CN104178491B - 治疗性人抗-il-1r1单克隆抗体 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及治疗性人抗‑IL‑1R1单克隆抗体。描述了与白介素‑1受体型1(IL‑1R1)相互作用的抗体。还描述了通过施用药学有效量的针对IL‑1R1的抗体治疗IL‑1介导的疾病的方法。另外还描述了使用针对IL‑1R1的抗体检测样品中IL‑1R1的量的方法。

Description

治疗性人抗-IL-1R1单克隆抗体
本申请是申请日为2003年9月5日，申请号为200910009932.1的、发明名称和本发明相同的发明专利申请的分案申请。
本发明涉及并要求2002年9月6日提交的美国临时申请序号60/408,719的优先权，其公开在此次被并入作为参考。
发明领域
本发明涉及结合白介素-1受体型1(IL-1R1)蛋白的抗体。还提供了用于治疗IL-1介导的疾病，如类风湿性关节炎、骨关节炎和其他炎性病症的组合物，特别是药物组合物和方法。
发明背景
抗体开发
炎症是身体对机械损伤、感染或抗原刺激导致的损伤的应答。炎症反应通常出现病理性地表达。当炎症以夸张方式表达，被不适当地刺激或者有害剂被除去后仍然持续时，出现这些病症。
炎症应答由细胞因子介导。目前发现的最有效的炎症细胞因子之一是白介素-1(IL-1)。IL-1信号增加导致与一些疾病有关的持续炎症，并且认为IL-1是许多疾病和医学病症的关键介导剂。该细胞因子主要(尽管不是专门地)由巨噬细胞/单核细胞谱系的细胞产生并且可以以两种形式产生：IL-1alpha(IL-1α)和IL-1beta(IL-1β)。
IL-1通过与异二聚体受体复合体相互作用刺激细胞应答，该异二聚体受体复合体由两种跨膜蛋白：IL-1受体型1(IL-1R1)和IL-1受体辅助蛋白(IL-1RAcP)组成。IL-1首先结合IL-1R1；然后IL-1RAcP被募集到该复合体(Greenfeder等人，1995，J.Biol.Chem.270：13757-13765；Yoon和Dinarello，1998，J.Immunology160：3170-3179；Cullinan等人，1998，J Immunology161：5614-5620)，接着是信号转导，从而诱导细胞应答。
基于细胞的结合研究表明IL-1RAcP通过延缓配体离开速度来稳定IL-1R信号复合体(Wesche等人，1998，FEBS Letters429：303-306)。尽管已经完全表征了IL-1和IL-1R的相互作用，但是IL-1RAcP与配体-结合的受体之间的相互作用仍然没有被较好地限定。因为IL-1RAcP与单独的IL-1或者IL-1R1都没有显著亲和性，但是与其复合体却有高亲和性，因此推断通过IL-1/IL-1R结合事件产生了IL-1RAcP的新的结合位点，该结合事件甚至包括IL-1残基的贡献(Ettorre等人，1997，Eur.Cytokine Netw.8：161-171)。另一种分子——IL-1受体拮抗剂(IL-1ra)与IL-1α和IL-1β竞争受体结合但是不能募集IL-1RAcP，导致一种被占据但是无信号的受体。IL-1活性还可以被II型IL-1R均衡，II型IL-1R是一种引诱受体，其结合配体但是由于截断的细胞内结构域而不参与信号化。IL-1ra和II型IL-1R降低IL-1介导的炎症事件的严重性和持续时间(Wesche等人，1998，FEBS Letters429：303-306；Dripps等人，1991，J.Biol.Chem.266：10331-10336；Dripps等人，1991，J.Biol.Chem.266：20331-20335)。
可以从能够特异防止IL-1的细胞受体活化的任一种蛋白质产生白介素-1抑制剂，该活化的防止可以来自许多机理。这些机理包括下调IL-1产生、结合游离的IL-1、干扰IL-1结合IL-1R、干扰IL-1R-IL-1RAcP复合体的形成或者干扰IL-1与其受体结合后IL-1信号化的调节。IL-1抑制剂的类别包括：
●白介素-1受体拮抗剂如IL-1ra，如下面描述的；
●抗-IL-1R单克隆抗体(例如，如在公布的欧洲专利申请号EP623674中公开的，其公开在此处被并入作为参考)；
●IL-1结合蛋白，如可溶性IL-1受体(例如，如在美国专利号5,492,888；5,488,032、5,464,937、5,319,071和5,180,812中公开的，它们的公开在此处被并入作为参考)；
●抗-IL-1单克隆抗体(例如，如在国际专利申请公布号WO9501997、WO9402627、WO9006371、美国专利号4,935,343、EP364778、EP267611和EP220063中公开的，它们的公开在此处被并入作为参考)；
●IL-1受体辅助蛋白和其抗体(例如，如在国际专利申请公布号WO96/23067和WO99/37773中公开的，它们的公开在此处被并入作为参考)；和
●白介素-1β转换酶抑制剂(ICE)或半胱天冬酶I(例如，如在国际专利申请公布号WO99/46248、WO99/47545和WO99/47154中公开的，它们的公开在此处被并入作为参考)；它们可用于抑制IL-1β产生和分泌；
●白介素-1β蛋白酶抑制剂；和
●其他化合物和蛋白质，它们阻断IL-1的体内合成或胞外释放。
示例性IL-1抑制剂在下面的参考文献中公开：美国专利号5,747,444、5,359,032、5,608,035、5,843,905、5,359,032、5,866,576、5,869,660、5,869,315、5,872,095、5,955,480、和5,965,564、国际专利申请公布号WO98/21957、WO96/09323、WO91/17184、WO96/40907、WO98/32733、WO98/42325、WO98/44940、WO98/47892、WO98/56377、WO99/03837、WO99/06426、WO99/06042、WO91/17249、WO98/32733、WO98/17661、WO97/08174、WO95/34326、WO99/36426、和WO99/36415、欧洲专利申请公布号EP534978和EP89479、和法国专利申请号FR2762514。所有上述参考文献的公开在此处被并入作为参考。
白介素-1受体拮抗剂(IL-1ra)是作为白介素-1的天然抑制剂的一种人体蛋白并且是IL-1家族的一员，IL-1家族包括IL-1α和IL-1β。优选的受体拮抗剂(包括IL-1ra和其变体与衍生物)，以及其产生和使用方法在美国专利号5,075,222、国际专利申请公布号WO91/08285、WO91/17184、WO92/16221、WO93/21946、WO94/06457、WO94/21275、WO94/21235、DE4219626，WO94/20517、WO96/22793、WO97/28828、和WO99/36541、澳大利亚专利申请号AU9173636，和法国专利申请号FR2706772中公开，它们的公开在此处被并入作为参考。蛋白质包括IL-1受体拮抗剂的糖基化和非糖基化形式。
特别地，在美国专利号5,075,222(’222专利)中公开和描述了IL-1ra的3个有用的形式及其变体。IL-1raα通过SDS-PAGE被表征为一种22-23kD的分子，等电点约为4.8，在Tris缓冲液(pH7.6)中约52mM NaCl处从Mono Q FPLC中洗脱出来。IL-1raβ被表征为22-23kD蛋白，在48mM NaCl处从Mono Q柱洗脱出来。IL-1raα和IL-1raβ都被糖基化。IL-1rax被表征为20kD蛋白，在48mM NaCl处从Mono Q柱被洗脱出来，并且未被糖基化。’222专利还公开了分离负责编码该抑制剂的基因、在适宜的载体和细胞类型中克隆该基因，并表达该基因以产生抑制剂的方法。尽管该方法有效，但是IL-1ra的半衰期相对较短。在当前使用中，IL-1ra被每天施用一次。具有相当长的半寿期的IL-1受体拮抗剂对于本领域是有益的。
通过抑制IL-1结合IL-1受体而防止IL-1信号化对于治疗IL-1介导的疾病是一种有吸引力的治疗方法。本领域中需要IL-1信号途径的临床上有效的抑制剂，该抑制剂可以改善IL-1介导的疾病的作用并且适于被递送到人类患者中。阻碍IL-1信号化的人抗体对实现该需求尤其有利并且将提供比当前可利用的治疗更长的半寿期。
发明概述
本发明提供了结合白介素-1受体型1(IL-1R1)的单克隆抗体。优选地，该抗体通过与IL-1β和IL-1α竞争结合IL-1R1而抑制IL-1信号化。本发明还提供了杂交瘤细胞系，其产生，并且最优选地，向细胞培养基分泌本发明的单克隆抗体。本发明的抗体成功地阻断人细胞中的IL-1信号化并从而可用于治疗患有IL-1介导的疾病的患者。本发明还提供了融合蛋白，其含有抗体Fc区的序列和选自SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：14、SEQ IDNO：16、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：26、SEQ IDNO：28、SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：38、和SEQID NO：40的一种或多种序列。可以使用如，例如，WO00/24782中描述的方法制备这些分子，WO00/24782在此处被并入作为参考。这些分子可以例如，在哺乳动物细胞(例如，中国仓鼠卵巢细胞)或者细菌细胞(例如，大肠杆菌细胞)中表达。
在某些方面，本发明提供了抗体，优选单克隆抗体，最优选人抗体，它们含有重链和轻链，其中重链含有如在SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：6或SEQ ID NO：8任一个中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
本发明还提供了抗体，优选单克隆抗体，最优选人抗体，其含有重链和轻链，其中轻链含有如在SEQ ID NO：4中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
在某些方面，本发明的抗体含有重链和轻链，其中重链的可变区含有如在SEQ IDNO：10、SEQ ID NO：14、或SEQ ID NO：16任一个中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。在其他方面，轻链可变区含有如在SEQ ID NO：12或SEQ ID NO：18任一个中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。在另外的方面，重链含有如在SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：34、或SEQ IDNO：36任一个中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。在其他方面，轻链含有如在SEQ ID NO：38或SEQ ID NO：40任一个中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。这些抗体链可用于制备特异结合IL-1R1的抗体，还可以用于制备双特异抗体，其中所得分子结合IL-1R1和/或另一种靶分子(例如，TNF或TNF受体)。
本发明还提供了特异结合IL-1R1的抗体，其中重链包含含有SEQ ID NO：10中提出的氨基酸序列的重链可变区，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段，轻链包含含有SEQ ID NO：12中提出的氨基酸序列的轻链可变区，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
在某些方面，本发明还提供了含有重链和轻链的抗体，其中重链含有第一可变区，并且其中第一可变区含有与SEQ ID NO：10中提出的氨基酸序列具有至少90％，更优选至少95％，最优选约99％的同一性的序列，其中轻链含有第二可变区，其中第二可变区含有与SEQ ID NO：12中提出的氨基酸序列具有至少90％，更优选至少95％，最优选约99％的同一性的序列，其中该抗体与IL-1R1相互作用。
本发明还提供了特异结合IL-1R1的抗体，其中重链包含含有如SEQ ID NO：14中提出的氨基酸序列的重链可变区，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段，轻链包含含有如SEQ ID NO：12中提出的氨基酸序列的轻链可变区，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
在某些方面，本发明提供了含有重链和轻链的抗体，其中重链含有第一可变区，并且其中第一可变区含有与SEQ ID NO：14中提出的氨基酸序列具有至少90％，更优选至少95％，最优选约99％的同一性的序列，并且其中轻链含有第二可变区，其中第二可变区含有与SEQ ID NO：12中提出的氨基酸序列具有至少90％，更优选至少95％，最优选约99％的同一性的序列，其中该抗体与IL-1R1相互作用。
本发明还提供了特异结合IL-1R1的抗体，其中重链包含含有如SEQ ID NO：16中提出的氨基酸序列的重链可变区，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段，并且轻链包含含有如SEQ ID NO：18中提出的氨基酸序列的轻链可变区，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
在某些方面，本发明提供了含有重链和轻链的抗体，其中重链含有第一可变区，并且其中第一可变区含有与SEQ ID NO：16中提出的氨基酸序列具有至少90％，更优选至少95％，最优选约99％的同一性的序列，并且其中轻链含有第二可变区，其中第二可变区含有与SEQ ID NO：18中提出的氨基酸序列具有至少90％，更优选至少95％，最优选约99％的同一性的序列，其中该抗体与IL-1R1相互作用。
本发明还提供了特异结合IL-1R1的抗体，其中重链含有如SEQ ID NO：20、SEQ IDNO：22、SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：28、或SEQ ID NO：30中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段，并且轻链含有如SEQ IDNO：38中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
本发明还提供了特异结合IL-1R1的抗体，其中重链含有如SEQ ID NO：32、SEQ IDNO：34、或SEQ ID NO：36中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段，并且轻链含有如SEQ ID NO：40中提出的氨基酸序列，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
本发明还提供了所有前述的实施方案，它们是单链抗体、单链Fv抗体、Fab抗体、Fab’抗体和(Fab’)2抗体。
在具体方面，本发明提供了含有如SEQ ID NO：38或SEQ ID NO：40任一个中提出的氨基酸序列的轻链，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
此外，本发明提供了含有如SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：24、SEQ IDNO：26、SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：34或SEQ ID NO：36任一个中提出的氨基酸序列的重链，或者其抗原结合片段或其具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
本发明还涉及分离的人抗体，其特异结合IL-1R1，其中该抗体含有：(a)人重链框架区、人重链CDR1区、人重链CDR2区，和人重链CDR3区；和(b)人轻链框架区、人轻链CDR1区、人轻链CDR2区，和人轻链CDR3区。在某些方面，人重链CDR1区可以是如图10中所示的26F5、27F2或15C4的重链CDR1区，人轻链CDR1区可以是如图11中所示的26F5、27F2或15C4的轻链CDR1区。在其他方面，人重链CDR2区可以是如图10中所示的26F5、27F2或15C4的重链CDR2区，人轻链CDR2区可以是如图11中所示的26F5、27F2或15C4的轻链CDR2区。在其他方面，人重链CDR3区可以是如图10中所示的26F5、27F2或15C4的重链CDR3区，人轻链CDR3区可以是如图11中所示的26F5、27F2或15C4的轻链CDR3区。
此外，本发明提供了分离的人抗体，其特异结合白介素-1受体1型(IL-1R1)，该抗体含有：人重链CDR1区，其中重链CDR1具有氨基酸序列SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62或SEQID NO：63；人重链CDR2区，其中重链CDR2具有氨基酸序列SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：65或SEQ ID NO：66；和/或人重链CDR3区，其中重链CDR3具有氨基酸序列SEQ ID NO：67、SEQ IDNO：68或SEQ ID NO：69。
本发明还提供了分离的人抗体，其特异结合白介素-1受体型1(IL-1R1)，该抗体含有：人轻链CDR1区，其中轻链CDR1具有氨基酸序列SEQ ID NO：70或SEQ ID NO：71；人轻链CDR2区，其中轻链CDR2具有氨基酸序列SEQ ID NO：72或SEQ IDNO：73；和/或人轻链CDR3区，其中轻链CDR3具有氨基酸序列SEQ ID NO：74或SEQ ID NO：75。
在一些实施方案中，本发明的抗体结合IL-1R1的第三个结构域，该结构域在图17中显示。优选地，本发明抗体的表位由氨基酸序列YSV组成，其在此处被称为表位4并且在图24中显示。本发明还涉及融合蛋白和能够结合表位4的其他分子(与上述抗体在此处统称为“特异结合配偶体”)，如使用如，例如，WO00/24782中描述的方法可以制备的分子，该文献在此处并入作为参考。可以在例如，哺乳动物细胞(例如，中国仓鼠卵巢细胞)或细菌细胞(例如，大肠杆菌细胞)中表达这些分子。
此外，本发明提供了所选抗原的表位作图方法。一方面，本发明包括步骤：(a)产生一组融合蛋白，其中每种融合蛋白含有(i)抗生物素蛋白和(ii)抗原的片段；(b)筛选与所述抗原的一种或多种特异结合配偶体结合的融合蛋白组；(c)在含有生物素的介质上分离融合蛋白，其中抗生物素蛋白结合生物素；和(d)分析被特异结合配偶体结合的融合蛋白以确定该特异结合配偶体在该抗原上的结合位点。在具体方面，特异结合配偶体是抗体。
在另外实施方案中，本发明提供了治疗IL-1介导的疾病、病症或失调的方法，该方法包括对需要该治疗的个体施用药学有效量的一种或多种本发明的单克隆抗体或者其抗原结合或具有免疫学功能的免疫球蛋白片段。
本发明还提供了检测生物样品中IL-1R1的水平的方法，该方法包括将样品与本发明的单克隆抗体或者其抗原结合片段接触。本发明的抗-IL-1R抗体可用于任一公知的测定方法，如竞争结合测定法、直接和间接三明治测定法、免疫沉淀测定法和酶联免疫吸附测定法(ELISA)(见，Sola，1987，Monoclonal Antibodies：A Manual of Techniques，147-158页，CRC Press，Inc.)中，以检测和定量IL-1R。抗体可结合IL-1R，其亲和力适于所用的测定方法。
从下面的一些优选的实施方案的更详细描述和权利要求，本发明的特别优选的实施方案将变得显而易见。
附图简述
图1A-1B描绘编码人抗-IL-1R1抗体重链IgG1恒定区的cDNA序列(SEQ ID NO：1)(图1A)和人抗-IL-1R1抗体重链IgG1恒定区的氨基酸序列(SEQ ID NO：2)(图1B)。
图2A-2B描绘编码人抗-IL-1R1抗体κ链恒定区的cDNA序列(SEQ ID NO：3)(图2A)和人抗-IL-1R1抗体κ链恒定区的氨基酸序列(SEQ ID NO：4)(图2B)。
图3A-3B描绘编码人抗-IL-1R1抗体重链IgG2恒定区的cDNA序列(SEQ ID NO：5)(图3A)和人抗-IL-1R1抗体重链IgG2恒定区的氨基酸序列(SEQ ID NO：6)(图3B)。
图4A-4B描绘编码人抗-IL-1R1抗体重链IgG4恒定区的cDNA序列(SEQ ID NO：7)(图4A)和人抗-IL-1R1抗体重链IgG4恒定区的氨基酸序列(SEQ ID NO：8)(图4B)。
图5A-5B描绘编码26F5抗-IL-1R1抗体重链可变区的cDNA序列(SEQ ID NO：9)(图5A)和26F5抗-IL-1R1抗体重链可变区的氨基酸序列(SEQ ID NO：10)(图5B)。
图6A-6B描绘编码26F5抗-IL-1R1抗体κ链可变区的cDNA序列(SEQ ID NO：11)(图6A)和26F5抗-IL-1R1抗体κ链可变区的氨基酸序列(SEQ ID NO：12)(图6B)。
图7A-7B描绘编码27F2抗-IL-1R1抗体重链可变区的cDNA序列(SEQ ID NO：13)(图7A)和27F2抗-IL-1R1抗体重链可变区的氨基酸序列(SEQ ID NO：14)(图7B)。
图8A-8B描绘编码15C4抗-IL-1R1抗体重链可变区的cDNA序列(SEQ ID NO：15)(图8A)和15C4抗-IL-1R1抗体重链可变区的氨基酸序列(SEQ ID NO：16)(图8B)。
图9A-9B描绘编码15C4抗-IL-1R1抗体κ链可变区的cDNA序列(SEQ ID NO：17)(图9A)和15C4抗-IL-1R1抗体κ链可变区的氨基酸序列(SEQ ID NO：18)(图9B)。
图10显示了命名为15C4(SEQ ID NO：80)、27F2(SEQ ID NO：82)和26F5(SEQ IDNO：84)的抗-IL-1R1抗体的重链的氨基酸序列比对。互补决定区(CDRs)被下划线标出。26F5的CDR1被指定为SEQ ID NO：61；27F2的CDR1被指定为SEQ ID NO：62；15C4的CDR1被指定为SEQ ID NO：63。26F5的CDR2被指定为SEQ ID NO：64；27F2的CDR2被指定为SEQ ID NO：65；15C4的CDR2被指定为SEQ ID NO：66。26F5的CDR3被指定为SEQ ID NO：67；27F2的CDR3被指定为SEQ ID NO：68；15C4的CDR3被指定为SEQ ID NO：69。
图11显示了命名为15C4(SEQ ID NO：81)、27F2(SEQ ID NO：83)和26F5(SEQ IDNO：83)的抗-IL-R1-γ抗体的轻链的氨基酸序列比对。26F5/27F2的CDR1被指定为SEQ IDNO：70；15C4的CDR1被指定为SEQ ID NO：71。26F5/27F2的CDR2被指定为SEQ ID NO：72；15C4的CDR2被指定为SEQ ID NO：73。26F5/27F2的CDR3被指定为SEQ ID NO：74；15C4的CDR3被指定为SEQ ID NO：75。
图12图解了抗-IL-1R1抗体对IL-1R/IL-1β/IL-1RAcP复合体形成的抑制作用。
图13图解了如此处描述并且被命名为15C4的抗-IL-1R1单克隆抗体对IL-1R/IL-1α/IL-1RacP复合体形成的抑制作用。
图14表示抗-IL-1R1抗体与IgG对照相比，阻断IL-1β结合而不显著干扰IL-1ra结合。
图15A显示与IL-1ra相比在此处鉴定被命名为15C4、26F5和27F2的抗-IL-1R1抗体抑制原代人软骨细胞中IL-6的产生。
图15B显示与10H7和24E12代表的单克隆抗体类相比，IL-1ra和单克隆抗体15C4和27F2抑制原代人软骨细胞中IL-6的产生。
图16显示与IL-1ra相比被命名为15C4、26F5和27F2的抗-IL-1R1单克隆抗体抑制人全血中IL-6的产生。
图17描绘了人氨基酸(SEQ ID NO：76)和核苷酸(SEQ ID NO：77)和大鼠核苷酸(SEQ ID NO：78)和氨基酸(SEQ ID NO：79)第三个结构域IL-1R1序列。人序列上编号的横条指出15个不同的突变位点，它们用于构建15种不同的突变蛋白。通过突变导入的大鼠残基在大鼠核酸序列下列出。
图18显示了蛋白质印迹分析，证明IL-1R1突变体的抗-IL-1R1单克隆抗体识别。
图19表示(I)IL-1信号途径的活化，其以IL-1β与IL-1R1的结合和IL-1RacP的募集开始，和三类抗-IL-1R1抗体：(II)第三结构域表位IL-1阻断剂，(III)第三结构域表位RAcP阻断剂，和(IV)第一/第二个结构域表位IL-1阻断剂。
图20描绘了具有如此处描述的突变10的15C4和27F2的晶体结构。灰色残基表示15C4和27F2表位。
图21描绘了胞外IL-1R1的第三个结构域中的15C4表位。
图22描绘了胞外IL-1R1的第三个结构域中的24E12表位。
图23描绘了本发明的抗生物素蛋白-人IL-1R1-FLAG嵌合蛋白的氨基酸序列(SEQID NO：59)。
图24描绘了抗生物素蛋白-猕猴IL-1R1-FLAG嵌合蛋白的氨基酸序列(SEQ ID NO：60)。重组鸡抗生物素蛋白(斜体)通过6个氨基酸组成的连接体连接到猕猴IL-1R1的成熟胞外结构域(下划线标出，C-末端FLAG标记为粗体)。单独或者组合导入猕猴序列的人IL-1R1的四个氨基酸在猕猴序列下用粗体表示。表位4用粗体、斜体和下划线表示。
图25A显示了结合IL-1R1的抗-人IL1-R1抗体(抗-huIL1-R1)的蛋白质印迹分析。*指示以5μg/mL使用的抗体，而剩余的抗体以1μg/mL使用。
图25B显示了一式两份的蛋白质印迹实验的光密度分析概况。
图26表示复合的基于珠子的结合测定法中抗huIL1R1抗体与抗生物素蛋白IL-1R1-FLAG蛋白的结合。
一些优选实施方案的详细描述
此处所用的章节标题仅用于组织的目的，不应被理解为限制所描述的主题。该申请中引用的所有参考文献在此次为了任何目的被特别地并入作为参考。
定义
如果天然发生的或者实验诱导的疾病或者医学病症与体液或者组织中IL-1的水平升高有关或者如果从身体得到的细胞或者组织在培养中产生水平升高的IL-1，那么疾病或者医学病症被认为是“白介素-1(IL-1)介导的疾病”。IL-1的升高的水平可以包括，例如，超过在具体细胞或组织中正常发现的水平的水平，或者可以是在通常不表达IL-1的细胞或组织中可检测的IL-1水平。在许多情况中，IL-1介导的疾病也被下面的额外的两个条件识别：通过使用IL-1或者IL-1的表达的上调可以在动物中通过实验模拟的与疾病或医学病症相关的病理发现；和(2)用抑制IL-1作用的试剂处理可以抑制或者消除在该疾病或者医学病症的实验动物模型中诱导的病理。在多数IL-1介导的疾病中，三个条件中的至少两个被满足，在许多IL-1介导的疾病中，所有三个条件都被满足。
急性和慢性IL-1-介导的疾病的非排他性列表包括但不限于下面的：急性胰腺炎、amyelolateroschlerosis(ALS)、阿尔茨海默氏病、恶病质/厌食，包括AIDS-诱导的恶病质；哮喘和其他肺病、动脉粥样硬化、自身免疫血管炎、慢性疲劳综合症、梭状芽孢杆菌相关的疾病，包括梭状芽孢杆菌相关的腹泻；冠状病症和适应症，包括充血性心力衰竭、冠状再狭窄、心肌梗塞、心肌功能异常(例如，与脓毒相关)，和冠状动脉旁路移植；癌，如多发性骨髓瘤和骨髓性(例如，AML或CML)和其他白血病，以及肿瘤转移、糖尿病(例如，依赖胰岛素的糖尿病)、子宫内膜异位症、发热、fibromyalgia、肾小球性肾炎、移植物抗宿主病/移植排斥、出血性休克、感觉过敏、炎性肠病、关节的炎性病症，包括骨关节炎、牛皮癣关节炎和类风湿性关节炎；炎性眼病，如可能与例如角膜移植有关的炎性眼病；局部缺血，包括脑局部缺血(例如，由于创伤导致的脑损伤、癫痫、出血或中风，它们的每一种都可以导致神经退化)；川畸病；学习损伤；肺病(例如，ARDS)；多发性硬化；肌病(例如，肌蛋白代谢，特别是脓毒症中)；神经毒性(例如，HIV诱导的)；骨质疏松；疼痛，包括癌相关的疼痛；帕金森病、牙周病、pre-term labor、牛皮癣、再灌注损伤、脓毒性休克、放射治疗的副作用、颞颚关节病、睡眠障碍、葡萄膜炎；或者损伤、扭伤、软骨损伤、外伤、矫形手术、感染或其他疾病过程导致的炎症。下面描述了治疗这些急性和慢性IL-1介导的疾病以及其他IL-1-介导的病症和疾病的本发明方法。
可以用常规技术制备重组DNA、进行寡核苷酸合成，和实施组织培养和转化(例如，电穿孔、转染或脂转染)。可以根据生产商的说明书或者如本领域中通常完成的或者如本文中描述的实施酶反应和纯化技术。可以根据本领域中熟知的常规方法或者如本说明书中引用和讨论的各种一般性和更具体的参考文献中描述的实施前面的技术和方法。见，例如，Sambrook等人，2001，Molecular Cloning：A Laboratory Manual，第三版，Cold SpringHarbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，N.Y.，其在此处为了任一目的被并入作为参考。除非提供具体定义，此处描述的与分析化学、合成有机化学，和医学和药物化学有关的术语和实验方法是本领域中熟知的并且通常用于本领域。标准技术可用于化学合成、化学分析、药物制备、制剂和递送，和患者的治疗。
如按照本公开所用的，下面的术语，除非特别说明，将被理解为具有下面的意思：
术语“分离的多核苷酸”指主题多核苷酸，(1)不与其他多核苷酸的所有或一部分结合(共价或非共价)，该主题多核苷酸在天然中与这些其他多核苷酸结合，(2)与一种分子结合，该主题多核苷酸在天然中不与该分子结合，或者(3)天然不与任何其他多核苷酸结合。这种分离的多核苷酸可以是基因组DNA、cDNA、mRNA或合成的其他RNA，或者它们的组合。
术语“分离的蛋白”在此处指主题蛋白(1)没有至少一些其他蛋白，这些蛋白通常被发现与主题蛋白在一起，(2)基本上无来自相同来源，例如，来自相同物种的其他蛋白，(3)被不同物种的细胞表达，(4)已经与至少50％的多核苷酸、脂质、糖类或自然界中与主题物质在一起的其他物质分开，(5)不与天然状态下通常与“分离的蛋白”结合的蛋白质的部分结合(共价或非共价相互作用)，(6)可操作地与一种多肽结合(通过共价或非共价相互作用)，自然中主题蛋白通常不与该多肽结合，或者(7)不在自然中发生。基因组DNA、cDNA、mRNA或者合成来源的其他RNA，或者它们的任一组合可以编码这种分离的蛋白。优选地，该分离的蛋白基本上不含有在其天然环境中发现的蛋白质或多肽或者其他污染物，这些蛋白质或多肽或者其他污染物将干扰该分离的蛋白质的治疗、诊断、预防、研究或其他的用途。
术语“多肽”或者“蛋白质”指一条或多条氨基酸链，其中每条链含有通过肽键共价连接的氨基酸，并且其中所述多肽或蛋白质可以包含非共价地和/或通过肽键共价连接的多条链，这些链具有天然蛋白的序列，即，通过天然发生的和特异非重组细胞，或者基因工程化的或者重组细胞产生蛋白质，并且包括具有天然蛋白质的氨基酸序列的分子，或者通过天然序列的一个或多个氨基酸的缺失、加入和/或置换得到的分子。术语“多肽”和“蛋白质”特别包括抗-IL1-R1抗体，或者抗-ILR-1R1抗体的一个或多个氨基酸的缺失、加入和/或置换得到的序列。从而，“多肽”或“蛋白质”可以包括一条(称为“单体”)或多条(称为“多体”)氨基酸链。
术语“多肽片段”指多肽，其可以是单体或多体的，该多肽具有天然发生的或重组产生的多肽的氨基末端缺失、羧基末端缺失，和/或内部缺失或置换。在一些实施方案中，多肽片段可含有至少5到约500个氨基酸长的氨基酸链。将明白在一些实施方案中，片段长为至少5、6、8、10、14、20、50、70、100、110、150、200、250、300、350、400、或450个氨基酸。特别有用的多肽片段包括功能结构域，包括结合结构域。对于抗-IL1-R1抗体，有用的片段包括，但不限于：CDR区，特别是重或轻链的CDR3区；重或轻链的可变结构域；抗体链的一部分或者其仅仅包括两个CDR的可变区；等等。
如此处所用的术语“具有免疫学功能的免疫球蛋白片段”指至少含有免疫球蛋白重链和轻链的可变结构域的多肽片段。本发明的有免疫学功能的免疫球蛋白片段能够结合配体，防止配体与其受体的结合，中断配体结合其受体导致的生物学应答，或者它们的任一组合。优选地，本发明的具有免疫学功能的免疫球蛋白片段特异结合IL-1R1。
术语“天然发生的”和“天然的”指用此术语的生物学材料(分子、序列、蛋白质复合体、细胞，等)可以在自然界中发现并且没有受到人的操作。例如，存在于可从天然来源分离并且没有被人有意地修饰的生物(包括病毒)中的多肽或者多核苷酸序列是天然发生的。同样，术语“非天然发生的”或者“非-天然的”指未在自然界中发现或者被人进行结构修饰或者合成的材料。
术语“可操作地连接”指该术语所指的组分处于一种关系中，该关系允许这些组分在适宜的条件下发挥它们的内在功能。例如，指控制序列“可操作地连接”到蛋白质编码序列，指控制序列连接到该蛋白质编码序列，从而在与控制序列的转录活性相容的条件下实现蛋白质编码序列的表达。
术语“控制序列“指主题多核苷酸序列可以影响其所连接的编码序列的表达和加工。这些控制序列的性质可取决于宿主生物。在具体实施方案中，原核生物的控制序列可以包括启动子、核糖体结合位点，和转录终止序列。在其他具体实施方案中，真核生物的控制序列可包括启动子，其含有转录因子的一个或多个识别位点、转录增强子序列，和转录终止序列。在特定实施方案中，“控制序列”可包括引导序列和/或融合配偶体序列。
术语“多核苷酸”指长至少10个碱基的单链或双链核酸聚合物。在一些实施方案中，含有核苷酸的多核苷酸可以是核糖核苷酸或者脱氧核糖核苷酸或者任一类型的核苷酸的修饰形式。所述修饰包括碱基修饰如溴尿苷和次黄苷衍生物，核糖衍生物如2’，3’-二脱氧核糖，和核苷酸间键修饰如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、硒代磷酸酯、二硒代磷酸酯、phosphoroanilothioate、phoshoraniladate和phosphoroamidate。该术语DNA的单链和双链形式。
术语“寡核苷酸”指含有长200个或更少碱基的多核苷酸。在优选的实施方案中，寡核苷酸长为10到60个碱基。在更优选的实施方案中，寡核苷酸长为12、13、14、15、16、17、18、19、或20到40个碱基。寡核苷酸可以是单链或双链的，例如，用于构建突变基因。本发明的寡核苷酸可以是有义或反义寡核苷酸。
术语“天然发生的寡核苷酸”包括脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸。术语“修饰的核苷酸”包括具有修饰的或取代的糖基或者修饰的或取代的碱基的核苷酸。术语“寡核苷酸键”包括如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、硒代磷酸酯、二硒代磷酸酯、phosphoroanilothioate、phoshoraniladate和phosphoroamidate等的键。见，例如，LaPlanche等人(1986)，Nucl.Acids Res14：9081；Stec等人(1984)，J.Am.Chem.Soc.106：6077；Stein等人(1988)，Nucl.Acids Res.16：3209；Zon等人(1991)，Anti-Cancer DrugDesign6：539；Zon等人(1991)，Oligonucleotides and Analogues：A PracticalApproach，87-108页(F.Eckstein，编者)，Oxford University Press，Oxford England；Stec等人，美国专利号5,151,510；Uhlmann和Peyman(1990)，Chemical Reviews90：543，这些文献的公开在此为了任何目的被并入作为参考。本发明的寡核苷酸可以含有标记，包括放射标记、荧光标记、半抗原或抗原性标记，以用于检测测定法。
术语“载体”指用于将编码信息转移到宿主细胞的任一种分子(例如，核酸、质粒、或病毒)。
术语“表达载体”或“表达构建体”指适于转化宿主细胞的载体并且该载体含有核酸序列，该核酸序列指导和/或控制(与宿主细胞联合)可操作地连接到该核酸序列的一个或多个异源编码区的表达。表达载体可包括，但不限于，一些序列，该序列影响或控制与其可操作地连接的编码区的转录、翻译和RNA剪接(如果存在内含子)。
术语“宿主细胞”指已经或者能够用核酸序列转化并从而表达所选的目标基因的细胞。该术语包括亲本细胞的后代，无论该后代与原来的亲本细胞在形态或基因组成上是否相同，只要后代存在所选基因即可。
术语“转导”指通常通过噬菌体将基因从一个细菌转移到另一细菌。“转导”还指通过逆转录病毒的真核细胞序列的获得和转移。
术语“转染”指外来或外源DNA被细胞摄入，当该外源DNA已经被导入细胞膜内时，该细胞已经被“转染”。许多转染技术是本领域熟知的并且在本文中公开。见例如，Graham等人，1973，Virology52：456；Sambrook等人，2001，Molecular Cloning：ALaboratoryManual，Id.；Davis等人，1986，Basic Methods in Molecular Biology，Elsevier；和Chu等人，1981，Gene13：197。这些技术可用于将一种或多种外源DNA部分导入适宜的宿主细胞。
术语“转化”指细胞遗传特征的变化，当其被修饰而含有新DNA时，该细胞已经被转化。例如，当通过转染、转导或其他技术使细胞从其天然状态被遗传修饰时，该细胞被转化。转染或转导后，转化DNA可以通过物理整合到细胞的染色体与细胞的DNA重组，或者可以作为附加体元件暂时保留而不被复制，或者可以作为质粒独立地复制。当转化DNA随着细胞的分离而复制时，认为细胞已经被“稳定转化”。
术语“抗原”指能够被选择性结合剂，如抗体结合，并且还能够用于动物中以产生能够结合该抗原的一个表位的抗体的分子或者分子的一部分。一个抗原可以具有一个或多个表位。
术语“表位”包括任一决定簇，优选多肽决定簇，其能够特异结合免疫球蛋白或T-细胞受体。在一些实施方案中，表位决定簇包括分子的化学活性表面基团，如氨基酸、糖侧链、膦酰基或磺酰基，并且，在一些实施方案中，可以具有特定三维结构特征，和/或特定电荷特征。表位是被抗体结合的抗原的一个区域。在一些实施方案中，当抗体优先识别蛋白质和/或大分子的复杂混合物中其靶标抗原时，可以说该抗体特异结合抗原。在优选的实施方案中，当解离常数小于或等于约10nM，更优选地，当解离常数小于或等于约100pM时，最优选地，当解离常数小于或等于约10pM时，可以说该抗体特异结合抗原。
术语“同一性”指两个或多个多肽分子或者两个或多个核酸分子序列之间的关系，该关系通过比较它们的序列确定。在本领域中，“同一性”还指核酸分子或者多肽序列相关性的程度，这可以通过两个或多个核苷酸或两个或多个氨基酸的序列之间的匹配来确定。“同一性”测量两个或多个序列的较小者之间相同匹配的百分数，用特定数学模型或计算机程序(即，“算法”)处理缺口比对(如果存在)。
术语“相似性”关于相关的概念用于本领域中；然而，与“同一性”相比，“相似性”指对相关性的一种量度，其包括相同匹配和保守置换匹配。如果两个多肽序列有，例如，10/20个相同氨基酸，并且剩余的都是非-保守置换，那么同一性和相似性百分数将都是50％。如果在相同实例中，还有5个位置有保守置换，那么同源性百分数仍然为50％，但是相似性百分数将是75％(15/20)。因此，对于有保守置换的情况，两个多肽之间的相似性百分数将高于那两个多肽之间的同一性百分数。
可以通过公知的方法容易地计算有关核酸和多肽的同一性和相似性。这些方法包括，但不限于，《计算分子生物学》(Lesk，A.M.，编者)，1988，Oxford University Press，NewYork；《生物计算：信息学和基因组计划》(Smith，D.W.，ed.)，1993，Academic Press，NewYork；《序列数据的计算机分析》，第一部，(Griffin，A.M.，和Griffin，H.G.，编者)，1994，Humana Press，New Jersey；von Heinje，G.，《分子生物学中的序列分析》，1987，AcademicPress；《序列分析引物》(Gribskov，M.and Devereux，J.，编者)，1991，M.Stockton Press，New York；Carillo等人，1988，SIAM J.Applied Math.48：1073；和Durbin等人，1998，生物序列分析，Cambridge Univers ity Press。
确定同一性的优选方法被设计用以得到所检查的序列之间的最大匹配。确定同一性的方法在公开的可得到的计算机程序中描述。确定两个序列之间同一性的优选计算机程序方法包括，但不限于，GCG程序包，包括GAP(Devereux等人，1984，Nucl.Acid.Res.12：387；Genetics Computer Group，University of Wisconsin，Madison，WI)、BLASTP、BLASTN和FASTA(Altschul等人，1990，J.Mol.Biol.215：403-410)。BLASTX程序可以公开地从国际生物技术信息中心(NCBI)和其他来源(BLAST手册，Altschul等，NCB/NLM/NIH Bethesda，MD20894；Altschul等人，1990，如前)得到。熟知的Smith Waterman算法也可用于确定同一性。
用于比对两个氨基酸序列的一些比对方案可导致这两个序列的仅仅短的区域匹配，并且该小的比对区域可能具有非常高的序列同一性，即使这两个全长序列之间没有明显的关系。因此，在一些实施方案中，所选择的比对方法(GAP程序)将导致一种比对，其横跨靶标多肽的至少50个相邻氨基酸。
例如，使用计算机算法GAP(Genetics Computer Group，University ofWisconsin，Madison，WI)，比对两个多肽以得到它们的各自氨基酸的最佳匹配(“匹配的跨度”，如该算法所确定的)，从而确定这两个多肽的序列同一性百分比。在一些实施方案中，缺口开口罚分(其被计算为三倍平均对角线，其中“平均对角线”是所用的比较矩阵的对角线平均值；“对角线”是具体比较矩阵分配给每个完全氨基酸匹配的得分或数字)和缺口延伸罚分(其通常是缺口开口罚分的十分之一)，以及比较矩阵如PAM250或BLOSUM62与算法结合使用。在一些实施方案中，算法也使用标准比较矩阵(对于PAM250比较矩阵，见Dayhoff等人，1978，Atlas of Protein Sequence and Structure5：345-352；对于BLOSUM62比较矩阵，见Henikoff等人，1992，Proc.Natl.Acad.Sci USA89：10915-10919)。
在一些实施方案中，多肽序列比较的参数包括下面的：
算法：Needleman等人(1970)，J.Mol.Biol.48：443-453；
比较矩阵：Henikoff等人(1992)(如前)的BLOSUM62；
缺口罚分：12
缺口长度罚分：4
相似性阈值：0
GAP程序可以使用上面的参数。在一些实施方案中，上述参数是使用GAP算法比较多肽的默认参数(对于末端缺口无罚分)。
术语“天然发生的”用于氨基酸，指20种常见氨基酸。见Immunology--ASynthesis，第二版，(E.S.Golub和D.R.Gren，编者)，Sinauer Associates：Sunderland，MA(1991)，其在此处为了任何目的被并入作为参考。
多肽类似物通常用于制药工业作为非肽药物，其具有类似于模板肽的性质。这些非-肽化合物类型被称为“肽模拟物”。见Fauchere(1986)，Adv.Drug Res.15：29；Veber&Freidinger，1985，TINS392页；和Evans等人(1987)，J.Med.Chez.30：1229，这些文献在此处为了任何目的被并入作为参考。通常通过计算机分子建模来开发这些化合物。结构类似于用于治疗的肽的肽模拟物可用于产生类似的治疗或预防效果。通常，肽模拟物结构上类似于范例肽或者多肽(即，具有生化性质或药理学活性的肽或多肽)，如人抗体，但是具有一个或多个肽连接，其任选通过本领域中熟知的方法用选自-CH2-NH-、-CH2-S-、-CH2-CH2-、-CH＝CH-(顺式和反式)、-COCH2-、-CH(OH)CH2-、和-CH2SO-的连接代替。在一些实施方案中，可以将共有序列的一个或多个氨基酸用相同类型的D-氨基酸(例如，D-赖氨酸置换L-赖氨酸)进行系统的置换以产生更稳定的肽。此外，通过本领域中公知的方法(Rizo&Gierasch，1992，Ann.Rev.Biochem.61：387，此处为了任何目的并入作为参考)；例如，通过加入能够形成分子内二硫键以环化该肽的内部半胱氨酸残基，可以产生含有共有序列或者基本上相同的共有序列变异的约束肽。
“抗体”或“抗体肽”指完整抗体，或者其结合片段，该结合片段与完整抗体竞争特异结合，抗体或抗体肽包括嵌合抗体、人源化抗体、完全人的抗体和双特异抗体。在一些实施方案中，通过重组DNA技术产生结合片段。在额外的实施方案中，通过完整抗体的酶或化学切割产生结合片段。结合片段包括，但不限于，Fab、Fab′、F(ab′)2、Fv、和单链抗体。
术语“重链”包括全长重链和其片段，该片段具有足够的可变区序列而赋予对IL-1R1的特异性。全长重链包括可变区结构域、VH和三个恒定区结构域：CH1、CH2和CH3。VH结构域在多肽的氨基末端，CH3结构域在羧基末端。
术语“轻链”包括全长轻链和其片段，该片段具有足够的可变区序列而赋予对IL-1R1的特异性。全长轻链包括可变区结构域、VL和恒定区结构域CL。类似重链，轻链的可变区结构域在多肽的氨基末端。
“Fab片段”由一条轻链和一条重链的CH1和可变区组成。Fab分子的重链不能与另一重链分子形成二硫键。
“Fab’片段”含有一条轻链和一条重链，该重链还含有CH1和CH2结构域之间的恒定区，从而两条重链之间可以形成链间二硫键而形成F(ab’)2分子。
“F(ab’)2片段”含有两条轻链和两条重链，重链含有CH1和CH2结构域之间的恒定区的一部分，从而两条重链之间形成链间二硫键。
“Fv区”含有来自重链和轻链的可变区，但是缺少恒定区。
“单链抗体”是Fv分子，其中重链和轻链可变区通过柔性连接体连接形成一条多肽链，该多肽链形成抗原-结合区。在国际专利申请WO88/01649和美国专利号4,946,778和5,260,203中详细讨论了单链抗体，这些文献在此为了任何目的被并入作为参考。
在一些实施方案中，“二价抗体”而不是“多特异的”或“多功能的”抗体被理解为含有具有相同抗原特异性的结合位点。
“双特异的”或“双功能的”抗体是具有两个不同重/轻链对和两个不同结合位点的杂交体抗体。可通过各种方法产生双特异抗体，这些方法包括，但不限于，杂交瘤的融合或Fab’片段的连接。见，例如，Songsivilai&Lachmann(1990)，Clin.Exp.Immunol.79：315-321；Kostelny等人(1992)，J.Immunol.148：1547-1553。
在评估根据本发明的抗体结合和特异性时，当抗体过量使受体结合到反受体的数量减少至少约20％、40％、60％、80％、85％，或更多(如在体外竞争结合测定法中测量)时，抗体“基本上”抑制配体对受体的结合。
术语“试剂”指化学化合物、化学化合物的混合物、生物大分子，或者生物材料的提取物。
术语“标记”或“标记的”指可检测标记物的掺入，例如，通过掺入放射标记的氨基酸或者将生物素部分附着到多肽，该生物素部分可以通过标记的抗生物素蛋白检测(例如，链霉抗生物素蛋白，其优选含有可检测标记如荧光标记物、化学发光标记物或可以被光学或者比色方法检测的酶活性)。在一些实施方案中，标记也可以是治疗性的。标记多肽和糖蛋白的各种方法是本领域中熟知的并且可有利地用于此处公开的方法中。多肽标记的实例包括，但不限于下面的：放射性同位素或放射性核素(例如，3H、14C、15N、35S、90Y、99mTc、111In、125I、131I)、荧光标记(例如，异硫氰酸荧光素(FITC)、罗丹明或镧系磷光素)、酶标记(例如，辣根过氧化物酶、β-半乳糖苷酶、萤光素酶、碱性磷酸酶)、化学发光标记、半抗原标记如生物素基，和被第二报道分子识别的预定的多肽表位(例如，亮氨酸拉链对序列、第二抗体的结合位点、金属结合结构域、表位标记)。在一些实施方案中，标记通过各种长度的间隔臂(如(CH2)n，其中n＜约20)附着以降低潜在的立体位阻。
术语“生物样品”包括，但不限于，来自活物或者以前的活物得到的物质的任一数量。这些活物包括，但不限于，人、小鼠、猴、大鼠、兔，和其他动物。这些物质包括，但不限于，血液、血清、尿、细胞、器官、组织、骨、骨髓、淋巴、淋巴结、滑液组织、软骨细胞、滑液巨噬细胞、内皮细胞、血管组织(特别是发炎的血管组织)，和皮肤。术语“药学试剂”和“药物”指当正确施用于患者时能够诱导所希望的治疗效果的化学化合物或组合物。
术语“患者”包括人和动物受试者。
除非上下文特别需要，单数术语将包括复数，复数术语将包括单数。
氨基酸
20种天然发生的氨基酸和它们的缩写按照常规用法。见Immunology--ASynthesis，第二版，(E.S.Golub和D.R.Gren，编者)，Sinauer Associates：Sunderland，MA(1991)，其为了任何目的在此处被并入作为参考。这20种常规氨基酸的立体异构体(例如，D-氨基酸)、非天然氨基酸如α-、α-二取代的氨基酸、N-烷基氨基酸，和其他非常规氨基酸也可以是本发明多肽的适宜组分。非常规氨基酸的实例包括：4-羟脯氨酸、γ-羧基谷氨酸、ε-N，N，N-三甲基赖氨酸、ε-N-乙酰基赖氨酸、O-磷丝氨酸、N-乙酰基丝氨酸、N-甲酰甲硫氨酸、3-甲基组氨酸、5-羟基赖氨酸、6-N-甲基精氨酸，和其他类似氨基酸和亚氨基酸(例如，4-羟基脯氨酸)。按照标准用法和常规，在此处所用的多肽符号中，左手方向是氨基末端方向，右手方向是羧基末端。
类似地，除非特别指出，单链多核苷酸序列的左手末端是5’末端；双链多核苷酸序列的左手方向被称为5’方向。新RNA转录物的5’到3’方向加入被称为转录方向；DNA链上具有和RNA转录物相同的序列并且在该RNA转录物的5’末端的5’的序列区被称为“上游序列”；DNA链上具有和RNA转录物相同的序列并且在该RNA转录物的3’末端的3’的序列区被称为“下游序列”。
天然发生的氨基酸残基可以基于通常的侧链性质分成下面的类别：
1)疏水的：正亮氨酸(Nor或Nle)、Met、Ala、Val、Leu、Ile；
2)中性亲水的：Cys、Ser、Thr、Asn、Gln；
3)酸性：Asp、Glu；
4)碱性：His、Lys、Arg；
5)影响链取向的残基：Gly、Pro；和
6)芳香族的：Trp、Tyr、Phe。
保守氨基酸置换可包括这些类别的之一的一个成员与相同类别的另一成员置换。保守氨基酸置换可包括非天然发生的氨基酸残基，其通常被化学肽合成而不是生物体系中的合成掺入。这些包括肽模拟物和氨基酸部分的其他颠倒或倒转的形式。
非保守氨基酸置换可包括这些类别之一的一个成员与另一类别的一个成员置换。这些置换的残基可被，例如，导入到与非人抗体同源的人抗体的区域，或者导入该分子的非同源区。
根据一些实施方案，在进行这些改变时，可以考虑氨基酸的亲水指数。基于每个氨基酸的疏水性和电荷特征对其分配亲水指数。它们是：异亮氨酸(+4.5)、缬氨酸(+4.2)、亮氨酸(+3.8)、苯丙氨酸(+2.8)、半胱氨酸/胱氨酸(+2.5)、甲硫氨酸(+1.9)、丙氨酸(+1.8)、甘氨酸(-0.4)、苏氨酸(-0.7)、丝氨酸(-0.8)、色氨酸(-0.9)、酪氨酸(-1.3)、脯氨酸(-1.6)、组氨酸(-3.2)、谷氨酸(-3.5)、谷氨酰胺(-3.5)、天冬氨酸(-3.5)、天冬酰胺(-3.5)、赖氨酸(-3.9)、和精氨酸(-4.5)。
亲水氨基酸指数在赋予蛋白质的相互作用生物功能中的重要性是本领域中理解的(见，例如，Kyte等人，1982，J.Mol.Biol.157：105-131)。公知一些氨基酸可被具有类似亲水指数或得分的其他氨基酸置换并且仍然保持类似的生物学活性。在基于亲水指数进行改变时，在一些实施方案中，包括氨基酸的亲水指数为±2以内的氨基酸置换。在一些实施方案中，包括氨基酸的亲水指数为±1以内的氨基酸置换，在一些实施方案中，包括氨基酸的亲水指数为±0.5以内的氨基酸置换。
在本领域中还理解可以基于亲水性有效进行像氨基酸的置换，特别当如此产生的生物学功能蛋白质或肽旨在用于如此处所公开的免疫学实施方案中时。在一些实施方案中，蛋白质的最大局部平均亲水性(受到其邻近氨基酸的亲水性的控制)与其免疫原性和抗原性，即，与该蛋白质的生物学性质相关。
下面的亲水性值被分配给这些氨基酸残基：精氨酸(+3.0)、赖氨酸(+3.0)、天冬氨酸(+3.0±1)、谷氨酸(+3.0±1)、丝氨酸(+0.3)、天冬氨酸(+0.2)、谷氨酰胺(+0.2)、甘氨酸(0)、苏氨酸(-0.4)、脯氨酸(-0.5±1)、丙氨酸(-0.5)、组氨酸(-0.5)、半胱氨酸(-1.0)、甲硫氨酸(-1.3)、缬氨酸(-1.5)、亮氨酸(-1.8)、异亮氨酸(-1.8)、酪氨酸(-2.3)、苯丙氨酸(-2.5)和色氨酸(-3.4)。在基于相似的亲水性值进行改变时，在一些实施方案中，包括氨基酸的亲水性值为±2以内的氨基酸置换。在一些实施方案中，包括氨基酸的亲水性值为±1以内的氨基酸置换，在一些实施方案中，包括氨基酸的亲水性值为±0.5以内的氨基酸置换。可以基于亲水性从原来的最初的氨基酸序列鉴定表位。这些区域也称为“表位核心区”。
示例性氨基酸置换在表1中给出。
表1
氨基酸置换
技术人员使用熟知的技术将能够确定如此处提出的多肽的适宜的变体。在一些实施方案中，本领域技术人员可以鉴定分子的适宜区域，可以改变认为对活性不重要的靶标区域而不破坏分子的活性。在其他实施方案中，技术人员可以鉴定分子的一些残基和部分，这些残基和部分在相似的多肽中是保守的。在其他实施方案中，甚至对于生物学活性或对于结构重要的区域也可以进行保守氨基酸置换而不破坏生物学活性或者对多肽结构造成不利影响。
此外，技术人员可以回顾结构-功能研究，这些研究鉴定相似的多肽中对于活性或结构重要的残基。鉴于这种比较，技术人员可以预测一种蛋白中相应于另一相似蛋白中对活性或结构重要的氨基酸残基的氨基酸残基的重要性。技术人员可以选择对这种被预测重要的氨基酸残基进行化学上相似的氨基酸置换。
技术人员还可关于类似多肽中的结构分析三维结构和氨基酸序列。考虑到该信息，技术人员可以关于三维结构预测抗体的氨基酸残基的排列。在一些实施方案中，技术人员可以选择不对预测位于蛋白质表面上的氨基酸残基进行根本的改变，因为这些残基可能参与与其他分子的重要的相互作用。此外，技术人员可以产生试验变体，其含有每个所希望的氨基酸残基处的一个氨基酸置换。然后可以使用本领域中技术人员公知的活性测定法筛选这些变体。这些变体可用于收集关于适宜变体的信息。例如，如果发现特定氨基酸残基的改变导致被破坏的、不希望地降低的，或者不适宜的活性，那么可以避免具有这种改变的变体。换句话说，基于从这些常规实验收集的信息，本领域技术人员可以容易地确定一些氨基酸，其中进一步置换应该被单独地或者与其他突变一起被避免。
许多科学出版物已经致力于二级结构的预测。见Moult，1996，Curr.Op.Biotech.7：422-427；Chou等人，1974，Biochemistry13：222-245；Chou等人，1974，Biochemistry113：211-222；Chou等人，1978，Adv.Enzymol.Relat.Areas Mol.Biol.47：45-148；Chou等人，1979，Ann.Rev.Biochem.47：251-276；和Chou等人，1979，Biophys.J.26：367-384。此外，当前可利用计算机程序辅助预测二级结构。预测二级结构的一种方法是基于同源性建模。例如，序列同源性大于30％，或者相似性大于40％的两种多肽或蛋白质通常具有相似的结构拓扑。蛋白质结构数据库(PDB)的最近的扩大已经增强了二级结构，包括多肽或蛋白质结构中的潜在折叠数目的可预测性。见，Holm等人，1999，Nucl.Acid.Res.27：244-247。已经提出(Brenner等人，1997，Curr.Op.Struct.Biol.7：369-376)在给定多肽或蛋白质中有有限数目的折叠，并且一但解决结构的临界数目，结构预测将变得十分准确。
预测二级结构的额外的方法包括“穿线(threading)”(Jones，1997，Curr.Opin.Struct.Biol.7：377-87；Sippl等人，1996，Structure4：15-19)、“概况分析”(Bowie等人，1991，Science253：164-170；Gribskov等人，1990，Meth.Enzym.183：146-159；Gribskov等人，1987，Proc.Nat.Acad.Sci.84：4355-4358)和“进化连接”(见Holm，1999，如前；和Brenner，1997，如前)。
在一些实施方案中，抗体变体包括糖基化变体，其中与亲本多肽的氨基酸序列相比，糖基化位点的数目和/或类型已经被改变。在一些实施方案中，蛋白质变体含有比天然蛋白或多或少的N-连接的糖基化位点。N-连接的糖基化位点的特征是序列：Asn-X-Ser或Asn-X-Thr，其中被指定为X的氨基酸残基可以是除了脯氨酸之外的任一氨基酸残基。产生该序列的氨基酸残基置换为N-连接的糖链的加入提供了潜在的新位点。备选地，除去该序列的置换将除去已有的N-连接的糖链。还提供了N-连接的糖链的重排，其中一个或多个N-连接的糖基化位点(典型为天然发生的)被除去并产生一个或多个新的N-连接的位点。额外优选的抗体变体包括半胱氨酸变体，其中与亲本氨基酸序列相比，一个或多个半胱氨酸残基被缺失或者被另一氨基酸(例如丝氨酸)置换。当例如，分离不可溶的包含体之后抗体必须被再折叠成生物活性构象时，可以使用半胱氨酸变体。半胱氨酸变体通常比天然蛋白具有更少的半胱氨酸残基，并且通常具有偶数半胱氨酸残基以最小化未配对半胱氨酸残基导致的相互作用。
根据一些实施方案，氨基酸残基置换为：(1)减小对蛋白质酶解的敏感性，(2)减小对氧化的敏感性，(3)改变对形成蛋白质复合体的结合亲和性，(4)改变结合亲和性，和/或(5)赋予或改变这些多肽上其他生理生化或功能性质的置换。根据一些实施方案，可以在天然发生的序列(在一些实施方案中，在形成分子间接触的结构域之外的多肽部分中)中进行单个或多个氨基酸置换(在一些实施方案中，保守氨基酸置换)。在优选实施方案中，保守氨基酸置换通常不实质性地改变亲本序列的结构特征(例如，置换氨基酸应该不倾向于断开亲本序列中发生的螺旋，或者破坏表征亲本序列的其他类型的二级结构)。在Proteins，Structures and Molecular Principles，(Creighton，编者)，1984，W.H.Freeman andCompany，New York；Introduction to Protein Structure(C.Branden和J.Tooze，编者)，1991，Garland Publishing，New York，N.Y.；和Thornton等人(1991)，Nature354：105中描述了本领域公知的多肽二级结构和三级结构的实例。
抗体的制备
天然发生的抗体结构单位通常含有四聚体。每种该四聚体通常由两对相同的多肽链组成，每一对具有一条完全长度的“轻”链(通常分子量为约25kDa)和一条完全长度的“重”链(通常分子量为约50-70kDa)。每条链的氨基末端部分通常包括约100到110个或更多氨基酸的可变区，其通常负责抗原识别。每条链的羧基末端部分通常限定了负责效应物功能的恒定区。人轻链通常被分为κ和λ轻链。重链通常分为μ、δ、γ、α、或ε，并且分别限定抗体的同种型为IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。IgG具有几种亚类，包括，但不限于，IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。IgM的亚类包括，但不限于，IgM1和IgM2。IgA被类似的细分成亚类，其包括，但不限于，IgA1和IgA2。在全长轻链和重链中，典型地，约12或更多氨基酸的“J”区连接可变区和恒定区，重链也包括约10个或更多氨基酸的“D”区。见，例如，Fundamental Immunology，第7章，第二版，(Paul，W.，等人)，1989，Raven Press，N.Y.(为了所有目的被完整并入作为参考)。每个轻链/重链对的可变区的组合形成了抗原结合位点。
每个重链和轻链的可变区通常表现出相同的一般结构，其含有四个相对保守的框架区(FR)，该框架区被三个高度区连接，该高度区称为互补决定区或CDRs。来自每一对的两条链的CDRs被框架区排列，该排列使得能够结合特定表位。从N-末端到C-末端，轻链和重链可变区通常都含有结构域FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4。通常按照Kabat Sequencesof Proteins of Immunologcal Interest(1987和1991，National Institutes ofHealth，Bethesda，Md.)、Chothia&Lesk，1987，J.Mol.Biol.196：901-917，或Chothia等人，1989，Nature342：878-883)的定义将氨基酸分配给每个结构域。
随着单克隆抗体的开发，抗体成为有用和有趣的药物剂。使用通过连续培养细胞系产生抗体分子的任一方法产生单克隆抗体。制备单克隆抗体的适宜方法的实例包括Kohler等人(1975，Nature256：495-497)的杂交瘤方法和人B-细胞杂交瘤方法(Kozbor，1984，J.Immunol.133：3001；和Brodeur等人，1987，Monoclonal Antibody ProductionTechniques and Applicat ions，(Marcel Dekker，Inc.，New York)，51-63页)。
可以修饰单克隆抗体以用作治疗剂。一个实例是“嵌合”抗体，其中重链和/或轻链的一部分与来自特定物种或属于特定抗体类别或亚类的抗体中相应序列相同或同源，而链的剩余部分与来自另一物种或属于另一抗体类别或亚类的抗体中相应序列相同或同源。其他实例是这些抗体的片段，只要这些片段表现出所希望的生物学活性。见，美国专利号4,816,567；和Morrison等人(1985)，Proc.Natl.Acad.Sci.USA81：6851-6855。相关发展是“CDR-嫁接的”抗体，其中抗体含有来自特定物种或属于特定抗体类别或亚类的一个或多个互补确定区(CDRs)，而抗体链的剩余部分来自另一物种或属于另一抗体类别或亚类的抗体中相应序列相同或同源。
另一发展是“人源化”抗体。人源化非人抗体的方法是本领域中熟知的(见美国专利号5,585,089，和5,693,762)。通常，通过非-人动物产生人源化抗体，然后将通常来自该抗体的非-抗原识别部分的一些氨基酸残基修饰以与相应同种型的人抗体中的所述残基同源。可以使用例如，本领域中描述的方法(Jones等人，1986，Nature321：522-525；Riechmann等人，1988，Nature332：323-327；Verhoeyen等人，1988，Science239：1534-1536)，通过将啮齿类可变区的至少一部分置换成人抗体的相应部分实施人源化。
更近并且更有希望的是开发人抗体而不用将抗原暴露于人(“完全人抗体”)。使用能够产生人抗体的所有组成成分而不产生内源小鼠免疫球蛋白的转基因动物(例如，小鼠)，通过用抗原(通常具有至少7个相邻氨基酸)(任选缀合到载体)免疫产生这些抗体。见例如，Jakobovits等人，1993，Proc.Natl.Acad.Sci.USA90：2551-2555；Jakobovits等人，1993，Nature362：255-258；和Bruggermann等人，1993，Year in Immunol.7：33。在这些方法的一个实施例中，通过将编码小鼠免疫球蛋白重链和轻链的内源小鼠免疫球蛋白基因座无能化，并将编码人重链和轻链蛋白的基因座插入小鼠的基因组产生转基因小鼠。部分修饰的动物没有完全修饰，将这些部分修饰的动物杂交得到具有所有所希望的免疫系统修饰的动物。当施用免疫原时，这些转基因动物产生对具有人(而不是鼠)氨基酸序列的那些抗原免疫特异的抗体，包括可变区。见PCT公布号WO96/33735和WO94/02602，这些文献被并入作为参考。其他方法在美国专利号5,545,807、PCT公布号WO91/10741、WO90/04036、和EP546073B1和EP546073A1中描述，这些文献被并入作为参考。也可以通过在宿主细胞中表达重组DNA或者在如此处描述的杂交瘤细胞中表达产生人抗体。
也可以从噬菌体展示文库(如在Hoogenboom等人，1991，J.Mol.Biol.227：381；和Marks等人，1991，J.Mol.Biol.222：581中公开)产生完全人抗体。这些方法通过将抗体的所有组成组分展示在丝状噬菌体的表面上，然后通过噬菌体对所选抗原的结合选择噬菌体来模拟免疫选择。一种该技术在PCT公布号WO99/10494中描述，其被并入作为参考，该文献描述了使用这种方法分离MPL-和msk-受体的高亲和性和功能激动抗体。
一旦确定了编码这些抗体的核苷酸序列，也可以通过重组方法产生嵌合抗体、CDR-嫁接的抗体、人源化抗体和完全的人抗体。使用本领域中公知的材料和方法将编码抗体的核酸导入宿主细胞并表达。
本发明提供了针对人IL-1R1的一种或多种完全人单克隆抗体。优选地，这些抗体结合IL-1R1的第三个结构域。在优选的实施方案中，本发明提供了编码重链和轻链免疫球蛋白分子，特别是相应于其可变区的序列的核苷酸序列和含有重链和轻链免疫球蛋白分子，特别是相应于其可变区的序列的氨基酸序列。在优选的实施方案中，提供了相应于互补决定区(CDRs)，特别是CDR1到CDR3的序列。在另外的优选实施方案中，本发明提供了杂交瘤细胞系，其表达这些免疫球蛋白分子和从中产生的单克隆抗体，最优选地，纯化的针对人IL-1R1的人单克隆抗体。
克隆和在酵母人工染色体(YACs)中重构Mb大小的人基因座并将酵母人工染色体导入小鼠种系提供了一种有利的方法以阐明非常大或者初步作图的基因座的功能组分以及产生人类疾病的有用模型。此外，使用这些技术将小鼠基因座用它们的人等价物置换对于发育期间人基因产物的表达和调节、它们与其他系统的交流，和它们与疾病诱导和发展的关系提供了独特的理解。
这种策略的一个重要的实际应用是小鼠体液免疫系统的“人源化”。将人免疫球蛋白(Ig)基因座导入小鼠中，其中内源Ig基因已经被失活，该导入为研究抗体的潜在的程序化表达和装配以及它们在B-细胞发育中的角色提供了机会。此外，这种策略为产生完全人单克隆抗体(Mabs)，特别用作治疗剂的完全人单克隆抗体提供了来源。预期完全人抗体使小鼠或小鼠来源的Mabs的内在免疫原性和变应原性应答最小，从而增加治疗应用中所施用的抗体的效能和安全性。完全人抗体可用于治疗慢性和复发性人疾病，如骨关节炎、类风湿性关节炎，和其他炎症，其治疗需要反复的抗体施用。
本领域技术人员可以用人Ig基因座大片段工程化小鼠抗体产生缺陷的小鼠品系从而这些小鼠产生人抗体而不产生小鼠抗体。大的人I g片段可以保存大可变基因多样性以及抗体产生和表达的正确调节。利用抗体多样化和选择以及对人蛋白免疫耐受的缺乏的小鼠机器，这些小鼠品系中再生的人抗体所有组成组分产生针对任一目标抗原，包括人抗原的高亲和性抗体。使用杂交瘤技术，可以产生和选择具有所希望的特异性的抗原-特异的人MAbs。
在一些实施方案中，技术人员可以使用来自不同于人的物种的恒定区以及这些小鼠中的人可变区以产生嵌合抗体。用全长IL-1R1、IL-1R1的可溶形式，或者其片段免疫这些动物可以产生本发明的抗体。见，例如，国际专利申请公布号WO93/12227。
本发明的抗-IL-1R1抗体的轻链和重链可变区的CDRs可以嫁接到相同或另一物种的框架区(FRs)。在一些实施方案中，抗-IL-1R1抗体的轻链和重链可变区的CDRs可以嫁接到共有人FRs。为了产生共有人FRs，对来自几种人重链或轻链氨基酸序列的FRs进行比对以鉴定共有氨基酸序列。抗-IL-1R1抗体的重链或轻链的FRs可以被来自不同重链或轻链的FRs代替。抗-IL-1R1抗体的重链和轻链的FRs中的稀有氨基酸通常不被置换，然而剩下的FR氨基酸可被置换。稀有氨基酸是特定氨基酸，在FR中它们所处的位置中不通常发现这些氨基酸。本发明的抗-IL-1R1抗体的嫁接的可变区可以与不同于抗IL-1R1抗体的恒定区一起使用。备选地，嫁接的可变区是单链Fv抗体的部分。CDR嫁接在例如，美国专利号6,180,370、5,693,762、5,693,761、5,585,089、和5,530,101中描述，它们在此处为了任何目的被并入作为参考。
在一些实施方案中，本发明提供了抗IL1-R1抗体，其含有具有SEQ ID NO：61、SEQID NO：62、或SEQ ID NO：63的氨基酸序列的人重链CDR1区；具有SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：65、或SEQ ID NO：66的氨基酸序列的人重链CDR2区；和/或具有SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：68、或SEQ ID NO：69的氨基酸序列的人重链CDR3区。
在另一实施方案中，本发明提供了抗-IL1-R1抗体，其含有具有SEQ ID NO：70或SEQ ID NO：71的氨基酸序列的人轻链CDR1区；具有SEQ ID NO：72或SEQ ID NO：73的氨基酸序列的人轻链CDR2区；和/或具有SEQ ID NO：74或SEQ ID NO：75的氨基酸序列的人轻链CDR3区。
优选使用转基因小鼠制备本发明的抗体，该转基因小鼠具有插入小鼠的抗体产生细胞中的人抗体-产生基因座的实质性部分，并且该小鼠被进一步工程化而在产生内源的鼠抗体方面有缺陷。这些小鼠能够产生人免疫球蛋白分子和抗体并且不产生鼠免疫球蛋白分子和抗体或者所产生的量充分减少。用于实现该结果的技术在本说明书中公开的专利、申请和参考文献中公开。在优选的实施方案中，技术人员可以使用如国际专利申请公布号WO98/24893中公开的方法，该专利申请为了任何目的被并入作为参考。还见Mendez等人，1997，Nature Genetics15：146-156，该文献为了任何目的被并入作为参考。
可通过各种技术产生本发明的单克隆抗体(MAbs)，这些技术包括常规单克隆抗体方法学，例如，Kohler和Milstein，1975，Nature256：495的标准体细胞杂交技术。尽管原则上优选体细胞杂交方法，但是也可使用产生单克隆抗体的其他技术，例如，B-淋巴细胞的病毒或癌基因转化。
在优选的实施方案中，可以使用称为“HuMab”小鼠的小鼠产生针对IL-1R1的人单克隆抗体，该小鼠含有人免疫球蛋白基因微基因座，该微基因座编码未重排的人重链(μ和γ)和κ轻链免疫球蛋白序列，以及靶定突变，该突变失活内源的μ和κ链基因座。Lonberg等人，1994，Nature368：856-859。因此，小鼠表现出小鼠IgM或κ表达减少和免疫应答的降低，所导入的人重链和轻链转基因经历类别转换和体细胞突变以产生高亲和性的人IgGκ单克隆抗体。Lonberg等人，如前；Lonberg和Huszar，1995，Intern.Rev.Immunol.13：65-93；Harding和Lonberg，1995，Ann.N.Y.Acad.Sci.764：536-546。HuMab小鼠的制备在Taylor等人，1992，Nucleic Acids Res.20：6287-6295；Chen等人，1993，InternationalImmunology5：647-656；Tuaillon等人，1994，J.Immunol.152：2912-2920；Lonberg等人，1994，Nature368：856-859；Lonberg，1994，Handbookof Exp.Pharmacology113：49-101；Taylor等人，1994，International Immunology：579-591；Lonberg&Huszar，1995，-Intern.Rev.Immunol.13：65-93；Harding&Lonberg，1995，Ann.N.Y.Acad.Sci764：536-546；Fishwild等人，1996，Nature Biotechnology14：845-851中详细描述，所有它们的内容在此处被完整并入作为参考。还见美国专利号Lonberg和Kay的5,545,806、5,569,825、5,625,126、5,633,425、5,789,650、5,877,397、5,661,016、5,814,318、5,874,299、和5,770,429；以及Surani等人的美国专利号5,545,807；1993年公布的国际专利申请公布号WO93/1227；1992年12月23日公布的WO92/22646；和1992年3月19日公布的WO92/03918，所有这些文献的公开被完整并入作为参考。备选地，在下面的实施例中描述的HCo7和HCo12转基因小鼠品系被用于产生人抗-IL-1R1抗体。
备选地，如下产生IL-1R1特异的全人单克隆抗体。用目标IL-1R1-相关的抗原免疫含有人免疫球蛋白基因的转基因小鼠。从表达抗体的小鼠得到淋巴细胞(如B-细胞)。这些回收的细胞与骨髓-型细胞系融合以制备无限增殖的杂交瘤细胞系，并且筛选和选择这些杂交瘤细胞系以鉴定产生目标抗原特异的抗体的杂交瘤细胞系。在一些实施方案中，提供了产生IL-1R1特异的抗体的杂交瘤细胞系。
在优选的实施方案中，通过杂交瘤系产生本发明的抗体。在这些实施方案中，本发明的抗体结合IL-1R1，它们之间的解离常数(Kd)约为4pM到100pM。在本发明的一些实施方案中，抗体结合IL-1R1，Kd小于约20pM。在其他实施方案中，本发明的抗体结合IL-1R1的第三个结构域。在图17中显示了人和大鼠IL1-R1的第三个结构域的核苷酸和氨基酸序列。
在优选的实施方案中，本发明的抗体是IgG1、IgG2或IgG4同种型抗体，最优选IgG2同种型。在本发明的优选实施方案中，抗体含有人κ轻链和人IgG1、IgG2或IgG4重链。在具体实施方案中，抗体的可变区连接到不同于IgG1、IgG2或IgG4同种型的恒定区的恒定区。在一些实施方案中，本发明的抗体已经被克隆以在哺乳动物细胞中表达。
在一些实施方案中，对抗IL-1R1抗体的重链和轻链的保守氨基酸置换(和编码核苷酸的相应修饰)产生的抗IL-1R1抗体将具有类似于抗IL-1R1抗体的功能和化学特征。相比，通过选择重链和轻链的氨基酸序列中的置换可以实现抗-IL-1R1抗体的功能和/或化学特征的实质的修饰，这些置换在它们对保持(a)置换的区域中分子主链的结构，例如，作为折叠或螺旋构象，(b)靶标位点处分子的电荷或疏水性，或(c)侧链的体积的效果方面显著不同。
例如，“保守性氨基酸置换“可包括用非天然残基置换天然氨基酸残基，从而对该位置上氨基酸残基的极性或电荷影响很小或没有影响。此外，多肽中的任一天然残基也可以用丙氨酸置换，如以前关于“丙氨酸扫描诱变”所描述的(Wells，1991，MethodsEnzymol.202：390(编者J.J.Langone)，Academic Press，London)。
本领域技术人员在希望时可以确定所希望的氨基酸置换(保守的或非保守的)。在一些实施方案中，氨基酸置换可用于鉴定抗-IL-1R1抗体的重要残基，或者增加或降低此处描述的抗-IL-1R1抗体的亲和性。
在备选实施方案中，本发明的抗体可以在不同于杂交瘤细胞系的细胞系中表达。在这些实施方案中，编码特定抗体的序列可用于转化适宜的哺乳动物宿主细胞。根据这些实施方案，可以利用将多核苷酸导入宿主细胞的任一公知的方法实现转化，该方法包括，例如，将多核苷酸包装在病毒(或者病毒载体)中并用该病毒(或载体)转导宿主细胞，或者通过本领域中公知的转染方法。这些方法由美国专利号4,399,216、4,912,040、4,740,461和4,959,455(所有都为了任何目的在此处被并入作为参考)例证。通常，所用的转化方法取决于所要转化的宿主。将异源多核苷酸导入哺乳动物细胞的方法是本领域中熟知的并且包括，但不限于，葡聚糖-介导的转染、磷酸钙沉淀、1，5-二甲基-1，5-二氮十一亚甲基聚甲溴化物(polybrene)介导的转染、原生质体融合、电穿孔、多核苷酸在脂质体中的包被、和DNA微注射到细胞核中。
根据本发明的一些实施方案，使用标准连接技术将本发明的IL-1R1抗体的重链恒定区、重链可变区、轻链恒定区，或轻链可变区的氨基酸序列的核酸分子插入适宜的表达载体中。在优选的实施方案中，IL-1R1重链或轻链恒定区附加到适宜的可变区的C-末端并被连接到表达载体。所选的载体通常在所用的具体宿主细胞中是有功能的(即，载体与宿主细胞机器相容从而可以发生基因的扩增和/或基因的表达)。对于表达载体综述，见Goeddel(编者)，1990，Meth.Enzymol.卷185，Academic Press.N.Y。
通常，用于任一种宿主细胞的表达载体将含有用于质粒维持和外源核苷酸序列的克隆和表达的序列。这些统称为“侧翼序列”的序列在一些实施方案中将通常包括一种或多种下面的核苷酸序列：启动子、一种或多种增强子序列、复制原点、转录终止序列、含有供体和受体剪接位点的完整内含子序列、编码多肽分泌的引导序列的序列、核糖体结合位点、聚腺苷酸序列、用于插入编码所要表达的多肽的核酸的多接头区，和可选择的标记物元件。下面讨论这些序列的每一种。
任选地，载体可含有“标记”编码序列，即位于IL-1R1多肽编码序列的5’或3’末端的寡核苷酸分子；该寡核苷酸序列编码聚His(如六聚His)，或者另一“标记”，如FLAG、HA(流感病毒血凝素)，或者myc，通过商业途径可得到这些标记的抗体。该标记在多肽表达时通常被融合到该多肽，并且可作为亲和纯化或者从宿主细胞检测IL-1R1抗体的方式。可以例如，通使用针对标记的抗体作为亲和基质通过柱层析实现亲和层析。任选地，可通过各种方法如使用一些用于切割的肽酶从纯化的IL-1R1多肽除去标记，
侧翼序列可以是同源的(例如，来自与宿主细胞相同的物种和/或品系)、异源的(例如，来自不同于宿主细胞种类或品系的物种)、杂交的(例如，来自一种以上来源的侧翼序列的组合)、合成的或天然的。同样地，侧翼序列的来源可以是任一种原核或真核生物，任一种脊椎动物或无脊椎动物生物，或者任一种植物，只要侧翼序列在宿主细胞机器中是有功能的并且可被宿主细胞机器活化。
可通过本领域中熟知的方法之一得到用于本发明的载体的侧翼序列。通常，用于此处的侧翼序列将事先已经通过作图和/或通过限制性内切酶消化鉴定并从而可以使用适宜的限制性内切酶从适当的组织来源分离。在一些情况中，可以知道侧翼序列的全部核苷酸序列。这里，可以用此处描述关于核酸合成或克隆的方法合成侧翼序列。
当知道了侧翼序列的所有或仅一部分时，可以使用聚合酶链式反应(PCR)和/或通过使用适宜的探针如寡核苷酸和/或来自相同或另一物种的侧翼序列片段筛选基因组文库得到该侧翼序列。当侧翼序列是未知的时候，可以从更大的DNA分离含有侧翼序列的DNA片段，该更大的DNA可能含有，例如，编码序列或者甚至另一个或几个基因。可通过限制性内切酶消化产生适当的DNA片段，然后使用琼脂糖凝胶纯化、柱层析(Chatsworth，CA)，或者技术人员公知的其他方法实现分离。实现该目的的适宜酶的选择对本领域普通技术人员是显而易见的。
复制原点通常是通过商业途径购买的那些原核表达载体的一部分，并且该原点有助于载体在宿主细胞中的扩增。如果所选载体不含有复制原点，可以基于公知的序列化学合成复制原点，并将其连接到载体。例如，来自质粒pBR322(New England Biolabs，Beverly，MA)的复制原点适于大多数革兰氏阴性细菌，并且各种病毒原点(例如，SV40、多形瘤、腺病毒、疱疹性口腔炎病毒(VSV)，或者乳头瘤病毒如HPV或BPV)可用于哺乳动物细胞中克隆载体。通常，哺乳动物表达载体不需要复制原点组分(例如，通常需要SV40原点仅仅是因为其也还含有病毒早启动子)。
转录终止序列通常位于多肽编码区末端的3’并且用于终止转录。通常，原核细胞中的转录终止序列是富含G-C的片段，接着是聚-T序列。尽管可以从文库容易地克隆该序列或者甚至作为载体的一部分通过商业途径购买，但是也可以使用核酸合成的方法(如本文中所描述的)容易地合成该序列。
选择性标记基因编码宿主细胞在选择性培养基上存活和生长所必需的蛋白。典型的选择标记基因编码的蛋白(a)赋予原核宿主细胞对抗体或其他毒素，例如氨苄西林、四环素，或者卡那霉素抗性；(b)细胞的互补营养缺陷型缺陷；或(c)提供从复杂或已知成分培养基不能得到的关键营养。优选的可选择标记是卡那霉素抗性基因、氨苄西林抗性基因，和四环素抗性基因。新霉素抗性基因也可以用于原核和真核宿主细胞的选择。
其他可选择基因也可用于扩增将要表达的基因。扩增是一种过程，其中更需要用于产生对生长或细胞存活关键的蛋白质的基因通常在重组细胞的连续世代的染色体中串联重复。哺乳动物的适宜的选择性标记的实例包括二氢叶酸还原酶(DHFR)和无启动子的胸苷激酶。哺乳动物细胞转化体被置于选择压力下，其中转化体通过载体中存在的选择性标记唯一地幸存。通过将所转化的细胞培养在培养基中选择剂浓度不断增加的条件下来加强选择压力，从而导致选择性基因和编码另一种基因的DNA，如含有IL-1R1多肽的载体都扩增。结果，从扩增的DNA合成量不断增加的多肽如IL-1R1多肽。
核糖体-结合位点通常是mRNA的翻译起始所必须的并且其特征是SD序列(原核生物)或Kozak序列(真核生物)。该元件通常位于启动子的3’和所要表达的多肽的编码区的5’。
在一些情况中，如当在真核宿主细胞表达系统中希望糖基化时，可以操作各种前序列或者原序列以提高糖基化或产率。例如，可以改变特定信号肽的肽酶切割位点，或者加入原序列，其也影响糖基化。最后的蛋白质产物可以具有-1位(相对于成熟蛋白的第一个氨基酸)的一个或多个与表达关联的额外的氨基酸，所述氨基酸可能没有被完全除去。例如，最终蛋白质产物可以具有在肽酶切割位点发现的一个或多个氨基酸残基，其附着到氨基末端。备选地，如果酶在成熟多肽的这些区域内切割，那么使用一些酶切割位点可导致所希望的多肽的稍微截短的形式。
本发明的表达和克隆载体将通常含有启动子，其被宿主生物识别并可操作地连接到编码抗IL-1R1抗体的分子。启动子是位于结构基因的起始密码子的上游(例如，5’)的未翻译序列(通常约100到1000bp)，其控制结构基因的转录。启动子通常分成两种类别之一：可诱导的启动子和组成性启动子。可诱导的启动子应答培养条件中的某种变化，如营养物的存在或缺乏，或者温度的改变，而启动处于它们控制下的DNA的转录水平增加。另一方面，组成性启动子，启动连续的基因产物产生；即，对基因表达几乎没有或者没有控制。熟知许多启动子，它们被各种潜在的宿主细胞识别。通过限制酶消化从源DNA除去启动子序列并将所希望的启动子序列插入载体，可以将适宜的启动子可操作地连接到编码含有本发明的抗IL-1R1抗体的重链或轻链的DNA。
用于酵母宿主的适宜的启动子也是本领域中公知的。酵母增强子可有利地与酵母启动子一起使用。用于哺乳动物宿主细胞的适宜的启动子是熟知的并且包括，但不限于，从病毒如多形瘤病毒、禽痘病毒、腺病毒(如腺病毒2)、牛乳头瘤病毒、鸟肉瘤病毒、巨细胞病毒、逆转录病毒、乙型肝炎病毒和最优选地猿病毒40(SV40)的基因组得到的启动子。其他适宜的哺乳动物启动子包括异源哺乳动物启动子，例如，热休克启动子和肌动蛋白启动子。
另外的目标启动子包括，但不限于：SV40早启动子区(Bernoist和Chambon，1981，Nature290：304-10)；CMV启动子；包含在劳氏肉瘤病毒的3’长末端重复的启动子(Yamamoto等人，1980，Cell22：787-97)；疱疹胸苷激酶启动子(Wagner等人，1981，Proc.Natl.Acad.Sci.USA78：1444-45)；金属硫蛋白基因的调节序列(Brinster等人，1982，Nature296：39-42)；原核生物表达载体如β-内酰胺酶启动子(Villa-Kamaroff等人，1978，Proc.Natl.Acad.Sci.USA75：3727-31)；或者tac启动子(DeBoer等人，1983，Proc.Natl.Acad.Sci.USA80：21-25)。还作为目标的是下面的动物转录控制区，其表现出组织特异性并且已经用于转基因动物：在胰腺腺泡细胞中有活性的弹性蛋白酶I基因控制区(Swift等人，1984，Ce1138：639-46；Ornitz等人，1986，Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.50：399-409(1986)；MacDonald，1987，Hepatology7：425-515)；在胰腺β细胞中有活性的胰岛素基因控制区(Hanahan，1985，Nature315：115-22)；在淋巴细胞中有活性的免疫球蛋白基因控制区(Grosschedl等人，1984，Cell38：647-58；Adames等人，1985，Nature318：533-38；Alexander etal.，1987，Mol.Cell.Biol.7：1436-44)；在睾丸、乳腺、淋巴和肥大细胞中有活性的小鼠乳腺肿瘤病毒控制区(Leder等人，1986，Cell45：485-95)；在肝脏中有活性的白蛋白基因控制区(Pinkert等人，1987，Genes and Devel.1：268-76)；在肝脏中有活性的α-feto-蛋白基因控制区(Krumlauf等人，1985，Mol.Cell.Biol.5：1639-48；Hammer等人，1987，Science235：53-58)；在肝脏中有活性的α1-抗胰蛋白酶基因控制区(Kelsey等人，1987，Genes and Devel.1：161-71)；在骨髓细胞中有活性的β-珠蛋白基因控制区(Mogram等人，1985，Nature315：338-40；Kollias etal.，1986，Cell46：89-94)；在脑中的少突胶质细胞中有活性的髓磷脂碱性蛋白基因控制区(Readhead等人，1987，Cell48：703-12)；在骨骼肌中有活性的肌球蛋白轻链-2基因控制区(Sani，1985，Nature314：283-86)；和在下丘脑中有活性的促性腺释放激素基因控制区(Mason等人，1986，Science234：1372-78)。
增强子序列可插入到载体以增强高级真核生物对编码本发明的抗IL-1R1抗体的轻链或重链的DNA的转录。增强子是DNA的顺式作用元件，通常长约10-300bp，作用于启动子以增加转录。增强子是相对独立于方向和位置的。已经在转录单位的5’和3’发现了增强子。公知可以从哺乳动物基因(例如，珠蛋白、弹性蛋白酶、白蛋白、α-feto-蛋白和胰岛素)得到一些增强子序列。然而，通常使用来自病毒的增强子。本领域中公知的SV40增强子、巨细胞病毒早启动子增强子、多形瘤增强子和腺病毒增强子是真核细胞启动子活化的示例性增强元件。尽管增强子可以在核酸分子的5’或3’位置剪接到载体中，但是其通常位于启动子的5’位。
可以从起始载体如通过商业途径可得到的载体构建本发明的表达载体。这些载体可以含有或不含有所有希望的侧翼序列。当一种或多种此处描述的侧翼序列不存在于该载体时，可以单独地得到这些侧翼序列并将它们连接到载体。得到每种侧翼序列的方法是本领域技术人员熟知的。
已经构建载体并且编码抗-IL-1R1抗体的轻链或重链或者轻链和重链的核酸分子已经被插入到载体的适当位点后，所完成的载体可被插入到适宜的宿主细胞以扩增和/或多肽表达。可以通过熟知的方法将抗-IL-1R1抗体的表达载体转化到所选的宿主细胞，该方法包括转染、感染、磷酸钙共沉淀、电穿孔、微注射、脂转染、DEAE-葡聚糖介导的转染，或者其他公知的技术。所选的方法将部分是所用的宿主细胞类型的函数。这些方法和其他适宜的方法是技术人员熟知的，并且在例如，Sambrook等人，(如前)中提出。
宿主细胞当在适宜的条件下培养时合成抗-IL-1R1抗体，随后从培养基(如果宿主细胞将抗体分泌到培养基)或者直接从产生抗体的宿主细胞(如果其不被分泌)回收抗IL-1R1抗体。适宜的宿主细胞的选择将取决于各种因素，如所希望的表达水平、所希望的或者活性所必要的多肽修饰(如糖基化或磷酸化)和折叠成生物活性分子的容易性。
可以得到的作为表达宿主的哺乳动物细胞系是本领域中熟知的并且包括，但不限于，可从美国典型培养物保藏中心(ATCC)得到的许多无限增殖的细胞系，包括但不限于中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、HeLa细胞、幼仓鼠肾(BHK)细胞、猴肾细胞(COS)、人肝细胞癌细胞(例如，Hep G2)，和许多其他细胞系。在一些实施方案中，可以通过确定哪些细胞系具有高表达水平并产生具有组成性IL-1R1结合性质的抗体来选择细胞系。在另一实施方案中，可以从来自不产生自身抗体但是能够产生并分泌异源抗体的B细胞谱系选择细胞系(例如，小鼠骨髓瘤细胞系NSO和SP2/0)。
本发明的抗体可用于检测生物样品中的IL-1R1和鉴定产生IL-1R1蛋白的细胞或组织。所述抗体结合IL-1R1并阻断与其他结合化合物的相互作用，该抗体具有治疗性用途，用以调节IL-1介导的疾病。在优选的实施方案中，针对IL-1R1的抗体可以阻断IL-1R1与IL-1β或IL-1α的结合，从而导致IL-1信号转导级联的破坏。
特异结合IL-1R1的本发明抗体可用于治疗IL-1介导的疾病，如下面所讨论的。所述抗体可用于结合测定法中检测IL-1R1结合以及它们抑制IL-1R1与IL-1β和IL-1R辅助蛋白(IL-1RAcP)或与IL-1α和IL-1RAcP形成复合物的能力。
在一些实施方案中，本发明提供了治疗与IL-1介导的炎症反应或者IL-1介导的免疫调节反应有关的医学失调。本发明的方法包括将本发明的抗-IL1R1抗体施用于受到IL-1介导的炎症或免疫调节疾病折磨的个体。如此处所用的，术语“病”、“疾病”、“医学病症”或“异常病症”可以与术语“医学失调”互换使用。
在具体实施方案中，本发明的方法包括对患者施用本发明的抗IL-1R1抗体，从而防止IL-1与其细胞表面受体(IL-1R1)的结合。
为了治疗特征为IL-1的异常或过量表达或者IL-1信号异常或过量的医学失调，将含有本发明的IL-1R1型I抗体施用于患者，所施用的量和持续的时间足够引起反映该失调的严重性的至少一种指标的持续改善。如果患者在相隔1到4周的至少两个场合表现出改善，那么认为该改善是“持续的”。改善的程度可基于病征或症状确定，并且也可以使用用于患者的调查表，如生命质量调查表。
可以评估反映患者疾病的程度的各种指标以确定治疗的量和时间是否足够。在使用第一剂抗体之前通过检查患者确定所选的一种或多种指标的基线值。优选地，在第一剂施用前约60天内进行基线检查。如果IL-1R抗体被用于治疗急性症状，如，例如，治疗外伤性损伤(外伤性膝损伤、中风、头损伤，等)，那么在损伤或事件发生后从实际出发尽快施用第一剂。
通过抗体剂量的反复施用引起改善，直到患者表现出所选一种或多种指标高于基线的改善。在治疗慢性病症时，通过在至少1个月或更长，例如，1、2、或3个月或更长或者无限地期间内反复施用该药物得到改善的程度。对于治疗急性病症，1到6周，或者甚至一剂通常就足够了。
尽管根据一种或多种指标，治疗后患者的疾病程度似乎改善了，但是可以无限地在相同水平上或者以更低的剂量或频率继续治疗。一旦治疗已经减小或停止，如果症状以后再次出现，其可能恢复到最初的水平。
任何一种有效施用途径都可用于治疗性施用抗体。可以通过关节内、静脉内、肌内、病灶内、腹膜内、颅内、吸入或者通过大丸剂皮下注射或者通过连续灌输注射抗体。例如，肺部疾病可包括鼻内和吸入方法。其他适宜的施用方法包括植入物的缓释、气溶胶吸入、滴眼液、口服制剂，包括丸剂、糖浆剂、锭剂或咀嚼树胶，和局部制剂如洗剂、凝胶剂、喷雾剂、软膏剂或其他适宜的技术。当治疗与肺部失调有关的疾病时，通过吸入施用尤其有利。
在本发明的一个实施方案中，本发明的抗-IL-1R1抗体可以每月一次施用。在另一实施方案中，每两周一次或每周一次施用抗体以治疗此处公开的各种医学失调。在再一个实施方案中，每周施用抗体至少两次，在另一实施方案中，每天施用抗体至少一次。成年患者是18岁或以上的人。如果注射，那么每个成人剂量的有效量为1-200mg/m2或1-40mg/m2或约5-25mg/m2。备选地，可以施用flat剂量，其量为2-400mg/剂、2-100mg/剂或约10-80mg/剂。如果剂量将以每周施用1次以上，那么示例性剂量范围和前面描述的剂量范围相同或更低。在本发明的一个实施方案中，通过将含有1L-1受体抗体的注射可接受的制剂以80-100mg/剂施用，或者备选地含有80mg/剂的制剂治疗下述各种适应症。剂量被反复施用。如果使用不同于注射的施用途径，那么根据标准医学惯例适当调节剂量。例如，如果施用途径是吸入，那么给药可以是每周1到7次，剂量范围为10mg/剂到50mg/剂。
在优选的实施方案中，本发明还提供了药物组合物，其含有治疗有效量的一种或多种本发明抗体以及药学上可接受的稀释剂、载体、溶解剂、乳化剂、防腐剂和/或佐剂。优选地，可接受的制剂物质在所用的剂量和浓度下对接受者是无毒的。在优选的实施方案中，提供了含有治疗有效量的抗-IL-1R1抗体的药物组合物。
在一些实施方案中，药物组合物可含有用于改变、保持或保存例如，pH、摩尔渗透压浓度、粘度、透明度、颜色、等渗性、气味、无菌性、稳定性、溶解或释放速度、组合物的吸收或渗透的制剂物质。在这些实施方案中，适宜的制剂物质包括，但不限于，氨基酸(如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、精氨酸或赖氨酸)、抗微生物剂、抗氧化剂(如抗坏血酸、亚硫酸钠或亚硫酸氢钠)、缓冲剂(如硼酸盐、碳酸氢盐、Tris-HCl、柠檬酸盐、磷酸盐或其他有机酸)、膨胀剂(如甘露醇或甘氨酸)、螯合剂(如乙二胺四乙酸(EDTA))、络合剂(如咖啡因、聚乙烯吡咯烷酮、β-环糊精或羟丙基-β-环糊精)、填充剂、单糖、二糖、和其他糖类(如葡萄糖、甘露糖或糊精)、蛋白质(如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白)、着色剂、增味剂和稀释剂、乳化剂、亲水性聚合物(如聚乙烯吡咯烷酮)、低分子量多肽、盐形成反离子(如钠)、防腐剂(如苯扎氯铵、苯甲酸、水杨酸、硫柳汞、苯乙醇、对羟基苯甲酸甲酯、对羟基苯甲酸丙酯、双氯苯双胍己烷、山梨酸或过氧化氢)、溶剂(如甘油、丙二醇或聚乙二醇)、糖醇(如甘露醇或山梨醇)、悬浮剂、表面活性剂或增湿剂(如pluronics、PEG、聚山梨糖酯、聚山梨醇酯如聚山梨醇酯20、聚山梨醇酯80、triton、trimethamine、卵磷脂、胆固醇、tyloxapal)、稳定增强剂(如蔗糖或山梨醇)、张力增强剂(如碱金属卤化物，优选氯化钠或钾、甘露醇、山梨醇)、递送载体、稀释剂、赋形剂和/或药学佐剂。见，Remington′s Pharmaceutical Sciences，第18版，(A.R.Gennaro，编者)，1990，Mack Publishing Company。
在一些实施方案中，本领域技术人员根据例如，所希望的施用途径、递送方式和所希望的剂量确定最佳药物组合物。见，例如，Remington′s Pharmaceutical Sciences，如前。在一些实施方案中，这些组合物可影响本发明抗体的物理状态、稳定性、体内释放速度和体内清除速度。
在一些实施方案中，药物组合物中的最初载体在性质上可以是水性或非水性的。例如，适宜的载体可以是注射用水、生理盐水或人工脑脊液，可能补充用于肠胃外施用的组合物中常用的其他物质。中性缓冲盐水或者与血清白蛋白混合的盐水是进一步的示例性载体。在优选的实施方案中，药物组合物含有pH约7.0-8.5的Tris缓冲液、pH约4.0-5.5的乙酸缓冲液，并且可以还包括山梨醇或适宜的替代物。在本发明的一些实施方案中，通过将所选的具有所希望的纯度的组合物与任选的配制剂(Remington′s Pharmaceutical Sciences，如前)以冻干饼或者水性溶液的形式混合可以制备用于保存的抗IL-1R1抗体组合物。此外，在一些实施方案中，可以用适宜的赋形剂如蔗糖将抗IL-1R1抗体产物制备成冻干物。
可以选择本发明的药物组合物用于肠胃外递送。可以选择该组合物用于吸入或通过消化道递送，如口服。这些药学上可接受的组合物的制备是本领域内的技术。
制剂组分存在的浓度优选为施用位点可接受的。在一些实施方案中，用缓冲剂保持组合物在生理pH或者稍低的pH，典型地为约5到约8的pH范围。
当预期肠胃外施用时，用于本发明的治疗性组合物可以以无致热原、肠胃外可接受的水性溶液的形式提供，该水性溶液含有药学上可接受的载体中的所希望的抗IL-1R1抗体。用于肠胃外注射的尤其适宜的载体是无菌蒸馏水，其中抗IL-1R1抗体被制备成无菌、等渗溶液，适当保存。在一些实施方案中，该制剂可包括所希望的分子与一种试剂，如微球体、生物可侵蚀的微粒、聚合的化合物(如聚乳酸或聚乙醇酸)珠子或脂质体的制剂，该试剂可以使通过depot注射递送的药物缓释或控释。在一些实施方案中，也可以使用透明质酸，其具有促进循环中持续时间的作用。在一些实施方案中，可施用可移植的药物递送装置导入所希望的抗体分子。
可以制备用于吸入的本发明的药物组合物。在这些实施方案中，抗IL-1R1抗体被制备成用于吸入的干粉。在优选的实施方案中，抗IL-1R1抗体吸入溶液也可以与推进剂配制用于气溶胶递送。在一些实施方案中，溶液可被雾化。在国际专利公布号WO94/20069中还描述了肺部施用和制备方法，该专利被并入作为参考，其描述了化学修饰的蛋白的肺部递送。
还预期制剂可以口服施用。以这种方式施用的抗-IL-1R1抗体可以与或不与用于固体剂型如片剂或胶囊剂的配制中通常使用的载体配制。在一些实施方案中，可以设计胶囊剂在胃肠道的某一点释放制剂的活性部分，在该点生物利用度最大并且前-系统性降解最小。还可以包括额外的试剂以促进抗-IL-R1抗体的吸收。也可以利用稀释剂、增味剂、低熔点蜡、植物油、润滑剂、悬浮剂、片剂崩解剂，和结合剂。
优选提供本发明的药物组合物含有与适于片剂生产的无毒赋形剂混合的有效量的一种或多种抗-IL-1R1抗体。将片剂溶于无菌水，或者另一种适宜的载体中，可以以单位-剂量形式制备溶液。适宜的赋形剂包括，但不限于，惰性稀释剂，如碳酸钙、碳酸钠或碳酸氢钠、乳糖，或磷酸钙；或者结合剂，如淀粉、明胶、或阿拉伯树胶；或者润滑剂如硬脂酸镁、硬脂酸或滑石粉。
另外的药物组合物对于本领域技术人员将是显然的，包括含有缓慢-或受控的递送制剂的抗-IL-1R1抗体的制剂。制备各种其他缓慢-或受控的递送方式的技术，如脂质体载体、生物-易侵蚀的微粒或者有孔珠和depot注射液，是本领域技术人员公知的。见，例如，国际专利公布号WO93/15722，其被并入参考文献，该专利描述了用于递送药物组合物的有孔聚合微粒的控制。缓释制剂可包括成形的物品形式的半透性聚合物基质，例如，膜剂或微胶囊剂。缓释基质可包括聚酯、水凝胶、聚交酯(如在美国专利号3,773,919和欧洲专利公布号EP058481中公开的)、L-谷氨酸和γ乙基-L-谷氨酸的共聚物(Sidman等人，1983，Biopolymers22：547-556)、聚(2-羟乙基-甲基丙烯酸酯)(Langer等人，1981，J.Biomed.Mater.Res.15：167-277和Langer，1982，Chem.Tech.12：98-105)、乙烯-乙酸乙烯共聚物(EVA)(Langer，如前)、或聚-D(-)-3-羟基丁酸(欧洲专利申请公布号EP133,988)。缓释组合物也可以包括脂质体，其可通过本领域中公知的若干方法之一制备。见，例如，Eppstein等人，1985，Proc.Natl.Acad.Sci.USA82：3688-3692；欧洲专利申请公布号EP036,676、EP088,046和EP143,949。
体内施用的药物组合物通常以无菌制剂提供。可通过无菌滤膜过滤实现除菌。当组合物被冻干时，可以在冻干和重构之前或之后用该方法除菌。用于肠胃外施用的组合物可以以冻干的形式保存或在溶液中保存。肠胃外组合物通常置于具有无菌入口的容器中，例如，静脉内溶液包或者具有塞子的小瓶，该塞子可被皮下注射针头穿透。
一旦已经配制了药物组合物，其可以作为溶液、悬浮液、凝胶剂、乳剂、固体，或者作为脱水或冻干的粉末保存在无菌小瓶中。这些制剂可以以直接使用的形式保存或者以施用前重构的形式(例如，冻干的)保存。
本发明还提供了产生单剂量施用形式的试剂盒。本发明的试剂盒可以每个含有具有干燥蛋白的第一容器和具有水性制剂的第二容器。在本发明的一些实施方案中，提供了含有一个或多个室的预装注射器(例如，液体注射器或lyosyringes)的试剂盒。
所用的含有抗-IL-1R1抗体的药物组合物的有效量将取决于例如，治疗背景和目标。本领域技术人员将明白治疗的适宜剂量水平将部分根据所递送的分子、所用的抗IL-IL-1R1抗体的适应症、施用途径和患者的大小(体重、体表面积或器官大小)和/或状况(年龄和一般健康)而变。在一些实施方案中，临床医生可以确定剂量和更改施用途径以得到最佳治疗效果。典型剂量可以为约0.1μg/kg到约100mg/kg或者以上，这取决于上述因素。在优选的实施方案中，剂量可以为约0.1μg/kg到约100mg/kg；更优选地，约1μg/kg到约100mg/kg；甚至更优选5μg/kg到约100mg/kg。
给药频率将取决于所用的制剂中特定抗IL-1R1抗体的药物动力学参数。通常，临床医生施用该组合物直到剂量达到实现所希望的效果的剂量。因此，组合物可以作为单剂施用，或者作为两个或多个剂量(可以含有或不含有相同量的所希望的分子)随时间施用，或者作为连续灌注液通过植入装置或导管施用。适宜剂量的其他完善可由本领域普通技术人员常规地进行并且在他们常规实施的任务的范围内。可通过使用适宜的剂量-应答数据确定合适的剂量。
药物组合物的施用途径是按照公知的方法，例如，经口，通过静脉内注射、腹膜内、脑内(实质内)、脑室内、肌内、眼内、动脉内、门脉内，或病灶内途径，通过缓释系统或者通过植入装置。在一些实施方案中，可通过大丸注射或通过连续灌注，或通过植入装置施用组合物。
也可以通过膜、海绵或其他适宜的材料的植入局部施用该组合物，在这些材料上已经吸附或包被所希望的分子。在一些实施方案中，当使用植入装置时，该装置可植入适宜的组织或器官，或者可通过扩散、定时释放的大丸剂，或者连续施用递送所希望的分子。
还希望体外使用根据本发明的抗-IL-1R1抗体药物组合物。在这些实例中，从患者除去的细胞、组织或器官被暴露于抗-IL-1R1抗体药物组合物，之后这些细胞、组织和/或器官被随后植入该患者体内。
具体地，，通过植入使用如此处描述的方法基因工程化而表达和分泌多肽的一些细胞递送抗IL-1R1抗体。在一些实施方案中，这些细胞可以是动物或人细胞，并且可以是自体的、异体的或异种的。在一些实施方案中，细胞可被永生化。在其他实施方案中，为了减少免疫应答的机会，可以将细胞胶囊化以避免周围组织的浸润。在其他实施方案中，胶囊化材料典型地为生物相容的、半透性聚合物壳或膜，其允许蛋白质产物的释放但是防止患者的免疫系统或者来自周围组织的其他有害因子对细胞的破坏。
在一些实施方案中，本发明还包括将本发明的抗IL-1R1抗体或者药物组合物与施用于同一患者的一种或多种其他药物同时施用，根据适于该药物的使用方案使用每种药物。这包括预治疗、同时治疗、顺次治疗或交替方案。这些药物的实例包括，但不限于，抗病毒剂、抗生素、镇痛剂、皮质类固醇、炎症细胞因子的拮抗剂、疾病-修饰性抗风湿病药物(DMARDs)和非类固醇消炎剂。
在其他实施方案中，本发明的抗IL-1R1抗体或药物组合物可以与其他细胞因子抑制剂组合施用，这些抑制剂包括拮抗，例如，RANKL、TGFβ、IFNγ、IL-6或IL-8和TNF，尤其TNFα的抑制剂。本发明的抗体与IL-6组合可用于治疗和预防抽搐的复发，这些抽搐包括GABAA受体拮抗诱导的抽搐、与EEG猝发相关的抽搐和癫痫状态期间发生的运动边缘系统抽搐。本发明的抗体与INFγ抑制剂组合可用于治疗自发性肺纤维样变性和囊性纤维样变性。与IL-1受体抗体和RANKL抑制剂，例如，RANKL抗体组合可用于预防各种情况的骨破坏，包括但不限于各种风湿性失调、骨质疏松、多发性骨髓瘤或导致骨退化的其他恶性肿瘤，或者针对防止向骨转移的抗肿瘤治疗，或者与假体磨损碎片或与牙周炎相关的骨破坏。此外，本发明的抗体可以与IL-17抑制剂如IL-17受体的可溶形式(如IL-17R：Fc)或者与IL-17抗体或IL-17R抗体、IL-18结合蛋白、IL-19受体的可溶形式，和IL-18抗体、针对IL-18受体的抗体或者针对CD30-配体或针对CD4的抗体组合施用。
本发明还包括使用本发明的抗IL-1R1抗体或药物组合物与TNF抑制剂，优选TNFR：Fc和上述细胞因子或细胞因子抑制剂(它们是组合治疗中的活性剂)的任一组合组合治疗此处公开的医学失调的方法。例如，根据本发明，组合治疗方法可用于治疗类风湿性关节炎、中风、哮喘、牛皮癣等。
此处描述的抗IL-1R1抗体或药物组合物可以有效治疗的病症包括肺病如哮喘、慢性阻塞性肺病、肺泡蛋白质沉积、博来霉素诱导的肺病变和纤维样变性、放射诱导的肺纤维样变性、囊性纤维样变性、肺中的胶原积累、和ARDS，所有这些都可以用针对IL-1R的抗体和IL-4抑制剂和/或IL-13抑制剂，例如抑制IL-13和IL-4活性的IL-4R抗体组合治疗。本发明公开的抗体和药物组合物也可用于治疗支气管肺发育不良(BPD)、慢性阻塞性肺病(例如，肺气肿和慢性支气管炎)，和早产儿的慢性纤维样变性肺病。此外，本发明的化合物、组合物和组合治疗可用于治疗职业性肺疾病，包括石棉肺、煤炭工人的尘肺、硅肺或与长期暴露于细小颗粒有关的类似病症。在本发明的其他方面，所公开的化合物、组合物和组合治疗用于治疗闭塞性支气管机化性肺炎(bronchioliterans organizing pneumonia)、肺纤维样变性，包括自发的肺纤维样变性和放射诱导的肺纤维样变性、肺肉样瘤病；和变态反应，包括过敏性鼻炎、接触性皮炎、特应性皮炎和哮喘。
这些组合物还可用于治疗各种皮肤失调的患者，这些皮肤失调包括但不限于疱疹样皮炎(Duhring氏病)、特应性皮炎、接触性皮炎、风疹(包括慢性自发性风疹)，和自身免疫水疱病，包括寻常天疱疮和大疱性类天疱疮。可以用IL-1R抗体和IL-4和/或IL-13抑制剂组合治疗的其他疾病包括myesthenia gravis、肉样瘤病，包括肺肉样瘤病、硬皮病、反应性关节炎、IgE过多综合症、多发性硬化和自发性嗜酸性粒细胞过多综合症。该组合物还可用于治疗对药物的变态反应和作为变态反应免疫治疗的佐剂。
此处描述的IL-1受体抗体和药物组合物用于治疗原生动物疾病，包括疟疾和血吸虫病，和治疗麻风的结节性红斑、细菌或病毒性脑膜炎、结核病，包括肺结核；细菌或病毒感染继发性肺炎和感染性单核细胞增多症。
单独用此处公开的药物组合物或抗IL-1R1抗体或者与其他细胞因子抑制剂组合可以治疗和/或防止心血管失调。可以治疗的心血管失调包括主动脉动脉瘤；包括腹部主动脉动脉瘤、急性冠状动脉综合症、动脉炎；血管阻塞，包括脑动脉阻塞；冠状动脉旁路手术并发症；局部缺血/再灌注损伤；心脏病，包括动脉粥样硬化性心脏病、心肌炎，包括慢性自身免疫心肌炎和病毒性心肌炎；心力衰竭，包括慢性心力衰竭、充血性心力衰竭、心力衰竭的恶病体质；心肌梗塞、心脏手术或颈动脉气囊血管成形术后的再狭窄和/或动脉粥样硬化；沉默性心肌局部缺血、左心室泵机能障碍、左心室辅助装置的移植后并发症、Raynaud氏现象、血栓性静脉炎、血管炎，包括川崎血管炎；静脉闭塞病、巨细胞动脉炎、Wegener氏肉芽肿病、心肺旁路手术后精神错乱，和Schoenlein-Henoch紫癜。
在一些实施方案中，本发明的抗IL-1R1抗体和药物组合物也可用于治疗慢性疼痛病症，如慢性骨盆痛，包括慢性前列腺炎/骨盆痛综合症，和疱疹后痛。
本发明的抗IL-1R1抗体和药物组合物也可用于治疗内分泌系统失调，包括青少年发作糖尿病(包括自身免疫糖尿病和胰岛素依赖的糖尿病)和成年发作糖尿病(包括非胰岛素依赖的和肥胖-介导的糖尿病)。这些治疗包括与糖尿病相关的继发性病症，如糖尿病性肥胖、糖尿病患者中肾移植排斥、肥胖-介导的胰岛素抗性，和肾衰竭，其自身可以与蛋白尿和高血压有关。用这些化合物也可以治疗其他内分泌失调，包括多囊卵巢病、X-连锁的脑白质肾上腺萎缩症、甲状腺功能不足和甲状腺炎，包括Hashimoto氏甲状腺炎(即，自身免疫甲状腺炎)、甲状腺细胞功能异常，包括甲状腺机能异常综合症。
本发明的抗IL-1R1抗体或药物组合物单独或与其他治疗剂组合可以治疗或预防胃肠道系统的病症。这些病症包括腹腔病、Crohn氏病；溃疡性结肠炎；自发性胃轻瘫；胰腺炎，包括慢性胰腺炎；急性胰腺炎、炎性肠病和溃疡，包括胃溃疡和十二指肠溃疡。
用此处描述的抗IL-1R1抗体或药物组合物也可以治疗或预防泌尿生殖系统的失调。这些失调包括肾小球性肾炎，包括自身免疫肾小球性肾炎、暴露于毒素导致的肾小球性肾炎或者溶血性链球菌或其他感染剂感染的继发性肾小球性肾炎。本发明的化合物、组合物和组合治疗还可以治疗的是尿毒症综合症及其临床并发症(例如，肾衰竭、贫血和肥大性心肌病)，包括与暴露于毒素、药物或其他原因相关的尿毒症综合症。本发明的抗体可以治疗或预防胆囊壁炎症导致吸收功能变化引起的并发症。这些并发症包括胆石病(胆结石)和胆总管石病(胆道结石)和胆石病和胆总管石病的复发。本发明的化合物、组合物和组合疗法可治疗的其他病症是血液透析并发症；前列腺病症，包括良性前列腺增生、非细菌性前列腺炎和慢性前列腺炎；和血液透析并发症。
此处还提供了使用本发明的抗IL-1R1抗体、组合物和组合治疗治疗各种血液和肿瘤疾病的方法。例如，抗IL-1R1抗体，单独地或者与上述其他细胞因子抑制剂或其他活性剂组合，可用于治疗各种形式的癌症，包括急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病、EB病毒阳性鼻咽癌、神经胶质瘤、结肠癌、胃癌、前列腺癌、肾细胞癌、宫颈癌和卵巢癌，肺癌(SCLC和NSCLC)，包括癌相关的恶病体质、疲劳、乏力、恶病体质和血钙过多的副肿瘤性综合症。实体瘤，包括肉瘤、骨肉瘤，和癌，如腺癌(例如，乳腺癌)和鳞状细胞癌也是可以治疗的。其他可治疗的癌包括esophogeal癌、胃癌、胆囊癌、白血病，包括急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病、骨髓白血病，慢性或急性成淋巴细胞白血病和毛细胞白血病。用主题化合物、组合物和组合治疗也可以治疗其他具有侵染转移潜力的恶性肿瘤，包括多发性骨髓瘤。
此外，所公开的抗-IL-1R1抗体可用于治疗贫血和血样失调，包括慢性自发性中性粒细胞减少、慢性病贫血、再生障碍性贫血，包括Fanconi氏再生障碍性贫血；自发性血小板减少性紫癜(ITP)、血栓性血小板减少性紫癜、myelodysplastic综合症(包括顽固性贫血、环状成高铁红细胞顽固性贫血、过量原始细胞顽固性贫血、转化的过量原始细胞顽固性贫血)；骨髓纤维化/骨髓外化生；和镰刀形细胞vasocclusive crisis。
本发明的抗-IL-1R1抗体也可以治疗各种淋巴增殖性失调，包括自身免疫淋巴增殖综合症(ALPS)、慢性成淋巴细胞白血病、毛细胞白血病、慢性淋巴白血病、外周T-细胞淋巴瘤、小淋巴细胞淋巴瘤、套(mantle)细胞淋巴瘤、滤泡细胞淋巴瘤、非洲淋巴瘤、EB病毒阳性T-细胞淋巴瘤、组织细胞淋巴瘤、Hodgkin氏病、扩散侵染性淋巴瘤、急性淋巴白血病、Tγ淋巴增殖病、皮肤B细胞淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤(例如，阿利贝尔氏病)和Sézary综合症。
本发明的抗体可以治疗遗传病症如Gaucher氏病、Huntington病、线性IgA病，和肌营养不良。
通过所公开的IL-1受体抗体或者药物组合物可以治疗或预防的其他病症包括头或脊髓损伤导致的病症，包括头部创伤导致的硬膜下血肿。关于该治疗，所描述的组合物和组合适于预防颅侧神经损伤和防止和治疗颈源性头痛。所描述的组合物和组合还适宜治疗与脑辐射相关的神经学上的副作用。
本发明的抗IL-1R1抗体和药物组合物还用于治疗肝脏病症如肝炎，包括急性酒精肝炎、急性药物诱导的或病毒性肝炎、甲肝、乙肝和丙肝、硬化性胆管炎、肝窦状隙上皮，和未知原因导致的肝炎症。
本发明的抗IL-1R1抗体或药物组合物可以治疗与听力损失和与异常IL-1表达有关的失调。这些失调包括耳蜗神经相关的听力损失，认为其由自身免疫过程导致，即，自身免疫神经损失。本发明的抗IL-1R1抗体或药物组合物还可以治疗或预防Meniere氏综合症和胆脂瘤、通常与听力损失有关的中耳失调。
此处描述的抗体还可以治疗骨和关节的非-关节炎性失调。这些失调包括导致骨损失的破骨细胞失调，如但不限于骨质疏松，包括绝经后骨质疏松、骨关节炎、导致牙齿松动或脱落的牙周炎，和关节替换后的假肢松动(通常与对磨损碎片的炎症反应有关)。该后一病症也称为“矫形植入骨质溶解”。本发明的化合物、组合物和组合治疗可以治疗的另一病症是暂时性下颌骨关节功能障碍(TMJ)。
本发明的抗IL-1R1抗体或者药物组合物还可用于治疗风湿性失调，包括成年人和青少年类风湿性关节炎；硬皮病、系统性红斑狼疮、痛风、骨关节炎、风湿性多肌痛、血清阴性脊椎关节病，包括关节强直性脊椎柱炎，和Reiter氏病，牛皮癣关节炎和慢性Lyme关节炎。本发明的抗体还可用于治疗随意肌和其他肌肉的炎症，包括皮肌炎、包含体肌炎、多肌炎，和淋巴管平滑肌瘤病。
本发明抗体和药物组合物的另一用途是治疗和/或预防原发性淀粉样变和继发性淀粉样变，其是各种病症的特征，这些病症包括阿尔茨海默氏病、继发反应性淀粉样变；Down氏综合症；和透析-相关的淀粉样变。本发明的抗体或药物组合物还可以治疗遗传性周期性发热综合症，包括家族性地中海发热、免疫球蛋白D过多和周期性发热综合症与TNF-受体相关的周期性综合症(TRAPS)。
在其他实施方案中，本发明的抗体或药物组合物可用于治疗皮肤或粘膜相关的失调。这些失调包括皮肤棘怪松解病，包括Darier氏病、毛囊角化和寻常天疱疮。可用本发明的抗体治疗的额外的皮肤失调包括粉刺、酒糟鼻、斑秃、口疮性口炎、大疱性类天疱疮、烧伤、湿疹、红斑，包括多形性红斑和大疱性多形性红斑(Stevens-Johnson综合症)、炎性皮肤病、扁平苔癣、线性IgA大疱病(儿童的慢性大疱性皮炎)、皮肤弹性丧失、粘膜表面溃疡，包括胃溃疡，嗜中性粒细胞皮炎(Sweet氏综合症)、皮肌炎、德佛札氏病、牛皮癣、坏疽性脓皮病、多中心网状内皮系统组织细胞瘤病和毒性表皮坏死溶解。本发明的治疗和组合治疗可以治疗的其他皮肤相关的病症包括疱疹样皮炎。
本发明的抗体或药物组合物可以治疗的额外的失调包括宿主抗移植物病，和实体器官移植，如心脏、肝脏、皮肤、肾脏、肺(肺移植气道闭塞)或其他移植，包括骨髓抑制导致的并发症。
所公开的抗-IL-1R1抗体或药物组合物也可以治疗或预防眼失调，其包括视网膜剥离，和炎性眼病，包括与吸烟和黄斑变性有关的炎性眼病。
如此处描述的抗体或药物组合物可用于治疗影响女性生殖系统的失调。实例包括，但不限于，多移植衰竭(multiple implant failure)/不育、胎儿流产综合症或IV胚胎流产(自发性流产)；惊厥前怀孕或惊厥；子宫内膜异位、慢性宫颈炎、和早产。
此外，本发明的抗体或药物组合物可用于治疗和/或预防坐骨神经痛、老化症状、严重药物反应(例如，IL-2毒性或博来霉素诱导的肺病和纤维化)，或者在心脏或其他手术中同种异型血红细胞输血之前、之间或之后抑制炎症反应，或者用于治疗四肢或关节的外伤性损伤，如外伤性膝损伤。用所公开的抗IL-1R1抗体或药物组合物可以治疗的各种其他医学病症包括：多发性硬化、Behcet氏综合症、Sjogren氏综合症、自身免疫溶血性贫血、β地中海贫血、肌萎缩性侧索硬化(Lou Gehrig氏病)、帕金森氏病、和不明原因的腱鞘炎，以及与遗传缺陷相关的各种自身免疫失调或疾病，包括x-连锁的智力迟钝。
此外，本发明的抗IL-1R1抗体或药物组合物可用于治疗中枢神经系统(CNS)损伤，包括中枢神经系统中炎症刺激过程中神经毒性神经递质释放的影响，和抑制或防止中枢神经系统损伤部位胶质疤痕的形成。关于癫痫和抽搐的治疗，本发明的抗IL-1R1抗体或药物组合物可用于减小复发性抽搐的严重性和次数，并减小抽搐的有害作用的严重性，减少神经元损失、神经元退化和与抽搐相关的神经胶质增生。
本发明的抗体或药物组合物的额外用途包括，但不限于，治疗临界疾病多发性神经病和肌病(critical illness polyneuropathy and myopathy)(CIPNM)急性多发性神经病、神经性食欲缺乏、Bell氏麻痹、慢性疲劳综合症、可遗传的痴呆，包括Creutzfeld-Jacob病；脱髓鞘神经病、Guillain-Barre综合症、脊椎间盘病、海湾战争综合症、慢性炎性脱髓鞘多发性神经病、重症肌无力、沉默脑局部缺血、睡眠失调，包括发作性睡病和睡眠呼吸暂停；慢性神经元退化；和中风，包括脑缺血病。本发明抗体的额外用途是厌食和/或厌食性病症、腹膜炎、内毒素性血症和脓毒性休克、肉芽瘤形成、热中风、Churg-Strauss综合症、急性感染后的慢性炎症如结核和麻风病、系统性硬化和肥大性瘢痕形成。
在其他实施方案中，可以构建含有本发明的IL-1R1抗体之一的氨基酸序列的抗生物素蛋白融合蛋白用于各种目的。使用例如，哺乳动物表达载体可以产生抗生物素蛋白融合蛋白，该载体含有编码与用于插入特异靶基因融合配偶体的多克隆位点邻接的重组鸡抗生物素蛋白的cDNA序列。该载体可以包括抗生物素蛋白序列与其内源信号序列，从而能够分泌不天然含有信号序列的不连续的融合基因配偶体。载体表达的融合蛋白具有融合配偶体的N-末端部分的抗生物素蛋白标记。如此处描述的融合策略能够分泌通常在细胞内表达的蛋白，如信号转导基因或核激素受体。
备选地，可以使用编码没有内源信号序列的抗生物素蛋白，其可导致融合蛋白配偶体的C-末端被标记。C-末端抗生物素蛋白融合也容许基于融合配偶体的内源信号序列的蛋白质分泌。可应用这种策略纠正蛋白质加工和折叠或者确定被提议的信号序列的有效性。此外，载体可以含有编码氨基酸序列的短核苷酸序列，该氨基酸序列可作为抗生物素蛋白和融合配偶体序列之间的特异酶切割底物。这种酶-可切割的序列允许为了纯化或蛋白质释放目的将融合配偶体与抗生物素蛋白分开。
本发明的抗生物素融合蛋白可用于，例如，抗体筛选、功能表征(确定抗体作为激动剂或拮抗剂、中和剂等的适用性)、表位作图，或免疫策略。靶蛋白的抗生物素融合也可以用于药物动力学、效能或其他标准测定法形式中，设计这些测定法是为了检验样品或临床患者样品是否在血液、尿或其他组织样品中存在治疗性抗体。可以将抗生物素蛋白融合蛋白配偶体制备为全长或截断的序列、特异分离的结构性结构域，或者作为与来自其他物种的融合配偶体的其他同系物的嵌合序列。
可以使用如此处描述的和本领域中公知的将基因导入细胞的任何一种标准方法来表达抗生物素蛋白融合蛋白。可通过在脂质，如Lipofectamine(Invitrogen，Carlsbad，CA)溶液中用抗生物素蛋白融合构建体转染细胞在例如293或CHO细胞中表达蛋白。
可收集条件培养基和/或表达融合蛋白的细胞的细胞裂解物并将其应用于测定基质，如生物素-包被的聚苯乙烯珠或生物素-包被的ELISA板。可以在允许融合蛋白最佳表达的时间点收集条件培养基和/或细胞裂解物。该时间点可以由本领域技术人员通过实验去定，但是通常为转染后约48小时。也可以分析融合蛋白在细胞膜或细胞内的表达和结合已知的配体、受体或抗体的功能性。
可以通过利用生物素-抗生物素蛋白相互作用的任一公知的或者以前表征的方法分析本发明的抗生物素蛋白融合蛋白。这些方法包括，但不限于，流式细胞术和荧光成像/显微术。例如，可将培养基中或细胞裂解物中的抗生物素蛋白融合应用于生物素-包被的珠子并用荧光标记的抗-抗生物素蛋白抗体染色以指示表达水平。而且，在多比色测定法形式中可以应用识别特定融合蛋白配偶体的荧光抗体。此外，在竞争性测定法中可以将对融合蛋白配偶体特异的未标记的抗体与荧光标记的抗体同时应用。
在一些实施方案中，本发明提供了使用抗生物素蛋白融合蛋白进行表位作图的方法。下面提供了关于抗IL-1R1抗体的表位作图的本发明的表位作图方法的一个实例。然而，本领域技术人员将认识到这些方法可容易地应用于任一抗体的表位作图并且不限于抗-IL-1R1抗体。例如，编码鸡抗生物素蛋白的cDNA(具有内源信号序列)可以与编码融合到3’末端FLAG-标记序列的目标蛋白(即被确定表位所希望的抗体识别的蛋白)的cDNA的5’末端连接。可以用常规分子技术将FLAG-标记的融合基因装配在表达载体中。可用常规技术产生一组突变的抗生物素-FLAG标记的蛋白，其中一些氨基酸已经被置换(例如，用来自另一动物物种的相应氨基酸残基置换)。可以在宿主细胞中表达突变的和野生型蛋白并使用，例如，蛋白质印迹分析或者如此处描述的基于珠子的结合测定法检测野生型或突变蛋白与目标抗体的结合。从而，通过确定突变蛋白中的哪些置换破坏了目标抗体的结合来限定表位。
实施例
提供了下面的实施例，包括所实施的实验和得到的结果，这些仅用于阐明性目的，不应被理解为限制本发明。
实施例1
产生针对白介素-1受体型1(IL-1R1)的人单克隆抗体
转基因HuMab小鼠
使用转基因小鼠HCo7品系制备针对IL-1受体型1(IL-1R1)的完全人单克隆抗体，该转基因小鼠HCo7品系表达人抗体基因。在这些小鼠品系的每一种中，已经如Chen等人(1993，EMBO J.12：811-820)描述的将内源小鼠κ轻链纯合地破坏，并且已经如国际专利申请公布号WO01/09187(并入参考文献)的实施例1中描述的将内源小鼠重链基因纯合地破坏。这些小鼠品系的每一个携带如Fishwild等人(1996，Nature Biotechnology14：845-851)中描述的人κ轻链转基因KCo5。HCo7品系携带如美国专利号5,545,806、5,625,825、和5,545,807(并入参考文献)中描述的HCo7人重链转基因。HCo7品系在此处被称为HuMab小鼠。
HuMab免疫
为产生针对IL-1R1的完全人单克隆抗体。用来自昆虫或哺乳动物细胞(例如，CHO细胞)的纯化的重组IL-1R1作为抗原免疫HuMab小鼠。HuMab小鼠的一般免疫方案在Lonberg等人(1994，Nature368：856-859；Fishwild等人，如前；和国际专利申请号WO98/24884中描述，这些文献的每一篇的教导都被并入作为参考。当第一次灌输抗原时小鼠为6-16周龄。IL-1R1抗原的纯化的重组制剂(25-50μg)(例如，从被转染的表达IL-1R1的昆虫或哺乳动物细胞纯化)用于腹膜内(IP)或皮下(Sc)免疫HuMab小鼠。
使用完全弗氏佐剂中的抗原并注射两次实现HuMab转基因小鼠的免疫，然后用不完全弗氏佐剂中的抗原腹膜内免疫2-4周(高达共11次免疫)。数打小鼠被每种抗原免疫。用IL-1R1免疫HCo7品系的共149只小鼠。通过眶后取血监视免疫应答。
为了选择结合IL-1R1的抗体的HuMab小鼠，如Fishwild等人(如前)描述的通过ELISA检验免疫小鼠的血清。简言之，将从昆虫或哺乳动物细胞纯化的重组IL-1R1溶于PBS中，浓度为1-2μg/mL，将该溶液以50μL/孔包被微量滴定板并在4℃过夜孵育，然后将微量滴定板用200μL/孔PBS/Tween(0.05％)中的5％鸡血清封闭。向每孔加入来自IL-1R1免疫的小鼠的血清稀释液并在室温孵育1-2小时。将板用PBS/Tween洗涤并用缀合辣根过氧化物酶(HRP)的山羊-抗-人IgG Fc-特异的多克隆试剂在室温下孵育1小时。将板用PBS/Tween洗涤并用缀合辣根过氧化物酶(HRP)的山羊-抗-人IgG Fc-特异的多克隆试剂在室温下孵育1小时。洗涤后，将板用ABTS底物显色(Sigma Chemical Co.，St.Louis，MO，目录号.A-1888，0.22mg/mL)并通过分光光度计在415-495nm下分析OD。用具有抗-IL-1R1人免疫球蛋白的足够效价的小鼠产生如下描述的单克隆抗体。
产生针对IL-1R1的人单克隆抗体的杂交瘤的制备
通过静脉内注射抗原强化来制备用于单克隆抗体产生的小鼠，强化后两天处死小鼠，之后除去脾脏。从HuMab小鼠分离小鼠脾细胞并通过标准方案用PEG将其与小鼠骨髓瘤细胞系融合。通常，对每种抗原实施20-30个融合。
简言之，用50％PEG(Sigma)将来自免疫小鼠的脾脏淋巴细胞的单一细胞悬浮液与P3X63-Ag8.653非分泌性小鼠骨髓瘤细胞(ATCC，记录号CRL1580)或者SP2/0非分泌性小鼠骨髓瘤细胞(ATCC，CRL1581)数目的1/4融合。将细胞以约1×105个/孔平铺在平底微量滴定板中，然后在含有10％胎牛血清、10％P388D1-(ATCC记录号CRL TIB-63)条件培养基、DMEM(Mediatech，目录号CRL10013，具有高葡萄糖、L-谷氨酰胺和丙酮酸钠)中的3-5％origen(IGEN)加5mM HEPES、0.055mM2-巯基乙醇，50mg/mL庆大霉素和1×HAT(Sigma，目录号CRLP-7185)的选择性培养基中孵育约2周。1-2周后，将细胞培养在以HT代替HAT的培养基中。
对所得杂交瘤筛选抗原-特异抗体的产生。通过ELISA对每个孔筛选人-抗-IL-1R1单克隆IgG抗体。一旦发生大范围的杂交瘤生长，通常在10-14天后监视培养基。将分泌抗体的杂交瘤再次涂板，再次筛选，如果对人IgG仍然阳性，那么通过有限稀释将抗IL-1R1单克隆抗体亚克隆至少2次。体外培养稳定的亚克隆以在组织培养基中产生少量抗体用于鉴定。
选择结合IL-1R1的人单克隆抗体
如上述的ELISA测定法被用于筛选与IL-1R1免疫原表现出阳性反应性的杂交瘤。对分泌高亲和性结合IL-1R1的单克隆抗体的杂交瘤亚克隆并进一步鉴定。为每种杂交瘤选择一个保留亲本细胞反应性(通过ELISA确定)的克隆以制备5-10个小瓶细胞库，将其保存在液氮中。
如此处公开的实施同种型-特异的ELISA以确定产生的单克隆抗体的同种型。在这些实验中，将微量滴定板孔用50μL溶液/孔包被，该溶液为溶于PBS中的1μg/ml小鼠抗-人κ轻链，并将板在4℃过夜孵育。用5％鸡血清封闭后，将板与每种受试单克隆抗体的上清液和纯化的同种型对照反应。将板在室温下孵育1-2小时。然后将孔与人IgG1、IgG2或IgG4-特异的辣根过氧化物酶-缀合的山羊-抗人多克隆抗血清反应并将板显色并如下描述的进行分析。
通过ELISA检测从杂交瘤上清液纯化的表现出对IL-1R1的显著结合的单克隆抗体，用体外结合测定法和基于人软骨细胞和全血细胞的测定法试验这些单克隆抗体的生物学活性。表现出最佳活性的抗体被指定为15C4、26F5、27F2、24E12、和10H7。对抗体实施初步表位分选实验。将ELISA板用人sIL-1R1(1+2+3结构域)、截断的人sIL-1R1(1+2结构域)、大鼠sIL-1R1、人sIL-1R型II和卵白蛋白(负对照)包被。用缀合辣根过氧化物酶的抗-人Fc抗体(Pierce Chemical Co.，Rockford，IL)检测抗体结合。结果概述于表2。表2中的勾号(√)代表结合的阳性结果；“×”代表阴性结果。抗体15C4、26F5、27F2和24E12仅结合具有所有三个胞外结构域的IL-1R1蛋白，表明每一种抗体的表位都落在第三个结构域内。抗体10H7结合全长胞外结构域IL-1R1和仅有结构域1和2的截断的蛋白，表明该抗体的表位位于结构域1或2内。所试验的抗体都没有与人II型受体或大鼠IL-1R1的交叉反应性。
表2
实施例2
通过抗IL-1R1抗体体外抑制IL-1受体型1复合体形成
在测定法中用重组蛋白体外评估抗体抑制IL-1信号化所需的胞外结合事件的能力，在该测定法中，IL-1对IL-1R的结合导致形成IL-1RAcP的高亲和性结合位点。如下测量IL-1RAcP与IL-1-结合的IL-1R的结合(称为“复合体形成”)。在结合测定法中，不存在(对照)或存在抗体时，在微量滴定板中孵育重组蛋白。将对照值与存在浓度为10fM到1μM的抗体时所得值比较得到IC50值。简言之，如下实施测定法。将生物素化IL-1R1和链霉抗生物素蛋白-包被的珠子(Dynal，Dynabeads M-28)分散在微量滴定板中。然后将抗体的宽范围浓度的连续稀释液加入适宜的孔中。IL-1β或IL-1α以1nM浓度加入，用钌标记的IL1RAcP(根据IGEN方案用NHS-Tag(IGEN)制备)以5nM的终浓度加入。室温下孵育1小时后，用ORIGENTM1.5或M8仪器(IGEN International Inc.)分析结合反应。通过与IL-1R1结合珠子相关的电化学发光信号确定IL-1RAcP对IL-1结合的IL-1R1的结合。IL-1或IL-1RAcP结合的抗体竞争导致的信号减弱被计算为最大结合(无竞争)的ECL信号的百分比。
用PRISMTM软件建立这些结合测定法中每种抗体的抑制应答曲线并得到IC50。通过图12中的图描绘IL-1β诱导的结合事件的抑制结果。在下面的表3中显示了抑制复合体形成的IC50。抗体15C4、26F5、27F2和24E12强烈抑制复合体形成。这些抗体都是IL-1R1第三结构域结合剂，如上述。抗体10H7属于一类抗体，其结合缺少第三结构域的IL-1R的构建体。10H7是比第三结构域结合剂稍弱的IL-1驱动的IL-1RAcP结合的抑制剂。将通过本发明的抗体产生的复合体形成抑制与IL-1ra抑制比较。第三结构域结合剂抑制复合体形成的能力与IL-1ra类似或稍强。
图13描绘了抗体15C4抑制IL-1R1/IL-1α/RAcP复合体形成的能力。IL-1R1/IL-1α/RacP复合体形成的IC50是43pM。
表3
实施例3抗-IL-1R1抗体抑制IL-1β和IL-1ra对受体的结合
用重组蛋白在测定法中评估抗-IL-1R1抗体抑制IL-1β或IL-1ra与IL-1R1结合的能力。反应混合物含有0.1mg/mL Dynabeads M-280链霉抗生物素蛋白(Dynal)和1nM生物素化IL-1R1。加入浓度为320nM到0.3nM的抗体。钌标记的IL-1β(5nM)或IL-1ra(1nM)的加入启动结合，该结合在室温下进行1h。如上使用ORIGENTM1.5或M8仪器(IGEN InternationalInc.)测量反应混合物。竞争被计算为最大结合(无竞争)的ECL信号的百分数。抗体15C4、26F5和27F2是最强的抗体，它们阻断配体(IL-1β)与受体的结合，但是与IgG对照相比不显著干扰IL-1ra的结合。相比，抗体24E12结合受体但是不阻断IL-1β或IL-1ra与受体的结合。从而，抗体24E12代表与15C4、26F5和27F2所代表的类别不同的独特类别的第三结构域结合剂。抗体10H7抑制IL-1β和IL-1ra与受体的结合。结果在图14中总结。
实施例4
软骨细胞和人全血测定法
将原代人软骨细胞(Cell Applications Inc.，San Diego，CA)以10,000个细胞/孔的密度接种在96-孔板中，孔中含有含1％FBS和1％PenStrep(GIBCO)的DMEM培养基。让细胞过夜恢复，然后在20分钟内加入浓度为10nM到0.1pM的抗-IL1-R1抗体。加入IL-1β至浓度为1pM(～EC50)并在37℃孵育16小时后收获培养上清液。使用ELISA(Pierce-Endogen，Rockford，IL，Cat#EH2IL-65)根据生产商的使用说明书测量上清液中的IL-6水平。使用PRISM软件为基于细胞的测定法中本发明的每种抗体建立抑制应答曲线并得到IC50值。与IL-1ra相比，抗体15C4、26F5和27F2是IL-1信号化的强烈抑制剂(图15A)。抗体24E12和10H7明显比15C4和27F2弱(图15B)。在表4A和4B中显示了人软骨细胞对IL-1β诱导的IL-6产生的抑制的IC50值(分别相应于图15A和15B)。
将抗IL-1R1单克隆抗体15C4、26F5和27F2与人全血细胞预孵育40-60分钟，该全血细胞从正常志愿者收集并溶于肝素钠真空容器(vacutainers)中。如下实施测定法：将100μl新鲜分离的血液等分到96孔板的孔中。向含有10％人AB血清的RPMI培养基加入50μL抗体。然后以30pM(EC50)的浓度加入IL-1β。18小时后收获培养上清液，并使用ELISA测量上清液中的IL-6水平。作为对照，将IL-1ra与全血预孵育40-60分钟，并如上测量IL-6的产生。三种抗-IL-1R1抗体封闭IL-1活性的有效性与IL-1ra的相当(图16)。在表5中显示了人全血中IL-1诱导的IL-6产生的抑制的IC50值。
表4A
表4B
表5
实施例5诱变和表位作图
使用IL-1R1的定点诱变(Al tered Sites In Vitro Mutagenesis System，Promega，Madison WI)制备一组突变的蛋白(“突变蛋白”)，其中大鼠氨基酸残基被相应的人序列置换。构建了15种不同的突变质粒(见图17中编号的横条)。编码这些置换蛋白和亲本IL-1R1的质粒被瞬时转染到CHO细胞中。产生假转染子作为阴性对照。用Centriprep10浓缩柱(Amicon)将来自这些细胞的条件培养基(CM)浓缩约20倍。通过SDS-PAGE和蛋白质印迹评估突变蛋白的表达。13种突变蛋白的表达水平允许评价抗体结合。将蛋白质加到凝胶、电泳并转移到膜。将膜在溶于PBS和0.1％Tween-20的1％奶封闭然后在室温下用溶于PBS和0.1％Tween-20的0.5μg/mL抗IL-1R抗体15C4、27F2、或24E12孵育1小时。洗涤后，将膜用山羊抗-人IgG-Fc-HRP孵育。使用化学发光(ECL)底物(Pierce Chemical Co.，Rockford，IL)检测信号。对抗体结合关键的人特异序列被鉴定为当用大鼠序列置换时ECL信号减弱或消除的那些序列。与24E12相比，15C4对突变体1、2、4和10的识别被削弱(图18，顶栏)。类似地，27F2对1、2和4的识别被削弱(图18，中间栏)。24E12对突变体12、13、14和15没有显著结合(图18，底部栏)。
对人抗-IL-1R1抗体的分离和表征已经鉴定了三种不同类的竞争性抗体(图19)。IL-1生物活性的最强烈的抑制剂(如通过基于细胞的生物测定阐明的)为结合IL-1R1的第三结构域并且防止IL-1-β解离的那些抗体。用一组第三结构域突变蛋白质实施表位作图实验，该实验表明这类抗体(包括15C4、27F2和26F5)具有重叠但是不相同的构象表位。图20和21在IL-1ra结合的IL-1受体的带状图(Schreuder等人，1997，Nature386：194-200).中阐明了IL-1受体的第三结构域上15C4表位的位置，定义最强的抗体类结合的IL-1受体残基以灰色图解。这些抗体已经表现了优良的效价，从而这些表位限定了优良类别抗体的结合位点。15C4和27F2结合位点是重叠但不是相同的，如通过上述IL-1R1中15种不同位点的突变分析所确定的。位点在图17中描绘为蛋白质序列上带编号的横条。相互作用的关键位点似乎在位点1(LSDIA；SEQ ID NO：41)、2(VIDE；SEQ ID NO：42)、4(YSV)和10(TCFA；SEQ ID NO：43)的突变内。15C4和27F2结合位点包含在位点1和2内，因为在任一位点内用人残基置换大鼠残基都消除了结合。27F2与15C4的不同之处在于在位点4完全消除其结合，而15C4结合被减弱而不是完全除去。突变10也减弱15C4结合，但是27F2与该位点没有明显的相互作用。晶体结构的检查揭示这些残基限定第三结构域的一面，该面指向被结合的配体所占据的空间(图20和21)(Vigers等人，1997，Nature386：190-194)。
所鉴定的第二类抗体的代表是10H7，这类抗体不需要第三结构域用于结合，并且不像优选的类，抑制IL-1ra结合。该类在生物测定中有活性，但是比优选的类别弱。
相比在生物测定中优选类别的抗体强烈抑制IL-1，24E12在生物测定中是无效抑制剂。抗体24E12抑制IL-1RAcP与IL-1-结合的IL-1R的结合。这类抗体的表位(通过突变体12、13、14和15限定)与IL-1R1的跨膜结构域接近，并且位于与IL-1和IL-1ra结合不直接相关的区域内(图22)。
实施例6克隆抗IL-1R1抗体的重链和轻链
抗-IL-1R115C4MAb轻链的克隆
将三种杂交瘤表达的结合αIL-1R1的单克隆抗体15C4、27F2和26F5的轻链克隆到哺乳动物细胞表达载体pDSRα19中(见国际专利申请公布号WO90/14363，其在此处为了任何目的被并入作为参考)。在此处清楚地描述了编码15C4κ轻链的质粒的构建；用类似方法实施其他轻链种类的克隆。用试剂(Invitrogen)制备αIL-1R1杂交瘤15C4总RNA，然后制备第一条链cDNA，用聚合酶链式反应(PCR)扩增方法从该第一条链cDNA得到αIL-1R1κ轻链可变区。用GeneRacerTM试剂盒(Invitrogen)，使用具有延伸接合体(adaptor)的随机引物(5′-GGC CGG ATA GGC CTC CAN NNNNNT-3′；SEQ ID NO：44)和5’RACE(cDNA末端的快速扩增)合成第一条链cDNA。对于全部轻链，正向引物是GeneRacerTM嵌套引物(5′GGA CACTGA CAT GGA CTG AAG GAGTA-3′；SEQ ID NO：45)并且反向引物是5′-GGG GTC AGG CTGGAA CTG AGG-3′(SEQ ID NO：46)。将RACE产物克隆到pCR4-TOPO(Invitrogen)中并确定DNA序列。15C4κ链共有DNA序列用于设计进行全长抗体链PCR扩增的引物。5’κPCR引物编码信号序列的氨基末端、XbaI限制酶位点，和优化的Kozak序列(5′-CAG CAG AAG CTT CTA GACCAC CAT GTC GCC ATC ACA ACT CAT TGGG-3′；SEQID NO：47)。3’引物编码羧基末端和终止密码子，以及SalI限制性位点(5′-CTT GTC GAC TCA ACA CTC TCC CCT GTT GAA GCTC-3′；SEQ ID NO：48)。
5’αIL-1R115C4kappa primer(SEQ ID NO：47)：
5’-CAG CAG AAG CTT CTA GAC CAC CAT GTC GCC ATC ACA ACT
XbaI Kozak M S P S Q L
CAT TGG G-3’
I G(SEQ ID NO：49)
3’αIL-1R115C4kappa primer(SEQ ID NO：48)：
5’-CTT GTC GAC TCA ACA CTC TCC CCT GTT GAA GCT C-3’
SalI * C E G R N F S(SEQ ID NO：50)
用pCR4：15C4κ克隆并使用5’和3’αIL-1R115C4κ引物通过PCR扩增克隆得到全长αIL-1R115C4κ链克隆。PCR反应产生了733个碱基对的产物，其编码αIL-1R115C4κ链的233个氨基酸残基(包括19个氨基酸的κ链信号序列)。用QIAquick PCR纯化试剂盒(QiagenCat.No.28104)纯化PCR产物，将其用Xba I和SalI切割、凝胶分离并用QIAquick凝胶提取试剂盒(Qiagen Cat.No.28704)纯化。该PCR片段含有完整αIL-1R115C4κ链，将该PCR片段连接到哺乳动物表达载体pDSRα19中。对15C4κ链表达克隆进行DNA测序以确定该克隆编码15C4杂交瘤中鉴定的相同肽。最终表达载体pDSRα19：15C4κ为5468个碱基对并含有表6中描述的7个功能区。
表6
质粒碱基对编号：
构建pDSR19：hIgG1CH
构建pDSRα19：大鼠可变区/人恒定区IgG1(rVh/hCh1)Mab表达质粒，构建过程是将具有Xba1和BsmBI末端的大鼠抗体可变区PCR产物、人IgG1恒定区(CH1、铰链、CH2和CH3结构域)和具有XbaI和Sa1I末端的线性化pDSRa19连接，其中人IgG1恒定区是通过将线性质粒pDSRα19：hIgG1 CH(HindIII和BsmBI末端)的BsmBI和SalI片段用SalI切割并凝胶分离得到(见共有的和共同待决的2002年4月5日提交的美国临时专利申请号60/370,407，“作为选择性OPGL途径抑制剂的人抗-OPGL中和抗体”，将其并入参考文献)。最终表达载体pDSRα19：大鼠可变区/人恒定区IgG1(rVh/hCh1)为6158个碱基对并且含有表7中描述的7个功能区。
表7
质粒碱基对编号：
用限制酶XbalI和BsmBI消化pDSR19：大鼠可变区/人恒定区IgG1质粒除去大鼠可变区并用QIAquick凝胶提取试剂盒纯化制备线性质粒pDSRα19：hIgG1CH。线性质粒pDSRα19：hIgG1CH含有1kbp人IgG1恒定区结构域，该质粒被用于接受从杂交瘤得到的αIL-1R抗体可变区。
克隆抗-IL1-R115C4MAb重链
将十种杂交瘤表达的结合αIL-1R1的单克隆抗体15C4、27F2和26F5的重链克隆到哺乳动物细胞表达载体pDSRα19中。已经清楚地描述了编码15C4重链的质粒的构建；用类似方法实施其他重链种类的克隆。用试剂从αIL-1RI杂交瘤15C4制备总RNA，然后制备第一条链cDNA，用PCR扩增方法从该第一条链cDNA得到αIL-1R115C4重链可变区。用GeneRacerTM试剂盒，使用具有延伸接合体的随机引物(5′-GGC CGG ATA GGC CTC CANNNNNNT-3′；SEQ ID NO：44)和5’RACE(cDNA末端的快速扩增)合成第一条链cDNA。对于部分长度重链，正向引物是GeneRacerTM嵌套引物(5′GGA CAC TGA CAT GGA CTG AAG GAGTA-3′；SEQ ID NO：45)并且反向引物是5′-TGA GGA CGC TGA CCA CAC G-3′(SEQ ID NO52.)。将RACE产物克隆到pCR4-TOPO中并确定DNA序列。15C4重链可变区共有DNA序列用于设计重链可变区PCR扩增的引物。5’重链PCR引物编码信号序列的氨基末端、XbaI限制酶位点，和优化的Kozak序列(5′-CAG CAG AAG CTT CTA GAC CAC CAT GGG GTC AAC CGC CAT CCT CG-3′；SEQ ID NO：53)。3’引物编码可变区的羧基末端，包括天然发生的有义链BsmBI位点(5′-GTGGAG GCA CTA GAG ACG GTG ACC AGG GTTCC-3′；SEQ ID NO：54)。
5’αIL-1R1 15C4 重链引物 (SEQ ID NO：53)：
5’-CAG CAG AAG CTT CTA GAC CAC C ATG GGG TCA ACC GCC
XbaI Kozak M G S T A
ATC CTCG-3’
I L(SEQ ID NO：55)
3’αIL-iR1 15C4 重链引物 (SEQ ID NO：54)：
5’-GTG GAG GCA CTA GAG ACG GTG ACC AGG GTT CC-3’
T S A S S V T V L T G(SEQID NO：56)
BsmBI
抗-IL1-R1IgG1重链表达克隆的构建
用pCR4：15C4重链克隆并使用5’和3’αIL-1R115C4重链引物通过PCR扩增得到全长αIL-1R115C4重链克隆。PCR反应产生了442个碱基对的产物，其编码αIL-1R115C4重链可变区的137个氨基酸残基(包括19个氨基酸的重链信号序列)。用QIAquick PCR纯化试剂盒纯化PCR产物，将其用XbaI和BsmBI切割、凝胶分离并用QIAquick凝胶提取试剂盒纯化。将含有完整αIL-1R115C4重链可变区的连接到哺乳动物表达载体pDSRα19：hIgG1CH中。对15C4重链IgG1表达克隆进行DNA测序以确定该克隆编码和在15C4杂交瘤中鉴定的相同的重链可变区肽。最终表达载体pDSRα19：15C4IgG1重链为6173个碱基对并含有表8中描述的7个功能区。
表8
质粒碱基对编号：
构建pDSR19：hIgG2CH
构建pDSRα19：人可变区/人恒定区IgG2(hVh/hCh2)Mab表达质粒，构建过程是将具有Xbal和BsmBI末端的人抗体可变区PCR产物、人IgG2恒定区(CH1、铰链、CH2和CH3结构域)的具有BsmBI和SalI末端的PCR产物和具有XbaI和SalI末端的线性化pDSRa19连接。最终表达载体pDSRα19：人可变区/人恒定区IgG1(hVh/hCh2)(见共有的和共同待决的2002年4月5日提交的美国临时专利申请号60/370,407，“作为选择性OPGL途径抑制剂的人抗-OPGL中和抗体”，将其并入参考文献)为6164个碱基对并且含有表9中描述的7个功能区。
表9
质粒碱基对编号：
用限制酶XbalI和BsmBI消化pDSR19：人可变区/人恒定区IgG2质粒除去人可变区并用QIAquick凝胶提取试剂盒纯化制备线性质粒pDSRα19：hIgG2CH。线性质粒pDSRα19：hIgG2CH含有1kbp人IgG2恒定区结构域，该质粒被用于接受从杂交瘤得到的αIL-1R抗体可变区。
抗-IL1-R1IgG2重链表达克隆的构建
如上面描述的，将αIL-1R115C4重链可变区片段连接到哺乳动物表达载体pDSRα19：hIgG2CH中。对15C4重链IgG2表达克隆进行DNA测序以确定该克隆编码与在15C4杂交瘤中鉴定的相同的重链可变区肽。最终表达载体pDSRα19：15C4IgG2重链为6161个碱基对并含有表10中描述的7个功能区。
表10
质粒碱基对编号：
构建pDSR19：hIgG4CH
构建pDSRα19：人可变区/人恒定区IgG4(hVh/hCh4)Mab表达质粒，构建过程是将具有Xbal和BsmBI末端的人抗体可变区PCR产物、用BsmBI和SalI消化并凝胶分离的人IgG4恒定区(CH1、铰链、CH2和CH3结构域)片段和具有XbaI和SalI末端的线性化pDSRa19连接。最终表达载体pDSRα19：人可变区/人恒定区IgG4(hVh/hCh4)(见共有的和共同待决的2002年4月5日提交的美国临时专利申请号60/370,407，“作为选择性OPGL途径抑制剂的人抗-OPGL中和抗体”，将其并入参考文献)为6167个碱基对并且含有表11中描述的7个功能区。
表11
质粒碱基对编号：
用限制酶XbalI和BsmBI消化pDSR19：人可变区/人恒定区IgG4质粒除去人可变区并用QIAquick凝胶提取试剂盒纯化制备线性质粒pDSRα19：hIgG4CH。线性质粒pDSRα19：hIgG4CH含有1kbp人IgG4恒定区结构域，该质粒被用于接受从杂交瘤得到的αIL-1R抗体可变区。
抗-IL1-R1IgG4重链表达克隆的构建
如上面描述的，将αIL-1R115C4重链可变区片段连接到哺乳动物表达载体pDSRα19：hIgG4CH中。对15C4重链IgG4表达克隆进行DNA测序以确定该克隆编码与在15C4杂交瘤中鉴定的相同的重链可变区肽。最终表达载体pDSRα19：15C4IgG4重链为6164个碱基对并含有表12中描述的7个功能区。
表12
质粒碱基对编号：
实施例7在中国仓鼠卵巢(CHO)细胞中表达抗-IL-1R1抗体
如美国专利号6,210,924(并入参考文献)所描述的在中国仓鼠卵巢细胞，特别在CHO AM-1/D中产生重组抗-IL-1R1抗体。简言之，将编码抗-IL-1R1抗体的完整重链和轻链的DNA序列克隆到表达载体中。用能够表达适宜的抗IL-1R1抗体的完整重链的表达载体和表达该抗体的完整轻链的表达载体共转染CHO AM-1/D细胞。例如，为了产生26F5抗体，用能够表达含有如SEQ ID NO：38中提出的氨基酸序列的完整轻链的载体和能够表达含有如SEQID NO：20、SEQ ID NO：22或SEQ ID NO：24中提出的氨基酸序列的完整重链的载体共转染细胞。为了产生27F2抗体，用能够表达含有如SEQ ID NO：38中提出的氨基酸序列的完整轻链的载体和能够表达含有如SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：28或SEQ ID NO：30中提出的氨基酸序列的完整重链的载体共转染细胞。为了产生15C4抗体，用能够表达含有如SEQ ID NO：40中提出的氨基酸序列的完整轻链的载体和能够表达含有如SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：34或SEQ ID NO：36中提出的氨基酸序列的完整重链的载体共转染细胞。表13概述了各种IL-1R1抗体的完整重链和完整轻链。名称“.../IgG_”描述具体抗体的恒定区序列。
表13
用表达载体共转染二氢叶酸还原酶缺陷型(DHFR-)CHO AM-1/D细胞实现抗-IL-1R1抗体的稳定表达。用标准技术(磷酸钙共沉淀)和DHFR选择实施转染。分离转染的菌落并使其在24孔板中生长到汇合。检验转染细胞所产生的抗体的适当折叠和中和活性。选择过量产生适当折叠的IgG1、IgG2和IgG4同型的抗IL-1R1抗体的克隆并如下描述的纯化抗体。
实施例8抗IL-1R1抗体的产生
通过CHO细胞的克隆系中表达产生抗IL-1R1抗体。对于每个产生试验，将来自单个小瓶的细胞在无血清的细胞培养基中解冻。细胞最初生长在T型烧瓶中，并通过一系列旋转烧瓶连续放大直到产生足够接种物接种20L生物反应器。生长5-10天后，将培养物用于接种300L生物反应器。再生长5-10天后，培养物用于接种2000L生物反应器。用补料分批培养基在2000L生物反应器中实施生产，其中加入含有浓缩培养基组分的营养料以维持细胞生长和培养物生活力。生产持续约2周，在该期间内抗-IL-R1抗体被细胞组成性地产生并分泌到细胞培养基中。
生产反应器被控制在固定pH、温度和溶解氧水平：通过二氧化碳气体和碳酸钠加入控制pH；通过空气、氮气和氧气流控制溶解氧。
在生产末，将细胞培养液加到盘式离心机(diskstack centrifuge)并使培养上清液与细胞分离。将浓缩物通过深度过滤器然后通过0.2μm滤器进一步澄清。然后通过切向流超滤浓缩澄清的条件培养基。该条件培养基被浓缩15-30倍。然后将所得浓缩的条件培养基纯化或者冰冻后用于以后的纯化。
实施例9
用抗生物素蛋白-融合蛋白进行表位作图
为了产生抗生物素蛋白-融合蛋白，将编码鸡抗生物素蛋白的cDNA(具有内源信号序列)与编码在3’端融合FLAG-标记序列的人或猕猴IL-1R1的成熟胞外结构域的cDNAs的5’末端连接。用常规分子技术将FLAG-标记的融合基因装配在pALTERMAX载体中。抗生物素蛋白-人IL-1R1融合蛋白的氨基酸序列在图23中显示(SEQ ID NO：59)。抗生物素蛋白-猕猴IL-1R1融合蛋白的氨基酸序列在图24中显示(SEQ ID NO：60)。用改变的位点II哺乳动物体外诱变系统(Altered Sites II Mammal ian In Vitro Mutagenes is System)(PromegaCorp.)产生一组突变的抗生物素蛋白-cynoIL-1R1-FLAG蛋白，其中人氨基酸被相应猕猴残基置换。突变在图24中阐明。
用Cytofectine转染试剂(Bio-Rad Laboratories，Inc.)将编码抗生物素蛋白-cynoIL-1R突变体和野生型蛋白以及抗生物素蛋白-huIL-1R1-FLAG蛋白的质粒瞬时转染到293T细胞中。假转染子用作阴性对照。通过蛋白质印迹和基于珠子的结合测定法，使用从被转染的细胞收获的条件培养基(CM)分析这些蛋白与抗-huIL-1R1单克隆抗体(MAb)的结合。
对于蛋白质印迹分析，将CM以1：3在非还原性SDS样品缓冲液中稀释，煮沸5-10分钟并加到10％Tris-甘氨酸凝胶中。SDS-PAGE和蛋白质转移后，将膜用PBS/0.1％Tween-20(PBST)中的3％BSA/1％卵清蛋白封闭并用抗-huIL-1R1Mab染色。以1∶15,000在PBST中稀释的山羊抗-人IgG-Fc-HRP抗体(Pierce Chemical Co.)用于次级检测。抗-FLAG检测用于对蛋白质加样标准化。用FluorChem8000数字成像系统(Alpha Innotech Corp.)实施图像捕捉和光密度分析。将抗-huIL-1R1MAb的信号强度对抗-FLAG抗体的值标准化以解决蛋白质加样中的差异。抗体结合表达为对抗生物素蛋白-人IL-1R1-FLAG的结合百分数。
图25A中显示了蛋白质印迹的结果。图25B显示了一式两份蛋白质印迹试验的光密度分析。对抗体结合关键的人残基是当置换成cyno-IL-1R1时恢复信号的那些人残基。通常，突变1和2(图24中阐明)单独或者组合可以恢复对许多抗体(15C4/IgG2、5B8、1C2、24H2、16E9、26E4和20G1)的结合而突变10.1和10.2却不能。这些抗体都不结合野生型cynoIL-1R1。两种抗体(27F2和19C8)总是结合所有突变蛋白以及野生型cynoIL-1R1。这表明表位4(cynoIL-1R的残基Y279-V281)是这些抗体的优势表位，其中表位4在大鼠/人共生同源蛋白中鉴定并且在猕猴IL-1R1中没有改变。表位4在图24所示氨基酸序列中被粗体化、斜体化和下划线化。
在多重基于珠子的结合测定中，将CM与生物素-包被的荧光珠孵育以捕获抗生物素蛋白融合蛋白，每种融合蛋白一套珠子(Beadlyte Multi-Biotin10plex Bead试剂盒；Upstate Biotechnologies)。洗涤珠子并将其在PBST中合并并等分到96-孔滤器底板(Millipore Corp.)的孔中。以25μg/ml加入抗体(抗-huIL-1R1MAbs或抗-FLAG-MAb)并孵育1小时。再次洗涤珠子并用藻红蛋白-缀合的抗-小鼠IgG抗体和抗-人IgG(Fab’)2的混合物检测抗体结合。孵育1小时后，洗涤珠子并将其重悬在PBST中。用Luminex100(LuminexCorp)测量平均荧光强度(MFI)。用MFI值标准化抗-FLAG MAb结合数据以解决蛋白质加样中的差异。抗体结合表达为结合抗生物素蛋白-huIL-1R1-FLAG的百分数(图26)。抗-IL-1R1抗体与用人残基突变的抗生物素蛋白-cynoIL1R1-FLAG蛋白以及野生型猕猴和人IL-1R1蛋白的结合模式与图25中所示的免疫印迹分析一致。
应该理解前面的公开着重于本发明的一些特定实施方案并且它们的所有修饰或备选等价方案都在所附权利要求书中提出的本发明的精神和范围之内。

Claims (28)

1.分离的核酸分子，其编码特异结合白介素-1受体型1，IL-1R1，的人抗体或其抗原结合片段，并且包含：
(a) 编码人重链框架区的核苷酸序列、编码由SEQ ID NO: 63组成的重链CDR1区的核苷酸序列、编码由SEQ ID NO: 66组成的重链CDR2区的核苷酸序列、和编码由SEQ ID NO:69组成的重链CDR3区的核苷酸序列；和
(b) 编码人轻链框架区的核苷酸序列、编码由SEQ ID NO: 71组成的轻链CDR1区的核苷酸序列、编码由SEQ ID NO: 73组成的轻链CDR2区的核苷酸序列、和编码由SEQ ID NO:75组成的轻链CDR3区的核苷酸序列。
2.分离的核酸分子，其包含编码特异结合白介素-1受体型1，IL-1R1，的人抗体或其抗原结合片段的核苷酸序列，其中所述抗体或其片段包含：
(a) 由SEQ ID NO: 15编码的氨基酸序列的重链可变区，或分别为SEQ ID NO: 63、SEQID NO: 66和SEQ ID NO: 69的氨基酸序列的重链CDR1、CDR2和CDR3；和
(b) 由SEQ ID NO: 17编码的氨基酸序列的轻链可变区，或分别为SEQ ID NO: 71、SEQID NO: 73和SEQ ID NO: 75的氨基酸序列的轻链CDR1、CDR2和CDR3。
3.权利要求2所述的分离的核酸分子，其中所述分离的核酸分子包含编码特异结合IL-1R1的抗体的重链可变区和轻链可变区的核酸序列的组合，所述组合分别包含：SEQ ID NO:85和SEQ ID NO: 86的核苷酸序列。
4.分离的核酸分子，其包含编码特异结合IL-1R1的人抗体的核苷酸序列，其中所述抗体包含具有重链可变区或其抗原结合片段的重链，其中所述重链可变区与由SEQ ID NO:85编码的氨基酸序列一致，并且其中所述抗原结合片段包含分别为SEQ ID NO: 63、SEQ IDNO: 66和SEQ ID NO: 69的氨基酸序列的重链CDR1、CDR2和CDR3，并且其中所述抗体包含具有轻链可变区或其抗原结合片段的轻链，其中所述轻链可变区与由SEQ ID NO: 86编码的氨基酸序列一致，并且其中所述抗原结合片段包含分别为SEQ ID NO: 71、SEQ ID NO: 73和SEQ ID NO: 75的氨基酸序列的轻链CDR1、CDR2和CDR3。
5.权利要求1－4中任一项所述的分离的核酸分子，其中所述核酸分子编码的抗体为IgG2抗体。
6.权利要求1－4中任一项所述的分离的核酸分子，其中所述核酸分子编码的抗体为全人抗体。
7.表达载体，其包含权利要求1－6中任一项所述的核酸分子。
8.分离的宿主细胞，其包含权利要求7所述的表达载体。
9.权利要求8所述的宿主细胞，其为真核细胞。
10.权利要求8所述的宿主细胞，其为原核细胞。
11.细胞系，其包含权利要求8所述的表达载体。
12.制备特异结合IL-1R1的抗体的方法，包括在宿主细胞中表达权利要求1－6中任一项所述的核酸。
13.制备特异结合IL-1R1的抗体的方法，包括培养权利要求9或10所述的宿主细胞。
14.制备特异结合IL-1R1的抗体的方法，包括培养权利要求11所述的细胞系。
15.一组核酸分子，其编码特异结合IL-1R1的人抗体或其抗原结合片段并且包含：
(a) 第一核酸分子，其编码人重链框架区、编码SEQ ID NO: 63的人重链CDR1区的核苷酸序列、编码SEQ ID NO: 66的人重链CDR2区的核苷酸序列、和编码SEQ ID NO: 69的人重链CDR3区的核苷酸序列；和
(b) 第二核酸分子，其编码人轻链框架区、编码SEQ ID NO: 71的人轻链CDR1区的核苷酸序列、编码SEQ ID NO: 73的人轻链CDR2区的核苷酸序列、和编码SEQ ID NO: 75的人轻链CDR3区的核苷酸序列。
16.一组核酸分子，其编码特异结合IL-1R1的人抗体或其抗原结合片段并且包含：
(a) 第一核酸分子，其编码由SEQ ID NO: 15编码的氨基酸序列的人抗体重链可变区，或SEQ ID NO: 63、SEQ ID NO: 66和SEQ ID NO: 69的氨基酸序列的重链CDR1、CDR2和CDR3；和
(b) 第二核酸分子，其编码由SEQ ID NO: 17编码的氨基酸序列的人抗体轻链可变区，或SEQ ID NO: 71、SEQ ID NO: 73和SEQ ID NO: 75的氨基酸序列的轻链CDR1、CDR2和CDR3。
17.权利要求15或16所述的一组核酸分子，其中第一核酸分子编码重链可变区并包含SEQ ID NO: 85的核苷酸序列，而第二核酸分子编码轻链可变区并包含SEQ ID NO: 86的核苷酸序列。
18.一组核酸分子，其编码特异结合IL-1R1的人抗体或其抗原结合片段并且包含：
(a) 第一核酸分子，其编码具有重链可变区或其抗原结合片段的人抗体重链，其中所述重链可变区与由SEQ ID NO: 85编码的氨基酸序列一致，并且其中所述抗原结合片段包含分别为SEQ ID NO: 63、SEQ ID NO: 66和SEQ ID NO: 69的氨基酸序列的重链CDR1、CDR2和CDR3；和
(b) 第二核酸分子，其编码具有轻链可变区或其抗原结合片段的人抗体轻链，其中所述轻链可变区与由SEQ ID NO: 86编码的氨基酸序列一致，并且其中所述抗原结合片段包含分别为SEQ ID NO: 71、SEQ ID NO: 73和SEQ ID NO: 75的氨基酸序列的轻链CDR1、CDR2和CDR3。
19.一组核酸分子，其编码特异结合IL-1R1的人抗体或其抗原结合片段并且包含：
(a) 第一核酸分子，其编码SEQ ID NO: 15的重链可变区；和
(b) 第二核酸分子，其编码SEQ ID NO: 17的轻链可变区。
20.一组核酸分子，其编码特异结合IL-1R1的人抗体或其抗原结合片段并且包含：
(a) 编码重链可变区的第一核酸分子，其中所述第一核酸分子由SEQ ID NO: 85的核苷酸序列组成；和
(b) 编码轻链可变区的第二核酸分子，其中所述第二核酸分子由SEQ ID NO: 86的核苷酸序列组成。
21.一组表达载体，其包含权利要求15－20中任一项所述的核酸分子，其中一种载体包含所述第一核酸分子，而另一种载体包含所述第二核酸分子。
22.分离的宿主细胞，其包含权利要求21所述的一组表达载体。
23.权利要求22所述的分离的宿主细胞，其为真核细胞。
24.权利要求22所述的分离的宿主细胞，其为原核细胞。
25.细胞系，其包含权利要求21所述的一组表达载体。
26.制备特异结合IL-1R1的抗体的方法，包括在宿主细胞中表达权利要求15－20中任一项所述的一组核酸分子。
27.制备特异结合IL-1R1的抗体的方法，包括培养权利要求23或24所述的宿主细胞。
28.制备特异结合IL-1R1的抗体的方法，包括培养权利要求25所述的细胞系。
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