具体实施方式
实施例1-919及其前导肽
脑膜炎奈瑟球菌(血清群B,菌株2996)的蛋白质919具有如下序列:
1
MKKYLFRAAL
YGIAAAILAA CQSKSIQTFP QPDTSVINGP DRPVGIPDPA
51 GTTVGGGGAV YTVVPHLSLP WHAAQDFAKS LQSFRLGCAN LKNRQGWQDV
101 CAQAFQTPVH SFQAKQFFER YFTPWQVAGN GSLAGTVTGY YKPVLKGDDR
151 RTAQARFPIY GIPDDFISVP LPAGLRSGKA LVRIRQTGKN SGTIDNTGGT
201 HTADLSRFPI TARTTAIKGR FEGSRFLPYH TRNQINGGAL DGKAPILGYA
251 EDPVELFFMH IQGSGRLKTP SGKYIRIGYA DKNEHPYVSI GRYMADKGYL
301 KLGQTSMQGI KAYMRQNPQR LAEVLGQNPS YIFFRELAGS SNDGPVGALG
351 TPLMGKYAGA VDRHYITLGA PLFVATAHPV TRKALNRLIM AQDTGSAIKG
401 AVRVDYFWGY GDEAGELAGK QKTTGYVWQL LPNGMKPEYR P*
在前导肽下加下划线。
可以在WO00/66741的图7和18中发现其它菌株的919序列。
WO99/57280的实施例2公开了在大肠杆菌中作为His-融合体的蛋白质919的表达。该蛋白质是优良的外露表面免疫原。
将另三种表达方法用于919:
1)919没有其前导肽(且没有成熟的N-未端半胱氨酸)且无任何融合配体(′919未标记的):
1 QSKSIQTFP QPDTSVINGP DRPVGIPDPA GTTVGGGGAV YTVVPHLSLP
50 HWAAQDFAKS LQSFRLGCAN LKNRQGWQDV CAQAFQTPVH SFQAKQFFER
100 YFTPWQVAGN GSLAGTVTGY YEPVLKGDDR RTAQARFPIY GIPDDFISVP
150 LPAGLRSGKA LVRIRQTGKN SGTIDNTGGT HTAKLSRFPI TARTTAIKGR
200 FEGSRFLPYH TRNQINGGAL DGKAPILGYA EDPVELFFMH IQGSGRLKTP
250 SGKYIRIGYA DKNEHPYVSI GRYMADKGYL KLGQTSMQGI KAYMRQNPQR
300 LAEVLGQNPS YIFFRELAGS SNDGPVGALG TPLMGEYAGA VDRHYITLGA
350 PLFVATAHPV TRKALNRLIM AQDTGSAIKG AVRVDYFWGY GDEAGELAGK
400 QKTTGYVWQL LPNGMKPEYR P*
通过设计从预定的前导序列的5′-端扩增引物下游除去前导肽和半胱氨酸。
2)包含其前导肽但无任何融合配体的919(‘919L′);和
3)包含ORF4的前导肽(MKTFFKTLSAAALALILAA)的919(‘919Orf4′)。
1
MKTFFKTLS
AAALALILAA CQSKSIQTFP QPDTSVINGP DRPVGIPDPA
50 GTTVGGGGAV YTVVPELSLP HWAAQDFAKS LQSFRLGCAN LKNRQGWQDV
100 CAQAFQTPVH SFQAKQFFER YFTPWQVAGN GSLAGTVTGY YEPVLKGDDR
150 RTAQARFPIY GIPDDFISVP LPAGLRSGKA LVRIRQTGKN SGTIDNTGGT
200 HTADLSRFPI TARTTAIKGR FEGSRFLPYH TRNQINGGAL DGKAPILGYA
250 EDPVKLFFMH IQGSGRLKTP SGKYIRIGYA DKNEHPYVSI GRYNADKGYL
300 KLGQTSMQGI KSYMRQNPQR LAEVLGQNPS YIFFRELAGS SNDGPVGALG
350 TPLMGEYAGA VDRHYITLGA PLFVATAHPV TRKALNRLIM AQDTGSAIKG
400 ARRVDYFWGY GDEAGELAGK QKTTGYVWQL LPNGMKPEYR P*
为了制备此构建物,编码ORF4前导肽的整个序列作为尾部包括于5′-引物(引物919L或f4For)。用编码ORF4前导序列的序列中的双核苷酸改变产生NheI限制酶切位点(无氨基酸改变),使不同的基因融合于ORF4前导肽序列。在所有的3′-端引物序列中包括终止密码子。
蛋白质的所有三种形式都被表达且可以纯化。
如所示的[3H]-棕榈酸标记的掺入,将‘919L′和‘919Orf4′表达产物脂化。919未标记的不掺入3H标记,且是在细胞内定位的。
与919L相比,919Lorf4更易纯化。将其纯化并用于免疫接种小鼠。得到的血清在FACS和ELISA测试以及杀菌试验中产生极佳的结果。该脂蛋白显示位于外膜。
919未标记的具有极佳的ELISA滴定度和高血清杀菌活性。FACS证明了其细胞表明的定位。
实施例2-919和表达温度
于37℃,表达919LOrf4蛋白质的大肠杆菌的生长导致细菌裂解。为了克服这个问题,重组细菌在30℃生长。防止了裂解,而不会制止表达。
实施例3-907、919和922的突变
假设蛋白质907、919和922是胞壁质水解酶和具体说是裂解性转糖基酶。胞壁质裂解酶位于外膜,且参与肽聚糖的降解。
因此测试纯化的蛋白质919未标记的、919Lorf4、919-His(即,包含C-未端His-标记)和922His的胞壁质水解酶活性[Ursinus & Holtje(1994)J.Bact.176:338-343]。使用两种不同的试验,一种用于确定不难溶性胞壁质小囊降解为可溶性胞壁肽的,另一种则是测定聚(MurNAc-GlcNAc)n>30聚糖链的断裂。
第一种试验使用由内消旋-2,6-二氨基-3,4,5-[3H]庚二酸放射标记的胞壁质小囊作为底物。于37℃,在总体积为100μl(包括10mM Tris-马来酸盐(pH5.5)、10mM MgCl2、0.2%v/v Triton X-100和[3H]A2pm标记的胞壁质小囊(约10000cpm))中培养酶(总共3-10μg)45分钟。将试验混合物置于冰上15分钟,在100μl 1%w/v N-乙酰基-N,N,N-三甲铵上15分钟,从10000g离心15分钟沉淀物质。用液体闪烁计数测定上清液中的放射活性。用大肠杆菌可溶性裂解性转糖基酶Slt70作为试验的阳性对照;阴性对照包括不含酶的上述试验溶液。
在第一个试验中,除919-His以外所有蛋白质都产生阳性结果。
第二种试验监测聚(MurNAc-GlcNAc)聚糖链的水解。于37℃,在10mMTris-马来酸盐(pH5.5)、10mM MgCl2和0.2%v/v Triton X-100中,将N-乙酰基-D-1-[3H]葡糖胺标记的纯化的链聚(MurNAc-GlcNAc)n>30与3μg 919L一起培育。煮沸5分钟终止反应,加入10μl 20%v/v磷酸将样品的pH调节至约3.5。如Harz等[Anal.Biochem.(1990)190:120-128]所述,在Nucleosil 300 C18柱上通过反相HPLC将底物与产物分开。在本试验中将大肠杆菌裂解性转糖基酶Mlt A作为阳性对照。无酶进行的试验作为阴性对照。
当用HPLC将无水双糖亚基从寡糖中分开时,用这种试验证明了919LOrf4水解分离的聚糖链的能力。
选择蛋白质919Lorf4用于动力学分析。在试验缓冲液中添加的0.2%v/vTriton X-100使919Lorf4的活性提高3.7倍。Triton X-100的存在对919未标记的活性没有影响。在范围为5.0-8.0的Tris-马来酸盐缓冲液中测定了pH对酶活性的影响。反应的最适pH为5.5。在18℃到42℃的温度范围中,在37℃观察到最大活性。在终浓度为10mM的各种离子的存在下进行反应,以测定各种离子对胞壁质水解酶活性的影响。发现存在Mg2+时活性最高,其刺激活性2.1倍。Mn2+和Ca2+还刺激酶活性至类似程度,而添加Ni2+和EDTA没有明显作用。相反,Fe2+和Zn2+显著抑制酶活性。
如Glauner[Anal.Biochem.(1988)172:451-464]所述,用反相HPLC分析由消化未标记的大肠杆菌胞壁质小囊得到的反应产物的结构。用由溶菌酶Cellosyl消化的胞壁质小囊来校准和标定Hypersil ODS柱。主要的反应产物是1,6-脱水双糖四和三肽,表明1,6-无水胞壁质酸(muraminic)分子内键的形成。
这些结果从实验角度表明,919是胞壁质水解酶,尤其是裂解性转糖基酶家族的成员。另外,922-His裂解胞壁质小囊的能力表明该蛋白质也是裂解性转糖基酶。
这种活性可有助于解释919在大肠杆菌内表达时的毒性作用。
为了消除酶促活性,使用合理的诱变。907、919和922显示对大肠杆菌的三种膜-结合的、脂化的胞壁质裂解性转糖基酶的相当低的同源性:
919(441aa)与大肠杆菌MLTA(P46885)为27.3%相同,超过440aa重叠;
922(369aa)与大肠杆菌MLTB(P41052)为38.7%相同,超过310aa重叠;和
907-2(207aa)与大肠杆菌MLTC(P52066)为26.8%相同,超过149aa重叠。
907-2还与大肠杆菌MLTD(P23913)和Slt70(P03810)具有同源性,它是一种位于周质间隙中的可溶性裂解性转糖基酶。在919、922和907-2之间没有测出明显的序列同源性,且在相应的MLTA、MLTB和MLTC蛋白质之间的情况也同样如此。
Slt70([1QTEA;1QTEB;Thunnissen等(1995)Biochemistry 34:12729-12737]和Slt35[1LTM;1QUS;1QUT;van Asselt等(1999)Structure Fold Des 7:1167-80](40kDa MLTB的可溶形式)可有晶体结构。
已鉴定了Slt70和MLTB的催化残基一种(谷氨酸)。
对Slt70而言,诱变研究表明即使用谷氨酰胺保守性地替代催化Glu505也会导致酶活性的完全丧失。虽然Slt35与Slt70没有明显的序列相似性,但它们的催化区域却显示出令人惊讶的相似性。MLTB中相应的催化残基是Glu162。
另一个被认为在酶裂缝的正确折叠中起重要作用的残基是谷氨酸的保守良好的甘氨酸(Gly)下游。最近,Terrak等[Mol.Microbiol.(1999)34:350-64]提出存在另一种重要的残基,它是位于催化性谷氨酸约70-75残基下游的芳族氨基酸。
进行Slt70与907-2的序列对比和MLTB与922的序列对比,以鉴定MenB抗原中相应的催化性残基。
催化区域的两个序列对比报道如下:
907-2/Slt70:
922/MLTB
从这些对比得出907-2中相应的催化谷氨酸盐是Glu117,而922中为Glu164。这两种抗原都有下游甘氨酸(在酶裂缝(粗体)折叠中起结构作用),922在约70aa下游(粗体)具有保守的芳族残基。
对蛋白质919而言,对大肠杆菌的同源MLTA没有3D结构,且对可能的催化性残基的了解为零。然而,通过与MLTA的序列对比,预计919中的三个氨基酸为催化残基:
919/MLTA
用符号显示三个可能的催化残基:
1)Glu225(MLTA中的Asp),其后为三个保守性甘氨酸(Gly263、Gly265和Gly272)和三个保守性芳族残基(位于约75-77残基下游)。这些下游残基以□显示。
2)Glu323(在MLTA中保守的),其后为2个保守的甘氨酸(Gly347和Gly355)和两个保守的芳族氨基酸(位于84-85残基下游)(Tyr406或Phe407)。用◇显示这些下游残基。
3)Asp362(替代预计的Glu),其后为一个甘氨酸(Gly369)和一个保守的芳族残基(Trp428)。用o显示这些下游残基。
WO00/66741中公开了919的多聚体形式的排序。
基于对催化残基的预测,已产生了919的三种突变体和907的一种突变体,各包含单个氨基取代。用基于PCR的SDM,以甘氨酸残基替代919蛋白质的255位和323位的谷氨酸、362位的天冬氨酸和907蛋白质的117位的谷氨酸。为了达到该目的,设计了包含从Glu或Asp变为Gly密码子的内部引物:
919-E255 for919-E255 rev |
CGAAGACCCCGTC
GgtCTTTTTTTTATGGTGCATAAAAAAAAGacCGACGGGGTCT |
GAA→Ggt |
919-E323 for919-E323 rev |
AACGCCTCGCC
GgtGTTTTGGGTCATTTGACCCAAAACacCGGCGAGGCG |
GAA→Ggt |
919-D362 for919-D362 rev |
TGCCGGCGCAGTC
GgtCGGCACTACATAATGTAGTGCCGacCGACTGCGCCG |
GAC→Ggt |
907-E117 for907-E117 rev |
TGATTGAGGTG
GgtAGCGCGTTCCGGGCGGAACGCGCTacCCACCTCAAT |
GAA→Ggt |
有下划线的核苷酸密码是甘氨酸的,突变的核苷酸为小写字母。
为了产生919-E255、919-E323和919-E362突变体,用20ng pET-LOrf4 DNA作为模板和以下的引物对进行PCR:
1)Orf4L正向/919-E255反向
2)919-E255正向/919L反向
3)Orf4L正向/919-E323反向
4)919-E323正向/919L反向
5)Orf4L正向/919-D362反向
6)919-D362正向/919L反向
用PCR1-2、3-4或5-6的产物作为模板和正向引物以及反向引物(“Orf4L正向”和“919L反向”),进行第二轮PCR。
对于突变体907-E117,用200ng 2996菌株的染色体DNA作为模板和以下的引物对进行PCR:
7)907L正向/907-E117反向
8)907-E117正向/907L反向
用PCR7和8的产物作为模板和寡“907L正向”和“907L反向”作为引物,进行第二轮PCR。
用以下的标准方法加工包含各突变的PCR片段,用NdeI和XhoI限制酶消化并克隆入pET-21b+载体中。用序列分析验证各突变的存在情况。
类似地进行907中的Glu117向Gly的突变,以及922中的残基Glu164、Ser213和Asn348的突变。
919的E255G的突变体显示活性低降50%;E323G突变体显示活性降低70%;E362G突变体显示活性没有降低。
实施例4-多聚体形式
将287-GST、919未标记的和953-His进行凝胶过滤以分析四级结构或制备性目的。用FPLC Superose 12(H/R 10/30)或Superdex 75凝胶过滤柱(Pharmacia)计算天然蛋白质的分子量。用于287、919和953层析的缓冲液分别是50mMTris-HCl(pH8.0)、20mM Bicine(pH8.5)和50mM Bicine(pH8.0)。
另外,各缓冲液包含150-200mM NaCl和10%v/v甘油。用适合的缓冲液透析蛋白质并以200μl体积施用。以0.5-2.0ml/分钟的流速进行凝胶过滤,在280nm监测洗脱物。收集组分,用SDS-PAGE分析。用蓝色葡聚糖2000和分子量标准核糖核酸酶A、胰凝乳蛋白酶A卵清蛋白、白蛋白(Pharmacia)校准柱。由标准的Kav与log Mr的校准曲线计算样品的分子量。凝胶过滤之前,用凝血酶消化287-GST以切割GST组成成分。
287、919和953-His的估计分子量分别为73kDa、47kDa和43kDa。这些结果表明919是单体而287和953主要是天然二聚的。对953-His而言,在凝胶过滤的过程中观察到两个高峰。主峰(80%)代表953的二聚形式,而次峰(20%)则为单体预计的大小。发现953单体形式比二聚形式具有更大的杀菌活性。
实施例5-pSM214和pET-24b载体
由pET载体和pSM214表达了包含天然前导肽而无融合配体的953蛋白质[Velati Bellini等,(1991)J.Biotechnol.18,177-192]。
用大肠杆菌MM294-1菌株作为宿主,以全长基因将953序列克隆入pSM214中。为了实现此目的,用如下引物通过PCR扩增953基因的整个DNA序列(从ATG到终止密码子):
953L for/2 CCG
GAATTCTTATGAAAAAAATCATCTTCGCCGC EcoRI
953L rev/2 GCCC
AAGCTTTTATTGTTTGGCTGCCTCGATT HindIII其分别包含EcoRI和HindIII限制酶切位点。用EcoRI和HindIII消化扩增的片段,并将其与用这两种酶消化的pSM214载体接连。将连接的质粒转化入大肠杆菌MM294-1细胞中(通过37℃,在冰上培育65分钟),并将细菌细胞涂布于包含20μg/ml氯霉素的LB琼脂上。
于37℃,在包含20μg/ml氯霉素的4ml LB肉汤中使重组菌落生长过夜;将细菌细胞离心,提取质粒DNA,并用EcoRI和HindIII限制进行分析。为了分析重组集落表达蛋白质的能力,将它们在包含20μg/ml氯霉素的LB肉汤中培育,并使它们在37℃生长16小时。离心细菌细胞,悬浮于PBS中。用SDS-PAGE和考马斯蓝染色分析蛋白质的表达。
pSM214质粒的表达水平出人意料的高。
用于将序列克隆入pSM-214载体中的寡(核苷酸)如下:
ΔG287(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-TCGCCCGATGTTAAATCGGCGGA |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCCG |
HindIII |
Δ2 287(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCTTCATG-AGCCAAGATATGGCGGCAGT |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCCG |
HindIII |
Δ3 287(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-TCCGCCGAATCCGCAAATCA |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCCG |
HindIII |
Δ4 287(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-GGAAGGGTTGATTTGGCTAATG |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCCG |
HindIII |
Orf46.1(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-TCAGATTTGGCAAACGATTCTT |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TTACGTATCATATTTCACGTGCTTC |
HindIII |
ΔG287-Orf46.1(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-TCGCCCGATGTTAAATCGGCGGA |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TTACGTATCATATTTCACGTGCTTC |
HindIII |
919(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-CAAAGCAAGAGCATCCAAACCT |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TTACGGGCGGTATTCGGGCT |
HindIII |
961L(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCATATG-AAACACTTTCCATCC |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TTACCACTCGTAATTGAC |
HindIII |
961(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCATATG-GCCACAAGCGACGAC |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TTACCACTCGTAATTGAC |
HindIII |
961cLpSM-214 |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-AAACACTTTCCATCC |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TCAACCCACGTTGTAAGGTTG |
HindIII |
961cpSM-214 |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-GCCACAAACGACGACG |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TCAACCCACGTTGTAAGGTTG |
HindIII |
953(pSM-214) |
Fwd |
CCG
GAATTCTTATG-GCCACCTACAAAGTGGACGA |
EcoRI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TTATTGTTTGGCTGCCTCGATT |
HindIII |
如对953L所述,操作、克隆和表达这些序列。
对pET-24载体而言,如以下对pET21所述,克隆这些序列并在pET-24中表达这些蛋白质。pET2具有与pET-21相同的序列,但其具有卡那霉素抗性盒替代氨苄青霉素盒。
用于将序列克隆入pET-24b中的寡核苷酸是:
ΔG287K |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCCGATGTTAAATCGGC§ |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCC* |
XhoI |
Δ2 287K |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CAAGATATGGCGGCAGT§ |
NheI |
Δ3 287K |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-GCCAATCCGCAAATCA§ |
NheI |
Δ4 287K |
Fwd |
CGC
GCTAGC-GGAAGGGTTGATTTGGCTAATGG§ |
NheI |
Orf46.1K |
Fwd |
GGGAATTC
CATATG-GGCATTTCCCGCAAAATATC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
Orf46AK |
Fwd |
GGGAATTC
CATATG-GGCATTTCCCGCAAAATATC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTCTATGCCTTGTGCGGCAT |
XhoI |
961K(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAGCGACGACGA |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCACTCGTAATTGAC |
XhoI |
961aK |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAACGACG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCATTTAGCAATATTATCTTTGTTC |
XhoI |
961bK |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAAGCAAACAGTGCCGAC |
NdeI |
Rev | CCCG
CTCGAG-TTACCACTCGTAATTGAC | XhoI |
961cK |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAACGACG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAACCCACGTTGTAAGGT |
XhoI |
961cLK |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ATGAAACACTTTCCATCC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAACCCACGTTGTAAGGT |
XhoI |
961dK |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAACGACG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAGTCTGACACTGTTTTATCC |
XhoI |
ΔG287-919K |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCCGATGTTAAATCGGC |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACGGGCGGTATTCGG |
XhoI |
ΔG 287-Orf46.1K |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCCGATGTTAAATCGGC |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
ΔG287-961K |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCCGATGTTAAATCGGC |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCACTCGTAATTGAC |
XhoI |
*将该引物用作所有287形式的反向引物。
§与ΔG278K反向引物联用的正向引物。
实施例6-ORF1及其前导肽
预计脑膜炎奈瑟球菌(血清群B,菌株MC58)的ORF1是用作外膜或分泌的蛋白质。其具有如下序列:
1
MKTTDKRTTE
THRKAPKTGR IRFSPAYLAI
CLSFGILPQA
WAGHTYFGIN
51 YQYYRDFAEN KGKFAVGAKD IEVYNKKGEL VGKSMTKAPM IDFSVVSRNG
101 VAALVGDGYI VSVAHNGGYN NVDFGAEGRN PDQHRFTYKI VKRNNYKAGT
151 KGHPYGGDYH MPRLHKFVTD AEPVEMTSYM DGRKYIDQNN YPDRVRIGAG
201 RQYWRSDEDE PNNRESSYHI ASAYSWLVGG NTFAQNGSGG GTVNLGSEKI
251 KHSPYGFLPT GGSFGDSGSP MFIYDAQKQK WLINGVLQTG NPYIGKSNGF
301 QLVRKDWFYD EIFAGDTHSV FYEPRQNGKY SFNDDNNGTG KINAKHEHNS
351 LPNRLKTRTV QLFNVSLSET AREPVYHAAG GVNSYRPRLN NGENISFIDE
401 GKGELILTSN INQGAGGLYF QGDFTVSPEN NETWQGAGVH ISEDSTVTWK
451 VNGVANDRLS KIGKGTLHVQ AKGENQGSIS VGDGTVILDQ QADDKGKKQA
501 FSEIGLVSGR GTVQLNADNQ FNPDKLYFGF RGGRLDLNGH SLSFHRIQNT
551 DEGAMIVNHN QDKESTVTIT GNKDIATTGN NNSLDSKKEI AYNGWFGEKD
601 TTKTNGRLNL VYQPAAEDRT LLLSGGTNLN GNITQTNGKL FFSGRPTPHA
651 YNHLNDHWSQ KEGIPRGEIV WDNDWINRTF KAENFQIKGG QAVVSRNVAK
701 VKGDWHLSNH AQAVFGVAPH QSHTICTRSD WTGLTNCVEK TITDDKVIAS
751 LTKTDISGNV DLADHAHLNL TGLATLNGNL SANGDTRYTV SHNATQNGNL
801 SLVGNAQATF NQATLNGNTS ASGNASFNLS DHAVQNGSLT LSGNAKANVS
851 HSALNGNVSL ADKAVFHFES SRFTGQISGG KDTALHLKDS KWTLPSGTEL
901 GNLNLDNATI TLNSAYRHDA AGAQTGSATD APRRRSRRSR RSLLSVTPPT
951 SVESRFNTLT VNGKLNGQGT FRFMSELFGY RSDKLKLAES SEGTYTLAVN
1001 NTGNEPASLE QLTVVEGKDN KPLSENLNFT LQNEHVDAGA WRYQLIRKDG
1051 EFRLHNPVKE QELSDKLGKA EAKKQAEKDN AQSLDALIAA GRDAVEKTES
1101 VAEPARQAGG ENVGIMQAEE EKKRVQADKD TALAKQREAE TRPATTAFPR
1151 ARRARRDLPQ LQPQPQPQPQ RDLISRYANS GLSEFSATLN SVFAVQDELD
1201 RVFAEDRRNA VWTSGIRDTK HYRSQDFRAY RQQTDLRQIG MQKNLGSGRV
1251 GILFSHNRTE NTFDDGIGNS ARLAHGAVFG QYGIDRFYIG ISAGAGFSSG
1301 SLSDGIGGKI RRRVLHYGIQ ARYRAGFGGF GIEPHIGATR YFVQKADYRY
1351 ENVNIATPGL AFNRYRAGIK ADYSFKPAQH ISITPYLSLS YTDAASGKVR
1401 TRVNTAVLAQ DFGKTRSAEW GVNAEIKGFT LSLHAAAAKG PQLEAQHSAG
1451 IKLGYRW*
前导肽是加下划线的。
WO99/55873公开了ORF1的多聚体形式。
已将三种表达策略用于ORF1:
1)使用His标记的ORF1,按照WO99/24578(ORF1-His);
2)包含自身前导肽但无任何融合配体的ORF1(‘ORF1L′);和
3)包含大肠杆菌OmpA的前导肽(MKKTAIAIAVALAGFATVAQA)的ORF1(‘Orf1LOmpA′):
MKKTAIAIAVALAGFATVAQAASAGHTYFGINYQYYRDFAENKGKFAVGAKDIEVYNKKGELVGKSMTKAPMIDFSV
VSRNGVAALVGDQYIVSVAHNGGYNNVDFGAEGRNPDQHRFTYKIVKRNNYKAGTKGHPYGGDYHMPRLHKFVTDAE
PVEMTSYMDGRKYIDQNNYTDRVRIGAGRQYWRSDEDEPNNRESSYHIASAYSWLVGGNTFAQNGSGGGTVNLGSEK
IKHSPYGFLPTGGSFGDSGSPMFIYDAQKQKWLINGVLQTGNPYIGKSNGFQLVRKDWFYDEIFAGDTHSVFYEPRQ
NGKYSFNDDNNGTGKINAKHEHNSLPNRLKTRTVQLFNVSLSETAREPVYHAAGGVNSYRPRLNNGENISFIDEGKG
ELILTSNINQGAGGLYFQGDFTVSPENNETWQGAGVHISEDSTVTWKVNGVANDRLSKIGKGTLHVQAKGENQGSIS
VGDGTVILDQQADDKGKKQAFSEIGLVSGRGTVQLNADNQFNPDKLYFGFRGGRLDLNGHSLSFHRIQNTDEGAMIV
NHNQDKESTVTIIGNKDIATTGNNNSLDSKKEIAYNGWFGEKDTTKTNGRLNLVYQPAAEDRTLLLSGGTNLNGNIT
QTNGKLFFSGRPTPHAYNHLNDHWSQKEGIPRGEIVWDNDWINRTFKAENFQIKGGQAVVSRNVAKVKGDWHLSNHA
QAVFGVAPHQSHTICTRSDWTGLTNCVEKTITDDKVIASLTKTKISGNVDLADHAHLNLTGLATLNGNLSANGDTRY
TVSHNATQNGNLSLVGNAQATFNQATLNGNTSASGNASFNLSDHAVQNGSLTLSGNAKANVSHSALNGNVSLADKAV
FHFESSRFTGQISGGKDTALHLKDSEWTLPSGTELGNLNLDNATITLNSAYRHDAAGAQTGSATDAPRRRSRRSRRS
LLSVTPPTSVESRFNTLTVNGKLNGQGTFRFMSELFGYRSDKLKLAESSEGTYTLAVNNTGNEPASLEQLTVVEGKD
NKPLSENLNFTLQNEHVDAGAWRYQLIRKDGEFRLHNPVKEQELSDKLGKAEAKKQAEKDNAQSLDALIAAGRDAVE
ETESVAEPARQAGGENVGDMQAEEEKKRVQADKDTALAKQREAETRPATTAFPRARRARRDLPQLQPQPQPQPQRDL
ISRYANSGLSEFSSTLNSVFAVQDELDRVFAEDRRNAVWTSGIRDTKHYRSQDFRAYRQQTDLRQIGMQKNLGSGRV
GILFSHNRTENTFDDGIGNSARLAHGAVFGQYGIDRFYIGISAGAGFSSGSLSDGIGGKIRRRVLHYGIQARYRAGF
GGFGIEPHIGATRYFVQKADYRYENVNIATPGLAFNRYRAGIKADYSFKPAQHISITPYLSLSYTDAASGKVRTRVN
TAVLAQDFGKTRSAEWGVNAEIKGFTLSLHAAAAKGPQLEAQHSAGIKLGYRW*
为了制备此构建物,用NheI和XhoI限制酶消化克隆pET911LOmpA(见如下),并纯化相应于携带OmpA前导序列的载体的片段(pETLOmpA)。用寡核苷酸ORF1-正向和ORF1-反向(分别包括NheI和XhoI限制性酶切位点)扩增编码成熟蛋白质的ORF1基因,用NheI和XhoI消化并连接到纯化的pETOmpA片段(参见图1)。由NheI位点引入另一AS二肽。
该蛋白质的所有三种形式都被表达。可纯化His-标记的蛋白质,并确证其为表面外露的且可能分泌的(参见图3)。用这种蛋白质免疫接种小鼠,得到的血清在杀菌试验中有极佳的结果。
将ORF1LOmpA作为完整膜纯化,并固定于内膜和外膜。出人意料地,针对ORF1LOmpA产生的血清比那些针对His-标记的蛋白质产生的血清显示更好的ELISA和抗杀菌特性。
在其定位的地方将ORFI1作为外膜纯化。
实施例7-蛋白质911及其前导肽
脑膜炎奈瑟球菌(血清群B,菌株MC58)的蛋白质911具有如下序列:
1
MKKNILEFWV GLFVLIGAAA VAFLAFRVAG GAAFGGSDKT YAVYADFGDI
51 GGLKVNAPVK SAGVLBGRVG AIGLDPKSYQ ARVRLDLDGK YQFSSDVSAQ
101 ILTSGLLGEQ YIGLQQGGDT ENLAAGDTIS VTSSAMVLEN LIGKFMTSFA
151 EKNADGGNAE KAAE*
前导肽是加下划线的。
将三种表达策略用于911:
1)包含其自身前导肽但无任何融合配体的911(‘911L′);
2)包含大肠杆菌OmpA的前导肽的911(‘911LOmpA′)。
为了制备该构建物,在5′-引物中包括编码OmpA前导肽的完整序列作为尾(引物911OmpA正向)。在编码OmpA前导肽的序列和编码预计的成熟蛋白质的911基因之间插入NheI限制酶切位点(插入一个氨基酸,一个丝氨酸),使该构建物用于克隆不同的基因下游OmpA前导肽序列。
3)包含胡萝卜软腐欧文氏菌(Erwinia carotovora)PelB的前导肽(MKYLLPTAAAGLLLAAQPAMA)的911(‘911LpelB)。
为了制备该构建物,将5′-端PCR引物设计为前导序列的下游,并包括NcoI限制酶切位点,从而使911直接融合于PelB前导序列;3’-端引物包括终止密码子。所用的表达载体是pET22b+(Novagen),其携带编码PelB前导肽的序列。NcoI位点在PelB序列后引入另一甲硫氨酸。
表达该蛋白质的所有三种形式。用911L的ELISA滴定度最高,919LOmpA也有良好的结果。
实施例8-ORF46
脑膜炎奈瑟球菌(血清群B,菌株2996)的完整ORF46蛋白质具有如下序列:
1
LGISRKISLI
LSILAVCLPM
HAHASDLAND SFIRQVLDRQ HFEPDGKYHL
51 FGSRGELAER SGHIGLGKIQ SHQLGNLMIQ QAAIKGNIGY IVRFSDHGHE
101 VHSPFDNHAS HSDSDEAGSP VDGFSLYRIH WDGYEHHPAD GYDGPQGGGY
151 PAPKGARDIY SYDIKGVAQN IRLNLTDNRS TGQRLADRFH NAGSMLTQGV
201 GDGFKRATRY SPELDRSGNA AEAFNGTADI VKNIIGAAGE IVGAGDAVQG
251 ISEGSNIAVM HGLGLLSTEN KMARINDLAD MAQLKDYAAA AIRDWAVQNP
301 NAAQGIEAVS NIFMAAIPIK GIGAVRGKYG LGGITAHPIK RSQMGAIALP
351 KGKSAVSDNF ADAAYAKYPS PYHSRNIRSN LBQRYGKHNI TSSTVPPSNG
401 KNVKLADQRH PKTGVPFDGK GFPNFEKHVK YDTKLDIQEL SGGGIPKAKP
451 VSDAKPRHEV DRKLNKLTTR EQVEKNVQEI RNGNKNSNFS QHAQLEREIN
501 KLKSADEINF ADGMGKFTDS MNDKAFSRLV KSVKENGFTN PVVEYVEING
551 KAYIVRGNNR VFAAEYLGRI HELKFKKVDF PVPNTSWKNP TDVLNESGNV
601 KRPRYRSK*
前导肽是加下划线的。
在WO00/66741中发现有其它菌株的ORF46序列。
已将三种表达策略用于ORF46:
1)包含自身前导肽但无任何融合配体的ORF46(‘ORF46-2L′);
2)不含自身前导肽且无任何融合配体的ORF46(‘ORF46-2′),通过从预计的前导序列设计5′-端扩增引物下游除去前导肽:
1 SDLANDSFIR QVLDRQHFEP DGKYHLFGSR GELAERSGHI GLGKIQSHQL
51 GNLMIQQAAI KGNIGYIVRF SDHGHEVHSP FDNHASHSDS DEAGSPVDGF
101 SLYRIHWDGY EHHPADGYDG PQGGGYPAPK GARDIYSYDI KGVAQNIRLN
151 LTDNRSTGQR LADRFENAGS NLTQGVGDGF KRATRYSPEL DRSGNAAEAF
201 NGTADIVKNI IGAAGEIVGA GDAVQGISKG SNIAVMBGLG LLSTKNKMAR
251 INDLADMAQL KDYAAAAIRD WAVQNPNAAQ GIEAVSNIFM AAIPIKGIGA
301 VRGKYGLGGI TAHPIKRSQM GAIALPKGKS AVSDNFADAA YAKYPSPYHS
351 RNIRSNLEQR YGKENITSST VPPSNGKNVK LADQRHPKTG VPFDGKGFPN
401 FEKHVKYDTK LDIQELSGGG IPKAKPVSDA KPRMEVDRKL NKLTTREQVE
451 KNVQEIRNGN KNSNFSQHAQ LKREINKLKS ADEINFADGN GKFTDSMNDK
501 AFSRLVKSVK KNGFTNPVVE YVEINGKAYI VRGNNRVFAA EYLGRIHELK
551 FKKVDFPVPN TSWKNPTKVL NESGNVKRPR YRSK*
3)作为一种截短的蛋白质的ORF46,由前433氨基酸构成(‘ORF46.1L′),通过设计PCR引物以扩增相应于aa1-433的部分序列构建。
在3′-端引物序列中包括终止密码子。
对大肠杆菌,ORF46-2L以很低的水平表达。除去它的前导肽(ORF46-2)也不能解决这个问题。然而,截短的ORF46.1L形式(前433个氨基酸,在血清群和品种中很好保守的)能很好地表达,且在ELISA和杀菌试验中得到极佳的结果。
也将ORF46.1用作杂交蛋白的基础。将其与287、919和ORF1融合。通常杂交蛋白是不溶的,但能得到一些良好的ELISA和杀菌(针对同源2996菌株)结果。
蛋白质 |
ELISA |
杀菌Ab |
Orf1-Orf46.1-His |
850 |
256 |
919-Orf46.1-His |
12900 |
512 |
919-287-Orf46-His |
n.d. |
n.d. |
Orf46.1-287His |
150 |
8192 |
Orf46.1-919His |
2800 |
2048 |
Orf46.1-287-919His |
3200 |
16384 |
为了比较,构建ORF46.1、287(作为GST融合或以ΔG287形式)的‘三′杂交体,针对各种菌株(包括同源2996菌株)与三种抗原的简单混合物测试。FCA用作佐剂:
|
2996 |
BZ232 |
MC58 |
NGH38 |
F6124 |
BZ133 |
混合物 |
8192 |
256 |
512 |
1024 |
>2048 |
>2048 |
ORF46.1-287-919his |
16384 |
256 |
4096 |
8192 |
8192 |
8192 |
ΔG287-919-ORf46.1his |
8192 |
64 |
4096 |
8192 |
8192 |
16384 |
ΔG287-ORF46.1-919his |
4096 |
128 |
256 |
8192 |
512 |
1024 |
另外,杂交体显示相等的或更佳的免疫活性。
针对各种异源菌株,将两种蛋白质(菌株2996)的杂交体与单种蛋白质进行比较:
|
1000 |
MC58 |
F6124(MenA) |
ORF46.1-His |
<4 |
4096 |
<4 |
ORF1-His |
8 |
256 |
128 |
ORF1-ORF46.1-His |
1024 |
512 |
1024 |
杂交体再一次显示相等的或更佳的免疫活性。
实施例9-蛋白质961
脑膜炎奈瑟球菌(血清群B,菌株MC58)的完整961蛋白质具有如下序列:
1
MSMKHFPAKV LTTAILATFC SGALAATSDD DVKKAATVAI VAAYNNGQEI
51 NGFKAGETIY DIGEDGTITQ KDATAADVEA DDFKGLGLKK VVTNLTKTVN
101 ENKQNVDAKV KAAESEIEKL TTKLADTDAA LADTDAALDE TTNALNKLGE
151 NITTFAEETK TNIVKIDEKL EAVADTVDKH AEAFNDIADS LDETNTKADE
201 AVKTANEAKQ TAEETKQNVD AKVKAAETAA GKAEAAAGTA NTAADKAEAV
251 AAKVTDIKAD IATNKADIAK NSARIDSLDK NVANLRKETR QGLAEQAALS
301 GLFQPYNVGR FNVTAAVGGY KSESAVAIGT GFRFTENFAA KAGVAVGTSS
351 GSSAAYHVGV NYEW*
前导肽是加下划线的。
对961的表达采用如下三种方法:
1)使用GST融合体的961,按照WO99/57280(‘GST961′);
2)包含其自身前导肽但无融合配体的961(‘961L′);和
3)无自身前导肽且不含任何融合配体的961(‘961未标记的′),通过设计从预计的前导序列的5′-端PCR引物下游除去前导肽。
该蛋白质的所有三种形式都被表达。可以纯化GST-融合蛋白,其抗体表明961是表面外露的(图4)。用该蛋白质免疫接种小鼠,得到的血清在杀菌试验中有极佳的结果。也可纯化961L,它产生非常高的ELISA滴定度。
蛋白质961似乎是为相变量。另外,在脑膜炎奈瑟球菌的所有菌株中都没有它。
实施例10-蛋白质287
脑膜炎奈瑟球菌(血清群B,菌株2996)的蛋白质287具有如下序列:
1
MFERSVIAMA
CIFALSACGG GGGGSPDVKS ADTLSKPAAP VVAEKETEVK
51 EDAPQAGSQG QGAPSTQGSQ DMAAVSAENT GNGGAATTDK PKNEDEGPQN
101 DMPQNSAESA NQTGNNQPAD SSDSAPASNP APANGGSNFG RVDLANGVLI
151 DGPSQNITLT HCKGDSCNGD NLLDEEAPSK SEFENLNESE RIEKYKKDGK
201 SDKFTNLVAT AVQANGTNKY VIIYKDKSAS SSSARFRRSA RSRRSLPAEM
251 PLIPVNQADT LIVDGEAVSL TGHSGNIFAP EGNYRYLTYG AEKLPGGSYA
301 LRVQGEPAKG EMLAGTAVYN GEVLHFHTEN GRPYPTRGRF AAKVDFGSKS
351 VDGIIDSGDD LHMGTQKFKA AIDGNGFKGT WTENGGGDVS GRFYGPAGEE
401 VAGKYSYRPT DAEKGGFGVF AGKKEQD*
前导肽是加下划线显示的。
在WO00/66741的图5和15中可以发现其它菌株的287序列。
WO99/57280的实施例9公开了在大肠杆菌中作为GST-融合蛋白的287的表达。
已使用许多其它方法在大肠杆菌中表达287,包括:
1)作为His-标记的融合蛋白的287(‘287-His′);
2)包含其自身前导肽但无任何融合配体的287(‘287L′);
3)包含ORF4前导肽且无任何融合配体的287(‘287LOrf4′);和
4)不含其自身前导肽且无任何融合配体的287(‘287未标记的′):
1 CGGGGGGSPD VKSADTLSKP AAPVVAEKET EVKEDAPQAG SQGQGAPSTQ
51 GSQDMAAVSA ENTGNGGAAT TDKPKNEDEG PQNDMPQNSA ESANQTGNNQ
101 PADSSDSAPA SNPAPANGGS NFGRVDLANG VLIDGPSQNI TLTHCKGDSC
151 NGDNLLDEEA PSKSEFENLN ESERIEKYKK DGKSDKFTNL VATAVQANGT
201 NKYVIIYKDK SASSSSARFR RSAFSRRSLP AEMPLIPVNQ QDTLIVDGEA
251 VSLTGHSGNI FAPEGNYRYL TYGAEKLPGG SYALRVQGEP AKGEMLAGTA
301 VYNGEVLHFH TENGPPYPPR GRFAAKVDFG SKSVDGIIDS GDDLHMGTQK
351 FKAAIDGNGF KGTWTENGGG DVSGRFYGPA GEEVAGKYSY RPTDAEKGGF
401 GVFAGKKEQD *
所有这些蛋白质都被表达和纯化。
证明‘287L′和‘287LOrf4′是脂蛋白。
如图2所示,通过用NheI和XhoI消化919LOrf4构建‘287LOrf4′。在5′-端引物(287LOrf正向)(融合于287编码序列)添加编码遗漏氨基酸的DNA序列(作为尾),恢复完整的ORF4前导肽。用寡核苷酸287LOrf4正向和反向(分别包含NheI和XhoI位点)扩增编码成熟蛋白质的287基因,用NheI和XhoI消化并连接于纯化的pETOrf4片段。
实施例11-包含/不含天然前导肽的其它非融合蛋白质
一种类似的方法适用于大肠杆菌表达WO99/24578、WO99/36544和WO99/57280的其它蛋白质。
以下是未用融合配体表达的:008、105、117-1、121-1、122-1、128-1、148、216、243、308、593、652、726、982和Orf143-1。FACS表明蛋白质117-1是表面外露的,且产生高ELISA滴定度。
以下是由天然前导肽但无融合配体表达的:111、149、206、225-1、235、247-1、274、283、286、292、401、406、502-1、503、519-1、525-1、552、556、557、570、576-1、580、583、664、759、907、913、920-1、926、936-1、953、961、983、989、Orf4、Orf7-1、Orf9-1、Orf23、Orf25、Orf37、Orf38、Orf40、Orf40.1、Orf40.2、Orf72-1、Orf76-1、Orf85-2、Orf91、Orf97-1、Orf119、Orf143.1。这些蛋白质都有后缀‘L′。
用或不用其前导肽表达His标记的蛋白质760。信号肽的缺失大大地增加了表达水平。使用2M尿素(用于增溶)最易纯化该蛋白质。
用其自身的信号肽能很好地表达His-标记的蛋白质264,且30kDa蛋白质得到阳性Western印迹结果。
所有蛋白质都成功地表达。
验证了593、121-1、128-1、593、726和982在细胞质中的定位。
验证了920-1L、953L、ORF9-1L、ORF85-2L、ORF97-1L、570L、580L和664L在周质中的定位。
验证了ORF40L在外膜中的定位,和008和519-1L在内膜中的定位。验证了ORF25L、ORF4L、406L、576-1L都是在膜中定位的。
发现蛋白质206不是脂蛋白。
用其天然前导肽但无融合配体表达的ORF25和ORF40,以及未用其天然前导肽和融合配体表达的蛋白质593,都产生良好的抗杀菌血清。令人惊讶地,未用融合配体而使用其前导肽(即‘ORF25L′和‘ORF40L′)表达的ORF25和ORF40形式比融合蛋白在杀菌试验中产生更好的结果。
将蛋白质920L和953L进行N-未端测序,结果分别为HRVWVETAH和ATYKVDEYHANARFAF。此测序结果表明切除了预计的前导肽,且当与周质定位联合时表明:当由它们的天然前导肽表达时,大肠杆菌正确地加工和定位这些蛋白质。
定位于内膜的蛋白质519.1L的N-未端序列是MEFFIILLA,表明未切除前导序列。因此,它可作为未切割的前导序列和跨膜锚(以与淋病奈瑟球菌的PBP1的前导肽类似的方式)[Ropp & Nicholas(1997)J.Bact.179:2783-2787.]。事实上,N-未端区域表现出强疏水性,且由Tmpred.程序预计为跨膜的。
实施例12-脂蛋白
用Kraft等[J.Bact.(1998)180:3441-3447.]的方法验证重组脂蛋白中棕榈酸盐的掺入。于37℃,在20ml LB/Amp(100μg/ml)的液体培养基中使携带感兴趣质粒的单集落生长过夜。在5.0ml含有5μC/ml[3H]棕榈酸盐(Amersham)的新鲜培养基LB/Amp培养基中,将培养物稀释至OD550为0.1。当培养物的OD550达到0.4-0.8时,用IPTG(终浓度为1.0mM)诱导重组脂蛋白1小时。用台式离心机以2700g离心15分钟收获细菌,用1.0ml冷PBS洗涤2次。将细胞悬浮于120μl 20mMTris-HCl(pH8.0)、1mM EDTA、1.0%w/v SDS中,并煮沸10分钟裂解。以13000g离心10分钟后,收集上清液,加入1.2ml冷丙酮沉淀蛋白质,在-20℃静置1小时。以13000g离心10分钟沉淀蛋白质,重悬浮于20-50μl(以培养物终O.D值校准负载量计算的)1.0%w/v SDS。将15μl等份与5μlSDS-PAGE样品缓冲液煮沸,用SDS-PAGE分析。电泳凝胶在10%v/v乙酸中固定1小时后,在扩增溶液(Amersham)中浸泡30分钟。加热真空干燥凝胶,-80℃暴露在Hyperfilm(Kodak)中过夜。
在以下蛋白质中发现[3H]棕榈酸盐标记的掺入(表明脂化):Orf4L、Orf25L、287L、287LOrf4、406L、576L、926L、919L和919LOrf4。
实施例13-287中的结构域
根据287中不同的结构域与隶属不同功能类别的蛋白质的同源性,如图5所示将其分为3个“结构域”。第二个结构显示与IgA蛋白酶同源,第三结构域显示与结合转铁蛋白的蛋白质同源。
在脑膜炎奈瑟球菌之间这三个“结构域”各表现出不同程度的序列保守性-结构域C为98%相同,结构域A为83%相同,而结构域B仅为71%相同。注意到菌株MC58中的蛋白质287比菌株2996的长61个氨基酸。图7显示了这两个序列的序列对比,WO00/66741(图5和15)公开了各种菌株的序列对比。
将这三个结构域分别表达成C-未端His-标记的蛋白质。用以下构建物对MC58和2996菌株进行处理:
287a-MC58(aa1-202),287b-MC58(aa203-288),287c-MC58(aa311-488)。
287a-2996(aa1-139),287b-2996(aa140-225),287c-2996(aa250-427)。
为了制备这些构建物,除去3′-端引物序列中的终止密码子序列。5′引物包括NheI限制酶切位点,3′引物包括作为尾部的XhoI,从而用NdeI-XhoI、NheI-XhoI或NdeI-HindIII限制酶切位点指导将各扩增片段克隆入表达载体pET21b+中。
所有六种构建物都可以表达,但287b-MC8需要变性和重折叠以增溶。
以下描述了结构域A的缺失(‘Δ4 287-His′)。
用菌株2996的各种结构域还获得了针对同源和异源MenB菌株以及MenA(F6124菌株)和MenC(BZ133菌株)的免疫学数据(血清杀菌试验):
|
2996 |
BZ232 |
MC58 |
NGH38 |
394/98 |
MenA |
MenC |
287-His |
32000 |
16 |
4096 |
4096 |
512 |
8000 |
16000 |
287(B)-His |
256 |
- |
- |
- |
- |
16 |
- |
287(C)-His |
256 |
- |
32 |
512 |
32 |
2048 |
>2048 |
287(B-C)His |
64000 |
128 |
4096 |
64000 |
1024 |
64000 |
32000 |
用菌株MC58的结构域获得以下结果:
|
MC58 |
2996 |
BZ232 |
NGH38 |
394/98 |
MenA |
MenC |
287-His |
4096 |
32000 |
16 |
4096 |
512 |
8000 |
16000 |
287(B)-His |
128 |
128 |
- |
- |
- |
- |
128 |
287(C)-His |
- |
16 |
- |
1024 |
- |
512 |
- |
287(B-C)-His |
16000 |
64000 |
128 |
64000 |
512 |
64000 |
>8000 |
实施例14-287中的缺失
与表达单一结构域一样,通过在第一结构域中的渐进缺失还表达了287(以C-未端His-标记的蛋白质)。使用菌株2996的蛋白质287的四缺失突变体(图6):
1)‘287-His′,由氨基酸18-427构成(即缺失前导肽);
2)‘Δ1 287-His′,由氨基酸26-427构成;
3)‘Δ2 287-His′,由氨基酸70-427构成;
4)‘Δ3 287-His′,由氨基酸107-427构成;和
5)‘Δ4 287-His′,由氨基酸140-427构成(=287-bc)。
还为菌株MC58制备了‘Δ4′蛋白质(‘Δ4 287MC58-His′,aa203-488)。
如上所述,用与287a/b/c相同的方法制备这些构建物。
可以表达所有六种构建物,并可纯化蛋白质。然而287-His的表达很差。
当除去C-未端His-标记物时,表达也很高。
用缺失突变体也获得了针对同源(2996)和异源MenB菌株以及MenA(F6124菌株)和MenC(BZ133菌株)的免疫学数据(血清杀菌试验):
|
2996 |
BZ232 |
MC58 |
NGH38 |
394/98 |
MenA |
MenC |
287-his |
32000 |
16 |
4096 |
4096 |
512 |
8000 |
16000 |
Δ1 287-His |
16000 |
128 |
4096 |
4096 |
1024 |
8000 |
16000 |
Δ2 287-His |
16000 |
128 |
4096 |
>2048 |
512 |
16000 |
>8000 |
Δ3 287-His |
16000 |
128 |
4096 |
>2048 |
512 |
16000 |
>8000 |
Δ4 287-His |
64000 |
128 |
4096 |
64000 |
1024 |
64000 |
32000 |
用菌株MC58的序列观察到Δ4缺失的相同高的活性。同样显示极佳的表达特性,因此突变体是免疫学相等的或更佳的。
实施例15-聚甘氨酸缺失
前实施例的‘Δ1 287-His′构建物与287-His和′287未标记的′的不同仅在于短的N-未端缺失(GGGGGGS)。然而使用一种以Nhe克隆位点中存在的密码子替代缺失的丝氨酸的表达载体,缺失仅为(Gly)6。因此,该(Gly)6序列的缺失显示对蛋白质表达有明显影响。
将缺失多达GGGGGG的N-未端氨基酸的蛋白质称为‘ΔG287′。在菌株MC58中,其序列(前导序列加下划线)为:
1
MFKRSVIAMA CIFALSACGG GGGGSPDVKS ADTLSKPAAP VVSEKETEAK
51 EDAPQAGSQG QGAPSAQGSQ DMAAVSEENT GNGGAVTADN PKNEDEVAQN
101 DMPQNAAGTD SSTPNHTPDP NMLAGNMENQ ATDAGESSQP ANQPDMANAA
151 DGMQGDDPSA GGQNAGNTAA QGANQAGNNQ AAGSSDPIPA SNPAPANGGS
201 NFGRVDLANG VLIDGPSQNI TLTHCKGDSC SGNNFLDEEV QLKSEFERLS
251 DADKISNYKK DGKNDKFVGL VADSVQMKGI NQYIIFYKPK PTSFARFRRS
301 ARSRRSLPAE MPLIPVNQAD TLIVDGEAVS LTGHSGNIFA PEGNYRYLTY
351 GAEKLPGGSY ALRVQGEPAK GEMLAGAAVY NGEVLHFHTE NGRPYPTRGR
401 FAAKVDFGSK SVDGIIDSGD DLHMGTQKFK AAIDGNGFKG TWTENGSGDV
451 SGKFYGPAGE EVAGKYSYRP TDAEKGGFGV FAGKKEQD*
与′287-His′或‘287未标记的′相比,有或无His-标记的ΔG287(分别为‘Δ287-His′和′ΔG287K′)以非常好的水平表达。
以基因变异性数据为基础,许多MenB菌株(尤其是菌株2996、MC58、1000和BZ232)的ΔG287-His的变体在大肠杆菌中表达。结果也非常好。
假设聚-Gly缺失可能是一种改进表达的常规策略。因此鉴定了含有类似(Gly)n基序(接近N-未端,丝氨酸的下游)的其它MenB脂蛋白,称为Tbp2(NMB0460)、741(NMB1870)和983(NMB1969):
1
MNNPLVNQAA MVLPVFLLSA CLGGGGSFDL DSVDTEAPRP APKYQDVFSE
51 KPQAQKDQGG YGFAMRLKRR NWYPQAKEDE VKLDESDWEA TGLPDERKKL
101 PKRQKSVIEK VETDSDNNIY SSPYLKPSNH QNGNTGNGIN QPKNQAKDYE
151 NFKYVYSGWF YKHAKREFNL KVEPKSAKNG DDGYIFYHGK EPSRQLPASG
201 KITYKGVWHF ATDTKKGQKF REIIQPSKSQ GDRYSGFSGD DGEEYSNKNK
251 STLTDGQEGY GFTSNLEVDF HNKKLTGKLI RNNANTDNNQ ATTTQYYSLR
301 AQVTGNRFNG KATATDKPQQ NSETKEHPFV SDSSSLSGGF FGPQGEELGF
351 RFLSDDQKVA VVGSAKTKDK PANGNTAAAS GGTDAAASNG AAGTSSENGK
401 LTTVLDAVEL KLGDKEVQKL DNFSNAAQLV VDGIMIPLLP EASESGNNQA
451 NQGTNGGTAF TRKFDHTPES DKKDAQAGTQ TNGAQTASNT AGDTNGKTKT
501 YEVEVCCSNL NYLKYGMLTR KNSKSAMQAG ESSSQADAKT EQVEQSMFLQ
551 GERTKEKEIP SEQNIVYRGS WYGYIANDKS TSWSGNASNA TSGNRAEFTV
601 NFADKKITGT LTADNRQEAT FTIDGNIKDN GFRGTAKTAE SGFDLDQSNT
651 TRTPKAYITD AKVQGGFYGP KAEELGGWFA YPGDKQTKNA TNASGNSSAT
701 VVFGAKRQQP VR*
741
ΔG741
1
VNRTAFCCLS LTTALILTAC SSGGGGVAAD IGAGLADALT APLDEKDKGL
51 QSLTLDQSVR KNRKLKLAAQ GARKTYGNGD SLNTGKLKND KVSRFDFIRQ
101 IEVDGQLITL ESGEFQVYKQ SHSALTAFQT EQIQDSEESG KMVAKRQFRI
151 GDIAGEHTSF DKLPEGGRAT YRGTAFGSDD AGGKLTYTID FAAKQGNGKI
201 EHLKSPKLNV DLAAADIKPD GKRHAVISGS VLYNQAEKGS YSLGIFGGKA
251 QEVAGSAEVK TVNGIRHIGL AAKQ*
983
ΔG983
1
MRTTPTFPTK TFKPTAMALA VATTLSACLG GGGGGTSAPD FNAGGTGIGS
51 NSRATTAKSA AVSYAGIKNE MCKDRSMLCA GRDDVAVTDR DAKINAPPPN
101 LHTGDFPNPN DAYKNLLNLK PAIEAGYTGR GVEVGIVDTG KSVGSISFPE
151 LYGRKKHGYN ENYKNYTAYM RKKAPEDGGG KDIEASFDDE AVIETEAKPT
201 DIRHVKEIGH IDLVSHIIGG RSVDGRPAGG IAPDATLHIM NTNDETKNEM
251 MVAAIRNAWV KLGERGVRIV NNSFGTTSRA GTADLFQIAN SEEQYRQALL
301 DYSGGDKTDE GIRLMQQSDY GNLSYHIRNK NMLFIFSTGN DAQAQPNTYA
351 LLPFYEKDAQ KGIITVAGVD RSGEKFKREM YGEPGTKPLE YGSNHCGITA
401 MWCLSAPYEA SVRFTRTNPI QIAGTSFSAP IVTGTAALLL QKYPWMSNDN
451 LRTTLLTTAQ DIGAVGVDSK FGWGLLDAGK AMNGPASFPF GDFTADTKGT
501 SDIAYSFRND ISGTGGLIKK GGSQLQLHGN NTYTGKTIIE GGSLVLYGNN
551 KSDMRVETKG ALIYNGAASG GSLNSDGIVY LADTDQSGAN ETVHIKGSLQ
601 LDGKGTLYTR LGKLLKVDGT AIIGGKLYMS ARGKGAGYLN STGRRVPFLS
651 AAKIGQDYSF FTNIETDGGL LASLDSVEKT AGSEGDTLSY YVRRGNAART
701 ASAAAHSAPA GLKHAVEQGG SNLENLMVEL DASESSATPE TVETAAADRT
751 DMPGIRPYGA TFRAAAAVQH ANAADGVRIF NSLAATVYAD STAAHADMQG
801 RRLKAVSDGL DENGTGLRVI AQTQQDGGTM EQGGVEGKMR GSTQTVGIAA
851 KTGENTTAAA TLGMGRSTWS ENSANAKTDS ISLFAGIRHD AGDIGYLKGL
901 FSYGRYKNSI SRSTGADKHA EGSVNGTLMQ LGALGGVNVP FAATGDLTVE
951 GGLRYDLLKQ DAFAEKGSAL GWSGNSLTEG TLVGLAGLKL SQPLSDKAVL
1001 FATAGVERDL NGRDYTVTGG FTGATAATGK TGARNMPHTR LVAGLGADVE
1051 FGNGWNGLAR YSYAGSKQYG NGSGRVGVGY RF*
Tbp2和741基因本源于菌株MC58;983和287基因来源于菌株2996。将它们克隆入pET载体中,并在大肠杆菌中表达而无编码它们前导肽的序列或以‘ΔG形式′(都融合于C-端His-标记)。在这每种情况中,发现相同的作用-在携带聚-甘氨酸段缺失的克隆中很好表达,如果在表达的蛋白质中存在甘氨酸则表达很差或不表达:
ORF 表达 纯化 细菌活性
287-His(2996) +/- + +
‘287未标记的’2996) +/- nd nd
ΔG287-His(2996) + + +
ΔG287K(2996) + + +
ΔG287-His(MC58) + + +
ΔG287-His(1000) + + +
ΔG287-His(BZ232) + + +
Tbp2-His(MC58) +/- nd nd
ΔGTbp2-His(MC58) + +
741-His(MC58) +/- nd nd
ΔG741-His(MC58) + +
983-His(2996)
ΔG983-His(2996) + +
图13显示了蛋白质的SDS-PAGE。
ΔG287和杂交体
制备和纯化菌株MC58、1000和BZ232的ΔG287蛋白质。它们都产生高ELISA滴定度,且血清杀菌滴定度>8192。由pET-24b表达的ΔG287K在ELISA和血清杀菌试验中的滴定度极佳。也可在pET-24b中表达ΔG287-ORF46.1K。
还将ΔG287直接融合于919、953、961和ORF46.1的符合读框的上游(如下显示的序列):
Δg287-919
1 ATGGCTAGCC CCGATGTTAA ATCGGCGGAC ACGCTGTCAA AACCGGCCGC
51 TCCTGTTGTT GCTGAAAAAG AGACAGAGGT AAAAGAAGAT GCGCCACAGG
101 CAGGTTCTCA AGGAACAGGC GCGCCATCCA CACAAGGCAG CCAAGATATG
151 GCGGCAGTTT CGGCAGAAAA TACAGGCAAT GGCGGTGCGG CAACAACGGA
201 CAAACCCAAA AATGAAGACG AGGGACCGCA AAATGATATG CCGCAAAATT
251 CCGCCGAATC CGCAAATCAA ACAGGGAACA ACCAACCCGC CGATTCTTCA
301 GATTCCGCCC CCGCGTCAAA CCCTGCACCT GCGAATGGCG GTAGCAATTT
351 TGGAAGGGTT GATTTGGCTA ATGGCGTTTT GATTGATGGG CCGTCGCAAA
401 ATATAACGTT GACCCACTGT AAAGGCGATT CTTGTAATGG TGATAATTTA
451 TTGGATGAAG AAGCACCGTC AAAATCAGAA TTTGAAAATT TAAATGAGTC
501 TGAACGAATT GAGAAATATA AGAAAGATGG GAAAAGCGAT AAATTTACTA
551 ATTTGGTTGC GACAGCAGTT CAAGCTAATG GAACTAACAA ATATGTCATC
601 ATTTATAAAG ACAAGTCCGC TTCATCTTCA TCTGCGCGAT TCAGGCGTTC
651 TGCACGGTCG AGGAGGTCGC TTCCTGCCGA GATGCCGCTA ATCCCCGTCA
701 ATCAGGCGGA TACGCTGATT GTCGATGGGG AAGCGGTCAG CCTGACGGGG
751 CATTCCGGCA ATATCTTCGC GCCCGAAGGG AATTACCGGT ATCTGACTTA
801 CGGGGCGGAA AAATTGCCCG GCGGATCGTA TGCCCTCCGT GTGCAAGGCG
851 AACCGGCAAA AGGCGAAATG CTTGCTGGCA CGGCCGTGTA CAACGGCGAA
901 GTGCTGCATT TTCATACGGA AAACGGCCGT CCGTACCCGA CTAGAGGCAG
951 GTTTGCCGCA AAAGTCGATT TCGGCAGCAA ATCTGTGGAC GGCATTATCG
1001 ACAGCGGCGA TGATTTGCAT ATGGGTACGC AAAAATTCAA AGCCGCCATC
1051 GATGGAAACG GCTTTAAGGG GACTTGGACG GAAAATGGCG GCGGGGATGT
1101 TTCCGGAAGG TTGGACGGCC CGGCCGGCGA GGAAGTGGCG GGAAAATACA
1151 GCTATCGCCC GACAGATGCG GAAAAGGGCG GATTCGGCGT GTTTGCCGGC
1201 AAAAAAGAGC AGGATGGATC CGGAGGAGGA GGATGCCAAA GCAAGAGCAT
1251 CCAAACCTTT CCGCAACCCG ACACATCCGT CATCAACGGC CCGGACCGGC
1301 CGGTCGGCAT CCCCGACCCC GCCGGAACGA CGGTCGGCGG CGGCGGGGCC
1351 GTCTATACCG TTGTACCGCA CCTGTCCCTG CCCCACTGGG CGGCGCAGGA
1401 TTTCGCCAAA AGCCTGCAAT CCTTCCGCCT CGGCTGCGCC AATTTGAAAA
1451 ACCGCCAAGG CTGGCAGGAT GTGTGCGCCC AAGCCTTTCA AACCCCCGTC
1501 CATTCCTTTC AGGCAAAACA GTTTTTTGAA CGCTATTTCA CGCCGTGGCA
1551 GGTTGCAGGC AACGGAAGCC TTGCCGGTAC GGTTACCGGC TATTACGAGC
1601 CGGTGCTGAA GGGCGACGAC AGGCGGACGG CACAAGCCCG CTTCCCGATT
1651 TACGGTATTC CCGACGATTT TATCTCCGTC CCCCTGCCTG CCGGTTTGCG
1701 GAGCGGAAAA GCCCTTGTCC GCATCCAGGA GACGGGAAAA AACAGCGGCA
1751 CAATCGACAA TACCGGCGGC ACACATACCG CCGACCTCTC CCGATTCCCC
1801 ATCACCGCGC GCACAACGGC AATCAAAGGC AGGTTTGAAG GAAGCCGCTT
1851 CCTCCCCTAC CACACGCGCA ACCAAATCAA CGGCGGCGCG CTTGACGGCA
1901 AAGCCCCGAT ACTCGGTTAC GCCGAAGACC CCGTCGAACT TTTTTTTATG
1951 CACATCCAAG GCTCGGGCCG TCTGAAAACC CCGTCCGGCA AATACATCCG
2001 CATCGGCTAT GCCGACAAAA ACGAACATCC CTACGTTTCC ATCGGACGCT
2051 ATATGGCGGA CAAAGGCTAC CTCAAGCTCG GGCAGACCTC GATGCAGGGC
2101 ATCAAAGCCT ATATGCGGCA AAATCCGCAA CGCCTCGCCG AAGTTTTGGG
2151 TCAAAACCCC AGCTATATCT TTTTCCGCGA GCTTGCCGGA AGCAGCAATG
2201 ACGGTCCCGT CGGCGCACTG GGCACGCCGT TGATGGGGAA ATATGCCGGC
2251 GCAGTCGACC GGCACTACAT TACCTTGGGC GCGCCCTTAT TTGTCGCCAC
2301 CGCCCATCCG GTTACCCGCA AAGCCCTCAA CCGCCTGATT ATGGCGCAGG
2351 ATACCGGCAG CGCGATTAAA GGCGCGGTGC GCGTGGATTA TTTTTGGGGA
2401 TACGGCGACG AAGCCGGCGA ACTTGCCGGC AAACAGAAAA CCACGGGTTA
2451 CGTCTGGCAG CTCCTACCCA ACGGTATGAA GCCCGAATAC CGCCCGTAAC
2501 TCGAG
1 MASPDVKSAD TLSKPAAPVV AEKETEVKED APQAGSQGQG APSTQGSQDM
51 AAVSAENTGN GGAATTDKPK NEDEGPQNDM PQNSAESANQ TGNNQPADSS
101 DSAPASNPAP ANGGSNFGRV DLANGVLIDG PSQNITLTHC KGDSCNGDNL
151 LDEEAPSKSE FKNLNESERI EKYKKDGKSD KFTNLVATAV QANGTNKYVI
201 IYKDKSASSS SARFRRSARS RRSLPAEMPL IPVNQADTLI VDGEAVSLTG
251 HSGNIFAPEG NYRYLTYGAE KLPGGSYALR VQGEPAKGEM LAGTAVYNGE
301 VLHFHTENGR PYPTRGRFAA KVDFGSKSVD GIIDSGDDLH MGTQKFKAAI
351 DGNQFKGTWT ENGGGDVSGR FYGPAGEEVA GKYSYRPTDA EKGGFGVFAG
401 KKEQDGSGGG GCQSKSIQTF PQPDTSVING PDRPVGIPDP AGTTVGGGGA
451 VYTVVPHLSL PHWAAQDFAK SLQSFRLGCA NLKNRQGWQD VCAQAFQTPV
501 HSFQAKQFFE RYFTPWQVAG NGSLAGTVTG YYEPVLKGDD RRTAQARFPI
551 YGIPDDFISV PLPAGLRSGK ALVRIRQTGK NSGTIDNTGG THTADLSRFP
601 ITARTTAIKG RFEGSRFLPY HTRNQINGGA LDGKAPILGY AEDPVELFFM
651 HIQGSGRLKT PSGKYIRIGY ADKNEHPYVS IGRYMADKGY LKLGQTSMQG
701 IKAYMRQNPQ RLAEVLGQNP SYIFFRELAG SSNDGPVGAL GTPLMGEYAG
751 AVDRHYITLG APLFVATAHP VTRKALNRLI MAQDTGSAIK GAVRVDYFWG
801 YGDEAGELAG KQKTTGYVWQ LLPNGMKPEY RP*
ΔG287-953
1 ATGGCTAGCC CCGATGTTAA ATCGGCGGAC ACGCTGTCAA AACCGGCCGC
51 TCCTGTTGTT GCTGAAAAAG AGACAGAGGT AAAAGAAGAT GCGCCACAGG
101 CAGGTTCTCA AGGACAGGGC GCGCCATCCA CACAAGGCAG CCAAGATATG
151 GCGGCAGTTT CGGCAGAAAA TACAGGCAAT GGCGGTGCGG CAACAACGGA
201 CAAACCCAAA AATGAAGACG AGGGACCGCA AAATGATATG CCGCAAAATT
251 CCGCCGAATC CGCAAATCAA ACAGGGAACA ACCAACCCGC CGATTCTTCA
301 GATTCCGCCC CCGCGTCAAA CCCTGCACCT GCGAATGGCG GTAGCAATTT
351 TGGAAGGGTT GATTTGGCTA ATGGCGTTTT GATTGATGGG CCGTCGCAAA
401 ATATAACGTT GACCCACTGT AAAGGCGATT CTTGTAATGG TGATAATTTA
451 TTGGATGAAG AAGCACCGTC AAAATCAGAA TTTGAAAATT TAAATGAGTC
501 TGAACGAATT GAGAAATATA AGAAAGATGG GAAAAGCGAT AAATTTACTA
551 ATTTGGTTGC GACAGCAGTT CAAGCTAATG GAACTAACAA ATATGTCATC
601 ATTTATAAAG ACAAGTCCGC TTCATCTTCA TCTGCGCGAT TCAGGCGTTC
651 TGCACGGTCG AGGAGGTCGC TTCCTGCCGA GATGCCGCTA ATCCCCGTCA
701 ATCAGGCGGA TACGCTGATT GTCGATGGGG AAGCGGTCAG CCTGACGGGG
751 CATTCCGGCA ATATCTTCGC GCCCGAAGGG AATTACCGGT ATCTGACTTA
801 CGGGGCGGAA AAATTGCCCG GCGGATCGTA TGCCCTCCGT GTGCAAGGCG
851 AACCGGCAAA AGGCGAAATG CTTGCTGGCA CGGCCGTGTA CAACGGCGAA
901 GTGCTGCATT TTCATACGGA AAACGGCCGT CCGTACCCGA CTAGAGGCAG
951 GTTTGCCGCA AAAGTCGATT TCGGCAGCAA ATCTGTGGAC GGCATTATCG
1001 ACAGCGGCGA TGATTTGCAT ATGGGTACGC AAAAATTCAA AGCCGCCATC
1051 GATGGAAACG GCTTTAAGGG GACTTGGACG GAAAATGGCG GCGGGGATGT
1101 TTCCGGAAGG TTTTACGGCC CGGCCGGCGA GGAAGTGGCG GGAAAATACA
1151 GCTATCGCCC GACAGATGCG GAAAAGGGCG GATTCGGCGT GTTTGCCGGC
1201 AAAAAAGAGC AGGATGGATC CGGAGGAGGA GGAGCCACCT ACAAAGTGGA
1251 CGAATATCAC GCCAACGCCC GTTTCGCCAT CGACCATTTC AACACCAGCA
1301 CCAACGTCGG CGGTTTTTAC GGTCTGACCG CTTCCGTCGA GTTCGACCAA
1351 GCAAAACGCG ACGGTAAAAT CCGCATCACC ATCCCCGTTG CCAACCTGCA
1401 AAGCGGTTCG CAACACTTTA CCGACCACCT GAAATCAGCC GACATCTTCG
1451 ATGCCGCCCA ATATCCGGAC ATCCGCTTTG TTTCCACCAA ATTCAACTTC
1501 AACGGCAAAA AACTGGTTTC CGTTGACGGC AACCTGACCA TGCACGGCAA
1551 AACCGCCCCC GTCAAACTCA AAGCCGAAAA ATTCAACTGC TACCAAAGCC
1601 CGATGGCGAA AACCGAAGTT TGCGGCGGCG ACTTCAGCAC CACCATCGAC
1651 CGCACCAAAT GGGGCGTGGA CTACCTCGTT AACGTTGGTA TGACCAAAAG
1701 CGTCCGCATC GACATCCAAA TCGAGGCAGC CAAACAATAA CTCGAG
1 MASPDVKSAD TLSKPAAPVV AEKETEVKED APQAGSQGQG APSTQGSQDM
51 AAVSAENTGN GGAATTDJPK NEDEGPQNDM PQNSAESANQ TGNNQPADSS
101 DSAPASNPAP ANGGSNFGRV DLANGVLIDG PSQNITLTHC KGDSCNGDNL
151 LDEEAPSKSE FENLNESERI EKYKKDGKSD KFTNLVATAV QANGTNKYVI
201 IYKDKSASSS SARFRRSARS RRSLPAEMPL IPVNQADTLI VDGEAVSLTG
251 HSGNIFAPEG NYRYLTYGAE KLPGGSYALR VQGEPAKGEM LAGTAVYNGE
301 VLHFHTENGR PYPTRGRFAA KVDFGSKSVD GIIDSGDDLH MGTQKFKAAI
351 DGNGFKGTWT ENGGGDVSGR FYGPAGEEVA GKYSYRPTDA EKGGFGVFAG
401 KKEQDGSGGG GATYKVDEYH ANARFAIDSF NTSTNVGGFY GLTGSVEFDQ
451 AKRDGKIDIT IPVANLQSGS QHFTDHLKSA DIFDAAQYPD IRFVSTKFNF
501 NGKKLVSVDG NLTMHGKTAP VKLKAEKFNC YQSPMAKTEV CGGDFSTTID
551 RTKWGVDYLV NVGMTKSVRI DIQIEAAKQ*
ΔG287-961
1 ATGGCTAGCC CCGATCTTAA ATCGGCGGAC ACGCTGTCAA AACCGGCCGC
51 TCCTGTTGTT GCTGAAAAAG AGACAGAGGT AAAAGAAGAT GCGCCACAGG
101 CAGGTTCTCA AGGACAGGGC GCGCCATCCA CACAAGGCAG CCAAGATATG
151 GCGGCAGTTT CGGCAGAAAA TACAGGCAAT GGCGGTGCGG CAACAACGGA
201 CAAACCCAAA AATGAAGACG AGGGACCGCA AAATGATATG CCGCAAAATT
251 CCGCCGAATC CGCAAATCAA ACAGGGAACA ACCAACCCGC CGATTCTTCA
301 GATTCCGCCC CCGCGTCAAA CCCTGCACCT GCGAATGGCG GTAGCAATTT
351 TGGAAGGGTT GATTTGGCTA ATGGCGTTTT GATTGATGGG CCGTCGCAAA
401 ATATAACGTT GACCCACTGT AAAGGCGATT CTTGTAATGG TGATAATTTA
451 TTGGATGAAG AAGCACCGTC AAAATCAGAA TTTGAAAATT TAAATGAGTC
501 TGAACGAATT GAGAAATATA AGAAAGATGG GAAAAGCGAT AAATTTACTA
551 ATTTGGTTGC GACAGCAGTT CAAGCTAATG GAACTAACAA ATATGTCATC
601 ATTTATAAAG ACAAGTCCGC TTCATCTTCA TCTGCGCGAT TCAGGCGTTC
651 TGCACGGTCG AGGAGGTCGC TTCCTGCCGA GATGCCGCTA ATCCCCGTCA
701 ATCAGGCGGA TACGCTGATT GTCGATGGGG AAGCGGTCAG CCTGACGGGG
751 CATTCCGGCA ATATCTTCGC GCCCGAAGGG AATTACCGGT ATCTGACTTA
801 CGGGGCGGAA AAATTGCCCG GCGGATCGTA TGCCCTCCGT GTGCAAGGCG
851 AACCGGCAAA AGGCGAAATG CTTGCTGGCA CGGCCGTGTA CAACGGCGAA
901 GTGCTGCATT TTCATACGGA AAACGGCCGT CCGTACCCGA CTAGAGGCAG
951 GTTTGCCGCA AAAGTCGATT TCGGCAGCAA ATCTGTGGAC GGCATTATCG
1001 ACAGCGGCGA TGATTTGCAT ATGGGTACGC AAAAATTCAA AGCCGCCATC
1051 GATGGAAACG GCTTTAAGGG GACTTGGACG GAAAATGGCG GCGGGGATGT
1101 TTCCGGAAGG TTTTACGGCC CGGCCGGCGA GGAAATGGCG GGAAAATACA
1151 GCTATCGCCC GACAGATGCG GAAAAGAACG GATTCGGCGT GTTTGCCGGC
1201 AAAAAAGAGC AGGATGGATC CGGAGGAGGA GGAGCCACAA ACGACGACGA
1251 TGTTAAAAAA GCTGCCACTG TGGCCATTGC TGCTGCCTAC AACAATGGCC
1301 AAGAAATCAA CGGTTTCAAA GCTGGAGAGA CCATCTACGA CATTGATGAA
1351 GACGGCACAA TTACCAAAAA AGACGCAACT GCAGCCGATG TTGAAGCCGA
1401 CGACTTTAAA GGTCTGGGTC TGAAAAAAGT CGTGACTAAC CTGACCAAAA
1451 CCGTCAATGA AAACAAACAA AACGTCGATG CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA
1501 TCTGAAATAG AAAAGTTAAC AACCAAGTTA GCAGACACTG ATGCCGCTTT
1551 AGCAGATACT GATGCCGCTC TGGATGCAAC CACCAACGCC TTGAATAAAT
1601 TGGGAGAAAA TATAACGACA TTTGCTGAAG AGACTAAGAC AAATATCGTA
1651 AAAATTGATG AAAAATTAGA AGCCGTGGCT GATACCGTCG ACAAGCATGC
1701 CGAAGCATTC AACGATATCG CCGATTCATT GGATGAAACC AACACTAAGG
1751 CAGACGAAGC CGTCAAAACC GCCAATGAAG CCAAACAGAC GGCCGAAGAA
1801 ACCAAACAAA ACGTCGATGC CAAAGTAAAA GCTGCAGAAA CTGCAGCAGG
1851 CAAAGCCGAA GCTGCCGCTG GCACAGCTAA TACTGCAGCC GACAAGGCCG
1901 AAGCTGTCGC TGCAAAAGTT ACCGACATCA AAGCTGATAT CGCTACGAAC
1951 AAAGATAATA TTGCTAAAAA AGCAAACAGT GCCGACGTGT ACACCAGAGA
2001 AGAGTCTGAC AGCAAATTTG TCAGAATTGA TGGTCTGAAC GCTACTACCG
2051 AAAAATTGGA CACACGCTTG GCTTCTGCTG AAAAATCCAT TGCCGATCAC
2101 GATACTCGCC TGAACGGTTT GGATAAAACA GTGTCAGACC TGCGCAAAGA
2151 AACCCGCCAA GGCCTTGCAG AACAAGCCGC GCTCTCCGGT CTGTTCCAAC
2201 CTTACAACGT GGGTCGGTTC AATGTAACGG CTGCAGTCGG CGGCTACAAA
2251 TCCGAATCGG CAGTCGCCAT CGGTACCGGC TTCCGCTTTA CCGAAAACTT
2301 TGCCGCCAAA GCAGGCGTGG CAGTCGGCAC TTCGTCCGGT TCTTCCGCAG
2351 CCTACCATGT CGGCGTCAAT TACGAGTGGT AACTCGAG
1 MASPDVKSAD TLSKPAAPVV AEKETEVKED APQAGSQGQG APSTQGSQDM
51 AAVSAENTGN GGAATTDKPK NEDEGPQNDM PQNSAESANQ TGNNQPADSS
101 DSAPASNPAP ANGGSNFGRV DLANGVLIDG PSQNITLTHC KGDSCNGDNL
151 LDEEAPSKSE FENLNESERI EKYKKDGKSD KFTNLVATAV QANGTNKYVI
201 IYKDKSASSS SARFRRSARS RRSLPAEMPL IPVNQADTLI VDGEAVSLTG
251 HSGNIFAPEG NYRYLTYGAE KLPGGSYALR VQGEPAKGEM LAGTAVYNGE
301 VLHFHTENGR PYPTRGRFAA KVDFGSKSVD GIIDSGDDLH MGTQKFKAAI
351 DGNGFKGTWT KNGGGDVSGR FYGPAGEEVA GKYSYRPTDA KKGGFGVFAG
401 KKEQDGSGGG GATNDDDVKK AATVAIAAAY NNGQEINGFK AGETIYDIDE
451 DGTITKKDAT AADVEADDFK GLGLKKVVTN LTKTVNENKQ NVDAKVKAAE
501 SEIEKLTTKL ADTDAALADT DAALDATTNA LNKLGENITT FAEETKTNIV
551 KIDEKLEAVA DTVDKHAEAF NDIADSLDET NTKADEAVKT ANEAKQTAEE
601 TKQNVDAKVK AAETAAGKAE AAAGTANTAA DKAEAVAAKV TDIKADIATN
651 KDNIAKKANS ADVYTREESD SKFVRIDGLN ATTEKLDTRL ASAEKSIADH
701 DTRLNGLDKT VSDLRKETRQ GLAEQAALSG LFQPYNVGRF NVTAAVGGYK
751 SESAVAIGTG FRFTENFAAK AGVAVGTSSG SSAAYHVGVN YEW
* |
ELISA |
杀菌 |
ΔG287-953-His |
3834 |
65536 |
ΔG287-961-His |
108627 |
65536 |
将抗体针对杂交蛋白产生的杀菌效力(同源菌株)与针对919和ORF46.1的组分抗原(使用287-GST)的简单化合物产生的抗体相比:
|
与287的混合物 |
与ΔG287的杂交体 |
919 |
32000 |
128000 |
ORF46.1 |
128 |
16000 |
还获得了针对异源MenB菌株和血清型A和C的杀菌活性的数据:
|
919 |
ORF46.1 |
菌株 |
混合物 |
杂交体 |
混合物 |
杂交体 |
NGH38 |
1024 |
32000 |
- |
16384 |
MC58 |
512 |
8192 |
- |
512 |
BZ232 |
512 |
512 |
- |
- |
MenA(F6124) |
512 |
32000 |
- |
8192 |
MenC(C11) |
>2048 |
>2048 |
- |
- |
MenC(BZ133) |
>4096 |
64000 |
- |
8192 |
因此,在与ΔG287(在N-未端)的杂交蛋白质比简单的与ΔG287-ORF46.1的混合物在免疫学上更优良,针对异源菌株尤其有效。也可在pET-24b中表达ΔG287-ORF46.1。
用新西兰菌株394/98而非2996制备相同的杂交蛋白:
ΔG287NZ-919
1 ATGGCTAGCC CCGATGTCAA GTCGGCGGAC ACGCTGTCAA AACCTGCCGC
51 CCCTGTTGTT TCTGAAAAAG AGACAGAGGC AAAGGAAGAT GCGCCACAGG
101 CAGGTTCTCA AGGACAGGGC GCGCCATCCG GACAAGGCGG TCAAGATATG
151 GCGGCGGTTT CGGAAGAAAA TACAGGCAAT GGCGGTGCGG CAGCAACGGA
201 CAAACCCAAA AATGAAGACG AGGGGGCGCA AAATGATATG CCGCAAAATG
251 CCGCCGATAC AGATAGTTTG ACACCGAATC ACACCCCGGC TTCGAATATG
301 CCGGCCGGAA ATATGGAAAA CCAAGCACCG GATGCCGGGG AATCGGAGCA
351 GCCGGCAAAC CAACCGGATA TGGCAAATAC GCGGACGGAA ATGCAGGGTG
401 ACGATCCGTC GGCAGGCGGG GAAAATGCCG GCAATACGGC TGCCCAAGGT
451 ACAAATCAAG CCGAAAACAA TCAAACCGCC GGTTCTCAAA ATCCTGCCTC
501 TTCAACCAAT CCTAGCGCCA CGAATAGCGG TGGTGATTTT GGAAGGACGA
551 ACGTGGGCAA TTCTGTTGTG ATTGACGGGC CGTCGCAAAA TATAACGTTG
601 ACCCACTGTA AAGGCGATTC TTCTAGTGGC AATAATTTCT TGGATGAAGA
651 AGTACAGCTA AAATCAGAAT TTGAAAAATT AAGTGATGCA GACAAAATAA
701 GTAATTACAA GAAAGATGGG AAGAATGACG GGAAGAATGA TAAATTTGTC
751 GGTTTGGTTG CCGATAGTGT GCAGATGAAG GGAATCAATC AATATATTAT
801 CTTTTATAAA CCTAAACCCA CTTCATTTGC GCGATTTAGG CGTTCTGCAC
851 GGTCGAGGCG GTCGCTTCCG GCCGAGATGC CGCTGATTCC CGTCAATCAG
901 GCGGATACGC TGATTCTCGA TGGGGAAGCG GTCAGCCTGA CGGGGCATTC
951 CGGCAATATC TTCGCGCCCG AAGGGAATTA CCGGTATCTG ACTTACGGGG
1001 CGGAAAAATT GCCCGGCGGA TCGTATGCCC TCCGTGTTCA AGGCGAACCT
1051 TCAAAAGGCG AAATGCTCGC GGGCACGGCA GTGTACAACG GCGAAGTGCT
1101 GCATTTTCAT ACGGAAAACG GCCGTCCGTC CCCGTCCAGA GGCAGGGTTG
1151 CCGCAAAAGT CGATTTCGGC AGCAAATCTG TGGACGGCAT TATCGACAGC
1201 GGCGATGGTT TGCATATGGG TACGCAAAAA TTCAAAGCCG CCATCGATGG
1251 AAACGGCTTT AAGGGGACTT GGACGGAAAA TGGCGGCGGG GATGTTTCCG
1301 GAAAGTTTTA CGGCCCGGCC GGCGAGGAAG TGGCGGGAAA ATACAGCTAT
1351 CGCCCAACAG ATGCGGAAAA GGGCGGATTC GGCGTGTTTG CCGGCAAAAA
1401 AGAGCAGGAT GGATCCGGAG GAGGAGGATG CCAAAGCAAG AGCATCCAAA
1451 CCTTTCCGCA ACCCGACACA TCCGTCATCA ACGGCCCGGA CCGGCCGGTC
1501 GGCATCCCCG ACCCCGCCGG AACGACGGTC GGCGGCGGCG GGGCCGTCTA
1551 TACCGTTGTA CCGCACCTGT CCGCTGCCCA CTGGGCGGCG CAGGATTTCG
1601 CCAAAAGCCT GCAATCCTTC CGCCTCGGCT GCGCCAATTT GAAAAACCGC
1651 CAAGGCTGGC AGGATGTGTG CGCCCAAGCC TTTCAAACCC CCGTCCATTC
1701 CTTTCAGGCA AAACAGTTTT TTGAACGCTA TTTCACGCCG TGGCAGGTTG
1751 CAGGCAACGG AAGCCTTGCC GGTACGGTTA CCGGCTATTA CGAGCCGGTG
1801 CTGAAGGGCG ACGACAGGCG GACGGCACAA GCCCGCTTCC CGATTTACGG
1851 TATTCCCGAC GATTTTATCT CCGTCCCCCT GCCTGCCGGT TTGCGGAGCG
1901 GAAAAGCCCT TGTCCGCATC AGGCAGACGG GAAAAAACAG CGGCACAATC
1951 GACAATACCG GCGGCACACA TACCGCCGAC CTCTCCCGAT TCCCCATCAC
2001 CGCGCGCACA ACGGCAATCA AAGGCAGGTT TGAAGGAAGC CGCTTCCTCC
2051 CCTACCACAC GCGCAACCAA ATCAACGGCG GCGCGCTTGA CGGCAAAGCC
2101 CCGATACTCG GTTACGCCGA AGACCCCGTC GAACTTTTTT TTATGCACAT
2151 CCAAGGCTCG GGCCGTCTGA AAACCCCGTC CGGCAAATAC ATCCGCATCG
2201 GCTATGCCGA CAAAAACGAA CATCCCTACG TTTCCATCGG ACGCTATATG
2251 GCGGACAAAG GCTACCTCAA GCTCGGGCAG ACCTCGATGC AGGGCATCAA
2301 AGCCTATAYG CGGCAAAATC CGCAACGCCT CGCCGAAGTT TTGGGTCAAA
2351 ACCCCAGCTA TATCTTTTTC CGCGAGCTTG CCGGAAGCAG CAATGACGGT
2401 CCCGTCGGCG CACTGGGCAC GCCGTTGATG GGGGAATATG CCGGCGCAGT
2451 CGACCGGCAC TACATTACCT TGGGCGCGCC CTTATTTGTC GCCACCGCCC
2501 ATCCGGTTAC CCGCAAAGCC CTCAACCGCC TGATTATGGC GCAGGATACC
2551 GGCAGCGCGA TTAAAGGCGC GGTGCGCGTG GATTATTTTT GGGGATACGG
2601 CGACGAAGCC GGCGAACTTG CCGGCAAACA GAAAACCACG GGTTACGTCT
2651 GGCAGCTCCT ACCCAACGGT ATGAAGCCCG AATACCGCCC GTAAAAGCTT
1 MASPDVKSAD TLSKPAAPVV SEKETETAKD APQAGSQGQG APSAQGGQDM
51 AAVSEENTGN GGAAATDKPK NEDEGAQNDM PQNAADTDSL TPNHTPASNM
101 PAGNMENQSP DAGESEQPAN QPIMANTADG MQGDDPSAGG ENAGNTAAQG
151 TNQAENNQTA GSQNPASSTN PSATNSGGDF GRTNVGNSVV IDGPSQNITL
201 THCKGDSCSG NNFLDEEVQL KSEFEKLSDA DKISNYKKDG KNDGKNDKFV
251 GLVADSVQMK GINQYIIFYK PKPTSFARFR RSARSRRSLP AEMPLIPVNQ
301 ADTLIVDGEA VSLTGHSGNI FAPEGNYRYL TYGAEKLPGG SYALRVQGEP
351 SKGEMLAGTA VYNGBVLHFH TENGRPSPSR GRFAAKVDFG SKSVDGIIDS
401 GDGLHMGTQK FKAAIDGNGF KGTWTENGGG DVSGKFYGPA GEEVAGKYSY
451 RPTDAEKGGF GVFAGKKEQD GSGGGGCQSK SIQTFPQPDT SVINGPDRPV
501 GIPDPAGTTV GGGGAVYTVV PHLSLPHWAA QDFAKSSQSF RLGCANLKNR
551 QGWQDVCAQA FQTPVHSFQA KQFFERYFTP WQVAGNGSLA GTVIGYYEPV
601 LKGDDRRTAQ ARFPIYGIPD DFISVPLPAD LRSGKALVRI RQTGKNSGTI
651 DNTGGTHTAD LSRFPITART TAIKGRFEGS RFLPYHTRNQ INGGALDGKA
701 PILGYAEDPV ELFFMHIQGS GRLKTPSGKY IRIGYADKNE HPYVSIGRYM
751 ADKGYLKLGQ TSMQGIKAYM RQNPQRLAEV LGQNPSYIFF RELAGSSNDG
801 PVGALGTPLM GEYAGAVDRH YITLGAPLFV ATAHPVTRKA LNRLIMAQDT
851 GSAIKGAVRV DYFWGYGDEA GELAGKQKTT GYVWQLLPNG MKPEYRP*
ΔG287NZ-953
1 ATGGCTAGCC CCGATGTCAA GTCGGCGGAC ACGCTGTCAA AACCTGCCGC
51 CCCTGTTGTT TCTGAAAAAG AGACAGAGGC AAAGGAAGAT GCGCCACAGG
101 CAGGTTCTCA AGGACAGGGC GCGCCATCCG CACAAGGCGG TCAAGATATG
151 GCGGCGGTTT CGGAAGAAAA TACAGGCAAT GGCGGTGCGG CAGCAACGGA
201 CAAACCCAAA AATGAAGACG AGGGGGCGCA AAATGATATG CCGCAAAATG
251 CCGCCGATAC AGATAGTTTG ACACCGAATC ACACCCCGGC TTCGAATATG
301 CCGGCCGGAA ATATGGAAAA CCAAGCACCG GATGCCGGGG AATCGGAGCA
351 GCCGGCAAAC CAACCGGATA TGGCAAATAC GGCGGACGGA ATGCAGGGTG
401 ACGATCCGTC GGCAGGCGGG GAAAATGCCG GCAATACGGC TGCCCAAGGT
451 ACAAATCAAG CCGAAAACAA TCAAACCGCC GGTTCTCAAA ATCCTGCCTC
501 TTCAACCAAT CCTAGCGCCA CGAATAGCGG TGGTGATTTT GGAAGGACGA
551 ACGTGGGCAA TTCTGTTGTG ATTGACGGGC CGTCGCAAAA TATAACGTTG
601 ACCCACTGTA AAGGCGATTC TTGTAGTGGC AATAATTTCT TGGATGAAGA
651 AGTACAGCTA AAATCAGAAT TTGAAAAATT AAGTGATGCA GACAAAATAA
701 GTAATTACAA GAAAGATGGG AAGAATGACG GGAAGAATGA TAAATTTGTC
751 GGTTTGGTTG CCGATAGTGT GCAGTGAAGG GGAATCAATC AATATATTAT
801 CTTTTATAAA CCTAAACCCA CTTCATTTGC GCGATTTAGG CGTTCTGCAC
851 GGTCGAGGCG GTCGCTTCCG GCCGAGATGC CGCTGATTCC CGTCAATCAG
901 GCGGATACGC TGATTGTCGA TGGGGAAGCG GTCAGCCTGA CGGGGGATTC
951 CGGCAATATC TTCGCGCCCG AAGGGAATTA CCGGTATCTG ACTTACGGGG
1001 CGGAAAAATT GCCCGGCGGA TCGTATGCCC TCCGTGTTCA AGGCGAACCT
1051 TCAAAAGGCG AAATGCTCGC GGGCACGGCA GTGTACAACG GCGAAGTGCT
1101 GCATTTTCAT ACGGAAAACG GCCGTCCGTC CCCGGTCAGA GGCAGGTTTG
1151 CCGCAAAAGT CGATTTCGGC AGCAAATCTG TGGACGGCAT TATCGACAGC
1201 GGCGATGGTT TGCATATGGG TACGCAAAAA TTCAAAGCCG CCATCGATGG
1251 AAACGGCTTT AAGGGGACTT GGACGGAAAA TGGCGGCGGG GATGTTTCCG
1301 GAAAGTTTTA CGGCCCGGCC GGCGAGGAAG TGGCGGGAAA ATACAGCTAT
1351 CGCCCAACAG ATGCGGAAAA GGGCGGATTC GGCGTGTTTG CCGGCAAAAA
1401 AGAGCAGGAT GGATCCGGAG GAGGAGGAGC CACCTACAAA GTGGACGAAT
1451 ATCACGCCAA CGCCCGTTTC GCCATCGACC ATTTCAACAC CAGCACCAAC
1501 GTCGGCGGTT TTTACGGTCT GACCGGTTCC GTCGAGTTCG ACCAAGCAAA
1551 ACGCGACGGT AAAATCGACA TCACCATCCC CGTTGCCAAC CTGCAAAGCG
1601 GTTCGCAACA CTTTACCGAC CACCTGAAAT CAGCCGACAT CTTCGATGCC
1651 GCCCAATATC CGGACATCCG CTTTGTTTCC ACCAAATTCA ACTTCAACGG
1701 CAAAAAACTG GTTTCCGTTG ACGGCAACCT GACCATGCAC GGCAAAACCG
1751 CCCCCGTCAA ACTCAAAGCC GAAAAATTCA ACTGCTACCA AAGCCCGATG
1801 GCGAAAACCG AAGTTTGCGG CGGCGACTTC AGCACCACCA TCGACCGCAC
1851 CAAATGGGGC GTGGACTACC TCGTTAACGT TGGTATGACC AAAGCGGTCC
1901 GCATCGACAT CCAAATCGAG GCAGCCAAAC AATAAAAGCT T
1 MASPDVKSAD TLSKPAAPVV SEKETEAKED APQAGSQGQG APSAQGGQDM
51 AAVSEENTGN GGAAATDKPK NEDEGAQNDM PQNAADTDSL TPNHTPASNM
101 PAGNMENQAP DAGESEQPAN QPDMANTADG MQGDDPSAGG ENAGNTAAQG
151 TNQAENNQTA GSQNPASSTN PSATNSGGDF GRTNVGNSVV IDGPSQNITL
201 THCKGDSCSG NNFLDEEVQL KSEFEKLSDA DKISNYKKDG KNDGKNDKFV
251 GLVADSVQMK GINQYIIFYK PKPTSFARFR RSARSRRSLP AEMPLIPVNQ
301 ADTLIVDGEA VSLTGHSGNI FAPEGNYRYL TYGAEKLPGG SYALRVQGEP
351 SKGEMLAGTA VYNGEVLHFH TENGRPSPSR GRFAAKVDFG SKSVDGIIDS
401 GDGLHMGTQK FKAAIDGNGF KGTWTENGGG DVSGKFYGPA GKEVAGKYSY
451 RPTDAEKGGF GVFAGKKEQD GSGGGGATYK VDEYHANARF AIDHFNTSTN
501 VGGFYGLTGS VEFDQAKRDG KIDITIPVAN LQSGSQHFTD HLKSADIFDA
551 AQYPDIRFVS TKFNFNGKKL VSVDGNLTMH GKTAPVKLKA EKFNCYQSPM
601 AKTEVCGGDF STTIDRTKWG VDYLVNVGMT KSVRIDIQIE AAKQ*
ΔG287NZ-961
1 ATGGCTAGCC CCGATGTCAA GTCGGCGGAC ACGCTGTCAA AACCTGCCGC
51 CCCTGTTGTT TCTGAAAAAG AGACAGAGGC AAAGGAAGAT GCGCCACAGG
101 CAGGTTCTCA AGGACAGGGC GCGCCATCCG CACAAGGCGG TCAAGATATG
151 GCGGCGGTTT CGGAAGAAAA TACAGGCAAT GGCGGTGCGG CAGCAACGGA
201 CAAACCCAAA AATGAAGACG AGGGGGCGCA AAATGATATG CCGCAAAATG
251 CCGCCGATAC AGATAGTTTG ACACCGAATC ACACCCCGGC TTCGAATATG
301 CCGGCCGGAA ATATGGAAAA CCAAGCACCG GATGCCGGGG AATCGGAGCA
351 GCCGGCAAAC CAACCGGATA TGGCAAATAC GGCGGACGGA ATGCAGGGTG
401 ACGATCCGTC GGCAGGCGGG GAAAATGCCG GCAATACGGC TGCCCAAGGT
451 ACAAATCAAG CCGAAAACAA TCAAACCGCC GGTTCTCAAA ATCCTGCCTC
501 TTCAACCAAT CCTAGCGCCA CGAATAGCGG TGGTGATTTT GGAAGGACGA
551 ACGTGGGCAA TTCTGTTGTG ATTGACGGGC CGTCGCAAAA TATAACGTTG
601 ACCCACTGTA AAGGCGATTC TTGTAGTGGC AATAATTTCT TGGATGAAGA
651 AGTACAGCTA AAATCAGAAT TTGAAAAATT AAGTGATGCA GACAAAATAA
701 GTAATTACAA GAAAGATGGG AAGAATGACG GGAAGAATGA TAAATTTGTC
751 GGTTTGGTTG CCGATAGTGT GCAGATGAAG GGAATCAATC AATATATTAT
801 CTTTTATAAA CCTAAACCCA CTTCATTTGC GCGATTTAGG CGTTCTGCAC
851 GGTCGAGGCG GTCGCTTCCG GCCGAGATGC CGCTGATTCC CGTCAATCAG
901 GCGGATACGC TGATTGTCGA TGGGGAAGCG GTCAGCCTGA CGGGGCATTC
951 CGGCAATATC TTCGCGCCCG AAGGGAATTA CCGGTATCTG ACTTACGGGG
1001 CGGAAAAATT GCCCGGCGGA TCGTATGCCC TCCGTGTTCA AGGCGAACCT
1051 TCAAAAGGCG AAATCGTCGC GGGCACGGCA GTGTACAACG GCGAAGTGCT
1101 GCATTTTCAT ACGGAAAACG GCCGTCCGTC CCCGTCCAGA GGCAGGTTTG
1151 CCGCAAAAGT CGATTTCGGC AGCAAATCTG TGGACGGCAT TATCGACAGC
1201 GGCGATGGTT TGCATATGGG TACGCAAAAA TTCAAAGCCG CCATCGATGG
1251 AAACGGCTTT AAGGGGACTT GGACGGAAAA TGGCGGCGGG GATGTTTCCG
1301 GAAAGTTTTA CGGCCCGGCC GGCGAGGAAG TGGCGGGAAA ATACAGCTAT
1351 CGCCCAACAG ATGCGGAAAA GGGCGGATTC GGCGTGTTTG CCGGCAAAAA
1401 AGAGCAGGAT GGATCCGGAG GAGGAGGAGC CACAAACGAC GACGATGTTA
1451 AAAAAGCTGC CACTGTGGCC ATTGCTGCTG CCTACAACAA TGGCCAAGAA
1501 ATCAACGGTT TCAAAGCTGG AGAGACCATC TACGACATTG ATGAAGACGG
1551 CACAATTACC AAAAAAGACG CAACTGCAGC CGATGTTGAA GCCGACGACT
1601 TTAAAGGTCT GGGTCTGAAA AAAGTCGTGA CTAACCTGAC CAAAACCGTC
1651 AATGAAAACA AACAAAACGT CGATGCCAAA GTAAAAGCTG CAGAATCTGA
1701 AATAGAAAAG TTAACAACCA AGTTAGCAGA CACTGATGCC GCTTTAGCAG
1751 ATACTGATGC CGCTCTGGAT GCAACCACCA ACGCCTTGAA TAAATTGGGA
1801 GAAAATATAA CGACATTTGC TGAAGAGACT AAGACAAATA TCGTAAAAAT
1851 TGATGAAAAA TTAGAAGCCG TGGCTGATAC CGTCGACAAG CATGCCGAAG
1901 CATTCAACGA TATCGCCGAT TCATTGGATG AAACCAACAC TAAGGCAGAC
1951 GAAGCCGTCA AAACCGCCAA TGAAGCCAAA CAGACGGCCG AAGAAACCAA
2001 ACAAAACGTC GATGCCAAAG TAAAAGCTGC AGAAACTGCA GCAGGCAAAA
2051 CCGAAGCTGC CGCTGGCACA GCTAATACTG CAGCCGACAA GGCCGAAGCT
2101 GTCGCTGCAA AAGTTACCGA CATCAAAGCT GATATCGCTA CGAACAAAGA
2151 TAATATTGCT AAAAAAGCAA ACAGTGCCGA CGTGTACACC AGAGAAGAGT
2201 CTGACAGCAA ATTTGTCAGA ATTGATGGTC TGAACGCTAC TACCGAAAAA
2251 TTGGACACAC GCTTGGCTTC TGCTGAAAAA TCCATTGCCG ATCACGATAC
2301 TCGCCTGAAC GGTTTGGATA AAACAGTGTC AGACCTGCGC AAAGAAACCC
2351 GCCAAGGCCT TGCAGAACAA GCCGCGCTCT CCGGTCTGTT CCAACCTTAC
2401 AACGTGGGTC GGTTCAATGT AACGGCTGCA GTCGGCGGCT ACAAATCCGA
2451 ATCGGCAGTC GCCATCGGTA CCGGCTTCCG CTTTACCGAA AACTTTGCCG
2501 CCAAAGCAGG CGTGGCAGTC GGCACTTCGT CCGGTTCTTC CGCAGCCTAC
2551 CATGTCGGCG TCAATTACGA GTGGTAAAAC CTT
1 MASPDVKSAD TLSKPAAPVV SEKETEAKED APQAGSQGQG APSAQGGQDM
51 AAVSEENTGN GGAAATDKPK NEKEGAQNDM PQNAADTDSL TOBGTOASNM
101 PAGNMENQAP DAGESEQPAN QODMANTADG MQGDDPSAGG KNAGNTAAQG
151 TNQAKNNQTA GSQNPASSTN PSATNSGGDF GRTNVGNSVV IDGPSQNITL
201 THCKGDSCSG NNFLDEEVQL KSEFEKLSDA DKISNYKKDG KNDGKNDKFV
251 GLVADSVQMK GINQYIIFYK PKPTSFARFR RSARSRRSLP AEMPLIPVNQ
301 ADTLIVDGEA VBLTGHSGNI FAPEGNYRYL TYGAEKLPGG SYALRVQGEP
351 SKGEMLAGTA VYNGEVLHFH TENGRPSPSR GRFAAKVDFG SKSVDGIIDS
401 GDGLHMGTQK FKAAIDGNGF KGTWTENGGG DVSGKFYGPA GEEVAGKYSY
451 RPTDAEKGGF GVFAGKKEQD GSGGGGATND DDVKKAATVA IAAAYNNGQE
501 INGFKAGETI YDIDEDGTIT KKDATAADVE ADDFKGLGLK KVVTNLTKTV
551 NENKQNVDAK VKAAESEIEK LTTKLADTDA ALADTDAALD ATTNALNKLG
601 ENITTFAEET KTNIVKIDEK LEAVADTVDK HAEAFNDIAD SLDETNTKAD
651 EAVKTANEAK QTAEETKQNV DAKVKAAETA AGKAEAAAGT ANTAADKAEA
701 VAAKVTDIKA DIATNKDNIA KKANSADVYT REESDSKFVR IDGLNATTEK
751 LDTRLASAEK SIADHDTRLN GLDKTVSDLR KETRQGLAEQ AALSGLFQPY
801 NVGRFNVTAA VGGYKSESAV AIGTGFRFTE NFAAKAGVAV GTSSGSSAAY
851 HVGVNYEW*
ΔG983和杂交体
测定了针对各种菌株(包括同源2996菌株)应答ΔG983(His-融合体)产生的杀菌滴定度:
|
2996 |
NGH38 |
BZ133 |
ΔG983 |
512 |
128 |
128 |
ΔG983还可以与ORF46.1、741、961或961c(在其C-未端)杂交的杂交体表达:
ΔG983-ORF46.1
1 ATGACTTCTG CGCCDGACTT CAATGCAGGC GGTACCGGTA TCGGCAGCAA
51 CAGCAGAGCA ACAACAGCGA AATCAGCAGC AGTATCTTAC GCCGGTATCA
101 AGAACGAAAT GTGCAAACAC AGAAGCATGC TCTGTGCCGG TCGGGATGAC
151 GTTGCGGTTA CAGACAGGGA TGCCAAAATC AATGCCCCCC CCCCGAATCT
201 GCATACCGGA GACTTTCCAA ACCCAAATGA CGCATACAAG AATTTGATCA
251 ACCTCAAACC TGCAATTGAA GCAGGCTATA CAGGACGCGG GGTAGAGGTA
301 GGTATCGTCG ACACAGGCGA ATCCGTCGGC AGCATATCCT TTCCCGAACT
351 GTATGGCAGA AAAGAACACG GCTATAACGA AAATTACAAA AACTATACGG
401 CGTATATGCG GAAGGAAGCG CCTGAAGACG GAGGCGGTAA AGACATTGAA
451 GCTTCTTTCG ACGATGAGGC CGTTATAGAG ACTGAAGCAA AGCCGACGGA
501 TATCCGCCAC GTAAAAGAAA TCGGACACAT CGATTTGGTC TCCCATATTA
551 TTGGCGGGCG TTCCGTGGAC GGCAGACCTG CAGGCGGTAT TGCGCCCGAT
601 GCGACGCTAC ACATAATGAA TACGAATGAT GAAACCAAGA ACGAAATGAT
651 GGTTGCAGCC ATCCGCAATG CATGGGTCAA GCTGGGCGAA CGTGGCGTGC
701 GCATCGTCAA TAACAGTTTT GGAACAACAT CGAGGGCAGG CACTGCCGAC
751 CTTTTCCAAA TAGCCAATTC GGAGGAGCAG TACCGCCAAG CGTTGCTCGA
801 CTATTCCGGC GGTGATAAAA CAGACGAGGG TATCCGCCTG ATGCAACAGA
851 GCGATTACGG CAACCTGTCC TACCACATCC GTAATAAAAA CATGCTTTTC
901 ATCTTTTCGA CAGGCAATGA CGCACAAGCT CAGCCCAACA CATATGCCCT
951 ATTGCCATTT TATGAAAAAG ACGCTCAAAA AGGCATTATC ACAGTCGCAG
1001 GCGTAGACCG CAGTGGAGAA AAGTTCAAAC GGGAAATGTA TGGAGAACCG
1051 GGTACAGAAC CGCTTGAGTA TGGCTCCAAC CATTGCGGAA TTACTGCCAT
1101 GTGGTGCCTG TCGGCACCCT ATGAAGCAAG CGTCCGTTTC ACCCGTACAA
1151 ACCCGATTCA AATTGCCGGA ACATCCTTTT CCGCACCCAT CGTAACCGGC
1201 ACGGCGGCTC TGCTGCTGCA GAAATACCCG TGGATGAGCA ACGACAACCT
1251 GCGTACCACG TTGCTGACGA CGGCTCAGGA CATCGGTGCA GTCGGCGTGG
1301 ACAGCAAGTT CGGCTGGGGA CTGCTGGATG CGGGTAAGGC CATGAACGGA
1351 CCCGCGTCCT TTCCGTTCGG CGACTTTACC GCCGATACGA AAGGTACATC
1401 CGATATTGCC TACTCCTTCC GTAACGACAT TTCAGGCACG GGCGGCCTGA
1451 TCAAAAAAGG CGGCAGCCAA CTGCAACTGC ACGGCAACAA CACCTATACG
1501 GGCAAAACCA TTATCGAAGG CGGTTCGCTG GTGTTGTACG GCAACAACAA
1551 ATCGGATATG CGCGTCGAAA CCAAAGGTGC GCTGATTTAT AACGGGGCGG
1601 CATCCGGCGG CAGCCTGAAC AGCGACGGCA TTGTCTATCT GGCAGATACC
1651 GACCAATCCG GCGCAAACGA AACCGTACAC ATCAAAGGCA GTCTGCAGCT
1701 GGACGGCAAA GGTACGCTGT ACACACGTTT GGGCAAACTG CTGAAAGTGG
1751 ACGGTACGGC GATTATCGGC GGCAAGCTGT ACATGTCGGC ACGCGGCAAG
1801 GGGGCAGGCT ATCTCAACAG TACCGGACGA CGTGTTCCCT TCCTGAGTGC
1851 CGCCAAAATC GGGCAGGATT ATTCTTTCTT CACAAACATC GAAACCGACG
1901 GCGGCCTGCT GGCTTCCCTC GACAGCGTCG AAAAAACAGC GGGCAGTGAA
1951 GGCGACACGC TGTCCTATTA TGTCCGTCGC GGCAATGCGG CACGGACTGC
2001 TTCGGCAGCG GCACATTCCG CGCCCGCCGG TCTGAAACAC GCCGTAGAAC
2051 AGGGCGGCAG CAATCTGGAA AACCTGATGG TCGAACTGGA TGCCTCCGAA
2101 TCATCCGCAA CACCCGAGAC GGTTGAAACT GCGGCAGCCG ACCGCACAGA
2151 TATGCCGGGC ATCCGCCCCT ACGGCGCAAC TTTCCGCGCA GCGGCAGCCG
2201 TACAGCATGC GAATGCCGCC GACGGTGTAC GCATCTTCAA CAGTCTCGCC
2251 GCTACCGTCT ATGCCGACAG TACCGCCGCC CATGCCGATA TGCAGGGACG
2301 CCGCCTGAAA GCCGTATCGG ACGGGTTGGA CCACAACGGC ACGGGTCTGC
2351 GCGTCATCGC GCAAACCCAA CAGGACGGTG GAACGTGGGA ACAGGGCGGT
2401 GTTGAAGGCA AAATGCGCGG CAGTACCCAA ACCGTCGGCA TTGCCGCGAA
2451 AACCGGCGAA AATACGACAG CAGCCGCCAC ACTGGGCATG GGACGCAGCA
2501 CATGGAGCGA AAACAGTGCA AATGCAAAAA CCGACAGCAT TAGTCTGTTT
2551 GCAGGCATAC GGCACGATGC GGGCGATATC GGCTATCTCA AAGGCCTGTT
2601 CTCCTACGGA CGCTACAAAA ACAGCATCAG CCGCAGCACC GGTGCGGACG
2651 AACATGCGGA AGGCAGCGTC AACGGCACGC TGATGCAGCT GGGCGCACTG
2701 GGCGGTGTCA ACGTTCCGTT TGCCGCAACG GGAGATTTGA CGGTCGAAGG
2751 CGGTCTGCGC TACGACCTGC TCAAACAGGA TGCATTCGCC GAAAAAGGCA
2801 GTGCTTTGGG CTGGAGCGGC AACAGCCTCA CTGAAGGCAC GCTGGTCGGA
2851 CTCGCGGGTC TGAAGCTGTC GCAACCCTTG AGCGATAAAG CCGTCCTGTT
2901 TGCAACGGCG GGCGTGGAAC GCGACCTGAA CGGACGCGAC TACACGGTAA
2951 CGGGCGGCTT TACCGGCGCG ACTGCAGCAA CCGGCAAGAC GGGGGCACGC
3001 AATATGCCGC ACACCCGTCT GGTTGCCGGC CTGGGCGCGG ATGTCGAATT
3051 CGGCAACGGC TGGAACGGCT TGGCACGTTA CAGCTAACCC GGTTCCAAAC
3101 AGTACGGCAA CCACAGCGGA CGAGTCGGCG TAGGCTACCG GTTCCTCGAC
3151 GGTGGCGGAG GCACTGGATC CTCAGATTTG GCAAACGATT CTTTTATCCG
3201 GCAGGTTCTC GACCGTCAGC ATTTCGAACC CGACGGGAAA TACCACCTAT
3251 TCGGCAGCAG GGGGGAACTT GCCGAGCGCA GCGGCCATAT CGGATTGGGA
3301 AAAATACAAA GCCATCAGTT GGGCAACCTG ATGATTCAAC AGGCGGCCAT
3351 TAAAGGAAAT ATCGGCTACA TTGTCCGCTT TTCCGATCAC GGGCACGAAG
3401 TCCATTCCCC CTTCGACAAC CATGCCTCAC ATTCCGATTC TGATGAAGCC
3451 GGTAGTCCCG TTGACGGATT TAGCCTTTAC CGCATCCATT GGGACGGATA
3501 CGAACACCAT CCCGCCGACG GCTATGACGG GCCACAGGGC GGCGGCTATC
3551 CCGCTCCCAA AGGCGCGAGG GATATATACA GCTACGACAT AAAAGGCGTT
3601 GCCCAAAATA TCCGCCTCAA CCTGACCGAC AACCGCAGCA CCGGACAACG
3651 GCTTGCCGAC CGTTTCCACA ATGCCGGTAG TATGCTGACG CAAGGATAAG
3701 GCGACGGATT CAAACGCGCC ACCCGATACA GCCCCGAGCT GGACAGATCG
3751 GGCAATGCCG CCGAAGCCTT CAACGGCACT GCAGATATCG TTAAAAACAT
3801 CATCGGCGCG GCAGGAGAAA TTGTCGGCGC AGGCGATGCC GTGCAGGGCA
3851 TAAGCGAAGG CTCAAACATT GCTGTCATGC ACGGCTTGGG TCTGCTTTCC
3901 ACCGAAAACA AGATGGCGCG CATCACGGAT TTGGCAGATA TGGCGCAACT
3951 CAAAGACTAT GCCGCAGCAG CCATCCGCGA TTGGGCAGTC CAAAACCCCA
4001 ATGCCGCACA AGGCATAGAA GCCGTCAGCA ATATCTTTAT GGCAGCCATC
4051 CCCATCAAAG GGATTGGAGC TGTTCGGGGA AAATACGGCT TGGGCGGCAT
4101 CACGGCACAT CCTATCAAGC GGTCGCAGAT GGGCGCGATC GCATTGCCGA
4151 AAGGGAAATC CGCCGTCAGC CGACAATTTG CCGATGCGGC ATACGCCAAA
4201 TACCCGTCCC CTTACCATTC CCGAAATATC CGTTCAAACT TGGAGCAGCG
4251 TTACGGCAAA GAAAACATCA CCTCCTCAAC GGTGCCGCCG TCAAACGGCA
4301 AAAATGTCAA ACTGGCAGAC CAACGCCACC CGAAGACAGG CGTACCGTTT
4351 GACGGTAAAG GGTTTCCGAA TTTTGAGAAG CACGTGAAAT ATGATACGCT
4401 CGAGCACCAC CACCACCACC ACTGA
1 MTSAPDFNAG GTGIGSNSRA TTAKSAAVSY AGIKNEMCKD RSMLCAGRDD
51 VAVTDRDAKI NAPPPNLHTG DFPNPNDAYK NLINLKPAIE AGYTGRGVEV
101 GIVDTGESVG SISFPELYGR KEHGYNENYK NYTAYMRKEA PEDGGGKDIE
151 ASFDDEAVIE TEAKPTDIRH VKEIGHIDLV SHIIGGRSVD GRPAGGIAPD
201 ATLHIMNTND ETKNEMMVAA IRNAWVKLGB RGVRIVNNSF GTTSRAGTAD
251 LFQIANSEHQ YRQALLDYSG GDKTDEGIRL MQQSDYGNLS YHIRNKNMLF
301 IFSTGNDAQA QPNTYALLPF YEKDAQKGII TVAGVDRSGE KFKREMYGEP
351 GTEPLEYGSN HCGITAMWCL SAPYEASVRF TRTNPIQIAG TSFSAPIVTG
401 TAALLLQKYP WMSNDNLRTT LLTTAQDIGA VGVDSKFGWG LLDAGKAMNG
451 PASFPFGDFT ADTKGTSDIA YSFRNDISGT GGLIKKGGSQ LQLHGNNTYT
501 GKTIIEGGSL VLYGNNKSDM RVETKGALIY NGAASGGSLN SDGIVYLADT
551 DQSGANETVH IKGSLQLDGK GTLYTRLGKL LKVDGTAIIG GKLYMSARGK
601 GAGYLNSTGR RVPFLSAAKI GQDYSFFTNI ETDGGLLASL DSVEKTAGSE
651 GDTLSYYVRR GNAARTASAA AHSAPAGLKH AVEQGGSNLE NLMVELDASS
701 SSATPETVET AAADRTDMPG IRPYGATFRA AAAVQHANAA DGVRIFNSLA
751 ATVYADSTAA HADMQGRRLK AVSDGLDHNG TGLRVIAQTQ QDGGTWEQGG
801 VEGKMRGSTQ TVGIAAKTGE NTTAAATLGM GRSTWSENSA NAKTDSISLF
851 AGIRHDAGDI GYLKGLFSYG RYKNSISRST GADEHAEGSV NGTLMQLGAL
901 GGVNVPFAAT GDLTVEGGLR YDLLKQDAFA EKGSALGWSG NSLTEGTLVG
951 LAGLKLSQPL SDKAVLFATA GVERDLNGRD YTVTGGFTGA TAATGKTGAR
1001 NMPHTRLVAG LGADVEFGNG WNGLARYSYA GSKQYGNHSG RVGVGYRFLD
1051 GGGGTGSSDL ANDSFIRQVL DRQHFEPDGK YHLFGSRGEL AERSGHIGLG
1101 KIQSHQLGNL MIQQAAIKGN IGYIVRFSDH GHEVHSPFDN HASHSDSDEA
1151 GSPVDGFSLY RIHWDGYEHH PADGYDGPQG GGYPAPKGAR DIYSYDIKGV
1201 AQNIRLNLTD NRSTGQRLAD RFHNAGSMLT QGVGDGFKRA TRYSPELDRS
1251 GNAAEAFNGT ADIVKNIIGA AGEIVGAGDA VQGISEQSNI AVMHGLGLLS
1301 TENKMARIND LADMAQLKDY AAAAIRDMAV QNPNAAQGIE AVSNIFMAAI
1351 PIKGIGAVRG KYGLGGITAH PIKRSQMGAI ALPKEKSAVS DNFADAAYAK
1401 YPSPYHSRNI RSNLEQRYGK ENITSSTVPP SNGKNVKLAD QRHPKTGVPF
1451 DGKGFPNFEK HVKYDTLEHH HHHH*
ΔG983-741
1 ATGACTTCTG CGCCCGACTT CAATGCAGGC GGTACCGGTA TCGGCAGCAA
51 CAGCAGAGCA ACAACAGCGA AATCAGCAGC AGTATCTTAC GCCGGTATCA
101 AGAACGAAAT GTGCAAAGAC AGAAGCATGC TCTGTGCCGG TCGGGATGAC
151 GTTGCGGTTA CAGACAGGGA TGCCAAAATC AATGCCCCCC CCCCGAATCT
201 GCATACCGGA GACTTTCCAA ACCCCAATGA CGCATACAAG AATTTGATCA
251 ACCTCAAACC TGCAATTGAA GCAGGCTATA CAGGACGCGG GGTAGAGGTA
301 GGTATCGTCG ACACAGGCGA ATCCGTCGGC AGCATATCCT TTCCCGAACT
351 GTATGGCAGA AAAGAACACG GCTATAACGA AAATTACAAA AACTATACGG
401 CGTATATGCG GAAGGAAGCG CCTGAAGACG GAGGCGGTAA AGACATTGAA
451 GCTTCTTTCG ACGATGAGGC CGTTATAGAG ACTGAAGCAA AGCCGACGGA
501 TATCCGCCAC GTAAAAGAAA TCGGACACAT CGATTTGGTC TCCCATATTA
551 TTGGCGGGCG TTCCGTGGAC GGCAGACCTG CAGGCGGTAT TGCGCCCGAT
601 GCGACGCTAC ACATAATGAA TACGAATGAT GAAACCAAGA ACGAAATGAT
651 GGTTGCAGCA ATCCGCAATG CATGGGTCAA GCTGGGCGAA CGTGGCGTGC
701 GCATCGTCAA TAACAGTTTT GGAACAACAT CGAGGGCAGG CACTGCCGAC
751 CTTTTCCAAA TAGCCAATTC GGAGGAGCAG TACCGCCAAG CGTTGCTCGA
801 CTATTCCGGC GGTGATAAAA CGGACGAGGG TATCCGCCTG ATGCAACAGA
851 GCGATTACGG CAACCTGTCC TACCACATCC GTAATAAAAA CATGCTTTTC
901 ATCTTTTCGA CAGGCAATGA CGCACAAGCT CAGCCCAACA CATATGCCCT
951 ATTGCCATTT TATGAAAAAA ACGCTCAAAA AGGCATTATC ACAGTCGCAG
1001 GCGTAGACCG CAGTGGAGAA AAGTTCAAAC GGGAAAGTAT TGGAGAACCG
1051 GGTACAGAAC CGCTTGAGTA TGGCTCCAAC CATTGCGGAA TTACTGCCAT
1101 GTGGTGCCGT TCGGCACCCT ATGAAGCAAG CGTCCGTTTC ACCCGTACAA
1151 ACCCGATTCA AATTGCCGGA ACATCCTTTT CCGCACCCAT CGTAACCGGC
1201 ACGGCGGCTC TGCTGCTGCA GAAATACCCG TGGATGAGCA ACGACAACCT
1251 GCGTACCACG TTGCTGACGA CGGCTCAGGA CATCGGTGCA GTCGGCGTGG
1301 ACAGCAAGTT CGGCTGGGGA CTGCTGGATG CGGGTAAGGC CATGAACGGA
1351 CCCGCGTCCT TTCCGTTCGG CGACTTTACC GCCGATACGA AAGGTACATC
1401 CGATATTGCC TACTCCTTCC GTAACGACAT TTCAGGCACG GGCGGCCTGA
1451 TCAAAAAAGG CGGCAGCCAA CTGCAACTGC ACGGCAACAA CACCTATACG
1501 GGCAAAACCA TTATCGAAGG CGGTTCGCTG GTGTTGTACG GCAACAACAA
1551 ATCGGATATG CGCGTCGAAA CCAAAGGTGC GCTGATTTAT AACGGGGCGG
1601 CATCCGGCGG CAGCCTGAAC AGCGACGGCA TTGTCTATCT GGCAGATACC
1651 GACCAATCCG GCGCAAACGA AACCGTACAC ATCAAAGGCA GTCTGCAGCT
1701 GGACGGCAAA GGTACGCTGT ACACACGTTT GGGCAAACTG CTGAAAGTGG
1751 ACGGTACGGC GATTATCGGC GGCAAGCTGT ACATGTCGGC ACGCGGCAAG
1801 GGGGCAGGCT ATCTCAACAG TACCGGACGA CGTGTTCCCT TCCTGAGTGC
1851 CGCCAAAATC GGGCAGGATT ATTCTTTCTT CACAAACATC GAAACCGACG
1901 GCGGCCTGCT GGCTTCCCTC GACAGCGTCG AAAAAACAGC GGGCAGTGAA
1951 GGCGACACGC TGTCCTATTA TGTCCGTCGC GGCAATGCGG CACGGACTGC
2001 TTCGGCAGCG GCACATTCCG CGCCCGCCGG TCTGAAACAC GCCGTAGAAC
2051 AGGGCGGCAG CAATCTGGAA AACCTGATGG TCGAACTGGA TGCCTCCGAA
2101 TCATCCGCAA CACCCGAGAC GGTTGAAACT GCGGCAGCCG ACCGCACAGA
2151 TATGCCGGGC ATCCGCCCCT ACGGCGCAAC TTTCCGCGCA GCGGCAGCCG
2201 TACAGCATGC GAATGCCGCC GACGGTGTAC GCATCTTCAA CAGTCTCGCC
2251 GCTACCGTCT ATGCCGACAG TACCGCCGCC CATGCCGATA TGCAGGGACG
2301 CCGCCTGAAA GCCGTATCGG ACGGGTTGGA CCACAACGGC ACGGGTCTGC
2351 GCGTCATCGC GCAAACCCAA CAGGACGGTG GAACGTGGGA ACAGGGCGGT
2401 GTTGAAGGCA AAATGCGCGG CAGTACCCAA ACCGTCGGCA TTGCCGCGAA
2451 AACCGGCGAA AATACGACAG CAGCCGCCAC ACTGGGCATG GGACGCAGCA
2501 CATGGAGCGA AAACAGTGCA AATGCAAAAA CCGACAGCAT TAGTCTGTTT
2551 GCAGGCATAC GGCACGATGC GGGCGATATC GGCTATCTCA AAGGCCTGTT
2601 CTCCTACGGA CGCTACAAAA ACAGCATCAG CCGCAGCACC GGTGCGGACG
2651 AACATGCGGA AGGCAGCGTC AACGGCACGC TGATGCAGCT GGGCGCACTG
2701 GGCGGTGTCA ACGTTCCGTT TGCCGCAACG GGAGATTTGA CGGTCGAAGG
2751 CGGTCTGCGC TACGACCTGC TCAAACAGGA TGCATTCGCC GAAAAAGGCA
2801 GTGCTTTGGG CTGGAGCGGC AACAGCCTCA CTGAAGGCAC GCTGGTCGGA
2851 CTCGCGGGTC TGAAGCTGTC GCAACCCTTG AGCGATAAAG CCGTCCTGTT
2901 TGCAACGGCG GGCGTGGAAC GCGACCTGAA CGGACGCGAC TACACGGTAA
2951 CGGGCGGCTT TACCGGCGCG ACTGCAGCAA CCGGCAAGAC GGGGGCACGC
3001 AATATGCCGC ACACCCGTCT GGTTGCCGGC CTGGGCGCGG ATGTCGAATT
3051 CGGCAACGGC TGGAACGGCT TGGCACGTTA CAGCTACGCC GGTTCCAAAC
3101 AGTACGGCAA CCACAGCGGA CGAGTCGGCG TAGGCTACCG GTTCCTCGAG
3151 GGATCCGGGA GGGGTGGTGT CGCCGCCGAC ATCGGTGCGG GGCTTGCCGA
3201 TGCACTAACC GCACCGCTCG ACCATAAAGA CAAAGGTTTG CAGTCTTTGA
3251 CGCTGGATCA GTCCGTCAGG AAAAACGAGA AACTGAAGCT GGCGGCACAA
3301 GGTGCGGAAA AAACTTATGG AAACGGTGAC AGCCTCAATA CGGGCAAATT
3351 GAAGAACGAC AAGGTCAGCC GTTTCGACTT TATCCGCCAA ATCGAAGTGG
3401 ACGGGCAGCT CATTACCTTG GAGAGTGGAG AGTTCCAACT ATACAAACAA
3451 AGCCATTCCG CCTTAACCGC CTTTCAGACC GAGCAAATAC AAGATTCGGA
3501 GCATTCCGGG AAGATGGTTG CGAAACGCCA GTTCAGAATC GGCGACATAG
3551 CGGGCGAACA TACATCTTTT GACAAGCTTC CCGAAGGCGG CAGGGCGACA
3601 TATCGCGGGA CGGCGTTCGG TTCAGACGAT GCCGGCGGAA AACTGACCTA
3651 CACCATAGAT TTCGCCGCCA AGCAGGGAAA CGGCAAAATC GAACATTTGA
3701 AATCGCCAGA ACTCAATGTC GACCTGGCCG CCGCCGATAT CAAGCCGGAT
3751 GGAAAACGCC ATGCCGTCAT CAGCGGTTCC GTCCTTTACA ACCAAGCCGA
3801 GAAAGGCAGT TACTCCCTCG GTATCTTTGG CGGAAAAGCC CAGGAAGTTG
3851 CCGGCAGCGC GGAAGTGAAA ACCGTAAACG GCATACGCCA TATCGGCCTT
3901 GCCGCCAAGC AACTCGAGCA CCACCACCAC CACCACTGA
1 MTSAPDFNAG GTGIGSNSRA TTAKSAAVSY AGIKNEMCKD RSMLCAGRDD
51 VAVTDRDAKI NAPPPNLHTG DFPNPNDAYK NLINLKPAIE AGYTGRGVEV
101 GIVDTGESVG SISFPELYGR KEHGYNENYK NYTAYMRKEA PEDGGGKDIE
151 ASFDDEAVIE TEAKPTDIRH VKEIGHIDLV SHIIGGRSVD GRPAGGIAPD
201 ATLHINNTND ETKNEMMVAA IRNAWVKLGE RGVRIVNNSF GTTSRAGTAD
251 LFQIANSEEQ YRQALLDYSG GDKTDEGIRL MQQSDYGNLS YHIRNKNMLF
301 IFSTGNDAQA QPNTYALLPF YEKDAQKGII TVAGVDRSGE KFKREMYGEP
351 GTEPLEYGSN HCGITAMWCL SAPYEASVRF TRTNPIQIAG TSFSAPIVTG
401 TAALLLQKYP WMSNDNLRTT LLTTAQDIGA VGVDSKFGWG LLDAGKAMNG
451 PASFPFGDFT ADTKGTSDIA YSFRNDISGT GGLIKKGGSQ LQLHGNNTYT
501 GKTIIEGGSL VLYGNNKSDM RVETKGALIY NGAASGGSLN SDGIVYLADT
551 DQSGANETVH IKGSLQLDGK GTLYTRLGKL LKVDGTAIIG GKLYMSARGK
601 GAGYLNSTGR RVPFLSAAKI GQDYSFFTNI ETDGGLLASL DSVEKTAGSE
651 GDTLSYYVRR GNAARTASAA AHSAPAGLKH AVEQGGSNLE NLNVELDASE
701 SSATPETVET AAADRTDMPG IRPYGATFRA AAAVQHANAA DGVRIFNSLA
751 ATVYADSTAA HADMQGRRLK AVSDGLDHNG TGLRVIAQTQ QDGGTWEQGG
801 VEGKMRGSTQ TVGIAAKTGE NTTAAATLGM GRSTWSENSA NAKTDSISLF
851 AGIRHDAGDI GYLKGLFSYG RYKNSISRST GADEHAEGSV NGTLMQLGAL
901 GGVNVPFAAT GDLTVEGGLR YDLLKQDAFA KKGSALGWSG NSLTEGTLVG
951 LAGLKLSQPL SDKAVLFATA GVERDLNGRD YTVTGGFTGA TAATGKTGAR
1001 NMPHTRLVAG LGADVEFGNG WNGLARYSYA GSKQYGNHSG RVGVGYRFLE
1051 GSGGGGVAAD IGAGLADALT APLDHKDKGL QSLTLDQSVR KNEKLKLAAQ
1101 GAEKTYGNGD SLNTGKLKND KVSRFDFIRQ IEVDGQLITL ESGEFQVYKQ
1151 SHSALTAFQT EQIQDSEHSG KMVAKRQFRI GDIAGEHTSF DKLPEGGRAT
1201 YRGTAFGSDD AGGKLTYTID FAAKQGNGKI EHLKSPELNV DLAAADIKPD
1251 GKRHAVISGS VLYNQAEKGS YSLGIFGGKA QEVAGSAEVK TVNGIRHIGL
1301 AAKQLEHHHH HH*
ΔG983-961
1 ATGACTTCTG CGCCCGACTT CAATGCAGGC GGTACCGGTA TCGGCAGCAA
51 CAGCAGAGCA ACAACAGCGA AATAAGCAGC AGTATCTTAC GCCGGTATCA
101 AGAACGAAAT GTGCAAAGAC AGAAGCATGC TCTGTGCCGG TCGGGATGAC
151 GTTGCGGTTA CAGACAGGGA TGCCAAAATC AATGCCCCCC CCCCGAATCT
201 GCATACCGGA GACTTTCCAA ACCCAAATGA CGCATACAAG AATTTGATCA
251 ACCTCAAACC TGCAATTGAA GCAGGCTATA CAGGACGCGG GGTAGAGGTA
301 GGTATCGTCG ACACAGGCGA ATCCGTCGGC AGCATATCCT TTCCCGAACT
351 GTATGGCAGA AAAGAACACG GCTATAACGA AAATTACAAA AACTATACGG
401 CGTATATGCG GAAGGAAGCG CCTGAAGACG GAGGCGGTAA AGACATTGAA
451 GCTTCTTTCG ACGATGAGGC CGTTATAGAG ACTGAAGCAA AGCCGACGGA
501 TATCCGCCAC GTAAAAGAAA TCGGACACAT CGATTTGGTC TCCCATATTA
551 TTGGCGGGCG TTCCGTGGAC GGCAGACCTG CAGGCGGTAT TGCGCCCGAT
601 GCGACGCTAC ATATAATGAA TACGAATGAT GAAACCAAGA ACGAAATGAT
651 GGTTGCAGCC ATCCGCAATG CATGGGTCAA GCTGGGCGAA CGTGGCGTGC
701 GCATCGTCAA TAACAGTTTT GGAACAACAT CGAGGGCAGG CACTGCCGAC
751 CTTTTCCAAA TAGCCAATTC GGAGGAGCAG TACCGCCAAG CGTTGCTCGA
801 CTATTCCGGC GGTGATAAAA CAGACGAGGG TATCCGCCTG ATGCAACAGA
851 GCGATTACGG CAACCTGTCC TACCACATCC GTAATAAAAA CATGCTTTTC
901 ATCTTTTCGA CAGGCAATGA CGCACAAGCT CAGCCCAACA CATATGCCCT
951 ATTGCCATTT TATGAAAAAG ACGCTCAAAA AGGCATTATC ACAGTCGCAG
1001 GCGTAGACCG CAGTGGAGAA AAGTTCAAAC GGGAAATGTA TGGAGAACCG
1051 GGTACAGAAC CGCTTGAGTA TGGCTCCAAC CATTGCGGAA TTACTGCCAT
1101 GTGGTGCCTG TCGGCACCCT ATGAAGCAAG CGTCCGTTTC ACCCGTACAA
1151 ACCCGATTCA AATTGCCGGA ACATCCTTTT CCGCACCCAT CGTAACCGGC
1201 ACGGCGGCTC TGCTGCTGCA GAAATACCCG TGGATGAGCA ACGACAACCT
1251 GCGTACCACG TTGCTGACGA CGGCTCAGGA CATCGGTGCA GTCGGCGTGG
1301 ACAGCAAGTT CGGCTGGGGA CTGCTGGATG CGGGTAAGGC CATGAACGGA
1351 CCCGCGTCCT TTCCGTTCGG CGACTTTACC GCCGATACGA AAGGTACATC
1401 CGATATTGCC TACTCCTTCC GTAACGACAT TTCAGGCACG GGCGGCCTGA
1451 TCAAAAAAGG CGGCAGCCAA CTGCAACTGC ACGGCAACAA CACCTATACG
1501 GGCAAAACCA TTATCGAAGG CGGTTCGCTG GTGTTGTACG GCAACAACAA
1551 ATCGGATATG CGCGTCGAAA CCAAAGGTGC GCTGATTTAT AACGGGGCGG
1601 CATCCGGCGG CAGCCTGAAC AGCGACGGCA TTGTCTATCT GGCAGATACC
1651 GACCAATCCG GCGCAAACGA AACCGTACAC ATCAAAGGCA GTCTGCAGCT
1701 GGACGGCAAA GGTACGCTGT ACACACGTTT GGGCAAACTG CTGAAAGTGG
1751 ACGGTACGGC GATTATCGGC GGCAAGCTGT ACATGTCGGC ACGCGGCAAG
1801 GGGGCAGGCT ATCTCAACAG TACCGGACGA CGTGTTCCCT TCCTGAGTGC
1851 CGCCAAAATC GGGCAGGATT ATTCTTTCTT CACAAACATC GAAACCGACG
1901 GCGGCCTGCT GGCTTCCCTC GACAGCGTCG AAAAAACAGC GGGCAGTGAA
1951 GGCGACACGC TGTCCTATTA TGTCCGTCGC GGCAATGCGG CACGGACTGC
2001 TTCGGCAGCG GCACATTCCG CGCCCGCCGG TCTGAAACAC GCCGTAGAAC
2051 AGGGCGGCAG CAATCTGGAA AACCTGATGG TCGAACTGGA TGCCTCCGAA
2101 TCATCCGCAA CACCCGAGAC GGTTGAAACT GCGGCAGCCG ACCGCACAGA
2151 TATGCCGGGC ATCCGCCCCT ACGGCGCAAC TTTCCGCGCA GCGGCAGCCG
2201 TACAGCATGC GAATGCCGCC GACGGTGTAC GCATCTTCAA CAGTCTCGCC
2251 GCTACCGTCT ATGCCGACAG TACCGCCGCC CATGCCGATA TGCAGGGACG
2301 CCGCCTGAAA GCCGTATCGG ACGGGTTGGA CCACAACGGC ACGGGTCTGC
2351 GCGTCATCGC GCAAACCCAA CAGGACGGTG GAACGTGGGA ACAGGGCGGT
2401 GTTGAAGGCA AAATGCGCGG CAGTACCCAA ACCGTCGGCA TTGCCGCGAA
2451 AACCGGCGAA AATACGACAG CAGCCGCCAC ACTGGGCATG GGACGCAGCA
2501 CATGGAGCGA AAACAGTGCA AATGCAAAAA CCGACAGCAT TAGTCTGTTT
2551 GCAGGCATAC GGCACGATGC GGGCGATATC GGCTATCTCA AAGGCCTGTT
2601 CTCCTACGGA CGCTACAAAA ACAGCATCAG CCGCAGCACC GGTGCGGACG
2651 AACATGCGGA AGGCAGCGTC AACGGCACGC TGATGCAGCT GGGCGCACTG
2701 GGCGGTGTCA ACGTTCCGTT TGCCGCAACG GGAGATTTGA CGGTCGAAGG
2751 CGGTCTGCGC TACGACCTGC TCAAACAGGA TGCATTCGCC GAAAAAGGCA
2801 GTGCTTTGGG CTGGAGCGGC AACAGCCTCA CTGAAGGCAC GCTGGTCGGA
2851 CTCGCGGGTC TGAAGCTGTC GCAACCCTTG AGCGATAAAG CCGTCCTGTT
2901 TGCAACGGCG GGCGTGGAAC GCGACCTGAA CGGACGCGAC TACACGGTAA
2951 CGGGCGGCTT TACCGGCGCG ACTGCAGCAA CCGGCAAGAC GGGGGCACGC
3001 AATATGCCGC ACACCCGTCT GGTTGCCGGC CTGGGCGCGG ATGTCGAATT
3051 CGGCAACGGC TGGAACGGCT TGGCACGTTA CAGCTACGCC GGTTCCAAAC
3101 AGTACGGCAA CCACAGCGGA CGAGTCGGCG TAGGCTACCG GTTCCTCGAG
3151 GGTGGCGGAG GCACTGGATC CGCCACAAAC GACGACGATG TTAAAAAAGC
3201 TGCCACTGTG GCCATTGCTG CTGCCTACAA CAATGGCCAA GAAATCAACG
3251 GTTTCAAAGC TGGAGAGACC ATCTACGACA TTGATGAACG CGGCACAATT
3301 ACCAAAAAAG ACGCAACTGC AGCCGATGTT GAAGCCGACG ACTTTAAAGG
3351 TCTGGGTCTG AAAAAAGTCG TGACTAACCT GACCAAAACC GTCAATGAAA
3401 ACAAACAAAA CGTCGATGCC AAAGTAAAAG CTGCAGAACT TGAAATAGAA
3451 AAGTTAACAA CCAAGTTAGC AGACACTGAT GCCGCTTTAG CAGATACTGA
3501 TGCCGCTCTG GATGCAACCA CCAACGCCTT GAATAAATTG GGAGAAAATA
3551 TAACGACATT TGCTGAAGAG ACTAAGACAA ATATCGTAAA AATTGATGAA
3601 AAATTAGAAG CCGTGGCTGA TACCGTCGAC AAGCATGCCG AAGCATTCAA
3651 CGATATCGCC GATTCATTGG ATGAAACCAA CACTAAGGCA GACGAAGCCG
3701 TCAAAACCGC CAATGAAGCC AAACAGACGG CCGAAGAAAC CAAACAAAAC
3751 GTCGATGCCA AAGTAAAAGC TGCAGAAACT GCAGCAGGCA AAGCCGAAGC
3801 TGCCGCTGGC ACAGCTAATA CTGCAGCCGA CAAGGCCGAA GCTGTCGCTG
3851 CAAAAGTTAC CGACATCAAA GCTGATATCG CTACGAACAA AGATAATATT
3901 GCTAAAAAAG CAAACAGTGC CGACGTGTAC ACCAGAGAAG AGTCTGACAG
3951 CAAATTTGTC AGAATTGATG GTCTGAACGC TACTACCGAA AAATTGGACA
4001 CACGCTTGGC TTCTGCTGAA AAATCCATTG CCGATCACGA TACTCGCCGT
4051 AACGGTTTGG ATAAAACAGT GTCAGACCTG CGCAAAGAAA CCCGCCAAGG
4101 CCTTGCAGAA CAAGCCGCGC TCTCCGGTCT GTTCCAACCT TACAACGTGG
4151 GTCGGTTCAA TGTAACGGCT GCAGTCGGCG GCTACAAATC CGAATCGGCA
4201 GTCGCCATCG GTACCGGCTT CCGCTTTACC GAAAACTTTG CCGCCAAAGC
4251 AGGCGTGGCA TGCGGCACTT CGTCCGGTTC TTCCGCAGCC TACCATGTCG
4301 GCGTCAATTA CGAGTGGCTC GAGCACCACC ACCACCACCA CTGA
1 MTSAPDFNAG GTGIGSNSRA TTAKSAAVSY AGIKNEMCKD RSMLCAGRDD
51 VAVTDRDAKI NAPPPNLHTG DFPNPNDAYK NLINLKPAIE AGYTGRGVEV
101 GIVDTGESVG SISFPELYGR KEHGYNENYK NYTAYMRKEA PEDGGGKDIE
151 ASFDDEAVIE TEAKPTDIRH VKEIGHIDLV SHIIGGRSVD GRPAGGIAPD
201 ATLHIMNTND ETKNEMMVAA IRNAWVKLGE RGVRIVNNSF GTTSRAGTAD
251 LFQIANSEEQ YRQALLDYSG GDKTDEGIRL MQQSDYGNLS YHIRNKNMLF
301 IFSTGNDAQA QPNTYALLPF YEKDAQKGII TVAGVDRSGE KFKREMYGEP
351 GTEPLEYGSN HCGITAMWCL SAPYEASVRF TRTNPIQIAG TSFSAPIVTG
401 TAALLLQKYP WNSNDNLRTT LLTTAQDIGA VGVDSKFGWG LLDAGKAMNG
451 PASFPFGDFT ADTKGTSDIA YSFRNDISGT GGLIKKGGSQ LQLHGNNTYT
501 GKTIIEGGSL VLYGNNKSDM RVETKGALIY NGAASGGSLN SDGIVYLADT
551 DQSGANETVH IKGSLQLDGK GTLYTRLGKL LKVDGTAIIG GKLYNSARGK
601 GAGYLNSTGR RVPFLSAAKI GQDYSFFTNI ETDGGLLASL DSVEKTAGSE
651 GDTLSYYVRR GNAARTASAA AHSAPAGLKH AVEQGGSNLE NLMVELDASE
701 SSATPETVET AAADRTDMPG IRPYGATFRA AAAVQHANAA DGVRIFNSLA
751 ATVYADSTAA HADMQGRRLK AVSDGLDHNG TGLRVIAQTQ QDGGTWEQGG
801 VEGKMRGSTQ TVGIAAKTGE NTTAAATLGM GRSTWSENSA NAKTDSISLF
851 AGIRHDAGDI GYLKGLFSYG RYKNSISRST GADEHAEGSV NGTLMQLGAL
901 GGVNVPFAAT GDLTVEGGLR YDLLKQDAFA EKGSALGWSG NSLTEGTLVG
951 LAGLKLSQPL SDKAVLFATA GVERDLNGRD YTVTGGFTGA TAATGKTGAR
1001 NMPHTRLVAG LGADVEFGNG WNGLARYSYA GSKQYGNHSG RVGVGYRFLE
1051 GGGGTGSATN DDDVKKAATV AIAAAYNNGQ EINGFKAGET IYDIDEDGTI
1101 TKKDATAADV EADDFKGLGL KKVVTNLTKT VNENKQNVDA KVKAAESEIE
1151 KLTTKLADTD AALADTDAAL DATTNALNKL GENITTFAEE TKTNIVKIDE
1201 KLEAVADTVD KHAEAFNDIA DSLDETNTKA DEAVKTANEA KQTAEETKQN
1251 VDAKVKAAET AAGKAEAAAG TANTAADKAE AVAAKVTDIK ADIATNKDNI
1301 AKKANSADVY TREESDSKFV RIDGLNATTE KLDTRLASAE KSIADHDTRL
1351 NGLDKTVSDL RKETRQGLAE QAALSGLFQP YNVGRFNVTA AVGGYKSESA
1401 VAIGTGFRFT ENFAAKAGVA VGTSSGSSAA YHVGVNYEWL EHHHHHH*
ΔG983-961c
1 ATGACTTCTG CGCCCGACTT CAATGCAGGC GGTACCGGTA TCGGCAGCAA
51 CAGCAGAGCA ACAACAGCGA AATCAGCAGC AGTATCTTAC GCCGGTATCA
101 AGAACGAAAT GTGCAAAGAC AGAAGCATGC TCTGTGCCGG TCGGGATGAC
151 GTTGCGGTTA CAGACAGGGA TGCCAAAATC AATGCCCCCC CCCCGAATCT
201 GCATACCGGA GACTTTCCAA ACCCAAATGA CGCATACAAG AATTTGATCA
251 ACCTCAAACC TGCAATTGAA GCAGGCTATA CAGGACGCGG GGTAGAGGTA
301 GGTATCGTCG ACACAGGCGA ATCCGTCGGC AGCATATCCT TTCCCGAACT
351 GTATGGCAGA AAAGAACACG GCTATAACGA AAATTACAAA AACTATACGG
401 CGTATATGCG GAAGGAAGCG CCTGAAGACG GAGGCGGTAA AGACATTGAA
451 GCTTCTTTCG ACGATGAGGC CGTTATAGAG ACTGAAGCAA AGCCGACGGA
501 TATCCGCCAC GTAAAAGAAA TCGGACACAT CGATTTGGTC TCCCATATTA
551 TTGGCGGGCG TTCCGTGGAC GGCAGACCTG CAGGCGGTAT TGCGCCCGAT
601 GCGACGCTAC ACATAATGAA TACGAATGAT GAAACCAAGA ACGAAATGAT
651 GGTTGCAGCC ATCCGCAATG CATGGGTCAA GCTGGGCGAA CGTGGCGTGC
701 GCATCGTCAA TAACAGTTTT GGAACAACAT CGAGGGCAGG CACTGCCGAC
751 CTTTTCCAAA TAGCCAATTC GGAGGAGCAG TACCGCCAAG CGTTGCTCGA
801 CTATTCCGGC GGTGATAAAA CAGACGAGGG TATCCGCCTG ATGCAACAGA
851 GCGATTACGG CAACCTGTCC TACCACATCC GTAATAAAAA CATGCTTTTC
901 ATCTTTTCGA CAGGCAATGA CGCACAAGCT CAGCCCAACA CATATGCCCT
951 ATTGCCATTT TATGAAAAAG ACGCTCAAAA AGGCATTATC ACAGTCGCAG
1001 GCGTGAACCG CAGTGGAGAA AAGTTCAAAC GGGAAATGTA TGGAGAACCG
1051 GGTACAGAAC CGCTTGAGTA TGGCTCCAAC CATTGCGGAA TTACTGCCAT
1101 GTGGTGCCTG TCGGCACCCT ATGAAGCAAG CGTCCGTTTC ACCCGTACAA
1151 ACCCGATTCA AATTGCCGGA ACATCCTTTT CCGCACCCAT CGTAACCGGC
1201 ACGGCGGCTC TGCTGCTGCA GAAATACCCG TGGATGAXCA ACGACAACCT
1251 GCGTACCACG TTGCTGACGA CGGCTCAGGA CATCGGTGCA GTCGGCGTGG
1301 ACAGCAAGTT CGGCTGGGGA CTGCTGGATG CGGGTAAGGC CATGAACGGA
1351 CCCGCGTCCT TTCCGTTCGG CGACTTTACC GCCGATACGA AAGGTACATC
1401 CGATATTGCC TACTCCTTCC GTAACGACAT TTCAGGCACG GGCGGCCTGA
1451 TCAAAAAAGG CGGCAGCCAA CTGCAACTGC ACGGCAACAA CACCTATACG
1501 GGCAAAACCA TTATCGAAGG CGGTTCGCTG GTGTTGTACG GCAACAACAA
1551 ATCGGATATG CGCGTCGAAA CCAAAGGTGC GCTGATTTAT AACGGGGCGG
1601 CATCCGGCGG CAGCCTGAAC AGCGACGGCA TTGTCTATCT GGCAGATACC
1651 GACCAATCCG GCGCAAACGA AACCGTACAC ATCAAAGGCA GTCTGCAGCT
1701 GGACGGCAAA GGTACGCTGT ACACACGTTT GGGCAAACTG CTGAAAGTGG
1751 ACGGTACGGC GATTATCGGC GGCAAGCTGT ACATGTCGGC ACGCGGCAAG
1801 GGGGCAGGCT ATCTCAACAG TACCGGACGA CGTGTTCCCT TCCTGAGTGC
1851 CGCCAAAATC GGGCAGGATT ATTCTTTCTT CACAAACATC GAAACCGACG
1901 GCGGCCTGCT GGCTTCCCTC GACAGCGTCG AAAAAACAGC GGGCAGTGAA
1951 GGCGACACGC TGTCCTATTA TGTCCGTCGC GGCAATGCGG CACGGACTGC
2001 TTCGGCAGCG GCACATTCCG CGCCCGCCGG TCTGAAACAC GCCGTAGAAC
2051 AGGGCGGCAG CAATCTGGAA AACCTGATGG TCGAACTGGA TGCCTCCGAA
2101 TCATCCGCAA CACCCGAGAC GGTTGAAACT GCGGCAGCCG ACCGCACAGA
2151 TATGCCGGGC ATCCGCCCCT ACGGCGCAAC TTTCCGCGCA GCGGCAGCCG
2201 TACAGCATGC GAATGCCGCC GACGGTGTAC GCATCTTCAA CAGTCTCGCC
2251 GCTACCGTCT ATGCCGACAG TACCGCCGCC CATGCCGATA TGCAGGGACG
2301 CCGCCTGAAA GCCGTATCGG ACGGGTTGGA CCACAACGGC ACGGTCTTGC
2351 GCGTCATCGC GCAAACCCAA CAGGACGGTG GAACGTGGGA ACAGGGCGGT
2401 GTTGAAGGCA AAATGCGCGG CAGTACCCAA ACCGTCGGCA TTGCCGCGAA
2451 AACCGGCCAA AATACGACAG CAGCCGCCAC ACTGGGCATG GGACGCAGCA
2501 CATGGAGCGA AAACTGTGCA AATGCAAAAA CCGACAGCAT TAGTCTGTTT
2551 GCAGGCATAC GGCACGATGC GGGCGATATC GGCTATCTCA AAGGCCTGTT
2601 CTCCTACGGA CGCTACAAAA ACAGCATCAG CCGCAGCACC GGTGCGGACG
2651 AACATGCGGA AGGCAGCGTC AACGGCACGC TGATGCAGCT GGGCGCACTG
2701 GGCGGTGTCA ACGTTCCGTT TGCCGCAACG GGAGATTTGA CGGTCGAAGG
2751 CGGTCTGCGC TACGACCTGC TCAAACAGGA TGCATTCGCC GAAAAAGGCA
2801 GTGCTTTGGG CTGGAGCGGC AACAGCCTCA CTGAAGGCAC GCTGGTCGGA
2851 CTCGCGGGTC TGAACCTGTC GCAACCCTTG AGCGATAAAG CCGTCCTGTT
2901 TGCAACGGCG GGCGTGGAAC GCGACCTGAA CGGACGCGAC TACACGGTAA
2951 CGGGCGGCTT TACCGGCGCG ACTGCAGCAA CCGGCAAGAC GGGGGCACGC
3001 AATATGCCGC ACACCCGTCT GGTTGCCGGC CTGGGCGCGG ATGTCGAATT
3051 CGGCAACGGC TGGAACGGCT TGGCACGTTA CAGCTACGCC GGTTCCAAAC
3101 AGTACGGCAA CCACAGCGGA CGAGTCGGCG TAGGCTACCG GTTCCTCGAG
3151 GGTGGCGGAG GCACTGGATC GCCCACAAAC GACGACGATG TTAAAAAAGC
3201 TGCCACTGTG GCCATTGCTG CTGCCTACAA CAATGGCCAA GAAATCAACG
3251 GTTTCAAAGC TGGAGAGACC ATCTACGACA TTGATGAAGA CGGCACAATT
3301 ACCAAAAAAG ACGCAACTGC AGCCGATGTT GAAGCCGACG ACTTTAAAGG
3351 TCTGGGTCTG AAAAAAGTCG TGACTAACCT GACCAAAACC GTCAATGAAA
3401 ACAAACAAAA CGTCGATGCC AAAGTAAAAG CTGCAGAATC TGAAATAGAA
3451 AAGTTAACAA CCAAGTTAGC AGACACTGAT GCCGCTTTAG CAGATACTGA
3501 TGCCGCTCTG GATGCAACCA CCAACGCCTT GAATAAATTG GGAGAAAATA
3551 TAACGACATT TGCTGAAGAG ACTAAGACAA ATATCGTAAA AATTGATGAA
3601 AAATTAGAAG CCGTGGCTGA TACCGTCGAC AAGCATGCCG AAGCATTCAA
3651 CGATATCGCC GATTCATTGG ATGAAACCAA CACTAAGGCA GACGAAGCCG
3701 TCAAAACCGC CAATGAAGCC AAACAGACGG CCGAAGAAAC CAAACAAAAC
3751 GTCGATGCCA AAGTAAAAGC TGCAGAAACT GCAGCAGGCA AAGCCGAAGC
3801 TGCCGCTGGC ACAGCTAATA CTGCAGCCGA CAAGGCCGAA GCTGTCGCTG
3851 CAAAAGTTAC CGACATCAAA GCTGATATCG CTACGCACAA AGATAATATT
3901 GCTAAAAAAG CAAACAGTGC CGACGTGTAC ACCAGAGAAG AGTCTGACAG
3951 CAAATTTGTC AGAATTGATG GTCTGAACGC TACTACCGAA AAATTGGACA
4001 CACGCTTGGC TTCTGCTGAA AAATCCATTG CCGATCACGA TACTCGCCTG
4051 AACGGTTTGG ATAAAACAGT GTCAGACCTG CGCAAAGAAA CCCGCCAAGG
4101 CCTTGCAGAA CAAGCCGCGC TCTCCGGTCT GTTCCAACCT TACAACGTGG
4151 GTCTCCGAGCA CCACCACCAC CACCACTGA
1 MTASPDFNAG GTGOGSMSRA TTALSAAVSY AGIKNEMCKD RSMLCAGRDD
51 VAVTDRDAKI NAPPPNLHTG DFPNPNDAYK NLINLKPAIE AGYTGRGVEV
101 GIVDTGESVG SISFPELYGR KKHGYNENYK NYTAYMRKEA PEDGGGKDIE
151 ASFDDEAVIE TEAKPTDIRH VKEIGHIDLV SHIIGGRSVD GRPAGGIAPD
201 ATLHIMNTND ETKNEMMVAA IRNAWVKLGB RGVRIVNNSF GTTSRAGTAD
251 LFQIANSEEQ YRQALLDYSG GDKTDEGIRL MQQSDYGNLS YHIRNKNMLF
301 IFSTGNDAQA QPNTYALLPF YEKDAQKGII TVAGVDRSGE KFKREMYGEP
351 GTEPLETGSN ECGITAMWCL SAPYEASVRF TRTNPIQIAG TSFSAPIVTG
401 TAALLLQKYP WMSNDNLRTT LLTTAQDIGA VGVDSKFGWG LLDAGKAMNG
451 PASFPFGDFT ADTKGTSDIA YSFRNDISGT GGLIKKGGSQ LQLHGNNTYT
501 GKTIIRGGSL VLYGNNKSDM RVETKGALIY NGAASGGSLN SDGIVYLADT
551 DQSGANETVH IKGSLQLDGK GTLYTRLGKL LKVDGTAIIG GKLYMSARGK
601 GAGYLNSTGR RVPFLSAAKI GQDYSFFTNI ETDGGLLASL DSVEKTAGSE
651 GDTLSYYVRR GNAARTASAA AHSAPAGLKH AVEQGGSNLE NLMVKLDASE
701 SSATOETVET AAADRTDMPG IRPYGATFRA AAAVQHANAA DGVRIFNSLA
751 ATVYADSTAA HADMQGRRLK AVSDGLDHNG TGLRVIAQTQ QDGGTWEQGG
801 VEGKMRGSTQ TVGIAAKTGE NTTAAATLGM GRSTWSKNSA NAKTDSISLF
851 AGIRKDAGDI GYLKGLFSYG RYKNSISRST GADEEAEGSV NGTLMQLGAL
901 GGVNVPFAAT GDLTVRGGLR YDLLKQDAFA EKGSALGWSG NSLTEGTLVG
951 LAGLKLSQPL SDKAVLAATA GVERDLNGRD YTVTGGFTGA TAATGKTGAR
1001 NMPHTRLVAG LGADVEFGNG WNGLARYSYA GSKQYGNHSG RVGVGYRFLE
1051 GGGGTGSATM DDDVKKAATV AIAAAYNNGQ EINGFKAGET IYDIDEDGTI
1101 TKKDATAADV EADDFKGLGL KKVVTNLTKT VNENKQNVDA KVKAAESRIE
1151 KLTTKLADTD AALADTDAAL DATTNALNKL GENITTFAEE TKTNIVKIDE
1201 KLEAVADTVD KHAEAFNDIA DSLDETNTKA DEAVKTANEA KQTAEETKQN
1251 VDAKVKTTET AAGKAEAAAG TANTAADKAE AVAAKVTDIK ADIATNKINI
1301 AKKANSADVY TREESDSKFV RIDGLNATTE KLDTRLASAE KSIADHDTRL
1351 NGLDKTVSDL RKETRQGLAE QAALSGLFQP YNVGLEHHHH HH*
ΔG741和杂交体
针对各种菌株(包括同源2996菌株),测定由应答ΔG741(His-融合)产生的杀菌滴定度:
|
2996 |
MC58 |
NGH38 |
F6124 |
BZ133 |
ΔG741 |
512 |
131072 |
>2048 |
16384 |
>2048 |
可以看出,针对异源菌株MC58,由ΔG741引发的抗-杀菌滴定度特别高。
还将ΔG741直接融合于蛋白质961、961c、983和ORF46.1的符合读框的上游:
ΔG741-961
1 ATGGTCGCCC CCGACATCGG TGCGGGGCTT GCCGATGCAC TAACCGCACC
51 GCTCGACCAT AAAGACAAAG GTTTGCAGTC TTTGACGCTG GATCAGTCCG
101 TCAGGAAAAA CGAGAAACTG AAGCTGGCGG CACAAGGTGC GGAAAAAACT
151 TATGGAAACG GTGACAGCCT CAATACGGGC AAATTGAAGA ACGACAAGGT
201 CAGCCGTTTC GACTTTATCC GCCAAATCGA AGTGGACGGG CAGCTCATTA
251 CCTTGGAGAG TGGAGAGTTC CAAGTATACA AACAAAGCCA TTCCGCCTTA
301 ACCGCCTTTC AGACCGAGCA AATACAAGAT TCGGAGCATT CCGGGAAGAT
351 GGTTGCGAAA CGCCAGTTCA GAATCGGCGA CATAGCGGGC GAACATACAT
401 CTTTTGACAA GCTTCCCGAA GGCGGCAGGG CGACATATCG CGGGACGGCG
451 TTCGGTTCAG ACGATGCCGG CGGAAAACTG ACCTACACCA TAGATTTCGC
501 CGCCAAGCAG GGAAACGGCA AAATCGAACA TTTGAAATCD CCAGAACTCA
551 ATGTCGACCT GGCCGCCGCC GATATCAAGC CGGATGGAAA ACGCCATGCC
601 GTCATCAGCG GTTCCGTCCT TTACAACCAA GCCGAGAAAG GCAGTTACTC
651 CCTCGGTATC TTTGGCGGAA AAGCCCAGGA AGTTGCCGGC AGCGCGGAAG
701 TGAAAACCGT AAACGGCATA CGCCATATCG GCCTTGCCGC CAAGCAACTC
751 GAGGGTGGCG GAGGCACTGG ATCCGCCACA AACGACGACG ATGTTAAAAA
801 AGCTGCCACT GTGGCCATTG CTGCTGCCTA CAACAATGGC CAAGAAATCA
851 ACGGTTTCAA AGCTGGAGAG ACCATCTACG ACATTGATGA AGACGGCACA
901 ATTACCAAAA AAGACGCAAC TGCAGCCGAT GTTGAAGCCG ACGACTTTAA
951 AGGTCTGGGT CTGAAAAAAG TCGTGACTAA CCTGACCAAA ACCGTCAATG
1001 AAAACAAACA AAACGTCGAT GCCAAAGTAA AAGCTGCAGA ATCTGAAATA
1051 GAAAAGTTAA CAACCAAGTT AGCAGACACT GATGCCGCTT TAGCAGATAC
1101 TGATGCCGCT CTGGATGCAA CCACCAACGC CTTGAATAAA TTGGGAGAAA
1151 ATATAACGAC ATTTGCTGAA GAGACTAAGA CAAATATCGT AAAAATTGAT
1201 GAAAAATTAG AAGCCGTGGC TGATACCGTC GACAAGCATG CCGAAGCATT
1251 CAACGATATC GCCGATTCAT TGGATGAAAC CAACACTAAG GCAGACGAAG
1301 CCGTCAAAAC CGCCAATGAA GCCAAACAGA CGGCCGAAGA AACCAAACAA
1351 AACGTCGATG CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA ACTGCAGCAG GCAAAGCCGA
1401 AGCTGCCGCT GGCACAGCTA ATACTGCAGC CGACAAGGCC GAACCTGTCG
1451 CTGCAAAAGT TACCGACATC AAAGCTGATA TCGCTACGAA CAAAGATAAT
1501 ATTGCTAAAA AAGCAAACAG TGCCGACGTG TACACCAGAG AAGAGTCTGA
1551 CAGCAAATTT GTCAGAATTG ATGGTCTGAA CGCTACTACC GAAAAATTGG
1601 ACACACGCTT GGCTTCTGCT GAAAAATCCA TTGCCGATCA CGATACTCGC
1651 CTGAACGGTT TGGATAAAAC AGTGTCAGAC CTGDGCAAAG AAACCCGCCA
1701 AGGCCTTGCA GAACAAGCCG CGCTCTCCGG TCTGTTCCAA ACCTACAACG
1751 TGGGTCGGTT CAATGTAACG GCTGCAGTCG GCGGCTACAA ATCCGAATCG
1801 GCAGTCGCCA TCGGTACCGG CTTCCGCTTT ACCGAAAACT TTGCCGCCAA
1851 AGCAGGCGTG GCAGTCGGCA CTTCGTCCGG TTCTTCCGCA AGCCTACCATG
1901 TCGGCGTCAA TTACGAGTGG CTCGAGCACC ACCACCACCA CCACTGA
1 MVAADIGAGL ADALTAPLDH KDKGLQSLTL DQSVRKNEKL KLAAQGAEKT
51 YGNGDSLNTG KLKNDKVSRF DFIRQIEVDG QLITLESGEF QVYKQSHSAL
101 TAFQTEQIQD SEHSGKMVAK RQFRIGKIAG EHTSFDKLPE GGRATYRGTA
151 FGSDDAGGKL TYTIDFAAKQ GNGKIEHLKS PELNVDLAAA DIKPDGKPHA
201 VISGSVLYNQ AEKGSYSLGI FGGKAQEVAG SSEVETVNGI RHIGLAAKQL
251 EGGGGTGSAT NDDDVKKAAT VAIAAAYNNG QEINGFKAGE TIYDIDEDGT
301 ITKKDATAAD VEADDFKGLG LKKVVTNLTK TVNENKQNVD AKVKAAESEI
351 EKLTTKLADT DAALADTDAA LDATTNALNK LGENITTFAE ETKTNIVKID
401 EKLEAVADTV DKHAEAFNDI ADSLDETNTK ADEAVKTANE AKQTAEETKQ
451 NVDAKVKAAE TAAGKAEAAA GTANTAADKA EAVAAKVTDI KADIATNKDN
501 IAKKANSADV YTREESDSKF VRIDGLNATT EKLDTRLASA EKTIADHDTR
551 LNGLDKTVSD LRKETRQGLA EQAALSGLFQ PYNVGRFNVT AAVGGYKSES
601 AVAIGTGFRF TENFAAKAGV AVGTSSGSSA AYHVGVNYEW LEHHHHHH*
ΔG741-961c
1 ATGGTCGCCG CCGACATCGG TGCGGGGCTT GCCGATGCAC TAACCGCACC
51 GCTCGACCAT AAAGACAAAG GTTTGCAGTC TTTGACGCTG GATCAGTCCG
101 TCAGGAAAAA CGAGAAACTG AAGCTGGCGG CACAAGGTGC GGAAAAAACT
151 TATGGAAACG GTGACAGCCT CAATACGGGC AAATTGAAGA ACGACAAGGT
201 CAGCCGTTTC GACTTTATCC GCCAAATCGA AGTGGACGGG CAGCTCATTA
251 CCTTGGAGAG TGGAGAGTTC CAAGTATACA AACAAAGCCA TTCCGCCTTA
301 ACCGCCTTTC AGACCGAGCA AATACAAGAT TCGGAGCATT CCGGGAAGAT
351 GGTTGCGAAA CGCCAGTTCA GAATCGGCGA CATAGCGGGC GAACATACAT
401 CTTTTGACAA GCTTCCCGAA GGCGGCAGGG CGACATATCG CGGGACGGCG
451 TTCGGTTCAG ACGATGCCGG CGGAAAACTG ACCTACACCA TAGATTTCGC
501 CGCCAAGCAG GGAAACGGCA AAATCGAACA TTTGAAATCG CCAGAACTCA
551 ATGTCGACCT GGCCGCCGCC GATATCAAGC CGGATGGAAA ACGCCATGCC
601 GTCATCAGCG GTTCCGTCCT TTACACCCAA GCCGAGAAAG GCAGTTACTC
651 CCTCGGTATC TTTGGCGGAA AAGCCCAGGA AGTTGCCGGC AGCGCGGAAG
701 TGAAAACCGT AAACGGCATA CGCCATATCG GCCTTGCCGC CAAGCAACTC
751 GAGGGTGGCG GAGGCACTGG ATCCGCCACA AACGACGACG ATGTTAAAAA
801 AGCTGCCACT GTGGCCATTG CTGCTGCCTA CAACAATGGC CAAGAAATCA
851 ACGGTTTCAA AGCTGGAGAG ACCATCTACG ACATTGATGA AGACGGCACA
901 ATTACCAAAA AAGACGCAAC TGCAGCCGAT GTTGAAGCCG ACGACTTTAA
951 AGGTCTGGGT CTGAAAAAAG TCGTGACTAA CCTGACCAAA ACCGTCAATG
1001 AAAACAAACA AAACGTCGAT GCCAAAGTAA AAGCTGCAGA ATCTGAAATA
1051 GAAAAGTTAA CAACCAAGTT AGCAGACACT GATGCCGCTT TAGCAGATAC
1101 TGATGCCGCT CTGGATGCAA CCACCAACGC CTTGAATAAA TTGGGAGAAA
1151 ATATAACGAC ATTTGCTGAA GAGACTAAGA CAAATATCGT AAAAATTGAT
1201 GAAAAATTAG AAGCCGTGGC TGATACCGTC GACAAGCATG CCGAAGCATT
1251 CAACGATATC GCCGATTCAT TGGATGAAAC CAACACTAAG GCAGACGAAG
1301 CCGTCAAAAC CGCCAATGAA GCCAAACAGA CGGCCGAAGA AACCAAACAA
1351 AACGTCGATG CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA ACTGCAGCAG GCAAAGCCGA
1401 AGCTGCCGCT GGCACAGCTA ATACTGCAGC CGACAAGGCC GAAGCTGTCG
1451 CTGCAAAAGT TACCGACATC AAAGCTGATA TCGCTACGAA CAAAGATAAT
1501 ATTGCTAAAA AAGCAAACAG TGCCGACGTG TACACCAGAG AAGAGTCTGA
1551 CAGCAAATTT GTCAGAATTG ATGGTCTGAA CGCTACTACC GAAAAATTGG
1601 ACACACGCTT GGCTTCTGCT GAAAAATCCA TTGCCGATCA CGATACTCGC
1651 CTGAACGGTT TGGATAAAAC AGTGTCAGAC CTGCGCAAAG AAACCCGCCA
1701 AGGCCTTGCA GAACAAGCCG CGCTCTCCGG TCTGTTCCAA CCTTACAACG
1751 TGGGTCTCGA GCACCACCAC CACCACCACT GA
1 MVAADIGAGL ADALTAPLDH KDKGLQSLTL DQSVRKNEEL KLAAQGAEKT
51 YGNGDSLNTG KLKNDKVSRF DFIRQIEVDG QLITLESGEF QVYKQSHSAL
101 TAFQTEQIQD SEHSGKMVAK FQFRIGDIAG KHTSFDKLPE GGRATYRGTA
151 FGSDDAGGKL TYTIDFAAKQ GNGKIEHLKS PELNVDLAAA DIKPDGKPHA
201 VISGSVLYNQ AEKGSYSLGI FGGKAQEVAG SAEVKTVNGI RHIGLAAKQL
251 EGGGGTGSAT NDDDVKKAAT VAIAAAYNNG QEINGFKAGE TIYDIDEDGT
301 ITKKDATAAD VEADDFKGLG LKKVVTNLTK TVNENEQNVD AKVKAAESEI
351 EKLTTKLADT DAALADTDAA LDATTNALNK LGENITTFAE ETKTNIVKID
401 EKLEAVADTV DKHAEAFNDI ADSLDETNTK ADEAVKTANE AKQTAEETKQ
451 NVDAKVKAAE TAAGKAEAAA GTANTAADKA EAVAAKVTDI KADIATNKDN
501 IAKKANSADV YTREESDSKF VRIDGLNATT EKLDTRLASA EKSIADHDTR
551 LNGLDKTVSD LRKETRQGLA EQAALSGLFQ PYNVGLEHHH HHH*
ΔG741-983
1 ATGGTCGCCG CCGACATCGG TGCGGGGCTT GCCGATGCAC TAACCGCACC
51 GCTCGACCAT AAAGACAAAG GTTTGCAGTC TTTGACGCTG GATCAGTCCG
101 TCAGGAAAAA CGAGAAACTG AAGCTGGCGG CACAAGGTGC GGAAAAAACT
151 TATGGAAACG GTGACAGCCT CAATACGGGC AAATTGAAGA ACGACAAGGT
201 CAGCCGTTTC GACTTTATCC GCCAAATCGA AGTGGACGGG CAGCTCATTA
251 CCTTGGAGAG TGGAGAGTTC CAAGTATACA AACAAAGCCA TTCCGCCTTA
301 ACCGCCTTTC AGACCGAGCA AATACAAGAT TCGGAGCATT CCGGGAAGAT
351 GGTTGCGAAA CGCCAGTTCA GAATCGGCGA CATAGCGGGC GAACATACAT
401 CTTTTGACAA GCTTCCCGAA GGCGGCAGGG CGACATATCG CGGGACGGCG
451 TTCGGTTCAG ACGATGCCGG CGGAAAACTG ACCTACACCA TAGATTTCGC
501 CGCCAAGCAG GGAAACGGCA AAATCGAACA TTTGAAATCG CCAGAACTCA
551 ATGTCGACCT GGCCGCCGCC GATATCAAGC CGGATGGAAA ACGCCATGCC
601 GTCATCAGCG GTTCCGTCCT TTACAACCAA GCCGAGAAAG GCAGTTACTC
651 CCTCGGTATC TTTGGCGGAA AAGCCCAGGA AGTTGCCGGC AGCGCGGAAG
701 TGAAAACCGT AAACGGCATA CGCCATATCG GCCTTGCCGC CAAGCAACTC
751 GAGGGATCCG GCGGAGGCGG CACTTCTGCG CCCGACTTCA ATGCAGGCGG
801 TACCGGTATC GGCAGCAACA GCAGAGCAAC AACAGCGAAA TCAGCAGCAG
851 TATCTTACGC CGGTATCAAG AACGAAATGT GCAAAGACAG AAGCATGCTC
901 TGTGCCGGTC GGGATGACGT TGCGGTTACA GACAGGGATG CCAAAATCAA
951 TGCCCCCCCC CCGAATCTGC ATACCGGAGA CTTTCCAAAC CCAAATGACG
1001 CATACAAGAA TTTGATCAAC CTCAAACCTG CAATTGAAGC AGGCTATACA
1051 GGACGCGGGG TAGAGGTAGG TATCGTCGAC ACAGGCGAAT CCGTCGGCAG
1101 CATATCCTTT CCCGAACTGT ATGGCAGAAA AGAACACGGC TATAACGAAA
1151 ATTACAAAAA CTATACGGCG TATATGCGGA AGGAAGCGCC TGAAGACGGA
1201 GGCGGTAAAG ACATTGAAGC TTCTTTCGAC GATGAGGCCG TTATAGAGAC
1251 TGAAGCAAAG CCGACGGATA TCCGCCACGT AAAAGAAATC GGACACATCG
1301 ATTTGGTCTC CCATATTATT GGCGGGCGTT CCGTGGACGG CAGACCTGCA
1351 GGCGGTATTG CGCCCGATGC GACGCTACAC ATAATGAATA CGAATGATGA
1401 AACCAAGAAC GAAATGATGG TTGCAGCCAT CCGCAATGCA TGGGTCAAGC
1451 TGGGCGAACG TGGCGTGCGC ATCGTCAATA ACAGTTTTGG AACAACATCG
1501 AGGGCAGGCA CTGCCGACCT TTTCCAAATA GCCAATTCGG AGGAGCAGTA
1551 CCGCCAAGCG TTGCTCGACT ATTCCGGCGG TGATAAAACA GACGAGGGTA
1601 TCCGCCTGAT GCAACAGAGC GATTACGGCA ACCTGTCCTA CCACATCCGT
1651 AATAAAAACA TGCTTTTCAT CTTTTCGACA GGCAATGACG CACAAGCTCA
1701 GCCCAACACA TATGCCCTAT TGCCATTTTA TGAAAAAGAC GCTCAAAAAG
1751 GCATTATCAC AGTCGCAGGC GTAGACCGCA GTGGAGAAAA GTTCAAACGG
1801 GAAATGTATG GAGAACCGGG TACAGAACCG CTTGAGTATG GCTCCAACCA
1851 TTGCGGAATT ACTGCCATGT GGTGCCTGTC GGCACCCTAT GAAGCAAGCG
1901 TCCGTTTCAC CCGTACAAAC CCGATTCAAA TTGCCGGAAC ATCCTTTTCC
1951 GCACCCATCG TAACCGGCAC GGCGGCTCTG CTGCTGCAGA AATACCCGTG
2001 GATGAGCAAC GACAACCTGC GTACCACGTT GCTGACGACG GCTCAGGACA
2051 TCGGTGCAGT CGGCGTGGAC AGCAAGTTCG GCTGGGGACT GCTGGATGCG
2101 GGTAAGGCCA TGAACGGACC CGCGTCCTTT CCGTTCGGCG ACTTTACCGC
2151 CGATACGAAA GGTACATCCG ATATTGCCTA CTCCTTCCGT AACGACATTT
2201 CAGGCACGGG CGGCCTGATC AAAAAAGGCG GCAGCCAACT GCAACTGCAC
2251 GGCAACAACA CCTATACGGG CAAAACCATT ATCGAAGGCG GTTCGCTGGT
2301 GTTGTACGGC AACAACAAAT CGGATATGCG CGTCGAAACC AAAGGTGCGC
2351 TGATTTATAA CGGGGCGGCA TCCGGCGGCA GCCTGAACAG CGACGGCATT
2401 GTCTATCTGG CAGATACCGA CCAATCCGGC GCAAACGAAA CCGTACACAT
2451 CAAAGGCAGT CTGCAGCTGG ACGGCAAAGG TACGCTGTAC ACACGTTTGG
2501 GCAAACTGCT GAAAGTGGAC GGTACGGCGA TTATCGGCGG CAAGCTGTAC
2551 ATGTCGGCAC GCGGCAAGGG GGCAGGCTAT CTCAACAGTA CCGGACGACG
2601 TGTTCCCTTC CTGAGTGCCG CCAAAATCGG GCAGGATTAT TCTTTCTTCA
2651 CAAACATCGA AACCGACGGC GGCCTGCTGG CTTCCCTCGA CAGCGTCGAA
2701 AAAACAGCGG GCAGTGAAGG CGACACGCTG TCCTATTATG TCCGTCGCGG
2751 CAATGCGGCA CGGACTGCTT CGGCAGCGGC ACATTCCGCG CCCGCCGGTC
2801 TGAAACACGC CGTAGAACAG GGCGGCAGCA ATCTGGAAAA CCTGATGGTC
2851 GAACTGGATG CCTCCGAATC ATCCGCAACA CCCGAGACGG TTGAAACTGC
2901 GGCAGCCGAC CGCACAGATA TGCCGGGCAT CCCGCCCTAC GGCGCAACTT
2951 TCCGCGCAGC GGCAGCCGTA CAGCATGCGA ATGCCGCCGA CGGTGTACGC
3001 ATCTTCAACA GTCTCGCCGC TACCGTCTAT GCCGACAGTA CCGCCGCCCA
3051 TGCCGATATG CAGGGACGCC GCCTGAAAGC CGTATCGGAC GGGTTGGACC
3101 ACAACGGCAC GGGGTCGCGC GTCATCGCGC AAACCCAACA GGACGGTGGA
3151 ACGTGGGAAC AGGGCGGTGT TGAAGGCAAA ATGCGCGGCA GTACCCAAAC
3201 CGTCGGCATT GCCGCGAAAA CCGGCGAAAA TACGACAGCA GCCGCCACAC
3251 TGGGCATGGG ACGCAGCACA TGGAGCGAAA ACAGTGCAAA TGCAAAAACC
3301 GACAGCATTA GTCTGTTTGC AGGCATACGG CACGATGCGG GCGATATCGG
3351 CTATCTCAAA GGCCTGTTCT CCTACGGACG CTACAAAAAC AGCATCAGCC
3401 GCAGCACCGG TGCGGACGAA CATGCGGAAG GCAGCGTCAA CGGCACGCTG
3451 ATGCAGCTGG GCGCACTGGG CGGTGTCAAC GTTCCGTTTG CCGCAACGGG
3501 AGATTTGACG GTCGAAGGCG GTCTGCGCTA CGACCTGCTC AAACAGGATG
3551 CATTCGCCGA AAAAGGCAGT GCTTTGGGCT GGAGCGGCAA CAGCCTCACT
3601 GAAGGCACGC TGGTCGGACT CGCGGGTCTG AAGCTGTCGC AACCCTTGAG
3651 CGATAAAGCC GTCCTGTTTG CAACGGCGGG CGTGGAACGC GACCTGAACG
3701 GACGCGACTA CACGGTAACG GGCGGCTTTA CCGGCGCGAC TGCAGCAACC
3751 GGCAAGACGG GGGCACGCAA TATGCCGCAC ACCCGTCTGG TTGCCGGCCT
3801 GGGCGCGGAT GTCGAATTCG GCAACGGCTG GAACGGCTTG GCACGTTACA
3851 GCTACGCCGG TTCCAAACAG TACGGCAACC ACAGCGGACG AGTCGGCGTA
3901 GGCTACCGGT TCCTCGAGCA CCACCACCAC CACCACTGA
1 MVAADIGAGL ADALTAPLDH KDKGLQSLTL DQSVRKNEKL KLAAQGAEKT
51 YGNGDSLNTG KLKNDKVSRF DFIRQIEVDG QLITLESGEF QVYKQSHSAL
101 TAFQTEQIQD SEHSGKMVAK RQFRIGDIAG EHTSFDKLPE GGRATYRGTA
151 FGSDDAGGKL TYTIDFAAKQ GNGKIEHLKS PELNVDLAAA DIKPDGKRHA
201 VISGSVLYNQ AEKGSYSLGI FGGKAQEVAG SAEVKTVNGI RHIGLAAKQL
251 EGSGGGGTSA PDFNAGGTGI GSNSRATTAK SAAVSYAGIK NEMCKDRSML
301 CAGRDDVAVT DRDAKINAPP PNLHTGDFPN PNDAYKNLIN LKPAIEAGYT
351 GRGVEVGIVD TGESVGSISF PELYGRKEHG YNENYKNYTA YMRKEAPEDG
401 GGKDIEASFD DEAVIETEAK PTDIRHVKEI GHIDLVSHII GGRSVDGRPA
451 GGIAPDATLH IMNTNDETKN EMMVAAIRNA WVKLGERGVR IVNNSFGTTS
501 RAGTADLFQI ANSEEQYRQA LLDYSGGDKT DEGIRLMQQS DYGNLSYHIR
551 NKNMLFIFST GNDAQAQPNT YALLPFYEKD AQKGIITVAG VDRSGEKFKR
601 EMYGEPGTEP LEYGSNHCGI TANWCLSAPY EASVRFTRTN PIQIAGTSFS
651 APIVTGTAAL LLQKYPWMSN DNLRTTLLTT AQDIGAVGVD SKFGWGLLDA
701 GKAMNGPASF PFGDFTADTK GTSDIAYSFR NDISGTGGLI KKGGSQLQLH
751 GNNTYTGKTI IEGGSLVLYG NNKSDMRVET KGALIYNGAA SGGSLNSDGI
801 VYLADTDQSG ANETVHIKGS LQLDGKGTLY TRLGKLLKVD GTAIIGGKLY
851 MSARGKGAGY LNSTGRRVPF LSAAKIGQDY SFFTNIETDG GLLASLDSVE
901 KTAGSEGDTL SYYVRRGNAA RTASAAAHSA PAGLKHAVEQ GGSNLENLMV
951 ELDASESSAT PETVETAAAD RTDMPGIRPY GATFRAAAAV QHANAADGVR
1001 IFNSLAATVY ADSTAAHADM QGRRLKAVSD GLDHNGTGLR VIAQTQQDGG
1051 TWEQGGVEGK MRGSTQTVGI AAKTGENTTA AATLGMGRST WSENSANAKT
1101 DSISLFAGIR HDAGDIGYLK GLFSYGRYKN SISRSTGADE HAEGSVNGTL
1151 MQLGALGGVN VPFAATGDLT VEGGLRYDLL KQDAFAEKGS ALGWSGNSLT
1201 EGTLVGLAGL KLSQPLSDKA VLFATAGVER DLNGRDYTVT GGFTGATAAT
1251 GKTGARNMPH TRLVAGLGAD VEFGNGWNGL ARYSYAGSKQ YGNHSGRVGV
1301 GYRFLEHHHH HH*
ΔG741-ORF46.1
1 ATGGTCGCCG CCGACATCGG TGCGGGGCTT GCCGATGCAC TAACCGCACC
51 GCTCGACCAT AAAGACAAAG GTTTGCAGTC TTTGACGCTG GATCAGTCCG
101 TCAGGAAAAA CGAGAAACTG AAGCTGGCGG CACAAGGTGC GGAAAAAACT
151 TATGGAAACG GTGACAGCCT CAATACGGGC AAATTGAAGA ACGACAAGGT
201 CAGCCGTTTC GACTTTATCC GCCAAATCGA AGTGGACGGG CAGCTCATTA
251 CCTTGGAGAG TGGAGAGTTC CAAGTATACA AACAAAGCCA TTCCGCCTTA
301 ACCGCCTTTC AGACCGAGCA AATACAAGAT TCGGAGCATT CCGGGAAGAT
351 GGTTGCGAAA CGCCAGTTCA GAATCGGCGA CATAGCGGGC GAACATACAT
401 CTTTTGACAA GCTTCCCGAA GGCGGCAGGG CGACATATCG CGGGACGGCG
451 TTCGGTTCAG ACGATGCCGG CGGAAAACTG ACCTACACCA TAGATTTCGC
501 CGCCAAGCAG GGAAACGGCA AAATCGAACA TTTGAAATCG CCAGAACTCA
551 ATGTCGACCT GGCCGCCGCC GATATCAAGC CGGATGGAAA ACGCCATGCC
601 GTCATCAGCG GTTCCGTCCT TTACAACCAA GCCGAGAAAG GCAGTTACTC
651 CCTCGGTATC TTTGGCGGAA AAGCCCAGGA AGTTGCCGGC AGCGCGGAAG
701 TGAAAACCGT AAACGGCATA CGCCATATCG GCCTTGCCGC CAAGCAACTC
751 GACGGTGGCG GAGGCACTGG ATCCTCAGAT TTGGCAAACG ATTCTTTTAT
801 CCGGCAGGTT CTCGACCGTC AGCATTTCGA ACCCGACGGG AAATACCACC
851 TATTCGGCAG CAGGGGGGAA CTTGCCGAGC GCAGCGGCCA TATCGGATTG
901 GGAAAAATAC AAAGCCATCA GTTGGGCAAC CTGATGATTC AACAGGCGGC
951 CATTAAAGGA AATATCGGCT ACATTGTCCG CTTTTCCGAT CACGGGCACG
1001 AAGTCCATTC CCCCTTCGAC AACCATGCCT CACATTCCGA TTCTGATGAA
1051 GCCGGTAGTC CCGTTGACGG ATTTAGCCTT TACCGCATCC ATTGGGACGG
1101 ATACGAACAC CATCCCGCCG ACGGCTATGA CGGGCCACAG GGCGGCGGCT
1151 ATCCCGCTCC CAAAGGCGCG AGGGATATAT ACAGCTACGA CATUAAAGGC
1201 GTTGCCCAAA ATATCCGCCT CAACCTGACC GACAACCGCA GCACCGGACA
1251 ACGGCTTGCC GACCGTTTCC ACAATGCCGG TAGTATGCTG ACGCAAGGAG
1301 TAGGCGACGG ATTCAAACGC GCCACCCGAT ACAGCCCCGA GCTGGACAGA
1351 TCGGGCAATG CCGCCGAAGC CTTCAACGGC ACTGCAGATA TCGTTAAAAA
1401 CATCATCGGC GCGGCAGGAG AAATTGTCGG CGCAGGCGCT GCCGTGCAGG
1451 GCATAAGCGA AGGCTCAAAC ATTGCTGTCA TGCACGGCTT GGGTCTGCTT
1501 TCCACCGAAA ACAAGATGGC GCGCATCAAC GATTTGGCAG ATATGGCGCA
1551 ACTCAAAGAC TATGCCGCAG CAGCCATCCG CGATTGGGCA GTCCAAAACC
1601 CCAATGCCGC ACAAGGCATA GAAGCCGTCA GCAATATCTT TATGGCAGCC
1651 ATCCCCATCA AAGGGATTGG AGCTGTTCGG GGAAAATACG GCTTGGGCGG
1701 CATCACGGCA CATCCTATCA AGCGGTCGCA GATGGGCGCG ATCGCATTGC
1751 CGAAAGGGAA ATCCGCCGTC AGCGACAATT TTGCCGATGC GGCATACGCC
1801 AAATACCCGT CCCCTTACCA TTCCCGAAAT ATCCGTTCAA ACTTGGAGCA
1851 GCGTTACGGC AAAGAAAACA TCACCTCCTC AACCGTGCCG CCGTCAAACG
1901 GCAAAAATGT CAAACTGGCA GACCAACGCC ACCCGAAGAC AGGCGTACCG
1951 TTTGACGGTA AAGGGTTTCC GAATTTTGAG AAGCACGTGA AATATGATAC
2001 GCTCGAGCAC CACCACCACC ACCACTGA
1 MVAADIGAGL ADALTAPLDH KDKGLQSLTL DQSVRKNKKL KLAAQGAELT
51 YGNGDSLNTG KLKNDKVSRF DFIRQIEVDG QLITLESGEF QVYKQSHSAL
101 TAFQTEQIQD SEHSGKMVAK RQFRIGDIAG EHTSFDKLPE GGRATYRGTA
151 FGSDDAGGKL TYTIDFAAKQ GNGKIEHLKS PELNVDLAAA DIKPDGKRHA
201 VISGSVLYNQ AEKGSYSLGI FGGKAQEVAG SAEVKTVNGI RHIGLAAKQL
251 DGGGGTGSSD LANDSFIRQV LDRQHFEPDG KYHLFGSRGE LAERSGHIGL
301 GKIQSHQLGN LMIQQAAIKG NIGYIVRFSD HGHEVHSPFD NHASHSDSDE
351 AGSPVDGFSL YRIHWDGYEH HPADGYDGPQ GGGYPAPKGA RDIYSYDIKG
401 VAQNIRLNLT DNRSTGQRLA DRFHNAGSML TQGVGDGFKR ATRYSPELDR
451 SGNAAEAFNG TADIVKNIIG AAGEIVGAGD AVQGISEGSN IAVMHGLGLL
501 STENKNARIN DLADMAQLKD YAAAAIRDWA VQNPNAAQGI EAVSNIFMAA
551 IPIKGIGAVR GKYGLGGITA HPIKRSQMGA IALPKGKSAV SDNFADAAYA
601 KYPSPYHSRN IRSNLEQRYG KENITSSTVP PSNGKNVKLA DQRHPKTGVP
651 FDGKGFPNFE KHVKYDTLEH HHHHH*
实施例16-与287/ΔG287的C-未端融合(‘杂交体′)
按照本发明,两种蛋白质A和B的杂交体可能是NH
2-A-B-COOH或NH
2-B-A-COOH。用在919、953和ORF46.1的C-端(以‘287-His′形式)或N-未端(以ΔG287形式-如上所示的序列)的蛋白质287研究了这种差异的影响。使用一组菌株,包括同源菌株2996。用FCA作为佐剂:
|
287&919 |
287&953 |
287&ORF46.1 |
菌株 |
ΔG287-919 |
919-287 |
ΔG287-953 |
953-287 |
ΔG287-46.1 |
46.1-287 |
2996 |
128000 |
16000 |
65536 |
8192 |
16384 |
8192 |
BZ232 |
256 |
128 |
128 |
<4 |
<4 |
<4 |
1000 |
2048 |
<4 |
<4 |
<4 |
<4 |
<4 |
MC58 |
8192 |
1024 |
16384 |
1024 |
512 |
128 |
NGH38 |
32000 |
2048 |
>2048 |
4096 |
16384 |
4096 |
394/98 |
4096 |
32 |
256 |
128 |
128 |
16 |
MenA(F6124) |
32000 |
2048 |
>2048 |
32 |
8192 |
1024 |
MenC(BZ133) |
64000 |
>8192 |
>8192 |
<16 |
8192 |
2048 |
通常用N-未端的297(以ΔG的形式)观察到较好的杀菌滴定度。
当融合于蛋白质961[NH2-ΔG287-961-COOH-上述可示序列]时,得到的的蛋白质是不溶的且必须变性和复性以用于纯化。复性后,发现50%蛋白质仍不溶解。比较可溶性和不溶性蛋白质,用可溶性蛋白质获得的杀菌滴定度好得多(FCA作为佐剂):
|
2996 |
BZ232 |
MC58 |
NGH38 |
F6124 |
BZ133 |
可溶性 |
65536 |
128 |
4096 |
>2048 |
>2048 |
4096 |
难溶性 |
8192 |
<4 |
<4 |
16 |
n.d. |
n.d. |
然而,用明矾佐剂替代可以改善难溶形式蛋白质的滴定度:
难溶性 |
32768 |
128 |
4096 |
>2048 |
>2048 |
2048 |
实施例17-N-未端融合(′杂交体′)于287
将蛋白质287以全长、含C-未端His-标记、或无其前导肽但而包含C-未端His-标记表达的水平相当低。用N-未端GST-融合实现较好的表达。
或者将GST用作N-未端融合配体,将287置于蛋白质919的C-未端(‘919-287′)、蛋白质953的C-未端(‘953-287′)和蛋白质ORF46.1的C-未端(‘ORF46.1-287′)。在这两种情况中,除去前导肽,且杂交体是直接的符合读框的融合。
为了产生953-287杂交体,设计各序列的前导肽的正向引物下游以除去这两种蛋白质的前导肽;除去953反向引物中的终止密码子序列,但包含在287反向引物中。对953基因而言,用于扩增的5′和3′引物分别包括NdeI和BamHI限制酶切位点,而对287基因的扩增而言,5′和3′引物分别包括BamHI和XhoI限制酶切位点。在这种方法中,使用NdeI-BamHI(用于克隆第一个基因)和随后的BamHI-XhoI(用于克隆第二基因)可以实现pET21b+中两个基因的顺序定向克隆。
通过将编码287的成熟部分的序列克隆入pET21b+中的919-His克隆的3′端的XhoI位点中,获得919-287杂交体。设计用于扩增287基因的引物,从而在PCR片段的5′端引入SalI限制酶切位点,并在3′端引入XhoI位点。由于由SalI和XhoI限制酶产生的粘性末端是相容的,可以将用SalI-XhoI消化的287PCR扩增产物插入由XhoI切割的pET21b-919克隆中。
类似地获得ORF46.1-287杂交体。
将针对杂交蛋白产生的抗体的杀菌效力(同源菌株)与针对组分抗原的简单混合物产生的抗体的杀菌效力相比较:
|
与287的混合物 |
与287的杂交体 |
919 |
32000 |
16000 |
953 |
8192 |
8192 |
ORF46.1 |
128 |
8192 |
还获得了919-287和953-287针对异源MenB菌株和血清型A和C的杀菌活性数据:
|
919 |
953 |
ORF46.1 |
菌株 |
混合物 |
杂交体 |
混合物 |
杂交体 |
混合物 |
杂交体 |
MC58 |
512 |
1024 |
512 |
1024 |
- |
1024 |
NGH38 |
1024 |
2048 |
2048 |
4096 |
- |
4096 |
BZ232 |
512 |
128 |
1024 |
16 |
- |
- |
MemA(F6124) |
512 |
2048 |
2048 |
32 |
- |
1024 |
MenC(C11) |
>2048 |
n.d. |
>2048 |
n.d. |
- |
n.d. |
MenC(BZ133) |
>4096 |
>8192 |
>4096 |
<16 |
- |
2048 |
还构建了ORF46.1和919的杂交体。最佳的结果(高四倍的滴定度)是用在N-未端的919实现的。
还测试了杂交体919-519His、ORF97-225His和225-ORF97His。它们得到中等ELISA滴定度和杀菌的抗体应答。
实施例18-ORF4的前导肽
如上所示,可以将ORF4的前导肽融合于其它蛋白质(如蛋白质287和919)的成熟序列。其可以指导大肠杆菌中的脂质化。
实施例19-564中的结构域
蛋白质′564′非常大(2073aa),且其难以克隆并以完整形式表达。为了便于表达,如图8所示(按MC58序列)将该蛋白质分为四个结构域:
结构域 |
A |
B |
C |
D |
氨基酸 |
79-360 |
361-731 |
732-2044 |
2045-2073 |
这些结构域显示出如下同源性:
·结构域A显示与其它细菌毒素同源:
gb|AAG03431.1|AE004443-9 可能血凝素[绿脓假单胞菌](38%)
gb|AAC31981.1|(139897) HecA[菊果胶杆菌](45%)
emb|CAA36409.1|(X52156) 丝状血凝素[百日咳博德特氏菌](31%)
gb|AAC79757.1|(AF057695) 大量上清液蛋白质1[杜氏嗜血菌](26%)
gb|AAA25657.1|(M30186) HpmA前体[奇异变形菌](29%)
·结构域B显示为非同源的,且是对564特异性的。
·结构域C显示为与以下同源:
gb|AAF84995.1|AE004032 HA-样分泌的蛋白质[苛养木杆菌](33%)
gb|AAG05850.1|AE004673 假说蛋白质[铜绿假单胞菌](27%)
gb|AAF68414.1AF237928 推定的FHA[多杀巴斯德氏菌](23%)
gb|AAC79757.1|(AF057695) 大量上清液蛋白质1[杜氏嗜血菌](23%)
pir||S21010 FHAB前体[百日咳博德特氏菌](20%)
·结构域D显示与前体细菌毒素同源:
gb|AAF84995.1|AE004032_14 HA-样分泌的蛋白质[苛养木杆菌](29%)
用MC58菌株序列,以GST-融合(未纯化)和his-标记的蛋白质形式获得564ab良好的细胞内表达;该结构域-对还以脂蛋白形式表达,其表现出在外膜/上清液组分中有中等表达。
当以his-标记的产物(未纯化)表达时,b结构域显示中等细胞内表达,而以GST-融合则表达良好。
以GST-融合表达时c,结构域显示良好的细胞内表达,但是不溶的。以his标记的产物(未纯化)表达时,d结构域显示中等细胞内表达。以GST-融合体表达时,cd蛋白质结构域对表现中等细胞内表达(未纯化)。
用c结构域和bc对观察到良好的杀菌试验滴定度。
实施例20-919前导肽
在以上的实施例1中讨论了919的20mer前导肽:
MKKYLFRAAL YGIAAAILAA
如实施例1所示,该前导肽的缺失改进了异源表达(如用ORF4前导肽替代该前导肽一样)。通过将编码序列融合于摩氏摩根氏菌(Morganella morganii)的PhoC报道基因研究了919前导肽对表达的影响[Thaller等,(1994)Microbiology 140:1341-1350]。将该构建物克隆入NdeI和XhoI位点间的pET21-b质粒中(图9):
1
MKKYLFRAAL YGIAAAILAA AIPAGNDATT KPDLYYLKNE QAIDSLKLLP
51 PPPEVGSIQF LNDQAMYEKG RMLRNTERGK QAQADADLAA GGVATAFSGA
101 FGYPITRKDS PELYKLLTNM IEDAGDLATR SAKEHYMRIR PFAFYGTETC
151 NTKDQKKLST NGSYPSGHTS IGWATALVLA EVNPANQDAI LERGYQLGSS
201 RVICGYHWQS DVDAARIVGS AAVATLHSDP AFQAQLAKAK QEFAQKSQK*
该质粒的PhoC的表达水平比相同的但包含天然PhoC信号肽的构建物中发现的低>200倍。即使用大肠杆菌Plac启动子替代T7启动子后也得到相同的结果。这表明919前导序列对表达的影响并非取决于所用的启动子。
为了研究这些结果是否是由于919信号肽核苷酸序列(二级结构形式,对RNA酶等敏感)的某些特性或存在该信号肽引起的蛋白质不稳定性导致的,产生了许多突变体。所用的方法是通过克隆含简并密码子的合成接头替代919信号肽序列的核苷酸。用这种方法获得含核苷酸和/或氨基酸取代的变体。
使用两种不同的接头,设计919信号肽序列的两个不同区域中产生突变,即在第一19碱基对(L1)中和碱基20-36之间(S1)。
L1:5′T ATG AAa/g TAc/t c/tTN TTt/c a/cGC GCC GCC CTG TAC GGC ATC GCC GCC
GCC ATC CTC GCC GCC GCG ATC CC 3′
S1:5′T ATG AAA AAA TAC CTA TTC CGa/g GCN GCN c/tTa/g TAc/t GGc/g ATC GCC
GCC GCC ATC CTC GCC GCC GCG ATC CC 3′
获得的一些突变体的序列排序如下。
L1变体:
9L1-a ATGAAGAAGTACCTTTTCAGCGCCGCC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
9L1-e ATGAAAAAATACTTTTTCCGCGCCGCC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
9L1-d ATGAAAAAATACTTTTTCCGCGCCGCC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
9L1-f ATGAAAAAATATCTCTTTAGCGCCGCCCTGTACGGCATCGCCGCCGCCATCCTCGCCGCC
919sp ATGAAAAAATACCTATTCCGCGCCGCCCTGTACGGCATCGCCGCCGCCATCCTCGCCGCC
9L1a MKKYLFSAA~~~~~~~~~~~
9L1e MKKYFFRAA~~~~~~~~~~~
9L1d MKKYFFRAA~~~~~~~~~~~
9L1f MKKYLFSAALYGIAAAILAA
919sp MKKYLFRAALYGIAAAILAA (即,天然信号肽)
S1突变体:
9S1-e ATGAAAAAATACCTATTC..................ATCGCCGCCGCCATCCTCGCCGCC
9S1-c ATGAAAAAATACCTATTCCGAGCTGCCCAATACGGCATCGCCGCCGCCATCCTCGCCGCC
9S1-b ATGAAAAAATACCTATTCCGGGCCGCCCAATACGGCATCGCCGCCGCCATCCTCGCCGCC
9S1-i ATGAAAAAATACCTATTCCGGGCGGCTTTGTACGGGATCGCCGCCGCCATCCTCGCCGCC
919sp ATGAAAAAATACCTATTCCGCGCCGCCCTGTACGGCATCGCCGCCGCCATCCTCGCCGCC
9S1e MKKYLF......IAAAILAA
9S1c MKKYLFRAAQYGIAAAILAA
9S1b MKKYLPRAAQYGIAAAILAA
9S1i MKKYLRFAALYGIAAAILAA
919sp MKKYLFRAALYGIAAAILAA
如序列排序中所示,分析的的大部分突变体包含由宿主细胞出人意料地产生的符合读框的缺失。
通过用从L1和S1突变的克隆制备的DNA转化大肠杆菌BL21(DE3)细胞进行突变体的筛选。通过在包含100μg/ml氨苄青霉素、50μg/ml甲基绿、1mg/mlPDP(酚酞二磷酸)的LB平板上划线,筛选高PhoC活性的单转化体。在该培养基上产生PhoC的细胞变成绿色(图10)。
用pNPP作为PhoC活性的底物,在液体培养基中对这些突变体产生的PhoC进行的定量分析。测定在液体培养基中生长0、30、90、180分钟的实变体的细胞提取物和上清液的比活性为:
细胞提取物
|
0 |
30 |
90 |
180 |
c对照 |
0,00 0,00 0,00 0,001,11 1,11 3,33 4,44102,12 111,00 149,85 172,05206,46 111,00 94,35 83,255,11 4,77 4,00 3,1127,75 94,35 82,14 36,63156,51 111,00 72,15 28,8672,15 33,30 21,09 14,43156,51 83,25 55,50 26,64194,25 180,93 149,85 142,08 |
9phoC |
9S1e |
9L1a |
9L1d |
9L1f |
9S1b |
9S1c |
9S1i |
phoCwt |
上清液
|
0 |
30 |
90 |
180 |
对照 |
0,00 0,00 0,00 0,000,33 0,00 0,00 0,000,11 0,22 0,44 0,894,88 5,99 5,99 7,220,11 0,11 0,11 0,110,11 0,22 0,11 0,111,44 1,44 1,44 1,670,44 0,78 0,56 0,670,22 0,44 0,22 0,7834,41 43,29 87,69 177,60 |
9phoC |
9S1e |
9L1a |
9L1d |
9L1f |
9S1b |
9S1c |
9S1l |
phoCwt |
一些突变体产生大量PhoC,尤其是突变体9L1a可以在培养基中分泌PhoC。这是值得关注的,因为该变体的信号肽序列的长度仅为9个氨基酸。这是至今最短的信号肽。
实施例21-Maf-相关蛋白质的C-端缺失
MafB-相关蛋白质包括703、ORF46和ORF29。
MC58的730蛋白质具有如下序列:
1
VKPLRRLTNL LAACAVAAAA LIQPALAADL AQDPFITDNA QRQHYEPGGK
51 YHLFGDPRGS VSDRTGKINV IQDYTHQMGN LLIQQANING TIGYHTRFSG
101 HGHEEHAPFD NHAADSASEE KGNVDEGFTV YRLNWEGHEH HPADSYDGPK
151 GGNYPKPTGA RDEYTYHVNG TARSIKLNPT DTRSIRQRIS DNYSNLGSNF
201 SDRADEANRK MFEHNAKLDR WGNSMEFING VAAGALNPFI SAGEALGIGD
251 ILYGTRYAID KAAMRNLAPL PAEGKFAVIG GLGSVAGFEK NTREAVDRWI
301 QENPNAAETV EAVFNVAAAA KVAKLAKAAK PGKAAVSGDF ADSYKKKLAL
351 SDSARQLYQN AKYREALDIH YEDLIRRKTD GSSKFINGRE IDAVTNDALI
401 QAKRTISAID KPKNFLNQKN RKQIKATIEA ANQQGKRAEF WFKYGVHSQV
451 KSYIESKGGI VKTGLGD*
前导肽是加下划线的。
730显示与ORF46类似的特性(见以上实施例8):
-与Orf46一样,730序列在MenB、MenA和淋球菌之间的保守性仅对N-未端部分高(>80%)。C-未端(自~340)是高度趋异的。
-其预计的二级结构包含跨越分子中心区域(aa.227-247)的疏水片段。
-大肠杆菌中全长基因的表达产生产量很低的蛋白质。从标记的或未标记的构建物(除去信号肽序列)的表达对宿主细胞有毒性影响。换言之,细胞质中全长成熟蛋白质的存在对宿主细胞是非常毒的,而当其转位至周质(由信号肽介导)对细胞生存力没有可检测的影响。730的这种“细胞内毒性”特别高,因为只可用recA遗传背景(大肠杆菌菌株:用于克隆的HB101;用于表达的HMS174(DE3))以很低的频率得到用于表达无前导肽的730的克隆。
为了克服这种毒性,将实施例8中用于ORF46的类似方法用于730。得到四种C-未端截短的形式,每种都被很好地表达。它们都是从His-标记的无前导肽730的细胞内表达得到的。
形式A由成熟蛋白质的N-未端疏水区域(aa.28-226)构成。将其纯化性作为可溶性His标记的产物,其具有比预计更高的分子量(MW)。
形式B延伸至血清群之间保守的区域(aa.28-340)的未端。将其纯化为不溶性His标记的产物。
在筛选能在菌株HMS174(DE3)中高水平表达730-His克隆的克隆后,获得命名为C1和C2的C-未端截短的形式。简言之,用含有编码全长成熟730蛋白质的His标记的序列的pET21b质粒转化recA菌株HMS174(DE3)。低频率得到转化体,其显示出两种表型:大集落和非常小的集落。分析了若干大集落和小集落对730-His克隆的表达。只有大集落的细胞超量表达抗730A抗体识别的蛋白质。但是,不同集落中超量表达的蛋白质的分子量各不相同。对其中的两个克隆进行测序表明:这两种情况中,在编码730的C未端区域的序列中发生了大肠杆菌IS序列的整合。这两个整合在C1中产生了与另一个密码子的符合读框的融合,在C2中产生了与另外12个密码子的符合读框的融合(图11)。产生的730“突变体”形式具有如下的序列:
730-C1(IS1插入引起的-图11A)
1 MADLAQDPFI TDNAQRQHYE PGGKYHLFGD PRGSVSDRTG KINVIQDYTH
51 QMGNLLIQQA NINGTIGYHT RFSGHGHEEH APFDNHAADS ASEEKGNVDE
101 GFTVYRLNWE GHEHHPADAY DGPKGGNYPK PTGARDEYTY HVNGTARSIK
151 LNPTDTRSIR QRISDNYSNL GSNFSDRADE ANRKMFEHNA KLDRWGNSME
201 FINGVAAGAL NPFISAGEAL GIGDILYGTR YAIDKAAMRN IAPLPAEGKF
251 AVIGGLGSVA GFEKNTREAV DRWIQENPNA AETVEAVFNV AAAAKVAKLA
301 KAAKPGKAAV SGDFADSYKK KLALSDSARQ LYQNAKYREA LDIHYEDLIR
351 RKTDGSSKFI NGREIDAVTN DALIQA
R *
由插入产生的其它氨基酸下加下划线。
730-C2(IS5插入引起的-图11B)
1 MADLAQDPEI TDNAQRQHYE PGGKYHLFGD PRGSVSDRGK KINVIQDYTH
51 QMGNLLIQQA NINGTIGYHT RFSGHGHEEH APFDNHAADS ASEEKGNVDE
101 GFTVYRLNWE GHEHHPADAY DGPKGGNYPK PTGARDEYTY HVNGTARSIK
151 LNPTDTRSIR QRISDNYSNL GSNFSDRADE ANRKMFEHNA KLDRWGNSME
201 FINGVAAGAL NPFISAGEAL GIGDILYGTR YAIDKAAMRN IAPLPAEGKF
251 AVIGGLGSVA GFEKNTREAV DRWIQENPNA AETVEAVFNV AAAAKVAKLA
301 KAAKPGKAAV SGDFADSYKK KLALSDSARQ LYQNAKYREA L
GKVRISGEI
351
LLG *
由插入产生的其它氨基酸下加下划线。
总之,730-C1形式的细胞内表达产生大很高水平的量蛋白质,且对宿主细胞无毒,而天然C-未端的存在则是有毒的。这些数据表明730的“细胞内毒性”与蛋白质的C-未端65氨基酸相关。
用有或无前导肽(氨基酸1-26;缺失得到胞质表达)和有或无His-标记的表达,已进行了ORF29到前231或368氨基酸的相等的截短。
实施例22-961中的结构域
如上实施例9所述,在大肠杆菌中最佳地表达961的GSt融合。为了改进表达,将蛋白质分成结构域(图12)。
以YadA(由耶尔森氏菌产生的粘附素,已证明其是位于细胞表面上的粘附素,其形成产生表面凸起的低聚物[Hoiczyk等(2000)EMBO J 19:5989-99])为基础,设计了916的结构域,它们为:前导肽、头部结构域、卷曲-螺旋区域(茎部)和膜锚着点结构域。
有或无前导肽表达这些结构域,且任选地融合于C-未端His-标记或N-未端GST。用SDS-PAGE和Western印迹,从过夜(o/n)培育或用IPTG诱导3小时后,分析表达961不同结构域的大肠杆菌克隆用于表达的蛋白质的产生和定位。结果如下:
|
总裂解物(Western印迹) |
周质(Western印迹) |
上清液(Western印迹) |
OMVSDS-PAGE |
961(o/n)961(IPTG) |
-+/- |
-- |
-- | |
961-L(o/n)961-L(IPTG) |
++ |
-- |
-- |
++ |
961c-L(o/n)961c-L(IPTG) |
-+ |
-+ |
-+ | |
961Δ1-L(o/n)961Δ1-L(IPTG) |
-+ |
-- |
-- | + |
这些结果在大肠杆菌中显示:
·961-L是高度表达的且位于外膜上。用Western印迹分析已检测到2个特异性条带:一条为~45kDa(预计的分子量),另一条为~180kDa,表明961-L可以形成低聚物。另外,这些聚集体在过夜培养物(无IPTG诱导)中表达得更多。用该克隆的OMV制备物免疫接种小鼠,并获得血清。用过夜培养物(主要为寡聚物形式)的血清是杀菌的;IPTG-诱导的培养物(主要为单体)不是杀菌的。
·961Δ1-L(在锚区域中部分缺失)是高度表达的,且位于外膜,但不形成低聚物;
·961c-L(无锚区域)以可溶的形式产生,并被在上清液中输出。
使用His-融合的ELISA和血清杀菌试验中的滴定度如下:
|
ELISA |
杀菌 |
961a(aa24-268) |
24397 |
4096 |
961b(aa269-405) |
7763 |
64 |
961c-L |
29770 |
8192 |
961c(2996) |
30774 |
>65536 |
961c(MC58) |
33437 |
16384 |
961d |
26069 |
>65536 |
用表达不同形式961(961、961-L、961Δ1-L和961c-L)的大肠杆菌克隆研究了961是否是粘附素(参见YadA)。用(a)人上皮细胞和(b)大肠杆菌克隆(过夜培育或IPTG诱导3小时后),进行粘附试验。过夜培育的961-L(961Δ1-L)和IPTG诱导的961c-L(在表面上表达蛋白质的克隆)粘附于人上皮细胞。
也将961c用于杂交蛋白(见上)。由于961和其结构域变体指导高效表达,它们理想地适用于杂交蛋白的N-未端部分。
实施例23-其它杂交体
以下显示了本发明的其它杂交蛋白(同样参见图14)。当与单独蛋白质相比时,它们是有利的:
ORF46.1-741
1 ATGTCAGATT TGGCAAACGA TTCTTTTATC CGGCAGGTTC TCGACCGTCA
51 GCATTTCGAA CCCGACGGGA AATACCACCT ATTCGGCAGC AGGGGGGAAC
101 TTGCCGAGCG CAGCGGCCAT ATCGGATTGG GAAAAATACA AAGCCATCAG
151 TTGGGCAACC TGATGATTCA ACAGGCGGCC ATTAAAGGAA ATATCGGCTA
201 CATTGTCCGC TTTTCCGATC ACGGGCACGA AGTCCATTCC CCCTTCGACA
251 ACCATGCCTC ACATTCCGAT TCTGATGAAG CCGGTAGTCC CGTTGACGGA
301 TTTAGCCTTT ACCGCATCCA TTGGGACGGA TACGAACACC ATCCCGCCGA
351 CGGCTATGAC GGGCCACAGG GCGGCGGCTA TCCCGCTCCC AAAGGCGCGA
401 GGGATATATA CAGCTACGAC ATAAAAGGCG TTGCCCAAAA TATCCGCCTC
451 AACCTGACCG ACAACCGCAG CACCGGACAA CGGCTTGCCG ACCGTTTCCA
501 CAATGCCGGT AGTATGCTGA CGCAAGGAGT AGGCGACGGA TTCAAACGCG
551 CCACCCGATA CAGCCCCGAG CTGGACAGAT CGGGCAATGC CGCCGAAGCC
601 TTCAACGGCA CTGCAGATAT CGTTAAAAAC ATCATCGGCG CGGCAGGAGA
651 AATTGTCGGC GCAGGCGATG CCGTGCAGGG CATAAGCGAA GGCTCAAACA
701 TTGCTGTCAT GCACGGCTTG GGTCTGCTTT CCACCGAAAA CAAGATGGCG
751 CGCATCAACG ATTTGGCAGA TATGGCGCAA CTCAAAGACT ATGCCGCAGC
801 AGCCATCCGC GATTGGGCAG TCCAAAACCC CAATGCCGCA CAAGGCATAG
851 AAGCCGTCAG CAATATCTTT ATGGCAGCCA TCCCCATCAA AGGGATTGGA
901 GCTGTTCGGG GAAAATACGG CTTGGGCGGC ATCACGGCAC ATCCTATCAA
951 GCGGTCGCAG ATGGGCGCGA TCGCATTGCC GAAAGGGAAA TCCGCCGTCA
1001 GCGACAATTT TGCCGATGCG GCATACGCCA AATACCCGTC CCCTTACCAT
1051 TCCCGAAATA TCCGTTCAAA CTTGGAGCAG CGTTACGGCA AAGAAAACAT
1101 CACCTCCTCA ACCGTGCCGC CGTCAAACGG CAAAAATGTC AAACTGGCAG
1151 ACCAACGCCA CCCGAAGACA GGCGTACCGT TTGACGGTAA AGGGTTTCCG
1201 AATTTTGAGA AGCACGTGAA ATATGATACG GGATCCGGAG GGGGTGGTGT
1251 CGCCGCCGAC ATCGGTGCGG GGCTTGCCGA TGCACTAACC GCACCGCTCG
1301 ACCATAAAGA CAAAGGTTTG CAGTCTTTGA CGCTGGATCA GTCCGTCAGG
1351 AAAAACGAGA AACTGAAGCT GGCGGCACAA GGTGCGGAAA AAACTTATGG
1401 AAACGGTGAC AGCCTCAATA CGGGCAAATT GAAGAACGAC AAGGTCAGCC
1451 GTTTCGACTT TATCCGCCAA ATCGAAGTGG ACGGGCAGCT CATTACCTTG
1501 GAGAGTGGAG AGTTCCAAGT ATACAAACAA AGCCATTCCG CCTTAACCGC
1551 CTTTCAGACC GAGCAAATAC AAGATTCGGA GCATTCCGGG AAGATGGTTG
1601 CGAAACGCCA GTTCAGAATC GGCGACATAG CGGGCGAACA TACATCTTTT
1651 GACAAGCTTC CCGAAGGCGG CAGGGCGACA TATCGCGGGA CGGCGTTCGG
1701 TTCAGACGAT GCCGGCGGAA AACTGACCTA CACCATAGAT TTCGCCGCCA
1751 AGCAGGGAAA CGGCAAAATC GAACATTTGA AATCGCCAGA ACTCAATGTC
1801 GACCTGGCCG CCGCCGATAT CAAGCCGGAT GGAAAACGCC ATGCCGTCAT
1851 CAGCGGTTCC GTCCTTTACA ACCAAGCCGA GAAAGGCAGT TACTCCCTCG
1901 GTATCTTTGG CGGAAAAGCC CAGGAAGTTG CCGGCAGCGC GGAAGTGAAA
1951 ACCGTAAACG GCATACGCCA TATCGGCCTT GCCGCCAAGC AACTCGAGCA
2001 CCACCACCAC CACCACTGA
1 MSDLANDSFI RQVLDRQHFE PDGKYHLFGS RGELAERSGH IGLGKIQSHQ
51 LGNLMIQQAA IKGNIGYIVR FSDHGHEVHS PFDNHASHSD SDEAGSPVDG
101 FSLYRIHWDG YEHHPADGYD GPQGGGYPAP KGARDIYSYD IKGVAQNIRL
151 NLTDNRSTGQ RLADRFHNAG SMLTQGVGDG FKRATRYSPE LDRSGMAAEA
201 FNGTADIVKN IIGAAGEIVG AGDAVQGISE GSNIAVMHGL GLLSTENKMA
251 RINDLADMAQ LKDYAAAAIR DWAVQNPNAA QGIEAVSNIF MAAIPIKGIG
301 AVRGKYGLGG ITAHPIKPSQ MGAIALPKGK SAVSDNFADA AYAKYPSPYH
351 SRNIRSNLEQ RYGKENITSS TVPPSNGKNV KLADQRHPKT GVPFDGKGFP
401 NFEKHVKYDT GSGGGGVAAD IGAGLADALT APLDHKDKGL QSLTLDQSVR
451 KNEKLKLAAQ GAEKTYGNGD SLNTGKLKND KVSRFDFIRQ IEVDGQLITL
501 ESGEFQVYKQ SHSALTAFQT EQIQDSEHSG KMVAKRQFRI GDIAGEHTSF
551 DKLPEGGRAT YRGTAFGSDD AGGKLTYTID FAAKQGNGKI EHLKSPELNV
601 DLAAADIKPD GKRHAVISGS VLYNQAEKGS YSLGIFGGKA QEVAGSAEVK
651 TVNGIRHIGL AAKQLEHHHH HH*
ORF46.1-961
1 ATGTCAGATT TGGCAAACGA TTCTTTTATC CGGCAGGTTC TCGACCGTCA
51 GCATTTCGAA CCCGACGGGA AATACCACCT ATTCGGCAGC AGGGGGGAAC
101 TTGCCGAGCG CAGCGGCCAT ATCGGATTGG GAAAAATACA AAGCCATCAG
151 TTGGGCAACC TGATGATTCA ACAGGCGGCC ATTAAAGGAA ATATCGGCTA
201 CATTGTCCGC TTTTCCGATC ACGGGCACGA AGTCCATTCC CCCTTCGACA
251 ACCATGCCTC ACATTCCGAT TCTGATGAAG CCGGTAGTCC CGTTGACGGA
301 TTTAGCCTTT ACCGCATCCA TTGGGACGGA TACGAACACC ATCCCGCCGA
351 CGGCTATGAC GGGCCACAGG GCGGCGGCTA TCCCGCTCCC AAAGGCGCGA
401 GGGATATATA CAGCTACGAC ATAAAAGGCG TTGCCCAAAA TATCCGCCTC
451 AACCTGACCG ACAACCGCAG CACCGGACAA CGGCTTGCCG ACCGTTTCCA
501 CAATGCCGGT AGTATGCTGA CGCAAGGAGT AGGCGACGGA TTCAAACGCG
551 CCACCCGATA CAGCCCCGAG CTGGACAGAT CGGGCAATGC CGCCGAAGCC
601 TTCAACGGCA CTGCAGATAT CGTTAAAAAC ATCATCGGCG CGGCAGGAGA
651 AATTGTCGGC GCAGGCGATG CCGTGCAGGG CATAAGCGAA GGCTCAAACA
701 TTGCTGTCAT GCACGGCTTG GGTCTGCTTT CCACCGAAAA CAAGATGGCG
751 CGCATCAACG ATTTGGCAGA TATGGCGCAA CTCAAAGACT ATGCCGCAGC
801 AGCCATCCGC GATTGGGCAG TCCAAAACCC CAATGCCGCA CAAGGCATAG
851 AAGCCGTCAG CAATATCTTT ATGGCAGCCA TCCCCATCAA AGGGATTGGA
901 GCTGTTCGGG GAAAATACGG CTTGGGCGGC ATCACGGCAC ATCCTATCAA
951 GCGGTCGCAG ATGGGCGCGA TCGCATTGCC GAAAGGGAAA TCCGCCGTCA
1001 GCGACAATTT TGCCGATGCG GCATACGCCA AATACCCGTC CCCTTACCAT
1051 TCCCGAAATA TCCGTTCAAA CTTGGAGCAG CGTTACGGCA AAGAAAACAT
1101 CACCTCCTCA ACCGTGCCGC CGTCAAACGG CAAAAATGTC AAACTGGCAG
1151 ACCAACGCCA CCCGAAGACA GGCGTACCGT TTGACGGTAA AGGGTTTCCG
1201 AATTTTGAGA AGCACGTGAA ATATGATACG GGATCCGGAG GAGGAGGAGC
1251 CACAAACGAC GACGATGTTA AAAAAGCTGC CACTGTGGCC ATTGCTGCTG
1301 CCTACAACAA TGGCCAAGAA ATCAACGGTT TCAAAGCTGG AGAGACCATC
1351 TACGACATTG ATGAAGACGG CACAATTACC AAAAAAGACG CAACTGCAGC
1401 CGATGTTGAA GCCGACGACT TTAAAGGTCT GGGTCTGAAA AAAGTCGTGA
1451 CTAACCTGAC CAAAACCGTC AATGAAAACA AACAAAACGT CGATGCCAAA
1501 GTAAAAGCTG CAGAATCTGA AATAGAAAAG TTAACAACCA AGTTAGCAGA
1551 CACTGATGCC GCTTTAGCAG ATACTGATGC CGCTCTGGAT GCAACCACCA
1601 ACGCCTTGAA TAAATTGGGA GAAAATATAA CGACATTTGC TGAAGAGACT
1651 AAGACAAATA TCGTAAAAAT TGATGAAAAA TTAGAAGCCG TGGCTGATAC
1701 CGTCGACAAG CATGCCGAAG CATTCAACGA TATCGCCGAT TCATTGGATG
1751 AAACCAACAC TAAGGCAGAC GAAGCCGTCA AAACCGCCAA TGAAGCCAAA
1801 CAGACGGCCG AAGAAACCAA ACAAAACGTC GATGCCAAAG TAAAAGCTGC
1851 AGAAACTGCA GCAGGCAAAG CCGAAGCTGC CGCTGGCACA GCTAATACTG
1901 CAGCCGACAA GGCCGAAGCT GTCGCTGCAA AAGTTACCGA CATCAAAGCT
1951 GATATCGCTA CGAACAAAGA TAATATTGCT AAAAAAGCAA ACAGTGCCGA
2001 CGTGTACACC AGAGAAGAGT CTGACAGCAA ATTTGTCAGA ATTGATGGTC
2051 TGAACGCTAC TACCGAAAAA TTGGACACAC GCTTGGCTTC TGCTGAAAAA
2101 TCCATTGCCG ATCACGATAC TCGCCTGAAC GGTTTGGATA AAACAGTGTC
2151 AGACCTGCGC AAAGAAACCC GCCAAGGCCT TGCAGAACAA GCCGCGCTCT
2201 CCGGTCTGTT CCAACCTTAC AACGTGGGTC GGTTCAATGT AACGGCTGCA
2251 GTCGGCGGCT ACAAATCCGA ATCGGCAGTC GCCATCGGTA CCGGCTTCCG
2301 CTTTACCGAA AACTTTGCCG CCAAAGCAGG CGTGGCAGTC GGCACTTCGT
2351 CCGGTTCTTC CGCAGCCTAC CATGTCGGCG TCAATTACGA GTGGCTCGAG
2401 CACCACCACC ACCACCACTG A
1 MSDLANDSFI RQVLDRQHFE PDGKYHLFGS RGELAERSGH IGLGKIQSHQ
51 LGNLMIQQAA IKGNIGYIVR FSDHGHEVHS PFDNHASHSD SDEAGSPVDG
101 FSLYRIHWDG YEHHPADGYD GPQGGGYPAP KGARDIYSYD IKGVAQNIRL
151 NLTDNRSTGQ RLADRFHNAG SMLTQGVGDG FKRATRYSPE LDRSGNAAEA
201 FNGTADIVKN IIGAAGEIVG AGDAVQGISE GSNIAVMHGL GLLSTENKMA
251 RINDLADMAQ LKDYAAAAIR DWAVQNPNAA QGIEAVSNIF MAAIPIKGIG
301 AVRGKYGLGG ITAHPIKRSQ MGAIALPKGK SAVSDNFADA AYAKYPSPYH
351 SRNIRSNLEQ RYGKENITSS TVPPSNGKNV KLADQRHPKT GVPFDGKGFP
401 NFEKHVKYDT GSGGGGATND DDVKKAATVA IAAAYNNGQE INGFKAGETI
451 YDIDEDGTTT KKDATAADVE ADDFKGLGLK KVVTNLTKTV NENKQNVDAK
501 VKAAESEIEK LTTKLADTDA ALADTDAALD ATTNALNKLG ENITTFAEET
551 KTNIVKIDEK LEAVADTVDK HAEAFNDIAD SLDETNTKAD EAVKTANEAK
601 QTAEETKQNV DAKVKAAETA AGKAEAAAGT ANTAADKAEA VAAKVTDIKA
651 DIATNKDNIA KKANSADVYT REESDSKFVR IDGLNATTEK LDTRLASAEK
701 SIADHDTRLN GLDKTVSDLR KETRQGLAEQ AALSGLFQPY NVGRFNVYAA
751 VGGYKSESAV AIGTGFRFTE NFAAKAGVAV GTSSGSSAAY HVGVNYEWLE
801 HHHHHH*
ORF46.1-961c
1 ATGTCAGATT TGGCAAACGA TTCTTTTATC CGGCAGGTTC TCGACCGTCA
51 GCATTTCGAA CCCGACGGGA AATACCACCT ATTCGGCAGC AGGGGGGAAC
101 TTGCCGAGCG CAGCGGCCAT ATCGGATTGG GAAAAATACA AAGCCATCAG
151 TTGGGCAACC TGATGATTCA ACAGGCGGCC ATTAAAGGAA ATATCGGCTA
201 CATTGTCCGC TTTTCCGATC ACGGGCACGA AGTCCATTCC CCCTTCGACA
251 ACCATGCCTC ACATTCCGAT TCTGATGAAG CCGGTAGTCC CGTTGACGGA
301 TTTAGCCTTT ACCGCATCCA TTGGGACGGA TACGAACACC ATCCCGCCGA
351 CGGCTATGAC GGGCCACAGG GCGGCGGCTA TCCCGCTCCC AAAGGCGCGA
401 GGGATATATA CAGCTACGAC ATAAAAGGCG TTGCCCAAAA TATCCGCCTC
451 AACCTGACCG ACAACCGCAG CACCGGACAA CGGCTTGCCG ACCGTTTCCA
501 CAATGCCGGT AGTATGCTGA CGCAAGGAGT AGGCGACGGA TTCAAACGCG
551 CCACCCGATA CAGCCCCGAG CTGGACAGAT CGGGCAATGC CGCCGAAGCC
601 TTCAACGGCA CTGCAGATAT CGTTAAAAAC ATCATCGGCG CGGCAGGAGA
651 AATTGTCGGC GCAGGCGATG CCGTGCAGGG CATAAGCGAA GGCTCAAACA
701 TTGCTGTCAT GCACGGCTTG GGTCTGCTTT CCACCGAAAA CAAGATGGCG
751 CGCATCAACG ATTTGGCAGA TATGGCGCAA CTCAAAGACT ATGCCGCAGC
801 AGCCATCCGC GATTGGGCAG TCCAAAACCC CAATGCCGCA CAAGGCATAG
851 AAGCCGTCAG CAATATCTTT ATGGCAGCCA TCCCCATCAA AGGGATTGGA
901 GCTGTTCGGG GAAAATACGG CTTGGGCGGC ATCACGGCAC ATCCTATCAA
951 GCGGTCGCAG ATGGGCGCGA TCGCATTGCC GAAAGGGAAA TCCGCCGTCA
1001 GCGACAATTT TGCCGATGCG GCATACGCCA AATACCCGTC CCCTTACCAT
1051 TCCCGAAATA TCCGTTCAAA CTTGGAGCAG CGTTACGGCA AAGAAAACAT
1101 CACCTCCTCA ACCGTGCCGC CGTCAAACGG CAAAAATGTC AAACTGGCAG
1151 ACCAACGCCA CCCGAAGACA GGCGTACCGT TTGACGGTAA AGGGTTTCCG
1201 AATTTTGAGA AGCACGTGAA ATATGATACG GGATCCGGAG GAGGAGGAGC
1251 CACAAACGAC GACGATGTTA AAAAAGCTGC CACTGTGGCC ATTGCTGCTG
1301 CCTACAACAA TGGCCAAGAA ATCAACGGTT TCAAAGCTGG AGAGACCATC
1351 TACGACATTG ATGAAGACGG CACAATTACC AAAAAAGACG CAACTGCAGC
1401 CGATGTTGAA GCCGACGACT TTAAAGGTCT GGGTCTGAAA AAAGTCGTGA
1451 CTAACCTGAC CAAAACCGTC AATGAAAACA AACAAAACGT CGATGCCAAA
1501 GTAAAAGCTG CAGAATCTGA AATAGAAAAG TTAACAACCA AGTTAGCAGA
1551 CACTGATGCC GCTTTAGCAG ATACTGATGC CGCTCTGGAT GCAACCACCA
1601 ACGCCTTGAA TAAATTGGGA GAAAATATAA CGACATTTGC TGAAGAGACT
1651 AAGACAAATA TCGTAAAAAT TGATGAAAAA TTAGAAGCCG TGGCTGATAC
1701 CGTCGACAAG CATGCCGAAG CATTCAACGA TATCGCCGAT TCATTGGATG
1751 AAACCAACAC TAAGGCAGAC GAAGCCGTCA AAACCGCCAA TGAAGCCAAA
1801 CAGACGGCCG AAGAAACCAA ACAAAACGTC GATGCCAAAG TAAAAGCTGC
1851 AGAAACTGCA GCAGGCAAAG CCGAAGCTGC CGCTGGCACA GCTAATACTG
1901 CAGCCGACAA GGCCGAAGCT GTCGCTGCAA AAGTTACCGA CATCAAAGCT
1951 GATATCGCTA CGAACAAAGA TAATATTGCT AAAAAAGCAA ACAGTGCCGA
2001 CGTGTACACC AGAGAAGAGT CTGACAGCAA ATTTGTCAGA ATTGATGFTC
2051 TGAACGCTAC TACCGAAAAA TTGGACACAC GCTTGGCTTC TGCTGAAAAA
2101 TCCATTGCCG ATCACGATAC TCGCCTGAAC GGTTTGGATA AAACAGTGTC
2151 AGACCTGCGC AAAGAAACCC GCCAAGGCCT TGCAGAACAA GCCGCGCTCT
2201 CCGGTCTGTT CCAACCTTAC AACGTGGGTC TCGAGCACCA CCACCACCAC
2251 CACTGA
1 MSDLANDSFI RQVLDRQHFE PDGKYHLFGS RGELAERSGH IGLGKIQSHQ
51 LGNLMIQQAA IKGNIGYIVR FSDHGHEVHS PFDNHASHSD SDEAGSPVDG
101 FSLYRIHWDG YEHHPADGYD GPQGGGYPAT KGARDIYSYD IKGVAQNIRL
151 NLTDNRSTGQ RLADRFHNAG SMLTQGVGDG FKRATRYSPE LDRSGNAAEA
201 FNGTADIVKN IIGAAGEIVG AGDAVQGISE GSNIAVMHGL GLLSTENKMA
251 RINDLADMAQ LKDYAAAAIR DWAVQNPNAA QGIEAVSNIF MAAIPIKGIG
301 AVRGKYGLGG ITAHPIKRSQ MGAIALPKGK SAVSDNFADA AYAKYPSPYH
351 SRNIRSNLEQ RYGKENITSS TVPPSNGKNV KLADQRHPKT GVPFDGKGFP
401 NFEKHVKYDT GSGGGGATND DDVKKAATVA IAAAYNNGQE INGFKAGETI
451 YDIDEDGTIT KKDATAADVE ADDFKGLGLK KVVTNLTKTV NENKQNVDAK
501 VKAAESEIEK LTTKLADTDA ALADTDAALD ATTNALNKLG ENITTFAEET
551 KTNIVKIDEK LEAVADTVDK HAEAFNDIAD SLDETNTKAD EAVKTANEAK
601 QTAEETKQNV DAKVKAAETA AGKAEAAAGT ANTAADKAEA VAAKVTDIKA
651 DIATNKDNIA KKANSADVYT REESDSKFVR IDGLNATTEK LDTRLASAEK
701 SIADHDTRLN GLDKTVSDLR KETRQGLAEQ AALSGLFQPY NVGLEHHHHH
751 H*
961-ORF46.1
1 ATGGCCACAA ACGACGACGA TGTTAAAAAA GCTGCCACTG TGGCCATTGC
51 TGCTGCCTAC AACAATGGCC AAGAAATCAA CGGTTTCAAA GCTGGAGAGA
101 CCATCTACGA CATTGATGAA GACGGCACAA TTACCAAAAA AGACGCAACT
151 GCAGCCGATG TTGAAGCCGA CGACTTTAAA GGTCTGGGTC TGAAAAAAGT
201 CGTGACTAAC CTGACCAAAA CCGTCAATGA AAACAAACAA AACGTCGATG
251 CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA TCTGAAATAG AAAAGTTAAC AACCAAGTTA
301 GCAGACACTG ATGCCGCTTT AGCAGATACT GATGCCGCTC TGGATGCAAC
351 CACCAACGCC TTGAATAAAT TGGGAGAAAA TATAACGACA TTTGCTGAAG
401 AGACTAAGAC AAATATCGTA AAAATTGATG AAAAATTAGA AGCCGTGGCT
451 GATACCGTCG ACAAGCATGC CGAAGCATTC AACGATATCG CCGATTCATT
501 GGATGAAACC AACACTAAGG CAGACGAAGC CGTCAAAACC GCCAATGAAG
551 CCAAACAGAC GGCCGAAGAA ACCAAACAAA ACGTCGATGC CAAAGTAAAA
601 GCTGCAGAAA CTGCAGCAGG CAAAGCCGAA GCTGCCGCTG GCACAGCTAA
651 TACTGCAGCC GACAAGGCCG AAGCTGTCGC TGCAAAAGTT ACCGACATCA
701 AAGCTGATAT CGCTACGAAC AAAGATAATA TTGCTAAAAA AGCAAACAGT
751 GCCGACGTGT ACACCAGAGA AGAGTCTGAC AGCAAATTTG TCAGAATTGA
801 TGGTCTGAAC GCTACTACCG AAAAATTGGA CACACGCTTG GCTTCTGCTG
851 AAAAATCCAT TGCCGATCAC GATACTCGCC TGAACGGTTT GGATAAAACA
901 GTGTCAGACC TGCGCAAAGA AACCCGCCAA GGCCTTGCAG AACAAGCCGC
951 GCTCTCCGGT CTGTTCCAAC CTTACAACGT GGGTCGGTTC AATGTAACGG
1001 CTGCAGTCGG CGGCTACAAA TCCGAATCGG CAGTCGCCAT CGGTACCGGC
1051 TTCCGCTTTA CCGAAAACTT TGCCGCCAAA GCAGGCGTGG CAGTCGGCAC
1101 TTCGTCCGGT TCTTCCGCAG CCTACCATGT CGGCGTCAAT TACGAGTGGG
1151 GATCCGGAGG AGGAGGATCA GATTTGGCAA ACGATTCTTT TATCCGGCAG
1201 GTTCTCGACC GTCAGCATTT CGAACCCGAC GGGAAATACC ACCTATTCGG
1251 CAGCAGGGGG GAACTTGCCG AGCGCAGCGG CCATATCGGA TTGGGAAAAA
1301 TACAAAGCCA TCAGTTGGGC AACCTGATGA TTCAACAGGC GGCCATTAAA
1351 GGAAATATCG GCTACATTGT CCGCTTTTCC GATCACGGGC ACGAAGTCCA
1401 TTCCCCCTTC GACAACCATG CCTCACATTC CGATTCTGAT GAAGCCGGTA
1451 GTCCCGTTGA CGGATTTAGC CTTTACCGCA TCCATTGGGA CGGATACGAA
1501 CACCATCCCG CCGACGGCTA TGACGGGCCA CAGGGCGGCG GCTATCCCGC
1551 TCCCAAAGGC GCGAGGGATA TATACAGCTA CGACATAAAA GGCGTTGCCC
1601 AAAATATCCG CCTCAACCTG ACCGACAACC GCAGCACCGG ACAACGGCTT
1651 GCCGACCGTT TCCACAATGC CGGTAGTATG CTGACGCAAG GAGTAGGCGA
1701 CGGATTCAAA CGCGCCACCC GATACAGCCC CGAGCTGGAC AGATCGGGCA
1751 ATGCCGCCGA AGCCTTCAAC GGCACTGCAG ATATCGTTAA AAACATCATC
1801 GGCGCGGCAG GAGAAATTGT CGGCGCAGGC GATGCCGTGC AGGGCATAAG
1851 CGAAGGCTCA AACATTGCTG TCATGCACGG CTTGGGTCTG CTTTCCACCG
1901 AAAACAAGAT GGCGCGCATC AACGATTTGG CAGATATGGC GCAACTCAAA
1951 GACTATGCCG CAGCAGCCAT CCGCGATTGG GCAGTCCAAA ACCCCAATGC
2001 CGCACAAGGC ATAGAAGCCG TCAGCAATAT CTTTATGGCA GCCATCCCCA
2051 TCAAAGGGAT TGGAGCTGTT CGGGGAAAAT ACGGCTTGGG CGGCATCACG
2101 GCACATCCTA TCAAGCGGTC GCAGATGGGC GCGATCGCAT TGCCGAAAGG
2151 GAAATCCGCC GTCAGCGACA ATTTTGCCGA TGCGGCATAC GCCAAATACC
2201 CGTCCCCTTA CCATTCCCGA AATATCCGTT CAAACTTGGA GCAGCGTTAC
2251 GGCAAAGAAA ACATCACCTC CTCAACCGTG CCGCCGTCAA ACGGCAAAAA
2301 TGTCAAACTG GCAGACCAAC GCCACCCGAA GACAGGCGTA CCGTTTGACG
2351 GTAAAGGGTT TCCGAATTTT GAGAAGCACG TGAAATATGA TGCGCTCGAG
2401 CACCACCACC ACCACCACTG A
1 MATNDDDVKK AATVAIAAAY NNGQEINGFK AGETIYDIDE DGTITKKDAT
51 AADVEADDFK GLGLKKVVTN LTKTVNENKQ NVDAKVKAAE SEIEKLTTKL
101 ADTDAALADT DAALDATTNA LNKLGENITT FAEETKTNIV KIDEKLEAVA
151 DTVDKHAEAF NDIADSLDET NTKADEAVKT ANEAKQTAEE TKQNVDAKVK
201 AAETAAGKAE AAAGTANTAA DKAEAVAAKV TDIKADIATN KDNIAKKANS
251 ADVYTREESD SKFVRIDGLN ATTEKLDTRL ASAEKSIADH DTRLNGLDKT
301 VSDLRKETRQ GLAEQAALSG LFQPYNVGRF NVTAAVGGYK SESAVAIGTG
351 FRFTENFAAK AGVAVGTSSG SSAAYHVGVN YEWGSGGGGS DLANDSFIRQ
401 VLDRQHFEPD GKYHLFGSRG ELAERSGHIG LGKIQSHQLG NLMIQQAAIK
451 GNIGYIVRFS DHGHEVHSPF DNHASHSDSD EAGSPVDGFS LYRIHWDGYE
501 HHPADGYDGP QGGGYPAPKG ARDIYSYDIK GVAQNIRLNL TDNRSTGQRL
551 ADRFHNAGSM LTQGVGDGFK RATRYSPELD RSGNAAEAFN GTADIVKNII
601 GAAGEIVGAG DAVQGISEGS NIAVMHGLGL LSTENKMARI NDLADMAQLK
651 DYAAAAIRDW AVQNPNAAQG IEAVSNIFMA AIPIKGIGAV RGKYGLGGIT
701 AHPIKRSQMG AIALPKGKSA VSDNFADAAY AKYPSPYHSR NIRSNLEQRY
751 GKENITSSTV PPSNGKNVKL ADQRHPKTGV PFDGKGFPNF EKHVKYDTLE
801 HHHHHH*
961-741
1 ATGGCCACAA ACGACGACGA TGTTAAAAAA GCTGCCACTG TGGCCATTGC
51 TGCTGCCTAC AACAATGGCC AAGAAATCAA CGGTTTCAAA GCTGGAGAGA
101 CCATCTACGA CATTGATGAA GACGGCACAA TTACCAAAAA AGACGCAACT
151 GCAGCCGATG TTGAAGCCGA CGACTTTAAA GGTCTGGGTC TGAAAAAAGT
201 CGTGACTAAC CTGACCAAAA CCGTCAATGA AAACAAACAA AACGTCGATG
251 CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA TCTGAAATAG AAAAGTTAAC AACCAAGTTA
301 GCAGACACTG ATGCCGCTTT AGCAGATACT GATGCCGCTC TGGATGCAAC
351 CACCAACGCC TTGAATAAAT TGGGAGAAAA TATAACGACA TTTGCTGAAG
401 AGACTAAGAC AAATATCGTA AAAATTGATG AAAAATTAGA AGCCGTGGCT
451 GATACCGTCG ACAAGCATGC CGAAGCATTC AACGATATCG CCGATTCATT
501 GGATGAAACC AACACTAAGG CAGACGAAGC CGTCAAAACC GCCAATGAAG
551 CCAAACAGAC GGCCGAAGAA ACCAAACAAA ACGTCGATGC CAAAGTAAAA
601 GCTGCAGAAA CTGCAGCAGG CAAAGCCGAA GCTGCCGCTG GCACAGCTAA
651 TACTGCAGCC GACAAGGCCG AAGCTGTCGC TGCAAAAGTT ACCGACATCA
701 AAGCTGATAT CGCTACGAAC AAAGATAATA TTGCTAAAAA AGCAAACAGT
751 GCCGACGTGT ACACCAGAGA AGAGTCTGAC AGCAAATTTG TCAGAATTGA
801 TGGTCTGAAC GCTACTACCG AAAAATTGGA CACACGCTTG GCTTCTGCTG
851 AAAAATCCAT TGCCGATCAC GATACTCGCC TGAACGGTTT GGATAAAACA
901 GTGTCAGACC TGCGCAAAGA AACCCGCCAA GGCCTTGCAG AACAAGCCGC
951 GCTCTCCGGT CTGTTCCAAC CTTACAACGT GGGTCGGTTC AATGTAACGG
1001 CTGCAGTCGG CGGCTACAAA TCCGAATCGG CAGTCGCCAT CGGTACCGGC
1051 TTCCGCTTTA CCGAAAACTT TGCCGCCAAA GCAGGCGTGG CAGTCGGCAC
1101 TTCGTCCGGT TCTTCCGCAG CCTACCATGT CGGCGTCAAT TACGAGTGGG
1151 GATCCGGAGG GGGTGGTGTC GCCGCCGACA TCGGTGCGGG GCTTGCCGAT
1201 GCACTAACCG CACCGCTCGA CCATAAAGAC AAAGGTTTGC AGTCTTTGAC
1251 GCTGGATCAG TCCGTCAGGA AAAACGAGAA ACTGAAGCTG GCGGCACAAG
1301 GTGCGGAAAA AACTTATGGA AACGGTGACA GCCTCAATAC GGGCAAATTG
1351 AAGAACGACA AGGTCAGCCG TTTCGACTTT ATCCGCCAAA TCGAAGTGGA
1401 CGGGCAGCTC ATTACCTTGG AGAGTGGAGA GTTCCAAGTA TACAAACAAA
1451 GCCATTCCGC CTTAACCGCC TTTCAGACCG AGCAAATACA AGATTCGGAG
1501 CATTCCGGGA AGATGGTTGC GAAACGCCAG TTCAGAATCG GCGACATAGC
1551 GGGCGAACAT ACATCTTTTG ACAAGCTTCC CGAAGGCGGC AGGGCGACAT
1601 ATCGCGGGAC GGCGTTCGGT TCAGACGATG CCGGCGGAAA ACTGACCTAC
1651 ACCATAGATT TCGCCGCCAA GCAGGGAAAC GGCAAAATCG AACATTTGAA
1701 ATCGCCAGAA CTCAATGTCG ACCTGGCCGC CGCCGATATC AAGCCGGATG
1751 GAAAACGCCA TGCCGTCATC AGCGGTTCCG TCCTTTACAA CCAAGCCGAG
1801 AAAGGCAGTT ACTCCCTCGG TATCTTTGGC GGAAAAGCCC AGGAAGTTGC
1851 CGGCAGCGCG GAAGTGAAAA CCGTAAACGG CATACGCCAT ATCGGCCTTG
1901 CCGCCAAGCA ACTCGAGCAC CACCACCACC ACCACTGA
1 MATNDDDVKK AATVAIAAAY NNGQEINGFK AGETIYDIDE DGTITKKDAT
51 AADVEADDFK GLGLKKVVTN LTKTVNENKQ NVDAKVKAAE SEIEKLTTKL
101 ADTDAALADT DAALDATTNA LNKLGENITT FAEETKTNIV KIDEKLEAVA
151 DTVDKHAEAF NDIADSLDET NTKADEAVKT ANEAKQTAEE TKQNVDAKVK
201 AAETAAGKAE AAAGTANTAA DKAEAVAAKV TDIKADIATN KDNIAKKANS
251 ADVYTREESD SKFVRIDGLN ATTEKLDTRL ASAEKSIADH DTRLNGLDKT
301 VSDLRKETRQ GLAEQAALSG LFQPYNVGRF NVTAAVGGYK SESAVAIGTG
351 FRFTENFAAK AGVAVGTSSG SSAAYHVGVN YEWGSGGGGV AADIGAGLAD
401 ALTAPLDHKD KGLQSLTLDQ SVRKNEKLKL AAQGAEKTYG NGDSLNTGKL
451 KNDKVSRFDF IRQIEVDGQL ITLESGEFQV YKQSHSALTA FQTEQIQDSE
501 HSGKMVAKRQ FRIGDIAGEH TSFDKLPEGG RATYRGTAFG SDDAGGKLTY
551 TIDFAAKQGN GKIEHLKSPE LNVDLAAADI KPDGKRHAVI SGSVLYNQAE
601 KGSYSLGIFG GKAQEVAGSA EVKTVNGIRH IGLAAKQLEH HHHHH*
961-983
1 ATGGCCACAA ACGACGACGA TGTTAAAAAA GCTGCCACTG TGGCCATTGC
51 TGCTGCCTAC AACAATGGCC AAGAAATCAA CGGTTTCAAA GCTGGAGAGA
101 CCATCTACGA CATTGATGAA GACGGCACAA TTACCAAAAA AGACGCAACT
151 GCAGCCGATG TTGAAGCCGA CGACTTTAAA GGTCTGGGTC TGAAAAAAGT
201 CGTGACTAAC CTGACCAAAA CCGTCAATGA AAACAAACAA AACGTCGATG
251 CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA TCTGAAATAG AAAAGTTAAC AACCAAGTTA
301 GCAGACACTG ATGCCGCTTT AGCAGATACT GATGCCGCTC TGGATGCAAC
351 CACCAACGCC TTGAATAAAT TGGGAGAAAA TATAACGACA TTTGCTGAAG
401 AGACTAAGAC AAATATCGTA AAAATTGATG AAAAATTAGA AGCCGTGGCT
451 GATACCGTCG ACAAGCATGC CGAAGCATTC AACGATATCG CCGATTCATT
501 GGATGAAACC AACACTAAGG CAGACGAAGC CGTCAAAACC GCCAATGAAG
551 CCAAACAGAC GGCCGGAAGA ACCAAACAAA ACGTCGATGC CAAAGTAAAA
601 GCTGCAGAAA CTGCAGCAGG CAAAGCCGAA GCTGCCGCTG GCACAGCTAA
651 TACTGCAGCC GACAAGGCCG AAGCTGTCGC TGCAAAAGTT ACCGACATCA
701 AAGCTGATAT CGCTACGAAC AAAGATAATA TTGCTAAAAA AGCAAACAGT
751 GCCGACGTGT ACACCAGAGA AGAGTCTGAC AGCAAATTTG TCAGAATTGA
801 TGGTCTGAAC GCTACTACCG AAAAATTGGA CACACGCTTG GCTTCTGCTG
851 AAAAATCCAT TGCCGATCAC GATACTCGCC TGAACQQTTT GGATAAAACA
901 GTGTCAGACC TGCGCAAAGA AACCCGCCAA GGCCTTGCAG AACAAGCCGC
951 GCTCTCCGGT CTGTTCCAAC CTTACAACGT GGGTCGGTTC AATGTAACGG
1001 CTGCAGTCGG CGGCTACAAA TCCQAATCGG CAGTCGCCAT CGGTACCGGC
1051 TTCCGCTTTA CCGAAAACTT TGCCGCAAAA GCAGGCGTGG CAGTCGGCAC
1101 TTCGTCCGGT TCTTCCQCAG CCTACCATGT CGGCGTCAAT TACGAGTGGG
1151 GATCCGGCGG AGGCGGCACT TCTGCGCCCG ACTTCAATGC AGGCGGTACC
1201 GGTATCGGCA GCAACAGCAG AGCAACAACA GCGAAATCAG CAGCAGTATC
1251 TTACGCCGGT ATCAAGAACG AAATGTGCAA AGACAGAAGC ATGCTCTGTG
1301 CCGGTCGGGA TGACGTTGCG GTTACAGACA GGGATGCCAA AATCAATGCC
1351 CCCCCCCCGA ATCTGCATAC CGGAGACTTT CCAAACCCAA ATGACGCATA
1401 CAAGAATTTG ATCAACCTCA AACCTGCAAT TGAAGCAGGC TATACAGGAC
1451 GCGGGGTAGA GGTAGGTATC GTCGACACAG GCGAATCCGT CGGCAGCATA
1501 TCCTTTCCCG AACTGTATGG CAGAAAAGAA CACGGCTATA ACGAAAATTA
1551 CAAAAACTAT ACGGCGTATA TGCGGAAGGA AGCGCCTGAA GACGGAGGCG
1601 GTAAAGACAT TGAAGCTTCT TTCGACGATG AGGCCGTTAT AGAGACTGAA
1651 GCAAAGCCGA CGGATATCCG CCACGTAAAA GAAATCGGAC ACATCGATTT
1701 GGTCTCCCAT ATTATTGGCG GGCGTTCCGT GGACGGCAGA CCTGCAGGCG
1751 GTATTGCGCC CGATGCGACG CTACACATAA TGAATACGAA TGATGAAACC
1801 AAGAACGAAA TGATGGTTGC AGCCATCCGC AATGCATGGG TCAAGCTGGG
1851 CGAACGTGGC GTGCGCATCG TCAATAACAG TTTTGGAACA ACATCGAGGG
1901 CAGGCACTGC CGACCTTTTC CAAATAGCCA ATTCGGAGGA GCAGTACCGC
1951 CAAGCGTTGC TCGACTATTC CGGCGGTGAT AAAACAGACG AGGGTATCCG
2001 CCTGATGCAA CAGAGCGATT ACGGCAACCT GTCCTACCAC ATCCGTAATA
2051 AAAACATGCT TTTCATCTTT TCGACAGGCA ATGACGCACA AGCTCAGCCC
2101 AACACATATG CCCTATTGCC ATTTTATGAA AAAGACGCTC AAAAAGGCAT
2151 TATCACAGTC GCAGGCGTAG ACCGCAGTGG AGAAAAGTTC AAACGGGAAA
2201 TGTATGGAGA ACCGGGTACA GAACCGCTTG AGTATGGCTC CAACCATTGC
2251 GGAATTACTG CCATGTGGTG CCTGTCGGCA CCCTATGAAG CAAGCGTCCG
2301 TTTCACCCGT ACAAACCCGA TTCAAATTGC CGGAACATCC TTTTCCGCAC
2351 CCATCGTAAC CGGCACGGCG GCTCTGCTGC TGCAGAAATA CCCGTGGATG
2401 AGCAACGACA ACCTGCGTAC CACGTTGCTG ACGACGGCTC AGGACATCGG
2451 TGCAGTCGGC GTGGACAGCA AGTTCGGCTG GGGACTGCTG GATGCGGGTA
2501 AGGCGATGAA CGGACCCGCG TCCTTTCCGT TCGGCGACTT TACCGCCGAT
2551 ACGAAAGGTA CATCCGATAT TGCCTACTCC TTCCGTAACG ACATTTCAGG
2601 CACGGGCGGC CTGATCAAAA AAGGCGGCAG CCAACTGCAA CTGCACGGCA
2651 ACAACACCTA TACGGGCAAA ACCATTATCG AAGGCGGTTC GCTGGTGTTG
2701 TACGGCAACA ACAAATCGGA TATGCGCGTC GAAACCAAAG GTGCGCTGAT
2751 TTATAACGGG GCGGCATCCG GCGGCAGCCT GAACAGCGAC GGCATTGTCT
2801 ATCTGGCAGA TACCGACCAA TCCGGCGCAA ACGAAACCGT ACACATCAAA
2851 GGCAGTCTGC AGCTGGACGG CAAAGGTACG CTGTACACAC GTTTGGGCAA
2901 ACTGCTGAAA GTGGACGGTA CGGCGATTAT CGGCGGCAAG CTGTACATGT
2951 CGGCACGCGG CAAGGGGGCA GGCTATCTCA ACAGTACCGG ACGACGTGTT
3001 CCCTTCCTGA GTGCCGCCAA AATCGGGCAG GATTATTCTT TCTTCACAAA
3051 CATCGAAACC GACGGCGGCC TGCTGGCTTC CCTCGACAGC GTCGGAAAAA
3101 CAGCGGGCAG TGAAGGCGAC ACGCTGTCCT ATTATGTCCG TCGCGGCAAT
3151 GCGGCACGGA CTGCTTCGGC AGCGGCACAT TCCGCGCQCG CCGGTCTGAA
3201 ACACGCCGTA GAACAGGGCG GCAGCAATCT GGAAAACCTG ATGGTCGAAC
3251 TGGATGCCTC CGAATCATCC GCAACACCCG AGACGGTTGA AACTGCGGCA
3301 GCCGACCGCA CAGATATGCC GGGCATCCGC CCCTACGGCG CAACTTTCCG
3351 CGCAGCGGCA GCCGTACAGC ATGCGAATGC CGCCGACGGT GTACGCATCT
3401 TCAACAGTCT CGCCGCTACC GTCTATGCCG ACAGTACCGC CGCCCATGCC
3451 GATATGCAGG GACGCCGCCT GAAAGCCGTA TCGGACGGGT TGGACCACAA
3501 CGGCACGGGT CTGCGCGTCA TCGCGCAAAC CCAACAGGAC GGTGGAACGT
3551 GGGAACAGGG CGGTGTTGAA GGCAAAATGC GCGGCAGTAC CCAAACCGTC
3601 GGCATTGCCG CGAAAACCGG CGAAAATACG ACAGCAGCCG CCACACTGGG
3651 CATGGGACGC AGCACATGGA GCGAAAACAG TGCAAATGCA AAAACCGACA
3701 GCATTAGTCT GTTTGCAGGC ATACGGCACG ATGCGGGCGA TATCGGCTAT
3751 CTCAAAGGCC TGTTCTCCTA CGGACGCTAC AAAAACAGCA TCAGCCGCAG
3801 CACCGGTGCG GACGAACATG CGGAAGGCAG CGTCAACGGC ACGCTGATGC
3851 AGCTGGGCGC ACTGGGCGGT GTCAACGTTC CGTTTGCCGC AACGGGAGAT
3901 TTGACGGTCG AAGGCGTTCT GCGCTACGAC CTGCTCAAAC AGGATGCATT
3951 CGCCGAAAAA GGCAGTGCTT TGGGCTGGAG CGGCAACAGC CTCACTGAAG
4001 GCACGCTGGT CGGACTCGCG GGTCTGAAGC TGTCGCAACC CTTGAGCGAT
4051 AAAGCCGTCC TGTTTGCAAC GGCGGGCGTG GAACGCGACC TGAACGGACG
4101 CGACTACACG GTAACGGGCG GCTTTACCGG CGCGACTGCA GCAACCGGCA
4151 AGACGGGGGC ACGCAATATG CCGCACACCC GTCTGGTTGC CGGCCTGGGC
4201 GCGGATGTCG AATTCGGCAA CGGCTGGAAC GGCTTGGCAC GTTACAGCTA
4251 CGCCGGTTCC AAACAGTACG GCAACCACAG CGGACGAGTC GGCGTAGGCT
4301 ACCGGTTCCT CGAGCACCAC CACCACCACC ACTGA
1 MATNDDDVKK AATVAIAAAY NNGQEINGFK AGETIYDIDE DGTITKKDAT
51 AADVEADDFK GLGLKKVVTN LTKTVNENKQ NVDAKVKAAE SEIKKLTTKL
101 ADTDAALADT DAALDATTNA LNKLGENITT FAEETKTNIV KIDEKLEAVA
151 DTVDKHAEAF NDIADSLDET NTKADEAVKT ANEAKQTAEE TKQNVDAKVK
201 AAETAAGKAE AAAGTANTAA DKAEAVAAKV TDIKADIATN KDNIAKKANS
251 ADVYTREESD SKFVRIDGLN ATTEKLDTRL ASAEKSIADH DTRLNGLDKT
301 VSDLRKETRQ GLAEQAALSG LFQPYNVGRF NVTAAVGGYK SESAVAIGTG
351 FRFTENFAAK AGVAVGTSSG SSAAYHVGVN YEWGSGGGGT SAPDFNAGGT
401 GIGSNSRATT AKSAAVSYAG IKNEMCKDRS MLCAGRDDVA VTDRDAKINA
451 PPPNLHTGDF PNPMDAYKNL INLKPAIEAG YTGRGVEVGI VDTGESVGSI
501 SFPELYGRKE HGYNENYKNY TAYMRKEAPE DGGGKDIEAS FDDEAVIETE
551 AKPTDIRHVK EIGHIDLVSH IIGGRSVDGR PAGGIAPDAT LHIMNTNDET
601 KNEMMVAAIR NAWVKLGERG VRIVNNSFGT TSRAGTADLF QIANSEEQYR
651 QALLDYSGGD KTDEGIRLMQ QSDYGNLSYH IRNKNMLFIF STGNDAQAQP
701 NTYALLPFYE KDAQKGIITV AGVDRSGEKF KREMYGEPGT EPLEYGSNHC
751 GITAMWCLSA PYEASVRFTR TNPIQIAGTS FSAPIVTGTA ALLLQKYPWM
801 SNDNLRTTLL TTAQDIGAVG VDSKFGWGLL DAGKAMNGPA SFPFGDFTAD
851 TKGTSDIAYS FRNDISGTGG LIKKGGSQLQ LHGNNTYTGK TIIEGGSLVL
901 YGNNKSDMRV ETKGALIYNG AASGGSLNSD GIVYLADTDQ SGANETVHIK
951 GSLQLDGKGT LYTRLGKLLK VDGTAIIGGK LYMSARGKGA GYLNSTGRRV
1001 PFLSAAKIGQ DYSFFTNIET DGGLLASLDS VEKTAGSEGD TLSYYVRRGN
1051 AARTASAAAH SAPAGLKHAV EQGGSNLENL MVELDASESS ATPETVETAA
1101 ADRTDMPGIR PYGATFRAAA AVQHANAADG VRIFNSLAAT VYADSTAAHA
1151 DMQGRRLKAV SDGLDHNGTG LRVIAQTQQD GGTWEQGGVE GKMRGSTQTV
1201 GIAAKTGENT TAAATLGMGR STWSENSANA KTDSISLFAG IRHDAGDIGY
1251 LKGLFSYGRY KNSISRSTGA DEHAEGSVNG TLMQLGALGG VNVPFAATGD
1301 LTVEGGLRYD LLKQDAFAEK GSALGWSGNS LTEGTLVGLA GLKLSQPLSD
1351 KAVLFATAGV ERDLNGRDYT VTGGFTGATA ATGKTGARNM PHTRLVAGLG
1401 ADVEFGNGWN GLARYSYAGS KQYGNHSGRV GVGYRFLEHH HHHH*
961c-ORF46.1
1 ATGGCCACAA ACGACCACGA TGTTAAAAAA GCTGCCACTG TGGCCATTGC
51 TGCTGCCTAC AACAATGGCC AAGAAATCAA CGGTTTCAAA GCTGGAGAGA
101 CCATCTACGA CATTGATGAA GACGGCACAA TTACCAAAAA AGACGCAACT
151 GCAGCCGATG TTGAAGCCGA CGACTTTAAA GGTCTGGGTC TGAAAAAAGT
201 CGTGACTAAC CTGACCAAAA CCGTCAATGA AAACAAACAA AACGTCGATG
251 CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA TCTGAAATAG AAAAGTTAAC AACCAAGTTA
301 GCAGACACTG ATGCCGCTTT AGCAGATACT GATGCCGCTC TGGATGCAAC
351 CACCAACGCC TTGAATAAAT TGGGAGAAAA TATAACGACA TTTGCTGAAG
401 AGACTAAGAC AAATATCGTA AAAATTGATG AAAAATTAGA AGCCGTGGCT
451 GATACCGTCG ACAAGCATGC CGAAGCATTC AACGATATCG CCGATTCATT
501 GGATGAAACC AACACTAAGG CAGACGAAGC CGTCAAAACC GCCAATGAAG
551 CCAAACAGAC GGCCGAAGAA ACCAAACAAA ACGTCGATGC CAAAGTAAAA
601 GCTGCAGAAA CTGCAGCAGG CAAAGCCGAA GCTGCCGCTG GCACAGCTAA
651 TACTGCAGCC GACAAGGCCG AAGCTGTCGC TGCAAAAGTT ACCGACATCA
701 AAGCTGATAT CGCTACGAAC AAAGATAATA TTGCTAAAAA AGCAAACAGT
751 GCCGACGTGT ACACCAGAGA AGAGTCTGAC AGCAAATTTG TCAGAATTGA
801 TGGTCTGAAC GCTACTACCG AAAAAATGGA CACACGCTTG GCTTCTGCTG
851 AAAAATCCAT TGCCGATCAC GATACTCGCC TGAACGGTTT GGATAAAACA
901 GTGTCAGACC TGCGCAAAGA AACCCGCCAA GGCCTTGCAG AACAAGCCGC
951 GCTCTCCGGT CTGTTCCAAC CTTACAACGT GGGTGGATCC GGAGGAGGAG
1001 GATCAGATTT GGCAAACGAT TCTTTTATCC GGCAGGTTCT CGACCGTCAG
1051 CATTTCGAAC CCGACGGGAA ATACCACCTA TTCGGCAGCA GGGGGGAACT
1101 TGCCGAGCGC AGCGGCCATA TCGGATTGGG AAAAATACAA AGCCATCAGT
1151 TGGGCAACCT GATGATTCAA CAGGCGGCCA TTAAAGGAAA TATCGGCTAC
1201 ATTGTCCGCT TTTCCGATCA CGGGCACGAA GTCCATTCCC CCTTCGACAA
1251 CCATGCCTCA CATTCCGATT CTGATGAAGC CGCTAGTCCC GTTGACGGAT
1301 TTAGCCTTTA CCGCATCCAT TGGGACGGAT ACGAACACCA TCCCGCCGAC
1351 GGCTATGACG GGCCACAGGG CGGCGGCTAT CCCGCTCCCA AAGGCGCGAG
1401 GGATATATAC AGCTACGACA TAAAAGGCGT TGCCCAAAAT ATCCGCCTCA
1451 ACCTGACCGA CAACCGCAGC ACCGGACAAC GGCTTGCCGA CCGTTTCCAC
1501 AATGCCGGTA GTATGCTGAC GCAAGGAGTA GGCGACGGAT TCAAACGCGC
1551 CACCCGATAC AGCCCCGAGC TGGACAGATC GGGCAATGCC GCCGAAGCCT
1601 TCAACGGCAC TGCAGATATC GTTAAAAACA TCATCGGCGC GGCAGGAGAA
1651 ATTGTCGGCG CAGGCGATGC CGTGCAGGGC ATAAGCGAAG GCTCAAACAT
1701 TGCTGTCATG CACGGCTTGG GTCTGCTTTC CACCGAAAAC AAGATGGCGC
1751 GCATCAACGA TTTGGCAGAT ATGGCGCAAC TCAAAGACTA TGCCGCAGCA
1801 GCCATCCGCG ATTGGGCAGT CCAAAACCCC AATGCCGCAC AAGGCATAGA
1851 AGCCGTCAGC AATATCTTTA TGGCAGCCAT CCCCATCAAA GGGATTGGAG
1901 CTGTTCGGGG AAAATACGGC TTGGGCGGCA TCACGGCACA TCCTATCAAG
1951 CGGTCGCAGA TGGGCGCGAT CGCATTGCCG AAAGGGAAAT CCGCCGTCAG
2001 CGACAATTTT GCCGATGCGG CATACGCCAA ATACCCGTCC CCTTACCATT
2051 CCCGAAATAT CCGTTCAAAC TTGGAGCAGC GTTACGGCAA AGAAAACATC
2101 ACCTCCTCAA CCGTGCCGCC GTCAAACGGC AAAAATGTCA AACTGGCAGA
2151 CCAACGCCAC CCGAAGACAG GCGTACCGTT TGACGGTAAA GGGTTTCCGA
2201 ATTTTGAGAA GCACGTGAAA TATGATACGC TCGAGCACCA CCACCACCAC
2251 CACTGA
1 MATNGGGVKK AATVAIAAAY NNGQEINGFK AGETIYDIDE DGTITKKDAT
51 AADVEADDFK GLGLKKVVTN LTKTVNENKQ NVDAKVKAAE SEIEELTTKL
101 ADTDAALADT DAALDATTNA LNKLGENITT FAEETKTNIV KIDEKLEAVA
151 DTVDKHAEAF NDIADSLDET NTKADEAVKT ANEAKQTAEE TKQNVDAKVK
201 AAETAAGKAE AAAGTANTAA DKAEAVAAKV TDIKADIATN KDNIAKKANS
251 ADVYTREESD SKFVRIDGLN ATTEKLDTRL ASAEKSIADH DTRLNGLDKT
301 VSDLRKETRQ GLAEQAALSG LFQPYNVGGS GGGGSDLAAN SFIRQVLDRQ
351 HFEPDGKYHL FGSRGELAER SGHIGLGKIQ SHQLGNLMIQ QAAIKGNIGY
401 IVRFSDHGHE VHSPFDNHAS HSDSDEAGSP VDGFSLYRIH WDGYEHHPAD
451 GYDGPQGGGY PAPKGARDIY SYDIKGVAQN IRLNLTDNRS TGQRLADRFH
501 NAGSMLTQGV GDGFKRATRY SPELDRSGNA AEAFNGTADI VKNIIGAAGE
551 IVGAGDAVQG ISEGSNIAVM HGLGLLSTEN KMARINDLAD MAQLKDYAAA
601 AIRDWAVQNP NAAQGIEAVS NIFMAAIPIK GIGAVRGKYG LGGITAHPIK
651 RSQMGAIALP KGKSAVSDNF ADAAYAKYPS PYHSRNIRSN LEQRYGKENI
701 TSSTVPPSNG KNVKLADQRH PKTGVPFDGK GFPNFEKHVK YDTLEHHHHH
751 H*
961c-741
1 ATGGCCACAA ACGACGACGA TGTTAAAAAA GCTGCCACTG TGGCCATTGC
51 TGCTGCCTAC AACAATGGCC AAGAAATCAA CGGTTTCAAA GCTGGAGAGA
101 CCATCTACGA CATTGATGAA GACGGCACAA TTACCAAAAA AGACGCAACT
151 GCAGCCGATG TTGAAGCCGA CGACTTTAAA GGTCTGGGTC TGAAAAAAGT
201 CGTGACTAAC CTGACCAAAA CCGTCAATGA AAACAAACAA AACGTCGATG
251 CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA TCTGAAATAG AAAAGTTAAC AACCAAGTTA
301 GCAGACACTG ATGCCGCTTT AGCAGATACT GATGCCGCTC TGGATGCAAC
351 CACCAACGCC TTGAATAAAT TGGGAGAAAA TATAACGACA TTTGCTGAAG
401 AGACTAAGAC AAATATCGTA AAAATTGATG AAAAATTAGA AGCCGTGGCT
451 GATACCGTCG ACAAGCATGC CGAAGCATTC AACGATATCG CCGATTCATT
501 GGATGAAACC AACACTAAGG CAGACGAAGC CGTCAAAACC GCCAATGAAG
551 CCAAACAGAC GGCCGAAGAA ACCAACAAAA ACGTCGATGC CAAAGTAAAA
601 GCTGCAGAAA CTGCAGCAGG CAAAGCCGAA GCTGCCGCTG GCACAGCTAA
651 TACTGCAGCC GACAAGGCCG AAGCTGTCGC TGCAAAAGTT ACCGACATCA
701 AAGCTGATAT CGCTACGAAC AAAGATAATA TTGCTAAAAA AGCAAACAGT
751 GCCGACGTGT ACACCAGAGA AGAGTCTGAC AGCAAATTTG TCAGAATTGA
801 TGGTCTGAAC GCTACTACCG AAAAATTGGA CACACGCTTG GCTTCTGCTG
851 AAAAATCCAT TGCCGATCAC GATACTCGCC TGAACGGTTT GGATAAAACA
901 GTGTCAGACC TGCGCAAAGA AACCCGCCAA GGCCTTGCAG AACAAGCCGC
951 GCTCTCCGGT CTGTTCCAAC CTTACAACGT GGGTGGATCC GGAGGGGGTG
1001 GTGTCGCCGC CGACATCGGT GCGGGGCTTG CCGATGCACT AACCGCACCG
1051 CTCGACCATA AAGACAAAGG TTTGCAGTCT TTGACGCTGG ATCAGTCCGT
1101 CAGGAAAAAC GAGAAACTGA AGCTGGCGGC ACAAGGTGCG GAAAAAACTT
1151 ATGGAAACGG TGACAGCCTC AATACGGGCA AATTGAAGAA CGACAAGGTC
1201 AGCCGTTTCG ACTTTATCCG CCAAATCGAA GTGGACGGGC AGCTCATTAC
1251 CTTGGAGAGT GGAGAGTTCC AAGTATACAA ACAAAGCCAT TCCGCCTTAA
1301 CCGCCTTTCA GACCGAGCAA ATACAAGATT CGGAGCATTC CGGGAAGATG
1351 GTTGCGAAAC GCCAGTTCAG AATCGGCGAC ATAGCGGGCG AACATACATC
1401 TTTTGACAAG CTTCCCGAAG GCGGCAGGGC GACATATCGC GGGACGGCGT
1451 TCGGTTCAGA CGATGCCGGC GGAAAACTGA CCTACACCAT AGATTTCGCC
1501 GCCAAGCAGG GAAACGGCAA AATCGAACAT TTGAAATCGC CAGAACTCAA
1551 TGTCGACCTG GCCGCCGCCG ATATCAAGCC GGATGGAAAA CGCCATGCCG
1601 TCATCAGCGG TTCCGTCCTT TACAACCAAG CCGAGAAAGG CAGTTACTCC
1651 CTCGGTATCT TTGGCGGAAA AGCCCAGGAA GTTGCCGGCA GCGCGGAAGT
1701 GAAAACCGTA AACGGCATAC GCCATATCGG CCTTGCCGCC AAGCAACTCG
1751 AGCACCACCA CCACCACCAC TGA
1 MATNDDDVKK AATVAIAAAY NNGQEINGFK AGETIYDIDE DGTITKKDAT
51 AADVEADDFK GLGLKKVVTN LTKTVNENKQ NVDAKVKAAE SEIEKLTTKL
101 ADTDAALADT DAALDATTNA LNKLGENITT FAEETKTNIV KIDEKLEAVA
151 DTVDKHAEAF NDIADSLDET NTKADEAVKT ANEAKQTAEE TKQNVDAKVK
201 AAETAAGKAE AAAGTANTAA DKAEAVAAKV TDIKADIATN KDNIAKKANS
251 ADVYTREESD SKFVRIDGLN ATTEKLDTRL ASAEKSIADH DTRLNGLDKT
301 VSDLRKETRQ GLAEQAALSG LFQPYNVGGS GGGGVAADIG AGLADALTAP
351 LDHKDKGLQS LTLDQSVRKN EKLKLAAQGA EKTYGNGDSL NTGKLKNDKV
401 SRFDFIRQIE VDGQLITLES GEFQVYKQSH SALTAFQTEQ IQDSEHSGKN
451 VAKRQFRIGD IAGEHTSFDK LPEGGRATYR GTAFGSDDAG GKLTYTIDFA
501 AKQGNGKIEH LKSPELNVDL AAADIKPDGK PHAVISGSVL YNQAEKGSYS
551 LGIFGGKAQE VAGSAEVKTV NGIRHIGLAA KQLEHHHHHH *
961c-983
1 ATGGCCACAA ACGACGACGA TGTTAAAAAA GCTGCCACTG TGGCCATTGC
51 TGCTGCCTAC AACAATGGCC AAGAAATCAA CGGTTTCAAA GCTGGAGAGA
101 CCATCTACGA CATTGATGAA GACGGCACAA TTACCAAAAA AGACGCAACT
151 GCAGCCGATG TTGAAGCCGA CGACTTTAAA GGTCTGGGTC TGAAAAAAGT
201 CGTGACTAAC CTGACCAAAA CCGTCAATGA AAACAAACAA AACGTCGATG
251 CCAAAGTAAA AGCTGCAGAA TCTGAAATAG AAAAGTTAAC AACCAAGTTA
301 GCAGACACTG ATGCCGCTTT AGCAGATACT GATGCCGCTC TGGATGCAAC
351 CACCAACGCC TTGAATAAAT TGGGAGAAAA TATAACGACA TTTGCTGAAG
401 AGACTAAGAC AAATATCGTA AAAATTGATG AAAAATTAGA AGCCGTGGCT
451 GATACCGTCG ACAAGCATGC CGAAGCATTC AACGATATCG CCGATTCATT
501 GGATGAAACC AACACTAAGG CAGACGAAGC CGTCAAAACC GCCAATGAAC
551 CCAAACAGAC GGCCGAAGAA ACCAAACAAA ACGTCGATGC CAAAGTAAAA
601 GCTGCAGAAA CTGCAGCAGG CAAAGCCGAA GCTGCCGCTG GCACAGCTAA
651 TACTGCAGCC GACAAGGCCG AAGCTGTCGC TGCAAAAGTT ACCGACATCA
701 AAGCTGATAT CGCTACGAAC AAAGATAATA TTGCTAAAAA AGCAAACAGT
751 GCCGACGTGT ACACCAGAGA AGAGTCTGAC AGCAAATTTG TCAGAATTGA
801 TGGTCTGAAC GCTACTACCG AAAAATTGGA CACACGCTTG GCTTCTGCTG
851 AAAAATCCAT TGCCGATCAC GATACTCGCC TGAACGGTTT GGATAAAACA
901 GTGTCAGACC TGCGCAAAGA AACCCGCCAA GGCCTTGCAG AACAAGCCGC
951 GCTCTCCGGT CTGTTCCAAC CTTACAACGT GGGTGGATCC GGCGGAGGCG
1001 GCACTTCTGC GCCCGACTTC AATGCAGGCG GTACCGGTAT CGGCAGCAAC
1051 AGCAGAGCAA CAACAGCGAA ATCAGCAGCA GTATCTTACG CCGGTATCAA
1101 GAACGAAATG TGCAAAGACA GAAGCATGCT CTGTGCCGGT CGGGATGACG
1151 TTGCGGTTAC AGACAGGGAT GCCAAAATCA ATGCCCCCCC CCCGAATCTG
1201 CATACCGGAG ACTTTCCAAA CCCAAATGAC GCATACAAGA ATTTGATCAA
1251 CCTCAAACCT GCAATTGAAG CAGGCTATAC AGGACGCGGG GTAGAGGTAG
1301 GTATCGTCGA CACAGGCGAA TCCGTCGGCA GCATATCCTT TCCCGAACTG
1351 TATGGCAGAA AAGAACACGG CTAATAAGAA AATTACAAAA ACTATACGGC
1401 GTATATGCGG AAGGAAGCGC CTGAAGACGG AGGCGGTAAA GACATTGAAG
1451 CTTCTTTCGA CGATGAGGCC GTTATAGAGA CTGAAGCAAA GCCGACGGAT
1501 ATCCGCCACG TAAAAGAAAT CGGACACATC GATTTGGTCT CCCATATTAT
1551 TGGCGGGCGT TCCGTGGACG GCAGACCTGC AGGCGGTATT GCGCCCGATG
1601 CGACGCTACA CATAATGAAT ACGAATGATG AAACCAAGAA CGAAATGATG
1651 GTTGCAGCCA TCCGCAATGC ATGGGTCAAG CTGGGCGAAC GTGGCGTGCG
1701 CATCGTCAAT AACAGTTTTG GAACAACATC GAGGGCAGGC ACTGCCGACC
1751 TTTTCCAAAT AGCCAATTCG GAGGAGCAGT ACCGCCAAGC GTTGCTCGAC
1801 TATTCCGGCG GTGATAAAAC AGACGAGGGT ATCCGCCTGA TGCAACAGAG
1851 CGATTACGGC AACCTGTCCT ACCACATCCG TAATAAAAAC ATGCAAAACA
1901 TCTTTTCGAC AGGCAATGAC GCACAAGCTC AGCCCAACAC ATATGCCCTA
1951 TTGCCATTTT ATGAAAAAGA CGCTCAAAAA GGCATTATCA CAGTCGCAGG
2001 CGTAGACCGC AGTGGAGAAA AGTTCAAACG GGAAATGTAT GGAGAACCGG
2051 GTACAGAACC GCTTGAGTAT GGCTCCAACC ATTGCGGAAT TACTGCCATG
2101 TGGTGCCTGT CGGCACCCTA TGAAGCAAGC GTCCGTTTCA CCCGTACAAA
2151 CCCGATTCAA ATTGCCGGAA CATCCTTTTC CGCACCCATC GTAACCGGCA
2201 CGGCGGCTCT GCTGCTGCAG AAATTACCGT GGATGAGCAA CGACAACCTG
2251 CGTACCACGT TGCTGACGAC GGCTCAGGAC ATCGGTGCAG TCGGCGTGGA
2301 CAGCAAGTTC GGCTGGGGAC TGCTGGATGC GGGTAAGGCC ATGAACGGAC
2351 CCGCGTCCTT TCCGTTCGGC GACTTTACCG CCGATACGAA AGGTACATCC
2401 GATATTGCCT ACTCCTTCCG TAACGACATT TCAGGCACGG GCGGCCTGAT
2451 CAAAAAAGGC GGCAGCCAAC TGCAACTGCA CGGCAACAAC ACCTATACGG
2501 GCAAAACCAT TATCGAAGGC GGTTCGCTGG TGTTGTACGG CAACAACAAA
2551 TCGGATATGC GCGTCGAAAC CAAAGGTGCG CTGATTTATA ACGGGGCGGC
2601 ATCCGGCGGC AGCCTGAACA GCGACGGCAT TGTCTATCTG GCAGATACCG
2651 ACCAATCCGG CGCAAACGAA ACCGTACACA TCAAAGGCAG TCTGCAGCTG
2701 GACGGCAAAG GTACGCTGTA CACACGTTTG GGCAAACTGC TGAAAGTGGA
2751 CGGTACGGCG ATTATCGGCG GCAAGCTGTA CATGTCGGCA CGCGGCAAGG
2801 GGGCAGGCTA TCTCAACAGT ACCGGACGAC GTGTTCCCTT CCTGAGTGCC
2851 GCCAAAATCG GGCAGGATTA TTCTTTCTTC ACAAACATCG AAACCGACGG
2901 CGGCCTGCTG GCTTTCCTCG ACAGCGTCGA AAAAACAGCG GGCAGTGAAG
2951 GCGACACGCT GTCCTATTAT GTCCGTCGCG GCAATGCGGC ACGGACTGCT
3001 TCGGCAGCGG CACATTCCGC GCCCGCCGGT CTGAAACACG CCGTAGAACA
3051 GGGCGGCAGC AATCTGGAAA ACCTGATGGT CGAACTGGAT GCCTCCGAAT
3101 CATCCGCAAC ACCCGAGACG GTTGAAACTG CGGCAGCCGA CCGCACAGAT
3151 ATGCCGGGCA TCCGCCCCTA CGGCGCAACT TTCCGCGCAG CGGCAGCCGT
3201 ACAGCATGCG AATGCCGCCG ACGGTGTACG CATCTTCAAC AGTCTCGCCG
3251 CTACCGTCTA TGCCGACAGT ACCGCCGCCC ATGCCGATAT GCAGGGACGC
3301 CGCCTGAAAG CCGTATCGGA CGGGTTGGAC CACAACGGCA CGGGTCTGCG
3351 CGTCATCGCG CAAACCCAAC AGGACGGTGG AACGTGGGAA CAGGGCGGTG
3401 TTGAAGGCAA AATGCGCGGC AGTACCCAAA CCGTCGGCAT TGCCGCGAAA
3451 ACCGGCGAAA ATACGACAGC AGCCGCCACA CTGGGCATGG GACGCAGCAC
3501 ATGGAGCGAA AACAGTGCAA ATGCAAAAAC CGACAGCATT AGTCTGTTTG
3551 CAGGCATACG GCACGATGCG GGCGATATCG GCTATCTCAA AGGCCTGTTC
3601 TCCTACGGAC GCTACAAAAA CAGCATCAGC CGCAGCACCG GTGCGGACGA
3651 ACATGCGGAA GGCAGCGTCA ACGGCACGCT GATGCAGCTG GGCGCACTGG
3701 GCGGTGTCAA CGTTCCGTTT GCCGCAACGG GAGATTTGAC GGTCGAAGGC
3751 GGTCTGCGCT ACGACCTGCT CAAACAGGAT GCATTCGCCG AAAAAGGCAG
3801 TGCTTTGGGC TGGAGCGGCA ACAGCCTCAC TGAAGGCACG CTGGTCGGAC
3851 TCGCGGGTCT GAAGCTGTCG CAACCCTTGA GCGATAAAGC CGTCCTGTTT
3901 GCAACGGCGG GCGTGGAACG CGACCTGAAC GGACGCGACT ACACGGTAAC
3951 GGGCGGCTTT ACCGGCGCGA CTGCAGCAAC CGGCAAGACG GGGGCACGCA
4001 ATATGCCGCA CACCCGTCTG GTTGCCGGCC TGGGCGCGGA TGTCGAATTC
4051 GGCAACGGCT GGAACGGCTT GGCACGTTAC AGCTACGCCG GTTCCAAACA
4101 GTACGGCAAC CACAGCGGAC GAGTCGGCGT AGGCTACCGG TTCCTCGAGC
4151 ACCACCACCA CCACCACTGA
1 MATNDDDVKK AATVAIAAAY NNGQEINGFK AGETIYDIDE DGTITKKDAT
51 AADVEADDFK GLGLKKVVTN LTKTVNENKQ NVDAKVKAAE SEIEKLTTKL
101 ADTDAALADT DAALDATTNA LNKLGENITT FAEETKTNIV KIDEKLEAVA
151 DTVDKHAEAF NDIADSLDET NTKADEAVKT ANEAKQTAEE TKQNVDAKVK
201 AAETAAGKAE AAAGTANTAA DKAEAVAAKV TDIKADIATN KDNIAKKANS
251 ADVYTREESD SKFVRIDGLN ATTEKLDTRL ASAEKSIADH DTRLNGLDKT
301 VSDLRKETRQ GLAEQAALSG LFQPYNVGGS GGGGTSAPDF NAGGTGIGSN
351 SRATTAKSAA VSYAGIKNEM CKDRSMLCAG RDDVAVTDRD AKIMAPPPNL
401 HTGDFPNPND AYKNLINLKP AIEAGYTGRG VEVGIVDTGE SVGSISFPEL
451 YGRKEHGYNE NYKNYTAYMR KEAPEDGGGK DIEASFDDEA VIETEAKPTD
501 IRHVKEIGHI DLVSHIIGGR SVDGRPAGGI APDATLHIMN TNDETKNEMM
551 VAAIRNAWVK LGERGVRIVN NSFGTTSRAG TADLFQIANS EEQYRQALLD
601 YSGGDKTDEG IRLMQQSDYG NLSYHIRNKN MLFIFSTGND AQAQPNTYAL
651 LPFYEKDAQK GIITVAGVDR SGEKFKREMY GEPGTEPLEY GSNHCGITAM
701 WCLSAPYEAS VRFTRTNPIQ IAGTSFSAPI VTGTAALLLQ KYPWMSNDNL
751 RTTLLTTAQD IGAVGVDSKF GWGLLDAGKA MNGPASFPFG DFTADTKGTS
801 DIAYSFRNDI SGTGGLIKKG GSQLQLHGNN TYTGKTIIEG GSLVLYGNNK
851 SDMRVETKGA LIYNGAASGG SLNSDGIVYL ADTDQSGANE TVHIKGSLQL
901 DGKGTLYTRL GKLLKVDGTA IIGGKLYMSA RGKGAGYLNS TGRRVPFLSA
951 AKIGQDYSFF TNIETDGGLL ASLDSVEKTA GSEGDTLSYY VRRGNAARTA
1001 SAAAHSAPAG LKHAVEQGGS NLENLMVELD ASESSATPET VETAAADRTD
1051 MPGIRPYGAT FRAAAAVQHA NAADGVRIFN SLAATVYADS TAAHADMQGR
1101 RLKAVSDGLD HNGTGLRVIA QTQQDGGTWE QGGVEGKMRG STQTVGIAAK
1151 TGENTTAAAT LGMGRSTWSE NSANAKTDSI SLFAGIRHDA GDIGYLKGLF
1201 SYGRYKNSIS RSTGADEHAE GSVNGTLMQL GALGGVNVPF AATGDLTVEG
1251 GLRYDLLKQD AFAEKGSALG WSGNSLTEGT LVGLAGLKLS QPLSDKAVLF
1301 ATAGVERDLN GRDYTVTGGF TGATAATGKT GARNMPHTRL VAGLGADVEF
1351 GNGWNGLARY SYAGSKQYGN HSGRVGVGYR FLEHHHHHH*
961cL-ORF46.1
1 ATGAAACACT TTCCATCCAA AGTACTGACC ACAGCCATCC TTGCCACTTT
51 CTGTAGCGGC GCACTGGCAG CCACAAACGA CGACGATGTT AAAAAAGCTG
101 CCACTGTGGC CATTGCTGCT GCCTACAACA ATGGCCAAGA AATCAACGGT
151 TTCAAAGCTG GAGAGACCAT CTACGACATT GATGAAGACG GCACAATTAC
201 CAAAAAAGAC GCAACTGCAG CCGATGTTGA AGCCGACGAC TTTAAAGGTC
251 TGGGTCTGAA AAAAGTCGTG ACTAACCTGA CCAAAACCGT CAATGAAAAC
301 AAACAAAACG TCGATGCCAA AGTAAAAGCT GCAGAATCTG AAATAGAAAA
351 GTTAACAACC AAGTTAGCAG ACACTGATGC CGCTTTAGCA GATACTGATG
401 CCGCTCTGGA TGCAACCACC AACGCCTTGA ATAAATTGGG AGAAAATATA
451 ACGACATTTG CTGAAGAGAC TAAGACAAAT ATCGTAAAAA TTGATGAAAA
501 ATTAGAAGCC GTGGCTGATA CCGTCGACAA GCATGCCGAA GCATTCAACG
551 ATATCGCCGA TTCATTGGAT GAAACCAACA CTAAGGCAGA CGAAGCCGTC
601 AAAACCGCCA ATGAAGCCAA ACAGACGGCC GAAGAAACCA AACAAAACGT
651 CGATGCCAAA GTAAAAGCTG CAGAAACTGC AGCAGGCAAA GCCGAAGCTG
701 CCGCTGGCAC AGCTAATACT GCAGCCGACA AGGCCGAAGC TGTCGCTGCA
751 AAAGTTACCG ACATCAAAGC TGATATCGCT ACGAACAAAG ATAATATTGC
801 TAAAAAAGCA AACAGTGCCG ACGTGTACAC CAGAGAAGAG TCTGACAGCA
851 AATTTGTCAG AATTGATGGT CTGAACGCTA CTACCGAAAA ATTGGACACA
901 CGCTTGGCTT CTGCTGAAAA ATCCATTGCC GATCACGATA CTCGCCTGAA
951 CGGTTTGGAT AAAACAGTGT CAGACCTGCG CAAAGAAACC CGCCAAGGCC
1001 TTGCAGAACA AGCCGCGCTC TCCGGTCTGT TCCAACCTTA CAACGTGGGT
1051 GGATCCGGAG GAGGAGGATC AGATTTGGCA AACGATTCTT TTATCCGGCA
1101 GGTTCTCGAC CGTCAGCATT TCGAACCCGA CGGGAAATAC CACCTATTCG
1151 GCAGCAGGGG GGAACTTGCC GAGCGCAGCG GCCATATCGG ATTGGGAAAA
1201 ATACAAAGCC ATCAGTTGGG CAACCTGATG ATTCAACAGG CGGCCATTAA
1251 AGGAAATATC GGCTACATTG TCCGCTTTTC CGATCACGGG CACGAAGTCC
1301 ATTCCCCCTT CGACAACCAT GCCTCACATT CCGATTCTGA TGAAGCCGGT
1351 AGTCCCGTTG ACGGATTTAG CCTTTACCGC ATCCATTGGG ACGGATACGA
1401 ACACCATCCC GCCGACGGCT ATGACGGGCC ACAGGGCGGC GGCTATCCCG
1451 CTCCCAAAGG CGCGAGGGAT ATATACAGCT ACGACATAAA AGGCGTTGCC
1501 CAAAATATCC GCCTCAACCT GACCGACAAC CGCAGCACCG GACAACGGCT
1551 TGCCGACCGT TTCCACAATG CCGGTAGTAT GCTGACGCAA GGAGTAGGCG
1601 ACGGATTCAA ACGCGCCACC CGATACAGCC CCGAGCTGGA CAGATCGGGC
1651 AATGCCGCCG AAGCCTTCAA CGGCACTGCA GATATCGTTA AAAACATCAT
1701 CGGCGCGGCA GGAGAAATTG TCGGCGCAGG CGATGCCGTG CAGGGCATAA
1751 GCGAAGGCTC AAACATTGCT GTCATGCACG GCTTGGGTCT GCTTTCCACC
1801 GAAAACAAGA TGGCGCGCAT CAACGATTTG GCAGATATGG CGCAACTCAA
1851 AGACTATGCC GCAGCAGCCA TCCGCGATTG GGCAGTCCAA AACCCCAATG
1901 CCGCACAAGG CATAGAAGCC GTCAGCAATA TCTTTATGGC AGCCATCCCC
1951 ATCAAAGGGA TTGGAGCTGT TCGGGGAAAA TACGGCTTGG GCGGCATCAC
2001 GGCACATCCT ATCAAGCGGT CGCAGATGGG CGCGATCGCA TTGCCGAAAG
2051 GGAAATCCGC CGTCAGCGAC AATTTTGCCG ATGCGGCATA CGCCAAATAC
2101 CCGTCCCCTT ACCATTCCCG AAATATCCGT TCAAACTTGG AGCAGCGTTA
2151 CGGCAAAGAA AACATCACCT CCTCAACCGT GCCGCCGTCA AACGGCAAAA
2201 ATGTCAAACT GGCAGACCAA CGCCACCCGA AGACAGGCGT ACCGTTTGAC
2251 GGTAAAGGGT TTCCGAATTT TGAGAAGCAC TGAGAAGCAC ATACGTAACT
2301 CGAG
1 MKHFPSKVLT TAILATFCSG ALAATNDDDV KKAATVAIAA AYNNGQEING
51 FKAGETIYDI DEDGTITKKD ATAADVEADD FKGLGLKKVV TNLTKTVNEN
101 KQNVDAKVKA AESEIEKLTT KLADTDAALA DTDAALDATT NALNKLGENI
151 TTFAEETKTN IVKIDEKLEA VADTVDKHAE AFNDIADSLD ETNTKADEAV
201 KTANEAKQTA EETKQNVDAK VKAAETAAGK AEAAAGTANT AADKAEAVAA
251 KVTDIKADIA TNKDNIAKKA NSADVYTREE SDSKFVRIDG LNATTEKLDT
301 RLASAEKSIA DHDTRLNGLD KTVSDLRKET RQGLAEQAAL SGLFQPYNVG
351 GSGGGGSDLA NDSFIRQVLD RQHFEPDGKY HLFGSRGELA ERSGHIGLGK
401 IQSHQLGNLM IQQAAIKGNI GYIVRFSDHG HEVHSPFDNH ASHSDSDEAG
451 SPVDGFSLYR IHWDGYEHHP ADGYDGPQGG GYPAPKGARD IYSYDIKGVA
501 QNIRLNLTDN RSTGQRLADR FHNAGSMLTQ GVGDGFKRAT RYSPELDRSG
551 NAAEAFNGTA DIVKNIIGAA GEIVGAGDAV QGISEGSNIA VMSGLGLLST
601 ENKMARINDL ADMAQLKDYA AAAIRDWAVQ NPNAAQGIKA VSNIFMAAIP
651 IKGIGAVRGK YGLGGITAHP IKPSQMGAIA LPKGKSAVSD NFADAAYAKY
701 PSPYHSRNIR SNLEQRYGKE NITSSTVPPS NGKNVKLADQ RHPKTGVPFD
751 GKGFPNFEKH VKYDT*
961cL-741
1 ATGAAACACT TTCCATCCAA AGTACTGACC ACAGCCATCC TTGCCACTTT
51 CTGTAGCGGC GCACTGGCAG CCACAAACGA CGACGATGTT AAAAAAGCTG
101 CCACTGTGGC CATTGCTGCT GCCTACAACA ATGGCCAAGA AATCAACGGT
151 TTCAAAGCTG GAGAGACCAT CTACGACATT GATGAAGACG GCACAATTAC
201 CAAAAAAGAC GCAACTGCAG CCGATGTTGA AGCCGACGAC TTTAAAGGTC
251 TGGGTCTGAA AAAAGTCGTG ACTAACCTGA CCAAAACCGT CAATGAAAAC
301 AAACAAAACG TCGATGCCAA AGTAAAAGCT GCAGAATCTG AAATAGAAAA
351 GTTAACAACC AAGTTAGCAG ACACTGATGC CGCTTTAGCA GATACTGATG
401 CCGCTCTGGA TGCAACCACC AACGCCTTGA ATAAATTGGG AGAAAATATA
451 ACGACATTTG CTGAAGAGAC TAAGACAAAT ATCGTAAAAA TTGATGAAAA
501 ATTAGAAGCC GTGGCTGATA CCGTCGACAA GCATGCCGAA GCATTCAACG
551 ATATCGCCGA TTCATTGGAT GAAACCAACA CTAAGGCAGA CGAAGCCGTC
601 AAAACCGCCA ATGAAGCCAA ACAGACGGCC GAAGAAACCA AACAAAACGT
651 CGATGCCAAA GTAAAAGCTG CAGAAACTGC AGCAGGCAAA GCCGAAGCTG
701 CCGCTGGCAC AGCTAATACT GCAGCCGACA AGGCCGAAGC TGTCGCTGCA
751 AAAGTTACCG ACATCAAAGC TGATATCGCT ACGAACAAAG ATAATATTGC
801 TAAAAAAGCA AACAGTGCCG ACGTGTACAC CAGAGAAGAG TCTGACAGCA
851 AATTTGTCAG AATTGATGGT CTGAACGCTA CTACCGAAAA ATTGGACACA
901 CGCTTGGCTT CTGCTGAAAA ATCCATTGCC GATCACGATA CTCGCCTGAA
951 CGGTTTGGAT AAAACAGTGT CAGACCTGCG CAAAGAAACC CGCCAAGGCC
1001 TTGCAGAACA AGCCGCGCTC TCCGGTCTGT TCCAACCTTA CAACGTGGGT
1051 GGATCCGGAG GGGGTGGTGT CGCCGCCGAC ATCGGTGCGG GGCTTGCCGA
1101 TGCACTAACC GCACCGCTCG ACCATAAAGA CAAAGGTTTG CAGTCTTTGA
1151 CGCTGGATCA GTCCGTCAGG AAAAACGAGA AACTGAAGCT GGCGGCACAA
1201 GGTGCGGAAA AAACTTATGG AAACGGTGAC AGCCTCAATA CGGGCAAATT
1251 GAAGAACGAC AAGGTCAGCC GTTTCGACTT TATCCGCCAA ATCGAAGTGG
1301 ACGGGCAGCT CATTACCTTG GAGAGTGGAG AGTTCCAAGT ATACAAACAA
1351 AGCCATTCCG CCTTAACCGC CTTTCAGACC GAGCAAATAC AAGATTCGGA
1401 GCATTCCGGG AAGATGGTTG CGAAACGCCA GTTCAGAATC GGCGACATAG
1451 CGGGCGAACA TACATCTTTT GACAAGCTTC CCGAAGGCGG CAGGGCGACA
1501 TATCGCGGGA CGGCGTTCGG TTCAGACGAT GCCGGCGGAA AACTGACCTA
1551 CACCATAGAT TTCGCCGCCA AGCAGGGAAA CGGCAAAATC CAACATTTGA
1601 AATCGCCAGA ACTCAATGTC GACCTGGCCG CCGCCGATAT CAAGCCGGAT
1651 GGAAAACGCC ATGCCGTCAT CAGCGGTTCC GTCCTTTACA ACCAAGCCGA
1701 GAAAGGCAGT TACTCCCTCG GTATCTTTGG CGGAAAAGCC CAGGAAGTTG
1751 CCGGCAGCGC GGAAGTGAAA ACCGTAAACG GCATACGCCA TATCGGCCTT
1801 GCCGCCAAGC AACTCGAGCA CCACCACCAC CACCACTGA
1 MKHFPSKVLT TAILATFCSG ALAATNDDDV KKAATVAIAA AYNNGQEING
51 FKAGETIYDI DKDGTITKKD ATAADVEADD FKGLGLKKVV TNLTKTVNEN
101 KQNVDAKVKA AESEIEKLTT KLADTDAALA DTDAALDATT NALNKLGENI
151 TTFAEETKTN IVKIDEKLEA VADTVDKHAE AFDNIADSLD ETNTKADEAV
201 KTANEAKQTA EETKQNVDAK VKAAETAAGK AEAAAGTANT AADKAEAVAA
251 KVTDIKADIA TNKDNIAKKA NSADVYTREE SDSKFVRIDG LNATTEKLDT
301 RLASAEKSIA DHDTRLNGLD KTVSDLRKET RQGLAEQAAL SGLFQPYNVG
351 GSGGGGVAAD IGAGLADALT APLDHKDKGL QSLTLDQSVR KNEKLKLAAQ
401 GAEKTYGNGD SLNTGKLKND KVSRFDFIRQ IEVDGQLITL ESGEFQVYKQ
451 SHSALTAFQT EQIQDSEHSG KMVAKRQFRI GDIAGEHTSF DKLPEGGRAT
501 YRGTAFGSDD AGGKLTYTID FAAKQGNGKI EHLKSPELNV DLAAADIKPD
551 GKRHAVISGS VLYNQAEKGS YSLGIFGGKA QEVAGSAEVK TVNGIRHIGL
601 AAKQLEHHHH HH*
961cL-983
1 ATGAAACACT TTCCATCCAA AGTACTGACC ACAGCCATCC TTGCCACTTT
51 CTGTAGCGGC CGACTGGCAG CCACAAACGA CGACGATGTT AAAAAAGCTG
101 CCACTGTGGC CATTGCTGCT GCCTACAACA ATGGCCAAGA AATCAACGGT
151 TTCAAAGCTG GAGAGACCAT CTACGACATT GATGAAGACG GCACAATTAC
201 CAAAAAAGAC GCAACTGCAG CCGATGTTGA AGCCGACGAC TTTAAAGGTC
251 TGGGTCTGAA AAAAGTCGTG ACTAACCTGA CCAAAACCGT CAATGAAAAC
301 AAACAAAACG TCGATGCCAA AGTAAAAGCT GCAGAATCTG AAATAGAAAA
351 GTTAACAACC AAGTTAGCAG ACACTGATGC CGCTTTAGCA GATACTGATG
401 CCGCTCTGGA TGCAACCACC AACGCCTTGA ATAAATTGGG AGAAAATATA
451 ACGACATTTG CTGAAGAGAC TAAGACAAAT ATCGTAAAAA TTGATGAAAA
501 ATTAGAAGCC GTGGCTGATA CCGTCGACAA GCATGCCGAA GCATTCAACG
551 ATATCGCCGA TTCATTGGAT GAAACCAACA CTAAGGCAGA CGAAGCCGTC
601 AAAACCGCCA ATGAAGCCAA ACAGACGGCC GAAGAAACCA AACAAAACGT
651 CGATGCCAAA GTAAAAGCTG CAGAAACTGC AGCAGGCAAA GCCGAAGCTG
701 CCGCTGGCAC AGCTAATACT GCAGCCGACA AGGCCGAAGC TGTCGCTGCA
751 AAAGTTACCG ACATCAAAGC TGATATCGCT ACGAACAAAG ATAATATTGC
801 TAAAAAAGCA AACAGTGCCG ACGTGTACAC CAGAGAAGAG TCTGACAGCA
851 AATTTGTCAG AATTGATGGT CTGAACGCTA CTACCGAAAA ATTGGACACA
901 CGCTTGGCTT CTGCTGAAAA ATCCATTGCC GATCACGATA CTCGCCTGAA
951 CGGTTTGGAT AAAACAGTGT CAGACCTGCG CAAAGAAACC CGCCAAGGCC
1001 TTGCAGAACA AGCCGCGCTC TCCGGTCTGT TCCAACCTTA CAACGTGGGT
1051 GGATCCGGCG GAGGCGGCAC TTCTGCGCCC GACTTCAATG CAGGCGGTAC
1101 CGGTATCGGC AGCAACAGCA GAGCAACAAC AGCGAAATCA GCAGCAGTAT
1151 CTTACGCCGG TATCAAGAAC GAAATGTGCA AAGACAGAAG CATGCTCTGT
1201 GCCGGTCGGG ATGACGTTGC GGTTACAGAC AGGGATGCCA AAATCAATGC
1251 CCCCCCCCCG AATCTGCATA CCGGAGACTT TCCAAACCCA AATGACGCAT
1301 ACAAGAATTT GATCAACCTC AAACCTGCAA TTGAAGCAGG CTATACAGGA
1351 CGCGGGGTAG AGGTAGGTAT CGTCGACACA GGCGAATCCG TCGGCAGCAT
1401 ATCCTTTCCC GAACTGTATG GCAGAAAAGA ACACGGCTAT AACGAAAATT
1451 ACAAAAACTA TACGGCGTAT ATGCGGAAGG AAGCGCCTGA AGACGGAGGC
1501 GGTAAAGACA TTGAAGCTTC TTTCGACGAT GAGGCCGTTA TAGAGACTGA
1551 AGCAAAGCCG ACGGATATCC GCCACGTAAA AGAAATCGGA CACATCGATT
1601 TGGTCTCCCA TATTATTGGC GGGCGTTCCG TGGACGGCAG ACCTGCAGGC
1651 GGTATTGCGC CCGATGCGAC GCTACACATA ATGAATACGA ATGATGAAAC
1701 CAAGAACGAA ATGATGGTTG CAGCCATCCG CAATGCATGG GTCAAGCTGG
1751 GCGAACGTGG CGTGCGCATC GTCAATAACA GTTTTGGAAC AACATCGAGG
1801 GCAGGCACTG CCGACCTTTT CCAAATAGCC AATTCGGAGG AGCAGTACCG
1851 CCAAGCGTTG CTCGACTATT CCGGCGGTGA TAAAACAGAC GAGGGTATCC
1901 GCCTGATGCA ACAGAGCGAT TACGGCAACC TGTCCTACCA CATCCGTAAT
1951 AAAAACATGC TTTTCATCTT TTCGACAGGC AATGACGCAC AAGCTCAGCC
2001 CAACACATAT GCCCTATTGC CATTTTATGA AAAAGACGCT CAAAAAGGCA
2051 TTATCACAGT CGCAGGCGTA GACCGCAGTG GAGAAAAGTT CAAACGGGAA
2101 ATGTATGGAG AACCGGGTAC AGAACCGCTT GAGTATGGCT CCAACCATTG
2151 CGGAATTACT GCCATGTGGT GCCTGTCGGC ACCCTATGAA GCAAGCGTCC
2201 GTTTCACCCG TACAAACCCG ATTCAAATTG CCGGAACATC CTTTTCCGCA
2251 CCCATCGTAA CCGGCACGGC GGCTCTGCTG CTGCAGAAAT ACCCGTGGAT
2301 GAGCAACGAC AACCTGCGTA CCACGTTGCT GACGACGGCT CAGGACATCG
2351 GTGCAGTCGG CGTGGACAGC AAGTTCGGCT GGGGACTGCT GGATGCGGGT
2401 AAGGCCATGA ACGGACCCGC GTCCTTTCCG TTCGGCGACT TTACCGCCGA
2451 TACGAAAGGT ACATCCGATA TTGCCTACTC CTTCCGTAAC GACATTTCAG
2501 GCACGGGCGG CCTGATCAAA AAAGGCGGCA GCCAACTGCA ACTGCACGGC
2551 AACAACACCT ATACGGGCAA AACCATTATC GAAGGCGGTT CGCTGGTGTT
2601 GTACGGCAAC AACAAATCGG ATATGCGCGT CGAAACCAAA GGTGCGCTGA
2651 TTTATAACGG GGCGGCATCC GGCGGCAGCC TGAACAGCGA CGGCATTGTC
2701 TATCTGGCAG ATACCGACCA ATCCGGCGCA AACGAAACCG TACACATCAA
2751 AGGCAGTCTG CAGCTGGACG GCAAAGGTAC GCTGTACACA CGTTTGGGCA
2801 AACTGCTGAA AGTGGACGGT ACGGCGATTA TCGGCGGCAA GCTGTACATG
2851 TCGGCACGCG GCAAGGGGGC AGGCTATCTC AACAGTACCG GACGACGTGT
2901 TCCCTTCCTG AGTGCCGCCA AAATCGGGCA GGATTATTCT TTCTTCACAA
2951 ACATCGAAAC CGACGGCGGC CTGCTGGCTT CCCTCGACAG CGTCGAAAAA
3001 ACAGCGGGCA GTGAAGGCGA CACGCTGTCC TATTATGTCC GTCGCGGCAA
3051 TGCGGCACGG ACTGCTTCGG CAGCGGCACA TTCCGCGCCC GCCGGTCTGA
3101 AACACGCCGT AGAACAGGGC GGCAGCAATC TGGAAAACCT GATGGTCGAA
3151 CTGGATGCCT CCGAATCATC CGCAACACCC GAGACGGTTG AAACTGCGGC
3201 AGCCGACCGC ACAGATATGC CGGGCATCCG CCCCTACGGC GCAACTTTCC
3251 GCGCAGCGGC AGCCGTACAG CATGCGAATG CCGCCGACGG TGTACGCATC
3301 TTCAACAGTC TCGCCGCTAC CGTCTATGCC GACAGTACCG CCGCCCATGC
3351 CGATATGCAG GGACGCCGCC TGAAAGCCGT ATCGGACGGG TTGGACCACA
3401 ACGGCACGGG TCTGCGCGTC ATCGCGCAAA CCCAACAGGA CGGTGGAACG
3451 TGGGAACAGG GCGGTGTTGA AGGCAAAATG CGCGGCAGTA CCCAAACCGT
3501 CGGCATTGCC GCGAAAACCG GCGAAAATAC GACAGCAGCC GCCACACTGG
3551 GCATGGGACG CAGCACATGG AGCGAAAACA GTGCAAATGC AAAAACCGAC
3601 AGCATTAGTC TGTTTGCAGG CATACGGCAC GATGCGGGCG ATATCGGCTA
3651 TCTCAAAGGC CTGTTCTCCT ACGGACGCTA CAAAAACAGC ATCAGCCGCA
3701 GCACCGGTGC GGACGAACAT GCGGAAGGCA GCGTCAACGG CACGCTGATG
3751 CAGCTGGGCG CACTGGGCGG TGTCAACGTT CCGTTTGCCG CAACGGGAGA
3801 TTTGACGGTC GAAGGCGGTC TGCGCTACGA CCTGCTCAAA CAGGATGCAT
3851 TCGCCGAAAA AGGCAGTGCT TTGGGCTGGA GCGGCAACAG CCTCACTGAA
3901 GGCACGCTGG TCGGACTCGC GGGTCTGAAG CTGTCGCAAC CCTTGAGCGA
3951 TAAAGCCGTC CTGTTTGCAA CGGCGGGCGT GGAACGCGAC CTGAACGGAC
4001 GCGACTACAC GGTAACGGGC GGCTTTACCG GCGCGACTGC AGCAACCGGC
4051 AAGACGGGGG CACGCAATAT GCCGCACACC CGTCTGGTTG CCGGCCTGGG
4101 CGCGGATGTC GAATTCGGCA ACGGCTGGAA CGGCTTGGCA CGTTACAGCT
4151 ACGCCGGTTC CAAACAGTAC GGCAACCACA GCGGACGAGT CGGCGTAGGC
4201 TACCGGTTCT GACTCGAG
1 MKHFPSKVLT TAILATFCSG ALAATNDDDV KKAATVAIAA AYNNGQEING
51 FKAGETIYDI DEDGTITKKD ATAADVEADD FKGLGLKKVV TNLTKTVNEN
101 KQNVDAKVKA AESEIEKLTT KLADTDAALA DTDAALDATT NALNKLGENI
151 TTFAEETKTN IVKIDEKLEA VADTVDKHAE AFNDIADSLD ETNTKADEAV
201 KTANEAKQTA EETKQNVDAK VKAAETAAGK AEAAAGTANT AADKAEAVAA
251 KVTDIKADIA TNKDNIAKKA NSADVYTREE SDSKFVRIDG LAATTEKLDT
301 RLASAEKSIA DHDTRLNGLD KTVSDLRKET RQGLAEQAAL SGLFQPYNVG
351 GSGGGGTSAP DFNAGGTGIG SNSRATTAKS AAVSYAGIKN EMCKDRSMLC
401 AGRDDVAVTD RDAKINAPPP NLHTGDFPNP NDAYKNLINL KPAIEAGYTG
451 RGVEVGIVDT GESVGSISFP ELYGRKEHGY NENYKNYTAY MRKEAPEDGG
501 GKDIEASFDD EAVIETEAKP TDIRHVKEIG HIDLVSHIIG GRSVDGRPAG
551 GIAPDATLHI MNTNDETKNE MMVAAIRNAW VKLGERGVRI VNNSFGTTSR
601 AGTADLFQIA NSEEQYRQAL LDYSGGDKTD EGIRLMQQSD YGNLSYHIRN
651 KNMLFIFSTG NDAQAQPNTY ALLPFYEKDA QKGIITVAGV DRSGEKFKRE
701 MYGEPGTEPL EYGSNHCGIT AMWCLSAPYE ASVRFTRTNP IQIAGTSFSA
751 PIVTGTAALL LQKYPWMSND NLRTTLLTTA QDIGAVGVDS KFGWGLLDAG
801 KAMNGPASFP FGDFTADTKG TSDIAYSFRN DISGTGGLIK KGGSQLQLHG
851 NNTYTGKTII EGGSLVLYGN NKSDMRVETK GALIYNGAAS GGSLNSDGIV
901 YLADTDQSGA NETVHIKGSL QLDGKGTLYT RLGKLLKVDG TAIIGGKLYM
951 SARGKGAGYL NSTGRRVPFL SAAKIGQDYS FFTNIETDGG LLASLDSVEK
1001 TAGSEGDTLS YYVRRGNAAR TASAAAHSAP AGLKHAVEQG GSNLENLMVE
1051 LDASESSATP ETVETAAADR TDMPGIRPYG ATFRAAAAVQ HANAADGVRI
1101 FNSLAATVYA DSTAAHADMQ GRRLKAVSDG LDHNGTGLRV IAQTQQDGGT
1151 WEQGGVEGKM RGSTQTVGIA AKTGENTTAA ATLGMGRSTW SENSANAKTD
1201 SISLFAGIRH DAGDIGYLKG LFSYGRYKNS ISRSTGADEH AEGSVNGTLM
1251 QLGALGGVNV PFAATGDLTV EGGLRYDLLK QDAFAEKGSA LGWSGNSLTE
1301 GTLVGLAGLK LSQPLSDKAV LFATAGVERD LNGRDYTVTG GFTGATAATG
1351 KTGARNMPHT RLVAGLGADV EFGNGWNGLA RYSYAGSKQY GNHSGRVGVG
1401 YRF*
可以理解本发明仅以例子的方式进行描述,在本发明的范围和精神内还可进行改变。例如,设想可以使用其它菌株的蛋白质[如,参见WO00/66741,ORF4、ORF40、ORF46、225、235、287、519、726、919和953的多聚体序列]。
实验详述
FPLC蛋白质纯化
下表总结了所用的FPLC蛋白质纯化:
蛋白质 |
PI |
柱 |
缓冲液 |
pH |
方法 |
121.1未标记的 |
6.23 |
单Q |
Tris |
8.0 |
A |
128.1未标记的 |
5.04 |
单Q |
Bis-Tris丙烷 |
6.5 |
A |
406.1L |
7.75 |
单Q |
二乙醇胺 |
9.0 |
B |
576.1L |
5.63 |
单Q |
Tris |
7.5 |
B |
593未标记的 |
8.79 |
单S |
Hepes |
7.4 |
A |
726未标记的 |
4.95 |
Hi-trap S |
Bis-Tris |
6.0 |
A |
919未标记的 |
10.5(-前导区) |
单S |
Bicine |
8.5 |
C |
919Lorf4 |
10.4(-前导区) |
单S |
Tris |
8.0 |
B |
920L |
6.92(-前导区) |
单Q |
二乙醇胺 |
8.5 |
A |
953L |
7.56(-前导区) |
单S |
MES |
6.6 |
D |
982未标记的 |
4.73 |
单Q |
Bis-Tris丙烷 |
6.5 |
A |
919-287 |
6.58 |
Hi-trap Q |
Tris |
8.0 |
A |
953-287 |
4.92 |
单Q |
Bis-Tris丙烷 |
6.2 |
A |
缓冲液包括20-120mM NaCl、5.0mg/ml CHAPS和10%v/v甘油。将透析液以13000g离心20分钟,加样到单Q或单S FPLC离子交换树脂上。按照感兴趣蛋白质的pI和FPLC方法手册[pharmacia:FPLC离子交换和层析聚焦;理论和方法。Pharmacia Publication]选择缓冲液和离子交换树脂。用分步NaCl梯度法脱蛋白质。用SDS-PAGE分析纯化,并用Bradford方法测定蛋白质浓度。
‘方法′栏中的字母为以下含义:
FPLC-A:破碎细胞后从大肠杆菌可溶性组分中纯化克隆121.1、128.1、593、726、982、周质蛋白质920L和杂交蛋白919-287、953-287。于37℃,在20ml LB/Amp(100μg/ml)液体培养基中,使携带感兴趣质粒的单集落生长过夜。用1.0L新鲜培养基以1∶30稀释细菌,并在30℃或37℃生长直到OD550到达0.6-0.8。以终浓度1.0mM的IPTG诱导重组蛋白质的表达。培育3小时后,于4℃以8000离心15分钟收获细菌。必要时将细胞存储于-20℃。随后的所有步骤都是在冰上或4℃进行的。对胞质蛋白质(121.1、128.1、593、726和982)和周质蛋白质920L而言,将细菌重悬浮于25ml含完整蛋白酶抑制剂(Boehringer-Mannheim)的PBS中。用Branson Sonifier 450通过超声处理裂解细胞。以8000g离心破碎的细胞30分钟,以沉淀未破碎的细胞和包含体,并加入3.9M(NH4)2SO4使上清液达到35%v/v饱和。以8000g沉积沉淀物30分钟。添加3.9M(NH4)2SO4使上清液达到70%v/v饱和,如上所述收集沉淀物。用SDS-PAGE鉴定含感兴趣蛋白质的沉淀物,并用适合的离子交换缓冲液(见以下)透析6小时或过夜。按Evans等[Infect.Immun.(1974)10:1010-1017]的方法制备表达953L大肠杆菌的周质组分,并用适合的离子交换缓冲液透析。根据感兴趣蛋白的pI和FPLC方法手册[Pharmacia]的推荐选择缓冲液和离子交换树脂。缓冲液包括20mM NaCl和10%(v/v)甘油。以13000g离心透析液20分钟,并加到单Q或单S FPLC离子交换树脂上。根据感兴趣蛋白的pI和FPLC方法手册[Pharmacia]的推荐选择缓冲液和离子交换树脂。用分步或连续NaCl梯度从离子交换树脂洗脱蛋白质。用SDS-PAGE分析纯化,并用Bradford方法测定蛋白质浓度。通过NH2-未端测序(见以下)验证周质蛋白质的前导肽的切割。
FPLC-B:从大肠杆菌的膜组分纯化这些蛋白质。37℃,在20ml LB/Amp(100μg/ml)液液培养基中使携带感兴趣质粒的单集落生长过夜。用1.0L新鲜培养基以1∶30稀释细菌。克隆406.1L和919LOrf4在30℃生长,Orf25L和576.1L在37℃生长,直到OD550达到0.6-0.8。对919LOrf4而言,生长必须在30℃,因为重组蛋白质在37℃的表达导致细胞的裂解。以终浓度为1.0mM的IPTG诱导重组蛋白质的表达。培育3小时后,于4℃以8000g离心15分钟收获细菌。必要时,将细胞存储于-20℃。随后的所有步骤都是在冰上或4℃进行的。将细菌重悬浮于25ml含完整蛋白酶抑制剂(Boehringer-Mannheim)的PBS中,并通过French Press以渗透性冲击2-3代裂解细菌。以5000g离心15分钟除去未破碎的细胞,以100000g(Beckman Ti50,38000rpm)离心45分钟沉淀膜。用Dounce匀浆器将膜沉淀物重悬浮于7.5ml 20mM Tris-HCl(pH8.0)、1.0M NaCl和完整的蛋白酶抑制剂中。混合悬浮液2-4小时,以100000g离心45分钟,并将沉淀物重悬浮于7.5ml 20mM Tris-HCl(pH8.0)、1.0M NaCl、5.0mg/mlCHAPS、10%(v/v)甘油和完整的蛋白酶抑制剂中。将此溶液混合过夜,以100000g离心45分钟,用适当选择的缓冲液透析上清液6小时。对Orf25.L而言,发现在CHAPS提取后得到的沉淀物包含重组蛋白质。无需进一步纯化,可将该组分用于免疫接种小鼠。
FPLC-C:与FPLC-A相同,但从用多粘菌素B渗透大肠杆菌后得到的可溶性组分进行纯化,而不是在细胞破碎后进行的。
FPLC-D:于37℃,使携带感兴趣质粒的单集落在20ml LB/Amp(100μg/ml)液态培养基中生长过夜。用1.0L新鲜培养基以1∶30稀释细菌,并在30℃生长直到OD550到达0.6-0.8。以终浓度1.0mM的IPTG诱导重组蛋白质的表达。培育3小时后,于4℃以8000离心15分钟收获细菌。必要时将细胞存储于-20℃。随后的所有步骤都是在冰上或4℃进行的。将细胞重悬浮于20mM Bicine(pH8.0)、20mM NaCl、10%(v/v)甘油和完整蛋白酶抑制剂(Boehringer-Mannheim)中,并用Branson Sonifier 450破碎细胞。以8000g离心超声处理液30分钟,以沉积未破碎的细胞和包含体。通过添加3.9M(NH4)2SO4,从饱和度为35%v/v到70%v/v之间的溶液中沉淀重组蛋白。以8000g沉积沉淀物30分钟,将其重悬浮于20mM Bicine(pH8.5)、20mM NaCl、10%(v/v)甘油,并用该缓冲液透析6小时或过夜。以13000g离心透析液20分钟,并加到FPLC树脂上。用分步NaCl梯度从该柱洗脱下蛋白质。用SDS-PAGE分析纯化,并用Bradford方法测定蛋白质浓度。
克隆策略和寡核苷酸设计
用以脑膜炎奈瑟球菌B MC58的基因组序列为基础设计的寡核苷酸,通过PCR扩增编码感兴趣抗原的基因。除非特别指出,通常将菌株2996的基因组DNA用作PCR反应的模板,将扩增的片段克隆入表达载体pET21b+(Novagen),从而以C-末端His标记的产物形式表达该蛋白质,或将其克隆入pET-24b+(Novagen)以‘未标记的′形式(如ΔG287K)表达该蛋白质。
当蛋白质不用融合配体和用其自身前导肽(如果存在时)表达时,进行开放读框(ATG到终止密码子)的扩增。
当蛋白质以‘未标记的′的形式表达时,通过从预计的前导序列设计5′-端扩增引物下游除去前导肽。
用于PCR的引物的解链温度取决于整个引物中杂交核苷酸的数量和类型,并用以下公式确定:
Tm1=4(G+C)+2(A+T) (除去尾部的)
Tm2=64.9+0.41(%GC)-600/N (完整的引物)
对整个寡聚物而言,所选寡核苷酸的解链温度通常为65-70℃,仅针对杂交区域,解链温度为50-60℃。
用Perkin Elmer 394 DNA/RNA合成仪合成寡核苷酸,将其从柱上洗脱到2.0ml NH
4OH中,在56℃培育5小时以去保护。加入0.3M乙酸钠和2体积的乙醇沉淀寡聚物。将样品离心,将沉淀物重悬浮于水中。
| |
序列 |
限制酶切位点 |
Orf1L |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-AAAACAACCGACAAACGG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCAGCGGTAGCCTA |
XhoI |
Orf1 |
Fwd |
CTA
GCTAGC-GGACACACTTATTTCGGCATC |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCAGCGGTAGCCTAATTTG |
XhoI |
Orf1LOmpA |
Fwd | |
NdeI-(NheI) |
Rev |
CCCG
CTCGAG |
XhoI |
Orf4L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAAACCTTCTTCAAAACC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTTGGCTGCGCCTTC |
XhoI |
Orf7-1L |
FwdRev |
GCGGC
ATTAAT-ATGTTGAGAAAATTGTTGAAATGGGCGGC
CTCGAG-TTATTTTTTCAAAATATATTTGC |
AseIXhoI |
Orf9-1L |
FwdRev |
GCGGC
CATATG-TTACCTAACCGTTTCAAAATGTGCGGC
CTCGAG-TTATTTCCGAGGTTTTCGGG |
NdeIXhoI |
Orf23L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ACACGCTTCAAATATTC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTTAAACCGATAGGTAAACGCGGATCC
CATATG-GGCAGGGAAGAACCGC |
XhoINdeI |
Orf25-1His |
Fwd |
Rev |
GCCC
AAGCTT-ATCGATGGAATAGCCGCG |
HindIII |
Orf29-1b-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-AACGGTTTGGATGCCCG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTTGTCTAAGTTCCTGATAT |
XhoI |
Orf29-1b-L(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-ATGAATTTGCCTATTCAAAAAT |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAATTCCCACCTGCCATC |
XhoI |
Orf29-1c-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-ATGAATTTGCCTATTCAAAAAT |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTGGACGATGCCCGCGAA |
XhoI |
Orf29-1c-L(MC58)Orf25LOrf37L |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-ATGAATTTGCCTATTCAAAAAT |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTGGACGATGCCCGC |
XhoI |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-TATCGCAAACTGATTGC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CTAATCGATGGAATAGCC |
XhoI |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAACAGACAGTCAAATG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATAACCCGCCTTCAG |
XhoI |
Orf38L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-TTACGTTTGACTGCTTTAGCCGTATGCACC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTTTGCCGCGTTAAAAGCGTCGGCAAC |
XhoI |
Orf40L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AACAAAATATACCGCAT |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCACTGATAACCGAC |
XhoI |
Orf40.2-His |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ACCGATGACGACGATTTAT |
NdeI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-CCACTGATAACCGACAGA |
HindIII |
Orf40.2L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AACAAAATATACCGCAT |
NdeI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TTACCACTGATAACCGAC |
HindIII |
Orf46-2L |
Fwd |
GGGAATTC
CATATG-GGCATTTCCCGCAAAATATC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTTACTCCTATAACGAGGTCTCTTAAC |
XhoI |
Orf46-2 |
Fwd |
GGGAATTC
CATATG-TCAGATTTGGCAAACGATTCTT |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTTACTCCTATAACGAGGTCTCTTAAC |
XhoI |
Orf46.1L |
Fwd |
GGGAATTC
CATATG-GGCATTTCCCGCAAAATATC |
NdeI |
|
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
orf46.(His-GST) |
Fwd |
GGGAATTC
CATATGCACGTGAAATATGATACGAAG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGTTTACTCCTATAACGAGGTCTCTTAAC |
XhoI |
orf46.1-His |
Fwd |
GGGAATTC
CATATGTCAGATTTGGCAAACGATTCTT |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGCGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
orf46.2-His |
Fwd |
GGGAATTC
CATATGTCAGATTTGGCAAACGATTCTT |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGTTTACTCCTATAACGAGGTCTCTTAAC |
XhoI |
Orf65-1-(His/GST)(MC58)Orf72-1L |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-CAAAATGCGTTCAAAATCCC |
BamHI-NdeI |
Rev |
CGCGGATCC
CATATG-AACAAAATATACCGCATCCCG
CTCGAG-TTTGCTTTCGATAGAACGG |
XhoI |
Fwd |
GCGGC
CATATG-GTCATAAAATATACAAATTTGAA |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTAGCCTGAGACCTTTGCAAATT |
XhoI |
Orf76-1L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-AAACAGAAAAAAAACCGCTG |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTACGGTTTGACACCGTTTTC |
XhoI |
Orf83.1LOrf85-2L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAAACCCTGCTCCTC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATCCTCCTTTGCGGC |
XhoI |
Fwd |
GCGGC
CATATG-GCAAAAATGATGAAATGGG |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTATCGGCGCGGCGGGCC |
XhoI |
Orf91L(MC58) |
FwdRev |
GCGGCCATATGAAAAAATCCTCCCTCATCAGCGGCCTCGAGTTATTTGCCGCCGTTTTTGGC |
NdeIXhoI |
Orf91-His(MC58) |
FwdRev |
GCGGCCATATGGCCCCTGCCGACGCGGTAAGGCGGCCTCGAGTTTGCCGCCGTTTTTGGCTTTC |
NdeIXhoI |
Orf97-1L |
FwdRev |
GCGGC
CATATG-AAACACATACTCCCCCTGAGCGGC
CTCGAG-TTATTCGCCTACGGTTTTTTG |
NdeIXhoI |
Orf119L(MC58) |
FwdRev |
GCGGCCATATGATTTACATCGTACTGTTTCGCGGCCTCGAGTTAGGAGAACAGGCGCAATGC |
NdeIXhoI |
Orf119-His(MC58) |
FwdRev |
GCGGCCATATGTACAACATGTATCAGGAAAACGCGGCCTCGAGGGAGAACAGGCGCAATGCGG |
NdeIXhoI |
Orf137.1(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCGCTAGCTGCGGCACGGCGGG |
BamHI-NheI |
Rec |
CCCG
CTCGAGATAACGGTATGCCGCCAG |
XhoI |
Orf143-1L |
FwdRev |
CGCGGATCC
CATATG-GAATCAACACTTTCACCCCG
CTCGAG-TTACACGCGGTTGCTGT |
NdeIXhoI |
008 |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AACAACAGACATTTTG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCTGTCCGGTAAAAG |
XhoI |
050-1(48) |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-ACCGTCATCAAACAGGAA |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAAGATTCGACGGGGA |
XhoI |
105 |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-TCCGCAAACGAATACG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAGTGTTCTGCCAGTTT |
XhoI |
111L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-CCGTCTGAAACACG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAGCGGAGCAGTTTTTC |
XhoI |
117-1 |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ACCGCCATCAGCC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAAAGCCGGGTAACGC |
XhoI |
121-1 |
Fwd |
GCGGC
CATATG-GAAACACAGCTTTACATCGG |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TCAATAATAATATCCCGCG |
XhoI |
122-1 |
FwdRev |
GCGGGC
CATATG-ATTAAAATCCGCAATATCC |
NdeI |
GCGGC
CTCGAG-TTAAATCTTGGTAGATTGGATTTGG |
XhoI |
128-1 |
FwdRev |
GCGGC
CATATG-ACTGACAACGCACTGCTCC |
NdeI |
GCGGC
CTCGAG-TCAGACCGCGGTTGTCGAAAC |
XhoI |
148 |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCGGTTAAAAACATCAAA |
NdeI |
RevFwdRev |
CCCG
CTCGAG-TCAGCCCTTCATACAGCGCGGCATTAATGGCACAAACTACACTCAAACCGCGGCCTCGAGTTAAAACTTCACGTTCACGCCG |
XhoIAseIXhoI |
149.1L(MC58) |
149.1-His(MC58) |
FwdRev |
GCGGCATTAATGCATGAAACTGAGCAATCGGTGGGCGGCCTCGAGAAACTTCACGTTCACGCCGCCGGTAAA |
AseIXhoI |
205(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGGCAAATCCGAAAATACG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGATAATGGCGGCGGCGG |
XhoI |
206L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-TTTCCCCCCGACAA |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCATTCTGTAAAAAAAGTATG |
XhoI |
214(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGCTTCAAAGCGACAGCAG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGTTCGGATTTTTGCGTACTC |
XhoI |
216 |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCAATGGCAGAAAACG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CTATACAATCCGTGCCG |
XhoI |
225-1L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GATTCTTTTTTCAAACC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAGTTCAGAAAGCGGG |
XhoI |
235L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAACCTTTGATTTTAGG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTTGGGCTGCTCTTC |
XhoI |
243 |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GTAATCGTCTGGTTG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CTACGACTTGGTTACCG |
XhoI |
247-1L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-AGACGTAAAATGCTAAAGCTAC |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TCAAAGTGTTCTGTTTGCGC |
XhoI |
264-His |
Fwd |
GCCGC
CATATG-TTGACTTTAACCCGAAAAA |
NdeI |
Rev |
GCCGC
CTCGAG-GCCGGCGGTCAATACCGCCCGAA |
XhoI |
270(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGCGCAATGCGATTTGAC |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGTTCGGCGGTAAATGCCG |
XhoI |
274L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-GCGGGGCCGATTTTTGT |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTATTTGCTTTCAGTATTATTG |
XhoI |
283L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-AACTTTGCTTTATCCGTCA |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTAACGGCAGTATTTGTTTAC |
XhoI |
285-His |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGGTTTGCGCTTCGGGC |
BamHI |
Rev |
GCCC
AAGCTTTTTTCCTTTGCCGTTTCCG |
HindIII |
286-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCGACCTTTCCGAAAA |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GAAGCGCGTTCCCAAGC |
XhoI |
286L(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-CACGACACCCGTACCCCG
CTCGAG-TTAGAAGCGCGTTCCCAA |
NdeIXhoI |
Rev |
287L |
Fwd |
CTA
GCTAGC-TTTAAACGCAGCGTAATCGCAATGG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
287 |
Fwd |
CTA
GCTAGC-GGGGGCGGCGGTGGCG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
287LOrf4 |
Fwd |
CTA
GCTAGCGCTCATCCTCGCCGCC-TGCGGGGGCGGCGGT |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
287-fu |
Fwd |
CGG
GGATCC-GGGGGCGGCGGTGGCG |
BamHI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
287-His |
Fwd |
CTA
GCTAGC-GGGGGCGGCGGTGGCG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGA-ATCCTGCTCTTTTTTGCC* |
XhoI |
287-His(2996) |
Fwd |
CTA
GCTAGC-TGCGGGGGCGGCGGTGGCG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-ATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
Δ1 287-His |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCCGATGTTAAATCGGC§ |
NheI |
Δ2 287-His |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CAAGATATGGCGGCAGT§ |
NheI |
Δ3 287-His |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-GCCGAATCCGCAAATCA§ |
NheI |
Δ4 287-His |
Fwd |
CGC
GCTAGC-GGAAGGGTTGATTTGGCTAATGG§ |
NheI |
Δ4 287-MC58-His |
Fwd |
CGC
GCTAGC-GGAAGGGTTGATTTGGCTAATGG§ |
NheI |
287a-His |
Fwd |
CGC
CATATG-TTTAAACGCAGCGTAATCGC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-AAAATTGCTACCGCCATTCGCAGG |
XhoI |
287b-His |
Fwd |
CGC
CATATG-GGAAGGGTTGATTTGGCTAATGG |
NdeI |
287b-2996-His |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CTTGTCTTTATAAATGATGACATATTTG |
XhoI |
287b-MC58-His |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTTATAAAAGATAATATATTGATTGATTCC |
XhoI |
287c-2996-His |
Fwd |
CGC
GCTAGC-ATGCCGCTGATTCCCGTCAATC§ |
NheI |
‘287未标记的’(2996) |
Fwd |
CTA
GCTAGC-GGGGGCGGCGGTGGCG |
NheI |
Rev | CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCCC | XhoI |
ΔG287-His* |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCCGATGTTAAATCGGC |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-ATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
ΔG287K(2996) |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCGATGTTAAATCGGC |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
ΔG287-L |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-TTTGAACGCAGTGTGATTGCAATGGCTTGTATTTTGCCCTTTCAGCCTGT TCGCCCGATGTTAAATCGGCG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TAATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
ΔG287-Orf4L |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CTCATCCTCGCCGCCTGC TCGCCCGATGTTAAATCG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
292L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAAACCAAGTTAATCAAA |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATGATTTTTGGGATGA |
XhoI |
308-1 |
Fwd |
CGCGGGATCC
CATATG-TTAAATCGGGTATTTTATC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAATCCGCCATTCCCTG |
XhoI |
401L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-AAATTACAACAATTGGCTG |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTACCTTACGTTTTTCAAAG |
XhoI |
406L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-CAAGCACGGCTGCT |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAAGGTTGTCCTTGTCA |
XhoI |
502-1L |
Fwd |
CGCGGATC
CATATG-ATGAAACCGCAACAAC |
NdeI |
Rev |
CCCCG
CTCGAG-TCAGTTGCTCAACACGTC |
XhoI |
502-A(His-GST) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGTAGACGCGCTTAAGCA |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGAGCTGCATGGCGGCG |
XhoI |
503-1L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCACGGGTCGTTATAC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CTACCGCGCATTCCTG |
XhoI |
519-1L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-GAATTTTTCATTATCTTGTT |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTATTTGGCGGTTTTGCTGC |
XhoI |
525-1L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-AAGTATGTCCGGTTATTTTTC |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTATCGGCTTGTGCAACGG |
XhoI |
529-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCGCTAGCGC-TCCGGCAGCAAAACCGA |
BamHI-NheI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-ACGCAGTTCGGAATGGAG |
HindIII |
552L |
Fwd |
GCCGCCATATGTTGAATATTAAACTGAAAACCTTG |
NdeI |
|
Rev |
GCCGCCTCGAGTTATTTCTGATGCCTTTTCCC |
XhoI |
556L |
Fwd |
GCCGCCATATGGACAATAAGACCAAACTG |
NdeI |
|
Rev |
GCCGCCTCGAGTTAACGGTGCGGACGTTTC |
XhoI |
557L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AACAAACTGTTTCTTAC |
NdeI |
|
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCATTCCGCCTTCAGAAA |
XhoI |
564ab-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-CAAGGTATCGTTGCCGACAAATCCGCACCT |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-AGCTAATTGTGCTTGGTTTGCAGATAGGAGTT |
XhoI |
564abL(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AACCGCACCCTGTACAAAGTTGTATTTAACAAACATC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAAGCTAATTGTGCTTGGTTTGCAGATAGGAGTT |
XhoI |
564b-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-ACGGGAGAAAATCATGGCGGTTTCACTTCATG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG- |
XhoI |
564c-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GTTTCAGACGGCCTATACAACCAACATGGTGAAATT |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GCGGTAACTGCCGCTTGCACTGAATCCGTAA |
XhoI |
564bc-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-ACGGGAGAAAATCATGCGGTTTCACTTCATG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GCGGTAACTGCCGCTTGCACTGAATCCGTAA |
XhoI |
564d-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-CAAAGCAAAGTCAAAGCAGACCATGCCTCCGTAA |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTGGAG-TCTTTTCCTTTCAATTATAACTTTAGTAGGTTCAATTTTGGTCCCC |
XhoI |
564cd-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GTTTCAGACGGCCTATACAACCAACATGGTGGAAATT |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCTTTTCCTTTCAATTATAACTTTAGTAGGTTCAATTTTGGTCCCC |
XhoI |
570L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-ACCCGTTTGACCCGCG |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TCAGGCGGGCGTTCATTTCTT |
XhoI |
576-1L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AACACCATTTTCAAAATC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAATTTACTTTTTTGATGTCG |
XhoI |
580L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-GATTCGCCCAAGGTCGG |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-CTACACTTCCCCCGAAGTGG |
XhoI |
583L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ATAGTTGACCAAAGCC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTTTTCCGATTTTTCGG |
XhoI |
593 |
Fwd |
GCGGC
CATATG-CTTGAACTGAACGGACT |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TCAGCGGAAGCGGACGATT |
XhoI |
650(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGTCCAAACTCAAAACCATCG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGGCTTCCAATCAGTTTGACC |
XhoI |
652 |
Fwd |
GCGGC
CATATG-AGCGCAATCGTTGATATTTC |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTATTTGCCCAGTTGGTAGAATG |
XhoI |
664L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-GTGATACATCCGCACTACTTC |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TCAAAATCGAGTTTTACACCA |
XhoI |
726 |
Fwd |
GCGGC
CATATG-ACCATCTATTTCAAAAACGG |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TCAGCCGATGTTTAGCGTCCATT |
XhpI |
741-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AGCAGCGGAGGGGGTG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTGCTTGGCGGCAAGGC |
XhoI |
ΔG741-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GTCGCCGCCGACATCG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTGCTTGGCGGCAAGGC |
XhoI |
686-2-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GGCGGTTCGGAAGGCG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTGAACACTGATGTCTTTTCCGA |
XhoI |
719-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCGCTAGC-AAACTGTCGTTGGTGTTAAC |
BamHI-NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTGACCCGCTCCACGG |
XhoI |
730-His(MC58) |
Fwd |
GCCGCCATATGGCGGACTTGGCGCAAGACCC |
NdeI |
|
Rev |
GCCGCCTCGAGATCTCCTAAACCTGTTTTAACAATGCCG |
XhoI |
730A-His(MC58) |
Fwd |
GCCGCCATATGGCGGACTTGGCGCAAGACCC |
NdeI |
|
Rev |
GCGGCCTCGAGCTCCATGCTGTTGCCCCAGC |
XhoI |
730B-His(MC58) |
Fwd |
GCCGCCATATGGCGGACTTGGCGCAAGACCC |
NdeI |
|
Rev |
GCGGCCTCGAGAAAATCCCCGCTAACCGCAG |
XhoI |
741-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AGCAGCGGAGGGGGTG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTTGCTTGGCGGCAAGGC |
XhoI |
ΔG741-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GTCGCCGCCGACATCG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTGCTTGGCGGCAAGGC |
XhoI |
743(His-GST) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGACGGTGTTGTGCCTGTT |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGCTTACGGATCAAATTGACG |
XhoI |
757(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGGCAGCCAATCTGAAGAA |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGCTCAGCTTTTGCCGTCAA |
XhoI |
759-His/GST(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCGCTAGC-TACTCATCCATTGTCCGC |
BamHI-NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CCAGTTGTAGCCTATTTTG |
XhoI |
759L(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-ATGCGCTTCACACACAC |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCAGTTGTAGCCTATTT |
XhoI |
760-His |
FwdRevFwd |
GCCGCCATATGGCACAAACGGAAGGTTTGGAAGCCGCCTCGAGAAAACTGTAACGCAGGTTTCCGTCGCGGCCATATGGAAGAAACACCGCGCGAACCG |
NdeIXhoINdeI |
|
769-His(NC58) |
|
Rev |
GCGGCCTCGAGGAACGTTTTATTAAACTCGAC |
XhoI |
907L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-AGAAAACCGACCGATACCCTA |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TCAACGCCACTGCCAGCGGTTG |
XhoI |
911L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAGAAGAACATATTGGAATTTTGGGTCGGACTG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTCGGCGGCTTTTCCCGCATTGCCG |
XhoI |
911LOmpA |
Fwd |
GGGAATTC
CATATGAAAAAGACAGCTATCGCGATTGCAGTGGCACTGGCTGGTTTCGCTACCGTAGCGCAGGCC
GC TAGC-GCTTTCCGCGTGGCCGGCGGTGC |
NdeI-(NheI) |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTCGGCGGCTTTTTCCGCATTGCCG |
XhoI |
911LPelB |
Fwd |
CATG
CCATGG-CTTTCCGCGTGGCCGGCGGTGC |
NcoI |
Rev |
CCCCG
CTCGAG-TTATTCGGCGGCTTTTTCCGCATTGCCG |
XhoI |
913-His/GST(MC58) |
FwdRev |
CGC
GGATCCCATATG-TTTGCCGAAACCCGCCCCCGC
CTCGAG-AGGTTGTGTTCCAGGTTG |
BamHI-NdeIXhoI |
913L(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAAAAAACGCCTATG |
NdeI |
Rev |
CCCCG
CTCGAG-TTAAGGTTGTGTTCCAGG |
XhoI |
919L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAAAAATACCTATTCCGC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACGGGCGGTATTCGG |
XhoI |
919 |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-CAAAGCAAGAGCATCCAAA |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACGGGCGTATTCGG |
XhoI |
919LOrf4 |
Fwd |
GGGAATTC
CATATGAAAACCTTCTTCAAAACCCTTTCCGCCGCCGC
GCTAGCGCTCATCCTCGCCGCC-TGCCAAAGCAAGAGCATC |
NdeI-(NheI) |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACGGGCGGTATTCGGGCTTCATACCG |
XhoI |
(919)-287fusion |
Fwd |
CGCGGATCC
GTCGAC-TGTGGGGGCGGCGGTGGC |
SalI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAATCCTGCTCTTTTTTGCC |
XhoI |
920-1L |
Fwd |
GCGGC
CATATG-AAGAAAACATTGACACTGC |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTAATGGTGCGAATGACCGAT |
XhoI |
925-His/GST(MC58)GATE |
FwdRev |
ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggctTGCGGCAAGGATGCCGGggggaccactttgtacaagaaagctgggtCTAAAGCAACAATGCCGG |
attB1attB2 |
|
926L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAACACACCGTATCC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATCTCGTGCGCGCC |
XhoI |
927-2-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AGCCCCGCGCCGATT |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTTTTGTGCGGTCAGGCG |
XhoI |
932-His/GST(MC58)GATE |
Fwd |
ggggacaagtttgtacaaaagcaggctTGTTCGTTTGGGGGATTTAAACCAAACCAAATC |
attBI |
935(His-GST)(MC58) |
For |
CGC
GGATCCCATATGGCGGATGCGCCCGCG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGAAACCGCCAATCCGCC |
XhoI |
936-1L |
Rev |
ggggaccactttgtacaagaaagcggggtTCATTTTGTTTTTCCTTCTTCTCGAGGCCATT |
attB2 |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAACCCAAACCGCAC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAGCGTTGGACGTAGT |
XhoI |
953L |
Fwd |
GGGAATTC
CATATG-AAAAAAATCATCTTCGCCG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTGTTTGGCTGCCTCGAT |
XhoI |
953-fu |
Fwd |
GGGAATTC
CATATG-GCCACCTACAAAGTGGACG |
NdeI |
Rev |
CGG
GGATCC-TTGTTTGGCTGCCTCGATTTG |
BamHI |
954(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGCAAGAACAATCGCAGAAAG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGTTTTTTCGGCAAATTGGCTT |
XhoI |
958-His/GST(MC58)GATE |
FwdRev |
ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggctGCCGATGCCGTTGCGGggggaccactttgtacaagaaagctgggtTCAGGGTCGTTTGTTGCG |
attB1attB2 |
961L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAACACTTTCCATCC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCACTCGTAATTGAC |
XhoI |
961 |
Fwd |
CCCG
CTCGAG-TTACCACTCGTAATTGAC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACCACTCGTAATTGAC |
XhoI |
961c(His/GST) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GCCACAAACGACG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-ACCCACGTTGTAAGGTTG |
XhoI |
961c-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GCCACAAGCGACGACGA |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-ACCCACGTTGTAAGGTTG |
XhoI |
961c-L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ATGAAACACTTTCCATCC |
NdeI |
Rev |
CCG
CTCGAG-TTAACCCACGTTGTAAGGT |
XhoI |
961c-L(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ATGAAACACTTTCCATCC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTAACCCACGTTGTAAGGT |
XhoI |
961d(His/GST) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GCCACAAACGACG |
BamHI-NdeI |
|
Rev |
CCCG
CTCGAG-GTCTGACACTGTTTTATCC |
XhoI |
961Δ1-L |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ATGAAACACTTTCCATCC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATGCTTTGGCGGCAAAG |
XhoI |
fu961-... |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAACGACGAC |
NdeI |
Rev |
CGC
GGATCC-CCACTCGTAATTGACGCC |
BamHI |
fu961-...(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAGCGACGAC |
NdeI |
Rev |
CGC
GGATCC-CCACTCGTAATTGACGCC |
BamHI |
fu961c-... |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAACGACGAC |
NdeI |
|
Rev |
CGC
GGATCC-ACCCACGTTGTAAGGTTG |
BamHI |
fu961c-L-... |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-ATGAAACACTTTCCATCC |
NdeI |
Rev |
CGC
GGATCC-ACCCACGTTGTAAGGTTG |
BamHI |
fu(961)-741(MC58)-His |
Fwd |
CGC
GGATCC-GGAGGGGGTGGTGTCG |
BamHI |
Rev |
CCC
GCTCGAG-TTGCTTGGCGGCAAGGC |
XhoI |
fu(961)-983-His |
Fwd |
CGC
GGATCC-GGCGGAGGCGGCACCTT |
BamHI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GAACCGGTAGCCTACG |
XhoI |
fu(961)-Orf46.1-His |
Fwd |
CGC
GGATCCGGTGGTGGTGGT-TCAGATTTGGCAAACGATTC |
BamHI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
fu(961c-L)-741(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCC-GGAGGGGGTGGTGTCG |
BamHI |
|
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTGCTTGGCGGCAAG |
XhoI |
fu(961c-L)-983 |
Fwd |
CGC
GGATCC-GGCGGAGGCGGCACTT |
BamHI |
Rev |
CCCG
CTGGAG-TCAGAACCGGTAGCCTAC |
XhoI |
fu(961c-L)-Orf46.1 |
Fwd |
CGC
GGATCCGGTGGTGGTGGT-TCAGATTTGGCAAACGATTC |
BamHI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTACGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
961-(His/GST) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GCCAACAAGCGACGACG |
BamHI-NdeI |
(MC58) |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CCACTCGTAATTGACGCC |
XhoI |
961Δ1-His961a-(His/GST) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAACGACGAC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TGCTTTGGCGGCAAAGTT |
XhoI |
FwdRev |
CGCGGATCC
CATATG-GCCACAAACGACGACCCCG
CTCGAG-TTTAGCAATATTATCTTTGTTCGTAGC |
BamHI-NdeIXhoI |
961b-(His/GST) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATGG-AAAGCAAACCGTGCCGA |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CCACTCGTAATTGACGCC |
XhoI |
961-His/GSTGATE |
FwdRev |
ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggctGCAGCCACAAACGACGACGATGTTAAAAAAGCggggaccactttgtacaagaaagctgggtTTACCACTCGTAATTGACGCCGACATGGTAGG |
attB1attB2 |
|
982 |
Fwd |
GCGGC
CATATG-GCAGCAAAAGACGTACAGTT |
NdeI |
Rev |
GCGGC
CTCGAG-TTACATCATGCCGCCCATACCA |
XhoI |
983-His(2996) |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-TTAGGCGGCGGCGGAG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GAACCGGTAGCCTACG |
XhoI |
ΔG983-His(2996) |
Fwd |
CCCCTA
GCTAGC-ACTTCTGCGCCCGACTT |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GAACCGGTAGCCTACG |
XhoI |
983-His |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-TTAGGCGGCGGCGGAG |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GAACCGGTAGCCTACG |
XhoI |
ΔG983-His |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-ACTTCTGCGCCCGACTT |
NheI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GAACCGGTAGCCTACG |
XhoI |
983L |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CGAACGACCCCAACCTTCCCTACAAAAACTTTCAA |
NheI |
RevFwdRev |
CCCG
CTCGAG-TCAGAACCGACGTGCCAAGCCGTTCGCCGCCATATGCCCCCACTGGAAGAACGGACGGCCGCCTCGAGTAATAAACCTTCTATGGGCAGCAG |
XhoINdeIXhoI |
987-His(MC58) |
|
989-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-TCCGTCCACGCATCCG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTTGAATTTGTAGGTGTATTGCGCGGATCC
CATATG-ACCCCTTCCGCACT |
XhoINdeI |
989L(MC58) |
Fwd |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTTGAATTTGTAGGTGTAT |
XhoI |
CrgA-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-AAAACCAATTCAGAAGAA |
NdeI |
RevFwd |
CCCG
CTCGAG-TCCACAGAGATTGTTTCCGATGCCCGAAGGGCGGG |
XhoI |
PilC1-ES(MC58) |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TCAGAAGAAGACTTCACGC | |
PilC1-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-CAAACCCATAAATACGCTATT |
NdeI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-GAAGAAGACTTCACGCCAG |
HindIII |
Δ1PilC1-His(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GTCTTTTTCGACAATACCGA |
NdeI |
Rev |
GCCC
AAGCTT- |
HindIII |
PilC1L(MC58) |
FwdRev |
CGCGGATCC
CATATG-AATAAAACTTTAAAAAGGCGGGCCC
AAGCTT-TCAGAAGAAAGACTTCACGC |
NdeIHindIII |
ΔGTbp2-His(MC58) |
Fwd |
CGCGAATCC
CATATG-TTCGATCTTGATTCTGTCGA |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCGCACAGGCTGTTGGCG |
XhoI |
Tbp2-His(MC58) |
Fwd |
CGCGAATCC
CATATG-TTGGGCGGAGGCGGCAG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCGCACAGGCTGTTGGCG |
XhoI |
Tbp2-His(MC58) |
Fwd |
CGCGAATCC
CATATG-TTGGGCGGAGGCGGCAG |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCGCACAGGCTGTTGGCG |
XhoI |
NMB0109-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GCAAATTTGGAGGTGCGC |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTCGGAGCGGTTGAAGC |
XhoI |
NMB0109L(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-CAACGTCGTATTATAACCC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTATTCGGAGCGGTTGAAG |
XhoI |
NMB0207-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GGCATCAAAGTCGCCATCAACGGCTAC |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTTGAGCGGGCGCACTTCAAGTCCG |
XhoI |
NMB0462-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GGCGGCAGCGAAAAAAAC |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GTTGGTGCCGACTTTGAT |
XhoI |
NMB0623-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GGCGGCGGAAGCGATA |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTTGCCCGCTTTGAGCC |
XhoI |
NMB0625(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGGCAAATCCGAAAATACG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGCATCCCGTACTGTTTCG |
XhoI |
NMB0634(His/GST)(MC58) |
Fwd |
ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggctCCGACATTACCGTGTACAACGGCCAACAAAGAA |
attB1 |
Rev |
ggggaccactttgtacaagaaagctgggtCTTATTTCATACCGGCTTGCTCAAGCAGCCGG |
attB2 |
NMB0776-His/GST(MC58)GATE |
FwdRev |
ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggctGATACGGTGTTTTCCTGTAAAACGGACAACAAggggaccactttgtacaagaaagctgggtCTAGGAAAAATCGTCATCGTTGAAATTCGCC |
attB1attB2 |
NMB1115-His/GST(MC58)GATE |
FwdRev |
ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggctATGCACCCCATCGAAACCggggaccactttgtacaagaaagctgggtCTAGTCTTGCAGTGCCTC |
attB1attB2 |
NMB1343-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-GGAAATTTCTTATATAGAGGCATTAG |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GTTAATTTCTATCAACTCTTTAGCAATAAT |
XhoI |
NMB1369(His-GST(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGCCTGCCAAGACGACA |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGCCGCCTCCTGCCGAAA |
XhoI |
NMB1551(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGGCAGAGATCTGTTTGATAA |
BamHI-Ndei |
Rev |
CCCG
CTCGAGCGGTTTTCCGCCCAATG |
XhoI |
NMB1899(His-GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATGCAGCCGGATACGGTC |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAGAATCACTTCCAACACAAAAT |
XhoI |
NMB2050-(His/GST)(MC58) |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-TGGTTGCTGATGAAGGGC |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GACTGCTTCATCTTCTGC |
XhoI |
NMB2050L(MC58) |
Fwd |
CGCGGATCC
CATATG-GAACTGATGACTGTTTTGC |
NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TCAGACTGCTTCATCTTCT |
XhoI |
NMB2159-(His/GST)(MC58)fu-ΔG287...-His |
Fwd |
CGC
GGATCCCATATG-AGCATTAAAGTAGCGATTAACGGTTTCGGC |
BamHI-NdeI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GATTTTGCCTGCGAAGTATTCCAAAGTGCG |
XhoI |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCCGATGTTAAATCGGC |
NheI |
|
Rev |
CGG
GGATCC-ATCCTGCTCTTTTTTGCCGG |
BamHI |
fu-(ΔG287)-919-His |
Fwd |
CGC
GGATCCGGTGGTGGTGGT-CAAAGCAAGAGCATCCAAACC |
BamHI |
Rev |
CCC
AAGCTT-TTCGGGCGGTATTCGGGCTTC |
GindIII |
fu-(ΔG287)-953-His |
Fwd |
CGC
GGATCCGGTGGTGGTGGT-GCCACCTACAAAGTGGAC |
BamHI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-TTGTTTGGCTGCCTCGAT |
HindIII |
fu-(ΔG287)-961-His |
Fwd |
CGC
GGATCCGGTGGTGGTGGT-ACAAGCGACGACG |
BamHI |
Rev |
GCCC
AAGCTT-CCACTCGTAATTGACGCC |
HindIII |
fu-(ΔG287)-Orf46.1-His |
Fwd |
CGC
GGATCCGGTGGTGGTGGT-TCAGATTTGGCAAACGATTC |
BamHI |
Rev |
CCC
AAGCTT-CGTATCATATTTCACGTGC |
HindIII |
fu-(ΔG287-919)-Orf46.1-His |
Fwd |
CCCC
AAGCTTGGTGGTGGTGGTGGT-TCAGATTTGGCAAACGATTC |
HindIII |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
fu-(ΔG287-Orf46.1)-919-His |
Fwd |
CCC
AAGCTTGGTGGTGGTGGTGGT-CAAAGCAAGAGCATCCAAACC |
HindIII |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CGGGCGGTATTCGGGCTT |
XhoI |
fuΔG287(394.98)-... |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-CCCGATGTTAAATCGGC |
NheI |
Rev |
CGG
GGATCC-ATCCTGCTCTTTTTTGCCGG |
BamHI |
fuOrf1-(Orf46.1)-His |
Fwd |
CGCGGATCC
GCTAGC-GGACACACTTATTTCGGCATC |
NheI |
Rev |
CGC
GGATCC-CCAGCGGTAGCCTAATTTGAT | |
fu(Orf1)-Orf46.1-His |
Fwd |
CGC
GGATCCGGTGGTGGTGGT-TCAGATTTGGCAAACGATTC |
BamHI |
Rev |
CCC
AAGCTT-CGTATCATATTTCACGTGC |
HindIII |
fu(919)-Orf46.1-His |
Fwd1 |
GCGGC
GTCGACGGTGGCGGAGGCACTGGATCCTCAG |
SalI |
Fwd2 |
GGAGGCACTGGATCCTCAGATTTGGCAAACGATTC | |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
Fuorf46-.... |
Fwd |
GGAATTC
CATATGTCAGATTTGGCAAACGATTC |
NdeI |
Rev |
CGC
GGATCCCGTATCATATTTCACGTGC |
BamHI |
Fu(orf46)-287-His |
Fwd |
CGG
GGATCCGGGGGCGGCGGTGGCG |
BamHI |
Rev |
CCC
AAGCTTATCCTGCTCTTTTTTGCCGGC |
HindIII |
Fu(orf46)-919-His |
Fwd |
CGC
GGATCCGGTGGTGGTGGTCAAAGCAAGAGCATCCAAACC |
BamHI |
Rev |
CCC
AAGCTTCGGGCGGTATTCGGGCTTC |
HindIII |
Fu(orf46-919)-287-His |
Fwd |
CCCC
AAGCTTGGGGGCGGCGGTGGCG |
HindIII |
Rev |
CCCG
CTCGAGATCCTGCTCTTTTTTGCCGGC |
XhoI |
Fu(orf46-287)-919-His |
Fwd |
CCC
AAGCTTGGTGGTGGTGGTGGTCAAAGCAAGAGCATCCAAACC |
HindIII |
Rev |
CCCG
CTCGAGCGGGCGGTATTCGGGCTT |
XhoI |
(ΔG741)-961c-His |
Fwd1Fwd2 |
GGAGGCACTGGATCCGCAGCCACAAACGACGACGAGCGGC
CTCGAG-GGTGGCGGAGGCACTGGATCCGCAG |
XhoI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-ACCCAGCTTGTAAGGTTG |
XhoI |
(ΔG741)-961-His |
Fwd1Fwd2 |
GGAGGCACTGGATCCGCAGCCACAAACGACGACGAGCGGC
CTCGAG-GGTGGCGGAGGCACTGGATCCGCAG |
XhoI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CCACTCGTAATTGACGCC |
XhoI |
(ΔG741)-983-His |
Fwd |
GCGGC
CTCGAG-GGATCCGGCGGAGGCGGCACTTCTGCG |
XhoI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-GAACCGGTAGCCTACG |
XhoI |
(ΔG741)-orf46.1-His |
Fwd1Fwd2 |
GGAGGCACTGGATCCTCAGATTTGGCAAACGATTCGCGGC
GTCGACGGTGGCGGAGGCACTGGATCCTCAGA |
SalI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
(ΔG983)-741(MC58)-His |
Fwd |
GCGGC
CTCGAG-GGATCCGGAGGGGGTGGTGTCGCC |
XhoI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-TTGCTTGGCCGGCAAG |
XhoI |
(ΔG983)-961c-His |
Fwd1Fwd2 |
GGAGGCACTGGATCCGCAGCCACAAACGACGACGAGCGGC
CTCGAG-GGTGGCGGAGGCACTGGATCCGCAG |
XhoI |
|
Rev |
CCCG
CTCGAG-ACCCAGCTTGTAAGGTTG |
XhoI |
(ΔG983)-961-His |
Fwd1Fwd2 |
GGAGGCACTGGATCCGCAGCCACAAACGACGACGAGCGGC
CTCGAG-GGTGGCGGAGGCACTGGATCCGCAG |
XhoI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CCACTCGTAATTGACGCC |
XhoI |
(ΔG983)-Orf46.1-His |
Fwd1Fwd2 |
GGAGGCACTGGATCCTCAGATTTGGCAAACGATTCGCGGC
GTCGACGGTGGCGGAGGCACTGGATCCTCAGA |
SalI |
Rev |
CCCG
CTCGAG-CGTATCATATTTCACGTGC |
XhoI |
*将该引物用作反向引物,将所有287的C未端融合于His-标记。
§与287-His反向引物联用的正向引物。
NB-所有PCR反应使用菌株2996,除非特别指出(如菌株MC58)。
在所有以ATG起始不跟随唯一NheI位点的构建物中,ATG密码子是用于克隆的NdeI位点的一部分。在5′端用NheI作为克隆位点制备的构建物(如所有那些在N-未端包含287的)另有两个融合于抗原的编码序列的密码子(GCTAGC)。
染色体DNA模板的制备
在100ml GC培养基中使脑膜炎奈瑟球菌菌株2996、MC58、394.98、1000和BZ232(及其它)生长至指数期,离心收获,并重悬浮于5ml缓冲液(20%w/v蔗糖、50mM Tris-HCl、50mM EDTA、pH8)中。在冰上培育10分钟后,加入10ml裂解液(50mM NaCl、1%十二烷基肌氨酸钠(Na-Sarkosyl)、50μg/ml蛋白酶K)裂解细菌,悬浮液在37℃培育2小时。进行2次苯酚提取(平衡至pH8)和一次CHCl3/异戊醇(24∶1)提取。加入0.3M乙酸钠和2体积乙醇沉降DNA,并离心收集。用70%(v/v)乙醇洗涤沉淀物1次,并重溶解于4.0ml TE缓冲液(10mM Tris-HCl、1mM EDTA、pH8.0)。读取OD260测定DNA浓度。
PCR扩增
标准的PCR过程进行如下:在40μM各寡核苷酸引物、400-800μM dNTP溶液、1×PCR缓冲液(包含1.5mM MgCl2)、2.5单位TaqI DNA聚合酶(用Perkin-Elmer AmpliTaQ,Boerhingher Mannheim ExpandTM长模板)存在时,将200ng 2996、MC581000、或BZ232菌株的基因组DNA或10ng重组克隆的质粒DNA制备物用作模板。
将整个混合物在95℃初步培育3分钟后,每份样品进行2-步的扩增:用除去引物(Tm1)的限制酶尾部的杂交温度进行前5轮。然后以按全长?聚物(Tm2)计算的杂交温度进行30轮。根据要扩增的Orf的长度,在68℃或72℃进行的延伸时间各不相同。对Orf1而言,自3分钟开始的延伸时间每轮递增15秒。以在72℃10分钟延伸步骤完成循环。
将扩增的DNA直接加到1%琼脂糖凝胶上。按制造商说明,用Qiagen凝胶提取试剂盒纯化相应于正确大小条带的DNA片段。
PCR片段和克隆载体的消化
用适合的限制酶消化相应于扩增片段的纯化DNA,从而克隆入pET-21b+、pET22b+、或pET-24b+。用QIAquick PCR纯化试剂盒(按制造商的说明)纯化消化的片段,用H2O或10mM Tris(pH8.5)洗脱。用适合的限制酶消化质粒载体,加到1.0%琼脂糖凝胶上,用Qiagen AIQquick凝胶提取试剂盒纯化相应于消化的载体的条带。
克隆
将预先消化和纯化的、相应于各基因的片段连接到pET21b+、pET22b+或pET-24b+中。将在连接缓冲液(由制造商提供)中的T4 DNA连接酶用于摩尔比为3∶1的片段/载体。
通过在冰上培育连接酶反应溶液和细菌40分钟,然后在37℃培育3分钟,将重组质粒转化入感受态大肠杆菌DH5或HB101中。
然后添加800μl LB肉汤,并在37℃培育20分钟。在Eppendorf微型离心机中以最高速度离心这些细胞,并重悬浮于约200μl的上清液中,并涂布在到LB氨苄青霉素(100mg/ml)琼脂上。
在4.0ml LB肉汤+100μg/ml氨苄青霉素中培育随机选择的集落过夜,进行重组集落的筛选。使细胞沉淀,并按制造商的说明用Qiagen QIAprep SpinMiniprep试剂盒提取质粒DNA。用适合的限制酶消化约1μg的各微型制备物,将消化物加到1-1.5%琼脂糖凝胶(取决于预计的插入大小)与分子量标记(1kbDNA Ladder,GIBCO)平行。根据插入的大小选择阳性克隆。
表达
各基因克隆入表达载体后,将重组质粒转化入适合表达重组蛋白的大肠杆菌菌株中。如上所述,用1μl各构建物转化大肠杆菌BL21-DE3。将单重组集落接种入2ml LB+Amp(100μg/ml)中,在37℃培育过夜,然后在100ml烧瓶中用20ml LB+Amp(100μg/ml)以1∶30稀释,使OD600在0.1-0.2之间。将烧瓶置于旋转式水浴摇床中于30℃或37℃培育,直到OD600显示适合诱导表达的指数生长期(0.4-0.8OD)。加入1.0mM IPTG诱导蛋白质表达。在30℃或37℃培育3小时后,测定OD600并检测表达。用微型离心机离心1.0ml各样品,将沉淀物重悬浮于PBS中,用SDS-PAGE和考马斯蓝染色分析。
Gateway克隆和表达
克隆GATE标记的序列,并用GATEWAY克隆方法(GIBCO-BRL)表达。重组克隆(CR)是根据介节噬菌体整合入大肠杆菌基因组和从大肠杆菌基因组切除噬菌体的重组反应。整合包括在位于细菌基因组attB位点中的噬菌体DNA的attP位点的重组(BP反应)和产生侧翼于attL和attR位点的整合的噬菌体基因组。切除将attL和attR位点重组回attP和attB位点(LR反应)。整合反应需要两种酶[噬菌体蛋白融合酶(Int)和细菌蛋白整合宿主因子(IHF)](BP克隆酶)。切除反应需要Iht、IHF和其它噬菌体酶切除酶(Xis)(LR克隆酶)。将25-bp细菌attB重组位点的人工衍生物(涉及B1和B2)加到用于PCR反应的引物的5′端,以扩增奈瑟球菌的ORF。用BP克隆酶,将得到的产物BP克隆入包含噬菌体attP重组位点的互补衍生物的“供体载体”中。得到的“进入克隆”包含侧翼于attL位点的衍生物(L1和L2)的ORF,用LR克隆酶将其亚克隆入包含attL-相容的attR位点的衍生物的表达“目的载体”中。得到“表达克隆”,其中ORF侧翼于B1和B2,且在读框内融合于GST或His N未端标记。
用于GATEWAY表达的大肠杆菌菌株是BL21-SI。通过在含有盐(0.3MNaCl)的培养基中培育,诱导该菌株的细胞表达T7 RNA聚合酶。
要注意的是该系统产生N-未端His标记。
膜蛋白的制备
分离主要由内膜、外膜或全膜构成的组分,以获得由膜定位的前导序列表达的重组蛋白。制备膜组分(富含重组蛋白)的方法是采用Filip等[J.Bact.(1973)115:717-722]和Davies等人[J.Innunol.Meth.(1990)143:215-225]的方法。于37℃,在20ml LB/Amp(100μg/ml)液体培养基中使携带感兴趣质粒中的单集落生长过夜。用1.0L新鲜培养基以1∶30稀释细菌,让其在30℃或37℃生长直到OD550达到0.6-0.8。用终浓度为1.0mM的IPTG诱导重组蛋白的表达。培育3小时后,在4℃以8000g离心15分钟收获细菌,并重悬浮于20ml 20mM Tris-HCl(pH7.5)和完整的蛋白酶抑制剂(Boehringer-Mannheim)中。随后的所有步骤都是在4℃或冰上进行的。
用Branson Sonifier 450进行超声处理破碎细胞,并以5000g离心20分钟以沉积未破碎的细胞和包含体。以50000g(Beckman Ti50,29000rpm)离心包含膜和细胞碎片的上清液75分钟,用20mM Bis-Tris丙烷(pH6.5)、1.0M NaCl、10%(v/v)甘油洗涤,并以50000g再次离心75分钟。将沉淀物重悬浮于20mMTris-HCl(pH7.5)、2.0%(v/v)十二烷基肌氨酸钠、完整的蛋白酶抑制剂(1.0mMEDTA终浓度),并培育20分钟以溶解内膜。以5000g离心沉淀的细胞碎片10分钟,以75000g离心上清液75分钟(Beckman Ti50,33000rpm)。在上清液中发现蛋白质008L和519L,表明内膜的定位。对这些蛋白质,用内膜和全膜组分(如上所述用NaCl洗涤)免疫接种小鼠。用20mM Tris-HCl(pH7.5)洗涤从75000g沉淀物得到的外膜小泡,并以75000g离心75分钟或过夜。最后将OMV重悬浮于500μl 20mM Tris-HCl(pH7.5)、10%v/v甘油中。Orf1L和Orf40L都定位于且在外膜组分中富含,将其用于免疫接种小鼠。用标准Bradford试验(Bio-Rad)计算蛋白质浓度,用DC蛋白质试验(Bio-Rad)确定内膜组分的蛋白质浓度。用SDS-PAGE分析分离步骤中的各种组分。
His-标记的蛋白质的纯化
从菌株2996和MC58中克隆了287的各种形式。用C-未端His标记的融合体进行构建,其包括成熟形式(aa18-427)、含缺失(Δ1、Δ2、Δ3和Δ4)的构建物和由B或C结构域组成的克隆。对以His-融合体纯化的各克隆而言,划线接种单集落,并且在37℃ LB/Amp(100μg/ml)琼脂板上培育过夜。将从该平板上分离的集落接种到20ml LB/Amp(100μg/ml)的液体培养基中,并在37℃振荡生长过夜。以1∶30将过夜培养物稀释到1.0L LB/Amp(100μg/ml)液体培养基中,让其在最佳温度(30或37℃)生长,直到OD550达到0.6-0.8。添加IPTG(终浓度为1.0mM)诱导重组蛋白的表达,再培育培养物3小时。于4℃,以8000g离心15分钟收获细菌。将细菌沉淀重物悬浮于7.5ml(i)冷缓冲液A(300mMNaCl、50mM磷酸盐缓冲液、10mM咪唑、pH8.0),用于可溶性蛋白质;或(ii)缓冲液B(10mM Tirs-HCl、100mM磷酸盐缓冲液,pH8.8和任选地8M尿素),用于不溶性蛋白质。以可溶形式纯化的蛋白质包括287-His、Δ1、Δ2、Δ3和Δ4287-His、Δ4287MC58-His、287c-His和287cMC58-His。蛋白质287bMC58-His是不溶的并相应地纯化。用Branson Sonifier 450,在冰上以40W、30秒超声处理破坏细胞4次,并于4℃以13000×g离心30分钟。对于不溶蛋白质,将沉淀物重悬浮于2.0ml缓冲液C(6M盐酸胍、100mM磷酸盐缓冲液、10mM Tris-HCl、pH7.5),并用Dounce匀浆器处理10次。以13000g离心匀浆30分钟并保留上清液。将可溶的和不溶制备物的上清液与150μl Ni2+-树脂(预先用缓冲液A或缓冲液B平衡)混合,并在室温温和振荡培育30分钟。树脂是按制造商说明制备的Chelating Sepharose Fast Flow(Pharmcia)。于4℃,以700g离心分批制备物5分钟,弃去上清液。用10ml缓冲液A或B洗涤树脂2次(分批)10分钟,重悬浮于1.0ml缓冲液A或B中,加到一次性柱上。用(i)缓冲液A(4℃)或(ii)缓冲液B(室温)持续洗涤树脂,直到流出物的OD280达到0.02-0.01。再用(i)冷缓冲液C(300mM NaCl、50mM磷酸盐缓冲液、20mM咪唑、pH8.0)或(ii)缓冲液D(10mM Tris-HCl、100mM磷酸盐缓冲液、pH6.3和任选地8M尿素)进一步洗涤树脂,直到流出物的OD280达到0.02-0.01。加入700μl(i)冷洗脱缓冲液A(300mM NaCl、50mM磷酸盐缓冲液、250mM咪唑、pH8.0)或(ii)洗脱缓冲液B(10mM Tris-HCl、100mM磷酸盐缓冲液、pH4.5和任选地8M尿素)洗脱His-融合蛋白,收集组分直到OD280显示获得了所有重组蛋白。用SDS-PAGE分析20μl量的各洗脱组分。用Bradford试验计算蛋白质浓度。
变性的His-融合蛋白的复性
需要变性以稳定287bMC8,因此在免疫接种前需要进行复性步骤。将甘油加到上述得到的变性组分中,使终浓度为10%v/v。用透析缓冲液I(10%v/v甘油,0.5M精氨酸、50mM磷酸盐缓冲液、5.0mM还原的谷胱甘肽、0.5mM氧化的谷胱甘肽、2.0M尿素,pH8.8)将蛋白质稀释至200μg/ml,用相同的缓冲液在4℃透析12-14小时。于4℃,用缓冲液II(10%v/v甘油,0.5M精氨酸、50mM磷酸盐缓冲液、5.0mM还原的谷胱甘肽、0.5mM氧化的谷胱甘肽、pH8.8)再进行透析12-14小时。用以下公式计算蛋白质的浓度:
蛋白质(mg/ml)=(1.55×OD280)-(0.76×OD260)
氨基酸序列分析
根据制造商的推荐,用配备在线乙内酰苯硫脲-氨基酸分析仪(System Gold)的Beckman测序仪(LF 3000)进行蛋白质NH2-末端的自动测序分析。
免疫接种
在第0、21和35天,用抗原免疫接种Balb/C小鼠,在第49天分析血清。
血清分析-ELISA
将不包囊的MenB M7和包囊的菌株置于巧克力琼脂板上,在37℃、5%CO2中培育过夜。用无菌Dracon刷从琼脂板上收集细菌菌落,并接种到含有0.25%葡萄糖的Mueller-Hinton肉汤(Difco)中。每30分钟监测一次细菌的生长,随后测定OD620。让细菌生长直到OD达到0.4-0.5。将培养物以4000rpm离心10分钟。弃去上清液,用PBS洗涤细菌2次,重悬浮于含有0.025%甲醛的PBS中,并在37℃培育1小时,然后在4℃搅拌培育过夜。在96孔Greiner板的各孔中添加100μl细菌细胞,并在4℃培育过夜。然后用PBT洗涤缓冲液(0.1%Tween-20的PBS溶液)冲洗这些孔3次。在各孔中加入200μl饱和缓冲液(2.7%聚乙烯吡咯烷酮10的水溶液),将这些平板在37℃培育2小时。用PBT冲洗这些孔3次。在各孔中加入200μl稀释的血清(稀释缓冲液:1%BSA、0.1%Tween-20、0.1%NaN3的PBS溶液),将这些平板在37℃培育2小时。用PBT冲洗这些孔3次。在各孔中加入100μl HRP-缀合的兔抗-小鼠(Dako)血清(用稀释缓冲液以1∶2000稀释),将这些平板置于37℃培育90分钟。用PBT缓冲液洗涤这些孔3次。在各孔中加入100μl HRP的底物缓冲液(25ml柠檬酸缓冲液pH5,10mg邻-苯二胺(phenildiamine)和10μl H2O2),并将平板在室温中静置20分钟。在各孔中加入100μl 12.5%H2SO4,随后测定OD490。计算ELISA滴定度,即高于预先免疫血清稀释度的、OD490值为0.4的血清稀释度。当OD490值为0.4的血清稀释度高于1∶400时,将ELISA视为阳性。
血清分析-FACS扫描细菌结合分析
将不包囊的MenB M7菌株置于巧克力琼脂板上,在37℃、5%CO2中培育过夜。用无菌Dracon刷从琼脂板上收集菌落,并接种到4支装有0.25%葡萄糖的8ml Mueller-Hinton肉汤(Difco)试管中。每30分钟监测细菌的生长,然后测定OD620。让细菌生长直到OD达到0.35-0.5。将培养物以4000rpm离心10分钟。弃去上清液,用封阻缓冲液(1%BSA的PBS溶液,0.4%NaN3)重悬浮沉淀物,并以4000rpm离心5分钟。将细胞重悬浮于封阻缓冲液,使OD620达到0.05。在96孔Costar板的各孔中添加100μl细菌细胞。在各孔中加入100μl稀释的(1∶100、1∶200、1∶400)血清(以封阻缓冲液配制),并将这些平板在4℃培育2小时。以4000rpm离心细胞5分钟,吸出上清液,在各孔中加入200μl/孔封阻缓冲液洗涤细胞。在各孔中加入100μl R-Phicoerytrin缀合的F(ab)2山羊抗-小鼠(以1∶100稀释),将平板置于4℃培育1小时。以4000rpm离心5分钟以沉淀细胞,加入200μl/孔封阻缓冲液洗涤细胞。吸出上清液,细胞重悬浮于200μl/孔PBS、0.25%甲醛。将样品转移到FACScan管中并读数。FACScan(Laser Power 15mW)的条件设为:FL2开;FSC-H阈值:92;FSC PMT电压:E01;SSC PMT:474;Amp.Gains 6.1;FL-2 PMT:586;补偿值:0。
血清分析-杀菌试验
于37℃、在5%CO2、在巧克力琼脂板(以冷冻原液起始)上培育脑膜炎奈瑟球菌2996过夜。收集菌落,并将其接种到7ml含有0.25%葡萄糖的Mueller-Hinton肉汤中,使OD620达到0.05-0.08。在37℃振荡培育约1.5小时,直到OD620达到0.23-0.24。用50mM磷酸盐缓冲液(pH7.2,含10mM MgCl2、10mM CaCl2和0.5%(w/v)BSA(分析缓冲液))以105CFU/ml工作稀释度稀释细菌。最终反应混合物的总体积为50μl,其中25μl连续2倍稀释的测试血清,12.5μl工作稀释度的细菌,12.5μl幼兔补体(终浓度25%)。
对照包括:用补体血清培育的细菌、用细菌培育并在56℃加热30分钟补充灭活的免疫血清。在加入幼兔补体后,用斜置方法立即将10μl对照置于Mueller-Hinton琼脂板上(0时间)。37℃旋转培育96孔板1小时。将每份样品的7μl涂布在Mueller-Hinton琼脂板上作为斑点,而用斜置方法将10μl对照涂布在Mueller-Hinton琼脂板上(1时间)。37℃培育琼脂板18小时,计算相应于0时间和1时间的菌落数量。
血清分析-Western印迹法
将纯化的蛋白质(500ng/泳道)、外膜小泡(5μg)和MenB菌株2996衍生的全细胞提取物(25μg)加到12%SDS-聚丙烯酰胺凝胶上,并转移到硝基纤维素膜上。用转化缓冲液(0.3%Tris碱,1.14%甘氨酸、20%(v/v)甲醇)在4℃、150mA进行转化2小时。于4℃在饱和缓冲液(10%脱脂乳、0.1%Triton X100的PBS溶液)中培育过夜使膜饱和。用冲洗缓冲液(3%脱脂乳、0.1%Triton X100的PBS溶液)冲洗膜2次,并在37℃与用洗涤缓冲液以1∶200稀释的小鼠血清一起培育2小时。冲洗膜2次,与1∶2000稀释的辣根过氧化物酶标记的抗-小鼠Ig一起培育90分钟。用0.1%Triton X100的PBS溶液冲洗膜2次,用Opti-4CN底物试剂盒(Bio-Rad)显色。加入水终止反应。
如下制备OMV:37℃、5%CO2,在5个GC板上让脑膜炎奈瑟球菌2996生长过夜,用接种环收获,并重悬浮于10ml 20mM Tris-HCl pH7.5、2mM EDTA中。在56℃热灭活45分钟,在冰上超声处理破碎细胞5分钟(50%负载循环(dutycycle)、50%输出,Branson超声仪3mm微型针头)。以5000g离心10分钟除去未破碎的细胞,回收含有完整细胞包膜组分的上清液,于4℃以50000g进一步离心过夜。将含有膜的沉淀物重悬浮于2%二烷基肌氨酸、20mM Tris-HClpH7.5、2mM EDTA中,在室温培育20分钟以溶解内膜。以10000g离心上清液10分钟除去聚集体,以50000g进一步离心上清液3小时。用PBS冲洗含有外膜的沉积物,并重悬浮于相同的缓冲液中。用BSA作为标准,由D.C.Bio-Rad蛋白分析(改进的Lowry方法)测定蛋白质的浓度。
如下制备全细胞提取物:使脑膜炎奈瑟球菌在GC板上培育过夜,用接种环收获,并重悬浮于1ml 20mM Tris-HCl中。在56℃热灭活30分钟。
961结构域的研究
细胞组分的制备 用过夜培养物或在IPTG培育3小时后的细菌制备表达961不同结构域的大肠杆菌克隆的全裂解物、周质、上清液和OMV。简单地说,获得周质,细菌悬浮于蔗糖25%和Tris 50mM(pH8)(含有polimixine100μg/ml)。1小时后,室温以13000rpm离心细菌15分钟,收集上清液。用0.2μm过滤培养物上清液,在冰中用TCA 50%沉淀2小时。离心(13000rp,30分钟)后,用乙醇70%漂洗沉淀物2次,并悬浮于PBS中。如上所述,进行OMV制备。用针对GST-961的多克隆抗血清,在SDS-PAGE或Western印迹中分析各细胞组分。
粘附分析 在补充有10%热灭活的PCS、15mM L-谷氨酰胺和抗生素的DMEM(Gibco)中维持张氏(Chang)上皮细胞(Wong-Kilbourne衍生物,克隆1-5c-4,人结膜)。
为了进行粘附分析,用PBS漂洗张氏上皮细胞的亚融合培养物,并用胰蛋白酶-EDTA(Giboc)处理,从而从塑性支持体上释放它们。然后将细胞悬浮于PBS中,计数并在PBS中稀释至5×105细胞/ml。
沉淀过夜培育的或用IPTG诱导后的细菌,并用PBS通过以13000离心5分钟洗涤2次。在室温、暗处,在1ml缓冲液(含有50mM NaHCO3和100mM NaClpH8)中将约2-3×108(cfu)与0.5mg/ml FITC(Sigma)一起培育30分钟。洗涤FITC标记的细菌2-3次,并以1-1.5×109/ml悬浮于PBS中。于37℃,将200μl此悬浮液(2-3×108)与200μl(1×105)上皮细胞一起培育30分钟。然后以2000rpm离心细胞5分钟,除去未粘附的细胞,悬浮液200μl PBS中,转移到FACScan管中并读数。