TW202237095A - Alc1抑制劑及與parpi之協同性 - Google Patents
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Abstract
本發明係有關一種小分子化合物,其變構性抑制ALC1 (CHD1L)且其誘導在染色質上或DNA損傷位點處捕捉PARP1、PARP2及/或PARP3。透過此等藥劑瓦解ALC1之染色質重塑力,可以在數種增生性疾病,尤指BRCA-缺陷癌症中,成為靶向PARP酵素之DNA損傷功能之高度選擇性療法。經由抑制該酵素活性,該化合物參與BRCA1/2與ALC1之間之合成性致死。ALC1之抑制劑藉由捕捉PARP酵素,加強PARP抑制劑殺死癌細胞之性質,成為以ALC1擴增為致癌基因時之醫療手段,可以在醫療上克服PARP抑制劑抗性機轉,成為另一種治療生殖系或後天BRCA1/BRCA2缺陷,包括由「BRCAness」或DNA修復網絡中的其他變化所界定腫瘤之手段。
Description
本發明係有關一種小分子化合物,其變構性抑制ALC1 (CHD1L)且其誘導在染色質上或DNA損傷位點處捕捉PARP1、PARP2及/或PARP3。透過此等製劑瓦解ALC1之染色質重塑力,可以在數種增生性疾病,尤指BRCA-缺陷癌症中,成為靶向PARP酵素之DNA 損傷功能之高度選擇性療法。經由抑制該酵素活性,該化合物在包括BRCA1/2及ALC1之間之HRD途徑中突變參與合成性致死。ALC1之抑制劑藉由捕捉PARP酵素,加強PARP抑制劑殺死癌細胞之性質,成為以ALC1擴增為致癌基因時之醫療手段,可以在醫療上克服PARP抑制劑抗性機轉,成為另一種治療生殖系或後天BRCA1/BRCA2缺陷,包括由「BRCAness」或DNA修復網絡中的其他變化所界定腫瘤之手段。
辨識單股及雙股斷裂(SSB/DSB)時,核聚-ADP-核糖聚合酶(PARP)酵素為DNA損傷反應(DDR)之早期關鍵因子。利用代謝物NAD
+、PARP-1及-2添加聚-ADP-核糖(PAR)鏈至染色質組份上及加至屬於DDR之因子上,同時PARP-3經由單-ADP-核糖基化而靶向染色質組份。PARP藉由DNA-損傷所誘導特異性改變之結構而被募集至DNA損傷處,其啟動其等PAR基化活性,進而調節其等活性及其他DDR與染色質蛋白質之活性,促進DDR (Ray Chaudhuri及Nussenzweig, 2017)。
此催化活性可以受到NAD
+類似物抑制,且已受到特別關注,並於臨床上適用於遺傳性癌症。應注意,在BRCA1或BRCA2缺陷背景下,藉由靶向合成性致死,採用所謂PARP抑制劑(PARPi)來治療同源修復(HR)-缺陷及其他癌症。此被認為係藉由降低PARP活性及/或藉由以生物化學方式在染色質上「捕捉」PARP-1/2/3而發生(Murai等人,2012, 2014)。雖然「捕捉」在分子學上仍未明確定義,但該術語定義PARP-1/2/3酵素在損傷之染色質上加強募集、聯結及/或滯留,通常係由PARP抑制劑(PARPi)處理PARP-1酵素所誘發,或PARP-1/2/3酵素在初次募集後減少釋出,造成延長滯留。此生物化學特性本身顯示在具有損傷之基因體區/基因座之PARP酵素加強穩定態聯結/滯留/結合(「捕捉」)上。
由於PARPi出現在臨床上, PARP-1已成為逐漸加長之癌症列表中之強力標靶,包括組合使用免疫-腫瘤學療法,如:目前的Lynparza/Keytruda試驗不過為許多實例其中之一。此外,第一線PARPi療法及應用也有可能用在生殖系 BRCA-1/2突變以外的內容中。
重點在於臨床PARPi化合物藉由阻斷受質NAD
+之結合,基本上均結合在活性位點之催化中心的相同位置,主要基於其等結構類似菸鹼醯胺(其係NAD
+核苷酸之部份體),因而防止聚(ADP-核糖)合成。
此外,PARPi在臨床上,在殺死腫瘤及患者的後果上具有很大不同之臨床效力。此等PARPi之作用之基本差異之一為其等在促進染色質上之PARP-1/-2捕捉程度有高度不同差異。目前普遍認為在DNA斷裂位點之最強力及臨床上最有效之PARPi捕捉PARP-1之強度遠高於臨床上較不適用之PARPi。當捕捉PARP時,DNA損傷變得更具細胞毒性,尤其在DNA股斷裂之修復上具有遺傳或表觀遺傳缺陷之突變腫瘤細胞,諸如:功能性HR-缺陷BRCA-1/2突變腫瘤細胞中。此外,目前尚不清楚PARP-1相對於PARP-2相對於PARP-3酵素之相對或優勢造成之影響,因為所有酵素均涉及感知DNA股斷裂,並募集至DNA損傷位點,而PARP-1及PARP-2二者則促進染色質因子之PAR基化,其中所有現有之臨床PARPi分子很難在這兩種相關PAR聚合酶酵素PARP-1與PARP-2之間區分。進而讓PARP捕捉被認為會在癌細胞中造成DNA複製壓力、基因體失穩及細胞死亡(Lord及Ashworth, 2012)。例如:加強PARP1之捕捉,被認為可以提高殺死癌細胞,尤指具有DNA修復途徑缺陷之癌症之能力(Zandarashvili等人,2020)。圖1出示經由PARPi捕捉PARP之細胞毒性機轉。
因此「PARP 捕捉」說明為在活細胞中(加強)PARP-1或PARP-2或PARP-3與染色質之聯結。利用PARPi,可以瓦解會造成PARP-1與DNA聯結之變構機轉(Zandarashvili等人,2020),依據試管內PARP-1、PARPi與DNA交互作用,其中有些PARPi造成滯留,及其他則加速促進釋放機轉(pro-release mechanism)(Zandarashvili等人,2020)。PARPi對PARP捕捉之不同機轉示於圖3。經過他拉唑帕尼(Talazoparib)處理之U2OS顯示標記GFP之PARP2加強滯留在所誘發之DNA損傷處,而經過維利帕尼(Veliparib)處理之細胞則顯示完全減少募集PARP2至DNA損傷處。
不論PARP-1或PARP-2均係充份募集SSB修復蛋白質至損傷位點之必要條件。經由PAR基化,經染色質重塑或經組蛋白修飾之酵素在DNA損傷位點激活,造成染色質壓縮之變化(Luijsterburg等人,2016;Mehrotra等人,2011;Sellou等人,2016;Smeenk等人,2013;Timinszky等人,2009)。
PARP-1及/或PARP-2酵素之激活造成許多蛋白質募集,尤其亦指特異性染色質重塑酵素,尤其包括含宏結構域(macrodomain)之核小體重塑因子ALC1(CHD1L) (Ahel等人,2009;Gottschalk等人,2009;Lehmann等人,2017;Singh等人,2017)。宏結構域通常會結合ADP-核糖、寡-ADP-核糖及聚-ADP-核糖(Karras等人,2005),因此含宏結構域(macrodomain)之蛋白質會反應並募集至基因體上之PARP激活位點,包括在DNA損傷期間及與癌症相關時。重要的是,與ALC1之宏結構域結合之PAR或寡-ADP-核糖一定會啟動染色質重塑活性(Ahel等人,2009;Gottschalk等人,2009;Lehmann等人,2017;Singh等人,2017),表示ALC1為受變構調節之染色質重塑酵素,其係其中第一種及係極少數幾種直接受PAR調節其催化活性之酵素之一。此外,ALC1為經過驗證之致癌基因,經常在BRCA1/2-缺陷卵巢癌及乳癌樣本中與PARP1一起進行基因擴增(參見圖2)。ALC1抑制劑,諸如:抑制ALC1之ATP酶功能及/或核小體重塑功能之小分子,可以強化PARPi之效應,造成加強殺死癌細胞及/或降低脫靶效應,因此減少對非癌細胞之細胞毒性。這種改變ALC1表現程度之事實(此時以基於CRISPR之剔除為例)會影響癌細胞對PARP抑制劑之敏感度,亦打開一個藉由改變ALC1之活性程度來克服PARP抑制劑抗性的機會,因為排除ALC1即一定可以加強PARPi奥拉帕尼(Olaparib)至足以迴避PARPi抗性之程度,諸如(但不限於)逆轉BRCA-缺陷狀態(例如:藉由內部刪除或透過喪失表觀遺傳BRCA1/2基因靜默)。由於癌細胞對PARP抑制劑之敏感性通常被認為(亦)源自PARPi捕捉染色質上PARP1(及亦同樣捕捉PARP2酵素,此點過去未曾在相關領域中建立)之能力,吾等假設小分子ALC1抑制劑可能介導PARPi敏化,避過PARPi抗性及/或透過直接或間接影響PARP1及/或PARP2捕捉而促進殺死癌細胞。明確言之,吾等假設使用小分子抑制ALC1,將會在DNA損傷位點加強捕捉PARP1/2,因此間接促進DNA 損傷及殺死癌細胞。
近來,已報告靶向ALC1(CHD1L)之第一種小分子抑制劑(Abbott等人,2020)。該文獻揭示ALC1抑制劑於控制歸因於致癌功能之惡性結腸直腸癌(CRC)上的角色,明確言之,係藉由影響CRC中,由Wnt/TCF-驅動之上皮-間質轉化(EMT)。使用一種特異性ALC1抑制劑分析時,量測DNA損傷標記物γH2AX,進一步顯示顯著DNA損傷之證據。此結果讓本作者假設ALC1可能提高結腸直腸癌標準照護法DNA傷害性化療(如:依託泊苷(etoposide))之效力,其會與DNA及拓樸異構酶II酵素形成三元複合物,防止DNA複製後之DNA股再黏接,因此造成DNA股斷裂及細胞死亡。重要的是此公開文獻沒有提出ALC1抑制劑對捕捉PARP-1/2/4之建議或實驗證據。
為了分析造成獨特捕捉效應之機轉,假設染色質重塑因子ALC1(CHD1L)會調節PARP滯留。包含PAR-結合性宏結構域之ALC1調節蛋白質募集至DNA損傷處(Ahel等人,2009;Gottschalk等人,2009;Lehmann等人,2017;Singh等人,2017)。如圖5與6所示,在U2OS細胞中,藉由ALCi抑制ALC1,會在DNA損傷處造成PARP-2之特異性滯留。
由於數種腫瘤中之ALC1會上調,並且已驗證為肝細胞癌瘤之致癌基因(Cheng等人,2013;Li等人,2019; Su等人,2014),因此藉由小分子抑制劑抑制ALC1,造成捕捉PARP-2,可以驅動DNA損傷反應之可靠變化。
本發明者假設,經由小分子操縱ALC1活性,足以避過低度或高度PARPi抗性。因此,可以開發ALC1及PARP-2來改善靶向PARP之療法在腫瘤學中之精細度。
此假說成為本發明之一部份,藉由小分子抑制劑操縱ALC1可透過捕捉PARP-1、PARP-2及/或PARP-3及捕捉尚未說明與PARP家族成員相關之染色質/DNA-損傷,來影響對DNA損傷之反應。此等化合物之設計在於抑制依賴ATP之染色質重塑因子ALC1 (CHD1L)之酵素活性,將會於試管內加強累積DNA損傷及因此介導針對BRCA缺陷之合成性致死,因為文獻上已依據臨床前及臨床證據完整說明抑制PARP之合成性致死,喪失BRCA-1/2腫瘤抑制子功能,壓制PARPi抗性機轉,打開ALC1抑制作用,作為具有完整HR途徑之癌症之醫療手段,及/或經由促進捕捉PARP-1/2/3來瓦解ALC1之致癌功能(諸如:HCC),可以靶向ALC1-擴增之腫瘤。此外,當誘發DNA損傷時,由於ALC1基因為PARP-染色質重排之關鍵介導者(Sellou等人,2016),靶向ALC1活性之小分子會影響PARP-1/2/3對染色質重排之細胞核DNA-損傷相關功能,不會影響細胞核內或核外之PARP-1/2/3之其他功能,或不會影響非-DNA-損傷所誘發之PARP酵素,其可能產生「第二代PARPi」,降低脫靶效應及/或降低副作用。
可以利用相關領域為PARP-1所建立之活細胞造影,目視PARP-1及PARP-2及PARP-3富集在DNA損傷位點之動力學(Ahel等人,2009;Gottschalk等人,2009)。野生型PARP-1及PARP-2快速募集至被雷射微束輻射誘發之DNA損傷處。吾等藉由標記GFP之PARP-1及PARP-2在永生化細胞株中之過渡轉染來量測ALC1i對其等募集至DNA損傷位點及在DNA損傷位點滯留之影響。
本發明者已成功判別ALC1之ATP酶結構域內之變構結合袋(allosteric binding pocket),並利用此資訊建立ALC1活性之抑制劑模型。提出上述ALC1對多種不同增生性疾病之相關性,特定言之彼等指BRCA1/2缺陷。因此本發明提供新穎一類化合物來治療或緩解腫瘤疾病,特定言之特徵在於例如:因ALC1表現增加而提高活性之腫瘤疾病。
此外,本發明者決定利用PARPi與ALC1抑制劑,較佳為本發明變構ALC1抑制劑之組合,可以驚人地加強PARPi之效應。因此本發明特別提供(i)對PARPi敏感之腫瘤的有效療法,(ii)介導PARPi敏化,(iii)避過PARPi抗性,(iv)可以減少PARPi投藥量,及/或(v)透過直接或間接影響捕捉PARP-1、PARP-2及/或PARP-3來促進殺死癌細胞。
本發明第一態樣有關一種染色質結構域(Chromodomain)-解旋酶-DNA-結合性蛋白質1-樣(ALC1)之變構抑制劑,其中該抑制劑特異性結合由跨越SEQ ID NO:1胺基酸殘基101至219之胺基酸延伸段形成之變構結合袋。
另一態樣中,本發明係有關一種式(I)化合物:
(I)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥,其中:
X 為N或S;
A 為C或N;
R
1為–CO-OR
6、-CO-R
7、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
1為-CO-OR
6;
R
2為-R
7、-NHR
8、-O-R
7、-C-O-R
7、Br、-C
3‑8‑環烷基(較佳為環丙基)、或-C
4‑8‑環烯基(較佳為環己烯基);
或
R
1及R
2共同形成5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、=O、[-O-CH
2-CH
2]-NH-CH(OH)-O-tBu;
R
3為H、=O、-OH、-O-R
7、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m 為0、1或2,及L為5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、-羥基C
1‑3‑烷基及=O;
R
4為H或-C
1-3-烷基,較佳為H;
R
5為‑(CH
2)
m-L、或-(CH
2)
m-(CH=CH)-L,其中m 為0、1或2,較佳為0或1,及L為5、6或7員碳環或雜環、金剛烷基、C
1‑4‑烷基、或-N(CH
3)
2,其可視需要經取代,較佳為經1、2、 3或4個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑CO‑OR
6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、-O-R
9、=O、及[-O-CH
2-CH
2]
q-NH-生物素,其中q為1、2、3、或4,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環;
或
R
4及R
5共同形成5、6、或7員碳環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、-O-R
9、‑R
9、=CH-R
A、及–CH
2-R
A,較佳為R
4及R
5共同形成C
5-7-環烷基;
R
6為H、-C
1-6-烷基、-C
2-6-烯基、-C
2-6-炔基,其可視需要經取代,較佳係R
6為H;
R
7為-C
1-3-烷基、-C
2-3-烯基、-C
2-3-炔基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3;
R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H;
R
9為-C
1-6-烷基、-C
2-6-烯基、-C
2-6-炔基、-C
1-6-烷基-芳基、或C
1-6-烷基-雜芳基(較佳為異㗁唑、噻唑、四唑、1,2,4-噻二唑、1,2,3-噻二唑、1,2,5-噻二唑、吡啶、1,2,4-㗁二唑、吡𠯤、或吡唑),視需要經1、2或3個選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-NO
2、-CN、-CONH
2、-CONH-C
1-3-烷基(較佳為–CONH-CH
3)、-NH-CO-C
1-3-烷基(較佳為-NH-CO-CH
3)、-C
1-6-烷基(較佳為-CH
3、乙基、丙基、第三丁基、或戊基)、-C
1-3-鹵代烷基(較佳為-CF
3、或-CHF
2)、-O-CHF
2、-O-CF
3、碳環(較佳為環丙基、環己基或苯基)、-O-碳環(較佳為苯氧基)、雜環(較佳為吡唑基)、-CO-雜環(較佳為–CO-(1-吡咯啶基))、-SO
2-CH
3、-SO
2-N(CH
3)
2、-O-C
1-4-烷基(較佳為-OCH
3)、-O-C
1-3-烷基-O-C
1-3-烷基(較佳為–O-CH
2-O-CH
3)、-SCH
3,或當R
9為-C
1-6-烷基-芳基時,則芳基部份體上兩個相鄰取代基可以形成5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代;
R
A為H、碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、‑O‑R
7、-O-(CH
2)
o-R
9、-SO
2NH
2、及=O,其中 o 為0或1。
另一態樣中,本發明係有關一種式(I)化合物:
(I)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥,其中:
X 為N或S;
A 為C或N;
R
1為–CO-OR
6、-CO-R
7、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
1為-CO-OR
6;
R
2為-R
7、-NHR
8、-C-O-R
7;
或
R
1及R
2共同形成5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O;
R
3為H、=O、-OH、-O-R
7、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m 為0、1或2,及L為5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、-羥基C
1‑3‑烷基及=O;
R
4為H或-C
1-3-烷基,較佳為H;
R
5為-(CH
2)
m-L、或-(CH
2)
m-(CH=CH)-L,其中m 為0、1或2,較佳為0或1,及L為5、6或7員碳環或雜環、或金剛烷基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、 3或4個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑CO‑OR
6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、-O-R
9、及=O,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環;
或
R
4及R
5共同形成5、6、或7員碳環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、-O-R
9、‑R
9、=CH-R
A,較佳為R
4及R
5共同形成C
5-7-環烷基;
R
6為H、-C
1-6-烷基、-C
2-6-烯基、-C
2-6-炔基,其可視需要經取代,較佳係R
6為H;
R
7為-C
1-3-烷基、-C
2-3-烯基、-C
2-3-炔基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3;
R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H;
R
9為-C
1-6-烷基、-C
2-6-烯基、-C
2-6-炔基、或-C
1-6-烷基-芳基,視需要經1、2或3個選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3;
R
A為H、碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、‑O‑R
7、-O-(CH
2)
o-R
9、‑SO
2NH
2、及=O,其中 o 為0或1。
第二態樣中,本發明係有關一種雙功能化合物,其包含本發明第一態樣或另一態樣之ALC1之變構抑制劑及募集E3泛素連接酶至ALC1之化合物(E3募集因子),其中ALC1之變構抑制劑與E3募集因子係視需要利用連接子共價連接。
第三態樣中,本發明係有關一種醫藥組合物,其包含ALC1之變構抑制劑及醫藥上可接受之賦形劑。
第四態樣中,本發明係有關一種ALC1抑制劑(ALC1i),用於治療或緩解患者之增生性疾病,其中該方法包括投與該ALC1i及可視需要投與聚(ADP-核糖)-聚合酶抑制劑 (PARPi)。
第五態樣中,本發明係有關一種PARPi,用於治療或緩解患者之增生性疾病,其中該方法包括投與該PARPi及投與該ALC1i。
第六態樣中,本發明係有關一種部件套組,其包含分開包裝之PARPi及ALC1i,或包含PARPi及ALC1i之組合物,較佳為附有指示用於治療或緩解增生性疾病之說明書。
在詳細說明本發明之前,咸了解本發明不受限於本文說明之特定方法、製程、及試劑,因為其等可能有變化。亦咸了解,本文所採用之術語僅係針對說明特定實施例的目的,並無意限制本發明之範圍,本發明範圍僅受附錄之申請專利範圍之限制。除非另有說明,否則本文所採用所有技術及科學術語具有習此相關技藝者習知之相同定義。
本說明書全文內容中已擷用數份文獻。本文所擷用之每一份文獻(包括所有專利案、專利申請案、科學公開文獻、製造商說明書、使用指引,等等),不論如上文或如下文所指示,均已以全文引用之方式併入本文中。本文任何內容均不應被理解為承認由於先前發明而使本發明無權早於該發明揭示。本文所擷用有些文獻之特徵為「以引用之方式併入」。若此等引用參考文獻之定義或教示與本說明書中採用之定義或教示之間出現矛盾時,將以本說明書內容優先。
下文將說明本發明元素。此等元素係以明確實施例列出,然而應了解其等可依任何方式及任何數量組合,以創造額外之實施例。各種不同說明之實例及較佳實施例不應構成讓本發明侷限於明確說明實施例之限制。應了解此說明所支持及涵括之實施例係組合明確說明之實施例與任何數量之揭示與/或較佳元素。此外,本申請案中所說明所有元素之任何排列及組合應視為由本發明申請案之說明所揭示,除非內文另有其他說明。
定義
為了操作本發明,除非另有說明,否則採用相關領域文獻中已解釋之慣用化學、生化學、及重組DNA技術之方法(參見例如:Molecular Cloning: A Laboratory Manual,第2版,J. Sambrook等人編輯,Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor 1989)。
下文中提供本說明書有些常用術語之定義。此等術語用在本說明書其餘內容中時,用在每一例時均具有其個別定義及較佳定義。
本說明書及其附錄之申請專利範圍中所使用之單數型「一種」、「一個」、及「該」包括複數型,除非另有說明。
術語「染色質結構域-解旋酶-DNA-結合性蛋白質1-樣」縮寫成CHD1L,係指亦稱為ALC1之蛋白質。人類 ALC1之胺基酸序列明確說明於SEQ ID NO:1。897個胺基酸殘基長度之蛋白質係由跨越胺基酸殘基40至513之N-末端Snf2-樣DNA依賴性ATP酶結構域組成,其包含催化作用所必要之保留解旋酶基序(Flaus等人,2006)。此結構域由兩個分別在胺基酸殘基48至261及351至513範圍之RecA樣小葉構成。已利用同源建模決定ATP酶結構域之截短之N-末端小葉之結構,以便判別推測之變構結合位點,圖20提供此模型之最小坐標檔案,可以讓習此相關技藝者在本發明者首次界定之變構結合袋內判別模型化合物。變構結合袋在空間上係與ALC1中涉及結合ATP之該部份分開。ATP酶結構域接著一個連接子區,範圍在胺基酸殘基514至703,其包含推測之捲曲螺旋區(胺基酸殘基638至675)及C-末端宏結構域(胺基酸殘基704至897)。該宏結構域已顯示直接與ATP酶結構域交互作用,藉以抑制其催化功能(Lehmann等人,2017;Singh等人,2017)。此交互作用係在聚(ADP-核糖)結合至宏結構域時釋出,造成激活染色質重塑酵素。
本發明內容中所使用術語「烷基」係指飽和直鏈或分支碳鏈。較佳為該鏈包含1至10個,亦即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個碳原子,例如:甲基、乙基、丙基(正丙基或異丙基)、丁基(正丁基、異丁基、第二丁基、第三丁基)、戊基、己基、庚基、辛基、壬基、癸基。烷基可視需要經取代。
本發明內容中所使用術語「雜烷基」係指飽和直鏈或分支碳鏈。較佳為該鏈包含1至9個,亦即1、2、3、4、5、6、7、8、或9個碳原子,例如:甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、第二丁基、第三丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基,其間可穿插一或多個,例如:1、2、3、4、5個相同或相異雜原子。較佳為該雜原子係選自:O、S、及N,例如:-(CH
2)
n-X-(CH
2)
mCH
3,其中n = 0、1、2、3、4、5、6、7、8、或9,m = 0、1、2、3、4、5、6、7、8、或9,及X = S、O或NR',其中R' = H或烴(例如:C
1至C
6烷基)。特定言之,「雜烷基」係指‑O-CH
3、-OC
2H
5、-CH
2-O-CH
3、-CH
2-O-C
2H
5、-CH
2-O-C
3H
7、-CH
2-O-C
4H
9、-CH
2-O-C
5H
11、‑C
2H
4-O-CH
3、-C
2H
4-O-C
2H
5、-C
2H
4-O-C
3H
7、-C
2H
4-O-C
4H
9,等等。雜烷基可視需要經取代。
術語「鹵代烷基」係指飽和直鏈或分支碳鏈,其中一或多個氫原子被鹵原子置換,例如:被氟、氯、溴、或碘置換。較佳為該鏈包含1至10個,亦即1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個碳原子。特定言之,「鹵代烷基」係指-CH
2F、-CHF
2、-CF
3、-C
2H
4F、-C
2H
3F
2、‑C
2H
2F
3、-C
2HF
4、-C
2F
5、-C
3H
6F、-C
3H
5F
2、-C
3H
4F
3、-C
3H
3F
4、-C
3H
2F
5、-C
3HF
6、-C
3F
7、‑CH
2Cl、-CHCl
2、-CCl
3、-C
2H
4Cl、-C
2H
3Cl
2、‑C
2H
2Cl
3、-C
2HCl
4、‑C
2Cl
5、-C
3H
6Cl、-C
3H
5Cl
2、‑C
3H
4Cl
3、-C
3H
3Cl
4、-C
3H
2Cl
5、-C
3HCl
6、及-C
3Cl
7。鹵代烷基可視需要經取代。
本發明內容中所使用術語「5、6、或7員碳環」係指具有5、6、或7個形成環之碳原子之「環烷基」、「環烯基」或「芳基」。
術語「環烷基」包括環戊基、環己基、及環庚基。環烷基可視需要經取代。
術語「環烯基」包括環戊烯基、環己烯基、及環庚烯基。環烯基可視需要經取代。
術語「芳基」 係指苯基。芳基可視需要經取代,例如:萘基。
本發明內容中所使用術語「5、6、或7員雜環」係指具有5、6、或7個形成環之原子之單環狀「5、6、或7員雜環烷基」或單環狀「5、6、或7員雜芳基」。
術語「5、6、或7員雜環烷基」 係指飽和單環中至少一個碳原子被1或2個(針對5員環)或1、2、或3個(針對6員環)或1、2、3、或4個(針對7員環)相同或相異雜原子,較佳被選自O、N及S之雜原子置換。雜環烷基之較佳實例包括 1-(1,2,5,6-四氫吡啶基)、1-哌啶基、2-哌啶基、3-哌啶基、4-嗎啉基、3-嗎啉基、四氫呋喃-2-基、四氫呋喃-3-基、四氫噻吩-2-基、四氫噻吩-3-基、1-哌𠯤基、或2-哌𠯤基。雜環烷基可視需要經取代。
本發明內容中所使用術語「雜芳基」係指5、6或7員芳香系單環中至少一個碳原子被1、2、或3個(針對5員環)或1、2、3、或4個(針對6員環)相同或相異雜原子,較佳被選自O、N及S之雜原子置換。較佳雜芳基實例為呋喃基、噻吩基、㗁唑基、異㗁唑基、1,2,5-㗁二唑基、1,2,3-㗁二唑基、吡咯基、咪唑基、吡唑基、1,2,3-三唑基、噻唑基、異噻唑基、1,2,3-噻二唑基、1,2,5-噻二唑基、吡啶基、嘧啶基、吡𠯤基、1,2,3-三𠯤基、1,2,4-三𠯤基、1,3,5-三𠯤基。雜芳基可視需要經取代。
若可以分別彼此獨立選出兩個或更多個基團,則術語「分別獨立」意指該等基團可能相同或可能相異。
若提及鹵素(特定言之,F、Cl、Br、或I)、‑NO
2、‑CN、‑OR'''、-NR'R''、‑COOR'''、-CONR'R''、‑NR'COR''、‑NR''COR'''、‑NR'CONR'R''、‑NR'SO
2E、‑COR''';-SO
2NR'R''、-OOCR'''、‑CR'''R''''OH、‑R'''OH、及‑E時沒有進一步明確說明,則各例中之術語「視需要經取代」係指
R'及R''係分別獨立選自下列組成之群中:氫、烷基、烯基、炔基、環烷基、雜環烷基、芳基、烷基、及雜芳基,或共同形成雜芳基、或雜環烷基;
R'''及R''''係分別獨立選自下列組成之群中:氫、烷基、烯基、炔基、環烷基、雜環烷基、烷氧基、芳基、芳烷基、雜芳基、及-NR'R'';
E係選自下列組成之群中:烷基、烯基、炔基、環烷基、烷氧基、烷氧基烷基、雜環烷基、脂環系、芳基及雜芳基;可視需要經取代。
「醫藥上可接受」意指由聯邦或政府之管理機構核准或列於美國藥典(U.S. Pharmacopeia)(United States Pharmacopeia-33/National Formulary-28 Reissue,由美國藥典委員會(United States Pharmacopeia Convention, Inc., Rockville Md.)出版,出版日期:2010年4月)或其他一般認可之藥典中,可用於動物,及更特定言之用於人類。
術語「醫藥上可接受之鹽」係指本發明化合物之鹽。本發明化合物之合適之醫藥上可接受之鹽包括酸加成鹽,其可以例如:由本文說明之化合物或其衍生物之溶液與醫藥上可接受之酸之溶液混合而形成,該等酸為如:鹽酸、硫酸、富馬酸、馬來酸、琥珀酸、乙酸、苯甲酸、檸檬酸、酒石酸、碳酸或磷酸。此外,若本發明化合物帶有酸性部份體時,其合適之醫藥上可接受之鹽可包括鹼金屬鹽(例如:鈉或鉀鹽);鹼土金屬鹽(例如:鈣或鎂鹽);及與合適有機配體形成之鹽(例如:銨、四級銨及胺陽離子使用抗衡陰離子如:鹵離子、氫氧化離子、羧酸根、硫酸根、磷酸根、硝酸根、烷基磺酸根及芳基磺酸根形成)。醫藥上可接受之鹽之例示性實例包括(但不限於):乙酸鹽、己二酸鹽、藻酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯磺酸鹽、苯甲酸鹽、碳酸氫鹽、硫酸氫鹽、酒石酸氫鹽、硼酸鹽、溴化物、丁酸鹽、乙二胺四乙酸鈣、樟腦酸鹽、樟腦磺酸鹽、右旋樟腦磺酸鹽、碳酸鹽、氯化物、檸檬酸鹽、克拉維酸鹽、環戊烷丙酸鹽、二葡糖酸鹽、二鹽酸鹽、十二烷基硫酸鹽、乙二胺四乙酸鹽、乙二磺酸酸鹽、十二烷基硫酸鹽(estolate)、乙磺酸鹽、乙烷磺酸鹽、甲酸鹽、富馬酸鹽、葡庚糖酸鹽、葡庚酸鹽、葡糖酸鹽、麩胺酸鹽、甘油磷酸鹽、羥乙醯胺基苯胂酸鹽、半硫酸鹽、庚酸鹽、己酸鹽、己基間苯二酚酸鹽、海巴明哈胺(hydrabamine)、氫溴酸鹽、鹽酸鹽、氫碘酸鹽、2-羥基乙磺酸鹽、羥基萘甲酸鹽、碘化物、羥乙基磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、丙二酸鹽、扁桃酸鹽、甲磺酸鹽、甲烷磺酸鹽、甲基硫酸鹽、黏酸鹽、2-萘磺酸鹽、萘磺酸鹽、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、N-甲基葡糖胺銨鹽、油酸鹽、草酸鹽、雙羥萘酸鹽(恩波酸鹽(embonate))、棕櫚酸鹽、泛酸鹽、果酸鹽、過硫酸鹽、3-苯基丙酸鹽、磷酸鹽/二磷酸酸鹽、苦味酸鹽、特戊酸鹽、聚半乳糖醛酸鹽、丙酸鹽、水楊酸鹽、硬脂酸鹽、硫酸鹽、鹼式乙酸鹽、琥珀酸鹽、單寧酸鹽、酒石酸鹽、茶鹼酸鹽、甲苯磺酸鹽、三乙基碘化物(triethiodide)、十一烷酸鹽、戊酸鹽、及類似物(參見例如:Berge, S.等人,「Pharmaceutical Salts」, Journal of Pharmaceutical Science, 1977, 66, 1-19)。某些特定本發明化合物同時包含鹼性與酸性官能基,容許該化合物轉化成鹼或酸加成鹽。
化合物之中性型可由該鹽與鹼或酸接觸,及依習知方式單離母化合物而產生。化合物之母型在某些物理性質上不同於多種不同鹽型,諸如:在極性溶劑中之溶解性,但針對本發明之目的,該鹽在其他方面則等同該化合物之母型。
除了鹽型,本發明亦提供呈前藥型之化合物。本文所說明化合物之前藥為容易在生理條件下進行化學變化而提供式(I)至(IV)化合物之彼等化合物,尤指圖14所示之化合物。前藥為有活性或無活性化合物,其在前藥投與患者後,透過活體內生理作用,如:水解、代謝,等等進行化學修飾,形成本發明化合物。此外,前藥可以於離體環境下經由化學或生化方法轉化成本發明化合物。例如:前藥當置於含有合適酵素之穿皮式貼布儲槽時,可以慢慢轉化成本發明化合物。涉及製造及使用前藥之適用性及技術係習此相關技藝者習知。有關涉及酯之前藥之一般討論可參見Svensson L.A.及Tunek A. (1988) Drug Metabolism Reviews 19(2): 165-194及Bundgaard H.「Design of Prodrugs」, Elsevier Science Ltd. (1985)。受遮蔽之羧酸根陰離子實例包括多種不同酯類,如:烷基(例如:甲基、乙基)、環烷基(例如:環己基)、芳烷基(例如:苯甲基、對甲氧基苯甲基)、及烷基羰基氧烷基(例如:特戊醯基氧甲基)。胺類已被遮蔽成芳基羰基氧甲基取代之衍生物,其等會於活體內被酯酶裂解,釋出游離藥及甲醛(Bundgaard H.等人(1989) J. Med. Chem. 32(12): 2503-2507)。此外,包含酸性NH基團之藥物,如:咪唑、亞胺、吲哚及類似物,已利用N-醯基氧甲基遮蔽(Bundgaard H.「Design of Prodrugs」, Elsevier Science Ltd. (1985))。羥基已遮蔽成酯類及醚類。EP 0 039 051 A2揭示曼尼-鹼(Mannich-base)異羥肟酸前藥,其製法及用途。
本發明化合物亦可在構成此等化合物之一個或多個原子上包含非天然比例之同位素原子。例如:化合物可經過放射性標記放射性同位素,如,例如:氚(
3H)、碘-125 (
125I)或碳-14 (
14C)。本發明化合物之所有同位素變化不論是否具有放射性,均計畫涵括在本發明範圍內。
當提及芳基之取代基時,本文所採用「對位」意指該取代基佔據的位置係與芳基連接化合物主幹之位置相對。
本文所採用「患者」意指可因接受本文所說明化合物治療而受益之任何哺乳動物或鳥類。較佳為「患者」係選自下列組成之群:實驗室動物、家畜動物、或靈長類,包括黑猩猩及人類。特別佳係該「患者」為人類。
本文在疾病或疾患上所採用「治療」或「處理」(treat、treating或treatment)意指完成下列一或多項:(a)降低疾患之嚴重性;(b)限制或防止所治療該(等)疾患之特徵症狀之發展;(c)抑制所治療該(等)疾患之特徵症狀之惡化;(d)限制或防止先前已患有該(等)疾患之患者之該(等)疾患復發;及(e)限制或防止先前已出現該(等)疾患症候之患者之症狀復發。
本文所採用疾病或疾患之「預防」、「防止」、「阻止」、或「預防性」意指為受試者防止疾患發展維持一段時間。例如:若本文所說明化合物基於預防疾病或疾患的目的投與受試者,則至少在投藥當天及較佳在投藥日之後一天或更多天(例如:1至30天;或2至28天;或3至21天;或4至14天;或5至10天),防止該疾病或疾患發生。
根據本發明「醫藥組合物」可呈組合物型式,其中由不同活性成份與稀釋劑及/或載劑彼此混合,或可呈組合製劑型式,其中由活性成份呈部份或完全獨立型式。此等組合或組合製劑之實例之一為部件套組。
「有效量」係足以達成計畫目的之醫療劑用量。指定醫療劑之有效量可以隨諸如:製劑性質、投藥途徑、接受該醫療劑之動物之大小與物種、及投藥目的等因素變化。每一個例子之有效量可由習此相關技藝者根據相關技藝已建立之方法由經驗決定。
本文所採用術語「載劑」係指與醫療劑一起投與之稀釋劑、佐劑、賦形劑、或媒劑。此等醫藥載劑可以為無菌液體,如:含於水中之生理鹽溶液,及油類,包括彼等源於石油、動物、植物或合成性者,如:花生油、大豆油、礦物油、芝麻油、及類似物。當醫藥組合物經靜脈內投藥時,以生理鹽溶液為較佳載劑。亦可使用生理鹽溶液及右旋糖與甘油水溶液作為液體載劑,特別用於注射液。合適之醫藥賦形劑包括澱粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明膠、麥芽、米磨粉、白堊、矽膠、硬脂酸鈉、單硬脂酸甘油酯、滑石、氯化鈉、脫脂奶粉、甘油、丙二醇、水、乙醇及類似物。若需要時,組合物亦可包含少量濕化劑或乳化劑、或pH緩衝劑。此等組合物可呈溶液、懸浮液、乳液、錠劑、丸劑、膠囊、粉劑、持續釋放性調配物及類似物等型式。組合物可以使用慣用之結合劑與載劑,如:三酸甘油酯,調配成栓劑。本發明化合物可以調配成中性或鹽型。醫藥上可接受之鹽類包括彼等與游離胺基形成之鹽類,如:彼等衍生自鹽酸、磷酸、乙酸、草酸、酒石酸,等等,及彼等與游離羧基形成之鹽類,如:彼等衍生自鈉、鉀、銨、鈣、鐵氫氧化物、異丙基胺、三乙基胺、2-乙基胺基乙醇、組胺酸、普魯卡因,等等。合適之醫藥載劑實例說明於E. W. Martin之「Remington's Pharmaceutical Sciences」。此等組合物將包含醫療有效量之化合物,較佳為純化型,及適量之載劑,一起形成適合投與患者之型式。該調配物應配合投藥模式。
本發明實施例
本發明者已判別及分析ALC1中之袋特徵,其似乎涉及變構調節ALC1之ATP酶活性。特異性結合此袋之化合物可以抑制ALC1之ATP酶活性。會結合至ALC1之ATP酶位點並阻斷ATP酶活性之化合物會與ATP競爭結合至ATP酶位點。由於細胞ATP隨細胞環境而定之濃度在1至10 mM範圍內,在低達奈莫耳濃度範圍下需要極高結合親和性才可成功阻止ATP結合至ALC1之ATP酶位點。ALC1之變構抑制劑則沒有這種限制,因為其等不需要阻止ATP結合,反而透過不同阻止機轉來抑制ALC1之ATP酶活性。本發明者已判別可以特異性結合至變構袋之化合物,並測定該化合物納入該袋中之空間及電子需求。因此,藉由界定該「鎖」,本發明者可以界定納入此袋,亦即變構結合袋中,並可以形成非共價鍵或其他穩定交互作用之「鑰匙」,亦即化合物 ,以讓其等化合物特異性結合至該袋。利用此合理設計法,本發明者已判別可以抑制ALC1在染色質上之移動,因此達成所謂的PARP捕捉。亦測試此等化合物殺死兩種不同腫瘤細胞株之能力,其中一種為BRCA 缺陷。
配體-蛋白質交互作用以結構為基礎之電腦建模法為目前最新藥物開發的核心組成(Charifson及Kuntz, 1997)。電腦運算法已在藥物開發過程提高藥物上市量扮演關鍵角色,包括HIV蛋白酶抑制劑(Charifson及Kuntz, 1997;Greer等人,1994;Jorgensen, 2004)及扎那米韋(zanamivir)(一種抗病毒神經醯胺酶抑制劑) (von Itzstein等人,1993),及用於發展新的候選藥物,如:HIV整合酶抑制劑(Hazuda等人,2004;Schames等人,2004)、肝炎C 蛋白酶抑制劑(Liverton等人,2008;Thomson及Perni, 2006)、及β-分泌酶抑制劑(BACE-1) (Stauffer等人,2007)。相關領域中,可以運用的物理運算電腦方法有三大類(從最快到最慢,及從最小實體到最大實體的順序列出):(1)極快速分子對接法,包括DOCK、Glide、AutoDock、FlexX、ICN、PMF、及GOLD、基於自由能之分子動力學方法(Molecular dynamics based free energy method)(MD),如:MM/GBSA或MM/PBSA,其中溶劑、蛋白質、及配體彼此受力,並在疊代步驟中受到此等力影響產生熱波動及移動,及(4) 絕對結合自由能(absolute binding free energy) (ABFE)方法,包括模擬煉藥法(alchemical simulation),其係成本最高的運算法,但其包括目前操作中最嚴格的物理學。ABFE法係從蛋白質未結合之配體及潛在未結合之結構開始,試圖預測所關注複合物之結構、親和性、及熱學性質。此等策略係相關技藝習知者,及特定言之,可採用實驗章節說明之方法,藉由與本發明者首次判別ALC1內之變構結合袋之結合性,來判別作為ALC1之變構抑制劑之化合物。
因此,
第一態樣中,本發明提供一種ALC1之變構抑制劑,其中該抑制劑特異性結合至由人類 ALC1跨越SEQ ID NO:1胺基酸殘基101至219之胺基酸延伸段所形成之變構結合袋。本文所採用術語「特異性結合」係指該化合物對具有根據SEQ ID NO:1胺基酸序列之全長度人類 ALC1之K
D為200 µM或更低,較佳為100 µM,更佳為50 µM,更佳為10 µM或更低,更佳為5 µM或更低,甚至更佳為1 µM,及甚至更佳為500 nM或更低。習此相關技藝者咸了解如何量測小分子與相關蛋白質之解離常數,其包括表面電漿共振。較佳為本發明化合物之K
D之量測係由全長度人類 ALC1固定在晶片表面上,隨後施加化合物至已固定之蛋白質上。此量測法較佳係在37°C下進行。
本發明較佳實施例中,ALC1之變構抑制劑在基於FRET之核小體重塑分析法中之ID
50值為500 µM或更低,較佳為250 µM或更低,更佳為 100 µM或更低,更佳為 50 µM或更低,更佳為 10 µM或更低,更佳為 5 µM或更低,或甚至更佳為 1 µM或更低。
跨越SEQ ID NO:1胺基酸殘基101至219之胺基酸延伸段中,並非每一個胺基酸均形成可用於結合本發明化合物之ALC1之變構袋之表面。此點歸因於有些胺基酸被埋在袋內,很難觸及,而其他位在ALC1內或外表面上卻甚至未成為袋的一部份。因此較佳實施例中,本發明ALC1之抑制劑可以特異性結合之變構結合袋包含以下或由以下組成:SEQ ID NO:1之胺基酸L101、Y153、C156、L157、A160、L163、K164、V173、D174、E175、A176、H177、R178、L179、S183、L186、H187、T189、L190、F193、L200、L201、T202、N208、S209、E212、L213、L216、及F219,更佳為該結合袋包含或組成為SEQ ID NO:1之Y153、C156、L157、A160、L163、V173、E175、R178、L186、H187、L190 F 193、L200、及E212。目前,仍未取得ALC1之3D 結構,然而,數種同源重塑因子的結構已寄存在蛋白質資料庫(Protein Data Bank)(PDB)。因此,習此相關技藝者可以依據其與其他染色質重塑酵素之同源性建立ALC1變構結合袋之模型。此等模型亦圖示於圖13至圖19,有本發明化合物及沒有本發明化合物之袋。特定言之,圖16 A及B所出示本發明化合物實例之體積模型說明習此相關技藝者如何目視指定化合物納入變構結合袋中之適合性。圖18僅出示可在袋中與本發明化合物交互作用之胺基酸,並提供進一步指示選擇符合該袋之立體性、疏水性、親水性及電荷需求之化合物。涉及與本發明化合物結合之ALC1之胺基酸之最小一組結構坐標提供於圖20中。
依據不同胺基酸在袋中之取向,其等可在袋表面上觸及者可以形成不同非共價鍵,特定言之,氫鍵、離子性交互作用、凡得瓦(van der Waals)交互作用及疏水性交互作用。因此,在較佳實施例中,抑制劑係與變構結合袋之一或多個胺基酸,較佳與一或多個ALC1之胺基酸L157、A160、K164、V173、D174、H177、R178、L179、L186、N208、及/或E212之主幹,及/或與ALC1之L101、Y153、C156、L157、A160、L163、E175、R178、L179、L186、H187、L190、F193、T202、N208、E212、或L213之側鏈,更佳為與ALC1之D174、H177、及R178之主幹,及與ALC1之Y153、E175、R178、H187、T202、N208及/或E212之側鏈形成非共價鍵。
較佳實施例中,ALC1之抑制劑係非共價結合至:
(i) ALC1之胺基酸Y153側鏈之芳香環,其係與芳香系碳環或雜環取代基之環面-面或端-面π-π交互作用,或與極性、帶電荷、或碳-鹵素取代基形成陽離子-π、極性-π、或鹵素-π交互作用;
(ii) ALC1之胺基酸Y153側鏈之末端氧,其利用提供氫鍵之基團;
(iii) H177主幹之羰基氧,其利用提供碳-鹵鍵或氫鍵之基團;
(iv) D174主幹之羰基氧,其利用提供碳-鹵鍵或氫鍵之基團;
(v) E175之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團;
(vi) R178之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團;
(vii) R178之主幹羰基氧,其利用提供碳-鹵鍵或氫鍵之基團;
(viii) H187之側鏈,其係與芳香系碳環或雜環取代基之環面-面或端-面π-π交互作用,或與極性、帶電荷、或碳-鹵素取代基形成陽離子-π、極性-π、或鹵素-π交互作用,或利用提供或接受氫鍵之基團;
(ix) T202之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團;
(x) N208之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團;及
(xi) E212之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團。
本發明第一態樣之較佳實施例中,變構抑制劑具有式(I)結構:
其中
(i) R
5包含芳香環,其與胺基酸Y153之芳香環進行π-堆積;及/或
(ii) N為胺基酸Y153末端OH接受氫鍵之基團;及/或
(iii) R
1包含對ALC1之胺基酸H177主幹羰基氧提供氫鍵之基團;及/或
(iv) R
3包含會與ALC1之胺基酸D174之主幹之羰基氧結合之提供碳-鹵鍵或氫鍵之基團;及/或
(v) R
1及R
2共同形成芳香系或雜芳香系單環,其包含提供或接受氫鍵之基團,尤其位在或鄰接R
1位置,其作用在於作為對ALC1之胺基酸E175及/或ALC1之胺基酸R178之側鏈提供或接受氫鍵之基團;及/或
(vi) R
1及R
2共同形成經取代之碳單環或雜單環,其包含提供或接受氫鍵之基團,較佳為位在或鄰接R
1位置,其為對ALC1之胺基酸R178側鏈提供或接受氫鍵之基團;及/或
(vii) R
3包含芳香環,其與ALC1之胺基酸H187之芳香環進行π-堆積或為缺電子取代基,尤其位在會與ALC1之胺基酸H187之芳香環形成極性-π或陽離子-π交互作用;
(viii) R
1及R
2共同形成芳香系或雜芳香系單環,其包含提供或接受氫鍵之基團,尤其位在或鄰接R
2位置,其作用在於作為對ALC1之胺基酸T202及/或胺基酸N208之側鏈提供或接受氫鍵之基團;
(ix) R
4為H或-C
1-3-烷基,較佳為H;及/或
(x) R
5為‑(CH
2)
m-L、或-(CH
2)
m-(CH=CH)-L,其中m為0、1或2,較佳為0或1,及L為5、6或7員碳環或雜環、或金剛烷基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、 3或4個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑CO‑OR
6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、-O-R
9、及=O,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環;及/或
(xi) R
4及R
5共同形成5、6、或7員碳環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、-O-R
9、‑R
9、=CH-R
A,較佳為R
4及R
5共同形成C
5-7-環烷基;及/或
(xii) X為S或N;
(xiii) A為N或C。
本發明之另一態樣或第一態樣之較佳實施例中,本發明係有關一種具有式(I)結構之變構抑制劑:
(I)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥,其中:
X 為 N或S;
A 為 C或N;
R
1為 –CO-OR
6、-CO-R
7、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
1為–CO-OR
6;
R
2為 -R
7、-NHR
8、-O-R
7、-C-O-R
7、Br、-C
3‑8‑環烷基(較佳為環丙基)、或-C
4‑8‑環烯基(較佳為環己烯基);
或
R
1及R
2共同形成5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、=O、[-O-CH
2-CH
2]-NH-CH(OH)-O-tBu;
R
3為H、=O、-OH、-O-R
7、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0、1或2,及L為5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、-羥基C
1‑3‑烷基及=O;
R
4為H或-C
1-3-烷基,較佳為H;
R
5為‑(CH
2)
m-L、或-(CH
2)
m-(CH=CH)-L,其中m為0、1或2,較佳為0或1,及L為5、6或7員碳環或雜環、金剛烷基、C
1‑4‑烷基、或-N(CH
3)
2,其可視需要經取代,較佳為經1、2、 3或4個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑CO‑OR
6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、-O-R
9、=O、及[-O-CH
2-CH
2]
q-NH-生物素,其中q為1、2、3、或4,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環;
或
R
4及R
5共同形成5、6、或7員碳環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、-O-R
9、‑R
9、=CH-R
A、及–CH
2-R
A,較佳為R
4及R
5共同形成C
5-7-環烷基;
R
6為H、-C
1-6-烷基、-C
2-6-烯基、-C
2-6-炔基,其可視需要經取代,較佳係R
6為H;
R
7為 -C
1-3-烷基、-C
2-3-烯基、-C
2-3-炔基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3;
R
8為 H或C
1-6-烷基,較佳為H;
R
9為 -C
1-6-烷基、-C
2-6-烯基、-C
2-6-炔基、-C
1-6-烷基-芳基、或C
1-6-烷基-雜芳基(較佳為異㗁唑、噻唑、四唑、1,2,4-噻二唑、1,2,3-噻二唑、1,2,5-噻二唑、吡啶、1,2,4-㗁二唑、吡𠯤、或吡唑),其可視需要經1、2或3個選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-NO
2、-CN、-CONH
2、-CONH-C
1-3-烷基(較佳為–CONH-CH
3)、-NH-CO-C
1-3-烷基(較佳為-NH-CO-CH
3)、-C
1-6-烷基(較佳為-CH
3、乙基、丙基、第三丁基、或戊基)、-C
1-3-鹵代烷基(較佳為-CF
3、或-CHF
2)、-O-CHF
2、-O-CF
3、碳環(較佳為環丙基、環己基或苯基)、-O-碳環(較佳為苯氧基)、雜環(較佳為吡唑基)、-CO-雜環(較佳為–CO-(1-吡咯啶基))、-SO
2-CH
3、-SO
2-N(CH
3)
2、-O-C
1-4-烷基(較佳為-OCH
3)、-O-C
1-3-烷基-O-C
1-3-烷基(較佳為–O-CH
2-O-CH
3)、-SCH
3,或當R
9為-C
1-6-烷基-芳基時,則芳基部份體上兩個相鄰取代基可以形成5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代;
R
A為H、碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、‑O‑R
7、-O-(CH
2)
o-R
9、-SO
2NH
2、及=O,其中 o為0或1。
本發明再另一態樣或第一態樣之更佳實施例中,本發明係有關一種具有式(I)結構之變構抑制劑:
(I)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥,其中:
X 為N或S;
A 為C或N;
R
1為–CO-OR
6、-CO-R
7、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
1為–CO-OR
6;
R
2為-R
7、-NHR
8、-O-R
7、-C-O-R
7;
或
R
1及R
2共同形成5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O;
R
3為H、=O、-OH、-O-R
7、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m 為0、1或2,及L 為 5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、-羥基C
1‑3‑烷基及=O;
R
4為H或-C
1-3-烷基,較佳為H;
R
5為‑(CH
2)
m-L、或-(CH
2)
m-(CH=CH)-L,其中m 為0、1或2,較佳為0或1,及L 為 5、6或7員碳環或雜環、或金剛烷基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、 3或4個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑CO‑OR
6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、-O-R
9、及=O,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環;
或
R
4及R
5共同形成5、6、或7員碳環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、-O-R
9、‑R
9、=CH-R
A,較佳為R
4及R
5共同形成C
5-7-環烷基;
R
6為H、-C
1-6-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-烷基)、-C
2-6-烯基(亦即C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-烯基)、-C
2-6-炔基(亦即C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-炔基),其可視需要經取代,較佳係R
6為H;
R
7為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基(亦即C
2-、C
3-炔基),其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3;
R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H;
R
9為-C
1-6-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-烷基)、-C
2-6-烯基(亦即C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-烯基)、-C
2-6-炔基(亦即C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-炔基)、或-C
1-6-烷基-芳基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-烷基-芳基),其可視需要經1、2或3個選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3;
R
A為H、碳環或雜環,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、‑O‑R
7、-O-(CH
2)
o-R
9、-SO
2NH
2、及=O,其中 o 為0或1。
本發明第一態樣或另一態樣之較佳實施例中,X 為N。
本發明第一態樣或另一態樣之較佳實施例中,A 為C。
本發明第一態樣之較佳實施例中,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係 R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H;
本發明第一態樣或另一態樣之較佳實施例中,R
1為–CO-OH。
本發明第一態樣或另一態樣之較佳實施例中,X 為N及R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H。
本發明第一態樣或另一態樣之較佳實施例中,A 為C及R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,及R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C及R
1為–CO-OH或-CO-NH
2.
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X 為N,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為–CO-OH,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N及R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C及R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C及R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C及R
1為–CO-OH或-CO-NH
2及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,及R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,及R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C及R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,及R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C及R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為–CO-OH及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為–CO-OH或-CO-NH
2及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為–CO-OH及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為–CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為-CO-OH及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為–CO-OH或-CO-NH
2,R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為-CO-OH、R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1、R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,及R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣之較佳實施例中,R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為-CO-OH及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為-CO-OH,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為C,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為C及R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,及R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,及R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,及R
1為-CO-OH或-CO-NH
2。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,及R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,及R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,及R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,及R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,及R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,及R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,及R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為 N,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、-R
7、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5、6或7員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
1為-CO-OH、R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、或-(CH
2)
m-L,其中m為0,及L為苯基或5員雜芳基,較佳為苯基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C
1‑3‑烷基、及-羥基C
1‑3‑烷基。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OR
6、或-CO-NR
6R
A,較佳係R
6為H、-C
1-3-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-烷基)、-C
2-3-烯基(亦即C
2-、C
3-烯基)、-C
2-3-炔基,亦即C
2-、C
3-視需要經取代,較佳係R
6為H,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1為-CO-OH或-CO-NH
2,及R
2為-NHR
8,其中R
8為H或C
1-6-烷基,較佳為H,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,R
1及R
2共同形成6員芳基或雜芳基部份體,其可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C
1-3-烷基、及=O,較佳為-OH及=O,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,A為N,R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,X為N,A為N,及R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶,及R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
5為-(CH
2)
m-L,其中m為0、或1,或-(CH
2)-(CH=CH)-L,及L為苯基或5、或6員雜芳基、或金剛烷基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑CO‑OR
6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、-O-R
9、及=O,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
4及R
5共同形成5或6員未取代或經單取代之雜環烷基,較佳為在R
4位置經=CH-R
A取代。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
A為經1或2個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代之碳環:‑Br、‑Cl、‑F、-O-(CH
2)
o-R
9、或-SCH
3,其中 o為0或1。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
4及R
5共同形成5或6員未取代或經單取代之雜環烷基,較佳為在R
4位置經=CH-R
A取代,其中R
A為經1或2個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代之碳環:‑Br、‑Cl、‑F、-O-(CH
2)
o-R
9、或-SCH
3,其中o為0或1。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
9為-C
1-4-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、或C
4-烷基)、-C
2-4-烯基(亦即C
2-、C
3-、或C
4-烯基)、或-C
1-6-烷基-芳基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-烷基-芳基),視需要經1或2個選自下列所組成群中之取代基取代:-Cl、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3。
本發明第一態樣或另一態樣或再另一態樣之較佳實施例中,R
5為-(CH
2)
m-L,其中m 為0或1,或-(CH
2)-(CH=CH)-L,及L為苯基或5或6員雜芳基、或金剛烷基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑CN、‑CO‑OR
6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R
9、-O-R
9、及=O,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環,其中R
9為-C
1-4-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、或C
4-烷基)、-C
2-4-烯基(亦即C
2-、C
3-、或C
4-烯基)、或-C
1-6-烷基-芳基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-烷基-芳基),視需要經1或2個選自下列所組成群中之取代基取代:-Cl、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3。
本發明第一態樣之特別佳實施例中,變構抑制劑具有式(Ia)結構:
(Ia)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥,其中:
A 為C或N;
R
1為–COOH;
R
2為-CH
3或-NH
2;
或
R
1及R
2共同形成尿嘧啶或3-去氮雜尿嘧啶;
R
3為H、=O、-OH、噻吩基、苯基、3,4,5-羥基甲基苯基、CF
2H、或CF
3;
R
4為H;
R
5為-L、或-CH
2-(CH=CH)-L,其中 L 為6員碳環或雜環、或金剛烷基,視需要經1或2個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO
2、‑Br、‑Cl、‑F、CH
3、-O-R
9、及=O,或兩個相鄰取代基形成5或6員雜環;
或
R
4及R
5共同形成5或6員未取代或經單取代之雜環烷基,較佳為在R
4位置經=CH-R
A取代;
R
9為-C
1-4-烷基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、或C
4-烷基)、-C
2-4-烯基(亦即C
2-、C
3-、或C
4-烯基)、或-C
1-6-烷基-芳基(亦即C
1-、C
2-、C
3-、C
4-、C
5-或C
6-烷基-芳基),其視需要經1或2個選自下列所組成群中之取代基取代:-Cl、-CH
3、-OCH
3、或-SCH
3;
R
A為經1或2個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代之碳環:‑Br、‑Cl、‑F、-O-(CH
2)
o-R
9、或-SCH
3,其中 o 為0或1。
本發明第一態樣及另一態樣之化合物之特別佳實施例具有如圖10所示之特定結構。
該雙功能化合物在募集涉及靶向被蛋白酶體所降解蛋白質之蛋白質上之用途已成為降解涉及疾病過程之蛋白質之潛力醫療策略。此方法已在癌症療法中受到特別重視(Khan S.等人,2020及Bushweller JH, 2019)。此等雙功能化合物通常稱為蛋白質降解靶向嵌合體(PROteolysis TArgeting Chimeras)(PROTAC)。本發明第一態樣及另一態樣之ALC1之變構抑制劑特異性結合至ALC1,因此適合募集作為泛素化途徑一部份之蛋白質至ALC1。
因此,在
第二態樣中,本發明係有關一種雙功能化合物,其包含本發明第一態樣或另一態樣之ALC1之變構抑制劑及募集作為泛素化途徑一部份之蛋白質至ALC1(較佳為募集至ALC1之E3泛素連接酶)之化合物(E3募集因子),其中ALC1之變構抑制劑與E3募集因子係共價連接,可視需要透過連接子。在本發明雙功能化合物內容中,本發明第一態樣及另一態樣之ALC1之變構抑制劑特異性結合至ALC1之能力特別重要。因此較佳係該ACL1之變構抑制劑與具有根據SEQ ID NO:1胺基酸序列之全長度人類 ALC1結合之KD為50 µM,更佳為10 µM或更低,更佳為5 µM或更低,甚至更佳為1 µM,更佳為500 nM,更佳為200 nM,及甚至更佳為100 nM或更低。
泛素化途徑之蛋白質可能與小分子或蛋白質配體結合,例如:特異性結合至泛素化途徑蛋白質之抗體或抗體樣蛋白質。此等蛋白質配體已說明於例如:US 7,223,556 B1。結合至作為泛素化途徑一部份之蛋白質之小分子化合物係相關技藝習知者,且可用於本發明雙功能化合物。此等分子實例說明於EP 3 131 588、WO 2017/024317、US 6,306,663、US 7,041,298、US 2016/0176916、US 2016/0235730、US 2016/0235731、US 2016/0243247、WO 2016/105518、WO 2016/077380、WO 2016/105518、WO 2016/077375、WO 2017/007612、及WO 2017/024317。
ALC1之變構抑制劑係共價連接至會募集作為泛素化途徑一部份之蛋白質至ALC1之化合物。較佳為由兩個組份透過一個連接子彼此共價連接。合適連接子具有不同長度與官能性。較佳係該連接子為碳鏈。較佳實施例中,碳鏈可視需要包含一、二、三個、或更多個選自N、O、及S之雜原子。較佳實施例中,碳鏈僅包含飽和鏈碳原子。較佳實施例中,碳鏈可視需要包含兩個更多個不飽和鏈碳原子(例如:C=C或C≡EC)。某些實施例中,碳鏈中一個或多個碳原子可視需要經一個或多個取代基(較佳為側氧基、C
1-C
6烷基、C
2-C
6烯基、C
2-C
6炔基、C
1-C
3烷氧基、OH、鹵素、NH
2、-NH(C
1-C
3烷基)、-N(C
1-C
3烷基)
2、CN、C
3-C
7環烷基、雜環基、苯基、及雜芳基)取代。
某些實施例中,連接子包含至少5個鏈原子(例如:C、O、N、及S)。某些實施例中,連接子包含少於20個鏈原子(例如:C、O、N、及S)。某些實施例中,連接子包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、或19個鏈原子(例如:C、O、N、及S)。某些實施例中,連接子包含5、7、9、11、13、15、17、或19個鏈原子(例如:C、O、N、及S)。某些實施例中,連接子包含5、7、9、或11個鏈原子(例如:C、O、N、及S)。某些實施例中,連接子包含6、8、10、12、14、16、或18個鏈原子(例如:C、O、N、及S)。某些實施例中,連接子包含6、8、10、或12個鏈原子(例如:C、O、N、及S)。
某些實施例中,連接子為碳鏈,其可視需要經非大型取代基取代,較佳為側氧基、C
1-C
6烷基、C
2-C
6烯基、C
2-C
6炔基、C
1-C
3烷氧基、OH、鹵素、NH
2、-NH(C
1-C
3烷基)、-N(C
1-C
3烷基)
2、CN、C
3-C
7環烷基、及CN。
某些實施例中,連接子為式L(VI):
(VI)
或其對映異構物、非對映異構物、或立體異構物,其中
p1為選自0至12之整數;
p2為選自0至12之整數;
p3為選自1至6之整數;
各W分別獨立為不存在、CH
2、O、S、NH或NR
5;
Z為不存在、CH
2、O、NH或NR
5;
各R
5分別獨立為H或C
1-C
3烷基,較佳為C
1-C
3烷基;及
Q為不存在或-CH
2C(0)NH-。
其中連接子係利用鄰接Q之鍵結共價結合至化合物(該化合物會募集作為泛素化途徑一部份之蛋白質)及利用鄰接Z之鍵結共價結合至ALC1之變構抑制劑,且其中連接子之鏈原子總數少於20個。
第三態樣中,本發明係有關一種醫藥組合物,其包含ALC1之變構抑制劑及醫藥上可接受之賦形劑。
第四態樣中,本發明係有關一種ALC1抑制劑(ALC1i),較佳為本發明第一態樣之彼等ALC1抑制劑,用於治療或緩解患者之增生性疾病,其包括投與該ALC1i及可視需要投與聚(ADP-核糖)-聚合酶抑制劑(PARPi)。本發明者已發現,ALC1i可以加強已知PARPi之PARP捕捉活性。基於此驚人之協同性,由PARPi與ALC1i組合用於治療各種不同增生性疾病特別有利。此協同性不限於本發明之變構抑制劑,亦可在藉由例如:結合至ATP酶位點或藉由降低例如:siRNA所主導其在ALC1之表現來抑制ALCi之抑制劑時觀察到。
ALC1可提供給投與抗增生療法之醫師,其可與PARPi分開提供或呈部件套組提供。因此可以在組合此二者以得到ALC1協同性效益之實施例中提供說明書,指示其與PARPi組合,或者在第四態樣中,可為PARPi提供說明書,指示其與ALC1組合。
因此,
第五態樣中,本發明係有關一種用於治療或緩解患者之增生性疾病之PARPi,其中該方法包括投與該PARPi及投與ALC1i。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中, PARPi會在染色質上降低PARP活性及/或抑制PARP1、PARP2及/或PARP3,較佳為PARP2。後者現象亦稱為捕捉PARP。因此在較佳實施例中,捕捉PARP1、PARP2及/或PARP3,較佳為PARP2。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中,
(i) 降低PARP活性之PARPi係選自:小型干擾RNA,及
(ii) 抑制PARP1之PARPi係選自下列組成之群中:以下化合物
(a) 式(II)
(II)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中:
A與B共同代表視需要經取代之稠合芳香環;
X為NR
X 或CR
X R
Y ;
若X=NR
X ,則n為1或2,及若X=CR
X R
Y ,則n為l;
R
X 係選自下列組成之群中:H、視需要經取代之C
l-20烷基、C
5-20芳基、C
3-20雜環基、醯胺基、硫醯胺基、酯、醯基、及磺醯基;
R
Y 係選自:H、羥基、胺基;
或R
X 及R
Y 可共同形成螺-C
3-7環烷基或雜環基;
R
C1 及R
C2 係分別獨立選自下列組成之群中:氫及C
l-4烷基,或當X為CR
X R
Y、R
C1 、R
C2 、R
X 及R
Y 時,可與其等附接之碳原子共同形成視需要經取代之稠合芳香環;及
R
1係選自:H及鹵基;
及
(b) 式(III)
(III)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中:
Y及Z係分別獨立選自下列組成之群中:
1. 芳基,其可視需要經1、2、或3個R
6取代;
2. 雜芳基,其可視需要經1、2、或3個R
6取代;
3. 分別獨立選自下列組成之群中之取代基:氫、烯基(例如:C
2-6-烯基)、烷氧基(例如:C
1-6-烷氧基)、烷氧基烷基(例如:C
1-6-烷氧基-C
1-6-烷基)、烷氧基羰基(例如:C
1-6-烷氧基-羰基)、烷氧基羰基烷基(例如:C
1-6-烷氧基-羰基-C
1-6-烷基)、烷基(例如:C
1-6-烷基)、炔基(例如:C
2-6-炔基)、芳基烷基(例如:芳基-C
1-6-烷基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、環烷基烷基(例如:C
3-8-環烷基-C
1-6-烷基)、鹵代烷基(例如:C
1-6-鹵代烷基)、羥基伸烷基(例如:羥基-C
1-6-伸烷基)、側氧基、雜環烷基(例如:C
2-8-雜環烷基)、雜環烷基烷基(例如:C
2-8-雜環烷基-C
1-6-烷基)、烷基羰基(例如:C
1-6-烷基-羰基)、芳基羰基、雜芳基羰基、烷基磺醯基(例如:C
1-6-烷基-磺醯基)、芳基磺醯基、雜芳基磺醯基、(R
AR
B)伸烷基(例如:(R
AR
B)-C
1-6-伸烷基)、(NR
AR
B)羰基、(NR
AR
B)羰基伸烷基(例如:NR
AR
B)羰基-C
1-6-伸烷基)、(NR
AR
B)磺醯基、及(R
AR
B)磺醯基伸烷基(例如:(R
AR
B)磺醯基-C
1-6-伸烷基);
其中各R
6係選自:OH、NO
2、CN、Br、Cl、F、I、C
1-6-烷基、C
3-8-環烷基、C
2-8-雜環烷基;C
2-6-烯基、烷氧基(例如:C
1-6-烷氧基)、烷氧基烷基(例如:C
1-6-烷氧基-C
1-6-烷基)、烷氧基羰基(例如:C
1-6-烷氧基-羰基)、烷氧基羰基烷基(例如:C
1-6-烷氧基-羰基-C
1-6-烷基)、C
2-6-炔基、芳基、芳基烷基(例如:芳基-C
1-6-烷基)、C
3-8-環烷基烷基(例如:C
3-8-環烷基-C
1-6-烷基)、鹵代烷氧基(例如:C
1-6-鹵代烷氧基)、鹵代烷基(例如:C
1-6-鹵代烷基)、羥基伸烷基(例如:羥基-C
1-6-伸烷基)、側氧基、雜芳基、雜芳基烷氧基(例如:雜芳基- C
1-6-烷氧基)、雜芳基氧、雜芳基硫、雜芳基烷基硫(例如:雜芳基-C
1-6-烷基硫)、雜環烷氧基(例如:C
2-8-雜環烷氧基)、C
2-8-雜環烷基硫、雜環基氧、雜環基硫、NR
AR
B、(R
AR
B)C
1-6-伸烷基、(NR
AR
B)羰基、(R
AR
B)羰基伸烷基(例如:(R
AR
B)羰基-C
1-6-伸烷基)、(NR
AR
B)磺醯基、及(NR
AR
B)磺醯基伸烷基(例如:(NR
AR
B)磺醯基-C
1-6-伸烷基);
R
1、R
2、及R
3係分別獨立選自下列組成之群中:氫、鹵素、烯基(例如:C
2-6-烯基)、烷氧基(例如:C
1-6-烷氧基)、烷氧基羰基(例如:C
1-6-烷氧基-羰基)、烷基(例如:C
1-6-烷基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、炔基(例如:C
2-6-炔基)、氰基、鹵代烷氧基(例如:C
1-6-鹵代烷氧基)、鹵代烷基(例如:C
1-6-鹵代烷基)、羥基、羥基伸烷基(例如:羥基-C
1-6-伸烷基)、硝基、NR
AR
B、NR
AR
B伸烷基(例如:NR
AR
BC
1-6-伸烷基)、及(R
AR
B)羰基;
A及B係各分別獨立選自:氫、Br、Cl、F、I、OH、C
1-6-烷基、C
3-8-環烷基、烷氧基(例如:C
1-6-烷氧基)、烷氧基烷基(例如:C
1-6-烷氧基-C
1-6-烷基),其中 C
1-6-烷基、C
3-8-環烷基、烷氧基、烷氧基烷基可視需要經至少一個選自下列之取代基取代:OH、NO
2、CN、Br、Cl、F、I、C
1-6-烷基、及C
3-8-環烷基,其中B不為OH;
R
A、及R
B係分別獨立選自下列組成之群中:氫、烷基(例如:C
1-6-烷基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、及烷基羰基(例如:C
1-6-烷基-羰基);或RA及RB與其等所附接之原子共同形成3-10員雜環,其可視需要具有一至三個選自下列所組成群中之雜原子或雜官能基:‑O‑、‑NH、‑N(C
1‑6‑烷基)‑、‑NCO(C
1‑
6‑烷基)‑、‑N(芳基)‑、‑N(芳基‑C
1‑
6‑烷基‑)、‑N(經取代之芳基-C
1-6-烷基‑)‑、-N(雜芳基)-、-N(雜芳基-C
1-C
6-烷基-)-、‑N(經取代之雜芳基-C
1-6烷基-)-、及-S-或S(O)q-,其中 q 為1或2,及該3-10員雜環可視需要經一個或多個取代基取代;
R
4及R
5係分別獨立選自下列組成之群中:氫、烷基(例如:C
1-6-烷基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、烷氧基烷基(例如:C
1-6-烷氧基-C
1-6-烷基)、鹵代烷基(例如:C
1-6-鹵代烷基)、羥基伸烷基(例如:羥基-C
1-6-伸烷基)、及(NR
AR
B)伸烷基(例如:NR
AR
BC
1-6-伸烷基);
(iii) 抑制PARP1及PARP2之PARPi係選自下列組成之群中之化合物:
(a) 式(IV)
(IV)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中:
R
1為氫或氟;及
R
2為氫或氟;
及
(b) 式(V)
(V)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中:
R
1、R
2、及R
3係分別獨立選自下列組成之群中:氫、烯基(例如:C
1-6-烯基)、烷氧基(例如:C
1-6-烷氧基)、烷氧基羰基(例如:C
1-6-烷氧基羰基)、烷基(例如:C
1-6-烷基)、炔基(例如:C
1-6-炔基)、氰基、鹵代烷氧基(例如:C
1-6-鹵代烷氧基)、鹵代烷基(例如:C
1-6-鹵代烷基)、鹵素、羥基、羥基烷基(例如:C
1-6-羥基烷基)、硝基、NR
AR
B、及(NR
AR
B)羰基;
A為非芳香系4、5、6、7、或8-員環,其包含1或2個氮原子及視需要一個硫或氧原子,其中該非芳香環可視需要經1、2、或3個選自下列所組成群中之取代基取代:烯基(例如:C
1-6-烯基)、烷氧基(例如:C
1-6-烷氧基)、烷氧基烷基(例如:C
1-6-烷氧基-C
1-6-烷基)、烷氧基羰基(例如:C
1-6-烷氧基羰基)、烷氧基羰基烷基(例如:C
1-6-烷氧基羰基-C
1-6-烷基)、烷基(例如:C
1-6-烷基)、炔基(例如:C
1-6-炔基)、芳基、芳基烷基(例如:芳基-C
1-6-烷基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、環烷基烷基(例如:C
3-8-環烷基-C
1-6-烷基)、氰基、鹵代烷氧基(例如:C
1-6-鹵代烷氧基)、鹵代烷基(例如:C
1-6-鹵代烷基)、鹵素、雜環、雜環烷基(例如:雜環-C
1-6-烷基)、雜芳基、雜芳基烷基(例如:雜芳基-C
1-6-烷基)、羥基、羥基烷基(例如:C
1-6-羥基烷基)、硝基、NR
CR
D、(NR
CR
D)烷基(例如:(NR
CR
D)-C
1-6-烷基)、(NR
CR
D)羰基、(NR
CR
D)羰基烷基(例如:(NR
CR
D)羰基-C
1-6-烷基)、及(NR
CR
D)磺醯基;及
R
A、R
B、R
C、及R
D係分別獨立選自下列組成之群中:氫、烷基(例如:C
1-6-烷基)、及烷基羰基(例如:C
1-6-烷基羰基)。
(iv) 抑制PARP1、PARP2及PARP3之PARPi為式(VI)化合物
(VI)
及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中:
R
1為:H;鹵素;氰基;視需要經取代之烷基(例如:C
1-6-烷基)、烯基(例如:C
2-6-烯基)、炔基(例如:C
2-6-炔基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、雜環烷基(例如:C
2-8-雜環烷基)、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、及胺基、烷氧基(例如:C
1-6-烷氧基)、烷基(例如:C
1-6-烷基)、及芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、羧基、及視需要經取代之胺基與醚基(如:O-芳基));或-C(O)-R
10,其中R
10為:H;視需要經取代之烷基(例如:C
1-6-烷基)、烯基(例如:C
1-6-烯基)、炔基(例如:C
1-6-炔基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、雜環烷基(例如:C
2-8-雜環烷基)、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、胺基、及烷基(例如:C
1-6-烷基)及芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵基、羥基、硝基、及胺基);或OR
100或NR
100R
110,其中R
100及R
110各分別獨立為H或視需要經取代之烷基(例如:C
1-6-烷基)、烯基(例如:C
2-6-烯基)、炔基(例如:C
2-6-炔基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、雜環烷基(例如:C
2-8-雜環烷基)、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:烷基(例如:C
1-6-烷基)、烯基(例如:C
2-6-烯基)、炔基(例如:C
2-6-炔基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、雜環烷基(例如:C
2-8-雜環烷基)、芳基、及雜芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、胺基、及烷基(例如:C
1-6-烷基)及芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、及視需要經取代之胺基);
R
2為H或烷基(例如:C
1-6-烷基);
R
3為H或烷基(例如:C
1-6-烷基);
R
4為H、鹵素或烷基(例如:C
1-6-烷基);
X 為O或S;
Y 為(CR
5R
6)(CR
7R
8)
n或N-C(R
5),其中
n 為0或1;
R
5及R
6各分別獨立為H或視需要經取代之烷基(例如:C
1-6-烷基)、烯基(例如:C
2-6-烯基)、炔基(例如:C
2-6-炔基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、雜環烷基(例如:C
2-8-雜環烷基)、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、胺基、及低碳數烷基(例如:C
1-4-烷基)、低碳數烷氧基(例如:C
1-4-烷氧基)、或芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、及胺基);及
R
7及R
8各分別獨立為H或視需要經取代之烷基(例如:C
1-6-烷基)、烯基(例如:C
2-6-烯基)、炔基(例如:C
2-6-炔基)、環烷基(例如:C
3-8-環烷基)、雜環烷基(例如:C
2-8-雜環烷基)、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、胺基、及低碳數烷基(例如:C
1-4-烷基)、低碳數烷氧基(例如:C
1-4-烷氧基)、及芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、及胺基);
其中當R
1、R
4、R
5、R
6、及R
7分別為H時,R
8不是未經取代之苯基。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中,PARPi係選自下列組成之群中:奧拉帕尼(Olaparib)、他拉唑帕尼(Talazoparib)、尼拉帕尼(Niraparib)、魯卡帕尼(Rucaparib)、及維利帕尼(Veliparib),特定言之,維利帕尼(Veliparib)、奧拉帕尼(Olaparib)、及他拉唑帕尼(Talazoparib)。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中,ALC1i為ALC1之ATP酶活性之直接抑制劑,或為ALC1之變構抑制劑。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中,ALC1i為本發明任何第一態樣或另一態樣之ALC1之抑制劑或第二態樣之雙功能化合物。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中,該增生性疾病係選自:BRCA1及/或2-缺陷腫瘤,係其中PARP1、PARP2、PARP3及/或ALC1之表現比非腫瘤細胞之腫瘤提高。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中,該腫瘤疾病係選自:肝細胞癌瘤、乳癌、卵巢癌、攝護腺癌、及結腸直腸癌。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中,(i)ALC1i會加強PARPi殺死癌細胞之效力,(ii)減少PARPi之投藥量,及/或(iii)避開PARPi抗性。
本發明第四態樣所使用之ALC1i或本發明第五態樣所使用之PARPi之較佳實施例中,PARPi係與ALC1i同時或分開投與。
第六態樣中,本發明係有關一種部件套組,其包含分開包裝之PARPi與ALC1i,或包含PARPi與ALC1i之組合物,較佳係附有用於治療或緩解增生性疾病之說明書。
實驗章節 所採用之細胞株
實例內容中使用之較佳細胞株為稱為U2OS之骨肉瘤細胞株。該U2OS細胞株為J. Ponten及E. Saksela在1964年從15歲女性白種人之中度分化的脛骨肉瘤所建立之人類癌細胞株(U-2 OS ATCC ® HTB-96
TM智人(Homo sapien)骨肉瘤,2016)。其可從許多來源取得,包括ATCC® HTB-96®。
採用MDA-MB-231細胞作為BRCA野生型細胞株。該細胞係從非整倍體女性人類建立。該細胞係在轉移部位的乳腺(乳房),從胸水中抽出。(MDA-MB-231)(ATCC® HTB-26™智人上皮乳腺)。其可從許多來源取得,包括ATCC® HTB-26™。
採用SUM-149-PT細胞作為BRCA陰性細胞株。該細胞株為三陰性乳癌(TNBC)細胞株,來自40歲女性,衍生自初代人類侵襲性乳管癌瘤轉移性結核。其包含半合子BRCA1突變(p.Pro724Leufs*12),且可從許多來源取得,包括bioIVT。
PARP-2 捕捉:
取U2OS細胞接種在4-孔Nunc Lab-Tek槽(Thermo Fisher Scientific)之正常DMEM中。細胞於37°C下培養過夜,使用脂染胺(Lipofectamine),經過帶有GFP標籤之PARP2質體轉染。轉染24h後,細胞使用裝備 sCMOS ORCA Flash 4.0相機(Hamamatsu)之Zeiss AxioObserver Z1轉盤式共聚焦顯微鏡造影。活細胞造影實驗係使用C-Apo 63×浸水式接物鏡進行。此期間,細胞在37°C及沒有CO
2下,維持在補充10% FBS之雷氏(Leibovitz)L-15培養基(Gibco)中。選拔具有類似轉基因表現程度之細胞,對PARP-2之捕捉進行造影及分析。以88像素之直線誘發DNA損傷,其係透過單點掃瞄頭操作20%雷射功率之355 nm雷射(UGA-42 firefly, Rapp OptoElectronics)曝光400 msec。活細胞PARP-2捕捉分析之圖解示於圖4。
追蹤累積在雷射微束輻射位點之帶有螢光團標籤之蛋白質15-30分鐘。使用所指定抑制劑濃度,在37°C下處理該細胞1小時後,才進行實驗分析。作為對照組之細胞則接受對應濃度之DMSO處理。採用在Fiji/ImageJ訂製之巨集,定量累積在微束輻射位點之帶有螢光團標籤之蛋白質。選拔所關注之損傷區,測定核之平均螢光強度,並扣除背景訊號。利用下列公式計算募集度:(損傷區(t) – 背景訊號 (t)) / (核強度 (t) – 背景 (t))
抑制劑相對於反應 ( 細胞存活性 ) 分析法
驗證小分子抑制劑時,採用MDA-MB-231細胞作為BRCA野生型細胞株及採用SUM-149-PT作為BRCA1缺陷細胞株,分析BRCA及ALC1之合成性致死。取細胞接種在96-孔盤(5000個細胞/孔)中,使用ALC1抑制劑,從50 µM開始滴定處理。作為對照之「無處理組」,則添加DMSO至細胞中。細胞於37°C及CO
25%下培養5天,直到使用10%TCA固定1h為止,使用磺醯羅丹明(sulforhodamine)染劑染色30分鐘。使用1%乙酸洗滌細胞後,使用10 mM Tris (pH 10.5)溶液溶解已染色之細胞。使用SUNRISE TECAN,量測492 nm之吸光度,數據經過零時間點之細胞數及100%存活性(=DMSO對照組)校正,採用GraphPad Prism分析。採用「抑制劑相對於反應之可變斜率曲線(四參數)」擬合存活曲線。ALC1抑制劑處理之IC50值示於圖8。
採用群落形成分析法進一步驗證化合物。此時,減少細胞接種量進行分析(100個細胞/孔)。使用ALC1抑制劑或PARPi與ALC1抑制劑之組合處理細胞11天。固定細胞,如上述分析數據。ALC1抑制劑之處理結果示於圖8及9。
基於 FRET 之核小體滑動分析法
本分析法係採用中間位置之單核小體,其可以採用FRET測定儀監測ALC1重塑酵素之滑動活性。在各核小體上標記兩種FRET染劑:在八聚體上標記Cy5 (與H2B偶聯之Cy5-馬來醯亞胺)及在其中一個DNA末端標記Cy3。DNA模板包括147 bp 601 DNA定位序列,每一邊側接DNA突出段。其他核小體定位序列(包括人造構築體及天然發生的序列),即使在定位核小體上之效力低於該601序列,亦可使用。核小體係利用鹽梯度透析,使用純化之Cy5-標記組蛋白八聚體及純化之Cy3-標記DNA模板組裝,產生FRET-標記中間位置核小體。此等核小體將從低FRET開始,當受到Cy3最大激發波長激發時,具有低的Cy5螢光,因為兩個螢光團分隔太遠不利於有效率的FRET。由於進行ALC1重塑反應,且重塑酵素將八聚體滑向DNA末端,縮短兩個FRET染劑之間距離,使來自Cy5/FRET之訊號上升。因此,可直接採用升高之FRET作為滑動的結果。
構築DNA模板以供重構單核小體
重構單核小體時,採用非天然Widom 601核小體定位序列作為組蛋白八聚體之高親和性結合位點(參見Lowary, P. T. & Widom, J. New DNA sequence rules for high affinity binding to histone octamer and sequence-directed nucleosome positioning.
J. Mol. Biol. 276, 19–42 (1998))。可構築包含此等601序列之Cy3-標記DNA所使用之方法包括PCR擴增,限制酶消解DNA質體後,進行克倫(Klenow)末端標記反應或其他標準分子生物技術。
ALC1及組蛋白八聚體之製備
全長度人類 ALC1 (1-897)或其截短型係依先前公開之方式(Singh, H.R.,等人,2017),從大腸桿菌(
E. coli)表現及純化出N-末端 6 × His-標籤融合蛋白質。
人類組蛋白蛋白質係於大腸桿菌(
E.coli)中重組表現(使用典型IPTG誘導法或使用自動誘導培養基)及從大腸桿菌包涵體中純化。純化程序包括使用鹽酸胍,從包涵體中萃取/溶解組蛋白,然後經過逆相層析法。純化之組蛋白經過凍乾,產生純化組蛋白蛋白質之TFA-鹽。
核小體之製備
為了組裝核小體,取模板DNA(250 μg/ml終濃度)與純化之組蛋白八聚體於高鹽緩衝液中,依不同莫耳比例之組蛋白八聚體:DNA混合。此混合物在4°C下,相對於低鹽緩衝液進行連續透析後,使離子強度降至< 600 mM NaCl。最後,該材料相對於TEA-20 (10 mM 三乙醇胺-Cl pH 7.5,20 mM NaCl,0.1 mM EDTA)透析。選拔最佳莫耳比例,亦即讓DNA完全組裝進入核小體中之比例,並用於進一步組裝。
或者,可以採用其他方法組裝核小體,如:採用聚麩胺酸或組蛋白伴護蛋白,或採用鹽分段稀釋法,讓組蛋白八聚體沉積在DNA上。
量測ALC1所介導滑動之方法;ALC1核小體滑動分析法
滑動反應係在384孔盤中,於室溫下,於10 mM Tris-HCl,pH 8.1、75 mM KCl、1 mM MgCl
2、1.0 mM EGTA、10%甘油、0.5 mM 二硫蘇糖醇(DTT)、0.01% TritonX100、0.02%NP40及包含中間位置核小體、三-ADP核糖或(ADP-核糖)
n及ALC1染色質重塑酵素之反應混合物中進行。添加ATP開始滑動,然後分析盤於1450 rpm下振盪5 sec,並使用容許讀取螢光之箔紙密封。立即採用螢光計(BMG reader PheraStar FSX,頻道A:激發光520 nm,發射光680 nm;頻道B:激發光520 nm,發射光590 nm)記錄FRET訊號,除非另有其他說明,否則進行重塑30 min。
FRET訊號之計算法係由680 nm之訊號(Cy5之發射光)除以590 nm之訊號(Cy3之發射光),再乘以10,000。為了測得ALC1-介導核小體滑動之表觀速率,以升高之FRET為函數,隨時間作圖,並由所得之運動力學軌跡代入擬合之線性曲線,得到ALC1-介導核小體滑動之初速率。
調控ALC1-介導滑動之分子之高通量篩選(HTS)及IC50測定法
調控ALC1滑動活性之化合物之高通量篩選(HTS)及IC50測定法係如上述說明,由核小體先與ALC1及三ADP-核糖或(ADP-核糖)
n於推斷之ALCi之存在下培養30 min後,添加ATP來啟動滑動。然後如上述測定滑動速率(初速率),並與沒有推斷之調控劑/化合物存在下之滑動速率比較(抑制%)。測定IC
50時,採用GraphPad Prism,由觀測之抑制%(y-軸)相對於化合物濃度(x-軸)作圖,並利用非線性迴歸模型擬合(四參數)。
ALC1 抑制劑之電腦模擬建模
為了判別ALC1之小分子抑制劑之結合袋,建立ALC1解旋酶結構域之同源模型,用於模擬分子對接及分子動力學
製備用於分子對接(molecular docking)及柔性對接(flexible docking)之同源模型及所有配體,然後在Intel(R) Xeon(R) Platinum 8268 CPU @ 2.90GHz cpu上進行同源建模,選擇ALCi-22進行MD模擬,因為其在生化滑動分析法及對接位姿中具有低IC50,該位姿係在過去在ATP酶結構域內但不在ATP結合位點本身未曾判別出之袋中。隨後在NVIDIA Tesla V100-SXM2-32gb GPU上啟動MD。MD模擬完成後,從軌跡中取出每第10幀(frame)。此等幀再與初始位姿比對,並進行PCA。採用最前面兩個主成份產生PCA之圖。手動判別8個簇集蛋白質構形。抽出接近各簇集中心之隨機點作為PDB檔案。手動檢查此等幀,最後選出幀編號 33449405用於圖示中,因為該配位體接近ALC1 ATP結合位點之催化殘基,而且因為其佔據過去未曾說明之結合袋。此袋係由下列人類ALC1之胺基酸構成:L101、Y153、C156、L157、A160、L163、K164、V173、D174、E175、A176、H177、R178、L179、S183、L186、H187、T189、L190、F193、L200、L201、T202、N208、S209、E212、L213、L216、F219。
ALC1 抑制劑之 SAR 分析法
檢視生化及細胞數據,出現數種與配體之結構及活性相關之顯著傾向。配體之「尾」清楚顯示長的疏水性附接最好係利用末端環戊烷(ALCi-123相對於ALCi-125)或不利用(ALCi-4相對於ALCi-2、相對於ALCi-1、相對於ALCi-22)。此外,「尾」區之親水性取代基係極為不利(ALCi-135)。此點符合建模位姿,其顯示分子之「尾」位在結合袋之高疏水區(圖14及15)。考慮到吡啶環時,其顯示在N反側之CF
3取代比CF
2H取代有利(ALCi-8相對於ALCi-4),但噻吩環比CF
3有利(ALCi-4相對於ALCi-56)。此點再度由建模位姿完整解釋,其顯示分子的此區再度與結合袋之高疏水區交互作用(圖14及15)。此外,在抑制劑之「頭」區,具有較多親水性取代基之分子比彼等較少者有利(ALCi-6相對於ALCi-72)。此外,當「頭」區之羧酸被取代時,其顯示可達到最高效力(ALCi-132),預測其與ARG135及可能與ASN 165直接交互作用(圖19)。事實上,其顯示與ARG165之交互作用可能對抑制或結合很重要,因為在頭區缺少對應親水性基團之ALCi-31、ALCi-32、ALCi-33、及ALCi-34均沒有活性(未出示數據)。總括而言,化合物之SAR顯然支持電腦模擬建模在新穎結合袋中預測之結合位點。
所選擇 ALC1 抑制劑之合成法
ALCi-72之合成法始於1-(4-溴苯基)乙-1-酮與2,2,2-三氟乙酸乙酯之間之羥醛縮合(Aldol condensation),其使用LiHMDS作為鹼,於THF中,於-78°C至室溫下進行16小時,產生1-(4-溴苯基)-4,4,4-三氟丁烷-1,3-二酮(參見圖22,R = Br)。此產物隨後參與形成吡啶,係與2-氰基乙硫醯胺,於乙酸及乙醇中,於回流下,產生6-(4-溴苯基)-2-亞硫烷基-4-(三氟甲基)-2,3-二氫吡啶-3-甲腈。步驟3中,由6-(4-溴苯基)-2-亞硫烷基-4-(三氟甲基)-2,3-二氫吡啶-3-甲腈與2-氯乙酸乙酯進行環化成噻吩并吡啶,其係使用碳酸鈉作為鹼,於乙醇中,於回流條件下12小時,產生3-胺基-6-(4-溴苯基)-4-(三氟甲基)噻吩并[2,3-b]吡啶-2-羧酸乙酯。最後於步驟5中,由3-胺基-6-(4-溴苯基)-4-(三氟甲基)噻吩并[2,3-b]吡啶-2-羧酸乙酯形成脲及環化成終產物,ALCi-72,其係利用ClSO
2NCO,分別於回流下之DCM及水中,然後於回流下之氫氧化鈉中6小時。
ALCi-117合成法始於1-(4-丁氧基苯基)乙-1-酮與2,2,2-三氟乙酸乙酯之間之羥醛縮合,其係使用NaH作為鹼,於THF中,於0°C至室溫下16小時,產生1-(4-丁氧基苯基)-4,4,4-三氟丁烷-1,3-二酮。此產物隨後參與形成吡啶,係與2-氰基乙硫醯胺,於乙酸及乙醇中,產生6-(4-丁氧基苯基)-2-硫烷基-4-(三氟甲基)吡啶-3-甲腈。步驟3中,由6-(4-丁氧基苯基)-2-硫烷基-4-(三氟甲基)吡啶-3-甲腈與2-氯乙酸乙酯進行環化成噻吩并吡啶,其係使用碳酸鈉作為鹼,於乙醇中,於回流條件下,產生3-胺基-6-(4-丁氧基苯基)-4-(三氟甲基)噻吩并[2,3-b]吡啶-2-羧酸乙酯。步驟4為與3-胺基-6-(4-丁氧基苯基)-4-(三氟甲基)噻吩并[2,3-b]吡啶-2-羧酸乙酯之山德邁耳反應(Sandmeyer reaction),產生3-溴-6-(4-丁氧基苯基)-4-(三氟甲基)噻吩并[2,3-b]吡啶-2-羧酸乙酯。隨後由3-溴-6-(4-丁氧基苯基)-4-(三氟甲基)噻吩并[2,3-b]吡啶-2-羧酸乙酯與CH
3BF
3-K+、Cs
2CO
3、Pd(dppf)Cl
2、DCM、及二㗁烷於150°C下,於鈴木偶合反應(Suzuki coupling reaction)下培養30分鐘,產生6-(4-丁氧基苯基)-3-甲基-4-(三氟甲基)噻吩并[2,3-b]吡啶-2-羧酸乙酯。最後步驟6為使用氫氧化鈉水解6-(4-丁氧基苯基)-3-甲基-4-(三氟甲基)噻吩并[2,3-b]吡啶-2-羧酸乙酯,產生產物ALCi-117。
ALCi-132合成法始於合成供最後步驟使用之中間物4-[(4-氯苯基)甲氧基]-3-甲氧基苯甲醛,其係在4-羥基-3-甲氧基苯甲醛與1-(溴甲基)-4-氯苯之間,經由1-(溴甲基)-4-氯苯,於回流條件下,使用丙酮與碳酸鉀。該合成法步驟1為形成噻吩,係使用3-側氧基丁酸乙酯、2-氰基乙酸乙酯及S8,於乙醇及Et
2NH中,形成5-胺基-3-甲基噻吩-2,4-二羧酸2,4-二乙酯。5-胺基-3-甲基噻吩-2,4-二羧酸2,4-二乙酯基隨後參與形成醯胺,其係與氧雜環戊烷-2,5-二酮,於醚、苯與二㗁烷之混合物中,於室溫下,形成3-{[3-胺甲醯基-5-(乙氧基羰基)-4-甲基噻吩-2-基]胺甲醯基}丙酸。步驟3中,由3-{[3-胺甲醯基-5-(乙氧基羰基)-4-甲基噻吩-2-基]胺甲醯基}丙酸進行施特格利希酯化(Steglich esterification),形成4-胺甲醯基-5-(4-甲氧基-4-側氧基丁烷醯胺基)-3-甲基噻吩-2-羧酸乙酯。4-胺甲醯基-5-(4-甲氧基-4-側氧基丁烷醯胺基)-3-甲基噻吩-2-羧酸乙酯接著進行Zn(BH
4)
2還原反應,形成4-胺甲醯基-5-(4-羥基丁烷醯胺基)-3-甲基噻吩-2-羧酸乙酯,其接著使用氫氧化鈉,於回流條件下環化 16小時,形成2-(3-羥基丙基)-5-甲基-4-側氧基-4H,4aH-噻吩并[2,3-d]嘧啶-6-羧酸。2-(3-羥基丙基)-5-甲基-4-側氧基-4H,4aH-噻吩并[2,3-d]嘧啶-6-羧酸係接著使用EtOH與H
2SO
4,於回流下酯化16小時,產生2-(3-羥基丙基)-5-甲基-4-側氧基-4H,4aH-噻吩并[2,3-d]嘧啶-6-羧酸乙酯。於室溫下,利用光延反應(Mitsunobu reaction),轉化2-(3-羥基丙基)-5-甲基-4-側氧基-4H,4aH-噻吩并[2,3-d]嘧啶-6-羧酸乙酯形成4-甲基-2-側氧基-6-硫雜-1λ⁴,8-二氮雜雙環[7.3.0.0³,⁷]十二-1(9),4,7-三烯-5-羧酸乙酯,其最後與中間物4-[(4-氯苯基)甲氧基]-3-甲氧基苯甲醛,使用Ac
2O,於回流下進行羥醛縮合,產生ALCi-132。
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˙ Zimmermann, M., Murina, O., Reijns, M. A. M., Agathanggelou, A., Challis, R., Tarnauskaitė, Ž. ė., Muir, M., Fluteau, A., Aregger, M., McEwan, A., Yuan, W., Clarke, M., Lambros, M. B., Paneesha, S., Moss, P., Chandrashekhar, M., Angers, S., Moffat, J., Brunton, V. G., … Durocher, D. (2018). CRISPR screens identify genomic ribonucleotides as a source of PARP-trapping lesions. Nature, 559(7713), 285–289. https://doi.org/10.1038/s41586-018-0291-z
˙ von Itzstein M, Wu WY, Kok GB, Pegg MS, Dyason JC, Jin B, Van Phan T, Smythe ML, White HF, Oliver SW, et al. Rational design of potent sialidase-based inhibitors of influenza virus replication. Nature 1993;363:418–423.
無
下文說明本說明書所涵括圖示之內容。本內容亦指上文及/或下文之本發明詳細說明。
圖 1 : PARPi 對 DNA 修復途徑之細胞毒性機轉造成 PARP 捕捉。上圖途徑出示經由DNA複製叉損傷干擾單股斷裂(SSB)之DNA修復,經由同源重組(HR)機轉造成修復。下圖途徑出示利用額外修復途徑,包括范可尼(Fanconi)途徑(FA)、模板轉換(TS)、ATM、FEN1(複製側翼核酸內切酶)及DNA聚合酶β,在損傷之DNA上捕捉PARP1/2蛋白質,造成複製叉損傷(Murai等人,2012, S. 5591)。
圖 2 :染色質重塑因子 ALC1(CHD1L) 經常於人類卵巢及乳癌樣本中與 PARP1 基因共同擴增。ALC1 (CHD1L)、PARP1、PARP2、BRCA1、BRCA2及最相關之染色質重塑因子CHD1在10792位乳房、輸卵管及卵巢癌症患者之基因體中之基因體變化(於08/12/2020在cBioPortal進行之OncoPrin分析 - www.cbioportal.org)。百分比數值指示所有基因體中,特定基因之變化百分比,其中已剖析特異基因之型態。已標示基因擴增(
黑色)、深度基因缺失(
深黑色)。相較於CHD1,ALC1經常與PARP1一起擴增(ALC1- PARP1:勝算比(OR)=1.581,q-值=<0.001;CHD1-PARP1: OR=-0.125,q- 值=0.250)。當BRCA1或BRCA2腫瘤抑制子基因具有深度缺失或突變時,不論ALC1或PARP1均沒有深度缺失或經常突變(ALC1-BRCA1/2:OR=<-3/-2.178,q-值=<0.001;PARP1-BRCA1/2:OR=<-3,q-值=<0.001)。
圖 3 :在 U2OS 細胞中雷射微束輻射位點之 GFP-PARP2 關聯性。U2OS細胞經過PARPi 維利帕尼(Veliparib) (10 µM)及他拉唑帕尼(Talazoparib) (100 nM)處理,及經過GFP-PARP2轉染。灰色訊號指示核中之PARP2。亮光直線顯示PARP2募集至雷射微束輻射損傷位點。該等影像係在輻射後1分鐘及15分鐘取得之影像。經過他拉唑帕尼處理時,顯示PARP2加強滯留在誘發之損傷位點(「捕捉PARP」),而經過維利帕尼處理時,造成較少PARP2募集至損傷位點。
圖 4 :活細胞之 PARP 捕捉分析法之圖解。細胞核經過355nm波長雷射進行微束輻射,以誘發DNA損傷(由左邊細胞黑色長條表示)。接著取得細胞在15分鐘期間的影像。灰色長條顯示PARP1/2募集至所誘發之DNA損傷位點(中間的細胞)。A) PARP2之訊號隨時間下降,表示PARP1/2滯留減少,B) PARP2延長滯留,活細胞影像對應地顯示分子在所誘發之DNA損傷位點捕捉PARP2。
圖 5 :經過 ALCi-9 處理後之 PARP2 相對募集至 DNA 損傷位點。野生型U2OS細胞經過GFP-PARP2穩定轉染。在化合物ALCi-9之存在及不存在下,以30分鐘時間,量測GFP-PARP2募集至DNA損傷處及從DNA損傷處解離之運動力學。經過ALCi-9處理時,相較於DMSO組,PARP2顯示加強滯留在DNA損傷位點。在1個生物重覆中分析9個細胞核。數據係以平均值+S.E.M出示,經過微束輻射位點之損傷前GFP強度校正。
圖 6 :經過 ALCi-9 處理後之 PARP2 相對募集至 DNA 損傷位點。野生型U2OS細胞經過GFP-PARP2穩定轉染。在化合物ALCi-9之存在及不存在下,以30分鐘時間,量測GFP-PARP2募集至DNA損傷處及從DNA損傷處解離之運動力學。上圖細胞核係經過DMSO處理,下圖細胞核係經過ALCi-9 (10 µM)處理1h。時間點0 min.表示微束輻射前之細胞核,時間點1 min.及30 min.表示輻射後之細胞核。經過ALCi-9處理,相較於DMSO組,顯示在DNA損傷位點之PARP2-捕捉。
圖 7 :在經過 ALCi-9 及 PARPi 維利帕尼共同處理後之 PARP2 捕捉。野生型U2OS細胞經過GFP-PARP2穩定轉染。在維利帕尼、化合物ALCi-9或此二者之組合之存在及不存在下,以30分鐘時間,量測GFP-PARP2募集至DNA損傷處及從DNA損傷處解離之運動力學。在1個生物重覆中分析4-11個細胞核。數據係以平均值+S.E.M出示,經過微束輻射位點之損傷前GFP強度校正。
圖 8 :經過 ALCi 處理之 BRCA 陽性及 BRCA 陰性細胞之群落形成分析。取MDA-MB-231細胞(BRCA1/2野生型)及SUM-149-PT細胞(BRCA1陰性)接種在96-孔盤中,使用不同ALCi之力價,從50 µM開始處理。細胞在37°C、CO
25%下培養11天,使用10%TCA固定,及使用磺醯羅丹明(sulforhodamine)染料染色,以分析存活細胞。數據經過代表100%存活之DMSO對照組校正。採用GraphPad Prism,以可變斜率擬合抑制劑相對於反應之曲線(四個參數)。長條係出示兩個技術重覆之誤差。
圖 9 : BRCA 陰性細胞經過 PARPi 共同處理群落形成分析法。 取SUM-149-PT細胞(BRCA1陰性)接種在96-孔盤中,使用不同ALCi之濃度及力價,從50 µM開始處理。細胞在37°C、CO
25%下培養11天,使用10%TCA固定,及使用磺醯羅丹明染料染色,以分析存活細胞。上圖出示SUM-149-PT細胞之存活曲線。黑色曲線指示ALCi-x與PARPi-y之共同處理。使用ALCi-132及ALCi-74處理顯示比僅使用維利帕尼或僅使用ALCi時加強殺死細胞。維利帕尼與ALCi-x在長條圖的某些濃度下顯示協同性。此時,僅經過維利帕尼處理、僅經過ALCi-x處理、及共同處理之對照生長(%)係以灰色表示。
圖
10
:
ALC1
抑制劑之結構及相關化合物代碼。
圖 11 :核小體重塑抑制性。ALC1抑制劑在基於FRET之核小體重塑分析法中之IC
50(µM)。IC
50值係以下列符號表示:+++:IC
50< 25µM;++:IC
50= 25-250µM;+ :IC
50> 250µM;及「-」:該化合物無活性(針對SAR之目的)。
圖 12 :細胞增生抑制性。ALC1抑制劑在5天之細胞增生分析法中,基於SRB讀數之 EC50 (µM)。EC
50值係以下列符號表示: +++:EC
50< 10µM;++:EC
50= 10-50µM;+:EC
50> 50µM;及「-」: 該化合物無活性。
圖 13 :ALC1解旋酶結構域第一葉之剖視圖(Surface Cutaway), 以「正面」
(A)及「背面」
(B)方向出示新判別之變構結合袋。ATP結合位點係以黑色圓圈表示。
圖 14 :ALC1解旋酶結構域第一葉之剖視圖,依據疏水性著色的區域係以「正面」
(A)及「背面」
(B)方向顯示。顏色越深表示親水性越高。
圖 15 :ALCi-22之ALC1解旋酶結構域第一葉之剖視圖,依據疏水性著色的區域係以「正面」
(A)及「背面」
(B)方向顯示。顏色越深表示親水性越高。
圖 16 :ALC1解旋酶結構域第一葉之剖視圖,以「正面」
(A)及「背面」
(B)方向,以白色顯示配位體ALCi-22之凡得瓦表面(Van der Waals surface)。
圖 17 :ALC1解旋酶結構域第一葉之剖視圖,以「正面」
(A)及「背面」
(B)方向,以白色出示配位體ALCi-22之球棍模型。
圖 18 :與ALC1之解旋酶結構域第一葉中變構位點結合之ALCi-22之Ligplot圖形。
圖 19 :ALC1解旋酶結構域第一葉之剖視圖,以「正面」方向,以白色顯示配位體ALCi-22,以黑虛線顯示與ASN165及ARG135之特異性交互作用。
圖 20 :ALC1之新穎變構袋之PDB檔。跨越根據SEQ ID NO:1之ALC1胺基酸101至219之胺基酸延伸段中所包含人類ALC1之變構結合袋表面上胺基酸之關鍵原子之結構配位。本發明變構ALC1抑制劑會與其中一個或多個關鍵原子交互作用,以便特異性結合至此袋。已採用swissmodel,利用同源建模來決定人類ALC1之袋結構。所出示之殘基為再現對接結果所必需之最小一組胺基酸,其係先使用swissmodel ,於較大之ALC1同源模型中執行。明確言之,在初次對接實驗中使用該swissmodel模型。選擇此袋的原因為其接近ATP結合位點及其新穎性。需要此等胺基酸來形成袋並可以對接,並可以比使用整個蛋白質時更快運算。
圖 21 :包含所採用每一種抑制劑之供應商之列表
。
圖 22 :根據式I抑制劑之一般合成反應圖。
圖 23 :包含基於FRET之核小體滑動分析法,每一種抑制劑在化合物濃度250µM下之ALC1抑制百分比。有些化合物由於溶解度問題必需低於250 µM之濃度,其等將示於表底下之說明。
無
Claims (15)
- 一種染色質結構域-解旋酶-DNA-結合性蛋白質1-樣(ALC1)之變構抑制劑,其中該抑制劑特異性結合至由跨越SEQ ID NO:1胺基酸殘基101至219之胺基酸延伸段形成之變構結合袋(pocket)。
- 如請求項1之ALC1之變構抑制劑,其中變構結合袋包含以下或由以下組成:SEQ ID NO:1之L101、Y153、C156、L157、A160、L163、K164、V173、D174、E175、A176、H177、R178、L179、S183、L186、H187、T189、L190、F193、L200、L201、T202、N208、S209、E212、L213、L216、及F219,較佳為包含以下或由以下組成:SEQ ID NO:1之Y153、C156、L157、A160、L163、V173、E175、R178、L186、H187、L190 F 193、L200、及E212。
- 如請求項1或2之ALC1之變構抑制劑,其中該抑制劑與變構結合袋之一個或多個胺基酸,較佳為與一個或多個胺基酸L157、A160、K164、V173、D174、H177、R178、L179、L186、N208、及/或E212之主幹及/或L101、Y153、C156、L157、A160、L163、E175、R178、L179、L186、H187、L190、F193、T202、N208、E212、及/或L213之側鏈,更佳為與D174、 H177、及R178之主幹及Y153、E175、R178、H187、T202、N208及E212之側鏈形成非共價鍵,較佳為該抑制劑係非共價結合至: (i) Y153側鏈之芳香環,其係與芳香系碳環或雜環取代基之環面-面或端-面π-π交互作用,或與極性、帶電荷、或碳-鹵素取代基形成陽離子-π、極性-π、或鹵素-π交互作用; (ii) Y153側鏈之末端氧,其利用提供氫鍵之基團; (iii) H177主幹之羰基氧,其利用提供碳-鹵鍵或氫鍵之基團; (iv) D174主幹之羰基氧,其利用提供碳-鹵鍵或氫鍵之基團; (v) E175之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團; (vi) R178之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團; (vii) R178主幹之羰基氧,其利用提供碳-鹵鍵或氫鍵之基團; (viii) H187之側鏈,其係與芳香系碳環或雜環取代基之環面-面或端-面π-π交互作用,或與極性、帶電荷、或碳-鹵素取代基形成陽離子-π、極性-π、或鹵素-π交互作用,或利用提供或接受氫鍵之基團; (ix) T202之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團; (x) N208之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團;及 (xi) E212之側鏈,其利用提供或接受氫鍵之基團。
- 如請求項3之ALC1之抑制劑,其中變構抑制劑具有式(I)結構式: 其中 (i) R 5包含芳香環,其與Y153之芳香環進行π-堆積;及/或 (ii) N為Y153末端OH之接受氫鍵之基團;及/或 (iii) R 1包含對H177主幹羰基氧提供氫鍵之基團;及/或 (iv) R 3包含與D174主幹之羰基氧結合之提供碳-鹵鍵或氫鍵之基團;及/或 (v) R 1及R 2共同形成芳香系或雜芳香系單環,其包含提供或接受氫鍵之基團,尤其位在或鄰接R 1位置,其作用在於作為對E175及/或R178之側鏈提供或接受氫鍵之基團;及/或 (vi) R 1及R 2共同形成經取代之碳單環或雜單環,其包含提供或接受氫鍵之基團,較佳為位在或鄰接R 1位置,其為對R178側鏈提供或接受氫鍵之基團;及/或 (vii) R 3包含芳香環,其與H187之芳香環進行π-堆積或為缺電子取代基,尤其位在會與H187之芳香環形成極性-π或陽離子-π交互作用; (viii) R 1及R 2共同形成芳香系或雜芳香系單環,其包含提供或接受氫鍵之基團,尤其位在或鄰接R 2位置,其作用在於作為對T202及/或N208之側鏈提供或接受氫鍵之基團; (ix) R 4為H或-C 1-3-烷基,較佳為H;及/或 (x) R 5為‑(CH 2) m-L、或-(CH 2) m-(CH=CH)-L,其中m為0、1或2,較佳為0或1,及L為5、6或7員碳環或雜環、或金剛烷基,其可視需要經取代,較佳為經1、2、3或4個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO 2、‑CN、‑CO‑OR 6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R 9、-O-R 9、及=O,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環;及/或 (xi) R 4及R 5共同形成5、6、或7員碳環,其可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO 2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、-O-R 9、‑R 9、=CH-R A,較佳為R 4及R 5共同形成C 5-7-環烷基;及/或 (xii) X為S或N;及/或 (xiii) A為N或C。
- 如請求項1至4中任一項之ALC1之變構抑制劑,其中該變構抑制劑具有式(I)之結構: (I) 及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥,其中: X 為N或S; A 為C或N; R 1為–CO-OR 6、-CO-R 7、或-CO-NR 6R A,較佳係R 1為-CO-OR 6; R 2為-R 7、-NHR 8、-O-R 7、-C-O-R 7、Br、-C 3‑8‑環烷基(較佳為環丙基)、或-C 4‑8‑環烯基(較佳為環己烯基); 或 R 1及R 2共同形成5、6或7員碳環或雜環,可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO 2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O-C 1-3-烷基、=O、[-O-CH 2-CH 2]-NH-CH(OH)-O-tBu; R 3為H、=O、-OH、-O-R 7、-R 7、或-(CH 2) m-L,其中m為0、1或2,及L為5、6或7員碳環或雜環,可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO 2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑O‑C 1‑3‑烷基、-羥基C 1‑3‑烷基及=O; R 4為H或-C 1-3-烷基,較佳為H; R 5為-(CH 2) m-L、或-(CH 2) m-(CH=CH)-L,其中m為0、1或2,較佳為0或1,及L為5、6或7員碳環或雜環、金剛烷基、C 1‑4‑烷基、或-N(CH 3) 2,可視需要經取代,較佳為經1、2、3或4個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO 2、‑CN、‑CO‑OR 6、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R 9、-O-R 9、=O、及[-O-CH 2-CH 2] q-NH-生物素,其中q為1、2、3、或4,或兩個相鄰取代基形成5、6或7員碳環或雜環; 或 R 4及R 5共同形成5、6、或7員碳環,可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO 2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、-O-R 9、‑R 9、=CH-R A、及–CH 2-R A,較佳為R 4及R 5共同形成C 5-7-環烷基; R 6為H、-C 1-6-烷基、-C 2-6-烯基、-C 2-6-炔基,可視需要經取代,較佳係R 6為H; R 7為-C 1-3-烷基、-C 2-3-烯基、-C 2-3-炔基,可視需要經取代,較佳為經1、2、或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-CH 3、-OCH 3、或-SCH 3; R 8為H或C 1-6-烷基,較佳為H, R 9為-C 1-6-烷基、-C 2-6-烯基、-C 2-6-炔基、-C 1-6-烷基-芳基、或C 1-6-烷基-雜芳基(較佳為異㗁唑、噻唑、四唑、1,2,4-噻二唑、1,2,3-噻二唑、1,2,5-噻二唑、吡啶、1,2,4-㗁二唑、吡𠯤、或吡唑)、視需要經1、2或3個選自下列所組成群中之取代基取代:-Br、-Cl、-F、-I、-NO 2、-CN、-CONH 2、-CONH-C 1-3-烷基(較佳為–CONH-CH 3)、-NH-CO-C 1-3-烷基(較佳為-NH-CO-CH 3)、-C 1-6-烷基(較佳為-CH 3、乙基、丙基、第三丁基、或戊基)、 -C 1-3-鹵代烷基(較佳為-CF 3、或-CHF 2)、-O-CHF 2、-O-CF 3、碳環(較佳為環丙基、環己基或苯基)、-O-碳環(較佳為苯氧基)、雜環(較佳為吡唑基)、-CO-雜環(較佳為–CO-(1-吡咯啶基))、-SO 2-CH 3、-SO 2-N(CH 3) 2、-O-C 1-4-烷基(較佳為-OCH 3)、-O-C 1-3-烷基-O-C 1-3-烷基(較佳為–O-CH 2-O-CH 3)、-SCH 3,或當R 9為-C 1-6-烷基-芳基時,則芳基部份體上兩個相鄰取代基可以形成5、6或7員碳環或雜環,其可視需要經取代; R A為H、碳環或雜環,可視需要經取代,較佳為經1、2或3個分別獨立選自下列所組成群中之取代基取代:‑OH、‑NO 2、‑CN、‑Br、‑Cl、‑F、‑I、‑R 9、‑O‑R 7、-O-(CH 2) o-R 9、-SO 2NH 2、及=O,其中 o 為0或1。
- 一種雙功能化合物,其包含如請求項1至5之ALC1之變構抑制劑及募集E3泛素連接酶至ALC1之化合物(E3募集因子),其中該ALC1之變構抑制劑及該E3募集因子可視需要透過連接子共價連接。
- 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至5之ALC1之變構抑制劑或如請求項6之雙功能化合物及醫藥上可接受之賦形劑。
- 一種ALC1抑制劑(ALC1i),其用於治療或緩解患者之增生性疾病,其中該方法包括投與該ALC1i及視需要投與聚(ADP-核糖)-聚合酶抑制劑 (PARPi)。
- 一種PARPi,其用於治療或緩解患者之增生性疾病,其中該方法包括投與該PARPi及投與ALC1i。
- 如請求項8所使用之ALC1i或如請求項9所使用之PARPi,其中PARPi在染色質上降低PARP活性及/或抑制PARP1、PARP2及/或PARP3,較佳為PARP2,其中較佳地 (i) 降低PARP活性之PARPi係選自:小型干擾RNA,及 (ii) 抑制PARP1之PARPi係選自下列組成之群中之化合物: (a) 式(II) (II) 及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中: A與B共同代表視需要經取代之稠合芳香環; X為NR X 或CR X R Y ; 若X=NR X ,則n為1或2,及若X=CR X R Y ,則n為l; R X 係選自下列組成之群:H、視需要經取代之C l-20烷基、C 5-20芳基、C 3-20雜環基、醯胺基、硫醯胺基、酯、醯基、及磺醯基; R Y 係選自:H、羥基、胺基; 或R X 及R Y 可共同形成螺-C 3-7環烷基或雜環基; R C1 及R C2 係分別獨立選自下列組成之群:氫及C l-4烷基,或當X為CR X R Y、R C1 、R C2 、R X 及R Y 時,其可與其等附接之碳原子共同形成視需要經取代之稠合芳香環;及 R 1係選自:H及鹵基; 及 (b) 式(III) (III) 及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中: Y及Z係分別獨立選自下列組成之群: 1. 芳基,其可視需要經1、2、或3個R 6取代; 2. 雜芳基,其可視需要經1、2、或3個R 6取代; 3. 分別獨立選自下列組成之群中之取代基:氫、烯基、烷氧基、烷氧基烷基、烷氧基羰基、烷氧基羰基烷基、烷基、炔基、芳基烷基、環烷基、環烷基烷基、鹵代烷基、羥基伸烷基、側氧基、雜環烷基、雜環烷基烷基、烷基羰基、芳基羰基、雜芳基羰基、烷基磺醯基、芳基磺醯基、雜芳基磺醯基、(R AR B)伸烷基、(NR AR B)羰基、(NR AR B)羰基伸烷基、(NR AR B)磺醯基、及(R AR B)磺醯基伸烷基; 其中各R 6係選自:OH、NO 2、CN、Br、Cl、F、I、C 1-6-烷基、C 3-8-環烷基、C 2-8-雜環烷基;C 2-6-烯基、烷氧基、烷氧基烷基、烷氧基羰基、烷氧基羰基烷基、C 2-6-炔基、芳基、芳基烷基、C 3-8-環烷基烷基、鹵代烷氧基、鹵代烷基、羥基伸烷基、側氧基、雜芳基、雜芳基烷氧基、雜芳基氧、雜芳基硫、雜芳基烷基硫、雜環烷氧基、C 2-8-雜環烷基硫、雜環基氧、雜環基硫、NR AR B、(R AR B)C 1-6-伸烷基、(NR AR B)羰基、(R AR B)羰基伸烷基、(NR AR B)磺醯基、及(NR AR B)磺醯基伸烷基; R 1、R 2、及R 3係分別獨立選自下列組成之群:氫、鹵素、烯基、烷氧基、烷氧基羰基、烷基、環烷基、炔基、氰基、鹵代烷氧基、鹵代烷基、羥基、羥基伸烷基、硝基、NR AR B、NR AR B伸烷基、及(R AR B)羰基; A及B各分別獨立選自:氫、Br、Cl、F、I、OH、C 1-6-烷基、C 3-8-環烷基、烷氧基、烷氧基烷基,其中C 1-6-烷基、C 3-8-環烷基、烷氧基、烷氧基烷基可視需要經至少一個選自下列之取代基取代:OH、NO 2、CN、Br、Cl、F、I、C 1-6-烷基、及C 3-8-環烷基,其中B不為OH; R A及R B係分別獨立選自下列組成之群:氫、烷基、環烷基、及烷基羰基;或RA及RB與其等所附接之原子共同形成3-10員雜環,其可視需要具有一至三個選自下列所組成群中之雜原子或雜官能基:‑O‑、‑NH、‑N(C 1‑6‑烷基)‑、‑NCO(C 1‑ 6‑烷基)‑、‑N(芳基)‑、‑N(芳基‑C 1‑ 6‑烷基‑)、‑N(經取代之芳基-C 1-6-烷基‑)‑、-N(雜芳基)-、-N(雜芳基-C 1-C 6-烷基-)-、‑N(經取代之雜芳基-C 1-6烷基-)-、及-S-或S(O)q-,其中 q為1或2,及3-10員雜環可視需要經一個或多個取代基取代; R 4及R 5係分別獨立選自下列組成之群:氫、烷基、環烷基、烷氧基烷基、鹵代烷基、羥基伸烷基、及(NR AR B)伸烷基; 及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥; (iii)抑制PARP1及PARP2之PARPi係選自下列組成之群中之化合物: (a) 式(IV) (IV) 及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中: R 1為氫或氟;及 R 2為氫或氟; 及 (b) 式(V) (V) 及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中: R 1、R 2、及R 3係分別獨立選自下列組成之群:氫、烯基、烷氧基、烷氧基羰基、烷基、炔基、氰基、鹵代烷氧基、鹵代烷基、鹵素、羥基、羥基烷基、硝基、NR AR B、及(NR AR B)羰基; A為非芳香系4、5、6、7、或8-員環,其包含1或2個氮原子及可視需要一個硫或氧原子,其中該非芳香環可視需要經1、2、或3個選自下列所組成群中之取代基取代:烯基、烷氧基、烷氧基烷基、烷氧基羰基、烷氧基羰基烷基、烷基、炔基、芳基、芳基烷基、環烷基、環烷基烷基、氰基、鹵代烷氧基、鹵代烷基、鹵素、雜環、雜環烷基、雜芳基、雜芳基烷基、羥基、羥基烷基、硝基、NR CR D、(NR CR D)烷基、(NR CR D)羰基、(NR CR D)羰基烷基、及(NR CR D)磺醯基;及 R A、R B、R C、及R D係分別獨立選自下列組成之群:氫、烷基、及烷基羰基; (iii) 抑制PARP1、PARP2及PARP3之PARPi為式(VI)化合物 (V) 及其異構物、鹽、溶劑合物、化學保護形式、及前藥;其中: R 1為:H;鹵素;氰基;視需要經取代之烷基、烯基、炔基、環烷基、雜環烷基、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、及胺基、烷氧基、烷基、與芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、羧基、及視需要經取代之胺基與醚基(如:O-芳基));或-C(O)-R 10,其中R 10為:H;視需要經取代之烷基、烯基、炔基、環烷基、雜環烷基、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、胺基、及烷基與芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵基、羥基、硝基、及胺基);或OR 100或NR 100R 110,其中R 100及R 110各分別獨立為H或視需要經取代之烷基、烯基、炔基、環烷基、雜環烷基、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:烷基、烯基、炔基、環烷基、雜環烷基、芳基、及雜芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、胺基、及烷基與芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、及視需要經取代之胺基); R 2為H或烷基; R 3為H或烷基; R 4為H、鹵素或烷基; X 為O或S; Y 為(CR 5R 6)(CR 7R 8) n或N-C(R 5),其中: n 為0或1; R 5及R 6各分別獨立為H或視需要經取代之烷基、烯基、炔基、環烷基、雜環烷基、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、胺基、及低碳數烷基、低碳數烷氧基、或芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、及胺基);及 R 7及R 8各分別獨立為H或視需要經取代之烷基、烯基、炔基、環烷基、雜環烷基、芳基、或雜芳基(例如:未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、胺基、及低碳數烷基、低碳數烷氧基、及芳基,其係未經取代或經一個或多個選自下列之取代基取代:鹵素、羥基、硝基、及胺基); 其中當R 1、R 4、R 5、R 6、及R 7分別為H時,R 8不是未經取代之苯基。
- 如請求項8或10所使用之ALC1i或如請求項9或10所使用之PARPi,其中PARPi係選自下列組成之群中奧拉帕尼(Olaparib)、他拉唑帕尼(Talazoparib)、尼拉帕尼(Niraparib)、魯卡帕尼(Rucaparib)、及維利帕尼(Veliparib),特定言之,維利帕尼(Veliparib)、奧拉帕尼(Olaparib)、及他拉唑帕尼(Talazoparib)。
- 如請求項8、10或11所使用之ALC1i或如請求項9至11所使用之PARPi,其中ALC1i為ALC1之ATP酶活性之直接抑制劑,或為ALC1之變構抑制劑, 其中較佳係ALC1i為如請求項1至5中任一項之ALC1之抑制劑或如請求項6之雙功能化合物。
- 如請求項8或10至12所使用之ALC1i或如請求項9至12所使用之PARPi,其中增生性疾病係選自:BRCA-1及/或BRCA-2-缺陷腫瘤,及其中PARP-1、PARP-2、PARP-3及/或ALC1之表現比非腫瘤細胞提高之腫瘤,及/或其中增生性疾病係選自:肝細胞癌瘤、乳癌、卵巢癌、攝護腺癌、結腸直腸癌。
- 如請求項8或10至13所使用之ALC1i或如請求項9至13所使用之PARPi,其中PARPi及ALC1i係同時或分開投與。
- 一種部件套組,其包含分開包裝之PARPi及ALC1i或包含PARPi與ALC1i之組合物,較佳附有指示用於治療或緩解增生性疾病之說明書。
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