試験する手段となる。DMDの研究に最も広く用いられている2種類の動物モデルが、mdxマウスとゴールデンレトリーバー筋ジストロフィー(GRMD)イヌであり、ともにジストロフィン陰性である(例えば、CollinsおよびMorgan,Int J Exp Pathol 84:165-172,2003を参照されたい)。上記およびその他の動物モデルを用いて様々なジストロフィンタンパク質の機能活性を測定することができる。短縮型のジストロフィン、例えば本開示の特定のエクソンスキッピングアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの投与後に生じる短縮型などが含まれる。
「ミスマッチ(1つまたは複数)」という用語は、オリゴマー核酸塩基配列内にあり塩基対形成の法則に従い標的プレmRNAとマッチしない1個または複数個の核酸塩基(連続しているか、分離しているかを問わない)を指す。完全な相補性が望まれることが多いが、いくつかの実施形態は、標的プレmRNAに対して1つまたは複数、好ましくは6つ、5つ、4つ、3つ、2つまたは1つのミスマッチを含み得る。オリゴマー内の任意の位置にあるばらつきが含まれる。ある特定の実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、内部の末端のばらつき付近の核酸塩基配列にばらつきを含み、それが存在する場合、通常、5’末端および/または3’末端の約6個、5個、4個、3個、2個または1個以内のサブユニットである。
「モルホリノ」、「モルホリノオリゴマー」および「PMO」という用語は、Summerton,J.et al.,Antisense & Nucleic Acid Drug Development,7:187-195(1997)の図2に記載されている以下の一般構造:
Figure 0007160807000025


のホスホロジアミダートモルホリノオリゴマーを指す。本明細書に記載されるモルホリノは、上記の一般構造のあらゆる立体異性体および互換異性体を包含する。モルホリノオリゴマーの合成、構造および結合特性については米国特許第5,698,685号;同第5,217,866号;同第5,142,047号;同第5,034,506号;同第5,166,315号;同第5,521,063号;同第5,506,337号;同第8,076,476号;および同第8,299,206号に詳述されており、上記の特許はいずれも参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態では、モルホリノをオリゴマーの5’末端または3’末端で「テール」部分とコンジュゲートして、その安定性および/または溶解性を増大させる。例示的テールとしては:
Figure 0007160807000026

が挙げられる。
上記の例示的テール部分のうち、「TEG」または「EG3」は以下のテール部分:
Figure 0007160807000027


を指す。
上記の例示的テール部分のうち、「GT」は以下のテール部分:
Figure 0007160807000028


を指す。
本明細書で使用される「-G-R」および「-G-R-Ac」という用語は互換的に使用され、本開示のアンチセンスオリゴマーとコンジュゲートしたペプチド部分を指す。様々な実施形態では、「G」は、「R」とアミド結合によりコンジュゲートしたグリシン残基を表し、「R」はそれぞれ、アミド結合により互いにコンジュゲートしたアルギニン残基を表し、したがって、「R」は、アミド結合により互いにコンジュゲートした6つの(6)アルギニン残基を意味する。アルギニン残基は任意の立体配置を有するものであり得、例えば、アルギニン残基はL-アルギニン残基、D-アルギニン残基またはD-アルギニン残基とL-アルギニン残基の混合物であり得る。ある特定の実施形態では、「-G-R」または「-G-R-Ac」は、本開示のPMOアンチセンスオリゴマーの最も3’側のモルホリノサブユニットのモルホリン環窒素とコンジュゲートしている。いくつかの実施形態では、「-G-R」または「-G-R-Ac」は、本開示のアンチセンスオリゴマーの3’末端とコンジュゲートしており、以下の式:
Figure 0007160807000029


のものである。
「核酸塩基」(Nu)、「塩基対形成部分」または「塩基」という用語は、天然に存在する、または「天然の」DNAまたはRNAにみられるプリン塩基またはピリミジン塩基(例えば、ウラシル、チミン、アデニン、シトシンおよびグアニン)ならびにこれらの天然に存在するプリンおよびピリミジンの類似体を指すのに互換的に使用される。これらの類似体は、オリゴマーに結合親和性などの特性の改善をもたらし得る。例示的類似体としては、ヒポキサンチン(イノシンの塩基成分);2,6-ジアミノプリン;5-メチルシトシン;C5-プロピニル修飾ピリミジン;10-(9-(アミノエトキシ)フェノキサジニル)(Gクランプ)などが挙げられる。
塩基対形成部分のさらなる例としては、特に限定されないが、アミノ基がそれぞれアシル保護基によって保護されたウラシル、チミン、アデニン、シトシン、グアニンおよびヒポキサンチン(イノシン)、2-フルオロウラシル、2-フルオロシトシン、5-ブロモウラシル、5-ヨードウラシル、2,6-ジアミノプリン、アザシトシン、ピリミジン類似体、例えばプソイドイソシトシンおよびプソイドウラシルならびにその他の修飾核酸塩基、例えば8-置換プリン、キサンチンまたはヒポキサンチン(最後の2つは天然の分解産物である)などが挙げられる。ChiuおよびRana,RNA,2003,9,1034-1048;Limbach et al.,Nucleic Acids Research,1994,22,2183-2196;ならびにRevankarおよびRao,Comprehensive Natural Products Chemistry,vol.7,313に開示されている修飾核酸塩基も企図され、上記参考文献の内容が参照により本明細書に組み込まれる。
塩基対形成部分のさらなる例としては、特に限定されないが、ベンゼン環が1つまたは複数付加されサイズが増大した核酸塩基が挙げられる。Glen Researchカタログ(www.glenresearch.com);Krueger AT et al.,Acc.Chem.Res.,2007,40,141-150;Kool,ET,Acc.Chem.Res.,2002,35,936-943;Benner S.A.et al.,Nat.Rev.Genet.,2005,6,553-543;Romesberg,F.E.et al.,Curr.Opin.Chem.Biol.,2003,7,723-733;およびHirao,I.,Curr.Opin.Chem.Biol.,2006,10,622-627に記載されている核酸塩基置換が本明細書に記載されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートに有用であるものとして企図され、上記参考文献の内容が参照により本明細書に組み込まれる。サイズが増大した核酸塩基の例としては、以下に示すもの
Figure 0007160807000030

およびその互変異性型が挙げられる。
本明細書で使用される「非経口投与」および「非経口的に投与する」という語句は、経腸および局所投与以外の通常は注射による投与様式を意味し、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、真皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、嚢下、くも膜下、脊髄内および胸骨内への注射および注入が非限定的に含まれる。
明確にするため、例えば式(IV)を含めた本開示の構造は、5’から3’まで連続したものであり、構造全体をコンパクトな形態で図示する都合上、「中断A」、「中断B」および「中断C」と表示される様々な図の中断が含まれている。当業者であれば理解されるように、例えば、「中断A」という表示はそれぞれ、構造の図がその地点で連続していることを示す。当業者には、上の構造の「中断B」および「中断C」の場合もそれぞれ同じことが当てはまることが理解される。しかし、図の中断はいずれも、上の構造が実際に不連続であることを意味することを意図するものではなく、また当業者にも、図の中断がそのような意味を有するものと理解されるものではない。
本明細書で使用される場合、構造式内で使用される1組の括弧は、括弧と括弧の間にある構造的特徴が反復されることを示す。いくつかの実施形態では、使用される括弧は「[」と「]」であり得、ある特定の実施形態では、反復される構造的特徴を示すのに使用される括弧は「(」と「)」であり得る。いくつかの実施形態では、括弧と括弧の間にある構造的特徴の反復回数は、括弧の外に示される2、3、4、5、6、7などの数字である。様々な実施形態では、括弧と括弧の間にある構造的特徴の反復回数は、括弧の外に示される「Z」などの変数によって示される。
本明細書で使用される場合、構造式内のキラル炭素原子またはキラルリン原子に対して描かれる直線状の結合または曲がりくねった結合は、そのキラル炭素またはキラルリンの立体化学が定まったものではなく、あらゆる形態のキラル中心を含むことを意図するものであることを示す。このような図示の例を下に示す。
Figure 0007160807000031
「薬学的に許容される」という語句は、物質または組成物が、製剤を構成する他の成分および/またはそれで治療する対象と化学的かつ/または毒物学的に適合性があるものでなければならないことを意味する。
本明細書で使用される「薬学的に許容される担体」という語句は、任意のタイプの無毒性で不活性の固体、半固体または液体の充填剤、希釈剤、封入材料または製剤助剤を意味する。薬学的に許容される担体としての役割を果たし得る材料のいくつかの例として、製剤者の判断により、ラクトース、グルコースおよびスクロースなどの糖;コーンスターチおよびバレイショデンプンなどのデンプン;カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロースおよび酢酸セルロースなどのセルロースおよびその誘導体;トラガント末;麦芽;ゼラチン;タルク;カカオ脂および坐剤ワックスなどの補形剤;ラッカセイ油、綿実油、ベニバナ油、ゴマ油、オリーブ油、トウモロコシ油およびダイズ油などの油;プロピレングリコールなどのグリコール;オレイン酸エチルおよびラウリン酸エチルなどのエステル;寒天;水酸化マグネシウムおよび水酸化アルミニウムなどの緩衝剤;アルギン酸;無発熱物質水;等張食塩水;リンガー溶液;エチルアルコール;リン酸緩衝液;無毒性で適合性のある滑沢剤、例えばラウリル硫酸ナトリウムおよびステアリン酸マグネシウム;着色剤;放出剤;コーティング剤;甘味剤;香味剤;着香剤;保存剤ならびに抗酸化剤がある。
ジストロフィンの合成または産生に関する「回復」という用語は一般に、本明細書に記載されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートで治療した後、筋ジストロフィー患者に短縮型のジストロフィンを含めたジストロフィンタンパク質が産生されることを指す。いくつかの実施形態では、治療により患者の新たなジストロフィン産生が1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または100%(間のあらゆる整数を含む)増大する。いくつかの実施形態では、治療により対象のジストロフィン陽性線維の数が正常の少なくとも約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%または約95%~100%まで増大する。他の実施形態では、治療により対象のジストロフィン陽性線維の数が正常の約20%~約60%または約30%~約50%まで増大する。治療後の患者のジストロフィン陽性線維のパーセントは、既知の技術を用いて筋生検により求めることができる。例えば、患者の上腕二頭筋などの適切な筋肉から筋生検試料を採取し得る。
治療前および/または治療後あるいは治療過程全体を通じた複数の時点でジストロフィン陽性線維の割合の解析を実施し得る。いくつかの実施形態では、治療前の生検と反対側の筋肉から治療後の生検試料を採取する。ジストロフィンに適した任意のアッセイを用いて治療前および治療後のジストロフィン発現解析を実施し得る。いくつかの実施形態では、筋生検から得た組織切片にジストロフィンのマーカーとなるモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体などの抗体を用いて免疫組織化学的検出を実施する。例えば、高感度のジストロフィンマーカーであるMANDYS106抗体を使用することができる。任意の適切な二次抗体を使用し得る。
いくつかの実施形態では、陽性線維の数をカウントした総線維数で除することによりジストロフィン陽性線維のパーセントを算出する。正常な筋試料ではジストロフィン陽性線維が100%である。したがって、ジストロフィン陽性線維のパーセントを正常に対する割合で表すことができる。治療前の筋肉および復帰変異体線維中にジストロフィンが微量に存在することを考慮に入れて制御するため、治療後の筋肉中のジストロフィン陽性線維をカウントする際に、患者の治療前の筋肉の切片を用いてベースラインを設定することができる。これをその患者の治療後の筋肉の切片に存在するジストロフィン陽性線維をカウントする際の閾値として使用し得る。他の実施形態では、Bioquant画像解析ソフトウェア(Bioquant Image Analysis社、ナッシュビル、テネシー州)を用いるジストロフィン定量化に抗体で染色した組織切片を使用することもできる。総ジストロフィン蛍光シグナル強度を正常に対する割合で報告することができる。さらに、モノクローナルまたはポリクローナル抗ジストロフィン抗体によるウエスタンブロット解析を用いてジストロフィン陽性線維の割合を求めることができる。例えば、Leica Biosystems社の抗ジストロフィン抗体NCL-Dys1を使用し得る。サルコグリカン複合体(β、γ)および/または神経型NOSの成分の発現を求めることによりジストロフィン陽性線維の割合を解析することもできる。
いくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートでの治療により、治療を実施しない場合にDMD患者に予想される進行性の呼吸筋機能障害および/または呼吸筋不全が緩徐化または軽減される。いくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートでの治療により、治療を実施しない場合に予想される呼吸補助の必要性が軽減または除去され得る。いくつかの実施形態では、疾患の経過を追跡する呼吸機能測定値および治療的介入の可能性の評価に最大吸気圧(MIP)、最大呼気圧(MEP)および努力肺活量(FVC)を含める。MIPおよびMEPはそれぞれ、人が吸息時および呼息時に発生させることができる圧力のレベルを測定するものであり、感度の高い呼吸筋力の尺度である。MIPは横隔膜筋力低下の尺度の1つである。
いくつかの実施形態では、MIPおよびFVCを含めた他の肺機能検査値が変化する前にMEPが低下し得る。ある特定の実施形態では、MEPを呼吸機能障害の初期の指標とし得る。ある特定の実施形態では、FVCを用いて、最大吸息後の努力呼息時に排出される空気の総体積を測定し得る。DMD患者では、10代前半までFVCが身体成長に伴って増大する。しかし、疾患進行により成長速度の低下または成長停止が起こると、筋力低下が進行し、肺活量が下降期に入り、10~12歳を過ぎてから年間約8~8.5パーセントの平均割合で低下する。ある特定の実施形態では、MIPの予測パーセント(体重に合わせて調整したMIP)、MEPの予測パーセント(年齢に合わせて調整したMEP)およびFVCの予測パーセント(年齢および身長に合わせて調整したFVC)を補助的解析とする。
本明細書で使用される「対象」および「患者」という用語は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートで治療することができる症状を呈するか、そのような症状を呈するリスクがある任意の動物、例えばDMDもしくはBMDまたはこれらの病態に関連するいずれかの症状(例えば、筋線維の減少)を有するか、これを有するリスクがある対象(または患者)などを包含する。適切な対象(または患者)としては、実験動物(マウス、ラット、ウサギまたはモルモットなど)、家畜および飼育動物またはペット(ネコまたはイヌなど)が挙げられる。非ヒト霊長類、好ましくはヒト患者(または対象)が含まれる。エクソン51スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子に変異を有する対象(または患者)にジストロフィンを産生させる方法も含まれる。
本明細書で使用される「全身投与」、「全身に投与する」、「末梢投与」および「末梢に投与する」という語句は、化合物、薬物またはその他の物質を中枢神経系内に直接投与するのではなく、患者の全身に入り、したがって、代謝およびその他の同様の過程を受けるように投与すること、例えば皮下投与を意味する。
「標的化配列」という相は、標的プレmRNA内のヌクレオチドの配列に相補的なオリゴマーの核酸塩基の配列を指す。本開示のいくつかの実施形態では、標的プレmRNA内のヌクレオチドの配列は、H53A(+36+60)と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53アニーリング部位である。
対象(例えば、ヒトなどの哺乳動物)または細胞の「治療」とは、対象または細胞の自然な過程を変化させるために用いる任意のタイプの介入のことである。治療は、特に限定されないが、オリゴマーまたはその医薬組成物の投与を含み、予防として、または病的事象の開始もしくは病原体との接触の後に実施し得る。治療には、特定の形態の筋ジストロフィーのようなジストロフィンタンパク質に関連する疾患または病態の症状または病変に対する任意の所望の効果が含まれ、例えば、治療する疾患または病態の1つまたは複数の測定可能なマーカーの最小限の変化または改善が含まれ得る。治療する疾患もしくは病態の進行速度の低下、その疾患もしくは病態の発症の遅延またはその発症の重症度の軽減を対象とし得る「予防的」治療も含まれる。「治療」または「予防」は、必ずしも疾患もしくは病態またはその関連症状を完全に根絶、治癒または予防することを表すものではない。
いくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートでの治療により、治療を実施しない場合に予想される新たなジストロフィン産生が増大し、疾患進行が遅延し、歩行能力低下の緩徐化もしくは軽減がみられ、筋炎が軽減され、筋肉損傷が軽減され、筋機能が改善され、肺機能低下が軽減され、かつ/または筋再生が増強される。いくつかの実施形態では、治療により疾患進行が維持される、遅延する、または緩徐化する。いくつかの実施形態では、治療により歩行能力が維持される、または歩行能力低下が軽減される。いくつかの実施形態では、治療により肺機能が維持される、または肺機能低下が軽減される。いくつかの実施形態では、治療により、例えば6分間歩行検査(6MWT)により測定される患者の安定歩行距離が維持される、または増大する。いくつかの実施形態では、治療により、10メートル歩く/走るのにかかる時間(すなわち、10メートル歩行/走検査)が維持または短縮される。いくつかの実施形態では、治療により、仰臥位から起立するのにかかる時間(すなわち、起立時間検査)が維持または短縮される。いくつかの実施形態では、治療により、4段の標準階段を昇るのにかかる時間(すなわち、4段昇段検査)が維持または短縮される。いくつかの実施形態では、治療により、例えばMRI(例えば、脚筋のMRI)により測定される患者の筋炎が維持または軽減される。いくつかの実施形態では、MRIによりT2および/または脂肪含有率を測定して筋変性を確認する。MRIにより炎症、浮腫、筋損傷および脂肪浸潤を原因とする筋肉の構造および組成の変化を確認することができる。
いくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートでの治療により新たなジストロフィン産生が増大し、治療を実施しない場合に予想される歩行能力低下が緩徐化または軽減される。例えば、治療により対象の歩行能力が安定化し得る、維持され得る、改善され得る、または増大し得る(例えば、歩行の安定化)。いくつかの実施形態では、治療により、例えばMcDonald et al.(Muscle Nerve,2010;42:966-74、参照により本明細書に組み込まれる)により記載されている6分間歩行検査(6MWT)により測定される患者の安定歩行距離が維持される、または増大する。6分間歩行距離(6MWD)の変化は絶対値、割合の変化または%予測値の変化で表され得る。いくつかの実施形態では、治療により、6MWTでの患者の安定歩行距離が健常な同等者に対して20%の不足から維持または改善される。%予測値を算出することにより、6MWTでの健常な同等者の典型的な成績と比較したDMD患者の成績を求めることができる。例えば、男性には以下の方程式:196.72+(39.81×年齢)-(1.36×年齢)+(132.28×身長(メートル))を用いて%予測6MWDを算出し得る。女性には以下の方程式:188.61+(51.50×年齢)-(1.86×年齢)+(86.10×身長(メートル))を用いて%予測6MWDを算出し得る(Henricson et al.,PLoS Curr.,2012,version 2、参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーでの治療により、患者の安定歩行距離がベースラインから3メートル、5メートル、6メートル、7メートル、8メートル、9メートル、10メートル、15メートル、20メートル、25メートル、30メートルまたは50メートル(間のあらゆる整数を含む)超まで増大する。
DMD患者の筋機能低下は、正常な小児の成長および発育を背景に起こり得る。実際、DMDを有する低年齢の小児では、進行性の筋機能障害があるにもかかわらず、約1年間にわたって6MWTでの歩行距離が増大し得る。いくつかの実施形態では、DMD患者の6MWDを通常の発育がみられる対照被験者ならびに年齢および性別が一致する被験者の既存の標準データと比較する。いくつかの実施形態では、年齢と身長に基づく方程式を標準データに当てはめて用い、正常な成長および発育を説明することができる。このような方程式を用いて、DMDを有する被験者の6MWDをパーセント予測(%予測)値に変換することができる。ある特定の実施形態では、%予測6MWDデータの解析が正常な成長および発育を説明する方法となり、低年齢(例えば、7歳以下)時の機能増大が、DMD患者の能力の改善ではなく安定を表すことを示すものとなり得る(Henricson et al.,PLoS Curr.,2012,version 2、参照により本明細書に組み込まれる)。
異なるアンチセンス分子を識別するため、アンチセンス分子の命名法が提唱され公開された(Mann et al.,(2002)J Gen Med 4,644-654を参照されたい)。この命名法は、いずれも下に示す同じ標的領域に方向付けられたわずかに異なる複数のアンチセンス分子を試験する際に特に重要なものとなった:
H#A/D(x:y)。
1番目の文字は種(例えば、H:ヒト、M:マウス、C:イヌ)を表す。「#」は標的ジストロフィンエクソンの番号を表す。「A/D」は、エクソンの先頭および末尾にあるアクセプタースプライス部位またはドナースプライス部位をそれぞれ表す。(x y)はアニーリング座標を表し、座標中、「-」または「+」はそれぞれイントロン配列またはエクソン配列を表す。例えば、A(-6+18)は、標的エクソンに先行するイントロンの最後の6塩基および標的エクソンの最初の18塩基を表す。最も近いスプライス部位がアクセプターとなるため、その座標の前には「A」が記載される。ドナースプライス部位でのアニーリング座標を記述すればD(+2-18)となり、座標中、最後の2個のエクソン塩基および最初の18個のイントロン塩基がアンチセンス分子のアニーリング部位に対応する。全体がエクソンでありA(+65+85)により表されるアニーリング座標は、そのエクソンの先頭から65番目のヌクレオチドと85番目のヌクレオチドの間にある部位である。
II.アンチセンスオリゴマー
A.エクソン53スキッピングを誘導するよう設計したアンチセンスオリゴマーコンジュゲート
ある特定の実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、ジストロフィン遺伝子のエクソン53標的領域に相補的であり、エクソン53スキッピングを誘導する。具体的には、本開示は、アニーリング部位と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53標的領域に相補的なアンチセンスオリゴマーコンジュゲートに関する。いくつかの実施形態では、アニーリング部位はH53A(+36+60)である。
本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、ジストロフィンプレmRNAを標的としてエクソン53のスキッピングを誘導し、このため、スプライスされた成熟mRNA転写物からエクソン53が排除またはスキップされる。エクソン53をスキップすることにより、崩壊していたリーディングフレームがインフレーム変異に回復する。DMDは様々な遺伝子サブタイプからなるが、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートはジストロフィンプレmRNAのエクソン53をスキップするよう特異的に設計されたものである。エクソン53のスキッピングが可能なDMD変異は、DMD患者の1つのサブグループ(8%)を構成する。
エクソン53スキッピングを誘導するアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの核酸塩基配列は、ジストロフィンプレmRNAのエクソン53内にある特定の標的配列になるよう設計されている。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートのアンチセンスオリゴマーはPMOであり、PMOの各モルホリノ環は、例えばDNAにみられる核酸塩基(アデニン、シトシン、グアニンおよびチミン)を含めた核酸塩基と結合している。
B.オリゴマーの化学的特徴
本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは様々なアンチセンスオリゴマー化学を用いることができる。オリゴマー化学の例としては、特に限定されないが、モルホリノオリゴマー、ホスホロチオアート修飾オリゴマー、2’O-メチル修飾オリゴマー、ペプチド核酸(PNA)、ロックト核酸(LNA)、ホスホロチオアートオリゴマー、2’O-MOE修飾オリゴマー、2’-フルオロ修飾オリゴマー、2’O,4’C-エチレン-架橋化核酸(ENA)、トリシクロ-DNA、トリシクロ-DNAホスホロチオアートサブユニット、2’-O-[2-(N-メチルカルバモイル)エチル]修飾オリゴマーが挙げられ、上記のいずれかのものの組合せもこれに含まれる。ホスホロチオアート化学と2’-O-Me-修飾化学を組み合わせて2’O-Me-ホスホロチオアート主鎖を作製することができる。例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるPCT国際公開第2013/112053号および同第2009/008725号を参照されたい。本開示のオリゴマー化学の例示的実施形態について以下でさらに記載する。
1.ペプチド核酸(PNA)
ペプチド核酸(PNA)とは、主鎖がデオキシリボース主鎖と構造的に同形であり、ピリミジン塩基またはプリン塩基が結合したN-(2-アミノエチル)グリシン単位からなるDNA類似体のことである。天然のピリミジン塩基およびプリン塩基が含まれるPNAは、ワトソン・クリック型塩基対形成の法則に従い相補的なオリゴマーとハイブリダイズし、塩基対認識の点でDNAを模倣する(Egholm,Buchardt et al.,1993)。PNAの主鎖はホスホジエステル結合ではなくペプチド結合によって形成され、このため、PNAはアンチセンス用途によく適している(下の構造を参照されたい)。主鎖は非荷電であるため、通常よりも高い熱安定性を示すPNA/DNAまたはPNA/RNA二本鎖が生じる。PNAはヌクレアーゼにもプロテアーゼにも認識されない。PNAの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000032

PNAは、天然の構造が根本的に変化したものであるにもかかわらず、DNAまたはRNAと配列特異的にらせん形に結合することができる。PNAの特徴としては、相補的なDNAまたはRNAに対する高い結合親和性、単一塩基ミスマッチによる不安定化作用、ヌクレアーゼおよびプロテアーゼに対する耐性、塩濃度とは無関係なDNAまたはRNAとのハイブリダイゼーションおよびホモプリンDNAとの三重鎖形成が挙げられる。PANAGENE(商標)社は、その独自のBts PNAモノマー(Bts;ベンゾチアゾール-2-スルホニル基)および独自のオリゴマー化工程を開発した。Bts PNAモノマー用いるPNAオリゴマー化は、脱保護、カップリングおよびキャッピングの反復サイクルからなるものである。PNAは、当該技術分野で公知の任意の技術を用いて合成により作製することができる。例えば、米国特許第6,969,766号、同第7,211,668号、同第7,022,851号、同第7,125,994号、同第7,145,006号および同第7,179,896号を参照されたい。PNAの調製については、米国特許第5,539,082号;同第5,714,331号;および同第5,719,262号も参照されたい。さらに、Nielsen et al.,Science,254:1497-1500,1991にはPNA化合物の教示をみることができる。上記のものはそれぞれ、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
2.ロックト核酸(LNA)
アンチセンスオリゴマーコンジュゲートには「ロックト核酸」サブユニット(LNA)も含まれ得る。「LNA」は、架橋化核酸(BNA)と呼ばれる修飾クラスのメンバーである。BNAは、リボース環の立体配座をC30-endo(ノーザン)糖パッカーに固定する共有結合を特徴とする。LNAでは、架橋が2’-O位と4’-C位の間のメチレンからなる。LNAは、主鎖の事前組織化および塩基スタッキングを促進してハイブリダイゼーションおよび熱安定性を増大させる。
LNAの構造は、例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるWengel et al.,Chemical Communications(1998)455;Koshkin et al.,Tetrahedron(1998)54:3607;Jesper Wengel,Accounts of Chem.Research(1999)32:301;Obika et al.,Tetrahedron Letters(1997)38:8735;Obika et al.,Tetrahedron Letters(1998)39:5401およびObika et al.,Bioorganic Medicinal Chemistry(2008)16:9230にみることができる。LNAの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000033
本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは1つまたは複数のLNAが組み込まれていてよく;いくつかの場合には、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートは完全にLNAからなるものであってよい。個々のLNAヌクレオシドサブユニットの合成およびそのオリゴマーへの組込みの方法は、例えば、それぞれ全体が参照により組み込まれる米国特許第7,572,582号;同第7,569,575号;同第7,084,125号;同第7,060,809号、同第7,053,207号、同第7,034,133号、同第6,794,499号;および同第6,670,461号に記載されている。典型的なサブユニット間リンカーとしてはホスホジエステル部分およびホスホロチオアート部分が挙げられ;あるいは、非亜リン酸含有リンカーを用いてもよい。さらなる実施形態は、各LNAサブユニットがDNAサブユニットによって隔てられているLNA含有アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを含む。特定のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、交互に並ぶLNAサブユニットとDNAサブユニットとからなり、サブユニット間リンカーがホスホロチオアートである。
2’O,4’C-エチレン-架橋化核酸(ENA)はBNAクラスのまた別のメンバーである。非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000034
ENAオリゴマーおよびその調製については、全体が参照により本明細書に組み込まれるObika et al.,Tetrahedron Lett(1997)38(50):8735に記載されている。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは1つまたは複数のENAサブユニットが組み込まれていてよい。
3.アンロックト核酸(UNA)
アンチセンスオリゴマーコンジュゲートはアンロックト核酸(UNA)サブユニットも含み得る。UNAおよびUNAオリゴマーは、サブユニットのC2’-C3’結合が切断されているRNAの類似体である。LNAが(DNAおよびRNAと比較して)立体構造的に制限されているのに対し、UNAは極めて柔軟性に富む。UNAは例えば国際公開2016/070166号に開示されている。UNAの非限定的な例を下に示す。
Figure 0007160807000035

典型的なサブユニット間リンカーとしては、ホスホジエステル部分およびホスホロチオアート部分が挙げられ;あるいは、非亜リン酸含有リンカーを用いてもよい。
4.ホスホロチオアート
「ホスホロチオアート」(またはSオリゴ)は、通常のDNAの非架橋酸素の1つが硫黄に置き換わったバリアントである。ホスホロチオアートの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000036
ヌクレオチド間結合の硫化により、5’~3’および3’~5’DNA POL 1エキソヌクレアーゼ、ヌクレアーゼS1およびP1、RNase、血清ヌクレアーゼならびにヘビ毒ホスホジエステラーゼを含めたエンドヌクレアーゼおよびエキソヌクレアーゼの作用が低下する。ホスホロチオアートは、2つの主要な経路によって、すなわち、二硫化炭素中の元素硫黄の溶液のホスホン酸水素に対する作用によって、または亜リン酸トリエステルをテトラエチルチウラムジスルフィド(TETD)もしくは3H-1,2-ベンソジチオール(bensodithiol)-3-オン1,1-ジオキシド(BDTD)で硫化する方法によって作製される(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるIyer et al.,J.Org.Chem.55,4693-4699,1990を参照されたい)。後者の方法では、元素硫黄が大部分の有機溶媒に不溶性であることおよび二硫化炭素の毒性という問題点が回避される。TETD法およびBDTD法でもさらに高純度のホスホロチオアートが得られる。
5.トリシクロDNAおよびトリシクロホスホロチオアートサブユニット
トリシクロDNA(tc-DNA)は、主鎖の配座柔軟性を制限し、ねじれ角γの主鎖構造を最適化するため各ヌクレオチドがシクロプロパン環の導入により修飾されている、制約のあるDNA類似体のクラスである。ホモ塩基性のアデニン含有tc-DNAおよびチミン含有tc-DNAは、相補的なRNAと極めて安定なA-T塩基対を形成する。トリシクロ-DNAおよびその合成については、全体が参照により本明細書に組み込まれる国際特許出願公開第2010/115993号に記載されている。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは1つまたは複数の三環DNAサブユニットが組み込まれていてよく;いくつかの場合には、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートは完全に三環DNAサブユニットからなるものであってよい。
トリシクロホスホロチオアートサブユニットはホスホロチオアートサブユニット間結合を有するトリシクロDNAサブユニットである。トリシクロホスホロチオアートサブユニットおよびその合成については、全体が参照により本明細書に組み込まれる国際特許出願公開第2013/053928号に記載されている。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは1つまたは複数の三環DNAサブユニットが組み込まれていてよく;いくつかの場合には、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートは完全に三環DNAサブユニットからなるものであってよい。三環DNA/三環ホスホチオアートサブユニットの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000037
6.2’O-メチル、2’O-MOEおよび2’-Fオリゴマー
「2’-O-Meオリゴマー」分子はリボース分子の2’-OH残基にメチル基を有するものである。2’-O-Me-RNAもDNAと同じ(または類似した)挙動を示すが、ヌクレアーゼによる分解から保護されている。2’-O-Me-RNAは、さらに安定化させるためにホスホロチオアートオリゴマー(PTO)と組み合わせることもできる。2’O-Meオリゴマー(ホスホジエステルまたはホスホチオアート)は当該技術分野で日常的な技術により合成することができる(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるYoo et al.,Nucleic Acids Res.32:2008-16,2004を参照されたい)。2’O-Meオリゴマーの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000038

2’O-メトキシエチルオリゴマー(2’-O MOE)は、リボース分子の2’-OH残基にメトキシエチル基を有し、全体が参照により本明細書に組み込まれるMartin et al.,Helv.Chim.Acta,78,486-504,1995で論じられている。2’O-MOEサブユニットの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000039
2’-フルオロ(2’-F)オリゴマーは、2’OHの代わりに2’位にフルオロラジカルを有する。2’-Fオリゴマーの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000040

2’-フルオロオリゴマーについては、全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第2004/043977号にさらに記載されている。
2’O-メチル、2’O-MOEおよび2’Fオリゴマーは、下に図示するように1つまたは複数のホスホロチオアート(PS)結合も含み得る:
Figure 0007160807000041
さらに、2’O-メチル、2’O-MOEおよび2’Fオリゴマーは、例えば下に図示する2’O-メチルPSオリゴマーのドリサペルセンのように、オリゴマー全体にPSサブユニット間結合を含み得る:
Figure 0007160807000042

あるいは、2’O-メチル、2’O-MOEおよび/または2’Fオリゴマーは、下に図示するようにオリゴマーの末端にPS結合を含み得る:
Figure 0007160807000043


式中、
RはCHCHOCH(メトキシエチルまたはMOE)であり;
x、yおよびzは、それぞれ5’ウィング領域、中央ギャップ領域および3’ウィング領域と命名される部分のそれぞれに含まれるヌクレオチドの数を表す。
本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、1つまたは複数の2’O-メチル、2’O-MOEおよび2’Fサブユニットが組み込まれていてよく、ここに記載したサブユニット間結合のいずれかを用いたものであり得る。いくつかの場合には、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、完全に2’O-メチル、2’O-MOEまたは2’Fサブユニットからなるものであり得る。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの1つの実施形態は、完全に2’O-メチルサブユニットからなるものである。
7.2’-O-[2-(N-メチルカルバモイル)エチル]オリゴマー(MCE)
MCEは、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートに有用な2’O修飾リボヌクレオシドのまた別の例である。ここでは、2’OHを2-(N-メチルカルバモイル)エチル部分に誘導体化してヌクレアーゼ耐性を増大させる。MCEオリゴマーの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000044


MCEおよびその合成については、全体が参照により本明細書に組み込まれるYamada et al.,J.Org.Chem.(2011)76(9):3042-53に記載されている。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは1つまたは複数のMCEサブユニットが組み込まれていてよい。
8.立体特異的オリゴマー
立体特異的オリゴマーとは、実質的に立体的に純粋なオリゴマーが得られる合成方法により各亜リン酸含有結合の立体化学が固定されたオリゴマーのことである。立体特異的オリゴマーの非限定的な例を下に図示する:
Figure 0007160807000045
上の例では、オリゴマーの各亜リン酸は同じ立体配置を有する。ほかの例としては、上記のオリゴマーが挙げられる。例えば、LNA、ENA、トリシクロDNA、MCE、2’O-メチル、2’O-MOE、2’-Fおよびモルホリノ系オリゴマーを立体特異的亜リン酸含有ヌクレオシド間結合、例えば,ホスホロチオアート結合、ホスホジエステル結合、ホスホラミダート結合、ホスホロジアミダート結合またはその他の亜リン酸含有ヌクレオシド間結合などにより調製することができる。立体特異的オリゴマー、このようなオリゴマーの調製に用いる調製方法、キラル制御合成、キラルの設計およびキラル補助基については、例えば、それぞれ全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第2017192664号、同第2017192679号、同第2017062862号、同第2017015575号、同第2017015555号、同第2015107425号、同第2015108048号、同第2015108046号、同第2015108047号、同第2012039448号、同第2010064146号、同第2011034072号、同第2014010250号、同第2014012081号、同第20130127858号および同第2011005761号に詳述されている。
立体特異的オリゴマーは、R立体配置またはS立体配置の亜リン酸含有ヌクレオシド間結合を有し得る。結合の立体配置が制御されたキラル亜リン酸含有結合を「立体的に純粋」と言い、結合の立体配置が制御されていないキラル亜リン酸含有結合を「立体的にランダム」と言う。ある特定の実施形態では、本開示のオリゴマーは、複数の立体的に純粋な結合および立体的にランダムな結合を含み、このため、得られるオリゴマーは、オリゴマーの予め特定された位置に立体的に純粋なサブユニットを有する。国際公開第2017/062862(A2)号の図7Aおよび7Bには、立体的に純粋なサブユニットの位置の例が記載されている。一実施形態では、オリゴマー内のいずれのキラル亜リン酸含有結合も立体的にランダムである。一実施形態では、オリゴマー内のいずれのキラル亜リン酸含有結合も立体的に純粋である。
n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個のキラル亜リン酸含有結合がいずれも立体的にランダムである。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個のキラル亜リン酸含有結合がいずれも立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも10%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも20%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも30%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも40%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも50%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも60%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも70%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも80%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマー内のn個の亜リン酸含有結合の少なくとも90%(最も近い整数に丸めて)が立体的に純粋である。
n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも2個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも3個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも4個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも5個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも6個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも7個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも8個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも9個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも10個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも11個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも12個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも13個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも14個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも15個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも16個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも17個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも18個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも19個含む。n個のキラル亜リン酸含有結合(nは1以上の整数である)を有するオリゴマーの一実施形態では、オリゴマーは、同じ立体配向(すなわち、R配向またはS配向のいずれか)の連続する立体的に純粋な亜リン酸含有結合を少なくとも20個含む。
9.モルホリノオリゴマー
本開示の例示的実施形態は、Summerton,J.et al.,Antisense & Nucleic Acid Drug Development,7:187-195(1997)の図2に記載されている以下の一般構造:
Figure 0007160807000046


のホスホロジアミダートモルホリノオリゴマーに関する。本明細書に記載されるモルホリノは、上記の一般構造のあらゆる立体異性体および互換異性体を包含するものとする。モルホリノオリゴマーの合成、構造および結合特性については米国特許第5,698,685号;同第5,217,866号;同第5,142,047号;同第5,034,506号;同第5,166,315号;同第5,521,063号;同第5,506,337号;同第8,076,476号;および同第8,299,206号に詳述されており、上記の特許は参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態では、モルホリノをオリゴマーの5’末端または3’末端で「テール」部分とコンジュゲートして、その安定性および/または溶解性を増大させる。例示的テールとしては:
Figure 0007160807000047


が挙げられる。
様々な実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(I):
Figure 0007160807000048

によるものまたはその薬学的に許容される塩であり、式中:
各Nuは、一緒になって標的化配列を形成する核酸塩基であり;
Tは:
Figure 0007160807000049

から選択される部分であり;
はC~Cアルキルであり;
標的化配列は、H53A(+36+60)と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53アニーリング部位に相補的である。
様々な実施形態では、Tは
Figure 0007160807000050


である。
様々な実施形態では、Rは、メチル、CF、CCl、CFCl、CFCl、エチル、CHCF、CFCF、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、sec-ブチル、t-ブチル、ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、ヘキシル、イソヘキシル、3-メチルペンチル、2,2-ジメチルブチルまたは2,3-ジメチルブチルである。
いくつかの実施形態では、式(I)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、そのHCl(塩酸)塩である。ある特定の実施形態では、HCl塩は.6HCl塩である。
いくつかの実施形態では、Nuはそれぞれ独立に、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)、アデニン(A)、5-メチルシトシン(5mC)、ウラシル(U)およびヒポキサンチン(I)から選択される。
いくつかの実施形態では、標的化配列は配列番号1(5’-GTTGCCTCCGGTTCTGAAGGTGTTC-3’)であり、式中、各チミン(T)は必要に応じてウラシル(U)である。
様々な実施形態では、Tは
Figure 0007160807000051


であり、標的化配列は配列番号1(5’-GTTGCCTCCGGTTCTGAAGGTGTTC-3’)であり、式中、各チミン(T)は必要に応じてウラシル(U)である。
様々な実施形態では、Tは
Figure 0007160807000052


であり、標的化配列は配列番号1(5’-GTTGCCTCCGGTTCTGAAGGTGTTC-3’)である。
例えば式(I)のいくつかの実施形態を含めたいくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(II)
Figure 0007160807000053


によるものまたはその薬学的に許容される塩であり、式中、
各Nuは、一緒になってH53A(+36+60)と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53アニーリング部位に相補的な標的化配列を形成する核酸塩基である。
いくつかの実施形態では、Nuはそれぞれ独立に、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)、アデニン(A)、5-メチルシトシン(5mC)、ウラシル(U)およびヒポキサンチン(I)から選択される。
様々な実施形態では、1~25および5’~3’の各Nuは(配列番号1):
Figure 0007160807000054

であり、表中、Aは
Figure 0007160807000055


であり、Cは
Figure 0007160807000056


であり、Gは
Figure 0007160807000057


であり、Xは
Figure 0007160807000058

である。ある特定の実施形態では、Xはそれぞれ独立に
Figure 0007160807000059


である。
いくつかの実施形態では、式(II)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、そのHCl(塩酸)塩である。ある特定の実施形態では、HCl塩は.6HCl塩である。
例えば式(II)のいくつかの実施形態を含めたいくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(IIA):
Figure 0007160807000060

によるものであり、式中、各Nuは、一緒になってH53A(+36+60)と命名されるジストロフィンプレmRNAのエクソン53アニーリング部位に相補的な標的化配列を形成する核酸塩基である。
いくつかの実施形態では、Nuはそれぞれ独立に、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)、アデニン(A)、5-メチルシトシン(5mC)、ウラシル(U)およびヒポキサンチン(I)から選択される。
様々な実施形態では、1~25および5’~3’の各Nuは(配列番号1):
Figure 0007160807000061

であり、表中、Aは
Figure 0007160807000062


であり、Cは
Figure 0007160807000063


であり、Gは
Figure 0007160807000064


であり、Xは
Figure 0007160807000065

である。ある特定の実施形態では、各Xは
Figure 0007160807000066


である。
例えば式(II)および式(IIA)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの実施形態を含めたいくつかの実施形態では、標的化配列は配列番号1(5’-GTTGCCTCCGGTTCTGAAGGTGTTC-3’)であり、式中、各チミン(T)は必要に応じてウラシル(U)である。例えば式(II)および式(IIA)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの実施形態を含めた様々な実施形態では、標的化配列は配列番号1(5’-GTTGCCTCCGGTTCTGAAGGTGTTC-3’)である。
例えば式(I)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの実施形態を含めたいくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(III):
Figure 0007160807000067

によるものまたはその薬学的に許容される塩である。
いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、そのHCl(塩酸)塩である。ある特定の実施形態では、HCl塩は.6HCl塩である。
例えば式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの実施形態を含めたいくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(IIIA):
Figure 0007160807000068

によるものである。
式(I)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートのいくつかの実施形態および式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの実施形態を含めた本開示のいくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(IV):
Figure 0007160807000069

によるものまたはその薬学的に許容される塩である。
いくつかの実施形態では、式(IV)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、そのHCl(塩酸)塩である。ある特定の実施形態では、HCl塩は.6HCl塩である。
例えば式(IV)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの実施形態を含めたいくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(IVA):
Figure 0007160807000070

によるものである。
10.核酸塩基の修飾および置換
ある特定の実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートはRNA核酸塩基およびDNA核酸塩基(当該技術分野では単に「塩基」と呼ぶことが多い)からなる。RNA塩基は一般に、アデニン(A)、ウラシル(U)、シトシン(C)およびグアニン(G)として知られている。DNA塩基は一般に、アデニン(A)、チミン(T)、シトシン(C)およびグアニン(G)として知られている。様々な実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)、アデニン(A)、5-メチルシトシン(5mC)、ウラシル(U)およびヒポキサンチン(I)からなる。
ある特定の実施形態では、オリゴマー中の1つまたは複数のRNA塩基またはDNA塩基をRNA塩基またはDNA塩基以外の塩基で修飾または置換し得る。修飾または置換された塩基が含まれるオリゴマーとしては、核酸に最もよくみられる1つまたは複数のプリンまたはピリミジン塩基が、まれな塩基または非天然の塩基に置き換わったオリゴマーが挙げられる。
プリン塩基は以下の一般式:
Figure 0007160807000071

によって表されるように、イミダゾール環と縮合したピリミジン環を含む。アデニンおよびグアニンは核酸に最もよくみられる2つのプリン核酸塩基である。その他の天然に存在するプリンとしては、特に限定されないが、N-メチルアデニン、N-メチルグアニン、ヒポキサンチンおよび7-メチルグアニンが挙げられる。
ピリミジン塩基は、以下の一般式:
Figure 0007160807000072

によって表されるように、6員ピリミジン環を含む。シトシン、ウラシルおよびチミンは核酸に最もよくみられるピリミジン塩基である。その他の天然のピリミジンとしては、特に限定されないが、5-メチルシトシン、5-ヒドロキシメチルシトシン、プソイドウラシルおよび4-チオウラシルが挙げられる。一実施形態では、本明細書に記載されるオリゴマーは、ウラシルの代わりにチミン塩基を含む。
その他の適切な塩基としては、特に限定されないが、2,6-ジアミノプリン、オロト酸、アグマチジン、ライシジン、2-チオピリミジン(例えば、2-チオウラシル、2-チオチミン)、Gクランプおよびその誘導体、5-置換ピリミジン(例えば、5-ハロウラシル、5-プロピニルウラシル、5-プロピニルシトシン、5-アミノメチルウラシル、5-ヒドロキシメチルウラシル、5-アミノメチルシトシン、5-ヒドロキシメチルシトシン、Super T)、7-デアザグアニン、7-デアザアデニン、7-アザ-2,6-ジアミノプリン、8-アザ-7-デアザグアニン、8-アザ-7-デアザアデニン、8-アザ-7-デアザ-2,6-ジアミノプリン、Super G、Super AおよびN4-エチルシトシンまたはその誘導体;N-シクロペンチルグアニン(cPent-G)、N-シクロペンチル-2-アミノプリン(cPent-AP)およびN-プロピル-2-アミノプリン(Pr-AP)、プソイドウラシルまたはその誘導体;ならびに2,6-ジフルオロトルエンのような縮重塩基もしくはユニバーサル塩基または脱塩基部位のような非存在塩基(例えば、1-デオキシリボース、1,2-ジデオキシリボース、1-デオキシ-2-O-メチルリボース;または環酸素が窒素に置き換わっているピロリジン誘導体(アザリボース))が挙げられる。Super A、Super GおよびSuper Tの誘導体の例は、全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第6,683,173号(Epoch Biosciences社)にみることができる。cPent-G、cPent-APおよびPr-APは、siRNAに組み込むと免疫刺激効果が低下することが示されている(Peacock H.et al.,J.Am.Chem.Soc.2011,133,9200)。プソイドウラシルは、通常のNグリコシドではなくウリジンのようにCグリコシドを有する天然に存在する異性化型のウラシルである。プソイドウリジンを含有する合成mRNAは、ウリジンを含有するmPvNAと比較して改善された安全性プロファイルを有し得る(全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第2009127230号)。
ある特定の核酸塩基は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの結合親和性を増大させるのに特に有用である。このようなものとしては、2-アミノプロピルアデニン、5-プロピニルウラシルならびに5-プロピニルシトシンを含めた5-置換ピリミジン、6-アザピリミジンならびにN-2、N-6およびO-6置換プリンが挙げられる。5-メチルシトシン置換は、核酸二本鎖の安定性を0.6~1.2℃増大させることが示されており、現時点で好ましい、さらにより具体的には2’-O-メトキシエチル糖修飾と組み合わせると好ましい塩基置換である。さらなる例示的な修飾核酸塩基としては、核酸塩基の少なくとも1個の水素原子がフッ素に置き換わったものが挙げられる。
11.アンチセンスオリゴマーコンジュゲートの薬学的に許容される塩
本明細書に記載されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの特定の実施形態は、アミノまたはアルキルアミノなどの塩基性官能基を含み得るものであり、したがって、薬学的に許容される酸とともに薬学的に許容される塩を形成することができる。これに関して、「薬学的に許容される塩」という用語は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの比較的無毒性の無機または有機酸付加塩を指す。これらの塩は、投与媒体または剤形の製造工程の現場で調製するか、別途、精製した遊離塩基形態の本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートと適切な有機酸または無機酸とを反応させ、このようにして形成された塩をのち精製過程で分離することにより調製することができる。代表的な塩としては、臭化水素酸塩、塩酸塩、硫酸塩、硫酸水素塩、リン酸塩、硝酸塩、酢酸塩、吉草酸塩、オレイン酸塩、パルミチン酸塩、ステアリン酸塩、ラウリン酸塩、安息香酸塩、乳酸塩、トシル酸塩、クエン酸塩、マレイン酸塩、フマル酸塩、コハク酸塩、酒石酸塩、ナフチル酸塩、メシル酸塩、グルコヘプトン酸塩、ラクトビオン酸塩およびラウリルスルホン酸塩などが挙げられる。(例えば、Berge et al.,(1977)「Pharmaceutical Salts」、J.Pharm.Sci.66:1-19を参照されたい)。
対象アンチセンスオリゴマーコンジュゲートの薬学的に許容される塩としては、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートの従来の無毒性塩または第四級アンモニウム塩、例えば無毒性の有機酸または無機酸由来の塩が挙げられる。例えば、このような従来の無毒性塩としては、無機酸、例えば塩酸、臭化水素酸、硫酸、スルファミン酸、リン酸、硝酸などに由来する塩;および有機酸、例えば酢酸、プロピオン酸、コハク酸、グリコール酸、ステアリン酸、乳酸、リンゴ酸、酒石酸、クエン酸、アスコルビン酸、パルミチン酸、マレイン酸、ヒドロキシマレイン酸、フェニル酢酸、グルタミン酸、安息香酸、サリチル酸、スルファニル酸、2-アセトキシ安息香酸、フマル酸、トルエンスルホン酸、メタンスルホン酸、エタンジスルホン酸、シュウ酸、イソチオン酸などから調製される塩が挙げられる。
ある特定の実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、1つまたは複数の酸性官能基を含み得るものであり、したがって、薬学的に許容される塩基とともに薬学的に許容される塩を形成することができる。この場合、「薬学的に許容される塩」という用語は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの比較的無毒性の無機および有機塩基付加塩を指す。これらの塩も同様に、投与媒体または剤形の製造工程の現場で調製するか、別途、精製した遊離酸形態のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを、適切な塩基、例えば薬学的に許容される金属陽イオンの水酸化物、炭酸塩または炭酸水素塩と、アンモニアと、または薬学的に許容される有機第一級、第二級または第三級アミンと反応させることにより調製することができる。代表的なアルカリ塩またはアルカリ土類塩としては、リチウム塩、ナトリウム塩、カリウム塩、カルシウム塩、マグネシウム塩およびアルミニウム塩などが挙げられる。塩基付加塩の形成に有用な代表的な有機アミンとしては、エチルアミン、ジエチルアミン、エチレンジアミン、エタノールアミン、ジエタノールアミン、ピペラジンなどが挙げられる。(例えば、Berge et al.,上記を参照されたい)。
III.製剤および投与様式
ある特定の実施形態では、本開示は、本明細書に記載されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの治療的送達に適した製剤または医薬組成物を提供する。したがって、ある特定の実施形態では、本開示は、治療有効量の1つまたは複数の本明細書に記載されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを含み、1つもしくは複数の薬学的に許容される担体(添加剤)および/または希釈剤とともに製剤化された薬学的に許容される組成物を提供する。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを単独で投与することも可能であるが、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを医薬製剤(組成物)として投与するのが好ましい。一実施形態では、製剤のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(III)によるものである。
本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートに適用することができる核酸分子の送達方法については、例えば、Akhtar et al.,1992,Trends Cell Bio.,2:139;Delivery Strategies for Antisense Oligonucleotide Therapeutics,編,Akhtar 1995, CRC Press;およびSullivan et al.,国際公開第94/02595号に記載されている。これらおよびその他のプロトコルを本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを含めた実質的に任意の核酸分子の送達に用いることができる。
本開示の医薬組成物は特に、以下のものに適合したものを含めた固体または液体形態で投与するよう製剤化され得る:(1)経口投与、例えば、水薬(水溶液もしくは非水溶液または懸濁液)、錠剤(バッカル、舌下または全身吸収を目的とするもの)、巨丸剤、散剤、顆粒剤、舌に塗布するパスタ剤;(2)例えば、例えば無菌溶液もしくは懸濁液として皮下、筋肉内、静脈内もしくは硬膜外注射または徐放性製剤による非経口投与;(3)例えば、皮膚に塗布するクリーム、軟膏または放出制御貼付剤もしくはスプレーとしての局所適用;(4)例えば、ペッサリー、クリーム、または泡として膣内または直腸内;(5)舌下;(6)眼球;(7)経皮;あるいは(8)経鼻。
薬学的に許容される担体としての役割を果たし得る材料の一部の例としては、非限定的に:(1)ラクトース、グルコースおよびスクロースなどの糖;(2)コーンスターチおよびバレイショデンプンなどのデンプン;(3)カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース、および酢酸セルロースなどのセルロースおよびその誘導体;(4)トラガント末;(5)麦芽;(6)ゼラチン;(7)タルク;(8)カカオ脂および坐剤ワックスなどの補形剤;(9)ラッカセイ油、綿実油、ベニバナ油、ゴマ油、オリーブ油、トウモロコシ油、およびダイズ油などの油;(10)プロピレングリコールなどのグリコール;(11)グリセリン、ソルビトール、マンニトール、およびポリエチレングリコールなどのポリオール;(12)オレイン酸エチルおよびラウリン酸エチルなどのエステル;(13)寒天;(14)水酸化マグネシウムおよび水酸化アルミニウムなどの緩衝剤;(15)アルギン酸;(16)無発熱物質水;(17)等張食塩水;(18)リンガー溶液;(19)エチルアルコール;(20)pH緩衝溶液;(21)ポリエステル、ポリカルボナート、および/またはポリ酸無水物;ならびに(22)医薬製剤に用いられるその他の無毒性で適合性のある物質が挙げられる。
本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートとの製剤化に適した剤のほかの非限定的な例としては:薬物が様々な組織の中に侵入するのを促進することができるPEGコンジュゲート核酸;リン脂質コンジュゲート核酸;親油性部分を含む核酸;ホスホロチオアート;P糖タンパク質阻害剤(プルロニックP85など);生分解性ポリマー、例えば埋込み後に徐放送達させるためのポリ(D,L-ラクチド-コグリコリド)マイクロスフェア(Emerich,D F et al.,1999,Cell Transplant,8,47-58)(Alkermes社、ケンブリッジ、マサチューセッツ州)など;および薬物を血液脳関門を横断して送達することができ、ニューロンによる取込み機序を変化させることができる充填ナノ粒子、例えばポリブチルシアノアクリラート製のもの(Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry,23,941-949,1999)などが挙げられる。
本開示は、ポリ(エチレングリコール)(「PEG」)脂質を含有する表面修飾リポソーム(PEG修飾、分岐鎖状および非分岐鎖状もしくはその組合せまたは長時間循環リポソーあるいはステルスリポソーム)を含む組成物の使用も特徴とする。本開示のオリゴマーコンジュゲートは、共有結合した様々な分子量のPEG分子も含み得る。これらの製剤は、標的組織への薬物の蓄積を増大させる方法となる。このクラスの薬物担体は、オプソニン化および単核食細胞系(MPSまたはRES)による除去に耐性を示し、それにより封入薬物の血中循環時間を延ばし組織への曝露を増大させる(Lasic et al.,Chem.Rev.1995,95,2601-2627;Ishiwata et al.,Chem.Pharm.Bull.1995,43,1005-1011)。このようなリポソームは、推測ではあるが、血管新生した標的組織での血管外漏出および捕捉により、腫瘍に選択的に蓄積することが示されている(Lasic et al.,Science 1995,267,1275-1276;Oku et al.,1995,Biochim.Biophys.Acta,1238,86-90)。長時間循環リポソームは、特にMPSの組織に蓄積することが知られている従来のカチオン性リポソームと比較して、DNAおよびRNAの薬物動態および薬力学を増強する(Liu et al.,J.Biol.Chem.1995,42,24864-24870;Choi et al.,国際公開第96/10391号;Ansell et al.,国際公開第96/10390号;Holland et al.,国際公開第96/10392号)。長時間循環リポソームは、それが肝臓および脾臓などの代謝活動が盛んなMPS組織への蓄積を回避することが可能であることに基づけば、薬物をヌクレアーゼ分解から保護する作用がカチオン性リポソームより強いという可能性も考えられる。
さらなる実施形態では、本開示は、米国特許第6,692,911号;同第7,163,695号;および同第7,070,807号に記載される送達に合わせて調製したアンチセンスオリゴマーコンジュゲート医薬組成物を含む。この点に関して、一実施形態では、本開示は、リジンとヒスチジンのコポリマー(HK)(米国特許第7,163,695号;同第7,070,807号;および同第6,692,911号に記載されている)を単独で、またはPEG(例えば、分岐鎖もしくは非分岐鎖PEGまたはその両方の混合物)と組み合わせて、PEGおよび標的化部分と組み合わせて、あるいは架橋剤と組み合わせた上記のいずれかのものを含む、組成物の形で本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、グルコン酸修飾ポリヒスチジンまたはグルコニル化ポリヒスチジン/トランスフェリン-ポリリジンを含む医薬組成物の形でアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを提供する。当業者には、組成物内でHisおよびLysと特性が類似したアミノ酸に置換し得ることも認識されよう。
湿潤剤、乳化剤および滑沢剤、例えばラウリル硫酸ナトリウムおよびステアリン酸マグネシウムなどならびに着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味剤、香味剤および着香剤、保存剤、および抗酸化剤が組成物中に存在してもよい。
薬学的に許容される抗酸化剤の例としては:(1)水溶性抗酸化剤、例えばアスコルビン酸、塩酸システイン、硫酸水素ナトリウム、二亜硫酸ナトリウム、亜硫酸ナトリウムなど;(2)油溶性抗酸化剤、例えばパルミチン酸アスコルビル、ブチル化ヒドロキシアニソール(BHA)、ブチル化ヒドロキシトルエン(BHT)、レシチン、没食子酸プロピル、アルファトコフェロールなど;および(3)金属キレート剤、例えばクエン酸、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ソルビトール、酒石酸、リン酸などが挙げられる。
本開示の製剤は、経口投与,経鼻投与,局所(バッカルおよび舌下を含む)投与,経直腸投与,経膣投与および/または非経口投与に適した製剤を含む。製剤は、単位投与剤形で提供するのが好都合であり得、薬学分野で周知の任意の方法により調製され得る。担体材料と組み合わせて単一剤形を作製することができる有効成分の量は、治療する対象、および具体的な投与様式に応じて異なるものとなり得る。担体材料と組み合わせて単一剤形を作製することができる有効成分の量は一般に、治療効果が得られる有効成分の量となる。この量は一般に、約0.1パーセント~約99パーセントの有効成分、好ましくは約5パーセント~約70パーセント、最も好ましくは約10パーセント~約30パーセントの範囲となる。
ある特定の実施形態では、本開示の製剤は、シクロデキストリン、セルロース、リポソーム、ミセル形成剤、例えば、胆汁酸およびポリマー担体、例えばポリエステルおよびポリ酸無水物から選択される補形剤と;本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートとを含む。一実施形態では、製剤のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(III)によるものである。ある特定の実施形態では、上記の製剤は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを経口的に生体利用可能にするものである。
これらの製剤および医薬組成物を調製する方法は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートと、担体および必要に応じて1つまたは複数の補助成分とを組み合わせる段階を含む。製剤は一般に、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートと、液体担体もしくは微粉化した固体担体またはその両方とを均一かつ密に組み合せ、次いで必要に応じて製品を成形することにより調製される。
経口投与に適した本開示の製剤は、カプセル剤、カシェ剤、丸剤、錠剤、トローチ剤(風味を付けた基剤、通常はスクロースおよびアラビアゴムもしくはトラガントを用いるもの)、散剤、顆粒剤の形態、または水性液体もしくは非水性液体を用いた液剤もしくは懸濁剤、または水中油型もしくは懸濁液油中水型液体エマルション、またはエリキシル剤もしくはシロップ剤、または香錠剤(ゼラチンとグリセリンもしくはスクロースとアラビアゴムなどの不活性な基剤を用いるもの)および/または洗口剤などであり得、それぞれ有効成分として所定量の本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを含有する。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを巨丸剤、舐剤またはパスタ剤として投与してもよい。
経口投与用の本開示の固形剤形(カプセル剤、錠剤、丸剤、糖衣錠剤、散剤、顆粒剤、トラウチ(trouch)など)では、有効成分をクエン酸ナトリウムもしくは第二リン酸カルシウムなどの1つもしくは複数の薬学的に許容される担体および/または以下のうちいずれかのもの:(1)充填剤または増量剤、例えばデンプン、ラクトース、スクロース、グルコース、マンニトールおよび/またはケイ酸など;(2)結合剤、例えば、カルボキシメチルセルロース、アルギネート、ゼラチン、ポリビニルピロリドン、スクロースおよび/またはアラビアゴムなど;(3)グリセロールなどの保湿剤;(4)崩壊剤、例えば寒天、炭酸カルシウム、ジャガイモまたはタピオカデンプン、アルギン酸、特定のケイ酸塩および炭酸ナトリウムなど;(5)パラフィンなどの溶解遅延剤;(6)吸収促進剤、例えば第四級アンモニウム化合物ならびにポロキサマーおよびラウリル硫酸ナトリウムなどの界面活性剤;(7)湿潤剤、例えば、セチルアルコール、グリセロールモノステアラートおよび非イオン界面活性剤など;(8)カオリンおよびベントナイト粘土などの吸着剤;(9)滑沢剤、例えばタルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固形ポリエチレングリコール、ラウリル硫酸ナトリウム、ステアリン酸亜鉛、ステアリン酸ナトリウム、ステアリン酸およびその混合物など;(10)着色剤;ならびに(11)クロスポビドンまたはエチルセルロースなどの放出制御剤と混合し得る。カプセル剤、錠剤および丸剤の場合、医薬組成物は緩衝剤も含み得る。同様のタイプの固形医薬組成物をラクトースまたは乳糖などの補形剤および高分子ポリエチレングリコールなどを用いた軟殻および硬殻ゼラチンカプセル剤に充填剤として用いてもよい。
錠剤は、必要に応じて1つまたは複数の補助成分とともに圧縮または成形することにより作製され得る。圧縮錠剤は、結合剤(例えば、ゼラチンまたはヒドロキシプロピルメチルセルロース)、滑沢剤、不活性希釈剤、保存剤、崩壊剤(例えば、デンプングリコール酸ナトリウムまたは架橋カルボキシメチルセルロースナトリウム)、界面活性剤または分散剤を用いて調製され得る。成形錠剤は、粉末化し不活性な液体希釈剤で湿潤させた化合物の混合物を適切な機械で成形することにより作製され得る。
本開示の医薬組成物の錠剤およびその他の固形剤形、例えば糖衣錠剤、カプセル剤、丸剤および顆粒剤などは、必要に応じて、割線を入れる、またはコーティング剤およびシェル、例えば医薬製剤技術分野で周知の腸溶性コーティング剤およびその他のコーティング剤などを用いて製剤化してよい。それらは、例えば、所望の放出プロファイルが得られる様々な割合のヒドロキシプロピルメチルセルロース、その他のポリマーマトリックス、リポソームおよび/またはマイクロスフェアを用いて、その中の有効成分の徐放または制御放出がもたらされるよう調製してもよい。それらは、速放されるよう製剤化する、例えば凍結乾燥させてよい。それらは、例えば、細菌保持フィルターでろ過することにより、または使用直前に滅菌水もしくは何らかの他の無菌注射媒体に溶かすことができる無菌固形医薬組成物の形態に滅菌剤を組み込むことにより、滅菌してよい。これらの医薬組成物は、必要に応じて乳白剤を含有してもよく、また有効成分(1つまたは複数)を、必要に応じて遅延させ、消化管の特定の部分で単独で、または優先的に放出する組成物のものであってよい。使用することができる包埋組成物の例としては、ポリマー性物質またはロウが挙げられる。有効成分は、必要に応じて上記の1つまたは複数の補形剤を含む、マイクロカプセル化形態であってもよい。
本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの経口投与用の液体剤形としては、薬学的に許容される乳剤、マイクロエマルション剤、液剤、懸濁剤、シロップ剤およびエリキシル剤が挙げられる。液体剤形は、有効成分に加えて、当該技術分野でよく用いられる不活性希釈剤、例えば、水またはその他の溶媒、可溶化剤および乳化剤、例えばエチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、1,3-ブチレングリコール、油(特に、綿実油、ラッカセイ油、トウモロコシ油、胚芽油、オリーブ油、ヒマシ油およびゴマ油)、グリセロール、テトラヒドロフリルアルコール、ポリエチレングリコールおよびソルビタン脂肪酸エステルならびにその混合物などを含有し得る。
経口医薬組成物は、不活性希釈剤以外にも、補助剤、例えば湿潤剤、乳化剤および懸濁化剤、甘味剤、香味剤、着色剤、着香剤および保存剤なども含み得る。
懸濁剤は、活性化合物に加えて、懸濁化剤、例えば、エトキシル化イソステアリルアルコール、ポリオキシエチレンソルビトールおよびソルビタンエステル、微結晶性セルロース、メタ水酸化アルミニウム、ベントナイト、寒天およびトラガントならびにその混合物などを含有し得る。
経直腸または経膣投与用の製剤は、坐剤として提供してよく、坐剤は、1つまたは複数の本開示の化合物と、例えばカカオ脂,ポリエチレングリコール,坐剤ワックスまたはサリチラートを含む1つまたは複数の適切な無刺激性の補形剤または担体とを混合することにより調製され得るものであり、また室温では固体であるが、体温では液体であり、したがって、直腸または膣腔の中で融解して活性化合物を放出する。
本明細書に提供されるオリゴマーの局所または経皮投与用の製剤または剤形としては、散剤、スプレー剤、軟膏剤、パスタ剤、クリーム剤、ローション剤、ゲル剤、液剤、貼付剤および吸入剤が挙げられる。活性なオリゴマーコンジュゲートを薬学的に許容される担体および必要とされ得る任意の保存剤、緩衝剤または噴射剤と無菌条件下で混合し得る。軟膏剤、パスタ剤、クリーム剤およびゲル剤は、本開示の活性化合物に加えて、補形剤、例えば動物性および植物性脂肪、油、ロウ、パラフィン、デンプン、トラガント、セルロース誘導体、ポリエチレングリコール、シリコーン、ベントナイト、ケイ酸、タルクおよび酸化亜鉛またはその混合物などを含有し得る。
散剤およびスプレー剤は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートに加えて、補形剤、例えばラクトース、タルク、ケイ酸、水酸化アルミニウム、ケイ酸カルシウムおよびポリアミド粉末または上記の物質の混合物などを含有し得る。スプレー剤はさらに、通常の噴射剤、例えばクロロフルオロ炭化水素ならびにブタンおよびプロパンなどの揮発性非置換炭化水素などを含有し得る。
経皮貼付剤には、体内への本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの制御送達がもたらされるというさらなる利点がある。このような剤形は、オリゴマーを適切な媒体に溶解または分散させることにより作製することができる。吸収促進剤を用いて、皮膚を通過する薬剤の流動を増大させてもよい。このような流動速度は、当該技術分野で公知の方法のなかでも特に、速度制御膜を設けるか、ポリマーマトリックスまたはゲルに薬剤を分散させることにより制御することができる。
非経口投与に適した医薬組成物は、1つまたは複数の本開示のオリゴマーコンジュゲートと、1つあるいは複数の薬学的に許容される無菌等張水溶液もしくは非水溶液、分散液剤、懸濁剤もしくは乳剤あるいは使用直前に糖、アルコール、抗酸化剤、緩衝剤、静菌剤、製剤を目的とする受益者の血液と等張にする溶質または懸濁化剤もしくは増粘剤を含有し得る無菌注射用液剤または分散液剤に再構成され得る無菌散剤とを組み合わせて含み得る。本開示の医薬組成物に使用され得る適切な水性または非水性担体の例としては、水、エタノール、ポリオール(グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど)およびその適切な混合物、オリーブ油などの植物油ならびにオレイン酸エチルなどの注射可能な有機エステルが挙げられる。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング材料の使用により、分散液剤の場合は必要な粒子径を維持することにより、また界面活性剤の使用により維持することができる。一実施形態では、医薬組成物のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは式(III)によるものである。
これらの医薬組成物は、保存剤、湿潤剤、乳化剤および分散剤などの補助剤も含有し得る。対象オリゴマーコンジュゲートに対する微生物の作用の防止は、様々な抗菌剤および抗真菌剤、例えばパラベン、クロロブタノール、フェノール ソルビン酸(phenol sorbic acid)などを含ませることにより確保され得る。組成物中に糖、塩化ナトリウムなどの等張剤を含めるのも望ましいことであり得る。さらに、吸収を遅らせる物質、例えばモノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンなどを含ませることにより、注射用医薬形態の持続的吸収がもたらされ得る。
いくつかの場合には、薬物の効果を持続させるため、皮下または筋肉内注射からの薬物の吸収速度を低下させるのが望ましい。このことは、当該技術分野で公知の方法のなかでも特に、水への溶解性が低い結晶性または非晶質物質の液体懸濁液の使用により達成され得る。このため、薬物の吸収速度はその溶解速度に左右され、ひいては結晶の大きさおよび結晶の形態に左右され得る。あるいは、薬物を油性媒体に溶解または懸濁させることにより、非経口投与する薬物形態の遅延吸収が達成される。
注射デポ剤形態は、ポリラクチド-ポリグリコリドなどの生分解性ポリマーで対象オリゴマーコンジュゲートのマイクロ封入マトリックスを形成することにより作製され得る。ポリマーに対するオリゴマーの比および用いる具体的なポリマーの性質に応じて、オリゴマー放出速度が制御され得る。その他の生分解性ポリマーの例としては、ポリ(オルトエステル)およびポリ(酸無水物)が挙げられる。デポ剤注射製剤は、身体組織と適合性のあるリポソームまたはマイクロエマルションに薬物を封入することにより調製してもよい。
本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを医薬品としてヒトおよび動物に投与する場合、それ自体を、または薬学的に許容される担体とともにアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを例えば0.1~99%(より好ましくは10~30%)含有する医薬組成物として投与することができる。
本開示の製剤または調製物を経口的に、非経口的に、局所的にまたは直腸内に投与し得る。通常、各投与経路に適した形態でそれらを投与する。例えば、それらを錠剤もしくはカプセル形態で、注射、吸入、点眼剤、軟膏、坐剤もしくは注入により;ローションもしくは軟膏により局所的に;または坐剤により経直腸的に投与する。
選択する投与経路に関係なく、適切な水和形態で使用され得る本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートおよび/または本開示の医薬組成物は、当業者に公知の従来の方法によって薬学的に許容される剤形に製剤化され得る。本開示の医薬組成物中の有効成分の実際の投与量レベルは、具体的な患者、組成物および投与様式で、患者に対して許容されない毒性を示さずに所望の治療反応を得るのに効果的な有効成分の量になるよう変化させ得る。
選択する投与量レベルは、用いる具体的な本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはそのエステル、塩もしくはアミドの活性、投与経路、投与時間、用いる具体的なオリゴマーの排泄または代謝の速度、吸収の速度および程度、治療の持続期間、用いる具体的なオリゴマーと併用する他の薬物、化合物および/または材料、治療する患者の年齢、性別、体重、体調、全般的健康状態および以前の既往歴ならびに医学分野で周知のこれと同様の因子を含めた様々な因子に左右される。
通常の技術を有する医師または獣医師であれば、必要とされる医薬組成物の有効量を容易に決定および処方することができる。例えば、医師または獣医師が、医薬組成物に用いる本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの用量を所望の治療効果を得るのに必要なレベルより低いレベルから開始し、所望の効果が得られるまで投与量を漸増させることが考えられる。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの適切な1日量は一般に、何らかの治療効果を得るのに有効な最小用量であるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの量となる。このような有効量は一般に、本明細書に記載される因子に左右される。必要な効果を得るのに使用する場合、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの患者に対する経口、静脈内、脳室内および皮下の用量は一般に、体重1キログラム当たり1日約0.0001~約100mgの範囲となる。
いくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを一般に約10~160mg/kgまたは20~160mg/kgの用量で投与する。いくつかの場合には、160mg/kgを超える用量が必要となり得る。いくつかの実施形態では、i.v.投与の用量は約0.5mg~160mg/kgである。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを約0.5mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、3mg/kg、4mg/kg、5mg/kg、6mg/kg、7mg/kg、8mg/kg、9mg/kgまたは10mg/kgの用量で投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを間のあらゆる整数を含めた約10mg/kg、11mg/kg、12mg/kg、15mg/kg、18mg/kg、20mg/kg、21mg/kg、25mg/kg、26mg/kg、27mg/kg、28mg/kg、29mg/kg、30mg/kg、31mg/kg、32mg/kg、33mg/kg、34mg/kg、35mg/kg、36mg/kg、37mg/kg、38mg/kg、39mg/kg、40mg/kg、41mg/kg、42mg/kg、43mg/kg、44mg/kg、45mg/kg、46mg/kg、47mg/kg、48mg/kg、49mg/kg、50mg/kg、51mg/kg、52mg/kg、53mg/kg、54mg/kg、55mg/kg、56mg/kg、57mg/kg、58mg/kg、59mg/kg、60mg/kg、65mg/kg、70mg/kg、75mg/kg、80mg/kg、85mg/kg、90mg/kg、95mg/kg、100mg/kg、105mg/kg、110mg/kg、115mg/kg、120mg/kg、125mg/kg、130mg/kg、135mg/kg、140mg/kg、145mg/kg、150mg/kg、155mg/kg、160mg/kgの用量で投与する。いくつかの実施形態では、オリゴマーを10mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、オリゴマーを20mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、オリゴマーを30mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、オリゴマーを40mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、オリゴマーを60mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、オリゴマーを80mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、オリゴマーを160mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、オリゴマーを50mg/kgで投与する。
いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを一般に約10~160mg/kgまたは20~160mg/kgの用量で投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートのi.v.投与の用量は、約0.5mg~160mg/kgである。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを約0.5mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、3mg/kg、4mg/kg、5mg/kg、6mg/kg、7mg/kg、8mg/kg、9mg/kgまたは10mg/kgの用量で投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを間のすべての整数を含めた約10mg/kg、11mg/kg、12mg/kg、15mg/kg、18mg/kg、20mg/kg、21mg/kg、25mg/kg、26mg/kg、27mg/kg、28mg/kg、29mg/kg、30mg/kg、31mg/kg、32mg/kg、33mg/kg、34mg/kg、35mg/kg、36mg/kg、37mg/kg、38mg/kg、39mg/kg、40mg/kg、41mg/kg、42mg/kg、43mg/kg、44mg/kg、45mg/kg、46mg/kg、47mg/kg、48mg/kg、49mg/kg、50mg/kg、51mg/kg、52mg/kg、53mg/kg、54mg/kg、55mg/kg、56mg/kg、57mg/kg、58mg/kg、59mg/kg、60mg/kg、65mg/kg、70mg/kg、75mg/kg、80mg/kg、85mg/kg、90mg/kg、95mg/kg、100mg/kg、105mg/kg、110mg/kg、115mg/kg、120mg/kg、125mg/kg、130mg/kg、135mg/kg、140mg/kg、145mg/kg、150mg/kg、155mg/kg、160mg/kgの用量で投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを10mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを20mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを30mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを40mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを60mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを80mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを160mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、式(III)のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを50mg/kgで投与する。
必要に応じて、有効な1日量の活性化合物を必要に応じて単位剤形の形で、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはそれより多くのサブ用量として1日を通して適切な間隔を空けて別々に投与し得る。ある特定の状況下では、投与を1日1回の投与とする。ある特定の実施形態では、所望の機能性ジストロフィンタンパク質発現を維持するため、投与を必要に応じて2日毎、3日毎、4日毎、5日毎、6日毎、7日毎、8日毎、9日毎、10日毎、11日毎、12日毎、13日毎、14日毎、または、1週間毎、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、6週間毎、7週間毎、8週間毎、9週間毎、10週間毎、11週間毎、12週間毎または1か月毎、2か月毎、3か月毎、4か月毎、5か月毎、6か月毎、7か月毎、8か月毎、9か月毎、10か月毎、11か月毎、12か月毎に1回または複数回の投与とする。ある特定の実施形態では、投与を2週間毎に1回、1回または複数回の投与とする。いくつかの実施形態では、投与を2週間毎に1回、1回の投与とする。様々な実施形態では、投与を1か月ごとに1回または複数回の投与とする。ある特定の実施形態では、投与を毎月1回の投与とする。
様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週10mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週20mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週30mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週40mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週60mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週80mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週100mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎週160mg/kgで投与する。本明細書で使用される毎週は、当該技術分野で認められている毎週という意味を有するものと理解される。
様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に10mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に20mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に30mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に40mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に60mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に80mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に100mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを隔週に160mg/kgで投与する。本明細書で使用される隔週は、当該技術分野で認められている隔週という意味を有するものと理解される。
様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に10mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に20mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に30mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に40mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に60mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に80mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に100mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを3週間毎に160mg/kgで投与する。本明細書で使用される3週間毎は、当該技術分野で認められている3週間毎に1回という意味を有するものと理解される。
様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月10mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月20mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月30mg/kgで投与する。様々な実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月40mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月60mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月80mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月100mg/kgで投与する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを毎月160mg/kgで投与する。本明細書で使用される毎月は、当該技術分野で認められている毎月という意味を有するものと理解される。
当該技術分野で理解されるように、毎週、隔週、3週間毎または毎月の投与は、本明細書で論じられるとおりの、1回もしくは複数回の投与または1つもしくは複数のサブ用量のものであり得る。
本明細書に記載される核酸分子およびアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、特に限定されないが、リポソームへの封入を含めた当業者に周知の様々な方法により、イオン導入法により、またはヒドロゲル、シクロデキストリン、生分解性ナノカプセルおよび生体接着マイクロスフェアなどの本明細書に記載されるおよび当該技術分野で公知の他の媒体への組込みにより細胞に投与することができる。ある特定の実施形態では、マイクロエマルション化技術を用いて親油性(不水溶性)医薬品のバイオアベイラビリティを改善し得る。例としては、Trimetrine(Dordunoo,S.K.et al.,Drug Development and Industrial Pharmacy,17(12),1685-1713,1991)およびREV5901(Sheen,P.C.et al.,J Pharm Sci 80(7),712-714,1991)が挙げられる。有益性のなかでも特に、マイクロエマルション化は、循環系の代わりにリンパ系に優先的に吸収させ、それにより肝臓を迂回し、肝胆道循環中での化合物の破壊を防ぐことによりバイオアベイラビリティを増大させる。
本開示の一態様では、製剤は、本明細書に提供されるオリゴマーと少なくとも1つの両親媒性担体とから形成されるミセルを含有し、このミセルは平均直径が約100nm未満である。より好ましい実施形態では、平均直径が約50nm未満のミセルが提供され、さらにより好ましい実施形態では、平均直径が約30nm未満または場合によっては約20nm未満のミセルが提供される。
あらゆる適切な両親媒性担体が企図されるが、現時点で好ましい担体は一般に、Generally-Recognized-as-Safe(GRAS)ステータスを有し、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを可溶化するとともに、のちの段階で溶液が複合水相(ヒトの胃腸管にみられるものなど)と接触するときにアンチセンスオリゴマーコンジュゲートをマイクロエマルション化するものである。これらの必要条件を満たす両親媒性成分は通常、HLB(親水性と親油性のバランス)値が2~20であり、その構造にはC-6~C-20の範囲内の直鎖脂肪族ラジカルが含まれている。例として、ポリエチレングリコール化脂肪グリセリドおよびポリエチレングリコールがある。
両親媒性担体の例としては、飽和および単不飽和ポリエチレングリコール化脂肪酸グリセリド、例えば完全水素化または部分水素化された様々な植物油から得られるものなどが挙げられる。このような油は、トリ脂肪酸グリセリド、ジ脂肪酸グリセリドおよびモノ脂肪酸グリセリドと、対応する脂肪酸のジポリ(エチレングリコール)エステルおよびモノポリ(エチレングリコール)エステルとからなり、カプリン酸4~10%、カプリン酸3~9%、ラウリン酸40~50%、ミリスチン酸14~24%、パルミチン酸4~14%およびステアリン酸5~15%を含む特に好ましい脂肪酸組成を有する点で有利であり得る。また別の有用なクラスの両親媒性担体としては、飽和または単不飽和脂肪酸との部分エステル化ソルビタンおよび/またはソルビトール(SPANシリーズ)またはこれに相当するエトキシ化類似体(TWEENシリーズ)が挙げられる。
Gelucireシリーズ、Labrafil、LabrasolまたはLauroglycol(いずれもフランス、サン=プリエストのGattefosse社が製造および流通を行っている)、PEG-モノ-オレアート、PEG-ジ-オレアート、PEG-モノ-ラウラートおよびジ-ラウラート、レシチン、ポリソルベート80など(米国および世界にある多数の会社が製造および流通を行っている)を含めた市販の両親媒性担体が特に有用であり得る。
ある特定の実施形態では、本開示の医薬組成物を適切な宿主細胞に導入するため、リポソーム、ナノカプセル、微粒子、マイクロスフェア、脂質粒子、小胞などの使用による送達を実施し得る。具体的には、本開示の医薬組成物を送達するため、これを脂質粒子、リポソーム、小胞、ナノスフェア、ナノ粒子などのいずれかに封入して製剤化し得る。製剤化およびそのような送達媒体の使用は、既知の従来技術を用いて実施することができる。
本開示での使用に適した親水性ポリマーは、易水溶性であり、小胞を形成する脂質と共有結合することができ、毒性作用がなくin vivoでの耐容性がある(すなわち、生体適合性である)ものである。適切なポリマーとしては、ポリ(エチレングリコール)(PEG)、ポリ乳酸(ポリラクチドとも呼ばれる)、ポリグリコール酸(ポリグリコリドとも呼ばれる)、ポリ乳酸-ポリグリコール酸コポリマーおよびポリビニルアルコールが挙げられる。ある特定の実施形態では、ポリマーは、約100もしくは120ダルトンから約5,000もしくは10,000ダルトンまで、または約300ダルトン~約5,000ダルトンの重量平均分子量を有する。他の実施形態では、ポリマーは、約100~約5,000ダルトンの重量平均分子量を有するか、約300~約5,000ダルトンの重量平均分子量を有するポリ(エチレングリコール)である。ある特定の実施形態では、ポリマーは約750ダルトンの重量平均分子量を有するポリ(エチレングリコール)、例えばPEG(750)である。ポリマーは、その中に含まれるモノマーの数によっても定義され得るものであり;本開示の好ましい実施形態では、少なくとも約3つのモノマーからなるポリマーを用い、このような3つのモノマーからなるPEGポリマーは、約132ダルトンの分子量を有する。
本開示での使用に適し得るその他の親水性ポリマーとしては、ポリビニルピロリドン、ポリメトキサゾリン、ポリエチルオキサゾリン、ポリヒドロキシプロピルメタクリルアミド、ポリメタクリルアミド、ポリジメチルアクリルアミドおよびヒドロキシメチルセルロースまたはヒドロキシエチルセルロースなどの誘導体化セルロースが挙げられる。
ある特定の実施形態では、本開示の製剤は、ポリアミド、ポリカルボナート、ポリアルキレン、アクリル酸およびメタクリル酸エステルのポリマー、ポリビニルポリマー、ポリグリコリド、ポリシロキサン、ポリウレタンおよびそのコ-ポリマー、セルロース、ポリプロピレン、ポリエチレン、ポリスチレン、乳酸およびグリコール酸のポリマー、ポリ酸無水物、ポリ(オルト)エステル、ポリ(酪酸)、ポリ(吉草酸)、ポリ(ラクチド-コ-カプロラクトン)、多糖、タンパク質、ポリヒアルロン酸、ポリシアノアクリラートならびにその配合物、混合物またはコポリマーからなる群より選択される生体適合性ポリマーを含む。
シクロデキストリンは、6個、7個または8個のグルコース単位からなり、それぞれα、βまたはγのギリシャ文字で命名される環状オリゴ糖である。グルコース単位はα-1,4-グルコシド結合によって結合している。糖単位がいす形配座であるため、(C-2、C-3の)第二級ヒドロキシル基がいずれも環の一方に位置し、C-6の第一級ヒドロキシル基がいずれも他方に位置している。その結果、外面が親水性となり、それによりシクロデキストリンが水溶性となる。これとは対照的に、シクロデキストリンの空洞は、C-3およびC-5原子の水素およびエーテル様酸素に覆われているため疎水性となる。これらのマトリックスにより、例えば17α-エストラジオールなどのステロイド化合物を含めた相対的に疎水性が強い様々な化合物との錯体形成が可能となる(例えば、van Uden et al.,Plant Cell Tiss.Org.Cult.38:1-3-113(1994)を参照されたい)。錯体形成はファンデルワールス相互作用および水素結合形成によって起こる。シクロデキストリンの化学的性質に関する概説についてはWenz,Agnew.Chem.Int.Ed.Engl.,33:803-822(1994)を参照されたい。
シクロデキストリン誘導体の物理化学的特性はその種類および置換度に大きく左右される。例えば、それらの水への溶解性は不溶性(例えば、トリアセチル-ベータ-シクロデキストリン)~147%の可溶性(w/v)(G-2-ベータ-シクロデキストリン)の範囲内にある。さらに、それらは多数の有機溶媒に可溶性である。このシクロデキストリンの特性は、その溶解性を増大または低下させることにより様々な製剤成分の溶解性を制御することを可能にする。
シクロデキストリンおよびその調製方法が多数記載されている。例えば、Parmeter(I)et al.(米国特許第3,453,259号)およびGramera et al.(米国特許第3,459,731号)は電気的に中性のシクロデキストリンについて記載している。その他の誘導体としては、カチオン特性を有するシクロデキストリン[Parmeter(II),米国特許第3,453,257号]、不溶性架橋シクロデキストリン(Solms,米国特許第3,420,788号)およびアニオン特性を有するシクロデキストリン[Parmeter(III),米国特許第3,426,011号]が挙げられる。アニオン特性を有するシクロデキストリン誘導体には、親シクロデキストリンにカルボン酸、亜リン酸、亜ホスフィン酸、ホスホン酸、リン酸、チオホスホン酸、チオスルフィン酸およびスルホン酸を付加したものがある[Parmeter(III)、上記を参照されたい]。さらに、スルホアルキルエーテルシクロデキストリン誘導体がStella et al.により記載されている(米国特許第5,134,127号)。
リポソームは、水性内部区画を取り囲む少なくとも1つの脂質二重層膜からなるものである。リポソームは膜のタイプおよび大きさにより特徴付けられ得る。小さい一枚膜小胞(SUV)は、単一の膜を有し、通常、直径が0.02~0.05μmの範囲内にあるものであり;大きい一枚膜小胞(LUV)は通常、0.05μmより大きいものである。オリゴラメラの大きい小胞および多重膜小胞は、通常は同心円状の膜層を複数有し、通常、0.1μmより大きい。同心円状でない複数の膜を有するリポソーム、すなわち、大きい小胞の中にそれより小さい複数の小胞が含まれたものを多胞小胞と呼ぶ。
本開示の一態様は、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを含有するリポソームを含み、運搬能が増大したリポソームが得られるようリポソーム膜が製剤化された製剤に関する。これに代えて、または加えて、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートをリポソームのリポソーム二重膜の中に含ませても、リポソーム二重膜上に吸着されてもよい。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを脂質界面活性剤で凝集させ、リポソームの内部空間内に運搬してもよく;このような場合、活性薬剤-界面活性剤凝集体の破壊作用に耐性を示すようリポソーム膜を製剤化する。
本開示の一実施形態では、PEG鎖が脂質二重層の内表面からリポソームに取り囲まれた内部空間内に伸長し、脂質二重層の外側から周囲環境内に伸長するように、リポソームの脂質二重層の中にポリ(エチレングリコール)(PEG)で誘導体化された脂質が含まれている。
本開示のリポソーム内に含まれている活性薬剤は可溶化形態である。界面活性剤と活性薬剤の凝集体(目的の活性薬剤が含まれたエマルションまたはミセルなど)が本開示によるリポソームの内部空間内に封入され得る。界面活性剤は、活性薬剤を分散および可溶化させる作用を示し、特に限定されないが様々な鎖長(例えば、約C14~約C20)の生体適合性リゾホスファチジルコリン(LPG)を含めた任意の適切な脂肪族、脂環式または芳香族界面活性剤から選択され得る。PEG脂質などのポリマー誘導体化脂質は、それがミセル/膜融合を阻害する作用を示し、界面活性剤分子へのポリマー付加が界面活性剤のCMCを低下させミセル形成を促進することから、ミセル形成にも使用し得る。好ましいのはマイクロモルの範囲内のCMOを有する界面活性剤であるが、これよりCMCが高い界面活性剤を用いて、本開示のリポソーム内に封入されたミセルを調製してもよい。
本開示によるリポソームは、当該技術分野で公知の様々な技術のいずれかにより調製され得る。例えば、米国特許第4,235,871号;国際公開第96/14057号;New RRC,Liposomes:A practical approach,IRL Press,Oxford(1990),pages 33-104;およびLasic DD,Liposomes from physics to applications,Elsevier Science Publishers BV,Amsterdam,1993を参照されたい。例えば、本開示のリポソームは、予め形成したリポソームを脂質グラフトポリマーからなるミセルに曝露することなどにより、親水性ポリマーで誘導体化した脂質をリポソームに望まれる誘導体化脂質の最終モルパーセントに相当する脂質濃度で、予め形成したリポソーム内に分散させることにより調製され得る。親水性ポリマーを含有するリポソームは、当該技術分野で公知のホモジナイゼーション技術、脂質領域水和技術または押出し技術により形成することもできる。
また別の例示的製剤方法では、最初に、活性薬剤を超音波処理により、疎水性分子を容易に可溶化するリゾホスファチジルコリンまたはその他の低CMC界面活性剤(ポリマーグラフト脂質を含む)に分散させる。次いで、得られた活性薬剤のミセル懸濁液を用いて、適切なモルパーセントのポリマーグラフト脂質またはコレステロールを含有する乾燥脂質試料を再水和する。次いで、当該技術分野で公知の押出し技術を用いて脂質と活性薬剤の懸濁液をリポソームにし、得られたリポソームを標準的なカラム分離により未封入溶液から分離する。
本開示の一態様では、選択した大きさの範囲内の実質的に均一な大きさになるようリポソームを調製する。ある有効なサイズ決定方法では、リポソームの水性懸濁液を選択した均一な細孔径を有する一連のポリカルボナート膜に通して押し出し;膜の細孔径は、その膜に通して押し出すことによって得られるリポソームの最大に大きさにほぼ相当する。例えば、米国特許第4,737,323号(1988年4月12日)を参照されたい。ある特定の実施形態では、DharmaFECT(登録商標)およびLipofectamine(登録商標)などの試薬を用いてポリヌクレオチドまたはタンパク質を細胞内に導入し得る。
本開示の製剤の放出特性は、封入材料、封入薬物の濃度および放出調節剤の存在に左右される。例えば、例えば胃内のような低pHまたは腸内のような高pHでのみ放出するpH感受性コーティング剤を用いて、放出をpH依存性になるよう操作することができる。腸溶性コーティング剤を用いて、胃を通過するまで放出が起こらないようにすることができる。複数のコーティング剤または様々な材料に封入したシアナミドの混合物を用いて、最初に胃内で放出させたのち、腸内で放出させることができる。水の取込みまたはカプセルからの拡散による薬物の放出を増大させることができる塩または細孔形成剤を含ませることによって放出を操作することもできる。薬物の溶解性を調節する補形剤を用いて放出速度を制御することもできる。マトリックスの分解またはマトリックスからの放出を促進する剤を組み込むこともできる。これらは化合物に応じて、薬物に添加することも、分離相として(すなわち、微粒子として)添加することも、あるいはポリマー相に共溶解させることもできる。ほとんどの場合、その量は0.1~30パーセント(w/wポリマー)にするべきである。分解促進剤のタイプとしては、硫酸アンモニウムおよび塩化アンモニウムなどの無機塩、クエン酸、安息香酸およびアスコルビン酸などの有機酸、炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、炭酸カルシウム、炭酸亜鉛および水酸化亜鉛などの無機塩基、ならびに、硫酸プロタミン、スペルミン、コリン、エタノールアミン、ジエタノールアミンおよびトリエタノールアミンなどの有機塩基ならびにTween(登録商標)およびPluronic(登録商標)などの界面活性剤が挙げられる。マトリックス(すなわち、無機塩および糖などの水溶性化合物)に微細構造を与える細孔形成剤を微粒子として添加する。その範囲は通常、1~30パーセント(w/wポリマー)である。
粒子の消化管内での滞留時間を変化させることにより取込みを操作することもできる。これは例えば、粒子を粘膜付着性ポリマーでコーティングするか、封入材料に粘膜付着性ポリマーを選択することにより達成することができる。例としては、遊離カルボキシル基を有する大部分のポリマー、例えばキトサン、セルロース、特にポリアクリラート(本明細書で使用されるポリアクリラートは、アクリラート基ならびにシアノアクリラートおよびメタクリラートなどの修飾アクリラート基を含めたポリマーを指す)などが挙げられる。
アンチセンスオリゴマーコンジュゲートを外科もしくは医療デバイスまたは埋植物の中に収まるよう製剤化する、あるいは外科もしくは医療デバイスまたは埋植物により放出されるよう適合させ得る。ある特定の態様では、埋植物をアンチセンスオリゴマーコンジュゲートでコーティングするか、別の方法によりアンチセンスオリゴマーコンジュゲートで処理し得る。例えば、ヒドロゲルまたはその他のポリマー、例えば生体適合性ポリマーおよび/または生分解性ポリマーなどを用いて、埋植物を本開示の医薬組成物でコーティングし得る(すなわち、ヒドロゲルまたはその他のポリマーを用いることにより、組成物を医療デバイスでの使用に適合させ得る)。医療デバイスを薬剤でコーティングするためのポリマーおよびコポリマーは当該技術分野で周知である。埋植物の例としては、特に限定されないが、ステント、薬物溶出ステント、縫合糸、人工器官、血管カテーテル、透析カテーテル、血管移植、人工心臓弁、心ペースメーカー、植込み型除細動器、IV針、ピン、スクリュー、プレートなどの骨の固定および形成のためのデバイスならびに創傷治癒のためのその他のデバイスおよび人工組織マトリックスが挙げられる。
本明細書に提供される方法に加えて、本開示に従って使用するアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを他の医薬品と同様に人間医学または獣医学に使用するのに好都合な任意の方法で投与するよう製剤化し得る。アンチセンスオリゴマーコンジュゲートおよびその対応する製剤を単独で、または筋ジストロフィー治療の他の治療戦略、例えば筋芽細胞移植、幹細胞療法、アミノグリコシド系抗生物質の投与、プロテアソーム阻害剤およびアップレギュレーション療法(例えば、ジストロフィンの常染色体パラログであるユートロフィンのアップレギュレーション)などと組み合わせて投与し得る。
いくつかの実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの投与の前に、それと同時に、またはその後に追加の治療薬を投与し得る。例えば、アンチセンスオリゴマーコンジュゲートをステロイドおよび/または抗生物質と組み合わせて投与し得る。ある特定の実施形態では、バックグランドステロイド療法(例えば、間欠的または長期的/継続的バックグランドステロイド療法)を受けている患者にアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを投与する。例えば、いくつかの実施形態では、患者は、アンチセンスオリゴマーの投与の前に副腎皮質ステロイドによる治療を受けており、そのステロイド治療を受け続ける。いくつかの実施形態では、ステロイドはグルココルチコイドまたはプレドニゾンである。
当業者であれば任意の特定の動物および病態に対して最適な投与経路および任意の投与量を容易に決定することが可能であるため、記載した投与経路は単なる指針に過ぎない。機能性の遺伝物質をin vitroおよびin vivoで細胞内に新たに導入する方法が複数試みられている(Friedmann(1989)Science,244:1275-1280)。これらの方法には、発現させる遺伝子を改変レトロウイルス内に組み込むこと(Friedmann(1989)上記;Rosenberg(1991)Cancer Research 51(18),suppl.:5074S-5079S);非レトロウイルスベクター(例えば、アデノ随伴ウイルスベクター)への組込み(Rosenfeld et al.(1992)Cell,68:143-155;Rosenfeld et al.(1991)Science,252:431-434);または異種プロモーター-エンハンサーエレメントと連結した導入遺伝子をリポソームにより送達すること(Friedmann(1989),上記;Brigham et al.(1989)Am.J.Med.Sci.,298:278-281;Nabel et al.(1990)Science,249:1285-1288;Hazinski et al.(1991)Am.J.Resp.Cell Molec.Biol.,4:206-209;ならびにWangおよびHuang(1987)Proc.Natl.Acad.Sci.(USA),84:7851-7855);リガンド特異的カチオンに基づく輸送系と連動した導入遺伝子の送達(WuおよびWu(1988)J.Biol.Chem.,263:14621-14624)またはネイキッドDNA、発現ベクターの使用(Nabel et al.(1990),上記;Wolff et al.(1990)Science,247:1465-1468)が含まれる。導入遺伝子を組織内に直接注入すれば局所発現のみが起こる(Rosenfeld(1992)上記;Rosenfeld et al.(1991)上記;Brigham et al.(1989)上記;Nabel(1990)上記;およびHazinski et al.(1991)上記)。Brigham et al.のグループ(Am.J.Med.Sci.(1989)298:278-281およびClinical Research(1991)39(abstract))は、DNAリポソーム複合体をマウスの静脈内または気管内に投与すると肺のみにin vivoトランスフェクションが起こることを報告している。ヒト遺伝子治療の方法に関する総説にはAnderson,Science(1992)256:808-813がある。
さらなる実施形態では、本開示の医薬組成物は、全体が参照により本明細書に組み込まれるHan et al.,Nat.Comms.7,10981(2016)に記載されているように、炭水化物をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、本開示の医薬組成物は、5%のヘキソース炭水化物を含み得る。例えば、本開示の医薬組成物は、5%のグルコース、5%のフルクトースまたは5%のマンノースを含み得る。ある特定の実施形態では、本開示の医薬組成物は、2.5%のグルコースと2.5%のフルクトースとを含み得る。いくつかの実施形態では、本開示の医薬組成物は、5体積%の量で存在するアラビノース、5体積%の量で存在するグルコース、5体積%の量で存在するソルビトール、5体積%の量で存在するガラクトース、5体積%の量で存在するフルクトース、5体積%の量で存在するキシリトール、5体積%の量で存在するマンノース、それぞれが2.5体積%の量で存在するグルコースとフルクトースの組合せ、および5.7体積%の量で存在するグルコースと2.86体積%の量で存在するフルクトースと1.4体積%の量で存在するキシリトールの組合せから選択される炭水化物を含み得る。
IV.使用方法
エクソンスキッピングを用いるジストロフィンリーディングフレームの回復
ジストロフィン遺伝子のアウトオブフレーム変異を原因とするDMDの治療に有望な治療方法が、インフレーム変異を原因としBMDとして知られる比較的軽度の型のジストロフィン異常症によって示唆されている。アウトオブフレーム変異をインフレーム変異に変換することができれば、仮説上はmRNAリーディングフレームを保存し、内部が短縮されてはいるが機能性であるジストロフィンタンパク質を産生させることができる。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートは、このことを達成するため設計したものである。
PMOと標的プレmRNA配列がハイブリダイズすると、プレmRNAスプライシング複合体の形成が阻害され、成熟mRNAからエクソン53が欠失する。本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの構造および立体配座は相補的配列との配列特異的塩基対形成を可能にするものである。例えば、ジストロフィンプレmRNAのエクソン51をスキップするよう設計されたPMOであるeteplirsenは、これと同様の機序により、ジストロフィンプレmRNAのエクソン51に含まれる相補的配列との配列特異的塩基対形成を可能にする。
79エクソンがすべて含まれる正常なジストロフィンmRNAからは正常なジストロフィンタンパク質が産生される。図1の図は、ジストロフィンのプレmRNAおよび成熟mRNAエクソン47からエクソン53までの小さいセクションを示している。各エクソンの形状は、コドンがエクソン間でどのように分割されているかを示しており;注目すべきなのは、各コドンが3個のヌクレオチドからなることである。長方形のエクソンは、完全なコドンで始まり、完全なコドンで終わっている。矢印形のエクソンは、完全なコドンで始まるが、コドンのヌクレオチド#1のみが含まれる分割されたコドンで終わっている。このコドンのヌクレオチド#2および#3は、山形で始まる次のエクソンに含まれている。
通常、ジストロフィン遺伝子からエクソン全体が失われたジストロフィンmRNAがあるとDMDが生じる。図2の図は、DMDが生じることが知られている遺伝子変異のタイプ(エクソン50の欠失)を示している。エクソン49は完全なコドンで終わり、エクソン51はコドンの2番目のヌクレオチドで始まるため、エクソン49の後のリーディングフレームがシフトし、それによりアウトオブフレームのmRNAリーディングフレームおよび変異下流の誤ったアミノ酸の組込みが生じる。その結果、機能的C末端ジストログリカン結合ドメインが欠如して不安定なジストロフィンタンパク質が産生される。
eteplirsenはエクソン51をスキップしてmRNAリーディングフレームを回復させる。エクソン49は完全なコドンで終わり、エクソン52はコドンの1番目のヌクレオチドで始まるため、エクソン51が欠失すればリーディングフレームが回復し、それにより「インフレーム」BMD変異と同じくインタクトのジストログリカン結合部位を有し内部が短縮したジストロフィンタンパク質が産生される(図3)。
エクソンスキッピングを用いジストロフィンmRNAオープンリーディングフレームを回復させてDMD表現型を改善することが実現可能であることは、非臨床研究により裏付けられている。DMDのジストロフィン動物モデルを用いた多数の試験でエクソンスキッピングによるジストロフィン回復により筋力および筋機能が確実に回復することが示されている(Sharp 2011;Yokota 2009;Wu 2008;Wu 2011;Barton-Davis 1999;Goyenvalle 2004;Gregorevic 2006;Yue 2006;Welch 2007;Kawano 2008;Reay 2008;van Putten 2012)。このことに関する説得力のある例の1つに、エクソンスキッピング(PMOを使用)療法後のジストロフィンレベルを同じ組織の筋機能と比較した試験がある。ジストロフィンmdxマウスでは、マウス特異的PMOで処置した前脛骨(TA)筋がストレス誘導性収縮後にその最大許容荷重の約75%を維持したのに対し、反対側の未処置TA筋はその最大許容荷重の約25%を維持するにとどまった(p<0.05)(Sharp 2011)。また別の試験では、2~5か月齢のジストロフィンCXMDイヌ3例にその遺伝子変異に特異的なPMOを用いたエクソンスキッピング療法を週1回で5~7週間または隔週で22週間実施した。エクソンスキッピング療法を実施した場合、3例全例で全身の骨格筋にジストロフィンの盛んな発現がみられたほか、ベースラインと比較して歩行能力(15m走検査)の維持または改善がみられた。これとは対照的に、月齢の一致する未処置CXMDイヌには、試験期間を通じて歩行能力の著明な低下がみられた(Yokota 2009)。
PMOはmdxマウスでも、ヒトDMD転写物全体を発現するヒト化DMD(hDMD)マウスモデルでも、等モル濃度でのエクソンスキッピング活性がホスホロチオアートより高いことが示されている(Heemskirk 2009)。正常ヒト骨格筋細胞またはエクソン51スキッピングが可能な様々な変異を有するDMD患者由来筋細胞に逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)およびウエスタンブロット(WB)を用いたin vitroの実験では、eteplirsen(PMO)がエクソン51スキッピングの強力な誘導因子であることが明らかになった。hDMDマウスモデルではeteplirsen誘導エクソン51スキッピングがin vivoで確認されている(Arechavala-Gomeza 2007)。
ヒトジストロフィンプレmRNAのエクソン53の標的領域に相補的でありエクソン53スキッピングを誘導するアンチセンスオリゴマーコンジュゲートの効果を解析するための臨床転帰としては、パーセントジストロフィン陽性線維(PDPF)、6分間歩行検査(6MWT)、歩行能力の低下(LOA)、North Star Ambulatory Assessment(NSAA)、肺機能検査(PFT)、外からの支援を受けずに起立する能力(仰臥位からの)、de novoのジストロフィン産生量、およびその他の機能測定が挙げられる。
いくつかの実施形態では、本開示は、エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有する対象にジストロフィンを産生させる方法であって、対象に本明細書に記載されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を投与することを含む、方法を提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、エクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有するデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)を有する対象にmRNAリーディングフレームを回復させてジストロフィンタンパク質産生を誘導する方法を提供する。タンパク質産生は、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)、ウエスタンブロット解析または免疫組織化学(IHC)により測定することができる。
いくつかの実施形態では、本開示は、必要とする対象のDMDを治療する方法を提供し、ここでは、対象はエクソン53スキッピングが可能なジストロフィン遺伝子の変異を有し、方法は、対象に本明細書に記載されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を投与することを含む。様々な実施形態では、対象の治療を疾患進行の遅延により測定する。いくつかの実施形態では、対象の治療を対象の歩行能力の維持または対象の歩行能力低下の抑制により測定する。いくつかの実施形態では、6分間歩行検査(6MWT)を用いて歩行能力を測定する。ある特定の実施形態では、North Start Ambulatory Assessment(NSAA)を用いて歩行能力を測定する。
様々な実施形態では、本開示は、DMDを有する対象の肺機能を維持する、または肺機能低下を抑制する方法を提供し、ここでは、対象はエクソン53スキッピングが可能なDMD遺伝子の変異を有し、方法は、対象に本明細書に記載されるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩を投与することを含む。いくつかの実施形態では、肺機能を最大呼気圧(MEP)として測定する。ある特定の実施形態では、肺機能を最大吸気圧(MIP)として測定する。いくつかの実施形態では、肺機能を努力肺活量(FVC)として測定する。
さらなる実施形態では、本開示の方法で本開示の医薬組成物を、全体が参照により本明細書に組み込まれるHan et al.,Nat.Comms.7,10981(2016)に記載されているように、同じ製剤で、または別個の製剤で炭水化物と共投与し得る。いくつかの実施形態では、本開示の医薬組成物を5%のヘキソース炭水化物と共投与し得る。例えば、本開示の医薬組成物を5%のグルコース、5%のフルクトースまたは5%のマンノースと共投与し得る。ある特定の実施形態では、本開示の医薬組成物を2.5%のグルコースおよび2.5%のフルクトースと共投与し得る。いくつかの実施形態では、本開示の医薬組成物を5体積%の量で存在するアラビノース、5体積%の量で存在するグルコース、5体積%の量で存在するソルビトール、5体積%の量で存在するガラクトース、5体積%の量で存在するフルクトース、5体積%の量で存在するキシリトール、5体積%の量で存在するマンノース、それぞれが2.5体積%の量で存在するグルコースとフルクトースの組合せ、および5.7体積%の量で存在するグルコースと、2.86体積%の量で存在するフルクトースと、1.4体積%の量で存在するキシリトールの組合せから選択される炭水化物と共投与し得る。
様々な実施形態では、本開示のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを治療有効量の非ステロイド性抗炎症化合物と共投与する。いくつかの実施形態では、非ステロイド性抗炎症化合物はNF-kB阻害剤である。例えば、いくつかの実施形態では、NF-kB阻害剤は、CAT-1004またはその薬学的に許容される塩であり得る。様々な実施形態では、NF-kB阻害剤はサリチル酸塩とDHAのコンジュゲートであり得る。いくつかの実施形態では、NF-kB阻害剤は、CAT-1041またはその薬学的に許容される塩である。ある特定の実施形態では、NF-kB阻害剤はサリチル酸塩とEPAのコンジュゲートである。様々な実施形態では、NF-kB阻害剤は
Figure 0007160807000073


またはその薬学的に許容される塩である。
いくつかの実施形態では、非ステロイド性抗炎症化合物はTGF-b阻害剤である。例えば、ある特定の実施形態では、TGF-b阻害剤はHT-100である。
ある特定の実施形態では、治療に使用する本明細書に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートが記載される。ある特定の実施形態では、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療に使用する本明細書に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートが記載される。ある特定の実施形態では、治療に使用する薬物の製造に使用する本明細書に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートが記載される。ある特定の実施形態では、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療のための薬物の製造に使用する本明細書に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートが記載される。
V.キット
本開示は、遺伝性疾患を有する患者を治療するためのキットも提供し、このキットは、適切な容器に包装された少なくとも1つのアンチセンス分子(例えば、配列番号1で記載されるアンチセンスオリゴマーを含むアンチセンスオリゴマーコンジュゲート)をその使用のための指示とともに含む。キットは、緩衝剤、安定剤などの特定の周辺試薬も含み得る。当業者は、上の方法の適用が他の多くの疾患の治療に使用するのに適したアンチセンス分子の特定に広い適用範囲を有することを理解するべきである。一実施形態では、キットは式(III)によるアンチセンスオリゴマーコンジュゲートを含む。
上記の開示は、明確な理解を目的として図および例によってある程度詳細に記載されているが、本開示の教示を踏まえれば、添付の「特許請求の範囲」の趣旨も範囲も逸脱することなく本開示に特定の改変および修正を施し得ることが当業者に容易に明らかになるであろう。以下の実施例は単に説明を目的とするものであって、限定を目的とするものではない。当業者には、改変または修正を施しても実質的にほぼ同じ結果が得られる様々な重要性の低いパラメータが容易に認識されよう。
材料および方法
細胞および組織の培養処理条件
分化ヒト筋細胞(ZenBio社)を用いてエクソンスキッピングを測定した。具体的には、筋芽細胞(ZenBio社、SKB-F)を増殖培地(SKB-M;ZenBio社)中、37℃、5%COで80~90%のコンフルエンスまで増殖させた。増殖培地を分化培地(SKM-D;ZenBio社)に入れ替えることにより分化を開始させた。エクソン53スキッピングをアッセイするため、分化した細胞1×10個を24ウェルプレートに播き、各ウェルに様々な濃度のPMOまたはPPMOを含有する分化培地(SKM-D;ZenBio社)1mLを加え、96時間インキュベートした。
ウエスタンブロット法解析
ウエスタンブロット解析には、直径約5mmの9~18×20μm組織切片に対して緩衝液133μLの比でホモジナイゼーション緩衝液(4%SDS、4M尿素、125mMトリス-HCl(pH6.8))を用いて組織をホモジナイズした。対応する溶解物を収集し、RC DC Protein Assay Kit(BioRad社、カタログ番号500-0122)を製造業者の指示通りに用いたタンパク質定量化に供した。ホモジナイゼーション緩衝液を用いて組織抽出試料を1:10に希釈してBSA標準曲線の範囲内に収まるようにした。タンパク質溶解物25μl、NuPAGE LDS Sample Buffer(Life Technologies社、カタログ番号NP0008、カールスバッド、カリフォルニア州、米国)7μl、およびNuPAGE Reducing Agent(10倍)(Life Technologies社、カタログ番号NP0004)3μlを用いて、試料35μlに所望の量のタンパク質が含まれるよう試料を調製した。タンパク質試料を95℃で5分間加熱した後、試料を遠心分離し、上清をNuPAGE Novex 10ウェル、1mm、ミニ3~8%ポリアクリルアミドトリス酢酸ゲル(Life Technologies社、カタログ番号EA0375)上に1レーン当たりの総タンパク質負荷量が最大50μgになるように負荷した。ゲルを室温にて、ダイフロントがゲルからはみ出るまで150ボルトで泳動させた。得られたタンパク質ゲルをPVDF膜(Life Technologies社、カタログ番号LC2007)に室温で75分間、NuPAGE転写緩衝液(Life Technologies社、NP006-1)、10%メタノールおよび0.1%NuPAGE抗酸化剤(Life Technologies社、NP0005)を用いて30ボルトで転写した。
タンパク質転写後、PVDF膜をTTBS緩衝液(1×TBS(Amresco社、カタログ番号J640-4L)、0.1%(v/v)tween-20)に浸した。膜をブロッキング緩衝液(TTBS中5%(w/v)の無脂肪粉乳(Lab Scientific社、カタログ番号M0841)に移し、4℃で一晩、穏やかに振盪しながら浸漬した。ブロッキング後、ブロッキング緩衝液を用いて1:20に希釈したDYS1(Leica社、カタログ番号NCL-DYS1)中、室温で60分間、またはブロッキング緩衝液で1:100,000に希釈した抗α-アクチニン抗体(Sigma-Aldrich社、カタログ番号NA931V)中、室温で20分間、膜をインキュベートし、次いで6回洗浄した(毎回TTBSで5分間)。ブロッキング緩衝液を用いて西洋ワサビペルオキシダーゼコンジュゲート抗マウスIgG(GE Healthcare社、カタログ番号NA931V)を1:40,000に希釈し、膜に45分間(DYS1)または15分間(α-アクチニン)加えた後、再び6回洗浄した。ECL Prime Western Detection Kit(GE Healthcare社、カタログ番号RPN2232)を用いて、フィルムをゲルに曝し、しかるべく現像した。現像したフィルムをスキャンし、ImageQuant TL Plusソフトウェア(バージョン8.1)を用いて解析し、Graphpadソフトウェアを用いて直線回帰分析を実施した。
ウエスタンブロットゲルにはそれぞれ、正常組織(マウスの四頭筋、横隔膜または心臓)から抽出した全タンパク質を例えば64%、16%、4%、1%および0.25%に希釈し(例えば、図5Aおよび5Bを参照されたい)、DMD組織(例えば、mdxマウスの四頭筋、横隔膜もしくは心臓、またはNHPの四頭筋、横隔膜もしくは平滑筋(GI))抽出物に添加したものを用いて作成した4ポイントまたは5ポイントのジストロフィン標準曲線が含まれる。標準曲線試料を上記の通りに処理した。ジストロフィンのバンド強度とゲル標準曲線とを比較することにより、ジストロフィンタンパク質レベルを野生型ジストロフィンレベルに対するパーセント(%WT)として求めた。
RT-PCR解析
RT-PCR解析には、Illustra GEスピンキットを製造業者のプロトコル通りに用いて、細胞からRNAを単離した。NanoDropを用いてRNAの濃度および純度を求めた。エクソン51/52接合部およびエクソン54と結合する順方向プライマー、配列番号5(5’-CATCAAGCAGAAGGCAACAA-3’)およびエクソン51/52接合部およびエクソン54と結合する逆方向プライマー、配列番号6(5’-GAAGTTTCAGGGCCAAGTCA-3’)を用いたRT-PCRによりエクソン53スキッピングを測定した。スキップされたエクソン53から201bpのアンプリコンが得られ、スキップされなかったエクソン53から413bpのアンプリコンが得られた。
順方向プライマー、配列番号7(5’-CACATCTTTGATGGTGTGAGG-3’)および逆方向プライマー、配列番号8(5’-CAACTTCAGCCATCCATTTCTG-3’)を用いたRT-PCRによりマウスのエクソン23スキッピングを測定した。
RNAをRT-PCRに供した後、ゲルキャピラリー電気泳動を用いるCaliper社製機器を用いて試料を解析した。以下の方程式:(スキップのあるバンドの曲線下面積)/(スキップのあるバンドとスキップのないバンドの曲線下面積の合計)×100を用いて、エクソンスキッピングのパーセントを算出した。
免疫組織化学:ジストロフィン染色:
10ミクロンのマウス四頭筋凍結組織切片を用いて、PBS中10%のヤギ血清+1%のBSAに溶かしたジストロフィン一次抗体(希釈比1:250、ウサギ、Abcam社、カタログ番号ab15277)および10%ヤギ血清+1%BSAに溶かした二次抗体Alexa-Fluoro 488ヤギ抗ウサギ(希釈比1:1000)によりジストロフィンを検出した。
モルホリノサブユニットの調製
Figure 0007160807000074
Bが塩基対形成部分を表すスキーム1を参照すると、図のように、対応するリビヌクレオシド(ribinucleoside)(1)からモルホリノサブユニットを調製し得る。必要に応じて、適切な保護基前駆体、例えば塩化トリチルとの反応によりモルホリノサブユニット(2)を保護し得る。下でさらに詳細に記載するように、3’保護基は一般に固相オリゴマー合成の過程で除去される。塩基対形成部分は固相オリゴマー合成に適した方法で保護し得る。適切な保護基として、アデニンおよびシトシンにはベンゾイル、グアニンにはフェニルアセチル、ヒポキサンチン(I)にはピバロイルオキシメチルが挙げられる。ピバロイルオキシメチル基はヒポキサンチン複素環塩基のN1位上に導入することができる。保護されていないヒポキサンチンサブユニットを用いてもよいが、塩基が保護されているときの方が活性化反応の収率がはるかに優れている。その他の適切な保護基としては、全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第8,076,476号に開示されているものが挙げられる。
3と活性化リン化合物4との反応により、所望の結合部分5を有するモルホリノサブユニットが得られる。
構造4の化合物は当業者に公知の多数の方法を用いて調製することができる。次いで、上に概説したようにモルホリノ部分とのカップリングが進行する。
サブユニット間結合を含むオリゴマーを調製には、構造5の化合物を固相オリゴマー合成に用いることができる。このような方法は当該技術分野で周知である。簡潔に述べれば、構造5の化合物の5’末端を固体支持体に対するリンカーが含まれるよう修飾し得る。支持されたのち、5の保護基(例えば、3’末端のトリチル)を除去し、遊離アミンを第二の構造5の化合物の活性化リン部分と反応させる。この配列を所望の長さのオリゴが得られるまで繰り返す。終末の3’末端にある保護基は、除去しても、あるいは3’修飾を望む場合は残してもよい。オリゴは、多数の方法または固体支持体との結合を切断する塩基を用いる例示の処理により固体支持体から切り離すことができる。
モルホリノオリゴマー全般および本開示の特定のモルホリノオリゴマーの調製について実施例でさらに詳細に記載する。
モルホリノオリゴマーの調製
スキーム2による以下のプロトコルを用いて本開示の化合物の調製を実施する:
Figure 0007160807000075

トリチルピペラジンフェニルカルバマート35の調製:冷却した化合物11のジクロロメタン(6mL/g11)懸濁液に炭酸カリウム(3.2eq)の水溶液(4mL/g炭酸カリウム)を加えた。この2相混合物にクロロギ酸フェニル(1.03eq)のジクロロメタン溶液(2g/gクロロギ酸フェニル)を徐々に加えた。反応混合物を20℃に温めた。反応終了時(1~2時間)、層を分離した。有機層を水で洗浄し、無水炭酸カリウムで乾燥させた。生成物35を晶析によりアセトニトリルから単離した。
カルバミン酸アルコール36の調製:水素化ナトリウム(1.2eq)を1-メチル-2-ピロリジノン(32mL/g水素化ナトリウム)に懸濁させた。この懸濁液にトリエチレングリコール(10.0eq)および化合物35(1.0eq)を加えた。得られたスラリーを95℃に加熱した。反応終了時(1~2時間)、混合物を20℃に冷却した。この混合物に30%ジクロロメタン/メチルtert-ブチルエーテル(v:v)および水を加えた。生成物が含まれる有機層をNaOH水溶液、コハク酸水溶液および飽和塩化ナトリウム水溶液で連続的に洗浄した。生成物36を晶析によりジクロロメタン/メチルtert-ブチルエーテル/ヘプタンから単離した。
テール酸37の調製:化合物36のテトラヒドロフラン溶液(7mL/g36)に無水コハク酸(2.0eq)およびDMAP(0.5eq)を加えた。混合物を50℃に加熱した。反応終了時(5時間)、混合物を20℃に冷却し、NaHCO3水溶液でpH8.5に調整した。メチルtert-ブチルエーテルを加え、生成物を水層内に抽出した。ジクロロメタンを加え、クエン酸水溶液で混合物をpH3に調整した。生成物が含まれる有機層をpH=3のクエン酸緩衝液と飽和塩化ナトリウム水溶液の混合物で洗浄した。この37のジクロロメタン溶液を単離せずに化合物38の調製に用いた。
38の調製:化合物37の溶液にN-ヒドロキシ-5-ノルボルネン-2,3-ジカルボン酸イミド(HONB)(1.02eq)、4-ジメチルアミノピリジン(DMAP)(0.34eq)、次いで1-(3-ジメチルアミノプロピル)-N’-エチルカルボジイミド・塩酸塩(EDC)(1.1eq)を加えた。混合物を55℃に加熱した。反応終了時(4~5時間)、混合物を20℃に冷却し、1:1の0.2Mクエン酸/ブラインおよびブラインで連続的に洗浄した。ジクロロメタン溶液にアセトン、次いでN,N-ジメチルホルムアミドへの溶媒交換を実施し、アセトン/N,N-ジメチルホルムアミドから飽和塩化ナトリウム水溶液中への沈殿により生成物を単離した。粗生成物を水で数回再スラリー化して残存するN,N-ジメチルホルムアミドおよび塩を除去した。
PMOの合成方法A:ジスルフィドアンカーの使用
固相合成過程のサブユニットの組込みに用いた方法により、アンカーを担持した樹脂への活性化「テール」の導入をジメチルイミダゾリジノン(DMI)中で実施した。
Figure 0007160807000076

この方法は、N2をフリットまたは真空抽出に通して泡立たせるための粗多孔性(40~60μm)ガラスフリット、オーバーヘッドスターラーおよび三方Teflon活栓を備えたシラン処理ジャケット式ペプチド容器(ChemGlass社、ニュージャージー州、米国)内で実施した。
以下の方法の樹脂の処理/洗浄段階は、樹脂流動化または攪拌床反応器および溶媒/溶液抽出の2つの基本操作からなる。樹脂流動化では、N2がフリットを通って上向きに流れるよう活栓を位置させ、反応器に指定の樹脂処理/洗浄剤を加え、樹脂に浸透させて完全に湿らせた。次いで、混合を開始し、樹脂スラリーを指定の時間にわたって混合した。溶媒/溶液抽出では、混合およびN2流を停止し、真空ポンプを起動し、次いで、樹脂処理/洗浄剤を排出して廃棄するよう活栓を位置させた。別途言及されない限り、樹脂処理/洗浄剤の体積は樹脂1g当たり15mLとした。
シラン処理ジャケット式ペプチド容器に入ったアミノメチルポリスチレン樹脂(100~200メッシュ;窒素置換に基づく担持量約1.0mmol/g;75g、1eq、Polymer Labs社、イギリス、パート番号1464-X799)に1-メチル-2-ピロリジノン(NMP;20ml/g樹脂)を加え、樹脂を1~2時間混合して膨潤させた。膨潤溶媒を排出した後、樹脂をジクロロメタン(2×1~2分)、25%イソプロパノール/ジクロロメタン中5%のジイソプロピルエチルアミン(2×3~4分)およびジクロロメタン(2×1~2分)で洗浄した。最後の洗浄剤を排出した後、樹脂をジスルフィドアンカー34の1-メチル-2-ピロリジノン溶液(0.17M;15mL/g樹脂、約2.5eq)で処理し、樹脂/試薬混合物を45℃で60時間加熱した。反応終了時、加熱をやめ、アンカー溶液を排出し、樹脂を1-メチル-2-ピロリジノン(4×3~4分)およびジクロロメタン(6×1~2分)で洗浄した。樹脂をジエチルジカルボナートの10%(v/v)ジクロロメタン溶液(16mL/g;2×5~6分)で処理し、次いでジクロロメタン(6×1~2分)で洗浄した。樹脂39をN2流下で1~3時間、次いで真空下で一定重量(±2%)になるまで乾燥させた。収率:元の樹脂重量の110~150%。
アミノメチルポリスチレン-ジスルフィド樹脂の担持量の決定:樹脂1グラム当たりのトリフェニルメチル(トリチル)基の数に関する分光アッセイにより樹脂の担持量(利用可能であると考えられる反応部位の数)を決定する。
既知の重量の乾燥樹脂(25±3mg)をシラン処理25mlメスフラスコに移し、2%(v/v)トリフルオロ酢酸のジクロロメタン溶液約5mLを加える。内容物を穏やかにかき混ぜて混合し、次いで30分間静置する。追加の2%(v/v)トリフルオロ酢酸のジクロロメタン溶液で体積を25mLにし、内容物を十分に混合する。ポジティブディスプレイスメント式ピペットを用いて、一定量のトリチル含有溶液(500μL)を10mLメスフラスコに移し、メタンスルホン酸で体積を10mLにする。
最終溶液中のトリチルカチオン含有量を431.7nmでのUV吸光度により測定し、適切な体積、希釈率、吸光係数(ε:41μmol-1cm-1)および樹脂重量を用いて、樹脂の担持量を樹脂1g当たりのトリチル基(μmol/g)として算出する。アッセイは三重反復で実施し、平均担持量を算出する。
この実施例の樹脂担持法では、樹脂の担持量が約500μmol/gとなる。ジスルフィドアンカー組込み段階を室温で24時間実施した場合、μmol/gで300~400の担持量が得られた。
テール担持:アミノメチルポリスチレン-ジスルフィド樹脂の調製と同じ装置および体積を用いて、テールを固体支持体に導入することができる。最初にアンカー担持樹脂を酸性条件下で脱保護し、得られた材料をカップリング前に中和した。カップリング段階では、ジスルフィドアンカー溶液の代わりに4-エチルモルホリン(NEM、0.4M)を含有する38のDMI溶液(0.2M)を使用した。45℃で2時間経過した後、樹脂39を25%イソプロパノール/ジクロロメタン中5%のジイソプロピルエチルアミンで2回、DCMで1回洗浄した。樹脂に無水安息香酸(0.4M)とNEM(0.4M)の溶液を加えた。25分後、反応器のジャケットを室温に冷却し、樹脂を25%イソプロパノール/ジクロロメタン中5%のジイソプロピルエチルアミンで2回、DCMで8回洗浄した。樹脂40をろ過し、高真空下で乾燥させた。樹脂40の担持量をテール担持に使用した元のアミノメチルポリスチレン-ジスルフィド樹脂39の担持量と定義する。
固相合成:Gilson AMS-422 Automated Peptide Synthesizerを用いてモルホリノオリゴマーを2mL Gilsonポリプロピレン反応カラム(パート番号3980270)中で調製した。カラムを合成装置に置く際に、水流用のチャネルを有するアルミニウムブロックをその周囲に置いた。あるいは、AMS-422は試薬/洗浄溶液を加え、指定の時間にわたって保持し、真空を用いてカラムを空にする。
長さが約25サブユニットまでの範囲のオリゴマーには、樹脂の担持量が約500μmol/gのアミノメチルポリスチレン-ジスルフィド樹脂が好ましい。これより大きいオリゴマーには、樹脂の担持量が300~400μmol/gのアミノメチルポリスチレン-ジスルフィド樹脂が好ましい。5’テールを有する分子を望む場合、テールが担持された樹脂を同じ担持指針で選択する。
以下の試薬溶液を調製した:
・脱トリチル化溶液:4:1のジクロロメタン/アセトニトリル中10%のシアノ酢酸(w/v);
・中和溶液:3:1のジクロロメタン/イソプロパノール中5%のジイソプロピルエチルアミン;ならびに
・カップリング溶液:1,3-ジメチルイミダゾリジノンに溶かした所望の塩基と結合タイプの0.18M(または20サブユニットより長く伸長したオリゴマーには0.24M)活性化モルホリノサブユニットおよび0.4M Nエチルモルホリン。
異なる試薬溶液洗浄液を分離する移行洗浄剤としてジクロロメタン(DCM)を用いた。
合成装置では、ブロックを42℃に設定し、アミノメチルポリスチレン-ジスルフィド樹脂(またはテール樹脂)30mgの入った各カラムに1-メチル-2-ピロリジノン2mLを加え、室温で30分間静置した。ジクロロメタン2mLで2回洗浄した後、以下の合成サイクルを用いた:
Figure 0007160807000077
各カラムに適切なカップリング溶液(A、C、G、T、I)が適切な順序で入るよう個々のオリゴマーの配列をプログラムした。カラム内のオリゴマーにその最後のサブユニットが完全に組み込まれたとき、カラムをブロックから取り外し、0.89Mの4-エチルモルホリンを含有する4-メトキシトリフェニルメチルクロリド(DMI中0.32M)からなるカップリング溶液を用いて最後のサイクルを手動で実施した。
樹脂からの切断ならびに塩基および主鎖保護基の除去:メトキシトリチル化の後、樹脂を1-メチル-2-ピロリジノン2mLで8回洗浄した。1-メチル-2-ピロリジノン中0.1Mの1,4-ジチオスレイトール(DTT)と0.73Mのトリエチルアミンとからなる切断溶液1mLを加え、カラムにキャップをし、室温で30分間静置した。そののち、溶液を12mLのWheatonバイアルの中に注いだ。大幅に収縮した樹脂を切断溶液300μLで2回洗浄した。溶液に濃アンモニア水溶液(-20℃で保管したもの)4.0mLを加え、バイアルに(Teflonで内張りしたスクリューキャップで)きつくキャップをし、混合物をかき混ぜて溶液を混合した。バイアルを45℃のオーブンの中に16~24時間置いて塩基および主鎖保護基の切断を実施した。
粗生成物の精製:バイアルに入った加アンモニア分解溶液をオーブンから取り出し、室温まで冷却させた。溶液を0.28%アンモニア水溶液20mLで希釈し、Macroprep HQ樹脂(BioRad社)の入った2.5×10cmのカラムに通した。塩勾配(A:0.28%アンモニアとB:0.28%アンモニア中1Mの塩化ナトリウム;60分間で0~100%のB)を用いて、ピークが含まれるメトキシトリチルを溶離した。合わせた画分をプールし、所望の生成物に応じてさらに処理した。
モルホリノオリゴマーの脱メトキシトリチル化:Macroprepによる精製でプールした画分を1M HPOで処理してpHを2.5に低下させた。最初の混合の後、試料を室温で4分間静置し、その時点で2.8%アンモニア/水を用いて試料をpH10~11に中和する。生成物を固相抽出(SPE)により精製した。
SPEカラムの充填および調整:20mLのフリットカラム(BioRad Econo-Pac chromatography Columns(732-1011))にAmberchrome CG-300M(Rohm and Haas社;フィラデルフィア、ペンシルベニア州)(3mL)を充填し、樹脂を3mLの以下のもの:0.28%NHOH/80%アセトニトリル;0.5M NaOH/20%エタノール;水;50mM HPO/80%アセトニトリル;水;0.5NaOH/20%エタノール;水;0.28%NHOHですすいだ。
SPE精製:脱メトキシトリチル化で得た溶液をカラムにかけ、樹脂を0.28%アンモニア水溶液3~6mLで3回すすいだ。Wheatonバイアル(12mL)をカラムの下に置き、0.28%アンモニア水溶液中45%のアセトニトリル2mLで2回洗浄することにより生成物を溶離した。
生成物の単離:溶液をドライアイスで凍結させ、バイアルを凍結乾燥機の中に置いて、綿毛状の白色粉末を得た。試料を水に溶かし、シリンジを用いて0.22ミクロンフィルター(Pall Life Sciences社、0.2ミクロンHT Tuffryn膜を有するAcrodisc 25mmシリンジフィルター)に通してろ過し、UV分光光度計で吸光度(OD)を測定して存在するオリゴマーのOD単位を求め、試料を解析用に分注した。次いで、溶液をWheatonバイアルに戻して凍結乾燥させた。
MALDIによるモルホリノオリゴマーの解析:MALDI-TOF質量分析法を用いて、精製で得た画分の組成を明らかにし、オリゴマーの同一性(分子量)を示す証拠を得た。試料をマトリックスである3,5-ジメトキシ-4-ヒドロキシケイ皮酸(シナピン酸)、3,4,5-トリヒドキシアセトフェノン(trihydoxyacetophenone)(THAP)またはアルファ-シアノ-4-ヒドキシケイ皮酸(hydoxycinnamic acid)(HCCA)の溶液で希釈した後、流した。
PMOの合成方法B:NCP2アンカーの使用
NCP2アンカーの合成:
1.メチル4-フルオロ-3-ニトロベンゾアート(1)の調製
Figure 0007160807000078


100Lフラスコに4-フルオロ-3-ニトロ安息香酸12.7kgを入れ、メタノール40kgおよび濃硫酸2.82kgを加えた。混合物を36時間還流攪拌(65℃)した。反応混合物を0℃に冷却した。38℃で結晶が形成された。混合物を0℃で4時間保持した後、窒素下でろ過した。100Lフラスコを洗浄し、ろ塊を0℃に冷却したメタノール10kgで洗浄した。固体のろ塊を漏斗上で1時間乾燥させ、トレーに移し、真空オーブン中、一定重量13.695kgのメチル4-フルオロ-3-ニトロベンゾアートになるまで室温で乾燥させた(収率100%;HPLC 99%)。
2.3-ニトロ-4-(2-オキソプロピル)安息香酸の調製
A.(Z)-メチル4-(3-ヒドロキシ-1-メトキシ-1-オキソブタ-2-エン-2-イル)-3-ニトロベンゾアート(2)
Figure 0007160807000079


100Lフラスコに前段階で得たメチル4-フルオロ-3-ニトロベンゾアート(1)3.98kg、DMF 9.8kg、アセト酢酸メチル2.81kgを入れた。混合物を攪拌し、0℃に冷却した。これに温度を5℃以下に維持しながらDBU 3.66kgを約4時間かけて加えた。混合物をさらに1時間攪拌した。クエン酸8.15kgを精製水37.5kgに溶かした溶液を反応フラスコに反応温度を15℃以下に維持しながら加えた。添加後、反応混合物をさらに30分間攪拌した後、窒素下でろ過した。水分を含むろ塊を精製水14.8kgとともに100Lフラスコに戻した。スラリーを10分間攪拌した後、ろ過した。水分を含む塊を再び100Lフラスコに戻し、精製水14.8kgを用いて10分間スラリー化し、ろ過して、粗(Z)-メチル4-(3-ヒドロキシ-1-メトキシ-1-オキソブタ-2-エン-2-イル)-3-ニトロベンゾアートを得た。
B.3-ニトロ-4-(2-オキソプロピル)安息香酸
Figure 0007160807000080


粗(Z)-メチル4-(3-ヒドロキシ-1-メトキシ-1-オキソブタ-2-エン-2-イル)-3-ニトロベンゾアートを窒素下で100L反応フラスコに入れた。これに1,4-ジオキサン14.2kgを加え、攪拌した。混合物に反応混合物の温度を15℃未満に維持しながら濃HCl 16.655kgと精製水13.33kgの溶液(6M HCl)を2時間かけて加えた。添加終了後、反応混合物を24時間加熱還流し(80℃)、室温に冷却し、窒素下でろ過した。固体のろ塊を精製水14.8kgで研和し、ろ過し、精製水14.8kgで再び研和し、ろ過した。固体をDCM 39.9kgとともに100Lフラスコに戻し、攪拌しながら1時間還流した。精製水1.5kgを加えて残りの固体を溶かした。底部の有機層を予め温めた72Lフラスコに分けた後、清潔な乾いた100Lフラスコに戻した。溶液を0℃に冷却し、1時間保持した後、ろ過した。固体のろ塊を2回、それぞれDCM 9.8kgとヘプタン5kgの溶液で洗浄した後、漏斗上で乾燥させた。固体をトレーに移し、一定重量1.855kgの3-ニトロ-4-(2-オキソプロピル)安息香酸になるまで乾燥させた。化合物1からの全収率42%。HPLC 99.45%。
3.N-トリチルピペラジンスクシナート(NTP)の調製
Figure 0007160807000081


72Lのジャケット付きフラスコにトリフェニルメチルクロリド1.805kgおよびトルエン8.3kg(TPC溶液)を窒素下で加えた。固体が溶けるまで混合物を攪拌した。100Lのジャケット付き反応フラスコにピペラジン5.61kg、トルエン19.9kgおよびメタノール3.72kgを窒素下で加えた。混合物を攪拌し、0℃に冷却した。これに反応温度を10℃以下に維持しながらTPC溶液を4時間かけて少量ずつ徐々に加えた。混合物を10℃で1.5時間攪拌した後、放置して14℃に温めた。精製水32.6kgを72Lフラスコに入れた後、内部のバッチ温度を20±5℃に維持しながら100Lフラスコに移した。層を分離させ、底部の水層を分離し保管した。有機層を精製水32kgで3回抽出し、水層を分離し、保管しておいた水溶液と合わせた。
残った有機層を18℃に冷却し、コハク酸847gを精製水10.87kgに溶かした溶液を少量ずつ有機層に徐々に加えた。混合物を20±5℃で1.75時間攪拌した。混合物をろ過し、固体をTBME 2kgおよびアセトン2kgで洗浄した後、漏斗上で乾燥させた。ろ塊を2回、それぞれアセトン5.7kgで研和し、ろ過し、研和と研和の間にアセトン1kgで洗浄した。固体を漏斗上で乾燥させた後、トレーに移し、真空オーブン中、一定重量2.32kgのNTPになるまで室温で乾燥させた。収率80%。
4.(4-(2-ヒドロキシプロピル)-3-ニトロフェニル)(4-トリチルピペラジン-1-イル)メタノンの調製
A.1-(2-ニトロ-4(4-トリチルピペラジン-1-カルボニル)フェニル)プロパン-2-オンの調製
Figure 0007160807000082


100Lのジャケット付きフラスコに3-ニトロ-4-(2-オキソプロピル)安息香酸(3)2kg、DCM 18.3kgおよびN-(3-ジメチルアミノプロピル)-N’-エチルカルボジイミド塩酸塩(EDC.HCl)1.845kgを窒素下で入れた。均一な混合物が形成されるまで溶液を攪拌した。NTP 3.048kgを室温で30分間かけて加え、8時間攪拌した。反応混合物に精製水5.44kgを加え、30分間攪拌した。層を分離させ、生成物が含まれる底部の有機層を抜き取り、保管した。水層をDCM 5.65kgで2回抽出した。合わせた有機層を、塩化ナトリウム1.08kgを精製水4.08kgに溶かした溶液で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム1.068kgで乾燥させ、ろ過した。硫酸ナトリウムをDCM 1.3kgで洗浄した。合わせた有機層をシリカゲル252gでスラリー化し、シリカゲル床252gの入ったフィルター漏斗でろ過した。シリカゲル床をDCM 2kgで洗浄した。合わせた有機層をロータリーエバポレーターで蒸発させた。残渣にTHF 4.8kgを加えた後、粗1-(2-ニトロ-4(4-トリチルピペラジン-1-カルボニル)フェニル)プロパン-2-オンがTHF中2.5体積に達するまでロータリーエバポレーターで蒸発させた。
B.(4-(2-ヒドロキシプロピル)-3-ニトロフェニル)(4-トリチルピペラジン-1-イル)メタノン(5)の調製
Figure 0007160807000083


100Lのジャケット付きフラスコに前段階で得た4を3600gおよびTHFを9800g、窒素下で入れた。攪拌した溶液を5℃以下に冷却した。溶液をエタノール11525gで希釈し、水素化ホウ素ナトリウム194gを5℃以下で約2時間かけて加えた。反応混合物を5℃以下でさらに2時間攪拌した。塩化アンモニウム約1.1kgを水約3kgに溶かした溶液を徐々に加えることにより反応を停止させて温度を10℃以下に維持した。反応混合物をさらに30分間攪拌し、ろ過して無機物を除去し、再び100Lのジャケット付きフラスコに入れ、DCM 23kgで抽出した。有機層を分離し、水層をさらに2回、それぞれDCM 4.7kgで抽出した。合わせた有機層を、塩化ナトリウム約800gを水約3kgに溶かした溶液で洗浄した後、硫酸ナトリウム2.7kgで乾燥させた。懸濁液をろ過し、ろ塊をDCM 2kgで洗浄した。合わせたろ液を2.0体積まで濃縮し、酢酸エチル約360gで希釈し、蒸発させた。粗生成物を窒素下、シリカ4kgをDCMとともに充填したシリカゲルカラムにかけ、酢酸エチル2.3kg/DCM 7.2kgで溶離した。合わせた画分を蒸発させ、残渣をトルエン11.7kgに溶かした。トルエン溶液をろ過し、ろ塊を2回、それぞれトルエン2kgで洗浄した。ろ塊を一定重量2.275kgの化合物5になるまで乾燥させた(化合物3からの収率46%)。HPLC 96.99%。
5.2,5-ジオキソピロリジン-1-イル(1-(2-ニトロ-4-(4-トリフェニルメチルピペラジン-1カルボニル)フェニル)プロパン-2-イル)カルボナート(NCP2アンカー)の調製
Figure 0007160807000084


100Lのジャケット付きフラスコに化合物5 4.3kg(残留トルエンに基づきHNMRにより重量を調整した;それに応じて以降の全試薬を計量した)およびピリジン12.7kgを窒素下で入れた。これに内部温度を35℃以下に維持しながらDSC 3.160kg(HNMRで78.91重量%)を入れた。反応混合物を周囲温度で約22時間熟成させた後、ろ過した。ろ塊をピリジン200gで洗浄した。それぞれ2分の1の体積のろ液を含む2つのバッチで、クエン酸約11kgを水約50kgに溶かした溶液を含む100Lのジャケット付きフラスコにろ液洗浄液を徐々に入れ、30分間攪拌して固体を沈殿させた。固体をフィルター漏斗で収集し、1回当たり4.3kgの水で2回洗浄し、真空下、フィルター漏斗上で乾燥させた。
合わせた固体を100Lのジャケット付きフラスコに入れ、DCM 28kgに溶かし、炭酸カリウム900gを水4.3kgに溶かした溶液で洗浄した。1時間後、層を分離させ、水層を除去した。有機層を水10kgで洗浄し、分離し、硫酸ナトリウム3.5kgで乾燥させた。DCMをろ過し、蒸発させ、6.16kgのNCP2アンカーになるまで真空下で乾燥させた(収率114%)。
NCP2アンカー担持樹脂の合成
Teflon止水栓を備えた75Lの固相合成反応器にNMP約52Lおよびアミノメチルポリスチレン樹脂2300gを入れた。樹脂をNMP中で約2時間攪拌して膨潤させた後、排出した。樹脂を1回当たり約4LのDCMで2回洗浄し、次いで、1回当たり39Lの中和溶液で2回洗浄し、次いで、1回当たり39LのDCMで2回洗浄した。攪拌している樹脂溶液にNCP2アンカー溶液を徐々に加え、室温で24時間攪拌し、排出した。樹脂を1回当たり39LのNMPで4回洗浄し、1回当たり39LのDCMで6回洗浄した。樹脂を2分の1のDEDCキャッピング溶液で30分間処理して攪拌し、排出し、次の2分の1のDEDCキャッピング溶液で30分間処理して攪拌し、排出した。樹脂を1回当たり39LのDCMで6回洗浄した後、一定重量3573.71gのアンカー担持樹脂になるまでオーブンで乾燥させた。
NCP2アンカーを用いたモルホリノオリゴマーの調製
Golodirsen(PMO#1)粗原薬の50L固相合成
1.原料
Figure 0007160807000085

Figure 0007160807000086
出発物質の化学構造:
A.活性化EG3テール
Figure 0007160807000087


B.活性化Cサブユニット(調製用、米国特許第8,067,571号を参照されたい)
Figure 0007160807000088


C.活性化Aサブユニット(調製用、米国特許第8,067,571号を参照されたい)
Figure 0007160807000089


D.活性化DPGサブユニット(調製用、国際公開第2009/064471号を参照されたい)
Figure 0007160807000090

E.活性化Tサブユニット(調製用、国際公開第2013/082551号を参照されたい)
Figure 0007160807000091



F.アンカー担持樹脂
Figure 0007160807000092


式中、Rは支持媒体である。
Figure 0007160807000093

2.Golodirsen粗原薬の合成
A.樹脂膨潤
アンカー担持樹脂750gおよびNMP 10.5Lを50Lのシラン処理反応器に入れ、3時間攪拌した。NMPを排出し、アンカー担持樹脂をそれぞれ5.5LのDCMで2回洗浄し、それぞれ5.5Lの30%TFE/DCMで2回洗浄した。
B.サイクル0:EG3テールのカップリング
アンカー担持樹脂を3回、それぞれ30%TFE/DCM 5.5Lで洗浄し、排出し、CYFTA溶液5.5Lで15分間洗浄し、排出し、再びCYTFA溶液5.5Lで15分間洗浄し、排出せずに1:1のNEM/DCM 122mLを入れ、懸濁液を2分間攪拌し、排出した。樹脂を中和溶液5.5Lで5分間、2回洗浄し、排出し、次いでそれぞれ5.5LのDCMで2回洗浄し、排出した。活性化EG3テール(MW765.85)706.2gおよびNEM 234mLをDMI 3Lに溶かした溶液を樹脂に加え、室温で3時間攪拌し、排出した。樹脂を1回当たり5.5Lの中和溶液で5分間、2回洗浄し、DCM 5.5Lで1回洗浄し、排出した。無水安息香酸374.8gおよびNEM 195mLをNMP 2680mLに溶かした溶液を入れ、15分間攪拌し、排出した。樹脂を中和溶液5.5Lとともに5分間攪拌した後、DCM 5.5Lで1回洗浄し、それぞれ5.5Lの30%TFE/DCMで2回洗浄した。樹脂を30%TFE/DCM 5.5Lに懸濁させ、14時間保持した。
C.サブユニットカップリングサイクル1~30
i.カップリング前の処理
図18に記載される各カップリングサイクルの前に、樹脂を:1)30%TFE/DCMで洗浄し;2)a)CYTFA溶液で15分間処理して排出し、b)CYTFA溶液で15分間処理し、これに1:1のNEM/DCMを加え、攪拌し、排出し;3)中和溶液とともに3回攪拌し;4)DCMで2回洗浄した。図18を参照されたい。
ii.カップリング後の処理
図18に記載されるように各サブユニット溶液を排出した後、樹脂を:1)DCMで洗浄し;2)30%TFE/DCMで2回洗浄した。次のカップリングサイクルの前に樹脂を一定時間保持した場合、2回目のTFE/DCM洗浄液は排出せず、前記TFE/DCM洗浄溶液中に樹脂を保持した。図18を参照されたい。
iii.活性化サブユニットカップリングサイクル
図18に記載される通りにカップリングサイクルを実施した。
iv.最後のIPA洗浄
図18に記載されるように最後のカップリング段階を実施した後、樹脂を8回、それぞれIPA 19.5Lで洗浄し、真空下、重量4857.9gになるまで室温で約63.5時間乾燥させた。
C.切断
上記の樹脂に結合したGolodirsen粗原薬を2つのロットに分け、各ロットを以下の通りに処理した。1619.3gのロットの樹脂を:1)NMP 10Lとともに2時間攪拌した後、NMPを排出し;2)それぞれ10Lの30%TFE/DCMで3回洗浄し;3)CYTFA溶液10Lで15分間処理し;4)CYTFA溶液10Lで15分間処理し、次いで、これに1:1のNEM/DCM 130mlを加え、2分間攪拌し、排出した。樹脂をそれぞれ10Lの中和溶液で3回処理し、DCM 10Lで6回洗浄し、それぞれ10LのNMPで8回洗浄した。DTT 1530.4gおよびDBU 2980をNMP 6.96Lに溶かした切断溶液で樹脂を2時間処理して樹脂からEteplisen粗原薬を脱離させた。切断溶液を排出し、別の容器に保持した。反応器および樹脂をNMP 4.97Lで洗浄し、これを切断溶液と合わせた。
D.脱保護
合わせた切断溶液とNMP洗浄液を圧力容器に移し、これに冷凍庫で-10℃~-25℃の温度に冷却しておいたNHOH(NH・HO)39.8Lを加えた。圧力容器を密閉し、16時間、45℃に加熱した後、25℃まで冷却させた。Golodirsen粗原薬を含有するこの脱保護溶液を精製水で3:1に希釈し、2Mリン酸でpHを3.0に調整し、次いでNHOHでpH8.03に調整した。HPLC:C18 77.552%およびSCX-10 73.768%。
Golodirsen(PMO#1)粗原薬の精製
上のD部で得たGolodirsen粗原薬を含有する脱保護溶液をToyoPearl Super-Q 650S陰イオン交換樹脂(Tosoh Bioscience社)のカラムにかけ、0~35%のBの勾配で17カラム体積分(緩衝液A:10mM水酸化ナトリウム;緩衝液B:10mM水酸化ナトリウム中1Mの塩化ナトリウム)溶離し、許容される純度の画分(C18およびSCX HPLC)をプールして精製製剤溶液とした。HPLC:93.571%(C18)88.270%(SCX)。
精製した原薬溶液を脱塩し、1450.72gの精製Golodirsen原薬になるまで凍結乾燥させた。収率54.56%;HPLC:93.531%(C18)88.354%(SCX)。
Figure 0007160807000094

CPPのコンジュゲーション
Figure 0007160807000095


解析手順:Bruker Autoflex(商標)Speedでシナピン酸(SA)マトリックスを用いてマトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量スペクトル(MALDI-TOF-MS)を記録した。3000ダイオードアレイ検出器とProPac(商標)SCX-20カラム(250×4mm)を備えたThermo Dionex UltiMate 3000システムで流速1.0mL/分(pH=2;カラム温度30℃)を用いてSCX-HPLCを実施した。移動相をA(24mM HPOを含有する25%アセトニトリル水溶液)およびB(1M KClと24mM HPOを含有する25%アセトニトリル水溶液)とした。以下の勾配溶離を用いた:0分、B35%;2分、B35%;22分、B80%;25分、B80%;25.1分、B35%;30分、B35%。
PMO#1(1.82g、0.177mmol、2日間凍結乾燥させることにより新たに乾燥させたもの)、Ac-L-Arg-L-Arg-L-Arg-L-Arg-L-Arg-L-Arg-Gly-OHヘキサトリフルオロアセタート(614.7mg、0.354mmol)および1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスファート(HATU、134.4mg、0.354mmol)の混合物にジメチルスルホキシド(DMSO、20mL)を加えた。混合物を室温で3時間攪拌した後、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA、68.5mg、0.530mmol)を加えた。5分後、濁った混合物が透明な溶液になった。SCX-HPLCにより反応をモニターした。2時間後、10%水酸化アンモニウム溶液(2.8%NH)20mLを加えた。混合物を室温でさらに2時間攪拌した。水400mLを添加することにより反応を停止させた。この溶液にトリフルオロエタノール(2.0mL)を加えた。
溶液を2部に分け、WCXカラム(1カラム当たり樹脂10g)により各部を精製した。最初に各WCXカラムを20%アセトニトリル水溶液(v/v)で洗浄してPMO#1出発物質を除去した。MALDI-TOF質量スペクトル解析でPMO#1のシグナルがみられなくなったとき、洗浄(各カラムに対し225mL)を止めた。次いで、各カラムを水(1カラム当たり100mL)で洗浄した。2.0MグアニジンHCl(各カラムに対し140mL)により所望の生成物PPMO#1を溶離した。精製したPPMO#1の溶液をともにプールした後、2部に分け、それぞれSPEカラム(各カラムとも樹脂10g)により脱塩した。
最初に、SPEカラムを1.0M NaCl水溶液(各カラムに対し100mL)で洗浄してPPMO#1の六塩酸塩を得た。次いで、各SPEカラムを水(各カラムに対し200mL)で洗浄した。最終的な脱塩PPMO#1を50%アセトニトリル水溶液(v/v、各カラムに対し150mL)により溶離した。減圧排出によりアセトニトリルを除去した。得られた水溶液を凍結乾燥させて、所望のコンジュゲートPPMO#1六塩酸塩を得た(1.93g、収率94.5%)。
実施例1:PMO#1
上記のPMO合成方法Bのプロトコルを用いてPMO#1を合成した:
Figure 0007160807000096

式中、1~25および5’~3’の各Nuは以下の通りである:
Figure 0007160807000097

表中、Aは
Figure 0007160807000098


であり、Cは
Figure 0007160807000099


であり、Gは
Figure 0007160807000100


であり、Tは
Figure 0007160807000101


である。
HPLC:71.85%;条件:Dionex DNAPac(DNX#97)勾配:0分に75%のA+20%のB+5%のC;20分に50%のA;21分に25%のA+75%のC;移動相A:10mM NaOH/20mM NaCl;C:10mM NaOH/0.5M NaCL。カラム温度:45℃;流速1.0mL/分。
実施例2:PPMO#1
上記のプロトコルを用いて、PMO#1からPPMO#1を合成した:
Figure 0007160807000102

式中、1~25および5’~3’の各Nuは以下の通りである:
Figure 0007160807000103

表中、Aは
Figure 0007160807000104


であり、Cは
Figure 0007160807000105


であり、Gは
Figure 0007160807000106


であり、Tは
Figure 0007160807000107


である。
実施例3:in vitro(筋芽細胞)のエクソン53スキッピング
ヒトジストロフィン(DMD)エクソン53を標的とし同じ配列を含む下の表に記載の2種類の化合物、PMO#1およびPPMO#1のDMDエクソン53スキッピングを健常ヒト筋芽細胞で評価した。
Figure 0007160807000108

具体的には、健常ヒト筋芽細胞(継代第5~6代、Zen-Bio社から購入したSKB-F-SL)を約40%のコンフルエンスで平板培養し、SKM-M培地(Zen-Bio社)中、様々な濃度(すなわち、40μm、20μm、10μm、5μm、2.5μmおよび1.25μm)のPMO#1またはPPMO#1で処置した。96時間インキュベートした後、筋芽細胞をPBSで洗浄し、Illustra GE RNAspin 96キット(カタログ番号25-055-75、GE Healthcare Bio-Sciences社)でRA1溶解緩衝液により溶解させた。RNAの溶離に無RNアーゼ水40μLを使用した以外は製造業者の推奨に従って全RNAを単離した。
両化合物によるエクソン53スキッピングを求めるため、2段階エンドポイントRT-PCRを実施した。具体的には、最初に、ランダムヘキサマーを用いたSuperScript IV First鎖合成キット(カタログ番号18091200、Invitrogen社)により11マイクロリットルの全RNAを製造業者の指示通りにcDNAに逆転写した。cDNA 9μLをPlatinum Taq DNAポリメラーゼPCR Supermix High Fidelity(カタログ番号12532024、Invitrogen社)にヒトDMDエクソン51/52接合部および54を標的とするプライマー(順方向プライマー:(配列番号5):CATCAAGCAGAAGGCAACAA;逆方向プライマー:(配列番号6):GAAGTTTCAGGGCCAAGTCA)とともに加えることによりPCRを実施した。BioRad CFX96リアルタイムサーモサイクラーを用い表2に示すプログラムを用いてPCR増幅を実施した。PCR産物32μLをLabChip GXシステムにかけ、DNA High Sensitivity Reagentキット(CLS760672、Perkin Elmer社)を用いてスキップのあるPCR産物またはスキップのないPCR産物の発現を評価した。エクソン53スキップのあるバンド(201bp)とエクソン53スキップのないバンド(413bp)の合計モル濃度と比較したエクソン53スキップのあるバンド(201bp)のモル濃度(nmol/l)の割合としてDMDエクソン53スキッピングの割合を算出する。
対応のない両側スチューデントt検定(等分散性)を用いて、各用量で2群の平均値に統計学的差がみられるかどうかを評価した。P値<0.05を統計学的に有意であるとした。
Figure 0007160807000109

結果を下の表および図4に示す。図4では、エラーバーは平均±SDを表し、バーの上の「[数字]x」は、各濃度でPMO#1と比較したPPMO#1によるエクソンスキッピングの割合の相対的変化倍数を表し、「」は、p値<0.05のPMO#1とPPMO#1の間の有意差を表す。
Figure 0007160807000110

驚くべきことに、上の表および図4のデータから、筋芽細胞をPPMO#1で処置すると、いずれの濃度でも細胞にPMO#1と比較して有意に高値のエクソン53スキッピングがもたらされることがわかり、その程度は予想外のものである。この有意な改善は、非ヒト霊長類(NHP)をPPMO#1またはPMO#1で処置し様々な関連する筋組織のエクソン53スキッピングを測定する実施例5のNHP試験(詳細については実施例5を参照されたい)などのin vivoの比較試験でさらに示される可能性がある。さらに、PPMO#1は、この実施例で使用したSKM-M培地中ではこの試験の時間尺度で分解される(データ不掲載)ことから、NHP試験では、この実施例で示されたものを大幅に上回る改善が示されるものと思われる。
実施例4:mdxマウス試験
mdxマウスは、ジストロフィン遺伝子のエクソン23に変異を含み、デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)の動物モデルとして認められよく特徴付けられたモデルである。M23Dアンチセンス配列(配列番号2)は、エクソン23スキッピングを誘導し機能性ジストロフィンの発現を回復されることがわかっている。6~7週齢のmdxマウスの尾静脈に下の表のPPMO4225またはPMO4225を用量40mg/kgで単回注射するか、または生理食塩水を単回注射した。
Figure 0007160807000111

PMO4225およびPPMO4225は、それぞれ上記のPMOの方法AおよびCPPのコンジュゲーション方法により調製した。
単回用量注射から7日後、30日後、60日後および90日後、処置マウスを屠殺した(1グループあたりn=6)。ジストロフィンタンパク質の産生量を測定するウエスタンブロット解析およびエクソンスキッピングの割合を測定するRT-PCR解析に横隔膜、心臓および右側四頭筋を、免疫組織化学およびH/E染色に左側四頭筋を上記の通りに処理した。
それぞれ上記の通りに、ジストロフィンタンパク質回復をウエスタンブロットにより定量化し、エクソン23スキッピングの割合をRT-PCRにより測定した。
RT-PCRおよびウエスタンブロットの結果を図5A~10Bおよび下の表に示す。驚くべきことに、PPMO4225はPMO4225と比較して、有意に高く持続的なレベルのジストロフィン回復およびエクソン23スキッピングを誘導し、注射から30日後に最大レベルがみられた。さらに驚くべきことに、PPMO4225は、PMO4225が心臓のジストロフィンレベルを増大させなくてもこれを増大させ;PMO4225では、いずれの時点でも心臓にジストロフィンおよびエクソンスキッピングが観察されなかった。
Figure 0007160807000112
Figure 0007160807000113
免疫組織化学の結果を図11に示す。図から、PPMO4225によって四頭筋全体にジストロフィンが回復しているのに対し、4225では「斑状」の発現パターンがみられる。PPMO4225で処置するとジストロフィンの均一な分布がみられることから、骨格筋を広範囲にわたって標的化することが可能であることがわかる。PPMO4225はin vivoでの送達がPMO4225よりも有意に改善されている。
実施例5:NHPでのエクソン53スキッピング
PPMOアンチセンスオリゴマーによるエクソンスキッピングの有効性をさらに明らかにするため、非ヒト霊長類を用いる。具体的には、下の表の投与スケジュールに従い、インタクトの筋組織を有するカニクイザルの静脈内にPPMO#1、PMO#1(実施例3のもの)または生理食塩水を注射する:
Figure 0007160807000114

試験全体を通して、臨床観察(例えば、皮膚および被毛、呼吸作用の評価)および体重測定を含めて動物を観察する。少なくとも試験開始前ならびに最初の投与および最後の投与(該当する場合)の24時間後に血液試料および尿試料を採取する。
スケジュールに組み込んだ剖検または瀕死状態での安楽死の際にはその都度、横隔膜、十二指腸、食道および大動脈の平滑筋、四頭筋、三角筋、二頭筋ならびに心臓の切片を収集し、急速凍結させる。上記のようにRT-PCRを用いてパーセントエクソン51スキッピングを求める。
実施例6:mdxマウスの用量反応試験
6~7週齢のmdxマウスの尾静脈に上記のPPMO4225またはPMO4225を用量40mg/kg、80mg/kgまたは120mg/kgで単回注射した(1グループ当たりn=6)。
注射から30日後、処置マウスを屠殺した。上記のウエスタンブロットプロトコル(例えば、実施例4で用いたもの)をベースとし以下のように改変を施したジストロフィンタンパク質の産生量を測定するウエスタンブロット解析用に横隔膜、四頭筋および心臓を処理した:
Figure 0007160807000115
野生型に対する%で表したジストロフィンタンパク質回復を下の表および図12~15に示す。
Figure 0007160807000116
驚くべきことに、データから、mdxマウスではPPMO4225の単回投与によってジストロフィンレベルが用量依存性にPMO4225より有意かつ大幅に増大することがわかる。
実施例7:mdxマウスの横隔膜および心臓に関するIHC試験
6~7週齢のmdxマウスの尾静脈にPPMO4225を用量80mg/kgで単回注射するか、または生理食塩水を単回注射し、6~7週齢の野生型マウスに生理食塩水を単回注射した。単回用量注射から30日後、処置mdxマウス、生理食塩水mdxマウスおよび野生型マウスを屠殺した(1グループ当たりn=4)。免疫組織化学の結果を図19に示す。図の結果から、PPMO4225で処置したmdxマウスでは、DMDの罹患率および死亡率と関連する組織中のジストロフィンが均一に増大していることがわかる。
実施例8:in vitro(筋管)のエクソン53スキッピング
ヒトジストロフィン(DMD)エクソン53を標的とし同じ配列を含む下の表に記載の2種類の化合物、PMO#1およびPPMO#1のDMDエクソン53スキッピングを健常ヒト筋管で評価した。
Figure 0007160807000117

具体的には、健常ヒト筋芽細胞(継代第5~6代、Zen-Bio社から購入したSKB-F-SL)をSKM-M培地で80~90%のコンフルエンスに達するまで培養した後、低血清培地(SKM-D、Zen-Bio社)でインキュベートすることにより分化を開始させた。分化から5日後、成熟筋管を様々な濃度(すなわち、40μm、20μm、10μm、5μm、2.5μmおよび1.25μm)の上記化合物とインキュベートした。96時間インキュベートした後、筋管をPBSで洗浄し、RNeasy Microキット(カタログ番号74004、Qiagen社)のRLT溶解緩衝液により溶解させた。RNAの溶離に無RNアーゼ水20μLを使用した以外は製造業者の推奨に従って全RNAを単離した。
両化合物によるエクソン53スキッピングを求めるため、2段階エンドポイントRT-PCRを実施した。具体的には、最初に、ランダムヘキサマーを用いたSuperScript IV First鎖合成キット(カタログ番号18091200、Invitrogen社)により7マイクロリットルの全RNAを製造業者の指示通りにcDNAに逆転写した。cDNA 5μLをPlatinum Taq DNAポリメラーゼPCR Supermix High Fidelity(カタログ番号12532024、Invitrogen社)にヒトDMDエクソン51/52接合部およびエクソン54を標的とするプライマー(順方向プライマー:CAT CAA GCA GAA GGC AAC AA;逆方向プライマー:GAA GTT TCA GGG CCA AGT CA)とともに加えることによりPCRを実施した。BioRad CFX96リアルタイムサーモサイクラーを用い表2に示すプログラムを用いてPCR増幅を実施した。PCR産物32μLをLabChip GXシステムにかけ、DNA High Sensitivity Reagentキット(CLS760672、Perkin Elmer社)を用いてスキップのあるPCR産物またはスキップのないPCR産物の発現を評価した。エクソン53スキップのあるバンド(201bp)とエクソン53スキップのないバンド(413bp)の合計モル濃度と比較したエクソン53スキップのあるバンド(201bp)のモル濃度(nmol/l)の割合としてDMDエクソン53スキッピングの割合を算出する。
対応のない両側スチューデントt検定(等分散性)を用いて、各用量で2群の平均値に統計学的差がみられるかどうかを評価した。P値<0.05を統計学的に有意であるとする。
Figure 0007160807000118

結果を下の表および図20に示す。図20では、エラーバーは平均±SDを表し、「[数字]x」は、各濃度でPMO#1と比較したPPMO#1によるエクソンスキッピングの割合の相対的変化倍数を表し、「」、「**」は、それぞれp値<0.05またはp値<0.005のPMO#1とPPMO#1の間の有意差を表す。
Figure 0007160807000119

驚くべきことに、上の表および図20のデータから、細胞をPPMO#1で処置すると、少なくとも5μmおよび10μmの濃度で筋管にPMO#1と比較して有意に高値のエクソン53スキッピングがもたらされることがわかり、その程度は予想外のものである。この有意な改善は、非ヒト霊長類(NHP)をPPMO#1またはPMO#1で処置し、様々な関連する筋組織のエクソン53スキッピングを測定する実施例5のNHP試験(詳細については実施例5を参照されたい)などのin vivoの比較試験でさらに示される可能性がある。さらに、PPMO#1は、この実施例で使用したSKM-M培地中ではこの試験の時間尺度で分解される(データ不掲載)ことから、NHP試験では、この実施例で示されたものを大幅に上回る改善が示されるものと思われる。
本明細書で引用される刊行物および特許出願はいずれも、個々の刊行物または特許出願が参照により組み込まれることをそれぞれ具体的かつ個別に明記した場合と同様に、参照により本明細書に組み込まれる。
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Figure 0007160807000120

Claims (6)

  1. 式(IV)
    Figure 0007160807000121

    のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩。
  2. 前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートが、薬学的に許容される塩の形態である、請求項1に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
  3. 前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートが式(IVA)
    Figure 0007160807000122

    ある、請求項2に記載のアンチセンスオリゴマーコンジュゲート。
  4. 式(IV)
    Figure 0007160807000123

    のアンチセンスオリゴマーコンジュゲートまたはその薬学的に許容される塩と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
  5. 前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートが、薬学的に許容される塩の形態である、請求項4に記載の医薬組成物。
  6. 前記アンチセンスオリゴマーコンジュゲートが式(IVA)
    Figure 0007160807000124

    ある、請求項5に記載の医薬組成物。
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