JP6072788B2 - 嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(cftr)遺伝子を改変するための方法および組成物 - Google Patents
嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(cftr)遺伝子を改変するための方法および組成物 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6072788B2 JP6072788B2 JP2014522973A JP2014522973A JP6072788B2 JP 6072788 B2 JP6072788 B2 JP 6072788B2 JP 2014522973 A JP2014522973 A JP 2014522973A JP 2014522973 A JP2014522973 A JP 2014522973A JP 6072788 B2 JP6072788 B2 JP 6072788B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- cftr
- cell
- gene
- cells
- sequence
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims description 196
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 105
- 201000003883 Cystic fibrosis Diseases 0.000 title claims description 69
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims description 48
- 239000012528 membrane Substances 0.000 title claims description 7
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 278
- 108010079245 Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Proteins 0.000 claims description 150
- 102000012605 Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Human genes 0.000 claims description 150
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 121
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 120
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 106
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 98
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 claims description 48
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 44
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 44
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 44
- 230000008439 repair process Effects 0.000 claims description 35
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 claims description 35
- 210000004263 induced pluripotent stem cell Anatomy 0.000 claims description 29
- 101150029409 CFTR gene Proteins 0.000 claims description 28
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 28
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 28
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 claims description 26
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 18
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 17
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 17
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 claims description 17
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 16
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 14
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 14
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 13
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 13
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 12
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 claims description 9
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 9
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 claims description 5
- 210000001665 muscle stem cell Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000001178 neural stem cell Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 79
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 73
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 64
- 101001086862 Homo sapiens Pulmonary surfactant-associated protein B Proteins 0.000 description 60
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 59
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 58
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 54
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 54
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 52
- 102100032617 Pulmonary surfactant-associated protein B Human genes 0.000 description 52
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 51
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 51
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 48
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 45
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 24
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 24
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 24
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 24
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 23
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 23
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 22
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 20
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 19
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 18
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 description 17
- 101150001462 SFTPB gene Proteins 0.000 description 17
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 17
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 description 17
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 17
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 16
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 16
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 16
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 16
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 16
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 15
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 15
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 15
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 14
- 230000006870 function Effects 0.000 description 14
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 14
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 13
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 13
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 13
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 13
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 12
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 12
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 11
- 230000005782 double-strand break Effects 0.000 description 11
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 11
- 239000000047 product Substances 0.000 description 11
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 11
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 11
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 11
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 10
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 10
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 10
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 9
- 108010040974 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator delta F508 Proteins 0.000 description 9
- 238000013461 design Methods 0.000 description 9
- 238000010362 genome editing Methods 0.000 description 9
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 9
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 9
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 9
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 9
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 9
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 9
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 8
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 8
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 8
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 8
- 230000008569 process Effects 0.000 description 8
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 8
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 8
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 8
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 7
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 7
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 7
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 7
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 7
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 7
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 7
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 7
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 7
- 239000013607 AAV vector Substances 0.000 description 6
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 6
- 208000019693 Lung disease Diseases 0.000 description 6
- 238000010459 TALEN Methods 0.000 description 6
- 108010043645 Transcription Activator-Like Effector Nucleases Proteins 0.000 description 6
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 6
- -1 but not limited to Proteins 0.000 description 6
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 6
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 6
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 6
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 6
- 230000006780 non-homologous end joining Effects 0.000 description 6
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 6
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 description 6
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 6
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 6
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 5
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 description 5
- 102000052510 DNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 5
- 238000010240 RT-PCR analysis Methods 0.000 description 5
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 5
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 230000034431 double-strand break repair via homologous recombination Effects 0.000 description 5
- 238000009510 drug design Methods 0.000 description 5
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 5
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 5
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 5
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 5
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 5
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 5
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 5
- IPVFGAYTKQKGBM-BYPJNBLXSA-N 1-[(2r,3s,4r,5r)-3-fluoro-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-iodopyrimidine-2,4-dione Chemical compound F[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(I)=C1 IPVFGAYTKQKGBM-BYPJNBLXSA-N 0.000 description 4
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 4
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 4
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 4
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 4
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 4
- 102100035423 POU domain, class 5, transcription factor 1 Human genes 0.000 description 4
- 101710126211 POU domain, class 5, transcription factor 1 Proteins 0.000 description 4
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 4
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 4
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 4
- 108010023082 activin A Proteins 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 4
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 4
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 4
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 4
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 4
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 4
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 4
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 4
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 4
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 4
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 4
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 3
- 108010051219 Cre recombinase Proteins 0.000 description 3
- 101710096438 DNA-binding protein Proteins 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000006947 Histones Human genes 0.000 description 3
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 3
- 102100034349 Integrase Human genes 0.000 description 3
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 3
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 3
- 101100310648 Mus musculus Sox17 gene Proteins 0.000 description 3
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 102000011931 Nucleoproteins Human genes 0.000 description 3
- 108010061100 Nucleoproteins Proteins 0.000 description 3
- 108010047956 Nucleosomes Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 3
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 3
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 3
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 238000007876 drug discovery Methods 0.000 description 3
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 3
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 3
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 3
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 3
- 239000007927 intramuscular injection Substances 0.000 description 3
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 3
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 3
- 210000005265 lung cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000003580 lung surfactant Substances 0.000 description 3
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 3
- 210000001623 nucleosome Anatomy 0.000 description 3
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 3
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 3
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 3
- 230000008672 reprogramming Effects 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 3
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 3
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 2
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 2
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108700011014 Congenital Deficiency of Pulmonary Surfactant Protein B Proteins 0.000 description 2
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 2
- 241000938605 Crocodylia Species 0.000 description 2
- 108700020911 DNA-Binding Proteins Proteins 0.000 description 2
- 101000889905 Enterobacteria phage RB3 Intron-associated endonuclease 3 Proteins 0.000 description 2
- 101000889904 Enterobacteria phage T4 Defective intron-associated endonuclease 3 Proteins 0.000 description 2
- 101000889900 Enterobacteria phage T4 Intron-associated endonuclease 1 Proteins 0.000 description 2
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 description 2
- 108090000379 Fibroblast growth factor 2 Proteins 0.000 description 2
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 2
- WZUVPPKBWHMQCE-UHFFFAOYSA-N Haematoxylin Chemical compound C12=CC(O)=C(O)C=C2CC2(O)C1C1=CC=C(O)C(O)=C1OC2 WZUVPPKBWHMQCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N Histamine Chemical compound NCCC1=CN=CN1 NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101001139134 Homo sapiens Krueppel-like factor 4 Proteins 0.000 description 2
- 101000687905 Homo sapiens Transcription factor SOX-2 Proteins 0.000 description 2
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 2
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 description 2
- 108010061833 Integrases Proteins 0.000 description 2
- 102100020677 Krueppel-like factor 4 Human genes 0.000 description 2
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 2
- 241000714177 Murine leukemia virus Species 0.000 description 2
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100087805 Ralstonia solanacearum rip19 gene Proteins 0.000 description 2
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 2
- 241000713311 Simian immunodeficiency virus Species 0.000 description 2
- 108091027967 Small hairpin RNA Proteins 0.000 description 2
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 2
- 206010043276 Teratoma Diseases 0.000 description 2
- 108010073062 Transcription Activator-Like Effectors Proteins 0.000 description 2
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 2
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 2
- 102100024270 Transcription factor SOX-2 Human genes 0.000 description 2
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 2
- 108010076089 accutase Proteins 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 2
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 2
- 210000003123 bronchiole Anatomy 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 108091092356 cellular DNA Proteins 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 2
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000002716 delivery method Methods 0.000 description 2
- 238000007877 drug screening Methods 0.000 description 2
- 210000001900 endoderm Anatomy 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 208000016361 genetic disease Diseases 0.000 description 2
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 2
- 239000012212 insulator Substances 0.000 description 2
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 2
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 2
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 2
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 2
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 2
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 2
- 238000000329 molecular dynamics simulation Methods 0.000 description 2
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 2
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 2
- 230000005501 phase interface Effects 0.000 description 2
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 2
- 244000000003 plant pathogen Species 0.000 description 2
- 229920001983 poloxamer Polymers 0.000 description 2
- 230000029279 positive regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 2
- 102000021127 protein binding proteins Human genes 0.000 description 2
- 108091011138 protein binding proteins Proteins 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 238000010187 selection method Methods 0.000 description 2
- 230000005783 single-strand break Effects 0.000 description 2
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 2
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 2
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 238000010396 two-hybrid screening Methods 0.000 description 2
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 2
- ALNDFFUAQIVVPG-NGJCXOISSA-N (2r,3r,4r)-3,4,5-trihydroxy-2-methoxypentanal Chemical compound CO[C@@H](C=O)[C@H](O)[C@H](O)CO ALNDFFUAQIVVPG-NGJCXOISSA-N 0.000 description 1
- OPCHFPHZPIURNA-MFERNQICSA-N (2s)-2,5-bis(3-aminopropylamino)-n-[2-(dioctadecylamino)acetyl]pentanamide Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCN(CC(=O)NC(=O)[C@H](CCCNCCCN)NCCCN)CCCCCCCCCCCCCCCCCC OPCHFPHZPIURNA-MFERNQICSA-N 0.000 description 1
- ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 2-deoxy-D-ribose Chemical group OC[C@@H](O)[C@@H](O)CC=O ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 230000005730 ADP ribosylation Effects 0.000 description 1
- 108010013043 Acetylesterase Proteins 0.000 description 1
- 101710159080 Aconitate hydratase A Proteins 0.000 description 1
- 101710159078 Aconitate hydratase B Proteins 0.000 description 1
- 241001655883 Adeno-associated virus - 1 Species 0.000 description 1
- 241000202702 Adeno-associated virus - 3 Species 0.000 description 1
- 241000580270 Adeno-associated virus - 4 Species 0.000 description 1
- 241001634120 Adeno-associated virus - 5 Species 0.000 description 1
- 241000972680 Adeno-associated virus - 6 Species 0.000 description 1
- 241001164825 Adeno-associated virus - 8 Species 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 235000002198 Annona diversifolia Nutrition 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000282672 Ateles sp. Species 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- 241001515796 Cebinae Species 0.000 description 1
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 102000011045 Chloride Channels Human genes 0.000 description 1
- 108010062745 Chloride Channels Proteins 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101710128223 Chloride channel protein Proteins 0.000 description 1
- 108060005980 Collagenase Proteins 0.000 description 1
- 102000029816 Collagenase Human genes 0.000 description 1
- 206010011732 Cyst Diseases 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 241000450599 DNA viruses Species 0.000 description 1
- 108010008532 Deoxyribonuclease I Proteins 0.000 description 1
- 102000007260 Deoxyribonuclease I Human genes 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 241000255925 Diptera Species 0.000 description 1
- 241000255581 Drosophila <fruit fly, genus> Species 0.000 description 1
- 101150005585 E3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000889899 Enterobacteria phage T4 Intron-associated endonuclease 2 Proteins 0.000 description 1
- 101800001467 Envelope glycoprotein E2 Proteins 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000289659 Erinaceidae Species 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 102000003974 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100024785 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 1
- 241000724791 Filamentous phage Species 0.000 description 1
- 238000011769 Fox Chase SCID beige mouse Methods 0.000 description 1
- 102000048120 Galactokinases Human genes 0.000 description 1
- 108700023157 Galactokinases Proteins 0.000 description 1
- 241000699694 Gerbillinae Species 0.000 description 1
- 241000713813 Gibbon ape leukemia virus Species 0.000 description 1
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108091027305 Heteroduplex Proteins 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 101000851181 Homo sapiens Epidermal growth factor receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000615488 Homo sapiens Methyl-CpG-binding domain protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001109800 Homo sapiens Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform Proteins 0.000 description 1
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000012330 Integrases Human genes 0.000 description 1
- 241000282838 Lama Species 0.000 description 1
- 241000254158 Lampyridae Species 0.000 description 1
- 241000288904 Lemur Species 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 108091036060 Linker DNA Proteins 0.000 description 1
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- 102000006830 Luminescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010047357 Luminescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000282553 Macaca Species 0.000 description 1
- 102100021299 Methyl-CpG-binding domain protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 108010059724 Micrococcal Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 241000713869 Moloney murine leukemia virus Species 0.000 description 1
- 241000282339 Mustela Species 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 208000030135 Neonatal acute respiratory distress due to SP-B deficiency Diseases 0.000 description 1
- 108010008964 Non-Histone Chromosomal Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000006570 Non-Histone Chromosomal Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091007494 Nucleic acid- binding domains Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 241000282577 Pan troglodytes Species 0.000 description 1
- 208000035467 Pancreatic insufficiency Diseases 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 102000011755 Phosphoglycerate Kinase Human genes 0.000 description 1
- 102000045595 Phosphoprotein Phosphatases Human genes 0.000 description 1
- 108700019535 Phosphoprotein Phosphatases Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- RVGRUAULSDPKGF-UHFFFAOYSA-N Poloxamer Chemical compound C1CO1.CC1CO1 RVGRUAULSDPKGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010007568 Protamines Proteins 0.000 description 1
- 102000007327 Protamines Human genes 0.000 description 1
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108700040121 Protein Methyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 102000055027 Protein Methyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 241000125945 Protoparvovirus Species 0.000 description 1
- 102000044126 RNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000004570 RNA-binding Effects 0.000 description 1
- 101710105008 RNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N Raffinose Natural products O(C[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O[C@@]2(CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O1)[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N 0.000 description 1
- 241000232299 Ralstonia Species 0.000 description 1
- 241000589771 Ralstonia solanacearum Species 0.000 description 1
- 101100272715 Ralstonia solanacearum (strain GMI1000) brg11 gene Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010091086 Recombinases Proteins 0.000 description 1
- 102000018120 Recombinases Human genes 0.000 description 1
- 241000242739 Renilla Species 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 101001025539 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Homothallic switching endonuclease Proteins 0.000 description 1
- 241000288961 Saguinus imperator Species 0.000 description 1
- 241000282695 Saimiri Species 0.000 description 1
- 108010067618 Sex Chromatin Proteins 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 101800001271 Surface protein Proteins 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 101001099217 Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) Triosephosphate isomerase Proteins 0.000 description 1
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N Thiophosphoric acid Chemical class OP(O)(S)=O RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- 101710183280 Topoisomerase Proteins 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N UNPD196149 Natural products OC1C(O)C(CO)OC1(CO)OC1C(O)C(O)C(O)C(COC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 241001416177 Vicugna pacos Species 0.000 description 1
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000589634 Xanthomonas Species 0.000 description 1
- PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N Zinc dication Chemical compound [Zn+2] PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HMNZFMSWFCAGGW-XPWSMXQVSA-N [3-[hydroxy(2-hydroxyethoxy)phosphoryl]oxy-2-[(e)-octadec-9-enoyl]oxypropyl] (e)-octadec-9-enoate Chemical compound CCCCCCCC\C=C\CCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(=O)OCCO)OC(=O)CCCCCCC\C=C\CCCCCCCC HMNZFMSWFCAGGW-XPWSMXQVSA-N 0.000 description 1
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000007815 allergy Effects 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000009583 bone marrow aspiration Methods 0.000 description 1
- 210000001710 bronchial artery Anatomy 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001364 causal effect Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 230000007910 cell fusion Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000007073 chemical hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 210000000038 chest Anatomy 0.000 description 1
- 210000004081 cilia Anatomy 0.000 description 1
- 238000000749 co-immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000000975 co-precipitation Methods 0.000 description 1
- 229960002424 collagenase Drugs 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 208000031513 cyst Diseases 0.000 description 1
- 230000002559 cytogenic effect Effects 0.000 description 1
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J dCTP(4-) Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 239000005546 dideoxynucleotide Substances 0.000 description 1
- 102000004419 dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 238000009509 drug development Methods 0.000 description 1
- 238000002651 drug therapy Methods 0.000 description 1
- 241001493065 dsRNA viruses Species 0.000 description 1
- 230000004064 dysfunction Effects 0.000 description 1
- 210000003981 ectoderm Anatomy 0.000 description 1
- 238000002337 electrophoretic mobility shift assay Methods 0.000 description 1
- 238000004836 empirical method Methods 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 1
- 108010050663 endodeoxyribonuclease CreI Proteins 0.000 description 1
- 108010026638 endodeoxyribonuclease FokI Proteins 0.000 description 1
- 230000020619 endoderm development Effects 0.000 description 1
- 230000008497 endothelial barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000007071 enzymatic hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006047 enzymatic hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N eosin Chemical compound [Na+].OC(=O)C1=CC=CC=C1C1=C2C=C(Br)C(=O)C(Br)=C2OC2=C(Br)C(O)=C(Br)C=C21 YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000799 fluorescence microscopy Methods 0.000 description 1
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 102000035122 glycosylated proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005608 glycosylated proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000000833 heterodimer Substances 0.000 description 1
- 229960001340 histamine Drugs 0.000 description 1
- 238000010562 histological examination Methods 0.000 description 1
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 1
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 1
- 102000055650 human NRG1 Human genes 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000012744 immunostaining Methods 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 238000007917 intracranial administration Methods 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 125000000741 isoleucyl group Chemical group [H]N([H])C(C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])[H])C(=O)O* 0.000 description 1
- RCRODHONKLSMIF-UHFFFAOYSA-N isosuberenol Natural products O1C(=O)C=CC2=C1C=C(OC)C(CC(O)C(C)=C)=C2 RCRODHONKLSMIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000006194 liquid suspension Substances 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 1
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 1
- 230000004199 lung function Effects 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 241001515942 marmosets Species 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 210000003716 mesoderm Anatomy 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 1
- 230000033607 mismatch repair Effects 0.000 description 1
- 238000007479 molecular analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 210000000663 muscle cell Anatomy 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 239000002547 new drug Substances 0.000 description 1
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 230000030648 nucleus localization Effects 0.000 description 1
- 210000004789 organ system Anatomy 0.000 description 1
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 1
- 239000005022 packaging material Substances 0.000 description 1
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 1
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 description 1
- 150000008298 phosphoramidates Chemical class 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000003032 phytopathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229960000502 poloxamer Drugs 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 229950008679 protamine sulfate Drugs 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 1
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-ZQSKZDJDSA-N raffinose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-ZQSKZDJDSA-N 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 230000000306 recurrent effect Effects 0.000 description 1
- 108010054624 red fluorescent protein Proteins 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000007634 remodeling Methods 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 230000029058 respiratory gaseous exchange Effects 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 1
- 239000011435 rock Substances 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 210000000671 sex chromatin Anatomy 0.000 description 1
- 230000001568 sexual effect Effects 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 230000037432 silent mutation Effects 0.000 description 1
- 210000001626 skin fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 230000010473 stable expression Effects 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000007910 systemic administration Methods 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical group [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 238000011200 topical administration Methods 0.000 description 1
- 108091006106 transcriptional activators Proteins 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 230000002463 transducing effect Effects 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000011820 transgenic animal model Methods 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 238000003160 two-hybrid assay Methods 0.000 description 1
- 238000010798 ubiquitination Methods 0.000 description 1
- 230000034512 ubiquitination Effects 0.000 description 1
- 238000005199 ultracentrifugation Methods 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 239000000277 virosome Substances 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
- 238000012070 whole genome sequencing analysis Methods 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
- A61P19/04—Drugs for skeletal disorders for non-specific disorders of the connective tissue
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
- C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
- C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
- C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0652—Cells of skeletal and connective tissues; Mesenchyme
- C12N5/0662—Stem cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/80—Fusion polypeptide containing a DNA binding domain, e.g. Lacl or Tet-repressor
- C07K2319/81—Fusion polypeptide containing a DNA binding domain, e.g. Lacl or Tet-repressor containing a Zn-finger domain for DNA binding
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/8509—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
- C12N2015/8527—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic for producing animal models, e.g. for tests or diseases
- C12N2015/8536—Animal models for genetic diseases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/30—Vector systems comprising sequences for excision in presence of a recombinase, e.g. loxP or FRT
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/80—Vectors containing sites for inducing double-stranded breaks, e.g. meganuclease restriction sites
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Mycology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- Rheumatology (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Physical Education & Sports Medicine (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Description
本出願は、2011年7月25日に出願された米国仮特許出願第61/511,434号の利益を主張するものであり、該米国仮特許出願の開示はその全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
連邦支援の研究に基づき成された
本発明は、アメリカ国立衛生研究所により授与されたHL099559を基に、政府支援を用いて成された。政府は本発明において特定の権利を有し得る。
1.
操作されたZnフィンガータンパク質DNA結合ドメインを含むタンパク質であって、前記DNA結合ドメインが、N末端からC末端に向かってF1からF4、F1からF5またはF1からF6と配列された4、5または6つのZnフィンガー認識領域を含み、前記F1からF4、F1からF5またはF1からF6が表1の単一列に示される配列を含む、上記タンパク質。
2.
実施形態1に記載のタンパク質および野生型のまたは操作された切断ドメインまたは切断ハーフドメインを含む融合タンパク質。
3.
実施形態1または2に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
4.
実施形態1もしくは2に記載のタンパク質または実施形態3に記載のポリヌクレオチドを含む単離細胞。
5.
前記細胞が胚性幹細胞(ESC)、造血幹細胞、神経幹細胞、皮膚幹細胞、筋幹細胞、肺幹細胞、誘導多能性幹細胞(iPSC)および線維芽細胞からなる群から選択される、実施形態4に記載の細胞。
6.
細胞における嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(CFTR)遺伝子または肺サーファクタントタンパク質B(SP−B)遺伝子を改変する方法であって、CFTRまたはSP−Bに標的化された一つまたは複数の融合タンパク質を用いてCFTRまたはSP−B遺伝子を切断することを含み、該融合タンパク質が実施形態2に記載の融合タンパク質およびSP−Bに標的化されたヌクレアーゼからなる群から選択される、上記方法。
7.
前記改変が、挿入、欠失、置換およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態6に記載の方法。
8.
CFTRまたはSP−B遺伝子に外来性配列を導入することをさらに含む、実施形態6または7に記載の方法。
9.
前記改変がCFTRまたはSP−B遺伝子における変異を修復する、実施形態6〜8のいずれか1項に記載の方法。
10.
前記変異がΔF508、ΔI507、121ins2およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態9に記載の方法。
11.
嚢胞性線維症(CF)または肺サーファクタントタンパク質B欠損症の研究用モデル系を作製する方法であって、実施形態6〜10のいずれかの方法に従って細胞を改変することを含む、上記方法。
12.
前記モデル系が細胞株または非ヒト動物を含む、実施形態11に記載の方法。
13.
対象においてCFまたはSP−B欠損症を治療する方法であって、実施形態9または10に記載の方法に従って、前記対象の一つまたは複数の細胞におけるCFTRまたはSP−B遺伝子を改変することを含む、上記方法。
14.
前記細胞がインビトロで改変され、前記細胞が前記対象に投与される、実施形態13に記載の方法。
15.
実施形態1に記載のタンパク質、実施形態2に記載の融合タンパク質、または実施形態3に記載のポリヌクレオチドを含むキット。
本発明は、例えば、以下の項目も提供する。
(項目1)
操作されたZnフィンガータンパク質DNA結合ドメインを含むタンパク質であって、前記DNA結合ドメインが、N末端からC末端に向かってF1からF4、F1からF5またはF1からF6と配列された4、5または6つのZnフィンガー認識領域を含み、前記F1からF4、F1からF5またはF1からF6が表1の単一列に示される配列を含む、上記タンパク質。
(項目2)
項目1に記載のタンパク質および野生型のまたは操作された切断ドメインまたは切断ハーフドメインを含む融合タンパク質。
(項目3)
項目1または項目2に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
(項目4)
項目1もしくは2に記載のタンパク質または項目3に記載のポリヌクレオチドを含む単離細胞。
(項目5)
前記細胞が胚性幹細胞(ESC)、造血幹細胞、神経幹細胞、皮膚幹細胞、筋幹細胞、肺幹細胞、誘導多能性幹細胞(iPSC)および線維芽細胞からなる群から選択される、項目4に記載の細胞。
(項目6)
細胞における嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(CFTR)遺伝子を改変する方法であって、
一つまたは複数の項目2に記載の融合タンパク質を用いてCFTRを切断すること、を含む上記方法。
(項目7)
前記改変が、挿入、欠失、置換およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目6に記載の方法。
(項目8)
CFTR遺伝子に外来性配列を導入することをさらに含む、項目6または項目7に記載の方法。
(項目9)
前記改変がCFTR遺伝子における変異を修復する、項目6〜8のいずれか1項に記載の方法。
(項目10)
前記変異がΔF508、ΔI507およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目9に記載の方法。
(項目11)
嚢胞性線維症(CF)の研究用モデル系を作製する方法であって、項目6〜10のいずれかの方法に従って細胞を改変することを含む、上記方法。
(項目12)
前記モデル系が細胞株または非ヒト動物を含む、項目11に記載の方法。
(項目13)
対象においてCFを治療する方法であって、項目9または10に記載の方法に従って、前記対象の一つまたは複数の細胞におけるCFTR遺伝子を改変することを含む、上記方法。
(項目14)
前記細胞がインビトロで改変され、前記細胞が前記対象に投与される、項目13に記載の方法。
(項目15)
項目1に記載のタンパク質、項目2に記載の融合タンパク質、または項目3に記載のポリヌクレオチドを含むキット。
本明細書で開示される方法の実践、並びに本明細書で開示される組成物の調製および使用には、特に明記しない限り、当業者の技能の範囲内である、分子生物学、生化学、クロマチンの構造および解析、計算化学、細胞培養、組換えDNA並びに関連分野における従来技術が使用される。これらの技術は以下の文献において十分に説明がなされている。例えば、Sambrook et al. MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, Second edition, Cold Spring HarborLaboratory Press, 1989 and Third edition, 2001; Ausubel et al., CURRENT PROTOCOLS INMOLECULAR BIOLOGY, JohnWiley & Sons, New York, 1987 and periodic updates; the series METHODS IN ENZYMOLOGY, Academic Press, San Diego; Wolffe, CHROMATINSTRUCTURE AND FUNCTION,Third edition, Academic Press, San Diego, 1998; METHODS IN ENZYMOLOGY, Vol. 304, “Chromatin” (P.M. Wassarmanand A. P. Wolffe, eds.), Academic Press, San Diego, 1999; および METHODS IN MOLECULARBIOLOGY, Vol. 119, “ChromatinProtocols” (P.B. Becker, ed.) Humana Press, Totowa, 1999を参照されたい。
「核酸」、「ポリヌクレオチド」、および「オリゴヌクレオチド」という用語は、同義的に使用され、直鎖または環状高次構造の、且つ一本鎖または二本鎖形態の、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドの重合体を指す。本開示の目的上、これらの用語は、重合体の長さに関する限定と解釈されるべきではない。これらの用語には、天然ヌクレオチドの既知の類似体、並びに塩基、糖および/またはリン酸部分(例えば、ホスホロチオエート骨格)において修飾されたヌクレオチドが包含され得る。一般的に、特定のヌクレオチドの類似体は同一の塩基対形成特性を有し、すなわち、Aの類似体はTと塩基対形成する。
例えばCFのモデルを作製するための、一つまたは複数の変異型CFTR対立遺伝子および/または一つまたは複数のCFTR対立遺伝子の変異の修復に有用な組成物、特にヌクレアーゼが、本明細書に記載される。ある実施形態では、ヌクレアーゼは天然のものである。他の実施形態では、ヌクレアーゼは天然でないもの、すなわち、DNA結合ドメインおよび/または切断ドメインに操作を受けたものである。例えば、天然のヌクレアーゼのDNA結合ドメインを改変して、選択された標的部位に結合することができる(例えば、その同起源の結合部位と異なる部位に結合するように操作されたメガヌクレアーゼ)。他の実施形態では、ヌクレアーゼは異種性のDNA結合ドメインおよび切断ドメインを含む(例えば、異種切断ドメインを有する、Znフィンガーヌクレアーゼ;TAL作動因子ヌクレアーゼ;メガヌクレアーゼDNA結合ドメイン)。
ある実施形態では、ヌクレアーゼはメガヌクレアーゼ(ホーミングエンドヌクレアーゼ)である。天然のメガヌクレアーゼは、15〜40塩基対の切断部位を認識し、一般的には4つのファミリーに分類される:LAGLIDADGファミリー、GIY−YIGファミリー、His−CystボックスファミリーおよびHNHファミリー。例示的なホーミングエンドヌクレアーゼには、I−SceI、I−CeuI、PI−PspI、PI−Sce、I−SceIV、I−CsmI、I−PanI、I−SceII、I−PpoI、I−SceIII、I−CreI、I−TevI、I−TevIIおよびI−TevIIIが含まれる。それらの認識配列は既知である。米国特許第5,420,032号;米国特許第6,833,252号;Belfort et al.(1997) NucleicAcidsRes.25:3379‐3388; Dujonet al. (1989) Gene 82:115‐118; Perler et al.(1994) Nucleic Acids Res. 22, 1125‐1127; Jasin(1996) Trends Genet. 12:224‐228; Gimble et al. (1996) J. Mol. Biol. 263:163‐180;Argast et al. (1998) J. Mol. Biol. 280:345‐353およびニュー・イングランド・バイオラボ社(NewEngland Biolabs)のカタログも参照されたい。
何らかの適切な切断ドメインをDNA結合ドメインに機能的に連結して、ヌクレアーゼを形成させることができる。例えば、ZFPDNA結合ドメインをヌクレアーゼドメインに融合することで、ZFN(その目的の核酸標的をその操作された(ZFP)DNA結合ドメインを介して認識し、ヌクレアーゼ活性によってZFP結合部位付近でDNA切断を引き起こすことができる機能的実体)が生成された。例えば、Kim et al. (1996) Proc Nat’l Acad Sci USA 93(3):1156-1160を参照されたい。より最近では、種々の生物におけるゲノム改変にZFNが使用された。例えば、米国特許出願公開第20030232410号;同第20050208489号;同第20050026157号;同第20050064474号;同第20060188987号;同第20060063231号;および国際公開番号WO07/014275を参照されたい。
上記で詳細に説明したように、DNAドメインは、CFTR遺伝子座またはSFTPB遺伝子座におけるあらゆる最適な配列に結合するように、操作することができる。操作されたDNA結合ドメインは、天然のDNA結合ドメインと比較して、新規の結合特異性を有し得る。操作方法には、限定はされないが、合理的設計および各種の選択が含まれる。合理的設計は、例えば、三つ組(または四つ組)ヌクレオチド配列および個々の(例えばZnフィンガーの)アミノ酸配列を含むデータベースの使用を含み、そのデータベースでは、各三つ組または四つ組ヌクレオチド配列が、特定の三つ組または四つ組配列と結合するDNA結合領域の一つまたは複数のアミノ酸配列と会合している。例えば、共有に係る米国特許第6,453,242号および第6,534,261号(その全体が参照によって本明細書に組み込まれる)を参照されたい。TAL作動因子ドメインの合理的設計を行うこともできる。例えば、米国特許出願公開第20110301073号を参照されたい。
上記で言及したように、CFTRまたはSFTPB遺伝子の改変は、例えば、変異遺伝子の修復または野生型遺伝子の変異のための、外来性配列(「ドナー配列」または「ドナー」とも呼ばれる)の挿入を含み得る。ドナー配列が典型的には置換するゲノム配列と同一でないことは、容易に明らかである。例えば、ドナーポリヌクレオチドの配列は、染色体配列との相同性が十分に存在する限りは、ゲノム配列に対して、一つまたは複数の一塩基の変化、挿入、欠失、逆位または再配列を含有し得る。あるいは、ドナー配列は、2つの相同領域に挟まれた非相同配列を含有し得る。さらに、ドナー配列は、細胞性クロマチン内の目的領域と相同でない配列を含有するベクター分子を含み得る。ドナー分子は、いくつかの非連続的な、細胞性クロマチンに相同な領域を含有し得る。例えば、目的領域内に通常は存在しない配列を標的挿入するために、前記配列を、ドナー核酸分子内に含ませ、目的領域内の配列に相同な領域で挟ませていてもよい。
ヌクレアーゼ、これらのヌクレアーゼをコードするポリヌクレオチド、ドナーポリヌクレオチド、並びに本明細書に記載のタンパク質および/またはポリヌクレオチドを含んで成る組成物は、いかなる適切な手段によっても、インビボまたはエキソビボで送達することができる。
本発明は、CF疾患および/またはSB−P欠損症等の肺障害における変異を導入または修復するために使用することができる方法および組成物を記載している。具体的には、CFの発症において病原性であることが示されているCFTR遺伝子における特定の変異には、ΔF508およびΔI507が含まれる。SFTPBにおける変異は、SB−P欠損症を引き起こす最も一般的な変異であり、121ins2(121C>GAA)が含まれる。従って、本発明の方法および組成物は、患者由来幹細胞の修復によって、またはヌクレアーゼおよびドナー分子のインビボ投与によって、CFTRおよび/またはSB−Pにおける変異を修復するのに有用である。また、CFTRおよびSFTPB変異に関連した細胞内の異常を研究するための、並びにその生物全体におけるこれらの変異の結果を研究するための、細胞および遺伝子導入動物モデルを開発する方法も有用であり、本明細書に記載される。従って、特定のCFTRまたはSFTPB変異(例えばCFTRにおけるΔF508変異)をノックアウト、ノックインおよび/または修復するよう設計された手段を使用して、根底にある生物学の理解を促進することに、および特異的な薬物療法の開発に有用な細胞モデルおよび動物モデルを作製することができる。さらに、特定のCFTRまたはSFTPB変異に標的化された特異的ヌクレアーゼを使用して、その変異をノックアウトまたは修復することができる。CFTRまたはSFTPB変異に特異的な治療薬の研究のための細胞株を開発するために、ヌクレアーゼを使用して、CFTRまたはSFTPB変異に特異的な標識の挿入を引き起こすこともできる。
A. 嚢胞性線維症初代線維芽細胞
ΔF508変異に関してホモ接合性と報告された患者(17歳男性)由来のCF初代線維芽細胞株GM04320を入手した(コリエルレポジトリー(Coriell Repository)、ニュージャージー州キャムデン)。この患者に関する臨床症状は、進行性肺疾患および膵不全と報告されたが;加えて、不完全なcAMP誘導塩素イオンチャネル活性もこの患者に由来する線維芽細胞で示された。Lin& Gruenstein (1987) J Biol Chem 262:15345-15347も参照されたい。
Lowry etal. (2008) Proc Natl Acad Sci USA 105:2883-2888に記載される、ヒト再プログラム因子(OCT4[17964]、SOX2[17965]、KLF4[17967]、C−MYC[17966]、NANOG[18115])をコードするpMXsレトロウイルスベクターを、CF初代線維芽細胞に導入した。非組込み法または組込みを含まない方法(例えばRNA、エピソームベクター、切除可能な再プログラム導入遺伝子、および/または小分子)を、再プログラム因子の導入に使用することもできる。例えば、Somerset al. (2010) Stem Cells 28:1728-1740; Warren et al. (2010) Cell StemCell7:618-630; Yu et al. (2009) Science 324:797-801; Li et al. (2009) Cell StemCell 4:16-19を参照されたい。Plat−GP細胞(セルバイオラボ社(Cell Biolabs))にベクターDNAおよびVSV−G発現プラスミド(pCMV−VSV−G[8454])を形質移入し、超遠心で100倍に濃縮することにより、VSV−Gエンベロープウイルスのストックを調製した。並行してpMXs−GFPベクターストックの製造を行い;初代ヒト線維芽細胞に感染させることでpMXs−GFPウイルスの力価測定を行い、続いてGFP−発現細胞のFACS解析を行った。
CF iPS細胞(クローン17)を四週齢のFox Chase SCIDベージュマウス(チャールズリバー)の後肢背側に筋肉内注射し、腫瘍増殖の様子を毎週モニターした。注射後7週間目に、腫瘍を摘出し、パラフィン包埋し、ヘマトキシリンおよびエオシンによる組織学的検討用に調製し、ベイラー医科大学の比較医学センターでの解析を行った。
CFTRに対し標的化されたZnフィンガーヌクレアーゼを、基本的には米国特許第6,534,261号に記載の通りに設計した。表1は、例示的なCFTR標的ZFPの認識へリックスDNA結合ドメインを示している。設計されたDNA結合ドメインは、特定の標的配列(表2参照)を認識する4〜6個のZnフィンガーを含有する。ZFP認識へリックスと接触する標的部位のヌクレオチドは大文字で表され;接触しないヌクレオチドは小文字で表される。
継代数2の時点で、QIAprep(登録商標)Spin Miniprep Kit(キアゲン社)またはArchivePure(商標)DNA Cell Tissue Kit(5プライム社(5 Prime))により、ピューロマイシン抵抗性クローンからゲノムDNAを単離した。製造業者のプロトコルに従って、種々のプライマーを使用するPCR増幅を行った。ABI3730XL配列決定装置上で配列決定を行った。
サザンブロットしたゲノムDNAをプローブするための放射線標識DNAを作製するために、ドナープラスミドをNdeI+SpeIで消化し、0.8%アガロースゲルで分離し、その後2.3kb断片を切り出し、ゲル精製(キアゲン社)した。製造業者の取扱説明書に従ってPrime−It(登録商標)II Random Primer Labelingキット(アジレント・テクノロジーズ社)を用いて、2.3kb断片を[α−32P]dCTPで標識した。25μgのゲノムDNA(gDNA)をSpeIで一晩消化し、フェノール/クロロホルム抽出で精製した。次にgDNAを1%アガロースゲルで分離し、Nytran(登録商標)Super Chargeメンブレン(シュライヒャー&シュール社(Schleicher and Schuell)に転写し、32P標識プローブでハイブリダイズした。システム(モレキュラー・ダイナミクス社(MolecularDynamics)を用いてメンブレンを露光し画像をスキャンした。
Cre発現プラスミド(pBS513 EF1α−creおよびpCAG−Cre(例えば、Le et al. (1999) Anal Biochem270:334-336; Matsuda & Cepko (2007)ProcNatl Acad Sci U S A 104:1027-1032を参照)を、Amaxa(商標)nucleofectionによりAccutase(商標)処理細胞に送達し、被照射MEF上に播種した。各コロニーを採取して増殖させ、次に2連で播種して、ピューロマイシン感受性になっていたそれらのクローンを同定した。あるいは、いくつかのクローンをFIAU(1μM、モラベック・バイオケミカルズ社(MoravekBiochemicals))に対するそれらの抵抗性に基づいて最初に同定し、増殖させ、次に2連で播種して、ピューロマイシン感受性クローンを同定した。
RNeasy(登録商標)キット(キアゲン社)を用いてiPSおよびiPS由来細胞からRNAを単離し、Improm−II(商標)Reverse Transcriptase oligodTキット(プロメガ社)を用いてcDNA合成を行い、Gotaq Hot Start(登録商標)ポリメラーゼ(プロメガ社)を用いてRT−PCRを行った。
基本的にはD'Amouret al. (2005) Nat Biotechnol 23:1534-1541に記載の通りに、iPS細胞の胚体内胚葉(definitiveendoderm)への短期分化を行った。簡潔に説明すると、MEF上に播種されたiPS細胞を、低濃度のウシ胎児血清(0日目は0&、1日目は0.2%、2〜5日目は2%)存在下で、アクチビンA(100μg/ml)に曝した。培養物を示された日にRNA用に採取し、遺伝子発現についてRT−PCRで解析した。長期分化については、VanHaute et al. (2009) Respir Res 10:105により報告された気相液相界面プロトコルを適合して、ヒトES細胞から肺上皮組織を作出した。簡潔に説明すると、コラゲナーゼ消化により回収したiPS細胞を、被照射MEFとの同時播種に先立ち、12ウェルプレートのウェル中の8.0μculture plate insert(P18P01250、ミリポア社)上に細胞塊として播種した。最初の8日間(0〜4日目:ヒトES培地;5〜8日目:分化培地[DM]:βメルカプトエタノールおよび塩基性線維芽細胞増殖因子を含有しないヒトES培地)は、メンブレンに播種された細胞を完全に覆うのに十分なレベルに培地を維持し;8〜28日目は、培地(DM)の体積を減少させて、所望の気相液相界面を得た。培養物を示された日にRNA用に回収し、遺伝子発現についてRT−PCRで解析した。
Δ508変異部位に近接するよう設計された表1に示されるZFN対には、Δ508の部位からおよそ115nt離れて結合するZFN対12897/9940、並びに標的部位がそれぞれ18および48ヌクレオチド離れている対32365/32366および32375/32376が含まれる。図6を参照されたい。さらに、Δ508対立遺伝子を特異的に標的とし、野生型対立遺伝子は標的としないように、対32401/32398を設計した(図6参照)。
ΔF508CFTR変異に関してホモ接合性と報告された患者から、CF初代線維芽細胞(GM04320;コリエルレポジトリー)を入手した。エクソン10の直接配列決定により、これらの細胞が実際には、CFTR遺伝子座において、一方の対立遺伝子はΔF508で、もう一方の対立遺伝子はΔI507である複合型ヘテロ接合性であることが明らかにされた。
CFTRエクソン10変異の全体的な修復戦略は図1に要約されており、CFTR特異的ZFNを、適切なCFTRドナーDNAと共に送達することを含み;loxP隣接puroTK選択カセットは、ピューロマイシンによる初期クローンの選択、およびそれに続くFIAUによるCre切除後クローンの選択を可能にする。CFTRエクソン10を標的とするZFNを設計して、HDRによるΔI507またはΔF508の修復を促進させた(図1参照)。CFTRエクソン10特異的ZFN(CFTR ZFN)は、エクソン10の開始点付近のDNA配列、ΔI507またはΔF508三塩基対欠失のおよそ110bp上流を認識する。
また、RT−PCRおよび配列解析によって、ZFNにより修復された細胞におけるCFTRの発現を決定した。実施例1を参照されたい。
このようにして、本明細書に記載の組成物および方法を使用して、CF研究のためのモデル系を作製することができる。例えば、修復された、または破損したΔF508(および/またはΔI507)を有する患者由来iPSCは、CF治療用の薬剤を試験するための細胞および動物モデルを提供する。
実施例6: SFTPBの修復
CFTR遺伝子座に対して特異的なTALEN対も設計し、米国特許出願公開第20110301073号(本明細書に記載のように参照によって組み込まれる)に記載の通りに、標準的な、および新規のRVDの両方を用いて構築する。TALENは、上記の通りに試験すると、活性である。
Claims (17)
- 嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(CFTR)遺伝子における標的部位に結合する操作されたZnフィンガータンパク質DNA結合ドメインを含むタンパク質であって、前記Znフィンガータンパク質が、N末端からC末端に向かってF1からF4、F1からF5またはF1からF6と配列された4、5または6つのZnフィンガー認識領域を含み、前記F1からF4、F1からF5またはF1からF6が表1:
- 請求項1に記載のタンパク質および野生型のまたは操作された切断ドメインまたは切断ハーフドメインを含む融合タンパク質。
- 請求項1または請求項2に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項1もしくは2に記載のタンパク質または請求項3に記載のポリヌクレオチドを含む単離細胞。
- 前記細胞が胚性幹細胞(ESC)、造血幹細胞、神経幹細胞、皮膚幹細胞、筋幹細胞、肺幹細胞、誘導多能性幹細胞(iPSC)および線維芽細胞からなる群から選択される、請求項4に記載の細胞。
- 細胞における嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(CFTR)遺伝子を改変するための組成物であって、
CFTRを切断する一つまたは複数の請求項2に記載の融合タンパク質を含む上記組成物。 - 前記改変が、挿入、欠失、置換およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項6に記載の組成物。
- CFTR遺伝子に導入される外来性配列をさらに含む、請求項6または請求項7に記載の組成物。
- 前記改変がCFTR遺伝子における変異を修復する、請求項6〜8のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記変異がΔF508、ΔI507およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項9に記載の組成物。
- 嚢胞性線維症(CF)の研究用モデル系を作製するための、細胞を改変する請求項6〜10のいずれかに記載の組成物。
- 前記モデル系が細胞株または非ヒト動物を含む、請求項11に記載の組成物。
- 対象においてCFを治療するための、請求項9または10に記載の組成物であって、前記組成物が、前記対象の一つまたは複数の細胞におけるCFTR遺伝子を改変することを特徴とする、上記組成物。
- 前記細胞がインビトロで改変され、前記細胞が前記対象に投与されることを特徴とする、請求項13に記載の組成物。
- 請求項1に記載のタンパク質、請求項2に記載の融合タンパク質、または請求項3に記載のポリヌクレオチドを含むキット。
- 野生型CFTR遺伝子を含む細胞を生成する方法であって、請求項6〜10のいずれか1項に記載の組成物によって細胞における変異型CFTR遺伝子を改変して、前記野生型CFTR遺伝子を含む細胞を得ることを含む方法。
- 請求項16に記載の方法に従って前記野生型CFTR遺伝子を含む細胞を生成するのに使用するための、変異型CFTR遺伝子を含む細胞を含む組成物であって、前記野生型CFTR遺伝子を含む細胞が、対象におけるCFの治療に使用されることを特徴とする、組成物。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201161511434P | 2011-07-25 | 2011-07-25 | |
US61/511,434 | 2011-07-25 | ||
PCT/US2012/048176 WO2013016446A2 (en) | 2011-07-25 | 2012-07-25 | Methods and compositions for alteration of a cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (cftr) gene |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2014523748A JP2014523748A (ja) | 2014-09-18 |
JP2014523748A5 JP2014523748A5 (ja) | 2015-07-16 |
JP6072788B2 true JP6072788B2 (ja) | 2017-02-01 |
Family
ID=47601755
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014522973A Active JP6072788B2 (ja) | 2011-07-25 | 2012-07-25 | 嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(cftr)遺伝子を改変するための方法および組成物 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US9161995B2 (ja) |
EP (1) | EP2737063B1 (ja) |
JP (1) | JP6072788B2 (ja) |
AU (1) | AU2012286901B2 (ja) |
CA (1) | CA2841541C (ja) |
HK (1) | HK1197427A1 (ja) |
WO (1) | WO2013016446A2 (ja) |
Families Citing this family (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2014165825A2 (en) | 2013-04-04 | 2014-10-09 | President And Fellows Of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
WO2015006498A2 (en) | 2013-07-09 | 2015-01-15 | President And Fellows Of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
US11306328B2 (en) * | 2013-07-26 | 2022-04-19 | President And Fellows Of Harvard College | Genome engineering |
WO2015179656A2 (en) * | 2014-05-23 | 2015-11-26 | The Scripps Research Institute | Specific targeted activation of cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (cftr) |
WO2018157133A1 (en) | 2017-02-27 | 2018-08-30 | Translate Bio, Inc. | Methods for purification of messenger rna |
CA3059793A1 (en) * | 2017-05-03 | 2018-11-08 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for modification of a cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (cftr) gene |
WO2019051097A1 (en) | 2017-09-08 | 2019-03-14 | The Regents Of The University Of California | RNA-GUIDED ENDONUCLEASE FUSION POLYPEPTIDES AND METHODS OF USING SAME |
US11690921B2 (en) | 2018-05-18 | 2023-07-04 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Delivery of target specific nucleases |
AU2020207252A1 (en) * | 2019-01-08 | 2021-08-19 | Asklepios Biopharmaceutical, Inc. | A method of treating cystic fibrosis |
CN115667505A (zh) * | 2020-03-19 | 2023-01-31 | 因特利亚治疗公司 | 用于定向基因组编辑的方法和组合物 |
Family Cites Families (74)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4897355A (en) | 1985-01-07 | 1990-01-30 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N[ω,(ω-1)-dialkyloxy]- and N-[ω,(ω-1)-dialkenyloxy]-alk-1-yl-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US5049386A (en) | 1985-01-07 | 1991-09-17 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N-ω,(ω-1)-dialkyloxy)- and N-(ω,(ω-1)-dialkenyloxy)Alk-1-YL-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US4946787A (en) | 1985-01-07 | 1990-08-07 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N-(ω,(ω-1)-dialkyloxy)- and N-(ω,(ω-1)-dialkenyloxy)-alk-1-yl-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US5356802A (en) | 1992-04-03 | 1994-10-18 | The Johns Hopkins University | Functional domains in flavobacterium okeanokoites (FokI) restriction endonuclease |
US5436150A (en) | 1992-04-03 | 1995-07-25 | The Johns Hopkins University | Functional domains in flavobacterium okeanokoities (foki) restriction endonuclease |
US5487994A (en) | 1992-04-03 | 1996-01-30 | The Johns Hopkins University | Insertion and deletion mutants of FokI restriction endonuclease |
US6242568B1 (en) | 1994-01-18 | 2001-06-05 | The Scripps Research Institute | Zinc finger protein derivatives and methods therefor |
WO1995019431A1 (en) | 1994-01-18 | 1995-07-20 | The Scripps Research Institute | Zinc finger protein derivatives and methods therefor |
US6140466A (en) | 1994-01-18 | 2000-10-31 | The Scripps Research Institute | Zinc finger protein derivatives and methods therefor |
AU696455C (en) | 1994-03-23 | 2006-03-02 | Case Western Reserve University | Compacted nucleic acids and their delivery to cells |
GB9824544D0 (en) | 1998-11-09 | 1999-01-06 | Medical Res Council | Screening system |
JP4118327B2 (ja) | 1994-08-20 | 2008-07-16 | ゲンダック・リミテッド | Dna認識のための結合タンパク質におけるまたはそれに関連する改良 |
US5789538A (en) | 1995-02-03 | 1998-08-04 | Massachusetts Institute Of Technology | Zinc finger proteins with high affinity new DNA binding specificities |
US5948681A (en) * | 1996-08-14 | 1999-09-07 | Children's Hospital Of Philadelphia | Non-viral vehicles for use in gene transfer |
US5925523A (en) | 1996-08-23 | 1999-07-20 | President & Fellows Of Harvard College | Intraction trap assay, reagents and uses thereof |
GB9703369D0 (en) | 1997-02-18 | 1997-04-09 | Lindqvist Bjorn H | Process |
GB2338237B (en) | 1997-02-18 | 2001-02-28 | Actinova Ltd | In vitro peptide or protein expression library |
GB9710807D0 (en) | 1997-05-23 | 1997-07-23 | Medical Res Council | Nucleic acid binding proteins |
GB9710809D0 (en) | 1997-05-23 | 1997-07-23 | Medical Res Council | Nucleic acid binding proteins |
US6410248B1 (en) | 1998-01-30 | 2002-06-25 | Massachusetts Institute Of Technology | General strategy for selecting high-affinity zinc finger proteins for diverse DNA target sites |
ATE466952T1 (de) | 1998-03-02 | 2010-05-15 | Massachusetts Inst Technology | Poly-zinkfinger-proteine mit verbesserten linkern |
US6140081A (en) | 1998-10-16 | 2000-10-31 | The Scripps Research Institute | Zinc finger binding domains for GNN |
US6453242B1 (en) | 1999-01-12 | 2002-09-17 | Sangamo Biosciences, Inc. | Selection of sites for targeting by zinc finger proteins and methods of designing zinc finger proteins to bind to preselected sites |
US6599692B1 (en) | 1999-09-14 | 2003-07-29 | Sangamo Bioscience, Inc. | Functional genomics using zinc finger proteins |
US7013219B2 (en) | 1999-01-12 | 2006-03-14 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins |
US6534261B1 (en) | 1999-01-12 | 2003-03-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins |
US7070934B2 (en) | 1999-01-12 | 2006-07-04 | Sangamo Biosciences, Inc. | Ligand-controlled regulation of endogenous gene expression |
US7030215B2 (en) | 1999-03-24 | 2006-04-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Position dependent recognition of GNN nucleotide triplets by zinc fingers |
US6794136B1 (en) * | 2000-11-20 | 2004-09-21 | Sangamo Biosciences, Inc. | Iterative optimization in the design of binding proteins |
DE60023936T2 (de) | 1999-12-06 | 2006-05-24 | Sangamo Biosciences Inc., Richmond | Methoden zur verwendung von randomisierten zinkfingerprotein-bibliotheken zur identifizierung von genfunktionen |
AU5077401A (en) | 2000-02-08 | 2001-08-20 | Sangamo Biosciences Inc | Cells for drug discovery |
US20020061512A1 (en) | 2000-02-18 | 2002-05-23 | Kim Jin-Soo | Zinc finger domains and methods of identifying same |
AU2001263155A1 (en) | 2000-05-16 | 2001-11-26 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and compositions for interaction trap assays |
JP2002060786A (ja) | 2000-08-23 | 2002-02-26 | Kao Corp | 硬質表面用殺菌防汚剤 |
US7067317B2 (en) | 2000-12-07 | 2006-06-27 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of angiogenesis with zinc finger proteins |
GB0108491D0 (en) | 2001-04-04 | 2001-05-23 | Gendaq Ltd | Engineering zinc fingers |
US20040224385A1 (en) | 2001-08-20 | 2004-11-11 | Barbas Carlos F | Zinc finger binding domains for cnn |
US7262054B2 (en) | 2002-01-22 | 2007-08-28 | Sangamo Biosciences, Inc. | Zinc finger proteins for DNA binding and gene regulation in plants |
CN100575485C (zh) | 2002-01-23 | 2009-12-30 | 犹他大学研究基金会 | 使用锌指核酸酶的定向染色体诱变 |
EP2368982A3 (en) | 2002-03-21 | 2011-10-12 | Sangamo BioSciences, Inc. | Methods and compositions for using zinc finger endonucleases to enhance homologous recombination |
US7361635B2 (en) | 2002-08-29 | 2008-04-22 | Sangamo Biosciences, Inc. | Simultaneous modulation of multiple genes |
US9447434B2 (en) | 2002-09-05 | 2016-09-20 | California Institute Of Technology | Use of chimeric nucleases to stimulate gene targeting |
EP3202899B1 (en) * | 2003-01-28 | 2020-10-21 | Cellectis | Custom-made meganuclease and use thereof |
US8409861B2 (en) | 2003-08-08 | 2013-04-02 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted deletion of cellular DNA sequences |
US7888121B2 (en) | 2003-08-08 | 2011-02-15 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for targeted cleavage and recombination |
ES2808687T3 (es) | 2003-08-08 | 2021-03-01 | Sangamo Therapeutics Inc | Métodos y composiciones para escisión dirigida y recombinación |
US7972854B2 (en) | 2004-02-05 | 2011-07-05 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for targeted cleavage and recombination |
JP4903689B2 (ja) | 2004-04-08 | 2012-03-28 | サンガモ バイオサイエンシズ インコーポレイテッド | 神経障害および神経変性症状を治療するための方法と組成物 |
JP2008506359A (ja) | 2004-04-08 | 2008-03-06 | サンガモ バイオサイエンシズ インコーポレイテッド | ジンクフィンガータンパク質による神経因性疼痛の処置 |
KR20070060115A (ko) | 2004-09-16 | 2007-06-12 | 상가모 바이오사이언스 인코포레이티드 | 단백질 생산을 위한 조성물 및 방법 |
EP1877583A2 (en) | 2005-05-05 | 2008-01-16 | Arizona Board of Regents on behalf of the Unversity of Arizona | Sequence enabled reassembly (seer) - a novel method for visualizing specific dna sequences |
US20100055793A1 (en) | 2005-07-25 | 2010-03-04 | Johns Hopkins University | Site-specific modification of the human genome using custom-designed zinc finger nucleases |
EP1913149A4 (en) | 2005-07-26 | 2009-08-05 | Sangamo Biosciences Inc | TARGETED INTEGRATION AND EXPRESSION OF EXOGENOUS NUCLEIC ACID SEQUENCES |
WO2007047859A2 (en) | 2005-10-18 | 2007-04-26 | Precision Biosciences | Rationally-designed meganucleases with altered sequence specificity and dna-binding affinity |
EP2213731B1 (en) | 2006-05-25 | 2013-12-04 | Sangamo BioSciences, Inc. | Variant foki cleavage half-domains |
US8110379B2 (en) | 2007-04-26 | 2012-02-07 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted integration into the PPP1R12C locus |
US8790345B2 (en) | 2007-08-21 | 2014-07-29 | Zimmer, Inc. | Titanium alloy with oxidized zirconium for a prosthetic implant |
CA2700231C (en) | 2007-09-27 | 2018-09-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Rapid in vivo identification of biologically active nucleases |
DE102007056956B4 (de) | 2007-11-27 | 2009-10-29 | Moosbauer, Peter, Dipl.-Ing.(FH) | Schaltung zur Regelung der Stromversorgung eines Verbrauchers und Verfahren zum Betrieb einer Schaltung |
US20090215878A1 (en) * | 2008-02-08 | 2009-08-27 | Sangamo Biosciences, Inc. | Treatment of chronic pain with zinc finger proteins |
AU2009238629C1 (en) | 2008-04-14 | 2015-04-30 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Linear donor constructs for targeted integration |
WO2009146179A1 (en) * | 2008-04-15 | 2009-12-03 | University Of Iowa Research Foundation | Zinc finger nuclease for the cftr gene and methods of use thereof |
EP2128245A1 (en) | 2008-05-27 | 2009-12-02 | Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Generation of induced pluripotent stem (iPS) cells |
EP2313515B1 (en) | 2008-08-22 | 2015-03-04 | Sangamo BioSciences, Inc. | Methods and compositions for targeted single-stranded cleavage and targeted integration |
US20110023151A1 (en) * | 2008-12-04 | 2011-01-27 | Sigma-Aldrich Co. | Genome editing of abc transporters |
US20100158868A1 (en) | 2008-12-19 | 2010-06-24 | Yuet W. Kan | Use of Fetal Cells for the Treatment of Genetic Diseases |
EP2206723A1 (en) | 2009-01-12 | 2010-07-14 | Bonas, Ulla | Modular DNA-binding domains |
CA2763482A1 (en) | 2009-05-27 | 2010-12-02 | The Salk Institute For Biological Studies | Generation of genetically corrected disease-free induced pluripotent stem cells |
EP2510096B2 (en) | 2009-12-10 | 2018-02-07 | Regents of the University of Minnesota | Tal effector-mediated dna modification |
JP6137596B2 (ja) | 2010-02-08 | 2017-05-31 | サンガモ セラピューティクス, インコーポレイテッド | 遺伝子操作された切断ハーフドメイン |
WO2011100058A1 (en) | 2010-02-09 | 2011-08-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules |
JP5898179B2 (ja) | 2010-05-03 | 2016-04-06 | サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド | ジンクフィンガーモジュールを連結するための組成物 |
CA2798988C (en) | 2010-05-17 | 2020-03-10 | Sangamo Biosciences, Inc. | Tal-effector (tale) dna-binding polypeptides and uses thereof |
JP6050230B2 (ja) * | 2010-07-21 | 2016-12-21 | サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド | Hla遺伝子座の修飾のための方法及び組成物 |
-
2012
- 2012-07-25 US US13/558,101 patent/US9161995B2/en active Active
- 2012-07-25 JP JP2014522973A patent/JP6072788B2/ja active Active
- 2012-07-25 WO PCT/US2012/048176 patent/WO2013016446A2/en unknown
- 2012-07-25 CA CA2841541A patent/CA2841541C/en active Active
- 2012-07-25 EP EP12817382.0A patent/EP2737063B1/en active Active
- 2012-07-25 AU AU2012286901A patent/AU2012286901B2/en active Active
-
2014
- 2014-03-25 US US14/225,191 patent/US20140205579A1/en not_active Abandoned
- 2014-10-30 HK HK14110921.7A patent/HK1197427A1/zh unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2013016446A3 (en) | 2013-04-18 |
EP2737063A4 (en) | 2014-11-19 |
US9161995B2 (en) | 2015-10-20 |
CA2841541A1 (en) | 2013-01-31 |
JP2014523748A (ja) | 2014-09-18 |
HK1197427A1 (zh) | 2015-01-16 |
AU2012286901B2 (en) | 2016-10-27 |
WO2013016446A2 (en) | 2013-01-31 |
US20140205579A1 (en) | 2014-07-24 |
CA2841541C (en) | 2019-11-12 |
AU2012286901A1 (en) | 2014-01-23 |
EP2737063B1 (en) | 2016-06-01 |
EP2737063A2 (en) | 2014-06-04 |
US20130145485A1 (en) | 2013-06-06 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6587666B2 (ja) | リソソーム貯蔵疾患の処置のための方法および組成物 | |
US9833479B2 (en) | Gene correction of SCID-related genes in hematopoietic stem and progenitor cells | |
JP6072788B2 (ja) | 嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(cftr)遺伝子を改変するための方法および組成物 | |
US10072066B2 (en) | Methods and compositions for treatment of a beta thalessemia | |
US8895264B2 (en) | Methods and compositions for modification of the HPRT locus | |
US9631187B2 (en) | Methods and compositions for gene correction | |
US20230330195A1 (en) | Methods and compositions for the treatment of neurologic disease | |
JP2022078282A (ja) | ファブリー病の治療のための方法および組成物 | |
JP2019531754A (ja) | 造血幹細胞および前駆細胞におけるscid関連遺伝子の遺伝子修正 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20150529 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20150529 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160322 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160620 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160913 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20161107 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20161129 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20161228 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6072788 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |