JP4472866B2 - ナイセリア抗原 - Google Patents

Description

本発明はＮｅｉｓｓｅｒｉａ細菌由来の抗原に関する。
【０００１】
（背景技術）
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮｅｉｓｓｅｒｉａ ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅは、ヒトにおいて病原性である非運動性のグラム陰性双球菌である。Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓは、咽頭にコロニー形成をし、髄膜炎（および、時折、髄膜炎のない敗血症）を引き起こす；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅは、生殖管にコロニー形成しそして淋病を引き起こす。身体の異なる領域にコロニーを形成しそして全く異なる疾患を引き起こすが、この２つの病原は密接に関係しており、髄膜炎菌が淋病菌と明らかに異なる１つの特徴は、全ての病原性髄膜炎菌に存在する多糖類性被膜の存在である。
【０００２】
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅは、米国のみで１９８３年〜１９９０年の期間中に１年間あたりおおよそ８００，０００件も引き起こした（ＭｅｉｔｚｎｅｒおよびＣｏｈｅｎ，「Ｖａｃｃｉｎｅｓ Ａｇａｉｎｓｔ Ｇｏｎｏｃｏｃｃａｌ Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ」，Ｎｅｗ Ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ Ｖａｃｃｉｎｅｓ，第２版，Ｌｅｖｉｎｅ，Ｗｏｏｄｒｏｗ，ＫａｐｅｒおよびＣｏｂｏｎ編，Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９７，８１７−８４２頁）。この疾患は、かなりの罹患率を生じるが死亡率は制限される。Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅに対するワクチン接種が、高く所望されたが、繰り返した試みは失敗している。このワクチンに対する主な候補抗原は、ピリ、ポーリンのような表面露出タンパク質、混濁付随タンパク質（Ｏｐａｓ）および他の表面露出タンパク質（Ｌｉｐ，Ｌａｚ，ＩｇＡ１プロテアーゼおよびトランスフェリン結合タンパク質）である。リポオリゴ糖（ＬＯＳ）もまた、ワクチンとして示唆されている（ＭｅｉｔｚｎｅｒおよびＣｏｈｅｎ，前出）。
【０００３】
Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓは、風土病および伝染病を引き起こす。米国において、発病率は１年間に１００，０００人中０．６〜１人の割合であり、そして大発生によりずっと大きくなり得る（Ｌｉｅｂｅｒｍａｎら（１９９６）Ｓａｆｅｌｙ ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ ｏｆ ａ Ｓｅｒｏｇｒｏｕｐｓ Ａ／Ｃ Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ−Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｃｏｎｊｕｇａｔｅ Ｖａｃｃｉｎｅ ｉｎ Ｙｏｕｎｇ Ｃｈｉｌｄｒｅｎ．ＪＡＭＡ ２７５（１９）：１４９９−１５０３；Ｓｃｈｕｃｈａｔら（１９９７）Ｂａｃｔｅｒｉａｌ Ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ ｉｎ １９９５，Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ３７７（１４）：９７０−９７６）。発展途上国では、風土病の割合は、よりずっと大きくそして伝染病発生率は１年間あたり１００，０００人あたり５００件に達し得る。死亡率は極めて高く、米国では１０〜２０％、そして発展途上国においてはよりずっと高い。Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅに対する共役ワクチンの導入の結果、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓは、米国において全ての年齢における細菌性髄膜炎の主な原因である（Ｓｃｈｕｃｈａｔ（１９９７）前出）。
【０００４】
生物の被膜多糖類に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの１２血清群が同定されている。Ａ群はサハラアフリカ周縁での伝染病において最も頻繁に関与している病原体である。血清型Ｂ群および血清型Ｃ群は、米国および大部分の先進国における症例の大部分の原因である。血清型Ｗ１３５およびＹは、米国および先進国における症例の残りの原因である。現在使用される髄膜炎ワクチンは、血清型Ａ、Ｃ、Ｙ、およびＷ１３５で構成される４価の多糖類ワクチンである。これは、青年および成人には効果があるが、弱い免疫応答および短い保護持続期間を誘導し、そして胎児には使用され得ない（例えば、Ｍｏｒｂｉｄｉｔｙ ａｎｄ Ｍｏｒｔａｌｉｔｙ ｗｅｅｋｌｙ ｒｅｐｏｒｔ，Ｖｏｌ．４６，Ｎｏ．ＰＲ−５（１９９７））。これは、多糖類が、繰り返し免疫処置により増強され得ない弱い免疫応答を誘導するＴ細胞独立性抗原であるからである。Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａに対するワクチン接種の成功に続き、血清型Ａおよび血清型Ｃに対する共役ワクチンが開発されており、そして臨床試験の最終段階である（Ｚｏｌｌｉｎｇｅｒ ＷＤ「Ｎｅｗ ａｎｄ Ｉｍｐｒｏｖｅｄ Ｖａｃｃｉｎｅｓ Ａｇａｉｎｓｔ Ｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｃａｌ Ｄｉｓｅａｓｅ」Ｎｅｗ Ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ Ｖａｃｃｉｎｅｓ，上記，４６９−４８８頁；Ｌｉｅｂｅｒｍａｎら（１９９６）上記；Ｃｏｓｔａｎｔｉｎｏら（１９９２）Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄ ｐｈｅａｓｅ Ｉ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｔｅｓｔｉｎｇ ｏｆ ａ ｃｏｎｊｕｇａｔｅ ｖａｃｃｉｎｅ ａｇａｉｎｓｔ ｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｕｓ ＡおよびＣ．Ｖａｃｃｉｎｅ １０：６９１−６９８）。
【０００５】
しかし、髄膜炎菌Ｂは問題を残している。この血清型は現在、米国、欧州、および南アメリカにおける全髄膜炎のおおよそ５０％の原因である。この多糖類アプローチは使用され得ない。なぜならばｍｅｎＢ被膜多糖類は、哺乳動物組織にもまた存在するα（２−８）−連結Ｎ−アセチルノイラミン酸のポリマーであるからである。これは抗原に対する寛容性を生ずる；実際、免疫応答が惹起された場合、それは抗−自己であり、それ故、所望されない。自己免疫の誘導を回避しそして保護的免疫応答を誘導するために、この被膜性多糖類は、例えば、Ｎ−アセチル基をＮ−プロピオニル基と置換するように化学的に改変されるが、特異的抗原性は不変のままである（ＲｏｍｅｒｏおよびＯｕｔｓｃｈｏｏｒｎ（１９９４）Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｓｔａｔｕｓ ｏｆ Ｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｃａｌ ｇｒｏｕｐ Ｂ ｖａｃｃｉｎｅ ｃａｎｄｉｄａｔｅｓ：ｃａｐｓｕｌａｒ ｏｒ ｎｏｎ−ｃａｐｓｕｌａｒ？ Ｃｌｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ Ｒｅｖ ７（４）：５５９−５７５）。
【０００６】
ｍｅｎＢワクチンに対する代替のアプローチは、外膜タンパク質（ＯＭＰ）の複合体混合物（ＯＭＰのみを含むかまたはポーリンに富むＯＭＰのいずれかを含む）を使用するか、または細菌活性をブロックする抗体を誘導すると考えられるクラス４ＯＭＰを欠失した。このアプローチは、十分に特徴付けられていないワクチンを産生する。それらワクチンは、相同な菌株に対して保護し得えるが、外膜タンパク質の多くの抗原性改変体が多く存在する場合、全体として効果がない。抗原変異性を克服するために、９つまでの異なるポリンを含む多価ワクチンが構築されている（例えば、Ｐｏｏｌｍａｎ ＪＴ（１９９２）Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ａ ｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｃａｌ ｖａｃｃｉｎｅ．Ｉｎｆｅｃｔ．Ａｇｅｎｔｓ Ｄｉｓ．４：１３−２８）。外膜ワクチンで使用されるさらなるタンパク質は、ｏｐａおよびｏｐｃタンパク質であるが、これらのアプローチは抗原変異性を克服し得ない（例えば、Ａｌａ’ＡｌｄｅｅｎおよびＢｏｒｒｉｅｌｌｏ（１９９６）Ｔｈｅ ｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｃａｌ ｔｒａｎｆｅｒｒｉｎ−ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎｓ １ ａｎｄ ２ ａｒｅ ｂｏｔｈ ｓｕｒｆａｃｅ ｅｘｐｏｓｅｄ ａｎｄ ｇｅｎｅｒａｔｅ ｂａｃｔｅｒｉｃｉｄａｌ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｃａｐａｂｌｅ ｏｆ ｋｉｌｌｉｎｇ ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ ａｎｄ ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓ ｓｔｒａｉｎｓ．Ｖａｃｃｉｎｅ １４（１）：４９−５３）。
【０００７】
特定の量の配列データは、髄膜炎菌および淋病菌の遺伝子およびタンパク質（例えば、ＥＰ−Ａ−０４６７７１４，ＷＯ９６／２９４１２）について利用可能であるが、これは決して完全ではない。さらなる配列の供給は、免疫系に対する標的と推測され、そして抗原的に変異し得ることのない分泌タンパク質または表面露出タンパク質を同定するための機会を提供し得た。例えば、同定されたタンパク質のいくつかは、髄膜炎菌Ｂに対して効果のあるワクチンの成分であり、いくつかは全ての髄膜炎菌血清型に対するワクチンの成分であり、そして他は全ての病原性Ｎｅｉｓｓｅｒｉａｅに対するワクチンの成分であり得た。
【０００８】
（本発明）
本発明は、本実施例で開示されたナイセリアアミノ酸配列を含むタンパク質を提供する。これらの配列はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓまたはＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅに関連する。
【０００９】
これはまた、本実施例で開示されるナイセリアアミノ酸配列と相同な（すなわち、配列同一性を有する）配列を含むタンパク質を提供する。この特定の配列に依存して、同一性の程度は、好ましくは５０％よりも大きい（例えば、６５％、８０％、９０％、またはこれ以上）。これらの相同なタンパク質は、本実施例で開示される配列の変異体および対立遺伝子の改変体を含む。代表的には、２つのタンパク質の間の５０％の同一性またはそれ以上の同一性は、機能的に等価であることの表示であると考えられる。タンパク質間の同一性は、好ましくはパラメーターｇａｐ ｏｐｅｎ ｐｅｎａｌｔｙ＝１２およびｇａｐ ｅｘｔｅｎｔｉｏｎ ｐｅｎａｌｔｙ＝１を有するａｆｆｉｎｅ変換ギャップ検索を使用して，ＭＰＳＲＣＨプログラム（Ｏｘｆｏｒｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ）において実行されるようなＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎ相同性検索アルゴリズムによって決定される。
【００１０】
本発明はさらに、本実施例で開示されるナイセリアアミノ酸配列のフラグメントを含むタンパク質を提供する。このフラグメントは、その配列由来の少なくともｎ個の連続したアミノ酸を含み、そしてその特定の配列に依存して、ｎは７またはそれ以上（例えば８、１０、１２、１４、１６、１８、２０またはそれ以上）である。好ましくはこのフラグメントは、その配列に由来するエピトープを含む。
【００１１】
本発明のタンパク質は、もちろん、種々の手段（例えば、組換えの発現、細胞培養物からの精製、化学合成など）によっておよび種々の型で（例えば、天然型、融合型など）調製され得る。これらは、好ましくは実質的に純粋または単離された型で調製される（すなわち、他のナイセリアタンパク質または宿主細胞タンパク質を実質的に含まない）。
【００１２】
さらなる局面に従って、本発明は、これらのタンパク質に結合する抗体を提供する。これらは、ポリクローナルまたはモノクローナルであり、そして任意の適切な手段により産生され得る。
【００１３】
さらなる局面に従って、本発明は、本実施例で開示されるナイセリアヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。さらに、本発明は、本実施例で開示されるナイセリアヌクレオチド配列と相同な（すなわち、配列同一性を有する）配列を含む核酸を提供する。
【００１４】
さらに、本発明は、本実施例で開示されるナイセリア核酸に、好ましくは「高ストリンジェンシー」な条件下で（例えば、０．１×ＳＳＣ、０．５％ＳＤＳ溶液中６５℃）ハイブリダイズし得る核酸を提供する。
【００１５】
これらの配列のフラグメントを含む核酸もまた、提供される。これらは、ナイセリア配列由来の少なくともｎ個の連続するヌクレオチドを含有すべきであり、そして特定の配列に依存して、ｎは１０またはそれ以上（例えば、１２、１４、１５、１８、２０、２５、３０、３５、４０またはそれ以上）である。
【００１６】
さらなる局面に従って、本発明は、本発明のタンパク質およびタンパク質フラグメントをコードする核酸を提供する。
【００１７】
本発明が上記に記載される配列と相補的な配列を含む核酸を提供することもまた、認識されるべきである（例えば、アンチセンス目的またはプローブの目的において）。
【００１８】
本発明に従う核酸は、もちろん、多くの様式（例えば、化学合成により、ゲノムライブラリーまたはｃＤＮＡライブラリーから、生物体自体から）で調製され得、そして種々の型（例えば、一本鎖、二本鎖、ベクター、プローブなど）をとり得る。
【００１９】
さらに、用語「核酸」は、ＤＮＡおよびＲＮＡ、そしてまた改変された骨格を含むＤＮＡおよびＲＮＡのようなそれらの類似物、そしてまたペプチド核酸（ＰＮＡ）などを含む。
【００２０】
さらなる局面に従って、本発明は、本発明のヌクレオチド配列を含むベクター（例えば、発現ベクター）およびそのようなベクターで形質転換された宿主細胞を提供する。
【００２１】
さらなる局面に従って、本発明は、本発明に従うタンパク質、抗体および／または核酸を含む組成物を提供する、これらの組成物は、例えばワクチンとして、または診断用試薬として、または免疫原性組成物として適切であり得る。
【００２２】
本発明はまた、医薬品として（例えばワクチンとして）または治療用試薬として使用するための、本発明に従う核酸、タンパク質、または抗体を提供する。また、以下の製造における、本発明に従う核酸、タンパク質、または抗体の使用を提供する：（ｉ）ナイセリア細菌に起因する感染の処置または予防のための医薬品；（ｉｉ）ナイセリア細菌またはナイセリア細菌に対して惹起された抗体の存在を検出するための診断用試薬；および／または（ｉｉｉ）ナイセリア細菌に対する抗体を惹起し得る試薬。上記のナイセリア細菌は任意の種または菌株であり得る（例えば、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ、またはＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの任意の菌株（例えば、菌株Ａ、菌株Ｂまたは菌株Ｃ））。
【００２３】
本発明はまた、治療的有効量の、本発明に従う核酸、タンパク質、および／または抗体を患者に投与する工程を含む、患者の処置の方法を提供する。
【００２４】
さらなる局面に従って、本発明は、種々のプロセスを提供する。
【００２５】
本発明のタンパク質を産生するためのプロセスであって、タンパク質の発現を誘導する条件下において、本発明に従う宿主細胞を培養する工程を包含する、プロセスが提供される。
【００２６】
本発明のタンパク質または核酸を産生するためのプロセスであって、ここでそのタンパク質または核酸は、化学的手段を使用して、一部または全体が合成されるプロセスが提供される。
【００２７】
本発明のポリヌクレオチドを検出するためのプロセスであって、（ａ）本発明に従う核プローブを、二重鎖を形成させるハイブリダイズの条件下で生物学的サンプルと接触させる工程；および（ｂ）上記の二重鎖を検出する工程を包含する、プロセスが提供される。
【００２８】
本発明のタンパク質を検出するためのプロセスであって、（ａ）本発明に従う抗体を、抗体−抗原複合体の形成に適した条件下で生物学的サンプルと接触させる工程；および（ｂ）上記の複合体を検出する工程を包含する、プロセスが提供される。
【００２９】
本発明を実行するために用いられ得る標準的な技術および手順（例えば、ワクチン接種目的または診断目的のために、開示された配列を利用するための）の要旨は以下の通りである。この要旨は、本発明に対する限定ではなく、むしろ使用され得るが必要とされるわけではない実施例を与えるものである。
【００３０】
（一般）
本発明の実施は、他に示されなければ、分子生物学、微生物学、組換えＤＮＡ、および免疫学の慣習的な技術を使用し、これらは当該分野の技術の範囲内である。このような技術は以下の文献で十分説明されている（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ；Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ 第２版（１９８９）；ＤＮＡ Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ｖｏｌｕｍｅｓ Ｉ ａｎｄ ｉｉ（Ｄ．Ｎ Ｇｌｏｖｅｒ編 １９８５）；Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｍ．Ｊ．Ｇａｉｔ編 １９８４）；Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ（Ｂ．Ｄ．ＨａｍｅｓおよびＳ．Ｊ．Ｈｉｇｇｉｎｓ編 １９８４）；Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ａｎｄ Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ（Ｂ．Ｄ．ＨａｍｅｓおよびＳ．Ｊ．Ｈｉｇｇｉｎｓ編 １９８４）；Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ（Ｒ．Ｉ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙ編 １９８６）；Ｉｍｍｏｂｉｌｉｚｅｄ Ｃｅｌｌｓ ａｎｄ Ｅｎｚｙｍｅｓ（ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ，１９８６）；Ｂ．Ｐｅｒｂａｌ，Ａ Ｐｒａｃｔｉａｌ Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ（１９８４）；ｔｈｅ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ｓｅｒｉｅｓ（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．），特に１５４および１５５巻；Ｇｅｎｅ Ｔｒａｎｓｆｅｒ Ｖｅｃｔｏｒ ｆｏｒ Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｃｅｌｌｓ（Ｊ．Ｈ．ＭｉｌｌｅｒおよびＭ．Ｐ．Ｃａｌｏｓ編１９８７，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ）；ＭａｙｅｒおよびＷａｌｋｅｒ，編（１９８７），Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｃｅｌｌ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｌｏｎｄｏｎ）；Ｓｃｏｐｅｓ，（１９８７）Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ，第２版（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎ．Ｙ．）、およびＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌｕｍｅｓ Ｉ−ＩＶ（Ｄ．Ｍ．ＷｅｉｒおよびＣ．Ｃ．Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ編 １９８６）。
【００３１】
ヌクレオチドおよびアミノ酸についての標準的な省略が、本明細書において使用される。
【００３２】
本明細書中で引用される全ての刊行物、特許、および特許出願は参考としてその全体が援用される。特に、英国特許出願９７２３５１６．２、９７２４１９０．５、９７２４３８６．９、９７２５１５８．１、９７２６１４７．３、９８００７５９．４、および９８１９０１６．８の内容が本明細書中に援用される。
【００３３】
（定義）
Ｘを含む組成物は、組成物中の全Ｘ＋Ｙの少なくとも８５重量％がＸであるとき、Ｙを「実質的に含まない」。好ましくは、Ｘは、組成物中の全Ｘ＋Ｙの少なくとも９０重量％を、さらに好ましくは少なくとも約９５重量％または９９重量％さえを含む。
【００３４】
用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」は「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」および「からなる」を意味する。例えば、Ｘを「含む」組成物は、もっぱらＸからなり得るか、またはＸ＋ＹのようなＸに付加したものも含み得る。
【００３５】
用語「異種」とは、天然では共に見られない２つの生物学的成分をいう。この成分は、宿主細胞、遺伝子、調節領域（例えば、プロモーター）であり得る。異種成分は天然では共に見られないが、遺伝子に対して異種のプロモーターがその遺伝子に作動可能に連結されるときのように、それらは共に機能し得る。別の例は、ナイセリア配列がマウス宿主細胞に対して異種であることである。さらなる例は、天然においてみられない配置で単一タンパク質に組み立てられる同じタンパク質または異なるタンパク質由来の２つのエピトープである。
【００３６】
「複製起点」とは、発現ベクターのような、ポリヌクレオチドの複製を開始または調節するポリヌクレオチド配列である。複製起点は、細胞内でのポリヌクレオチド複製の自律性ユニットとして振る舞い、それ自体の制御下で複製し得る。複製起点は、ベクターが特定の宿主細胞において複製するために必要であり得る。特定の複製起点を有せば、発現ベクターは、細胞内の適切なタンパク質の存在下で高いコピー数で再生され得る。起点の例は、酵母において有効な自律性複製配列；およびＣＯＳ−７細胞で有効であるウイルスＴ抗原である。
【００３７】
「変異体」配列は、天然の配列または開示された配列とは異なるが配列同一性を有するＤＮＡ配列、ＲＮＡ配列またはアミノ酸配列として規定される。特定の配列に依存して、天然の配列または開示された配列と変異体配列との間の配列同一性の程度は、好ましくは５０％より大きい（例えば、上記記載のＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムを使用して算出して６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上）。本明細書中で使用されるように、本明細書で核酸分子配列が提供される核酸分子、または領域の「対立遺伝子改変体」は、別のもしくは２番目の単離体のゲノム中の同じ遺伝子座で本質的に生ずる領域および、例えば、変異または組換えにより生ずる天然変化に起因して、類似するが、しかし同一でない核酸配列を有する核酸分子、または領域である。コード領域の対立遺伝子改変体は、代表的には、比較される遺伝子によってコードされるタンパク質の活性と類似した活性を有するタンパク質をコードする。対立遺伝子改変体はまた、遺伝子の５’または３’非翻訳領域（例えば、調節制御領域）での変化を含み得る（例えば、米国特許第５，７５３，２３５号）。
【００３８】
（発現系）
ナイセリアヌクレオチド配列は、種々の異なる発現系；例えば、哺乳動物細胞、バキュロウイルス、植物、細菌、および酵母と共に使用される発現系において発現され得る。
【００３９】
（ｉ．哺乳動物系）
哺乳動物発現系は当該分野において公知である。哺乳動物プロモーターは、哺乳動物ＲＮＡポリメラーゼを結合し、コード配列（例えば、構造遺伝子）のｍＲＮＡへの下流（３’）転写を開始し得る任意のＤＮＡ配列である。プロモーターは、転写開始領域（これはコード配列の５’末端の近位に通常位置する）およびＴＡＴＡボックス（転写開始部位の２５〜３０塩基対（ｂｐ）上流に通常位置する）を有する。ＴＡＴＡボックスは、その正しい部位においてＲＮＡポリメラーゼＩＩにＲＮＡ合成を開始させるよう指示すると考えられている。哺乳動物プロモーターはまた、ＴＡＴＡボックスの１００〜２００ｂｐ上流以内に通常位置する上流プロモーターエレメントを含む。上流プロモーターエレメントは、転写が開始され、そしていずれかの方向において作用し得る速度を決定する（Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９）「Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ Ｃｌｏｎｅｄ Ｇｅｎｅｓ ｉｎ Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｃｅｌｌｓ」 Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、第２版）
哺乳動物ウイルス遺伝子は、しばしば高度に発現され、そして広い宿主範囲を有する；従って、哺乳動物ウイルス遺伝子をコードする配列は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例は、ＳＶ４０初期プロモーター、マウス乳癌ウイルスＬＴＲプロモーター、アデノウイルス主要後期プロモーター（Ａｄ ＭＬＰ）、および単純疱疹ウイルスプロモーターを含む。さらに、マウスのメタロチオネイン遺伝子のような非ウイルス性遺伝子に由来する配列もまた、有用なプロモーター配列を提供する。発現は、構成性であるかまたは調節される（誘導可能）かいずれかであり得る、プロモーターに依存して、ホルモン応答性細胞においてグルココルチコイドで誘導され得る。
【００４０】
上記に記載されるプロモーターエレメントと組み合わされるエンハンサーエレメント（エンハンサー）の存在は、通常発現レベルを増大させる。エンハンサーは、相同性プロモーターまたは異種プロモーターに連結されるとき、転写を１００倍まで刺激し得る調節ＤＮＡ配列であり、合成は、通常のＲＮＡ開始部位で開始する。エンハンサーはまた、それらが、通常方向もしくはｆｌｉｐｐｅｄ方向のいずれかで転写開始部位より上流または下流に、もしくはプロモーターから１０００ヌクレオチドを超える距離で位置するとき、活性である（Ｍａｎｉａｔｉｓら（１９８７） Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３６：１２３７；Ａｌｂｅｒｔｓら（１９８９）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｃｅｌｌ，第２版）。ウイルス由来のエンハンサーエレメントは、それらは通常、より広い宿主範囲を有するため、特に有用であり得る。例は、ＳＶ４０初期遺伝子エンハンサー（Ｄｉｊｋｅｍａら（１９８５）ＥＭＢＯ Ｊ．４：７６１）およびラウス肉腫ウイルスの長末端反復（ＬＴＲ）に由来するエンハンサー／プロモーター（Ｇｏｒｍａｎら（１９８２ｂ）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．７９：６７７７）およびヒトサイトメガウイルスに由来するエンハンサー／プロモーター（Ｂｏｓｈａｒｔら（１９８５）Ｃｅｌｌ ４１：５２１）を包含する。さらに、いくつかのエンハンサーは調節可能であり、そしてホルモンまたは金属イオンのような誘導因子の存在下のみで活性になる（Ｓａｓｓｏｎｅ−ＣｏｒｓｉおよびＢｏｒｅｌｌｉ（１９８６）Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｅｎｅｔ．２：２１５；Ｍａｎｉａｔｉｓら（１９８７）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３６：１２３７）。
【００４１】
ＤＮＡ分子は、哺乳動物細胞において細胞内で発現され得る。プロモーター配列は、組換えタンパク質のＮ末端における最初のアミノ酸が常にＡＴＧ開始コドンによりコードされるメチオニンである場合、ＤＮＡ分子と直接連結され得る。所望される場合、Ｎ末端は、臭化シアンとのインビトロでのインキュベーションによりタンパク質から切断され得る。
【００４２】
あるいは、外来タンパク質もまた、哺乳動物細胞において外来タンパク質の分泌を提供するリーダー配列フラグメントで構成される融合タンパク質をコードするキメラＤＮＡ分子を作製することにより、細胞から成長培地へ分泌され得る。好ましくは、インビボまたはインビトロのいずれかにおいて切断され得る、リーダーフラグメントおよび外来遺伝子との間にコードされるプロセシング部位が存在する。リーダー配列フラグメントは通常、細胞からのタンパク質の分泌を指示する疎水性アミノ酸で構成される単一のペプチドをコードする。アデノウイルス３分割リーダーは、哺乳動物細胞における外来タンパク質の分泌を提供するリーダー配列の例である。
【００４３】
通常、哺乳類細胞によって認識される転写終結配列およびポリアデニル化配列は、翻訳終止コドンの３’側に存在する調節領域であり、従って、プロモーターエレメントと共に、コード配列に隣接する。成熟ｍＲＮＡの３’末端は、部位特異的転写後切断およびポリアデニル化により形成される（Ｂｉｒｎｓｔｉｅｌら．（１９８５）Ｃｅｌｌ ４１：３４９；ＰｒｏｕｄｆｏｏｔおよびＷｈｉｔｅｌａｗ（１９８８）「Ｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ａｎｄ ３’ｅｎｄ ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ ｏｆ ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ ＲＮＡ．」Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ａｎｄ ｓｐｌｉｃｉｎｇ（Ｂ．Ｄ．ＨａｍｅｓおよびＤ．Ｍ．Ｇｌｏｖｅｒ編）；Ｐｒｏｕｄｆｏｏｔ（１９８９）Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｃｉ．１４：１０５）。これらの配列は、ｍＲＮＡの転写を方向づけ、そのｍＲＮＡは、そのＤＮＡにコードされるポリペプチドに翻訳され得る。転写終結／ポリアデニル化シグナルの例としては、ＳＶ４０由来のシグナルが挙げられる（Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９）「Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ｃｌｏｎｅｄ ｇｅｎｅｓ ｉｎ ｃｕｌｔｕｒｅｄ ｍａｍｍａｌｉａｎ ｃｅｌｌｓ．」Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ）。
【００４４】
通常、プロモーター、ポリアデニル化シグナル、および転写終結配列を含む上記の構成要素は、発現構築物内に共に導入される。エンハンサー、機能的なスプライス供与部位および受容部位を有するイントロン、ならびにリーダー配列もまた、所望される場合、発現構築物内に含まれ得る。発現構築物はしばしば、哺乳類細胞または細菌のような宿主内で安定的に維持し得る染色体外エレメント（例えば、プラスミド）のような、レプリコン内で維持される。哺乳類の複製系としては、複製にトランス作用性の因子を必要とする、動物ウイルス由来の複製系が挙げられる。例えば、ＳＶ４０（Ｇｌｕｚｍａｍ（１９８１）Ｃｅｌｌ ２３：１７５）、あるいはポリオーマウイルスのようなパポバウイルスの複製系を含むプラスミドは、適切なウイルスのＴ抗原の存在下で極めて高いコピー数で複製する。哺乳類レプリコンの別の例としては、ウシパピローマウイルスおよびエプスタイン−バーウイルス由来のレプリコンが挙げられる。さらに、このレプリコンは、二つの複製系を有し得、従って、例えば、発現用の哺乳類細胞内で、ならびにクローニングおよび増幅用の原核生物の宿主内で、そのレプリコンは維持することが可能である。このような哺乳類−細菌シャトルベクターの例としては、ｐＭＴ２（Ｋａｕｆｍａｎら．（１９８９）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．９：９４６）およびｐＨＥＢＯ（Ｓｈｉｍｉｚｕら．（１９８６）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．６：１０７４）が挙げられる。
【００４５】
使用される形質転換の手順は、形質転換される宿主に依存する。異種のポリヌクレオチドの哺乳類細胞への導入方法は、当該分野で公知であり、その方法としては、デキストラン媒介トランスフェクション、リン酸カルシウム沈殿、ポリブレン媒介トランスフェクション、プロトプラスト融合、エレクトロポレーション、リポソーム内でのポリヌクレオチドの封入、およびＤＮＡの核内への直接微量注入が挙げられる。
【００４６】
発現用宿主として利用可能な哺乳類細胞株は、当該分野で公知であり、そのような細胞株としては、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、ＨｅＬａ細胞、乳仔ハムスター腎臓（ＢＨＫ）細胞、サル腎臓細胞（ＣＯＳ）、ヒト肝細胞癌細胞（例えば、Ｈｅｐ Ｇ２）および多くの他の細胞株を含むが、これらに限定しない、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）から入手可能な多くの不死化細胞株が含まれる。
【００４７】
（ｉｉ バキュロウイルス系）
タンパク質をコードしているポリヌクレオチドはまた、適切な昆虫の発現ベクター内に挿入され得、そしてそのベクター内で、制御エレメントに作動可能に連結される。ベクターの構築には、当該分野で公知の技術を使用する。一般に、その発現系の構成要素として、以下のものが挙げられる：バキュロウイルスゲノムのフラグメント、および発現させる異種遺伝子の挿入用の簡便な制限部位の両方を有する転移ベクター（通常は細菌ベクター）；転移ベクター内のバキュロウイルスに特異的なフラグメントに相同性のある配列を有する野生型バキュロウイルス（これは、バキュロウイルスゲノム内への異種遺伝子の相同組換えを可能にする）；ならびに適切な昆虫宿主細胞および生育培地。
【００４８】
転移ベクターにタンパク質をコードするＤＮＡ配列を挿入した後、そのベクターおよび野生型ウイルスゲノムを、昆虫宿主細胞にトランスフェクトし、そこでベクターとウイルスゲノムを組換え可能にする。パッケージングされた組換えウイルスは発現され、そして組換えプラークが同定されそして精製される。バキュロウイルス／昆虫細胞発現系の材料および方法は、特に、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ ＣＡからキット形態（「ＭａｘＢａｃ」キット）で市販される。これらの技術は、一般に当業者に公知であり、そしてＳｕｍｍｅｒｓならびにＳｍｉｔｈ，Ｔｅｘａｓ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔ Ｓｔａｔｉｏｎ Ｂｕｌｌｅｔｉｎ Ｎｏ．１５５５（１９８７）（以下、「Ｓｕｍｍｅｒｓ ａｎｄ Ｓｍｉｔｈ」）に十分に記載されている。
【００４９】
タンパク質をコードするＤＮＡ配列をバキュロウイルスゲノムに挿入するのに先立って、プロモーター配列、リーダー配列（所望される場合は）、目的のコード配列、および転写終結配列を含む上記の構成要素を、通常、中間転移構築物（転移ベクター）に構築する。この構築物は、単一の遺伝子および作動可能に連結された調節エレメント；操作可能に連結された調節エレメントのセットを各々が所有する複数の遺伝子；あるいは同じ調節エレメントのセットにより調節される複数の遺伝子を含み得る。中間転移構築物は、しばしば、細菌のような宿主内で安定的に維持し得る染色体外エレメント（例えば、プラスミド）のような、レプリコン内で維持される。レプリコンは、複製系を有しており、従って、それはクローニングおよび増幅用の適切な宿主内で維持され得る。
【００５０】
現在、外来遺伝子のＡｃＮＰＶへの導入のために最も一般に使用される転移ベクターは、ｐＡｃ３７３である。当業者に公知の多くの他のベクターもまた設計され、これらのものとして、例えば、ｐＶＬ９８５（ポリへドリンの開始コドンをＡＴＧからＡＴＴに変化させ、そしてそのＡＴＴから３２塩基対下流に、ＢａｍＨＩクローニング部位を導入する；ＬｕｃｋｏｗおよびＳｕｍｍｅｒｓ，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ（１９８９）１７：３１）が挙げられる。
【００５１】
そのプラスミドも通常、ポリへドリンポリアデニル化シグナル（Ｍｉｌｌｅｒら、（１９８８）Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．，４２：１７７）、および原核生物のアンピシリン耐性（ａｍｐ）遺伝子、および大腸菌においての選抜ならびに増殖のための複製起点を有する。
【００５２】
バキュロウイルス転移ベクターは通常、バキュロウイルスプロモーターを有する。バキュロウイルスプロモーターは、バキュロウイルスＲＮＡポリメラーゼに結合し、そしてコード配列（例えば、構造遺伝子）のｍＲＮＡへの下流（５’から３’）方向の転写を開始し得る任意のＤＮＡ配列である。プロモーターは、通常、コード配列の５’末端に近接して存在する転写開始領域を有している。この転写開始領域は通常、ＲＮＡポリメラーゼ結合部位および転写開始点を含む。バキュロウイルス転移ベクターは、またエンハンサーと呼ばれる第二のドメインを有し得、存在する場合は、通常、構造遺伝子に対し遠位にある。発現は調節され得るか、あるいは構成的であり得る。
【００５３】
ウイルスの感染周期の後期で大量に転写される構造遺伝子は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例としては、ウイルス多面体タンパク質をコードする遺伝子（Ｆｒｉｅｓｅｎら、（１９８６）「Ｔｈｅ Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，」：Ｔｈｅ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓｅｓ（Ｗａｌｔｅｒ Ｄｏｅｒｆｌｅｒ編）；ＥＰＯ公開番号１２７８３９および１５５４７６；ならびにｐ１０タンパク質をコードする遺伝子（Ｖｌａｋら，（１９８８），Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．６９：７６５）由来の配列が挙げられる。
【００５４】
適切なシグナル配列をコードするＤＮＡは、分泌昆虫タンパク質、あるいはバキュロウイルスポリへドリン遺伝子（Ｃａｒｂｏｎｅｌｌら，（１９９８）Ｇｅｎｅ，７３：４０９）のような、分泌バキュロウイルスタンパク質の遺伝子から由来し得る。あるいは、哺乳類細胞の翻訳後修飾（シグナルペプチド切断、タンパク質分解性切断、およびリン酸化のような）のシグナルは、昆虫細胞に認識されると思われ、そして分泌および核蓄積に必要なシグナルはまた、無脊椎動物細胞および脊椎動物細胞間で保存されると思われるために、ヒトインターフェロンα（Ｍａｅｄａら，（１９８５），Ｎａｔｕｒｅ ３１５：５９２）；ヒトガストリン放出ペプチド（Ｌｅｂａｃｑ−Ｖｅｒｈｅｙｄｅｎら，（１９８８），Ｍｏｌｅｃ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．８：３１２９）；ヒトＩＬ−２（Ｓｍｉｔｈら，（１９８５）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、８２：８４０４）；マウスＩＬ−３（Ｍｉｙａｊｉｍａら，（１９８７）Ｇｅｎｅ ５８：２７３）；およびヒトグルコセレブロシダーゼ（Ｍａｒｔｉｎら，（１９８８）ＤＮＡ、７：９９）をコードする遺伝子由来のような、非昆虫起源のリーダーも、昆虫での分泌を与えるために使用され得る。
【００５５】
組換えポリペプチドあるいは組換えポリタンパク質は、細胞内に発現され得、あるいは適切な調節配列と共に発現される場合、分泌され得る。非融合の外来タンパク質の優れた細胞内発現には通常、ＡＴＧ開始シグナルに先行する適切な翻訳開始シグナルを含む短いリーダー配列を理想的には有する異種遺伝子が必要である。所望であれば、Ｎ末端のメチオニンは、臭化シアンとのインビトロインキュベーションにより、成熟タンパク質から切断され得る。
【００５６】
あるいは、自然に分泌されない組換えポリタンパク質あるいは組換えタンパク質は、昆虫において外来タンパク質の分泌を与えるリーダー配列フラグメントを含む、融合タンパク質をコードするキメラＤＮＡ分子を作成することにより、昆虫細胞から分泌され得る。リーダー配列フラグメントは通常、タンパク質の小胞体内への輸送を指示する疎水性アミノ酸からなるシグナルペプチドをコードしている。
【００５７】
タンパク質の前駆体である発現産物をコードするＤＮＡ配列および／または遺伝子の挿入後、昆虫細胞宿主に、転移ベクターの異種ＤＮＡおよび野生型バキュロウイルスのゲノムＤＮＡを同時形質転換（通常は、同時トランスフェクションによって）する。構築物のプロモーターおよび転写終結配列は、通常バキュロウイルスゲノムの２〜５ｋｂの区域を含む。バキュロウイルスウイルスの望ましい部位に異種ＤＮＡを導入する方法は、当該分野で公知である（ＳｕｍｍｅｒｓおよびＳｍｉｔｈ、上記；Ｊｕら（１９８７）；Ｓｍｉｔｈら，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．（１９８３）３：２１５６；ならびにＬｕｃｋｏｗおよびＳｕｍｍｅｒｓ（１９８９）を参照のこと）。例えば、その挿入物は、相同二重交差組換え（ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ ｄｏｕｂｌｅ ｃｒｏｓｓｏｖｅｒ ｒｅｃｏｎｖｉｎａｔｉｏｎ）により、ポリへドリン遺伝子のような遺伝子内にあり得る；挿入物はまた、所望のバキュロウイルス遺伝子に設計された制限酵素部位内にあり得る。Ｍｉｌｌｅｒら、（１９８９）、Ｂｉｏｅｓｓａｙｓ ４；９１。発現ベクター内のポリへドリン遺伝子の代わりにクローン化される場合のＤＮＡ配列は、ポリへドリン特異的配列により５’および３’の両側で隣接され、そしてポリへドリンプロモーターの下流に位置される。
【００５８】
新規に形成されたバキュロウイルス発現ベクターは続いて、感染性の組換えバキュロウイルス内にパッケージされる。相同組換えは、低い頻度で起こる（約１％〜約５％の間）；それゆえ、同時トランスフェクション後に産生されたウイルスの大半は、依然野生型ウイルスである。従って、方法には、組換えウイルスの同定が必要となる。その発現系の利点は、組換えウイルスを区別させ得る可視的スクリーニングである。天然のウイルスにより産生されるポリへドリンタンパク質は、ウイルス感染後の後期で、その感染された細胞の核内で非常に高いレベルで産生される。蓄積されたポリへドリンタンパク質は、閉塞体を形成し、またそれは包理された粒子を含む。これらの閉塞体は、最大１５μｍの大きさで、高度に屈折し、明るく輝く外見を与え、容易に光学顕微鏡下で可視化される。組換えウイルスに感染された細胞は、閉塞体を欠く。組換えウイルスと野生型ウイルスを区別するために、トランスフェクションの上清を、当業者に公知の技術により昆虫細胞の単層にプラーク形成させた。すなわち、プラークを、光学顕微鏡下で閉塞体の存在（野性型ウイルスを示す）または非存在（組換えウイルスを示す）によりスクリーニングする。「Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ」２巻（Ａｕｓｕｂｅｌら編）１６．８（増補１０、１９９０）；ＳｕｍｍｅｒｓおよびＳｍｉｔｈ、上記；Ｍｉｌｌｅｒら（１９８９）。
【００５９】
組換えバキュロウイルス発現ベクターは、いくらかの昆虫細胞への感染用に開発された。例えば、組換えバキュロウイルスは、特に以下に示すもののために開発された：Ａｅｄｅｓ ａｅｇｙｐｔｉ、Ａｕｔｏｇｒａｐｈａ ｃａｌｉｆｏｒｎｉｃａ、Ｂｏｍｂｙｘ ｍｏｒｉ、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ ｍｅｌａｎｏｇａｓｔｅｒ、Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ、およびＴｒｉｃｈｏｐｌｕｓｉａ ｎｉ（ＷＯ８９／０４６６９９；Ｃａｒｂｏｎｅｌｌら，（１９８５）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．５６：１５３；Ｗｒｉｇｈｔ（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２１：７１８；Ｓｍｉｔｈら，（１９８３）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．３：２１５６；およびＦｒａｓｅｒら，（１９８９）Ｉｎ Ｖｉｔｒｏ Ｃｅｌｌ．Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．２５：２２５を一般に参照のこと）。
【００６０】
細胞および細胞培養培地は、バキュロウイルス／発現系における異種ポリペプチドの直接発現および融合発現の両方のために市販される；細胞培養技術は、一般に当業者に公知である。例えば、上記ＳｕｍｍｅｒｓおよびＳｍｉｔｈを参照のこと。
【００６１】
改変した昆虫細胞をさらに、適切な栄養培地で増殖し、その改変した昆虫宿主内で存在するプラスミドの安定的維持を可能にする。発現産物の遺伝子が、誘導性の制御下にある場合、宿主は高密度で増殖され得、そして発現は誘導され得る。あるいは、発現が構成的である場合、その産物は培地中に連続的に発現され、そして栄養培地を連続的に循環し、目的産物を取り出し、そして枯渇した栄養を補給する必要がある。その産物は、クロマトグラフィー（例えば、ＨＰＬＣ、アフィニティークロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィーなど）；電気泳動；密度勾配遠心；溶媒抽出などのような技術により精製し得る。適切には、その産物をさらに精製し、必要ならば、培地中に分泌された、または昆虫細胞の溶解から生じた任意の昆虫タンパク質を実質的に除去し、宿主細片（例えば、タンパク質、脂質および多糖類）を少なくとも実質的に含まない産物を供給する。
【００６２】
タンパク質の発現を得るために、形質転換体に由来する組換え宿主細胞は、組換えタンパク質をコードする配列の発現を可能にする条件下でインキュベートされる。これらの条件は、選択された宿主細胞に依存して変動する。しかし、その条件は、当該分野で公知の条件に基づいて、当業者に容易に確かめられる。
【００６３】
（ｉｉｉ 植物系）
当該分野で公知の多くの植物細胞培養および全植物遺伝子発現系が存在する。例示的な植物細胞遺伝子発現系としては、米国特許第５，６９３，５０６号；米国特許第５，６５９，１２２号；米国特許第５，６０８，１４３号のような特許に記載されるものが挙げられる。植物細胞培養における遺伝子発現の別の例は、Ｚｅｎｋ，Ｐｈｙｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ３０：３８６１−３８６３（１９９１）に記載された。植物タンパク質のシグナルペプチドの記載は、上記の参考文献に加え、以下に示すものの中においても確認される；Ｖａｕｌｃｏｍｂｅら，Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２０９：３３−４０（１９８７）；Ｃｈａｎｄｌｅｒら，Ｐｌａｎｔ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ３：４０７−４１８（１９８４）；Ｒｏｇｅｒｓ，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６０：３７３１−３７３８（１９８５）；Ｒｏｔｈｓｔｅｉｎら，Ｇｅｎｅ ５５：３５３−３５６（１９８７）；Ｗｈｉｔｔｉｅｒら，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １５：２５１５−２５３５（１９８７）；Ｗｉｒｓｅｌら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ ３：３−１４（１９８９）；Ｙｕら，Ｇｅｎｅ １２２：２４７−２５３（１９９２）。植物ホルモン（ジベレリン酸およびジベレリン酸により誘導される分泌酵素）による植物遺伝子発現の調節の記載は、Ｒ．Ｌ．ＪｏｎｅｓおよびＪ．ＭａｃＭｉｌｌｉｎ，Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌｉｎｓ：Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｐｌａｎｔ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ，Ｍａｌｃｏｌｍ Ｂ．Ｗｉｌｋｉｎｓ編 １９８４ Ｐｉｔｍａｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｌｉｍｉｔｅｄ，Ｌｏｎｄｏｎ，２１−５２頁の中に確認され得る。他の代謝調節性遺伝子が記載される参考文献は；Ｓｈｅｅｎ，Ｐｌａｎｔ Ｃｅｌｌ，２：１０２７−１０３８（１９９０）；Ｍａａｓら，ＥＭＢＯ Ｊ．９：３４４７−３４５２（１９９０）；ＢｅｎｋｅｌおよびＨｉｃｋｅｙ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８４：１３３７−１３３９（１９８７）。
【００６４】
代表的に、当該分野で公知の技術を使用して、所望のポリヌクレオチド配列は、植物内で操作するために設計された遺伝子調節エレメントを含む発現カセットの中に挿入される。その発現カセットは、植物宿主内での発現に適切な発現カセットの上流および下流にコンパニオン配列を有する望ましい発現ベクターの中に挿入される。そのコンパニオン配列は、プラスミドまたはウイルス起源のものであり、そしてそのベクターが、細菌のような本来のクローニング宿主から、所望の植物宿主へＤＮＡを移動させるために必要とされる特徴をベクターに提供する。基本的な細菌／植物ベクター構築物は、好ましくは、広い宿主範囲の原核生物の複製起点；原核生物の選択マーカー；および、アグロバクテリウムの形質転換については、アグロバクテリウム媒介転位のためのＴ ＤＮＡ配列を植物染色体に提供する。異種遺伝子が容易に検出に従順しない場合は、好ましくは、その構築物はまた、植物細胞が形質転換されたかどうかを決定するために適した選択マーカー遺伝子を有する。適切なマーカーの一般的な総説は、例えば、イネ科については、ＷｉｌｍｉｎｋおよびＤｏｎｓ，１９９３，Ｐｌａｎｔ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐｔｒ，１１（２）：１６５−１８５に見られる。
【００６５】
植物ゲノムへの異種配列の組み込みを可能にするために適した配列もまた、推奨される。これらは、植物ゲノム内へ異種発現カセットのランダム挿入を可能にする相同組換え用のためのトランスポゾン配列など、およびＴｉ配列を含み得る。適切な原核生物選択マーカーとしては、アンピシリンまたはテトラサイクリンのような抗生物質に対する耐性が挙げられる。別の機能をコードしている他のＤＮＡ配列はまた、そのベクターの中に存在し得、当該分野で公知である。
【００６６】
本発明の核酸分子はまた、目的のタンパク質の発現用の発現カセットに含まれ得る。２つ以上も可能であるが、通常はただ一つの発現カセットである。組換え発現カセットは、異種タンパクのコード配列に加え、以下のエレメントを含む；プロモーター領域、植物５’非翻訳配列、構造遺伝子がそれを備えているかどうかに依存して、開始コドン、ならびに転写および翻訳終結配列。そのカセットの５’および３’末端の独特な制限酵素部位は、既存のベクター内への容易な挿入を可能にする。
【００６７】
異種のコード配列は、本発明に関係する任意のタンパク質のための配列であり得る。目的のタンパクをコードする配列は、そのタンパク質の適切なプロセッシングおよび輸送を可能にするシグナルペプチドをコードし、そして通常、本発明の所望のタンパク質の膜への結合を生じ得る任意の配列を欠いている。翻訳開始領域は、大部分は、発芽中に発現および輸送される遺伝子のためのものであるから、輸送を与えるシグナルペプチドを使用することにより、それはまた、目的のタンパク質の輸送を提供し得る。この方法で、目的のタンパク質は、それらが発現される細胞から輸送され、そして効率的に回収され得る。代表的には、種子における分泌は、種子の胚乳内へ、アリューロン層あるいは胚盤上皮層を通過する。タンパク質がそれが産生された細胞から分泌される必要がない場合、このことは組換えタンパク質の分離および精製を容易にする。
【００６８】
所望の遺伝子産物の過剰発現が、真核生物におけるものであるために、クローン化した遺伝子の任意の部分が、イントロンのように、宿主のスプライセオソーム（ｓｐｌｉｃｏｓｏｍｅ）機構より、プロセッシングされる配列を含むかどうかを決定することが望ましい。そのような場合、「イントロン」領域の部位特異的変異誘発は、仮性イントロンコードとして遺伝的情報の一部を欠失することを防ぐために実施され得る。ＲｅｅｄおよびＭａｎｉａｔｉｓ、Ｃｅｌｌ ４１：９５−１０５（１９８５）。
【００６９】
ベクターは、組換えＤＮＡを機械的に転移するためにマイクロピペットを用いて植物細胞内に直接的に微量注入され得る（Ｃｒｏｓｓｗａｙ、Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ，２０２：１７９−１８５、１９８５）。遺伝子物質はまた、ポリエチレングリコールを用いて植物細胞内に転移され得る（Ｋｒｅｎｓら、Ｎａｔｕｒｅ，２９６、７２−７４、１９８２）。核酸部分の導入の別の方法は、小さいビーズまたは微粒子のいずれかのマトリックスの内部に、あるいは表面に核酸を有する小さな微粒子による高速バリスティック（ｂａｌｌｉｓｔｉｃ）穿通法である（Ｋｌｅｉｎら，Ｎａｔｕｒｅ，３２７，７０−７３，１９８７ならびにＫｎｕｄｓｅｎおよびＭｕｌｌｅｒ，１９９１，Ｐｌａｎｔａ，１８５：３３０−３３６は、大麦胚乳の粒子の照射（ｂｏｍｂａｒｄｍｅｎｔ）によりトランスジェニック大麦を作製することを示している）。さらに別の導入方法は、他の物体、いずれかのミニ細胞、細胞、リソソームあるいは他の易融な脂肪表面体とのプロトプラストの融合である（Ｆｒａｌｅｙら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，７９，１８５９−１８６３，１９８２）。
【００７０】
ベクターはまた、エレクトロポレーションにより植物細胞内に導入され得る（Ｆｒｏｍｍら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｉ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８２：５８２４，１９８５）。この技術において、植物プロトプラストは、遺伝子構築物を含むプラスミドの存在中でエレクトロポレートされる。高い電界の強さの電気衝撃により、生体膜を可逆的に通過できるようにし、プラスミドの導入を可能にする。エレクトロポレートされた植物プロトプラストは細胞壁を再形成し、分裂し、植物カルス形成する。
【００７１】
プロトプラストが単離され得、そして培養されて完全な再生植物を与え得る全ての植物は、本発明により形質転換され得、転移した遺伝子を保持する完全な植物が再生される。実際に、全ての植物は、さとうきび、甜菜、綿、果実および他の樹木、マメ科植物および野菜の全ての主要な種を含むがそれらに限定されない培養細胞あるいは組織から再生され得る。いくつかの適応した植物としては、例えば、以下の属由来の種が挙げられる；Ｆｒａｇａｒｉａ，Ｌｏｔｕｓ，Ｍｅｄｉｃａｇｏ，Ｏｎｏｂｒｙｃｈｉｓ，Ｔｒｉｆｏｌｉｕｍ，Ｔｒｉｇｏｎｅｌｌａ，Ｖｉｇｎａ，Ｃｉｔｒｕｓ，Ｌｉｎｕｍ，Ｇｅｒａｎｉｕｍ，Ｍａｎｉｈｏｔ，Ｄａｕｃｕｓ，Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ，Ｂｒａｓｓｉｃａ，Ｒａｐｈａｎｕｓ，Ｓｉｎａｐｉｓ，Ａｔｒｏｐａ，Ｃａｐｓｉｃｕｍ，Ｄａｔｕｒａ，Ｈｙｏｓｃｙａｍｕｓ，Ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｏｎ，Ｎｉｃｏｔｉａｎａ，Ｓｏｌａｎｕｍ，Ｐｅｔｕｎｉａ，Ｄｉｇｉｔａｌｉｓ，Ｍａｊｏｒａｎａ，Ｃｉｃｈｏｒｉｕｍ，Ｈｅｌｉａｎｔｈｕｓ，Ｌａｃｔｕｃａ，Ｂｒｏｍｕｓ，Ａｓｐａｒａｇｕｓ，Ａｎｔｉｒｒｈｉｎｕｍ，Ｈｅｒｅｒｏｃａｌｌｉｓ，Ｎｅｍｅｓｉａ，Ｐｅｌａｒｇｏｎｉｕｍ，Ｐａｎｉｃｕｍ，Ｐｅｎｎｉｓｅｔｕｍ，Ｒａｎｕｎｃｕｌｕｓ，Ｓｅｎｅｃｉｏ，Ｓａｌｐｉｇｌｏｓｓｉｓ，Ｃｕｃｕｍｉｓ，Ｂｒｏｗａａｌｉａ，Ｇｌｙｃｉｎｅ，Ｌｏｌｉｕｍ，Ｚｅａ，Ｔｒｉｔｉｃｕｍ，Ｓｏｒｇｈｕｍ，およびＤａｔｕｒａ。
【００７２】
再生のための手法は、植物の種によって変化するが、しかし一般に異種遺伝子のコピーを含む形質転換されたプロトプラストの懸濁液が最初に提供される。カルス組織は形成され、そしてシュートがカルスから誘導され、続いて発根される。あるいは、胚形成がプロトプラスト懸濁液から誘導され得る。これらの胚は、天然の胚として発芽し、植物を形成する。培養培地は、一般に種々のアミノ酸、ならびにオーキシンおよびサイトカイニンのようなホルモンを含有する。またグルタミン酸およびプロリンを培地に添加することは、特にコーンおよびアルファルファのような種にとって有用である。シュートおよび根は通常、同時に発生する。効果的な再生は培地、遺伝子型、および培養遍歴に依存する。これらの３つの変数が制御される場合は、再生は十分に再現性がありそして繰り返し可能である。
【００７３】
いくつかの植物細胞培養系において、本発明の所望のタンパク質は排出され、あるいはこのタンパク質は植物全体から抽出され得る。本発明の所望のタンパク質は培地内に分泌される場合、これは回収され得る。あるいは、胚および胚のない不完全な種子または他の植物組織は、機械的に破壊され細胞間および組織間の任意の分泌されたタンパク質を放出し得る。その混合物は緩衝液に懸濁され、可溶タンパクを回収し得る。次いで、慣用的なタンパク質分離および精製方法は組換えタンパク質を精製するために使用される。時間、温度、ｐＨ、酸素、および容量のパラメーターは、異種タンパク質の適切な発現および回収のために慣用的な方法により調整される。
【００７４】
（ＩＶ．細菌系）
細菌の発現技術は、当該分野で公知である。細菌のプロモーターは、細菌のＲＮＡポリメラーゼに結合し得、そしてコード配列（例えば、構造遺伝子）の下流方向（３’方向）へのｍＲＮＡへの転写を開始し得る任意のＤＮＡ配列である。プロモーターは、通常、コード配列の５’末端に近接して存在する転写開始領域を有する。この転写開始領域は、通常、ＲＮＡポリメラーゼ結合部位および転写開始部位を含む。細菌のプロモーターはまた、オペレーターと呼ばれる第二のドメインを有し、ＲＮＡ合成が始まる近接のＲＮＡポリメラーゼ結合部位と重複している。オペレーターは、遺伝子リプレッサータンパク質が、オペレーターに結合し、そのため特定の遺伝子の転写を抑制し得るような、負の調節された（誘導性の）転写を可能にする。構成的発現は、オペレーターのような負の調節エレメントの非存在下で起こり得る。さらに、正の調節は、遺伝子アクチベータータンパク質結合配列により達成され得、その配列が存在する場合は通常、ＲＮＡポリメラーゼ結合配列の（５’）側に近接している。遺伝子アクチベータータンパク質の例としては、異化活性化タンパク質（ＣＡＰ）があり、それはＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ（Ｅ．Ｃｏｌｉ）におけるｌａｃオペロンの転写の開始を助ける（Ｒａｉｂａｕｄら（１９８４）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｇｅｎｅｔ．１８：１７３）。調節される発現は、それゆえ正または負のいずれかであり、従って転写を増強するかまたは低下し得る。
【００７５】
代謝経路の酵素をコードする配列は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例としては、ガラクトース、ラクトース（ｌａｃ）（Ｃｈａｎｇら．（１９９７）Ｎａｔｕｒｅ １９８：１０５６）、およびマルトースのような糖代謝の酵素由来のプロモーター配列が挙げられる。さらなる例としては、トリプトファン（ｔｒｐ）（Ｇｏｅｄｄｅｌら．（１９８０）Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．８：４０５７；Ｙｅｌｖｅｒｔｏｎら．（１９８１）Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．９：７３１；米国特許第４，７３８，９２１号；ＥＰ−Ａ−００３６７７６号およびＥＰ−Ａ−０１２１７７５）のような生合成酵素由来のプロモーター配列が挙げられる。ｇ−ラクタマーゼ（ｇ−ｌａｏｔａｍａｓｅ）（ｂｌａ）プロモーター系（Ｗｅｉｓｓｍａｎｎ（１９８１）「Ｔｈｅ ｃｌｏｎｉｎｇ ｏｆ Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ｍｉｓｔａｋｅｓ．」Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ３（Ｉ．Ｇｒｅｓｓｅｒ編））、バクテリオファージλＰＬ（Ｓｈｉｍａｔａｋｅら．（１９８１）Ｎａｔｕｒｅ ２９２：１２８）およびＴ５（米国特許第４，６８９，４０６号）プロモーター系もまた有用なプロモーター配列を提供する。
【００７６】
さらに、天然に存在しない合成プロモーターもまた、細菌のプロモーターとして機能する。例えば、あるバクテリアあるいはバクテリオファージプロモーターの転写活性化配列は、別のバクテリアあるいはバクテリオファージプロモーターのオペロン配列と結合し得、合成ハイブリッドプロモーターを形成する。（米国特許第４，５５１，４３３号）。例えば、ｔａｃプロモーターは、ｌａｃリプレッサーにより調節されるｔｒｐプロモーター配列およびｌａｃオペロン配列の両方から構成される、ハイブリッドｔｒｐ−ｌａｃプロモーターである（Ａｍａｎｎら．（１９８３）Ｇｅｎｅ ２５：１６７；ｄｅ Ｂｏｅｒら．（１９８３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８０：２１）。
【００７７】
さらに、ある細菌のプロモーターは、細菌のＲＮＡポリメラーゼに結合し、そして転写を開始させる能力を有する非細菌起源の天然に存在するプロモーターを含み得る。非細菌起源の天然に存在するプロモーターはまた、原核生物内でいくらかの遺伝子の高いレベルでの発現を生じるために、適合性のあるＲＮＡポリメラーゼと結合され得る。バクテリオファージＴ７ ＲＮＡポリメラーゼ／プロモーター系は、連結したプロモーター系の例である（Ｓｔｕｄｉｅｒら．（１９８６）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１８９：１１３；Ｔａｂｏｒら．（１９８５）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８２：１０７４）。さらに、ハイブリッドプロモーターはまた、バクテリオファージプロモーターおよびＥ．ｃｏｌｉオペレーター領域から構成され得る（ＥＰＯ−Ａ−０２６７８５１）。
【００７８】
機能性のプロモーター配列に加え、効果的なリボソーム結合部位はまた、原核生物における外来遺伝子の発現に有用である。Ｅ．ｃｏｌｉにおいて、リボソーム結合部位は、シャイン−ダルガノ（ＳＤ）配列と呼ばれ、そして開始コドン（ＡＴＧ）および開始コドンの３〜１１ヌクレオチド上流に位置する長さ３〜９ヌクレオチドの配列を含む（Ｓｈｉｎｅら．（１９７５）Ｎａｔｕｒｅ ２５４：３４）。ＳＤ配列は、ＳＤ配列とＥ．ｃｏｌｉの１６ＳｒＲＮＡの３’側との間の塩基対形成によりｍＲＮＡのリボソームへの結合を促進すると考えられている（Ｓｔｅｉｔｚら．（１９７９）「Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｓｉｇｎａｌｓ ａｎｄ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｉｎ ｍｅｓｓｅｎｇｅｒ ＲＮＡ．」Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ：Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ（Ｒ．Ｆ．Ｇｏｌｄｂｅｒｇｅｒら編））。弱いリボソーム結合部位を有する真核遺伝子および原核遺伝子の発現のためには（Ｓａｍｂｒｏｏｋら．（１９８９）「Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ｃｌｏｎｅｄ ｇｅｎｅｓ ｉｎ Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ．」Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ）。
【００７９】
ＤＮＡ分子は、細胞内で発現され得る。プロモーター配列は、直接的にそのＤＮＡ分子と連結され得、この場合、Ｎ末端の最初のアミノ酸は、常に、ＡＴＧ開始コドンによりコードされるメチオニンである。所望される場合、Ｎ末端のメチオニンは、臭化シアンとのインビトロインキュベーション、あるいは細菌のメチオニンＮ末端ペプチダーゼとのインビボまたはインビトロインキュベーションのいずれかによりタンパク質から切断され得る（ＥＰＯ−Ａ−０２１９２３７）。
【００８０】
融合タンパク質は、直接的発現に代わるものを提供する。通常、内在性の細菌のタンパク質、あるいは他の安定なタンパク質のＮ末端部分をコードするＤＮＡ配列は、異種のコード配列の５’末端と融合される。発現の際に、この構築物は、２つのアミノ酸配列の融合を提供する。例えば、バクテリオファージλ細胞遺伝子は、外来遺伝子の５’末端と連結し得、そして細菌において発現され得る。生じた融合タンパク質は、好ましくは、外来遺伝子由来のバクテリオファージタンパク質を切断するための切断酵素（第Ｘａ因子）用の部位を保持する（Ｎａｇａｉら．（１９８４）Ｎａｔｕｒｅ ３０９：８１０）。融合タンパク質はまた、ｌａｃＺ（Ｊｉａら．（１９８７）Ｇｅｎｅ ６０：１９７）、ｔｒｐＥ（Ａｌｌｅｎら．（１９８７）Ｊ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．５：９３；Ｍａｋｏｆｆら．（１９８９）Ｊ．Ｇｅｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１３５：１１）、およびＣｈｅｙ（ＥＰ−Ａ−０３２４６４７）遺伝子由来の配列を用いて作製され得る。２つのアミノ酸配列の接合部でのＤＮＡ配列は、切断部位をコードしてもよいし、あるいはコードしなくてもよい。別の例としては、ユビキチン融合タンパク質である。そのような融合タンパク質は、好ましくは、外来タンパク質からユビキチンを切断するための切断酵素（例えば、ユビキチン特異的切断プロテアーゼ）用の部位を保持するユビキチン領域と共に作製され得る。この方法を通して、天然外来タンパク質は分離され得る（Ｍｉｌｌｅｒら．（１９８９）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ７：６９８）。
【００８１】
あるいは、外来タンパク質はまた、細菌における外来タンパク質の分泌を提供するシグナルペプチド配列フラグメントから構成される、融合タンパク質をコードするキメラＤＮＡ分子を作製することによって、細胞から分泌され得る（米国特許４，３３６，３３６）。シグナル配列フラグメントは、通常、細胞からのタンパク質の分泌を指向する、疎水性アミノ酸から構成されるシグナルペプチドをコードする。このタンパク質は、増殖培地（グラム陽性細菌）、または細胞の内膜と外膜との間に位置する細胞周辺腔（グラム陰性細菌）のいずれかへ分泌される。好ましくは、インビボまたはインビトロのいずれかで切断され得る、このシグナルペプチドフラグメントと外来遺伝子との間にコードされるプロセシング部位がある。
【００８２】
適切なシグナル配列をコードするＤＮＡは、Ｅ．ｃｏｌｉ外膜タンパク質遺伝子（ｏｍｐＡ）（Ｍａｓｕｉら（１９８３）、Ｅｘｐｅｒｉｍｅｔａｌ Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ；Ｇｈｒａｙｅｂら、（１９８４）ＥＭＢＯ Ｊ．３：２４３７）およびＥ．ｃｏｌｉアルカリホスファターゼシグナル配列（ｐｈｏＡ）（Ｏｋａら（１９８５）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８２：７２１２）のような、分泌性細菌タンパク質に関する遺伝子由来であり得る。さらなる例として、種々のＢａｃｉｌｌｕｓ株由来のα−アミラーゼ遺伝子のシグナル配列は、Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ由来の異種タンパク質を分泌するために使用され得る（Ｐａｌｖａら（１９８２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７９：５５８２；ＥＰ−Ａ−０２４４０４２）。
【００８３】
通常、細菌によって認識される転写終結配列は、翻訳終止コドンの３’側に位置する調節領域であり、そして従って、プロモーターとともに、コード配列に隣接する。これらの配列は、そのＤＮＡによってコードされるポリペプチドへと翻訳され得るｍＲＮＡの転写を指向する。転写終結配列は、しばしば、転写の終結を補助するステムループ構造を形成し得る、約５０ヌクレオチドのＤＮＡ配列を含む。例は、強力なプロモーターを有する遺伝子（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉのｔｒｐ遺伝子および他の生合成遺伝子）由来の転写終結配列を含む。
【００８４】
通常、上記の成分（プロモーター、シグナル配列（もし所望ならば）、目的のコード配列、および転写終結配列を含む）は、組み立てられて発現構築物となる。発現構築物は、しばしば、宿主（例えば細菌）における安定な保持が可能である染色体外エレメント（例えばプラスミド）のような、レプリコンに保持される。このレプリコンは複製系を有し、従って、このことが、発現またはクローニングおよび増幅のいずれかのために、レプリコンが原核生物宿主において保持されることを可能にする。さらに、レプリコンは、高コピー数プラスミドまたは低コピー数プラスミドのいずれかであり得る。高コピー数プラスミドは、一般に約５〜約２００、そして通常約１０〜約１５０の範囲のコピー数を有する。高コピー数プラスミドを含む宿主は、好ましくは少なくとも約１０個、そしてより好ましくは少なくとも約２０個のプラスミドを含む。高コピー数ベクターまたは低コピー数ベクターのいずれもが選択され得、それは、宿主に対するベクターおよび外来タンパク質の効果に依存する。
【００８５】
あるいは、発現構築物は、組み込みベクターを用いて、細菌のゲノムへ組み込まれ得る。組み込みベクターは、通常、ベクターが組み込むのを可能にする、細菌の染色体と相同な少なくとも１つの配列を含む。組み込みは、ベクターにおける相同なＤＮＡと細菌の染色体との間の組換えから生じるようである。例えば、種々のＢａｃｉｌｌｕｓ株からのＤＮＡによって構築される組み込みベクターは、Ｂａｃｉｌｌｕｓ染色体に組み込まれる（ＥＰ−Ａ−０ １２７ ３２８）。組み込みベクターはまた、バクテリオファージまたはトランスポゾン配列から構成され得る。
【００８６】
通常、染色体外発現構築物および組み込み発現構築物は、選択マーカーを含んで、形質転換された細菌株の選択を可能にし得る。選択マーカーは、細菌宿主において発現され得、そして細菌が薬物（例えば、アンピシリン、クロラムフェニコール、エリスロマイシン、カナマイシン（ネオマイシン）、およびテトラサイクリン）に耐性になるようにする遺伝子を含み得る（Ｄａｖｉｅｓら（１９７８）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．３２：４６９）。選択マーカーはまた、ヒスチジン、トリプトファン、およびロイシンの生合成経路における生合成遺伝子のような、生合成遺伝子を含み得る。
【００８７】
あるいは、上記の成分のいくつかは、形質転換ベクターにおいて組み立てられ得る。形質転換ベクターは、通常、上記のように、レプリコンにおいて保持されるか、または組み込みベクターへと開発されるかのいずれかの選択マーカー（ｍａｒｋｅｔ）から構成され得る。
【００８８】
発現ベクターまたは形質転換ベクターは、染色体外レプリコンまたは組み込みベクターのいずれも、多くの細菌への形質転換のために開発されてきた。例えば、発現ベクターは、とりわけ、以下の細菌のために開発されてきた：Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ（Ｐａｌｖａら（１９８２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７９：５５８２；ＥＰ−Ａ−０ ０３６ ２５９およびＥＰ−Ａ−０ ０６３ ９５３；ＷＯ ８４／０４５４１）、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ（Ｓｈｉｍａｔａｋｅら（１９８１）Ｎａｔｕｒｅ ２９２：１２８；Ａｍａｎｎら（１９８５）Ｇｅｎｅ ４０：１８３；Ｓｔｕｄｉｅｒら（１９８６）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１８９：１１３；ＥＰ−Ａ−０ ０３６ ７７６、ＥＰ−Ａ−０ １３６ ８２９およびＥＰ−Ａ−０ １３６ ９０７）、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｒｅｍｏｒｉｓ（Ｐｏｗｅｌｌら（１９８８）Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．５４：６５５）；Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌｉｖｉｄａｎｓ（Ｐｏｗｅｌｌら（１９８８）Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．５４：６５５）、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｌｉｖｉｄａｎｓ（米国特許４，７４５，０５６）。
【００８９】
外来ＤＮＡを細菌宿主へ導入する方法は、当該分野において周知であり、そして通常、ＣａＣｌ_２または他の薬剤（例えば、２価の陽イオンおよびＤＭＳＯ）のいずれかで処理された細菌の形質転換を含む。ＤＮＡはまた、エレクトロポレーションによって、細菌細胞へ導入され得る。形質転換の手順は、通常、形質転換される細菌の種によって変化する。例えば以下を参照のこと：（Ｍａｓｓｏｎら（１９８９）ＦＥＭＳ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｌｅｔｔ．６０：２７３；Ｐａｌｖａら（１９８２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７９：５５８２；ＥＰ−Ａ−０ ０３６ ２５９およびＥＰ−Ａ−０６３ ９５３；ＷＯ ８４／０４５４１、Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、（Ｍｉｌｌｅｒら（１９８８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８５：８５６；Ｗａｎｇら（１９９０）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１７２：９４９、Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ）、（Ｃｏｈｅｎら（１９７３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．６９：２１１０；Ｄｏｗｅｒら（１９８８）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１６：６１２７；Ｋｕｓｈｎｅｒ（１９７８）「ＣｏｌＥ１由来のプラスミドによるＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉの形質転換のための改良された方法」Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ：Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ ｏｎ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ（Ｈ．Ｗ．ＢｏｙｅｒおよびＳ．Ｎｉｃｏｓｉａ編）；Ｍａｎｄｅｌら（１９７０）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．５３：１５９；Ｔａｋｅｔｏ（１９８８）Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ ９４９：３１８；Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）、（Ｃｈａｓｓｙら（１９８７）ＦＥＭＳ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｌｅｔｔ．４４：１７３ Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）；（Ｆｉｅｄｌｅｒら（１９８８）Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ １７０：３８、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）；（Ａｕｇｕｓｔｉｎら（１９９０）ＦＥＭＳ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｌｅｔｔ．６６：２０３、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、（Ｂａｒａｎｙら（１９８０）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１４４：６９８；Ｈａｒｌａｎｄｅｒ（１９８７）「エレクトロポレーションによるＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓの形質転換」Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃａｌ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ（Ｊ．ＦｅｒｒｅｔｔｉおよびＲ．Ｃｕｒｔｉｓｓ ＩＩＩ編）；Ｐｅｒｒｙら（１９８１）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．３２：１２９５；Ｐｏｗｅｌｌら（１９８８）Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．５４：６５５；Ｓｏｍｋｕｔｉら（１９８７）Ｐｒｏｃ．４ｔｈ Ｅｖｒ．Ｃｏｎｇ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １：４１２、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）。
【００９０】
（ｖ．酵母発現）
酵母発現系もまた、当業者に公知である。酵母プロモーターは、酵母ＲＮＡポリメラーゼに結合可能であり、そしてコード配列（例えば、構造遺伝子）からｍＲＮＡへの下流の（３’側の）転写を開始し得る、任意のＤＮＡ配列である。プロモーターは、通常、コード配列の５’末端の近位に位置する転写開始領域を有する。この転写開始領域は、通常、ＲＮＡポリメラーゼ結合部位（「ＴＡＴＡボックス」）および転写開始部位を含む。酵母プロモーターはまた、上流アクチベーター配列（ＵＡＳ）と呼ばれる第２のドメインを有し得、これは、もし存在するならば、通常、構造遺伝子とは遠位である。このＵＡＳは、調節される（誘導できる）発現を可能にする。構成的発現は、ＵＡＳの非存在下で生じる。調節される発現は、正または負のいずれかであり得、それによって転写を増加させるかまたは減少させるかのいずれかであり得る。
【００９１】
酵母は、活性な代謝経路を有する発酵性微生物であり、従って、代謝経路における酵素をコードする配列は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例としては、以下が挙げられる：アルコールデヒドロゲナーゼ（ＡＤＨ）（ＥＰ−Ａ−０ ２８４ ０４４）、エノラーゼ、グルコキナーゼ、グルコース−６−リン酸イソメラーゼ、グリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰまたはＧＡＰＤＨ）、ヘキソキナーゼ、ホスホフルクトキナーゼ、３−ホスホグリセリン酸ムターゼ、およびピルビン酸キナーゼ（ＰｙＫ）（ＥＰＯ−Ａ−０ ３２９ ２０３）。酵母ＰＨＯ５遺伝子はまた、酸性ホスファターゼをコードし、有用なプロモーター配列を提供する（Ｍｙａｎｏｈａｒａら（１９８３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８０：１）。
【００９２】
さらに、天然には生じない合成プロモーターもまた、酵母のプロモーターとして機能する。例えば、ある１つの酵母プロモーターのＵＡＳ配列は、別の酵母プロモーターの転写活性化領域と連結され得、合成ハイブリッドプロモーターを生成し得る。このようなハイブリッドプロモーターの例は、ＧＡＰ転写活性化領域と連結されるＡＤＨ調節配列（米国特許第４，８７６，１９７号および同第４，８８０，７３４号）を含む。ハイブリッドプロモーターの他の例は、ＡＤＨ２、ＧＡＬ４、ＧＡＬ１０、またはＰＨＯ５遺伝子のいずれかの調節配列からなり、ＧＡＰまたはＰｙＫ（ＥＰ−Ａ−０ １６４ ５５６）のような解糖酵素遺伝子の転写活性化領域に結合されているプロモーターを含む。さらに、酵母プロモーターは、酵母ＲＮＡポリメラーゼと結合し、そして転写を開始する能力を有する、天然に生じる非酵母起源のプロモーターを含み得る。このようなプロモーターの例としては、とりわけ、以下が挙げられる：（Ｃｏｈｅｎら、（１９８０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７７：１０７８；Ｈｅｎｉｋｏｆｆら（１９８１）Ｎａｔｕｒｅ ２８３：８３５；Ｈｏｌｌｅｎｂｅｒｇら（１９８１）Ｃｕｒｒ．Ｔｏｐｉｃｓ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９６：１１９；Ｈｏｌｌｅｎｂｅｒｇら（１９７９）「酵母Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅにおける細菌の抗生物質耐性遺伝子の発現」、Ｐｌａｓｍｉｄｓ ｏｆ Ｍｅｄｉｃａｌ，Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｃｏｍｍｅｒｃｉａｌ Ｉｍｐｏｒｔａｎｃｅ（Ｋ．Ｎ．ＴｉｍｍｉｓおよびＡ．Ｐｕｈｌｅｒ編）；Ｍｅｒｃｅｒａｕ−Ｐｕｉｇａｌｏｎら（１９８０）Ｇｅｎｅ １１：１６３；Ｐａｎｔｈｉｅｒら（１９８０）Ｃｕｒｒ．Ｇｅｎｅｔ．２：１０９；）。
【００９３】
ＤＮＡ分子は、酵母において、細胞内で発現され得る。プロモーター配列は、ＤＮＡ分子と直接連結され得、その場合、組換えタンパク質のＮ末端にある最初のアミノ酸は常にＡＴＧ開始コドンによってコードされているメチオニンである。もし所望ならば、Ｎ末端のメチオニンは、臭化シアンとのインビトロインキュベーションによって、タンパク質から切断され得る。
【００９４】
融合タンパク質は、酵母発現系について、ならびに哺乳動物、バキュロウイルス、および細菌の発現系において、代替物を提供する。通常、内因性酵母タンパク質、または他の安定なタンパク質のＮ末端部分をコードするＤＮＡ配列は、異種コード配列の５’末端に融合される。発現において、この構築物は、２つのアミノ酸配列の融合物を提供する。例えば、酵母またはヒトのスーパーオキシドジスムターゼ（ＳＯＤ）遺伝子は、外来遺伝子の５’末端に連結され、そして酵母において発現し得る。２つのアミノ酸配列の連結部にあるＤＮＡ配列は、切断部位をコードしてもよいし、コードしなくてもよい。例えば、ＥＰ−Ａ−０ １９６ ０５６を参照のこと。別の例はユビキチン融合タンパク質である。このような融合タンパク質は、外来タンパク質からユビキチンを切断するプロセシング酵素（例えば、ユビキチン特異的プロセシングプロテアーゼ）のための部位を好ましくは保持する、ユビキチン領域を伴って作製される。従って、この方法を通じて、ネイティブな融合タンパク質は、単離され得る（例えば、ＷＯ８８／０２４０６６）。
【００９５】
あるいは、外来タンパク質はまた、酵母における外来タンパク質の分泌を提供する、リーダー配列フラグメントから構成される融合タンパク質をコードする、キメラＤＮＡ分子を作製することによって、細胞から増殖培地へ分泌され得る。好ましくは、インビボまたはインビトロのいずれかで切断され得る、リーダーフラグメントと外来遺伝子との間にコードされるプロセシング部位が存在する。リーダー配列フラグメントは、細胞からのタンパク質の分泌を指向する、疎水性アミノ酸から構成されるシグナルペプチドを、通常コードする。
【００９６】
適切なシグナル配列をコードするＤＮＡは、分泌性酵母タンパク質に関する遺伝子由来であり得、その遺伝子は例えば、酵母インベルターゼ遺伝子（ＥＰ−Ａ−０ ０１２ ８７３；ＪＰＯ．６２，０９６，０８６）およびＡ因子遺伝子（米国特許４，５８８，６８４）である。あるいは、インターフェロンリーダーのような、酵母における分泌もまた提供する、非酵母起源のリーダーが存在する（ＥＰ−Ａ−０ ０６０ ０５７）。
【００９７】
好ましいクラスの分泌リーダーは、酵母α因子遺伝子のフラグメントを使用するリーダーであり、これは「プレ」シグナル配列、および「プロ」領域の両方を含む。用いられ得るこの型のα因子フラグメントは、完全長の、プレ−プロα因子リーダー（約８３アミノ酸残基）および短縮されたα因子リーダー（通常約２５〜約５０アミノ酸残基）を含む（米国特許４，５４６，０８３および４，８７０，００８；ＥＰ−Ａ−０ ３２４ ２７４）。分泌を提供するα因子リーダーフラグメントを使用するさらなるリーダーは、第１の酵母のプレ配列を有するが、第２の酵母α因子からのプロ領域を有しないで作製される、ハイブリッドα因子リーダーを含む（例えば、ＷＯ８９／０２４６３を参照のこと）。
【００９８】
通常、酵母に認識される転写終結配列は、翻訳終止コドンの３’側に位置する調節領域であり、そして従って、プロモーターと共にコード配列に隣接する。これらの配列は、そのＤＮＡにコードされるポリペプチドへと翻訳され得る、ｍＲＮＡの転写を指向する。転写終結配列および他の酵母に認識される終結配列の例は、例えば、解糖酵素をコードする転写終結配列である。
【００９９】
通常、上記の成分（プロモーター、リーダー（もし所望ならば）、目的のコード配列、および転写終結配列を含む）は、組み立てられて発現構築物になる。発現構築物は、宿主（例えば、酵母または細菌）において安定に保持され得る染色体外エレメント（例えば、プラスミド）のような、レプリコンにおいてしばしば保持される。このレプリコンは、２つの複製系を有し得、従って、このことが、例えば、発現のために酵母において、ならびにクローニングおよび増幅のために原核生物宿主において保持されることを可能にする。このような酵母−細菌シャトルベクターの例としては、以下が挙げられる：ＹＥｐ２４（Ｂｏｔｓｔｅｉｎら（１９７９）Ｇｅｎｅ ８：１７〜２４）、ｐＣｌ／１（Ｂｒａｋｅら（１９８４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８１：４６４２〜４６４６）、およびＹＲｐ１７（Ｓｔｉｎｃｈｃｏｍｂら（１９８２）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５８：１５７）。さらに、レプリコンは、高コピー数プラスミドまたは低コピー数プラスミドのいずれかであり得る。高コピー数プラスミドは、一般に約５〜約２００、そして通常約１０〜約１５０の範囲のコピー数を有し得る。高コピー数プラスミドを含む宿主は、好ましくは少なくとも約１０個、そしてより好ましくは少なくとも約２０個を有する。高コピー数ベクターまたは低コピー数ベクターのいずれかが選択され得、それは、宿主に対するベクターおよび外来タンパク質の効果に依存する。例えば、Ｂｒａｋｅら、前出を参照のこと。
【０１００】
あるいは、発現構築物は、組み込みベクターを用いて、酵母のゲノムへ組み込まれ得る。組み込みベクターは、通常、ベクターが組み込むのを可能にする、酵母の染色体と相同な少なくとも１つの配列を含み、そして好ましくは、発現構築物に隣接する２つの相同配列を含む。組み込みは、ベクターにおける相同なＤＮＡと酵母の染色体との間の組換えから生じるようである（Ｏｒｒ−Ｗｅａｖｅｒら（１９８３）Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌ．１０１：２２８〜２４５）。組み込みベクターは、そのベクター中に含有するために適切な相同配列を選択することによって、酵母における特定の遺伝子座を指向され得る。Ｏｒｒ−Ｗｅａｖｅｒら、前出を参照のこと。１つ以上の発現構築物が組み込まれ得、おそらく産生される組換えタンパク質のレベルに影響を与え得る（Ｒｉｎｅら（１９８３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８０：６７５０）。ベクターに含まれる染色体配列は、ベクターにおける単一セグメント（ベクター全体の組み込みを生じる）、または染色体における隣接セグメントに相同でかつベクターにおける発現構築物に隣接する２つのセグメント（発現構築物のみの安定した組み込みを生じ得る）のいずれかとして生じ得る。
【０１０１】
通常、染色体外発現構築物および組み込み発現構築物は、選択マーカーを含み得、形質転換された酵母株の選択を可能にする。選択マーカーは、酵母宿主において発現され得る生合成遺伝子を含み得、それは例えば、ＡＤＥ２、ＨＩＳ４、ＬＥＵ２、ＴＲＰ１、およびＡＬＧ７、ならびにＧ４１８耐性遺伝子であり、それぞれ、酵母細胞がツニカマイシンおよびＧ４１８に耐性になるようにする。さらに、適切な選択マーカーはまた、金属のような毒性化合物の存在下において増殖する能力を、酵母に提供し得る。例えば、ＣＵＰ１の存在は、酵母が、銅イオンの存在下において増殖することを可能にする（Ｂｕｔｔら（１９８７）Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．５１：３５１） あるいは、上記成分のうちのいくつかは、組み立てられて形質転換ベクターになり得る。形質転換ベクターは、通常、上記のように、レプリコンにおいて保持されるか、または組み込みベクターに開発されるかのいずれかである、選択マーカーから構成される。
【０１０２】
発現ベクターおよび形質転換ベクターは、染色体外レプリコンまたは組み込みベクターのいずれかであり、多くの酵母への形質転換のために開発されてきた。例えば、発現ベクターは、とりわけ、以下の酵母のために開発されてきた：Ｃａｎｄｉｄａ ａｌｂｉｃａｎｓ（Ｋｕｒｔｚら（１９８６）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．６：１４２）、Ｃａｎｄｉｄａ ｍａｌｔｏｓａ（Ｋｕｎｚｅら（１９８５）Ｊ．Ｂａｓｉｃ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２５：１４１）。Ｈａｎｓｅｎｕｌａ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ（Ｇｌｅｅｓｏｎら（１９８６）Ｊ．Ｇｅｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１３２：３４５９；Ｒｏｇｇｅｎｋａｍｐら（１９８６）Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２０２：３０２）、Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ（Ｄａｓら（１９８４）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１５８：１１６５）、Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ ｌａｃｔｉｓ（Ｄｅ Ｌｏｕｖｅｎｃｏｕｒｔら（１９８３）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１５４：７３７；Ｖａｎ ｄｅｎ Ｂｅｒｇら（１９９０）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ８：１３５）、Ｐｉｃｈｉａ ｇｕｉｌｌｅｒｉｍｏｎｄｉｉ（Ｋｕｎｚｅら（１９８５）Ｊ．Ｂａｓｉｃ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２５：１４１）、Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ（Ｃｒｅｇｇら（１９８５）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．５：３３７６；米国特許第４，８３７，１４８号および同第４，９２９，５５５号）、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ（Ｈｉｎｎｅｎら（１９７８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７５：１９２９；Ｉｔｏら（１９８３）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１５３：１６３）、Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ（ＢｅａｃｈおよびＮｕｒｓｅ（１９８１）Ｎａｔｕｒｅ ３００：７０６）、およびＹａｒｒｏｗｉａ ｌｉｐｏｌｙｔｉｃａ（Ｄａｖｉｄｏｗら（１９８５）Ｃｕｒｒ．Ｇｅｎｅｔ．１０：３８０４７１；Ｇａｉｌｌａｒｄｉｎら（１９８５）Ｃｕｒｒ．Ｇｅｎｅｔ．１０：４９）。
【０１０３】
外来ＤＮＡを酵母宿主へ導入する方法は、当該分野において周知であり、そして通常、スフェロプラストの、またはアルカリ陽イオンで処置された無傷の酵母細胞のいずれかの形質転換を含む。形質転換の手順は、通常、形質転換される酵母の種によって変化する。例えば以下を参照のこと：（Ｋｕｒｔｚら（１９８６）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．６：１４２；Ｋｕｎｚｅら（１９８５）Ｊ．Ｂａｓｉｃ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２５：１４１；Ｃａｎｄｉｄａ）；（Ｇｌｅｅｓｏｎら（１９８６）Ｊ．Ｇｅｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１３２：３４５９；Ｒｏｇｇｅｎｋａｍｐら（１９８６）Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２０２：３０２；Ｈａｎｓｅｎｕｌａ）；（Ｄａｓら（１９８４）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１５８：１１６５；Ｄｅ Ｌｏｕｖｅｎｃｏｕｒｔら（１９８３）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１５４：１１６５；Ｖａｎ ｄｅｎ Ｂｅｒｇら（１９９０）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ８：１３５；Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）；（Ｃｒｅｇｇら（１９８５）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．５：３３７６；Ｋｕｎｚｅら（１９８５）Ｊ．Ｂａｓｉｃ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２５：１４１；米国特許第４，８３７，１４８号および同第４，９２９，５５５号；Ｐｉｃｈｉａ）；（Ｈｉｎｎｅｎら（１９７８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７５：１９２９；Ｉｔｏら（１９８３）Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１５３：１６３ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）；（ＢｅａｃｈおよびＮｕｒｓｅ（１９８１）Ｎａｔｕｒｅ ３００：７０６；Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）；（Ｄａｖｉｄｏｗら（１９８５）Ｃｕｒｒ．Ｇｅｎｅｔ．１０：３９；Ｇａｉｌｌａｒｄｉｎら（１９８５）Ｃｕｒｒ．Ｇｅｎｅｔ．１０：４９；Ｙａｒｒｏｗｉａ）。
【０１０４】
（抗体）
本明細書中で使用される場合、用語「抗体」とは、少なくとも１つの抗体結合部位から構成されるポリペプチドまたはポリペプチド群をいう。「抗体結合部位」は、内部表面形状および抗原のエピトープの特徴に相補的な電荷分布を有する、３次元結合空間であり、これが、抗体と抗原の結合を可能にする。「抗体」は、例えば、脊椎動物抗体、ハイブリッド抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、変化された抗体、単価抗体、Ｆａｂタンパク質、および単一ドメイン抗体を含む。
【０１０５】
本発明のタンパク質に対する抗体は、親和性クロマトグラフィー、免疫アッセイ、およびＮｅｉｓｓｅｒｉａのタンパク質の識別／同定に有用である。
【０１０６】
本発明のタンパク質に対する抗体（ポリクローナルおよびモノクローナルの両方）は、従来の方法によって調製され得る。一般に、タンパク質は、最初に、適切な動物、好ましくはマウス、ラット、ウサギ、またはヤギを免疫するために使用される。ウサギおよびヤギは、得られ得る血清の容量、および標識された抗ウサギ抗体および抗ヤギ抗体の入手可能性に起因して、ポリクローナル血清の調製のために好ましい。免疫は、一般的に、タンパク質を生理的食塩水（好ましくはフロイント完全アジュバントのようなアジュバント）に混合または乳化し、そして混合物または乳化物を非経口的に（一般的に皮下、または筋肉内に）注射することによって、行われる。５０〜２００μｇ／注射の用量が、代表的に充分である。免疫は、一般的に、２〜６週後に生理的食塩水（好ましくはフロイント不完全アジュバント）中のタンパク質の１回以上の注射でブーストされる。あるいは、当該分野において公知の方法を使用するインビトロ免疫によって抗体を産生し得、これは、本発明の目的にとっては、インビボ免疫に等しいと考えられる。ポリクローナル抗血清は、免疫された動物からガラスまたはプラスチック製容器へ採血し、その血液を２５℃で１時間インキュベートし、その後４℃で２〜１８時間インキュベートすることによって得られる。この血清は、遠心分離（例えば１，０００ｇ、１０分間）によって回収される。ウサギから、採血につき約２０〜５０ｍｌが得られ得る。
【０１０７】
モノクローナル抗体は、ＫｏｈｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ（Ｎａｔｕｒｅ（１９７５）２５６：４９５〜９６）の標準的方法、またはその改変版を使用して調製される。代表的には、マウスまたはラットが、上記のように免疫される。しかし、血清を抽出するために動物から採血するよりも、脾臓（および必要に応じていくつかの大きなリンパ節）が取り出され、そして単細胞へ解離される。もし所望ならば、脾臓細胞は、（非特異的付着細胞の回収後）細胞懸濁液をタンパク質抗原でコーティングされたプレートまたはウェルへアプライすることによって、スクリーニングされ得る。この抗原に特異的な膜結合免疫グロブリンを発現するＢ細胞は、このプレートに結合し、そして残りの懸濁液によって、洗い落とされない。生じるＢ細胞、または全ての解離された脾臓細胞は、次に骨髄腫細胞と融合するように誘導されてハイブリドーマを形成し、そして選択培地（例えばヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン培地、「ＨＡＴ」）において培養される。生じるハイブリドーマは、限界希釈によってプレーティングされ、そして免疫する抗原に対して特異的に結合する（かつ関連しない抗原に結合しない）抗体の産生についてアッセイされる。選択されるＭＡｂ分泌ハイブリドーマは、次にインビトロ（例えば、組織培養瓶または中空線維リアクター中で）、またはインビボ（マウスにおける腹水として）のいずれかで培養される。
【０１０８】
もし所望ならば、抗体は（ポリクローナルまたはモノクローナルいずれであっても）、従来技術を使用して標識され得る。適切な標識としては、以下が挙げられる：発蛍光団、発色団、放射性原子（特に^３２Ｐおよび^１２５Ｉ）、電子密度試薬、酵素、および特異的結合パートナーを有するリガンド。酵素は、代表的に、その活性によって検出される。例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼは、通常、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）を青い色素（分光光度計を用いて定量可能）へ変換するその能力によって、検出される。「特異的結合パートナー」とは、高い特異性でリガンド分子に結合し得るタンパク質をいい、例えば抗原およびそれに特異的なモノクローナル抗体の場合である。他の特異的結合パートナーは、ビオチンおよびアビジンまたはストレプトアビジン、ＩｇＧおよびプロテインＡ、ならびに当該分野において公知の多くのレセプター−リガンド対を含む。同じ標識がいくつかの異なる様式で働き得るので、以上の記載が、種々の標識を別個のクラスへ分類することを意味しないことは、理解されるべきである。例えば、^１２５Ｉは、放射性標識として、または電子密度試薬として働き得る。ＨＲＰは、酵素として、またはＭＡｂについての抗原として働き得る。さらに、所望の効果のために、種々の標識を組合せ得る。例えば、ＭＡｂおよびアビジンはまた、本発明の実施において、標識を必要とする。従って、ＭＡｂをビオチンで標識して、そして^１２５Ｉで標識したアビジン、またはＨＲＰで標識した抗ビオチンＭＡｂで、その存在を検出し得る。他の置換および可能性は、当業者に容易に明らかであり、そして本発明の範囲内に等しいと考えられる。
【０１０９】
（薬学的組成物）
薬学的組成物は、本発明のポリペプチド、抗体または核酸のいずれかを含み得る。この薬学的組成物は、治療上有効な量の、本願発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオチドのいずれかを含む。
【０１１０】
本明細書において使用される用語「治療上有効な量」とは、所望の疾患または状態を処置、改善、または予防するための治療薬剤の量、または、検出可能な治療効果または予防効果を示すための治療薬剤の量をいう。この効果は、例えば、キメラマーカーまたは抗原レベルによって検出され得る。治療効果はまた、体温低下のような、身体の症状における減少を含む。被験体に関する正確な有効量は、被験体の大きさおよび健康、状態の性質および程度、および投与のために選択される治療または治療の組合せに依存する。従って、あらかじめ正確な有効量を特定することは有用ではない。しかし、所定情況のための有効量は、慣用的な実験によって決定され得、そして臨床医の判断内である。
【０１１１】
本発明の目的のために、有効な用量は、ＤＮＡ構築物が投与される個体において、ＤＮＡ構築物の約０．０１ｍｇ／ｋｇ〜５０ｍｇ／ｋｇまたは０．０５ｍｇ／ｋｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇである。
【０１１２】
薬学的組成物はまた、薬学的に受容可能なキャリアを含み得る。用語「薬学的に受容可能なキャリア」とは、抗体またはポリペプチド、遺伝子、および他の治療薬剤のような、治療薬剤の投与のためのキャリアをいう。この用語は、この組成物を受け取る個体に有害な抗体の産生をそれ自体誘導しない、任意の薬学的キャリアをいい、そして、過度の毒性を伴わずに投与され得る。適切なキャリアは、タンパク質、多糖、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、重合アミノ酸、アミノ酸コポリマー、および不活性ウイルス粒子のように、大きく、遅く代謝される巨大分子であり得る。このようなキャリアは、当業者に周知である。
【０１１３】
薬学的に受容可能な塩が、その中で使用され得る。例えば、塩酸塩、臭化水素塩、リン酸塩、硫酸塩などのような鉱酸塩；および酢酸塩、プロピオン酸塩、マロン酸塩、安息香酸塩などのような有機酸の塩である。薬学的に受容可能な賦形剤の徹底的な議論は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（Ｍａｃｋ Ｐｕｂ．Ｃｏ．、Ｎ．Ｊ．１９９１）にて利用可能である。
【０１１４】
治療組成物における薬学的に受容可能なキャリアは、水、生理的食塩水、グリセロールおよびエタノールのような液体を含み得る。さらに、湿潤剤または乳化剤、ｐＨ緩衝物質などのような補助物質が、このようなビヒクルに存在し得る。代表的には、治療組成物は、液体溶液または懸濁液のいずれかの、注射可能物質として調製される；注射前に液体ビヒクルに溶解または懸濁するのに適切な固体形態もまた、調製され得る。リポソームは、薬学的に受容可能なキャリアの定義中に含まれる。
【０１１５】
（送達方法）
一旦処方されると、本発明の組成物は、その被験体へ直接投与され得る。処置される被験体は、動物であり得；特に、ヒト被験体が処置され得る。
【０１１６】
その組成物直接送達は、一般的に、皮下的に、腹腔内に、静脈内に、または筋肉内のいずれかでの注入によって達成されるか、あるいは、組織の間質空間へ送達される。この組成物はまた、病巣へ投与され得る。他の投与様式には、経口投与、および肺投与、坐剤、および経皮（ｔｒａｎｓｄｅｒｍａｌ）適用または経皮（ｔｒａｎｓｃｕｔａｎｅｏｕｓ）適用（例えば、ＷＯ９８／２０７３４を参照のこと）、針、および遺伝子銃またはハイポスプレー（ｈｙｐｏｓｐｒａｙ）が含まれる。投薬処置は、単回用量スケジュール、または多数回用量スケジュールであり得る。
【０１１７】
（ワクチン）
本発明に従うワクチンは、予防的（すなわち、感染を予防するため）または治療（すなわち、感染後の疾患を処置するため）のいずれかであり得る。
【０１１８】
このようなワクチンは、免疫抗原、免疫原、ポリペプチド、タンパク質または核酸を、通常「薬学的に受容可能なキャリア」とともに含み、このキャリア自体は、その組成物を受ける個体に有害である抗体の産生を誘発しない任意のキャリアを含む。適切なキャリアは、代表的に、大きく、ゆっくり代謝される高分子（例えば、タンパク質、ポリサッカリド、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、ポリマー性アミノ酸、アミノ酸コポリマー、脂質凝集物（例えば、油小滴またはリポソーム）、および不活性ウイルス粒子である。このようなキャリアは、当該分野で周知である。さらに、これらのキャリアは免疫刺激薬剤（「アジュバント」）として機能し得る。さらに、この抗原または免疫原は、細菌毒素（例えば、ジフテリア、破傷風、コレラ、Ｈ．ｐｙｌｏｒｉなどの病原因子からの毒素）と結合体化され得る。
【０１１９】
この組成物の効力を増強するために好ましいアジュバントは、（１）アルミニウム塩（「明礬」）（例えば、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、硫酸アルミニウムなど）、（２）水中油懸濁処方物（他の特定の免疫刺激薬剤（例えば、ムラミルペプチド（以下を参照のこと）または細菌細胞壁成分）を伴うか伴わない）を包含するが、それらに限定されず、例えば、以下：（ａ）５％スクアレン、０．５％ Ｔｗｅｅｎ ８０、および０．５％ Ｓｐａｎ８５（必要に応じて、種々の量のＭＴＰ−ＰＥ（以下を参照のこと）を含有するが、必要ではない）を含み、モデル１１０Ｙ微小流体化器（Ｍｉｃｒｏｆｌｕｉｄｉｃｓ、Ｎｅｗｔｏｎ、ＭＡ）のような微小流体化器を用いてμ未満の粒子へと処方されたＭＦ５９^ＴＭ（ＷＯ９０／１４８３７；Ｖａｃｃｉｎｅ ｄｅｓｉｇｎ：ｔｈｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ａｎｄ ａｄｊｕｖａｎｔ ａｐｐｒｏａｃｈ、編、Ｐｏｗｅｌｌ ＆ Ｎｅｗｍａｎ、Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ １９９５の第１０節）；（ｂ）μ未満のエマルジョンへと微小流体化されたか、またはボルテックスして、より大きな粒子径エマルジョンを生成したかのいずれかである、１０％スクアレン、０．４％Ｔｗｅｅｎ８０、５％プルロニックブロックポリマーＬ１２１、およびｔｈｒ−ＭＤＰ（以下を参照のこと）を含有するＳＡＦ、ならびに（ｃ）２％スクアレン、０．２％Ｔｗｅｅｎ８０、およびモノホスホリピドＡ（ＭＰＬ）、トレハロースジミコレート（ＴＤＭ）、および細胞壁骨格（ＣＷＳ）好ましくはＭＰＬおよびＣＷＳ（Ｄｅｔｏｘ^ＴＭ）からなる群由来の１つ以上の細菌細胞壁成分を含むＲｉｂｉ^ＴＭアジュバント系（ＲＡＳ）、（Ｒｉｂｉ Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍ、Ｈａｍｉｌｔｏｎ、ＭＴ）；（３）サポニンアジュバント（例えば、Ｓｔｉｍｕｌｏｎ^ＴＭ）（Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ、Ｗｏｒｃｅｓｔｅｒ、ＭＡ）を使用し得るか、またはそれから粒子（例えば、ＩＳＣＯＭ（免疫刺激性複合体）を生成し得る；（４）完全フロイントアジュバント（ＣＦＡ）および不完全フロイントアジュバント（ＩＦＡ）；（５）サイトカイン（例えば、インターロイキン（例えば、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−１２など）、インターフェロン（例えば、γインターフェロン）、マクロファージコロニー刺激因子（Ｍ−ＣＳＦ）、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）など；および（６）その組成物の効力を強化するための免疫刺激因子として作用する他の物質を包含するがそれらに限定されない。ミョウバンおよびＭＦ５９^ＴＭが好ましい。
【０１２０】
上記で言及したように、ムラミルペプチドは、Ｎ−アセチル−ムラミル−Ｌ−スレオニル−Ｄ−イソグルタミン（ｔｈｒ−ＭＤＰ）、Ｎ−アセチル−ノルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ノル−ＭＤＰ）、Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミニル−Ｌ−アラニン−２−（１’−２’−ジパルミトイル−ｓｎ−グリセロ−３−ヒドロキシホスホリルオキシ）−エチルアミン（ＭＴＰ−ＰＥ）などを包含するがそれらに限定されない。
【０１２１】
免疫原性組成物（例えば、免疫化抗原／免疫原／ポリペプチド／タンパク質／核酸、薬学的に受容可能なキャリア、およびアジュバント）は、代表的に、希釈剤（例えば、水、生理食塩水、グリセロール、エタノールなど）を含有する。さらに、補助物質（例えば、湿潤剤または乳化剤、ｐＨ緩衝物質など）は、このようなビヒクルにおいて存在し得る。
【０１２２】
代表的に、免疫原性組成物は、液体溶液または懸濁物として、注射剤として調製され；注射前に液体ビヒクルにおける溶液または懸濁物として適切な固体形態もまた調製され得る。この調製物はまた、薬学的に受容可能なキャリアの下で、上記に記載のように、アジュバント効果の強化のために乳化され得るかまたはリポソーム中にカプセル化され得る。
【０１２３】
ワクチンとして使用される免疫原性組成物は、免疫学的有効量の抗原性または免疫原性のポリペプチド、および任意の他の上記の成分を必要に応じて含む。「免疫学的有効量」とは、その量の個体への投与が、単回用量であれ、一連の（用量の）一部としてであれ、処置または予防に有効であることを意味する。この量は、処置される個体の健康および身体状態、処置される個体の分類学上の群（例えば、非ヒト霊長類、霊長類など）、個体の免疫系が抗体を合成する能力、所望される保護の程度、そのワクチンの処方物、処置する医師の医療的状況の評価、および他の関連する因子に依存して変動する。その量は、比較的広い範囲に入り、この量が慣用的な試行を通して決定され得ることが予想される。
【０１２４】
免疫学的組成物は、従来のように、非経口的（例えば、皮下、筋肉内または経皮（ｔｒａｎｓｕｄｅｒｍａｌｌｙ）／経皮（ｔｒａｎｓｕｃｕｔａｎｅｏｕｓｌｙ）のいずれかでの注射による）（例えば、ＷＯ９８／２０７３４）に投与される）。他の投与様式に適切なさらなる処方物は、経口処方物および肺処方物、坐剤、および経皮適用を含む。投薬処置は、単回用量スケジュールまたは多数回用量スケジュールであり得る。ワクチンは、他の免疫調節剤とともに投与され得る。
【０１２５】
タンパク質ベースのワクチンの代替として、ＤＮＡワクチンを使用し得る（例えば、ＲｏｂｉｎｓｏｎおよびＴｏｒｒｅｓ（１９９７）Ｓｅｍｉｎａｒｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ９：２７１−２８３；Ｄｏｎｎｅｌｌｙら（１９９７）Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ １５：６１７−６４８；本明細書中後半部を参照のこと）。
【０１２６】
（遺伝子送達ビヒクル）
本発明の治療剤のコード配列を含む、哺乳動物における発現のためにその哺乳動物へ送達される構築物の送達のための遺伝子治療ビヒクルは、局所または全身的のいずれかで投与され得る。これらの構築物は、ウイルスベクターアプローチまたは非ウイルスベクターアプローチを、インビボまたはエキソビボの様式で利用し得る。このようなコード配列の発現は、内因性哺乳動物プロモーターまたは外因性プロモーターを用いて誘導され得る。このコード配列のインビボでの発現は、構成性または調節性のいずれかであり得る。
【０１２７】
本発明は、意図された核酸配列を発現し得る遺伝子送達ビヒクルを含む。この遺伝子送達ビヒクルは、好ましくは、ウイルスベクター、およびより好ましくはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター、ヘルペスウイルスベクターまたはαウイルスベクターである。このウイルスベクターはまた、アストロウイルスベクター、コロナウイルスベクター、オルトミクソウイルスベクター、パポバウイルスベクター、パラミクソウイルスベクター、パルボウイルスベクター、ピコルナウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、またはトガウイルスベクターであり得る。一般的には、Ｊｏｌｌｙ（１９９４）Ｃａｎｃｅｒ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ １：５１−６４；Ｋｉｍｕｒａ（１９９４）Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ５：８４５−８５２；Ｃｏｎｎｅｌｌｙ（１９９５）Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ６：１８５−１９３；およびＫａｐｌｉｔｔ（１９９４）Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ６：１４８−１５３を参照のこと。
【０１２８】
レトロウイルスベクターは、当該分野で周知であり、そして本発明者らは、任意のレトロウイルス遺伝子治療ベクターが本発明において使用可能であることを意図する。これには、Ｂ型、Ｃ型およびＤ型のレトロウイルス、異種栄養性ウイルス（例えば、ＮＺＢ−Ｘ１、ＮＺＢ−Ｘ２およびＮＺＢ９−１（Ｏ’Ｎｅｉｌｌ（１９８５）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．５３：１６０を参照のこと）多栄養性レトロウイルス（例えば、ＭＣＦおよびＭＣＦ−ＭＬＶ（Ｋｅｌｌｙ（１９８３）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．４５：２９１を参照のこと）、スプマウイルスおよびレンチウイルスが含まれる。ＲＮＡ Ｔｕｍｏｒ Ｖｉｒｕｓｅｓ、第２版、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｏｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ、１９８５を参照のこと。
【０１２９】
レトロウイルス遺伝子治療ベクターの部分は、異なるレトロウイルスに由来し得る。例えば、レトロウイルスＬＴＲは、マウス肉腫ウイルスに由来し得、ｔＲＮＡ結合部位はラウス肉腫ウイルスに由来し得、パッケージングシグナルはマウス白血病ウイルスに由来し得、そして第二の鎖合成の起源はトリ白血病ウイルスに由来し得る。
【０１３０】
これらの組換えレトロウイルスベクターを使用して、適切なパッケージング細胞株へそれらを導入することによって形質導入適合性レトロウイルスベクター粒子を生成し得る（米国特許第５，５９１，６２４号を参照のこと）。レトロウイルスベクターは、レトロウイルス粒子へのキメラインテグラーゼ酵素の組込みによって宿主細胞ＤＮＡへの部位特異的組込みについて構築され得る（ＷＯ９６／３７６２６号を参照のこと）。この組換えウイルスベクターは複製欠損組換えウイルスであることが好ましい。
【０１３１】
上記に記載のレトロウイルスベクターを伴う使用について適切なパッケージング細胞株は、当該分野で周知であり、容易に調製され（ＷＯ９５／３０７６３号およびＷＯ９２／０５２６６号を参照のこと）、そしてこれを使用して、組換えベクター粒子の生産のためのプロデューサー細胞株（これは、ベクター細胞株または「ＶＣＬ」とも称される）を作製し得る。好ましくは、このパッケージング細胞株は、ヒトの親細胞（例えば、ＨＴ１０８０細胞）またはミンク親細胞株から作製され、これは、ヒト血清における不活化を除去する。
【０１３２】
レトロウイルス遺伝子治療ベクターの構築のために好ましいレトロウイルスは、トリ白血病ウイルス、ウシ白血病ウイルス、マウス白血病ウイルス、ミンク細胞フォーカス形成ウイルス、マウス肉腫ウイルス、細網内皮症ウイルス、およびラウス肉腫ウイルスを含む。特に好ましいマウス白血病ウイルスは、４０７０Ａおよび１５０４Ａ（ＨａｒｔｌｅｙおよびＲｏｗｅ（１９７６）Ｊ． Ｖｉｒｏｌ．１９：１９−２５）、Ａｂｅｌｓｏｎ（ＡＴＣＣ番号ＶＲ−９９９）、Ｆｒｉｅｎｄ（ＡＴＣＣ番号ＶＲ−２４５）、Ｇｒａｆｆｉ、Ｇｒｏｓｓ（ＡＴＣＣ番号ＶＲ−５９０）、Ｋｉｒｓｔｅｎ、Ｈａｒｖｅｙ肉腫ウイルスおよびＲａｕｓｃｈｅｒ（ＡＴＣＣ番号ＶＲ−９９８）およびモロニーマウス白血病ウイルス（ＡＴＣＣ番号ＶＲ−１９０）を含む。このようなレトロウイルスベクターは、寄託機関または収集機関（例えば、アメリカンタイプカルチャーコレクション（「ＡＴＣＣ」）、Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ、Ｍａｒｙｌａｎｄ）から入手し得るか、
または一般に利用可能な技術を用いて公知の供給源から単離され得る。
【０１３３】
本発明において使用可能な例示的な公知のレトロウイルス遺伝子治療ベクターは、特許出願ＧＢ２２００６５１、ＥＰ０４１５７３１、ＥＰ０３４５２４２、ＥＰ０３３４３０１、ＷＯ８９／０２４６８；ＷＯ８９／０５３４９、ＷＯ８９／０９２７１．ＷＯ９０／０２８０６、ＷＯ９０／０７９３６、ＷＯ９４／０３６２２、ＷＯ９３／２５６９８、ＷＯ９３／２５２３４、ＷＯ９３／１１２３０、ＷＯ９３／１０２１８、ＷＯ９１／０２８０５、ＷＯ９１／０２８２５、ＷＯ９５／０７９９４、米国特許第５，２１９，７４０号、同４，４０５，７１２号、同４，８６１，７１９号、同４，９８０，２８９号、同４，７７７，１２７号、同５，５９１，６２４号に記載されるものを含む。Ｖｉｌｅ（１９９３）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５３：３８６０−３８６４；Ｖｉｌｅ（１９９３）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５３：９６２−９６７；Ｒａｍ（１９９３）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５３（１９９３）８３−８８；Ｔａｋａｍｉｙａ（１９９２）Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ Ｒｅｓ ３３：４９３−５０３；Ｂａｂａ（１９９３）Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ ７９：７２９−７３５；Ｍａｎｎ（１９８３）Ｃｅｌｌ ３３：１５３；Ｃａｎｅ（１９８４）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ８１；６３４９；およびＭｉｌｌｅｒ（１９９０）Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ １もまた参照のこと。
【０１３４】
ヒトアデノウイルス遺伝子治療ベクターもまた当該分野で公知であり、そして本発明において使用可能である。例えば、Ｂｅｒｋｎｅｒ（１９８８）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ６：６１６およびＲｏｓｅｎｆｅｌｄ（１９９１）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５２：４３１；ならびにＷＯ９３／０７２８３、ＷＯ９３／０６２２３、およびＷＯ９３／０７２８２を参照のこと。本発明において使用可能な例示的な公知のアデノウイルス遺伝子治療ベクターは、上記に参照される文書およびＷＯ９４／１２６４９、ＷＯ９３／０３７６９、ＷＯ９３／１９１９１、ＷＯ９４／２８９３８、ＷＯ９５／１１９８４、ＷＯ９５／００６５５、ＷＯ９５／２７０７１、ＷＯ９５／２９９９３、ＷＯ９５／３４６７１、ＷＯ９６／０５３２０、ＷＯ９４／０８０２６、ＷＯ９４／１１５０６、ＷＯ９３／０６２２３、ＷＯ９４／２４２９９、ＷＯ９５／１４１０２、ＷＯ９５／２４２９７、ＷＯ９５／０２６９７、ＷＯ９４／２８１５２、ＷＯ９４／２４２９９、ＷＯ９５／０９２４１，ＷＯ９５／２５８０７、ＷＯ９５／０５８３５、ＷＯ９４／１８９２２およびＷＯ９５／０９６５４において記載されるものを含む。あるいは、Ｃｕｒｉｅｌ（１９９２）Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．３：１４７−１５４に記載されるような殺傷したアデノウイルスに連結したＤＮＡの投与が使用され得る。本発明の遺伝子送達ビヒクルはまた、アデノウイルス随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターを含む。本発明における使用のためのこのようなベクターの主要なおよび好ましい例は、Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ＷＯ９３／０９２３９に開示されるＡＡＶ−２ベースのベクターである。最も好ましいＡＡＶベクターは、２つのＡＡＶ逆方向末端反復を含む。ここで、ネイティブＤ配列は、ヌクレオチドの置換によって改変され、その結果、少なくとも５つのネイティブなヌクレオチドおよび１８までのネイティブヌクレオチド、好ましくは少なくとも１０のネイティブヌクレオチドから１８までのネイティブヌクレオチド、最も好ましくは１０のネイティブヌクレオチドが維持され、そしてＤ配列の残りのヌクレオチドが欠失またはネイティブでないヌクレオチドで置換されている。ＡＡＶ逆方向末端反復のネイティブなＤ配列は、各ＡＡＶ逆方向末端反復において（すなわち、各末端に１つの配列が存在する）２０の連続するヌクレオチドの配列であって、これは、ＨＰ形成に関与しない。ネイティブでない置換ヌクレオチドは、同じ位置でのネイティブなＤ配列に見出されるヌクレオチド以外の任意のヌクレオチドであり得る。他の使用可能な例示的なＡＡＶベクターは、、ｐＷＰ−１９、ｐＷＮ−１であり、これらは両方ともＮａｈｒｅｉｎｉ（１９９３）Ｇｅｎｅ １２４：２５７−２６２に開示される。このようなＡＡＶベクターの別の例は、ｐｓｕｂ２０１（Ｓａｍｕｌｓｋｉ（１９８７）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．６１：３０９６を参照のこと）である。別の例示的なＡＡＶベクターは、Ｄｏｕｂｌｅ−Ｄ ＩＴＲベクターである。Ｄｏｕｂｌｅ−Ｄ ＩＴＲベクターの構築は、米国特許第５，４７８，７４５号に開示される。なお他のベクターは、Ｃａｒｔｅｒ 米国特許第４，７９７，３６８号およびＭｕｚｙｃｚｋａ 米国特許第５，１３９，９４１号、Ｃｈａｒｔｅｊｅｅ 米国特許第５，４７４，９３５号ならびにＫｏｔｉｎ ＷＯ９４／２８８１５７に開示されるものである。本発明において使用可能なＡＡＶベクターのなおさらなる例は、ＳＳＶ９ＡＦＡＢＴＫｎｅｏであり、これは、ＡＦＰエンハンサーおよびアルブミンプロモーターを含み、そして肝臓において優性に発現を指向する。その構造および構築は、Ｓｕ（１９９６）Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ７：４６３−４７０に開示される。さらなるＡＡＶ遺伝子治療ベクターは、米国特許第５，３５４，６７８号、同５，１７３，４１４号、同５，１３９，９４１号、および同５，２５２，４７９号に開示される。
【０１３５】
本発明の遺伝子治療ベクターはまた、ヘルペスウイルスベクターを含む。主要なおよび好ましい例は、チミジンキナーゼポリペプチドをコードする配列を含む単純ヘルペスウイルスベクター（例えば、米国特許第５，２８８，６４１号、およびＥＰ０１７６１７０（Ｒｏｉｚｍａｎ）に開示されるもの）である。さらなる例示的な単純ヘルペスウイルスベクターは、ＷＯ９５／０４１３９（Ｗｉｓｔａｒ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ）に開示されるＨＦＥＭ／ＩＣＰ６−ｌａｃＺ、Ｇｅｌｌｅｒ（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４１：１６６７−１６６９ならびにＷＯ９０／０９４４１およびＷＯ９２／０７９４５に記載されるｐＨＳＶｌａｃ、Ｆｉｎｋ（１９９２）Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ３：１１−１９に記載されるＨＳＶ Ｕｓ３：：ｐｇＣ−ｌａｃＺ、ならびにＥＰ０４５３２４２（Ｂｒｅａｋｅｆｉｅｌｅｄ）に記載されるＨＳＶ ７１３４、２ＲＨ １０５およびＧＡＬ４、ならびにＡＴＣＣに受託番号ＡＴＣＣ ＶＲ−９７７およびＡＴＣＣ ＶＲ−２６０として寄託されたものを含む。
【０１３６】
意図されるのはまた、本発明において使用され得るαウイルス遺伝子治療ベクターである。好ましいαウイルスベクターは、シンドビスウイルスベクターである。トガウイルス、セムリキ森林ウイルス（ＡＴＣＣ ＶＲ−６７；ＡＴＣＣ ＶＲ−１２４７）、Ｍｉｄｄｌｅｂｅｒｇウイルス（ＡＴＣＣ ＶＲ−３７０）、ロスリバーウイルス（ＡＴＣＣ ＶＲ−３７３；ＡＴＣＣ ＶＲ−１２４６）、ベネズエラウマ脳脊髄炎ウイルス（ＡＴＣＣ ＶＲ−９２３；ＡＴＣＣ ＶＲ−１１２５０；ＡＴＣＣ ＶＲ−１２４９；ＡＴＣＣ ＶＲ−５３２）および米国特許第５，００９１，３０９号、同５，２１７，８７９号、およびＷＯ９２／１０５７８に記載されるもの。より詳細には、米国特許出願第０８／４０５，６２７号（１９９５年３月１５日出願）、ＷＯ９４／２１７９２号、ＷＯ９２／１０５７８号、ＷＯ９５／０７９９４号、米国特許第５，０９１，３０９号、および米国特許第５，２１７，８７９号に記載されるそれらのαウイルスベクターが使用可能である。このようなαウイルスは、ＡＴＣＣ、Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ、Ｍａｒｙｌａｎｄのような寄託機関または収集機関から入手し得るか、または一般的に利用可能な技術を用いて公知の供給源から単離され得る。好ましくは、細胞傷害性が減少したαウイルスベクターを使用する（米国特許仮出願０８／６７９６４０号を参照のこと）。
【０１３７】
ＤＮＡベクター系（例えば、真核細胞層状発現系）もまた、本発明の核酸の発現について有用である。真核生物層状発現系の詳細な説明についてはＷＯ９５／０７９９４を参照のこと。好ましくは、本発明の真核細胞層状発現系はαウイルスベクターに由来し、そして最も好ましくはシンドビスウイルスベクターに由来する。
【０１３８】
本発明における使用に適切な他のウイルスベクターは、ポリオウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−５８およびＥｖａｎｓ、Ｎａｔｕｒｅ（１９８９）３８５およびＳａｂｉｎ（１９７３）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｓｔａｎｄａｒｄｉｚａｔｉｏｎ １：１１５に記載されるもの；リノウイルス、例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−１１１０およびＡｒｎｏｌｄ（１９９０）Ｊ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｌ４０１に記載されるもの；ポックスウイルス（例えば、カナリアポックスルウイルスまたはワクシニアウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−１１１およびＡＴＣＣ ＶＲ−２０１０ならびにＦｉｓｈｅｒ−Ｈｏｃｈ（１９８９）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ８６：３１７；Ｆｌｅｘｎｅｒ（１９８９）Ａｎｎ ＮＹ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ５６９：８６、Ｆｌｅｘｎｅｒ（１９９０）Ｖａｃｃｉｎｅ ８：１７；米国特許第４，６０３，１１２号および同４，７６９，３３０号ならびにＷＯ８９／０１９７３号に記載されるもの））；ＳＶ４０ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−３０５およびＭｕｌｌｉｇａｎ（１９７９）Ｎａｔｕｒｅ ２７７：１０８およびＭａｄｚａｋ（１９９２）Ｊ Ｇｅｎ Ｖｉｒｏｌ ７３：１５３３に記載されるもの）；インフルエンザウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−７９７および米国特許第５，１６６，０５７号およびＥｎａｍｉ（１９９０）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ．８７：３８０２−３８０５；ＥｎａｍｉおよびＰａｌｅｓｅ（１９９１）Ｊ Ｖｉｒｏｌ ６５：２７１１−２７１３およびＬｕｙｔｊｅｓ（１９８９）Ｃｅｌｌ ５９−１１０（ＭｃＭｉｃｈａｅｌ（１９８３）ＮＥＪ Ｍｅｄ ３０９：１３ならびにＹａｐ（１９７８）Ｎａｔｕｒｅ ２７３：２３８およびＮａｔｕｒｅ（１９７９）２７７：１０８もまた参照のこと）に記載されるような逆遺伝子技術を使用して作製した組換えインフルエンザウイルス）；ＥＰ−０３８６８８２およびＢｕｃｈｓｃｈａｃｈｌｅｒ（１９９２）Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．６６：２７３１に記載されるようなヒト免疫不全ウイルス；麻疹ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−６７およびＶＲ−１２４７ならびにＥＰ−０４４０２１９に記載されるもの）；アウラウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−３６８）；ベバルウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−６００およびＡＴＣＣ ＶＲ−１２４０）；カバス（Ｃａｂａｓｓｏｕ）ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−９２２）；チクングンヤウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−６４およびＡＴＣＣ ＶＲ−１２４１）；フォートモーガン（Ｆｏｒｔ Ｍｏｒｇａｎ）ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−９２４）；ゲタウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−３６９およびＡＴＣＣ ＶＲ−１２４３）；キジラガハ（Ｋｙｚｙｌａｇａｃｈ）ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−９２７）；マヤロウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−６６）；ムカンボウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−５８０およびＡＴＣＣ ＶＲ−１２４４）；ヌヅムウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−３７１）；ピクスナウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−３７２およびＡＴＣＣ ＶＲ−１２４５）；トナテ（Ｔｏｎａｔｅ）ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−９２５）；トリニティウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−４６９）；ユナウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−３７４）；ワタロアウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−９２６）；Ｙ−６２−３３ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−３７５）；オニオニオンウイルス、東部ウマ脳脊髄炎ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−６５およびＡＴＣＣ ＶＲ−１２４２）；西部ウマ脳脊髄炎ウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−７０、ＡＴＣＣ ＶＲ−１２５１、ＡＴＣＣ ＶＲ−６２２およびＡＴＣＣ ＶＲ−１２５２）；ならびにコロナウイルス（例えば、ＡＴＣＣ ＶＲ−７４０）およびＨａｍｒｅ（１９６６）Ｐｒｏｃ Ｓｏｃ Ｅｘｐ Ｂｉｏｌ Ｍｅｄ １２１：１９０に記載のものを含む。
【０１３９】
本発明の組成物の細胞への送達は、上記に言及したウイルスベクターに限定されない。他の送達方法および媒体が使用され得る（例えば、核酸発現ベクター、殺傷したアデノウイルスに連結したかまたは連結してないポリカチオン性縮合ＤＮＡ単独（例えば、米国特許出願番号０８／３６６，７８７（１９９４年１２月３０日出願）およびＣｕｒｉｅｌ（１９９２）Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ３：１４７−１５４を参照のこと）、リガンド連結ＤＮＡ（例えば、Ｗｕ（１９８９）Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２６４：１６９８５−１６９８７を参照のこと）、真核生物細胞送達ビヒクル細胞（例えば、米国特許出願番号０８／２４０，０３０（１９９４年５月９日出願）および米国特許出願番号０８／４０４，７９６を参照のこと）、光重合化ヒドロゲル物質の沈着、手動の遺伝子送達粒子銃（米国特許第５，１４９，６５５号に記載されるような）、米国特許第５，２０６，１５２およびＷＯ９２／１１０３３に記載されるような電離放射線、核酸電荷中和または細胞膜との融合）。さらなるアプローチは、Ｐｈｉｌｉｐ（１９９４）Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ １４：２４１１−２４１８およびＷｏｆｆｅｎｄｉｎ（１９９４）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ９１：１５８１−１５８５に記載される。
【０１４０】
粒子媒介遺伝子送達が使用され得る（例えば、米国特許出願６０／０２３，８６７号を参照のこと）。手短には、配列を、高レベル発現のための従来の制御配列を含む従来のベクターに挿入し得、次いで細胞標的化リガンド（例えば、アシアロオロソムコイド（ＷｕおよびＷｕ（１９８７）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６２：４４２９−４４３２に記載されるような）、Ｈｕｃｋｅｄ（１９９０）Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ ４０：２５３−２６３に記載されるようなインスリン、Ｐｌａｎｋ（１９９２）Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ Ｃｈｅｍ ３：５３３−５３９に記載されるようなガラクトース、ラクトースまたはトランスフェリン）に連結された合成遺伝子送達分子（例えば、重合ＤＮＡ結合カチオン様ポリリジン、プロタミンおよびアルブミン）とともにインキュベートされ得る。
【０１４１】
裸のＤＮＡもまた使用され得る。例示的な裸のＤＮＡ導入方法は、ＷＯ９０／１１０９２および米国特許第５，５８０，８５９号に記載される。取り込み効率は、生体分解性のラテックスビーズを用いて改良され得る。ＤＮＡコートラテックスビーズは、ビーズによるエンドサイトーシス開始の後に効率よく細胞へと輸送される。この方法は、ビーズを処理して疎水性を高め、それによってエンドソームの破壊および細胞質へのＤＮＡの放出を容易にすることによってさらに改良され得る。
【０１４２】
遺伝子送達ビヒクルとして作用し得るリポソームは、米国特許第５，４２２，１２０号、ＷＯ９５／１３７９６、ＷＯ９４／２３６９７、ＷＯ９１／１４４４５、およびＥＰ５２４，９６８に記載される。米国特許出願６０／０２３，８６７に記載されるように、非ウイルス性送達において、ポリペプチドをコードする核酸配列は、高レベル発現のための従来の制御配列を含む従来のベクターへと挿入され得、次いで細胞標的化リガンド（例えば、アシアロオロソムコイド、インスリン、ガラクトース、ラクトースまたはトランスフェリン）に連結された、重合性ＤＮＡ結合カチオン（例えば、ポリリジン、プロタミン、およびアルブミン）のような合成遺伝子伝達分子とともにインキュベートされ得る。他の送達系は、種々の組織特異的または普遍的作用性のプロモーターの制御下に遺伝子を含むＤＮＡをカプセル化するためのリポソームの使用を含む。さらに、使用に適切な非ウイルス送達は、機械的送達系（例えば、Ｗｏｆｆｅｎｄｉｎら（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９１（２４）：１１５８１−１１５８５に記載されるアプローチを含む。さらに、コード配列およびそのようなものの発現産物は、光重合化ヒドロゲル物質の沈着を介して送達され得る。コード配列の送達について使用され得る、遺伝子送達のための他の従来の方法は、例えば、手動の遺伝子送達粒子銃（米国特許第５，１４９，６５５号に記載されるような）；移入された遺伝子を活性化するための電離放射線の使用（米国特許第５，２０６，１５２号およびＷＯ９２／１１０３３に記載されるような）を含む。
【０１４３】
例示的なリポソームおよびポリカチオン性遺伝子送達ビヒクルは、米国特許第５，４２２，１２０号および同４，７６２，９１５号；ＷＯ９５／１３７９６；ＷＯ９４／２３６９７；およびＷＯ９１／１４４４５；ＥＰ−０５２４９６８；およびＳｔｒｙｅｒ、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、２３６−２４０頁（１９７５）、Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ、Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ；Ｓｚｏｋａ（１９８０）Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ａｃｔａ ６００：１；Ｂａｙｅｒ（１９７９） Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ａｃｔａ ５５０：４６４；Ｒｉｖｎａｙ（１９８７）Ｍｅｔｈ Ｅｎｚｙｍｏｌ １４９：１１９；Ｗａｎｇ（１９８７）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ８４：７８５１；Ｐｌａｎｔ（１９８９）Ａｎａｌ Ｂｉｏｃｈｅｍ １７６：４２０に記載されるものである。
【０１４４】
ポリヌクレオチド組成物は、治療有効量（この用語は上記に定義されるとおりである）の遺伝子治療ビヒクルを含み得る。本発明の目的のために、有効用量は、投与される個体において、約０．０１ｍｇ／ｋｇ〜５０ｍｇ／ｋｇまたは０．０５ｍｇ／ｋｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇのＤＮＡ構築物である。
【０１４５】
（送達方法）
一旦処方されると、本発明のポリヌクレオチド組成物は、（１）被験体に直接）；（２）エキソビボで被験体由来の細胞に送達されて；または（３）組換えタンパク質の発現のためにインビトロで、投与され得る。処置される被験体は、哺乳動物または鳥類であり得る。ヒト被験体もまた処置され得る。
【０１４６】
この組成物の直接送達は、皮下、腹腔内、静脈内、または筋肉内の注射によって、または組織の間質空間への送達のいずれかによって一般的に達成される。この組成物はまた、病巣へ投与され得る。他の投与様式は、経口投与または肺投与、坐剤、および経皮または経皮適用（例えば、ＷＯ９８／２０７３４を参照のこと）、針、および遺伝子銃またはハイポスプレーを含む。投薬治療は、単回用量スケジュールまたは多数回用量スケジュールであり得る。
【０１４７】
エキソビボ送達および被験体への形質転換細胞の再移植のための方法は、当該分野で公知であり、そして例えばＷＯ９３／１４７７８に記載されている。エキソビボ適用に有用である細胞の例は、例えば、幹細胞、特に、造血細胞、リンパ細胞、マクロファージ、樹状細胞または腫瘍細胞を含む。
【０１４８】
一般的に、エキソビボ適用およびインビトロ適用の両方のための核酸の送達は、以下の手順：例えば、デキストラン媒介トランスフェクション、リン酸カルシウム沈降、ポリブレン媒介トランスフェクション、原形質融合、エレクトロポレーション、ポリヌクレオチドのリポソーム内へのカプセル化、およびＤＮＡの核への直接の微量注入（これらはすべて当該分野で周知である）で達成され得る。
【０１４９】
（ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの薬学的組成物）
上記に記載の薬学的に受容可能なキャリアおよび塩に加えて、以下のさらなる薬剤がポリヌクレオチド組成物および／またはポリペプチド組成物とともに使用され得る。
【０１５０】
（Ａ．ポリペプチド）
１つの例は、限定することなく以下を包含する：アシアロオロソムコイド（ＡＳＯＲ）；トランスフェリン；アシアロ糖タンパク質；抗体；抗体フラグメント；フェリチン；インターロイキン；インターフェロン；顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、マクロファージコロニー刺激因子（Ｍ−ＣＳＦ）、幹細胞因子およびエリスロポエチン。ウイルス抗原（例えば、エンベロープタンパク質）もまた、使用され得る。また、他の侵襲性生物由来のタンパク質（例えば、ＲＩＩとして知られるＰｌａｓｍｏｄｉｕｍ ｆａｌｃｉｐａｒｕｍの環境スポロゾイト（ｃｉｒｃｕｍｓｐｏｒｏｚｏｉｔｅ）タンパク質由来の１７アミノ酸ペプチド）。
【０１５１】
（Ｂ．ホルモン、ビタミンなど）
包含され得る他の群は、例えば、ホルモン、ステロイド、アンドロゲン、エストロゲン、甲状腺ホルモン、またはビタミン、葉酸である。
【０１５２】
（Ｃ．ポリアルキレン、ポリサッカリドなど）
また、ポリアルキレングリコールが、所望のポリヌクレオチド／ポリペプチドとともに含有され得る。好ましい実施態様において、ポリアルキレングリコールは、ポリエチレングリコールである。さらに、モノサッカリド、ジサッカリド、またはポリサッカリドが含有され得る。この局面の好ましい実施態様において、このポリサッカリドは、デキストランまたはＤＥＡＥデキストランである。また、キトサンおよびポリ（乳酸−コ−グリコリド）。
【０１５３】
（Ｄ．脂質およびリポソーム）
所望のポリヌクレオチド／ポリペプチドはまた、被験体またはそれに由来する細胞への送達の前に、脂質中にカプセル化され得るか、またはリポソーム中にパッケージングされ得る。
【０１５４】
脂質カプセル化は、一般的に核酸に安定に結合し得るか、または核酸を捕捉もしくは維持し得るリポソームを用いて達成される。縮合ポリヌクレオチドの脂質調製物に対する比は、変動し得るが、一般的に約１：１（ｍｇＤＮＡ：マイクロモル脂質）であるか、またはより多くの脂質である。核酸の送達のためのキャリアとしてリポソーム使用の概説については、ＨｕｇおよびＳｌｅｉｇｈｔ（１９９１）Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ．１０９７：１−１７；Ｓｔｒａｕｂｉｎｇｅｒ（１９８３）Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１０１：５１２−５２７を参照のこと。
【０１５５】
本発明における使用のためのリポソーム調製物は、カチオン性（正に荷電した）アニオン性（負に荷電した）および中性の調製物を包含する。カチオン性リポソームは、機能的な形態で、プラスミドＤＮＡ（Ｆｅｌｇｎｅｒ（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８４：７４１３−７４１６）；ｍＲＮＡ（Ｍａｌｏｎｅ（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６：６０７７−６０８１；および精製した転写因子（Ｄｅｂｓ（１９９０）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６５：１０１８９−１０１９２）の細胞内送達を媒介することが示されている。
【０１５６】
カチオン性リポソームは容易に入手可能である。例えば、Ｎ［１−２，３−ジオレイルオキシ）プロピル］−Ｎ，Ｎ，Ｎ−トリエチルアンモニウム（ＤＯＴＭＡ）リポソームは、ＧＩＢＣＯ ＢＲＬ、Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ、ＮＹからの商標リポフェクチン（Ｌｉｐｏｆｅｃｔｉｎ）の下で入手可能である（Ｆｅｇｎｅｒ前出もまた参照のこと）。他の市販されているリポソームは、トランスフェクテース（ｔｒａｎｓｆｅｃｔａｃｅ）（ＤＤＡＢ／ＤＯＰＥ）およびＤＯＴＡＰ／ＤＯＰＥ（Ｂｏｅｒｈｉｎｇｅｒ）を含む。他のカチオン性リポソームは、当該分野で周知の技法を使用する容易に利用可能な物質から調製され得る。例えば、ＤＯＴＡＰ（１，２−ビス（オレイルオキシ）−３−（トリメチルアンモニオ）プロパン）リポソームの合成の記載について、Ｓｚｏｋａ（１９７８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７５：４１９４−４１９８；ＷＯ９０／１１０９２を参照のこと。
【０１５７】
同様に、アニオン性および中性リポソームは、例えば、Ａｖａｎｔｉ Ｐｏｌａｒ Ｌｉｐｉｄｓ（Ｂｉｒｍｉｎｇｈａｍ，ＡＬ）から容易に入手可能であるか、または容易に入手可能な物質を使用してたやすく調製され得る。このような物質には、とりわけ、ホスファチジルコリン、コレステロール、ホスファチジルエタノールアミン、ジオレオイルホスファチジルコリン（ＤＯＰＣ）、ジオレオイルホスファチジルグリセロール（ＤＯＰＧ）、ジオレオイルホスファチジルエタノールアミン（ＤＯＰＥ）などが含まれる。これらの物質はまた、適切な比率のＤＯＴＭＡおよびＤＯＴＡＰの出発物質と混合され得る。これらの物質を使用してリポソームを作製する方法は、当該分野で周知である。
【０１５８】
このリポソームは、多重膜のベシクル（ＭＬＶ）、小さな単一膜ベシクル（ＳＵＶ）、または大きな単一膜のベシクル（ＬＵＶ）を含み得る。種々のリポソーム−核酸複合体は当該分野で公知の方法を使用して調製され得る。例えば、Ｓｔｒａｕｂｉｎｇｅｒ（１９８３）Ｍｅｔｈ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１０１：５１２−５２７；Ｓｚｏｋａ（１９７８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７５：４１９４−４１９８；Ｐａｐａｈａｄｊｏｐｏｕｌｏｓ（１９７５）Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ ３９２：４８３；Ｗｉｌｓｏｎ（１９７９）Ｃｅｌｌ １７：７７）；ＤｅａｍｅｒおよびＢａｎｇｈａｍ（１９７６）Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ ４４３：６２９；Ｏｓｔｒｏ（１９７７）Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．７６：８３６；Ｆｒａｌｅｙ（１９７９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７６：３３４８）；ＥｎｏｃｈおよびＳｔｒｉｔｔｍａｔｔｅｒ（１９７９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７６：１４５；Ｆｒａｌｅｙ（１９８０）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．（１９８０）２５５：１０４３１；ＳｚｏｋａおよびＰａｐａｈａｄｊｏｐｏｕｌｏｓ（１９７８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７５：１４５；ならびにＳｃｈａｅｆｅｒ
−Ｒｉｄｄｅｒ（１９８２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２１５：１６６を参照のこと。
【０１５９】
（Ｅ．リポタンパク質）
さらに、リポタンパク質が、送達されるポリヌクレオチド／ポリペプチドとともに含まれ得る。利用されるリポタンパク質の例は、キロミクロン、ＨＤＬ、ＩＤＬ、ＬＤＬ、およびＶＬＤＬを含む。これらのタンパク質の変異体、フラグメント、または融合物もまた、使用され得る。また、天然に存在するリポタンパク質の改変体（例えば、アセチル化されたＬＤＬ）が使用され得る。これらのリポタンパク質は、リポタンパク質レセプターを発現する細胞へ、ポリヌクレオチドの送達を標的化し得る。好ましくは、リポタンパク質が、送達されるポリヌクレオチドとともに含まれる場合、他の標的化リガンドはその組成物中には含まれない。
【０１６０】
天然に存在するリポタンパク質は、脂質部分およびタンパク質部分を含む。このタンパク質部分は、アポタンパク質として知られる。現在では、アポタンパク質Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、およびＥが単離および同定されている。少なくともこれらの２つはいくつかのタンパク質を含み、ローマ数字、ＡＩ、ＡＩＩ、ＡＩＶ；ＣＩ、ＣＩＩ、ＣＩＩＩによって命名されている。
【０１６１】
１つのリポタンパク質は、１を超えるアポタンパク質を含み得る。例えば、天然に存在するキロミクロンはＡ、Ｂ、Ｃ、およびＥからなり、そして時間が経てばこれらのリポタンパク質はＡを欠失し、そしてＣおよびＥアポタンパク質を獲得する。ＶＬＤＬは、Ａ、Ｂ、Ｃ、およびＥアポタンパク質を含み、ＬＤＬはアポタンパク質Ｂを含み；そしてＨＤＬはアポタンパク質Ａ、Ｃ、およびＥを含む。
【０１６２】
これらのアポタンパク質のアミノ酸は公知であり、そして例えば、Ｂｒｅｓｌｏｗ（１９８５）Ａｎｎｕ Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ ５４：６９９；Ｌａｗ（１９８６）Ａｄｖ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．Ｂｉｏｌ．１５１：１６２；Ｃｈｅｎ（１９８６）Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２６１：１２９１８；Ｋａｎｅ（１９８０）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ７７：２４６５；Ｕｔｅｒｍａｎｎ（１９８４）Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ６５：２３２に記載されている。
【０１６３】
リポタンパク質は、トリグリセリド、コレステロール（遊離およびエステル）、およびリン脂質を含む、種々の脂質を含む。この脂質の組成は、天然に存在するリポタンパク質において変化する。例えば、キロミクロンは主としてトリグリセリドを含む。天然に存在するリポタンパク質の脂質含有物のより詳細な記載は、例えば、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１２８（１９８６）に見いだされ得る。この脂質の組成は、レセプター結合活性についてアポタンパク質の立体構造において補助するために選択される。脂質組成はまた、ポリヌクレオチド結合分子との疎水性相互作用および会合を容易にするように選択され得る。
【０１６４】
天然に存在するリポタンパク質は、例えば、血清から超遠心分離によって単離され得る。そのような方法は、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．（前出）；Ｐｉｔａｓ（１９８０）Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．２５３：５４５４−５４６０およびＭａｈｅｙ（１９７９）Ｊ Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ ６４：７４３−７５０に記載される。リポタンパク質はまた、インビトロまたは所望の宿主細胞中のアポタンパク質遺伝子の発現による組換え方法によって産生され得る。例えば、Ａｔｋｉｎｓｏｎ（１９８６）Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｃｈｅｍ １５：４０３およびＲａｄｄｉｎｇ（１９５８）Ｂｉｏｃｈｉｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ａｃｔａ ３０：４４３を参照のこと。リポタンパク質はまた、Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｔｅｃｈｎｉｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．，Ｓｔｏｕｇｈｔｏｎ，Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ，ＵＳＡのような商業的な供給者から購入され得る。さらなるリポタンパク質の記載は、Ｚｕｃｋｅｒｍａｎｎら、ＰＣＴ／ＵＳ９７／１４４６５に見い出され得る。
【０１６５】
（Ｆ．ポリカチオン性薬剤）
ポリカチオン性薬剤は、送達される所望のポリヌクレオチド／ポリペプチドを有する組成物中に、リポタンパク質を伴って、またはリポタンパク質を伴わずに含まれ得る。
【０１６６】
ポリカチオン性薬剤は、代表的には、生理的に適切なｐＨにおいて正味の正電荷を示し、そして所望の位置への送達を容易にするための核酸の電荷を中和し得る。これらの薬剤は、インビトロ、エキソビボ、およびインビボ適用のいずれもを有する。ポリカチオン性薬剤は、生きている被験体に、筋肉内、皮下などのいずれかで核酸を送達するために使用され得る。
【０１６７】
以下は、ポリカチオン性薬剤としての有用なポリペプチドの例である：ポリリジン、ポリアルギニン、ポリオルニチン、およびプロタミン。他の例は、ヒストン、プロタミン、ヒト血清アルブミン、ＤＮＡ結合タンパク質、非ヒストン染色体タンパク質、ＤＮＡウイルス由来のコートタンパク質（例えば、Ｘ１７４）を含む。転写因子もまた、ＤＮＡに結合するドメインを含み、従って核酸縮合薬剤として有用であり得る。手短に言えば、転写因子（例えば、Ｃ／ＣＥＢＰ、ｃ−ｊｕｎ、ｃ−ｆｏｓ、ＡＰ−１、ＡＰ−２、ＡＰ−３、ＣＰＦ、Ｐｒｏｔ−１、Ｓｐ−１、Ｏｃｔ−１、Ｏｃｔ−２、ＣＲＥＰ、およびＴＦＩＩＤ）は、ＤＮＡ配列に結合する塩基性ドメインを含む。
【０１６８】
有機ポリカチオン性薬剤は、スペルミン、スペルミジン、およびプトレシン（ｐｕｒｔｒｅｓｃｉｎｅ）を含む。
【０１６９】
ポリカチオン性薬剤の大きさおよびその物理的特性は、上記の表から外挿されて、他のポリカチオン性薬剤が構築され得るか、または合成ポリカチオン性薬剤が産生され得る。
【０１７０】
有用な合成ポリカチオン性薬剤は、例えば、ＤＥＡＥ−デキストラン、ポリブレンを含む。Ｌｉｐｏｆｅｃｔｉｎ^ＴＭ、およびｌｉｐｏｆｅｃｔＡＭＩＮＥ^ＴＭは、ポリヌクレオチド／ポリペプチドと組み合わせた場合にポリカチオン性複合体を形成するモノマーである。
【０１７１】
（免疫診断アッセイ）
本発明のＮｅｉｓｓｅｒｉａ抗原は、抗体レベルを検出するためのイムノアッセイにおいて使用され得る（または、逆に抗Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ抗体は抗原レベルを検出するために使用され得る）。充分に規定された組換え抗原に基づくイムノアッセイは、侵襲性の診断方法と置き換えるために開発され得る。生物学的サンプル（例えば、血液サンプルまたは血清サンプルを含む）内のＮｅｉｓｓｅｒｉａタンパク質に対する抗体が検出され得る。このイムノアッセイの設計は、多くのバリエーションの対象であり、そして種々のこれらは当該分野で公知である。イムノアッセイのプロトコルは、例えば、競合アッセイ、または直接反応アッセイ、またはサンドイッチ型アッセイに基づき得る。プロトコルはまた、例えば、固体支持体を使用し得、または免疫沈降によってなされ得る。ほとんどのアッセイは、標識された抗体またはポリペプチドの使用を含み、その標識は、例えば、蛍光分子、化学発光分子、放射性分子、または色素分子であり得る。プローブからのシグナルを増幅するアッセイは公知である；これらの例は、ビオチンおよびアビジンを利用するアッセイ、ならびに酵素標識および酵素媒介イムノアッセイ（例えば、ＥＬＡＳＡアッセイ）である。
【０１７２】
免疫診断に適切でありそして適切な標識試薬を備えるキットは、適切な容器中に、アッセイの実行に必要とされる残りの試薬および物質（例えば、適切な緩衝液、塩溶液など）ならびに適切なセットのアッセイの説明書と共に本発明の組成物を含む適切な物質を詰めることによって構築される。
【０１７３】
（核酸ハイブリダイゼーション）
「ハイブリダイゼーション」とは、水素結合による２つの核酸配列の互いの会合をいう。代表的には、１つの配列は、固体支持体に固定され、そして他方は溶液中で遊離している。次いで、２つの配列は水素結合に好ましい条件下で互いに接触される。この結合に影響を与える因子は以下を含む：溶媒のタイプおよび容量；反応温度；ハイブリダイゼーションの時間；撹拌；液体相の配列の固体支持体への非特異的な付着をブロックする薬剤（Ｄｅｎｈａｒｄｔ’ｓ試薬またはＢＬＯＴＴＯ）；配列の会合の速度を増大させる化合物（硫酸デキストランまたはポリエチレングリコール）の使用；およびハイブリダイゼーション後の洗浄条件のストリンジェンシー。Ｓａｍｂｒｏｏｋら（前出）第２巻、第９章、９．４７〜９．５７頁。
【０１７４】
「ストリンジェンシー」とは、異なる配列よりも非常に類似する配列の会合に好ましいハイブリダイゼーション反応における条件をいう。例えば、研究中のハイブリッドの計算されたＴｍより約１２０〜２００℃低い温度および塩濃度の組み合わせが選択されるべきである。温度および塩条件はしばしば、フィルターに固定したゲノムＤＮＡのサンプルが目的の配列にハイブリダイズし、次いで異なるストリンジェンシーの条件下で洗浄される、予備的な実験において経験的に決定され得る。Ｓａｍｂｒｏｏｋら、９．５０頁を参照のこと。
【０１７５】
例えば、サザンブロットを行う場合、考慮する変数は、（１）ブロットされるＤＮＡの複雑さ、および（２）プローブおよび検出される配列の間の相同性である。研究されるフラグメント全量は、プラスミドまたはファージ消化物については０．１〜１μｇ、高度に複雑な真核生物ゲノム中の単一コピーについては１０^−９〜１０^−８ｇまで、１０倍変化し得る。より低い複雑さのポリヌクレオチドについては、実質的により短いブロッティング、ハイブリダイゼーション、および曝露回数、より少量の出発ポリヌクレオチド、およびより低い非活性のプローブが使用され得る。例えば、単一コピーの酵母遺伝子は、１μｇの酵母ＤＮＡで開始し、２時間ブロットし、そして４〜８時間１０^８ｃｐｍ／μｇを用いてハイブリダイズして、わずか１時間の曝露時間を用いて検出され得る。単一コピーの哺乳動物遺伝子について、保存性のアプローチは、１０μｇのＤＮＡで開始し、一晩ブロットし、そして１０^８ｃｐｍ／μｇより多いプローブを用いて１０％硫酸デキストランの存在下で一晩ハイブリダイズし、約２４時間露光時間を生じる。
【０１７６】
いくつかの因子が、プローブと目的のフラグメントとの間のＤＮＡ−ＤＮＡハイブリッドの融解温度（Ｔｍ）、ならびに、結果として、ハイブリダイゼーションおよび洗浄についての適切な条件に影響を与え得る。多くの場合において、そのプローブはフラグメントに対して１００％相同なわけではない。他の共通して直面する変化には、長さ、ハイブリダイズする配列の全Ｇ＋Ｃ含量、ならびにイオン強度およびハイブリダイゼーション緩衝液のホルムアミド含量が含まれる。これらのすべての因子の効果は、一つの式によって近似され得る：
Ｔｍ＝８１＋１６．６（ｌｏｇ_１０Ｃｉ）＋０．４［％（Ｇ＋Ｃ）］−０．６（％ホルムアミド）−６００／ｎ−１．５（％ミスマッチ）。
ここでＣｉは塩濃度（一価イオン）であり、およびｎは塩基対内のハイブリッドの長さである（ＭｅｉｎｋｏｔｈおよびＷａｈｌ（１９８４）Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１３８：２６７／２８４からわずかに改変した）。
【０１７７】
ハイブリダイゼーション実験の設計において、核酸ハイブリダイゼーションに影響を与えるいくつかの因子が簡便に変更され得る。ハイブリダイゼーションおよび洗浄の温度ならびに洗浄時の塩濃度を調整するのが最も単純である。ハイブリダイゼーション温度（すなわち、ストリンジェンシー）が上昇するにつれて、非相同的な鎖の間で起こるハイブリダイゼーションは起こりにくくなるようであり、結果として、バックグラウンドが減少する。放射標識したプローブが固定化されたフラグメントと完全に相同ではない場合（遺伝子ファミリーおよび種間のハイブリダイゼーション実験における場合で頻繁であるように）、ハイブリダイゼーション温度は低下されなければならず、そしてバックグラウンドが増大する。洗浄の温度は、類似の様式で、ハイブリダイゼーションバンドの強度、およびバックグラウンドの程度に影響を与える。洗浄のストリンジェンシーはまた、塩濃度の減少とともに増大する。
【０１７８】
一般的に、５０％ホルミアミドの存在下で都合よいハイブリダイゼーション温度は、標的フラグメントに９５％〜１００％相同であるプローブについて４２℃、９０％〜９５％相同性では３７℃、８５％〜９０％相同性については３２℃である。より低い相同性については、上記の式を用いて、適切にホルムアミド含量が低くされ、そして温度が調整されるべきである。プローブと標的フラグメントとの間の相同性が未知である場合、最も単純なアプローチは、ともにストリンジェントではないハイブリダイゼーション条件および洗浄条件で開始することである。オートラジオグラフィー後に非特異的バンドまたは高いバックグラウンドが観察される場合、フィルターは高ストリンジェンシーで洗浄され得、そして再び露光され得る。露光のために必要な時間がこのアプローチを非実用的にする場合、いくつかのハイブリダイゼーションおよび／または洗浄ストリンジェンシーが並行して試験されるべきである。
【０１７９】
（核酸プローブアッセイ）
本発明に従う核酸プローブを利用する、ＰＣＲ、分枝ＤＮＡプローブアッセイ、またはブロッティング技術のような方法は、ｃＤＮＡまたはｍＲＮＡの存在を決定し得る。プローブは、検出されるに十分に安定な、二重鎖または二本鎖複合体を形成し得る場合に、本発明の配列に「ハイブリダイズする」といわれる。
【０１８０】
核酸プローブは、本発明のＮｅｉｓｓｅｒｉａヌクレオチド配列（センス鎖およびアンチセンス鎖の両方を含む）にハイブリダイズする。多くの異なるヌクレオチド配列がアミノ酸配列をコードするが、ネイティブなＮｅｉｓｓｅｒｉａ配列は、細胞に存在する実際の配列であるので、好ましい。ｍＲＮＡは、コード配列を表し、従ってプローブはコード配列に相補的であるべきであり、一本鎖ｃＤＮＡはｍＲＮＡに相補的であり、従ってｃＤＮＡプローブは非コード配列に相補的であるべきである。
【０１８１】
プローブ配列はＮｅｉｓｓｅｒｉａ配列（またはその相補物）に同一である必要はない。核酸プローブが標的ヌクレオチドと検出され得る二重鎖を形成し得る場合、配列および長さの変動は、アッセイの感受性の増加をもたらし得る。また、核酸プローブは、形成された二重鎖を安定化するためにさらなるヌクレオチドを含み得る。さらなるＮｅｉｓｓｅｒｉａ配列もまた、形成された二重鎖を検出するための標識としての一助となり得る。例えば、非相補的ヌクレオチド配列が、そのプローブの５’末端に付着され得、ここでそのプローブ配列の残りはＮｅｉｓｓｅｒｉａ配列に相補的である。あるいは、プローブ配列が、それとハイブリダイズし、そしてそれによって検出され得る二重鎖を形成するためにＮｅｉｓｓｅｒｉａ配列との十分な相補性を有する場合、非相補的塩基またはより長い配列は、プローブ中に分散され得る。
【０１８２】
プローブの正確な長さおよび配列は、ハイブリダイゼーション条件（例えば、温度、塩条件など）に依存する。例えば、診断的適用については、分析物の配列の複雑さに依存して、核酸プローブは、代表的には、少なくとも１０〜２０ヌクレオチド、好ましくは１５〜２５、そして最も好ましくは少なくとも３０ヌクレオチドを含むが、これよりも短くもあり得る。短いプライマーは、一般的には、鋳型との安定なハイブリッド複合体を形成するのにより低い温度を必要とする。
【０１８３】
プローブは、合成的手順（例えば、Ｍａｔｔｅｕｃｃｉらのトリエステル法、（Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．（１９８１）１０３：３１８５））、またはＵｒｄｅａら（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ（１９８３）８０：７４６１）に従って、または市販の自動オリゴヌクレオチド合成機を使用して、産生され得る。
【０１８４】
プローブの化学的性質は、優先度に従って選択され得る。特定の適用については、ＤＮＡまたはＲＮＡが適切である。他の適用については、改変（例えば、ホスホロチオエートまたはメチルホスホネートのようなバックボーンの改変）が組み込まれ得、インビボの半減期を増大させるために使用され得、ＲＮＡ親和性を変化させ、ヌクレアーゼ耐性などを増大させるなどを行い（例えば、ＡｇｒａｗａｌおよびＩｙｅｒ（１９９５）Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ６：１２−１９；Ａｇｒａｗａｌ（１９９６）ＴＩＢＴＥＣＨ １４：３７６−３８７）；ペプチド核酸のようなアナログもまた使用され得る（例えば、Ｃｏｒｅｙ（１９９７）ＴＩＢＴＥＣＨ １５ ２２４−２２９；Ｂｕｃｈａｒｄｔら（１９９３）ＴＩＢＴＥＣＨ １１：３８４−３８６）。
【０１８５】
あるいは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）は、少量の標的核酸を検出する別の周知の手段である。そのアッセイは、Ｍｕｌｌｉｓら、（Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．（１９８７）１５５：３３５−３５０）；米国特許第４，６８３，１９５号および同第４，６８３，２０２号に記載されている。２つの「プライマー」ヌクレオチドは、標的核酸とハイブリダイズし、そして反応を開始するために使用される。このプライマーは、増殖標的（またはその相補物）の配列にハイブリダイズしない、二重鎖の安定性を補助するための、または、例えば、首尾よい制限部位を組み込むための配列を含む。代表的には、このような配列は、所望のＮｅｉｓｓｅｒｉａ配列に隣接する。
【０１８６】
熱安定性のポリメラーゼは、もともとの標的核酸を鋳型として使用して、プライマーから標的核酸のコピーを作製する。標的核酸の閾値量がポリメラーゼによって産生された後、それらはより従来的な方法（例えば、サザンブロット）によって検出され得る。サザンブロット法を使用する場合、標識されたプローブは、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ配列（またはその相補物）にハイブリダイズする。
【０１８７】
また、ｍＲＮＡまたはｃＤＮＡは、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（前出）に記載される、従来的なブロッティング技術によって検出され得る。ｍＲＮＡ、またはｍＲＮＡからポリメラーゼ酵素を使用して生成されたｃＤＮＡは、ゲル電気泳動を使用して精製および分離され得る。次いで、ゲル上のこの核酸は、ニトロセルロースのような固体支持体にブロットされる。この固体支持体は、標識されたプローブに曝露され、次いですべてのハイブリダイズしていないプローブを洗浄して除去する。次に、標識プローブを含む二重鎖を検出する。代表的には、そのプローブは、放射活性部分で標識される。
【０１８８】
（実施例）
本実施例は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定された核酸配列を、推定の翻訳産物と共に記載し、そしてまたＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの核酸配列および翻訳産物も記載する。すべての核酸配列が完全なわけではなく、すなわち、それらは、全長の野生型タンパク質より短い配列をコードする。
【０１８９】
本実施例は一般的には以下の様式である：
・Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ｂ株）において同定されたヌクレオチド配列
・この配列の推定の翻訳産物
・データベースの比較に基づく翻訳産物のコンピューター分析
・Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）およびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅにおいて同定された対応する遺伝子およびタンパク質配列
・適切に抗原性であることを示すタンパク質の性質の記載
・生化学的分析の結果（発現、精製、ＥＬＩＳＡ、ＦＡＣＳなど）。
【０１９０】
本実施例は、代表的には種および株の間の配列同一性の詳細を含む。配列において類似のタンパク質は、一般的に構造および機能の両方において類似し、そして配列同一性はしばしば、共通の進化の起源を示す。公知の機能のタンパク質の配列との比較は、新しい配列に対する推定のタンパク質の機能の割り当てのための指針として広く使用され、そして、特に全ゲノム分析において有用であることが証明されている。
【０１９１】
配列比較を、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ２、ＢＬＡＳＴｎ、ＢＬＡＳＴｐ、ｔＢＬＡＳＴｎ、ＢＬＡＳＴｘ、およびｔＢＬＡＳＴｘの各アルゴリズム（例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌら、（１９９７）Ｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴ ａｎｄ ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ：ａ ｎｅｗ ｇｅｎｅｒａｉｏｎ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎ ｄａｔａｂａｓｅ ｓｅａｒｃｈ ｐｒｏｇｒａｍｓ．Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓａｅｒｃｈ ２５：２２８９−３４０２もまた参照のこと）を使用して、ＮＣＢＩ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ）で行った。検索を、以下のデータベースに対して行った：縮重しないＧｅｎＢａｎｋ＋ＥＭＢＬ＋ＤＤＢＬ＋ＰＤＢ配列および縮重しないＧｅｎＢａｎｋ ＣＤＳ 翻訳物＋ＰＤＢ＋ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ＋ＳＰｕｐｄａｔｅ＋ＰＩＲ配列。
【０１９２】
Ｍｅｎｉｎｇｃｏｃｃｕｓの配列およびＧｏｎｏｃｏｃｃｕｓの配列を比較するために、ｔＢＬＡＳＴｘアルゴニズムを、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｅｎｏｍｅ．ｏｕ．ｅｄｕ／ｇｏｎｏ＿ｂｌａｓｔ．ｈｔｍｌに実施されるように使用した。ＦＡＳＴＡアルゴリズムをまた使用して、ＯＲＦを比較した（ＧＣＧ Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｐａｃｋａｇｅ、バージョン９．０）。
【０１９３】
ヌクレオチド配列中のドット（例えば、配列番号１１中の４９５位）は、リーディングフレームを維持するために任意に導入したヌクレオチドを示す。同様に、二重下線を付したヌクレオチドを取り除いた。小文字（例えば、配列番号１１の４９６位）は、独立した配列決定反応のアラインメントの間に生じたあいまいさを示す（本実施例におけるヌクレオチド配列のいくつかは２つ以上の実験の結果を合わせて得られる）。
【０１９４】
ヌクレオチド配列を６つのリーディングフレームで走査して、Ｅｓｐｏｓｔｉら（Ｃｒｉｔｉｃａｌ ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｈｙｄｒｏｐａｔｈｙ ｏｆ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｐｒｏｔｅｉｎｓ（１９９０）Ｅｕｒ Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ １９０：２０７−２１９）の統計学的な研究に基づくアルゴニズムを用いて、疎水性ドメインの存在を予測した。これらのドメインは、潜在的な膜貫通ドメインまたは疎水性リーダー配列を表す。
【０１９５】
オープンリーディングフレームを、プログラムＯＲＦＦＩＮＤＥＲ（ＮＣＢＩ）を使用して、フラグメント化されたヌクレオチド配列から予測した。
【０１９６】
下線を付したアミノ酸配列は、ＰＳＯＲＴアルゴリズム（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｐｓｏｒｔ．ｎｉｂｂ．ａｃ．ｊｐ）によって予測される、ＯＲＦ中の潜在的な膜貫通ドメインまたはリーダー配列を示す。機能的なドメインもまた、ＭＯＴＩＦＳプログラム（ＧＣＧ ＷｉｓｃｏｎｓｉｎおよびＰＲＯＳＩＴＥ）を使用して予測した。
【０１９７】
種々の試験を使用して、本実施例で同定されたタンパク質のインビボの免疫原性を評価し得る。例えば、そのタンパク質は、組換え的に発現され得、そしてイムノブロットによって患者の血清をスクリーニングするために使用し得る。タンパク質と患者の血清との間の陽性反応は、この患者が以前に問題のタンパク質に対する免疫応答を引き起こしたことを示す（すなわち、このタンパク質は免疫原である）。この方法はまた、免疫優性タンパク質を同定するために使用され得る。
【０１９８】
この組み換えタンパク質をまた、例えばマウスで抗体を調製するために簡便に使用し得る。タンパク質が細胞表面に局在することの直接的な確認のために、これらを使用し得る。標識された抗体（例えば、ＦＡＣＳのための蛍光標識）をインタクトな細菌とインキュベートし、そして細菌表面における標識の存在がこのタンパク質の局在を確認する。
【０１９９】
特に、以下の方法（Ａ）〜（Ｓ）を使用して、本発明のタンパク質の発現、精製、および生化学的特徴付けを行った。
【０２００】
（Ａ．染色体ＤＮＡ調製）
Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ株２９９６を、１００ｍｌのＧＣ培地中で対数増殖期まで増殖させ、遠心分離によって収集し、そして５ｍｌ緩衝液（２０％スクロース、５０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、５０ｍＭ ＥＤＴＡ、ｐＨ８）に再懸濁した。氷上で１０分間インキュベーションした後、その細菌を１０ｍｌ溶解溶液（５０ｍＭ ＮａＣｌ、１％ Ｎａ−サルコシル、５０μｇ／ｍｌ プロテイナーゼＫ）の添加によって溶菌し、そしてその懸濁液を３７℃で２時間インキュベートした。２回のフェノール抽出（ｐＨ８に平衡化）および１回のクロロホルム／イソアミルアルコール（２４：１）抽出を行った。ＤＮＡを、０．３Ｍ 酢酸ナトリウムおよび２容量のエタノールの添加によって沈殿させ、そして遠心分離によって収集した。ペレットを、７０％エタノールで１回洗浄し、そして４ｍｌ緩衝液（１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、１ｍＭ ＥＤＴＡ、ｐＨ８）に再溶解した。ＤＮＡ濃度を、２６０ｎｍにおけるＯＤを読みとることによって測定した。
【０２０１】
（Ｂ．オリゴヌクレオチド設計）
合成オリゴヌクレオチドプライマーを、（ａ）利用可能な場合にはｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｃｕｓＢ配列、または（ｂ）ｇｏｎｏｃｏｃｃｕｓ／ｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｃｕｓＡ配列を使用して、必要に応じて、ｍｅｎｉｎｇｏｃｏｃｃｕｓの好ましいコドンに適合させて、各々のＯＲＦのコード配列に基づいて設計した。予測されるリーダー配列の直後の下流の５’末端増幅プライマー配列を推定することによって、任意の予測されるシグナルペプチドを除外した。
【０２０２】
大部分のＯＲＦについて、５’プライマーは２つの制限酵素部位を含んだ（その遺伝子自体の制限パターンに依存して、ＢａｍＨＩ−ＮｄｅＩ、ＢａｍＨＩ−ＮｈｅＩ、またはＥｃｏＲＩ−ＮｈｅＩ）；３’プライマーは、ＸｈｏＩ制限部位を含んだ。この手順を、各々の増幅産物（各々のＯＲＦに一致する）のクローニングを２つの異なる発現系：ｐＧＥＸ−ＫＧ（ＢａｍＨＩ−ＸｈｏＩまたはＥｃｏＲＩ−ＸｈｏＩのいずれかを使用する）、およびｐＥＴ２１ｂ＋（ＮｄｅＩ−ＸｈｏＩまたはＮｈｅＩ−ＸｈｏＩのいずれかを使用する）に指向させるために確立した。
【０２０３】
５’末端プライマーテイル：ＣＧＣＧＧＡＴＣＣＣＡＴＡＴＧ （ＢａｍＨＩ−ＮｄｅＩ）
ＣＧＣＧＧＡＴＣＣＧＣＴＡＧＣ （ＢａｍＨＩ−ＮｈｅＩ）
ＣＣＧＧＡＡＴＴＣＴＡＧＣＴＡＧＣ （ＥｃｏＲＩ−ＮｈｅＩ）
３’末端プライマーテイル： ＣＣＣＧＣＴＣＧＡＧ （ＸｈｏＩ）。
【０２０４】
ＯＲＦ５、ＯＲＦ１５、ＯＲＦ１７、ＯＲＦ１９、ＯＲＦ２０、ＯＲＦ２２、ＯＲＦ２７、ＯＲＦ２８、ＯＲＦ６５、およびＯＲＦ８９については、２つの異なる増幅を、各々のＯＲＦを２つの発現系でクローニングされるように行った。２つの異なるＰＣＲプライマーを、各々のＯＲＦについて使用した；同じ３’ＸｈｏＩプライマーを以前のように使用した：
５’末端プライマーテイル：ＧＧＡＡＴＴＣＣＡＴＡＴＧＧＣＣＡＴＧＧ （ＮｄｅＩ）
５’末端プライマーテイル：ＣＧＧＧＡＴＣＣ （ＢａｍＨＩ）
ＯＲＦ７６をｐＴＲＣ発現ベクターにクローニングし、そしてアミノ末端Ｈｉｓ−タグ融合物として発現した。特定の場合において、予想されたシグナルペプチドを最終産物に含めた。ＮｈｅＩ−ＢａｍＨＩ制限部位を、プライマーを使用して組み込んだ：
５’末端プライマーテイル：ＧＡＴＣＡＧＣＴＡＧＣＣＡＴＡＴＧ （ＮｈｅＩ）
３’末端プライマーテイル：ＣＧＧＧＡＴＣＣ （ＢａｍＨＩ）。
【０２０５】
制限酵素認識配列を含むのと同様に、プライマーは、増幅される配列にハイブリダイズするヌクレオチドを含んだ。ハイブリダイズするヌクレオチドの数は、プライマー全体の融解温度に依存し、そして各々のプライマーについて以下の式を使用して決定した：
Ｔ_ｍ＝４（Ｇ＋Ｃ）＋２（Ａ＋Ｃ） （テイルを除外）
Ｔ_ｍ＝６４．９＋０．４１（％ＧＣ）−６００／Ｎ （プライマー全体）
選択したオリゴの融解温度は、オリゴ全体について６５〜７０℃であり、そしてハイブリダイズ領域単独では５０〜５５℃であった。
【０２０６】
表Ｉ（４８７頁）は、各増幅のために使用される正方向および逆方向のプライマーを示す。特定の場合において、プライマー配列は、ＯＲＦの配列に正確にはマッチしないことが注目される。対応する配列が、ｇｏｎｏｃｏｃｃｕｓにおいて同定されていたが、初期の増幅が行われた時、完全な５’および／または３’配列は、いくつかのｍｅｎｉｇｏｃｏｃｃａｌ ＯＲＦについて公知ではなかった。従って、増幅について、ｇｏｎｏｃｏｃｃａｌ配列を、プライマー設計についての基礎として使用し得、コドンの優先性を考慮して変化され得る。特に、以下のコドンを変化させた：ＡＴＡ→ＡＴＴ；ＴＣＧ→ＴＣＴ；ＣＡＧ→ＣＡＡ；ＡＡＧ→ＡＡＡ；ＧＡＧ→ＧＡＡ；ＣＧＡ→ＣＧＣ；ＣＧＧ→ＣＧＣ；ＧＧＧ→ＧＧＣ。表Ｉにおいてイタリックとしたヌクレオチドは、そのような変化を示す。一旦完全な配列が同定されると、このアプローチが一般的にもはや必要でないことが理解される。
【０２０７】
Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ ３９４ ＤＮＡ／ＲＮＡ合成機によってオリゴを合成し、２ｍｌのＮＨ_４ＯＨ中でカラムから溶出し、５６℃での５時間のインキュベートにより脱保護した。このオリゴを０．３Ｍ 酢酸ナトリウムおよび２容量のエタノールの添加によって沈殿させた。次に、このサンプル遠心分離し、そしてそのペレットを１００μｌまたは１ｍｌの水のいずれかに再懸濁した。ＯＤ_２６０を、Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ Ｌａｍｂｄａ Ｂｉｏ分光光度計を使用して決定し、濃度を決定し、そして２〜１０ｐｍｏｌ／μｌに調整した。
【０２０８】
（Ｃ）増幅）
標準ＰＣＲプロトコールは、以下のとおりである：５０〜２００ｎｇのゲノムＤＮＡを、２０〜４０μＭの各オリゴ、４００〜８００μＭのｄＮＴＰｓ溶液、１×ＰＣＲ緩衝液（１．５ｍＭ ＭｇＣｌ_２を含む）、２．５単位のＴａｑＩ ＤＮＡポリメラーゼ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ ＡｍｐｌｉＴａｑ、ＧＩＢＣＯ Ｐｌａｔｉｎｕｍ、Ｐｗｏ ＤＮＡポリメラーゼ、またはＴａｋａｒａ Ｓｈｕｚｏ Ｔａｑポリメラーゼを使用する）の存在下でテンプレートとして使用した。
【０２０９】
いくつかの場合において、ＰＣＲを１０μｌのＤＭＳＯまたは５０μｌの２Ｍベタインの添加によって最適化した。
【０２１０】
ホットスタート（全混合物を９５℃で予め３分間インキュベーションしている間にポリメラーゼを添加する）の後に、各サンプルに二工程増幅を行った：最初の５サイクルを、制限酵素のテールを除く１つのオリゴのハイブリダイゼーション温度を使用して行い、次にオリゴ全長のハイブリダイゼーション温度に従って３０サイクルを行った。このサイクルの次に、７２℃で最後の１０分間の伸長をした。
【０２１１】
標準サイクルは、以下のとおりである：
変性 ハイブリダイゼーション 伸長
最初の５サイクル ３０秒 ３０秒 ３０〜６０秒
９５℃ ５０〜５５℃ ７２℃
最後の３０サイクル ３０秒 ３０秒 ３０〜６０秒
伸長時間は、増幅されるＯＲＦの長さに従って変化する。
【０２１２】
増幅を９６００または２４００ Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ ＧｅｎｅＡｍｐ ＰＣＲシステムのいずれかを使用して行った。結果を確認するために、増幅容量の１／１０を１〜１．５％アガロースゲルにロードし、そして各増幅フラグメントのサイズをＤＮＡ分子量マーカーと比較した。
【０２１３】
増幅したＤＮＡを、１％アガロースゲルに直接ロードしたか、またはまずエタノール沈殿をして、適切な容量中に再懸濁し、１％アガロースゲルにロードした。次に、正確なサイズのバンドに対応するＤＮＡフラグメントを、Ｑｉａｇｅｎ Ｇｅｌ Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ Ｋｉｔを使用し、製造業者の指示に従い、ゲルから溶出して精製した。ＤＮＡフラグメントの最終容量は、水または１０ｍＭ Ｔｒｉｓ、ｐＨ８．５の、３０μｌまたは５０μｌのいずれかであった。
【０２１４】
（Ｄ）ＰＣＲフラグメントの切断）
増幅フラグメントに対応する精製ＤＮＡを２つのアリコートに分け、そして以下を用いて２重に消化した：
−ｐＥＴ−２１ｂ＋へのクローニングおよびＣ末端Ｈｉｓ−タグ融合物としてのタンパク質のさらなる発現のためのＮｄｅＩ／ＸｈｏＩまたはＮｈｅＩ／ＸｈｏＩ
−ｐＧＥＸ−ＫＧへのクローニングおよびＮ末端ＧＳＴ融合物としてのタンパク質のさらなる発現のためのＢａｍＨＩ／ＸｈｏＩまたはＥｃｏＲＩ／ＸｈｏＩ−ＯＲＦ７６について、ｐＴＲＣ−ＨｉｓＡベクターへのクローニングおよびＮ末端Ｈｉｓ−タグ融合物としてのタンパク質のさらなる発現のためのＮｈｅＩ／ＢａｍＨＩ
−ｐＧｅｘ−ＨｉｓへのクローニングおよびＮ末端Ｈｉｓ−タグ融合物としてのタンパク質のさらなる発現のためのＥｃｏＲＩ／ＰｓｔＩ、ＥｃｏＲＩ／ＳａｌＩ、ＳａｌＩ／ＰｓｔＩ。
【０２１５】
各精製ＤＮＡフラグメントを、各制限酵素（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ）２０単位を用い、３０または４０μｌのいずれかの最終容量中で、適切な緩衝液の存在下で、インキュベート（３７℃で３時間〜オーバーナイト）した。次に、消化産物をＱＩＡｑｕｉｃｋ ＰＣＲ精製キットを使用して、製造業者の指示に従い、精製し、そして、水または１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．５）のいずれかの３０または５０μｌの最終容量中で溶出した。最終ＤＮＡ濃度を、適定した分子量マーカーの存在下での１％アガロースゲル電気泳動によって決定した。
【０２１６】
（Ｅ）クローニングベクター（ｐＥＴ２２Ｂ、ｐＧＥＸ−ＫＧ、ｐＴＲＣ−ＨｉｓＡ、およびｐＧｅｘ−Ｈｉｓ）の消化）
１０μｇのプラスミドを、適切な緩衝液の存在下で、２００μｌの反応容量中で、５０単位の各制限酵素を用いて、３７℃でオーバーナイトのインキュベーションで２重に消化した。消化物全体を１％アガロースゲルにロードした後に、消化したベクターに対応するバンドを、Ｑｉａｇｅｎ ＱＩＡｑｕｉｃｋ Ｇｅｌ Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ Ｋｉｔを使用してゲルから精製し、そのＤＮＡを５０μｌの１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．５）中に溶出した。ＤＮＡ濃度をサンプルのＯＤ_２６０を測定することにより推定し、そして５０μｇ／μｌに調整した。１μｌのプラスミドを、各クローニング手順に使用した。
【０２１７】
ベクターｐＧＥＸ−Ｈｉｓは、トロンビン切断部位の上流に６つのヒスチジン残基をコードする領域を有し、ベクターｐＴＲＣ９９（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）の多重クローニング部位を含有する改変したｐＧＥＸ−２Ｔベクターである。
【０２１８】
（Ｆ）クローニング）
以前に消化して精製した各ＯＲＦに対応するフラグメントを、ｐＥＴ２２ｂおよびｐＧＥＸ−ＫＧの両方にライゲーションした。最終容量２０μｌ中で、分子比３：１のフラグメント／ベクターを、０．５μｌのＮＥＢ Ｔ４ ＤＮＡリガーゼ（４００単位／μｌ）を使用して、製造業者から供給された緩衝液の存在下でライゲーションした。この反応物を、室温で３時間、インキュベートした。いくつかの実験において、ライゲーションを、Ｂｏｈｅｒｉｎｇｅｒの「Ｒａｐｉｄ Ｌｉｇａｔｉｏｎ Ｋｉｔ」を使用して、製造業者の指示に従い、行った。
【０２１９】
適切な株に組換えプラスミドを導入するために、１００μｌのＥ．ｃｏｌｉ ＤＨ５コンピテント細胞を、リガーゼ反応溶液とともに、４０分間氷上でインキュベートし、次に、３７℃で３分間インキュベートし、次に、８００μｌのＬＢブロスを添加した後、再度３７℃で２０分間インキュベートした。次に細胞を、Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆの微量遠心機において最大速度で遠心分離し、そして約２００μｌの上清に再懸濁した。次に、その懸濁物をＬＢアンピシリン（１００ｍｇ／ｍｌ）上にプレーティングした。
【０２２０】
組換えクローンのスクリーニングを、無作為に選択した５つのコロニーを、１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを加えた２ｍｌ（ｐＧＥＸまたはｐＴＣクローン）または５ｍｌ（ｐＥＴクローン）のＬＢブロスのいずれかにおいて３７℃でオーバーナイトで増殖させて、行った。次に、細胞をペレットにして、Ｑｉａｇｅｎ ＱＩＡｐｒｅｐ Ｓｐｉｎ Ｍｉｎｉｐｒｅｐ Ｋｉｔを使用し、製造業者の指示に従い、ＤＮＡを最終容量３０μｌに抽出した。各々個々のミニプレップ（約１ｇ）の５μｌを、ＮｄｅＩ／ＸｈｏＩまたはＢａｍＨＩ／ＸｈｏＩのいずれかを用いて消化し、そして全消化物を、１〜１．５％アガロースゲル（予想インサートのサイズに依存する）に、分子量マーカー（１Ｋｂ ＤＮＡ Ｌａｄｄｅｒ、ＧＩＢＣＯ）と並行してロードした。陽性クローンのスクリーニングを、正確なインサートのサイズに基づいて行った。
【０２２１】
ＯＲＦ１１０、１１１、１１３、１１５、１１９、１２２、１２５および１３０のクローニングのために、２重に消化したＰＣＲ産物を、ＥｃｏＲＩ−ＰｓｔＩクローニング部位を使用して、２重消化したベクター中にライゲーションした。あるいは、ＯＲＦ１１５および１２７のクローニングのために、ＥｃｏＲＩ−ＳａｌＩクローニング部位を使用したか、またはＯＲＦ１２２のクローニングのために、ＳａｌＩ−ＰｓｔＩクローニング部位を使用した。クローニングの後に、組換えプラスミドをＥ．ｃｏｌｉ宿主Ｗ３１１０に導入した。個々のクローンを５０μｌ／ｍｌアンピシリンを含有するＬブロス中で３７℃で、オーバーナイトで増殖させた。
【０２２２】
（Ｇ）発現）
発現ベクター中の各ＯＲＦクローンを、組換えタンパク質産物の発現に適切な株中に形質転換した。各構築物の１μｌを使用して、３０μｌのＥ．ｃｏｌｉ ＢＬ２１（ｐＧＥＸベクター）、Ｅ．ｃｏｌｉ ＴＯＰ１０（ｐＴＲＣベクター）またはＥ．ｃｏｌｉ ＢＬ２１−ＤＥ３（ｐＥＴベクター）を、上記のように形質転換した。ｐＧＥＸ−Ｈｉｓベクターの場合、同一のＥ．ｃｏｌｉ株（Ｗ３１１０）を初期のクローニングおよび発現のために使用した。単一の組換えコロニーを２ｍｌのＬＢおよびアンピシリン（１００μｇ／ｍｌ）に接種し、３７℃でオーバーナイトでインキュベートし、次に、１００ｍｌのフラスコ中で２０ｍｌのＬＢおよびアンピシリン（１００μｇ／ｍｌ）中に１：３０で希釈した（ＯＤ_６００の範囲が０．１〜０．１５の間であることを確認する）。このフラスコをＯＤが発現の誘導に適切な指数増殖期を示すまで（ｐＥＴおよびｐＴＲＣベクターについて、０．４〜０．８ ＯＤ；ｐＧＥＸおよびｐＧＥＸ−Ｈｉｓベクターについて０．８〜１ ＯＤ）、回転型水浴振とう機中で３０℃でインキュベートした。ｐＥＴ、ｐＴＲＣおよびｐＧＥＸ−Ｈｉｓベクターについて、タンパク質の発現を１ｍＭ ＩＰＴＧの添加によって誘導し、一方、ｐＧＥＸ系の場合、ＩＰＴＧの最終濃度は、０．２ｍＭであった。３０℃での３時間のインキュベーションの後、サンプルの最終濃度を、ＯＤによって確認した。発現を確認するために、１ｍｌの各サンプルを取り出し、微量遠心機で遠心分離し、ペレットをＰＢＳ中で再懸濁し、そしてクマシーブルー染色を用いる１２％ ＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析した。全サンプルを６０００ｇで遠心分離し、そしてペレットをさらなる使用のためにＰＢＳ中に再懸濁した。
【０２２３】
（Ｈ）ＧＳＴ融合タンパク質の大規模精製）
単一のコロニーをＬＢおよびアンピシリンアガープレート上で３７℃でオーバーナイトで増殖させた。細菌を、水浴振とう機中の２０ｍｌのＬＢおよびアンピシリン液体培養物中に接種し、オーバーナイトで増殖させた。細菌を、６００ｍｌの新鮮な培地中に１：３０に希釈し、最適な温度（２０〜３７℃）でＯＤ_５５０が０．８〜１まで増殖させた。タンパク質の発現を０．２ｍＭのＩＰＴＧを用いて誘導し、続いて、３時間インキュベートした。培養物を８０００ｒｐｍで４℃で遠心分離した。上清を捨て、細菌のペレットを７．５ｍｌの冷ＰＢＳ中に懸濁した。この細胞を、Ｂｒａｎｓｏｎ ｓｏｎｉｆｉｅｒ Ｂ−１５を使用し、氷上で、３０秒間、４０Ｗで超音波処理して、破砕し、２回凍結融解して、再度遠心分離した。この上清を回収し、１５０μｌのグルタチオン−Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ ４Ｂ樹脂（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）（前もってＰＢＳで洗浄）と混合し、室温で３０分間インキュベートした。このサンプルを７００ｇで５分間４℃で遠心分離した。この樹脂を１０ｍｌの冷ＰＢＳを用いて、１０分間、２回洗浄し、１ｍｌの冷ＰＢＳに再懸濁し、そして使い捨てカラムにロードした。この樹脂を素通り画分が０．０２〜０．０６のＯＤ_２８０に到達するまで２ｍｌの冷ＰＢＳで２回洗浄した。ＧＳＴ融合タンパク質を、７００μｌの冷グルタチオン溶出緩衝液（１０ｍＭ 還元グルタチオン、５０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ）の添加によって溶出し、そして画分をＯＤ_２８０が０．１になるまで回収した。各画分の２１μｌを、Ｂｉｏｒａｄ ＳＤＳ−ＰＡＧＥ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｗｅｉｇｈｔ ｓｔａｎｄａｒｄ ｂｒｏａｄ ｒａｎｇｅ（Ｍ１）（２００、１１６．２５、９７．４、６６．２、４５、３１、２１．５、１４．４、６．５ｋＤａ）またはＡｍｅｒｓｈａｍ Ｒａｉｎｂｏｗ Ｍａｒｋｅｒ（Ｍ２）（２２０、６６、４６、３０、２１．５、１４．３ｋＤａ）のいずれかを標準として使用する１２％ ＳＤＳゲル上にロードした。ＧＳＴの分子量が２６ｋＤａなので、この値を各ＧＳＴ融合タンパク質の分子量に添加しなければならない。
【０２２４】
（Ｉ）Ｈｉｓ−融合物の溶解度分析（ＯＲＦ１１１〜１２９））
Ｈｉｓ融合発現産物の溶解度を分析するために、３ｍｌ培養物のペレットを、緩衝液Ｍ１（５００μｌ ＰＢＳ ｐＨ７．２）中に再懸濁した。２５μｌのリゾチーム（１０ｍｇ／ｍｌ）を添加し、細菌を１５分間、４℃でインキュベートした。このペレットを、Ｂｒａｎｓｏｎ ｓｏｎｉｆｉｅｒ Ｂ−１５を使用し、３０秒間、４０Ｗで超音波処理して、２回凍結融解して、再度、遠心分離工程によってペレットと上清に分離した。この上清を回収し、そしてこのペレットを緩衝液Ｍ２（８Ｍ 尿素、０．５Ｍ ＮａＣｌ、２０ｍＭ イミダゾールおよび０．１Ｍ ＮａＨ_２ＰＯ_４）に再懸濁し、３〜４時間４℃でインキュベートした。遠心分離の後、上清を回収し、そしてペレットを緩衝液Ｍ３（６Ｍ グアニジン−ＨＣｌ、０．５Ｍ ＮａＣｌ、２０ｍＭ イミダゾールおよび０．１Ｍ ＮａＨ_２ＰＯ_４）に４℃、オーバーナイトで再懸濁した。全工程からの上清を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで分析した。
【０２２５】
ＯＲＦ１１３、１１９および１２０から発現したタンパク質が、ＰＢＳに可溶性であることを見いだした。その一方で、可溶化のために、ＯＲＦ１１１、１２２、１２６および１２９は、尿素を必要とし、そしてＯＲＦ１２５および１２７は、グアニジン−ＨＣｌを必要とした。
【０２２６】
（Ｊ）Ｈｉｓ−融合物の大規模精製）
単一のコロニーをＬＢおよびアンピシリンアガープレート上で３７℃でオーバーナイトで増殖させた。細菌を、２０ｍｌのＬＢおよびアンピシリン液体培養物中に接種し、水浴振とう機中でオーバーナイトでインキュベートした。細菌を、６００ｍｌの新鮮な培地中に１：３０に希釈し、最適な温度（２０〜３７℃）でＯＤ_５５０が０．６〜０．８まで増殖させた。タンパク質の発現を１ｍＭのＩＰＴＧの添加によって誘導し、そして、培養物をさらに３時間インキュベートした。培養物を８０００ｒｐｍで４℃で遠心分離した。上清を捨て、細菌のペレットを７．５ｍｌの（ｉ）可溶性タンパク質について冷緩衝液Ａ（３００ｍＭ ＮａＣｌ、５０ｍＭ リン酸緩衝液、１０ｍＭ イミダゾール、ｐＨ８）、または（ｉｉ）不溶性タンパク質について緩衝液Ｂ（尿素８Ｍ、１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、１００ｍＭ リン酸緩衝液、ｐＨ８．８）中に懸濁した。
【０２２７】
この細胞を、Ｂｒａｎｓｏｎ ｓｏｎｉｆｉｅｒ Ｂ−１５を使用し、氷上で、３０秒間、４０Ｗで超音波処理して、破砕し、２回凍結融解して、そして再度遠心分離した。
【０２２８】
不溶性タンパク質について、上清を−２０℃に保存し、一方、ペレットを２ｍｌの緩衝液Ｃ（６Ｍ 塩酸グアニジン、１００ｍＭ リン酸緩衝液、１０ｍＭ Ｔｒｉｓ―ＨＣｌ、ｐＨ７．５）に再懸濁し、そしてホモジナイザー中で１０サイクル処理した。この産物を１３０００ｒｐｍで４０分間遠心分離した。
【０２２９】
上清を回収し、１５０μｌのＮｉ^２＋−樹脂（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）（適切なように、緩衝液Ａまたは緩衝液Ｂのいずれかで前もって洗浄する）と混合し、３０分間、穏やかな撹拌をしながら、室温でインキュベートした。このサンプルを７００ｇで５分間４℃で遠心分離した。この樹脂を１０ｍｌの緩衝液ＡまたはＢを用いて１０分間、２回洗浄し、１ｍｌの緩衝液ＡまたはＢ中に再懸濁し、使い捨てカラムにロードした。この樹脂を、（ｉ）２ｍｌの冷緩衝液Ａを用いて４℃で、または（ｉｉ）２ｍｌの緩衝液Ｂを用いて室温でのいずれかで、素通り画分が０．０２〜０．０６のＯＤ_２８０に達するまで洗浄した。
【０２３０】
この樹脂を、（ｉ）２ｍｌの冷２０ｍＭのイミダゾール緩衝液（３００ｍＭ ＮａＣｌ、５０ｍＭ リン酸緩衝液、２０ｍＭ イミダゾール、ｐＨ８）、または（ｉｉ）緩衝液Ｄ（尿素８Ｍ、１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、１００ｍＭ リン酸緩衝液、ｐＨ６．３）のいずれかで、素通り画分が０．０２〜０．０６のＯＤ_２８０に達するまで洗浄した。このＨｉｓ−融合タンパク質を、７００μｌの（ｉ）冷溶出緩衝液Ａ（３００ｍＭ ＮａＣｌ、５０ｍＭ リン酸緩衝液、２５０ｍＭ イミダゾール、ｐＨ８）、または（ｉｉ）溶出緩衝液Ｂ（尿素８Ｍ、１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、１００ｍＭ リン酸緩衝液、ｐＨ４．５）のいずれかの添加によって溶出し、ＯＤ_２８０が０．１になるまで、画分を回収した。２１μｌの各画分を、１２％ＳＤＳゲルにロードした。
【０２３１】
（Ｋ）Ｈｉｓ−融合タンパク質の再生） １０％グリセロールを、変性タンパク質に添加した。次にこのタンパク質を透析緩衝液Ｉ（１０％グリセロール、０．５Ｍ アルギニン、５０ｍＭ リン酸緩衝液、５ｍＭ 還元型グルタチオン、０．５ｍＭ 酸化型グルタチオン、２Ｍ 尿素、ｐＨ８．８）を使用して２０μｇ／ｍｌまで希釈し、同じ緩衝液に対して、４℃で１２〜１４時間透析した。このタンパク質をさらに透析緩衝液ＩＩ（１０％グリセロール、０．５Ｍ アルギニン、５０ｍＭ リン酸緩衝液、５ｍＭ 還元型グルタチオン、０．５ｍＭ 酸化型グルタチオン、ｐＨ８．８）に対して４℃で１２〜１４時間透析した。タンパク質濃度を、以下の式を用いて推定した：
タンパク質（ｍｇ／ｍｌ）＝（１．５５×ＯＤ_２８０）−（０．７６×ＯＤ_２６０）。
【０２３２】
（Ｌ）Ｈｉｓ−融合物の大規模精製（ＯＲＦ１１１〜１２９））
５００ｍｌの細菌培養物を誘導し、そして融合タンパク質を、上記の手順を使用して、緩衝液Ｍ１、Ｍ２またはＭ３中で可溶化した。細菌の粗抽出物を、この融合タンパク質の可溶化緩衝液に依存して、緩衝液Ｍ１、Ｍ２またはＭ３を用いて平衡化したＮｉ−ＮＴＡスーパーフローカラム（Ｑｕｉａｇｅｎ）上にロードした。結合しない物質を、カラムを同一の緩衝液で洗浄することにより溶出した。対応する５００ｍＭのイミダゾールを含有する緩衝液を用いて、特異的なタンパク質を溶出し、イミダゾールを含有しない対応する緩衝液に対して、透析した。各操作の後、このカラムを、少なくとも２カラム容量の０．５Ｍ 水酸化ナトリウムを用いて洗浄することにより、消毒し、次の使用の前に再度平衡化した。
【０２３３】
（Ｍ）マウスの免疫化
２０μｇの各精製タンパク質を使用して、マウスの腹腔内で免疫した。ＯＲＦ２、４、１５、２２、２７、２８、３７、７６、８９および９７の場合、Ｂａｌｂ−Ｃマウスを、Ａｌ（ＯＨ）_３をアジュバントとして用いて、１、２１および４２日目に免疫し、そして５６日目に採取したサンプルにおける免疫応答をモニターした。ＯＲＦ４４、１０６および１３２について、ＣＤ１マウスを、同一のプロトコールを用いて免疫した。ＯＲＦ２５および４０について、ＣＤ１マウスを、ＡＬ（ＯＨ）_３ではなくフロイントアジュバントを用いて免疫し、そして免疫応答を５６日目ではなく４２日目に測定したことを除いて、同一の免疫プロトコールを使用した。同様に、ＯＲＦ２３、３２、３８および７９について、ＣＤ１マウスをフロイントアジュバントを用いて免疫したが、免疫応答を４９日目に測定した。
【０２３４】
（Ｎ）ＥＬＩＳＡアッセイ（血清分析））
無莢膜のＭｅｎＢ Ｍ７株を、チョコレートアガープレート上にプレートし、３７℃でオーバーナイトでインキュベートした。細菌のコロニーをアガープレートから滅菌ドラコン（ｄｒａｃｏｎ）スワブを使用して回収し、０．２５％グルコースを含有する７ｍｌのＭｕｅｌｌｅｒ−Ｈｉｎｔｏｎブロス（Ｄｉｆｃｏ）中に接種した。細菌の増殖を３０分毎に、ＯＤ_６２０を追跡することによりモニターした。細菌をＯＤが０．３〜０．４の値に達するまで増殖させた。培養物を１０分間１００００ｒｐｍで遠心分離した。上清を捨て、細菌をＰＢＳで１回洗浄し、０．０２５％のホルムアルデヒドを含有するＰＢＳ中に再懸濁し、室温で２時間インキュベートし、次に４℃でオーバーナイトで攪拌しながらインキュベートした。１００μｌの細菌細胞を、９６ウェルＧｒｅｉｎｅｒプレートの各ウェルに添加し、そして４℃でオーバーナイトでインキュベートした。次にそのウェルをＰＢＴ洗浄緩衝液（ＰＢＳ中の０．１％ Ｔｗｅｅｎ−２０）を用いて３回洗浄した。２００μｌの飽和緩衝液（水中に２．７％のポリビニルピロリドン １０）を各ウェルに添加し、そしてプレートを３７℃で２時間インキュベートした。ウェルをＰＢＴで３回洗浄した。２００μｌの希釈血清（希釈緩衝液：ＰＢＳ中に１％ ＢＳＡ、０．１％ Ｔｗｅｅｎ−２０、０．１％ ＮａＮ_３）を各ウェルに添加し、そしてそのプレートを３７℃で９０分間インキュベートした。ウェルをＰＢＴで３回洗浄した。希釈緩衝液中に１：２０００に希釈した１００μｌのＨＲＰ−結合体化ウサギ抗マウス（Ｄａｋｏ）血清を、各ウェルに添加し、そのプレートを３７℃で９０分間インキュベートした。ウェルを、ＰＢＴ緩衝液で３回洗浄した。１００μｌのＨＲＰのための基質緩衝液（２５ｍｌのクエン酸緩衝液、ｐＨ５、１０ｍｇのＯ−フェニルジアミンおよび１０μｌのＨ_２Ｏ）を各ウェルに添加し、このプレートを室温に２０分間放置した。１００μｌのＨ_２ＳＯ_４を各ウェルに添加し、ＯＤ_４９０を追跡した。ＯＤ_４９０が対応する免疫前血清の２．５倍である場合、ＥＬＩＳＡが陽性であると考慮した。
【０２３５】
（Ｏ）ＦＡＣＳｃａｎ細菌結合アッセイ手順）
無莢膜ＭｅｎＢ Ｍ７株をチョコレートアガープレートにプレートし、３７℃でオーバーナイトでインキュベートした。細菌のコロニーをアガープレートから滅菌ドラコン（ｄｒａｃｏｎ）スワブを使用して回収し、０．２５％グルコースを含有する８ｍｌのＭｕｅｌｌｅｒ−Ｈｉｎｔｏｎブロス（Ｄｉｆｃｏ）を含む４本のチューブに中に接種した。細菌の増殖を３０分毎に、ＯＤ_６２０を追跡することによりモニターした。細菌をＯＤが０．３５〜０．５の値に達するまで増殖させた。培養物を５分間４０００ｒｐｍで遠心分離した。上清を捨て、ペレットをブロッキング緩衝液（１％ ＢＳＡ、０．４％ ＮａＮ_３）中に再懸濁し、５分間４０００ｒｐｍで遠心分離した。細胞をＯＤ_６２０が０．０７に達するようにブロッキング緩衝液に再懸濁した。１００μｌの細菌細胞を、Ｃｏｓｔｅｒ９６ウェルプレートの各ウェルに添加した。１００μｌの希釈（１：２００）血清（ブロッキング緩衝液中）を各ウェルに添加し、そしてそのプレートを４℃で２時間インキュベートした。細胞を５分間４０００ｒｐｍで遠心分離し、その上清を吸引し、各ウェルに２００μｌ／ウェルのブロッキング緩衝液を添加することにより、細胞を洗浄した。１００μｌのＲ−フィコエリトリン結合体化Ｆ（ａｂ）_２ヤギ抗マウス（１：１００希釈）を各ウェルに添加し、そしてプレートを１時間４℃でインキュベートした。細胞を、４０００ｒｐｍ５分間の遠心分離によって遠心沈殿し、２００μｌ／ウェルのブロッキング緩衝液を添加することにより、洗浄した。その上清を吸引し、そして細胞を２００μｌ／ウェルのＰＢＳ、０．２５％のホルムアルデヒドに再懸濁した。そのサンプルをＦＡＣＳｃａｎチューブに移して、読み取った。ＦＡＣＳｃａｎ設定の状態は、以下のとおりである：ＦＬ１ オン、ＦＬ２およびＦＬ３ オフ；ＦＳＣ−Ｈ閾値：９２；ＦＳＣ ＰＭＴ電圧：Ｅ ０２；ＳＳＣ ＰＭＴ：４７４；増幅利得 ７．１：ＦＬ−２ ＰＭＴ：５３９；補償値：０。
【０２３６】
（Ｐ）ＯＭＶ調製）
細菌を５ＧＣプレート上でオーバーナイトで増殖させ、ループを用いて収穫し、そして１０ｍｌの２０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌに再懸濁した。５６℃、３０分の熱不活化を行い、そして細菌を１０分間氷上で超音波処理することにより破壊した（５０％ 衝撃係数、５０％ 出力）。未破壊細胞を５０００ｇ、１０分間の遠心分離によって除去し、そして全細胞エンベロープ画分を５００００ｇ、４℃、７５分間の遠心分離によって回収した。細胞質膜タンパク質を粗外膜から抽出するために、全画分を２％サルコシル（Ｓｉｇｍａ）中に再懸濁し、そして室温で２０分間インキュベートした。この懸濁液を、１００００ｇで１０分間遠心し、凝集物を除去し、そしてこの上清をさらに５００００ｇで７５分間、超遠心分離して、外膜をペレット化した。この外膜を、１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８）に再懸濁し、そしてそのタンパク質濃度をＢｉｏ−Ｒａｄ Ｐｒｏｔｅｉｎアッセイによって、ＢＳＡを標準として測定した。
【０２３７】
（Ｑ）全抽出物の調製）
細菌をＧＣプレート上でオーバーナイトで増殖させ、ループを用いて収穫し、そして１ｍｌの２０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌに再懸濁した。５６℃、３０分の熱不活化を行った。
【０２３８】
（Ｒ）ウェスタンブロッティング）
ＭｅｎＢ株２９９６由来の精製タンパク質（５００ｎｇ／レーン）、外膜ベシクル（５μｇ）および全細胞抽出物（２５μｇ）を、１５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ上にロードし、ニトロセルロース膜上に転写した。この転写を、２時間、１５０ｍＡ、４℃、転写緩衝液中（０．３％ Ｔｒｉｓ Ｂａｓｅ、１．４４％ グリシン、２０％ メタノール）で行った。この膜を飽和緩衝液（ＰＢＳ中の１０％ スキムミルク、０．１％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ１００）中での４℃のオーバーナイトのインキュベートにより飽和させた。この膜を洗浄緩衝液（ＰＢＳ中の３％ スキムミルク、０．１％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ１００）を用いて２回洗浄し、洗浄緩衝液中に１：２００に希釈したマウス血清とともに、２時間３７℃でインキュベートした。この膜を２回洗浄し、１：２０００希釈の西洋わさびペルオキシダーゼ標識化抗マウスＩｇとともに９０分間インキュベートした。この膜をＰＢＳ中の０．１％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ１００を用いて２回洗浄し、Ｏｐｔｉ−４ＣＮ基質キット（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）を用いて、発色させた。この反応を水を添加して停止した。
【０２３９】
（Ｓ）殺菌性アッセイ）
ＭＣ５８株をチョコレートアガープレート上で、３７℃でオーバーナイトで増殖させた。５〜７のコロニーを回収し、そして７ｍｌのＭｕｅｌｌｅｒ−Ｈｉｎｔｏｎブロスに接種するために使用した。この懸濁液を、旋回装置上で３７℃でインキュベートし、ＯＤ_６２０が０．５〜０．８になるまで増殖させた。この培養物を滅菌１．５ｍｌエッペンドルフチューブに等分し、微量遠心機中で最大速度で２０分間遠心分離した。このペレットをＧｅｙ緩衝液（Ｇｉｂｃｏ）中で１回洗浄し、そして同一の緩衝液中でＯＤ_６２０を０．５に再懸濁し、Ｇｅｙ緩衝液中に１：２００００に希釈し、２５℃で保存した。
【０２４０】
５０μｌのＧｅｙ緩衝液／１％ ＢＳＡを９６ウェル組織培養プレートの各ウェルに添加した。２５μｌの希釈マウス血清（Ｇｅｙ緩衝液／０．２％ ＢＳＡ中に１：１００）を各ウェルに添加し、そのプレートを４℃でインキュベートした。上記記載の細菌懸濁液の２５μｌを各ウェルに添加した。熱不活化（５６℃水浴中に３０分）または正常乳児ウサギ補体のいずれかの２５μｌを各ウェルに添加した。乳児ウサギ補体の添加の直後に、１ウェルあたり２２μｌの各サンプルをＭｕｅｌｌｅｒ−Ｈｉｎｔｏｎアガープレート上にプレートした（時間０）。この９６ウェルプレートを１時間３７℃で回転しながらインキュベートし、次に、１ウェルあたり２２μｌの各サンプルをＭｕｅｌｌｅｒ−Ｈｉｎｔｏｎアガープレート上にプレートした（時間１）。オーバーナイトのインキュベートの後、時間０および時間１に対応するコロニーを計数した。
【０２４１】
表ＩＩは、クローニング、発現および精製結果の概要を示す。
【０２４２】
（実施例１）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定された（配列番号１）：
【０２４３】
【化１】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号２；ＯＲＦ３７）に対応する：
【０２４４】
【化２】

さらなる研究は、以下の完全ヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号３）
【０２４５】
【化３】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号４；ＯＲＦ３７−１）に対応する：
【０２４６】
【化４】

さらなる研究は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統における対応遺伝子を同定した（配列番号５）：
【０２４７】
【化５】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号６；ＯＲＦ３７ａ）を有するタンパク質をコードする：
【０２４８】
【化６】

初めに同定されたＢ系統部分配列（ＯＲＦ３７）は、ＯＲＦ３７ａとの７５アミノ酸にわたる重複で６８．０％の同一性示す：
【０２４９】
【化７】

さらなる研究は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅにおいて対応する遺伝子を同定した（配列番号７）：
【０２５０】
【化８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号８；ＯＲＦ３７ｎｇ）を有するタンパク質をコードする：
【０２５１】
【化９】

初めに同定されたＢ系統部分配列（ＯＲＦ３７）は、ＯＲＦ３７ｎｇとの１１１アミノ酸にわたる重複で６４．９％の同一性示す：
【０２５２】
【化１０】

Ｂ系統完全配列（ＯＲＦ３７−１）およびＯＲＦ３７ｎｇは、１９８アミノ酸の重複において５１．５％の同一性を示す：
【０２５３】
【化１１】

これらのアミノ酸配列に関するコンピューター分析は推定リーダー配列を示し、そしてＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体の惹起のための有用な抗原になり得ることが予測された。
【０２５４】
ＯＲＦ３７−１（１１ｋＤａ）を上記のように、ｐＥＴベクターおよびｐＧｅｘベクターにクローン化し、Ｅ．ｃｏｌｉにおいて発現させた。タンパク質発現および精製の産物を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図１ＡはＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティ−精製の結果を示し、図１ＢはＥ．ｃｏｌｉにおけるＨｉｓ融合体の発現の結果を示す。精製ＧＳＴ融合タンパク質を使用してマウスを免疫し、その血清をＥＬＩＳＡのため（陽性結果）、ＦＡＣＳ分析のため（図１Ｃ）および殺菌性アッセイのため（図１Ｄ）に使用した。これらの実験は、ＯＲＦ３７−１が表面露出タンパク質であり、そして有用な免疫原であることを確認する。
【０２５５】
図１Ｅは、ＯＲＦ３７−１についての親水性、抗原性指標、およびＡＭＰＨＩ領域のプロットを示す。
【０２５６】
（実施例２）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号９）：
【０２５７】
【化１２】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１０）に対応する。
【０２５８】
【化１３】

【０２５９】
【化１４】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（仮定のＨ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅタンパク質（ｙｂｒｄ．ｈａｅｉｎ；登録番号ｐ４５０２９）との相同性）
配列番号９およびｙｂｒｄ．ｈａｅｉｎは、１２２アミノ酸の重複内で４８．４％のアミノ酸同一性を示す：
【０２６０】
【化１５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
配列番号９は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦと１１８アミノ酸にわたる重複で９９．２％の同一性を示す：
【０２６１】
【化１６】

完全ｙｒｂｄ Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ配列は、リーダー配列を有し、そして、全長相同性Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓタンパク質もまたリーダー配列を有することが予測される。これは、それが膜タンパク質、分泌タンパク質、または表面タンパク質のいずれかであること、およびそのタンパク質、またはそのエピトープの１つが、ワクチンまたは診断薬のための有用な抗原であり得ることを示唆する。
【０２６２】
（実施例３）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号１１）：
【０２６３】
【化１７】

【０２６４】
【化１８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１２；ＯＲＦ３）に対応する：
【０２６５】
【化１９】

さらなる配列分析は、以下の完全ヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号１３）：
【０２６６】
【化２０】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１４；ＯＲＦ３−１）に対応する：
【０２６７】
【化２１】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ系統）由来の推定ＯＲＦとの相同性） ＯＲＦ３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統由来のＯＲＦ（ＯＲＦ３ａ）との２８６アミノ酸にわたる重複で９３．０％の同一性を示す：
【０２６８】
【化２２】

完全長ＯＲＦ３ａヌクレオチド配列（配列番号１５）は以下に示す：
【０２６９】
【化２３】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１６）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【０２７０】
【化２４】

【０２７１】
【化２５】

２つの膜貫通ドメインに、下線を付す。
【０２７２】
ＯＲＦ３−１はＯＲＦ３ａとの４１０アミノ酸の重複内で９４．６％の同一性を示す：
【０２７３】
【化２６】

（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓのｙｖｆｃ遺伝子（登録番号Ｚ７１９２８）によりコードされる仮定タンパク質との相同性）
ＯＲＦ３およびＹＶＦＣタンパク質は、１７０アミノ酸の重複（ＢＬＡＳＴｐ）において５５％のアミノ酸同一性を示す：
【０２７４】
【化２７】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ３．ｎｇ）との２８６アミノ酸にわたる重複で８６．３％の同一性を示す：
【０２７５】
【化２８】

完全長ＯＲＦ３ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１７）は、以下に示す：
【０２７６】
【化２９】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１８）を有するタンパク質をコードする：
【０２７７】
【化３０】

このタンパク質はＯＲＦ３−１との４１３アミノ酸の重複内で８６．９％の同一性を示す：
【０２７８】
【化３１】

さらに、ＯＲＦ３ｎｇはＢ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ由来の仮定タンパク質との有意な相同性を示す：
【０２７９】
【化３２】

ｙｖｆｃ遺伝子の仮定の産物は、Ｒ．ｍｅｌｉｌｏｔｉのＥＸＯＹ（エキソ多糖類生産タンパク質）に類似性を示す。このこと、および相同性Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ配列内の２つの推定膜貫通領域に基づき、これらのタンパク質、またはこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体の惹起のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０２８０】
（実施例４）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号１９）：
【０２８１】
【化３３】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号２０；ＯＲＦ５）に対応する：
【０２８２】
【化３４】

さらなる配列分析は、完全ＤＮＡ配列が以下の配列（配列番号２１）であることを明らかにした：
【０２８３】
【化３５】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号２２；ＯＲＦ５−１）に対応する：
【０２８４】
【化３６】

さらなる研究は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統における対応遺伝子を同定した（配列番号２３）：
【０２８５】
【化３７】

【０２８６】
【化３８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号２４；ＯＲＦ５ａ）を有するタンパク質をコードする：
【０２８７】
【化３９】

初めに同定されたＢ系統部分配列（ＯＲＦ５）は、ＯＲＦ５ａとの１２４アミノ酸にわたる重複で５４．７％の同一性を示す：
【０２８８】
【化４０】

Ｂ系統完全配列（ＯＲＦ５−１）およびＯＲＦ５ａは３００アミノ酸の重複内で９２．７％の同一性を示す：
【０２８９】
【化４１】

【０２９０】
【化４２】

さらなる研究は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅにおけるＤＮＡ部分配列（配列番号２５）を同定した。これは、以下のアミノ酸配列（配列番号２６；ＯＲＦ５ｎｇ）を有するタンパク質をコードする。：
【０２９１】
【化４３】

さらなる分析は完全淋菌ヌクレオチド配列（配列番号２７）が以下であることを明らかにした：
【０２９２】
【化４４】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号２８；ＯＲＦ５ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０２９３】
【化４５】

初めに同定されたＢ系統部分配列（ＯＲＦ５）は、部分淋菌配列（ＯＲＦ５ｎｇ）との１３５アミノ酸にわたる重複で８３．１％の同一性を示す：
【０２９４】
【化４６】

Ｂ系統完全配列および淋菌配列（ＯＲＦ５−１およびＯＲＦ５ｎｇ−１）は、３０４アミノ酸の重複内で９２．４％の同一性を示す：
【０２９５】
【化４７】

【０２９６】
【化４８】

これらのアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、推定リーダー配列を示し、そして以下の相同性を同定した：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅの溶血素ホモログＴｌｙＣ（登録番号Ｕ３２７１６）との相同性）
ＯＲＦ５およびＴｌｙＣタンパク質は、７７アミノ酸の重複（ＢＬＡＳＴｐ）において５８％のアミノ酸同一性を示す。
【０２９７】
【化４９】

ＯＲＦ５ｎｇ−１はまたＴｌｙＣとの有意な相同性を示す：
【０２９８】
【化５０】

【０２９９】
【化５１】

（Ｅ．ｃｏｌｉ由来の仮定の分泌タンパク質との相同性）
ＯＲＦ５ａはＥ．ｃｏｌｉ由来の仮定の分泌タンパク質との相同性を示す：
【０３００】
【化５２】

この分析（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ由来のＴｌｙＣ溶血素ホモログ（溶血素は分泌タンパク質である）に対するアミノ酸相同性を含む）に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質は分泌され、従って、ワクチンまたは診断薬に有用な抗原であり得ることが予測された。
【０３０１】
ＯＲＦ５−１（３０．７ｋＤａ）を、上記のようにｐＧｅｘベクターにクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉにおいて発現させた。タンパク質発現および精製の産物をＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図２Ａは、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティ−精製の結果を示す。精製ＧＳＴ融合タンパク質使用してマウスを免疫し、その血清をウエスタンブロット分析（図１Ｂ）のために使用した。これらの実験は、ＯＲＦ５−１が表面露出タンパク質であり、そして有用な免疫原であることを確認する。
【０３０２】
（実施例５）
以下の部分ＤＮＡ配列はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号２９）：
【０３０３】
【化５３】

【０３０４】
【化５４】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号３０；ＯＲＦ７）に対応する：
【０３０５】
【化５５】

さらなる配列分析は、以下の完全ＤＮＡ配列（配列番号３１）を明らかにした：
【０３０６】
【化５６】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号３２；ＯＲＦ７−１）に対応する：
【０３０７】
【化５７】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は以下の結果を与えた：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅのｙｃｅｇ遺伝子（登録番号Ｐ４４２７０）によりコードされる仮定のタンパク質との相同性）
ＯＲＦ７およびｙｃｅｇタンパク質は１９２アミノ酸の重複内で４４％のアミノ酸同一性を示す：
【０３０８】
【化５８】

【０３０９】
【化５９】

完全長ＹＣＥＧタンパク質は以下の配列を有する：
【０３１０】
【化６０】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ系統）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統由来のＯＲＦ（ＯＲＦ７ａ）との１８７アミノ酸にわたる重複で９５．２％の同一性を示す：
【０３１１】
【化６１】

完全長ＯＲＦ７ａヌクレオチド配列（配列番号３３）は以下に示す：
【０３１２】
【化６２】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号３４）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【０３１３】
【化６３】

リーダー配列に下線を付す。
【０３１４】
ＯＲＦ７ａおよびＯＲＦ７−１は、３３１アミノ酸重複において９８．８％の同一性を示す：
【０３１５】
【化６４】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ７．ｎｇ）との１８７アミノ酸にわたる重複で９４．７％の同一性を示す：
【０３１６】
【化６５】

【０３１７】
【化６６】

ＯＲＦ７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号３５）は、以下のアミノ酸配列（配列番号３６）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【０３１８】
【化６７】

さらなる配列分析は、ＯＲＦ７ｎｇの部分ＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号３７）：
【０３１９】
【化６８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号３８；ＯＲＦ７ｎｇ−１）に対応する：
【０３２０】
【化６９】

ＯＲＦ７ｎｇ−１およびＯＲＦ７−１は、２９８アミノ酸の重複内で９８．０％の同一性を示す：
【０３２１】
【化７０】

【０３２２】
【化７１】

さらに、ＯＲＦ７ｎｇ−１は、仮定のＥ．ｃｏｌｉタンパク質との有意な相同性を示す：
【０３２３】
【化７２】

この分析（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ ＹＣＥＧタンパク質が可能性のあるリーダー配列を有するという事実を含む）に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０３２４】
（実施例６）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号３９）：
【０３２５】
【化７３】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号４０；ＯＲＦ９）に対応する：
【０３２６】
【化７４】

【０３２７】
【化７５】

さらなる配列分析は、完全ＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号４１）：
【０３２８】
【化７６】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号４２；ＯＲＦ９−１）に対応する：
【０３２９】
【化７７】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ系統）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統由来のＯＲＦ（ＯＲＦ９ａ）との１６６アミノ酸にわたる重複で８９．８％の同一性を示す：
【０３３０】
【化７８】

【０３３１】
【化７９】

完全長ＯＲＦ９ａヌクレオチド配列（配列番号４３）は、以下に示す：
【０３３２】
【化８０】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号４４）を有するタンパク質をコードする：
【０３３３】
【化８１】

【０３３４】
【化８２】

ＯＲＦ９ａおよびＯＲＦ９−１は６１４アミノ酸の重複内で９５．３％の同一性を示す：
【０３３５】
【化８３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ９は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ９．ｎｇ）との１６３アミノ酸にわたる重複で８２．８％の同一性を示す：
【０３３６】
【化８４】

ＯＲＦ９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４５）は、以下のアミノ酸配列（配列番号４６）を有するタンパク質をコードすると予測された：
【０３３７】
【化８５】

アミノ酸１〜２８は推定リーダー配列であり、そしてアミノ酸１７３〜１８９は膜貫通ドメインであると予測される。
【０３３８】
さらなる配列分析は完全長ＯＲＦ９ｎｇ ＤＮＡ配列（配列番号４７）を明らかにした：
【０３３９】
【化８６】

【０３４０】
【化８７】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号４８）を有するタンパク質をコードする：
【０３４１】
【化８８】

ＯＲＦ９ｎｇおよびＯＲＦ９−１は、６１４アミノ酸の重複内で８８．１％の同一性を示す：
【０３４２】
【化８９】

【０３４３】
【化９０】

さらに、ＯＲＦ９ｎｇはＰ．ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ由来の仮定のタンパク質との有意な相同性を示す：
【０３４４】
【化９１】

【０３４５】
【化９２】

この分析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０３４６】
（実施例７）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号４９）；
【０３４７】
【化９３】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号５０；ＯＲＦ１１）に対応する：
【０３４８】
【化９４】

さらなる配列分析は完全ＤＮＡ配列（配列番号５１）を明らかにした：
【０３４９】
【化９５】

【０３５０】
【化９６】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号５２；ＯＲＦ１１−１）に対応する：
【０３５１】
【化９７】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｐｕｔｉｄａの６０ｋＤａ内膜タンパク質（登録番号Ｐ２５７５４）との相同性）
ＯＲＦ１１および６０ｋＤａタンパク質は、２２９アミノ酸重複において５８％のアミノ酸同一性を示す（ＢＬＡＳＴｐ）。
【０３５２】
【化９８】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ系統）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１１ａ）との２４０アミノ酸にわたる重複で９７．９％の同一性を示す：
【０３５３】
【化９９】

【０３５４】
【化１００】

完全長ＯＲＦ１１ａヌクレオチド配列（配列番号５３）は以下に示す：
【０３５５】
【化１０１】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号５４）を有するタンパク質をコードする：
【０３５６】
【化１０２】

ＯＲＦ１１ａおよびＯＲＦ１１−１は、５４４アミノ酸の重複内で９５．２％の同一性を示す：
【０３５７】
【化１０３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１１．ｎｇ）との２４０アミノ酸にわたる重複で９６．３％の同一性を示す：
【０３５８】
【化１０４】

【０３５９】
【化１０５】

ＯＲＦ１１ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５５）は、以下のアミノ酸配列（配列番号５６）を有するタンパク質をコードすると予測された：
【０３６０】
【化１０６】

さらなる配列分析は、完全淋菌ＤＮＡ配列（配列番号５７）が以下の配列であることを明らかにした：
【０３６１】
【化１０７】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号５８；ＯＲＦ１１ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０３６２】
【化１０８】

【０３６３】
【化１０９】

ＯＲＦ１１ｎｇ−１およびＯＲＦ１１−１は、５４６アミノ酸の重複内で９５．１％の同一性を示す：
【０３６４】
【化１１０】

さらに、ＯＲＦ１１ｎｇ−１は、データベースからの内膜タンパク質（登録番号ｐ２５７５４）との有意な相同性を示す：
【０３６５】
【化１１１】

この分析（Ｐ．ｐｕｔｉｄａ由来の内膜タンパク質および推定膜貫通ドメイン（髄膜炎菌性および淋菌性タンパク質の両方において見られる）に対する相同性を含む）に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０３６６】
（実施例８）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号５９）：
【０３６７】
【化１１２】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号６０；ＯＲＦ１３）に対応する：
【０３６８】
【化１１３】

さらなる配列分析は、ＤＮＡ配列をわずかに精巧にした（配列番号６１）：
【０３６９】
【化１１４】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号６２；ＯＲＦ１３−１）に対応する：
【０３７０】
【化１１５】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ系統）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３ａ）との１２６アミノ酸にわたる重複で９２．９％の同一性を示す：
【０３７１】
【化１１６】

【０３７２】
【化１１７】

完全長ＯＲＦ１３ａヌクレオチド配列（配列番号６３）は、以下に示す：
【０３７３】
【化１１８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号６４）を有するタンパク質をコードする：
【０３７４】
【化１１９】

ＯＲＦ１３ａおよびＯＲＦ１３−１は、１２６アミノ酸重複において９４．４％の同一性を示す：
【０３７５】
【化１２０】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１３．ｎｇ）との１２６アミノ酸配列にわたる重複で８９．７％の同一性を示す：
【０３７６】
【化１２１】

完全長ＯＲＦ１３ｎｇヌクレオチド配列（配列番号６５）は、以下に示す：
【０３７７】
【化１２２】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号６６）を有するタンパク質をコードする：
【０３７８】
【化１２３】

ＯＲＦ１３ｎｇは、ＯＲＦ１３−１との１２６アミノ酸重複において９１．３％の同一性を示す：
【０３７９】
【化１２４】

この分析（このタンパク質中の延長リーダー配列を含む）に基づき、ＯＲＦ１３およびＯＲＦ１３ｎｇは外膜タンパク質である可能性が高いと予測される。よって、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体の惹起のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０３８０】
（実施例９）
以下のＤＮＡ配列はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号６７）：
【０３８１】
【化１２５】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号６８；ＯＲＦ２）に対応する：
【０３８２】
【化１２６】

さらなる研究は完全ヌクレオチド配列（配列番号６９）を明らかにした：
【０３８３】
【化１２７】

【０３８４】
【化１２８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号７０；ＯＲＦ２−１）に対応する：
【０３８５】
【化１２９】

さらなる研究は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統において対応する遺伝子を同定した（配列番号７１）：
【０３８６】
【化１３０】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号７２；ＯＲＦ２ａ）をコードする：
【０３８７】
【化１３１】

初めに同定されたＢ系統部分配列（ＯＲＦ２）は、ＯＲＦ２ａとの１１８アミノ酸にわたる重複で９７．５％の同一性を示す：
【０３８８】
【化１３２】

Ｂ系統完全配列（ＯＲＦ２−１）およびＯＲＦ２ａは、２２８アミノ酸の重複内で９８．２％の同一性を示す：
【０３８９】
【化１３３】

【０３９０】
【化１３４】

さらなる研究は、以下のアミノ酸配列（配列番号７４；ＯＲＦ２ｎｇ）をコードする、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅにおける部分ＤＮＡ配列（配列番号７３）を同定した：
【０３９１】
【化１３５】

さらなる研究は、完全淋菌遺伝子配列（配列番号７５）を同定した：
【０３９２】
【化１３６】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号７６；ＯＲＦ２ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０３９３】
【化１３７】

初めに同定されたＢ系統部分配列（ＯＲＦ２）は、ＯＲＦ２ｎｇと１３６アミノ酸にわたる重複で８７．５％の同一性を示す：
【０３９４】
【化１３８】

Ｂ系統完全配列および淋菌配列（ＯＲＦ２−１およびＯＲＦ２ｎｇ−１）は、２２９アミノ酸重複において９１．７％の同一性を示す：
【０３９５】
【化１３９】

【０３９６】
【化１４０】

これらのアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、膜貫通領域（下線）を示し、そしてまた淋菌配列とＥ．ｃｏｌｉのＴａｔＢタンパク質との間の相同性（５９％の同一性）を明らかにした：
【０３９７】
【化１４１】

この分析に基づき、ＯＲＦ２、ＯＲＦ２ａ、およびＯＲＦ２ｎｇは膜タンパク質である可能性が高いこと、従ってＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０３９８】
ＯＲＦ２−１（１６ｋＤａ）を、上記のように、ｐＥＴおよびｐＧｅｘベクターにクローン化し、Ｅ．ｃｏｌｉにおいて発現させた。タンパク質発現および精製の産物をＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図３Ａは、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティ−精製の結果を示し、そして図３Ｂは、Ｅ．ｃｏｌｉにおけるＨｉｓ融合タンパク質の発現の結果を示す。精製ＧＳＴ融合タンパク質を使用してマウスを免疫し、その血清をウェスタンブロットために（図３Ｃ）、ＥＬＩＳＡのために（陽性結果）、およびＦＡＣＳ分析のために（図３Ｄ）使用した。これらの実験は、ＯＲＦ３７−１が表面露出タンパク質であり、そして有用な免疫原であることを確認する。
【０３９９】
（実施例１０）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号７７）：
【０４００】
【化１４２】

【０４０１】
【化１４３】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号７８；ＯＲＦ１５）に対応する：
【０４０２】
【化１４４】

さらなる研究は、完全ヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号７９）
【０４０３】
【化１４５】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号８０；ＯＲＦ１５−１）に対応する：
【０４０４】
【化１４６】

さらなる研究は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統における対応遺伝子を同定した（配列番号８１）：
【０４０５】
【化１４７】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号８２；ＯＲＦ１５ａ）を有するタンパク質をコードする：
【０４０６】
【化１４８】

【０４０７】
【化１４９】

初めに同定されたＢ系統部分配列（ＯＲＦ１５）は、ＯＲＦ１５ａとの２１３アミノ酸にわたる重複で９８．１％の同一性を示す：
【０４０８】
【化１５０】

Ｂ系統完全配列（ＯＲＦ１５−１）およびＯＲＦ１５ａは、３２０アミノ酸重複において９８．８％の同一性を示す：
【０４０９】
【化１５１】

【０４１０】
【化１５２】

さらなる研究は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅにおける対応遺伝子を同定した（配列番号８３）：
【０４１１】
【化１５３】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号８４；ＯＲＦ１５ｎｇ）を有するタンパク質をコードする：
【０４１２】
【化１５４】

初めに同定されたＢ系統部分配列（ＯＲＦ１５）は、ＯＲＦ１５ｎｇとの２１３アミノ酸にわたる重複で９７．２％の同一性を示す：
【０４１３】
【化１５５】

Ｂ系統完全配列（ＯＲＦ１５−１）およびＯＲＦ１５ｎｇは、３２０アミノ酸重複において９８．８％の同一性を示す：
【０４１４】
【化１５６】

【０４１５】
【化１５７】

これらのアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、ＩＬＳＡＣモチーフ（ＭＯＴＩＦＳプログラムにより予測されるように、推定の膜リポタンパク質脂質結合部位）を明らかにし、推定リーダー配列を示し、そしてＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断薬のために、または抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることが予測される。
【０４１６】
ＯＲＦ１５−１（３１．７ｋＤａ）を、上記のように、ｐＥＴベクターおよびｐＧｅｘベクターにクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉにおいて発現させた。タンパク質発現および精製の産物をＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図４ＡはＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティ−精製の結果を示し、そして図４ＢはＥ．ｃｏｌｉにおけるＨｉｓ融合タンパク質の発現の結果を示す。精製ＧＳＴ融合タンパク質を使用してマウスを免疫し、その血清をウェスタンブロットのために（図４Ｃ）およびＥＬＩＳＡのために（陽性結果）使用した。これらの実験は、ＯＲＦＸ−１が表面露出タンパク質であり、そして有用な免疫原であることを確認する。
【０４１７】
（実施例１１）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号８５）：
【０４１８】
【化１５８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号８６；ＯＲＦ１７）に対応する：
【０４１９】
【化１５９】

【０４２０】
【化１６０】

さらなる研究は、完全ヌクレオチド配列（配列番号８７）を明らかにした：
【０４２１】
【化１６１】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号８８；ＯＲＦ１７−１）に対応する：
【０４２２】
【化１６２】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（仮定のＨ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ膜貫通タンパク質ＨＩ０９０２（登録番号Ｐ４４０７０）との相同性）
ＯＲＦ１７およびＨＩ０９０２タンパク質は、１９２アミノ酸の重複において２８％のアミノ酸同一性を示す：
【０４２３】
【化１６３】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ系統）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１７は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１７ａ）との１９６アミノ酸にわたる重複で９６．９％の同一性を示す：
【０４２４】
【化１６４】

【０４２５】
【化１６５】

完全長ＯＲＦ１７ａヌクレオチド配列（配列番号８９）は、以下に示す：
【０４２６】
【化１６６】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号９０）を有するタンパク質をコードする：
【０４２７】
【化１６７】

ＯＲＦ１７ａおよびＯＲＦ１７−１は、２６８アミノ酸重複において９８．９％の同一性を示す：
【０４２８】
【化１６８】

【０４２９】
【化１６９】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１７．ｎｇ）との１９６アミノ酸にわたる重複で９３．９％の同一性を示す：
【０４３０】
【化１７０】

ＯＲＦ１７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号９１）は、以下のアミノ酸配列（配列番号９２）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【０４３１】
【化１７１】

さらなる研究は、完全淋菌ＤＮＡ配列（配列番号９３）を明らかにした：
【０４３２】
【化１７２】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号９４；ＯＲＦ１７ｎｇ−１）に対応する：
【０４３３】
【化１７３】

ＯＲＦ１７ｎｇ−１およびＯＲＦ１７−１は、２６８アミノ酸重複において９６．６％の同一性を示す：
【０４３４】
【化１７４】

【０４３５】
【化１７５】

さらに、ＯＲＦ１７ｎｇ−１は、仮定のＨ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅタンパク質との有意な相同性を示す：
【０４３６】
【化１７６】

この分析は（仮定のＨ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ膜貫通タンパク質との相同性を含む）、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることを示唆する。
【０４３７】
（実施例１２）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号９５）：
【０４３８】
【化１７７】

【０４３９】
【化１７８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号９６；ＯＲＦ１８）に対応する：
【０４４０】
【化１７９】

さらなる研究は、完全ヌクレオチド配列（配列番号９７）を明らかにした：
【０４４１】
【化１８０】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号９８；ＯＲＦ１８−１）に対応する：
【０４４２】
【化１８１】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ系統）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１８は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１８ａ）との１１６アミノ酸にわたる重複で９８．３％の同一性を示す：
【０４４３】
【化１８２】

完全長ＯＲＦ１８ａヌクレオチド配列（配列番号９９）は、以下に示す：
【０４４４】
【化１８３】

【０４４５】
【化１８４】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１００）を有するタンパク質をコードする：
【０４４６】
【化１８５】

ＯＲＦ１８ａおよびＯＲＦ１８−１は、２０１アミノ酸重複において９９．０％の同一性を示す：
【０４４７】
【化１８６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１８．ｎｇ）との１１６アミノ酸にわたる重複において９３．１％の同一性を示す：
【０４４８】
【化１８７】

完全長ＯＲＦ１８ｎｇヌクレオチド配列は、以下（配列番号１０１）である：
【０４４９】
【化１８８】

【０４５０】
【化１８９】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１０２）を有するタンパク質をコードする：
【０４５１】
【化１９０】

このＯＲＦ１８ｎｇタンパク質配列は、ＯＲＦ１８−１との２０１アミノ酸重複において９４．０％の同一性を示す：
【０４５２】
【化１９１】

この分析（淋菌タンパク質内のいくつかの推定膜貫通ドメインの存在を含む）に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体の惹起のための有用な抗原であり得ることが予測される：
（実施例１３）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号１０３）：
【０４５３】
【化１９２】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１０４；ＯＲＦ１９）に対応する：
【０４５４】
【化１９３】

さらなる研究は、以下の完全ヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号１０５）：
【０４５５】
【化１９４】

【０４５６】
【化１９５】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１０６；ＯＲＦ１９−１）に対応する：
【０４５７】
【化１９６】

このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅの推定膜貫通タンパク質ＹＨＦＫ（登録番号Ｐ４４２８９）との相同性）
ＯＲＦ１９およびＹＨＦＫタンパク質は、９７アミノ酸重複において４５％のアミノ酸同一性を示す：
【０４５８】
【化１９７】

【０４５９】
【化１９８】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ系統）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ系統由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１９ａ）との１０２アミノ酸にわたる重複で９２．２％の同一性を示す：
【０４６０】
【化１９９】

完全長ＯＲＦ１９ａヌクレオチド配列（配列番号１０７）は、以下に示す：
【０４６１】
【化２００】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１０８）を有するタンパク質をコードする：
【０４６２】
【化２０１】

ＯＲＦ１９ａおよびＯＲＦ１９−１は、７１６アミノ酸重複において９８．３％の同一性を示す：
【０４６３】
【化２０２】

【０４６４】
【化２０３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１９は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１９．ｎｇ）と、１０２アミノ酸の重複にわたって、９５．１％の同一性を示す。
【０４６５】
【化２０４】

ＯＲＦ１９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１０９）は、以下のアミノ酸配列（配列番号１１０）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【０４６６】
【化２０５】

さらなる研究は、以下の完全ヌクレオチド配列（配列番号１１１）を明らかにした：
【０４６７】
【化２０６】

【０４６８】
【化２０７】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１１２；ＯＲＦ１９ｎｇ−１）に対応する：
【０４６９】
【化２０８】

ＯＲＦ１９ｎｇ−１およびＯＲＦ１９−１は、７１６アミノ酸重複において９５．５％の同一性を示す：
【０４７０】
【化２０９】

【０４７１】
【化２１０】

さらに、ＯＲＦ１９ｎｇ−１は、以前にデータベース登録された仮定の淋菌タンパク質に対して有意な相同性を示す：
【０４７２】
【化２１１】

【０４７３】
【化２１２】

この分析（淋菌タンパク質内のいくつかの推定膜貫通ドメインの存在（そのうちの最初のものは、髄膜炎菌性タンパク質においてもまた見られる）を含む）、およびＹＨＫタンパク質との相同性に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体の惹起のための有用な抗原であり得ることが予測される：
（実施例１４）
完全であると考えられる、以下のＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１１３）：
【０４７４】
【化２１３】

これは、アミノ酸配列（配列番号１１４；ＯＲＦ２０）に対応する：
【０４７５】
【化２１４】

これらの配列がさらに精巧に配列決定され、そしてその完全なＤＮＡ配列（配列番号１１５）は以下である：
【０４７６】
【化２１５】

【０４７７】
【化２１６】

これは、アミノ酸配列（配列番号１１６；ＯＲＦ２０−１）に対応する：
【０４７８】
【化２１７】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０４７９】
（Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍのＭｖｉＮのビルレニス因子（登録番号Ｐ３７１６９）との相同性）
ＯＲＦ２０およびＭｖｉＮタンパク質は、４４０アミノ酸重複において６３％アミノ酸同一性を示す：
【０４８０】
【化２１８】

【０４８１】
【化２１９】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２０は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ２０ａ）と４４７アミノ酸重複にわたって９３．５％の同一性を示す：
【０４８２】
【化２２０】

完全長ＯＲＦ２０ａヌクレオチド配列（配列番号１１７）は以下である：
【０４８３】
【化２２１】

【０４８４】
【化２２２】

これは、アミノ酸配列（配列番号１１８）を有するタンパク質をコードする：
【０４８５】
【化２２３】

ＯＲＦ２０ａおよびＯＲＦ２０−１は、５１２アミノ酸重複において９６．５％の同一性を示す：
【０４８６】
【化２２４】

【０４８７】
【化２２５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２０は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ２０ｎｇ）と４５４アミノ酸重複にわたって９２．１％の同一性を示す：
【０４８８】
【化２２６】

ＯＲＦ２０ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１１９）は、アミノ酸配列（配列番号１２０）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【０４８９】
【化２２７】

さらなるＤＮＡ配列の解析は、以下のＤＮＡ配列（配列番号１２１）を示した：
【０４９０】
【化２２８】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号１２２；ＯＲＦ２０ｎｇ−１）をコードする：
【０４９１】
【化２２９】

ＯＲＦ２０ｎｇ−１およびＯＲＦ２０−１は、５１２アミノ酸重複中で９５．７％の同一性を示す：
【０４９２】
【化２３０】

【０４９３】
【化２３１】

さらに、ＯＲＦ２０ｎｇ−１は、Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍのビルレニス因子と有意な相同性を示す：
【０４９４】
【化２３２】

【０４９５】
【化２３３】

Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ由来のビルレニス因子との相同性を含むこの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０４９６】
（実施例１５）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１２３）：
【０４９７】
【化２３４】

これは、アミノ酸配列（配列番号１２４；ＯＲＦ２２）に対応する：
【０４９８】
【化２３５】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号１２５）を示した：
【０４９９】
【化２３６】

【０５００】
【化２３７】

これは、アミノ酸配列（配列番号１２６；ＯＲＦ２２−１）に対応する：
【０５０１】
【化２３８】

さらなる研究は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株中で対応する遺伝子を同定した（配列番号１２７）：
【０５０２】
【化２３９】

これは、アミノ酸配列（配列番号１２８；ＯＲＦ２２ａ）を有するタンパク質をコードする：
【０５０３】
【化２４０】

最初に同定された部分的なＢ株の配列（ＯＲＦ２２）は、ＯＲＦ２０ａと１５８アミノ酸重複にわたって９４．２％の同一性を示す：
【０５０４】
【化２４１】

【０５０５】
【化２４２】

完全なＢ株配列は（ＯＲＦ２２−１）およびＯＲＦ２２ａは、４４７アミノ酸重複中で９４．９％同一性を示す：
【０５０６】
【化２４３】

さらなる研究は、以下のアミノ酸配列（配列番号１３０；ＯＲＦ２２ｎｇ）をコードする、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の部分的な遺伝子配列（配列番号１２９）を同定した：
【０５０７】
【化２４４】

【０５０８】
【化２４５】

さらなる研究は、完全な淋菌遺伝子を同定した（配列番号１３１）：
【０５０９】
【化２４６】

これは、アミノ酸配列（配列番号１３２；ＯＲＦ２２ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０５１０】
【化２４７】

最初に同定された部分的なＢ株配列（ＯＲＦ２２）は、ＯＲＦ２２ｎｇと１５８アミノ酸重複にわたって９３．７％の同一性を示す：
【０５１１】
【化２４８】

Ｂ株（ＯＲＦ２２−１）および淋菌（ＯＲＦ２２ｎｇ）由来の完全な配列は、４４７アミノ酸重複にわたって９６．２％の同一性を示す：
【０５１２】
【化２４９】

【０５１３】
【化２５０】

これらの配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０５１４】
（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅの４８ｋＤａ外膜タンパク質（登録番号Ｕ２４４９２）との相同性）
ＯＲＦ２２およびこの４８ｋＤａタンパク質は、１５８アミノ酸重複において７２％の同一性を示す：
【０５１５】
【化２５１】

ＯＲＦ２２ａもまた、４８ｋＤａ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅタンパク質と相同性を示す：
【０５１６】
【化２５２】

【０５１７】
【化２５３】

ＯＲＦ２２ｎｇ−１もまた、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ由来ＯＭＰと相同性を示す：
【０５１８】
【化２５４】

Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅの外膜タンパク質との相同性を含むこの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定された。
【０５１９】
上記のように、ＯＲＦ２２−１（３５．４ｋＤａ）は、ｐＥＴおよびｐＧｅｘベクターにクローニングされ、そしてＥ．ｃｏｌｉ中で発現された。タンパク質の発現および精製の産物は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析された。図５Ａは、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示し、そして図５Ｂは、Ｅ．ｃｏｌｉ中でのＨｉｓ融合物の発現の結果を示す。精製されたＧＳＴ融合タンパク質は、マウスを免疫するために用いられ、このマウスの血清はＥＬＩＳＡ（陽性結果）およびＦＡＣＳ分析（図５Ｃ）に用いられた。これらの実験は、ＯＲＦ２２−１が表面に曝露されるタンパク質であり、そしてそれが有用な免疫原であることを確認する。
【０５２０】
（実施例１６）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された：
（配列番号１３３）
【０５２１】
【化２５５】

これは、アミノ酸配列（配列番号１３４；ＯＲＦ１２）に対応する：
【０５２２】
【化２５６】

さらなる配列解析は、完全なＤＮＡ配列（配列番号１３５）が以下であることを示した：
【０５２３】
【化２５７】

【０５２４】
【化２５８】

これは、アミノ酸配列（配列番号１３６；ＯＲＦ１２−１）に対応する：
【０５２５】
【化２５９】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０５２６】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１２ａ）と３２０アミノ酸重複にわたって９６．３％の同一性を示す：
【０５２７】
【化２６０】

【０５２８】
【化２６１】

完全長ＯＲＦ１２ａヌクレオチド配列（配列番号１３７）は以下である：
【０５２９】
【化２６２】

これは、アミノ酸配列（配列番号１３８）を有するタンパク質をコードする：
【０５３０】
【化２６３】

ＯＲＦ１２ａおよびＯＲＦ１２−１は、５２２アミノ酸重複中で９９．０％同一性を示す：
【０５３１】
【化２６４】

【０５３２】
【化２６５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１２．ｎｇ）と３２０アミノ酸重複にわたって９２．５％の同一性を示す：
【０５３３】
【化２６６】

【０５３４】
【化２６７】

完全長ＯＲＦ１２ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１３９）は以下である：
【０５３５】
【化２６８】

これは、アミノ酸配列（配列番号１４０）を有するタンパク質をコードする：
【０５３６】
【化２６９】

ＯＲＦ１２ｎｇは、ＯＲＦ１２−１と５２２アミノ酸重複中で９７．１％同一性を示す：
【０５３７】
【化２７０】

【０５３８】
【化２７１】

さらに、ＯＲＦ１２ｎｇは、Ｅ．ｃｏｌｉ由来のハイポセティカルタンパク質と有意な相同性を示す：
【０５３９】
【化２７２】

【０５４０】
【化２７３】

いくつかの推定膜貫通ドメインおよび淋菌タンパク質中の推定アクチン型アクチン結合ドメイン記号（太字で示す）の存在を含む、この解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそのタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０５４１】
（実施例１７）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１４１）：
【０５４２】
【化２７４】

これは、アミノ酸配列（配列番号１４２；ＯＲＦ１４）に対応する：
【０５４３】
【化２７５】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０５４４】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１４ａ）と１６７アミノ酸重複にわたって９４．０％同一性を示す：
【０５４５】
【化２７６】

【０５４６】
【化２７７】

完全長ＯＲＦ１４ａヌクレオチド配列（配列番号１４３）は以下である：
【０５４７】
【化２７８】

これは、アミノ酸配列（配列番号１４４）を有するタンパク質をコードする：
【０５４８】
【化２７９】

この配列が、１１８の位置の終止コドン含むことに留意すべきである。
【０５４９】
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１４．ｎｇ）と１６７アミノ酸重複にわたって８９．８％同一性を示す：
【０５５０】
【化２８０】

完全長ＯＲＦ１４ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１４５）は、アミノ酸配列（配列番号１４６）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【０５５１】
【化２８１】

淋菌タンパク質中の推定の膜貫通ドメインに基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそのタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０５５２】
（実施例１８）
以下の部分的なＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１４７）：
【０５５３】
【化２８２】

これは、アミノ酸配列（配列番号１４８；ＯＲＦ１６）に対応する：
【０５５４】
【化２８３】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列を示した（配列番号１４９）：
【０５５５】
【化２８４】

これは、アミノ酸配列（配列番号１５０；ＯＲＦ１６−１）に対応する：
【０５５６】
【化２８５】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０５５７】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１６は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１６ａ）と１８１アミノ酸重複にわたって９６．７％の同一性を示す：
【０５５８】
【化２８６】

完全長ＯＲＦ１６ａヌクレオチド配列（配列番号１５１）は以下である：
【０５５９】
【化２８７】

【０５６０】
【化２８８】

これは、アミノ酸配列（配列番号１５２）を有するタンパク質をコードする：
【０５６１】
【化２８９】

ＯＲＦ１６ａおよびＯＲＦ１６−１は、４５１アミノ酸重複中で９９．６％同一性を示す：
【０５６２】
【化２９０】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１６は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１６．ｎｇ）と１８１アミノ酸重複にわたって９３．９％の同一性を示す：
【０５６３】
【化２９１】

完全長ＯＲＦ１６ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１５３）は以下である：
【０５６４】
【化２９２】

これは、アミノ酸配列（配列番号１５４）を有するタンパク質をコードする：
【０５６５】
【化２９３】

ＯＲＦ１６ｎｇおよびＯＲＦ１６−１は、２６１アミノ酸重複中で８９．３％同一性を示す：
【０５６６】
【化２９４】

【０５６７】
【化２９５】

淋菌タンパク質中のいくつかの推定の膜貫通ドメインの存在を含む、この解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそのタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０５６８】
（実施例１９）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１５５）：
【０５６９】
【化２９６】

これは、アミノ酸配列（配列番号１５６；ＯＲＦ２８）に対応する：
【０５７０】
【化２９７】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号１５７）を示した：
【０５７１】
【化２９８】

これは、アミノ酸配列（配列番号１５８；ＯＲＦ２８−１）に対応する：
【０５７２】
【化２９９】

【０５７３】
【化３００】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０５７４】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２８は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ２８ａ）と１２０アミノ酸重複にわたって７９．２％の同一性を示す：
【０５７５】
【化３０１】

完全長ＯＲＦ２８ａヌクレオチド配列（配列番号１５９）は以下である：
【０５７６】
【化３０２】

これは、アミノ酸配列（配列番号１６０）を有するタンパク質をコードする：
【０５７７】
【化３０３】

ＯＲＦ２８ａおよびＯＲＦ２８−１は、２３８アミノ酸重複中で８６．１％同一性を示す：
【０５７８】
【化３０４】

【０５７９】
【化３０５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ２８．ｎｇ）と１２０アミノ酸重複にわたって８４．２％の同一性を示す：
【０５８０】
【化３０６】

完全長ＯＲＦ２８ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１６１）は以下である：
【０５８１】
【化３０７】

これは、アミノ酸配列（配列番号１６２）を有するタンパク質をコードする：
【０５８２】
【化３０８】

ＯＲＦ２８ｎｇおよびＯＲＦ２８−１は、２３１アミノ酸重複中で９０．０％同一性を共有する：
【０５８３】
【化３０９】

【０５８４】
【化３１０】

淋菌タンパク質中の推定の膜貫通ドメインの存在を含むこの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定された。
【０５８５】
上記のように、ＯＲＦ２８−１（２４ｋＤａ）は、ｐＥＴおよびｐＧｅｘベクターにクローニングされ、そしてＥ．ｃｏｌｉ中で発現された。タンパク質の発現および精製の産物は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析された。図６Ａは、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示し、そして図６Ｂは、Ｅ．ｃｏｌｉ中でのＨｉｓ融合物の発現の結果を示す。精製されたＧＳＴ融合タンパク質は、マウスを免疫するために用いられ、このマウスの血清はＥＬＩＳＡに用いられ、ＥＬＩＳＡは陽性結果を与えた。これらの実験は、ＯＲＦ２２−１が、表面に曝露されるタンパク質であり、そしてそれが有用な免疫原であり得ることを確認する。
【０５８６】
（実施例２０）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１６３）：
【０５８７】
【化３１１】

これは、アミノ酸配列（配列番号１６４；ＯＲＦ２９）に対応する：
【０５８８】
【化３１２】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号１６５）を示した：
【０５８９】
【化３１３】

【０５９０】
【化３１４】

これは、アミノ酸配列（配列番号１６６；ＯＲＦ２９−１）に対応する：
【０５９１】
【化３１５】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０５９２】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ２９ａ）と１２５アミノ酸重複にわたって８８．０％の同一性を示す：
【０５９３】
【化３１６】

完全長ＯＲＦ２９ａヌクレオチド配列（配列番号１６７）は以下である：
【０５９４】
【化３１７】

【０５９５】
【化３１８】

これは、アミノ酸配列（配列番号１６８）を有するタンパク質をコードする：
【０５９６】
【化３１９】

ＯＲＦ２９ａおよびＯＲＦ２９−１は、３５８アミノ酸重複中で９０．１％同一性を示す：
【０５９７】
【化３２０】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２９は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ２９．ｎｇ）と１２５アミノ酸重複にわたって８８．８％の同一性を示す：
【０５９８】
【化３２１】

完全長ＯＲＦ２９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１６９）は、アミノ酸配列（配列番号１７０）を有するタンパク質をコードすることが推定される：
【０５９９】
【化３２２】

２番目の実験で、以下のＤＮＡ配列（配列番号１７１）が同定された：
【０６００】
【化３２３】

これは、アミノ酸配列（配列番号１７２；ＯＲＦ２９ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０６０１】
【化３２４】

【０６０２】
【化３２５】

ＯＲＦ２９ｎｇ−１およびＯＲＦ２９−１は、４０１アミノ酸重複中で８６．０％同一性を示す：
【０６０３】
【化３２６】

淋菌タンパク質中の推定のリーダー配列の存在を含む、この解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０６０４】
（実施例２１）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１７３）：
【０６０５】
【化３２７】

これは、アミノ酸配列（配列番号１７４；ＯＲＦ３０）に対応する：
【０６０６】
【化３２８】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号１７５）を示した：
【０６０７】
【化３２９】

これは、アミノ酸配列（配列番号１７６；ＯＲＦ３０−１）に対応する：
【０６０８】
【化３３０】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０６０９】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３０は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ３０ａ）と４２アミノ酸重複にわたって９７．６％の同一性を示す：
【０６１０】
【化３３１】

完全長ＯＲＦ３０ａヌクレオチド配列（配列番号１７７）は以下である：
【０６１１】
【化３３２】

これは、アミノ酸配列（配列番号１７８）を有するタンパク質をコードする：
【０６１２】
【化３３３】

ＯＲＦ３０ａおよびＯＲＦ３０−１は、１８１アミノ酸重複中で９７．８％同一性を示す：
【０６１３】
【化３３４】

【０６１４】
【化３３５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３０は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ３０．ｎｇ）と４２アミノ酸重複にわたって９７．６％の同一性を示す：
【０６１５】
【化３３６】

完全長ＯＲＦ３０ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１７９）は以下である
【０６１６】
【化３３７】

これは、アミノ酸配列（配列番号１８０）を有するタンパク質をコードする：
【０６１７】
【化３３８】

ＯＲＦ３０ｎｇおよびＯＲＦ３０−１は、１８１アミノ酸重複中で９８．３％同一性を示す：
【０６１８】
【化３３９】

淋菌タンパク質中の推定のリーダー配列の存在を含むこの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０６１９】
（実施例２２）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１８１）：
【０６２０】
【化３４０】

これは、アミノ酸配列（配列番号１８２；ＯＲＦ３１）に対応する：
【０６２１】
【化３４１】

さらなる研究は、さらなる部分的ヌクレオチド配列（配列番号１８３）を示した：
【０６２２】
【化３４２】

これは、アミノ酸配列（配列番号１８４；ＯＲＦ３１−１）に対応する：
【０６２３】
【化３４３】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０６２４】
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３１は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ３１．ｎｇ）と８４アミノ酸重複にわたって７６．２％の同一性を示す：
【０６２５】
【化３４４】

完全長ＯＲＦ３１ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１８５）は以下である：
【０６２６】
【化３４５】

【０６２７】
【化３４６】

これは、アミノ酸配列（配列番号１８６）を有するタンパク質をコードする：
【０６２８】
【化３４７】

この淋菌タンパク質は、Ｅｒｗｉｎｉａ ｃｈｒｙｓａｎｔｈｅｍｉ（登録番号Ｌ３９８９７）由来の細孔形成（ｐｏｒｅ−ｆｏｒｍｉｎｇ）溶血素類似ＨｅｃＡタンパク質と１４９アミノ酸重複にわたって５０．０％の同一性を共有する：
【０６２９】
【化３４８】

さらに、ＯＲＦ３１ｎｇおよびＯＲＦ３１−１は、８３アミノ酸重複中で７９．５％同一性を示す：
【０６３０】
【化３４９】

溶血素との相同性、およびまた付着因子との相同性を含むこの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０６３１】
（実施例２３）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１８７）：
【０６３２】
【化３５０】

これは、アミノ酸配列（配列番号１８８；ＯＲＦ３２）に対応する：
【０６３３】
【化３５１】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号１８９）を示した：
【０６３４】
【化３５２】

【０６３５】
【化３５３】

これは、アミノ酸配列（配列番号１９０；ＯＲＦ３２−１）に対応する：
【０６３６】
【化３５４】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０６３７】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３２は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ３２ａ）と８１アミノ酸重複にわたって９３．８％の同一性を示す：
【０６３８】
【化３５５】

完全長ＯＲＦ３２ａヌクレオチド配列（配列番号１９１）は以下である：
【０６３９】
【化３５６】

【０６４０】
【化３５７】

これは、アミノ酸配列（配列番号１９２）を有するタンパク質をコードする：
【０６４１】
【化３５８】

ＯＲＦ３２ａおよびＯＲＦ３２−１は、３８２アミノ酸重複中で９３．２％同一性を示す：
【０６４２】
【化３５９】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ３２．ｎｇ）と８２アミノ酸重複にわたって９５．１％の同一性を示す：
【０６４３】
【化３６０】

【０６４４】
【化３６１】

ＯＲＦ３２ｎｇヌクレオチド配列（配列番号１９３）は、アミノ酸配列（配列番号１９４）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【０６４５】
【化３６２】

さらなる配列決定は、以下のＤＮＡ配列（配列番号１９５）を示した：
【０６４６】
【化３６３】

これは、アミノ酸配列（配列番号１９６；ＯＲＦ３２ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０６４７】
【化３６４】

ＯＲＦ３２ｎｇ−１およびＯＲＦ３２−１は、３８３アミノ酸重複中で９３．５％同一性を示す：
【０６４８】
【化３６５】

【０６４９】
【化３６６】

淋菌タンパク質中の付着因子に特徴的な、ＲＧＤ配列を含むこの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０６５０】
上記のように、ＯＲＦ３２−１（４２ｋＤａ）は、ｐＥＴおよびｐＧｅｘベクターにクローニングされ、そしてＥ．ｃｏｌｉ中で発現された。タンパク質の発現および精製の産物は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析された。図７Ａは、Ｈｉｓ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示し、そして図７Ｂは、Ｅ．ｃｏｌｉ中のＧＳＴ融合物の発現の結果を示す。精製されたＨｉｓ融合タンパク質は、マウスを免疫するために用いられ、このマウスの血清はＥＬＩＳＡに用いられ、ＥＬＩＳＡは陽性結果を与えた。これらの実験は、ＯＲＦ３２−１が、表面に曝露されるタンパク質であり、そしてそれは有用な免疫原であり得ることを確認する。
【０６５１】
（実施例２４）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号１９７）：
【０６５２】
【化３６７】

これは、アミノ酸配列（配列番号１９８；ＯＲＦ３３）に対応する：
【０６５３】
【化３６８】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号１９９）を示した：
【０６５４】
【化３６９】

これは、アミノ酸配列（配列番号２００；ＯＲＦ３３−１）に対応する：
【０６５５】
【化３７０】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０６５６】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ３３ａ）と１４３アミノ酸重複にわたって９０．９％の同一性を示す：
【０６５７】
【化３７１】

完全長ＯＲＦ３３ａヌクレオチド配列（配列番号２０１）は以下である：
【０６５８】
【化３７２】

これは、アミノ酸配列（配列番号２０２）を有するタンパク質をコードする：
【０６５９】
【化３７３】

ＯＲＦ３３ａおよびＯＲＦ３３−１は、４４４アミノ酸重複中で９４．１％同一性を示す：
【０６６０】
【化３７４】

【０６６１】
【化３７５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３３は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ３３．ｎｇ）と１４３アミノ酸重複にわたって９１．６％の同一性を示す：
【０６６２】
【化３７６】

ＯＲＦ３３ｎｇヌクレオチド配列（配列番号２０３）は、アミノ酸配列（配列番号２０４）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【０６６３】
【化３７７】

さらに配列解析は、以下のＤＮＡ配列（配列番号２０５）を示した：
【０６６４】
【化３７８】

【０６６５】
【化３７９】

これは、アミノ酸配列（配列番号２０６；ＯＲＦ３３ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０６６６】
【化３８０】

ＯＲＦ３３ｎｇ−１およびＯＲＦ３３−１は、４４６アミノ酸重複中で９４．６％同一性を示す：
【０６６７】
【化３８１】

【０６６８】
【化３８２】

淋菌タンパク質中のいくつかの推定の膜貫通ドメインの存在に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０６６９】
（実施例２５）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号２０７）：
【０６７０】
【化３８３】

これは、アミノ酸配列（配列番号２０８；ＯＲＦ３４）に対応する：
【０６７１】
【化３８４】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号２０９）を示した：
【０６７２】
【化３８５】

これは、アミノ酸配列（配列番号２１０；ＯＲＦ３４−１）に対応する：
【０６７３】
【化３８６】

【０６７４】
【化３８７】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０６７５】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３４は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ３４ａ）と１６１アミノ酸重複にわたって７３．３％の同一性を示す：
【０６７６】
【化３８８】

完全長ＯＲＦ３４ａヌクレオチド配列（配列番号２１１）は以下である：
【０６７７】
【化３８９】

これは、アミノ酸配列（配列番号２１２）を有するタンパク質をコードする：
【０６７８】
【化３９０】

ＯＲＦ３４ａおよびＯＲＦ３４−１は、４５９アミノ酸重複中で９１．３％同一性を示す：
【０６７９】
【化３９１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３４は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ３４．ｎｇ）と１６１アミノ酸重複にわたって７７．６％の同一性を示す：
【０６８０】
【化３９２】

【０６８１】
【化３９３】

完全長ＯＲＦ３４ｎｇヌクレオチド配列（配列番号２１３）は以下である：
【０６８２】
【化３９４】

これは、アミノ酸配列（配列番号２１４）を有するタンパク質をコードする：
【０６８３】
【化３９５】

ＯＲＦ３４ｎｇおよびＯＲＦ３４−１は、４５９アミノ酸重複中で９０．０％同一性を示す：
【０６８４】
【化３９６】

【０６８５】
【化３９７】

淋菌タンパク質中の推定のリーダー配列（二重下線）およびいくつかの推定の膜貫通ドメイン（下線）の存在を含むこの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【０６８６】
（実施例２６）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号２１５）：
【０６８７】
【化３９８】

これは、アミノ酸配列（配列番号２１６；ＯＲＦ４）に対応する：
【０６８８】
【化３９９】

さらに配列解析は、完全なヌクレオチド配列（配列番号２１７）を示した：
【０６８９】
【化４００】

【０６９０】
【化４０１】

これは、アミノ酸配列（配列番号２１８；ＯＲＦ４−１）に対応する：
【０６９１】
【化４０２】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０６９２】
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ４は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ４ａ）と９３アミノ酸重複にわたって９３．５％の同一性を示す：
【０６９３】
【化４０３】

完全長ＯＲＦ４ａヌクレオチド配列（配列番号２１９）は以下である：
【０６９４】
【化４０４】

これは、アミノ酸配列（配列番号２２０）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【０６９５】
【化４０５】

【０６９６】
【化４０６】

リーダーペプチドは下線である。
【０６９７】
これらのＡ株配列のさらなる解析は、完全なＤＮＡ配列（配列番号２２１）を示した：
【０６９８】
【化４０７】

これは、アミノ酸配列（配列番号２２２；ＯＲＦ４ａ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０６９９】
【化４０８】

ＯＲＦ４ａ−１およびＯＲＦ４−１は、２８７アミノ酸重複中で９９．７％同一性を示す：
【０７００】
【化４０９】

（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａ ｈａｍｏｌｉｔｉｃａ（登録番号ｑ０８８６９）の外膜タンパク質との相同性）
ＯＲＦ４およびこの外膜タンパク質は、９１アミノ酸重複中で３３％同一性を示す：
【０７０１】
【化４１０】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ４は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ４．ｎｇ）と９４アミノ酸重複にわたって９３．６％の同一性を示す：
【０７０２】
【化４１１】

完全長ＯＲＦ４ｎｇヌクレオチド配列（配列番号２２３）は、アミノ酸配列（配列番号２２４）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【０７０３】
【化４１２】

さらなる解析は、完全長ＯＲＦ４ｎｇＤＮＡ配列（配列番号２２５）が以下であることを示した：
【０７０４】
【化４１３】

【０７０５】
【化４１４】

これは、アミノ酸配列（配列番号２２６；ＯＲＦ４ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【０７０６】
【化４１５】

これは、ＯＲＦ４−１と２８８アミノ酸重複中で９７．６％同一性を示す：
【０７０７】
【化４１６】

さらに、ＯＲＦ４ｎｇ−１は、データベースから外膜タンパク質と有意な相同性を示す：
【０７０８】
【化４１７】

【０７０９】
【化４１８】

Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａ ｈａｍｏｌｉｔｉｃａの外膜タンパク質との相同性を含むこの解析、および淋菌タンパク質中の推定の原核生物膜リポタンパク質の脂質付着部位の存在に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、およびそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断のため、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定された。
【０７１０】
上記のように、ＯＲＦ４−１（３０ｋＤａ）は、ｐＥＴおよびｐＧｅｘベクターにクローニングされ、そしてＥ．ｃｏｌｉ中で発現された。タンパク質の発現および精製のその産物は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析された。図８Ａおよび８Ｂは、それぞれ、Ｈｉｓ融合物およびＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示す。精製されたＨｉｓ融合タンパク質は、マウスを免疫するために用いられ、このマウスの血清はＥＬＩＳＡ（陽性結果）、ウエスタンブロット（図８Ｃ）、ＦＡＣＳ解析（図８Ｄ）、および殺菌性解析（図８Ｅ）に用いられた。これらの実験は、ＯＲＦ４−１が、表面に曝露されるタンパク質であり、有用な免疫原であることを確認する。
【０７１１】
図８Ｆは、ＯＲＦ４−１のための、親水性のプロット、抗原性指数、およびＡＭＰＨＩ領域を示す。
【０７１２】
（実施例２７）
以下の部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ中で同定された（配列番号２２７）：
【０７１３】
【化４１９】

【０７１４】
【化４２０】

これは、アミノ酸配列（配列番号２２８；ＯＲＦ８）に対応する：
【０７１５】
【化４２１】

このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた。
【０７１６】
（配列モチーフ）
ＯＲＦ８は、プロリンリッチであり、そして表面局在と一致しているプロリン残基の分布を有する。さらに、ＲＧＤモチーフの存在は、細菌接着事象において可能な役割を示し得る。
【０７１７】
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ８．ｎｇ）に対して、３１２ａａのオーバーラップにわたって、８６．５％の同一性を示す：
【０７１８】
【化４２２】

この完全長のＯＲＦ８ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号２２９＞は、以下のアミノ酸配列＜配列番号２３０＞を有するタンパク質をコードすることが予測される：
【０７１９】
【化４２３】

【０７２０】
【化４２４】

これらのタンパク質における配列モチーフに基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のための、または抗体を産生させるための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０７２１】
（実施例２８）
以下に示す部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定した＜配列番号２３１＞：
【０７２２】
【化４２５】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２３２；ＯＲＦ６１＞に対応する：
【０７２３】
【化４２６】

さらなる研究により、以下の完全なヌクレオチド配列＜配列番号２３３＞を明らかにした：
【０７２４】
【化４２７】

【０７２５】
【化４２８】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２３４；ＯＲＦ６１−１＞に対応する：
【０７２６】
【化４２９】

図９は、ＯＲＦ６１−１について、親水性領域、抗原性領域、およびＡＭＰＨＩ領域のプロットを示す。このアミノ酸配列のさらなるコンピュータ解析の結果を以下に示す：
（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓのｂａｆタンパク質（登録番号第Ｕ１２０２０号）との相同性）
ＯＲＦ６１およびｂａｆタンパク質は、１６６ａａが一致し、３３％のａａ同一性を示す：
【０７２７】
【化４３０】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ６１ａ）に対して、１８９ａａのオーバーラップにわたって、９７．４％の同一性を示す：
【０７２８】
【化４３１】

【０７２９】
【化４３２】

この完全長ＯＲＦ６１ａヌクレオチド配列＜配列番号２３５＞は、以下の通りである：
【０７３０】
【化４３３】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２３６＞を有するタンパク質をコードする：
【０７３１】
【化４３４】

ＯＲＦ６１およびＯＲＦ６１−１は、５９１ａａのオーバーラップにおいて、９８．５％の同一性を示す：
【０７３２】
【化４３５】

【０７３３】
【化４３６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６１は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ６１．ｎｇ）に対して、８９ａａのオーバーラップにわたって、９４．２％の相同性を示す：
【０７３４】
【化４３７】

ＯＲＦ６１ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号２３７＞は、以下のアミノ酸配列＜配列番号２３８＞を有するタンパク質をコードすることが予測された：
【０７３５】
【化４３８】

さらなる解析により、以下に示す完全な淋菌ＤＮＡ配列＜配列番号２３９＞が明らかになった：
【０７３６】
【化４３９】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２４０；ＯＲＦ６１ｎｇ−１＞に対応する：
【０７３７】
【化４４０】

ＯＲＦ６１ｎｇ−１およびＯＲＦ６１−１は、５９１ａａにおいて、９３．９％の同一性を示す：
【０７３８】
【化４４１】

この解析（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓのｂａｆタンパク質との相同性および推定される原核生物の膜リポタンパク質脂質付着部位の存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するために有用な抗原であり得ることが予測される。
【０７３９】
（実施例２９）
以下に示す部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ＜配列番号２４１＞で同定した。
【０７４０】
【化４４２】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２４２；ＯＲＦ６２＞に対応する：
【０７４１】
【化４４３】

さらなる研究により、以下の完全なヌクレオチド配列＜配列番号２４３＞が明らかになった：
【０７４２】
【化４４４】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２４４；ＯＲＦ６２−１＞に対応する：
【０７４３】
【化４４５】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅの仮定的膜貫通タンパク質Ｈ１０９７６（登録番号第Ｏ５７１４７）の相同性）
ＯＲＦ６２およびＨＩ０９７６は、１１４ａａのオーバーラップにわたって、５０％のａａ同一性を示す：
【０７４４】
【化４４６】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６２は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ６２ａ）に対して、２１６ａａのオーバーラップにわたって、９９．５％の同一性を示す：
【０７４５】
【化４４７】

【０７４６】
【化４４８】

この完全長ＯＲＦ６２ａヌクレオチド配列＜配列番号２４５＞は、以下の通りである：
【０７４７】
【化４４９】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２４６＞を有するタンパク質をコードする：
【０７４８】
【化４５０】

ＯＲＦ６２ａおよびＯＲＦ６２−１は、２８４ａａのオーバーラップにわたって、９８．９％の同一性を示す：
【０７４９】
【化４５１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ６２．ｎｇ）と２１６ａａのオーバーラップにわたって、９９．５％の相同性を示す：
【０７５０】
【化４５２】

この完全長ＯＲＦ６２ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号２４７＞は、以下の通りである：
【０７５１】
【化４５３】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２４８＞を有するタンパク質をコードする：
【０７５２】
【化４５４】

ＯＲＦ６２ｎｇおよびＯＲＦ６２−１は、２８３ａａのオーバーラップにおいて、９７．９％の同一性を示す：
【０７５３】
【化４５５】

【０７５４】
【化４５６】

さらに、ＯＲＦ６２ｎｇは、仮定的Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅタンパク質と有意な相同性を示す：
【０７５５】
【化４５７】

この解析（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅの膜貫通タンパク質および淋菌タンパク質中の推定されるリーダー配列およびいくつかの膜貫通ドメインとの相同性を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するために有用な抗原であり得ることが予測される。
【０７５６】
（実施例３０）
以下の部分的ＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定した＜配列番号２４９＞：
【０７５７】
【化４５８】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２５０；ＯＲＦ６４＞に対応する：
【０７５８】
【化４５９】

【０７５９】
【化４６０】

さらなる研究により、以下の完全なヌクレオチド配列＜配列番号２５１＞を明らかにした：
【０７６０】
【化４６１】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２５２；ＯＲＦ６４−１＞に対応する：
【０７６１】
【化４６２】

このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６４は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ６４ａ）と３９２ａａのオーバーラップにわたって、９２．６％の同一性を示す：
【０７６２】
【化４６３】

この完全長ＯＲＦ６４ａヌクレオチド配列＜配列番号２５３＞は、以下の通りである：
【０７６３】
【化４６４】

【０７６４】
【化４６５】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２５４＞を有するタンパク質をコードする：
【０７６５】
【化４６６】

ＯＲＦ６４ａおよびＯＲＦ６４−１は、７０６ａａのオーバーラップにわたって、９６．６％の同一性を示す：
【０７６６】
【化４６７】

【０７６７】
【化４６８】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６４は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ６４．ｎｇ）と３８７ａａのオーバーラップにわたって、８６．６％の同一性を示す：
【０７６８】
【化４６９】

【０７６９】
【化４７０】

ＯＲＦ６４ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号２５５＞は、アミノ酸配列＜配列番号２５６＞を有するタンパク質をコードすることが予測された：
【０７７０】
【化４７１】

さらなる研究により、完全な淋菌ＤＮＡ配列＜配列番号２５７＞が明らかになった：
【０７７１】
【化４７２】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２５８；ＯＲＦ６４ｎｇ−１＞に対応する：
【０７７２】
【化４７３】

ＯＲＦ６４ｎｇ−１およびＯＲＦ６４−１は、７０６ａａのオーバーラップにおいて９３．８％の同一性を示す：
【０７７３】
【化４７４】

【０７７４】
【化４７５】

さらに、ＯＲＦ６４ｎｇ−１は、Ａ．ｃａｕｌｉｎｏｄａｎｓ由来のタンパク質と有意な同一性を示す：
【０７７５】
【化４７６】

【０７７６】
【化４７７】

この解析（淋菌タンパク質中の推定されるリーダー配列（二重下線）およびいくつかの推定される膜貫通ドメイン（一重下線）の存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０７７７】
（実施例３１）
以下に示す部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定した＜配列番号２５９＞：
【０７７８】
【化４７８】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２６０；ＯＲＦ６６＞に対応する：
【０７７９】
【化４７９】

さらなる研究により、以下の完全なヌクレオチド配列＜配列番号２６１＞が明らかになった：
【０７８０】
【化４８０】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２６２；ＯＲＦ６６−１＞に対応する：
【０７８１】
【化４８１】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｅ．ｃｏｌｉの仮定的タンパク質ｏ２２１（登録番号第Ｐ３７６１９号）との相同性）
ＯＲＦ６６およびｏ２２１タンパク質は、１５５ａａのオーバーラップにおいて、６７％の同一性を示す：
【０７８２】
【化４８２】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６６は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ６６ａ）と１５５ａａのオーバーラップにわたって、９６．１％の相同性を示す：
【０７８３】
【化４８３】

この完全長ＯＲＦ６６ａヌクレオチド配列＜配列番号２６３＞を以下に示す：
【０７８４】
【化４８４】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２６４＞を有するタンパク質をコードする：
【０７８５】
【化４８５】

ＯＲＦ６６ａおよびＯＲＦ６６−１は、２２８ａａのオーバーラップにおいて、９７．８％の同一性を示す：
【０７８６】
【化４８６】

【０７８７】
【化４８７】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦとの同一性）
ＯＲＦ６６は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ６６．ｎｇ）と１５５ａａのオーバーラップにわたって、９４．２％の同一性を示す：
【０７８８】
【化４８８】

この完全長ＯＲＦ６６ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号２６５＞は、以下の通りである：
【０７８９】
【化４８９】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２６６＞を有するタンパク質をコードする：
【０７９０】
【化４９０】

代替の注釈の配列は、以下の通りである：
【０７９１】
【化４９１】

ＯＲＦ６６ｎｇおよびＯＲＦ６６−１は、２２８ａａのオーバーラップにおいって、９６．１％の同一性を示す：
【０７９２】
【化４９２】

さらに、ＯＲＦ６６ｎｇは、Ｅ．ｃｏｌｉ ＯＲＦと有意な相同性を示す：
【０７９３】
【化４９３】

この解析（Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質との相同性および淋菌タンパク質中のいくつかの推定膜貫通ドメインの存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０７９４】
（実施例３２）
以下に示す部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定した＜配列番号２６７＞：
【０７９５】
【化４９４】

【０７９６】
【化４９５】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２６８；ＯＲＦ７２＞に対応する：
【０７９７】
【化４９６】

さらなる研究により、完全なヌクレオチド配列＜配列番号２６９＞が明らかになった：
【０７９８】
【化４９７】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２７０；ＯＲＦ７２−１＞に対応する：
【０７９９】
【化４９８】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７２は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ７２ａ）と１４７ａａのオーバーラップにわたって、９８．０％の同一性を示す：
【０８００】
【化４９９】

この全長ＯＲＦ７２ａヌクレオチド配列＜配列番号２７１＞は、以下の通りである：
【０８０１】
【化５００】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２７２＞を有するタンパク質をコードする：
【０８０２】
【化５０１】

ＯＲＦ７２およびＯＲＦ７２−１は、１５０ａａのオーバーラップにおいて、１００％の同一性を示す：
【０８０３】
【化５０２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ７２．ｎｇ）と１７３ａａのオーバーラップにわたって、８９％の同一性を示す：
【０８０４】
【化５０３】

ＯＲＦ７２ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号２７３＞は、以下のアミノ酸配列＜配列番号２７４＞を有するタンパク質をコードすることが予測された：
【０８０５】
【化５０４】

さらなる解析後、以下の淋菌ＤＮＡ配列＜配列番号２７５＞を同定した：
【０８０６】
【化５０５】

これは、アミノ酸配列＜配列番号２７６；ＯＲＦ７２ｎｇ−１＞に対応する：
【０８０７】
【化５０６】

ＯＲＦ７２ｎｇ−１およびＯＲＦ７２１−１は、１４５ａａのオーバーラップにおいて、８９．７％の同一性を示す：
【０８０８】
【化５０７】

この解析（淋菌タンパク質中での推定されるリーダー配列および膜貫通ドメインの存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するために有用な抗原であり得ることが予測される。
【０８０９】
（実施例３３）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定した＜配列番号２７７＞：
【０８１０】
【化５０８】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２７８；ＯＲＦ７３＞に対応する：
【０８１１】
【化５０９】

さらなる研究により、完全なヌクレオチド配列＜配列番号２７９＞を明らかにした：
【０８１２】
【化５１０】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２８０；ＯＲＦ７３−１＞に対応する：
【０８１３】
【化５１１】

【０８１４】
【化５１２】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｉｎｇｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｉｎｇｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ７３ａ）と７６ａａのオーバーラップにわたって、９０．８％の同一性を示す：
【０８１５】
【化５１３】

この完全長ＯＲＦ７３ａヌクレオチド配列＜配列番号２８１＞は以下の通りである：
【０８１６】
【化５１４】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２８２＞を有するタンパク質をコードする：
【０８１７】
【化５１５】

ＯＲＦ７３ａおよびＯＲＦ７３−１は、１６１ａａのオーバーラップにおいて、９１．３％の同一性を示す
【０８１８】
【化５１６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦは、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ７３．ｎｇ）と７６ａａのオーバーラップにわたって、９２．１％の同一性を示す：
【０８１９】
【化５１７】

【０８２０】
【化５１８】

この完全長ＯＲＦ７３ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号２８３＞は以下の通りである：
【０８２１】
【化５１９】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２８４＞を有するタンパク質をコードする：
【０８２２】
【化５２０】

ＯＲＦ７３ｎｇおよびＯＲＧ７３−１は、１６１ａａのオーバーラップにおいて、９３．８％の同一性を示す：
【０８２３】
【化５２１】

この解析（淋菌タンパク質中で推定されるリーダー配列および推定膜貫通ドメインの存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するために有用な抗原であり得ることが予測される。
【０８２４】
（実施例３４）
以下の部分的ＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定した＜配列番号２８５＞：
【０８２５】
【化５２２】

【０８２６】
【化５２３】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２８６；ＯＲＦ７５＞に対応する：
【０８２７】
【化５２４】

さらなる研究により、完全ヌクレオチド配列＜配列番号２８７＞が明らかになった：
【０８２８】
【化５２５】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２８８；ＯＲＦ７５−１＞に対応する：
【０８２９】
【化５２６】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７５は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ７５ａ）と２８３ａａのオーバーラップにわたって、９５．８％の同一性を示す：
【０８３０】
【化５２７】

【０８３１】
【化５２８】

この完全長ＯＲＦ７５ａヌクレオチド配列＜配列番号２８９＞は、以下の通りである：
【０８３２】
【化５２９】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２９０＞を有するタンパク質をコードする：
【０８３３】
【化５３０】

ＯＲＦ７５ａおよびＯＲＦ７５−１は、２９１ａａのオーバーラップにおいて、９８．３％の同一性を示す：
【０８３４】
【化５３１】

【０８３５】
【化５３２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７５は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ７５．ｎｇ）と２９２ａａのオーバーラップにわたって、９３．２％の同一性を示す：
【０８３６】
【化５３３】

ＯＲＦ７５ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号２９１＞は、以下のアミノ酸配列＜配列番号２９２＞を有するタンパク質をコードすることが予測された：
【０８３７】
【化５３４】

さらなる解析後、以下の淋菌ＤＮＡ配列＜配列番号２９３＞を同定した：
【０８３８】
【化５３５】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２９４；ＯＲＦ７５ｎｇ−１＞に対応する：
【０８３９】
【化５３６】

ＯＲＦ７５ｎｇ−１およびＯＲＦ７５−１は、２９１ａａのオーバーラップにわたって、９６．２％の同一性を示す：
【０８４０】
【化５３７】

さらに、ＯＲＧ７５ｎｇ−１は、仮定的なＥ．ｃｏｌｉタンパク質と有意な相同性を示す：
【０８４１】
【化５３８】

この解析（淋菌タンパク質中での推定される膜貫通ドメインの存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生させるための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０８４２】
（実施例３５）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定した＜配列番号２９５＞：
【０８４３】
【化５３９】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２９６；ＯＲＦ７６＞に対応する：
【０８４４】
【化５４０】

さらなる研究により、完全なヌクレオチド配列＜配列番号２９７＞が明らかになった：
【０８４５】
【化５４１】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号２９８；ＯＲＦ７６−１＞に対応する：
【０８４６】
【化５４２】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７６は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ７６ａ）と３０ａａのオーバーラップにわたって９６．７％の同一性を示し、そして３１ａａのオーバーラップにわたって９６．８％の同一性を示す：
【０８４７】
【化５４３】

【０８４８】
【化５４４】

この完全長ＯＲＦ７６ａヌクレオチド配列＜配列番号２９９＞は、以下の通りである：
【０８４９】
【化５４５】

これは、アミノ酸配列＜配列番号３００＞を有するポリペプチドをコードする：
【０８５０】
【化５４６】

ＯＲＦ７６ａおよびＯＲＦ７６−１は、２５２ａａのオーバーラップにおいて、９７．６％の同一性を示す：
【０８５１】
【化５４７】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
Ｎ末端およびＣ末端のＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のＯＲＦ７６ならびに予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ７６．ｎｇ）の整列化したａａ配列は、それぞれ、３０ａａおよび３１ａａのオーバーラップにわたって、９６．７％および１００％同一性を示す：
【０８５２】
【化５４８】

この完全長ＯＲＦ７６ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号３０１＞は、以下の通りである：
【０８５３】
【化５４９】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３０２＞を有するタンパク質をコードする：
【０８５４】
【化５５０】

ＯＲＦ７６ｎｇおよびＯＲＦ７６−１は、２５２ａａのオーバーラップにおいて、９６．０％の同一性を示す：
【０８５５】
【化５５１】

さらに、ＯＲＦ７６ｎｇは、Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓエクスポートタンパク質前駆体との有意な同一性を示す：
【０８５６】
【化５５２】

この解析（淋菌タンパク質中で推定されるリーダー配列およびＲＧＤモチーフの存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０８５７】
ＯＲＦ７６−１（２７．８ｋＤａ）を、上記に記載したように、ｐＥＴベクターにおいてクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉにおいて発現した。タンパク質発現および精製の産物を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析した。図１０Ａは、Ｈｉｓ融合タンパク質のアフィニティ精製の結果を示し、精製されたＨｉｓ融合タンパク質を、免疫マウス（この血清はウエスタンブロット（図１０Ｂ）について使用された）、ＥＬＩＳＡ（陽性結果）、およびＦＡＣＳ分析（図１０Ｃ）に使用した。これらの実験は、ＯＲＦ７６−１は表面が曝露されたタンパク質であり、そして有用な免疫原であることを確認する。
【０８５８】
（実施例３６）
以下の部分的ＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ＜配列番号３０３＞で同定した：
【０８５９】
【化５５３】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３０４；ＯＲＦ８１＞に対応する：
【０８６０】
【化５５４】

【０８６１】
【化５５５】

さらなる研究により、以下の完全はヌクレオチド配列＜配列番号３０５＞が明らかになった：
【０８６２】
【化５５６】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３０６；ＯＲＦ８１−１＞に対応する：
【０８６３】
【化５５７】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ８１ａ）と８５ａａのオーバーラップにわたって８４．７％の同一性を示し、そして１２１ａａのオーバーラップにわたって９９．２％の同一性を示す：
【０８６４】
【化５５８】

【０８６５】
【化５５９】

この完全長ＯＲＦ８１ａヌクレオチド配列＜配列番号３０７＞は、以下の通り
である：
【０８６６】
【化５６０】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３０８＞を有するタンパク質をコードする：
【０８６７】
【化５６１】

ＯＲＦ８１ａおよびＯＲＦ８１−１は、５２４ａａのオーバーラップにおいて、７７．９％の同一性を示す：
【０８６８】
【化５６２】

【０８６９】
【化５６３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
Ｎ末端およびＣ末端のＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のＯＲＦ８１ならびに予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ８１．ｎｇ）の整列化したａａ配列は、それぞれ、８５ａａおよび１２１ａａのオーバーラップにおいて、８２．４％および９７．５％同一性を示す：
【０８７０】
【化５６４】

【０８７１】
【化５６５】

この完全長ＯＲＦ８１ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号３０９＞は、以下の通りである：
【０８７２】
【化５６６】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３１０＞を有するタンパク質をコードする：
【０８７３】
【化５６７】

ＯＲＦ８１ｎｇおよびＯＲＦ８１−１は、５２４ａａのオーバーラップにおいて、９６．４％の同一性を示す：
【０８７４】
【化５６８】

【０８７５】
【化５６９】

さらに、ＯＲＦ８１ｎｇは、Ｅ．ｃｏｌｉ ＯＭＰと有意な相同性を示す：
【０８７６】
【化５７０】

【０８７７】
【化５７１】

この解析（淋菌タンパク質中の推定されるリーダー配列（二重下線）およびいくつかの推定される膜貫通ドメイン（一重下線）を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０８７８】
（実施例３７）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ＜配列番号３１１＞で同定した：
【０８７９】
【化５７２】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３１２；ＯＲＦ８３＞に対応する：
【０８８０】
【化５７３】

さらなる研究により、以下の完全なヌクレオチド配列＜配列番号３１３＞が明らかになった：
【０８８１】
【化５７４】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３１４；ＯＲＦ８３−１＞に対応する：
【０８８２】
【化５７５】

【０８８３】
【化５７６】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来のＯＲＦ（ＯＲＦ８３ａ）と１９７ａａのオーバーラップにわたって、９６．４％の相同性を示す：
【０８８４】
【化５７７】

この完全長ＯＲＦ８３ａヌクレオチド配列＜配列番号３１５＞は、以下の通りである：
【０８８５】
【化５７８】

これは、アミノ酸配列＜配列番号３１６＞を有するタンパク質をコードする：
【０８８６】
【化５７９】

ＯＲＦ８３ａおよびＯＲＦ８３−１は、３１３ａａのオーバーラップにおいて、９８．４％の同一性を示す：
【０８８７】
【化５８０】

【０８８８】
【化５８１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８３は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ８３．ｎｇ）と１９７ａａのオーバーラップにわたって、９４．９％の同一性を示す：
【０８８９】
【化５８２】

この完全長ＯＲＦ８３ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号３１７＞は、以下の通りである：
【０８９０】
【化５８３】

【０８９１】
【化５８４】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３１８＞を有するタンパク質をコードする：
【０８９２】
【化５８５】

ＯＲＦ８３ｎｇおよびＯＲＦ８３−１は、３１３ａａのオーバーラップにわたって、９７．１％の同一性を示す：
【０８９３】
【化５８６】

この解析（淋菌タンパク質中の推定されるＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位モチーフＡ（Ｐループ）（二重下線）、および推定される原核生物の膜リポタンパク質脂質吸着部位（一重下線）の存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０８９４】
（実施例３８）
完全であると考えられる以下のＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ＜配列番号３１９＞で同定した：
【０８９５】
【化５８７】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３２０；ＯＲＦ８４＞に対応する：
【０８９６】
【化５８８】

さらなる研究により完全なヌクレオチド配列＜配列番号３２１＞が明らかになった：
【０８９７】
【化５８９】

これは、アミノ酸配列＜配列番号３２２；ＯＲＦ８４−１＞に対応する：
【０８９８】
【化５９０】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８４は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの菌株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ８４ａ）と３９５ａａのオーバーラップにわたって、９３．９％の相同性を示す：
【０８９９】
【化５９１】

この全長ＯＲＦ８４ａヌクレオチド配列＜配列番号３２３＞は、以下の通りである：
【０９００】
【化５９２】

【０９０１】
【化５９３】

これは、アミノ酸配列＜配列番号３２４＞を有するタンパク質をコードする：
【０９０２】
【化５９４】

ＯＲＦ８４ａおよびＯＲＦ８４−１は、３９５ａａのオーバーラップにおいて、９５．２％の同一性を示す：
【０９０３】
【化５９５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８４は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されたＯＲＦ（ＯＲＦ８４．ｎｇ）と３９５ａａのオーバーラップにわたって、９４．２％の同一性を示す：
【０９０４】
【化５９６】

この完全長ＯＲＦ８４ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号３２５＞は、以下の通りである：
【０９０５】
【化５９７】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３２６＞を有するタンパク質をコードする：
【０９０６】
【化５９８】

ＯＲＦ８４ｎｇおよびＯＲＦ８４−１は、３９５ａａのオーバーラップにわたって、９５．４％の同一性を示す：
【０９０７】
【化５９９】

この解析（淋菌タンパク質中の推定される膜通過ドメイン（一重下線）、および仮定的ＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位モチーフＡ（Ｐループ、二重下線）の存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０９０８】
（実施例３９）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓで同定した＜配列番号３２７＞：
【０９０９】
【化６００】

【０９１０】
【化６０１】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３２８；ＯＲＦ８８＞に対応する：
【０９１１】
【化６０２】

さらなる研究により、以下の完全なヌクレオチド配列＜配列番号３２９＞が明らかになった：
【０９１２】
【化６０３】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３３０；ＯＲＦ８８−１＞に対応する：
【０９１３】
【化６０４】

【０９１４】
【化６０５】

このアミノ酸配列のコンピュータ解析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８８は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（菌株Ａ）由来のＯＲＦ（ＯＲＦ８８ａ）と３７１ａａのオーバーラップにわたって、９５．７％の同一性を示す：
【０９１５】
【化６０６】

この完全長ＯＲＦ８８ａヌクレオチド配列＜配列番号３３１＞は、以下の通りである：
【０９１６】
【化６０７】

【０９１７】
【化６０８】

これは、以下のアミノ酸配列＜配列番号３３２＞を有するタンパク質をコードする：
【０９１８】
【化６０９】

ＯＲＦ８８ａおよびＯＲＦ８８−１は、６７１ａａのオーバーラップにおいて、１００．０％の同一性を示す：
【０９１９】
【化６１０】

【０９２０】
【化６１１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ８８．ｎｇ）と３７１ａａのオーバーラップにわたって、９３．８％の同一性を示す：
【０９２１】
【化６１２】

ＯＲＦ８８ｎｇヌクレオチド配列＜配列番号３３３＞は、以下のアミノ酸配列＜配列番号３３４＞を有するタンパク質をコードすることが予測された：
【０９２２】
【化６１３】

さらなる研究により、完全な淋菌ＤＮＡ配列＜配列番号３３５＞が明らかになった：
【０９２３】
【化６１４】

これは、アミノ酸配列＜配列番号３３６；ＯＲＦ８８ｎｇ−１＞に対応する：
【０９２４】
【化６１５】

【０９２５】
【化６１６】

ＯＲＦ８８ｎｇ−１およびＯＲＦ８８−１は、６７１ａａのオーバーラップにおいて、９７．０％の同一性を示す：
【０９２６】
【化６１７】

さらに、ＯＲＧ８８ｎｇ−１は、Ａｑｕｉｆｅｘ ａｅｏｌｉｃｕｓ由来の仮定的タンパク質と同一性を示す：
【０９２７】
【化６１８】

【０９２８】
【化６１９】

この解析（淋菌タンパク質中の推定される膜貫通ドメインを含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断薬のため、または抗体を産生するための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０９２９】
（実施例４０）
以下のＤＮＡ配列は完全であると考えられ、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号３３７）：
【０９３０】
【化６２０】

これはアミノ酸配列（配列番号３３８；ＯＲＦ８９）に対応する：
【０９３１】
【化６２１】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号３３９）：
【０９３２】
【化６２２】

これはアミノ酸配列（配列番号３４０；ＯＲＦ８９−１）に対応する：
【０９３３】
【化６２３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのＰｉｌＥとの相同性（受託番号Ｚ６９２６０））
ＯＲＦ８９およびＰｉｌＥタンパク質は１２０ａａの重複部分にわたって３０％の同一性を示す：
【０９３４】
【化６２４】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ８９ａ）と１６２ａａ重複部分にわたって８３．３％の同一性を示す：
【０９３５】
【化６２５】

完全長ＯＲＦ８９ａヌクレオチド配列（配列番号３４１）は以下である：
【０９３６】
【化６２６】

これはアミノ酸配列（配列番号３４２）を有するタンパク質をコードする：
【０９３７】
【化６２７】

ＯＲＦ８９ａおよびＯＲＦ８９−１は１６２ａａの重複部分において８３．３％の同一性を示す：
【０９３８】
【化６２８】

【０９３９】
【化６２９】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８９はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ８９．ｎｇ）と１６２ａａの重複部分にわたって８４．６％の同一性を示す：
【０９４０】
【化６３０】

完全長ＯＲＦ８９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号３４３）は以下である：
【０９４１】
【化６３１】

これはアミノ酸配列（配列番号３４４）を有するタンパク質をコードする：
【０９４２】
【化６３２】

この淋菌タンパク質は、推定リーダーペプチド（下線）およびＮ末端メチル化部位（ＮＭｅＰｈｅまたはｔｙｐｅ−４ ｐｉｌｉ、二重下線）を有する。さらに、ＯＲＦ８９ｎｇおよびＯＲＦ８９−１は、１６２ａａの重複部分において８８．３％の同一性を示す：
【０９４３】
【化６３３】

淋菌性モチーフおよび公知のＰｉｌＥタンパク質との相同性を含む、この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測された。
【０９４４】
上述したように、ＯＲＦ８９−１（１３．６ｋＤａ）を、ｐＧｅｘベクターでクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉで発現させた。タンパク質の発現および精製の産物をＳＤＳ−ＰＡＧＥで分析した。図１１ＡはＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示す。精製したＧＳＴ融合タンパク質を使用してマウスを免疫し、この血清はＥＬＩＳＡ試験において陽性結果を生じた。ＯＲＦ８９−１は表面に露出されるタンパク質（ｓｕｒｆａｃｅ−ｅｘｐｏｓｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ）であり、有用な免疫原であることを確認した。
【０９４５】
（実施例４１）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号３４５）：
【０９４６】
【化６３４】

これはアミノ酸配列（配列番号３４６；ＯＲＦ９１）に対応する：
【０９４７】
【化６３５】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号３４７）：
【０９４８】
【化６３６】

これはアミノ酸配列（配列番号３４８；ＯＲＦ９１−１）に対応する：
【０９４９】
【化６３７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ９１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ９１ａ）と９２ａａ重複部分にわたって９２．４％の同一性を示す：
【０９５０】
【化６３８】

【０９５１】
【化６３９】

完全長ＯＲＦ９１ａヌクレオチド配列（配列番号３４９）は以下である：
【０９５２】
【化６４０】

これはアミノ酸配列（配列番号３５０）を有するタンパク質をコードする：
【０９５３】
【化６４１】

ＯＲＦ９１ａおよびＯＲＦ９１−１は１９６ａａの重複部分において９８．０％の同一性を示す：
【０９５４】
【化６４２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ９１はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ９１．ｎｇ）と９２ａａの重複部分にわたって８４．８％の同一性を示す：
【０９５５】
【化６４３】

完全長ＯＲＦ９１ｎｇヌクレオチド配列（配列番号３５１）は、アミノ酸配列（配列番号３５２）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【０９５６】
【化６４４】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号３５３）：
【０９５７】
【化６４５】

これはアミノ酸配列（配列番号３５４；ＯＲＦ９１ｎｇ−１）に対応する：
【０９５８】
【化６４６】

ＯＲＦ９１ｎｇ−１およびＯＲＦ９１−１は１９６ａａの重複部分において９２．３％の同一性を示す：
【０９５９】
【化６４７】

さらに、ＯＲＦ９１ｎｇ−１は仮定のＥ．ｃｏｌｉのタンパク質と相同性を示す：
【０９６０】
【化６４８】

【０９６１】
【化６４９】

淋菌性タンパク質における推定リーダー配列の存在を含む、この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ由来およびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【０９６２】
（実施例４２）
以下のＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号３５５）：
【０９６３】
【化６５０】

これはアミノ酸配列（配列番号３５６；ＯＲＦ９７）に対応する：
【０９６４】
【化６５１】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号３５７）：
【０９６５】
【化６５２】

これはアミノ酸配列（配列番号３５８；ＯＲＦ９７−１）に対応する：
【０９６６】
【化６５３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ９７は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ９１ａ）と１５９ａａ重複部分にわたって８８．７％の同一性を示す：
【０９６７】
【化６５４】

【０９６８】
【化６５５】

完全長ＯＲＦ９７ａヌクレオチド配列（配列番号３５９）は以下である：
【０９６９】
【化６５６】

これはアミノ酸配列（配列番号３６０）を有するタンパク質をコードする：
【０９７０】
【化６５７】

ＯＲＦ９７ａおよびＯＲＦ９７−１は１５９ａａの重複部分にわたって９５．６％の同一性を示す：
【０９７１】
【化６５８】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ９７はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ９７．ｎｇ）と１５９ａａの重複部分にわたって８８．１％の同一性を示す：
【０９７２】
【化６５９】

完全長ＯＲＦ９７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号３６１）は、アミノ酸配列（配列番号３６２）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【０９７３】
【化６６０】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号３６３）：
【０９７４】
【化６６１】

これはアミノ酸配列（配列番号３６４；ＯＲＦ９７ｎｇ−１）に対応する：
【０９７５】
【化６６２】

ＯＲＦ９７ｎｇ−１およびＯＲＦ９７−１は１５９ａａの重複部分において９６．２％の同一性を示す：
【０９７６】
【化６６３】

淋菌性タンパク質における推定リーダー配列の存在を含む、この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ由来およびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測された。
【０９７７】
上述したように、ＯＲＦ９７−１（１５．３ｋＤａ）を、ｐＥＴベクターおよびｐＧｅｘベクターでクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉで発現させた。タンパク質の発現および精製の産物をＳＤＳ−ＰＡＧＥで分析した。図１２Ａおよび図１２Ｂはそれぞれ、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果、ならびにＨｉｓ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示す。精製したＧＳＴ融合タンパク質を使用してマウスを免疫し、この血清を、ウエスタンブロット解析（図１２Ｃ）、ＥＬＩＳＡ解析（陽性結果）、およびＦＡＣＳ解析（図１２Ｄ）のために使用した。これらの実験は、ＯＲＦ９７−１は表面に露出されるタンパク質であり、有用な免疫原であることを確認した。図１２Ｅは、ＯＲＦ９７−１についての親水性、抗原性指数、およびＡＭＰＨＩ領域のプロットを示す。
【０９７８】
（実施例４３）
以下のＤＮＡ配列は完全である考えられ、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号３６５）：
【０９７９】
【化６６４】

これはアミノ酸配列（配列番号３６６；ＯＲＦ１０６）に対応する：
【０９８０】
【化６６５】

さらなる研究は以下のＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号３６７）：
【０９８１】
【化６６６】

これはアミノ酸配列（配列番号３６８；ＯＲＦ１０６−１）に対応する：
【０９８２】
【化６６７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０６はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０６ａ）と１９９ａａの重複部分にわたって８７．４％の同一性を示す：
【０９８３】
【化６６８】

【０９８４】
【化６６９】

１１１残基でのＫ→Ｎ置換のために、ＯＲＦ１０６ａとＯＲＦ１０６−１との間の相同性は、同様の１９９ａａの重複部分にわたって８７．９％である。
【０９８５】
完全長ＯＲＦ１０６ａヌクレオチド配列（配列番号３６９）は以下である：
【０９８６】
【化６７０】

これはアミノ酸配列（配列番号３７０）を有するタンパク質をコードする：
【０９８７】
【化６７１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０６はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０６．ｎｇ）と１９９ａａの重複部分にわたって９０．５％の同一性を示す：
【０９８８】
【化６７２】

１１１残基でのＫ→Ｎ置換のために、ＯＲＦ１０６ｎｇとＯＲＦ１０６−１との間の相同性は、同様の１９９ａａの重複部分にわたって９１．０％である。
【０９８９】
完全長ＯＲＦ１０６ｎｇヌクレオチド配列（配列番号３７１）は以下である：
【０９９０】
【化６７３】

これはアミノ酸配列（配列番号３７２）を有するタンパク質をコードする：
【０９９１】
【化６７４】

淋菌性タンパク質の推定リーダー配列の存在を含む、この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測された。
【０９９２】
上述したように、ＯＲＦ１０６−１（１８ｋＤａ）を、ｐＥＴベクターおよびｐＧｅｘベクターでクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉで発現させた。タンパク質の発現および精製の産物をＳＤＳ−ＰＡＧＥで分析した。図１３ＡはＨｉｓ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果、および図１３ＢはＥ．ｃｏｌｉにおけるＧＳＴ融合の発現の結果を示す。精製したＨｉｓ融合タンパク質を使用してマウスを免疫し、この血清をＦＡＣＳ解析（図１３Ｃ）のために使用した。これらの実験は、ＯＲＦ１０６−１は表面に露出されるタンパク質であり、有用な免疫原であることを確認する。
【０９９３】
（実施例４４）
以下のＤＮＡ配列は、完全あると考えられ、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号３７３）：
【０９９４】
【化６７５】

【０９９５】
【化６７６】

これはアミノ酸配列（配列番号３７４；ＯＲＦ１０）に対応する：
【０９９６】
【化６７７】

さらなる配列解析は以下の完全ＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号３７５）：
【０９９７】
【化６７８】

これはアミノ酸配列（配列番号３７６；ＯＲＦ１０−１）に対応する：
【０９９８】
【化６７９】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（予測）
ＯＲＦ１０−１は、いくつか（１２−１３）の潜在的な膜貫通セグメントを包含しているので、内在性膜蛋白の前駆体であり、推定切断可能なシグナルペプチドであると予測される。
【０９９９】
（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｃｕｓ ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ（受託番号Ｕ４０８３０）由来のＥｐｓとの相同性）
ＯＲＦ１０はＳ．ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓのｅｐｓＭ遺伝子と相同性を示す。ｅｐｓＭ遺伝子は、ＯＲＦ１０と類似する大きさのタンパク質をコードし、そしてエクソポリサッカリド合成に関与する。他の相同性は原核生物の膜タンパク質とである：
【１０００】
【化６８０】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１０ａ）と４７５ａａの重複部分にわたって９５．４％の同一性を示す：
【１００１】
【化６８１】

【１００２】
【化６８２】

完全長ＯＲＦ１０ａヌクレオチド配列（配列番号３７７）は以下である：
【１００３】
【化６８３】

これはアミノ酸配列（配列番号３７８）を有するタンパク質をコードする：
【１００４】
【化６８４】

ＯＲＦ１０ａおよびＯＲＦ１０−１は４７５ａａの重複部分において９５．４％の同一性を示す：
【１００５】
【化６８５】

【１００６】
【化６８６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０．ｎｇ）と４７５ａａにわたり９４．１％の相同性を示す：
【１００７】
【化６８７】

【１００８】
【化６８８】

完全長ＯＲＦ１０ｎｇヌクレオチド配列（配列番号３７９）は以下である：
【１００９】
【化６８９】

これはアミノ酸配列（配列番号３８０）を有するタンパク質をコードする：
【１０１０】
【化６９０】

ＯＲＦ１０ｎｇおよびＯＲＦ１０−１は４７３ａａの重複部分において９６．４％の同一性を示す：
【１０１１】
【化６９１】

【１０１２】
【化６９２】

推定リーダーペプチドおよびいくつかの膜貫通セグメントの存在、ならびにロイシンジッパーモチーフ（４Ｌｅｕ残基が６ａａによって区切られる、太字で示している）の存在を含む、この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１０１３】
（実施例４５）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号３８１）：
【１０１４】
【化６９３】

これはアミノ酸配列（配列番号３８２；ＯＲＦ６５）に対応する：
【１０１５】
【化６９４】

【１０１６】
【化６９５】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号３８３）：
【１０１７】
【化６９６】

これはアミノ酸配列（配列番号３８４；ＯＲＦ６５−１）に対応する：
【１０１８】
【化６９７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６５は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ６５ａ）と１５０ａａ重複部分にわたって９２．０％の同一性を示す：
【１０１９】
【化６９８】

完全長ＯＲＦ６５ａヌクレオチド配列（配列番号３８５）は以下である：
【１０２０】
【化６９９】

【１０２１】
【化７００】

これはアミノ酸配列（配列番号３８６）を有するタンパク質をコードする：
【１０２２】
【化７０１】

ＯＲＦ６５ａおよびＯＲＦ６５−１は２８９ａａの重複部分にわたって９６．５％の同一性を示す：
【１０２３】
【化７０２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６５はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ６５．ｎｇ）と２１２ａａの重複部分にわたって８９．６％の同一性を示す：
【１０２４】
【化７０３】

【１０２５】
【化７０４】

ＯＲＦ６５ｎｇヌクレオチド配列（配列番号３８７）は、アミノ酸配列（配列番号３８８）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【１０２６】
【化７０５】

さらなる解析の後、完全な淋菌ＤＮＡ配列（配列番号３８９）が以下であることを見出した：
【１０２７】
【化７０６】

これは以下のアミノ酸配列（配列番号３９０）をコードする：
【１０２８】
【化７０７】

ＯＲＦ６５ｎｇ−１およびＯＲＦ６５−１は２９０ａａの重複部分において８９．０％の同一性を示す：
【１０２９】
【化７０８】

【１０３０】
【化７０９】

淋菌タンパク質の推定膜貫通ドメインの存在を含む、この基準に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１０３１】
（実施例４６）
以下のＤＮＡ配列は完全であると考えられ、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号３９１）：
【１０３２】
【化７１０】

これはアミノ酸配列（配列番号３９２；ＯＲＦ１０３）に対応する：
【１０３３】
【化７１１】

さらなる研究は以下のようなＤＮＡ配列を合成（ｅｌａｂｏｒａｔｅ）した（配列番号３９３）：
【１０３４】
【化７１２】

【１０３５】
【化７１３】

これはアミノ酸配列（配列番号３９４；ＯＲＦ１０３−１）に対応する：
【１０３６】
【化７１４】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１０３ａ）と２２２ａａ重複部分にわたって９３．８％の同一性を示す：
【１０３７】
【化７１５】

完全長のＯＲＦ１０３ａヌクレオチド配列（配列番号３９５）は以下である：
【１０３８】
【化７１６】

これはアミノ酸配列（配列番号３９６）を有するタンパク質をコードする：
【１０３９】
【化７１７】

【１０４０】
【化７１８】

ＯＲＦ１０３ａおよびＯＲＦ１０３−１は２２２ａａの重複部分において９７．７％の同一性を示す：
【１０４１】
【化７１９】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの予測されたＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０３はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０３．ｎｇ）と２２２ａａの重複部分にわたって９５．５％の同一性を示す：
【１０４２】
【化７２０】

完全長ＯＲＦ１０３ｎｇヌクレオチド配列（配列番号３９７）は以下である：
【１０４３】
【化７２１】

これはアミノ酸配列（配列番号３９８）を有するタンパク質をコードする：
【１０４４】
【化７２２】

さらに、ＯＲＦ１０３ｎｇおよびＯＲＦ１０３−１は２２２ａａの重複部分において９７．３％の同一性を示す：
【１０４５】
【化７２３】

淋菌タンパク質における推定リーダー配列（二重線）およびいくつかの推定の膜貫通ドメイン（一重線）の存在を含む、この解析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１０４６】
（実施例４７）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号３９９）：
【１０４７】
【化７２４】

これはアミノ酸配列（配列番号４００；ＯＲＦ１０４）に対応する：
【１０４８】
【化７２５】

【１０４９】
【化７２６】

さらなる研究は、さらなる部分的なＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号４０１）：
【１０５０】
【化７２７】

これはアミノ酸配列（配列番号４０２；ＯＲＦ１０４−１）に対応する：
【１０５１】
【化７２８】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ（受託番号Ｕ３２７６９）の仮定のＨＩ０８７８タンパク質との相同性）
ＯＲＦ１０４およびＨＩ０８７８は、２７７ａａの重複部分にわたって４０％ａａの同一性を示す：
【１０５２】
【化７２９】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０４は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１０４ａ）と２７７ａａ重複部分にわたって９５．３％の同一性を示す：
【１０５３】
【化７３０】

【１０５４】
【化７３１】

完全長ＯＲＦ１０４ａヌクレオチド配列（配列番号４０３）は以下である：
【１０５５】
【化７３２】

これはアミノ酸配列（配列番号４０４）を有するタンパク質をコードする：
【１０５６】
【化７３３】

ＯＲＦ１０４ａおよびＯＲＦ１０４−１は２７７ａａの重複部分において９８．２％の同一性を示す：
【１０５７】
【化７３４】

【１０５８】
【化７３５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０４はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲ１０４．ｎｇ）と２７７ａａの重複部分にわたって９３．９％の同一性を示す：
【１０５９】
【化７３６】

完全長ＯＲＦ１０４ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４０５）を、アミノ酸配列（配列番号４０６）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【１０６０】
【化７３７】

さらなる研究は完全な淋菌のヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号４０７）：
【１０６１】
【化７３８】

【１０６２】
【化７３９】

これはアミノ酸配列（配列番号４０８；ＯＲＦ１０４ｎｇ−１）に対応する：
【１０６３】
【化７４０】

ＯＲＦ１０４ｎｇ−１およびＯＲＦ１０４−１は２７７ａａの重複部分にわたって９７．５％の同一性を示す：
【１０６４】
【化７４１】

さらに、ＯＲＦ１０４ｎｇ−１は、仮定のＨ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅのタンパク質と有意な相同性を示す。
【１０６５】
【化７４２】

【１０６６】
【化７４３】

淋菌のタンパク質の、推定リーダー配列、およびいくつかの推定膜貫通ドメインの存在を含む、これらの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ由来およびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１０６７】
（実施例４８）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４０９）：
【１０６８】
【化７４４】

これはアミノ酸配列（配列番号４１０；ＯＲＦ１０５）に対応する：
【１０６９】
【化７４５】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号４１１）：
【１０７０】
【化７４６】

これはアミノ酸配列（配列番号４１２；ＯＲＦ１０５−１）に対応する：
【１０７１】
【化７４７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０５は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１０５ａ）と２２６ａａの重複部分にわたって８９．４％の同一性を示す：
【１０７２】
【化７４８】

完全長ＯＲＦ１０５ａヌクレオチド配列（配列番号４１３）は以下である：
【１０７３】
【化７４９】

これはアミノ酸配列（配列番号４１４）を有するタンパク質をコードする：
【１０７４】
【化７５０】

【１０７５】
【化７５１】

ＯＲＦ１０５ａおよびＯＲＦ１０５−１は２９１ａａの重複部分において９３．８％の同一性を示す：
【１０７６】
【化７５２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０５はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０５．ｎｇ）と３１２ａａの重複部分にわたって８７．５％の同一性を示す：
【１０７７】
【化７５３】

完全長ＯＲＦ１０５ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４１５）は、アミノ酸配列（配列番号４１６）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【１０７８】
【化７５４】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号４１７）：
【１０７９】
【化７５５】

これはアミノ酸配列（配列番号４１８；ＯＲＦ１０５ｎｇ−１）に対応する：
【１０８０】
【化７５６】

ＯＲＦ１０５ｎｇ−１およびＯＲＦ１０５−１は２９１ａａの重複部分において９３．５％の同一性を示す：
【１０８１】
【化７５７】

さらに、ＯＲＦ１０５ｎｇ−１は酵母の酵素と相同性を示す：
【１０８２】
【化７５８】

淋菌のタンパク質における推定膜貫通ドメインの存在を含む、これらの解析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ由来およびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅこれらののタンパク質、ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１０８３】
（実施例４９）
以下のＤＮＡ配列は、完全であると考えられ、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４１９）：
【１０８４】
【化７５９】

これはアミノ酸配列（配列番号４２０；ＯＲＦ１０７）に対応する：
【１０８５】
【化７６０】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０７は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１０７ａ）と１８６ａａの重複部分にわたって９７．８％の同一性を示す：
【１０８６】
【化７６１】

【１０８７】
【化７６２】

完全長ＯＲＦ１０７ａヌクレオチド配列（配列番号４２１）は以下である：
【１０８８】
【化７６３】

これはアミノ酸配列（配列番号４２２）を有するタンパク質をコードする：
【１０８９】
【化７６４】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのＡ株由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０７．ｎｇ）と１８８ａａの重複部分にわたって９５．７％の同一性を示す：
【１０９０】
【化７６５】

完全長ＯＲＦ１０７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４２３）は、アミノ酸配列（配列番号４２４）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【１０９１】
【化７６６】

淋菌のタンパク質における、推定膜貫通ドメインの存在に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ由来およびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質が予測され、そしてこれらのエピトープは、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１０９２】
（実施例５０）
以下のＤＮＡ配列は完全である考えられ、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４２５）：
【１０９３】
【化７６７】

これはアミノ酸配列（配列番号４２６；ＯＲＦ１０８）に対応する：
【１０９４】
【化７６８】

さらなる研究は以下のＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号４２７）：
【１０９５】
【化７６９】

これはアミノ酸配列（配列番号４２８；ＯＲＦ１０８−１）に対応する：
【１０９６】
【化７７０】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０８はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０８．ｎｇ）と１８１ａａの重複部分にわたって８８．４％の同一性を示す：
【１０９７】
【化７７１】

ＯＲＦ１０８−１はＯＲＦ１０８ｎｇと１８１ａａの重複部分にわたって９２．３％の同一性を示す：
【１０９８】
【化７７２】

完全長ＯＲＦ１０８ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４２９）は以下である：
【１０９９】
【化７７３】

これはアミノ酸配列（配列番号４３０）を有するタンパク質をコードする：
【１１００】
【化７７４】

淋菌のタンパク質における、予測される原核生物の膜リポタンパク質脂質結合部位（下線）および推定ＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位モチーフＡ（Ｐループ、二重下線）の存在を含む、この解析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ由来およびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１１０１】
（実施例５１）
以下のＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４３１）：
【１１０２】
【化７７５】

これはアミノ酸配列（配列番号４３２；ＯＲＦ１０９）に対応する：
【１１０３】
【化７７６】

さらなる研究は以下のＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号４３３）：
【１１０４】
【化７７７】

これはアミノ酸配列（配列番号４３４；ＯＲＦ１０９−１）に対応する：
【１１０５】
【化７７８】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１０９ａ）と１４７ａａの重複部分にわたって９５．９％の同一性を示す：
【１１０６】
【化７７９】

【１１０７】
【化７８０】

完全長ＯＲＦ１０９ａヌクレオチド配列（配列番号４３５）は以下である：
【１１０８】
【化７８１】

これはアミノ酸配列（配列番号４３６）を有するタンパク質をコードする：
【１１０９】
【化７８２】

ＯＲＦ１０９ａおよびＯＲＦ１０９−１は２６２ａａの重複部分において９９．２％の同一性を示す：
【１１１０】
【化７８３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０９はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０９．ｎｇ）と２３１ａａの重複部分にわたって９８．３％の同一性を示す：
【１１１１】
【化７８４】

ＯＲＦ１０９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４３７）は、アミノ酸配列（配列番号４３８）を有するタンパク質をコードすると予測された：
【１１１２】
【化７８５】

さらなる研究は、以下の淋菌ＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号４３９）：
【１１１３】
【化７８６】

これはアミノ酸配列（配列番号４４０；ＯＲＦ１０９ｎｇ−１）に対応する：
【１１１４】
【化７８７】

ＯＲＦ１０９ｎｇ−１およびＯＲＦ１０９−１は２６２ａａの重複部分にわたって９８．９％の同一性を示す：
【１１１５】
【化７８８】

【１１１６】
【化７８９】

さらに、ＯＲＦ１０９ｎｇ−１は、仮定のＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓタンパク質に対して相同性を示す：
【１１１７】
【化７９０】

淋菌のタンパク質において推定リーダー配列（二重下線）およびいくつかの推定膜貫通ドメイン（一重下線）の存在を含む、この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ由来およびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープは、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１１１８】
（実施例５２）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４４１）：
【１１１９】
【化７９１】

【１１２０】
【化７９２】

これはアミノ酸配列（配列番号４４２；ＯＲＦ１１０）に対応する：
【１１２１】
【化７９３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来のＯＲＦ８８ａとの相同性）
ＯＲＦ１１０は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ８８ａと１８８ａａの重複部分にわたって９１．５％の同一性を示す：
【１１２２】
【化７９４】

しかし、ＯＲＦ８８およびＯＲＦ１１０は２つの異なる同種のタンパク質フラグメントを示すため、整列しない。
【１１２３】
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１０はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１１０．ｎｇ）と２１１ａａの重複部分にわたって８８．６％の同一性を示す：
【１１２４】
【化７９５】

【１１２５】
【化７９６】

完全長ＯＲＦ１１０ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４４３）は、アミノ酸配列（配列番号４４４）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【１１２６】
【化７９７】

淋菌のタンパク質における推定膜貫通ドメインに基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１１２７】
（実施例５３）
以下のＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４４５）：
【１１２８】
【化７９８】

これはアミノ酸配列（配列番号４４６；ＯＲＦ１１１）に対応する：
【１１２９】
【化７９９】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示す：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１１１ａ）と３５１ａａ重複部分にわたって９６．９％の同一性を示す：
【１１３０】
【化８００】

完全長ＯＲＦ１１１ａヌクレオチド配列（配列番号４４７）は以下である：
【１１３１】
【化８０１】

これはアミノ酸配列（配列番号４４８）を有するタンパク質をコードする：
【１１３２】
【化８０２】

【１１３３】
【化８０３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１１はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ１１１．ｎｇ）と３５１ａａの重複部分にわたって９６．６％の同一性を示す：
【１１３４】
【化８０４】

完全長ＯＲＦ１１１ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４４９）は以下である：
【１１３５】
【化８０５】

【１１３６】
【化８０６】

これはアミノ酸配列（配列番号４５０）を有するタンパク質をコードする：
【１１３７】
【化８０７】

これはＨ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ由来の仮定のリポタンパク質前駆体との相同性を示す：
【１１３８】
【化８０８】

この解析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１１３９】
（実施例５４）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４５１）：
【１１４０】
【化８０９】

【１１４１】
【化８１０】

これはアミノ酸配列（配列番号４５２；ＯＲＦ３５）に対応する：
【１１４２】
【化８１１】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（受託番号Ａ３２２４７）の推定分泌ＶｉｒＧホモログとの相同性）
ＯＲＦおよびｖｉｒｇ−ｈタンパク質は、２６１ａａの重複部分において５１％の同一性を示す：
【１１４３】
【化８１２】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３５は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ３５ａ）と２５９ａａの重複部分にわたって９６．９％の同一性を示す：
【１１４４】
【化８１３】

【１１４５】
【化８１４】

完全長ＯＲＦ３５ａヌクレオチド配列（配列番号４５３）は以下である：
【１１４６】
【化８１５】

これはアミノ酸配列（配列番号４５４）を有するタンパク質をコードする：
【１１４７】
【化８１６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ３５は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ３５ｎｇｈ）と２６１ａａの重複部分にわたって５１．７％の同一性を示す：
【１１４８】
【化８１７】

【１１４９】
【化８１８】

部分的なＯＲＦ３５ｎｇｈのヌクレオチド配列（配列番号４５５）は、部分的なアミノ酸配列（配列番号４５６）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【１１５０】
【化８１９】

この予測に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得る。
【１１５１】
（実施例５５）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４５７）：
【１１５２】
【化８２０】

これはアミノ酸配列（配列番号４５８；ＯＲＦ４６）に対応する：
【１１５３】
【化８２１】

さらなる研究は、さらに部分的なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号４５９）：
【１１５４】
【化８２２】

【１１５５】
【化８２３】

これはアミノ酸配列（配列番号４６０；ＯＲＦ４６−１）に対応する：
【１１５６】
【化８２４】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ４６はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予測されるＯＲＦ（ＯＲＦ４６ｎｇ）と１１１ａａの重複部分にわたって９８．２％の同一性を示す：
【１１５７】
【化８２５】

部分的なＯＲＦ４６ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４６１）は、部分的なアミノ酸配列（配列番号４６２）を有するタンパク質をコードすると予測される：
【１１５８】
【化８２６】

さらなる研究は完全な淋菌のＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号４６３）：
【１１５９】
【化８２７】

【１１６０】
【化８２８】

これはアミノ酸配列（配列番号４６４；ＯＲＦ４６ｎｇ−１）に対応する：
【１１６１】
【化８２９】

ＯＲＦ４６ｎｇ−１およびＯＲＦ４６−１は２２７ａａの重複部分において９４．７％の同一性を示す。
【１１６２】
【化８３０】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ４９ｎｇ−１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ４６ａ）と４８６ａａの重複部分にわたって８７．４％の同一性を示す：
【１１６３】
【化８３１】

【１１６４】
【化８３２】

完全長ＯＲＦ４６ａＤＮＡ配列（配列番号４６５）は以下である：
【１１６５】
【化８３３】

【１１６６】
【化８３４】

これはアミノ酸配列（配列番号４６６）に対応する：
【１１６７】
【化８３５】

淋菌のタンパク質（特に付着因子）におけるＲＧＤ配列の存在を含む、この解析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断薬のため、あるいは抗体産生のための有用な抗原であり得ることが予測される。
【１１６８】
（実施例５６）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号４６７）：
【１１６９】
【化８３６】

これはアミノ酸配列（配列番号４６８；ＯＲＦ４８）に対応する：
【１１７０】
【化８３７】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号４６９）：
【１１７１】
【化８３８】

【１１７２】
【化８３９】

これはアミノ酸配列（配列番号４７０；ＯＲＦ４８−１）に対応する：
【１１７３】
【化８４０】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予測されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ４８は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ４８ａ）と１１９ａａの重複部分にわたって９４．１％の同一性を示す：
【１１７４】
【化８４１】

完全長ＯＲＦ４８ａヌクレオチド配列（配列番号４７１）は以下である：
【１１７５】
【化８４２】

【１１７６】
【化８４３】

これはアミノ酸配列（配列番号４７２）を有するタンパク質をコードする：
【１１７７】
【化８４４】

ＯＲＦ４８ａおよびＯＲＦ４８−１は４７２ａａの重複部分において９６．８％の同一性を示す：
【１１７８】
【化８４５】

【１１７９】
【化８４６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ４８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ４８ｎｇ）と１１９アミノ酸の重複にわたって９７．５％の同一性を示す：
【１１８０】
【化８４７】

このＯＲＦ４８ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４７３）は、アミノ酸配列（配列番号４７４）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【１１８１】
【化８４８】

さらなる仕事は、完全な淋菌ＤＮＡ配列（配列番号４７５）を同定した：
【１１８２】
【化８４９】

これはアミノ酸配列（配列番号４７６；ＯＲＦ４８ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【１１８３】
【化８５０】

ＯＲＦ４８ｎｇ−１およびＯＲＦ４８−１は、４７２アミノ酸の重複にわたって９７．９％の同一性を示す。
【１１８４】
【化８５１】

淋菌タンパク質における推定リーダー配列（二重下線）および２つの推定膜貫通ドメイン（一重下線）の存在を含むこの分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のための有用な抗原であり得ることが推定される。
【１１８５】
（実施例５７）
以下の部分ＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号４７７）において同定した：
【１１８６】
【化８５２】

これはアミノ酸配列（配列番号４７８；ＯＲＦ５３）に対応する：
【１１８７】
【化８５３】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号４７９）を明らかにした：
【１１８８】
【化８５４】

これはアミノ酸配列（配列番号４８０；ＯＲＦ５３−１）に対応する：
【１１８９】
【化８５５】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ５３はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ５３ａ）と１３９アミノ酸配列の重複にわたって９３．５％の同一性を示す：
【１１９０】
【化８５６】

この完全な長さのＯＲＦ５３ａヌクレオチド配列（配列番号４８１）は：
【１１９１】
【化８５７】

である。
【１１９２】
これはアミノ酸配列（配列番号４８２）を有するタンパク質をコードする：
【１１９３】
【化８５８】

ＯＲＦ５３ａはＯＲＦ５３−１と４１７アミノ酸の重複にわたって１００％の同一性を示す：
【１１９４】
【化８５９】

【１１９５】
【化８６０】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ５３はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ５３ｎｇ）と１３９アミノ酸の重複にわたって９２．１％の同一性を示す：
【１１９６】
【化８６１】

ＯＲＦ５３ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４８３）は、アミノ酸配列（配列番号４８４）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【１１９７】
【化８６２】

さらなる分析は、さらなる部分ＤＮＡ淋菌配列（配列番号４８５）を明らかにした：
【１１９８】
【化８６３】

【１１９９】
【化８６４】

これはアミノ酸配列（配列番号４８６；ＯＲＦ５３ｎｇ−１）に対応する：
【１２００】
【化８６５】

ＯＲＦ５３ｎｇ−１およびＯＲＦ５３−１は、３３６個のアミノ酸配列の重複にわたって９４．０％の同一性を示す：
【１２０１】
【化８６６】

淋菌タンパク質において推定リーダー配列（二重下線）およびいくつかの推定膜貫通ドメイン（一重下線）の存在を含むこの分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来タンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のための有用な抗原であり得ることが推定される。
【１２０２】
（実施例５８）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号４８７）において同定した：
【１２０３】
【化８６７】

これはアミノ酸配列（配列番号４８８；ＯＲＦ５８）に対応する：
【１２０４】
【化８６８】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号４８９）を明らかにした：
【１２０５】
【化８６９】

【１２０６】
【化８７０】

これはアミノ酸配列（配列番号４９０；ＯＲＦ５８−１）に対応する：
【１２０７】
【化８７１】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、示された膜貫通領域を推定し、そしてまた以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ５８はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ５８ａ）と１３９個のアミノ酸配列の重複にわたって９６．６％の同一性を示す：
【１２０８】
【化８７２】

この完全な長さのＯＲＦ５３ａヌクレオチド配列（配列番号４９１）は：
【１２０９】
【化８７３】

である。
【１２１０】
これはアミノ酸配列（配列番号４９２）を有するタンパク質をコードする：
【１２１１】
【化８７４】

【１２１２】
【化８７５】

ＯＲＦ５８ａおよびＯＲＦ５８−１は、１０１４個のアミノ酸の重複にわたって９６．６％の同一性を示す：
【１２１３】
【化８７６】

【１２１４】
【化８７７】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ５８はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ５８ｎｇ）と９アミノ酸の重複にわたって完全な同一性を示す：
【１２１５】
【化８７８】

ＯＲＦ５８ｎｇヌクレオチド配列（配列番号４９３）は、部分アミノ酸配列（配列番号４９４）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【１２１６】
【化８７９】

【１２１７】
【化８８０】

この部分淋菌配列は、推定膜貫通領域および推定ＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位モチーフＡ（Ｐ−ループ；二重下線）を含む。さらに、それはＥ．ｃｏｌｉのＦＴＳＫ細胞分裂タンパク質に相同なドメインを有する。ＯＲＦ５８ｎｇおよびＦｔｓＫ（登録番号ｐ４６８８９）の整合は、４５９個の重複にわたって６５％のアミノ酸同一性を示す：
【１２１８】
【化８８１】

ＯＲＦ５８ｎｇに関するさらなる仕事は、完全な淋菌ＤＮＡ配列が（配列番号４９５）であることを明らかにした：
【１２１９】
【化８８２】

【１２２０】
【化８８３】

これはアミノ酸配列（配列番号４９６；ＯＲＦ５８ｎｇ−１）に対応する：
【１２２１】
【化８８４】

ＯＲＦ５８ｎｇ−１およびＯＲＦ５８−１は、１０１４個のアミノ酸の重複にわたって９７．２％の同一性を示す：
【１２２２】
【化８８５】

【１２２３】
【化８８６】

さらに、ＯＲＦ５８ｎｇ−１は、Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質、ＦｔｓＫに対する有意な相同性を示す：
【１２２４】
【化８８７】

この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１２２５】
（実施例５９）
以下の部分的なＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号４９７）において同定した：
【１２２６】
【化８８８】

これはアミノ酸配列（配列番号４９８；ＯＲＦ１０１）に対応する：
【１２２７】
【化８８９】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号４９９）を明らかにした：
【１２２８】
【化８９０】

これはアミノ酸配列（配列番号５００；ＯＲＦ１０１−１）に対応する：
【１２２９】
【化８９１】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１０１ａ）と５７個のアミノ酸の重複にわたって９１．２％の同一性および６９個のアミノ酸の重複にわたって９５．７％の同一性を示す：
【１２３０】
【化８９２】

この完全な長さのＯＲＦ１０１ａヌクレオチド配列（配列番号５０１）は：
【１２３１】
【化８９３】

である。
【１２３２】
これはアミノ酸配列（配列番号５０２）を有するタンパク質をコードする：
【１２３３】
【化８９４】

ＯＲＦ１０１ａおよびＯＲＦ１０１−１は、３７１個のアミノ酸の重複にわたって９５．４％の同一性を示す：
【１２３４】
【化８９５】

【１２３５】
【化８９６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０１は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１０１ｎｇ）とＮ末端ドメインにおける５７個のアミノ酸の重複にわたって９６．５％の同一性、Ｃ末端ドメインにおける６１個のアミノ酸の重複にわたって９５．１％の同一性をそれぞれ示す：
【１２３６】
【化８９７】

【１２３７】
【化８９８】

ＯＲＦ１０１ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５０３）は、部分アミノ酸配列（配列番号５０４）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【１２３８】
【化８９９】

さらなる仕事は、完全なヌクレオチド配列（配列番号５０５）を明らかにした：
【１２３９】
【化９００】

これはアミノ酸配列（配列番号５０６；ＯＲＦ１０１ｎｇ−１）に対応する：
【１２４０】
【化９０１】

ＯＲＦ１０１ｎｇ−１およびＯＲＦ１０１−１は、３７１個のアミノ酸の重複にわたって９７．６％の同一性を示す：
【１２４１】
【化９０２】

淋菌タンパク質において推定リーダー配列（二重下線）およびいくつかの推定膜貫通ドメイン（一重下線）の存在を含むこの分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１２４２】
（実施例６０）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号５０７）において同定した：
【１２４３】
【化９０３】

これはアミノ酸配列（配列番号５０８；ＯＲＦ１１３）に対応する：
【１２４４】
【化９０４】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのｐｓｐＡ推定分泌タンパク質（登録番号ＡＦ０３０９４１）との相同性）
ＯＲＦおよびｐｓｐＡは、１７９個のアミノ酸重複にわたって４４％のアミノ酸の同一性を示す：
【１２４５】
【化９０５】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１３は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１１３ｎｇ）とＮ末端部分における５２個のアミノ酸の重複にわたって８６．５％の同一性、Ｃ末端部分における１７個のアミノ酸の重複にわたって９４．１％の同一性を示す：
【１２４６】
【化９０６】

完全長のＯＲＦ１１３ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５０９）は、アミノ酸配列（配列番号５１０）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【１２４７】
【化９０７】

【１２４８】
【化９０８】

この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１２４９】
（実施例６１）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号５１１）において同定した：
【１２５０】
【化９０９】

これはアミノ酸配列（配列番号５１２；ＯＲＦ１１５）に対応する：
【１２５１】
【化９１０】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ由来のｐｓｐＡ推定分泌タンパク質（登録番号ＡＦ０３０９４１）との相同性）
ＯＲＦ１１５およびｐｓｐＡタンパク質は、３２５個のアミノ酸の重複にわたって５０％のアミノ酸同一性を示す：
【１２５２】
【化９１１】

【１２５３】
【化９１２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１５は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１１５ｎｇ）と３３４個のアミノ酸の重複にわたって９１．９％の同一性を示す：
【１２５４】
【化９１３】

ＯＲＦ１１５ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５１３）は、アミノ酸配列（配列番号５１４）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【１２５５】
【化９１４】

さらなる仕事は、以下の部分ＤＮＡ配列（配列番号５１５）を明らかにした：
【１２５６】
【化９１５】

【１２５７】
【化９１６】

これはアミノ酸配列（配列番号５１６；ＯＲＦ１１５ｎｇ−１）に対応する：
【１２５８】
【化９１７】

この淋菌タンパク質（ＯＲＦ１１５ｎｇ−１）は、３３４個のアミノ酸にわたってＯＲＦ１１５と９１．９％の同一性を示す：
【１２５９】
【化９１８】

【１２６０】
【化９１９】

さらに、それはデータベース中の分泌Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓタンパク質との相同性を示す：
【１２６１】
【化９２０】

【１２６２】
【化９２１】

この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１２６３】
（実施例６２）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号５１７）：
【１２６４】
【化９２２】

これはアミノ酸配列（配列番号５１８；ＯＲＦ１１７）に対応する：
【１２６５】
【化９２３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのｐｓｐＡ推定分泌タンパク質（登録番号ＡＦ０３０９４１）との相同性）
ＯＲＦ１１７およびｐｓｐＡタンパク質は、２２４個のアミノ酸重複にわたって４５％のアミノ酸同一性を示す：
【１２６６】
【化９２４】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１１７ｎｇ）と２３０個のアミノ酸の重複にわたって９０％の同一性を示す：
【１２６７】
【化９２５】

ＯＲＦ１１７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５１９）は、アミノ酸配列（配列番号５２０）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【１２６８】
【化９２６】

さらなる仕事は、以下の淋菌の部分ＤＮＡ配列（配列番号５２１）を明らかにした：
【１２６９】
【化９２７】

【１２７０】
【化９２８】

これはアミノ酸配列（配列番号５２２；ＯＲＦ１１７ｎｇ−１）に対応する：
【１２７１】
【化９２９】

ＯＲＦ１１７ｎｇ−１は、ＯＲＦ１１７と２３０個のアミノ酸にわたって同じ９０％の同一性を示す。さらに、それはデータベース中の分泌Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓタンパク質との相同性を示す：
【１２７２】
【化９３０】

【１２７３】
【化９３１】

この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１２７４】
（実施例６３）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号５２３）において同定した：
【１２７５】
【化９３２】

これはアミノ酸配列（配列番号５２４；ＯＲＦ１１９）に対応する：
【１２７６】
【化９３３】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号５２５）を明らかにした：
【１２７７】
【化９３４】

【１２７８】
【化９３５】

これはアミノ酸配列（配列番号５２６；ＯＲＦ１１９−１）に対応する：
【１２７９】
【化９３６】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１１９ａ）と１７５個のアミノ酸配列の重複にわたって９３．７％の同一性を示す：
【１２８０】
【化９３７】

この完全長のＯＲＦ１１９ａヌクレオチド配列（配列番号５２７）は：
【１２８１】
【化９３８】

【１２８２】
【化９３９】

である。
【１２８３】
これはアミノ酸配列（配列番号５２８）を有するタンパク質をコードする：
【１２８４】
【化９４０】

ＯＲＦ１１９ａおよびＯＲＦ１１９−１は、４２８個のアミノ酸の重複にわたって９８．６％の同一性を示す：
【１２８５】
【化９４１】

【１２８６】
【化９４２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１９は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１１９ｎｇ）と１７５個のアミノ酸の重複にわたって９３．１％の同一性を示す：
【１２８７】
【化９４３】

この完全長のＯＲＦ１１９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５２９）は：
【１２８８】
【化９４４】

である。
【１２８９】
これはアミノ酸配列（配列番号５３０）を有するタンパク質をコードする：
【１２９０】
【化９４５】

ＯＲＦ１１９ｎｇおよびＯＲＦ１１９−１は、４２８個のアミノ酸の重複にわたって９８．４％の同一性を示す：
【１２９１】
【化９４６】

【１２９２】
【化９４７】

淋菌タンパク質における推定リーダー配列の存在を含むこの分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１２９３】
（実施例６４）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号５３１）：
【１２９４】
【化９４８】

これはアミノ酸配列（配列番号５３２；ＯＲＦ１３４）に対応する：
【１２９５】
【化９４９】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号５３３）を明らかにした：
【１２９６】
【化９５０】

これはアミノ酸配列（配列番号５３４；ＯＲＦ１３４−１）に対応する：
【１２９７】
【化９５１】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｅ．ｃｏｌｉの仮定タンパク質ｏ６４８（登録番号ＡＥ０００１８９）との相同性）
ＯＲＦ１３４およびｏ６４８タンパク質は、１５３個のアミノ酸重複にわたって４５％のアミノ酸同一性を示す。
【１２９８】
【化９５２】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３４はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３４ａ）と１５４個のアミノ酸配列の重複にわたって９８．７％の同一性を示す：
【１２９９】
【化９５３】

【１３００】
【化９５４】

この完全長のＯＲＦ１３４ａヌクレオチド配列（配列番号５３５）は：
【１３０１】
【化９５５】

である。
【１３０２】
これはアミノ酸配列（配列番号５３６）を有するタンパク質をコードする：
【１３０３】
【化９５６】

ＯＲＦ１３４ａおよびＯＲＦ１３４−１は、３８８個のアミノ酸の重複にわたって１００％の同一性を示す：
【１３０４】
【化９５７】

【１３０５】
【化９５８】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３４は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１３４ｎｇ）と１５４アミノ酸の重複にわたって９６．８％の同一性を示す：
【１３０６】
【化９５９】

この完全長のＯＲＦ１３４ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５３７）は、
【１３０７】
【化９６０】

である。
【１３０８】
これはアミノ酸配列（配列番号５３８）を有するタンパク質をコードする：
【１３０９】
【化９６１】

【１３１０】
【化９６２】

ＯＲＦ１３４ｎｇおよびＯＲＦ１３４−１は、３８８個のアミノ酸の重複にわたって９７．９％の同一性を示す：
【１３１１】
【化９６３】

ＯＲＦ１３４ｎｇはまた、Ｅ．ｃｏｌｉ ＡＢＣ輸送担体に対する相同性を示す：
【１３１２】
【化９６４】

淋菌タンパク質における推定リーダー配列および膜貫通領域の存在を含むこの分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起について有用な抗原であり得ることが推定される。
【１３１３】
（実施例６５）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号５３９）において同定した：
【１３１４】
【化９６５】

これはアミノ酸配列（配列番号５４０；ＯＲＦ１３５）に対応する：
【１３１５】
【化９６６】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号５４１）を明らかにした：
【１３１６】
【化９６７】

これはアミノ酸配列（配列番号５４２；ＯＲＦ１３５−１）に対応する：
【１３１７】
【化９６８】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３５は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３５ａ）と１９７個のアミノ酸配列の重複にわたって９９．０％の同一性を示す：
【１３１８】
【化９６９】

この完全長のＯＲＦ１３５ａヌクレオチド配列（配列番号５４３）は：
【１３１９】
【化９７０】

である。
【１３２０】
これはアミノ酸配列（配列番号５４４）を有するタンパク質をコードする：
【１３２１】
【化９７１】

ＯＲＦ１３５ａおよびＯＲＦ１３５−１は、３００個のアミノ酸の重複にわたって９９．３％の同一性を示す：
【１３２２】
【化９７２】

【１３２３】
【化９７３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３５は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１３５ｎｇ）と２０１個のアミノ酸の重複にわたって９７％の同一性を示す：
【１３２４】
【化９７４】

ＯＲＦ１３５ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５４５）は、アミノ酸配列（配列番号５４６）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【１３２５】
【化９７５】

さらなる仕事は、以下の淋菌配列（配列番号５４７）を明らかにした：
【１３２６】
【化９７６】

【１３２７】
【化９７７】

これはアミノ酸配列（配列番号５４８；ＯＲＦ１３５ｎｇ−１）に対応する：
【１３２８】
【化９７８】

ＯＲＦ１３５ｎｇ−１およびＯＲＦ１３５−１は、３００個のアミノ酸の重複にわたって９７．０％の同一性を示す：
【１３２９】
【化９７９】

淋菌タンパク質のいくつかの推定膜貫通ドメインの存在を含むこの分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１３３０】
（実施例６６）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号５４９）において同定した：
【１３３１】
【化９８０】

これはアミノ酸配列（配列番号５５０；ＯＲＦ１３６）に対応する：
【１３３２】
【化９８１】

【１３３３】
【化９８２】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号５５１）を明らかにした：
【１３３４】
【化９８３】

これはアミノ酸配列（配列番号５５２；ＯＲＦ１３６−１）に対応する：
【１３３５】
【化９８４】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３６は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３６ａ）と２３７個のアミノ酸の重複にわたって７１．７％の同一性を示す：
【１３３６】
【化９８５】

この完全長のＯＲＦ１３６ａヌクレオチド配列（配列番号５５３）は：
【１３３７】
【化９８６】

【１３３８】
【化９８７】

である。
【１３３９】
これはアミノ酸配列（配列番号５５４）を有するタンパク質をコードする：
【１３４０】
【化９８８】

ＯＲＦ１３６ａおよびＯＲＦ１３６−１は、２３８個のアミノ酸の重複にわたって７３．１％の同一性を示す：
【１３４１】
【化９８９】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３６は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１３６ｎｇ）と２３４個のアミノ酸の重複にわたって９２．３％の同一性を示す：
【１３４２】
【化９９０】

この完全長のＯＲＦ１３６ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５５５）は：
【１３４３】
【化９９１】

【１３４４】
【化９９２】

である。
【１３４５】
これはアミノ酸配列（配列番号５５６）を有するタンパク質をコードする：
【１３４６】
【化９９３】

ＯＲＦ１３６ｎｇおよびＯＲＦ１３６−１は、２３５個のアミノ酸の重複にわたって９３．６％の同一性を示す：
【１３４７】
【化９９４】

淋菌タンパク質における推定膜貫通ドメインの存在に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１３４８】
（実施例６７）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号５５７）：
【１３４９】
【化９９５】

これはアミノ酸配列（配列番号５５８；ＯＲＦ１３７）に対応する：
【１３５０】
【化９９６】

さらなる仕事は、完全なヌクレオチド配列（配列番号５５９）を明らかにした：
【１３５１】
【化９９７】

これはアミノ酸配列（配列番号５６０；ＯＲＦ１３７−１）に対応する：
【１３５２】
【化９９８】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３７は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３７ａ）と１４９個のアミノ酸配列の重複にわたって９３．３％の同一性を示す：
【１３５３】
【化９９９】

この完全長のＯＲＦ１３７ａヌクレオチド配列（配列番号５６１）は：
【１３５４】
【化１０００】

【１３５５】
【化１００１】

である。
【１３５６】
これはアミノ酸配列（配列番号５６２）を有するタンパク質をコードする：
【１３５７】
【化１００２】

ＯＲＦ１３７ａおよびＯＲＦ１３７−１は、３００個のアミノ酸の重複にわたって９７．３％の同一性を示す：
【１３５８】
【化１００３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１３７ｎｇ）と１４９個のアミノ酸の重複にわたって８９．９％の同一性を示す：
【１３５９】
【化１００４】

この完全長のＯＲＦ１３７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５６３）は：
【１３６０】
【化１００５】

【１３６１】
【化１００６】

である。
【１３６２】
これはアミノ酸配列（配列番号５６４）を有するタンパク質をコードする：
【１３６３】
【化１００７】

ＯＲＦ１３７ｎｇおよびＯＲＦ１３７−１は、３００個のアミノ酸の重複にわたって９６．０％の同一性を示す：
【１３６４】
【化１００８】

淋菌タンパク質における原核生物の推定膜リポタンパク質脂質付着部位の存在に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１３６５】
（実施例６８）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号５６５）において同定した：
【１３６６】
【化１００９】

これはアミノ酸配列（配列番号５６６；ＯＲＦ１３８）に対応する：
【１３６７】
【化１０１０】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号５６７）を明らかにした：
【１３６８】
【化１０１１】

これはアミノ酸配列（配列番号５６８；ＯＲＦ１３８−１）に対応する：
【１３６９】
【化１０１２】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３８は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３８ａ）と１２３個のアミノ酸の重複にわたって９９．２％の同一性を示す：
【１３７０】
【化１０１３】

この完全長のＯＲＦ１３８ａヌクレオチド配列（配列番号５６９）は：
【１３７１】
【化１０１４】

【１３７２】
【化１０１５】

である。
【１３７３】
これはアミノ酸配列（配列番号５７０）を有するタンパク質をコードする：
【１３７４】
【化１０１６】

ＯＲＦ１３８ａおよびＯＲＦ１３８−１は、２９８個のアミノ酸の重複にわたって９９．７％の同一性を示す：
【１３７５】
【化１０１７】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１３８ｎｇ）と１２個のアミノ酸の重複にわたって９４．３％の同一性を示す：
【１３７６】
【化１０１８】

この完全長のＯＲＦ１３８ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５７１）は：
【１３７７】
【化１０１９】

【１３７８】
【化１０２０】

である。
【１３７９】
これはアミノ酸配列（配列番号５７２）を有するタンパク質をコードする：
【１３８０】
【化１０２１】

ＯＲＦ１３８ｎｇおよびＯＲＦ１３８−１は、２９９個のアミノ酸の重複にわたって９４．３％の同一性を示す：
【１３８１】
【化１０２２】

さらに、ＯＲＦ１３８ｎｇは、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ由来のｈｔｒＢタンパク質と相同的である：
【１３８２】
【化１０２３】

淋菌タンパク質において推定膜貫通ドメインの存在を含むこの分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１３８３】
上記のように、ｐＧｅｘベクターにＯＲＦ１３８−１（５７ｋＤａ）をクローン化し、そして大腸菌で発現した。ＳＤＳ−ＰＡＧＥによってタンパク質発現およびタンパク質精製の産物を分析した。図１４Ａは、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示す。精製されたＧＳＴ融合タンパク質を使用しマウスを免疫した。この血清をＥＬＩＳＡ（陽性結果）およびＦＡＣＳ分析に使用した（図１４Ｂ）。これらの実験は、ＯＲＦ１３８−１が表面に暴露されたタンパク質であり、そしてそれは有用な免疫原であることを確認する。
【１３８４】
（実施例６９）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号５７３）において同定した：
【１３８５】
【化１０２４】

これはアミノ酸配列（配列番号５７４；ＯＲＦ１３９）に対応する：
【１３８６】
【化１０２５】

さらなる仕事は完全なヌクレオチド配列（配列番号５７５）を明らかにした：
【１３８７】
【化１０２６】

これはアミノ酸配列（配列番号５７６；ＯＲＦ１３９−１）に対応する：
【１３８８】
【化１０２７】

【１３８９】
【化１０２８】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３９ａ）と１８９個のアミノ酸の重複にわたって９４．７％の同一性を示す：
【１３９０】
【化１０２９】

この完全長のＯＲＦ１３９ａヌクレオチド配列（配列番号５７７）は：
【１３９１】
【化１０３０】

【１３９２】
【化１０３１】

である。
【１３９３】
これはアミノ酸配列（配列番号５７８）を有するタンパク質をコードする：
【１３９４】
【化１０３２】

ＯＲＦ１３９ａおよびＯＲＦ１３９−１は、５１４個のアミノ酸の重複にわたって９６．５％の同一性を示す：
【１３９５】
【化１０３３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３９は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１３９ｎｇ）と１８９個のアミノ酸の重複にわたって９５．２％の同一性を示す：
【１３９６】
【化１０３４】

【１３９７】
【化１０３５】

この完全長のＯＲＦ１３９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号５７９）は、アミノ酸配列（配列番号５８０）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【１３９８】
【化１０３６】

さらなる仕事は変異体の淋菌ＤＮＡ配列（配列番号５８１）を明らかにした：
【１３９９】
【化１０３７】

これはアミノ酸配列（配列番号５８２；ＯＲＦ１３９ｎｇ−１）に対応する：
【１４００】
【化１０３８】

ＯＲＦ１３９ｎｇ−１およびＯＲＦ１３９−１は、５１３個のアミノ酸の重複にわたって９５．９％の同一性を示す：
【１４０１】
【化１０３９】

淋菌タンパク質における推定結合タンパク質依存性輸送系内膜成分記号（下線）の存在に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断、あるいは抗体の惹起のための有用な抗原であり得ることが推定される。
【１４０２】
（実施例７０）
以下の部分ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号５８３）：
【１４０３】
【化１０４０】

これはアミノ酸配列（配列番号５８４；ＯＲＦ１４０）に対応する：
【１４０４】
【化１０４１】

さらなる仕事は、完全なヌクレオチド配列（配列番号５８５）を明らかにした：
【１４０５】
【化１０４２】

【１４０６】
【化１０４３】

これはアミノ酸配列（配列番号５８６；ＯＲＦ１４０−１）に対応する：
【１４０７】
【化１０４４】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（株Ａ）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４０は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓの株Ａ由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１４０ａ）と８７個のアミノ酸配列の重複にわたって９５．４％の同一性を示す：
【１４０８】
【化１０４５】

この完全長のＯＲＦ１４０ａヌクレオチド配列（配列番号５８７）は：
【１４０９】
【化１０４６】

【１４１０】
【化１０４７】

である。
【１４１１】
これはアミノ酸配列（配列番号５８８）を有するタンパク質をコードする：
【１４１２】
【化１０４８】

ＯＲＦ１４０ａおよびＯＲＦ１４０−１は、４６１個のアミノ酸の重複にわたって９９．８％の同一性を示す：
【１４１３】
【化１０４９】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４０は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１４０ｎｇ）と８７アミノ酸の重複部分に渡って９２％の同一性を示す：
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ：
【１４１４】
【化１０５０】

完全長ＯＲＦ１４０ｎｇのヌクレオチド配列（配列番号５８９）は、アミノ酸配列（配列番号５９０）を有するタンパク質をコードすることが推定された：
【１４１５】
【化１０５１】

さらなる研究は、改変型淋菌ＤＮＡ配列（配列番号５９１）を明らかにした：
【１４１６】
【化１０５２】

これはアミノ酸配列（配列番号５９２；ＯＲＦ１４０ｎｇ−１）に相当する：
【１４１７】
【化１０５３】

ＯＲＦ１４０ｎｇ−１およびＯＲＦ１４０−１は、４６１アミノ酸の重複部分に渡って９６．３％の同一性を示す：
【１４１８】
【化１０５４】

【１４１９】
【化１０５５】

さらに、ＯＲＦ１４０ｎｇ−１は、Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質に対して相同性である：
【１４２０】
【化１０５６】

この分析（淋菌タンパク質における推定リーダー配列（二重下線を附す）およびいくつかの推定膜貫通ドメイン（１重下線を附す）の存在の同定を含む）に基いて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅならびにそれらのエピトープに由来するタンパク質が、ワクチンまたは診断について、あるいは抗体を惹起するために有用な抗原であり得ると推定される。
【１４２１】
（実施例７１）
以下の部分的ＤＮＡ配列はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓと同一であった（配列番号５９３）：
【１４２２】
【化１０５７】

これはアミノ酸配列（配列番号５９４；ＯＲＦ１４１）に相当する：
【１４２３】
【化１０５８】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列（配列番号５９５）を明らかにした：
【１４２４】
【化１０５９】

これはアミノ酸配列（配列番号５９６；ＯＲＦ１４１−１）に相当する：
【１４２５】
【化１０６０】

【１４２６】
【化１０６１】

このアミノ酸配列のコンピューター分析から以下の結果を得た。
【１４２７】
（Ｎ．Ｍｅｎｉｎｇｏｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦ配列との相同性）
ＯＲＦ１４１は、Ｎ．ＭｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１４１ａ）と１４０アミノ酸の重複部分に渡って９５．０％の同一性を示す：
【１４２８】
【化１０６２】

完全長ＯＲＦ１４１ａのヌクレオチド配列（配列番号５９７）は以下である：
【１４２９】
【化１０６３】

【１４３０】
【化１０６４】

これはアミノ酸配列（配列番号５９８）を有するタンパク質をコードする：
【１４３１】
【化１０６５】

ＯＲＦ１４１ａおよびＯＲＦ１４１−１は５５３アミノ酸の重複部分において９８．２％の同一性を示す：
【１４３２】
【化１０６６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４１は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１４１ｎｇ）と１４１アミノ酸の重複部分に渡って９５％の同一性を示す：
【１４３３】
【化１０６７】

【１４３４】
【化１０６８】

ＯＲＦ１４１ｎｇのヌクレオチド配列（配列番号５９９）は、アミノ酸配列（配列番号６００）を有するタンパク質をコードすることが推定された。
【１４３５】
【化１０６９】

さらなる研究は、以下の淋菌ＤＮＡ配列（配列番号６０１）を明らかにした：
【１４３６】
【化１０７０】

これはアミノ酸配列（配列番号６０２；ＯＲＦ１４１ｎｇ−１）に相当する：
【１４３７】
【化１０７１】

【１４３８】
【化１０７２】

ＯＲＦ１４１ｎｇ−１およびＯＲＦ１４１−１は、５５３アミノ酸の重複部分において９７．５％の同一性を示す：
【１４３９】
【化１０７３】

淋菌タンパク質におけるいくつかの推定膜貫通ドメインの存在に基づいて、Ｎ．ＭｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏａｅならびにそれらのエピトープに由来するタンパク質は、ワクチンもしくは診断について、または抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１４４０】
（実施例７２）
以下の部分的ＤＮＡ配列（配列番号６０３）はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された：
【１４４１】
【化１０７４】

これはアミノ酸配列（配列番号６０４；ＯＲＦ１４２）に相当する：
【１４４２】
【化１０７５】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列（配列番号６０５）を明らかにした：
【１４４３】
【化１０７６】

これはアミノ酸配列（配列番号６０６；ＯＲＦ１４２−１）に相当する：
【１４４４】
【化１０７７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析から以下の結果を得た：
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１４２ｎｇ）と５９アミノ酸の重複部分に渡って８８．１％の同一性を示す：
【１４４５】
【化１０７８】

全長ＯＲＦ１４２ｎｇのヌクレオチド配列（配列番号６０７）は以下である：
【１４４６】
【化１０７９】

【１４４７】
【化１０８０】

これはアミノ酸配列（配列番号６０８）を有するタンパク質をコードする：
【１４４８】
【化１０８１】

下線を附した配列（芳香族−Ｘａａ−芳香族のアミノ酸モチーフ）は、外膜タンパク質のＣ末端において通常は見出される。
【１４４９】
ＯＲＦ１４２ｎｇおよびＯＲＦ１４２−１は、３４２アミノ酸の重複部分に渡って９５．６％の同一性を示す：
【１４５０】
【化１０８２】

ＯＲＦ１４２ｎｇはさらに、Ｅ．ｃｈｒｙｓａｎｔｈｅｍｉのＨｅｃＢタンパク質と相同性である：
【１４５１】
【化１０８３】

この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断のための、または抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１４５２】
（実施例７３）
以下の部分的なＤＮＡ配列（配列番号６０９）は、Ｎ．Ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された。
【１４５３】
【化１０８４】

これはアミノ酸配列（配列番号６１０；ＯＲＦ１４３）に相当する：
【１４５４】
【化１０８５】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号６１１）を明らかにした：
【１４５５】
【化１０８６】

これはアミノ酸配列（配列番号６１２；ＯＲＦ１４３−１）に相当する：
【１４５６】
【化１０８７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析から以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１４３ａ）と１０５アミノ酸の重複部分に渡って９２．４％の相同性を示す：
【１４５７】
【化１０８８】

【１４５８】
【化１０８９】

全長ＯＲＦ１４３ａのヌクレオチド配列（配列番号６１３）は以下である；
【１４５９】
【化１０９０】

これはアミノ酸配列（配列番号６１４）を有するタンパク質をコードする：
【１４６０】
【化１０９１】

ＯＲＦ１４３ａおよびＯＲＦ１４３−１は、２０７アミノ酸の重複部分において９７．１％の同一性を示す：
【１４６１】
【化１０９２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４３はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１４３ｎｇ）と１１０アミノ酸の重複部分に渡って９５．５％の同一性を示す：
【１４６２】
【化１０９３】

ＯＲＦ１４３ｎｇヌクレオチド配列（配列番号６１５）は、アミノ酸配列（配列番号６１６）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【１４６３】
【化１０９４】

さらなる研究は、以下の淋菌のＤＮＡ配列（配列番号６１７）を明らかにした：
【１４６４】
【化１０９５】

これはアミノ酸配列（配列番号６１８；ＯＲＦ１４３ｎｇ−１）に相当する：
【１４６５】
【化１０９６】

ＯＲＦ１４３ｎｇ−１およびＯＲＦ１４３−１は、２４１アミノ酸の重複部分において９５．８％の同一性を示す：
【１４６６】
【化１０９７】

淋菌のタンパク質における推定膜貫通ドメインの存在に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断について、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることが推定される：
（実施例７４）
以下の部分的なＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号６１９）：
【１４６７】
【化１０９８】

これはアミノ酸配列（配列番号６２０；ＯＲＦ１４４）に相当する；
【１４６８】
【化１０９９】

さらなる研究は全長ヌクレオチド配列（配列番号６２１）を明らかにした：
【１４６９】
【化１１００】

これはアミノ酸配列（配列番号番号６２２；ＯＲＦ１４４−１）に相当する：
【１４７０】
【化１１０１】

このアミノ酸配列のコンピューター分析から以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４４は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１４４ａ）と１３６アミノ酸の重複部分に渡って９６．３％の同一性を示す：
【１４７１】
【化１１０２】

【１４７２】
【化１１０３】

全長ＯＲＦ１４４ａのヌクレオチド配列（配列番号６２３）は以下である；
【１４７３】
【化１１０４】

これはアミノ酸配列（配列番号６２４）を有するタンパク質をコードする：
【１４７４】
【化１１０５】

ＯＲＦ１４４ａおよびＯＲＦ１４４−１は、４０６アミノ酸の重複部分において９７．８％の同一性を示す：
【１４７５】
【化１１０６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４４はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１４４ｎｇ）と１３６アミノ酸の重複部分に渡って９１．２％の同一性を示す：
【１４７６】
【化１１０７】

全長ＯＲＦ１４４ｎｇヌクレオチド配列（配列番号６２５）は、アミノ酸配列（配列番号６２６）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【１４７７】
【化１１０８】

さらなる研究は、以下の淋菌のＤＮＡ配列（配列番号６２７）を明らかにした：
【１４７８】
【化１１０９】

これは、アミノ酸配列（配列番号６２８；ＯＲＦ１４４ｎｇ−１）を有するＯＲＦ１４４ｎｇに相当する：
【１４７９】
【化１１１０】

【１４８０】
【化１１１１】

ＯＲＦ１４４ｎｇ−１およそＯＲＦ１４４−１は、４０６アミノ酸の重複部分において９４．１％の同一性を示す：
【１４８１】
【化１１１２】

淋菌のタンパク質におけるいくつかの推定膜貫通ドメインの同定を含む、この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断について、または抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることが推定される：
（実施例７５）
以下の部分的なＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号６１９）：
【１４８２】
【化１１１３】

これは、アミノ酸配列（配列番号６３０；ＯＲＦ１４６）に相当する；
【１４８３】
【化１１１４】

さらなる研究は全長ヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号６３１）：
【１４８４】
【化１１１５】

【１４８５】
【化１１１６】

これは、アミノ酸配列（配列番号６３２；ＯＲＦ１４６−１）に相当する：
【１４８６】
【化１１１７】

このアミノ酸配のコンピューター分析から以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓｍ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４６は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１４６ａ）と７４アミノ酸の重複部分に渡って９８．６％の同一性を示す：
【１４８７】
【化１１１８】

全長ＯＲＦ１４６ａヌクレオチド配列（配列番号６３３）は以下である：
【１４８８】
【化１１１９】

これはアミノ酸配列（配列番号６３４）を有するタンパク質をコードする：
【１４８９】
【化１１２０】

ＯＲＦ１４６ａおよびＯＲＦ１４６−１は３７４アミノ酸の重複部分において９９．５％の同一性を示す：
【１４９０】
【化１１２１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４６はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１４６ｎｇ）と７５アミノ酸の重複部分に渡って９７．３％の同一性を示す：
【１４９１】
【化１１２２】

ＯＲＦ１４６ｎｇのヌクレオチド配列番号（配列番号６３５）は、アミノ酸配列（配列番号６３６）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【１４９２】
【化１１２３】

さらなる研究は、以下の淋菌のＤＮＡ配列（配列番号６３７）を明らかにした：
【１４９３】
【化１１２４】

これはアミノ酸配列（配列番号６３８；ＯＲＦ１４６ｎｇ−１）に相当する
【１４９４】
【化１１２５】

ＯＲＦ１４６ｎｇ−１およびＯＲＦ１４６−１は３７５アミノ酸重複部分において９６．５％の同一性を示す：
【１４９５】
【化１１２６】

さらに、ＯＲＦ１４６−ｎｇ１は仮定されるＥ．ｃｏｌｉタンパク質との相同性を示す。
【１４９６】
【化１１２７】

【１４９７】
【化１１２８】

この分析（淋菌タンパク質における幾つかの膜貫通ドメインの同定を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断または抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることが推定される：
（実施例７６）
以下のＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号６３９）：
【１４９８】
【化１１２９】

これはアミノ酸配列（配列番号６４０；ＯＲＦ１４７）に相当する：
【１４９９】
【化１１３０】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列（配列番号６４１）を明らかにした：
【１５００】
【化１１３１】

【１５０１】
【化１１３２】

これはアミノ酸配列（配列番号６４２；ＯＲＦ１４７−１）に相当する：
【１５０２】
【化１１３３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析から以下の結果を得た：
（Ｅ．ｃｏｌｉの仮定タンパク質のＯＲＦ２８６（登録番号Ｕ１８９９７）との相同性）
ＯＲＦ１４７およびＥ．ｃｏｌｉのＯＲＦ２８６のタンパク質は、２３７アミノ酸重複部分において３６％の同一性を示す：
【１５０３】
【化１１３４】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４７は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ７５ａと２３７アミノ酸の重複部分に渡って９６．６％の同一性を示す：
【１５０４】
【化１１３５】

【１５０５】
【化１１３６】

ＯＲＦ１４７ａはＯＲＦ７５ａと同一であり、これはＯＲＦ７５の５６〜２９２アミノ酸を含む。
【１５０６】
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１４７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１４７ｎｇ）と２３７アミノ酸の重複部分に渡って９４．１％の同一性を示す：
【１５０７】
【化１１３７】

ＯＲＦ１４７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号６４３）は、アミノ酸配列（配列番号６４４）を有するタンパク質をコードすると推定された：
【１５０８】
【化１１３８】

さらなる研究は以下の淋菌のＤＮＡ配列（配列番号６４５）を明らかにした：
【１５０９】
【化１１３９】

これはアミノ酸配列に相当する（配列番号６４６；ＯＲＦ１４７ｎｇ−１）：
【１５１０】
【化１１４０】

ＯＲＦ１４７ｎｇは、仮定上のＥ．ｃｏｌｉタンパク質との相同性を示す：
【１５１１】
【化１１４１】

淋菌のタンパク質におけるコンピューター分析および推定膜貫通ドメインの存在に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンまたは診断についての、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【１５１２】
（実施例７７）
以下の部分的なＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号番号６４７）：
【１５１３】
【化１１４２】

【１５１４】
【化１１４３】

これはアミノ酸配列番号（配列番号６４８；ＯＲＦ１）に相当する：
【１５１５】
【化１１４４】

【１５１６】
【化１１４５】

さらなる配列決定分析は全長ヌクレオチド配列（配列番号６４９）を明らかにした：
【１５１７】
【化１１４６】

【１５１８】
【化１１４７】

これは、アミノ酸配列（配列番号６５０；ＯＲＦ１−１）に相当する：
【１５１９】
【化１１４８】

これらの配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１ａ）と１４５６アミノ酸の重複部分に渡って５７．８％の同一性を示す：
【１５２０】
【化１１４９】

【１５２１】
【化１１５０】

【１５２２】
【化１１５１】

全長ＯＲＦ１ａのヌクレオチド配列（配列番号６５１）は、以下である：
【１５２３】
【化１１５２】

【１５２４】
【化１１５３】

これはアミノ酸配列（配列番号６５２）を有するタンパク質をコードする：
【１５２５】
【化１１５４】

膜貫通領域に下線を附す。
【１５２６】
ＯＲＦ１−１はＯＲＦ１ａと１４６２アミノ酸の重複部分に渡って８６．７％の同一性を示す：
【１５２７】
【化１１５５】

【１５２８】
【化１１５６】

【１５２９】
【化１１５７】

（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ（登録番号Ｐ４５３８７）の接着および透過タンパク質であるｈａｐ前駆体との相同性）
ＯＲＦ１のアミノ酸２３〜４２３は、４５０アミノ酸の重複部分でｈａｐタンパク質と５９％のアミノ酸同一性を示す：
【１５３０】
【化１１５８】

【１５３１】
【化１１５９】

ＯＲＦ１のアミノ酸７１５〜１０１１は、２５８アミノ酸の重複部分においてｈａｐタンパク質と５０％のアミノ酸同一性を示す：
【１５３２】
【化１１６０】

ＯＲＦ１のアミノ酸１１９２〜１４５０は、２５９アミノ酸の重複部分においてｈａｐタンパク質と４１％のアミノ酸の同一性を示す：
【１５３３】
【化１１６１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１のブロックは、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ１ｎｇ）とそれぞれ４６７アミノ酸、２９８アミノ酸および２５９アミノ酸の重複部分において８３．５％、８８．３％および９９．７％の同一性を示す：
【１５３４】
【化１１６２】

【１５３５】
【化１１６３】

全長ＯＲＦ１ｎｇのヌクレオチド配列を同定した（配列番号６５３）：
【１５３６】
【化１１６４】

【１５３７】
【化１１６５】

これは、アミノ酸配列（配列番号６５４）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【１５３８】
【化１１６６】

下線を附した配列および二重下線を附した配列は、セリンプロテアーゼ（トリプシンファミリー）の活性部位およびＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位のモチーフＡ（Ｐ−ループ）を表す。
【１５３９】
ＯＲＦ−１およびＯＲＦ１ｎｇは、１４７１アミノ酸の重複部分において９３．７％の同一性を示す：
【１５４０】
【化１１６７】

【１５４１】
【化１１６８】

【１５４２】
【化１１６９】

さらに、ＯＲＦ１ｎｇはｈａｐタンパク質（Ｐ４５３８７）と１４５５アミノ酸重複部分に渡って５５．７％の同一性を示す：
【１５４３】
【化１１７０】

【１５４４】
【化１１７１】

【１５４５】
【化１１７２】

この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断についての、または抗体を惹起するための有用な抗原であることが推定される。
【１５４６】
（実施例７８）
以下の部分的ＤＮＡ配列はＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号６５５）
【１５４７】
【化１１７３】

これはアミノ酸配列（配列番号６５６；ＯＲＦ６）に相当する：
【１５４８】
【化１１７４】

さらなる配列分析はさらなる部分的ＤＮＡ配列を明らかにした（配列番号６５７）：
【１５４９】
【化１１７５】

これは、アミノ配列（配列番号６５８；ＯＲＦ６−１）に相当する：
【１５５０】
【化１１７６】

アミノ酸配列のコンピューター分析はから以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株に由来するＯＲＦ（ＯＲＦ６ａ）と１４０アミノ酸の重複部分に渡って９８．６％の同一性を示す：
【１５５１】
【化１１７７】

【１５５２】
【化１１７８】

全長ＯＲＦ６ａのヌクレオチド配列（配列番号６５９）：
【１５５３】
【化１１７９】

これはアミノ酸配列（配列番号６６０）を有するタンパク質をコードすると推定される：
【１５５４】
【化１１８０】

ＯＲＦ６ａおよびＯＲＦ６−１は１３１アミノ酸配列の重複部分において１００．０％の同一性を示す：
【１５５５】
【化１１８１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ６ｎｇ）と１４０アミノ酸の重複部分に渡って９５．７％の同一性を示す：
【１５５６】
【化１１８２】

全長ＯＲＦ６ｎｇのヌクレオチド配列（配列番号６６１）は以下のように同定した：
【１５５７】
【化１１８３】

これはアミノ酸配列（配列番号６６２）を有するタンパク質をコードする：
【１５５８】
【化１１８４】

ＯＲＦ６ｎｇおよびＯＲＦ６−１は、１３１アミノ酸重複部分において９６．９％の同一性を示す：
【１５５９】
【化１１８５】

Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断について、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることが推定される。
【１５６０】
（実施例７９）
以下の部分的ＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号６６３）：
【１５６１】
【化１１８６】

【１５６２】
【化１１８７】

これは、アミノ酸配列（配列番号６６４；ＯＲＦ２３）に対応する：
【１５６３】
【化１１８８】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号６６５）：
【１５６４】
【化１１８９】

これは、アミノ酸配列（配列番号６６６；ＯＲＦ２３−１）に相当する：
【１５６５】
【化１１９０】

【１５６６】
【化１１９１】

このアミノ酸配列のコンピューター分析から以下の結果を得た：
（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｐｕｔｉｄａの鉄の擬バクチン（ｂａｃｔｉｎ）レセプターであるＰｕｐＢ（登録番号Ｐ３８０４７）との相同性）
ＯＲＦ２３およびＰｕｐＢタンパク質は２０５アミノ酸配列の重複部分において３２％の同一性を示す：
【１５６７】
【化１１９２】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ２３ａ）と２１１アミノ酸の重複部分に渡って９５．７％の同一性を示す：
【１５６８】
【化１１９３】

完全長ＯＲＦ２３ａのヌクレオチド配列（配列番号６６７）は、以下である：
【１５６９】
【化１１９４】

これはアミノ酸配列（配列番号６６８）を有するタンパク質をコードする：
【１５７０】
【化１１９５】

ＯＲＦ２３ａおよびＯＲＦ２３−１は７２５アミノ酸の重複部分において９９．２％の同一性を示す：
【１５７１】
【化１１９６】

【１５７２】
【化１１９７】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２３はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ２３．ｎｇ）と２１１アミノ酸の重複部分に渡って９３．４％の同一性を示す：
【１５７３】
【化１１９８】

ＯＲＦ２３ｎｇのヌクレオチド配列（配列番号６６９）はアミノ酸配列（配列番号６７０）を含むタンパク質をコードすると推測される：
【１５７４】
【化１１９９】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列番号を明らかにした（配列番号６７１）：
【１５７５】
【化１２００】

【１５７６】
【化１２０１】

これは、アミノ酸配列（配列番号６７２；ＯＲＦ２３ｎｇ−１）に相当する：
【１５７７】
【化１２０２】

ＯＲＦ２３ｎｇ−１およびＯＲＦ２３−１は７２５アミノ酸の重複部分において９５．９％の同一性を示す：
【１５７８】
【化１２０３】

【１５７９】
【化１２０４】

さらに、ＯＲＦ２３ｎｇ−１は、Ｅ．ｃｏｌｉ由来のＯＭＰと有意な相同性を示す：
【１５８０】
【化１２０５】

【１５８１】
【化１２０６】

この分析に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質ならびにそれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断について、または抗体を惹起するための有用な抗原であり得ると推定される。
【１５８２】
ＯＲＦ２３−１（７７．５ｋＤａ）をｐＥＴベクターおよびｐＧｅｘベクターにクローニングし、そして上記のようにＥ．ｃｏｌｉ中で発現させる。タンパク質の発現産物および精製物をＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図１５Ａは、Ｈｉｓ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示し、そして図１５ＢはＥ．ｃｏｌｉにおけるＧＳＴ融合物の発現の結果を示す。精製したＨｉｓ融合タンパク質を使用してマウスを免疫し、マウスの血清をウェスタンブロット（図１５Ｃ）およびＥＬＩＳＡ（陽性結果）について使用した。これらの実験は、ＯＲＦ２３−１が表面露出型タンパク質であり、しかも免疫原として有用であることを確実にする。
【１５８３】
（実施例８０）
以下の部分的ＤＮＡ配列をＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号６７３）：
【１５８４】
【化１２０７】

これは、アミノ酸配列（配列番号６７４；ＯＲＦ２４）に相当する：
【１５８５】
【化１２０８】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列を明らかにした（配列番号６７５）：
【１５８６】
【化１２０９】

これは、アミノ酸配列（配列番号６７６；ＯＲＦ２４−１）に相当する：
【１５８７】
【化１２１０】

このアミノ酸配列のコンピューター分析から以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２４は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ２４ａ）と３０７アミノ酸の重複部分に渡って９６．４％の同一性を示す：
【１５８８】
【化１２１１】

【１５８９】
【化１２１２】

完全長ＯＲＦ２４ａのヌクレオチド配列（配列番号６７７）は以下である：
【１５９０】
【化１２１３】

これは、アミノ酸配列（配列番号６７８）を有するタンパク質をコードする：
【１５９１】
【化１２１４】

このタンパク質は、１９８位にて停止コドンを含むことに留意すべきである。
【１５９２】
ＯＲＦ２４ａおよびＯＲＦ２４−１は、３０７アミノ酸の重複部分において９６．４％の同一性を示す：
【１５９３】
【化１２１５】

【１５９４】
【化１２１６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２４はＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定ＯＲＦ（ＯＲＦ２４ｎｇ）と１２１アミノ酸の重複部分に渡って９６．７％の同一性を示す：
【１５９５】
【化１２１７】

全長ＯＲＦ２４ｎｇのヌクレオチド配列（配列番号６７９）は、以下である：
【１５９６】
【化１２１８】

これはアミノ酸配列（配列番号６８０）を有するタンパク質をコードする：
【１５９７】
【化１２１９】

ＯＲＦ２４ｎｇおよびＯＲＦ２４−１は３０７アミノ酸の重複部分において９６．１％の同一性を示す：
【１５９８】
【化１２２０】

【１５９９】
【化１２２１】

この分析（淋菌タンパク質における推定リーダー配列（最初の１８アミノ酸−２重線で下線を附した）および推定膜貫通ドメイン（１本線で下線を附した）の存在を含む）に基づいて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質ならびにそれらのエピトープはワクチンもしくは診断について、または抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることが推定される。
【１６００】
（実施例８１）
以下の部分的なＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号６８１）：
【１６０１】
【化１２２２】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号６８２；ＯＲＦ２５）に対応する：
【１６０２】
【化１２２３】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号６８３）を明らかにした：
【１６０３】
【化１２２４】

これは、以下のアミノ酸配列（配列番号６８４；ＯＲＦ２５−１）に対応する：
【１６０４】
【化１２２５】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２５は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株からのＯＲＦ（ＯＲＦ２５ａ）と６０アミノ酸にわたる重複において，９８，３％の同一性を示す：
【１６０５】
【化１２２６】

完全な長さのＯＲＦ２５ａヌクレオチド配列（配列番号６８５）は：
【１６０６】
【化１２２７】

これはアミノ酸配列（配列番号６８６）を有するタンパク質をコードする：
【１６０７】
【化１２２８】

ＯＲＦ２５ａおよびＯＲＦ２５−１は、３３８アミノ酸配列重複において９３，５％の同一性を示す：
【１６０８】
【化１２２９】

【１６０９】
【化１２３０】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの推定のＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２５は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ２５ｎｇ）との６０アミノ酸にわたる重複において、１００％の同一性を示す：
【１６１０】
【化１２３１】

完全な長さのＯＲＦ２５ｎｇのヌクレオチド配列（配列番号６８７）は：
【１６１１】
【化１２３２】

これは、アミノ酸配列（配列番号６８８）を有するタンパク質をコードする：
【１６１２】
【化１２３３】

ＯＲＦ２５ｎｇおよびＯＲＦ２５−１は、３３８アミノ酸重複において９５．９％の同一性を示す：
【１６１３】
【化１２３４】

この分析をもとに（淋菌タンパク質において予想される原核生物膜リポタンパク質脂質の付着（ａｔｔｃｈｍｅｎｔ）部位（下線部）の存在を含む）、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原となり得ると予想された。
【１６１４】
ＯＲＦ２５−１（３７ＫＤａ）は、上記に記載されるように、ｐＥＴおよびｐＧｅｘベクターにおいてクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉにおいて発現された。タンパク質発現産物および精製産物を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図１６Ａは、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示し、そして図１６Ｂは、Ｅ．ｃｏｌｉにおけるＨｉｓ融合の結果を示す。精製されたＨｉｓ融合タンパク質を用いて、マウスを免疫化した。このマウスの血清を、ウエスタンブロット（図１６Ｃ）、ＥＬＩＳＡ（陽性コントロール）、およびＦＡＣＳ分析（図１６Ｄ）について使用した。これらの実験により、ＯＲＦ２５−１は、表面露出タンパク質であること、およびそれが有用な免疫原であることを確認する。
【１６１５】
図１６Ｅは、ＯＲＦ２５−１について親水性のプロット、抗原性指数およびＡＭＰＨＩ領域を示す。
【１６１６】
（実施例８２）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号６８９）
【１６１７】
【化１２３５】

これはアミノ酸配列（配列番号６９０；ＯＲＦ２６）に対応する：
【１６１８】
【化１２３６】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号６９１）を明らかにした：
【１６１９】
【化１２３７】

【１６２０】
【化１２３８】

これは、アミノ酸配列（配列番号６９２；ＯＲＦ２６−１）に対応する：
【１６２１】
【化１２３９】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅの仮説的膜貫通タンパク質ＨＩ１５８６（受託番号Ｐ４４２６３）との相同性）
ＯＲＦ２６およびＨＩ１５８６は、それぞれＮ末端およびＣ末端の、９７および２２１アミノ酸重複において、５３％および４９％のアミノ酸同一性を示す：
【１６２２】
【化１２４０】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２６は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株からのＯＲＦ（ＯＲＦ２６ａ）と５０２アミノ酸にわたる重複において部分において５８．２％の同一性を示す：
【１６２３】
【化１２４１】

【１６２４】
【化１２４２】

完全な長さのＯＲＦ２６ａヌクレオチド配列（配列番号６９３）は：
【１６２５】
【化１２４３】

【１６２６】
【化１２４４】

これは、アミノ酸配列（配列番号６９４）を有するタンパク質をコードする：
【１６２７】
【化１２４５】

ＯＲＦ２６ａおよびＯＲＦ２６−１は、５０６アミノ酸重複において９７．８％の同一性を示す：
【１６２８】
【化１２４６】

【１６２９】
【化１２４７】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２６は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ２６ｎｇ）と、それぞれＮ末端およびＣ末端の、９７および２０６アミノ酸重複において、９８．４％および９９％の同一性を示す：
【１６３０】
【化１２４８】

完全な長さのＯＲＦ２６ｎｇヌクレオチド配列（配列番号６９５）は：
【１６３１】
【化１２４９】

これは、アミノ酸配列（配列番号６９６）を有するタンパク質をコードする：
【１６３２】
【化１２５０】

ＯＲＦ２６ｎｇおよびＯＲＦ２６−１は、５０５アミノ酸重複において９８．４％の同一性を示す：
【１６３３】
【化１２５１】

さらに、ＯＲＦ２５ｎｇは、仮説的なＨ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅタンパク質に対して有意な相同性を示す：
【１６３４】
【化１２５２】

この分析に基づき、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのこれらのタンパク質ならびにこれらのエピトープは、ワクチンもしくは診断、または抗体惹起のための有用な抗原となり得ることが予想される。
【１６３５】
（実施例８３）
以下の部分的なＤＮＡ配列が、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号６９７）：
【１６３６】
【化１２５３】

これは、アミノ酸配列（配列番号６９８；ＯＲＦ２７）に対応する：
【１６３７】
【化１２５４】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号６９９）を明らかにした：
【１６３８】
【化１２５５】

【１６３９】
【化１２５６】

これは、アミノ酸配列（配列番号７００；ＯＲＦ２７−１）に対応する：
【１６４０】
【化１２５７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２７は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓＡ株から得たＯＲＦ（ＯＲＦ２７ａ）と、８２アミノ酸にわたる重複において、９１．５％の同一性を示す：
【１６４１】
【化１２５８】

完全な長さのＯＲＦ２７ａのヌクレオチド配列（配列番号７０１）は：
【１６４２】
【化１２５９】

これは、アミノ酸配列（配列番号７０２）を有するタンパク質をコードする：
【１６４３】
【化１２６０】

ＯＲＦ２７およびＯＲＦ２７−１は、２４５アミノ酸重複において９４．７％の同一性を示す：
【１６４４】
【化１２６１】

【１６４５】
【化１２６２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ２７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ２７ｎｇ）と、８２アミノ酸にわたる重複において９６．３％の同一性を示す：
【１６４６】
【化１２６３】

完全な長さのＯＲＦ２７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７０３）は：
【１６４７】
【化１２６４】

これは、アミノ酸配列（配列番号７０４）を有するタンパク質をコードする：
【１６４８】
【化１２６５】

ＯＲＦ２７ｎｇおよびＯＲＦ２７−１は、２４５アミノ酸重複において９８．８％の相同性を示す：
【１６４９】
【化１２６６】

【１６５０】
【化１２６７Ａ】

この分析をもとに（淋菌のタンパク質における推定されるリーダー配列を含む）、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原であり得ると予想された。
【１６５１】
ＯＲＦ２７−１（２４．５ＫＤａ）を、上記に記載されるように、ｐＥＴおよびｐＧｅｘベクターにおいてクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉにおいて発現した。タンパク質発現産物および精製産物を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図１７Ａは、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示し、そして図１７Ｂは、Ｅ．ｃｏｌｉにおけるＧｓｔ融合の発現の結果を示す。精製したＧｓｔ融合タンパク質を用いて、マウスを免疫した。このマウスの血清は、ＥＬＩＳＡについて用いた。これは、陽性の結果を与え、ＯＲＦ２７−１が、表面露出タンパク質であること、およびそれが有用な免疫原であることを確認した。
【１６５２】
（実施例８４）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号７０５）：
【１６５３】
【化１２６７Ｂ】

これは、アミノ酸配列（配列番号７０６；ＯＲＦ４７）に対応する：
【１６５４】
【化１２６８】

【１６５５】
【化１２６９】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号７０７）を明らかにした：
【１６５６】
【化１２７０】

これは、アミノ酸配列（配列番号７０８；ＯＲＦ４７−１）に対応する：
【１６５７】
【化１２７１】

このアミノ酸配列のコンピューター分析によりリーダーペプチドを予想し、そしてまた以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ４７は、Ａ株のＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓから得たＯＲＦ（ＯＲＦ４７ａ）と、１７２アミノ酸にわたる重複において、９９．４％の同一性を示す：
【１６５８】
【化１２７２】

完全な長さのＯＲＦ４７ａのヌクレオチド配列（配列番号７０９）は：
【１６５９】
【化１２７３】

これは、アミノ酸配列（配列番号７１０）を有するタンパク質をコードする：
【１６６０】
【化１２７４】

ＯＲＦ４７ａおよびＯＲＦ４７−１は、３８４アミノ酸重複において９９．２％の同一性を示す：
【１６６１】
【化１２７５】

【１６６２】
【化１２７６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ４７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ４７ｎｇ）と、１７２アミノ酸にわたる重複において９７．１％の同一性を示す：
【１６６３】
【化１２７７】

ＯＲＦ４７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７１１）は、アミノ酸配列（配列番号７１２）を含むタンパク質をコードすると予想される：
【１６６４】
【化１２７８】

予想されるリーダーペプチドおよび膜貫通ドメインは、（８７位の残基のＩｌｅ／Ａｌａ置換および１４０位の残基のＬｅｕ／Ｉｌｅ置換を除く）髄膜炎菌のタンパク質と同一である（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｔｕｔｚｅｒｉ ｏｒｆ３９６、受託番号ｅ２４６５４０参照のこと）：
【１６６５】
【化１２７９】

さらなる研究が、完全な淋菌のＤＮＡ配列（配列番号７１３）を明らかにした：
【１６６６】
【化１２８０】

【１６６７】
【化１２８１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７１４；ＯＲＦ４７ｎｇ−１）を有するタンパク質をコードする：
【１６６８】
【化１２８２】

ＯＲＦ４７ｎｇ−１およびＯＲＦ４７−１は、３８４重複アミノ酸において、９７．４％の同一性を示す：
【１６６９】
【化１２８３】

さらに、ＯＲＦ４７ｎｇ−１は、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｔｕｔｚｅｒｉからのＯＲＦと有意な相同性を示す：
【１６７０】
【化１２８４】

【１６７１】
【化１２８５】

この分析をもとに、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原となり得ると予想される。
【１６７２】
（実施例８５）
以下の部分的なＤＮＡ配列が、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号７１５）：
【１６７３】
【化１２８６】

これは、アミノ酸配列（配列番号７１６；ＯＲＦ６７）に対応する：
【１６７４】
【化１２８７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ６７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ６７ｎｇ）と、１９９アミノ酸にわたる重複において５１．８％の同一性を示す：
【１６７５】
【化１２８８】

ＯＲＦ６７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７１７）は、アミノ酸配列（配列番号７１８）を含むタンパク質をコードすると予想される：
【１６７６】
【化１２８９】

淋菌タンパク質のいくつかの推定される膜貫通ドメインの存在をもとに、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原となり得ると予想される。
【１６７７】
（実施例８６）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号７１９）：
【１６７８】
【化１２９０】

これは、アミノ酸配列（配列番号７２０；ＯＲＦ７８）に対応する：
【１６７９】
【化１２９１】

さらなる研究が、ヌクレオチド配列（配列番号７２１）を明らかにした：
【１６８０】
【化１２９２】

【１６８１】
【化１２９３】

これは、アミノ酸配列（配列番号７２２；ＯＲＦ７８−１）に対応する：
【１６８２】
【化１２９４】

このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、いくつかの膜貫通ドメインを予想し、そしてまた以下の結果を与えた：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅのｄｅｄＡホモログ（受託番号Ｐ４５２８０）、との相同性）
ＯＲＦ７８およびｄｅｄＡホモログは、１４４アミノ酸重複において５８％のアミノ酸の同一性を示す．
【１６８３】
【化１２９５】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７８は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株からのＯＲＦ（ＯＲＦ７８ａ）と、１４５アミノ酸にわたる重複において９３．８％の同一性を示す：
【１６８４】
【化１２９６】

完全な長さのＯＲＦ７８ａのヌクレオチド配列（配列番号７２３）は：
【１６８５】
【化１２９７】

【１６８６】
【化１２９８】

これは、アミノ酸配列（配列番号７２４）を有するタンパク質をコードする：
【１６８７】
【化１２９９】

ＯＲＦ７８ａおよびＯＲＦ７８−１は２２７のアミノ酸重複において８９．０％の同一性を示す：
【１６８８】
【化１３００】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ７８ｎｇ）と３８アミノ酸にわたる重複において９７．４％の同一性を示す：
【１６８９】
【化１３０１】

ＯＲＦ７８ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７２５）は、アミノ酸配列（配列番号７２６）を含むタンパク質をコードすることが予想される：
【１６９０】
【化１３０２】

さらなる研究が、淋菌の完全なヌクレオチド配列（配列番号７２７）を明らかにした：
【１６９１】
【化１３０３】

【１６９２】
【化１３０４】

これは、アミノ酸配列（配列番号７２８；ＯＲＦ７８ｎｇ−１）に対応する：
【１６９３】
【化１３０５】

ＯＲＦ７８ｎｇ−１およびＯＲＦ７８−１は、２２７重複アミノ酸において、８８．１％の同一性を示す：
【１６９４】
【化１３０６】

さらに、ＯＲＦ７８ｎｇ−１は、Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅのｄｅｄＡタンパク質と相同性を示す：
【１６９５】
【化１３０７】

この分析をもとに（推定の膜貫通ドメインの存在を含む）、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原となり得ると予想される。
【１６９６】
（実施例８７）
以下の部分的なＤＮＡ配列が、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号７２９）：
【１６９７】
【化１３０８】

これは、アミノ酸配列（配列番号７３０；ＯＲＦ７９）に対応する：
【１６９８】
【化１３０９】

さらなる研究が、完全なヌクレオチド配列（配列番号７３１）を明らかにした：
【１６９９】
【化１３１０】

これは、アミノ酸配列（配列番号７３２；ＯＲＦ７９−１）に対応する：
【１７００】
【化１３１１】

このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、推定されるリーダーペプチドを明らかとし、そしてまた以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株からの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ７９ａ）と、１４７アミノ酸にわたる重複において、９４．６％の同一性を示す：
【１７０１】
【化１３１２】

【１７０２】
【化１３１３】

完全な長さのＯＲＦ７９ａヌクレオチド配列（配列番号７３３）は：
【１７０３】
【化１３１４】

これは、アミノ酸配列（配列番号７３４）を有するタンパク質をコードする：
【１７０４】
【化１３１５】

ＯＲＦ７９ａおよびＯＲＦ７９−１は、１５７アミノ酸重複において９４．９％の相同性を有する：
【１７０５】
【化１３１６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ７９は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ７９ｎｇ）と、７６アミノ酸にわたる重複において９６．１％の同一性を示す：
【１７０６】
【化１３１７】

ＯＲＦ７９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７３５）は、アミノ酸配列（配列番号７３６）を含むタンパク質をコードすることが予想された
【１７０７】
【化１３１８】

さらなる研究が、淋菌の完全なＤＮＡ配列（配列番号７３７）を明らかにした：
【１７０８】
【化１３１９】

これは、アミノ酸配列（配列番号７３８；ＯＲＦ７９ｎｇ−１）に対応する：
【１７０９】
【化１３２０】

ＯＲＦ７９ｎｇ−１およびＯＲＦ７９−１は、１５７重複アミノ酸において、９５．５％の同一性を示す：
【１７１０】
【化１３２１】

さらに、ＯＲＦ７９ｎｇ−１は、Ａｑｕｉｆｅｘ ａｅｏｌｉｃｕｓからのタンパク質と有意な相同性を示す：
【１７１１】
【化１３２２】

この分析をもとに、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原であり得ると予想される。
【１７１２】
ＯＲＦ７９−１（１５．６ＫＤａ）と、上記に記載されるように、ｐＥＴベクターにクローニングし、そしてＥ．ｃｏｌｉにおいて発現した。タンパク質発現産物および精製産物を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図１８Ａは、Ｈｉｓ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示す。精製したＨｉｓ融合タンパク質を用いて、マウスを免疫した。このマウスの血清を、ＥＬＩＳＡ（陽性コントロール）、およびＦＡＣＳ分析（図１８Ｂ）について使用した。これらの研究により、ＯＲＦ７９−１は、表面露出タンパク質であること、およびそれが免疫原として有用であることを確認する。
【１７１３】
（実施例８８）
以下のＤＮＡ配列（完全であると考えられる）を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号７３９）：
【１７１４】
【化１３２３】

これは、アミノ酸配列（配列番号７４０；ＯＲＦ９８）に対応する：
【１７１５】
【化１３２４】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号７４１）を明らかにした：
【１７１６】
【化１３２５】

これは、アミノ酸配列（配列番号７４２；ＯＲＦ９８−１）に対応する：
【１７１７】
【化１３２６】

このアミノ酸配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ９８は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株から得たＯＲＦ（ＯＲＦ９８ａ）と２３３アミノ酸にわたる重複において９６．１％の同一性を示す：
【１７１８】
【化１３２７】

【１７１９】
【化１３２８】

完全な長さのＯＲＦ９８ａのヌクレオチド配列（配列番号７４３）は：
【１７２０】
【化１３２９】

これは、アミノ酸配列（配列番号７４４）を有するタンパク質をコードする：
【１７２１】
【化１３３０】

ＯＲＦ９８ａおよびＯＲＦ９８−１は、２３３アミノ酸重複において９８．７％の同一性を示す：
【１７２２】
【化１３３１】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ９８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ９８ｎｇ）と、２３３アミノ酸にわたる重複において９５．３％の同一性を示す：
【１７２３】
【化１３３２】

完全な長さのＯＲＦ９８ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７４５）は、アミノ酸配列（配列番号７４６）を有するタンパク質をコードすることが予想される：
【１７２４】
【化１３３３】

さらなる研究が、完全なヌクレオチド配列（配列番号７４７）を明らかにした：
【１７２５】
【化１３３４】

これは、アミノ酸配列（配列番号７４８；ＯＲＦ９８ｎｇ−１）に対応する：
【１７２６】
【化１３３５】

ＯＲＦ９８ｎｇ−１およびＯＲＦ９８−１は、２３３アミノ酸重複において、９７．９％の同一性を示す：
【１７２７】
【化１３３６】

【１７２８】
【化１３３７】

この分析をもとに（淋菌タンパク質における推定の膜貫通ドメインが、髄膜炎菌タンパク質の配列と一致するという事実を含む）、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原となり得ると予想される。
【１７２９】
（実施例８９）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号７４９）：
【１７３０】
【化１３３８】

これは、アミノ酸配列（配列番号７５０；ＯＲＦ１００）に対応する：
【１７３１】
【化１３３９】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号７５１）を明らかにした：
【１７３２】
【化１３４０】

【１７３３】
【化１３４１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７５２；ＯＲＦ１００−１）に対応する：
【１７３４】
【化１３４２】

このアミノ酸配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１００は、Ａ株のＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓから得たＯＲＦ（ＯＲＦ１００ａ）と、３８６アミノ酸にわたる重複において９３．５％の同一性を示す：
【１７３５】
【化１３４３】

【１７３６】
【化１３４４】

完全な長さのＯＲＦ１００ａのヌクレオチド配列（配列番号７５３）は：
【１７３７】
【化１３４５】

これは、アミノ酸配列（配列番号７５４）を有するタンパク質をコードする：
【１７３８】
【化１３４６】

ＯＲＦ１００ａおよびＯＲＦ１００−１は、４０６アミノ酸重複において９５．１％の同一性を示す：
【１７３９】
【化１３４７】

【１７４０】
【化１３４８】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１００は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ１００ｎｇ）と、３８６アミノ酸にわたる重複において９３．３％の同一性を示す：
【１７４１】
【化１３４９】

完全な長さのＯＲＦ１００ｎｇのヌクレオチド配列（配列番号７５５）は：
【１７４２】
【化１３５０】

【１７４３】
【化１３５１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７５６）を有するタンパク質をコードする：
【１７４４】
【化１３５２】

ＯＲＦ１００ｎｇおよびＯＲＦ１００−１は、４０２アミノ酸重複において９５．３％の同一性を示す：
【１７４５】
【化１３５３】

【１７４６】
【化１３５４】

この分析をもとに（推定のリーダー配列、推定の膜貫通ドメイン、およびＲＧＤモチーフの存在を含む）、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原となり得ると予想される。
【１７４７】
（実施例９０）
以下のＤＮＡ配列（完全であると考えられる）を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号７５７）：
【１７４８】
【化１３５５】

これは、アミノ酸配列（配列番号７５８；ＯＲＦ１０２）に対応する：
【１７４９】
【化１３５６】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号７５９）を明らかにした：
【１７５０】
【化１３５７】

これは、アミノ酸配列（配列番号７６０；ＯＲＦ１０２−１）に対応する：
【１７５１】
【化１３５８】

このアミノ酸配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉからのＨＰ１４８４仮説的な内在性膜タンパク質（受託番号ＡＥ０００６４７）との相同性）
ＯＲＦ１０２とＨＰ１４８４は、１４３アミノ酸重複において３３％の同一性を示す：
【１７５２】
【化１３５９】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０２は、Ａ株のＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓから得たＯＲＦ（ＯＲＦ１０２ａ）と、１４２アミノ酸にわたる重複において９９．３％の同一性を示す：
【１７５３】
【化１３６０】

完全な長さのＯＲＦ１０２ａのヌクレオチド配列（配列番号７６１）は：
【１７５４】
【化１３６１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７６２）を有するタンパク質をコードする：
【１７５５】
【化１３６２】

ＯＲＦ１０２ａおよびＯＲＦ１０２−１は、１４２アミノ酸重複において完全な相同性を示す：
【１７５６】
【化１３６３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１０２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ１０２ｎｇ）と、１４２アミノ酸にわたる重複において９７．９％の同一性を示す：
【１７５７】
【化１３６４】

完全な長さのＯＲＦ１０２ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７６３）は：
【１７５８】
【化１３６５】

これは、アミノ酸配列（配列番号７６４）を有するタンパク質をコードする：
【１７５９】
【化１３６６】

ＯＲＦ１０２ｎｇおよびＯＲＦ１０２−１は、１４２アミノ酸重複において９８．６％の相同性を有する：
【１７６０】
【化１３６７】

さらに、ＯＲＦ１０２ｎｇは、Ｈ．ｐｙｌｏｒｉからの膜タンパク質と有意な相同性を示す：
【１７６１】
【化１３６８】

この分析をもとに、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原であり得ると予想される。
【１７６２】
（実施例９１）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号７６５）：
【１７６３】
【化１３６９】

これは、アミノ酸配列（配列番号７６６；ＯＲＦ８５）に対応する：
【１７６４】
【化１３７０】

さらなる研究がさらに部分的なヌクレオチド配列（配列番号７６７）を明らかにした：
【１７６５】
【化１３７１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７６８；ＯＲＦ８５−１）に対応する：
【１７６６】
【化１３７２】

このアミノ酸配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８５は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株から得たＯＲＦ（ＯＲＦ８５ａ）との４１アミノ酸にわたる重複において８７．８％の同一性を示し、１５３アミノ酸にわたる重複において９９．３％の同一性を示す：
【１７６７】
【化１３７３】

完全な長さのＯＲＦ８５ａのヌクレオチド配列（配列番号７６９）は：
【１７６８】
【化１３７４】

これは、アミノ酸配列（配列番号７７０）を有するタンパク質をコードする：
【１７６９】
【化１３７５】

【１７７０】
【化１３７６】

ＯＲＦ８５ａおよびＯＲＦ８５−１は、３３４アミノ酸重複において９８．２％の同一性を示す：
【１７７１】
【化１３７７】

図１９Ｄは、ＯＲＦ８５ａについての親水性プロット、抗原性指数、およびＡＭＰＨＩ領域を示す。
【１７７２】
（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ８５は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ８５ｎｇ）との高い程度の同一性を示す：
【１７７３】
【化１３７８】

完全な長さのＯＲＦ８５ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７７１）は：
【１７７４】
【化１３７９】

これは、アミノ酸配列（配列番号７７２）を有するタンパク質をコードする：
【１７７５】
【化１３８０】

ＯＲＦ８５ｎｇおよびＯＲＦ８５−１は３３４アミノ酸重複において９６．１％の同一性を示す：
【１７７６】
【化１３８１】

【１７７７】
【化１３８２】

さらに、ＯＲＦ８５ｎｇは、Ｅ．ｃｏｌｉ膜融合タンパク質と有意な相同性を示す：
【１７７８】
【化１３８３】

この分析をもとに、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原であり得ると予想された。
【１７７９】
ＯＲＦ８５−１（４０．４ＫＤａ）と、上記に記載されるように、ｐＧｅｘベクターにおいてクローン化し、そしてＥ．ｃｏｌｉにおいて発現した。タンパク質発現産物および精製産物を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。図１９Ａは、ＧＳＴ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示す。精製されたＧＳＴ融合タンパク質を使用して、マウスを免疫した。このマウスの血清は、ウエスタンブロット（図１９Ｂ）、ＦＡＣＳ分析（図１９Ｃ）、およびＥＬＩＳＡの陽性の結果について使用した。これらの研究により、ＯＲＦ８５−１は、表面露出タンパク質であること、およびそれが有用な免疫原であることが確認される。
【１７８０】
（実施例９２）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号７７３）：
【１７８１】
【化１３８４】

【１７８２】
【化１３８５】

これは、アミノ酸配列（配列番号７７４；ＯＲＦ１２０）に対応する：
【１７８３】
【化１３８６】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号７７５）を明らかにした：
【１７８４】
【化１３８７】

これは、アミノ酸配列（配列番号７７６；ＯＲＦ１２０−１）に対応する：
【１７８５】
【化１３８８】

このアミノ酸配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２０は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株からのＯＲＦ（ＯＲＦ１２０ａ）と、１８４アミノ酸にわたる重複において９２．４％の同一性を示す：
【１７８６】
【化１３８９】

【１７８７】
【化１３９０】

完全な長さのＯＲＦ１２０ａのヌクレオチド配列（配列番号７７７）は：
【１７８８】
【化１３９１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７７８）を有するタンパク質をコードする：
【１７８９】
【化１３９２】

ＯＲＦ１２０ａおよびＯＲＦ１２０−１は、２２３アミノ酸重複において９３．３％の同一性を示す：
【１７９０】
【化１３９３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２０は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ１２０ｎｇ）と、１８４アミノ酸にわたる重複において９７．８％の同一性を示す：
【１７９１】
【化１３９４】

【１７９２】
【化１３９５】

完全な長さのＯＲＦ１２０ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７７９）は：
【１７９３】
【化１３９６】

これは、アミノ酸配列（配列番号７８０）を有するタンパク質をコードする：
【１７９４】
【化１３９７】

ＯＲＦ１２０−１と比較して、ＯＲＦ１２０ｎｇは、２２３アミノ酸重複において、９７．８％の同一性を示す：
【１７９５】
【化１３９８】

この分析は、（淋菌タンパク質における推定されるリーダー配列の存在を含む）Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原であり得ることを示唆する。
【１７９６】
（実施例９３）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号７８１）：
【１７９７】
【化１３９９】

これは、アミノ酸配列（配列番号７８２；ＯＲＦ１２１）に対応する：
【１７９８】
【化１４００】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号７８３）を明らかにした：
【１７９９】
【化１４０１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７８４；ＯＲＦ１２１−１）に対応する：
【１８００】
【化１４０２】

このアミノ酸配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株から得たＯＲＦ（ＯＲＦ１２１ａ）との１５６アミノ酸にわたる重複において９８．７％の同一性を示す：
【１８０１】
【化１４０３】

【１８０２】
【化１４０４】

完全な長さのＯＲＦ１２１ａのヌクレオチド配列（配列番号７８５）は：
【１８０３】
【化１４０５】

これは、アミノ酸配列（配列番号７８６）を有するタンパク質をコードする：
【１８０４】
【化１４０６】

ＯＲＦ１２１ａおよびＯＲＦ１２１−１は、３５６アミノ酸重複において９９．２％の同一性を示す：
【１８０５】
【化１４０７】

【１８０６】
【化１４０８】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２１は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ１２１ｎｇ）と、１５６アミノ酸にわたる重複において９７．４％の同一性を示す：
【１８０７】
【化１４０９】

ＯＲＦ１２１ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７８７）は、アミノ酸配列（配列番号７８８）を有するタンパク質をコードすることが予想された：
【１８０８】
【化１４１０】

さらなる研究が、以下の淋菌のＤＮＡ配列（配列番号７８９）を明らかにした：
【１８０９】
【化１４１１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７９０；ＯＲＦ１２１ｎｇ−１）に対応する：
【１８１０】
【化１４１２】

ＯＲＦ１２１ｎｇ−１およびＯＲＦ１２１−１は、３５６アミノ酸重複において、９７．５％の同一性を示す：
【１８１１】
【化１４１３】

さらに、ＯＲＦ１２１ｎｇ−１は、Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅからの透過酵素と相同性を示す：
【１８１２】
【化１４１４】

【１８１３】
【化１４１５】

この分析をもとに（これらの２つのタンパク質における推定リーダー配列および膜貫通ドメインの存在を含む）、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原であり得ると予想された。
【１８１４】
（実施例９４）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号７９１）：
【１８１５】
【化１４１６】

これは、アミノ酸配列（配列番号７９２；ＯＲＦ１２２）に対応する：
【１８１６】
【化１４１７】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号７９３）を明らかにした：
【１８１７】
【化１４１８】

これは、アミノ酸配列（配列番号７９４；ＯＲＦ１２２−１）に対応する：
【１８１８】
【化１４１９】

このアミノ酸配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２２は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株から得たＯＲＦ（ＯＲＦ１２２ａ）と、１８２アミノ酸にわたる重複において９４．０％の同一性を示す：
【１８１９】
【化１４２０】

完全な長さのＯＲＦ１２２ａのヌクレオチド配列（配列番号７９５）は：
【１８２０】
【化１４２１】

これは、アミノ酸配列（配列番号７９６）を有するタンパク質をコードする：
【１８２１】
【化１４２２】

ＯＲＦ１２２ａおよびＯＲＦ１２２−１は、２５６アミノ酸重複において９６．９％の同一性を示す：
【１８２２】
【化１４２３】

【１８２３】
【化１４２４】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ１２２ｎｇ）と、１８２アミノ酸にわたる重複において８９．６％の同一性を示す：
【１８２４】
【化１４２５】

完全な長さのＯＲＦ１２２ｎｇヌクレオチド配列（配列番号７９７）は：
【１８２５】
【化１４２６】

これは、アミノ酸配列（配列番号７９８）を有するタンパク質をコードする：
【１８２６】
【化１４２７】

ＯＲＦ１２２ｎｇおよびＯＲＦ１２２−１は、２５６アミノ酸重複において、９２．６％の同一性を示す：
【１８２７】
【化１４２８】

この分析をもとに、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからのタンパク質、ならびにそれらのエピトープが、ワクチンもしくは診断のための、または抗体惹起のための有用な抗原であり得ると予想される。
【１８２８】
（実施例９５）
以下の部分的なＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号７９９）：
【１８２９】
【化１４２９】

これは、アミノ酸配列（配列番号８００；ＯＲＦ１２５）に対応する：
【１８３０】
【化１４３０】

さらなる研究が完全なヌクレオチド配列（配列番号８０１）を明らかにした：
【１８３１】
【化１４３１】

【１８３２】
【化１４３２】

これは、アミノ酸配列（配列番号８０２；ＯＲＦ１２５−１）に対応する：
【１８３３】
【化１４３３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析により以下の結果を得た：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）からの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２５は、Ａ株のＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓから得たＯＲＦ（ＯＲＦ１２５ａ）と、５１アミノ酸にわたる重複において７６．５％の同一性を示す：
【１８３４】
【化１４３４】

ＯＲＦ１２５ａの部分的なヌクレオチド配列（配列番号８０３）は：
【１８３５】
【化１４３５】

これは、部分的なアミノ酸配列（配列番号８０４）を有するタンパク質をコードする：
【１８３６】
【化１４３６】

【１８３７】
【化１４３７】

ＯＲＦ１２５ａおよびＯＲＦ１２５−１は、３４７アミノ酸重複において９４．５％の同一性を示す：
【１８３８】
【化１４３８】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２５は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅからの予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ１２５ｎｇ）と、６５アミノ酸にわたる重複において８６．２％の同一性を示す：
【１８３９】
【化１４３９】

ＯＲＦ１２５ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８０５）は、アミノ酸配列（配列番号８０６）を有するタンパク質をコードすることが予想された：
【１８４０】
【化１４４０】

さらなる研究が、以下の淋菌のＤＮＡ配列（配列番号８０７）を明らかにした：
【１８４１】
【化１４４１】

これは、アミノ酸配列（配列番号８０８；ＯＲＦ１２５ｎｇ−１）に対応する：
【１８４２】
【化１４４２】

ＯＲＦ１２５ｎｇ−１およびＯＲＦ１２５−１は、４０８ａａの重複部分にわたって９５．１％の同一性を示す。
【１８４３】
【化１４４３】

【１８４４】
【化１４４４】

淋菌のタンパク質において推定のリーダー配列および膜貫通ドメインの存在を含むこの分析に基いて、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそれらのタンパク質、およびそのエピトープは、ワクチンまたは診断のために、もしくは抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることを予測する。
【１８４５】
（実施例９６）
以下の部分ＤＮＡ配列（配列番号８０９）を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した：
【１８４６】
【化１４４５】

これはアミノ酸配列（配列番号８１０；ＯＲＦ１２６）に対応する：
【１８４７】
【化１４４６】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列（配列番号８１１）を明らかにした：
【１８４８】
【化１４４７】

これはアミノ酸配列（配列番号８１２；ＯＲＦ１２６−１）に対応する：
【１８４９】
【化１４４８】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２６は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１２６ａ）と１８０ａａの重複部分にわたって９０．０％の同一性を示す：
【１８５０】
【化１４４９】

完全長のＯＲＦ１２６ａヌクレオチド配列（配列番号８１３）は：
【１８５１】
【化１４５０】

これはアミノ酸配列（配列番号８１４）を有するタンパク質をコードする：
【１８５２】
【化１４５１】

【１８５３】
【化１４５２】

ＯＲＦ１２６ａおよびＯＲＦ１２６−１は、３６６ａａの重複部分にわたって９５．４％の同一性を示す：
【１８５４】
【化１４５３】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２６は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦ（ＯＲＦ１２６ｎｇ）と１８０ａａの重複部分にわたって９０％の同一性を示す：
【１８５５】
【化１４５４】

ＯＲＦ１２６ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８１５）は、アミノ酸配列（配列番号８１６）を有するタンパク質をコードすることが推定された。
【１８５６】
【化１４５５】

【１８５７】
【化１４５６】

さらなる研究は以下の淋菌ＤＮＡ配列（配列番号８１７）を明らかにした：
【１８５８】
【化１４５７】

これはアミノ酸配列（配列番号８１８；ＯＲＦ１２６ｎｇ−１）に対応する：
【１８５９】
【化１４５８】

ＯＲＦ１２６ｎｇ−１およびＰＲＦ１２６−１は、３６６ａａの重複部分にわたって９５．１％の同一性を示す。
【１８６０】
【化１４５９】

【１８６１】
【化１４６０】

さらに、ＯＲＦ１２６ｎｇ−１は推定のＲｈｉｚｏｂｉｕｍオキシダーゼフラビンタンパク質と相同性を示す：
【１８６２】
【化１４６１】

この分析は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそれらのタンパク質、およびそのエピトープが、ワクチンまたは診断のための抗原として、あるいは抗体を惹起するための有用な抗原であり得ることを示唆する。
【１８６３】
（実施例９７）
完全であると考えられる以下のＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定した（配列番号８１９）：
【１８６４】
【化１４６２】

これはアミノ酸配列（配列番号８２０；ＯＲＦ１２７）に対応する：
【１８６５】
【化１４６３】

さらなる仕事は以下のＤＮＡ配列（配列番号８２１）を明らかにした：
【１８６６】
【化１４６４】

これはアミノ酸配列（配列番号８２２；ＯＲＦ１２７−１）に対応する：
【１８６７】
【化１４６５】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２７は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１２７ａ）と１５０ａａの重複部分にわたって９８．０％の同一性を示す：
【１８６８】
【化１４６６】

完全長ＯＲＦ１２７ａヌクレオチド配列（配列番号８２３）は：
【１８６９】
【化１４６７】

これはアミノ酸配列（配列番号８２４）を有するタンパク質をコードする：
【１８７０】
【化１４６８】

ＯＲＦ１２７ａおよびＯＲＦ１２７−１は、１４９ａａの重複部分において９９．３％の同一性を示す：
【１８７１】
【化１４６９】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予想されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２７は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ１２７ｎｇ）と１５０ａａの重複部分にわたって９７．３％の相同性を示す：
【１８７２】
【化１４７０】

完全長ＯＲＦ１２７ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８２５）は：
【１８７３】
【化１４７１】

これはアミノ酸配列（配列番号８２６）を有するタンパク質をコードする：
【１８７４】
【化１４７２】

ＯＲＦ１２７ｎｇおよびＯＲＦ１２７−１は、１４９ａａの重複部分において１００．０％の同一性を示す：
【１８７５】
【化１４７３】

【１８７６】
【化１４７４】

予想された膜貫通ドメインが、骨髄炎菌性および淋菌性のタンパク質に共有されることの事実を含むこの分析は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそれらのタンパク質、ならびにそのエピトープが、ワクチンまたは診断のために、あるいは抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることを示唆する。
【１８７７】
（実施例９８）
以下部分的ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓにおいて同定された（配列番号８２７）
【１８７８】
【化１４７５】

これはアミノ酸配列（配列番号８２８；ＯＲＦ１２８）に対応する：
【１８７９】
【化１４７６】

さらなる研究は完全なヌクレオチド配列（配列番号８２９）を明らかにした：
【１８８０】
【化１４７７】

【１８８１】
【化１４７８】

これはアミノ酸配列（配列番号８３０；ＯＲＦ１２８−１）に対応する：
【１８８２】
【化１４７９】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅの仮定の完全な膜タンパク質ＨＩ０３９２（受託番号Ｕ３２７２３）との相同性）
ＯＲＦ１２８およびＨＩ０３９２は、１８０ａａの重複部分において５２％ａａの同一性を示す：
【１８８３】
【化１４８０】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の予想されたＯＲＦとの相同性
）
ＯＲＦ１２８は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１２８ａ）と２４４ａａの重複部分にわたって９８．０％の同一性を示す：
【１８８４】
【化１４８１】

【１８８５】
【化１４８２】

完全長ＯＲＦ１２８ａヌクレオチド配列（配列番号８３１）は：
【１８８６】
【化１４８３】

これはアミノ酸配列（配列番号８３２）を有するタンパク質をコードする：
【１８８７】
【化１４８４】

【１８８８】
【化１４８５】

ＯＲＦ１２８ａおよびＯＲＦ１２８−１は、６２２ａａの重複部分において９９．５％の同一性を示す：
【１８８９】
【化１４８６】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予想されるＯＲＦとの相同性
ＯＲＦ１２８は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の予想されるＯＲＦ（ＯＲＦ１２８ｎｇ）と２４４ａａの重複部分にわたって９３．４％の同一性を示す：
【１８９０】
【化１４８７】

【１８９１】
【化１４８８】

完全長ＯＲＦ１２８ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８３３）は：
【１８９２】
【化１４８９】

これはアミノ酸配列（配列番号８３４）を有するタンパク質をコードする：
【１８９３】
【化１４９０】

ＯＲＦ１２８ｎｇおよびＯＲＦ１２８−１は、６２２ａａの重複部分において９５．７％の同一性を示す：
【１８９４】
【化１４９１】

【１８９５】
【化１４９２】

さらに、ＯＲＦ２１８ｎｇは、仮定のＨ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅタンパク質と相同性を示す。
【１８９６】
【化１４９３】

いくつかの推定の膜貫通ドメインの同定を含むこの分析は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそれらのタンパク質、ならびにそのエピトープが、ワクチンまたは診断のために、あるいは抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることを示唆する。
【１８９７】
（実施例９９）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号８３５）において同定された：
【１８９８】
【化１４９４】

これはアミノ酸配列（配列番号８３６；ＯＲＦ１２９）に対応する：
【１８９９】
【化１４９５】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号８３７）を明らかにした：
【１９００】
【化１４９６】

これはアミノ酸配列（配列番号８３８；ＯＲＦ１２９−１）に対応する：
【１９０１】
【化１４９７】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２９は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１２９ａ）と８８ａａの重複部分にわたって９８．９％の同一性を示す：
【１９０２】
【化１４９８】

完全長ＯＲＦ１２９ａヌクレオチド配列（配列番号８３９）は：
【１９０３】
【化１４９９】

【１９０４】
【化１５００】

これはアミノ酸配列（配列番号８４０）を有するタンパク質をコードする：
【１９０５】
【化１５０１】

ＯＲＦ１２９ａおよびＯＲＦ１２９−１は、２４８ａａの重複部分において１００．０％の同一性を示す：
【１９０６】
【化１５０２】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１２９は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦ（ＯＲＦ１２９ｎｇ）と８８ａａの重複部分にわたって９８．９％の同一性を示す：
【１９０７】
【化１５０３】

ＯＲＦ１２９ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８４１）は、アミノ酸配列（配列番号８４２）を有するタンパク質をコードすることを予想される：
【１９０８】
【化１５０４】

さらなる研究は、以下の淋菌の配列（配列番号８４３）を明らかにした：
【１９０９】
【化１５０５】

【１９１０】
【化１５０６】

これはアミノ酸配列（配列番号８４４；ＯＲＦ１２９ｎｇ−１）に対応する：
【１９１１】
【化１５０７】

ＯＲＦ１２９ｎｇ−１およびＯＲＦ１２９−１は、２４８ａａの重複部分において９９．２％の同一性を示す：
【１９１２】
【化１５０８】

さらに、ＯＲＦ１２９ｎｇ−１は、Ａ．ｆｕｌｇｉｄｕｓ由来のＡＢＣトランスポーターと相同である：
【１９１３】
【化１５０９】

２つのタンパク質における膜貫通ドメインの同定を含むこの分析は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそれらのタンパク質、ならびにそのエピトープが、ワクチンまたは診断のために、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることを示唆する。
【１９１４】
（実施例１００）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号８４５）
において同定された：
【１９１５】
【化１５１０】

これはアミノ酸配列（配列番号８４６；ＯＲＦ１３０）に対応する：
【１９１６】
【化１５１１】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号８４７）を明らかにした：
【１９１７】
【化１５１２】

これはアミノ酸配列（配列番号８４８；ＯＲＦ１３０−１）に対応する：
【１９１８】
【化１５１３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ，ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３０は、Ｎ，ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３０ａ）と１９３ａａの重複部分にわたって９４．３％の同一性を示す：
【１９１９】
【化１５１４】

完全長のＯＲＦ１３０ａヌクレオチド配列（配列番号８４９）は：
【１９２０】
【化１５１５】

これはアミノ酸配列（配列番号８５０）を有するタンパク質をコードする：
【１９２１】
【化１５１６】

ＯＲＦ１３０ａおよびＯＲＦ１３０−１は、３５７ａａの重複部分において９８．３％の同一性を示す：
【１９２２】
【化１５１７】

【１９２３】
【化１５１８】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３０は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦ（ＯＲＦ１３０ｎｇ）と１９３ａａの重複部分にわたって９１．７％の同一性を示す：
【１９２４】
【化１５１９】

ＯＲＦ１３０ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８５１）は、アミノ酸配列（配列番号８５２）を有するタンパク質をコードすることを予想された：
【１９２５】
【化１５２０】

さらなる研究は、以下の淋菌ＤＮＡ配列（配列番号８５３）を明らかにした：
【１９２６】
【化１５２１】

【１９２７】
【化１５２２】

これはアミノ酸配列（配列番号８５４；ＯＲＦ１３０ｎｇ−１）に対応する：
【１９２８】
【化１５２３】

ＯＲＦ１３０ｎｇ−１およびＯＲＦ１３０−１は、３５７ａａの重複部分において９２．４％の同一性を示す：
【１９２９】
【化１５２４】

この分析に基き、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断のために、あるいは抗体の惹起のために有用な抗原であり得ることを予測する。
【１９３０】
（実施例１０１）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号８５５）
において同定された：
【１９３１】
【化１５２５】

これはアミノ酸配列（配列番号８５６；ＯＲＦ１３１）に対応する：
【１９３２】
【化１５２６】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号８５７）を明らかにした：
【１９３３】
【化１５２７】

【１９３４】
【化１５２８】

これはアミノ酸配列（配列番号８５８；ＯＲＦ１３１−１）に対応する：
【１９３５】
【化１５２９】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ，ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３１は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３１ａ）と１２１ａａの重複部分にわたって９５．０％の同一性を示す：
【１９３６】
【化１５３０】

完全長のＯＲＦ１３１ａヌクレオチド配列（配列番号８５９）は：
【１９３７】
【化１５３１】

これはアミノ酸配列（配列番号８６０）を有するタンパク質をコードする：
【１９３８】
【化１５３２】

ＯＲＦ１３１ａおよびＯＲＦ１３１−１は、１３５ａａの重複部分において９７．０％の同一性を示す：
【１９３９】
【化１５３３】

【１９４０】
【化１５３４】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３１は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦ（ＯＲＦ１３１ｎｇ）と１２１ａａの重複部分にわたって８９．３％の同一性を示す：
【１９４１】
【化１５３５】

完全長ＯＲＦ１３１ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８６１）は、アミノ酸配列（配列番号８６２）を有するタンパク質をコードすることを予想された：
【１９４２】
【化１５３６】

さらなる研究は、以下の淋菌ＤＮＡ配列（配列番号８６３）を明らかにした：
【１９４３】
【化１５３７】

これはアミノ酸配列（配列番号８６４；ＯＲＦ１３１ｎｇ−１）に対応する：
【１９４４】
【化１５３８】

ＯＲＦ１３１ｎｇ−１およびＯＲＦ１３１−１は、１３５ａａの重複部分において９２．６％の同一性を示す：
【１９４５】
【化１５３９】

推定される原核生物膜リポタンパク質脂質付着部位の存在に基き、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断のために、あるいは抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることを予測する。
【１９４６】
（実施例１０２）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号８６５）において同定された：
【１９４７】
【化１５４０】

これはアミノ酸配列（配列番号８６６；ＯＲＦ１３２）に対応する：
【１９４８】
【化１５４１】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号８６７）を明らかにした：
【１９４９】
【化１５４２】

これはアミノ酸配列（配列番号８６８；ＯＲＦ１３２−１）に対応する：
【１９５０】
【化１５４３】

【１９５１】
【化１５４４】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｅ．ｃｏｌｉの仮定のｏ４５７タンパク質との相同性（受託番号Ｕ１４００３））
ＯＲＦ１３２およびｏ４５７は、１４０ａａの重複部分にわたって５８％の同一性を示す：
【１９５２】
【化１５４５】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３２は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３２ａ）と１８９ａａの重複部分にわたって７４．６％の同一性を示す：
【１９５３】
【化１５４６】

完全長のＯＲＦ１３２ａヌクレオチド配列（配列番号８６９）：
【１９５４】
【化１５４７】

【１９５５】
【化１５４８】

これはアミノ酸配列（配列番号８７０）を有するタンパク質をコードする：
【１９５６】
【化１５４９】

ＯＲＦ１３２ａおよびＯＲＦ１３２−１は、４５８ａａの重複部分において９３．９％の同一性を示す：
【１９５７】
【化１５５０】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦ（ＯＲＦ１３２ｎｇ）と２５９ａａの重複部分にわたって８９．６％の同一性を示す：
【１９５８】
【化１５５１】

【１９５９】
【化１５５２】

ＯＲＦ１３２ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８７１）は、アミノ酸配列（配列番号８７２）を有するタンパク質をコードすることを予想された：
【１９６０】
【化１５５３】

さらなる研究は、以下の淋菌ＤＮＡ配列（配列番号８７３）を示した：
【１９６１】
【化１５５４】

これはアミノ酸配列（配列番号８７４；ＯＲＦ１３２ｎｇ−１）に対応する：
【１９６２】
【化１５５５】

ＯＲＦ１３２ｎｇ−１およびＯＲＦ１３２−１は、４５８ａａの重複部分において９３．２％の同一性を示す：
【１９６３】
【化１５５６】

さらに、ＯＲＦ１３２ｎｇ−１は、仮定のＥ．ｃｏｌｉタンパク質と相同である：
【１９６４】
【化１５５７】

【１９６５】
【化１５５８】

この分析に基き、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のそれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断のために、あるいは抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることを予測する。
【１９６６】
ＯＲＦ１３２−１（２６．４ｋＤａ）を、上記のように、ｐＥＴおよびｐＧｅｘベクターにクローニングし、そしてＥ．ｃｏｌｉ中に発現させた。タンパク質発現および精製の産物をＤＳＤ−ＰＡＧＥにより分析した。図２０Ａは、Ｈｉｓ融合タンパク質のアフィニティー精製の結果を示し、そして図２０Ｂは、Ｅ．ｃｏｌｉでのＧＳＴ融合物の発現の結果を示す。精製したＨｉｓ融合タンパク質を、マウスを免疫するために使用し、マウスの血清を、ＦＡＣＳ分析（図２０Ｃ）およびＥＬＩＳＡ（ポジティブな結果）のために使用した。これらの実験は、ＯＲＦ１３２が、表面露出タンパク質であること、および有用な免疫原であることを確認する。
【１９６７】
（実施例１０３）
以下の部分ＤＮＡ配列を、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号８７５）において同定した：
【１９６８】
【化１５５９】

これはアミノ酸配列（配列番号８７６；ＯＲＦ１３３）に対応する：
【１９６９】
【化１５６０】

さらなる研究は、完全なヌクレオチド配列（配列番号８７７）を明らかにした：
【１９７０】
【化１５６１】

【１９７１】
【化１５６２】

これはアミノ酸配列（配列番号８７８；ＯＲＦ１３３−１）に対応する：
【１９７２】
【化１５６３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅの有望なＴｏｎＢ依存性レセプターＨＩ１２１との相同性（受託番号Ｕ３２８０１））
ＯＲＦ１３３およびＨＩ１２１は、３６３ａａの重複部分にわたって５７％の同一性を示す：
【１９７３】
【化１５６４】

（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３３は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１３３ａ）と３９２ａａの重複部分にわたって９０．８％の同一性を示す：
【１９７４】
【化１５６５】

【１９７５】
【化１５６６】

部分的ＯＲＦ１３３ａヌクレオチド配列（配列番号８７９）は：
【１９７６】
【化１５６７】

これは（部分的）アミノ酸配列（配列番号８８０）を有するタンパク質をコードする：
【１９７７】
【化１５６８】

ＯＲＦ１３３ａおよびＯＲＦ１３３−１は、８７１ａａの重複部分において９４．３％の同一性を示す：
【１９７８】
【化１５６９】

【１９７９】
【化１５７０】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１３３は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦ（ＯＲＦ１３３ｎｇ）と３９２ａａの重複部分にわたって９２．３％の同一性を示す：
【１９８０】
【化１５７１】

【１９８１】
【化１５７２】

完全長ＯＲＦ１３３ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８８１）は、アミノ酸配列（配列番号８８２）を有するタンパク質をコードすることを予想された：
【１９８２】
【化１５７３】

改変体もまた、淋菌ＤＮＡ配列（配列番号８８３）によりコードされることが同定された：
【１９８３】
【化１５７４】

【１９８４】
【化１５７５】

これはアミノ酸配列（配列番号８８４；ＯＲＦ１３３ｎｇ−１）に対応する：
【１９８５】
【化１５７６】

ＯＲＦ１３３ｎｇ−１およびＯＲＦ１３３−１は、８８９ａａの重複部分において９６．２％の同一性を示す：
【１９８６】
【化１５７７】

【１９８７】
【化１５７８】

さらに、ＯＲＦ１３３ｎｇ−１は、Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅにおけるＴｏｎＢ依存性レセプターと相同である：
【１９８８】
【化１５７９】

淋菌タンパク質（骨髄炎菌のタンパク質にも存在する）における下線を引いたモチーフは、ＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位モチーフＡ（Ｐ−ループ）であると予想され、そしてこの分析は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断のために、あるいは抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることを示唆する。
【１９８９】
（実施例１０４）
以下の部分ＤＮＡ配列は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（配列番号８８５）において同定された：
【１９９０】
【化１５８０】

これはアミノ酸配列（配列番号８８６；ＯＲＦ１１２）に対応する：
【１９９１】
【化１５８１】

さらなる研究は、さらに部分的なヌクレオチド配列（配列番号８８７）を明らかにした：
【１９９２】
【化１５８２】

これはアミノ酸配列（配列番号８８８；ＯＲＦ１１２−１）に対応する：
【１９９３】
【化１５８３】

このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた：
（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ（Ａ株）由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１２は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓのＡ株由来のＯＲＦ（ＯＲＦ１１２ａ）と１６６ａａの重複部分にわたって９６．４％の同一性を示す：
【１９９４】
【化１５８４】

ＯＲＦ１１２ａヌクレオチド配列（配列番号８８９）は：
【１９９５】
【化１５８５】

これはアミノ酸配列（配列番号８９０）を有するタンパク質をコードする：
【１９９６】
【化１５８６】

ＯＲＦ１１２ａおよびＯＲＦ１１２−１は、３２６ａａの重複部分において９６．３％の同一性を示す：
【１９９７】
【化１５８７】

【１９９８】
【化１５８８】

（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦとの相同性）
ＯＲＦ１１２は、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来の推定されるＯＲＦ（ＯＲＦ１１２ｎｇ）と１６６ａａの重複部分にわたって９５．８％の同一性を示す：
【１９９９】
【化１５８９】

完全長ＯＲＦ１１２ｎｇヌクレオチド配列（配列番号８９１）：
【２０００】
【化１５９０】

これはアミノ酸配列（配列番号８９２）を有するタンパク質をコードする：
【２００１】
【化１５９１】

【２００２】
【化１５９２】

ＯＲＦ１１２ｎｇおよびＯＲＦ１１２−１は、３２６ａａの重複部分において９４．２％の同一性を示す：
【２００３】
【化１５９３】

この分析は、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓおよびＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ由来のこれらのタンパク質、ならびにこれらのエピトープが、ワクチンまたは診断のために、あるいは抗体を惹起するために有用な抗原であり得ることを示唆する。
【２００４】
本発明が、例示のみのために記載され、そして改変が発明の精神および範囲内でなされ得ることを理解する。
【２００５】
【表１】

【２００６】
【表２】

【２００７】
（配列表）
SEQUENCE LISTING
<110> Chiron S.r.l.
<120> Neisserial antigens
<130> F100811840
<140> JP 2000-520572
<141> 1998-10-09
<150> GB 9723516.2
<151> 1997-11-06
<150> GB 9724190.5
<151> 1997-11-14
<150> GB 9724386.9
<151> 1997-11-18
<150> GB 9725158.1
<151> 1997-11-27
<150> GB 9726147.3
<151> 1997-12-10
<150> GB 9800759.4
<151> 1998-01-14
<150> GB 9819016.8
<151> 1998-09-01
<160> 892
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 506
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<220>
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cggcaggcgg cagcgcaggg ggtagcccaa gcccaaaaca atttgggcgt gatgtatgcc 480
gaaagancgc gcgtgcgcca agaccg 506
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<211> 168
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (6)..(6)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (23)..(23)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<222> (34)..(34)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (163)..(163)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 2
Met Lys Gln Thr Val Xaa Met Leu Ala Ala Ala Leu Ile Ala Leu Gly
1 5 10 15
Leu Asn Arg Pro Val Trp Xaa Asp Asp Val Ser Asp Phe Arg Glu Asn
20 25 30
Leu Xaa Ala Ala Ala Gln Gly Asn Ala Ala Ala Gln Tyr Asn Leu Gly
35 40 45
Ala Met Tyr Xaa Gln Arg Thr Arg Val Arg Arg Asp Asp Ala Glu Ala
50 55 60
Val Arg Trp Tyr Arg Gln Pro Ala Glu Gln Gly Leu Ala Gln Ala Gln
65 70 75 80
Tyr Asn Leu Gly Trp Met Tyr Ala Asn Gly Arg Xaa Val Arg Gln Asp
85 90 95
Asp Thr Glu Ala Val Arg Trp Tyr Arg Gln Ala Ala Ala Gln Gly Val
100 105 110
Val Gln Ala Gln Tyr Asn Leu Gly Val Ile Tyr Ala Glu Gly Arg Gly
115 120 125
Val Arg Gln Asp Asp Val Glu Ala Val Arg Trp Phe Arg Gln Ala Ala
130 135 140
Ala Gln Gly Val Ala Gln Ala Gln Asn Asn Leu Gly Val Met Tyr Ala
145 150 155 160
Glu Arg Xaa Arg Val Arg Gln Asp
165
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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atgaaacaga cagtcaaatg gcttgccgcc gccctgattg ccttgggctt gaaccgagcg 60
gtgtgggcgg atgacgtatc ggattttcgg gaaaacttgc aggcggcagc acagggaaat 120
gcagcagccc aatacaattt gggcgcaatg tattacaaag gacgcggcgt gcgccgggat 180
gatgctgaag cggtcagatg gtatcggcag gcggcggaac aggggttagc ccaagcccaa 240
tacaatttgg gctggatgta tgccaacggg cgcggcgtgc gccaagatga taccgaagcg 300
gtcagatggt atcggcaggc ggcagcgcag ggggttgtcc aagcccaata caatttgggc 360
gtgatatatg ccgaaggacg tggagtgcgc caagacgatg tcgaagcggt cagatggttt 420
cggcaggcgg cagcgcaggg ggtagcccaa gcccaaaaca atttgggcgt gatgtatgcc 480
gaaagacgcg gcgtgcgcca agaccgcgcc cttgcacaag aatggtttgg caaggcttgt 540
caaaacggag accaagacgg ctgcgacaat gaccaacgcc tgaaggcggg ttattga 597
<210> 4
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 4
Met Lys Gln Thr Val Lys Trp Leu Ala Ala Ala Leu Ile Ala Leu Gly
1 5 10 15
Leu Asn Arg Ala Val Trp Ala Asp Asp Val Ser Asp Phe Arg Glu Asn
20 25 30
Leu Gln Ala Ala Ala Gln Gly Asn Ala Ala Ala Gln Tyr Asn Leu Gly
35 40 45
Ala Met Tyr Tyr Lys Gly Arg Gly Val Arg Arg Asp Asp Ala Glu Ala
50 55 60
Val Arg Trp Tyr Arg Gln Ala Ala Glu Gln Gly Leu Ala Gln Ala Gln
65 70 75 80
Tyr Asn Leu Gly Trp Met Tyr Ala Asn Gly Arg Gly Val Arg Gln Asp
85 90 95
Asp Thr Glu Ala Val Arg Trp Tyr Arg Gln Ala Ala Ala Gln Gly Val
100 105 110
Val Gln Ala Gln Tyr Asn Leu Gly Val Ile Tyr Ala Glu Gly Arg Gly
115 120 125
Val Arg Gln Asp Asp Val Glu Ala Val Arg Trp Phe Arg Gln Ala Ala
130 135 140
Ala Gln Gly Val Ala Gln Ala Gln Asn Asn Leu Gly Val Met Tyr Ala
145 150 155 160
Glu Arg Arg Gly Val Arg Gln Asp Arg Ala Leu Ala Gln Glu Trp Phe
165 170 175
Gly Lys Ala Cys Gln Asn Gly Asp Gln Asp Gly Cys Asp Asn Asp Gln
180 185 190
Arg Leu Lys Ala Gly Tyr
195
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 5
atgaaacaga cagtcaaatg gcttgccgcc gccctgattg ccttgggctt gaaccaagcg 60
gtgtgggcgg atgacgtatc ggattttcgg gaaaacttgc aggcggcagc acagggaaat 120
gcagcagccc aaaacaattt gggcgtgatg tatgccgaaa gacgcggcgt gcgccaagac 180
cgcgcccttg cacaagaatg gcttggcaag gcttgtcaaa acggatacca agacagctgc 240
gacaatgacc aacgcctgaa agcgggttat tga 273
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Met Lys Gln Thr Val Lys Trp Leu Ala Ala Ala Leu Ile Ala Leu Gly
1 5 10 15
Leu Asn Gln Ala Val Trp Ala Asp Asp Val Ser Asp Phe Arg Glu Asn
20 25 30
Leu Gln Ala Ala Ala Gln Gly Asn Ala Ala Ala Gln Asn Asn Leu Gly
35 40 45
Val Met Tyr Ala Glu Arg Arg Gly Val Arg Gln Asp Arg Ala Leu Ala
50 55 60
Gln Glu Trp Leu Gly Lys Ala Cys Gln Asn Gly Tyr Gln Asp Ser Cys
65 70 75 80
Asp Asn Asp Gln Arg Leu Lys Ala Gly Tyr
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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atgaaacaga cagtcaaatg gcttgccgcc gccctgattg ccttgggctt gaaccaagcg 60
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caacaatggc ttggcaaggc ttgtcaaaac ggagaccaaa acagctgcga caatgaccaa 360
cgcctgaagg cgggttatta a 381
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 8
Met Lys Gln Thr Val Lys Trp Leu Ala Ala Ala Leu Ile Ala Leu Gly
1 5 10 15
Leu Asn Gln Ala Val Trp Ala Gly Asp Val Ser Asp Phe Arg Glu Asn
20 25 30
Leu Gln Ala Ala Glu Gln Gly Asn Ala Ala Ala Gln Phe Asn Leu Gly
35 40 45
Val Met Tyr Glu Asn Gly Gln Gly Val Arg Gln Asp Tyr Val Gln Ala
50 55 60
Val Gln Trp Tyr Arg Lys Ala Ser Glu Gln Gly Asp Ala Gln Ala Gln
65 70 75 80
Tyr Asn Leu Gly Leu Met Tyr Tyr Asp Gly Arg Gly Val Arg Gln Asp
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Leu Ala Leu Ala Gln Gln Trp Leu Gly Lys Ala Cys Gln Asn Gly Asp
100 105 110
Gln Asn Ser Cys Asp Asn Asp Gln Arg Leu Lys Ala Gly Tyr
115 120 125
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 9
ttcggcgaca tcggcggttt gaaggtcaat gcccccgtca aatccgcagg cgtattggtc 60
gggcgcgtcg gcgctatcgg acttgacccg aaatcctatc aggcgagggt gcgcctcgat 120
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acgagttttg ccgagaaaaa tgccgacggc ggcaatgcgg aaaaagccgc cgaataa 357
<210> 10
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Phe Gly Asp Ile Gly Gly Leu Lys Val Asn Ala Pro Val Lys Ser Ala
1 5 10 15
Gly Val Leu Val Gly Arg Val Gly Ala Ile Gly Leu Asp Pro Lys Ser
20 25 30
Tyr Gln Ala Arg Val Arg Leu Asp Leu Asp Gly Lys Tyr Gln Phe Ser
35 40 45
Ser Asp Val Ser Ala Gln Ile Leu Thr Ser Gly Leu Leu Gly Glu Gln
50 55 60
Tyr Ile Gly Leu Gln Gln Gly Gly Asp Thr Glu Asn Leu Ala Ala Gly
65 70 75 80
Asp Thr Ile Ser Val Thr Ser Ser Ala Met Val Leu Glu Asn Leu Ile
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Gly Lys Phe Met Thr Ser Phe Ala Glu Lys Asn Ala Asp Gly Gly Asn
100 105 110
Ala Glu Lys Ala Ala Glu
115
<210> 11
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (495)..(495)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 11
attttgatat acctcatccg caagaatcta ggttcgcccg tcttcttctt tcaggaacgc 60
cccggaaagg acggaaaacc ttttaaaatg gtcaaattcc gttccatgcg cgacggcttg 120
tattcagacg gcattccgct gcccgacgga gaacgcctga caccgttcgg caaaaaactg 180
cgtgccgcca gtwtggacga actgcctgaa ttatggaata tcttaaaagg cgagatgagc 240
ctggtcggcc cccgcccgct gctgatgcaa tatctgccgc tgtacgacaa cttccaaaac 300
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ctcgacatca aaatcctact gctgacggtt aaaaaagtat taatcaagga agggatttcc 480
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acgctgctgc ttgaaaacag tttatcgccc gaacaatacg acgtcgccgt cgccgtcggc 720
aacaaccgca tccgccgcca aatcgccgaa aaagccgccg cgctcggctt cgccctgccc 780
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gttatggcga aagcggtcg 859
<210> 12
<211> 286
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (65)..(65)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (165)..(165)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 12
Ile Leu Ile Tyr Leu Ile Arg Lys Asn Leu Gly Ser Pro Val Phe Phe
1 5 10 15
Phe Gln Glu Arg Pro Gly Lys Asp Gly Lys Pro Phe Lys Met Val Lys
20 25 30
Phe Arg Ser Met Arg Asp Gly Leu Tyr Ser Asp Gly Ile Pro Leu Pro
35 40 45
Asp Gly Glu Arg Leu Thr Pro Phe Gly Lys Lys Leu Arg Ala Ala Ser
50 55 60
Xaa Asp Glu Leu Pro Glu Leu Trp Asn Ile Leu Lys Gly Glu Met Ser
65 70 75 80
Leu Val Gly Pro Arg Pro Leu Leu Met Gln Tyr Leu Pro Leu Tyr Asp
85 90 95
Asn Phe Gln Asn Arg Arg His Glu Met Lys Pro Gly Ile Thr Gly Trp
100 105 110
Ala Gln Val Asn Gly Arg Asn Ala Leu Ser Trp Asp Glu Lys Phe Ala
115 120 125
Cys Asp Val Trp Tyr Ile Asp His Phe Ser Leu Cys Leu Asp Ile Lys
130 135 140
Ile Leu Leu Leu Thr Val Lys Lys Val Leu Ile Lys Glu Gly Ile Ser
145 150 155 160
Ala Gln Gly Glu Xaa Thr Met Pro Pro Phe Thr Gly Lys Arg Lys Leu
165 170 175
Ala Val Val Gly Ala Gly Gly His Gly Lys Val Val Ala Asp Leu Ala
180 185 190
Ala Ala Leu Gly Arg Tyr Arg Glu Ile Val Phe Leu Asp Asp Arg Ala
195 200 205
Gln Gly Ser Val Asn Gly Phe Ser Val Ile Gly Thr Thr Leu Leu Leu
210 215 220
Glu Asn Ser Leu Ser Pro Glu Gln Tyr Asp Val Ala Val Ala Val Gly
225 230 235 240
Asn Asn Arg Ile Arg Arg Gln Ile Ala Glu Lys Ala Ala Ala Leu Gly
245 250 255
Phe Ala Leu Pro Val Leu Val His Pro Asp Ala Thr Val Ser Pro Ser
260 265 270
Ala Thr Val Gly Gln Gly Ser Val Val Met Ala Lys Ala Val
275 280 285
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<211> 1242
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 13
atgagtaaat tcttcaaacg cctgtttgac attgttgcct ccgcctcggg actgattttc 60
ctctcgccag tatttttgat tttgatatac ctcatccgca agaatctagg ttcgcccgtc 120
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ttaaaaggcg agatgagcct ggtcggcccc cgcccgctgc tgatgcaata tctgccgctg 360
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gaccacttca gcctgtgcct cgacatcaaa atcctactgc tgacggttaa aaaagtatta 540
atcaaggaag ggatttccgc acagggcgaa gccaccatgc cccctttcac aggaaaacgc 600
aaactcgccg tcgtcggtgc gggcggacac ggaaaagtcg ttgccgacct tgccgccgca 660
ctcggccggt acagggaaat cgtttttctg gacgaccgcg cacaaggcag cgtcaacggc 720
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ctcggcttcg ccctgcccgt tctggttcat ccggacgcga ccgtctcgcc ttctgcaaca 900
gtcggacaag gcagcgtcgt tatggcgaaa gccgtcgtac aggcaggcag cgtattgaaa 960
gacggcgtga ttgtgaacac tgccgccacc gtcgatcacg actgcctgct taacgctttc 1020
gtccacatca gcccaggcgc gcacctgtcg ggcaacacgc atatcggcga agaaagctgg 1080
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gcgggcgcag tcgtcgtacg cgacgtttca gacggcatga ccgtcgcggg caatccggca 1200
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Met Ser Lys Phe Phe Lys Arg Leu Phe Asp Ile Val Ala Ser Ala Ser
1 5 10 15
Gly Leu Ile Phe Leu Ser Pro Val Phe Leu Ile Leu Ile Tyr Leu Ile
20 25 30
Arg Lys Asn Leu Gly Ser Pro Val Phe Phe Phe Gln Glu Arg Pro Gly
35 40 45
Lys Asp Gly Lys Pro Phe Lys Met Val Lys Phe Arg Ser Met Arg Asp
50 55 60
Ala Leu Asp Ser Asp Gly Ile Pro Leu Pro Asp Gly Glu Arg Leu Thr
65 70 75 80
Pro Phe Gly Lys Lys Leu Arg Ala Ala Ser Leu Asp Glu Leu Pro Glu
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Leu Trp Asn Ile Leu Lys Gly Glu Met Ser Leu Val Gly Pro Arg Pro
100 105 110
Leu Leu Met Gln Tyr Leu Pro Leu Tyr Asp Asn Phe Gln Asn Arg Arg
115 120 125
His Glu Met Lys Pro Gly Ile Thr Gly Trp Ala Gln Val Asn Gly Arg
130 135 140
Asn Ala Leu Ser Trp Asp Glu Lys Phe Ala Cys Asp Val Trp Tyr Ile
145 150 155 160
Asp His Phe Ser Leu Cys Leu Asp Ile Lys Ile Leu Leu Leu Thr Val
165 170 175
Lys Lys Val Leu Ile Lys Glu Gly Ile Ser Ala Gln Gly Glu Ala Thr
180 185 190
Met Pro Pro Phe Thr Gly Lys Arg Lys Leu Ala Val Val Gly Ala Gly
195 200 205
Gly His Gly Lys Val Val Ala Asp Leu Ala Ala Ala Leu Gly Arg Tyr
210 215 220
Arg Glu Ile Val Phe Leu Asp Asp Arg Ala Gln Gly Ser Val Asn Gly
225 230 235 240
Phe Ser Val Ile Gly Thr Thr Leu Leu Leu Glu Asn Ser Leu Ser Pro
245 250 255
Glu Gln Tyr Asp Val Ala Val Ala Val Gly Asn Asn Arg Ile Arg Arg
260 265 270
Gln Ile Ala Glu Lys Ala Ala Ala Leu Gly Phe Ala Leu Pro Val Leu
275 280 285
Val His Pro Asp Ala Thr Val Ser Pro Ser Ala Thr Val Gly Gln Gly
290 295 300
Ser Val Val Met Ala Lys Ala Val Val Gln Ala Gly Ser Val Leu Lys
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Asp Gly Val Ile Val Asn Thr Ala Ala Thr Val Asp His Asp Cys Leu
325 330 335
Leu Asn Ala Phe Val His Ile Ser Pro Gly Ala His Leu Ser Gly Asn
340 345 350
Thr His Ile Gly Glu Glu Ser Trp Ile Gly Thr Gly Ala Cys Ser Arg
355 360 365
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Val Val Arg Asp Val Ser Asp Gly Met Thr Val Ala Gly Asn Pro Ala
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Lys Pro Leu Pro Arg Lys Asn Pro Glu Thr Ser Thr Ala
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<211> 1242
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 15
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tccatgcacg acgcgcttga ttcagacggc attctgctgc ccgacggaga acgcctgaca 240
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ctcaaaggcg acatgagcct ggtcggcccc cgcccgctgc tgatgcaata tctgccgctg 360
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gtcaacgggc gcaacgcgct ttcgtgggac gaacgcttcg catgcgacat ctggtatatc 480
gaccacttca gcctgtgcct cgacatcaaa atcctactgc tgacggttaa aaaagtatta 540
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ctcggcttcg ccctgcccgt cctgattcat ccggactcga ccgtctcgcc ttctgcaaca 900
gtcggacaag gcggcgtcgt tatggcgaaa gccgtcgtac aggctgacag cgtattgaaa 960
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gtccacatca gcccgggcgc gcacctgtcg ggcaacacgc gtatcggcga agaaagctgg 1080
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 16
Met Ser Lys Phe Phe Lys Arg Leu Phe Asp Ile Val Ala Ser Ala Ser
1 5 10 15
Gly Leu Ile Phe Leu Ser Pro Val Phe Leu Ile Leu Ile Tyr Leu Ile
20 25 30
Arg Lys Asn Leu Gly Ser Pro Val Phe Phe Phe Gln Glu Arg Pro Gly
35 40 45
Lys Asp Gly Lys Pro Phe Lys Met Val Lys Phe Arg Ser Met His Asp
50 55 60
Ala Leu Asp Ser Asp Gly Ile Leu Leu Pro Asp Gly Glu Arg Leu Thr
65 70 75 80
Pro Phe Gly Lys Lys Leu Arg Ala Ala Ser Leu Asp Glu Leu Pro Glu
85 90 95
Leu Trp Asn Val Leu Lys Gly Asp Met Ser Leu Val Gly Pro Arg Pro
100 105 110
Leu Leu Met Gln Tyr Leu Pro Leu Tyr Asp Asn Phe Gln Asn Arg Arg
115 120 125
His Glu Met Lys Pro Gly Ile Thr Gly Trp Ala Gln Val Asn Gly Arg
130 135 140
Asn Ala Leu Ser Trp Asp Glu Arg Phe Ala Cys Asp Ile Trp Tyr Ile
145 150 155 160
Asp His Phe Ser Leu Cys Leu Asp Ile Lys Ile Leu Leu Leu Thr Val
165 170 175
Lys Lys Val Leu Ile Lys Glu Gly Ile Ser Ala Gln Gly Glu Ala Thr
180 185 190
Met Pro Pro Phe Thr Gly Lys Arg Lys Leu Ala Val Val Gly Ala Gly
195 200 205
Gly His Gly Lys Val Val Ala Glu Leu Ala Ala Ala Leu Gly Thr Tyr
210 215 220
Gly Glu Ile Val Phe Leu Asp Asp Arg Val Gln Gly Ser Val Asn Gly
225 230 235 240
Phe Pro Val Ile Gly Thr Thr Leu Leu Leu Glu Asn Ser Leu Ser Pro
245 250 255
Glu Gln Phe Asp Ile Ala Val Ala Val Gly Asn Asn Arg Ile Arg Arg
260 265 270
Gln Ile Ala Glu Lys Ala Ala Ala Leu Gly Phe Ala Leu Pro Val Leu
275 280 285
Ile His Pro Asp Ser Thr Val Ser Pro Ser Ala Thr Val Gly Gln Gly
290 295 300
Gly Val Val Met Ala Lys Ala Val Val Gln Ala Asp Ser Val Leu Lys
305 310 315 320
Asp Gly Val Ile Val Asn Thr Ala Ala Thr Val Asp His Asp Cys Leu
325 330 335
Leu Asp Ala Phe Val His Ile Ser Pro Gly Ala His Leu Ser Gly Asn
340 345 350
Thr Arg Ile Gly Glu Glu Ser Trp Ile Gly Thr Gly Ala Cys Ser Arg
355 360 365
Gln Gln Ile Arg Ile Gly Ser Arg Ala Thr Ile Gly Ala Gly Ala Val
370 375 380
Val Val Arg Asp Val Ser Asp Gly Met Thr Val Ala Gly Asn Pro Ala
385 390 395 400
Lys Pro Leu Ala Gly Lys Asn Thr Glu Thr Leu Arg Ser
405 410
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<211> 1242
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 17
atgagtaaag ccgtcaaacg cctgttcgac atcatcgcat ccgcatcggg gctgattgtc 60
ctgtcgcccg tgtttttggt tttaatatac ctcatccgca aaaacttagg ttcgcccgtc 120
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ctcggcacat acggcgaaat cgtttttctg gacgaccgca cccaaggcag cgtcaacggc 720
ttccccgtca tcggcacgac gctgctgctt gaaaacagtt tatcgcccga acaattcgac 780
atcaccgtcg ccgtcggcaa caaccgcatc cgccgccaaa tcaccgaaaa cgccgccgcg 840
ctcggcttca aactgcccgt tctgattcat cccgacgcga ccgtctcgcc ttctgcaata 900
atcggacaag gcagcgtcgt aatggcgaaa gccgtcgtac aggccggcag cgtattgaaa 960
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gtccacatca gcccgggcgc gcacctgtcg ggcaacacgc gtatcggcga agaaagccgg 1080
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aagcccctta cgggcaaaaa ccccaagacc gggacggcat aa 1242
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 18
Met Ser Lys Ala Val Lys Arg Leu Phe Asp Ile Ile Ala Ser Ala Ser
1 5 10 15
Gly Leu Ile Val Leu Ser Pro Val Phe Leu Val Leu Ile Tyr Leu Ile
20 25 30
Arg Lys Asn Leu Gly Ser Pro Val Phe Phe Ile Arg Glu Arg Pro Gly
35 40 45
Lys Asp Gly Lys Pro Phe Lys Met Val Lys Phe Arg Ser Met Arg Asp
50 55 60
Ala Leu Asp Ser Asp Gly Ile Pro Leu Pro Asp Ser Glu Arg Leu Thr
65 70 75 80
Asp Phe Gly Lys Lys Leu Arg Ala Thr Ser Leu Asp Glu Leu Pro Glu
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Leu Trp Asn Val Leu Lys Gly Glu Met Ser Leu Val Gly Pro Arg Pro
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Leu Leu Met Gln Tyr Leu Pro Leu Tyr Asn Lys Phe Gln Asn Arg Arg
115 120 125
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Asn Ala Leu Ser Trp Asp Glu Lys Phe Ser Cys Asp Val Trp Tyr Thr
145 150 155 160
Asp Asn Phe Ser Phe Trp Leu Asp Met Lys Ile Leu Phe Leu Thr Val
165 170 175
Lys Lys Val Leu Ile Lys Glu Gly Ile Ser Ala Gln Gly Glu Ala Thr
180 185 190
Met Pro Pro Phe Ala Gly Asn Arg Lys Leu Ala Val Ile Gly Ala Gly
195 200 205
Gly His Gly Lys Val Val Ala Glu Leu Ala Ala Ala Leu Gly Thr Tyr
210 215 220
Gly Glu Ile Val Phe Leu Asp Asp Arg Thr Gln Gly Ser Val Asn Gly
225 230 235 240
Phe Pro Val Ile Gly Thr Thr Leu Leu Leu Glu Asn Ser Leu Ser Pro
245 250 255
Glu Gln Phe Asp Ile Thr Val Ala Val Gly Asn Asn Arg Ile Arg Arg
260 265 270
Gln Ile Thr Glu Asn Ala Ala Ala Leu Gly Phe Lys Leu Pro Val Leu
275 280 285
Ile His Pro Asp Ala Thr Val Ser Pro Ser Ala Ile Ile Gly Gln Gly
290 295 300
Ser Val Val Met Ala Lys Ala Val Val Gln Ala Gly Ser Val Leu Lys
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Asp Gly Val Ile Val Asn Thr Ala Ala Thr Val Asp His Asp Cys Leu
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Leu Asp Ala Phe Val His Ile Ser Pro Gly Ala His Leu Ser Gly Asn
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
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<210> 20
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (79)..(79)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 20
Asn His Met Ala Ile Val Ile Asp Glu Tyr Gly Gly Thr Ser Gly Leu
1 5 10 15
Val Thr Phe Glu Asp Ile Ile Glu Gln Ile Val Gly Glu Ile Glu Asp
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Glu Phe Asp Glu Asp Asp Ser Ala Asp Asn Ile His Ala Val Ser Ser
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Asp Thr Trp Arg Ile His Ala Ala Thr Glu Ile Glu Asp Ile Asn Thr
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Pro Ala Tyr Ala Asp Gly Asp Pro Arg Glu Val Ser Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Arg Arg Phe Cys Thr Val
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 21
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gaatacagca gcgaagaagc cgacaccatt cggcctggtc attcaagagt tgggacatct 720
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<210> 22
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 22
Met Asp Gly Ala Gln Pro Lys Thr Asn Phe Phe Glu Arg Leu Ile Ala
1 5 10 15
Arg Leu Ala Arg Glu Pro Asp Ser Ala Glu Asp Val Leu Asn Leu Leu
20 25 30
Arg Gln Ala His Glu Gln Glu Val Phe Asp Ala Asp Thr Leu Leu Arg
35 40 45
Leu Glu Lys Val Leu Asp Phe Ser Asp Leu Glu Val Arg Asp Ala Met
50 55 60
Ile Thr Arg Ser Arg Met Asn Val Leu Lys Glu Asn Asp Ser Ile Glu
65 70 75 80
Arg Ile Thr Ala Tyr Val Ile Asp Thr Ala His Ser Arg Phe Pro Val
85 90 95
Ile Gly Glu Asp Lys Asp Glu Val Leu Gly Ile Leu His Ala Lys Asp
100 105 110
Leu Leu Lys Tyr Met Phe Asn Pro Glu Gln Phe His Leu Lys Ser Ile
115 120 125
Leu Arg Pro Ala Val Phe Val Pro Glu Gly Lys Ser Leu Thr Ala Leu
130 135 140
Leu Lys Glu Phe Arg Glu Gln Arg Asn His Met Ala Ile Val Ile Asp
145 150 155 160
Glu Tyr Gly Gly Thr Ser Gly Leu Val Thr Phe Glu Asp Ile Ile Glu
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Gln Ile Val Gly Glu Ile Glu Asp Glu Phe Asp Glu Asp Asp Ser Ala
180 185 190
Asp Asn Ile His Ala Val Ser Ser Glu Arg Trp Arg Ile His Ala Ala
195 200 205
Thr Glu Ile Glu Asp Ile Asn Thr Phe Phe Gly Thr Glu Tyr Ser Ser
210 215 220
Glu Glu Ala Asp Thr Ile Arg Pro Gly His Ser Arg Val Gly Thr Ser
225 230 235 240
Ala Arg Ala Arg Arg Lys Ser Pro Tyr Arg Arg Phe Ala Val His Arg
245 250 255
Arg Thr Arg Arg Gln Pro Pro Pro Ala Tyr Ala Asp Gly Asp Pro Arg
260 265 270
Glu Val Ser Thr Ala Val Ser Ala Gln Phe Arg Met Thr Val Arg Ala
275 280 285
Phe Ser Val Ser Ile Arg Pro Ile Arg Gln Thr
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<220>
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taa 903
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 24
Met Asp Gly Ala Gln Pro Lys Thr Asn Phe Xaa Xaa Arg Leu Ile Ala
1 5 10 15
Arg Leu Ala Arg Glu Pro Asp Ser Ala Glu Asp Val Leu Thr Leu Leu
20 25 30
Arg Gln Ala His Glu Gln Glu Val Phe Asp Ala Asp Thr Leu Leu Arg
35 40 45
Leu Glu Lys Val Leu Asp Phe Ser Asp Leu Glu Val Arg Asp Ala Met
50 55 60
Ile Thr Arg Ser Arg Met Asn Val Leu Lys Glu Asn Asp Ser Ile Glu
65 70 75 80
Arg Ile Thr Ala Tyr Val Ile Asp Thr Ala His Ser Arg Phe Pro Val
85 90 95
Ile Gly Glu Asp Lys Asp Glu Val Leu Gly Ile Leu His Ala Lys Asp
100 105 110
Leu Leu Lys Tyr Met Phe Asn Pro Glu Gln Phe His Leu Lys Ser Ile
115 120 125
Leu Arg Pro Ala Val Phe Val Pro Glu Gly Lys Ser Leu Thr Ala Leu
130 135 140
Leu Lys Glu Phe Arg Glu Gln Arg Asn His Met Ala Ile Val Ile Asp
145 150 155 160
Glu Tyr Gly Gly Thr Ser Gly Leu Val Thr Phe Glu Asp Ile Ile Glu
165 170 175
Gln Ile Val Gly Asp Ile Glu Asp Glu Phe Asp Glu Asp Glu Ser Ala
180 185 190
Asp Asn Ile His Ala Val Ser Ala Glu Arg Trp Arg Ile His Ala Ala
195 200 205
Thr Glu Ile Glu Asp Ile Asn Ala Phe Phe Gly Thr Glu Tyr Ser Ser
210 215 220
Glu Glu Ala Asp Thr Ile Gly Gly Xaa Gly His Ser Gly Ile Gly Thr
225 230 235 240
Pro Ala Arg Ala Arg Arg Lys Ser Xaa Tyr Arg Arg Xaa Ala Xaa His
245 250 255
Xaa Arg Xaa Arg Xaa Gln Pro Pro Pro Ala Tyr Ala Asp Gly Asp Pro
260 265 270
Arg Glu Val Ser Ser Ala Val Ser Val Gln Phe Arg Met Thr Val Arg
275 280 285
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
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n 1
<210> 26
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 26
Met Asp Gly Ala Gln Pro Lys Thr Asn Phe Phe Glu Arg Leu Ile Ala
1 5 10 15
Arg Leu Ala Arg Glu Pro Asp Ser Ala Glu Asp Val Leu Asn Leu Leu
20 25 30
Arg Gln Ala His Glu Gln Glu Val Phe Asp Ala Asp Thr Leu Thr Arg
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Leu Glu Lys Val Leu Asp Phe Ala Glu Leu Glu Val Arg Asp Ala Met
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Ile Thr Arg Ser Arg Met Asn Val Leu Lys Glu Asn Asp Ser Ile Glu
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Arg Ile Thr Ala Tyr Val Ile Asp Thr Ala His Ser Arg Phe Pro Val
85 90 95
Ile Gly Glu Asp Lys Asp Glu Val Leu Gly Ile Leu His Ala Lys Asp
100 105 110
Leu Leu Lys Tyr Met Phe Asn Pro Glu Gln Phe His Leu Lys Ser Val
115 120 125
Leu Arg Pro Ala Val Phe Val Pro Glu Gly Lys Ser Leu Thr Ala Leu
130 135 140
Leu Lys Glu Phe Arg Glu Gln Arg Asn His Met Ala Ile Val Ile Asp
145 150 155 160
Glu Tyr Gly Gly Thr Ser Gly Leu Val Thr Phe Glu Asp Ile Ile Glu
165 170 175
Gln Ile Val Gly Asp Ile Glu Asp Glu Phe Asp Glu Asp Glu Ser Ala
180 185 190
Asp Asp Ile His Ser Val Ser Ala Glu Arg Trp Arg Ile His Ala Ala
195 200 205
Thr Glu Ile Glu Asp Ile Asn Ala Phe Phe Gly Thr Glu Tyr Gly Ser
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Glu Glu Ala Asp Thr Ile Arg Arg Leu Gly His Ser Gly Ile Gly Thr
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Pro Ala Arg Ala Arg Arg Lys Ser Pro Tyr Arg Arg Phe Ala Val His
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<210> 28
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 28
Met Asp Gly Ala Gln Pro Lys Thr Asn Phe Phe Glu Arg Leu Ile Ala
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Arg Leu Ala Arg Glu Pro Asp Ser Ala Glu Asp Val Leu Asn Leu Leu
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 29
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Met Arg Gly Gly Arg Pro Asp Ser Val Thr Val Gln Ile Ile Glu Gly
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Xaa Xaa Ser Val Ile Tyr Gly Met Gly Ala Ala Tyr Lys Gly Lys Ile
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<213> Neisseria meningitidis
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<220>
<221> misc_feature
<222> (1165)..(1165)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (1609)..(1609)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 43
atgttacccg cccgtttcac cattttatct gtgctcgcgg cagccctgct tgccgggcag 60
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<222> (73)..(73)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (320)..(320)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (537)..(537)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 44
Met Leu Pro Ala Arg Phe Thr Ile Leu Ser Val Leu Ala Ala Ala Leu
1 5 10 15
Leu Ala Gly Gln Ala Tyr Ala Ala Gly Ala Ala Asp Ala Lys Pro Pro
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Lys Glu Val Gly Lys Val Phe Arg Lys Gln Gln Arg Tyr Ser Glu Glu
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Glu Ile Lys Asn Glu Arg Ala Arg Leu Ala Ala Val Gly Glu Arg Val
50 55 60
Asn Gln Ile Phe Thr Leu Leu Gly Xaa Glu Thr Ala Leu Gln Lys Gly
65 70 75 80
Gln Ala Gly Thr Ala Leu Ala Thr Tyr Met Leu Met Leu Glu Arg Thr
85 90 95
Lys Ser Pro Glu Val Ala Glu Arg Ala Leu Glu Met Ala Val Ser Leu
100 105 110
Asn Ala Phe Glu Gln Ala Glu Met Ile Tyr Gln Lys Trp Arg Gln Ile
115 120 125
Glu Pro Ile Pro Gly Lys Ala Gln Lys Arg Ala Gly Trp Leu Arg Asn
130 135 140
Val Leu Arg Glu Arg Gly Asn Gln His Leu Asp Gly Leu Glu Glu Xaa
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Leu Ala Gln Ala Asp Glu Xaa Gln Asn Arg Arg Val Phe Leu Leu Leu
165 170 175
Ala Gln Ala Ala Val Gln Gln Asp Gly Leu Ala Gln Lys Ala Ser Lys
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Ala Val Arg Arg Ala Ala Leu Arg Tyr Glu His Leu Pro Glu Ala Ala
195 200 205
Val Ala Asp Val Val Phe Ser Val Gln Xaa Arg Glu Lys Glu Lys Ala
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Ile Gly Ala Leu Gln Arg Leu Ala Lys Leu Asp Thr Glu Ile Leu Pro
225 230 235 240
Pro Thr Leu Met Thr Leu Arg Leu Thr Ala Arg Lys Tyr Pro Glu Ile
245 250 255
Leu Asp Gly Phe Phe Glu Gln Thr Asp Thr Gln Asn Leu Ser Ala Val
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Trp Gln Glu Met Glu Ile Met Asn Leu Val Ser Leu His Arg Leu Asp
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Asp Ala Tyr Ala Arg Leu Asn Val Leu Leu Glu Arg Asn Pro Asn Ala
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Asp Leu Tyr Ile Gln Ala Ala Ile Leu Ala Ala Asn Arg Lys Glu Xaa
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Ala Ser Val Ile Asp Gly Tyr Ala Glu Lys Ala Tyr Gly Arg Gly Thr
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Gly Glu Gln Arg Gly Arg Ala Ala Met Thr Ala Ala Met Ile Tyr Ala
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Asp Arg Arg Asp Tyr Thr Lys Val Arg Gln Trp Leu Lys Lys Val Ser
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Ala Pro Glu Tyr Leu Phe Asp Lys Gly Val Leu Ala Ala Ala Ala Ala
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Val Glu Leu Asp Xaa Gly Arg Ala Ala Leu Arg Gln Ile Gly Arg Val
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Arg Lys Leu Pro Glu Gln Gln Gly Arg Tyr Phe Thr Ala Asp Asn Leu
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Asp Arg Leu Gly Lys Arg Lys Lys Met Ile Ser Asp Leu Glu Arg Ala
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Phe Arg Leu Ala Pro Asp Asn Ala Gln Ile Met Asn Asn Leu Gly Tyr
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Ser Leu Leu Ser Asp Ser Lys Arg Leu Asp Glu Gly Phe Ala Leu Leu
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Tyr Leu Arg Tyr Ser Phe Glu Asn Asp Pro Glu Pro Glu Val Ala Ala
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<221> misc_feature
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Met Ile Met Leu Pro Ala Arg Phe Thr Ile Leu Ser Val Leu Ala Ala
1 5 10 15
Ala Leu Leu Ala Gly Gln Ala Tyr Ala Ala Gly Ala Ala Asp Val Glu
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Leu Pro Lys Glu Val Gly Lys Val Leu Arg Lys His Arg Arg Tyr Ser
35 40 45
Glu Glu Glu Ile Lys Asn Glu Arg Ala Arg Leu Ala Ala Val Gly Glu
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Arg Val Asn Arg Val Phe Thr Leu Leu Gly Gly Glu Thr Ala Leu Gln
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Lys Gly Gln Ala Gly Thr Ala Leu Ala Thr Tyr Met Leu Met Leu Glu
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Glu Val Pro Ala Gln Ser Asp Tyr Val His Gln Pro Met Ile Phe Leu
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Leu Leu Val Gln Ala Ala Val Gln His Gly Gly Val Ala Gln Lys Pro
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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caggcggcac accttagggg agacaagaaa atatggcggg agacgctcaa acgctacgga 1800
atcgccttgc ccgagccttc ccgaaaaccc cggaaataa 1839
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<211> 612
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 48
Met Leu Pro Ala Arg Phe Thr Ile Leu Ser Val Leu Ala Ala Ala Leu
1 5 10 15
Leu Ala Gly Gln Ala Tyr Ala Ala Gly Ala Ala Asp Val Glu Leu Pro
20 25 30
Lys Glu Val Gly Lys Val Leu Arg Lys His Arg Arg Tyr Ser Glu Glu
35 40 45
Glu Ile Lys Asn Glu Arg Ala Arg Leu Ala Ala Val Gly Glu Arg Val
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Asn Arg Val Phe Thr Leu Leu Gly Gly Glu Thr Ala Leu Gln Lys Gly
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Gln Ala Gly Thr Ala Leu Ala Thr Tyr Met Leu Met Leu Glu Arg Thr
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Lys Ser Pro Glu Val Ala Glu Arg Ala Leu Glu Met Ala Val Ser Leu
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Asn Ala Phe Glu Gln Ala Glu Met Ile Tyr Gln Lys Trp Arg Gln Ile
115 120 125
Glu Pro Ile Pro Gly Glu Ala Gln Lys Pro Ala Gly Trp Leu Arg Asn
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Val Leu Lys Glu Gly Gly Asn Gln His Leu Asp Gly Leu Lys Glu Val
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Leu Ala Gln Ser Asp Asp Val Gln Lys Arg Arg Ile Phe Leu Leu Leu
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Val Gln Ala Ala Val Gln Gln Gly Gly Val Ala Gln Lys Ala Ser Lys
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Ala Val Arg Arg Ala Ala Leu Lys Tyr Glu His Leu Pro Glu Ala Ala
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Val Ala Asp Ala Val Phe Gly Val Gln Gly Arg Glu Lys Glu Lys Ala
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Pro Thr Leu Met Thr Leu Arg Leu Thr Ala Arg Lys Tyr Pro Glu Ile
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Leu Asp Gly Phe Phe Glu Gln Thr Asp Thr Gln Asn Leu Ser Ala Val
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Trp Gln Glu Met Glu Ile Met Asn Leu Val Ser Leu Arg Lys Pro Asp
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Asn Leu Tyr Ile Gln Ala Ala Ile Leu Ala Ala Asn Arg Lys Glu Gly
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Ala Ser Val Ile Asp Gly Tyr Ala Glu Lys Ala Tyr Gly Arg Gly Thr
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Gly Glu Gln Arg Gly Arg Ala Ala Met Thr Ala Ala Met Ile Tyr Ala
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Asp Arg Arg Asp Tyr Ala Lys Val Arg Gln Trp Leu Lys Lys Val Ser
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Ala Glu Leu Asp Gly Gly Arg Ala Ala Leu Arg Gln Ile Gly Arg Val
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Arg Lys Leu Pro Glu Gln Gln Gly Arg Tyr Phe Thr Ala Asp Asn Leu
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Ser Lys Ile Gln Met Leu Ala Leu Ser Lys Leu Pro Asp Lys Arg Glu
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Ala Leu Ile Gly Leu Asn Asn Ile Ile Ala Lys Leu Ser Ala Ala Gly
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Ser Thr Glu Pro Leu Ala Glu Ala Leu Ala Gln Arg Ser Ile Ile Tyr
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Leu Lys Leu Thr Pro Asp Asn Ala Gln Ile Met Asn Asn Leu Gly Tyr
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Ala Ala Pro Lys Leu Gln Ala Ile Lys Glu Lys Tyr Gly Asp Asp Arg
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Met Ala Gln Gln Gln Ala Met Met Gln Leu Tyr Thr Asp Glu Lys Ile
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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1 5 10 15
Met Ile Gly Trp Glu Lys Met Phe Pro Thr Pro Lys Pro Val Pro Ala
20 25 30
Pro Gln Gln Ala Ala Gln Gln Gln Ala Val Thr Ala Ser Ala Glu Ala
35 40 45
Ala Leu Ala Pro Ala Thr Pro Ile Thr Val Thr Thr Asp Thr Val Gln
50 55 60
Ala Val Ile Asp Glu Lys Ser Gly Asp Leu Arg Arg Leu Thr Leu Leu
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Ser Tyr Leu Val Asn Val Arg Phe Asp Ile Ala Asn Gly Ser Gly Gln
165 170 175
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545
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naaangatgt tccccactcc gaagcccgtc cccgcgcccc aacagacggc acaacaacag 120
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aaatacaaag caaccggcga cnaaaataaa ccgttcatcc tgtttggcga cggcaaanaa 300
tacacctacn tcgcccantc cgaacttttg gacgcgcagg gcaacaacat tctaaaaggc 360
atcggcttta gcgcaccgaa aaaacagtac agcttggaag gcgacaaagt tgaagtccgc 420
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<212> PRT
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Xaa Xaa Asp Ile Lys Arg Arg Asn Asp Lys Leu Tyr Ser Thr Ser Val
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gacaagctgt acagcgcaag cgtcagcgtg cctttaaccg ctatcccaac ccgggggcca 900
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130 135 140
Glu Thr Asn Gly Leu Lys Ile Asp Lys Val Tyr Thr Phe Thr Lys Asp
145 150 155 160
Ser Tyr Leu Val Asn Val Arg Phe Asp Ile Ala Asn Gly Ser Gly Gln
165 170 175
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Asp Asp Ala Lys Ser Gly Lys Ser Glu Ala Glu Tyr Ile Arg Lys Thr
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Pro Thr Gly Trp Leu Gly Met Ile Glu His His Phe Met Ser Thr Trp
245 250 255
Ile Leu Gln Pro Lys Gly Gly Gln Asn Val Cys Ala Gln Gly Asp Cys
260 265 270
Arg Ile Asp Ile Lys Arg Arg Asn Asp Lys Leu Tyr Ser Ala Ser Val
275 280 285
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Ile Met Pro Leu Val Phe Ser Val Met Phe Phe Phe Phe Pro Ala Gly
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Leu Val Leu Tyr Trp Val Val Asn Asn Leu Leu Thr Ile Ala Gln Gln
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Val Ser
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Ala Val Leu Ile Ile Glu Leu Leu Thr Gly Thr Val Tyr Leu Leu Val
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Val Ser Ala Ala Leu Ala Gly Ser Gly Ile Ala Tyr Gly Leu Thr Gly
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ttggcgggtt cgggcattgc ttacgggctg accggcagta cgcctgccgc cgtcttgacc 120
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Ala Val Leu Ile Ile Glu Leu Leu Thr Gly Thr Val Tyr Leu Leu Val
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Val Ser Ala Ala Leu Ala Gly Ser Gly Ile Ala Tyr Gly Leu Thr Gly
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> n is a, c, g, or t
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atgcaagcac ggctgctgat acctattctt ttttcagttt ttattttatc cgcntgcggg 60
acactgacag gtattccatc gcatggcgga gktaaacgct ttgcgtcgaa caagaacttg 120
tggccgcttc tgccagagct gccgttaaag acatggattt acaggcatta cacggacgaa 180
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cgctactcca ttgatgcack grtwcstggc gaatacataa acagccctgc cgtccgtacc 300
gattacacct atccacgtta cgaaaccacc gctgaaacaa catcaggcgg tttgacaggt 360
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<211> 213
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<222> (31)..(31)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<222> (87)..(89)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 78
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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gccgtcgcat tcaaaacact gcataccggt cgtcagacgg catcccgccc gctgcccggg 420
ctgcccggac tgactgcggt ttccacactg ttcggcgcaa tgtcgagctg ggtcggcata 480
ggcggcggtt cactttccgt ccccttctta atccactgcg gcttccccgc ccataaagcc 540
atcggcacat catccggcct tgcctggccg attgcactct ccggcgcaat atcgtatctg 600
gtcaacggtc tgaatattgc aggattgccc gaagggtcgc tgggcttcct ttacctgccc 660
gccgtcgccg tcctcagcgc ggcaaccatt gcctttgccc cgctcggtgt caaaaccgcc 720
cacaaacttt cttctgccaa actcaaagaa tccttcggca ttatgttgct tttgattgcc 780
ggaaaaatgc tgtacaacct gctttaa 807
<210> 94
<211> 268
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 94
Met Trp His Trp Asp Ile Ile Leu Ile Leu Leu Ala Val Gly Ser Ala
1 5 10 15
Ala Gly Phe Ile Ala Gly Leu Phe Gly Val Gly Gly Gly Thr Leu Ile
20 25 30
Val Pro Val Val Leu Trp Val Leu Asp Leu Gln Gly Leu Ala Gln His
35 40 45
Pro Tyr Ala Gln His Leu Ala Val Gly Thr Ser Phe Ala Val Met Val
50 55 60
Phe Thr Ala Phe Ser Ser Met Leu Gly Gln His Lys Lys Gln Ala Val
65 70 75 80
Asp Trp Lys Thr Ile Phe Ala Met Met Pro Gly Met Ile Phe Gly Val
85 90 95
Phe Ala Gly Ala Leu Ser Ala Lys Tyr Ile Pro Ala Phe Gly Leu Gln
100 105 110
Ile Phe Phe Ile Leu Phe Leu Thr Ala Val Ala Phe Lys Thr Leu His
115 120 125
Thr Gly Arg Gln Thr Ala Ser Arg Pro Leu Pro Gly Leu Pro Gly Leu
130 135 140
Thr Ala Val Ser Thr Leu Phe Gly Ala Met Ser Ser Trp Val Gly Ile
145 150 155 160
Gly Gly Gly Ser Leu Ser Val Pro Phe Leu Ile His Cys Gly Phe Pro
165 170 175
Ala His Lys Ala Ile Gly Thr Ser Ser Gly Leu Ala Trp Pro Ile Ala
180 185 190
Leu Ser Gly Ala Ile Ser Tyr Leu Val Asn Gly Leu Asn Ile Ala Gly
195 200 205
Leu Pro Glu Gly Ser Leu Gly Phe Leu Tyr Leu Pro Ala Val Ala Val
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Leu Ser Ala Ala Thr Ile Ala Phe Ala Pro Leu Gly Val Lys Thr Ala
225 230 235 240
His Lys Leu Ser Ser Ala Lys Leu Lys Glu Ser Phe Gly Ile Met Leu
245 250 255
Leu Leu Ile Ala Gly Lys Met Leu Tyr Asn Leu Leu
260 265
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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ggaaacggat ggcaggcaga ccccgaacat ccgctgctcg ggctttttgc cgtcagtaat 60
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 96
Gly Asn Gly Trp Gln Ala Asp Pro Glu His Pro Leu Leu Gly Leu Phe
1 5 10 15
Ala Val Ser Asn Val Ser Met Thr Leu Ala Phe Val Gly Ile Cys Ala
20 25 30
Leu Val His Tyr Cys Phe Ser Gly Thr Val Gln Val Phe Val Phe Ala
35 40 45
Ala Leu Leu Lys Leu Tyr Ala Leu Lys Pro Val Tyr Trp Phe Val Leu
50 55 60
Gln Phe Val Leu Met Ala Val Ala Tyr Val His Arg Cys Gly Ile Asp
65 70 75 80
Arg Gln Pro Pro Ser Thr Phe Gly Gly Ser Gln Leu Arg Leu Gly Gly
85 90 95
Leu Thr Ala Ala Leu Met Gln Val Ser Val Leu Val Leu Leu Leu Ser
100 105 110
Glu Ile Gly Arg
115
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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atgattttgc tgcatttgga ttttttgtct gccttactgt atgcggcggt ttttctgttt 60
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Met Ile Leu Leu His Leu Asp Phe Leu Ser Ala Leu Leu Tyr Ala Ala
1 5 10 15
Val Phe Leu Phe Leu Ile Phe Arg Ala Gly Met Leu Gln Trp Phe Trp
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Ala Ser Ile Met Leu Trp Leu Gly Ile Ser Val Leu Gly Ala Lys Leu
35 40 45
Met Pro Gly Ile Trp Gly Met Thr Arg Ala Ala Pro Leu Phe Ile Pro
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His Phe Tyr Leu Thr Leu Gly Ser Ile Phe Phe Phe Ile Gly His Trp
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Asn Arg Lys Thr Asp Gly Asn Gly Trp Gln Ala Asp Pro Glu His Pro
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Leu Leu Gly Leu Phe Ala Val Ser Asn Val Ser Met Thr Leu Ala Phe
100 105 110
Val Gly Ile Cys Ala Leu Val His Tyr Cys Phe Ser Gly Thr Val Gln
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Val Phe Val Phe Ala Ala Leu Leu Lys Leu Tyr Ala Leu Lys Pro Val
130 135 140
Tyr Trp Phe Val Leu Gln Phe Val Leu Met Ala Val Ala Tyr Val His
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Arg Cys Gly Ile Asp Arg Gln Pro Pro Ser Thr Phe Gly Gly Ser Gln
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Leu Arg Leu Gly Gly Leu Thr Ala Ala Leu Met Gln Val Ser Val Leu
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Val Leu Leu Leu Ser Glu Ile Gly Arg
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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Met Ile Leu Leu His Leu Asp Phe Leu Ser Ala Leu Leu Tyr Ala Ala
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Val Phe Leu Phe Leu Ile Phe Arg Ala Gly Met Leu Gln Trp Phe Trp
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Ala Ser Ile Met Leu Trp Leu Gly Ile Ser Val Leu Gly Ala Lys Leu
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Met Pro Gly Ile Trp Gly Met Thr Arg Ala Ala Pro Leu Phe Ile Pro
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His Phe Tyr Leu Thr Leu Gly Ser Ile Phe Phe Phe Ile Gly His Trp
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Asn Arg Lys Thr Asp Gly Asn Gly Trp Gln Ala Asp Pro Glu His Pro
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Leu Leu Gly Leu Phe Ala Val Ser Asn Val Ser Met Thr Leu Ala Phe
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Val Gly Ile Cys Ala Leu Val His Tyr Cys Phe Ser Xaa Thr Val Gln
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Val Phe Val Phe Ala Ala Leu Leu Lys Leu Tyr Ala Leu Lys Pro Val
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Tyr Trp Phe Val Leu Gln Phe Val Leu Met Ala Val Ala Tyr Val His
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Arg Cys Gly Ile Asp Arg Gln Pro Pro Ser Thr Phe Gly Gly Ser Gln
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Leu Arg Leu Gly Gly Leu Thr Ala Ala Leu Met Gln Xaa Ser Val Leu
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Val Leu Leu Leu Ser Glu Ile Gly Arg
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atgattttgc tgcatttgga ttttttgtct gccttactgt atgcggcggt ttttctgttt 60
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agatga 606
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<211> 201
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 102
Met Ile Leu Leu His Leu Asp Phe Leu Ser Ala Leu Leu Tyr Ala Ala
1 5 10 15
Val Phe Leu Phe Leu Ile Phe Arg Ala Gly Met Leu Gln Trp Phe Trp
20 25 30
Ala Ser Ile Ala Leu Trp Leu Gly Ile Ser Val Leu Gly Val Lys Leu
35 40 45
Met Pro Gly Met Trp Gly Met Thr Arg Ala Ala Pro Leu Phe Ile Pro
50 55 60
His Phe Tyr Leu Thr Leu Gly Ser Ile Phe Phe Phe Ile Gly Tyr Trp
65 70 75 80
Asn Arg Lys Thr Asp Gly Asn Gly Trp Gln Ala Asp Pro Glu His Pro
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Leu Leu Gly Leu Phe Ala Val Ser Asn Val Ser Met Thr Leu Ala Phe
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Val Gly Ile Cys Ala Leu Val His Tyr Cys Phe Ser Gly Thr Val Gln
115 120 125
Val Phe Val Phe Ala Ala Leu Leu Lys Leu Tyr Ala Leu Lys Pro Val
130 135 140
Tyr Trp Phe Val Leu Gln Phe Val Leu Met Ala Val Ala Tyr Val His
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Arg Cys Gly Ile Asp Arg Gln Pro Pro Ser Thr Phe Gly Gly Ser Gln
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Leu Arg Leu Gly Val Leu Ala Ala Met Leu Met Gln Val Ala Val Thr
180 185 190
Ala Met Leu Leu Ala Glu Ile Gly Arg
195 200
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (103)..(103)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 104
Met Lys Thr Pro Leu Leu Lys Pro Leu Leu Ile Thr Ser Leu Pro Val
1 5 10 15
Phe Ala Ser Val Phe Thr Ala Ala Ser Ile Val Trp Gln Leu Gly Glu
20 25 30
Pro Lys Leu Ala Met Pro Phe Val Leu Gly Ile Ile Ala Gly Gly Leu
35 40 45
Val Asp Leu Asp Asn Xaa Xaa Thr Gly Arg Leu Lys Asn Ile Ile Thr
50 55 60
Thr Val Ala Leu Phe Thr Leu Ser Ser Leu Thr Ala Gln Ser Thr Leu
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Gly Thr Gly Leu Pro Phe Ile Leu Ala Met Thr Leu Met Thr Xaa Xaa
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Phe Thr Ile Leu Gly Ala Xaa
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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atgaaaaccc cactcctcaa gcctctgctc attacctcgc ttcccgtttt cgccagtgtt 60
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gcagtcagct acctgtggcc agactggaaa tacctcacgc tcgaacgcac cgccgccctt 1620
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<210> 106
<211> 716
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 106
Met Lys Thr Pro Leu Leu Lys Pro Leu Leu Ile Thr Ser Leu Pro Val
1 5 10 15
Phe Ala Ser Val Phe Thr Ala Ala Ser Ile Val Trp Gln Leu Gly Glu
20 25 30
Pro Lys Leu Ala Met Pro Phe Val Leu Gly Ile Ile Ala Gly Gly Leu
35 40 45
Val Asp Leu Asp Asn Arg Leu Thr Gly Arg Leu Lys Asn Ile Ile Thr
50 55 60
Thr Val Ala Leu Phe Thr Leu Ser Ser Leu Thr Ala Gln Ser Thr Leu
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Gly Thr Gly Leu Pro Phe Ile Leu Ala Met Thr Leu Met Thr Phe Gly
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Phe Thr Ile Leu Gly Ala Val Gly Leu Lys Tyr Arg Thr Phe Ala Phe
100 105 110
Gly Ala Leu Ala Val Ala Thr Tyr Thr Thr Leu Thr Tyr Thr Pro Glu
115 120 125
Thr Tyr Trp Leu Thr Asn Pro Phe Met Ile Leu Cys Gly Thr Val Leu
130 135 140
Tyr Ser Thr Ala Ile Leu Leu Phe Gln Ile Val Leu Pro His Arg Pro
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Val Gln Glu Ser Val Ala Asn Ala Tyr Asp Ala Leu Gly Gly Tyr Leu
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Glu Ala Lys Ala Asp Phe Phe Asp Pro Asp Glu Ala Ala Trp Ile Gly
180 185 190
Asn Arg His Ile Asp Leu Ala Met Ser Asn Thr Gly Val Ile Thr Ala
195 200 205
Phe Asn Gln Cys Arg Ser Ala Leu Phe Tyr Arg Leu Arg Gly Lys His
210 215 220
Arg His Pro Arg Thr Ala Lys Met Leu Arg Tyr Tyr Phe Ala Ala Gln
225 230 235 240
Asp Ile His Glu Arg Ile Ser Ser Ala His Val Asp Tyr Gln Glu Met
245 250 255
Ser Glu Lys Phe Lys Asn Thr Asp Ile Ile Phe Arg Ile His Arg Leu
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Leu Glu Met Gln Gly Gln Ala Cys Arg Asn Thr Ala Gln Ala Leu Arg
275 280 285
Ala Ser Lys Asp Tyr Val Tyr Ser Lys Arg Leu Gly Arg Ala Ile Glu
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Gly Cys Arg Gln Ser Leu Arg Leu Leu Ser Asp Ser Asn Asp Ser Pro
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Asp Ile Arg His Leu Arg Arg Leu Leu Asp Asn Leu Gly Ser Val Asp
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Gln Gln Phe Arg Gln Leu Gln His Asn Gly Leu Gln Ala Glu Asn Asp
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Phe Arg His Ala Val Arg Leu Ser Leu Val Val Ala Ala Ala Cys Thr
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Ile Val Glu Ala Leu Asn Leu Asn Leu Gly Tyr Trp Ile Leu Leu Thr
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Arg Gln Arg Ile Ala Gly Thr Val Leu Gly Val Ile Val Gly Ser Leu
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Val Pro Tyr Phe Thr Pro Ser Val Glu Thr Lys Leu Trp Ile Val Ile
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Ala Ser Thr Thr Leu Phe Phe Met Thr Arg Thr Tyr Lys Tyr Ser Phe
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Ser Thr Phe Phe Ile Thr Ile Gln Ala Leu Thr Ser Leu Ser Leu Ala
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Gly Leu Asp Val Tyr Ala Ala Met Pro Val Arg Ile Ile Asp Thr Ile
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Ile Gly Ala Ser Leu Ala Trp Ala Ala Val Ser Tyr Leu Trp Pro Asp
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Trp Lys Tyr Leu Thr Leu Glu Arg Thr Ala Ala Leu Ala Val Cys Ser
530 535 540
Asn Gly Ala Tyr Leu Glu Lys Ile Thr Glu Arg Leu Lys Ser Gly Glu
545 550 555 560
Thr Gly Asp Asp Val Glu Tyr Arg Ala Thr Arg Arg Arg Ala His Glu
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His Thr Ala Ala Leu Ser Ser Thr Leu Ser Asp Met Ser Ser Glu Pro
580 585 590
Ala Lys Phe Ala Asp Ser Leu Gln Pro Gly Phe Thr Leu Leu Lys Thr
595 600 605
Gly Tyr Ala Leu Thr Gly Tyr Ile Ser Ala Leu Gly Ala Tyr Arg Ser
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Glu Met His Glu Glu Cys Ser Pro Asp Phe Thr Ala Gln Phe His Leu
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<211> 2151
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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atgaaaaccc cacccctcaa gcctctgctc attacctcgc ttcccgtttt cgccagtgtc 60
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65 70 75 80
Glu Ala Phe Ile Arg His Val Ala Gly Met Leu Ser Phe Val Leu Val
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Ile Val Thr Ala Leu Gly Ile Leu Ala Ala Pro Trp Val Ile Tyr Val
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Ser Ala Pro Ser Phe Ala Gln Asp Ala Asp Lys Phe Gln Leu Ser Ile
115 120 125
Asp Leu Leu Arg Ile Thr Phe Pro Tyr Ile Leu Leu Ile Ser Leu Ser
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Ser Phe Val Gly Ser Val Leu Asn Ser Tyr His Lys Phe Gly Ile Pro
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Ala Phe Thr Pro Xaa Phe Leu Asn Val Ser Phe Ile Val Phe Ala Leu
165 170 175
Phe Phe Val Pro Tyr Phe Asp Pro Pro Val Thr Ala Xaa Ala Trp Ala
180 185 190
Val Phe Val Gly Gly Ile Leu Gln Leu Xaa Phe Gln Leu Pro Trp Leu
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Ala Lys Leu Gly Phe Leu Lys Leu Pro Lys Leu Ser Phe Lys Asp Ala
210 215 220
Ala Val Asn Arg Val Met Lys Gln Met Ala Pro Ala Ile Leu Gly Val
225 230 235 240
Ser Val Ala Gln Val Ser Leu Val Ile Asn Thr Ile Phe Ala Ser Tyr
245 250 255
Leu Gln Ser Gly Ser Val Ser Trp Met Tyr Tyr Ala Asp Arg Met Met
260 265 270
Glu Leu Pro Ser Gly Val Leu Gly Ala Ala Leu Gly Thr Ile Leu Leu
275 280 285
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290 295 300
Ala Leu Leu Asp Trp Gly Leu Arg Leu Cys Met Leu Leu Thr Leu Pro
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Ala Ala Val Gly Leu Ala Val Leu Ser Phe Pro Leu Val Ala Thr Leu
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Phe Met Tyr Arg Xaa Phe Thr Leu Phe Asp Ala Gln Met Thr Gln His
340 345 350
Ala Leu Ile Ala Tyr Ser Phe Gly Leu Ile Gly Leu Ile Met Ile Lys
355 360 365
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385 390 395 400
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450
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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gccgacaaat ttcagctctc catcgatttg ctgcggatta cgtttcctta tatattattg 420
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n 1
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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245 250 255
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260 265 270
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340 345 350
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355 360 365
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370 375 380
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405 410 415
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420 425 430
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435 440 445
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450 455 460
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<211> 474
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<222> (4)..(4)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (7)..(7)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (23)..(25)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 133
gcgncgnaaa tcatccatcc ccnnnacgtc gtaggccctg aagccaactg gttttttatg 60
gtagccagta cgtttgtgat tgctttgatt ggttattttg ttactgaaaa aatcgtcgaa 120
ccgcaattgg gcccttatca atcagatttg tcacaagaag aaaaagacat tcggcattcc 180
aatgaaatca cgcctttgga atataaagga ttaatttggg ctggcgtggt gtttgttgcc 240
ttatccgccc tattggcttg gagcatcgtc cctgccgacg gtattttgcg tcatcctgaa 300
acaggattgg tttccggttc gccgttttta aaatcgattg ttgtttttat tttcttgttg 360
tttgcactgc cgggcattgt ttatggccgg gtaacccgaa gtttgcgcgg cgaacaggaa 420
gtcgttaatg cgmyggccga atcgatgagt actctggsgc tttmtttgsw cakcatcttt 480
tttgccgcac agtttgtcgc attttttaat tggacgaata ttgggcaata tattgccgtt 540
aaaggggcga cgttcttaaa agaagtcggc ttgggcggca gcgtgttgtt tatcggtttt 600
attttaattt gtgcttttat caatctgatg ataggctccg cctccgcgca atgggcggta 660
actgcgccga ttttcgtccc tatgctgatg ttggccggct acgcgcccga agtcattcaa 720
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wctatgatgt tgccgtattc cgctttcttc ttgattgcgt ggattgcctt attctgcatt 900
tgggtatttg ttttgggcct gcccgtcggt cccggcgcgc ccacattcta tcccgcacct 960
taa 963
<210> 134
<211> 320
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (2)..(3)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (8)..(9)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (145)..(145)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (281)..(281)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 134
Ala Xaa Xaa Ile Ile His Pro Xaa Xaa Val Val Gly Pro Glu Ala Asn
1 5 10 15
Trp Phe Phe Met Val Ala Ser Thr Phe Val Ile Ala Leu Ile Gly Tyr
20 25 30
Phe Val Thr Glu Lys Ile Val Glu Pro Gln Leu Gly Pro Tyr Gln Ser
35 40 45
Asp Leu Ser Gln Glu Glu Lys Asp Ile Arg His Ser Asn Glu Ile Thr
50 55 60
Pro Leu Glu Tyr Lys Gly Leu Ile Trp Ala Gly Val Val Phe Val Ala
65 70 75 80
Leu Ser Ala Leu Leu Ala Trp Ser Ile Val Pro Ala Asp Gly Ile Leu
85 90 95
Arg His Pro Glu Thr Gly Leu Val Ser Gly Ser Pro Phe Leu Lys Ser
100 105 110
Ile Val Val Phe Ile Phe Leu Leu Phe Ala Leu Pro Gly Ile Val Tyr
115 120 125
Gly Arg Val Thr Arg Ser Leu Arg Gly Glu Gln Glu Val Val Asn Ala
130 135 140
Xaa Ala Glu Ser Met Ser Thr Leu Xaa Leu Xaa Leu Xaa Xaa Ile Phe
145 150 155 160
Phe Ala Ala Gln Phe Val Ala Phe Phe Asn Trp Thr Asn Ile Gly Gln
165 170 175
Tyr Ile Ala Val Lys Gly Ala Thr Phe Leu Lys Glu Val Gly Leu Gly
180 185 190
Gly Ser Val Leu Phe Ile Gly Phe Ile Leu Ile Cys Ala Phe Ile Asn
195 200 205
Leu Met Ile Gly Ser Ala Ser Ala Gln Trp Ala Val Thr Ala Pro Ile
210 215 220
Phe Val Pro Met Leu Met Leu Ala Gly Tyr Ala Pro Glu Val Ile Gln
225 230 235 240
Ala Ala Tyr Arg Ile Gly Asp Ser Val Thr Asn Ile Ile Thr Pro Met
245 250 255
Met Ser Tyr Phe Gly Leu Ile Met Ala Thr Val Xaa Xaa Tyr Lys Lys
260 265 270
Asp Ala Gly Val Gly Thr Leu Ile Xaa Met Met Leu Pro Tyr Ser Ala
275 280 285
Phe Phe Leu Ile Ala Trp Ile Ala Leu Phe Cys Ile Trp Val Phe Val
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Leu Gly Leu Pro Val Gly Pro Gly Ala Pro Thr Phe Tyr Pro Ala Pro
305 310 315 320
<210> 135
<211> 1568
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 135
atgagtcaaa ccgatacgca acgggacgga cgatttttac gcacagtcga atggctgggc 60
aatatgttgc cgcatccggt tacgcttttt attattttca ttgtgttatt gctgattgcc 120
tctgccgtcg gtgcgtattt cggactatcc gtccccgatc cgcgccctgt tggtgcgaaa 180
ggacgtgccg atgacggttt gatttacatt gtcagcctgc tcaatgccga cggttttatc 240
aaaatcctga cgcataccgt taaaaatttc accggtttcg cgccgttggg aacggtgttg 300
gtttctttat tgggcgtggg gattgcggaa aaatcgggct tgatttccgc attaatgcgc 360
ttattgctca caaaatcgcc acgcaaactc actactttta tggttgtttt tacagggatt 420
ttatctaata ccgcttctga attgggctat gtcgtcctaa tccctttgtc cgccatcatc 480
tttcattccc tcggccgcca tccgcttgcc ggtctgctgc ggctttcgcc ggcgtttcgg 540
gcggttattc ggccaatctg ttcttaggca caatcgatcc gctcttggca ggcatcaccc 600
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ttatggtagc cagtacgttt gtgattgctt tgattggtta ttttgttact gaaaaaatcg 720
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ttgccttatc cgccctattg gcttggagca tcgtccctgc cgacggtatt ttgcgtcatc 900
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aggaagtcgt taatgcgatg gccgaatcga tgagtactct ggggctttat ttggtcatca 1080
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caccttaa 1568
<210> 136
<211> 522
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 136
Met Ser Gln Thr Asp Thr Gln Arg Asp Gly Arg Phe Leu Arg Thr Val
1 5 10 15
Glu Trp Leu Gly Asn Met Leu Pro His Pro Val Thr Leu Phe Ile Ile
20 25 30
Phe Ile Val Leu Leu Leu Ile Ala Ser Ala Val Gly Ala Tyr Phe Gly
35 40 45
Leu Ser Val Pro Asp Pro Arg Pro Val Gly Ala Lys Gly Arg Ala Asp
50 55 60
Asp Gly Leu Ile Tyr Ile Val Ser Leu Leu Asn Ala Asp Gly Phe Ile
65 70 75 80
Lys Ile Leu Thr His Thr Val Lys Asn Phe Thr Gly Phe Ala Pro Leu
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Gly Thr Val Leu Val Ser Leu Leu Gly Val Gly Ile Ala Glu Lys Ser
100 105 110
Gly Leu Ile Ser Ala Leu Met Arg Leu Leu Leu Thr Lys Ser Pro Arg
115 120 125
Lys Leu Thr Thr Phe Met Val Val Phe Thr Gly Ile Leu Ser Asn Thr
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Ala Ser Glu Leu Gly Tyr Val Val Leu Ile Pro Leu Ser Ala Ile Ile
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Phe His Ser Leu Gly Arg His Pro Leu Ala Gly Leu Ala Ala Ala Phe
165 170 175
Ala Gly Val Ser Gly Gly Tyr Ser Ala Asn Leu Phe Leu Gly Thr Ile
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Asp Pro Leu Leu Ala Gly Ile Thr Gln Gln Ala Ala Gln Ile Ile His
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Pro Asp Tyr Val Val Gly Pro Glu Ala Asn Trp Phe Phe Met Val Ala
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Ser Thr Phe Val Ile Ala Leu Ile Gly Tyr Phe Val Thr Glu Lys Ile
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Val Glu Pro Gln Leu Gly Pro Tyr Gln Ser Asp Leu Ser Gln Glu Glu
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Lys Asp Ile Arg His Ser Asn Glu Ile Thr Pro Leu Glu Tyr Lys Gly
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Leu Ile Trp Ala Gly Val Val Phe Val Ala Leu Ser Ala Leu Leu Ala
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Trp Ser Ile Val Pro Ala Asp Gly Ile Leu Arg His Pro Glu Thr Gly
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Leu Val Ser Gly Ser Pro Phe Leu Lys Ser Ile Val Val Phe Ile Phe
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Leu Leu Phe Ala Leu Pro Gly Ile Val Tyr Gly Arg Val Thr Arg Ser
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Leu Arg Gly Glu Gln Glu Val Val Asn Ala Met Ala Glu Ser Met Ser
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Thr Leu Gly Leu Tyr Leu Val Ile Ile Phe Phe Ala Ala Gln Phe Val
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Ala Phe Phe Asn Trp Thr Asn Ile Gly Gln Tyr Ile Ala Val Lys Gly
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Ala Thr Phe Leu Lys Glu Val Gly Leu Gly Gly Ser Val Leu Phe Ile
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Gly Phe Ile Leu Ile Cys Ala Phe Ile Asn Leu Met Ile Gly Ser Ala
405 410 415
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Leu Ala Gly Tyr Ala Pro Glu Val Ile Gln Ala Ala Tyr Arg Ile Gly
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Leu Ile Ser Met Met Leu Pro Tyr Ser Ala Phe Phe Leu Ile Ala Trp
485 490 495
Ile Ala Leu Phe Cys Ile Trp Val Phe Val Leu Gly Leu Pro Val Gly
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Pro Gly Ala Pro Thr Phe Tyr Pro Ala Pro
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<210> 137
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 137
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<213> Neisseria meningitidis
<400> 138
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Ala Thr Phe Leu Lys Glu Val Gly Leu Gly Gly Ser Val Leu Phe Ile
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Leu Ala Gly Tyr Ala Pro Glu Val Ile Gln Ala Ala Tyr Arg Ile Gly
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Ile Ala Leu Phe Cys Ile Trp Val Phe Val Leu Gly Leu Pro Val Gly
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<210> 139
<211> 1569
<212> DNA
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<400> 139
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<223> n is a, c, g, or t
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acagccggcg cagcaggttn cncggtcttc gttttcgtaa cggacagtca ggtggaggtg 60
ttcgggaaca tccagaccgc agtggaaaca ggtttttttc atggcatttc ggtttcgtct 120
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ttttcagcaa cggaaatgcg gacggcggca atttttcccg cagcgtcgcg ccatatgccc 240
gtgttttgtt cttcagacgg cagcaggtcg gttttgttgt acaccttgat gcacggaata 300
tcgccggcat ggatttcttg cagtacgttt tccacgtctt caatctgctg tccgctgttc 360
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aggataatgc tgcattcggg act 503
<210> 142
<211> 167
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (7)..(8)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (152)..(152)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 142
Thr Ala Gly Ala Ala Gly Xaa Xaa Val Phe Val Phe Val Thr Asp Ser
1 5 10 15
Gln Val Glu Val Phe Gly Asn Ile Gln Thr Ala Val Glu Thr Gly Phe
20 25 30
Phe His Gly Ile Ser Val Ser Ser Val Phe Gly Ala Ala Ala Gln Asp
35 40 45
Ser Ala Met Ala Ser Arg Ser Ala Ser Ile Pro Val Phe Ser Ala Thr
50 55 60
Glu Met Arg Thr Ala Ala Ile Phe Pro Ala Ala Ser Arg His Met Pro
65 70 75 80
Val Phe Cys Ser Ser Asp Gly Ser Arg Ser Val Leu Leu Tyr Thr Leu
85 90 95
Met His Gly Ile Ser Pro Ala Trp Ile Ser Cys Ser Thr Phe Ser Thr
100 105 110
Ser Ser Ile Cys Cys Pro Leu Phe Gly Ala Ala Ala Ser Thr Thr Cys
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Ser Ser Thr Ser Ala Cys Ala Val Ser Ser Ser Val Ala Glu Lys Ala
130 135 140
Glu Ile Ser Leu Cys Gly Arg Xaa Leu Thr Asn Pro Thr Val Ser Val
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Arg Ile Met Leu His Ser Gly
165
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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atggaggatt tgcaggaaat cgggttcgat gtcgccgccg taaaggtagg tcggcagcgc 60
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 144
Met Glu Asp Leu Gln Glu Ile Gly Phe Asp Val Ala Ala Val Lys Val
1 5 10 15
Gly Arg Gln Arg Glu His His Arg Leu His His Pro Gln Pro Gly Asn
20 25 30
Gly Glu Ala Asp Asp Val Leu Phe Ala Phe Phe Leu Val Gly Gly Phe
35 40 45
Asp Phe Leu Arg Val Ile Gly Cys Gly Gly Val Ala Tyr Leu Pro Asp
50 55 60
Phe Gln Gln Asn Val Gly Lys Ala Asp Phe Ala Val Val Pro Asp Asp
65 70 75 80
Ala Ala Ala Val Arg Ala Val Ile Glu Val Asp Ala Asp Asp Ala Val
85 90 95
Cys Thr Gln Lys Leu Leu Phe Asp Gln Pro Asp Ala Gly Gly Ala Gly
100 105 110
Asp Ala Ala Glu His Asn Arg Leu Ala Arg Ala Ala Val Gly Phe His
115 120 125
Lys Val Gly Leu Asp Phe Gly Gln Val Val Gln Ala Asp Leu Val Glu
130 135 140
Asp Phe Leu Gly Arg Gln Leu Gly Phe Leu Arg Val Gly Gly Ala Leu
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Phe Val Ile Thr Ala Gln Ala Arg Val Asn Asn Ala Leu Cys Asp Cys
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Leu Thr Thr Gly Ala Ala Gly Phe Ala Val Phe Val Phe Val Thr Asp
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195 200 205
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210 215 220
Tyr Ser Ala Met Ala Ser Arg Ser Ala Ser Ile Pro Val Phe Ser Ala
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Thr Glu Met Arg Thr Ala Ala Ile Phe Pro Ala Ala Ser Arg His Met
245 250 255
Pro Val Phe Cys Ser Ser Asp Gly Ser Arg Ser Val Leu Leu Tyr Thr
260 265 270
Leu Met His Gly Ile Ser Pro Ala Trp Ile Ser Cys Ser Thr Phe Ser
275 280 285
Thr Ser Ser Ile Cys Cys Pro Leu Phe Gly Ala Ala Ala Ser Thr Thr
290 295 300
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Val Arg Ile Met Leu His Ser Gly Leu Met Tyr Ser Arg Arg Ala Val
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Val Ser Ser Val Ala Lys Ser Trp Ser Phe Ala Tyr Met Pro Asp Leu
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
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n 1
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 146
Met Glu Asp Leu Gln Glu Ile Gly Phe Asp Val Ala Ala Val Lys Val
1 5 10 15
Gly Arg Gln Arg Glu His His Arg Leu His His Thr Gln Ser Gly Asn
20 25 30
Gly Lys Ala Asp Asp Val Leu Phe Ala Phe Phe Leu Val Gly Gly Phe
35 40 45
Asp Phe Leu Arg Val Ile Gly Cys Gly Gly Val Ala Cys Leu Pro Asp
50 55 60
Phe Gln Gln Asn Val Gly Glu Ala Asp Phe Ala Val Val Pro Asp Asp
65 70 75 80
Ala Ala Ala Val Arg Ala Val Ile Glu Val Asp Ala Asp Asp Ala Val
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Cys Ala Gln Lys Leu Leu Phe Asp Gln Pro Asp Ala Gly Gly Ala Gly
100 105 110
Asn Ala Ala Glu His Gln His Cys Phe Val Arg Ala Ile Met Gly Phe
115 120 125
His Lys Val Gly Leu Asp Phe Gly Gln Val Val Gln Ala Asp Leu Val
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Glu Asp Phe Leu Gly Arg Gln Phe Gly Phe Phe Arg Val Gly Gly Ala
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Ser Phe Val Ile Thr Ala Gln Ala Gly Ile Asp Asp Ala Leu Cys Asp
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Cys Leu Thr Ala Asp Ala Ala Gly Phe Ala Val Phe Ala Phe Val Ala
180 185 190
Asp Gly Gln Met Gln Val Phe Gly Asn Val Gln Pro Ala Val Glu Thr
195 200 205
Gly Phe Phe His Gly Ile Ser Val Ser Ser Val Phe Gly Ala Ala Ala
210 215 220
Gln Tyr Ser Ala Met Ala Ser Arg Ser Ala Ser Ile Pro Val Phe Ser
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Ala Thr Glu Met Arg Thr Ala Ala Ile Phe Pro Ala Ala Ser Arg His
245 250 255
Met Pro Val Phe Cys Ser Ser Asp Gly Ser Arg Ser Val Leu Leu Tyr
260 265 270
Thr Leu Met His Gly Ile Ser Trp Ala Trp Ile Ser Cys Ser Thr Phe
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Thr Cys Ser Ser Thr Ser Ala Cys Thr Val Ser Ser Lys Val Ala Glu
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Lys Ala Glu Ile Ser Leu Cys Gly Arg Ser Leu Thr Asn Pro Thr Val
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Ser Val Arg Ile Met Leu His Ala Gly Leu Met Tyr Ser Arg Arg Ala
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Val Val Ser Arg Val Ala Lys Ser Trp Ser Phe Ala Tyr Met Pro Asp
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Leu Val Ser Arg Leu Asn Arg Leu Asp Leu Pro Thr Leu Val
370 375 380
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
<222> (538)..(538)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 147
ggccattact ccgaccgcac ttggaagccg cgtttggncg gccgccgtct gccgtatctg 60
ctttatggca cgctgattgc ggttattgtg atgattttga tgccgaactc gggcagcttc 120
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ggcgttgtgc cgcagaccgt ggtcgtggcg ttttatgtgg gtgcggcgtt gctggtgatt 420
accagcgcgt tcacgatttt caaagtgaag gaatacganc cggaaaccta cgcccgttac 480
cacggcatcg atgtcgccgc gaatcaggaa aaagccaact ggatcgcact cttaaaancc 540
gcgc 544
<210> 148
<211> 181
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (13)..(13)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (85)..(85)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (119)..(119)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (153)..(153)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (180)..(180)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 148
Gly His Tyr Ser Asp Arg Thr Trp Lys Pro Arg Leu Xaa Gly Arg Arg
1 5 10 15
Leu Pro Tyr Leu Leu Tyr Gly Thr Leu Ile Ala Val Ile Val Met Ile
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Leu Met Pro Asn Ser Gly Ser Phe Gly Phe Gly Tyr Ala Ser Leu Ala
35 40 45
Ala Leu Ser Phe Gly Ala Leu Met Ile Ala Leu Leu Asp Val Ser Ser
50 55 60
Asn Met Ala Met Gln Pro Phe Lys Met Met Val Gly Asp Met Val Asn
65 70 75 80
Glu Glu Gln Lys Xaa Tyr Ala Tyr Gly Ile Gln Ser Phe Leu Ala Asn
85 90 95
Thr Gly Ala Val Val Ala Ala Ile Leu Pro Phe Val Phe Ala Tyr Ile
100 105 110
Gly Leu Ala Asn Thr Ala Xaa Lys Gly Val Val Pro Gln Thr Val Val
115 120 125
Val Ala Phe Tyr Val Gly Ala Ala Leu Leu Val Ile Thr Ser Ala Phe
130 135 140
Thr Ile Phe Lys Val Lys Glu Tyr Xaa Pro Glu Thr Tyr Ala Arg Tyr
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His Gly Ile Asp Val Ala Ala Asn Gln Glu Lys Ala Asn Trp Ile Ala
165 170 175
Leu Leu Lys Xaa Ala
180
<210> 149
<211> 1356
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 149
atgtcggaat atacgcctca aacagcaaaa caaggtttgc ccgcgctggc aaaaagcacg 60
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<211> 451
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 150
Met Ser Glu Tyr Thr Pro Gln Thr Ala Lys Gln Gly Leu Pro Ala Leu
1 5 10 15
Ala Lys Ser Thr Ile Trp Met Leu Ser Phe Gly Phe Leu Gly Val Gln
20 25 30
Thr Ala Phe Thr Leu Gln Ser Ser Gln Met Ser Arg Ile Phe Gln Thr
35 40 45
Leu Gly Ala Asp Pro His Asn Leu Gly Trp Phe Phe Ile Leu Pro Pro
50 55 60
Leu Ala Gly Met Leu Val Gln Pro Ile Val Gly His Tyr Ser Asp Arg
65 70 75 80
Thr Trp Lys Pro Arg Leu Gly Gly Arg Arg Leu Pro Tyr Leu Leu Tyr
85 90 95
Gly Thr Leu Ile Ala Val Ile Val Met Ile Leu Met Pro Asn Ser Gly
100 105 110
Ser Phe Gly Phe Gly Tyr Ala Ser Leu Ala Ala Leu Ser Phe Gly Ala
115 120 125
Leu Met Ile Ala Leu Leu Asp Val Ser Ser Asn Met Ala Met Gln Pro
130 135 140
Phe Lys Met Met Val Gly Asp Met Val Asn Glu Glu Gln Lys Gly Tyr
145 150 155 160
Ala Tyr Gly Ile Gln Ser Phe Leu Ala Asn Thr Gly Ala Val Val Ala
165 170 175
Ala Ile Leu Pro Phe Val Phe Ala Tyr Ile Gly Leu Ala Asn Thr Ala
180 185 190
Glu Lys Gly Val Val Pro Gln Thr Val Val Val Ala Phe Tyr Val Gly
195 200 205
Ala Ala Leu Leu Val Ile Thr Ser Ala Phe Thr Ile Phe Lys Val Lys
210 215 220
Glu Tyr Asp Pro Glu Thr Tyr Ala Arg Tyr His Gly Ile Asp Val Ala
225 230 235 240
Ala Asn Gln Glu Lys Ala Asn Trp Ile Glu Leu Leu Lys Thr Ala Pro
245 250 255
Lys Ala Phe Trp Thr Val Thr Leu Val Gln Phe Phe Cys Trp Phe Ala
260 265 270
Phe Gln Tyr Met Trp Thr Tyr Ser Ala Gly Ala Ile Ala Glu Asn Val
275 280 285
Trp His Thr Thr Asp Ala Ser Ser Val Gly Tyr Gln Glu Ala Gly Asn
290 295 300
Trp Tyr Gly Val Leu Ala Ala Val Gln Ser Val Ala Ala Val Ile Cys
305 310 315 320
Ser Phe Val Leu Ala Lys Val Pro Asn Lys Tyr His Lys Ala Gly Tyr
325 330 335
Phe Gly Cys Leu Ala Leu Gly Ala Leu Gly Phe Phe Ser Val Phe Phe
340 345 350
Ile Gly Asn Gln Tyr Ala Leu Val Leu Ser Tyr Thr Leu Ile Gly Ile
355 360 365
Ala Trp Ala Gly Ile Ile Thr Tyr Pro Leu Thr Ile Val Thr Asn Ala
370 375 380
Leu Ser Gly Lys His Met Gly Thr Tyr Leu Gly Leu Phe Asn Gly Ser
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Val Leu Leu Leu Gly Ala Phe Ser Val Phe Leu Ile Lys Glu Thr His
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Gly Gly Val
450
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 151
atgtcggaat atacgcctca aacagcaaaa caaggtttgc ccgcgctggc aaaaagcacg 60
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gtgttcctga ttaaagaaac acacggcggg gtttga 1356
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Met Ser Glu Tyr Thr Pro Gln Thr Ala Lys Gln Gly Leu Pro Ala Leu
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100 105 110
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Phe Lys Met Met Val Gly Asp Met Val Asn Glu Glu Gln Lys Gly Tyr
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165 170 175
Ala Ile Leu Pro Phe Val Phe Ala Tyr Ile Gly Leu Ala Asn Thr Ala
180 185 190
Glu Lys Gly Val Val Pro Gln Thr Val Val Val Ala Phe Tyr Val Gly
195 200 205
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<211> 1020
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 153
atgatagggg atcgccgcgc cggcaaccat ttcggatttt ccaaagcaaa tacttttcaa 60
atcaaaaaaa aggatttact ttatgtcgga atatacgcct caaacagcaa aacaaggttt 120
gcccgcgccg gcaaaaagca cgatttggat gttgagcttc ggctatctcg gcgttcagac 180
ggcctttacc ctgcaaagct cgcagatgag ccgcattttt caaacgctag gcgcagaccc 240
gcacaatttg ggctggtttt tcatcctgcc gccgctggcg gggatgctgg ttcagccgat 300
agtggctact actcagaccg cacttggaag ccgcgcttgg gcggccgccg cctgccgtat 360
ctgctttacg gcacgctgat tgcggtcatc gtgatgattt tgatgccgaa ctcgggcagc 420
ttcggtttcg gctatgcgtc gctggcggcc ttgtcgttcg gcgcgctgat gattgcgctg 480
ttggacgtgt cgtcgaatat ggcgatgcag ccgtttaaga tgatggtcgg cgatatggtc 540
aacgaggagc agaaaagcta cgcctacggg attcaaagtt tcttagcgaa tacggacgcg 600
gttgtggcag cgattctgcc gtttgtgttc gcgtatatcg gtttggcgaa cactgccgag 660
aaaggcgttg tgccacaaac cgtggtcgta gcattctatg tgggtgcggc gttactgatt 720
attaccagtg cgttcacaat ctccaaagtc aaagaatacg acccggaaac ctacgcccgt 780
taccacggca tcgatgtcgc cgcgaatcag gaaaaagcca actggttcga actcttaaaa 840
accgcgccta aagtgttttg gacggttact ccggtacagt ttttctgctg gttcgccttc 900
cggtatatgt ggacttactc ggcaggcgcg attgcagaaa acgtctggca cactaccgat 960
gcgtcttccg taggccatca ggaggcgggc aaccggtacg gcgttttggc ggcggtgtag 1020
<210> 154
<211> 339
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 154
Met Ile Gly Asp Arg Arg Ala Gly Asn His Phe Gly Phe Ser Lys Ala
1 5 10 15
Asn Thr Phe Gln Ile Lys Lys Lys Asp Leu Leu Tyr Val Gly Ile Tyr
20 25 30
Ala Ser Asn Ser Lys Thr Arg Phe Ala Arg Ala Gly Lys Lys His Asp
35 40 45
Leu Asp Val Glu Leu Arg Leu Ser Arg Arg Ser Asp Gly Leu Tyr Pro
50 55 60
Ala Lys Leu Ala Asp Glu Pro His Phe Ser Asn Ala Arg Arg Arg Pro
65 70 75 80
Ala Gln Phe Gly Leu Val Phe His Pro Ala Ala Ala Gly Gly Asp Ala
85 90 95
Gly Ser Ala Asp Ser Gly Tyr Tyr Ser Asp Arg Thr Trp Lys Pro Arg
100 105 110
Leu Gly Gly Arg Arg Leu Pro Tyr Leu Leu Tyr Gly Thr Leu Ile Ala
115 120 125
Val Ile Val Met Ile Leu Met Pro Asn Ser Gly Ser Phe Gly Phe Gly
130 135 140
Tyr Ala Ser Leu Ala Ala Leu Ser Phe Gly Ala Leu Met Ile Ala Leu
145 150 155 160
Leu Asp Val Ser Ser Asn Met Ala Met Gln Pro Phe Lys Met Met Val
165 170 175
Gly Asp Met Val Asn Glu Glu Gln Lys Ser Tyr Ala Tyr Gly Ile Gln
180 185 190
Ser Phe Leu Ala Asn Thr Asp Ala Val Val Ala Ala Ile Leu Pro Phe
195 200 205
Val Phe Ala Tyr Ile Gly Leu Ala Asn Thr Ala Glu Lys Gly Val Val
210 215 220
Pro Gln Thr Val Val Val Ala Phe Tyr Val Gly Ala Ala Leu Leu Ile
225 230 235 240
Ile Thr Ser Ala Phe Thr Ile Ser Lys Val Lys Glu Tyr Asp Pro Glu
245 250 255
Thr Tyr Ala Arg Tyr His Gly Ile Asp Val Ala Ala Asn Gln Glu Lys
260 265 270
Ala Asn Trp Phe Glu Leu Leu Lys Thr Ala Pro Lys Val Phe Trp Thr
275 280 285
Val Thr Pro Val Gln Phe Phe Cys Trp Phe Ala Phe Arg Tyr Met Trp
290 295 300
Thr Tyr Ser Ala Gly Ala Ile Ala Glu Asn Val Trp His Thr Thr Asp
305 310 315 320
Ala Ser Ser Val Gly His Gln Glu Ala Gly Asn Arg Tyr Gly Val Leu
325 330 335
Ala Ala Val
<210> 155
<211> 360
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (111)..(111)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
<222> (346)..(346)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 155
atgttgttcc gtaaaacgac cgccgccgtt ttggcgcata ccttgatgct gaacggctgt 60
acgttgatgt tgtggggaat gaacaacccg gtcagcgaaa caatcacccg naaacacgtt 120
gncaaagacc aaatccgngn cttcggtgtg gttgccgaag acaatgccca attggaaaag 180
ggcagcctgg tgatgatggg cggaaaatac tggttcgtcg tcaatcccga agattcggcg 240
aanntgacgg gnattttgan ggcagggctg gacaaaccct tccaaatagt tnaggatacc 300
ccgagctatg cntgccacca agccctgccg gtcaaactcg gatcgnctgg cagccagaat 360
<210> 156
<211> 120
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (41)..(41)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (116)..(116)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 156
Met Leu Phe Arg Lys Thr Thr Ala Ala Val Leu Ala His Thr Leu Met
1 5 10 15
Leu Asn Gly Cys Thr Leu Met Leu Trp Gly Met Asn Asn Pro Val Ser
20 25 30
Glu Thr Ile Thr Arg Lys His Val Xaa Lys Asp Gln Ile Arg Xaa Phe
35 40 45
Gly Val Val Ala Glu Asp Asn Ala Gln Leu Glu Lys Gly Ser Leu Val
50 55 60
Met Met Gly Gly Lys Tyr Trp Phe Val Val Asn Pro Glu Asp Ser Ala
65 70 75 80
Xaa Xaa Thr Gly Ile Leu Xaa Ala Gly Leu Asp Lys Pro Phe Gln Ile
85 90 95
Val Xaa Asp Thr Pro Ser Tyr Xaa Cys His Gln Ala Leu Pro Val Lys
100 105 110
Leu Gly Ser Xaa Gly Ser Gln Asn
115 120
<210> 157
<211> 716
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 157
atgttgttcc gtaaaacgac cgccgccgtt ttggcggcaa ccttgatgct gaacggctgt 60
acgttgatgt tgtggggaat gaacaacccg gtcagcgaaa caatcacccg caaacacgtt 120
gacaaagcca aatccgcgcc ttcggtgtgg ttgccgaaga caatgcccaa ttggaaaagg 180
gcagcctggt gatgatgggc ggaaaatact ggttcgtcgt caatcccgaa gattcggcga 240
agctgacggg cattttgaag gcagggctgg acaaaccctt ccaaatagtt gaggataccc 300
cgagctatgc tcgccaccaa gccctgccgg tcaaactcga atcgcctggc agccagaatt 360
tcagtaccga aggcctttgc ctgcgctacg ataccgacaa gcctgccgac atcgccaagc 420
tgaaacagct cgggtttgaa gcggtcaaac tcgacaatcg gaccatttac acgcgctgcg 480
tatccgccaa aggcaaatac tacgccacac cgcaaaaact gaacgccgat taccattttg 540
agcaaagtgt gcctgccgat atttattaca cggttactga agaacatacc gacaaatcca 600
agctgtttgc aaatatctta tatacgcccc cctttttgat actggatgcg gcgggcgcgg 660
tactggcctt gcctgcggcg gctctgggtg cggtcgtgga tgccgcccgc aaatga 716
<210> 158
<211> 238
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 158
Met Leu Phe Arg Lys Thr Thr Ala Ala Val Leu Ala Ala Thr Leu Met
1 5 10 15
Leu Asn Gly Cys Thr Leu Met Leu Trp Gly Met Asn Asn Pro Val Ser
20 25 30
Glu Thr Ile Thr Arg Lys His Val Asp Lys Asp Gln Ile Arg Ala Phe
35 40 45
Gly Val Val Ala Glu Asp Asn Ala Gln Leu Glu Lys Gly Ser Leu Val
50 55 60
Met Met Gly Gly Lys Tyr Trp Phe Val Val Asn Pro Glu Asp Ser Ala
65 70 75 80
Lys Leu Thr Gly Ile Leu Lys Ala Gly Leu Asp Lys Pro Phe Gln Ile
85 90 95
Val Glu Asp Thr Pro Ser Tyr Ala Arg His Gln Ala Leu Pro Val Lys
100 105 110
Leu Glu Ser Pro Gly Ser Gln Asn Phe Ser Thr Glu Gly Leu Cys Leu
115 120 125
Arg Tyr Asp Thr Asp Lys Pro Ala Asp Ile Ala Lys Leu Lys Gln Leu
130 135 140
Gly Phe Glu Ala Val Lys Leu Asp Asn Arg Thr Ile Tyr Thr Arg Cys
145 150 155 160
Val Ser Ala Lys Gly Lys Tyr Tyr Ala Thr Pro Gln Lys Leu Asn Ala
165 170 175
Asp Tyr His Phe Glu Gln Ser Val Pro Ala Asp Ile Tyr Tyr Thr Val
180 185 190
Thr Glu Glu His Thr Asp Lys Ser Lys Leu Phe Ala Asn Ile Leu Tyr
195 200 205
Thr Pro Pro Phe Leu Ile Leu Asp Ala Ala Gly Ala Val Leu Ala Leu
210 215 220
Pro Ala Ala Ala Leu Gly Ala Val Val Asp Ala Ala Arg Lys
225 230 235
<210> 159
<211> 714
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 159
atgttgttcc gtaaaacgac cgccgccgtt ttggcggcaa ccttgatgtt gaacggctgt 60
acggtaatga tgtggggtat gaacagcccg ttcagcgaaa cgaccgcccg caaacacgtt 120
gacaaggacc aaatccgcgc cttcggtgtg gttgccgaag acaatgccca attggaaaag 180
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aagctgacgg gcattttgaa ggccgggttg gacaagcagt ttcaaatggt tgagcccaac 300
ccgcgctttg cctaccaagc cctgccggtc aaactcgaat cgcccgccag ccagaatttc 360
agtaccgaag gcctttgcct gcgctacgat accgacagac ctgccgacat cgccaagctg 420
aaacagcttg agtttgaagc ggtcgaactc gacaatcgga ccatttacac gcgctgcgtc 480
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ctggccttgc ctgtcgcggc gttgattgca gccacgaatt cctcagacaa atga 714
<210> 160
<211> 237
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 160
Met Leu Phe Arg Lys Thr Thr Ala Ala Val Leu Ala Ala Thr Leu Met
1 5 10 15
Leu Asn Gly Cys Thr Val Met Met Trp Gly Met Asn Ser Pro Phe Ser
20 25 30
Glu Thr Thr Ala Arg Lys His Val Asp Lys Asp Gln Ile Arg Ala Phe
35 40 45
Gly Val Val Ala Glu Asp Asn Ala Gln Leu Glu Lys Gly Ser Leu Val
50 55 60
Met Met Gly Gly Lys Tyr Trp Phe Val Val Asn Pro Glu Asp Ser Ala
65 70 75 80
Lys Leu Thr Gly Ile Leu Lys Ala Gly Leu Asp Lys Gln Phe Gln Met
85 90 95
Val Glu Pro Asn Pro Arg Phe Ala Tyr Gln Ala Leu Pro Val Lys Leu
100 105 110
Glu Ser Pro Ala Ser Gln Asn Phe Ser Thr Glu Gly Leu Cys Leu Arg
115 120 125
Tyr Asp Thr Asp Arg Pro Ala Asp Ile Ala Lys Leu Lys Gln Leu Glu
130 135 140
Phe Glu Ala Val Glu Leu Asp Asn Arg Thr Ile Tyr Thr Arg Cys Val
145 150 155 160
Ser Ala Lys Gly Lys Tyr Tyr Ala Thr Pro Gln Lys Leu Asn Ala Asp
165 170 175
Tyr His Phe Glu Gln Ser Val Pro Ala Asp Ile Tyr Tyr Thr Val Thr
180 185 190
Lys Lys His Thr Asp Lys Ser Lys Leu Phe Glu Asn Ile Ala Tyr Thr
195 200 205
Pro Thr Thr Leu Ile Leu Asp Ala Val Gly Ala Val Leu Ala Leu Pro
210 215 220
Val Ala Ala Leu Ile Ala Ala Thr Asn Ser Ser Asp Lys
225 230 235
<210> 161
<211> 714
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 161
atgttgttcc gtaaaacgac cgccgccgtt ttggcggcaa ccttgatact gaacggctgt 60
acgatgatgt tgcgggggat gaacaacccg gtcagccaaa caatcacccg caaacacgtt 120
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gtgctggtct tgcctatggc tctgattgca gccgcgaatt cctcagacaa atga 714
<210> 162
<211> 237
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 162
Met Leu Phe Arg Lys Thr Thr Ala Ala Val Leu Ala Ala Thr Leu Ile
1 5 10 15
Leu Asn Gly Cys Thr Met Met Leu Arg Gly Met Asn Asn Pro Val Ser
20 25 30
Gln Thr Ile Thr Arg Lys His Val Asp Lys Asp Gln Ile Arg Ala Phe
35 40 45
Gly Val Val Ala Glu Asp Asn Ala Gln Leu Glu Lys Gly Ser Leu Val
50 55 60
Met Met Gly Gly Lys Tyr Trp Phe Ala Val Asn Pro Glu Asp Ser Ala
65 70 75 80
Lys Leu Thr Gly Leu Leu Lys Ala Gly Leu Asp Lys Pro Phe Gln Ile
85 90 95
Val Glu Asp Thr Pro Ser Tyr Ala Arg His Gln Ala Leu Pro Val Lys
100 105 110
Phe Glu Ala Pro Gly Ser Gln Asn Phe Ser Thr Gly Gly Leu Cys Leu
115 120 125
Arg Tyr Asp Thr Gly Arg Pro Asp Asp Ile Ala Lys Leu Lys Gln Leu
130 135 140
Glu Phe Lys Ala Val Lys Leu Asp Asn Arg Thr Ile Tyr Thr Arg Cys
145 150 155 160
Val Ser Ala Lys Gly Lys Tyr Tyr Ala Thr Pro Gln Lys Leu Asn Ala
165 170 175
Asp Tyr His Phe Glu Gln Ser Val Pro Ala Asp Ile Tyr Tyr Thr Val
180 185 190
Thr Glu Lys His Thr Asp Lys Ser Lys Leu Phe Gly Asn Ile Leu Tyr
195 200 205
Thr Pro Pro Leu Leu Ile Leu Asp Ala Ala Ala Ala Val Leu Val Leu
210 215 220
Pro Met Ala Leu Ile Ala Ala Ala Asn Ser Ser Asp Lys
225 230 235
<210> 163
<211> 375
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (235)..(235)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 163
gtcagtcctg tactgcctat tacacacgaa cggacagggt ttgaaggtgt tatcggttat 60
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ggtgccgcct ctggt 375
<210> 164
<211> 125
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (79)..(79)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 164
Val Ser Pro Val Leu Pro Ile Thr His Glu Arg Thr Gly Phe Glu Gly
1 5 10 15
Val Ile Gly Tyr Glu Thr His Phe Ser Gly His Gly His Glu Val His
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Ser Pro Phe Asp His His Asp Ser Lys Ser Thr Ser Asp Phe Ser Gly
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Gly Val Asp Gly Gly Phe Thr Val Tyr Gln Leu His Arg Thr Trp Ser
50 55 60
Glu Ile His Pro Glu Asp Glu Tyr Asp Gly Pro Gln Ala Ala Xaa Tyr
65 70 75 80
Pro Pro Pro Gly Gly Ala Arg Asp Ile Tyr Ser Tyr Tyr Val Lys Gly
85 90 95
Thr Ser Thr Lys Thr Lys Thr Ser Ile Val Pro Gln Ala Pro Phe Ser
100 105 110
Asp Arg Trp Leu Glu Glu Asn Ala Gly Ala Ala Ser Gly
115 120 125
<210> 165
<211> 1452
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 165
atgaatttgc ctattcaaaa attcatgatg ctgtttgcag cagcaatatc gttgctgcaa 60
atccccatta gtcatgcgaa cggtttggat gcccgtttgc gcgatgatat gcaggcaaaa 120
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ttagacaaat ga 1452
<210> 166
<211> 483
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 166
Met Asn Leu Pro Ile Gln Lys Phe Met Met Leu Phe Ala Ala Ala Ile
1 5 10 15
Ser Leu Leu Gln Ile Pro Ile Ser His Ala Asn Gly Leu Asp Ala Arg
20 25 30
Leu Arg Asp Asp Met Gln Ala Lys His Tyr Glu Pro Gly Gly Lys Tyr
35 40 45
His Leu Phe Gly Asn Ala Arg Gly Ser Val Lys Lys Arg Val Tyr Ala
50 55 60
Val Gln Thr Phe Asp Ala Thr Ala Val Ser Pro Val Leu Pro Ile Thr
65 70 75 80
His Glu Arg Thr Gly Phe Glu Gly Val Ile Gly Tyr Glu Thr His Phe
85 90 95
Ser Gly His Gly His Glu Val His Ser Pro Phe Asp His His Asp Ser
100 105 110
Lys Ser Thr Ser Asp Phe Ser Gly Gly Val Asp Gly Gly Phe Thr Val
115 120 125
Tyr Gln Leu His Arg Thr Gly Ser Glu Ile His Pro Glu Asp Gly Tyr
130 135 140
Asp Gly Pro Gln Gly Ser Asp Tyr Pro Pro Pro Gly Gly Ala Arg Asp
145 150 155 160
Ile Tyr Ser Tyr Tyr Val Lys Gly Thr Ser Thr Lys Thr Lys Thr Asn
165 170 175
Ile Val Pro Gln Ala Pro Phe Ser Asp Arg Trp Leu Lys Glu Asn Ala
180 185 190
Gly Ala Ala Ser Gly Phe Phe Ser Arg Ala Asp Glu Ala Gly Lys Leu
195 200 205
Ile Trp Glu Ser Asp Pro Asn Lys Asn Trp Trp Ala Asn Arg Met Asp
210 215 220
Asp Val Arg Gly Ile Val Gln Gly Ala Val Asn Pro Phe Leu Met Gly
225 230 235 240
Phe Gln Gly Val Gly Ile Gly Ala Ile Thr Asp Ser Ala Val Ser Pro
245 250 255
Val Thr Asp Thr Ala Ala Gln Gln Thr Leu Gln Gly Ile Asn Asp Leu
260 265 270
Gly Lys Leu Ser Pro Glu Ala Gln Leu Ala Ala Ala Ser Leu Leu Gln
275 280 285
Asp Ser Ala Phe Ala Val Lys Asp Gly Ile Asn Ser Ala Lys Gln Trp
290 295 300
Ala Asp Ala His Pro Asn Ile Thr Ala Thr Ala Gln Thr Ala Leu Ser
305 310 315 320
Ala Ala Glu Ala Ala Gly Thr Val Trp Arg Gly Lys Lys Val Glu Leu
325 330 335
Asn Pro Thr Lys Trp Asp Trp Val Lys Asn Thr Gly Tyr Lys Lys Pro
340 345 350
Ala Ala Arg His Met Gln Thr Leu Asp Gly Glu Met Ala Gly Gly Asn
355 360 365
Lys Pro Ile Lys Ser Leu Pro Asn Ser Ala Ala Glu Lys Arg Lys Gln
370 375 380
Asn Phe Glu Lys Phe Asn Ser Asn Trp Ser Ser Ala Ser Phe Asp Ser
385 390 395 400
Val His Lys Thr Leu Thr Pro Asn Ala Pro Gly Ile Leu Ser Pro Asp
405 410 415
Lys Val Lys Thr Arg Tyr Thr Ser Leu Asp Gly Lys Ile Thr Ile Ile
420 425 430
Lys Asp Asn Glu Asn Asn Tyr Phe Arg Ile His Asp Asn Ser Arg Lys
435 440 445
Gln Tyr Leu Asp Ser Asn Gly Asn Ala Val Lys Thr Gly Asn Leu Gln
450 455 460
Gly Lys Gln Ala Lys Asp Tyr Leu Gln Gln Gln Thr His Ile Arg Asn
465 470 475 480
Leu Asp Lys
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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atgaattngc ctattcaaaa attcatgatg ctgtttgcag cagcaatatc gtngctgcaa 60
atcccnatta gtcatgcgaa cggtttggat gcccgtttgc gcgatgatat gcaggcaaaa 120
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tgggattggg ttaaaaatac nggctataan acacctgctg ttcgcaccat gcatactttg 1080
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65 70 75 80
His Glu Arg Thr Gly Phe Glu Gly Ile Ile Gly Tyr Glu Thr His Phe
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Lys Ser Thr Ser Asp Phe Ser Gly Gly Val Asp Gly Gly Phe Thr Val
115 120 125
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130 135 140
Asp Gly Pro Gln Gly Ser Asp Tyr Pro Pro Pro Gly Gly Ala Arg Asp
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Ile Tyr Xaa Xaa Tyr Val Lys Gly Thr Ser Thr Lys Thr Lys Ser Asn
165 170 175
Ile Val Pro Arg Ala Pro Phe Ser Asp Arg Trp Leu Lys Glu Asn Ala
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Gly Ala Ala Ser Gly Phe Phe Ser Arg Ala Asp Glu Ala Gly Lys Leu
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225 230 235 240
Phe Gln Gly Val Gly Ile Gly Ala Ile Thr Asp Ser Ala Val Ser Pro
245 250 255
Val Thr Asp Thr Ala Ala Gln Gln Thr Leu Gln Gly Xaa Asn His Leu
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Gly Xaa Leu Ser Pro Glu Ala Gln Leu Ala Ala Ala Thr Ala Leu Gln
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Asp Ser Ala Phe Ala Val Lys Asp Gly Ile Asn Ser Ala Arg Gln Trp
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Ala Asp Ala His Pro Asn Ile Thr Ala Thr Ala Gln Thr Ala Leu Ala
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Ala Val Arg Thr Met His Thr Leu Asp Gly Glu Met Ala Gly Gly Asn
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Arg Pro Pro Lys Ser Ile Thr Ser Asn Ser Lys Ala Asp Ala Ser Thr
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Asn Ile Asn Ser Pro Ala Asp Phe Ala Arg His Ile Glu Asn Ile Val
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Ser Leu Leu Gln Ile Pro Ile Ser His Ala Asn Gly Leu Asp Ala Arg
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Leu Arg Asp Asp Met Gln Ala Lys His Tyr Glu Pro Gly Gly Lys Tyr
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Val Gln Thr Phe Asp Ala Thr Ala Val Gly Pro Ile Leu Pro Ile Thr
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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35 40 45
Lys Glu Met Lys Xaa Thr Xaa Gly Ala Phe Leu Pro Leu Xaa Ile Leu
50 55 60
Gly Gly Ala Ala Ile Gly Met Trp Thr Gln His Gly Phe Ser Tyr Ala
65 70 75 80
Thr Thr Gly Arg Pro Ala Ser Val Arg Asp Val Ala Ile Ala Gly Gly
85 90 95
Leu Gly Ala Ile Pro Gly Xaa Val Gly Ala Ala Gly Lys Val Val Ser
100 105 110
Phe Ala Lys Tyr Gly Arg Glu Ile Lys Ile Gly Asn Asn Met Arg Ile
115 120 125
Ala Pro Phe Gly Asn Arg Thr Gly His Pro Ile Gly Lys Phe Pro His
130 135 140
Tyr His Arg Arg Val Thr Asp Asn Thr Gly Lys Thr Leu Pro Gly Gln
145 150 155 160
Gly Ile Gly Arg His Arg Pro Trp Glu Ser Lys Ser Thr Asp Arg Ser
165 170 175
Trp Lys Asn Arg Phe
180
<210> 179
<211> 540
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 179
atgaaaaaac aaatcaccgc agccgtaatg atgctgtcta tgatcgcccc cgcaatggca 60
aacggattgg acaatcaggc atttgaagac caagtgttcc acacgcgggc agatgcgccg 120
atgcagttgg cggagctttc tcagaaggag atgaaggaga ctgaaggggc ttttcttcca 180
ttggctatct tgggtggtgc tgccattggt atgtggacac agcatggttt tagttatgca 240
acgacaggca gaccagcttc tgttagagat gttgctggcg gattaggcgc aattcctggt 300
gatgtaggtg ctgcaggaaa ggttgtttcc tttgctaaat atggacgtga gattaaaatc 360
ggcaataata tgcggatagc ccctttcggt aatagaacag gtcatcctat tggaaaattt 420
ccccattatc atcgtcgagt tacggataat acgggcaaga ctttgcctgg acagggaatt 480
ggtcgtcatc gcccttggga atcaaaatct acggacagat catggaaaaa ccgcttctaa 540
<210> 180
<211> 179
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 180
Met Lys Lys Gln Ile Thr Ala Ala Val Met Met Leu Ser Met Ile Ala
1 5 10 15
Pro Ala Met Ala Asn Gly Leu Asp Asn Gln Ala Phe Glu Asp Gln Val
20 25 30
Phe His Thr Arg Ala Asp Ala Pro Met Gln Leu Ala Glu Leu Ser Gln
35 40 45
Lys Glu Met Lys Glu Thr Glu Gly Ala Phe Leu Pro Leu Ala Ile Leu
50 55 60
Gly Gly Ala Ala Ile Gly Met Trp Thr Gln His Gly Phe Ser Tyr Ala
65 70 75 80
Thr Thr Gly Arg Pro Ala Ser Val Arg Asp Val Ala Gly Gly Leu Gly
85 90 95
Ala Ile Pro Gly Asp Val Gly Ala Ala Gly Lys Val Val Ser Phe Ala
100 105 110
Lys Tyr Gly Arg Glu Ile Lys Ile Gly Asn Asn Met Arg Ile Ala Pro
115 120 125
Phe Gly Asn Arg Thr Gly His Pro Ile Gly Lys Phe Pro His Tyr His
130 135 140
Arg Arg Val Thr Asp Asn Thr Gly Lys Thr Leu Pro Gly Gln Gly Ile
145 150 155 160
Gly Arg His Arg Pro Trp Glu Ser Lys Ser Thr Asp Arg Ser Trp Lys
165 170 175
Asn Arg Phe
<210> 181
<211> 252
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (164)..(164)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 181
atgaataaaa ctctctatcg tgtaattttc aaccgcaaac gtggggctgt grtagccgtt 60
gctgaaacta ccaagcgcga aggtaaaagc tgtgccgata gtgattcagg cagcgctcat 120
gtgaaatctg ttccttttgg tactactcat gcacctgttt gtgncgttac aaatatcttt 180
tctttttctt tattgggctt ttctttatgt ttggctgtag gtacggycaa tattgctttt 240
gctgatggca tt 252
<210> 182
<211> 84
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)..(18)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (55)..(55)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (76)..(76)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 182
Met Asn Lys Thr Leu Tyr Arg Val Ile Phe Asn Arg Lys Arg Gly Ala
1 5 10 15
Val Xaa Ala Val Ala Glu Thr Thr Lys Arg Glu Gly Lys Ser Cys Ala
20 25 30
Asp Ser Asp Ser Gly Ser Ala His Val Lys Ser Val Pro Phe Gly Thr
35 40 45
Thr His Ala Pro Val Cys Xaa Val Thr Asn Ile Phe Ser Phe Ser Leu
50 55 60
Leu Gly Phe Ser Leu Cys Leu Ala Val Gly Thr Xaa Asn Ile Ala Phe
65 70 75 80
Ala Asp Gly Ile
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<211> 249
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 183
atgaataaaa ctctctatcg tgtaattttc aaccgcaaac gtggggctgt ggtagccgtt 60
gctgaaacta ccaagcgcga aggtaaaagc tgtgccgata gtgattcagg cagcgctcat 120
gtgaaatctg ttccttttgg tactactcat gcacctgttt gtcgttcaaa tatcttttct 180
ttttctttat tgggcttttc tttatgtttg gctgtaggta cggccaatat tgcttttgct 240
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<210> 184
<211> 83
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 184
Met Asn Lys Thr Leu Tyr Arg Val Ile Phe Asn Arg Lys Arg Gly Ala
1 5 10 15
Val Val Ala Val Ala Glu Thr Thr Lys Arg Glu Gly Lys Ser Cys Ala
20 25 30
Asp Ser Asp Ser Gly Ser Ala His Val Lys Ser Val Pro Phe Gly Thr
35 40 45
Thr His Ala Pro Val Cys Arg Ser Asn Ile Phe Ser Phe Ser Leu Leu
50 55 60
Gly Phe Ser Leu Cys Leu Ala Val Gly Thr Ala Asn Ile Ala Phe Ala
65 70 75 80
Asp Gly Ile
<210> 185
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 185
atgaacaaaa ccctctatcg tgtgattttc aaccgcaaac gcggtgctgt ggtagctgtt 60
gccgaaacca ccaagcgcga aggtaaaagc tgtgccgata gtggttcggg cagcgtttat 120
gtgaaatccg tttctttcat tcctactcat tccaaagcct tttgtttttc tgcattaggc 180
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gatgtgggta atcgcggggc gattttaaac aacagtcgca gcaacaccca aacacagcta 420
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caaatcaaca gcagccatcc ttcacaactg aatggctata ttgaagtggg tggacgacgt 540
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gatttcacac gtattcttgt atgccaacaa aatcaccttg atcagtacgg ccgaacaagc 780
aggcattcgt aa 792
<210> 186
<211> 263
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 186
Met Asn Lys Thr Leu Tyr Arg Val Ile Phe Asn Arg Lys Arg Gly Ala
1 5 10 15
Val Val Ala Val Ala Glu Thr Thr Lys Arg Glu Gly Lys Ser Cys Ala
20 25 30
Asp Ser Gly Ser Gly Ser Val Tyr Val Lys Ser Val Ser Phe Ile Pro
35 40 45
Thr His Ser Lys Ala Phe Cys Phe Ser Ala Leu Gly Phe Ser Leu Cys
50 55 60
Leu Ala Leu Gly Thr Val Asn Ile Ala Phe Ala Asp Gly Ile Ile Thr
65 70 75 80
Asp Lys Ala Ala Pro Lys Thr Gln Gln Ala Thr Ile Leu Gln Thr Gly
85 90 95
Asn Gly Ile Pro Gln Val Asn Ile Gln Thr Pro Thr Ser Ala Gly Val
100 105 110
Ser Val Asn Gln Tyr Ala Gln Phe Asp Val Gly Asn Arg Gly Ala Ile
115 120 125
Leu Asn Asn Ser Arg Ser Asn Thr Gln Thr Gln Leu Gly Gly Trp Ile
130 135 140
Gln Gly Asn Pro Trp Leu Thr Arg Gly Glu Ala Arg Val Val Val Asn
145 150 155 160
Gln Ile Asn Ser Ser His Pro Ser Gln Leu Asn Gly Tyr Ile Glu Val
165 170 175
Gly Gly Arg Arg Ala Glu Val Val Ile Ala Asn Pro Ala Gly Ile Ala
180 185 190
Val Asn Gly Gly Gly Phe Ile Asn Ala Ser Arg Ala Thr Leu Thr Thr
195 200 205
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210 215 220
Gln Gly Asn Ala Val Ile Ala Gly His Gly Leu Asp Ala Arg Asp Thr
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Asp Phe Thr Arg Ile Leu Val Cys Gln Gln Asn His Leu Asp Gln Tyr
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Gly Arg Thr Ser Arg His Ser
260
<210> 187
<211> 243
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 187
atgaatactc ctccttttgt ctgttggatt ttttgcaagg tcatcgacaa tttcggcgac 60
atcggcgttt cgtggcggct cgcccgtgtt ttgcaccgcg aactcggttg gcaggtgcat 120
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gcg 243
<210> 188
<211> 81
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 188
Met Asn Thr Pro Pro Phe Val Cys Trp Ile Phe Cys Lys Val Ile Asp
1 5 10 15
Asn Phe Gly Asp Ile Gly Val Ser Trp Arg Leu Ala Arg Val Leu His
20 25 30
Arg Glu Leu Gly Trp Gln Val His Leu Trp Thr Asp Asp Val Ser Ala
35 40 45
Leu Arg Ala Leu Cys Pro Asp Leu Pro Asp Val Pro Cys Val His Gln
50 55 60
Asp Ile His Val Arg Thr Trp His Ser Asp Ala Ala Asp Ile Asp Thr
65 70 75 80
Ala
<210> 189
<211> 1149
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 189
atgaatactc ctccttttgt ctgttggatt ttttgcaagg tcatcgacaa tttcggcgac 60
atcggcgttt cgtggcggct cgcccgtgtt ttgcaccgcg aactcggttg gcaggtgcat 120
ttgtggacgg acgatgtgtc cgccttgcgt gcgctttgcc ctgatttgcc cgatgttccc 180
tgcgttcatc aggatattca tgtccgcact tggcattccg atgcggcaga tattgatacc 240
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atacgctag 1149
<210> 190
<211> 382
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 190
Met Asn Thr Pro Pro Phe Val Cys Trp Ile Phe Cys Lys Val Ile Asp
1 5 10 15
Asn Phe Gly Asp Ile Gly Val Ser Trp Arg Leu Ala Arg Val Leu His
20 25 30
Arg Glu Leu Gly Trp Gln Val His Leu Trp Thr Asp Asp Val Ser Ala
35 40 45
Leu Arg Ala Leu Cys Pro Asp Leu Pro Asp Val Pro Cys Val His Gln
50 55 60
Asp Ile His Val Arg Thr Trp His Ser Asp Ala Ala Asp Ile Asp Thr
65 70 75 80
Ala Pro Val Pro Asp Val Val Ile Glu Thr Phe Ala Cys Asp Leu Pro
85 90 95
Glu Asn Val Leu His Ile Ile Arg Arg His Lys Pro Leu Trp Leu Asn
100 105 110
Trp Glu Tyr Leu Ser Ala Glu Glu Ser Asn Glu Arg Leu His Leu Met
115 120 125
Pro Ser Pro Gln Glu Gly Val Gln Lys Tyr Phe Trp Phe Met Gly Phe
130 135 140
Ser Glu Lys Ser Gly Gly Leu Ile Arg Glu Arg Asp Tyr Cys Glu Ala
145 150 155 160
Val Arg Phe Asp Thr Glu Ala Leu Arg Glu Arg Leu Met Leu Pro Glu
165 170 175
Lys Asn Ala Ser Glu Trp Leu Leu Phe Gly Tyr Arg Ser Asp Val Trp
180 185 190
Ala Lys Trp Leu Glu Met Trp Arg Gln Ala Gly Ser Pro Met Thr Leu
195 200 205
Leu Leu Ala Gly Thr Gln Ile Ile Asp Ser Leu Lys Gln Ser Gly Val
210 215 220
Ile Pro Gln Asp Ala Leu Gln Asn Asp Gly Asp Val Phe Gln Thr Ala
225 230 235 240
Ser Val Arg Leu Val Lys Ile Pro Phe Val Pro Gln Gln Asp Phe Asp
245 250 255
Gln Leu Leu His Leu Ala Asp Cys Ala Val Ile Arg Gly Glu Asp Ser
260 265 270
Phe Val Arg Ala Gln Leu Ala Gly Lys Pro Phe Phe Trp His Ile Tyr
275 280 285
Pro Gln Asp Glu Asn Val His Leu Asp Lys Leu His Ala Phe Trp Asp
290 295 300
Lys Ala His Gly Phe Tyr Thr Pro Glu Thr Val Ser Ala His Arg Arg
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Leu Ser Asp Asp Leu Asn Gly Gly Glu Ala Leu Ser Ala Thr Gln Arg
325 330 335
Leu Glu Cys Trp Gln Thr Leu Gln Gln His Gln Asn Gly Trp Arg Gln
340 345 350
Gly Ala Glu Asp Trp Ser Arg Tyr Leu Phe Gly Gln Pro Ser Ala Pro
355 360 365
Glu Lys Leu Ala Ala Phe Val Ser Lys His Gln Lys Ile Arg
370 375 380
<210> 191
<211> 1149
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (28)..(28)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (179)..(179)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (251)..(251)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (336)..(336)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (439)..(441)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (536)..(536)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (642)..(642)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 191
atgaatactc ctcctttttc tgctggantt ttttgcaagg tcatcgacaa tttcggcgac 60
atcggcgttt cgtggcggct tgcccgtgtt ttgcaccgcg aactcggttg gcaggtgcat 120
ttgtggacgg acgatgtgtc cgccttgcgt gcgctttgcc ctgatttgcc cgatgttcnc 180
tgcgttcatc aggatattca tgtccgcact tggcattccg atgcggcaga tattgatacc 240
gcgcctgttc ncgatgtcgt catcgaaact tttgcctgcg acctgcccga aaatgtgctg 300
cacatcatcc gccgacacaa gccgctttgg ctgaantggg aatatttgag cgcggaggan 360
agcaatgaaa ggctgcacnt gatgccttcg ccgcaggaga gtgttcnaaa atanttttgg 420
tttatgggtt tcagcgaann nagcggcgga ctgatacgcg aacgcgatta ctgcgaagcc 480
gtccgtttcg atagcggagc cttgcgcaag aggctgatgc ttcccgaaaa aaacgncccc 540
gaatggctgc ttttcggcta tcggagcgat gtttgggcaa agtggctgga aatgtggcga 600
caggcaggca gtccgttgac acttttgctg gcnggggcgc anattatcga cagcctcaaa 660
caaaacggcg ttattccgca agatgccctg caaaacgacg gcgatgtttt tcagacggca 720
tccgtccgcc tcgtcaaaat ccctttcgtg ccgcaacagg acttcgacaa actgctgcac 780
cttgccgact gcgccgtcat ccgcggcgaa gacagtttcg tgcgcgccca gcttgcgggc 840
aaacccttct tttggcacat ctacccgcaa gatgagaatg tccatctcga caaactccac 900
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ctttcagacg acctcaacgg cggagaggct ttatccgcaa cacaacgcct cgaatgttgg 1020
caaatcctgc aacaacatca aaacggctgg cggcaaggcg cggaggattg gagccgttat 1080
ctttttgggc agccttccgc atccgaaaaa ctcgccgcct ttgtttcaaa gcatcaaaaa 1140
atacgctag 1149
<210> 192
<211> 382
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (10)..(10)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (60)..(60)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (84)..(84)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (112)..(112)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (120)..(120)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (127)..(127)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (136)..(136)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (138)..(138)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (147)..(147)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (179)..(179)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (214)..(214)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 192
Met Asn Thr Pro Pro Phe Ser Ala Gly Xaa Phe Cys Lys Val Ile Asp
1 5 10 15
Asn Phe Gly Asp Ile Gly Val Ser Trp Arg Leu Ala Arg Val Leu His
20 25 30
Arg Glu Leu Gly Trp Gln Val His Leu Trp Thr Asp Asp Val Ser Ala
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Leu Arg Ala Leu Cys Pro Asp Leu Pro Asp Val Xaa Cys Val His Gln
50 55 60
Asp Ile His Val Arg Thr Trp His Ser Asp Ala Ala Asp Ile Asp Thr
65 70 75 80
Ala Pro Val Xaa Asp Val Val Ile Glu Thr Phe Ala Cys Asp Leu Pro
85 90 95
Glu Asn Val Leu His Ile Ile Arg Arg His Lys Pro Leu Trp Leu Xaa
100 105 110
Trp Glu Tyr Leu Ser Ala Glu Xaa Ser Asn Glu Arg Leu His Xaa Met
115 120 125
Pro Ser Pro Gln Glu Ser Val Xaa Lys Xaa Phe Trp Phe Met Gly Phe
130 135 140
Ser Glu Xaa Ser Gly Gly Leu Ile Arg Glu Arg Asp Tyr Cys Glu Ala
145 150 155 160
Val Arg Phe Asp Ser Gly Ala Leu Arg Lys Arg Leu Met Leu Pro Glu
165 170 175
Lys Asn Xaa Pro Glu Trp Leu Leu Phe Gly Tyr Arg Ser Asp Val Trp
180 185 190
Ala Lys Trp Leu Glu Met Trp Arg Gln Ala Gly Ser Pro Leu Thr Leu
195 200 205
Leu Leu Ala Gly Ala Xaa Ile Ile Asp Ser Leu Lys Gln Asn Gly Val
210 215 220
Ile Pro Gln Asp Ala Leu Gln Asn Asp Gly Asp Val Phe Gln Thr Ala
225 230 235 240
Ser Val Arg Leu Val Lys Ile Pro Phe Val Pro Gln Gln Asp Phe Asp
245 250 255
Lys Leu Leu His Leu Ala Asp Cys Ala Val Ile Arg Gly Glu Asp Ser
260 265 270
Phe Val Arg Ala Gln Leu Ala Gly Lys Pro Phe Phe Trp His Ile Tyr
275 280 285
Pro Gln Asp Glu Asn Val His Leu Asp Lys Leu His Ala Phe Trp Asp
290 295 300
Lys Ala His Gly Phe Tyr Thr Pro Glu Thr Ala Ser Ala His Arg Arg
305 310 315 320
Leu Ser Asp Asp Leu Asn Gly Gly Glu Ala Leu Ser Ala Thr Gln Arg
325 330 335
Leu Glu Cys Trp Gln Ile Leu Gln Gln His Gln Asn Gly Trp Arg Gln
340 345 350
Gly Ala Glu Asp Trp Ser Arg Tyr Leu Phe Gly Gln Pro Ser Ala Ser
355 360 365
Glu Lys Leu Ala Ala Phe Val Ser Lys His Gln Lys Ile Arg
370 375 380
<210> 193
<211> 1
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 193
n 1
<210> 194
<211> 345
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 194
Met Val Met Asn Thr Tyr Ala Phe Pro Val Cys Trp Ile Phe Cys Lys
1 5 10 15
Val Ile Asp Asn Phe Gly Asp Ile Gly Val Ser Trp Arg Leu Ala Arg
20 25 30
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100 105 110
Trp Leu Asn Trp Glu Tyr Leu Ser Ala Glu Glu Ser Asn Glu Arg Leu
115 120 125
His Leu Met Pro Ser Pro Gln Glu Gly Val Gln Lys Tyr Phe Trp Phe
130 135 140
Met Gly Phe Ser Glu Lys Ser Gly Gly Leu Ile Arg Glu Arg Asp Tyr
145 150 155 160
Arg Glu Ala Val Arg Phe Asp Thr Glu Ala Leu Arg Arg Arg Leu Val
165 170 175
Leu Pro Glu Lys Asn Ala Pro Glu Trp Leu Leu Phe Gly Tyr Arg Gly
180 185 190
Asp Val Trp Ala Lys Trp Leu Asp Met Trp Gln Gln Ala Gly Ser Leu
195 200 205
Met Thr Leu Leu Leu Ala Gly Ala Gln Ile Ile Asp Ser Leu Lys Gln
210 215 220
Ser Gly Val Ile Pro Gln Asn Ala Leu Gln Asn Glu Gly Gly Val Phe
225 230 235 240
Gln Thr Ala Ser Val Arg Leu Val Lys Ile Pro Phe Val Pro Gln Gln
245 250 255
Asp Phe Asp Lys Leu Leu His Leu Ala Asp Cys Ala Val Ile Arg Gly
260 265 270
Glu Asp Ser Phe Val Arg Thr Gln Leu Ala Gly Lys Pro Phe Phe Trp
275 280 285
His Ile Tyr Pro Gln Asp Glu Asn Val His Leu Asp Lys Leu His Ala
290 295 300
Phe Trp Asp Lys Ala Tyr Gly Phe Tyr Thr Pro Glu Thr Ala Ser Val
305 310 315 320
His Arg Leu Leu Ser Asp Asp Leu Asn Gly Gly Glu Ala Leu Ser Ala
325 330 335
Thr Gln Arg Leu Glu Cys Gly Val Leu
340 345
<210> 195
<211> 1152
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 195
atgaatacat acgcttttcc tgtctgttgg attttttgca aggtcatcga caatttcggc 60
gacatcggcg tttcgtggcg gctcgcccgt gttttgcacc gcgaactcgg ttggcaggtg 120
catttgtgga cggacgacgt gtccgccttg cgcgcgcttt gtcccgattt gcccgatgtt 180
cccttcgttc atcaggatat tcatgtccgc acttggcatt ccgatgcggc agacattgat 240
accgcgcccg ttcccgatgc cgttatcgaa acttttgcct gcgacctgcc cgaaaatgtg 300
ctgaacatca tccgccgaca caaaccgctt tggctgaatt gggaatattt gagcgcggag 360
gaaagcaatg aaaggctgca cctgatgcct tcgccgcagg agggcgttca aaaatatttt 420
tggtttatgg gtttcagcga aaaaagcggc gggttgatac gcgaacgcga ttaccgcgaa 480
gccgtccgtt tcgataccga agccctgcgc cggcggctgg tgctgcccga aaaaaacgcc 540
cccgaatggc tgcttttcgg ctatcggggc gatgtttggg caaagtggct ggacatgtgg 600
caacaggcag gcagcctgat gaccctactg ctggcggggg cgcaaattat cgacagcctc 660
aaacaaagcg gcgttattcc gcaaaacgcc ctgcaaaatg aaggcggtgt ctttcagacg 720
gcatccgtcc gccttgtcaa aatcccgttc gtgccgcaac aggacttcga caaattgctg 780
cacctcgccg actgcgccgt gatacgcggc gaagacagtt tcgtgcgtac ccagcttgcc 840
ggaaaaccct ttttttggca catctacccg caagacgaga atgtccatct cgacaaactc 900
cacgcctttt gggataaggc atacggcttc tacacgcccg aaaccgcatc ggtgcaccgc 960
ctcctttcgg acgacctcaa cggcggagag gctttatccg caacacaacg cctcgaatgt 1020
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tatcttttcg ggcagccttc cgcatccgaa aaactcgccg cctttgtttc aaagcatcaa 1140
aaaatacgct ag 1152
<210> 196
<211> 383
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 196
Met Asn Thr Tyr Ala Phe Pro Val Cys Trp Ile Phe Cys Lys Val Ile
1 5 10 15
Asp Asn Phe Gly Asp Ile Gly Val Ser Trp Arg Leu Ala Arg Val Leu
20 25 30
His Arg Glu Leu Gly Trp Gln Val His Leu Trp Thr Asp Asp Val Ser
35 40 45
Ala Leu Arg Ala Leu Cys Pro Asp Leu Pro Asp Val Pro Phe Val His
50 55 60
Gln Asp Ile His Val Arg Thr Trp His Ser Asp Ala Ala Asp Ile Asp
65 70 75 80
Thr Ala Pro Val Pro Asp Ala Val Ile Glu Thr Phe Ala Cys Asp Leu
85 90 95
Pro Glu Asn Val Leu Asn Ile Ile Arg Arg His Lys Pro Leu Trp Leu
100 105 110
Asn Trp Glu Tyr Leu Ser Ala Glu Glu Ser Asn Glu Arg Leu His Leu
115 120 125
Met Pro Ser Pro Gln Glu Gly Val Gln Lys Tyr Phe Trp Phe Met Gly
130 135 140
Phe Ser Glu Lys Ser Gly Gly Leu Ile Arg Glu Arg Asp Tyr Arg Glu
145 150 155 160
Ala Val Arg Phe Asp Thr Glu Ala Leu Arg Arg Arg Leu Val Leu Pro
165 170 175
Glu Lys Asn Ala Pro Glu Trp Leu Leu Phe Gly Tyr Arg Gly Asp Val
180 185 190
Trp Ala Lys Trp Leu Asp Met Trp Gln Gln Ala Gly Ser Leu Met Thr
195 200 205
Leu Leu Leu Ala Gly Ala Gln Ile Ile Asp Ser Leu Lys Gln Ser Gly
210 215 220
Val Ile Pro Gln Asn Ala Leu Gln Asn Glu Gly Gly Val Phe Gln Thr
225 230 235 240
Ala Ser Val Arg Leu Val Lys Ile Pro Phe Val Pro Gln Gln Asp Phe
245 250 255
Asp Lys Leu Leu His Leu Ala Asp Cys Ala Val Ile Arg Gly Glu Asp
260 265 270
Ser Phe Val Arg Thr Gln Leu Ala Gly Lys Pro Phe Phe Trp His Ile
275 280 285
Tyr Pro Gln Asp Glu Asn Val His Leu Asp Lys Leu His Ala Phe Trp
290 295 300
Asp Lys Ala Tyr Gly Phe Tyr Thr Pro Glu Thr Ala Ser Val His Arg
305 310 315 320
Leu Leu Ser Asp Asp Leu Asn Gly Gly Glu Ala Leu Ser Ala Thr Gln
325 330 335
Arg Leu Glu Cys Trp Gln Thr Leu Gln Gln His Gln Asn Gly Trp Arg
340 345 350
Gln Gly Ala Glu Asp Trp Ser Arg Tyr Leu Phe Gly Gln Pro Ser Ala
355 360 365
Ser Glu Lys Leu Ala Ala Phe Val Ser Lys His Gln Lys Ile Arg
370 375 380
<210> 197
<211> 429
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (15)..(15)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (59)..(59)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (114)..(114)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (137)..(137)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (411)..(411)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 197
ttgttcctgc gtgtnaaagt ggggcgtttt ttcagcagtc cggcgacgtg gtttcgggnc 60
aaagaccctg taaatcaggc ggtgttgcgg ctgtatncgg acgagtggcg gcanacttcg 120
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ctcggtttcc ctgtccccga tgcgcggtcg gtcatcgaag gccgtctgaa cggcaatatt 360
gccgatgcgc gggcttggtc ggggctgctg gtcgncagta tcgcctgcta nggcatcctg 420
ccgcgcctg 429
<210> 198
<211> 143
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (20)..(20)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (33)..(33)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (38)..(38)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (46)..(46)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (132)..(132)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (137)..(137)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 198
Leu Phe Leu Arg Val Lys Val Gly Arg Phe Phe Ser Ser Pro Ala Thr
1 5 10 15
Trp Phe Arg Xaa Lys Asp Pro Val Asn Gln Ala Val Leu Arg Leu Tyr
20 25 30
Xaa Asp Glu Trp Arg Xaa Thr Ser Val Arg Trp Lys Ile Xaa Ala Thr
35 40 45
Ser His Ser Leu Trp Leu Cys Thr Leu Leu Gly Met Leu Val Ser Val
50 55 60
Leu Leu Leu Leu Leu Val Arg Gln Tyr Thr Phe Asn Trp Glu Ser Thr
65 70 75 80
Leu Leu Ser Asn Ala Ala Ser Val Arg Ala Val Glu Met Leu Ala Trp
85 90 95
Leu Pro Ser Lys Leu Gly Phe Pro Val Pro Asp Ala Arg Ser Val Ile
100 105 110
Glu Gly Arg Leu Asn Gly Asn Ile Ala Asp Ala Arg Ala Trp Ser Gly
115 120 125
Leu Leu Val Xaa Ser Ile Ala Cys Xaa Gly Ile Leu Pro Arg Leu
130 135 140
<210> 199
<211> 1341
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 199
atgttgaatc catcccgaaa actggttgag ctggtccgta ttttggacga aggcggtttt 60
attttcagcg gcgatcccgt acaggcgacg gaggctttgc gccgcgtgga cggcagtacg 120
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ttggaacgtg tgcgtgcggg gtcgttctgg ttgtgggtgg tggcggcgac gtttgcattt 240
tttaccggtt tttcagtcac ttatcttcta atggacaatc agggtctgaa tttctttttg 300
gttttggcgg gcgtgttggg catgaatacg ctgatgctgg cagtatggtt ggcaatgttg 360
ttcctgcgtg tgaaagtggg gcgttttttc agcagtccgg cgacgtggtt tcggggcaaa 420
gaccctgtaa atcaggcggt gttgcggctg tatgcggacg agtggcggca accttcggta 480
cgttggaaaa taggcgcaac gtcgcacagc ctgtggctct gcacgctgct cggaatgctg 540
gtgtcggtat tgttgctgct tttggtgcgg caatatacgt tcaactggga aagcacgctg 600
ttgagcaatg ccgcttcggt acgcgcggtg gaaatgttgg catggctgcc gtcgaaactc 660
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gatgcgcggg cttggtcggg gctgctggtc ggcagtatcg cctgctacgg catcctgccg 780
cgcctgctgg cttgggtagt gtgtaaaatc cttttgaaaa caagcgaaaa cggattggat 840
ttggaaaagc cctattatca ggcggtcatc cgccgctggc agaacaaaat caccgatgcg 900
gatacgcgtc gggaaaccgt gtccgccgtt tcaccgaaaa tcatcttgaa cgatgcgccg 960
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gcgcaggaat ggctggataa gggcgttgcc accaatcggg aacaggttgc cgcgctggag 1080
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gggcgtttga aagaccaata a 1341
<210> 200
<211> 446
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 200
Met Leu Asn Pro Ser Arg Lys Leu Val Glu Leu Val Arg Ile Leu Asp
1 5 10 15
Glu Gly Gly Phe Ile Phe Ser Gly Asp Pro Val Gln Ala Thr Glu Ala
20 25 30
Leu Arg Arg Val Asp Gly Ser Thr Glu Glu Lys Ile Ile Arg Arg Ala
35 40 45
Glu Met Ile Asp Arg Asn Arg Met Leu Arg Glu Thr Leu Glu Arg Val
50 55 60
Arg Ala Gly Ser Phe Trp Leu Trp Val Val Ala Ala Thr Phe Ala Phe
65 70 75 80
Phe Thr Gly Phe Ser Val Thr Tyr Leu Leu Met Asp Asn Gln Gly Leu
85 90 95
Asn Phe Phe Leu Val Leu Ala Gly Val Leu Gly Met Asn Thr Leu Met
100 105 110
Leu Ala Val Trp Leu Ala Met Leu Phe Leu Arg Val Lys Val Gly Arg
115 120 125
Phe Phe Ser Ser Pro Ala Thr Trp Phe Arg Gly Lys Asp Pro Val Asn
130 135 140
Gln Ala Val Leu Arg Leu Tyr Ala Asp Glu Trp Arg Gln Pro Ser Val
145 150 155 160
Arg Trp Lys Ile Gly Ala Thr Ser His Ser Leu Trp Leu Cys Thr Leu
165 170 175
Leu Gly Met Leu Val Ser Val Leu Leu Leu Leu Leu Val Arg Gln Tyr
180 185 190
Thr Phe Asn Trp Glu Ser Thr Leu Leu Ser Asn Ala Ala Ser Val Arg
195 200 205
Ala Val Glu Met Leu Ala Trp Leu Pro Ser Lys Leu Gly Phe Pro Val
210 215 220
Pro Asp Ala Arg Ala Val Ile Glu Gly Arg Leu Asn Gly Asn Ile Ala
225 230 235 240
Asp Ala Arg Ala Trp Ser Gly Leu Leu Val Gly Ser Ile Ala Cys Tyr
245 250 255
Gly Ile Leu Pro Arg Leu Leu Ala Trp Val Val Cys Lys Ile Leu Leu
260 265 270
Lys Thr Ser Glu Asn Gly Leu Asp Leu Glu Lys Pro Tyr Tyr Gln Ala
275 280 285
Val Ile Arg Arg Trp Gln Asn Lys Ile Thr Asp Ala Asp Thr Arg Arg
290 295 300
Glu Thr Val Ser Ala Val Ser Pro Lys Ile Ile Leu Asn Asp Ala Pro
305 310 315 320
Lys Trp Ala Val Met Leu Glu Thr Glu Trp Gln Asp Gly Glu Trp Phe
325 330 335
Glu Gly Arg Leu Ala Gln Glu Trp Leu Asp Lys Gly Val Ala Thr Asn
340 345 350
Arg Glu Gln Val Ala Ala Leu Glu Thr Glu Leu Lys Gln Lys Pro Ala
355 360 365
Gln Leu Leu Ile Gly Val Arg Ala Gln Thr Val Pro Asp Arg Gly Val
370 375 380
Leu Arg Gln Ile Val Arg Leu Ser Glu Ala Ala Gln Gly Gly Ala Val
385 390 395 400
Val Gln Leu Leu Ala Glu Gln Gly Leu Ser Asp Asp Leu Ser Glu Lys
405 410 415
Leu Glu His Trp Arg Asn Ala Leu Ala Glu Cys Gly Ala Ala Trp Leu
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Glu Pro Asp Arg Ala Ala Gln Glu Gly Arg Leu Lys Asp Gln
435 440 445
<210> 201
<211> 1350
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (241)..(241)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (248)..(248)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (316)..(316)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (470)..(470)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (814)..(814)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (817)..(817)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (851)..(851)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
<222> (860)..(862)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (865)..(865)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (1206)..(1206)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 201
atgttgaatc catcccgaaa actggttgag ctggtccgta ttttggaaga aggcggcttt 60
attttcagcg gcgatcccgt gcaggcgacg gaggctttgc gccgcgtgga cggcagtacg 120
gaggaaaaaa tcatccgtcg ggcgaagatg atcgacagga accgtatgct gcgggagacg 180
ttggaacgtg tgcgtgcggg gtcgttctgg ttgtgggtgg cggcggcgac gtttgcgttt 240
nttaccgntt tttcagttac ttatcttcta atggacaatc agggtctgaa tttctttttg 300
gttttggcgg gcgtgntggg catgaatacg ctgatgctgg cagtatggtt ggcaatgttg 360
ttcctgcgcg tgaaagtggg gcgttttttc agcagtccgg cgacgtggtt tcggggcaaa 420
gaccctgtca atcaggcggt gttgcggctg tatgcggacg agtggcggcn accttcggta 480
cgttggaaaa taggcgcaac gtcgcacagc ctgtggctct gcacgctgct cggaatgctg 540
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gatgcgcggg cttggtcggg gctgctggtc ggcagtatcg cctgctacgg catcctgccg 780
cgcctcttgg cttgggcggt atgcaaaatc cttntgnaaa caagcgaaaa cggcttggat 840
ttggaaaagc ncnnnnntcn nncgntcatc cgccgctggc agaacaaaat caccgatgcg 900
gatacgcgtc gggaaaccgt gtccgccgtt tcgccgaaaa tcgtcttgaa cgatgcgccg 960
aaatgggcgg tcatgctgga gaccgaatgg caggacggcg aatggttcga gggcaggctg 1020
gcgcaggaat ggctggataa gggcgttgcc gccaatcggg aacaggttgc cgcgctggag 1080
acagagctga agcagaaacc ggcgcaactg cttatcggcg tgcgcgccca aactgtgccc 1140
gaccgcggcg tgttgcggca gatcgtccga ctttcggaag cggcgcaggg cggcgcggtg 1200
gtgcancttt tggcggaaca ggggctttca gacgaccttt cggaaaagct ggaacattgg 1260
cgtaacgcgc tgaccgaatg cggcgcggcg tggctggaac ccgacagagc ggcgcaggaa 1320
ggccgtctga aaaccaacga ccgcacttga 1350
<210> 202
<211> 449
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (81)..(81)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (83)..(83)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (106)..(106)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (157)..(157)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (272)..(273)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (284)..(289)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (402)..(402)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 202
Met Leu Asn Pro Ser Arg Lys Leu Val Glu Leu Val Arg Ile Leu Glu
1 5 10 15
Glu Gly Gly Phe Ile Phe Ser Gly Asp Pro Val Gln Ala Thr Glu Ala
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Leu Arg Arg Val Asp Gly Ser Thr Glu Glu Lys Ile Ile Arg Arg Ala
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Lys Met Ile Asp Arg Asn Arg Met Leu Arg Glu Thr Leu Glu Arg Val
50 55 60
Arg Ala Gly Ser Phe Trp Leu Trp Val Ala Ala Ala Thr Phe Ala Phe
65 70 75 80
Xaa Thr Xaa Phe Ser Val Thr Tyr Leu Leu Met Asp Asn Gln Gly Leu
85 90 95
Asn Phe Phe Leu Val Leu Ala Gly Val Xaa Gly Met Asn Thr Leu Met
100 105 110
Leu Ala Val Trp Leu Ala Met Leu Phe Leu Arg Val Lys Val Gly Arg
115 120 125
Phe Phe Ser Ser Pro Ala Thr Trp Phe Arg Gly Lys Asp Pro Val Asn
130 135 140
Gln Ala Val Leu Arg Leu Tyr Ala Asp Glu Trp Arg Xaa Pro Ser Val
145 150 155 160
Arg Trp Lys Ile Gly Ala Thr Ser His Ser Leu Trp Leu Cys Thr Leu
165 170 175
Leu Gly Met Leu Val Ser Val Leu Leu Leu Leu Leu Val Arg Gln Tyr
180 185 190
Thr Phe Asn Trp Glu Ser Thr Leu Leu Gly Asp Ser Ser Ser Val Arg
195 200 205
Leu Val Glu Met Leu Ala Trp Leu Pro Ala Lys Leu Gly Phe Pro Val
210 215 220
Pro Asp Ala Arg Ala Val Ile Glu Gly Arg Leu Asn Gly Asn Ile Ala
225 230 235 240
Asp Ala Arg Ala Trp Ser Gly Leu Leu Val Gly Ser Ile Ala Cys Tyr
245 250 255
Gly Ile Leu Pro Arg Leu Leu Ala Trp Ala Val Cys Lys Ile Leu Xaa
260 265 270
Xaa Thr Ser Glu Asn Gly Leu Asp Leu Glu Lys Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
275 280 285
Xaa Ile Arg Arg Trp Gln Asn Lys Ile Thr Asp Ala Asp Thr Arg Arg
290 295 300
Glu Thr Val Ser Ala Val Ser Pro Lys Ile Val Leu Asn Asp Ala Pro
305 310 315 320
Lys Trp Ala Val Met Leu Glu Thr Glu Trp Gln Asp Gly Glu Trp Phe
325 330 335
Glu Gly Arg Leu Ala Gln Glu Trp Leu Asp Lys Gly Val Ala Ala Asn
340 345 350
Arg Glu Gln Val Ala Ala Leu Glu Thr Glu Leu Lys Gln Lys Pro Ala
355 360 365
Gln Leu Leu Ile Gly Val Arg Ala Gln Thr Val Pro Asp Arg Gly Val
370 375 380
Leu Arg Gln Ile Val Arg Leu Ser Glu Ala Ala Gln Gly Gly Ala Val
385 390 395 400
Val Xaa Leu Leu Ala Glu Gln Gly Leu Ser Asp Asp Leu Ser Glu Lys
405 410 415
Leu Glu His Trp Arg Asn Ala Leu Thr Glu Cys Gly Ala Ala Trp Leu
420 425 430
Glu Pro Asp Arg Ala Ala Gln Glu Gly Arg Leu Lys Thr Asn Asp Arg
435 440 445
Thr
<210> 203
<211> 1
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 203
n 1
<210> 204
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 204
Met Ile Asp Arg Asp Arg Met Leu Arg Asp Thr Leu Glu Arg Val Arg
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65 70 75 80
Phe Ser Ser Pro Ala Thr Trp Phe Arg Gly Lys Gly Pro Val Asn Gln
85 90 95
Ala Val Leu Arg Leu Tyr Ala Asp Gln Trp Arg Gln Pro Ser Val Arg
100 105 110
Trp Lys Ile Gly Ala Thr Ala His Ser Leu Trp Leu Cys Thr Leu Leu
115 120 125
Gly Met Leu Val Ser Val Leu Leu Leu Leu Leu Val Arg Gln Tyr Thr
130 135 140
Phe Asn Trp Glu Ser Thr Leu Leu Ser Asn Ala Ala Ser Val Arg Ala
145 150 155 160
Val Glu Met Leu Ala Trp Leu Pro Ser Lys Leu Gly Phe Pro Val Pro
165 170 175
Asp Ala Arg Ala Val Ile Glu Gly Arg Leu Asn Gly Asn Ile Ala Asp
180 185 190
Ala Arg Ala Trp Ser Gly Leu Leu Val Gly Ser Ile Val Cys Tyr Gly
195 200 205
Ile Leu Pro Arg Leu Leu Ala Trp Val Val Cys Lys Ile Leu Leu Lys
210 215 220
Thr Ser Glu Asn Gly Leu Asp Leu Glu Lys Thr Tyr Tyr Gln Ala Val
225 230 235 240
Ile Arg Arg Trp Gln Asn Lys Ile Thr Asp Ala Asp Thr Arg Arg Glu
245 250 255
Thr Val Ser Ala Val Ser Pro Lys Ile Val Leu Asn Asp Ala Pro Lys
260 265 270
Trp Ala Leu Met Leu Glu Thr Glu Trp Gln Asp Gly Gln Trp Phe Glu
275 280 285
Gly Arg Leu Ala Gln Glu Trp Leu Asp Lys Gly Val Ala Ala Asn Arg
290 295 300
Glu Gln Val Ala Ala Leu Glu Thr Glu Leu Lys Gln Lys Pro Ala Gln
305 310 315 320
Leu Leu Ile Gly Val Arg Ala Gln Thr Val Pro Asp Arg Gly Val Leu
325 330 335
Arg Gln Ile Val Arg Leu Ser Glu Ala Ala Gln Gly Gly Ala Val Val
340 345 350
Gln Leu Leu Ala Glu Gln Gly Leu Ser Asp Asp Leu Ser Glu Lys Leu
355 360 365
Glu His Trp Arg Asn Ala Leu Thr Glu Cys Gly Ala Ala Trp Leu Glu
370 375 380
Pro Asp Arg Val Ala Gln Glu Gly Arg Leu Lys Asp Gln
385 390 395
<210> 205
<211> 1341
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 205
atgttgaatc catcccgaaa actggttgag ctggtccgta ttttgaataa agggggtttt 60
attttcagcg gcgatcctgt gcaggcgacg gaggctttgc gccgcgtgga cggcagtacg 120
gaggaaaaaa tcttccgtcg ggcggagatg atcgacaggg accgtatgtt gcgggacacg 180
ttggaacgtg tgcgtgcggg gtcgttctgg ttatgggtgg tggtggcatc gatgatgttt 240
accgccggat tttcaggcac ttatcttctg atggacaatc aggggctgaa tttcttttta 300
gttttggcgg gagtgttggg catgaatacg ctgatgctgg cagtatggtt ggcaacgttg 360
ttcctgcgcg tgaaagtggg acggtttttc agcagtccgg cgacgtggtt tcggggcaaa 420
ggccctgtaa atcaggcggt gttgcggctg tatgcggacc agtggcggca accttcggta 480
cgatggaaaa taggcgcaac ggcgcacagc ttgtggctct gcacgctgct cggaatgctg 540
gtgtcggtat tgctgctgct tttggtgcgg caatatacgt tcaactggga aagcacgctg 600
ttgagcaatg ccgcttcggt acgcgcggtg gaaatgttgg catggctgcc gtcgaaactc 660
ggtttccctg tccccgatgc gcgggcggtc atcgaaggtc gtctgaacgg caatattgcc 720
gatgcgcggg cttggtcggg gctgctggtc ggcagtatcg tctgctacgg catcctgccg 780
cgcctcttgg cttgggtagt gtgtaaaatc cttttgaaaa caagcgaaaa cggattggat 840
ttggaaaaaa cctattatca ggcggtcatc cgccgctggc agaacaaaat caccgatgcg 900
gatacgcgtc gggaaaccgt gtccgccgtt tcgccgaaaa tcgtcttgaa cgatgcgccg 960
aaatgggcgc tcatgctgga gaccgagtgg caggacggcc aatggttcga gggcaggctg 1020
gcgcaggaat ggctggataa gggcgttgcc gccaatcggg aacaggttgc cgcgctggag 1080
acagagctga agcagaaacc ggcgcaactg cttatcggcg tacgcgccca aactgtgccg 1140
gaccggggcg tgctgcggca gattgtgcgg ctttcggaag cggcgcaggg cggcgcggtg 1200
gtgcagcttt tggcggaaca ggggctttca gacgaccttt cggaaaagct ggaacattgg 1260
cgtaacgcgc tgaccgaatg cggcgcggcg tggcttgagc ctgacagggt ggcgcaggaa 1320
ggccgtttga aagaccaata a 1341
<210> 206
<211> 446
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 206
Met Leu Asn Pro Ser Arg Lys Leu Val Glu Leu Val Arg Ile Leu Asn
1 5 10 15
Lys Gly Gly Phe Ile Phe Ser Gly Asp Pro Val Gln Ala Thr Glu Ala
20 25 30
Leu Arg Arg Val Asp Gly Ser Thr Glu Glu Lys Ile Phe Arg Arg Ala
35 40 45
Glu Met Ile Asp Arg Asp Arg Met Leu Arg Asp Thr Leu Glu Arg Val
50 55 60
Arg Ala Gly Ser Phe Trp Leu Trp Val Val Val Ala Ser Met Met Phe
65 70 75 80
Thr Ala Gly Phe Ser Gly Thr Tyr Leu Leu Met Asp Asn Gln Gly Leu
85 90 95
Asn Phe Phe Leu Val Leu Ala Gly Val Leu Gly Met Asn Thr Leu Met
100 105 110
Leu Ala Val Trp Leu Ala Thr Leu Phe Leu Arg Val Lys Val Gly Arg
115 120 125
Phe Phe Ser Ser Pro Ala Thr Trp Phe Arg Gly Lys Gly Pro Val Asn
130 135 140
Gln Ala Val Leu Arg Leu Tyr Ala Asp Gln Trp Arg Gln Pro Ser Val
145 150 155 160
Arg Trp Lys Ile Gly Ala Thr Ala His Ser Leu Trp Leu Cys Thr Leu
165 170 175
Leu Gly Met Leu Val Ser Val Leu Leu Leu Leu Leu Val Arg Gln Tyr
180 185 190
Thr Phe Asn Trp Glu Ser Thr Leu Leu Ser Asn Ala Ala Ser Val Arg
195 200 205
Ala Val Glu Met Leu Ala Trp Leu Pro Ser Lys Leu Gly Phe Pro Val
210 215 220
Pro Asp Ala Arg Ala Val Ile Glu Gly Arg Leu Asn Gly Asn Ile Ala
225 230 235 240
Asp Ala Arg Ala Trp Ser Gly Leu Leu Val Gly Ser Ile Val Cys Tyr
245 250 255
Gly Ile Leu Pro Arg Leu Leu Ala Trp Val Val Cys Lys Ile Leu Leu
260 265 270
Lys Thr Ser Glu Asn Gly Leu Asp Leu Glu Lys Thr Tyr Tyr Gln Ala
275 280 285
Val Ile Arg Arg Trp Gln Asn Lys Ile Thr Asp Ala Asp Thr Arg Arg
290 295 300
Glu Thr Val Ser Ala Val Ser Pro Lys Ile Val Leu Asn Asp Ala Pro
305 310 315 320
Lys Trp Ala Leu Met Leu Glu Thr Glu Trp Gln Asp Gly Gln Trp Phe
325 330 335
Glu Gly Arg Leu Ala Gln Glu Trp Leu Asp Lys Gly Val Ala Ala Asn
340 345 350
Arg Glu Gln Val Ala Ala Leu Glu Thr Glu Leu Lys Gln Lys Pro Ala
355 360 365
Gln Leu Leu Ile Gly Val Arg Ala Gln Thr Val Pro Asp Arg Gly Val
370 375 380
Leu Arg Gln Ile Val Arg Leu Ser Glu Ala Ala Gln Gly Gly Ala Val
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Val Gln Leu Leu Ala Glu Gln Gly Leu Ser Asp Asp Leu Ser Glu Lys
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Leu Glu His Trp Arg Asn Ala Leu Thr Glu Cys Gly Ala Ala Trp Leu
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Glu Pro Asp Arg Val Ala Gln Glu Gly Arg Leu Lys Asp Gln
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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cagaagagtt tgtcgagaat ttctttatgg ggtttgggcg gcgtgttttt cggggtgtcc 60
ggtctggtat ggttttcttt gggcgtttct ttngagtgcg cctgtttttc gggtgtttct 120
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cgnngtttga cccggttttt cttgggtgcg gcaggggacg tcattctcct gccgctttcg 300
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 208
Gln Lys Ser Leu Ser Arg Ile Ser Leu Trp Gly Leu Gly Gly Val Phe
1 5 10 15
Phe Gly Val Ser Gly Leu Val Trp Phe Ser Leu Gly Val Ser Xaa Glu
20 25 30
Cys Ala Cys Phe Ser Gly Val Ser Phe Arg Gly Ser Gly Arg Gly Thr
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Phe Val Gly Ser Thr Gly Val Ser Leu Ser Val Phe Ser Ala Cys Val
50 55 60
Xaa Gly Val Val Arg Leu Pro Val Gly Leu Ser Cys Val Gly Arg Leu
65 70 75 80
Xaa Xaa Leu Thr Arg Phe Phe Leu Gly Ala Ala Gly Asp Val Ile Leu
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Leu Pro Leu Ser Ser Val Pro Ser Gly Cys Ala Gly Ser Asp Glu Ala
100 105 110
Ala Trp Trp Cys Ser Gly Trp Ala Ala Ser Cys Pro Thr Thr Pro Phe
115 120 125
Gly Ser Gln Asn Ser Val Ser Arg Gly Leu Ser Val Cys Cys Gly Ser
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Ala Arg Val Leu Ser Ser
145 150
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<211> 1362
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 209
atgatgatgc cgttcataat gcttccttgg attgckggtg tgcctgccgt gccgggtcag 60
aataggttgt ccagaatttc tttatggggt ttgggcggcg tgtttttcgg ggtgtccggt 120
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gcttgtgttc cggcgtcgtc cggctgcctg tcggtttgag ctgtgtcggc aggttgcggt 300
ttgacccggt ttttcttggg tgcggcaggg gacggcagtc cgctgccgct ttcgtctgtg 360
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aatgcgccga tggcggcgat acagatgagc aatacggcgc gtatcaggag tttgggggtc 600
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<210> 210
<211> 453
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 210
Met Met Met Pro Phe Ile Met Leu Pro Trp Ile Ala Gly Val Pro Ala
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Gly Val Phe Phe Gly Val Ser Gly Leu Val Trp Phe Ser Leu Gly Val
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Ala Cys Val Pro Ala Ser Ser Gly Cys Leu Ser Val Xaa Ala Val Ser
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Met Pro Ile Ala Asn Ala Pro Met Ala Ala Ile Gln Met Ser Asn Thr
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Ala Arg Ile Arg Ser Leu Gly Val Ser Leu Lys Gly Leu Phe Gly Phe
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Asp Val Ala Gly Ser Ala Arg Gln Gly Gly Asp Gly Asn Ile Val Val
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Phe Phe Ala Phe Gly Gly Asp Leu Ser Glu Gln Gln Gln Val Ala Val
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Val Ala Asp Asp Gly Asp Leu Gly Arg Val Ala Phe Gly Leu Val Val
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Leu Ala Gln Ile Gly Thr Gly Gly Gly Phe Asp Thr Gln Arg His Asn
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Val Val Val Gly Leu Arg Ala Gly Gly Ser Ala Val Asp Gly Gly Phe
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Arg Ala Asp Gly Gly Ala Ser Asp Tyr Cys Ala Asp Ala Ala Ala Lys
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Gly Lys Ala Glu Asn Gly Gly Asn Gln Gly Ala Asp Gly Val Arg Phe
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Gly Phe His Arg Val Leu Pro Phe Leu Gly Val Ser Asp Gly Ile Ala
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Leu Arg His Ala Val
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<213> Neisseria meningitidis
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<400> 211
atgatgatnc cgttnataat gcttccttgg attgcgggtg tgcctgccgt gccgggtcag 60
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<211> 459
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (395)..(395)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 212
Met Met Xaa Pro Xaa Ile Met Leu Pro Trp Ile Ala Gly Val Pro Ala
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Val Pro Gly Gln Lys Arg Leu Ser Arg Xaa Ser Leu Trp Gly Leu Gly
20 25 30
Gly Xaa Phe Phe Gly Val Ser Gly Leu Val Trp Phe Ser Leu Gly Val
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Ser Xaa Ser Leu Gly Val Ser Xaa Gly Cys Ala Cys Phe Ser Gly Val
50 55 60
Ser Phe Arg Gly Ser Gly Arg Gly Thr Phe Val Gly Ser Thr Gly Val
65 70 75 80
Ser Leu Ser Val Phe Ser Ala Cys Ala Pro Ala Ser Ser Gly Cys Leu
85 90 95
Ser Val Xaa Ala Val Ser Ala Gly Cys Gly Leu Thr Arg Xaa Phe Xaa
100 105 110
Gly Ala Ala Gly Asp Gly Ser Pro Leu Pro Leu Ser Ser Val Pro Ser
115 120 125
Gly Cys Ala Gly Ala Asp Glu Glu Ala Xaa Xaa Cys Ser Gly Trp Ala
130 135 140
Ala Ser Cys Pro Thr Thr Pro Phe Gly Ser Gln Asn Ser Val Ser Arg
145 150 155 160
Gly Leu Ser Val Cys Cys Gly Ser Val Trp Arg Val Leu Ser Pro Phe
165 170 175
Gly Xaa Asn Val Leu Thr Met Pro Ile Ala Asn Ala Pro Met Ala Val
180 185 190
Ile Gln Met Ser Asn Thr Ala Arg Ile Arg Ser Leu Gly Val Ser Leu
195 200 205
Lys Gly Leu Phe Xaa Phe Phe Ala Ile Leu Ile Val Leu Leu Gly Cys
210 215 220
Arg Ala Met Pro Ser Glu Gly Gly Ser Asp Gly Ile Ala Glu Ser Ala
225 230 235 240
Leu Asp Val Val Xaa Val Glu Gly Asp Asp Phe Leu Tyr Ala Asp Gly
245 250 255
Gly Ala Asp Phe Leu Gly Asn Leu Arg Leu Phe Phe Gly Gly Glu Asp
260 265 270
Ala His Asn Val Gly Tyr Val Ala Val Gly Asn Asp Phe Asp Ala Arg
275 280 285
Leu Cys Gly Gly Ala Asp Ala Gln Gln Arg Gly Ala Asp Phe Gly Cys
290 295 300
Val Pro Ser Val Ala Gly Asp Val Ala Gly Ser Ala Arg Gln Gly Gly
305 310 315 320
Asp Gly Asn Val Xaa Val His Ala Phe Gly Gly Leu Phe Gly Thr Cys
325 330 335
Asn Leu Thr Asp Glu Leu Phe Leu Ala Phe Gly Gly Asp Leu Ser Glu
340 345 350
Gln Gln Gln Val Ala Val Val Ala Asp Asn Gly Asp Leu Gly Arg Val
355 360 365
Xaa Phe Gly Leu Val Val Leu Ala Gln Ile Gly Ala Gly Gly Gly Phe
370 375 380
Asp Thr Gln Arg His Tyr Val Val Val Gly Xaa Arg Ala Gly Gly Ser
385 390 395 400
Ala Val Asp Gly Gly Phe Arg Ala Asp Arg Arg Ala Ala Asp Asp Cys
405 410 415
Ala Asp Ala Ala Ala Glu Gly Lys Ala Glu Asp Gly Gly Ser Gln Gly
420 425 430
Ala Asp Gly Val Arg Phe Gly Phe His Arg Val Leu Pro Phe Leu Gly
435 440 445
Val Ser Asp Gly Ile Ala Leu Arg His Ala Val
450 455
<210> 213
<211> 1380
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 213
atgatgatgc cgttcataat gcttccttgg attgcgggtg tgcctgccgt gccgggtcaa 60
aagaggttgt cgagaatctc tttatggggt ttggccggcg tgtttttcgg ggtgtccggt 120
ttggtatggt tttctttggg cgtttctttt tctttgggtg tttctttggg ctgcgcctgt 180
ttttcgggtg tttcttttcg gggttcggga tggggggcgt ttgtgggcag tacgggggtt 240
tctttgagtg tgttttcagc ttgtgttccg gtgccggtta acgaatcggc tgcccgggcc 300
gcatccgaag ggcgcggttt gacccggttt ttcttgggtg cggcagggga cggcagtccg 360
ctgccgcttt cttctgtgcc gtccggctgt gcgggttcgg atgaggcggc gtggtggtgt 420
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atcaggagtt tgggggtcag cctgaagggt ttgttcggtt tttttgccat tttgattgtg 660
cttttggggt gtcgggcaat gccgtctgaa ggcggttcag acggcattgc cgagtcagcg 720
ttggacgtag ttttggtaga gggtaatgac tttttgtacg ccgacggtgg tgctgacttt 780
ttgggtaatc tgcgcctgtt cttcgggggt gaggatgccc ataacgtagg ttacattgcc 840
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gacggtaatg tagttgtata cgccttcggc ggcctgttcg gaacgtgcaa tctgaccgac 1020
gaactgtttt tcgccttcgg tggcgacttg tccgagcagc agcaggtggc ggttgtagcc 1080
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<210> 214
<211> 459
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 214
Met Met Met Pro Phe Ile Met Leu Pro Trp Ile Ala Gly Val Pro Ala
1 5 10 15
Val Pro Gly Gln Lys Arg Leu Ser Arg Ile Ser Leu Trp Gly Leu Ala
20 25 30
Gly Val Phe Phe Gly Val Ser Gly Leu Val Trp Phe Ser Leu Gly Val
35 40 45
Ser Phe Ser Leu Gly Val Ser Leu Gly Cys Ala Cys Phe Ser Gly Val
50 55 60
Ser Phe Arg Gly Ser Gly Trp Gly Ala Phe Val Gly Ser Thr Gly Val
65 70 75 80
Ser Leu Ser Val Phe Ser Ala Cys Val Pro Val Pro Val Asn Glu Ser
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Ala Ala Arg Ala Ala Ser Glu Gly Arg Gly Leu Thr Arg Phe Phe Leu
100 105 110
Gly Ala Ala Gly Asp Gly Ser Pro Leu Pro Leu Ser Ser Val Pro Ser
115 120 125
Gly Cys Ala Gly Ser Asp Glu Ala Ala Trp Trp Cys Ser Gly Trp Ala
130 135 140
Ala Ser Cys Pro Thr Ala Pro Phe Gly Ser Gln Asn Ser Val Ser Arg
145 150 155 160
Gly Leu Ser Val Cys Cys Gly Ser Val Trp Arg Val Leu Ser Pro Phe
165 170 175
Gly Leu Asn Val Leu Thr Met Pro Thr Ala Asn Ala Pro Met Ala Val
180 185 190
Ile Gln Met Ser Asn Thr Ala Arg Ile Arg Ser Leu Gly Val Ser Leu
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Lys Gly Leu Phe Gly Phe Phe Ala Ile Leu Ile Val Leu Leu Gly Cys
210 215 220
Arg Ala Met Pro Ser Glu Gly Gly Ser Asp Gly Ile Ala Glu Ser Ala
225 230 235 240
Leu Asp Val Val Leu Val Glu Gly Asn Asp Phe Leu Tyr Ala Asp Gly
245 250 255
Gly Ala Asp Phe Leu Gly Asn Leu Arg Leu Phe Phe Gly Gly Glu Asp
260 265 270
Ala His Asn Val Gly Tyr Ile Ala Val Gly Asn Asp Phe Asp Ala Arg
275 280 285
Leu Cys Ser Gly Ala Asp Ala Gln Gln Arg Gly Ala Asp Phe Gly Arg
290 295 300
Val Pro Ser Val Ala Gly Asp Val Ala Arg Ser Ala Arg Gln Gly Gly
305 310 315 320
Asp Gly Asn Val Val Val Tyr Ala Phe Gly Gly Leu Phe Gly Thr Cys
325 330 335
Asn Leu Thr Asp Glu Leu Phe Phe Ala Phe Gly Gly Asp Leu Ser Glu
340 345 350
Gln Gln Gln Val Ala Val Val Ala Asp Asp Gly Asp Leu Gly Arg Val
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370 375 380
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385 390 395 400
Ala Val Asp Asp Gly Phe Cys Ala Asp Gly Gly Pro Ala Asp Asp Cys
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Ala Glu Ala Ala Ala Glu Gly Lys Ala Glu Asp Gly Gly Asn Gln Gly
420 425 430
Ala Asp Gly Val Trp Phe Gly Phe His Arg Gly Leu Pro Phe Leu Gly
435 440 445
Val Ser Asp Gly Ile Ala Leu Arg His Ala Val
450 455
<210> 215
<211> 280
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (66)..(66)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 215
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<210> 216
<211> 93
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (22)..(22)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 216
Met Lys Thr Phe Phe Lys Thr Leu Ser Ala Ala Ala Leu Ala Leu Ile
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<210> 217
<211> 864
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 217
atgaaaacct tcttcaaaac cctttccgcc gccgcactcg cgctcatcct cgccgcctgc 60
ggcggtcaaa aagacagcgc gcccgccgca tccgcttctg ccgccgccga caacggcgcg 120
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<210> 218
<211> 287
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 218
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Leu Ala Ala Cys Gly Gly Gln Lys Asp Ser Ala Pro Ala Ala Ser Ala
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130 135 140
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<210> 219
<211> 864
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<220>
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<220>
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<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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atgaaaacct tcttcaaaac cctttccgcc gccgcactcg cgctcatcct cgccgcctgc 60
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<211> 287
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (119)..(119)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (141)..(141)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (206)..(219)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 220
Met Lys Thr Phe Phe Lys Thr Leu Ser Ala Ala Ala Leu Ala Leu Ile
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Tyr Val Arg Xaa Asn Leu Ala Leu Ala Glu Gly Glu Leu Asp Ile Asn
85 90 95
Val Xaa Gln His Xaa Xaa Tyr Leu Asp Asp Xaa Lys Lys Xaa His Asn
100 105 110
Leu Asp Ile Thr Xaa Val Xaa Gln Val Pro Thr Ala Pro Leu Gly Leu
115 120 125
Tyr Pro Gly Lys Leu Lys Ser Leu Xaa Xaa Val Lys Xaa Gly Ser Thr
130 135 140
Val Ser Ala Pro Asn Asp Pro Xaa Xaa Phe Xaa Arg Val Leu Val Met
145 150 155 160
Leu Asp Glu Leu Gly Xaa Ile Lys Leu Lys Asp Xaa Ile Xaa Xaa Xaa
165 170 175
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
180 185 190
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Xaa Xaa Xaa
195 200 205
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ser Gly Met Lys Leu
210 215 220
Thr Glu Ala Leu Phe Gln Glu Pro Ser Phe Ala Tyr Val Asn Trp Ser
225 230 235 240
Ala Val Lys Thr Ala Asp Lys Asp Ser Gln Trp Leu Lys Asp Val Thr
245 250 255
Glu Ala Tyr Asn Ser Asp Ala Phe Lys Ala Tyr Ala His Lys Arg Phe
260 265 270
Glu Gly Tyr Lys Ser Pro Ala Ala Trp Asn Glu Gly Ala Ala Lys
275 280 285
<210> 221
<211> 864
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 221
atgaaaacct tcttcaaaac cctttccgcc gccgcactcg cgctcatcct cgccgcctgc 60
ggcggtcaaa aagatagcgc gcccgccgca tccgcttctg ccgccgccga caacggcgcg 120
gcgaaaaaag aaatcgtctt cggcacgacc gtcggcgact tcggcgatat ggtcaaagaa 180
caaatccaac ccgagctgga gaaaaaaggc tacaccgtca aactggtcga gtttaccgac 240
tatgtgcgcc cgaatctggc attggctgag ggcgagttgg acatcaacgt cttccaacac 300
aaaccctatc ttgacgactt caaaaaagaa cacaatctgg acatcaccga agtcttccaa 360
gtgccgaccg cgcctttggg actgtacccg ggcaagctga aatcgctgga agaagtcaaa 420
gacggcagca ccgtatccgc gcccaacgac ccgtccaact tcgcccgcgt cttggtgatg 480
ctcgacgaac tgggttggat caaactcaaa gacggcatca atccgctgac cgcatccaaa 540
gcggacattg ccgaaaacct gaaaaacatc aaaatcgtcg agcttgaagc cgcgcaactg 600
ccgcgtagcc gcgccgacgt ggattttgcc gtcgtcaacg gcaactacgc cataagcagc 660
ggcatgaagc tgaccgaagc cctgttccaa gaaccgagct ttgcctatgt caactggtct 720
gccgtcaaaa ccgccgacaa agacagccaa tggcttaaag acgtaaccga ggcctataac 780
tccgacgcgt tcaaagccta cgcgcacaaa cgcttcgagg gctacaaatc ccctgccgca 840
tggaatgaag gcgcagccaa ataa 864
<210> 222
<211> 287
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 222
Met Lys Thr Phe Phe Lys Thr Leu Ser Ala Ala Ala Leu Ala Leu Ile
1 5 10 15
Leu Ala Ala Cys Gly Gly Gln Lys Asp Ser Ala Pro Ala Ala Ser Ala
20 25 30
Ser Ala Ala Ala Asp Asn Gly Ala Ala Lys Lys Glu Ile Val Phe Gly
35 40 45
Thr Thr Val Gly Asp Phe Gly Asp Met Val Lys Glu Gln Ile Gln Pro
50 55 60
Glu Leu Glu Lys Lys Gly Tyr Thr Val Lys Leu Val Glu Phe Thr Asp
65 70 75 80
Tyr Val Arg Pro Asn Leu Ala Leu Ala Glu Gly Glu Leu Asp Ile Asn
85 90 95
Val Phe Gln His Lys Pro Tyr Leu Asp Asp Phe Lys Lys Glu His Asn
100 105 110
Leu Asp Ile Thr Glu Val Phe Gln Val Pro Thr Ala Pro Leu Gly Leu
115 120 125
Tyr Pro Gly Lys Leu Lys Ser Leu Glu Glu Val Lys Asp Gly Ser Thr
130 135 140
Val Ser Ala Pro Asn Asp Pro Ser Asn Phe Ala Arg Val Leu Val Met
145 150 155 160
Leu Asp Glu Leu Gly Trp Ile Lys Leu Lys Asp Gly Ile Asn Pro Leu
165 170 175
Thr Ala Ser Lys Ala Asp Ile Ala Glu Asn Leu Lys Asn Ile Lys Ile
180 185 190
Val Glu Leu Glu Ala Ala Gln Leu Pro Arg Ser Arg Ala Asp Val Asp
195 200 205
Phe Ala Val Val Asn Gly Asn Tyr Ala Ile Ser Ser Gly Met Lys Leu
210 215 220
Thr Glu Ala Leu Phe Gln Glu Pro Ser Phe Ala Tyr Val Asn Trp Ser
225 230 235 240
Ala Val Lys Thr Ala Asp Lys Asp Ser Gln Trp Leu Lys Asp Val Thr
245 250 255
Glu Ala Tyr Asn Ser Asp Ala Phe Lys Ala Tyr Ala His Lys Arg Phe
260 265 270
Glu Gly Tyr Lys Ser Pro Ala Ala Trp Asn Glu Gly Ala Ala Lys
275 280 285
<210> 223
<211> 1
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 223
n 1
<210> 224
<211> 288
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 224
Met Lys Thr Phe Phe Lys Thr Leu Ser Thr Ala Ser Leu Ala Leu Ile
1 5 10 15
Leu Ala Ala Cys Gly Gly Gln Lys Asp Ser Ala Pro Ala Ala Ser Ala
20 25 30
Ala Ala Pro Ser Ala Asp Asn Gly Ala Ala Lys Lys Glu Ile Val Phe
35 40 45
Gly Thr Thr Val Gly Asp Phe Gly Asp Met Val Lys Glu Gln Ile Gln
50 55 60
Ala Glu Leu Glu Lys Lys Gly Tyr Thr Val Lys Leu Val Glu Phe Thr
65 70 75 80
Asp Tyr Val Arg Pro Asn Leu Ala Leu Ala Glu Gly Glu Leu Asp Ile
85 90 95
Asn Val Phe Gln His Lys Pro Tyr Leu Asp Asp Phe Lys Lys Glu His
100 105 110
Asn Leu Asp Ile Thr Glu Ala Phe Gln Val Pro Thr Ala Pro Leu Gly
115 120 125
Leu Tyr Pro Gly Lys Leu Lys Ser Leu Glu Glu Val Lys Asp Gly Ser
130 135 140
Thr Val Ser Ala Pro Asn Asp Pro Ser Asn Phe Ala Arg Ala Leu Val
145 150 155 160
Met Leu Asn Glu Leu Gly Trp Ile Lys Leu Lys Asp Gly Ile Asn Pro
165 170 175
Leu Thr Ala Ser Lys Ala Asp Ile Ala Glu Asn Leu Lys Asn Ile Lys
180 185 190
Ile Val Glu Leu Glu Ala Ala Gln Leu Pro Arg Ser Arg Ala Asp Val
195 200 205
Asp Phe Ala Val Val Asn Gly Asn Tyr Ala Ile Ser Ser Gly Met Lys
210 215 220
Leu Thr Glu Ala Leu Phe Gln Glu Pro Ser Phe Ala Tyr Val Asn Trp
225 230 235 240
Ser Ala Val Lys Thr Ala Asp Lys Asp Ser Gln Trp Leu Lys Asp Val
245 250 255
Thr Glu Ala Tyr Asn Ser Asp Ala Phe Lys Ala Tyr Ala His Lys Arg
260 265 270
Phe Glu Gly Tyr Lys Tyr Pro Ala Ala Trp Asn Glu Gly Ala Ala Lys
275 280 285
<210> 225
<211> 867
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 225
atgaaaacct tcttcaaaac cctttccgcc gccgcactcg cgctcatcct cgcagcctgc 60
ggcggtcaaa aagacagcgc gcccgcagcc tctgccgccg ccccttctgc cgataacggc 120
gcggcgaaaa aagaaatcgt cttcggcacg accgtgggcg acttcggcga tatggtcaaa 180
gaacaaatcc aagccgagct ggagaaaaaa ggctacaccg tcaaattggt cgaatttacc 240
gactatgtgc gcccgaatct ggcattggcg gagggcgagt tggacatcaa cgtcttccaa 300
cacaaaccct atcttgacga tttcaaaaaa gaacacaacc tggacatcac cgaagccttc 360
caagtgccga ccgcgccttt gggactgtat ccgggcaaac tgaaatcgct ggaagaagtc 420
aaagacggca gcaccgtatc cgcgcccaac gacccgtcca acttcgcacg cgccttggtg 480
atgctgaacg aactgggttg gatcaaactc aaagacggca tcaatccgct gaccgcatcc 540
aaagccgaca tcgcggaaaa cctgaaaaac atcaaaatcg tcgagcttga agccgcacaa 600
ctgccgcgca gccgcgccga cgtggatttt gccgtcgtca acggcaacta cgccataagc 660
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gcatggaatg aaggcgcagc caaataa 867
<210> 226
<211> 288
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 226
Met Lys Thr Phe Phe Lys Thr Leu Ser Ala Ala Ala Leu Ala Leu Ile
1 5 10 15
Leu Ala Ala Cys Gly Gly Gln Lys Asp Ser Ala Pro Ala Ala Ser Ala
20 25 30
Ala Ala Pro Ser Ala Asp Asn Gly Ala Ala Lys Lys Glu Ile Val Phe
35 40 45
Gly Thr Thr Val Gly Asp Phe Gly Asp Met Val Lys Glu Gln Ile Gln
50 55 60
Ala Glu Leu Glu Lys Lys Gly Tyr Thr Val Lys Leu Val Glu Phe Thr
65 70 75 80
Asp Tyr Val Arg Pro Asn Leu Ala Leu Ala Glu Gly Glu Leu Asp Ile
85 90 95
Asn Val Phe Gln His Lys Pro Tyr Leu Asp Asp Phe Lys Lys Glu His
100 105 110
Asn Leu Asp Ile Thr Glu Ala Phe Gln Val Pro Thr Ala Pro Leu Gly
115 120 125
Leu Tyr Pro Gly Lys Leu Lys Ser Leu Glu Glu Val Lys Asp Gly Ser
130 135 140
Thr Val Ser Ala Pro Asn Asp Pro Ser Asn Phe Ala Arg Ala Leu Val
145 150 155 160
Met Leu Asn Glu Leu Gly Trp Ile Lys Leu Lys Asp Gly Ile Asn Pro
165 170 175
Leu Thr Ala Ser Lys Ala Asp Ile Ala Glu Asn Leu Lys Asn Ile Lys
180 185 190
Ile Val Glu Leu Glu Ala Ala Gln Leu Pro Arg Ser Arg Ala Asp Val
195 200 205
Asp Phe Ala Val Val Asn Gly Asn Tyr Ala Ile Ser Ser Gly Met Lys
210 215 220
Leu Thr Glu Ala Leu Phe Gln Glu Pro Ser Phe Ala Tyr Val Asn Trp
225 230 235 240
Ser Ala Val Lys Thr Ala Asp Lys Asp Ser Gln Trp Leu Lys Asp Val
245 250 255
Thr Glu Ala Tyr Asn Ser Asp Ala Phe Lys Ala Tyr Ala His Lys Arg
260 265 270
Phe Glu Gly Tyr Lys Tyr Pro Ala Ala Trp Asn Glu Gly Ala Ala Lys
275 280 285
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
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cctcgtcgtc ctcggcatgc tccagtttca aggggcgatt tactccaagg cggtggaacg 60
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gctcatcggc gacaacggca gcgaatggct cgacagcgga ctcatgcgcg ccatgaacgt 300
cctcatcggc gyggccatcg ccatcgccgc cgccaaactg ctgccgctga aatccacact 360
gatgtggcgt ttcatgcttg ccgacaacct ggccgactgc agcaaaatga ttgccgaaat 420
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nnnnnnnngc agacacgccc gccgcatccg catcgacacc gccatcaacc ccgaactgga 780
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tgcccacgaa cgccaacacc tgcgccaaag cctgcttga 939
<210> 228
<211> 318
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(6)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (201)..(201)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (239)..(249)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 228
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Pro Arg Arg Pro Arg His Ala Pro Val Ser
1 5 10 15
Arg Gly Asp Leu Leu Gln Gly Gly Gly Thr Tyr Ala Arg His Gly His
20 25 30
Arg Ala Gly Arg Gly Phe Gly Arg Phe Met Ala Glu Pro Ala Leu Phe
35 40 45
Pro Arg Gln Pro Pro Leu Leu Pro His Arg Arg His Gly Lys Arg Thr
50 55 60
Gly Arg Leu Gly Gly Gly Arg Gln Lys Arg Leu Arg Pro Xaa Ala Gly
65 70 75 80
Arg Ala Asp Asp Val Tyr Ala His Arg Arg Gln Arg Gln Arg Met Ala
85 90 95
Arg Gln Arg Thr His Ala Arg His Glu Arg Pro His Arg Arg Gly His
100 105 110
Arg His Arg Arg Arg Gln Thr Ala Ala Ala Glu Ile His Thr Asp Val
115 120 125
Ala Phe His Ala Cys Arg Gln Pro Gly Arg Leu Gln Gln Asn Asp Cys
130 135 140
Arg Asn Gln Gln Arg Gln Ala His Asp Pro Arg Thr Pro Arg Gly Glu
145 150 155 160
His Gly Glu Asn Ala Pro Asn Gln Arg Thr His Gly Gln Lys Pro Gln
165 170 175
Pro Ser Arg Arg His Ile Gly Arg Lys Leu His Gln Pro Arg His Asp
180 185 190
Gly Ser His Ala Ala Arg Pro Pro Xaa Asn Arg Gln His His Arg Ala
195 200 205
Ala Pro Asp His Arg Arg Gln Ala Ala Ile Ser Gln Thr Gln Arg Gln
210 215 220
Arg Asn Pro Ala Ala Xaa Pro Pro Leu His Thr Ala Pro Asn Xaa Xaa
225 230 235 240
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gln Thr Arg Pro Pro His Pro
245 250 255
His Arg His Arg His Gln Pro Arg Thr Gly Ser Pro Arg Arg Thr Pro
260 265 270
Pro Leu Pro Met Ala Gly Leu Pro Leu Ala Gln His Arg Tyr Ala Ser
275 280 285
Gly Asn Phe Arg Pro Arg His Pro Ala Ala Thr His Pro Pro Gln Met
290 295 300
Ala Gly Cys Pro Arg Thr Pro Thr Pro Ala Pro Lys Pro Ala
305 310 315
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<211> 1
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 229
n 1
<210> 230
<211> 318
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 230
Met Asp Arg Asp Asp Arg Leu Arg Arg Pro Arg His Ala Pro Val Pro
1 5 10 15
Arg Arg Asp Leu Leu Gln Arg Gly Gly Thr Tyr Ala Arg Tyr Gly His
20 25 30
Arg Ala Gly Arg Gly Phe Gly Arg Phe Met Ala Glu Pro Ala Leu Phe
35 40 45
Pro Arg Gln Pro Pro Leu Leu Pro Asp His Arg His Gly Lys Arg Thr
50 55 60
Gly Arg Leu Gly Gly Gly Arg Gln Lys Arg Leu Arg Pro Tyr Val Gly
65 70 75 80
Gly Ala Asp Asp Val His Ala His Arg Arg Gln Arg Gln Arg Met Ala
85 90 95
Arg Gln Arg Pro Asp Ala Arg Asp Glu Arg Pro His Arg Arg Arg His
100 105 110
Arg His Cys Arg Arg Gln Thr Ala Ala Ala Glu Ile His Thr Asp Val
115 120 125
Ala Phe His Ala Cys Arg Gln Pro Gly Arg Leu Gln Gln Asn Asp Cys
130 135 140
Arg Asn Gln Gln Arg Gln Ala Tyr Asp Ala Arg Thr Phe Gly Ala Glu
145 150 155 160
Tyr Gly Gln Asn Ala Pro Asn Gln Arg Thr His Gly Gln Lys Pro Gln
165 170 175
Pro Pro Arg Arg His Ile Gly Arg Lys Pro His Gln Pro Leu His Asp
180 185 190
Gly Ser His Ala Ala Arg Pro Pro Gln Asn Arg Gln His His Arg Ala
195 200 205
Ala Pro Asp His Arg Arg Gln Ala Ala Ile Ser Gln Thr Gln Arg Gln
210 215 220
Arg Asn Pro Ala Ala Arg Pro Pro Leu His Thr Ala Pro Asn Arg Pro
225 230 235 240
Ala Thr Asn Arg Arg Pro His Gln Arg Gln Thr Arg Pro Pro His Pro
245 250 255
His Arg His Arg His Gln Pro Arg Thr Gly Ser Pro Arg Arg Thr Pro
260 265 270
Pro Leu Pro Met Ala Gly Phe Pro Leu Ala Gln His Gln Tyr Ala Ser
275 280 285
Gly Asn Phe Arg Pro Arg His Pro Pro Ala Thr His Pro Pro Gln Met
290 295 300
Ala Gly Cys Pro Arg Thr Pro Thr Pro Ala Pro Lys Pro Ala
305 310 315
<210> 231
<211> 569
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (22)..(22)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (306)..(306)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (468)..(468)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 231
gaaatcagcc tgcggtccga cnacaggccg gtttccgtgn cgaagcggcg ggattcggaa 60
cgttttctgc tgttggacgg cggcaacagc cggctcaagt gggcgtgggt ggaaaacggc 120
acgttcgcaa ccgtcggtag cgcgccgtac cgcgatttgt cgcctttggg cgcggagtgg 180
gcggaaaagg cggatggaaa tgtccgcatc gtcggttgcg ctgtgtgcgg agaattcaaa 240
aaggcacaag tgcaggaaca gctcgcccga aaaatcgagt ggctgccgtc ttccgcacag 300
gctttnggca tacgcaacca ctaccgccac cccgaagaac acggttccga ccgctggttc 360
aacgccttgg gcagccgccg cttcagccgc aacgcctgcg tcgtcgtcag ttgcggcacg 420
gcggtaacgg ttgacgcgct caccgatgac ggacattatc tcggagangg aaccatcatg 480
cccggtttcc acctgatgaa agaatcgctc gccgtccgaa ccgccaacct caaccggcac 540
gccggtaagc gttatccttt cccgaccgg 569
<210> 232
<211> 189
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (8)..(8)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (14)..(14)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (102)..(102)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (156)..(156)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 232
Glu Ile Ser Leu Arg Ser Asp Xaa Arg Pro Val Ser Val Xaa Lys Arg
1 5 10 15
Arg Asp Ser Glu Arg Phe Leu Leu Leu Asp Gly Gly Asn Ser Arg Leu
20 25 30
Lys Trp Ala Trp Val Glu Asn Gly Thr Phe Ala Thr Val Gly Ser Ala
35 40 45
Pro Tyr Arg Asp Leu Ser Pro Leu Gly Ala Glu Trp Ala Glu Lys Ala
50 55 60
Asp Gly Asn Val Arg Ile Val Gly Cys Ala Val Cys Gly Glu Phe Lys
65 70 75 80
Lys Ala Gln Val Gln Glu Gln Leu Ala Arg Lys Ile Glu Trp Leu Pro
85 90 95
Ser Ser Ala Gln Ala Xaa Gly Ile Arg Asn His Tyr Arg His Pro Glu
100 105 110
Glu His Gly Ser Asp Arg Trp Phe Asn Ala Leu Gly Ser Arg Arg Phe
115 120 125
Ser Arg Asn Ala Cys Val Val Val Ser Cys Gly Thr Ala Val Thr Val
130 135 140
Asp Ala Leu Thr Asp Asp Gly His Tyr Leu Gly Xaa Gly Thr Ile Met
145 150 155 160
Pro Gly Phe His Leu Met Lys Glu Ser Leu Ala Val Arg Thr Ala Asn
165 170 175
Leu Asn Arg His Ala Gly Lys Arg Tyr Pro Phe Pro Thr
180 185
<210> 233
<211> 1779
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 233
atgacggttt tgaagctttc gcactggcgg gtgttggcgg agcttgccga cggtttgccg 60
caacacgtct cgcaactggc gcgtatggcg gatatgaagc cgcagcagct caacggtttt 120
tggcagcaga tgccggcgca catacgcggg ctgttgcgcc aacacgacgg ctattggcgg 180
ctggtgcgcc cattggcggt tttcgatgcc gaaggtttgc gcgagctggg ggaaaggtcg 240
ggttttcaga cggcattgaa gcacgagtgc gcgtccagca acgacgagat actggaattg 300
gcgcggattg cgccggacaa ggcgcacaaa accatatgcg tgacccacct gcaaagtaag 360
ggcagggggc ggcaggggcg gaagtggtcg caccgtttgg gcgagtgtct gatgttcagt 420
tttggctggg tgtttgaccg gccgcagtat gagttgggtt cgctgtcgcc tgttgcggca 480
gtggcgtgtc ggcgcgcctt gtcgcgttta ggtttggatg tgcagattaa gtggcccaat 540
gatttggttg tcggacgcga caaattgggc ggcattctga ttgaaacggt caggacgggc 600
ggcaaaacgg ttgccgtggt cggtatcggc atcaattttg tcctgcccaa ggaagtagaa 660
aatgccgctt ccgtgcaatc gctgtttcag acggcatcgc ggcggggcaa tgccgatgcc 720
gccgtgctgc tggaaacgct gttggtggaa ctggacgcgg tgttgttgca atatgcgcgg 780
gacggatttg cgccttttgt ggcggaatat caggctgcca accgcgacca cggcaaggcg 840
gtattgctgt tgcgcgacgg cgaaaccgtg ttcgaaggca cggttaaagg cgtggacgga 900
caaggcgttt tgcacttgga aacggcagag ggcaaacaga cggtcgtcag cggcgaaatc 960
agcctgcggt ccgacgacag gccggtttcc gtgccgaagc ggcgggattc ggaacgtttt 1020
ctgctgttgg acggcggcaa cagccggctc aagtgggcgt gggtggaaaa cggcacgttc 1080
gcaaccgtcg gtagcgcgcc gtaccgcgat ttgtcgcctt tgggcgcgga gtgggcggaa 1140
aaggcggatg gaaatgtccg catcgtcggt tgcgctgtgt gcggagaatt caaaaaggca 1200
caagtgcagg aacagctcgc ccgaaaaatc gagtggctgc cgtcttccgc acaggctttg 1260
ggcatacgca accactaccg ccaccccgaa gaacacggtt ccgaccgctg gttcaacgcc 1320
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cacctgatga aagaatcgct cgccgtccga accgccaacc tcaaccggca cgccggtaag 1500
cgttatcctt tcccgaccac aacgggcaat gccgtcgcca gcggcatgat ggatgcggtt 1560
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cctgcactgc ccgcctgccg ccgtcatgtc ggcaagattc cgcgtgagga atggaagccg 180
ttgctgattg tgtcgttcgt caactatgtg ctgaccctgc tgcttcagtt tgtcgggttg 240
aaatacactt ccgccgccag cgcatcggtc attgtcggac tcgagccgct gctgatggtg 300
tttgtcggac actttttctt caacgacaaa gcgcgtgcct accactggat atgcggcgcg 360
gcggcatttg ccggtgtcgc gctgctgatg gcgggcggtg cggaagaggg cggcgaagtc 420
ggctggttcg gctgcctgct ggtgttgttg gcgggcgcgg gcttttgtgc cgctatgcgt 480
ccgacgcaaa ggctgattgc acgcatcggc gcaccggcat tcacatctgt ttccattgcc 540
gccgcatcgt tgatgtgcct gccgttttcg cttgctttgg cgcaaagtta taccgtggac 600
tggagcgtcg ggatggtatt gtcgctgctg tatttgggtt tggggtgcgg ctggtacgcc 660
tattggctgt ggaacaaggg gatgagccgt gttcctgcca atgtttcggg actgttgatt 720
tcgctcgaac ccgtcgtcgg cgtgctgctg gcggttttga ttttgggcga acacctgtcg 780
cccgtgtccg ccttgggcgt gtttgtcgtc atcgccgcca ccttggttgc cggccggctg 840
tcgcatcaaa aataa 855
<210> 244
<211> 284
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 244
Met Phe Tyr Gln Ile Leu Ala Leu Ile Ile Trp Ser Ser Ser Phe Ile
1 5 10 15
Ala Ala Lys Tyr Val Tyr Gly Gly Ile Asp Pro Ala Leu Met Val Gly
20 25 30
Val Arg Leu Leu Ile Ala Ala Leu Pro Ala Leu Pro Ala Cys Arg Arg
35 40 45
His Val Gly Lys Ile Pro Arg Glu Glu Trp Lys Pro Leu Leu Ile Val
50 55 60
Ser Phe Val Asn Tyr Val Leu Thr Leu Leu Leu Gln Phe Val Gly Leu
65 70 75 80
Lys Tyr Thr Ser Ala Ala Ser Ala Ser Val Ile Val Gly Leu Glu Pro
85 90 95
Leu Leu Met Val Phe Val Gly His Phe Phe Phe Asn Asp Lys Ala Arg
100 105 110
Ala Tyr His Trp Ile Cys Gly Ala Ala Ala Phe Ala Gly Val Ala Leu
115 120 125
Leu Met Ala Gly Gly Ala Glu Glu Gly Gly Glu Val Gly Trp Phe Gly
130 135 140
Cys Leu Leu Val Leu Leu Ala Gly Ala Gly Phe Cys Ala Ala Met Arg
145 150 155 160
Pro Thr Gln Arg Leu Ile Ala Arg Ile Gly Ala Pro Ala Phe Thr Ser
165 170 175
Val Ser Ile Ala Ala Ala Ser Leu Met Cys Leu Pro Phe Ser Leu Ala
180 185 190
Leu Ala Gln Ser Tyr Thr Val Asp Trp Ser Val Gly Met Val Leu Ser
195 200 205
Leu Leu Tyr Leu Gly Leu Gly Cys Gly Trp Tyr Ala Tyr Trp Leu Trp
210 215 220
Asn Lys Gly Met Ser Arg Val Pro Ala Asn Val Ser Gly Leu Leu Ile
225 230 235 240
Ser Leu Glu Pro Val Val Gly Val Leu Leu Ala Val Leu Ile Leu Gly
245 250 255
Glu His Leu Ser Pro Val Ser Ala Leu Gly Val Phe Val Val Ile Ala
260 265 270
Ala Thr Leu Val Ala Gly Arg Leu Ser His Gln Lys
275 280
<210> 245
<211> 855
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 245
atgttttacc aaatccttgc cctgattatc tggagcagct cgtttattgc cgccaaatat 60
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tcgcatcaaa aataa 855
<210> 246
<211> 284
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 246
Met Phe Tyr Gln Ile Leu Ala Leu Ile Ile Trp Ser Ser Ser Phe Ile
1 5 10 15
Ala Ala Lys Tyr Val Tyr Gly Gly Ile Asp Pro Ala Leu Met Val Gly
20 25 30
Val Arg Leu Leu Ile Ala Ala Leu Pro Ala Leu Pro Ala Cys Arg Arg
35 40 45
His Val Gly Lys Ile Pro Arg Glu Glu Trp Lys Pro Leu Leu Ile Val
50 55 60
Ser Phe Val Asn Tyr Val Leu Thr Leu Leu Leu Gln Phe Val Gly Leu
65 70 75 80
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85 90 95
Leu Leu Met Val Phe Val Gly His Phe Phe Phe Asn Asp Lys Ala Arg
100 105 110
Ala Tyr His Trp Ile Cys Gly Ala Ala Ala Phe Ala Gly Val Ala Leu
115 120 125
Leu Met Ala Gly Gly Ala Glu Glu Gly Gly Glu Val Gly Trp Phe Gly
130 135 140
Cys Leu Leu Val Leu Leu Ala Gly Ala Gly Phe Cys Ala Ala Met Arg
145 150 155 160
Pro Thr Gln Arg Leu Ile Ala Arg Ile Gly Ala Pro Ala Phe Thr Ser
165 170 175
Val Ser Ile Ala Ala Ala Ser Leu Met Cys Leu Pro Phe Ser Leu Ala
180 185 190
Leu Ala Gln Ser Tyr Thr Val Asp Trp Ser Val Gly Met Val Leu Ser
195 200 205
Leu Leu Tyr Leu Gly Val Gly Cys Ser Trp Tyr Ala Tyr Trp Leu Trp
210 215 220
Asn Lys Gly Met Ser Arg Val Pro Ala Asn Val Ser Gly Leu Leu Ile
225 230 235 240
Ser Leu Glu Pro Val Val Gly Val Leu Leu Ala Val Leu Ile Leu Gly
245 250 255
Glu His Leu Ser Pro Val Ser Val Leu Gly Val Phe Val Val Ile Ala
260 265 270
Ala Thr Leu Val Ala Gly Arg Leu Ser His Gln Lys
275 280
<210> 247
<211> 876
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 247
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cctgcactgc ccgcctgccg ccgtcatgtc ggcaagattc cgcgtgagga atggaagccg 180
ttgctgattg tgtcgttcgt caactatgtg ctgaccctgc tgcttcagtt tgtcgggttg 240
aaatacactt ccgccgccag cgcatcggtc attgtcggac tcgagccgct gctgatggtg 300
tttgtcggac actttttctt caacgacaaa gcgcgtgcct accactggat atgcggcgcg 360
gcggcatttg ccggtgtcgc gctgctgatg gcgggcggtg cggaagaggg cggcgaagtc 420
ggctggttcg gctgcctgct ggtgttgttg gcgggcgcgg gcttttgtgc cgctatgcgt 480
ccgacgcaaa ggctgattgc ccgcatcggc gcaccggcat tcacatctgt ttccattgcc 540
gccgcatcgt tgatgtgcct gccgttttcg cttgctttgg cgcaaagtta taccgtggac 600
tggagcgtcg ggatggtatt gtcgctgttg tatttgggtt tggggtgcgg ctggtacgcc 660
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tcgcgcaggg acgcgcaaaa cggcaatgcc gtctga 876
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 248
Met Phe Tyr Gln Ile Leu Ala Leu Ile Ile Trp Gly Ser Ser Phe Ile
1 5 10 15
Ala Ala Lys Tyr Val Tyr Gly Gly Ile Asp Pro Ala Leu Met Val Gly
20 25 30
Val Arg Leu Leu Ile Ala Ala Leu Pro Ala Leu Pro Ala Cys Arg Arg
35 40 45
His Val Gly Lys Ile Pro Arg Glu Glu Trp Lys Pro Leu Leu Ile Val
50 55 60
Ser Phe Val Asn Tyr Val Leu Thr Leu Leu Leu Gln Phe Val Gly Leu
65 70 75 80
Lys Tyr Thr Ser Ala Ala Ser Ala Ser Val Ile Val Gly Leu Glu Pro
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Leu Leu Met Val Phe Val Gly His Phe Phe Phe Asn Asp Lys Ala Arg
100 105 110
Ala Tyr His Trp Ile Cys Gly Ala Ala Ala Phe Ala Gly Val Ala Leu
115 120 125
Leu Met Ala Gly Gly Ala Glu Glu Gly Gly Glu Val Gly Trp Phe Gly
130 135 140
Cys Leu Leu Val Leu Leu Ala Gly Ala Gly Phe Cys Ala Ala Met Arg
145 150 155 160
Pro Thr Gln Arg Leu Ile Ala Arg Ile Gly Ala Pro Ala Phe Thr Ser
165 170 175
Val Ser Ile Ala Ala Ala Ser Leu Met Cys Leu Pro Phe Ser Leu Ala
180 185 190
Leu Ala Gln Ser Tyr Thr Val Asp Trp Ser Val Gly Met Val Leu Ser
195 200 205
Leu Leu Tyr Leu Gly Leu Gly Cys Gly Trp Tyr Ala Tyr Trp Leu Trp
210 215 220
Asn Lys Gly Met Ser Arg Val Pro Ala Asn Ala Ser Gly Leu Leu Ile
225 230 235 240
Ser Leu Glu Pro Val Val Gly Val Leu Leu Ala Val Leu Ile Leu Gly
245 250 255
Glu His Leu Ser Pro Val Ser Ala Leu Gly Val Phe Val Val Ile Ala
260 265 270
Ala Thr Phe Ala Ala Gly Arg Leu Ser Arg Arg Asp Ala Gln Asn Gly
275 280 285
Asn Ala Val
290
<210> 249
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (235)..(235)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 249
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<210> 250
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (13)..(14)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (16)..(17)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (70)..(71)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (85)..(85)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (335)..(335)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 250
Met Arg Arg Phe Leu Pro Ile Ala Ala Ile Cys Ala Xaa Xaa Leu Xaa
1 5 10 15
Xaa Gly Leu Thr Ala Ala Thr Gly Ser Thr Ser Ser Leu Ala Asp Tyr
20 25 30
Phe Trp Trp Ile Val Ala Phe Ser Ala Met Leu Leu Leu Val Leu Ser
35 40 45
Ala Val Leu Ala Arg Tyr Val Ile Leu Leu Leu Lys Asp Arg Arg Asp
50 55 60
Gly Val Phe Gly Ser Xaa Xaa Ala Lys Xaa Pro Xaa Xaa Xaa Met Phe
65 70 75 80
Thr Leu Val Ala Xaa Leu Pro Gly Val Phe Leu Phe Gly Phe Pro Ala
85 90 95
Gln Phe Ile Asn Gly Thr Ile Asn Ser Trp Phe Gly Asn Asp Thr His
100 105 110
Glu Ala Leu Glu Arg Ser Leu Asn Leu Ser Lys Ser Ala Leu Asn Leu
115 120 125
Ala Ala Asp Asn Ala Leu Gly Asn Ala Val Pro Val Gln Ile Asp Leu
130 135 140
Ile Gly Ala Ala Ser Leu Pro Gly Asp Met Gly Arg Val Leu Glu His
145 150 155 160
Tyr Ala Gly Ser Gly Phe Ala Gln Leu Ala Leu Tyr Asn Xaa Ala Ser
165 170 175
Gly Lys Ile Glu Lys Ser Ile Asn Pro His Lys Leu Asp Gln Pro Phe
180 185 190
Pro Gly Lys Ala Arg Trp Glu Lys Ile Gln Arg Ala Gly Ser Val Arg
195 200 205
Asp Leu Glu Ser Ile Gly Gly Val Leu Tyr Ala Gln Gly Trp Leu Ser
210 215 220
Ala Gly Thr His Xaa Gly Arg Asp Tyr Ala Leu Phe Phe Arg Gln Pro
225 230 235 240
Val Pro Lys Gly Val Ala Glu Asp Ala Val Leu Ile Glu Lys Ala Arg
245 250 255
Ala Lys Tyr Ala Glu Leu Ser Tyr Ser Lys Lys Gly Leu Gln Thr Phe
260 265 270
Phe Leu Ala Thr Leu Leu Ile Ala Ser Leu Leu Ser Ile Phe Leu Ala
275 280 285
Leu Val Met Ala Leu Tyr Phe Ala Arg Arg Phe Val Glu Pro Val Leu
290 295 300
Ser Leu Ala Glu Gly Ala Lys Ala Val Ala Gln Gly Asp Phe Ser Gln
305 310 315 320
Thr Arg Pro Val Leu Arg Asn Asp Glu Phe Gly Arg Leu Thr Xaa Leu
325 330 335
Phe Asn His Met Thr Glu Gln Leu Ser Ile Ala Lys Asp Ala Asp Glu
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Arg Asn Arg Arg Arg Glu Glu Ala Ala Arg His Tyr Leu Glu Cys Val
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Leu Lys Thr Phe Asn Lys Ala Ala Gly Thr
385 390
<210> 251
<211> 2121
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 251
atgcgccgtt ttctaccgat cgcagccata tgcgccgtcg tcctgttgta cggactgacg 60
gcggcaaccg gcagcaccag ttcgctggcg gattatttct ggtggattgt tgcgttcagc 120
gcaatgctgc tgctggtgtt gtccgccgtt ttggcacgtt atgtcatatt gctgttgaaa 180
gacaggcgcg acggcgtatt cggttcgcag attgccaaac gcctttctgg gatgtttacg 240
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acgattaatt cgtggttcgg caacgatacc cacgaggcgc ttgaacgcag cctcaatttg 360
agcaagtccg cattgaattt ggcggcagac aacgccctcg gcaacgccgt ccccgtgcag 420
atagacctca tcggcgcggc ttccctgccc ggggatatgg gcagggtgct ggaacattac 480
gccggcagcg gttttgccca gcttgccctg tacaatgccg caagcggcaa aatcgaaaaa 540
agcatcaacc cgcacaagct cgatcagccg tttccaggta aggcgcgttg ggaaaaaatc 600
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tggctgtcgg cgggtacgca caacgggcgc gattacgcct tgtttttccg tcagccggtt 720
cccaaaggcg tggcagagga tgccgtctta atcgaaaagg caagggcgaa atatgctgag 780
ttgagttaca gcaaaaaagg tttgcagacc tttttcctgg caaccctgct gattgcctcg 840
ctgctgtcga tttttcttgc actggtcatg gcactgtatt tcgcccgccg tttcgtcgaa 900
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cgccccgtgt tgcgcaacga cgagttcgga cgcttgacca agttgttcaa ccacatgacc 1020
gagcagcttt ccatcgccaa agaagcagac gagcgcaacc gccggcgcga ggaagccgcc 1080
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caaggctgtc tgaaaacctt caacaaagcg gcggaacaga ttttggggat gccgcttacc 1200
cccctgtggg gcagcagccg gcacggttgg cacggcgttt cggcgcagca gtccctgctt 1260
gccgaagtgt ttgccgccat cggcgcggcg gcaggtacgg acaaaccggt ccatgtgaaa 1320
tatgccgcgc cggacgatgc caaaatcctg ctgggcaagg caaccgtcct gcccgaagac 1380
aacggcaacg gcgtggtaat ggtgattgac gacatcaccg ttttgataca cgcgcaaaaa 1440
gaagccgcgt ggggcgaagt ggcgaagcgg ctggcacacg aaatccgcaa tccgctcacg 1500
cccatccagc tttccgccga acggctggcg tggaaattgg gcgggaagct ggatgagcag 1560
gatgcgcaaa tcctgacgcg ttcgaccgac accatcgtca aacaggtggc ggcattgaag 1620
gaaatggtcg aagcattccg caattatgcg cgttcccctt cgctcaaatt ggaaaatcag 1680
gatttgaacg ccttaatcgg cgatgtgttg gcattgtatg aagccggtcc gtgccggttt 1740
gcggcggagc ttgccggcga accgctgacg gtggcggcgg atacgaccgc catgcggcag 1800
gtgctgcaca atattttcaa aaatgccgcc gaagcggcgg aagaagccga tgtgcccgaa 1860
gtcagggtaa aatcggaaac agggcaggac ggtcggattg tcctgacggt ttgcgacaac 1920
ggcaaagggt tcggcaggga aatgctgcac aacgccttcg agccgtatgt aacggacaaa 1980
ccggcgggaa cgggattggg tctgcctgtg gtgaaaaaaa tcattgaaga acacggcggc 2040
cgcatcagcc tgagcaatca ggatgcgggt ggcgcgtgtg tcagaatcat cttgccaaaa 2100
acggtaaaaa cttatgcgta g 2121
<210> 252
<211> 706
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 252
Met Arg Arg Phe Leu Pro Ile Ala Ala Ile Cys Ala Val Val Leu Leu
1 5 10 15
Tyr Gly Leu Thr Ala Ala Thr Gly Ser Thr Ser Ser Leu Ala Asp Tyr
20 25 30
Phe Trp Trp Ile Val Ala Phe Ser Ala Met Leu Leu Leu Val Leu Ser
35 40 45
Ala Val Leu Ala Arg Tyr Val Ile Leu Leu Leu Lys Asp Arg Arg Asp
50 55 60
Gly Val Phe Gly Ser Gln Ile Ala Lys Arg Leu Ser Gly Met Phe Thr
65 70 75 80
Leu Val Ala Val Leu Pro Gly Val Phe Leu Phe Gly Val Ser Ala Gln
85 90 95
Phe Ile Asn Gly Thr Ile Asn Ser Trp Phe Gly Asn Asp Thr His Glu
100 105 110
Ala Leu Glu Arg Ser Leu Asn Leu Ser Lys Ser Ala Leu Asn Leu Ala
115 120 125
Ala Asp Asn Ala Leu Gly Asn Ala Val Pro Val Gln Ile Asp Leu Ile
130 135 140
Gly Ala Ala Ser Leu Pro Gly Asp Met Gly Arg Val Leu Glu His Tyr
145 150 155 160
Ala Gly Ser Gly Phe Ala Gln Leu Ala Leu Tyr Asn Ala Ala Ser Gly
165 170 175
Lys Ile Glu Lys Ser Ile Asn Pro His Lys Leu Asp Gln Pro Phe Pro
180 185 190
Gly Lys Ala Arg Trp Glu Lys Ile Gln Arg Ala Gly Ser Val Arg Asp
195 200 205
Leu Glu Ser Ile Gly Gly Val Leu Tyr Ala Gln Gly Trp Leu Ser Ala
210 215 220
Gly Thr His Asn Gly Arg Asp Tyr Ala Leu Phe Phe Arg Gln Pro Val
225 230 235 240
Pro Lys Gly Val Ala Glu Asp Ala Val Leu Ile Glu Lys Ala Arg Ala
245 250 255
Lys Tyr Ala Glu Leu Ser Tyr Ser Lys Lys Gly Leu Gln Thr Phe Phe
260 265 270
Leu Ala Thr Leu Leu Ile Ala Ser Leu Leu Ser Ile Phe Leu Ala Leu
275 280 285
Val Met Ala Leu Tyr Phe Ala Arg Arg Phe Val Glu Pro Val Leu Ser
290 295 300
Leu Ala Glu Gly Ala Lys Ala Val Ala Gln Gly Asp Phe Ser Gln Thr
305 310 315 320
Arg Pro Val Leu Arg Asn Asp Glu Phe Gly Arg Leu Thr Lys Leu Phe
325 330 335
Asn His Met Thr Glu Gln Leu Ser Ile Ala Lys Glu Ala Asp Glu Arg
340 345 350
Asn Arg Arg Arg Glu Glu Ala Ala Arg His Tyr Leu Glu Cys Val Leu
355 360 365
Glu Gly Leu Thr Thr Gly Val Val Val Phe Asp Glu Gln Gly Cys Leu
370 375 380
Lys Thr Phe Asn Lys Ala Ala Glu Gln Ile Leu Gly Met Pro Leu Thr
385 390 395 400
Pro Leu Trp Gly Ser Ser Arg His Gly Trp His Gly Val Ser Ala Gln
405 410 415
Gln Ser Leu Leu Ala Glu Val Phe Ala Ala Ile Gly Ala Ala Ala Gly
420 425 430
Thr Asp Lys Pro Val His Val Lys Tyr Ala Ala Pro Asp Asp Ala Lys
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450 455 460
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595 600 605
Ala Ala Glu Ala Ala Glu Glu Ala Asp Val Pro Glu Val Arg Val Lys
610 615 620
Ser Glu Thr Gly Gln Asp Gly Arg Ile Val Leu Thr Val Cys Asp Asn
625 630 635 640
Gly Lys Gly Phe Gly Arg Glu Met Leu His Asn Ala Phe Glu Pro Tyr
645 650 655
Val Thr Asp Lys Pro Ala Gly Thr Gly Leu Gly Leu Pro Val Val Lys
660 665 670
Lys Ile Ile Glu Glu His Gly Gly Arg Ile Ser Leu Ser Asn Gln Asp
675 680 685
Ala Gly Gly Ala Cys Val Arg Ile Ile Leu Pro Lys Thr Val Lys Thr
690 695 700
Tyr Ala
705
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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atgcgccgtt ttctaccgat cgcagccata tgcgccgtcg tcctgttgta cggactgacg 60
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cccgtcctat cgcttgccga gggggcgaag gcggtggcgc aaggcgattt cagccagacg 960
cgccccgtgt tgcgcaacga cgagttcgga cgcttgacca agttgttcaa ccacatgacc 1020
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agacattatc tcgaatgcgt gttggagggg ctgaccacgg gcgtggtggt gtttgacgaa 1140
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aaatggtcga ggcattccgc aattacncgc gttccccttc gnctcaattg gaaaatcagg 1680
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Phe Trp Trp Ile Val Ala Phe Ser Ala Met Leu Leu Leu Val Leu Ser
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Gly Val Phe Gly Ser Gln Ile Ala Lys Arg Leu Ser Gly Met Phe Thr
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Leu Val Ala Val Leu Pro Gly Val Phe Leu Phe Gly Val Ser Ala Gln
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Phe Ile Asn Gly Thr Ile Asn Ser Trp Phe Gly Asn Asp Thr His Glu
100 105 110
Ala Leu Glu Arg Ser Leu Asn Leu Ser Lys Ser Ala Leu Asn Leu Ala
115 120 125
Ala Asp Asn Ala Leu Gly Asn Ala Ile Pro Val Gln Ile Asp Xaa Ile
130 135 140
Gly Ala Ala Ser Leu Pro Xaa Asp Met Gly Arg Val Leu Glu His Tyr
145 150 155 160
Ala Gly Ser Gly Phe Ala Gln Leu Ala Leu Tyr Asn Ala Ala Ser Gly
165 170 175
Lys Ile Glu Lys Ser Ile Asn Pro His Lys Leu Asp Gln Pro Phe Pro
180 185 190
Gly Lys Ala Arg Trp Glu Lys Ile Gln Gln Ala Gly Ser Val Arg Asp
195 200 205
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210 215 220
Xaa Thr His Asn Gly Arg Asp Tyr Ala Leu Phe Phe Arg Gln Pro Val
225 230 235 240
Pro Lys Gly Val Ala Glu Asp Ala Val Leu Ile Glu Lys Ala Arg Ala
245 250 255
Xaa Xaa Xaa Xaa Leu Ser Tyr Ser Lys Lys Gly Leu Gln Thr Phe Phe
260 265 270
Leu Ala Thr Leu Leu Ile Ala Ser Leu Leu Ser Ile Phe Leu Ala Leu
275 280 285
Val Met Ala Leu Tyr Phe Ala Arg Arg Phe Val Glu Pro Val Leu Ser
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Leu Ala Glu Gly Ala Lys Ala Val Ala Gln Gly Asp Phe Ser Gln Thr
305 310 315 320
Arg Pro Val Leu Arg Asn Asp Glu Phe Gly Arg Leu Thr Lys Leu Phe
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Asn His Met Thr Glu Gln Leu Ser Ile Ala Lys Glu Ala Asp Glu Arg
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Asn Arg Arg Arg Glu Glu Ala Ala Arg His Tyr Leu Glu Cys Val Leu
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Ala Gly Gly Ala Xaa Val Arg Ile Ile Leu Pro Lys Thr Val Glu Thr
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Tyr Ala
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<221> misc_feature
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Asn Arg Arg Arg Glu Glu Ala Ala Arg His Tyr Leu Glu Cys Val Leu
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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Ser Glu Thr Gly Gln Asp Gly Arg Ile Val Leu Thr Val Cys Asp Asn
625 630 635 640
Gly Lys Gly Phe Gly Lys Glu Met Leu His Asn Ala Phe Glu Pro Tyr
645 650 655
Val Thr Asp Lys Pro Ala Gly Thr Gly Leu Gly Leu Pro Val Val Lys
660 665 670
Lys Ile Ile Gly Glu His Gly Gly Arg Ile Ser Leu Ser Asn Gln Asp
675 680 685
Ala Gly Gly Ala Cys Val Arg Ile Ile Leu Pro Lys Thr Val Glu Thr
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Tyr Ala
705
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<211> 465
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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Val Leu Phe His Ile Leu Ile Ile Ala Ala Ser Asn Tyr Leu Val Gln
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35 40 45
Phe Pro Phe Ile Phe Leu Ala Thr Asp Leu Thr Val Arg Ile Phe Gly
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Leu Ala Ser Phe Ala Ala Tyr Ala Ile Gly Gln Ile Leu Asp Ile Phe
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<213> Neisseria meningitidis
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85 90 95
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Val Leu Phe His Ile Leu Ile Ile Ala Ala Ser Asn Tyr Leu Val Gln
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<222> (32)..(32)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (71)..(71)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Pro Asp Leu Asn Pro Asp Ala Asn Pro Asp Thr Asp Gly Gln Pro Gly
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<210> 275
<211> 435
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 275
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atgtattcgt ttgaagcgaa tgcaaatgca gtaaaaatat ctgaaactct ttcggttgat 120
accggacaag gcgcgaaagt tcataagttc gttcctaaat caagtaatat ttattcatct 180
gatttaacaa aagcggtaga tttaacgcat atccccacgg gcgcaaaagc ccgaatcaac 240
gccaaaataa ccgccagcgt atcccgcgcc ggcgtattgt cgggggtcgg caaacttgtc 300
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cacgacgtat acgaaacttt caaagaagac atacaggcac gaggctgccg atacgatccc 420
gaaaccgaca aattt 435
<210> 276
<211> 145
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 276
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Phe
145
<210> 277
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 277
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aatgagaagc ggcgggaagg tatccgttta tcagatgttg tggcctatc 229
<210> 278
<211> 76
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 278
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<210> 279
<211> 486
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 279
atgagatttt tcggtatcgg ttttttggtg ctgctgtttt tggagattat gtcgattgtg 60
tgggttgccg attggctggg cggcggctgg acgttgtttt tgatggcggc aggttttgcc 120
gccggcgtgc tgatgctcag gcatacgggg ctgtccggtc ttttattggc gggcgcggca 180
atgagaagcg gcgggagggt atccgtttat cagatgttgt ggcctatccg ttatacggtg 240
gcggctgtgt gtctgatgag tccgggattc gtatcctcgg tgttggcggt attgctgctg 300
ctgccgttta agggaggggc agtgttgcag gcaggaggtg cggaaaattt tttcaacatg 360
aaccaatcgg gcagaaaaga gggcttttcc cgcgatgacg atattatcga gggagaatat 420
acggttgaag agccttacgg cggcaatcgt tcccgaaacg ccatcgaaca caaaaaagac 480
gaataa 486
<210> 280
<211> 161
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 280
Met Arg Phe Phe Gly Ile Gly Phe Leu Val Leu Leu Phe Leu Glu Ile
1 5 10 15
Met Ser Ile Val Trp Val Ala Asp Trp Leu Gly Gly Gly Trp Thr Leu
20 25 30
Phe Leu Met Ala Ala Gly Phe Ala Ala Gly Val Leu Met Leu Arg His
35 40 45
Thr Gly Leu Ser Gly Leu Leu Leu Ala Gly Ala Ala Met Arg Ser Gly
50 55 60
Gly Arg Val Ser Val Tyr Gln Met Leu Trp Pro Ile Arg Tyr Thr Val
65 70 75 80
Ala Ala Val Cys Leu Met Ser Pro Gly Phe Val Ser Ser Val Leu Ala
85 90 95
Val Leu Leu Leu Leu Pro Phe Lys Gly Gly Ala Val Leu Gln Ala Gly
100 105 110
Gly Ala Glu Asn Phe Phe Asn Met Asn Gln Ser Gly Arg Lys Glu Gly
115 120 125
Phe Ser Arg Asp Asp Asp Ile Ile Glu Gly Glu Tyr Thr Val Glu Glu
130 135 140
Pro Tyr Gly Gly Asn Arg Ser Arg Asn Ala Ile Glu His Lys Lys Asp
145 150 155 160
Glu
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<211> 486
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
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<400> 281
atgagatttt tcggtatcgg ttttttggtg ctgctgtttt tggagattat gtcgattgtg 60
tgggttgccg attggttggg cggcggttgg acgctgtttc taatggcggc aacctttgcc 120
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atgagaagcg gcgggagggt atccgtttat canatgttgt ggcntatccg ttatacggtg 240
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acggttgaag anccttacgg cggcantcgt ttccgaaacg ccntngaaca caaaaaagac 480
gaataa 486
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<211> 161
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 282
Met Arg Phe Phe Gly Ile Gly Phe Leu Val Leu Leu Phe Leu Glu Ile
1 5 10 15
Met Ser Ile Val Trp Val Ala Asp Trp Leu Gly Gly Gly Trp Thr Leu
20 25 30
Phe Leu Met Ala Ala Thr Phe Ala Ala Gly Val Val Met Leu Arg His
35 40 45
Thr Gly Leu Ser Gly Leu Leu Leu Ala Gly Ala Ala Met Arg Ser Gly
50 55 60
Gly Arg Val Ser Val Tyr Xaa Met Leu Trp Xaa Ile Arg Tyr Thr Val
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Gly Ala Glu Asn Phe Phe Asn Met Asn Xaa Ser Gly Arg Lys Xaa Gly
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 284
Met Arg Phe Phe Gly Ile Gly Phe Leu Val Leu Leu Phe Leu Glu Ile
1 5 10 15
Met Ser Ile Val Trp Val Ala Asp Trp Leu Gly Gly Gly Trp Thr Leu
20 25 30
Phe Leu Met Ala Ala Thr Phe Ala Ala Gly Val Leu Met Leu Arg His
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Thr Gly Leu Ser Gly Leu Leu Leu Ala Gly Ala Ala Val Lys Ser Ser
50 55 60
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Ala Ala Val Cys Leu Met Ser Pro Gly Phe Val Ser Ser Val Leu Ala
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100 105 110
Gly Ala Glu Asn Phe Phe Asn Met Asn Gln Ser Gly Arg Lys Glu Gly
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Phe Phe His Asp Asp Asp Ile Ile Glu Gly Glu Tyr Thr Val Glu Lys
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Pro Asp Gly Gly Asn Arg Ser Arg Asn Ala Ile Glu His Glu Lys Asp
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Glu
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<221> misc_feature
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<400> 285
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 286
Met Phe Val Phe Gln Thr Ala Phe Xaa Met Phe Gln Lys His Leu Gln
1 5 10 15
Lys Ala Ser Asp Ser Val Val Gly Gly Thr Leu Tyr Val Val Ala Thr
20 25 30
Pro Ile Gly Asn Leu Ala Asp Ile Thr Leu Arg Ala Leu Ala Val Leu
35 40 45
Gln Lys Ala Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Glu Asp Thr Arg Val Thr Ala Gln
50 55 60
Leu Leu Ser Ala Tyr Gly Ile Gln Gly Lys Leu Val Ser Val Arg Glu
65 70 75 80
His Asn Glu Arg Gln Met Ala Asp Lys Ile Val Gly Tyr Leu Ser Asp
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Gly Met Val Val Ala Gln Val Ser Asp Ala Gly Thr Pro Ala Val Cys
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Asp Pro Gly Ala Lys Leu Ala Arg Arg Val Arg Glu Ala Gly Phe Lys
115 120 125
Val Val Pro Val Val Gly Ala Xaa Ala Val Met Ala Ala Leu Ser Val
130 135 140
Ala Gly Val Glu Gly Ser Asp Phe Tyr Phe Asn Gly Phe Val Pro Pro
145 150 155 160
Lys Ser Gly Glu Arg Arg Lys Leu Phe Ala Lys Trp Val Arg Ala Ala
165 170 175
Phe Pro Ile Val Met Phe Glu Thr Pro His Arg Ile Gly Ala Ala Leu
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Ala Asp Met Ala Glu Leu Phe Pro Glu Arg Arg Leu Met Leu Ala Arg
195 200 205
Glu Ile Thr Lys Thr Phe Glu Thr Phe Leu Ser Gly Thr Val Gly Glu
210 215 220
Ile Gln Thr Ala Leu Ser Ala Asp Gly Asp Gln Ser Arg Gly Glu Met
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Val Leu Val Leu Tyr Pro Ala Gln Asp Glu Lys His Glu Gly Leu Ser
245 250 255
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260 265 270
Lys Gln Ala Ala Glu Leu Ala Ala Lys Ile Thr Gly Glu Gly Lys Lys
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Ala Leu Tyr Asp
290
<210> 287
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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Thr Leu Tyr Val Val Ala Thr Pro Ile Gly Asn Leu Ala Asp Ile Thr
20 25 30
Leu Arg Ala Leu Ala Val Leu Gln Lys Ala Asp Ile Ile Cys Ala Glu
35 40 45
Asp Thr Arg Val Thr Ala Gln Leu Leu Ser Ala Tyr Gly Ile Gln Gly
50 55 60
Lys Leu Val Ser Val Arg Glu His Asn Glu Arg Gln Met Ala Asp Lys
65 70 75 80
Ile Val Gly Tyr Leu Ser Asp Gly Met Val Val Ala Gln Val Ser Asp
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Ala Gly Thr Pro Ala Val Cys Asp Pro Gly Ala Lys Leu Ala Arg Arg
100 105 110
Val Arg Glu Ala Gly Phe Lys Val Val Pro Val Val Gly Ala Ser Ala
115 120 125
Val Met Ala Ala Leu Ser Val Ala Gly Val Glu Gly Ser Asp Phe Tyr
130 135 140
Phe Asn Gly Phe Val Pro Pro Lys Ser Gly Glu Arg Arg Lys Leu Phe
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Ala Lys Trp Val Arg Ala Ala Phe Pro Ile Val Met Phe Glu Thr Pro
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His Arg Ile Gly Ala Thr Leu Ala Asp Met Ala Glu Leu Phe Pro Glu
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Arg Arg Leu Met Leu Ala Arg Glu Ile Thr Lys Thr Phe Glu Thr Phe
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Glu Lys His Glu Gly Leu Ser Glu Ser Ala Gln Asn Ile Met Lys Ile
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Leu Thr Ala Glu Leu Pro Thr Lys Gln Ala Ala Glu Leu Ala Ala Lys
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Ile Thr Gly Glu Gly Lys Lys Ala Leu Tyr Asp Leu Ala Leu Ser Trp
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<213> Neisseria meningitidis
<400> 289
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ccgattttta tttcaacggt tttgtaccgc cgaaatcggg cgaacgtagg aaattgtttg 480
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cggcggacgg caaccaatcg cgcggcgaga tggtgttggt gctttatccg gcgcaggatg 720
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<211> 291
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Met Phe Gln Lys His Leu Gln Lys Ala Ser Asp Ser Val Val Gly Gly
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Thr Leu Tyr Val Val Ala Thr Pro Ile Gly Asn Leu Ala Asp Ile Thr
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Leu Arg Ala Leu Ala Val Leu Gln Lys Ala Asp Ile Ile Cys Ala Glu
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Asp Thr Arg Val Thr Ala Gln Leu Leu Ser Ala Tyr Gly Ile Gln Gly
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Lys Leu Val Ser Val Arg Glu His Asn Glu Arg Gln Met Ala Asp Lys
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Ile Val Gly Tyr Leu Ser Asp Gly Met Val Val Ala Gln Val Ser Asp
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Val Met Ala Ala Leu Ser Val Ala Gly Val Ala Gly Ser Asp Phe Tyr
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Phe Asn Gly Phe Val Pro Pro Lys Ser Gly Glu Arg Arg Lys Leu Phe
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His Arg Ile Gly Ala Thr Leu Ala Asp Met Ala Glu Leu Phe Pro Glu
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Arg Arg Leu Met Leu Ala Arg Glu Ile Thr Lys Thr Phe Glu Thr Phe
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Leu Ser Gly Thr Val Gly Glu Ile Gln Thr Ala Leu Ala Ala Asp Gly
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Lys Asn Lys
290
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<221> misc_feature
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Ala Asp Met Ala Glu Leu Phe Pro Glu Arg Arg Leu Met Leu Ala Arg
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Ile Gln Thr Ala Leu Ala Ala Asp Gly Asn Gln Ser Arg Gly Glu Met
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 293
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gtaatcggtt tcctttcaga cggcctggtt gtggcgcagg tttccgatgc gggtacgccg 300
gccgtgtgcg acccgggcgc gaaactcgcc cgccgcgtgc gcgaagcagg gttcaaagtc 360
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tccgattttt atttcaacgg ttttgtaccg ccgaaatcgg gcgaacgtag gaaattgttt 480
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ttgtacgatt tggcactgtc gtggaaaaac aaatga 876
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<211> 291
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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Arg Arg Leu Met Leu Ala Arg Glu Ile Thr Lys Thr Phe Glu Thr Phe
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<213> Neisseria meningitidis
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<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 180
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 240
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 300
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 360
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 420
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 480
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 540
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 600
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 660
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Glu Leu Val Arg
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<211> 252
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Ile Asp Ala Ile Leu Glu Glu Asn Gly Val Lys Pro
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<211> 759
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 301
atgaaacaga aaaagaccgc tgccgcagtt attgctgcaa tgttggcagg ttttgcggca 60
gccaaagcac ccgaaatcga cccggctttg gtggatacgc tggtggcgca gatcatgcag 120
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gataaggata aggatgtcca aaaccgcttt aaaatcgccg aagcgtcttt ttatgccgag 300
gagtacgtcc gttttctgga acgttcggaa acggtttccg aaagcgcact gcgtcagttt 360
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gcgcgtcagg cgcagcagct cctgctcaaa gggctgtctt ttgaagggct gatgaagcgt 480
tatccgaacg acgagcaggc gttcgacggt ttcattatgg cgcagcagct tcccgagccg 540
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atcgatgccc ttttggaaga aaacggtgtc aaaccgtaa 759
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 302
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Gly Phe Ala Ala Ala Lys Ala Pro Glu Ile Asp Pro Ala Leu Val Asp
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 960
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<210> 304
<211> 524
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (86)..(403)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 304
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
180 185 190
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
195 200 205
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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<213> Neisseria meningitidis
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (16)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
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<210> 316
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<221> misc_feature
<222> (6)..(6)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 316
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 320
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 326
Met Ala Glu Ile Cys Leu Ile Thr Gly Thr Pro Gly Ser Gly Lys Thr
1 5 10 15
Leu Lys Met Val Ser Met Met Ala Asn Asp Glu Met Phe Lys Pro Asp
20 25 30
Glu Asn Gly Val Arg Arg Lys Val Phe Thr Asn Ile Lys Gly Leu Lys
35 40 45
Ile Pro His Thr His Ile Glu Thr Asp Ala Lys Lys Leu Pro Lys Ser
50 55 60
Thr Asp Glu Gln Leu Ser Ala His Asp Met Tyr Glu Trp Ile Lys Lys
65 70 75 80
Pro Glu Asn Val Gly Ala Ile Val Ile Val Asp Glu Ala Gln Asp Val
85 90 95
Trp Pro Ala Arg Ser Ala Gly Ser Lys Ile Pro Glu Asn Val Gln Trp
100 105 110
Leu Asn Thr His Arg His Gln Gly Ile Asp Ile Phe Val Leu Thr Gln
115 120 125
Gly Pro Lys Leu Leu Asp Gln Asn Leu Arg Thr Leu Val Lys Arg His
130 135 140
Tyr His Ile Ala Ala Asn Lys Met Gly Leu Arg Thr Leu Leu Glu Trp
145 150 155 160
Lys Val Cys Ala Asp Asp Pro Val Lys Met Ala Ser Ser Ala Phe Ser
165 170 175
Ser Ile Tyr Thr Leu Asp Lys Lys Val Tyr Asp Leu Tyr Glu Ser Ala
180 185 190
Glu Ile His Thr Val Asn Lys Val Lys Arg Ser Lys Trp Phe Tyr Ala
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Leu Pro Val Ile Ile Leu Leu Ile Pro Leu Phe Val Gly Leu Ser Tyr
210 215 220
Lys Met Leu Gly Ser Tyr Gly Lys Lys Gln Glu Glu Pro Ala Ala Gln
225 230 235 240
Glu Ser Ala Ala Thr Glu Gln Gln Ala Val Leu Pro Asp Lys Thr Glu
245 250 255
Gly Glu Ser Val Asn Asn Gly Asn Leu Thr Ala Asp Met Phe Val Pro
260 265 270
Thr Leu Pro Glu Lys Pro Glu Ser Lys Pro Ile Tyr Asn Gly Val Arg
275 280 285
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Thr Gly Cys Thr Cys Tyr Ser His Gln Gly Thr Ala Leu Lys Glu Val
305 310 315 320
Thr Glu Leu Met Cys Lys Asp Tyr Val Lys Asn Gly Leu Pro Phe Asn
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Pro Tyr Lys Glu Glu Ser Gln Gly Gln Glu Val Gln Gln Ser Ala Gln
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Gln His Ser Asp Arg Ala Gln Val Ala Thr Leu Gly Gly Lys Pro Gln
355 360 365
Gln Asn Leu Met Tyr Asp Asn Trp Glu Glu Arg Gly Lys Pro Phe Glu
370 375 380
Gly Ile Gly Gly Gly Val Val Gly Ser Ala Asn
385 390 395
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 328
Met Val Phe Leu Asn Ala Asp Asn Gly Ile Leu Val Gln Asp Leu Pro
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Phe Glu Val Lys Leu Lys Lys Phe His Ile Asp Phe Tyr Asn Thr Gly
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Met Pro Arg Asp Phe Ala Ser Asp Ile Glu Val Thr Asp Lys Ala Thr
35 40 45
Gly Glu Lys Leu Glu Arg Thr Ile Arg Val Asn His Pro Leu Thr Leu
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Leu Thr Phe Lys Ala Trp Asn Leu Gly Asp Ala Ser Arg Glu Pro Val
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His Lys Tyr Arg Leu Glu Phe Asp Gln Phe Thr Ser Met Asn Val Glu
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Tyr Arg Ile Arg Asp Ala Pro Gly Gln Ala Val
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Arg Glu Phe Leu Lys Asp Gly Glu Gly Arg Lys Arg Xaa Val Ala Asp
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Ala Thr Lys Gly Ala Pro Ala Glu Ile Arg Glu Gln Phe Met Leu Ala
245 250 255
Ala Glu Asn Thr Leu Asn Ile Phe Ala Gln Lys Gly Tyr Leu Gly Leu
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Val Tyr Leu
370
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<211> 2016
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 329
atgagtaaat cccgtagatc tcccccactt ctttcccgtc cgtggttcgc ttttttcagc 60
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<210> 330
<211> 671
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 330
Met Ser Lys Ser Arg Arg Ser Pro Pro Leu Leu Ser Arg Pro Trp Phe
1 5 10 15
Ala Phe Phe Ser Ser Met Arg Phe Ala Val Ala Leu Leu Ser Leu Leu
20 25 30
Gly Ile Ala Ser Val Ile Gly Thr Val Leu Gln Gln Asn Gln Pro Gln
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Thr Asp Tyr Leu Val Lys Phe Gly Ser Phe Trp Ala Gln Ile Phe Gly
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Phe Leu Gly Leu Tyr Asp Val Tyr Ala Ser Ala Trp Phe Val Val Ile
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Met Met Phe Leu Val Val Ser Thr Ser Leu Cys Leu Ile Arg Asn Val
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Lys Ser Leu Ala Ala Met Arg His Ser Ser Leu Leu Asp Val Lys Ile
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Lys Thr Ile Asn Arg Glu Asp Gly Ser Val Leu Ile Ala Ala Lys Lys
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Val Ile Cys Leu Gly Gly Leu Ile Asp Ser Asn Leu Leu Leu Lys Leu
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Gly Met Leu Thr Gly Arg Ile Val Pro Asp Asn Gln Ala Val Tyr Ala
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Lys Asp Phe Lys Pro Glu Ser Ile Leu Gly Ala Ser Asn Leu Ser Phe
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 331
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 333
n 1
<210> 334
<211> 434
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (398)..(398)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 334
Met Val Phe Leu Asn Ala Asp Asn Gly Met Leu Val Gln Asp Leu Pro
1 5 10 15
Phe Glu Val Lys Leu Lys Lys Phe His Ile Asp Phe Tyr Asn Thr Gly
20 25 30
Met Pro Arg Asp Phe Ala Ser Asp Ile Glu Val Thr Asp Lys Ala Thr
35 40 45
Gly Glu Lys Leu Glu Arg Thr Ile Arg Val Asn His Pro Leu Thr Leu
50 55 60
His Gly Ile Thr Ile Tyr Gln Ala Ser Phe Ala Asp Gly Gly Ser Asp
65 70 75 80
Leu Thr Phe Lys Ala Trp Asn Leu Arg Asp Ala Ser Arg Glu Pro Val
85 90 95
Val Leu Lys Ala Thr Ser Ile His Gln Phe Pro Leu Glu Ile Gly Lys
100 105 110
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115 120 125
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Asn Asp Val Arg Ala Val Thr Gln Glu Gly Lys Lys Tyr Thr Asn Ile
145 150 155 160
Gly Pro Ser Ile Val Tyr Arg Ile Arg Asp Ala Ala Gly Gln Ala Val
165 170 175
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Arg Glu Phe Leu Lys Asp Gly Glu Gly Arg Lys Arg Leu Val Ala Asp
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Ala Thr Lys Asp Ala Pro Ala Glu Ile Arg Glu Gln Phe Met Leu Ala
245 250 255
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Asp Glu Phe Ile Thr Ser Asn Ile Pro Lys Gly Gln Gln Asp Lys Met
275 280 285
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Ala Arg Asn Arg Phe Leu Leu His Ser Met Asp Ala Tyr Thr Gly Leu
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<211> 2016
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 335
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ttgcacggca tcacgattta tcaggcgagt tttgccgacg gcggttcgga tttgacattc 960
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<210> 336
<211> 671
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 336
Met Ser Lys Ser Arg Ile Ser Pro Thr Leu Leu Ser Arg Pro Trp Phe
1 5 10 15
Ala Phe Phe Ser Ser Met Arg Phe Ala Val Ala Leu Leu Ser Leu Leu
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Gly Ile Ala Ser Val Ile Gly Thr Val Leu Gln Gln Asn Gln Pro Gln
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Met Met Phe Leu Val Val Ser Thr Ser Leu Cys Leu Ile Arg Asn Val
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Leu Asn Ala Asp Asn Gly Met Leu Val Gln Asp Leu Pro Phe Glu Val
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Lys Lys
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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Met Met Ser Asn Lys Met Glu Gln Lys Gly Phe Thr Leu Ile Glu Met
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Met Ile Val Val Ala Ile Leu Gly Ile Ile Ser Val Ile Ala Ile Pro
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 342
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tcaggctata agatgaatcc gaaaattgcc aaaaaatata gtgtttcggt aaggtttgtc 300
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<221> misc_feature
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 362
Met Lys His Ile Leu Pro Pro Ile Ala Ala Ser Ala Phe Cys Ile Ser
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Thr Ala Ser Ala His Pro Ala Gly Lys Pro Pro Thr Gln Asn Glu Thr
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 364
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<213> Neisseria meningitidis
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 367
atggctttta ttacgcgctt attcaaaagc agtaaatggc tgattgtgcc gctgatgctc 60
cccgcctttc agaatgtggc ggcggagggg atagatgtga gccgtgccga agcgaggata 120
accgacggcg ggcagctttc catcagcagc cgcttccaaa ccgagctgcc cgaccagctc 180
caacaggcgt tgcgccgggg cgtgccgctc aactttacct taagctggca gctttccgcc 240
ccgataatcg cttcttatcg gtttaaattg gggcaactga ttggcgatga cgacaatatt 300
gactacaaac tgagtttcca tccgctgacc aaccgctacc gcgttaccgt cggcgcgttt 360
tcgacagact acgacacctt ggatgcggca ttgcgcgcga ccggcgcggt tgccaactgg 420
aaagtcctga acaaaggcgc gctgtccggt gcggaagcag gggaaaccaa ggcggaaatc 480
cgcctgacgc tgtccacttc aaaactgccc aagccttttc aaatcaatgc attgacttct 540
caaaactggc atttggattc gggttggaaa cctctaaaca tcatcgggaa caaataa 597
<210> 368
<211> 198
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 368
Met Ala Phe Ile Thr Arg Leu Phe Lys Ser Ser Lys Trp Leu Ile Val
1 5 10 15
Pro Leu Met Leu Pro Ala Phe Gln Asn Val Ala Ala Glu Gly Ile Asp
20 25 30
Val Ser Arg Ala Glu Ala Arg Ile Thr Asp Gly Gly Gln Leu Ser Ile
35 40 45
Ser Ser Arg Phe Gln Thr Glu Leu Pro Asp Gln Leu Gln Gln Ala Leu
50 55 60
Arg Arg Gly Val Pro Leu Asn Phe Thr Leu Ser Trp Gln Leu Ser Ala
65 70 75 80
Pro Ile Ile Ala Ser Tyr Arg Phe Lys Leu Gly Gln Leu Ile Gly Asp
85 90 95
Asp Asp Asn Ile Asp Tyr Lys Leu Ser Phe His Pro Leu Thr Asn Arg
100 105 110
Tyr Arg Val Thr Val Gly Ala Phe Ser Thr Asp Tyr Asp Thr Leu Asp
115 120 125
Ala Ala Leu Arg Ala Thr Gly Ala Val Ala Asn Trp Lys Val Leu Asn
130 135 140
Lys Gly Ala Leu Ser Gly Ala Glu Ala Gly Glu Thr Lys Ala Glu Ile
145 150 155 160
Arg Leu Thr Leu Ser Thr Ser Lys Leu Pro Lys Pro Phe Gln Ile Asn
165 170 175
Ala Leu Thr Ser Gln Asn Trp His Leu Asp Ser Gly Trp Lys Pro Leu
180 185 190
Asn Ile Ile Gly Asn Lys
195
<210> 369
<211> 600
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (125)..(125)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (147)..(147)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (150)..(150)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (187)..(189)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (193)..(194)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (196)..(196)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (218)..(218)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (372)..(372)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 369
atggctttta ttacgcgctt attcaaaagc attaaacaat ggcttgtgct gctgccgatg 60
ctttccgttt tgccggacgc ggcggcggag gggatagatg tgagccgcgc cgaagcgagg 120
ataancgacg gcgggcagct ttccatnagn agccgcttcc aaaccgagct gcccgaccag 180
ctccaannng cgnngngccg gggcgtgncg ctcaactnta ccttaagntg gcagctttcc 240
gccccgataa tcgcttctta tcggtttnaa ttggggcaac tgattggcga tgacgacnat 300
attgactaca aactgagttt ccatccgctg accaaccgct accgcgttac cgtcggcgcg 360
ttttcgacag antacgacac cttggatgcg gcattgcgcg cgaccggcgc ggttgccaac 420
tggaaagtcc tgaacaaagg cgcgctgtcc ggtgcggaag caggggaaac caaggcggaa 480
atccgcctga cgctgtccac ttcaaaactg cccaagcctt ttcaaatcaa tgcattgact 540
tctcaaaact ggcatttgga ttcgggttgg aaacctctaa acatcatcgg gaacaaataa 600
<210> 370
<211> 199
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (42)..(42)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (49)..(50)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (63)..(63)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (70)..(70)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (73)..(73)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (76)..(76)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (90)..(90)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (100)..(100)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (124)..(124)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 370
Met Ala Phe Ile Thr Arg Leu Phe Lys Ser Ile Lys Gln Trp Leu Val
1 5 10 15
Leu Leu Pro Met Leu Ser Val Leu Pro Asp Ala Ala Ala Glu Gly Ile
20 25 30
Asp Val Ser Arg Ala Glu Ala Arg Ile Xaa Asp Gly Gly Gln Leu Ser
35 40 45
Xaa Xaa Ser Arg Phe Gln Thr Glu Leu Pro Asp Gln Leu Gln Xaa Ala
50 55 60
Xaa Xaa Arg Gly Val Xaa Leu Asn Xaa Thr Leu Xaa Trp Gln Leu Ser
65 70 75 80
Ala Pro Ile Ile Ala Ser Tyr Arg Phe Xaa Leu Gly Gln Leu Ile Gly
85 90 95
Asp Asp Asp Xaa Ile Asp Tyr Lys Leu Ser Phe His Pro Leu Thr Asn
100 105 110
Arg Tyr Arg Val Thr Val Gly Ala Phe Ser Thr Xaa Tyr Asp Thr Leu
115 120 125
Asp Ala Ala Leu Arg Ala Thr Gly Ala Val Ala Asn Trp Lys Val Leu
130 135 140
Asn Lys Gly Ala Leu Ser Gly Ala Glu Ala Gly Glu Thr Lys Ala Glu
145 150 155 160
Ile Arg Leu Thr Leu Ser Thr Ser Lys Leu Pro Lys Pro Phe Gln Ile
165 170 175
Asn Ala Leu Thr Ser Gln Asn Trp His Leu Asp Ser Gly Trp Lys Pro
180 185 190
Leu Asn Ile Ile Gly Asn Lys
195
<210> 371
<211> 600
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 371
atggctttta ttacgcgctt attcaaaagc attaaacaat ggcttgtgct gttgccgata 60
ctctccgttt tgccggacgc ggcggcggag ggcattgccg cgacccgcgc cgaagcgagg 120
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tctcaaaact ggcatttgga ttcgggttgg aaacctctaa acatcatcgg gaacaaataa 600
<210> 372
<211> 199
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 372
Met Ala Phe Ile Thr Arg Leu Phe Lys Ser Ile Lys Gln Trp Leu Val
1 5 10 15
Leu Leu Pro Ile Leu Ser Val Leu Pro Asp Ala Ala Ala Glu Gly Ile
20 25 30
Ala Ala Thr Arg Ala Glu Ala Arg Ile Thr Asp Gly Gly Arg Leu Ser
35 40 45
Ile Ser Ser Arg Phe Gln Thr Glu Leu Pro Asp Gln Leu Gln Gln Ala
50 55 60
Leu Arg Arg Gly Val Pro Leu Asn Phe Thr Leu Ser Trp Gln Leu Ser
65 70 75 80
Ala Pro Thr Ile Ala Ser Tyr Arg Phe Lys Leu Gly Gln Leu Ile Gly
85 90 95
Asp Asp Asp Asn Ile Asp Tyr Lys Leu Ser Phe His Pro Leu Thr Asn
100 105 110
Arg Tyr Arg Val Thr Val Gly Ala Phe Ser Thr Asp Tyr Asp Thr Leu
115 120 125
Asp Ala Ala Leu Arg Ala Thr Gly Ala Val Ala Asn Trp Lys Val Leu
130 135 140
Asn Lys Gly Ala Leu Ser Gly Ala Glu Ala Gly Glu Thr Lys Ala Glu
145 150 155 160
Ile Arg Leu Thr Leu Ser Thr Ser Lys Leu Pro Lys Pro Phe Gln Ile
165 170 175
Asn Ala Leu Thr Ser Gln Asn Trp His Leu Asp Ser Gly Trp Lys Pro
180 185 190
Leu Asn Ile Ile Gly Asn Lys
195
<210> 373
<211> 1425
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (24)..(24)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
<222> (994)..(994)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (1146)..(1146)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 373
atggacacaa aagaaatcct cggntacgcg gcaggctcga tcggcagcgc ggttttagcc 60
gtcatcatcc tgccgctgct gtcgtggtat ttccccgccg acgacatcgg gcgcatcgtg 120
ctgatgcaga cggcggcggg gctgacggtg tcggtgttgt gcctcgggct ggatcaggca 180
tacgtccgcg aatactatgc caccgccgac aaagacacct tgttcaaaac cctgttcctg 240
ccgccgctgc tgtctgccgc cgcgatagcc gccctgctgc tttcccgccc gtccctgccg 300
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ctgagcttcc tgcccatccg ctttctctta ctggttttgc gtatggaagg acgcgccctt 420
gccttttcgt ccgcgcaact cgtgcccaag ctcgccatcc tgctgctgnt gccgctgacg 480
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aaccttgccg ccgccgcctt tttgctgttt caaaaccgat gccgtctgaa ggccgtccgg 600
cacgcaccgt tttcgcccgc cgtcctgcac cgggggntgc gctacggcat accgatcgca 660
ctgagcagca tcgcctattg ggggctggca tccgccgacc gtttgttcct gaaaaaatat 720
gccggcctgg aacagctcgg cgtttattcg atgggtattt cgttcggcgg ggcggcatta 780
ttgttccaaa gcatcttttc aacggtctgg acaccgtata ttttccgcgc aatcgaagaa 840
aacgccccgc ccgctcgcct ctcggcaacg gcagaatccg ccgccgccct gcttgcctcc 900
gccctctgcn tgaccggcat tttctcgccc cttgcctccc tcctgctgcc ggaaaactac 960
gccgccgtcc ggtttatcgt cgtatcgtgt atgntgccgc cgctgttttg cacgctggcg 1020
gaaatcagcg gcatcggttt gaacgtcgtt cgcaaaacgc gcccgatcgc gctcgccacc 1080
ttgggcgcgc tggcggcaaa cctgctgctg ctggggcttg accgtgccgt accggcgagg 1140
ccgccnggcg cggcggttgc ctgtgccgcc tcattctggc tgttttttgc cttcaagacc 1200
gaaagctcyt gccgcctgtg gcagccgctc aaacgcctgc cgctttatct gcacacattg 1260
ttctgcctga cctcctcggc ggcctacacc tgcttcggca cgccggcaaa ctatcccctg 1320
tttgccggcg tatgggcggc atatctggca ggctgcatcc tgcgccaccg gaaagatttg 1380
cacaaactgt ttcattattt gaaaaaacaa ggtttcccat tatga 1425
<210> 374
<211> 474
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (8)..(8)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (157)..(157)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (213)..(213)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (304)..(304)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (332)..(332)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (382)..(382)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 374
Met Asp Thr Lys Glu Ile Leu Xaa Tyr Ala Ala Gly Ser Ile Gly Ser
1 5 10 15
Ala Val Leu Ala Val Ile Ile Leu Pro Leu Leu Ser Trp Tyr Phe Pro
20 25 30
Ala Asp Asp Ile Gly Arg Ile Val Leu Met Gln Thr Ala Ala Gly Leu
35 40 45
Thr Val Ser Val Leu Cys Leu Gly Leu Asp Gln Ala Tyr Val Arg Glu
50 55 60
Tyr Tyr Ala Thr Ala Asp Lys Asp Thr Leu Phe Lys Thr Leu Phe Leu
65 70 75 80
Pro Pro Leu Leu Ser Ala Ala Ala Ile Ala Ala Leu Leu Leu Ser Arg
85 90 95
Pro Ser Leu Pro Ser Glu Ile Leu Phe Ser Leu Asp Asp Ala Ala Ala
100 105 110
Gly Ile Gly Leu Val Leu Phe Glu Leu Ser Phe Leu Pro Ile Arg Phe
115 120 125
Leu Leu Leu Val Leu Arg Met Glu Gly Arg Ala Leu Ala Phe Ser Ser
130 135 140
Ala Gln Leu Val Pro Lys Leu Ala Ile Leu Leu Leu Xaa Pro Leu Thr
145 150 155 160
Val Gly Leu Leu His Phe Pro Ala Asn Thr Ala Val Leu Thr Ala Val
165 170 175
Tyr Ala Leu Ala Asn Leu Ala Ala Ala Ala Phe Leu Leu Phe Gln Asn
180 185 190
Arg Cys Arg Leu Lys Ala Val Arg His Ala Pro Phe Ser Pro Ala Val
195 200 205
Leu His Arg Gly Xaa Arg Tyr Gly Ile Pro Ile Ala Leu Ser Ser Ile
210 215 220
Ala Tyr Trp Gly Leu Ala Ser Ala Asp Arg Leu Phe Leu Lys Lys Tyr
225 230 235 240
Ala Gly Leu Glu Gln Leu Gly Val Tyr Ser Met Gly Ile Ser Phe Gly
245 250 255
Gly Ala Ala Leu Leu Phe Gln Ser Ile Phe Ser Thr Val Trp Thr Pro
260 265 270
Tyr Ile Phe Arg Ala Ile Glu Glu Asn Ala Pro Pro Ala Arg Leu Ser
275 280 285
Ala Thr Ala Glu Ser Ala Ala Ala Leu Leu Ala Ser Ala Leu Cys Xaa
290 295 300
Thr Gly Ile Phe Ser Pro Leu Ala Ser Leu Leu Leu Pro Glu Asn Tyr
305 310 315 320
Ala Ala Val Arg Phe Ile Val Val Ser Cys Met Xaa Pro Pro Leu Phe
325 330 335
Cys Thr Leu Ala Glu Ile Ser Gly Ile Gly Leu Asn Val Val Arg Lys
340 345 350
Thr Arg Pro Ile Ala Leu Ala Thr Leu Gly Ala Leu Ala Ala Asn Leu
355 360 365
Leu Leu Leu Gly Leu Asp Arg Ala Val Pro Ala Arg Pro Xaa Gly Ala
370 375 380
Ala Val Ala Cys Ala Ala Ser Phe Trp Leu Phe Phe Ala Phe Lys Thr
385 390 395 400
Glu Ser Ser Cys Arg Leu Trp Gln Pro Leu Lys Arg Leu Pro Leu Tyr
405 410 415
Leu His Thr Leu Phe Cys Leu Thr Ser Ser Ala Ala Tyr Thr Cys Phe
420 425 430
Gly Thr Pro Ala Asn Tyr Pro Leu Phe Ala Gly Val Trp Ala Ala Tyr
435 440 445
Leu Ala Gly Cys Ile Leu Arg His Arg Lys Asp Leu His Lys Leu Phe
450 455 460
His Tyr Leu Lys Lys Gln Gly Phe Pro Leu
465 470
<210> 375
<211> 1422
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 375
atggacacaa aagaaatcct cggctacgcg gcaggctcga tcggcagcgc ggttttagcc 60
gtcatcatcc tgccgctgct gtcgtggtat ttccccgccg acgacatcgg gcgcatcgtg 120
ctgatgcaga cggcggcggg gctgacggtg tcggtgttgt gcctcgggct ggatcaggca 180
tacgtccgcg aatactatgc caccgccgac aaagacacct tgttcaaaac cctgttcctg 240
ccgccgctgc tgtctgccgc cgcgatagcc gccctgctgc tttcccgccc gtccctgccg 300
tctgaaatcc tgttttcact cgacgatgcc gccgccggca tcgggctggt gctgtttgaa 360
ctgagcttcc tgcccatccg ctttctctta ctggttttgc gtatggaagg acgcgccctt 420
gccttttcgt ccgcgcaact cgtgcccaag ctcgccatcc tgctgctgct gccgctgacg 480
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aaccttgccg ccgccgcctt tttgctgttt caaaaccgat gccgtctgaa ggccgtccgg 600
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ctgagcagca tcgcctattg ggggctggca tccgccgacc gtttgttcct gaaaaaatat 720
gccggcctgg aacagctcgg cgtttattcg atgggtattt cgttcggcgg ggcggcatta 780
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gccgccgtcc ggtttatcgt cgtatcgtgt atgctgccgc cgctgttttg cacgctggcg 1020
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gccggcgtat gggcggcata tctggcaggc tgcatcctgc gccaccggaa agatttgcac 1380
aaactgtttc attatttgaa aaaacaaggt ttcccattat ga 1422
<210> 376
<211> 473
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 376
Met Asp Thr Lys Glu Ile Leu Gly Tyr Ala Ala Gly Ser Ile Gly Ser
1 5 10 15
Ala Val Leu Ala Val Ile Ile Leu Pro Leu Leu Ser Trp Tyr Phe Pro
20 25 30
Ala Asp Asp Ile Gly Arg Ile Val Leu Met Gln Thr Ala Ala Gly Leu
35 40 45
Thr Val Ser Val Leu Cys Leu Gly Leu Asp Gln Ala Tyr Val Arg Glu
50 55 60
Tyr Tyr Ala Thr Ala Asp Lys Asp Thr Leu Phe Lys Thr Leu Phe Leu
65 70 75 80
Pro Pro Leu Leu Ser Ala Ala Ala Ile Ala Ala Leu Leu Leu Ser Arg
85 90 95
Pro Ser Leu Pro Ser Glu Ile Leu Phe Ser Leu Asp Asp Ala Ala Ala
100 105 110
Gly Ile Gly Leu Val Leu Phe Glu Leu Ser Phe Leu Pro Ile Arg Phe
115 120 125
Leu Leu Leu Val Leu Arg Met Glu Gly Arg Ala Leu Ala Phe Ser Ser
130 135 140
Ala Gln Leu Val Pro Lys Leu Ala Ile Leu Leu Leu Leu Pro Leu Thr
145 150 155 160
Val Gly Leu Leu His Phe Pro Ala Asn Thr Ala Val Leu Thr Ala Val
165 170 175
Tyr Ala Leu Ala Asn Leu Ala Ala Ala Ala Phe Leu Leu Phe Gln Asn
180 185 190
Arg Cys Arg Leu Lys Ala Val Arg His Ala Pro Phe Ser Pro Ala Val
195 200 205
Leu His Arg Gly Leu Arg Tyr Gly Ile Pro Ile Ala Leu Ser Ser Ile
210 215 220
Ala Tyr Trp Gly Leu Ala Ser Ala Asp Arg Leu Phe Leu Lys Lys Tyr
225 230 235 240
Ala Gly Leu Glu Gln Leu Gly Val Tyr Ser Met Gly Ile Ser Phe Gly
245 250 255
Gly Ala Ala Leu Leu Phe Gln Ser Ile Phe Ser Thr Val Trp Thr Pro
260 265 270
Tyr Ile Phe Arg Ala Ile Glu Glu Asn Ala Pro Pro Ala Arg Leu Ser
275 280 285
Ala Thr Ala Glu Ser Ala Ala Ala Leu Leu Ala Ser Ala Leu Cys Leu
290 295 300
Thr Gly Ile Phe Ser Pro Leu Ala Ser Leu Leu Leu Pro Glu Asn Tyr
305 310 315 320
Ala Ala Val Arg Phe Ile Val Val Ser Cys Met Leu Pro Pro Leu Phe
325 330 335
Cys Thr Leu Ala Glu Ile Ser Gly Ile Gly Leu Asn Val Val Arg Lys
340 345 350
Thr Arg Pro Ile Ala Leu Ala Thr Leu Gly Ala Leu Ala Ala Asn Leu
355 360 365
Leu Leu Leu Gly Leu Ala Val Pro Ser Gly Gly Ala Arg Gly Ala Ala
370 375 380
Val Ala Cys Ala Ala Ser Phe Trp Leu Phe Phe Ala Phe Lys Thr Glu
385 390 395 400
Ser Ser Cys Arg Leu Trp Gln Pro Leu Lys Arg Leu Pro Leu Tyr Leu
405 410 415
His Thr Leu Phe Cys Leu Thr Ser Ser Ala Ala Tyr Thr Cys Phe Gly
420 425 430
Thr Pro Ala Asn Tyr Pro Leu Phe Ala Gly Val Trp Ala Ala Tyr Leu
435 440 445
Ala Gly Cys Ile Leu Arg His Arg Lys Asp Leu His Lys Leu Phe His
450 455 460
Tyr Leu Lys Lys Gln Gly Phe Pro Leu
465 470
<210> 377
<211> 1422
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 377
atggacacaa aagaaatcct cggctacgcg gcaggctcga tcggcagcgc ggttttagcc 60
gtcatcatcc tgccgctgct gtcgtggtat ttccctgccg acgacatcgg acgcatcgtg 120
ctgatgcaga cggcggcggg gctgacggtg tcggtgttgt gcctcgggct ggatcaggca 180
tacgtccgcg aatactatgc cgccgccgac aaagacactt tgttcaaaac cctgttcctg 240
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 389
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gagaaaaaag cttcaaaaga agagaaaaag gcggcgaaag aaaaagttgc acccaaaccg 540
accccggaac aaatcctcaa cagccgcagc atcgaaaaag cgcgtagtgc cgctgccaaa 600
gaagtgcaga aaatgaaaaa ctttgggcaa ggcggaagcc aacgcattat ctgcaaatgg 660
gcgcgtatgc cgaccgtccg gagcgcggaa gggcagcgtg ccaaactggc aatcttgggc 720
atatcttccg aagtggtcgg ctatcaggcg ggacataaaa cgctttaccg cgtgcaaagc 780
ggcaatatgt ccgccgatgc ggtgaaaaaa atgcaggacg agttgaaaaa gcatggggtt 840
gccagcctga tccgtgcgat tgaaggcaaa taa 873
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<211> 290
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 390
Met Phe Met Asn Lys Phe Ser Gln Ser Gly Lys Gly Leu Ser Gly Phe
1 5 10 15
Phe Phe Gly Leu Ile Leu Ala Thr Val Ile Ile Ala Gly Ile Leu Leu
20 25 30
Tyr Leu Asn Gln Gly Gly Gln Asn Ala Phe Lys Ile Pro Ala Pro Ser
35 40 45
Lys Gln Pro Ala Glu Thr Glu Ile Leu Lys Leu Lys Asn Gln Pro Lys
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Glu Asp Ile Gln Pro Glu Pro Ala Asp Gln Asn Ala Leu Ser Glu Pro
65 70 75 80
Asp Val Ala Lys Glu Ala Glu Gln Ser Asp Ala Glu Lys Ala Ala Asp
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Glu Pro Glu Arg Glu Glu Pro Asp Gly Gln Ala Val Arg Lys Lys Ala
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Asp Ala Glu Thr Val Lys Lys Gln Ala Val Lys Pro Ser Lys Glu Thr
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Glu Lys Lys Ala Ser Lys Glu Glu Lys Lys Ala Ala Lys Glu Lys Val
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Ala Pro Lys Pro Thr Pro Glu Gln Ile Leu Asn Ser Arg Ser Ile Glu
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Lys Ala Arg Ser Ala Ala Ala Lys Glu Val Gln Lys Met Lys Asn Phe
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Gly Gln Gly Gly Ser Gln Arg Ile Ile Cys Lys Trp Ala Arg Met Pro
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Thr Val Arg Ser Ala Glu Gly Gln Arg Ala Lys Leu Ala Ile Leu Gly
225 230 235 240
Ile Ser Ser Glu Val Val Gly Tyr Gln Ala Gly His Lys Thr Leu Tyr
245 250 255
Arg Val Gln Ser Gly Asn Met Ser Ala Asp Ala Val Lys Lys Met Gln
260 265 270
Asp Glu Leu Lys Lys His Gly Val Ala Ser Leu Ile Arg Ala Ile Glu
275 280 285
Gly Lys
290
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (99)..(99)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 391
atgaaccacg acatcacttt cctcaccctg ttcctactcg gtktcttcgg cggaacgcac 60
tgcatcggta tgtgcggcgg attaagcagc gcgtttgsns tccaactccc cccgcatatc 120
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cagaatattt tatacacggc cgccaacctc ctgctgctct ttttaggctt atacttgagc 300
ggtatttctt ccttggcggc aaaaatcgag aaaatcggca aaccgatatg gcggaacctg 360
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 392
Met Asn His Asp Ile Thr Phe Leu Thr Leu Phe Leu Leu Gly Xaa Phe
1 5 10 15
Gly Gly Thr His Cys Ile Gly Met Cys Gly Gly Leu Ser Ser Ala Phe
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Xaa Xaa Gln Leu Pro Pro His Ile Asn Arg Phe Trp Leu Ile Leu Leu
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Leu Asn Thr Gly Arg Val Ser Ser Tyr Thr Ala Ile Gly Leu Ile Leu
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Gln Asn Ile Leu Tyr Thr Ala Ala Asn Leu Leu Leu Leu Phe Leu Gly
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Leu Tyr Leu Ser Gly Ile Ser Ser Leu Ala Ala Lys Ile Glu Lys Ile
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Gly Lys Pro Ile Trp Arg Asn Leu Asn Pro Ile Leu Asn Arg Leu Leu
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Pro Ile Lys Ser Ile Pro Ala Cys Leu Ala Val Gly Ile Leu Trp Gly
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Ser Gly Ser Ala Ala Thr Gly Gly Leu Tyr Met Leu Ala Phe Ala Leu
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Gly Thr Leu Pro Asn Leu Leu Ala Ile Gly Ile Phe Ser Leu Gln Leu
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Xaa Lys Ile Met Gln Asn Arg Tyr Ile Arg Leu Cys Thr Gly Leu Ser
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 394
Met Asn His Asp Ile Thr Phe Leu Thr Leu Phe Leu Leu Gly Phe Phe
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Gly Gly Thr His Cys Ile Gly Met Cys Gly Gly Leu Ser Ser Ala Phe
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Ala Leu Gln Leu Pro Pro His Ile Asn Arg Phe Trp Leu Ile Leu Leu
35 40 45
Leu Asn Thr Gly Arg Val Ser Ser Tyr Thr Ala Ile Gly Leu Ile Leu
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Gln Asn Ile Leu Tyr Thr Ala Ala Asn Leu Leu Leu Leu Phe Leu Gly
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Leu Tyr Leu Ser Gly Ile Ser Ser Leu Ala Ala Lys Ile Glu Lys Ile
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Gly Lys Pro Ile Trp Arg Asn Leu Asn Pro Ile Leu Asn Arg Leu Leu
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Pro Ile Lys Ser Ile Pro Ala Cys Leu Ala Val Gly Ile Leu Trp Gly
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Ser Gly Ser Ala Ala Thr Gly Gly Leu Tyr Met Leu Ala Phe Ala Leu
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Gly Thr Leu Pro Asn Leu Leu Ala Ile Gly Ile Phe Ser Leu Gln Leu
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Val Ser Leu Trp Ala Leu Trp Lys Leu Ala Val Leu Trp Leu
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<212> DNA
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atgaaccang acatcacttt cctcaccctg ttcctactcg gtttcttcgg cggaacgcac 60
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 396
Met Asn Xaa Asp Ile Thr Phe Leu Thr Leu Phe Leu Leu Gly Phe Phe
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Gly Gly Thr His Cys Ile Gly Met Cys Gly Gly Leu Ser Ser Ala Phe
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Ala Leu Gln Leu Pro Pro His Ile Asn Arg Xaa Trp Leu Ile Leu Leu
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Leu Asn Thr Gly Arg Val Ser Ser Tyr Thr Ala Ile Gly Leu Ile Leu
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Gly Leu Ile Gly Gln Val Gly Val Ser Leu Asp Gln Thr Arg Val Xaa
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Leu Tyr Leu Ser Gly Ile Ser Ser Leu Ala Ala Lys Ile Glu Lys Ile
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Gly Lys Pro Ile Trp Arg Asn Leu Asn Pro Ile Leu Asn Arg Leu Leu
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Trp Leu Pro Cys Gly Leu Val Tyr Ser Ala Ser Leu Tyr Ala Leu Gly
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Ser Gly Ser Ala Ala Thr Gly Gly Leu Tyr Met Leu Ala Phe Ala Leu
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Gly Thr Leu Pro Asn Leu Xaa Ala Ile Gly Ile Phe Ser Leu Gln Leu
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Xaa Lys Ile Met Gln Asn Arg Tyr Ile Arg Leu Cys Thr Gly Leu Ser
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<211> 222
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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Met Asn His Asp Ile Thr Phe Leu Thr Leu Phe Leu Leu Gly Phe Phe
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Gly Gly Thr His Cys Ile Gly Met Cys Gly Gly Leu Ser Ser Ala Phe
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Ala Leu Gln Leu Pro Pro His Ile Asn Arg Phe Trp Leu Ile Leu Leu
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Leu Asn Thr Gly Arg Ile Ser Ser Tyr Thr Ala Ile Gly Leu Met Leu
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Gly Leu Ile Gly Gln Leu Gly Ile Ser Leu Asp Gln Thr Arg Val Leu
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Pro Ile Lys Ser Ile Pro Ala Cys Leu Ala Val Gly Ile Leu Trp Gly
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<221> misc_feature
<222> (25)..(25)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (157)..(157)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 400
Met Glu Asn Gln Arg Pro Leu Leu Gly Phe Arg Leu Ala Leu Leu Ala
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Gly Ile Ser Ala Asn Phe Val Leu Ile Ala Gln Gly Leu His Tyr Ile
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Lys Ile Gly Leu Val Leu Leu Leu Ala Gly Leu Leu Met Tyr Phe Asn
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Asp Lys Phe Gly Glu Leu Ser Gly Leu Gly Ala Tyr Xaa Lys Gly Val
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Leu Leu Cys Ala Ala Gly Ser Met Ala Trp Val Cys Asn Ala Val Ala
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Ile Tyr Ala Ala Ser Ala Ala Val Phe Leu Pro Phe Ala Glu Pro Ala
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (262)..(263)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 402
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65 70 75 80
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Lys Ile Gly Leu Val Leu Leu Leu Ala Gly Leu Leu Met Phe Phe Asn
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Asp Lys Phe Gly Glu Leu Ser Gly Leu Gly Ala Tyr Ala Lys Gly Val
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 403
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Val Leu Pro Glu Thr Phe Leu Pro Glu Asn Gln Asp Gly Glu Val Ala
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Gly Phe Glu Lys Met Asp Ile Gly Gly Leu Leu Asp Ala Met Leu Ser
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Lys Asn Met Met His Asp Ala Gln Leu Val Thr Leu Asp Ala Phe Tyr
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Arg Tyr Gly Leu Ile Asp Ala Ala His Pro Leu Ser Glu Trp Leu Asp
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Gly Ile Arg Leu
370
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Leu Asp Asn Ile Ala Gly Gly Gly Val Ser Gly Gly Glu Met Pro Ser
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Phe Glu Lys Met Asp Ile Gly Gly Leu Leu Asp Ala Met Leu Ser Lys
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290
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rgkacaatta cagcgaaatt cgtggaagat ggmsaaaagg ttaaggctgg cgacaagcta 300
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<213> Neisseria meningitidis
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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ctgacgggta aagtgattct gacacgaccg ttgtcatttt ccctatggac gacatttgca 120
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acagtggagg gacaaatttt acctgcatcg ggcgtaatca gggtgtatgc accggatacg 240
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cttcaggaaa tccgcacgca gaatctgaca ttggnnagcc tcccccaagc ggcatga 717
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria meningitidis
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<221> misc_feature
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<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (15)..(15)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 426
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 430
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (426)..(426)
<223> n is a, c, g, or t
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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Pro Ala Leu Leu Leu Ala Gly Ile Pro Pro Val Ser Ala Ile Ala Thr
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Ala Arg Lys Gly Leu Ile Asp Trp Lys Lys Gly Leu Pro Ile Ala Ala
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Ala Ser Phe Val Gly Gly Val Ala Gly Ala Leu Ser Val Ser Leu Val
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 440
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35 40 45
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (255)..(255)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (295)..(295)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (305)..(305)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 448
Met Pro Ser Glu Thr Arg Leu Pro Asn Phe Ile Arg Thr Leu Ile Phe
1 5 10 15
Ala Leu Ser Phe Ile Phe Leu Asn Ala Cys Ser Glu Gln Thr Ala Gln
20 25 30
Thr Val Thr Leu Gln Gly Glu Thr Met Gly Thr Thr Tyr Thr Val Lys
35 40 45
Tyr Leu Ser Asn Asn Arg Asp Xaa Leu Pro Ser Pro Ala Glu Ile Gln
50 55 60
Xaa Arg Ile Asp Asp Ala Leu Lys Glu Val Asn Arg Gln Met Ser Thr
65 70 75 80
Tyr Gln Pro Asp Ser Glu Ile Ser Arg Phe Asn Gln His Thr Ala Gly
85 90 95
Lys Pro Leu Arg Ile Ser Ser Asp Phe Ala His Val Thr Ala Glu Ala
100 105 110
Val His Leu Asn Arg Leu Thr His Gly Ala Leu Asp Val Thr Val Gly
115 120 125
Pro Leu Val Asn Leu Trp Gly Phe Gly Pro Asp Lys Ser Val Thr Arg
130 135 140
Glu Pro Ser Pro Glu Gln Ile Lys Gln Ala Ala Ser Tyr Thr Gly Ile
145 150 155 160
Asp Lys Ile Ile Leu Lys Gln Gly Lys Asp Tyr Ala Ser Leu Ser Lys
165 170 175
Thr His Pro Lys Ala Tyr Leu Asp Leu Ser Ser Ile Ala Lys Gly Phe
180 185 190
Gly Val Asp Xaa Val Ala Gly Glu Leu Glu Lys Tyr Gly Ile Gln Asn
195 200 205
Tyr Leu Val Glu Ile Gly Gly Glu Leu His Gly Lys Xaa Lys Asn Ala
210 215 220
Arg Gly Glu Pro Trp Arg Ile Gly Ile Glu Gln Pro Asn Ile Val Gln
225 230 235 240
Gly Gly Asn Thr Gln Ile Ile Val Pro Leu Asn Asn Arg Ser Xaa Ala
245 250 255
Thr Ser Gly Asp Tyr Arg Ile Phe His Val Asp Lys Ser Gly Lys Arg
260 265 270
Leu Ser His Ile Ile Asn Pro Asn Asn Lys Arg Pro Ile Ser His Asn
275 280 285
Leu Ala Ser Ile Ser Val Xaa Ala Asp Ser Ala Met Thr Ala Asp Gly
290 295 300
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305 310 315 320
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Gly Tyr Arg Thr Ala Met Ser Ser Glu Phe Glu Lys Leu Leu Arg
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 449
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atttcaagcg atttcgcaca cgttaccgcc gaagccgtcc gcctgaaccg cctgactcac 360
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tccgttaccc gtgaaccgtc gccggaacaa atcaaacagg cggcatctta tacgggcata 480
gacaaaatca ttttgcaaca aggcaaagat tacgcttcct tgagcaaaac ccaccccaaa 540
gcctatttgg atttatcttc gattgccaaa ggcttcggcg ttgataaagt tgcgggcgaa 600
ctggaaaaat acggcattca aaattatctg gtcgaaatcg gcggcgagtt gcacggcaaa 660
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<210> 450
<211> 351
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 450
Met Pro Ser Glu Thr Arg Leu Pro Asn Leu Ile Arg Ala Leu Ile Phe
1 5 10 15
Ala Leu Gly Phe Ile Phe Leu Asn Ala Cys Ser Glu Gln Thr Ala Gln
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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Glu Pro Ser Pro Glu Gln Ile Lys Gln Ala Ala Ser Tyr Thr Gly Ile
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Asp Lys Ile Ile Leu Gln Gln Gly Lys Asp Tyr Ala Ser Leu Ser Lys
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Thr His Pro Lys Ala Tyr Leu Asp Leu Ser Ser Ile Ala Lys Gly Phe
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Gly Val Asp Lys Val Ala Gly Glu Leu Glu Lys Tyr Gly Ile Gln Asn
195 200 205
Tyr Leu Val Glu Ile Gly Gly Glu Leu His Gly Lys Gly Lys Asn Ala
210 215 220
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225 230 235 240
Gly Gly Asn Thr Gln Ile Ile Val Pro Leu Asn Asn Arg Ser Leu Ala
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260 265 270
Leu Ser His Ile Ile Asn Pro Asn Asn Lys Arg Pro Ile Ser His Asn
275 280 285
Leu Ala Ser Ile Ser Val Val Ser Asp Ser Ala Met Thr Ala Asp Gly
290 295 300
Leu Ser Thr Gly Leu Phe Val Leu Gly Glu Thr Glu Ala Leu Arg Leu
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Gly Tyr Arg Thr Ala Met Ser Ser Glu Phe Ala Lys Leu Leu Arg
340 345 350
<210> 451
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 451
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<210> 452
<211> 263
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (60)..(60)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 452
Pro Cys Arg Arg Gln Gly Asp Asp Val Tyr Ala Ala His Ala Ser Arg
1 5 10 15
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65 70 75 80
Gly Ala Ala Gly Ser Asp Leu Tyr Gly Tyr Gly Gly Gly Val Tyr Ala
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Leu Ala Gly Arg Thr Ala Leu Glu Gly Arg Phe Gly Ile Glu Ala Gly
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Trp Lys Gly His Met Ser Ala
260
<210> 453
<211> 1860
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 453
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 454
Met Phe Arg Ala Gln Leu Gly Ser Asn Thr Arg Ser Thr Lys Ile Gly
1 5 10 15
Asp Asp Ala Asp Phe Ser Phe Ser Asp Lys Pro Lys Pro Gly Thr Ser
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His Tyr Phe Ser Ser Gly Lys Thr Asp Gln Asn Ser Ser Glu Tyr Gly
35 40 45
Tyr Asp Glu Ile Asn Ile Gln Gly Lys Asn Tyr Asn Ser Gly Ile Leu
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Gly Asp Asn Leu Lys Asp Ala Val Lys Lys Gln Leu Gln Asp Leu Tyr
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195 200 205
Leu Asn Thr Lys Asp Glu Lys Leu Thr Val His Lys Ala Tyr Gln Gly
210 215 220
Gly Ala Asp Phe Leu Phe Gly Tyr Asp Val Arg Glu Ser Asp Lys Pro
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245 250 255
Glu Arg Arg Pro Glu Asn Leu Lys Thr Leu Asp Gly Arg Lys Leu Ile
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<221> misc_feature
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 456
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Arg Leu Asn Asp Lys Asn Ser Asp Ile Phe Asp Arg Thr Leu Pro Arg
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Gly Leu Met Gly Gly Gln Ala Glu Gln Arg Ser Thr Phe Arg Asn Pro
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Asp Thr Asp Asn Leu Thr Thr Gly Asn Val Lys Gly Phe Gly Ala Gly
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Val Asp Ser Trp Met Gln Tyr Gln Arg Phe Arg His Arg Ile Asn Thr
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Glu Tyr Ala Thr Glu Arg Phe Thr Ser Lys Gly Ile Thr Ala Ser Ile
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Glu Ala Gly Tyr Asn Ala Leu Leu Ala Glu His Phe Thr Lys Lys Gly
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<220>
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 458
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<213> Neisseria meningitidis
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<222> (12)..(12)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (34)..(34)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 459
gcagtgtgcc tnccgatgca tgcacacgcc tcanatttgg caaacgattc ttttatccgg 60
caggttctcg accgtcagca tttcgaaccc gacgggaaat accacctatt cggcagcagg 120
ggggaacttg ccgagcgcca gtctcatatc ggattgggaa aaatacaaag ccatcagttg 180
ggcaacctga tgattcaaca ggcggccatt aaaggaaata tcggctacat tgtccgcttt 240
tccgatcacg ggcacgaagt ccattccccs ttcgacaacc atgcctcaca ttccgattct 300
gatgaagccg gtagtcccgt tgacggattt agcctttacc gcatccattg ggacggatac 360
gaacaccatc ccgccgacgg ctatgacggg ccacagggcg gcggctatcc cgctcccaaa 420
ggcgcgaggg atatatacag ttacgacata aaaggcgttg cccaaaatat ccgcctcaac 480
ctgaccgaca accgcagcac cggacaacgg cttgccgacc gtttccacaa tgccggtagt 540
atgctgacgc aaggagtagg cgacggattc aaacgcgcca cccgatacag ccccgagctg 600
gacagatcgg gcaatgccgc cgaagccttc aacggcactg cagatatcgt taaaaacatc 660
atcggcgctg caggagaaat tgt 683
<210> 460
<211> 227
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (12)..(12)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 460
Ala Val Cys Leu Pro Met His Ala His Ala Ser Xaa Leu Ala Asn Asp
1 5 10 15
Ser Phe Ile Arg Gln Val Leu Asp Arg Gln His Phe Glu Pro Asp Gly
20 25 30
Lys Tyr His Leu Phe Gly Ser Arg Gly Glu Leu Ala Glu Arg Gln Ser
35 40 45
His Ile Gly Leu Gly Lys Ile Gln Ser His Gln Leu Gly Asn Leu Met
50 55 60
Ile Gln Gln Ala Ala Ile Lys Gly Asn Ile Gly Tyr Ile Val Arg Phe
65 70 75 80
Ser Asp His Gly His Glu Val His Ser Pro Phe Asp Asn His Ala Ser
85 90 95
His Ser Asp Ser Asp Glu Ala Gly Ser Pro Val Asp Gly Phe Ser Leu
100 105 110
Tyr Arg Ile His Trp Asp Gly Tyr Glu His His Pro Ala Asp Gly Tyr
115 120 125
Asp Gly Pro Gln Gly Gly Gly Tyr Pro Ala Pro Lys Gly Ala Arg Asp
130 135 140
Ile Tyr Ser Tyr Asp Ile Lys Gly Val Ala Gln Asn Ile Arg Leu Asn
145 150 155 160
Leu Thr Asp Asn Arg Ser Thr Gly Gln Arg Leu Ala Asp Arg Phe His
165 170 175
Asn Ala Gly Ser Met Leu Thr Gln Gly Val Gly Asp Gly Phe Lys Arg
180 185 190
Ala Thr Arg Tyr Ser Pro Glu Leu Asp Arg Ser Gly Asn Ala Ala Glu
195 200 205
Ala Phe Asn Gly Thr Ala Asp Ile Val Lys Asn Ile Ile Gly Ala Ala
210 215 220
Gly Glu Ile
225
<210> 461
<211> 1
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 461
n 1
<210> 462
<211> 298
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (93)..(93)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (108)..(108)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 462
Arg Arg Leu Lys His Cys Cys His Ala Arg Leu Gly Ser Ala Phe His
1 5 10 15
Arg Lys Gln Asp Gly Ala His Gln Arg Phe Gly Arg Tyr Gly Ala Thr
20 25 30
Gln Arg Leu Cys Arg Ser Ser His Pro Arg Leu Gly Ser Pro Lys Pro
35 40 45
Gln Cys Arg Thr Arg His Arg Ser Arg Gln Gln Tyr Leu Tyr Gly Ser
50 55 60
His Pro His Gln Arg Asp Trp Ser Cys Pro Gly Lys Ile Gln Leu Gly
65 70 75 80
Arg His His Gly Thr Ser Cys Arg Ala Val Ala Asp Xaa Arg Asp Arg
85 90 95
Ile Cys Glu Arg Glu Ile Arg Arg Gln Arg Gln Xaa Cys Arg Cys Arg
100 105 110
Leu Gly Lys Ile Pro Ser Leu Ser Ile Pro Lys Tyr Pro Leu Lys Leu
115 120 125
Glu Gln Arg Tyr Gly Lys Glu Asn Ile Thr Ser Ser Thr Val Pro Pro
130 135 140
Ser Asn Gly Lys Asn Val Lys Leu Ala Asp Gln Arg His Pro Lys Thr
145 150 155 160
Gly Val Pro Phe Asp Gly Lys Gly Phe Pro Asn Phe Glu Lys His Val
165 170 175
Lys Tyr Asp Thr Lys Leu Asp Ile Gln Glu Leu Ser Gly Gly Gly Ile
180 185 190
Pro Lys Ala Lys Pro Val Phe Asp Ala Lys Pro Arg Trp Glu Val Asp
195 200 205
Arg Lys Leu Asn Lys Leu Thr Thr Arg Glu Gln Val Glu Lys Asn Val
210 215 220
Gln Glu Thr Arg Arg Arg Ser Gln Ser Ser Gln Phe Lys Ala His Ala
225 230 235 240
Gln Arg Glu Trp Glu Asn Lys Thr Gly Leu Asp Phe Asn His Phe Ile
245 250 255
Gly Gly Asp Ile Asn Lys Lys Gly Ala Val Thr Gly Gly His Ser Leu
260 265 270
Thr Arg Gly Asp Val Arg Val Ile Gln Gln Thr Ser Ala Pro Asp Lys
275 280 285
His Gly Val Leu Ser Ser Asp Ser Gly Asn
290 295
<210> 463
<211> 1887
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (175)..(175)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 463
ttgggcattt cccgcaaaat atcccttatt ctgtccatac tggcagtgtg cctgccgatg 60
catgcacacg cctcagattt ggcaaacgat ccctttatcc ggcaggttct cgaccgtcag 120
catttcgaac ccgacgggaa ataccaccta ttcggcagca ggggggagct tgccnagcgc 180
aacggccata tcggattggg aaacatacaa agccatcagt tgggccacct gatgattcaa 240
caggcggccg ttgaaggaaa tatcggctac attgtccgct tttccgatca cgggcacaaa 300
ttccattcgc ccttcgacaa ccatgcctca cattccgatt ctgacgaagc cggtagtccc 360
gttgacggat tcagccttta ccgcatccat tgggacggat acgaacacca tcccgccgac 420
ggctatgacg ggccacaggg cggcggctat cccgctccca aaggcgcgag ggatatatac 480
agctacgaca taaaaggcgt tgcccaaaat atccgcctca acctgaccga caaccgcagc 540
accggacaac ggcttgccga ccgtttccac aatgccggcg ctatgctgac gcaaggagta 600
ggcgacggat tcaaacgcgc cacccgatac agccccgagc tggacagatc gggcaatgcc 660
gccgaagcct tcaacggcac tgcagatatc gtcaaaaaca tcatcggcgc ggcaggagaa 720
attgtcggcg caggcgatgc cgtgcagggt ataagcgaag gctcaaacat tgctgtcatg 780
cacggcttgg gtctgctttc caccgaaaac aagatggcgc gcatcaacga tttggcagat 840
atggcgcaac tcaaagacta tgccgcagca gccatccgcg attgggcagt ccaaaacccc 900
aatgccgcac aaggcataga agccgtcagc aatatcttta tggcagccat ccccatcaaa 960
gggattggag ctgtccgggg aaaatacggc ttgggcggca tcacggcaca tcctgtcaag 1020
cggtcgcaga tgggcgcgat cgcattgccg aaagggaaat ccgccgtcag cgacaatttt 1080
gccgatgcgg catacgccaa atacccgtcc ccttaccatt cccgaaatat ccgttcaaac 1140
ttggagcagc gttacggcaa agaaaacatc acctcctcaa ccgtgccgcc gtcaaacggc 1200
aaaaatgtca aactggcaga ccaacgccac ccgaagacag gcgtaccgtt tgacggtaaa 1260
gggtttccga attttgagaa gcacgtgaaa tatgatacga agctcgatat tcaagaatta 1320
tcggggggcg gtatacctaa ggctaagcct gtgtttgatg cgaaaccgag atgggaggtt 1380
gataggaagc ttaataaatt gacaactcgt gagcaggtgg agaaaaatgt tcaggaaacg 1440
agaagaagga gtcagagtag tcagtttaaa gcccatgcgc aacgagaatg ggaaaataaa 1500
acagggttag attttaatca ttttataggt ggtgatatca ataagaaagg cacagtaaca 1560
ggagggcata gtctaacccg tggtgatgta cgggtgatac aacaaacctc ggcacctgat 1620
aaacatgggg tttatcaagc gacagtggaa attaaaaagc ctgatggaag ttgggaggtg 1680
aaaacgaaaa aaggtgggaa agtgatgacc aagcacacca tgttcccaaa agattgggat 1740
gaggctagaa ttagggctga agttacttcg gcttgggaaa gtagaataat gcttaaggat 1800
aataaatggc agggtacaag taaatcgggt attaaaatag aaggatttac cgaacctaat 1860
agaacagcat atcccattta tgaatag 1887
<210> 464
<211> 628
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (59)..(59)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 464
Leu Gly Ile Ser Arg Lys Ile Ser Leu Ile Leu Ser Ile Leu Ala Val
1 5 10 15
Cys Leu Pro Met His Ala His Ala Ser Asp Leu Ala Asn Asp Pro Phe
20 25 30
Ile Arg Gln Val Leu Asp Arg Gln His Phe Glu Pro Asp Gly Lys Tyr
35 40 45
His Leu Phe Gly Ser Arg Gly Glu Leu Ala Xaa Arg Asn Gly His Ile
50 55 60
Gly Leu Gly Asn Ile Gln Ser His Gln Leu Gly His Leu Met Ile Gln
65 70 75 80
Gln Ala Ala Val Glu Gly Asn Ile Gly Tyr Ile Val Arg Phe Ser Asp
85 90 95
His Gly His Lys Phe His Ser Pro Phe Asp Asn His Ala Ser His Ser
100 105 110
Asp Ser Asp Glu Ala Gly Ser Pro Val Asp Gly Phe Ser Leu Tyr Arg
115 120 125
Ile His Trp Asp Gly Tyr Glu His His Pro Ala Asp Gly Tyr Asp Gly
130 135 140
Pro Gln Gly Gly Gly Tyr Pro Ala Pro Lys Gly Ala Arg Asp Ile Tyr
145 150 155 160
Ser Tyr Asp Ile Lys Gly Val Ala Gln Asn Ile Arg Leu Asn Leu Thr
165 170 175
Asp Asn Arg Ser Thr Gly Gln Arg Leu Ala Asp Arg Phe His Asn Ala
180 185 190
Gly Ala Met Leu Thr Gln Gly Val Gly Asp Gly Phe Lys Arg Ala Thr
195 200 205
Arg Tyr Ser Pro Glu Leu Asp Arg Ser Gly Asn Ala Ala Glu Ala Phe
210 215 220
Asn Gly Thr Ala Asp Ile Val Lys Asn Ile Ile Gly Ala Ala Gly Glu
225 230 235 240
Ile Val Gly Ala Gly Asp Ala Val Gln Gly Ile Ser Glu Gly Ser Asn
245 250 255
Ile Ala Val Met His Gly Leu Gly Leu Leu Ser Thr Glu Asn Lys Met
260 265 270
Ala Arg Ile Asn Asp Leu Ala Asp Met Ala Gln Leu Lys Asp Tyr Ala
275 280 285
Ala Ala Ala Ile Arg Asp Trp Ala Val Gln Asn Pro Asn Ala Ala Gln
290 295 300
Gly Ile Glu Ala Val Ser Asn Ile Phe Met Ala Ala Ile Pro Ile Lys
305 310 315 320
Gly Ile Gly Ala Val Arg Gly Lys Tyr Gly Leu Gly Gly Ile Thr Ala
325 330 335
His Pro Val Lys Arg Ser Gln Met Gly Ala Ile Ala Leu Pro Lys Gly
340 345 350
Lys Ser Ala Val Ser Asp Asn Phe Ala Asp Ala Ala Tyr Ala Lys Tyr
355 360 365
Pro Ser Pro Tyr His Ser Arg Asn Ile Arg Ser Asn Leu Glu Gln Arg
370 375 380
Tyr Gly Lys Glu Asn Ile Thr Ser Ser Thr Val Pro Pro Ser Asn Gly
385 390 395 400
Lys Asn Val Lys Leu Ala Asp Gln Arg His Pro Lys Thr Gly Val Pro
405 410 415
Phe Asp Gly Lys Gly Phe Pro Asn Phe Glu Lys His Val Lys Tyr Asp
420 425 430
Thr Lys Leu Asp Ile Gln Glu Leu Ser Gly Gly Gly Ile Pro Lys Ala
435 440 445
Lys Pro Val Phe Asp Ala Lys Pro Arg Trp Glu Val Asp Arg Lys Leu
450 455 460
Asn Lys Leu Thr Thr Arg Glu Gln Val Glu Lys Asn Val Gln Glu Thr
465 470 475 480
Arg Arg Arg Ser Gln Ser Ser Gln Phe Lys Ala His Ala Gln Arg Glu
485 490 495
Trp Glu Asn Lys Thr Gly Leu Asp Phe Asn His Phe Ile Gly Gly Asp
500 505 510
Ile Asn Lys Lys Gly Thr Val Thr Gly Gly His Ser Leu Thr Arg Gly
515 520 525
Asp Val Arg Val Ile Gln Gln Thr Ser Ala Pro Asp Lys His Gly Val
530 535 540
Tyr Gln Ala Thr Val Glu Ile Lys Lys Pro Asp Gly Ser Trp Glu Val
545 550 555 560
Lys Thr Lys Lys Gly Gly Lys Val Met Thr Lys His Thr Met Phe Pro
565 570 575
Lys Asp Trp Asp Glu Ala Arg Ile Arg Ala Glu Val Thr Ser Ala Trp
580 585 590
Glu Ser Arg Ile Met Leu Lys Asp Asn Lys Trp Gln Gly Thr Ser Lys
595 600 605
Ser Gly Ile Lys Ile Glu Gly Phe Thr Glu Pro Asn Arg Thr Ala Tyr
610 615 620
Pro Ile Tyr Glu
625
<210> 465
<211> 1671
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 465
ttgggcattt cccgcaaaat atcccttatt ctgtccatac tggcagtgtg cctgccgatg 60
catgcacacg cctcagattt ggcaaacgat tcttttatcc ggcaggttct cgaccgtcag 120
catttcgaac ccgacgggaa ataccaccta ttcggcagca ggggggaact tgccgagcgc 180
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caggcggcca ttaaaggaaa tatcggctac attgtccgct tttccgatca cgggcacgaa 300
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ggctatgacg ggccacaggg cggcggctat cccgctccca aaggcgcgag ggatatatac 480
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attgtcggcg caggcgatgc cgtgcagggt ataagcgaag gctcaaacat tgctgttatg 780
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gggattggag ctgttcgggg aaaatacggc ttgggcggca tcacggcaca tcctgtcaag 1020
cggtcgcaga tgggcgagat cgcattgccg aaagggaaat ccgccgtcag cgacaatttt 1080
gccgatgcgg catacgccaa atacccgtcc ccttaccatt cccgaaatat ccgttcaaac 1140
ttggagcagc gttacggcaa agaaaacatc acctcctcaa ccgtgccgcc gtcaaacgga 1200
aagaatgtga aactggcaaa caaacgccac ccgaagacca aagtgccgtt tgacggtaaa 1260
gggtttccga attttgaaaa agacgtaaaa tacgatacga gaattaatac cgctgtacca 1320
caagtgaatc ctatagatga acccgtcttt aatcctaaag gttctgtcgg atcggctcat 1380
tcttggtcta taactgccag aattcaatac gcaaaattac caaggcaagg tagaatcaga 1440
tatatcccac ctaaaaatta ctctccttca gcaccgctac caaaaggacc taataatgga 1500
tatttggata aatttggtaa tgaatggact aaaggtccat caagaactaa aggtcaagaa 1560
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gatggtaagc atttaaatat atcaattgat ggaaagatta cacacaaatg a 1671
<210> 466
<211> 556
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 466
Leu Gly Ile Ser Arg Lys Ile Ser Leu Ile Leu Ser Ile Leu Ala Val
1 5 10 15
Cys Leu Pro Met His Ala His Ala Ser Asp Leu Ala Asn Asp Ser Phe
20 25 30
Ile Arg Gln Val Leu Asp Arg Gln His Phe Glu Pro Asp Gly Lys Tyr
35 40 45
His Leu Phe Gly Ser Arg Gly Glu Leu Ala Glu Arg Ser Gly His Ile
50 55 60
Gly Leu Gly Asn Ile Gln Ser His Gln Leu Gly Asn Leu Phe Ile Gln
65 70 75 80
Gln Ala Ala Ile Lys Gly Asn Ile Gly Tyr Ile Val Arg Phe Ser Asp
85 90 95
His Gly His Glu Val His Ser Pro Phe Asp Asn His Ala Ser His Ser
100 105 110
Asp Ser Asp Glu Ala Gly Ser Pro Val Asp Gly Phe Ser Leu Tyr Arg
115 120 125
Ile His Trp Asp Gly Tyr Glu His His Pro Ala Asp Gly Tyr Asp Gly
130 135 140
Pro Gln Gly Gly Gly Tyr Pro Ala Pro Lys Gly Ala Arg Asp Ile Tyr
145 150 155 160
Ser Tyr Asp Ile Lys Gly Val Ala Gln Asn Ile Arg Leu Asn Leu Thr
165 170 175
Asp Asn Arg Ser Thr Gly Gln Arg Leu Val Asp Arg Phe His Asn Thr
180 185 190
Gly Ser Met Leu Thr Gln Gly Val Gly Asp Gly Phe Lys Arg Ala Thr
195 200 205
Arg Tyr Ser Pro Glu Leu Asp Arg Ser Gly Asn Ala Ala Glu Ala Phe
210 215 220
Asn Gly Thr Ala Asp Ile Val Lys Asn Ile Ile Gly Ala Ala Gly Glu
225 230 235 240
Ile Val Gly Ala Gly Asp Ala Val Gln Gly Ile Ser Glu Gly Ser Asn
245 250 255
Ile Ala Val Met His Gly Leu Gly Leu Leu Ser Thr Glu Asn Lys Met
260 265 270
Ala Arg Ile Asn Asp Leu Ala Asp Met Ala Gln Leu Lys Asp Tyr Ala
275 280 285
Ala Ala Ala Ile Arg Asp Trp Ala Val Gln Asn Pro Asn Ala Ala Gln
290 295 300
Gly Ile Glu Ala Val Ser Asn Ile Phe Thr Ala Val Ile Pro Val Lys
305 310 315 320
Gly Ile Gly Ala Val Arg Gly Lys Tyr Gly Leu Gly Gly Ile Thr Ala
325 330 335
His Pro Val Lys Arg Ser Gln Met Gly Glu Ile Ala Leu Pro Lys Gly
340 345 350
Lys Ser Ala Val Ser Asp Asn Phe Ala Asp Ala Ala Tyr Ala Lys Tyr
355 360 365
Pro Ser Pro Tyr His Ser Arg Asn Ile Arg Ser Asn Leu Glu Gln Arg
370 375 380
Tyr Gly Lys Glu Asn Ile Thr Ser Ser Thr Val Pro Pro Ser Asn Gly
385 390 395 400
Lys Asn Val Lys Leu Ala Asn Lys Arg His Pro Lys Thr Lys Val Pro
405 410 415
Phe Asp Gly Lys Gly Phe Pro Asn Phe Glu Lys Asp Val Lys Tyr Asp
420 425 430
Thr Arg Ile Asn Thr Ala Val Pro Gln Val Asn Pro Ile Asp Glu Pro
435 440 445
Val Phe Asn Pro Lys Gly Ser Val Gly Ser Ala His Ser Trp Ser Ile
450 455 460
Thr Ala Arg Ile Gln Tyr Ala Lys Leu Pro Arg Gln Gly Arg Ile Arg
465 470 475 480
Tyr Ile Pro Pro Lys Asn Tyr Ser Pro Ser Ala Pro Leu Pro Lys Gly
485 490 495
Pro Asn Asn Gly Tyr Leu Asp Lys Phe Gly Asn Glu Trp Thr Lys Gly
500 505 510
Pro Ser Arg Thr Lys Gly Gln Glu Phe Glu Trp Asp Val Gln Leu Ser
515 520 525
Lys Thr Gly Arg Glu Gln Leu Gly Trp Ala Ser Arg Asp Gly Lys His
530 535 540
Leu Asn Ile Ser Ile Asp Gly Lys Ile Thr His Lys
545 550 555
<210> 467
<211> 357
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 467
atgaatattc acaccctgct ctccaaacaa tggacgctgc cgccattcct gccgaaacgg 60
ctgctgctgt ccctgctgat actgcttgcc cccaatgcgg tgttttgggt tttggcactg 120
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aacctcgtcc ccttcatcct gaccgccccc gccccttatc agataatgac cgggctg 357
<210> 468
<211> 119
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 468
Met Asn Ile His Thr Leu Leu Ser Lys Gln Trp Thr Leu Pro Pro Phe
1 5 10 15
Leu Pro Lys Arg Leu Leu Leu Ser Leu Leu Ile Leu Leu Ala Pro Asn
20 25 30
Ala Val Phe Trp Val Leu Ala Leu Leu Thr Ala Thr Ala Arg Pro Ile
35 40 45
Val Asn Leu Asp Tyr Leu Pro Ala Ala Leu Leu Ile Ala Leu Pro Trp
50 55 60
Arg Phe Val Lys Ile Ala Gly Val Leu Ala Phe Trp Leu Ala Val Leu
65 70 75 80
Phe Asp Gly Leu Met Met Val Ile Gln Leu Phe Pro Phe Met Asp Leu
85 90 95
Ile Gly Ala Ile Asn Leu Val Pro Phe Ile Leu Thr Ala Pro Ala Pro
100 105 110
Tyr Gln Ile Met Thr Gly Leu
115
<210> 469
<211> 1419
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 469
atgaatattc acaccctgct ctccaaacaa tggacgctgc cgccattcct gccgaaacgg 60
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agttactacg accggggtcg gatggccaat atcttcggcg caaacaactt ctactacgcc 540
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gcctacggcg gtttgcgcgg gttcgcactg cgccgcgcgc ccgacgaaaa atttgcccgc 900
tgcctcccca accgtttgaa acaagaaggt tacgccacct ttgcgatgca cggcgcgggc 960
agttcgcttt acgaccgctt cagctggtat ccgagggcgg gctttcaaga aatcaaaacc 1020
gccgaaaacc tgatcggtaa aaaaacctgc gccattttcg gcggcgtgtg cgacagcgag 1080
ctgttcggcg aagtgtcggc atttttcaaa aaacacgaca agggactgtt ttactggatg 1140
acgctgacca gccacgccga ctatcccgaa tccgacattt tcaaccacag gctcaaatgc 1200
accgaatatg gcctgcccgc cgaaaccgac ctctgccgca atttcagcct gcacacccaa 1260
ttcttcgacc aactggcgga tttgatccaa cgccccgaaa tgaaaggcac ggaagtcatc 1320
atcgtcggcg accatccgcc gcccgtcggc aacctcaatg aaaccttccg ctacctcaaa 1380
caggggcacg tcgcctggct gaacttcaaa atcaaataa 1419
<210> 470
<211> 472
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 470
Met Asn Ile His Thr Leu Leu Ser Lys Gln Trp Thr Leu Pro Pro Phe
1 5 10 15
Leu Pro Lys Arg Leu Leu Leu Ser Leu Leu Ile Leu Leu Ala Pro Asn
20 25 30
Ala Val Phe Trp Val Leu Ala Leu Leu Thr Ala Thr Ala Arg Pro Ile
35 40 45
Val Asn Leu Asp Tyr Leu Pro Ala Ala Leu Leu Ile Ala Leu Pro Trp
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Ser Ala Thr Ile Asn Ala Gly Ala Val Ala Ile Val Thr Ala Ala Ile
100 105 110
Val Lys Met Ala Ile Pro Ser Leu Met Phe Asp Ala Gly Thr Val Ala
115 120 125
Ala Leu Ile Met Ala Ser Cys Leu Ile Ile Leu Val Ser Gly Arg Tyr
130 135 140
Arg Ala Leu Asp Arg Val Ser Lys Ile Ile Ile Val Thr Leu Ser Ile
145 150 155 160
Ala Thr Leu Ala Ala Ala Gly Ile Ala Met Ser Arg Gly Met Gln Met
165 170 175
Gln Ser Asp Phe Ile Glu Pro Thr Pro Trp Thr Leu Ala Gly Leu Gly
180 185 190
Phe Leu Ile Ala Leu Met Gly Trp Met Pro Ala Pro Ile Glu Ile Ser
195 200 205
Ala Ile Asn Ser Leu Trp Val Thr Glu Lys Gln Arg Ile Asn Pro Ser
210 215 220
Glu Tyr Arg Asp Gly Ile Phe Asp Phe Asn Val Gly Tyr Ile Ala Ser
225 230 235 240
Ala Val Leu Ala Leu Val Phe Leu Ala Leu Gly Ala Phe Val Gln Tyr
245 250 255
Gly Asn Gly Glu Ala Val Gln Met Ala Gly Gly Lys Tyr Ile Gly Gln
260 265 270
Leu Ile Asn Met Tyr Ala Val Thr Ile Gly Gly Trp Ser Arg Pro Leu
275 280 285
Val Ala Phe Ile Ala Phe Ala Cys Met Tyr Gly Thr Thr Ile Thr Val
290 295 300
Val Asp Gly Tyr Ala Arg Ala Ile Ala Glu Pro Val Arg Leu Leu Arg
305 310 315 320
Gly Lys Asp Lys Thr Gly Asn Ala Glu Phe Phe Ala Trp Asn Ile Trp
325 330 335
Val Ala Gly Ser Gly Leu Ala Val Ile Phe Trp Phe Asp Gly Val Met
340 345 350
Ala Asn Leu Leu Lys Phe Ala Met Ile Ala Ala Phe Val Ser Ala Pro
355 360 365
Val Phe Ala Trp Leu Asn Tyr Arg Leu Val Lys Gly Asp Glu Lys His
370 375 380
Lys Leu Thr Ser Gly Met Asn Ala Leu Ala Leu Ala Gly Leu Ile Tyr
385 390 395 400
Leu Thr Gly Phe Thr Val Leu Phe Leu Leu Asn Leu Ala Gly Met Phe
405 410 415
Lys
<210> 481
<211> 1254
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 481
atgtccgaac aacatatttc gacttggaaa agtaaaatca acgcattggg accggggatt 60
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ctttacggct ggcagatcgc gctcatcatc atcctgacca acctcttcaa atacccgttt 180
ttccgcttca gcgcgcatta cacgctggac acgggcaaga gcctgattga aggttatgcc 240
gagaaaagcc gcgtttattt gtgggtattc ctgattttgt gcatcctctc cgccacgatt 300
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agcggacgtt accgcgcttt ggatcgcgtt tccaaaatca tcatcgttac tttgagtatc 480
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ctgaccggtt ttaccgtttt gttcttattg aatttggcgg gaatgttcaa atga 1254
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 482
Met Ser Glu Gln His Ile Ser Thr Trp Lys Ser Lys Ile Asn Ala Leu
1 5 10 15
Gly Pro Gly Ile Met Met Ala Ser Ala Ala Val Gly Gly Ser His Leu
20 25 30
Ile Ala Ser Thr Gln Ala Gly Ala Leu Tyr Gly Trp Gln Ile Ala Leu
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Ile Ile Ile Leu Thr Asn Leu Phe Lys Tyr Pro Phe Phe Arg Phe Ser
50 55 60
Ala His Tyr Thr Leu Asp Thr Gly Lys Ser Leu Ile Glu Gly Tyr Ala
65 70 75 80
Glu Lys Ser Arg Val Tyr Leu Trp Val Phe Leu Ile Leu Cys Ile Leu
85 90 95
Ser Ala Thr Ile Asn Ala Gly Ala Val Ala Ile Val Thr Ala Ala Ile
100 105 110
Val Lys Met Ala Ile Pro Ser Leu Met Phe Asp Ala Gly Thr Val Ala
115 120 125
Ala Leu Ile Met Ala Ser Cys Leu Ile Ile Leu Val Ser Gly Arg Tyr
130 135 140
Arg Ala Leu Asp Arg Val Ser Lys Ile Ile Ile Val Thr Leu Ser Ile
145 150 155 160
Ala Thr Leu Ala Ala Ala Gly Ile Ala Met Ser Arg Gly Met Gln Met
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Gln Ser Asp Phe Ile Glu Pro Thr Pro Trp Thr Leu Ala Gly Leu Gly
180 185 190
Phe Leu Ile Ala Leu Met Gly Trp Met Pro Ala Pro Ile Glu Ile Ser
195 200 205
Ala Ile Asn Ser Leu Trp Val Thr Glu Lys Gln Arg Ile Asn Pro Ser
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Glu Tyr Arg Asp Gly Ile Phe Asp Phe Asn Val Gly Tyr Ile Ala Ser
225 230 235 240
Ala Val Leu Ala Leu Val Phe Leu Ala Leu Gly Ala Phe Val Gln Tyr
245 250 255
Gly Asn Gly Glu Ala Val Gln Met Ala Gly Gly Lys Tyr Ile Gly Gln
260 265 270
Leu Ile Asn Met Tyr Ala Val Thr Ile Gly Gly Trp Ser Arg Pro Leu
275 280 285
Val Ala Phe Ile Ala Phe Ala Cys Met Tyr Gly Thr Thr Ile Thr Val
290 295 300
Val Asp Gly Tyr Ala Arg Ala Ile Ala Glu Pro Val Arg Leu Leu Arg
305 310 315 320
Gly Lys Asp Lys Thr Gly Asn Ala Glu Phe Phe Ala Trp Asn Ile Trp
325 330 335
Val Ala Gly Ser Gly Leu Ala Val Ile Phe Trp Phe Asp Gly Val Met
340 345 350
Ala Asn Leu Leu Lys Phe Ala Met Ile Ala Ala Phe Val Ser Ala Pro
355 360 365
Val Phe Ala Trp Leu Asn Tyr Arg Leu Val Lys Gly Asp Glu Lys His
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Lys Leu Thr Ser Gly Met Asn Ala Leu Ala Leu Ala Gly Leu Ile Tyr
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Leu Thr Gly Phe Thr Val Leu Phe Leu Leu Asn Leu Ala Gly Met Phe
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Lys
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<212> DNA
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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Met Pro Lys Lys Ser Cys Val Tyr Leu Trp Val Phe Leu Ile Leu Cys
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Ile Ala Ser Ala Thr Ile Asn Ala Gly Ala Val Ala Ile Val Thr Ala
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Leu Arg Gly Lys Asp Lys Thr Ala Arg Pro Ile Val Leu Leu Glu Lys
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Leu Gly Gly Arg His Arg Phe Gly Arg Asp Phe Leu Val
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 485
aagaaaagct gcgtttattt gtgggttttt ttgattttgt gtatcgcctc cgccacgatt 60
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 486
Lys Lys Ser Cys Val Tyr Leu Trp Val Phe Leu Ile Leu Cys Ile Ala
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Ser Ala Thr Ile Asn Ala Gly Ala Val Ala Ile Val Thr Ala Ala Ile
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Val Lys Met Ala Ile Pro Ser Leu Met Phe Asp Ala Gly Thr Val Ala
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Ala Leu Ile Met Ala Ser Cys Leu Ile Ile Leu Val Ser Gly Arg Tyr
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Arg Ala Leu Asp Arg Val Ser Lys Ile Ile Ile Val Thr Leu Ser Ile
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Ala Thr Leu Ala Ala Ala Gly Ile Ala Met Ser Arg Gly Met Gln Met
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Phe Leu Ile Ala Leu Met Gly Trp Met Pro Ala Pro Ile Glu Ile Ser
115 120 125
Ala Ile Asn Ser Leu Trp Val Thr Glu Lys Gln Arg Ile Asn Pro Ser
130 135 140
Glu Tyr Arg Asp Gly Ile Phe Asp Phe Asn Val Gly Tyr Ile Ala Ser
145 150 155 160
Ala Val Leu Ala Leu Val Phe Leu Ala Leu Gly Ala Phe Val Gln Tyr
165 170 175
Gly Asn Gly Glu Ala Val Gln Met Ala Gly Gly Lys Tyr Ile Gly Gln
180 185 190
Leu Ile Asn Met Tyr Ala Val Thr Ile Gly Gly Trp Ser Arg Pro Leu
195 200 205
Val Ala Phe Ile Ala Phe Ala Cys Met Tyr Gly Thr Thr Ile Thr Val
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Val Asp Gly Tyr Ala Arg Ala Ile Ala Glu Pro Val Arg Leu Leu Arg
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Gly Arg Asp Lys Thr Gly Asn Ala Glu Leu Phe Ala Trp Asn Ile Trp
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Val Ala Gly Ser Gly Leu Ala Val Ile Phe Trp Phe Asp Gly Ala Met
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Ala Glu Leu Leu Lys Phe Ala Met Ile Ala Ala Phe Val Ser Ala Pro
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Val Phe Ala Trp Leu Asn Tyr Arg Leu Val Lys Gly Asp Lys Arg His
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Arg Leu Thr Ala Gly Met Asn Ala Leu Ala Ile Val Gly Leu Leu Tyr
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Leu Ala Gly Phe Ala Val Leu Phe Leu Leu Asn Leu Thr Gly Leu Leu
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Ala
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 487
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 488
Leu Arg Glu Thr Ala Tyr Val Leu Asp Ser Phe Asp Arg Tyr Phe Val
1 5 10 15
Val Ala Leu Ala Gly Leu Phe Phe Val Arg Ala Gln Ser Glu Arg Glu
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Pro Asp Arg Pro Val Pro Pro
100
<210> 489
<211> 3045
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 489
atgttttgga tagttttgat cgttattttg ttgcttgcgc ttgccggctt gttttttgtc 60
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cacaacggca accgtacgat tctcgtcccc ttggacaatg cttga 3045
<210> 490
<211> 1014
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 490
Met Phe Trp Ile Val Leu Ile Val Ile Leu Leu Leu Ala Leu Ala Gly
1 5 10 15
Leu Phe Phe Val Arg Ala Gln Ser Glu Arg Glu Trp Met Arg Glu Val
20 25 30
Ser Ala Trp Gln Glu Lys Lys Gly Glu Lys Gln Ala Glu Leu Pro Glu
35 40 45
Ile Lys Asp Gly Met Pro Asp Phe Pro Glu Leu Ala Leu Met Leu Phe
50 55 60
His Ala Val Lys Thr Ala Val Tyr Trp Leu Phe Val Gly Val Val Arg
65 70 75 80
Phe Cys Arg Asn Tyr Leu Ala His Glu Ser Glu Pro Asp Arg Pro Val
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Val Ile Asp Asn Arg Arg Ile Pro Phe Asp Arg Ser Ile Ala Glu Gly
145 150 155 160
Leu Met Pro Ser Glu Ser Glu Ile Ser Pro Val Arg Pro Val Phe Lys
165 170 175
Glu Ile Thr Leu Glu Glu Ala Thr Arg Ala Leu Asn Ser Ala Ala Leu
180 185 190
Arg Glu Thr Lys Lys Arg Tyr Ile Asp Ala Phe Glu Lys Asn Glu Thr
195 200 205
Ala Val Pro Lys Val Arg Val Ser Asp Thr Pro Met Glu Gly Leu Gln
210 215 220
Ile Ile Gly Leu Asp Asp Pro Val Leu Gln Arg Thr Tyr Ser His Met
225 230 235 240
Phe Asp Ala Asp Lys Glu Ala Phe Ser Glu Ser Ala Asp Tyr Gly Phe
245 250 255
Glu Pro Tyr Phe Glu Lys Gln His Pro Ser Ala Phe Ser Ala Val Lys
260 265 270
Ala Glu Asn Ala Arg Asn Ala Pro Phe His Arg His Ala Gly Gln Gly
275 280 285
Lys Gly Gln Ala Glu Ala Lys Ser Pro Asp Val Ser Gln Gly Gln Ser
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Val Ser Asp Gly Thr Ala Val Arg Asp Ala Arg Arg Arg Val Ser Val
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Asn Leu Lys Glu Pro Asn Lys Ala Thr Val Ser Ala Glu Ala Arg Ile
325 330 335
Ser Arg Leu Ile Pro Glu Ser Gln Thr Val Val Gly Lys Arg Asp Val
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Glu Met Pro Ser Glu Thr Glu Asn Val Phe Thr Glu Thr Val Ser Ser
355 360 365
Val Gly Tyr Gly Gly Pro Val Tyr Asp Glu Thr Ala Asp Ile His Ile
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Glu Glu Pro Ala Ala Pro Asp Ala Trp Val Val Glu Pro Pro Glu Val
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Val Arg Met Ile Met Ile Asp Pro Lys Met Leu Glu Leu Ser Ile Tyr
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Glu Gly Ile Pro His Leu Leu Ala Pro Val Val Thr Asp Met Lys Leu
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Ala Ala Asn Ala Leu Asn Trp Cys Val Asn Glu Met Glu Lys Arg Tyr
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Arg Leu Met Ser Phe Met Gly Val Arg Asn Leu Ala Gly Phe Asn Gln
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Lys Ile Ala Glu Ala Ala Ala Arg Gly Glu Lys Ile Gly Asn Pro Phe
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Ser Leu Thr Pro Asp Asp Pro Glu Pro Leu Glu Lys Leu Pro Phe Ile
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Val Val Val Val Asp Glu Phe Ala Asp Leu Met Met Thr Ala Gly Lys
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Lys Ile Glu Glu Leu Ile Ala Arg Leu Ala Gln Lys Ala Arg Ala Ala
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Gly Ile His Leu Ile Leu Ala Thr Gln Arg Pro Ser Val Asp Val Ile
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Ser Ser Lys Ile Asp Ser Arg Thr Ile Leu Asp Gln Met Gly Ala Glu
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Asn Leu Leu Gly Gln Gly Asp Met Leu Phe Leu Leu Pro Gly Thr Ala
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Ser Gly Asp Asp Glu Thr Asp Pro Met Tyr Asp Glu Ala Val Ser Val
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Val Pro Leu Asp Asn Ala
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atgttttgga tagttttgat cgttattttg ttgcttgcgc ttgccggctt gttttttgtc 60
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gaaaaacagg cggagctgcc tgaaatcaaa gacggtatgc ccgattttcc cgaacttgcc 180
ctgatgcttt tccatgccgt caaaacggca gtgtattggc tgtttgtcgg tgtcgtccgt 240
ttctgccgaa actatctggc gcacgaatcc gaaccggaca ggcccgttcc gcctgcttct 300
gcaaatcgtg cggatgttcc gaccgcatcc gacggatatt cagacagtgg aaacgggacg 360
gaagaagcgg aaacggaaga agcagaagct gcggaggaag aggctgccga tacggaagac 420
attgcaactg ccgtaatcga caaccgccgc atcccattcg accggagtat tgctgaaggg 480
ttgatgccgt ctgaaagcga aatttcgccc gtccgtccgg tttttaagga aatcactttg 540
gaagaagcaa cgcgtgcttt aaacagcgcg gctttaaggg aaacgaaaaa acgctatatc 600
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ttccgccgtc atgcagggca gggnaaaggg caggcggagg cnaaatcccc ggatgtttcc 900
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aatttgaaag aaccgaacaa ggcaacggtt tctgcggagg cgcggatttc gcgcctgatt 1020
ccggaaagtc ggacggttgt cgggaaacgg gatgtcgaaa tgccgtctga aaccgaaaat 1080
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aaccgtacct atgaaccgcc ggcaggattc gagcaggtgc aacgcagccg cattgccgaa 1320
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165 170 175
Glu Ile Thr Leu Glu Glu Ala Thr Arg Ala Leu Asn Ser Ala Ala Leu
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Ile Ile Gly Leu Asp Asp Pro Val Leu Gln Arg Thr Tyr Ser Arg Met
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Phe Asp Ala Asp Lys Glu Ala Phe Ser Glu Ser Ala Asp Tyr Gly Phe
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420 425 430
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435 440 445
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Ser Val Leu Asn Leu Glu Lys Xaa Leu Ala Arg Ser Leu Gly Val Ala
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<210> 495
<211> 3045
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 495
atgttttgga tagttttgat cgttattgtg ttgcttgcgc ttgccggcct gttttttgtc 60
cgcgcacaat ccgaacgcga gtggatgcgc gaggtttctg cgtggcagga aaagaaaggg 120
gaaaaacagg cggagctgcc tgaaatcaaa gacggtatgc ccgattttcc cgagttttcc 180
ctgatgcttt tccatgccgt caaaacggca gtgtattggc tgtttgtcgg tgtcgtccgt 240
ttctgccgaa actatctggc gcacgaatcc gaaccggaca ggcccgttcc gcctgcttct 300
gcaaaccgtg cggatgttcc gaccgcatcc gacgggtatt cagacagtgg aaacgggacg 360
gaagaagcgg aaacggaagc agcagaagct gcggaggaag aggctgccga tacggaagac 420
attgcaactg ccgtaatcga caaccgccgc atcccattcg accggagtat tgctgaaggg 480
ttgatgcagt ctgaaagcaa aacttcgccc gtccgtccgg tttttaagga aatcactttg 540
gaagaagcaa cgcgtgcttt aagcagcgcg gctttaaggg aaacgaaaaa acgctatatc 600
gatgcatttg agaaaaacgg aacagccgtc cccaaagtac gcgtgtccga taccccgatg 660
gaagggctgc agattatcgg tttggacgac cctgtgcttc aacgcacgta ttcccgtatg 720
tttgatgcgg acaaagaagc gttttccgag tctgcggatt acggatttga gccgtatttt 780
gagaagcagc atccgtctgc cttttctgca gtcaaagccg aaaatgcacg gaatgcgccg 840
ttccgccgtc atgcagggca ggagaaaggg caggcggagg caaaatcccc ggatgtttcc 900
caagggcagt ccgtttcaga cggcacagcc gtccgcgatg cccgccgccg cgtttccgtc 960
aatttgaaag aaccgaacaa ggcaacggtt tctgcggagg cgcggatttc gcgcctgatt 1020
ccggaaagtc ggacggttgt cgggaaacgg gatgtcgaaa tgccgtctga aaccgaaaat 1080
gttttcacgg aaaccgtttc gtctgtggga tacggcggtc cggtttatga tgaagctgcc 1140
gatatccata ttgaagagcc tgccgcgccc gatgcttggg tggtcgaacc acccgaagtg 1200
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aaccgtacct atgagccgcc ggcaggattc gagcaggcgc aacgcagccg cattgccgaa 1320
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cacaacggca accgtacgat tctcgtcccc ttggacaatg cttga 3045
<210> 496
<211> 1014
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 496
Met Phe Trp Ile Val Leu Ile Val Ile Val Leu Leu Ala Leu Ala Gly
1 5 10 15
Leu Phe Phe Val Arg Ala Gln Ser Glu Arg Glu Trp Met Arg Glu Val
20 25 30
Ser Ala Trp Gln Glu Lys Lys Gly Glu Lys Gln Ala Glu Leu Pro Glu
35 40 45
Ile Lys Asp Gly Met Pro Asp Phe Pro Glu Phe Ser Leu Met Leu Phe
50 55 60
His Ala Val Lys Thr Ala Val Tyr Trp Leu Phe Val Gly Val Val Arg
65 70 75 80
Phe Cys Arg Asn Tyr Leu Ala His Glu Ser Glu Pro Asp Arg Pro Val
85 90 95
Pro Pro Ala Ser Ala Asn Arg Ala Asp Val Pro Thr Ala Ser Asp Gly
100 105 110
Tyr Ser Asp Ser Gly Asn Gly Thr Glu Glu Ala Glu Thr Glu Ala Ala
115 120 125
Glu Ala Ala Glu Glu Glu Ala Ala Asp Thr Glu Asp Ile Ala Thr Ala
130 135 140
Val Ile Asp Asn Arg Arg Ile Pro Phe Asp Arg Ser Ile Ala Glu Gly
145 150 155 160
Leu Met Gln Ser Glu Ser Lys Thr Ser Pro Val Arg Pro Val Phe Lys
165 170 175
Glu Ile Thr Leu Glu Glu Ala Thr Arg Ala Leu Ser Ser Ala Ala Leu
180 185 190
Arg Glu Thr Lys Lys Arg Tyr Ile Asp Ala Phe Glu Lys Asn Gly Thr
195 200 205
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210 215 220
Ile Ile Gly Leu Asp Asp Pro Val Leu Gln Arg Thr Tyr Ser Arg Met
225 230 235 240
Phe Asp Ala Asp Lys Glu Ala Phe Ser Glu Ser Ala Asp Tyr Gly Phe
245 250 255
Glu Pro Tyr Phe Glu Lys Gln His Pro Ser Ala Phe Ser Ala Val Lys
260 265 270
Ala Glu Asn Ala Arg Asn Ala Pro Phe Arg Arg His Ala Gly Gln Glu
275 280 285
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Val Ser Asp Gly Thr Ala Val Arg Asp Ala Arg Arg Arg Val Ser Val
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Asn Leu Lys Glu Pro Asn Lys Ala Thr Val Ser Ala Glu Ala Arg Ile
325 330 335
Ser Arg Leu Ile Pro Glu Ser Arg Thr Val Val Gly Lys Arg Asp Val
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Glu Met Pro Ser Glu Thr Glu Asn Val Phe Thr Glu Thr Val Ser Ser
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Val Gly Tyr Gly Gly Pro Val Tyr Asp Glu Ala Ala Asp Ile His Ile
370 375 380
Glu Glu Pro Ala Ala Pro Asp Ala Trp Val Val Glu Pro Pro Glu Val
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Pro Glu Val Ala Val Pro Glu Ile Asp Ile Leu Pro Pro Pro Pro Val
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420 425 430
Ala Gln Arg Ser Arg Ile Ala Glu Thr Asp His Leu Ala Ala Asp Val
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Leu Asn Gly Gly Trp Gln Glu Glu Thr Ala Ala Ile Ala Asp Asp Gly
450 455 460
Ser Glu Gly Ala Ala Glu Arg Ser Ser Gly Gln Tyr Leu Ser Glu Thr
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Glu Ala Phe Gly His Asp Ser Gln Ala Val Cys Pro Phe Glu Asp Val
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Pro Ser Glu Arg Pro Ser Cys Arg Val Ser Asp Thr Glu Ala Asp Glu
500 505 510
Gly Ala Phe Gln Ser Glu Glu Thr Gly Ala Val Ser Glu His Leu Pro
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Thr Thr Asp Leu Leu Leu Pro Pro Leu Phe Asn Pro Glu Ala Thr Gln
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Thr Glu Glu Glu Leu Leu Glu Asn Ser Ile Thr Ile Glu Glu Lys Leu
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Ala Glu Phe Lys Val Lys Val Lys Val Val Asp Ser Tyr Ser Gly Pro
565 570 575
Val Ile Thr Arg Tyr Glu Ile Glu Pro Asp Val Gly Val Arg Gly Asn
580 585 590
Ser Val Leu Asn Leu Glu Lys Asp Leu Ala Arg Ser Leu Gly Val Ala
595 600 605
Ser Ile Arg Val Val Glu Thr Ile Pro Gly Lys Thr Cys Met Gly Leu
610 615 620
Glu Leu Pro Asn Pro Lys Arg Gln Met Ile Arg Leu Ser Glu Ile Phe
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Asn Ser Pro Glu Phe Ala Glu Ser Lys Ser Lys Leu Thr Leu Ala Leu
645 650 655
Gly Gln Asp Ile Thr Gly Gln Pro Val Val Thr Asp Leu Gly Lys Ala
660 665 670
Pro His Leu Leu Val Ala Gly Thr Thr Gly Ser Gly Lys Ser Val Gly
675 680 685
Val Asn Ala Met Ile Leu Ser Met Leu Phe Lys Ala Ala Pro Glu Asp
690 695 700
Val Arg Met Ile Met Ile Asp Pro Lys Met Leu Glu Leu Ser Ile Tyr
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Glu Gly Ile Thr His Leu Leu Ala Pro Val Val Thr Asp Met Lys Leu
725 730 735
Ala Ala Asn Ala Leu Asn Trp Cys Val Asn Glu Met Glu Lys Arg Tyr
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Arg Leu Met Ser Phe Met Gly Val Arg Asn Leu Ala Gly Phe Asn Gln
755 760 765
Lys Ile Ala Glu Ala Ala Ala Arg Gly Glu Lys Ile Gly Asn Pro Phe
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Ser Leu Thr Pro Asp Asp Pro Glu Pro Leu Glu Lys Leu Pro Phe Ile
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Val Val Val Val Asp Glu Phe Ala Asp Leu Met Met Thr Ala Gly Lys
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Lys Ile Glu Glu Leu Ile Ala Arg Leu Ala Gln Lys Ala Arg Ala Ala
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Gly Ile His Leu Ile Leu Ala Thr Gln Arg Pro Ser Val Asp Val Ile
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Thr Gly Leu Ile Lys Ala Asn Ile Pro Thr Arg Ile Ala Phe Gln Val
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Ser Ser Lys Ile Asp Ser Arg Thr Ile Leu Asp Gln Met Gly Ala Glu
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Asn Leu Leu Gly Gln Gly Asp Met Leu Phe Leu Pro Pro Gly Thr Ala
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<210> 497
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (125)..(126)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (172)..(909)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 497
atgatttatc aaagaaacct catcaaagaa ctctctttta ccgccgtcgg cattttcgtc 60
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gggcnngtga tcgccatcga tgccgtgttg gcattggtcg gcttctgggt cnnnnnnnnn 180
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 240
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 300
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 360
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 420
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 480
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 540
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 600
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 660
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 720
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 780
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 840
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 900
nnnnnnnnna ttgccatcgg tttgttttta atttaccaaa acgggctgac cctgcttttt 960
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<211> 373
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (42)..(42)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 498
Met Ile Tyr Gln Arg Asn Leu Ile Lys Glu Leu Ser Phe Thr Ala Val
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Gly Ile Phe Val Val Leu Leu Ala Val Leu Val Ser Thr Gln Ala Ile
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Asn Leu Leu Gly Arg Ala Ala Asp Gly Xaa Val Ile Ala Ile Asp Ala
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Val Leu Ala Leu Val Gly Phe Trp Val Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
50 55 60
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
65 70 75 80
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
85 90 95
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
100 105 110
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
115 120 125
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
130 135 140
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
145 150 155 160
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
165 170 175
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
180 185 190
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
195 200 205
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
210 215 220
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
225 230 235 240
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
245 250 255
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
260 265 270
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
275 280 285
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ile
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Ala Ile Gly Leu Phe Leu Ile Tyr Gln Asn Gly Leu Thr Leu Leu Phe
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Glu Ala Val Glu Asp Gly Lys Ile His Phe Trp Leu Gly Leu Leu Pro
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Met His Ile Ile Met Phe Val Leu Ala Leu Ile Leu Leu Arg Val Arg
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Leu Lys Gly Gly Lys
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 500
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130 135 140
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Gly Gly Lys
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<400> 501
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ataccgtggg cagagctacg cagccgcgaa tacgctgaaa tcctgaagca gaagcaggaa 420
ttgtctttgg tggaggcagg cgggttcaac agtttgggca agcgcaacgg cagggtttat 480
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 502
Met Ile Tyr Gln Arg Asn Leu Ile Lys Glu Leu Ser Phe Thr Ala Val
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Gly Ile Phe Val Val Leu Leu Ala Val Leu Val Ser Thr Gln Ala Ile
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Val Ala Val Met Gln Leu Trp Val Ile Pro Trp Ala Glu Leu Arg Ser
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130 135 140
Glu Ala Gly Gly Phe Asn Ser Leu Gly Lys Arg Asn Gly Arg Val Tyr
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Gly Ser Ser Asn Pro Gln His Xaa Ala Glu Leu Met Trp Arg Ile Ser
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Leu Thr Val Ser Val Leu Leu Leu Cys Leu Leu Ala Val Pro Leu Ser
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Gly Leu Phe Leu Ile Tyr Gln Asn Gly Leu Thr Leu Leu Phe Glu Ala
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Ile Ile Met Phe Val Ile Ala Ile Val Leu Leu Arg Val Arg Ser Met
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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Met Ile Tyr Gln Arg Asn Leu Ile Lys Glu Leu Ser Phe Thr Ala Val
1 5 10 15
Gly Ile Phe Val Val Leu Leu Ala Val Leu Val Ser Thr Gln Ala Ile
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Asn Leu Leu Gly Arg Ala Ala Asp Gly Arg Val Ala Ile Asp Ala Val
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Leu Ala Leu Val Gly Phe Trp Val Ile Gly Met Thr Pro Leu Leu Leu
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Leu Arg Glu Gln Asp Lys Asn Gly Gly Asp Asn Ile Ile Phe Ala Lys
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Ile Asp Pro Val Ser His Arg Arg Thr Ile Ser Thr Ala Gln Leu Ile
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Gly Ser Ser Asn Pro Gln His Gln Ala Glu Leu Met Trp Arg Ile Ser
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<212> DNA
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<211> 371
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 506
Met Ile Tyr Gln Arg Asn Leu Ile Lys Glu Leu Ser Phe Thr Ala Val
1 5 10 15
Gly Ile Phe Val Val Leu Leu Ala Val Leu Val Ser Thr Gln Ala Ile
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Asn Leu Leu Gly Arg Ala Ala Asp Gly Arg Val Ala Ile Asp Ala Val
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Ile Ala Val Met Gln Leu Trp Val Ile Pro Trp Ala Glu Leu Arg Ser
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Arg Glu Tyr Ala Glu Ile Leu Lys Gln Lys Gln Glu Leu Ser Leu Val
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Leu Thr Val Ser Val Leu Leu Leu Cys Leu Leu Ala Val Pro Leu Ser
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Ile Ile Met Phe Val Ile Ala Ile Val Leu Leu Arg Val Arg Ser Met
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Pro Ser Gln Pro Phe Trp Gln Ala Val Gly Lys Ser Leu Thr Leu Lys
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Gly Gly Lys
370
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<211> 408
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (118)..(118)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 508
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 509
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<210> 510
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 510
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Ser Val Asn Gln Tyr Ala Gln Phe Asp Val Gly Asn Arg Gly Ala Ile
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Gln Gly Asn Pro Trp Leu Thr Arg Gly Glu Ala Arg Val Val Val Asn
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
<400> 512
Ser Thr Gly His Ser Glu Gln Asn Tyr Thr Leu Pro Arg Glu Ile Thr
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Arg Asn Ile Ser Leu Gly Ser Phe Ala Tyr Glu Ser His Arg Lys Ala
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Thr Asp Pro Arg Phe Ala Asn Tyr Arg Gln Trp Leu Gly Ser Asp Tyr
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Leu Thr Gly His Arg Arg Leu Asp Gly Tyr Gln Asn Asp Glu Glu Gln
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Phe Lys Ala Leu Met Asp Asn Gly Ala Thr Ala Ala Arg Ser Met Asn
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Leu Ser Val Gly Ile Ala Leu Ser Ala Glu Gln Val Ala Gln Leu Thr
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Ser Asp Ile Val Trp Leu Val Gln Lys Glu Val Lys Leu Pro Asp Gly
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Gly Thr Gln Thr Val Leu Val Pro Gln Val Tyr Val Arg Val Lys Asn
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Gly Asp Ile Asp Gly Lys Gly Ala Leu Leu Ser Gly Ser Asn Thr Gln
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Lys Glu Lys Gly Val
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<210> 513
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 513
n 1
<210> 514
<211> 721
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 514
Met Leu Val Gln Thr Glu Lys Asp Gly Leu His Asn Glu Gln Thr Phe
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Gly Glu Lys Lys Val Phe Ser Glu Asn Gly Lys Leu His Asn Tyr Trp
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Arg Ala Arg Arg Lys Gly His Asp Glu Thr Gly His Arg Glu Gln Asn
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Tyr Thr Leu Pro Glu Glu Ile Thr Arg Asp Ile Ser Leu Gly Ser Phe
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Gly Thr Glu Leu Pro Gln Ser Asn Arg Asp Asn Ile Arg Thr Ala Lys
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Pro Gly Ser Ser Leu Tyr Ile Ile Asn Pro Ala Asn Lys Gly Tyr Leu
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Val Glu Thr Asp Pro Arg Phe Ala Asn Tyr Arg Gln Trp Leu Gly Ser
130 135 140
Asp Tyr Met Leu Gly Ser Leu Lys Leu Asp Pro Asn Asn Leu His Lys
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Arg Leu Gly Asp Gly Tyr Tyr Glu Gln Arg Leu Ile Asn Glu Gln Ile
165 170 175
Ala Glu Leu Thr Gly His Arg Arg Leu Asp Gly Tyr Gln Asn Asp Glu
180 185 190
Glu Gln Phe Lys Ala Leu Met Asp Asn Gly Ala Thr Ala Ala Arg Ser
195 200 205
Met Asn Leu Ser Val Gly Ile Ala Leu Ser Ala Glu Gln Ala Ala Gln
210 215 220
Leu Thr Ser Asp Ile Val Trp Leu Val Gln Lys Glu Val Lys Leu Pro
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Asp Gly Gly Thr Gln Thr Val Leu Met Pro Gln Val Tyr Val Arg Val
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Asn Asn Ile Gly Gly Ile Leu Ser Ala Glu Gln Thr Leu Leu Leu Asn
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Ser Gly Ile His Ala Gly Gln Val Asp Asp Ala Ser Lys His Thr Gly
485 490 495
Arg Ser Gly Gly Gly Asn Lys Leu Val Ile Thr Asp Lys Ala Gln Ser
500 505 510
His His Glu Thr Ala Gln Ser Ser Thr Phe Glu Gly Lys Gln Val Val
515 520 525
Leu Gln Ala Gly Asn Asp Ala Asn Ile Leu Gly Ser Asn Val Ile Ser
530 535 540
Asp Asn Gly Thr Arg Ile Gln Ala Gly Asn His Val Arg Ile Gly Thr
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Thr Gln Thr Gln Ser Gln Ser Glu Thr Tyr His Gln Thr Gln Lys Ser
565 570 575
Gly Leu Met Ser Ala Gly Ile Gly Phe Thr Ile Gly Ser Lys Thr Asn
580 585 590
Thr Gln Glu Asn Gln Ser Gln Ser Asn Glu His Thr Gly Ser Thr Val
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acttag 2166
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<211> 721
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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245 250 255
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria meningitidis
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65 70 75 80
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Met Leu Phe Ser Thr Val Thr Leu Gly Ala Ala Ala Val Leu Arg Arg
275 280 285
Asp Thr Phe Arg Thr Pro His Trp Lys Asn His Leu Asn Arg Ser Met
290 295 300
Val Gly Thr Gly Ala Met Leu Leu Leu Phe Tyr Ala Val Thr His Leu
305 310 315 320
Pro Leu Thr Thr Gly Val Thr Leu Ser Tyr Thr Ser Ser Ile Phe Leu
325 330 335
Ala Val Phe Ser Phe Leu Ile Leu Lys Glu Arg Ile Ser Val Tyr Thr
340 345 350
Gln Ala Val Leu Leu Leu Gly Phe Ala Gly Val Val Leu Leu Leu Asn
355 360 365
Pro Ser Phe Arg Ser Gly Gln Glu Pro Ala Ala Leu Ala Gly Leu Ala
370 375 380
Gly Gly Ala Met Ser Gly Trp Ala Tyr Leu Lys Val Arg Glu Leu Ser
385 390 395 400
Leu Ala Gly Glu Pro Gly Trp Arg Val Val Phe Tyr Leu Ser Ala Thr
405 410 415
Gly Val Ala Met Ser Ser Val Trp Ala Thr Leu Thr Gly Trp His Thr
420 425 430
Leu Ser Phe Pro Ser Ala Val Tyr Leu Ser Gly Ile Gly Val Ser Ala
435 440 445
Leu Ile Ala Gln Leu Ser Met Thr Arg Ala Tyr Lys Val Gly Asp Lys
450 455 460
Phe Thr Val Ala Ser Leu Ser Tyr Met Thr Val Val Phe Ser Ala Leu
465 470 475 480
Ser Ala Ala Phe Phe Leu Gly Glu Glu Leu Phe Trp Gln Glu Ile Leu
485 490 495
Gly Met Cys Ile Ile Ile Ser Ala Ala Phe
500 505
<210> 547
<211> 903
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 547
atggataccg caaaaaaaga cattttagga tcgggctgga tgctggtggc ggcggcctgc 60
ttcaccgtta tgaacgtatt gattaaagag gcatcggcaa aatttgccct cggcagcggc 120
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cggcgcgaca ccttccgcac gccccattgg aaaaaccact taaaccgcag tatggtcggg 240
acgggggcga tgctgctgct gttttacgcg gtaacgcatc tgcctttgac aaccggcgtt 300
accctgagtt acacctcgtc gatttttttg gcggtatttt ccttcctgat tttgaaagaa 360
cggatttccg tttacacgca ggcggtgctg ctccttggtt ttgccggcgt ggtattgctg 420
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taa 903
<210> 548
<211> 300
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 548
Met Asp Thr Ala Lys Lys Asp Ile Leu Gly Ser Gly Trp Met Leu Val
1 5 10 15
Ala Ala Ala Cys Phe Thr Val Met Asn Val Leu Ile Lys Glu Ala Ser
20 25 30
Ala Lys Phe Ala Leu Gly Ser Gly Glu Leu Val Phe Trp Arg Met Leu
35 40 45
Phe Ser Thr Val Thr Leu Gly Ala Ala Ala Val Leu Arg Arg Asp Thr
50 55 60
Phe Arg Thr Pro His Trp Lys Asn His Leu Asn Arg Ser Met Val Gly
65 70 75 80
Thr Gly Ala Met Leu Leu Leu Phe Tyr Ala Val Thr His Leu Pro Leu
85 90 95
Thr Thr Gly Val Thr Leu Ser Tyr Thr Ser Ser Ile Phe Leu Ala Val
100 105 110
Phe Ser Phe Leu Ile Leu Lys Glu Arg Ile Ser Val Tyr Thr Gln Ala
115 120 125
Val Leu Leu Leu Gly Phe Ala Gly Val Val Leu Leu Leu Asn Pro Ser
130 135 140
Phe Arg Ser Gly Gln Glu Pro Ala Ala Leu Ala Gly Leu Ala Gly Gly
145 150 155 160
Ala Met Ser Gly Trp Ala Tyr Leu Lys Val Arg Glu Leu Ser Leu Ala
165 170 175
Gly Glu Pro Gly Trp Arg Val Val Phe Tyr Leu Ser Ala Thr Gly Val
180 185 190
Ala Met Ser Ser Val Trp Ala Thr Leu Thr Gly Trp His Thr Leu Ser
195 200 205
Phe Pro Ser Ala Val Tyr Leu Ser Gly Ile Gly Val Ser Ala Leu Ile
210 215 220
Ala Gln Leu Ser Met Thr Arg Ala Tyr Lys Val Gly Asp Lys Phe Thr
225 230 235 240
Val Ala Ser Leu Ser Tyr Met Thr Val Val Phe Ser Ala Leu Ser Ala
245 250 255
Ala Phe Phe Leu Gly Glu Glu Leu Phe Trp Gln Glu Ile Leu Gly Met
260 265 270
Cys Ile Ile Ile Leu Ser Gly Ile Leu Ser Ser Ile Arg Pro Ile Ala
275 280 285
Phe Lys Gln Arg Leu Gln Ala Leu Phe Arg Gln Arg
290 295 300
<210> 549
<211> 706
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 549
atgaagcggc gtatagccgt cttcgtcctg ttcccgcaga taatccgagt tttgggacaa 60
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (115)..(115)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (231)..(232)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 550
Met Lys Arg Arg Ile Ala Val Phe Val Leu Phe Pro Gln Ile Ile Arg
1 5 10 15
Val Leu Gly Gln Leu Leu Pro Lys Ile Val Asn Thr Val Pro Ala His
20 25 30
Arg Met Leu Phe Gln Ile Phe Gly Met Phe Phe Phe Phe Ile His Gln
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Lys Ala Ala Val Gly Asp Ala Val Ala His Glu His Pro Val Ala Asp
85 90 95
Val Val Asn Arg Asn Ala Asn Ala Phe Ala Leu Phe Asp Ile Gly Gln
100 105 110
Phe Ala Xaa Phe Ile Val Gln His Thr Val Asn Ile Lys Thr Val Lys
115 120 125
Ile Asn Ile Val Asp Pro His Met Phe Ala Asn Phe Ala Val Phe Ala
130 135 140
Val Leu Glu Lys Arg Asp Phe Asp His Gly Lys Ile Gln Gly Gly Asn
145 150 155 160
Asn Ala Ala Ala Phe Pro Lys Lys Leu Ala Pro Lys Ile Phe Glu Cys
165 170 175
Phe Thr Gly Ala Phe Val Gly Thr Val Tyr Arg Phe Val Cys Leu Phe
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Tyr Ile Ile Asn Asp Gly Ile Ala His His Ser Ala Pro Gln Arg Val
195 200 205
Arg Tyr Leu Phe Ala Pro Tyr Cys Gly Phe Leu Pro Ser Ala Ser Asp
210 215 220
Ser Asp Leu Lys Ser Ser Xaa Xaa Ser Glu
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
<400> 552
Met Met Lys Arg Arg Ile Ala Val Phe Val Leu Phe Pro Gln Ile Ile
1 5 10 15
Arg Val Leu Gly Gln Leu Leu Pro Lys Ile Val Asn Thr Val Pro Ala
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Gln Gln Tyr Leu Pro Gly Ile Ala Glu Ile Asp Ser Pro Cys Gly Ile
50 55 60
Val Phe Gly Ala Leu Leu Phe Arg His Leu Pro Ala His Cys Leu Tyr
65 70 75 80
Gly Lys Ala Ala Val Gly Asp Ala Val Ala His Glu His Pro Val Ala
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Asp Val Val Asn Arg Asn Ala Asn Ala Phe Ala Leu Phe Asp Ile Gly
100 105 110
Gln Phe Ala Gly Phe Ile Val Gln His Thr Val Asn Ile Lys Thr Val
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Lys Ile Asn Ile Val Asp Pro His Met Phe Ala Asn Phe Ala Val Phe
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Ala Val Leu Glu Lys Arg Asp Phe Asp His Gly Lys Ile Gln Gly Gly
145 150 155 160
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165 170 175
Cys Phe Thr Gly Ala Phe Val Gly Thr Val Tyr Arg Phe Val Cys Leu
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Phe Tyr Ile Ile Asn Asp Gly Ile Ala His His Ser Ala Pro Gln Arg
195 200 205
Val Arg Tyr Leu Phe Ala Pro Tyr Cys Gly Phe Leu Pro Ser Ala Ser
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Asp Ser Asp Leu Lys Ser Ser Lys Tyr Ser Glu
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<210> 553
<211> 708
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
<222> (481)..(482)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 553
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ggtaaagccg ccgtagggaa tgccgttgca cacgaacatc cagtcgctga tgtcgtcaac 300
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ccttcggcat ccgattcgga tttgaaaagt tccaaatatt cggaatag 708
<210> 554
<211> 234
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (195)..(195)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 554
Met Met Lys Arg Arg Ile Ala Val Phe Val Leu Leu Met Gln Lys Ile
1 5 10 15
Arg Ile Leu Gly Gln Leu Leu Pro Lys Ile Val Asn Thr Val Pro Ala
20 25 30
His Arg Met Leu Phe Gln Xaa Phe Gly Met Phe Phe Phe Phe Ile His
35 40 45
Gln Gln Tyr Leu Pro Gly Ile Ala Glu Ile Asp Ser Pro Cys Gly Ile
50 55 60
Val Phe Gly Thr Leu Leu Phe Arg His Xaa Ser Thr His Cys Leu Tyr
65 70 75 80
Gly Lys Ala Ala Val Gly Asn Ala Val Ala His Glu His Pro Val Ala
85 90 95
Asp Val Val Asn Arg Asn Ala Asn Ala Phe Ala Leu Phe Asp Ile Gly
100 105 110
Gln Phe Ala Gly Phe Ile Val Gln His Ala Ile Asn Val Lys Thr Val
115 120 125
Lys Ile Asn Ile Val Asp Pro His Met Phe Ala Asn Phe Ala Xaa Phe
130 135 140
Ala Val Leu Glu Lys Arg Ala Leu Thr Met Ala Lys Ser Lys Xaa Xaa
145 150 155 160
Xaa Met Arg Arg Arg Ser Gln Lys Ser Ser Arg Gln Lys Tyr Leu Asn
165 170 175
Val Leu Arg Ala Arg Ser Pro Ala Arg Phe Thr Gly Leu Ser Ala Cys
180 185 190
Ser Thr Xaa Met Thr Glu Ser Pro Ile Ile Ser Ala Pro Gln Arg Val
195 200 205
Arg Tyr Leu Phe Ala Pro Tyr Cys Gly Phe Leu Pro Ser Ala Ser Asp
210 215 220
Ser Asp Leu Lys Ser Ser Lys Tyr Ser Glu
225 230
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<211> 708
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 555
atgatgaagc ggcgtatagc cgtcttcgtc ctgctcatgc agaaaatccg gattttggga 60
caactgttgc cgaaaatcgt caatacagtt ccggcacatc ggatgctctt ccaaattttc 120
gggatgttct ttttcttcat acaccggcaa tacctgcccg ggatcgccga aatcgattcc 180
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cctccggcat ccgattcgga tttgaaaagt tccaaatatt cggaatag 708
<210> 556
<211> 235
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 556
Met Met Lys Arg Arg Ile Ala Val Phe Val Leu Leu Met Gln Lys Ile
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Arg Ile Leu Gly Gln Leu Leu Pro Lys Ile Val Asn Thr Val Pro Ala
20 25 30
His Arg Met Leu Phe Gln Ile Phe Gly Met Phe Phe Phe Phe Ile His
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Arg Gln Tyr Leu Pro Gly Ile Ala Glu Ile Asp Ser Pro Gly Gly Ile
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Val Phe Gly Thr Leu Leu Phe Arg His Leu Ser Ala His Cys Leu Tyr
65 70 75 80
Gly Lys Ala Ala Val Gly Asp Ala Val Ala His Glu His Pro Val Ala
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Asp Val Ala Asn Arg Asn Ala Asn Ala Phe Ala Leu Phe Asp Ile Gly
100 105 110
Gln Ser Ala Gly Phe Ile Val Gln His Thr Val Asn Ile Lys Thr Val
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Lys Ile Asn Ile Val Asp Pro His Met Phe Ala Asn Phe Ala Val Phe
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Ala Val Leu Glu Lys Arg Asp Phe Asp His Gly Lys Ile Gln Gly Gly
145 150 155 160
Asn Asn Ala Ala Ala Phe Pro Lys Lys Leu Ala Pro Lys Val Phe Glu
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Cys Phe Thr Gly Ala Phe Ala Gly Thr Val Tyr Arg Phe Val Cys Leu
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Phe Tyr Ile Ile Asn Asp Gly Ile Ala His His Thr Ala Pro Gln Arg
195 200 205
Val Arg Tyr Leu Phe Ala Pro Tyr Arg Gly Phe Leu Pro Pro Ala Ser
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Asp Ser Asp Leu Lys Ser Ser Lys Tyr Ser Glu
225 230 235
<210> 557
<211> 447
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (73)..(73)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 557
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<211> 149
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (25)..(25)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 558
Met Glu Asn Met Val Thr Phe Ser Lys Ile Arg Pro Leu Leu Ala Ile
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Ala Ala Ala Ala Leu Leu Ala Ala Xaa Arg Thr Ala Gly Asn Asn Ala
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Val Arg Lys Pro Val Gln Thr Ala Lys Pro Ala Ala Val Val Gly Leu
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Ala Leu Gly Gly Gly Ala Ser Lys Gly Phe Ala His Val Gly Ile Ile
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Lys Val Leu Lys Glu Asn Gly Ile Pro Val Lys Val Val Thr Gly Thr
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Ser Ala Gly Ser Ile Val Gly Asn Leu Phe Ala Ser Gly Met Ser Pro
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Asp Arg Leu Glu Leu Glu Ala Glu Ile Leu Gly Lys Thr Asp Leu Val
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Asp Leu Thr Leu Ser Thr Asn Gly Phe Ile Lys Gly Ala Lys Leu Gln
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Asn Tyr Ile Asn Arg Lys Leu Arg Gly Met Gln Ile Gln Gln Phe Pro
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Ile Lys Phe Ala Ala
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<210> 559
<211> 903
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 559
atggaaaata tggtaacgtt ttcaaaaatc agaccgcttt tggcaatcgc cgccgccgcg 60
ttgcttgccg cctgcggcac ggcgggaaat aatgctgtcc gcaagccggt gcaaaccgcc 120
aaacccgccg cagtggtcgg tttggcactc ggtggcggcg catctaaagg atttgcccat 180
gtaggtatta ttaaggtttt gaaagaaaac ggtattcctg tgaaggtggt taccggcaca 240
tcggcaggtt cgattgtcgg cagccttttt gcatcgggta tgtcgcccga ccgcctcgaa 300
ttggaagccg aaattttagg caaaaccgat ttggtcgatt taaccttgtc caccagtggt 360
tttatcaaag gcgaaaagct gcaaaattac atcaaccgaa aagtcggcgg caggcagatt 420
cagcagtttc ccatcaaatt tgccgccgtt gctactgatt ttgaaaccgg caaggccgtc 480
gctttcaatc aggggaatgc cgggcaggct gtgcgcgctt ccgccgccat tcccaatgtg 540
ttccaacccg ttatcatcgg caggcataca tatgttgacg gcggtctgtc gcagcccgtg 600
cccgtcagtg ccgcccggcg gcagggggcg aatttcgtga ttgccgtcga tatttccgcc 660
cgtccgggca aaaacatcag ccaaggtttc ttctcttatc tcgatcagac gctgaacgta 720
atgagcgttt ctgcgttgca aaatgagttg gggcaggcgg atgtggttat caaaccgcag 780
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gaggaggcag cacgtgccgc attgcctgaa atcaaacgca aactggcggc ataccgttat 900
tga 903
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 560
Met Glu Asn Met Val Thr Phe Ser Lys Ile Arg Pro Leu Leu Ala Ile
1 5 10 15
Ala Ala Ala Ala Leu Leu Ala Ala Cys Gly Thr Ala Gly Asn Asn Ala
20 25 30
Val Arg Lys Pro Val Gln Thr Ala Lys Pro Ala Ala Val Val Gly Leu
35 40 45
Ala Leu Gly Gly Gly Ala Ser Lys Gly Phe Ala His Val Gly Ile Ile
50 55 60
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130 135 140
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145 150 155 160
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Ile Lys Pro Gln Val Leu Asp Leu Gly Ala Val Gly Gly Phe Asp Gln
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Lys Lys Arg Ala Ile Arg Leu Gly Glu Glu Ala Ala Arg Ala Ala Leu
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (60)..(60)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 594
Asp Phe Gly Ile Ser Pro Val Tyr Leu Trp Val Ala Ala Ala Phe Lys
1 5 10 15
His Leu Leu Ser Pro Trp Ala Ala Asp Ser Tyr Asp Val Ala Arg Phe
20 25 30
Ala Gly Val Phe Phe Ala Val Ile Gly Leu Thr Ser Cys Gly Phe Ala
35 40 45
Gly Phe Asn Phe Leu Gly Arg His His Gly Arg Xaa Val Val Leu Ile
50 55 60
Leu Ile Gly Cys Ile Gly Leu Ile Pro Val Ala His Phe Leu Asn Pro
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Ala Ala Ala Ala Phe Ala Ala Ala Gly Leu Val Leu His Gly Tyr Ser
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Leu Ala Arg Arg Arg Val Ile Ala Ala Ser Phe Leu Leu Gly Thr Gly
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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Ala Ala Ala Phe Lys His Leu Leu Ser Pro Trp Ala Ala Asp Ser Tyr
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Ser Val Val Leu Ile Leu Ile Gly Cys Ile Gly Leu Ile Pro Val Ala
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<400> 598
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180 185 190
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195 200 205
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245 250 255
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Cys Ile Gly Ile Gly Gly Gly Asp Leu His Thr Arg Ile Val Trp Thr
485 490 495
Gln Tyr Gly Thr Leu Pro His Arg Val Gly Asp Val Arg Cys Arg Tyr
500 505 510
Arg Ile Val Arg Leu Pro Gln Asn Ala Asp Ala Pro Gln Gly Trp Gln
515 520 525
Thr Val Trp Gln Gly Ala Arg Pro Arg Asn Lys Asp Ser Lys Phe Ala
530 535 540
Leu Ile Arg Lys Ile Gly Glu Asn Ile Leu Lys Thr Thr Asp
545 550 555
<210> 603
<211> 180
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 603
caatccgcca aatggttatc gggccaaact ctagtcggca cagcaattgg gatacgcggg 60
cagataaagc ttggcggcaa cctgcattac gatatattta ccggccgcgc attgaaaaag 120
cccgaatttt tccaatcaag gaaatgggca agcggttttc aggtaggcta tacgttttaa 180
<210> 604
<211> 59
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 604
Gln Ser Ala Lys Trp Leu Ser Gly Gln Thr Leu Val Gly Thr Ala Ile
1 5 10 15
Gly Ile Arg Gly Gln Ile Lys Leu Gly Gly Asn Leu His Tyr Asp Ile
20 25 30
Phe Thr Gly Arg Ala Leu Lys Lys Pro Glu Phe Phe Gln Ser Arg Lys
35 40 45
Trp Ala Ser Gly Phe Gln Val Gly Tyr Thr Phe
50 55
<210> 605
<211> 1028
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 605
atggataatt cgggtagtga ggcgacagga aaataccaag gaaatatcac tttctctgcc 60
gacaatcctt tgggactgag tgatatgttc tatgtaaatt atggacgttc gattggcggt 120
acgcccgatg aggaaagttt tgacggccat cgcaaagaag gcggatcaaa caattacgcc 180
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actgatttcg gcttcaaccg cctgttgtat cgtgatgcca aacgcaaaac ctatctcggt 360
gtaaaactgt ggatgaggga aacaaaaagt tacattgatg atgccgaact gactgtacaa 420
cggcgtaaaa cgcgggttgg ttggcagaac tttcccacaa agaatatatc ggtcgcagta 480
cggcagattt taagttgaaa tataaacgcg gcaccggcat gaaagatgct ctgcgcgcgc 540
ctgaagaagc ctttggcgaa ggcacgtcac gtatgaaaat ttggacggca tcggctgatg 600
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cgttttaa 1028
<210> 606
<211> 342
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 606
Met Asp Asn Ser Gly Ser Glu Ala Thr Gly Lys Tyr Gln Gly Asn Ile
1 5 10 15
Thr Phe Ser Ala Asp Asn Pro Leu Gly Leu Ser Asp Met Phe Tyr Val
20 25 30
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35 40 45
Gly His Arg Lys Glu Gly Gly Ser Asn Asn Tyr Ala Val His Tyr Ser
50 55 60
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65 70 75 80
Tyr His Gln Ala Val Ser Gly Leu Ser Glu Val Tyr Asp Tyr Asn Gly
85 90 95
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100 105 110
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115 120 125
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145 150 155 160
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180 185 190
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195 200 205
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Val Arg Gly Phe Asp Gly Glu Met Ser Leu Ser Ala Glu Arg Gly Trp
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Tyr Trp Arg Asn Asp Leu Ser Trp Gln Phe Lys Pro Gly His Gln Leu
260 265 270
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<212> DNA
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<210> 608
<211> 342
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 608
Met Asp Asn Ser Gly Ser Glu Ala Thr Gly Lys Tyr Gln Gly Asn Ile
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180 185 190
Lys Ile Trp Thr Ala Ser Ala Asp Val Asn Thr Pro Phe Gln Ile Gly
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<213> Neisseria meningitidis
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 611
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<213> Neisseria meningitidis
<400> 612
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130 135 140
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<210> 613
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<213> Neisseria meningitidis
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<220>
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<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (221)..(221)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 614
Met Glu Ser Thr Xaa Ser Leu Gln Ala Asn Leu Tyr Xaa Arg Leu Thr
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Pro Ala Gly Ala Phe Tyr Ala Val Ser Ser Asp Xaa Pro Ser Ala Gly
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Trp Gly Val Cys Asp Pro Ser Gly Gln Ser Glu Leu Thr Phe Phe Pro
165 170 175
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<210> 615
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<220>
<221> misc_feature
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<400> 615
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 616
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115 120 125
Leu Thr Phe Phe Pro Leu Tyr Ile Gly Ser Thr Lys Phe Ile Leu Val
130 135 140
Ile Ala Gly Ile Pro Asp Leu Ser Lys Gly Gly Ile Cys Tyr Phe Gly
145 150 155 160
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165 170 175
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Asn Thr Ser Thr Asp Ile Ile Ala Ser Ala Val Ile Ser Thr Asp Gly
195 200 205
Leu Pro Met Ala Thr Met Leu Pro Ser His Leu Asn Ser Asp Arg Val
210 215 220
Gly Ala Ile Ser Ala Thr Leu Leu Ala Leu Gly Ser Arg Ser Val Gln
225 230 235 240
Glu Leu Ala Cys Gly Glu Leu Glu Gln Val Met Ile Lys Gly Lys Ser
245 250 255
Gly Tyr Ile Leu Leu Ser Gln Ala Gly Lys Asp Ala Val Leu Val Leu
260 265 270
Val Ala Lys Glu Thr Gly Arg Leu Gly Leu Ile Leu Leu Asp Ala Lys
275 280 285
Arg Ala Ala Arg His Ile Ala Glu Ala Ile
290 295
<210> 617
<211> 642
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 617
atggaatcaa cactttcact acaagcgaat ttatatccct gcctgactcc tgccggtgca 60
ttttatgccg tatccagcga tgcccccagt gccggtaaaa ctttgttgcg cagcctgttg 120
aaagcggatg cggacgaagt ggtcagcagt gagaagctgc tcgcggcgga caccgccgac 180
atcgataccg ctttgaacct gttgtaccgt ttgcaaaaac tcgaattcct ctatggcgat 240
gaaaacggtc attcagacgg catcaatttg tcggacgagc aattgccgtt gctgatggaa 300
caattgtccg gcagcggtaa ggcattattg gtcgatcgga acggtctgta tcttgccaac 360
gccaatttcc atcatgagtc ggcggaagag ttggggttgt tggcggcaga agtcgcacag 420
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 618
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Leu Leu Met Glu Gln Leu Ser Gly Ser Gly Lys Ala Leu Leu Val Asp
100 105 110
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115 120 125
Glu Glu Leu Gly Leu Leu Ala Ala Glu Val Ala Gln Met Glu Lys Lys
130 135 140
Tyr Arg Leu Leu Ile Arg Asn Asn Leu Tyr Ile Asn Asn Asn Ala Trp
145 150 155 160
Gly Val Cys Asp Pro Ser Gly Gln Ser Glu Leu Thr Phe Phe Pro Leu
165 170 175
Tyr Ile Gly Ser Thr Lys Phe Ile Leu Val Ile Ala Gly Ile Pro Asp
180 185 190
Leu Ser Lys Glu Ala Phe Val Thr Leu Val Arg Ile Leu Tyr Arg Arg
195 200 205
Tyr Ser Asn Arg Val
210
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 620
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1 5 10 15
Ala Phe Ala Trp Phe Val Val Arg Arg Phe Asp Glu Glu Arg Val Pro
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 622
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1 5 10 15
Ala Phe Ala Trp Phe Val Val Arg Arg Phe Asp Glu Glu Arg Val Pro
20 25 30
Gln Ala Ala Ala Ser Met Thr Phe Thr Thr Leu Leu Ala Leu Val Pro
35 40 45
Val Leu Thr Val Met Val Ala Val Ala Ser Ile Phe Pro Val Phe Asp
50 55 60
Arg Trp Ser Asp Ser Phe Val Ser Phe Val Asn Gln Thr Ile Val Pro
65 70 75 80
Gln Gly Ala Asp Met Val Phe Asp Tyr Ile Asn Ala Phe Arg Glu Gln
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Ala Asn Arg Leu Thr Ala Ile Gly Ser Val Met Leu Val Val Thr Ser
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Leu Met Leu Ile Arg Thr Ile Asp Asn Thr Phe Asn Arg Ile Trp Arg
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Val Asn Ser Gln Arg Pro Trp Met Met Gln Phe Leu Val Tyr Trp Ala
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Leu Leu Thr Phe Gly Pro Leu Ser Leu Gly Val Gly Ile Ser Phe Met
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Val Gly Ser Val Gln Asp Ala Ala Leu Ala Ser Gly Ala Pro Gln Trp
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Ile Tyr Gly Ala Phe Ala Ala Val Pro Phe Phe Leu Leu Trp Leu Asn
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Leu Leu Trp Thr Leu Val Leu Gly Gly Ala Val Leu Thr Ser Ser Leu
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<221> misc_feature
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<400> 625
n 1
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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Gln Gly Ala Asp Met Val Phe Asp Tyr Ile Asp Ala Phe Arg Asp Gln
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Ala Gly Val Ala Glu Ser Asp Phe Tyr Phe Asn Gly Phe Val Pro Pro
145 150 155 160
Lys Ser Gly Glu Arg Arg Lys Leu Phe Ala Lys Trp Val Arg Ala Ala
165 170 175
Phe Pro Val Val Met Phe Glu Thr Pro His Arg Ile Gly Ala Thr Leu
180 185 190
Ala Asp Met Ala Glu Leu Phe Pro Glu Arg Arg Leu Met Leu Ala Arg
195 200 205
Glu Ile Thr Lys Thr Phe Glu Thr Phe Leu Ser Gly Thr Val Gly Glu
210 215 220
Ile Gln Thr Ala Leu Ala Ala Asp Gly Asn Gln Ser Arg Gly Glu Met
225 230 235 240
Val Leu Val Leu Tyr Pro Ala Gln Asp Glu Lys His Glu Gly Leu Ser
245 250 255
Glu Ser Ala Gln Asn Ala Met Lys Ile Leu Ala Ala Glu Leu Pro Thr
260 265 270
Lys Gln Ala Ala Glu Leu Ala Ala Lys Ile Thr Gly Glu Gly Lys Lys
275 280 285
Ala Leu Tyr Asp Leu Ala Leu Ser Trp Lys Asn Lys
290 295 300
<210> 645
<211> 876
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 645
atgtttcaga aacacttgca gaaagcctcc gacagcgtcg tcggagggac attatacgtg 60
gttgccacgc ccatcggcaa tttggcagac attaccctgc gcgctttggc ggtattgcaa 120
aaggcggaca tcatttgtgc cgaagacacg cgcgttactg cgcagctttt gagcgcgtac 180
ggcattcagg gcaggttggt cagtgtgcgc gaacacaacg agcggcagat ggcggacaag 240
gtaatcggtt tcctttcaga cggcctggtt gtggcgcagg tttccgatgc gggtacgccg 300
gccgtgtgcg acccgggcgc gaaactcgcc cgccgcgtgc gcgaagcagg gttcaaagtc 360
gttcccgtcg tgggcgcaag cgcggtaatg gcggcgttga gtgtggccgg tgtggcggaa 420
tccgattttt atttcaacgg ttttgtaccg ccgaaatcgg gcgaacgtag gaaattgttt 480
gccaaatggg tgcgggcggc atttcctgtc gtcatgtttg aaacgccgca ccgaatcggg 540
gcaacgcttg ccgatatggc ggaattgttc cccgaacgcc gtctgatgct ggcgcgcgaa 600
atcacgaaaa cgtttgaaac gttcttaagc ggcacggttg gggaaattca gacggcattg 660
gcggcggacg gcaaccaatc gcgcggcgag atggtgttgg tgctttatcc ggcgcaggat 720
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ctgccgacca agcaggcggc ggagcttgcc gccaagatta caggtgaggg caaaaaggct 840
ttgtacgatt tggcactgtc gtggaaaaac aaatga 876
<210> 646
<211> 291
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 646
Met Phe Gln Lys His Leu Gln Lys Ala Ser Asp Ser Val Val Gly Gly
1 5 10 15
Thr Leu Tyr Val Val Ala Thr Pro Ile Gly Asn Leu Ala Asp Ile Thr
20 25 30
Leu Arg Ala Leu Ala Val Leu Gln Lys Ala Asp Ile Ile Cys Ala Glu
35 40 45
Asp Thr Arg Val Thr Ala Gln Leu Leu Ser Ala Tyr Gly Ile Gln Gly
50 55 60
Arg Leu Val Ser Val Arg Glu His Asn Glu Arg Gln Met Ala Asp Lys
65 70 75 80
Val Ile Gly Phe Leu Ser Asp Gly Leu Val Val Ala Gln Val Ser Asp
85 90 95
Ala Gly Thr Pro Ala Val Cys Asp Pro Gly Ala Lys Leu Ala Arg Arg
100 105 110
Val Arg Glu Ala Gly Phe Lys Val Val Pro Val Val Gly Ala Ser Ala
115 120 125
Val Met Ala Ala Leu Ser Val Ala Gly Val Ala Glu Ser Asp Phe Tyr
130 135 140
Phe Asn Gly Phe Val Pro Pro Lys Ser Gly Glu Arg Arg Lys Leu Phe
145 150 155 160
Ala Lys Trp Val Arg Ala Ala Phe Pro Val Val Met Phe Glu Thr Pro
165 170 175
His Arg Ile Gly Ala Thr Leu Ala Asp Met Ala Glu Leu Phe Pro Glu
180 185 190
Arg Arg Leu Met Leu Ala Arg Glu Ile Thr Lys Thr Phe Glu Thr Phe
195 200 205
Leu Ser Gly Thr Val Gly Glu Ile Gln Thr Ala Leu Ala Ala Asp Gly
210 215 220
Asn Gln Ser Arg Gly Glu Met Val Leu Val Leu Tyr Pro Ala Gln Asp
225 230 235 240
Glu Lys His Glu Gly Leu Ser Glu Ser Ala Gln Asn Ala Met Lys Ile
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Leu Ala Ala Glu Leu Pro Thr Lys Gln Ala Ala Glu Leu Ala Ala Lys
260 265 270
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Lys Asn Lys
290
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<223> n is a, c, g, or t
<400> 647
atgaaaacaa ccgacaaacg gacaaccgaa acacaccgca aagccccgaa aaccggtcgc 60
atccgcttct cngctgctta cttagccata tgcctgtcgt tcggcattct tccccaagcc 120
tgggcgggac acacttattt cggcatcaac taccaatact atcgcgactt tgccgaaaat 180
aaaggcaagt ttgcagtcgg ggcgaaagat attgaggttt acaacaaaaa aggggagttg 240
gtcggcaaat caatgacaaa agccccgatg attgattttt ctgtggtgtc gcgtaacggc 300
gtggcggcat tggtgggcgt atcaatatat tgtgagcgtg gcacataacg gcggctataa 360
caacgttgat tttggtgcgg aaggaaknaa tatcccngat caacawcgww ttacttataa 420
aattgtgaaa cggaataatt ataaagcagg gactaaaggc catccttatg gcggcgatta 480
tcatatgccg cgtttgcata aatwtgtcac agatgcagaa cctgttgaaa tgaccagtta 540
tatggatggg cggaaatata tcgatcaaaa taattaccct gaccgtgttc gtattggggc 600
aggcaggcaa tattggcgat ctgatgaaga tgagcccaat aaccgcgaaa gttcatatca 660
tattgcaagt nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnggctc 720
accaatgttt atctatgatg cccaaaagca aaagtggtta attaatgggg tattgcaaac 780
gggcaacccc tatataggaa aaagcaatgg cttccagctg gttcgtaaag attggttcta 840
tgatgaaatc tttgctggag atacccattc agtattctac gaaccacgtc aaaatgggaa 900
atactctttt aacgacgata ataatggcac aggaaaaatc aatgccaaac atgaacacaa 960
ttctctgcct aatagattaa aaacacgaac cgttcaattg tttaatgttt ctttatccga 1020
gacagcaaga gaacctgttt atcatgctgc aggtggtgtc aacagttatc gacccagact 1080
gaataatgga gaaaatattt cctttattga cgaaggaaaa ggcgaattga tacttaccag 1140
caacatcaat caaggtgctg gaggattata tttccaagga gattttacgg tctcgcctga 1200
aaataacgaa acttggcaag gcgcgggcgt tcatatcagt gaagacagta ccgttacttg 1260
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1380
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1440
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1500
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1620
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1680
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1740
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1800
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1860
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1920
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 1980
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2040
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 2100
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnngataaag tgactgcttc 2160
attgactaag accgacatca gcggcaatgt cgatcttgcc gatcacgctc atttaaatct 2220
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3180
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3240
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3300
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3360
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3420
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3480
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 3540
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnttagac cgcgtatttg ccgaagaccg 3600
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cggcaactcg gcacggcttg cccacggcgc cgttttcggg caatacggca tcgacaggtt 3840
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gagsmaaawt ccgccgccgc gtgctgcatt acggcattca ggcacgatac cgcgccggtt 3960
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<220>
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 648
Met Lys Thr Thr Asp Lys Arg Thr Thr Glu Thr His Arg Lys Ala Pro
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Lys Thr Gly Arg Ile Arg Phe Xaa Ala Ala Tyr Leu Ala Ile Cys Leu
20 25 30
Ser Phe Gly Ile Leu Pro Gln Ala Trp Ala Gly His Thr Tyr Phe Gly
35 40 45
Ile Asn Tyr Gln Tyr Tyr Arg Asp Phe Ala Glu Asn Lys Gly Lys Phe
50 55 60
Ala Val Gly Ala Lys Asp Ile Glu Val Tyr Asn Lys Lys Gly Glu Leu
65 70 75 80
Val Gly Lys Ser Met Thr Lys Ala Pro Met Ile Asp Phe Ser Val Val
85 90 95
Ser Arg Asn Gly Val Ala Ala Leu Val Gly Val Gln Tyr Ile Val Ser
100 105 110
Val Ala His Asn Gly Gly Tyr Asn Asn Val Asp Phe Gly Ala Glu Gly
115 120 125
Xaa Asn Ile Xaa Asp Gln Xaa Arg Xaa Thr Tyr Lys Ile Val Lys Arg
130 135 140
Asn Asn Tyr Lys Ala Gly Thr Lys Gly His Pro Tyr Gly Gly Asp Tyr
145 150 155 160
His Met Pro Arg Leu His Lys Xaa Val Thr Asp Ala Glu Pro Val Glu
165 170 175
Met Thr Ser Tyr Met Asp Gly Arg Lys Tyr Ile Asp Gln Asn Asn Tyr
180 185 190
Pro Asp Arg Val Arg Ile Gly Ala Gly Arg Gln Tyr Trp Arg Ser Asp
195 200 205
Glu Asp Glu Pro Asn Asn Arg Glu Ser Ser Tyr His Ile Ala Ser Xaa
210 215 220
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Ser
225 230 235 240
Pro Met Phe Ile Tyr Asp Ala Gln Lys Gln Lys Trp Leu Ile Asn Gly
245 250 255
Val Leu Gln Thr Gly Asn Pro Tyr Ile Gly Lys Ser Asn Gly Phe Gln
260 265 270
Leu Val Arg Lys Asp Trp Phe Tyr Asp Glu Ile Phe Ala Gly Asp Thr
275 280 285
His Ser Val Phe Tyr Glu Pro Arg Gln Asn Gly Lys Tyr Ser Phe Asn
290 295 300
Asp Asp Asn Asn Gly Thr Gly Lys Ile Asn Ala Lys His Glu His Asn
305 310 315 320
Ser Leu Pro Asn Arg Leu Lys Thr Arg Thr Val Gln Leu Phe Asn Val
325 330 335
Ser Leu Ser Glu Thr Ala Arg Glu Pro Val Tyr His Ala Ala Gly Gly
340 345 350
Val Asn Ser Tyr Arg Pro Arg Leu Asn Asn Gly Glu Asn Ile Ser Phe
355 360 365
Ile Asp Glu Gly Lys Gly Glu Leu Ile Leu Thr Ser Asn Ile Asn Gln
370 375 380
Gly Ala Gly Gly Leu Tyr Phe Gln Gly Asp Phe Thr Val Ser Pro Glu
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Asn Asn Glu Thr Trp Gln Gly Ala Gly Val His Ile Ser Glu Asp Ser
405 410 415
Thr Val Thr Trp Lys Val Asn Gly Val Ala Asn Asp Arg Leu Ser Lys
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Ile Gly Lys Gly Thr Leu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
435 440 445
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
450 455 460
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
465 470 475 480
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
485 490 495
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
500 505 510
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp Lys Val Thr Ala Ser
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Leu Thr Lys Thr Asp Ile Ser Gly Asn Val Asp Leu Ala Asp His Ala
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Lys Ala Val Phe His Phe Glu Ser Ser Arg Phe Thr Gly Gln Ile Ser
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Gly Gly Lys Asp Thr Ala Leu His Leu Lys Asp Ser Glu Trp Thr Leu
850 855 860
Pro Ser Gly Xaa Glu Leu Gly Asn Leu Asn Leu Asp Asn Ala Thr Ile
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885 890 895
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Leu Leu Xaa Val Thr Pro Pro Thr Ser Val Glu Ser Arg Phe Asn Thr
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Leu Thr Val Asn Gly Lys Leu Asn Gly Gln Gly Thr Phe Arg Phe Met
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Ser Glu Leu Phe Gly Tyr Arg Ser Asp Lys Leu Lys Leu Ala Glu Ser
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Ser Glu Gly Thr Tyr Thr Leu Ala Val Asn Asn Thr Gly Asn Glu Pro
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Leu Ser Glu Asn Leu Asn Phe Thr Leu Gln Asn Glu His Val Asp Ala
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Gly Ala Trp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1010 1015 1020
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1115 1120 1125
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1175 1180 1185
Xaa Xaa Xaa Leu Asp Arg Val Phe Ala Glu Asp Arg Arg Asn Ala
1190 1195 1200
Val Trp Thr Ser Gly Ile Arg Asp Thr Lys His Tyr Arg Ser Gln
1205 1210 1215
Asp Phe Arg Ala Tyr Arg Gln Gln Thr Asp Leu Arg Gln Ile Gly
1220 1225 1230
Met Gln Lys Asn Leu Gly Ser Gly Arg Val Gly Ile Leu Phe Ser
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His Asn Arg Thr Glu Asn Thr Phe Asp Asp Gly Ile Gly Asn Ser
1250 1255 1260
Ala Arg Leu Ala His Gly Ala Val Phe Gly Gln Tyr Gly Ile Asp
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Arg Phe Tyr Ile Gly Ile Ser Ala Gly Ala Gly Phe Ser Ser Gly
1280 1285 1290
Ser Leu Ser Asp Gly Ile Gly Xaa Lys Xaa Arg Arg Arg Val Leu
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His Tyr Gly Ile Gln Ala Arg Tyr Arg Ala Gly Phe Gly Gly Phe
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Gly Ile Glu Pro His Ile Gly Ala Thr Arg Tyr Phe Val Gln Lys
1325 1330 1335
Ala Asp Tyr Arg Tyr Glu Asn Val Asn Ile Ala Thr Pro Gly Leu
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Ala Phe Asn Arg Tyr Arg Ala Gly Ile Lys Ala Asp Tyr Ser Phe
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Lys Pro Ala Gln His Ile Ser Ile Thr Pro Tyr Leu Ser Leu Ser
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Ala Val Leu Ala Gln Asp Phe Gly Lys Thr Arg Ser Ala Glu Trp
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Gly Val Asn Ala Glu Ile Lys Gly Phe Thr Leu Ser Leu His Ala
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Ala Ala Ala Lys Gly Pro Gln Leu Glu Ala Gln His Ser Ala Gly
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Ile Lys Leu Gly Tyr Arg Trp
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 649
atgaaaacaa ccgacaaacg gacaaccgaa acacaccgca aagccccgaa aaccggccgc 60
atccgcttct cgcctgctta cttagccata tgcctgtcgt tcggcattct tccccaagcc 120
tgggcgggac acacttattt cggcatcaac taccaatact atcgcgactt tgccgaaaat 180
aaaggcaagt ttgcagtcgg ggcgaaagat attgaggttt acaacaaaaa aggggagttg 240
gtcggcaaat caatgacaaa agccccgatg attgattttt ctgtggtgtc gcgtaacggc 300
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aacgttgatt ttggtgcgga aggaagaaat cccgatcaac atcgttttac ttataaaatt 420
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gatgggcgga aatatatcga tcaaaataat taccctgacc gtgttcgtat tggggcaggc 600
aggcaatatt ggcgatctga tgaagatgag cccaataacc gcgaaagttc atatcatatt 660
gcaagtgcgt attcttggct cgttggtggc aatacctttg cacaaaatgg atcaggtggt 720
ggcacagtca acttaggtag tgaaaaaatt aaacatagcc catatggttt tttaccaaca 780
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cagctggttc gtaaagattg gttctatgat gaaatctttg ctggagatac ccattcagta 960
ttctacgaac cacgtcaaaa tgggaaatac tcttttaacg acgataataa tggcacagga 1020
aaaatcaatg ccaaacatga acacaattct ctgcctaata gattaaaaac acgaaccgtt 1080
caattgttta atgtttcttt atccgagaca gcaagagaac ctgtttatca tgctgcaggt 1140
ggtgtcaaca gttatcgacc cagactgaat aatggagaaa atatttcctt tattgacgaa 1200
ggaaaaggcg aattgatact taccagcaac atcaatcaag gtgctggagg attatatttc 1260
caaggagatt ttacggtctc gcctgaaaat aacgaaactt ggcaaggcgc gggcgttcat 1320
atcagtgaag acagtaccgt tacttggaaa gtaaacggcg tggcaaacga ccgcctgtcc 1380
aaaatcggca aaggcacgct gcacgttcaa gccaaagggg aaaaccaagg ctcgatcagc 1440
gtgggcgacg gtacagtcat tttggatcag caggcagacg ataaaggcaa aaaacaagcc 1500
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ttcaaccccg acaaactcta tttcggcttt cgcggcggac gtttggattt aaacgggcat 1620
tcgctttcgt tccaccgtat tcaaaatacc gatgaagggg cgatgattgt caaccacaat 1680
caagacaaag aatccaccgt taccattaca ggcaataaag atattgctac aaccggcaat 1740
aacaacagct tggatagcaa aaaagaaatt gcctacaacg gttggtttgg cgagaaagat 1800
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ctgctgcttt ccggcggaac aaatttaaac ggcaacatca cgcaaacaaa cggcaaactg 1920
tttttcagcg gcagaccaac accgcacgcc tacaatcatt taaacgacca ttggtcgcaa 1980
aaagagggca ttcctcgcgg ggaaatcgtg tgggacaacg actggatcaa ccgcacattt 2040
aaagcggaaa acttccaaat taaaggcgga caggcggtgg tttcccgcaa tgttgccaaa 2100
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Met Lys Thr Thr Asp Lys Arg Thr Thr Glu Thr His Arg Lys Ala Pro
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Lys Thr Gly Arg Ile Arg Phe Ser Pro Ala Tyr Leu Ala Ile Cys Leu
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Ser Phe Gly Ile Leu Pro Gln Ala Trp Ala Gly His Thr Tyr Phe Gly
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Ile Asn Tyr Gln Tyr Tyr Arg Asp Phe Ala Glu Asn Lys Gly Lys Phe
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Ala Val Gly Ala Lys Asp Ile Glu Val Tyr Asn Lys Lys Gly Glu Leu
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Val Gly Lys Ser Met Thr Lys Ala Pro Met Ile Asp Phe Ser Val Val
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Ser Arg Asn Gly Val Ala Ala Leu Val Gly Asp Gln Tyr Ile Val Ser
100 105 110
Val Ala His Asn Gly Gly Tyr Asn Asn Val Asp Phe Gly Ala Glu Gly
115 120 125
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Asn Tyr Lys Ala Gly Thr Lys Gly His Pro Tyr Gly Gly Asp Tyr His
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Met Pro Arg Leu His Lys Phe Val Thr Asp Ala Glu Pro Val Glu Met
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Thr Ser Tyr Met Asp Gly Arg Lys Tyr Ile Asp Gln Asn Asn Tyr Pro
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Asp Arg Val Arg Ile Gly Ala Gly Arg Gln Tyr Trp Arg Ser Asp Glu
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Ser Trp Leu Val Gly Gly Asn Thr Phe Ala Gln Asn Gly Ser Gly Gly
225 230 235 240
Gly Thr Val Asn Leu Gly Ser Glu Lys Ile Lys His Ser Pro Tyr Gly
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Ile Tyr Asp Ala Gln Lys Gln Lys Trp Leu Ile Asn Gly Val Leu Gln
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Thr Gly Asn Pro Tyr Ile Gly Lys Ser Asn Gly Phe Gln Leu Val Arg
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Phe Tyr Glu Pro Arg Gln Asn Gly Lys Tyr Ser Phe Asn Asp Asp Asn
325 330 335
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Asn Arg Leu Lys Thr Arg Thr Val Gln Leu Phe Asn Val Ser Leu Ser
355 360 365
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Gly Lys Gly Glu Leu Ile Leu Thr Ser Asn Ile Asn Gln Gly Ala Gly
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Gly Leu Tyr Phe Gln Gly Asp Phe Thr Val Ser Pro Glu Asn Asn Glu
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Trp Lys Val Asn Gly Val Ala Asn Asp Arg Leu Ser Lys Ile Gly Lys
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Gly Thr Leu His Val Gln Ala Lys Gly Glu Asn Gln Gly Ser Ile Ser
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Val Gly Asp Gly Thr Val Ile Leu Asp Gln Gln Ala Asp Asp Lys Gly
485 490 495
Lys Lys Gln Ala Phe Ser Glu Ile Gly Leu Val Ser Gly Arg Gly Thr
500 505 510
Val Gln Leu Asn Ala Asp Asn Gln Phe Asn Pro Asp Lys Leu Tyr Phe
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Gly Phe Arg Gly Gly Arg Leu Asp Leu Asn Gly His Ser Leu Ser Phe
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<220>
<221> misc_feature
<222> (2433)..(2433)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<400> 651
atgaaaacaa ccgacaaacg gacaaccgaa acacaccgca aagccccgaa aaccggccgc 60
atccgcttct cgcctgctta cttagccata tgcctgtcgt tcggcattct tccccaagct 120
tgggcgggac acacttattt cggcatcaac taccaatact atcgcgactt tgccgaaaat 180
aaaggcaagt ttgcagtcgg ggcgaaagat attgaggtnt acaacaaaaa aggggagttg 240
gtcggcaaat caatgacaaa agccccgatg attgattttt ctgtggtgtc gcgtaacggc 300
gtggcggcat tggtgggcga tcaatatatt gtgagcgtgg cacataacgg cggctataac 360
aacgttgatt ttggtgcgga aggaagnaat cccgatcagc accgtttttc ttaccaaatt 420
gtgaaaagaa ataattataa gcctgacaat tcacaccctt acaacggcga ttancatatg 480
ccgcgtttgc ataaatttgt cacagatgca gaacctgtcg aaatgacgag tgacatgagg 540
gggaatacct attccgataa agaaaaatat cccgagcgtg tccgcatcgg ctcaggacac 600
cactattggc gttatgatga tgacaaacac ggcgatttat cctactccgg cgcatggtta 660
attggcggca atacacatat gcagggttgg ggaaataatg gcgtanttag tttgagcggc 720
gatgtgcgcc atgccaacga ctatggccct atgccgattg caggtgcggc aggcgacagc 780
ggttcgccaa tgtttattta tgacaaaaca aacaataaat ggctgctcaa cggagtttta 840
caaaccggct acccttattc cggcagggaa aacggtttcc agctgatacg caaagattgg 900
ttctacgatg acatttacag aggcgataca cataccgtct nttttgaacc gcgcagtaac 960
ggacattttt cctttacatc caacaacaac ggtacgggta cggtaacaga aaccaacgaa 1020
aaggtntcca atccaaagct taaagtacag acagtccgac tgtttgacga atctttgaat 1080
gaaactgata aagaaccagt ttacgcggca gggggtgtta atcagtaccg tccaaggtta 1140
aacaacggtg aaaacctttc ttttatcgat tacggcaacg gcaaactcat cttatcaaac 1200
aacatcaacc aaggcgcggg cggtttgtat tttgaaggtg attttacggt ctcgcctgaa 1260
aacaacgaaa cgtggcaagg cgcgggcgtt catatcagtg aagacagtac cgttacttgg 1320
aaagtaaacg gcgtggcaaa cgaccgcctg tccaaaatcg gcaaaggcac gctgcacgtt 1380
caagccaaag gggaaaacca aggctcgatc agcgtgggcg acggtacagt cattttggat 1440
cagcaggcag acgataaagg caaaaaacaa gcctttagtg aaatcggctt gntcagcggc 1500
aggggtacgg tgcaactgaa tgccgataat cagttcaacc ccgacaaact ctatttcggc 1560
tttcgcggcg gacgtttgga tttaaacggg cattcgcttt cgttccaccg tattcaaaat 1620
accgatgaag gggcgatgat tgncnatcat aatgcacaac aacatccacc gttaccatta 1680
cagggaatga aagtattaca caaccgagtg gtaagaatat caatagactt aattacagca 1740
aagaaattgc ctacaacggt tggtttggcg agaaagatac gaccaaaacg aacgggcggc 1800
tcaaccttgt ttaccagccc gccgcagaag accgcacccn gctgctttcc ggcggaacaa 1860
atttaaacgg caacatcacg caaacaaacg gcaaactgtt tttcagcggc agaccgacac 1920
cgcacgccta caatcattta ggaagcgggt ggtcaaaaat ggaaggtatc ccacaaggag 1980
aaatcgtgtg ggacaacgac tggatcnacc gcacgtttaa agcggaaaat ttccatattc 2040
agggcgggca ggcggtgatt tcccgcaatg ttgccaaagt ggaaggcgat tgncatttga 2100
gcaatcacgc ccaagcagtt tttggtgtcg caccgcatca aagccataca atctgtacac 2160
gttcggactg gacnggtctg acaaattgtg tcgaanaaan cattaccgac gataaagtga 2220
ttgcttcatt gactaagacn gacntnagcg gcantgtnag nctnnccnat nacgntnntt 2280
naaanctcnc ngggcntgcn ncactnaang gcaatcttag tgcaaatggc gatacacgtt 2340
atacagtcag ccacaacgcc acccaaaacg gcaaccttag cctcgtgggc aatgcccaag 2400
caacatttaa tcaagccaca ttaaacggca acncatcggn ttcgggcaat gcttcattta 2460
atctaagcaa caacgccgca caaaacggca gtctgacgct ttccgacaac gctaaggcaa 2520
acgtaagcca ttccgcactc aacggcaatg tctccctagc cgataaggca gtattccatt 2580
ttgaaaacag ccgctttacc ggacaactca gcggcagcaa gganacagca ttacacttaa 2640
aagacagcga atggacgctg ccgtcaggca cggaattagg caatttaaac cttgacaacg 2700
ccaccattac actcaattcc gcctatcgcc acgatgctgc aggcgcgcaa accggcagng 2760
tgtcagacac gccgcgccgc cgttcgcgcc gttccctatt atccgttaca ccgccaactt 2820
cggtagaatc ccgtttcaac acgctgacgg taaacggcaa attgaacngt caaggaacat 2880
tccgctttat gtcggaactc ttcggctacc gaagcgacaa attgaagctg gcggaaagtt 2940
ccgaaggnac ttacaccttg gcggtcaaca ataccggcaa cgaacccgta agcctcgatc 3000
aattgacggt agtggaaggg aaagacaaca aaccgctgtc cgaaaacctt aatttcaccc 3060
tgcaaaacga acacgtcgat gccggcgcgt ggcgttacca actcatccgc aaagacggcg 3120
agttccgcct gcataatccg gtcaaagaac aagagctttc cgacaaactc ggcaaggcag 3180
aagccaaaaa acaggcggaa aaagacaacg cgcaaagcct tgacgcgctg attgcggccg 3240
ggcgcgatgc cgccgaaaag acagaaagcg ttgccgaacc ggcccggcng gcaggcgggg 3300
aaaatgtcgg cattatgcag gcggaggaag agaaaaaacg ggtgcaggcg gataaagaca 3360
gcgcnttggc gaaacagcgc gaagcggaaa cccggccggn taccaccgcc ttcccccgcg 3420
cccgcngcgc ccgccgggat ttgccgcaac cgcagcccca accgcaacct caaccccaac 3480
cgcagcgcga cctgatnagc cgttatgcca atagcggttt gagtgaattt tccgccacgc 3540
tcaacagcgt tttcgccgta caggacgaat tggaccgcgt gtttgccgaa gaccgccgca 3600
acgcngtttg gacaagcngc atccggnaca ccaaacacta ccgttcgcaa gatttccgcg 3660
cctaccgcca acaaaccgac ctgcgccaaa tcggtatgca gaaaaacctc ggcagcgggc 3720
gcgtcggcat cctgttttcg cacaaccgga ccgaaaacan cttcgacgac ggcatcggca 3780
actcggcacg gcttgcccac ggcgccgttt tcgggcaata cggcatcggc aggttcgaca 3840
tcggcatcag cacgggcgcg ggttttagca gcggcantct ntcagacggc atcggaggca 3900
aaatccgccg ccgcgtgctg cattacggca ttcaggcacg ataccgcgcc ggtttcggcg 3960
gattcggcat cgaaccgtac atcggcgcaa cgcgctattt cgtccaaaaa gcggattacc 4020
gctacgaaaa cgtcaatatc gccacccccg gtcttgcgtt caaccgntac cgngcgggca 4080
ttaaggcaga ttattcattc aaaccggcgc aacacatntc catcacncct tatttnagcc 4140
tgtcctatac cgatgccgct tcgggcaaag tccgaacacg cgtcaatacc gcngtattgg 4200
ctcaggattt cggcaaaacc cgcagtgcgg aatggggcgt aaacgccgaa atcaaaggtt 4260
tcacgctgtc cntccacgct gccgccgcca aaggnccgca actggaagcg caacacagcg 4320
cgggcatcaa attaggctac cgctggtaa 4349
<210> 652
<211> 1449
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<220>
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (1425)..(1425)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 652
Met Lys Thr Thr Asp Lys Arg Thr Thr Glu Thr His Arg Lys Ala Pro
1 5 10 15
Lys Thr Gly Arg Ile Arg Phe Ser Pro Ala Tyr Leu Ala Ile Cys Leu
20 25 30
Ser Phe Gly Ile Leu Pro Gln Ala Trp Ala Gly His Thr Tyr Phe Gly
35 40 45
Ile Asn Tyr Gln Tyr Tyr Arg Asp Phe Ala Glu Asn Lys Gly Lys Phe
50 55 60
Ala Val Gly Ala Lys Asp Ile Glu Val Tyr Asn Lys Lys Gly Glu Leu
65 70 75 80
Val Gly Lys Ser Met Thr Lys Ala Pro Met Ile Asp Phe Ser Val Val
85 90 95
Ser Arg Asn Gly Val Ala Ala Leu Val Gly Asp Gln Tyr Ile Val Ser
100 105 110
Val Ala His Asn Gly Gly Tyr Asn Asn Val Asp Phe Gly Ala Glu Gly
115 120 125
Xaa Asn Pro Asp Gln His Arg Phe Ser Tyr Gln Ile Val Lys Arg Asn
130 135 140
Asn Tyr Lys Pro Asp Asn Ser His Pro Tyr Asn Gly Asp Xaa His Met
145 150 155 160
Pro Arg Leu His Lys Phe Val Thr Asp Ala Glu Pro Val Glu Met Thr
165 170 175
Ser Asp Met Arg Gly Asn Thr Tyr Ser Asp Lys Glu Lys Tyr Pro Glu
180 185 190
Arg Val Arg Ile Gly Ser Gly His His Tyr Trp Arg Tyr Asp Asp Asp
195 200 205
Lys His Gly Asp Leu Ser Tyr Ser Gly Ala Trp Leu Ile Gly Gly Asn
210 215 220
Thr His Met Gln Gly Trp Gly Asn Asn Gly Val Xaa Ser Leu Ser Gly
225 230 235 240
Asp Val Arg His Ala Asn Asp Tyr Gly Pro Met Pro Ile Ala Gly Ala
245 250 255
Ala Gly Asp Ser Gly Ser Pro Met Phe Ile Tyr Asp Lys Thr Asn Asn
260 265 270
Lys Trp Leu Leu Asn Gly Val Leu Gln Thr Gly Tyr Pro Tyr Ser Gly
275 280 285
Arg Glu Asn Gly Phe Gln Leu Ile Arg Lys Asp Trp Phe Tyr Asp Asp
290 295 300
Ile Tyr Arg Gly Asp Thr His Thr Val Xaa Phe Glu Pro Arg Ser Asn
305 310 315 320
Gly His Phe Ser Phe Thr Ser Asn Asn Asn Gly Thr Gly Thr Val Thr
325 330 335
Glu Thr Asn Glu Lys Val Ser Asn Pro Lys Leu Lys Val Gln Thr Val
340 345 350
Arg Leu Phe Asp Glu Ser Leu Asn Glu Thr Asp Lys Glu Pro Val Tyr
355 360 365
Ala Ala Gly Gly Val Asn Gln Tyr Arg Pro Arg Leu Asn Asn Gly Glu
370 375 380
Asn Leu Ser Phe Ile Asp Tyr Gly Asn Gly Lys Leu Ile Leu Ser Asn
385 390 395 400
Asn Ile Asn Gln Gly Ala Gly Gly Leu Tyr Phe Glu Gly Asp Phe Thr
405 410 415
Val Ser Pro Glu Asn Asn Glu Thr Trp Gln Gly Ala Gly Val His Ile
420 425 430
Ser Glu Asp Ser Thr Val Thr Trp Lys Val Asn Gly Val Ala Asn Asp
435 440 445
Arg Leu Ser Lys Ile Gly Lys Gly Thr Leu His Val Gln Ala Lys Gly
450 455 460
Glu Asn Gln Gly Ser Ile Ser Val Gly Asp Gly Thr Val Ile Leu Asp
465 470 475 480
Gln Gln Ala Asp Asp Lys Gly Lys Lys Gln Ala Phe Ser Glu Ile Gly
485 490 495
Leu Xaa Ser Gly Arg Gly Thr Val Gln Leu Asn Ala Asp Asn Gln Phe
500 505 510
Asn Pro Asp Lys Leu Tyr Phe Gly Phe Arg Gly Gly Arg Leu Asp Leu
515 520 525
Asn Gly His Ser Leu Ser Phe His Arg Ile Gln Asn Thr Asp Glu Gly
530 535 540
Ala Met Ile Xaa Xaa His Asn Ala Thr Thr Thr Ser Thr Val Thr Ile
545 550 555 560
Thr Gly Asn Glu Ser Ile Thr Gln Pro Ser Gly Lys Asn Ile Asn Arg
565 570 575
Leu Asn Tyr Ser Lys Glu Ile Ala Tyr Asn Gly Trp Phe Gly Glu Lys
580 585 590
Asp Thr Thr Lys Thr Asn Gly Arg Leu Asn Leu Val Tyr Gln Pro Ala
595 600 605
Ala Glu Asp Arg Thr Xaa Leu Leu Ser Gly Gly Thr Asn Leu Asn Gly
610 615 620
Asn Ile Thr Gln Thr Asn Gly Lys Leu Phe Phe Ser Gly Arg Pro Thr
625 630 635 640
Pro His Ala Tyr Asn His Leu Gly Ser Gly Trp Ser Lys Met Glu Gly
645 650 655
Ile Pro Gln Gly Glu Ile Val Trp Asp Asn Asp Trp Ile Xaa Arg Thr
660 665 670
Phe Lys Ala Glu Asn Phe His Ile Gln Gly Gly Gln Ala Val Ile Ser
675 680 685
Arg Asn Val Ala Lys Val Glu Gly Asp Xaa His Leu Ser Asn His Ala
690 695 700
Gln Ala Val Phe Gly Val Ala Pro His Gln Ser His Thr Ile Cys Thr
705 710 715 720
Arg Ser Asp Trp Thr Gly Leu Thr Asn Cys Val Glu Xaa Xaa Ile Thr
725 730 735
Asp Asp Lys Val Ile Ala Ser Leu Thr Lys Thr Asp Xaa Ser Gly Xaa
740 745 750
Val Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Leu Xaa Gly Xaa Ala Xaa
755 760 765
Leu Xaa Gly Asn Leu Ser Ala Asn Gly Asp Thr Arg Tyr Thr Val Ser
770 775 780
His Asn Ala Thr Gln Asn Gly Asn Leu Ser Leu Val Gly Asn Ala Gln
785 790 795 800
Ala Thr Phe Asn Gln Ala Thr Leu Asn Gly Asn Xaa Ser Xaa Ser Gly
805 810 815
Asn Ala Ser Phe Asn Leu Ser Asn Asn Ala Ala Gln Asn Gly Ser Leu
820 825 830
Thr Leu Ser Asp Asn Ala Lys Ala Asn Val Ser His Ser Ala Leu Asn
835 840 845
Gly Asn Val Ser Leu Ala Asp Lys Ala Val Phe His Phe Glu Asn Ser
850 855 860
Arg Phe Thr Gly Gln Leu Ser Gly Ser Lys Xaa Thr Ala Leu His Leu
865 870 875 880
Lys Asp Ser Glu Trp Thr Leu Pro Ser Gly Thr Glu Leu Gly Asn Leu
885 890 895
Asn Leu Asp Asn Ala Thr Ile Thr Leu Asn Ser Ala Tyr Arg His Asp
900 905 910
Ala Ala Gly Ala Gln Thr Gly Xaa Val Ser Asp Thr Pro Arg Arg Arg
915 920 925
Ser Arg Arg Ser Leu Leu Ser Val Thr Pro Pro Thr Ser Val Glu Ser
930 935 940
Arg Phe Asn Thr Leu Thr Val Asn Gly Lys Leu Asn Xaa Gln Gly Thr
945 950 955 960
Phe Arg Phe Met Ser Glu Leu Phe Gly Tyr Arg Ser Asp Lys Leu Lys
965 970 975
Leu Ala Glu Ser Ser Glu Gly Thr Tyr Thr Leu Ala Val Asn Asn Thr
980 985 990
Gly Asn Glu Pro Val Ser Leu Asp Gln Leu Thr Val Val Glu Gly Lys
995 1000 1005
Asp Asn Lys Pro Leu Ser Glu Asn Leu Asn Phe Thr Leu Gln Asn
1010 1015 1020
Glu His Val Asp Ala Gly Ala Trp Arg Tyr Gln Leu Ile Arg Lys
1025 1030 1035
Asp Gly Glu Phe Arg Leu His Asn Pro Val Lys Glu Gln Glu Leu
1040 1045 1050
Ser Asp Lys Leu Gly Lys Ala Glu Ala Lys Lys Gln Ala Glu Lys
1055 1060 1065
Asp Asn Ala Gln Ser Leu Asp Ala Leu Ile Ala Ala Gly Arg Asp
1070 1075 1080
Ala Ala Glu Lys Thr Glu Ser Val Ala Glu Pro Ala Arg Xaa Ala
1085 1090 1095
Gly Gly Glu Asn Val Gly Ile Met Gln Ala Glu Glu Glu Lys Lys
1100 1105 1110
Arg Val Gln Ala Asp Lys Asp Ser Ala Leu Ala Lys Gln Arg Glu
1115 1120 1125
Ala Glu Thr Arg Pro Xaa Thr Thr Ala Phe Pro Arg Ala Arg Xaa
1130 1135 1140
Ala Arg Arg Asp Leu Pro Gln Pro Gln Pro Gln Pro Gln Pro Gln
1145 1150 1155
Pro Gln Pro Gln Arg Asp Leu Xaa Ser Arg Tyr Ala Asn Ser Gly
1160 1165 1170
Leu Ser Glu Phe Ser Ala Thr Leu Asn Ser Val Phe Ala Val Gln
1175 1180 1185
Asp Glu Leu Asp Arg Val Phe Ala Glu Asp Arg Arg Asn Ala Val
1190 1195 1200
Trp Thr Ser Xaa Ile Arg Xaa Thr Lys His Tyr Arg Ser Gln Asp
1205 1210 1215
Phe Arg Ala Tyr Arg Gln Gln Thr Asp Leu Arg Gln Ile Gly Met
1220 1225 1230
Gln Lys Asn Leu Gly Ser Gly Arg Val Gly Ile Leu Phe Ser His
1235 1240 1245
Asn Arg Thr Glu Asn Xaa Phe Asp Asp Gly Ile Gly Asn Ser Ala
1250 1255 1260
Arg Leu Ala His Gly Ala Val Phe Gly Gln Tyr Gly Ile Gly Arg
1265 1270 1275
Phe Asp Ile Gly Ile Ser Thr Gly Ala Gly Phe Ser Ser Gly Xaa
1280 1285 1290
Leu Ser Asp Gly Ile Gly Gly Lys Ile Arg Arg Arg Val Leu His
1295 1300 1305
Tyr Gly Ile Gln Ala Arg Tyr Arg Ala Gly Phe Gly Gly Phe Gly
1310 1315 1320
Ile Glu Pro Tyr Ile Gly Ala Thr Arg Tyr Phe Val Gln Lys Ala
1325 1330 1335
Asp Tyr Arg Tyr Glu Asn Val Asn Ile Ala Thr Pro Gly Leu Ala
1340 1345 1350
Phe Asn Arg Tyr Arg Ala Gly Ile Lys Ala Asp Tyr Ser Phe Lys
1355 1360 1365
Pro Ala Gln His Xaa Ser Ile Thr Pro Tyr Xaa Ser Leu Ser Tyr
1370 1375 1380
Thr Asp Ala Ala Ser Gly Lys Val Arg Thr Arg Val Asn Thr Ala
1385 1390 1395
Val Leu Ala Gln Asp Phe Gly Lys Thr Arg Ser Ala Glu Trp Gly
1400 1405 1410
Val Asn Ala Glu Ile Lys Gly Phe Thr Leu Ser Xaa His Ala Ala
1415 1420 1425
Ala Ala Lys Gly Pro Gln Leu Glu Ala Gln His Ser Ala Gly Ile
1430 1435 1440
Lys Leu Gly Tyr Arg Trp
1445
<210> 653
<211> 4407
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 653
atgaaaacaa ccgacaaacg gacaaccgaa acacaccgca aagcccctaa aaccggccgc 60
atccgcttct cgcccgctta cttagccata tgcctgtcgt tcggcattct gccccaagcc 120
cgggcgggac acacttattt cggcatcaac taccaatact atcgcgactt tgccgaaaat 180
aaaggcaagt ttgcagtcgg ggcgaaagat attgaggttt acaacaaaaa aggggagttg 240
gtcggcaaat cgatgacgaa agccccgatg attgattttt ctgtggtatc gcgtaacggc 300
gtggcggcat tggcgggcga tcaatatatt gtgagcgtgg cacataacgg cggctataac 360
aatgttgatt ttggtgcgga gggaagcaat cccgatcagc accgcttttc ttaccaaatt 420
gtgaaaagaa ataattataa agcagggact aacggccatc cttatggcgg cgattatcat 480
atgccgcgtt tgcacaaatt tgtcacagat gcagaacctg ttgagatgac cagttatatg 540
gatgggtgga aatacgctga tttaaataaa taccctgatc gtgttcgaat cggagcaggc 600
agacaatatt ggcggtctga tgaagacgaa cccaataacc gcgaaagttc atatcatatt 660
gcaagcgcat attcttggct cgtcggtggc aatacctttg cacaaaatgg atcaggtggt 720
ggcacagtca acttaggtag cgaaaaaatt aaacatagcc catatggttt tttaccaaca 780
ggaggctcat ttggcgacag tggctcacca atgtttatct atgatgccca aaagcaaaag 840
tggttaatta atggggtatt gcaaacaggc aacccctata taggaaaaag caatggcttc 900
cagctagttc gtaaagattg gttctatgat gaaatctttg ctggagatac ccattcagta 960
ttctacgaac cacatcaaaa tgggaaatac ttttttaacg acaataataa tggcgcagga 1020
aaaatcgatg ccaaacataa acactattct ctaccttata gattaaaaac acgaaccgtt 1080
caattgttta atgtttcttt atccgagaca gcaagagaac ctgtttatca tgctgcaggt 1140
ggggtcaaca gttatcgacc cagactgaat aatggagaaa atatttcctt tattgacaaa 1200
ggaaaaggtg aattgatact taccagcaac atcaaccaag gcgcgggcgg tttgtatttt 1260
gagggtaatt ttacggtctc gcctaaaaac aacgaaacgt ggcaaggcgc gggcgttcat 1320
atcagtgatg gcagtaccgt tacttggaaa gtaaacggcg tggcaaacga ccgcctgtcc 1380
aaaatcggca aaggcacgct gctggttcaa gccaaagggg aaaaccaagg ctcggtcagc 1440
gtgggcgacg gtaaagtcat cttagatcag caggcggacg atcaaggcaa aaaacaagcc 1500
tttagtgaaa tcggcttggt cagcggcagg gggacggtgc aactgaatgc cgataatcag 1560
ttcaaccccg acaaactcta tttcggcttt cgcggcggac gtttggattt gaacgggcat 1620
tcgctttcgt tccaccgcat tcaaaatacc gatgaagggg cgatgattgt caaccacaat 1680
caagacaaag aatccaccgt taccattaca ggcaataaag atattactac aaccggcaat 1740
aacaacaact tggatagcaa aaaagaaatt gcctacaacg gttggtttgg cgagaaagat 1800
gcaaccaaaa cgaacgggcg gctcaatctg aattaccaac cggaagaagc ggatcgcact 1860
ttactgcttt ccggcggaac aaatttaaac ggcaatatca cgcaaacaaa cggcaaactg 1920
tttttcagcg gcagaccgac accgcacgcc tacaatcatt taggaagcgg gtggtcaaaa 1980
atggaaggta tcccacaagg agaaatcgtg tgggacaacg attggatcga ccgcacattt 2040
aaagcggaaa acttccatat tcagggcgga caagcggtgg tttcccgcaa tgttgccaaa 2100
gtggaaggcg attggcattt aagcaatcac gcccaagcag ttttcggtgt cgcaccgcat 2160
caaagccaca caatctgtac acgttcggac tggacgggtc tgacaagttg taccgaaaaa 2220
accattaccg acgataaagt gattgcttca ttgagcaaga ccgacatcag aggcaatgtc 2280
agccttgccg atcacgctca tttaaatctc acaggacttg ccacactcaa cggcaatctt 2340
agtgcaggcg gagacacgca ctatacggtt acgcgcaacg ccacccaaaa cggcaacctc 2400
agcctcgtgg gcaatgccca agcaacattt aatcaagcca cattaaacgg caacacatcg 2460
gcttcggaca atgcttcatt taatctaagc aacaacgccg tacaaaacgg cagtctgacg 2520
ctttccgaca acgctaaggc aaacgtaagc cattccgcac tcaacggcaa tgtctcccta 2580
gccgataagg cagtattcca ttttgaaaac agccgcttta ccggaaaaat cagcggcggc 2640
aaggatacgg cattacactt aaaagacagc gaatggacgc tgccgtcggg cacggaatta 2700
ggcaatttaa accttgacaa cgccaccatt acactcaatt ccgcctatcg acacgatgcg 2760
gcaggcgcgc aaaccggcag tgcggcagat gcgccgcgcc gccgttcgcg ccgttcccta 2820
ttatccgtta cgccgccaac ttcggcagaa tcccgtttca acacgctgac ggtaaacggc 2880
aaattgaacg gtcagggaac attccgcttt atgtcggaac tcttcggcta ccgcagcggc 2940
aaattgaagc tggcggaaag ttccgaaggc acttacacct tggctgtcaa caataccggc 3000
aacgaacccg taagtctcga gcaattgacg gtagtggaag gaaaagacaa cacaccgctg 3060
tccgaaaatc ttaatttcac cctgcaaaac gaacacgtcg atgccggcgc atggcgttat 3120
cagcttatcc gcaaagacgg cgagttccgc ctgcataatc cggtcaaaga acaagagctt 3180
tccgacaaac tcggcaaggc gggagaaaca gaggccgcct tgacggcaaa acaggcacaa 3240
cttgccgcca aacaacaggc ggaaaaagac aacgcgcaaa gccttgacgc gctgattgcg 3300
gccgggcgca atgccaccga aaaggcagaa agtgttgccg aaccggcccg gcaggcaggc 3360
ggggaaaatg ccggcattat gcaggcggag gaagagaaaa aacgggtgca ggcggataaa 3420
gacaccgcct tggcgaaaca gcgcgaagcg gaaacccggc cggctaccac cgccttcccc 3480
cgcgcccgcc gcgcccgccg ggatttgccg caaccgcagc cccaaccgca accccaaccg 3540
cagcgcgacc tgatcagccg ttatgccaat agcggtttga gtgaattttc cgccacgctc 3600
aacagcgttt tcgccgtaca ggacgaattg gaccgcgtgt ttgccgaaga ccgccgcaac 3660
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tcggcacggc ttgcccacgg tgccgttttc gggcaatacg gcatcggcag gttcgacatc 3900
ggcatcagcg cgggcgcggg ttttagtagc ggcagccttt cagacggcat cagaggcaaa 3960
atccgccgcc gcgtgctgca ttacggcatt caggcaagat accgcgcagg tttcggcgga 4020
ttcggcatcg aaccgcacat cggcgcaacg cgctatttcg tccaaaaagc ggattaccga 4080
tacgaaaacg tcaatatcgc caccccgggc cttgcattca accgctaccg cgcgggcatt 4140
aaggcagatt attcattcaa accggcgcaa cacatttcca tcacgcctta tttgagcctg 4200
tcctataccg atgccgcttc cggcaaagtc cgaacgcgcg tcaataccgc cgtattggcg 4260
caggatttcg gcaaaacccg cagtgcggaa tggggcgtaa acgccgaaat caaaggtttc 4320
acgctgtccc tccacgctgc cgccgccaag gggccgcaat tggaagcgca gcacagcgcg 4380
ggcatcaaat taggctaccg ctggtaa 4407
<210> 654
<211> 1468
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 654
Met Lys Thr Thr Asp Lys Arg Thr Thr Glu Thr His Arg Lys Ala Pro
1 5 10 15
Lys Thr Gly Arg Ile Arg Phe Ser Pro Ala Tyr Leu Ala Ile Cys Leu
20 25 30
Ser Phe Gly Ile Leu Pro Gln Ala Arg Ala Gly His Thr Tyr Phe Gly
35 40 45
Ile Asn Tyr Gln Tyr Tyr Arg Asp Phe Ala Glu Asn Lys Gly Lys Phe
50 55 60
Ala Val Gly Ala Lys Asp Ile Glu Val Tyr Asn Lys Lys Gly Glu Leu
65 70 75 80
Val Gly Lys Ser Met Thr Lys Ala Pro Met Ile Asp Phe Ser Val Val
85 90 95
Ser Arg Asn Gly Val Ala Ala Leu Ala Gly Asp Gln Tyr Ile Val Ser
100 105 110
Val Ala His Asn Gly Gly Tyr Asn Asn Val Asp Phe Gly Ala Glu Gly
115 120 125
Ser Asn Pro Asp Gln His Arg Phe Ser Tyr Gln Ile Val Lys Arg Asn
130 135 140
Asn Tyr Lys Ala Gly Thr Asn Gly His Pro Tyr Gly Gly Asp Tyr His
145 150 155 160
Met Pro Arg Leu His Lys Phe Val Thr Asp Ala Glu Pro Val Glu Met
165 170 175
Thr Ser Tyr Met Asp Gly Trp Lys Tyr Ala Asp Leu Asn Lys Tyr Pro
180 185 190
Asp Arg Val Arg Ile Gly Ala Gly Arg Gln Tyr Trp Arg Ser Asp Glu
195 200 205
Asp Glu Pro Asn Asn Arg Glu Ser Ser Tyr His Ile Ala Ser Ala Tyr
210 215 220
Ser Trp Leu Val Gly Gly Asn Thr Phe Ala Gln Asn Gly Ser Gly Gly
225 230 235 240
Gly Thr Val Asn Leu Gly Ser Glu Lys Ile Lys His Ser Pro Tyr Gly
245 250 255
Phe Leu Pro Thr Gly Gly Ser Phe Gly Asp Ser Gly Ser Pro Met Phe
260 265 270
Ile Tyr Asp Ala Gln Lys Gln Lys Trp Leu Ile Asn Gly Val Leu Gln
275 280 285
Thr Gly Asn Pro Tyr Ile Gly Lys Ser Asn Gly Phe Gln Leu Val Arg
290 295 300
Lys Asp Trp Phe Tyr Asp Glu Ile Phe Ala Gly Asp Thr His Ser Val
305 310 315 320
Phe Tyr Glu Pro His Gln Asn Gly Lys Tyr Phe Phe Asn Asp Asn Asn
325 330 335
Asn Gly Ala Gly Lys Ile Asp Ala Lys His Lys His Tyr Ser Leu Pro
340 345 350
Tyr Arg Leu Lys Thr Arg Thr Val Gln Leu Phe Asn Val Ser Leu Ser
355 360 365
Glu Thr Ala Arg Glu Pro Val Tyr His Ala Ala Gly Gly Val Asn Ser
370 375 380
Tyr Arg Pro Arg Leu Asn Asn Gly Glu Asn Ile Ser Phe Ile Asp Lys
385 390 395 400
Gly Lys Gly Glu Leu Ile Leu Thr Ser Asn Ile Asn Gln Gly Ala Gly
405 410 415
Gly Leu Tyr Phe Glu Gly Asn Phe Thr Val Ser Pro Lys Asn Asn Glu
420 425 430
Thr Trp Gln Gly Ala Gly Val His Ile Ser Asp Gly Ser Thr Val Thr
435 440 445
Trp Lys Val Asn Gly Val Ala Asn Asp Arg Leu Ser Lys Ile Gly Lys
450 455 460
Gly Thr Leu Leu Val Gln Ala Lys Gly Glu Asn Gln Gly Ser Val Ser
465 470 475 480
Val Gly Asp Gly Lys Val Ile Leu Asp Gln Gln Ala Asp Asp Gln Gly
485 490 495
Lys Lys Gln Ala Phe Ser Glu Ile Gly Leu Val Ser Gly Arg Gly Thr
500 505 510
Val Gln Leu Asn Ala Asp Asn Gln Phe Asn Pro Asp Lys Leu Tyr Phe
515 520 525
Gly Phe Arg Gly Gly Arg Leu Asp Leu Asn Gly His Ser Leu Ser Phe
530 535 540
His Arg Ile Gln Asn Thr Asp Glu Gly Ala Met Ile Val Asn His Asn
545 550 555 560
Gln Asp Lys Glu Ser Thr Val Thr Ile Thr Gly Asn Lys Asp Ile Thr
565 570 575
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Asn Gly Trp Phe Gly Glu Lys Asp Ala Thr Lys Thr Asn Gly Gly Leu
595 600 605
Asn Leu Asn Tyr Pro Pro Glu Glu Ala Asp Arg Thr Leu Leu Leu Ser
610 615 620
Gly Gly Thr Asn Leu Asn Gly Asn Ile Thr Gln Thr Asn Gly Lys Leu
625 630 635 640
Phe Phe Ser Gly Arg Pro Thr Pro His Ala Tyr Asn His Leu Gly Ser
645 650 655
Gly Trp Ser Lys Met Glu Gly Ile Pro Gln Gly Glu Ile Val Trp Asp
660 665 670
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675 680 685
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690 695 700
Trp His Leu Ser Asn His Ala Gln Ala Val Phe Gly Val Ala Pro His
705 710 715 720
Gln Ser His Thr Ile Cys Thr Arg Ser Asp Trp Thr Gly Leu Thr Ser
725 730 735
Cys Thr Glu Lys Thr Ile Thr Asp Asp Lys Val Ile Ala Ser Leu Ser
740 745 750
Lys Thr Asp Val Arg Gly Asn Val Ser Leu Ala Asp His Ala His Leu
755 760 765
Asn Leu Thr Gly Leu Ala Thr Phe Asn Gly Asn Leu Val Gln Ala Glu
770 775 780
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785 790 795 800
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805 810 815
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820 825 830
Ala Val Gln Asn Gly Ser Leu Thr Leu Ser Asp Asn Ala Lys Ala Asn
835 840 845
Val Ser His Ser Ala Leu Asn Gly Asn Val Ser Leu Ala Asp Lys Ala
850 855 860
Val Phe His Phe Glu Asn Ser Arg Phe Thr Gly Lys Ile Ser Gly Gly
865 870 875 880
Lys Asp Thr Ala Leu His Leu Lys Asp Ser Glu Trp Thr Leu Pro Ser
885 890 895
Gly Thr Glu Leu Gly Asn Leu Asn Leu Asp Asn Ala Thr Ile Thr Leu
900 905 910
Asn Ser Ala Tyr Arg His Asp Ala Ala Gly Ala Gln Thr Gly Ser Ala
915 920 925
Ala Asp Ala Pro Arg Arg Arg Ser Arg Arg Ser Leu Leu Ser Val Thr
930 935 940
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Lys Leu Asn Gly Gln Gly Thr Phe Arg Phe Met Ser Glu Leu Phe Gly
965 970 975
Tyr Arg Ser Gly Lys Leu Lys Leu Ala Glu Ser Ser Glu Gly Thr Tyr
980 985 990
Thr Leu Ala Val Asn Asn Thr Gly Asn Glu Pro Val Ser Leu Glu Gln
995 1000 1005
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1010 1015 1020
Leu Asn Phe Thr Leu Gln Asn Glu His Val Asp Ala Gly Ala Trp
1025 1030 1035
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1040 1045 1050
Pro Val Lys Glu Gln Glu Leu Ser Asp Lys Leu Gly Lys Ala Gly
1055 1060 1065
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1070 1075 1080
Lys Gln Gln Ala Glu Lys Asp Asn Ala Gln Ser Leu Asp Ala Leu
1085 1090 1095
Ile Ala Ala Gly Arg Asn Ala Thr Glu Lys Ala Glu Ser Val Ala
1100 1105 1110
Glu Pro Ala Arg Gln Ala Gly Gly Glu Asn Ala Gly Ile Met Gln
1115 1120 1125
Ala Glu Glu Glu Lys Lys Arg Val Gln Ala Asp Lys Asp Thr Ala
1130 1135 1140
Leu Ala Lys Gln Arg Glu Ala Glu Thr Arg Pro Ala Thr Thr Ala
1145 1150 1155
Phe Pro Arg Ala Arg Arg Ala Arg Arg Asp Leu Pro Gln Pro Gln
1160 1165 1170
Pro Gln Pro Gln Pro Gln Pro Gln Arg Asp Leu Ile Ser Arg Tyr
1175 1180 1185
Ala Asn Ser Gly Leu Ser Glu Phe Ser Ala Thr Leu Asn Ser Val
1190 1195 1200
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1205 1210 1215
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1220 1225 1230
Arg Ser Gln Asp Phe Arg Ala Tyr Arg Gln Gln Thr Asp Leu Arg
1235 1240 1245
Gln Ile Gly Met Gln Lys Asn Leu Gly Ser Gly Arg Val Gly Ile
1250 1255 1260
Leu Phe Ser His Asn Arg Thr Gly Asn Thr Phe Asp Asp Gly Ile
1265 1270 1275
Gly Asn Ser Ala Arg Leu Ala His Gly Ala Val Phe Gly Gln Tyr
1280 1285 1290
Gly Ile Gly Arg Phe Asp Ile Gly Ile Ser Ala Gly Ala Gly Phe
1295 1300 1305
Ser Ser Gly Ser Leu Ser Asp Gly Ile Arg Gly Lys Ile Arg Arg
1310 1315 1320
Arg Val Leu His Tyr Gly Ile Gln Ala Arg Tyr Arg Ala Gly Phe
1325 1330 1335
Gly Gly Phe Gly Ile Glu Pro His Ile Gly Ala Thr Arg Tyr Phe
1340 1345 1350
Val Gln Lys Ala Asp Tyr Arg Tyr Glu Asn Val Asn Ile Ala Thr
1355 1360 1365
Pro Gly Leu Ala Phe Asn Arg Tyr Arg Ala Gly Ile Lys Ala Asp
1370 1375 1380
Tyr Ser Phe Lys Pro Ala Gln His Ile Ser Ile Thr Pro Tyr Leu
1385 1390 1395
Ser Leu Ser Tyr Thr Asp Ala Ala Ser Gly Lys Val Arg Thr Arg
1400 1405 1410
Val Asn Thr Ala Val Leu Ala Gln Asp Phe Gly Lys Thr Arg Ser
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Ala Glu Trp Gly Val Asn Ala Glu Ile Lys Gly Phe Thr Leu Ser
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Leu His Ala Ala Ala Ala Lys Gly Pro Gln Leu Glu Ala Gln His
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Ser Ala Gly Ile Lys Leu Gly Tyr Arg Trp
1460 1465
<210> 655
<211> 423
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (24)..(24)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 655
aaggtgtggc aatttgtcga aganccgctg cgtgccgtcg tgcctgccga cagttttgaa 60
ccgaccgcgc aaaaattgaa cctgtttaag gcgggtgcgg caaccatttt gttttatgaa 120
gatcaaaatg tcgtcaaagg tttgcaggag cagttccctg cttatgccgc taacttcccc 180
gtttgggcgg atcaggcaaa cgcgatggtg cagtatgccg tttggacgac acttgccgcg 240
gtcggcgtag gtgcaaacct gcaacattac aatcccttgc ccgatgcggc gattgccaaa 300
gcgtggaata tccccgaaaa ctggttgttg cgcgcacaaa tggttatcgg cggtattgaa 360
ggggcggcag gtgaaaagac ctttgaaccc gttgcagaac gtttgaaagt gttcggcgca 420
taa 423
<210> 656
<211> 140
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (8)..(8)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 656
Lys Val Trp Gln Phe Val Glu Xaa Pro Leu Arg Ala Val Val Pro Ala
1 5 10 15
Asp Ser Phe Glu Pro Thr Ala Gln Lys Leu Asn Leu Phe Lys Ala Gly
20 25 30
Ala Ala Thr Ile Leu Phe Tyr Glu Asp Gln Asn Val Val Lys Gly Leu
35 40 45
Gln Glu Gln Phe Pro Ala Tyr Ala Ala Asn Phe Pro Val Trp Ala Asp
50 55 60
Gln Ala Asn Ala Met Val Gln Tyr Ala Val Trp Thr Thr Leu Ala Ala
65 70 75 80
Val Gly Val Gly Ala Asn Leu Gln His Tyr Asn Pro Leu Pro Asp Ala
85 90 95
Ala Ile Ala Lys Ala Trp Asn Ile Pro Glu Asn Trp Leu Leu Arg Ala
100 105 110
Gln Met Val Ile Gly Gly Ile Glu Gly Ala Ala Gly Glu Lys Thr Phe
115 120 125
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130 135 140
<210> 657
<211> 396
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 657
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aaggcgggtg cggcaaccat tttgttttat gaagatcaaa atgtcgtcaa aggtttgcag 120
gagcagttcc ctgcttatgc cgctaacttc cccgtttggg cggatcaggc aaacgcgatg 180
gtgcagtatg ccgtttggac gacacttgcc gcggtcggcg taggtgcaaa cctgcaacat 240
tacaatccct tgcccgatgc ggcgattgcc aaagcgtgga atatccccga aaactggttg 300
ttgcgcgcac aaatggttat cggcggtatt gaaggggcgg caggtgaaaa gacctttgaa 360
cccgttgcag aacgtttgaa agtgttcggc gcataa 396
<210> 658
<211> 131
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 658
Leu Arg Ala Val Val Pro Ala Asp Ser Phe Glu Pro Thr Ala Gln Lys
1 5 10 15
Leu Asn Leu Phe Lys Ala Gly Ala Ala Thr Ile Leu Phe Tyr Glu Asp
20 25 30
Gln Asn Val Val Lys Gly Leu Gln Glu Gln Phe Pro Ala Tyr Ala Ala
35 40 45
Asn Phe Pro Val Trp Ala Asp Gln Ala Asn Ala Met Val Gln Tyr Ala
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Val Trp Thr Thr Leu Ala Ala Val Gly Val Gly Ala Asn Leu Gln His
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Tyr Asn Pro Leu Pro Asp Ala Ala Ile Ala Lys Ala Trp Asn Ile Pro
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Glu Asn Trp Leu Leu Arg Ala Gln Met Val Ile Gly Gly Ile Glu Gly
100 105 110
Ala Ala Gly Glu Lys Thr Phe Glu Pro Val Ala Glu Arg Leu Lys Val
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Phe Gly Ala
130
<210> 659
<211> 606
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 659
atgacccgtc aatctctgca acaggctgcc gaaagccgcc gttccattta ttcgttaaat 60
aaaaatctgc ccgtcggcaa agatgaaatc gtccaaatcg tcgaacacgc cgttttgcac 120
acaccttctt cgttcaattc ccaatctgcc cgtgtggtcg tgctgtttgg cgaagagcat 180
gataaggtgt ggcaatttgt cgaagacgcg ctgcgtgccg tcgtgcctgc cgacagtttt 240
gaaccgaccg cgcaaaaatt gaacctgttt aaggcgggtg cggcaactat tttgttttat 300
gaagatcaaa atgtcgtcaa aggtttgcag gagcagttcc ctgcttatgc cgccaacttt 360
cccgtttggg cggaccaggc gaacgcgatg gtgcagtatg ccgtttggac gacacttgcc 420
gcggtcggcg taggtgcaaa cctgcaacat tacaatccct tgcccgatgc ggcgattgcc 480
aaagcgtgga atatccccga aaactggttg ttgcgcgcac aaatggttat cggcggtatt 540
gaaggggcgg caggtgaaaa gacctttgaa ccagttgcag aacgtttgaa agtgttcggc 600
gcataa 606
<210> 660
<211> 201
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 660
Met Thr Arg Gln Ser Leu Gln Gln Ala Ala Glu Ser Arg Arg Ser Ile
1 5 10 15
Tyr Ser Leu Asn Lys Asn Leu Pro Val Gly Lys Asp Glu Ile Val Gln
20 25 30
Ile Val Glu His Ala Val Leu His Thr Pro Ser Ser Phe Asn Ser Gln
35 40 45
Ser Ala Arg Val Val Val Leu Phe Gly Glu Glu His Asp Lys Val Trp
50 55 60
Gln Phe Val Glu Asp Ala Leu Arg Ala Val Val Pro Ala Asp Ser Phe
65 70 75 80
Glu Pro Thr Ala Gln Lys Leu Asn Leu Phe Lys Ala Gly Ala Ala Thr
85 90 95
Ile Leu Phe Tyr Glu Asp Gln Asn Val Val Lys Gly Leu Gln Glu Gln
100 105 110
Phe Pro Ala Tyr Ala Ala Asn Phe Pro Val Trp Ala Asp Gln Ala Asn
115 120 125
Ala Met Val Gln Tyr Ala Val Trp Thr Thr Leu Ala Ala Val Gly Val
130 135 140
Gly Ala Asn Leu Gln His Tyr Asn Pro Leu Pro Asp Ala Ala Ile Ala
145 150 155 160
Lys Ala Trp Asn Ile Pro Glu Asn Trp Leu Leu Arg Ala Gln Met Val
165 170 175
Ile Gly Gly Ile Glu Gly Ala Ala Gly Glu Lys Thr Phe Glu Pro Val
180 185 190
Ala Glu Arg Leu Lys Val Phe Gly Ala
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 662
Met Ala Val Ala Ser Asn Val Ser Leu Asp Met Ser Asn Pro Thr Val
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Leu Arg Met Gly Leu Pro Leu Tyr Ile Ala Ser Leu Arg Arg Gly Ala
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Ile Tyr Lys Val Trp Gln Phe Val Glu Asp Ala Leu Arg Ala Val Val
35 40 45
Pro Ala Asp Ser Phe Glu Pro Thr Ala Gln Lys Leu Lys Leu Phe Lys
50 55 60
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Gly Leu Gln Glu Gln Phe Pro Ala Tyr Ala Ala Asn Phe Pro Val Trp
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Ala Ala Val Gly Ala Gly Ala Asn Leu Gln His Tyr Asn Pro Leu Pro
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<223> n is a, c, g, or t
<400> 663
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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Leu Phe Glu Val Arg Ala Glu Ala Gly Asn Arg Lys His Phe Gly Leu
85 90 95
Gly Ala Asp Val Ser Gly Ser Leu Asn Ala Glu Gly Thr Leu Arg Gly
100 105 110
Arg Leu Val Ser Thr Phe Gly Arg Gly Asp Ser Trp Arg Gln Leu Glu
115 120 125
Arg Ser Arg Asp Ala Glu Leu Tyr Gly Ile Leu Glu Tyr Asp Ile Ala
130 135 140
Pro Gln Thr Arg Val His Ala Gly Met Asp Tyr Gln Gln Ala Lys Glu
145 150 155 160
Thr Ala Asp Ala Pro Leu Ser Tyr Ala Val Tyr Asp Ser Gln Gly Tyr
165 170 175
Ala Thr Ala Phe Gly Pro Lys Asp Asn Pro Ala Thr Asn Trp Ser Asn
180 185 190
Ser Arg Asn Arg Ala Leu Asn Leu Phe Ala Gly Ile Glu His Arg Phe
195 200 205
Asn Gln Asp Trp Lys Leu Lys Ala Glu Tyr Asp Tyr Thr Arg Ser Arg
210 215 220
Phe Arg Gln Pro Tyr Gly Val Ala Gly Val Leu Ser Ile Asp His Ser
225 230 235 240
Thr Ala Ala Thr Asp Leu Ile Pro Gly Tyr Trp His Ala Asp Pro Arg
245 250 255
Thr His Ser Ala Ser Met Ser Leu Thr Gly Lys Tyr Arg Leu Phe Gly
260 265 270
Arg Glu His Asp Leu Ile Ala Gly Ile Asn Gly Tyr Lys Tyr Ala Ser
275 280 285
Asn Lys Tyr Gly Glu Arg Ser Ile Ile Pro Asn Ala Ile Pro Asn Ala
290 295 300
Tyr Glu Phe Ser Arg Thr Gly Ala Tyr Pro Gln Pro Ser Ser Phe Ala
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Arg Tyr Ser Arg Tyr Arg Ala Gly Ser Tyr Asn Ser Arg Thr Gln Gly
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Phe Asp Leu Thr Gly Asn Leu Ser Leu Tyr Gly Ser Tyr Ser Ser Leu
385 390 395 400
Phe Val Pro Gln Leu Gln Lys Asp Glu His Gly Ser Tyr Leu Lys Pro
405 410 415
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Gly Arg Leu Asn Ala Ser Ala Ala Val Tyr Arg Ala Arg Lys Asn Asn
435 440 445
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485 490 495
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500 505 510
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530 535 540
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545 550 555 560
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565 570 575
Ala Arg Tyr Arg Phe Asn Pro Arg Thr Glu Leu Ser Leu Asn Val Asp
580 585 590
Asn Leu Phe Asn Lys His Tyr Arg Thr Gln Pro Asp Arg His Ser Tyr
595 600 605
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<210> 671
<211> 2178
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 671
atgacacgct tcaaatactc cctgcttttt gccgccctgc tacccgtgta cgcgcaggcc 60
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<210> 672
<211> 725
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 672
Met Thr Arg Phe Lys Tyr Ser Leu Leu Phe Ala Ala Leu Leu Pro Val
1 5 10 15
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65 70 75 80
Gln Gln Met Arg Asp Gln Asn Ile Lys Thr Leu Asp Arg Ala Leu Leu
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Gln Ala Thr Gly Thr Ser Arg Gln Ile Tyr Gly Ser Asp Arg Ala Gly
100 105 110
Tyr Asn Tyr Leu Phe Ala Arg Gly Ser Arg Ile Ala Asn Tyr Gln Ile
115 120 125
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130 135 140
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180 185 190
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195 200 205
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Leu Glu Tyr Asp Ile Ala Pro Gln Thr Arg Val His Ala Gly Met Asp
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Tyr Gln Gln Ala Lys Glu Thr Ala Asp Ala Pro Leu Ser Tyr Ala Val
260 265 270
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275 280 285
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Asp Tyr Thr Arg Ser Arg Phe Arg Gln Pro Tyr Gly Val Ala Gly Val
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435 440 445
Ser Leu Ile Leu Gly Gly Arg Tyr Ser Arg Tyr Arg Ala Gly Ser Tyr
450 455 460
Asn Ser Arg Thr Gln Gly Met Thr Tyr Val Ser Ala Asn Arg Phe Thr
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485 490 495
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<223> n is a, c, g, or t
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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acttcggcaa cttcggtcaa tgtcgttgca tccgaatttt ccaacgcggc ttttacgaca 540
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tccatattga taccggcgcg cgtactgccg atattgatgg agctgcacac gatatcagta 780
gtcttcatcg cttcgggaat ggaacggatn aacacctcgt cagaaggcga catacctttt 840
tgcaccagcg cggaaaagcc gccaataaaa gacacgccga tggctttggc agccttatcc 900
aaagtttgcg ccacgctgac gtaa 924
<210> 678
<211> 307
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<222> (198)..(198)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<220>
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 678
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145 150 155 160
Thr Ser Ala Thr Ser Val Asn Val Val Ala Ser Glu Phe Ser Asn Ala
165 170 175
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Thr Leu Thr
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 679
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tccatattga taccggcacg cgtgctgccg atattgatgg agctgcacac gatatcggta 780
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aaagtctgcg ccacgctgac ataa 924
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 680
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195 200 205
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210 215 220
Val Ile Ser Ala Val Arg Leu Met Val Ser Pro Ala Ser Leu Thr Ala
225 230 235 240
Ser Ile Leu Ile Pro Ala Arg Val Leu Pro Ile Leu Met Glu Leu His
245 250 255
Thr Ile Ser Val Val Phe Ile Ala Ser Gly Thr Glu Arg Ile Asn Thr
260 265 270
Ser Ser Glu Gly Asp Ile Pro Phe Cys Thr Ser Ala Glu Lys Pro Pro
275 280 285
Ile Lys Asp Thr Pro Met Ala Leu Ala Ala Leu Ser Lys Val Cys Ala
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<213> Neisseria meningitidis
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accgacgtgc aaaaagagtt ggtcggcgaa caacgcaagt gggcgcagga aaaaatcagc 60
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caatgcgaca cgcggatgac gcgcgaacgg atacagtatc ttcgcggcta ttccatcgat 180
tag 183
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 682
Thr Asp Val Gln Lys Glu Leu Val Gly Glu Gln Arg Lys Trp Ala Gln
1 5 10 15
Glu Lys Ile Ser Asn Cys Arg Gln Ala Ala Ala Gln Ala Asp Arg Gln
20 25 30
Glu Tyr Ala Glu Tyr Leu Lys Leu Gln Cys Asp Thr Arg Met Thr Arg
35 40 45
Glu Arg Ile Gln Tyr Leu Arg Gly Tyr Ser Ile Asp
50 55 60
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 684
Met Tyr Arg Lys Leu Ile Ala Leu Pro Phe Ala Leu Leu Leu Ala Ala
1 5 10 15
Cys Gly Arg Glu Glu Pro Pro Lys Ala Leu Glu Cys Ala Asn Pro Ala
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Val Leu Gln Gly Ile Arg Gly Asn Ile Gln Glu Thr Leu Thr Gln Glu
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115 120 125
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Gly Met Ala Ala Gln Thr Leu Ser Ala Ala Leu Leu Pro Tyr Gly Val
165 170 175
Lys Ser Ile Val Met Ile Asp Gly Lys Ala Val Lys Lys Glu Asp Ala
180 185 190
Val Arg Ile Leu Ser Gly Lys Ala Arg Glu Glu Glu Pro Ser Lys Pro
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210 215 220
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Asp Asp Gly Glu Arg Ala Asp Thr Val Thr Val Ser Arg Gly Glu Val
245 250 255
Glu Glu Ala Arg Val Gln Asn Gln Arg Ala Glu Ser Glu Ile Thr Lys
260 265 270
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275 280 285
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<213> Neisseria meningitidis
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<220>
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<210> 686
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 686
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100 105 110
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115 120 125
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210 215 220
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 687
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<210> 688
<211> 338
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 688
Met Tyr Arg Lys Leu Ile Ala Leu Pro Phe Ala Leu Leu Leu Ala Ala
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Cys Gly Arg Glu Glu Pro Pro Lys Ala Leu Glu Cys Ala Asn Pro Ala
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145 150 155 160
Gly Met Ala Thr Gln Thr Leu Ser Ala Ala Leu Leu Pro Tyr Gly Val
165 170 175
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180 185 190
Val Arg Val Leu Ser Gly Lys Ala Arg Glu Glu Glu Pro Ser Lys Pro
195 200 205
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Asp Asp Val Glu Arg Ala Asp Thr Val Thr Val Ser Arg Gly Glu Val
245 250 255
Glu Glu Ala Arg Val Gln Asn Gln Arg Ala Glu Ser Glu Ile Thr Lys
260 265 270
Leu Trp Gly Gly Leu Asp Thr Asp Val Gln Lys Glu Leu Val Gly Glu
275 280 285
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<213> Neisseria meningitidis
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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnact tcgctggtat 900
tcggcggcac ttgcggcgtc tttgccgtcg ttctctgcac gctcggcacg attaaaaccg 960
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (39)..(40)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (68)..(68)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (81)..(81)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (98)..(296)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 690
Met Gln Leu Ile Asp Tyr Ser His Ser Phe Phe Ser Val Val Pro Pro
1 5 10 15
Phe Leu Ala Leu Ala Leu Ala Val Ile Thr Arg Arg Val Leu Leu Ser
20 25 30
Leu Gly Ile Gly Ile Leu Xaa Xaa Val Ala Phe Leu Val Gly Gly Asn
35 40 45
Pro Val Asp Gly Leu Thr His Leu Lys Asp Met Val Val Gly Leu Ala
50 55 60
Trp Ser Asp Xaa Asp Trp Ser Leu Gly Lys Pro Lys Ile Leu Val Phe
65 70 75 80
Xaa Ile Leu Leu Gly Ile Phe Thr Ser Leu Leu Thr Tyr Ser Gly Ser
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Asn Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
130 135 140
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
180 185 190
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
195 200 205
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
210 215 220
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
225 230 235 240
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
245 250 255
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
260 265 270
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
275 280 285
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Thr Ser Leu Val Phe Gly Gly Thr
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Ala Ile Ala Ile Leu Ile Leu Ala Trp Leu Ile Ser Thr Val Val Gly
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355 360 365
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370 375 380
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Ile Ala Ala Ala Met Ala Val Lys Val Glu Pro Ala Leu Ile Ile Pro
405 410 415
Cys Met Ser Ala Val Met Ala Gly Ala Val Cys Gly Asp His Cys Ser
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435 440 445
His Ile Asp His Val Thr Ser Gln Leu Pro Tyr Ala Leu Thr Val Ala
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Ala Ala Ala Ala Ser Gly Tyr Leu Ala Leu Gly Leu Thr Lys Ser Ala
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<212> DNA
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<210> 692
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 692
Met Gln Leu Ile Asp Tyr Ser His Ser Phe Phe Ser Val Val Pro Pro
1 5 10 15
Phe Leu Ala Leu Ala Leu Ala Val Ile Thr Arg Arg Val Leu Leu Ser
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Leu Gly Ile Gly Ile Leu Val Gly Val Ala Phe Leu Val Gly Gly Asn
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Pro Val Asp Gly Leu Thr His Leu Lys Asp Met Val Val Gly Leu Ala
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Leu Ile Leu Leu Gly Ile Phe Thr Ser Leu Leu Thr Tyr Ser Gly Ser
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Ala Ile Ala Ile Leu Ile Leu Ala Trp Leu Ile Ser Thr Val Val Gly
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<210> 693
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (1410)..(1410)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
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<211> 506
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (486)..(486)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 694
Met Gln Leu Ile Asp Tyr Ser His Ser Phe Phe Ser Val Val Pro Pro
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Phe Leu Ala Leu Ala Leu Ala Val Ile Thr Arg Arg Val Leu Leu Ser
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Leu Gly Ile Gly Ile Leu Val Gly Val Ala Phe Leu Val Gly Gly Asn
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Pro Val Asp Gly Leu Thr His Leu Lys Asp Met Val Val Gly Leu Ala
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Trp Ser Asp Gly Asp Trp Ser Leu Gly Lys Pro Lys Xaa Leu Val Phe
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Leu Ile Leu Leu Gly Ile Phe Thr Ser Leu Leu Thr Tyr Ser Gly Ser
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Ser Ile Ile Ala Thr Leu Ala Gly Leu Leu Val Thr Tyr Lys Ile Thr
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Ala His Asp Glu Thr Ala Val Ser Asp Gly Ser Trp Gly Arg Val Tyr
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Ala Asp Tyr Pro Lys Ala Val Trp Gln Gly Ala Lys Ser Met Phe Gly
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Ala Ile Ala Ile Leu Ile Leu Ala Trp Leu Ile Ser Thr Val Val Gly
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Ala Phe Ala Thr Gly Thr Ser Trp Gly Thr Phe Gly Ile Met Leu Pro
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Ile Ala Ala Ala Met Ala Val Lys Val Asp Pro Ser Leu Ile Ile Pro
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Cys Met Ser Ala Val Met Ala Gly Ala Val Cys Gly Asp His Cys Ser
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Pro Ile Ser Asp Thr Thr Ile Leu Ser Ser Thr Gly Ala Arg Cys Asn
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His Ile Asp His Val Thr Ser Gln Leu Pro Tyr Ala Leu Thr Val Ala
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Ala Ala Ala Ala Ser Gly Tyr Leu Ala Leu Gly Leu Thr Lys Ser Ala
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Leu Leu Gly Phe Gly Xaa Thr Gly Ile Val Leu Ala Val Leu Ile Phe
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Leu Leu Lys Asp Lys Lys Arg Ala Asn Ala
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<210> 695
<211> 1521
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 695
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<211> 506
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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290 295 300
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340 345 350
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<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria meningitidis
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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275 280 285
His Leu Ile Gly Val Gly Gly Ile Gly Val Leu Thr Leu Gly Met Met
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Ala Arg Thr Ala Leu Gly His Thr Gly Asn Pro Ile Tyr Pro Pro Pro
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Lys Ala Val Pro Val Ala Phe Trp Leu Met Met Ala Ala Thr Ala Val
325 330 335
Arg Met Val Ala Val Phe Ser Ser Gly Thr Ala Tyr Thr His Ser Ile
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Arg Thr Ser Ser Val Leu Phe Ala Leu Ala Leu Leu Val Tyr Ala Trp
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Lys Tyr Ile Pro Trp Leu Ile Arg Pro Arg Ser Asp Gly Arg Pro Gly
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Tyr Ser Leu Ala Ala Leu Tyr Gly Ala Leu Ser Val Leu Leu Trp Gly
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Phe Gly Tyr Thr Gly Thr His Glu Leu Ser Gly Phe Tyr Trp His Ala
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His Glu Met Ile Trp Gly Tyr Ala Gly Leu Val Val Ile Ala Phe Leu
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Leu Thr Ala Val Ala Thr Trp Thr Gly Gln Pro Pro Thr Arg Gly Gly
65 70 75 80
Val Leu Val Gly Leu Thr Ala Phe Trp Leu Ala Ala Arg Ile Ala Ala
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Phe Ile Pro Gly Trp Gly Ala Ala Ala Ser Gly Ile Leu Gly Thr Leu
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Phe Phe Trp Tyr Gly Ala Val Cys Met Ala Leu Pro Val Ile Arg Ser
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Gly Thr His Ala Ala Phe His Val Gln Leu His Asn Gly Asn Leu Gly
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Gly Leu Leu Ser Gly Leu Gln Ser Gly Leu Val Met Val Trp Gly Phe
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<220>
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<222> (1)..(1)
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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atgtttgccc ttttggaagc cttttttgtc gaatacggct atgcggccgt gtttttcgtt 60
ttggtcatct gcggtttcgg cgtgccgatt cccgaagatt tgaccttggt aacgggcggc 120
gtgatttcgg gtatgggtta taccaatccg catattatgt ttgcggtcgg tatgctcggc 180
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aagttcaaac cgattgcgcg catcatgacg ccgaaacgtt acgcgcaggt tcaggaaaaa 300
ttcgacaaat acggcaactg ggttctgttt gtcgcccgtt tcctgccggg tttgcggact 360
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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Val Phe Phe Val Leu Val Ile Cys Gly Phe Gly Val Pro Ile Pro Glu
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Asp Leu Thr Leu Val Thr Gly Gly Val Ile Ser Gly Met Gly Tyr Thr
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50 55 60
Asp Gly Val Met Phe Ala Ala Gly Arg Ile Trp Gly Gln Lys Ile Leu
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Arg Phe Leu Pro Gly Leu Arg Thr Ala Val Phe Val Thr Ala Gly Ile
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Ser Arg Lys Val Ser Tyr Leu Arg Phe Leu Ile Met Asp Gly Leu Ala
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Ile Phe Ile Ala Leu Gly Val Leu Ala Ala Ala Leu Ala Trp Phe Trp
180 185 190
Trp Arg Lys Arg Arg His Tyr Gln Leu Tyr Arg Ala Gln Leu Ser Glu
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Lys Arg Ala Lys Arg Lys Ala Glu Lys Ala Ala Lys Lys Ala Ala Gln
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225
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 729
atgaaaaaat tattggcggc cgtgatgatg gcaggtttgg caggcgcggt ttccgccgcc 60
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 730
Met Lys Lys Leu Leu Ala Ala Val Met Met Ala Gly Leu Ala Gly Ala
1 5 10 15
Val Ser Ala Ala Gly Val His Val Glu Asp Gly Trp Ala Arg Thr Thr
20 25 30
Val Glu Gly Met Lys Ile Gly Gly Ala Phe Met Lys Ile His Asn Asp
35 40 45
Glu Ala Lys Gln Asp Phe Leu Leu Gly Gly Ser Ser Pro Val Ala Asp
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85 90 95
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100 105 110
Leu Lys Glu Gly Asp Lys Ile Pro Val Thr Leu Lys Phe Lys Asn Ala
115 120 125
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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atgaaaaaat tattggcggc cgtgatgatg gcaggtttgg caggcgcggt ttccgccgcc 60
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cgcgaagtcg aaggcggcgt gcctttggaa gcgaaatccg ttaccgaact caaacccggc 300
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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Met Lys Lys Leu Leu Ala Ala Val Met Met Ala Gly Leu Ala Gly Ala
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Val Ser Ala Ala Gly Val His Val Glu Asp Gly Trp Ala Arg Thr Thr
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Val Glu Gly Met Lys Ile Gly Gly Ala Phe Met Lys Ile His Asn Asp
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Glu Ala Lys Gln Asp Phe Leu Leu Gly Gly Ser Ser Pro Val Ala Asp
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<220>
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<223> n is a, c, g, or t
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gcgttcatga aaatccacaa cgacgaagcc aaacaagact ttttgctcgg cggaagcagc 180
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ccgatgtcgg caatggacca cggtcatcac cacggcgaag cgcatcagca ctaa 474
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Met Lys Xaa Leu Leu Ala Ala Val Met Met Ala Gly Leu Ala Gly Ala
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Val Ser Ala Ala Gly Ile His Val Glu Asp Gly Trp Ala Arg Thr Thr
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Val Glu Gly Met Lys Met Gly Gly Ala Phe Met Lys Ile His Asn Asp
35 40 45
Glu Ala Lys Gln Asp Phe Leu Leu Gly Gly Ser Ser Pro Val Ala Asp
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Arg Val Glu Val His Thr His Ile Asn Asp Asn Gly Val Met Arg Met
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Arg Glu Val Glu Gly Gly Val Pro Leu Glu Ala Lys Ser Val Thr Glu
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Leu Lys Xaa Gly Asp Lys Ile Pro Val Thr Leu Lys Phe Lys Asn Ala
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Lys Ala Gln Thr Val Gln Leu Glu Val Lys Thr Ala Pro Met Ser Ala
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n 1
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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Ile Asn Asp Asn Gly Val Met Arg Met Arg Glu Val Lys Gly Gly Val
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Pro Leu Glu Ala Lys Ser Val Thr Glu Leu Lys Pro Gly Ser Tyr His
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Pro Val Thr Leu Lys Phe Lys Asn Ala Lys Ala Gln Thr Val Gln Leu
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85
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<211> 157
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 738
Met Lys Lys Leu Leu Ala Ala Val Met Met Ala Gly Leu Ala Gly Ala
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Val Ser Ala Ala Gly Val His Val Glu Asp Gly Trp Ala Arg Thr Thr
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Val Glu Gly Met Lys Met Gly Gly Ala Phe Met Lys Ile His Asn Asp
35 40 45
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<211> 233
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<222> (1)..(1)
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<211> 702
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 747
atgacggaac ctgcggccga aggcggcaaa gctgccaagg cgttaaaaaa atatctgatt 60
acaggcattt tggtctggct gccgattgcg gtaacggttt gggtggtttc ctatatcgtt 120
tccgcgtccg accagcttgt caacctgctg ccgaagcaat ggcggccgca atatgttttg 180
gggtttaata tccccgggct cggcgttatt gttgccattg ccgtattgtt tgtaaccgga 240
ttatttgccg caaacgtgtt gggccggcag attcttgccg cgtgggacag cctgttgggg 300
cggattccgg ttgtcaaatc catctattcg agtgtgaaaa aagtatccga atcgctgctg 360
tccgacagca gccgttcgtt taaaacgccg gtactcgtgc cgtttcccca atcgggtatt 420
tggacaatcg cattcgtgtc cggtcaggtg tcgaatgcgg ttaaggccgc attgccgcag 480
gatggcgatt atctttccgt gtatgtcccg accacgccca acccgaccgg cggttactat 540
attatggtaa agaaaagcga tgtgcgcgaa ctcgatatga gcgtggacga agcgttgaaa 600
tatgtgattt cgctgggtat ggtcatccct gacgacctgc ccgtcaaaac attggcagga 660
cctatgccgc ctgaaaaggc ggagttgccc gaacaacaat aa 702
<210> 748
<211> 233
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 748
Met Thr Glu Pro Ala Ala Glu Gly Gly Lys Ala Ala Lys Ala Leu Lys
1 5 10 15
Lys Tyr Leu Ile Thr Gly Ile Leu Val Trp Leu Pro Ile Ala Val Thr
20 25 30
Val Trp Val Val Ser Tyr Ile Val Ser Ala Ser Asp Gln Leu Val Asn
35 40 45
Leu Leu Pro Lys Gln Trp Arg Pro Gln Tyr Val Leu Gly Phe Asn Ile
50 55 60
Pro Gly Leu Gly Val Ile Val Ala Ile Ala Val Leu Phe Val Thr Gly
65 70 75 80
Leu Phe Ala Ala Asn Val Leu Gly Arg Gln Ile Leu Ala Ala Trp Asp
85 90 95
Ser Leu Leu Gly Arg Ile Pro Val Val Lys Ser Ile Tyr Ser Ser Val
100 105 110
Lys Lys Val Ser Glu Ser Leu Leu Ser Asp Ser Ser Arg Ser Phe Lys
115 120 125
Thr Pro Val Leu Val Pro Phe Pro Gln Ser Gly Ile Trp Thr Ile Ala
130 135 140
Phe Val Ser Gly Gln Val Ser Asn Ala Val Lys Ala Ala Leu Pro Gln
145 150 155 160
Asp Gly Asp Tyr Leu Ser Val Tyr Val Pro Thr Thr Pro Asn Pro Thr
165 170 175
Gly Gly Tyr Tyr Ile Met Val Lys Lys Ser Asp Val Arg Glu Leu Asp
180 185 190
Met Ser Val Asp Glu Ala Leu Lys Tyr Val Ile Ser Leu Gly Met Val
195 200 205
Ile Pro Asp Asp Leu Pro Val Lys Thr Leu Ala Gly Pro Met Pro Pro
210 215 220
Glu Lys Ala Glu Leu Pro Glu Gln Gln
225 230
<210> 749
<211> 1162
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (235)..(235)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (591)..(591)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 749
atgaaaacgg tagtctggat tgtcgtcctg tttgccgccg ccgtcggact ggcgctggct 60
tcgggcattt acaccggcga cgtgtatatc gtactcggac agaccatgct cagaatcaac 120
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ttcattatcg gsggtactca atatccccga aaagatgcag cgtttcggtt cggcncgtaa 240
aggcckcaag sscgsgcttg ccttgaacaa ggcgggtttg gcgtattttg aagggcgttt 300
tgaaaaggcg gaactagaag cctcacgcgt gttggtcaac aaagtaggcc gagagacaac 360
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cgcgaccgtt atcttgcgga aatcgccaaa ctgccggaaa aacagcagct ttcccgttat 480
cttttgttgg cggaatcggc gttgaaccgg cgcgattacg aagcggcgga agccaatctt 540
catgcggcgg cgaagatgaa tgccaacctt acgcgcctcg tgcgtctgca nattcgttac 600
gctttcgaca ggggcgacgc gttgcaggtt ctggcaaaaa ccgaaaaact ttccaaggcg 660
ggcgcgttgg gcaaatcgga aatggaacgg tatcaaaatt gggcatatcc gtcgccagct 720
ggcggatgct gccgatgccg ccgctttgaa aacctgcctg aagcggattc ccgacagcct 780
caaaaacggg gaattgagcg tatcggttgc ggaaaagtac gaacgtttgg gactgtatgc 840
cgatgcggtc aaatgggtca aacagcatta tccgcasaac cgccgccccg agcttttgga 900
agcctttgtc gaaagcgtgc gctttttggg cgagcgcgaa cagcagaaag ccatcgattt 960
tgccgatgct tggctgaaag aacagcccga taacgcgctt ctgctgatgt atctcggtcg 1020
gctcgccttc ggccgcaaac tttggggcaa ggcaaaaggc taccttgaag cgagcattgc 1080
attaaagccg agtatttccg cgcgtttggt tctaacaaag gttttcgacg aaatcggaga 1140
accgcagaag gcggaggcgc ac 1162
<210> 750
<211> 386
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (82)..(82)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (291)..(291)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 750
Met Lys Thr Val Val Trp Ile Val Val Leu Phe Ala Ala Ala Val Gly
1 5 10 15
Leu Ala Leu Ala Ser Gly Ile Tyr Thr Gly Asp Val Tyr Ile Val Leu
20 25 30
Gly Gln Thr Met Leu Arg Ile Asn Leu His Ala Phe Val Leu Gly Ser
35 40 45
Leu Ile Ala Val Val Val Trp Tyr Phe Leu Phe Lys Phe Ile Ile Gly
50 55 60
Val Leu Asn Ile Pro Glu Lys Met Gln Arg Phe Gly Ser Ala Arg Lys
65 70 75 80
Gly Xaa Lys Xaa Xaa Leu Ala Leu Asn Lys Ala Gly Leu Ala Tyr Phe
85 90 95
Glu Gly Arg Phe Glu Lys Ala Glu Leu Glu Ala Ser Arg Val Leu Val
100 105 110
Asn Lys Val Gly Arg Asp Asn Arg Thr Leu Ala Leu Met Leu Xaa Ala
115 120 125
His Ala Ala Gly Gln Met Glu Asn Ile Xaa Xaa Arg Asp Arg Tyr Leu
130 135 140
Ala Glu Ile Ala Lys Leu Pro Glu Lys Gln Gln Leu Ser Arg Tyr Leu
145 150 155 160
Leu Leu Ala Glu Ser Ala Leu Asn Arg Arg Asp Tyr Glu Ala Ala Glu
165 170 175
Ala Asn Leu His Ala Ala Ala Lys Met Asn Ala Asn Leu Thr Arg Leu
180 185 190
Val Arg Leu Xaa Ile Arg Tyr Ala Phe Asp Arg Gly Asp Ala Leu Gln
195 200 205
Val Leu Ala Lys Thr Glu Lys Leu Ser Lys Ala Gly Ala Leu Gly Lys
210 215 220
Ser Glu Met Glu Arg Tyr Gln Asn Trp Ala Tyr Arg Arg Gln Leu Ala
225 230 235 240
Asp Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Lys Thr Cys Leu Lys Arg Ile Pro
245 250 255
Asp Ser Leu Lys Asn Gly Glu Leu Ser Val Ser Val Ala Glu Lys Tyr
260 265 270
Glu Arg Leu Gly Leu Tyr Ala Asp Ala Val Lys Trp Val Lys Gln His
275 280 285
Tyr Pro Xaa Asn Arg Arg Pro Glu Leu Leu Glu Ala Phe Val Glu Ser
290 295 300
Val Arg Phe Leu Gly Glu Arg Glu Gln Gln Lys Ala Ile Asp Phe Ala
305 310 315 320
Asp Ala Trp Leu Lys Glu Gln Pro Asp Asn Ala Leu Leu Leu Met Tyr
325 330 335
Leu Gly Arg Leu Ala Phe Gly Arg Lys Leu Trp Gly Lys Ala Lys Gly
340 345 350
Tyr Leu Glu Ala Ser Ile Ala Leu Lys Pro Ser Ile Ser Ala Arg Leu
355 360 365
Val Leu Thr Lys Val Phe Asp Glu Ile Gly Glu Pro Gln Lys Ala Glu
370 375 380
Ala His
385
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<211> 1224
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 751
atgaaaacgg tagtctggat tgtcgtcctg tttgccgccg ccgtcggact ggcgctggct 60
tcgggcattt acaccggcga cgtgtatatc gtactcggac agaccatgct cagaatcaac 120
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<210> 752
<211> 407
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 752
Met Lys Thr Val Val Trp Ile Val Val Leu Phe Ala Ala Ala Val Gly
1 5 10 15
Leu Ala Leu Ala Ser Gly Ile Tyr Thr Gly Asp Val Tyr Ile Val Leu
20 25 30
Gly Gln Thr Met Leu Arg Ile Asn Leu His Ala Phe Val Leu Gly Ser
35 40 45
Leu Ile Ala Val Val Val Trp Tyr Phe Leu Phe Lys Phe Ile Ile Gly
50 55 60
Val Leu Asn Ile Pro Glu Lys Met Gln Arg Phe Gly Ser Ala Arg Lys
65 70 75 80
Gly Arg Lys Ala Ala Leu Ala Leu Asn Lys Ala Gly Leu Ala Tyr Phe
85 90 95
Glu Gly Arg Phe Glu Lys Ala Glu Leu Glu Ala Ser Arg Val Leu Val
100 105 110
Asn Lys Glu Ala Gly Asp Asn Arg Thr Leu Ala Leu Met Leu Gly Ala
115 120 125
His Ala Ala Gly Gln Met Glu Asn Ile Glu Leu Arg Asp Arg Tyr Leu
130 135 140
Ala Glu Ile Ala Lys Leu Pro Glu Lys Gln Gln Leu Ser Arg Tyr Leu
145 150 155 160
Leu Leu Ala Glu Ser Ala Leu Asn Arg Arg Asp Tyr Glu Ala Ala Glu
165 170 175
Ala Asn Leu His Ala Ala Ala Lys Met Asn Ala Asn Leu Thr Arg Leu
180 185 190
Val Arg Leu Gln Leu Arg Tyr Ala Phe Asp Arg Gly Asp Ala Leu Gln
195 200 205
Val Leu Ala Lys Thr Glu Lys Leu Ser Lys Ala Gly Ala Leu Gly Lys
210 215 220
Ser Glu Met Glu Arg Tyr Gln Asn Trp Ala Tyr Arg Arg Gln Leu Ala
225 230 235 240
Asp Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Lys Thr Cys Leu Lys Arg Ile Pro
245 250 255
Asp Ser Leu Lys Asn Gly Glu Leu Ser Val Ser Val Ala Glu Lys Tyr
260 265 270
Glu Arg Leu Gly Leu Tyr Ala Asp Ala Val Lys Trp Val Lys Gln His
275 280 285
Tyr Pro His Asn Arg Arg Pro Glu Leu Leu Glu Ala Phe Val Glu Ser
290 295 300
Val Arg Phe Leu Gly Glu Arg Glu Gln Gln Lys Ala Ile Asp Phe Ala
305 310 315 320
Asp Ala Trp Leu Lys Glu Gln Pro Asp Asn Ala Leu Leu Leu Met Tyr
325 330 335
Leu Gly Arg Leu Ala Tyr Gly Arg Lys Leu Trp Gly Lys Ala Lys Gly
340 345 350
Tyr Leu Glu Ala Ser Ile Ala Leu Lys Pro Ser Ile Ser Ala Arg Leu
355 360 365
Val Leu Ala Lys Val Phe Asp Glu Ile Gly Glu Pro Gln Lys Ala Glu
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Ala Gln Arg Asn Leu Val Leu Glu Ala Val Ser Asp Asp Glu Arg His
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Ala Ala Leu Glu Gln His Ser
405
<210> 753
<211> 1218
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (42)..(43)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
<222> (1197)..(1197)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 753
atgaaaacgg tagtctggat tgtcgtcctg tttgccgccg cnntcgggct ggcattggcg 60
tcgggcattn acaccggcga cgtgtatatc gtactcggac agaccatgct cagaatcaac 120
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ttcatcatcg gcgtactcaa tanccccgaa aagatgcagc gtttcggttc ggcgcgtaaa 240
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ttgttggcgg aatcggcgtt gaaccggcgc gattacgaag cggcggaagc caatcttcat 540
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gatgctgccg atgccgccgc tttgaaaacc tgcctgaagc ggattcccga cagcctcaaa 780
aacggggaat tgagcgtatc ggttgcggaa aagtacgaac gtttgggact gtatgccgat 840
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tttgtcgaaa gcgtgcgctt tttgggcgaa cgcgatcagc agaaagccat cgattttgcc 960
gatgcttggc tgaaagaaca gcccgataat gcgcttctgc tgangtatct cggtcggctc 1020
gcctacggcc gcaaactttg gggcaaggca aaaggctacc ttgaagcgag cattgcatta 1080
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cagaaggcgg aggcgcagcg caacttggtt ttggcaagcg ttgccgagga aaaccgncct 1200
tccgccgaaa cccattga 1218
<210> 754
<211> 405
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (15)..(15)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (68)..(68)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (216)..(216)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (222)..(222)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (240)..(240)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (335)..(335)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 754
Met Lys Thr Val Val Trp Ile Val Val Leu Phe Ala Ala Ala Xaa Gly
1 5 10 15
Leu Ala Leu Ala Ser Gly Ile Xaa Thr Gly Asp Val Tyr Ile Val Leu
20 25 30
Gly Gln Thr Met Leu Arg Ile Asn Leu His Ala Phe Val Leu Gly Ser
35 40 45
Leu Ile Ala Val Val Val Trp Tyr Phe Leu Phe Lys Phe Ile Ile Gly
50 55 60
Val Leu Asn Xaa Pro Glu Lys Met Gln Arg Phe Gly Ser Ala Arg Lys
65 70 75 80
Gly Arg Lys Ala Ala Leu Ala Leu Asn Lys Ala Gly Leu Ala Tyr Phe
85 90 95
Glu Gly Arg Phe Glu Lys Ala Glu Leu Glu Ala Ser Arg Val Leu Gly
100 105 110
Asn Lys Glu Ala Gly Asp Asn Arg Thr Leu Ala Leu Met Leu Gly Ala
115 120 125
His Ala Ala Gly Gln Met Glu Asn Ile Glu Leu Arg Asp Arg Tyr Leu
130 135 140
Ala Glu Ile Ala Lys Leu Pro Glu Lys Gln Gln Leu Ser Arg Tyr Leu
145 150 155 160
Leu Leu Ala Glu Ser Ala Leu Asn Arg Arg Asp Tyr Glu Ala Ala Glu
165 170 175
Ala Asn Leu His Ala Ala Ala Lys Met Asn Ala Asn Leu Thr Arg Leu
180 185 190
Val Arg Leu Gln Leu Arg Tyr Ala Phe Asp Arg Gly Asp Ala Leu Gln
195 200 205
Val Leu Ala Lys Thr Glu Lys Xaa Ser Lys Ala Gly Ala Xaa Gly Lys
210 215 220
Ser Glu Met Glu Arg Tyr Gln Asn Trp Ala Tyr Arg Arg Gln Leu Xaa
225 230 235 240
Asp Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Lys Thr Cys Leu Lys Arg Ile Pro
245 250 255
Asp Ser Leu Lys Asn Gly Glu Leu Ser Val Ser Val Ala Glu Lys Tyr
260 265 270
Glu Arg Leu Gly Leu Tyr Ala Asp Ala Val Lys Trp Val Lys Gln His
275 280 285
Tyr Pro His Asn Arg Arg Pro Glu Leu Leu Glu Ala Phe Val Glu Ser
290 295 300
Val Arg Phe Leu Gly Glu Arg Asp Gln Gln Lys Ala Ile Asp Phe Ala
305 310 315 320
Asp Ala Trp Leu Lys Glu Gln Pro Asp Asn Ala Leu Leu Leu Xaa Tyr
325 330 335
Leu Gly Arg Leu Ala Tyr Gly Arg Lys Leu Trp Gly Lys Ala Lys Gly
340 345 350
Tyr Leu Glu Ala Ser Ile Ala Leu Lys Pro Ser Ile Ser Ala Arg Leu
355 360 365
Val Leu Ala Lys Val Phe Asp Glu Thr Gly Glu Pro Gln Lys Ala Glu
370 375 380
Ala Gln Arg Asn Leu Val Leu Ala Ser Val Ala Glu Glu Asn Arg Pro
385 390 395 400
Ser Ala Glu Thr His
405
<210> 755
<211> 1218
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 755
atgaaaacgg tagtctggat tgttgtcctg tttgccgccg ccgtcggact ggcgctggct 60
tcgggcattt acaccggcga cgtgtatatc gtactcggac agaccatgct cagaatcaac 120
ctgcacgcct ttgtgttagg ttcgctgatt gccgtcgtgg tgtggtattt cctgtttaaa 180
ttcatcatcg gcgtactcaa tatccccgaa aatatgcggc gttccggttc ggcgcggaaa 240
ggccgcaagg ccgcgcttgc cttgaataag gcgggtttgg cgtatttcga agggcgtttt 300
gaaaaggcgg aactcgaagc ctctcgagtg ttgggcaaca aagaggccgg agacaaccgg 360
actttggcat tgatgctggg cgcgcacgcg gcaggacaga tggaaaatat cgagctgcgc 420
gaccgttatc ttgcggaaat cgccaaactg ccggaaaaac agcagctttc ccgctatctt 480
ctgctggcgg aatcggcgtt aaaccggcgc gattacgaag cggcggaagc caatcttcat 540
gcggcggcga agatgaatgc caaccttacg cgcctcgtgc gtctgcaact tcgttacgcc 600
ttcgatcggg gcgatgcgtt gcaggttctg gcaaaaaccg aaaaactttc caaggcgggc 660
gcgttgggca aatcggaaat ggaacggtat caaaattggg cataccgccg ccagatggcg 720
gatgctgccg atgccgccgc tttgaaaacc tgcctgaagc ggattcccga cagcctcaaa 780
aacggggaat tgagcgtatc ggttgcggaa aagtacgaac gtttgggact gtatgccgat 840
gcggtcaaat gggtcaaaca gcattatccg cacaaccgcc gccccgagct tttggaagcc 900
tttgtcgaaa gcgtgcgctt tttgggcgag cgcgaacagc agaaagccat cgattttgcc 960
gattcttggc tgaaagaaca gcccgataac gcgcttctgc tgatgtatct cggccggctc 1020
gcctacggcc gcaaactttg gggtaaggca aaaggctacc ttgaagcgag tattgcactg 1080
aagccgagta ttccggcgcg tttggtgttg gcaaaggttt ttgacgaaac cgcacagtcg 1140
caaaaagccg aagcacagcg caacttggtt ttggcaagcg ttgccgggga aaaccgccct 1200
tccgccgaaa cccgttga 1218
<210> 756
<211> 405
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 756
Met Lys Thr Val Val Trp Ile Val Val Leu Phe Ala Ala Ala Val Gly
1 5 10 15
Leu Ala Leu Ala Ser Gly Ile Tyr Thr Gly Asp Val Tyr Ile Val Leu
20 25 30
Gly Gln Thr Met Leu Arg Ile Asn Leu His Ala Phe Val Leu Gly Ser
35 40 45
Leu Ile Ala Val Val Val Trp Tyr Phe Leu Phe Lys Phe Ile Ile Gly
50 55 60
Val Leu Asn Ile Pro Glu Asn Met Arg Arg Ser Gly Ser Ala Arg Lys
65 70 75 80
Gly Arg Lys Ala Ala Leu Ala Leu Asn Lys Ala Gly Leu Ala Tyr Phe
85 90 95
Glu Gly Arg Phe Glu Lys Ala Glu Leu Glu Ala Ser Arg Val Leu Gly
100 105 110
Asn Lys Glu Ala Gly Asp Asn Arg Thr Leu Ala Leu Met Leu Gly Ala
115 120 125
His Ala Ala Gly Gln Met Glu Asn Ile Glu Leu Arg Asp Arg Tyr Leu
130 135 140
Ala Glu Ile Ala Lys Leu Pro Glu Lys Gln Gln Leu Ser Arg Tyr Leu
145 150 155 160
Leu Leu Ala Glu Ser Ala Leu Asn Arg Arg Asp Tyr Glu Ala Ala Glu
165 170 175
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Val Leu Ala Lys Thr Glu Lys Leu Ser Lys Ala Gly Ala Leu Gly Lys
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<220>
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<222> (42)..(239)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ile
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ctgaccgtga aaaatcgcgg cggcaaggcg ttcgtacgcg tgttgggtgc ggacggcaag 1020
gcagtggaac gcgaaatccg gaccggtatg aaagacagta tgaataccga agtgaaaagc 1080
gggttgaaag agggggacaa agtggtcatc tccgaaataa ccgccgccga gcagcaggaa 1140
agcggcgaac gcgccctagg cggcccgccg cgccgataa 1179
<210> 772
<211> 392
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 772
Met Ala Lys Met Met Lys Trp Ala Ala Val Ala Ala Val Ala Ala Ala
1 5 10 15
Ala Val Trp Gly Gly Trp Ser Tyr Leu Lys Pro Glu Pro Gln Ala Ala
20 25 30
Tyr Ile Thr Glu Ala Val Arg Arg Gly Asp Ile Ser Arg Thr Val Ser
35 40 45
Ala Thr Gly Glu Ile Ser Pro Ser Asn Leu Val Ser Val Gly Ala Gln
50 55 60
Ala Ser Gly Gln Ile Lys Lys Leu Tyr Val Lys Leu Gly Gln Gln Val
65 70 75 80
Lys Lys Gly Asp Leu Ile Ala Glu Ile Asn Ser Thr Thr Gln Thr Asn
85 90 95
Thr Ile Asp Met Glu Lys Ser Lys Leu Glu Thr Tyr Gln Ala Lys Leu
100 105 110
Val Ser Ala Gln Ile Ala Leu Gly Ser Ala Glu Lys Lys Tyr Lys Arg
115 120 125
Gln Ala Ala Leu Trp Lys Asp Asp Ala Thr Ser Lys Glu Asp Leu Glu
130 135 140
Ser Ala Gln Asp Ala Leu Ala Ala Ala Lys Ala Asn Val Ala Glu Leu
145 150 155 160
Lys Ala Leu Ile Arg Gln Ser Lys Ile Ser Ile Asn Thr Ala Glu Ser
165 170 175
Asp Leu Gly Tyr Thr Arg Ile Thr Ala Thr Met Asp Gly Thr Val Val
180 185 190
Ala Ile Pro Val Glu Glu Gly Gln Thr Val Asn Ala Ala Gln Ser Thr
195 200 205
Pro Thr Ile Val Gln Leu Ala Asn Leu Asp Met Met Leu Asn Lys Met
210 215 220
Gln Ile Ala Glu Gly Asp Ile Thr Lys Val Lys Ala Gly Gln Asp Ile
225 230 235 240
Ser Phe Thr Ile Leu Ser Glu Pro Asp Thr Pro Ile Lys Ala Lys Leu
245 250 255
Asp Ser Val Asp Pro Gly Leu Thr Thr Met Ser Ser Gly Gly Tyr Asn
260 265 270
Ser Ser Thr Asp Thr Ala Ser Asn Ala Val Tyr Tyr Tyr Ala Arg Ser
275 280 285
Phe Val Pro Asn Pro Asp Gly Lys Leu Ala Thr Gly Met Thr Thr Gln
290 295 300
Asn Thr Val Glu Ile Asp Gly Val Lys Asn Val Leu Leu Ile Pro Ser
305 310 315 320
Leu Thr Val Lys Asn Arg Gly Gly Lys Ala Phe Val Arg Val Leu Gly
325 330 335
Ala Asp Gly Lys Ala Val Glu Arg Glu Ile Arg Thr Gly Met Lys Asp
340 345 350
Ser Met Asn Thr Glu Val Lys Ser Gly Leu Lys Glu Gly Asp Lys Val
355 360 365
Val Ile Ser Glu Ile Thr Ala Ala Glu Gln Gln Glu Ser Gly Glu Arg
370 375 380
Ala Leu Gly Gly Pro Pro Arg Arg
385 390
<210> 773
<211> 555
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 773
attcccgcca cgatgacatt tgaacgcagc ggcaatgctt acaaaatcgt ttcgacgatt 60
aaagtgccgc tatacaatat ccgtttcgag tccggcggta cggttgtcgg caataccctg 120
caccctacct actatagaga catacgcagg ggcaaactgt atgcggaagc caaattcgcc 180
gacggcagcg taacttacgg caaagcgggc gagagcaaaa ccgagcaaag ccccaaggct 240
atggatttgt tcacgcttgc ctggcagttg gcggcaaatg acgcgaaact ccccccgggg 300
ctgaaaatca ccaacggcaa aaaactttat tccgtcggcg gtttgaataa ggcgggtaca 360
ggaaaataca gcataggcgg cgtggaaacc gaagtcgtca aatatcgggt gcggcgcggc 420
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tataccgacg acggcaaaac ctatacgctg aaactcaaat cggtgcagat caacggccag 540
gcagccaaac cgtaa 555
<210> 774
<211> 184
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 774
Ile Pro Ala Thr Met Thr Phe Glu Arg Ser Gly Asn Ala Tyr Lys Ile
1 5 10 15
Val Ser Thr Ile Lys Val Pro Leu Tyr Asn Ile Arg Phe Glu Ser Gly
20 25 30
Gly Thr Val Val Gly Asn Thr Leu His Pro Thr Tyr Tyr Arg Asp Ile
35 40 45
Arg Arg Gly Lys Leu Tyr Ala Glu Ala Lys Phe Ala Asp Gly Ser Val
50 55 60
Thr Tyr Gly Lys Ala Gly Glu Ser Lys Thr Glu Gln Ser Pro Lys Ala
65 70 75 80
Met Asp Leu Phe Thr Leu Ala Trp Gln Leu Ala Ala Asn Asp Ala Lys
85 90 95
Leu Pro Pro Gly Leu Lys Ile Thr Asn Gly Lys Lys Leu Tyr Ser Val
100 105 110
Gly Gly Leu Asn Lys Ala Gly Thr Gly Lys Tyr Ser Ile Gly Gly Val
115 120 125
Glu Thr Glu Val Val Lys Tyr Arg Val Arg Arg Gly Asp Asp Ala Val
130 135 140
Met Tyr Phe Phe Ala Pro Ser Leu Asn Asn Ile Pro Ala Gln Ile Gly
145 150 155 160
Tyr Thr Asp Asp Gly Lys Thr Tyr Thr Leu Lys Leu Lys Ser Val Gln
165 170 175
Ile Asn Gly Gln Ala Ala Lys Pro
180
<210> 775
<211> 672
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 775
atgatgaaga cttttaaaaa tatattttcc gccgccattt tgtccgccgc cctgccgtgc 60
gcgtatgcgg cagggctgcc ccaatccgcc gtgctgcact attccggcag ctacggcatt 120
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gtgccgctat acaatatccg tttcgagtcc ggcggtacgg ttgtcggcaa taccctgcac 240
cctacctact atagagacat acgcaggggc aaactgtatg cggaagccaa attcgccgac 300
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aaaatcacca acggcaaaaa actttattcc gtcggcggtt tgaataaggc gggtacagga 480
aaatacagca taggcggcgt ggaaaccgaa gtcgtcaaat atcgggtgcg gcgcggcgac 540
gatgcggtaa tgtatttctt cgcaccgtcc ctgaacaata ttccggcaca aatcggctat 600
accgacgacg gcaaaaccta tacgctgaaa ctcaaatcgg tgcagatcaa cggccaggca 660
gccaaaccgt aa 672
<210> 776
<211> 223
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 776
Met Met Lys Thr Phe Lys Asn Ile Phe Ser Ala Ala Ile Leu Ser Ala
1 5 10 15
Ala Leu Pro Cys Ala Tyr Ala Ala Gly Leu Pro Gln Ser Ala Val Leu
20 25 30
His Tyr Ser Gly Ser Tyr Gly Ile Pro Ala Thr Met Thr Phe Glu Arg
35 40 45
Ser Gly Asn Ala Tyr Lys Ile Val Ser Thr Ile Lys Val Pro Leu Tyr
50 55 60
Asn Ile Arg Phe Glu Ser Gly Gly Thr Val Val Gly Asn Thr Leu His
65 70 75 80
Pro Thr Tyr Tyr Arg Asp Ile Arg Arg Gly Lys Leu Tyr Ala Glu Ala
85 90 95
Lys Phe Ala Asp Gly Ser Val Thr Tyr Gly Lys Ala Gly Glu Ser Lys
100 105 110
Thr Glu Gln Ser Pro Lys Ala Met Asp Leu Phe Thr Leu Ala Trp Gln
115 120 125
Leu Ala Ala Asn Asp Ala Lys Leu Pro Pro Gly Leu Lys Ile Thr Asn
130 135 140
Gly Lys Lys Leu Tyr Ser Val Gly Gly Leu Asn Lys Ala Gly Thr Gly
145 150 155 160
Lys Tyr Ser Ile Gly Gly Val Glu Thr Glu Val Val Lys Tyr Arg Val
165 170 175
Arg Arg Gly Asp Asp Ala Val Met Tyr Phe Phe Ala Pro Ser Leu Asn
180 185 190
Asn Ile Pro Ala Gln Ile Gly Tyr Thr Asp Asp Gly Lys Thr Tyr Thr
195 200 205
Leu Lys Leu Lys Ser Val Gln Ile Asn Gly Gln Ala Ala Lys Pro
210 215 220
<210> 777
<211> 672
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (82)..(82)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (129)..(129)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (149)..(149)
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<220>
<221> misc_feature
<222> (158)..(158)
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
<221> misc_feature
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<220>
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<220>
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<220>
<221> misc_feature
<222> (378)..(378)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 777
atgatgaaga cttttaaaaa tatattttcc gccgccattt tgtccgccgc cctgccgtgc 60
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aaatacagca taggcggcgt ggaaaccgaa gtcgtcaaat atcgggtgcg gcgcggcgac 540
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gccaaaccgt aa 672
<210> 778
<211> 223
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (28)..(28)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (44)..(50)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (53)..(53)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
<222> (109)..(114)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 778
Met Met Lys Thr Phe Lys Asn Ile Phe Ser Ala Ala Ile Leu Ser Ala
1 5 10 15
Ala Leu Pro Cys Ala Tyr Ala Ala Gly Leu Pro Xaa Ser Ala Val Leu
20 25 30
His Tyr Ser Gly Ser Tyr Gly Ile Pro Ala Thr Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
35 40 45
Xaa Xaa Asn Ala Xaa Lys Ile Val Ser Thr Ile Lys Val Pro Leu Tyr
50 55 60
Asn Ile Arg Phe Glu Ser Gly Gly Thr Val Val Gly Asn Thr Leu His
65 70 75 80
Pro Thr Tyr Tyr Arg Asp Ile Arg Arg Gly Lys Leu Tyr Ala Glu Ala
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Lys Phe Ala Asp Gly Ser Val Thr Tyr Gly Lys Ala Xaa Xaa Xaa Xaa
100 105 110
Xaa Xaa Gln Ser Pro Lys Ala Met Asp Leu Phe Thr Leu Ala Trp Gln
115 120 125
Leu Ala Ala Asn Asp Ala Lys Leu Pro Pro Gly Leu Lys Ile Thr Asn
130 135 140
Gly Lys Lys Leu Tyr Ser Val Gly Gly Leu Asn Lys Ala Gly Thr Gly
145 150 155 160
Lys Tyr Ser Ile Gly Gly Val Glu Thr Glu Val Val Lys Tyr Arg Val
165 170 175
Arg Arg Gly Asp Asp Ala Val Met Tyr Phe Phe Ala Pro Ser Leu Asn
180 185 190
Asn Ile Pro Ala Gln Ile Gly Tyr Thr Asp Asp Gly Lys Thr Tyr Thr
195 200 205
Leu Lys Leu Lys Ser Val Gln Ile Asn Gly Gln Ala Ala Lys Pro
210 215 220
<210> 779
<211> 672
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 779
atgatgaaga cttttaaaaa tatattttcc gccgccattt tgtccgccgc cctgccgtgc 60
gcgtatgcgg caaggctacc ccaatccgcc gtgctgcact attccggcag ctacggcatt 120
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gccaaaccgt aa 672
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<211> 223
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 780
Met Met Lys Thr Phe Lys Asn Ile Phe Ser Ala Ala Ile Leu Ser Ala
1 5 10 15
Ala Leu Pro Cys Ala Tyr Ala Ala Arg Leu Pro Gln Ser Ala Val Leu
20 25 30
His Tyr Ser Gly Ser Tyr Gly Ile Pro Ala Thr Met Thr Phe Glu Arg
35 40 45
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50 55 60
Asn Ile Arg Phe Glu Ser Gly Gly Thr Val Val Gly Asn Thr Leu His
65 70 75 80
Pro Ala Tyr Tyr Lys Asp Ile Arg Arg Gly Lys Leu Tyr Ala Glu Ala
85 90 95
Lys Phe Ala Asp Gly Ser Val Thr Tyr Gly Lys Ala Gly Glu Ser Lys
100 105 110
Thr Glu Gln Ser Pro Lys Ala Met Asp Leu Phe Thr Leu Ala Trp Gln
115 120 125
Leu Ala Ala Asn Asp Ala Lys Leu Pro Pro Gly Leu Lys Ile Thr Asn
130 135 140
Gly Lys Lys Leu Tyr Ser Val Gly Gly Leu Asn Lys Ala Gly Thr Gly
145 150 155 160
Lys Tyr Ser Ile Gly Gly Val Glu Thr Glu Val Val Lys Tyr Arg Val
165 170 175
Arg Arg Gly Asp Asp Thr Val Thr Tyr Phe Phe Ala Pro Ser Leu Asn
180 185 190
Asn Ile Pro Ala Gln Ile Gly Tyr Thr Asp Asp Gly Lys Thr Tyr Thr
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Leu Lys Leu Lys Ser Val Gln Ile Asn Gly Gln Ala Ala Lys Pro
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<211> 468
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (51)..(51)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 781
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gccttggtct ggctggtttt cgcgctcggc gatactttga ctccgtttgc ggttgcggcg 120
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attatcgtcc ctatgctggt cgggcagttc aacaatttgg catcgcgcct gccccaatta 300
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (17)..(17)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 782
Met Tyr Arg Arg Lys Gly Arg Gly Ile Lys Pro Trp Met Gly Ala Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Phe Ala Ala Leu Val Trp Leu Val Phe Ala Leu Gly Asp Thr
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Leu Thr Pro Phe Ala Val Ala Ala Val Leu Ala Tyr Val Leu Asp Pro
35 40 45
Leu Val Glu Trp Leu Gln Lys Lys Gly Leu Asn Arg Ala Ser Ala Ser
50 55 60
Met Ser Val Met Val Phe Ser Leu Ile Leu Leu Leu Ala Leu Leu Leu
65 70 75 80
Ile Ile Val Pro Met Leu Val Gly Gln Phe Asn Asn Leu Ala Ser Arg
85 90 95
Leu Pro Gln Leu Ile Gly Phe Met Gln Asn Thr Leu Leu Pro Trp Leu
100 105 110
Lys Asn Thr Ile Gly Gly Tyr Val Glu Ile Asp Gln Ala Ser Ile Ile
115 120 125
Ala Trp Leu Gln Ala His Thr Gly Glu Leu Ser Asn Ala Leu Lys Ala
130 135 140
Trp Phe Pro Val Leu Met Arg Gln Gly Gly Asn Ile
145 150 155
<210> 783
<211> 1071
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 783
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gccttggtct ggctggtttt cgcgctcggc gatactttga ctccgtttgc ggttgcggcg 120
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attatcgtcc ctatgctggt cgggcagttc aacaatttgg catcgcgcct gccccaatta 300
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<210> 784
<211> 356
<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<400> 784
Met Tyr Arg Arg Lys Gly Arg Gly Ile Lys Pro Trp Met Gly Ala Gly
1 5 10 15
Ala Ala Phe Ala Ala Leu Val Trp Leu Val Phe Ala Leu Gly Asp Thr
20 25 30
Leu Thr Pro Phe Ala Val Ala Ala Val Leu Ala Tyr Val Leu Asp Pro
35 40 45
Leu Val Glu Trp Leu Gln Lys Lys Gly Leu Asn Arg Ala Ser Ala Ser
50 55 60
Met Ser Val Met Val Phe Ser Leu Ile Leu Leu Leu Ala Leu Leu Leu
65 70 75 80
Ile Ile Val Pro Met Leu Val Gly Gln Phe Asn Asn Leu Ala Ser Arg
85 90 95
Leu Pro Gln Leu Ile Gly Phe Met Gln Asn Thr Leu Leu Pro Trp Leu
100 105 110
Lys Asn Thr Ile Gly Gly Tyr Val Glu Ile Asp Gln Ala Ser Ile Ile
115 120 125
Ala Trp Leu Gln Ala His Thr Gly Glu Leu Ser Asn Ala Leu Lys Ala
130 135 140
Trp Phe Pro Val Leu Met Arg Gln Gly Gly Asn Ile Val Ser Ser Ile
145 150 155 160
Gly Asn Leu Leu Leu Leu Pro Leu Leu Leu Tyr Tyr Phe Leu Leu Asp
165 170 175
Trp Gln Arg Trp Ser Cys Gly Ile Ala Lys Leu Val Pro Arg Arg Phe
180 185 190
Ala Gly Ala Tyr Thr Arg Ile Thr Gly Asn Leu Asn Glu Val Leu Gly
195 200 205
Glu Phe Leu Arg Gly Gln Leu Leu Val Met Leu Ile Met Gly Leu Val
210 215 220
Tyr Gly Leu Gly Leu Val Leu Val Gly Leu Asp Ser Gly Phe Ala Ile
225 230 235 240
Gly Met Leu Ala Gly Ile Leu Val Phe Val Pro Tyr Leu Gly Ala Phe
245 250 255
Thr Gly Leu Leu Leu Ala Thr Val Ala Ala Leu Leu Gln Phe Gly Ser
260 265 270
Trp Asn Gly Ile Leu Ser Val Trp Ala Val Phe Ala Val Gly Gln Phe
275 280 285
Leu Glu Ser Phe Phe Ile Thr Pro Lys Ile Val Gly Asp Arg Ile Gly
290 295 300
Leu Ser Pro Phe Trp Val Ile Phe Ser Leu Met Ala Phe Gly Gln Leu
305 310 315 320
Met Gly Phe Val Gly Met Leu Ala Gly Leu Pro Leu Ala Ala Val Thr
325 330 335
Leu Val Leu Leu Arg Glu Gly Val Gln Lys Tyr Phe Ala Gly Ser Phe
340 345 350
Tyr Arg Gly Arg
355
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<211> 1071
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 785
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attattgtcc ctatgctggt cgggcagttc aacaatttgg catcgcgcct gccccaatta 300
atcggtttta tgcagaacac gctgctgccg tggttgaaaa atacaatcgg cggatatgtg 360
gaaatcgatc aggcatctat tattgcgtgg cttcaggcgc atacgggcga gttgagcaac 420
gcgcttaagg cgtggtttcc cgttttgatg aggcagggcg gcaatattgt cagcagtatc 480
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 807
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 808
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Val Trp Phe Gly Ala Ala Val Ser Ile Ala Glu Ile Ser Thr Gly Thr
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Lys Cys Gly Ser Val Leu Phe Ser Val Ala Asn Met Leu Gln Leu Ala
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<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<213> Neisseria meningitidis
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Gly Gly Val Ala Asp Asp Glu Ile Val Arg Trp Arg Ala Asp Asp Ile
115 120 125
Ala Glu Arg Glu Pro Gln Leu Gly Gly Arg Phe Ser Asp Gly Ile Tyr
130 135 140
Leu Pro Thr Glu Gly Gln Leu Asp Gly Arg Gln Ile Leu Ser Ala Leu
145 150 155 160
Ala Asp Ala Leu Asp Glu Leu Asn Val Pro Cys His Trp Glu His Glu
165 170 175
Cys Val Pro Glu Gly Leu Gln Ala Gln Tyr Asp Trp Leu Ile Asp Cys
180 185 190
Arg Gly Tyr Gly Ala Lys Thr Ala Trp Asn Gln Ser Pro Glu His Thr
195 200 205
Ser Thr Leu Arg Gly Ile Arg Gly Glu Val Ala Arg Val Tyr Thr Pro
210 215 220
Glu Ile Thr Leu Asn Arg Pro Val Arg Leu Leu His Pro Arg Tyr Pro
225 230 235 240
Leu Tyr Ile Ala Pro Lys Glu Asn His Val Phe Val Ile Gly Ala Thr
245 250 255
Gln Ile Glu Ser Glu Ser Gln Ala Pro Ala Ser Val Arg Ser Gly Leu
260 265 270
Glu Leu Leu Ser Ala Leu Tyr Ala Ile His Pro Ala Phe Gly Glu Ala
275 280 285
Asp Ile Leu Glu Ile Ala Thr Gly Leu Arg Pro Thr Leu Asn His His
290 295 300
Asn Pro Glu Ile Arg Tyr Asn Arg Ala Arg Arg Leu Ile Glu Ile Asn
305 310 315 320
Gly Leu Phe Arg His Gly Phe Met Ile Ser Pro Ala Val Thr Ala Ala
325 330 335
Ala Ala Arg Leu Ala Val Ala Leu Phe Asp Gly Lys Asp Ala Pro Glu
340 345 350
Arg Asp Lys Glu Ser Gly Leu Ala Tyr Ile Arg Arg Gln Asp
355 360 365
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
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<223> n is a, c, g, or t
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Arg Gly Tyr Gly Ala Lys Thr Ala Trp Asn Gln Ser Pro Xaa Xaa Thr
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Ser Thr Leu Arg Gly Ile Arg Gly Glu Val Ala Arg Val Tyr Thr Pro
210 215 220
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 816
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Ala Glu Arg Glu Pro Gln Leu Gly Gly Arg Phe Ser Asp Gly Ile Tyr
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Leu Pro Thr Glu Gly Gln Leu Asp Gly Arg Gln Ile Leu Ser Ala Leu
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165 170 175
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180 185 190
Arg Gly Tyr Gly Ala Lys Thr Ala Trp Asn Gln Ser Pro Glu His Thr
195 200 205
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210 215 220
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Ser Thr Ser Pro Arg Lys Lys Thr Thr Ser Ser Ser Ser Ala Arg Pro
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<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
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Gln Ile Glu Ser Glu Ser Gln Ala Pro Ala Ser Val Arg Ser Gly Leu
260 265 270
Glu Leu Leu Ser Ala Leu Tyr Ala Val His Pro Ala Phe Gly Glu Ala
275 280 285
Asp Ile Leu Glu Ile Ala Ala Gly Leu Arg Pro Thr Leu Asn His His
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Asn Pro Glu Ile Arg Tyr Ser Arg Glu Arg Arg Leu Ile Glu Ile Asn
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Gly Leu Phe Arg His Gly Phe Met Ile Ser Pro Ala Val Thr Ala Ala
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
<221> misc_feature
<222> (92)..(92)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 820
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<212> DNA
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
<400> 824
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 825
atgactgata atcgggggtt tacactggtt gaattaatat cagtggtctt gatattgtct 60
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<211> 149
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<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 826
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<213> Neisseria meningitidis
<400> 827
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gtttttgcca agcgggtttt ataccgacat cctcaaccaa cccaatactt attacctttc 360
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Phe Arg Gln Pro Glu Thr Cys Arg Tyr Phe Asp Gly Gly Val Val Ala
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Cys Cys Gly Cys Phe Ile Ala Val Phe Thr Ala Thr Cys Arg Ile Phe
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Arg Arg Arg Leu Leu Ala Gly Val Ala Ala Val Leu Arg Leu Ala Asp
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Leu Ala Arg Arg Gln His Arg Thr Leu Arg Ser Val Asp Val Thr Ala
115 120 125
Ala Phe Thr Val Phe Gln Thr Ala Tyr Ala Val Ser Gly Asp Leu Asn
130 135 140
Leu Leu Arg Ala Gln Val His Leu Asn Met Ala Ala Val Met Phe Val
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Ser Val Arg Val Ser Val Leu Leu Gly Thr Glu Thr Leu Lys Glu Cys
165 170 175
Arg Leu Lys Asp Pro Val Phe Ile Pro Asn Val Ile Tyr Lys Asn Ile
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Ala Ile Thr Leu Leu Leu His Ala Ala Ala Glu Leu Trp Leu Pro Ala
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Leu Ile Thr Leu Gly Gly Met Thr Gly Gly Val Met Met Val Trp Leu
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria meningitidis
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<400> 867
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195 200 205
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210 215 220
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Leu Asp Lys Gly Cys Trp Thr Pro Val Glu Lys Phe Gly Thr Glu His
245 250 255
Gly Trp Gln Ala Gly Glu Ala Asn Ala Asp Gly Ser Phe Asp Val Leu
260 265 270
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275 280 285
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<220>
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<222> (319)..(320)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
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<222> (888)..(888)
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<223> n is a, c, g, or t
<400> 869
atgaaacaca tccacattat cggtatcggc ggcacgttta tgggtgggat tgccgccatt 60
gccaaagaag cagggtttga antcagcggt tgcgatgcga agatgtatcc gccgatgagc 120
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cgctccaaat tcgtgcatta ccgtccgcgt accgccgtgt tgaacaatct ggaattcgac 600
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Met Lys His Ile His Ile Ile Gly Ile Gly Gly Thr Phe Met Gly Gly
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Ile Ala Ala Ile Ala Lys Glu Ala Gly Phe Glu Xaa Ser Gly Cys Asp
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Ala Lys Met Tyr Pro Pro Met Ser Thr Gln Leu Glu Ala Leu Gly Ile
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Gly Val Tyr Glu Gly Phe Asp Thr Ala Gln Leu Asp Glu Phe Lys Ala
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Asp Val Tyr Val Ile Gly Asn Val Ala Lys Arg Gly Met Asp Val Val
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Glu Ala Ile Leu Asn Arg Gly Leu Pro Tyr Ile Ser Gly Pro Gln Trp
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Leu Ala Glu Asn Xaa Leu His His His Trp Xaa Leu Gly Val Ala Xaa
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Phe Ser Val Ser Ala Arg Leu Pro Gln Thr Pro Arg Gln Asp Pro Asn
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Ser Gln Ser Pro Phe Phe Val Ile Glu Ala Asp Glu Tyr Asp Thr Ala
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Phe Phe Asp Lys Arg Ser Lys Phe Val His Tyr Arg Pro Arg Thr Ala
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Leu Asp Lys Gly Cys Trp Thr Pro Val Glu Lys Phe Gly Thr Glu His
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Gly Trp Gln Ala Gly Glu Ala Asn Ala Asp Gly Ser Phe Asp Val Leu
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Gly Val Asp Ile Gln Thr Ala Cys Glu Ala Leu Ser Thr Phe Lys Asn
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Val Lys Arg Arg Met Glu Ile Lys Gly Thr Ala Asn Gly Ile Thr Val
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Tyr Asp Asp Phe Ala His His Pro Thr Ala Ile Glu Thr Thr Ile Gln
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Gly Leu Arg Gln Arg Val Gly Gly Ala Arg Ile Leu Ala Val Leu Glu
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Pro Arg Ser Asn Thr Met Lys Leu Gly Thr Met Lys Ala Ala Leu Pro
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Asp Trp Asp Val Ala Glu Ala Leu Ala Pro Leu Gly Gly Arg Leu His
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Val Gly Lys Asp Phe Asp Ala Phe Val Ala Glu Ile Val Lys Asn Ala
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n 1
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 872
Met Lys His Ile His Ile Ile Gly Ile Gly Gly Thr Phe Met Gly Gly
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Ile Ala Ala Ile Ala Lys Glu Ala Gly Phe Lys Val Ser Gly Cys Asp
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Ala Lys Met Tyr Pro Pro Met Ser Thr Gln Leu Glu Ala Leu Gly Ile
35 40 45
Gly Val His Glu Gly Phe Asp Ala Ala Gln Leu Glu Glu Phe Gln Ala
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Asp Ile Tyr Val Ile Gly Asn Val Ala Arg Arg Gly Met Asp Val Val
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Leu Ala Glu Asn Val Leu His His His Trp Val Leu Gly Val Ala Gly
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Phe Arg Arg Phe Arg Pro Pro Thr Ala Asn Ala Ala Ser Arg Pro Glu
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Gln Gln Ile Ala Val Phe Arg His Arg Ser Arg Arg Ile Arg His Arg
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Leu Phe Arg Gln Thr Leu Gln Ile Arg Ala Leu Ser Pro Ala Tyr Arg
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Arg Val Glu Gln Ser Gly Ile Arg Pro Arg Arg His Leu Arg Arg Leu
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Gly Arg Asp Thr Asp Pro Val Pro Pro Pro Arg Ala His Arg Thr Ile
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Arg Arg Pro His Arg Leu Gln Arg Thr Ala Ala Lys Pro Ala Arg Tyr
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Phe Gly Gln Arg Leu Leu Asp Ala Gly Gly Lys Ile Arg His Arg Thr
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 874
Met Lys His Ile His Ile Ile Gly Ile Gly Gly Thr Phe Met Gly Gly
1 5 10 15
Ile Ala Ala Ile Ala Lys Glu Ala Gly Phe Lys Val Ser Gly Cys Asp
20 25 30
Ala Lys Met Tyr Pro Pro Met Ser Thr Gln Leu Glu Ala Leu Gly Ile
35 40 45
Gly Val His Glu Gly Phe Asp Ala Ala Gln Leu Glu Glu Phe Gln Ala
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Asp Ile Tyr Val Ile Gly Asn Val Ala Arg Arg Gly Met Asp Val Val
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Glu Ala Ile Leu Asn Arg Gly Leu Pro Tyr Ile Ser Gly Pro Gln Trp
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Leu Ala Glu Asn Val Leu His His His Trp Val Leu Gly Val Ala Gly
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Thr His Gly Lys Thr Thr Thr Ala Ser Met Leu Ala Trp Val Leu Glu
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Tyr Ala Gly Leu Ala Pro Gly Phe Leu Ile Gly Gly Val Pro Glu Asn
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Phe Gly Val Ser Ala Arg Leu Pro Gln Thr Pro Arg Gln Asp Pro Asn
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Ser Lys Ser Pro Phe Phe Val Ile Glu Ala Asp Glu Tyr Asp Thr Ala
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Phe Phe Asp Lys Arg Ser Lys Phe Val His Tyr Arg Pro Arg Thr Ala
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Val Leu Asn Asn Leu Glu Phe Asp His Ala Asp Ile Phe Ala Asp Leu
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Gly Ala Ile Gln Thr Gln Phe His His Leu Val Arg Thr Val Pro Ser
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Glu Gly Leu Ile Val Cys Asn Gly Gln Gln Gln Ser Leu Gln Asp Thr
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Leu Asp Lys Gly Cys Trp Thr Pro Val Glu Lys Phe Gly Thr Gly His
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Gly Trp Gln Ile Gly Glu Val Asn Ala Asp Gly Ser Phe Asp Val Leu
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Leu Asp Gly Lys Lys Ala Gly His Val Ala Trp Asp Leu Met Gly Gly
275 280 285
His Asn Arg Met Asn Ala Leu Ala Val Ile Ala Ala Ala Arg His Ala
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Gly Val Asp Val Gln Thr Ala Cys Glu Ala Leu Gly Ala Phe Lys Asn
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Val Lys Arg Arg Met Glu Ile Lys Gly Thr Ala Asn Gly Ile Thr Val
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Tyr Asp Asp Phe Ala His His Pro Thr Ala Ile Glu Thr Thr Ile Gln
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Gly Leu Arg Gln Arg Val Gly Gly Ala Arg Ile Leu Ala Val Leu Glu
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Ala Ser Leu Lys Glu Ala Asp Gln Val Phe Cys Tyr Ala Gly Gly Ala
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Asp Trp Asp Val Ala Glu Ala Leu Ala Pro Leu Gly Cys Arg Leu Arg
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Val Gly Lys Asp Phe Asp Thr Phe Val Ala Glu Ile Val Lys Asn Ala
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Arg Thr Gly Asp His Ile Leu Val Met Ser Asn Gly Gly Phe Gly Gly
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Ile His Thr Lys Leu Leu Asp Ala Leu Arg
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<213> Neisseria meningitidis
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<223> n is a, c, g, or t
<400> 875
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
<221> misc_feature
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 876
Pro Gly Tyr Tyr Gly Ser Asp Asp Glu Phe Lys Arg Ala Phe Gly Glu
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Asn Ser Pro Thr Xaa Lys Lys His Cys Asn Arg Ser Cys Gly Ile Tyr
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Glu Pro Val Leu Lys Lys Tyr Gly Lys Lys Arg Ala Asn Asn His Ser
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Val Ser Ile Ser Ala Asp Phe Gly Asp Tyr Phe Met Pro Phe Ala Ser
50 55 60
Tyr Ser Arg Thr His Arg Met Pro Asn Ile Gln Glu Met Tyr Phe Ser
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Gln Ile Gly Asp Ser Gly Val His Thr Ala Leu Lys Pro Glu Arg Ala
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Asn Thr Trp Gln Phe Gly Phe Xaa Thr Tyr Lys Lys Gly Leu Leu Lys
100 105 110
Gln Asp Asp Thr Leu Gly Leu Lys Leu Val Gly Tyr Arg Ser Arg Ile
115 120 125
Asp Asn Tyr Ile His Asn Val Tyr Gly Lys Trp Trp Asp Leu Asn Gly
130 135 140
Asp Ile Pro Ser Trp Val Ser Ser Thr Gly Leu Ala Tyr Thr Ile Gln
145 150 155 160
His Arg Xaa Phe Xaa Asp Lys Val His Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
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Xaa Xaa Tyr Asp Tyr Gly Arg Phe Phe Thr Asn Leu Ser Tyr Ala Tyr
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Gln Lys Ser Thr Gln Pro Thr Asn Phe Ser Asp Ala Ser Glu Ser Pro
195 200 205
Asn Asn Ala Ser Lys Glu Asp Gln Leu Lys Gln Gly Tyr Gly Leu Ser
210 215 220
Arg Val Ser Ala Leu Pro Arg Asp Tyr Gly Arg Leu Glu Val Gly Thr
225 230 235 240
Arg Trp Leu Gly Asn Lys Leu Thr Leu Gly Gly Ala Met Arg Tyr Phe
245 250 255
Gly Lys Ser Ile Arg Ala Thr Ala Glu Glu Arg Tyr Ile Asp Gly Thr
260 265 270
Asn Gly Gly Asn Thr Ser Asn Phe Arg Gln Leu Gly Lys Arg Ser Ile
275 280 285
Lys Gln Thr Glu Thr Leu Ala Arg Gln Pro Leu Ile Xaa Asp Phe Asn
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Ala Ala Tyr Glu Pro Lys Lys Asn Leu Ile Phe Arg Ala Glu Val Lys
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Asn Leu Phe Asp Arg Arg Tyr Ile Asp Pro Leu Asp Ala Gly Asn Asp
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Ala Ala Xaa Glu Arg Tyr Tyr Ser Ser Phe Asp Pro Lys Asp Lys Asp
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Xaa Asp Val Thr Cys Asn Ala Asp Lys Thr Leu Cys Asn Gly Lys Tyr
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Gly Gly Thr Ser Lys Ser Val Leu Thr Asn Phe Ala Arg Gly Arg Thr
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<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<222> (835)..(835)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 877
gaggcgcaga tacaggtttt ggaagatgtg cacgtcaagg cgaagcgcgt accgaaagac 60
aaaaaagtgt ttaccgatgc gcgtgccgta tcgacccgtc aggatatatt caaatccagc 120
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agccaatatt tcaacacgtt ctacttcgat gccgcgctca aaaaagacat ttaccgctta 1440
aactacagca ccaataccgt cggctaccgt ttcggcggcg aatatacggg ctattacggc 1500
tcggatgacg aatttaagcg ggcattcgga gaaaactcgc cgacatacaa gaaacattgc 1560
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tcgcgcacac accgtatgcc caacatccaa gaaatgtatt tttcccaaat cggcgactcc 1740
ggcgttcaca ccgccttaaa accagagcgc gcaaacactt ggcaatttgg cttcaatacc 1800
tataaaaaag gattgttaaa acaagatgat acattaggat taaaactggt cggctaccgc 1860
agccgcatcg acaactacat ccacaacgtt tacgggaaat ggtgggattt gaacggggat 1920
attccgagct gggtcagcag caccgggctt gcctacacca tccaacatcg caatttcaaa 1980
gacaaagtgc acaaacacgg ttttgagttg gagctgaatt acgattatgg gcgttttttc 2040
accaaccttt cttacgccta tcaaaaaagc acgcaaccga ccaacttcag cgatgcgagc 2100
gaatcgccca acaatgcgtc caaagaagac caactcaaac aaggttatgg gttgagcagg 2160
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<213> Neisseria gonorrhoeae
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<213> Neisseria meningitidis
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<210> 889
<211> 1071
<212> DNA
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<222> (148)..(148)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<400> 889
atgaacctga tttcacgtta catcatccgt caaatggcgg ttatggcggt ttacgcgctc 60
cttgccttcc tcgctttgta cagctttttt gaaatcctgt acgaaaccgg caacctcggc 120
aaaggcagtt acggcatatg ggaaatgntg ggntacaccg ccctcaaaat gnccgcccgc 180
gcctacgaac tgatgcccct cgccgtcctt atcggcggac tggtctctnt cagccagctt 240
gccgccggca gcgaactgan cgtcatcaaa gccagcggca tgagcaccaa aaagctgctg 300
ttgattctgt cgcagttcgg ttttattttt gctattgcca ccgtcgcgct cggcgaatgg 360
gttgcgccca cactgagcca aaaagccgaa aacatcaaag ccgcggccat caacggcaaa 420
atcagtaccg gcaataccgg cctttggctg aaagaaaaaa acagcattat caatgtgcgc 480
gaaatgttgc ccgaccatac cctgctgggc attaaaatct gggcccgcaa cgataaaaac 540
gaactggcag aggcagtgga agccgattcc gccgttttga acagcgacgg cagttggcag 600
ttgaaaaaca tccgccgcag cacgcttggc gaagacaaag tcgaggtctc tattgcggct 660
gaagaaaant ggccgatttc cgtcaaacgc aacctgatgg acgtattgct cgtcaaaccc 720
gaccaaatgt ccgtcggcga actgaccacc tacatccgcc acctccaaan nnacagccaa 780
aacacccgaa tctacgccat cgcatggtgg cgcaaattgg tttaccccgc cgcagcctgg 840
gtgatggcgc tcgtcgcctt tgcctttacc ccgcaaacca cccgccacgg caatatgggc 900
ttaaaantct tcggcggcat ctgtctcgga ttgctgttcc accttgccgg ncggctcttc 960
nggtttacca gccaactcta cggcatcccg cccttcctcg ncggcgcact acctaccata 1020
gccttcgcct tgctcgccgt ttggctgata cgcaaacagg aaaaacgcta a 1071
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<212> PRT
<213> Neisseria meningitidis
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<220>
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<220>
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 890
Met Asn Leu Ile Ser Arg Tyr Ile Ile Arg Gln Met Ala Val Met Ala
1 5 10 15
Val Tyr Ala Leu Leu Ala Phe Leu Ala Leu Tyr Ser Phe Phe Glu Ile
20 25 30
Leu Tyr Glu Thr Gly Asn Leu Gly Lys Gly Ser Tyr Gly Ile Trp Glu
35 40 45
Met Xaa Gly Tyr Thr Ala Leu Lys Met Xaa Ala Arg Ala Tyr Glu Leu
50 55 60
Met Pro Leu Ala Val Leu Ile Gly Gly Leu Val Ser Xaa Ser Gln Leu
65 70 75 80
Ala Ala Gly Ser Glu Leu Xaa Val Ile Lys Ala Ser Gly Met Ser Thr
85 90 95
Lys Lys Leu Leu Leu Ile Leu Ser Gln Phe Gly Phe Ile Phe Ala Ile
100 105 110
Ala Thr Val Ala Leu Gly Glu Trp Val Ala Pro Thr Leu Ser Gln Lys
115 120 125
Ala Glu Asn Ile Lys Ala Ala Ala Ile Asn Gly Lys Ile Ser Thr Gly
130 135 140
Asn Thr Gly Leu Trp Leu Lys Glu Lys Asn Ser Ile Ile Asn Val Arg
145 150 155 160
Glu Met Leu Pro Asp His Thr Leu Leu Gly Ile Lys Ile Trp Ala Arg
165 170 175
Asn Asp Lys Asn Glu Leu Ala Glu Ala Val Glu Ala Asp Ser Ala Val
180 185 190
Leu Asn Ser Asp Gly Ser Trp Gln Leu Lys Asn Ile Arg Arg Ser Thr
195 200 205
Leu Gly Glu Asp Lys Val Glu Val Ser Ile Ala Ala Glu Glu Xaa Trp
210 215 220
Pro Ile Ser Val Lys Arg Asn Leu Met Asp Val Leu Leu Val Lys Pro
225 230 235 240
Asp Gln Met Ser Val Gly Glu Leu Thr Thr Tyr Ile Arg His Leu Gln
245 250 255
Xaa Xaa Ser Gln Asn Thr Arg Ile Tyr Ala Ile Ala Trp Trp Arg Lys
260 265 270
Leu Val Tyr Pro Ala Ala Ala Trp Val Met Ala Leu Val Ala Phe Ala
275 280 285
Phe Thr Pro Gln Thr Thr Arg His Gly Asn Met Gly Leu Lys Xaa Phe
290 295 300
Gly Gly Ile Cys Leu Gly Leu Leu Phe His Leu Ala Gly Arg Leu Phe
305 310 315 320
Xaa Phe Thr Ser Gln Leu Tyr Gly Ile Pro Pro Phe Leu Xaa Gly Ala
325 330 335
Leu Pro Thr Ile Ala Phe Ala Leu Leu Ala Val Trp Leu Ile Arg Lys
340 345 350
Gln Glu Lys Arg
355
<210> 891
<211> 1071
<212> DNA
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 891
atgaacctga tttcacgtta catcatccgc caaatggcgg ttatggcggt ttacgcgctc 60
cttgccttcc tcgctttgta cagctttttt gaaatcctgt acgaaaccgg caacctcggc 120
aaaggcagtt acggcatatg ggaaatgctg ggctacaccg ccctcaaaat gcccgcccgc 180
gcctacgaac tcatgcccct cgccgtcctc atcggcggac tggcctctct cagccagctt 240
gccgccggca gcgaactggc cgtcatcaaa gccagcggca tgagcaccaa aaagctgctg 300
ttgattctgt ctcagttcgg ttttattttt gctattgccg ccgtcgcgct cggcgaatgg 360
gttgcgccca cgctgagcca aaaagccgaa aacatcaaag ccgccgccat taacggcaaa 420
atcagcaccg gcaataccgg cctttggctg aaagaaaaaa ccagcattat caatgtgcgc 480
ggaatgttgc ccgaccatac gcttttgggc atcaaaattt gggcgcgcaa cgataaaaac 540
gaattggcag aggcagtgga agccgattcc gccgttttga acagcgacgg cagctggcag 600
ttgaaaaaca tccgccgcag catcatgggt acagacaaaa tcgaaacatc cgccgccgcc 660
gaagaaactt ggccgattgc cgtcagacgc aacctgatgg acgtattgct cgtcaagccc 720
gaccaaatgt ccgtcggcga gctgaccacc tacatccgcc acctccaaaa caacagccaa 780
aacacccaaa tctacgccat cgcatggtgg cgtaaactcg tttaccccgt cgccgcatgg 840
gtcatggcgc tcgttgcctt cgcctttacg ccgcaaacca cgcgccacgg caatatgggc 900
ttaaaactct tcggcggcat ctgtctcgga ttgctgttcc accttgccgg caggctcttc 960
gggtttacca gccaactcta cggcacccca cccttcctcg ccggcgcact gcctaccata 1020
gccttcgcct tgctcgctgt ttggctgata cgcaaacagg aaaaacgttg a 1071
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<211> 356
<212> PRT
<213> Neisseria gonorrhoeae
<400> 892
Met Asn Leu Ile Ser Arg Tyr Ile Ile Arg Gln Met Ala Val Met Ala
1 5 10 15
Val Tyr Ala Leu Leu Ala Phe Leu Ala Leu Tyr Ser Phe Phe Glu Ile
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Leu Tyr Glu Thr Gly Asn Leu Gly Lys Gly Ser Tyr Gly Ile Trp Glu
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Met Pro Leu Ala Val Leu Ile Gly Gly Leu Ala Ser Leu Ser Gln Leu
65 70 75 80
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Ala Ala Val Ala Leu Gly Glu Trp Val Ala Pro Thr Leu Ser Gln Lys
115 120 125
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130 135 140
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145 150 155 160
Gly Met Leu Pro Asp His Thr Leu Leu Gly Ile Lys Ile Trp Ala Arg
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Asn Asp Lys Asn Glu Leu Ala Glu Ala Val Glu Ala Asp Ser Ala Val
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Leu Pro Thr Ile Ala Phe Ala Leu Leu Ala Val Trp Leu Ile Arg Lys
340 345 350
Gln Glu Lys Arg
355
【図面の簡単な説明】
【図１】 図１は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ３７を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。殺菌性アッセイの結果において：菱形は、免疫前のデータを示し；三角形は、ＧＳＴコントロールデータを示し；丸は、組換えＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓタンパク質のデータを示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図２】 図２は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ５を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す。
【図３】 図３は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ２を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す。ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。
【図４】 図４は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ１５を示す。Ｍ１およびＭ２は、分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す。ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。
【図５】 図５は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ２２を示す。Ｍ１およびＭ２は、分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。
【図６】 図６は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ２８を示す。Ｍ１およびＭ２は、分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。
【図７】 図７は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ３２を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。
【図８】 図８は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ４を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す。ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。殺菌性アッセイの結果において；菱形は、免疫前のデータを示し；三角形は、ＧＳＴコントロールデータを示し；丸は、組換えＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓタンパク質のデータを示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図９】 図９は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ６１を示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図１０】 図１０は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ７６を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す。ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。
【図１１】 図１１は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ８９を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。
【図１２】 図１２は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ９７を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す；ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図１３】 図１３は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ１０６を示す。Ｍ１およびＭ２は、分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図１４】 図１４は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ１３８を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図１５】 図１５は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ２３を示す。Ｍ１およびＭ２は、分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す；ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。
【図１６】 図１６は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ２５を示す。Ｍ１およびＭ２は、分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す；ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図１７】 図１７は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ２７を示す。Ｍ１およびＭ２は、分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。
【図１８】 図１８は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ７９を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図１９】 図１９は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ８５を示す。Ｍ１は分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す；ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。
【図２０】 図２０は、実施例から得られた生化学的データを示し、そしてまた配列分析、ＯＲＦ１３２を示す。Ｍ１およびＭ２は、分子量マーカーである。矢印は、ウェスタンブロッティングにおける主要な組換え産物の位置を示すか、または主要なＮ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ免疫活性バンドの位置を示す。ＴＰは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ全タンパク質抽出物を示す；ＯＭＶは、Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ外膜ベシクル調製物を示す。コンピューター分析は、親水性プロット（上段）、抗原性指数（中段）、およびＡＭＰＨＩ分析（下段）を示す。ＡＭＰＨＩプログラムは、Ｔ細胞エピトープ（Ｇａｏら（１９８９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４３：３００７；Ｒｏｂｅｒｔｓら（１９９６）ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒ １２：５９３；Ｑｕａｋｙｉら（１９９２）Ｓｃａｎｄ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ 補遺 １１：９）を予測するために使用されており、そしてＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．（１２２８ Ｓｏｕｔｈ Ｐａｒｋ Ｓｔｒｅｅｔ，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ５３７１５ ＵＳＡ）のＰｒｏｔｅａｎ ｐａｃｋａｇｅで利用可能である。

Claims (9)

1. 配列番号４、６および８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、タンパク質。
2. 請求項１に記載のタンパク質をコードする、核酸分子。
3. 配列番号３、５および７からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項２に記載の核酸分子。
4. 請求項１に記載のタンパク質と９０％またはそれより多くの配列同一性を有する、タンパク質であって、
   該タンパク質は、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ細菌に対する免疫原性活性を示し、
   該タンパク質を免疫原として使用した場合、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ細菌に対する殺菌活性を示す免疫応答が惹起される、タンパク質。
5. 請求項１または４のいずれか１つの請求項に記載のタンパク質と結合する抗体。
6. 請求項１または４のいずれか１つの請求項に記載のタンパク質をコードする、核酸分子。
7. 請求項６に記載の核酸分子と相補的なヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
8. 請求項３に記載の核酸分子と９０％またはそれより多くの配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、核酸分子であって、
   該核酸分子によりコードされるタンパク質は、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ細菌に対する免疫原性活性を示し、
   該タンパク質を免疫原として使用した場合、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ細菌に対する殺菌活性を示す免疫応答が惹起される、核酸分子。
9. 配列番号３、５および７からなる群から選択されるヌクレオチド配列もしくはその相補鎖、または少なくとも１５ヌクレオチドの長さであるそれらの断片であるプローブまたはプライマーであって、配列番号３、５および７からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその相補鎖を特異的に検出または増幅できるプローブまたはプライマー。

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