TW202222840A - Cd73的抗原結合蛋白及其應用 - Google Patents

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朱向陽
于海佳
韋小越
童玲
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Abstract

本申請係關於一種分離的抗原結合蛋白,其能夠結合CD73。本申請還係關於所述抗原結合蛋白的製備方法和應用。

Description

CD73的抗原結合蛋白及其應用
本申請係關於生物醫藥領域,具體的係關於一種CD73的抗原結合蛋白及其應用。
CD73,也稱NT5E,是一種分子量約為70Kd的細胞外5-核酸酶(NT5E),藉由糖磷脂醯肌醇(GPI)錨定於細胞表面,主要以二聚體形式存在。在正常生理狀態下,CD73可表達於多種組織或器官,如肝臟、大腸、腎臟、脾臟、肺、卵巢、淋巴結等組織。
大量臨床前研究結果顯示,CD73在多種腫瘤細胞表面異常高表達,包括腦膠質瘤,乳腺癌,黑色素瘤,非小細胞肺癌,膀胱癌,卵巢癌,結直腸癌等,且臨床資料顯示CD73的高表達與腫瘤病人的不良預後密切相關,因此CD73可作為多種腫瘤臨床治療及預後的潛在靶標。
但是,目前市面上尚未有針對人CD73的抗體或小分子藥物問世,迫切需要開發更多的靶向腫瘤CD73的藥物,為治療CD73異常表達的癌症提供新的思路和前景。
本申請提供了一種分離的抗原結合蛋白,其表現出一種或多種期望的功能特性,例如其能夠特異性結合CD73或其功能活性片段;其能夠阻止或減少CD73的活化;當與該CD73結合後,該分離的抗原結合蛋白能夠與CD73的第143-157位胺基酸或與其對應的CD73序列、第178-191位胺基酸或與其對應的CD73序列和第381-386位胺基酸或與其對應的CD73序列中的至少一個胺基酸殘基相結合;能夠抑制CD73的酶活性;以及能夠誘導細胞表面CD73的內吞。本申請還提供編碼該分離的抗原結合蛋白的核酸分子、表達載體、宿主細胞和製備該分離的抗原結合蛋白的方法。本申請該分離的抗原結合蛋白可以用於預防和/或治療疾病和/或病症,例如腫瘤。
一方面,本申請提供了一種分離的抗原結合蛋白,其包含HCDR3,該HCDR3包含SEQ ID NO:3所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含HCDR2,該HCDR2包含SEQ ID NO:2所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含HCDR1,該HCDR1包含SEQ ID NO:1所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含LCDR3,該LCDR3包含SEQ ID NO:6所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含LCDR2,該LCDR2包含SEQ ID NO:5所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含LCDR1,該LCDR1包含SEQ ID NO:4所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含H-FR1,該H-FR1的C末端與該HCDR1的N末端直接或間接相連,且該H-FR1包含SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:15或SEQ ID NO:19所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含H-FR2,該H-FR2位於該HCDR1與該HCDR2之間,且該H-FR2包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:21所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含H-FR3,該H-FR3位於該HCDR2與該HCDR3之間,且該H-FR3包含SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:22所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含H-FR4,該H-FR4的N末端與該HCDR3的C末端相連,且該H-FR4包含SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:18所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含L-FR1,該L-FR1的C末端與該LCDR1的N末端直接或間接相連,且該L-FR1包含SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:23所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含L-FR2,該L-FR2位於該LCDR1與該LCDR2之間,且該L-FR2包含SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:24所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含L-FR3,該L-FR3位於該LCDR2與該LCDR3之間,且該L-FR3包含SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:28所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含L-FR4,該L-FR4 的N末端與該LCDR3的C末端相連,且該L-FR4包含SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:26所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含VH,該VH包含SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:33或SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含VL,該VL包含SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:34或SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含選自下述的任一組VH和VL:
1)該VH包含SEQ ID NO:29所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:30所示的胺基酸序列;
2)該VH包含SEQ ID NO:31所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:32所示的胺基酸序列;
3)該VH包含SEQ ID NO:33所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:34所示的胺基酸序列;
4)該VH包含SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列;
5)該VH包含SEQ ID NO:33所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列;以及
6)該VH包含SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:34所示的胺基酸序列。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含抗體重鏈恆定區。
在某些實施方式中,該抗體重鏈恆定區源自人抗體重鏈恆定區。
在某些實施方式中,該抗體重鏈恆定區源自人IgG重鏈恆定區。
在某些實施方式中,該抗體重鏈恆定區源自人IgG1重鏈恆定區。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含抗體輕鏈恆定區。
在某些實施方式中,該抗體輕鏈恆定區源自人Igκ恆定區。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白包含抗體或其抗原結合片段。
在某些實施方式中,該抗原結合片段包括Fab、Fab’、Fv片段、F(ab’)2、F(ab)2、scFv、di-scFv和/或dAb。
在某些實施方式中,該抗體選自下組中的一種或多種:單株抗體、嵌合抗體、人源化抗體和全人源抗體。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白能夠特異性結合CD73或其功能活性片段。
在某些實施方式中,該CD73包括人CD73和/或猴CD73。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白能夠阻止或減少CD73的活化。
在某些實施方式中,當與該CD73結合時,該分離的抗原結合蛋白與SEQ ID NO:40所示的胺基酸序列的第143-157位胺基酸或與其對應的CD73序列、SEQ ID NO:40所示的胺基酸序列的第178-191位胺基酸或與其對應的CD73序列和SEQ ID NO:40所示的胺基酸序列的第381-386位胺基酸或與其對應的CD73序列中的至少一個胺基酸殘基相結合。
在某些實施方式中,該第143-157位胺基酸或與其對應的CD73序列位於該CD73的N端結構域,該第178-191位胺基酸或與其對應的CD73序列位於該CD73的N端結構域,且該第381-386位胺基酸或與其對應的CD73序列位於該CD73的C端結構域。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白能夠抑制CD73的酶活性。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白能夠誘導細胞表面CD73的內吞。
另一方面,本申請還提供了一種多肽分子,其包含該分離的抗原結合蛋白。
在某些實施方式中,該多肽分子包含融合蛋白。
另一方面,本申請還提供了一種分離的核酸分子,其編碼該分離的額抗原結合蛋白或該多肽分子。
另一方面,本申請還提供了一種載體,其包含該核酸分子。
另一方面,本申請還提供了一種細胞,其包含該核酸分子和/或該載體。
另一方面,本申請還提供了一種免疫綴合物,其包含該分離的抗原結合蛋白。
另一方面,本申請還提供了一種醫藥組成物,其包含該分離的抗原結合蛋白,該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞和/或該免疫綴合物,以及視需要地藥學上可接受的載劑。
另一方面,本申請還提供了一種製備該分離的抗原結合蛋白的方 法,其包括在使得該分離的抗原結合蛋白表達的條件下,培養該細胞。
另一方面,本申請還提供了該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物在製備藥物中的用途,該藥物用於預防和/或治療疾病和/或病症。
另一方面,本申請還提供了預防和/或治療疾病和/或病症的方法,該方法可以包括向有需要的受試者施用本申請該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物。
另一方面,本申請該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物,其可以用於預防和/或治療疾病和/或病症。
在某些實施方式中,該疾病和/或病症是CD73介導的疾病和/或病症。
在某些實施方式中,該疾病和/或病症包括腫瘤。
在某些實施方式中,該腫瘤包括實體瘤和/或血液瘤。
在某些實施方式中,該疾病和/或病症包括乳腺癌。
另一方面,本申請還提供了檢測樣品中CD73的方法,其包括施用該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物。
另一方面,本申請還提供了檢測樣品中CD73的試劑或試劑盒,其包含該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物。
另一方面,本申請還提供了該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、 該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物在製備試劑盒中的用途,該試劑盒用於檢測樣品中CD73的存在和/或含量。
所屬技術領域具有通常知識者能夠從下文的詳細描述中容易地洞察到本申請的其它方面和優勢。下文的詳細描述中僅顯示和描述了本申請的示例性實施方式。如所屬技術領域具有通常知識者將認識到的,本申請的內容使得所屬技術領域具有通常知識者能夠對所公開的實施方式進行改動而不脫離本申請所係關於發明的精神和範圍。相應地,本申請的圖式和說明書中的描述僅僅是示例性的,而非為限制性的。
本申請所係關於的發明的具體特徵如所附申請專利範圍所顯示。藉由參考下文中詳細描述的示例性實施方式和圖式能夠更好地理解本申請所係關於發明的特點和優勢。對圖式簡要說明書如下:
圖1顯示的是本申請該抗原結合蛋白900581、900565與細胞表面CD73的結合活性。
圖2顯示的是本申請該抗原結合蛋白900581、900694-900698與細胞表面CD73的結合活性。
圖3顯示的是本申請該抗原結合蛋白900581、900694-900698對重組CD73的酶活性的抑制。
圖4顯示的是本申請該抗原結合蛋白900581、900565對細胞表面CD73的酶活性的抑制。
圖5顯示的是本申請該抗原結合蛋白900581、900697和900698對細 胞表面CD73的酶活性的抑制。
圖6顯示的是本申請該抗原結合蛋白900581誘導細胞表面CD73內吞的效率。
圖7顯示的是本申請該抗原結合蛋白結合表位元的結構模型。
圖8顯示的是本申請該抗原結合蛋白與900609的競爭結合活性。
圖9顯示的是本申請該抗原結合蛋白的體內治療腫瘤的效果。
圖10顯示的是本申請該抗原結合蛋白的體內治療腫瘤的效果。
以下由特定的具體實施例說明本申請發明的實施方式,熟悉此技術的人士可由本說明書所公開的內容容易地瞭解本申請發明的其他優點及效果。
術語定義
在本申請中,術語“CD73”也稱“NT5E”、“分化簇73”、“5’-核苷酸酶(5’-NT)”或“胞外5’-核苷酸酶”。該術語涵蓋“全長”、未加工的CD73以及由細胞加工所產生的任何形式的CD73。在本申請中,術語“CD73”包括全長野生型CD73及其突變體、片段、變體、同種型和同源物。在某些實施方式中,該CD73可以包括人CD73。例如針對人CD73的序列可以見Uniprot登錄號P21589下。在本申請中,該CD73可以包含如SEQ ID NO:40所示的胺基酸序列。
在本申請中,術語“分離的”通常指從天然狀態下經人工手段獲得的。如果自然界中出現某一種“分離”的物質或成分,那麼可能是其所處的天然環境發生了改變,或從天然環境下分離出該物質,或二者情況均有發生。例如,某 一活體動物體內天然存在某種未被分離的多聚核苷酸或多肽,而從這種天然狀態下分離出來的高純度的相同的多聚核苷酸或多肽即稱之為分離的。術語“分離的”不排除混有人工或合成的物質,也不排除存在不影響物質活性的其它不純物質。
在本申請中,術語“分離的抗原結合蛋白”通常指脫離了其天然存在狀態的具有抗原結合能力的蛋白。該“分離的抗原結合蛋白”可以包含結合抗原的部分和視需要地,允許抗原結合部分採用促進該抗原結合部分結合抗原的構象的框架或構架部分。抗原結合蛋白可以包含例如抗體來源的蛋白框架區(FR)或具有移植的CDR或CDR衍生物的備選蛋白框架區或人工框架區。此類框架包括,但不限於包含被引入例如以穩定抗原結合蛋白的三維結構的突變的抗體來源的框架區以及包含例如生物相容性聚合物的完全合成的框架區。參見例如Korndorfer等,2003,Proteins:Structure,Function,andBioinformatics,53(1):121-129(2003);Roque等,Biotechnol.Prog.20:639-654(2004)。抗原結合蛋白的實例包括但不限於:人抗體、人源化抗體;嵌合抗體;重組抗體;單鏈抗體;雙功能抗體;三功能抗體;四功能抗體;Fab、Fab’、Fv片段、F(ab’)2、F(ab)2、scFv、di-scFv、dAb、IgD抗體;IgE抗體;IgM抗體;IgG1抗體;IgG2抗體;IgG3抗體;或IgG4抗體以及其片段。
在本申請中,術語“CDR”也稱“互補決定區”,通常指抗體可變結構域中的區域,其序列是高度可變的和/或形成結構定義環。通常,抗體包括六個CDR;在VH中三個(HCDR1、HCDR2、HCDR3),和在VL中三個(LCDR1、LCDR2、LCDR3)。在某些實施方案中,僅由重鏈組成的天然存在的駱駝抗體在缺乏輕鏈的情況下,其功能也能夠正常且穩定。參見,例如,Hamers-Casterman et al.,Nature 363:446-448(1993);Sheriff et al,Nature Struct.Biol.3:733-736(1996)。抗體CDR可以藉由多種編碼系統來確定,如CCG、Kabat、Chothia、IMGT、綜合考慮Kabat/Chothia等。這些編碼系統為本領域內已知,具體可參見,例如,http://www.bioinf.org.uk/abs/index.html#kabatnum。例如,該抗原結合蛋白的胺基酸序列編號可以按照IMGT編號方案(IMGT,the international ImMunoGeneTics information system@imgt.cines.fr;http://imgt.cines.fr;Lefranc等,1999,Nucleic Acids Res.27:209-212;Ruiz等,2000 Nucleic Acids Res.28:219-221;Lefranc等,2001,Nucleic Acids Res.29:207-209;Lefranc等,2003,Nucleic Acids Res.31:307-310;Lefranc等,2005,DevComp Immunol 29:185-203)。例如,該抗原結合蛋白的CDR可以根據Kabat編號系統確定(參見例如Kabat EA &Wu TT(1971)Ann NY AcadSci 190:382-391和Kabat EAet al.,(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,FifthEdition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242)。
在本申請中,術語“FR”通常指抗體可變結構域的更高度保守的部分,其被稱為框架區。通常,天然重鏈和輕鏈的可變結構域各自包含四個FR區,即在VH中四個(H-FR1、H-FR2、H-FR3和H-FR4),和在VL中四個(L-FR1、L-FR2、L-FR3和L-FR4)。
在本申請中,術語“可變結構域”與“可變區”可以互換使用,通常指抗體重鏈和/或輕鏈的一部分。重鏈和輕鏈的可變結構域可以分別稱為“VH”和“VL”(或者分別稱為“VH”和“VL”)。這些結構域通常是抗體的變化最大的部分(相對於相同類型的其它抗體),且包含抗原結合位點。
在本申請中,術語“可變”通常指在抗體之間可變結構域的某些區 段在序列上可能存在較大差異。可變結構域介導抗原結合並決定特定抗體對其特定抗原的特異性。然而,可變性並非在整個可變結構域範圍內均勻分佈。它通常集中在輕鏈和重鏈可變結構域中稱為高變區(CDR或HVR)的三個區段中。可變結構域的更高度保守的部分稱為框架區(FR)。天然重鏈和輕鏈的可變結構域各自包含四個FR區,大多數採用β-折疊構型,藉由三個CDR連接,其形成環形連接,並且在一些情況下形成β-折疊結構的一部分。每條鏈中的CDR藉由FR區緊密靠近地保持在一起,並且來自另一條鏈的CDR一同促進抗體的抗原結合位點的形成(參見Kabat et al,Sequences of Immunological Interest,Fifth Edition,National Institute of Health,Bethesda,Md.(1991))。
在本申請中,術語“抗體”通常指免疫球蛋白或其片段或其衍生物,涵蓋包括抗原結合位點的任何多肽,無論其是在體外還是體內產生的。該術語包括但不限於多株的、單株的、單特異性的、多特異性的、非特異性的、人源化的、單鏈的、嵌合的、合成的、重組的、雜化的、突變的和移植的抗體。除非另外被術語“完整的”修飾,如在“完整的抗體”中,為了本發明的目的,術語“抗體”也包括抗體片段,比如Fab、F(ab')2、Fv、scFv、Fd、dAb和保持抗原結合功能(例如,特異性結合人CD73)的其它抗體片段。通常,這樣的片段應當包括抗原結合結構域。基本的4鏈抗體單元是由兩個相同的輕(L)鏈和兩個相同的重(H)鏈組成的異四聚體糖蛋白。IgM抗體由5個基本的異四聚體單元與另外一個稱為J鏈的多肽組成,且含有10個抗原結合位點,而IgA抗體包括2-5個可以與J鏈相結合聚合形成多價組合的基本4鏈單元。就IgG而言,4鏈單元一般為約150,000道爾頓。每個L鏈藉由一個共價二硫鍵與H鏈連接,而兩個H鏈藉由一個或多個取決於H鏈同種型的二硫鍵相互連接。每個H和L鏈還具有規則間隔的鏈內二硫化橋鍵。每個H鏈 在N末端具有可變結構域(VH),對於α和γ鏈各自繼之以三個恆定結構域(CH)、對於μ和ε同種型繼之以四個CH結構域。每個L鏈在N末端具有可變結構域(VL),在其另一端具有恆定結構域。VL與VH對應,且CL與重鏈的第一恆定結構域(CH1)相對應。特定的胺基酸殘基被認為在輕鏈和重鏈可變結構域之間形成介面。VH和VL配對一起形成單個抗原結合位點。對於不同類別抗體的結構和性質,參見例如Basic and Clinical Immunology,8th Edition,Daniel P.Sties,Abba I.Terr and Tristram G.Parsolw(eds),Appleton & Lange,Norwalk,Conn.,1994,第71頁和第6章。來自任何脊椎動物物種的L鏈可以基於其恆定結構域的胺基酸序列被分為兩種明顯不同的類型中的一種,稱為κ和λ。根據重鏈(CH)恆定結構域的胺基酸序列,可以將免疫球蛋白分為不同的類別或同種型。目前存在五類免疫球蛋白:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,具有分別被命名為α、δ、ε、γ和μ的重鏈。
在本申請中,術語“抗原結合片段”通常指具有特異結合抗原(例如,CD73)能力的一個或多個片段。在本申請中,該抗原結合片段可以包括Fab,Fab’,F(ab)2、Fv片段、F(ab’)2,scFv,di-scFv和/或dAb。
在本申請中,術語“Fab”通常指抗體的抗原結合片段。如上所述,可以使用木瓜蛋白酶消化完整的抗體。抗體經木瓜蛋白酶消化後產生兩個相同的抗原結合片段,即“Fab”片段,和殘餘的“Fc”片段(即Fc區,同上)。Fab片段可以由一條完整的L鏈與一條重鏈的可變區和該H鏈(VH)的第一恆定區(CH1)組成。
在本申請中,術語“Fab'片段”通常指人單株抗體的單價抗原結合片段,該片段比Fab片段稍大。例如,Fab'片段可以包括所有輕鏈,所有重鏈可變區以及重鏈的所有或部分第一和第二恆定區。例如,Fab'片段還可包括重鏈的部分或所有的220-330個胺基酸殘基。
在本申請中,術語“F(ab')2”通常指藉由胃蛋白酶消化完整抗體所產生的抗體片段。F(ab')2片段含有由二硫鍵維持在一起的兩個Fab片段和部分鉸鏈區。F(ab')2片段具有二價抗原結合活性並且能夠交聯抗原。
在本申請中,術語“Fv片段”通常指人單株抗體的單價抗原結合片段,包括所有或部分重鏈可變區和輕鏈可變區,並且缺乏重鏈恆定區和輕鏈恆定區。重鏈可變區和輕鏈可變區包括例如CDR。例如,Fv片段包括重鏈和輕鏈的約110個胺基酸的所有或部分胺基端可變區。
在本申請中,術語“scFv”通常指包含至少一個包括輕鏈的可變區抗體片段和至少一個包括重鏈的可變區的抗體片段的融合蛋白,其中該輕鏈和重鏈可變區是鄰接的(例如經由合成接頭例如短的柔性多肽接頭),並且能夠以單鏈多肽形式表達,且其中該scFv保留其所來源的完整抗體的特異性。除非特別說明,否則如本申請中使用的那樣,scFv可以以任何順序(例如相對於多肽的N末端和C末端)具有該VL和VH可變區,scFv可以包括VL-接頭-VH或可以包括VH-接頭-VL。
在本申請中,術語“dAb”通常是指具有VH域、VL域或具有VH域或VL域的抗原結合片段,參考例如Ward等人(Nature,1989Oct 12;341(6242):544-6),參考Holt等人,Trends Biotechnol.,2003,21(11):484-490;以及參考例如WO 06/030220、WO 06/003388和DomantisLtd的其它公佈的專利申請。
在本申請中,術語“單株抗體”通常指單分子組成的抗體分子製備物。單株抗體通常針對單個抗原位點具有高度特異性。而且,與常規多株抗體製劑(通常具有針對不同決定簇的不同抗體)不同,各單株抗體是針對抗原上的單個決定簇。除了它們的特異性之外,單株抗體的優點在於它們可以藉由融合瘤培 養合成,不受其他免疫球蛋白污染。修飾語“單株”表示從基本上同質的抗體群體獲得的抗體的特徵,並且不被解釋為需要藉由任何特定方法產生抗體。例如,本申請使用的單株抗體可以在融合瘤細胞中製備,或者可以藉由重組DNA方法製備。
在本申請中,術語“嵌合抗體”通常是指其中可變區源自一個物種,而恆定區源自另一個物種的抗體。通常,可變區源自實驗動物諸如齧齒動物的抗體(“親本抗體”),且恆定區源自人類抗體,使得所得嵌合抗體與親本(例如小鼠來源)抗體相比,在人類個體中引發不良免疫反應的可能性降低。
在本申請中,術語“人源化抗體”通常是指非人抗體(例如小鼠抗體)的CDR區以外的部分或全部有的胺基酸被源自人免疫球蛋白的相應的胺基酸置換的抗體。在CDR區中,胺基酸的小的添加、缺失、插入、置換或修飾也可以是允許的,只要它們仍保留抗體結合特定抗原的能力。人源化抗體可視需要地包含人類免疫球蛋白恆定區的至少一部分。“人源化抗體”保留類似於原始抗體的抗原特異性。非人(例如鼠)抗體的“人源化”形式可以最低限度地包含衍生自非人免疫球蛋白的序列的嵌合抗體。在某些情形中,可以將人免疫球蛋白(受體抗體)中的CDR區殘基用具有所期望性質、親和力和/或能力的非人物種(供體抗體)(諸如小鼠、大鼠、家兔或非人靈長類動物)的CDR區殘基替換。在某些情形中,可以將人免疫球蛋白的FR區殘基用相應的非人殘基替換。此外,人源化抗體可包含在受體抗體中或在供體抗體中沒有的胺基酸修飾。進行這些修飾可以是為了進一步改進抗體的性能,諸如結合親和力。
術語“全人源抗體”通常指僅包含人類免疫球蛋白蛋白質序列的抗體。如果其是在小鼠中、在小鼠細胞中或在衍生自小鼠細胞的融合瘤中生產,那 麼全人源抗體可能含有鼠糖鏈。類似地,“小鼠抗體”或“大鼠抗體”分別指僅包含小鼠或大鼠免疫球蛋白序列的抗體。可藉由噬菌體展示或其它分子生物學方法,在人體內、在具有人類免疫球蛋白種系序列的轉基因動物體內生成全人源抗體。可用於製造抗體的示例性技術在美國專利:6,150,584、6,458,592、6,420,140中描述。其它技術,如使用文庫,是本領域已知的。
在本申請中,術語“多肽分子”和“多肽”、“肽”可以互換使用,通常指胺基酸殘基的聚合物。術語“融合蛋白”通常指具有至少兩個共價連接在一起的部分的多肽。其中每個部分可以是具有不同特性的多肽。該特性可以是生物學性質,例如體外或體內活性。該性質也可以是簡單的化學或物理性質,例如與靶分子的結合,反應的催化等。這兩個部分可以藉由單個肽鍵或藉由肽接頭直接連接。
在本申請中,術語“核酸分子”通常指任何長度的分離形式的核苷酸,去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸,或從其天然環境分離的或人工合成的類似物。
在本申請中,術語“載體”通常指可將編碼某蛋白的多聚核苷酸插入其中並使蛋白獲得表達的一種核酸運載工具。載體可藉由轉化、轉導或轉染宿主細胞,使其攜帶的遺傳物質元件在宿主細胞內表達得以表達。舉例來說,載體可以包括:質粒;噬菌粒;柯斯質粒;人工染色體如酵母人工染色體(YAC)、細菌人工染色體(BAC)或P1來源的人工染色體(PAC);噬菌體如λ噬菌體或M13噬菌體及動物病毒等。用作載體的動物病毒種類可以包括逆轉錄酶病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相關病毒、皰疹病毒(如單純皰疹病毒)、痘病毒、杆狀病毒、乳頭瘤病毒、乳頭多瘤空泡病毒(如SV40)。一種載體可能含有多種 控制表達的元件,包括啟動子序列、轉錄起始序列、增強子序列、選擇元件及報告基因。另外,載體還可含有複製起始位點。載體還有可能包括有協助其進入細胞的成分,如病毒顆粒、脂質體或蛋白外殼,但不僅僅只有這些物質。
在本申請中,術語“細胞”通常指可以是或已經是受試者質粒或載體的接受者的單個細胞、細胞系或細胞培養物,其包括本發明所述的核酸分子或本發明所述的載體。細胞可以包括單個細胞的後代。由於天然、偶然或有意的突變,後代可以不一定與原始母細胞完全相同(在總DNA互補體的形態上或在基因組上)。細胞可包括用本申請所述的載體在體外轉染的細胞。細胞可以是細菌細胞(例如,大腸桿菌)、酵母細胞或其它真核細胞,例如COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、CHO-K1細胞、LNCAP細胞、HeLa細胞、HEK293細胞、COS-1細胞、NS0細胞。在某些實施方案中,細胞為哺乳動物細胞。在某些實施方案中,哺乳動物細胞為HEK293細胞。
在本申請中,術語“免疫綴合物”通常指該其他試劑(例如,化療劑、放射性元素、細胞生長抑制劑和細胞毒性劑)與該抗體或其抗原結合片段綴合(例如,藉由連接分子共價相連)而形成的綴合物,該綴合物可以藉由該抗體或其抗原結合片段與靶細胞上的抗原特異性結合,將該其他試劑遞送至靶細胞(例如,腫瘤細胞)。
在本申請中,術語“醫藥組成物”通常指用於預防/治療疾病或病症的組成物。該醫藥組成物可以包含本申請所述的分離的抗原結合蛋白、本申請所述的核酸分子、本申請所述的載體和/或本申請所述的細胞,以及視需要地藥學上可接受的佐劑。此外,該醫藥組成物還可以包含一種或多種(藥學上有效的)載劑、穩定劑、賦形劑、稀釋劑、增溶劑、表面活性劑、乳化劑和/或防腐劑的合 適的製劑。組成物的可接受成分在所用劑量和濃度下較佳地對接受者無毒。本發明的醫藥組成物包括但不限於液體、冷凍和凍乾組成物。
在本申請中,術語“藥學上可接受的載劑”通常包括藥劑學可接受的載體、賦形劑或穩定劑,它們在所採用的劑量和濃度對暴露於其的細胞或哺乳動物是無毒的。生理學可接受的載體可包括例如緩衝劑、抗氧化劑、低分子量(少於約10個殘基)多肽、蛋白質、親水性聚合物、胺基酸、單糖、二糖和其它碳水化合物、螯合劑、糖醇、成鹽反荷離子、例如鈉;和/或非離子表面活性劑。
在本申請中,術語“特異性結合”或“特異性的”通常指可測量的和可再現的相互作用,例如靶標和抗體之間的結合,可在分子(包括生物分子)的異質群體存在的情況決定靶標的存在。例如,特異性結合靶標(其可以為表位)的抗體可以是以比它結合其它靶標更大的親和性、親合力、更容易、和/或以更大的持續時間結合該靶標的抗體。在某些實施方案中,抗體特異性結合蛋白質上的表位,該表位在不同種屬的蛋白質中是保守的。在某些實施方案中,特異性結合可以包括但不要求排他性地結合。
在本申請中,術語“受試者”通常指人類或非人類動物,包括但不限於貓、狗、馬、豬、奶牛、羊、兔、小鼠、大鼠或猴。
術語“腫瘤”通常指任何新的病理性的組織增生。腫瘤細胞可以局部地或藉由血流和淋巴系統擴散到身體其他部分。在本申請中,該腫瘤可以包括良性腫瘤和惡性腫瘤。在本申請中,該腫瘤可以包括實體瘤和/或血液瘤。在本申請中,該腫瘤可以包括癌症。在本申請中,該腫瘤的實例包括但不限於:腦膠質瘤、乳腺癌、黑色素瘤、非小細胞肺癌、膀胱癌、卵巢癌和結直腸癌。
在本申請中,術語“活化”通常指從無活性狀態向有活性狀態的轉 化。在某些實施方式中,阻止或減少CD73的活化可以指阻止或減少CD73從無催化活性的開放構象向催化活性的封閉構象的轉化。
在本申請中,術語“減少”通常指與原水準相比,在數量和/或程度上的降低。例如,該減少CD73的活化可以指與該分離的抗原結合蛋白不存在的情況下相比,將CD73的活化減少至少約0.5倍、至少約1倍、至少約1.5倍、至少約2倍、至少約5倍、至少約10倍、至少約20倍、至少約30倍、至少約40倍、至少約50倍、至少約60倍、至少約70倍、至少約80倍、至少約90倍或至少約100倍。
在本申請中,係關於的蛋白質、多肽和/或胺基酸序列,還應理解為至少包含以下的範圍:與該蛋白質或多肽具備相同或類似功能的變體或同源物。
在本申請中,該變體可以為,例如在該蛋白質和/或該多肽(例如,特異性結合CD73蛋白的抗體或其片段)的胺基酸序列中經過取代、缺失或添加一個或多個胺基酸的蛋白質或多肽。例如,該功能性變體可包含已經藉由至少1個,例如1-30個、1-20個或1-10個,又例如1個、2個、3個、4個或5個胺基酸取代、缺失和/或插入而具有胺基酸改變的蛋白質或多肽。該功能性變體可基本上保持改變(例如取代、缺失或添加)之前的該蛋白質或該多肽的生物學特性。例如,該功能性變體可保持改變之前的該蛋白質或該多肽的至少60%,70%,80%,90%,或100%的生物學活性(例如抗原結合能力)。例如,該取代可以為保守取代。
在本申請中,該同源物可以為與該蛋白質和/或該多肽(例如,特異性結合CD73蛋白的抗體或其片段)的胺基酸序列具有至少約85%(例如,具有至少約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或更高的)序列同源性的蛋白質或多肽。
在本申請中,該同源性通常是指兩個或多個序列之間的相似性、類似或關聯。可以藉由以下方式計算“序列同源性百分比”:將兩條待比對的序列在比較窗中進行比較,確定兩條序列中存在相同核酸鹼基(例如,A、T、C、G、I)或相同胺基酸殘基(例如,Ala、Pro、Ser、Thr、Gly、Val、Leu、Ile、Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg、His、Asp、Glu、Asn、Gln、Cys和Met)的位置的數目以得到匹配位置的數目,將匹配位置的數目除以比較窗中的總位置數(即,窗大小),並且將結果乘以100,以產生序列同源性百分比。為了確定序列同源性百分數而進行的比對,可以按本領域已知的多種方式實現,例如,使用可公開獲得的電腦軟體如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體。所屬技術領域具有通常知識者可以確定用於比對序列的適宜參數,包括為實現正在比較的全長序列範圍內或目標序列區域內最大比對所需要的任何演算法。該同源性也可以藉由以下的方法測定:FASTA和BLAST。對FASTA演算法的描述可以參見W.R.Pearson和D.J.Lipman的“用於生物學序列比較的改進的工具”,美國國家科學院院刊(Proc.Natl.Acad.Sci.),85:2444-2448,1988;和D.J.Lipman和W.R.Pearson的“快速靈敏的蛋白質相似性搜索”,Science,227:1435-1441,1989。對BLAST演算法的描述可參見S.Altschul、W.Gish、W.Miller、E.W.Myers和D.Lipman的“一種基本的局部對比(alignment)搜索工具”,分子生物學雜誌,215:403-410,1990。
在本申請中,術語“包括”通常是指包含、總括、含有或包涵的含義。在某些情況下,也表示“為”、“由......組成”的含義。
在本申請中,術語“約”通常是指在指定數值以上或以下0.5%-10%的範圍內變動,例如在指定數值以上或以下0.5%、1%、1.5%、2%、2.5%、3%、 3.5%、4%、4.5%、5%、5.5%、6%、6.5%、7%、7.5%、8%、8.5%、9%、9.5%、或10%的範圍內變動。
發明詳述
分離的抗原結合蛋白
抗體的CDR又稱互補決定區,是可變區的一部分。該區域的胺基酸殘基可以與抗原或抗原表位接觸。抗體CDR可以藉由多種編碼系統來確定,如CCG、Kabat、Chothia、IMGT、綜合考慮Kabat/Chothia等。這些編碼系統為本領域內已知,具體可參見,例如,http://www.bioinf.org.uk/abs/index.html#kabatnum。所屬技術領域具有通常知識者可以根據抗體的序列和結構,用不同的編碼系統確定出CDR區。使用不同的編碼系統,CDR區可能存在差別。在本申請中,該CDR涵蓋根據任何CDR劃分方式劃分得到的CDR序列;也涵蓋其變體,該變體包括該CDR的胺基酸序列經過取代、缺失和/或添加一個或多個胺基酸。例如1-30個、1-20個或1-10個,又例如1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個或9個胺基酸取代、缺失和/或插入;也涵蓋其同源物,該同源物可以為與該CDR的胺基酸序列具有至少約85%(例如,具有至少約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或更高的)序列同源性的胺基酸序列。在某些實施方式中,該CDR由IMGT編號方案來確定。
一方面,本申請提供了一種分離的抗原結合蛋白,其包含HCDR3,該HCDR3可以包含如SEQ ID NO:3所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白還可以包含HCDR2,該HCDR2可以包含如SEQ ID NO:2所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白還可以包含HCDR1,該 HCDR1可以包含如SEQ ID NO:1所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含HCDR3,HCDR2和HCDR1。例如,該分離的抗原結合蛋白的HCDR3可以包含SEQ ID NO:3所示的胺基酸序列,HCDR2可以包含SEQ ID NO:2所示的胺基酸序列,且HCDR1可以包含SEQ ID NO:1所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含LCDR3,該LCDR3可以包含如SEQ ID NO:6所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白還可以包含LCDR2,該LCDR2可以包含如SEQ ID NO:5所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白還可以包含LCDR1,該LCDR1可以包含如SEQ ID NO:4所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含LCDR3,LCDR2和LCDR1。例如,該分離的抗原結合蛋白的LCDR3可以包含SEQ ID NO:6所示的胺基酸序列,LCDR2可以包含SEQ ID NO:5所示的胺基酸序列,且LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含HCDR3,HCDR2,HCDR1,LCDR3,LCDR2和LCDR1。例如,本申請所述的分離的抗原結合蛋白HCDR3可以包含SEQ ID NO:3所示的胺基酸序列,HCDR2可以包含SEQ ID NO:2所示的胺基酸序列,HCDR1可以包含SEQ ID NO:1所示的胺基酸序列,LCDR3可以包含SEQ ID NO:6所示的胺基酸序列,LCDR2可以包含SEQ ID NO:5所示的胺基酸序列,且LCDR1可以包含SEQ ID NO:4所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含H-FR1,該H-FR1的 C末端可以與該HCDR1的N末端直接或間接相連,該H-FR1可以包含如SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:15或SEQ ID NO:19所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含H-FR2,該H-FR2可以位於該HCDR1與該HCDR2之間,該H-FR2可以包含如SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:21所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含H-FR3,該H-FR3可以位於該HCDR2與該HCDR3之間,該H-FR3可以包含如SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:22所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含H-FR4,該H-FR4的N末端可以與該HCDR3的C末端相連,該H-FR4可以包含如SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:18所示的胺基酸序列。
在本申請中,該抗原結合蛋白可以包含H-FR1,H-FR2,H-FR3和H-FR4。例如,該分離的抗原結合蛋白的H-FR1,H-FR2,H-FR3和H-FR4可分別依次包含SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示的胺基酸序列。例如,該分離的抗原結合蛋白的H-FR1,H-FR2,H-FR3和H-FR4可分別依次包含SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18所示的胺基酸序列。例如,該分離的抗原結合蛋白的H-FR1,H-FR2,H-FR3和H-FR4可分別依次包含SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:18所示的胺基酸序列。例如,該分離的抗原結合蛋白的H-FR1,H-FR2,H-FR3和H-FR4可分別依次包含SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:18所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含L-FR1,該L-FR1的 C末端可以與該LCDR1的N末端直接或間接相連,該L-FR1可以包含如SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:23所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含L-FR2,該L-FR2可以位於該LCDR1與該LCDR2之間,該L-FR2可以包含如SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:24所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含L-FR3,該L-FR3可以位於該LCDR2與該LCDR3之間,該L-FR3可以包含如SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:28所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含L-FR4,該L-FR4的N末端可以與該LCDR3的C末端相連,該L-FR4可以包含如SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:26所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含L-FR1,L-FR2,L-FR3和L-FR4。例如,該分離的抗原結合蛋白的L-FR1,L-FR2,L-FR3和L-FR4可分別依次包含SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示的胺基酸序列。例如,該分離的抗原結合蛋白的L-FR1,L-FR2,L-FR3和L-FR4可分別依次包含SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26所示的胺基酸序列。例如,該分離的抗原結合蛋白的L-FR1,L-FR2,L-FR3和L-FR4可分別依次包含SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:26所示的胺基酸序列。例如,該分離的抗原結合蛋白的L-FR1,L-FR2,L-FR3和L-FR4可分別依次包含SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:28和SEQ ID NO:26所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可包含VH,該VH可以包含 SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:33或SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可包含VL,該VL可以包含SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:34或SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可包含該VH和VL。在某些實施方式中,該VH可以包含SEQ ID NO:29所示的胺基酸序列,且該VL可以包含SEQ ID NO:30所示的胺基酸序列。在某些實施方式中,該VH可以包含SEQ ID NO:31所示的胺基酸序列,且該VL可以包含SEQ ID NO:32所示的胺基酸序列。在某些實施方式中,該VH可以包含SEQ ID NO:33所示的胺基酸序列,且該VL可以包含SEQ ID NO:34所示的胺基酸序列。在某些實施方式中,該VH可以包含SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列,且該VL可以包含SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列。在某些實施方式中,該VH可以包含SEQ ID NO:33所示的胺基酸序列,且該VL可以包含SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列。在某些實施方式中,該VH可以包含SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列,且該VL可以包含SEQ ID NO:34所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含本申請所述的VH中的至少一個CDR。在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含本申請所述的VL中的至少一個CDR。該CDR可以根據任何劃分方式劃分得到。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含本申請該VH中的HCDR1,HCDR2和HCDR3。該VH可以包含SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:33或SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含本申請該VL中的LCDR1,LCDR2和LCDR3。該VL可以包含SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:34或SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包括抗體重鏈恆定區。該抗體重鏈恆定區可以源自人IgG重鏈恆定區。在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白可以包括抗體重鏈恆定區,且該抗體重鏈恆定區可以源自人IgG1重鏈恆定區。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包括抗體輕鏈恆定區。該抗體輕鏈恆定區可以源自人Igκ恆定區。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白可以包含抗體或其抗原結合片段。
在某些實施方式中,該抗原結合片段可以包括Fab、Fab’、Fv片段、F(ab’)2、F(ab)2、scFv、di-scFv和/或dAb。
在某些實施方式中,該抗體可以包括單株抗體、嵌合抗體、人源化抗體和/或全人源抗體。
例如,該嵌合抗體的VH可以包含SEQ ID NO:29所示的胺基酸序列,且該嵌合抗體的VL可以包含SEQ ID NO:30所示的胺基酸序列。
例如,該人源化抗體的VH可以包含SEQ ID NO:31所示的胺基酸序列,且該人源化抗體的VL可以包含SEQ ID NO:32所示的胺基酸序列。
例如,該人源化抗體的VH可以包含SEQ ID NO:33所示的胺基酸序列,且該人源化抗體的VL可以包含SEQ ID NO:34所示的胺基酸序列。
例如,該人源化抗體的VH可以包含SEQ ID NO:35所示的胺基酸 序列,且該人源化抗體的VL可以包含SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列。
例如,該人源化抗體的VH可以包含SEQ ID NO:33所示的胺基酸序列,且該人源化抗體的VL可以包含SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列。
例如,該人源化抗體的VH可以包含SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列,且該人源化抗體的VL可以包含SEQ ID NO:34所示的胺基酸序列。
此外,需要說明的是,本申請該分離的抗原結合蛋白可以包含與其存在一個或多個保守序列修飾的重鏈和/或輕鏈序列。所謂“保守序列修飾”是指不會顯著影響或改變抗體結合特性的胺基酸修飾。這樣的保守修飾包括胺基酸替換、添加和刪除。可以藉由領域內已知的標準技術,例如點突變和PCR介導的突變,將修飾引入本申請該分離的抗原結合蛋白中。保守胺基酸替換是胺基酸殘基用具有相似側鏈的胺基酸殘基進行替換。具有相似側鏈的胺基酸殘基組在領域內已知。這些胺基酸殘基組包括具有鹼性側鏈(例如,賴胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如,天冬胺酸、谷胺酸)、不帶電極性側鏈(例如,甘胺酸、天冬醯胺、穀氨醯胺、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸、色胺酸)、非極性側鏈(例如,丙胺酸、纈胺酸、亮胺酸、異亮胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸)、β-支鏈側鏈(例如,蘇胺酸、纈胺酸、異亮胺酸)和芳香族側鏈(例如,酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)的胺基酸。在某些實施方式中,本申請該分離的抗原結合蛋白的CDR區中的一個或多個胺基酸殘基可以用同側鏈組的其他胺基酸殘基替換。所屬技術領域具有通常知識者知道,一些保守序列修改不會使抗原結合性消失,具體可以參見,例如,Brummell et al.,(1993)Biochem 32:1180-8;de Wildt et al.,(1997)Prot.Eng.10:835-41;Komissarov et al.,(1997)J.Biol.Chem.272:26864-26870;Hall et al.,(1992)J.Immunol.149:1605-12;Kelley and O'Connell(1993)Biochem.32:6862-35;Adib-Conquy et al.,(1998)Int.Immunol.10:341-6 and Beers et al.,(2000)Clin.Can.Res.6:2835-43。
可以藉由本領域已知的各種測定鑑別、篩選或表徵本申請該CD73抗原結合蛋白。
例如,可藉由已知方法諸如酶聯免疫吸附測定(ELISA)、免疫印跡(例如,蛋白質印跡)、流式細胞術(例如,FACS)、免疫組織化學、免疫螢光等來測試本申請抗原結合蛋白或融合蛋白的抗原結合活性。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白能夠特異性結合CD73或其功能活性片段。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白可以藉由Biacore進行親和力篩選。該分離的抗原結合蛋白可以以5×10-9M或更低的KD與CD73蛋白相結合,例如,本申請所述的抗原結合蛋白可以以小於約4×10-9M、小於約3×10-9M、小於約2×10-9M、小於約1×10-9M、小於約7×10-10M、小於約6×10-10M、小於約5×10-10M、小於約4×10-10M、小於約3×10-10M、小於約2×10-10M、小於約1×10-10M、小於約9×10-11M、小於約5×10-11M、小於約2×10-11M的KD結合CD73。在某些實施方式中,本申請也包括使用FACS方法測定抗原結合蛋白與抗原的結合活性。例如,本申請所述抗原結合蛋白可以以小於或等於約0.5μg/mL、小於或等於約0.4μg/mL、小於或等於約0.3μg/mL、小於或等於約0.2μg/mL、小於或等於約0.1μg/mL的EC50值與細胞表面人CD73結合。例如,本申請所述抗原結合蛋白可以以小於或等於約0.4μg/mL、小於或等於約0.3μg/mL、小於或等於約0.2μg/mL、小於或等於約0.1μg/mL的EC50值與細胞表面人CD73結合。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白能夠結合CD73。在某 些情形中,本申請所述的抗原結合蛋白還可以與猴的CD73交叉反應。例如,藉由FACS所檢測的。在本申請中,“交叉反應”通常指抗體與來自其他物種的同源蛋白反應的能力。
在某些實施方式中,本申請所述分離的抗原結合蛋白不與小鼠和/或大鼠的CD73結合。
例如,可以藉由ELISA方法檢測效價。例如,可以使用FACS檢測檢測該分離的抗原結合蛋白的結合活性或功能活性。例如,可以對該分離的抗原結合蛋白進行親和力檢測。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白能夠阻止或減少CD73的活化。例如,該分離的抗原結合蛋白能夠阻止或減少CD73由無催化活性的開放構象向催化活性的封閉構象的轉化。例如,該分離的抗原結合蛋白能夠將CD73催化中心封閉,從而抑制CD73的酶活。
在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白的結合表位可以藉由氫氘交換質譜(HDX-MS)測定。在某些實施方式中,該分離的抗原結合蛋白與CPI-006抗體(Corvus)具有競爭結合活性。
在本申請中,當與該CD73相結合時,該分離的抗原結合蛋白與CD73 N端結構域的143-NIKAKGPLASQISGL-157區域(SEQ ID NO:37)或與其對應的CD73序列,178-SKETPFLSNPGTNL-191區域(SEQ ID NO:38)或與其對應的CD73序列,以及CD73 C端結構域的381-WNHVSM-386的區域(SEQ ID NO:39)或與其對應的CD73序列中的至少一個胺基酸殘基相結合。
在本申請中,“與其對應的CD73序列”可以指其同源物(或者來自其他物種的CD73)中相應位置處的胺基酸序列。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白能夠抑制CD73的酶活性。例如,該分離的抗原結合蛋白可以對重組CD73具有酶活性抑制的效果。例如,該分離的抗原結合蛋白可以對人CD73具有酶活性抑制的效果。本申請所述酶活性可以藉由本領域常用的任何方法檢測得到。該酶活性的檢測可以包括將CD73抗原結合蛋白與重組CD73蛋白混勻,加入AMP和ATP,將CellTiter-Glo®受質加入CellTiter-Glo®緩衝液,混勻並平衡至室溫反應,進行全波長檢測。例如,該分離的抗原結合蛋白可以以小於或等於約0.8μg/mL、小於或等於約0.7μg/mL、小於或等於約0.6μg/mL、小於或等於約0.5μg/mL、小於或等於約0.4μg/mL、小於或等於約0.3μg/mL、小於或等於約0.2μg/mL的EC50值抑制重組CD73蛋白的酶活性。例如,該分離的抗原結合蛋白可以以小於或等於約6μg/mL、小於或等於約5μg/mL、小於或等於約4μg/mL、小於或等於約3μg/mL、小於或等於約2μg/mL、小於或等於約1μg/mL、小於或等於約0.5μg/mL的EC50值抑制細胞膜上CD73蛋白的酶活性。
在本申請中,該分離的抗原結合蛋白能夠誘導細胞表面CD73的內吞。在某些實施方式中,可以藉由螢光標記的方法判斷蛋白的內吞情況。例如,可以使用流式細胞術檢測細胞的螢光強度獲得該抗原結合蛋白誘導細胞表面CD73內吞的效率。在某些情形下,該分離的抗原結合蛋白可以以約50%或更高的效率誘導CD73的內吞。
多肽分子、核酸分子、載體、細胞、免疫綴合物和醫藥組成物
另一方面,本申請提供了多肽分子,其可以包含本申請所述的分離的抗原結合蛋白。
在某些實施方式中,該多肽分子可以包含融合蛋白。在某些實施 方式中,該多肽分子可以為融合蛋白。
另一方面,本申請提供了分離的核酸分子,其可以編碼本申請所述的分離的抗原結合蛋白。例如,其可以是藉由以下方法產生或合成的:(i)在體外擴增的,例如藉由聚合酶鏈式反應(PCR)擴增產生的;(ii)藉由選殖重組產生的;(iii)純化的,例如藉由酶切和凝膠電泳分級分離;或者(iv)合成的,例如藉由化學合成。
另一方面,本申請提供了一種載體,其可以包含本申請所述的核酸分子。此外,該載體中還可包含其他基因,例如允許在適當的宿主細胞中和在適當的條件下選擇該載體的標記基因。此外,該載體還可包含允許編碼區在適當宿主中正確表達的表達控制元件。這樣的控制元件為所屬技術領域具有通常知識者所熟知的,例如,可包括啟動子、核糖體結合位點、增強子和調節基因轉錄或mRNA翻譯的其他控制元件等。該載體可藉由轉化、轉導或轉染宿主細胞,使其攜帶的遺傳物質元件在宿主細胞內表達得以表達。該載體可以包括,例如質粒、黏粒、病毒、噬菌體或者在例如遺傳工程中通常使用的其他載體。例如,該載體為表達載體。此外,該載體還可以包括有協助其進入細胞的成分,如病毒顆粒、脂質體或蛋白外殼,但不僅僅只有這些物質。
另一方面,本申請提供了一種細胞,其可以包含本申請該核酸分子或本申請所述的載體。在某些實施方式中,每種或每個宿主細胞可包含一個或一種本申請所述的核酸分子或載體。在某些實施方式中,每種或每個宿主細胞可包含多個(例如,2個或以上)或多種(例如,2種或以上)本申請所述的核酸分子或載體。例如,可將本申請所述的載體引入該宿主細胞中,例如真核細胞,如來自植物的細胞、真菌或酵母細胞等。在某些實施方式中,該細胞可以是細菌細 胞(例如,大腸桿菌)、酵母細胞或其它真核細胞,例如COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、CHO-K1細胞、LNCAP細胞、HeLa細胞、293T細胞、COS-1細胞、SP2/0細胞、NS0細胞或骨髓瘤細胞。可藉由本領域已知的方法將本申請所述的載體引入該宿主細胞中,例如電穿孔、lipofectine轉染、lipofectamin轉染等。
另一方面,本申請還提供了免疫綴合物,其可以包含本申請所述的分離的抗原結合蛋白。
在某些實施方式中,可以將本申請所述的分離的抗原結合蛋白或其片段與另一試劑,如化學治療劑、毒素、免疫治療劑、成像探針、分光鏡探針等的連接。該連接可以藉由一個或多個共價鍵,或非共價相互作用,並且可以包括螯合作用。可以使用多種接頭(該接頭可以為本領域所知)以形成免疫綴合物。此外,可以以融合蛋白質的形式提供免疫綴合物,其可以由編碼免疫綴合物的多核苷酸表達。該免疫綴合物還可以包含例如抗體-藥物綴合物(ADC)。合適的藥物可以包括細胞毒素、烷化劑、DNA小溝結合分子、DNA嵌入劑、DNA交聯劑、組蛋白去乙醯化酶抑制劑、核輸出抑制劑、蛋白酶體抑制劑、拓撲異構酶I或II的抑制劑、熱激蛋白抑制劑、酪胺酸激酶抑制劑、抗生素和抗有絲分裂劑。在ADC中,抗體和治療劑可以藉由接頭交聯,該接頭可切割,例如肽類接頭、二硫類接頭或腙類接頭。
另一方面,本申請還提供了醫藥組成物,其可以包含本申請所述的分離的抗原結合蛋白、本申請所述的多肽分子、本申請所述的免疫綴合物、本申請所述的核酸分子、本申請所述的載體和/或本申請所述的細胞,以及視需要地藥學上可接受的載劑。
在某些實施方案中,該醫藥組成物還可以包含一種或多種(藥學上 有效的)佐劑、穩定劑、賦形劑、稀釋劑、增溶劑、表面活性劑、乳化劑和/或防腐劑的合適的製劑。組成物的可接受成分在所用劑量和濃度下較佳地對接受者無毒。本發明的醫藥組成物包括但不限於液體、冷凍和凍乾組成物。
在某些實施方案中,該醫藥組成物還可含有多於一種活性化合物,通常為不會不利地影響彼此的具有互補活性的那些活性化合物。此類藥物的類型和有效量可以取決於例如製劑中存在的拮抗劑的量和類型,以及受試者的臨床參數。
在某些實施方案中,該藥學上可接受的載劑可以包括與藥物給藥相容的任何和所有的溶劑、分散介質、包衣、等滲劑和吸收延遲劑,通常安全、無毒。
在某些實施方案中,該醫藥組成物可以包含腸胃外、經皮、腔內、動脈內、鞘內和/或鼻內施用或直接注射到組織中。例如,該醫藥組成物可以藉由輸注或注射施用於患者或者受試者。在某些實施方案中,該醫藥組成物的施用可以藉由不同的方式進行,例如靜脈內、腹膜內、皮下、肌肉內、局部或真皮內施用。在某些實施方案中,該醫藥組成物可以不間斷施用。該不間斷(或連續)施用可以藉由患者佩戴的小泵系統來實現,以測量流入患者體內的治療劑,如WO2015/036583該。
製備方法
另一方面,本申請提供了製備該抗原結合蛋白的方法。該方法可包括,在使得該抗原結合蛋白表達的條件下,培養該本申請該宿主細胞。例如,可藉由使用適當的培養基、適當的溫度和培養時間等,這些方法是所屬技術領域具有通常知識者所瞭解的。
任何適於產生單株抗體的方法都可用於產生本申請的抗原結合蛋白。例如,可以用連接或天然存在的CD73或其片段,免疫動物。可以使用合適的免疫接種方法,包括佐劑、免疫刺激劑、重複加強免疫接種,可以使用一種或多種途徑。例如,可以使用融合瘤製備方法,獲取已經過免疫的小鼠的脾細胞與SP2/0骨髓瘤細胞進行融合,經過HAT篩選出融合瘤細胞株。
任何合適形式的CD73都可以作為免疫原(抗原),用於產生對CD73特異的非人抗體,篩選該抗體的生物學活性。例如,激發免疫原可以是全長的成熟人CD73,包括天然的同源二聚體,或含單個/多個表位的肽。免疫原可以單獨使用,或與本領域已知的一種或多種免疫原性增強劑組合使用。
嵌合人源抗體可以選自任何種類的免疫球蛋白,包括IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。在本申請中,抗體可以是IgG抗體,可以使用IgG1亞型。可以藉由用下文實施例中描述的生物學測定篩選抗體實現必需恆定結構域序列的優化,以產生所需生物學活性。同樣,任一類輕鏈都可以在本申請的化合物和方法中使用。例如,本申請的化合物和方法中可以使用κ鏈或其變體。
方法和用途
另一方面,本申請提供了該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物在製備藥物中的用途,該藥物用於預防和/或治療疾病和/或病症。
另一方面,本申請還提供了預防和/或治療疾病和/或病症的方法,該方法可以包括向有需要的受試者施用本申請該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物。
在本申請中,該使用可以藉由不同方式進行,例如靜脈內、瘤內、 腹膜內、皮下、肌肉內、局部或真皮內施用。
另一方面,本申請該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物,其可以用於預防和/或治療疾病和/或病症。
在本申請中,該疾病和/或病症可以是CD73介導的疾病和/或病症。
在本申請中,該疾病和/或病症包括腫瘤。
在本申請中,該腫瘤包括實體瘤和/或血液瘤。
在本申請中,該疾病和/或病症包括乳腺癌。
另一方面,本申請還提供了檢測樣品中CD73的方法,該方法包括施用該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物。
在某些情形中,該檢測樣品中CD73的方法是體外方法。在某些情形中,該檢測樣品中CD73的方法為非治療目的。在某些情形中,該檢測樣品中CD73的方法不是診斷方法。
另一方面,本申請還提供了檢測樣品中CD73的試劑或試劑盒,其包含該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物。
另一方面,本申請還提供了該分離的抗原結合蛋白、該多肽分子、該核酸分子、該載體、該細胞、該免疫綴合物和/或該醫藥組成物在製備試劑盒中的用途,該試劑盒用於檢測樣品中CD73的存在和/或含量。
不欲被任何理論所限,下文中的實施例僅僅是為了闡釋本申請的融合蛋白、製備方法和用途等,而不用於限制本申請發明的範圍。
實施例
實施例1 抗人CD73的鼠源抗原結合蛋白的製備方法
1.1 製備產生鼠源抗原結合蛋白的融合瘤細胞
製備產生鼠源抗原結合蛋白的融合瘤細胞
製備鼠源單株抗原結合蛋白的方法採用Kohler和Milstein 1975年發明的融合瘤製備技術(Nature,1975,256:495-497)。首先將人CD73帶有His標籤蛋白(Met 1-Lys 547)作為免疫抗原,一部分使用弗氏佐劑:Freund’s Adjuvant,Complete(Sigma cat no.F5881,別名:FCA)與Freund’s Adjuvant,Incomplete(Sigma cat no.F5506,別名:FICA)進行免疫,另一部分使用Quick Antibody-Mouse 5w(博奧龍cat no.KX0210041)佐劑,分別對多隻BALB/c、CD1小鼠進行多點皮下免疫。經過三次免疫後取血清用ELISA法檢測效價,FACS檢測結合活性及功能活性。最終挑選最佳小鼠獲取脾細胞與SP2/0骨髓瘤細胞進行融合。經過HAT篩選出融合瘤細胞株,取細胞培養上清用FACS檢測方法,篩選出特異性結合人CD73、猴CD73的單株融合瘤細胞株,再次篩選出具有抑制CD73酶活性的單株細胞株,並對篩選出的單株細胞株進行親和力(Biacore)篩選,最終得到表達人CD73抗原結合蛋白的單株融合瘤細胞株進行序列分析,篩選資料列舉見表1。
表1 融合瘤篩選
Figure 110145875-A0101-12-0037-1
經過高通量篩選,最終得到的單株融合瘤細胞株具有高親和力,可以與人和猴都具有結合活性。
實施例2 抗CD73抗原結合蛋白可變區基因測序以及各抗原結合蛋 白的製備
2.1 融合瘤細胞中抗原結合蛋白的可變區基因測序及選殖
基於TAKARA的5’RACE技術原理,選殖出由融合瘤細胞株3A9表達的小鼠抗原結合蛋白可變區的cDNA序列。簡言之,用SMARTer 5’RACE合成試劑盒(TAKARA,#634859)按說明書合成重鏈和輕鏈的可變區基因特異性cDNA。用PCR引子修飾cDNA序列的5’和3’端,該引子設計成為分別在重鏈和輕鏈可變區cDNA上增加合適的前導序列,使所得PCR產物能夠藉由無縫選殖的方法選殖到現有重組抗原結合蛋白表達的重鏈載體pHB-Fc和輕鏈載體pHB-Cκ上。pHB-Fc表達載體上含有人IgG1重鏈恆定區基因序列,其中CH2上帶有抗原結合蛋白ADCC敲除(knock out,KO)效應的L234A和L235A(Eu numbering)突變;pHB-Cκ載體上含有人κ輕鏈恆定區基因序列。將重鏈和輕鏈可變區PCR擴增產物藉由In-fusion選殖試劑(TAKARA,#639650)選殖到表達載體上,並轉化到E.coli DH5α大腸桿菌感受態細胞(益生生技,#FYE607-80VL)中。藉由挑選單株菌落進行Sanger以及NGS測序,經分析獲得抗原結合蛋白可變區序列。其中3A9表達的抗CD73抗原結合蛋白可變區序列如下:
3A9 VH SEQ ID NO:29
Figure 110145875-A0101-12-0038-2
3A9 VL SEQ ID NO:30
Figure 110145875-A0101-12-0038-3
其中,底線區為CDRs(IMGT定義,各CDR列表如下):
表2.鼠源CD73抗原結合蛋白CDR序列
Figure 110145875-A0101-12-0039-4
2.2 抗原結合蛋白的表達
將實施例2.1中所得表達載體經過大腸桿菌擴增,用去內毒素質粒抽提試劑盒(天根生化科技(北京)有限公司,#DP117)製備足量質粒,用於暫態轉染表達抗原結合蛋白。表達所用的宿主細胞為CHO-S細胞(賽默飛,#R80007)。藉由將製備所得的兩種重鏈載體分別和輕鏈載體一起,與聚醚醯亞胺(PEI,Polysciences,# 24765-1)混合形成脂質體複合物後,轉染CHO-S細胞,放入培養箱中培養5-7天。離心收集細胞培養液上清,藉由Protein A親和層析管柱純化得到人鼠抗原結合蛋白(3A9表達的抗原結合蛋白編號為900581)。
2.3 抗原結合蛋白900694-900698的製備
抗原結合蛋白的人源化採用3D建模的方法:先對鼠源抗原結合蛋白進行三維結構建模,選出最優結構模型,具體為分別使用Discovery Studio和Schrödinger Antibody Modeling,採用同源建模方法選取5-10個最優結構解,Loop 區域一般使用同源建模方法建模,如CDR胺基酸序列比對結果顯示低於50% Identity,則使用從頭建模方法搭建CDR3結構模型。使用PDB BLAST調取序列最接近的10個抗體晶體結構模型(結構解析度高於2.5埃),對比自動建模模型,選取最優的結構模型。然後將抗原結合蛋白的可變區序列與NCBI IgBlast資料庫中的可用序列比較,藉由鑑定和分析,最終確定了適合在其上構建CDR移植重鏈和輕鏈的人源構架區(FR區)。
改造時,根據人抗體FR區保守的胺基酸殘基以及抗體FR區中重要的胺基酸殘基,設計改造位點,對本申請抗原結合蛋白900581的重輕鏈的可變區分別進行人源化突變設計,設計的人源化序列應滿足不影響抗體結構穩定性,不影響抗原結合蛋白與抗原結合,不引入糖基化、磷酸化等蛋白修飾位點,不引入易被氧化、胺基化等位元點,增強結構穩定性等要求。經分析本次針對900581的鼠源抗原結合蛋白序列共設計了3條人源化重鏈序列以及3條人源化輕鏈序列,並將人源化點突變抗原結合蛋白表達質粒分別經CHO-S細胞表達,純化後得到人源化抗原結合蛋白。利用ELISA,Biacore和流式細胞術等檢測方法,對人源化抗原結合蛋白的受體結合能力,功能抑制活性和非特異結合特性,熱穩定性等指標進行篩選,獲得了5個性能優異的人源化抗CD73抗原結合蛋白。所獲得人源化抗CD73抗原結合蛋白的蛋白號以及相應的VH和VL序列下所示:
900694 VH SEQ ID NO:31
Figure 110145875-A0101-12-0040-5
900694 VL SEQ ID NO:32
Figure 110145875-A0101-12-0041-6
900695以及900697 VH SEQ ID NO:33
Figure 110145875-A0101-12-0041-7
900695以及900698 VL SEQ ID NO:34
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVGTAEAWYQQKPGKAPKLLIYWASTRHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYSSYPLTFGQGTKLEIK
900696以及900698 VH SEQ ID NO:35
Figure 110145875-A0101-12-0041-8
900696以及900697 VL SEQ ID NO:36
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVGTAEAWYQQKPGKAPKLLIYWASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYSSYPLTFGQGTKLEIK
其中,底線區為CDRs(IMGT定義),900694,900695,900696,900697以及900698分別為5個抗CD73人源化抗原結合蛋白編號。
實施例3 抗CD73抗原結合蛋白對細胞表面人CD73的結合活性檢測
抗CD73抗原結合蛋白900581、900565以及900581抗原結合蛋白的人源化抗原結合蛋白900694,900695,900696,900697以及900698與細胞表面人CD73的細胞(CHOK1-huCD73-3F4,華博生物)的結合活性檢測。其中嵌合抗體 900565來源於融合瘤細胞株115B10。900565的重鏈可變區(VH)胺基酸序列如SEQ ID NO:41所示,900565的輕鏈可變區(VL)胺基酸序列如SEQ ID NO:42所示。
所有抗原結合蛋白均用含1%BSA的PBS溶液(1%BSA/PBS)稀釋至30μg/ml,再3倍稀釋11個梯度,每孔20μL加入96孔U型板中,同步設定陰性對照(只加1%BSA/PBS)。取對數生長期內表達人CD73的細胞(CHOK1-huCD73-3F4,華博生物)懸液,離心(1000rpm×5min)棄培養液,用1%BSA/PBS重新懸浮至活細胞密度為1×106/mL,每孔20μL(2×104個細胞)加入已有抗CD73抗原結合蛋白的96孔U型板中室溫反應30min。將反應後的96孔U型板用1%BSA/PBS重新懸浮,離心(300g×3min)棄上層液,如此洗滌1遍,加入1:200稀釋的PE-羊抗人-Fc(Jackson ImmunoResearch,#109-115-098),室溫避光反應15min;將反應後的96孔U型板用1%BSA/PBS重新懸浮,離心(300g×3min)棄上層液,如此洗滌3遍,最終用每孔100μL 1%BSA/PBS重新懸浮,用流式細胞儀(BD,#Canto Ⅱ)檢測PE通道的螢光強度。
900581抗原結合蛋白結合活力結果見圖1及表3,900694-900698抗原結合蛋白結合活力結果見圖2及表4,結果表明900581抗原結合蛋白與細胞表面表達人CD73的細胞(CHOK1-huCD73-3F4,華博生物)有很好的親和力,900694-900698與900581的結合活性相當。
表3.900581、900565對細胞表面人CD73結合活性
Figure 110145875-A0101-12-0042-9
表4.900581、900694-900698對細胞表面人CD73結合活性
Figure 110145875-A0101-12-0043-10
實施例4 抗CD73抗原結合蛋白對重組CD73酶活性抑制的效果檢測
900581以及900694,900695,900696,900697以及900698對重組CD73蛋白(ACRO,#CD3-H52H7-100μg)蛋白酶活性抑制的效果檢測。具體操作如下:用TM Buffer(ROCKLAND,#MB-059)將系列CD73抗原結合蛋白稀釋成120μg/mL,再5倍稀釋10個梯度,25μL/well加入96孔板中。再用TM Buffer(ROCKLAND,#MB-059)將重組CD73蛋白稀釋至0.3μg/ml,各25μL/well加入96孔板中,混勻。然後將稀釋好的AMP和ATP進行1:1混合,50μL/well加入上述96孔板中,反應15min。最後將CellTiter-Glo®受質加入CellTiter-Glo®緩衝液,混勻並平衡至室溫,然後加入待測孔,100μL/well,室溫反應10min,全波長檢測。
900581,900694,900695,900696,900697以及900698對重組CD73蛋白(ACRO,# CD3-H52H7-100μg)酶活性抑制的結果見圖3以及表5,結果表明900694,900695,900696,900697和900698與900581抗原結合蛋白對重組CD73蛋白酶活性抑制的效果相當。
表5.900581、900694-900698對重組CD73蛋白酶活性抑制
Figure 110145875-A0101-12-0043-11
實施例5 抗CD73抗原結合蛋白對細胞膜上CD73酶活性抑制的效果檢測
所有抗原結合蛋白均用PBS溶液稀釋至30μg/ml,再以5倍比例稀釋6個梯度。取對數生長期內表達人CD73的細胞(CHOK1-huCD73-3F4,華博生物)懸液,用培養基製備成4X105/ml細胞懸液,每孔100ul(約40000個細胞)加入96孔U型板中,1500rpm×5min離心,去上清。然後用系列稀釋的抗原結合蛋白重新懸浮細胞,每孔加入100ul,混勻,37℃孵育20min。孵育結束後,1500rpm離心5min,去上清,200ul/well PBS洗滌1遍,然後用100μL/well 180μM AMP重新懸浮,37℃孵育60min。孵育結束後,1500rpm×5min離心,取50μL/well上清,轉移至96孔黑板中,再加入50ul/well配製好的ATP,混勻,37℃反應15min。最後將CellTiter-Glo®受質加入CellTiter-Glo®緩衝液,混勻並平衡至室溫,然後加入待測孔,100μL/well,室溫反應10min,全波長檢測。酶活性的百分比按照如下該進行評估:殘餘CD73的活性為:(CHOK1-huCD73-3F4細胞+Ab+ATP+AMP)-(ATP+AMP)/(CHOK1-huCD73-3F4細胞+ATP+AMP)-(ATP+AMP)*100。
抗CD73嵌合抗體900581,900565對CD73的細胞(CHOK1-huCD73-3F4,華博生物)酶活性抑制的效果見圖4以及表6,900581,900697以及900698對CD73的細胞(CHOK1-huCD73-3F4,華博生物)酶活性抑制的效果見圖5以及表7,結果表明900697,900698與900581對細胞膜上CD73酶活性抑制的效果基本一致。
表6.900581、900565對細胞膜上CD73酶活性抑制
Figure 110145875-A0101-12-0044-12
表7.900581、900697、900698對細胞膜上CD73酶活性抑制
Figure 110145875-A0101-12-0045-13
實施例6 抗CD73抗原結合蛋白與人CD73的結合親和力檢測
900581,900694,900695,900696,900697以及900698與人CD73蛋白(廠家:ACRO Biosystems,貨號:CD3-H52H7)的結合動力學實驗運用Biacore(GE,型號為T200)檢測,實驗緩衝液為HBS-EP+(pH7.4),protein A晶片(廠家:GE,貨號:29-1275-56)。
設置樣品倉和流路溫度為25℃,protein A晶片分別捕獲抗原結合蛋白作為配體固定約100RU。人CD73蛋白用實驗緩衝液稀釋至50nM,25nM,12.5nM,6.25nM,3.12nM,1.57nM一系列濃度作為分析物,並以實驗緩衝液作為0濃度對照,30μL/min流速下,結合120s,解離600s。10mM Glycine pH 1.5在50μL/min流速下,再生60s多迴圈動力學檢測。採用1:1結合模型,選用Fit local模式擬合出結合速率常數(ka),解離速率常數(kd)和解離平衡速率常數(KD),擬合結果見表8,顯示所有抗原結合蛋白均與人CD73蛋白結合,且大部分抗原結合蛋白與人CD73蛋白的結合親和力無顯著差異。
表8:900581、900694-900698對人CD73蛋白的結合親和力檢測
Figure 110145875-A0101-12-0046-14
實施例7 抗CD73抗原結合蛋白與不同種屬CD73(人、小鼠、大鼠、猴)的結合親和力檢測
900581,900694,900695,900696,900697以及900698分別與人CD73蛋白(廠家:ACRO Biosystems,貨號:CD3-H52H7),小鼠CD73/NT5E(廠家:ACRO Biosystems,貨號:CD3-M52H9),大鼠CD73(廠家:Novoprotein,貨號:CB16)和猴CD73(廠家:Novoprotein,貨號:CI21)的結合動力學實驗運用Biacore(GE,型號為T200)檢測,使用protein A晶片(廠家:GE,貨號:29-1275-56),實驗緩衝液為HBS-EP+(pH7.4)。
設置樣品倉和流路溫度為25℃,Protein A晶片分別捕獲抗原結合蛋白作為配體固定為約100RU。人CD73蛋白/猴CD73/大鼠CD73/小鼠CD73分別用實驗緩衝液稀釋至50nM,25nM,12.5nM,6.25nM,3.12nM,1.57nM一系列濃度作為分析物,並以實驗緩衝液作為0濃度對照,30μL/min流速下,結合120s, 解離600s。10mM Glycine pH 1.5在50μL/min流速下,再生60s多迴圈動力學檢測。採用1:1結合模型,選用Fit local模式擬合出結合速率常數(ka),解離速率常數(kd)和解離平衡速率常數(KD),擬合結果見表9,顯示上述抗原結合蛋白均與人CD73,猴CD73(廠家:Novoprotein,貨號:CI21)都能結合,且大部分抗原結合蛋白與人、猴CD73蛋白的結合親和力無顯著差異,同時所有抗原結合蛋白均不與小鼠(廠家:ACRO Biosystems,貨號:CD3-M52H9)和大鼠(廠家:Novoprotein,貨號:CB16)的CD73蛋白結合。
表9:900581、900694-900698對猴CD73蛋白的結合親和力檢測
Figure 110145875-A0101-12-0047-15
實施例8 抗CD73抗原結合蛋白誘導細胞表面CD73內吞能力的檢測
將對照蛋白900222、嵌合蛋白900581以及人源化蛋白900697、900698蛋白用PBS溶液稀釋至1μg/ml,每個濃度重複2孔。其中,對照蛋白900222 序列來源於百時美施貴寶公司的CD73抗體專利US20190284293A1中的mAb-CD73.4-IgG2抗體序列。取對數生長期內的Calu6細胞,將細胞製備成2×105/ml細胞懸液,每孔100μL(約20000個細胞)加入96孔U型板中,300g×3min離心,去上清。再用稀釋的抗原結合蛋白重新懸浮細胞,100μL/well,混勻,4℃孵育30min。孵育結束後,300g×3min離心,去上清,1%BSA重新懸浮,一半37℃孵育,另一半4℃孵育,孵育時間為5h。孵育結束後,取出對應時間的孔,300g×3min離心去上清,加入PE anti-huIgG Fc(1:200),50μL/孔,混勻,4℃反應30min。孵育結束後,洗2遍,300g×3min,流式檢測螢光強度。抗CD73抗原結合蛋白誘導的細胞表面CD73內吞檢測結果如下表10以及圖6所示,結果表明嵌合蛋白900581以及人源化蛋白900697、900698蛋白誘導CD73內吞的效果顯著優於對照蛋白900222,且人源化蛋白900697以及900698的誘導內吞效果又比嵌合體900581要好。
表10.抗CD73抗原結合蛋白誘導細胞表面CD73內吞效率
Figure 110145875-A0101-12-0048-16
實施例9 抗CD73抗原結合蛋白的結合表位鑑定
9.1 氫氘交換質譜(HDX-MS)測定900581抗原結合蛋白的結合表位
將5~10μM抗原或抗原結合蛋白或抗原-結合蛋白複合物(1:1 molar ratio)(50mM HEPES,pH 7.4,150mM NaCl,4mM TCEP)分別在4℃下放置1小時,使之形成複合物的穩定狀態。在4℃,之後將5μL樣品稀釋到20μL D2O(氘)中並放置到不同的HDX時間點進入質譜分析(例如,0、10、60、300、900秒)。 氫氘交換一段時間後,藉由與25μL冰冷的4M鹽酸胍和1%三氟乙酸混合來終止反應。在停止反應後立即將樣品管置於乾冰上直至樣品注入HDX LEAP PAL3.0平臺。注射後到全自動氫氘交換平臺後,樣品以120μL/min流速藉由固定的胃蛋白酶管柱,並將酶解的肽段捕獲在C18捕獲管柱上並脫鹽。在8分鐘內,用2.1mm×5cm C18管柱(1.9μm Hypersil Gold,Thermo Fisher)以4-40%乙腈和0.3%甲酸的線性梯度分離脫鹽的肽段。在樣品處理過程中,蛋白質酶解和肽段分離均在4℃下進行。使用Orbitrap質譜儀(Orbitrap FusionTM TribridTM Mass Spectrometer,Thermo Fisher)獲得氫氘交換的質譜資料,測量的解析度為65,000(m/z 400)。每一個樣品在每一個時間點都有三次HDX測定(triplicates)。
氫氘交換質譜(HDX-MS)測定結果表明900581的結合表位主要包括CD73 N端結構域的143-NIKAKGPLASQISGL-157區域(SEQ ID NO:37),178-SKETPFLSNPGTNL-191區域(SEQ ID NO:38),以及CD73 C端結構域的381-WNHVSM-386的區域(SEQ ID NO:39),將該三段非連續區域定位到CD73的三維結構模型上時,發現該表位處於CD73催化活性中心邊緣,具體如圖7所示。當900581結合在該表位時可以將CD73催化中心非常高效地封閉,從而最大效率地抑制CD73的酶活。查閱專利和文獻表明目前本公司的900581是迄今為止首次報導的結合在CD73催化中心周圍的並給出具體表位元資訊的治療性抗原結合蛋白。
9.2 非水解形式的AMP類似物APCP競爭結合實驗驗證900581抗原結合蛋白的結合表位
CD73結合受質AMP之後會發生從開放構象到封閉構象的構型改變,採用AMP非水解形式的類似物APCP替代AMP之後,由於APCP無法水解生 成腺苷,從而可以將CD73鎖定在封閉構象的催化中間狀態。隨著APCP濃度的增加,處於封閉構象的催化中間狀態的CD73比例會相應增加,對於結合在催化區域的抗原結合蛋白,則結合上去的比例會相應減少,而結合在非催化區域的抗原結合蛋白結合上去的比例則不會變化。該方法具體操作如下:將細胞用1%BSA製備成1E6/ml細胞懸液,每孔20μL加入96孔U型板中。將APCP用1%BSA分別稀釋成30nM/30μM,20μL/well加入上述96孔U型板中,混勻,室溫放置30min。將待測抗原結合蛋白稀釋至90μg/ml,再分別3倍稀釋10個梯度。將系列稀釋的抗原結合蛋白加入上述96孔U型板中,20μL/well,混勻,室溫放置30min。孵育結束後,300g×3min離心,去上清,再20μL/well加入二抗PE羊抗人IgG Fc(1:200),混勻,室溫放置15min;孵育結束後,洗滌2遍,300g×3min,流式檢測PE-MFI。
檢測結果如圖8所示,其中900609是Corvus公司的被證明結合在催化中心周圍的CPI-006抗體,TNP是陰性對照抗體。結果表明900581抗原結合蛋白的表現和CPI-006抗體類似,隨著APCP濃度的增加結合到CD73上的抗原結合蛋白比例會逐漸降低,從而進一步證明900581結合在CD73催化活性中心周圍。
實施例10 抗CD73抗原結合蛋白的體內治療腫瘤的效果檢測
10.1
本實驗利用CD73人源化小鼠建立MDA-MB-231三陰性乳腺癌動物模型並測試受試抗體的藥效。首先,將MDA-MB-231(ATCC庫)細胞(2E6個)100μl接種於CD73人源化小鼠中建立CD73人源化小鼠MDA-MB-231三陰性乳腺癌動物模型,成瘤小鼠根據小鼠腫瘤體積和體重平均分配到4個實驗組中,每組6隻,腹腔注射給藥,每週給藥2次共給藥6次。具體給藥方案見下表。其中,900201為陰性對照抗體,不與CD73抗原結合。900201的重鏈(HC)胺基酸序列如SEQ ID NO:43所示,900201的輕鏈(LC)胺基酸序列如SEQ ID NO:44所示。
結果顯示900581、900697以及900698能夠顯著抑制MDA-MB-231三陰性乳腺癌的生長,同時對小鼠的體重生長指標沒有影響。而陰性對照抗體900201則不能抑制腫瘤的生長。
表11 給藥方案
Figure 110145875-A0101-12-0051-17
10.2
利用NPG小鼠建立MDA-MB-231三陰性乳腺癌動物模型並測試受試抗體的藥效。用於本實驗的人乳腺癌細胞MDA-MB-231以L-15培養基添加10% FBS培養於含無CO2的37℃培養箱。細胞連續培養十代之前,將約含5.0×106 MDA-MB-231細胞混懸於100μL PBS中,和等體積Matrigel混勻後,藉由皮下注射接種於NPG人源化小鼠背部右邊靠近腋下,接種體積為200μL左右。接種前用2-5%異氟烷將小鼠麻醉。在接種當天,經尾靜脈注射1.0×107 PBMC(100μL),當腫瘤生長到平均約50-80mm3左右時,18隻荷瘤小鼠將根據腫瘤體積和體重被隨機分成3組,每組6隻。分組當天進行給藥,具體給藥方案見表12。其中,900201為陰性對照抗體,不與CD73抗原結合。900201的重鏈(HC)胺基酸序列如SEQ ID NO:43所示,900201的輕鏈(LC)胺基酸序列如SEQ ID NO:44所示。Oleclumab為阿斯利康開發的抗CD73單株抗體。
結果如下表12和圖9所示,oleclumab以及900698能夠顯著抑制MDA-MB-231三陰性乳腺癌的生長,而陰性對照抗體900201則不能抑制腫瘤的生長。
表12
Figure 110145875-A0101-12-0052-18
實施例11 抗CD73抗原結合蛋白的體內治療胰腺癌的效果檢測
本實驗利用NPG小鼠建立BxPC-3胰腺癌動物模型並測試受試抗體的藥效。用於本實驗的人胰腺癌細胞BxPC-3,以RPMI-1640培養基添加10% FBS培養於含5% CO2的37℃培養箱。細胞連續培養十代之前,將約含1×107 BxPC-3細胞的PBS 100μL和等體積Matrigel混勻後,藉由皮下注射接種於18隻NPG小鼠背部右邊靠近腋下,接種體積為200μL左右。接種前用2-5%異氟烷將小鼠麻醉。在接種當天,經尾靜脈注射1.0×107 PBMC(100μL),當腫瘤生長到平均約50-80mm3左右時,18隻荷瘤小鼠將根據腫瘤體積和體重被隨機分成3組,每組6隻。分組當天進行給藥,具體給藥方案見表13。其中,900201為陰性對照抗體,不與CD73抗原結合。900201的重鏈(HC)胺基酸序列如SEQ ID NO:43所示,900201的輕鏈(LC)胺基酸序列如SEQ ID NO:44所示。Oleclumab為阿斯利康開發的抗CD73單株抗體。
結果如下表13和圖10所示,oleclumab以及900698能夠顯著抑制 BxPC-3胰腺癌的生長,而陰性對照抗體900201則不能抑制腫瘤的生長。
表13 胰腺癌模型給藥方案
Figure 110145875-A0101-12-0053-19
<110> 上海華奧泰生物藥業股份有限公司(SHANGHAI HUAOTA BIOPHARMACEUTICAl CO.,LTD.) 華博生物醫藥技術(上海)有限公司(HUABO BIOPHARM(SHANGHAI)CO.,LTD.)
<120> CD73的抗原結合蛋白及其應用
<130> 0211-PA-003TW
<160> 46
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(HCDR1)
<400> 1
Figure 110145875-A0101-12-0054-20
<210> 2
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(HCDR2)
<400> 2
Figure 110145875-A0101-12-0054-21
<210> 3
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(HCDR3)
<400> 3
Figure 110145875-A0101-12-0054-22
<210> 4
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(LCDR1)
<400> 4
Figure 110145875-A0101-12-0055-23
<210> 5
<211> 3
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(LCDR2)
<400> 5
Figure 110145875-A0101-12-0055-24
<210> 6
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(LCDR3)
<400> 6
Figure 110145875-A0101-12-0055-25
<210> 7
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(H-FR1)
<400> 7
Figure 110145875-A0101-12-0055-26
<210> 8
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(H-FR2)
<400> 8
Figure 110145875-A0101-12-0055-27
<210> 9
<211> 38
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(H-FR3)
<400> 9
Figure 110145875-A0101-12-0056-28
<210> 10
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(H-FR4)
<400> 10
Figure 110145875-A0101-12-0056-29
<210> 11
<211> 26
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(L-FR1)
<400> 11
Figure 110145875-A0101-12-0056-30
<210> 12
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(L-FR2)
<400> 12
Figure 110145875-A0101-12-0056-31
Figure 110145875-A0101-12-0057-32
<210> 13
<211> 36
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(L-FR3)
<400> 13
Figure 110145875-A0101-12-0057-33
<210> 14
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(L-FR4)
<400> 14
Figure 110145875-A0101-12-0057-34
<210> 15
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694(H-FR1)
<400> 15
Figure 110145875-A0101-12-0057-35
<210> 16
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694、900695、900697(H-FR2)
<400> 16
Figure 110145875-A0101-12-0058-36
<210> 17
<211> 38
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694(H-FR3)
<400> 17
Figure 110145875-A0101-12-0058-37
<210> 18
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694、900695、900696、900697、900698(H-FR4)
<400> 18
Figure 110145875-A0101-12-0058-38
<210> 19
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900695、900697、900696、900698(H-FR1)
<400> 19
Figure 110145875-A0101-12-0058-39
<210> 20
<211> 38
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900695、900697(H-FR3)
<400> 20
Figure 110145875-A0101-12-0059-40
<210> 21
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900696、900698(H-FR2)
<400> 21
Figure 110145875-A0101-12-0059-41
<210> 22
<211> 38
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900696、900698(H-FR3)
<400> 22
Figure 110145875-A0101-12-0059-42
<210> 23
<211> 26
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694、900695、900696、900697、900698(L-FR1)
<400> 23
Figure 110145875-A0101-12-0059-43
Figure 110145875-A0101-12-0060-44
<210> 24
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694、900695、900696、900697、900698(L-FR2)
<400> 24
Figure 110145875-A0101-12-0060-45
<210> 25
<211> 36
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694(L-FR3)
<400> 25
Figure 110145875-A0101-12-0060-46
<210> 26
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694、900695、900696、900697、900698(L-FR4)
<400> 26
Figure 110145875-A0101-12-0060-47
<210> 27
<211> 36
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900695、900698(L-FR3)
<400> 27
Figure 110145875-A0101-12-0061-48
<210> 28
<211> 36
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900696、900697(L-FR3)
<400> 28
Figure 110145875-A0101-12-0061-49
<210> 29
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(VH)
<400> 29
Figure 110145875-A0101-12-0061-50
Figure 110145875-A0101-12-0062-51
<210> 30
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900581(VL)
<400> 30
Figure 110145875-A0101-12-0062-52
<210> 31
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694(VH)
<400> 31
Figure 110145875-A0101-12-0062-53
Figure 110145875-A0101-12-0063-54
<210> 32
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900694(VL)
<400> 32
Figure 110145875-A0101-12-0063-55
<210> 33
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900695、900697(VH)
<400> 33
Figure 110145875-A0101-12-0064-56
<210> 34
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900695、900698(VL)
<400> 34
Figure 110145875-A0101-12-0064-57
Figure 110145875-A0101-12-0065-58
<210> 35
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900696、900698(VH)
<400> 35
Figure 110145875-A0101-12-0065-59
<210> 36
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900696、900697(VL)
<400> 36
Figure 110145875-A0101-12-0065-60
Figure 110145875-A0101-12-0066-61
<210> 37
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CD73(143-157位胺基酸)
<400> 37
Figure 110145875-A0101-12-0066-62
<210> 38
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CD73(178-191位胺基酸)
<400> 38
Figure 110145875-A0101-12-0066-63
<210> 39
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CD73(381-386位胺基酸)
<400> 39
Figure 110145875-A0101-12-0066-64
<210> 40
<211> 574
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CD73酗唗蹈
<400> 40
Figure 110145875-A0101-12-0067-65
Figure 110145875-A0101-12-0068-66
Figure 110145875-A0101-12-0069-67
<210> 41
<211> 122
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900565(VH)
<400> 41
Figure 110145875-A0101-12-0069-68
<210> 42
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900565(VL)
<400> 42
Figure 110145875-A0101-12-0069-69
Figure 110145875-A0101-12-0070-70
<210> 43
<211> 450
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900201(HC)
<400> 43
Figure 110145875-A0101-12-0070-71
Figure 110145875-A0101-12-0071-72
Figure 110145875-A0101-12-0072-73
<210> 44
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 900201(LC)
<400> 44
Figure 110145875-A0101-12-0072-74
Figure 110145875-A0101-12-0073-75
<210> 45
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Oleclumab(HC)
<400> 45
Figure 110145875-A0101-12-0073-76
Figure 110145875-A0101-12-0074-77
<210> 46
<211> 216
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Oleclumab(LC)
<400> 46
Figure 110145875-A0101-12-0075-78

Claims (50)

  1. 一種分離的抗原結合蛋白,其包含HCDR3,該HCDR3包含SEQ ID NO:3所示的胺基酸序列。
  2. 如請求項1所述的分離的抗原結合蛋白,其包含HCDR2,該HCDR2包含SEQ ID NO:2所示的胺基酸序列。
  3. 如請求項1或2所述的分離的抗原結合蛋白,其包含HCDR1,該HCDR1包含SEQ ID NO:1所示的胺基酸序列。
  4. 如請求項1至3中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含LCDR3,該LCDR3包含SEQ ID NO:6所示的胺基酸序列。
  5. 如請求項1至4中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含LCDR2,該LCDR2包含SEQ ID NO:5所示的胺基酸序列。
  6. 如請求項1至5中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含LCDR1,該LCDR1包含SEQ ID NO:4所示的胺基酸序列。
  7. 如請求項3至6中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含H至FR1,該H至FR1的C末端與該HCDR1的N末端直接或間接相連,且該H至FR1包含SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:15或SEQ ID NO:19所示的胺基酸序列。
  8. 如請求項2至7中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含H至FR2,該H至FR2位於該HCDR1與該HCDR2之間,且該H至FR2包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:21所示的胺基酸序列。
  9. 如請求項2至8中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含H至FR3,該H至FR3位於該HCDR2與該HCDR3之間,且該H至FR3包含SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:22所示的胺基酸序列。
  10. 如請求項1至9中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含H至FR4,該H至FR4的N末端與該HCDR3的C末端相連,且該H至FR4包含SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:18所示的胺基酸序列。
  11. 如請求項6至10中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含L至FR1,該L至FR1的C末端與該LCDR1的N末端直接或間接相連,且該L至FR1包含SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:23所示的胺基酸序列。
  12. 如請求項6至11中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含L至FR2,該L至FR2位於該LCDR1與該LCDR2之間,且該L至FR2包含SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:24所示的胺基酸序列。
  13. 如請求項5至12中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含L至FR3,該L至FR3位於該LCDR2與該LCDR3之間,且該L至FR3包含SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:28所示的胺基酸序列。
  14. 如請求項4至13中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含L至FR4,該L至FR4的N末端與該LCDR3的C末端相連,且該L至FR4包含SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:26所示的胺基酸序列。
  15. 如請求項6至14中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其中該HCDR3包含SEQ ID NO:3所示的胺基酸序列,該HCDR2包含SEQ ID NO:2所示的胺基酸序列,該HCDR1包含SEQ ID NO:1所示的胺基酸序列,且該LCDR3包含SEQ ID NO:6所示的胺基酸序列,該LCDR2包含SEQ ID NO:5所示的胺基酸序列,該LCDR1包含SEQ ID NO:4所示的胺基酸序列。
  16. 如請求項1至15中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包 含VH,該VH包含SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:33或SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列。
  17. 如請求項1至16中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含VL,該VL包含SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:34或SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列。
  18. 如請求項17所述的分離的抗原結合蛋白,其包含選自下述的任一組VH和VL:
    1)該VH包含SEQ ID NO:29所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:30所示的胺基酸序列;
    2)該VH包含SEQ ID NO:31所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:32所示的胺基酸序列;
    3)該VH包含SEQ ID NO:33所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:34所示的胺基酸序列;
    4)該VH包含SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列;
    5)該VH包含SEQ ID NO:33所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:36所示的胺基酸序列;以及
    6)該VH包含SEQ ID NO:35所示的胺基酸序列,且該VL包含SEQ ID NO:34所示的胺基酸序列。
  19. 如請求項1至18中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含抗體重鏈恆定區。
  20. 如請求項19所述的分離的抗原結合蛋白,其中該抗體重鏈恆定區源自人抗體重鏈恆定區。
  21. 如請求項19或20所述的分離的抗原結合蛋白,其中該抗體重鏈恆定區源自人IgG重鏈恆定區。
  22. 如請求項19至21中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其中該抗體重鏈恆定區源自人IgG1重鏈恆定區。
  23. 如請求項1至22中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包括抗體輕鏈恆定區。
  24. 如請求項23所述的分離的抗原結合蛋白,其中該抗體輕鏈恆定區源自人Igκ恆定區。
  25. 如請求項1至24中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其包含抗體或其抗原結合片段。
  26. 如請求項25所述的分離的抗原結合蛋白,其中該抗原結合片段包括Fab、Fab’、Fv片段、F(ab’)2、F(ab)2、scFv、di至scFv和/或dAb。
  27. 如請求項25或26所述的分離的抗原結合蛋白,其中該抗體選自下組中的一種或多種:單株抗體、嵌合抗體、人源化抗體和全人源抗體。
  28. 如請求項1至27中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其能夠特異性結合CD73或其功能活性片段。
  29. 如請求項28所述的分離的抗原結合蛋白,該CD73包括人CD73和/或猴CD73。
  30. 如請求項1至29中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其能夠阻止或減少CD73的活化。
  31. 如請求項28至30中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,當與該CD73結合時,該分離的抗原結合蛋白與SEQ ID NO:40所示的胺基酸序列的第143至157位胺基酸或與其對應的CD73序列、SEQ ID NO:40所示的胺基酸序列的第178至191位胺基酸或與其對應的CD73序列和SEQ ID NO:40所示的胺基酸序列的第381至386位胺基酸或與其對應的CD73序列中的至少一個胺基酸殘基相結合。
  32. 如請求項31所述的分離的抗原結合蛋白,其中該第143至157位胺基酸或與其對應的CD73序列位於該CD73的N端結構域,該第178至191位胺基酸或與其對應的CD73序列位於該CD73的N端結構域,且其中該第381至386位胺基酸或與其對應的CD73序列位於該CD73的C端結構域。
  33. 如請求項1至32中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其能夠抑制CD73的酶活性。
  34. 如請求項1至33中任一項所述的分離的抗原結合蛋白,其能夠誘導細胞表面CD73的內吞。
  35. 一種多肽分子,其包含如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白。
  36. 如請求項35所述的多肽分子,其包含融合蛋白。
  37. 一種分離的核酸分子,其編碼如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白或如請求項35或36所述的多肽分子。
  38. 一種載體,其包含如請求項37所述的核酸分子。
  39. 一種細胞,其包含如請求項37所述的核酸分子和/或如請求項38所述的載體。
  40. 一種免疫綴合物,其包含如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白。
  41. 一種醫藥組成物,其包含如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、如請求項35或36所述的多肽分子、如請求項37所述的核酸分子、如請求項38所述的載體、如請求項39所述的細胞和/或如請求項40所述的免疫綴合物,以及視需要地藥學上可接受的載劑。
  42. 一種製備如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白的方法,該方法包括在使得該分離的抗原結合蛋白表達的條件下,培養如請求項39所述的細胞。
  43. 一種如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、如請求項35或36所述的多肽分子、如請求項37所述的核酸分子、如請求項38所述的載體、如請求項39所述的細胞、如請求項40所述的免疫綴合物和/或如請求項41所述的醫藥組成物在製備藥物中的用途,該藥物用於預防和/或治療疾病和/或病症。
  44. 如請求項43所述的用途,其中該疾病和/或病症是CD73介導的疾病和/或病症。
  45. 如請求項43或44所述的用途,其中該疾病和/或病症包括腫瘤。
  46. 如請求項45所述的用途,其中該腫瘤包括實體瘤和/或血液瘤。
  47. 如請求項43至46中任一項所述的用途,其中該疾病和/或病症包括乳腺癌。
  48. 一種檢測樣品中CD73的方法,該方法包括施用如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、如請求項35或36所述的多肽分子、如請求項37所述的核酸分子、如請求項38所述的載體、如請求項39所述的細胞、如請求項40所述的免疫綴合物和/或如請求項41所述的醫藥組成物。
  49. 一種檢測樣品中CD73的試劑或試劑盒,其包含如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、如請求項35或36所述的多肽分子、如請求項37所述的核酸分子、如請求項38所述的載體、如請求項39所述的細胞、如請求項40所述的免疫綴合物和/或如請求項41所述的醫藥組成物。
  50. 一種如請求項1至34中任一項所述的分離的抗原結合蛋白、如請求項35或36所述的多肽分子、如請求項37所述的核酸分子、如請求項38所述的載體、如請求項39所述的細胞、如請求項40所述的免疫綴合物和/或如請求項41所述的醫藥組成物在製備試劑盒中的用途,該試劑盒用於檢測樣品中CD73的存在和/或含量。
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