ES2360746T3 - Expresión híbrida de proteínas e neisseriales. - Google Patents
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Abstract
Una proteína híbrida de fórmula NH 2-A-B-COOH, en la que A comprende la proteína ΔG287 de Neisseria, y B comprende la proteína 961 de Neisseria, y en la que la secuencia de aminoácidos de la proteína híbrida es la descrita en SEQ ID NO:8, o es una secuencia que tiene más de 70% de identidad de secuencia con ésta.
Description
Campo técnico
La presente invención pertenece al campo de la expresión de proteínas. En particular, se refiere a la expresión heteróloga de proteínas de Neisseria (por ejemplo, N. gonorrhoeae o, preferiblemente, N. meningitidis).
Las solicitudes de patente internacional WO99/24578, WO99/35544, WO99/57280 y WO00/22430 divulgan proteínas de Neisseria meningitidis y Neisseria gonorrhoeae. Estas proteínas se describen, de forma típica, expresadas en E. coli (es decir, una expresión heteróloga) como fusiones con GST N-terminales o como fusiones con marcador de His C-terminales, aunque también se describen otros sistemas de expresión, incluyendo la expresión en Neisseria nativa.
Gruiller et al., Biotecnología aplicada, 1996, vol. 13, nº 4, págs. 271-275 divulga una proteína de fusión de la proteína
Un objeto de la presente invención es proporcionar estrategias alternativas y mejoradas para la expresión heteróloga de estas proteínas. Estas estrategias afectan, de modo típico, al nivel de expresión, la facilidad de purificación, la localización celular de la expresión y/o las propiedades inmunológicas de la proteína expresada.
Divulgación de la invención
Según la invención, se expresan dos proteínas de la invención como una única proteína híbrida. Se prefiere no
utilizar un compañero de fusión que no provenga de Neisseria (por ejemplo, GST o poli-His).
Esto ofrece dos ventajas. En primer lugar, una proteína que puede ser inestable, o que se expresa poco por sí sola,
puede mejorarse añadiendo un compañero de hibridación adecuado que solucione el problema.
En segundo lugar, se simplifica la fabricación comercial, ya que sólo es necesario emplear una expresión y
purificación para producir dos proteínas útiles por separado.
Así, la invención proporciona un procedimiento para la expresión heteróloga simultánea de dos proteínas de la
invención, en el que dichas dos o más proteínas de la invención están fusionadas (es decir, se traducen como una
sóla cadena polipeptídica).
El procedimiento incluirá de forma típica las etapas de obtener un primer ácido nucleico que codifique una primera
proteína de la invención; obtener un segundo ácido nucleico que codifique una segunda proteína de la invención;
ligar el primer y el segundo ácido nucleico. El ácido nucleico resultante puede insertarse en un vector de expresión, o
puede ser ya parte de un vector de expresión.
La proteína híbrida puede representarse con la fórmula NH2-A-B-COOH. A comprende la proteína 287 y B
comprende la proteína 961.
287 es su forma ΔG-287 con deleciones de poliglicina (ΔG).
La proteína híbrida de la invención es ΔG287-961.
287 se usa en el extremo N-terminal como una forma ΔG de 287, como el extremo N-terminal de un híbrido con 961.
287 es preferentemente de la cepa 1996 o de la cepa 394/98. Pueden usarse las formas de dominios de 961.
Las alineaciones de formas polimórficas de ORF46, 287, 919 y 953 se divulgan en el documento WO00/66741.
Cualquiera de estos polimorfos puede usarse de acuerdo con la presente invención.
Preferentemente, las proteínas constituyentes (A y B) e una proteína híbrida de acuerdo con la invención vendrán de
la misma cepa.
Las proteínas fusionadas en el híbrido están unidas directamente.
Las proteínas fusionadas pueden carecer de los péptidos conductores nativos, o pueden incluir la secuencia
peptídica conductora del compañero de fusión N-terminal
Huésped
Se prefiere utilizar un huésped heterólogo. El huésped heterólogo puede ser procariota o eucariota. Preferiblemente es E. coli, pero otros huéspedes adecuados incluyen Bacillus subtilis, Vibrio cholerae, Salmonella typhi, Salmonella typhimurium, Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Neisseria lactamica, Neisseria cinerea, Mycobacteria
5 (por ejemplo, M. tuberculosis), levaduras, etc.
Secuencias
La invención también proporciona una proteína que comprende las secuencias de la secuencia SEQ ID NO 8.
El grado de "identidad de secuencia" es preferiblemente mayor que 70%. Esto incluye mutantes y variantes alélicas [por ejemplo, véase el documento WO00/66741]. La identidad se determina preferiblemente mediante el algoritmo de
10 búsqueda de homología de Smith-Waterman, ejecutado en el programa MPSRCH (Oxford Molecular), empleando una búsquedad de huecos afines con los parámetros penalización de hueco abierto = 12 y penalización de extensión de hueco = 1.
Las proteínas de la invención preferidas se encuentran en el serogrupo B de N. meningitidis.
Las proteínas de la invención preferidas son las del serogrupo B de la cepa 2996 o de la cepa 394/98 (una cepa de
15 Nueva Zelanda) . A menos que se indique lo contrario, las proteínas mencionadas en la presente proceden de la cepa 2996 de N. meningitidis. Sin embargo, se apreciará que la invención no está limitada, en general, por la cepa. Puede considerarse que las referencias a una proteína concreta (por ejemplo, “287”, “919”, etc.) incluyen esa proteína de cualquier cepa.
Breve descripción de los dibujos
20 Las figuras 1 y 2 muestran las proteínas híbridas de acuerdo con la invención.
Modos de realizar la invención
Se descubrió que la deleción de la secuencia (Gly)6 en 287 tiene un profundo efecto sobre la expresión proteica. La proteína que carece de los aminoácidos N-terminales hasta GGGGGG se denomina "G287". En la cepa MC58, su
25 secuencia básica (el péptido conductor está subrayado) es:
La G287, con o sin un marcador de His ("G287-His" y "G287K", respectivamente) se expresa a niveles muy buenos, comparada con "287-His" o "287sin marcar".
Basándose en los datos de variabilidad genética, se expresaron variantes de -G287-His en E. coli de una serie de
30 cepas MenB, en particular de las cepas 2996, MC58, 1000 y BZ232. Los resultados también fueron buenos; cada uno de ellos produjo altas valoraciones con ELISA y también unas valoraciones bactericidas séricas >8192. La G287K, expresada a partir de pET-24b, produjo excelentes valoraciones en el ensayo ELISA y bactericida sérico.
La G287 se fusionó directamente dentro de marco cadena arriba de 919 (las secuencias que aparecen a continuación):
- ELISA
- Bactericida
- G287-961-His
- 108627 65536
Se prepararon las mismas proteínas híbridas utilizando la cepa 394/98 de Nueva Zelanda en lugar de 2996:
La expresión de 287, de longitud completa con un marcador de His C-terminal, o sin su péptido conductor pero con
5 un marcador de His C-terminal, produce unos niveles de expresión bastante bajos. Se logró una mejor expresión empleando una fusión con GST N-terminal. Cuando se fusiona con la proteína 961 (la secuencia NH2-G287-961COOH mostrada anteriormente), la proteína resultante es insoluble y debe desnaturalizarse y renaturalizarse para la purificación. Después de la renaturalización, se descubrió que aproximadamente 50% de la proteína permanecía insoluble. Las proteínas soluble e insoluble se compararon, y se obtuvieron unas valoraciones bactericidas mucho
10 mejores con la proteína soluble (FCA como adyuvante):
- 2996
- BZ232 MC58 NGH38 F6124 BZ133
- Soluble
- 65536 128 4096 >2048 >2048 4096
- Insoluble
- 8192 <4 <4 16 n.d. n.d.
Sin embargo, las valoraciones con la forma insoluble mejoraron utilizando un adyuvante de alumbre:
- Insoluble
- 32768 128 4096 >2048 >2048 2048
También se usó 961c en las proteínas híbridas (véase anteriormente). Puesto que 961 y sus variantes de dominio 5 dirigen una expresión eficaz, son idealmente adecuados como porción N-terminal de una proteína híbrida.
Detalles experimentales
Estrategia de clonación y diseño de oligonucleótidos
Los genes que codifican los antígenos de interés se amplificaron mediante PCR, utilizando oligonucleótidos diseñados basándose en la secuencia genómica de N. meningitidis B MC58. Siempre se utiliza ADN genómico de la
10 cepa 2996 como molde en las reacciones de PCR, a menos que se indique lo contrario, y los fragmentos amplificados se clonaron en el vector de expresión pET21b+ (Novagen) para expresar la proteína como producto marcado con His C-terminal, o en pET-24b+ (Novagen) para expresar la proteína en forma "no marcada" (por ejemplo, G287K).
Cuando una proteína se expresa sin un compañero de fusión y con su propio péptido conductor (si está presente), se 15 realiza una amplificación del marco de lectura abierto (codones desde ATG hasta FIN).
Cuando una proteína se expresa en forma "no marcada", el péptido conductor se omite diseñando el cebador de amplificación del 5'-terminal cadena abajo de la secuencia conductora predicha.
La temperatura de fusión de los cebadores utilizados en la PCR depende del número y tipo de nucleótidos hibridantes en el cebador completo, y se determinó empleando las fórmulas:
20 Tm1 = 4(G+C) + 2(A+T) (sin la cola)
Tm2 = 64,9 + 0,41 (GC%) - 600/N (cebador completo)
Las temperaturas de fusión de los oligonucleótidos seleccionados eran normalmente de 65-70ºC para el oligonucleótido completo, y de 50-60ºC para la región de hibridación sola.
Se sintetizaron oligonucleótidos utilizando un sintetizador de ADN/ARN Perkin Elmer 394, se eluyeron de las
25 columnas en 2,0 ml de NH4OH, y se desprotegieron mediante 5 horas de incubación a 56ºC. Los oligonucleótidos se precipitaron mediante la adición de acetato de Na 0,3 M y 2 volúmenes de etanol. Las muestras se centrifugaron y los sedimentos se resuspendieron en agua.
En todos los constructos que comienzan con un ATG no seguido por un sitio NheI exclusivo, el codón ATG es parte del sitio NheI utilizado para la clonación. Los constructos fabricados utilizando NheI como sitio de clonación en el extremo 5' (por ejemplo, los que contienen 287 en el N-terminal) tienen dos codones más (GCT AGC) fusionados a la secuencia codificadora del antígeno.
Preparación de moldes de ADN cromosómico
Las cepas 2996, MC58, 394.98, 1000 y BZ232 (y otras) de N. meningitidis se cultivaron hasta la fase exponencial en 100 ml de medio GC, se recogieron mediante centrifugación, y se resuspendieron en 5 ml de tampón (sacarosa al 20% p/v, Tris-HCl 50 mM, EDTA 50 mM, pH 8). Después de 10 min de incubación en hielo, las bacterias se lisaron añadiendo 10 ml de disolución de lisis (NaCl 50 mM, Na-Sarkosyl al 1%, proteinasa K 50 g/ml), y la suspensión se incubó a 37ºC durante 2 horas. Se realizaron dos extracciones con fenol (equilibrado a pH 8) y una extracción con CHCl3/alcohol isoamílico (24:1). El ADN se precipitó mediante la adición de acetato de sodio 0,3 M y 2 volúmenes de etanol, y se recogió mediante centrifugación. El sedimento se lavó una vez con etanol al 70% (v/v) y se redisolvió en 4,0 ml de tampón TE (Tris-HCl 10 mM, EDTA 1 mM, pH 8,0). Se midió la concentración de ADN mediante una lectura de DO260.
Amplificación mediante PCR
El protocolo de PCR convencional fue el siguiente: se utilizó como molde 200 ng de ADN genómico procedente de las cepas 2996, MC581000 o BZ232, o 10 ng de preparación de ADN de plásmido de clones recombinantes, en presencia de 40 M de cada uno de los cebadores oligonucleotídicos, disolución de dNTP 400-800 M, 1x tampón de PCR (que incluye MgCl2 1,5 mM), 2,5 unidades de TaqI ADN polimerasa (utilizando Perkin-Elmer AmpliTaQ, molde largo Boehringer Mannheim Expand).
Después de una incubación preliminar de 3 minutos de la mezcla completa a 95ºC, cada muestra se sometió a una amplificación en dos etapas: los primeros 5 ciclos se realizaron utilizando la temperatura de hibridación que excluye la cola de enzimas de restricción del cebador (Tm1). Después siguieron 30 ciclos según la temperatura de hibridación calculada para los oligonucleótidos de longitud completa (Tm2). Los tiempos de alargamiento, realizado a 68ºC o 72ºC, varían según la longitud del Orf (marco de lectura abierto) que se va a amplificar. En el caso de Orf1, el tiempo de alargamiento, comenzando a partir de 3 minutos, aumentó en 15 segundos cada ciclo. Los ciclos se completaron con una etapa de extensión de 10 minutos a 72ºC.
El ADN amplificado se cargó directamente sobre un gel de agarosa al 1%. El fragmento de ADN que corresponde a la banda del tamaño correcto se purificó del gel utilizando el kit de extracción de gel de Qiagen, siguiendo el protocolo del fabricante.
Digestión de los fragmentos de PCR y de los vectores de clonación
El ADN purificado que corresponde al fragmento amplificado se digirió con las enzimas de restricción apropiadas para clonarlo en pET-21b+, pET22b+ o pET-24b+. Los fragmentos digeridos se purificaron utilizando el kit de purificación de PCR QIAquick (siguiendo las instrucciones del fabricante) y se eluyeron con H2O, o con Tris 10 mM, pH 8,5. Los vectores plásmidos se digirieron con las enzimas de restricción apropiadas, se cargaron sobre un gel de agarosa al 1,0%, y la banda correspondiente al vector digerido se purificó utilizando el kit de extracción de gel QIAquick de Qiagen.
Los fragmentos que correspondían a cada gen, previamente digeridos y purificados, se acoplaron a pET-21b+, pET22b+ o pET-24b+. Se empleó una proporción molar de fragmento/vector 3:1 con ADN ligasa de T4 en el tampón de acoplamiento suministrado por el fabricante.
El plásmido recombinante se transformó en E. coli DH5 o HB101 competente mediante la incubación de la disolución de reacción de ligasa y bacterias durante 40 minutos en hielo, y después a 37ºC durante 3 minutos. A esto le siguió la adición de 800 l de caldo de cultivo LB y una incubación a 37ºC durante 20 minutos. Las células se centrifugaron a velocidad máxima en una microcentífuga Eppendorf, se resuspendieron en aproximadamente 200 l del sobrenadante, y se colocaron en placas con agar con ampicilina y LB (100 mg/ml).
La selección de los clones recombinantes se realizó cultivando colonias, seleccionadas aleatoriamente, durante la noche a 37ºC en 4,0 ml de caldo de cultivo LB + ampicilina 100 g/ml. Las células se sedimentaron y el ADN del plásmido se extrajo utilizando el kit de minipreparaciones de centrifugación QIAprep de Qiagen, siguiendo las instrucciones del fabricante. Se digirió aproximadamente 1 g de cada minipreparación individual con las enzimas de restricción apropiadas, y el digerido se cargó sobre un gel de agarosa al 1-1,5% (dependiendo del tamaño esperado del inserto), en paralelo con el marcador de peso molecular (1 kb de DNA Ladder, GIBCO). Los clones positivos se seleccionaron basándose en el tamaño del inserto.
Después de clonar cada gen en el vector de expresión, los plásmidos recombinantes se transformaron en cepas de
E. coli adecuadas para la expresión de la proteína recombinante. Se empleó 1 l de cada constructo para transformar E. coli BL21-DE3 como se describió anteriormente. Se inocularon colonias recombinantes individuales en 2 ml de LB + ampicilina (100 g/ml), se incubaron a 37ºC durante la noche, después se diluyeron 1:30 en 20 ml de LB + ampicilina (100 g/ml) en matraces de 100 ml, para producir una DO600 entre 0,1 y 0,2. Los matraces se incubaron a 30ºC o a 37ºC en un agitador de baño de agua giratorio hasta que la DO600 indicó un crecimiento exponencial adecuado para la inducción de la expresión (0,4-0,8 DO). La expresión de las proteínas se indujo mediante la adición de IPTG 1,0 mM. Después de 3 horas de incubación a 30ºC o a 37ºC, se midió la DO600 y se estudió la expresión. Se centrifugaron 1,0 ml de cada muestra en una microcentrífuga, el sedimento se resuspendió en PBS y se analizó mediante SDS-PAGE y tinción con azul de Coomassie.
Purificación de proteínas marcadas con His
Se clonaron diversas formas de 287 a partir de las cepas 2996 y MC58. Se construyeron con una fusión de un marcador de His C-terminal e incluían una forma madura (aa 18-427), constructos con deleciones (1, 2, 3 y 4), y clones compuestos de dominios B o C. Para cada clon purificado como una fusión con His, se realizó una siembra en estría de una única colonia y se cultivó durante la noche a 37ºC sobre una placa de agar con LB/ampicilina (100 g/ml). Una colonia aislada de esta placa se inoculó en 20 ml de medio líquido de LB/ampicilina (100 g/ml) y se cultivó durante la noche a 37ºC con agitación. El cultivo de la noche se diluyó 1:30 en 1,0 l de medio líquido de LB/ampicilina (100 g/ml) y se dejó que creciese a la temperatura óptima (30ºC o 37ºC) hata que la DO550 alcanzó un valor de 0,6-0,8. La expresión de la proteína recombinante se indujo mediante la adición de IPTG (concentración final 1,0 mM) y el cultivo se incubó durante 3 horas más. Las bacterias se recolectaron mediante centrifugación a 8000 g durante 15 min a 4ºC. El sedimento bacteriano se resuspendió en 7,5 ml de (i) tampón A frío (NaCl 300 mM, tampón fosfato 50 mM, imidazol 10 mM, pH 8,0) para proteínas solubles, o (ii) tampón B (Tris-HCl 10 mM, tampón fosfato 100 mM, pH 8,8 y, opcionalmente, urea 8 M) para proteínas insolubles. Las proteínas purificadas en forma soluble incluían 287-His, 1, 2, 3 y 4287-His, 4287MC58-His, 287c-His y 287c-MC58-His. La proteína 287bMC58-His era insoluble y se purificó en consecuencia. Las células se rompieron mediante sonicación sobre hielo cuatro veces durante 30 seg a 40 W utilizando un sonicador 450 Branson, y se centrifugaron a 13000 x g durante 30 min a 4ºC. Para las proteínas insolubles, los sedimentos se resuspendieron en 2,0 ml de tampón C (clorhidrato de guanidina 6 M, tampón fosfato 100 mM, Tris-HCl 10 mM, pH 7,5), y se trataron con 10 pases con un homogeneizador Dounce. El homogeneizado se centrífugo a 13000 g durante 30 min y se guardó el sobrenadante. Los sobrenadantes de las preparaciones soluble e insoluble se mezclaron con 150 l de resina Ni2+ (previamente equilibrada con tampón A o tampón B, según sea apropiado) y se incubaron a temperatura ambiente con una agitación suave durante 30 min. La resina era Chelating Sepharose Fast Flow (Pharmacia), preparada según las instrucciones del fabricante. La preparación discontinua se centrífugo a 700 g durante 5 min a 4ºC y se rechazó el sobrenadante. La resina se lavó dos veces (de forma discontinua) con 10 ml de tampón A o B durante 10 min, se resuspendió en 1,0 ml de tampón A
o B, y se cargó en una columna desechable. La resina continuó lavándose con (i) tampón A a 4ºC, o (ii) tampón B a temperatura ambiente, hasta que la DO280 de la corriente alcanzó un valor de 0,02-0,01. La resina se volvió a lavar con (i) tampón C frío (NaCl 300 mM, tampón fosfato 50 mM, imidazol 20 mM, pH 8,0), o (ii) tampón D (Tris-HCl 10 mM, tampón fosfato 100 mM, pH 6,3 y, opcionalmente, urea 8 M) hasta que la DO280 de la corriente alcanzó un valor de 0,02-0,01. La proteína de fusión-His se eluyó mediante la adición de 700 l de (i) tampón de elución A frío (NaCl 300 mM, tampón fosfato 50 mM, imidazol 250 mM, pH 8,0), o (ii) tampón de elución B (Tris-HCl 10 mM, tampón fosfato 100 mM, pH 4,5 y, opcionalmente, urea 8 M), y las fracciones se recogieron hasta que la DO280 indicó que se había obtenido toda la proteína recombinante. Se analizaron partes alícuotas de 20 l de cada fracción de elución mediante SDS-PAGE. Se estimaron las concentraciones de proteínas utilizando el ensayo de Bradford.
Renaturalización de las proteínas de fusión-His desnaturalizadas
Se requiere una desnaturalización para solubilizar 287bMC8, por tanto se empleó una etapa de renaturalización antes de la inmunización. Se añadió glicerol a las fracciones desnaturalizadas obtenidas anteriormente para producir una concentración final de 10% v/v. Las proteínas se diluyeron hasta 200 g/ml utilizando tampón de diálisis I (glicerol al 10% v/v, arginina 0,5 M, tampón fosfato 50 mM, glutatión reducido 5,0 mM, glutatión oxidado 0,5 mM, urea 2,0 M, pH 8,8), y se dializaron contra el mismo tampón durante 12-14 horas a 4ºC. Se realizó otra diálisis con tampón II (glicerol al 10% v/v, arginina 0,5 M, tampón fosfato 50 mM, glutatión reducido 5,0 mM, glutatión oxidado 0,5 mM, pH 8,8) durante 12-14 horas a 4ºC. Se estimó la concentración de proteína utilizando la fórmula:
Proteína (mg/ml) = (1,55 x DO280) - (0,76 x DO260)
Se inmunizaron ratontes Balb/C con antígenos en los días 0, 21 y 35, y se analizaron los sueros el día 49.
Las cepas MenB M7 acapsuladas y las capsuladas se cultivaron en placas de agar de chocolate y se incubaron durante la noche a 37ºC con CO2 al 5%. Las colonias bacterianas se recogieron de las placas de agar utilizando un hisopo Dracon estéril y se inocularon en caldo de cultivo Mueller-Hinton (Difco) que contenía glucosa al 0,25%. El crecimiento bacteriano se controló cada 30 minutos siguiendo la DO620. Se dejaron crecer las bacterias hasta que la DO alcanzó un valor de 0,4-0,5. El cultivo se centrífugo durante 10 minutos a 4000 rpm. El sobrenadante se eliminó y las bacterias se lavaron dos veces con PBS, se resuspendieron en PBS que contenía formaldehído al 0,025%, y se incubaron durante 1 hora a 37ºC, y después durante la noche a 4ºC con agitación. Se añadieron 100 l de células bacterianas a cada pocillo de una placa Greiner de 96 pocillos y se incubaron durante la noche a 4ºC. Los pocillos entonces se lavaron tres veces con tampón de lavado PBT (Tween-20 al 0,1% en PBS). Se añadieron 200 l de tampón de saturación (polivinilpirrolidona 10 al 2,7% en agua) a cada pocillo y las placas se incubaron durante 2 horas a 37ºC. Los pocillos se lavaron tres veces con PBT. Se añadieron 200 l de los sueros diluidos (tampón de dilución: BSA al 1%, Tween-20 al 0,1%, NaN3 al 0,1% en PBS) a cada pocillo, y las placas se incubaron durante 2 horas a 37ºC. Los pocillos se lavaron tres veces con PBT. Se añadieron 100 l a cada pocillo de suero antirratón de conejo conjugado con HRP (Dako) diluido 1:2000 en tampón de dilución, y las placas se incubaron durante 90 minutos a 37ºC. Los pocillos se lavaron tres veces con tampón PBT. Se añadieron 100 l de tampón sustrato para HRP (25 ml de tampón citrato, pH 5, 10 mg de O-fenildiamina, y 10 l de H2O2) a cada pocillo, y las placas se dejaron a temperatura ambiente durante 20 minutos. Se añadieron 100 l de H2SO4 al 12,5% a cada pocillo y se siguió la DO490. Las valoraciones de ELISA se calcularon de manera arbitraria como la dilución de los sueros que produce un valor de DO490 de 0,4 por encima del nivel de los sueros preinmunológicos. El ELISA se consideró positivo cuando la dilución de los sueros con una DO490 de 0,4 era mayor que 1:400.
Análisis de los sueros - Ensayo de unión de bacterias con barrido FACS
La cepa MenB M7 acapsulada se cultivó en placas de agar de chocolate y se incubó durante la noche a 37ºC con CO2 al 5%. Las colonias bacterianas se recogieron de las placas de agar utilizando un hisopo Dracon estéril y se inocularon en 4 tubos que contenían cada uno 8 ml de caldo de cultivo Mueller-Hinton (Difco) que contenía glucosa al 0,25%. El crecimiento bacteriano se controló cada 30 minutos siguiendo la DO620. Se dejaron crecer las bacterias hasta que la DO alcanzó un valor de 0,35-0,5. El cultivo se centrífugo durante 10 minutos a 4000 rpm. El sobrenadante se eliminó y el sedimento se resuspendió en tampón de bloqueo (BSA al 1% en PBS, NaN3 al 0,1% en PBS) y se centrífugo durante 5 minutos a 4000 rpm. Las células se resuspendieron en tampón de bloqueo para alcanzar una DO620 de 0,05. Se añadieron 100 l de células bacterianas a cada pocillo de una placa Costar de 96 pocillos. Se añadieron 100 l de los sueros diluidos (1:100, 1:200, 1:400) (en tampón de bloqueo) a cada pocillo, y las placas se incubaron durante 2 horas a 4ºC. Las células se centrifugaron durante 5 minutos a 4000 rpm, el sobrenadante se aspiró y las células se lavaron mediante la adición de 200 l/pocillo de tampón de bloqueo en cada pocillo. Se añadieron 100 l de F(ab)2 de cabra antirratón conjugado con R-ficoeritrina, diluido 1:100, a cada pocillo, y las placas se incubaron durante 1 hora a 4ºC. Las células se sedimentaron mediante centrifugación a 4000 rpm durante 5 minutos, y se lavaron mediante la adición de 200 l/pocillo de tampón de bloqueo. El sobrenadante se aspiró y las células se resuspendieron en 200 l/pocillo de PBS, formaldehído al 0,25%. Las muestras se trasladaron a tubos FACScan y se leyeron. Los ajustes del FACScan (potencia del láser 15 mW) fueron: FL2 activo; umbral de FSC-H: 92; voltaje de FSC PMT: E 01; SSC PMT: 474; ganancias de amp. 61; FL-2 PMT: 586; valores de compensación: 0.
Análisis de los sueros - Ensayo bactericida
Se cultivó la cepa 2996 de N. meningitidis durante la noche a 37ºC sobre placas de agar de chocolate (a partir de una cepa congelada) con CO2 al 5%. Las colonias se recogieron y se utilizaron para inocular 7 ml de caldo de cultivo Mueller-Hinton que contenía glucosa al 0,25% hasta alcanzar una DO620 de 0,05-0,08. El cultivo se incubó durante aproximadamente 1,5 horas a 37ºC con agitación hasta que la DO620 alcanzó un valor de 0,23-0,24. Las bacterias se diluyeron en tampón fosfato 50 mM, pH 7,2, que contenía MgCl2 10 mM, CaCl2 10 mM, y BSA al 0,5% (p/v) (tampón de ensayo) con una dilución de trabajo de 105 CFU/ml. El volumen total de la mezcla de reacción final era de 50 l, con 25 l de dilución en dos veces en serie del suero de ensayo, 12,5 l de bacterias en la dilución de trabajo, y 12,5 l de complemento de cría de conejo (concentración final 25%).
Los controles incluían bacterias incubadas con suero de complemento, sueros inmunológicos incubados con bacterias y con complemento inactivado mediante calentamiento a 56ºC durante 30 minutos. Inmediatamente después de la adición del complemento de cría de conejo, 10 l de los controles se cultivaron en placas de agar Mueller-Hinton utilizando el procedimiento de plano inclinado (tiempo 0). La placa de 96 pocillos se incubó durante 1 hora a 37ºC con rotación. Se colocaron 7 l de cada muestra sobre placas de agar Mueller-Hinton como gotas, mientras que 10 l de los controles se cultivaron en placas de agar Mueller-Hinton utilizando el procedimiento de plano inclinado (tiempo 1). Las placas de agar se incubaron durante 18 horas a 37ºC y se contaron las colonias correspondientes al tiempo 0 y tiempo 1.
Proteínas purificadas (500 ng/carril), vesículas de membrana externa (5 g) y extractos de células totales (25 g) procedentes de la cepa 2996 MenB se cargaron sobre un gel de SDS al 12%-poliacrilamida y se transfirieron a una membrana de nitrocelulosa. La transferencia se realizó durante 2 horas a 150 mA a 4ºC, utilizando tampón de transferencia (base Tris al 0,3%, glicina al 1,44%, etanol al 20% (v/v)). La membrana se saturó mediante una incubación durante la noche a 4ºC en tampón de saturación (leche desnatada al 10%, Triton X100 al 0,1% en PBS). La membrana se lavó dos veces con tampón de lavado (leche desnatada al 3%, Triton X100 al 0,1% en PBS) y se incubó durante 2 horas a 37ºC con sueros de ratón diluidos 1:200 en tampón de lavado. La membrana se lavó dos veces y se incubó durante 90 minutos con una dilución 1:2000 de anti-Ig de ratón marcada con peroxidasa de rábano. La membrana se lavó dos veces con Triton X100 al 0,1% en PBS y se reveló con el kit de sustrato Opti-4CN (Bio-Rad). La reacción se detuvo añadiendo agua.
Las VME (vesículas de membrana externa) se prepararon como sigue: la cepa 2996 de N. meningitidis se cultivó durante la noche a 37ºC con CO2 al 5% en 5 placas GC, se recolectó con un asa de siembra y se resuspendió en 10 ml de Tris-HCl 20 mM, pH 7,5, EDTA 2 mM. La inactivación con calor se realizó a 56ºC durante 45 minutos y las bacterias se rompieron mediante sonicación durante 5 min en hielo (50% del ciclo de servicio, 50% de salida, micropunta de 3 mm de sonicador Branson). Las células sin romper se retiraron mediante centrifugaciópn a 5000 g durante 10 minutos, el sobrenadante que contenía la fracción de la envuelta celular total se recuperó y se volvió a centrifugar durante la noche a 50000 g a una temperatura de 4ºC. El sedimento que contenía las membranas se resuspendió en Sarkosyl al 2%, Tris-HCl 20 mM, pH 7,5, EDTA 2 mM, y se incubó a temperatura ambiente durante 20 minutos para solubilizar las membranas internas. La suspensión se centrífugo a 1000 g durante 10 minutos para retirar los agregados, y el sobrenadante se volvió a centrifugar a 50000 g durante 3 horas. El sedimento, que contenía las membranas externas, se lavó en PBS y se resuspendió en el mismo tampón. La concentración de proteínas se midió mediante el ensayo de proteínas D.C. Bio-Rad (procedimiento de Lowry modificado), utilizando BSA como patrón.
Los extractos de células totales se prepararon como sigue: la cepa 2996 de N. meningitidis se cultivó durante la noche en una placa GC, se recolectó con un asa de siembra y se resuspendió en 1 ml de Tris-HCl 20 mM. La inactivación con calor se realizó a 56ºC durante 30 minutos.
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<220>
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<213> Secuencia artificial
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido
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<223> Oligonucleótido
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cccgctcgag cgtatcatat ttcacgtgc 29
Listado de secuencias
5 <110> Novartis Vaccines and Diagnostics SRL
<120> Expresión híbrida de proteínas de Neisseria
<130> P048826EP
<150> EP-01914098.7
<151> 28 de febrero de 2001 10 <150> PCT/IB01/00420
<151> 28 de febrero 2001
<150> GB 0004695.3
<151> 28 de febrero 200
<150> GB0027875.8 15 <151> 13 de noviembre 2000
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<170> SeqWin99, versión 1.02
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<220>
<223> 741
<400> 25
<210> 26
<211> 248
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> deltaG741
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<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
<220>
<223> deltaG741-961c 15 <400> 30
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<212> ADN
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<212> PRT
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<211> 2028
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<212> ADN
<213> Secuencia artificial
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
<220>
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<212> AND
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
<220>
<223> 961c-983
<400> 52
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<211> 2304
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
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5 <211> 765
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
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<212> ADN
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<212> ADN
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<223> 961cL-983
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<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> 961cL-983
<400> 58
<210> 59
<211> 25
<212> ADN
5 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 59
cgcggatccg gagggggtgg tgtcg 25 10 <210> 60
<211> 27
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 60 cccgctcgag ttgcttggcg gcaaggc 27
<210> 61
<211> 25
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 61 cgcggatccg gcggaggcgg cactt 25
<210> 62
<211> 26
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 62 cccgctcgag gaaccggtag cctacg 26
<210> 63
<211> 41
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 63 cgcggatccg gtggtggtgg ttcagatttg gcaaacgatt c 41
<210> 64
<211> 29
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 64
cccgctcgag cgtatcatat ttcacgtgc 29
<210> 65
<211> 25
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 65 cgcggatccg gagggggtgg tgtcg 25
<210> 66
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 66 cccgctcgag ttattgcttg gcggcaag 28
<210> 67
<211> 25
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 67 cgcggatccg gcggaggcgg cactt 25
<210> 68
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 68 cccgctcgag tcagaaccgg tagcctac 28
<210> 69
<211> 41
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 69 cgcggatccg gtggtggtgg ttcagatttg gcaaacgatt c 41
<210> 70
<211> 32
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 70 cccgctcgag ttacgtatca tatttcacgt gc 32
<210> 71
<211> 42
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 71 cgcggatccg gtggtggtgg tcaaagcaag agcatccaaa cc 42
<210> 72
<211> 30
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 72 cccaagcttt tcgggcggta ttcgggcttc 30
<210> 73
<211> 39
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 73 cgcggatccg gtggtggtgg tgccacctac aaagtggac 39
<210> 74
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 74 gcccaagctt ttgtttggct gcctcgat 28
<210> 75
<211> 34
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 75 cgcggatccg gtggtggtgg tacaagcgac gacg 34
<210> 76
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 76 gcccaagctt ccactcgtaa ttgacgcc 28
<210> 77
<211> 41
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 77 cgcggatccg gtggtggtgg ttcagatttg gcaaacgatt c 41
<210> 78
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 78 cccaagcttc gtatcatatt tcacgtgc 28
<210> 79
<211> 44
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 79 cccaagcttg gtggtggtgg tggttcagat ttggcaaacg attc 44
<210> 80
<211> 29
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 80 cccgctcgag cgtatcatat ttcacgtgc 29
<210> 81
<211> 45
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 81 cccaagcttg gtggtggtgg tggtcaaagc aagagcatcc aaacc 45
<210> 82
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 82 cccgctcgag cgggcggtat tcgggctt 28
<210> 83
<211> 32
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 83 cgcggatccg ctagccccga tgttaaatcg gc 32
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<211> 29
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 84 cggggatcca tcctgctctt ttttgccgg 29
<210> 85
<211> 36
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 85 cgcggatccg ctagcggaca cacttatttc ggcatc 36
<210> 86
<211> 30
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 86 cgcggatccc cagcggtagc ctaatttgat 30
<210> 87
<211> 41
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 87 cgcggatccg gtggtggtgg ttcagatttg gcaaacgatt c 41
<210> 88
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 88 cccaagcttc gtatcatatt tcacgtgc 28
<210> 89
<211> 36
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 89 gcggcgtcga cggtggcgga ggcactggat cctcag 36
<210> 90
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 90 ggaggcactg gatcctcaga tttggcaaac gattc 35
<210> 91
<211> 29
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 91 cccgctcgag cgtatcatat ttcacgtgc 29
<210> 92
<211> 25
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 92 cggggatccg ggggcggcgg tggcg 25
<210> 93
<211> 30
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 93 cccaagctta tcctgctctt ttttgccggc 30
<210> 94
<211> 42
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 94 cgcggatccg gtggtggtgg tcaaagcaag agcatccaaa cc 42
<210> 95
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 95 cccaagcttc gggcggtatt cgggcttc 28
<210> 96
<211> 26
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 96 ccccaagctt gggggcggcg gtggcg 26
<210> 97
<211> 31
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 97 cccgctcgag atcctgctct tttttgccgg c 31
<210> 98
<211> 45
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 98 cccaagcttg gtggtggtgg tggtcaaagc aagagcatcc aaacc 45
<210> 99
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 99
cccgctcgag cgggcggtat tcgggctt 28
<210> 100
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 100 ggaggcactg gatccgcagc cacaaacgac gacga 35
<210> 101
<211> 36
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 101 gcggcctcga gggtggcgga ggcactggat ccgcag 36
<210> 102
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 102 cccgctcgag acccaqcttg taaggttg 28
<210> 103
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 103 ggaggcactg gatccgcagc cacaaacgac gacga 35
<210> 104
<211> 36
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 104 gcggcctcga gggtggcgga ggcactggat ccgcag 36
<210> 105
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 105 cccgctcgag ccactcgtaa ttgacgcc 28
<210> 106
<211> 38
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 106 gcggcctcga gggatccggc ggaggcggca cttctgcg 38
<210> 107
<211> 26
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 107 cccgctcgag gaaccggtag cctacg 26
<210> 108
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 108 ggaggcactg gatcctcaga tttggcaaac gattc 35
<210> 109
<211> 37
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 109 gcggcgtcga cggtggcgga ggcactggat cctcaga 37
<210> 110
<211> 29
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 110 cccgctcgag cgtatcatat ttcacgtgc 29
<210> 111
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 111 gcggcctcga gggatccgga gggggtggtg tcgcc 35
<210> 112
<211> 25
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 112 cccgctcgag ttgcttggcg gcaag 25
<210> 113
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 113 ggaggcactg gatccgcagc cacaaacgac gacga 35
<210> 114
<211> 36
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 114 gcggcctcga gggtggcgga ggcactggat ccgcag 36
<210> 115
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 115 cccgctcgag acccagcttg taaggttg 28
<210> 116
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 116 ggaggcactg gatccgcagc cacaaacgac gacga 35
<210> 117
<211> 36
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 117 gcggcctcga gggtggcgga ggcactggat ccgcag 36
<210> 118
<211> 28
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 118 cccgctcgag ccactcgtaa ttgacgcc 28
<210> 119
<211> 35
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 119 ggaggcactg gatcctcaga tttggcaaac gattc 35
<210> 120
<211> 37
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Oligonucleótido
<400> 120 gcggcgtcga cggtggcgga ggcactggat cctcaga 37
<210> 121
<211> 29
<212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220> <223> Oligonucleótido
<400> 121 cccgctcgag cgtatcatat ttcacgtgc 29
Claims (2)
- REIVINDICACIONES1.- Una proteína híbrida de fórmula NH2-A-B-COOH, en la que A comprende la proteína G287 de Neisseria, y B comprende la proteína 961 de Neisseria, y en la que la secuencia de aminoácidos de la proteína híbrida es la descrita en SEQ ID NO:8, o es una secuencia que tiene más de 70% de identidad de secuencia con ésta.
- 2.- La proteína de la reivindicación 1, en la que G287 es de la cepa 2996 o 394/98 3.- La proteína de la reivindicación 1, en la que 961 es de la cepa 2996 o 394/98. 4.- La proteína de la reivindicación 1, en la que A y B son de la misma cepa. 5.- La proteína de la reivindicación 1, que comprende la secuencia de aminoácidos definida en SEQ ID NO:8.
Applications Claiming Priority (5)
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