TWI711630B - 抗cd73抗體及其用途 - Google Patents

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TWI711630B TW104138281A TW104138281A TWI711630B TW I711630 B TWI711630 B TW I711630B TW 104138281 A TW104138281 A TW 104138281A TW 104138281 A TW104138281 A TW 104138281A TW I711630 B TWI711630 B TW I711630B
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    • G01N2333/90Enzymes; Proenzymes
    • G01N2333/914Hydrolases (3)
    • G01N2333/916Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. phosphatases (3.1.3), phospholipases C or phospholipases D (3.1.4)

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Abstract

本發明提供經分離單株抗體、具體而言人類抗體,其以高親和力結合至人類分化簇73(CD73)且抑制CD73之活性,並視情況調介抗體依賴性CD73內化。本發明亦提供編碼本發明抗體之核酸分子、用於表現本發明抗體之表現載體、宿主細胞及方法。本發明亦提供包含本發明抗體之免疫偶聯物、雙特異性分子及醫藥組合物。本發明亦提供使用本發明抗體抑制表現CD73之腫瘤細胞生長之方法,包括治療多種癌症之方法。

Description

抗CD73抗體及其用途
本申請案主張於2014年11月21日提出申請之標題為「Antibodies Against CD73 and Uses Thereof」之美國臨時申請案第62/083,056號的優先權,該申請案之內容以引用方式併入本文中。
分化簇73(CD73)(亦稱為胞外-5'-核苷酸酶(胞外-5'NT,EC 3.1.3.5))係在大部分組織中發現、但尤其在內皮細胞及造血細胞亞組中表現之糖基-磷脂醯肌醇(GPI)偶聯之細胞表面酶(Resta等人,Immunol Rev 1998;161:95-109及Colgan等人,Prinergic Signal 2006;2:351-60)。已知CD73催化細胞外核苷單磷酸鹽去磷酸化成核苷,例如腺苷。腺苷係經廣泛研究之經由若干受體(包括A1、A2A、A2B及A3)調介其生物效應之信號傳導分子。已顯示腺苷調控許多癌症之增殖及遷移且經由調控抗腫瘤T細胞而具有免疫阻抑效應(Zhang等人,Cancer Res 2010;70:6407-11)。
CD73已經報導在許多不同癌症上表現,包括結腸癌、肺癌、胰臟癌、卵巢癌、膀胱癌、白血病、神經膠質瘤、神經膠母細胞瘤、黑色素瘤、甲狀腺癌、食道癌、前列腺癌及乳癌(Jin等人,Cancer Res 2010;70:2245-55及Stagg等人,PNAS 2010;107:1547-52)。另外,癌症中之CD73表現與增加的增殖、遷移、新血管形成、侵襲力、轉移及較短患者存活期相關。亦已提出CD73活性作為乳頭狀甲狀腺癌中之 預後標記物。儘管已顯示CD73調控腫瘤細胞上之細胞-細胞及細胞-基質相互作用,但CD73表現及活性亦與減弱的T細胞反應相關且參與藥物抵抗(Spychala等人,Pharmacol Ther 3000;87:161-73)。因此,CD73可以直接及間接方式二者調控癌症進展,此突出強調其作為新穎治療靶之潛能。
鑒於仍需要經改良以靶向疾病(例如癌症)之策略,業內高度期望經由多種機制調控腫瘤進展之方法以及調控CD73活性之方法及相關治療劑。
本文提供特異性結合CD73且具有期望功能特性之經分離抗體,例如單株抗體(其抗原結合部分),具體而言人類單株抗體。該等特性包括高親和力結合至人類CD73、結合至猴CD73(例如食蟹獼猴CD73)及抑制CD73酶活性之能力。本文所述抗體可用於抑制腫瘤生長、減少腺苷產生、刺激免疫反應及檢測樣品中之CD73蛋白。
在某些實施例中,抗CD73抗體展現以下特性中之至少一者:(a)抑制CD73酶活性;(b)結合至食蟹獼猴CD73;(c)抗體介導之CD73內化至細胞(例如腫瘤細胞)中;及(d)結合至包含人類CD73之胺基酸65-83及157-172之構象表位。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分以如藉由例如BIACORE® SPR分析所量測約10nM至0.1nM或更小之KD結合至人類CD73(單體及/或二聚體CD73),且以如藉由例如脈衝追蹤所量測且如實例中所述不超過10min之T1/2內化至腫瘤細胞中。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分結合在例如人類CD73之區域FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及/或LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)內,其中該表位跨越人類 CD73之FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及/或LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)或與其重疊。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分結合至人類CD73(SEQ ID NO:1)上包括胺基酸殘基FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及/或LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)之全部或一部分的表位。在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分所結合之表位係藉由例如HDX-MS及/或結晶學來測定。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含在本文所述抗CD73抗體之可變重鏈及可變輕鏈對中之三個可變重鏈CDR及三個可變輕鏈CDR,該等可變重鏈及可變輕鏈對係例如表31中之鏈,例如SEQ ID NO:4及8;SEQ ID NO:4及12;SEQ ID NO:16及20;SEQ ID NO:16及24;SEQ ID NO:16及28;SEQ ID NO:32及36;SEQ ID NO:40及44;SEQ ID NO:40及48;SEQ ID NO:52及56;SEQ ID NO:60及64;SEQ ID NO:68及72;SEQ ID NO:68及76;SEQ ID NO:80及84;SEQ ID NO:88及92;SEQ ID NO:135及8;或SEQ ID NO:135及12。例如,抗CD73抗體包含:(a)分別包含SEQ ID NO:5、6及7之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:9、10及11之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(b)分別包含SEQ ID NO:5、6及7之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:13、14及15之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(c)分別包含SEQ ID NO:17、18及19之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:21、22及23之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(d)分別包含SEQ ID NO:17、18及19之重鏈CDR1、CDR2及 CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:25、26及27之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(e)分別包含SEQ ID NO:17、18及19之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:29、30及31之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(f)分別包含SEQ ID NO:33、34及35之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:37、38及39之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(g)分別包含SEQ ID NO:41、42及43之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:45、46及47之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(h)分別包含SEQ ID NO:41、42及43之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:49、50及51之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(i)分別包含SEQ ID NO:53、54及55之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:57、58及59之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(j)分別包含SEQ ID NO:61、62及63之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:65、66及67之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(k)分別包含SEQ ID NO:69、70及71之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:73、74及75之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(l)分別包含SEQ ID NO:69、70及71之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:77、78及79之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列; (m)分別包含SEQ ID NO:81、82及83之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:85、86及87之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;或(n)分別包含SEQ ID NO:89、90及91之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:93、94及95之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分包含重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,分別為SEQ ID NO:5、6及7,及/或輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,分別為SEQ ID NO:9、10及11。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分包含重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,分別為SEQ ID NO:5、6及7,及/或輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,分別為SEQ ID NO:13、14及15。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分包含重鏈及輕鏈可變區,其具有與本文所述抗CD73抗體之重鏈可變區(例如,包含SEQ ID NO:4、16、32、40、52、60、68、80、88、135、170-177中所述之胺基酸序列)及/或本文所述抗CD73抗體之輕鏈可變區(例如,包含SEQ ID NO:8、12、20、24、28、36、44、48、56、64、72、76、84或92中所述之胺基酸序列)的胺基酸序列至少80%一致、例如至少85%一致、至少90%一致、至少95%一致、至少96%一致、至少97%一致、至少98%一致或至少99%一致或更大一致之胺基酸序列。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分包含與以下胺基酸序列至少80%一致、例如至少85%一致、至少90%一致、至少95%一致、至少96%一致、至少97%一致、至少98%一致或至少99%一致或更大(例如100%)一致之重鏈及輕鏈可變區序列:SEQ ID NO:135及8;SEQ ID NO:135及12;SEQ ID NO:4及8;SEQ ID NO:4及12;SEQ ID NO:16及20;SEQ ID NO:16及24;SEQ ID NO:16及28; SEQ ID NO:32及36;SEQ ID NO:40及44;SEQ ID NO:40及48;SEQ ID NO:52及56;SEQ ID NO:60及64;SEQ ID NO:68及72;SEQ ID NO:68及76;SEQ ID NO:80及84;SEQ ID NO:88及92;SEQ ID NO:170及SEQ ID NO:20、24及28中之任一者;SEQ ID NO:171-176中之任一者及SEQ ID NO:8或12;或SEQ ID NO:177及36。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分包含選自由以下組成之群之重鏈及輕鏈可變區:SEQ ID NO:135及8;SEQ ID NO:135及12;SEQ ID NO:4及8;SEQ ID NO:4及12;SEQ ID NO:16及20;SEQ ID NO:16及24;SEQ ID NO:16及28;SEQ ID NO:32及36;SEQ ID NO:40及44;SEQ ID NO:40及48;SEQ ID NO:52及56;SEQ ID NO:SEQ ID NO:60及64;SEQ ID NO:68及72;SEQ ID NO:68及76;SEQ ID NO:80及84;SEQ ID NO:88及92;SEQ ID NO:170及SEQ ID NO:20、24及28中之任一者;SEQ ID NO:171-176中之任一者及SEQ ID NO:8或12;或SEQ ID NO:177及36。
在某些實施例中,抗體或其抗原結合部分包含具有SEQ ID NO:135中所述之胺基酸序列的重鏈可變區及具有SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:12中所述之胺基酸序列的輕鏈可變區。
本文提供抗CD73抗體或其抗原結合部分,其具有分別與本文所述任一抗CD73抗體之胺基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之全長重鏈及輕鏈序列,例如,SEQ ID NO:100及101;SEQ ID NO:100及102;SEQ ID NO:103及104;SEQ ID NO:103及105;SEQ ID NO:103及106;SEQ ID NO:107及108;SEQ ID NO:109及110;SEQ ID NO:109及111;SEQ ID NO:112及113;SEQ ID NO:114及115;SEQ ID NO:116及117;SEQ ID NO:116及118;SEQ ID NO:119及120;SEQ ID NO:121及122;SEQ ID NO:133或189(不含C末端離胺酸)及101;SEQ ID NO:133或 189及102;SEQ ID NO:189及101;SEQ ID NO:189及102;SEQ ID NO:184-186中之任一者及SEQ ID NO:104-106中之任一者;SEQ ID NO:187-207中之任一者及SEQ ID NO:101或102;或SEQ ID NO:208-210中之任一者及SEQ ID NO:108。
在某些實施例中,抗體或其抗原結合部分包含具有SEQ ID NO:133或189中所述之胺基酸序列的重鏈區域及具有SEQ ID NO:101或SEQ ID NO:102中所述之胺基酸序列的輕鏈區域。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分係IgG1、IgG2、IgG3或IgG4抗體或其變體。在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分結合與具有前述重鏈及輕鏈可變區序列之抗體(例如抗體CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11)相同之CD73上之表位。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分包含按N至C末端之順序包括例如人類CH1結構域、人類鉸鏈結構域、人類CH2結構域及人類CH3結構域之經修飾重鏈恆定區,其中至少2個結構域具有不同同型(例如IgG1、IgG2、IgG3及IgG4同型)。例如,在某些實施例中,經修飾恆定區包含人類IgG2鉸鏈,且CH1、CH2及CH3結構域中之至少一者不具IgG2同型。在某些實施例中,CH1係例如具有胺基酸序列ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTV(SEQ ID NO:124)之人類IgG2 CH1結構域。經修飾恆定區可包括人類IgG2鉸鏈結構域,例如減小半胱胺酸結合異質性之人類IgG2鉸鏈結構域,例如相對於野生型人類IgG2鉸鏈結構域(SEQ NO 136)在C219處具有胺基酸取代(例如C219S)之人類IgG2鉸鏈結構域,例如具有胺基酸序列ERKSCVECPPCPAPPVAG(SEQ ID NO:123)之人類IgG2鉸鏈結 構域。經修飾恆定區可包括降低或消除效應子功能之人類IgG1 CH2結構域,例如相對於野生型人類IgG1 CH2結構域(SEQ ID NO:137)具有胺基酸取代A330S及P331S之人類IgG1 CH2結構域,例如包含胺基酸序列PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPSSIEKTISKAK(SEQ ID NO:125)之人類IgG1 CH2結構域。經修飾恆定區可包括例如具有胺基酸序列GQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO:128)之野生型人類IgG1 CH3結構域。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含例如包含(i)IgG2鉸鏈或(ii)IgG2鉸鏈及IgG CH1結構域之經修飾重鏈區域,前提係該抗體不為IgG2抗體,例如該抗體不包含野生型IgG2重鏈恆定區。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分包含本文所述恆定區中之任一者,例如包含SEQ ID NO:126、127、129、130、162-169、180-183及267-284中所述之胺基酸序列之恆定區。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含11F11或CD73.4之VH及VL結構域以及包含IgG2鉸鏈之重鏈恆定區或包含IgG2鉸鏈及IgG2 CH1結構域之重鏈恆定區。重鏈恆定區可為IgG2CS-IgG1.1f(SEQ ID NO:169)或IgG2CS-IgG1f(SEQ ID NO:165),其中「CS」係指「C219S」。
本文提供包含連接至具有第二結合特異性之分子之抗CD73抗體或其抗原結合部分之雙特異性分子,以及包含連接至藥劑之抗CD73 抗體或其抗原結合部分之免疫偶聯物。
亦提供編碼抗CD73抗體之重鏈及/或輕鏈可變區序列之核酸分子,以及包含該等核酸分子之表現載體及經該等表現載體轉形之細胞。
亦提供包含抗CD73抗體或其抗原結合部分之組合物及套組。
本文提供製備抗CD73抗體之方法,其包含在細胞中表現本文所揭示之抗CD73抗體及自細胞分離該抗體。
亦提供使用本文所揭示之抗CD73抗體之方法,例如減小例如腫瘤(例如表現CD73之腫瘤細胞)中或由腫瘤產生之腺苷含量之方法、刺激抗原特異性T細胞反應之方法、刺激個體中之免疫反應之方法、抑制個體中之腫瘤細胞生長之方法、藉由例如免疫療法治療癌症之方法。在某些實施例中,癌症係膀胱癌、乳癌、子宮/子宮頸癌、卵巢癌、前列腺癌、睪丸癌、食道癌、胃腸癌、胰臟癌、結腸直腸癌、結腸癌、腎癌、頭頸癌、肺癌、胃癌、生殖細胞癌、骨癌、肝癌、甲狀腺癌、皮膚癌、中樞神經系統贅瘤、淋巴瘤、白血病、骨髓瘤、肉瘤或病毒相關之癌症。癌症可為轉移性癌症、難治性癌症或復發性癌症。
在某些實施例中,本文所述方法進一步包含投與一或多種其他治療劑,例如刺激免疫系統之治療劑,例如PD-1拮抗劑、CTLA-4拮抗劑、LAG-3拮抗劑、GITR拮抗劑及/或抗CD39抗體、抗A2AR抗體或A2AR之化學抑制劑。
根據以下詳細描述及實例將明瞭本發明之其他特徵及優點,該等實例不應理解為具有限制性。
圖1A顯示CD73.4-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:237)及胺基酸序列(SEQ ID NO:135)。描繪CDR1(SEQ ID NO:5)、CDR2(SEQ ID NO:6)及CDR3(SEQ ID NO:7)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖1B顯示CD73.4-1人類單株抗體之輕鏈可變區(VK1)之核苷酸序列(SEQ ID NO:140)及胺基酸序列(SEQ ID NO:8)。描繪CDRI(SEQ ID NO:9)、CDR2(SEQ ID NO:10)及CDR3(SEQ ID NO:11)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖2A顯示CD73.4-2人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:237)及胺基酸序列(SEQ ID NO:135)。描繪CDR1(SEQ ID NO:5)、CDR2(SEQ ID NO:6)及CDR3(SEQ ID NO:7)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖2B顯示CD73.4-2人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:141)及胺基酸序列(SEQ ID NO:12)。描繪CDR1(SEQ ID NO:13)、CDR2(SEQ ID NO:14)及CDR3(SEQ ID NO:15)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖3A顯示11F11-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:139)及胺基酸序列(SEQ ID NO:4)。描繪CDR1(SEQ ID NO:5)、CDR2(SEQ ID NO:6)及CDR3(SEQ ID NO:7)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖3B顯示11F11-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:140)及胺基酸序列(SEQ ID NO:8)。描繪CDR1(SEQ ID NO:9)、CDR2(SEQ ID NO:10)及CDR3(SEQ ID NO:11)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖4A顯示11F11-2人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:139)及胺基酸序列(SEQ ID NO:4)。描繪CDR1(SEQ ID NO:5)、CDR2(SEQ ID NO:6)及CDR3(SEQ ID NO:7)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖4B顯示11F11-2人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:141)及胺基酸序列(SEQ ID NO:12)。描繪CDR1(SEQ ID NO:13)、CDR2(SEQ ID NO:14)及CDR3(SEQ ID NO:15)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖5A顯示4C3-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:142)及胺基酸序列(SEQ ID NO:16)。描繪CDR1(SEQ ID NO:17)、CDR2(SEQ ID NO:18)及CDR3(SEQ ID NO:19)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖5B顯示4C3-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:143)及胺基酸序列(SEQ ID NO:20)。描繪CDR1(SEQ ID NO:21)、CDR2(SEQ ID NO:22)及CDR3(SEQ ID NO:23)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖6A顯示4C3-2人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:142)及胺基酸序列(SEQ ID NO:16)。描繪CDR1(SEQ ID NO:17)、CDR2(SEQ ID NO:18)及CDR3(SEQ ID NO:19)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖6B顯示4C3-2人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:144)及胺基酸序列(SEQ ID NO:24)。描繪CDR1(SEQ ID NO:25)、CDR2(SEQ ID NO:26)及CDR3(SEQ ID NO:27)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖7A顯示4C3-3人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:142)及胺基酸序列(SEQ ID NO:16)。描繪CDR1(SEQ ID NO:17)、CDR2(SEQ ID NO:18)及CDR3(SEQ ID NO:19)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖7B顯示4C3-3人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:145)及胺基酸序列(SEQ ID NO:28)。描繪CDR1(SEQ ID NO: 29)、CDR2(SEQ ID NO:30)及CDR3(SEQ ID NO:31)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖8A顯示4D4-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:146)及胺基酸序列(SEQ ID NO:32)。描繪CDR1(SEQ ID NO:33)、CDR2(SEQ ID NO:34)及CDR3(SEQ ID NO:35)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖8B顯示4D4-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:147)及胺基酸序列(SEQ ID NO:36)。描繪CDR1(SEQ ID NO:37)、CDR2(SEQ ID NO:38)及CDR3(SEQ ID NO:39)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖9A顯示10D2-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:148)及胺基酸序列(SEQ ID NO:40)。描繪CDR1(SEQ ID NO:41)、CDR2(SEQ ID NO:42)及CDR3(SEQ ID NO:43)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖9B顯示10D2-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:149)及胺基酸序列(SEQ ID NO:44)。描繪CDR1(SEQ ID NO:45)、CDR2(SEQ ID NO:46)及CDR3(SEQ ID NO:47)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖10A顯示10D2-2人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:148)及胺基酸序列(SEQ ID NO:40)。描繪CDR1(SEQ ID NO:41)、CDR2(SEQ ID NO:42)及CDR3(SEQ ID NO:43)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖10B顯示10D2-2人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:150)及胺基酸序列(SEQ ID NO:48)。描繪CDR1(SEQ ID NO:49)、CDR2(SEQ ID NO:50)及CDR3(SEQ ID NO:51)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖11A顯示11A6-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:151)及胺基酸序列(SEQ ID NO:52)。描繪CDR1(SEQ ID NO:53)、CDR2(SEQ ID NO:54)及CDR3(SEQ ID NO:55)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖11B顯示11A6-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:152)及胺基酸序列(SEQ ID NO:56)。描繪CDR1(SEQ ID NO:57)、CDR2(SEQ ID NO:58)及CDR3(SEQ ID NO:59)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖12A顯示24H2-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:153)及胺基酸序列(SEQ ID NO:60)。描繪CDR1(SEQ ID NO:61)、CDR2(SEQ ID NO:62)及CDR3(SEQ ID NO:63)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖12B顯示24H2-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:154)及胺基酸序列(SEQ ID NO:64)。描繪CDR1(SEQ ID NO:65)、CDR2(SEQ ID NO:66)及CDR3(SEQ ID NO:67)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖13A顯示5F8-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:155)及胺基酸序列(SEQ ID NO:68)。描繪CDR1(SEQ ID NO:69)、CDR2(SEQ ID NO:70)及CDR3(SEQ ID NO:71)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖13B顯示5F8-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:156)及胺基酸序列(SEQ ID NO:72)。描繪CDR1(SEQ ID NO:73)、CDR2(SEQ ID NO:74)及CDR3(SEQ ID NO:75)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖14A顯示5F8-2人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:155)及胺基酸序列(SEQ ID NO:68)。描繪CDR1(SEQ ID NO: 69)、CDR2(SEQ ID NO:70)及CDR3(SEQ ID NO:71)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖14B顯示5F8-2人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:157)及胺基酸序列(SEQ ID NO:76)。描繪CDR1(SEQ ID NO:77)、CDR2(SEQ ID NO:78)及CDR3(SEQ ID NO:79)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖15A顯示5F8-3人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:155)及胺基酸序列(SEQ ID NO:68)。描繪CDR1(SEQ ID NO:69)、CDR2(SEQ ID NO:70)及CDR3(SEQ ID NO:71)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖15B顯示5F8-3人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:242)及胺基酸序列(SEQ ID NO:238)。描繪CDR1(SEQ ID NO:239)、CDR2(SEQ ID NO:240)及CDR3(SEQ ID NO:241)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖16A顯示6E11-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:158)及胺基酸序列(SEQ ID NO:80)。描繪CDR1(SEQ ID NO:81)、CDR2(SEQ ID NO:82)及CDR3(SEQ ID NO:83)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖16B顯示6E11-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:159)及胺基酸序列(SEQ ID NO:84)。描繪CDR1(SEQ ID NO:85)、CDR2(SEQ ID NO:86)及CDR3(SEQ ID NO:87)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖17A顯示7A11-1人類單株抗體之重鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:160)及胺基酸序列(SEQ ID NO:88)。描繪CDR1(SEQ ID NO:89)、CDR2(SEQ ID NO:90)及CDR3(SEQ ID NO:91)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖17B顯示7A11-1人類單株抗體之輕鏈可變區之核苷酸序列(SEQ ID NO:161)及胺基酸序列(SEQ ID NO:92)。描繪CDR1(SEQ ID NO:93)、CDR2(SEQ ID NO:94)及CDR3(SEQ ID NO:95)區域且指示V、D及J種系衍生。
圖18顯示抗CD73抗體CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f之重鏈之胺基酸序列(SEQ ID NO:189)及其可變區、CDR1、2及3、CH1、鉸鏈、CH2及CH3結構域。
圖19顯示600nM、200nM、66.7nM、22.2nM、7.4nM及2.5nM人類-CD73-his(粗線)或食蟹獼猴-CD73-his(細線)與在25℃下在固定蛋白質A表面上捕獲之CD73.4-IgG2-C219S-IgG1.1f之結合的SPR感測圖數據。
圖20A1及20A2顯示具有所指示重鏈恆定區之11F11、CD73.4及CD73.10抗體與人類CD73陽性Calu6細胞(人類肺腺癌細胞系)之結合。
圖20B1及20B2顯示具有所指示重鏈恆定區之11F11、CD73.4及CD73.10抗體與人類CD73陰性DMS114細胞(小肺細胞癌細胞系)之結合。
圖20C1及20C2顯示具有所指示重鏈恆定區之11F11、CD73.4及CD73.10抗體與食蟹獼猴CD73陽性CHO細胞之結合。
圖20D1及20D2顯示具有所指示重鏈恆定區之11F11、CD73.4及CD73.10抗體與食蟹獼猴CD73陰性CHO-K1細胞之結合。
圖20E顯示所指示抗體與供體D1及D2之T細胞之結合。
圖20F顯示所指示抗體與供體D1及D2之T細胞之結合。
圖21A1及21A2顯示具有所指示重鏈恆定區之抗CD73抗體11F11、CD73.4及CD73.10對珠粒結合之人類CD73酶活性的抑制。所有抗體皆抑制人類CD73酶活性。
圖21B1及21B2顯示具有所指示重鏈恆定區之抗CD73抗體 11F11、CD73.4及CD73.10對珠粒結合之食蟹獼猴CD73酶活性的抑制。所有抗體皆抑制食蟹獼猴CD73酶活性。
圖22A1及22A2顯示具有所指示重鏈恆定區之11F11、CD73.4及CD73.10抗體對人類CD73陽性Calu6細胞中之CD73酶抑制。所有抗體皆抑制該等細胞中之CD73酶活性。
圖22B1及22B2顯示具有所指示重鏈恆定區之11F11、CD73.4及CD73.10抗體對人類CD73陰性DMS-114細胞中之CD73酶抑制。
圖22C顯示11F11及11F11F(ab’)2片段對內源CD73活性之抑制之EC50及Ymax值,如在cAMP分析中使用Calu-6及HEK/A2R細胞所測定。圖22C亦顯示在Calu-6內化分析中11F11及11F11F(ab’)2片段之EC50及Ymax值。該圖顯示11F11 Fab片段在該兩個分析中無活性。
圖22D顯示如藉由LC/MS/MS所量測之來自經11F11或4C3抗體處理之Calu6細胞之腺苷產生的時程,此指示11F11抗體對CD73酶之抑制快於4C3抗體對CD73酶之抑制。
圖23A顯示在H2228細胞中以下抗體對CD73之抗體介導之內化之動力學:11F11、4C3、6D11、具有4C3Vk1輕鏈之CD73.3-IgG1.1f(「3-Vh-hHC-IgG1.1f/4C3Vk1」)、具有11F11 Vk2輕鏈之CD73.4-IgG2CS(「4-Vh-hHC-IgG2-C219S/11F11-Vk2」)、CD73.10-IgG2CS(「CD73.10-Vh-hHC-IgG2-C219S」)、CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f(「CD73.10-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f」)及CD73.10-IgG1.1f(「CD73.10-Vh-hHC-IgG1.1f」)抗體。與其他測試抗體(其具有IgG1同型)相比,11F11(其具有IgG2同型)、CD73.4-IgG2CS、CD73.10-IgG2CS及CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f抗體內化較快且程度較高。
圖23B顯示在HCC15細胞(非小細胞肺癌細胞系)中與圖23A中所顯示之抗體相同之抗體的抗體介導之CD73內化之動力學,其顯示與在H2228細胞(非小細胞肺癌細胞系)中所獲得之結果類似之結果。
圖23C顯示在Calu6細胞中與圖23A及23B中所顯示之抗體相同之抗體以及CD73.11-IgG2CS(「11-Vh-hVC-IgG2-C219S」)的抗體介導之CD73內化之動力學,其顯示與在H2228及HCC15細胞中所獲得之結果類似之結果。
圖23D顯示在NCI-2030細胞(非小細胞肺癌細胞系)中與圖23C中所顯示之抗體相同之抗體的抗體介導之CD73內化之動力學,其顯示與H2228、HCC15及Calu6細胞中所獲得之結果類似之結果。
圖23E顯示在Calu6細胞中所指示抗體之抗體介導之CD73內化之動力學,如藉由流式細胞術所量測。
圖23F顯示在NCI-H292細胞(黏液表皮樣肺癌細胞系)中所指示抗體之抗體介導之CD73內化之動力學,如藉由流式細胞術所量測,但其中在將細胞與抗體首次一起培育後未洗掉該等抗體。
圖23G顯示在經所指示抗體處理之Calu6細胞中內化之CD73之百分比,其顯示在Calu6細胞中所指示抗體隨時間之抗體介導之CD73內化。
圖23H顯示在經所指示抗體處理之NCI-H292細胞中隨時間內化之CD73之百分比,其顯示在NCI-H292細胞中所指示抗體隨時間之抗體介導之CD73內化。
圖23I顯示在經所指示抗體處理之SNU-C1細胞(結腸癌細胞系)中隨時間內化之CD73之百分比,其顯示在SNU-C1細胞中所指示抗體隨時間之抗體介導之CD73內化。
圖23J顯示在經所指示抗體處理之NCI-H1437細胞(非小細胞肺癌細胞系)中隨時間內化之CD73之百分比,其顯示在NCI-H1437細胞中所指示抗體隨時間之抗體介導之CD73內化。
圖23K顯示在經所指示抗體處理之Calu6細胞中隨時間內化之CD73之百分比,其顯示在Calu6細胞中所指示抗體隨時間之抗體介導 之CD73內化。
圖23L顯示在經所指示抗體處理之NCI-H292細胞中隨時間內化之CD73之百分比,其顯示在NCI-H292細胞中所指示抗體隨時間之抗體介導之CD73內化。
圖23M顯示經5μg/ml所指示抗體處理0分鐘、5分鐘、15分鐘或30分鐘之Calu6細胞表面上之CD73的含量。
圖24A顯示在用對照抗體治療動物後4天收穫且針對CD73酶活性染色之動物異種移植腫瘤切片。該等切片顯示緻密棕色,此指示CD73酶活性。
圖24B顯示在用11F11抗體治療動物後1天收穫且針對CD73酶活性染色之動物異種移植腫瘤切片。該等切片顯示相對於圖24A中所顯示之對照腫瘤切片顯著較少之棕色,此指示早在治療開始後1天CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f對CD73酶活性之活體內抑制。
圖24C顯示在用CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f治療動物後2天收穫且針對CD73酶活性染色之動物異種移植腫瘤切片。該等切片顯示相對於圖24A中所顯示之對照腫瘤切片且相對於在用CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f治療動物後1天之腫瘤切片顯著較少之棕色,此指示在治療開始後至少2天CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f對CD73酶活性之活體內抑制。
圖24D顯示在用CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f治療動物後3天收穫且針對CD73酶活性染色之動物異種移植腫瘤切片。該等切片顯示相對於圖24A中所顯示之對照腫瘤切片顯著較少之棕色,此指示在治療開始後至少3天CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f對CD73酶活性之活體內抑制。
圖24E顯示在用CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f治療動物後7天收穫且針對CD73酶活性染色之動物異種移植腫瘤切片。該等切片顯示相對於圖24A中所顯示之對照腫瘤切片顯著較少之棕色,此指示在治療開始後至少7天CD73.10-IgG2CS-IgG1.1f對CD73酶活性之活體內抑制。
圖24F顯示在經對照(非CD73)抗體或經1mg/kg、3mg/kg或10mg/kg CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f治療之異種移植小鼠中SNUC1腫瘤中之人類CD73之酶活性的時程,此顯示抗CD73抗體有效地降低異種移植小鼠腫瘤中之CD73酶活性。
圖25A顯示在帶有同基因4T1腫瘤及對照mIgG之Balb/c小鼠之對照腫瘤切片中小鼠CD73酶活性之水準。
圖25B顯示經抗小鼠CD73抗體TY23皮下治療之帶有同基因4T1腫瘤之Balb/c小鼠之腫瘤切片(4T1第1-7天),此顯示TY23在活體內抑制CD73酶抑制。
圖26A顯示抗CD73抗體4C3、7A11、6E11、5F8、4C3、11F11及11A6對4C3之交叉阻斷程度,如藉由流式細胞術所測定。
圖26B顯示抗CD73抗體4C3、7A11、6E11、5F8、4C3、11F11及11A6對11F11之交叉阻斷程度,如藉由流式細胞術所測定。
圖27A顯示人類CD73之胺基酸序列(SEQ ID NO:283)及與CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f相互作用之區域,其以深灰色表示。相互作用越強,灰色越深。
圖27B顯示二聚體人類CD73蛋白與CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f之間之相互作用模型。
圖28A顯示人類CD73與11F11Fab’片段之間相互作用之結晶學模型。
圖28B顯示具有11F11之兩個人類CD73複合物之複合結構之模型。
圖28C顯示人類CD73與11F11抗體之間之相互作用模型。
圖28D顯示11F11與人類CD73之間之相互作用模型。
圖29A顯示人類CD73及抗體複合物之SEC-MALS數據。「CD73.4雜合體」係指CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f。
圖29B顯示人類CD73及抗體複合物之DLS數據。
圖30A顯示hCD73-his與含有不同恆定區之CD73.4抗體之複合物之SEC層析圖數據,其顯示IgG2鉸鏈及CH1結構域對抗體/抗原複合物大小之效應。
圖30B顯示hCD73-his與含有不同恆定區之CD73.4抗體之複合物之DLS數據,其顯示IgG2鉸鏈及CH1結構域對抗體/抗原複合物大小之效應。
圖30C顯示hCD73-his與含有不同恆定區之CD73.4抗體之複合物之MALS數據,其顯示IgG2鉸鏈及CH1結構域對抗體/抗原複合物大小之效應。
圖30D顯示源自圖30C中MALS測定之質量之hCD73-his/mAb複合物的示意性模型。
圖30E顯示較高階複合物受CH1區影響。直方圖顯示圖中所顯示每一構築體之峰1及2下之面積%。
圖31顯示多種抗CD73抗體之VH及VL序列之比對。VH及VLCDR1、CDR2及CDR3序列加粗。
本文闡述特異性結合至CD73且由此降低CD73活性之經分離抗體,具體而言單株抗體,例如人類單株抗體(「拮抗劑抗CD73抗體」)。在某些實施例中,本文所述抗體源自具體重鏈及輕鏈種系序列及/或包含包括具體胺基酸序列之具體結構特徵,例如CDR區。本文提供經分離抗體、製備該等抗體之方法、包含該等抗體之免疫偶聯物及雙特異性分子以及經調配以含有該等抗體之醫藥組合物。本文亦提供使用抗體單獨或與其他治療劑(例如抗體)及/或癌症療法之組合來減緩腫瘤生長之方法。因此,本文所述抗CD73抗體可用於眾多種治療應用之治療中,包括例如抑制腫瘤生長、抑制轉移及增強針對腫瘤 之免疫反應。
定義
為更容易地理解本描述,首先定義某些術語。其他定義陳述於詳細描述通篇中。
如本文所使用之術語「分化簇73」或「CD73」係指能夠將細胞外核苷5’單磷酸鹽轉換成核苷、即將腺苷單磷酸鹽(AMP)轉換成腺苷之酶(核苷酸酶)。CD73通常係以經由糖基磷脂醯肌醇(GPI)鍵錨定至細胞膜之二聚體形式發現,具有胞外酶活性且在信號轉導中起作用。CD73之主要功能係其將細胞外核苷酸(例如5'-AMP)轉換成高度免疫阻抑分子腺苷。因此,胞外-5'-核苷酸酶催化嘌昤及嘧啶核糖核苷及去氧核糖核苷單磷酸鹽去磷酸化成相應核苷。儘管CD73具有廣泛的受質特異性,但其偏好嘌呤核糖核苷。
CD73亦稱為胞外-5'核酸酶(胞外-5'NT,EC 3.1.3.5)。術語「CD73」包括CD73之由細胞天然表現之任何變體或亞型。因此,本文所述抗體可與來自非人類物種之CD73(例如食蟹獼猴CD73)交叉反應。另一選擇為,該等抗體可特異性針對人類CD73且可不展現與其他物種之任何交叉反應性。CD73或其任何變體及亞型可自天然表現其之細胞或組織分離或使用業內所熟知技術及/或本文所述之彼等以重組方式產生。
業內已鑒定出人類CD73之兩個亞型,該二者共享相同的N末端及C末端部分。亞型1(登錄號NP_002517.1;SEQ ID NO:1)代表由574個胺基酸及9個外顯子組成之最長蛋白質。亞型2(登錄號NP_001191742.1;SEQ ID NO:2)編碼由524個胺基酸組成、缺少胺基酸404-453之較短蛋白質。亞型2缺少交替框內外顯子,從而產生僅具有8個外顯子、但具有相同的N及C末端序列之轉錄本。
食蟹獼猴(cyno)CD73蛋白質序列係以SEQ ID NO:3提供。術語 食蟹獼猴(cynomolgus)及食蟹獼猴(cyno)皆係指食蟹獼猴(Macaca fascicularis)物種且在本說明書通篇中可互換使用。
如本文所使用之術語「抗體」可包括完整抗體及其任何抗原結合片段(即「抗原結合部分」)或單鏈。在一個實施例中,「抗體」係指包含藉由二硫鍵互連之至少兩個重(H)鏈及兩個輕(L)鏈之糖蛋白或其抗原結合部分。每一重鏈包含重鏈可變區(在本文中縮寫為VH)及重鏈恆定區。在某些天然IgG、IgD及IgA抗體中,重鏈恆定區包含三個結構域,CH1、CH2及CH3。在某些天然抗體中,每一輕鏈包含輕鏈可變區(在本文中縮寫為VL)及輕鏈恆定區。輕鏈恆定區包含一個結構域CL。可將VH及VL區進一步細分成超變區(稱為互補決定區(CDR))及更保守之區域(稱為框架區(FR)),二者間雜排列。每一VH及VL係由三個CDR及四個FR構成,其自胺基末端至羧基末端按下列順序佈置:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鏈及輕鏈之可變區含有與抗原相互作用之結合結構域。抗體之恆定區可調介免疫球蛋白與宿主組織或因子(包括免疫系統之各種細胞(例如效應細胞)及經典補體系統之第一組份(C1q))的結合。
抗體之重鏈可或可不含有末端離胺酸(K)或末端甘胺酸及離胺酸(GK)。因此,本文所提供重鏈序列及重鏈恆定區序列中之任一者可以GK或G結尾,或缺少K或GK,此與序列之最後一個胺基酸所提供項無關。此乃因末端離胺酸及有時甘胺酸及離胺酸在抗體表現期間裂解。
抗體通常以由10-7M至10-11M或更小之解離常數(KD)反映之高親和力特異性結合至其同源抗原。通常認為大於約10-6M之任何KD指示非特異性結合。如本文所使用,「特異性結合」至抗原之抗體係指以高親和力結合至抗原且實質上相同之抗原、但不以高親和力結合至不相關抗原之抗體,高親和力意指具有10-7M或更小、較佳10-8M或更 小、甚至更佳5×10-9M或更小、且最佳介於10-8M與10-10M之間或更小之KD。若抗原展現與給定抗原之高度序列一致性,例如若其展現與給定抗原之序列至少80%、至少90%、至少95%、至少97%或至少99%或更大之序列一致性,則該抗原與給定抗原「實質上相同」。舉例而言,特異性結合至人類CD73之抗體亦可與來自某些非人類靈長類動物物種(例如食蟹獼猴)之CD73交叉反應,但不可與來自其他物種之CD73或與除CD73外之抗原交叉反應。
免疫球蛋白可來自普遍已知同型中之任一者,包括(但不限於)IgA、分泌性IgA、IgG及IgM。IgG同型在某些物種中分成多個子類:在人類中分成IgG1、IgG2、IgG3及IgG4,且在小鼠中分成IgG1、IgG2a、IgG2b及IgG3。在某些實施例中,本文所述抗CD73抗體具有人類IgG1或IgG2子型。免疫球蛋白(例如人類IgG1)係以若干異型存在,其彼此相差至多幾個胺基酸。舉例而言,「抗體」可包括天然及非天然抗體;單株及多株抗體;嵌合及人類化抗體;人類及非人類抗體;全合成抗體;及單鏈抗體。
如本文所使用,術語抗體之「抗原結合部分」係指抗體之保留特異性結合至抗原(例如人類CD73)之能力的一或多個片段。已顯示,抗體之抗原結合功能可由全長抗體之片段來實施。涵蓋於術語抗體(例如本文所述之抗CD73抗體)之「抗原結合部分」內之結合片段的實例包括(i)Fab片段,其係由VL、VH、CL及CH1結構域組成之單價片段;(ii)F(ab')2片段,其係包含藉由二硫橋在鉸鏈區處連接之兩個Fab片段之二價片段;(iii)Fd片段,其係由VH及CH1結構域組成;(iv)Fv片段,其係由抗體單臂之VL及VH結構域組成,(v)dAb片段(Ward等人(1989)Nature 341:544-546),其係由VH結構域組成;及(vi)經分離互補決定區(CDR),或(vii)可視情況藉由合成連接體連結之兩個或更多個經分離CDR之組合。另外,儘管Fv片段之兩個結構域VL及VH係由 單獨基因編碼,但其可利用重組方法藉由合成連接體來連結,該合成連接體使該等結構域能夠以VL及VH區配對形成單價分子的單一蛋白鏈(稱為單鏈Fv(scFv))製備;參見例如Bird等人,(1988)Science 242:423-426;及Huston等人(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883)。該等單鏈抗體亦欲涵蓋於術語抗體之「抗原結合部分」內。該等及其他潛在構築體闡述於Chan及Carter(2010)Nat.Rev.Immunol.10:301。該等抗體片段係使用彼等熟習此項技術者已知之習用技術來獲得,且該等片段經篩選以與完整抗體相同之方式使用。抗原結合部分可藉由重組DNA技術或藉由酶或化學裂解完整免疫球蛋白來產生。
「雙特異性」或「雙功能抗體」係具有兩個不同重鏈/輕鏈對、從而產生特異性針對不同抗原之兩個抗原結合位點之人工雜合抗體。雙特異性抗體可藉由多種方法(包括雜交瘤融合或連接Fab'片段)來產生。例如,參見Songsivilai及Lachmann,Clin.Exp.Immunol.79:315-321(1990);Kostelny等人,J.Immunol.148,1547-1553(1992)。
如本文所使用,術語「單株抗體」係指展示針對抗體之具體表位或組合物之單一結合特異性及親和力之抗體,其中所有抗體皆展示針對具體表位之單一結合特異性及親和力。通常,該等單株抗體將源自編碼抗體之單一細胞或核酸,且將在不有意引入任何序列變化下繁殖。因此,術語「人類單株抗體」係指具有源自人類種系免疫球蛋白序列之可變區及可選恆定區之單株抗體。在一個實施例中,人類單株抗體係藉由例如藉由融合自轉基因或轉染色體非人類動物(例如具有包含人類重鏈轉基因及輕鏈轉基因之基因組之轉基因小鼠)獲得之B細胞與永生細胞獲得的雜交瘤產生。
如本文所使用,術語「重組人類抗體」包括藉由重組方式製備、表現、產生或分離之所有人類抗體,例如(a)自對人類免疫球蛋白基因轉基因或轉染色體之動物(例如小鼠)或自其製備之雜交瘤分離 之抗體,(b)自經轉形以表現該抗體之宿主細胞、例如自轉染瘤分離之抗體,(c)自重組、組合人類抗體文庫分離之抗體,及(d)藉由涉及將人類免疫球蛋白基因序列剪接至其他DNA序列之任何其他方式製備、表現、產生或分離的抗體。該等重組人類抗體包含利用具體人類種系免疫球蛋白序列且由種系基因編碼、但包括在例如抗體成熟期間發生之後續重排及突變之可變區及恆定區。如業內已知(例如,參見Lonberg(2005)Nature Biotech.23(9):1117-1125),可變區含有由重排以形成特異性針對外源抗原之抗體之不同基因編碼之抗原結合結構域。除重排之外,可變區可進一步經多個單一胺基酸變化(稱為體細胞突變或超突變)修飾以增加抗體對外源抗原之親和力。恆定區將進一步因應抗原而改變(即同型切換)。因此,因應抗原之編碼輕鏈及重鏈免疫球蛋白多肽之經重排及體細胞突變之核酸序列可與原始種系序列不一致,但將實質上一致或相似(即具有至少80%一致性)。
「人類」抗體(HuMAb)係指具有框架區及CDR區皆源自人類種系免疫球蛋白序列之可變區之抗體。另外,若抗體含有恆定區,則恆定區亦係源自人類種系免疫球蛋白序列。本文所述抗體可包括不由人類種系免疫球蛋白序列編碼之胺基酸殘基(例如,藉由活體外隨機誘變或位點特異性誘變或藉由活體內體細胞突變引入之突變)。然而,如本文所使用,術語「人類抗體」並不欲包括源自另一哺乳動物物種(例如小鼠)種系之CDR序列已移植至人類框架序列上之抗體。術語「人類」抗體與「全人類」抗體係以同義使用。
「人類化」抗體係指非人類抗體之CDR結構域外之一些、大部分或所有胺基酸經源自人類免疫球蛋白之相應胺基酸替代之抗體。在抗體之人類化形式之一個實施例中,CDR結構域外之一些、大部分或所有胺基酸已經來自人類免疫球蛋白之胺基酸替代,而一或多個CDR區內之一些、大部分或所有胺基酸未發生變化。可容許存在胺基酸之小 添加、缺失、插入、取代或修飾,只要其不消除抗體結合具體抗原之能力即可。「人類化」抗體保留類似於原始抗體之抗原特異性之抗原特異性。
「嵌合抗體」係指可變區源自一個物種且恆定區源自另一物種之抗體,例如可變區源自小鼠抗體且恆定區源自人類抗體之抗體。
「經修飾重鏈恆定區」係指包含恆定結構域CH1、鉸鏈、CH2及CH3之重鏈恆定區,其中一或多個恆定結構域來自不同同型(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4)。在某些實施例中,經修飾恆定區包括人類IgG2 CH1結構域及融合至人類IgG1 CH2結構域之人類IgG2鉸鏈及人類IgG1 CH3結構域。在某些實施例中,該等經修飾恆定區亦包括一或多個結構域內相對於野生型胺基酸序列之胺基酸修飾。
在本文將抗體稱為「CD73.3」或「CD73.4」而未指示恆定區之一致性時,除非另有指示,否則其係指分別具有CD73.3或CD73.4之可變區以及本文所述之任何恆定區的抗體。
如本文所使用,「同型」係指由重鏈恆定區基因編碼之抗體類別(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD及IgE抗體)。
「異型」係指特定同型群內之天然變體,該等變體相差幾個胺基酸(例如,參見Jefferis等人(2009)mAbs 1:1)。本文所述抗體可具有任何異型。
除非本文在別處另有說明,否則所有胺基酸編號皆係根據Kabat系統之EU指數(Kabat,E.A.等人(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,U.S.Department of Health and Human Services,NIH公開案第91-3242號)。
片語「識別抗原之抗體」及「特異性針對抗原之抗體」在本文中可與術語「特異性結合至抗原之抗體」互換使用。
如本文所使用,術語「經分離抗體」欲指實質上不含具有不同抗原特異性之其他抗體之抗體(例如,特異性結合至CD73之經分離抗體實質上不含特異性結合除CD73外之抗原的抗體)。然而,特異性結合至CD73之表位之經分離抗體可具有針對不同物種之其他CD73蛋白的交叉反應性。
如本文所使用,「抑制CD73」之抗體係指抑制CD73之生物功能及/或酶功能之抗體。該等功能包括例如抗體抑制CD73酶活性、例如CD73調控之腺苷產生或cAMP產生減少之能力。
如本文所使用,「內化」之抗體係指在結合至細胞表面抗原後穿過細胞膜之抗體。內化包括抗體介導之受體(例如CD73)內化。在一些實施例中,抗體以等於約10min或更短之T1/2之速率「內化」至表現CD73之細胞中。
「效應子功能」係指抗體Fc區與Fc受體或配體之相互作用或源自其之生物化學事件。實例性「效應子功能」包括C1q結合、補體依賴性細胞毒性(CDC)、Fc受體結合、FcγR介導之效應子功能(例如ADCC及抗體依賴性細胞介導之吞噬作用(ADCP))及下調細胞表面受體(例如B細胞受體;BCR)。該等效應子功能通常需要組合Fc區與結合結構域(例如抗體可變結構域)。
「Fc受體」或「FcR」係結合至免疫球蛋白之Fc區之受體。結合至IgG抗體之FcR包含FcγR家族之受體,包括對偶基因變體及另一選擇為該等受體之剪接形式。FcγR家族係由三種活化受體(在小鼠中為FcγRI、FcγRIII及FcγRIV;在人類中為FcγRIA、FcγRIIA及FcγRIIIA)及一種抑制性受體(FcγRIIB)組成。人類FcγR之多種特性概述於表1中。大部分固有效應細胞類型共表現一或多種活化FcγR及抑制性FcγRIIB,而自然殺手(NK)細胞選擇性表現一種活化Fc受體(小鼠中之FcγRIII及人類中之FcγRIIIA),但不表現小鼠及人類中之抑制性 FcγRIIB。人類IgG1結合至大部分人類Fc受體且認為其所結合之活化Fc受體類型等效於鼠類IgG2a。
Figure 104138281-A0202-12-0028-1
「鉸鏈」、「鉸鏈結構域」或「鉸鏈區」或「抗體鉸鏈區」係指重鏈恆定區之連結CH1結構域與CH2結構域且包括鉸鏈之上部分、中間部分及下部分之結構域(Roux等人,J.Immunol.1998 161:4083)。鉸鏈提供抗體之結合區域與效應子區域之間之不同撓性度且亦提供兩個重鏈恆定區之間之分子間二硫鍵結的位點。如本文所使用,對於所有IgG同型,鉸鏈起始於Glu216且終止於Gly237(Roux等人,1998 J Immunol 161:4083)。野生型IgG1、IgG2、IgG3及IgG4鉸鏈之序列顯示於表2及31中。
Figure 104138281-A0202-12-0029-2
術語「鉸鏈」包括野生型鉸鏈(例如表2及31中所述之彼等)以及其變體(例如非天然鉸鏈或經修飾鉸鏈)。例如,術語「IgG2鉸鏈」包括如表2中所顯示之野生型IgG2鉸鏈及具有1個、2個、3個、4個、5 個、1-3個、1-5個、3-5個及/或至多5個、4個、3個、2個或1個突變(例如取代、缺失或添加)之變體。實例性IgG2鉸鏈變體包括1個、2個、3個或所有4個半胱胺酸(C219、C220、C226及C229)變成另一胺基酸之IgG2鉸鏈。在特定實施例中,IgG2包含C219S取代。IgG2鉸鏈亦可包含C220處之取代或C219及C220二者處之取代。IgG2鉸鏈可包含單獨或與重鏈或輕鏈之其他區域中之一或多個取代一起使抗體採用形式A或B之取代(例如,參見Allen等人(2009)Biochemistry 48:3755)。在某些實施例中,鉸鏈係包含來自至少兩個同型之序列之雜合鉸鏈。例如,鉸鏈可包含來自一個同型之上鉸鏈、中間鉸鏈或下鉸鏈及來自一或多個其他同型之鉸鏈其餘部分。例如,鉸鏈可為IgG2/IgG1鉸鏈,且可包含例如IgG2之上鉸鏈及中間鉸鏈以及IgG1之下鉸鏈。鉸鏈可具有效應子功能或喪失效應子功能。例如,野生型IgG1之下鉸鏈提供效應子功能。
術語「CH1結構域」係指連接可變結構域與重鏈恆定結構域中之鉸鏈之重鏈恆定區。如本文所使用,CH1結構域起始於A118且終止於V215。術語「CH1結構域」包括野生型CH1結構域(例如對於IgG1具有SEQ ID NO:98且對於IgG2具有SEQ ID NO:124)以及其變體(例如非天然CH1結構域或經修飾CH1結構域)。例如,術語「CH1結構域」包括野生型CH1結構域及其具有1個、2個、3個、4個、5個、1-3個、1-5個、3-5個及/或至多5個、4個、3個、2個或1突變(例如取代、缺失或添加)之變體。實例性CH1結構域包括具有改變抗體之生物活性(例如ADCC、CDC或半衰期)之突變的CH1結構域。本文提供影響抗體生物活性之CH1結構域修飾。CH1結構域可包含取代C131S,該取代可產生IgG2抗體或包含IgG2抗體之至少一部分(例如鉸鏈及/或鉸鏈及CH1)的抗體,以採用與抗體之A形式相對之B形式。
術語「CH2結構域」係指連接重鏈恆定結構域中之鉸鏈與CH3結 構域之重鏈恆定區。如本文所使用,CH2結構域起始於P238且終止於K340。術語「CH2結構域」包括野生型CH2結構域(例如對於IgG1具有SEQ ID NO:137;表31)以及其變體(例如非天然CH2結構域或經修飾CH2結構域)。例如,術語「CH2結構域」包括野生型CH2結構域及其具有1個、2個、3個、4個、5個、1-3個、1-5個、3-5個及/或至多5個、4個、3個、2個或1個突變(例如取代、缺失或添加)之變體。實例性CH2結構域包括具有改變抗體之生物活性(例如ADCC、CDC或半衰期)之突變的CH2結構域。在某些實施例中,CH2結構域包含降低效應子功能之取代A330S/P331S。本文提供影響抗體生物活性之其他CH2結構域修飾。
術語「CH3結構域」係指在重鏈恆定結構域中為CH2結構域之C末端之重鏈恆定區。如本文所使用,CH3結構域起始於G341且終止於K447。術語「CH3結構域」包括野生型CH3結構域(例如對於IgG1具有SEQ ID NO:138;表31)以及其變體(例如非天然CH3結構域或經修飾CH3結構域)。例如,術語「CH3結構域」包括野生型CH3結構域及其具有1個、2個、3個、4個、5個、1-3個、1-5個、3-5個及/或至多5個、4個、3個、2個或1個突變(例如取代、缺失或添加)之變體。實例性CH3結構域包括具有改變抗體之生物活性(例如ADCC、CDC或半衰期)之突變的CH3結構域。本文提供影響抗體生物活性之CH3結構域修飾。
「CL結構域」係指輕鏈之恆定結構域。術語「CL結構域」包括野生型CL結構域及其變體(例如包含C214S之變體)。
「天然序列Fc區」或「天然序列Fc」包含與自然界中發現之Fc區之胺基酸序列一致的胺基酸序列。天然序列人類Fc區包括天然序列人類IgG1 Fc區;天然序列人類IgG2 Fc區;天然序列人類IgG3 Fc區;及天然序列人類IgG4 Fc區以及其天然變體。天然序列Fc包括Fc之多 個異型(例如,參見Jefferis等人(2009)mAbs 1:1)。
術語「表位」或「抗原決定簇」係指抗原(例如CD73)上免疫球蛋白或抗體特異性結合之位點。蛋白質抗原內之表位可自連續胺基酸(通常為線性表位)或藉由蛋白質之三級摺疊并置之非連續胺基酸二者形成(通常為構象表位)。在暴露於變性溶劑時,通常但不始終保留自連續胺基酸形成之表位,而在用變性溶劑處理時通常丟失由三級摺疊形成之表位。在獨特空間構象中,表位通常包括至少3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個或15個胺基酸。確定由給定抗體結合表位之方法(即表位定位)為業內所熟知,且包括例如免疫印跡及免疫沈澱分析,其中測試重疊或連續肽(例如來自CD73)與給定抗體(例如抗CD73抗體)之反應性。確定表位之空間構象的方法包括業內之技術及彼等本文所述者,例如x射線結晶學、2維核磁共振及HDX-MS(例如,參見Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology,第66卷,G.E.Morris編輯(1996))。
術語「表位定位」係指鑒定抗原上參與抗體-抗原識別之分子決定簇之方法。
關於兩種或更多種抗體之術語「結合至相同表位」意指該等抗體結合至胺基酸殘基之同一區段,如藉由給定方法所確定。用於確定抗體是否結合至與本文所述抗體「相同之CD73上之表位」之技術包括例如表位定位方法,例如抗原:抗體複合物晶體之x射線分析(其提供表位之原子解析度)及氫/氘交換質譜法(HDX-MS)。其他方法監測抗體與抗原片段(例如蛋白水解片段)或抗原之突變變化形式的結合,其中由於抗原序列內胺基酸殘基之修飾所致之結合損失通常視為可指示表位組份(例如丙胺酸掃描誘變-Cunningham及Wells(1985)Science 244:1081)。另外,亦可使用表位定位之計算組合方法。該等方法取決於所關注抗體自組合噬菌體展示肽文庫親和分離特異性短肽的能 力。
「與另一抗體競爭結合至靶」之抗體係指抑制(部分或完全)另一抗體與靶之結合之抗體。可使用已知競爭實驗(例如實例中所述之彼等)來確定兩種抗體是否彼此競爭結合至靶,即一種抗體是否抑制另一抗體與靶之結合以及抑制程度。在某些實施例中,抗體與另一抗體競爭與靶之結合,且抑制至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%的該結合。抑制或競爭之程度可端視哪種抗體為「封阻抗體」(即首先與靶一起培育之冷抗體)而不同。競爭分析可如例如以下文獻中所述來實施:Ed Harlow及David Lane,Cold Spring Harb Protoc;2006;doi:10.1101/pdb.prot4277或「Using Antibodies」,Ed Harlow及David Lane,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY,USA 1999之第11章。競爭性抗體結合至相同表位、重疊表位或毗鄰表位(例如,如藉由位阻所證實)。
其他競爭性結合分析包括:固相直接或間接放射性免疫分析(RIA)、固相直接或間接酶免疫分析(EIA)、夾心競爭分析(參見Stahli等人,Methods in Enzymology 9:242(1983));固相直接生物素-抗生物素蛋白EIA(參見Kirkland等人,J.Immunol.137:3614(1986));固相直接標記分析、固相直接標記夾心分析(參見Harlow及Lane,Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press(1988));使用I-125標記之固相直接標記RIA(參見Morel等人,Mol.Immunol.25(1):7(1988));固相直接生物素-抗生物素蛋白EIA(Cheung等人,Virology 176:546(1990));及直接標記RIA。(Moldenhauer等人,Scand.J.Immunol.32:77(1990))。
如本文所使用,術語「特異性結合(specific binding)」、「選擇性結合(selective binding)」、「選擇性結合(selectively binds)」及「特異性結合(specifically binds)」係指抗體結合至預定抗原上之表位 但不結合至其他抗原。通常,抗體(i)當在BIACORE® 2000表面電漿子共振儀器中藉由例如使用預定抗原(例如重組人類CD73)作為分析物及抗體作為配體之表面電漿子共振(SPR)技術或抗體與抗原陽性細胞之結合之Scatchard分析測定時,以約小於10-7M、例如約小於10-8M、10-9M或10-10M或甚至更小之平衡解離常數(KD)結合,及(ii)結合至預定抗原且親和力係其與除預定抗原或密切相關抗原外之非特異性抗原(例如BSA、酪蛋白)結合之親和力的至少兩倍。因此,除非另有指示,否則「特異性結合至人類CD73」之抗體係指以10-7M或更小、例如約小於10-8M、10-9M或10-10M或甚至更小之KD結合至可溶性或細胞結合之人類CD73之抗體。「與食蟹獼猴CD73交叉反應」之抗體係指以10-7M或更小、例如小於10-8M、10-9M或10-10M或甚至更小之KD結合至食蟹獼猴CD73之抗體。在某些實施例中,在標準結合分析中,不與來自非人類物種之CD73交叉反應之抗體展現針對該等蛋白質基本上不可檢測之結合。
如本文所使用,術語「K締合」或「Ka」欲指具體抗體-抗原相互作用之締合速率常數,而如本文所使用,術語「K解離」或「Kd」欲指具體抗體-抗原相互作用之解離速率常數。如本文所使用,術語「KD」欲指平衡解離常數,其係自Kd對Ka之比率(即Kd/Ka)獲得且以莫耳濃度(M)表示。可使用業內充分確立之方法測定抗體之KD值。測定抗體之KD之較佳方法係藉由使用表面電漿子共振,較佳使用生物感測器系統,例如Biacore®表面電漿子共振系統或流式細胞術或Scatchard分析。
術語「EC50」在使用抗體或其抗原結合片段之活體外或活體內分析背景下係指誘導50%最大反應、即介於最大反應與基線之間之中途的反應之抗體或其抗原結合部分之濃度。
如由抗體(例如抗CD73抗體)介導之抗體或受體(例如CD73)之 「內化速率」可由例如內化之T1/2表示,例如如實例中所顯示。藉由使抗體之重鏈恆定區變成經修飾重鏈恆定區(例如含有IgG2鉸鏈及IgG2 CH1結構域者),抗CD73抗體之內化速率可增強或增加至少10%、30%、50%、75%、2倍、3倍、5倍或更大,從而使T1/2縮短至少10%、30%、50%、75%、2倍、3倍、5倍或更大。例如,作為具有10分鐘之T1/2之替代,經修飾重鏈恆定區可增加內化速率且由此使T1/2縮短至5分鐘(即內化速率增加兩倍或T1/2減小兩倍)。「T1/2」定義為如自將抗體添加至細胞中時之時間所量測,達成最大內化一半時之時間。最大內化程度可為針對抗體濃度繪製之表示內化之圖的平穩段之內化程度。經修飾重鏈恆定區可使抗體之最大內化程度增加至少10%、30%、50%、75%、2倍、3倍、5倍或更大。比較不同抗體(例如具有經修飾重鏈恆定區之抗體及不具經修飾重鏈恆定區之同一抗體)之內化功效之另一方式係藉由比較其在給定抗體濃度(例如100nM)下或給定時間(例如2分鐘、5分鐘、10分鐘或30分鐘)下之內化程度。比較內化程度亦可藉由比較EC50內化程度來進行。一種抗體之內化程度可相對於給定(參照)抗體(例如本文所述抗體,例如11F11或CD73.4-IgG2CS-IgG1或CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f)之內化程度來定義,且可指示為佔使用給定(參照)抗體所獲得值之百分比。內化程度與藉由該等方法中之任一者相比可增強至少10%、30%、50%、75%、2倍、3倍、5倍或更大。
如本文所使用之術語「天然」在應用於目標時係指可在自然界中發現目標之事實。例如,存在於可自自然界來源分離且尚未在實驗室中經人類有意修飾之生物體(包括病毒)中的多肽或多核苷酸序列係天然的。
「多肽」係指包含至少兩個連續連接之胺基酸殘基之鏈,且鏈之長度無上限。蛋白質中之一或多個胺基酸殘基可含有修飾,例如 (但不限於)糖基化、磷酸化或二硫鍵。「蛋白質」可包含一或多個多肽。
如本文所使用,術語「核酸分子」意欲包括DNA分子及RNA分子。核酸分子可為單鏈或雙鏈,且可為cDNA。
亦提供本文所述SEQ ID NO中所述序列之「保守序列修飾」,即不消除由核苷酸序列編碼或含有胺基酸序列之抗體與抗原之結合的核苷酸及胺基酸序列修飾。該等保守序列修飾包括保守核苷酸及胺基酸取代以及核苷酸及胺基酸添加及缺失。例如,可藉由業內已知之標準技術(例如定點誘變及PCR介導之誘變)將修飾引入本文所述之SEQ ID NO中。保守序列修飾包括用具有類似側鏈之胺基酸殘基替代胺基酸殘基之保守胺基酸取代。業內已定義具有類似側鏈之胺基酸殘基之家族。該等家族包括具有鹼性側鏈之胺基酸(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、具有酸性側鏈之胺基酸(例如天冬胺酸、麩胺酸)、具有不帶電極性側鏈之胺基酸(例如甘胺酸、天冬醯胺、麩胺醯胺、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸、色胺酸)、具有非極性側鏈之胺基酸(例如丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸)、具有β分枝側鏈之胺基酸(例如蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)及具有芳香族側鏈之胺基酸(例如酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。因此,抗CD73抗體中之所預測非必需胺基酸殘基較佳經來自同一側鏈家族之另一胺基酸殘基替代。鑒定不消除抗原結合之核苷酸及胺基酸保守取代之方法為業內所熟知(例如,參見Brummell等人,Biochem.32:1180-1187(1993);Kobayashi等人,Protein Eng.12(10):879-884(1999);及Burks等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 94:412-417(1997))。
另一選擇為,在另一實施例中,可藉由例如飽和誘變沿抗CD73抗體編碼序列之全部或一部分隨機引入突變,且可針對改良之結合活 性篩選所得經修飾抗CD73抗體。
對於核酸而言,術語「實質同源性」指示,兩個核酸或其指定序列在最佳比對及比較(其中適當插入或缺失核苷酸)時有至少約80%之核苷酸、通常至少約90%至95%、且更佳至少約98%至99.5%之核苷酸一致。另一選擇為,當區段將在選擇性雜交條件下與鏈之補體雜交時存在實質同源性。
對於多肽而言,術語「實質同源性」指示,兩個多肽或其指定序列在最佳比對及比較(其中適當插入或缺失核苷酸)時有至少約80%之胺基酸、通常至少約90%至95%、且更佳至少約98%至99.5%之胺基酸一致。
兩條序列之間之一致性%在最佳比對序列時隨該等序列所共享之一致位置數而變化(即同源性%=一致位置數/總位置數×100),其中最佳比對係考慮到為達成兩條序列之最佳比對而需要引入之空位數及每一空位之長度來確定。兩條序列之間之序列比較及一致性%測定可使用數學演算法來完成,如下文非限制性實例中所述。
兩條核苷酸序列之間之一致性%可使用GCG軟體包(可在http://www.gcg.com上獲得)中之GAP程式、使用NWSgapdna.CMP矩陣及空位權重40、50、60、70或80以及長度權重1、2、3、4、5或6來測定。兩條核苷酸或胺基酸序列之間之一致性%亦可使用已納入比對程式(2.0版)中之E.Meyers及W.Miller(CABIOS,4:11-17(1989))演算法、使用PAM120權重殘基表、空位長度罰分12及空位罰分4來測定。另外,兩條胺基酸序列之間之一致性%可使用已納入GCG軟體包(可在http://www.gcg.com上獲得)中之空位程式中之Needleman及Wunsch(J.Mol.Biol.(48):444-453(1970))演算法、使用Blossum 62矩陣或PAM250矩陣及空位權重16、14、12、10、8、6或4以及長度權重1、2、3、4、5或6來測定。
本文所述之核酸及蛋白質序列可進一步用作「詢問序列」來實施針對公共數據庫之檢索,以例如鑒定相關序列。該等檢索可使用Altschul等人(1990)J.Mol.Biol.215:403-10之NBLAST及XBLAST程式(2.0版)來實施。BLAST核苷酸檢索可使用NBLAST程式、評分=100、字長=12來實施,以獲得與本文所述核酸分子同源之核苷酸序列。BLAST蛋白質檢索可使用XBLAST程式、評分=50、字長=3來實施,以獲得與本文所述蛋白質分子同源之胺基酸序列。為獲得空位比對用於比較目的,可如Altschul等人(1997)Nucleic Acids Res.25(17):3389-3402中所述使用空位BLAST。在使用BLAST及空位BLAST程式時,可使用各別程式(例如XBLAST及NBLAST)之預設參數。參見www.ncbi.nlm.nih.gov。
該等核酸可存在於完整細胞中,存在於細胞溶解物中,或以部分純化或實質上純淨之形式存在。當藉由標準技術實施純化以清除其他細胞組份或其他污染物(例如其他細胞核酸(例如染色體之其他部分)或蛋白質)時,核酸係「經分離」或「實質上純淨」的,該等標準技術包括鹼/SDS處理、CsCl顯帶、管柱層析、瓊脂糖凝膠電泳及業內熟知之其他方法。參見F.Ausubel等人編輯.Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing and Wiley Interscience,New York(1987)。
核酸(例如cDNA)可根據標準技術進行突變以提供基因序列。對於編碼序列,該等突變可視需要影響胺基酸序列。具體而言,涵蓋與天然V序列、D序列、J序列、恆定序列、切換序列及本文所述之其他該等序列實質上同源或源自其之DNA序列。
如本文所使用,術語「載體」欲指能夠轉運與其連接之另一核酸之核酸分子。一類載體為「質體」,其係指其他DNA區段可接合至其中之環形雙鏈DNA環。另一類載體為病毒載體,其中其他DNA區 段可接合至病毒基因組中。某些載體能夠在已引入其之宿主細胞中進行自主複製(例如,具有細菌複製起點之細菌載體及游離型哺乳動物載體)。其他載體(例如非游離型哺乳動物載體)可在引入宿主細胞中時整合至該宿主細胞之基因組中,並藉此隨宿主基因組一同複製。另外,某些載體能夠引導與其可操作連接之基因的表現。該等載體在本文中稱為「重組表現載體」(或簡稱為「表現載體」)。一般而言,用於重組DNA技術中之表現載體通常呈質體形式。在本說明書中,「質體」與「載體」可互換使用,此乃因質體係載體之最常用形式。然而,本發明亦包括提供等效功能之其他形式之表現載體,例如病毒載體(例如複製缺陷型反轉錄病毒、腺病毒及腺相關病毒)。
如本文所使用,術語「重組宿主細胞」(或簡稱為「宿主細胞」)欲指包含並非天然存在於細胞中之核酸之細胞,且可為已引入重組表現載體中之細胞。應理解,該等術語不僅欲指具體個體細胞且亦欲指此一細胞之子代。由於突變或環境影響可使後續各代發生某些改變,故該子代實際上可能與親代細胞不同,但仍包括於如本文所使用之術語「宿主細胞」之範疇內。
如本文所使用,術語「抗原」係指任何天然或合成免疫原性物質,例如蛋白質、肽或半抗原。抗原可為CD73或其片段。
「免疫反應」係指脊椎動物內針對外源藥劑之生物反應,該反應保護生物體免受該等藥劑及其所致疾病的影響。免疫反應係由免疫系統之細胞(例如T淋巴球、B淋巴球、自然殺手(NK)細胞、巨噬細胞、嗜酸性球、肥大細胞、樹突狀細胞或嗜中性球)及由該等細胞中之任一者或肝臟產生之可溶性大分子(包括抗體、細胞介素及補體)的作用來調介,該作用導致選擇性靶向、結合、損傷、破壞及/或自脊椎動物身體消除侵襲性病原體、感染病原體之細胞或組織、癌性或其他異常細胞或(在自體免疫或病理性發炎之情形下)正常人類細胞或組 織。免疫反應(response)或反應(reaction)包括例如活化或抑制T細胞(例如效應T細胞或Th細胞,例如CD4+或CD8+ T細胞)或抑制Treg細胞。
「免疫調節劑」或「免疫調控劑」係指可參與調節、調控或改變免疫反應之藥劑,例如信號傳導路徑之組份。「調節」、「調控」或「改變」免疫反應係指免疫系統細胞或該細胞(例如效應T細胞)活性之任何變化。該調節包括免疫系統之刺激或阻抑,其可藉由不同細胞類型數量之增加或減少、該等細胞活性之增加或降低或可發生在免疫系統內之任何其他變化來表現。業內已鑒定出抑制性及刺激性免疫調節劑二者,其中之一些在腫瘤微環境中可具有增強的功能。免疫調節劑可位於T細胞之表面上。「免疫調節靶」或「免疫調控靶」係靶向物質、藥劑、部分、化合物或分子之結合、且其活性因物質、藥劑、部分、化合物或分子之結合而改變之免疫調節劑。免疫調節靶包括例如細胞表面上之受體(「免疫調節受體」)及受體配體(「免疫調節配體」)。
增加的刺激免疫反應或免疫系統之能力可源自T細胞共刺激受體之增強的激動劑活性及/或抑制性受體之增強的拮抗劑活性。增加的刺激免疫反應或免疫系統之能力可藉由量測免疫反應之分析(例如量測細胞介素或趨化介素釋放、細胞溶解活性(直接在靶細胞上測定或經由檢測CD107a或顆粒酶間接測定)及增殖之變化的分析)中EC50或最大活性程度之增加倍數來反映。刺激免疫反應或免疫系統活性之能力可增強至少10%、30%、50%、75%、2倍、3倍、5倍或更大。
「免疫療法」係指藉由包含誘導、增強、阻抑或以其他方式改變免疫反應之方法治療患有疾病或具有感染疾病或遭受疾病復發之風險之個體。
「免疫刺激療法」或「免疫刺激性療法」係指可增加(誘導或增 強)個體之免疫反應來例如治療癌症之療法。
「強化內源免疫反應」意指增加個體之現有免疫反應之有效性或效能。有效性及效能之此增加可例如藉由克服阻抑內源宿主免疫反應之機制或藉由刺激增強內源宿主免疫反應之機制來達成。
「T效應子」(「Teff」)細胞係指具有細胞溶解活性之T細胞(例如CD4+及CD8+ T細胞)以及T輔助(Th)細胞,其分泌細胞介素並活化且引導其他免疫細胞,但不包括調控T細胞(Treg細胞)。
如本文所使用,術語「連接」係指兩個或更多個分子之締合。連接可為共價或非共價。連接亦可為遺傳連接(即以重組方式融合)。該等連接可使用眾多種業內公認技術(例如化學偶聯及重組蛋白產生)來達成。
如本文所使用,「投與」係指使用彼等熟習此項技術者已知之多種方法及遞送系統中之任一者將包含治療劑之組合物物理引入至個體。本文所述抗體之較佳投與途徑包括靜脈內、腹膜內、肌內、皮下、脊柱或其他非經腸投與途徑,例如藉由注射或輸注。如本文所使用之片語「非經腸投與」意指除經腸及局部投與外之投與模式,通常藉由注射,且包括(但不限於)靜脈內、腹膜內、肌內、動脈內、鞘內、淋巴內、病灶內、囊內、眶內、心內、皮內、經氣管、皮下、表皮下、關節內、囊下、蛛網膜下、脊柱內、硬膜外及胸骨內注射及輸注,以及活體內電穿孔。另一選擇為,本文所述抗體可經由經腸途徑來投與,例如局部、表皮或黏膜投與途徑,例如經鼻內、經口、經陰道、經直腸、經舌下或經局部。亦可實施例如一次、複數次投與及/或經一或多個延長時段實施投與。
如本文所使用,術語「T細胞介導之反應」係指由T細胞、包括效應T細胞(例如CD8+細胞)及輔助T細胞(例如CD4+細胞)介導之反應。T細胞介導之反應包括例如T細胞毒性及增殖。
如本文所使用,術語「細胞毒性T淋巴球(CTL)反應」係指由細胞毒性T細胞誘導之免疫反應。CTL反應主要係由CD8+ T細胞介導。
如本文所使用,術語「抑制」或「阻斷」(例如,提及CD73結合或活性之抑制/阻斷)可互換使用且涵蓋部分及完全抑制/阻斷二者。
如本文所使用,「癌症」係指特徵在於身體中之不受控異常細胞生長之廣泛疾病群。失調的細胞分裂可形成侵襲鄰近組織且可經由淋巴系統或血流轉移至身體遠端之惡性腫瘤或細胞。
如本文所使用,術語「治療(treat)」、「治療(treating)」及「治療(treatment)」係指對個體實施或向個體投與活性劑以逆轉、緩和、改善、抑制或減緩或預防與疾病相關之症狀、併發症、病況或生物化學標記之進展、發展、嚴重程度或復發的任何類型之干預或過程。預防係指投與未患疾病之個體來預防疾病發生或若發生疾病最小化其效應。
「血液惡性病」包括淋巴瘤、白血病、骨髓瘤或淋巴樣惡性病以及脾及淋巴結癌症。實例性淋巴瘤包括B細胞淋巴瘤及T細胞淋巴瘤二者。B細胞淋巴瘤包括霍奇金氏淋巴瘤(Hodgkin's lymphomas)及大多數非霍奇金氏淋巴瘤二者。B細胞淋巴瘤之非限制性實例包括瀰漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、黏膜相關淋巴組織淋巴瘤、小細胞淋巴球性淋巴瘤(與慢性淋巴球性白血病重疊)、外套細胞淋巴瘤(MCL)、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)、縱膈大B細胞淋巴瘤、瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症(Waldenström macroglobulinemia)、結節性邊緣帶B細胞淋巴瘤、脾邊緣帶淋巴瘤、血管內大B細胞淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、淋巴瘤樣肉芽腫病。T細胞淋巴瘤之非限制性實例包括結節外T細胞淋巴瘤、皮膚T細胞淋巴瘤、退行性大細胞淋巴瘤及血管免疫母細胞性T細胞淋巴瘤。血液惡性病亦包括白血病,例如(但不限於)繼發性白血病、慢性淋巴球性白血病、急性骨髓 性白血病、慢性骨髓性白血病及急性淋巴母細胞性白血病。血液惡性病進一步包括骨髓瘤,例如(但不限於)多發性骨髓瘤及鬱積型多發性骨髓瘤。術語血液惡性病涵蓋其他血液及/或B細胞或T細胞相關之癌症。
術語「有效劑量(effective dose)」或「有效劑量(effective dosage)」定義為足以達成或至少部分達成期望效應之量。藥物或治療劑之「治療有效量」或「治療有效劑量」係藥物在單獨或與另一治療劑組合使用時促進疾病消退之任何量,該疾病消退係藉由減輕疾病症狀之嚴重程度、增加無疾病症狀期之頻率及持續時間或預防因感病性所致之損害或失能來證實。藥物之「預防有效量」或「預防有效劑量」係藥物在單獨或與另一治療劑組合投與具有罹患疾病或遭受疾病復發之風險之個體時抑制該疾病之發展或復發的量。治療或預防劑促進疾病消退或抑制疾病之發展或復發之能力可使用熟習此項技術者已知之多種方法來評估,例如在臨床試驗期間在人類個體中,在預測在人類中之功效之動物模型系統中或藉由在活體外分析中分析藥劑之活性。
舉例而言,抗癌劑係在個體中減緩癌症進展或促進癌症消退之藥物。在較佳實施例中,治療有效量之藥物促進癌症消退至消除癌症之點。「促進癌症消退」意指在患者中投與有效量之單獨或與抗癌劑組合之藥物可降低腫瘤生長或大小、腫瘤壞死,降低至少一種疾病症狀之嚴重程度,增加無疾病症狀期之頻率及持續時間,預防因感病性所致之損害或失能或以其他方式改善疾病症狀。藥理有效性係指藥物促進患者中之癌症消退之能力。生理學安全性係指源自藥物投與之可接受低的毒性程度或在細胞、器官及/或生物體層面上之其他不良生理學效應(不良效應)。
舉例而言,對於腫瘤之治療,相對於未經治療之個體,治療有 效量或劑量之藥物較佳抑制至少約20%、更佳至少約40%、甚至更佳至少約60%、且仍更佳至少約80%之細胞生長或腫瘤生長。在最佳實施例中,治療有效量或劑量之藥物完全抑制細胞生長或腫瘤生長,即較佳抑制100%之細胞生長或腫瘤生長。可使用下文所述之分析評估化合物抑制腫瘤生長之能力。另一選擇為,可藉由檢查化合物抑制細胞生長之能力來評估組合物之此特性,該抑制可在活體外藉由熟習此項技術者已知之分析來量測。在本文所述之其他較佳實施例中,可觀察到腫瘤消退且可持續至少約20天、更佳至少約40天或甚至更佳至少約60天之時段。
術語「患者」及「個體」係指接受預防或治療性治療之任何人類或非人類動物。例如,可使用本文所述之方法及組合物來治療患有癌症之個體。術語「非人類動物」包括所有脊椎動物,例如哺乳動物及非哺乳動物,例如非人類靈長類動物、綿羊、狗、牛、雞、兩棲動物、爬行動物等。
本文所述之多個態樣進一步詳細闡述於以下子部分中。
I. 抗CD73抗體
本文闡述特徵在於具體功能特徵或特性之抗體,例如全人類抗體。例如,該等抗體特異性結合人類CD73。另外,抗體可與來自一或多種非人類靈長類動物之CD73(例如食蟹獼猴CD73)交叉反應。
除特異性結合至可溶性及/或膜結合之人類CD73外,本文所述抗體展現以下功能特性中之一或多者:(a)抑制CD73酶活性,從而減少腺苷產生;(b)結合至食蟹獼猴CD73;(c)抗體介導之CD73內化至細胞(例如腫瘤細胞)中;及(d)結合至包含人類CD73之胺基酸65-83及157-172之構象表位。
較佳地,抗CD73抗體以高親和力、例如以10-7M或更小、10-8M 或更小、10-9M或更小、10-10M或更小、10-11M或更小、10-12M或更小、10-12M至10-7M、10-11M至10-7M、10-10M至10-7M、10-9M至10-7M或10-10M至10-8M之KD結合至人類CD73(單體或二聚體;亞型1或2)。在某些實施例中,例如如藉由BIACORE® SPR分析所測定,抗CD73抗體以10-7M或更小、10-8M或更小、10-9M(1nM)或更小、10-10M或更小、10-12M至10-7M、10-11M至10-7M、10-10M至10-7M、10-9M至10-7M、10-8M至10-7M或10-10M至10-8M之KD結合至可溶性人類CD73。在某些實施例中,例如如本文所進一步闡述所測定,抗CD73抗體以小於1nM之EC50結合至經結合(例如細胞膜結合之例如Calu6細胞)人類CD73。在某些實施例中,例如如藉由流式細胞術及Scatchard曲線所測定,抗CD73抗體以10-7M或更小、10-8M或更小、10-9M(1nM)或更小、10-10M或更小、10-12M至10-7M、10-11M至10-8M、10-10M至10-8M、10-9M至10-8M、10-11M至10-9M、10-10M至10-8M或10-10M至10-9M之KD結合至經結合人類CD73(例如細胞膜結合之人類CD73)。在某些實施例中,抗CD73抗體以10-7M或更小、10-8M或更小、10-9M(1nM)或更小、10-10M或更小、10-12M至10-7M、10-11M至10-7M、10-10M至10-7M、10-9M至10-7M、10-10M至10-8M或10-8M至10-7M之KD結合至可溶性人類CD73,且以10-7M或更小、10-8M或更小、10-9M(1nM)或更小、10-10M或更小、10-12M至10-7M、10-11M至10-8M、10-10M至10-8M、10-9M至10-8M、10-11M至10-9M或10-10M至10-9M之KD或EC50結合至經結合人類CD73(例如細胞膜結合之人類CD73)。
在某些實施例中,如例如本文所進一步闡述所測定,抗CD73抗體以高親和力結合至食蟹獼猴CD73,例如其以0.1nM至10nM之EC50、例如小於1nM之EC50結合至表現食蟹獼猴CD73之CHO細胞。
在某些實施例中,如例如在實例中所量測,本文所述之抗CD73 抗體亦以100nM或更小、10nM或更小、1nM或更小、100nM至0.01nM、100nM至0.1nM、100nM至1nM或10nM至0.1nM之EC50結合至食蟹獼猴CD73,例如結合至膜結合之食蟹獼猴CD73,例如結合至表現食蟹獼猴CD73之CHO細胞。
在某些實施例中,如例如藉由SEC所測定,抗CD73抗體係至少90%、95%、98%或99%單體。抗CD73抗體之生物物理特徵亦可類似於本文所述抗體之彼等或在其範圍內。
在某些實施例中,抗CD73抗體抑制人類及/或食蟹獼猴CD73之酶活性,例如如在CD73珠粒結合分析中所測定,或如在細胞(例如Calu6、SKMEL24或H292細胞)中所測定,或如在例如如實例中進一步闡述之活體內分析(例如異種移植腫瘤模型)中所測定。抗CD73抗體之抑制活性可至少類似於本文所述抗體之彼等或在其範圍內。例如,抗CD73抗體可以小於10nM或小於5nM或介於1nM至10nM或5nM至10nM範圍內之EC50抑制人類CD73(例如結合至固體之CD73)酶活性(腺苷產生)。抗CD73抗體可以小於10nM或小於1nM或介於0.1nM至10nM、0.1nM至1nM或0.1nM至0.5nM範圍內之EC50抑制人類CD73對細胞(例如Calu6細胞)之活性。
在某些實施例中,抗CD73抗體係由其所結合之細胞內化(並調介CD73內化),如例如在高含量內化分析中或藉由FACS或流式細胞術所測定,如實例中進一步闡述。抗CD73抗體之內化特徵(EC50、T1/2及Ymax)及至平穩段時間可至少類似於實例中所述抗體之彼等或在其範圍內。在某些實施例中,在一或多種細胞系(實例中所述之彼等)中,抗CD73抗體之內化T1/2小於1小時,例如小於30分鐘、小於15分鐘、小於12分鐘、小於10分鐘、小於7分鐘或甚至小於5分鐘,如例如在高含量內化分析(闡述於實例6A中)中所測定。在某些實施例中,抗CD73抗體在10小時或更短、6小時或更短、5小時或更短、4小時或更 短、3小時或更短、2小時或更短、1小時或更短、例如在10分鐘至10小時、10分鐘至6小時、1小時至10小時或1小時至6小時範圍內達到最大抗CD73抗體介導之內化,如例如使用如例如實例6A中所述之高含量內化分析或使用如例如實例6B中所述之流式細胞術所測定。抗CD73抗體介導之CD73最大內化程度可為至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%或更大,此端視細胞類型而定。例如,如在實例中所述之高含量內化分析中所量測,在Calu6細胞中抗CD73抗體介導之CD73內化之EC50可小於10nM,例如為0.1nM至10nM或1nM至10nM或1nM至5nM,且Ymax為至少90%或至少95%。
抗CD73抗體(例如,具有IgG2鉸鏈或IgG2鉸鏈及IgG2 CH1結構域之抗體)可調介如在例如如實例6A中所述之高含量內化分析中所量測之以下CD73內化特徵:-EC50為10nM或更小、5nM或更小、1nM或更小或0.1nM至10nM或0.1nM至1nM;在Calu6細胞中Ymax(最大內化百分比)為至少90%、95%或98%,且在Calu6細胞中T1/2小於30分鐘或小於10分鐘;-在人類細胞(例如Calu6細胞、HCC44細胞、H2030細胞、H2228細胞、HCC15細胞、SKLU1細胞、SKMES1細胞或SW900細胞)中,T1/2小於30分鐘或小於10分鐘。
抗CD73抗體(例如,具有IgG2鉸鏈或IgG2鉸鏈及IgG2 CH1結構域之抗體)可調介如藉由例如如實例6B中所述之流式細胞術所量測之以下CD73內化特徵:-在Calu6細胞中,T1/2為1小時或更短且Ymax為至少70%;-在NCI-H292細胞中,T1/2為30分鐘或更短且Ymax為至少70%;-在SNUC1細胞中,T1/2為2小時或更短且Ymax為至少30%;及/或-在NCI-H1437細胞中,T1/2為30分鐘或更短且Ymax為至少 60%。
在某些實施例中,抗CD73抗體係bin抗體,即其與11F11、而不與4C3競爭結合至人類CD73。
在某些實施例中,抗CD73抗體結合至表位,例如人類CD73之N末端部分中之構象表位,例如位於人類CD73之胺基酸65-83(SEQ ID NO:96)內之表位,如藉由例如如實例中進一步闡述之HDX-MS所測定。在某些實施例中,抗CD73抗體結合至人類CD73之胺基酸157-172(SEQ ID NO:97),或結合至位於人類CD73之胺基酸157-172(SEQ ID NO:97)內之表位,如藉由例如HDX-MS所測定。另一選擇為,抗CD73抗體結合至表位,例如人類CD73之N末端部分中之不連續表位,如藉由例如HDX-MS所測定。
在某些實施例中,抗CD73抗體結合至人類CD73之胺基酸65至83及胺基酸157-172,或結合至人類CD73亞型1或2之胺基酸65至83及胺基酸157-172(即胺基酸序列FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97))內之表位,如藉由例如HDX-MS所測定。在某些實施例中,抗CD73抗體結合至人類CD73之胺基酸65至83及胺基酸157-172之全部或一部分,如藉由例如HDX-MS所測定。在某些實施例中,抗CD73抗體結合至糖基化及非糖基化人類CD73二者。在某些實施例中,抗CD73抗體僅結合至糖基化CD73且不結合至非糖基化CD73。
抗CD73抗體可與包含本文所述CDR或可變區(例如,CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11之彼等)之抗CD73抗體競爭結合至CD73(或抑制其結合)。在某些實施例中,抗CD73抗體抑制CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11、4C3、4D4、10D2、11A6、24H2、5F8、6E11及/或7A11與人 類CD73至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%的結合。在某些實施例中,CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11抑制抗CD73抗體與人類CD73至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%的結合。在某些實施例中,抗CD73抗體抑制結合CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11與人類CD73至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%的結合,且CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11抑制抗CD73抗體與人類CD73至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%的結合(例如,在兩個方向上競爭)。競爭實驗可如例如本文例如實例中所進一步闡述來實施。
在某些實施例中,抗CD73抗體抑制CD73酶活性及/或在細胞中內化而無需多價交聯,如例如藉由缺少FcR結合之需要所測定。
在某些實施例中,抗CD73抗體具有表3中所列示之1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個或11個特徵。
表3:抗CD73抗體之潛在特徵
(1)例如以例如如藉由BIACORE® SPR分析所量測10nM或更小(例如0.01nM至10nM)之KD結合至人類CD73,例如珠粒結合之人類單體及二聚體人類CD73亞型1及2;(2)例如以1nM或更小(例如0.01nM至1nM)之EC50結合至膜結合之人類CD73;(3)例如以10nM或更小(例如0.01nM至10nM)之EC50結合至食 蟹獼猴CD73,例如結合至膜結合之食蟹獼猴CD73;(4)例如以10nM或更小之EC50抑制人類CD73酶活性;(5)例如以10nM或更小之EC50抑制食蟹獼猴CD73酶活性;(6)以10nM或更小之EC50抑制Calu6細胞中之內源(細胞)人類CD73酶活性;(7)抑制活體內人類CD73酶活性;(8)例如以小於1小時、30分鐘或10分鐘之T1/2及/或至少70%、80%或90%之Ymax內化(例如抗體介導之(或依賴性)CD73內化)至細胞中;(9)結合至人類CD73上之構象表位,例如胺基酸序列(SEQ ID NO:1)內包括胺基酸殘基FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及/或LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)之全部或一部分之不連續表位;(10)在任一方向或兩個方向上與CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11競爭結合至人類CD73;及(11)以與CD73.4類似之模式與人類CD73相互作用,如藉由X射線結晶學所測定。
應理解,如根據業內已知之方法確定並在本文中闡述之展現該等功能特性中之一或多者(例如生物化學、免疫化學、細胞、生理學或其他生物活性或諸如此類)之抗體與具體活性相對於在抗體不存在下(例如,或在存在不相關特異性之對照抗體時)所觀察到的活性統計學上顯著之差異有關。在某些實施例中,本文所揭示之抗CD73抗體使所量測參數(例如腫瘤體積、腫瘤轉移、腺苷含量、cAMP含量)減小所量測參數之至少10%,更佳減小至少20%、30%、40%、50%、 60%、70%、80%或90%,且在某些較佳實施例中減小92%、94%、95%、97%、98%或99%以上。反之,本文所揭示之抗CD73抗體使所量測參數增加至少10%,例如增加至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、100%(即2倍)、3倍、5倍或10倍。
業內已知評估抗體對不同物種之CD73之結合能力之標準分析,包括例如ELISA、西方印跡(Western blot)及RIA。適宜分析詳細闡述於實例中。亦可藉由業內已知之標準分析(例如藉由BIACORE® SPR分析)評價抗體之結合動力學(例如結合親和力)。評估抗體對CD73之功能特性之效應(例如腺苷產生、腫瘤生長及轉移、T細胞抑制)的分析進一步詳細闡述於下文及實例中。
在某些實施例中,抗CD73抗體並非天然(native)抗體或並非天然(naturally-occurring)抗體。例如,抗CD73抗體與天然抗體之轉譯後修飾之不同之處在於例如具有更多、更少或不同類型之轉譯後修飾。
在某些實施例中,抗CD73抗體例如藉由自T細胞表面去除CD73及/或藉由抑制其酶活性來刺激Teff(T效應子)功能及/或降低Treg功能。
在某些實施例中,抗CD3抗體包含至少一個IgG2鉸鏈及亦視情況一個IgG2 CH1結構域或鉸鏈及/或CH1結構域之片段或衍生物及抗體形式A(例如,參見Allen等人(2009)Biochemistry 48:3755)。在某些實施例中,抗CD3抗體包含至少一個IgG2鉸鏈亦及視情況IgG2 CH1結構域或鉸鏈及/或CH1結構域之片段或衍生物,且該抗體已採用形式B(例如,參見Allen等人(2009)Biochemistry 48:3755)。
本文提供以下抗人類CD73抗體:(i)包含結合至人類CD73上類似於11F11所結合區域之區域、但不結合至類似於4C3所結合區域之區域的可變區(即為bin抗體);(ii)以10nM或更小之Kd結合至單體及二聚體人類CD73;(iii)以小於10nM之EC50抑制人類CD73對例如細 胞(例如Calu6細胞)之酶活性(將AMP轉換成腺苷);及(iv)調介細胞中之抗體依賴性CD73內化,例如在人類細胞(例如Calu6細胞、H2228細胞、HCC15細胞H2030細胞、SNUC1細胞)中,T1/2為1小時或更短(或30分鐘或更短或10分鐘或更短),Ymax為50%或更大(或60%或更大、70%或更大、80%或更大或90%或更大)。在某些實施例中,抗體包含IgG2鉸鏈或IgG2鉸鏈及IgG2 CH1結構域。本文提供以下抗人類CD73抗體:(i)包含結合至人類CD73上類似於11F11所結合區域之區域、但不結合至類似於4C3所結合區域之區域的可變區(即為bin抗體);(ii)以10nM或更小之Kd結合至單體及二聚體人類CD73,如藉由SPR(Biacore)所測定;(iii)以小於10nM之EC50抑制人類CD73對例如細胞(例如Calu6細胞)之酶活性(將AMP轉換成腺苷);及(iv)調介細胞中之抗體依賴性CD73內化,例如在人類Calu6、H2228、HCC15或H2030細胞中,T1/2為30分鐘或更短,Ymax為80%或更大,如使用實例6A中所述之高含量內化分析所測定。
在較佳實施例中,本文所述之抗CD73抗體無顯著毒性。例如,抗CD73抗體對人類之器官(例如肝、腎、腦、肺及心臟中之一或多者)無顯著毒性,如例如在臨床試驗中所測定。在某些實施例中,抗CD73抗體不會顯著觸發不期望免疫反應,例如自體免疫或發炎。
II. 實例性抗CD73抗體 抗CD73抗體之可變區
本文所述之具體抗體係具有抗體11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11、7A11、CD73.3-1、CD73.3-2或CD73.3-3、CD73.4-1及CD73.4-1-2、CD73.4-2、CD73.5-1及CD73.5-2、CD73.6-1及CD73.6-2、CD73.7-1及CD73.7-2、CD73.8-1及CD73.8-2、CD73.9-1及CD73.9-2、CD73.10-1及CD73.10-2以及CD73.11之CDR及/或可變區序列之抗 體(例如單株抗體),以及與其可變區或CDR序列具有至少80%一致性(例如至少85%、至少90%、至少95%或至少99%一致性)之抗體。表4陳述每一抗體之VH及VL區CDR之SEQ ID NO以及VH及VL區之SEQ ID NO。如實例中進一步闡述,對於某些重鏈可存在一條以上之輕鏈,且交替輕鏈之SEQ ID NO亦提供於下表中。
Figure 104138281-A0202-12-0053-3
Figure 104138281-A0202-12-0054-4
本文提供包含重鏈及輕鏈可變區之經分離抗體或其抗原結合部分,其中重鏈可變區包含選自由以下組成之群之胺基酸序列:SEQ ID NO:4、16、32、40、52、60、68、80、88、135及170-177。
亦提供包含重鏈及輕鏈可變區之經分離抗體或其抗原結合部分,其中輕鏈可變區包含選自由以下組成之群之胺基酸序列:SEQ ID NO:8、12、20、24、28、36、44、48、56、64、72、76、84、92及238。
本文提供經分離抗體或其抗原結合部分,其包含:(a)分別包含SEQ ID NO:135及8之重鏈及輕鏈可變區序列;(b)分別包含SEQ ID NO:135及12之重鏈及輕鏈可變區序列;(c)分別包含SEQ ID NO:4及8之重鏈及輕鏈可變區序列;(d)分別包含SEQ ID NO:4及12之重鏈及輕鏈可變區序列;(e)分別包含SEQ ID NO:16及20之重鏈及輕鏈可變區序列;(f)分別包含SEQ ID NO:16及24之重鏈及輕鏈可變區序列;(g)分別包含SEQ ID NO:16及28之重鏈及輕鏈可變區序列;(h)分別包含SEQ ID NO:32及36之重鏈及輕鏈可變區序列;(i)分別包含SEQ ID NO:40及44之重鏈及輕鏈可變區序列; (j)分別包含SEQ ID NO:40及48之重鏈及輕鏈可變區序列;(k)分別包含SEQ ID NO:52及56之重鏈及輕鏈可變區序列;(l)分別包含SEQ ID NO:60及64之重鏈及輕鏈可變區序列;(m)分別包含SEQ ID NO:68及72之重鏈及輕鏈可變區序列;(n)分別包含SEQ ID NO:68及76之重鏈及輕鏈可變區序列;(o)分別包含SEQ ID NO:68及238之重鏈及輕鏈可變區序列;(p)分別包含SEQ ID NO:80及84之重鏈及輕鏈可變區序列;(q)分別包含SEQ ID NO:88及92之重鏈及輕鏈可變區序列;(r)分別包含SEQ ID NO:170及20之重鏈及輕鏈可變區序列;(s)分別包含SEQ ID NO:170及24之重鏈及輕鏈可變區序列;(t)分別包含SEQ ID NO:170及28之重鏈及輕鏈可變區序列;(u)分別包含SEQ ID NO:171及8之重鏈及輕鏈可變區序列;(v)分別包含SEQ ID NO:171及12之重鏈及輕鏈可變區序列;(w)分別包含SEQ ID NO:172及8之重鏈及輕鏈可變區序列;(x)分別包含SEQ ID NO:172及12之重鏈及輕鏈可變區序列;(y)分別包含SEQ ID NO:173及8之重鏈及輕鏈可變區序列;(z)分別包含SEQ ID NO:173及12之重鏈及輕鏈可變區序列;(a2)分別包含SEQ ID NO:174及8之重鏈及輕鏈可變區序列;(b2)分別包含SEQ ID NO:174及12之重鏈及輕鏈可變區序列;(c2)分別包含SEQ ID NO:175及8之重鏈及輕鏈可變區序列;(d2)分別包含SEQ ID NO:175及12之重鏈及輕鏈可變區序列;(e2)分別包含SEQ ID NO:176及8之重鏈及輕鏈可變區序列;(f2)分別包含SEQ ID NO:176及12之重鏈及輕鏈可變區序列;或(g2)分別包含SEQ ID NO:177及36之重鏈及輕鏈可變區序列。
抗CD73抗體可包含本文所述抗CD73抗體(例如,CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、11F11、4C3-1、4C3-2、 4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、5F8-3、6E11及7A11或其組合)之重鏈及輕鏈CDR1、CDR2及CDR3。
鑒於該等抗體中之每一者皆結合至CD73且抗原結合特異性主要係由CDR1區、2區及3區提供,可「混合並匹配」VH CDR1、2及3序列以及VL CDR1、2及3序列(即可混合並匹配來自不同抗體之CDR,但每一抗體必須含有VH CDR1、2及3以及VL CDR1、2及3),以產生本文所述之其他抗CD73結合分子。可使用上文及實例中所述之結合分析(例如ELISA)來測試該等「混合並匹配」抗體之CD73結合。較佳地,當混合並匹配VH CDR序列時,來自具體VH序列之CDR1、CDR2及/或CDR3序列經結構類似之CDR序列替代。同樣,當混合並匹配VL CDR序列時,來自具體VL序列之CDR1、CDR2及/或CDR3序列較佳經結構類似之CDR序列替代。熟習此項技術者將容易明瞭,可藉由用來自本文針對單株抗體CD73.4-1、CD73.4-2、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11所揭示之CDR序列之結構類似之序列取代一或多條VH及/或VL CDR區序列產生新穎VH及VL序列。可選擇具有等效於或優於本文所揭示特定抗體之結合親和力、生物活性及/或其他特性之「混合並匹配」抗體用於本發明方法中。
本文提供經分離抗體或其抗原結合部分,其包含:(a)重鏈可變區CDR1,其包含選自由以下組成之群之胺基酸序列:SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89;(b)重鏈可變區CDR2,其包含選自由以下組成之群之胺基酸序列:SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90;(c)重鏈可變區CDR3,其包含選自由以下組成之群之胺基酸序列:SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91;(d)輕鏈可變區CDR1,其包含選自由以下組成之群之胺基酸序 列:SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85及93;(e)輕鏈可變區CDR2,其包含選自由以下組成之群之胺基酸序列:SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86及94;及(f)輕鏈可變區CDR3,其包含選自由以下組成之群之胺基酸序列:SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87及95;其中該抗體特異性結合至人類CD73。
在某些實施例中,抗體包含重鏈及輕鏈可變區,其中重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3區包含SEQ ID NO:5-7;17-19;33-35;41-43;53-55;61-63;69-71;81-83;或89-91;其中該抗體特異性結合至人類CD73。
在某些實施例中,抗體包含重鏈及輕鏈可變區,其中輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3區包含:(a)SEQ ID NO:9-11;13-15;21-23;25-27;29-31;37-39;45-47;49-51;57-59;65-67;73-75;77-79;85-87;或93-95;其中該抗體特異性結合至人類CD73。
在某些實施例中,抗體包含重鏈及輕鏈可變區,其中:(a)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:5-7,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:9-11;(b)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:5-7,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:13-15;(c)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:17-19,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:21-23; (d)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:17-19,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:25-27;(e)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:17-19,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:29-31;(f)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:33-35,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:37-39;(g)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:41-43,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:45-47;(h)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:41-43,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:49-51;(i)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:53-55,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:57-59;(j)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:61-63,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:65-67;(k)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:69-71,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:73-75;(l)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:69-71,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:77- 79;(m)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:81-83,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:85-87;或(n)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:89-91,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別包含SEQ ID NO:93-95;其中該抗體特異性結合至人類CD73,且視情況具有表3中所列示之一或多個特徵,例如抑制AMP去磷酸化之能力及調介受體依賴性CD73內化之能力。
在某些實施例中,抗體包含重鏈及輕鏈可變區,其中:(a)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:5-7組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:9-11組成;(b)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:5-7組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:13-15組成;(c)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:17-19組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:21-23組成;(d)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:17-19組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:25-27組成;(e)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:17-19組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:29-31組成; (f)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:33-35組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:37-39組成;(g)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:41-43組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:45-47組成;(h)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:41-43組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:49-51組成;(i)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:53-55組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:57-59組成;(j)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:61-63組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:65-67組成;(k)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:69-71組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:73-75組成;(l)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:69-71組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:77-79組成;(m)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:81-83組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:85-87組成;或(n)重鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO:89-91組成,且輕鏈可變區CDR1、CDR2及CDR3分別係由SEQ ID NO: 93-95組成;其中該抗體特異性結合至人類CD73,且視情況具有表3中所列示之一或多個特徵,例如抑制AMP去磷酸化之能力及調介受體依賴性CD73內化之能力。
抗CD73抗體之重鏈恆定結構域
本文所述抗CD73抗體之重鏈恆定區可具有任何同型,例如IgG1、IgG2、IgG3及IgG4或其組合及/或其修飾。抗CD73抗體可具有效應子功能或可具有降低的或無效應子功能。在某些實施例中,本文所述之抗CD73抗體包含向抗體提供增強的特性之經修飾重鏈恆定區。如實例中所顯示,具有IgG2鉸鏈及視情況IgG2 CH1結構域之抗CD73抗體(例如具有11F11抗體之可變區之彼等)相對於具有相同可變區但具有非IgG2鉸鏈或CH1之抗體(例如,相對於具有IgG1鉸鏈或IgG1鉸鏈及IgG1 CH1之抗體)內化較佳且較快。例如,在結合至細胞膜上之CD73時,包含11F11抗體之可變區且包含IgG2鉸鏈及視情況IgG2 CH1以及IgG1 CH2及IgG1 CH3結構域且無論具或不具效應子功能之抗體相對於具有IgG1鉸鏈或IgG1鉸鏈及IgG1 CH1結構域之相同抗體更有效地內化至細胞中。如本文進一步顯示,具有IgG2鉸鏈及IgG1同型抗體之剩餘部分的CD73抗體比其中鉸鏈具有IgG1同型之相同抗體更有效地內化。除IgG2鉸鏈外具有IgG2 CH1結構域之抗體比CH1結構域為IgG1 CH1結構域之相同抗體甚至更有效地內化。如本文進一步顯示,與具有IgG1鉸鏈或IgG1鉸鏈及IgG1 CH1之抗體相比,具有IgG2鉸鏈及視情況IgG2 CH1之抗CD73抗體亦形成較大抗體/抗原複合物。增加的內化似乎與增加的抗體/抗原複合物大小相關。如實例中進一步闡述,增強的內化似乎並不與抗體之較高或較低親和力相關。因此,本文提供具有調介抗體介導之CD73內化之經修飾重鏈恆定區之抗CD73抗體,且其中具有經修飾重鏈恆定區之抗體以與具有 不同重鏈恆定區之相同抗體類似之親和力結合至CD73。
在某些實施例中,CD73抗體包含包含IgG2同型之鉸鏈(「IgG2鉸鏈」)及CH1、CH2及CH3結構域之經修飾重鏈恆定區。在某些實施例中,經修飾重鏈恆定區包含IgG2鉸鏈以及CH1、CH2及CH3結構域,其中CH1、CH2及CH3結構域中之至少一者不具IgG2同型。在某些實施例中,經修飾重鏈恆定區包含IgG2同型之鉸鏈、IgG2同型之CH1,其中CH2及CH3結構域中之至少一者不具IgG2同型。IgG2鉸鏈可為野生型IgG2鉸鏈,例如野生型人類IgG2鉸鏈(例如,具有SEQ ID NO:136)或其變體,前提係相對於包含非IgG2鉸鏈及視情況非IgG2 CH1結構域之相同抗體之能力,IgG2鉸鏈保留賦予抗體增強的活性之能力(例如,增加的細胞內化;增強的酶活性抑制;增加的拮抗劑或阻斷活性;形成大抗體/抗原交聯複合物之能力;增加的刺激或增強免疫反應之能力;及/或增加的抗增生或抗腫瘤效應)。在某些實施例中,IgG2鉸鏈變體保留與野生型IgG2鉸鏈類似之剛性或剛度。鉸鏈或抗體之剛性可例如藉由電腦建模、電子顯微鏡、光譜法(例如核磁共振(NMR))、X射線結晶學(B因子)或沈澱速度分析型超速離心(AUC)來測定以量測或比較包含鉸鏈之抗體之回轉半徑。若包含鉸鏈之抗體的自上句所述測試中之一者獲得之值比具有不同鉸鏈(例如IgG1鉸鏈)之相同抗體之值小5%、10%、25%、50%、75%或100%,則鉸鏈或抗體可具有相對於另一鉸鏈類似或較高之剛性。熟習此項技術者將能夠根據測試藉由分別解釋該等測試之結果確定鉸鏈或抗體是否具有與另一鉸鏈或抗體至少類似之剛性。實例性人類IgG2鉸鏈變體係包含四個半胱胺酸殘基(即C219、C220、C226及C229)中一或多者之取代之IgG2鉸鏈。半胱胺酸可經絲胺酸替代。實例性IgG2鉸鏈係包含C219S突變之人類IgG2鉸鏈(例如SEQ ID NO:123)。其他可用IgG2鉸鏈變體包括包含C220、C226及/或C229取代(例如C220S、C226S或C229S突變(其 可與C219S突變組合))之人類IgG2鉸鏈。IgG2鉸鏈亦可為其中鉸鏈之一部分係另一同型之一部分的IgG2鉸鏈(即其為嵌合鉸鏈),前提係嵌合鉸鏈之剛性至少類似於野生型IgG2鉸鏈之剛性。例如,IgG2鉸鏈可為其中下鉸鏈(如表2中所定義)具有IgG1同型且為例如野生型IgG1下鉸鏈之IgG2鉸鏈。
若鉸鏈之超過一半之連續胺基酸來自一同型,則「雜合」或「嵌合」鉸鏈稱為具有特定同型。例如,具有IgG2之上鉸鏈及中間鉸鏈以及IgG1之下鉸鏈的鉸鏈視為IgG2鉸鏈。
在某些實施例中,經修飾重鏈恆定區包含為IgG1或IgG2同型之野生型CH1結構域(分別為「IgG1 CH1結構域」或「IgG2 CH1結構域」)之CH1結構域。亦可使用同型IgG3及IgG4之CH1結構域(分別為「IgG3 CH1結構域」及「IgG2 CH1結構域」)。CH1結構域亦可為野生型CH1結構域之變體,例如野生型IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 CH1結構域之變體。CH1結構域之實例性變體包括A114C、T173C及/或C131(例如C131S)。
在某些實施例中,經修飾重鏈恆定區包含為IgG1、IgG2、IgG3或IgG4同型之野生型CH2結構域(分別為「IgG1 CH2結構域」、「IgG2 CH2結構域」、「IgG3 CH2結構域」或「IgG4 CH2結構域」)之CH2結構域。CH2結構域亦可為野生型CH2結構域之變體,例如野生型IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 CH2結構域之變體。CH2結構域之實例性變體包括調節抗體Fc區之生物活性(例如ADCC或CDC)或調節抗體之半衰期或其穩定性的變體。在一個實施例中,CH2結構域係具有A330S及P331S突變之人類IgG1 CH2結構域,其中CH2結構域具有相對於不具該等突變之相同CH2突變降低的效應子功能。其他突變進一步陳述於本文別處。其他可用IgG2 CH1突變包括SE(S267E)、SELF(S267E/L328F)、SDIE(S239D/I332E)、SEFF及GASDALIE (G236A/S239D/A330L/I332E)突變。
在某些實施例中,經修飾重鏈恆定區包含為IgG1、IgG2、IgG3或IgG4同型之野生型CH3結構域(分別為「IgG1 CH3結構域」、「IgG2 CH3結構域」、「IgG3 CH3結構域」或「IgG4 CH3結構域」)之CH3結構域。CH3結構域亦可為野生型CH3結構域之變體,例如野生型IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 CH3結構域之變體。CH3結構域之實例性變體包括調節抗體Fc區之生物活性(例如ADCC或CDC)或調節抗體之半衰期或其穩定性的變體。
在某些實施例中,經修飾重鏈恆定區包含IgG2同型之鉸鏈及IgG2同型之CH1區。IgG2鉸鏈及CH1可為野生型IgG2鉸鏈及CH1或其變體,前提係其具有期望生物活性。在某些實施例中,經修飾重鏈恆定區包含包括C219S突變之IgG2鉸鏈及可為野生型或包含至多1-10個、1-5個、1-3個、1-2個或1個胺基酸取代、缺失或添加之IgG2 CH1。經修飾重鏈恆定區可進一步包含野生型或突變CH2及CH3結構域。例如,CD73抗體可包含包括IgG2 CH1結構域、可包含C219S之IgG2鉸鏈以及IgG1 CH2及CH3結構域的重鏈恆定結構域,其中CH2及CH3結構域可為較差效應子(effectorless),例如包含突變A330S及P331S。
通常,CH1、鉸鏈、CH2或CH3結構域之變體可包含1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個或更多個突變,及/或至多10個、9個、8個、7個、6個、5個、4個、3個、2個或1個突變,或1-10個或1-5個突變,或包含與相應野生型結構域(分別為CH1、鉸鏈、CH2或CH3結構域)之胺基酸序列至少約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之胺基酸序列,前提係包含特定變體之重鏈恆定區保留所需的生物活性。
表5陳述包含人類CH1、鉸鏈、CH2及/或CH3結構域之實例性人 類重鏈恆定區,其中每一結構域係野生型結構域或其向重鏈恆定區提供期望生物活性之變體。表5中之未填充單元格指示存在或不存在結構域,且若存在則可具有任一同型,例如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4。例如,包含表5中之重鏈恆定區1之抗體係包含包括至少一條IgG2鉸鏈且亦可包括CH1、CH2及/或CH3結構域之重鏈恆定區的抗體,且若存在則該CH1、CH2及/或CH3結構域具有IgG1、IgG2、IgG3或IgG4同型。作為用於理解表5之另一實例,包含重鏈恆定區8之抗體係包含包括IgG1 CH1結構域及IgG2鉸鏈、IgG1 CH2結構域且可或亦可不包括CH3結構域之重鏈恆定區的抗體,該CH3結構域若存在則可具有IgG1、IgG2、IgG3或IgG4同型。
Figure 104138281-A0202-12-0065-5
Figure 104138281-A0202-12-0066-6
在某些實施例中,抗CD73抗體包含表5中所顯示之重鏈恆定區,且具有相對於不包含此特定重鏈恆定區之包含重鏈恆定區之相同抗體增強的生物活性。在某些實施例中,包含表5中所顯示之重鏈恆定區之抗體具有相對於包含不包括IgG2鉸鏈及CH1結構域或相同IgG2鉸鏈及CH1結構域之重鏈恆定區的相同抗體增強的生物活性。在某些實施例中,包含表5中所顯示之重鏈恆定區之抗體具有相對於包含包括非IgG2鉸鏈且包括例如IgG1、IgG3或IgG4鉸鏈之重鏈恆定區的相同抗體增強的生物活性。在某些實施例中,包含表5中所顯示之重鏈恆定區之抗體具有相對於包含不包括相同CH1、鉸鏈、CH2或CH3結構域中一或多者之重鏈恆定區的相同抗體增強的生物活性。例如,在某些實施例中,包含表5中所顯示之重鏈恆定區之抗體具有相對於包含不包括IgG2鉸鏈及特定同型之CH1、CH2及/或CH3結構域之重鏈恆定區的相同抗體增強的生物活性。例如,包含表5中所顯示之重鏈恆定區22之抗體可具有相對於以下抗體增強的生物活性:(i)包含不包括IgG2鉸鏈且包括例如非IgG2鉸鏈(例如IgG1、IgG3或IgG4鉸鏈)之重鏈 恆定區的相同抗體;(ii)包含不包括IgG2鉸鏈及IgG1 CH1且包括例如非IgG2鉸鏈及/或非IgG1 CH1之重鏈恆定區的相同抗體;(iii)包含不包括IgG2鉸鏈及IgG2 CH2且包括例如非IgG2鉸鏈及/或非IgG2 CH2之重鏈恆定區的相同抗體;(iv)包含不包括IgG2鉸鏈及IgG1 CH3且包括例如非IgG2鉸鏈及/或非IgG1 CH3之重鏈恆定區的相同抗體;(v)包含不包括IgG2鉸鏈、IgG1 CH1及IgG2 CH2且包括例如非IgG2鉸鏈及/或非IgG1 CH1及/或非IgG2 CH2之重鏈恆定區的相同抗體;(vi)包含不包括IgG2鉸鏈、IgG1 CH1及IgG1 CH3且包括例如非IgG2鉸鏈及/或非IgG1 CH1及/或非IgG1 CH3之重鏈恆定區的相同抗體;(vii)包含不包括IgG2鉸鏈、IgG2 CH2及IgG1 CH3且包括例如非IgG2鉸鏈及/或非IgG2 CH及/或非IgG1 CH3之重鏈恆定區的相同抗體;(viii)或包含不包括IgG2鉸鏈、IgG1 CH1、IgG2 CH2及IgG1 CH3且包括例如非IgG2鉸鏈及/或非IgG1 CH1及/或非IgG2 CH2及/或非IgG1 CH3之重鏈恆定區的相同抗體。增強的生物活性可為以下中之一或多者:(a)增加的細胞內化;(b)增強的酶活性抑制;(c)增加的拮抗劑或阻斷活性;(d)形成大抗體/抗原交聯複合物之能力;(e)增加的刺激或增強免疫反應之能力;及/或(f)增加的抗增生或抗腫瘤效應,如本文進一步闡述。
在某些實施例中,用於改良包含非IgG2鉸鏈及/或非IgG2 CH1結構域之CD73抗體之生物活性的方法包含提供包含非IgG2鉸鏈及/或非IgG2 CH1結構域之抗CD73抗體,及分別用IgG2鉸鏈及IgG2 CH1結構域替代非IgG2鉸鏈及非IgG2 CH1結構域。用於改良不包含經修飾重鏈恆定區之CD73抗體之生物活性的方法可包含提供不包含經修飾重鏈恆定區之抗CD73抗體,及用經修飾重鏈恆定區替代其重鏈恆定區。
可連接至抗CD73可變區(例如本文所述之彼等)之實例性經修飾 重鏈恆定區提供於表6中,其陳述每一結構域之一致性。
Figure 104138281-A0202-12-0068-9
Figure 104138281-A0202-12-0069-10
Figure 104138281-A0202-12-0070-11
在某些實施例中,抗體包含經修飾重鏈恆定區,其包含包括SEQ ID NO:123、136、178或179或其變體之IgG2鉸鏈,例如包括以下胺基酸序列之IgG2鉸鏈:(i)與SEQ ID NO:123、136、178或179相差1個、2個、3個、4個或5個胺基酸取代、添加或缺失;(ii)與SEQ ID NO:123、136、178或179相差至多5個、4個、3個、2個或1個胺基酸取代、添加或缺失;(iii)與SEQ ID NO:123、136、178或179相差1-5個、1-3個、1-2個、2-5個或3-5個胺基酸取代、添加或缺失,及/或(iv)包含與SEQ ID NO:123、136、178或179至少約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之胺基酸序列,其中在(i)-(iv)中之任一者中,胺基酸取代可為保守胺基酸取代或非保守胺基酸取代;且其中經修飾重鏈恆定區具有相對於另一重鏈恆定區(例如,包含非IgG2鉸鏈之重鏈恆定區)或相對於包含非IgG2鉸鏈之相同經修飾重鏈恆定區增強的生物活性。例如,鉸鏈可為野生型,或包含C219S、C220S或C219S及C220S取代。
在某些實施例中,抗體包含經修飾重鏈恆定區,其包含包括SEQ ID NO:98之IgG1 CH1結構域、或包括SEQ ID NO:124或SEQ ID NO:98或124之變體的IgG2 CH1結構域,該變體(i)與SEQ ID NO:98或124相差1個、2個、3個、4個或5個胺基酸取代、添加或缺失;(ii)與SEQ ID NO:98或124相差至多5個、4個、3個、2個或1個胺基酸取代、添加或缺失;(iii)與SEQ ID NO:98或124相差1-5個、1-3個、1-2個、2-5個或3-5個胺基酸取代、添加或缺失,及/或(iv)包含與SEQ ID NO:98或124至少約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之胺基酸序列,其中在(i)-(iv)中之任一者中,胺基酸取代可為保守胺基酸取代或非保守胺基酸取代;且其中經修飾重鏈恆定區具有相對於另一重鏈恆定區(例如,包含非IgG2鉸鏈或非IgG2鉸鏈及CH1結構域之重鏈恆定區)或相對於包含非IgG2鉸鏈或非IgG2鉸鏈及CH1結構域之相同經修飾重鏈恆定區增強的生物活性。IgG2 CH1結構域可包含C131S或使含有IgG2鉸鏈及CH1之抗體採用A或B形式之其他突變。
在某些實施例中,抗體包含經修飾重鏈恆定區,其包含包括SEQ ID NO:137或125或SEQ ID NO:137或125之變體的IgG1 CH2結構域,該變體(i)與SEQ ID NO:137或125相差1個、2個、3個、4個或5個胺基酸取代、添加或缺失;(ii)與SEQ ID NO:137或125相差至多5個、4個、3個、2個或1個胺基酸取代、添加或缺失;(iii)與SEQ ID NO:137或125相差1-5個、1-3個、1-2個、2-5個或3-5個胺基酸取代、添加或缺失,及/或(iv)包含與SEQ ID NO:137或125至少約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之胺基酸序列,其中在(i)-(iv)中之任一者中,胺基酸取代可為保守胺基酸取代或非保守胺基酸取代;且其中經修飾重鏈恆定區具有相對於另一重鏈恆定區(例如,包含非IgG2鉸鏈之重鏈恆定區)或相對於包含非IgG2鉸鏈之相同經修飾重鏈恆定區增強的生物活性。
在某些實施例中,抗體包含經修飾重鏈恆定區,其包含包括SEQ ID NO:138或SEQ ID NO:138之變體的IgG1 CH3結構域,該變體(i)與SEQ ID NO:138相差1個、2個、3個、4個或5個胺基酸取代、添加或缺失;(ii)與SEQ ID NO:138相差至多5個、4個、3個、2個或1個胺基酸取代、添加或缺失;(iii)與SEQ ID NO:138相差1-5個、1-3個、1-2個、2-5個或3-5個胺基酸取代、添加或缺失,及/或(iv)包含 與SEQ ID NO:138至少約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之胺基酸序列,其中在(i)-(iv)中之任一者中,胺基酸取代可為保守胺基酸取代或非保守胺基酸取代;且其中經修飾重鏈恆定區具有相對於另一重鏈恆定區(例如,包含非IgG2鉸鏈之重鏈恆定區)或相對於包含非IgG2鉸鏈之相同經修飾重鏈恆定區增強的生物活性。
經修飾重鏈恆定區亦可包含上述CH1、鉸鏈、CH2及CH3結構域之組合。
在某些實施例中,CD73抗體包含包括SEQ ID NO:162-169及180-183中之任一者或SEQ ID NO:162-169及180-183中任一者之變體的經修飾重鏈恆定區,該變體(i)與SEQ ID NO:162-169及180-183相差1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個或更多個胺基酸取代、添加或缺失;(ii)與SEQ ID NO:162-169及180-183相差至多10個、9個、8個、7個、6個、5個、4個、3個、2個或1個胺基酸取代、添加或缺失;(iii)與SEQ ID NO:162-169及180-183相差1-5個、1-3個、1-2個、2-5個、3-5個、1-10個或5-10個胺基酸取代、添加或缺失,及/或(iv)包含與SEQ ID NO:162-169及180-183中之任一者至少約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之胺基酸序列,其中在(i)-(iv)中之任一者中,胺基酸取代可為保守胺基酸取代或非保守胺基酸取代;且其中經修飾重鏈恆定區具有相對於另一重鏈恆定區(例如,包含非IgG2鉸鏈或非IgG2 CH1結構域之重鏈恆定區)或相對於包含非IgG2鉸鏈及/或非IgG2 CH1結構域之相同經修飾重鏈恆定區增強的生物活性。
經修飾重鏈恆定區可具有(i)相對於野生型重鏈恆定區之類似、降低或增加的效應子功能(例如結合至FcγR,例如FcγRIIB),及/或(ii)相對於野生型重鏈恆定區之類似、降低或增加的半衰期(或結合至 FcRn受體)。
本文所述抗CD73抗體之VH結構域可連接至本文所述之重鏈恆定區。例如,圖18顯示抗體CD73.4之連接至重鏈恆定區IgG2CS-IgG1.1f(SEQ ID NO:133或169)之胺基酸序列。本文亦涵蓋包含重鏈之抗體,該重鏈包含與CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f之胺基酸序列(SEQ ID NO:133或189)相差至多1-30個、1-25個、1-20個、1-15個、1-10個、1-5個、1-4個、1-3個、1-2個或1個胺基酸(取代、添加或缺失)及/或與CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f重鏈之胺基酸序列(SEQ ID NO:133或189)至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的胺基酸序列。例如,本文涵蓋包含CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f之重鏈(SEQ ID NO:133或189)之抗體,且其中缺失或存在C末端K或GK或PGK。CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f(SEQ ID NO:133或189)之其他變體包括具有不同異型重鏈之彼等,且其中例如胺基酸356及358分別為D及L。變體包括具有在IgG2鉸鏈中突變之另一半胱胺酸(例如C220)(或具有C220S而非C219S)之彼等及不具突變A330S及/或P331S之彼等。CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f(SEQ ID NO:133或189)之變體較佳具有相對於CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f(SEQ ID NO:133或189)至少類似之生物化學特性及/或生物活性,例如內化效率、CD73酶活性抑制、對人類CD73之親和力及與相同或相似表位之結合。
在某些實施例中,抗CD73抗體或其抗原結合部分包含本文所述恆定區中之任一者,例如包含SEQ ID NO:126、127、129、130、162-169、180-183及267-284中所述之胺基酸序列之恆定區。
抗CD73抗體之輕鏈可包含包括SEQ ID NO:131或SEQ ID NO:131之變體的輕鏈恆定區,該變體(i)與SEQ ID NO:131相差1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個或更多個胺基酸取代、添加或缺失;(ii)與SEQ ID NO:131相差至多10個、9個、8個、 7個、6個、5個、4個、3個、2個或1個胺基酸取代、添加或缺失;(iii)與SEQ ID NO:131相差1-5個、1-3個、1-2個、2-5個、3-5個、1-10個或5-10個胺基酸取代、添加或缺失,及/或(iv)包含與SEQ ID NO:131至少約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之胺基酸序列,其中在(i)-(iv)中之任一者中,胺基酸取代可為保守胺基酸取代或非保守胺基酸取代。實例性CL突變包括C124S。
如本文所詳述包含與表31中所述重鏈或輕鏈中之任一者至少99%、98%、97%、96%、95%、90%、85%、80%、75%或70%一致之胺基酸序列之重鏈及輕鏈(或其可變區)可用於形成具有期望特徵(例如,本文進一步闡述之彼等)之抗人類CD73抗體。實例性變體係包含例如恆定結構域中之異型變化之彼等。如本文所述包含與表31中所述重鏈或輕鏈中之任一者相差至多1-30個、1-25個、1-20個、1-15個、1-10個、1-5個、1-4個、1-3個、1-2個或1個胺基酸(取代、添加或缺失)之胺基酸序列之重鏈及輕鏈(或其可變區)可用於形成具有期望特徵(例如,本文進一步闡述之彼等)之抗人類CD73抗體。
在多個實施例中,上述抗體展現表3中所列示之一或多種、兩種或更多種、三種或更多種、四種或更多種、五種或更多種、六種或更多種、七種或更多種、八種或更多種、九種或更多種、十種或所有功能特性。
該等抗體包括例如人類抗體、人類化抗體或嵌合抗體。
在一個實施例中,本文所述之抗CD73抗體結合至糖基化(例如N-偶聯或O-偶聯之糖基化)及非糖基化人類CD73。某些抗CD73抗體可結合至糖基化、而非非糖基化CD73或結合至非糖基化而非糖基化CD73。
在一個實施例中,本文所述之抗CD73抗體結合至構象表位。
在一個實施例中,本文所述之抗CD73抗體結合至人類CD73之以 下區域內之胺基酸殘基:FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96),且該等胺基酸殘基對應於人類CD73(SEQ ID NO:1或2)之胺基酸殘基65-83,如藉由例如HDX-MS所測定。
在一個實施例中,本文所述之抗CD73抗體結合至人類CD73中之以下胺基酸殘基之全部或一部分:FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96),其對應於人類CD73(SEQ ID NO:1或2)之胺基酸殘基65-83,如藉由例如HDX-MS所測定。
在一個實施例中,本文所述之抗CD73抗體結合至人類CD73內之以下區域內之胺基酸殘基:LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)
其對應於人類CD73(SEQ ID NO:1或2)之胺基酸殘基157-172,如藉由例如HDX-MS所測定。
在一個實施例中,本文所述之抗CD73抗體結合至人類CD73內之以下胺基酸殘基之全部或一部分:LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97),其對應於人類CD73(SEQ ID NO:1或2)之胺基酸殘基157-172,如藉由例如HDX-MS所測定。
在一個實施例中,本文所述之抗CD73抗體結合至人類CD73(SEQ ID NO:1或2)之以下區域內之不連續胺基酸殘基:FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)。
在一個實施例中,本文所述之抗CD73抗體結合至人類CD73(SEQ ID NO:1或2)之以下區域內之不連續胺基酸殘基的全部或一部分:FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97),其對應於人類CD73(SEQ ID NO:1或2)之胺基酸殘基65-83及157-172,如藉由例如HDX-MS所 測定。
在某些實施例中,抗CD73抗體與人類CD73(對應於表30中所顯示之彼等)具有相互作用,如藉由X射線結晶學所測定。抗體可共享表30中所顯示之與人類CD73相互作用之至少50%、60%、70%、80%、90%、95%或99%。
III. 具有具體種系序列之抗體
在某些實施例中,抗CD73抗體包含來自具體種系重鏈免疫球蛋白基因之重鏈可變區及/或來自具體種系輕鏈免疫球蛋白基因之輕鏈可變區。
如本文所展示,業內已製備包含為人類種系VH 3-33基因、VH 3-10基因、VH 3-15基因、VH 3-16、JH6b基因、VH 6-19基因、VH 4-34基因及/或JH3b基因之產物或源自該等基因之重鏈可變區的特異性針對CD73之人類抗體。因此,本文提供特異性針對人類CD73之經分離單株抗體或其抗原結合部分,其包含為選自由以下組成之群之人類VH種系基因之產物或源自該基因之重鏈可變區:VH 3-33、VH 3-10、VH 3-15、VH 3-16、VH 6-19及VH 4-34。
業內已製備包含為人類種系VK L6基因、VK L18基因、VK L15基因、VK L20基因、VK A27基因、JK5基因、JK4基因、JK2基因及JK1基因之產物或源自該等基因之輕鏈可變區的特異性針對CD73之人類抗體。因此,本文提供特異性針對人類CD73之經分離單株抗體或其抗原結合部分,其包含為選自由以下組成之群之人類VK種系基因之產物或源自該基因之輕鏈可變區:VK L6、VK L18、VK L15、VK L20及VK A27。
本文所述之較佳抗體係包含為一種上文所列示人類種系VH基因之產物或源自該基因的重鏈可變區且亦包含為一種上文所列示人類種系VK基因之產物或源自該基因的輕鏈可變區之彼等。
如本文所使用,若人類抗體之可變區係自使用人類種系免疫球蛋白基因之系統獲得,則該抗體包含為具體種系序列之「產物」或「源自」該序列之重鏈或輕鏈可變區。該等系統包括用所關注抗原免疫攜載人類免疫球蛋白基因之轉基因小鼠或用所關注抗原篩選展示於噬菌體上之人類免疫球蛋白基因文庫。為人類種系免疫球蛋白序列之「產物」或「源自」該序列之人類抗體可藉由以下方式來鑒定:比較人類抗體之胺基酸序列與人類種系免疫球蛋白之胺基酸序列,並選擇序列最接近人類抗體序列(即最大一致性%)之人類種系免疫球蛋白序列。為具體人類種系免疫球蛋白序列之「產物」或「源自」該序列之人類抗體與種系序列相比可含有胺基酸差異,此乃因存在例如天然體細胞突變或有意引入定點突變。然而,所選人類抗體之胺基酸序列通常與由人類種系免疫球蛋白基因編碼之胺基酸序列至少90%一致,且含有當與其他物種之種系免疫球蛋白胺基酸序列(例如鼠類種系序列)相比時將人類抗體鑒定為人類之胺基酸殘基。在某些情形下,人類抗體之胺基酸序列可與由種系免疫球蛋白基因編碼之胺基酸序列至少95%或甚至至少96%、97%、98%或99%一致。通常,源自具體人類種系序列之人類抗體將展示與由人類種系免疫球蛋白基因編碼之胺基酸序列不大於10個的胺基酸差異。在某些情形下,人類抗體可展示與由種系免疫球蛋白基因編碼之胺基酸序列不大於5個或甚至不大於4個、3個、2個或1個的胺基酸差異。
IV. 同源抗體
本文涵蓋具有包含與本文所述較佳抗體之胺基酸序列同源之胺基酸序列之重鏈及輕鏈可變區的抗體,且其中該抗體保留本文所述抗CD73抗體之期望功能特性。
例如,經分離之抗CD73抗體或其抗原結合部分可包含重鏈可變區及輕鏈可變區,其中: (a)重鏈可變區包含分別與選自由SEQ ID NO:4、16、32、40、52、60、68、80、88、135及170-177組成之群之胺基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致、或分別包含相對於選自由SEQ ID NO:4、16、32、40、52、60、68、80、88、135及170-177組成之群之胺基酸序列1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個、1-5個、1-10個、1-15個、1-20個、1-25個或1-50個胺基酸變化(即胺基酸取代、添加或缺失)的胺基酸序列;(b)輕鏈可變區包含分別與選自由SEQ ID NO:8、12、20、24、28、36、44、48、56、64、72、76、84、92及138組成之群之胺基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致、或分別包含相對於選自由SEQ ID NO:8、12、20、24、28、36、44、48、56、64、72、76、84、92及238組成之群之胺基酸序列1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個、1-5個、1-10個、1-15個、1-20個、1-25個或1-50個胺基酸變化(即胺基酸取代、添加或缺失)的胺基酸序列;(c)該抗體特異性結合至CD73,且(d)該抗體展現表3中所列示之1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或所有功能特性。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含具有上文所論述之一致性%及/或胺基酸變化及功能(即(a)-(d))之重鏈及輕鏈可變區,其中重鏈可變區之CDR3包含選自由SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91組成之群之胺基酸序列,且視情況重鏈可變區之CDR1包含選自由SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89組成之群之胺基酸序列,且視情況重鏈可變區之CDR2包含選自由SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90組成之群之胺基酸序列。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含具有上文所論述之一致性% 及/或胺基酸變化及功能(即(a)-(d))之重鏈及輕鏈可變區,其中輕鏈可變區之CDR3包含選自由SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87、95及241組成之群之胺基酸序列,且視情況輕鏈可變區之CDR1包含選自由SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85、93及239組成之群之胺基酸序列,且視情況輕鏈可變區之CDR2包含選自由SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86、94及240組成之群之胺基酸序列。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含具有上文所論述之一致性%及/或胺基酸變化及功能(即(a)-(d))之重鏈及輕鏈可變區,其中重鏈可變區之CDR3包含選自由SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91組成之群之胺基酸序列,且視情況重鏈可變區之CDR1包含選自由SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89組成之群之胺基酸序列,且視情況重鏈可變區之CDR2包含選自由SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90組成之群之胺基酸序列,且其中輕鏈可變區之CDR3包含選SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87、95及241以下組成之群之胺基酸序列,且視情況輕鏈可變區之CDR1包含選自由SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85、93及239組成之群之胺基酸序列,且視情況輕鏈可變區之CDR2包含選自由SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86、94及240組成之群之胺基酸序列。
在多個實施例中,抗體可為例如人類抗體、人類化抗體或嵌合抗體。
經分離之抗CD73抗體或其抗原結合部分可包含重鏈及輕鏈,其中: (a)重鏈包含分別與選自由SEQ ID NO:100、103、107、109、112、114、116、119、121、133、184-210組成之群之胺基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致、或分別包含相對於選自由SEQ ID NO:100、103、107、109、112、114、116、119、121、133及184-210組成之群之胺基酸序列1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個、1-5個、1-10個、1-15個、1-20個、1-25個或1-50個胺基酸變化(即胺基酸取代、添加或缺失)的胺基酸序列;(b)輕鏈包含分別與選自由SEQ ID NO:101、102、104、105、106、108、110、111、113、115、117、118、120及122組成之群之胺基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致、或分別包含相對於選自由SEQ ID NO:101、102、104、105、106、108、110、111、113、115、117、118、120及122組成之群之胺基酸序列1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個、1-5個、1-10個、1-15個、1-20個、1-25個或1-50個胺基酸變化(即胺基酸取代、添加或缺失)的胺基酸序列;(c)該抗體特異性結合至CD73,且(d)該抗體展現表3中所列示之1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或所有功能特性。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含具有上文所論述之一致性%及/或胺基酸變化及功能(即(a)-(d))之重鏈及輕鏈,其中重鏈可變區之CDR3包含選自由SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91組成之群之胺基酸序列,且視情況重鏈可變區之CDR1包含選自由SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89組成之群之胺基酸序列,且視情況重鏈可變區之CDR2包含選自由SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90組成之群之胺基酸序列。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含具有上文所論述之一致性%及/或胺基酸變化及功能(即(a)-(d))之重鏈及輕鏈,其中輕鏈可變區之CDR3包含選自由SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87、95及241組成之群之胺基酸序列,且視情況輕鏈可變區之CDR1包含選自由SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85、93及239組成之群之胺基酸序列,且視情況輕鏈可變區之CDR2包含選自由SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86、94及240組成之群之胺基酸序列。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含具有上文所論述之一致性%及/或胺基酸變化及功能(即(a)-(d))之重鏈及輕鏈,其中重鏈可變區之CDR3包含選自由SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91組成之群之胺基酸序列,且視情況重鏈可變區之CDR1包含選自由SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89組成之群之胺基酸序列,且視情況重鏈可變區之CDR2包含選自由SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90組成之群之胺基酸序列,且其中輕鏈可變區之CDR3包含選自由SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87、95及241組成之群之胺基酸序列,且視情況輕鏈可變區之CDR1包含選自由SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85、93及239組成之群之胺基酸序列,且視情況輕鏈可變區之CDR2包含選自由SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86、94及240組成之群之胺基酸序列。
亦提供包含與CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11之相應CDR相差1個、2個、3個、4 個、5個、1-2個、1-3個、1-4個或1-5個胺基酸變化(即胺基酸取代、添加或缺失)之VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2及/或VLCDR3的抗CD73抗體。在某些實施例中,抗CD73抗體包含1個、2個、3個、4個、5個或6個CDR中之每一者中相對於CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、11F11、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11中之相應序列的1-5個胺基酸變化。在某些實施例中,抗CD73抗體包含所有CDR中相對於CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11中之CDR的總共1-5個胺基酸變化。
在某些實施例中,抗CD73抗體包含由CD73.4-1或CD73.4-2之CDR組成之VH及VL CDR,其中一或多個CDR中之一或多個胺基酸係本文所揭示之其他抗CD73抗體之彼等。
可在抗CD73抗體之可變區序列中製造之突變(例如取代、添加、缺失)可基於以下各項來確定:(i)引入抗體中之突變,如實例中所述;及(ii)本文所述抗CD73抗體之可變結構域中每一位置之胺基酸殘基之比較(參見表31及圖31):抗CD73抗體中某一位置之不同胺基酸可指示此位置之胺基酸殘基可在不顯著影響抗體之活性下變成另一胺基酸殘基;而若在若干或所有抗CD73抗體中之相同位置發現相同的胺基酸殘基,則此可指示應保留此具體胺基酸且不應變成另一殘基。實例性實施例提供於下文中。
在某些實施例中,可在本文所述抗CD73抗體之重鏈可變區之位置25(11F11中之...RLSCA T SGFTF...)引入框架取代(例如保守取代,例如至S或A)。例如,若此位置之胺基酸係T,則可引入A或S取代;若此位置之胺基酸係A,則可引入S或T取代;且若此位置之胺基酸係 S,則可引入T或A取代。抗體24H2、4D4、10D2、6E11、7A11、11A6及4C3在此位置具有A,11F11在此位置具有T,且73.5、73.7及73.9在此位置具有S。
類似地,在某些實施例中,可在重鏈可變區之胺基酸位置94(11F11中之...AEDTA V YYCAR...)引入框架取代(例如V至L或L至V)。例如,抗體11F11、73.3-73.10、24H2、4D4、5F8及10D2在此位置具有V,且6E11、7A11、11A6及4C3在此位置具有L。
在某些實施例中,可對本文所揭示抗CD73抗體之重鏈可變區CDR2製造胺基酸取代。例如,位置52之胺基酸(11F11中之...WVAVI L YDGSN...)可經W取代,或若此位置之胺基酸係W,則該胺基酸可經L取代(抗體11F11及73.4-73.7在此位置具有L,且抗體73.8-73.10、24H2及4D4在此位置具有W)。
類似地,在某些實施例中,位置54之胺基酸(11F11中之...VILYD G SNKYY...)可經S或E取代,或若此位置之胺基酸係S,則該胺基酸可經E取代。抗體11F11、73.4、73.5、24H2、10D2及5F8在此位置具有G,抗體73.6-73.9、6E11、7A11、4C3及73.3在此位置具有S,且抗體73.10及4D4在此位置具有E。
可基於使用與上文所述類似之原理比對圖31中之重鏈及輕鏈可變區序列來確定可變區中之其他容許取代。
可藉由誘變(例如定點誘變或PCR介導之誘變)核酸分子(例如,SEQ ID NO:139、142、146、148、151、153、155、158、160、237及/或SEQ ID NO:140、141、143、144、145、147、149、150、152、154、156、157、159、161或SEQ ID NO:134、243、246、250、252、255、257、259、262、264,及/或SEQ ID NO:244、245、247、248、249、251、253、254、256、258、260、261、263、265、266)獲得序列與CD73.3、CD73.4、CD73.5、CD73.6、 CD73.7、CD73.8、CD73.9、CD73.10、CD73.11、11F11、4C3、4D4、10D2、11A6、24H2、5F8、6E11及/或7A11之彼等(例如,分別地SEQ ID NO:4、16、32、40、52、60、68、80、88、135、170-177及SEQ ID NO:8、12、20、24、28、36、44、48、56、64、72、76、84、92之VH及VL區,或分別地SEQ ID NO:100、103、107、109、112、114、116、119、121、133及184-210及SEQ ID NO:101、102、104、105、106、108、110、111、113、115、117、118、120及122之重鏈及輕鏈,或CDR)同源的抗體,然後使用本文所述之功能分析測試所編碼經改變抗體之保留功能。
V. 具有保守修飾之抗體
抗CD73抗體可包含包括CDR1、CDR2及CDR3序列之重鏈可變區及包括CDR1、CDR2及CDR3序列之輕鏈可變區,其中該等CDR序列中之一或多者包含基於本文所述較佳抗體之指定胺基酸序列,例如CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11之指定胺基酸序列或其保守修飾,且其中該抗體保留本文所述抗CD73抗體之期望功能特性。因此,經分離之抗CD73抗體或其抗原結合部分可包含包括CDR1、CDR2及CDR3序列之重鏈可變區及包括CDR1、CDR2及CDR3序列之輕鏈可變區,其中:(a)重鏈可變區CDR3序列包含選自由SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91之胺基酸序列組成之群之胺基酸序列及其保守修飾,例如1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個或1-5個保守胺基酸取代;(b)輕鏈可變區CDR3序列包含選自由SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87及95之胺基酸序列組成之群之胺基酸序列及其保守修飾,例如1個、2個、3個、4個、5 個、1-2個、1-3個、1-4個或1-5個保守胺基酸取代;(c)該抗體特異性結合至CD73,且(d)該抗體展現表3中所列示之1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或所有功能特性。
在較佳實施例中,重鏈可變區CDR2序列包含選自由SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90之胺基酸序列組成之群之胺基酸序列及其保守修飾,例如1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個或1-5個保守胺基酸取代;且輕鏈可變區CDR2序列包含選自由SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86及94之胺基酸序列組成之群之胺基酸序列及其保守修飾,例如1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個或1-5個保守胺基酸取代。在另一較佳實施例中,重鏈可變區CDR1序列包含選自由SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89之胺基酸序列組成之群之胺基酸序列及其保守修飾,例如1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個或1-5個保守胺基酸取代;且輕鏈可變區CDR1序列包含選自由SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85及93之胺基酸序列組成之群之胺基酸序列及其保守修飾,例如1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個或1-5個保守胺基酸取代。
在多個實施例中,抗體可為例如人類抗體、人類化抗體或嵌合抗體。
亦可在抗體之非CDR或除CDR外之部分中製造保守胺基酸取代。例如,可在框架區或恆定區(例如Fc區)中製造保守胺基酸修飾。本文所述之任一取代可為保守取代。可變區或重鏈或輕鏈可包含相對於本文所提供之抗CD73抗體序列1個、2個、3個、4個、5個、1-2個、1-3個、1-4個、1-5個、1-10個、1-15個、1-20個、1-25個或1-50個保守胺 基酸取代。在某些實施例中,抗CD73抗體包含保守及非保守胺基酸修飾之組合。
VI. 結合與本文所述抗體相同之CD73上之表位或與本文所述抗體競爭結合至CD73之抗體
亦提供與本文所述之具體抗CD73抗體(例如,抗體CD73.4、CD73.3、11F11、4C3、4D4、10D2、11A6、24H2、5F8、6E11及7A11)競爭結合至CD73之抗體。該等競爭性抗體可基於在標準CD73結合分析中其競爭性抑制與單株抗體11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11、7A11及/或CD73.3或CD73.4(具有本文針對該等抗體所述之任何恆定區及輕鏈)中一或多者之CD73結合的能力來鑒定。例如,可使用標準ELISA分析或競爭性ELISA分析,其中將重組人類CD73蛋白固定在板上,添加不同濃度之未經標記之第一抗體,洗滌板,添加經標記之第二抗體,洗滌,並量測結合標記之量。若遞增濃度之未經標記(第一)抗體(亦稱為「封阻抗體」)抑制經標記(第二)抗體之結合,則認為第一抗體抑制第二抗體與板上靶之結合,或認為第一抗體與第二抗體之結合競爭。另外或另一選擇為,可使用BIACORE® SPR分析來評價該等抗體競爭之能力。測試抗體抑制本文所述抗CD73抗體與CD73結合之能力展示測試抗體可與該抗體競爭結合至CD73。
本文亦提供以下抗CD73抗體:抑制本文所述抗CD73抗體與細胞(例如腫瘤細胞)上之CD73至少10%、20%、30%、40%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的結合,及/或抑制其與細胞(例如腫瘤細胞)上之CD73至少10%、20%、30%、40%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的結合,例如如例 如藉由使用前一段落中所述之分析藉由ELISA或FACS所量測。
與本文所述之抗CD73抗體競爭結合之抗體可藉由使用業內已知之方法來鑒定。例如,可用如本文所述之人類CD73免疫小鼠,產生雜交瘤,且針對與本文所述抗體競爭結合至CD73之能力篩選所得單株抗體。亦可用含有抗體所結合之表位之較小CD73片段來免疫小鼠。該表位或包含該表位之區域可藉由例如針對與跨越CD73之一系列重疊肽之結合進行篩選來鑒定。另一選擇為,可使用Jespers等人,Biotechnology 12:899,1994之方法來指導具有與本文所述抗CD73抗體相同之表位且因此具有相似特性之抗體的選擇。使用噬菌體展示,首先使抗CD73抗體之重鏈與(較佳人類)輕鏈譜配對來選擇CD73結合抗體,且然後使新輕鏈與(較佳人類)重鏈譜配對來選擇具有與本文所述抗CD73抗體相同之表位或表位區域的(較佳人類)CD73結合抗體。另一選擇為,本文所述抗體之變體可藉由誘變編碼該抗體之重鏈及輕鏈之cDNA獲得。
用於確定結合至與本文所述抗體「相同之CD73上之表位」之抗體的技術包括例如表位定位方法,例如抗原:抗體複合物晶體之x射線分析,其提供表位之原子解析度。其他方法監測抗體與抗原片段或抗原之突變變化形式的結合,其中由於抗原序列內胺基酸殘基之修飾所致之結合損失通常視為可指示表位組份。另外,亦可使用表位定位之計算組合方法。各方法亦可取決於所關注抗體自組合噬菌體展示肽文庫親和分離特異性短肽(呈天然三維形式或呈變性形式)的能力。隨後該等肽可視為界定對應於用於篩選肽文庫之抗體之表位的引導者。對於表位定位而言,亦已研發出已顯示可定位構象不連續表位之計算演算法。
亦可使用如Cunningham及Wells(1989)Science 244:1081-1085所述之丙胺酸掃描誘變或CD73中胺基酸殘基之一些其他形式之點誘變 來確定抗CD73抗體之功能表位。然而,誘變研究亦可揭露對CD73之整體三維結構至關重要但不直接參與抗體-抗原接觸之胺基酸殘基,且因此,可能需要其他方法來確認使用此方法確定之功能表位。
亦可藉由評價抗體與包含CD73之片段(例如非變性或變性片段)之肽的結合來確定特異性抗體所結合之表位或表位區域(「表位區域」係包含該表位或與該表位重疊之區域)。可合成涵蓋CD73(例如人類CD73)之序列之一系列重疊肽,並針對例如在直接ELISA、競爭性ELISA(其中評價該肽防止抗體與結合至微量滴定板孔之CD73結合之能力)中或在晶片上之結合進行篩選。該等肽篩選方法可能無法檢測一些不連續功能表位,即涉及沿CD73多肽鏈之一級序列不連續之胺基酸殘基之功能表位。
亦可藉由基於MS之蛋白質足跡法(例如氫/氘交換質譜法(HDX-MS)及蛋白質之快速光化學氧化(FPOP))來鑒定表位。HDX-MS可如例如實例及Wei等人(2014)Drug Discovery Today 19:95中所進一步闡述來實施,其中之方法以引用方式明確併入本文中。FPOP可如例如Hambley及Gross(2005)J.American Soc.Mass Spectrometry 16:2057中所述來實施,其中之方法以引用方式明確併入本文中。
抗CD73抗體所結合之表位亦可藉由諸如以下等結構方法來確定:X射線晶體結構測定(例如WO2005/044853)、分子建模及核磁共振(NMR)光譜法(包括CD73在游離及與所關注抗體以複合物形式結合時不穩定醯胺氫之H-D交換速率之NMR測定)(Zinn-Justin等人(1992)Biochemistry 31,11335-11347;Zinn-Justin等人(1993)Biochemistry 32,6884-6891)。
關於X射線結晶學,可使用業內已知之任一方法來完成結晶(例如Giege等人(1994)Acta Crystallogr.D50:339-350;McPherson(1990)Eur.J.Biochem.189:1-23),該等方法包括微配液(例如Chayen(1997) Structure 5:1269-1274)、懸滴蒸汽擴散(例如McPherson(1976)J.Biol.Chem.251:6300-6303)、加晶種及透析。業內期望使用濃度為至少約1mg/mL且較佳為約10mg/mL至約20mg/mL之蛋白質製劑。在含有聚乙二醇1000-20,000(PEG;平均分子量介於約1000Da至約20,000Da範圍內)、較佳約5000Da至約7000Da、更佳約6000Da、且濃度介於約10%至約30%(w/v)範圍內之沈澱劑溶液中可達成最佳結晶。亦可期望納入蛋白質穩定劑,例如濃度介於約0.5%至約20%範圍內之甘油。亦可期望在沈澱劑溶液中存在濃度較佳介於約1mM至約1000mM範圍內之適宜鹽,例如氯化鈉、氯化鋰或檸檬酸鈉。較佳將沈澱劑緩衝至約3.0至約5.0、較佳約4.0之pH。可用於沈澱劑溶液中之特定緩衝液可變化且為業內所熟知(Scopes,Protein Purification:Principles and Practice,第3版(1994)Springer-Verlag,New York)。有用緩衝液之實例包括(但不限於)HEPES、Tris、MES及檸檬酸鹽。晶體可在寬範圍溫度(包括2℃、4℃、8℃及26℃)下生長。
抗體:抗原晶體可使用熟知X射線繞射技術來研究且可使用電腦軟體來精修,該電腦軟體係例如X-PLOR(Yale University,1992,由Molecular Simulations,Inc.發佈;參見例如Blundell及Johnson(1985)Meth.Enzymol.114及115,H.W.Wyckoff等人編輯,Academic Press;美國專利申請公開案第2004/0014194號)及BUSTER(Bricogne(1993)Acta Cryst.D49:37-60;Bricogne(1997)Meth.Enzymol.276A:361-423,Carter及Sweet編輯;Roversi等人(2000)Acta Cryst.D56:1313-1323),該等文獻之揭示內容之全文皆以引用方式併入本文中。
抗CD73抗體可結合至與具有本文所述胺基酸序列之任一抗CD73抗體相同之表位,如藉由表位定位技術(例如本文所述之技術)所測定。抗CD73抗體亦可具有類似的與人類CD73之相互作用,例如其可 具有表30中所顯示之至少約50%、60%、70%、80%、90%、95%或更大之相互作用,如藉由X射線結晶學所測定。
VII. 經改造及經修飾抗體 VH及VL區
本文亦提供經改造及經修飾抗體,其可使用具有本文所揭示VH及/或VL序列中之一或多者之抗體作為起始材料來製備以改造經修飾抗體,該經修飾抗體可具有自起始抗體改變之特性。抗體可藉由修飾一或兩個可變區(即VH及/或VL)內、例如一或多個CDR區內及/或一或多個框架區內之一或多個殘基來改造。另外或另一選擇為,抗體可藉由修飾恆定區內之殘基來改造,例如改變抗體之效應子功能。
可實施之一種可變區改造類型係CDR移植。抗體與靶抗原主要經由位於六個重鏈及輕鏈互補決定區(CDR)中之胺基酸殘基相互作用。出於此原因,在個別抗體之間CDR內之胺基酸序列比CDR外之序列更不同。由於CDR序列負責大部分抗體-抗原相互作用,故可藉由構築表現載體來表現模擬特異性參照抗體之特性之重組抗體,該等表現載體包括來自特異性參照抗體、移植至具有不同特性之不同抗體之框架序列上的CDR序列(例如,參見Riechmann,L.等人(1998)Nature 332:323-327;Jones,P.等人(1986)Nature 321:522-525;Queen,C.等人(1989)Proc.Natl.Acad.U.S.A. 86:10029-10033;授予Winter之美國專利第5,225,539號及授予Queen等人之美國專利第5,530,101號;第5,585,089號;第5,693,762號及第6,180,370號)。
因此,本文所述之另一實施例係關於經分離單株抗體或其抗原結合部分,其包含重鏈可變區,其包含分別包括選自由SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89、SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90、及SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91組成之群之胺基酸序列的CDR1、CDR2及CDR3序列;及 輕鏈可變區,其包含分別包括選自由SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85及93、SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86及94、及SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87及95組成之群之胺基酸序列的CDR1、CDR2及CDR3序列。因此,該等抗體含有單株抗體CD73.4-1、CD73.4-2、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及7A11之VH及VLCDR序列,但可含有來自該等抗體之不同框架序列。
該等框架序列可自包括種系抗體基因序列之公開DNA數據庫或公開參考文獻來獲得。例如,人類重鏈及輕鏈可變區基因之種系DNA序列可參見「VBase」人類種系序列數據庫(可在互聯網www.mrc-cpe.cam.ac.uk/vbase上獲得)以及Kabat,E.A.等人(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,U.S.Department of Health and Human Services,NIH公開案第91-3242號;Tomlinson,I.M.等人(1992)「The Repertoire of Human Germline VH Sequences Reveals about Fifty Groups of VH Segments with Different Hypervariable Loops」J.Mol.Biol. 227:776-798;及Cox,J.P.L.等人(1994)「A Directory of Human Germ-line VH Segments Reveals a Strong Bias in their Usage」Eur.J.Immunol. 24:827-836;該等文獻中每一者之內容皆以引用方式明確併入本文中。
用於本文所述抗體中之較佳框架序列係結構類似於本文所述抗體所用之框架序列之彼等。可將VH CDR1、2及3序列以及VL CDR1、2及3序列移植至具有與發現於衍生出框架序列之種系免疫球蛋白基因中之序列一致之序列的框架區上,或可將CDR序列移植至與種系序列相比含有至多20個、較佳保守胺基酸取代之框架區上。例如已發現, 在某些情況下,有益地突變框架區內之殘基以維持或增強抗體之抗原結合能力(例如,參見授予Queen等人之美國專利第5,530,101號;第5,585,089號;第5,693,762號及第6,180,370號)。
本文所述之經改造抗體包括已對VH及/或VL內之框架殘基進行修飾以例如改良抗體特性之彼等。通常,該等框架修飾經製造以降低抗體之免疫原性。例如,一種方式係將一或多個框架殘基「回復突變」成相應的種系序列。更特定而言,已經受體細胞突變之抗體可含有與衍生出該抗體之種系序列不同之框架殘基。該等殘基可藉由比較抗體框架序列與衍生出該抗體之種系序列來鑒定。為使框架區序列返回至其種系構型,可藉由例如定點誘變或PCR介導之誘變將體細胞突變「回復突變」成種系序列。本發明亦欲涵蓋該等「回復突變」抗體。另一類型之框架修飾涉及突變框架區或甚至一或多個CDR區內之一或多個殘基,以去除T細胞表位,由此降低抗體之潛在免疫原性。此方式亦稱為「去免疫化」且進一步詳細闡述於Carr等人之美國專利公開案第20030153043號中。
另一類型之可變區修飾係突變CDR區內之胺基酸殘基以改良所關注抗體之一或多種結合特性(例如親和力)。可實施定點誘變或PCR介導之誘變以引入突變,且可在如本文所述且於實例中提供之活體外或活體內分析中評估對抗體結合之效應或所關注之其他功能特性。較佳引入保守修飾(如上文所論述)。突變可為胺基酸添加、缺失或較佳取代。另外,通常改變CDR區內之不超過一個、兩個、三個、四個或五個殘基。
因此,本發明亦提供經分離之抗CD73單株抗體或其抗原結合部分,其包含包括以下各項之重鏈可變區:(a)VH CDR1區,其包含選自由SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89組成之群之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89相 比具有一個、兩個、三個、四個或五個胺基酸取代、缺失或添加之胺基酸序列;(b)VH CDR2區,其包含選自由SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90組成之群之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90相比具有一個、兩個、三個、四個或五個胺基酸取代、缺失或添加之胺基酸序列;(c)VH CDR3區,其包含選自由SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91組成之群之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91相比具有一個、兩個、三個、四個或五個胺基酸取代、缺失或添加之胺基酸序列;(d)VL CDR1區,其包含選自由SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85及93組成之群之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85及93相比具有一個、兩個、三個、四個或五個胺基酸取代、缺失或添加之胺基酸序列;(e)VL CDR2區,其包含選自由SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86及94組成之群之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86及94相比具有一個、兩個、三個、四個或五個胺基酸取代、缺失或添加之胺基酸序列;及(f)VL CDR3區,其包含選自由SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87及95組成之群之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87及95相比具有一個、兩個、三個、四個或五個胺基酸取代、缺失或添加之胺基酸序列。
抗體CDR中之甲硫胺酸殘基可發生氧化,從而產生可能的化學降解且因此降低抗體之效能。因此,本發明亦提供在重鏈及/或輕鏈CDR中具有一或多個經不經受氧化降解之胺基酸殘基替代之甲硫胺酸殘基之抗CD73抗體。
類似地,可自抗CD73抗體、具體而言CDR去除去醯胺位點。
較佳消除抗原結合結構域內之潛在糖基化位點以防止可能干擾抗原結合之糖基化。例如,參見美國專利第5,714,350號。
靶抗原結合
在多個實施例中,本發明抗體經修飾以選擇性阻斷其中抗原結合將有害之組織及環境中之抗原結合,但允許其中其將有益之抗原結合。在一個實施例中,產生特異性結合至抗體之抗原結合表面且干擾抗原結合之封阻肽「遮罩」,該遮罩藉由肽酶可裂解連接體連接至抗體之每一結合臂。例如,參見授予CytomX之美國專利第8,518,404號。該等構築體可用於治療在腫瘤微環境中蛋白酶含量與非腫瘤組織相比極大增加之癌症。選擇性裂解腫瘤微環境中之可裂解連接體允許遮蔽/封阻肽解離,此使得能夠在腫瘤而非抗原結合可引起不期望負效應之外周組織中進行選擇性抗原結合。
另一選擇為,在相關實施例中,研發出包含兩個抗原結合結構域之二價結合化合物(「遮蔽配體」),其結合至(二價)抗體之兩個抗原結合表面且干擾抗原結合,其中兩個結合結構域遮罩藉由例如可經肽酶裂解之可裂解連接體彼此連接(而非與抗體連接)。例如,參見授予Tegopharm公司之國際專利申請公開案第WO 2010/077643號。遮蔽配體可包含或源自抗體意欲結合之抗原或可獨立地產生。該等遮蔽配體可用於治療在腫瘤微環境中蛋白酶含量與非腫瘤組織相比大大增加之癌症。選擇性裂解腫瘤微環境中之可裂解連接體允許兩個結合結構域彼此解離,從而降低對抗體之抗原結合表面之親合力。遮蔽配體與抗體之所得解離使得能夠在腫瘤而非抗原結合可能引起不期望負效應之外周組織中進行選擇性抗原結合。
Fc及經修飾Fc
除源自抗原結合結構域與抗原之結合之治療性抗體的活性(例如 在拮抗劑抗體情形下阻斷同源配體或受體蛋白或在激動劑抗體情形下誘導信號傳導)外,抗體之Fc部分通常以複雜方式與免疫系統相互作用以引發任何數量之生物效應。雖然藉由不同機制,但效應子功能(例如免疫球蛋白之Fc區負責許多重要的抗體功能,例如抗原依賴性細胞毒性(ADCC)、補體依賴性細胞毒性(CDC)及抗體依賴性細胞介導之吞噬作用(ADCP))可殺死靶細胞。
抗CD73抗體可包含本文所述抗體之可變結構域與包括基於用於預期用途之抗體之生物活性(若有)選擇之不同Fc區的恆定結構域。Salfeld(2007)Nat.Biotechnol.25:1369。例如,人類IgG可分成四個子類,IgG1、IgG2、IgG3及IgG4,且該等中之每一者包含具有針對與一或多種Fcγ受體(活化受體FcγRI(CD64)、FcγRIIA、FcγRIIC(CD32);FcγRIIIA及FcγRIIIB(CD16)及抑制受體FcγRIIB)之結合及針對補體之第一組份(C1q)的獨特特徵之Fc區。人類IgG1及IgG3結合至所有Fcγ受體;IgG2結合至FcγRIIAH131,且以較低親和力結合至FcγRIIAR131、FcγRIIIAV158;IgG4結合至FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB、FcγRIIC及FcγRIIIAV158;且抑制性受體FcγRIIB對IgG1、IgG2及IgG3之親和力低於對所有其他Fcγ受體之親和力。Bruhns等人(2009)Blood 113:3716。研究已顯示,FcγRI不與IgG2結合,且FcγRIIIB不與IgG2或IgG4結合。同前。一般而言,對於ADCC活性,人類IgG1≧IgG3≫IgG4≧IgG2。因此,例如,倘若期望ADCC,則可選擇IgG1恆定結構域而非IgG2或IgG4用於期望ADCC之藥物中;若活化表現FcγRIIIA之NK細胞、單核球或巨噬細胞則可選擇IgG3;且若該抗體欲用於使過敏患者脫敏,則可選擇IgG4。若期望抗體缺少所有效應子功能,則亦可選擇IgG4。
因此,本文所述之抗CD73可變區可連接(例如,共價連接或融合)至Fc,例如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 Fc,該Fc可具有任何異型或 同種異型,例如對於IgG1:G1m、G1m1(a)、G1m2(x)、G1m3(f)、G1m17(z);對於IgG2:G2m、G2m23(n);對於IgG3:G3m、G3m21(g1)、G3m28(g5)、G3m11(b0)、G3m5(b1)、G3m13(b3)、G3m14(b4)、G3m10(b5)、G3m15(s)、G3m16(t)、G3m6(c3)、G3m24(c5)、G3m26(u)、G3m27(v)。例如,參見Jefferis等人(2009)mAbs 1:1。異型之選擇可受潛在免疫原性問題之影響,例如最小化抗藥物抗體之形成。
本文所述之可變區可連接至包含一或多個修飾之Fc,通常以改變抗體之一或多種功能特性,例如血清半衰期、補體固定、Fc受體結合及/或抗原依賴性細胞毒性。另外,本文所述抗體可經化學修飾(例如可將一或多個化學部分附接至該抗體)或其可經修飾以改變其糖基化,以改變該抗體之一或多種功能特性。該等實施例中之每一者進一步詳細闡述於下文中。Fc區中殘基之編號係Kabat之EU指數編號。參照後面為在天然胺基酸之位置中經取代之胺基酸、視情況在此位置之天然殘基之前之殘基編號提供本文所揭示之序列變體。倘若在給定位置可存在多個胺基酸,例如若天然同型之間之序列不同或若在該位置可取代多個突變,則藉由斜線將其分開(例如「X/Y/Z」)。
例如,可在Fc區中製造修飾以產生具有以下性質之Fc變體:(a)增加或減小的抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC),(b)增加或減小的補體介導之細胞毒性(CDC),(c)增加或減小的對C1q之親和力,及/或(d)相對於親代Fc增加或減小的對Fc受體之親和力。該等Fc區變體通常將包含Fc區中之至少一個胺基酸修飾。業內認為組合胺基酸修飾尤其合意。例如,變體Fc區可包括例如本文所鑒定之特定Fc區位置之兩個、三個、四個、五個等取代。實例性Fc序列變體揭示於本文中,且亦提供於美國專利第5,624,821號;第6,277,375號;第6,737,056號;第6,194,551號;第7,317,091號;第8,101,720號;PCT專 利公開案WO 00/42072;WO 01/58957;WO 04/016750;WO 04/029207;WO 04/035752;WO 04/074455;WO 04/099249;WO 04/063351;WO 05/070963;WO 05/040217,WO 05/092925及WO 06/020114中。
降低效應子功能
可藉由修飾Fc區降低ADCC活性。在某些實施例中,可去除影響與Fc受體結合之位點,較佳除補救受體結合位點外之位點。在其他實施例中,Fc區可經修飾以去除ADCC位點。ADCC位點為業內已知;例如,關於IgG1中之ADCC位點參見Sarmay等人(1992)Molec.Immunol.29(5):633-9。在一個實施例中,人類IgG1之G236R及L328R變體可有效地消除FcγR結合。Horton等人(2011)J.Immunol.186:4223及Chu等人(2008)Mol.Immunol.45:3926。在其他實施例中,具有降低的與FcγR結合之Fc包含胺基酸取代L234A、L235E及G237A。Gross等人(2001)Immunity 15:289。
亦可藉由修飾Fc區降低CDC活性。在IgG1位置D270、K322、P329及P331之突變、特定而言丙胺酸突變D270A、K322A、P329A及P331A會顯著降低相應抗體結合C1q及活化補體之能力。Idusogie等人(2000)J.Immunol.164:4178;WO 99/51642。已顯示IgG1之位置331之修飾(例如P331S)會減少補體結合。Tao等人(1993)J.Exp.Med.178:661以及Canfield及Morrison(1991)J.Exp.Med.173:1483。在另一實例中,改變胺基酸位置231至239內之一或多個胺基酸殘基,由此降低抗體固定補體之能力。WO 94/29351。
在一些實施例中,具有降低的補體固定之Fc具有胺基酸取代A330S及P331S。Gross等人(2001)Immunity 15:289。
為用於完全避免效應子功能時,例如單獨抗原結合足以產生期望治療益處且效應子功能僅引起不期望負效應(或增加其風險)時,可 使用IgG4抗體,或可設計缺少Fc區或其實質性部分之抗體或片段,或可使Fc突變以完全消除糖基化(例如N297A)。另一選擇為,已產生人類IgG2(CH1結構域及鉸鏈區)及人類IgG4(CH2及CH3結構域)之雜合構築體,其不具效應子功能,從而缺少結合FcγR之能力(如IgG2)且無法活化補體(如IgG4)。Rother等人(2007)Nat.Biotechnol.25:1256。亦參見Mueller等人(1997)Mol.Immunol.34:441;Labrijn等人(2008)Curr.Op.Immunol.20:479(論述通常降低效應子功能之Fc修飾)。
在其他實施例中,藉由用不同胺基酸殘基替代至少一個胺基酸殘基來改變Fc區以降低抗體之所有效應子功能。例如,可用不同胺基酸殘基替代一或多個選自胺基酸殘基234、235、236、237、297、318、320及322之胺基酸,使得抗體具有降低的對效應子配體之親和力但保留親代抗體之抗原結合能力。對其之親和力改變之效應子配體可為例如Fc受體(殘基234、235、236、237、297)或補體之C1組份(殘基297、318、320、322)。美國專利第5,624,821號及第5,648,260號,二者皆授予Winter等人。
WO 88/007089提出修飾IgG Fc區以減少與FcγRI之結合來降低ADCC(234A;235E;236A;G237A)或阻斷與補體組份C1q之結合來消除CDC(E318A或V/K320A及K322A/Q)。亦參見Duncan及Winter(1988)Nature 332:563;Chappel等人(1991)Proc.Nat’l Acad.Sci.(USA)88:9036;及Sondermann等人(2000)Nature 406:267(論述該等突變對FcγRIII結合之效應)。
降低效應子功能之Fc修飾亦包括位置234、235、236、237、267、269、325及328之取代、插入及缺失,例如234G、235G、236R、237K、267R、269R、325L及328R。Fc變體可包含236R/328R。降低FcyR及補體相互作用之其他修飾包括取代297A、234A、235A、237A、318A、228P、236E、268Q、309L、330S、 331S、220S、226S、229S、238S、233P及234V。該等及其他修飾綜述於Stroh1(2009)Current Opinion in Biotechnology 20:685-691中。可藉由突變位置233-236及327-331中一或多者之IgG殘基(例如IgG1中之E233P、L234V、L235A,視情況G236△、A327G、A330S及P331S;IgG4中之E233P、F234V、L235A,視情況G236△;及IgG2中之A330S及P331S)降低效應子功能(ADCC及補體活化二者),同時維持新生FcR結合(維持半衰期)。參見Armour等人(1999)Eur.J.Immunol.29:2613;WO 99/58572。降低效應子功能之其他突變包括IgG1中之L234A及L235A(Alegre等人(1994)Transplantation 57:1537);IgG2中之V234A及G237A(Cole等人(1997)J.Immunol.159:3613;亦參見美國專利第5,834,597號);及IgG4之S228P及L235E(Reddy等人(2000)J.Immunol.164:1925)。人類IgG1中用於降低效應子功能之突變之另一組合包括L234F、L235E及P331S。Oganesyan等人(2008)Acta Crystallogr.D.Biol.Crystallogr.64:700。通常參見Labrijn等人(2008)Curr.Op.Immunol.20:479。發現在Fc(IgG1)融合蛋白(阿巴他賽(abatacept))背景下降低效應子功能之其他突變係C226S、C229S及P238S(EU殘基編號)。Davis等人(2007)J.Immunol.34:2204。
具有降低的ADCC及/或CDC之其他Fc變體揭示於Glaesner等人(2010)Diabetes Metab.Res.Rev.26:287(在IgG4中降低ADCC及ADCP之F234A及L235A);Hutchins等人(1995)Proc.Nat’l Acad.Sci.(USA)92:11980(IgG4中之F234A、G237A及E318A);An等人(2009)MAbs 1:572及美國專利申請公開案2007/0148167(IgG2中之H268Q、V309L、A330S及P331S);McEarchern等人(2007)Blood 109:1185(IgG1中之C226S、C229S、E233P、L234V、L235A);Vafa等人(2014)Methods 65:114(IgG2中之V234V、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S)。
在某些實施例中,選擇基本上不具效應子功能之Fc,即其具有降低的與FcγR之結合及降低的補體固定。為較差效應子之實例性Fc(例如IgG1 Fc)包含以下五個突變:L234A、L235E、G237A、A330S及P331S。Gross等人(2001)Immunity 15:289。包含該等突變之實例性重鏈陳述於序列表中,如表31所詳述。該五個取代亦可與N297A組合以消除糖基化。
增強效應子功能
另一選擇為,可藉由修飾Fc區來增加ADCC活性。關於ADCC活性,人類IgG1≧IgG3≫IgG4≧IgG2,因此可選擇IgG1恆定結構域而非IgG2或IgG4用於期望ADCC之藥物中。另一選擇為,Fc區可藉由修飾以下位置之一或多個胺基酸來修飾以增加抗體依賴性細胞毒性(ADCC)及/或增加對Fcγ受體之親和力:234、235、236、238、239、240、241、243、244、245、247、248、249、252、254、255、256、258、262、263、264、265、267、268、269、270、272、276、278、280、283、285、286、289、290、292、293、294、295、296、298、299、301、303、305、307、309、312、313、315、320、322、324、325、326、327、329、330、331、332、333、334、335、337、338、340、360、373、376、378、382、388、389、398、414、416、419、430、433、434、435、436、437、438或439。參見WO 2012/142515;亦參見WO 00/42072。實例性取代包括236A、239D、239E、268D、267E、268E、268F、324T、332D及332E。實例性變體包括239D/332E、236A/332E、236A/239D/332E、268F/324T、267E/268F、267E/324T及267E/268F/324T。例如,已顯示包含可視情況與I332E組合之G236A變體之人類IgG1Fc使FcγIIA/FcγIIB結合親和力比率增加約15倍。Richards等人(2008)Mol.Cancer Therap.7:2517;Moore等人(2010)mAbs 2:181。增強FcyR及補體相互作用之 其他修飾包括(但不限於)取代298A、333A、334A、326A、247I、339D、339Q、280H、290S、298D、298V、243L、292P、300L、396L、305I及396L。該等及其他修飾綜述於Strohl(2009)Current Opinion in Biotechnology 20:685-691中。特定而言,可藉由改變IgG1之位置E333、例如E333A來增強ADCC及CDC二者。Shields等人(2001)J.Biol.Chem.276:6591。使用P247I及A339D/Q突變來增強IgG1中之效應子功能揭示於WO 2006/020114中,且D280H、K290S±S298D/V揭示於WO 2004/074455中。已顯示K326A/W及E333A/S變體增加人類IgG1中之效應子功能,且E333S增加IgG2中之效應子功能。Idusogie等人(2001)J.Immunol.166:2571。
特定而言,已定位人類IgG1上針對FcγR1、FcγRII、FcγRIII及FcRn之結合位點,且已闡述具有經改良結合之變體。Shields等人(2001)J.Biol.Chem. 276:6591-6604。顯示位置256、290、298、333、334及339之特異性突變改良與FcγRIII之結合,包括組合突變體T256A/S298A、S298A/E333A、S298A/K224A及S298A/E333A/K334A(具有增強的FcγRIIIa結合及ADCC活性)。已鑒定出具有與FcγRIIIa之強增強結合之其他IgG1變體,包括具有S239D/I332E及S239D/I332E/A330L突變之變體,其顯示在食蟹獼猴中對FcγRIIIa親和力之最大增加、FcγRIIb結合之減少及強細胞毒性活性。Lazar等人(2006)Proc.Nat’l Acad Sci.(USA)103:4005;Awan等人(2010)Blood 115:1204;Desjarlais及Lazar(2011)Exp.Cell Res.317:1278。在猴中,將三重突變引入抗體(例如阿倫珠單抗(alemtuzumab,CD52特異性)、曲妥珠單抗(trastuzumab,HER2/neu特異性)、利妥昔單抗(rituximab,CD20特異性)及西妥昔單抗(cetuximab,EGFR特異性))中在活體外轉譯成極大增強的ADCC活性,且S239D/I332E變體顯示增強的清除B細胞之能力。Lazar等人(2006)Proc.Nat’l Acad Sci.(USA) 103:4005。另外,在B細胞惡性病及乳癌模型中已鑒定出在表現人類FcγRIIIa之轉基因小鼠中展現與FcγRIIIa增強的結合及同時增強的ADCC活性之含有L235V、F243L、R292P、Y300L、V305I及P396L突變之IgG1突變體。Stavenhagen等人(2007)Cancer Res.67:8882;美國專利第8,652,466號;Nordstrom等人(2011)Breast Cancer Res.13:R123。
不同的IgG同型亦展現差異CDC活性(IgG3>IgG1>>IgG2
Figure 104138281-A0202-12-0102-791
IgG4)。Dangl等人(1988)EMBO J.7:1989。對於期望增強的CDC中之用途,亦可引入增加與C1q結合之突變。可藉由IgG2中K326及/或E333之突變、例如K326W(其降低ADCC活性)及E333S來增強募集補體(CDC)之能力,以增加與補體級聯之第一組份C1q之結合。Idusogie等人(2001)J.Immunol.166:2571。將S267E/H268F/S324T(單獨或以任何組合)引入人類IgG1中會增強C1q結合。Moore等人(2010)mAbs 2:181。Natsume等人(2008)Cancer Res.68:3863(圖1中)之IgG1/IgG3雜合同型抗體「113F」之Fc區亦賦予增強的CDC。亦參見Michaelsen等人(2009)Scand.J.Immunol.70:553及Redpath等人(1998)Immunology 93:595。
可增加或降低效應子功能之其他突變揭示於Dall’Acqua等人(2006)J.Immunol.177:1129中。亦參見Carter(2006)Nat.Rev.Immunol.6:343;Presta(2008)Curr.Op.Immunol.20:460。
亦可使用增強對抑制性受體FcyRIIb之親和力之Fc變體,例如以增強細胞凋亡誘導之活性或佐劑活性。Li及Ravetch(2011)Science 333:1030;Li及Ravetch(2012)Proc.Nat’l Acad.Sci(USA)109:10966;美國專利申請公開案2014/0010812。該等變體可提供具有與FcyRllb+細胞(包括例如B細胞及單核球)相關之免疫調節活性之抗體。在一個實施例中,Fc變體提供相對於一或多種活化受體與 FcyRllb選擇性增強之親和力。根據EU指數,用於改變與FcyRllb結合之修飾包括選自由以下組成之群之位置之一或多個修飾:234、235、236、237、239、266、267、268、325、326、327、328及332。用於增強FcyRllb親和力之實例性取代包括(但不限於)234D、234E、234F、234W、235D、235F、235R、235Y、236D、236N、237D、237N、239D、239E、266M、267D、267E、268D、268E、327D、327E、328F、328W、328Y及332E。實例性取代包括235Y、236D、239D、266M、267E、268D、268E、328F、328W及328Y。用於增強與FcyRllb結合之其他Fc變體包括235Y/267E、236D/267E、239D/268D、239D/267E、267E/268D、267E/268E及267E/328F。特定而言,人類IgG1之S267E、G236D、S239D、L328F及I332E變體(包括S267E+L328F雙變體)之特異性增強之對抑制性FcyRllb受體之親和力具有具體值。Chu等人(2008)Mol.Immunol.45:3926;美國專利申請公開案2006/024298;WO 2012/087928。可藉由添加P238D取代獲得增強的對FcγRIIb之特異性(與FcγRIIaR131不同)。Mimoto等人(2013)Protein.Eng.Des.& Selection 26:589;WO 2012/115241。
在某些實施例中,抗體經修飾以延長其生物半衰期。多種方式係可能的。例如,此可藉由增加Fc區對FcRn之結合親和力來進行。在一個實施例中,抗體經改變在CH1或CL區內含有取自IgG之Fc區之CH2結構域的兩個環之補救受體結合表位,如Presta等人之美國專利第5,869,046號及第6,121,022號中所述。增加與FcRn之結合及/或改良藥物動力學特性之其他實例性Fc變體包括位置259、308及434、包括例如259I、308F、428L、428M、434S、434H、434F、434Y及434M之取代。增加Fc與FcRn之結合之其他變體包括:250E、250Q、428L、428F、250Q/428L(Hinton等人,2004,J.Biol.Chem.279(8):6213-6216;Hinton等人,2006 Journal of Immunology 176:346-356)、 256A、272A、305A、307A、311A、312A、378Q、380A、382A、434A(Shields等人,Journal of Biological Chemistry,2001,276(9):6591-6604)、252F、252Y、252W、254T、256Q、256E、256D、433R、434F、434Y、252Y/254T/256E、433K/434F/436H(Dall Acqua等人,Journal of Immunology,2002,169:5171-5180;Dall'Acqua等人,2006,Journal of Biological Chemistry 281:23514-23524)。參見美國專利第8,367,805號。
業內已提出修飾IgG Fc中之某些保守殘基(I253/H310/Q311/H433/N434)(例如N434A變體)(Yeung等人(2009)J.Immunol.182:7663)作為增加FcRn親和力之方式,由此延長循環抗體之半衰期。WO 98/023289。已顯示包含M428L及N434S之組合Fc變體增加FcRn結合且使血清半衰期延長高達五倍。Zalevsky等人(2010)Nat.Biotechnol.28:157。包含T307A、E380A及N434A修飾之組合Fc變體亦延長IgG1抗體之半衰期。Petkova等人(2006)Int.Immunol.18:1759。另外,亦已顯示,包含M252Y/M428L、M428L/N434H、M428L/N434F、M428L/N434Y、M428L/N434A、M428L/N434M及M428L/N434S變體之組合Fc變體延長半衰期。WO 2009/086320。
另外,包含M252Y、S254T及T256E之組合Fc變體使半衰期延長大約4倍。Dall’Acqua等人(2006)J.Biol.Chem.281:23514。已使用提供增加的FcRn親和力但降低的pH依賴性之相關IgG1修飾(M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F)來產生IgG1構築體(「MST-HN Abdeg」)以作為競爭劑用於防止其他抗體與FcRn之結合,從而增加此另一抗體(內源IgG(例如在自體免疫環境下)或另一外源(治療性)mAb)之清除率。Vaccaro等人(2005)Nat.Biotechnol.23:1283;WO 2006/130834。
用於增加FcRn結合之其他修飾闡述於Yeung等人(2010)J. Immunol.182:7663-7671;6,277,375;6,821,505;WO 97/34631;WO 2002/060919中。
在某些實施例中,可使用雜合IgG同型來增加FcRn結合,且潛在地延長半衰期。例如,可藉由用來自IgG3之兩個同型不同之位置之胺基酸取代CH2及/或CH3區中的IgG1位置來構築IgG1/IgG3雜合變體。因此,可構築包含一或多個取代之雜合變體IgG抗體,該等取代係例如274Q、276K、300F、339T、356E、358M、384S、392N、397M、422I、435R及436F。在本文所述之其他實施例中,可藉由用來自IgG1之兩個同型不同之位置之胺基酸取代CH2及/或CH3區中的IgG2位置來構築IgG1/IgG2雜合變體。因此,可構築包含一或多個取代之雜合變體IgG抗體,該等取代之例如以下胺基酸取代中之一或多者:233E、234L、235L、-236G(指在位置236插入甘胺酸)及327A。參見美國專利第8,629,113號。已產生據稱延長血清半衰期且改良表現之IgG1/IgG2/IgG4序列之雜合體。美國專利第7,867,491號(其中序列號為18)。
亦可藉由聚乙二醇化來延長本發明抗體之血清半衰期。抗體可經聚乙二醇化以例如延長抗體之生物(例如血清)半衰期。為對抗體實施聚乙二醇化,通常在一或多個PEG基團附接至抗體或抗體片段之條件下,使抗體或其片段與聚乙二醇(PEG)試劑(例如PEG之反應性酯或醛衍生物)反應。較佳地,聚乙二醇化係藉由與反應性PEG分子(或類似反應性水溶性聚合物)之醯化反應或烷基化反應來實施。如本文所使用,術語「聚乙二醇」意欲涵蓋PEG之已用於衍生其他蛋白質之任一形式,例如單(C1-C10)烷氧基-或芳氧基-聚乙二醇或聚乙二醇-馬來醯亞胺。在某些實施例中,欲經聚乙二醇化之抗體係無糖基化抗體。用於聚乙二醇化蛋白質之方法其業內已知且可應用於本文所述抗體。例如,參見Nishimura等人之EP 0154316及Ishikawa等人之EP 0401384。
另一選擇為,在一些情況下,可期望縮短而非延長本發明抗體之半衰期。人類IgG1之Fc中之修飾(例如I253A(Hornick等人(2000)J.Nucl.Med.41:355)及H435A/R I253A或H310A(Kim等人(2000)Eur.J.Immunol.29:2819))可減少FcRn結合,由此縮短半衰期(增加清除率)以用於快速清除率較佳之情況(例如醫學成像)下。亦參見Kenanova等人(2005)Cancer Res.65:622。增強清除率之其他方式包括將本發明之抗原結合結構域格式化為缺少結合FcRn能力之抗體片段,例如Fab片段。該修飾可將抗體之循環半衰期自幾週縮短至幾小時。然後若需要,可利用抗體片段之選擇性聚乙二醇化來細調(延長)抗體片段之半衰期。Chapman等人(1999)Nat.Biotechnol.17:780。亦可使抗體片段融合至例如融合蛋白構築體中之人類血清白蛋白,以延長半衰期。Yeh等人(1992)Proc.Nat’l Acad.Sci.89:1904。另一選擇為,雙特異性抗體可經構築具有本發明之第一抗原結合結構域及結合至人類血清白蛋白(HSA)之第二抗原結合結構域。參見國際專利申請公開案WO 2009/127691及其中所引用之專利參考文獻。另一選擇為,可將專門多肽序列添加至抗體片段中來延長半衰期,例如「XTEN」多肽序列。Schellenberger等人(2009)Nat.Biotechnol.27:1186;國際專利申請公開案WO 2010/091122.Additional Fc Variants
在使用IgG4恆定結構域時,通常較佳包括取代S228P,其模擬IgG1中之鉸鏈序列且由此使IgG4分子穩定,例如減少所治療患者中治療性抗體與內源IgG4之間之Fab臂交換。Labrijn等人(2009)Nat.Biotechnol.27:767;Reddy等人(2000)J.Immunol.164:1925。
可藉由D221G及K222S修飾消除IgG1構築體之鉸鏈中之潛在蛋白酶裂解位點,從而增加抗體之穩定性。WO 2014/043344。
Fc變體對其配體(Fc受體)之親和力及結合特性可藉由業內已知之 多種活體外分析方法(基於生物化學或免疫學之分析)來測定,包括(但不限於)平衡方法(例如酶聯免疫吸附分析(ELISA)或放射性免疫分析(RIA))或動力學(例如BIACORE® SPR分析)及其他方法,例如間接結合分析、競爭性抑制分析、螢光共振能力轉移(FRET)、凝膠電泳及層析(例如凝膠過濾)。該等及其他方法可在所檢查組份之一或多者上利用標記及/或採用多種檢測方法,包括(但不限於)發色、螢光、發光或同位素標記。結合親和力及動力學之詳細描述可參見Paul,W.E.編輯,Fundamental Immunology,第4版,Lippincott-Raven,Philadelphia(1999),其針對抗體-免疫原相互作用。
在其他實施例中,抗體之糖基化經修飾以增加或降低效應子功能。例如,可藉由突變位置297之保守天冬醯胺殘基(例如N297A)、由此消除補體及FcγRI結合來製造缺少所有效應子功能之無糖基化抗體。Bolt等人(1993)Eur.J.Immunol.23:403。亦參見Tao及Morrison(1989)J.Immunol.143:2595(使用IgG1中之N297Q來消除位置297之糖基化)。
儘管無糖基化抗體通常缺少效應子功能,但可引入突變來恢復此功能。可進一步突變無糖基化抗體(例如源自N297A/C/D/或H突變或在不使蛋白質糖基化之系統(例如大腸桿菌(E.coli))中產生之彼等)以恢復FcγR結合,例如S298G及/或T299A/G/或H(WO 2009/079242)或E382V及M428I(Jung等人(2010)Proc.Nat’l Acad.Sci(USA)107:604)。
另外,可藉由改變糖基化來製造具有增強的ADCC之抗體。例如,已顯示基於經改良之與FcγRIIIa之結合,自重鏈Asn297偶聯之寡糖去除岩藻糖癸會增強ADCC。Shields等人(2002)JBC 277:26733;Niwa等人(2005)J.Immunol.Methods 306:151;Cardarelli等人(2009)Clin.Cancer Res.15:3376(MDX-1401);Cardarelli等人(2010)Cancer Immunol.Immunotherap.59:257(MDX-1342)。該等低岩藻糖抗體可例如在缺少岩藻糖基轉移酶(FUT8)之基因敲除中國倉鼠卵巢(CHO)細胞中(Yamane-Ohnuki等人(2004)Biotechnol.Bioeng.87:614)或在產生無岩藻糖基化抗體之其他細胞中產生。例如,參見Zhang等人(2011)mAbs 3:289及Li等人(2006)Nat.Biotechnol.24:210(二者皆闡述經糖基工程化之甲醇畢赤酵母(Pichia pastoris)中之抗體產生);Mossner等人(2010)Blood 115:4393;Shields等人(2002)J.Biol.Chem.277:26733;Shinkawa等人(2003)J.Biol.Chem.278:3466;EP 1176195B1。ADCC亦可如PCT公開案WO 03/035835中所述增強,該公開案揭示使用具有降低的使岩藻糖附接至Asn(297)偶聯之碳水化合物之能力之變體CHO細胞系Lec13亦產生在此宿主細胞中表現的抗體之低岩藻糖基化(亦參見Shields,R.L.等人(2002)J.Biol.Chem. 277:26733-26740)。另一選擇為,可在抗體產生期間將岩藻糖類似物添加至培養基中以抑制岩藻糖納入抗體上之碳水化合物中。WO 2009/135181。
增加抗體偶聯之寡糖中之二等分型GlcNac結構亦增強ADCC。授予Umana等人之PCT公開案WO 99/54342闡述經改造以表現修飾糖蛋白之糖基轉移酶(例如,β(1,4)-N-乙醯基葡萄糖胺基轉移酶III(GnTIII))之細胞系,使得在經改造細胞系中表現之抗體展現增加的二等分型GlcNac結構,從而增加抗體之ADCC活性(亦參見Umana等人(1999)Nat.Biotech. 17:176-180)。
業內已研發出不含半乳糖、唾液酸、岩藻糖及木糖殘基之其他糖基化變體(所謂的GNGN糖型),其展現增強的ADCC及ADCP但降低的CDC;以及不含唾液酸、岩藻糖及木糖之其他糖基化變體(所謂的G1/G2糖型),其展現增強的ADCC、ADCP及CDC。美國專利申請公開案第2013/0149300號。具有該等糖基化模式之抗體視情況在經遺傳修飾已敲除內源木糖基及岩藻糖基轉移酶基因之圓葉菸草(N. benthamiana)植物中產生。
糖基工程化亦可藉由改變附接在Fc區之Asn297之碳水化合物鏈之α2,6唾液醯基含量用於改變IgG構築體之抗發炎特性,其中增加的α2,6唾液酸化形式比例產生增強的抗發炎效應。參見Nimmerjahn等人(2008)Ann.Rev.Immunol.26:513。反之,減小具有α2,6唾液酸化碳水化合物之抗體之比例可用於不期望抗發炎特性之情形下。例如藉由選擇性純化α2,6唾液酸化形式或藉由酶修飾改變抗體之α2,6唾液酸化含量之方法提供於美國專利申請公開案第2008/0206246號中。在其他實施例中,Fc區之胺基酸序列可例如藉由納入F241A修飾來修飾以模擬α2,6唾液酸化之效應。WO 2013/095966。
VIII. 抗體物理特性
本文所述抗體在輕鏈或重鏈可變區可含有一或多個糖基化位點。該等糖基化位點可因改變抗原結合所致增加抗體之免疫原性或改變抗體之pK(Marshall等人(1972)Annu Rev Biochem 41:673-702;Gala及Morrison(2004)J.Immunol 172:5489-94;Wallick等人(1988)J Exp Med 168:1099-109;Spiro(2002)Glycobiology 12:43R-56R;Parekh等人(1985)Nature 316:452-7;Mimura等人(2000)Mol Immunol 37:697-706)。已知糖基化發生在含有N-X-S/T序列之基序處。在一些情況下,較佳具有不含可變區糖基化之抗CD73抗體。此可藉由選擇不含可變區中之糖基化基序之抗體或藉由突變糖基化區域內之殘基來達成。
在某些實施例中,本文所述抗體不含天冬醯胺異構位點。天冬醯胺之去醯胺可發生在N-G或D-G序列上,且可產生可將扭結引入多肽鏈中並可降低其穩定性(異天冬胺酸效應)之異天冬胺酸殘基。例如,若胺基酸序列Asp-Gly存在於抗體之重鏈及/或輕鏈CDR序列中,則該序列經未經受異構化之胺基酸序列取代。在一個實施例中,抗體 包含SEQ ID NO:6中所述之重鏈可變區CDR2序列,但其中Asp-Gly序列(VILYDGSNKYYPDSVKG;SEQ ID NO:6)中之Asp或Gly經未經受異構化之胺基酸序列(例如Asp-Ser或Ser-Gly序列)替代。
每一抗體將具有獨特的等電點(pI),其通常介於6與9.5之間之pH範圍內。IgG1抗體之pI通常在7-9.5之pH範圍內,且IgG4抗體之pI通常在6-8之pH範圍內。推測pI不在正常範圍內之抗體在活體內條件下可具有一定去摺疊及不穩定性。因此,較佳具有含有在正常範圍內之pI值之抗CD73抗體。此可藉由選擇pI在正常範圍內之抗體或藉由突變帶電表面殘基來達成。
每一抗體將具有特有的熔融溫度,且較高熔融溫度指示較大活體內總體穩定性(Krishnamurthy R及Manning M C(2002)Curr Pharm Biotechnol 3:361-71)。通常,TM1(初始去摺疊溫度)較佳大於60℃,較佳大於65℃,甚至更佳大於70℃。抗體之熔點可使用差示掃描量熱(Chen等人(2003)Pharm Res 20:1952-60;Ghirlando等人(1999)Immunol Lett 68:47-52)或圓二色性(Murray等人(2002)J.Chromatogr Sci 40:343-9)來量測。
在較佳實施例中,選擇不快速降解之抗體。抗體之降解可使用毛細管電泳(CE)及MALDI-MS(Alexander A J及Hughes D E(1995)Anal Chem 67:3626-32)來量測。
在另一較佳實施例中,選擇具有最小聚集效應之抗體,此可觸發不期望免疫反應及/或引起經改變或不利的藥物動力學特性。通常,業內可接受具有以下聚集之抗體:25%或更小、較佳20%或更小、甚至更佳15%或更小、甚至更佳10%或更小且甚至更佳5%或更小。聚集可藉由若干技術來量測,該等技術包括粒徑排阻管柱(SEC)、高效液相層析(HPLC)及光散射。
IX. 改造抗體之方法
如上文所論述,可使用具有本文所揭示VH及VL序列之抗CD73抗體藉由修飾VH及/或VL序列或附接至其之恆定區來產生新穎抗CD73抗體。因此,在本文所述之另一態樣中,使用本文所述抗CD73抗體(例如CD73.4、11F11、4C3、4D4、10D2、11A6、24H2、5F8、6E11及/或7A11)之結構特徵來產生保留本文所述抗體之至少一種功能特性(例如結合至人類CD73及食蟹獼猴CD73)之結構上相關之抗CD73抗體。例如,11F11、4C3、4D4、10D2、11A6、24H2、5F8、6E11及/或7A11之一或多個CDR區或其突變可以重組方式與已知框架區及/或其他CDR組合產生其他經重組改造之本文所述抗CD73抗體,如上文所論述。其他類型之修飾包括先前部分中所述之彼等。用於改造方法之起始材料係本文所提供VH及/或VL序列中之一或多者或其一或多個CDR區。為產生經改造抗體,實際上無需製備(即表現為蛋白質)具有本文所提供VH及/或VL序列中之一或多者或其一或多個CDR區之抗體。而是,使用序列中所含有之資訊作為起始材料來產生源自初始序列之「第二代」序列,且然後製備「第二代」序列並表現為蛋白質。
因此,本文提供用於製備抗CD73抗體之方法,其包含:(a)提供:(i)重鏈可變區抗體序列,其包含選自由SEQ ID NO:5、17、33、41、53、61、69、81及89組成之群之CDR1序列、選自由SEQ ID NO:6、18、34、42、54、62、70、82及90組成之群之CDR2序列、及/或選自由SEQ ID NO:7、19、35、43、55、63、71、83及91組成之群之CDR3序列;及(ii)輕鏈可變區抗體序列,其包含選自由SEQ ID NO:9、13、21、25、29、37、45、49、57、65、73、77、85及93組成之群之CDR1序列、選自由SEQ ID NO:10、14、22、26、30、38、46、50、58、66、74、78、86及94組成之群之CDR2序列、及/或選自由SEQ ID NO:11、15、23、27、31、39、47、51、59、67、75、79、87及95組成之群之CDR3序列; (b)改變重鏈可變區抗體序列及/或輕鏈可變區抗體序列內之至少一個胺基酸殘基以產生至少一條經改變之抗體序列;及(c)將經改變抗體序列表現為蛋白質。
可使用標準分子生物學技術來製備並表現經改變抗體序列。
較佳地,由經改變抗體序列編碼之抗體係保留本文所述抗CD73抗體之一種、一些或所有功能特性(包括表3中所列示之彼等)者。
使用本文所述之功能分析,經改變抗體可展現一或多種、兩種或更多種、三種或更多種、四種或更多種、五種或更多種、六種或更多種、七種或更多種、八種或更多種、九種或更多種、十種或所有功能特性。經改變抗體之功能特性可使用業內可獲得及/或本文所述之標準分析(例如實例中所述之彼等,例如ELISA、FACS)來評價。
在改造本文所述抗體之方法之某些實施例中,可沿抗CD73抗體編碼序列之全部或一部分隨機或選擇性引入突變,且可針對結合活性及/或如本文所述之其他功能特性篩選所得經修飾抗CD73抗體。突變方法已於業內有所闡述。例如,PCT公開案WO 02/092780簡短闡述使用飽和誘變、合成性接合組裝或其組合產生及篩選抗體突變之方法。另一選擇為,Lazar等人之PCT公開案WO 03/074679闡述使用計算篩選方法最佳化抗體之物理化學特性之方法。
X. 核酸分子
本文所述之另一態樣係關於編碼本文所述抗體之核酸分子。該等核酸可存在於完整細胞中,存在於細胞溶解物中,或以部分純化或實質上純淨之形式存在。當藉由標準技術實施純化以清除其他細胞組份或其他污染物(例如其他細胞核酸(例如其他染色體DNA,例如連接至自然界中之經分離DNA之染色體DNA)或蛋白質)時,核酸係「經分離」或「實質上純淨的」,該等標準技術包括鹼/SDS處理、CsCl顯帶、管柱層析、限制酶、瓊脂糖凝膠電泳及業內熟知之其他方法。參 見F.Ausubel等人編輯(1987)Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing and Wiley Interscience,New York。本文所述之核酸可為例如DNA或RNA且可含或可不含內含子序列。在某些實施例中,核酸係cDNA分子。
本文所述之核酸可使用標準分子生物學技術來獲得。對於由雜交瘤(例如自攜載人類免疫球蛋白基因之轉基因小鼠製備之雜交瘤,如下文進一步闡述)表現之抗體,編碼藉由雜交瘤製造之抗體之輕鏈及重鏈的cDNA可藉由標準PCR擴增或cDNA選殖技術來獲得。對於自免疫球蛋白基因文庫(例如使用噬菌體展示技術)獲得之抗體,可自該文庫回收編碼該抗體之核酸。
本文所述之較佳核酸分子係編碼本文所述抗CD73抗體(例如,CD73.4、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11、7A11、CD73.3及/或CD73.4單株抗體)之VH及VL序列之彼等。編碼CD73.4(CD73.4-1及CD73.4-2)、11F11(11F11-1及11F11-2)、4C3(4C3-1、4C3-2及4C3-3)、4D4、10D2(10D2-1及10D2-2)、11A6、24H2、5F8(5F8-1及5F8-2)、6E11、7A11、CD73.3及CD73.4之VH序列之DNA序列分別陳述於SEQ ID NO:4、16、32、40、52、60、68、80、88、135及170中。編碼11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11、7A11、CD73.3及/或CD73.4之VL序列之DNA序列分別陳述於SEQ ID NO:8、12、20、24、28、36、44、48、56、64、72、76、84及92中。
一旦獲得編碼VH及VL區段之DNA片段,即可藉由標準重組DNA技術進一步操縱該等DNA片段,以例如將可變區基因轉換成全長抗體鏈基因、Fab片段基因或scFv基因。在該等操縱中,編碼VL或VH之DNA片段可操作地連接至編碼另一蛋白質之另一DNA片段,例如抗 體恆定區或撓性連接體。如在此上下文中所使用,術語「可操作地連接」欲指連結兩個DNA片段,使得由該兩個DNA片段編碼之胺基酸序列保留在框內。
可藉由將編碼VH之DNA可操作地連接至編碼重鏈恆定區(鉸鏈、CH1、CH2及/或CH3)之另一DNA分子,將編碼VH區之經分離DNA轉換成全長重鏈基因。人類重鏈恆定區基因之序列用業內已知(例如,參見Kabat,E.A.等人(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,U.S.Department of Health and Human Services,NIH公開案第91-3242號),且涵蓋該等區域之DNA片段可藉由標準PCR擴增來獲得。重鏈恆定區可為IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgE、IgM或IgD恆定區,例如IgG1區。對於Fab片段重鏈基因,編碼VH之DNA可操作地連接至僅編碼重鏈CH1恆定區之另一DNA分子。
可藉由將編碼VL之DNA可操作地連接至編碼輕鏈恆定區CL之另一DNA分子,將編碼VL區之經分離DNA轉換成全長輕鏈基因(以及Fab輕鏈基因)。人類輕鏈恆定區基因之序列為業內已知(例如,參見Kabat,E.A.等人(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,U.S.Department of Health and Human Services,NIH公開案第91-3242號),且涵蓋該等區域之DNA片段可藉由標準PCR擴增來獲得。輕鏈恆定區可為κ或λ恆定區。
為產生scFv基因,將編碼VH及VL之DNA片段可操作地連接至編碼撓性連接體、例如編碼胺基酸序列(Gly4-Ser)3之另一片段,使得VH及VL序列可表現為連續單鏈蛋白質,且藉由撓性連接體連結VL及VH區(例如,參見Bird等人(1988)Science 242:423-426;Huston等人(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883;McCafferty等人,(1990)Nature 348:552-554)。
本文亦提供編碼與本文所述抗體(例如,11F11-1、11F11-2、 4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11、7A11、CD73.3及/或CD73.4單株抗體)同源之VH及VL序列或全長重鏈及輕鏈的核酸分子。實例性核酸分子編碼與編碼11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11、7A11、CD73.3及/或CD73.4單株抗體之VH及VL序列或全長重鏈及輕鏈(例如表31中所述之序列)之核酸分子至少70%一致、例如至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%一致的VH及VL序列。例如,本文提供抗CD73抗體,其包含由與SEQ ID NO:139及SEQ ID NO:140或141;SEQ ID NO:237及SEQ ID NO:140或141;SEQ ID NO:142及SEQ ID NO:143、144或145;SEQ ID NO:146及SEQ ID NO:147;SEQ ID NO:148及SEQ ID NO:149或150;SEQ ID NO:151及SEQ ID NO:152;SEQ ID NO:153及SEQ ID NO:154;SEQ ID NO:155及SEQ ID NO:156或157或242;SEQ ID NO:158及SEQ ID NO:159;SEQ ID NO:160及SEQ ID NO:161至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之核苷酸序列編碼的VH鏈及VL鏈。本文亦提供抗CD73抗體,其包含由與SEQ ID NO:134、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、243、266(重鏈)及SEQ ID NO:244或245(輕鏈);SEQ ID NO:211、212、213或246及SEQ ID NO:247、248或249;SEQ ID NO:235、236或250及251;SEQ ID NO:252及SEQ ID NO:253或254;SEQ ID NO:255及SEQ ID NO:256;SEQ ID NO:257及SEQ ID NO:258;SEQ ID NO:259及SEQ ID NO:260或261;SEQ ID NO:262及SEQ ID NO:263;SEQ ID NO:264及SEQ ID NO:265至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之核苷酸序列編碼的重鏈及輕鏈。本文亦提供具有沉 默突變(即在核酸分子轉譯時不改變所得胺基酸序列之鹼基變化)、例如以供密碼子最佳化之核酸分子。
XI. 抗體產生
本發明之多種抗體(例如與本文所揭示之抗人類CD73抗體競爭或結合至與其相同之表位之彼等)可使用多種已知技術(例如Kohler及Milstein,Nature 256:495(1975)所述之標準體細胞雜交技術)來產生。儘管體細胞雜交程序較佳,但原則上,亦可採用產生單株抗體之其他技術,例如B淋巴球之病毒或致癌轉化、使用人類抗體基因文庫之噬菌體展示技術。
用於製備雜交瘤之較佳動物系統係鼠類系統。小鼠中之雜交瘤產生係已充分確立之程序。業內已知分離融合用免疫脾細胞之免疫方案及技術。亦已知融合伴侶(例如鼠類骨髓瘤細胞)及融合程序。
可基於如上文所述製備之鼠類單株抗體之序列來製備本文所述之嵌合或人類化抗體。編碼重鏈及輕鏈免疫球蛋白之DNA可自所關注鼠類雜交瘤獲得並使用標準分子生物學技術進行改造以含有非鼠類(例如人類)免疫球蛋白序列。舉例而言,為產生嵌合抗體,可使用業內已知方法將鼠類可變區連接至人類恆定區(例如,參見授予Cabilly等人之美國專利第4,816,567號)。為產生人類化抗體,可使用業內已知之方法將鼠類CDR區插入人類框架中(例如,參見授予Winter之美國專利第5,225,539號及授予Queen等人之美國專利第5,530,101號;第5,585,089號;第5,693,762號及第6,180,370號)。
在一個實施例中,本文所述抗體係人類單株抗體。可使用攜載人類免疫系統而非小鼠系統之部分的轉基因或轉染色體小鼠來產生該等針對CD73之人類單株抗體。該等轉基因及轉染色體小鼠包括在本文中分別稱為HuMAb小鼠及KM小鼠之小鼠,且在本文中統稱為「人類Ig小鼠」。
HuMAb小鼠®(Medarex,Inc.)含有編碼未重排人類重鏈(μ及γ)及κ輕鏈免疫球蛋白序列以及使內源性μ及κ鏈基因座失活之靶突變的人類免疫球蛋白基因微小基因座(例如,參見Lonberg等人(1994)Nature 368(6474):856-859)。因此,小鼠展現降低的小鼠IgM或κ表現及對免疫之反應,所引入之人類重鏈及輕鏈轉基因經受類別切換及體細胞突變以產生高親和力人類IgGκ單株抗體(Lonberg,N.等人(1994),上文文獻;綜述於Lonberg,N.(1994)Handbook of Experimental Pharmacology 113:49-101;Lonberg,N.及Huszar,D.(1995)Intern.Rev.Immunol. 13:65-93,及Harding,F.及Lonberg,N.(1995)Ann.N.Y.Acad.Sci. 764:536-546中)。HuMab小鼠及該等小鼠所攜載之遺傳修飾之製備及使用進一步闡述於以下文獻中:Taylor,L.等人(1992)Nucleic Acids Research 20:6287-6295;Chen,J.等人(1993)International Immunology 5:647-656;Tuaillon等人(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:3720-3724;Choi等人(1993)Nature Genetics 4:117-123;Chen,J.等人(1993)EMBO J. 12:821-830;Tuaillon等人(1994)J.Immunol. 152:2912-2920;Taylor,L.等人(1994)International Immunology 6:579-591;及Fishwild,D.等人(1996)Nature Biotechnology 14:845-851,所有該等文獻之內容之全文皆以引用方式併入本文中。另外,參見美國專利第5,545,806號;第5,569,825號;第5,625,126號;第5,633,425號;第5,789,650號;第5,877,397號;第5,661,016號;第5,814,318號;第5,874,299號;及第5,770,429號;其皆授予Lonberg及Kay;授予Surani等人之美國專利第5,545,807號;PCT公開案第WO 92/03918號、第WO 93/12227號、第WO 94/25585號、第WO 97/13852號、第WO 98/24884及第WO 99/45962號,其皆授予Lonberg及Kay;及授予Korman等人之PCT公開案第WO 01/14424號。
在某些實施例中,本文所述之抗體係使用在轉基因及轉染色體上攜載人類免疫球蛋白序列之小鼠(例如攜載人類重鏈轉基因及人類輕鏈轉染色體之小鼠)來產生。在本文中稱為「KM小鼠」之該等小鼠詳細闡述於授予Ishida等人之PCT公開案WO 02/43478中。
另外,業內可獲得表現人類免疫球蛋白基因之替代性轉基因動物系統且可使用其來產生本文所述之抗CD73抗體。例如,可使用稱為Xenomouse(Abgenix,Inc.)之替代性轉基因系統;該等小鼠闡述於例如授予Kucherlapati等人之美國專利第5,939,598號;第6,075,181號;第6,114,598號;第6,150,584號及第6,162,963號中。
另外,業內可獲得表現人類免疫球蛋白基因之替代性轉染色體動物系統且可使用其來產生本文所述之抗CD73抗體。例如,可使用攜載人類重鏈轉染色體及人類輕鏈轉染色體二者之小鼠,稱為「TC小鼠」;該等小鼠闡述於Tomizuka等人(2000)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 97:722-727中。另外,業內已闡述攜載人類重鏈及輕鏈轉染色體之牛(Kuroiwa等人(2002)Nature Biotechnology 20:889-894)且可使用其產生本文所述之抗CD73抗體。
業內所述用於產生人類抗體(例如人類抗CD73抗體)之其他小鼠系統包括(i)VelocImmune®小鼠(Regeneron Pharmaceuticals,Inc.),其中內源小鼠重鏈及輕鏈可變區已經由同源重組經可操作地連接至內源小鼠恆定區之人類重鏈及輕鏈可變區替代,使得在小鼠中產生嵌合抗體(人類V/小鼠C),且然後使用標準重組DNA技術轉換成全人類抗體;及(ii)MeMo®小鼠(Merus Biopharmaceuticals,Inc.),其中小鼠含有未重排人類重鏈可變區但含有單一重排人類普遍輕鏈可變區。該等小鼠及其產生抗體之用途闡述於例如WO 2009/15777、US 2010/0069614、WO 2011/072204、WO 2011/097603、WO 2011/163311、WO 2011/163314、WO 2012/148873、US 2012/0070861 及US 2012/0073004中。
本文所述之人類單株抗體亦可使用噬菌體展示方法篩選人類免疫球蛋白基因文庫來製備。業內已確立用於分離人類抗體之該等噬菌體展示方法。例如,參見:授予Ladner等人之美國專利第5,223,409號、第5,403,484號及第5,571,698號;授予Dower等人之美國專利第5,427,908號及第5,580,717號;授予McCafferty等人之美國專利第5,969,108號及第6,172,197號;及授予Griffiths等人之美國專利第5,885,793號、第6,521,404號、第6,544,731號、第6,555,313號、第6,582,915號及第6,593,081號。
本文所述之人類單株抗體亦可使用SCID小鼠來製備,其中人類免疫細胞已經重構使得可在免疫後產生人類抗體反應。該等小鼠闡述於例如授予Wilson等人之美國專利第5,476,996號及第5,698,767號中。
免疫
為產生針對CD73之全人類抗體,可如例如Lonberg等人(1994)Nature 368(6474):856-859;Fishwild等人(1996)Nature Biotechnology 14:845-851及WO 98/24884針對其他抗原所述,用CD73抗原及/或表現CD73之細胞的經純化或經富集製劑免疫含有人類免疫球蛋白基因之轉基因或轉染色體小鼠(例如HCo12、HCo7或KM小鼠)。另一選擇為,可用編碼人類CD73之DNA免疫小鼠。較佳地,在第一次輸注時小鼠將為6-16週齡。例如,可使用重組CD73抗原之經純化或經富集製劑(5-50μg)腹膜內免疫HuMAb小鼠。在使用CD73抗原之經純化或經富集製劑免疫不產生抗體之情況下,亦可用表現CD73之細胞(例如細胞系)來免疫小鼠以促進免疫反應。實例性細胞系包括過表現CD73之穩定CHO及Raji細胞系。
使用多種抗原之累積經驗已顯示,HuMAb轉基因小鼠在最初用Ribi佐劑中之抗原腹膜內(IP)或皮下(SC)免疫、然後每隔一週用Ribi佐 劑中之抗原IP/SC免疫(至多總共10次)時反應最佳。可在免疫方案之進程內監測免疫反應,其中藉由眶後采血獲得血漿樣品。可藉由ELISA及FACS(如下文所述)篩選血漿,且可使用具有足夠抗CD73人類免疫球蛋白效價之小鼠進行融合。可用抗原對小鼠實施靜脈內加強免疫,3天後殺死並去除脾及淋巴結。預期對於每次免疫可能需要實施2-3次融合。對於每一抗原通常免疫6至24隻小鼠。通常,使用HCo7、HCo12及KM品系。另外,可使HCo7及HCo12轉基因二者一起育種至具有兩個不同人類重鏈轉基因(HCo7/HCo12)之單一小鼠中。
產生針對CD73之單株抗體之雜交瘤之產生
為產生產生本文所述之人類單株抗體之雜交瘤,可自免疫小鼠分離脾細胞及/或淋巴結細胞並融合至適宜永生細胞系,例如小鼠骨髓瘤細胞系。所得雜交瘤可經篩選用於產生抗原特異性抗體。例如,用50% PEG將來自經免疫小鼠之脾淋巴球之單細胞懸浮液融合至Sp2/0非分泌小鼠骨髓瘤細胞(ATCC,CRL 1581)。將細胞以約2×105平鋪於平底微量滴定板中,然後在含有10%胎牛純系血清、18%「653」條件化培養基、5%奧瑞金(origen,IGEN)、4mM L-麩醯胺酸、1mM丙酮酸鈉、5mM HEPES、0:055mM 2-巰基乙醇、50單位/ml青黴素(penicillin)、50mg/ml鏈黴素(streptomycin)、50mg/ml慶大黴素(gentamycin)及1×HAT(Sigma)之選擇培養基中培育兩週。約兩週後,可在其中HAT更換為HT之培養基中培養細胞。然後可藉由ELISA篩選針對人類單株IgM及IgG抗體之個別孔。一旦出現雜交瘤過度生長,通常即可在10-14天後觀察培養基。可將分泌雜交瘤之抗體再平鋪,再篩選,且若對人類IgG仍呈陽性,則可藉由限制性稀釋將單株抗體亞選殖至少兩次。然後可在活體外培養穩定的亞純系以在組織培養基中產生少量抗體用於表徵。
為純化人類單株抗體,可使所選雜交瘤在兩升旋轉燒瓶中生長 用於純化單株抗體。可將上清液過濾並濃縮,然後用蛋白質A-sepharose(Pharmacia,Piscataway,N.J.)進行親和層析。可藉由凝膠電泳及高效液相層析檢查所溶析之IgG以確保純度。可將緩衝溶液更換為PBS,且可使用1.43消光係數藉由OD280來測定濃度。可將單株抗體等分並儲存在-80℃下。
XII. 抗體製造 產生針對CD73之單株抗體之轉染瘤之產生
可在宿主細胞轉染瘤中使用例如如業內所熟知之重組DNA技術及基因轉染方法之組合來產生本發明抗體,包括提供序列之特異性抗體及其他相關抗CD73抗體二者(Morrison,S.(1985)Science 229:1202)。
例如,為表現抗體或其抗體片段,可藉由標準分子生物學技術(例如PCR擴增或使用表現所關注抗體之雜交瘤之cDNA選殖)獲得編碼部分或全長輕鏈及重鏈之DNA,且可將DNA插入表現載體中,使得該等基因可操作地連接至轉錄及轉譯控制序列。在此背景下,術語「可操作地連接」欲指將抗體基因接合至載體中,使得該載體內之轉錄及轉譯控制序列發揮其調控抗體基因之轉錄及轉譯之期望功能。表現載體及表現控制序列經選擇與所用表現宿主細胞相容。可將抗體輕鏈基因及抗體重鏈基因插入單獨載體中,或將兩種基因插入同一表現載體中。藉由標準方法(例如,接合抗體基因片段上之互補限制位點與載體,或若不存在限制位點則利用鈍端接合)將抗體基因插入表現載體中。可使用本文所述抗體之輕鏈及重鏈可變區藉由將其插入已編碼期望同型之重鏈恆定區及輕鏈恆定區之表現載體中來產生任何抗體同型之全長抗體基因,使得VH區段可操作地連接至載體內之CH區段,且使得VL區段可操作地連接至載體內之CL區段。另外或另一選擇為,重組表現載體可編碼促進宿主細胞分泌抗體鏈之信號肽。可將 抗體鏈基因選殖至載體中,使得信號肽框內連接至抗體鏈基因之胺基末端。信號肽可係免疫球蛋白信號肽或異源信號肽(即,來自非免疫球蛋白之信號肽)。
除抗體鏈基因外,重組表現載體可攜載控制抗體鏈基因在宿主細胞中之表現之調控序列。術語「調控序列」意欲包括控制抗體鏈基因轉錄或轉譯之啟動子、增強子及其他表現控制元件(例如多腺苷酸化信號)。該等調控序列闡述於例如Goeddel(Gene Expression Technology.Methods in Enzymology 185,Academic Press,San Diego,CA(1990))中。彼等熟習此項技術者應瞭解,表現載體之設計(包括調控序列之選擇)可端視諸如欲轉形宿主細胞之選擇、期望蛋白質之表現量等要素而定。用於哺乳動物宿主細胞表現之較佳調控序列包括在哺乳動物細胞中引導較高蛋白質表現量之病毒元件,例如源自以下各項之啟動子及/或增強子:巨細胞病毒(CMV)、猿猴病毒40(SV40)、腺病毒(例如,腺病毒主要晚期啟動子(AdMLP))及多瘤病毒。另一選擇為,可使用非病毒調控序列,例如泛素啟動子或β-球蛋白啟動子。另外,調控元件係由來自不同來源(例如SRα啟動子系統)之序列構成,該SRα啟動子系統含有來自SV40早期啟動子之序列及人類T細胞1型白血病病毒之長末端重複(Takebe,Y.等人(1988)Mol.Cell.Biol. 8:466-472)。
除抗體鏈基因及調控序列外,重組表現載體可攜載其他序列,例如調控載體在宿主細胞中複製之序列(例如複製起點)及可選標記物基因。可選標記物基因幫助選擇其中已引入載體之宿主細胞(例如,參見美國專利第4,399,216號、第4,634,665號及第5,179,017號,其皆來自Axel等人)。例如,通常可選標記物基因賦予已引入載體之宿主細胞對藥物(例如G418、潮黴素(hygromycin)或胺甲喋呤)之抗性。較佳可選標記物基因包括二氫葉酸還原酶(DHFR)基因(用於利用胺甲喋 呤選擇/擴增之dhfr-宿主細胞中)及neo基因(用於G418選擇)。
對於輕鏈及重鏈之表現,藉由標準技術將編碼重鏈及輕鏈之表現載體轉染至宿主細胞中。術語「轉染」之各種形式意欲涵蓋常用於將外源DNA引入原核或真核宿主細胞中之多種技術,例如電穿孔、磷酸鈣沈澱、DEAE-葡聚糖轉染及諸如此類。儘管理論上可在原核或真核宿主細胞中表現本文所述之抗體,但在真核細胞、且最佳哺乳動物宿主細胞中表現抗體最佳,此乃因該等真核細胞且具體而言哺乳動物細胞比原核細胞更有可能裝配並分泌經適當摺疊且具有免疫活性之抗體。已報導抗體基因之原核表現無法有效地產生高產量之活性抗體(Boss,M.A.及Wood,C.R.(1985)Immunology Today 6:12-13)。本發明抗體亦可在酵母菌甲醇畢赤酵母之糖基工程化品系中產生。Li等人(2006)Nat.Biotechnol.24:210。
用於表現本文所述重組抗體之較佳哺乳動物宿主細胞包括中國倉鼠卵巢(CHO細胞)[包括dhfr-CHO細胞(闡述於Urlaub及Chasin,(1980)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216-4220中),其與DHFR可選標記物(例如,如R.J.Kaufman及P.A.Sharp(1982)Mol.Biol.159:601-621中所述)一起使用]、NSO骨髓瘤細胞、COS細胞及SP2細胞。具體而言,為與NSO骨髓瘤細胞一起使用,另一較佳表現系統係WO 87/04462、WO 89/01036及EP 338,841中所揭示之GS基因表現系統。當將編碼重組表現載體之抗體基因引入哺乳動物宿主細胞中時,藉由將宿主細胞培養一段時間來產生抗體,該段時間足以允許抗體在宿主細胞中表現或更佳地使抗體分泌至使宿主細胞生長之培養基中。可使用標準蛋白質純化方法自培養基回收抗體。
因通常所觀察到之轉譯後修飾所致,本發明抗體多肽鏈之N末端及C末端之不同之處可在於預期序列。例如,C末端離胺酸殘基通常自抗體重鏈丟失。Dick等人(2008)Biotechnol.Bioeng.100:1132。N末 端麩醯胺酸殘基及在較小程度上麩胺酸殘基通常轉換成治療性抗體之輕鏈及重鏈二者上之焦麩胺酸殘基。Dick等人(2007)Biotechnol.Bioeng.97:544;Liu等人(2011)JBC 28611211;Liu等人(2011)J.Biol.Chem.286:11211。
XIII. 分析
可藉由例如標準ELISA測試本文所述抗體與CD73之結合。簡言之,用1-2μg/ml於PBS中之經純化CD73包覆微量滴定板,且然後用PBS中之5%牛血清白蛋白封阻。將抗體之稀釋物(例如,來自CD73免疫小鼠之血漿之稀釋物)添加至每孔中且在37℃下培育1-2小時。用PBS/Tween洗滌板,且然後在37℃下與偶聯至辣根過氧化物酶(HRP)之二級試劑(例如針對人類抗體,山羊-抗人類IgG Fc特異性多株試劑)一起培育1小時。洗滌後,用ABTS受質(Moss Inc,產品:ABTS-1000)使板顯影,且藉由分光光度計在OD 415-495下分析。然後藉由流式細胞術針對與表現人類CD73之細胞系、而非與不表現CD73之對照細胞系之結合進一步篩選經免疫小鼠之血清。簡言之,藉由一起培育以1:20稀釋之表現CD73之CHO細胞與抗CD73抗體來評價抗CD73抗體之結合。將細胞洗滌且用PE標記之抗人類IgG Ab檢測結合。使用FACScan流式細胞術(Becton Dickinson,San Jose,CA)實施流式細胞術分析。較佳地,將使用產生最高效價之小鼠進行融合。
可使用如上文所述之ELISA分析來篩選抗體,且因此篩選產生顯示與CD73免疫原之陽性反應性之抗體的雜交瘤。然後可亞選殖且進一步表徵產生較佳以高親和力結合至CD73之抗體之雜交瘤。然後可選擇每一雜交瘤之保留親代細胞之反應性(藉由ELISA)之一個純系來製造細胞庫及用於抗體純化。
為純化抗CD73抗體,可使所選雜交瘤在兩升旋轉燒瓶中生長用於純化單株抗體。可將上清液過濾並濃縮,然後用蛋白質A-sepharose (Pharmacia,Piscataway,NJ)進行親和層析。可藉由凝膠電泳及高效液相層析檢查所溶析之IgG以確保純度。可將緩衝溶液更換為PBS,且可使用1.43消光係數藉由OD280來測定濃度。可將單株抗體等分並儲存在-80℃下。
為確定所選抗CD73單株抗體是否結合至獨特表位,可使用市售試劑(Pierce,Rockford,IL)將每一抗體生物素化。可使用鏈黴抗生物素(streptavidin)標記之探針來檢測生物素化mAb結合。可使用如上文所述經CD73包覆之ELISA板使用未經標記之單株抗體及生物素化單株抗體實施競爭研究。
為確定經純化抗體之同型,可使用特異性針對具體同型之抗體之試劑實施同型ELISA。例如,為確定人類單株抗體之同型,可在4℃下用1μg/ml抗人類免疫球蛋白將微量滴定板之孔包覆過夜。用1% BSA封阻後,在環境溫度下使板與1μg/ml或更小之測試單株抗體或經純化同型對照反應1至2小時。然後可使各孔與人類IgG1或人類IgM特異性鹼性磷酸酶偶聯之探針反應。如上文所述將板顯影且分析。
為測試單株抗體與表現CD73之活細胞之結合,可使用流式細胞術,如實例中所述。簡言之,在4℃下,將表現膜結合CD73之細胞系(在標準生長條件下生長)與含有0.1% BSA之PBS中不同濃度之單株抗體混合1小時。洗滌後,在與一級抗體染色相同之條件下使細胞與螢光素標記之抗IgG抗體反應。可利用光及側散射特性藉由FACScan儀器分析樣品以對單一細胞設門並測定經標記抗體之結合。除流式細胞術分析外或作為其替代,可利用使用螢光顯微鏡之替代性分析。可恰如上文所述對細胞進行染色且藉由螢光顯微鏡檢查。此方法允許個別細胞可視化,但端視抗原之密度可能具有減小的靈敏度。
可藉由西方印跡進一步測試抗CD73抗體與CD73抗原之反應性。簡言之,可製備來自表現CD73之細胞之細胞提取物且使其經歷十二 烷基硫酸鈉聚丙烯醯胺凝膠電泳。電泳後,將所分離抗原轉移至硝基纖維素膜,用20%小鼠血清封阻,且用欲測試單株抗體探測。可使用抗IgG鹼性磷酸酶檢測IgG結合且用BCIP/NBT受質錠劑(Sigma Chem.Co.,St.Louis,MO)顯影。
用於分析多種抗CD73抗體之結合親和力、交叉反應性及結合動力學之方法包括業內已知之標準分析,例如使用BIACORE® 2000 SPR儀器(Biacore AB,Uppsala,Sweden)之BIACORE®表面電漿子共振(SPR)分析。
XIV. 免疫偶聯物及抗體衍生物
本文所述抗體可用於診斷目的,包括樣品測試及活體內成像,且出於此目的,可將抗體(或其結合片段)偶聯至適宜可檢測劑,以形成免疫偶聯物。出於診斷之目的,適宜藥劑係可檢測標記,包括用於全身成像之放射性同位素及用於樣品測試之放射性同位素、酶、螢光標記及其他適宜抗體標籤。
可檢測標記可為目前用於活體外診斷領域中之各種類型中之任一者,包括包含金屬溶膠之微粒標記(例如膠體金)、同位素(例如與例如N2S2、N3S或N4類型之肽螯合劑一起呈現之I125或Tc99)、發色團(包括螢光標記物、生物素、發光標記物、磷光標記物及諸如此類)以及將給定受質轉換成可檢測標記物之酶標記及在例如藉由聚合酶鏈式反應擴增後顯露之多核苷酸標籤。然後將可藉由抗生物素蛋白或鏈黴抗生物素結合來檢測生物素化抗體。適宜酶標記包括辣根過氧化物酶、鹼性磷酸酶及諸如此類。例如,標記可為鹼性磷酸酶,其係藉由在轉換1,2二氧雜環丁烷受質(例如金剛烷基甲氧基磷醯基氧基苯基二氧雜環丁烷(AMPPD)、3-(4-(甲氧基螺{1,2-二氧雜環丁烷-3,2'-(5'-氯)三環{3.3.1.13,7}癸}-4-基)苯基磷酸二鈉(CSPD))以及CDP及CDP-star®或彼等熟習此項技術者所熟知之其他發光受質(例如適宜鑭系(例如鋱(III) 及銪(III))之螯合物)後量測化學發光之存在或形成進行檢測。檢測方式係根據所選標記來確定。標記或其反應產物之出現可使用肉眼(在標記為微粒且以適當量積聚之情形下)或使用儀器(例如分光光度計、發光計、螢光計及諸如此類)來達成,所有皆符合標準實踐。
較佳地,偶聯方法產生實質上(或幾乎)無免疫原性之鍵,例如肽鍵(即醯胺鍵)、硫鍵、(空間位阻)、二硫鍵、腙鍵及醚鍵。該等鍵幾乎無免疫原性且在血清內顯示合理穩定性(例如,參見Senter,P.D.,Curr.Opin.Chem.Biol.13(2009)235-244;WO 2009/059278;WO 95/17886)。
端視該部分及該抗體之生物化學性質,可採用不同的偶聯策略。倘若該部分係介於50至500個胺基酸之間之天然或重組多肽,則採用教科書中闡述合成蛋白質偶聯物之化學法之標準程序,其可容易地由熟習此項技術者仿效(例如,參見Hackenberger,C.P.R.及Schwarzer,D.,Angew.Chem.Int.Ed.Engl.47(2008)10030-10074)。在一個實施例中,使用馬來醯亞胺基部分與該抗體或該部分內之半胱胺酸殘基之反應。此在例如使用抗體之Fab或Fab'片段之情形下係尤其適宜之偶合化學法。另一選擇為,在一個實施例中實施至該抗體或部分之C末端之偶合。可如所述(Sunbul,M.及Yin,J.,Org.Biomol.Chem.7(2009)3361-3371)實施蛋白質(例如Fab片段)之C末端修飾。
一般而言,位點特異性反應及共價偶合係基於將天然胺基酸轉化成具有與所存在其他官能基之反應性正交之反應性的胺基酸。例如,罕見序列背景內之特定半胱胺酸可以酶方式在醛中轉換(參見Frese,M.A.及Dierks,T.,ChemBioChem.10(2009)425-427)。亦可藉由利用某些酶與給定序列背景下之天然胺基酸之特異性酶反應性獲得期望胺基酸修飾(例如,參見Taki,M.等人,Prot.Eng.Des.Sel.17(2004)119-126;Gautier,A.等人,Chem.Biol.15(2008)128-136)。 蛋白酶催化之C--N鍵形成闡述於Bordusa,F.,Highlights in Bioorganic Chemistry(2004)389-403中。
位點特異性反應及共價偶合亦可藉由末端胺基酸與適宜修飾試劑之選擇性反應來達成。可利用N末端半胱胺酸與苯甲腈之反應性(參見Ren,H.等人,Angew.Chem.Int.Ed.Engl.48(2009)9658-9662)來達成位點特異性共價偶合。天然化學接合亦可取決於C末端半胱胺酸殘基(Taylor,E.Vogel;Imperiali,B,Nucleic Acids and Molecular Biology(2009),22(Protein Engineering),65-96)。EP 1 074 563闡述基於一段帶負電胺基酸內之半胱胺酸之反應快於位於一段帶正電胺基酸中之半胱胺酸反應之偶聯方法。
該部分亦可為合成肽或肽模擬物。在多肽係經化學合成之情形下,在該合成期間可納入具有正交化學反應性之胺基酸(例如,參見de Graaf,A.J.等人,Bioconjug.Chem.20(2009)1281-1295)。由於眾多個正交官能基至關重要且可引入合成肽中,故標準化學法係將該肽偶聯至連接體。
為獲得單標記多肽,可藉由層析分離具有1:1化學計量之偶聯物與其他偶聯副產物。此程序可藉由使用染料標記之結合對成員及帶電連接體來促進。藉由使用此類標記及帶高負電之結合對成員,單偶聯多肽容易地與未經標記之多肽及攜載一個以上連接體之多肽分離,此乃因可利用電荷及分子量之差異來分離。螢光染料可用於自未結合組份(如經標記單價結合劑)純化複合物。
在一個實施例中,附接至抗CD73抗體之部分選自由結合部分、標記部分及生物活性部分組成之群。
本文所述抗體亦可偶聯至治療劑以形成免疫偶聯物,例如抗體-藥物偶聯物(ADC)。適宜治療劑包括抗代謝物、烷基化劑、DNA小溝結合劑、DNA嵌入劑、DNA交聯劑、組蛋白去乙醯酶抑制劑、出核 抑制劑、蛋白酶體抑制劑、拓撲異構酶I或II抑制劑、熱休克蛋白抑制劑、酪胺酸激酶抑制劑、抗生素及抗有絲分裂劑。在ADC中,抗體及治療劑較佳係經由可裂解連接體(例如肽基、二硫化物或腙連接體)偶聯。更佳地,連接體係肽基連接體,例如Val-Cit、Ala-Val、Val-Ala-Val、Lys-Lys、Pro-Val-Gly-Val-Val(SEQ ID NO:219)、Ala-Asn-Val、Val-Leu-Lys、Ala-Ala-Asn、Cit-Cit、Val-Lys、Lys、Cit、Ser或Glu。ADC可如以下專利中所述來製備:美國專利第7,087,600號;第6,989,452號;及第7,129,261號;PCT公開案WO 02/096910;WO 07/038658;WO 07/051081;WO 07/059404;WO 08/083312;及WO 08/103693;美國專利公開案20060024317;20060004081;及20060247295;該等專利之揭示內容皆以引用方式併入本文中。本文在別處提供抗CD73抗體之其他用途,例如作為單一療法用於例如與組合治療相關之部分中。
更特定而言,在ADC中,抗體偶聯至藥物,且該抗體作為靶向劑發揮將ADC引導至表現其抗原之靶細胞(例如癌細胞)之功能。較佳地,抗原係腫瘤相關抗原,即由癌細胞獨特表現或過表現者。在此處後,藥物在靶細胞內部或其附近釋放以起治療劑作用。關於ADC在癌症療法中之作用機制及用途參見Schrama等人,Nature Rev.Drug Disc.2006,5,147。
對於癌症治療,藥物較佳係引起所靶向癌細胞死亡之細胞毒性藥物。可用於ADC中之細胞毒性藥物包括以下類型之化合物及其類似物及衍生物:(a)烯二炔,例如卡奇黴素(calicheamicin)(例如,參見Lee等人,J.Am.Chem.Soc.1987,109、3464及3466)及昂塞拉黴素(uncialamycin)(例如,參見Davies等人,WO 2007/038868 A2(2007)及Chowdari等人,US 8,709,431 B2(2012)); (b)微管溶素(例如,參見Domling等人,US 7,778,814 B2(2010);Cheng等人,US 8,394,922 B2(2013);及Cong等人,US 2014/0227295 A1);(c)CC-1065及多卡米星(duocarmycin)(例如,參見Boger,US 6,5458,530 B1(2003);Sufi等人,US 8,461,117 B2(2013);及Zhang等人,US 2012/0301490 A1(2012));(d)埃博黴素(epothilone)(例如,參見Vite等人,US 2007/0275904 A1(2007)及US RE42930 E(2011));(e)奧裡斯他汀(auristatin)(例如,參見Senter等人,US 6,844,869 B2(2005)及Doronina等人,US 7,498,298 B2(2009));(f)吡咯并苯并二氮呯(PBD)二聚體(例如,參見Howard等人,US 2013/0059800 A1(2013);US 2013/0028919 A1(2013);及WO 2013/041606 A1(2013));及(g)類美登素(maytansinoid),例如DM1及DM4(例如,參見Chari等人,US 5,208,020(1993)及Amphlett等人,US 7,374,762 B2(2008))。
XV. 雙特異性分子
本文所述抗體可用於形成雙特異性分子。抗CD73抗體或其抗原結合部分可衍生或連接至另一功能分子,例如另一肽或蛋白質(例如受體之另一抗體或配體),以產生結合至至少兩個不同結合位點或靶分子之雙特異性分子。本文所述抗體事實上可衍生或連接至一個以上之其他功能分子,以產生結合至兩個以上不同結合位點及/或靶分子之多特異性分子;該等多特異性分子亦欲涵蓋於如本文所使用之術語「雙特異性分子」中。為產生本文所述之雙特異性分子,本文所述抗體可在功能上連接(例如藉由化學偶合、遺傳融合、非共價締合或其他方式)至一或多個其他結合分子,例如另一抗體、抗體片段、肽或 結合模擬物,使得產生雙特異性分子。
因此,本文提供包含至少一種針對CD73之第一結合特異性及針對第二靶表位之第二結合特異性之雙特異性分子。在其中雙特異性分子具有多特異性之本文所述實施例中,該分子可進一步包括第三結合特異性。
在一個實施例中,本文所述之雙特異性分子包含至少一種抗體或其抗體片段(包括例如Fab、Fab'、F(ab')2、Fv或單鏈Fv)作為結合特異性。抗體亦可為輕鏈或重鏈二聚體或其任何最小片段,例如Fv或單鏈構築物,如Ladner等人,美國專利第4,946,778號中所述,其內容以引用方式明確併入本文中。
雙特異性分子與其特異性靶之結合可使用業內公認方法(例如酶聯免疫吸附分析(ELISA)、放射性免疫分析(RIA)、FACS分析、生物分析(例如生長抑制)或西方印跡分析)來確認。該等分析中之每一者通常藉由採用特異性針對所關注複合物之經標記試劑(例如抗體)來檢測尤其受關注之蛋白質-抗體複合物之存在。
XVI. 組合物
本文進一步提供組合物,例如醫藥組合物,其含有與醫藥上可接受之載劑調配在一起之本文所述抗CD73抗體或其抗原結合部分中之一者或組合。該等組合物可包括本文所述(例如兩種或更多種不同)抗體或免疫偶聯物或雙特異性分子中之一者或組合。例如,本文所述之醫藥組合物可包含結合至靶抗原上之不同表位或具有互補活性之抗體(或免疫偶聯物或雙特異性分子)之組合。
在某些實施例中,組合物包含以下濃度之抗CD73抗體:至少1mg/ml、5mg/ml、10mg/ml、50mg/ml、100mg/ml、150mg/ml、200mg/ml、1-300mg/ml或100-300mg/ml。
本文所述之醫藥組合物亦可以組合療法、即與其他藥劑組合投 與。例如,組合療法可包括本文所述抗CD73抗體與至少一種其他抗癌及/或T細胞刺激(例如活化)劑之組合。可用於組合療法中之治療劑之實例更詳細闡述於下文關於本文所述抗體之用途部分中。
在一些實施例中,本文所揭示之治療組合物可包括用於治療癌症之其他化合物、藥物及/或藥劑。該等化合物、藥物及/或藥劑可包括例如刺激針對給定癌症之免疫反應之化學療法藥物、小分子藥物或抗體。在一些情況下,治療組合物可包括例如關於組合療法之部分中所列示之一或多種藥劑。
如本文所使用,「醫藥上可接受之載劑」包括任何及所有溶劑、分散介質、包衣、抗細菌及抗真菌劑、等滲劑及吸收延遲劑及生理上相容之類似試劑。較佳地,載劑適於靜脈內、肌內、皮下、非經腸、脊柱或表皮投與(例如藉由注射或輸注)。端視投與途徑,可於材料中對活性化合物(即抗體、免疫偶聯物或雙特異性分子)進行包衣以保護化合物免受酸及可使化合物失活之其他天然條件的作用。
本文所述之醫藥化合物可包括一或多種醫藥上可接受之鹽。「醫藥上可接受之鹽」係指保留親代化合物之期望生物活性且不賦予任何不期望毒理學效應之鹽(例如,參見Berge,S.M.等人(1977)J.Pharm.Sci. 66:1-19)。該等鹽之實例包括酸加成鹽及鹼加成鹽。酸加成鹽包括源自無毒無機酸(例如鹽酸、硝酸、磷酸、硫酸、氫溴酸、氫碘酸、亞磷酸及諸如此類)以及源自無毒有機酸(例如脂肪族單及二羧酸、經苯基取代之鏈烷酸、羥基鏈烷酸、芳香族酸、脂肪族及芳香族磺酸及諸如此類)之彼等。鹼加成鹽包括源自鹼土金屬(例如鈉、鉀、鎂、鈣及諸如此類)以及源自無毒有機胺(例如N,N'-二苄基乙二胺、N-甲基葡萄糖胺、氯普魯卡因(chloroprocaine)、膽鹼、二乙醇胺、乙二胺、普魯卡因及諸如此類)之彼等。
本文所述之醫藥組合物亦可包括醫藥上可接受之抗氧化劑。醫 藥上可接受之抗氧化劑之實例包括:(1)水溶性抗氧化劑,例如抗壞血酸、半胱胺酸鹽酸鹽、硫酸氫鈉、偏亞硫酸氫鈉、亞硫酸鈉及諸如此類;(2)油溶性抗氧化劑,例如抗壞血酸棕櫚酸酯、丁基化羥基苯甲醚(BHA)、丁基化羥基甲苯(BHT)、卵磷脂、沒食子酸丙酯、α-生育酚及諸如此類;及(3)金屬螯合劑,例如檸檬酸、乙二胺四乙酸(EDTA)、山梨醇、酒石酸、磷酸及諸如此類。
可用於本文所述醫藥組合物中之適宜水性及非水性載劑之實例包括水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇、聚乙二醇及諸如此類)及其適宜混合物、植物油(例如橄欖油)及可注射有機酯(例如油酸乙酯)。例如,可藉由使用諸如卵磷脂等包衣材料、藉由維持所需粒徑(在分散液之情形下)及藉由使用表面活性劑來維持適當流動性。
該等組合物亦可含有佐劑,例如防腐劑、潤濕劑、乳化劑及分散劑。可藉由上述滅菌程序並納入各種抗細菌劑及抗真菌劑(例如對羥基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、山梨酸及諸如此類)二者確保阻止微生物之存在。該等組合物中亦可期望包括等滲劑,例如糖、氯化鈉及諸如此類。另外,可藉由納入吸收延遲劑(例如單硬脂酸鋁及明膠)來實現可注射醫藥形式之長效吸收。
醫藥上可接受之載劑包括無菌水溶液或分散液及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌粉劑。業內已知用於醫藥活性物質之該等介質及藥劑之使用。除任何與活性化合物不相容之習用介質或藥劑外,本發明涵蓋其於本文所述醫藥組合物中之用途。該等組合物中亦可納入附加活性化合物。
通常,治療組合物必須無菌且在製造及儲存條件下穩定。可將組合物調配成溶液、微乳液、脂質體或其他適於高藥物濃度之有序結構。載劑可為溶劑或分散介質,其含有例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇及液體聚乙二醇及諸如此類)及其適宜混合物。可例如 藉由使用諸如卵磷脂等包衣、藉由維持所需粒徑(在分散液之情形下)及藉由使用表面活性劑來維持適當流動性。在許多情形下,較佳將等滲劑(例如糖、多元醇(例如甘露醇、山梨醇)或氯化鈉)納入組合物中。可藉由在組合物中納入延遲吸收劑(例如單硬脂酸鹽及明膠)來實現可注射組合物之長效吸收。
無菌可注射溶液可藉由以下步驟來製備:將所需量之活性化合物納入含有上文所列舉活性成份中之一者或組合(視需要)之適宜溶劑中,然後進行無菌微濾。通常,藉由將活性化合物納入含有基本分散介質及來自彼等上文所列舉者之所需其他成份的無菌媒劑中來製備分散液。在使用無菌粉末來製備無菌可注射溶液之情形下,較佳製備方法係真空乾燥及冷凍乾燥(凍乾),其可自其預先經無菌過濾之溶液產生由活性劑加上任一其他期望成份構成之粉末。
可與載劑材料組合產生單一劑型之活性成份之量將端視所治療個體及具體投與模式而變化。可與載劑材料組合產生單一劑型之活性成份之量通常將為產生治療效應之組合物之量。通常,以100%計,此量將介於活性成份的約0.01%至約99%範圍內,較佳活性成份與醫藥上可接受之載劑之組合的約0.1%至約70%,最佳約1%至約30%。
可對劑量方案進行調整以提供最佳期望反應(例如治療反應)。例如,可投與單次濃注,可隨時間投與若干個分開劑量或可根據治療狀況之緊急程度所指示按比例減少或增加劑量。尤其有利地將非經腸組合物調配成劑量單位形式以便於投與及劑量均勻性。如本文所使用之劑量單位形式係指適於作為單位劑量供欲治療個體使用之物理離散單位;各單位含有預定量之活性化合物,該預定量經計算與所需醫藥載劑一起產生期望治療效應。本文所述劑量單位形式之規格取決於且直接依賴於下列因素:(a)活性化合物之獨特特徵及欲達成之具體治療效應,及(b)複合此一活性化合物來治療個體敏感性之技術中的固有 限制條件。
對於抗體之投與,劑量介於約0.0001mg/kg至100mg/kg、且更通常0.01mg/kg至5mg/kg宿主體重範圍內。例如,劑量可為0.3mg/kg體重、1mg/kg體重、3mg/kg體重、5mg/kg體重或10mg/kg體重或在1-10mg/kg範圍內。實例性治療方案需要每週一次、每兩週一次、每三週一次、每四週一次、每月一次、每3個月一次或每3至6個月一次投與。
在一些方法中,同時投與兩種或更多種具有不同結合特異性之單株抗體,在該情形下所投與每一抗體之劑量在所指示範圍內。抗體通常係在多個情況下來投與。單一劑量之間之間隔可為例如每週、每月、每三個月或每年。間隔亦可如藉由量測患者之針對靶抗原之抗體血液含量所指示而不規則。在一些方法中,對劑量進行調整以達成約1-1000μg/ml、且在一些方法中為約25-300μg/ml之血漿抗體濃度。
抗體可以持續釋放調配物形式來投與,在該情形下需要較不頻繁投與。劑量及頻率端視抗體在患者中之半衰期而變化。一般而言,人類抗體顯示最長半衰期,其次為人類化抗體、嵌合抗體及非人類抗體。投與劑量及頻率可端視治療為預防性抑或治療性而變化。在預防性應用中,以相對較不頻繁之間隔經較長時間段投與相對較低之劑量。一些患者在其餘生中持續接受治療。在治療性應用中,有時需要相對較短間隔之相對較高之劑量直至減輕或終止疾病進展,且較佳直至患者顯示疾病症狀之部分或完全改善。此後,可向患者投與預防性方案。
本文所述醫藥組合物中活性成份之實際劑量值可有所變化,以獲得對於具體患者、組合物及投與模式可有效地達到期望治療反應而對患者不具毒性之活性成份量。所選劑量值將端視多種藥物動力學因素而定,該等因素包括所用本文所述具體組合物或其酯、鹽或醯胺之 活性、投與途徑、投與時間、所用具體化合物之排泄速率、治療之持續時間、與所用具體組合物組合使用之其他藥物、化合物及/或材料、所治療患者之年齡、性別、體重、身體狀況、一般健康情況及先前病史及醫學技術中所熟知之類似因素。
本文所述抗CD73抗體之「治療有效量」較佳可降低疾病症狀之嚴重程度,增加無疾病症狀期之頻率及持續時間或預防因感病性所致之損害或失能。在癌症背景下,治療有效劑量較佳預防與癌症相關之身體症狀之進一步劣化。癌症之症狀為業內所熟知且包括例如不常見胎痣特徵、胎痣外觀之變化(包括不對稱、邊界、色彩及/或直徑)、新色素皮膚區域、異常胎痣、指甲下之暗化區域、乳房腫塊、乳頭變化、乳房囊腫、乳房疼痛、死亡、體重損失、虛弱、過度疲勞、飲食困難、食欲下降、慢性咳嗽、氣喘惡化、咳血、尿中帶血、便血、噁心、嘔吐、肝轉移、肺轉移、骨轉移、腹滿、氣脹、體液在腹腔中積聚、陰道出血、便秘、腹脹、結腸穿孔、急性腹膜炎(感染、發熱、疼痛)、疼痛、吐血、倒汗、發熱、高血壓、貧血、腹瀉、黃疸、眩暈、風寒、肌肉痙攣、結腸轉移、肺轉移、膀胱轉移、肝轉移、骨轉移、腎轉移及胰臟轉移、吞嚥困難及諸如此類。
治療有效劑量可預防或延遲癌症之發作,例如可能在存在疾病之早期或初步體徵時合意。用於診斷癌症之實驗室測試包括化學法(包括量測CD73含量)、血液學、血清學及放射學。因此,可使用監測前述任一者之任何臨床或生物化學分析來確定具體治療是否係治療癌症之治療有效劑量。熟習此項技術者將能夠基於諸如個體大小、個體症狀之嚴重程度及所選具體組合物或投與途徑等要素來確定該等量。
本文所述之組合物可使用業內已知之多種方法中之一或多者經由一或多個投與途徑來投與。如熟習此項技術者應瞭解,投與途徑及/或模式將端視期望結果而變化。本文所述抗體之較佳投與途徑包括 靜脈內、肌內、皮內、腹膜內、皮下、脊柱或其他非經腸投與途徑,例如藉由注射或輸注。如本文所使用之片語「非經腸投與」意指除經腸及局部投與外之投與模式,通常藉由注射,且包括(但不限於)靜脈內、肌內、動脈內、鞘內、囊內、眶內、心內、皮內、腹膜內、經氣管、皮下、表皮下、關節內、囊下、蛛網膜下、脊柱內、硬膜外及胸骨內注射及輸注。
另一選擇為,本文所述抗體可經由經腸途徑來投與,例如局部、表皮或黏膜投與途徑,例如經鼻內、經口、經陰道、經直腸、經舌下或經局部。
活性化合物可利用保護化合物免於快速釋放之載劑製備,例如控制釋放調配物,包括植入物、經皮貼劑及微囊封遞送系統。可使用生物可降解之生物相容性聚合物,例如乙烯基乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原、聚原酸酯及聚乳酸。用於製備該等調配物之許多方法已獲得專利權或通常為彼等熟習此項技術者所知。例如,參見Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems,J.R.Robinson編輯,Marcel Dekker,Inc.,New York,1978。
治療組合物可使用業內已知之醫療器件來投與。例如,在較佳實施例中,本文所述之治療組合物可使用皮下無針注射器件來投與,例如美國專利第5,399,163號;第5,383,851號;第5,312,335號;第5,064,413號;第4,941,880號;第4,790,824號;或第4,596,556號中所揭示之器件。與本文所述抗CD73抗體一起使用之熟知植入物及模組之實例包括:美國專利第4,487,603號,其揭示用於以可控速率分配藥劑之可植入微輸注幫浦;美國專利第4,486,194號,其揭示用於經由皮膚投與藥劑之治療器件;美國專利第4,447,233號,其揭示用於以精確輸注速率遞送藥劑之藥劑輸注幫浦;美國專利第4,447,224號,其揭示用於持續藥物遞送之可變流量可植入輸注裝置;美國專利第4,439,196 號,其揭示具有多室隔室之滲透藥物遞送系統;及美國專利第4,475,196號,其揭示滲透藥物遞送系統。該等專利皆以引用方式併入本文中。許多其他該等植入物、遞送系統及模組為彼等熟習此項技術者已知。
在某些實施例中,本文所述之抗CD73抗體可經調配以確保活體內之適當分佈。例如,血腦屏障(BBB)排除許多高度親水性化合物。為確保本文所述之治療化合物穿過BBB(若需要),可將其調配於例如脂質體中。關於製造脂質體之方法參見例如美國專利4,522,811;5,374,548;及5,399,331。脂質體可包含一或多個選擇性轉運至特定細胞或器官中、由此增強靶向藥物遞送之部分(例如,參見V.V.Ranade(1989)J.Clin.Pharmacol.29:685)。實例性靶向部分包括葉酸或生物素(例如,參見授予Low等人之美國專利5,416,016);甘露糖苷(Umezawa等人,(1988)Biochem.Biophys.Res.Commun.153:1038);抗體(P.G.Bloeman等人(1995)FEBS Lett.357:140;M.Owais等人(1995)Antimicrob.Agents Chemother.39:180);表面活性劑蛋白質A受體(Briscoe等人(1995)Am.J.Physiol.1233:134);p120(Schreier等人(1994)J.Biol.Chem.269:9090);亦參見K.Keinanen;M.L.Laukkanen(1994)FEBS Lett.346:123;J.J.Killion;I.J.Fidler(1994)Immunomethods 4:273。
XVII. 用途及方法
本文所述之抗體、抗體組合物及方法具有多種活體外及活體內應用,例如抑制腫瘤生長、抑制腫瘤轉移、藉由例如減少腺苷信號傳導增強免疫反應或檢測CD73。在較佳實施例中,本文所述抗體係人類抗體。例如,本文所述之抗CD73抗體可在活體外或離體投與培養物中之細胞或例如在活體內投與人類個體,以抑制腫瘤細胞增殖。因此,本文提供改變個體中之腫瘤生長之方法,其包含向個體投與本文 所述之抗體或其抗原結合部分,使得個體之腫瘤生長減緩。
在具體實施例中,該等方法尤其適於在活體內治療癌症。為達成腫瘤生長之抗原特異性抑制,本文所述之抗CD73抗體可與所關注抗原一起投與或該抗原可已存在於欲治療個體(例如帶有腫瘤之個體)中。當針對CD73之抗體與另一藥劑一起投與時,該兩者可單獨或同時投與。
本文亦涵蓋用於檢測樣品中人類CD73抗原之存在或量測人類CD73抗原之量的方法,其包含使樣品及對照樣品與特異性結合至人類CD73之人類單株抗體或其抗原結合部分在允許抗體或其部分與人類CD73之間形成複合物之條件下接觸。然後檢測複合物之形成,其中該樣品之間之複合物形成與對照樣品相比之差異指示該樣品中存在人類CD73抗原。另外,可使用本文所述之抗CD73抗體經由免疫親和純化來純化人類CD73。
本文進一步涵蓋刺激個體之免疫反應(例如抗原特異性T細胞反應)之方法,其包含向個體投與本文所述之抗CD73抗體,使得刺激個體之免疫反應(例如抗原特異性T細胞反應)。在較佳實施例中,個體係帶有腫瘤之個體且刺激針對腫瘤之免疫反應。腫瘤可為實體腫瘤或液體腫瘤,例如血液惡性病。在某些實施例中,腫瘤係免疫原性腫瘤。在某些實施例中,腫瘤具有非免疫原性。
本文所述之該等及其他方法進一步詳細論述於下文中。
癌症
抗CD73抗體對CD73之抑制可減少患者之腫瘤生長及轉移。抗CD73抗體對CD73之抑制亦可增強患者中對癌性細胞之免疫反應。本文提供用於治療患有癌症之個體之方法,其包含向個體投與本文所述之抗CD73抗體,使得治療個體,例如使得抑制或減緩癌性腫瘤之生長及/或使得腫瘤消退。可單獨使用抗CD73抗體來抑制癌性腫瘤之生 長。另一選擇為,抗CD73抗體可與另一藥劑(例如其他免疫原性劑、標準癌症治療或其他抗體)結合使用,如下文所述。
因此,本文提供例如藉由抑制個體之腫瘤細胞之生長來治療癌症的方法,其包含向個體投與治療有效量之本文所述抗CD73抗體或其抗原結合部分。該抗體可為人類抗CD73抗體(例如本文所述人類抗人類CD73抗體中之任一者)。另外或另一選擇為,抗體可為嵌合或人類化抗CD73抗體,例如包含本文所述抗CD73抗體或其抗原結合部分之嵌合或人類化抗CD73抗體。
可使用本發明抗體抑制其生長之癌症包括通常對免疫療法有反應之癌症。用於治療之癌症之非限制性實例包括鱗狀細胞癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、鱗狀非小細胞肺癌(NSCLC)、非NSCLC、神經膠質瘤、胃腸癌、腎癌(例如透明細胞癌)、卵巢癌、肝癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌、腎癌(例如腎細胞癌(RCC))、前列腺癌(例如激素難治性前列腺腺癌)、甲狀腺癌、神經胚細胞瘤、胰臟癌、神經膠母細胞瘤(多形性神經膠母細胞瘤)、子宮頸癌、胃癌、膀胱癌、肝癌、乳癌、結腸癌及頭頸癌(或癌瘤)、胃癌、生殖細胞腫瘤、小兒肉瘤、鼻竇自然殺手、黑色素瘤(例如轉移性惡性黑色素瘤,例如皮膚或眼內惡性黑色素瘤)、骨癌、皮膚癌、子宮癌、肛區癌、睪丸癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、兒童實體腫瘤、輸尿管癌、腎盂癌、中樞神經系統贅瘤(CNS)、原發性CNS淋巴瘤、腫瘤血管生成、脊椎腫瘤、腦幹神經膠質瘤、垂體腺瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、表皮樣癌、鱗狀細胞癌、T細胞淋巴瘤、環境誘導之癌症(包括由石棉誘導之彼等)、病毒相關之癌症(例如人類乳頭瘤病毒(HPV)相關腫瘤)及源自兩個主要血球譜系(即骨髓樣細胞系(其產生顆粒球、紅血球、血小板、巨噬細胞及肥 大細胞)或淋巴樣細胞系(其產生B、T、NK及血漿細胞))中任一者之血液惡性病,例如所有類型之白血病、淋巴瘤及骨髓瘤,例如急性、慢性、淋巴球性及/或骨髓性白血病,例如急性白血病(ALL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性淋巴球性白血病(CLL)及慢性骨髓性白血病(CML)、未分化AML(M0)、成髓細胞性白血病(M1)、成髓細胞性白血病(M2;具有細胞成熟)、前髓細胞性白血病(M3或M3變體[M3V])、骨髓單核球性白血病(M4或具有嗜酸性球增多症之M4變體[M4E])、單核球性白血病(M5)、紅白血病(M6)、巨核細胞性白血病(M7)、孤立性粒細胞肉瘤及綠色瘤;淋巴瘤,例如霍奇金氏淋巴瘤(HL)、非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)、B細胞淋巴瘤、T細胞淋巴瘤、淋巴漿細胞樣淋巴瘤、單核球樣B細胞淋巴瘤、黏膜相關淋巴樣組織(MALT)淋巴瘤、退行性(例如Ki1+)大細胞淋巴瘤、成人T細胞淋巴瘤/白血病、外套細胞淋巴瘤、血管免疫母細胞性T細胞淋巴瘤、血管中心性淋巴瘤、腸道T細胞淋巴瘤、原發性縱膈B細胞淋巴瘤、前體T淋巴母細胞性淋巴瘤、T淋巴母細胞性;及淋巴瘤/白血病(T-Lbly/T-ALL)、外周T細胞淋巴瘤、淋巴母細胞性淋巴瘤、移植後淋巴組織增生性病症、真性組織細胞性淋巴瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、原發性積液淋巴瘤、淋巴母細胞性淋巴瘤(LBL)、淋巴樣譜系之造血腫瘤、急性淋巴母細胞性白血病、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、伯基特氏淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、瀰漫性組織細胞性淋巴瘤(DHL)、免疫母細胞性大細胞淋巴瘤、前體B淋巴母細胞性淋巴瘤、皮膚T細胞淋巴瘤(CTLC)(亦稱為蕈樣黴菌病或Sezary症候群)及淋巴漿細胞樣淋巴瘤(LPL)與瓦登斯特倫巨球蛋白血症(Waldenstrom's macroglobulinemia);骨髓瘤,例如IgG骨髓瘤、輕鏈骨髓瘤、非分泌性骨髓瘤、鬱積型骨髓瘤(亦稱為無痛性骨髓瘤)、孤立性漿細胞瘤及多發性骨髓瘤、慢性淋巴球性白血病(CLL)、多毛細胞淋巴瘤;骨髓樣譜系之造血腫瘤、間葉來源之腫 瘤,包括纖維肉瘤及橫紋肌肉瘤;精原細胞瘤、畸形癌、中樞及外周神經腫瘤,包括星形細胞瘤、神經鞘瘤;間葉來源之腫瘤,包括纖維肉瘤、橫紋肌肉瘤及骨肉瘤;及其他腫瘤,包括黑色素瘤、著色性乾皮病、角質棘皮瘤、精原細胞瘤、甲狀腺濾泡癌及畸形癌、淋巴樣譜系之造血腫瘤,例如T細胞及B細胞腫瘤,包括(但不限於)T細胞病症,例如T前淋巴球性白血病(T-PLL),包括小細胞及腦狀細胞類型;較佳T細胞類型之大顆粒淋巴球白血病(LGL);a/d T-NHL肝脾淋巴瘤;外周/胸腺後T細胞淋巴瘤(多形及免疫母細胞性子型);血管中心性(鼻)T細胞淋巴瘤;頭頸癌、腎癌、直腸癌、甲狀腺癌;急性骨髓樣淋巴瘤以及該等癌症之任何組合。本文所述方法亦可用於治療轉移性癌症、難治性癌症(例如,對例如使用封阻性CTLA-4或PD-1抗體之先前免疫療法具有難治性之癌症)及復發性癌症。
抗CD73抗體可作為單一療法或僅作為免疫刺激療法來投與。針對CD73之抗體(例如本文所述之抗CD73抗體)亦可與免疫原性劑(例如癌性細胞、經純化腫瘤抗原(包括重組蛋白、肽及碳水化合物分子)、細胞及經編碼免疫刺激細胞介素之基因轉染之細胞)組合(He等人(2004)J.Immunol.173:4919-28)。可用腫瘤疫苗之非限制性實例包括黑色素瘤抗原之肽,例如gp100、MAGE抗原、Trp-2、MART1及/或酪胺酸酶之肽,或經轉染以表現細胞介素GM-CSF之腫瘤細胞(進一步論述於下文中)。
在人類中,已顯示一些腫瘤具有免疫原性,例如黑色素瘤。經由CD73抑制減小T細胞活化之臨限值,可活化宿主中之腫瘤反應,從而允許治療非免疫原性腫瘤或具有有限免疫原性之彼等。
抗CD73抗體(例如本文所述之抗CD73抗體)可與疫苗接種方案組合。業內已設計出針對腫瘤之疫苗接種之許多實驗策略(參見Rosenberg,S.,2000,Development of Cancer Vaccines,ASCO Educational Book Spring:60-62;Logothetis,C.,2000,ASCO Educational Book Spring:300-302;Khayat,D.2000,ASCO Educational Book Spring:414-428;Foon,K.2000,ASCO Educational Book Spring:730-738;亦參見Restifo,N.及Sznol,M.,Cancer Vaccines,第61章,第3023-3043頁,DeVita等人(編輯),1997,Cancer:Principles and Practice of Oncology,第5版)。在該等策略中之一者中,疫苗係使用自體或同種異體腫瘤細胞來製備。已顯示該等細胞疫苗在腫瘤細胞經轉導以表現GM-CSF時最有效。已顯示GM-CSF係抗原呈遞之強效活化劑用於腫瘤疫苗接種(Dranoff等人(1993)Proc.Natl.Acad.Sci U.S.A.90:3539-43)。
不同腫瘤中之基因表現及大規模基因表現模式之研究已產生所謂的腫瘤特異性抗原之定義(Rosenberg,S A(1999)Immunity 10:281-7)。在許多情形下,該等腫瘤特異性抗原係在腫瘤及產生腫瘤之細胞中表現之分化抗原,例如黑色素細胞抗原gp100、MAGE抗原及Trp-2。更重要地,可顯示該等抗原中之許多係在宿主中發現之腫瘤特異性T細胞之靶。CD73抑制可與在腫瘤中表現之重組蛋白及/或肽之集合聚合使用以產生針對該等蛋白質之免疫反應。該等蛋白質通常被免疫系統視為自體抗原且因此對其耐受。腫瘤抗原可包括蛋白質端粒酶,其為合成染色體之端粒所必需且在85%以上之人類癌症及僅有限數量之體細胞組織中表現(Kim等人(1994)Science 266:2011-2013)。由於改變蛋白質序列或在兩條不相關序列(即費城染色體(Philadelphia chromosome)中之bcr-abl)之間產生融合蛋白或來自B細胞腫瘤之個體基因型的體細胞突變,腫瘤抗原亦可為在癌細胞中表現之「新抗原」。
其他腫瘤疫苗可包括來自參與人類癌症之病毒(例如人類乳頭瘤病毒(HPV)、肝炎病毒(HBV及HCV)及卡波西氏皰疹肉瘤病毒 (Kaposi's Herpes Sarcoma Virus,KHSV))之蛋白質。可與CD73抑制結合使用之另一形式之腫瘤特異性抗原係自腫瘤組織自身分離之經純化熱休克蛋白(HSP)。該等熱休克蛋白含有來自腫瘤細胞之蛋白質之片段,且該等HSP在遞送至抗原呈遞細胞以引發腫瘤免疫性時高度有效(Suot及Srivastava(1995)Science 269:1585-1588;Tamura等人(1997)Science 278:117-120)。
樹突狀細胞(DC)係可用於引發抗原特異性反應之強效抗原呈遞細胞。DC可離體產生且負載有多種蛋白質及肽抗原以及腫瘤細胞提取物(Nestle等人(1998)Nature Medicine 4:328-332)。DC亦可藉由遺傳方式轉導以亦表現該等腫瘤抗原。DC亦已出於免疫之目的直接融合至腫瘤細胞(Kugler等人(2000)Nature Medicine 6:332-336)。作為疫苗接種之方法,DC免疫可有效地與CD73抑制組合來活化更強效的抗腫瘤反應。
CD73抑制亦可與標準癌症治療(例如手術、輻射及化學療法)組合。CD73抑制可有效地與化學治療方案組合。在該等情況下,可減小所投與化學治療試劑之劑量(Mokyr等人(1998)Cancer Research 58:5301-5304)。此一組合之實例係抗CD73抗體與達卡巴嗪(decarbazine)組合治療黑色素瘤。此一組合之另一實例係抗CD73抗體與介白素-2(IL-2)組合治療黑色素瘤。組合使用CD73抑制及化學療法之科學原理在於,細胞死亡(為大部分化學治療性化合物之細胞毒性作用之結果)應增加抗原呈遞路徑中腫瘤抗原之含量。可經由細胞死亡引起與CD73抑制之協同作用之其他組合療法係輻射、手術及激素剝奪。該等方案中之每一者在宿主中產生腫瘤抗原之來源。血管生成抑制劑亦可與CD73抑制組合。抑制血管生成會導致腫瘤細胞死亡,此可將腫瘤抗原進給至宿主抗原呈遞路徑中。
此一組合之另一實例係抗CD73抗體與抗CD39、抗A2AR或化學 抑制劑或抗A2BR抗體或化學抑制劑之組合。組合使用CD73抑制及CD39、A2AR或A2BR抑制之原理在於,該等蛋白質亦與CD73生物功能及信號傳導相關。特定而言,CD39催化ATP或ADP轉換成AMP,由此提供用於CD73酶活性(即AMP轉換成腺苷)之受質(AMP)。另外,腺苷係四種已知受體(包括A1R、A2AR、A2BR及A3)之配體。已顯示A2AR及A2BR經由cAMP信號傳導調控腫瘤環境中之腫瘤細胞增殖、生長、遷移及轉移以及T細胞活化。
本文所述之抗CD73抗體亦可與使表現Fcα或Fcγ受體之效應細胞靶向腫瘤細胞之雙特異性抗體組合使用(例如,參見美國專利第5,922,845號及第5,837,243號)。雙特異性抗體可用於靶向兩種單獨抗原。例如,已使用抗Fc受體/抗腫瘤抗原(例如Her-2/neu)雙特異性抗體使巨噬細胞靶向腫瘤位點。此靶向可更有效地活化腫瘤特異性反應。另一選擇為,可藉由使用結合至腫瘤抗原及樹突狀細胞特異性細胞表面標記物之雙特異性抗體將抗原直接遞送至DC。
腫瘤藉助眾多種機制避開宿主免疫監督。該等機制中之許多可藉由使由腫瘤表現且具有免疫阻抑性之蛋白質失活來克服。該等蛋白質尤其包括TGF-β(Kehrl等人(1986)J.Exp.Med.163:1037-1050)、IL-10(Howard及O'Garra(1992)Immunology Today 13:198-200)及Fas配體(Hahne等人(1996)Science 274:1363-1365)。針對該等實體中每一者之抗體可與抗CD73抗體組合使用以抵消免疫阻抑劑之效應且有利於宿主之腫瘤免疫反應。
活化宿主免疫反應性之其他抗體可與抗CD73抗體組合使用。該等抗體包括樹突狀細胞表面上之活化DC功能及抗原呈遞之分子。抗CD40抗體能夠有效地取代T細胞輔助活性(Ridge等人(1998)Nature 393:474-478)且可與抗CD73抗體結合使用。活化針對T細胞共刺激分子(例如OX-40(Weinberg等人(2000)Immunol 164:2160-2169)、4-1BB (Melero等人(1997)Nature Medicine 3:682-685(1997)及ICOS(Hutloff等人(1999)Nature 397:262-266))之抗體亦可提供增加的T細胞活化程度。PD1、PD-L1或CTLA-4之抑制劑(例如美國專利第5,811,097號)亦可與抗CD73抗體結合使用。
使用本文所述之其他方法來治療已暴露於具體毒素或病原體下之患者。因此,本文所述之另一態樣提供治療個體之傳染病之方法,其包含向個體投與抗CD73抗體或其抗原結合部分,使得治療該個體之傳染病。另外或另一選擇為,抗體可為嵌合或人類化抗體。
在所有上述方法中,CD73抑制可與其他形式之免疫療法(例如細胞介素治療(例如干擾素、GM-CSF、G-CSF、IL-2))或提供增強的腫瘤抗原呈遞之雙特異性抗體療法組合(例如,參見Holliger(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448;Poljak(1994)Structure 2:1121-1123)。
組合療法
除上文所提供之組合療法外,本文所述之抗CD73抗體亦可於組合療法中用於例如治療癌症,如下文所述。
本文進一步提供組合療法之方法,其中共投與抗CD73抗體與一或多種可有效地刺激免疫反應、由此進一步增強、刺激或上調個體之免疫反應之其他藥劑(例如抗體)。
通常,本文所述之抗CD73抗體可與以下各項組合:(i)共刺激受體之激動劑及/或(ii)T細胞上抑制信號之拮抗劑,該二者皆放大抗原特異性T細胞反應(免疫檢查點調控劑)。大多數共刺激及共抑制分子係免疫球蛋白超家族(IgSF)之成員,且本文所述之抗CD73抗體可與靶向IgSF家族成員之藥劑一起投與以增加免疫反應。結合至共刺激或共抑制受體之膜結合配體之一個重要家族係B7家族,其包括B7-1、B7-2、B7-H1(PD-L1)、B7-DC(PD-L2)、B7-H2(ICOS-L)、B7-H3、B7- H4、B7-H5(VISTA)及B7-H6。結合至共刺激或共抑制受體之膜結合配體之另一家族係結合至同源TNF受體家族成員之分子之TNF家族,其包括CD40及CD40L、OX-40、OX-40L、CD70、CD27L、CD30、CD30L、4-1BBL、CD137、GITR、TRAIL/Apo2-L、TRAILR1/DR4、TRAILR2/DR5、TRAILR3、TRAILR4、OPG、RANK、RANKL、TWEAKR/Fn14、TWEAK、BAFFR、EDAR、XEDAR、TACI、APRIL、BCMA、LTβR、LIGHT、DcR3、HVEM、VEGI/TL1A、TRAMP/DR3、EDAR、EDA1、XEDAR、EDA2、TNFR1、淋巴毒素α/TNFβ、TNFR2、TNFα、LTβR、淋巴毒素α 1β2、FAS、FASL、RELT、DR6、TROY、NGFR(例如,參見Tansey(2009)Drug Discovery Today 00:1)。亦藉由可溶性細胞介素來調控T細胞活化。因此,抗CD73抗體可與以下各項組合使用:(i)抑制T細胞活化之IgSF家族或B7家族或TNF家族蛋白質之拮抗劑(或抑制劑或阻斷劑)或抑制T細胞活化之細胞介素(例如IL-6、IL-10、TGF-β、VEGF;「免疫阻抑性細胞介素」)之拮抗劑,及/或(ii)IgSF家族、B7家族或TNF家族之刺激性受體或刺激T細胞活化之細胞介素的激動劑,用於刺激免疫反應,例如用於治療增生性疾病,例如癌症。
例如,T細胞反應可由本文所述抗CD73抗體(例如CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f)及以下藥劑中之一或多者的組合來刺激:
(1)抑制T細胞活化之蛋白質(例如CTLA-4、PD-1、PD-L1、PD-L2及LAG-3,如上文所述)之拮抗劑(例如免疫檢查點抑制劑)及以下蛋白質中任一者之拮抗劑(抑制劑或阻斷劑):TIM-3、半乳糖凝集素9、CEACAM-1、BTLA、CD69、半乳糖凝集素-1、TIGIT、CD113、GPR56、VISTA、2B4、CD48、GARP、CD73、PD1H、LAIR1、TIM-1、TIM-4、CD39。
(2)刺激T細胞活化之蛋白質(例如B7-1、B7-2、CD28、4-1BB (CD137)、4-1BBL、GITR、GITRL、ICOS、ICOS-L、OX40、OX40L、CD70、CD27、CD40、DR3及CD28H)之激動劑。
調節上述蛋白質中之一者且可與拮抗劑抗CD73抗體(例如本文所述之彼等)組合治療癌症之實例性藥劑包括:YervoyTM(伊匹單抗(ipilimumab))或曲美木單抗(Tremelimumab,針對CTLA-4)、加利昔單抗(galiximab,針對B7.1)、BMS-936558(針對PD-1)、CT-011(針對PD-1)、MK-3475(針對PD-1)、AMP224(針對B7DC)、BMS-936559(針對B7-H1)、MPDL3280A(針對B7-H1)、MEDI-570(針對ICOS)、AMG557(針對B7H2)、MGA271(針對B7H3)、IMP321(針對LAG-3)、BMS-663513(針對CD137)、PF-05082566(針對CD137)、CDX-1127(針對CD27)、抗OX40(Providence Health Services)、huMAbOX40L(針對OX40L)、阿塞西普(Atacicept,針對TACI)、CP-870893(針對CD40)、魯卡木單抗(Lucatumumab,針對CD40)、達西珠單抗(Dacetuzumab,針對CD40)、莫羅單抗(Muromonab)-CD3(針對CD3)、易普利單抗(Ipilumumab,針對CTLA-4)。
可與拮抗劑抗CD73抗體組合治療癌症之其他分子包括NK細胞上抑制性受體之拮抗劑或NK細胞上活化受體之激動劑。例如,抗CD73拮抗劑抗體可與KIR拮抗劑(例如利利單抗(lirilumab))組合。
T細胞活化亦由可溶性細胞介素來調控,且抗CD73抗體可與抑制T細胞活化之細胞介素之拮抗劑或刺激T細胞活化之細胞介素之激動劑一起投與例如患有癌症之個體。
在某些實施例中,抗CD73抗體可與以下各項組合使用:(i)抑制T細胞活化之IgSF家族或B7家族或TNF家族蛋白質之拮抗劑(或抑制劑或阻斷劑)或抑制T細胞活化之細胞介素(例如IL-6、IL-10、TGF-β、VEGF;「免疫阻抑性細胞介素」)之拮抗劑,及/或(ii)刺激T細胞活化之IgSF家族、B7家族或TNF家族之刺激性受體或細胞介素之激動 劑,用於刺激免疫反應,例如用於治療增生性疾病,例如癌症。
用於組合療法之其他藥劑包括抑制或清除巨噬細胞或單核球之藥劑,包括(但不限於)CSF-1R拮抗劑,例如CSF-1R拮抗劑抗體,包括RG7155(WO11/70024、WO11/107553、WO11/131407、WO13/87699、WO13/119716、WO13/132044)或FPA-008(WO11/140249;WO13169264;WO14/036357)。
抗CD73抗體亦可與抑制TGF-β信號傳導之藥劑一起投與。
可與抗CD73抗體組合之其他藥劑包括增強腫瘤抗原呈遞之藥劑,例如樹突狀細胞疫苗、GM-CSF分泌細胞疫苗、CpG寡核苷酸及咪喹莫特(imiquimod),或增強腫瘤細胞之免疫原性之療法(例如蒽環類抗生素(anthracycline))。
可與抗CD73抗體組合之其他療法包括清除或阻斷Treg細胞之療法,例如特異性結合至CD25之藥劑。
可與抗CD73抗體組合之另一療法係抑制代謝酶(例如吲哚胺雙加氧酶(IDO)、雙加氧酶、精胺酸酶或一氧化氮合成酶)之療法。
可與抗CD73抗體一起使用之另一類藥劑包括抑制腺苷形成或抑制腺苷A2A受體之藥劑。
可與抗CD73抗體組合治療癌症之其他療法包括逆轉/預防T細胞無效能或耗竭之療法及觸發腫瘤位點處之固有免疫活化及/或發炎之療法。
抗CD73抗體可與一種以上之免疫腫瘤劑組合,且可例如與靶向免疫路徑之多個元件之組合方法組合,該組合方法係例如以下中之一或多者:增強腫瘤抗原呈遞之療法(例如樹突狀細胞疫苗、GM-CSF分泌細胞疫苗、CpG寡核苷酸、咪喹莫特);例如藉由抑制CTLA-4及/或PD1/PD-L1/PD-L2路徑及/或清除或阻斷Treg或其他免疫阻抑細胞抑制負免疫調控之療法;例如使用刺激CD-137、OX-40及/或GITR路徑及/ 或刺激T細胞效應子功能之激動劑刺激正免疫調控之療法;以全身性方式增加抗腫瘤T細胞頻率之療法;例如使用CD25拮抗劑(例如達利珠單抗(daclizumab))或藉由離體抗CD25珠粒清除來清除或抑制Treg(例如腫瘤中之Treg)之療法;影響腫瘤中之阻抑骨髓樣細胞之功能之療法;增強腫瘤細胞之免疫原性之療法(例如蒽環類抗生素);授受性T細胞或NK細胞轉移,包括經遺傳修飾之細胞,例如由嵌合抗原受體修飾之細胞(CAR-T療法);抑制代謝酶(例如吲哚胺雙加氧酶(IDO)、雙加氧酶、精胺酸酶或一氧化氮合成酶)之療法;逆轉/預防T細胞無效能或耗竭之療法;觸發腫瘤位點處之固有免疫活化及/或發炎之療法;投與免疫刺激性細胞介素;或阻斷免疫阻抑性細胞介素。
通常,本文所述之抗CD73抗體可與以下藥劑中之一或多者一起使用:接合陽性共刺激受體之激動劑、減弱通過抑制性受體之信號傳導之阻斷劑、拮抗劑及一或多種以全身性方式增加抗腫瘤T細胞頻率之藥劑、克服腫瘤微環境內之不同免疫阻抑路徑(例如阻斷抑制性受體接合(例如PD-L1/PD-1相互作用)、清除或抑制Treg(例如,使用抗CD25單株抗體(例如,達利珠單抗)或藉由離體抗CD25珠粒清除)、抑制代謝酶(例如IDO)或逆轉/預防T細胞無效能或耗竭)之藥劑及觸發腫瘤位點處之固有免疫活化及/或發炎之藥劑。增加的抑制性受體內化可轉化成較低量之潛在抑制劑(假設隨後不發生信號傳導)。
在某些實施例中,若個體呈BRAF V600突變陽性,則將抗CD73抗體與BRAF抑制劑一起投與個體。
本文提供用於刺激個體之免疫反應之方法,其包含向個體投與拮抗劑抗CD73分子(例如抗體)及一或多種其他免疫刺激性抗體(例如抗PD-1拮抗劑(例如拮抗劑抗體)、抗PD-L1拮抗劑(例如拮抗劑抗體)、拮抗劑抗CTLA-4拮抗劑(例如拮抗劑抗體)及/或抗LAG3拮抗劑(例如拮抗劑抗體)),使得刺激個體之免疫反應,例如以抑制腫瘤生長 或刺激抗病毒反應。在一個實施例中,向個體投與拮抗劑抗CD73抗體及拮抗劑抗PD-r抗體。在一個實施例中,向個體投與拮抗劑抗CD73抗體及拮抗劑抗PD-L1抗體。在一個實施例中,向個體投與拮抗劑抗CD73抗體及拮抗劑抗CTLA-4抗體。在一個實施例中,抗CD73抗體係人類抗體,例如本文所述抗體。另一選擇為,抗CD73抗體可為例如嵌合或人類化抗體(例如,自小鼠抗CD73 mAb製備),例如本文進一步闡述之彼等。在一個實施例中,至少一種其他免疫刺激性抗體(例如拮抗劑抗PD-1、拮抗劑抗PD-L1、拮抗劑抗CTLA-4及/或拮抗劑抗LAG3抗體)係人類抗體。另一選擇為,至少一種其他免疫刺激性抗體可為例如嵌合或人類化抗體(例如,自小鼠抗PD-1、抗PD-L1、抗CTLA-4及/或抗LAG3抗體製備)。
本文提供用於治療過度增生性疾病(例如癌症)之方法,其包含向個體投與拮抗劑抗CD73抗體及拮抗劑PD-1抗體。在某些實施例中,以低治療劑量投與抗CD73抗體,抗PD-1抗體係以低治療劑量來投與,或以低治療劑量投與二者。本文亦提供改變與使用免疫刺激劑治療過度增生性疾病相關之不良事件之方法,其包含向個體投與抗CD73抗體及低治療劑量之抗PD-1抗體。在某些實施例中,個體係人類。在某些實施例中,抗PD-1抗體係人類序列單株抗體且抗CD73抗體係人類序列單株抗體,例如包含本文所述11F11、4C3、4D4、10D2、11A6、24H2、5F8、6E11、7A11、CD73.3、CD73.4、CD73.5、CD73.6、CD73.7、CD73.8、CD73.9、CD73.10或CD73.11之CDR或可變區之抗體或本文所述之另一拮抗劑抗CD73抗體。
適用於本文所述方法中之PD-1拮抗劑包括(但不限於)配體、抗體(例如單株抗體及雙特異性抗體)及多價藥劑。在一個實施例中,PD-1拮抗劑係融合蛋白,例如Fc融合蛋白,例如AMP-244。在一個實施例中,PD-1拮抗劑係抗PD-1或抗PD-L1抗體。
實例性抗PD-1抗體係尼沃魯單抗(nivolumab,BMS-936558)或包含WO 2006/121168中所述之抗體17D8、2D3、4H1、5C4、7D3、5F4及4A11中之一者的CDR或可變區之抗體。在某些實施例中,抗PD1抗體係WO2012/145493中所述之MK-3475(拉波裡單抗(Lambrolizumab));WO 2012/145493中所述之AMP-514;及CT-011(易普利姆碼(Pidilizumab);先前稱為CT-AcTibody或BAT;例如,參見Rosenblatt等人(2011)J.Immunotherapy 34:409)。其他已知PD-1抗體及其他PD-1抑制劑包括以下專利中所述之彼等:WO 2009/014708、WO 03/099196、WO 2009/114335、WO 2011/066389、WO 2011/161699、WO 2012/145493、美國專利第7,635,757號及第8,217,149號以及美國專利公開案第2009/0317368號。亦可使用WO2013/173223中所揭示之任一抗PD-1抗體。與該等抗體中之一者競爭結合及/或結合至與該等抗體中之一者相同之PD-1表位的抗PD-1抗體亦可用於組合治療中。
在某些實施例中,抗PD-1抗體以5×10-8M或更小之KD結合至人類PD-1,以1×10-8M或更小之KD結合至人類PD-1,以5×10-9M或更小之KD結合至人類PD-1,或以介於1×10-8M與1×10-10M之間或更小之KD結合至人類PD-1。
本文提供用於治療過度增生性疾病(例如癌症)之方法,其包含向個體投與拮抗劑抗CD73抗體及拮抗劑PD-L1抗體。在某些實施例中,以低治療劑量投與抗CD73抗體,以低治療劑量投與抗PD-L1抗體,或以低治療劑量投與二者。本文提供用於改變與使用免疫刺激劑治療過度增生性疾病相關之不良事件之方法,其包含向個體投與抗CD73抗體及低治療劑量之抗PD-L1抗體。在某些實施例中,個體係人類。在某些實施例中,抗PD-L1抗體係人類序列單株抗體且抗CD73抗體係人類序列單株抗體,例如包含本文所述11F11、4C3、4D4、10D2、 11A6、24H2、5F8、6E11、7A11、CD73.3、CD73.4、CD73.5、CD73.6、CD73.7、CD73.8、CD73.9、CD73.10或CD73.11之CDR或可變區之抗體或本文所述之另一拮抗劑抗CD73抗體。
在一個實施例中,抗PD-L1抗體係BMS-936559(在WO 2007/005874及美國專利第7,943,743號中稱為12A4),或PCT公開案WO 07/005874及美國專利第7,943,743號中所述之包含3G10、12A4、10A5、5F8、10H10、1B12、7H1、11E6、12B7及13G4之CDR或可變區之抗體。在某些實施例中,抗PD-L1抗體係MEDI4736(亦稱為抗B7-H1)或MPDL3280A(亦稱為RG7446)。亦可使用WO2013/173223、WO2011/066389、WO2012/145493、美國專利第7,635,757號及第8,217,149號以及美國公開案第2009/145493號中所揭示之任一抗PD-L1抗體。與該等抗體中之任一者競爭及/或結合至與該等抗體中之任一者相同之表位的抗PD-L1抗體亦可用於組合治療中。
在某些實施例中,抗PD-L1抗體以5×10-8M或更小之KD結合至人類PD-L1,以1×10-8M或更小之KD結合至人類PD-L1,以5×10-9M或更小之KD結合至人類PD-L1,或以介於1×10-8M與1×10-10M之間或更小之KD結合至人類PD-L1。
本文提供用於治療過度增生性疾病(例如癌症)之方法,其包含向個體投與本文所述之抗CD73抗體及CTLA-4拮抗劑抗體。在某些實施例中,以低治療劑量投與抗CD73抗體,以低治療劑量投與抗CTLA-4抗體,或以低治療劑量投與二者。本文提供用於改變與使用免疫刺激劑治療過度增生性疾病相關之不良事件之方法,其包含向個體投與抗CD73抗體及低治療劑量之抗CTLA-4抗體。在某些實施例中,個體係人類。在某些實施例中,抗CTLA-4抗體係選自以下之群之抗體:YervoyTM(PCT公開案WO 01/14424中所述之伊匹單抗或抗體10D1)、曲美木單抗(之前稱為替西莫單抗(ticilimumab)、CP-675,206)、以下 公開案中之任一者所述之單株或抗CTLA-4抗體:WO 98/42752;WO 00/37504;美國專利第6,207,156號;Hurwitz等人(1998)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95(17):10067-10071;Camacho等人(2004)J.Clin.Oncology 22(145):摘要編號2505(抗體CP-675206);及Mokyr等人(1998)Cancer Res.58:5301-5304。亦可使用WO2013/173223中所揭示之任一抗CTLA-4抗體。
在某些實施例中,抗CTLA-4抗體以5×10-8M或更小之KD結合至人類CTLA-4,以1×10-8M或更小之KD結合至人類CTLA-4,以5×10-9M或更小之KD結合至人類CTLA-4,或以介於1×10-8M與1×10-10M之間或更小之KD結合至人類CTLA-4。
本文提供用於治療過度增生性疾病(例如癌症)之方法,其包含向個體投與抗CD73抗體及抗LAG-3抗體。在其他實施例中,以低治療劑量投與抗CD73抗體,以低治療劑量投與抗LAG-3抗體,或以低治療劑量投與二者。本文提供用於改變與使用免疫刺激劑治療過度增生性疾病相關之不良事件之方法,其包含向個體投與抗CD73抗體及低治療劑量之抗LAG-3抗體。在某些實施例中,個體係人類。在某些實施例中,抗PD-L1抗體係人類序列單株抗體且抗CD73抗體係人類序列單株抗體,例如包含11F11、4C3、4D4、10D2、11A6、24H2、5F8、6E11、7A11、CD73.3、CD73.4、CD73.5、CD73.6、CD73.7、CD73.8、CD73.9、CD73.10或CD73.11之CDR或可變區之抗體或本文所述之另一拮抗劑抗CD73抗體。抗LAG3抗體之實例包括美國專利公開案第US2011/0150892及WO2014/008218號中所述之包含抗體25F7、26H10、25E3、8B7、11F2或17E5之CDR或可變區之抗體。在一個實施例中,抗LAG-3抗體係BMS-986016。其他業內公認之可用抗LAG-3抗體包括US 2011/007023中所述之IMP731。亦可使用IMP-321。與該等抗體中之任一者競爭及/或結合至與該等抗體中之任一者相同之表 位的抗LAG-3抗體亦可用於組合治療中。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體以5×10-8M或更小之KD結合至人類LAG-3,以1×10-8M或更小之KD結合至人類LAG-3,以5×10-9M或更小之KD結合至人類LAG-3,或以介於1×10-8M與1×10-10M之間或更小之KD結合至人類LAG-3。
在某些實施例中,抗CD73抗體係與抗GITR激動劑抗體一起投與,例如具有6C8之CDR序列之抗體,例如具有如例如WO2006/105021中所述之6C8之CDR的人類化抗體;包含WO2011/028683中所述之抗GITR抗體之CDR的抗體;包含JP2008278814中所述之抗GITR抗體之CDR的抗體;或包含PCT/US2015/033991中所述之抗GITR抗體之CDR的抗體。
投與針對一或多種第二靶抗原(例如LAG-3及/或CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1)之本文所述抗CD73抗體及拮抗劑(例如拮抗劑抗體)可增強患者對癌性細胞之免疫反應。可使用本發明抗體抑制其生長之癌症包括通常對免疫療法有反應之癌症。使用本發明組合療法治療之癌症之代表性實例包括上文在使用抗CD73抗體之單一療法的論述中所明確列示之彼等癌症。
在某些實施例中,本文所論述治療性抗體之組合可作為醫藥上可接受之載劑中之單一組合物同時投與,或作為醫藥上可接受之載劑中之含有每一抗體之單獨組合物同時投與。在另一實施例中,可依序投與治療性抗體之組合。例如,可依序投與抗CTLA-4抗體及抗CD73抗體,例如首先投與抗CTLA-4抗體且隨後投與抗CD73抗體,或首先投與抗CD73抗體且隨後投與抗CTLA-4抗體。另外或另一選擇為,可依序投與抗PD-1抗體及抗CD73抗體,例如首先投與抗PD-1抗體且隨後投與抗CD73抗體,或首先投與抗CD73抗體且隨後投與抗PD-1抗體。另外或另一選擇為,可依序投與抗PD-L1抗體及抗CD73抗體,例 如首先投與抗PD-L1抗體且隨後投與抗CD73抗體,或首先投與抗CD73抗體且隨後投與抗PD-L1抗體。另外或另一選擇為,可依序投與抗LAG-3抗體及抗CD73抗體,例如首先投與抗LAG-3抗體且隨後投與抗CD73抗體,或首先投與抗CD73抗體且隨後投與抗LAG-3抗體。
另外,若依序投與一個以上劑量之組合療法,則依序投與之順序可顛倒或在每一投與時間點保持相同順序,依序投與可與同時投與組合,或其任何組合。例如,抗CTLA-4抗體及抗CD73抗體之組合之第一次投與可為同時投與,第二次投與可為依序投與,其中首先投與抗CTLA-4抗體並隨後投與抗CD73抗體,且第三次投與可為依序投與,其中首先投與抗CD73抗體並隨後投與抗CTLA-4抗體等。另外或另一選擇為,抗PD-1抗體及抗CD73抗體之組合之第一次投與可為同時投與,第二次投與可為依序投與,其中首先投與抗PD-1抗體並隨後投與抗CD73抗體,且第三次投與可為依序投與,其中首先投與抗CD73抗體並隨後投與抗PD-1抗體等。另外或另一選擇為,抗PD-L1抗體及抗CD73抗體之組合之第一次投與可為同時投與,第二次投與可為依序投與,其中首先投與抗PD-L1抗體並隨後投與抗CD73抗體,且第三次投與可為依序投與,其中首先投與抗CD73抗體並隨後投與抗PD-L1抗體等。另外或另一選擇為,抗LAG-3抗體及抗CD73抗體之組合之第一次投與可為同時與,第二次投與可為依序投與,其中首先投與抗LAG-3抗體並隨後投與抗CD73抗體,且第三次投與可為依序與,其中首先投與抗CD73抗體並隨後投與抗LAG-3抗體等。另一代表性投藥方案可涉及第一次投與,其為依序投與,其中首先投與抗CD73並隨後投與抗CTLA-4抗體(及/或抗PD-1抗體及/或抗PD-L1抗體及/或抗LAG-3抗體),且後續投與可為同時投與。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體, 其中免疫腫瘤劑係CD137(4-1BB)激動劑,例如激動性CD137抗體。適宜CD137抗體包括例如烏瑞蘆單抗(urclumab)或PF-05082566(WO12/32433)。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體,其中免疫腫瘤劑係OX40激動劑,例如激動性OX40抗體。適宜OX40抗體包括例如MEDI-6383、MEDI-6469或MOXR0916(RG7888;WO06/029879)。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體,其中免疫腫瘤劑係CD40激動劑,例如激動性CD40抗體。在某些實施例中,免疫腫瘤劑係CD40拮抗劑,例如拮抗性CD40抗體。適宜CD40抗體包括例如魯卡木單抗(HCD122)、達西珠單抗(SGN-40)、CP-870,893或Chi Lob 7/4。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體,其中免疫腫瘤劑係CD27激動劑,例如激動性CD27抗體。適宜CD27抗體包括例如瓦利珠單抗(varlilumab,CDX-1127)。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體,其中免疫腫瘤劑係MGA271(針對B7H3)(WO11/109400)。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體,其中免疫腫瘤劑係KIR拮抗劑,例如利利單抗。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體, 其中免疫腫瘤劑係IDO拮抗劑。適宜IDO拮抗劑包括例如INCB-024360(WO2006/122150、WO07/75598、WO08/36653、WO08/36642)、吲哚莫德(indoximod)、NLG-919(WO09/73620、WO09/1156652、WO11/56652、WO12/142237)或F001287。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體,其中免疫腫瘤劑係類鐸受體激動劑,例如TLR2/4激動劑(例如卡介苗);TLR7激動劑(例如Hiltonol或咪喹莫特);TLR7/8激動劑(例如雷西莫特(Resiquimod));或TLR9激動劑(例如CpG7909)。
在一個實施例中,藉由向個體投與免疫腫瘤劑及抗CD73抗體來治療患有可自刺激免疫系統受益之疾病(例如癌症或傳染病)之個體,其中免疫腫瘤劑係TGF-β抑制劑,例如GC1008、LY2157299、TEW7197或IMC-TR1。
在一個態樣中,抗CD73抗體係在投與第二藥劑(例如免疫腫瘤劑)之前依序投與。在一個態樣中,抗CD73抗體係與第二藥劑(例如免疫腫瘤劑)同時投與。在另一態樣中,抗CD73抗體係在投與第二藥劑之後依序投與。兩種藥劑之投與可間隔例如30分鐘、60分鐘、90分鐘、120分鐘、3小時、6小時、12小時、24小時、36小時、48小時、3天、5天、7天或一或多週開始,或第二藥劑之投與可在已投與第一藥劑後例如30分鐘、60分鐘、90分鐘、120分鐘、3小時、6小時、12小時、24小時、36小時、48小時、3天、5天、7天或一或多週開始。
在某些態樣中,抗CD73抗體及第二藥劑(例如免疫腫瘤劑)係例如經30分鐘或60分鐘之時段同時投與(例如同時輸注)至患者。抗CD73抗體可與第二藥劑(例如免疫腫瘤劑)共調配。
視情況,作為唯一免疫治療劑之抗CD73或抗CD73抗體及一或多種其他免疫治療性抗體(例如抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/ 或抗LAG-3阻斷)之組合可進一步與免疫原性劑(例如癌性細胞、經純化腫瘤抗原(包括重組蛋白、肽及碳水化合物分子)、細胞及經編碼免疫刺激細胞介素之基因轉染之細胞)組合(He等人(2004)J.Immunol.173:4919-28)。可用腫瘤疫苗之非限制性實例包括黑色素瘤抗原之肽,例如gp100、MAGE抗原、Trp-2、MART1及/或酪胺酸酶之肽,或經轉染以表現細胞介素GM-CSF之腫瘤細胞(進一步論述於下文中)。組合的CD73抑制及一或多種其他抗體(例如CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷)亦可進一步與標準癌症治療組合。例如,組合的CD73抑制及一或多種其他抗體(例如CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷)可有效地與化學治療方案組合。在該等情況下,可減小與本發明組合一起投與之其他化學治療試劑之劑量(Mokyr等人(1998)Cancer Research 58:5301-5304)。此一組合之實例係抗CD73拮抗劑抗體(有或沒有)及另一抗體(例如抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體及/或抗PD-L1抗體及/或抗LAG-3抗體)之組合進一步與達卡巴嗪組合治療黑色素瘤。另一實例係抗CD73抗體(有或沒有)及抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體及/或抗PD-L1抗體及/或LAG-3抗體之組合進一步與介白素-2(IL-2)組合治療黑色素瘤。組合使用CD73抑制及CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷與化學療法之科學原理在於,細胞死亡(為大多數化學治療化合物之細胞毒性作用之結果)應增加抗原呈遞路徑中腫瘤抗原之含量。可經由細胞死亡引起與組合的CD73抑制(有或沒有)及CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷之協同作用之其他組合療法包括輻射、手術或激素剝奪。該等方案中之每一者在宿主中產生腫瘤抗原之來源。血管生成抑制劑亦可與組合的CD73抑制及CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷組合。抑制血管生成會導致腫瘤細胞死亡,其可為進給至宿主抗原呈遞路徑中之腫瘤抗原之來源。
作為唯一免疫治療劑之抗CD73拮抗劑抗體或CD73拮抗性抗體及CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷抗體之組合亦可與使表現Fcα或Fcγ受體之效應細胞靶向腫瘤細胞之雙特異性抗體組合使用(例如,參見美國專利第5,922,845號及第5,837,243號)。雙特異性抗體可用於靶向兩種單獨抗原。該等反應之T細胞臂將因使用組合的CD73抑制及CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷而加強。
在另一實例中,作為唯一免疫治療劑之抗CD73拮抗劑抗體或抗CD73抗體及其他免疫刺激劑(例如抗CTLA-4抗體及/或抗PD-1抗體及/或抗PD-L1抗體及/或LAG-3劑(例如抗體))之組合可與諸如以下等抗腫瘤抗體結合使用:Rituxan®(利妥昔單抗)、Herceptin®(曲妥珠單抗)、Bexxar®(托西莫單抗(tositumomab))、Zevalin®(替伊莫單抗(ibritumomab))、Campath®(阿倫珠單抗)、Lymphocide®(依帕珠單抗(eprtuzumab))、Avastin®(貝伐珠單抗(bevacizumab))及Tarceva®(埃羅替尼(erlotinib))及諸如此類。舉例而言且不希望受限於理論,使用抗癌抗體或偶聯至毒素之抗癌抗體治療可導致癌細胞死亡(例如腫瘤細胞),此將強化由免疫刺激劑(例如CD73、CTLA-4、PD-1、PD-L1或LAG-3劑,例如抗體)介導之免疫反應。在實例性實施例中,過度增生性疾病(例如癌症腫瘤)之治療可包括抗癌劑(例如抗體)與抗CD73及視情況另一免疫刺激劑(例如抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或抗LAG-3劑,例如抗體)之組合、同時或依序或其任何組合,此可強化宿主之抗腫瘤免疫反應。
腫瘤藉助眾多種機制避開宿主免疫監督。該等機制中之許多可藉由使由腫瘤表現且具有免疫阻抑性之蛋白質失活來克服。該等蛋白質尤其包括TGF-β(Kehrl等人(1986)J.Exp.Med.163:1037-1050)、IL-10(Howard及O'Garra(1992)Immunology Today 13:198-200)及Fas配體(Hahne等人(1996)Science 274:1363-1365)。針對該等實體中每 一者之抗體可進一步與具或不具另一免疫刺激劑(例如抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或抗LAG-3劑,例如抗體)之抗CD73抗體組合,以抵消免疫阻抑劑之效應且有利於宿主之抗腫瘤免疫反應。
可用於活化宿主免疫反應性之其他藥劑(例如抗體)可進一步與具或不具另一免疫刺激劑(例如抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或抗LAG-3抗體)之抗CD73抗體組合使用。該等藥劑包括樹突狀細胞表面上之活化DC功能及抗原呈遞之分子。抗CD40抗體(Ridge等人,上文文獻)可與抗CD73抗體及視情況另一免疫刺激劑(例如抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或抗LAG-3劑,例如抗體)結合使用。亦可提供針對T細胞共刺激分子之其他活化抗體(Weinberg等人,上文文獻;Melero等人,上文文獻;Hutloff等人,上文文獻)來增加T細胞活化程度。
如上文所論述,目前正使用骨髓移植來治療多種造血來源之腫瘤。可使用單獨或與CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷組合之抗CD73免疫療法來增加供體植入腫瘤特異性T細胞之有效性。
若干實驗治療方案涉及抗原特異性T細胞之離體活化及擴增以及該等細胞至接受者中之授受性轉移以使抗原特異性T細胞針對腫瘤(Greenberg及Riddell,上文文獻)。該等方法亦可用於活化T細胞對感染物(例如CMV)之反應。可預期在具或不具其他免疫刺激療法(例如抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或抗LAG-3抗體)之抗CD73存在下之離體活化會增加授受性轉移之T細胞之頻率及活性。
本文提供用於與使用免疫刺激劑治療過度增生性疾病(例如癌症)相關之不良事件之方法,其包含向個體投與抗CD73抗體(有或沒有)及低治療劑量之抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或抗LAG-3劑,例如抗體。例如,本文所述方法提供藉由向患者投與不可吸收性類固醇來降低免疫刺激性治療抗體誘導之結腸炎或腹瀉之發病率之方法。 如本文所使用,「不可吸收性類固醇」係展現過度首渡代謝、使得在肝中代謝後類固醇之生物利用度較低(即小於約20%)之糖皮質素。在本文所述之一個實施例中,不可吸收性類固醇係布地奈德(budesonide)。布地奈德係在局部作用之糖皮質類固醇,其在口服投與後主要由肝過度代謝。ENTOCORT EC®(Astra-Zeneca)係布地奈德之pH及時間依賴性口服調配物,其經研發以最佳化至迴腸及整個結腸之藥物遞送之。ENTOCORT EC®在美國經批準用於治療涉及迴腸及/或升結腸之輕度至中度克羅恩氏病(Crohn's disease)。用於治療克羅恩氏病之ENTOCORT EC®之常用口服劑量為6mg/天至9mg/天。ENTOCORT EC®在小腸中釋放,然後被吸收且保留在腸黏膜中。一旦其通過腸黏膜靶組織,ENTOCORT EC®立即由肝中之細胞色素P450系統過度代謝成具有可忽略糖皮質素活性之代謝產物。因此,生物利用度較低(約10%)。布地奈德之低生物利用度可產生與具有較不過度首渡代謝之其他糖皮質素相比經改良之治療比。布地奈德產生少於全身性作用之皮質類固醇之不良效應,包括較少下視丘-垂體阻抑。然而,長期投與ENTOCORT EC®可產生全身性糖皮質素效應,例如腎上腺皮質機能亢進及腎上腺阻抑。參見PDR第58版,2004;608-610。
在其他實施例中,具或不具CTLA-4及/或PD-1及/或PD-L1及/或LAG-3阻斷之CD73抑制(即免疫刺激性治療性抗體抗CD73及視情況抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或抗LAG-3抗體)與不可吸收性類固醇之結合可進一步與水楊酸鹽組合。水楊酸鹽包括5-ASA劑,例如:柳氮磺吡啶(sulfasalazine,AZULFIDINE®,Pharmacia & UpJohn);奧沙拉秦(olsalazine,DIPENTUM®,Pharmacia & UpJohn);巴柳氮(balsalazide,COLAZAL®,Salix Pharmaceuticals,Inc.);及美沙拉明(mesalamine,ASACOL®,Procter & Gamble Pharmaceuticals;PENTASA®,Shire US;CANASA®,Axcan Scandipharm,Inc.;ROWASA®,Solvay)。
根據本文所述之方法,出於降低由免疫刺激性抗體引起之結腸炎之發病率之目的,水楊酸鹽與具或不具抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或LAG-3抗體之抗CD73及不可吸收性類固醇之組合投與可包括水楊酸鹽及不可吸收性類固醇之任何重疊或依序投與。因此,例如,用於降低由本文所述之免疫刺激性抗體引起之結腸炎之發病率的方法涵蓋同時或依序投與水楊酸鹽及不可吸收性類固醇(例如,在不可吸收性類固醇後6小時投與水楊酸鹽)或其任何組合。另外,水楊酸鹽及不可吸收性類固醇可藉由同一途徑(例如,二者皆經口投與)或藉由不同途徑(例如,經口投與水楊酸鹽且經直腸投與不可吸收性類固醇)來投與,此可不同於投與抗CD73及抗CTLA-4及/或抗PD-1及/或抗PD-L1及/或抗LAG-3抗體所使用之途徑。
本文所述之抗CD73抗體及組合抗體療法亦可與針對其對所治療適應症(例如癌症)之具體用途選擇之其他熟知療法結合使用。本文所述抗CD73抗體之組合可與已知醫藥上可接受之藥劑依序使用。
例如,本文所述之抗CD73抗體及組合抗體療法可與諸如以下等其他治療組合(例如同時或單獨)使用:照射、化學療法(例如,使用喜樹鹼(camptothecin,CPT-11)、5-氟尿嘧啶(5-FU)、順鉑(cisplatin)、多柔比星(doxorubicin)、伊立替康(irinotecan)、太平洋紫杉醇(paclitaxel)、吉西他濱(gemcitabine)、順鉑、太平洋紫杉醇、卡鉑(carboplatin)-太平洋紫杉醇(Taxol)、多柔比星、5-fu或喜樹鹼+apo2l/TRAIL(6X組合))、一或多種蛋白酶體抑制劑(例如硼替佐米(bortezomib)或MG132)、一或多種Bcl-2抑制劑(例如BH3I-2’(bcl-xl抑制劑)、吲哚胺雙加氧酶-1(IDO1)抑制劑(例如INCB24360)、AT-101(R-(-)-棉酚衍生物)、ABT-263(小分子)、GX-15-070(奧巴克拉 (obatoclax))或MCL-1(骨髓樣白血病細胞分化蛋白-1)拮抗劑)、iAP(細胞凋亡蛋白之抑制劑)拮抗劑(例如smac7、smac4、小分子smac模擬物、合成smac肽(參見Fulda等人,Nat Med 2002;8:808-15)、ISIS23722(LY2181308)或AEG-35156(GEM-640))、HDAC(組蛋白去乙醯酶)抑制劑、抗CD20抗體(例如利妥昔單抗)、血管生成抑制劑(例如貝伐珠單抗)、靶向VEGF及VEGFR之抗血管生成劑(例如阿瓦斯汀(Avastin))、合成三萜(參見Hyer等人,Cancer Research 2005;65:4799-808)、c-FLIP(細胞FLICE抑制蛋白)調節劑(例如PPARγ(過氧化物酶體增殖物活化受體γ)之天然及合成配體、5809354或5569100)、激酶抑制劑(例如索拉菲尼(Sorafenib))、曲妥珠單抗、西妥昔單抗、替西羅莫司(Temsirolimus)、mTOR抑制劑(例如雷帕黴素(rapamycin)及替西羅莫司)、硼替佐米、JAK2抑制劑、HSP90抑制劑、PI3K-AKT抑制劑、來那度胺(Lenalildomide)、GSK3β抑制劑、IAP抑制劑及/或具遺傳毒性之藥物。
本文所述之抗CD73抗體及組合抗體療法可進一步與一或多種抗增生細胞毒性劑組合使用。可用作抗增生細胞毒性劑之化合物之類別包括(但不限於)以下:烷基化劑(包括(但不限於)氮芥(nitrogen mustards)、乙烯亞胺衍生物、磺酸烷基酯、亞硝基脲及三氮烯):尿嘧啶氮芥、甲川氯(Chlormethine)、環磷醯胺(CYTOXANTM)、異環磷醯胺、美法侖(Melphalan)、苯丁酸氮芥、哌血生(Pipobroman)、三乙烯三聚氰胺、三乙烯硫代磷醯胺、白消安(Busulfan)、卡莫司汀(Carmustine)、洛莫司汀(Lomustine)、鏈脲黴素(Streptozocin)、達卡巴嗪及替莫唑胺(Temozolomide)。
抗代謝物(包括(但不限於)葉酸拮抗劑、嘧啶類似物、嘌呤類似物及腺苷去胺酶抑制劑):胺甲喋呤、5-氟尿嘧啶、氟尿苷、阿糖胞 苷(Cytarabine)、6-巰基嘌呤、6-硫鳥嘌呤、磷酸氟達拉濱(Fludarabine phosphate)、噴司他丁(Pentostatine)及吉西他濱。
除業內已知之其他微小管穩定劑外,適於與拮抗劑抗CD73抗體組合之抗增生劑包括(但不限於)紫杉烷(taxane)、太平洋紫杉醇(太平洋紫杉醇係以TAXOLTM在市面上出售)、多西他賽(docetaxel)、海綿內酯(DDM)、迪克他汀(dictyostatin,DCT)、培洛賽德(Peloruside)A、埃博黴素、埃博黴素A、埃博黴素B、埃博黴素C、埃博黴素D、埃博黴素E、埃博黴素F、呋喃埃博黴素D、去氧埃博黴素B1、[17]-去氫去氧埃博黴素B、[18]去氫去氧埃博黴素B、C12,13-環丙基-埃博黴素A、C6-C8橋接埃博黴素A、反式-9,10-去氫埃博黴素D、順式-9,10-去氫埃博黴素D、16-去甲基埃博黴素B、埃博黴素B10、海綿內酯、帕土匹龍(patupilone,EPO-906)、KOS-862、KOS-1584、ZK-EPO、ABJ-789、XAA296A(海綿內酯)、TZT-1027(索利多汀(soblidotin))、ILX-651(鹽酸泰絲多汀(tasidotin hydrochloride))、軟海綿素(Halichondrin)B、甲磺酸艾日布林(Eribulin mesylate,E-7389)、哈米特林(Hemiasterlin,HTI-286)、E-7974、薩托辛(Cyrptophycin)、LY-355703、類美登素免疫偶聯物(DM-1)、MKC-1、ABT-751、T1-38067、T-900607、SB-715992(伊斯平斯(ispinesib))、SB-743921、MK-0731、STA-5312、艾榴塞洛素(eleutherobin)、17β-乙醯氧基-2-乙氧基-6-側氧基-B-均-雌甾-1,3,5(10)-三烯-3-醇、環鏈汀(cyclostreptin)、異勞力馬來(isolaulimalide)、勞力馬來、4-表-7-去羥基-14,16-二去甲基-(+)-海綿內酯及克托賽龍(cryptothilone)1。
在期望結合使用本文所述抗CD73抗體治療或在其之前使異常增殖細胞靜止之情形下,亦可向患者投與激素及類固醇(包括合成類似物),例如17a-炔雌醇、乙烯雌酚、睪固酮、潑尼松(Prednisone)、氟甲睪酮(Fluoxymesterone)、屈他雄酮丙酸酯(Dromostanolone propionate)、睪內酯(Testolactone)、乙酸甲地孕酮(Megestrolacetate)、甲基潑尼松龍(Methylprednisolone)、甲基-睪固酮、潑尼松龍、安西諾隆(Triamcinolone)、氯烯雌醚(Chlorotrianisene)、羥基孕酮、胺魯米特(Aminoglutethimide)、雌莫司汀(Estramustine)、乙酸甲羥孕酮(Medroxyprogesteroneacetate)、柳菩林(Leuprolide)、氟他胺(Flutamide)、托瑞米芬(Toremifene)、ZOLADEXTM。當採用本文所述之方法或組合物時,亦可視需要投與用於調節臨床環境中之腫瘤生長或轉移之其他藥劑,例如抗模擬物。
安全且有效地投與化學治療劑之方法為彼等熟習此項技術者已知。另外,其投與闡述於標準文獻中。例如,許多化學治療劑之投與闡述於Physicians' Desk Reference(PDR)例如1996版(Medical Economics公司,Montvale,N.J.07645-1742,USA)中;其揭示內容以引用方式併入本文中。
化學治療劑及/或輻射療法可根據業內所熟知之治療方案來投與。彼等熟習此項技術者將明瞭,化學治療劑及/或輻射療法之投與可端視所治療疾病以及化學治療劑及/或輻射療法對此疾病之已知效應而變化。而且,根據熟習此項技術者之知識,治療方案(例如劑量量及投與次數)可根據所觀察到的所投與治療劑對患者之效應及根據所觀察到的疾病對所投與治療劑之反應而變化。
實例性實施例
1. 一種經分離人類抗體或其抗原結合部分,其結合至人類分化簇73(CD73)且展現以下特性中之一或多者:(a)抑制CD73酶活性;(b)內化至腫瘤細胞中,或(c)結合至包含人類CD73之胺基酸65-83及157-172之構象表位。
2. 如實施例1之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體以如藉由脈 衝追蹤所量測不超過10min之T1/2內化至腫瘤細胞中。
3. 如實施例1或2之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體以如藉由BIACORE® SPR分析所量測約0.1nM至10nM或更小之KD結合至可溶性人類CD73。
4. 如前述實施例中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體以如藉由FACS所量測0.1nM至10nM或更小之EC50結合至人類CD73。
5. 如前述實施例中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體以如藉由FACS所量測0.1nM至10nM或更小之EC50結合至食蟹獼猴CD73。
6. 如前述實施例中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體結合至人類CD73(SEQ ID NO:1)上包括胺基酸殘基FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及/或LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)之表位。
7. 如實施例6之抗體或其抗原結合部分,其中該表位跨越胺基酸殘基FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及/或LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)或與其重疊。
8. 如前述實施例中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體選自由IgG1、IgG2、IgG3、IgG4或其變體組成之群。
9. 一種經分離單株抗體或其抗原結合部分,其結合至人類CD73且包含分別在選自由以下組成之群之重鏈及輕鏈可變區對中之三個重鏈可變區CDR及三個輕鏈可變區CDR:(a)SEQ ID NO:4及8(b)SEQ ID NO:4及12;(c)SEQ ID NO:16及20;(d)SEQ ID NO:16及24; (e)SEQ ID NO:16及28;(f)SEQ ID NO:32及36;(g)SEQ ID NO:40及44;(h)SEQ ID NO:40及48;(i)SEQ ID NO:52及56;(j)SEQ ID NO:60及64;(k)SEQ ID NO:68及72;(l)SEQ ID NO:68及76;(m)SEQ ID NO:80及84;(n)SEQ ID NO:88及92;(o)SEQ ID NO:135及8;及(p)SEQ ID NO:135及12。
10. 一種經分離單株抗體或其抗原結合部分,其結合至人類CD73且包含:(a)分別包含SEQ ID NO:5、6及7之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:9、10及11之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(b)分別包含SEQ ID NO:5、6及7之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:13、14及15之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(c)分別包含SEQ ID NO:17、18及19之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:21、22及23之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(d)分別包含SEQ ID NO:17、18及19之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:25、26及27之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列; (e)分別包含SEQ ID NO:17、18及19之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:29、30及31之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(f)分別包含SEQ ID NO:33、34及35之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:37、38及39之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(g)分別包含SEQ ID NO:41、42及43之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:45、46及47之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(h)分別包含SEQ ID NO:41、42及43之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:49、50及51之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(i)分別包含SEQ ID NO:53、54及55之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:57、58及59之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(j)分別包含SEQ ID NO:61、62及63之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:65、66及67之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(k)分別包含SEQ ID NO:69、70及71之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:73、74及75之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(l)分別包含SEQ ID NO:69、70及71之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:77、78及79之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列;(m)分別包含SEQ ID NO:81、82及83之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:85、86及87之輕鏈CDR1、 CDR2及CDR3序列;或(n)分別包含SEQ ID NO:89、90及91之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包含SEQ ID NO:93、94及95之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列。
11. 如實施例10之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體包含分別包括SEQ ID NO:5、6及7之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包括SEQ ID NO:9、10及11之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列。
12. 如實施例11之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體包含分別包括SEQ ID NO:5、6及7之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,及/或分別包括SEQ ID NO:13、14及15之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列。
13. 一種經分離單株抗體或其抗原結合部分,其結合至人類CD73且包含重鏈及輕鏈可變區,其中該重鏈可變區包含與選自由以下組成之群之胺基酸序列至少90%一致之胺基酸序列:SEQ ID NO:4、16、32、40、52、60、68、80、88及135。
14. 一種經分離單株抗體或其抗原結合部分,其結合至人類CD73且包含重鏈及輕鏈可變區,其中該輕鏈可變區包含與選自由以下組成之群之胺基酸序列至少90%一致之胺基酸序列:SEQ ID NO:8、12、20、24、28、36、44、48、56、64、72、76、84及92。
15. 一種經分離單株抗體或其抗原結合部分,其結合至人類CD73且包含分別與選自由以下組成之群之重鏈及輕鏈可變區胺基酸序列至少85%一致的重鏈及輕鏈可變區:(a)SEQ ID NO:4及8(b)SEQ ID NO:4及12;(c)SEQ ID NO:16及20;(d)SEQ ID NO:16及24;(e)SEQ ID NO:16及28; (f)SEQ ID NO:32及36;(g)SEQ ID NO:40及44;(h)SEQ ID NO:40及48;(i)SEQ ID NO:52及56;(j)SEQ ID NO:60及64;(k)SEQ ID NO:68及72;(l)SEQ ID NO:68及76;(m)SEQ ID NO:80及84;(n)SEQ ID NO:88及92;(o)SEQ ID NO:135及8;及(p)SEQ ID NO:135及12。
16. 如實施例15之抗體或其抗原結合部分,其中該等重鏈及輕鏈可變區分別包含與選自由(a)-(p)組成之群之重鏈及輕鏈可變區至少90%一致之胺基酸序列。
17. 如實施例16之抗體或其抗原結合部分,其中該等重鏈及輕鏈可變區分別包含與選自由(a)-(p)組成之群之重鏈及輕鏈可變區至少95%一致之胺基酸序列。
18. 如實施例17之抗體或其抗原結合部分,其中該等重鏈及輕鏈可變區分別包含選自由(a)-(p)組成之群之重鏈及輕鏈可變區。
19. 如實施例18之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體包含包括SEQ ID NO:135中所述之胺基酸序列的重鏈可變區及包括SEQ ID NO:8中所述之胺基酸序列的輕鏈可變區。
20. 如實施例18之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體包含包括SEQ ID NO:135中所述之胺基酸序列的重鏈可變區及包括SEQ ID NO:12中所述之胺基酸序列的輕鏈可變區。
21. 一種經分離單株抗體或其抗原結合部分,其結合至與如實 施例1-20中任一者之抗體相同之CD73上之表位。
22. 如實施例9-21中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體展現以下特性中之任一者:(1)例如以10nM或更小(例如0.01nM至10nM)之KD結合至可溶性人類CD73,例如如藉由BIACORE® SPR分析所量測;(2)例如以1nM或更小(例如0.01nM至1nM)之EC50結合至膜結合之人類CD73;(3)例如以10nM或更小(例如0.01nM至10nM)之EC50結合至食蟹獼猴CD73,例如結合至膜結合之食蟹獼猴CD73;(4)例如以10nM或更小之EC50抑制人類CD73酶活性;(5)例如以10nM或更小之EC50抑制食蟹獼猴CD73酶活性;(6)抑制活體內人類CD73酶活性;誘導或增強T細胞活化而無需多價交聯;(7)例如以小於10分鐘之T1/2內化至細胞中;(8)結合至人類CD73上之構象表位,例如胺基酸序列(SEQ ID NO:1)內包括胺基酸殘基FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)及/或LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)之不連續表位(9)結合至糖基化而非非糖基化人類CD73;及(10)在任一方向或兩個方向上與CD73.4-1、CD73.4-2、CD73.3、11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4、10D2-1、10D2-2、11A6、24H2、5F8-1、5F8-2、6E11及/或7A11競爭結合至人類CD73。
23. 一種經分離單株抗體或其抗原結合部分,其結合至CD73且包含分別與選自由以下組成之群之重鏈及輕鏈序列之胺基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的重鏈及輕鏈序列: (a)分別地SEQ ID NO:100及101;(b)分別地SEQ ID NO:100及102;(c)分別地SEQ ID NO:103及104;(d)分別地SEQ ID NO:103及105;(e)分別地SEQ ID NO:103及106;(f)分別地SEQ ID NO:107及108;(g)分別地SEQ ID NO:109及110;(h)分別地SEQ ID NO:109及111;(i)分別地SEQ ID NO:112及113;(j)分別地SEQ ID NO:114及115;(k)分別地SEQ ID NO:116及117;(l)分別地SEQ ID NO:116及118;(m)分別地SEQ ID NO:119及120;(n)分別地SEQ ID NO:121及122;(o)分別地SEQ ID NO:133及101;及(p)分別地SEQ ID NO:133及102。
24. 如實施例23之抗體或其抗原結合部分,其中該等重鏈及輕鏈包含選自由(a)-(p)組成之群之重鏈及輕鏈。
25. 如實施例24之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體包含包括SEQ ID NO:135中所述之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:101中所述之胺基酸序列的輕鏈。
26. 如實施例24之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體包含包括SEQ ID NO:135中所述之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:102中所述之胺基酸序列的輕鏈。
27. 如實施例23-26中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體展現以下特性中之任一者: (a)抑制CD73酶活性;(b)內化至腫瘤細胞中,或(c)結合至包含人類CD73之胺基酸65-83及157-172之構象表位。
28. 如前述實施例中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體結合至食蟹獼猴CD73。
29. 如實施例10-22之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體包含較差效應子Fc。
30. 如實施例1-7及9-22之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體包含按N至C末端之順序包括人類CH1結構域、人類鉸鏈結構域、人類CH2結構域及人類CH3結構域之經修飾重鏈恆定區。
31. 如實施例30之抗體或其抗原結合部分,其中該經修飾恆定區包含至少2個不同同型結構域,該等同型選自由IgG1、IgG2、IgG3及IgG4組成之同型之群。
32. 如實施例30或31之抗體或其抗原結合部分,其中該經修飾恆定區包含人類IgG2 CH1結構域,且CH2、CH3及鉸鏈結構域中之至少一者不為IgG2同型。
33. 如實施例32之抗體或其抗原結合部分,其中該IgG2 CH1結構域包含胺基酸序列ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTV(SEQ ID NO:124)。
34. 如實施例30-33中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該經修飾恆定區包含減小半胱胺酸結合異質性之人類IgG2鉸鏈結構域。
35. 如實施例34之抗體或其抗原結合部分,其中該鉸鏈結構域相對於野生型人類IgG2鉸鏈結構域(SEQ NO 136)包含胺基酸取代C219。
36. 如實施例35之抗體或其抗原結合部分,其中該鉸鏈結構域包含胺基酸序列ERKSCVECPPCPAPPVAG(SEQ ID NO:123)。
37. 如實施例30-36中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該經修飾恆定區包含降低或消除效應子功能之人類IgG1 CH2結構域。
38. 如實施例37之抗體或其抗原結合部分,其中該CH2結構域相對於野生型人類IgG1 CH2結構域(SEQ ID NO:137)包含胺基酸取代A330S及P331S。
39. 如實施例38之抗體或其抗原結合部分,其中該CH2結構域包含胺基酸序列APPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPSSIEKTISKAK(SEQ ID NO:125)。
40. 如實施例30-39中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該經修飾恆定區包含人類IgG1 CH3結構域。
41. 如實施例40之抗體或其抗原結合部分,其中該CH3結構域包含胺基酸序列GQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO:128)。
42. 如實施例9-29中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中該抗體或其抗原結合部分係人類或人類化抗體。
43. 如實施例1-8中任一者之抗體或其抗原結合部分,其中CDR區中之甲硫胺酸殘基經不經受氧化之胺基酸殘基替代。
44. 一種雙特異性分子,其包含連接至具有第二結合特異性之分子之如前述實施例中任一者之抗體。
45. 一種免疫偶聯物,其包含連接至第二種不同藥劑之如實施 例1-43中任一者之抗體。
46. 一種經分離核酸分子,其編碼如實施例1-43中任一者之抗體或其抗原結合部分之重鏈及/或輕鏈可變區。
47. 一種表現載體,其包含如實施例46之核酸分子。
48. 一種細胞,其經如實施例47之表現載體轉形。
49. 一種組合物,其包含如實施例1-45中任一者之抗體或其抗原結合部分、雙特異性分子或免疫偶聯物,及載劑。
50. 一種套組,其包含如實施例1-45中任一者之抗體或其抗原結合部分或雙特異性分子或免疫偶聯物,及使用說明書。
51. 一種製備抗CD73抗體或其抗原結合部分之方法,其包含在如實施例48之細胞中表現抗體或其抗原結合部分,及自該細胞分離該抗體或其抗原結合部分。
52. 一種減小表現CD73之腫瘤細胞中之腺苷含量之方法,其包含使細胞與如實施例1-45中任一者之抗體、其抗原結合部分、雙特異性分子或免疫偶聯物接觸,使得腺苷含量減小。
53. 一種刺激有需要之個體中針對表現CD73之腫瘤細胞之T細胞反應的方法,其包含投與有效量之如實施例1-45中任一者之抗體或其抗原結合部分、雙特異性分子或免疫偶聯物,使得刺激針對腫瘤細胞之T細胞反應。
54. 一種刺激個體之免疫反應之方法,其包含向個體投與如實施例1-45中任一者之抗體或其抗原結合部分、雙特異性分子或免疫偶聯物,使得刺激個體之免疫反應。
55. 如實施例54之方法,其中該個體具有表現CD73之腫瘤細胞,且刺激針對腫瘤細胞之免疫反應。
56. 一種抑制個體之表現CD73之腫瘤細胞生長之方法,其包含向個體投與如實施例1-45中任一者之抗體或其抗原結合部分、雙特異 性分子或免疫偶聯物,使得抑制個體之腫瘤生長。
57. 一種治療癌症之方法,其包含向有需要之個體投與治療有效量之如實施例1-45中任一者之抗體或其抗原結合部分、雙特異性分子或免疫偶聯物來治療癌症。
58. 如實施例57之方法,其中癌症選自由以下組成之群:膀胱癌、乳癌、子宮/子宮頸癌、卵巢癌、前列腺癌、睪丸癌、食道癌、胃腸癌、胰臟癌、結腸直腸癌、結腸癌、腎癌、頭頸癌、肺癌、胃癌、生殖細胞癌、骨癌、肝癌、甲狀腺癌、皮膚癌、中樞神經系統贅瘤、淋巴瘤、白血病、骨髓瘤、肉瘤及病毒相關之癌症。
59. 如實施例57或58之方法,其中癌症係轉移性癌症、難治性癌症或復發性癌症。
60. 如實施例53-59中任一者之方法,其進一步包含投與一或多種其他治療劑。
61. 如實施例60之方法,其中另一治療劑係免疫強化分子(例如PD-1拮抗劑、CTLA-4拮抗劑、LAG-3拮抗劑)、抗CD39抗體或抗A2AR抗體。
62. 一種檢測樣品中人類CD73之存在之方法,其包含使該樣品與如實施例1-45中任一者之抗體或其抗原結合部分在允許在抗體或其抗原結合部分與CD73之間形成複合物之條件下接觸,及檢測複合物之形成。
藉由以下實例進一步說明本發明,該等實例不應理解為進一步限制本發明。本申請案通篇中所引用之所有圖及所有參考文獻、基因庫序列、專利及公開專利申請案之內容皆以引用方式明確併入本文中。具體而言,PCT公開案WO 09/045957、WO 09/073533、WO 09/073546、WO 09/054863及PCT/US2013/072918及美國專利公開案第2011/0150892號之揭示內容皆以引用方式明確併入本文中。
實例 實例1:人類抗CD73抗體之產生
在HuMAb®轉基因小鼠(「HuMAb」係Medarex,Inc.,Princeton,New Jersey之商標)及KM小鼠(KM小鼠®品系含有SC20轉染色體,如PCT公開案WO 02/43478中所述)之Hco7、Hco27、Hco20、Hco12、Hco17及Hc2品系中產生人類抗人類CD73單株抗體。HC2/KCo27HuMAb小鼠及KM小鼠係如美國專利第5,770,429號及第5,545,806號中所述來產生,該等專利之全部揭示內容皆以引用方式併入本文中。
使用不同的免疫策略(不同抗原、不同劑量、持續時間、投與途徑(足墊(fp)、腹膜內(ip)及皮下(sc)及佐劑(CFA/IFA、Ribi及抗體)等)來免疫小鼠,包括轉基因小鼠之多個基因型(例如KM、Hco7、Hco27、Hco20、Hco12、Hco17及Hc2)。自小鼠實施融合且篩選,並自該等融合物鑒定抗體。進一步表徵可分離尤其受關注之抗體,包括稱為11F11-1、11F11-2、4C3-1、4C3-2、4C3-3、4D4-1、10D2-1、10D2-2、11A6-1、24H2-1、5F8-1、5F8-2、6E11-1及7A11-1之抗體。表7(下文)提供每一抗體之重鏈之IgG同型及異型以及輕鏈之該類型。僅輕鏈不同之抗體由虛線後之不同數位表示。例如,11F11-1具有與11F11-2相同之重鏈,但11F11-1具有輕鏈VK1,而11F11-2具有輕鏈VK2。除非另有說明,否則基於表中抗體之VH區之重組抗體經製造具有主要輕鏈。
Figure 104138281-A0202-12-0178-12
Figure 104138281-A0202-12-0179-13
每一抗體之重鏈及輕鏈之全長序列、VH及VL結構域及CDR的胺基酸及核苷酸序列提供於序列表及表31中。VH及VL胺基酸序列亦提供於圖1A至17B中,且多種抗體之VH與VL胺基酸序列之比對提供於圖31(CDR序列以粗體表示)中。
實例2:可變區及同型變化形式中之胺基酸取代
藉由在以下胺基酸殘基處引入一或多個突變來突變抗體11F11之VH區之框架區(顯示周圍胺基酸且加下劃線處為突變胺基酸):T25(框架突變;...RLSCATSGFTF...)、L52(CDR2突變;...WVAVILYDGSN...)、G54(CDR2突變;...VILYDGSNKYY...)及V94(框架突變;...AEDTAVYYCAR...)。構築體之名稱及其中每一者中之取代陳述於表8中:
Figure 104138281-A0202-12-0179-15
比較之目的列示於該表中。
抗體11F11及4D4之恆定區亦藉由將其切換成具有C219S取代之IgG2恆定區(CH1、鉸鏈、CH2及CH3)(「IgG2CS」;SEQ ID NO:267)、具有取代L234A、L235E、G237A、A330S及P331S之較差效應子IgG1恆定區(「IgG1.1f」;SEQ ID NO:268)或含有IgG2之CH1及鉸鏈(具有C219S)及IgG1之CH2及CH3(具有A330S/P331S)之較差效應子IgG1/IgG2雜合恆定區(「IgG2CS-IgG1.1f」或「IgG2C219S-IgG1.1f」;SEQ ID NO:169)來修飾。所製造之構築體列示於表9中。
Figure 104138281-A0202-12-0180-16
CD73.4-IgG2CS IgG1.1f之胺基酸序列顯示於圖18中(SEQ ID NO:189)。
如下製造Ab CD73.3-CD73.11。將輕鏈VK2(SEQ ID NO:102)用 於源自11F11之抗體(CD73.4、CD73.6、CD73.8及CD73.10)。在HEK293-6E細胞中表現重鏈及輕鏈且在轉染後5天收穫培養基。
經由SPR量測構築體與人類FcγR之結合。hCD64及hCD32a-H131對IgG1.1及IgG2分子之結合數據與不同Fc之預期值一致。IgG1.1f係最具惰性的Fc。IgG2及IgG2-C219S顯示典型的FcR對IgG2結合。如所預期,IgG2-C219S-G1.1f之數據表明比野生型IgG1或IgG2顯著較弱之結合,但與IgG1.1f相比增加之結合。IgG2-C219S-G1.1f具有較弱的hCD32a-H131結合(KD為2.3μM),且與所有其他FcγR之結合親和力小於5μM。IgG2-C219S-G1.1f與食蟹獼猴FcγR之結合親和力大於5μM。IgG2-C219S-G1.1f與人類FcRn之結合之SPR分析顯示pH依賴性結合(在pH 6下較強,且在pH 7.4下較弱結合並快速解離)。
業內發現重組製劑通常缺少重鏈之C末端Lys。例如,Ab CD73.4.IgG2-C219S-G1.1f之97%之重鏈缺少C末端離胺酸。某些製劑在重鏈之N末端Q(麩醯胺酸)具有焦-Q。例如,Ab CD73.4.IgG2-C219S-G1.1f重鏈之94%之N末端麩醯胺酸為焦-Q。
實例3:抗CD73抗體之結合特徵 A. 表面電漿子共振(SPR)
在25℃下藉由表面電漿子共振(SPR)使用Biacore T100儀器(GE Healthcare)研究CD73結合動力學及親和力。
一個實驗格式測試hCD73之N末端結構域(由人類CD73之殘基26-336組成;稱為N-hCD73)與在固定蛋白質A表面上捕獲之抗體的結合。對於該等實驗,在0.01M HEPES(pH 7.4)、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.005% v/v tween 20之運行緩衝液中,使用標準乙基(二甲基胺基環丙基)碳化二亞胺(EDC)/N-羥基琥珀醯亞胺(NHS)化學品與乙醇胺封阻,將蛋白質A(Pierce)以3000-4000 RU之密度固定於CM5感測器晶片(GE Healthcare)之流動池1-4上。藉由以下實施動力學實驗: 首先以10μl/min使用30s接觸時間捕獲蛋白質A表面上之抗體(5-10μg/ml),並以30μl/min之流速使用180s締合時間及360s解離時間結合600nM、200nM、66.7nM、22.2nM、7.4nM及2.5nM N-hCD73-his。用於動力學實驗之運行緩衝液係10mM磷酸鈉、130mM氯化鈉、0.05% tween 20,pH 7.1。在以30μl/min之流速使用兩個30s脈衝之10mM甘胺酸(pH 1.5)之每一循環後使表面再生。感應圖數據為雙參照,且然後使用Biacore T100評估軟體v2.0.4擬合至1:1 Langmuir模型,以確定締合速率常數(ka)、解離速率常數(kd)及平衡解離常數(KD)。
結果顯示於表10中。該表編譯來自不同實驗之數據。對於顯示兩個或更多個數值集合之抗體,每一集合對應於在單獨實驗中所獲得之數據。
Figure 104138281-A0202-12-0182-17
Figure 104138281-A0202-12-0183-18
該表中之KD係單價KD,即抗體與人類CD73之N末端部分結合之KD,其為單價。
耐受G54S突變且似乎稍微增加親和力,同時去除所預測之DG異構化位點。L52W突變似乎使親和力減小約10倍。4D4變體具有獨特的CDR3序列及不同動力學(與11F11分子相比較緩慢之締合)。
CD73.4-IgG2-C219S-IgG1.1f之來自10個實驗之平均KD係1.1±0.4nM。相對於11F11之T25A突變並不影響親和力。
結果顯示所有抗CD73抗體以良好親和力結合至人類CD73且具有緩慢解離速率。
結合研究之結果指示,在將突變引入11F11、4C3或4D4中或同型切換後維持結合活性,但一些抗體具有相對於原始抗體(即11F11、4C3或4D4)降低的親和力。具體而言,CD73.10(T25A、L52W、G54E)具有快於CD73.4(T25A)或CD73.11(4D4)之解離速率。所有IgG2分子之比較指示,11F11及CD73.4(11F11-T25A)具有最高單價CD73親和力(KD=1.1nM±0.4nM)。CD73.10(11F11-T25A、L52W、G54E)之CD73親和力係11F11或CD73.4之CD73親和力的約1/10。此表明當與其他11F11序列組合時,L52W或G54E或兩個突變降低CD73親和力。4D4及CD73.11具有與CD73.10(KD約5nM)相當之親和力,但具有不同的動力學。人們認為4C3表位包括CD73之N及C結構域之區域,因此所量測經分離N結構域之KD較弱(KD=100-200nM)。
亦研究CD73.4-IgG2-C219S-IgG1.1f與食蟹獼猴CD73之結合。在25℃下藉由表面電漿子共振(SPR)使用Biacore T100儀器(GE Healthcare)比較CD73.4-IgG2-C219S-IgG1.1f結合食蟹獼猴CD73之特異性與結合至人類CD73之特異性。測試人類CD73之全長細胞外結構域(由人類CD73之連接至His標籤之殘基27-547組成,稱為hCD73-his)或食蟹獼猴CD73之全長細胞外結構域(由食蟹獼猴CD73之連接至His標籤之殘基27-547組成,稱為cy-CD73-his)與在固定蛋白質A表面上捕 獲之抗體的結合。對於該等實驗,在0.01M HEPES pH 7.4、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.005% v/v tween 20之運行緩衝液中,使用標準乙基(二甲基胺基環丙基)碳化二亞胺(EDC)/N-羥基琥珀醯亞胺(NHS)化學品與乙醇胺封阻,將蛋白質A(Pierce)以3000-4000 RU之密度固定於CM5感測器晶片(GE Healthcare)之流動池1-4上。藉由以下方式實施實驗:首先以10μl/min使用30s接觸時間捕獲蛋白質A表面上之抗體(5-10μg/ml),並以30μl/min之流速使用180s締合時間及360s解離時間結合600nM、200nM、66.7nM、22.2nM、7.4nM及2.5nM hCD73-his或食蟹獼猴-CD73-his。該等實驗之運行緩衝液係10mM磷酸鈉、130mM氯化鈉、0.05% tween 20,pH 7.1。在以30μl/min之流速使用兩個30s脈衝之10mM甘胺酸(pH 1.5)之每一循環後使表面再生。
圖19中所顯示之結果指示,CD73.4-IgG2-C219S-IgG1.1f以相似之親和力及動力學結合至食蟹獼猴及人類CD73。CD73.4-IgG2-C219S-IgG1.1f以小於1nM之KD結合至全長人類及食蟹獼猴CD73二聚體。觀察到CD73.4-IgG2-C219S-IgG1.1f對小鼠或大鼠CD73無顯著交叉反應性。
亦藉由SPR評估11F11抗體之經分離Fab片段之動力學及親和力。在該等實驗中,使用EDC/NHS將鼠類抗6×His抗體之Fab結構域以約3000 RU之密度固定於CM5感測器晶片上。以10μl/min使用30s接觸時間,將全長hCD73-his捕獲至Fc2上之10 RU密度(1μg/ml hCD73-his),Fc3上之40 RU密度(5μg/ml hCD73-his)及Fc4上之160 RU密度(20μg/ml hCD73-his)。然後,在10mM磷酸鈉、130mM氯化鈉、0.05% tween 20之運行緩衝液(pH 7.1)中,以30μl/min使用180s締合時間、600s解離時間測試11F11 Fab片段(自胃蛋白酶裂解之L-半胱胺酸還原之11F11抗體純化)在400nM、135nM、44.4nM、14.8nM、 4.9nM、1.7nM、0.55nM下之結合。以30μl/min之流速使用兩個15s脈衝之10mM甘胺酸(pH 2.0)之每一循環後使表面再生。感應圖數據為雙參照,且然後使用Biacore T100評估軟體v2.0.4擬合至1:1 Langmuir模型,以確定締合速率常數(ka)、解離速率常數(kd)及平衡解離常數(KD)。結果顯示於下表11中。
Figure 104138281-A0202-12-0186-19
因此,結果顯示11F11 Fab片段具有針對hCD73之高親和力(KD約0.74nM)。
B. CD73抗體與CD73陽性細胞之結合
使用Calu6(CD73內源表現子;人類肺腺癌細胞系)、DMS114(CD73陰性;人類小細胞肺癌細胞系)、CHO-食蟹獼猴CD73(經食蟹獼猴CD73轉染)及CHO-K1(食蟹獼猴CD73陰性)細胞上之CD73抗體、使用Alexa Fluor® 647山羊抗人類IgG(H+L)作為二級抗體(Invitrogen目錄編號A-21445)、使用以下方法產生滴定結合曲線:
將100000個細胞平鋪於100μL PBS+2% FBS/孔中,且封阻20min。使用U形底96深孔板,合併如下表12所指示之多個體積之抗體及PBS+2% FBS。
Figure 104138281-A0202-12-0187-20
藉由將1/6體積(90μL)稀釋於450μL PBS+2% FBS中來實施8點連續稀釋。在1500rpm下將細胞板旋轉沉降5分鐘。將100μL經稀釋抗體添加至板之每一孔中。將100μL PBS+2% FBS添加至所有其他孔中。將板在冰上染色45min,在1500rpm下旋轉沉降5min且在200μL PBS+2% FBS/孔中洗滌兩次。將已接受未偶聯抗體之孔加每一細胞系一個未染色孔重懸浮於100μL APC抗人類二級抗體(20μg/mL)中。將100μL PBS+2% FBS添加至所有其他孔中,且在冰上染色45min。在1500rpm下將板旋轉沉降5min且在200μL PBS+2% FBS/孔中洗滌。將板再洗滌,重懸浮於200μL於PBS中之2% FBS/孔中且運行樣品。
圖20A1、20A2、20B1、20B2、20C1、20C2、20D1、20D2及表13中所顯示之結果指示,所有CD73抗體結合至天然表現CD73之細胞(Calu6細胞)及經轉染以表現食蟹獼猴CD73之CHO細胞,但該等抗體並不結合至不表現CD73之細胞(DMS114及CHO-K1)。對每一抗體獲得之結合之EC50顯示於表13中。
Figure 104138281-A0202-12-0188-21
CD73.4-IgG2-IgG1.1f與人類腫瘤細胞系之結合之EC50係0.5nM(0.3nM至0.67nM之範圍)。CD73.4-IgG2-IgG1.1f與食蟹獼猴CD73轉染之CHO細胞之結合之EC50係0.3nM(0.1nM至0.5nM之範圍)。
亦測定CD73.4抗體與人類B及T細胞之結合。自Immunsciences,BMS獲得兩個供體D316及D329之人類血液。使用Lympholyte-H細胞分離梯度介質分離外周血單核細胞(PBMC)。將PBMC與經連續稀釋之FITC標記之CD73.4-IgG2、CD73.4-IgG2-IgG1.1f或CD73.4-IgG1.1f抗體一起培育,且使用螢光染料標記之針對CD3及CD20之抗體鑒定T細胞及B細胞。彙集兩個供體之細胞用於未經染色及FMO(螢光減一)對照樣品。圖20E及F及表14中所顯示之結果指示該等抗體特異性結合至人類B及T細胞。
Figure 104138281-A0202-12-0188-22
Figure 104138281-A0202-12-0189-24
實例4:抗CD73抗體之生物物理特徵 A. 偶合至連線多角度光散射檢測器(SEC-MALS)之粒徑排阻層析
藉由偶合至連線多角度光散射檢測器(SEC-MALS)之粒徑排阻層析來檢查CD73 mAb之寡聚狀態。在連接至Prominence Shimadzu UFLC之Shodex PROTEIN KW-803管柱上在含有200mM K2HPO4、150mM NaCl(pH 6.8)且含有0.02%疊氮化鈉(經0.1μm過濾)之緩衝液中且在0.5mL/min下運行來實施等度分離。使用SIL-20AC Prominence Shimadzu自動取樣器將樣品注射至管柱上,且自串聯連接之三個在線檢測器獲得數據:Prominence SPD-20AD二極體陣列UV/vis分光光度計,其後為Wyatt miniDAWNTM TREOS多角度光散射檢測器,然後為Wyatt Optilab T-rEX折射率檢測器。收集數據(如下表15中所顯示)且使用Astra(Wyatt)及Labsolutions(Shimadzu)軟體分析。結果顯示於表15中。
B. 差示掃描量熱(DSC)
使用MicroCal Capillary DSC儀器(GE Healthcare)來測定CD73 mAb之熱穩定性。以PBS(pH 7.1)中之0.5-0.75mg/ml之濃度分析抗體。為穩定DSC儀器基線且獲得一致熱史,在樣品分析之前僅記錄樣品池及參照池二者中之緩衝液之多次掃描。樣品掃描含有樣品池中之mAb及參照池中之PBS(pH 7.1)。自10℃-110℃以60℃/hr之掃描速率使用5分鐘循環前恒溫時段及無循環後恒溫時段運行所有掃描。使用MicroCal Origin Cap DSC分析軟體分析數據(如下表15中所顯示)。自樣品-緩衝液數據減去適宜緩衝液-緩衝液空白掃描,且藉由將數據擬合至非2態模型來確定轉變中點溫度(Tm)值。結果顯示於表15中。 Tm1、Tm2及Tm3係抗體中不同結構域之Tm。
Figure 104138281-A0202-12-0190-25
結果顯示所有抗體幾乎係單體且穩定。
實例5:抗CD73 Ab對酶活性之抑制 A. 珠粒結合之CD73酶活性之抑制
為評價抗CD73抗體對珠粒結合之CD73酶活性抑制,使用以下材料及方法:
材料
TM緩衝液:25mM Tris、5mM MgCl2於水中
0.5mM磷酸鈉緩衝液,pH 8.0
洗滌緩衝液(10mL 0.5mM磷酸鈉,pH 8.0;10mL 5M NaCl;34mL水;10μL Tween-20)
腺苷5'-單磷酸二鈉鹽,Sigma目錄編號01930-%G,300mM於TM緩衝液中
腺苷5'-三磷酸二鈉鹽水合物,Sigma目錄編號A6419-1G,100mM於TM緩衝液中
rhCD73,0.781mg/mL
食蟹獼猴CD73,Sino Biological Inc目錄編號90192-C08H
his標籤磁珠,Invitrogen目錄編號10103D
CellTiter-Glo®發光細胞活力分析,Promega目錄編號G7572
mAbO,其係一種不結合CD73之不相關抗體
方法
藉由合併如表16中所指示之多個體積並稀釋3倍(將225μL轉移至450μL TM緩衝液中)來實施表16中所列示抗CD73抗體之6點連續稀釋(最大濃度為10μg/mL)。具有IgG2鉸鏈之所有抗體皆含有C219S突變。
Figure 104138281-A0202-12-0192-26
在微量離心管中之1mL磷酸鈉緩衝液中洗滌磁珠(2μl珠粒/樣品)。用磁鐵將珠粒拉下且重懸浮於400μL TM緩衝液中。對於每一種CD73:在單獨管中,合併CD73(75ng/樣品)與TM以使體積達到400μL。準備第三管用於空白珠粒(不含CD73)。合併珠粒懸浮液與rhCD73溶液且在室溫下在振盪器上混合5min。用磁鐵將珠粒拉下且在1mL洗滌緩衝液中洗滌珠粒。用磁鐵將珠粒拉下且重懸浮於TM緩衝液(40μL/樣品)中。將珠粒轉移至PCR 96孔板(40μL/孔)。將200μL/孔經連續稀釋之CD73 HuMab添加至板中且充分混合。在室溫下將板培育30min。製備各自700μL之400μM ATP(8×)及1.2mM AMP(8×)。合併各自之650μL以製備4×AMP/ATP原液混合物。將珠粒拉下且用200μL TM緩衝液/孔洗滌兩次。將珠粒再拉下且重懸浮於30μL TM緩衝液中。將30μL珠粒轉移至96孔黑色板。添加10μL 4×AMP/ATP原液(最終濃度為150μM AMP/50μM ATP)且混合。以40μL體積添加對照孔(最終濃度為150μM AMP及/或50μM ATP)。在37℃下將板培育15min。
結果顯示於圖21A1、21A2、21B1及21B2及表17中。
Figure 104138281-A0202-12-0193-27
食蟹獼猴CD73之酶抑制結果陳述於表18中。
Figure 104138281-A0202-12-0193-28
結果顯示抗體劑量依賴性抑制人類CD73之酶活性。在重組人類CD73酶抑制分析中,CD73.4.IgG2-C219S-IgG1.1f之EC50為2.97(範圍 為2.9nM至3.1nM)。在重組食蟹獼猴CD73酶抑制分析中,CD73.4.IgG2-C219S-IgG1.1f之EC50為3.7(範圍為1.6nM至12.6nM)。因此,所測試之所有針對CD73之抗體皆抑制珠粒結合之人類及食蟹獼猴CD73酶活性。
B. Calu6細胞中CD73酶活性之抑制
此實例闡述在用抗CD73抗體處理後用於AMP之CD73去磷酸化之Calu6(CD73陽性)及DMS-114(CD73陰性)細胞之評價。
材料:
CD73抗體;參見下表
MabO對照抗體,5.38mg/mL
TM緩衝液:25mM Tris、5mM MgCl2於水中
腺苷5'-單磷酸二鈉鹽,Sigma目錄編號01930-5G,300mM於TM緩衝液中
腺苷5'-三磷酸二鈉鹽水合物,Sigma目錄編號A6419-1G,100mM於TM緩衝液中
rhCD73,0.781mg/mL
CellTiter-Glo®發光細胞活力分析,Promega目錄編號G7572
方法:
藉由在U形底96孔板中合併如下表19中所指示之多個體積之經純化抗體及PBS來連續稀釋抗體。實施抗體之6點連續稀釋(最大濃度為25μg/mL,300μL)及5倍稀釋(將60μL轉移至240μL PBS中)。具有IgG2鉸鏈之所有抗體皆含有C219S突變。
Figure 104138281-A0202-12-0195-29
利用Versene收穫細胞且計數。對板接種,在1500rpm下旋轉沉降5min,且重懸浮於100μL經連續稀釋之抗體中。將所有其他孔重懸浮於100μL PBS中。在37℃下培育20min。於TM緩衝液中製備15mL 180μM AMP原液。
在1500rpm下將板旋轉沉降5min且用200μL PBS/孔洗滌一次。將板再旋轉沉降且重懸浮於100μL AMP中。將所有其他孔重懸浮於100μL TM緩衝液中。在37℃下將細胞與AMP一起培育60min。製備ATP於TM緩衝液中之7.5mL 60μM原液。在1500rpm下將板旋轉沉降5min且將50μL上清液轉移至黑色96孔板。添加50μL ATP。將rhCD73以75ng/孔添加至某些孔中作為陽性對照。使用TM緩衝液將未接受rhCD73之孔補足至100μL。最終濃度為90μM AMP:30μM ATP。在37℃下培育15min。對於CellTiterGlo分析(其檢測ATP),每孔添加100μL且讀取板。
圖22A1、22A2、22B1、22B2及表20中所顯示之結果指示,抗CD73抗體在人類CD73陽性Calu6細胞中抑制AMP之去磷酸化(或減少AMP處理),但在CD73陰性DMS114細胞中不具效應。CD73.4-IgG2S- IgG1.1f抗體在人類腫瘤細胞系Calu6中阻斷內源細胞CD73之EC50係0.39nM(範圍為0.31nM至0.48nM)。在NCI-H292(黏液表皮樣癌細胞系)及SK-MEL-24(人類黑色素瘤細胞系)細胞中重複該等實驗且結果相似(表20)。
Figure 104138281-A0202-12-0196-30
Figure 104138281-A0202-12-0197-31
1對具有內源CD73表現之Calu6細胞之結合滴定。在2-6個獨立實驗中測試抗體,且指示平均值。
2來自此實例之部分A之數據。在1-5個獨立實驗中測試抗體,且指示平均值。
3抑制所指示細胞系中之細胞CD73活性。在2-4個獨立實驗中測試抗體,且指示平均值。
C. 在雙重細胞系cAMP分析中CD73酶活性之抑制 均相時間解析螢光(HTRF)cAMP分析
用含有0.2% BSA之PBS緩衝液連續稀釋CD73抗體,且以5μl/孔平鋪於384孔白底proxi板(PerkinElmer,Waltham,MA)中。收穫Calu-6細胞且將其重懸浮於含有0.2% BSA之PBS中,然後將5μl細胞(300個細胞/孔)添加至板中。在37℃ 5% CO2及95%濕度下將細胞與抗體一起培育10分鐘,然後添加5μl/孔80mM AMP。在37℃下將細胞與AMP再一起培育30分鐘。在此時間期間,收穫HEK293/A2AR細胞且在含有0.2% BSA之PBS中將其稀釋至40萬/ml。將其以5μl/孔添加至分析板中且在37℃下繼續培育1hr。根據製造商之說明書,使用均相時間解析螢光(HTRF)HiRange cAMP檢測套組(Cisbio,Bedford,MA)藉由添加溶解緩衝液中之10μl/孔cAMP偶聯之d2及10μl/孔銪穴狀化合物偶聯之抗cAMP抗體來實施HRTF分析。在室溫下將板培育60分鐘,且使用EnVision板讀取器(PerkinElmer,Waltham,MA)讀取螢光共振能量轉移(FRET)信號(665nM及615nM)。將FRET信號計算為665nm(受體)與615nm(供體)通道之信號之比率且乘以10,000。量測IC50 及Ymax。藉由與100nM劑量之11F11比較來確定Ymax作為內部最大值。所有計算確定為與設定為100%之此對照相比之抑制百分比。
表21中所顯示之結果指示,抗CD73 mAb在使用細胞系共培養系統之此cAMP分析中展示不同的功效及效能。所有Ab皆顯示一定程度之腺苷產生減少,且所篩選大多數Ab之抑制程度相似。對11F11、11A6、4C3及5F8可見最大抑制。
Figure 104138281-A0202-12-0198-32
亦使用11F11 Fab及F(ab’)2實施酶抑制分析。圖22C中所顯示之結果指示使用F(ab’)2片段發生酶抑制,但使用Fab片段未發生酶抑制。因此,Fc區並非11F11酶抑制所必需,但需要二價性。
亦使用上述cAMP分析測定包含表26中所顯示之不同重鏈恆定區之CD73.4抗體的Calu6細胞中之酶抑制。根據EC50及抑制程度對背景(「S:B」)之結果提供於表28之最後兩行中。該等結果指示所有CD73.4抗體皆抑制Calu6細胞中之人類CD73酶活性。
D. CD73酶活性抑制之時程
亦藉由LC/MS/MS評估腺苷產生來評估酶活性抑制之時程。將Calu6細胞與11F11或4C3一起培育30分鐘、2小時或4小時,然後添加50μM AMP且藉由LC/MS/MS使用標準方法評估腺苷產生。
質譜條件(Xevo TQ-S):
儀器:Xevo TQ-S(具有Waters 2777C)
Figure 104138281-A0202-12-0199-33
圖22D中所顯示之結果指示,培育時間在30min時間點時的確不同且11F11之抑制比4C3之抑制更快。儘管兩種抗體在後來時間點達成相同抑制,但11F11抗體更快速抑制細胞中之CD73酶活性。
實例6:抗體介導之CD73內化
在兩個不同分析中量測抗CD73抗體介導之CD73內化。
A. 高含量內化分析(2小時固定時間分析)
使用抗CD73抗體藉由在抗體培育2小時後評價細胞表現來測試Calu6細胞中之抗CD73抗體依賴性CD73內化。將20μl完全培養基(含有10%熱失活胎牛血清之Gibco RPMI培養基1640)中之細胞(2,000個細胞/孔)平鋪於384 BD Falcon板中且使其在37℃ 5% CO2及95%濕度下生長過夜。用含有0.2% BSA之PBS緩衝液連續稀釋抗CD73抗體,且以5μl/孔添加至細胞板中。在37℃ 5% CO2及95%濕度下將細胞與抗體一起培育2小時,然後用PBS緩衝液洗滌一次。然後將甲醛(最終為PBS中之4%)以20μl/孔添加至細胞板中,且在室溫下將板培育10分鐘。此後,抽出所有液體且用30μl PBS將細胞洗滌一次。將檢測抗 體(2.5μg/孔抗CD73 Ab CD73.10.IgG2C219S)以15μg/孔添加至固定細胞板中。在4℃下將細胞培育過夜。在第二天,用PBS緩衝液將板洗滌兩次,然後添加含有Alexa-488山羊抗人類及DAPI之二級抗體,在室溫下染色1小時。在PBS緩衝液中洗滌3次後,在Arrayscan Vti(Cellomics,Pittsburgh,PA)上將板成像。量測IC50及Ymax。藉由與100nM劑量之11F11比較來測定Ymax作為內部最大值。所有計算確定為與設定為100%之此對照相比之內化百分比。
結果提供於表22中。
Figure 104138281-A0202-12-0200-34
ND=未檢測到
NA=不適用
因此,結果指示在表現人類CD73之細胞系Calu6中由CD73.4.IgG2-C219S-IgG1.1f介導之CD73內化之EC50係1.2nM,且該 細胞系中之最大內化程度係97.5%。
亦使用11F11 Fab及F(ab’)2實施內化分析。圖22C中所顯示之結果指示使用F(ab’)2片段發生內化,但使用Fab片段不發生內化。因此,Fc區並非11F11內化所必需。
實施動力學內化研究來評價內化速率。將20μl完全培養基(含有10%熱失活胎牛血清之Gibco RPMI培養基1640)中之細胞(2,000個細胞/孔)平鋪於384 BD Falcon板中且使其在37℃ 5% CO2及95%濕度下生長過夜。用含有0.2% BSA之PBS緩衝液將CD73抗體稀釋至10μg/ml且將5μl/孔添加至細胞板中。在37℃下將細胞與抗體一起培育0-2小時時程,然後用PBS緩衝液洗滌一次。隨後在室溫下用甲醛(最終為PBS中之4%)將細胞固定10分鐘,且然後用30μl PBS洗滌一次。用含有0.2% BSA之PBS緩衝液稀釋檢測抗體(2.5μg/孔抗CD73 Ab CD73.10.IgG2C219S),且將15μl/孔添加至固定細胞板中。在4℃下將板培育過夜。在第二天,在PBS緩衝液中洗滌3次後,添加二級抗體Alexa488-山羊抗人類與DAPI。在室溫下將細胞染色60分鐘,洗滌3次後,使用Arrayscan Vti(Cellomics,Pittsburgh,PA)獲取影像。結果提供於圖23A-23D及表23及24中。表24中之值源自圖23A-D中所顯示之數據。
Figure 104138281-A0202-12-0201-35
Figure 104138281-A0202-12-0202-36
Figure 104138281-A0202-12-0202-37
結果指示倉1抗體(11F11及其衍生物CD73.4及CD73.10)顯示良好的內化EC50及最大值(97.5%),但一些抗體之內化程度大於其他抗體。11F11最具活性且在數分鐘內內化,在30分鐘內達到平穩段,而6E11(亦為倉1抗體,IgG1)內化較緩慢,在約1hr內達到平穩段(圖23A-D)。倉2抗體(5F8及4C3)未顯著內化。另外,IgG2鉸鏈及CH1結構域之存在增強了內化之速度及程度。在若干細胞系中觀察到此趨勢(圖23A-D及表24)。
B. 藉由流式細胞術量測之內化
亦藉由流式細胞術測試抗CD73抗體介導之CD73內化。在冰上將所指示細胞與10μg/mL所指示抗體一起培育30分鐘,洗滌若干次,且轉移至37℃持續所指示時間。在所指示培育時間後之同時收穫細胞。再用一級抗體(與初始培育所使用相同之抗體)、然後用抗人類二級抗體對細胞染色。然後藉由流式細胞術分析細胞之CD73表現。
圖23E及表25中所顯示之結果與上述內化分析中所獲得之彼等一致,且指示具有IgG2鉸鏈及CH1之所有抗體皆誘導快速且完全的內化。CD73含量在洗掉後22小時後保持較低,此指示內化係可持續的。
在NCI-H292細胞系中獲得圖23F及表25中所顯示之類似結果,其中在培育時間期間(未洗掉)將抗體維持在培養物中。而且,該等數據指示內源CD73之快速且顯著之內化及下調之維持。
亦使用人類SNU-C1(結腸癌細胞系)及NCI-H1437(非小細胞肺癌細胞系)細胞實施內化分析。圖23I及J及表25中所顯示之結果亦指示在5小時內達到最大程度之快速內化,且在SNU-C1中CD73.4.IgG2-C219S-IgG1.1f之最大內化程度為約50%且對於NCI-H1437細胞為60%。圖23G及H顯示在Calu6及NCI-H292細胞中CD73.4.IgG2-C219S-IgG1.1f內化之相似動力學。對於顯示內化CD73%之圖表,如下獲得此數值:
Figure 104138281-A0202-12-0203-38
其中對於每一抗體,MFIt=x係給定時間點之MFI且MFIt=0係t=0時之最大螢光,且MFI背景係僅二級Ab之MFI。
Figure 104138281-A0202-12-0204-39
在Calu6及H292細胞中實施其他內化分析以進一步區分同型對內化之作用。如上文所述實施內化分析(無抗體洗掉步驟之方案),且在培育時間期間將表26中所顯示不同雜合同型之抗體以10μg/mL維持在培養物中。
Figure 104138281-A0202-12-0204-40
Figure 104138281-A0202-12-0205-41
顯示FcγR結合係如對每一構築體所預期,即FcγR結合係藉由下鉸鏈/CH2區來驅動。
結果顯示於圖23K、L、M及表27及28中。
Figure 104138281-A0202-12-0205-42
Figure 104138281-A0202-12-0206-43
Figure 104138281-A0202-12-0206-44
圖23K、L及M及表27及28指示具有IgG2同型之鉸鏈及CH1結構域之抗體在驅動CD73內化方面最有效,而具有IgG1鉸鏈及CH1結構域之抗體對應於圖中之下方曲線,即較低內化程度。另外,僅具有來自IgG2之鉸鏈之抗體具有與人類IgG1鉸鏈相比增加的內化。因此,具有IgG2同型之鉸鏈及CH1結構域之抗體具有相對於具有IgG1同型之抗體較優異之內化特徵。
因此,抗CD73抗體mAb-CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f誘導依賴於所測試細胞系之快速內化。內化之T1/2介於數分鐘至不到1小時範圍內。所測試之大多數細胞系之T1/2不到10分鐘。對於一些細胞系誘導幾乎完全之內化且所測試之所有細胞系之表面CD73表現皆減少至少50%,該表面CD73表現通常截至5小時達到最大程度,在一些情形下更短。
實例9:在異種移植物動物模型中腫瘤之CD73酶抑制
在生長7天後用CD73.10-IgG1.1、CD73.10-IgG2CS或CD73.10-IgG2CS-IgG1.1治療帶有皮下人類Calu6腫瘤之小鼠。以10mg/kg IP投用抗體。在抗體投與後第1天、第2天、第3天及第7天收穫腫瘤,包埋於OCT中且快速冷凍於冷異戊烷中。將經OCT包埋之腫瘤切割成5-6μm切片且在室溫下乾燥過夜。使用冷10%磷酸鹽緩衝之福馬林及丙酮之1:1混合物將腫瘤切片固定2.5min,然後在室溫下在含有2mM CaCl2及0.25M蔗糖之50mM Tris-馬來酸鹽緩衝液(pH 7.4)中預培育1小時。1小時後,去除預培育緩衝液且更換為補充有5mM MnCl2、2mM Pb(NO3)2、2.5%葡聚糖T200、2.5mM左旋咪唑及1mM AMP之相同緩衝液。在37℃下實施1h之酶反應。用DI水沖洗後,將切片與1%(NH4)2S一起培育正好1min,然後在DI水中快速沖洗。使用蘇木精對切片對比染色,脫水且用基於二甲苯之固定培養基固定。棕色指示活性CD73之存在,而缺少棕色指示CD73酶活性受抗體抑制。
結果指示CD73.10-IgG1.1、CD73.10-IgG2CS及CD73.10-IgG2CS-IgG1.1抑制活體內CD73酶活性。經CD73.10-IgG2CS-IgG1.1抗體治療之小鼠之腫瘤的代表性染色切片顯示於圖24 A-E中。經另兩種抗體治療之小鼠之腫瘤的染色切片相似。CD73之抑制程度與抗體之血清含量相關。因此,在第3天實例中觀察到之稍高CD73活性程度與低於第7天實例之抗體血清含量相關。
對帶有皮下人類SNUC1結腸腺癌源性異種移植腫瘤且經抗CD73抗體CD73.4IgG2CS-IgG1.1f治療之小鼠實施與上文所述類似之實驗。在第0天,用CD73.4IgG2CS-IgG1.1f以1mg/kg、3mg/kg及10mg/kg IP治療具有SNUC1腫瘤之小鼠。在投藥後24h、48h、72h、96h及168h收穫腫瘤。如上文所述實施CD73酶抑制分析。使用Image Pro Premier軟體(Media Cybernetics)實施棕色染色之量化。
圖24F之圖表中所呈現之結果顯示,當與經對照抗體治療之小鼠相比時,投用抗CD73抗體之動物之CD73活性顯著降低,此指示所有三種濃度之抗體之強CD73酶抑制。因此,抗CD73抗體CD73.4CS-IgG1.1f可有效地抑制活體內CD73酶活性。亦在4T1同基因腫瘤模型中測定抗CD73抗體之CD73抑制之動力學。在4T1腫瘤細胞注射後第7天注射TY/23(大鼠抗小鼠CD73抗體)或大鼠IgG對照(10mg/kg)。在Ab治療後第1天、第2天、第3天、第6天及第7天收集腫瘤、脾、全血及血清。如上文所述在來自所指示天數之切片中量測CD73活性之抑制。代表性腫瘤切片顯示於圖25A及B中。數據指示TY/23抑制活體內CD73活性。
實例10:表位分倉及基於流式細胞術之交叉阻斷
在25℃下藉由Biolayer Interferometry(BLI)使用Octet RED儀器(Pall Fortebio)實施表位分倉研究。對於該等研究,於抗五his感測器上使用90-180s負載期捕獲20-30μg/ml hCD73-his。藉由允許給定抗 體(mAb1)結合至hCD73-his表面達180s、然後立即於第二抗體溶液(mAb2)下暴露達180s來評估抗體競爭。比較預結合mAb1後mAb2之結合信號與在競爭不存在下mAb2之結合信號,以確定mAb1及mAb2是否結合至hCD73-his表面。對多個mAb對以兩種順序(mAb1然後mAb2及mAb2然後mAb1)實施該等實驗以確立競爭概況及表位倉(如下表29中所概述)。
如表29中所顯示,表位分倉分析揭露2個表位倉。
Figure 104138281-A0202-12-0209-45
亦使抗體經歷基於流式細胞術之交叉阻斷。使用一組經螢光標記之抗體及第二組未經標記抗體如下實施實驗:對每孔接種100000個NCI-H292細胞。將板旋轉沉降且將細胞重懸浮於每孔100μL於PBS中之2% FBS中。在冰上將細胞封阻20min。將如指示於PBS中之2% FBS中之未經標記抗體添加至每孔中。將板旋轉沉降,且將細胞重懸浮於偶聯至FITC之100μL/孔經稀釋之經標記抗體(10μg/mL)、即4C3或11F11中。將6孔細胞不與抗體一起培育,且僅將其重懸浮於100μL於PBS中之2% FBS(用於對照)中。然後在冰上將細胞培育30min。用PBS中之2% FBS將細胞洗滌兩次且將樣品重懸浮於140μL於PBS中之2% FBS中,並在FacsCalibur流式細胞儀(Becton Dickinson)上分析。
圖26A及B中所顯示之基於流式細胞術之交叉阻斷之結果確認上述SPR表位分倉數據。例如,7A11與11F11競爭,但4C3不與11F11競 爭。
實例11:藉由HDX之表位定位
此實例闡述使用HDX-MS來鑒定人類CD73上結合至CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f之表位。
氫/氘交換質譜(HDX-MS)方法藉由監測蛋白質骨架醯胺氫原子(脯胺酸除外)之氘交換之速率及程度探測溶液中之蛋白質構象及構象動力學。HDX之交換程度取決於蛋白質溶劑可及性及氫鍵,且可藉由MS精確量測HDX上蛋白質之質量增加。當此技術與酶消化配對時,可以肽層面解析結構特徵,此使得能夠將表面暴露之肽與內部摺疊之肽區分開。在表位定位實驗中,對抗原及抗原/mAb複合物平行實施氘標記及後續驟冷實驗,然後進行在線胃蛋白酶消化、肽分離及MS分析。
在藉由HDX-MS使CD73.4-IgG2-CS-IgG1.1f在CD73中表位定位之前,實施非氘化實驗以產生重組人類全長ECD二聚體CD73(12μM)之常見胃蛋白酶解肽之列表及重組人類CD73及CD73 mAb之蛋白質複合物(1:1莫耳比,對於CD73 mAb為12μM),從而達成全長ECD CD73之88%之序列覆蓋率。在HDX-MS實驗中,將5μL CD73(SEQ ID NO:99)或含有CD73.4-IgG2-CS-IgG1.1fmAb之CD73稀釋至55μL D2O緩衝液(10mM磷酸鹽緩衝液、D2O,pD 7.0)中,以在室溫下起始標記反應。所用CD73蛋白係具有SEQ ID NO:99之糖基化全長二聚體hCD73(亦顯示於下文中)。持續不同時間段實施反應:20sec、1min、10min及240min。截至每一標記反應時段結束,藉由添加驟冷緩衝液(含有4M GdnCl及0.4M TCEP之100mM磷酸鹽緩衝液,pH 2.5,1:1,v/v)來驟冷反應,且將50μL驟冷樣品注射至Waters HDX-MS系統中用於分析。在CD73 mAb不存在/存在下監測常見胃蛋白酶解肽之氘攝取量。
所用CD73蛋白具有具有SEQ ID NO:99之胺基酸序列。
對CD73中之CD73 mAb之HDX-MS量測指示,CD73.4-IgG2-CS-IgG1.1f mAb識別包含CD73之N末端區域中之兩個肽區域的不連續表位:
肽區域1(65-83):FTKVQQIRRAEPNVLLLDA(SEQ ID NO:96)
肽區域2(157-172):LYLPYKVLPVGDEVVG(SEQ ID NO:97)
相互作用之三維視圖(圖27B)顯示該兩個區域在幾何學上接近。相互作用之明細圖顯示於圖27A中。
實例12:結合至CD73之11F11之晶體結構
此實例闡述結合至CD73(26-336)His之11F11之Fab’之晶體結構。
使用標準方案自經瞬時轉染之HEK-293 E細胞純化CD73(26-336)His,且以原樣使用,或藉由PNGase F處理去糖基化並濃縮至1.2mg/ml。使用標準方案藉由胃蛋白酶消化11F11製備抗體11F11 Fab’,且濃縮至1.1mg/ml。
藉由在4℃下將等體積之去糖基化hCD73(26-336)His及11F11 Fab’培育過夜形成複合物,藉由使用GE Superdex 200 26/60管柱純化,且使用10k MWCO旋轉濃縮器濃縮至9.5mg/ml。
在坐滴蒸汽擴散實驗中使晶體生長,且該滴為與0.25μL儲藏溶液混合之0.25μL蛋白質。設定超過7100個結晶實驗。初始晶體引線小約10μm。最佳化晶體之大小為200-300μm。結晶最佳化包括篩選:添加劑、清潔劑、沈澱劑、pH、溫度及緩衝液類型。允許晶體形成之條件如下:儲藏溶液係由34%聚丙二醇P400、0.1M Na/K PO4(pH 6.5)及15μM CYMAL-7組成;在室溫下設定結晶實驗且然後置於4℃下培育;並在4℃下培育7天。僅使用糖基化CD73蛋白觀察到晶體形成。
自結晶滴直接收穫晶體且將其直接置於液體N2中。篩選出超過 100個晶體用於內部繞射。
在具有Rayonix MX-33HS高速CCD檢測器之SER-CAT束線22ID上使用小束極小減弱及螺旋數據收集來收集數據。在4.1Å、3.8Å、3.5Å及最後3.05Å下收集數據集。使用常規HKL2000處理並縮放之數據(Otwinowski Z.、Minor W.,Methods in Enzymology 276,307-326(1997))針對3.04Å解析度為96%完整性。
使用BLAST(Altschul等人(1990)「Basic local alignment search tool.」J.Mol.Biol.215:403-410)檢索來發現RCSB蛋白質數據庫中CD73 N末端結構域及Fc及Fv結構域之最接近模型以用於分子替代檢索:CD73模型來自PDB條目4H1S(Heuts等人,Chembiochem.2012年1月5日;13(16):2384-91)。
使用該等模型作為PHASER(McCoy等人,J.Appl.Cryst.(2007).40,658-674)分子替代檢索中之起始模型。CD73檢索發現不對稱單元中之5個分子。保持CD73固定,利用重鏈檢索模型之檢索發現不對稱單元中之2個分子。保持CD73及重鏈固定,使用輕鏈之第三PHASER檢索亦發現不對稱單元中之2個分子。藉由疊加五個CD73並使重鏈與輕鏈吻合自部分溶液製造五個完整複合物之複合模型。使用此作為BUSTER(Bricogne等人(2011)BUSTER 2.11.6版.Cambridge,United Kingdom:Global Phasing Ltd)之起始模型。
該模型已經再擬合且胺基酸發生變化以反映11F11序列。該模型經受過度手動建模及。運行總共五個BUSTER循環以完成。27,484個蛋白質原子及24個溶劑分子之最終R-因子係20.59%(R-自由=24.58%)。
複合物之晶體結構之代表圖陳述於圖28A-D中。
該晶體結構顯示除一種以外之所有相互作用來自CDR區中之殘基,且大多數相互作用來自VH結構域,另外兩種相互作用來自VL結 構域(圖28A)。人類CD73及11F11 Fab’之相互作用殘基顯示於表30中。
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基於兩個CD73(NDT)/11F11複合物疊加在CD73二聚體(PDB條目4H1S)上之複合結構的模型表明11F11結合至CD73上遠離二聚體界面之表面,此表明Fab將不干擾二聚體形成。
對CD73/11F11複合物之HDX-MS定位及X射線結果之比較顯示其基本上一致地顯示相似的CD73上之表位(65-83及157-172)。然而,X射線結構顯示Met-105至Asp-111(包括與Arg-109及Tyr-110之H鍵)、Lys-135至Pro-139及Asp-317至Ile-320(包括與Ser-319之H鍵)之區域中之其他相互作用(小於6Å)。
實例13:不同鉸鏈/Fc對抗體/CD73複合物大小之影響
如上述實例中所顯示,具有IgG2鉸鏈及CH1之抗CD73抗體與具有IgG1鉸鏈之相同抗體相比係較佳之細胞上CD73酶活性抑制劑且內化較佳。基於此觀察及IgG2鉸鏈比IgG1鉸鏈硬之事實,假設在抗原與具有IgG2鉸鏈之抗體之間相對於具有IgG1鉸鏈之抗體形成較大複合物。實施以下實驗來分析此假說。
藉由SEC-MALS及DLS檢查溶液中CD73/抗體複合物之結構及寡聚狀態。對於該等研究,以不同莫耳比混合含有IgG1或IgG2恆定區之抗體與包含人類CD73之含有C末端多組胺酸標籤之全長細胞外結構域(人類CD73之胺基酸殘基26-546,稱為「hCD73-his」)或對應於人類CD73之N末端結構域之片段(胺基酸殘基26-336,稱為「N-hCD73-his」)的重組蛋白。
藉由偶合至連線多角度光散射檢測器(SEC-MALS)之粒徑排阻層 析來檢查CD73/抗體複合物之寡聚狀態。在連接至Prominence Shimadzu UFLC之Shodex PROTEIN KW-803管柱上在含有200mM K2HPO4、150mM NaCl(pH 6.8)且含有0.02%疊氮化鈉(經0.1μm過濾)之緩衝液中且在0.5mL/min下運行的來實施等度分離。使用SIL-20AC Prominence Shimadzu自動取樣器將樣品注射至管柱中,且自串聯連接之三個在線檢測器獲得數據:Prominence SPD-20AD二極體陣列UV/vis分光光度計,其後為Wyatt miniDAWNTM TREOS多角度光散射檢測器,然後為Wyatt Optilab T-rEX折射率檢測器。收集數據且使用Astra(Wyatt)及Labsolutions(Shimadzu)軟體分析。
在384孔板中在25℃下對Wyatt DynaPro板讀取器實施動態光散射(DLS)研究。實驗參數係每一量測各自5s之20次獲取,且以一式四份記錄量測,其中報告平均值及標準偏差。使用Dynamics軟體(Wyatt Technologies)中之「正則化」演算法擬合強度自相關函數。
SEC-MALS及DLS之概述提供於圖29A及B中。僅抗體之分析顯示為典型單體單株抗體之每一抗體之滯留時間(約16-17min)、質量(140-150kDa)及流體力學半徑(5.0-5.4nm)。hCD73-his蛋白之數據與採用溶液中之所預期二聚體結構之蛋白質一致;具體而言,根據SEC-MALS數據確定之質量(120kDa)與對CD73-his二聚體所預期之質量(117kDa)一致且與對hCD73-his單體所預期之質量(58.5kDa)不一致。N-hCD73之數據與在溶液中為單體之重組N-結構域蛋白一致(SEC-MALS量測之質量=38kDa,與預期單體質量=35.0kDa相比),其經預期之原因在於全長CD73細胞外結構域之負責蛋白質二聚化之區域含於不貢獻N-結構域殘基之C末端結構域內。
發現給定抗體與N-hCD73-his之等莫耳混合物在SEC中溶析為單一物質且具有短於單獨抗體或N-hCD73-his之滯留時間以及藉由DLS之較大流體力學半徑(Rh),此與複合物之形成一致。MALS數據指示 該等複合物之質量為約210kDa。此與一個N-hCD73-his分子結合至給定抗體之兩個Fab結構域中之每一者以形成1:2抗體:N-hCD73-his複合物一致。
抗CD73抗體與hCD73-his二聚體之混合物之SEC-MALS數據顯示該混合物比單獨hCD73-his或抗體較早溶析,此表明形成複合物。比較含有相同可變區但不同恆定結構域之mAb之數據顯示,hCD73-his與含有IgG2恆定結構域(IgG2-C219S、IgG2-C219S-IgG1.1f)之mAb之複合物的溶析時間早於hCD73-his與含有IgG1.1f恆定結構域之mAb之複合物的彼等。另外,MALS測定之hCD73-his與含有IgG2恆定結構域之mAb之複合物的質量大於hCD73-his與含有IgG1恆定結構域之mAb之複合物的彼等。DLS數據進一步顯示,hCD73-his與含有IgG2恆定結構域之mAb之複合物的流體力學半徑大於hCD73-his與含有IgG1恆定結構域之mAb之複合物的彼等。例如,具有三個不同恆定區(IgG2-C219S、IgG2-C219S-IgG1.1f或IgG1.1f)之CD73.4之SEC-MALS及DLS數據顯示於圖30中。在此處可見,與hCD73-his與CD73.4-IgG1.1f之複合物相比,hCD73-his與含有IgG2恆定結構域之CD73.4之複合物具有較短滯留時間(圖30A)、較大流體力學半徑(圖30B)及較大MALS測定之質量(圖30C)。基於MALS質量,hCD73-his與抗體之間之複合物的結構及化學計量之示意性模型顯示於圖30D中,其中含有CD73.4-IgG1.1f之複合物主要形成較小2:2(峰1=約550kDa)或4:4mAb/CD73二聚體複合物(峰2=約1300kDa),而CD73.4-IgG2-C219S或CD73.4-IgG2-C219S-IgG1.1f與hCD73-his形成顯著較大之複合物(>3000kDa),無法信賴地對其精確結構及化學計量建模。
亦測試具有表26中所述之重鏈恆定區之CD73.4抗體之複合物形成的大小。如圖30D中所顯示,結果指示使用具有IgG2 CH1結構域之抗體相對於具有IgG1 CH1結構域之彼等形成較高次複合物。
總之,SEC-MALS及DLS數據展示與含有IgG1鉸鏈及CH1區(IgG1.1f)之彼等相比,在hCD73-his與含有IgG2鉸鏈及CH1區(IgG2-C219S或IgG2-C219S-IgG1.1f)之mAb之間形成較大複合物。另外,具有IgG2 CH1結構域之抗體形成大於具有IgG1 CH1結構域之彼等之複合物。
等效內容
熟習此項技術者僅使用常規實驗即可認識或能夠確定本文所述特定實施例之許多等效內容。該等等效內容皆意欲涵蓋在下文申請專利範圍內。
序列表之概述
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Figure 104138281-A0202-12-0352-204
序列表提供成熟可變區及重鏈及輕鏈之序列(即序列不包括信號肽)。
等效內容:
熟習此項技術者僅使用常規實驗即可認識或能夠確定本文所揭示特定實施例之許多等效內容。該等等效內容皆意欲涵蓋在下文申請專利範圍內。
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<210> 1
<211> 574
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(574)
<223> 人類CD73亞型1
<400> 1
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Figure 104138281-A0202-12-0354-206
Figure 104138281-A0202-12-0355-207
<210> 2
<211> 524
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(524)
<223> 人類CD73亞型2
<400> 2
Figure 104138281-A0202-12-0356-208
Figure 104138281-A0202-12-0357-209
<210> 3
<211> 574
<212> PRT
<213> 食蟹獼猴
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(574)
<223> 食蟹獼猴CD73
<400> 3
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<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VH
<400> 4
Figure 104138281-A0202-12-0360-213
<210> 5
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VH CDR1
<400> 5
Figure 104138281-A0202-12-0361-214
<210> 6
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VH CDR2
<400> 6
Figure 104138281-A0202-12-0361-215
<210> 7
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VH CDR3
<400> 7
Figure 104138281-A0202-12-0361-216
<210> 8
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK1
<400> 8
Figure 104138281-A0202-12-0361-217
Figure 104138281-A0202-12-0362-218
<210> 9
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK1 CDR1
<400> 9
Figure 104138281-A0202-12-0362-219
<210> 10
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK1 CDR2
<400> 10
Figure 104138281-A0202-12-0362-220
<210> 11
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK1 CDR3
<400> 11
Figure 104138281-A0202-12-0362-221
<210> 12
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK2
<400> 12
Figure 104138281-A0202-12-0362-222
Figure 104138281-A0202-12-0363-223
<210> 13
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK2 CDR1
<400> 13
Figure 104138281-A0202-12-0363-224
<210> 14
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK2 CDR2
<400> 14
Figure 104138281-A0202-12-0363-225
<210> 15
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK2 CDR3
<400> 15
Figure 104138281-A0202-12-0363-226
<210> 16
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VH
<400> 16
Figure 104138281-A0202-12-0364-227
<210> 17
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VH CDR1
<400> 17
Figure 104138281-A0202-12-0364-228
<210> 18
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VH CDR2
<400> 18
Figure 104138281-A0202-12-0365-230
<210> 19
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VH CDR3
<400> 19
Figure 104138281-A0202-12-0365-231
<210> 20
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK1
<400> 20
Figure 104138281-A0202-12-0365-232
<210> 21
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK1 CDR1
<400> 21
Figure 104138281-A0202-12-0366-233
<210> 22
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK1 CDR2
<400> 22
Figure 104138281-A0202-12-0366-234
<210> 23
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK1 CDR3
<400> 23
Figure 104138281-A0202-12-0366-235
<210> 24
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK2
<400> 24
Figure 104138281-A0202-12-0366-236
Figure 104138281-A0202-12-0367-237
<210> 25
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK2 CDR1
<400> 25
Figure 104138281-A0202-12-0367-238
<210> 26
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK2 CDR2
<400> 26
Figure 104138281-A0202-12-0367-239
<210> 27
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK2 CDR3
<400> 27
Figure 104138281-A0202-12-0367-240
<210> 28
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK3
<400> 28
Figure 104138281-A0202-12-0367-241
Figure 104138281-A0202-12-0368-242
<210> 29
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK3 CDR1
<400> 29
Figure 104138281-A0202-12-0368-243
<210> 30
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK3 CDR2
<400> 30
Figure 104138281-A0202-12-0368-244
<210> 31
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK3 CDR3
<400> 31
Figure 104138281-A0202-12-0368-245
<210> 32
<211> 122
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VH
<400> 32
Figure 104138281-A0202-12-0369-246
<210> 33
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VH CDR1
<400> 33
Figure 104138281-A0202-12-0369-247
<210> 34
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VH CDR2
<400> 34
Figure 104138281-A0202-12-0369-248
<210> 35
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VH CDR3
<400> 35
Figure 104138281-A0202-12-0370-249
<210> 36
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VK1
<400> 36
Figure 104138281-A0202-12-0370-250
<210> 37
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VK1 CDR1
<400> 37
Figure 104138281-A0202-12-0370-251
<210> 38
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VK1 CDR2
<400> 38
Figure 104138281-A0202-12-0371-252
<210> 39
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VK1 CDR3
<400> 39
Figure 104138281-A0202-12-0371-253
<210> 40
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VH1
<400> 40
Figure 104138281-A0202-12-0371-254
Figure 104138281-A0202-12-0372-255
<210> 41
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VH1 CDR1
<400> 41
Figure 104138281-A0202-12-0372-256
<210> 42
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VH1 CDR2
<400> 42
Figure 104138281-A0202-12-0372-257
<210> 43
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VH1 CDR3
<400> 43
Figure 104138281-A0202-12-0372-258
<210> 44
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK1
<400> 44
Figure 104138281-A0202-12-0372-259
Figure 104138281-A0202-12-0373-260
<210> 45
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK1 CDR1
<400> 45
Figure 104138281-A0202-12-0373-261
<210> 46
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK1 CDR2
<400> 46
Figure 104138281-A0202-12-0373-262
<210> 47
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK1 CDR3
<400> 47
Figure 104138281-A0202-12-0373-263
<210> 48
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK2
<400> 48
Figure 104138281-A0202-12-0374-264
<210> 49
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK2 CDR1
<400> 49
Figure 104138281-A0202-12-0374-265
<210> 50
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK2 CDR2
<400> 50
Figure 104138281-A0202-12-0374-266
<210> 51
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK2 CDR3
<400> 51
Figure 104138281-A0202-12-0375-267
<210> 52
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VH
<400> 52
Figure 104138281-A0202-12-0375-268
<210> 53
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VH CDR1
<400> 53
Figure 104138281-A0202-12-0375-269
<210> 54
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VH CDR2
<400> 54
Figure 104138281-A0202-12-0376-270
<210> 55
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VH CDR3
<400> 55
Figure 104138281-A0202-12-0376-271
<210> 56
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VK1
<400> 56
Figure 104138281-A0202-12-0376-272
<210> 57
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VK1 CDR1
<400> 57
Figure 104138281-A0202-12-0377-273
<210> 58
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VK1 CDR2
<400> 58
Figure 104138281-A0202-12-0377-274
<210> 59
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VK1 CDR3
<400> 59
Figure 104138281-A0202-12-0377-275
<210> 60
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VH
<400> 60
Figure 104138281-A0202-12-0377-276
Figure 104138281-A0202-12-0378-277
<210> 61
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VH CDR1
<400> 61
Figure 104138281-A0202-12-0378-278
<210> 62
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VH CDR2
<400> 62
Figure 104138281-A0202-12-0378-279
<210> 63
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VH CDR3
<400> 63
Figure 104138281-A0202-12-0378-280
<210> 64
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VK1
<400> 64
Figure 104138281-A0202-12-0379-281
<210> 65
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VK1 CDR1
<400> 65
Figure 104138281-A0202-12-0379-282
<210> 66
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VK1 CDR2
<400> 66
Figure 104138281-A0202-12-0379-283
<210> 67
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VK1 CDR3
<400> 67
Figure 104138281-A0202-12-0380-284
<210> 68
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VH
<400> 68
Figure 104138281-A0202-12-0380-285
<210> 69
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VH CDR1
<400> 69
Figure 104138281-A0202-12-0380-286
<210> 70
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VH CDR2
<400> 70
Figure 104138281-A0202-12-0381-287
<210> 71
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VH CDR3
<400> 71
Figure 104138281-A0202-12-0381-288
<210> 72
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK1
<400> 72
Figure 104138281-A0202-12-0381-289
<210> 73
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK1 CDR1
<400> 73
Figure 104138281-A0202-12-0382-290
<210> 74
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK1 CDR2
<400> 74
Figure 104138281-A0202-12-0382-291
<210> 75
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK1 CDR3
<400> 75
Figure 104138281-A0202-12-0382-292
<210> 76
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK2
<400> 76
Figure 104138281-A0202-12-0382-293
Figure 104138281-A0202-12-0383-295
<210> 77
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK2 CDR1
<400> 77
Figure 104138281-A0202-12-0383-296
<210> 78
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK2 CDR2
<400> 78
Figure 104138281-A0202-12-0383-297
<210> 79
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK2 CDR3
<400> 79
Figure 104138281-A0202-12-0383-298
<210> 80
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VH
<400> 80
Figure 104138281-A0202-12-0384-299
<210> 81
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VH CDR1
<400> 81
Figure 104138281-A0202-12-0384-300
<210> 82
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VH CDR2
<400> 82
Figure 104138281-A0202-12-0384-301
<210> 83
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VH CDR3
<400> 83
Figure 104138281-A0202-12-0385-302
<210> 84
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VK1
<400> 84
Figure 104138281-A0202-12-0385-303
<210> 85
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VK1 CDR1
<400> 85
Figure 104138281-A0202-12-0385-304
<210> 86
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VK1 CDR2
<400> 86
Figure 104138281-A0202-12-0386-305
<210> 87
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VK1 CDR3
<400> 87
Figure 104138281-A0202-12-0386-306
<210> 88
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VH
<400> 88
Figure 104138281-A0202-12-0386-307
<210> 89
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VH CDR1
<400> 89
Figure 104138281-A0202-12-0387-308
<210> 90
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VH CDR2
<400> 90
Figure 104138281-A0202-12-0387-309
<210> 91
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VH CDR3
<400> 91
Figure 104138281-A0202-12-0387-310
<210> 92
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VK1
<400> 92
Figure 104138281-A0202-12-0387-311
Figure 104138281-A0202-12-0388-312
<210> 93
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VK1 CDR1
<400> 93
Figure 104138281-A0202-12-0388-313
<210> 94
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VK1 CDR2
<400> 94
Figure 104138281-A0202-12-0388-314
<210> 95
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VK1 CDR3
<400> 95
Figure 104138281-A0202-12-0388-315
<210> 96
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11表位編號1
<400> 96
Figure 104138281-A0202-12-0389-316
<210> 97
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11表位編號2
<400> 97
Figure 104138281-A0202-12-0389-317
<210> 98
<211> 98
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(98)
<223> 野生型IgG1 CH1
<400> 98
Figure 104138281-A0202-12-0389-318
<210> 99
<211> 553
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:帶His標籤之CD73
<400> 99
Figure 104138281-A0202-12-0390-319
Figure 104138281-A0202-12-0391-320
Figure 104138281-A0202-12-0392-321
<210> 100
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11(全長重鏈)
<400> 100
Figure 104138281-A0202-12-0392-322
Figure 104138281-A0202-12-0393-323
<210> 101
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11(全長輕鏈1)
<400> 101
Figure 104138281-A0202-12-0394-324
<210> 102
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11(全長輕鏈2)
<400> 102
Figure 104138281-A0202-12-0395-325
<210> 103
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3(全長重鏈)
<400> 103
Figure 104138281-A0202-12-0396-326
Figure 104138281-A0202-12-0397-327
<210> 104
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3(全長輕鏈1)
<400> 104
Figure 104138281-A0202-12-0398-328
<210> 105
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3(全長輕鏈2)
<400> 105
Figure 104138281-A0202-12-0399-329
<210> 106
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3(全長輕鏈3)
<400> 106
Figure 104138281-A0202-12-0399-330
Figure 104138281-A0202-12-0400-331
<210> 107
<211> 448
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4(全長重鏈)
<400> 107
Figure 104138281-A0202-12-0400-332
Figure 104138281-A0202-12-0401-333
Figure 104138281-A0202-12-0402-334
<210> 108
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4(全長輕鏈1)
<400> 108
Figure 104138281-A0202-12-0402-335
Figure 104138281-A0202-12-0403-337
<210> 109
<211> 448
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2(全長重鏈)
<400> 109
Figure 104138281-A0202-12-0403-338
Figure 104138281-A0202-12-0404-339
Figure 104138281-A0202-12-0405-340
<210> 110
<211> 213
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2(全長輕鏈1)
<400> 110
Figure 104138281-A0202-12-0405-341
Figure 104138281-A0202-12-0406-342
<210> 111
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2(全長輕鏈2)
<400> 111
Figure 104138281-A0202-12-0406-343
Figure 104138281-A0202-12-0407-344
<210> 112
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6(全長重鏈)
<400> 112
Figure 104138281-A0202-12-0407-345
Figure 104138281-A0202-12-0408-346
Figure 104138281-A0202-12-0409-347
<210> 113
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6(全長輕鏈1)
<400> 113
Figure 104138281-A0202-12-0409-348
Figure 104138281-A0202-12-0410-349
<210> 114
<211> 448
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2(全長重鏈)
<400> 114
Figure 104138281-A0202-12-0410-350
Figure 104138281-A0202-12-0411-351
Figure 104138281-A0202-12-0412-352
<210> 115
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2(全長輕鏈1)
<400> 115
Figure 104138281-A0202-12-0412-353
Figure 104138281-A0202-12-0413-354
<210> 116
<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8(全長重鏈)
<400> 116
Figure 104138281-A0202-12-0413-355
Figure 104138281-A0202-12-0414-356
<210> 117
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8(全長輕鏈1)
<400> 117
Figure 104138281-A0202-12-0415-357
<210> 118
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8(全長輕鏈2)
<400> 118
Figure 104138281-A0202-12-0416-358
<210> 119
<211> 451
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11(全長重鏈)
<400> 119
Figure 104138281-A0202-12-0417-359
Figure 104138281-A0202-12-0418-360
<210> 120
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11(全長輕鏈1)
<400> 120
Figure 104138281-A0202-12-0418-361
Figure 104138281-A0202-12-0419-362
<210> 121
<211> 451
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11(全長重鏈)
<400> 121
Figure 104138281-A0202-12-0419-363
Figure 104138281-A0202-12-0420-364
Figure 104138281-A0202-12-0421-365
<210> 122
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11(全長輕鏈1)
<400> 122
Figure 104138281-A0202-12-0421-366
Figure 104138281-A0202-12-0422-367
<210> 123
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:鉸鏈C219S
<400> 123
Figure 104138281-A0202-12-0422-368
<210> 124
<211> 98
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(98)
<223> IgG2 CH1(野生型)
<400> 124
Figure 104138281-A0202-12-0423-369
<210> 125
<211> 103
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1 CH2+A330S及P331S
<400> 125
Figure 104138281-A0202-12-0423-370
Figure 104138281-A0202-12-0424-371
<210> 126
<211> 330
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(330)
<223> 人類IgG1恆定區
<400> 126
Figure 104138281-A0202-12-0424-372
Figure 104138281-A0202-12-0425-373
<210> 127
<211> 330
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(330)
<223> 人類IgG1恆定區(異型變體)
<400> 127
Figure 104138281-A0202-12-0425-374
Figure 104138281-A0202-12-0426-375
<210> 128
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1 CH3+E356及M358
<400> 128
Figure 104138281-A0202-12-0427-376
<210> 129
<211> 330
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1恆定區
<400> 129
Figure 104138281-A0202-12-0427-377
Figure 104138281-A0202-12-0428-378
<210> 130
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2恆定區
<400> 130
Figure 104138281-A0202-12-0429-379
Figure 104138281-A0202-12-0430-380
<210> 131
<211> 107
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(107)
<223> 人類IgG1 κ輕鏈(CL)
<400> 131
Figure 104138281-A0202-12-0430-381
<210> 132
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:重鏈C末端
<400> 132
Figure 104138281-A0202-12-0431-382
<210> 133
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f,AA序列
<400> 133
Figure 104138281-A0202-12-0431-383
Figure 104138281-A0202-12-0432-384
<210> 134
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.4-IgG2CS-IgG1.1f,NT序列
<400> 134
Figure 104138281-A0202-12-0433-385
<210> 135
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.4 VH(a.a.)
<400> 135
Figure 104138281-A0202-12-0434-386
<210> 136
<211> 18
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(18)
<223> 野生型IgG2鉸鏈
<400> 136
Figure 104138281-A0202-12-0434-387
<210> 137
<211> 103
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(103)
<223> 野生型IgG1 CH2
<400> 137
Figure 104138281-A0202-12-0435-388
<210> 138
<211> 107
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(107)
<223> 野生型IgG1 CH3
<400> 138
Figure 104138281-A0202-12-0435-389
<210> 139
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VH-核苷酸序列
<400> 139
Figure 104138281-A0202-12-0436-390
<210> 140
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK1-核苷酸序列
<400> 140
Figure 104138281-A0202-12-0436-392
<210> 141
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11 VK2-核苷酸序列
<400> 141
Figure 104138281-A0202-12-0436-393
Figure 104138281-A0202-12-0437-394
<210> 142
<211> 360
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VH-核苷酸序列
<400> 142
Figure 104138281-A0202-12-0437-395
<210> 143
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK1-核苷酸序列
<400> 143
Figure 104138281-A0202-12-0437-397
<210> 144
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK2-核苷酸序列
<400> 144
Figure 104138281-A0202-12-0437-398
<210> 145
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3 VK3-核苷酸序列
<400> 145
Figure 104138281-A0202-12-0438-399
<210> 146
<211> 366
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VH-核苷酸序列
<400> 146
Figure 104138281-A0202-12-0438-400
<210> 147
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4 VK1-核苷酸序列
<400> 147
Figure 104138281-A0202-12-0438-401
Figure 104138281-A0202-12-0439-402
<210> 148
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VH1-核苷酸序列
<400> 148
Figure 104138281-A0202-12-0439-403
<210> 149
<211> 318
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK1-核苷酸序列
<400> 149
Figure 104138281-A0202-12-0439-406
<210> 150
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2 VK2-核苷酸序列
<400> 150
Figure 104138281-A0202-12-0439-408
Figure 104138281-A0202-12-0440-410
<210> 151
<211> 360
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VH-核苷酸序列
<400> 151
Figure 104138281-A0202-12-0440-412
<210> 152
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6 VK1-核苷酸序列
<400> 152
Figure 104138281-A0202-12-0440-413
<210> 153
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VH-核苷酸序列
<400> 153
Figure 104138281-A0202-12-0440-414
Figure 104138281-A0202-12-0441-415
<210> 154
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2 VK1-核苷酸序列
<400> 154
Figure 104138281-A0202-12-0441-416
<210> 155
<211> 357
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VH-核苷酸序列
<400> 155
Figure 104138281-A0202-12-0441-417
<210> 156
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK1-核苷酸序列
<400> 156
Figure 104138281-A0202-12-0441-418
Figure 104138281-A0202-12-0442-419
<210> 157
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK2-核苷酸序列
<400> 157
Figure 104138281-A0202-12-0442-422
<210> 158
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VH-核苷酸序列
<400> 158
Figure 104138281-A0202-12-0442-423
<210> 159
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11 VK1-核苷酸序列
<400> 159
Figure 104138281-A0202-12-0442-424
Figure 104138281-A0202-12-0443-425
<210> 160
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VH-核苷酸序列
<400> 160
Figure 104138281-A0202-12-0443-427
<210> 161
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11 VK1-核苷酸序列
<400> 161
Figure 104138281-A0202-12-0443-428
<210> 162
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-IgG2-IgG1f2(MHCCR)
<400> 162
Figure 104138281-A0202-12-0443-429
Figure 104138281-A0202-12-0444-430
Figure 104138281-A0202-12-0445-431
<210> 163
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-IgG2CS-IgG1f2(MHCCR)
<400> 163
Figure 104138281-A0202-12-0445-432
Figure 104138281-A0202-12-0446-433
<210> 164
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2-IgG1f2(MHCCR)
<400> 164
Figure 104138281-A0202-12-0446-434
Figure 104138281-A0202-12-0447-435
<210> 165
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2CS-IgG1f2(MHCCR)
<400> 165
Figure 104138281-A0202-12-0448-436
Figure 104138281-A0202-12-0449-437
<210> 166
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-IgG2-IgG1.1f(MHCCR)
<400> 166
Figure 104138281-A0202-12-0449-438
Figure 104138281-A0202-12-0450-439
<210> 167
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-IgG2CS-IgG1.1f(MHCCR)
<400> 167
Figure 104138281-A0202-12-0450-440
Figure 104138281-A0202-12-0451-441
Figure 104138281-A0202-12-0452-442
<210> 168
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2-IgG1.1f(MHCCR)
<400> 168
Figure 104138281-A0202-12-0452-443
Figure 104138281-A0202-12-0453-444
<210> 169
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2CS-IgG1.1f(MHCCR)
<400> 169
Figure 104138281-A0202-12-0453-445
Figure 104138281-A0202-12-0454-446
<210> 170
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.3 VH(a.a)
<400> 170
Figure 104138281-A0202-12-0455-447
<210> 171
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.5 VH(a.a)
<400> 171
Figure 104138281-A0202-12-0455-448
Figure 104138281-A0202-12-0456-449
<210> 172
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.6 VH(a.a)
<400> 172
Figure 104138281-A0202-12-0456-450
<210> 173
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.7 VH(a.a)
<400> 173
Figure 104138281-A0202-12-0457-451
<210> 174
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.8 VH(a.a)
<400> 174
Figure 104138281-A0202-12-0457-452
Figure 104138281-A0202-12-0458-453
<210> 175
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.9 VH(a.a)
<400> 175
Figure 104138281-A0202-12-0458-454
<210> 176
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.10 VH(a.a)
<400> 176
Figure 104138281-A0202-12-0458-455
Figure 104138281-A0202-12-0459-456
<210> 177
<211> 122
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.11 VH(a.a)
<400> 177
Figure 104138281-A0202-12-0459-457
<210> 178
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2/IgG1雜合鉸鏈
<400> 178
Figure 104138281-A0202-12-0460-458
<210> 179
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2 C219S/IgG1雜合鉸鏈
<400> 179
Figure 104138281-A0202-12-0460-459
<210> 180
<211> 327
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-IgG2-IgG1f
<400> 180
Figure 104138281-A0202-12-0460-460
Figure 104138281-A0202-12-0461-461
<210> 181
<211> 327
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-IgG2CS-IgG1f
<400> 181
Figure 104138281-A0202-12-0462-462
Figure 104138281-A0202-12-0463-463
<210> 182
<211> 327
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2-IgG1f
<400> 182
Figure 104138281-A0202-12-0463-464
Figure 104138281-A0202-12-0464-465
<210> 183
<211> 327
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2CS-IgG1f
<400> 183
Figure 104138281-A0202-12-0464-466
Figure 104138281-A0202-12-0465-467
Figure 104138281-A0202-12-0466-468
<210> 184
<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.3-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 184
Figure 104138281-A0202-12-0466-469
Figure 104138281-A0202-12-0467-470
<210> 185
<211> 445
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.3-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 185
Figure 104138281-A0202-12-0468-471
Figure 104138281-A0202-12-0469-472
<210> 186
<211> 445
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.3-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 186
Figure 104138281-A0202-12-0470-473
Figure 104138281-A0202-12-0471-474
<210> 187
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.4-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 187
Figure 104138281-A0202-12-0471-475
Figure 104138281-A0202-12-0472-476
Figure 104138281-A0202-12-0473-477
<210> 188
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.4-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 188
Figure 104138281-A0202-12-0473-478
Figure 104138281-A0202-12-0474-479
Figure 104138281-A0202-12-0475-480
<210> 189
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.4-Vh-hHC-IgG2-C219S/IgG1.1f(與SEQ ID NO:133一致,只是缺少C末端離胺酸)
<400> 189
Figure 104138281-A0202-12-0475-481
Figure 104138281-A0202-12-0476-482
Figure 104138281-A0202-12-0477-483
<210> 190
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.5-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 190
Figure 104138281-A0202-12-0477-484
Figure 104138281-A0202-12-0478-485
Figure 104138281-A0202-12-0479-486
<210> 191
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.5-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 191
Figure 104138281-A0202-12-0479-487
Figure 104138281-A0202-12-0480-488
<210> 192
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.5-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 192
Figure 104138281-A0202-12-0481-489
Figure 104138281-A0202-12-0482-490
<210> 193
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.6-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 193
Figure 104138281-A0202-12-0482-491
Figure 104138281-A0202-12-0483-492
Figure 104138281-A0202-12-0484-493
<210> 194
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.6-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 194
Figure 104138281-A0202-12-0484-494
Figure 104138281-A0202-12-0485-495
Figure 104138281-A0202-12-0486-496
<210> 195
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.6-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 195
Figure 104138281-A0202-12-0486-497
Figure 104138281-A0202-12-0487-498
Figure 104138281-A0202-12-0488-499
<210> 196
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.7-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 196
Figure 104138281-A0202-12-0488-500
Figure 104138281-A0202-12-0489-501
Figure 104138281-A0202-12-0490-502
<210> 197
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.7-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 197
Figure 104138281-A0202-12-0490-503
Figure 104138281-A0202-12-0491-504
<210> 198
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.7-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 198
Figure 104138281-A0202-12-0492-505
Figure 104138281-A0202-12-0493-506
<210> 199
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.8-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 199
Figure 104138281-A0202-12-0493-507
Figure 104138281-A0202-12-0494-508
Figure 104138281-A0202-12-0495-509
<210> 200
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.8-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 200
Figure 104138281-A0202-12-0495-510
Figure 104138281-A0202-12-0496-511
Figure 104138281-A0202-12-0497-512
<210> 201
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.8-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 201
Figure 104138281-A0202-12-0497-513
Figure 104138281-A0202-12-0498-514
Figure 104138281-A0202-12-0499-515
<210> 202
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.9-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 202
Figure 104138281-A0202-12-0499-516
Figure 104138281-A0202-12-0500-517
Figure 104138281-A0202-12-0501-518
<210> 203
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.9-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 203
Figure 104138281-A0202-12-0501-520
Figure 104138281-A0202-12-0502-521
<210> 204
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.9-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 204
Figure 104138281-A0202-12-0503-522
Figure 104138281-A0202-12-0504-523
<210> 205
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.10-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 205
Figure 104138281-A0202-12-0504-524
Figure 104138281-A0202-12-0505-525
Figure 104138281-A0202-12-0506-526
<210> 206
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.10-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 206
Figure 104138281-A0202-12-0506-528
Figure 104138281-A0202-12-0507-529
Figure 104138281-A0202-12-0508-530
<210> 207
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.10-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 207
Figure 104138281-A0202-12-0508-531
Figure 104138281-A0202-12-0509-532
Figure 104138281-A0202-12-0510-533
<210> 208
<211> 451
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.11-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 208
Figure 104138281-A0202-12-0510-534
Figure 104138281-A0202-12-0511-535
Figure 104138281-A0202-12-0512-536
<210> 209
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.11-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 209
Figure 104138281-A0202-12-0512-537
Figure 104138281-A0202-12-0513-538
Figure 104138281-A0202-12-0514-539
<210> 210
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.11-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 210
Figure 104138281-A0202-12-0514-540
Figure 104138281-A0202-12-0515-541
<210> 211
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.3-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 211
Figure 104138281-A0202-12-0516-542
<210> 212
<211> 1337
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.3-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 212
Figure 104138281-A0202-12-0516-543
Figure 104138281-A0202-12-0517-544
<210> 213
<211> 1338
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.3-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 213
Figure 104138281-A0202-12-0517-545
Figure 104138281-A0202-12-0518-546
<210> 214
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.4-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 214
Figure 104138281-A0202-12-0518-547
Figure 104138281-A0202-12-0519-548
<210> 215
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.4-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 215
Figure 104138281-A0202-12-0519-549
Figure 104138281-A0202-12-0520-550
<210> 216
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.4-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 216
Figure 104138281-A0202-12-0520-551
<210> 217
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.5-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 217
Figure 104138281-A0202-12-0521-552
<210> 218
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.5-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 218
Figure 104138281-A0202-12-0521-553
Figure 104138281-A0202-12-0522-554
<210> 219
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.5-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 219
Figure 104138281-A0202-12-0522-556
Figure 104138281-A0202-12-0523-557
<210> 220
<211> 1254
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.6-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 220
Figure 104138281-A0202-12-0523-558
Figure 104138281-A0202-12-0524-559
<210> 221
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.6-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 221
Figure 104138281-A0202-12-0524-560
<210> 222
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.6-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 222
Figure 104138281-A0202-12-0525-561
<210> 223
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.7-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 223
Figure 104138281-A0202-12-0525-562
Figure 104138281-A0202-12-0526-563
<210> 224
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.7-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 224
Figure 104138281-A0202-12-0526-564
Figure 104138281-A0202-12-0527-565
<210> 225
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.7-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 225
Figure 104138281-A0202-12-0527-566
Figure 104138281-A0202-12-0528-567
<210> 226
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.8-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 226
Figure 104138281-A0202-12-0528-568
Figure 104138281-A0202-12-0529-569
<210> 227
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.8-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 227
Figure 104138281-A0202-12-0529-570
<210> 228
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.8-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 228
Figure 104138281-A0202-12-0530-571
<210> 229
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.9-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 229
Figure 104138281-A0202-12-0530-572
Figure 104138281-A0202-12-0531-573
<210> 230
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.9-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 230
Figure 104138281-A0202-12-0531-574
Figure 104138281-A0202-12-0532-575
<210> 231
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.9-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 231
Figure 104138281-A0202-12-0532-576
Figure 104138281-A0202-12-0533-577
<210> 232
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.10-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 232
Figure 104138281-A0202-12-0533-578
Figure 104138281-A0202-12-0534-579
<210> 233
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.10-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 233
Figure 104138281-A0202-12-0534-580
<210> 234
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.10-Vh-hHC-IgG2-C219S-IgG1.1f
<400> 234
Figure 104138281-A0202-12-0535-581
<210> 235
<211> 1353
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.11-Vh-hHC-IgG1.1f
<400> 235
Figure 104138281-A0202-12-0536-582
<210> 236
<211> 1344
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:mAb-CD73.11-Vh-hHC-IgG2-C219S
<400> 236
Figure 104138281-A0202-12-0536-583
Figure 104138281-A0202-12-0537-584
<210> 237
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.4(VH)核苷酸序列
<400> 237
Figure 104138281-A0202-12-0537-585
<210> 238
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK3
<400> 238
Figure 104138281-A0202-12-0538-586
<210> 239
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK3 CDR1
<400> 239
Figure 104138281-A0202-12-0538-587
<210> 240
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK3 CDR2
<400> 240
Figure 104138281-A0202-12-0538-588
<210> 241
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK3 CDR3
<400> 241
Figure 104138281-A0202-12-0539-589
<210> 242
<211> 357
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8 VK3核苷酸序列
<400> 242
Figure 104138281-A0202-12-0539-590
<210> 243
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11(全長重鏈)NT序列
<400> 243
Figure 104138281-A0202-12-0539-592
Figure 104138281-A0202-12-0540-593
<210> 244
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11(全長輕鏈1)NT序列
<400> 244
Figure 104138281-A0202-12-0540-594
<210> 245
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11F11(全長輕鏈2)NT序列
<400> 245
Figure 104138281-A0202-12-0540-595
Figure 104138281-A0202-12-0541-596
<210> 246
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3(全長重鏈)NT序列
<400> 246
Figure 104138281-A0202-12-0541-597
Figure 104138281-A0202-12-0542-599
<210> 247
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3(全長輕鏈1)NT序列
<400> 247
Figure 104138281-A0202-12-0542-601
<210> 248
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3(全長輕鏈2)NT序列
<400> 248
Figure 104138281-A0202-12-0542-602
<210> 249
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4C3(全長輕鏈3)NT序列
<400> 249
Figure 104138281-A0202-12-0543-603
<210> 250
<211> 1344
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4(全長重鏈)NT序列
<400> 250
Figure 104138281-A0202-12-0543-604
Figure 104138281-A0202-12-0544-605
<210> 251
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:4D4(全長輕鏈1)NT序列
<400> 251
Figure 104138281-A0202-12-0544-606
<210> 252
<211> 1344
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2(全長重鏈)NT序列
<400> 252
Figure 104138281-A0202-12-0544-607
Figure 104138281-A0202-12-0545-608
<210> 253
<211> 639
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2(全長輕鏈1)NT序列
<400> 253
Figure 104138281-A0202-12-0545-609
Figure 104138281-A0202-12-0546-610
<210> 254
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:10D2(全長輕鏈2)NT序列
<400> 254
Figure 104138281-A0202-12-0546-611
<210> 255
<211> 1350
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6(全長重鏈)NT序列
<400> 255
Figure 104138281-A0202-12-0546-613
Figure 104138281-A0202-12-0547-614
<210> 256
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:11A6(全長輕鏈1)NT序列
<400> 256
Figure 104138281-A0202-12-0547-616
<210> 257
<211> 1344
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2(全長重鏈)NT序列
<400> 257
Figure 104138281-A0202-12-0548-617
<210> 258
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:24H2(全長輕鏈1)NT序列
<400> 258
Figure 104138281-A0202-12-0548-618
Figure 104138281-A0202-12-0549-619
<210> 259
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8(全長重鏈)NT序列
<400> 259
Figure 104138281-A0202-12-0549-620
Figure 104138281-A0202-12-0550-621
<210> 260
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8(全長輕鏈1)NT序列
<400> 260
Figure 104138281-A0202-12-0550-622
<210> 261
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:5F8(全長輕鏈2)NT序列
<400> 261
Figure 104138281-A0202-12-0550-623
<210> 262
<211> 1353
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11(全長重鏈)NT序列
<400> 262
Figure 104138281-A0202-12-0551-624
<210> 263
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:6E11(全長輕鏈1)NT序列
<400> 263
Figure 104138281-A0202-12-0551-625
Figure 104138281-A0202-12-0552-626
<210> 264
<211> 1353
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11(全長重鏈)NT序列
<400> 264
Figure 104138281-A0202-12-0552-627
Figure 104138281-A0202-12-0553-628
<210> 265
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:7A11(全長輕鏈1)NT序列
<400> 265
Figure 104138281-A0202-12-0553-629
<210> 266
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:CD73.4.IgG2C219SIgG1.1f替代性NT序列
<400> 266
Figure 104138281-A0202-12-0553-630
Figure 104138281-A0202-12-0554-631
<210> 267
<211> 330
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1f
<400> 267
Figure 104138281-A0202-12-0554-632
Figure 104138281-A0202-12-0555-633
<210> 268
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.3
<400> 268
Figure 104138281-A0202-12-0556-634
Figure 104138281-A0202-12-0557-635
<210> 269
<211> 327
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.3G1-AY
<400> 269
Figure 104138281-A0202-12-0557-636
Figure 104138281-A0202-12-0558-637
<210> 270
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.3G1-KH
<400> 270
Figure 104138281-A0202-12-0558-638
Figure 104138281-A0202-12-0559-639
Figure 104138281-A0202-12-0560-641
<210> 271
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.5
<400> 271
Figure 104138281-A0202-12-0560-642
Figure 104138281-A0202-12-0561-644
<210> 272
<211> 330
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1.1f
<400> 272
Figure 104138281-A0202-12-0561-645
Figure 104138281-A0202-12-0562-646
<210> 273
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.3G1.1f-KH
<400> 273
Figure 104138281-A0202-12-0563-647
Figure 104138281-A0202-12-0564-648
<210> 274
<211> 327
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-deltaTHT
<400> 274
Figure 104138281-A0202-12-0564-649
Figure 104138281-A0202-12-0565-650
<210> 275
<211> 329
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.3-plusTHT
<400> 275
Figure 104138281-A0202-12-0565-651
Figure 104138281-A0202-12-0566-652
Figure 104138281-A0202-12-0567-653
<210> 276
<211> 329
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.3-plusGGG
<400> 276
Figure 104138281-A0202-12-0567-654
Figure 104138281-A0202-12-0568-655
<210> 277
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.5G1.1f-KH
<400> 277
Figure 104138281-A0202-12-0568-656
Figure 104138281-A0202-12-0569-657
<210> 278
<211> 327
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.5G1-AY
<400> 278
Figure 104138281-A0202-12-0570-658
Figure 104138281-A0202-12-0571-659
<210> 279
<211> 326
<212> PRT
<2133> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.5G1-KH
<400> 279
Figure 104138281-A0202-12-0571-660
Figure 104138281-A0202-12-0572-661
<210> 280
<211> 329
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG2.5-plusTHT
<400> 280
Figure 104138281-A0202-12-0572-662
Figure 104138281-A0202-12-0573-663
Figure 104138281-A0202-12-0574-664
<210> 281
<211> 327
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-G2.3G1-AY
<400> 281
Figure 104138281-A0202-12-0574-665
Figure 104138281-A0202-12-0575-666
<210> 282
<211> 326
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:IgG1-G2.3G1-KH
<400> 282
Figure 104138281-A0202-12-0575-668
Figure 104138281-A0202-12-0576-669
<210> 283
<211> 553
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成:來自圖27A之CD73
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1)
<223> Xaa可為任何天然胺基酸
<400> 283
Figure 104138281-A0202-12-0577-670
Figure 104138281-A0202-12-0578-671
Figure 104138281-A0202-12-0579-672
<210> 284
<211> 5
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(5)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 284
Figure 104138281-A0202-12-0579-674
<210> 285
<211> 5
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(5)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 285
Figure 104138281-A0202-12-0579-675
<210> 286
<211> 10
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(10)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 286
Figure 104138281-A0202-12-0579-676
<210> 287
<211> 12
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(12)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 287
Figure 104138281-A0202-12-0580-677
<210> 288
<211> 4
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(4)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 288
Figure 104138281-A0202-12-0580-678
<210> 289
<211> 7
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(7)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 289
Figure 104138281-A0202-12-0580-679
<210> 290
<211> 5
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(5)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 290
Figure 104138281-A0202-12-0580-680
<210> 291
<211> 9
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(9)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 291
Figure 104138281-A0202-12-0581-681
<210> 292
<211> 50
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(50)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 292
Figure 104138281-A0202-12-0581-682
<210> 293
<211> 35
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(35)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 293
Figure 104138281-A0202-12-0581-683
Figure 104138281-A0202-12-0582-684
<210> 294
<211> 20
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(20)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 294
Figure 104138281-A0202-12-0582-685
<210> 295
<211> 41
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(41)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 295
Figure 104138281-A0202-12-0582-686
<210> 296
<211> 11
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(11)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 296
Figure 104138281-A0202-12-0582-688
<210> 297
<211> 5
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(5)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 297
Figure 104138281-A0202-12-0583-689
<210> 298
<211> 7
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(7)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 298
Figure 104138281-A0202-12-0583-690
<210> 299
<211> 6
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(6)
<223> 鉸鏈區胺基酸
<400> 299
Figure 104138281-A0202-12-0583-691

Claims (14)

  1. 一種經分離抗體,其結合至人類分化簇73(CD73)且包含分別包括SEQ ID NO:5、6及7之重鏈CDR1、CDR2及CDR3序列及分別包括SEQ ID NO:13、14及15之輕鏈CDR1、CDR2及CDR3序列,其中該抗體包含重鏈恆定區,其包含人類IgG2鉸鏈及人類IgG2 CH1結構域。
  2. 如請求項1之經分離抗體,其中該鉸鏈結構域相對於野生型人類IgG2鉸鏈結構域(SEQ ID NO:136)包含胺基酸取代C219S(根據Kabat系統之EU指數)。
  3. 如請求項1或2之經分離抗體,其中該重鏈恆定區包含:(a)CH1結構域,其包含SEQ ID NO:124之胺基酸序列;及(b)鉸鏈結構域,其包含SEQ ID NO:123之胺基酸序列。
  4. 如請求項1或2之經分離抗體,其中該抗體包含包括SEQ ID NO:135所載之胺基酸序列的重鏈可變區及包括SEQ ID NO:12所載之胺基酸序列的輕鏈可變區。
  5. 如請求項1或2之經分離抗體,其中該抗體包含包括SEQ ID NO:133或189所載之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:102所載之胺基酸序列的輕鏈。
  6. 如請求項1或2之經分離抗體,其中該重鏈及輕鏈分別為全長重鏈及輕鏈。
  7. 如請求項6之經分離抗體,其係IgG抗體。
  8. 如請求項1或2之經分離抗體,其中該抗體包含包括SEQ ID NO:133所載之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:102所載之胺基酸序列的輕鏈。
  9. 如請求項1或2之經分離抗體,其中該抗體包含包括SEQ ID NO: 189所載之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:102所載之胺基酸序列的輕鏈。
  10. 如請求項1或2之經分離抗體,其係人類抗體且展現以下特性中之一或多者:(a)由表面電漿子共振(SPR)測定以10nM或更小之KD結合至人類CD73;(b)抑制CD73酶活性;(c)藉由抗體介導之CD73內化將CD73內化至腫瘤細胞;及(d)由FACS量測以0.1至10nM或更低之EC50結合至人類CD73。
  11. 如請求項7之經分離抗體,其中該重鏈恆定區進一步包含人類IgG1 CH2結構域,該人類IgG1 CH2結構域相對於野生型人類IgG1 CH2結構域(SEQ ID NO:137)包含胺基酸取代A330S及P331S(根據Kabat系統之EU指數)。
  12. 一種組合物,其包含如請求項1至11中任一項之經分離抗體,及醫藥上可接受之載劑。
  13. 如請求項12之組合物,其進一步包含一或多種其他治療劑。
  14. 如請求項13之組合物,其中該其他治療劑係計畫性細胞死亡蛋白1(PD-1)拮抗劑抗體、計畫性死亡-配位體1(PD-L1)拮抗劑抗體、胞毒T細胞相關蛋白4(CTLA-4)拮抗劑抗體或淋巴球活化基因-3(LAG-3)拮抗劑抗體。
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