JP2021008507A - イミド系タンパク質分解モジュレーター及び関連する使用方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、米国仮出願番号第61/979,351号、2014年4月14日出願、タイトル「IMIDE−BASED MODULATORS OF PROTEOLYSIS AND ASSOCIATED METHODS OF USE」の利益及び優先権を主張する国際PCT出願であり、先の出願は、そのまま全体が本明細書中に参照として援用される。
連邦規則第37部門第1.52条第(e)項に従い、コンピューターで読み込み可能な形式の配列表情報を、PatentIn−3.5を使用して、ファイル名:Sequence_Listing_ST25.txt;サイズ2KB;作成日:2015年4月14日として.txtフォーマットにて本明細書とともに提出し、この配列表情報は、そのまま全体が本明細書により参照として援用される。
本説明は、イミド系化合物、及びそれを含む二機能性化合物、ならびに関連する使用方法を提供する。二機能性化合物は、特に本発明による二機能性化合物により分解及び/またはさもなくば阻害される様々なポリペプチド及び他のタンパク質に関して、標的指向ユビキチン化のモジュレーターとして有用である。
ほとんどの小分子薬物は、酵素または受容体と、ぴったりした明確に定義されたポケットにて結合する。一方で、タンパク質−タンパク質相互作用は、タンパク質の巨大な接触表面及び浅い溝または平坦な界面故に、小分子を用いて標的とすることが非常に困難である。E3ユビキチンリガーゼ(そのうちの数百種はヒトで知られている)は、ユビキチン化の基質特異性を与え、したがって、それらの特定タンパク質基質に対する特異性故に、総合的なプロテアソーム阻害剤よりも魅力的な治療標的である。E3リガーゼのリガンド開発は、一部には、タンパク質−タンパク質相互作用を破壊せざるを得ないという事実故に、困難であることが明らかになってきた。しかしながら、最近の開発により、これらのリガーゼに結合する特異的リガンドが提供されている。例えば、最初の小分子E3リガーゼ阻害剤であるニュートリンの発見以来、E3リガーゼを標的とするさらなる化合物が報告されてきているが、しかしながらこの分野は依然として発展途上である。
のとおり示すことができる。
のとおり示すことができ、図中、PTMは、タンパク質/ポリペプチド標的指向部分であり、Lはリンカーであり、及びCLMは、セレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分である。
以下に詳細な説明を提供して、当業者が本発明を実施する助けとする。当業者なら、本開示の精神または範囲から逸脱することなく、本明細書中記載される実施形態に修飾及び変更を加えることができる。本明細書中言及される文献、特許出願、特許、図面、及び他の参照は全て、そのまま全体が参照として明らかに援用される。
1つの態様において、本説明は、E3ユビキチンリガーゼ結合部分(「ULM」)、すなわちセレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分(「CLM」)を含む化合物を提供する。1つの実施形態において、CLMは、以下の構造:
(I)L−CLM
に従って、化学リンカー(L)でカップリングしており、式中、Lは、化学リンカー基であり、CLMは、セレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分である。本明細書中示される化合物中の各部分の個数及び/または相対配置は、例示で示されるにすぎない。当業者には当然のことながら、本明細書中記載されるとおりの化合物は、それぞれの機能部分の個数及び/または配置をどのようにも望み通りに合成することができる。
(II)PTM−CLM
のとおりに示すことができる。
(III)PTM−L−CLM
のとおりに示すことができ、式中、PTMは、タンパク質/ポリペプチド標的指向性部分であり、Lはリンカーであり、CLMは、セレブロンE3リガーゼ結合部分である。
(IV)CLM−CLMまたは
(V)CLM−L−CLM
のとおり示すことができる。
(VI)CLM−CLM'または
(VII)CLM−L−CLM'
のとおり示すことができる。式中、CLM'は、CLMとは構造が異なるセレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分を示す。ある特定の実施形態において、化合物は、複数のCLM及び/または複数のCLM'を含んでいてもよい。さらなる実施形態において、少なくとも2つの異なるCLM、複数のCLM、及び/または、複数のCLM'を含む化合物は、さらに、直接または化学リンカー(L)を介してまたはその両方でCLMまたはCLM'とカップリングした少なくとも1つのPTMを含む。本明細書中記載される実施形態のどれにおいても、少なくとも2つの異なるCLMを含む化合物は、さらに、複数のPTMを含むことができる。なおさらなる実施形態において、PTMは、同一であるか、任意選択で異なっている。なおさらなる実施形態において、PTMが異なる場合、それぞれのPTMは、同じタンパク質標的に結合してもよいし、異なるタンパク質標的に特異的に結合してもよい。なおさらなる実施形態において、PTMは、それ自身が、ULMまたはCLM(あるいはULM'またはCLM')である。
1つの態様において、本説明は、セレブロンと結合する及び/またはセレブロンを阻害するのに有用な化合物を提供する。ある特定の実施形態において、化合物は、以下の化学構造からなる群より選択され:
式中、
Wは、独立して、以下の群、CH2、CHR、C=O、SO2、NH、及びN−アルキルより選択され;
Xは、独立して、以下の群、O、S、及びH2より選択され;
Yは、独立して、以下の群、NH、N−アルキル、N−アリール、N−ヘタリール、N−シクロアルキル、N−ヘテロシクリル、O、及びSより選択され;
Zは、独立して、以下の群、O及びS、またはH2より選択されるが、ただしX及びZの両方がH2であることはできず;
G及びG'は、独立して、以下の群、H、アルキル、OH、R'で置換されていてもよいCH2−ヘテロシクリル、及びR'で置換されていてもよいベンジルより選択され;
Q1〜Q4は、R'、N、またはN−オキシドから独立して選択される基で置換される炭素Cを表し;
Aは、独立して、以下の群、アルキル、シクロアルキル、Cl、及びFより選択され;
Rは、以下を含むが、それらに限定されず:−CONR'R''、−OR'、−NR'R''、−SR'、−SO2R'、−SO2NR'R''、−CR'R''−、−CR'NR'R''−、−アリール、−ヘタリール、−アルキル、−シクロアルキル、−ヘテロシクリル、−P(O)(OR')R''、−P(O)R'R''、−OP(O)(OR')R''、−OP(O)R'R''、−Cl、−F、−Br、−I、−CF3、−CN、−NR'SO2NR'R''、−NR'CONR'R''、−CONR'COR''、−NR'C(=N−CN)NR'R''、−C(=N−CN)NR'R''、−NR'C(=N−CN)R''、−NR'C(=C−NO2)NR'R''、−SO2NR'COR''、−NO2、−CO2R'、−C(C=N−OR')R''、−CR'=CR'R''、−CCR'、−S(C=O)(C=N−R')R''、−SF5、及び−OCF3
R'及びR''は、独立して、結合、H、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘタリール、ヘテロシクリルから選択され、
nは、1−4の整数であり;
は、立体特異性((R)または(S))であっても非立体特異性であってもよい結合を表し;かつ、
Rnは、1〜4つの独立した官能基または原子を含む。
本明細書中記載される化合物のどれであっても、CLMは、以下の群から選択される化学構造を有し:
式中、
Wは、独立して、以下の群、CH2、CHR、C=O、SO2、NH、及びN−アルキルより選択され;
Xは、独立して、以下の群、O、S、及びH2より選択され;
Yは、独立して、以下の群、NH、N−アルキル、N−アリール、N−ヘタリール、N−シクロアルキル、N−ヘテロシクリル、O、及びSより選択され;
Zは、独立して、以下の群、O及びS、またはH2より選択されるが、ただしX及びZの両方がH2であることはできず;
G及びG'は、独立して、以下の群、H、アルキル、OH、R'で置換されていてもよいCH2−ヘテロシクリル、及びR'で置換されていてもよいベンジルより選択され;
Q1〜Q4は、R'、N、またはN−オキシドから独立して選択される基で置換される炭素Cを表し;
Aは、独立して、以下の群、アルキル、シクロアルキル、Cl、及びFより選択され;
Rは、以下を含むが、それらに限定されず:−CONR'R''、−OR'、−NR'R''、−SR'、−SO2R'、−SO2NR'R''、−CR'R''−、−CR'NR'R''−、−アリール、−ヘタリール、−アルキル、−シクロアルキル、−ヘテロシクリル、−P(O)(OR')R''、−P(O)R'R''、−OP(O)(OR')R''、−OP(O)R'R''、−Cl、−F、−Br、−I、−CF3、−CN、−NR'SO2NR'R''、−NR'CONR'R''、−CONR'COR''、−NR'C(=N−CN)NR'R''、−C(=N−CN)NR'R''、−NR'C(=N−CN)R''、−NR'C(=C−NO2)NR'R''、−SO2NR'COR''、−NO2、−CO2R'、−C(C=N−OR')R''、−CR'=CR'R''、−CCR'、−S(C=O)(C=N−R')R''、−SF5、及び−OCF3
R'及びR''は、独立して、結合、H、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘタリール、ヘテロシクリルから選択され、
nは、1〜4の整数であり;
は、立体特異性((R)または(S))であっても非立体特異性であってもよい結合を表し;かつ、
Rnは、1〜4つの独立した官能基または原子を含み、かつ任意選択で、それらのうちの1つは、PTM、化学リンカー基(L)、ULM、CLM(またはCLM')、またはそれらの組み合わせと共有結合するように修飾される。
式中、
Scは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
RHETは、H、CN、NO2、ハロ(好ましくはClまたはF)、置換されていてもよいC1−C6アルキル(好ましくは、1つまたは2つのヒドロキシル基または上限3つまでのハロ基(例えばCF3)で置換されたもの)、置換されていてもよいO(C1−C6アルキル)(好ましくは、1つまたは2つのヒドロキシル基または上限3つまでのハロ基で置換されたもの)、あるいは置換されていてもよいアセチレン基−C≡C−Ra、式中、Raは、HまたはC1−C6アルキル基(好ましくはC1−C3アルキル)であり;
RSSは、H、CN、NO2、ハロ(好ましくはFまたはCl)、置換されていてもよいC1−C6アルキル(好ましくは、1つまたは2つのヒドロキシル基または上限3つまでのハロ基で置換されたもの)、置換されていてもよいO−(C1−C6アルキル)(好ましくは、1つまたは2つのヒドロキシル基または上限3つまでのハロ基で置換されたもの)、あるいは置換されていてもよいC(O)(C1−C6アルキル)(好ましくは、1つまたは2つのヒドロキシル基または上限3つまでのハロ基で置換されたもの)であり;
RUREは、H、C1−C6アルキル(好ましくは、HまたはC1−C3アルキル)、または−C(O)(C1−C6アルキル)、これらの基はそれぞれ、1つまたは2つのヒドロキシル基または上限3つまでのハロゲン、好ましくはフッ素基で置換されていてもよく、あるいは置換されていてもよいヘテロ環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジン、これらの基はそれぞれ、置換されていてもよく、及び
YCは、NまたはC−RYCであり、式中、RYCは、H、OH、CN、NO2、ハロ(好ましくはClまたはF)、置換されていてもよいC1−C6アルキル(好ましくは、1つまたは2つのヒドロキシル基または上限3つまでのハロ基で置換されたもの(例えばCF3))、置換されていてもよいO(C1−C6アルキル)(好ましくは、1つまたは2つのヒドロキシル基または上限3つまでのハロ基で置換されたもの)、あるいは置換されていてもよいアセチレン基−C≡C−Ra、式中、Raは、HまたはC1−C6アルキル基(好ましくはC1−C3アルキル)である。
ある特定の実施形態において、本明細書中記載されるとおりの化合物は、化学リンカー(L)を介して化学的に連結またはカップリングできる。ある特定の実施形態において、リンカー基Lは、1つまたは複数の共有結合で接続した構造単位Aを含む基であり(例えば、−A1...Aq−)、式中、A1は、ULM、PTM、またはそれらの組み合わせのうちの少なくとも1つとカップリングした基である。ある特定の実施形態において、A1は、ULM、PTM、またはそれらの組み合わせと、別のULM、PTM、またはそれらの組み合わせを、直接連結する。他の実施形態において、A1は、ULM、PTM、またはそれらの組み合わせと、別のULM、PTM、またはそれらの組み合わせを、Aqを通じて間接的に連結する。
RL1、RL2、RL3、RL4、及びRL5は、それぞれ独立して、H、ハロ、C1−8アルキル、OC1−8アルキル、SC1−8アルキル、NHC1−8アルキル、N(C1−8アルキル)2、C3−11シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、C3−11ヘテロシクリル、OC1−8シクロアルキル、SC1−8シクロアルキル、NHC1−8シクロアルキル、N(C1−8シクロアルキル)2、N(C1−8シクロアルキル)(C1−8アルキル)、OH、NH2、SH、SO2C1−8アルキル、P(O)(OC1−8アルキル)(C1−8アルキル)、P(O)(OC1−8アルキル)2、CC−C1−8アルキル、CCH、CH=CH(C1−8アルキル)、C(C1−8アルキル)=CH(C1−8アルキル)、C(C1−8アルキル)=C(C1−8アルキル)2、Si(OH)3、Si(C1−8アルキル)3、Si(OH)(C1−8アルキル)2、COC1−8アルキル、CO2H、ハロゲン、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1−8アルキル、SO2N(C1−8アルキル)2、SONHC1−8アルキル、SON(C1−8アルキル)2、CONHC1−8アルキル、CON(C1−8アルキル)2、N(C1−8アルキル)CONH(C1−8アルキル)、N(C1−8アルキル)CON(C1−8アルキル)2、NHCONH(C1−8アルキル)、NHCON(C1−8アルキル)2、NHCONH2、N(C1−8アルキル)SO2NH(C1−8アルキル)、N(C1−8アルキル)SO2N(C1−8アルキル)2、NHSO2NH(C1−8アルキル)、NHSO2N(C1−8アルキル)2、NHSO2NH2である。
本発明の好適な態様において、PTM基は、標的タンパク質と結合する基である。PTM基の標的は、種類が多数あり、配列の少なくとも一部分が細胞で発見されておりかつPTM基と結合する可能性があるように、細胞で発現するタンパク質から選択される。「タンパク質」という用語は、本発明によるPTM基と結合することができる、十分な長さを持つオリゴペプチド配列及びポリペプチド配列を含む。本明細書中いずれかで記載されるとおり、ウイルス、細菌、もしくは真菌をはじめとする、真核生物系または微生物系の任意のタンパク質が、本発明による化合物が介在するユビキチン化の標的である。好ましくは、標的タンパク質は、真核生物タンパク質である。ある特定の態様において、タンパク質結合部分は、ハロアルカン、好ましくは少なくとも1つのハロ基で置換されたC1−C10アルキル基であり、好ましくは、ハロ基はアルキル基の遠位端にあり(すなわち、リンカーまたはCLM基から離れており)、このハロアルカンは、患者または対象において、あるいは診断アッセイにおいて、デハロゲナーゼ酵素と共有結合することができる。
HSP90阻害剤は、本明細書中使用される場合、以下のものを含むがそれらに限定されない。
が含まれ、誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、末端アミド基を介して結合する。
この場合、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、末端アセチレン基を介して結合する。
が含まれ、誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、アミド基を介して(アミンにおいて、またはアミンのアルキル基において)結合する。
が含まれ、この場合、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、ブチル基を介して結合する。
キナーゼ阻害剤は、本明細書中使用される場合、以下を含むが、それらに限定されない。
誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、アミン(アニリン)、カルボン酸、またはシクロプロピル基に対してアルファ位のアミン、またはシクロプロピル基を介して結合する。
が含まれ、YIX(1−エチル−3−(2−{[3−(1−メチルエチル)[1,2,4]トリアゾロ[4,3−a]ピリジン−6−イル]スルファニル}ベンジル)尿素
誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、iプロピル基を介して結合する;
YIW
1−(3−tert−ブチル−1−フェニル−1H−ピラゾール−5−イル)−3−(2−{[3−(1−メチルエチル)[1,2,4]トリアゾロ[4,3−a]ピリジン−6−イル]スルファニル}ベンジル)尿素
誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、好ましくはi−プロピル基またはt−ブチル基いずれかを介して結合する。
6TP
4−アミノ−2−[4−(tert−ブチルスルファモイル)フェニル]−N−メチルチエノ[3,2−c]ピリジン−7−カルボキサミド
チエノピリジン化合物19
誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、アミド部分に結合した末端メチル基を介して結合する;
0TP
4−アミノ−N−メチル−2−[4−(モルホリン−4−イル)フェニル]チエノ[3,2−c]ピリジン−7−カルボキサミド
チエノピリジン化合物8
誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、アミド部分に結合した末端メチル基を介して結合する。
07U
2−メチル−N〜1〜−[3−(ピリジン−4−イル)−2,6−ナフチリジン−1−イル]プロパン−1,2−ジアミン
が含まれ、誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、第二級アミンまたは末端アミノ基を介して結合する。
が含まれ、誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、末端ヒドロキシル基のいずれかを介して結合する。
XK9
N−{4−[(1E)−N−(N−ヒドロキシカルバムイミドイル)エタンヒドラゾノイル]フェニル}−7−ニトロ−1H−インドール−2−カルボキサミド;
NXP
N−{4−[(1E)−N−カルバムイミドイルエタンヒドラゾノイル]フェニル}−1H−インドール−3−カルボキサミド
が含まれ、誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、末端ヒドロキシル基(XK9)またはヒドラゾン基(NXP)いずれかを介して結合する。
(誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、メトキシまたはエーテル基を介して結合する)。
(誘導体化では、Rが、例えば、フェニル部分に結合した、またはアニリンアミン基を介して結合したリンカー基Lまたは−(L−CLM)基である)。
(誘導体化では、Rが、例えば、フェニル部分またはキノリン部分のヒドロキシルもしくはエーテル基に結合した、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基である)。
誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、Rにおいて、結合する;(誘導体化では、「R」は、ピペラジン部分でのリンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。
HDM2/MDM2阻害剤は、本明細書中使用される場合、以下を含むが、それらに限定されない。
(誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、メトキシ基において、またはヒドロキシル基として結合する);
(誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、メトキシ基またはヒドロキシル基において結合する);
(誘導体化では、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基は、例えば、メトキシ基を介して、またはヒドロキシル基として結合する)。
ヒトBETブロモドメイン含有タンパク質を標的とする化合物として、例えば、以下に記載されるとおりの標的に関連する化合物が挙げられるが、それらに限定されず、式中、「R」は、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する。
(式中、Rは、各場合において、例えば、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。
HDAC阻害剤(の誘導体)として、以下が挙げられるが、それらに限定されない。
(誘導体化では、「R」は、例えば、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。
ヒトリジンメチルトランスフェラーゼ阻害剤として、以下が挙げられるが、それらに限定されない。
(誘導体化では、「R」は、例えば、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。
(誘導体化では、「R」は、例えば、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。
血管新生阻害剤として、以下が挙げられるが、それらに限定されない。
免疫抑制化合物として、以下が挙げられるが、それらに限定されない。
アリール炭化水素受容体(AHR)を標的とする化合物として、以下が挙げられるが、それらに限定されない。
1.アンドロゲン受容体のRU59063リガンド(の誘導体)
(誘導体化では、例えば、「R」が、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。
1.甲状腺ホルモン受容体リガンド(の誘導体)
(誘導体化では、「R」が、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定し、MOMOは、メトキシメトキシ基を示す)。
1.HIVプロテアーゼの阻害剤(の誘導体)
(誘導体化では、「R」が、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。J. Med. Chem. 2010, 53, 521−538を参照。
(誘導体化では、「R」が、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合の可能性がある部位を指定する)。J. Med. Chem. 2010, 53, 521−538を参照。
1.HIVインテグラーゼの阻害剤(の誘導体)
(誘導体化では、「R」が、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。J.Med.Chem.2010、53、6466を参照。
(誘導体化では、「R」が、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。J. Med. Chem. 2010, 53, 6466を参照。
1.APT1及びAPT2の阻害剤(の誘導体)
(誘導体化では、「R」が、リンカー基Lまたは−(L−CLM)基の結合部位を指定する)。Angew. Chem. Int.版. 2011, 50, 9838−9842を参照、式中、Lは、本明細書中いずれかで記載されるとおりのリンカー基であり、このCLM基は、−(L−CLM)が、本明細書中いずれかで記載されるとおりにCLM基をPTM基に結合させるようになっている本明細書中いずれかで記載されるとおりである。
少なくとも1種の本明細書中記載されるとおりの二機能性化合物を有効量で、及び本明細書中いずれかで記載される1種または複数の化合物を全て有効量で、含み、さらに薬学上有効量の担体、添加剤、または賦形剤を合わせて含む医薬組成物は、本開示のさらなる態様である。
さらなる態様において、本説明は、本明細書中記載されるとおりの化合物またはその塩を有効量で、及び薬学上許容される担体を含む治療組成物を提供する。治療組成物は、患者または対象、例えば、ヒトなどの動物においてタンパク質分解を調節するので、分解したタンパク質を通じて調節される疾患または症状を治療または寛解するのに使用することができる。
本明細書中記載されるとおりの二機能性分子の合成の実現及び最適化は、段階的またはモジュール様式で取り組んでも良い。例えば、標的分子と結合する化合物の同定には、適切なリガンドを直ちに入手できない場合には、ハイスループットまたは中程度スループットスクリーニング作戦を含めることができる。通常は、初期リガンドについて、適切なin vitro及び薬理学及び/またはADMETアッセイから得られるデータにより同定されるとおりの次善の態様を改善する反復設計及び最適化サイクルが必要になることはない。最適化/SAR作戦の部分は、リガンドの、置換に耐性があり、本明細書中上記で触れたリンカー化学基を結合させるのに適切な場所と思われる位置を探索するものになるだろう。結晶またはNMR構造データが入手可能な場合、それらのデータを使用して、そうした合成努力に集中することができる。
本説明は、細胞でタンパク質レベルを制御する方法も提供する。この方法は、in vivoでの標的タンパク質の分解が、生体系でのタンパク質の量の制御をもたらし、好ましくは特定の治療効果を与えるように、特定の標的タンパク質と相互作用することがわかっている、本明細書中記載されるとおりの化合物の使用に基づいている。
本開示は、以下の具体的な実施形態を包含する。これらの以下の実施形態は、記載どおり、これから記載する実施形態に列挙される特徴の全てを含んでいてもよい。当てはまる場合、以下の実施形態はまた、これから記載する実施形態のいずれかに列挙される特徴を包括的に、またはそれの代替実施形態に列挙される特徴を含むこともできる(例えば、実施形態(8)は、実施形態(1)に列挙される特徴を、列挙どおりに、及び/または実施形態(2)〜(7)のいずれかの特徴を含んでいてもよい)。
(1)以下を含む化学構造:
L−CLM
を有し、式中、
Lが、リンカー基であり;かつ
CLMが、セレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分であり、
該リンカー基が、該CLMと化学的に連結している、
化合物、またはその薬学上許容される塩、鏡像異性体、立体異性体、溶媒和物もしくは多形。
(2)以下を含む化学構造:
PTM−L−CLM
を有し、式中、
PTMが、標的タンパク質または標的ポリペプチドと結合するタンパク質標的指向部分であり、
該PTMが、前記リンカー基を通じて前記CLMと化学的に連結している、
(1)の化合物。
(3)前記CLMが、イミド、チオイミド、アミド、またはチオアミドに由来する化学基を含む、(1)に記載の化合物。
(4)前記化学基が、フタルイミド基またはその類似体もしくは誘導体である、(1)に記載の化合物。
(5)前記CLMが、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、それらの類似体、それらの同配体、またはそれらの誘導体である、(1)に記載の化合物。
(6)前記化合物が、ULM、第二のCLM、CLM'、またはそれらの複数もしくは組み合わせをさらに含み、
ULMが、E3ユビキチンリガーゼ結合部分であり、
該第二のCLMが、前記CLMと同じ化学構造を有し、
CLM'が、前記CLMと構造が異なるセレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分であり、
該ULM、該第二のCLM、該CLM'、またはそれらの複数もしくは組み合わせが、さらなるリンカー基とカップリングされていてもよい、
(1)に記載の化合物。
(7)前記CLMが、以下で表される化学構造を有し:
式中、
Wが、CH2、CHR、C=O、SO2、NH、及びN−アルキルからなる群より選択され;
各Xが、独立して、O、S、及びH2からなる群より選択され;
Yが、NH、N−アルキル、N−アリール、N−ヘタリール、N−シクロアルキル、N−ヘテロシクリル、O、及びSからなる群より選択され;
Zが、O、S、及びH2からなる群より選択され;
G及びG'が、独立して、H、アルキル、OH、R'で置換されていてもよいCH2−ヘテロシクリル、及びR'で置換されていてもよいベンジルからなる群より選択され;
Q1、Q2、Q3、及びQ4が、R'、N、またはN−オキシドから独立して選択される基で置換される炭素Cを表し;
Aが、独立して、以下の群、アルキル、シクロアルキル、Cl、及びFより選択され;
Rが、−CONR'R''、−OR'、−NR'R''、−SR'、−SO2R'、−SO2NR'R''、−CR'R''−、−CR'NR'R''−、−アリール、−ヘタリール、−アルキル、−シクロアルキル、−ヘテロシクリル、−P(O)(OR')R''、−P(O)R'R''、−OP(O)(OR')R''、−OP(O)R'R''、−Cl、−F、−Br、−I、−CF3、−CN、−NR'SO2NR'R''、−NR'CONR'R''、−CONR'COR''、−NR'C(=N−CN)NR'R''、−C(=N−CN)NR'R''、−NR'C(=N−CN)R''、−NR'C(=C−NO2)NR'R''、−SO2NR'COR''、−NO2、−CO2R'、−C(C=N−OR')R''、−CR'=CR'R''、−CCR'、−S(C=O)(C=N−R')R''、−SF5、及び−OCF3を含み;
R'及びR''が、独立して、結合、H、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘタリール、ヘテロシクリルからなる群より選択され;
が、立体特異性((R)または(S))であっても非立体特異性であってもよい結合を表し;かつ、
Rnが、官能基または原子を含み、
式中、nが、1〜4の整数であり、かつ式中、
nが1の場合、Rnが、前記リンカー基(L)と共有結合しているように修飾され、及び
nが、2、3、または4である場合は、1つのRnが前記リンカー基(L)と共有結合しているように修飾されて、それ以外のRnは、PTM、ULM、前記CLMと同じ化学構造を有する第二のCLM、CLM'、第二のリンカー、またはそれらの任意の複数もしくは組み合わせと共有結合しているように修飾されていてもよい、
(1)に記載の化合物。
(8)前記CLMが、以下からなる群より選択される、(1)に記載の化合物:
4−{3−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザトリデカン−13−イル}オキシ)フェニル]−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−[3−(4−{3−[3−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)プロポキシ]プロポキシ}フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル]−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−{3−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル}オキシ)フェニル]−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(3−{4−[(1−{2−[(3S)−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル]−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル}−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル)オキシ]フェニル}−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(3−{4−[(1−{2−[(3R)−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル]−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル}−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル)オキシ]フェニル}−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−{3−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10,13,16−ペンタオキサ−1−アザオクタデカン−18−イル}オキシ)フェニル]−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(3−{4−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]フェニル}−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−[3−(4−{2−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]エトキシ}フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル]−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−[3−(4−{3−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]プロポキシ}フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル]−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−{3−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザテトラデカン−14−イル}オキシ)フェニル]−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−{[5−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)ペンチル]オキシ}−N−[trans−3−(3−クロロ−4−シアノフェノキシ)−2,2,4,4−テトラメチルシクロブチル]ベンズアミド;
4−{4,4−ジメチル−3−[4−({1−[2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザトリデカン−13−イル}オキシ)フェニル]−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−[3−(4−{4−[(5−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}ペンチル)オキシ]フェニル}フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル]−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル}オキシ)フェニル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10,13−テトラオキサ−1−アザペンタデカン−15−イル}オキシ)フェニル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−(4−{2−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]エトキシ}フェニル)アセトアミド;
N−{3−[(5−ブロモ−2−{[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル}オキシ)フェニル]アミノ}ピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルシクロブタンカルボキサミド;
N−{3−[(5−ブロモ−2−{[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10,13,16−ペンタオキサ−1−アザオクタデカン−18−イル}オキシ)フェニル]アミノ}ピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルシクロブタンカルボキサミド;
N−{3−[(5−ブロモ−2−{[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10,13−テトラオキサ−1−アザペンタデカン−15−イル}オキシ)フェニル]アミノ}ピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルシクロブタンカルボキサミド;
4−(4−{[(5Z)−3−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エチル]−2,4−ジオキソ−1,3−チアゾリジン−5−イリデン]メチル}−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(4−{[(5Z)−3−[3−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)プロピル]−2,4−ジオキソ−1,3−チアゾリジン−5−イリデン]メチル}−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(4−{[(5Z)−3−{2−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]エチル}−2,4−ジオキソ−1,3−チアゾリジン−5−イリデン]メチル}−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1S)−1−[4−(4−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}ブトキシ)フェニル]エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[3−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)プロピル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロピル)アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1S)−1−{4−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]フェニル}エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1R)−1−[4−(4−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}ブトキシ)フェニル]エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1R)−1−{4−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]フェニル}エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1R)−1−[4−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)フェニル]エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−{2−[4−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)フェニル]ピリミジン−5−イル}アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−{4−[3−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)プロポキシ]−3−フルオロフェニル}アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−{4−[4−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)ブトキシ]−2−フルオロフェニル}アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−{4−[4−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)ブトキシ]−3−フルオロフェニル}アセトアミド;及び
2−[(9R)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル}オキシ)フェニル]アセトアミド。
(9)前記リンカー基(L)が、以下の式:
−Aq−
で表される化学構造単位を含み、式中、
qが、1より大きい整数であり;かつ
Aが、独立して、結合、CRL1RL2、O、S、SO、SO2、NRL3、SO2NRL3、SONRL3、CONRL3、NRL3CONRL4、NRL3SO2NRL4、CO、CRL1=CRL2、C≡C、SiRL1RL2、P(O)RL1、P(O)ORL1、NRL3C(=NCN)NRL4、NRL3C(=NCN)、NRL3C(=CNO2)NRL4、0〜6個のRL1及び/またはRL2基で置換されていてもよいC3−11シクロアルキル、0〜6個のRL1及び/またはRL2基で置換されていてもよいC3−11ヘテロシクリル、0〜6個のRL1及び/またはRL2基で置換されていてもよいアリール、0〜6個のRL1及び/またはRL2基で置換されていてもよいヘテロアリールからなる群より選択され;
RL1、RL2、RL3、RL4、及びRL5が、それぞれ独立して、H、ハロ、C1−8アルキル、OC1−8アルキル、SC1−8アルキル、NHC1−8アルキル、N(C1−8アルキル)2、C3−11シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、C3−11ヘテロシクリル、OC1−8シクロアルキル、SC1−8シクロアルキル、NHC1−8シクロアルキル、N(C1−8シクロアルキル)2、N(C1−8シクロアルキル)(C1−8アルキル)、OH、NH2、SH、SO2C1−8アルキル、P(O)(OC1−8アルキル)(C1−8アルキル)、P(O)(OC1−8アルキル)2、CC−C1−8アルキル、CCH、CH=CH(C1−8アルキル)、C(C1−8アルキル)=CH(C1−8アルキル)、C(C1−8アルキル)=C(C1−8アルキル)2、Si(OH)3、Si(C1−8アルキル)3、Si(OH)(C1−8アルキル)2、COC1−8アルキル、CO2H、ハロゲン、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1−8アルキル、SO2N(C1−8アルキル)2、SONHC1−8アルキル、SON(C1−8アルキル)2、CONHC1−8アルキル、CON(C1−8アルキル)2、N(C1−8アルキル)CONH(C1−8アルキル)、N(C1−8アルキル)CON(C1−8アルキル)2、NHCONH(C1−8アルキル)、NHCON(C1−8アルキル)2、NHCONH2、N(C1−8アルキル)SO2NH(C1−8アルキル)、N(C1−8アルキル)SO2N(C1−8アルキル)2、NHSO2NH(C1−8アルキル)、NHSO2N(C1−8アルキル)2、及びNHSO2NH2からなる群より選択され;かつ
qが1より大きい場合、RL1またはRL2が、それぞれ独立して、別のA基と連結して、0〜4個のRL5基でさらに置換することができるシクロアルキル及び/またはヘテロシクリル部分を形成することができる、
(1)に記載の化合物。
(10)前記PTMが、標的タンパク質、標的ポリペプチド、またはそれらの断片と結合するタンパク質標的指向部分であり、該標的タンパク質、該標的ポリペプチド、またはそれらの断片が、構造、制御、ホルモン、酵素、遺伝子、免疫、収縮、貯蔵、輸送、及びシグナル伝達からなる群より選択される生物学的機能を有する、(2)に記載の化合物。
(11)前記PTM基が、標的タンパク質と結合する部分であり、該標的タンパク質が、B7.1及びB7、TINFR1m、TNFR2、NADPHオキシダーゼ、アポトーシス経路のBclIBax及び他のパートナー、C5a受容体、HMG−CoAレダクターゼ、PDE Vホスホジエステラーゼ型、PDE IVホスホジエステラーゼ4型、PDE I、PDE II、PDE III、スクアレンシクラーゼ阻害剤、CXCR1、CXCR2、一酸化窒素(NO)シンターゼ、シクロオキシゲナーゼ1、シクロオキシゲナーゼ2、5HT受容体、ドーパミン受容体、Gタンパク質、Gq、ヒスタミン受容体、5−リポキシゲナーゼ、トリプターゼセリンプロテアーゼ、チミジル酸シンターゼ、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、トリパノソーマGAPDH、グリコーゲンホスホリラーゼ、炭酸脱水酵素、ケモカイン受容体、JAW STAT、RXR及び類似のもの、HIV 1プロテアーゼ、HIV 1インテグラーゼ、インフルエンザ、ノイラミニダーゼ、B型肝炎逆転写酵素、ナトリウムチャネル、多剤耐性(MDR)、タンパク質P糖タンパク質(及びMRP)、チロシンキナーゼ、CD23、CD124、チロシンキナーゼp56 lck、CD4、CD5、IL−2受容体、IL−1受容体、TNF−アルファR、ICAM1、Cat+チャネル、VCAM、VLA−4インテグリン、セレクチン、CD40/CD40L、ニューロキニン及び受容体、イノシンモノホスフェートデヒドロゲナーゼ、p38MAPキナーゼ、Ras/Raf/ME/ERK経路、インターロイキン−1変換酵素、カスパーゼ、HCV、NS3プロテアーゼ、HCV NS3 RNAヘリカーゼ、グリシンアミドリボヌクレオチドホルミルトランスフェラーゼ、ライノウイルス3Cプロテアーゼ、単純ヘルペスウイルス−1(HSV−I)、プロテアーゼ、サイトメガロウイルス(CMV)プロテアーゼ、ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ、サイクリン依存性キナーゼ、血管内皮増殖因子、c−Kit、TGFβ活性化キナーゼ1、ラパマイシンの哺乳類標的、SHP2、アンドロゲン受容体、オキシトシン受容体、ミクロソーム輸送タンパク質阻害剤、胆汁酸輸送阻害剤、5アルファレダクターゼ阻害剤、アンジオテンシン11、グリシン受容体、ノルアドレナリン再取り込み受容体、エストロゲン受容体、エストロゲン関連受容体、接着斑リン酸化酵素、Src、エンドセリン受容体、ニューロペプチドY及び受容体、アデノシン受容体、アデノシンキナーゼ及びAMPデアミナーゼ、プリン受容体(P2Y1、P2Y2、P2Y4、P2Y6、P2X1−7)、ファルネシルトランスフェラーゼ、ゲラニルゲラニルトランスフェラーゼ、TrkAすなわちNGF受容体、ベータ−アミロイド、チロシンキナーゼFlk−IIKDR、ビトロネクチン受容体、インテグリン受容体、Her−21 neu、テロメラーゼ阻害、細胞質型ホスホリパーゼA2、及びEGF受容体チロシンキナーゼからなる群より選択される、(2)に記載の化合物。さらなるタンパク質標的として、例えば、エクジソン20−モノオキシゲナーゼ、GABA作動性クロリドチャンネルのイオンチャネル、アセチルコリンエステラーゼ、電位感受性ナトリウムチャネルタンパク質、カルシウム放出チャネル、及びクロリドチャネルが挙げられる。なおさらなる標的タンパク質として、アセチル−CoAカルボキシラーゼ、アデニロコハク酸シンテターゼ、プロトポルフィリノーゲンオキシダーゼ、及びエノールピルビルシキミ酸−リン酸シンターゼが挙げられる。
(12)前記PTM基が、Hsp90阻害剤;キナーゼ阻害剤、ホスファターゼ阻害剤、HDM2/MDM2阻害剤、ヒトBETブロモドメイン含有タンパク質を標的とする化合物、HDAC阻害剤、ヒトリジンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、RAF受容体を標的とする化合物、FKBPを標的とする化合物、血管新生阻害剤、免疫抑制化合物、アリール炭化水素受容体を標的とする化合物、アンドロゲン受容体を標的とする化合物、エストロゲン受容体を標的とする化合物、エストロゲン関連受容体を標的とする化合物、甲状腺ホルモン受容体を標的とする化合物、HIVプロテアーゼを標的とする化合物、HIVインテグラーゼを標的とする化合物、HCVプロテアーゼを標的とする化合物、またはアシルタンパク質チオエステラーゼ1及び/または2を標的とする化合物である、(2)に記載の化合物。
(13)前記PTM基が、TANK結合キナーゼ1(TBK1)、エストロゲン受容体α(ERα)、ブロモドメイン含有タンパク質4(BRD4)、アンドロゲン受容体(AR)、及びc−Mycからなる群より選択される、(2)に記載の化合物。
(14)(2)に記載の化合物を含む、組成物。
(15)(2)に記載の化合物、及び薬学上許容される担体、添加剤、及び/または賦形剤を含む、医薬組成物。
(16)生体活性作用剤をさらに含む、(15)に記載の医薬組成物。
(17)前記生体活性作用剤が、抗ウイルス剤である、(16)に記載の医薬組成物。
(18)前記抗ウイルス剤が、抗HIV作用剤である、(17)に記載の医薬組成物。
(19)前記抗HIV作用剤が、ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤(NRTI)、非ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤、プロテアーゼ阻害剤、融合阻害剤、またはそれらの混合物である、(18)に記載の医薬組成物。
(20)前記抗ウイルス剤が、抗HCV剤である、(17)に記載の医薬組成物。
(21)前記生体活性作用剤が、抗炎症剤、免疫作用剤、心血管系作用剤、及び神経作用剤からなる群より選択される、(16)に記載の医薬組成物。
(22)前記生体活性作用剤が、抗癌剤である、(16)に記載の医薬組成物。
(23)前記抗癌剤が、エベロリムス、トラベクテジン、アブラキサン、TLK 286、AV−299、DN−101、パゾパニブ、GSK690693、RTA 744、ON 0910.Na、AZD 6244(ARRY−142886)、AMN−107、TKI−258、GSK461364、AZD 1152、エンザスタウリン、バンデタニブ、ARQ−197、MK−0457、MLN8054、PHA−739358、R−763、AT−9263、FLT−3阻害剤、VEGFR阻害剤、EGFR TK阻害剤、オーロラキナーゼ阻害剤、PIK−1モジュレーター、Bcl−2阻害剤、HDAC阻害剤、c−MET阻害剤、PARP阻害剤、Cdk阻害剤、EGFR TK阻害剤、IGFR−TK阻害剤、抗HGF抗体、PI3キナーゼ阻害剤、AKT阻害剤、mTORC1/2阻害剤、JAK/STAT阻害剤、チェックポイント−1または2阻害剤、接着斑キナーゼ阻害剤、Mapキナーゼキナーゼ(mek)阻害剤、VEGFトラップ抗体、ペメトレキセド、エルロチニブ、ダサチニブ、ニロチニブ、デカタニブ、パニツムマブ、アムルビシン、オレゴボマブ、Lep−etu、ノラトレキセド、azd2171、バタブリン、オファツムマブ、ザノリムマブ、エドテカリン、テトランドリン、ルビテカン、テスミリフェン、オブリメルセン、チシリムマブ、イピリムマブ、ゴシポール、Bio 111、131−I−TM−601、ALT−110、BIO 140、CC 8490、シレンギチド、ギマテカン、IL13−PE38QQR、INO 1001、IPdR1 KRX−0402、ルカントン、LY317615、ノイラジアブ、ビテスパン、Rta 744、Sdx 102、タランパネル、アトラセンタン、Xr 311、ロミデプシン、ADS−100380、スニチニブ、5−フルオロウラシル、ボリノスタット、エトポシド、ゲムシタビン、ドキソルビシン、リポソームドキソルビシン、5'−デオキシ−5−フルオロウリジン、ビンクリスチン、テモゾロミド、ZK−304709、セリシクリブ;PD0325901、AZD−6244、カペシタビン、L−グルタミン酸、N−[4−[2−(2−アミノ−4,7−ジヒドロ−4−オキソ−1H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−5−イル)エチル]ベンゾイル]−、二ナトリウム塩、七水和物、カンプトテシン、PEG標識化イリノテカン、タモキシフェン、クエン酸トレミフェン、アナストロゾール、エキセメスタン、レトロゾール、DES(ジエチルスチルベストロール)、エストラジオール、エストロゲン、結合型エストロゲン、ベバシズマブ、IMC−1C11、CHIR−258;3−[5−(メチルスルホニルピペラジンメチル)−インドリル]−キノロン、バタラニブ、AG−013736、AVE−0005、[D−Ser(But)6,Azgly 10]の酢酸塩(ピロ−Glu−His−Trp−Ser−Tyr−D−Ser(But)−Leu−Arg−Pro−Azgly−NH2アセタート[C59H84N18Oi4−(C2H4O2)X、式中x=1〜2.4]、酢酸ゴセレリン、酢酸ロイプロリド、トリプトレリンパモ酸塩、酢酸メドロキシプロゲステロン、カプロン酸ヒドロキシプロゲステロン、酢酸メゲストロール、ラロキシフェン、ビカルタミド、フルタミド、ニルタミド、酢酸メゲストロール、CP−724714;TAK−165、HKI−272、エルロチニブ、ラパチニブ、カネルチニブ、ABX−EGF抗体、アービタックス、EKB−569、PKI−166、GW−572016、ロナファルニブ、BMS−214662、チピファルニブ;アミホスチン、NVP−LAQ824、スベロイルアニリドヒドロキサム酸、バルプロ酸、トリコスタチンA、FK−228、SU11248、ソラフェニブ、KRN951、アミノグルテチミド、アムサクリン、アナグレリド、L−アスパラギナーゼ、カルメット・ゲラン桿菌(BCG)ワクチン、アドリアマイシン、ブレオマイシン、ブセレリン、ブスルファン、カルボプラチン、カルムスチン、クロラムブシル、シスプラチン、クラドリビン、クロドロネート、シプロテロン、シタラビン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ジエチルスチルベストロール、エピルビシン、フルダラビン、フルドロコルチゾン、フルオキシメステロン、フルタミド、グリーベック、ゲムシタビン、ヒドロキシ尿素、イダルビシン、イホスファミド、イマチニブ、ロイプロリド、レバミソール、ロムスチン、メクロレタミン、メルファラン、6−メルカプトプリン、メスナ、メトトレキセート、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、ニルタミド、オクトレオチド、オキサリプラチン、パミドロネート、ペントスタチン、プリカマイシン、ポルフィマー、プロカルバジン、ラルチトレキセド、リツキシマブ、ストレプトゾシン、テニポシド、テストステロン、サリドマイド、チオグアニン、チオテパ、トレチノイン、ビンデシン、13−cis−レチノイン酸、フェニルアラニンマスタード、ウラシルマスタード、エストラムスチン、アルトレタミン、フロクスウリジン、5−デオキシウリジン、シトシンアラビノシド、6−メルカプトプリン、デオキシコホルマイシン、カルシトリオール、バルルビシン、ミトラマイシン、ビンブラスチン、ビノレルビン、トポテカン、ラゾキシン、マリマスタット、COL−3、ネオバスタット、BMS−275291、スクアラミン、エンドスタチン、SU5416、SU6668、EMD121974、インターロイキン−12、IM862、アンジオスタチン、ビタキシン、ドロロキシフェン、イドキシフェン、スピロノラクトン、フィナステリド、シミチジン、トラスツズマブ、デニロイキンジフチトクス、ゲフィチニブ、ボルテゾミブ、パクリタキセル、クレモホールを含まないパクリタキセル、ドセタキセル、エポチロンB、BMS−247550、BMS−310705、ドロロキシフェン、4−ヒドロキシタモキシフェン、ピペンドキシフェン、ERA−923、アルゾキシフェン、フルベストラント、アコルビフェン、ラソホキシフェン、イドキシフェン、TSE−424、HMR−3339、ZK186619、トポテカン、PTK787/ZK 222584、VX−745、PD 184352、ラパマイシン、40−O−(2−ヒドロキシエチル)−ラパマイシン、テムシロリムス、AP−23573、RAD001、ABT−578、BC−210、LY294002、LY292223、LY292696、LY293684、LY293646、ウォルトマンニン、ZM336372、L−779,450、PEG−フィルグラスチム、ダルベポエチン、エリスロポエチン、顆粒球コロニー刺激因子、ゾレドロネート、プレドニゾン、セツキシマブ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、ヒストレリン、ペグ化インターフェロンアルファ−2a、インターフェロンアルファ−2a、ペグ化インターフェロンアルファ−2b、インターフェロンアルファ−2b、アザシチジン、PEG−L−アスパラギナーゼ、レナリドミド、ゲムツズマブ、ヒドロコルチゾン、インターロイキン−11、デクスラゾキサン、アレムツズマブ、全トランス型レチノイン酸、ケトコナゾール、インターロイキン−2、メゲストロール、免疫グロブリン、ナイトロジェンマスタード、メチルプレドニゾロン、イブリツモマブチウキセタン、アンドロゲン、デシタビン、ヘキサメチルメラミン、ベクサロテン、トシツモマブ、三酸化ヒ素、コルチゾン、エチドロネート、ミトタン、シクロスポリン、リポソームダウノルビシン、エルウィニア−アスパラギナーゼ、ストロンチウム89、カソピタント、ネツピタント、NK−1受容体アンタゴニスト、パロノセトロン、アプレピタント、ジフェンヒドラミン、ヒドロキシジン、メトクロプラミド、ロラゼパム、アルプラゾラム、ハロペリドール、ドロペリドール、ドロナビノール、デキサメタゾン、メチルプレドニゾロン、プロクロルペラジン、グラニセトロン、オンダンセトロン、ドラセトロン、トロピセトロン、ペグフィルグラスチム、エリスロポエチン、エポエチンアルファ、ダルベポエチンアルファ、及びそれらの混合物からなる群より選択される、(22)に記載の組成物。
(24)細胞における標的タンパク質の分解を誘導するための方法であって、
(2)に記載の化合物の有効量を該細胞に投与する段階を含む、前記方法。
(25)細胞における標的タンパク質の分解を誘導するための方法であって、
(10)に記載の化合物の有効量を該細胞に投与する段階を含む、前記方法。
(26)細胞における標的タンパク質の分解を誘導するための方法であって、
(11)に記載の化合物の有効量を該細胞に投与する段階を含む、前記方法。
(27)患者における標的タンパク質の分解を誘導するための方法であって、
(2)に記載の化合物の有効量を該患者に投与する段階を含む、前記方法。
(28)調節不全のタンパク質活性が原因である疾患状態または症状の場合の患者における該疾患状態または症状を治療するための方法であって、(2)に記載の化合物の有効量を投与する段階を含む、前記方法。
(29)前記疾患状態または症状が、喘息、多発性硬化症、癌、繊毛関連疾患、口蓋裂、糖尿病、心疾患、高血圧、炎症性腸疾患、精神発達遅滞、気分障害、肥満、屈折異常、不妊、アンジェルマン症候群、カナバン病、セリアック病、シャルコー・マリー・トゥース病、嚢胞性線維症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、血色素症、血友病、クラインフェルター症候群、神経線維腫症、フェニルケトン尿症、多発性嚢胞腎疾患、(PKD1)または4(PKD2)プラダー・ウィリー症候群、鎌状赤血球症、テイ・サックス病、ターナー症候群である、(28)に記載の方法。
(30)前記疾患状態または症状が、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症(ルー・ゲーリック病)、神経性食欲不振症、不安症、粥状動脈硬化、注意欠陥多動性障害、自閉症、双極性障害、慢性疲労症候群、慢性閉塞性肺疾患、クローン病、冠動脈心疾患、認知症、抑うつ、1型真性糖尿病、2型真性糖尿病、癲癇、ギラン・バレー症候群、過敏性腸症候群、狼瘡、メタボリックシンドローム、多発性硬化症、心筋梗塞、肥満、強迫性障害、パニック障害、パーキンソン病、乾癬、リウマチ様関節炎、類肉腫症、統合失調症、脳卒中、閉塞性血栓血管炎、トゥレット症候群、血管炎である、(28)に記載の方法。
(31)前記疾患状態または症状が、無セルロプラスミン血症、II型軟骨無発生症、軟骨無形成症、尖頭症、2型ゴーシェ病、急性間欠性ポルフィリン症、カナバン病、大腸腺腫症、ALAデヒドラターゼ欠損、アデニロコハク酸リアーゼ欠損、副腎性器症候群、副腎白質ジストロフィー、ALA−Dポルフィリン症、ALAデヒドラターゼ欠損、アルカプトン尿症、アレキサンダー病、アルカプトン尿症オクロノーシス、アルファ1−アンチトリプシン欠損、アルファ−1プロテイナーゼ阻害剤、肺気腫、筋萎縮性側索硬化症、アルストレーム症候群、アレキサンダー病、遺伝性エナメル質形成不全症、ALAデヒドラターゼ欠損、アンダーソン・ファブリー病、アンドロゲン不感性症候群、貧血、びまん性体幹被角血管腫、網膜血管腫症(フォンヒッペル・リンドウ病)、アペール症候群、クモ指症(マルファン症候群)、スティックラー症候群、先天性多発性関節弛緩症(エーラス・ダンロス症候群#多発性関節弛緩型)、毛細血管拡張性運動失調症、レット症候群、原発性肺高血圧症、サンドホフ病、神経線維腫症II型、ベアレ・スティーブンソン脳回状皮膚症候群、地中海熱、家族性、ベンジャミン症候群、ベータ−サラセミア、両側性聴神経腫瘍(神経線維腫症II型)、第V因子ライデン血栓形成傾向、ブロッホ・ズルツベルガー症候群(色素失調症)、ブルーム症候群、X連鎖鉄芽球性貧血、ボネビー・ウルリッヒ症候群(ターナー症候群)、ブルヌヴィーユ病(結節性硬化症)、プリオン病、バート・ホッグ・デューベ症候群、脆弱骨症(骨形成不全症)、幅広母指/母趾症候群(ルビンシュタイン・テイビ症候群)、青銅色糖尿病/青銅色化肝硬変(血色素症)、球脊髄性筋萎縮症(ケネディ病)、ビュルガー・グリュッツ症候群(リポタンパク質リパーゼ欠損症)、CGD慢性肉芽腫性疾患、屈曲肢異形成症、ビオチニダーゼ欠損、心筋症(ヌーナン症候群)、ネコ鳴き症候群、CAVD(先天性輸精管欠損)、Caylor心顔症候群(CBAVD)、CEP(先天性赤血球生成性ポルフィリン症)、嚢胞性線維症、先天性副甲状腺機能低下症、軟骨異栄養症(軟骨無形成症)、耳脊椎巨大骨端異形成、レッシュ・ナイハン症候群、ガラクトース血症、エーラス・ダンロス症候群、致死性骨異形成症、コフィン・ローリー症候群、コケイン症候群、(家族性大腸腺腫症)、先天性赤血球生成性ポルフィリン症、先天性心疾患、メトヘモグロビン血症/先天性メトヘモグロビン血症、軟骨無形成症、X連鎖鉄芽球性貧血、膠原病、円錐動脈幹異常顔貌症候群、クーリー貧血(ベータ−サラセミア)、銅蓄積症(ウィルソン病)、銅輸送病(メンケス病)、遺伝性コプロポルフィリン症、カウデン病、頭蓋顔面異骨症(クルーゾン病)、クロイツフェルト・ヤコブ病(プリオン病)、コケイン症候群、カウデン病、Curschmann−Batten−Steinert症候群(筋緊張性ジストロフィー)、ベアレ・スティーブンソン脳回状皮膚症候群、原発性高シュウ酸尿症、脊椎骨端骨幹端異形成(Strudwick型)、筋ジストロフィー、デュシェンヌ型及びベッカー型筋ジストロフィー(DBMD)、アッシャー症候群、de Grouchy症候群及びデジュリーヌ・ソッタス病を含む神経変性疾患、発達障害、遠位型脊髄性筋萎縮症、V型、アンドロゲン不感性症候群、びまん性グロボイド体硬化症(クラッベ病)、ディジョージ症候群、ジヒドロテストステロン受容体欠損、アンドロゲン不感性症候群、ダウン症、低身長症、赤血球生成性プロトポルフィリン症、赤血球5−アミノレブリン酸シンターゼ欠損、赤血球生成性ポルフィリン症、赤血球生成性プロトポルフィリン症、赤血球生成性ウロポルフィリン症、フリードライヒ運動失調、家族性発作性多発性漿膜炎、晩発性皮膚ポルフィリン症、家族性圧脆弱性ニューロパチー、原発性肺高血圧症(PPH)、膵臓の線維嚢胞性疾患、脆弱X症候群、ガラクトース血症、遺伝性脳障害、巨細胞肝炎(新生児血色素症)、グレンブラッド・ストランドバーグ症候群(弾力線維性仮性黄色腫)、ギュンター病(先天性赤血球生成性ポルフィリン症)、血色素症、ハルグレン症候群、鎌状赤血球貧血、血友病、肝骨髄性ポルフィリン症(HEP)、ヒッペル・リンドウ病(フォンヒッペル・リンドウ病)、ハンチントン病、ハッチンソン・ギルフォード早老症候群(早老症)、アンドロゲン過剰症、軟骨低形成症、低色素性貧血、X連鎖重症複合免疫不全を含む免疫系障害、Insley−Astley症候群、ジャクソン・ワイス症候群、ジュベール症候群、レッシュ・ナイハン症候群、ジャクソン・ワイス症候群、高シュウ酸尿症を含む腎臓疾患、クラインフェルター症候群、クニースト骨異形成症、ラクナ型認知症、ランガー・サルディーノ型軟骨無発生症、毛細血管拡張性運動失調症、リンチ症候群、リジルヒドロキシラーゼ欠損、マシャド・ジョセフ病、クニースト骨異形成症を含む代謝障害、マルファン症候群、運動障害、モワット・ウィルソン症候群、嚢胞性線維症、ムエンケ症候群、多発性神経線維腫症、Nance−Insley症候群、Nance−Sweeney軟骨異形成、ニーマン・ピック病、ノアク症候群(プファイファー症候群)、オスラー・ウェーバー・ランデュ病、ポイツ・ジェガース症候群、多発性嚢胞腎疾患、多骨性線維性骨異形成症(マキューン・オルブライト症候群)、ポイツ・ジェガース症候群、プラダー・ラープハルト・ウィリー症候群、血色素症、原発性高尿酸血症症候群(レッシュ・ナイハン症候群)、原発性肺高血圧症、原発性老人性退行性認知症、プリオン病、早老症(ハッチンソン・ギルフォード早老症候群)、進行性舞踏病、慢性遺伝性(ハンチントン)(ハンチントン病)、進行性筋萎縮症、脊髄性筋萎縮症、プロピオン酸血症、プロトポルフィリン症、近位型筋強直性ジストロフィー、肺動脈性肺高血圧症、PXE(弾力線維性仮性黄色腫)、Rb(網膜芽細胞腫)、レックリングハウゼン病(神経線維腫症I型)、再発性多発性漿膜炎、網膜障害、網膜芽細胞腫、レット症候群、RFALS3型、リッカー症候群、ライリー・デイ症候群、ルーシー・レヴィー症候群、発育遅延及び黒色表皮腫を伴う重症軟骨無形成症(SADDAN)、リー・フラウメニ症候群、肉腫、乳がん、白血病、及び副腎(SBLA)症候群、結節性硬化症(結節性硬化症)、SDAT、先天性SED(先天性脊椎骨端異形成症)、Strudwick型SED(脊椎骨端骨幹端異形成、Strudwick型)、SEDc(先天性脊椎骨端異形成症)、SEMD、Strudwick型(脊椎骨端骨幹端異形成、Strudwick型)、シュプリンツェン症候群、皮膚色素沈着障害、スミス・レムリ・オピッツ症候群、南アフリカ遺伝性ポルフィリン症(異型性ポルフィリン症)、乳児期発症上向性遺伝性痙性麻痺、会話及びコミュニケーション障害、スフィンゴリピド症、テイ・サックス病、脊髄小脳失調症、スティックラー症候群、脳卒中、アンドロゲン不感性症候群、テトラヒドロビオプテリン欠損、ベータ−サラセミア、甲状腺疾患ソーセージ様ニューロパチー(遺伝性圧脆弱性ニューロパチー)トリーチャー・コリンズ症候群、トリプロX症候群(トリプルX症候群)、21番染色体トリソミー(ダウン症)、X染色体トリソミー、VHL症候群(フォンヒッペル・リンドウ病)、視力障害及び失明(アルストレーム症候群)、フロリク病、ワールデンブルグ症候群、Warburg Sjo Fledelius症候群、Weissenbacher−Zweymuller症候群、ウォルフ・ヒルシュホーン症候群、ウォルフ周期性疾患、Weissenbacher−Zweymuller症候群、及び色素性乾皮症である、(28)に記載の方法。
(32)前記疾患状態または症状が、癌である、(28)に記載の方法。
(33)前記癌が、扁平細胞癌、基底細胞癌、腺癌、肝細胞癌、及び腎細胞癌;膀胱、腸、乳房、子宮頚部、結腸、食道、頭部、腎臓、肝臓、肺、頚部、卵巣、膵臓、前立腺、及び胃の癌;白血病;良性及び悪性リンパ腫、特にバーキットリンパ腫及び非ホジキンリンパ腫;良性及び悪性黒色腫;骨髄増殖性疾患;多発性骨髄腫、肉腫、これには、ユーイング肉腫、血管肉腫、カポジ肉腫、脂肪肉腫、筋肉腫、末梢性神経上皮腫、滑膜肉腫、神経膠腫、星状細胞腫、乏突起膠腫、上衣腫、神経膠芽腫、神経芽細胞腫、神経節腫、神経節膠腫、髄芽細胞腫、脊髄細胞腫、髄膜腫、髄膜肉腫、神経線維腫、及びシュワン細胞腫が含まれ;腸癌、乳癌、前立腺癌、子宮頸癌、子宮癌、肺癌、卵巣癌、精巣癌、甲状腺癌、星状細胞腫、食道癌、膵癌、胃癌、肝臓癌、結腸癌、黒色腫;癌肉腫、ホジキン病、ウィルムス腫瘍、または奇形癌腫である、(32)に記載の方法。
(34)前記癌が、T細胞性急性リンパ芽球性白血病(T−ALL)、T細胞性リンパ芽球性リンパ腫(T−LL)、末梢性T細胞リンパ腫、成人T細胞白血病、Pre−B ALL、Pre−Bリンパ腫、巨大B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、B細胞ALL、フィラデルフィア染色体陽性ALL、及びフィラデルフィア染色体陽性CMLである、(32)に記載の方法。
(35)1種より多い(1)に記載の化合物を含む、化合物ライブラリー。
(36)セレブロン(CRBN)を認識するE3ユビキチンリガーゼ結合部分を含有する化合物の同定方法であって、
試験化合物をCRBNタンパク質とともにインキュベートする段階;
該CRBNタンパク質と結合した該試験化合物の量を求める段階
を含む、前記方法。
(37)以下で表される化学構造:
を有し、式中
Wが、CH2、CHR、C=O、SO2、NH、及びN−アルキルからなる群より選択され;
各Xが、独立して、O、S、及びH2からなる群より選択され;
Yが、NH、N−アルキル、N−アリール、N−ヘタリール、N−シクロアルキル、N−ヘテロシクリル、O、及びSからなる群より選択され;
Zが、O、S、及びH2からなる群より選択され;
G及びG'が、独立して、H、アルキル、OH、R'で置換されていてもよいCH2−ヘテロシクリル、及びR'で置換されていてもよいベンジルからなる群より選択され;
Q1、Q2、Q3、及びQ4が、R'、N、またはN−オキシドから独立して選択される基で置換される炭素Cを表し;
Aが、独立して、以下の群、アルキル、シクロアルキル、Cl、及びFより選択され;
Rが、−CONR'R''、−OR'、−NR'R''、−SR'、−SO2R'、−SO2NR'R''、−CR'R''−、−CR'NR'R''−、−アリール、−ヘタリール、−アルキル、−シクロアルキル、−ヘテロシクリル、−P(O)(OR')R''、−P(O)R'R''、−OP(O)(OR')R''、−OP(O)R'R''、−Cl、−F、−Br、−I、−CF3、−CN、−NR'SO2NR'R''、−NR'CONR'R''、−CONR'COR''、−NR'C(=N−CN)NR'R''、−C(=N−CN)NR'R''、−NR'C(=N−CN)R''、−NR'C(=C−NO2)NR'R''、−SO2NR'COR''、−NO2、−CO2R'、−C(C=N−OR')R''、−CR'=CR'R''、−CCR'、−S(C=O)(C=N−R')R''、−SF5、及び−OCF3を含み;
R'及びR''が、独立して、結合、H、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘタリール、ヘテロシクリルからなる群より選択され;
が、立体特異性((R)または(S))であっても非立体特異性であってもよい結合を表し;かつ、
Rnが、官能基または原子を含み、
式中、nが、1〜4の整数である、
セレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分(CLM)。
(38)前記Rnが、リンカー基(L)、タンパク質標的指向部分(PTM)、E3ユビキチンリガーゼ結合部分(ULM)、またはそれらの任意の複数もしくは組み合わせと共有結合した官能基あるいは原子を含む、(37)に記載のCLM。
(39)前記ULMが、第二のCLM、CLM'、またはそれらの任意の複数もしくは組み合わせであり、
該第二のCLMが、前記CLMと同じ化学構造を有し、かつ
該CLM'が、前記CLMと構造的に異なっている、(38)に記載のCLM。
1.CRBNアッセイ−ヒトCRBN及びDDB1のクローニング、発現、及び精製
この手順は、当業者にとって標準的なものであり、Lopez−Gironaらの記載(Cereblon is a direct protein target for immunomodulatory and antiproliferative activities of lenalidomide and pomalidomide, A Lopez−Girona, D Mendy, T Ito, K Miller, A K Gandhi, J Kang, S Karasawa, G Carmel, P Jackson, M Abbasian, A Mahmoudi, B Cathers, E Rychak, S Gaidarova, R Chen, P H Schafer, H Handa, T O Daniel, J F Evans and R Chopra, Leukemia 26: 2326−2335, 2012)は、その典型例である。
このアッセイは、当業者にとって標準的なものであり、Lopez−Gironaらの記載(Cereblon is a direct protein target for immunomodulatory and antiproliferative activities of lenalidomide and pomalidomide, A Lopez−Girona, D Mendy, T Ito, K Miller, A K Gandhi, J Kang, S Karasawa, G Carmel, P Jackson, M Abbasian, A Mahmoudi, B Cathers, E Rychak, S Gaidarova, R Chen, P H Schafer, H Handa, T O Daniel, J F Evans and R Chopra, Leukemia 26: 2326−2335, 2012)は、その典型例である。
Poroshell 120 EC C18カラム(50mm×内径3.0mm、充填物径2.7μm)にて、45℃で分析を行う。
A=0.1%v/vのギ酸の水溶液。
B=0.1%v/vのギ酸のアセトニトリル溶液。
HPLC分析を、X Bridge RP18 OBDカラム(150mm×内径19mm、充填物径5μm)にて、周辺温度で行う。
A=0.1%v/vのギ酸の水溶液。
B=アセトニトリル。
HPLC分析を、X Bridge RP18 OBDカラム(150mm×内径19mm、充填物径5μm)にて、周辺温度で行う。
A=10mMの重炭酸アンモニウム水溶液。
B=アセトニトリル。
以下に含まれる実施例についての合成詳細は、より広範囲な例の組の合成について情報を提供する一般手順の代表例である。
工程1:4−フルオロイソベンゾフラン−1,3−ジオン
3−フルオロフタル酸(50g、271.7mmol)を無水酢酸(400mL)に加えた混合物を、2時間還流させた。揮発分を減圧除去し、残渣を無水酢酸に入れて結晶化させて、4−フルオロイソベンゾフラン−1,3−ジオン(40g、未精製)を褐色固体として得た。
工程2:5−アミノ−2−(4−フルオロ−1,3−ジオキソイソインドリン−2−イル)−5−オキソペンタン酸
上記の4−フルオロイソベンゾフラン−1,3−ジオン(40g、未精製)及びL−グルタミン(35g、239mmol)を乾燥DMF(200mL)に加えた混合物を、90℃で8時間攪拌した。溶媒を減圧除去した。残渣を4NのHCl(200mL)に再溶解させ、さらに8時間攪拌した。生じる沈殿物を濾過して集め、水で洗い、乾燥させて、5−アミノ−2−(4−フルオロ−1,3−ジオキソイソインドリン−2−イル)−5−オキソペンタン酸(37g、未精製)を、オフホワイト色固体として得た。
工程3:2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−1,3−ジオン
上記の5−アミノ−2−(4−フルオロ−1,3−ジオキソイソインドリン−2−イル)−5−オキソペンタン酸(37g、未精製)、1,1'−カルボニルジイミダゾール(CDI)(24.2g、149.4mmol)、及び4−ジメチルアミノピリジン(DMAP)(1.3g、11.5mmol)をアセトニトリル(80mL)に加えた混合物を、5時間還流させた。反応混合物を室温に冷却した。得られる固体を濾過して集め、アセトニトリル(100mL)で洗って、粗生成物を得て、これを、溶離液として1−10%MeOH含有DCMを用いてシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(9.0g、3工程を通して収率12%)を淡黄色固体として得た。
工程1:tert−ブチル N−{3−[(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルカルバマート
tert−ブチル N−(3−アミノプロピル)−N−メチルカルバマート(826mg、4.40mmol)及び5−ブロモ−2,4−ジクロロピリミジン(400mg、1.76mmol)をMeOH(10mL)に加えた混合物を、室温で1時間攪拌した。次いで、反応混合物を減圧濃縮し、残渣をTeledyne ISCOクロマトグラフィー[0→35%のEtOAc/ヘプタン]で精製して、tert−ブチル N−{3−[(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルカルバマート(615mg、収率92%)を得た。LC−MS(ES+):m/z=381.05/383.05[MH+]、tR=2.55分。
工程2:{3−[(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}(メチル)アミン
tert−ブチル N−{3−[(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルカルバマート(615mg、1.62mmol)をDCM(5mL)に溶解させた溶液に、室温で、トリフルオロ酢酸(0.54mL、6.5mmol)を加えた。1時間攪拌後、混合物を減圧濃縮した。残渣をTeledyne ISCOクロマトグラフィー[0→15%メタノール含有DCM]で精製して、{3−[(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}(メチル)アミン(371mg、収率82%)を得た。LC−MS(ES+):m/z=280.99/282.99[MH+]、tR=1.13分。
工程3:N−{3−[(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルシクロブタンカルボキサミド
{3−[(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}(メチル)アミン(371mg、1.33mmol)及び塩化シクロブタンカルボニル(188mg、1.60mmol)をDCM(10mL)に溶解させた溶液に、室温で、トリエチルアミン(0.41mL、2.92mmol)を加えた。反応混合物を室温で16時間攪拌放置し、次いで減圧濃縮した。残渣を、Teledyne ISCOクロマトグラフィー[0→100%EtOAc/ヘプタン]で精製して、N−{3−[(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルシクロブタンカルボキサミド(268mg、56%)を得た。LC−MS(ES+):m/z=363.04/365.04[MH+]、tR=2.18分。
表題化合物を、WO2011/143660に記載される手順に従って調製した。
表題化合物を、Patch, R. J.ら J. Med. Chem. 2011, 54, 788−808に記載される手順に従って調製した。
表題化合物を,Jung, M. E.ら J. Med. Chem. 2010, 53, 2779−2796に記載される手順に従って調製した。
表題化合物を,Guo, C.ら J. Med. Chem. 2011, 54, 7693−7704に記載される手順に従って調製した。
(表1に示す化合物構造#17)
工程1:2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチル 4−メチルベンゼンスルホナート
2,2'−(2,2'−オキシビス(エタン−2,1−ジイル)ビス(オキシ))ビス(エタン−2,1−ジイル) ビス(4−メチルベンゼンスルホナート)(3g、5.96mmol)、4−ニトロフェノール(813mg、5.84mmol)、及び炭酸カリウム(1.65g、11.94mmol)を乾燥N,N−ジメチルホルムアミド(20mL)に加えた混合物を、50℃で一晩攪拌した。混合物を、室温に冷却し、水(60mL)に注ぎ、次いで酢酸エチル(80mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、水(50mL)及びブライン(50mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させて、減圧濃縮した。残渣を、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(10−20%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチル 4−メチルベンゼンスルホナート(2.65g、収率95%)を黄色油状物として得た。LC−MS(ES+):m/z 470.2[MH+](tR=2.83分)。
工程2:[1−(2−(2−(2−(2−アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)−4−ニトロベンゼン]
2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチル 4−メチルベンゼンスルホナート(2.65g、5.64mmol)及びアジ化ナトリウム(734mg、11.29mmol)をエタノール(30mL)に加えた混合物を、16時間還流させた。混合物を、室温に冷却し、水(50mL)でクエンチし、ジクロロメタン(50mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、水(50mL)及びブライン(40mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮して、粗1−(2−(2−(2−(2−アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)−4−ニトロベンゼン(865mg)を黄色油状物として得た。
工程3:[2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エタンアミン]
上記1−(2−(2−(2−(2−アジドエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)−4−ニトロベンゼン(865mg、2.54mmol)、トリフェニルホスフィン(999mg、3.81mmol)、及び水(69mg、3.83mmol)をテトラヒドロフラン(10mL)に加えた混合物を、窒素雰囲気下、室温で14時間攪拌した。揮発分を減圧除去して粗残渣を得て、これをシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(3−5%メタノール含有ジクロロメタンで溶出)により精製して、2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エタンアミン(661mg、83%収率)を黄色油状物として得た。
工程4:tert−ブチル 2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート
2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エタンアミン(661mg、2.1mmol)、トリエチルアミン(449mg、4.43mmol)、及びジ−tert−ブチル ジカーボナート(505mg、2.31mmol)をジクロロメタン(25mL)に加えた混合物を、室温で2時間攪拌した。混合物をジクロロメタン(100mL)に希釈し、水(30mL×2)及びブライン(30mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。残渣を、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(20−40%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、tert−ブチル 2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(818mg、94%収率)を黄色油状物として得た。
工程5:tert−ブチル 2−(2−(2−(2−(4−アミノフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート
2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(818mg、1.97mmol)、鉄粉(1.1g、0.65mmol)、及び塩化アンモニウム(528mg、9.87mmol)を、エタノール(20mL)及び水(5mL)に加えた混合物を、80℃で1時間攪拌した。混合物を室温に冷却し、固体沈殿物を、濾過して取り出し、酢酸エチル(20mL×2)で洗った。濾液を酢酸エチル(120mL)と水(30mL)で分配した。有機相をブライン(30mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(30−40%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、tert−ブチル 2−(2−(2−(2−(4−アミノフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(512mg、67%収率)を黄色油状物として得た。
工程6:tert−ブチル 2−(2−(2−(2−(4−(5−ブロモ−4−(3−(N−メチルシクロブタンカルボキサミド)プロピルアミノ)ピリミジン−2−イルアミノ)フェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート
tert−ブチル 2−(2−(2−(2−(4−アミノフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(130mg、0.34mmol)、N−(3−(5−ブロモ−2−クロロピリミジン−4−イルアミノ)プロピル)−N−メチルシクロブタンカルボキサミド(24mg、0.06mmol)、及びp−トルエンスルホン酸(11.6mg、0.07mmol)をジオキサン(1.5mL)に加えた混合物を、16時間還流させた。反応混合物を室温に冷却し、重炭酸ナトリウム水溶液(1.0N、30mL)でクエンチし、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて水(30mL)及びブライン(30mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。粗残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(50%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、tert−ブチル 2−(2−(2−(2−(4−(5−ブロモ−4−(3−(N−メチルシクロブタンカルボキサミド)プロピルアミノ)ピリミジン−2−イルアミノ)フェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(40mg、収率17%)を黄色油状物として得た。
工程7:N−(3−(2−(4−(2−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)フェニルアミノ)−5−ブロモピリミジン−4−イルアミノ)プロピル)−N−メチルシクロブタンカルボキサミド
tert−ブチル 2−(2−(2−(2−(4−(5−ブロモ−4−(3−(N−メチルシクロブタンカルボキサミド)プロピルアミノ)ピリミジン−2−イルアミノ)フェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(40mg、0.06mmol)を2,2,2−トリフルオロ酢酸(1mL)及びジクロロメタン(1mL)に加えた混合物を、室温で2時間攪拌した。揮発分を減圧除去した。残渣を、ジクロロメタン(60mL)と重炭酸ナトリウム水溶液(2.0N、30mL)で分配した。有機層をブライン(20mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮して、N−(3−(2−(4−(2−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)フェニルアミノ)−5−ブロモピリミジン−4−イルアミノ)プロピル)−N−メチルシクロブタンカルボキサミド(18mg、収率52%)を黄色油状物として得た。
工程8:N−(3−(5−ブロモ−2−(4−(2−(2−(2−(2−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イルアミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)フェニルアミノ)ピリミジン−4−イルアミノ)プロピル)−N−メチルシクロブタンカルボキサミド
N−(3−(2−(4−(2−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)フェニルアミノ)−5−ブロモピリミジン−4−イルアミノ)プロピル)−N−メチルシクロブタンカルボキサミド(130mg、0.03mmol)、2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−1、3−ジオン(8.2mg、0.03mmol)、及びN−エチル−N−イソプロピルプロパン−2−アミン(7.6mg、0.06mmol)を乾燥N,N−ジメチルホルムアミド(1mL)に加えた混合物を、90℃で12時間攪拌した。反応混合物を室温に冷却し、酢酸エチル(100mL)と水(30mL)で分配した。有機相をブライン(30mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。残渣を、分取TLCにより精製して、N−(3−(5−ブロモ−2−(4−(2−(2−(2−(2−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イルアミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)フェニルアミノ)ピリミジン−4−イルアミノ)プロピル)−N−メチルシクロブタンカルボキサミド(10.2mg、収率40%)を黄色固体として得た。LC−MS(ES+):m/z=865.27/867.27(1:1)[MH]+.tR=2.06分。
(表1に示す化合物構造#14)
工程1:(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−(2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルアミノ)イソインドリン−1,3−ジオン
2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エタンアミン(128mg、0.41mmol)、2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−1,3−ジオン(112.5mg、0.41mmol)、及びN−エチル−N−イソプロピルプロパン−2−アミン(105mg、0.81mmol)を乾燥N,N−ジメチルホルムアミド(2mL)に加えた混合物を、90℃で12時間攪拌した。混合物を室温に冷却し、水(20mL)に注ぎ、酢酸エチル(35mL×2)で抽出した。有機相を1つにまとめて、水(30mL)及びブライン(30mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。粗残渣を、分取TLCにより精製して、2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−(2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルアミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(73mg、収率31%)を黄色固体として得た。LC−MS(ES+):m/z571.3[MH+]、tR=2.46分。
工程2:(4−(2−(2−(2−(2−(4−アミノフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルアミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−(2−(2−(2−(2−(4−ニトロフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルアミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(73mg、0.128mmol)及び鉄粉(71.6mg、1.28mmol)をエタノール(2mL)に加えた懸濁液に、室温で、塩化アンモニウム(68mg、1.26mmol)を水(0.5mL)に加えた溶液を加え、得られる混合物を80℃で1時間攪拌した。混合物を室温に冷却した後、固体沈殿物を濾過し、酢酸エチル(10mL×2)で洗った。濾液を酢酸エチル(60mL)と水(30mL)で分配した。有機層を、ブライン(30mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮して、4−(2−(2−(2−(2−(4−アミノフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルアミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(66.5mg、未精製)を黄色油状物として得た。LC−MS(ES+):m/z541.5[MH+]、tR=1.593分。
工程3:2−((S)−4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)−N−(4−(2−(2−(2−(2−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イルアミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)フェニル)アセトアミド
4−(2−(2−(2−(2−(4−アミノフェノキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチルアミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(58.4mg、0.11mmol)、(S)−2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)酢酸(43.3mg、0.11mmol)、及びN−エチル−N−イソプロピルプロパン−2−アミン(41.8mg、0.32mmol)を乾燥N,N−ジメチルホルムアミド(1mL)に溶解させた溶液を攪拌しながら、0℃で、そこに(2−(7−アザ−1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート)(82mg、0.21mmol)を加えた。得られる混合物を室温まで自然に昇温させ、室温で20分間攪拌した。混合物を水(25mL)に注ぎ、酢酸エチル(35ml×2)で抽出した。有機相を1つにまとめて、水(20mL)及びブライン(30mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。粗残渣を、分取TLCにより精製して、2−((S)−4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)−N−(4−(2−(2−(2−(2−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イルアミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)フェニル)アセトアミド(52mg、収率52%)を黄色固体として得た。LC−MS(ES+):m/z923.29/925.29(3:1)[MH+]、tR=2.689分。
(表1に示す化合物構造#22)
工程1:(Z)−2−(2−(2−(5−(4−(4−シアノ−2−(トリフルオロメチル)フェノキシ)−3−メトキシベンジリデン)−2,4−ジオキソチアゾリジン−3−イル)エトキシ)エトキシ)エチル=4−メチルベンゼンスルホナート)
(Z)−4−(4−((2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル(1.0g、2.3mmol)、炭酸カリウム(1.0g、6.9mmol)、及び2,2'−(エタン−1,2−ジイルビス(オキシ))ビス(エタン−2,1−ジイル)=ビス(4−メチルベンゼンスルホナート)(1.3g、2.7mmol)をN,N−ジメチルホルムアミド(10mL)に加えた混合物を、80℃で16時間攪拌した。反応混合物を室温に冷却し、水(10mL)でクエンチし、酢酸エチル(40mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、水(50mL)及びブライン(50mL)で洗い、硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧エバポレートした。粗残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(10−30%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、(Z)−2−(2−(2−(5−(4−(4−シアノ−2−(トリフルオロメチル)フェノキシ)−3−メトキシベンジリデン)−2,4−ジオキソチアゾリジン−3−イル)エトキシ)エトキシ)エチル=4−メチルベンゼンスルホナート(1.0g、収率61%)を淡黄色固体として得た。
工程2:(Z)−4−(4−((3−(2−(2−(2−アジドエトキシ)エトキシ)エチル)−2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル
(Z)−2−(2−(2−(5−(4−(4−シアノ−2−(トリフルオロメチル)フェノキシ)−3−メトキシベンジリデン)−2,4−ジオキソチアゾリジン−3−イル)エトキシ)エトキシ)エチル=4−メチルベンゼンスルホナート(1.0g、1.4mmol)及びアジ化ナトリウム(185mg、2.8mmol)をエタノール(20mL)に加えた混合物を、16時間還流させた。反応混合物を室温に冷却し、酢酸エチル(100mL)と水(20mL)で分配した。有機層をブライン(30ml)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮して、(Z)−4−(4−((3−(2−(2−(2−アジドエトキシ)エトキシ)エチル)−2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル(130mg、未精製)を明黄色油状物として得た。これは、それ以上精製することなく、次の工程に使用した。
工程3:(Z)−4−(4−((3−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エチル)−2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル
上記(Z)−4−(4−((3−(2−(2−(2−アジドエトキシ)エトキシ)エチル)−2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル)(130mg、未精製)、トリフェニルホスフィン(100mg、0.34mmol)を、水(0.2mL)及びテトラヒドロフラン(20mL)に加えた混合物を、室温で14時間攪拌した。混合物を減圧濃縮した。粗残渣を、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(3−5%メタノール含有ジクロロメタンで溶出)により精製して、(Z)−4−(4−((3−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エチル)−2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル(60mg、2工程を通して収率8%)を黄色油状物として得た。LC−MS(ES+):m/z552.1[MH+]、tR=2.15分。
工程4:(Z)−4−(4−((3−(2−(2−(2−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イルアミノ)エトキシ)エトキシ)エチル)−2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル
(Z)−4−(4−((3−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エチル)−2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル)(60mg、0.10mmol)、2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−1,3−ジオン(30mg、0.13mmol)、及びN−エチル−N−イソプロピルプロパン−2−アミン(50mg、0.39mmol)を1−メチルピロリジン−2−オン(1mL)に加えた混合物を、90℃で16時間攪拌した。反応混合物を室温に冷却し、水(5mL)でクエンチし、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。有機層を1つにまとめて、水(10mL×2)及びブライン(10mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。粗残渣を分取TLCにより精製して、(Z)−4−(4−((3−(2−(2−(2−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イルアミノ)エトキシ)エトキシ)エチル)−2,4−ジオキソチアゾリジン−5−イリデン)メチル)−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル(9.5mg、11.8%収率)を黄色固体として得た。LC−MS(ES+):m/z808.19[MH+]、tR=3.022分。
(表1に示す化合物構造#1)
工程1:1,1,1,16−テトラフェニル−2,5,8,11,15−ペンタオキサヘキサデカン
2−(2−(2−(トリチルオキシ)エトキシ)エトキシ)エタノール(7g、17.7mmol)をN,N−ジメチルホルムアミド(50mL)に溶解させた溶液に、0℃で、水素化ナトリウム(鉱物油中60%、707mg、17.7mmol)をゆっくりと加えた。混合物を室温で30分間攪拌した後、0℃で、3−(ベンジルオキシ)プロピル 4−メチルベンゼンスルホナート(5.8g、18.0mmol)を一度に加え、得られる混合物を70℃で一晩攪拌放置した。室温に冷却した後、混合物を注意しながら水(40mL)でクエンチし、酢酸エチル(60mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、ブライン(80mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。粗残渣を、シリカゲルフラッシュクロマトグラフィー(5−10%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、1,1,1,16−テトラフェニル−2,5,8,11,15−ペンタオキサヘキサデカン(4.8g、収率50%)を無色油状物として得た。
工程2:1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン−14−オール
1,1,1,16−テトラフェニル−2,5,8,11,15−ペンタオキサヘキサデカン(4.8g、8.8mmol)を塩化メチレン(10mL)及びメタノール(10mL)に溶解させた溶液に、0℃で、塩酸水溶液(37%、2.5mL)を加えた。反応混合物を室温で2時間攪拌した。反応混合物を水(30mL)に注ぎ、ジクロロメタン(20mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、重炭酸ナトリウム水溶液(1N、50mL)、水(30mL)、ブラインで洗い、無水Na2SO4で乾燥させ、減圧濃縮した。粗残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(20−40%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン−14−オール(1.9g、73%収率)を無色油状物として得た。
工程3:1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン−14−イル 4−メチルベンゼンスルホナート
1−フェニル−2,7,10,13−テトラオキサペンタデカン−15−オール(1.9g、6.3mmol)、トリエチルアミン(1.3mL、9.5mmol)、N,N−ジメチルピリジン−4−アミン(75mg、0.63mmol)、及び塩化4−メチルベンゼン−1−スルホニル(1.45g、7.65mmol)をジクロロメタン(20mL)に加えた混合物を、室温で3時間攪拌した。水(20mL)を加えて反応をクエンチし、生成物をジクロロメタン(40mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、ブライン(50mL)で洗い、硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧エバポレートした。粗残渣を、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(10−30%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン−14−イル 4−メチルベンゼンスルホナート(2.2g、収率78%)を無色油状物として得た。
工程4:14−アジド−1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン
1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン−14−イル 4−メチルベンゼンスルホナート(2.2g、4.9mmol)及びアジ化ナトリウム(420mg、6.3mmol)をエタノール(10mL)に加えた混合物を、5時間還流させた。反応混合物を室温に冷却し、水(10mL)に注ぎ、ジクロロメタン(50mL×3)で抽出した。有機層を1つにまとめてブライン(50mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮して、14−アジド−1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン(1.4g、未精製)を無色油状物として得た。これは、それ以上精製することなく、次の工程に使用した。
工程5:tert−ブチル (1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン−14−イル)カルバマート
上記14−アジド−1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン(1.4g,未精製)及びトリフェニルホスフィン(1.7g、6.5mmol)をテトラヒドロフラン(15mL)及び水(0.5mL)に加えた混合物を、窒素雰囲気下、室温で一晩攪拌した。反応混合物に、0℃で、トリエチルアミン(0.9mL、6.5mmol)及びジ−tert−ブチル ジカーボナート(1.1g、5.2mmol)を加えた。得られる混合物を室温まで自然に昇温させ、室温で2時間攪拌した。揮発分を減圧エバポレートし、残渣をジクロロメタン(100mL)と水(50mL)で分配した。有機相をブライン(30mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。粗残渣を、シリカゲルフラッシュクロマトグラフィー(30−50%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、tert−ブチル (1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン−14−イル)カルバマート(1.2g、2工程を通して収率50%)を無色油状物として得た。
工程6:tert−ブチル 2−(2−(2−(3−ヒドロキシプロポキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート
tert−ブチル (1−フェニル−2,6,9,12−テトラオキサテトラデカン−14−イル)カルバマート(1.2g、3mmol)及びパラジウム炭素(10%、200mg)をエタノール(50mL)に加えた混合物を、水素雰囲気下(水素風船)、室温で攪拌した。パラジウム炭素を濾過して除去し、エタノール(20mL)で洗った。濾液を減圧濃縮して、tert−ブチル 2−(2−(2−(3−ヒドロキシプロポキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(900mg、未精製)を無色油状物として得た。これは、それ以上精製することなく、次の工程に使用した。
工程7:2,2−ジメチル−4−オキソ−3,8,11,14−テトラオキサ−5−アザヘプタデカン−17−イル 4−メチルベンゼンスルホナート
上記のtert−ブチル 2−(2−(2−(3−ヒドロキシプロポキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(900mg、未精製)、トリエチルアミン(0.6mL、4.35mmol)、N,N−ジメチルピリジン−4−アミン(16mg、0.14mmol)、及び塩化4−メチルベンゼン−1−スルホニル(660mg、3.5mmol)を無水ジクロロメタン(15mL)に加えた混合物を、室温で3時間攪拌した。水(20mL)を加えて反応をクエンチし、生成物をジクロロメタン(50mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、ブライン(50mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧エバポレートした。粗残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(20−30%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、2,2−ジメチル−4−オキソ−3,8,11,14−テトラオキサ−5−アザヘプタデカン−17−イル 4−メチルベンゼンスルホナート(650mg、収率77%)を明黄色油状物として得た。
工程8:tert−ブチル (2−(2−(2−(3−(4−(3−(4−シアノ−3−(トリフルオロメチル)フェニル)−5,5−ジメチル−4−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)フェノキシ)プロポキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)カルバマート
2,2−ジメチル−4−オキソ−3,8,11,14−テトラオキサ−5−アザヘプタデカン−17−イル 4−メチルベンゼンスルホナート(115mg、0.25mmol)、炭酸カリウム(69mg、0.50mmol)、及び4−(3−(4−ヒドロキシフェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル(100mg、0.25mmol)をアセトニトリル(5mL)に加えた混合物を、80℃で16時間攪拌した。反応混合物を室温に冷却し、水(30mL)でクエンチし、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、水(30mL)及びブライン(30mL)で洗い、硫酸マグネシウムで乾燥させ、減圧エバポレートした。粗残渣を、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフ(10−30%酢酸エチル含有ヘキサンで溶出)により精製して、tert−ブチル 2−(2−(2−(3−(4−(3−(4−シアノ−3−(トリフルオロメチル)フェニル)−5,5−ジメチル−4−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)フェノキシ)プロポキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(150mg、収率82%)を黄色油状物として得た。LC−MS(ES+):m/z695.40[MH+]、tR=2.79分。
工程9:4−(3−(4−(3−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)プロポキシ)フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル
tert−ブチル 2−(2−(2−(3−(4−(3−(4−シアノ−3−(トリフルオロメチル)フェニル)−5,5−ジメチル−4−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)フェノキシ)プロポキシ)エトキシ)エトキシ)エチルカルバマート(150mg、0.21mmol)を無水ジクロロメタン(2mL)及び2,2,2−トリフルオロ酢酸(1mL)に加えた混合物を、室温で1時間攪拌した。揮発分を減圧エバポレートし、残渣を重炭酸ナトリウム水溶液(1N、20mL)に注いで、ジクロロメタン(50mL×3)で抽出した。有機相を1つにまとめて、ブライン(50mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮して、4−(3−(4−(3−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)プロポキシ)フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル(115mg,未精製)を褐色油状物として得た。これは、それ以上精製することなく、次の工程に使用した。
工程10:4−(3−(4−(3−(2−(2−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)プロポキシ)フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル
上記の4−(3−(4−(3−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)プロポキシ)フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル(115mg、未精製)、2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−1,3−ジオン(41mg、0.15mmol)、及びN−エチル−N−イソプロピルプロパン−2−アミン(58mg、0.44mmol)をN,N−ジメチルホルムアミド(2mL)に溶解させた溶液を、90℃で16時間攪拌した。反応混合物を室温に冷却し、水(3mL)でクエンチし、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。有機層を1つにまとめて、水(30mL×2)及びブライン(20mL)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧濃縮した。粗残渣を分取TLCにより精製して、4−(3−(4−(3−(2−(2−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)プロポキシ)フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−チオキソイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル(34.5mg、収率27%)を黄色固体として得た。LC−MS(ES+):m/z851.25[MH+]、tR=2.652分。
工程1:3−[(5−ヒドロキシペンチル)オキシ]プロパンニトリル
水素化ナトリウム(鉱物油中60%分散、820mg、34.2mmol)をTHF(50mL)に加えた懸濁液に、ペンタン−1,5−ジオール(2.98g、28.6mmol)を加えた。室温で20分間攪拌した後、混合物を0℃に冷却し、アクリロニトリル(1.20g、22.8mmol)を滴下した。得られる混合物を室温で10時間攪拌した。溶媒の一部を減圧除去し、残渣を水に注いだ。混合物をDCM(3×)で抽出した。有機層を、バイオタージユニバーサルフェーズセパレーターで濾過し、減圧濃縮した。粗物質を、Teledyne Combiflash ISCOカラムからMeOH/DCM(0:100から3:97へ)で溶出させるシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、3−[(5−ヒドロキシペンチル)オキシ]プロパンニトリルを得た(635mg、収率18%)。
工程2:tert−ブチル N−{3−[(5−ヒドロキシペンチル)オキシ]プロピル}カルバマート
3−[(5−ヒドロキシペンチル)オキシ]プロパンニトリル(400mg、2.54mmol)をMeOH(12mL)及びH2O(2.0mL)に溶解させた溶液に、塩化ニッケル(II)(393mg、3.04mmol)、続いて水素化ホウ素ナトリウム(360mg、9.52mmol)を少しずつ加えた。混合物を室温で3時間攪拌し、次いでMeOH(12mL)でクエンチした。混合物をセライト濾過し、MeOHで洗った。濾液を減圧濃縮した。上記粗生成物をTHF(5mL)に溶解させた溶液に、6MのNaOH水溶液(0.5mL)及びジ−tert−ブチル ジカーボナート(831mg、3.81mmol)を加え、得られる混合物を室温で3時間攪拌し、次いで減圧濃縮した。粗物質を、Teledyne Combiflash ISCOカラムからMeOH/DCM(0:100から4:96へ)で溶出させるシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、tert−ブチル N−{3−[(5−ヒドロキシペンチル)オキシ]プロピル}カルバマートを得た(366mg、収率55%)。
工程3:tert−ブチル N−[3−({5−[(4−メチルベンゼンスルホニル)オキシ]ペンチル}オキシ)プロピル]カルバマート
tert−ブチル (3−((5−ヒドロキシペンチル)オキシ)プロピル)カルバマート(300mg、3.88mmol)をDCM(10mL)に溶解させた溶液に、DIPEA(599.3μL、3.44mmol)、塩化トシル(262.3mg、1.38mmol)、及び4−ジメチルアミノピリジン(14.0mg、0.115mmol)を加えた。得られる混合物を、室温で20時間攪拌した。半飽和重炭酸ナトリウムで反応をクエンチし、DCM(2×)で抽出し、バイオタージユニバーサルフェーズセパレーターで濾過し、減圧濃縮した。粗物質を、Teledyne Combiflash ISCOカラムからEtOAc/ヘプタン(0:100から30:70へ)で溶出させるシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、tert−ブチル N−[3−({5−[(4−メチルベンゼンスルホニル)オキシ]ペンチル}オキシ)プロピル]カルバマートを得た(914mg、収率26%)。
工程4:メチル 4−{[5−(3−{[(tert−ブトキシ)カルボニル]アミノ}プロポキシ)ペンチル]オキシ}ベンゾアート
tert−ブチル N−[3−({5−[(4−メチルベンゼンスルホニル)オキシ]ペンチル}オキシ)プロピル]カルバマート(340mg、0.82mmol)、メチル=4−ヒドロキシベンゾアート(117mg、0.77mmol)、炭酸カリウム(203mg、1.47mmol)をMeCN(10mL)に加えた混合物を、80℃で24時間攪拌した。反応混合物をEtOAcで希釈し、半飽和重炭酸ナトリウム溶液(1×)、水(2×)、ブライン(1×)で洗い、次いでバイオタージユニバーサルフェーズセパレーターで濾過した。濾液を減圧濃縮し、残渣をTeledyne Combiflash ISCOカラムからEtOAc/ヘプタン(0:100から50:50へ)で溶出させるシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、メチル 4−{[5−(3−{[(tert−ブトキシ)カルボニル]アミノ}プロポキシ)ペンチル]オキシ}ベンゾアートを得た(300mg、収率93%)。LC−MS(ES+):m/z418.21[MNa+]、tR=2.74分。
工程5:4−{[5−(3−{[(tert−ブトキシ)カルボニル]アミノ}プロポキシ)ペンチル]オキシ}安息香酸
4−{[5−(3−{[(tert−ブトキシ)カルボニル]アミノ}プロポキシ)ペンチル]オキシ}ベンゾアート(150mg、0.38mmol)を1:1:1のTHF/水/MeOH(6.0mL、v/v/v)に溶解させた溶液に、水酸化リチウム(81.6mg、3.41mmol)を加えた。得られる混合物を室温で一晩攪拌し、次いで6NのHCl水溶液でpH2〜3の酸性にした。混合物を減圧濃縮して、溶媒をほとんど除去し、次いでEtOAcで希釈し、水(2×)、ブライン(2×)で洗い、バイオタージユニバーサルフェーズセパレーターで濾過し、減圧濃縮した。粗生成物は、それ以上精製することなく次の工程に用いた(123mg)。LC−MS(ES+):m/z404.20[MNa+]、tR=2.40分。
工程6:tert−ブチル N−(3−{[5−(4−{[trans−3−(3−クロロ−4−シアノフェノキシ)−2,2,4,4−テトラメチルシクロブチル]カルバモイル}フェノキシ)ペンチル]オキシ}プロピル)カルバマート
4−{[5−(3−{[(tert−ブトキシ)カルボニル]アミノ}プロポキシ)ペンチル]オキシ}安息香酸(124mg、0.322mmol)、2−クロロ−4−(trans−3−アミノ−2,2,4,4−テトラメチルシクロブトキシ)ベンゾニトリル(89.8mg、0.322mmol)をDMF(5mL)に溶解させた溶液に、DIPEA(112μL、0.65mmol)及びTBTU(155mg、0.48mmol)を加えた。得られる混合物を室温で1時間攪拌し、次いでEtOAcで希釈し、水(3×)、ブライン(1×)で洗い、バイオタージユニバーサルフェーズセパレーターで濾過し、減圧濃縮した。残渣を、Teledyne Combiflash ISCOカラムからMeOH/DCM(0:100から5:95へ)で溶出させるシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、tert−ブチル N−(3−{[5−(4−{[trans−3−(3−クロロ−4−シアノフェノキシ)−2,2,4,4−テトラメチルシクロブチル]カルバモイル}フェノキシ)ペンチル]オキシ}プロピル)カルバマートを得た(169mg、収率82%)。LC−MS(ES+):m/z643.32/645.31(3:1)[MH+]、tR=3.04分。
tert−ブチル N−(3−{[5−(4−{[trans−3−(3−クロロ−4−シアノフェノキシ)−2,2,4,4−テトラメチルシクロブチル]カルバモイル}フェノキシ)ペンチル]オキシ}プロピル)カルバマート(124mg、0.192mmol)をDCM(5mL)に溶解させた溶液に、トリフルオロ酢酸(372μL、4.86mmol)を加え、反応が完了するまで45℃で1時間加熱した。次いで、反応物を減圧濃縮して固体とし、それ以上精製することなく次の工程に用いた(104mg、収率99%)。LC−MS(ES+):m/z543.27/545.26(3:1)[MH+]、tR=2.26分。
(表1に示す化合物構造#11)
4−{[5−(3−アミノプロポキシ)ペンチル]オキシ}−N−[trans−3−(3−クロロ−4−シアノフェノキシ)−2,2,4,4−テトラメチルシクロブチル]ベンズアミド(30.0mg、0.0553mmol)を1,4−ジオキサン(2mL)に溶解させた溶液に、ジイソプロピルエチルアミン(384μL、2.21mmol)、2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−1,3−ジオン(18.3mg、0.0664mmol)を加えた。得られる混合物を、16時間還流させ、次いでEtOAcで希釈し、半飽和ブライン溶液(2×)で洗い、バイオタージユニバーサルフェーズセパレーターで濾過し、減圧濃縮した。残渣を、Teledyne Combiflash ISCOカラムからMeOH/DCM(0:100から7:93へ)で溶出させるシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、4−{[5−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)ペンチル]オキシ}−N−[trans−3−(3−クロロ−4−シアノフェノキシ)−2,2,4,4−テトラメチルシクロブチル]ベンズアミドを得た(12mg、収率28%)。LC−MS(ES+):m/z799.31/801.31(3:1)[MH+]、tR=2.97分。
以下のバイオアッセイを行って、本明細書中開示される代表化合物を使用して種々の細胞型で観察されるタンパク質分解のレベルを評価した。
Panc02.13細胞を、ATCCから購入して、15%FBS(ATCC)及び10Units/mLのヒト組換えインシュリン(Gibco)を補充したRPMI−1640(Gibco)で培養した。12ウェルプレートで16時間、DMSO対照及び化合物処理(0.1μM、0.3μM、及び1μM)を行った。最後の3時間は、TLR3アゴニストPolyI:C(Invivogen;tlrl−pic)を添加しておいた。細胞を回収し、プロテアーゼ阻害剤及びホスファターゼ阻害剤を補充したRIPA緩衝液(50mMのトリス(pH8)、150mMのNaCl、1%Tx−100、0.1%SDS、0.5%デオキシコール酸ナトリウム)で溶解させた。溶解物を、16,000gで10分間遠心して清澄させ、上清をSDS−PAGEで分離させた。標準プロトコルを用いて免疫ブロッティングを行った。使用した抗体は、TBK1(Cell Signaling#3504)、pIRF3(abcam#ab76493)、及びGAPDH(Cell Signaling#5174)であった。Biorad ChemiDoc MP画像化システムを使用して、バンドを定量した。
NAMALWA細胞(ATCC)を、15%FBS(Life Technologies)を補充したRPMI−1640(Life Technologies)で培養した。24ウェルプレートで16時間、DMSO対照及び化合物インキュベーション(0.1μM、0.3μM、及び1μM)を行った。細胞を回収し、プロテアーゼ阻害剤(Thermo Scientific)含有細胞溶解液(Cell Signaling Technologies)で溶解させた。溶解物を、16,000gで10分間遠心して清澄させ、上清をSDS−PAGEで分離させた。標準プロトコルを用いて免疫ブロッティングを行った。使用した抗体は、ERRα(Cell Signaling#8644)及びGAPDH(Cell Signaling#5174)であった。Bio−Rad ChemiDoc MP画像化システムを使用して、バンドを定量した。
VCaP細胞をATCCから購入し、10%FBS(ATCC)及びペニシリン/ストレプトマイシン(Life Technologies)を補充したダルベッコ変法イーグル培地(ATCC)で培養した。12ウェルプレートで16時間、DMSO対照及び化合物処理(0.003μM、0.01μM、0.03μM、及び0.1μM)を行った。細胞を回収し、プロテアーゼ阻害剤及びホスファターゼ阻害剤を補充したRIPA緩衝液(50mMのトリス(pH8)、150mMのNaCl、1%Tx−100、0.1%SDS、0.5%デオキシコール酸ナトリウム)で溶解させた。溶解物を、16,000gで10分間遠心して清澄させ、タンパク質濃度を測定した。等量のタンパク質(20μg)でSDS−PAGE分析を行い、続いて標準プロトコルに従って免疫ブロッティングを行った。使用した抗体は、BRD4(Cell Signaling#13440)、及びActin(Sigma#5441)であった。検出試薬は、Clarity Western ECL基質(Bio−rad#170−5060)であった。
VCaP細胞をATCCから購入し、10%FBS(ATCC)及びペニシリン/ストレプトマイシン(Life Technologies)を補充したダルベッコ変法イーグル培地(ATCC)で培養した。96ウェルプレートで16時間、DMSO対照及び化合物処理(0.0001μM〜1μM)を行った。細胞を回収し、細胞溶解液(Catalog#9803)(20mMのトリス−HCL(pH7.5)、150mMのNaCl、1mMのNa2EDTA、1mMのEGTA、1%のTriton、2.5mMのピロリン酸ナトリウム、1mMのB−グリセロリン酸、1mMのNa3VO4、1ug/mlのロイペプチンで溶解させた。溶解物を、16,000gで10分間遠心して清澄させ、PathScan AR ELISA(Cell Signaling Catalog#12850)に添加した。PathScan(登録商標)全アンドロゲン受容体サンドイッチELISAキットは、全アンドロゲン受容体タンパク質の内在レベルを検出する固相サンドイッチ酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)である。アンドロゲン受容体ウサギmAbが、マイクロウェルにコーティングしてある。細胞溶解物とともにインキュベーションすると、コーティングされた抗体によりアンドロゲン受容体タンパク質が捕獲される。十分に洗浄した後、アンドロゲン受容体マウス検出mAbを添加して、捕獲されたアンドロゲン受容体タンパク質を検出する。次いで、抗マウスIgG、HRP結合抗体を使用して、結合した検出抗体を認識させる。HRP基質であるTMBを添加して、発色させる。発色の吸光度は、全アンドロゲン受容体タンパク質量と比例する。
22RV−1細胞をATCCから購入し、RPMI+10%FBS培地で培養した。トリプシン(Gibco#25200−114)を用いて細胞を回収し、計数して、96ウェルプレートに、RPMI+10%FBS培地中、75μL/ウェルの体積で、30,000細胞/ウェルで播種した。細胞に、0.1%DMSOで希釈した化合物を投与し、18時間インキュベートし、次いで洗浄し、プロテアーゼ阻害剤及びホスファターゼ阻害剤を補充したRIPA緩衝液(50mMのトリス(pH8)、150mMのNaCl、1%Tx−100、0.1%SDS、0.5%デオキシコール酸ナトリウム)50uLで溶解させた。溶解物を、4℃で4000rpmで10分間遠心して清澄させ、次いで一定分量を、Life Technologies Catalog#KHO2041のNovex Human c−myc ELISAキットの96−ウェルELISAプレートに添加した。各ウェルにc−Myc検出抗体50ulを添加し、プレートを室温で3時間インキュベートし、次いでELISA洗浄緩衝液で洗浄した。各ウェルに抗ウサギIgG−HRP二次抗体100uLを添加して、室温で30分間インキュベートした。プレートをELISA洗浄緩衝液で洗浄し、各ウェルに100μLのTMBを添加し、次いで5分ごとに色の変化を観察した。停止溶液100μLを添加し、プレートを450nmで読んだ。
表1に、本開示に包含される複数の代表的な化合物で得られた実験データの結果を提示する。詳細には、種々の細胞型を表1に列挙する化合物で処理した。これらの化合物は、化学構造、質量分析特性決定、及び化合物名で同定される。
Claims (39)
- 以下を含む化学構造:
L−CLM
を有し、式中、
Lが、リンカー基であり;かつ
CLMが、セレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分であり、
該リンカー基が、該CLMと化学的に連結している、
化合物、またはその薬学上許容される塩、鏡像異性体、立体異性体、溶媒和物、もしくは多形。 - 以下を含む化学構造:
PTM−L−CLM
を有し、式中、
PTMが、標的タンパク質または標的ポリペプチドと結合するタンパク質標的指向部分であり、
該PTMが、前記リンカー基を通じて前記CLMと化学的に連結している、請求項1に記載の化合物。 - 前記CLMが、イミド、チオイミド、アミド、またはチオアミドに由来する化学基を含む、請求項1に記載の化合物。
- 前記化学基が、フタルイミド基またはその類似体もしくは誘導体である、請求項3に記載の化合物。
- 前記CLMが、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、それらの類似体、それらの同配体、またはそれらの誘導体である、請求項1に記載の化合物。
- 前記化合物が、ULM、第二のCLM、CLM'、またはそれらの複数もしくは組み合わせをさらに含み、
ULMが、E3ユビキチンリガーゼ結合部分であり、
該第二のCLMが、前記CLMと同じ化学構造を有し、
CLM'が、前記CLMと構造が異なるセレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分であり、
該ULM、該第二CLM、該CLM'、またはそれらの複数もしくは組み合わせが、さらなるリンカー基とカップリングされていてもよい、請求項1に記載の化合物。 - 前記CLMが、以下で表される化学構造を有し:
式中、
Wが、CH2、CHR、C=O、SO2、NH、及びN−アルキルからなる群より選択され;
各Xが、独立して、O、S、及びH2からなる群より選択され;
Yが、NH、N−アルキル、N−アリール、N−ヘタリール、N−シクロアルキル、N−ヘテロシクリル、O、及びSからなる群より選択され;
Zが、O、S、及びH2からなる群より選択され;
G及びG'が、独立して、H、アルキル、OH、R'で置換されていてもよいCH2−ヘテロシクリル、及びR'で置換されていてもよいベンジルからなる群より選択され;
Q1、Q2、Q3、及びQ4が、R'、N、またはN−オキシドから独立して選択される基で置換される炭素Cを表し;
Aが、独立して、以下の群、アルキル、シクロアルキル、Cl、及びFより選択され;
Rが、−CONR'R''、−OR'、−NR'R''、−SR'、−SO2R'、−SO2NR'R''、−CR'R''−、−CR'NR'R''−、−アリール、−ヘタリール、−アルキル、−シクロアルキル、−ヘテロシクリル、−P(O)(OR')R''、−P(O)R'R''、−OP(O)(OR')R''、−OP(O)R'R''、−Cl、−F、−Br、−I、−CF3、−CN、−NR'SO2NR'R''、−NR'CONR'R''、−CONR'COR''、−NR'C(=N−CN)NR'R''、−C(=N−CN)NR'R''、−NR'C(=N−CN)R''、−NR'C(=C−NO2)NR'R''、−SO2NR'COR''、−NO2、−CO2R'、−C(C=N−OR')R''、−CR'=CR'R''、−CCR'、−S(C=O)(C=N−R')R''、−SF5、及び−OCF3を含み;
R'及びR''が、独立して、結合、H、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘタリール、ヘテロシクリルからなる群より選択され;
が、立体特異性((R)または(S))であっても非立体特異性であってもよい結合を表し;かつ、
Rnが、官能基または原子を含み、
式中、nが、1〜4の整数であり、かつ式中、
nが1の場合、Rnが、前記リンカー基(L)と共有結合しているように修飾され、及び
nが、2、3、または4である場合は、1つのRnが前記リンカー基(L)と共有結合しているように修飾されて、それ以外のRnは、PTM、ULM、前記CLMと同じ化学構造を有する第二のCLM、CLM'、第二のリンカー、またはそれらの任意の複数もしくは組み合わせと共有結合しているように修飾されていてもよい、請求項1に記載の化合物。 - 前記CLMが、以下からなる群より選択される、請求項1に記載の化合物:
4−{3−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザトリデカン−13−イル}オキシ)フェニル]−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−[3−(4−{3−[3−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)プロポキシ]プロポキシ}フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル]−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−{3−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル}オキシ)フェニル]−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(3−{4−[(1−{2−[(3S)−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル]−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル}−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル)オキシ]フェニル}−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(3−{4−[(1−{2−[(3R)−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル]−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル}−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル)オキシ]フェニル}−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−{3−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10,13,16−ペンタオキサ−1−アザオクタデカン−18−イル}オキシ)フェニル]−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(3−{4−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]フェニル}−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル)−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−[3−(4−{2−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]エトキシ}フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル]−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−[3−(4−{3−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]プロポキシ}フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル]−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−{3−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザテトラデカン−14−イル}オキシ)フェニル]−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−{[5−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)ペンチル]オキシ}−N−[trans−3−(3−クロロ−4−シアノフェノキシ)−2,2,4,4−テトラメチルシクロブチル]ベンズアミド;
4−{4,4−ジメチル−3−[4−({1−[2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザトリデカン−13−イル}オキシ)フェニル]−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル}−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−[3−(4−{4−[(5−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}ペンチル)オキシ]フェニル}フェニル)−4,4−ジメチル−5−オキソ−2−スルファニリデンイミダゾリジン−1−イル]−2−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル}オキシ)フェニル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10,13−テトラオキサ−1−アザペンタデカン−15−イル}オキシ)フェニル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−(4−{2−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]エトキシ}フェニル)アセトアミド;
N−{3−[(5−ブロモ−2−{[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル}オキシ)フェニル]アミノ}ピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルシクロブタンカルボキサミド;
N−{3−[(5−ブロモ−2−{[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10,13,16−ペンタオキサ−1−アザオクタデカン−18−イル}オキシ)フェニル]アミノ}ピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルシクロブタンカルボキサミド;
N−{3−[(5−ブロモ−2−{[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10,13−テトラオキサ−1−アザペンタデカン−15−イル}オキシ)フェニル]アミノ}ピリミジン−4−イル)アミノ]プロピル}−N−メチルシクロブタンカルボキサミド;
4−(4−{[(5Z)−3−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エチル]−2,4−ジオキソ−1,3−チアゾリジン−5−イリデン]メチル}−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(4−{[(5Z)−3−[3−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)プロピル]−2,4−ジオキソ−1,3−チアゾリジン−5−イリデン]メチル}−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
4−(4−{[(5Z)−3−{2−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]エチル}−2,4−ジオキソ−1,3−チアゾリジン−5−イリデン]メチル}−2−メトキシフェノキシ)−3−(トリフルオロメチル)ベンゾニトリル;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1S)−1−[4−(4−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}ブトキシ)フェニル]エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[3−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)プロピル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロピル)アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1S)−1−{4−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]フェニル}エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1R)−1−[4−(4−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}ブトキシ)フェニル]エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1R)−1−{4−[2−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)エトキシ]フェニル}エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[(1R)−1−[4−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)フェニル]エチル]アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−{2−[4−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)フェニル]ピリミジン−5−イル}アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−{4−[3−(2−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}エトキシ)プロポキシ]−3−フルオロフェニル}アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−{4−[4−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)ブトキシ]−2−フルオロフェニル}アセトアミド;
2−[(9S)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−{4−[4−(3−{[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]アミノ}プロポキシ)ブトキシ]−3−フルオロフェニル}アセトアミド;及び
2−[(9R)−7−(4−クロロフェニル)−4,5,13−トリメチル−3−チア−1,8,11,12−テトラアザトリシクロ[8.3.0.02,6]トリデカ−2(6),4,7,10,12−ペンタエン−9−イル]−N−[4−({1−[2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソ−2,3−ジヒドロ−1H−イソインドール−4−イル]−4,7,10−トリオキサ−1−アザドデカン−12−イル}オキシ)フェニル]アセトアミド。 - 前記リンカー基(L)が、以下の式:
−Aq−
で表される化学構造単位を含み、式中、
qが、1より大きい整数であり;かつ
Aが、独立して、結合、CRL1RL2、O、S、SO、SO2、NRL3、SO2NRL3、SONRL3、CONRL3、NRL3CONRL4、NRL3SO2NRL4、CO、CRL1=CRL2、C≡C、SiRL1RL2、P(O)RL1、P(O)ORL1、NRL3C(=NCN)NRL4、NRL3C(=NCN)、NRL3C(=CNO2)NRL4、0〜6個のRL1及び/またはRL2基で置換されていてもよいC3−11シクロアルキル、0〜6個のRL1及び/またはRL2基で置換されていてもよいC3−11ヘテロシクリル、0〜6個のRL1及び/またはRL2基で置換されていてもよいアリール、0〜6個のRL1及び/またはRL2基で置換されていてもよいヘテロアリールからなる群より選択され;
RL1、RL2、RL3、RL4、及びRL5が、それぞれ独立して、H、ハロ、C1−8アルキル、OC1−8アルキル、SC1−8アルキル、NHC1−8アルキル、N(C1−8アルキル)2、C3−11シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、C3−11ヘテロシクリル、OC1−8シクロアルキル、SC1−8シクロアルキル、NHC1−8シクロアルキル、N(C1−8シクロアルキル)2、N(C1−8シクロアルキル)(C1−8アルキル)、OH、NH2、SH、SO2C1−8アルキル、P(O)(OC1−8アルキル)(C1−8アルキル)、P(O)(OC1−8アルキル)2、CC−C1−8アルキル、CCH、CH=CH(C1−8アルキル)、C(C1−8アルキル)=CH(C1−8アルキル)、C(C1−8アルキル)=C(C1−8アルキル)2、Si(OH)3、Si(C1−8アルキル)3、Si(OH)(C1−8アルキル)2、COC1−8アルキル、CO2H、ハロゲン、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1−8アルキル、SO2N(C1−8アルキル)2、SONHC1−8アルキル、SON(C1−8アルキル)2、CONHC1−8アルキル、CON(C1−8アルキル)2、N(C1−8アルキル)CONH(C1−8アルキル)、N(C1−8アルキル)CON(C1−8アルキル)2、NHCONH(C1−8アルキル)、NHCON(C1−8アルキル)2、NHCONH2、N(C1−8アルキル)SO2NH(C1−8アルキル)、N(C1−8アルキル)SO2N(C1−8アルキル)2、NHSO2NH(C1−8アルキル)、NHSO2N(C1−8アルキル)2、及びNHSO2NH2からなる群より選択され;かつ
qが1より大きい場合、RL1またはRL2が、それぞれ独立して、別のA基と連結して、0〜4個のRL5基でさらに置換することができるシクロアルキル及び/またはヘテロシクリル部分を形成することができる、請求項1に記載の化合物。 - 前記PTMが、標的タンパク質、標的ポリペプチド、またはそれらの断片と結合するタンパク質標的指向部分であり、該標的タンパク質、該標的ポリペプチド、またはそれらの断片が、構造、制御、ホルモン、酵素、遺伝子、免疫、収縮、貯蔵、輸送、及びシグナル伝達からなる群より選択される生物学的機能を有する、請求項2に記載の化合物。
- 前記PTM基が、標的タンパク質と結合する部分であり、該標的タンパク質が、B7.1及びB7、TINFR1m、TNFR2、NADPHオキシダーゼ、アポトーシス経路のBclIBax及び他のパートナー、C5a受容体、HMG−CoAレダクターゼ、PDE Vホスホジエステラーゼ型、PDE IVホスホジエステラーゼ4型、PDE I、PDE II、PDEIII、スクアレンシクラーゼ阻害剤、CXCR1、CXCR2、一酸化窒素(NO)シンターゼ、シクロオキシゲナーゼ1、シクロオキシゲナーゼ2、5HT受容体、ドーパミン受容体、Gタンパク質、Gq、ヒスタミン受容体、5−リポキシゲナーゼ、トリプターゼセリンプロテアーゼ、チミジル酸シンターゼ、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、トリパノソーマGAPDH、グリコーゲンホスホリラーゼ、炭酸脱水酵素、ケモカイン受容体、JAW STAT、RXR及び類似のもの、HIV 1プロテアーゼ、HIV 1インテグラーゼ、インフルエンザ、ノイラミニダーゼ、B型肝炎逆転写酵素、ナトリウムチャネル、多剤耐性(MDR)、タンパク質P糖タンパク質(及びMRP)、チロシンキナーゼ、CD23、CD124、チロシンキナーゼp56 lck、CD4、CD5、IL−2受容体、IL−1受容体、TNF−アルファR、ICAM1、Cat+チャネル、VCAM、VLA−4インテグリン、セレクチン、CD40/CD40L、ニューロキニン及び受容体、イノシンモノホスフェートデヒドロゲナーゼ、p38MAPキナーゼ、Ras/Raf/ME/ERK経路、インターロイキン−1変換酵素、カスパーゼ、HCV、NS3プロテアーゼ、HCV NS3 RNAヘリカーゼ、グリシンアミドリボヌクレオチドホルミルトランスフェラーゼ、ライノウイルス3Cプロテアーゼ、単純ヘルペスウイルス−1(HSV−I)、プロテアーゼ、サイトメガロウイルス(CMV)プロテアーゼ、ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ、サイクリン依存性キナーゼ、血管内皮増殖因子、c−Kit、TGFβ活性化キナーゼ1、ラパマイシンの哺乳類標的、SHP2、アンドロゲン受容体、オキシトシン受容体、ミクロソーム輸送タンパク質阻害剤、胆汁酸輸送阻害剤、5アルファレダクターゼ阻害剤、アンジオテンシン11、グリシン受容体、ノルアドレナリン再取り込み受容体、エストロゲン受容体、エストロゲン関連受容体、接着斑リン酸化酵素、Src、エンドセリン受容体、ニューロペプチドY及び受容体、アデノシン受容体、アデノシンキナーゼ及びAMPデアミナーゼ、プリン受容体(P2Y1、P2Y2、P2Y4、P2Y6、P2X1−7)、ファルネシルトランスフェラーゼ、ゲラニルゲラニルトランスフェラーゼ、TrkAすなわちNGF受容体、ベータ−アミロイド、チロシンキナーゼFlk−IIKDR、ビトロネクチン受容体、インテグリン受容体、Her−21 neu、テロメラーゼ阻害、細胞質型ホスホリパーゼA2、及びEGF受容体チロシンキナーゼからなる群より選択される、請求項2に記載の化合物。さらなるタンパク質標的として、例えば、エクジソン20−モノオキシゲナーゼ、GABA作動性クロリドチャンネルのイオンチャネル、アセチルコリンエステラーゼ、電位感受性ナトリウムチャネルタンパク質、カルシウム放出チャネル、及びクロリドチャネルが挙げられる。なおさらなる標的タンパク質として、アセチル−CoAカルボキシラーゼ、アデニロコハク酸シンテターゼ、プロトポルフィリノーゲンオキシダーゼ、及びエノールピルビルシキミ酸−リン酸シンターゼが挙げられる。
- 前記PTM基が、Hsp90阻害剤;キナーゼ阻害剤、ホスファターゼ阻害剤、HDM2/MDM2阻害剤、ヒトBETブロモドメイン含有タンパク質を標的とする化合物、HDAC阻害剤、ヒトリジンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、RAF受容体を標的とする化合物、FKBPを標的とする化合物、血管新生阻害剤、免疫抑制化合物、アリール炭化水素受容体を標的とする化合物、アンドロゲン受容体を標的とする化合物、エストロゲン受容体を標的とする化合物、エストロゲン関連受容体を標的とする化合物、甲状腺ホルモン受容体を標的とする化合物、HIVプロテアーゼを標的とする化合物、HIVインテグラーゼを標的とする化合物、HCVプロテアーゼを標的とする化合物、またはアシルタンパク質チオエステラーゼ1及び/または2を標的とする化合物である、請求項2に記載の化合物。
- 前記PTM基が、TANK結合キナーゼ1(TBK1)、エストロゲン受容体α(ERα)、ブロモドメイン含有タンパク質4(BRD4)、アンドロゲン受容体(AR)、及びc−Mycからなる群より選択される、請求項2に記載の化合物。
- 請求項2に記載の化合物を含む、組成物。
- 請求項2に記載の化合物、及び薬学上許容される担体、添加剤、及び/または賦形剤を含む、医薬組成物。
- 生体活性作用剤をさらに含む、請求項15に記載の医薬組成物。
- 前記生体活性作用剤が、抗ウイルス剤である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記抗ウイルス剤が、抗HIV作用剤である、請求項17に記載の医薬組成物。
- 前記抗HIV作用剤が、ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤(NRTI)、非ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤、プロテアーゼ阻害剤、融合阻害剤、またはそれらの混合物である、請求項18に記載の医薬組成物。
- 前記抗ウイルス剤が、抗HCV剤である、請求項17に記載の医薬組成物。
- 前記生体活性作用剤が、抗炎症剤、免疫作用剤、心血管系作用剤、及び神経作用剤からなる群より選択される、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記生体活性作用剤が、抗癌剤である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記抗癌剤が、エベロリムス、トラベクテジン、アブラキサン、TLK 286、AV−299、DN−101、パゾパニブ、GSK690693、RTA 744、ON 0910.Na、AZD 6244(ARRY−142886)、AMN−107、TKI−258、GSK461364、AZD 1152、エンザスタウリン、バンデタニブ、ARQ−197、MK−0457、MLN8054、PHA−739358、R−763、AT−9263、FLT−3阻害剤、VEGFR阻害剤、EGFR TK阻害剤、オーロラキナーゼ阻害剤、PIK−1モジュレーター、Bcl−2阻害剤、HDAC阻害剤、c−MET阻害剤、PARP阻害剤、Cdk阻害剤、EGFR TK阻害剤、IGFR−TK阻害剤、抗HGF抗体、PI3キナーゼ阻害剤、AKT阻害剤、mTORC1/2阻害剤、JAK/STAT阻害剤、チェックポイント−1または2阻害剤、接着斑キナーゼ阻害剤、Mapキナーゼキナーゼ(mek)阻害剤、VEGFトラップ抗体、ペメトレキセド、エルロチニブ、ダサチニブ、ニロチニブ、デカタニブ、パニツムマブ、アムルビシン、オレゴボマブ、Lep−etu、ノラトレキセド、azd2171、バタブリン、オファツムマブ、ザノリムマブ、エドテカリン、テトランドリン、ルビテカン、テスミリフェン、オブリメルセン、チシリムマブ、イピリムマブ、ゴシポール、Bio 111、131−I−TM−601、ALT−110、BIO 140、CC 8490、シレンギチド、ギマテカン、IL13−PE38QQR、INO 1001、IPdR1 KRX−0402、ルカントン、LY317615、ノイラジアブ、ビテスパン、Rta 744、Sdx 102、タランパネル、アトラセンタン、Xr 311、ロミデプシン、ADS−100380、スニチニブ、5−フルオロウラシル、ボリノスタット、エトポシド、ゲムシタビン、ドキソルビシン、リポソームドキソルビシン、5'−デオキシ−5−フルオロウリジン、ビンクリスチン、テモゾロミド、ZK−304709、セリシクリブ;PD0325901、AZD−6244、カペシタビン、L−グルタミン酸、N−[4−[2−(2−アミノ−4,7−ジヒドロ−4−オキソ−1H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−5−イル)エチル]ベンゾイル]−、二ナトリウム塩、七水和物、カンプトテシン、PEG標識化イリノテカン、タモキシフェン、クエン酸トレミフェン、アナストロゾール、エキセメスタン、レトロゾール、DES(ジエチルスチルベストロール)、エストラジオール、エストロゲン、結合型エストロゲン、ベバシズマブ、IMC−1C11、CHIR−258;3−[5−(メチルスルホニルピペラジンメチル)−インドリル]−キノロン、バタラニブ、AG−013736、AVE−0005、[D−Ser(But)6,Azgly 10]の酢酸塩(ピロ−Glu−His−Trp−Ser−Tyr−D−Ser(But)−Leu−Arg−Pro−Azgly−NH2 アセタート[C59H84N18Oi4−(C2H4O2)X、式中、x=1〜2.4]、酢酸ゴセレリン、酢酸ロイプロリド、トリプトレリンパモ酸塩、酢酸メドロキシプロゲステロン、カプロン酸ヒドロキシプロゲステロン、酢酸メゲストロール、ラロキシフェン、ビカルタミド、フルタミド、ニルタミド、酢酸メゲストロール、CP−724714;TAK−165、HKI−272、エルロチニブ、ラパチニブ、カネルチニブ、ABX−EGF抗体、アービタックス、EKB−569、PKI−166、GW−572016、ロナファルニブ、BMS−214662、チピファルニブ;アミホスチン、NVP−LAQ824、スベロイルアニリドヒドロキサム酸、バルプロ酸、トリコスタチンA、FK−228、SU11248、ソラフェニブ、KRN951、アミノグルテチミド、アムサクリン、アナグレリド、L−アスパラギナーゼ、カルメット・ゲラン桿菌(BCG)ワクチン、アドリアマイシン、ブレオマイシン、ブセレリン、ブスルファン、カルボプラチン、カルムスチン、クロラムブシル、シスプラチン、クラドリビン、クロドロネート、シプロテロン、シタラビン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ジエチルスチルベストロール、エピルビシン、フルダラビン、フルドロコルチゾン、フルオキシメステロン、フルタミド、グリーベック、ゲムシタビン、ヒドロキシ尿素、イダルビシン、イホスファミド、イマチニブ、ロイプロリド、レバミソール、ロムスチン、メクロレタミン、メルファラン、6−メルカプトプリン、メスナ、メトトレキセート、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、ニルタミド、オクトレオチド、オキサリプラチン、パミドロネート、ペントスタチン、プリカマイシン、ポルフィマー、プロカルバジン、ラルチトレキセド、リツキシマブ、ストレプトゾシン、テニポシド、テストステロン、サリドマイド、チオグアニン、チオテパ、トレチノイン、ビンデシン、13−cis−レチノイン酸、フェニルアラニンマスタード、ウラシルマスタード、エストラムスチン、アルトレタミン、フロクスウリジン、5−デオキシウリジン、シトシンアラビノシド、6−メルカプトプリン、デオキシコホルマイシン、カルシトリオール、バルルビシン、ミトラマイシン、ビンブラスチン、ビノレルビン、トポテカン、ラゾキシン、マリマスタット、COL−3、ネオバスタット、BMS−275291、スクアラミン、エンドスタチン、SU5416、SU6668、EMD121974、インターロイキン−12、IM862、アンジオスタチン、ビタキシン、ドロロキシフェン、イドキシフェン、スピロノラクトン、フィナステリド、シミチジン、トラスツズマブ、デニロイキンジフチトクス、ゲフィチニブ、ボルテゾミブ、パクリタキセル、クレモホールを含まないパクリタキセル、ドセタキセル、エポチロンB、BMS−247550、BMS−310705、ドロロキシフェン、4−ヒドロキシタモキシフェン、ピペンドキシフェン、ERA−923、アルゾキシフェン、フルベストラント、アコルビフェン、ラソホキシフェン、イドキシフェン、TSE−424、HMR−3339、ZK186619、トポテカン、PTK787/ZK 222584、VX−745、PD 184352、ラパマイシン、40−O−(2−ヒドロキシエチル)−ラパマイシン、テムシロリムス、AP−23573、RAD001、ABT−578、BC−210、LY294002、LY292223、LY292696、LY293684、LY293646、ウォルトマンニン、ZM336372、L−779,450、PEG−フィルグラスチム、ダルベポエチン、エリスロポエチン、顆粒球コロニー刺激因子、ゾレドロネート、プレドニゾン、セツキシマブ、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、ヒストレリン、ペグ化インターフェロンアルファ−2a、インターフェロンアルファ−2a、ペグ化インターフェロンアルファ−2b、インターフェロンアルファ−2b、アザシチジン、PEG−L−アスパラギナーゼ、レナリドミド、ゲムツズマブ、ヒドロコルチゾン、インターロイキン−11、デクスラゾキサン、アレムツズマブ、全トランス型レチノイン酸、ケトコナゾール、インターロイキン−2、メゲストロール、免疫グロブリン、ナイトロジェンマスタード、メチルプレドニゾロン、イブリツモマブチウキセタン、アンドロゲン、デシタビン、ヘキサメチルメラミン、ベクサロテン、トシツモマブ、三酸化ヒ素、コルチゾン、エチドロネート、ミトタン、シクロスポリン、リポソームダウノルビシン、エルウィニア−アスパラギナーゼ、ストロンチウム89、カソピタント、ネツピタント、NK−1受容体アンタゴニスト、パロノセトロン、アプレピタント、ジフェンヒドラミン、ヒドロキシジン、メトクロプラミド、ロラゼパム、アルプラゾラム、ハロペリドール、ドロペリドール、ドロナビノール、デキサメタゾン、メチルプレドニゾロン、プロクロルペラジン、グラニセトロン、オンダンセトロン、ドラセトロン、トロピセトロン、ペグフィルグラスチム、エリスロポエチン、エポエチンアルファ、ダルベポエチンアルファ、及びそれらの混合物からなる群より選択される、請求項22に記載の組成物。
- 細胞における標的タンパク質の分解を誘導するための方法であって、
請求項2に記載の化合物の有効量を該細胞に投与する段階を含む、前記方法。 - 細胞における標的タンパク質の分解を誘導するための方法であって、
請求項10に記載の化合物の有効量を該細胞に投与する段階を含む、前記方法。 - 細胞における標的タンパク質の分解を誘導するための方法であって、
請求項11に記載の化合物の有効量を該細胞に投与する段階を含む、前記方法。 - 患者における標的タンパク質の分解を誘導するための方法であって、
請求項2に記載の化合物の有効量を該患者に投与する段階を含む、前記方法。 - 調節不全のタンパク質活性が原因である疾患状態または症状の場合の患者における該疾患状態または症状を治療するための方法であって、請求項2に記載の化合物の有効量を投与する段階を含む、前記方法。
- 前記疾患状態または症状が、喘息、多発性硬化症、癌、繊毛関連疾患、口蓋裂、糖尿病、心疾患、高血圧、炎症性腸疾患、精神発達遅滞、気分障害、肥満、屈折異常、不妊、アンジェルマン症候群、カナバン病、セリアック病、シャルコー・マリー・トゥース病、嚢胞性線維症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、血色素症、血友病、クラインフェルター症候群、神経線維腫症、フェニルケトン尿症、多発性嚢胞腎疾患、(PKD1)または4(PKD2)プラダー・ウィリー症候群、鎌状赤血球症、テイ・サックス病、ターナー症候群である、請求項28に記載の方法。
- 前記疾患状態または症状が、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症(ルー・ゲーリック病)、神経性食欲不振症、不安症、粥状動脈硬化、注意欠陥多動性障害、自閉症、双極性障害、慢性疲労症候群、慢性閉塞性肺疾患、クローン病、冠動脈心疾患、認知症、抑うつ、1型真性糖尿病、2型真性糖尿病、癲癇、ギラン・バレー症候群、過敏性腸症候群、狼瘡、メタボリックシンドローム、多発性硬化症、心筋梗塞、肥満、強迫性障害、パニック障害、パーキンソン病、乾癬、リウマチ様関節炎、類肉腫症、統合失調症、脳卒中、閉塞性血栓血管炎、トゥレット症候群、血管炎である、請求項28に記載の方法。
- 前記疾患状態または症状が、無セルロプラスミン血症、II型軟骨無発生症、軟骨無形成症、尖頭症、2型ゴーシェ病、急性間欠性ポルフィリン症、カナバン病、大腸腺腫症、ALAデヒドラターゼ欠損、アデニロコハク酸リアーゼ欠損、副腎性器症候群、副腎白質ジストロフィー、ALA−Dポルフィリン症、ALAデヒドラターゼ欠損、アルカプトン尿症、アレキサンダー病、アルカプトン尿症オクロノーシス、アルファ1−アンチトリプシン欠損、アルファ−1プロテイナーゼ阻害剤、肺気腫、筋萎縮性側索硬化症、アルストレーム症候群、アレキサンダー病、遺伝性エナメル質形成不全症、ALAデヒドラターゼ欠損、アンダーソン・ファブリー病、アンドロゲン不感性症候群、貧血、びまん性体幹被角血管腫、網膜血管腫症(フォンヒッペル・リンドウ病)、アペール症候群、クモ指症(マルファン症候群)、スティックラー症候群、先天性多発性関節弛緩症(エーラス・ダンロス症候群#多発性関節弛緩型)、毛細血管拡張性運動失調症、レット症候群、原発性肺高血圧症、サンドホフ病、神経線維腫症II型、ベアレ・スティーブンソン脳回状皮膚症候群、地中海熱、家族性、ベンジャミン症候群、ベータ−サラセミア、両側性聴神経腫瘍(神経線維腫症II型)、第V因子ライデン血栓形成傾向、ブロッホ・ズルツベルガー症候群(色素失調症)、ブルーム症候群、X連鎖鉄芽球性貧血、ボネビー・ウルリッヒ症候群(ターナー症候群)、ブルヌヴィーユ病(結節性硬化症)、プリオン病、バート・ホッグ・デューベ症候群、脆弱骨症(骨形成不全症)、幅広母指/母趾症候群(ルビンシュタイン・テイビ症候群)、青銅色糖尿病/青銅色化肝硬変(血色素症)、球脊髄性筋萎縮症(ケネディ病)、ビュルガー・グリュッツ症候群(リポタンパク質リパーゼ欠損症)、CGD慢性肉芽腫性疾患、屈曲肢異形成症、ビオチニダーゼ欠損、心筋症(ヌーナン症候群)、ネコ鳴き症候群、CAVD(先天性輸精管欠損)、Caylor心顔症候群(CBAVD)、CEP(先天性赤血球生成性ポルフィリン症)、嚢胞性線維症、先天性副甲状腺機能低下症、軟骨異栄養症(軟骨無形成症)、耳脊椎巨大骨端異形成、レッシュ・ナイハン症候群、ガラクトース血症、エーラス・ダンロス症候群、致死性骨異形成症、コフィン・ローリー症候群、コケイン症候群、(家族性大腸腺腫症)、先天性赤血球生成性ポルフィリン症、先天性心疾患、メトヘモグロビン血症/先天性メトヘモグロビン血症、軟骨無形成症、X連鎖鉄芽球性貧血、膠原病、円錐動脈幹異常顔貌症候群、クーリー貧血(ベータ−サラセミア)、銅蓄積症(ウィルソン病)、銅輸送病(メンケス病)、遺伝性コプロポルフィリン症、カウデン病、頭蓋顔面異骨症(クルーゾン病)、クロイツフェルト・ヤコブ病(プリオン病)、コケイン症候群、カウデン病、Curschmann−Batten−Steinert症候群(筋緊張性ジストロフィー)、ベアレ・スティーブンソン脳回状皮膚症候群、原発性高シュウ酸尿症、脊椎骨端骨幹端異形成(Strudwick型)、筋ジストロフィー、デュシェンヌ型及びベッカー型筋ジストロフィー(DBMD)、アッシャー症候群、de Grouchy症候群及びデジュリーヌ・ソッタス病を含む神経変性疾患、発達障害、遠位型脊髄性筋萎縮症、V型、アンドロゲン不感性症候群、びまん性グロボイド体硬化症(クラッベ病)、ディジョージ症候群、ジヒドロテストステロン受容体欠損、アンドロゲン不感性症候群、ダウン症、低身長症、赤血球生成性プロトポルフィリン症、赤血球5−アミノレブリン酸シンターゼ欠損、赤血球生成性ポルフィリン症、赤血球生成性プロトポルフィリン症、赤血球生成性ウロポルフィリン症、フリードライヒ運動失調、家族性発作性多発性漿膜炎、晩発性皮膚ポルフィリン症、家族性圧脆弱性ニューロパチー、原発性肺高血圧症(PPH)、膵臓の線維嚢胞性疾患、脆弱X症候群、ガラクトース血症、遺伝性脳障害、巨細胞肝炎(新生児血色素症)、グレンブラッド・ストランドバーグ症候群(弾力線維性仮性黄色腫)、ギュンター病(先天性赤血球生成性ポルフィリン症)、血色素症、ハルグレン症候群、鎌状赤血球貧血、血友病、肝骨髄性ポルフィリン症(HEP)、ヒッペル・リンドウ病(フォンヒッペル・リンドウ病)、ハンチントン病、ハッチンソン・ギルフォード早老症候群(早老症)、アンドロゲン過剰症、軟骨低形成症、低色素性貧血、X連鎖重症複合免疫不全を含む免疫系障害、Insley−Astley症候群、ジャクソン・ワイス症候群、ジュベール症候群、レッシュ・ナイハン症候群、ジャクソン・ワイス症候群、高シュウ酸尿症を含む腎臓疾患、クラインフェルター症候群、クニースト骨異形成症、ラクナ型認知症、ランガー・サルディーノ型軟骨無発生症、毛細血管拡張性運動失調症、リンチ症候群、リジルヒドロキシラーゼ欠損、マシャド・ジョセフ病、クニースト骨異形成症を含む代謝障害、マルファン症候群、運動障害、モワット・ウィルソン症候群、嚢胞性線維症、ムエンケ症候群、多発性神経線維腫症、Nance−Insley症候群、Nance−Sweeney軟骨異形成、ニーマン・ピック病、ノアク症候群(プファイファー症候群)、オスラー・ウェーバー・ランデュ病、ポイツ・ジェガース症候群、多発性嚢胞腎疾患、多骨性線維性骨異形成症(マキューン・オルブライト症候群)、ポイツ・ジェガース症候群、プラダー・ラープハルト・ウィリー症候群、血色素症、原発性高尿酸血症症候群(レッシュ・ナイハン症候群)、原発性肺高血圧症、原発性老人性退行性認知症、プリオン病、早老症(ハッチンソン・ギルフォード早老症候群)、進行性舞踏病、慢性遺伝性(ハンチントン)(ハンチントン病)、進行性筋萎縮症、脊髄性筋萎縮症、プロピオン酸血症、プロトポルフィリン症、近位型筋強直性ジストロフィー、肺動脈性肺高血圧症、PXE(弾力線維性仮性黄色腫)、Rb(網膜芽細胞腫)、レックリングハウゼン病(神経線維腫症I型)、再発性多発性漿膜炎、網膜障害、網膜芽細胞腫、レット症候群、RFALS3型、リッカー症候群、ライリー・デイ症候群、ルーシー・レヴィー症候群、発育遅延及び黒色表皮腫を伴う重症軟骨無形成症(SADDAN)、リー・フラウメニ症候群、肉腫、乳がん、白血病、及び副腎(SBLA)症候群、結節性硬化症(結節性硬化症)、SDAT、先天性SED(先天性脊椎骨端異形成症)、Strudwick型SED(脊椎骨端骨幹端異形成、Strudwick型)、SEDc(先天性脊椎骨端異形成症)、SEMD、Strudwick型(脊椎骨端骨幹端異形成、Strudwick型)、シュプリンツェン症候群、皮膚色素沈着障害、スミス・レムリ・オピッツ症候群、南アフリカ遺伝性ポルフィリン症(異型性ポルフィリン症)、乳児期発症上向性遺伝性痙性麻痺、会話及びコミュニケーション障害、スフィンゴリピド症、テイ・サックス病、脊髄小脳失調症、スティックラー症候群、脳卒中、アンドロゲン不感性症候群、テトラヒドロビオプテリン欠損、ベータ−サラセミア、甲状腺疾患ソーセージ様ニューロパチー(遺伝性圧脆弱性ニューロパチー)トリーチャー・コリンズ症候群、トリプロX症候群(トリプルX症候群)、21番染色体トリソミー(ダウン症)、X染色体トリソミー、VHL症候群(フォンヒッペル・リンドウ病)、視力障害及び失明(アルストレーム症候群)、フロリク病、ワールデンブルグ症候群、Warburg Sjo Fledelius症候群、Weissenbacher−Zweymuller症候群、ウォルフ・ヒルシュホーン症候群、ウォルフ周期性疾患、Weissenbacher−Zweymuller症候群、及び色素性乾皮症である、請求項28に記載の方法。
- 前記疾患状態または症状が、癌である、請求項28に記載の方法。
- 前記癌が、扁平細胞癌、基底細胞癌、腺癌、肝細胞癌、及び腎細胞癌;膀胱、腸、乳房、子宮頚部、結腸、食道、頭部、腎臓、肝臓、肺、頚部、卵巣、膵臓、前立腺、及び胃の癌;白血病;良性及び悪性リンパ腫、特にバーキットリンパ腫及び非ホジキンリンパ腫;良性及び悪性黒色腫;骨髄増殖性疾患;多発性骨髄腫、肉腫、これには、ユーイング肉腫、血管肉腫、カポジ肉腫、脂肪肉腫、筋肉腫、末梢性神経上皮腫、滑膜肉腫、神経膠腫、星状細胞腫、乏突起膠腫、上衣腫、神経膠芽腫、神経芽細胞腫、神経節腫、神経節膠腫、髄芽細胞腫、脊髄細胞腫、髄膜腫、髄膜肉腫、神経線維腫、及びシュワン細胞腫が含まれ;腸癌、乳癌、前立腺癌、子宮頸癌、子宮癌、肺癌、卵巣癌、精巣癌、甲状腺癌、星状細胞腫、食道癌、膵癌、胃癌、肝臓癌、結腸癌、黒色腫;癌肉腫、ホジキン病、ウィルムス腫瘍、または奇形癌腫である、請求項32に記載の方法。
- 前記癌が、T細胞性急性リンパ芽球性白血病(T−ALL)、T細胞性リンパ芽球性リンパ腫(T−LL)、末梢性T細胞リンパ腫、成人T細胞白血病、Pre−B ALL、Pre−Bリンパ腫、巨大B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、B細胞ALL、フィラデルフィア染色体陽性ALL、及びフィラデルフィア染色体陽性CMLである、請求項32に記載の方法。
- 1種より多い請求項1に記載の化合物を含む、化合物ライブラリー。
- セレブロン(CRBN)を認識するE3ユビキチンリガーゼ結合部分を含有する化合物の同定方法であって、
試験化合物をCRBNタンパク質とともにインキュベートする段階;
該CRBNタンパク質と結合した該試験化合物の量を求める段階、
を含む、前記方法。 - 以下で表される化学構造:
を有し、式中、
Wが、CH2、CHR、C=O、SO2、NH、及びN−アルキルからなる群より選択され;
各Xが、独立して、O、S、及びH2からなる群より選択され;
Yが、NH、N−アルキル、N−アリール、N−ヘタリール、N−シクロアルキル、N−ヘテロシクリル、O、及びSからなる群より選択され;
Zが、O、S、及びH2からなる群より選択され;
G及びG'が、独立して、H、アルキル、OH、R'で置換されていてもよいCH2−ヘテロシクリル、及びR'で置換されていてもよいベンジルからなる群より選択され;
Q1、Q2、Q3、及びQ4が、R'、N、またはN−オキシドから独立して選択される基で置換される炭素Cを表し;
Aが、独立して、以下の群、アルキル、シクロアルキル、Cl、及びFより選択され;
Rが、−CONR'R''、−OR'、−NR'R''、−SR'、−SO2R'、−SO2NR'R''、−CR'R''−、−CR'NR'R''−、−アリール、−ヘタリール、−アルキル、−シクロアルキル、−ヘテロシクリル、−P(O)(OR')R''、−P(O)R'R''、−OP(O)(OR')R''、−OP(O)R'R''、−Cl、−F、−Br、−I、−CF3、−CN、−NR'SO2NR'R''、−NR'CONR'R''、−CONR'COR''、−NR'C(=N−CN)NR'R''、−C(=N−CN)NR'R''、−NR'C(=N−CN)R''、−NR'C(=C−NO2)NR'R''、−SO2NR'COR''、−NO2、−CO2R'、−C(C=N−OR')R''、−CR'=CR'R''、−CCR'、−S(C=O)(C=N−R')R''、−SF5、及び−OCF3を含み;
R'及びR''が、独立して、結合、H、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘタリール、ヘテロシクリルからなる群より選択され;
が、立体特異性((R)または(S))であっても非立体特異性であってもよい結合を表し;かつ、
Rnが、官能基または原子を含み、
式中、nが、1〜4の整数である、
セレブロンE3ユビキチンリガーゼ結合部分(CLM)。 - 前記Rnが、リンカー基(L)、タンパク質標的指向部分(PTM)、E3ユビキチンリガーゼ結合部分(ULM)、またはそれらの任意の複数もしくは組み合わせと共有結合した官能基あるいは原子を含む、請求項1に記載のCLM。
- 前記ULMが、第二のCLM、CLM'、またはそれらの任意の複数もしくは組み合わせであり、
該第二のCLMが、前記CLMと同じ化学構造を有し、かつ
該CLM'が、前記CLMと構造的に異なっている、請求項2に記載のCLM。
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