ES2339619T3 - Moleculas de acidos nucleicos que codifican una enzima ramificadora procedente de bacterias del genero neisseria, asi como procedimientos para la preparacion de alfa-1,4-glucanos ramnificados en las posiciones alfa-1,6. - Google Patents
Moleculas de acidos nucleicos que codifican una enzima ramificadora procedente de bacterias del genero neisseria, asi como procedimientos para la preparacion de alfa-1,4-glucanos ramnificados en las posiciones alfa-1,6. Download PDFInfo
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Abstract
Molécula de ácido nucleico que codifica una enzima ramificadora procedente de una bacteria del género Neisseria, seleccionada entre el conjunto que se compone de (a) moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína, que comprende la secuencia de aminoácidos que se indica dentro de SEQ ID NO: 2; (b) moléculas de ácidos nucleicos que comprenden la región codificadora que se indica dentro de SEQ ID NO: 1; (c) moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína, que comprende la secuencia de aminoácidos, que es codificada por la inserción en el plásmido DSM 12425; (d) moléculas de ácidos nucleicos, que comprenden la región codificadora contenida en la inserción en el plásmido DSM 12425 para una enzima ramificadora; (e) moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una enzima ramificadora procedente de una bacteria del género Neisseria, cuya secuencia en la región de los primeros 100 aminoácidos presenta una identidad entre secuencias de por lo menos un 65% con respecto a la secuencia de aminoácidos indicada dentro de SEQ ID NO: 2; (f) moléculas de ácidos nucleicos, cuya cadena complementaria se hibrida en condiciones rigurosas con una molécula de ácido nucleico de acuerdo con (a), (b), (c), (d) y/o (e), y que codifican una enzima ramificadora procedente de una bacteria del género Neisseria; y (g) moléculas de ácidos nucleicos, cuya secuencia se diferencia de la secuencia de una molécula de ácido nucleico de acuerdo con (f) a causa de la degeneración del código genético.
Description
Moléculas de ácidos nucleicos que codifican una
enzima ramificadora procedente de bacterias del género Neisseria,
así como procedimientos para la preparación de
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6.
El presente invento se refiere a moléculas de
ácidos nucleicos que codifican una enzima ramificadora procedente
de bacterias de género Neisseria, a vectores, a células anfitrionas,
a células de plantas y a plantas que contienen dichas moléculas de
ácidos nucleicos, así como a procedimientos para la producción de un
almidón.
Los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 presentan un
extraordinario interés en diferentes aspectos, puesto que ellos son
idóneos por ejemplo para la producción de productos en el sector de
las industrias farmacéutica y cosmética. Por ejemplo, ellos se
pueden utilizar como agentes aglutinantes para tabletas, como
materiales de vehículo para sustancias activas farmacéuticas, como
un material para envasar, como un material de soporte para
sustancias aditivas a polvos para espolvorear, como sustancia
aditiva absorbente de los rayos UV (ultravioletas), en cremas de
protección contra el sol y como material de soporte o de vehículo
de sustancias aromatizantes u odoríferas.
Los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 se presentan en el reino
vegetal principalmente como una amilopectina como un componente del
almidón. En el reino animal y en bacterias estos glucanos
ramificados aparecen principalmente en forma de glicógeno.
El polisacárido almidón está constituido a base
de eslabones fundamentales químicamente uniformes, a saber las
moléculas de glucosa, pero constituye una compleja mezcla de
diferentes formas de moléculas, que presentan diferencias en lo que
se refiere al grado de polimerización y al grado de ramificación, y
por consiguiente se diferencian grandemente unas de otras en sus
propiedades físicas y químicas. Se establece diferencia entre el
almidón de amilosa, que es un polímero esencialmente no ramificado a
base de unidades de glucosa unidas por enlaces glicosídicos en las
posiciones \alpha-1,4, y el almidón de
amilopectina, que es un polímero ramificado en el que las
ramificaciones pueden realizarse mediante la aparición de
adicionales enlaces glicosídicos en las posiciones
\alpha-1,6. De acuerdo con los datos de un manual
(Voet y Voet, Biochemistry, John Wiley & Sons, 1990), las
ramificaciones en las posiciones \alpha-1,6
aparecen en promedio por cada 24 a 30 radicales de glucosa. Esto
corresponde a un grado de ramificación de aproximadamente 3%-4%. Los
datos acerca del grado de ramificación son variables y dependientes
de la procedencia (p.ej. una especie de planta, una variedad
vegetal, etc.) del respectivo almidón. En unas típicas plantas
utilizadas para la producción de almidón a escala industrial, la
proporción de amilosa en el contenido global de almidón varía entre
10 y 25%. Para la preparación de
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6, con diverso grado de
ramificación, ya se describieron diferentes enfoques, que
comprenden la utilización de plantas (transgénicas).
Así, por ejemplo, la expresión heteróloga de una
glicógeno sintasa bacteriana en plantas de patata conduce a una
ligera disminución del contenido de amilosa, a un aumento del grado
de ramificación y a una modificación del modelo de ramificaciones
de la amilopectina en comparación con plantas de tipo salvaje
(Shewmaker y colaboradores, Plant. Physiol. 104 (1994),
1159-1166). Además, se observó que la expresión
heteróloga de la enzima ramificadora procedente de E. coli
(glgB) en unas mutantes de patatas exentas de amilosa (amf)
(Jacobsen y colaboradores, Euphytica 44 (1989),
43-48) conducía a unas moléculas de amilopectina con
un 25% más de sitios de ramificación (Kortstee y colaboradores,
Plant J. 10 (1996), 83-90) que el testigo (amf). El
aislamiento de los glucanos con diverso grado de ramificación,
producidos en plantas transgénicas, necesita para la eliminación
p.ej. del componente amilosa, unas etapas de purificación
adicionales, que son muy costosas y por lo tanto necesitan una
intensa dedicación de tiempo y de costos. Además, no es posible un
ajuste deliberado del grado de ramificación con tales enfoques. Por
lo demás, tales procedimientos in vivo, a causa de las
condiciones fluctuantes de los ensayos (factores medioambientales,
sitio de localización) poseen una alta variabilidad en lo que se
refiere a la calidad de los productos.
Un grado de ramificación más alto que el de la
amilopectina lo tiene el glicógeno. También este polisacárido
contiene \alpha-1,4-glucanos
ramificados en las posiciones \alpha-1,6. El
glicógeno se diferencia del almidón también en la longitud media de
las cadenas laterales y en el grado de polimerización. El glicógeno,
de acuerdo con los datos de un manual (Voet y Voet, Biochemistry,
John Wiley & Sons, 1990) contiene en promedio por cada 8 a 12
radicales de glucosa un sitio de ramificación en
\alpha-1,6. Esto corresponde a un grado de
ramificación de aproximadamente 8% a 12%. Para el peso molecular de
un glicógeno se encuentran diferentes datos, que se extienden desde
1 millón hasta de más 1.000 millones (D. J. Manners en: Advances in
Carbohydrate Chemistry (Avances en la química de los hidratos de
carbono), coordinador de edición M. L. Wolfrom, Academic Press,
Nueva York (1957), 261-298; Geddes y colaboradores
Carbohydr. Res. 261 (1994), 79-89). También estos
datos son grandemente dependientes del respectivo organismo de
origen, de su estado de nutrición, así como del modo de realizar el
aislamiento del glicógeno. Un glicógeno es obtenido por regla
general a partir de moluscos (p.ej. Mytillus edulis), a
partir de hígados o músculos de mamíferos (p.ej. conejos, ratas)
(Bell y colaboradores Biochem. J. 28 (1934), 882; Bueding y Orrell,
J. Biol. Chem. 236 (1961), 2854). Esto hace que una producción a la
escala industrial necesite una intensa dedicación de tiempo y de
costos.
Los descritos
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6, almidón y glicógeno,
que aparecen de un modo natural, que se han descrito, se comportan
de una manera muy diversa, dependiendo de su proporción de
ramificaciones glicosídicas en las posiciones 1,6. Esto es válido,
entre otras cosas, en lo que se refiere a su solubilidad, su
transparencia, su hidrólisis enzimática, su reología, y sus
propiedades de formación de geles y de retrogradación. Sin embargo,
una tal fluctuación en las propiedades no siempre es tolerable para
muchas aplicaciones industriales.
\global\parskip0.900000\baselineskip
Una alternativa para la obtención de
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 a partir de plantas u
organismos animales la constituyen unos enfoques in vitro.
Estos se distinguen, en comparación con los procedimientos in
vivo, por lo general, por una mejor regulabilidad y por una
reproducibilidad más alta, puesto que las condiciones de reacción
in vitro se pueden ajustar de una manera definida, al
contrario que las condiciones que se presentan en un organismo
vivo. Esto hace posible por regla general la producción de
productos invariables con una gran uniformidad y una gran pureza y
por consiguiente una gran calidad, lo que es de gran importancia
para el uso industrial ulterior. El tratamiento de productos con una
calidad invariable conduce a disminuciones de los costos, puesto
que los parámetros de procedimiento, que son necesarios para el
tratamiento, no tienen que volver a ser optimizados de nuevo para
cada tanda de tratamiento. Otra ventaja adicional de determinados
procedimientos in vitro consiste en que los productos están
libres de los organismos que se utilizan en el procedimiento in
vivo. Para determinadas aplicaciones en la industria alimentaria
y en la industria farmacéutica esto es imperativamente
necesario.
Los procedimientos in vitro se pueden
subdividir en términos generales en dos diferentes conjuntos.
En el caso de uno de los conjuntos de
procedimientos, se someten diferentes substratos, tales como p.ej.
amilosa, amilopectina y glicógeno, a la actividad de una enzima
ramificadora.
Así, Borovsky y colaboradores (Eur. J. Biochem.
59 (1975), 615-625) pudieron mostrar que la
utilización de la enzima ramificadora procedente de patata, en
unión con el substrato amilosa, conduce a unos productos, que
ciertamente son similares a una amilopectina, pero sin embargo se
diferencian estructuralmente de ésta.
Boyer y Preiss (Biochemistry 16 (1977),
3693-3699) mostraron además que se puede utilizar
una enzima ramificadora purificada
(\alpha-1,4-glucano:
\alpha-1,4-glucano
6-glicosil-transferasa) procedente
de E. coli, con el fin de aumentar el grado de ramificación
de la amilosa o amilopectina.
Si, por el contrario, un glicógeno procedente de
E. coli o del hígado de un conejo es incubado con la enzima
ramificadora procedente de E. coli, entonces se consigue
solamente un débil aumento del grado de ramificación (Boyer y
Preiss, véase cita anterior).
También Rumbak y colaboradores (J. Bacteriol.
173 (1991), 6732-6741) pudieron aumentar
adicionalmente el grado de ramificación de una amilosa, una
amilopectina y un glicógeno, al incubar ella a estos substratos con
la enzima ramificadora procedente de Butyrivibrio
fibrisolvens.
Un enfoque similar fue seguido por Okada y
colaboradores, (documento de patente de los EE.UU. nº US 4454161),
con el fin de mejorar las propiedades de unos alimentos que
contienen almidón. En tal caso se incubaron unas sustancias, tales
como una amilosa, una amilopectina, un almidón o una dextrina, en
común con una enzima ramificadora. Esto tenía unos efectos
ventajosos sobre la estabilidad de los alimentos, que contenían las
sustancias correspondientemente modificadas. Además, el documento
de solicitud de patente europea EP-A1 0.690.170
describe la reacción de un almidón gelificado en una solución
acuosa mediando utilización de una enzima ramificadora. Esto conduce
a unos almidones que tienen propiedades ventajosas en la producción
de papel.
Los procedimientos in vitro descritos
precedentemente tienen sin embargo la desventaja de que ya a causa
del grado de ramificación fluctuante de los eductos (productos de
partida) (p.ej. un almidón, una amilopectina, etc.) no es posible
la producción de productos uniformes. Además, no es posible una
regulación deliberada del grado de ramificación, y además de esto
los substratos utilizados son relativamente caros.
El otro conjunto de procedimientos in
vitro comprende la síntesis de novo de
\alpha-1,4-glucanos ramificados
en las posiciones \alpha-1,6
(glucosa-1-fosfato,
ADP-glucosa, UDP-glucosa) mediando
utilización de una combinación de enzimas, que se compone de una
enzima formadora de cadenas de glucanos en las posiciones 1,4
(fosforilasa, sintasa de almidón, sintasa de glicógeno) y de una
enzima ramificadora.
Así, Illingwort y colaboradores (Proc. Nat.
Acad. Sci. USA 47 (1961), 469-478) pudieron mostrar
para un procedimiento in vitro, mediando utilización de una
fosforilasa a procedente de músculos (de un organismo desconocido)
en combinación con una enzima ramificadora (de un organismo
desconocido), que es posible la síntesis de novo de
moléculas similares al glicógeno mediando utilización del substrato
glucosa-1-fosfato. Boyer y Preiss
(véase cita anterior) combinaron la actividad enzimática de una
fosforilasa procedente de músculos de conejo o respectivamente de
una glicógeno sintasa procedente de E. coli, con la de una
enzima ramificadora procedente de E. coli mediando
utilización del substrato
glucosa-1-fosfato o respectivamente
UDP-glucosa, y produjeron de esta manera unos
\alpha-glucanos ramificados. También, Borovsky y
colaboradores (Eur. J. Biochem. 59 (1975), 615-625)
investigaron la síntesis de novo de
1,4-glucanos ramificados en las posiciones
\alpha-1,6 a partir de un
glucosa-1-fosfato mediando
utilización de una enzima ramificadora procedente de patata en
combinación con una fosforilasa
(1,4-\alpha-D-glucano:
ortofosfato \alpha-glicosiltransferasa [EC
2.4.1.1]) procedente de maíz. Doi (Biochimica et Biophysica Acta
184 (1969), 477-485) mostró que la combinación de
enzimas, de una sintasa de almidón
(ADP-D-glucosa:
\alpha-1,4-glucano
\alpha-4-glucosiltransferasa)
procedente de espinaca y de una enzima ramificadora procedente de
patata mediando empleo del substrato ADP-glucosa,
conduce a unos productos similares a las amilopectinas. Parodi y
colaboradores (Arch. Biochem. Biophys. 132 (1969),
11-117) utilizaron, para la síntesis de novo
de glucanos ramificados a partir de una
UDP-glucosa, una glicógeno sintasa procedente de
hígados de ratas, combinada con una enzima ramificadora procedente
de hígados de ratas. Ellos obtuvieron un polímero, que se asemeja al
glicógeno natural y que se diferencia de los polímeros que están
basados en un glucosa-1-fosfato.
\global\parskip1.000000\baselineskip
También este segundo conjunto de procedimientos
in vitro presenta la desventaja de que los substratos, p.ej.
glucosa-1-fosfato,
UDP-glucosa y ADP-glucosa, son muy
caros. Además, también en este caso parece no ser posible una
regulación deliberada del grado de ramificación.
Büttcher y colaboradores (J. Bacteriol. 179
(1997), 3324-3330) describen un procedimiento in
vitro para la preparación de
\alpha-1,4-glucanos insolubles en
agua, mediando utilización de una amilosacarasa y de sacarosa como
substrato. En este caso se sintetizan sin embargo solamente
\alpha-1,4-glucanos lineales sin
ramificaciones.
El presente invento está basado por consiguiente
en la misión de poner a disposición un procedimiento que haga
posible la preparación barata de
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 para finalidades
industriales, así como la de poner a disposición unas moléculas de
ácidos nucleicos, que codifiquen unas enzimas empleables en tales
procedimientos, en particular enzimas ramificadoras.
El problema planteado por esta misión es
resuelto mediante las formas de realización designadas en las
reivindicaciones.
Por consiguiente, el presente invento se refiere
a unas moléculas de ácidos nucleicos que codifican una enzima
ramificadora (EC 2.4.1.18) procedente de bacterias del género
Neisseria, seleccionadas entre el conjunto que se compone de
- (a)
- moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína, que comprende la secuencia de aminoácidos que se representa en SEQ ID NO: 2;
- (b)
- moléculas de ácidos nucleicos, que comprenden la secuencia de nucleótidos de la región codificadora, que se representa en SEQ ID NO: 1;
- (c)
- moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína, que comprende la secuencia de aminoácidos, que es codificada por la inserción en el plásmido DSM 12425;
- (d)
- moléculas de ácidos nucleicos que comprenden la región de la inserción en el plásmido DSM 12425, que codifica una enzima ramificadora procedente de Neisseria denitrificans;
- (e)
- moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína, cuya secuencia tiene en la región de los primeros 100 aminoácidos una identidad entre secuencias de por lo menos un 65% con respecto a la secuencia indicada dentro de SEQ ID NO: 2;
- (f)
- moléculas de ácidos nucleicos, cuya cadena complementaria se hibrida con una molécula de ácido nucleico según (a), (b), (c), (d) y/o (e), y que codifican una enzima ramificadora procedente de una bacteria del género Neisseria; y
- (g)
- moléculas de ácidos nucleicos, cuya secuencia de nucleótidos se diferencia de la secuencia de una molécula de ácido nucleico de acuerdo con (f) a causa de la degeneración del código genético.
\vskip1.000000\baselineskip
La secuencia de ácido nucleico representada en
SEQ ID NO:1 es una secuencia genómica, que comprende una región
codificadora para una enzima ramificadora procedente de Neisseria
denitrificans. Un plásmido que contiene esta secuencia de ADN
fue depositado como DSM 12425. Con ayuda de esta secuencia o
respectivamente de esta molécula se ha hecho posible por fin para
un experto en la especialidad aislar secuencias homólogas
procedentes de otras especies o cepas de Neisseria. Esto se puede
efectuar, por ejemplo, con ayuda de métodos convencionales tales
como el escrutinio de ADNc (cromosómico) o de bancos genómicos con
unas apropiadas sondas de hibridación. El aislamiento de secuencias
homólogas puede efectuarse también tal como se ha descrito en el
Ejemplo 1. De este modo es posible por ejemplo identificar y aislar
unas moléculas de ácido nucleico, que se hibridan con la secuencia
indicada dentro de SEQ ID NO:1 y que codifican una enzima
ramificadora.
Las moléculas de ácidos nucleicos conformes al
invento pueden codificar en principio una enzima ramificadora
procedente de cualquier bacteria arbitraria del género Neisseria,
preferiblemente ellas codifican una enzima ramificadora procedente
de Neisseria denitrificans.
El concepto de "hibridación" significa, en
el marco del presente invento, una hibridación en condiciones
convencionales de hibridación, de manera preferida en condiciones
rigurosas, tal como ellas se han descrito por ejemplo en la obra de
Sambrook y colaboradores, Molecular Cloning, A Laboratory Manual
(clonación molecular, un manual de laboratorio), 2ª edición (1989)
Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY). De
manera especialmente preferida el concepto de "hibridación"
significa una hibridación en las siguientes condiciones:
- Tampón de hibridación:
- 2xSSC; 10x solución de Denhardt (Fikoll 400+PEG+BSA; relación 1:1:1); 0,1% de SDS; 5 mM de EDTA; 50 mM de Na_{2}HPO_{4}; 250 \mug/ml de ADN de esperma de arenque; 50 \mug/ml de ARNt (ARN de transferencia); o 25 M de un tampón fosfato de sodio de pH 7,2; 1 mM de EDTA; 7% de SDS
- Temperatura de hibridación:
- T = de 65 a 68ºC
- Tampón de lavado:
- 0,2xSSC; 0,1% de SDS
- Temperatura de lavado:
- T = de 65 a 68ºC.
Las moléculas de ácidos nucleicos, que se
hibridan con las moléculas de ácidos nucleicos conformes al invento,
pueden proceder en principio de cualquier bacteria arbitraria del
género Neisseria, que exprese una correspondiente proteína, de
manera preferida ellas proceden de Neisseria denitrificans.
Las moléculas de ácidos nucleicos, que se hibridan con las
moléculas conformes al invento, se pueden aislar p.ej. a partir de
bibliotecas genómicas o de ADNc. La identificación y el aislamiento
de tales moléculas de ácidos nucleicos se pueden efectuar en tal
caso mediando utilización de las moléculas de ácidos nucleicos
conformes al invento, o de partes de estas moléculas o
respectivamente de los complementos inversos de estas moléculas,
p.ej. mediante una hibridación de acuerdo con procedimientos
clásicos (véase p.ej. Sambrook y colaboradores, 1989, Molecular
Cloning, A Laboratory Manual, 2ª edición Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY) o por amplificación
mediante una PCR (reacción en cadena de la polimerasa).
Como sonda de hibridación se pueden utilizar
p.ej. unas moléculas de ácidos nucleicos que tienen exactamente o
en esencial la secuencia de nucleótidos que se indica dentro de SEQ
ID NO:1, o partes de esta secuencia. En el caso de los fragmentos
utilizados como sonda de hibridación puede tratarse también de unos
fragmentos sintéticos, que se habían producido con ayuda de las
técnicas de síntesis corrientes, y cuya secuencia coincide en lo
esencial con la de una molécula de ácido nucleico conforme al
invento. Si se han identificado y aislado unos genes, que se
hibridan con las secuencias de ácidos nucleicos conformes al
invento, deberían efectuarse una determinación de la secuencia y un
análisis de las propiedades de las proteínas codificadas por esta
secuencia, con el fin de comprobar si se trata de una enzima
ramificadora. Para esto, son apropiadas en particular unas
comparaciones de homologías en el plano de la secuencia de ácido
nucleico o de la secuencia de aminoácidos, así como la
determinación de la actividad enzimática.
Las moléculas que se hibridan con las moléculas
de ácidos nucleicos conformes al invento comprenden en particular
fragmentos, derivados y variantes alélicas de las moléculas de
ácidos nucleicos que más arriba se han descrito, las cuales
codifican una enzima ramificadora procedente de bacterias del género
Neisseria, preferiblemente procedentes de Neisseria
denitrificans. La expresión derivado significa en este contexto
el hecho de que las secuencias de estas moléculas se diferencian de
las secuencias de los ácidos nucleicos, que más arriba se han
descrito, en una o varias posiciones, y presentan un alto grado de
homología con respecto de estas secuencias. Homología significa en
este contexto una identidad entre secuencias a lo largo de toda la
longitud, de por lo menos un 60%, en particular una identidad de
por lo menos un 70%, de manera preferida situada por encima de un
80%, de manera especialmente preferida por encima de un 90% y en
particular de por lo menos un 95%. Las desviaciones con respecto de
las moléculas de ácidos nucleicos que más arriba se han descrito
pueden haber resultado en este contexto p.ej. por deleción,
adición, sustitución, inserción o recombinación.
Homología significa además el hecho de que
existe una equivalencia funcional y/o estructural entre las
correspondientes moléculas de ácidos nucleicos o entre las
proteínas codificadas por ellas. En el caso de las moléculas de
ácidos nucleicos, que son homólogas con respecto a las moléculas que
se han descrito más arriba y que constituyen derivados de estas
moléculas, se trata por regla general de unas variaciones de estas
moléculas, que constituyen unas modificaciones, que ejercen la
misma función biológica. En este contexto, puede tratarse tanto de
variaciones que aparecen de un modo natural, por ejemplo puede
tratarse de secuencias de otras especies o cepas de Neisseria o de
unas mutaciones, realizándose que estas mutaciones pueden haber
aparecido de una manera natural o habían sido introducidas mediante
una mutagénesis deliberada. Además, en el caso de las variaciones
puede tratarse de unas secuencias producidas por síntesis. En el
caso de las variantes alélicas, puede tratarse tanto de unas
variantes que aparecen de una manera natural como también de unas
variantes producidas por síntesis o por técnicas de ADN
recombinantes.
Las proteínas codificadas por las diferentes
variantes de las moléculas de ácidos nucleicos, presentan
determinadas características en común. A éstas pueden pertenecer
p.ej. la actividad biológica, el peso molecular, la reactividad
inmunológica, la conformación, etc., así como ciertas propiedades
físicas tales como p.ej. el comportamiento de elución en
electroforesis en gel, el comportamiento cromatográfico, los
coeficientes de sedimentación, la solubilidad, las propiedades
espectroscópicas, la estabilidad; el valor óptimo del pH, el valor
óptimo de la temperatura, etc.
El peso molecular de la enzima ramificadora que
se deriva de la secuencia de aminoácidos, procedente de Neisseria
denitrificans, es de 86,3 kDa (kilodalton). El peso molecular
que se deriva de una proteína conforme al invento está situado por
lo tanto de manera preferida en el intervalo de 70 kDa a 100 kDa, de
manera más preferida en el intervalo de 77 kDa a 95 kDa y de manera
especialmente preferida en alrededor de 86 kDa.
El presente invento concierne también a unas
moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína con la
actividad enzimática de una enzima ramificadora, presentando la
proteína codificada en la región del extremo terminal de N, de
manera preferida en los primeros 110 aminoácidos y de manera
especialmente preferida en los primeros 120 aminoácidos, una
homología de por lo menos un 65%, de manera preferida de por lo
menos un 80% y de manera especialmente preferida de por lo menos un
95% con respecto a la secuencia de aminoácidos que se indica dentro
de SEQ ID NO:2.
En otra forma de realización adicional, la
presente solicitud concierne a unas moléculas de ácidos nucleicos,
que codifican una proteína con una actividad de enzima ramificadora,
que comprende por lo menos uno, de manera preferida por lo menos 5,
en particular por lo menos 10 y de manera especialmente preferida
por lo menos 20 de los siguientes motivos de péptidos:
- (a)
- MNRNRHI (SEQ ID NO:8),
- (b)
- RPDAHH (SEQ ID NO:9),
- (c)
- HAPDYAL (SEQ ID NO:10),
- (d)
- EGEAA (SEQ ID NO:11),
- (e)
- DDYRF (SEQ ID NO:12),
- (f)
- SALQH (SEQ ID NO:13),
- (g)
- YETLG (SEQ ID NO:14),
- (h)
- VSGVR (SEQ ID NO:15),
- (i)
- VSVIG (SEQ ID NO:16),
- (j)
- FNGWD (SEQ ID NO:17),
- (k)
- LYKFS (SEQ ID NO:18),
- (l)
- PYAFG (SEQ ID NO:19),
- (m)
- RPTTAS (SEQ ID NO:20),
- (n)
- FRRRA (SEQ ID NO:21),
- (o)
- DELVNY (SEQ ID NO:22),
- (p)
- LPLSEY (SEQ ID NO:23),
- (q)
- YQATGL (SEQ ID NO:24).
- (r)
- DDHGL (SEQ ID NO:25),
- (s)
- HQDWN (SEQ ID NO:26),
- (t)
- DGIRV (SEQ ID NO:27),
- (u)
- YGGSEN (SEQ ID NO:28),
- (v)
- SFAEES (SEQ ID NO:29),
- (w)
- DPVHR (SEQ ID NO:30),
- (x)
- WQQFAN (SEQ ID NO:31),
- (y)
- EILNS (SEQ ID NO:32),
- (z)
- ATEIQTAL (SEQ ID NO:33),
- (aa)
- VKDKQAKAK (SEQ ID NO:34).
Las moléculas de ácidos nucleicos conformes al
invento pueden ser unas arbitrarias moléculas de ácidos nucleicos,
en particular unas moléculas de ADN o ARN, por ejemplo de ADNc, ADN
genómico, ARNm (ARN mensajero), etc. Ellas pueden ser unas
moléculas que se presentan de un modo natural o pueden ser unas
moléculas producidas por procedimientos de tecnología genética o de
síntesis química. Ellas pueden ser unas moléculas monocatenarias,
que contienen o bien la cadena codificadora o la cadena no
codificadora, o unas moléculas bicatenarias.
Además, la presente divulgación concierne a unas
moléculas de ácidos nucleicos que tienen una longitud de por lo
menos 15, de manera preferida de más de 50 y de manera especialmente
preferida de más de 200 nucleótidos, que se hibridan
específicamente con por lo menos una molécula de ácido nucleico
conforme al invento. El concepto de hibridarse específicamente
significa en este contexto que estas moléculas se hibridan con unas
moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína conforme
al invento, pero no con unas moléculas de ácidos nucleicos, que
codifican otras proteínas. El concepto de hibridarse significa en
este contexto preferiblemente una hibridación en condiciones
rigurosas (véanse más arriba). En particular, la divulgación se
refiere a aquellas moléculas de ácidos nucleicos, que se hibridan
con unos transcritos de moléculas conformes al invento y de esta
manera pueden impedir su traducción. Tales moléculas de ácidos
nucleicos, que se hibridan específicamente con las moléculas de
ácidos nucleicos conformes al invento, pueden ser por ejemplo partes
componentes de construcciones artificiales antisentido o ribozimas
o se pueden utilizar como cebadores para la amplificación mediante
una PCR.
Además, el invento se refiere a unos vectores,
en particular a plásmidos, cósmidos, virus, bacteriófagos y otros
vectores, que son corrientes en la tecnología genética, los cuales
contienen las moléculas de ácidos nucleicos conformes al invento
que más arriba se han descrito.
En una forma preferida de realización, las
moléculas de ácidos nucleicos contenidas en los vectores están
unidas en una orientación en el mismo sentido (in sense) con
unos elementos reguladores, que garantizan la expresión en células
procarióticas o eucarióticas. El concepto de "expresión" puede
significar en tal contexto una transcripción así como también una
transcripción y una traducción.
La expresión de las moléculas de ácidos
nucleicos conformes al invento en células procarióticas, por ejemplo
en Escherichia coli, hace posible por ejemplo una
caracterización más exacta de las actividades enzimáticas de las
proteínas codificadas. Además de esto, es posible introducir,
mediante técnicas corrientes de biología molecular (compárese p.ej.
Sambrook y colaboradores, véase cita anterior), mutaciones de
diversos tipos en las moléculas de ácidos nucleicos conformes al
invento, con lo cual se llega a la síntesis de unas proteínas que
tienen unas propiedades biológicas eventualmente modificadas. Es
posible la producción de unas mutantes por deleción, en las cuales,
mediante deleciones progresivas desde el extremo 5' o desde el
extremo 3' de la secuencia de ADN codificadora, se producen unas
moléculas de ácidos nucleicos que conducen a la síntesis de unas
proteínas correspondientemente acortadas. Es posible también la
introducción de mutaciones puntuales en unas posiciones, que tienen
una cierta influencia por ejemplo sobre la actividad enzimática o
sobre la regulación de la enzima. De esta manera, se pueden
producir p.ej. unas mutantes que poseen un valor de K_{m}
modificado o que ya no están sujetas a los mecanismos de regulación
que normalmente están presentes en la célula, a través de una
regulación alostérica o de una modificación covalente. Además, se
pueden producir unas mutantes, que presentan una especificidad
modificada para ciertos substratos o productos. Además, se pueden
producir unas mutantes que presentan un perfil modificado de
actividades y temperaturas. La manipulación por tecnología genética
en células eucarióticas puede efectuarse de acuerdo con los métodos
conocidos por un experto en la especialidad (compárese Sambrook y
colaboradores, véase cita anterior).
Unas secuencias reguladoras de la expresión en
organismos procarióticos, p.ej. E. coli, y en organismos
eucarióticos, se han descrito suficientemente en la bibliografía,
en particular las destinadas a la expresión en levaduras, tales
como p.ej. Saccharomyces cerevisiae. Una recopilación de los
diferentes sistemas para la expresión de proteínas en diferentes
organismos anfitriones, se encuentra p.ej. en la cita de Methods in
Enzymology 153 (1987), 383-516 y en la cita de
Bitter y colaboradores (Methods in Enzymology 153 (1987),
516-544).
De manera preferida, la molécula de ácido
nucleico conforme al invento, insertada en un vector conforme al
invento, está modificada de una manera tal que la proteína
codificada, después de una expresión en un apropiado organismo
anfitrión, puede ser aislada con mayor facilidad a partir del medio
de cultivo. Así, existe por ejemplo la posibilidad de expresar el
sistema de ramificación codificado como una proteína de fusión con
una secuencia de polipéptido adicional, cuyas propiedades
específicas de fijación permiten el aislamiento de la proteína de
fusión a través de una cromatografía de afinidad (véanse p.ej. las
citas de Chong y colaboradores, Gene 192 (1997),
271-281; Hopp y colaboradores, Bio/Technology 6
(1988), 1204-1210; Sassenfeld, Trends Biotechnol. 8
(1990), 88-93).
Además, es preferido que la molécula de ácido
nucleico, que está contenida en un vector conforme al invento,
abarque unas secuencias de nucleótidos, que permitan la secreción de
la enzima ramificadora en el medio de cultivo. De manera preferida,
se utiliza una secuencia que codifica el péptido de señal de la
\alpha-CGTase procedente de Klebsiella
oxytoca M5A1 (Fiedler y colaboradores, J. Mol. Biol. 256 (1996),
279-291; nº de acceso al Genebank X86014, CDS
11529-11618). Mediante la secreción de la enzima
dentro del medio de cultivo se simplifican la recuperación y la
purificación. Se evita una disgregación de las células y la enzima
se puede recuperar a partir del medio de cultivo, pudiéndose
emplear para la eliminación de los componentes residuales del medio
de cultivo unos métodos corrientes, tales como p.ej., diálisis,
ósmosis, métodos cromatográficos, etc.
Además, los vectores conformes al invento pueden
comprender otras unidades funcionales adicionales, que producen una
estabilización del vector en un organismo anfitrión, tal como p.ej.
un origen de replicación bacteriano o el ADN 2\mu para la
estabilización en S. cerevisiae.
En una forma de realización adicional, el
invento se refiere a unas células anfitrionas, en particular a unas
células procarióticas o eucarióticas, que habían sido transformadas
con un vector descrito más arriba, así como unas células que
proceden de tales células anfitrionas y que contienen los vectores
descritos. Las células anfitrionas pueden ser células de bacterias
(p.ej. de E. coli) o de hongos (p.ej. de levaduras, en
particular de S. cerevisiae), así como células de plantas o
animales. El concepto "transformado" significa en este
contexto que las células conformes al invento están modificadas
genéticamente con una molécula de ácido nucleico conforme al
invento, por cuanto que ellas, adicionalmente a su genoma natural,
contienen por lo menos una molécula de ácido nucleico conforme al
invento. Ésta puede presentarse libremente en la célula,
eventualmente como una molécula autorreplicante, o puede
presentarse integrada establemente en el genoma de la célula
anfitriona.
De manera preferida, las células anfitrionas son
microorganismos. Dentro de este concepto se entienden en el marco
de la presente solicitud todas las bacterias y todos los protistas
(p.ej. hongos, en particular levaduras y algas), tal como ellas/os
se han descrito p.ej. en la obra de Schlegel "Allgemeine
Mikrobiologie" (Microbiología general) (editorial Georg Thieme
(1985), 1-2).
De manera especialmente preferida, las células
anfitrionas conformes al invento son células de plantas. En tal
contexto puede tratarse en principio de células de plantas
procedentes de cualquier especie arbitraria de plantas, es decir
plantas tanto monocotiledóneas como también dicotiledóneas. De
manera preferida, se trata de células de plantas procedentes de
plantas útiles agrícolas, es decir procedentes de plantas que son
cultivadas por los seres humanos con finalidades de nutrición o
para finalidades técnicas, en particular industriales. De manera
preferida, el invento se refiere a unas células de plantas
procedentes de plantas que forman fibras (p.ej. lino, cáñamo,
algodón), que almacenan aceite (p.ej. colza, girasol, soja), que
almacenan azúcares (p.ej. remolacha azucarera, caña de azúcar, mijo
azucarero, bananos) y plantas que almacenan proteínas (p.ej.
leguminosas).
En otra forma de realización adicional, el
invento se refiere a unas células de plantas procedentes de plantas
forrajeras (p.ej. hierbas forrajeras y de prado (alfalfa, trébol,
etc.)), plantas de hortalizas (p.ej. tomate, lechuga,
achicoria).
En una forma preferida de realización, el
invento se refiere a unas células de plantas procedentes de plantas
que almacenan almidón (p.ej. trigo, cebada, avena, centeno, patata,
maíz, arroz, guisante, mandioca, haba de mung), son especialmente
preferidas unas células de plantas procedentes de plantas de maíz,
arroz, trigo y patata.
Además, el presente invento se refiere a un
procedimiento para la producción de una enzima ramificadora
procedente de bacterias del género Neisseria, en el que se cultivan
células anfitrionas conformes al invento en unas condiciones, que
permiten la expresión de la proteína, y la proteína es recuperada a
partir del cultivo, es decir a partir de las células y/o del medio
de cultivo. De manera preferida se utiliza en tal caso un organismo
hospedante, que secreta la enzima ramificadora.
Además, el presente invento se refiere a un
procedimiento para la producción de una enzima ramificadora
procedente de bacterias del género Neisseria, siendo producida la
proteína en un sistema de transcripción y traducción in
vitro mediando utilización de una molécula de ácido nucleico
conforme al invento. Tales sistemas son habituales para un experto
en la especialidad.
El invento se refiere también a unas proteínas,
que son codificadas por las moléculas de ácidos nucleicos conformes
al invento, o que son obtenibles mediante un procedimiento conforme
al invento.
El presente invento se refiere además a unos
anticuerpos, que reconocen específicamente a una proteína conforme
al invento. Éstos pueden ser p.ej. anticuerpos monoclonales o
policlonales. También pueden ser fragmentos de anticuerpos, que
reconocen a las proteínas conformes al invento. Los métodos para la
producción de tales anticuerpos o respectivamente fragmentos son
habituales para un experto en la especialidad.
Además, el presente invento se refiere a la
utilización de una enzima ramificadora conforme al invento destinada
a la preparación de
\alpha-1.4-glucanos, ramificados
en las posiciones \alpha-1,6, en unos sistemas
in vitro.
El presente invento se refiere en particular
también a unas células de plantas transgénicas, que contienen las
moléculas de ácidos nucleicos o los vectores conformes al invento.
De manera preferida, las células conformes al invento están
caracterizadas por el hecho de que la molécula de ácido nucleico,
que se ha introducido conforme al invento, está integrada de una
manera estable en el genoma y se encuentra bajo el control de un
promotor que es activo en células de plantas.
Para la expresión de una molécula de ácido
nucleico conforme al invento en células de plantas, están a
disposición un gran número de promotores o respectivamente de
elementos reguladores. Los elementos reguladores para la expresión
en células de plantas son en este contexto en principio todos los
promotores, intensificadores, terminadores, etc., que son activos
en células de plantas. En principio se puede utilizar cualquier
promotor que sea funcional en las plantas escogidas para la
transformación. El promotor puede ser homólogo o heterólogo en
relación con la especie de planta utilizada. En este caso, puede ser
escogido de tal manera que la expresión se efectúe de una manera
constitutiva o solamente en un tejido determinado, en un momento
determinado del desarrollo de la planta o en un momento que ha sido
determinado por influencias externas. Es apropiado por ejemplo el
promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor (Odell y
colaboradores, Nature 313 (1985), 810-812 o el
documento de patente de los EE.UU US 5.352.605), que garantiza una
expresión constitutiva en todos los tejidos de una planta y la
construcción artificial de promotor, que se describe en el documento
de solicitud de patente internacional WO/9401571. Otro ejemplo
distinto es el promotor de ubiquitina (véase p.ej. el documento US
5.614.399) así como los promotores de los genes de poliubiquitina
procedentes de maíz (Christensen y colaboradores, véase cita
anterior). Sin embargo, también se pueden utilizar unos promotores,
que son activados solamente en un momento que ha sido determinado
por influencias externas (véase por ejemplo el documento
WO/9307279). Pueden presentar un interés especial en este contexto
unos promotores de proteínas de choque térmico (en inglés
heat-shock), que permiten una sencilla inducción.
Además, se pueden utilizar los promotores, que en un determinado
tejido de la planta conducen a una expresión de secuencias
conectadas posteriormente, por ejemplo en un tejido activo
fotosintéticamente. Ejemplos de ellos son el promotor de
ST-LS1 (Stockhaus y colaboradores, Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 84 (1987), 7943-7947; Stockhaus y
colaboradores, EMBO J. 8 (1989), 2445-2451), el
promotor de Ca/b (véanse p.ej. los documentos US 5.656.496, US
5.639.952, Bansal y colaboradores, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89
(1992), 3654-3658) y el promotor SSU de Rubisco
(véanse p.ej. los documentos US 5.034.322.y US 4.962.028). Han de
mencionarse además unos promotores, que son activos en los órganos
almacenadores de almidón de las plantas que se han de transformar.
Estos son, p.ej. en el caso del maíz, los granos de maíz, mientras
que en el caso de la patata son los tubérculos. Para la
sobreexpresión de las moléculas de ácidos nucleicos conformes al
invento en la patata, se puede utilizar por ejemplo el promotor B33
del gen de patatin (Rocha-Sosa y colaboradores,
EMBO J. 8 (1989), 23-29). Unos promotores
específicos para las semillas ya se han descrito para diferentes
especies de plantas. Así, p.ej. el promotor USP procedente de Vicia
faba, que garantiza una expresión específica para las semillas en
V. faba y otras plantas (Fiedler y colaboradores, Plant Mol. Biol.
22 (1993), 669-679; Bäumlein y colaboradores, Mol
Gen. Genet. 225 (1991), 459-467).
Además, se pueden emplear también unos
promotores específicos para frutos, tales como p.ej. los que se
describen en el documento WO 9101373. De manera especialmente
preferida se utilizan promotores para una expresión específica en
el endospermo, tales como p.ej. el promotor de glutelina (Leisy y
colaboradores, Plant Mol. Biol. 14 (1990), 41-50;
Zheng y colaboradores, Plant J. 4 (1993), 357-366),
el promotor HMG procedente de trigo, el promotor USP, el promotor
de faseolina o promotores de genes de zeina procedentes de maíz
(Pedersen y colaboradores, Cell 29 (1982),
1015-1026; Quatroccio y colaboradores, Plant Mol.
Biol. 15 (1990), 81-93). Con ayuda de promotores
específicos para el endospermo es posible aumentar la cantidad de
los transcritos de las moléculas de ácidos nucleicos conformes al
invento en el endospermo, en comparación con el endospermo de unas
correspondientes plantas de tipo salvaje.
De manera especialmente preferida se utiliza el
promotor shrunken-1 (sh-1)
procedente de maíz (Werr y colaboradores, EMBO J. 4 (1985),
1373-1380).
Además, puede estar presente una secuencia de
terminación, que sirve para la terminación correcta de la
transcripción así como para la adición al transcrito de una cola de
poly-A, a la que se atribuye una función en el caso
de la estabilización de de los transcritos. Tales elementos han sido
descritos en la bibliografía (compárese p.ej. Gielen y
colaboradores, EMBO J. 8 (1989), 23-29) y son
permutables arbitrariamente.
Es posible por consiguiente la expresión de las
moléculas de ácidos nucleicos conformes al invento en células de
plantas.
Por consiguiente, el presente invento se refiere
asimismo a un procedimiento para la producción de células de
plantas transgénicas, que comprenden la introducción de una molécula
de ácido nucleico o de un vector conforme al invento en células de
plantas. En este caso están a disposición de un experto en la
especialidad diferentes sistemas de transformación de plantas,
p.ej. se ha investigado intensamente la utilización de un
ADN-T para la transformación de células de plantas
y se ha descrito en el documento
EP-A-120.516; y en las citas de
Hoekema: The Binary Plant Vector System (el sistema de vectores
vegetales de plantas), Offsetdrukkerij Kanters B.V., Alblasserdam
(1985), capítulo V, Fraley, Crit. Rev. Plant. Sci., 4,
1-46 und An, EMBO J. 4 (1985),
277-287.
Para la transferencia de los ADN a la célula de
planta, unos explantes de plantas se pueden cultivar
concomitantemente, de manera conveniente con Agrobacterium
tumefaciens o Agrobacterium rhizogenes. A partir del
material infectado de las plantas (p.ej. trozos de hojas, segmentos
de tallos, raíces, pero también protoplastos o células de plantas
cultivadas en suspensión) entonces se pueden regenerar de nuevo
plantas enteras en un medio apropiado, que puede contener
antibióticos o biocidas para la selección de células transformadas.
Las plantas obtenidas de esta manera pueden ser investigadas en
cuanto a la presencia del ADN introducido. Otras posibilidades de
la introducción de ADN ajenos, mediando utilización del
procedimiento biolístico o mediante transformación de protoplastos,
son conocidas (compárese p.ej. Willmitzer, L., 1993 Transgenic
plants. In: Biotechnology, A Multi-Volume
Comprehensive Treatise (Plantas transgénicas. En: biotecnología un
tratado comprensivo de volúmenes múltiples) (H.J. Rehm, G. Reed, A.
Pühler, P. Stadler, coordinadores de edición), volumen 2,
627-659, VCH Weinheim - Nueva York - Basilea -
Cambridge).
Unos sistemas alternativos para la
transformación de plantas monocotiledóneas son la transformación
mediante el enfoque biolístico, la asimilación de ADN en
protoplastos que ha sido inducida por medios eléctricos o químicos,
la electroporación de células parcialmente permeabilizadas, la
macroinyección de ADN en inflorescencias, la microinyección de ADN
en microsporas y pro-embriones, la asimilación de
ADN por un polen en germinación y la asimilación de ADN en
embriones por hinchamiento (véanse p.ej. Lusardi, Plant J. 5 (1994),
571-582; Paszkowski, Biotechnology 24 (1992),
387-392).
Mientras que la transformación de plantas
dicotiledóneas a través de sistemas de vectores del plásmido Ti con
ayuda de Agrobacterium tumefaciens está bien consagrada, unos
nuevos trabajos apuntan a que también las plantas monocotiledóneas
son muy perfectamente accesibles a la transformación mediantes
vectores que se basan en Agrobacterium (Chan, Plant Mol. Biol. 22
(1993), 491-506; Hiei, Plant J. 6 (1994),
271-282; Bytebier, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84
(1987), 5345-5349; Raineri, Bio/Technology 8 (1990),
33-38; Gould, Plant Physiol. 95 (1991),
426-434; Mooney, Plant, Cell Tiss. & Org. Cult.
25 (1991), 209-218; Li, Plant Mol. Biol. 20 (1992),
1037-1048).
Tres de los sistemas de transformación que
arriba se han mencionado pudieron ser consagrados en el pasado para
diferentes cereales: la electroporación de tejidos, la
transformación de protoplastos y la transferencia de ADN mediante
disparo de partículas en tejidos y células regenerables (para la
recopilación, véase Jähne, Euphytica 85 (1995),
35-44). La transformación de trigo ha sido descrita
de manera diversa en la bibliografía (para una recopilación: véase
Maheshwari, Critical Reviews in Plant Science 14 (2) (1995),
149-178).
En particular, la transformación de maíz fue
descrita de manera múltiple en la bibliografía (compárense p.ej.
los documentos WO 95/06128, EP 0513849, EP 0465875, EP 292435; Fromm
y colaboradores, Biotechnology 8 (1990), 833-844;
Gordon-Kamm y colaboradores Plant Cell 2 (1990),
603-618; Koziel y colaboradores, Biotechnology 11
(1993), 194-200; Moroc y colaboradores Theor. Appl.
Genet. 80 (1990), 721-726).
También fue descrita ya la transformación con
éxito de otras especies de cereales, p.ej. para la cebada (Wan y
Lemaux, véase cita anterior; Ritala y colaboradores véase cita
anterior; Krens y colaboradores Nature 296 (1982),
72-74) y para el trigo (Nehra y colaboradores, Plant
J. 5 (1994), 285-297).
En el caso de la expresión de las moléculas de
ácidos nucleicos conformes al invento en plantas existe
fundamentalmente la posibilidad de que la proteína sintetizada
pueda ser localizada en cualquier compartimiento arbitrario de la
célula de planta. Con el fin de conseguir la localización en un
determinado compartimiento, región codificadora debe de ser unida
eventualmente con unas secuencias de ADN que garanticen la
localización en el respectivo compartimiento. Tales secuencias son
conocidas (véanse por ejemplo Braun, EMBO J. 11 (1992),
3219-3227; Sonnewald, Plant J. 1 (1991),
95-106; Rocha-Sosa, EMBO J. 8
(1989), 23-29).
Como secuencia de señal plastídica se puede
utilizar por ejemplo la del sistema de ferrodoxina:NADP+
oxidorreductasa (FNR) procedente de espinaca. Esta secuencia
contiene la región no traducida en 5' así como la secuencia
flanqueadora de péptido de transito del ADNc de la proteína
plastídica ferrodoxina: NADP+ oxidorreductasa procedente de
espinaca (los nucleótidos -171 hasta + 165; Jansen y colaboradores,
Current Genetics 13 (1988),
517-522).
517-522).
Además, como secuencia de señal plastídica se
puede utilizar por ejemplo el péptido de tránsito de la proteína
cerosa (en inglés waxy) procedente de maíz más los primeros 34
aminoácidos de la proteína cerosa madura (Klösgen y colaboradores,
Mol Gen Genet. 217 (1989), 155-161). Además de esto,
se puede utilizar el péptido de tránsito de la proteína cerosa
procedente de maíz (véase más arriba) también sin los primeros 34
aminoácidos de la proteína cerosa madura.
Además, se puede concebir la utilización de las
siguientes secuencias de señales plastídicas: la secuencia de señal
de la subunidad pequeña de la ribulosa bisfosfato carboxilasa
(Wolter y colaboradores, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85 (1988),
846-850; Nawrath y colaboradores, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 91 (1994), 12760-12764); la secuencia de
señal de la NADP-malato deshidrogenasa (Gallardo y
colaboradores, Planta 197 (1995), 324-332); la
secuencia de señal de la glutatión reductasa (Creissen y
colaboradores, Plant J. 8 (1995), 167-175).
El presente invento concierne por consiguiente
también a unas células de plantas transgénicas, que habían sido
transformadas con una o varias molécula(s) de ácido(s)
nucleico(s) conforme(s) al invento, así como a unas
células de plantas transgénicas, que proceden de células
transformadas de tal manera. Tales células contienen una o varias
de las moléculas de ácidos nucleicos conformes al invento, estando
unida(s) ésta(s) preferiblemente con unos elementos
de ADN reguladores, que garantizan la transcripción en el seno de
células de plantas, en particular con un promotor. Tales células se
pueden diferenciar de unas células de plantas presentes de un modo
natural, en el hecho de que ellas contienen por lo menos una
molécula de ácido nucleico conforme al invento.
Las células de plantas transgénicas pueden ser
regeneradas de acuerdo con técnicas conocidas de un experto en la
especialidad para formar plantas enteras. Las plantas obtenibles por
regeneración de las células de plantas transgénicas conformes al
invento son asimismo un objeto del presente invento.
Son además un objeto del invento unas plantas
que contienen las células de plantas conformes al invento, que se
han descrito más arriba. En el caso de las plantas conformes al
invento se puede tratar en principio de plantas de cualquier
especie arbitraria de plantas, es decir plantas tanto
monocotiledóneas como también dicotiledóneas. De manera preferida,
se trata de plantas útiles, es decir de unas plantas que son
cultivadas por los seres humanos para finalidades de nutrición o
para finalidades técnicas, en particular industriales. De manera
preferida, el invento se refiere a células de plantas procedentes
de plantas que forman fibras (p.ej. lino, cáñamo, algodón), que
almacenan aceite (p.ej. colza, girasol, soja), que almacenan
azúcares (p.ej. remolacha azucarera, caña de azúcar, mijo
azucarero, bananos) y plantas que almacenan proteínas (p.ej.
leguminosas).
En otra forma adicional de realización, el
invento se refiere a plantas forrajeras (p.ej. hierbas forrajeras y
de prado (alfalfa, trébol, etc.)), o a plantas de hortalizas, (p.ej.
tomate, lechuga, achicoria).
\newpage
En una forma preferida de realización, el
invento se refiere a plantas que almacenan almidón (p.ej. trigo,
cebada, avena, centeno, patata, maíz, arroz, guisante, mandioca,
haba de mung), son particularmente preferidas las plantas de maíz,
arroz, trigo y patata.
En una forma preferida de realización, las
células de las plantas conformes al invento presentan, en
comparación con unas correspondientes células de plantas no
modificadas genéticamente de plantas de tipo salvaje, una actividad
aumentada de una proteína conforme al invento. Éstas son de manera
preferida unas células de tejidos que almacenan almidón, en
particular células procedentes de tubérculos o del endospermo, de
manera preferida células procedentes de tubérculos de patata o del
endospermo de plantas de maíz, trigo o arroz.
El concepto de "elevación de la actividad"
significa en este contexto, en el marco del presente invento, una
elevación de la expresión de una molécula de ácido nucleico conforme
al invento, que codifica una proteína con actividad de enzima
ramificadora, una elevación de la cantidad de una proteína con
actividad de enzima ramificadora y/o una elevación de la actividad
de una proteína con actividad de enzima ramificadora en las
plantas.
La elevación de la expresión se puede determinar
por ejemplo mediante una medición de la cantidad de transcritos que
codifican tales proteínas, p.ej. mediante un análisis de borrón de
transferencia Northern o una RT-PCR (una reacción
en cadena de la polimerasa de transcriptasa inversa). Una elevación
significa en este contexto, de manera preferida, una elevación de
la cantidad de transcritos, en comparación con unas células de
plantas no modificadas genéticamente, en por lo menos un 10%, de
manera preferida en por lo menos un 20%, en particular en por lo
menos un 50% y de manera especialmente preferida en por lo menos un
75%.
La elevación de la cantidad de la proteína con
actividad de enzima ramificadora se puede determinar por ejemplo
mediante un análisis de borrón de transferencia Western. Una
elevación significa en este contexto preferiblemente una elevación
de la cantidad de una proteína con actividad de enzima ramificadora,
en comparación con unas correspondientes células no modificadas
genéticamente, en por lo menos un 10%, de manera preferida en por
lo menos un 20%, en particular en por lo menos un 50% y de manera
especialmente preferida en por lo menos un 75%.
La elevación de la actividad de la enzima
ramificadora se puede determinar por ejemplo de acuerdo con el
método descrito en la cita de Lloyd y colaboradores, (Biochem. J.
338 (1999), 515-521). Una elevación significa en
este contexto preferiblemente una elevación de la actividad de la
enzima ramificadora en por lo menos un 10%, de manera preferida en
por lo menos un 20% y de manera especialmente preferida en por lo
menos un 50% y de manera muy especialmente preferida en por lo menos
un 75%.
Se encontró de un modo sorprendente que unas
plantas, que contienen células de plantas conformes al invento con
una actividad elevada de una enzima ramificadora conforme al
invento, sintetizan un almidón modificado en comparación con el de
unas correspondientes plantas de tipo salvaje no modificadas
genéticamente. El almidón modificado puede haber sido modificado
por ejemplo en sus propiedades físicas y químicas, en particular en
la relación de amilosa/amilopectina, el grado de ramificación, la
longitud media de las cadenas, el contenido de fosfato, el
comportamiento de viscosidad, el tamaño de los granos de almidón, la
distribución de las cadenas laterales y/o la forma de los granos de
almidón en comparación con un almidón sintetizado en plantas de tipo
salvaje, de manera tal que éste sea mejor apropiado para
finalidades especiales de utilización.
Además, se encontró de un modo sorprendente que
en unas células de plantas conformes al invento, en las cuales se
ha elevado la actividad de la enzima ramificadora conforme al
invento, se ha modificado la composición del almidón de una manera
tal que éste, en comparación con un almidón procedente de
correspondientes plantas de tipo salvaje, presenta una resistencia
de gel aumentada y/o un contenido disminuido de fosfato y/o una
viscosidad pico disminuida y/o una temperatura de engrudamiento
disminuida y/o un tamaño disminuido de los granos de almidón y/o
una distribución modificada de las cadenas laterales.
El concepto de "resistencia de gel elevada"
significa en este contexto una elevación en por lo menos un 10%, de
manera preferida en por lo menos un 50%, en particular en por lo
menos un 100%, en por o menos 200% y de manera especialmente
preferida en por lo menos un 300% en comparación con la resistencia
de gel de un almidón procedente de plantas de tipo salvaje. La
determinación de la resistencia de gel se efectúa en este contexto
tal como se describe más adelante.
El concepto de "contenido disminuido de
fosfato" significa, en conexión con el presente invento, el hecho
de que el contenido total de fosfato combinado covalentemente y/o
el contenido de fosfato en la posición C-6 del
almidón sintetizado en las células de plantas conformes al invento,
se han disminuido en por lo menos un 20%, de manera preferida en
por lo menos un 40%, de manera especialmente preferida en por lo
menos un 60% y en particular en por lo menos un 80% en comparación
con un almidón procedente de células de plantas de correspondientes
plantas de tipo salvaje.
La determinación del contenido total de fosfato
o respectivamente del contenido de fosfato en la posición
C-6 puede efectuarse de acuerdo con el método
descrito más adelante.
El concepto de "viscosidad pico disminuida"
significa, en conexión con el presente invento, una disminución de
la viscosidad pico en por lo menos un 10%, de manera preferida en
por lo menos un 25%, en particular un 50%, de manera especialmente
preferida un 75% en comparación con la viscosidad pico de almidones
procedentes de plantas de tipo salvaje.
El concepto de "temperatura disminuida de
engrudamiento" significa en el presente contexto una disminución
de la temperatura de engrudamiento en por lo menos 0,5ºC,
preferiblemente en por lo menos 1,0ºC, en particular en por lo
menos 2,0ºC, de manera especialmente preferida en por lo menos
3,0ºC, en comparación con la temperatura de engrudamiento de
almidones procedentes de plantas de tipo salvaje.
La determinación de la viscosidad pico y de la
temperatura de engrudamiento se efectúa con ayuda de un aparato
analizador Rapid Visco, del modo que se describe más adelante.
Los conceptos de "viscosidad pico" y de
"temperatura de engrudamiento" son habituales para un experto
en la especialidad.
El concepto de "tamaño disminuido de los
granos de almidón" significa que la proporción porcentual de
granos de almidón que tienen un tamaño de granos de hasta 15
\mum, en comparación con plantas de tipo salvaje, se ha aumentado
en por lo menos un 10% de manera preferida en por lo menos un 30%,
en particular en por lo menos un 50%, un 100% y de manera
especialmente preferida en por lo menos un 150%.
La determinación del tamaño de granos del
almidón se efectúa con ayuda de un aparato medidor fotográfico de
la sedimentación del tipo "Lumosed" de la entidad Retsch GmbH,
Alemania, del modo que se describe más adelante.
Por el concepto de "distribución modificada de
las cadenas laterales" debe de entenderse en este contexto una
elevación de la proporción de cadenas laterales con un DP (grado de
polimerización) de 6 a 9 en por lo menos un 25%, de manera
preferida en por lo menos un 50%, en particular en por lo menos un
100% y de manera especialmente preferida de por lo menos un 200%,
en comparación con la proporción de cadenas laterales con un DP de
6 a 9 de una amilopectina procedente de plantas del tipo
salvaje.
En otra forma de realización del invento, por el
concepto de una "distribución modificada de las cadenas
laterales" debe de entenderse una elevación de la proporción de
cadenas laterales con un DP de 6 a 8, de manera preferida de 6 a 7,
en por lo menos un 25%, de manera preferida en por lo menos un 50%,
en particular en por lo menos de un 100% y de manera especialmente
preferida en por lo menos un 200% en comparación con la proporción
de cadenas laterales que tienen un correspondiente grado de
polimerización de una amilopectina procedente de plantas de tipo
salvaje.
La determinación de la proporción de cadenas
laterales se efectúa a través de la determinación de la proporción
porcentual de una determinada cadena lateral en la proporción total
de todas las cadenas laterales. La proporción total de todas las
cadenas laterales se determina a través de la determinación del área
total por debajo de los picos, que representan en el cromatograma
de HPCL los grados de polimerización DP de 6 a 30. La proporción
porcentual de una determinada cadena lateral en la proporción global
de todas las cadenas laterales se determina a través de la
determinación de la relación del área por debajo del pico, que
representa a esta cadena lateral en el cromatograma de HPLC
(cromatografía de fase líquida de alto rendimiento), con respecto al
área total. De manera preferida se utiliza el programa
AI-450, versión 3.31 de la entidad Dionex,
EE.UU.
La presente divulgación se refiere a un almidón,
cuya amilopectina presenta en comparación con la amilopectina de
almidones de plantas de tipo salvaje, unas cadenas laterales con un
DP = 5.
El presente invento se refiere además a un
procedimiento para la producción de una planta transgénica, que
sintetiza un almidón modificado, realizándose que
- (a)
- una célula de planta es modificada genéticamente mediante la introducción de una molécula de ácido nucleico conforme al invento y/o de un vector conforme al invento, cuya presencia o cuya expresión conduce a la elevación de la actividad de una proteína con la actividad de una enzima ramificadora;
- (b)
- a partir de la célula según la etapa (a) se regenera una planta; y
- (c)
- a partir de la planta producida según la etapa (b) se producen eventualmente otras plantas adicionales, que contienen unas células, las cuales a su vez contienen una molécula de ácido nucleico conforme al invento o un vector conforme al invento.
En una forma preferida de realización del
procedimiento, el almidón está modificado de tal manera, que
presenta una resistencia aumentada de gel y/o un contenido
disminuido de fosfato y/o una viscosidad pico disminuida y/o una
temperatura de engrudamiento disminuida y/o un tamaño disminuido de
los granos de almidón y/o una distribución modificada de las
cadenas laterales en comparación con un almidón procedente de unas
correspondientes plantas de tipo salvaje.
Los conceptos de "resistencia aumentada de
gel", "contenido disminuido de fosfato", "viscosidad pico
disminuida", "temperatura disminuida de engrudamiento",
"tamaño disminuido de los granos de almidón" y "distribución
modificada de las cadenas laterales" se definen en este contexto
tal como ya se ha hecho más arriba.
La modificación genética introducida según la
etapa (a) significa lo mismo que ya se explico más arriba en otro
contexto con las plantas conformes al invento.
La regeneración de plantas de acuerdo con la
etapa (b) puede efectuarse de acuerdo con métodos conocidos para un
experto en la especialidad.
La producción de plantas adicionales de acuerdo
con la etapa (b) del procedimiento conforme al invento puede
efectuarse p.ej. mediante reproducción vegetativa (por ejemplo a
través de plantones, tubérculos o por medio del cultivo de callos o
de la regeneración de plantas enteras) o mediante una reproducción
sexual. La reproducción sexual tiene lugar en este caso
preferiblemente de una manera controlada, es decir que se cruzan
entre sí y se reproducen unas plantas seleccionadas con unas
determinadas propiedades.
El presente invento se refiere también a las
plantas obtenibles mediante los procedimientos conformes al
invento.
El presente invento se refiere también a un
material de reproducción de plantas conformes al invento así como a
las plantas transgénicas producidas de acuerdo con el procedimiento
conforme al invento. El concepto de material de reproducción
comprende en este contexto aquellos componentes de la planta, que
son apropiados para la producción de descendientes por una vía
vegetativa o generativa. Para la reproducción vegetativa son
apropiados por ejemplo plantones, cultivos de callos, rizomas o
tubérculos. Otro material de reproducción distinto comprende por
ejemplo frutos, semillas, plántulas, protoplastos, cultivos
celulares, etc. De manera preferida, en el caso del material de
reproducción se trata de tubérculos y semillas.
Las células de plantas y las plantas
transgénicas conformes al invento sintetizan, en virtud de la
expresión de una molécula de ácido nucleico conforme al invento o
de un vector conforme al invento, cuya presencia o cuya expresión
conducen a una elevación de la actividad de una enzima ramificadora,
en comparación con unas correspondientes células de plantas no
modificadas genéticamente de plantas de tipo salvaje, un almidón,
que ha sido modificado en sus propiedades físicas y químicas, en
particular la resistencia de gel y/o el comportamiento de
engrudamiento y/o el tamaño de los granos del almidón y/o el
contenido de fosfato y/o la distribución de las cadenas laterales,
en comparación con un almidón sintetizado en plantas de tipo
salvaje.
Los conceptos de "resistencia aumentada de
gel", "contenido disminuido de fosfato", "viscosidad pico
disminuida", "temperatura disminuida de engrudamiento",
"tamaño disminuido de los granos de almidón" y "distribución
modificada de las cadenas laterales" se definen en este contexto
tal como ya se ha definido más arriba.
El presente invento se refiere además a un
procedimiento para la producción de un almidón modificado, que
comprende la etapa de la extracción del almidón a partir de una
(célula de) planta y/o a partir de partes que almacenan almidón de
una tales plantas. De manera preferida, un tal procedimiento
comprende también la etapa de la cosecha de las plantas cultivadas
y/o de las partes que almacenan almidón de estas plantas, antes de
la extracción del almidón, y de manera especialmente preferida
además la etapa de la cultivación de plantas conformes al invento
antes de la cosecha. Los procedimientos para la extracción del
almidón de plantas o de partes que almacenan almidón de plantas,
son conocidos para un experto en la especialidad. Además, se
describen procedimientos para la extracción del almidón a partir de
diferentes plantas que almacenan almidón, p.ej. en ``Starch:
Chemistry and Technology [Almidón: química y tecnología]
(coordinadores de edición) Whistler, BeMiller und Paschall (1994),
2ª edición, Academic Press Inc. London Ltd; ISBN
0-12-746270-8; véase
p.ej. el capítulo XII, páginas 412-468: almidones
de maíz y de sorgo: producción; de Watson; capítulo XIII, páginas
469-479: almidones de tapioca, arrurruz y sagú:
producción; de Corbishley y Miller; capítulo XIV, páginas
479-490: almidón de patata: producción y
utilizaciones; de Mitch; capítulo XV, páginas 491 a 506: almidón de
trigo: producción, modificación y utilizaciones; de Knight y Oson; y
capítulo XVI, páginas 507 a 528: almidón de arroz: producción y
utilizaciones; de Rohmer y Klem; almidón de maíz: Eckhoff y
colaboradores, Cereal Chem. 73 (1996), 54-57, la
extracción de un almidón de maíz a la escala industrial se consigue
por regla general mediante la denominada molienda en húmedo (en
inglés "wet milling")). Los dispositivos, que se utilizan
habitualmente en el caso de los procedimientos para la extracción
de un almidón a partir de un material de plantas son aparatos
separadores, decantadores, hidrociclones, secadores por atomización
y secadores de capa fluidizada.
Los almidones obtenibles a partir de las
plantas, las células de las plantas o las partes de las plantas
conformes al invento pueden ser modificadas posteriormente de
acuerdo con procedimientos conocidos para un experto en la
especialidad, y se adecuan en una forma no modificada o modificada
para diferentes utilizaciones en el sector alimentario o no
alimentario.
Fundamentalmente, la posibilidad de empleo del
almidón se puede subdividir en dos grandes sectores. Uno de los
sectores abarca los productos de hidrólisis del almidón,
principalmente glucosa y eslabones de glucanos, que se obtienen por
medio de procedimientos enzimáticos o químicos. Ellos sirven como
sustancia de partida para otras modificaciones químicas y otros
procesos, tales como una fermentación. Para obtener una reducción
de los costos, pueden ser importantes en este contexto la sencillez
y la realización barata de un procedimiento de hidrólisis.
Actualmente, éste discurre en lo esencial por una vía enzimática
mediando utilización de una amiloglucosidasa. Se podría imaginar un
ahorro de los costos mediante el empleo de una menor cantidad de
enzimas. Una modificación estructural del almidón, p.ej. un aumento
del área de superficie del grano o una estructura estérea, que
limita la accesibilidad para las enzimas empleadas, podría realizar
esta función.
El otro sector, en el que se utiliza el almidón
a causa de su estructura polimérica como un denominado almidón
natural, se clasifica en otros dos sectores de empleo
adicionales:
Un almidón es una sustancia aditiva clásica para
muchos alimentos, en los cuales él toma a su cargo en lo esencial
la función de la aglutinación y fijación de sustancias aditivas
acuosas, o respectivamente provoca una elevación de la viscosidad o
sino una formación aumentada de gel. Unas importantes
características de propiedades son los comportamientos de fluidez y
de sorción, las temperaturas de hinchamiento y engrudamiento, la
viscosidad y el rendimiento de espesamiento, la solubilidad del
almidón, la transparencia y la estructura del engrudo, las
estabilidades frente al calor, a la cizalladura y a los ácidos, la
tendencia a la retrogradación, la capacidad para la formación de
películas, la estabilidad frente a la congelación y la
descongelación, la digestibilidad así como la capacidad para formar
compuestos complejos p.ej. con iones inorgánicos u orgánicos.
En este gran sector, el almidón se puede emplear
como una sustancia auxiliar para diferentes procesos de producción
o respectivamente como una sustancia aditiva en productos técnicos.
En el caso de la utilización del almidón como sustancia auxiliar,
hay que mencionar aquí en particular las industrias del papel y del
cartón. El almidón sirve en este contexto en primer término para la
retardación (retención de materiales sólidos), la aglutinación de
partículas de materiales de carga y materiales finos, como material
de consolidación y para la deshidratación. Además de ello se
aprovechan las favorables propiedades del almidón en lo que se
refiere a la rigidez, a la dureza, al sonido, al tacto, al brillo,
a la lisura, a la resistencia a la disgregación así como a las
superficies.
Dentro del proceso de producción de papel hay
que establecer diferencia entre cuatro sectores de uso, a saber la
superficie, el estucado, la masa y la atomización.
Los requisitos en cuanto al almidón en lo que se
refiere al tratamiento superficial son en lo esencial un alto grado
de blancura, una viscosidad adaptada, una alta estabilidad de la
viscosidad, una buena formación de películas, así como una pequeña
formación de polvo fino. En el caso de la utilización en el estucado
desempeña un importante cometido el contenido de materiales
sólidos, una viscosidad adaptada, una alta capacidad de fijación y
aglutinación así como una alta afinidad para los pigmentos. Como
adición a la masa tiene importancia una distribución rápida,
uniforme y exenta de pérdidas, una alta estabilidad mecánica y una
retención total en el flujo de papel. En el caso del empleo del
almidón en el sector de atomización y rociada tienen importancia
asimismo un contenido adaptado de materiales sólidos, una alta
viscosidad así como una alta capacidad de fijación.
Un gran sector de empleo de los almidones
consiste en la industria de los pegamentos, en donde las
posibilidades de empleo se clasifican en cuatro sectores parciales:
la utilización como una cola pura de almidón, la utilización en el
caso de colas de almidón tratadas con agentes químicos especiales,
la utilización del almidón como una adición a resinas sintéticas y
a dispersiones poliméricas, así como la utilización de almidones
como agentes extendedores para pegamentos sintéticos. Un 90% de los
pegamentos constituidos sobre la base de almidón se emplean en los
sectores de producción de cartón ondulado, producción de sacos de
papel, bolsas y bolsitas o cucuruchos, producción de materiales
compuestos para papel y aluminio, producción de cartonajes, y colas
humectables renovadamente para sobres de cartas, sellos de correo,
etc.
Un gran sector de empleo para los almidones como
agente auxiliar y sustancia aditiva es el sector de la producción
de materiales textiles y agentes para el cuidado de materiales
textiles. Dentro de la industria textil hay que establecer
diferencia entre los siguientes cuatro sectores de empleo: El empleo
del almidón como agente de apresto, es decir como sustancia
auxiliar para el alisamiento y la consolidación del comportamiento
de trepa para la protección contra las fuerzas de tracción que
actúan al tejer en telar, así como para la elevación de la
resistencia a la abrasión al tejer en telar, un almidón como agente
para el apresto de materiales textiles, sobre todo después de unos
tratamientos previos que empeoran la calidad, tales como blanqueo,
tinción, etc., un almidón como agente de espesamiento en el caso de
la producción de pastas de tinción para la evitación de difusiones
de colorantes así como un almidón como adición a agentes de urdidura
para hilos de costura.
El cuarto sector de empleo es la utilización de
los almidones como una adición en el caso de materiales de
construcción. Un ejemplo es la producción de planchas de cartón
yeso, en el que el almidón mezclado en la papilla de yeso se
engruda con el agua, se difunde junto a la superficie de la plancha
de yeso y allí fija el cartón a la plancha. Otros sectores de
empleo son la adición a las mezclas para fibras de limpieza y
minerales. En el caso de un hormigón transportable, el almidón se
puede emplear con el fin de retrasar el fraguado.
Otro mercado para el almidón se ofrece en el
caso de la producción de agentes para la estabilización de los
suelos, que se emplean en el caso de movimientos de tierra
artificiales para la protección provisional de partículas del suelo
frente al agua. Unos productos combinados a base del almidón y de
unas emulsiones de polímeros se han de equiparar de acuerdo con los
actuales conocimientos en cuanto a su efecto de disminución de la
erosión y del encostramiento a los productos hasta ahora empleados,
pero en cuanto al precio están situados manifiestamente por debajo
de
éstos.
éstos.
Modificación de las propiedades específicas de
las formulaciones. Así, el almidón se puede emplear para la
disminución de la mojadura de agentes fitoprotectores y
fertilizantes, para la liberación dosificada de las sustancias
activas, para la transformación de sustancias activas líquidas,
volátiles y/o malolientes en sustancias moldeables, estables y
microcristalinas, para la mezcladura de compuestos incompatibles y
para la prolongación de la duración de la acción por medio de una
disminución de la descomposición.
Un sector adicional de empleo consiste en el
sector de los fármacos, de la medicina y de la industria cosmética.
En la industria farmacéutica el almidón se puede emplear como agente
aglutinante para tabletas o para la dilución de agentes
aglutinantes en cápsulas. Además el almidón puede servir como
agentes disgregantes de tabletas, puesto que ellas absorben líquido
después de la deglución y después de un corto tiempo se hinchan en
tal grado que la sustancia activa es puesta en libertad. Los polvos
para espolvorear lubricantes y vulnerarios medicinales son otras
posibilidades de utilización. En el sector de la industria
cosmética, el almidón se puede emplear por ejemplo como soporte
para sustancias aditivas a polvos para espolvorear, tales como
perfumes y ácido salicílico. Un sector de utilización relativamente
grande para el almidón se encuentra en las pastas dentífricas.
Un sector de empleo aconseja al almidón como
sustancia aditiva al carbón y a las briquetas. El carbón puede ser
aglomerado o respectivamente briqueteado con alto valor cuantitativo
con una adición de almidón, con lo cual se impide una
desintegración prematura de las briquetas. La adición del almidón se
encuentra situada en el caso de carbón para parrillas de asar entre
4 y 6%, en el caso de un carbón con poder calorífico aumentado
entre 0,1 y 0,5%. Por lo demás, el almidón se adecua como agente
aglutinante, puesto que mediante su adición al carbón y las
briquetas se puede disminuir de manera manifiesta la expulsión de
sustancias nocivas.
El almidón se puede emplear además en el caso
del tratamiento de lodos de minerales y de carbón como agente de
floculación.
Otro sector de empleo se encuentra como un
aditivo para sustancias auxiliares de fundición. En el caso de
diferentes procedimientos de fundición y moldeo por colada se
necesitan unos machos que se producen a base de arenas mezcladas
con agentes aglutinantes. Como agente aglutinante se emplea hoy en
día predominantemente una bentonita, que se ha mezclado con unos
almidones modificados, en la mayor parte de los casos con almidones
hinchables.
La finalidad de la adición de un almidón es la
elevación de la resistencia a la fluidez así como el mejoramiento
de la resistencia de fijación. Además de esto, los almidones
hinchables pueden presentar otros requisitos técnicos de
producción, tales como los de ser dispersables en agua fría,
rehidratables, bien miscibles en arena y presentar una alta
capacidad de fijación de agua.
En la industria de los cauchos el almidón se
puede emplear para el mejoramiento de las calidades técnicas y
ópticas. Los motivos son en este caso el mejoramiento del brillo
superficial, el mejoramiento del tacto y del aspecto exterior, para
esto el almidón, antes de la vulcanización en frío, es esparcido
sobre las superficies vulcanizadas pegajosas de materiales de
caucho, así como el mejoramiento de la imprimibilidad del
caucho.
Una posibilidad adicional de uso y venta de los
almidones modificados consiste en la producción de materiales
sustitutivos de los cueros.
En el sector de los materiales sintéticos, se
delinean los siguientes sectores de empleo: La incorporación y
fijación de productos secuenciales del almidón en el proceso de
elaboración (el almidón es solamente un material de carga, no
existe ninguna fijación directa entre un polímero sintético y un
almidón) o alternativamente, la incorporación y fijación de
productos secuenciales del almidón en la producción de polímeros (un
almidón y un polímero pasan a formar una fijación firme).
La utilización del almidón como material de
carga puro no es competitiva en comparación con las otras sustancias
u otros materiales tales como un talco. Se observa un cuadro
distinto, cuando pasan a ser importantes las propiedades
específicas de los almidones y con ello se modifica manifiestamente
el perfil de propiedades de los productos finales. Un ejemplo de
esto es la utilización de productos de almidones en la elaboración
de materiales termoplásticos, tales como los de polietileno. En
este caso, el almidón y el polímero sintético se combinan mediante
expresión o extrusión concomitante en la relación de 1:1 para formar
una tanda patrón (en inglés "master batch"), a partir de la
cual se pueden producir diversos productos con un polietileno
granulado mediando utilización de técnicas habituales de procesos.
Mediante la incorporación y aglutinación del almidón en láminas de
polietileno se puede conseguir una permeabilidad aumentada a las
sustancias en el caso de cuerpos huecos, una permeabilidad mejorada
al vapor de agua, un comportamiento antiestático mejorado, un
comportamiento antiapelmazante mejorado, así como una aptitud
mejorada para la impresión con tintas acuosas.
Otra posibilidad se encuentra en el uso del
almidón en espumas de poliuretanos. Con la adaptación de los
derivados de almidones así como mediante la optimización técnica de
procesos es posible regular de una manera deliberada la reacción
entre los polímeros sintéticos y los grupos hidroxi de los
almidones. El resultado de esto son unas láminas de poliuretanos,
que mediante el uso de un almidón adquieren los siguientes perfiles
de propiedades: una disminución del coeficiente de dilatación
térmica, una disminución del comportamiento de contracción, un
mejoramiento del comportamiento frente a compresión y tensiones, un
aumento de la permeabilidad al vapor de agua sin ninguna
modificación de la absorción de agua, una disminución de la
inflamabilidad y de la densidad de hendiduras, ningún escurrimiento
de partes combustibles, ausencia de halógenos y un envejecimiento
disminuido. Unas desventajas que actualmente están todavía
presentes, son una resistencia disminuida a la compresión así como
una resistencia disminuida frente a los golpes.
El desarrollo de productos ya no se restringe
entre tanto solamente a láminas. También se pueden producir unos
productos sólidos de materiales sintéticos, tales como macetas,
planchas y cubetas, con un contenido de almidón situado por encima
de un 50%. Además, se han de valorar favorablemente ciertas mezclas
de almidones y polímeros, puesto que ellas presentan una
degradabilidad biológica muchísimo más alta.
Una importancia extraordinaria la han adquirido
además los polímeros por injerto con almidón, a causa de su
extremada capacidad de fijación de agua. Éstos son productos con una
cadena principal a base de un almidón y de un retículo lateral de
un monómero sintético, injertado de acuerdo con el principio del
mecanismo de encadenamiento de radicales. Los polímeros de injerto
con almidón, hoy en día disponibles, se distinguen por una mejor
capacidad de fijación y retención de hasta 1.000 g de agua por cada
g de almidón, junto con una alta viscosidad. Los sectores de uso
para estos superabsorbentes se han propagado grandemente en los
últimos años y se encuentran en el sector de la higiene, con
productos tales como pañales y colchones, así como en el sector
agrícola, p.ej. en el caso de granulaciones de simientes.
Son decisivos para el empleo de los nuevos
almidones modificados por tecnología genética, por una parte, la
estructura, el contenido de agua, el contenido de proteínas, el
contenido de lípidos, el contenido de fibras, el contenido de
cenizas y de fosfato, la relación entre amilosa y amilopectina, la
distribución de masas moleculares, el grado de ramificación, el
tamaño y la forma de los granos así como la cristalinidad y, por
otra parte, también las propiedades que desembocan en las
siguientes características: el comportamiento de fluidez y de
sorción, la temperatura de engrudamiento, la viscosidad, el
rendimiento de espesamiento, la solubilidad, la estructura y la
transparencia de los engrudos, la estabilidad frente al calor, a la
cizalladura y a los ácidos, la tendencia a la retrogradación, la
formación de geles, la estabilidad frente a congelación y
descongelación, la formación de compuestos complejos, la fijación
de yodo, la formación de películas, la fuerza adhesiva, la
estabilidad frente a enzimas, la digestibilidad y la
reactividad.
La producción de almidones modificados mediante
intervenciones de tecnología genética en una planta transgénica
puede modificar, por una parte, las propiedades del almidón obtenido
a partir de la planta, en el sentido de que ya no aparecen como
necesarias otras modificaciones adicionales mediante procedimientos
químicos o físicos. Por otra parte, los almidones modificados
mediante procedimientos de tecnología genética pueden ser sometidos
a otras modificaciones químicas y/o físicas adicionales, lo cual
conduce a otros mejoramientos adicionales de la calidad para
determinados de los sectores de empleo que arriba se han descrito.
Estas modificaciones químicas y físicas son fundamentalmente
conocidas. En particular se trata en este contexto en unas
modificaciones por:
- tratamiento por calor
- tratamiento por ácidos
- producción de éteres de almidones
- éteres alquílicos, éteres O-alílicos, éteres hidroxialquílicos, éteres O-carboxilmetílicos de almidones, éteres de almidones que contienen N, éteres de almidones que contienen P, éteres de almidones que contienen S
- producción de almidones reticulados
- producción de polímeros de injerto con
almidones
- oxidación y
- esterificaciones, que conducen a la formación
de almidones tratados con fosfato, nitrato, sulfato, xantato,
acetato y citrato. Otros ácidos orgánicos se pueden emplear asimismo
para la esterificación.
En otra forma de realización adicional, el
presente invento se refiere a partes de plantas cosechables de
plantas conformes al invento, tales como frutos, raíces
almacenadoras, raíces, flores, capullos, vástagos o troncos,
preferiblemente semillas o tubérculos, conteniendo estas partes
cosechables las células de plantas conformes al invento.
En un aspecto adicional, el presente invento se
refiere a una región reguladora, que de un modo natural codifica la
transcripción de una molécula de ácido nucleico conforme al invento
que arriba se ha descrito, que codifica una enzima ramificadora
procedente de bacterias del género Neisseria, y que controla en
células bacterianas, conteniendo la región reguladora una secuencia
de nucleótidos que se selecciona entre el conjunto que se compone
de:
- (a)
- secuencias de nucleótidos que comprenden los nucleótidos 1 a 169, de la secuencia de nucleótidos que se representa en SEQ ID NO: 1, y
- (b)
- la secuencia de nucleótidos de la región reguladora, que está contenida en la inserción en el plásmido DSM 12425.
En el marco del presente invento se entiende por
el concepto de "región reguladora" una región que influye
sobre la especificidad y/o sobre la magnitud de la expresión de una
secuencia de gen, por ejemplo de tal manera que la expresión
aparece como respuesta a una excitación externa determinada o en un
momento determinado. Tales regiones reguladoras están situadas por
regla general en una zona, que es designada como promotor. El
concepto de "promotor" comprende, en el marco del presente
invento, unas secuencias de nucleótidos que son necesarias para la
iniciación de la transcripción, es decir para la fijación de la
polimerasa de ARN, y puede comprender p.ej. también la(s)
caja(s) TATA.
Los nucleótidos 1 a 169 de la secuencia
representada en SEQ ID NO:1 pertenecen a la región reguladora del
gen de la enzima ramificadora procedente de Neisseria
denitrificans. Unas putativas secuencias de promotores se
encuentran en las posiciones 36 a 44, 51 a 55 y 157 a 162,
tratándose en el caso de la secuencia "GGGAGA" posiblemente de
una secuencia de Shine-Dalgarno.
La presente divulgación se refiere asimismo a
moléculas de ADN recombinantes, que comprenden una región reguladora
conforme al invento.
De manera preferida, en una de tales moléculas
de ADN recombinantes la región reguladora está unida con una
secuencia de ADN heteróloga. En este contexto, la expresión
"heteróloga" significa que una tal secuencia no está unida de
un modo natural con la región reguladora.
Además, una de tales moléculas de ADN
recombinantes puede contener otros elementos reguladores
adicionales, que tienen importancia para la transcripción y/o la
traducción en el seno de células bacterianas, p.ej. intensificadores
de la transcripción o de la traducción.
Además, la presente divulgación se .refiere a
unas células anfitrionas, que han sido transformadas con una región
reguladora conforme al invento, con una molécula de ADN recombinante
o con un vector.
La presente divulgación se refiere además a unos
vectores, que contienen una región reguladora conforme al invento o
una molécula de ADN recombinante conforme al invento. Tales vectores
comprenden p.ej. también plásmidos, cósmidos, bacteriófagos, virus,
etc., que habitualmente se utilizan para métodos de tecnología
molecular.
La enzima ramificadora conforme al invento se
puede utilizar en un procedimiento in vitro para la
preparación de \alpha-1,4 glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 mediando utilización del
substrato sacarosa y una combinación de enzimas a base de una
amilosacarasa y de la enzima ramificadora. Por un "procedimiento
in vitro" se entiende en el marco del presente invento una
conversión química, es decir una reacción que transcurre fuera de
un organismo vivo. El concepto "in vitro" significa en
particular que el procedimiento conforme al invento transcurre
dentro de un recipiente de reacción. De manera especialmente
preferida, el concepto "in vitro" significa que la
reacción tiene lugar en ausencia de células vivas.
Una ventaja de un tal procedimiento consiste en
que es posible regular el grado de ramificación y que mediante esta
regulación las propiedades del glucano sintetizado se pueden adaptar
a la respectiva utilización planificada del glucano. Así existe
posiblemente en el sector de la utilización como material de
encapsulación en el sector químico, la posibilidad de conseguir,
por medio de un ajuste deliberado del grado de ramificación, una
optimización de la velocidad de liberación de sustancias activas
como medicamentos.
En conexión con el procedimiento in vitro
antes mencionado, se entiende como una amilosacarasa (sacarosa:
1,4-\alpha-D-glucano
4-\alpha-glucosiltransferasa, E.C.
2.4.1.4.), una enzima que cataliza la conversión química de la
sacarosa en \alpha-1,4-glucanos
insolubles en agua y fructosa. Para esta enzima se propone el
siguiente esquema de reacción:
Sacarosa +
(\alpha-1,4-D-glucano)_{n}
\rightarrow
D-fructosa+(\alpha-1,4-D-glucano)_{n}+1.
En este caso se trata de una reacción de
transglucosilación. Los productos de esta reacción son
\alpha-1,4-glucanos insolubles en
agua y fructosa. La transglucosilación puede tener lugar en ausencia
o en presencia de moléculas aceptoras. Tales moléculas aceptoras
pueden ser p.ej. polisacáridos tales como p.ej. maltooligosacáridos,
dextrina o glicógeno. Cuando una de tales moléculas aceptoras es un
\alpha-1,4-glucano oligómero
lineal, el producto resultante de la reacción de transglucosilación
mediante la amilosacarasa es un
\alpha-1,4-glucano lineal
polímero. Cuando la reacción de transglucosilación se lleva a cabo
mediante la amilosacarasa en ausencia de aquellas moléculas
aceptoras, se obtiene un glucano con una molécula de fructosa
terminal. Dentro del marco de la presente divulgación se designa
como \alpha-1,4-glucanos a todos
los productos obtenibles mediante una amilosacarasa, en ausencia o
presencia de moléculas aceptoras.
Para el mecanismo de reacción de una
transglucosilación mediante una amilosacarasa en ausencia de una
molécula aceptora, se propone el siguiente esquema de reacción:
G-F +
n(G-F) \rightarrow
G_{n}-G-F +
nF,
realizándose que
G-F es sacarosa, G es glucosa, F es fructosa y
G_{n}-G-F es un
\alpha-1,4-glucano.
Para el mecanismo de reacción de una
transglucosilación mediante una amilosacarasa en presencia de una
molécula aceptora se propone el siguiente esquema de reacción:
mG-F + G_{n}
\rightarrow G_{n}-m +
mF,
realizándose que G_{n} es una
molécula aceptora de polisacáridos, G_{n}-m es un
polisacárido que se compone de un aceptor más una cadena de
\alpha-1,4-glucano adyacentemente
sintetizada, G-F es sacarosa, F es fructosa y G es
glucosa.
Para la transglucosilación mediante una
amilosacarasa no se necesitan cofactores de ningún tipo.
Para la realización del procedimiento son
apropiadas en principio todas las amilosacarasas que catalizan la
síntesis de \alpha-1,4-glucanos
lineales partiendo de sacarosa.
Se conocen hasta ahora unas amilosacarasas
procedentes de algunas especies de bacterias, en particular
principalmente procedentes de especies de Neisseria (MacKenzie y
colaboradores, Can. J. Microbiol. 24 (1978),
357-362).
De manera preferida se utiliza por lo tanto una
amilosacarasa de origen procariótico. Se conocen hasta ahora por
ejemplo amilosacarasas procedentes de Neisseria perflava
(Okada y Hehre, J. Biol. Chem. 249 (1974), 126-135;
MacKenzie y colaboradores, Can. J. Microbiol. 23 (1977),
1303-1307) o de Neisseria canis, Neisseria
cinerea, Neisseria denitrificans, Neisseria sicca
y Neisseria subflava (MacKenzie y colaboradores, Can. J.
Microbiol. 24 (1978, 357-362)). Además, el
documento de solicitud de patente internacional WO 95/31553 describe
una amilosacarasa procedente de Neisseria polysaccharea. De
manera especialmente preferida se utiliza una amilosacarasa
secretada de un modo natural por un procariota.
En una forma preferida de realización del
procedimiento se utiliza una amilosacarasa procedente de
Neisseria polysaccharea.
La enzima, que es expresada en Neisseria
polysaccharea, es extremadamente estable, se fija muy firmemente
a los productos de la polimerización y es inhibida de una manera
competitiva por el producto de reacción fructosa (MacKenzie y
colaboradores, Can. J. Microbiol. 23
(1977)1303-1307). En el caso de la especie de
Neisseria, Neisseria polysaccharea, se secreta la
amilosacarasa (Riou y colaboradores, Can. J. Microbiol. 32 (1986),
909-911), al contrario de lo cual en otras especies
de Neisseria ésta permanece en la célula. De manera muy
especialmente preferida se utiliza una amilosacarasa con la
secuencia de aminoácidos indicada en Seq ID No. 5.
En otra forma de realización preferida se
utiliza una amilosacarasa purificada.
Como una amilosacarasa purificada se entiende en
este contexto una enzima que está ampliamente libre de componentes
celulares de las células, en las cuales es sintetizada la proteína.
De manera preferida, el concepto de "amilosacarasa purificada"
significa una amilosacarasa que presenta un grado de pureza de por
lo menos un 70%, de manera preferida de por lo menos un 85% y de
manera especialmente preferida de por lo menos un 90%.
El empleo de una proteína purificada para la
preparación de \alpha-1,4-glucanos
ofrece diferentes ventajas. En comparación con los procedimientos,
que trabajan con unos extractos proteínicos parcialmente
purificados, el medio de reacción del procedimiento conforme al
invento no contiene ningún resto de la cepa de producción
(microorganismo), que se utiliza con el fin de purificar la proteína
o producirla por tecnología genética.
Además, mediante el empleo de la proteína
purificada se pueden observar ciertas ventajas para el uso en las
industrias alimentaria y farmacéutica. Mediante la composición
definida del medio de reacción, y que ha sido liberada de todos lo
componentes innecesarios, también el producto es definido con mayor
exactitud en sus componentes. Esto conduce a un procedimiento de
autorización esencialmente menos extenso para estos productos
producidos por biotecnología en las industrias alimentaria y
farmacéutica, en particular puesto que estos productos no deberían
tener ninguna traza de un organismo transgénico.
En el marco del presente invento se entiende
como una enzima ramificadora
(\alpha-1,4-glucano:
\alpha-1,4-glucano
6-glucosiltransferasa, E.C. 2.4.1.18) una proteína
que cataliza una reacción de transglucosilación, en la que unos
enlaces en \alpha-1,4- de un donante de
\alpha-1,4-glucano son
hidrolizados y las cadenas de
\alpha-1,4-glucano que se liberan
en este caso son transferidas a una cadena de aceptor de
\alpha-1,4-glucano y en este
contexto son transformados en enlaces
\alpha-1,6.
En una forma preferida de realización del
procedimiento in vitro que se ha descrito, se utiliza una
enzima ramificadora purificada. Por una enzima ramificadora
purificada se entiende en este contexto una enzima que está
ampliamente exenta de componentes celulares de las células, en las
que es sintetizada la proteína. De manera preferida el concepto de
"enzima ramificadora purificada" significa que la enzima tiene
un grado de pureza de por lo menos un 70%, de manera preferida de
por lo menos un 85% y de manera especialmente preferida de por lo
menos un 90%.
Además, en el procedimiento in vitro que
se ha descrito, se utilizan de manera preferente unas proteínas
producidas por vía recombinante. Por este concepto se entienden
unas proteínas, que se habían producido mediante el recurso de que
en una célula anfitriona se incorpora una secuencia de ADN que
codifica la respectiva proteína y allí se lleva a expresión. La
proteína puede luego ser recuperada a partir de la célula anfitriona
y/o a partir del medio de cultivo. La célula anfitriona es en este
caso de manera preferente una bacteria o un protista (p.ej. hongos,
en particular levaduras, algas) tal como se define p.ej. en la obra
de Schlegel "Allgemeine Mikrobiologie" [microbiología general]
(editorial Georg Thieme 1985, 1-2). De manera
especialmente preferida, las proteínas se secretan a partir de la
célula anfitriona. La producción de tales células anfitrionas para
la producción de una proteína recombinante puede efectuarse de
acuerdo con los métodos conocidos para un experto en la
especialidad. Una recopilación acerca de diferentes sistemas de
expresión se encuentra p.ej. en la cita Methods in Enzymology
(métodos en enzimología) 153 (1987), 385-516, y en
Bitter y colaboradores, (Methods in Enzymology 153 (1987),
516-544), Sawers y colaboradores, Applied
Microbiology and Biotechnology (microbiología y biotecnología
aplicadas) 46 (1996), 1-9,
Billman-Jacobe, Current Opinion in Biotechnology
(opinión actual en biotecnología) 7 (1996),
500-504, Hockney, Trends in Biotechnology
(tendencias en biotecnología) 12 (1994), 456-463, y
Griffiths y colaboradores, Methods in Molecular Biology (métodos en
biología molecular) 75 (1997), 427-440.
Se describen vectores de expresión en la
bibliografía en gran extensión. Ellos contienen, junto con un gen
marcador de selección y con un origen de replicación que asegura la
replicación en el anfitrión escogido, por regla general un promotor
bacteriano o vírico así, como en la mayor parte de los casos una
señal de terminación para la transcripción. Entre el promotor y la
señal de terminación se encuentran por lo menos un sitio de corte
por restricción o un poliengarzador, que hacen posible la inserción
de una secuencia de ADN codificadora. Como secuencia de promotor se
puede utilizar, siempre que ella sea activa en el organismo
anfitrión escogido, la secuencia de ADN que regula de un modo
natural la transcripción del correspondiente gen. Esta secuencia,
sin embargo, puede ser intercambiada por otras secuencias de
promotores. Se pueden utilizar tanto unos promotores, que dan lugar
a una expresión constitutiva del gen, como también unos promotores
inducibles, que permiten una regulación deliberada de la expresión
del gen conectado a continuación. Unas secuencias de promotores
bacterianos y víricos con estas propiedades se describen
detalladamente en la bibliografía. Unas secuencias reguladoras para
la expresión en microorganismos (p.ej. E. coli, S.
cerevisiae) se han descrito suficientemente en la bibliografía.
Unos promotores, que permiten una expresión especialmente fuerte del
gen conectado a continuación son p.ej. el promotor T7 (Studier y
colaboradores, Methods in Enzymology 185 (1990),
60-89), los promotores lacuv5, trp,
trp-lacUV5 (DeBoer y colaboradores, en Rodríguez y
Chamberlin (coordinadores de edición), promotores, estructura y
función; Praeger, Nueva York, (1982), 462-481;
DeBoer y colaboradores Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1983),
21-25), \lambdap1, rac (Boros y colaboradores,
Gene 42 (1986), 97-100). Por regla general, las
cantidades de proteínas alcanzan su cénit desde el centro hacia el
final de la fase logarítmica del ciclo de crecimiento del
microorganismo. Para la síntesis de proteínas se utilizan por lo
tanto de manera preferida unos promotores inducibles. Éstos
conducen con frecuencia a unos rendimientos más altos de la proteína
que los promotores constitutivos. La utilización de promotores
constitutivos fuertes conduce, a través de la transcripción y la
traducción constante de un gen clonado, con frecuencia a que se
pierda energía para otras esenciales funciones de las células y con
ello se decelere el crecimiento de las células. (Bernard R.
Glick/Jack J. Pasternak, Molekulare Biotechnologie biotecnología
molecular) (1995), Spektrum Akademischer Verlag GmbH, Heidelberg
Berlin Oxford página 342.). Con el fin de alcanzar un valor óptimo
de la cantidad de proteína, se usa por lo tanto con frecuencia un
procedimiento en dos etapas. En primer lugar, las células
anfitrionas son cultivadas en condiciones óptimas hasta llegar a
una densidad celular relativamente alta. En la segunda etapa, se
induce luego la transcripción, según sea el tipo del promotor
empleado. Es especialmente apropiado en este contexto un promotor
tac inducible por lactosa o IPTG (=
isopropil-\beta-D-tiogalacto-piranósido)
(deBoer y colaboradores, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80 (1983),
21-25). Se describen asimismo en la bibliografía
señales de terminación para la transcripción.
La transformación de la célula anfitriona con el
ADN que codifica una correspondiente proteína, se puede llevar a
cabo por regla general de acuerdo con métodos clásicos, tal como
p.ej. se describen en Sambrook y colaboradores (Molecular Cloning:
A Laboratory Course Manual [clonación molecular: un manual de curso
de laboratorio], 2ª edición (1989), Cold Spring Harbor Press, Nueva
York). La cultivación de la célula anfitriona se efectúa en unos
medios nutritivos, que satisfacen las necesidades de la célula
anfitriona que en cada caso se utiliza, en particular tomando en
consideración el valor del pH, la temperatura, la concentración de
sal, la aireación, los antibióticos, las vitaminas, los elementos
trazas, etc.
La purificación de la enzima producida por las
células anfitrionas puede efectuarse de acuerdo con métodos
habituales de purificación, tales como los de precipitación,
cromatografía con intercambio de iones, cromatografía de afinidad,
filtración a través de gel, cromatografía de fase inversa HPLC,
etc.
Por medio de una modificación de los ADN
expresados en las células anfitrionas se puede producir en la célula
anfitriona un polipéptido, que en virtud de determinadas
propiedades puede ser aislado con mayor facilidad a partir del
medio de cultivo. Así, existe la posibilidad de expresar la proteína
que se ha de expresar como una proteína de fusión con una secuencia
adicional de polipéptido, cuyas propiedades específicas de fijación
hacen posible el aislamiento de la proteína de fusión por medio de
una cromatografía de afinidad. (p.ej. Hopp y colaboradores
Bio/Technology 6 (1988), 1204-1210; Sassenfeld,
Trends Biotechnol. 8 (1990), 88-93).
En una forma preferida de realización del
procedimiento in vitro que se ha descrito, se utilizan unas
enzimas que se habían producido por vía recombinante y habían sido
secretadas por la célula anfitriona en el medio nutritivo, de
manera tal que no se necesita ninguna disgregación de células ni
ninguna purificación adicional de la proteína, puesto que la
proteína secretada se puede recuperar a partir del material
sobrenadante. Para la eliminación de componentes residuales del
medio de cultivo se pueden emplear unos métodos habituales en la
técnica de procedimientos, tales como p.ej. los de diálisis, ósmosis
inversa, métodos de cromatografía, etc. Lo mismo es válido también
para el aumento de concentración de la proteína secretada dentro del
medio de cultivo. La secreción de proteínas mediante
microorganismos es mediada normalmente por péptidos de señal en el
extremo terminal de N (secuencia de señal, péptido director
(leader)). Unas proteínas con esta secuencia de señal pueden
atravesar la membrana celular del microorganismo. Una secreción de
proteínas se puede conseguir mediante el recurso de que la
secuencia de ADN, que codifica este péptido de señal, es adosada a
la correspondiente región que codifica la enzima.
Es preferido un péptido de señal presente de un
modo natural, por ejemplo el de la amilosacarasa procedente de
Neisseria polysaccharea.
De manera muy especialmente preferida el péptido
de señal es la \alpha-CGTase procedente de
Klebsiella oxytoca M5A1 (Fiedler y colaboradores J. Mol.
Biol. 256 (1996), 279-291) o un péptido de señal,
tal como es codificado por los nucleótidos
11529-11618 de la secuencia que es accesible en el
banco de genes GenBank bajo el número de acceso X86014.
Alternativamente, las enzimas utilizadas en el
procedimiento in vitro que se ha descrito pueden haber sido
producidas también mediando utilización de un sistema de
transcripción y traducción in vitro, que conduce a la
expresión de las proteínas, sin el empleo de microorganismos.
En otra forma preferida de realización
adicional, la amilosacarasa y/o la enzima ramificadora están
inmovilizadas junto a un material de soporte.
Una inmovilización de las enzimas ofrece la
ventaja de que las enzimas se pueden recuperar y utilizar múltiples
veces como catalizadores de la reacción de síntesis, de una manera
sencilla a partir de la mezcla de reacción. Puesto que la
purificación de enzimas presenta por regla general intensos costos y
un intenso consumo de tiempo, una inmovilización y una reutilización
hacen posible un considerable ahorro de costos. Una ventaja
adicional la constituye el grado de pureza de los productos de
reacción, que no contienen ningún residuo de proteínas.
Para la inmovilización de proteínas están a
disposición un gran número de materiales de soporte, pudiendo
efectuarse el acoplamiento al material de soporte a través de
enlaces covalentes o no covalentes (para una recopilación véase:
Methods in Enzymology 135, 136, 137). Una amplia propagación como
material de soporte la tienen p.ej. agarosa, un alginato, una
celulosa, una poli(acrilamida), una sílice o un nylon.
En otra forma preferida de realización del
procedimiento se utiliza un extracto enzimático en bruto
(parcialmente purificado) de una amilosacarasa y/o de la enzima
ramificadora conforme al invento. Como un extracto en bruto se
entiende en este contexto una preparación de amilosacarasa y/o de
enzima ramificadora con un grado de pureza disminuido al contrario
que una enzima purificada (véanse por ejemplo los Ejemplos 5 y
6).
En una forma preferida de realización, en el
caso del procedimiento in vitro que se ha descrito, la
modificación del grado de ramificación de los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 se consigue mediante la
modificación de la relación de actividades proteínicas de la enzima
ramificadora a la de la amilosacarasa. Por la relación de
actividades proteínicas se entiende en este caso la relación la
relación de las actividades proteínicas empleadas (u) de la
amilosacarasa a la de la enzima ramificadora. La determinación de
las actividades proteínicas se puede efectuar en este contexto tal
como se describe en los Ejemplos 7 y 8. En el caso de la
realización del procedimiento (véase el Ejemplo 9) se puede utilizar
una relación de actividades proteínicas (unidades de
amilosacarasa/unidades de la enzima ramificadora) situada en el
intervalo de 1/4.000 a 2.000/1.
En una forma de realización preferida, la
relación de actividades proteínicas está situada en un intervalo de
1/1.500 a 1.500/1.
En otra forma preferida de realización
adicional, la relación de actividades proteínicas está situada en un
intervalo de 1/800 a 1.300/1.
En una forma de realización especialmente
preferida, la relación de actividades proteínicas está situada en
un intervalo de 1/400 a 1.200/1.
Por medio de la modificación de la relación de
actividades proteínicas es posible la modificación del grado de
ramificación de los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6-que se
han obtenido, desde 0,05% a 35%.
En una forma de realización preferida es posible
la modificación del grado de ramificación en la posición 6 de los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 que se han obtenido, de
0,15% a 25%, en particular de 0,20% a 15% y de manera muy
especialmente preferida de 0,25% a 12%.
Con ayuda del procedimiento conforme al invento
es posible en particular producir unos productos que tienen un
grado de ramificación más alto que el glicógeno.
Por el concepto de grado de ramificación se
entiende en el marco del presente invento la proporción media de
ramificaciones en la posición O-6 en comparación con
todas las unidades de glucosa unidas de otra manera distinta, que
se puede determinar por medio de un análisis de la metilación (véase
el Ejemplo 10).
En otra forma preferida de realización
adicional, en el caso del procedimiento in vitro que se ha
descrito, la modificación del peso molecular del producto se
consigue mediante la modificación de la relación de actividades
proteínicas de la enzima ramificadora a la de la amilosacarasa. En
este caso, es particularmente posible que se modifique la relación
de actividades proteínicas durante la reacción, que conduce a la
síntesis de los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6.
En otra forma preferida de realización adicional
del procedimiento in vitro que se ha descrito, está previsto
que el procedimiento se lleve a cabo con unas diversas
concentraciones de sacarosa. Es posible en principio la realización
en un intervalo de concentraciones de preferiblemente 1% a 80% de
sacarosa (en peso/volumen), de manera preferida en un intervalo de
5% a 50% y de manera especialmente preferida en un intervalo de 10%
a 40%.
En conexión con el presente invento, el peso
molecular es determinado mediante experimentos de dispersión de la
luz (Light Scattering from Polymer solutions [dispersión de la luz a
partir de soluciones de polímeros], coordinador de edición: Huglin.
M. B., Academic Press, London, 1972) de acuerdo con Berry (J. Chem.
Phys. 44 (1966), páginas 4550 y siguientes).
Con ayuda del procedimiento in vitro que
se ha descrito, es posible en particular ajustar en el intervalo de
1.000 a 3.000 x 10^{6} el peso molecular de los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 que se han preparado
mediante el procedimiento. De manera preferida, los
\alpha-1,4-glucanos ramificados
en las posiciones \alpha-1,6 que se han preparado,
tienen un peso molecular situado en el intervalo de 100.000 a 1.500
x 10^{6}, en particular en el intervalo de 100.000 a 1.000 x
10^{6}, de manera preferida en el intervalo de 262.000 a 1.000 x
10^{6} y de manera especialmente preferida en el intervalo de
262.000 a 499 x 10^{6}.
Los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6, obtenibles mediante el
procedimiento in vitro que se ha descrito, tienen un grado
de ramificación que está situado por encima del grado de
ramificación que se alcanza cuando se emplea la actividad de una
amilosacarasa, y que como máximo está situado en 25% en moles.
De manera preferida, los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6, que son obtenibles,
tienen un grado de modificación de 0,05% a 20%, situado de manera
preferida en el intervalo de 0,15% a 17%, en particular en el
intervalo de 0,2% a 15%, de manera especialmente preferida en el
intervalo de 0,25% a 13%, y de manera muy especialmente preferida
en el intervalo de 0,3% a 12%.
De manera preferida, el grado de ramificación
está situado en el intervalo de 0.35% a 11%, y en particular en el
intervalo de 0,4% a 10,5%.
Los
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6, que son obtenibles
mediante el procedimiento in vitro que se ha descrito, se
pueden utilizar, tal como más arriba se ha descrito para el almidón,
en la industria alimentaria y en la industria no alimentaria.
El plásmido pBB48, producido en el marco del
presente invento fue depositado en la Deutsche Sammlung von
Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) [Colección alemana de
microorganismos y cultivos celulares] reconocida como centro de
depósito internacional, con sede en Braunschweig, República Federal
Alemana, de modo correspondiente a los requisitos del convenio de
Budapest, el 25 de Septiembre de 1998, bajo el número de depósito
DSM 12425.
\global\parskip0.950000\baselineskip
La Figura 1 muestra esquemáticamente la
estructura del plásmido pBB48 (DSM 12425).
La Figura 2 muestra una serie de
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 en diverso grado, que
habían sido producidos mediante el procedimiento conforme al invento
y que habían sido teñidos a continuación con una solución de
Lugol.
De izquierda a derecha: amilosacarasa
(izquierda), amilosacarasa + unas cantidades decrecientes de
actividad de la enzima ramificadora. Los máximos de absorción de
las correspondientes muestras estaban situados en 615 nm, 483 nm,
500 nm, 526 nm, 534 nm, 560 nm, 577 nm.
La Figura 3 muestra un cromatograma de HPLC de
un producto (A) del procedimiento (altamente ramificado, que ha
sido desramificado con isoamilasa y de una muestra (B) de glicógeno
de hígado de rata, que ha sido desramificado con una
isoamilasa.
La Figura 4 muestra el esquema del análisis de
la metilación.
La Figura 5 muestra un diagrama de los
resultados de los análisis de la muestra 7 descrita en los Ejemplos
9 y 10 después de una etapa y después de dos etapas de metilación.
Los valores para las metilaciones en 2, 3, 6 son de 96,12% o
respectivamente 96,36%.
La Figura 6 muestra una representación gráfica
de las proporciones de unidades de glucosa terminales ("2346
Me") y unidas en 6 ("23 Me") de las muestras de glucanos que
se han investigado.
Las Figuras 7 y 8 muestran unos cromatogramas de
gases de las muestras 3 y 7 que se han descrito en los Ejemplos.
La Figura 9 muestra esquemáticamente el plásmido
pBE-fnr-Km.
La Figura 10 muestra un gel de actividad para la
enzima ramificadora.
La Figura 11 muestra la representación
esquemática de un perfil de RVA.
La Figura 12 muestra la distribución de tamaños
de granos de los linajes 143-13A y
143-59A en comparación con la del tipo salvaje.
La Figura 13 muestra el aumento con microscopio
del tamaño de los granos de almidón de los linajes
143-13A, 143-34A y
143-59A en comparación con granos de almidón de
plantas de tipo salvaje (microscopio óptico de la entidad Leitz,
Alemania).
La Figura 14 muestra la resistencia de gel de
los almidones de diferentes linajes transgénicos en comparación con
unos almidones procedentes de plantas de tipo salvaje, determinada
con ayuda de un aparato analizador de la textura.
La Figura 15 muestra el perfil de RVA de los
almidones de los linajes 143-11A,
143-13A, 143-59A en comparación con
el del tipo salvaje.
Las Figuras 16 a 18 muestran los resultados de
unas cromatografías por HPLC, que representan el modelo de las
distribuciones de cadenas laterales de los linajes
143-WT (= tipo salvaje), 143-13A y
143-59A.
La Figura 19 muestra los gradientes de elución
utilizados para las cromatografías que se han representado en las
Figuras 16 a 18.
La Figura 20 muestra la desviación porcentual de
cadenas laterales con determinadas longitudes de cadenas de los
almidones investigados en las Figuras 16 hasta 18 con respecto del
tipo salvaje.
Los siguientes Ejemplos explican el invento
- Tampón de disgregación:
- 100 mM de Tris/HCl de pH 8,5; 5 mM de Na_{2}EDTA; 2 mM de DTT; 1 mM de Pefabloc®
- Tampón de lavado:
- 50 mM de Tris/HCl de pH 8,5; 5 mM de Na_{2}EDTA; 10% de glicerol)
- Tampón HIC:
- 50 mM de fosfato de potasio de pH 7,0; 5 mM de EDTA; 2 mM de DTT; 10% de glicerol
Glicógeno de ostra del tipo II procedente de
ostras (Sigma G8751)
\global\parskip1.000000\baselineskip
Se aisló, de acuerdo con métodos clásicos, un
almidón a partir de plantas de patata, y se determinó la relación
de amilosa a amilopectina de acuerdo con el método descrito por
Hovenkamp-Hermelink y colaboradores (Potato
Research 31 (1988), 241-246).
En el almidón pueden estar fosforiladas las
posiciones C2, C3 y C6 de las unidades de glucosa.
Para la determinación del contenido de grupos de
fosfato en la posición C6 se hidrolizaron 100 mg de un almidón en 1
ml de HCl 0,7 M durante 4 horas a 95ºC (Nielsen y colaboradores,
Plant Physiol. 105 (1994), 11-117). Después de una
neutralización con KOH 0,7 M para la determinación de
glucosa-6-fosfato se sometieron 50
ml del material hidrolizado a un ensayo óptico - enzimático. La
modificación de la absorción de la tanda de ensayo (100 mM de
imidazol/HCl; 10 mM de MgCl_{2}; 0,4 mM de NAD; 2 unidades de
glucosa-6-fosfato deshidrogenasa
procedente de Leuconostoc mesenteroides; a 30ºC) se vigiló a 334
nm.
La determinación del contenido total de fosfato
se efectuó de acuerdo con el método de Ames (Methods in Enzymology
VIII (1966), 115-118).
Se mezclan aproximadamente 50 mg del almidón con
30 \mul de una solución etanólica de nitrato de magnesio y se
incineran durante tres horas a 500ºC en un horno de mufla. El
residuo se mezcla con 300 \mul de ácido clorhídrico 0,5 M y se
incuba durante 30 min a 60ºC. A continuación, una parte alícuota se
completa hasta 300 \mul con ácido clorhídrico 0,5 M, se añade a
una mezcla de 100 \mul de ácido ascórbico al 10% y de 600 \mul
de molibdato de amonio al 0,42% en ácido sulfúrico 2 M y se incuba
durante 20 min a 45ºC.
Sigue una determinación fotométrica a 820 nm,
tomando en consideración una serie de calibración de fosfato como
patrón.
2 g de un almidón (TS = como sustancia seca) se
engrudan en 25 ml de H_{2}O (compárese el RVA) y a continuación
se almacena en estado cerrado a 25ºC de modo estanco al aire durante
24 h. Las muestras se fijan por debajo de la sonda (estampa
circular) de un aparato analizador de la textura
TA-XT2 de la entidad Stable Micro Systems y se
determina la resistencia de gel con los siguientes parámetros:
2 g de un almidón (como sustancia seca) se
recogen en 25 ml de H_{2}O y se utilizan para el análisis en un
aparato analizador Rapid Visco Analyzer (Newport Scientific Pty
Ltd., Investment Support Group, Warriewod NSW 2102, Australia). El
funcionamiento del aparato se efectúa de acuerdo con los datos del
fabricante. Para la determinación de la viscosidad de la solución
acuosa del almidón, la suspensión de almidón es calentada en primer
lugar desde 50ºC a 95ºC, con una velocidad de 12ºC por minuto. A
continuación, la temperatura es mantenida durante 2,5 min a 95ºC.
Después de esto la solución es enfriada desde 95ºC a 50ºC, con una
velocidad de 12ºC por minuto. A lo largo de todo el período de
tiempo se determina la viscosidad.
La determinación de la temperatura de
engrudamiento se efectúa a través de la pendiente de la curva de
viscosidad en función del tiempo. Si la pendiente de la curva es
mayor que 1,2 (este valor es preestablecido por el usuario), el
programa de ordenador identifica la temperatura medida en este
momento como temperatura de engrudamiento.
La determinación de los contenidos de glucosa,
fructosa y sacarosa se efectúa de acuerdo con el método descrito
por Stitt y colaboradores (Methods in Enzymology 174 (1989),
518-552).
La distribución de cadenas laterales o
respectivamente la preparación previa se determina tal como se ha
descrito en la cita de Lloyd y colaboradores (Biochem. J. 338
(1999), 515-521). En tal contexto hay que hacer
mención al hecho de que en el caso de este método es desramificada
solamente la amilopectina y de que la amilosa, antes de la
desramificación de la amilopectina, es separada de la amilopectina
mediante una precipitación con timol. Se escogen las siguientes
condiciones de elución (representación simplificada, el perfil
exacto de elución puede tomarse de la Figura 19).
La determinación de los tamaños de granos se
llevó a cabo con un medidor fotográfico de la sedimentación del
tipo "Lumosed" de la entidad Retsch GmbH, Alemania.
La distribución de tamaños de granos se
determinó en una solución acuosa y se efectuó de acuerdo con los
datos de fabricante así como basándose en la bibliografía de p.ej.
H. Pitsch, determinación de tamaños de granos;
LABO-1988/3 Fachzeitschrift für Labortechnik,
Darmstadt.
Para la determinación de la capacidad de
fijación de agua, el residuo, después de la separación de la parte
soluble mediante centrifugación del almidón hinchado a 70ºC, se
pesó. La capacidad de fijación de agua (WBV, acrónimo de
Wasserbindevermögen del almidón) fue referida a
la pesada inicial de almidón corregida por la masa soluble.
WBV (g/g) =
(residuo - (pesada inicial de la porción soluble))/(pesada inicial
de la porción
soluble)
Para el aislamiento de la enzima ramificadora
procedente de Neisseria denitrificans se estableció
primeramente una biblioteca genómica de ADN. Para esto, se
cultivaron unas células de Neisseria denitrificans de la cepa
que ha sido depositada como ATCC 14686 en la ATCC, sobre placas de
agar y sangre de Columbia y a continuación se cosechan. El ADN
genómico fue aislado y purificado de acuerdo con el método de
Ausubel y colaboradores. (en: Current Protocolls in Molecular
Biology [protocolos actuales en biología molecular] (1987); J. Wiley
& Sons, NY). Después de una digestión parcial por restricción
con la endonucleasa de restricción Sau3A se efectuó una ligación
con el ADN de vector de fago cortado con BamH I (lambdaZAP Express
de Stratagene). Después de la excisión in vivo de la
biblioteca de fagos, los plásmidos obtenidos se transformaron en el
seno del mutante (PGM-) de E. coli (Adhya y Schwartz, J.
Bacteriol. 108 (1971), 621-626). Este mutante forma,
al crecer sobre maltosa, unos polisacáridos lineales que aparecen
de color azul después de la tinción con yodo. Se sembraron 60.000
transformantes sobre placas de agar YT con IPTG (1 mM), kanamicina
(12,5 mg/l) y maltosa (1%) y después de una incubación durante 16
horas se trataron en fase de vapor con yodo a 37ºC. 60 colonias de
bacterias, que después del tratamiento en fase de vapor con yodo
tenían un color rojo, un color pardo o un color amarillo, se
seleccionaron y a partir de ellas se aisló el ADN plasmídico
(Birmboim-Doly, Nucleic Acid Res. 7,
1513-1523). Los plásmidos aislados fueron a
continuación utilizados para la retransformación del mismo mutante
(PGM-) de E. coli (Adhya y Schwartz, J. Bacteriol. 108
(1971), 621-626). Después de una repetida siembra en
placas y de un tratamiento repetido en fase de vapor con yodo, los
clones se pudieron reducir desde 60 a cuatro materiales aislados.
De estos cuatro plásmidos se llevó a cabo un análisis por
restricción, que en la totalidad de los cuatro plásmidos mostró un
fragmento de EcoR I de igual tamaño (1,6 kb) (Figura 1).
\vskip1.000000\baselineskip
A partir de un clon (pBB48), obtenido de modo
correspondiente al Ejemplo 1, que tenía una inserción con un tamaño
de aproximadamente 3,9 kb en el vector pBK-CMV (de
Stratagene), se aisló el fragmento de EcoRI de 1,6 kb (Geneclean,
Bio101) y con la finalidad de la secuenciación del ADN se clonó en
el vector pBluescript cortado con EcoRI. El plásmido así obtenido
fue secuenciado. Con ayuda del plásmido de partida pBB48 se
determinaron, después de esto, la secuencia de ADN que codifica la
enzima ramificadora total así como la secuencia de regiones
flanqueadoras (SEQ ID NO: 1). El plásmido pBB48 se representa en la
Fig. 1. El plásmido ha sido depositado bajo el número DSM
12425.
\vskip1.000000\baselineskip
En las cepas de laboratorio de E. coli se
expresa por lo general una enzima ramificadora endógena (glgB). Por
este motivo, para la detección de la actividad de la enzima
ramificadora se usó la mutante G6MD2 de E. coli. La cepa Hfr
G6MD2 E. coli (del E. coli Genetic Stock Center,
Universidad de Yale, CGSC nº 5080) es portadora de una deleción
extendida en la región del gen de síntesis de glucanos (glgA, glgB,
glgC). Para la detección de la actividad de la enzima ramificadora,
esta mutante se transformó con el plásmido pBB48 y a partir de las
células multiplicadas se preparó un extracto en bruto. Las proteínas
de este extracto en bruto fueron separadas por electroforesis en un
gel de poli(acrilamida) y para la detección de la actividad
de la enzima ramificadora se incubaron seguidamente con y sin
fosforilasa b de conejo (100 mM de citrato de Na, de pH 7,0; AMP,
glucosa-1-fosfato). Solamente en el
gel estimulado en la fosforilasa aparecieron unas bandas de color
violeta, lo cual apunta a una fuerte actividad de la enzima
ramificadora.
\vskip1.000000\baselineskip
Para la expresión de la enzima ramificadora, la
mutante de E. coli G6MD2 se transformó con el plásmido pBB48.
Las células se cultivaron con un medio YT con kanamicina (12,5
mg/l) durante 16 h mediando sacudimiento en el matraz de
Erlenmeyer. Después de una centrifugación (con 5.000 xg) el
sedimento obtenido se lavó con 100 mM de Tris/HCl, de pH 7,5, y con
1 mM de DTT, y después de haberlo suspendido en el mismo tampón, las
células se disgregaron con una sonda por ultrasonidos. Una
centrifugación adicional (con 10.000 xg) separó los desechos
celulares desde las proteínas solubles y proporcionó un material
sobrenadante de color amarillento con una concentración de
proteínas de aproximadamente 10 mg/ml.
De este extracto en bruto de proteínas, obtenido
de esta manera, se añadieron luego diferentes cantidades (100
\mul, 10 \mul, 1 \mul, 0,1 \mul, 0,01 \mul, 0,001 \mul)
en común con una cantidad en cada caso constante de una
amilosacarasa en 50 ml de citrato de Na 100 mM de pH 7,0 con 20% de
sacarosa y 0,02% de aziduro de Na. Después de unas pocas horas, se
pudieron observar los primeros enturbiamientos en la mezcla de
reacción. Después de tres días se centrifugó y los productos
resultantes se lavaron con agua desionizada.
Los productos son solubles en DMSO y pueden ser
caracterizados por medio de la medición de un espectro de absorción
con una solución de Lugol. A través de éste es posible una
estimación del grado de ramificación de los productos producidos.
Para esto, la solución en DMSO se diluyó fuertemente con agua, se
mezcló con una solución de Lugol e inmediatamente después se midió
el espectro desde 400 nm hasta 700 nm en un espectrofotómetro de
Beckmann (véase la Fig. 2).
Una separación de cadenas laterales disociadas
con isoamilasa sobre una columna de Carbopak PA100 mediante una
HPLC (DIONEX; agente eluyente: 150 mM de NaOH con gradientes de
acetato de Na 1 M) muestra para un producto fuertemente ramificado
el mismo modelo que para un glicógeno de hígado de rata
desramificado con isoamilasa (Fig. 3).
Una separación de cadenas laterales después de
una incubación con una pululanasa apareció solamente en muy pequeña
medida.
\vskip1.000000\baselineskip
Para el aislamiento de la enzima ramificadora
procedente de Neisseria denitrificans a partir de células de
E. coli Hfr G6MD2 recombinantes (véase más arriba), que
habían sido transformadas con el pBB48, se centrifugó primeramente
un cultivo durante una noche de estas células. El precipitado
celular fue suspendido a continuación en 3 volúmenes de un tampón
de disgregación y se disgregó a una presión de aproximadamente
16.000-17.000 psi (1.120-1.190
kg/cm^{2}) en la prensa de French. Después de una centrifugación
durante una hora a 10.000 g, el material sobrenadante fue diluido
hasta el volumen 4 veces mayor por adición de un tampón de lavado,
en un procedimiento discontinuo (en inglés batch) se fijó a DEAE
celulosa DE52 y se rellenó en una columna de cromatografía, que
había sido lavada con 2 a 3 volúmenes de columna del tampón de
lavado. Después de esto, para la elución se estableció un gradiente
lineal de NaCl 1 M. Las fracciones con actividad de la enzima
ramificadora (véase el Ejemplo 8) fueron reunidas, mezcladas con
(NH_{4})_{2} SO_{4} (concentración final 20% (p/v)) y
aplicadas sobre una columna de TSK Butyl-Toyopearl
650M. Después de haber lavado con 2 a 3 volúmenes de columna del
tampón HIC, que previamente se había mezclado adicionalmente con una
solución de sulfato de amonio que tenía un grado de saturación de
20% (114 g de sulfato de amonio por litro), la enzima ramificadora
fue eluída mediando empleo de un gradiente de sulfato de amonio
descendente linealmente desde 20% a 0% en el tampón HIC. Las
fracciones con actividad de enzima ramificadora fueron reunidas.
Para el aumento de la concentración de la proteína se repitió a
continuación la etapa de purificación con las fracciones reunidas
mediando utilización de una columna pequeña de TSK
Butyl-Toyopearl 650M (de Tose Haas (Montgomery
Ville, Pensilvania)). La proteína purificada fue aplicada a
continuación sobre un gel de poli(acrilamida), sometida a
transferencia de motas (en alemán geblottet) sobre una membrana de
PVDF, luego llevada nuevamente a disolución y secuenciada en el
extremo terminal de N por la entidad WITA GmbH, Teltow, Alemania, de
acuerdo con el método de Edman. La secuencia obtenida se presentó
como: MNRNXH (SEQ ID NO:3).
\vskip1.000000\baselineskip
Para la producción de una amilosacarasa se
utilizaron unas células de E. coli, las cuales habían sido
transformadas con un ADN, que codificaba una amilosacarasa
procedente de Neisseria polysaccharea. El ADN tiene la
secuencia de nucleótidos que se representa dentro de SEQ ID NO:4 y
procede de una biblioteca genómica de N. polysaccharea.
Un cultivo durante la noche de estas células de
E. coli, que secretaban la amilosacarasa procedente de
Neisseria polysaccharea, fue separado por centrifugación y
vuelto a suspender en aproximadamente 1/20 volúmenes de un tampón
de citrato de sodio 50 mM de (pH 6,5), 10 mM DTT (ditiotreitol) y 1
mM de PMSF (fluoruro de fenil metilsulfonilo). A continuación las
células fueron disgregadas dos veces a 16.000 p.s.i. (1.120
kg/cm^{2}) con una prensa French. Después de esto, al extracto
celular se le añadió 1 mM de MgCl_{2} así como benzonasa (de
Merck; 100.000 unidades; 250 unidades \mul^{-1}) en una
concentración final de 12,5 unidades ml^{-1}. A continuación, la
tanda se incubó a 37ºC mediando ligera agitación durante por lo
menos 30 min. El extracto se dejó reposar sobre hielo por lo menos
durante 1,5 horas. A continuación, se centrifugó durante 30 min a
4ºC a aproximadamente 40.000 g hasta que el material sobrenadante
fuese relativamente transparente.
Se llevó a cabo una filtración previa con una
membrana de PVDF (de Millipore "Durapore", véase cita
anterior), que poseía un diámetro de poros de 0,45 \mum. El
extracto se dejó reposar durante una noche a 4ºC. Antes de la
realización de la cromatografía de HI (acrónimo de hydrophobic
interaction = interacción hidrófoba), el extracto se mezcló con
NaCl sólido, y se ajustó a una concentración de 2 M de NaCl. A
continuación se centrifugó de nuevo durante 30 min a 4ºC y a
aproximadamente 40.000 mg. Después de esto, el extracto fue liberado
de los últimos residuos de E. coli, al ser filtrado con una
membrana de PVDF (de Millipore "Durapore", véase más arriba)
que tenía un diámetro de poros de 0,22 \mum. El extracto filtrado
se separó sobre una columna de Butylsepharose-4B
(de Pharmacia) (volumen de la columna: 93 ml, longitud: 17,5 cm).
Aproximadamente 50 ml del extracto con una actividad de
amilosacarasa de 1 a 5 unidades \mul^{-1} se añadieron a la
columna. A continuación, las proteínas que no se habían fijado con
150 ml del tampón B se separaron por lavado desde la columna
(tampón B: 50 mM de citrato de sodio de pH 6,5, 2 M de NaCl). La
amilosacarasa fue eluída finalmente con ayuda de un gradiente
lineal descendente de NaCl (desde 2 M hasta 0 M de NaCl en 50 mM de
citrato de sodio en un volumen de 433 ml con una velocidad de
afluencia de 1,5 ml min^{-1}), que había sido generado con un
sistema de bombeo automático (FPLC, de Pharmacia). La elución de la
amilosacarasa se efectuó entre 0,7 M y 0,1 M de NaCl. Las
fracciones fueron recogidas, desalinizadas a través de una columna
de PD10 Sephadex (de Pharmacia) estabilizadas con 8,7% de glicerol,
comprobadas en cuanto a la actividad de amilosacarasa y finalmente
congeladas en un tampón de almacenamiento (8,7% de glicerol, 50 mM
de citrato).
\vskip1.000000\baselineskip
La determinación de la actividad de
amilosacarasa se efectúa mediante el recurso de que una proteína
purificada o un extracto proteínico en bruto se añade en diferentes
diluciones en tandas de 1 ml, que contienen 5% de sacarosa, 0,1% de
dextrina y 100 mM de citrato de pH 6,5, y se incuba a 37ºC. Después
de 0 min, 30 min, 60 min, 120 min, 180 min, 240 min, 300 min y 360
min se sacan de esta tanda sendas porciones de 10 \mul y por
inmediato calentamiento a 95ºC se termina la actividad enzimática de
la amilosacarasa. En el ensayo fotométrico acoplado se determina a
continuación la proporción de la fructosa puesta en libertad por la
amilosacarasa. Para esto, se añaden desde 1 \mul hasta 10 \mul
de la muestra desactivada en 1 ml de un tampón de imidazol 50 mM de
pH 6,9, 2 mM de MgCl_{2}, 1 mM de ATP, 0,4 mM de NAD^{+} y 0,5
U/ml de hexocinasa. Después de una adición secuencial de la
glucosa-6-fosfato deshidrogenasa
(procedente de Leuconostoc mesenteroides) y de la
fosfoglucosa isomerasa, se mide la modificación de la absorción a
340 nm. A continuación, con ayuda de la ley de
Lambert-Beer se calcula la cantidad de fructosa que
se ha puesto en libertad.
Si se pone en relación el valor obtenido con el
momento de la toma de muestras, entonces se puede determinar el
número de las unidades (1U = \mumol de fructosa/min) (por cada
\mul del extracto proteínico o respectivamente por cada \mug de
la proteína purificada).
\vskip1.000000\baselineskip
La determinación de la actividad enzimática de
la enzima ramificadora se llevó a cabo apoyándose en un método
descrito en la bibliografía (Krisman y colaboradores, Analytical
Biochemistry 147 (1985), 491-496; Brown y Brown,
Meth. Enzymol. 8 (1966), 395-403). El método se basa
en el principio de la afinidad disminuida para la fijación de yodo
de glucanos ramificados en comparación con
\alpha-1,4-glucanos no
ramificados.
Para la determinación de la actividad enzimática
de la enzima ramificadora, se añadieron en una placa de
microtitulación enfriada una serie de muestras de diferentes
diluciones de la enzima ramificadora. A continuación, la reacción
se comenzó por medio de una adición en cada caso de 190 \mul de
una mezcla de reacción con amilosa (formulación véase más adelante)
y se incubó a 37ºC en el armario de incubación. Exactamente después
de 30 min, se detuvo la reacción mediante la adición de 100 \mul
de una solución de Lugol (0,5 mM) y las muestras se midieron en el
aparato lector de placas de microtitulación (de Molecular Devices) a
650 nm. Como testigo sirvió una tanda sin amilosa. La muestra de
referencia con el valor de extinción máximo, que contenía amilosa
pero nada de enzima ramificadora, presentó una DO_{650} =1,2
[DO_{650} = densidad óptica a 650 nm].
Para la mejor comparabilidad de ensayos
independientes, se utiliza para la evaluación solamente la dilución
de una muestra, que conduce durante el período de tiempo de
incubación de 30 min a una disminución de la DO_{650} en 0,5
unidades.
Media unidad de la enzima ramificadora es la
cantidad de enzima que en el ensayo descrito da lugar a una
disminución desde 1,2 a 0,7 de la DO_{650} en 0,5 unidades en el
transcurso de 30 min.
1 ml de una solución al 0,5% de amilosa
(fabricante: Fluka; amilosa procedente de patata) en p/v
(peso/volumen) en DMSO se añade mediando agitación a 10 ml de un
tampón de citrato de Na (100 mM, pH 6,5, 0,02% p/v NaN_{3}). La
solución original transparente se diluye, para efectuar la medición,
nuevamente a 1:4 hasta 1:8 con un tampón de citrato de Na. La
absorción con una solución de Lugol debería estar situada en el
ensayo en 1,2 (máximo) en el caso de la muestra de referencia
empleada.
\vskip1.000000\baselineskip
Para la preparación de
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
\alpha-1,6 con diferentes grados de ramificación,
una solución al 20% de sacarosa (en p/v) se mezcló en un volumen de
reacción de 10,86 ml con una amilosacarasa purificada procedente de
Neisseria polysaccharea (véase el Ejemplo 6) y con una enzima
ramificadora purificada procedente de Neisseria
denitrificans (véase el Ejemplo 5). Según fuese la tanda de
ensayo, estas dos enzimas se emplearon en diferentes relaciones de
las actividades proteínicas (determinación de amilosacarasa: véase
el Ejemplo 7; determinación de la enzima ramificadora, véase el
Ejemplo 8) (véase la Tabla 1):
Formulación de amilosacarasa: 6,2 U/mg; 1,8
mg/ml
Formulación de enzima ramificadora: 75 U/mg; 6,9
mg/ml
El grado de ramificación de los glucanos
obtenidos se determinó a continuación por medio de un análisis de
la metilación.
- -
- metilación de todos los grupos OH libres de las muestras de glucanos, en cada caso determinaciones dobles
- -
- hidrólisis de los polímeros permetilados, seguida por la reducción en C-1 y la acetilación de la mezcla de monómeros
- -
- análisis por cromatografía de gases y cuantificación de los productos de la reacción
La puesta en claro del grado de ramificación de
las muestras de glucanos se efectuó a través de un análisis de la
metilación (véase la Figura 4). Los grupos OH libres del polímero se
marcan mediante una transformación en el éter metílico.
La descomposición para dar los monómeros se
efectúa mediante una hidrólisis con ácidos y conduce a unas
moléculas de glucosa parcialmente metiladas, que se presentan en
forma de piranósido/furanósido así como en forma de \alpha- y
\alpha-glucósidos. Estas variantes son enfocadas
por reducción con NaBH_{4} en el respectivo derivado de sorbitol
parcialmente metilado. Mediante la acetilación final de los grupos
OH libres se pueden investigar los productos de reacción mediante
una cromatografía de gases.
La siguiente tabla muestra la consistencia así
como la solubilidad en DMSO de los glucanos obtenidos
Se prepararon unas soluciones al 1% (p/v) en
DMSO. No todas las muestras eran bien solubles a la temperatura
ambiente: las 1, 3 y 13 tuvieron que ser calentadas a 110ºC durante
30 minutos. Exceptuando las soluciones 1 y 3, que eran ligeramente
turbias, resultaron unas soluciones ópticamente transparentes (véase
la Tabla 2).
2 ml de la solución en DMSO (es decir, 20 mg de
un polímero) se transfirieron a un matraz con nitrógeno que tenía
una capacidad de 50 ml, se mezclaron en una corriente de N_{2} con
5 equivalentes/OH (eq./OH) de una solución de dimsilo recientemente
preparada, y se agitaron durante 30 minutos. Las soluciones se
volvieron en tal caso turbias y viscosas. El contenido del matraz
se congeló en un baño de hielo, se mezcló con 10 eq./OH de yoduro
de metilo y después de la descongelación se agitó durante por lo
menos 2 h. Antes de la segunda etapa de desprotonación y
metilación, se eliminó en vacío el yoduro de metilo en exceso.
El tratamiento se efectuó después de haber
eliminado el yoduro de metilo en exceso por medio de una adición de
50 ml de agua y una extracción repetida 5 veces, cada vez con 10 ml
de diclorometano. La fase orgánica se liberó a continuación de las
trazas de DMSO mediante una extracción con agua repetida 3 veces, se
secó con CaCl_{2}, se filtró y se concentró por evaporación. Los
productos se presentaban como unas películas transparentes,
ligeramente amarillentas.
Con ayuda de la muestra 7 se comprobó en primer
lugar cuántas etapas de metilación son necesarias para realizar la
permetilación de los grupos hidroxilo. Después de la primera
metilación, se trató la mitad de la tanda y la otra mitad se metiló
de nuevo. Después de la descomposición de ambas muestras se
compararon los resultados de los análisis por GC (cromatografía de
gases). Se mostró que la reacción, ya después de una etapa de
metilación, era casi cuantitativa (véase la Figura 5). Con el fin
de verificar una eventual ramificación en C-3, que
también ser confundida por una inframetilación en esta posición, en
cada caso se hizo seguir una segunda metilación.
La Figura 5 muestra un diagrama de los
resultados de los análisis de la muestra 7 después de una etapa y de
dos etapas de metilación; los valores para la metilación en 2,3,6
son de 96,12% o respectivamente de 96,36%.
2 mg de la muestra metilada se pesaron
inicialmente en un vaso a presión con una capacidad de 1 ml, se
mezclaron con 0,9 ml de ácido trifluoroacético 2 M y se agitaron a
120ºC durante 2,5 h. Después del enfriamiento del vaso, se
concentró por evaporación en una corriente de N_{2}. Para la
eliminación de las trazas del ácido se añadió tres veces tolueno y
éste se separó por soplado.
El residuo de la precedente etapa de reacción se
mezcló con 0,5 ml de una solución amoniacal 0,5 M de NaBD4 y se
agitó durante 1 h a 60ºC. El reactivo se destruyó cuidadosamente con
algunas gotas de ácido acético glacial, el borato resultante se
eliminó mediante una adición repetida cinco veces de ácido acético
metanólico al 15% y una subsiguiente separación por soplado en forma
del éster trimetílico de ácido bórico.
El residuo de la precedente etapa de reacción se
mezcló con 50 \mul de piridina y 250 \mul de anhídrido de ácido
acético y se agitó durante 2 h a 95ºC. Después del enfriamiento, la
mezcla de reacción se añadió gota a gota a 10 ml de una solución
saturada de NaHCO_{3} y se extrajo cinco veces con diclorometano.
Los productos de reacción en la fase orgánica se investigaron por
cromatografía de gases (acerca de los productos véase la Figura
4).
Las investigaciones por cromatografía de gases
se llevaron a cabo en un aparato de la entidad Carlo Erba GC 6000
Vega serie 2 con una entrada sobre la columna y un detector de FID.
Las separaciones se efectuaron en una columna capilar de sílice
fusionada Supelco SPB5 (diámetro interno 0,2 mm, longitud 30 m) con
hidrógeno como gas portador y a una presión de 80 kPa. Se utilizó
el siguiente programa de temperaturas:
60ºC (1 min) -25ºC/min
\rightarrow 130ºC-4ºC/min \rightarrow
280ºC.
La evaluación de los cromatogramas de gases se
efectuó mediante identificación de los picos, integración de las
áreas de superficie de los picos y corrección de los datos con ayuda
del concepto ECR de Sweet y colaboradores (Sweet y colaboradores
Carbohydr. Res. 40 (1975), 217).
\newpage
Los compuestos con 1,6-anhidro,
que se pueden observar en los casos de las muestras 1 y 3, han de
ser atribuidos al alto grado de ramificación en
C-6. Éste conduce durante la hidrólisis a unos
monómeros con un grupo OH libre en C-6, que puede
reaccionar ulteriormente en las condiciones de reacción para dar
estos derivados. Las porciones deben de ser sumadas al calcular el
grado de ramificación para dar el valor de
"2,3-Me".
La Figura 6 es una representación gráfica de las
proporciones de unidades de glucosa terminales ("2346Me") y
enlazadas en 6 ("23"Me) de las muestras de glucanos
investigadas.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Para la preparación de
\alpha-1,4-glucanos ramificados en
las posiciones \alpha-1,6 con diferentes pesos
moleculares, se mezcló una solución al 20% (p/v) de sacarosa en un
volumen de reacción de 10,86 ml con una amilosacarasa purificada
procedente de Neisseria polysaccharea (véase el Ejemplo 6) y
con una enzima ramificadora purificada procedente de Neisseria
denitrificans (véase el Ejemplo 5). Según fuese la tanda de
ensayo, estas dos enzimas se emplearon en diferentes relaciones de
actividades proteínicas (determinación de la actividad de
amilosacarasa: véase el Ejemplo 7; de la enzima ramificadora: véase
el Ejemplo 8) (véase la Tabla 1). La determinación de los pesos
moleculares y del radio de inercia Rg se efectuó mediante dispersión
de luz láser (Light Scattering from Polymer solutions [dispersión
de luz a partir de soluciones de polímeros], coordinador de
edición: Huglin, M. B., Academic Press, Londres, 1972). Para esto,
las muestras 1-11 secadas se disolvieron en una
mezcla de DMSO y H_{2}O (en la relación 90:10) y se analizaron
diferentes diluciones (desde aproximadamente 2,5 g/l hasta 0,25
g/l) en un aparato medidor de la dispersión de la luz (SOFICA,
Societe francaise d'instruments de controle et d'analyses. Le
Mesnil Saint-Denis, Francia). Los datos obtenidos de
esta manera se evaluaron de acuerdo con Berry (J. Chem. Phys. 44
(1966), 4550 y siguientes).
Con la utilización de los oligonucleótidos
BE-5' y BE-3' (SEQ ID NO:6 y SEQ ID
NO:7) se amplificó mediante una PCR la secuencia que codifica la
enzima ramificadora procedente de Neisseria denitrificans,
partiendo del plásmido pBB48 (depositado en la Deutsche Sammlung
für Mikroorgansimen und Zellkulturen (DSMZ) en Braunschweig,
República Federal Alemana, bajo el número de depósito DSM 12425).
Los materiales amplificados obtenidos a partir de esto se
digirieron con las endonucleasas de restricción SalI y SdaI y se
clonaron en el plásmido pBinARfnr cortado con SalI y SdaI. El
plásmido resultante a partir de esto se designó con el nombre
pBE-fnr-Km (Fig. 9):
Condiciones de la reacción PCR
Tampón y polimerasa de Boehringer Mannheim (Pwo
polimerasa nº: 1644947)
\newpage
Condiciones de reacción
El plásmido
pBE-fnr-Km se utilizó para la
transformación de plantas de patata de acuerdo con métodos clásicos
(véase más arriba).
\vskip1.000000\baselineskip
Mediante un análisis de transferencia de borrón
Northern se pudieron identificar, entre las plantas de patatas
transgénicas producidas de acuerdo con el Ejemplo 12, aquellas que
tenían el ARNm de una enzima ramificadora procedente de
Neisseria denitrificans. Para la detección de la actividad de
la enzima ramificadora en plantas transformadas de una manera
estable, el material de las hojas de las plantas a investigar se
congeló en nitrógeno líquido y a continuación se desmenuzó en un
mortero previamente enfriado con nitrógeno líquido. Antes de que el
material desmenuzado se descongelase, se efectuó una adición de un
tampón de extracción (50 mM de citrato de sodio, pH 6,5, 4 mM de
DTT, 2 mM de cloruro de calcio). A aproximadamente 100 mg del
material de las plantas (peso fresco) se añadieron aproximadamente
200 \mul de un tampón de extracción. Los componentes sólidos de
la suspensión a base del material desmenuzado de las plantas y del
tampón de extracción se separaron por centrifugación (10.000x g).
Una parte alícuota del material sobrenadante transparente obtenido a
partir de esto, se mezcló con una cuarta parte del volumen de
extracto del tampón de elución (40% de glicerol, 250 mM de Tris de
pH 8,8, 0,02% de azul de bromofenol) y se separó en el gel de
poli(acrilamida (véase más adelante), con una intensidad de
corriente eléctrica constante de 20 mA por cada gel. (Antes de que
los extractos proteínicos hubieran sido aplicados, se efectuó una
electroforesis de los geles durante 20 minutos en las condiciones
que más arriba se han indicado). Después de que el colorante azul de
bromofenol, presente en el tampón de elución, hubiera salido desde
el gel, se terminó la electroforesis. El gel fue a continuación
equilibrado cinco veces en un tampón de lavado (100 mM de citrato
de sodio de pH 6,5) cada vez en una cantidad cinco veces mayor del
volumen del gel, en cada caso durante 20 minutos mediante agitación
a la temperatura ambiente. A continuación, el gel se incubó durante
16 horas a 30ºC en una cantidad cinco veces mayor del volumen del
gel del tampón de incubación (100 mM de citrato de sodio de pH 6,5,
5% de sacarosa, 0,625 unidades de amilosacarasa purificada
procedente de Neisseria polysaccharea (acerca de la
purificación de la enzima y la determinación de la actividad véase
más arriba). Después haber vaciado el tampón de incubación, y
después de la adición de una solución de Lugol (diluida a 1:5), el
glucano que había sido formado por la amilosacarasa en combinación
con la enzima ramificadora era visible como una banda de color pardo
azulado (Fig. 10). La totalidad del gel de poli(acrilamida)
restante se tiñe de azul en este caso mediante la actividad de
amilosacarasa presente en el tampón de incubación.
Composición del gel de
poli(acrilamida):
- a)
- Gel de separación
- 375 mM de Tris de pH 8,8
- 7,5% de poli(acrilamida) (Biorad nº EC-890)
- Para la polimerización:
- 1/2.000 volúmenes de TEMED
- 1/100 volúmenes de persulfato de amonio
- b)
- Gel de recogida
- 125 mM de Tris de pH 6,8
- 4% de poli(acrilamida) (Biorad nº EC-890)
- Para la polimerización:
- 1/2.000 volúmenes de TEMED
- 1/100 volúmenes de persulfato de amonio
- c)
- Tampón de electroforesis
- 375 mM de Tris de pH 8,8
- 200 mM de glicina.
\vskip1.000000\baselineskip
A partir de plantas de patatas transgénicas, que
se habían producido de acuerdo con los Ejemplos 12 y 13, se aisló
un almidón de acuerdo con procedimientos clásicos y se investigó en
lo que se refiere a sus propiedades físicas y químicas. En tal
caso, se comprobó que el almidón formado a partir de las plantas de
patatas transgénicas se diferencia, p.ej. de un almidón sintetizado
en plantas de tipo salvaje, en su contenido de fosfato y en las
propiedades de viscosidad y engrudamiento determinadas mediante un
RVA. Los resultados de la caracterización
físico-química de los almidones modificados, que se
basan en los métodos de análisis arriba descritos, se representan
en la siguiente Tabla
Leyendas:
143-13A;
143-11A, 143-59A: plantas de patatas
transgénicas, que sobreexpresan la enzima ramificadora procedente de
Neisseria denitrificans
RVA = aparato analizador Rapid Visco
Analyzer
Max = viscosidad máxima = viscosidad pico
Min = viscosidad mínima
Fin = viscosidad al final de la medición
Set = retroceso = diferencia entre min y fin
T = temperatura de engrudamiento
Los valores porcentuales están referidos al tipo
salvaje (= 100%) con excepción del contenido de amilosa.
\vskip1.000000\baselineskip
Los resultados del análisis con RVA, del
análisis de la distribución de tamaños de granos y de la resistencia
del gel se reproducen también en las Figuras 11 a 15.
Además, las Figuras 16 a 18 muestran los
resultados de unas cromatografías HPLC, que constituyen el modelo
de la distribución de cadenas laterales de los linajes
143-WT (=tipo salvaje), 143-13A y
143-59A. La Figura 19 muestra en este caso el
gradiente de elución que se utilizó en conexión con el análisis por
HPLC. En la Figura 20 se representa, además de ello, la desviación
porcentual de cadenas laterales con determinadas longitudes de
cadena desde el tipo salvaje.
Las siguientes dos Tablas explican como se
efectuó en este contexto el cálculo de las proporciones de cadenas
laterales.
\vskip1.000000\baselineskip
Las áreas de pico en las columnas A 1, A 2, C 1
y C 2 fueron determinadas con el programa de aplicación
AI-450 versión 3.31 de la entidad Dionex.
\global\parskip0.000000\baselineskip
<110> PlantTec Biotechnologie GmbH
\hskip1cmMax-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V.
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Moléculas de ácidos nucleicos que
codifican una enzima ramificadora procedente de bacterias de género
Neisseria así como procedimiento para la preparación de
alfa-1,4-glucanos ramificados en
alfa-1,6
\vskip0.400000\baselineskip
<130> C1434PCT
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2475
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (170)..(2458)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 762
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2914
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria polysaccharea
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (957)..(2867)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 636
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria polysaccharea
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Neisseria denitrificans
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Claims (18)
1. Molécula de ácido nucleico que codifica una
enzima ramificadora procedente de una bacteria del género Neisseria,
seleccionada entre el conjunto que se compone de
- (a)
- moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína, que comprende la secuencia de aminoácidos que se indica dentro de SEQ ID NO: 2;
- (b)
- moléculas de ácidos nucleicos que comprenden la región codificadora que se indica dentro de SEQ ID NO: 1;
- (c)
- moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una proteína, que comprende la secuencia de aminoácidos, que es codificada por la inserción en el plásmido DSM 12425;
- (d)
- moléculas de ácidos nucleicos, que comprenden la región codificadora contenida en la inserción en el plásmido DSM 12425 para una enzima ramificadora;
- (e)
- moléculas de ácidos nucleicos, que codifican una enzima ramificadora procedente de una bacteria del género Neisseria, cuya secuencia en la región de los primeros 100 aminoácidos presenta una identidad entre secuencias de por lo menos un 65% con respecto a la secuencia de aminoácidos indicada dentro de SEQ ID NO: 2;
- (f)
- moléculas de ácidos nucleicos, cuya cadena complementaria se hibrida en condiciones rigurosas con una molécula de ácido nucleico de acuerdo con (a), (b), (c), (d) y/o (e), y que codifican una enzima ramificadora procedente de una bacteria del género Neisseria; y
- (g)
- moléculas de ácidos nucleicos, cuya secuencia se diferencia de la secuencia de una molécula de ácido nucleico de acuerdo con (f) a causa de la degeneración del código genético.
2. Vector que contiene una molécula de ácido
nucleico de acuerdo con la reivindicación 1.
3. Vector de acuerdo con la reivindicación 2,
estando la molécula de ácido nucleico unida en orientación en el
mismo sentido (in sense) con unas secuencias reguladoras, que
garantizan la transcripción en células procarióticas o
eucarióticas.
4. Célula anfitriona, que es transformada con un
vector de acuerdo con la reivindicación 2 o 3.
5. Procedimiento para la producción de una
enzima ramificadora a partir de una bacteria del género Neisseria,
siendo cultivada una célula anfitriona de acuerdo con la
reivindicación 4 en unas condiciones que permiten la expresión de
la proteína, y siendo aislada la proteína a partir de las células
cultivadas y/o del medio de cultivo.
6. Procedimiento para la producción de una
enzima ramificadora a partir de una bacteria del género Neisseria,
siendo producida la proteína en un sistema de transcripción y
traducción in vitro mediando utilización de una molécula de
ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 1.
7. Enzima ramificadora codificada por una
molécula de ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 1 u
obtenible mediante un procedimiento de acuerdo con la reivindicación
5 ó 6.
8. Anticuerpo, que reconoce específicamente una
proteína de acuerdo con la reivindicación 7.
9. Utilización de una proteína de acuerdo con la
reivindicación 7, para la preparación de
\alpha-1,4-glucanos ramificados
en \alpha-1,6 en sistemas in vitro.
10. Célula de planta transgénica que contiene
una molécula de ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 1,
estando la molécula de ácido nucleico unida con unas secuencias
reguladoras, que garantizan la transcripción en células de
plantas.
11. Célula de planta transgénica de acuerdo con
la reivindicación 10, estando unida la molécula de ácido nucleico
con una secuencia, que codifica una secuencia de señal, que
garantiza la localización de la proteína codificada en los
plastidios de las células.
12. Planta transgénica que contiene células de
plantas de acuerdo con la reivindicación 10 u 11.
13. Procedimiento para la producción de una
planta transgénica, realizándose que
- (a)
- una célula de planta es modificada genéticamente mediante la introducción de una molécula de ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 1 o de un vector de acuerdo con la reivindicación 2 o 3;
- (b)
- a partir de la célula producida de acuerdo con la etapa (a) se regenera una planta; y
- (c)
- a partir de la planta producida de acuerdo con la etapa (b) se producen eventualmente otras plantas adicionales, que contienen unas células, que a su vez contienen una molécula de ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 1 o un vector de acuerdo con la reivindicación 2 ó 3.
14. Partes de plantas cosechables de plantas de
acuerdo con la reivindicación 12 o de plantas obtenibles mediante
un procedimiento de acuerdo con la reivindicación 13, conteniendo
estas partes de plantas unas células de plantas transgénicas de
acuerdo con la reivindicación 10 u 11.
15. Célula de planta transgénica de acuerdo con
la reivindicación 10 u 11, planta transgénica de acuerdo con la
reivindicación 12, procedimiento de acuerdo con la reivindicación 13
y partes de plantas de acuerdo con la reivindicación 14, siendo la
planta una planta de patata y procediendo las células de plantas y
las partes de plantas de plantas de patata.
16. Procedimiento para la producción de un
almidón, que comprende la extracción del almidón a partir de plantas
transgénicas de acuerdo con la reivindicación 12 o 15, a partir de
plantas transgénicas mediante un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 13 o 15, a partir de partes que almacenan almidón de
una de tales plantas o a partir de células de plantas de acuerdo
con la reivindicación 10, 11 o 15.
17. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 16, siendo producido un almidón de patata, que, en
comparación con un almidón procedente de correspondientes plantas
de tipo salvaje, presenta una proporción porcentual aumentada en
por lo menos un 10% de granos de almidón que tienen un tamaño de
granos de hasta 15 \mum.
18. Región reguladora, que contiene una
secuencia de nucleótidos seleccionada entre el conjunto que se
compone de:
- (a)
- secuencias de nucleótidos, que comprenden los nucleótidos 1 a 169 de la secuencia de nucleótidos que se representa en SEQ ID NO:1; y
- (b)
- la secuencia de nucleótidos de la región codificadora, que está contenida en la inserción en el plásmido DSM 12425.
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