JP2015172063A - モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 - Google Patents
モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2015172063A JP2015172063A JP2015104349A JP2015104349A JP2015172063A JP 2015172063 A JP2015172063 A JP 2015172063A JP 2015104349 A JP2015104349 A JP 2015104349A JP 2015104349 A JP2015104349 A JP 2015104349A JP 2015172063 A JP2015172063 A JP 2015172063A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- recognition
- dna
- repeat
- polypeptide
- domain
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
- C12N15/8217—Gene switch
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
- C12N15/8237—Externally regulated expression systems
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
- C12N15/8237—Externally regulated expression systems
- C12N15/8238—Externally regulated expression systems chemically inducible, e.g. tetracycline
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
- C12N15/8237—Externally regulated expression systems
- C12N15/8239—Externally regulated expression systems pathogen inducible
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/825—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving pigment biosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8279—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8279—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
- C12N15/8281—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for bacterial resistance
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/80—Fusion polypeptide containing a DNA binding domain, e.g. Lacl or Tet-repressor
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Botany (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
Abstract
Description
米国特許第7,273,923号、米国特許第7,220,719号)。さらに、デザイナーDNA結合ドメインを含有するポリペプチドは、ポリペプチド内のヌクレアーゼ触媒ドメイン等のドメインを修飾するDNAの組み込みによって、実際の標的DNA配列を修飾するために利用することができる。かかる例としては、非特異的ヌクレアーゼドメインと組み合わせた、メガヌクレアーゼ/ホーミングエンドヌクレアーゼDNA認識部位のDNA結合ドメイン(米国特許出願第2007/0141038号を参照されたい)、修飾されたメガヌクレアーゼDNA認識部位および/または同一のまたは異なるメガヌクレアーゼからのヌクレアーゼドメイン(米国特許出願公開第20090271881号を参照されたい)、および典型的にFokI等のIIS型制限エンドヌクレアーゼからの、ヌクレアーゼ活性を備えるドメインと組み合わせた亜鉛フィンガードメイン(Bibikova et al.(2003)Science300:764、Urnov et al.(2005)Nature435,646、Skukla,et al.(2009)Nature459,437−441、Townsend et al.(2009)Nature459:442445、Kim et al.(1996)Proc.NatlAcad.Sci USA93:1156−1160、米国特許第7,163,824号)が挙げられる。カスタム亜鉛フィンガーDNA結合ドメインを特定するために利用される現在の方法は、所望のDNA特異性を備えるマルチフィンガードメインを生成するために、大型無作為化ライブラリ(典型的に108超のサイズ)を利用する、組み合わせ選択に基づく方法を採用する(Greisman&Pabo(1997)Science275:657−661、Hurt et al.(2003)Proc NatlAcad Sci USA100:12271−12276、Isalan et al.(2001)Nat Biotechnol19:656−660。かかる方法は、時間がかかり、技術的に要求が厳しく、かつ潜在的に相当の費用がかかる。DNA結合ポリペプチドの操作のための、単純な認識コードの特定は、所望のヌクレオチド標的を認識するDNA結合ドメインを設計するための現在の方法を上回る有意な前進を表すであろう。
添付の図および配列表に列挙されるヌクレオチドおよびアミノ酸配列は、ヌクレオチド塩基の標準文字略号およびアミノ酸の1文字コードを用いて示される。ヌクレオチド配列は、配列の5’末端で始まり、3’末端へと前進する(すなわち、各ラインの左から右へ)、標準慣例に従う。各核酸配列の1本鎖のみが示されるが、表示される鎖の任意の参照によって、相補鎖が含まれることが理解される。アミノ酸配列は、アミノ末端で始まり、カルボキシ末端へと前進する(すなわち、各ラインの左から右へ)、標準慣例に従う。
付加することができる。
ることができる。そこから制御性ドメインを得ることができる転写因子ポリペプチドには、制御転写および基礎転写に関与するポリペプチドが含まれる。かかるポリペプチドには、転写因子、それらのエフェクタードメイン、共活性化因子、サイレンサー、核内ホルモン受容体が含まれる(例えば、核酸要素に関与するタンパク質および転写の概説については、Goodrich et al.(1996)Cell84:825 30を参照されたく、一般的な転写因子は、Barnes&Adcock(1995)Clin.Exp.Allergy25 Suppl.2:46 9およびRoeder(1996)Methods Enzymol.273:165 71に概説される)。転写因子を専門とするデータベースは既知である(例えば、Science(1995)269:630を参照されたい)。核内ホルモン受容体転写因子は、例えば、Rosen et al.(1995)J.Med.Chem.38:4855 74に記載される。転写因子のC/EBPファミリーは、Wedel et al.(1995)Immunobiology193:171 85に概説される。核内ホルモン受容体によって転写制御を仲介する共活性化因子および共抑制因子は、例えば、Meier(1996)Eur.J.Endocrinol.134(2):158 9、Kaiser et al.(1996)Trends Biochem.Sci.21:342 5、およびUtley et
al.(1998)Nature394:498 502)に概説される。GATA転写因子は、造血の制御に関与し、例えば、Simon(1995)Nat.Genet.11:9 11、Weiss et al.(1995)Exp.Hematol.23:99−107に記載される。TATAボックス結合タンパク質(TBP)およびその関連するTAFポリペプチド(TAF30、TAF55、TAF80、TAF110、TAF150、およびTAF250を含む)は、Goodrich&Tjian(1994)Curr.Opin.CellBiol.6:403 9およびHurley(1996)Curr.Opin.Struct.Biol.6:69 75に記載される。転写因子のSTATファミリーは、例えば、BarahmおよびPour et al.(1996)Curr.Top.Microbiol.Immunol.211:121 8に概説される。疾患に関与する転写因子は、Aso et al.(1996)J.Clin.Invest.97:1561 9に概説される。遺伝子制御に関与するポリペプチドを修飾するキナーゼ、ホスファターゼ、および他のタンパク質はまた、本発明のポリペプチドのための制御性ドメインとしても有用である。かかる修飾因子は、例えば、ホルモンによって仲介される、転写のスイッチオンまたはオフにしばしば関与する。転写制御に関与するキナーゼは、Davis(1995)Mol.Reprod.Dev.42:459 67,Jackson et al.(1993)Adv.Second Messenger Phosphoprotein Res.28:279 86、およびBoulikas(1995)Crit.Rev.Eukaryot.Gene Expr.5:1 77に概説される一方で、ホスファターゼは、例えば、Schonthal&Semin(1995)Cancer Biol.6:239 48に概説される。核内チロシンキナーゼは、Wang(1994)Trends Biochem.Sci.19:373 6に記載される。有用なドメインは、発癌遺伝子の遺伝子産物(例えば、myc、jun、fos、myb、max、mad、rel、ets、bcl、myb、mosファミリーメンバー)ならびにそれらの関連する因子および修飾因子から得ることができる。発癌遺伝子は、例えば、Cooper,Oncogenes,2nd ed.,The Jones and Bartlett Series in Biology,Boston,Mass.,Jones and Bartlett Publishers,1995に記載される。ets転写因子は、Waslylk et al.(1993)Eur.J.Biochem.211:7 18およびCrepieux et
al.(1994)Crit.Rev.Oncog.5:615 38に概説される。Myc発癌遺伝子は、例えば、Ryan et al.(1996)Biochem.J.314:713 21に概説される。junおよびfos転写因子は、例えば、The
Fos and Jun Families of Transcription F
actors,Angel&Herrlich,eds.(1994)に記載される。max発癌遺伝子は、Hurlin et al.Cold Spring Harb.Symp.Quant.Biol.59:109 16に概説される。myb遺伝子ファミリーは、Kanei−Ishii et al.(1996)Curr.Top.Microbiol.Immunol.211:89 98に概説される。mosファミリーは、Yew et al.(1993)Curr.Opin.Genet.Dev.3:19 25に概説される。本発明のポリペプチドは、DNA修復酵素ならびにそれらの関連する因子および修飾因子から得られる、制御性ドメインを含み得る。DNA修復システムは、例えば、Vos(1992)Curr.Opin.CellBiol.4:385 95、Sancar(1995)Ann.Rev.Genet.29:69 105、Lehmann(1995)Genet.Eng.17:1 19、およびWood(1996)Ann.Rev.Biochem.65:135 67に概説される。DNA再構成酵素ならびにそれらの関連する因子および修飾因子はまた、制御性ドメインとして使用することができる(例えば、Gangloff et al.(1994)ExperientiA50:261 9、Sadowski(1993)FASEB J.7:760 7を参照されたい)。
em.273:23781 23785を参照されたい)。
分子の全ての形態も包含する。さらに、当業者は、本明細書に開示されるDNA配列がまた、その例示的ヌクレオチド配列の補体も包含することを理解する。
る。例えば、AvrBs3およびAvrBs3様ファミリーメンバーAvrBs4は、AvrBs3に対するAvrBs4のC末端における4つのアミノ酸欠失を除いて、それらの反復ドメイン領域において排他的に異なる。
変領域を含むために修飾され、高度可変領域が、標的DNA配列内の塩基対の認識を決定する、ポリペプチドに導入することによって、規定の標的DNA配列に対する多種多様のタンパク質の認識が有効となるであろう。
LTPEQVVAIASNGGGKQALETVQRLLPVLCQAHG
LTPEQVVAIASNGGGKQALETVQRLLPVLCQAPHD
・C/Gの認識のためのHD
・A/Tの認識のためのNI
・T/Aの認識のためのNG
・C/GまたはA/TまたはT/AまたはG/Cの認識のためのNS
・G/CまたはA/Tの認識のためのNN
・T/Aの認識のためのIG
・C/GまたはT/Aの認識のためのN
・T/Aの認識のためのHG
・T/Aの認識のためのH
・G/Cの認識のためのNK。
タンパク質ファミリーのメンバーは、vrBs3のアミノ酸配列に対して、特にAvrBs3の反復単位のアミノ酸配列に対して、少なくとも95%、少なくとも90%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも60%、少なくとも50%、少なくとも40%、または少なくとも35%のアミノ酸相同性を有する。これを念頭に置くと、反復単位内の高度可変領域は、AvrBs3ファミリーのメンバーの間のアミノ酸比較によって推定され得る。特に好ましい実施形態では、アミノ酸は、AvrBs3の反復単位の12位および13位にある。しかしながら、可変領域はまた、異なるアミノ酸位置に位置してもよい。可変位置の例としては、アミノ酸番号4、11、24、および32が挙げられる。本発明のさらなる実施形態では、DNA配列内の塩基対の特異的認識に関与するアミノ酸は、典型的に、AvrBs3ファミリーのメンバーの間で異ならない位置、または可変であるが、高度可変ではない位置に位置する。
エンドヌクレアーゼドメインと組み合わされる。かかるエンドヌクレアーゼ切断は、真菌、植物、および動物を含む真核生物中の相同組み換えの率を刺激することが知られる。部位特異的エンドヌクレアーゼ切断の結果として、特異的部位の相同組み換えを刺激する能力は、部位特異的切断を行わなかった場合に可能である頻度よりもはるかに高い頻度で、特異的部位の目的のDNA配列を統合した、形質転換された細胞の回復を可能にする。加えて、反復ドメインおよびエンドヌクレアーゼドメインから形成されるポリペプチドによって引き起こされる切断等のエンドヌクレアーゼ切断は、時に、切断の部位で配列を変化させる方法で細胞DNA代謝機構によって、例えば、変化していない配列と比較して、切断の部位で短挿入または欠失を引き起こすことによって修復される。これらの配列変化は、例えば、タンパク質−コード配列を、非機能タンパク質を作製するために変化させること、スプライス部位を、遺伝子転写物が適切に切断されないように修飾すること、非機能転写物を作成すること、遺伝子のプロモーター配列を、それがもはや適切に転写されないように変化させること等による、遺伝子またはタンパク質の機能の不活性化を引き起こし得る。
al.(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A89(10):4275−4279、およびKim et al.(1996)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A93(3):1156−1160、参考文献の開示は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。1本鎖FokIダイマーもまた開発され、また利用することができる(Mino et al.(2009)J.Biotechnol.140:156−161)。所望の標的DNA配列の認識のための反復ドメイン、ならびに亜鉛フィンガーヌクレアーゼを採用する、従来行われた作業に類似した、標的DNA配列のまたはその近辺のDNA切断を誘発する、FokIエンドヌクレアーゼドメインを含有するエフェクターを構築することができる(Townsend et al.(2009)Nature459:442−445、Shukla et al.(2009)Nature459,437−441、これらの参考文献の全ては、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。かかるエフェクターの比較は、Bibikova et al.(2003)Science300,764、Urnov et al.(2005)Nature435,646、Wright et al.(2005)ThePlant Journal 44:693−705、および米国特許第7,163,824号および同第7,001,768号の通り、亜鉛フィンガーヌクレアーゼについて報告されるそれらの使用に類似する、付加、欠失、および他の修飾を含むゲノムの標的変化の生成を可能にし得、参考文献および特許の全ては、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
識部位である(Thierry et al.(1991)Nucleic Acids
Res.19(1):189−190、参考文献の開示は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。I−SceIによって認識される切断部位の低頻度のために、それは相同組み換えを亢進するための使用に好適である。DNA切断を誘発するための、I−SceIの使用に関するさらなる説明は、米国特許出願第20090305402号に見出され得、この特許は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
al.(1995)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.92(3):806−810、Choulika et al.(1995)Mol.CellBiol.15(4):1968−1973、およびPuchta et al.(1993)Nucleic Acids Res.21(22):5034−5040を参照されたく、参考文献の開示は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。非相同DNA結合ドメインと共に作動する任意の他のエンドヌクレアーゼドメインは、エフェクター内で利用され得、I−SceIエンドヌクレアーゼは、1つのかかる非限定的例であることが理解されるであろう。DNA認識およびI−SceI等の結合ドメインを有する、エンドヌクレアーゼの使用の限定は、認識部位が所望の位置にまだ存在しない場合、かかる部位が、その部位で相同組み換えを亢進させるために、エンドヌクレアーゼの使用前に、所望の位置で相同組み換えの標準方法によって導入されなければならないことである。既知のエンドヌクレアーゼを修飾することによってまたは1つ以上のかかるエンドヌクレアーゼのキメラ版を作製することによって等の、新規標的DNA配列を認識する、新規エンドヌクレアーゼの設計および合成を可能にする方法が報告されており、こうして目的の内因性標的DNA配列を切断する、かかる操作されたエンドヌクレアーゼドメインの生成のための道が開かれている(Chevalier et al.(2002)MolecularCell10:895−905、国際公開第2007/060495号、国際公開第2009/095793号、Fajardo−Sanchez et al.(2008)Nucleic Acids Res.36:2163−2173、公開および参考文献の双方は、参照によりそれらの全体が組み込まれる)。このため、DNA結合活性を非機能にするが、DNA切断機能は活性に保つために、および上のFokIの使用に類似したDNA切断を誘発するように、エフェクター内で同様に操作されたエンドヌクレアーゼ切断ドメインを利用するために、かかるエンドヌクレアーゼドメインが同様に操作され得ることが構想され得る。かかる用途では、標的DNA配列認識は、好ましくは、エフェクターの反復ドメインによって提供されるであろうが、DNA切断は、操作されたエンドヌクレアーゼドメインによって遂行されるであろう。
エンドヌクレアーゼドメインを含むエフェクターを用いて、内因性標的DNA配列内で2本鎖切断を生成することと、内因性標的DNAの少なくとも一部と相同な配列を含む外因性核酸を、外因性核酸と内因性標的DNA配列との間で相同組み換えが生じることを可能にする条件下で、植物細胞に導入することと、相同組み換えが生じている植物細胞から植物を生成することと、を含み得る。他の実施形態は、上述および本明細書の方法に従って作製される、遺伝子組み換え細胞および植物に関する。標的DNA配列は、人工または天然産であり得ることに留意すべきである。かかる方法は、当該技術分野で既知であり、かかる目的で利用される技術および方法を用いて、任意の生物(動物、ヒト、真菌、卵菌細菌、およびウイルスを含むような非限定的生物)において使用され得ることは理解されるであろう。
とも1つの反復ドメインを含み、これらの反復単位は、高度可変領域を含有し、各反復単位は、標的DNA配列内の1塩基対の認識に関与する。ポリペプチドは、ポリペプチドをコードするDNAとして導入されるか、またはポリペプチドは、当該技術分野で既知の方法によって、それ自体が細胞へ導入される。どのように導入されるかに関わらず、ポリペプチドは、塩基対の標的DNAを特異的に認識し、好ましくはそれに結合し、また標的遺伝子の発現を調節する、少なくとも1つの反復ドメインを含むはずである。好ましい実施形態では、全ての反復単位は、標的DNA配列内の塩基対の認識を決定する高度可変領域を含有する。
et al.(1991)J.CellBiol.113:1025 1032(1991)、Donnelly et al.(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA90:3530 3534、Carbonetti et al.(1995)Abstr.Annu.Meet.Am.Soc.Microbiol.95:295、Sebo et al.(1995)Infect.Immun.63:3851
3857、Klimpel et al.(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:10277 10281、およびNovak et al.(1992)J.Biol.Chem.267:17186 17193)。
・C/Gの認識のためのHD
・A/Tの認識のためのNI
・T/Aの認識のためのNG
・C/GまたはA/TまたはT/AまたはG/Cの認識のためのNS
・G/CまたはA/Tの認識のためのNN
・T/Aの認識のためのIG
・C/GまたはT/Aの認識のためのN
・T/Aの認識のためのHG
・T/Aの認識のためのH
・G/Cの認識のためのNK。
・HDによる認識のためのC/G
・NIによる認識のためのA/T
・NGによる認識のためのT/A
・NSによる認識のためのCTまたはA/TまたはT/AまたはG/C
・NNによる認識のためのG/CまたはA/T
・IGによる認識のためのT/A。
・Nによる認識のためのC/GまたはT/A
・HGによる認識のためのT/A
・Hによる認識のためのT/A
・NKによる認識のためのG/C。
に、固相支持体に結合される。例えば、ポリペプチドは、アクリルアミドもしくはアガロースゲルマトリックス中に存在してもよいか、またはより好ましくは、膜の表面上またはマイクロタイタープレートのウェル中で固定化される。
ば、部位特異的突然変異を用いることによって生成されるが、本発明のタンパク質を依然としてコードするDNA配列等の、合成的に誘発されたDNA配列を含む。概して、本発明の特定のDNA配列の変異体は、本明細書の他の箇所に記載される配列整列プログラムおよびパラメータによって決定される、その特定のポリヌクレオチドに対して、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれを超える配列同一性を有するであろう。
al.(1997)NatureBiotech.15:436−438、Moore
et al.(1997)J.Mol.Biol.272:336−347、Zhang et al.(1997)Proc.Natl.Acad.Sci.USA94:4504−4509、Crameri et al.(1998)Nature391:288−291、および米国特許第5,605,793号および同第5,837,458号を参照されたい。
Spring Harbor LaboratoryPress,Plainview,New York)に開示される。
ッチの程度が、45℃未満(水溶液)または32℃未満(ホルムアミド溶液)のTmをもたらす場合、高い温度が使用され得るように、SSC濃度を増加させることが最適である。核酸のハイブリダイゼーションの広範な指導は、Tijssen(1993)LaboratoryTechniques in Biochemistry and Molecular Biology-Hybridization with Nuclei
c Acid Probes,Part I,Chapter 2(Elsevier,New York)、およびAusubel et al.,eds.(1995)Current Protocols in Molecular Biology,Chapter 2(GreenePublishing and Wiley−Interscience,New York)で見出される。Sambrook et al.(1989)Molecular Cloning:ALaboratoryManual(2d ed.,Cold Spring Harbor LaboratoryPress,Plainview,New York)を参照されたい。
LAST、およびPSI−Blastプログラムを利用するとき、それぞれのプログラム(例えば、XBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメータを使用することができる。http://www.ncbi.nlm.nih.govを参照されたい。配列の比較に利用される数学的アルゴリズムの別の好ましい、非限定的例は、MyersおよびMiller(1988)CABIOS 4:11−17のアルゴリズムである。かかるアルゴリズムは、ALIGNプログラム(2.0版)に組み込まれ、それは、GCG配列整列ソフトウェアパッケージの部分である。アミノ酸配列を比較するためにALIGNプログラムを利用するとき、PAM120重量残基表、12のギャップ長ペナルティ、および4のギャップペナルティを使用することができる。整列はまた、検査によって手動で行われてもよい。
チドが由来する種とは異なる種に由来するか、または、同一の/類似した種に由来する場合、1つまたは双方は、それらの原型および/またはゲノム遺伝子座から実質的に修飾されるか、またはプロモーターは、作動可能に結合されたポリヌクレオチドのための天然プロモーターでない。本明細書で使用されるとき、キメラ遺伝子は、コード配列と非相同な転写開始領域に作動可能に結合されたコード配列を含む。
al.(1995)Gene165(2):233−238)、MDMVリーダー(MaizeDwarf Mosaic ウイルス)(Virology154:9−20)、およびヒト免疫グロブリン重鎖結合タンパク質(BiP)(Macejak et al.(1991)Nature353:90−94)、アルファルファモザイクウイルスのコートタンパク質mRNAからの非翻訳リーダー(AMV RNA4)(Joblin
g et al.(1987)Nature325:622−625)、タバコモザイクウイルスリーダー(TMV)(Gallie et al.(1989)in Molecular Biologyof RNA,ed.Cech(Liss,New York),pp.237−256)、およびメイズクロロティックモットルウイルスリーダー(MCMV)(Lommel et al.(1991)Virology81:382−385)。また、Della−Cioppa et al.(1987)Plant Physiol.84:965−968も参照されたい。
al.(1985)Nature313:810−812)、イネアクチン(McElroy et al.(1990)Plant Cell2:163−171)、ユビキチン(Christensen et al.(1989)Plant Mol.Biol.12:619−632、およびChristensen et al.(1992)Plant Mol.Biol.18:675−689)、pEMU(Last et al.(1991)Theor.Appl.Genet.81:581−588)、MAS(Velten et al.(1984)EMBO J.3:2723−2730)、ALSプロモーター(米国特許第5,659,026号)等が含まれる。他の構成的プロモーターには、例えば、米国特許第5,608,149号、同第5,608,144号、同第5,604,121号、同第5,569,597号、同第5,466,785号、同第5,399,680号、同第5,268,463号、同第5,608,142号、および同第6,177,611号が含まれる。
al.(1996)Plant Physiol.112(2):525−535、Canevascini et al.(1996)Plant Physiol.112(2):513−524、Yamamoto et al.(1994)Plant CellPhysiol.35(5):773−778、Lam(1994)Results Probl.CellDiffer.20:181−196、Orozco et al.(1993)Plant MolBiol.23(6):1129−1138、Matsuoka et al.(1993)Proc Natl.Acad.Sci.U
SA90(20):9586−9590、およびGuevara−Garcia et al.(1993)Plant J.4(3):495−505を含む。かかるプロモーターは、必要な場合、低発現のために修飾することができる。
も含む。選択可能なマーカー遺伝子は、形質転換された細胞または組織の選択に利用される。マーカー遺伝子は、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼII(NEO)およびヒグロマイシンホスホトランスフェラーゼ(HPT)をコードする遺伝子等の、抗生物質抵抗性をコードする遺伝子、ならびにグルホシネートアンモニウム、ブロモキシニル、イミダゾリノン、および2,4−ジクロロフェノキシ酢酸(2,4−D)等の除草化合物に対する抵抗性を付与する遺伝子を含む。さらなる選択可能なマーカーは、β−ガラクトシダーゼ等の表現型マーカーおよび緑色蛍光タンパク質(GFP)(Su et al.(2004)BiotechnolBioeng 85:610−9およびFetter et al.(2004)Plant Cell16:215−28)、青緑色蛍光タンパク質(CYP)(Bolte et al.(2004)J.CellScience117:943−54およびKato et al.(2002)Plant Physiol129:913−42)、および黄色蛍光タンパク質(EvrogenからのPhiYFP(商標)、Bolte et al.(2004)J.CellScience117:943−54を参照されたい)等の蛍光タンパク質を含む。さらなる選択可能なマーカーについては、概して、Yarranton(1992)Curr.Opin.Biotech.3:506−511、Christopherson et al.(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:6314−6318、Yao et al.(1992)Cell71:63−72、Reznikoff(1992)Mol.Microbiol.6:2419−2422、Barkley et al.(1980)in TheOperon、pp.177−220、Hu et al.(1987)Cell48:555−566、Brown et al.(1987)Cell49:603−612、Figge et al.(1988)Cell52:713−722、Deuschle et al.(1989)Proc.Natl.Acad.Aci.USA86:5400−5404、Fuerst et al.(1989)Proc.Natl.Acad.Sci.USA86:2549−2553、Deuschle et al.(1990)Science248:480−483、Gossen(1993)Ph.D.Thesis,Universityof Heidelberg、Reines et al.(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA90:1917−1921、Labow et al.(1990)Mol.Cell.Biol.10:3343−3356、Zambretti et al.(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:3952−3956、Baim et al.(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.USA88:5072−5076、Wyborski et al.(1991)Nucleic Acids Res.19:4647−4653、HillenおよびWissman(1989)Topics Mol.Struc.Biol.10:143−162、Degenkolb et al.(1991)Antimicrob.Agents
Chemother.35:1591−1595、Kleinschnidt et al.(1988)Biochemistry27:1094−1104、Bonin(1993)Ph.D.Thesis,Universityof Heidelberg;Gossen et al.(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:5547−5551、Oliva et al.(1992)Antimicrob.Agents Chemother.36:913−919、Hlavka et al.(1985)Handbook of ExperimentalPharmacology,Vol.78( Springer−Verlag,Berlin)、Gill et al.(1988)Nature334:721−724を参照されたい。かかる開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
al.(1994)Plant CellRep.13、Ayeres N.M.およびPark,W.D.(1994)Crit.Rev.Plant.Sci.13:219−239、Barcelo,et al.(1994)Plant.J.5:583−592、Becker,et al.(1994)Plant.J.5:299−307、Borkowska et al.(1994)Acta.PhysiolPlant.16:225−230、Christou,P.(1994)Agro.Food.Ind.Hi Tech.5:17−27、Eapen et al.(1994)Plant CellRep.13:582−586、Hartman,et al.(1994)Bio−Technology12:919923;Ritala,et al.(1994)Plant.Mol.Biol.24:317−325;およびWan,Y.C.およびLemaux,P.G.(1994)Plant Physiol.104:3748を参照されたい。
標的宿主の種に依存する。
Molecular Biology(WeissbachおよびWeissbach,eds.)Academic Press,Inc.(1988)、およびMethods in Plant Molecular Biology(SchulerおよびZielinski,eds.)Academic Press、Inc.(1989)。形質転換の方法は、形質転換される植物細胞、使用されるベクターの安定性、遺伝子産物の発現レベル、および他のパラメータに依存する。
k(ホスホグリセリン酸キナーゼ)プロモーター)、エンハンサー(Queen et al.(1986)Immunol.Rev.89:49)等の発現制御配列、およびリボソーム結合部位、RNAスプライス部位、ポリアデニル化部位(例えば、SV40大型T AgポリA付加部位)等の必要なプロセシング情報部位、および転写終結配列を含んでもよい。本発明のタンパク質の産生に有用な他の動物細胞は、例えば、American TypeCultureCollectionから入手可能である。
al.(1981)Nature292:128)等の一般的に使用されるプロモーターを含む。選択マーカーの、大腸菌中にトランスフェクトされたDNAベクターへの組み込みもまた有用である。かかるマーカーの例としては、アンピシリン、テトラサイクリン、またはクロラムフェニコールに対する抵抗性を特定する遺伝子が挙げられる。
プラスミドベクターが使用される場合、細菌細胞は、プラスミドベクターDNAでトランスフェクトされる。本発明のタンパク質を発現するための発現システムは、バチルス属菌およびサルモネラ(Palva et al.(1983)Gene22:229−235)、Mosbach et al.(1983)Nature302:543−545)を用いて入手可能である。
AvrBs3が、誘発標的遺伝子内のプロモーター要素であるUPAボックスに直接に結合するという事実に促され(Kay et al.(2007)Science318,648−651、Roemer et al.(2007)Science318:645−648)、我々は、DNA配列特異性のための塩基を調査した。各反復領域は、概して34個のアミノ酸からなり、反復単位は、ほぼ同一であるが、アミノ酸12および13は、高度可変である(Schornack et al.(2006)J.Plant
Physiol.163:256−272、図1A)。AvrBs3のC最末端の反復は、その最初の20個のアミノ酸においてのみ他の反復単位との配列類似性を示し、したがって半反復と称される。反復単位は、それらの高度可変な第12および第13アミノ酸に基づいて、異なる反復タイプに分類することができる(図1B)。UPAボックス(18(20)/19(21)bp)のサイズは、AvrBs3中の反復単位の数(17.5個)にほぼ対応するため、我々は、AvrBs3の1つの反復単位が、1つの特異的DNA塩基対に接触するという可能性を考えた。AvrBs3の反復タイプ(各反復のアミノ酸12および13)がUPAボックスに投影されるとき、特定の反復タイプが、標的DNA内の特異的塩基対と相関することが明白となる。例えば、HDおよびNI反復単位は、それぞれ、CおよびAへの強い選好を有する(図1B)。簡潔にするために、上部(センス)DNA鎖の塩基のみを指定する。我々の認識特異性のモデルは、4つの反復単位(Δ11〜14、図5A、B)を欠く、AvrBs3反復欠失誘導体AvrBs3Δrep16が、より短いおよび異なる標的DNA配列を認識するという事実によって支持される(図5〜8)。AvrBs3誘発性トウガラシ遺伝子のUPAボックスの配列比較、および突然変異分析に基づいて、AvrBs3の標的DNAボックスは、AvrBs3の反復単位の数よりも1bp長いようである。加えて、Tは、第1反復の予測認識特異性の直前に、UPAボックスの5’末端で保存される(図1)。興味深いことに、アミノ酸配列保存の欠如にもかかわらず、第1反復および反復領域に先行するタンパク質領域の二次構造予測は、類似性を示す。これは、反復0と名付けられる、さらなる反復を示唆する(図1B
)。
一方で、他がより柔軟であることを強力に示唆する。
転写物レベルの半定量的分析により、PAP1の発現が、Hax2によって強力に誘発されることが示された(図14C)。PAP1プロモーター領域の目視検査により、最適以下のHax2ボックスの存在が示された(図14D、E)。TALエフェクター反復タイプのためのコード(図1D)および上述のデータに基づいて、その幾つかは重要な病原性因子であるさらなるTALエフェクターのための推定標的DNA配列を予測した(図15、表1)。
在時に、GUSレポーターのみを強力におよび特異的に誘発した(図3E、図11)。1つの反復単位が、各反復のアミノ酸12および13を介してDNA内の1つの塩基対に接触するという、TALエフェクターの認識特異性についての我々のモデルは、TALエフェクターの結合特異性およびの植物標的遺伝子の特定を予測することを可能にする。多くのTALエフェクターは、主な病原性因子であるため、植物標的遺伝子の知識は、キサントモナズ(xanthomonads)によって引き起こされる植物疾患発生の我々の理解を大幅に高めるであろう。加えて、我々は、特異的DNA結合ドメインを備える転写因子として作用する、人工エフェクターの設計に成功した。従来、亜鉛フィンガー単位の縦列配列を含有する亜鉛フィンガー転写因子は、特異的標的DNA配列に結合するように操作されている。
AvrBs3ファミリーの天然産エフェクターの反復ドメインの反復単位は、対応するDNA結合特異性をコードする。これらの認識配列は、認識コードで予測することができる。
植物遺伝子のプロモーター領域内のAvrBs3ファミリーの、対応するエフェクターのDNA標的配列の予測は、エフェクターによるこれらの遺伝子の誘発性発現のための指標である。本発明に従う方法を用いて、誘発性植物遺伝子を予測することが可能である。予測は、特に、配列されたゲノム内で明快である。
Hax3およびHax4の使用に類似して、AvrBs3ファミリーの他のメンバーの予測DNA結合配列は、対応するAvrBs3エフェクターによって誘導することができる新規制御可能なプロモーターを生成するために、プロモーターに挿入することができる。
2つの構築物を植物に導入する。第1に、その発現が誘発性プロモーターの制御下にあるhax3遺伝子である。第2に、プロモーター内にHax3ボックスを含有する標的遺伝子である。hax3の発現の誘発は、次いで標的遺伝子の発現を誘発するHax3タン
パク質の産生をもたらす。説明される2成分性構築物は、標的遺伝子の可変の発現を可能にする、2倍の発現スイッチをもたらす。トランス活性化因子および標的遺伝子もまた、最初に異なる植物株に存在してもよく、自由に遺伝子移入されてもよい。これに類似して、Hax4および対応するHax4ボックスを使用することができる。このシステムはまた、AvrBs3ファミリーの他のメンバーまたは人工誘導体および予測DNA標的配列と共に使用することもできる。このシステムの機能は、すでに検証することができた。その天然プロモーターの制御下で誘発性avrBs3遺伝子ならびにBs3遺伝子を含有し、その発現がAvrBs3によって誘発され得る、トランスジェニックアラビドプシス・タリアナ植物を構築した。avrBs3の発現の誘発は、Bs3の発現、したがって細胞死をもたらす。国際公開第2009/042753号を参照されたく、それは参照により本明細書に組み込まれる。
AvrBs3類似エフェクターのDNA標的配列が、その発現が植物の防御反応(抵抗性仲介遺伝子)をもたらす遺伝子の前に挿入される場合、対応するように構築されたトランスジェニック植物は、植物病原体生物の感染に対して抵抗性となり、このエフェクターを有効にするであろう。かかる抵抗性仲介遺伝子は、例えば、生物/病原体の分散を防止する局在細胞死をもたらすことができるか、または植物細胞の基礎抵抗性もしくは全身抵抗性を誘発することができる。
中央反復ドメインのモジュラー構造は、明確なDNA結合特異性の標的構築、およびこれと共に、選択された植物遺伝子の転写の誘発を可能にする。DNA結合特異性は、新規エフェクター−DNAボックス変異体が標的遺伝子の発現の誘発性のために生成されるように、標的遺伝子の前に人工的に挿入することができる。さらに、生物中の天然産DNA配列を認識する反復ドメインを構築することができる。このアプローチの利点は、本発明の対応するエフェクターが、この生物の細胞中に存在する場合、非トランスジェニック生物中の任意の遺伝子の発現が、誘発され得るということである。
(1)タンパク質輸送システムで細菌を介して転移する(例えば、III型分泌系);
(2)人工AvrBs3タンパク質での細胞衝撃;
(3)遺伝子移入、アグロバクテリウム、ウイルスベクター、もしくは細胞衝撃を介する、エフェクターの産生をもたらすDNAセグメントの転移;または
(4)標的細胞によってエフェクタータンパク質の取り込みをもたらす他の方法。
AvrBs3様ファミリーのエフェクターは、植物細胞中の遺伝子の発現を誘発する。このために、タンパク質のC末端は、必須であり、それはタンパク質の植物核への移入を仲介する、転写活性化ドメインおよび核局在配列を含有する。AvrBs3相同タンパク質のC末端は、それが真菌、動物、またはヒト系における遺伝子の発現を仲介するような方法で、修飾することができる。それによって、ヒト、他の動物、または真菌において転写活性化因子として機能するエフェクターを構築することができる。したがって、本発明
に従う方法は、植物だけでなく、他の生存生物にも適用することができる。
反復ドメインのDNA結合特異性は、特異的抑制因子として作用するエフェクターを構築するために、タンパク質融合体内の他のドメイン共に使用することができる。これらのエフェクターは、それらが標的遺伝子のプロモーターに結合するような方法で生成されている、DNA結合特異性を示す。転写活性化因子であるTALエフェクターと対照的に、これらのエフェクターは、標的遺伝子の発現をブロックするために構築される。典型的抑制因子と同様に、これらのエフェクターは、それらの標的DNA配列の認識またはそこへの結合によってプロモーター配列をカバーし、さもなければ標的遺伝子の発現を制御する因子に対して、それらをアクセス不可能にすることが予測される。代替的に、または加えて、反復ドメインは、EARモチーフ等の転写抑制ドメインに融合することができる(Ohta et al.Plant Cell13:1959−1968(2001))。
反復ドメインの、特異的標的DNA配列を認識する能力は、特異的DNA配列を標識化するために、他のドメインと共に使用することができる。C末端側GFP(「緑色蛍光タンパク質」)は、例えば、所望のDNA配列を検出する人工反復ドメインに融合することができる。この融合タンパク質は、インビボおよびインビトロで、対応するDNA配列に結合する。この配列の染色体上の位置を、融合GFPタンパク質を用いて局在化することができる。類似した方法では、タンパク質の細胞局在(例えば、FISHによって)を可能にする他のタンパク質ドメインを、細胞のゲノム内の対応するDNA配列に対するタンパク質を標的とする、特異的人工反復ドメインに融合することができる。加えて、本発明の反復ドメインのDNA認識特異性は、特異的DNA配列を単離するために使用することができる。このために、AvrBs3様タンパク質をマトリックスに固定化することができ、マッチング配列を含有する対応するDNA分子と相互作用する。したがって、特異的DNA配列を、DNA分子の混合物から単離することができる。
反復ドメインのDNA認識特異性は、DNAを特異的に切断するために、好適な制限エンドヌクレアーゼと融合することができる。したがって、反復ドメインの列特異的結合は、エンドヌクレアーゼが、所望の位置でDNAを特異的に切断するように、少数の特異的配列に対する融合タンパク質の局在をもたらす。亜鉛フィンガーヌクレアーゼを用いて行われた作業に類似して、標的DNA配列の認識を用いて、FokI等の非特異的ヌクレアーゼを、特異的エンドヌクレアーゼに変化させることができる。例えば、2つのエフェクターDNA標的部位の間の最適距離は、2つのFokIドメインの二量体化を支持するのに必要であろう距離に決定されるであろう。これは、2つのDNA結合部位が、異なるサイズのスペーサー配列によって分離される構築物の収集を分析することによって達成されるであろう。このアプローチを用いることにより、ヌクレアーゼ仲介型DNA切断が生じることを可能にする距離、および異なるDNA配列を標的とするさらなるエフェクターヌクレアーゼの機能分析を決定することが可能となる。代替的アプローチでは、新規に開発された1本鎖FokIダイマー(Mino et al.(2009)J Biotechnol140:156−161)が採用される。このアプローチでは、2つのFokI触媒ドメインは、本発明の単反復ドメインに転写的に融合される。したがって、対応するヌクレアーゼの機能性は、2つの異なるタンパク質上に位置する、2つのFokIドメインの分子内二量体化にもはや依存しない。このタイプの構築は、亜鉛フィンガーベースのDNA結合モチーフの背景において首尾よく使用されている。さらに、これらの方法は、複合DNA−分子内の少数の位置のみでの非常に特異的な切断を可能にする。これらの方法は、とりわけ、インビボで2本鎖切断を導入するために、およびこれらの位置でドナーDNAを選択的に組み込むために使用することができる。これらの方法はまた、トランス
遺伝子を特異的に挿入するためにも使用することができる。
反復ドメインの個々の反復単位の間の高い類似性に起因して、上述のカスタムDNA結合ポリペプチドの構築は、従来のクローン化方法を用いる方法を通じては実行できない可能性がある。この実施例に詳述される通り、Bs4プロモーター(図17B、C)等の、目的のプロモーター内の所望のDNA配列にマッチする反復単位順序を備える反復ドメインは、本発明の認識コードに基づいて決定される。「ゴールデンゲート」クローン化を用いて、特異的11.5個の反復単位順序の生成を達成した(Engler et al.(2008)PLoS ONE3:e3647)。形成ブロックとして、Hax3のN末端およびC末端、ならびに11.5個の反復単位に類似した12個の個々の反復単位をサブクローン化した。各形成ブロックは、フラグメントの、カスタムエフェクターポリペプチドへの秩序組立てを可能にする、個々の隣接BsaI部位(図18)を含有した。エフェクター(ARTBs4)を、合計14個のフラグメントから、カスタムエフェクターポリペプチドの、植物細胞中のN末端側標識GFP融合(図18)としてのアグロバクテリウム仲介型の発現を可能にするBsaI適合性バイナリーベクターへと正確に組み立てた。
反復ドメインのヌクレオチド結合特異性は、細胞中のウイルス複製を妨害するエフェクターを設計するために使用することができる。これらのエフェクターは、ウイルスの複製起点におけるヌクレオチド配列およびウイルス機能に重要な他の配列に対して標的化された、ヌクレオチド結合特異性を示すであろう。ウイルス機能をブロックするために、さらなるタンパク質ドメインがこれらの反復ドメインに融合される必要はない。それらは、プロモーター、エンハンサー、長末端反復単位、および内部リボソーム進入部位を含む、複製の起点または他の主要な配列を、それらに結合し、かつウイルスによりコードされたRNA依存性RNAポリメラーゼ、ヌクレオキャプシドタンパク質、およびインテグラーゼを含む、ウイルス複製およびウイルス機能に関与する、宿主もしくはウイルス因子に対してそれらをアクセス不可能にすることによりカバーすることによって、典型的抑制因子と同様に作用する、このタイプの戦略は、亜鉛フィンガータンパク質で首尾よく使用されている(Sera(2005)J.Vir.79:2614−2619、Takenaka
et al.(2007)NuclAcids Symposium Series 51:429−430)。
また、本発明の範囲内である。
細菌株および増殖条件。エスケリキア・コリを溶原培養液(LB)中で37℃で、アグロバクテリウムツメファシエンスGV3101を酵母エキス培養液(YEB)中で30℃で培養し、適切な抗生物質を補充した。
末端(S3、図S5)に標的DNAボックスを備えるpENTR/D−TOPO(Invitrogen)に挿入した。プロモーター誘導体を、プロモーターレスuidA遺伝子を含有するpGWB3(S2)へとクローン化した。
ターフラグメント)を用いて、Bs3およびBs3−EプロモーターDNAの蛍光標識されたPCR産物を生成した。テンプレートおよびPhusion DNAポリメラーゼ(Finnzymes)として、プラスミドpCRBluntII−TOPO::FPU20−ubm−r16(ubm−r16突然変異を含有する、−213〜+86のUPA20プロモーターフラグメント(S7)を用いて、UPA20−ubm−r16プロモーターDNAの蛍光標識されたPCR産物を生成した。製造業者の指示に従って、Thermo SequenaseDyePrimer ManualCycleSequencing Kit(USB)を用いて、プラスミドpCRBluntII−TOPO::FPBs3、pCRBluntII−TOPO::FPBs3−E、およびpCRBluntII−TOPO::FPU20−ubm−r16を配列した。内部遺伝子GeneScan−500LIZ SizeStandard(Applied Biosystems)を、DNAフラグメントサイズを決定するために使用した。
TALエフェクターのDNA結合ドメインは、縦列配列された34アミノ酸反復単位からなる。反復単位のアミノ酸配列は、DNA標的特異性を定める12位および13位の2つの隣接した高度可変残基(HVR)を除いて、主に保存されている(Boch et al.(2009)Science326:1509−1512、Moscou&Bogdanove(2009)Science326:1501)。機能分析は、A(NI)、C(HD)、T(NG、IG)に優先的に結合するか、またはGおよびA(NN)に同等によく結合するHVRモチーフを特定した(Boch et al.(2009)Science326:1509−1512)。バイオインフォマティクス分析により、所定のプロモーター−TALエフェクター相互作用におけるHVRが、Gに特異的にマッチすることが示された(Moscou&Bogdanove(2009)Science326:1501)。しかしながら、この分析は、単一の(HN&NA)または2つの(NK)相互作用部位に基づいていた。我々の見解では、相互作用部位の数は、HVR特異性についての信頼できる結論に達するには少なすぎる。それにもかかわらず、これらのHVRは、Gへの特異的結合を仲介し得る好適な候補であると考えることができる。
TALエフェクターのDNA結合ドメインは、縦列配列された34アミノ酸反復単位(
REF)からなる。反復単位のアミノ酸配列は、DNA標的特異性を定める12位および13位の2つの隣接した高度可変残基(HVR)を除いて、主に保存されている(Boch et al.(2009)Science326:1509−1512、Moscou&Bogdanove(2009)Science326:1501)。異なるHVRモチーフは、異なるレベルの特異性で、個々のA、C、G、またはTヌクレオチドに結合する。重要なことに、統計的分析は、縦列配列された反復単位が、隣接単位の特異性を干渉しないことを示唆する(Moscou&Bogdanove(2009)Science326:1501)。したがって、事前に特徴付けられた特異性を備える反復単位のモジュラー組立ては、所望のDNA特異性を備えるDNA−認識モジュールの生成のための効率的な方法を提供する可能性が高い。
ONE4:e5553)。
異なる末端を大文字で定義し(粘着末端の配列オーバーハングの代わりに)、それらの配向(反復単位のN末端またはC末端)を角括弧内のNまたはC(例えば、A[C])で示す。第1反復単位遺伝子を含有する挿入プラスミドは、BsaI処置がA[N]およびB[C]末端を作り出すような方法で設計される。第2反復単位遺伝子は、BsaI切断後にB[N]およびC[C]末端を有する一方で、第3反復単位遺伝子を備える挿入プラスミドのBsaI切断は、C[N]およびD[C]末端等をもたらす。適合する末端のみが融合され得るため、第1反復単位遺伝子のB[C]末端は、第2反復単位遺伝子のB[N]末端に特異的に融合するであろう。同様に、第2反復単位遺伝子のC[C]末端は、第3反復単位遺伝子のC[N]末端に特異的に連結し、他も同様であろう。
FokIエンドヌクレアーゼまたは他の所望の機能ドメインへの、反復配列の融合も可能にする。
標的DNA配列およびFokIヌクレアーゼ(「TAL−type−ヌクレアーゼ」)を認識する、本発明の反復ドメインを含む融合タンパク質を、本明細書に開示される方法または当該技術分野で既知の方法のいずれかによって説明される通りに産生する。対応する標的DNAでのインキュベーションによって、融合タンパク質を、ヌクレアーゼ活性について試験する。反復ドメインDNA標的部位を、プラスミドベクターの多重クローン化部位へとクローン化する(例えば、ブルースクリプト)。陰性対照として、TALヌクレアーゼ標的部位を含有しない「空のベクター」または突然変異でクローン化された標的部位のいずれかを使用する。DNA基質のTALタイプヌクレアーゼでの処置の前に、ベクターを、ベクター骨格内で切断する好適な標準エンドヌクレアーゼでの処置によって直線化する。この直線化されたベクターを、インビトロで生成された反復ドメイン−FokIヌクレアーゼ融合タンパク質でインキュベートし、産物をアガロースゲル電気泳動によって分析する。ゲル電気泳動における2つのDNAフラグメントの検出は、特異的ヌクレアーゼ仲介型切断のための指標である。対照的に、反復ドメインによって認識される標的部位を含有しない陰性対照は、反復ドメイン−FokIヌクレアーゼ融合タンパク質での処置による影響を受けない。反復ドメイン−FokIヌクレアーゼ融合タンパク質を生成するために、インビトロ遺伝子発現およびタンパク質合成のための、DNA主導型、無細胞システムを使用する(例えば、T7High−Yield Protein Expression System;Promega)。かかるシステムを使用するために、反復ドメイン−FokIヌクレアーゼ融合タンパク質ヌクレオチド配列を、T7RNAポリメラーゼの前にクローン化する。インビトロ転写および翻訳を介して産生されるかかる融合タンパク質を、さらなる精製を行わずにDNA切断検定で使用する。
2009 004 659.3号、2009年7月13日に出願されたEP第09165328号、および2009年7月13日に出願されたUS第61/225,043号。
Claims (47)
- 標的DNA配列内の少なくとも1つの塩基対を選択的に認識するポリペプチドを産生する方法であって、前記方法は、反復ドメインを含むポリペプチドを合成することを含み、前記反復ドメインは、転写活性化因子様(TAL)エフェクターに由来する少なくとも1つの反復単位を含み、前記反復単位は、前記標的DNA配列内の塩基対の認識を決定する高度可変領域を含み、前記反復単位は、前記DNA配列内の1つの塩基対の前記認識に関与し、かつ前記高度可変領域は、
(a) C/Gの認識のためのHD、
(b) A/Tの認識のためのNI、
(c) T/Aの認識のためのNG、
(d) C/GまたはA/TまたはT/AまたはG/Cの認識のためのNS、
(e) G/CまたはA/Tの認識のためのNN、
(f) T/Aの認識のためのIG、
(g) C/Gの認識のためのN、
(h) C/GまたはT/Aの認識のためのHG、
(i) T/Aの認識のためのH、および
(j) G/Cの認識のためのNKからなる群から選択されるメンバーを含む、方法
。 - 前記高度可変領域は、前記反復単位内のアミノ酸12および13に対応する、請求項1に記載の方法。
- 前記反復ドメインは、1.5〜40.5個の反復単位を含む、請求項1または2に記載の方法。
- 前記反復ドメインは、11.5〜33.5個の反復単位を含む、請求項1または2に記載の方法。
- 前記ポリペプチドは、前記反復ドメインに作動可能に結合された少なくとも1つの追加ドメインをさらに含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記追加ドメインは、細菌、ウイルス、真菌、卵菌、ヒト、動物、植物、もしくは人工タンパク質、またはそれらの一部を含む、請求項5に記載の方法。
- 前記追加ドメインは、DNAまたはRNAを修飾することができる、タンパク質またはその機能部分もしくはドメインを含む、請求項6に記載の方法。
- 前記追加ドメインは、転写活性化因子、転写抑制因子、抵抗性仲介タンパク質、ヌクレアーゼ、トポイソメラーゼ、リガーゼ、インテグラーゼ、リコンビナーゼ、リゾルバーゼ、メチラーゼ、アセチラーゼ、デメチラーゼ、およびデアセチラーゼからなる群から選択されるタンパク質またはその機能部分もしくはドメインを含む、請求項6に記載の方法。
- 前記ポリペプチドの前記反復ドメインは、前記ポリペプチドをコードするDNA配列を発現することによって合成され、前記ポリペプチドをコードする前記DNA配列は、その後、前記ポリペプチドをコードする前記DNA配列を含む最終ベクターへと組み立てられる1つ以上の標的ベクター内で、前記反復単位を事前組み立てすることによって組み立てられる、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記反復単位は、30〜40個のアミノ酸を含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載
の方法。 - 前記反復単位は、33、34、35、または39個のアミノ酸を含む、請求項10に記載の方法。
- 前記ポリペプチドは、前記標的DNA配列内の、少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の塩基対を認識する、請求項1〜11のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリペプチドは、前記標的DNA配列内の全ての塩基対を認識する、請求項12に記載の方法。
- 前記ポリペプチドは、前記標的DNA配列に結合することができる、請求項12に記載の方法。
- 請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法によって産生される、ポリペプチド。
- 前記ポリペプチドは、天然産でない、請求項15に記載のポリペプチド。
- 請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法によって産生される前記ポリペプチドのためのコード配列を含む、DNA。
- 前記DNAは、天然産でない、請求項17に記載のDNA。
- 請求項17に記載のDNAに作動可能に結合されたプロモーターを含む、発現カセット。
- 請求項19に記載の発現カセットを含む、非ヒト宿主細胞。
- 前記宿主細胞は、細菌細胞、真菌細胞、動物細胞、または植物細胞である、請求項20に記載の宿主細胞。
- 請求項19に記載の発現カセットを含む、形質転換された、非ヒト生物。
- 前記生物は、真菌、動物、または植物である、請求項22に記載の形質転換生物。
- ポリペプチドによって、DNA配列内の塩基対を選択的に認識する方法であって、前記方法は、反復ドメインを含むポリペプチドを構築することを含み、前記反復ドメインは、TALエフェクターに由来する少なくとも1つの反復単位を含み、前記反復単位は、前記DNA配列内の塩基対の認識を決定する高度可変領域を含み、前記反復単位は、前記DNA配列内の1つの塩基対の前記認識に関与し、かつ前記高度可変領域は、
(a) C/Gの認識のためのHD、
(b) A/Tの認識のためのNI、
(c) T/Aの認識のためのNG、
(d) C/GまたはA/TまたはT/AまたはG/Cの認識のためのNS、
(e) G/CまたはA/Tの認識のためのNN、
(f) T/Aの認識のためのIG、
(g) C/Gの認識のためのN、
(h) C/GまたはT/Aの認識のためのHG、
(i) T/Aの認識のためのH、および
(j) G/Cの認識のためのNKからなる群から選択されるメンバーを含む、方法
。 - 前記高度可変領域は、前記反復単位内のアミノ酸12および13に対応する、請求項24に記載の方法。
- 前記反復ドメインは、1.5〜40.5個の反復単位を含む、請求項24または25に記載の方法。
- 前記反復ドメインは、11.5〜33.5個の反復単位を含む、請求項24または25に記載の方法。
- 前記ポリペプチドは、前記反復ドメインに作動可能に結合された少なくとも1つの追加ドメインをさらに含む、請求項24〜27のいずれか一項に記載の方法。
- 前記反復単位は、30〜40個のアミノ酸を含む、請求項24〜28のいずれか一項に記載の方法。
- 前記反復単位は、33、34、35、または39個のアミノ酸を含む、請求項29に記載の方法。
- 反復単位を含む前記反復ドメインは、標的認識および好ましくはDNA配列内の1つ以上の特異的塩基対の結合を達成するために、細菌、ウイルス、真菌、卵菌、ヒト、動物、または植物ポリペプチドに挿入され、任意に、前記反復単位は、DNA配列内の1つ以上の塩基対に対する事前選択された比活性を得るために、さらに任意に修飾されるAvrBs3様エフェクターの前記反復ドメインに由来する、請求項24〜30のいずれか一項に記載の方法。
- 前記反復単位を含む前記反復ドメインは、遺伝子の転写を制御するポリペプチド内、任意に転写活性化因子または抑制因子タンパク質内、任意にAvrBs3様タンパク質内、例えば、AvrBs3またはHaxエフェクタータンパク質内に含有される、請求項24〜31のいずれか一項に記載の方法。
- 反復ドメインの前記N末端領域は、前記反復単位の認識特異性のT/A5’に対する認識特異性を付与する、請求項24〜32のいずれか一項に記載の方法。
- 前記DNA配列内の前記塩基対は、遺伝子と組み合わされた発現制御要素に挿入され、前記発現制御要素は、前記遺伝子の前記発現を特異的に制御するために、前記発現制御要素に位置する前記塩基対を認識する前記反復単位内の、前記高度可変領域を含む転写制御タンパク質によって標的化され、前記発現制御要素は、好ましくはプロモーターである、請求項24〜33のいずれか一項に記載の方法。
- 前記遺伝子は、疾患抵抗性生物を得るための抵抗性仲介遺伝子であって、前記発現制御要素は、任意にAvrBs3様エフェクタータンパク質のための前記標的配列である、請求項31に記載の方法。
- 細胞中の標的遺伝子の発現を調節する方法であって、ポリペプチドを含有する細胞が提供され、前記ポリペプチドは、反復ドメインを含み、前記反復ドメインは、TALエフェクターに由来する少なくとも1つの反復単位を含み、前記反復単位は、DNA配列内の塩基対の認識を決定する高度可変領域を含み、前記反復単位は、前記DNA配列内の1つの
塩基対の前記認識に関与し、かつ前記高度可変領域は、
(a) C/Gの認識のためのHD、
(b) A/Tの認識のためのNI、
(c) T/Aの認識のためのNG、
(d) C/GまたはA/TまたはT/AまたはG/Cの認識のためのNS、
(e) G/CまたはA/Tの認識のためのNN、
(f) T/Aの認識のためのIG、
(g) C/Gの認識のためのN、
(h) C/GまたはT/Aの認識のためのHG、
(i) T/Aの認識のためのH、および
(j) G/Cの認識のためのNKからなる群から選択されるメンバーを含む、方法
。 - 反復ドメインを含むポリペプチドであって、前記反復ドメインは、TALエフェクターに由来する少なくとも1つの反復単位を含み、前記反復単位は、DNA配列内の塩基対の認識を決定する高度可変領域を含み、前記反復単位は、前記DNA配列内の1つの塩基対の前記認識に関与し、かつ前記高度可変領域は、
(a) C/Gの認識のためのHD、
(b) A/Tの認識のためのNI、
(c) T/Aの認識のためのNG、
(d) C/GまたはA/TまたはT/AまたはG/Cの認識のためのNS、
(e) G/CまたはA/Tの認識のためのNN、
(f) T/Aの認識のためのIG、
(g) C/Gの認識のためのN、
(h) C/GまたはT/Aの認識のためのHG、
(i) T/Aの認識のためのH、および
(j) G/Cの認識のためのNKからなる群から選択されるメンバーを含む、ポリ
ペプチド。 - 請求項37に記載のポリペプチドのためのコード配列を含む、DNA。
- 標的DNA配列内に位置する塩基対が、反復ドメインを含むポリペプチドによって特異的に認識され得るように、前記塩基対を含むように修飾されるDNAであって、前記反復ドメインは、TALエフェクターに由来する少なくとも1つの反復単位を含み、前記反復単位は、前記DNA配列内の塩基対の認識を決定する高度可変領域を含み、前記反復単位は、前記DNA配列内の1つの塩基対の前記認識に関与し、前記高度可変領域による選択的および決定された認識を受容するために、前記塩基対は、
(a) HDによる認識のためのC/G、
(b) NIによる認識のためのA/T、
(c) NGによる認識のためのT/A、
(d) NSによる認識のためのCTまたはA/TまたはT/AまたはG/C、
(e) NNによる認識のためのG/CまたはA/T、
(f) IGによる認識のためのT/A、
(g) Nによる認識のためのC/GまたはT/A、
(h) HGによる認識のためのT/A、
(i) Hによる認識のためのT/A、および
(j) NKによる認識のためのG/Cからなる群から選択される、DNA。 - 前記塩基対は、プロモーターまたは他の遺伝子制御配列内に位置する、請求項39に記載のDNA。
- 前記DNAは、天然産でない、請求項39に記載のDNA。
- 請求項39に記載のDNAを含む、ベクター。
- 請求項39に記載のDNAを含む、非ヒト宿主細胞。
- 前記宿主細胞は、細菌細胞、真菌細胞、動物細胞、または植物細胞である、請求項43に記載の宿主細胞。
- 請求項39に記載のDNAを含む、形質転換された、非ヒト生物。
- 前記生物は、真菌、動物、または植物である、請求項45に記載の形質転換生物。
- 反復ドメインを含むポリペプチドによって選択的に認識される、標的DNA配列を含むDNAを産生する方法であって、前記反復ドメインは、TALエフェクターに由来する少なくとも1つの反復単位を含み、前記反復単位は、前記標的DNA配列内で塩基対の認識を決定する高度可変領域を含み、前記反復単位は、前記標的DNA配列内で1つの塩基対の前記認識に関与し、前記方法は、前記反復単位によって認識されることができる塩基対を含む、DNAを合成することを含み、前記塩基対は、
(a) HDによる認識のためのC/G、
(b) NIによる認識のためのA/T、
(c) NGによる認識のためのT/A、
(d) NSによる認識のためのCTまたはA/TまたはT/AまたはG/C、
(e) NNによる認識のためのG/CまたはA/T、
(f) IGによる認識のためのT/A、
(g) Nによる認識のためのC/GまたはT/A、
(h) HGによる認識のためのT/A、
(i) Hによる認識のためのT/A、および
(j) NKによる認識のためのG/Cからなる群から選択される、方法。
Applications Claiming Priority (6)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE102009004659.3 | 2009-01-12 | ||
DE102009004659 | 2009-01-12 | ||
US22504309P | 2009-07-13 | 2009-07-13 | |
EP09165328A EP2206723A1 (en) | 2009-01-12 | 2009-07-13 | Modular DNA-binding domains |
US61/225,043 | 2009-07-13 | ||
EP09165328.7 | 2009-07-13 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2011544945A Division JP5753793B2 (ja) | 2009-01-12 | 2010-01-12 | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017253389A Division JP6508605B2 (ja) | 2009-01-12 | 2017-12-28 | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2015172063A true JP2015172063A (ja) | 2015-10-01 |
Family
ID=41264164
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2011544945A Active JP5753793B2 (ja) | 2009-01-12 | 2010-01-12 | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 |
JP2015104349A Pending JP2015172063A (ja) | 2009-01-12 | 2015-05-22 | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 |
JP2017253389A Active JP6508605B2 (ja) | 2009-01-12 | 2017-12-28 | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2011544945A Active JP5753793B2 (ja) | 2009-01-12 | 2010-01-12 | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017253389A Active JP6508605B2 (ja) | 2009-01-12 | 2017-12-28 | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US9353378B2 (ja) |
EP (5) | EP2206723A1 (ja) |
JP (3) | JP5753793B2 (ja) |
CN (3) | CN106008675B (ja) |
AU (1) | AU2010204105A1 (ja) |
CA (1) | CA2749305C (ja) |
DK (2) | DK3187587T3 (ja) |
IL (1) | IL213971A (ja) |
MX (1) | MX2011007467A (ja) |
SG (1) | SG172928A1 (ja) |
WO (1) | WO2010079430A1 (ja) |
Families Citing this family (418)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20120196370A1 (en) | 2010-12-03 | 2012-08-02 | Fyodor Urnov | Methods and compositions for targeted genomic deletion |
US20110239315A1 (en) | 2009-01-12 | 2011-09-29 | Ulla Bonas | Modular dna-binding domains and methods of use |
EP2206723A1 (en) | 2009-01-12 | 2010-07-14 | Bonas, Ulla | Modular DNA-binding domains |
US8772008B2 (en) | 2009-05-18 | 2014-07-08 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for increasing nuclease activity |
EP2449135B1 (en) | 2009-06-30 | 2016-01-06 | Sangamo BioSciences, Inc. | Rapid screening of biologically active nucleases and isolation of nuclease-modified cells |
EP2461819A4 (en) | 2009-07-28 | 2013-07-31 | Sangamo Biosciences Inc | METHODS AND COMPOSITIONS FOR TREATING TRI-NUCLEOTIDE REPEAT DISORDERS |
US8586526B2 (en) | 2010-05-17 | 2013-11-19 | Sangamo Biosciences, Inc. | DNA-binding proteins and uses thereof |
KR102262704B1 (ko) | 2009-08-11 | 2021-06-09 | 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 | 표적화 변형에 대한 동형접합성 유기체 |
NZ599351A (en) | 2009-10-22 | 2014-02-28 | Dow Agrosciences Llc | Engineered zinc finger proteins targeting plant genes involved in fatty acid biosynthesis |
US8956828B2 (en) | 2009-11-10 | 2015-02-17 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted disruption of T cell receptor genes using engineered zinc finger protein nucleases |
CN102725412B (zh) | 2009-11-27 | 2017-09-22 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 优化的内切核酸酶及其用途 |
EP2504430A4 (en) | 2009-11-27 | 2013-06-05 | Basf Plant Science Co Gmbh | CHIMERIC ENDONUCLEASES AND USES THEREOF |
CN102770539B (zh) | 2009-12-10 | 2016-08-03 | 明尼苏达大学董事会 | Tal效应子介导的dna修饰 |
WO2011100058A1 (en) | 2010-02-09 | 2011-08-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules |
CA2796600C (en) * | 2010-04-26 | 2019-08-13 | Sangamo Biosciences, Inc. | Genome editing of a rosa locus using zinc-finger nucleases |
EP2392208B1 (en) * | 2010-06-07 | 2016-05-04 | Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) | Fusion proteins comprising a DNA-binding domain of a Tal effector protein and a non-specific cleavage domain of a restriction nuclease and their use |
WO2011159369A1 (en) * | 2010-06-14 | 2011-12-22 | Iowa State University Research Foundation, Inc. | Nuclease activity of tal effector and foki fusion protein |
EP3511420B1 (en) | 2010-09-27 | 2021-04-07 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Compositions for inhibiting viral entry into cells |
JP6018069B2 (ja) | 2010-10-12 | 2016-11-02 | ザ・チルドレンズ・ホスピタル・オブ・フィラデルフィアThe Children’S Hospital Of Philadelphia | 血友病bを治療する方法及び組成物 |
US20140137292A1 (en) | 2011-01-14 | 2014-05-15 | University Of Florida Research Foundation Inc. | Citrus trees with resistance to citrus canker |
US9499592B2 (en) * | 2011-01-26 | 2016-11-22 | President And Fellows Of Harvard College | Transcription activator-like effectors |
WO2012116274A2 (en) * | 2011-02-25 | 2012-08-30 | Recombinetics, Inc. | Genetically modified animals and methods for making the same |
US10920242B2 (en) | 2011-02-25 | 2021-02-16 | Recombinetics, Inc. | Non-meiotic allele introgression |
US9528124B2 (en) | 2013-08-27 | 2016-12-27 | Recombinetics, Inc. | Efficient non-meiotic allele introgression |
US10030245B2 (en) | 2011-03-23 | 2018-07-24 | E I Du Pont De Nemours And Company | Methods for producing a complex transgenic trait locus |
KR101982360B1 (ko) * | 2011-04-05 | 2019-05-24 | 셀렉티스 | 콤팩트 tale-뉴클레아제의 발생 방법 및 이의 용도 |
EP2517731A1 (en) * | 2011-04-07 | 2012-10-31 | Ludwig-Maximilians-Universität München | Method of activating a target gene in a cell |
BR112013025567B1 (pt) | 2011-04-27 | 2021-09-21 | Amyris, Inc | Métodos para modificação genômica |
EP2535416A1 (en) | 2011-05-24 | 2012-12-19 | BASF Plant Science Company GmbH | Development of phytophthora resistant potato with increased yield |
TR201802544T4 (tr) | 2011-06-06 | 2018-03-21 | Bayer Cropscience Nv | Önceden seçilmiş bir bölgede bir bitki genomunu modifiye için yöntemler ve araçlar. |
AU2012333207A1 (en) | 2011-06-21 | 2014-01-23 | E.I. Du Pont De Nemours And Company | Methods and compositions for producing male sterile plants |
US20130097734A1 (en) | 2011-07-12 | 2013-04-18 | Two Blades Foundation | Late blight resistance genes |
EP3461896B1 (en) | 2011-07-15 | 2023-11-29 | The General Hospital Corporation | Methods of transcription activator like effector assembly |
JP6072788B2 (ja) | 2011-07-25 | 2017-02-01 | サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド | 嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(cftr)遺伝子を改変するための方法および組成物 |
WO2013019411A1 (en) | 2011-08-03 | 2013-02-07 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Methods and compositions for targeted integration in a plant |
CN102787125B (zh) * | 2011-08-05 | 2013-12-04 | 北京大学 | 一种构建tale重复序列的方法 |
BR112014003919A2 (pt) | 2011-08-22 | 2017-03-14 | Bayer Cropscience Ag | métodos e meios para modificar um genoma de planta |
CA2848417C (en) | 2011-09-21 | 2023-05-02 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for regulation of transgene expression |
CA2851563A1 (en) | 2011-10-12 | 2013-04-18 | Bayer Cropscience Ag | Plants with decreased activity of a starch dephosphorylating enzyme |
WO2013053730A1 (en) | 2011-10-12 | 2013-04-18 | Bayer Cropscience Ag | Plants with decreased activity of a starch dephosphorylating enzyme |
AU2012328682B2 (en) | 2011-10-27 | 2017-09-21 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for modification of the HPRT locus |
WO2013074999A1 (en) | 2011-11-16 | 2013-05-23 | Sangamo Biosciences, Inc. | Modified dna-binding proteins and uses thereof |
US9708414B2 (en) | 2011-11-18 | 2017-07-18 | UNIVERSITé LAVAL | Methods and products for increasing frataxin levels and uses thereof |
US10801017B2 (en) * | 2011-11-30 | 2020-10-13 | The Broad Institute, Inc. | Nucleotide-specific recognition sequences for designer TAL effectors |
US8450107B1 (en) | 2011-11-30 | 2013-05-28 | The Broad Institute Inc. | Nucleotide-specific recognition sequences for designer TAL effectors |
RU2691027C2 (ru) | 2011-12-05 | 2019-06-07 | Фэктор Байосайенс Инк. | Способы и препараты для трансфекции клеток |
DE102011122267A1 (de) | 2011-12-23 | 2013-06-27 | Kws Saat Ag | Neue aus Pflanzen stammende cis-regulatorische Elemente für die Entwicklung Pathogen-responsiver chimärer Promotoren |
WO2013101877A2 (en) | 2011-12-29 | 2013-07-04 | Iowa State University Research Foundation, Inc. | Genetically modified plants with resistance to xanthomonas and other bacterial plant pathogens |
EP2612918A1 (en) | 2012-01-06 | 2013-07-10 | BASF Plant Science Company GmbH | In planta recombination |
BR112014018294B1 (pt) | 2012-01-26 | 2022-01-11 | Norfolk Plant Sciences, Ltd | Método para produzir uma planta, cassete de expressão, e, célula bacteriana |
WO2013113911A2 (en) * | 2012-02-02 | 2013-08-08 | Ludwig-Maximilians-Universität München | Nucleotide sequences involved in plant pest resistance |
AU2013225950B2 (en) | 2012-02-29 | 2018-02-15 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for treating huntington's disease |
WO2013136274A1 (en) | 2012-03-13 | 2013-09-19 | University Of Guelph | Myb55 promoter and use thereof |
HUP1400495A2 (en) | 2012-03-13 | 2015-03-02 | Univ Guelph Guelph Ontario | Methods of increasing tolerance to heat stress and amino acid content of plants |
EP2828384B1 (en) * | 2012-03-23 | 2018-05-09 | Cellectis | Method to overcome dna chemical modifications sensitivity of engineered tale dna binding domains |
CN102627690B (zh) * | 2012-04-05 | 2014-12-17 | 浙江大学 | 一对转录激活子样效应因子核酸酶及其编码基因与应用 |
EP2841581B2 (en) | 2012-04-23 | 2023-03-08 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Targeted genome engineering in plants |
EP3597741A1 (en) * | 2012-04-27 | 2020-01-22 | Duke University | Genetic correction of mutated genes |
US9738879B2 (en) | 2012-04-27 | 2017-08-22 | Duke University | Genetic correction of mutated genes |
BR112014027468A2 (pt) | 2012-05-04 | 2017-06-27 | Du Pont | polinucleotídeo isolado ou recombinante, construção de dna recombinante, célula, planta, explante vegetal, semente transgênica, polipeptídeo isolado, composição, métodos de produção de meganuclease, de introdução de rompimento e de integração de um polinucleotídeo. |
AU2013259647B2 (en) | 2012-05-07 | 2018-11-08 | Corteva Agriscience Llc | Methods and compositions for nuclease-mediated targeted integration of transgenes |
CN102702331B (zh) * | 2012-05-23 | 2014-08-06 | 上海斯丹赛生物技术有限公司 | 一对转录激活子样效应因子核酸酶及其编码基因与应用 |
DK3401400T3 (da) | 2012-05-25 | 2019-06-03 | Univ California | Fremgangsmåder og sammensætninger til rna-styret mål-dna-modifikation og til rna-styret transskriptionsmodulering |
US9890364B2 (en) | 2012-05-29 | 2018-02-13 | The General Hospital Corporation | TAL-Tet1 fusion proteins and methods of use thereof |
US9815877B2 (en) | 2012-06-07 | 2017-11-14 | The Children's Hospital Of Philadelphia | Controlled gene expression methods |
CA2877290A1 (en) | 2012-06-19 | 2013-12-27 | Daniel F. Voytas | Gene targeting in plants using dna viruses |
ES2613691T3 (es) | 2012-07-11 | 2017-05-25 | Sangamo Biosciences, Inc. | Métodos y composiciones para el tratamiento de enfermedades por almacenamiento lisosomal |
US10648001B2 (en) | 2012-07-11 | 2020-05-12 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Method of treating mucopolysaccharidosis type I or II |
JP6329537B2 (ja) | 2012-07-11 | 2018-05-23 | サンガモ セラピューティクス, インコーポレイテッド | 生物学的薬剤の送達のための方法および組成物 |
US10058078B2 (en) | 2012-07-31 | 2018-08-28 | Recombinetics, Inc. | Production of FMDV-resistant livestock by allele substitution |
WO2014036219A2 (en) | 2012-08-29 | 2014-03-06 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for treatment of a genetic condition |
KR102147007B1 (ko) | 2012-09-07 | 2020-08-21 | 다우 아그로사이언시즈 엘엘씨 | Fad3 성능 유전자좌 및 표적화 파단을 유도할 수 있는 상응하는 표적 부위 특이적 결합 단백질 |
UA118090C2 (uk) | 2012-09-07 | 2018-11-26 | ДАУ АГРОСАЙЄНСІЗ ЕлЕлСі | Спосіб інтегрування послідовності нуклеїнової кислоти, що представляє інтерес, у ген fad2 у клітині сої та специфічний для локусу fad2 білок, що зв'язується, здатний індукувати спрямований розрив |
UA119135C2 (uk) | 2012-09-07 | 2019-05-10 | ДАУ АГРОСАЙЄНСІЗ ЕлЕлСі | Спосіб отримання трансгенної рослини |
EP3763810A3 (en) | 2012-10-10 | 2021-07-14 | Sangamo Therapeutics, Inc. | T cell modifying compounds and uses thereof |
EP2906602B1 (en) | 2012-10-12 | 2019-01-16 | The General Hospital Corporation | Transcription activator-like effector (tale) - lysine-specific demethylase 1 (lsd1) fusion proteins |
RU2711249C2 (ru) | 2012-11-01 | 2020-01-15 | Фэктор Байосайенс Инк. | Способы и продукты для экспрессии белков в клетках |
BR112015009967B1 (pt) | 2012-11-01 | 2022-07-12 | Medicago Inc. | Método para a produção de um polipeptídeo terapêutico |
WO2014089212A1 (en) | 2012-12-05 | 2014-06-12 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for regulation of metabolic disorders |
MX2015007550A (es) | 2012-12-12 | 2017-02-02 | Broad Inst Inc | Suministro, modificación y optimización de sistemas, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias y aplicaciones terapéuticas. |
WO2014093709A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
ES2673864T3 (es) | 2012-12-21 | 2018-06-26 | Cellectis | Patatas con endulzamiento inducido en frío reducido |
WO2014100525A2 (en) | 2012-12-21 | 2014-06-26 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods for auxin-analog conjugation |
EP3623463B1 (en) | 2013-02-07 | 2021-10-20 | The General Hospital Corporation | Tale transcriptional activators |
EP2963113B1 (en) * | 2013-02-14 | 2019-11-06 | Osaka University | Method for isolating specific genomic region using molecule binding specifically to endogenous dna sequence |
CN103319574A (zh) * | 2013-02-16 | 2013-09-25 | 清华大学 | 分离的多肽及其应用 |
CN109913495B (zh) | 2013-02-20 | 2022-11-25 | 瑞泽恩制药公司 | 大鼠的遗传修饰 |
AU2014218807A1 (en) | 2013-02-22 | 2015-09-03 | Cellular Dynamics International, Inc. | Hepatocyte production via forward programming by combined genetic and chemical engineering |
CA2901676C (en) | 2013-02-25 | 2023-08-22 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for enhancing nuclease-mediated gene disruption |
CA2905399A1 (en) | 2013-03-11 | 2014-10-09 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Methods and compositions employing a sulfonylurea-dependent stabilization domain |
RU2694686C2 (ru) | 2013-03-12 | 2019-07-16 | Е.И.Дюпон Де Немур Энд Компани | Способы идентификации вариантных сайтов распознавания для редкощепящих сконструированных средств для индукции двунитевого разрыва, и композиции с ними, и их применения |
BR112015023286A2 (pt) | 2013-03-14 | 2018-03-06 | Arzeda Corp | polipeptídeo recombinante com atividade da dicamba descarboxilase, construto de polinucleotídeo, célula, método de produção de uma célula hospedeira compreendendo um polinucleotídeo heterólogo que codifica um polipeptídeo tendo atividade da dicamba descarboxilase, método para descarboxilar dicamba, um derivado de dicamba ou um metabolito de dicamba, método para a detecção de um polipeptideo e método para a detecção da presença de um polinucleotideo que codifica um polipeptideo tendo atividade da dicamba descarboxilase |
US20140289906A1 (en) | 2013-03-14 | 2014-09-25 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions Having Dicamba Decarboxylase Activity and Methods of Use |
US10113162B2 (en) | 2013-03-15 | 2018-10-30 | Cellectis | Modifying soybean oil composition through targeted knockout of the FAD2-1A/1B genes |
US9828582B2 (en) | 2013-03-19 | 2017-11-28 | Duke University | Compositions and methods for the induction and tuning of gene expression |
US9937207B2 (en) | 2013-03-21 | 2018-04-10 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Targeted disruption of T cell receptor genes using talens |
CA2908403A1 (en) | 2013-04-02 | 2014-10-09 | Bayer Cropscience Nv | Targeted genome engineering in eukaryotes |
CA2908512C (en) | 2013-04-05 | 2023-10-24 | Dow Agrosciences Llc | Methods and compositions for integration of an exogenous sequence within the genome of plants |
CN111500630A (zh) | 2013-04-16 | 2020-08-07 | 瑞泽恩制药公司 | 大鼠基因组的靶向修饰 |
EP2796558A1 (en) | 2013-04-23 | 2014-10-29 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Improved gene targeting and nucleic acid carrier molecule, in particular for use in plants |
CN103289974A (zh) * | 2013-04-28 | 2013-09-11 | 新疆农垦科学院 | 绵羊fgf5基因定点敲除系统及其应用 |
CN103233004B (zh) * | 2013-04-28 | 2015-04-29 | 新疆农垦科学院 | 一种人工dna分子及检测目标基因表达的方法 |
US10604771B2 (en) | 2013-05-10 | 2020-03-31 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Delivery methods and compositions for nuclease-mediated genome engineering |
US10704060B2 (en) | 2013-06-05 | 2020-07-07 | Duke University | RNA-guided gene editing and gene regulation |
EP4245853A3 (en) | 2013-06-17 | 2023-10-18 | The Broad Institute, Inc. | Optimized crispr-cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation |
AU2014281028B2 (en) | 2013-06-17 | 2020-09-10 | Massachusetts Institute Of Technology | Delivery and use of the CRISPR-Cas systems, vectors and compositions for hepatic targeting and therapy |
JP6702858B2 (ja) | 2013-06-17 | 2020-06-03 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | ウイルス成分を使用して障害および疾患をターゲティングするためのCRISPR−Cas系および組成物の送達、使用および治療上の適用 |
EP3011029B1 (en) | 2013-06-17 | 2019-12-11 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, engineering and optimization of tandem guide systems, methods and compositions for sequence manipulation |
EP3725885A1 (en) | 2013-06-17 | 2020-10-21 | The Broad Institute, Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions methods, screens and applications thereof |
EP2818867A1 (en) | 2013-06-27 | 2014-12-31 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Antibodies conjugated to at least one nucleic acid molecule and their use in multiplex immuno-detection assays |
CA2920899C (en) | 2013-08-28 | 2023-02-28 | Sangamo Biosciences, Inc. | Compositions for linking dna-binding domains and cleavage domains |
DE102013014637A1 (de) | 2013-09-04 | 2015-03-05 | Kws Saat Ag | HELMlNTHOSPORlUM TURClCUM-RESlSTENTE PFLANZE |
WO2015032494A2 (de) | 2013-09-04 | 2015-03-12 | Kws Saat Ag | Helminthosporium turcicum-resistente pflanze |
US9476884B2 (en) | 2013-10-04 | 2016-10-25 | University Of Massachusetts | Hybridization- independent labeling of repetitive DNA sequence in human chromosomes |
WO2015052335A1 (en) * | 2013-10-11 | 2015-04-16 | Cellectis | Methods and kits for detecting nucleic acid sequences of interest using dna-binding protein domain |
ES2881473T3 (es) | 2013-10-17 | 2021-11-29 | Sangamo Therapeutics Inc | Métodos de suministro y composiciones para la modificación por ingeniería genética del genoma mediada por nucleasas |
EP3057432B1 (en) | 2013-10-17 | 2018-11-21 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Delivery methods and compositions for nuclease-mediated genome engineering in hematopoietic stem cells |
AP2016009207A0 (en) | 2013-10-25 | 2016-05-31 | Livestock Improvement Corp Ltd | Genetic markers and uses therefor |
JP6560205B2 (ja) | 2013-11-04 | 2019-08-14 | ダウ アグロサイエンシィズ エルエルシー | 最適なダイズ遺伝子座 |
AU2014341929B2 (en) | 2013-11-04 | 2017-11-30 | Corteva Agriscience Llc | Optimal maize loci |
CN106164085A (zh) | 2013-11-04 | 2016-11-23 | 美国陶氏益农公司 | 最优玉米座位 |
KR102269377B1 (ko) | 2013-11-04 | 2021-06-28 | 코르테바 애그리사이언스 엘엘씨 | 최적 대두 유전자좌 |
KR102431079B1 (ko) | 2013-11-11 | 2022-08-11 | 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 | 헌팅턴병을 치료하기 위한 방법 및 조성물 |
WO2015073683A2 (en) | 2013-11-13 | 2015-05-21 | Children's Medical Center Corporation | Nuclease-mediated regulation of gene expression |
EP2878667A1 (en) * | 2013-11-29 | 2015-06-03 | Institut Pasteur | TAL effector means useful for partial or full deletion of DNA tandem repeats |
CA2931637C (en) | 2013-12-09 | 2023-10-10 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for treating hemophilia |
RS58159B1 (sr) | 2013-12-11 | 2019-03-29 | Regeneron Pharma | Postupci i kompozicije za ciljanu modifikaciju genoma |
US9546384B2 (en) | 2013-12-11 | 2017-01-17 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions for the targeted modification of a mouse genome |
SG10201804973TA (en) | 2013-12-12 | 2018-07-30 | Broad Inst Inc | Compositions and Methods of Use of Crispr-Cas Systems in Nucleotide Repeat Disorders |
WO2015089364A1 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | The Broad Institute Inc. | Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof |
EP3080271B1 (en) | 2013-12-12 | 2020-02-12 | The Broad Institute, Inc. | Systems, methods and compositions for sequence manipulation with optimized functional crispr-cas systems |
CN111206032A (zh) | 2013-12-12 | 2020-05-29 | 布罗德研究所有限公司 | 用于基因组编辑的crispr-cas系统和组合物的递送、用途和治疗应用 |
WO2015092460A1 (en) | 2013-12-18 | 2015-06-25 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | New gene mutations for the diagnosis of arthrogryposis multiplex congenita and congenital peripheral neuropathies disease |
KR102274445B1 (ko) | 2013-12-19 | 2021-07-08 | 아미리스 인코퍼레이티드 | 게놈 삽입을 위한 방법 |
US10774338B2 (en) | 2014-01-16 | 2020-09-15 | The Regents Of The University Of California | Generation of heritable chimeric plant traits |
WO2015116680A1 (en) | 2014-01-30 | 2015-08-06 | Two Blades Foundation | Plants with enhanced resistance to phytophthora |
EP4249036A3 (en) | 2014-01-31 | 2023-10-25 | Factor Bioscience Inc. | Methods and products for nucleic acid production and delivery |
WO2015117081A2 (en) | 2014-02-03 | 2015-08-06 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for treatment of a beta thalessemia |
US10370680B2 (en) | 2014-02-24 | 2019-08-06 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Method of treating factor IX deficiency using nuclease-mediated targeted integration |
TW201538518A (zh) | 2014-02-28 | 2015-10-16 | Dow Agrosciences Llc | 藉由嵌合基因調控元件所賦予之根部特異性表現 |
CN106459894B (zh) | 2014-03-18 | 2020-02-18 | 桑格摩生物科学股份有限公司 | 用于调控锌指蛋白表达的方法和组合物 |
GB201406970D0 (en) | 2014-04-17 | 2014-06-04 | Green Biologics Ltd | Targeted mutations |
GB201406968D0 (en) | 2014-04-17 | 2014-06-04 | Green Biologics Ltd | Deletion mutants |
US20170107486A1 (en) | 2014-04-21 | 2017-04-20 | Cellular Dynamics International, Inc. | Hepatocyte production via forward programming by combined genetic and chemical engineering |
WO2015164748A1 (en) | 2014-04-24 | 2015-10-29 | Sangamo Biosciences, Inc. | Engineered transcription activator like effector (tale) proteins |
CN104178506B (zh) * | 2014-04-30 | 2017-03-01 | 清华大学 | Taler蛋白通过空间位阻发挥转录抑制作用及其应用 |
WO2015171603A1 (en) | 2014-05-06 | 2015-11-12 | Two Blades Foundation | Methods for producing plants with enhanced resistance to oomycete pathogens |
RU2691102C2 (ru) | 2014-05-08 | 2019-06-11 | Сангамо Байосайенсиз, Инк. | Способы и композиции для лечения болезни хантингтона |
EP3142707A4 (en) | 2014-05-13 | 2018-02-21 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for prevention or treatment of a disease |
CN113215196A (zh) | 2014-06-06 | 2021-08-06 | 瑞泽恩制药公司 | 用于修饰所靶向基因座的方法和组合物 |
WO2015193858A1 (en) | 2014-06-20 | 2015-12-23 | Cellectis | Potatoes with reduced granule-bound starch synthase |
SI3354732T1 (sl) | 2014-06-23 | 2020-07-31 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Z nukleazo posredovan DNA sklop |
HUE041584T2 (hu) | 2014-06-26 | 2019-05-28 | Regeneron Pharma | Célzott genetikai módosítások és alkalmazási módszerek és készítmények |
US9757420B2 (en) | 2014-07-25 | 2017-09-12 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Gene editing for HIV gene therapy |
WO2016014794A1 (en) | 2014-07-25 | 2016-01-28 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for modulating nuclease-mediated genome engineering in hematopoietic stem cells |
US9616090B2 (en) | 2014-07-30 | 2017-04-11 | Sangamo Biosciences, Inc. | Gene correction of SCID-related genes in hematopoietic stem and progenitor cells |
CN108064129A (zh) | 2014-09-12 | 2018-05-22 | 纳幕尔杜邦公司 | 玉米和大豆中复合性状基因座的位点特异性整合位点的产生和使用方法 |
CA2960769A1 (en) | 2014-09-16 | 2016-03-24 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for nuclease-mediated genome engineering and correction in hematopoietic stem cells |
CN104267011A (zh) * | 2014-09-23 | 2015-01-07 | 中国科学院东北地理与农业生态研究所 | 一种转基因羊卵母细胞的筛选方法 |
WO2016061374A1 (en) | 2014-10-15 | 2016-04-21 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions for generating or maintaining pluripotent cells |
WO2016066671A1 (en) | 2014-10-29 | 2016-05-06 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Method for treating resistant cancers using progastrin inhibitors |
DE102014016667B4 (de) | 2014-11-12 | 2024-03-07 | Kws Saat Se | Haploideninduktoren |
WO2016081924A1 (en) | 2014-11-20 | 2016-05-26 | Duke University | Compositions, systems and methods for cell therapy |
WO2016094867A1 (en) | 2014-12-12 | 2016-06-16 | The Broad Institute Inc. | Protected guide rnas (pgrnas) |
US20170327834A1 (en) | 2014-12-15 | 2017-11-16 | Syngenta Participations Ag | Pesticidal microrna carriers and use thereof |
US10889834B2 (en) | 2014-12-15 | 2021-01-12 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for enhancing targeted transgene integration |
RU2707137C2 (ru) | 2014-12-19 | 2019-11-22 | Регенерон Фармасьютикалз, Инк. | Способы и композиции для нацеленной генетической модификации посредством одноэтапного множественного нацеливания |
US10676726B2 (en) | 2015-02-09 | 2020-06-09 | Duke University | Compositions and methods for epigenome editing |
US20180031579A1 (en) | 2015-02-12 | 2018-02-01 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods for predicting the responsiveness of a patient affected with malignant hematological disease to chemotherapy treatment and methods of treatment of such disease |
CA2976376A1 (en) | 2015-02-13 | 2016-08-18 | Factor Bioscience Inc. | Nucleic acid products and methods of administration thereof |
WO2016142427A1 (en) | 2015-03-10 | 2016-09-15 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Method ank kit for reprogramming somatic cells |
EP3270685B1 (en) | 2015-03-19 | 2023-07-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Methods and compositions for accelerated trait introgression |
EP3277823B1 (en) | 2015-04-03 | 2023-09-13 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Composition and methods of genome editing of b-cells |
EP3283633A2 (en) | 2015-04-15 | 2018-02-21 | Dow AgroSciences LLC | Plant promoter for transgene expression |
KR20170136573A (ko) | 2015-04-15 | 2017-12-11 | 다우 아그로사이언시즈 엘엘씨 | 트랜스젠 발현을 위한 식물 프로모터 |
JP6544565B2 (ja) * | 2015-04-28 | 2019-07-17 | 国立大学法人広島大学 | 哺乳動物細胞内で目的遺伝子の発現を高める方法およびキット、並びに、その利用 |
US10179918B2 (en) | 2015-05-07 | 2019-01-15 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for increasing transgene activity |
WO2016182881A1 (en) | 2015-05-09 | 2016-11-17 | Two Blades Foundation | Late blight resistance gene from solanum americanum and methods of use |
CN108290933A (zh) | 2015-06-18 | 2018-07-17 | 布罗德研究所有限公司 | 降低脱靶效应的crispr酶突变 |
WO2016205759A1 (en) | 2015-06-18 | 2016-12-22 | The Broad Institute Inc. | Engineering and optimization of systems, methods, enzymes and guide scaffolds of cas9 orthologs and variants for sequence manipulation |
CA2991301A1 (en) | 2015-07-13 | 2017-01-19 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Delivery methods and compositions for nuclease-mediated genome engineering |
CA2996001A1 (en) | 2015-08-25 | 2017-03-02 | Duke University | Compositions and methods of improving specificity in genomic engineering using rna-guided endonucleases |
US10837024B2 (en) | 2015-09-17 | 2020-11-17 | Cellectis | Modifying messenger RNA stability in plant transformations |
TW201718862A (zh) | 2015-09-22 | 2017-06-01 | Dow Agrosciences Llc | 用於轉殖基因表現之植物啟動子及3’utr |
TW201718861A (zh) | 2015-09-22 | 2017-06-01 | 道禮責任有限公司 | 用於轉殖基因表現之植物啟動子及3’utr |
CN108348576B (zh) | 2015-09-23 | 2022-01-11 | 桑格摩生物治疗股份有限公司 | Htt阻抑物及其用途 |
WO2017062790A1 (en) | 2015-10-09 | 2017-04-13 | Two Blades Foundation | Cold shock protein receptors and methods of use |
EP4089175A1 (en) | 2015-10-13 | 2022-11-16 | Duke University | Genome engineering with type i crispr systems in eukaryotic cells |
US10280429B2 (en) | 2015-10-22 | 2019-05-07 | Dow Agrosciences Llc | Plant promoter for transgene expression |
US20170121726A1 (en) | 2015-11-04 | 2017-05-04 | Dow Agrosciences Llc | Plant promoter for transgene expression |
BR112018007796A2 (pt) | 2015-11-06 | 2018-10-30 | Du Pont | plantas de soja, partes de plantas de soja ou sementes de soja, método para selecionar uma célula de soja, métodos de seleção de uma célula de soja e de produção de um locus e molécula de ácido nucleico |
CA3004349A1 (en) | 2015-11-23 | 2017-06-01 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for engineering immunity |
EP3173485B1 (de) | 2015-11-27 | 2021-08-25 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Kühletolerante pflanze |
EP3390437A4 (en) | 2015-12-18 | 2019-10-16 | Sangamo Therapeutics, Inc. | TARGETED DISORDER OF MHC CELL RECEPTOR |
JP7128741B2 (ja) | 2015-12-18 | 2022-08-31 | サンガモ セラピューティクス, インコーポレイテッド | T細胞受容体の標的化破壊 |
DE102015016445A1 (de) | 2015-12-21 | 2017-06-22 | Kws Saat Se | Restorer-Pflanze |
DE102015017161A1 (de) | 2015-12-21 | 2017-06-22 | Kws Saat Se | Restorer-Pflanze |
US11840693B2 (en) | 2015-12-21 | 2023-12-12 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Restorer plants |
CN109072195A (zh) | 2015-12-30 | 2018-12-21 | 诺华股份有限公司 | 具有增强功效的免疫效应细胞疗法 |
EP3769775A3 (en) | 2016-02-02 | 2021-03-17 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Compositions for linking dna-binding domains and cleavage domains |
WO2017134601A1 (en) | 2016-02-02 | 2017-08-10 | Cellectis | Modifying soybean oil composition through targeted knockout of the fad3a/b/c genes |
US20190249172A1 (en) | 2016-02-18 | 2019-08-15 | The Regents Of The University Of California | Methods and compositions for gene editing in stem cells |
JP2019515654A (ja) | 2016-03-16 | 2019-06-13 | ザ ジェイ. デヴィッド グラッドストーン インスティテューツ | 肥満及び/又は糖尿病を処置するための方法及び組成物、並びに候補処置薬剤を識別するための方法及び組成物 |
CN107344962B (zh) * | 2016-05-04 | 2021-03-02 | 中国科学院微生物研究所 | 阻遏蛋白、调控元件组和基因表达调控系统及其构建方法 |
EP4219731A3 (en) | 2016-05-18 | 2023-08-09 | Amyris, Inc. | Compositions and methods for genomic integration of nucleic acids into exogenous landing pads |
CN109415737A (zh) | 2016-05-25 | 2019-03-01 | 嘉吉公司 | 用于在植物中产生突变的工程化核酸酶 |
MX2018014496A (es) | 2016-05-26 | 2019-03-28 | Nunhems Bv | Plantas productoras de frutas sin semillas. |
US11293021B1 (en) | 2016-06-23 | 2022-04-05 | Inscripta, Inc. | Automated cell processing methods, modules, instruments, and systems |
CN109803530A (zh) | 2016-07-29 | 2019-05-24 | 瑞泽恩制药公司 | 包含引起c-截短的原纤维蛋白-1表达的突变的小鼠 |
SG11201901107RA (en) | 2016-08-11 | 2019-03-28 | Jackson Lab | Methods and compositions relating to improved human red blood cell survival in genetically modified immunodeficient non-human animals |
US10576167B2 (en) | 2016-08-17 | 2020-03-03 | Factor Bioscience Inc. | Nucleic acid products and methods of administration thereof |
KR20220145913A (ko) | 2016-08-24 | 2022-10-31 | 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 | 가공된 표적 특이적 뉴클레아제 |
WO2018049009A2 (en) | 2016-09-07 | 2018-03-15 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Modulation of liver genes |
US20190225974A1 (en) | 2016-09-23 | 2019-07-25 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Targeted genome optimization in plants |
CN109844126A (zh) | 2016-09-28 | 2019-06-04 | 诺华股份有限公司 | 基于多孔膜的大分子递送系统 |
EP3519574B1 (en) | 2016-10-03 | 2022-01-19 | Corteva Agriscience LLC | Plant promoter for transgene expression |
US10519459B2 (en) | 2016-10-03 | 2019-12-31 | Dow Agrosciences Llc | Plant promoter from Panicum virgatum |
EP3757120B8 (en) | 2016-10-04 | 2022-06-15 | Precision Biosciences, Inc. | Co-stimulatory domains for use in genetically-modified cells |
WO2018069232A1 (en) | 2016-10-10 | 2018-04-19 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods for predicting the risk of having cardiac hypertrophy |
GB201617559D0 (en) | 2016-10-17 | 2016-11-30 | University Court Of The University Of Edinburgh The | Swine comprising modified cd163 and associated methods |
CN110022904B (zh) | 2016-10-20 | 2024-04-19 | 桑格摩生物治疗股份有限公司 | 用于治疗法布里病的方法和组合物 |
WO2018081775A1 (en) | 2016-10-31 | 2018-05-03 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Gene correction of scid-related genes in hematopoietic stem and progenitor cells |
WO2018076335A1 (en) | 2016-10-31 | 2018-05-03 | Institute Of Genetics And Developmental Biology, Chinese Academy Of Sciences | Compositions and methods for enhancing abiotic stress tolerance |
US20180245065A1 (en) | 2016-11-01 | 2018-08-30 | Novartis Ag | Methods and compositions for enhancing gene editing |
UY37482A (es) | 2016-11-16 | 2018-05-31 | Cellectis | Métodos para alterar el contenido de aminoácidos en plantas mediante mutaciones de desplazamiento de marco |
MX2019006426A (es) | 2016-12-01 | 2019-08-14 | Sangamo Therapeutics Inc | Reguladores de tau, y composiciones y metodos para su administracion. |
CN110249051A (zh) | 2016-12-08 | 2019-09-17 | 凯斯西储大学 | 增强功能性髓鞘产生的方法和组合物 |
CN110462047A (zh) | 2016-12-16 | 2019-11-15 | 双刃基金会 | 晚疫病抗性基因及使用方法 |
RU2021133626A (ru) | 2017-01-23 | 2022-01-31 | Регенерон Фармасьютикалз, Инк. | Варианты hsd17b13 и их применения |
EP3366778A1 (de) | 2017-02-28 | 2018-08-29 | Kws Saat Se | Haploidisierung in sorghum |
WO2018160731A1 (en) | 2017-02-28 | 2018-09-07 | Novartis Ag | Shp inhibitor compositions and uses for chimeric antigen receptor therapy |
JP2020515248A (ja) | 2017-03-21 | 2020-05-28 | ザ ジャクソン ラボラトリーThe Jackson Laboratory | ヒトAPOE4およびマウスTrem2 p.R47Hを発現する遺伝子改変されたマウス、ならびにその使用の方法 |
RU2019133280A (ru) | 2017-03-22 | 2021-04-22 | Новартис Аг | Композиции и способы для иммуноонкологии |
US10980779B2 (en) | 2017-03-24 | 2021-04-20 | Inserm (Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale) | GFI1 inhibitors for the treatment of hyperglycemia |
WO2018198049A1 (en) | 2017-04-25 | 2018-11-01 | Cellectis | Alfalfa with reduced lignin composition |
EP3615068A1 (en) | 2017-04-28 | 2020-03-04 | Novartis AG | Bcma-targeting agent, and combination therapy with a gamma secretase inhibitor |
US20200055948A1 (en) | 2017-04-28 | 2020-02-20 | Novartis Ag | Cells expressing a bcma-targeting chimeric antigen receptor, and combination therapy with a gamma secretase inhibitor |
EP3619322A4 (en) | 2017-05-03 | 2021-06-30 | Sangamo Therapeutics, Inc. | METHODS AND COMPOSITIONS FOR MODIFICATION OF A TRANSMEMBRANARY CONDUCTANCE REGULATORY GENE IN MUCOVISCIDOSIS (CFTR) |
CA3062698A1 (en) | 2017-05-08 | 2018-11-15 | Precision Biosciences, Inc. | Nucleic acid molecules encoding an engineered antigen receptor and an inhibitory nucleic acid molecule and methods of use thereof |
WO2018209209A1 (en) | 2017-05-12 | 2018-11-15 | Two Blades Foundation | Methods for screening proteins for pattern recognition receptor function in plant protoplasts |
EP3621433B1 (en) | 2017-05-12 | 2022-07-27 | The Jackson Laboratory | Nsg mice lacking mhc class i and class ii |
US11512287B2 (en) | 2017-06-16 | 2022-11-29 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Targeted disruption of T cell and/or HLA receptors |
US9982279B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-05-29 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
US20200291413A1 (en) | 2017-06-23 | 2020-09-17 | University Of Kentucky Research Foundation | Method |
US10011849B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-07-03 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
WO2019005957A1 (en) | 2017-06-30 | 2019-01-03 | Precision Biosciences, Inc. | GENETICALLY MODIFIED T CELLS COMPRISING A MODIFIED INTRON IN THE ALPHA T CELL RECEPTOR GENE |
US20200140896A1 (en) | 2017-06-30 | 2020-05-07 | Novartis Ag | Methods for the treatment of disease with gene editing systems |
HRP20220615T1 (hr) | 2017-06-30 | 2022-06-24 | Inscripta, Inc. | Postupci, moduli, instrumenti i sustavi za automatiziranu obradu stanica |
EP3658675A1 (en) | 2017-07-28 | 2020-06-03 | Two Blades Foundation | Potyvirus resistance genes and methods of use |
EP3447134B1 (en) | 2017-08-22 | 2023-10-11 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Increased fungal resistance in crop plants |
US10738327B2 (en) | 2017-08-28 | 2020-08-11 | Inscripta, Inc. | Electroporation cuvettes for automation |
EP3675623A1 (en) | 2017-08-29 | 2020-07-08 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Improved blue aleurone and other segregation systems |
CN111356766A (zh) | 2017-09-18 | 2020-06-30 | 阿迈瑞斯公司 | 用于遗传工程改造克鲁维酵母宿主细胞的方法 |
EP3684927B1 (en) | 2017-09-18 | 2024-05-29 | Amyris, Inc. | Methods for genomic integration for kluyveromyces host cells |
CN107759673B (zh) * | 2017-09-27 | 2021-06-04 | 复旦大学 | 可对hbv的dna进行表观甲基化修饰的蛋白分子及其应用 |
MX2020003589A (es) | 2017-09-29 | 2020-07-22 | Regeneron Pharma | Animales no humanos que comprenden un locus ttr humanizado y metodos de uso. |
EP3687621A4 (en) | 2017-09-30 | 2021-08-11 | Inscripta, Inc. | CONTINUOUS FLOW ELECTROPORATION INSTRUMENTATION |
WO2019070856A1 (en) | 2017-10-03 | 2019-04-11 | Precision Biosciences, Inc. | MODIFIED EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR PEPTIDES FOR USE IN GENETICALLY MODIFIED CELLS |
US20200299658A1 (en) | 2017-11-01 | 2020-09-24 | Precision Biosciences, Inc. | Engineered nucleases that target human and canine factor viii genes as a treatment for hemophilia a |
WO2019094725A2 (en) | 2017-11-09 | 2019-05-16 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Genetic modification of cytokine inducible sh2-containing protein (cish) gene |
WO2019108619A1 (en) | 2017-11-28 | 2019-06-06 | Two Blades Foundation | Methods and compositions for enhancing the disease resistance of plants |
EP3501268B1 (en) | 2017-12-22 | 2021-09-15 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Regeneration of plants in the presence of histone deacetylase inhibitors |
EP3508581A1 (en) | 2018-01-03 | 2019-07-10 | Kws Saat Se | Regeneration of genetically modified plants |
CN111954540A (zh) | 2018-02-08 | 2020-11-17 | 桑格摩生物治疗股份有限公司 | 工程化靶标特异性核酸酶 |
EP3768836B1 (en) | 2018-03-20 | 2023-12-20 | Tsinghua University | Alzheimer's disease animal model and use thereof |
EP3545756A1 (en) | 2018-03-28 | 2019-10-02 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Regeneration of plants in the presence of inhibitors of the histone methyltransferase ezh2 |
EP3775159A4 (en) | 2018-03-29 | 2022-01-19 | Inscripta, Inc. | AUTOMATED REGULATION OF CELL GROWTH RATES FOR INDUCTION AND TRANSFORMATION |
CN112105731A (zh) | 2018-03-30 | 2020-12-18 | 日内瓦大学 | 微小rna表达构建体及其用途 |
WO2019200004A1 (en) | 2018-04-13 | 2019-10-17 | Inscripta, Inc. | Automated cell processing instruments comprising reagent cartridges |
WO2019209926A1 (en) | 2018-04-24 | 2019-10-31 | Inscripta, Inc. | Automated instrumentation for production of peptide libraries |
US10557216B2 (en) | 2018-04-24 | 2020-02-11 | Inscripta, Inc. | Automated instrumentation for production of T-cell receptor peptide libraries |
US10858761B2 (en) | 2018-04-24 | 2020-12-08 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided editing of exogenous polynucleotides in heterologous cells |
US20210047405A1 (en) | 2018-04-27 | 2021-02-18 | Novartis Ag | Car t cell therapies with enhanced efficacy |
EP3567111A1 (en) | 2018-05-09 | 2019-11-13 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Gene for resistance to a pathogen of the genus heterodera |
US11690921B2 (en) | 2018-05-18 | 2023-07-04 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Delivery of target specific nucleases |
SG11202011962TA (en) | 2018-06-07 | 2020-12-30 | Brigham & Womens Hospital Inc | Methods for generating hematopoietic stem cells |
EP3802825A1 (en) | 2018-06-08 | 2021-04-14 | Intellia Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for immunooncology |
CA3103500A1 (en) | 2018-06-15 | 2019-12-19 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Methods for improving genome engineering and regeneration in plant ii |
US20210254087A1 (en) | 2018-06-15 | 2021-08-19 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Methods for enhancing genome engineering efficiency |
EP3806619A1 (en) | 2018-06-15 | 2021-04-21 | Nunhems B.V. | Seedless watermelon plants comprising modifications in an abc transporter gene |
US20220025388A1 (en) | 2018-06-15 | 2022-01-27 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Methods for improving genome engineering and regeneration in plant |
US20210195879A1 (en) | 2018-06-21 | 2021-07-01 | The Jackson Laboratory | Genetically modified mouse models of alzheimer's disease |
US20210371847A1 (en) * | 2018-06-27 | 2021-12-02 | Altius Institute For Biomedical Sciences | Gapped And Tunable Repeat Units For Use In Genome Editing And Gene Regulation Compositions |
EP4070802A1 (en) | 2018-06-30 | 2022-10-12 | Inscripta, Inc. | Instruments, modules, and methods for improved detection of edited sequences in live cells |
GB201812603D0 (en) | 2018-08-02 | 2018-09-19 | British American Tobacco Investments Ltd | Method |
US11142740B2 (en) | 2018-08-14 | 2021-10-12 | Inscripta, Inc. | Detection of nuclease edited sequences in automated modules and instruments |
US10532324B1 (en) | 2018-08-14 | 2020-01-14 | Inscripta, Inc. | Instruments, modules, and methods for improved detection of edited sequences in live cells |
SG11202101801RA (en) | 2018-08-23 | 2021-03-30 | Sangamo Therapeutics Inc | Engineered target specific base editors |
WO2020047138A1 (en) | 2018-08-29 | 2020-03-05 | Amyris, Inc. | Cells and methods for selection based assay |
WO2020081149A2 (en) | 2018-08-30 | 2020-04-23 | Inscripta, Inc. | Improved detection of nuclease edited sequences in automated modules and instruments |
CA3111386A1 (en) | 2018-09-06 | 2020-03-12 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Cellulose-synthase-like enzymes and uses thereof |
EP3623379A1 (en) | 2018-09-11 | 2020-03-18 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Beet necrotic yellow vein virus (bnyvv)-resistance modifying gene |
JP2022500052A (ja) | 2018-09-18 | 2022-01-04 | サンガモ セラピューティクス, インコーポレイテッド | プログラム細胞死1(pd1)特異的ヌクレアーゼ |
EP3870697A4 (en) | 2018-10-22 | 2022-11-09 | Inscripta, Inc. | MODIFIED ENZYMES |
US11214781B2 (en) | 2018-10-22 | 2022-01-04 | Inscripta, Inc. | Engineered enzyme |
GB201817971D0 (en) | 2018-11-02 | 2018-12-19 | British American Tobacco Investments Ltd | Method |
GB201818715D0 (en) | 2018-11-16 | 2019-01-02 | British American Tobacco Investments Ltd | Method |
KR20200071198A (ko) | 2018-12-10 | 2020-06-19 | 네오이뮨텍, 인코퍼레이티드 | Nrf2 발현 조절 기반 T 세포 항암면역치료법 |
AU2019403015B2 (en) | 2018-12-20 | 2024-01-18 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Nuclease-mediated repeat expansion |
EP3898661A1 (en) | 2018-12-21 | 2021-10-27 | Precision BioSciences, Inc. | Genetic modification of the hydroxyacid oxidase 1 gene for treatment of primary hyperoxaluria |
CA3123890A1 (en) | 2019-01-04 | 2020-07-09 | Cargill Incorporated | Engineered nucleases to generate mutations in plants |
AU2020205717A1 (en) | 2019-01-11 | 2021-08-12 | Acuitas Therapeutics, Inc. | Lipids for lipid nanoparticle delivery of active agents |
GB201900940D0 (en) | 2019-01-23 | 2019-03-13 | British American Tobacco Investments Ltd | Method |
WO2020157573A1 (en) | 2019-01-29 | 2020-08-06 | The University Of Warwick | Methods for enhancing genome engineering efficiency |
CN112805026A (zh) | 2019-02-06 | 2021-05-14 | 桑格摩生物治疗股份有限公司 | 用于治疗i型黏多糖贮积症的方法 |
WO2020178193A1 (en) | 2019-03-01 | 2020-09-10 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Method of treatment of sarcoidosis |
EP3708651A1 (en) | 2019-03-12 | 2020-09-16 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Improving plant regeneration |
US11001831B2 (en) | 2019-03-25 | 2021-05-11 | Inscripta, Inc. | Simultaneous multiplex genome editing in yeast |
CA3134168A1 (en) | 2019-03-25 | 2020-10-01 | Inscripta, Inc. | Simultaneous multiplex genome editing in yeast |
WO2020205838A1 (en) | 2019-04-02 | 2020-10-08 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods for the treatment of beta-thalassemia |
CA3135799A1 (en) | 2019-04-03 | 2020-10-08 | Precision Biosciences, Inc. | Genetically-modified immune cells comprising a microrna-adapted shrna (shrnamir) |
KR20210148154A (ko) | 2019-04-03 | 2021-12-07 | 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 | 세이프 하버 좌위 내로의 항체 코딩 서열의 삽입을 위한 방법 및 조성물 |
CA3133360A1 (en) | 2019-04-04 | 2020-10-08 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-human animals comprising a humanized coagulation factor 12 locus |
WO2020206134A1 (en) | 2019-04-04 | 2020-10-08 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods for scarless introduction of targeted modifications into targeting vectors |
CA3136265A1 (en) | 2019-04-05 | 2020-10-08 | Precision Biosciences, Inc. | Methods of preparing populations of genetically-modified immune cells |
PE20212332A1 (es) | 2019-04-23 | 2021-12-14 | Sangamo Therapeutics Inc | Moduladores de la expresioon del gen de marco de lectura abierto 72 del cromosoma 9 y usos de los mismos |
GB201906768D0 (en) | 2019-05-14 | 2019-06-26 | British American Tobacco Investments Ltd | Method |
US11891618B2 (en) | 2019-06-04 | 2024-02-06 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Mouse comprising a humanized TTR locus with a beta-slip mutation and methods of use |
AU2020288623A1 (en) | 2019-06-06 | 2022-01-06 | Inscripta, Inc. | Curing for recursive nucleic acid-guided cell editing |
AU2020289581A1 (en) | 2019-06-07 | 2021-11-18 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Non-human animals comprising a humanized albumin locus |
JP2022536606A (ja) | 2019-06-14 | 2022-08-18 | リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド | タウオパチーのモデル |
US10920189B2 (en) | 2019-06-21 | 2021-02-16 | Inscripta, Inc. | Genome-wide rationally-designed mutations leading to enhanced lysine production in E. coli |
US10927385B2 (en) | 2019-06-25 | 2021-02-23 | Inscripta, Inc. | Increased nucleic-acid guided cell editing in yeast |
BR112021026248A2 (pt) | 2019-06-27 | 2022-03-03 | Two Blades Found | Molécula de ácido nucleico isolada que codifica uma proteína atrlp23 engenheirada, proteína atrlp23 engenheirada, cassete de expressão, vetor, célula hospedeira, planta ou célula vegetal, métodos para fazer uma proteína atrlp23 engenheirada, para fazer uma molécula de ácido nucleico que codifica uma proteína atrlp23 engenheirada e para intensificar a resistência de uma planta |
EP3757219A1 (en) | 2019-06-28 | 2020-12-30 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Enhanced plant regeneration and transformation by using grf1 booster gene |
GB201909563D0 (en) | 2019-07-03 | 2019-08-14 | British American Tobacco Investments Ltd | Method |
GB201909562D0 (en) | 2019-07-03 | 2019-08-14 | British American Tobacco Investments Ltd | Method |
WO2021011348A1 (en) | 2019-07-12 | 2021-01-21 | The Regents Of The University Of California | Plants with enhanced resistance to bacterial pathogens |
WO2021009692A1 (en) | 2019-07-15 | 2021-01-21 | Medimmune Limited | Tripartite systems for protein dimerization and methods of use |
US20220273715A1 (en) | 2019-07-25 | 2022-09-01 | Precision Biosciences, Inc. | Compositions and methods for sequential stacking of nucleic acid sequences into a genomic locus |
US10501404B1 (en) | 2019-07-30 | 2019-12-10 | Factor Bioscience Inc. | Cationic lipids and transfection methods |
AU2020333851A1 (en) | 2019-08-20 | 2022-03-31 | Precision Biosciences, Inc. | Lymphodepletion dosing regimens for cellular immunotherapies |
WO2021035170A1 (en) | 2019-08-21 | 2021-02-25 | Precision Biosciences, Inc. | Compositions and methods for tcr reprogramming using fusion proteins |
WO2021087305A1 (en) | 2019-10-30 | 2021-05-06 | Precision Biosciences, Inc. | Cd20 chimeric antigen receptors and methods of use for immunotherapy |
IL292605A (en) | 2019-11-08 | 2022-07-01 | Regeneron Pharma | CRISPR and AAV strategies for the treatment of x-linked childhood retinoschisis |
CA3157872A1 (en) | 2019-11-12 | 2021-05-20 | Otto Torjek | Gene for resistance to a pathogen of the genus heterodera |
WO2021102059A1 (en) | 2019-11-19 | 2021-05-27 | Inscripta, Inc. | Methods for increasing observed editing in bacteria |
WO2021108363A1 (en) | 2019-11-25 | 2021-06-03 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Crispr/cas-mediated upregulation of humanized ttr allele |
WO2021113543A1 (en) | 2019-12-06 | 2021-06-10 | Precision Biosciences, Inc. | Methods for cancer immunotherapy, using lymphodepletion regimens and cd19, cd20 or bcma allogeneic car t cells |
EP4069837A4 (en) | 2019-12-10 | 2024-03-13 | Inscripta, Inc. | NEW MAD NUCLEASES |
US10704033B1 (en) | 2019-12-13 | 2020-07-07 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
CN114787362A (zh) | 2019-12-13 | 2022-07-22 | 中外制药株式会社 | 检测细胞外嘌呤受体配体的系统和导入该系统的非人动物 |
EP3835309A1 (en) | 2019-12-13 | 2021-06-16 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Method for increasing cold or frost tolerance in a plant |
WO2021126886A1 (en) | 2019-12-18 | 2021-06-24 | Inscripta, Inc. | Cascade/dcas3 complementation assays for in vivo detection of nucleic acid-guided nuclease edited cells |
US10689669B1 (en) | 2020-01-11 | 2020-06-23 | Inscripta, Inc. | Automated multi-module cell processing methods, instruments, and systems |
KR20220133257A (ko) | 2020-01-27 | 2022-10-04 | 인스크립타 인코포레이티드 | 전기천공 모듈 및 기구 |
US20230070181A1 (en) | 2020-02-05 | 2023-03-09 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods of treatment of cancer disease by targeting an epigenetic factor |
WO2021158915A1 (en) | 2020-02-06 | 2021-08-12 | Precision Biosciences, Inc. | Recombinant adeno-associated virus compositions and methods for producing and using the same |
EP4114946A1 (en) | 2020-03-04 | 2023-01-11 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions for sensitization of tumor cells to immune therapy |
CN115697044A (zh) | 2020-03-31 | 2023-02-03 | 艾洛生物系统有限公司 | 西瓜和其他葫芦科中内源罗汉果苷途径基因的调控 |
KR20220165764A (ko) | 2020-04-09 | 2022-12-15 | 아아르. 제이. 레날드즈 토바코 캄파니 | 니코티아나 타바쿰에서 니코틴 수준을 조절하는 방법 |
US20210332388A1 (en) | 2020-04-24 | 2021-10-28 | Inscripta, Inc. | Compositions, methods, modules and instruments for automated nucleic acid-guided nuclease editing in mammalian cells |
CA3173889A1 (en) | 2020-05-04 | 2021-11-11 | Saliogen Therapeutics, Inc. | Transposition-based therapies |
JP2023525513A (ja) | 2020-05-06 | 2023-06-16 | セレクティス ソシエテ アノニム | 細胞ゲノムにおける外因性配列の標的化挿入のための方法 |
EP4146284A1 (en) | 2020-05-06 | 2023-03-15 | Cellectis S.A. | Methods to genetically modify cells for delivery of therapeutic proteins |
WO2021231259A1 (en) | 2020-05-11 | 2021-11-18 | Precision Biosciences, Inc. | Self-limiting viral vectors encoding nucleases |
US11787841B2 (en) | 2020-05-19 | 2023-10-17 | Inscripta, Inc. | Rationally-designed mutations to the thrA gene for enhanced lysine production in E. coli |
IL298558A (en) | 2020-05-27 | 2023-01-01 | Antion Biosciences Sa | Adapter molecules redirect CAR T cells to the antigen of interest |
US20230332104A1 (en) | 2020-06-11 | 2023-10-19 | Novartis Ag | Zbtb32 inhibitors and uses thereof |
EP4171527A1 (en) | 2020-06-25 | 2023-05-03 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods of treatment and diagnostic of pathological conditions associated with intense stress |
WO2022013268A1 (en) | 2020-07-14 | 2022-01-20 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Methods for identifying and selecting maize plants with resistance to northern corn leaf blight |
CN116096702A (zh) | 2020-07-16 | 2023-05-09 | 爱康泰生治疗公司 | 用于脂质纳米颗粒的阳离子脂质 |
EP4192875A1 (en) | 2020-08-10 | 2023-06-14 | Precision BioSciences, Inc. | Antibodies and fragments specific for b-cell maturation antigen and uses thereof |
WO2022046760A2 (en) | 2020-08-25 | 2022-03-03 | Kite Pharma, Inc. | T cells with improved functionality |
WO2022049273A1 (en) | 2020-09-07 | 2022-03-10 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods of treatment of inflammatory bowel diseases |
US11299731B1 (en) | 2020-09-15 | 2022-04-12 | Inscripta, Inc. | CRISPR editing to embed nucleic acid landing pads into genomes of live cells |
US20230365995A1 (en) | 2020-10-07 | 2023-11-16 | Precision Biosciences, Inc. | Lipid nanoparticle compositions |
WO2022087527A1 (en) | 2020-10-23 | 2022-04-28 | Elo Life Systems, Inc. | Methods for producing vanilla plants with improved flavor and agronomic production |
EP4240874A1 (en) | 2020-11-06 | 2023-09-13 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | Methods for diagnosis and treating polycystic ovary syndrome (pcos) |
US11512297B2 (en) | 2020-11-09 | 2022-11-29 | Inscripta, Inc. | Affinity tag for recombination protein recruitment |
US20230407350A1 (en) | 2020-11-10 | 2023-12-21 | Industrial Microbes, Inc. | Microorganisms capable of producing poly(hiba) from feedstock |
US20240003879A1 (en) | 2020-11-27 | 2024-01-04 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods for diagnosis and monitoring of toxic epidermal necrolysis |
EP4019638A1 (en) | 2020-12-22 | 2022-06-29 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Promoting regeneration and transformation in beta vulgaris |
EP4019639A1 (en) | 2020-12-22 | 2022-06-29 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Promoting regeneration and transformation in beta vulgaris |
WO2022146497A1 (en) | 2021-01-04 | 2022-07-07 | Inscripta, Inc. | Mad nucleases |
US11332742B1 (en) | 2021-01-07 | 2022-05-17 | Inscripta, Inc. | Mad nucleases |
JP2024502630A (ja) | 2021-01-12 | 2024-01-22 | マーチ セラピューティクス, インコーポレイテッド | コンテキスト依存性二本鎖dna特異的デアミナーゼ及びその使用 |
EP4284823A1 (en) | 2021-01-28 | 2023-12-06 | Precision BioSciences, Inc. | Modulation of tgf beta signaling in genetically-modified eukaryotic cells |
US11884924B2 (en) | 2021-02-16 | 2024-01-30 | Inscripta, Inc. | Dual strand nucleic acid-guided nickase editing |
WO2022218998A1 (en) | 2021-04-13 | 2022-10-20 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods for treating hepatitis b and d virus infection |
US20240141311A1 (en) | 2021-04-22 | 2024-05-02 | North Carolina State University | Compositions and methods for generating male sterile plants |
CN113201548A (zh) * | 2021-04-30 | 2021-08-03 | 上海交通大学 | 水稻OsTFIIAγ1基因启动子中的EBE位点及应用 |
CA3218511A1 (en) | 2021-05-10 | 2022-11-17 | Sqz Biotechnologies Company | Methods for delivering genome editing molecules to the nucleus or cytosol of a cell and uses thereof |
WO2022240931A1 (en) | 2021-05-11 | 2022-11-17 | Two Blades Foundation | Methods for preparing a library of plant disease resistance genes for functional testing for disease resistance |
WO2022251644A1 (en) | 2021-05-28 | 2022-12-01 | Lyell Immunopharma, Inc. | Nr4a3-deficient immune cells and uses thereof |
WO2022256437A1 (en) | 2021-06-02 | 2022-12-08 | Lyell Immunopharma, Inc. | Nr4a3-deficient immune cells and uses thereof |
WO2023042104A1 (en) | 2021-09-16 | 2023-03-23 | Novartis Ag | Novel transcription factors |
AU2022356378A1 (en) | 2021-09-30 | 2024-05-02 | Two Blades Foundation | Plant disease resistance genes against stem rust and methods of use |
CN118119702A (zh) | 2021-10-14 | 2024-05-31 | 隆萨销售股份有限公司 | 用于细胞外囊泡产生的经修饰的生产者细胞 |
WO2023064872A1 (en) | 2021-10-14 | 2023-04-20 | Precision Biosciences, Inc. | Combinations of anti-bcma car t cells and gamma secretase inhibitors |
AU2022371430A1 (en) | 2021-10-19 | 2024-05-30 | Precision Biosciences, Inc. | Gene editing methods for treating alpha-1 antitrypsin (aat) deficiency |
US11753677B2 (en) | 2021-11-10 | 2023-09-12 | Encodia, Inc. | Methods for barcoding macromolecules in individual cells |
WO2023091910A1 (en) | 2021-11-16 | 2023-05-25 | Precision Biosciences, Inc. | Methods for cancer immunotherapy |
WO2023095034A1 (en) | 2021-11-24 | 2023-06-01 | Novartis Ag | Modulators of adeno-associated virus transduction and uses thereof |
GB202117314D0 (en) | 2021-11-30 | 2022-01-12 | Clarke David John | Cyclic nucleic acid fragmentation |
GB202118058D0 (en) | 2021-12-14 | 2022-01-26 | Univ Warwick | Methods to increase yields in crops |
WO2023129974A1 (en) | 2021-12-29 | 2023-07-06 | Bristol-Myers Squibb Company | Generation of landing pad cell lines |
WO2023148478A1 (en) | 2022-02-03 | 2023-08-10 | Nicoventures Trading Limited | Method of modulating alkaloid content in tobacco plants |
WO2023148476A1 (en) | 2022-02-03 | 2023-08-10 | Nicoventures Trading Limited | Method of modulating alkaloid content in tobacco plants |
WO2023148475A1 (en) | 2022-02-04 | 2023-08-10 | Nicoventures Trading Limited | Method of modulating alkaloid content in tobacco plants |
GB202205148D0 (en) | 2022-04-07 | 2022-05-25 | Nicoventures Trading Ltd | Method |
GB202205149D0 (en) | 2022-04-07 | 2022-05-25 | Nicoventures Trading Ltd | Method |
GB202205562D0 (en) | 2022-04-14 | 2022-06-01 | Nicoventures Trading Ltd | Method |
GB202205561D0 (en) | 2022-04-14 | 2022-06-01 | Nicoventures Trading Ltd | Method |
GB202206107D0 (en) | 2022-04-27 | 2022-06-08 | Nicoventures Trading Ltd | Method |
GB202206109D0 (en) | 2022-04-27 | 2022-06-08 | Nicoventures Trading Ltd | Method |
WO2023220603A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Vectors and methods for in vivo antibody production |
WO2023225665A1 (en) | 2022-05-19 | 2023-11-23 | Lyell Immunopharma, Inc. | Polynucleotides targeting nr4a3 and uses thereof |
CN115035947B (zh) * | 2022-06-10 | 2023-03-10 | 水木未来(北京)科技有限公司 | 蛋白质结构建模方法及装置、电子设备和存储介质 |
GB2621813A (en) | 2022-06-30 | 2024-02-28 | Univ Newcastle | Preventing disease recurrence in Mitochondrial replacement therapy |
WO2024026474A1 (en) | 2022-07-29 | 2024-02-01 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for transferrin receptor (tfr)-mediated delivery to the brain and muscle |
WO2024031053A1 (en) | 2022-08-05 | 2024-02-08 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Aggregation-resistant variants of tdp-43 |
WO2024064958A1 (en) | 2022-09-23 | 2024-03-28 | Lyell Immunopharma, Inc. | Methods for culturing nr4a-deficient cells |
WO2024064952A1 (en) | 2022-09-23 | 2024-03-28 | Lyell Immunopharma, Inc. | Methods for culturing nr4a-deficient cells overexpressing c-jun |
WO2024077174A1 (en) | 2022-10-05 | 2024-04-11 | Lyell Immunopharma, Inc. | Methods for culturing nr4a-deficient cells |
WO2024084025A1 (en) | 2022-10-21 | 2024-04-25 | Keygene N.V. | Rna transfection in plant cells with modified rna |
US20240173426A1 (en) | 2022-11-14 | 2024-05-30 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for fibroblast growth factor receptor 3-mediated delivery to astrocytes |
WO2024121354A1 (en) | 2022-12-08 | 2024-06-13 | Keygene N.V. | Duplex sequencing with covalently closed dna ends |
Family Cites Families (95)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4179337A (en) | 1973-07-20 | 1979-12-18 | Davis Frank F | Non-immunogenic polypeptides |
US4535060A (en) | 1983-01-05 | 1985-08-13 | Calgene, Inc. | Inhibition resistant 5-enolpyruvyl-3-phosphoshikimate synthetase, production and use |
US5380831A (en) | 1986-04-04 | 1995-01-10 | Mycogen Plant Science, Inc. | Synthetic insecticidal crystal protein gene |
US4761373A (en) | 1984-03-06 | 1988-08-02 | Molecular Genetics, Inc. | Herbicide resistance in plants |
US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US5569597A (en) | 1985-05-13 | 1996-10-29 | Ciba Geigy Corp. | Methods of inserting viral DNA into plant material |
US4940835A (en) | 1985-10-29 | 1990-07-10 | Monsanto Company | Glyphosate-resistant plants |
CA1293460C (en) | 1985-10-07 | 1991-12-24 | Brian Lee Sauer | Site-specific recombination of dna in yeast |
US4810648A (en) | 1986-01-08 | 1989-03-07 | Rhone Poulenc Agrochimie | Haloarylnitrile degrading gene, its use, and cells containing the gene |
ES2018274T5 (es) | 1986-03-11 | 1996-12-16 | Plant Genetic Systems Nv | Celulas vegetales resistentes a los inhibidores de glutamina sintetasa, preparadas por ingenieria genetica. |
US4975374A (en) | 1986-03-18 | 1990-12-04 | The General Hospital Corporation | Expression of wild type and mutant glutamine synthetase in foreign hosts |
US5273894A (en) | 1986-08-23 | 1993-12-28 | Hoechst Aktiengesellschaft | Phosphinothricin-resistance gene, and its use |
US5276268A (en) | 1986-08-23 | 1994-01-04 | Hoechst Aktiengesellschaft | Phosphinothricin-resistance gene, and its use |
US5013659A (en) | 1987-07-27 | 1991-05-07 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Nucleic acid fragment encoding herbicide resistant plant acetolactate synthase |
US5268463A (en) | 1986-11-11 | 1993-12-07 | Jefferson Richard A | Plant promoter α-glucuronidase gene construct |
US5608142A (en) | 1986-12-03 | 1997-03-04 | Agracetus, Inc. | Insecticidal cotton plants |
US4873192A (en) | 1987-02-17 | 1989-10-10 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Process for site specific mutagenesis without phenotypic selection |
US5006333A (en) | 1987-08-03 | 1991-04-09 | Ddi Pharmaceuticals, Inc. | Conjugates of superoxide dismutase coupled to high molecular weight polyalkylene glycols |
US5316931A (en) | 1988-02-26 | 1994-05-31 | Biosource Genetics Corp. | Plant viral vectors having heterologous subgenomic promoters for systemic expression of foreign genes |
US5162602A (en) | 1988-11-10 | 1992-11-10 | Regents Of The University Of Minnesota | Corn plants tolerant to sethoxydim and haloxyfop herbicides |
US5501967A (en) | 1989-07-26 | 1996-03-26 | Mogen International, N.V./Rijksuniversiteit Te Leiden | Process for the site-directed integration of DNA into the genome of plants |
US5484956A (en) | 1990-01-22 | 1996-01-16 | Dekalb Genetics Corporation | Fertile transgenic Zea mays plant comprising heterologous DNA encoding Bacillus thuringiensis endotoxin |
EP0452269B1 (en) | 1990-04-12 | 2002-10-09 | Syngenta Participations AG | Tissue-preferential promoters |
US5204253A (en) | 1990-05-29 | 1993-04-20 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Method and apparatus for introducing biological substances into living cells |
US5498830A (en) | 1990-06-18 | 1996-03-12 | Monsanto Company | Decreased oil content in plant seeds |
US5767366A (en) | 1991-02-19 | 1998-06-16 | Louisiana State University Board Of Supervisors, A Governing Body Of Louisiana State University Agricultural And Mechanical College | Mutant acetolactate synthase gene from Ararbidopsis thaliana for conferring imidazolinone resistance to crop plants |
US5399680A (en) | 1991-05-22 | 1995-03-21 | The Salk Institute For Biological Studies | Rice chitinase promoter |
WO1993004178A1 (en) | 1991-08-23 | 1993-03-04 | University Of Florida | A novel method for the production of transgenic plants |
HU219057B (hu) | 1991-08-27 | 2001-02-28 | Novartis Ag. | Inszekticid hatású proteinek Homoptera rovarok ellen és alkalmazásuk a növényvédelemben |
JPH06511152A (ja) | 1991-10-04 | 1994-12-15 | ノースカロライナ ステイト ユニバーシティー | 病原体耐性トランスジェニック植物 |
TW261517B (ja) | 1991-11-29 | 1995-11-01 | Mitsubishi Shozi Kk | |
US5792640A (en) | 1992-04-03 | 1998-08-11 | The Johns Hopkins University | General method to clone hybrid restriction endonucleases using lig gene |
US5356802A (en) | 1992-04-03 | 1994-10-18 | The Johns Hopkins University | Functional domains in flavobacterium okeanokoites (FokI) restriction endonuclease |
US5436150A (en) | 1992-04-03 | 1995-07-25 | The Johns Hopkins University | Functional domains in flavobacterium okeanokoities (foki) restriction endonuclease |
US5487994A (en) | 1992-04-03 | 1996-01-30 | The Johns Hopkins University | Insertion and deletion mutants of FokI restriction endonuclease |
WO1994000977A1 (en) | 1992-07-07 | 1994-01-20 | Japan Tobacco Inc. | Method of transforming monocotyledon |
IL108241A (en) | 1992-12-30 | 2000-08-13 | Biosource Genetics Corp | Plant expression system comprising a defective tobamovirus replicon integrated into the plant chromosome and a helper virus |
ATE513037T1 (de) | 1993-02-12 | 2011-07-15 | Univ Johns Hopkins | Funktionelle domänen der restriktionsendonukleasen aus flavobakterium okeanokoites (foki) |
US5789156A (en) | 1993-06-14 | 1998-08-04 | Basf Ag | Tetracycline-regulated transcriptional inhibitors |
US5814618A (en) | 1993-06-14 | 1998-09-29 | Basf Aktiengesellschaft | Methods for regulating gene expression |
US5605793A (en) | 1994-02-17 | 1997-02-25 | Affymax Technologies N.V. | Methods for in vitro recombination |
US5837458A (en) | 1994-02-17 | 1998-11-17 | Maxygen, Inc. | Methods and compositions for cellular and metabolic engineering |
US6808904B2 (en) | 1994-06-16 | 2004-10-26 | Syngenta Participations Ag | Herbicide-tolerant protox genes produced by DNA shuffling |
US5608144A (en) | 1994-08-12 | 1997-03-04 | Dna Plant Technology Corp. | Plant group 2 promoters and uses thereof |
US7285416B2 (en) | 2000-01-24 | 2007-10-23 | Gendaq Limited | Regulated gene expression in plants |
US6326166B1 (en) | 1995-12-29 | 2001-12-04 | Massachusetts Institute Of Technology | Chimeric DNA-binding proteins |
US5659026A (en) | 1995-03-24 | 1997-08-19 | Pioneer Hi-Bred International | ALS3 promoter |
US5853973A (en) | 1995-04-20 | 1998-12-29 | American Cyanamid Company | Structure based designed herbicide resistant products |
US6084155A (en) | 1995-06-06 | 2000-07-04 | Novartis Ag | Herbicide-tolerant protoporphyrinogen oxidase ("protox") genes |
JPH10117776A (ja) | 1996-10-22 | 1998-05-12 | Japan Tobacco Inc | インディカイネの形質転換方法 |
CA2315549A1 (en) | 1998-02-26 | 1999-09-02 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Family of maize pr-1 genes and promoters |
AU762993C (en) | 1998-02-26 | 2004-06-10 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Constitutive maize promoters |
US6465636B1 (en) * | 1998-04-01 | 2002-10-15 | Zeneca Mogen B.V. | Pathogen-inducible promoter |
WO2000014260A1 (en) * | 1998-09-03 | 2000-03-16 | University Of Florida | Methods for controlling viral diseases in plants |
GB9819693D0 (en) | 1998-09-10 | 1998-11-04 | Zeneca Ltd | Glyphosate formulation |
US7070934B2 (en) | 1999-01-12 | 2006-07-04 | Sangamo Biosciences, Inc. | Ligand-controlled regulation of endogenous gene expression |
US7013219B2 (en) | 1999-01-12 | 2006-03-14 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins |
US6534261B1 (en) | 1999-01-12 | 2003-03-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins |
CA2361191A1 (en) | 1999-02-03 | 2000-08-10 | The Children's Medical Center Corporation | Gene repair involving the induction of double-stranded dna cleavage at a chromosomal target site |
US6451732B1 (en) | 1999-06-04 | 2002-09-17 | Syngenta, Limited | Herbicidal compositions of glyphosate trimesium |
DE60126483T2 (de) | 2000-04-28 | 2007-12-06 | Sangamo BioSciences, Inc., Richmond | Gezielte Modifikation der Chromatinstruktur |
US6368227B1 (en) | 2000-11-17 | 2002-04-09 | Steven Olson | Method of swinging on a swing |
US7273923B2 (en) | 2001-01-22 | 2007-09-25 | Sangamo Biosciences, Inc. | Zinc finger proteins for DNA binding and gene regulation in plants |
US7262054B2 (en) | 2002-01-22 | 2007-08-28 | Sangamo Biosciences, Inc. | Zinc finger proteins for DNA binding and gene regulation in plants |
WO2009095742A1 (en) | 2008-01-31 | 2009-08-06 | Cellectis | New i-crei derived single-chain meganuclease and uses thereof |
WO2003080809A2 (en) | 2002-03-21 | 2003-10-02 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for using zinc finger endonucleases to enhance homologous recombination |
US7361635B2 (en) | 2002-08-29 | 2008-04-22 | Sangamo Biosciences, Inc. | Simultaneous modulation of multiple genes |
AU2004208031B2 (en) | 2003-01-28 | 2009-10-08 | Cellectis | Use of meganucleases for inducing homologous recombination ex vivo and in toto in vertebrate somatic tissues and application thereof. |
US7888121B2 (en) | 2003-08-08 | 2011-02-15 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for targeted cleavage and recombination |
US7189691B2 (en) | 2004-04-01 | 2007-03-13 | The Administrators Of The Tulane Educational Fund | Methods and compositions for treating leukemia |
WO2007060495A1 (en) | 2005-10-25 | 2007-05-31 | Cellectis | I-crei homing endonuclease variants having novel cleavage specificity and use thereof |
WO2008010009A1 (en) | 2006-07-18 | 2008-01-24 | Cellectis | Meganuclease variants cleaving a dna target sequence from a rag gene and uses thereof |
US8563314B2 (en) | 2007-09-27 | 2013-10-22 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for modulating PD1 |
EP2235050A1 (en) | 2007-09-28 | 2010-10-06 | Two Blades Foundation | Bs3 resistance gene and methods of use |
BRPI0921909A2 (pt) | 2008-11-10 | 2017-06-13 | Two Blades Found | métodos para fabricar um promotor indutível por patógeno, e um gene r, para intensificar a resistência de uma planta, e para identificar uma caixa upa, promotor indutível por patógeno, cassete de expressão, molécula de ácido nucléico, planta transformada, semente da planta transformada, célula hospedeira. |
ES2627552T3 (es) | 2008-12-04 | 2017-07-28 | Sigma Aldrich Company | Edición de genoma en ratas usando nucleasas con dedos de cinc |
EP2206723A1 (en) | 2009-01-12 | 2010-07-14 | Bonas, Ulla | Modular DNA-binding domains |
US8772008B2 (en) | 2009-05-18 | 2014-07-08 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for increasing nuclease activity |
EP2449135B1 (en) * | 2009-06-30 | 2016-01-06 | Sangamo BioSciences, Inc. | Rapid screening of biologically active nucleases and isolation of nuclease-modified cells |
US20120178647A1 (en) | 2009-08-03 | 2012-07-12 | The General Hospital Corporation | Engineering of zinc finger arrays by context-dependent assembly |
KR102262704B1 (ko) | 2009-08-11 | 2021-06-09 | 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 | 표적화 변형에 대한 동형접합성 유기체 |
US8586526B2 (en) | 2010-05-17 | 2013-11-19 | Sangamo Biosciences, Inc. | DNA-binding proteins and uses thereof |
NZ599351A (en) | 2009-10-22 | 2014-02-28 | Dow Agrosciences Llc | Engineered zinc finger proteins targeting plant genes involved in fatty acid biosynthesis |
US8956828B2 (en) | 2009-11-10 | 2015-02-17 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted disruption of T cell receptor genes using engineered zinc finger protein nucleases |
CN102725412B (zh) | 2009-11-27 | 2017-09-22 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 优化的内切核酸酶及其用途 |
CA2781693C (en) | 2009-11-27 | 2018-12-18 | Basf Plant Science Company Gmbh | Chimeric endonucleases and uses thereof |
EP2504430A4 (en) | 2009-11-27 | 2013-06-05 | Basf Plant Science Co Gmbh | CHIMERIC ENDONUCLEASES AND USES THEREOF |
CN102770539B (zh) | 2009-12-10 | 2016-08-03 | 明尼苏达大学董事会 | Tal效应子介导的dna修饰 |
US20110203012A1 (en) | 2010-01-21 | 2011-08-18 | Dotson Stanton B | Methods and compositions for use of directed recombination in plant breeding |
US8962281B2 (en) | 2010-02-08 | 2015-02-24 | Sangamo Biosciences, Inc. | Engineered cleavage half-domains |
WO2011100058A1 (en) | 2010-02-09 | 2011-08-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules |
CA2796600C (en) | 2010-04-26 | 2019-08-13 | Sangamo Biosciences, Inc. | Genome editing of a rosa locus using zinc-finger nucleases |
EP2392208B1 (en) | 2010-06-07 | 2016-05-04 | Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) | Fusion proteins comprising a DNA-binding domain of a Tal effector protein and a non-specific cleavage domain of a restriction nuclease and their use |
WO2011159369A1 (en) | 2010-06-14 | 2011-12-22 | Iowa State University Research Foundation, Inc. | Nuclease activity of tal effector and foki fusion protein |
US9401201B1 (en) | 2015-05-22 | 2016-07-26 | Qualcomm Incorporated | Write driver for memory |
-
2009
- 2009-07-13 EP EP09165328A patent/EP2206723A1/en not_active Ceased
-
2010
- 2010-01-12 DK DK16197321.9T patent/DK3187587T3/da active
- 2010-01-12 CN CN201610232787.3A patent/CN106008675B/zh active Active
- 2010-01-12 EP EP21177164.7A patent/EP3981881A1/en active Pending
- 2010-01-12 EP EP13189680.5A patent/EP2703492B1/en active Active
- 2010-01-12 CN CN201080008139.0A patent/CN102325791B/zh active Active
- 2010-01-12 DK DK13189680.5T patent/DK2703492T3/en active
- 2010-01-12 SG SG2011050176A patent/SG172928A1/en unknown
- 2010-01-12 AU AU2010204105A patent/AU2010204105A1/en not_active Abandoned
- 2010-01-12 CA CA2749305A patent/CA2749305C/en active Active
- 2010-01-12 EP EP10706358.8A patent/EP2379583B1/en active Active
- 2010-01-12 WO PCT/IB2010/000154 patent/WO2010079430A1/en active Application Filing
- 2010-01-12 CN CN201410199018.9A patent/CN103992393B/zh active Active
- 2010-01-12 MX MX2011007467A patent/MX2011007467A/es active IP Right Grant
- 2010-01-12 JP JP2011544945A patent/JP5753793B2/ja active Active
- 2010-01-12 EP EP16197321.9A patent/EP3187587B1/en active Active
-
2011
- 2011-01-28 US US13/016,297 patent/US9353378B2/en active Active
- 2011-07-07 IL IL213971A patent/IL213971A/en active IP Right Grant
-
2012
- 2012-01-31 US US13/362,660 patent/US8420782B2/en active Active
-
2015
- 2015-05-22 JP JP2015104349A patent/JP2015172063A/ja active Pending
-
2017
- 2017-12-28 JP JP2017253389A patent/JP6508605B2/ja active Active
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
JPN6016017922; nature biotechnology Vol. 29, No. 2, 201102, p. 143-148 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU2010204105A1 (en) | 2011-08-18 |
CN103992393A (zh) | 2014-08-20 |
SG172928A1 (en) | 2011-08-29 |
US20120122205A1 (en) | 2012-05-17 |
CN106008675A (zh) | 2016-10-12 |
JP6508605B2 (ja) | 2019-05-08 |
IL213971A (en) | 2017-11-30 |
US8420782B2 (en) | 2013-04-16 |
WO2010079430A1 (en) | 2010-07-15 |
JP2012514976A (ja) | 2012-07-05 |
JP5753793B2 (ja) | 2015-07-22 |
MX2011007467A (es) | 2011-09-26 |
US20120064620A1 (en) | 2012-03-15 |
EP2703492B1 (en) | 2015-12-02 |
CA2749305A1 (en) | 2010-07-15 |
EP2206723A1 (en) | 2010-07-14 |
CN102325791B (zh) | 2016-05-18 |
EP2703492A1 (en) | 2014-03-05 |
DK3187587T3 (da) | 2021-08-30 |
JP2018078899A (ja) | 2018-05-24 |
EP2379583A1 (en) | 2011-10-26 |
CN102325791A (zh) | 2012-01-18 |
US9353378B2 (en) | 2016-05-31 |
DK2703492T3 (en) | 2016-02-22 |
CN103992393B (zh) | 2019-07-05 |
EP3187587A1 (en) | 2017-07-05 |
EP2379583B1 (en) | 2016-11-09 |
EP3981881A1 (en) | 2022-04-13 |
CA2749305C (en) | 2017-01-24 |
EP3187587B1 (en) | 2021-06-02 |
CN106008675B (zh) | 2021-03-09 |
IL213971A0 (en) | 2011-08-31 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11827676B2 (en) | Modular DNA-binding domains and methods of use | |
JP6508605B2 (ja) | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 | |
US20240199708A1 (en) | Modular dna-binding domains and methods of use | |
JP7303847B2 (ja) | モジュラーdna結合ドメインおよび使用方法 | |
AU2013204150A1 (en) | Modular DNA-binding domains and methods of use |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160517 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160817 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20170106 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20170901 |
|
RD03 | Notification of appointment of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7423 Effective date: 20171225 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20171225 |