TWI672318B - 葉酸受體１抗體類和免疫共軛物類及彼等之用途 - Google Patents

葉酸受體１抗體類和免疫共軛物類及彼等之用途 Download PDF

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Abstract

提供新穎的抗癌劑，其包括但不限於結合至人類葉酸受體1之抗體與免疫共軛物。進一步提供使用該劑、抗體或免疫共軛物的方法，例如抑制腫瘤生長的方法。

Description

葉酸受體1抗體類和免疫共軛物類及彼等之用途 〔相關申請案的交互參照〕
本申請案主張申請於2010年2月24日的美國臨時申請案61/307,797號、申請於2010年5月20日的美國臨時申請案61/346,595號以及申請於2010年11月12日的美國臨時申請案61/413,172號之優先權，其在此將全文併入本文以做為參考。
本發明的領域係廣泛地相關於結合至人類葉酸受體1的抗體與免疫共軛物，以及相關於使用所述抗體與免疫共軛物的方法，該方法係用以治療例如癌症的疾病。
癌症是已開發國家主要死亡原因之一，每年僅在美國就有超過一百萬人診斷為癌症以及500,000人死亡。整體來說，據估計三個人中超過一人在他們的一生中將發展出某種形式的癌症。有超過200種不同的癌症，其中四種-乳癌、肺癌、直腸癌以及攝護腺癌-佔了新病例的超過半 數。(Jemal et al.,2003,Cancer J.Clin.53：5-26)。
葉酸受體1(FOLR1)，亦稱為葉酸受體-α或葉酸結合蛋白，為在細胞質膜上表現的N端糖化蛋白質。FOLR1具有對葉酸以及數種還原型葉酸衍生物的高度親合力。FOLR1媒介生理葉酸5-甲基四氫葉酸的運輸至細胞內部。
FOLR1在大多數的卵巢癌中以及在許多的子宮癌、子宮內膜癌、胰腺癌、腎臟癌、肺癌以及乳癌中過量表現，然而FOLR1在正常組織的表現被限制在腎臟近端小管之上皮細胞的頂膜、肺臟的泡狀肺泡壁細胞、膀胱、睪丸、脈絡叢以及甲狀腺(Weitman SD,et al.,Cancer Res 52：3396-3401(1992)；Antony AC,Annu Rev Nutr 16：501-521(1996)；Kalli KR,et al.Gynecol Oncol 108：619-626(2008))。FOLR1的表現型態使其成為針對FOLR1之癌症療法的適合標的。
因為卵巢癌直到晚期前典型地為無症狀的，其經常在晚期被確診，並且當以目前可用的程序，典型地為在手術減積(surgical de-bulking)後以化療藥物治療時具有不良的預後(von Gruenigen V et al.,Cancer 112：2221-2227(2008)；Ayhan A et al.,Am J Obstet Gynecol 196：81e81-86(2007)；Harry VN et al.,Obstet Gynecol Surv 64：548-560(2009))。因此對於卵巢癌更有效的治療法具有明確的未滿足的醫療需求。
三個抗FOLR1抗體已被檢驗為潛在的抗癌藥物。鼠類單株抗體Mov18以及Mov19於1980年代晚期被分離出 (Miotti S et al.,Int J Cancer 39：297-303(1987))，經確認以FOLR1為標的(Coney LR et al.,Cancer Res 51：6125-6132(1991))，並且於臨床前研究中作為伴隨細胞毒性核糖體失活蛋白質之共軛物，以測試它們消滅表現抗原的癌症細胞的能力(Conde FP et al.,Eur J Biochem 178：795-802(1989))。
將Mov19以對細胞毒性T細胞以及自然殺手細胞為目標的雙特異性抗體而測試(Mezzanzanica D et al.,Int J Cancer 41：609-615(1988)；Ferrini S et al.,Int J Cancer Suppl 4：53-55(1989)；Ferrini S et al.,Int J Cancer 48：227-233(1991))，以及以Mov19之單鏈Fv(scFv)與介白素2的融合蛋白在活體內測試(Melani C et al.,Cancer Res 58：4146-4154(1998))。嵌合的(鼠類變異區/人類恆定區)抗FOLR1抗體Mov18以及Mov19已對它們在體外媒介細胞毒性免疫細胞依賴殺傷表現FOLR1的腫瘤細胞的能力作臨床前檢驗(Coney LR et al.,Cancer Res 54：2448-2455(1994))，並且在IgE依賴免疫療法臨床前模式中測試嵌合的Mov18-IgE(Karagiannis SN et al.,J Immunol 179：2832-2843(2007)；Gould HJ et al.,Eur J Immunol 29：3527-3537(1999))。
Mov18於臨床前研究，接著在1990年代早期的臨床試驗中，以伴隨許多放射性核素之共軛物的形式被研究(Zacchetti A et al.,,Nucl Med Biol 36：759-770 (2009))，其以沒有任何用於臨床的藥物被核准作結。
鼠類單株抗FOLR1抗體LK26的人類化形式MORAb003以未經修飾的抗體(Ebel W et al.,Cancer Immun 7：6(2007))以及以放射性核素111In之共軛物(Smith-Jones PM et al.,Nucl Med Biol 35：343-351(2008))於臨床前評估，並且目前正以未經修飾的抗體進行臨床試驗(D.K.Armstrong et al.J.Clin.Oncol.26：2008,May 20 suppl；摘要5500)。
本發明提供結合至人類葉酸受體1的新穎抗體、包含這些抗體的免疫共軛物以及它們的使用方法。本發明進一步提供新穎的多肽，例如結合人類葉酸受體1的抗體、此類抗體的片段以及其他與此類抗體相關的多肽。亦提供包含編碼多肽的核酸序列之多核苷酸，因為是含有多核苷酸之載體。進一步提供包含本發明的多肽及/或多核苷酸之細胞。亦提供包含新穎的葉酸受體1抗體或免疫共軛物之組成物(例如，藥學組成物)。此外，亦提供製造以及使用新穎的葉酸受體1抗體或免疫共軛物之方法，例如使用新穎的葉酸受體1抗體或免疫共軛物以抑制腫瘤生長及/或治療癌症的方法。
因此，在一方面，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或其抗原結合片段，其中抗體包含(a)包含GYFMN(SEQ ID NO：1)的重鏈CDR1；包含 RIHPYDGDTFYNQXaa1FXaa2Xaa3(SEQ ID NO：56)的重鏈CDR2；以及包含YDGSRAMDY(SEQ ID NO：3)的重鏈CDR3；以及(b)包含KASQSVSFAGTSLMH(SEQ ID NO：7)的輕鏈CDR1；包含RASNLEA(SEQ ID NO：8)的輕鏈CDR2；以及包含QQSREYPYT(SEQ ID NO：9)的輕鏈CDR3；其中Xaa1係選自K、Q、H以及R；Xaa2係選自Q、H、N以及R；並且Xaa3係選自G、E、T、S、A以及V。在某個具體實施例中，結合人類葉酸受體1的人類化抗體或其抗原結合片段具有與抗體嵌合的Mov19實質上相同的親和力。在某個具體實施例中，人類化抗體或其抗原結合片段包含重鏈CDR2序列RIHPYDGDTFYNQKFQG(SEQ ID NO：2)。
在某個具體實施例中，經由流式細胞儀、Biacore或放射免疫分析測量結合親和力。
在另一具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或其抗原結合片段，其中該抗體包含(a)包含GYFMN(SEQ ID NO：1)的重鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；包含RIHPYDGDTFYNQKFQG(SEQ ID NO：2)的重鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；以及包含YDGSRAMDY(SEQ ID NO：3)的重鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；以及/或(b)包含KASQSVSFAGTSLMH(SEQ ID NO：7)的輕鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化 物；包含RASNLEA(SEQ ID NO：8)的輕鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；以及包含QQSREYPYT(SEQ ID NO：9)的輕鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物。
在某個具體實施例中，本發明提供的專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或其抗原結合片段，包含SEQ ID NO：6之重鏈。在另一具體實施例中，人類化抗體或其抗原結合片段係經由在2010年4月7日寄存於ATCC並具有ATCC寄存編號PTA-10772以及PTA-10773或10774之質體DNA編碼。
在某個具體實施例中，本發明提供與抗體競爭結合至FOLR1的人類化抗體或其抗原結合片段，其包含(a)包含GYFMN(SEQ ID NO：1)的重鏈CDR1；包含RIHPYDGDTFYNQXaa1FXaa2Xaa3(SEQ ID NO：56)的重鏈CDR2；以及包含YDGSRAMDY(SEQ ID NO：3)的重鏈CDR3；以及(b)包含KASQSVSFAGTSLMH(SEQ ID NO：7)的輕鏈CDR1；包含RASNLEA(SEQ ID NO：8)的輕鏈CDR2；以及包含QQSREYPYT(SEQ ID NO：9)的輕鏈CDR3；其中Xaa1係選自K、Q、H以及R；Xaa2係選自Q、H、N以及R；並且Xaa3係選自G、E、T、S、A以及V。在某個具體實施例中，人類化抗體包含重鏈CDR2序列RIHPYDGDTFYNQKFQG(SEQ ID NO：2)。
在某個具體實施例中，本發明提供多肽、人類化抗體或其抗原結合片段，其包含與SEQ ID NO：4至少約90%相 同的重鏈變異區域，以及與SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11至少約90%相同的輕鏈變異區域。在另一具體實施例中，人類化抗體或抗原結合片段包含與SEQ ID NO：4至少約95%相同的重鏈變異區域，以及與SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11至少約95%相同的輕鏈變異區域。在進一步的具體實施例中，人類化抗體包含與SEQ ID NO：4至少約99%相同的重鏈變異區域，以及與SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11至少約99%相同的輕鏈變異區域。在某個具體實施例中，人類化抗體包含SEQID NO：4的重鏈變異區域，以及SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11的輕鏈變異區域。在某些具體實施例中，本發明提供與SEQ ID NOs：88-119至少約90%相同的多肽、抗體或抗原結合片段。在某些具體實施例中，本發明提供與SEQ ID NOs：88-119至少約95%相同的多肽、抗體或抗原結合片段。在某些具體實施例中，本發明提供與SEQ ID NOs：88-119至少約99%相同的多肽、抗體或抗原結合片段。
在某個具體實施例中，本發明提供在真核細胞中較chMov19表現高至少10倍之人類化抗體或其抗原結合片段。在某個具體實施例中，真核細胞為HEK-293T細胞。
在某些具體實施例中，本發明提供的專一地結合人類葉酸受體1之抗體或其抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含SSYGMS(SEQ ID NO：30)的重鏈CDR1；包含TISSGGSYTY(SEQ ID NO：31)的重鏈CDR2；及/或包含DGEGGLYAMDY(SEQ ID NO：32)的 重鏈CDR3；及/或(b)包含KASDHINNWLA(SEQ ID NO：27)的輕鏈CDR1；包含GATSLET(SEQ ID NO：28)的輕鏈CDR2；及/或包含QQYWSTPFT(SEQ ID NO：29)的輕鏈CDR3。在另一具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之抗體或其抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含TNYWMQ(SEQ ID NO：60)的重鏈CDR1；包含AIYPGNGDSR(SEQ ID NO：61)的重鏈CDR2；及/或包含RDGNYAAY(SEQ ID NO：62)的重鏈CDR3；及/或(b)包含RASENIYSNLA(SEQ ID NO：57)的輕鏈CDR1；包含AATNLAD(SEQ ID NO：58)的輕鏈CDR2；及/或包含QHFWASPYT(SEQ ID NO：59)的輕鏈CDR3。在另一具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之抗體或其抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含TNYWMY(SEQ ID NO：66)的重鏈CDR1；包含AIYPGNSDTT(SEQ ID NO：67)的重鏈CDR2；及/或包含RHDYGAMDY(SEQ ID NO：68)的重鏈CDR3；及/或(b)包含RASENIYTNLA(SEQ ID NO：63)的輕鏈CDR1；包含TASNLAD(SEQ ID NO：64)的輕鏈CDR2；及/或包含QHFWVSPYT(SEQ ID NO：65)的輕鏈CDR3。在另一具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之抗體或其抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含SSFGMH(SEQ ID NO：72)的重鏈CDR1；包含YISSGSSTIS(SEQ ID NO：73)的重鏈CDR2；及/或包含EAYGSSMEY(SEQ ID NO：74)的重 鏈CDR3；及/或(b)包含RASQNINNNLH(SEQ ID NO：69)的輕鏈CDR1；包含YVSQSVS(SEQ ID NO：70)的輕鏈CDR2；及/或包含QQSNSWPHYT(SEQ ID NO：71)的輕鏈CDR3。在另一具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之抗體或其抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含TSYTMH(SEQ ID NO：78)的重鏈CDR1；包含YINPISGYTN(SEQ ID NO：79)的重鏈CDR2；及/或包含GGAYGRKPMDY(SEQ ID NO：80)的重鏈CDR3；及/或(b)包含KASQNVGPNVA(SEQ ID NO：75)的輕鏈CDR1；包含SASYRYS(SEQ ID NO：76)的輕鏈CDR2；及/或包含QQYNSYPYT(SEQ IDNO：77)的輕鏈CDR3。
在某些具體實施例中，本發明中之多肽是全長抗體或抗原結合片段。在某些具體實施例中，抗體或抗原結合片段是Fab、Fab’、F(ab’)2、Fd、單鏈Fv或scFv、連結二硫化物的Fv、V NAR區域、IgNar、內抗體、IgG-CH2、微抗體(minibody)、F(ab’)3、四鏈抗體(tetrabody)、三鏈抗體(triabody)、雙鏈抗體(diabody)、單域抗體、DVD-Ig、Fcab、mAb2、(scFv)2或scFv-Fc。
在某些具體實施例中，本發明中的結合至人類葉酸受體1之抗體或多肽具有約1.0至約10nM之Kd。在一具體實施例中，結合至人類葉酸受體1之抗體或多肽具有約1.0nM或更佳之Kd。在某個具體實施例中，經由流式細胞儀、Biacore或放射免疫分析測量結合親和力。
本發明亦提供製作本發明中之抗體的方法，包含(a)培養表現所述抗體的細胞；以及(b)自所述培養之細胞分離抗體。在某個具體實施例中，細胞是真核細胞。
本發明亦提供具有化學式(A)-(L)-(C)之免疫共軛物，其中：(A)是本發明中之抗體或抗原結合片段或多肽；(L)是連接元以及(C)是細胞毒性劑，其中所述連接元(L)連結(A)至(C)。
在一具體實施例中，連接元係選自可裂解連接元、不可裂解連接元、親水性連接元以及二羧酸為基底的連接元之群組。在進一步的具體實施例中，連接元係選自由：N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)戊酸酯(SPP)或N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)-2-磺酸基戊酸酯(磺酸基-SPP)；N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)丁酸酯(SPDB)或N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)-2-磺酸基丁酸酯(磺酸基-SPDB)；N-琥珀醯亞胺4-(馬來醯亞胺基甲基)環己烷羧酯(SMCC)；N-磺基琥珀醯亞胺4-(馬來醯亞胺基甲基)環己烷羧酯(sulfoSMCC)；N-琥珀醯亞胺-4-(碘乙醯基)-胺基苯甲酸酯(SIAB)；以及N-琥珀醯亞胺-〔(N-馬來醯亞胺基丙醯胺基)-四甘醇〕酯(NHS-PEG4-馬來醯亞胺)組成之群組。在某個具體實施例中，連接元是N-琥珀醯亞胺-〔(N-馬來醯亞胺基丙醯胺基)-四甘醇〕酯(NHS-PEG4-馬來醯亞胺)。
在一具體實施例中，免疫共軛物包含選自美登素衍生物、美登素衍生物類似物、苯二氮平、類紫杉醇、CC- 1065、CC-1065類似物、倍癌黴素、倍癌黴素類似物、加利車黴素、多拉司他汀、多拉司他汀類似物、奧利斯汀、托美黴素衍生物以及細黴素衍生物或該劑之前藥所組成之群組的細胞毒性劑。在進一步的具體實施例中，細胞毒性劑是美登素衍生物。在另一具體實施例中，細胞毒性劑是N(2’)-去乙醯-N(2’)-(3-巰基-1-氧代丙基)-美登素或N(2’)-去乙醯-N2-(4-巰基-4-甲基-1-氧代戊基)-美登素。
在一具體實施例中，本發明提供免疫共軛物，其包含：(A)包含SEQ ID NO：4之重鏈變異區域，以及SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之輕鏈變異區域的人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺-〔(N-馬來醯亞胺基丙醯胺基)-四甘醇〕酯(NHS-PEG4-馬來醯亞胺)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N2-(4-巰基-4-甲基-1-氧代戊基)-美登素；其中(L)將(A)連接至(C)。
在一具體實施例中，本發明提供免疫共軛物，其包含：(A)包含SEQ ID NO：4之重鏈變異區域，以及SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之輕鏈變異區域的人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫基)丁酸酯(SPDB)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N2-(4-巰基-4-甲基-1-氧代戊基)-美登素；其中(L)將(A)連接至(C)。
在一具體實施例中，本發明提供免疫共軛物，其包含：(A)包含SEQ ID NO：4之重鏈變異區域，以及SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之輕鏈變異區域的人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫基)2-磺基丁酸酯(磺基-SPDB)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N2-(4-巰基-4-甲基-1-氧代戊基)-美登素；其中(L)將(A)連接至(C)。
在一具體實施例中，本發明提供免疫共軛物，其包含：(A)包含SEQ ID NO：4之重鏈變異區域，以及SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之輕鏈變異區域的人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫基)-2-磺基戊酸酯(磺基-SPP)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N(2’)-(3-巰基-1-氧代丙基)-美登素；其中(L)將(A)連接至(C)。
在一具體實施例中，本發明提供免疫共軛物，其包含：(A)包含SEQ ID NO：4之重鏈變異區域，以及SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之輕鏈變異區域的人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫基)戊酸酯(SPP)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N(2’)-(3-巰基-1-氧代丙基)-美登素；其中(L)將(A)連接至(C)。
本發明亦提供包含本發明中之抗體、抗原結合片段、多肽或免疫共軛物的藥學組成物以及藥學上可接受的載體。在某個具體實施例中，藥學組成物進一步包含第二抗癌劑。
本發明亦提供包含被標記的本發明中之抗體、抗原結合片段、多肽或免疫共軛物之診斷劑。在一具體實施例 中，標記係選自放射性標記、螢光團、發色團、顯影劑以及金屬離子之群組。
本發明亦提供包含本發明中之抗體、抗原結合片段、多肽或免疫共軛物之套組。
本發明亦提供抑制病人腫瘤生長的方法，其包含將一治療有效量的本發明中之抗體、抗原結合片段、多肽、免疫共軛物或藥學組成物投藥予病人。在某個具體實施例中，本發明提供抑制病人腫瘤生長的方法，其包含將一治療有效量之具有化學式(A)-(L)-(C)的免疫共軛物投藥予病人，其中：(A)是專一結合人類葉酸受體1的抗體或其抗原結合片段；(L)是連接元；以及(C)是選自由美登素衍生物以及美登素衍生物類似物組成的群組之細胞毒素；其中(L)將(A)鍵聯至(C)，並且其中該免疫共軛物在KB異體移植模式中減少腫瘤體積至少二倍。在某個具體實施例中，此方法包含投藥抗體或其抗原結合片段，其包含(a)一種包含GYFMN(SEQ ID NO：1)的重鏈CDR1；一種包含RIHPYDGDTFYNQXaa1FXaa2Xaa3(SEQ ID NO：56)的重鏈CDR2；以及一種包含YDGSRAMDY(SEQ ID NO：3)的重鏈CDR3；以及(b)一種包含KASQSVSFAGTSLMH(SEQ ID NO：7)的輕鏈CDR1；一種包含RASNLEA(SEQ ID NO：8)的輕鏈CDR2；以及一種包含QQSREYPYT(SEQ ID NO：9)的輕鏈CDR3；其中Xaa1係選自K、Q、H以及R；Xaa2係選自Q、H、N以及R；以及Xaa3係選自G、E、T、S、A以及 V。在進一步的具體實施例中，抗體含有包含RIHPYDGDTFYNQKFQG(SEQ ID NO：2)的重鏈CDR2。
在某個具體實施例中，本發明提供抑制腫瘤生長的方法，其包含投藥抗體或其抗原結合片段，其係經由在2010年4月7日寄存於ATCC並且具有ATCC寄存編號PTA-10772以及PTA-10773或10774之質體DNA編碼。
在另一具體實施例中，此方法提供投藥包含含有重鏈變異區域SEQ ID NO：4以及輕鏈變異區域SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之人類化抗體的免疫共軛物；(L)N-琥珀醯亞胺-〔(N-馬來醯亞胺基丙醯胺基)-四甘醇〕酯(NHS-PEG4-馬來醯亞胺)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N2-(4-巰基-4-甲基-1-氧代戊基)-美登素。
在另一具體實施例中，此方法包含投藥免疫共軛物，其包含(A)包含重鏈變異區域SEQ ID NO：4以及輕鏈變異區域SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)丁酸酯(SPDB)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N2-(4-巰基-4-甲基-1-氧代戊基)-美登素；其中(L)將(A)鍵聯至(C)。
在另一具體實施例中，此方法包含投藥免疫共軛物，其包含(A)包含重鏈變異區域SEQ ID NO：4以及輕鏈變異區域SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)2-磺酸基丁酸酯 (磺酸基-SPDB)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N2-(4-巰基-4-甲基-1-氧代戊基)-美登素；其中(L)將(A)鍵聯至(C)。
在另一具體實施例中，此方法包含投藥免疫共軛物，其包含(A)包含重鏈變異區域SEQ ID NO：4以及輕鏈變異區域SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)-2-磺酸基戊酸酯(磺酸基-SPP)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N(2’)-(3-巰基-1-氧代丙基)-美登素；其中(L)將(A)鍵聯至(C)。
在另一具體實施例中，此方法包含投藥免疫共軛物，其包含(A)包含重鏈變異區域SEQ ID NO：4以及輕鏈變異區域SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11之人類化抗體；(L)N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)戊酸酯(SPP)；以及(C)N(2’)-去乙醯-N(2’)-(3-巰基-1-氧代丙基)-美登素；其中(L)將(A)鍵聯至(C)。
在另一具體實施例中，此方法包含投藥免疫共軛物，其包含在April 7,2010寄存於ATCC之抗體huFR-1-21並且具有ATCC寄存編號PTA-10775以及PTA-10776。在某個具體實施例中，此huFR1-21抗體包含(a)一種包含SSYGMS(SEQ ID NO：30)之重鏈CDR1；一種包含TISSGGSYTY(SEQ ID NO：31)之重鏈CDR2；一種包含DGEGGLYAMDY(SEQ ID NO：32)之重鏈CDR3；以及(b)一種包含KASDHINNWLA(SEQ ID NO：27)之輕 鏈CDR1；一種包含GATSLET(SEQ ID NO：28)之輕鏈CDR2；一種包含QQYWSTPFT(SEQ ID NO：29)之輕鏈CDR3。在某些具體實施例中，此方法包含投藥含有抗體為huFR1-48抗體之免疫共軛物，其包含：(a)一種包含TNYWMQ(SEQ ID NO：60)之重鏈CDR1；一種包含AIYPGNGDSR(SEQ ID NO：61)之重鏈CDR2；一種包含RDGNYAAY(SEQ ID NO：62)之重鏈CDR3；以及(b)一種包含RASENIYSNLA(SEQ ID NO：57)之輕鏈CDR1；一種包含AATNLAD(SEQ ID NO：58)之輕鏈CDR2；一種包含QHFWASPYT(SEQ ID NO：59)之輕鏈CDR3。在某些具體實施例中，此方法包含投藥含有抗體為huFR1-49抗體之免疫共軛物，其包含：(a)一種包含TNYWMY(SEQ ID NO：66)之重鏈CDR1；一種包含AIYPGNSDTT(SEQ ID NO：67)之重鏈CDR2；一種包含RHDYGAMDY(SEQ ID NO：68)之重鏈CDR3；以及(b)一種包含RASENIYTNLA(SEQ ID NO：63)之輕鏈CDR1；一種包含TASNLAD(SEQ ID NO：64)之輕鏈CDR2；一種包含QHFWVSPYT(SEQ ID NO：65)之輕鏈CDR3。在某些具體實施例中，此方法包含投藥含有抗體為huFR1-57抗體之免疫共軛物，其包含：(a)一種包含SSFGMH(SEQ ID NO：72)之重鏈CDR1；一種包含YISSGSSTIS(SEQ ID NO：73)之重鏈CDR2；一種包含EAYGSSMEY(SEQ ID NO：74)之重鏈CDR3；以及(b)一種包含RASQNINNNLH(SEQ ID NO：69)之輕鏈 CDR1；一種包含YVSQSVS(SEQ ID NO：70)之輕鏈CDR2；一種包含QQSNSWPHYT(SEQ ID NO：71)之輕鏈CDR3。在某些具體實施例中，此方法包含投藥含有抗體為huFR1-65抗體之免疫共軛物，其包含：(a)一種包含TSYTMH(SEQ ID NO：78)之重鏈CDR1；一種包含YINPISGYTN(SEQ ID NO：79)之重鏈CDR2；一種包含GGAYGRKPMDY(SEQ ID NO：80)之重鏈CDR3；以及(b)一種包含KASQNVGPNVA(SEQ ID NO：75)之輕鏈CDR1；一種包含SASYRYS(SEQ ID NO：76)之輕鏈CDR2；一種包含QQYNSYPYT(SEQ ID NO：77)之輕鏈CDR3。
在一具體實施例中，此方法抑制卵巢腫瘤、腦腫瘤、乳腺腫瘤、子宮腫瘤、子宮內膜腫瘤、胰腺腫瘤、腎腫瘤或肺腫瘤生長。在某個具體實施例中，此方法抑制卵巢腫瘤生長。在另一具體實施例中，本發明抑制肺腫瘤生長。在某個具體實施例中，抑制腫瘤生長用以治療癌症。在進一步的具體實施例中，此方法包含將第二抗癌劑投藥予主體。在某個具體實施例中，第二抗癌劑是化療劑。
本發明亦提供產生本發明中之抗體、抗原結合片段或多肽的分離細胞。
本發明亦提供分離之多核苷酸，其包含與選自由SEQ ID NOs：5、14、15、37、38、43、44、47、48以及120-127所組成之群組的序列至少90%相同的序列。在某個具體實施例中，分離的多核苷酸與選自由SEQ ID NOs：5、 14、15、37、38、43、44、47、48以及120-127所組成之群組的序列至少95%相同的序列。在另一具體實施例中，分離的多核苷酸與選自由SEQ ID NOs：5、14、15、37、38、43、44、47、48以及120-12 7所組成之群組的序列至少99%相同的序列。本發明亦提供包含SEQ ID NOs：5、14、15、37、38、43、44、47、48以及120-127之任一多核苷酸的載體。在另一具體實施例中，本發明提供含有包含SEQ ID NOs：5、14、15、37、38、43、44、47、48以及120-127的多核苷酸之載體的宿主細胞。
第1圖. 鼠類(muMov19)以及人類化(huMov19)之Mov19的表面殘基。(A)鼠類以及人類化Mov19之輕鏈表面殘基。提供鼠類以及人類化Mov19之輕鏈變異區骨架表面殘基以及位置編號(Kabat系統)。將與原始鼠類序列相異的人類殘基標示底線。*位置74不是表面位置，但為移去版本1.00中的一致性N端鍵聯醣化位置，將此位置改成蘇胺酸(在此位置最普遍的人類殘基)，造成版本1.60。(B)鼠類和人類Mov19重鏈表面殘基。提供鼠類以及人類化Mov19之重鏈變異區骨架表面殘基以及位置編號(Kabat系統)。將與原始鼠類序列相異的人類殘基標示底線。(C)鼠類和人類FR1-21輕鏈變異區表面殘基和位置編號(Kabat系統)。(D)鼠類和人類FR1-21重鏈變異區表面殘基和位置編號(Kabat系統)。
第2圖. 嵌合的Mov19與huMov19重和輕鏈變異區域以及muFR1-21與huFR1-21重和輕鏈變異區域之排列。針對伴隨它們的鼠類配對物之Mov19與Fr1-21變異區域的表面重塑序列之排列。A)以及C)輕鏈變異區域。B)以及D)重鏈變異區域。破折號「-」代表與鼠類序列相同。將CDRs(Kabat定義)標示底線。
第3圖. 嵌合Mov19與huMov19在HEK細胞中的表現。將嵌合和人類Mov19表現質體暫時轉染至懸浮的HEK293-T細胞中，在7天後收穫，並且將表現的抗體經由定量ELISA測定。將輕鏈和重鏈質體以各自3：1或6：1之莫耳比率轉染。
第4圖. 抗FOLR1抗體之結合專一性，經由它們結合至FOLR1-表現300-19細胞而偵測。經由流動式細胞測量huMov19結合至300-19-FOLR1細胞。300-19親代細胞表現FOLR-1。灰色實體陰影代表細胞自發螢光；黑色點狀線條代表與FITC結合之抗人類第二抗體培養的細胞，黑色實線代表與huMov-19抗體以及與FITC結合之抗人類第二抗體培養的細胞。
第5圖. 抗FOLR1抗體以及免疫共軛物之結合親和力以及在體外之細胞毒活性。於SKOV3細胞測量huMov19以及多種鼠類以及人類化FR-1抗體的結合親和力。亦分析所列抗體之PEG4-Mal-DM4共軛物在體外的細胞毒活性。
第6圖. 免疫共軛物的抗體相關細胞毒性。對Igrov1細胞分析huMov19、huFR1-21以及Mor003之ADCC活性。將 Igrov 1以15000細胞/孔培養，標的：NK細胞比率1：4。
第7圖. 於KB細胞中huFR1-21-PEG4-mal-DM4以及huMov19-PEG4-mal-DM4持續暴露之細胞毒活性。當它們在KB細胞存在下一起培養時，過量的非共軛抗體抑制免疫共軛物活性，意指細胞毒活性是抗原依賴的。
第8圖. 在KB異體移植模式中以huMov19為標的之共軛物在體內的功效。標的FOLR1之可裂解共軛物huMov19-SPDB-DM4(B)與非標的FOLR1 huC242-SPDB-DM4(D)的比較，以及非可裂解共軛物huMov19-PEG4-Mal-DM4(C)與非標的huC242-PEG4Mal-DM4(E)的比較係使用已建立的KB細胞植入SCID小鼠皮下之異體移植模式。經由huMov19標的FOLR1造成平均腫瘤體積的顯著降低。
第9圖. 於KB異體移植模式中huMov19-PEG4-Mal-DM4相較於鼠類FR-1抗FOLR1抗體在活體的功效。將與PEG4-Mal-DM4非共軛或共軛之FR-1系列抗體，對於它們相較於huMov19-PEG4-Mal-DM4在KB異體移植模式中降低平均腫瘤體積的能力測試。(A)FR-1-9，(B)FR-1-13，(C)FR-1-22以及(D)FR-1-23。
第10圖. 於KB異體移植模式中huMov19-PEG4-Mal-DM4以及huFR1-21-PEG4-Mal-DM4在活體的功效。在接種執行後的第6天，執行huMov19-PEG4-Mal-DM4以及huFR1-21-PEG4-Mal-DM4之10mg/kg單一注射。huMov19-PEG4-Mal-DM4以及huFR1-21-PEG4-Mal-DM4皆顯示平均 腫瘤體積的顯著降低。「Mean TV」意指平均腫瘤體積。
第11圖. 於KB異體移植模式中HuMov19-PEG4-mal-DM4顯示劑量依賴活性。在整個測試劑量的範圍分析免疫共軛物的劑量依賴活性。每週以劑量投藥造成抗腫瘤活性的改善。高藥物量僅少量地改善10mg/kg劑量組別的活性，伴隨在較低劑量組別中的活性降低。3.7DAR意指每抗體3.7藥物分子。
第12圖. 與DM1和DM4以各種連接元共軛之huMov19在活體的功效。將huMov19以每抗體3.9藥物分子共軛至SMCC-DM1(A)；以每抗體3.7藥物分子共軛至磺酸基-mal-DM4(B)以及以每抗體8.23藥物分子共軛至磺酸基-mal-DM4(C)並且相較於huMov19-PEG4-mal-DM4以各種濃度分析它們降低平均腫瘤體積的能力。
第13圖. 與DM1和DM4以各種連接元共軛之huMov19在活體的功效。將huMov19以每抗體4.3藥物分子共軛至SPP-DM1；以每抗體3.8藥物分子共軛至磺酸基-SPDB-DM4，以每抗體3.8藥物分子共軛至SPDB-DM4，以及以每抗體6.8藥物分子共軛至磺酸基-SPDB-DM4並且分析它們降低平均腫瘤體積的能力。以5mg/kg(A)以及2.5mg/kg(B)的上列共軛物的一者或僅以PBS處理小鼠。
第14圖. 於OVCAR-3異體移植腫瘤模式中huMov19-磺基-SPDB-DM4在活體之功效。以25、50或100μg/kg的huMov19-磺酸基-SPDB-DM4或僅以PBS處理小鼠。
第15圖. 於IGROV-1異體移植腫瘤模式中huMov19-磺酸基-SPDB-DM4在活體之功效。以25、50或100μg/kg的huMov19-磺酸基-SPDB-DM4或僅以PBS處理小鼠。
第16圖. 於OV-90異體移植腫瘤模式中huMov19-磺酸基-SPDB-DM4在活體之功效。以25、50或100μg/kg的huMov19-磺酸基-SPDB-DM4或僅以PBS處理小鼠。
第17圖. 於KB異體移植模式中，可裂解以及非可裂解鏈合劑對免疫共軛物的功效之影響。
第18圖. 於(A)KB異體移植模式(B)OVCAR-3異體移植模式中，可裂解鏈合劑對免疫共軛物的功效之影響。
第19圖. 於KB以及異體移植腫瘤模式中huFR1-48、huFR1-49、huFR1-57以及huFR1-65-SMCC-DM1在體外以及在活體之功效。以200μg/kg單一劑量處理小鼠。
本發明提供新穎之劑，其包括但不限於多肽例如結合至人類葉酸受體1(FOLR1)之抗體以及免疫共軛物。亦提供相關的多肽以及多核苷酸、包含結合FOLR1之劑之組成物以及製作結合FOLR1之劑的方法。進一步提供使用此新穎的結合FOLR1之劑的方法，例如抑制腫瘤生長及/或治療癌症的方法。
定義
為幫助了解本發明，將數個用語與措詞定義如下。
該用語「人類葉酸受體1」或「FOLR1」，如同本文中所使用的，除非另外指明，意指任何自然人類FOLR1。該用語「FOLR1」包括「全長」、未處理的FOLR1以及起因於在細胞中處理之任何形式的FOLR1。該用語亦包括天然發生之FOLR1的變化物，例如，剪接變化物、對偶變化物以及異構物。本文中所描述之FOLR1多肽可由各種來源分離出，例如從人類組織類型或從另外的來源，或經由重組或合成方法製備。FOLR1序列的範例包括但不限於，NCBI參考編號P15328、NP_001092242.1、AAX29268.1、AAX37119.1、NP_057937.1以及NP_057936.1。
該用語「抗體」表示透過免疫球蛋白分子的變異區內的至少一個抗原辨識位置辨認以及專一性地結合至標的之免疫球蛋白分子，例如蛋白質、多肽、肽、碳水化合物、多核苷酸、脂肪或上述的結合。如同本文中所使用的，該用語「抗體」包括完整的多株抗體、完整的單株抗體、抗體片段(例如Fab、Fab’、F(ab’)2以及Fv片段)、單鏈Fv(scFv)突變、多專一性抗體(例如由至少兩個完整抗體生成之雙特異性抗體)、嵌合抗體、人類化抗體、人類抗體、含有抗體之抗原決定部分的融合蛋白以及包含抗原辨認位置的任何其他經修飾的免疫球蛋白分子，只要抗體表現所希望的生物活性。抗體可以是免疫球蛋白的五個主要類別的任一者：IgA、IgD、IgE、IgG以及IgM，或其子類別(亞型)(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1以及IgA2)根據它 們的重鏈恆定區的識別而分別稱為α(alpha)、δ(delta)、ε(epsilon)、γ(gamma)以及μ(mu)。不同類別的免疫球蛋白具有不同且已熟知的次單元結構以及三度空間構形。抗體可為裸露的或共軛至其他分子例如毒素、放射性同位素等等。
「阻斷」抗體或「拮抗劑」抗體為抑制或降低其結合抗原之生物活性者，例如FOLR1。在某個具體實施例中，阻斷抗體或拮抗劑抗體實質上或完全地抑制抗原的生物活性。希望地，降低生物活性10%、20%、30%、50%、70%、80%、90%、95%或甚至100%。
該用語「抗FOLR1抗體」或「結合至FOLR1的抗體」意指能夠以足夠的親和力結合FOLR1的抗體，使得抗體在標的FOLR1以作為診斷及/或治療劑是有效用的。抗FOLR1抗體結合至非相關的、非-FOLR1蛋白質的程度比抗體結合至FOLR1所測到的程度少約10%，例如，經由放射免疫測定法(RIA)。在某些具體實施例中，結合至FOLR1的抗體具有解離常數(Kd)1μM、100nM、10nM、1nM或0.1nM。
該用語「抗體片段」意指完整抗體的一部分以及意指完整抗體的抗原決定變異區域。抗體片段的範例包括但不限於Fab、Fab’、F(ab’)2以及Fv片段、線性抗體、單鏈抗體，以及由抗體片段形成的多專一性抗體。
「單株抗體」意指涉及單一抗原決定物或抗原決定基的高度專一辨識與結合的同源抗體族群。這與典型地包括 以不同抗體針對不同抗原決定物之多株抗體相反。該用語「單株抗體」包括完整與全長兩者之單株抗體以及抗體片段(例如Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv)、單鏈(scFv)突變物、包含抗體部分的融合蛋白以及任何其他含有抗原辨識位置之經修飾的免疫球蛋白分子。此外，「單株抗體」意指此類以任意數種方式而製造的抗體，其方式包括但不限於經由融合瘤細胞、噬菌體篩選、重組表現以及基因轉殖動物。
該用語「人類化抗體」意指非人類(例如鼠類)抗體的形式，其為專一的免疫球蛋白鏈、嵌合免疫球蛋白或其包含最小的非人類(例如鼠類)序列的片段。典型地，人類化抗體是其中來自互補決定區(CDR)之殘基被來自非人類物種(例如小鼠、大鼠、兔、倉鼠)之CDR殘基所取代的人類免疫球蛋白，其具有希望的專一性、親和力與功能(Jones et al.,1986,Nature,321：522-525；Riechmann et al.,1988,Nature,332：323-327；Verhoeyen et al.,1988,Science,239：1534-1536)。在一些例子中，人類免疫球蛋白的Fv骨架區域(FR)殘基被以相對應的來自非人類物種之抗體中的殘基取代，其抗體具有希望的專一性、親和力與功能。人類化抗體可被進一步經由在Fv骨架區域及/或在被取代的非人類殘基中的任一者之額外殘基的取代作用而修飾，以改良並且最佳化抗體的專一性、親和力及/或功能。實質來說，人類化抗體將實質地包含其所有至少一個，以及典型地二或三個變異區，其包含全部 或實質上全部之對應於非人類免疫球蛋白的CDR區域，而全部或實質上全部的FR區域為那些人類免疫球蛋白之一致序列。人類化抗體亦可包含至少一部分的免疫球蛋白恆定區或域(Fc)，典型地為人類免疫球蛋白的免疫球蛋白恆定區或域(Fc)。用以生成人類化抗體的方法描述於美國專利5,225,539或5,639,641。
抗體的「變異區」意指抗體輕鏈的變異區或抗體重鏈的變異區其單獨或結合的任一者。每個重以及輕鏈的變異區皆由以三個亦稱為超變異區的互補決定區段(CDRs)所鍵聯的四個骨架區(FR)組成。在每個鏈的CDRs係經由FRs抓住靠近在一起，並且伴隨來自其他鏈的CDRs，促成抗體之抗原結合位置的生成。有至少兩個技術用以測定CDRs：(1)以跨物種序列變異性為基礎的方法(即Kabat et al.Sequences of Proteins of Immunological Interest,(5th ed.,1991,National Institutes of Health,Bethesda Md.))；以及(2)以抗原-抗體複合物之晶體學研究為基礎的方法(Al-lazikani et al(1997)J.Molec.Biol.273：927-948)。此外，有時本領域使用這兩個方法的結合以測定CDRs。
Kabat編號系統一般用於意指在變異區域中的殘基時(大約輕鏈的1-107殘基以及重鏈的1-113殘基)(例如Kabat et al.,Sequences of Immunological Interest.5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991))。
如同在Kabat中胺基酸位置的編號，意指使用作為在Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)中之抗體編譯的重鏈變異區或輕鏈變異區之編號系統。使用此編號系統，實際線性胺基酸序列可包含較少或額外的胺基酸對應於減短或插入變異區的一FR或CDR。舉例來說，重鏈變異區可包括在H2之殘基52之後的單一胺基酸插入(根據Kabat殘基52a)以及在重鏈FR殘基82之後的插入之殘基(例如根據Kabat殘基82a、82b以及82c等)。對於所給的抗體之殘基之Kabat編號可經由與一「標準」Kabat編號序列排列抗體的同源序列區域而決定。Chothia指出以結構環狀之位置取代(Chothia and Lesk J.Mol.Biol.196：901-917(1987))。當使用Kabat編號慣例將Chothia CDR-H1環狀的結尾編號時，依據環狀的長度介於H32和H34間變化(此乃因為Kabat編號方案將插入置於H35A以及H35B；若35A或35B皆不存在，此環結束於32；若只有35A存在，此環結束於33；若35A以及35B兩者皆存在，此環結束於34)。AbM超變異區代表在Kabat CDRs以及Chothia結構環間的折衷，並且經由Oxford Molecular’s AbM抗體模型軟體所而使用。
該用語「人類抗體」代表經由人類製造的抗體或具有對應於使用本領域所知的任何技術以人類製造的抗體之胺基酸序列的抗體。此人類抗體的定義包括完整的或全長的抗體、其片段及/或包含至少一個人類重及/或輕鏈多肽的抗體，例如舉例來說，包含鼠類輕鏈以及人類重鏈多肽的抗體。
該用語「嵌合抗體」意指抗體其中免疫球蛋白分子的胺基酸序列係衍生自二或更多個物種。典型地，輕與重鏈的變異區兩者皆對應於衍生自哺乳動物的一個物種(例如老鼠、大鼠、兔等)之抗體變異區，其伴隨希望的專一性、親和力以及功能，而恆定區係與衍生自另一物種(通常為人類)的抗體中序列同源，以避免引起在那個物種中的免疫反應。
該用語「抗原決定基」或「抗原決定物」於本文中交替使用並且意指抗原能夠被辨識並專一地被特定的抗體結合的那個部分。當抗原是多肽，抗原決定基可由相鄰的胺基酸和蛋白質三級折疊並列的非相鄰的胺基酸兩者而形成。自相鄰的胺基酸形成的抗原決定基典型地於蛋白質變 性時保留，而自三級折疊而形成的抗原決定基典型地於蛋白質變性時失去。，一個抗原決定基典型地包括至少3，並且更經常地，至少5或8-10個以獨特空間構形之胺基酸。
「結合親和力」一般意指分子(例如，抗體)單一結合位置以及其結合搭檔(例如，抗原)之間的非共價交互作用力的總和強度。除非另外指明，如同本文中所使用的，「結合親和力」意指反映結合對成員之間(例如，抗體以及抗原)1：1交互作用內部的結合親和力。分子X對於其搭檔Y的親和力一般可經由解離常數(Kd)表示。親和力可經由本領域所知的普遍方法測量，包括本文中所描述的那些方法。低親和力的抗體一般結合抗原緩慢並傾向容易立刻解離，而高親和力的抗體一般較快結合抗原並傾向維持更久的結合。有各種本領域所知的測量結合親和力的方法，其任一者可用於本發明的目的。具體說明之具體實施例係描述於下。
當本文中使用「或更佳」以意指結合親和力時，意指分子和其結合搭檔間更強的結合。當本文中使用「或更佳」以意指更強的結合，以更小數字之Kd值代表。舉例來說，具有對於抗原親和力「0.6nM或更佳」的抗體，此抗體對於抗原的親和力為<0.6nM，即0.59nM、0.58nM、0.57nM等等或任何小於0.6nM的數值。
該措辭「實質上相似」或「實質上相同」，如同本文中所使用的，表示兩數值間足夠高程度之相似(一般地一 者相關於本發明的抗體以及另一個相關於參考/比較抗體)使得本領域之技術人員將在所述之值所測得的生物特性的情況內考量兩數值間的差異為極小或無生物及/或統計顯著性。所述兩數值的差異為對於參考/比較抗體少於約50%、少於約40%、少於約30%、少於約20%或少於約10%的函數值。
被「分離」之多肽、抗體、多核苷酸、質體、細胞或組成物為自然中找不到的形式之多肽、抗體、多核苷酸、質體、細胞或組成物。被分離的多肽、抗體、多核苷酸、質體、細胞或組成物包括那些已被純化成它們不再是於自然中找到它們時的形式的程度。在一些具體實施例中，被分離的抗體、多核苷酸、質體、細胞或組成物實質上是純的。
如同本文中所使用的，「實質上純的」意指是至少50%純的物質(即，無汙染物)、至少90%純的、至少95%純的、至少98%純的或至少99%純的。
如本文中所使用的該用語「免疫共軛物」或「共軛物」意指鍵聯至細胞結合劑(即，抗FOLR1抗體或其片段)之化合物或其衍生物並由通式：C-L-A定義，其中C=細胞毒素，L=鏈合劑，以及A=細胞結合劑或抗FOLR1抗體或抗體片段。免疫共軛物亦可由相反順序的通式：A-L-C定義。
「鏈合劑」是任何能夠以穩定、共價的方式鍵聯經常為藥物，例如美登素衍生物的化合物至例如抗FOLR1抗體 之細胞結合劑或其片段的化學基元。鏈合劑於化合物或抗體保持活性的情況下對酸類誘發的裂解、光誘發的裂解、肽酶誘發的裂解、酯酶誘發的裂解以及二硫化鍵的裂解可以是敏感的或是實質上耐受的。合適的鏈合劑為本領域熟知的，並且包括，舉例來說，雙硫基團、硫醚基團、不耐酸基團、不耐光基團、不耐肽酶基團以及不耐酯酶基團。鏈合劑亦包括帶電的鏈合劑，以及其如同本文中所描述的以及本領域所知的親水形式。
該用語「癌症」以及「癌的」意指或描述在哺乳動物中的生理情況，其細胞族群以未調節的細胞生長為特徵。癌症的範例包括但不限於，惡性腫瘤、淋巴瘤、胚細胞瘤、肉瘤以及血癌。此類癌症更具體的範例包括鱗狀細胞癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、鱗狀細胞肺癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃腸癌、胰腺癌、神經膠母細胞瘤、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝腫瘤、乳癌、結腸癌、直腸癌、子宮內膜或子宮腫瘤、唾腺癌、腎臟癌、肝癌、前列腺癌、外陰部癌、甲狀腺癌、肝癌以及各種型式的頭頸癌。
「腫瘤(tumor)」以及「腫瘤(neoplasm)」意指由過量細胞生長或增生引起之任何組織團塊，良性(非癌的)或惡性(癌的)之任一者，包括癌症前期病變。
該用語「癌細胞」、「腫瘤細胞」以及語法的等同物意指衍生自腫瘤或癌症前期病變之全部細胞族群，包括無致癌性的細胞，其包含大批腫瘤細胞族群，以及致癌性的 幹細胞(癌症幹細胞)兩者。如同本文中所使用的，當僅意指那些缺乏更新與分化能力的腫瘤細胞時，該用語「腫瘤細胞」將以用語「非致癌性」修飾，以與那些來自癌症幹細胞的那些腫瘤細胞區分。
該用語「主體」意指任何動物(例如，哺乳動物)，包括但不限於人類、非人類的靈長類動物、嚙齒類動物，以及諸如此類，其為特定治療的接受者。典型地，該用語「主體(subject)」以及「病人(patient)」於本文中交替使用以意指人類主體。
「結合」一或更多進一步的治療劑投藥包括同步(同時)以及以任何順序連續進行投藥。
該用語「藥劑配方」意指其以此類形式以使活性成分之生物活性有效的製備，並且其不包含對此配方投藥的主體為不可接受毒性的額外成分。此類配方可以是無菌的。
抗體的「有效量」如同本文所揭露的是足夠進行特定所述的目的之量。「有效量」可憑經驗決定並且以與所述之目的相關的慣例方式。
該用語「治療有效量」意指抗體或其他藥物對「治療」在主體或哺乳動物中的疾病或失調有效的量。在癌症的案例中，藥物的治療有效量可降低癌細胞數目；減少腫瘤尺寸；抑制(即，延緩至某種程度以及在某個具體實施例中，停止)癌細胞滲透至周圍器官；抑制(即，延緩至某種程度以及在某個具體實施例中，停止)腫瘤轉移；某種程度地抑制腫瘤生長；及/或某程度地緩解一或更多相 關於癌症的症狀。見本文中「治療」的定義。達到藥物可防止生長及/或殺傷存在的癌細胞的程度，其可以是細胞生長抑制及/或細胞毒性的。「預防性有效量」意指在劑量以及必要的一段時間，以達到所希望的預防結果之有效量。典型但非必要地，因預防的劑量係用於先前或於疾病的早期之主體，預防性有效量將少於治療有效量。
當本文使用該詞語「標記」意指可偵測的化合物或組成物，其直接或間接地結合至抗體，使得產生「標記」的抗體。此標記可以是本身可偵測的(例如放射性同位素標記或螢光標記)或，在酵素標記的例子中，可催化可偵測的受質化合物或組成物的化學轉變。
「化療劑」是有效用於治療癌症化學化合物，無論作用機制。化療劑的類別包括但不限於：烷化劑、抗代謝物、紡錘毒素植物生物鹼、細胞毒性/抗腫瘤抗生素、拓撲解旋酶抑制劑、抗體、光敏劑以及激酶抑制劑。化療劑包括使用於「標耙療法」以及傳統化療的化合物。
用語例如「治療(treating)」或「治療(treatment)」或「治療(to treat)」或「減輕(alleviating)」或「減輕(to alleviate)」意指兩者1)治癒、延緩、減輕所診斷的病理情況或失調症狀及/或停止所診斷的病理情況或失調的發展之治療措施以及2)預防(Prophylatic)及/或預防(preventative)所針對的病理情況或失調的發展之預防性的或預防措施。因此，那些需要治療的對象包括那些已經帶有失調者；那些容易得到 失調者；以及那些將預防失調者。在某些具體實施例中，若主體顯示以下一或更多，則主體成功地根據本發明的方法「治療」癌症：癌細胞數目降低或完全沒有癌細胞；腫瘤尺寸降低；抑制或無癌細胞滲透至周圍器官，其包括，舉例來說，癌症擴散至軟組織與骨；抑制或無腫瘤轉移；抑制或無腫瘤生長；緩解一或更多相關於特定癌症的症狀；降低發病率與死亡率；生活品質的改善；降低腫瘤的腫瘤發生率、致腫瘤頻率或致腫瘤能力；降低腫瘤中的癌症幹細胞的數量或頻率；致癌細胞分化為非致癌狀態；或一些效果的結合。
「多核苷酸」或「核酸」如同在本文中交替使用，意指任何長度的核苷酸聚合物，並且包括DNA與RNA。核苷酸可以是去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、經修飾的核苷酸或鹼基及/或它們的類似物，或任何可被DNA或RNA聚合酶併入的受質。多核苷酸可包含經修飾的核苷酸，例如甲基化的核苷酸以及它們的類似物。如果存在，可在聚合物組裝前或後給予對核苷酸結構的修飾作用。核苷酸序列可被非核苷酸成分中斷。多核苷酸可在聚合作用後進一步修飾，例如經由與標記成分共軛。其他類型的修飾作用包括，舉例來說，「加帽」，將一或更多自然發生的核苷酸以類似物取代的取代作用、核苷酸間修飾作用例如，舉例來說，那些伴隨不帶電的鍵結(例如，甲基磷酸酯、磷酸三酯、亞磷胺、胺基甲酸酯等)以及伴隨帶電的鍵結(例如，硫代磷酸酯、硫代二磷酸酯等)、那些包含懸吊的基 元，例如，舉例來說，蛋白質(例如，核酸水解酶、毒素、抗體、信息胜肽、ply-L-離胺酸等)、那些伴隨嵌入試劑(intercalators)者(例如，吖啶、補骨脂素等)、那些包含螫合劑者(例如，金屬、放射性金屬、硼、氧化金屬等)、那些包含烷化劑者、那些伴隨經修飾的鍵結(例如，α異位性核酸等)以及多核苷酸未經修飾的形式。進一步地，任何原先存在於糖中的羥基基團可被舉例來說，以磷酸脂基團、磷酸鹽基團替換，可被標準保護基團保護，或可被活化以製備額外的鍵結至額外的核苷酸，或可被共軛至固體支持物。此5’與3’端OH可被磷酸化或以胺類或自1至20個碳原子之有機加帽基團基元取代。其他羥基亦可被衍生為標準保護基團。多核苷酸也可包含本領域一般所知的核糖或去氧核糖糖類的類似物形式，包括舉例來說，2’-O-甲基-,2’-O-烯丙基、2’-氟-或2’-疊氮-核糖、碳環糖類似物、α異位性糖、映異構糖例如阿拉伯糖、木糖或來蘇糖、吡喃糖、呋喃糖、景天庚酮糖、無環類似物以及無鹼基核苷類似物例如甲基核糖苷。一或更多磷酸二酯鍵結可被替代的鍵結基團取代。這些替代的鍵結基團包括但不限於，具體實施例其中磷酸鹽被P(O)S(「硫代鹽」)、P(S)S(「二硫代鹽」)、"(O)NR2(「醯胺鹽」)、P(O)R、P(O)OR’、CO或CH2(「甲縮醛」)替代，其中每個R或R’獨立地是H或隨選地包含醚(--O--)鍵結、芳基、烯基、環烷基、環烯基或芳醛基之被取代或未被取代的烷基(1-20 C)。不是所有 在多核苷酸中之鍵結需為相同的。前面的描述適用於所有本文中所意指之多核苷酸，包括RNA以及DNA。
該用語「載體」代表一建構，其能夠在宿主細胞中輸送並表現一或更多有興趣的基因或序列。載體的範例包括但不限於，病毒載體，裸DNA或RNA表現載體、質體、黏接質體或噬菌體載體、與陽離子凝結劑相關的DNA或RNA表現載體、包裹在脂質體以及某些真核細胞，例如生產細胞中的DNA或RNA表現載體。
該用語「多肽」、「肽」以及「蛋白質」於本文中交替使用，以意指任何長度的胺基酸聚合物。此聚合物可為線性或分支的，其可包含經修飾的胺基酸，以及其可被非胺基酸中斷。該用語亦包括已經天然或被插入修飾的胺基酸聚合物；舉例來說，二硫化鍵的生成、醣化、脂化、乙醯化、磷酸化或任何其他操作或修飾，例如與標記成分共軛。亦包括在定義中者為，舉例來說，包含一或更多胺基酸的類似物之多肽(包括，舉例來說，非自然胺基酸等)以及其他本領域所知的修飾作用。應了解因本發明的多肽係根據抗體，在某些具體實施例中，多肽可以單鏈或組合鏈發生。
在二或更多個核酸或多肽的內容中該用語「相同(identical)」或「一致性(identity)」百分比意指二或更多相同或具有特定百分率之相同的核苷酸或胺基酸殘基的序列或子序列，當以最大對應比較並比對(如有需要，引入間隔)時，不考慮以任何保留胺基酸的取代作為序列 一致性的一部分。一致性百分比可使用序列比較軟體或演算法或經由目視檢查而測得。各種演算法以及軟體為本領域所知的，其可使用以獲得胺基酸或核苷酸序列之比對。此類序列比對演算法的非限制性範例之一者為描述於Karlin et al,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.,87：2264-2268的演算法，如於Karlin et al.,1993,Proc.Natl.Acad.Sci.,90：5873-5877中所修改，並且被納入NBLAST以及XBLAST程式(Altschul et al.,1991,Nucleic Acids Res.,25：3389-3402)。在某些具體實施例中，Gapped BLAST可如同描述於Altschul et al.,1997,Nucleic Acids Res.25：3389-3402而使用。BLAST-2、WU-BLAST-2(Altschul et al.,1996,Methods in Enzymology,266：460-480)、ALIGN、ALIGN-2(Genentech,South San Francisco,California)或Megalign(DNASTAR)是可用以比對序列的額外的可公開取得軟體程式。在某些具體實施例中，兩核苷酸間的一致性百分比係使用GCG軟體中之GAP程式而測定(例如，使用NWSgapdna.CMP陣列並且間隔權重40、50、60、70或90以及長度權重1、2、3、4、5或6)。在某些替代的具體實施例中，GCG軟體套裝中引入Needleman以及Wunsch之演算法(J.Mol.Biol.(48)：444-453(1970))之GAP程式，可用以決定兩胺基酸序列間的一致性百分比(例如，使用Blossum 62陣列或PAM250陣列的任一者，以及間隔權重16、14、12、10、8、6或4以及長度權重1、2、3、4、5)。替代地，在某些 具體實施例中，核苷酸或胺基酸序列間的一致性百分比係使用Myers以及Miller之演算法(CABIOS,4：11-17(1989))而決定。舉例來說，一致性百分比可使用ALIGN程式(版本2.0)決定並且使用具有殘基表格的PAM120而決定，間隔長度損失12以及間隔損失4。經由特定比對軟體對於最大比對之合適參數可由本領域的技術人員決定。在某些具體實施例中，使用比對軟體之預設參數。在某些具體實施例中，第一個胺基酸序列對第二個胺基酸序列之一致性百分比「X」係計算為100x(Y/Z)，其中Y是以在第一和第二個序列比對中記分為相同匹配之胺基酸殘基數目(如同經由目視檢查或特定序列比對程式而比對)以及Z是第二個序列的殘基總數。若第一個序列的長度較第二個序列長，第一個序列對第二個序列的一致性百分比將會長於第二個序列對第一個序列的一致性百分比。
作為非限制性的範例，不論任何特定多核苷酸對參考序列具有特定百分率之序列一致性(例如，為至少80%相同、至少85%相同、至少90%相同，以及在一些具體實施例中，至少95%、96%、97%、98%或99%相同)，在某些具體實施例中，可使用Bestfit程式決定(Wisconsin Sequence Analysis Package,Version 8 for Unix,Genetics Computer Group,University Research Park,575 Science Drive,Madison,WI 53711)。Bestfit使用Smith及Waterman,Advances in Applied Mathematics 2：482 489 (1981)之區域同源性(local homology)演算法，以尋找兩序列間最好的同源區段。當使用Bestfit或任何其他序列比對程式以決定特定序列對根據本發明之參考序列是否為，舉例來說，95%相同，參數被設定使得一致性百分率透過參考核苷酸序列的全長而計算，並且容許達到參考序列中核苷酸總數5%的同源性間隔。
在一些具體實施例中，當以最大對應比較與比對，如使用序列比較演算法或經由目視檢查而測量，本發明之二個核酸或多肽為實質上相同，表示它們具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%，以及在一些具體實施例中，至少95%、96%、97%、98%或99%的核苷酸或胺基酸殘基相同。在某些具體實施例中，一致性存在於至少約10、約20、約40-60個殘基長度或任何介於之間的整數值之序列區域，或於較60-80殘基長的整個區域，至少約90-100殘基，或序列與相比較的序列全長為實質上相同的，像是舉例來說核苷酸序列的編碼區。
「保留胺基酸取代」為一個胺基酸殘基被另一個具有相似側鏈的胺基酸殘基取代的情況。具有相似側鏈的胺基酸殘基家族已被本領域定義，包括鹼性側鏈(例如，離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如，天門冬胺酸、麩胺酸)、不帶電極性側鏈(例如，天門冬醯胺酸、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸)、非極性側鏈(例如，甘胺酸、丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸、色胺酸)、β-分枝側 鏈(例如，蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)以及芳香族側鏈(例如，酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。舉例來說，用苯丙胺酸取代酪胺酸為保留性取代。在某些具體實施例中，在本發明中之多肽以及抗體序列的保留性取代不廢除包含那個胺基酸序列的多肽或抗體結合至抗原，即，多肽或抗體結合的FOLR1。在某些具體實施例中，識別核苷酸以及胺基酸不消除抗原結合之保留性取代的方法為本領域熟知的(見例如，Brummell et al.,Biochem.32：1180-1 187(1993)；Kobayashi et al.Protein Eng.12(10)：879-884(1999)；以及Burks et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 94：.412-417(1997))。
如同本揭露內容和申請專利範圍所使用的，除非內文清楚另外指出，單數形式「一(a)」、「一(an)」以及「該(the)」包括複數形式。
已了解無論具體實施例於本文中以語言文字「包含(comprising)」描述，否則亦提供以用語「由...組成(consisting of)」及/或「實質上由...組成(consisting essentially of)」描述的類似的具體實施例。
該用語「及/或」如同用於一措辭中例如「A及/或B」此處意圖包括兩者「A及B」、「A或B」、「A」以及「B」。同樣的，該用語「及/或」如同用於一措辭中例如「A、B及/或C」意圖包括下列實施例的每一者：A、B以及C；A、B或C；A或C；A或B；B或C；A及C；A及B；B及C；(僅)A；(僅)B；以及(僅)C。
FOLR1-結合劑
本發明提供專一地結合人類FOLR1之劑。這些劑本文統稱為「FOLR1-結合劑」。對FOLR1之全長度胺基酸(aa)以及核苷酸(nt)序列為本領域所知的，並且亦分別表示為SEQ ID NOs：25與26提供於本文。
在某些具體實施例中，FOLR1結合劑為抗體、免疫共軛物或多肽。在一些具體實施例中，FOLR1結合劑為人類化抗體。在某些具體實施例中，FOLR1結合劑為鼠類Mov19抗體之人類化版本(變異重鏈與輕鏈分別展示為SEQ ID NOs：17與18)。
在某些具體實施例中，FOLR1結合劑具有一或更多下列的效果：抑制腫瘤細胞增生、經由降低腫瘤中的癌症幹細胞頻率以降低腫瘤致癌性、抑制腫瘤生長、增加存活、觸發腫瘤細胞的細胞死亡、分化致癌性的細胞為非致癌性的狀態或預防腫瘤細胞的轉移。
在某些具體實施例中，專一地結合人類FOLR1之免疫共軛物或其他劑藉由細胞毒性劑而觸發細胞死亡。舉例來說，在某些具體實施例中，將對人類FOLR1抗體之抗體共軛至在腫瘤細胞中活化的美登素衍生物，其腫瘤細胞經由蛋白質內化作用而表現FOLR1。在某些替代的具體實施例中，試劑或抗體不為共軛的。
在某些具體實施例中，FOLR1結合劑能夠抑制腫瘤生長。在某些具體實施例中，FOLR1結合劑能夠抑制腫瘤在 活體內生長(例如，在異體移植老鼠模式中及/或在具有癌症的人類中)。在某些具體實施例中，FOLR1結合劑能夠抑制腫瘤在人類中生長。
因此，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或其抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含GYFMN(SEQ ID NO：1)之重鏈CDR1；包含RIHPYDGDTFYNQXaa1FXaa2Xaa3(SEQ ID NO：56)之重鏈CDR2；以及包含YDGSRAMDY(SEQ ID NO：3)之重鏈CDR3；以及(b)包含KASQSVSFAGTSLMH(SEQ ID NO：7)之輕鏈CDR1；包含RASNLEA(SEQ ID NO：8)之輕鏈CDR2；以及包含QQSREYPYT(SEQ ID NO：9)之輕鏈CDR3；其中Xaa1係選自K、Q、H以及R；Xaa2係選自Q、H、N以及R；以及Xaa3係選自G、E、T、S、A以及V。在某些具體實施例中，抗體為huMov19抗體，其為包含重鏈CDR2 RIHPYDGDTFYNQKFQG(SEQ ID NO：2)的上述抗體。
在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合至FOLR1之人類化抗體或抗原結合片段，其包含huMov19之CDRs伴隨每CDR多至四個(即0、1、2、3或4)保留性胺基酸取代。因此，在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含GYFMN(SEQ ID NO：1)之重鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；包含RIHPYDGDTFYNQKFQG(SEQ ID NO：2)之重 鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；以及包含YDGSRAMDY(SEQ ID NO：3)之重鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或(b)包含KASQSVSFAGTSLMH(SEQ ID NO：7)之輕鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；包含RASNLEA(SEQ ID NO：8)之輕鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；以及包含QQSREYPYT(SEQ ID NO：9)之輕鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物。
本發明亦提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體(huFR1-21)或其抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含SSYGMS(SEQ ID NO：30)之重鏈CDR1；包含TISSGGSYTY(SEQ ID NO：31)之重鏈CDR2；以及包含DGEGGLYAMDY(SEQ ID NO：32)之重鏈CDR3；及/或(b)包含KASDHINNWLA(SEQ ID NO：27)之輕鏈CDR1；包含GATSLET(SEQ ID NO：28)之輕鏈CDR2；以及包含QQYWSTPFT(SEQ ID NO：29)之輕鏈CDR3。
在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合至FOLR1之人類化抗體或抗原結合片段，其包含huFR1-21之CDRs，具有每CDR多至四個(即0、1、2、3或4)保留性胺基酸取代。因此，在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含SSYGMS(SEQ ID NO：30)之重鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變 化物；及/或包含TISSGGSYTY(SEQ ID NO：31)之重鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含DGEGGLYAMDY(SEQ ID NO：32)之重鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或(b)包含KASDHINNWLA(SEQ ID NO：27)之輕鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含GATSLET(SEQ ID NO：28)之輕鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含QQYWSTPFT(SEQ ID NO：29)之輕鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物。
在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合至FOLR1之人類化抗體或抗原結合片段，其包含huFR1-48之CDRs，具有每CDR多至四個(即0、1、2、3或4)保留性胺基酸取代。因此，在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含TNYWMQ(SEQ ID NO：60)之重鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含IYPGNGDSR(SEQ ID NO：61)之重鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含RDGNYAAY(SEQ ID NO：62)之重鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或(b)包含RASENIYSNLA(SEQ ID NO：57)之輕鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之 變化物；及/或包含AATNLAD(SEQ ID NO：58)之輕鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含QHFWASPYT(SEQ ID NO：59)之輕鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物。
在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合至FOLR1之人類化抗體或抗原結合片段，其包含huFR1-49之CDRs，具有每CDR多至四個(即0、1、2、3或4)保留性胺基酸取代。因此，在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含TNYWMY(SEQ ID NO：66)之重鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含AIYPGNSDTT(SEQ ID NO：67)之重鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含RHDYGAMDY(SEQ ID NO：68)之重鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或(b)包含RASENIYTNLA(SEQ ID NO：63)之輕鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含TASNLAD(SEQ ID NO：64)之輕鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含QHFWVSPYT(SEQ ID NO：65)之輕鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物。
在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合至 FOLR1之人類化抗體或抗原結合片段，其包含huFR1-57之CDRs，具有每CDR多至四個(即0、1、2、3或4)保留性胺基酸取代。因此，在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含SSFGMH(SEQ ID NO：72)之重鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含YISSGSSTIS(SEQ ID NO：73)之重鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含EAYGSSMEY(SEQ ID NO：74)之重鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或(b)包含RASQNINNNLH(SEQ ID NO：69)之輕鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含YVSQSVS(SEQ ID NO：70)之輕鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含QQSNSWPHYT(SEQ ID NO：71)之輕鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物。
在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合至FOLR1之人類化抗體或抗原結合片段，其包含huFR1-65之CDRs，具有每CDR多至四個(即0、1、2、3或4)保留性胺基酸取代。因此，在某些具體實施例中，本發明提供專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或抗原結合片段，其中抗體包含：(a)包含TSYTMH(SEQ ID NO：78)之重鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變 化物；及/或包含YINPISGYTN(SEQ ID NO：79)之重鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含GGAYGRKPMDY(SEQ ID NO：80)之重鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或(b)包含KASQNVGPNVA(SEQ ID NO：75)之輕鏈CDR1或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含SASYRYS(SEQ ID NO：76)之輕鏈CDR2或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物；及/或包含QQYNSYPYT(SEQ ID NO：77)之輕鏈CDR3或其包含1、2、3或4個保留性胺基酸取代之變化物。
亦提供包含描述於本文個別之輕鏈或重鏈之一的多肽，以及包含輕鏈或重鏈兩者之多肽(例如，抗體)。SEQ ID NOs：4與6之多肽分別包含huMov19之重鏈變異區，以及huMov19之重鏈。SEQ ID NOs：10-13之多肽分別包含huMov19之變異區輕鏈1.00版、變異區輕鏈1.60版、輕鏈1.00版以及輕鏈1.60版。SEQ ID NOs：42與46之多肽分別包含huFR1-21之重鏈變異區，以及huFR1-21之重鏈。SEQ ID NOs：41與45之多肽分別包含huFR1-21之變異區輕鏈以及輕鏈。SEQ ID NOs：97與113之多肽分別包含huFR1-48之重鏈變異區，以及huFR1-48之重鏈。SEQ ID NOs：96與112之多肽分別包含huFR1-48之變異區輕鏈以及輕鏈。SEQ ID NOs：99與115之多肽分別包含huFR1-49之重鏈變異區，以及huFR1-49之重鏈。SEQ ID NOs： 98與114之多肽分別包含huFR1-49之變異區輕鏈以及輕鏈。SEQ ID NOs：101與117之多肽分別包含huFR1-57之重鏈變異區，以及huFR1-57之重鏈。SEQ ID NOs：100與116之多肽分別包含huFR1-57之變異區輕鏈以及輕鏈。SEQ ID NOs：103與119之多肽分別包含huFR1-65之重鏈變異區，以及huFR1-65之重鏈。SEQ ID NOs：102與118之多肽分別包含huFR1-65之變異區輕鏈以及輕鏈。
亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：4或6至少約90%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：10-13至少約90%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：42或46序列一致性至少約90%之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：41及45至少約90%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：97或113至少約90%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：96或112至少約90%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：99或115至少約90%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：98或114至少約90%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：101或117至少約90%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：100或116至少約90%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：103或119至少約90%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：102或118至少約90%序列 一致性之多肽。在某些具體實施例中，多肽包含具有對SEQ ID NO：4、6、10-13、41、42、45或46至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%、至少約99%序列一致性之多肽。因此，在某些具體實施例中，多肽包含(a)具有對SEQ ID NO：4或6至少約95%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：10-13至少約95%序列一致性之多肽。在某些具體實施例中，多肽包含(a)具有對SEQ ID NO：42或46至少約95%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：41或45至少約95%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：97或113至少約95%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：96或112至少約95%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：99或115至少約95%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：98或114至少約95%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：101或117至少約95%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：100或116至少約95%序列一致性之多肽。亦提供的是多肽其包含：(a)具有對SEQ ID NO：103或119至少約95%序列一致性之多肽；及/或(b)具有對SEQ ID NO：102或118至少約95%序列一致性之多肽。在某些具體實施例中，多肽包含(a)具有SEQ ID NO：4的胺基酸序列之多肽；及/或(b)具有SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11的胺基酸序列之多肽。在某些具體實施例中，多 肽包含(a)具有SEQ ID NO：45的胺基酸序列之多肽；及/或(b)具有SEQ ID NO：46的胺基酸序列之多肽。在某些具體實施例中，多肽包含(a)具有SEQ ID NO：6的胺基酸序列之多肽；及/或(b)具有SEQ ID NO：12或SEQ ID NO：13的胺基酸序列之多肽。在某些具體實施例中，多肽是抗體及/或多肽專一地結合人類葉酸受體1。在某些具體實施例中，多肽是專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體。舉例來說，本發明提供專一地結合人類FOLR1之抗體或人類化抗體，其包含(a)具有SEQ ID NO：4的胺基酸序列之多肽；以及(b)具有SEQ ID NO：10或SEQ ID NO：11的胺基酸序列之多肽。在某些具體實施例中，包含SEQ ID NO：4之多肽是重鏈變異區。在某些具體實施例中，包含SEQ ID NO：10或11之多肽是輕鏈變異區。本發明亦提供專一地結合人類FOLR1之抗體或人類化抗體，其包含(a)具有SEQ ID NO：6的胺基酸序列之多肽；及(b)具有SEQ ID NO：12或SEQ ID NO：13的胺基酸序列之多肽。本發明亦提供專一地結合人類FOLR1之抗體或人類化抗體，其包含(a)具有SEQ ID NO：45的胺基酸序列之多肽；以及(b)具有SEQ ID NO：46的胺基酸序列之多肽。本發明亦提供專一地結合人類FOLR1之抗體或人類化抗體，其包含(a)具有SEQ ID NO：112的胺基酸序列之多肽；以及(b)具有SEQ ID NO：113的胺基酸序列之多肽。本發明亦提供專一地結合人類FOLR1之抗體或人類化抗體，其包含(a)具有SEQ ID NO：114 的胺基酸序列之多肽；以及(b)具有SEQ ID NO：115的胺基酸序列之多肽。本發明亦提供專一地結合人類FOLR1之抗體或人類化抗體，其包含(a)具有SEQ ID NO：116的胺基酸序列之多肽；以及(b)具有SEQ ID NO：117的胺基酸序列之多肽。本發明亦提供專一地結合人類FOLR1之抗體或人類化抗體，其包含(a)具有SEQ ID NO：118的胺基酸序列之多肽；以及(b)具有SEQ ID NO：119的胺基酸序列之多肽。在某些具體實施例中，具有對SEQ ID NO：4、6、10-13、41、42、45、46、96-103以及112-119特定百分率的序列一致性之多肽，與僅藉由保留性胺基酸取代的SEQ ID NO：4、6、10-13、41、42、45、46、96-103以及112-119物相異。
在某些具體實施例中，FOLR1結合劑包含、實質上由或由抗FOLR1抗體組成，其選自huMov19、FR-1-21、FR1-48、FR1-49、FR1-57以及FR1-65抗體所組成的群組。
在某些具體實施例中，huMov19抗體由質體編碼，該質體係於2010年4月7日寄存於美國菌種中心(ATCC)，並且具有ATCC寄存編號PTA-10772以及PTA-10773或10774。
在某些具體實施例中，FR-1-21抗體由質體編碼，該質體係於2010年4月7日寄存於美國菌種中心(ATCC)，並指派ATCC寄存編號PTA-10775以及10776。
在某些具體實施例中，人類化抗體以與抗體嵌合Mov19實質上相同的親和力結合FOLR1。抗體對抗原的親 和力或結合性可使用本領域所熟知的任何合適的方法以實驗決定，例如流式細胞儀、酵素鍵聯免疫吸附分析法(ELISA)或放射性免疫分析(RIA)、或動力學(例如，BIACORETM分析)。可以容易地使用直接結合試驗以及競爭性結合試驗的形式(見，舉例來說，Berzofsky,et al.,"Antibody-Antigen Interactions," In Fundamental Immunology,Paul,W.E.,Ed.,Raven Press：New York,N.Y.(1984)；Kuby,Janis Immunology,W.H.Freeman and Company：New York,N.Y.(1992)；以及描述於本文的方法)。若在不同條件下測量，測得的特定抗體-抗原交互作用的親和力可能變動(例如，鹽類濃度、pH、溫度)。因此，親和力和其他抗原-結合參數的測量(例如，KD或Kd、Kon、Koff)係以標準化的抗體與抗原溶液，以及標準化的緩衝液，如同本領域所知的並且例如描述於本文的緩衝液作出。
在一方面，結合試驗可使用流式細胞儀於在表面表現FOLR1抗原的細胞上而進行。舉例來說，使用每樣品1x105個細胞在100μL FACS緩衝液(以2%正常羊血清補充的RPMI-1640培養基)中將FOLR1陽性細胞例如SKOV3與多種濃度的抗FOLR1抗體培養。接著，將細胞沉澱、清洗並以100μL之結合FITC-羊-抗小鼠或羊-抗人類IgG-抗體培養1小時(像是從例如Jackson Laboratory獲得，在FACS緩衝液中6μg/mL)。將細胞再沉澱、以FACS緩衝液清洗並且重新懸浮於包含1%甲醛之200μL PBS中。舉例來說，樣品係使用FACSCalibur流式細胞儀伴隨HTS多孔上樣器以取得，並且使用CellQuest Pro分析(所有皆來自BD Biosciences,San Diego,US)。針對每個樣品，將FL1(MFI)之平均螢光強度輸出，並對抗體濃度以半-對數繪圖，以產生結合曲線。將S形劑量-反應曲線對結合曲線最適化，並且使用程式例如GraphPad Prism v4以預設參數計算EC50數值(GraphPad軟體，San Diego,CA)。可使用EC50數值作為對每個抗體表觀解離常數「Kd」或「KD」的測量。
單株抗體可使用融合瘤細胞的方法而製備，例如那些由Kohler and Milstein(1975)Nature 256：495所描述者。使用融合瘤細胞的方法，將小鼠、倉鼠或其他合適的宿主動物如同上述免疫接種，以引發淋巴細胞的抗體產生，其將專一地結合至免疫注射之抗原。淋巴細胞亦可於體外行免疫作用。在免疫作用之後，將淋巴細胞分離並使用例如聚乙二醇與合適的骨髓瘤細胞株融合，以生成融合瘤細胞，接著可將其從未融合的淋巴細胞與骨髓瘤細胞中篩選出來。產生專一地針對所選抗原之單株抗體的融合瘤細胞如同經由免疫沉澱、免疫轉漬、或經由活體外結合反應(例如放射性免疫分析(RIA)；酵素鍵聯免疫吸附分析法(ELISA))而測定，可以接著使用標準方法在活體外培養(Goding,Monoclonal Antibodies：Principles and Practice,Academic Press,1986)或在動物體內以腹水瘤而增殖。接著可將單株抗體如同對多株抗體所描述再由培養 基或腹水中純化。
替代的單株抗體亦可使用如同在美國專利4,816,567之重組DNA方法製作。將編碼單株抗體之多核苷酸從成熟的B細胞或融合瘤細胞中分離，例如經由使用專一地放大編碼抗體的重與輕鏈的基因之寡核苷酸引子之RT-PCR，並且它們的序列係使用傳統步驟決定。將分離的編碼重與輕鏈之多核苷酸接著轉殖至合適的表現載體，將其轉染至不產生免疫球蛋白的宿主細胞例如E.coli細胞、猴COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞或骨髓瘤細胞時，單株抗體經由宿主細胞而產生。同時，可將所希望物種之重組單株抗體或其片段如同敘述從表現所希望物種之CDRs的噬菌體表現基因庫中分離(McCafferty et al.,1990,Nature,348：552-554；Clackson et al.,1991,Nature,352：624-628；以及Marks et al.,1991,J.Mol.Biol.,222：581-597)。
編碼單株抗體的多核苷酸可進一步以數個不同的方式使用重組DNA技術修飾以產生替代的抗體。在一些具體實施例中，舉例來說，小鼠單株抗體之輕與重鏈的恆定區可1)舉例來說，以人類抗體的那些區域取代以產生嵌合抗體或2)以非免疫球蛋白多肽取代以產生融合抗體。在一些具體實施例中，恆定區被截斷或移除以產生所希望的單株抗體之抗體片段。變異區的定點(site-directed)或高密度突變(high-density mutagenesis)可用以最佳化單株抗體之專一性、親和力等。
在一些具體實施例中，對人類FOLR1的單株抗體是人類化抗體。在某些具體實施例中，此類抗體係治療性使用以在投藥予人類主體時降低抗原性以及HAMA(人類抗小鼠抗體)反應。
用以設計、人類化或表面重塑非人類或人類抗體的方法亦可被使用並且為本領域所熟知。一個經人類化的、表面重塑的或相似地設計之抗體可具有一或更多來自非人類來源的胺基酸殘基，例如，但不限於，小鼠、大鼠、兔、非人類靈長類動物或其他哺乳類動物。這些非人類胺基酸殘基係由經常稱為「輸入(import)」殘基之殘基取代，其典型地取自已知人類序列之「輸入」變異、恆定或其他區域。
此類輸入序列可被用以降低免疫原性或降低、提升或修飾結合、親和力、結合速率、解離速率、結合性、專一性、半衰期或如同本領域所知的任何其他合適的特性。一般來說，CDR殘基為直接且最顯著地涉及影響FOLR1結合。因此，雖然變異與恆定區的非人類序列可被人類的或其他胺基酸取代，部分或全部的非人類或人類CDR序列會維持。
抗體亦可隨選地被人類化、表面重塑、設計或人類抗體以保持對抗原FOLR1高親和力以及其他有利的生物特性而設計。為了達成這個目標，人類化(或人類的)或設計之抗FOLR1抗體以及表面重塑的抗體可經由親代序列的分析處理而隨選地製備，並且使用親代的、設計的以及人 類化的序列之三度空間模式隨選地製備各種概念性的人類化以及設計的產物。三度空間之免疫球蛋白模式為常用的並且對本領域的技術人員是熟悉的。電腦程式是可用的，其說明並展示所選的候選免疫球蛋白序列可能的三度空間構形結構。這些展示的檢視容許殘基在候選免疫球蛋白序列功能之可能角色的分析，即，影響候選免疫球蛋白結合其抗原(例如FOLR1)的能力之殘基的分析。這樣，可從一致且輸入的序列中篩選與合併骨架(FR)殘基，使得達成所希望的抗體特性，例如對標的之抗原增加的親和力。
本發明之抗體的人類化作用、表面重塑或設計可使用任何已知的方法而進行，例如但不限於描述於Winter(Jones et al.,Nature 321：522(1986)；Riechmann et al.,Nature 332：323(1988)；Verhoeyen et al.,Science 239：1534(1988))、Sims et al.,J.Immunol.151：2296(1993)；Chothia and Lesk,J.Mol.Biol.196：901(1987)、Carter et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.89：4285(1992)；Presta et al.,J.Immunol.151：2623(1993)、美國專利案號5,639,641、5,723,323；5,976,862；5,824,514；5,817,483；5,814,476；5,763,192；5,723,323；5,766,886；5,714,352；6,204,023；6,180,370；5,693,762；5,530,101；5,585,089；5,225,539；4,816,567；PCT/：US98/16280；US96/18978；US91/09630；US91/05939；US94/01234；GB89/01334；GB91/01134；GB92/01755；WO90/14443； WO90/14424；WO90/14430；EP 229246；7,557,189；7,538,195以及7,342,110的那些，其每個以全文併入本文作為參考，包括其中引用的參考資料。
在某些替代的具體實施例中，對FOLR1之抗體是人類抗體。人類抗體可使用各種本領域已知的技術直接製備。以體外免疫或是從產生直接對抗目標抗原的抗體的免疫注射的個體分離，可產生不死的人類B淋巴細胞(見，例如，Cole et al.,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,p.77(1985)；Boemer et al.,1991,J.Immunol.,147(1)：86-95；以及美國專利5,750,373)。同時，人類抗體可選自噬菌體基因庫，其噬菌體基因庫表現人類抗體，舉例來說，如同於Vaughan et al.,1996,Nat.Biotech.,14：309-314,Sheets et al.,1998,Proc.Nat’l.Acad.Sci.,95：6157-6162、Hoogenboom and Winter,1991,J.Mol.Biol.,227：381以及Marks et al.,1991,J.Mol.Biol.,222：581所描述的)。對於產生和使用抗體噬菌體基因庫的技術亦描述於美國專利號5,969,108、6,172,197、5,885,793、6,521,404；6,544,731；6,555,313；6,582,915；6,593,081；6,300,064；6,653,068；6,706,484與7,264,963以及Rothe et al.,2007,J.Mol.Bio.,doi：10.1016/j.jmb.2007.12.018(其每個以全文的方式併入以作為參考)。親和力成熟(affinity maturation)策略以及基因片段洗牌(chain shuffling)策略(Marks et al.,1992,Bio/Technology 10： 779-783，以全文的方式併入以作為參考)為本領域所知的，並且可應用以產生高親和力的人類抗體。
人類化抗體亦可在包含人類免疫球蛋白位點的基因轉殖鼠中製造，其於免疫接種時能夠在沒有內源性免疫球蛋白生產下，製造完全功能之人類抗體。該方法係描述於美國專利5,545,807；5,545,806；5,569,825；5,625,126；5,633,425；以及5,661,016。
本發明亦包括專一地辨認人類葉酸受體1之雙專一性抗體。雙專一性抗體為能夠專一地辨認並結合至少兩個不同抗原決定基的抗體。不同的抗原決定基可在相同分子內(例如，相同的人類葉酸受體1)或在不同分子上，使得兩者，舉例來說，抗體可專一地辨認並結合人類葉酸受體1以及例如1)在白血球上的效應分子例如T細胞受體(例如CD3)或Fc受體(例如CD64、CD32或CD16)或2)如下文詳細描述之細胞毒素劑。
示範的雙專一性抗體可結合至兩個不同的抗原決定基，其中至少一個來自本發明之多肽。替代地，免疫球蛋白分子的抗-抗原臂可與結合至白血球上的觸發分子之臂結合，其白血球例如T細胞受體分子(例如CD2、CD3、CD28或B7)或對IgG之Fc受體，以集中對表現特定抗原細胞的細胞防禦機制。亦可使用雙專一性抗體以引導細胞毒素劑至表現特定抗原的細胞。這些抗體擁有抗原結合臂以及結合細胞毒素劑或放射核素螫合劑例如EOTUBE、DPTA、DOTA或TETA之臂。用以製作雙專一性抗體的技 術在本領域為普遍的(Millstein et al.,1983,Nature 305：537-539；Brennan et al.,1985,Science 229：81；Suresh et al,1986,Methods in Enzymol.121：120；Traunecker et al.,1991,EMBO J.10：3655-3659；Shalaby et al.,1992,J.Exp.Med.175：217-225；Kostelny et al.,1992,J.Immunol.148：1547-1553；Gruber et al.,1994,J.Immunol.152：5368以及美國專利5,731,168)。亦考慮帶有多於兩個性價的抗體。舉例來說，可製備三專一性抗體(Tutt et al.,J.Immunol.147：60(1991))。因此，在某些具體實施例中，對FOLR1之抗體是多專一性的。
在某些具體實施例中提供，舉例來說，增加腫瘤滲透性的抗體片段。已知各種作為生產抗體片段的技術。傳統地，這些片段係藉由完整抗體的蛋白水解消化而衍生(舉例來說Morimoto et al.,1993,Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24：107-117；Brennan et al.,1985,Science,229：81)。在某些具體實施例中，以重組產生抗體片段。Fab、Fv以及scFv抗體片段皆可在E.coli或其他宿主細胞中表現並由其分泌，因而使這些片段大量產生。此類抗體片段亦可自上述討論之抗體噬菌體基因庫中分離。抗體片段亦可以是如同例如美國專利5,641,870中所描述之線性抗體，並且可以是單專一性或雙專一性的。其他作為生產抗體片段的技術對熟練的從業人員將是顯而易見的。
根據本發明，可將技術用於生產對人類葉酸受體1專 一的單鏈抗體(見美國專利案號4,946,778)。此外，可將方法用於Fab表現基因庫的建構(Huse,et al.,Science 246：1275-1281(1989))，以快速並且有效率的辨識具有對葉酸1受體或其衍生物、片段、類似物或同源物所希望的專一性的單株Fab片段。抗體片段可經由本領域的技術生產，包括但不限於：(a)經由抗體分子的胃蛋白酶消化作用產生之F(ab’)2片段；(b)經由還原F(ab’)2片段的二硫鍵所生成之Fab片段，(c)經由將抗體分子以木瓜酵素與還原劑處理所生成之Fab片段，以及(d)Fv片段。
為了增加其血清半衰期而修飾抗體可進一步是令人滿意的，特別是在抗體片段的例子中。這可以經由，舉例來說，將救援受體結合位點合併至抗體片段而達成，其係經由抗體片段中合適區域的突變或經由將抗原決定基併入胜肽標記，然後將其融合至抗體片段的尾端或中間任一者(例如，經由DNA或肽合成)。
異源共軛抗體亦在本發明的範圍內。異源共軛抗體係由兩個共價連結的抗體組成。此類抗體，舉例來說，已提出使免疫細胞得以針對有害的細胞(美國專利號4,676,980)。考量到抗體可使用已知合成蛋白化學的方法在體外製備，包括那些涉及交聯試劑(crosslinking agents)的方法。舉例來說，可利用雙硫交換反應或經由生成硫醚鍵而建構免疫毒素。為此目的之合適試劑的範例包括亞胺基硫氫根(iminothiolate)以及甲基-4-巰基丁醯 亞胺甲酯鹽酸鹽。
為了本發明之目的，應理解經修飾的抗體可包含任何類型的變異區，其提供抗體與人類FOLR1之多肽結合。在這方面，變異區可包含或衍生自任何類型的哺乳動物，其可誘導發動體液的反應並且生成對抗希望的腫瘤相關抗原之免疫球蛋白。因此，經修飾的抗體之變異區可以是，舉例來說，人類的、鼠類的、非人類靈長類動物的(例如食蟹猴、獼猴等)或lupine origin。在一些具體實施例中，經修飾的免疫球蛋白之變異區和恆定區兩者皆是人類的。在其他具體實施例中，可設計或專一地修改相容抗體的變異區(經常衍生自非人類來源)以改善結合特性或降低分子的致免疫性。在這方面，可將本發明中有用的變異區經由送入胺基酸序列的內含物而人類化或以其他方式改變。
在某些具體實施例中，在重和輕鏈的變異區係經由一或更多CDRs之至少部分的取代，以及如有必要，經由部分骨架區域取代作用以及序列改變而改變。雖然CDRs可衍生自與骨架區域衍生來源相同的類別或甚至子類的抗體，應設想CDRs將衍生自不同類別的抗體，以及在某些具體實施例中，衍生自來自不同物種的抗體。可能不必要以來自供應者變異區之完整CDRs取代所有的CDRs，以將一個變異區的抗原結合能力轉變成另一個。相反地，可能僅需要轉移那些必要維持抗原結合位置之活性的殘基。所給的範例載於美國專利案號5,585,089、5,693,761以及5,693,762，這將是本領域的技術人員很好勝任的，無論是 進行例行的實驗或試誤測試，以獲得帶有降低致免疫性之功能性抗體。
雖然轉變為變異區，本領域的技術人員將領會本發明之經修飾的抗體將包含其中一或更多之恆定區區域的至少一小部分已被刪除或以別的方式改變之抗體(例如，全長度抗體或其免疫反應片段)，以提供所需的生化特性例如，當與約略相同的致免疫性之包含天然或未改變的恆定區之抗體比較時，增加的腫瘤局部性或降低的血清半衰期。在一些具體實施例中，經修飾抗體的恆定區將包含人類恆定區。對與本發明相容之恆定區的修飾包含在一或更多區域之一或更多胺基酸的加入、刪除或取代。亦即，本文所揭露之經修飾的抗體可包含對三重鏈恆定區(CH1、CH2或CH3)及/或對輕鏈恆定區(CL)之一或更多的改變或修飾。在一些具體實施例中，考量其中一或更多區域為部分地或完全地刪除的經修飾的恆定區。在一些具體實施例中，經修飾抗體將包含刪除區域的建構物或變異物，其中整個CH2區域已被移除(△CH2建構物)。在一些具體實施例中，被省略的恆定區區域將由短的胺基酸間隔(例如10個殘基)取代，其間隔提供典型地由缺乏的恆定區所給予之一些分子彈性。
除了它們的構形，本領域已知恆定區媒介數種效應功能。舉例來說，補體的C1成分結合至抗體活化補體系統。補體活化作用對調理作用和細胞病原溶解是重要的。補體活化作用亦刺激發炎反應，並且亦可與自體免疫過敏性相 關。進一步地，抗體藉由Fc區域結合至細胞，以在抗體Fc區域上的Fc受體位點結合至細胞上的Fc受體(FcR)。有對不同類別的抗體專一的數個Fc受體，其抗體包括IgG(γ受體)、IgE(ε受體)、IgA(α受體)以及IgM(μ受體)。抗體結合至細胞表面的Fc受體觸發數個重要且多樣的生物反應，包含抗體包覆顆粒的吞噬與破壞作用、免疫複合物的清除、抗體包覆標的細胞被殺手細胞溶解(稱為抗體依賴細胞媒介細胞毒性，或ADCC)、發炎性媒介物的釋放、胎盤轉移以及免疫球蛋白生成的控制。
在某些具體實施例中，FOLR1結合抗體提供改變的效應功能，其反過來影響所投予抗體之生物概況。舉例來說，恆定區的刪除或去活化(經由點突變或其他方法)可降低循環的經修飾抗體之Fc受體的結合從而增加腫瘤的局部化。在其他例子中與本發明一致的恆定區修飾作用，可能舒緩補體結合並因而降低血清的半衰期以及共軛細胞毒素之非專一性關聯。其他恆定區的修飾作用仍可用以去除雙硫鍵接或寡醣基元，其使得局部化由於抗原專一性或抗體靈活度的增加而提升。同樣地，符合本發明之對恆定區的修飾作用可在熟練的技術人員之職權範圍內，使用熟知的生化或分子工程技術而輕易地製造。
在某些具體實施例中，為抗體的FOLR1結合劑不具有一或更多效應功能。舉例來說，在一些具體實施例中，抗體不具有抗體依賴細胞毒性(ADCC)之活性及/或無補體依賴細胞毒性(CDC)之活性。在某些具體實施例中，抗 體不結合至Fc受體及/或補體因子。在某些具體實施例中，抗體不具有效應功能。
將注意在某些具體實施例中，經修飾的抗體可設計成直接將CH3區域融合至各自的經修飾抗體之絞鏈區。在其他建置中，提供肽間隔於絞鏈區與經修飾之CH2及/或CH3區域之間可能是令人滿意的。舉例來說，可表示相容的建構，其中CH2區域已刪除並將維持的CH3區域(經修飾或未經修飾)伴隨5-20個胺基酸間隔而連結到絞鏈區。可加入此類間隔，舉例來說，以確保恆定區的調節性元素維持自由且易接近的或絞鏈區維持彈性。然而，在一些例子中，應注意胺基酸間隔可能證明為致免疫性的且引起對建構物有害的免疫反應。因此，在某些具體實施例中，任何加至建構物的間隔將是相對地非致免疫性的，或甚至完全省略，以維持經修飾抗體所希望的生化素質。
除了整個恆定區區域的刪除，將領會本發明的抗體可經由少數或單一胺基酸的部分刪除或取代而提供。舉例來說，在CH2區域的所選的區域中之單一胺基酸突變可能足以實質上地降低Fc結合，並且從而增加腫瘤的局部性。同樣地，只刪除一或更多控制受調節之效應功能(例如補體C1Q結合)的恆定區區域的部分，可能是令人滿意的。此類恆定區的部分刪除可改善抗體的所選特性(血清半衰期)而維持其他所希望的與主要恆定區區域相關功能的完整。而且，正如上文提到的，所揭露之抗體的恆定區可經由一或更多的胺基酸突變或取代而修飾，其提高了所生成 之建構物的概況。在此方面，擾亂由保留的結合位點(例如Fc結合)所提供的活性，而實質上地維持經修飾抗體的構形與免疫性之概況也許是可能的。某些具體實施例可包含一或更多胺基酸加入至恆定區，以提高所希望的特性例如降低或增加效應功能或提供給更多細胞毒素或碳水化合物的附著。在此類具體實施例中，插入或複製衍生自所選的恆定區區域之特定序列可以是令人滿意的。
本發明進一步包含與本文所載的嵌合、人類化與人類抗體或其抗體片段實質上同源之變異物與同等物。這些可包含，舉例來說，保留性取代突變，即一或更多胺基酸被相似胺基酸的取代作用。舉例來說，保留性取代意指胺基酸與另一在相同一般類別的胺基酸例如，舉例來說，一酸性胺基酸與另一酸性胺基酸、一鹼性胺基酸與另一鹼性胺基酸或一中性胺基酸與另一中性胺基酸的取代作用。保留性胺基酸取代之意圖是本領域所熟知的。
本發明之多肽可以是包含對抗人類FOLR1之抗體或其片段的重組多肽、天然多肽或合成多肽。本領域將認出本發明的一些胺基酸序列可被改變而對蛋白質的結構或功能沒有顯著影響。因此，本發明進一步地包括多肽的變異物，其對人類葉酸受體蛋白質顯示實質上的活性或是其包括抗體或其片段的區域。此類突變包括缺失、插入、倒置、重複以及類型取代。
可進一步將多肽和類似物修飾成為包含非蛋白質尋常部分之額外的化學基元。那些衍生化的基元可改善溶解 度、生物半衰期或蛋白質吸收作用。基元亦可降低或消除任何所希望的蛋白質以及諸如此類的副作用。對那些基元的概述可發現於REMINGTON’S PHARMACEUTICAL SCIENCES,20th ed.,Mack Publishing Co.,Easton,PA(2000)。
描述於本文之分離的多肽可經由本領域所知的任何合適方法而生產。此類方法範圍由直接的蛋白質合成方法，到建構編碼分離的多肽序列之DNA序列並且在合適的轉殖宿主內表現那些序列。在一些具體實施例中，DNA序列係使用重組技術，經由分離或合成編碼有興趣的野生型蛋白質之DNA序列而建構。隨選地，可將序列經由定點特異突變(site-specific mutagenesis)而致突變，以提供其功能性類似物。見，例如Zoeller et al.,Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA 81：5662-5066(1984)以及美國專利號4,588,585。
在一些具體實施例中，將編碼感興趣的多肽之DNA序列使用寡核苷酸合成儀經由化學合成而建構。此類寡核苷酸可根據所希望的多肽之胺基酸序列而設計，並選擇且那些將生產感興趣重組多肽的宿主細胞中偏好的密碼子。可應用標準方法以合成分離的多核苷酸序列，其編碼感興趣的分離多肽。舉例來說，完整的胺基酸序列可用以建構倒退轉譯基因。進一步地，可合成包含核苷酸序列之DNA寡聚合物，其序列編碼特定的分離多肽。舉例來說，可合成然後接合數種編碼所需多肽的部分之小寡核苷酸。個別的寡核苷酸典型地包含5’或3’突出以供互補的組合。
一旦組合(經由合成、定點突變或另外的方法)，編碼特定感興趣的分離多肽之多核苷酸序列將插入至表現載體中，並且操作地鍵聯至適用於在希望的宿主中之表現蛋白質的表現控制序列。妥當的組合可經由核苷酸定序、限制圖譜以及在合適的宿主中表現具生物活性的多肽而確認。如同本領域所熟知的，為獲得轉染基因在宿主中的高表現程度，基因必須以操作鍵聯至在所選的表現宿主中具功能的轉錄與轉譯的表現控制序列。
在某些具體實施例中，重組表現載體係用以放大並表現編碼針對人類FOLR1抗體或其片段之DNA。重組表現載體為具有合成的或cDNA衍生的DNA片段之可複製的DNA建構物，其編碼抗FOLR1抗體或其片段之多肽鏈，以操作鍵聯至衍生自哺乳動物、微生物、病毒或昆蟲基因之合適轉錄或轉譯調節元素。轉錄單元一般包含(1)基因元素或具有在基因表現中調節的角色之元素，舉例來說，轉錄啟動子或加強子，(2)轉錄成mRNA並且轉譯成蛋白質之結構或編碼序列，以及(3)適合的轉錄與轉譯起始與終止序列的組合，如同下文所詳述者。此類調節元素可包括操縱子序列以控制轉錄。在宿主中複製的能力，經常由複製的起始所授予，以及可將促進轉染物識別的選擇基因額外地併入。當它們彼此為功能性地相關時，將DNA區域以操作鍵聯。舉例來說，若其表現為參與多肽分泌之前趨物，將作為信號胜肽(分泌引導者)之DNA以操作鍵聯至作為多肽之DNA；若其控制序列轉錄，將啟動子以操作 鍵聯至編碼序列；或者如果將其置於得以轉譯的位置，將核糖體結合位置以操作鍵聯至編碼序列。意圖用於酵母菌表現系統之結構元素包括使轉譯的蛋白質由宿主細胞行細胞外分泌的領導序列。替代地，沒有領導或運輸序列而表現重組蛋白質處，其可包括N端的甲硫胺酸殘基。此殘基可被隨選地由表現的重組蛋白質連續裂解以提供最終產物。
表現控制序列和表現載體的選擇將視宿主的選擇而定。可採用多種表現宿主/載體組合。對真核宿主有用的表現載體，包括，舉例來說，包含來自SV40、牛乳突瘤病毒、腺病毒以及巨細胞病毒之表現控制序列的載體。對細菌宿主有用的表現載體包括已知的細菌質體，例如來自大腸桿菌的質體，包括pCR 1、pBR322、pMB9以及它們的衍生物，較寬的宿主範圍之質體，例如M13以及絲狀單股DNA噬菌體。
用以表現FOLR1結合多肽或抗體(或使用FOLR1蛋白質作為抗原)之合適的宿主細胞包括在合適的啟動子控制下的原核生物、酵母菌、昆蟲或更高等的真核細胞。原核生物包括葛蘭氏陰性或葛蘭氏陽性的個體，舉例來說大腸桿菌(E.coli)或桿菌。更高等的真核細胞包括如同描述於下的哺乳動物來源所建立之細胞株。亦可採用非細胞轉譯系統(cell-free translation systems)。作為伴隨細菌、真菌、酵母菌以及哺乳動物細胞宿主而使用之合適的選殖以及表現載體係由Pouwels et al.描述(Cloning Vectors： A Laboratory Manual,Elsevier,N.Y.,1985)，其相關的揭露內容以此方式併入以作為參考。關於蛋白質生產方法的額外資訊，包括抗體生產，可發現於，例如美國專利申請公開號2008/0187954、美國專利號6,413,746與6,660,501，以及國際專利公開號WO 04009823，其每個以此方式將全文併入本文以作為參考。
多種哺乳動物或昆蟲細胞培養系統也有益地被使用以表現重組蛋白質。在哺乳動物細胞中重組蛋白質的表現可進行，因為此類蛋白質通常是正確地折疊、經合宜的修飾以及具完整地功能。合適的哺乳動物宿主細胞株的範例包括由Gluzman(Cell 23：175,1981)描述的HEK-293以及HEK-293T、猴子腎臟細胞的COS-7株，以及其他細胞株包括，舉例來說，L細胞、C127、3T3、中國倉鼠卵巢(CHO)、HeLa以及BHK細胞株。哺乳動物表現載體可包含非轉錄元素例如複製起點、鍵聯至欲表現的基因之合適啟動子與加強子以及其他5’或3’毗鄰的非轉錄序列，以及5’或3’非轉譯序列，例如必需的核醣體結合位置、多腺苷酸位置、剪接提供者與接收者位置以及轉錄終止序列。在昆蟲細胞中生產異源蛋白質的桿狀病毒系統係經由Luckow and Summers,Bio/Technology 6：47(1988)回顧。
由轉殖宿主生產的蛋白質可根據任何適合的方法純化。此類標準方法包括層析法(例如，離子交換、親和力與尺寸管柱層析)、離心、差別溶解度或經由任何其他作 為蛋白質純化的標準技術。親和力標記例如hexahistidine((組胺酸)6、(His)6)、麥芽糖結合區域、流行性感冒被覆序列以及麩胱甘肽-S-轉移酶可被附著於蛋白質經由通過合適的親和力管柱以容許簡單純化。分離的蛋白質亦可使用此類技術如蛋白質水解、核磁共振以及X射線結晶學而物理特徵化。
舉例來說，來自分泌重組蛋白質至培養基的系統之上清液可先使用商業上可取得的蛋白質濃縮過濾器以濃縮，舉例來說，Amicon或Millipore Pellicon ultrafiltration unit。濃縮步驟之後，可將濃縮物用至合適的純化基質。替代地，可採用陰離子交換樹脂，舉例來說，具有懸吊的二乙胺基乙基(DEAE)基團的基質或受質。基質可為丙烯醯胺、瓊脂糖、葡聚糖、纖維素或其他常用於蛋白質純化的種類。替代地，可採用陽離子交換步驟。合適的陽離子交換器包括各種包含磺酸基丙基或羧甲基基團的不溶基質。最後，一或更多的反相高效液相層析法(RP-HPLC)步驟採用疏水性的RP-HPLC培養基，例如，具有懸吊甲基或其他脂肪族基團的矽膠，可被採用以進一步純化FOLR1結合劑。前述的純化步驟中的一些或全部亦可以不同的結合而用以提供均質的重組蛋白質。
在細菌培養基生產的重組蛋白質可被分離，舉例來說，經由起始從細胞沉澱萃取，其次是一或更多的濃縮、鹽析、水溶液離子交換或大小排阻層析法(size exclusion chromatography)的步驟。可採用高效液相層析法 (HPLC)作為最後純化的步驟。在表現重組蛋白質所採用的微生物細胞可以任何合宜的方法破裂，包括冰凍解凍循環、超音波、機械性破裂或使用細胞水解劑。
本領域所知用以純化抗體以及其他蛋白質的方法亦包括，舉例來說，這些描述於美國專利公開號2008/0312425、2008/0177048以及2009/0187005，其每個以此方式將全文併入本文以作為參考。
在某些實施例中，FOLR1結合劑是非抗體的多肽。各種作為識別與生產以高親和力結合至蛋白質標的之非抗體多肽的方法為本領域所知。見例如，Skerra,Curr.Opin.Biotechnol.,18：295-304(2007)、Hosse et al.,Protein Science,15：14-27(2006)、Gill et al.,Curr.Opin.Biotechnol.,17：653-658(2006)、Nygren,FEBS J.,275：2668-76(2008)以及Skerra,FEBS J.,275：2677-83(2008)，其每個將全文併入本文以作為參考。在某些具體實施例中，噬菌體表現技術已被用以識別/生產FOLR1結合多肽。在某些實施例中，多肽包含選自蛋白質A、脂質載運蛋白(lipocalin)、纖維連結蛋白區域(fribronectin domain)、錨蛋白一致重複區域(ankyrin consensus repeat domain)以及硫代氧化還原蛋白(thioredoxin)所組成的群組之類型的蛋白質鷹架。
在一些實施例中，試劑為非蛋白質分子。在某些實施例中，試劑為小分子。對識別非蛋白質FOLR1結合劑有用的組合式化學資料庫(combinatorial chemistry libraries) 以及技術為本領域的技術人員所知的。見，例如Kennedy et l1.,J.Comb.Chem,10：345-354(2008)、Dolle et al,J.Comb.Chem.,9：855-902(2007)以及Bhattacharyya,Curr.Med.Chem.,8：1383-404(2001)，其每個將全文併入本文以作為參考。在某些進一步的實施例中，試劑為碳水化合物、醣胺聚多醣、醣蛋白或蛋白多醣。
在某些實施例中，試劑為核酸適體。適體是以它們結合至另一分子的能力為基礎而被選出(例如，由隨機或突變庫)的多核苷酸分子。在一些實施例中，適體包含DNA多核苷酸。在某些替代實施例中，適體包含RNA多核苷酸。在某些實施例中，適體包含一或更多經修飾的核酸殘基。生成與篩選作為結合至蛋白質之核酸適體的方法是本領域所熟知的。見，例如，美國專利號5,270,163、美國專利號5,683,867、美國專利號5,763,595、美國專利號6,344,321、美國專利號7,368,236、美國專利號5,582,981、美國專利號5,756,291、美國專利號5,840,867、美國專利號7,312,325、美國專利號7,329,742、國際專利公開號WO 02/077262、國際專利公開號WO 03/070984、美國專利申請公開號2005/0239134、美國專利申請公開號2005/0124565以及美國專利申請公開號2008/0227735，其每個將全文併入本文以作為參考。
III. 免疫共軛物
本發明亦針對共軛物(本文亦意指為免疫共軛物)， 其包含抗FOLR1抗體、抗體片段、功能同等物、改良的抗體以及其如同本文所揭露的方面、鍵聯的或共軛至細胞毒素(藥物)或前驅藥物。因此，在某個實施例中，本發明提供包含專一地結合人類葉酸受體1之人類化抗體或其抗原結合片段的免疫共軛物，其中抗體包含：(a)包含GYFMN(SEQ ID NO：1)的重鏈CDR1；包含RIHPYDGDTFYNQXaa1FXaa2Xaa3(SEQ ID NO：56)的重鏈CDR2；以及包含YDGSRAMDY(SEQ ID NO：3)的重鏈CDR3；以及(b)包含KASQSVSFAGTSLMH(SEQ ID NO：7)的輕鏈CDR1；包含RASNLEA(SEQ ID NO：8)的輕鏈CDR2；以及包含QQSREYPYT(SEQ ID NO：9)的輕鏈CDR3；其中Xaa1係選自K、Q、H以及R；Xaa2係選自Q、H、N以及R；並且Xaa3係選自G、E、T、S、A以及V。在某些實施例中，抗體是huMov19抗體，其為上述之包含重鏈CDR2 RIHPYDGDTFYNQKFQG(SEQ ID NO：2)的抗體。在其他實施例中，抗體是FR1-21並且包含(a)包含SSYGMS(SEQ ID NO：30)的重鏈CDR1；包含TISSGGSYTY(SEQ ID NO：31)的重鏈CDR2；及/或包含DGEGGLYAMDY(SEQ ID NO：32)的重鏈CDR3；以及(b)包含KASDHINNWLA(SEQ ID NO：27)的輕鏈CDR1；包含GATSLET(SEQ ID NO：28)的輕鏈CDR2；以及包含QQYWSTPFT(SEQ ID NO：29)的輕鏈CDR3。在其他實施例中，抗體是FR1-48並且包含(a)包含TNYWMQ(SEQ ID NO：60)的重鏈 CDR1；包含AIYPGNGDSR(SEQ ID NO：61)的重鏈CDR2；及/或包含RDGNYAAY(SEQ ID NO：62)的重鏈CDR3；及/或(b)包含RASENIYSNLA(SEQ ID NO：57)的輕鏈CDR1；包含AATNLAD(SEQ ID NO：58)的輕鏈CDR2；以及包含QHFWASPYT(SEQ ID NO：59)的輕鏈CDR3。在其他實施例中，抗體是FR1-49並且包含(a)包含TNYWMY(SEQ ID NO：66)的重鏈CDR1；包含AIYPGNSDTT(SEQ ID NO：67)的重鏈CDR2；及/或包含RHDYGAMDY(SEQ ID NO：68)的重鏈CDR3；及/或(b)包含RASENIYTNLA(SEQ ID NO：63)的輕鏈CDR1；包含TASNLAD(SEQ ID NO：64)的輕鏈CDR2；以及包含QHFWVSPYT(SEQ ID NO：65)的輕鏈CDR3。在其他實施例中，抗體是FR1-57並且包含(a)包含SSFGMH(SEQ ID NO：72)的重鏈CDR1；包含YISSGSSTIS(SEQ ID NO：73)的重鏈CDR2；及/或包含EAYGSSMEY(SEQ ID NO：74)的重鏈CDR3；及/或(b)包含RASQNINNNLH(SEQ ID NO：69)的輕鏈CDR1；包含YVSQSVS(SEQ ID NO：70)的輕鏈CDR2；以及包含QQSNSWPHYT(SEQ ID NO：71)的輕鏈CDR3。在又一具體實施例中，抗體是FR1-65並且包含(a)包含TSYTMH(SEQ ID NO：78)的重鏈CDR1；包含YINPISGYTN(SEQ ID NO：79)的重鏈CDR2；及/或包含GGAYGRKPMDY(SEQ ID NO：80)的重鏈CDR3；及/或(b)包含KASQNVGPNVA(SEQ ID NO：75)的輕 鏈CDR1；包含SASYRYS(SEQ ID NO：76)的輕鏈CDR2；以及包含QQYNSYPYT(SEQ ID NO：77)的輕鏈CDR3。
合適的藥物或前驅藥物是本領域所知的。在某些實施例中，藥物或前驅藥物是細胞毒性劑。用於本發明之細胞毒素共軛物之細胞毒性劑可以是造成細胞死亡、或誘發細胞死亡或以某些方式減少細胞存活率的任何化合物，並且包括，舉例來說，美登素衍生物以及美登素衍生物類似物、苯二氮平、類紫杉醇、CC-1065、CC-1065類似物、倍癌黴素與倍癌黴素類似物、烯二炔(enediynes)，例如加利車黴素、多拉司他汀、多拉司他汀類似物，其包括奧利斯汀(auristatin)、托美黴素(tomaymycin)衍生物以及細黴素衍生物、甲氨蝶呤、順鉑、卡鉑、柔紅黴素、阿黴素、長春新鹼、長春鹼、馬法蘭、絲裂黴素C、氯黴素以及嗎啉阿黴素。在某些實施例中，細胞毒性劑是美登素衍生物以及美登素衍生物類似物。
此類共軛物可經由使用鍵聯基團以鍵聯藥物或前驅藥物至抗體或功能同等物而製備。合適的鍵聯基團是本領域所熟知的，並且包括，舉例來說，雙硫基團、硫醚基團、不耐酸基團、不耐光基團、不耐肽酶基團以及不耐酯酶基團。
藥物或前驅藥物可以，舉例來說，經由雙硫鍵被鍵聯至抗FOLR1抗體或其抗體片段。連接元分子或包含反應性化學基團之交聯劑，其可以與抗FOLR1抗體或其抗體片段 反應。在某些實施例中，作為與細胞結合劑反應的反應性化學基團為N-琥珀醯亞胺酯以及N-磺酸基基琥珀醯亞胺酯。額外地連接元分子包含反應性化學基團，在某些實施例中二硫代吡啶二硫基可與藥物反應以生成雙硫鍵。在某些實施例中，連接元分子包括，舉例來說，N-琥珀醯亞胺3-(2-吡啶二硫代基)丙酸酯(SPDP)(見，例如，Carlsson et al.,Biochem.J.,173：723-737(1978))、N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代基)丁酸酯(SPDB)(見，例如，美國專利號4,563,304)、N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代基)2-磺酸基丁酸酯(磺酸基基-SPDB)(見美國公開號20090274713)、N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代基)戊酸酯(SPP)(見，例如，CAS註冊號341498-08-6)、2-亞胺基硫烷或乙醯基琥珀酸酐。舉例來說，抗體或細胞結合劑可以交聯劑修飾，並且接著將包含由此衍生的自由或受保護之硫醇的抗體或細胞結合劑與包含二硫化物或硫醇的美登素衍生物反應以產生共軛物。共軛物可經由層析法純化，其包括但不限於HPLC、大小排斥作用、吸附作用、離子交換以及親和力補捉、透析或切流式過濾。在某些實施例中，將抗FOLR1抗體經由SPDB或磺酸基-SPDB連接元鍵聯至細胞毒素。在某個實施例中，將huMov19抗體經由SPDB或磺酸基-SPDB連接元鍵聯至細胞毒素。
在本發明的另一方面，將抗FOLR1抗體經由雙硫鍵以及聚乙二醇間隔鍵聯至細胞毒素藥物以提高免疫共軛物的 強度、可溶性或功效。此類可裂解的親水性連接元係描述於WO2009/0134976。此連接元設計額外的好處為令人滿意的高單體比率以及抗體-藥物共軛物的最小聚集。在這個方面的具體設想為敘述將細胞結合劑和藥物之共軛物經由帶有聚乙二醇間隔((CH2CH2O)n=1-14)之雙硫基團(-S-S-)鍵聯，伴隨窄範圍的藥物含量2-8，其顯示對癌症細胞相對高效的生物活性並具有高共軛產率以及伴隨最小的蛋白質聚集的高單體比率的令人滿意的的生化性質。
在這個方面的具體設想為具有化學式(I)之抗FOLR1抗體藥物共軛物或具有化學式(I’)之共軛物：A-[X1-(-CH2-CH2O-)n-Y-C]m (I)
[C-Y-(-CH2-CH2O-)n-X1]m-A (I’)
其中：A代表抗FOLR1抗體或片段；C代表細胞毒素或藥物；X代表藉由硫醚鍵、醯胺鍵、胺甲酸酯鍵或醚鍵而附接至細胞結合劑的脂肪族、芳香族或雜環單元；Y代表經由雙硫鍵附接至藥物的脂肪族、芳香族或雜環單元；l是0或1；m是一個由2至8的整數；以及n是一個由1至24的整數。
在某些實施例中，m是一個由2至6的整數。
在某些實施例中，m是一個由3至5的整數。
同時，在某些實施例中，n是一個由2至8的整數。替代地，如同揭露於，舉例來說，美國專利號6,441,163以及7,368,565，可首先將藥物修飾以引入具反應的適合與細胞結合劑反應之反應性酯類。包含伴隨細胞結合劑之活化的連接元基元之這些藥物的反應提供另一個生產細胞結合劑藥物共軛物的方法。亦可使用PEG鏈合基團將美登素衍生物鍵聯至抗FOLR1抗體或片段，如同在美國專利號6,716,821中之範例所述。這些PEG非裂解鍵聯基團可溶於水以及非水溶液溶劑中，並可用以連結一或更多細胞毒性劑至細胞結合劑。範例性的PEG鍵聯基團包括異雙功能性PEG連接元，其經由在一端為功能性巰基或雙硫基團以及在另一端為活性酯類，而與位於連接元相反端的細胞毒性劑以及細胞結合劑反應。作為使用PEG鍵聯基團之細胞毒素共軛物的合成之一般範例，再次以美國專利號6,716,821當參考，其以全文併入本文以作為參考。合成以將帶有反應性PEG基元的一或更多細胞毒性劑與細胞結合劑的反應開始，造成每個反應性PEG基元末端活性酯類被細胞結合劑之胺基酸殘基的取代作用，以生成細胞毒素共軛物，其包含一或更多經由PEG鍵聯基團以共價鍵結至細胞結合劑的細胞毒性劑。替代地，細胞結合可以雙功能PEG交聯劑而修飾，以引入反應性二硫化物基元(例如吡啶二硫化物)，其可再以包含硫醇之美登素衍生物處理，以提供共軛物。在另一方法中，細胞結合可以雙功能PEG交聯劑修飾以引入硫醇基元，其可再以包含反應性二硫化物的美登 素衍生物(例如吡啶二硫化物)處理，以提供共軛物。
亦可製備帶有非可裂解鍵聯之抗體-美登素衍生物共軛物。此類交聯劑係於本領域所描述(見ThermoScientific Pierce Crosslinking Technical Handbook以及美國專利申請公開號2005/0169933)並且包括但不限於，N-琥珀醯亞胺4-(馬來醯亞胺基甲基)環己烷羧酯(SMCC)、N-琥珀醯亞胺-4-(N-馬來醯亞胺基甲基)-環己烷-1-羧基-(6-醯胺基己酸)，其為SMCC之“長鏈”類似物(LC-SMCC)、-馬來醯亞胺基十一酸N-琥珀醯亞胺酯(KMUA)、β-馬來醯亞胺基丙酸N-琥珀醯亞胺酯(BMPS)、竚-馬來醯亞胺基丁酸N-琥珀醯亞胺酯(GMBS)、珹-馬來醯亞胺基己酸N-羥基琥珀醯亞胺酯(EMCS),m-馬來醯亞胺基芐醯基-N-羥基琥珀醯亞胺酯(MBS)、N-(莲-馬來醯亞胺基乙醯氧代)-琥珀醯亞胺酯(AMAS)、琥珀醯亞胺-6-(递-馬來醯亞胺基丙醯胺基)己酸酯(SMPH)、N-琥珀醯亞胺4-(p-馬來醯亞胺基苯基)-丁酸酯(SMPB)以及N-(p-馬來醯亞胺基苯基)異氰酸酯(PMPI)、N-琥珀醯亞胺-4-(碘乙醯基)-胺基苯甲酸酯(SIAB)、N-琥珀醯亞胺碘乙酸酯(SIA)、N-琥珀醯亞胺溴乙酸酯(SBA)以及N-琥珀醯亞胺3-(溴乙醯胺基)丙酸酯(SBAP)。在某些實施例中，將抗體以例如琥珀醯亞胺4-(N-馬來醯亞胺基甲基)-環己烷-1-羧酯(SMCC)、磺酸基-SMCC、馬來醯亞胺基芐醯基-N-羥基琥珀醯亞胺酯(MBS)、磺酸基-MBS 或琥珀醯亞胺-碘乙酸酯的交聯試劑修飾，如同文獻中描述的，引入1-10個反應性基團(Yoshitake et al,Eur.J.Biochem.,101：395-399(1979)；Hashida et al,J.Applied Biochem.,56-63(1984)；以及Liu et al,Biochem.,18：690-697(1979))。再將經修飾的抗體與包含硫醇之美登素衍生物反應以產生共軛物。共軛物可經由通過Sephadex G25管柱之膠體過濾或經由透析或切流式過濾加以純化。將經過修飾的抗體以包含硫醇之美登素衍生物(1至2莫耳當量/馬來醯亞胺基基團)處理並且將抗體-美登素衍生物共軛物經由通過Sephadex G-25管柱之膠體過濾、於陶瓷羥基磷灰石管柱之層析、透析或切流式過濾或其方法的結合而純化。典型地，平均每抗體鍵聯1-10個美登素衍生物。一個方法是以琥珀醯亞胺4-(N-馬來醯亞胺基甲基)-環己烷-1-羧酯(SMCC)修飾抗體，以引入馬來醯亞胺基基團，接著是將修飾的抗體與包含硫醇之美登素衍生物反應，以得到硫醚鍵聯之共軛物。再一次地，每個抗體分子帶有1-10個藥物分子的共軛物生成。抗體、抗體片段、蛋白質荷爾蒙、蛋白質生長因子以及其他蛋白質之美登素衍生物共軛物皆以相同方式製作。
在本發明的另一方面，將FOLR1抗體(例如，huMov19、FR1-21、FR1-48、FR1-49、FR1-57或FR1-65)藉由非裂解鍵結透過PEG間隔中間物而鍵聯至藥物。包含親水性PEG鏈之合適的交聯試劑，其在藥物與抗FOLR1抗體或片段之間形成連接元，亦為本領域所熟知，或為商業 上可取得的(舉例來說由Quanta Biodesign,Powell,Ohio的範例)。包含PEG之合適的交聯劑亦可使用本領域之技術人員所知的標準合成化學技術，由商業上可得之PEGs本身合成。藥物可與經由詳述於美國專利公開號20090274713以及於WO2009/0134976的方法，與包含雙功能PEG之交聯劑反應，以得到下列化學式之化合物，Z-X1-(-CH2-CH2-O-)n-Yp-D，其可再與細胞結合劑反應以提供共軛物。替代地，細胞結合可以雙功能PEG交聯劑修飾，以引進硫醇反應性基團(例如，馬來亞醯胺或鹵乙醯胺)，硫醇反應性基團可再以包含硫醇之美登素衍生物處理以提供共軛物。在另一方法中，細胞結合可以雙功能PEG交聯劑修飾，以引進硫醇基元，硫醇基元可再以包含硫醇反應性之美登素衍生物處理(例如帶有馬來亞醯胺或鹵乙醯胺之美登素衍生物)，以提供共軛物。
因此，本發明的另一方面為具有化學式(II)或化學式(II’)之抗FOLR1抗體藥物共軛物：A-[X1-(-CH2-CH2-O-)n-Yp-C]m (II)
[C-Yp-(-CH2-CH2-O-)n-X1]m-A (II’)
其中，A代表抗FOLR1抗體或片段；C代表細胞毒素或藥物；X代表經由硫醚鍵、醯胺鍵、胺甲酸酯鍵或醚鍵而結合至細胞結合劑的脂肪族、芳香族或雜環單元；Y代表經由選自以硫醚鍵、醯胺鍵、胺甲酸酯鍵、醚鍵、胺鍵、碳-碳鍵以及腙鍵所組成的群組之共價鍵結合 至藥物的脂肪族、芳香族或雜環單元；l是0或1；p是0或1；m是一個由2至15的整數；以及n是一個由1至2000的整數。
在某一實施例中，m是一個由2至8的整數；以及n是一個由1至24的整數。
在某一實施例中，m是一個由2至6的整數。
在某一實施例中，m是一個由2至8的整數。
在某一實施例中，m是一個由3至5的整數。在某一實施例中，抗體是huMov19。在另一實施例中，抗體是FR-1-21。在另一實施例中，抗體是FR-1-48。在另一實施例中，抗體是FR-1-49。在另一實施例中，抗體是FR-1-57。在另一實施例中，抗體是FR-1-65。
包含PEG之合適連接元的範例包括具有N-琥珀醯亞胺酯或N-磺酸基琥珀醯亞胺酯基元之連接元，用於與抗FOLR1抗體或其抗體片段反應，以及包括以馬來醯亞胺或以鹵乙醯基為基礎之基元，用於與化合物反應。PEG間隔可藉由本文所描述的方法併入任何本領域所知的交聯劑。
本文中所揭露的許多連接元詳述於美國專利公開號20050169933與20090274713，以及於WO2009/0134976；其內容全部併入本文以作為參考。
本發明包括的方面，其中約2至約8藥物分子(「藥物含量」)，舉例來說，美登素衍生物，鍵聯至抗FOLR1 抗體或其抗體片段，共軛物的抗腫瘤效果與鍵聯至相同細胞結合劑之較少或較高數目藥物含量的藥物相較為更有效許多。「藥物含量」，如同本文中所使用的，意指可附接至細胞結合劑(例如，抗FOLR1抗體或其抗體片段)之藥物分子(例如，美登素衍生物)的數目。在一方面，可附接至細胞結合劑之藥物分子的數目可平均從約2至約8(例如，1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5.0、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0、8.1)。在某些實施例中，藥物是N 2’-去乙醯-N 2’-(3-巰基-1-氧代丙基)-美登素(DM1)或N 2’-去乙醯-N2’-(4-巰基-4-甲基-1-氧代戊基)美登素(DM4)。因此，在某個實施例中，抗體huMov19為共軛至DM1或DM4。在另一實施例中，抗體FR-1-21為共軛至DM1或DM4。在另一實施例中，抗體FR-1-48為共軛至DM1或DM4。在另一實施例中，抗體FR-1-49為共軛至DM1或DM4。在另一實施例中，抗體FR-1-57為共軛至DM1或DM4。在另一實施例中，抗體FR-1-65為共軛至DM1或DM4。
因此，在一方面，免疫共軛物包含每抗體1個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體2個美登素 衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體3個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體4個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體5個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體6個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體7個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體8個美登素衍生物。
在一方面，免疫共軛物包含每抗體大約1至大約8個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體大約2至大約7個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體大約2至大約6個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體大約2至大約5個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體大約3至大約5個美登素衍生物。在另一方面，免疫共軛物包含每抗體大約3至大約4個美登素衍生物。
在一方面，包含免疫共軛物之組成物具有每抗體平均大約2至大約8(例如，1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5.0、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0、8.1)個藥物分子(例如，美登素衍生物)附接。在一方面，包含免疫共軛物之組成 物具有每抗體平均大約1至大約8個藥物分子(例如，美登素衍生物)。在一方面，包含免疫共軛物之組成物具有每抗體平均大約2至大約7個藥物分子(例如，美登素衍生物)。在一方面，包含免疫共軛物之組成物具有每抗體平均大約2至大約6個藥物分子(例如，美登素衍生物)。在一方面，包含免疫共軛物之組成物具有每抗體平均大約2至大約5個藥物分子(例如，美登素衍生物)。在一方面，包含免疫共軛物之組成物具有每抗體平均大約3至大約5個藥物分子(例如，美登素衍生物)。在一方面，包含免疫共軛物之組成物具有每抗體平均大約3至大約4個藥物分子(例如，美登素衍生物)。在一方面，包含免疫共軛物之組成物具有每抗體平均大約3.5至大約4個藥物分子(例如，美登素衍生物)。
在一方面，包含免疫共軛物之組成物具有每抗體平均大約2±0.5、大約2.5±0.5、大約3±0.5、大約3.5±0.5、大約4±0.5、大約4.5±0.5、大約5±0.5、大約5.5±0.5、大約6±0.5、大約6.5±0.5、大約7±0.5、大約7.5±0.5或大約8±0.5個藥物分子(例如，美登素衍生物)附接。在一方面，包含免疫共軛物的組成物具有每抗體平均大約3.5±0.5個藥物分子(例如，美登素衍生物)。
抗FOLR1抗體或其抗體片段可經由將雙功能交聯試劑與抗FOLR1抗體或其抗體片段反應而加以修飾，從而造成連接元分子之共價附接至抗FOLR1抗體或其抗體片段。如同本文中所使用的，「雙功能交聯試劑」為任何將細胞結 合劑以共價連結至藥物之化學基元，例如本文中所描述的藥物。在另一方法中，鏈合基元的一部分由藥物提供。在此方面，藥物包含作為較大連接元分子的一部分之鍵聯基元，較大鏈合劑分子用以鍵聯細胞結合劑至藥物。舉例來說，為生成美登素衍生物DM1，位於美登素的C-3羥基基團之側鏈被修飾為具有自由的巰基基團(SH)。美登素的此硫醇化形式與經修飾的細胞結合劑反應以生成共軛物。因此，最終的連接元係由兩成分組合，其中一個由交聯試劑提供，而另一個係由來自DM1的側鏈提供。
亦可將藥物分子經由中間載體分子例如血清白蛋白鍵聯至抗體分子。
如同本文中所使用的，「鍵聯至細胞結合劑」或「鍵聯至抗FOLR1抗體或片段」之表示意指包含至少一個藥物衍生物，經由合適的鏈合基團或其先質而結合至細胞結合劑、抗FOLR1抗體或片段之共軛物分子。在某些實施例中，鏈合基團為SMCC。
在某些實施例中，本發明中有用的細胞毒性劑是美登素衍生物以及美登素衍生物類似物。合適的美登素衍生物之範例包括美登素醇之酯類以及美登素醇類似物。包括者為抑制微管生成以及對哺乳動物細胞為高度毒性的任何藥物，如同為美登素醇以及美登素醇類似物。
合適的美登素醇酯類之範例包括那些具有經修飾的芳香環以及那些具有在其他位置之修飾作用者。此類合適的美登素衍生物係揭露於美國專利號4,424,219； 4,256,746；4,294,757；4,307,016；4,313,946；4,315,929；4,331,598；4,361,650；4,362,663；4,364,866；4,450,254；4,322,348；4,371,533；5,208,020；5,416,064；5,475,092；5,585,499；5,846,545；6,333,410；7,276,497以及7,473,796。
在某一實施例中，本發明之免疫共軛物利用包含硫醇之美登素衍生物(DM1)，正式名稱為N 2’-去乙醯-N 2’-(3-巰基-1-氧代丙基)-美登素，作為細胞毒性劑。DM1以下列結構式(III)表示：
在另一實施例中，本發明之共軛物利用包含硫醇之美登素衍生物N 2’-去乙醯-N 2’(4-甲基-4-巰基-1-氧代戊基)-美登素(例如，DM4)作為細胞毒性劑。DM4以下列結構式(IV)表示：
含有包含立體阻障硫醇鍵結之側鏈的另一美登素衍生物為N 2’-去乙醯-N-2’(4-巰基-1-氧代戊基)-美登素(稱為DM3)，以下列結構式(V)表示：
於美國專利號5,208,020以及7,276,497中教導之每個美登素衍生物亦可用於本發明之共軛物。在這方面，5,208,020以及7,276,697之完整揭露內容併入本文以作為參考。
在美登素衍生物上的許多位置可作為化學地鍵聯鏈合基元的位置。舉例來說，具有羥基基團的C-3位置、以羥甲基修飾的C-14位置、以羥基基團的C-15位置以及具有羥基基團的C-20位置都被預期是有用的。在某些實施例中，C-3位置被利用。在某些實施例中，美登素醇的C-3位置被利用。
某些共軛物的結構表示係如下顯示：
在某一實施例中，抗體是huMov19。在另一實施例中，抗體是FR1-21。
對於生產此類抗體-美登素衍生物共軛物的數個描述係提供於美國專利號6,333,410、6,441,163、6,716,821以及7,368,565，其每個以全文方式併入本文。
一般而言，在緩衝溶液中的抗體溶液可與帶反應性基團之具有雙硫基元的莫耳數過量之美登素衍生物培養。反應混合物可經由加入過量胺類(例如乙醇胺、牛磺酸等)而平息。美登素-抗體共軛物可再經由膠體過濾而純化。與每抗體分子結合之美登素衍生物分子的數目可經由分光光度計測量在252nm以及280nm的吸收率而測定。使用平均1-10個美登素衍生物分子/抗體分子，以及在某些實施 例中亦使用平均2-5個美登素衍生物分子/抗體分子。美登素衍生物分子/抗體的平均數目可以是，舉例來說，大約1-10、2-5、3-4、3.5-4或3.5。在一方面，美登素衍生物分子/抗體的平均數目大約為3.5±0.5。在一方面，美登素衍生物分子/抗體的平均數目約為3.5-4。
帶有美登素衍生物藥物的抗體共軛物被評估其在體外抑制各種有害的細胞株增生的能力。舉例來說，例如人類KB細胞株的細胞株可容易地用於這些化合物的細胞毒性評估。待評估的細胞可暴露於化合物4至5天，並且經由已知的方法於直接的試驗中測量細胞存活率。可再從試驗的結果計算IC50數值。
例如，於美國專利申請公開號2010/0203007描述的苯二氮平化合物(例如，吲哚啉基苯二氮平或噁唑烷基苯二氮平)，其衍生物、其中間產物，亦可能用以製備抗FOLR1抗體片段或共軛物。
有用的苯二氮平包括化學式(XIV)、(XV)以及(XVI)的化合物，其中二聚體化合物隨選地帶有允許鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團。
其中N與C之間的雙線代表單鍵或雙鍵，規定當其為雙鍵時X不存在並且Y為H，以及當其為單鍵時，X為H或為將化合物轉變為前驅藥物的胺類保護基團；Y係選自-OR、以-OCOR’表示的酯類、以-OCOOR’表示的碳酸鹽、以-OCONR’R”表示的胺甲酸酯、以NR’R”表示的胺類或羥基胺、以-NRCOR’表示的醯胺、以NRCOP表示的肽，其中P是胺基酸或包含2至20個胺基酸單元之間的多肽、以SR’表示的硫醚、以SOR’表示的亞碸、以-SO2R’表示的碸、以-SO3表示的亞硫酸鹽、以-OSO3表示的亞硫酸氫鹽、鹵素、氰基、疊氮或硫醇，其中R、R’以及R”為相同或不同，並且選自H、具有從1至10個碳原子之被取代或未被取代的直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基、聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數、具有從6至10個碳原子的芳基、具有從3至10個碳原子之雜環，其中取代基係選自鹵素、OR7、NR8R9、NO2、NRCOR’、SR10、以SOR’表示的亞碸、以-SO2R’表示的碸、亞硫酸鹽-SO3、亞硫酸氫鹽-OSO3、以SO2NRR’表示的磺化胺、氰基、疊氮、-COR11、OCOR11或 OCONR11R12，其中R7、R8、R9、R10、R11以及R12的定義係如同上述所提供，隨選地R”為OH；W是C=O、C=S、CH2、BH、SO或SO2；每個R1、R2、R3、R4、R1’、R2’、R3’以及R4’係獨立地選自氫、具有從1至10個碳原子之被取代或未被取代的直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基、聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數，或取代基選自鹵素、胍〔-NH(C=NH)NH2〕、OR7、NR8R9、NO2、NRCOR’、SR10、以SOR’表示的亞碸、以-SO2R’表示的碸、亞硫酸鹽-SO3、亞硫酸氫鹽-OSO3、以SO2NRR’表示的磺胺、氰基、疊氮、-COR11、OCOR11或OCONR11R12，其中每個R7、R8、R9、R10、R11以及R12係獨立地選自H、具有從1至10個碳原子的直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基、聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數、具有從6至10個碳原子的芳基、具有從3至10個碳原子之雜環，隨選地R10是SR13或COR13，其中R13係選自具有從1至10個碳原子的直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基、聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數、具有從6至10個碳原子的芳基、具有從3至10個碳原子之雜環，隨選地R11是OR14，其中R14具有與R相同的定義，隨選地，R1、R2、R3、R4、R1’、R2’、R3’或R4’的任何一個是能藉由共價鍵鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團或選自隨選地帶有能鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團的聚吡咯基、聚吲哚基、聚咪唑基、聚吡咯-咪唑基、聚吡咯-吲哚 基或聚咪唑-吲哚基單元；Z係選自(CH2)n，其中n是1、2或3，CR15R16、NR17、O或S，其中每個R15、R16以及R17是獨立地選自H、具有從1至10個碳原子的直線、分支或環狀的烷基、聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數；R6是OR、SR或NRR’，其中R與R’具有與上述所提供者相同的定義；X’係選自CH2、NR、CO、BH、SO或SO2，其中R具有與上述所提供者相同的定義；Y’是O、CH2、NR或S，其中R具有與上述所提供者相同的定義；Z’是CH2或(CH2)n，其中n是2、3或4，規定X’、Y’以及Z’不全部同時為CH2；A與A’為相同或不同並且係選自O、-CRR’O、S、-CRR’S、-NR15或CRR’NHR15，其中R與R’具有與上述所提供者相同的定義；以及其中R15具有與上述對R所提供之相同的定義；D與D’為相同或不同並且係獨立地選自具有從1至10個碳原子之直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基、隨選地被鹵素、OR7、NR8R9、NO2、NRCOR’、SR10、以SOR’表示的亞碸、以-SO2R’表示的碸、亞硫酸鹽-SO3、亞硫酸氫鹽-OSO3、以SO2NRR’表示的磺醯胺、氰基、疊氮、-COR11、OCOR11或OCONR11R12中的任何一個取代，其中R7、R8、R9、R10、R11以及R12的定義係如上所提供，聚乙 二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數；L是具有從3至10個隨選地被取代之碳原子的隨選的苯基基團或雜環，其中取代基為經由共價鍵使能鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團，或係選自具有從1至10個碳原子之線性、分支或環狀烷基、烯基或炔基，隨選地被鹵素、OR7、NR8R9、NO2、NRCOR’、SR10、以SOR’表示的亞碸、以-SO2R’表示的碸、亞硫酸鹽-SO3、亞硫酸氫鹽-OSO3、以SO2NRR’表示的磺胺、氰基、疊氮、-COR11、OCOR11或OCONR11R12中的任何一個取代，其中R7、R8、R9、R10、R11以及R12的定義係如上所提供，聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數；隨選地，L本身是經由共價鍵使能鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團；或這些化合物其藥學上可接受的溶劑、鹽類、水合物或水合鹽類、它們的光學異構物、消旋物、非鏡像異構物、鏡像異構物或多形性晶體結構；規定化合物具有不超過一個經由共價鍵使能鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團。
在一方面，N與C之間的雙線代表單鍵或雙鍵，規定當其為雙鍵時，X不存在並且Y為H，以及當其為單鍵時，X為H或為將化合物轉變為前驅藥物的胺類保護基團；Y係選自-OR、NR’R”、亞硫酸鹽-SO3或亞硫酸氫鹽-OSO3，其中R係選自H、具有從1至10個碳原子之直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基、聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數、具有從6至10個碳原子的芳基、具有從3至10個碳原子之雜環； W是C=O、CH2或SO2；每個R1、R2、R3、R4、R1’、R2’、R3’以及R4’係獨立地選自H、NO2或經由共價鍵使能鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團；R6是OR18，其中R18具有與R相同的定義；Z係選自(CH2)n，其中n是1、2或3，CR15R16、NR17、O或S，其中每個R15、R16以及R17係獨立地選自H、具有從1至10個碳原子之直線、分支或環狀烷基、聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數；X’係選自CH2或C=O；Y’是O、NR或S，其中R如同上述所定義；Z’是CH2或(CH2)2；A與A’每個為O；D與D’為相同或不同並且係獨立地選自具有從1至10個碳原子之直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基；L是隨選性的苯基基團或具有從3至10個隨選地被取代之碳原子的雜環，其中取代基為經由共價鍵使能鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團，或係選自具有從1至10個碳原子之直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基、隨選地被鹵素、OR7、NR8R9、NO2、NRCOR’、SR10、以SOR’表示的亞碸、以-SO2R’表示的碸、亞硫酸鹽-SO3、亞硫酸氫鹽-OSO3、以SO2NRR’表示的磺胺、氰基、疊氮、-COR11、OCOR11或OCONR11R12中的任何一個取代，聚乙二醇單元(-OCH2CH2)n，其中n是從1至2000的整數；隨選地，L 本身是經由共價鍵使能連結至細胞結合劑之鏈合基團；或這些化合物其藥學上可接受的溶劑、鹽類、水合物或水合鹽類、它們的光學異構物、消旋物、非鏡像異構物、鏡像異構物或多形性晶體結構。
在另一方面，化合物以化學式(XVII)表示：
其中N與C之間的雙線代表單鍵或雙鍵，規定當其為雙鍵時，X不存在並且Y為H，以及當其為單鍵時，X為H或為將化合物轉變為前驅藥物的胺類保護基團，以及Y係選自OH、以-OR表示之醚、亞硫酸鹽-SO3或亞硫酸氫鹽-OSO3，其中R係選自帶有從1至10個碳原子之直線、分支或環狀烷基、烯基或炔基，R2、R3的其中一個是使能經由共價鍵鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團以及另一個是H，L’、L”或L”’的其中一個是使能鍵聯至細胞結合劑之鏈合基團，而其他的為H；L’可以是鏈合基團而G是CH或N。其他範例係描述於美國專利申請號61/150,201，將其以全文的方式併入本文以供參考。因此，在某一實施例中，抗體huMov19係共軛至具有以上述XIX-XXII所顯示結構之苯二氮平。在另一實施例中，抗體FR-1-21係共軛至具有以上述XIX-XXII所顯示結構之苯二氮平。
IV. 多核苷酸
在某些實施例中，本發明包括多核苷酸，其含有編碼專一地結合人類FOLR1受體之多肽或此類多肽之片段的多核苷酸。舉例來說，本發明提供包含編碼對人類FOLR1的抗體或編碼此類抗體片段之核酸序列的多核苷酸。本發明的多核苷酸可以為RNA的形式或以DNA的形式。DNA包括cDNA、基因組DNA以及合成的DNA；並且可以是雙股或單股的，以及若單股的可為編碼股或非編碼(反義)股。
在某些實施例中，多核苷酸被分離。在某些實施例中，多核苷酸實質上是純的。
本發明提供多核苷酸，其包含編碼含有選自由SEQ ID NOs：4、10、11、41、42以及88-103所組成群組的序列之多肽的多核苷酸。亦提供編碼具有對SEQ ID NOs：4、10、11、41、42以及88-103至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%序列一致性之多肽的多核苷酸。
多核苷酸SEQ ID NOs：5、14以及15分別包含對huMov19變異區重鏈、變異區輕鏈版本1.00以及變異區輕鏈版本1.60的編碼序列。
本發明進一步提供包含選自由SEQ ID NOs：5、14、15、37、38、43、44、47、48以及120-127所組成之群組的序列之多核苷酸。亦提供的是具有對SEQ ID NOs：5、14、15、37、38、43、44、47、48以及120-127至少約 95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%序列一致性之多核苷酸。因此，在某些實施例中，多核苷酸包含(a)具有對SEQ ID NO：5至少約95%序列一致性之多核苷酸，及/或(b)具有對SEQ ID NO：14或15至少約95%序列一致性之多核苷酸。在某些實施例中，多核苷酸包含(a)具有SEQ ID NO：5之胺基酸序列的多核苷酸；及/或(b)具有SEQ ID NO：14或SEQ ID NO：15之胺基酸序列的多核苷酸。
在某些實施例中，多核苷酸包含作為成熟多肽的編碼序列，其以相同閱讀框架融合至多核苷酸，舉例來說，該多核苷酸協助來自宿主細胞之多肽的表現以及分泌(例如當作用於控制來自細胞的多肽運輸之分泌序列的領導序列)。具有領導序列的多肽是蛋白質前體(preprotein)並且可具有經由宿主細胞切斷的領導序列以生成多肽的成熟形式。多核苷酸亦可編碼前蛋白(proprotein)，其為成熟蛋白質加上額外的5’胺基酸殘基。具有前序列的成熟蛋白質為前蛋白並且是蛋白質的不活化形式。一旦前序列被切斷，則留下具活性的成熟蛋白質。
在某些實施例中，多核苷酸包含作為成熟多肽的編碼序列，其以相同讀框融合至標記序列，舉例來說，該標記序列允許所編碼多肽的純化。舉例來說，在細菌宿主的例子中，標記序列可以是由pQE-9載體所提供的(組胺酸)6標籤，以提供用於融合至標記的成熟多肽之純化，或當使用哺乳動物的宿主(例如COS-7細胞)時，標記序列可以 是衍生自流行性感冒血球凝集素蛋白質之血球凝集素(HA)標籤。
本發明進一步關於上文所述之編碼多核苷酸的變異物，舉例來說，片段、類似物以及衍生物。
多核苷酸變異物可包含在編碼區、非編碼區或兩者的替代。在一些實施例中，多核苷酸變異物包含產生沉默性取代、加入或刪除的替代，但不改變所編碼多肽之特性或活性。在一些實施例中，由於遺傳密碼變性，核苷酸變異物係沉默取代而產生。多核苷酸變異物可因許多理由而產生，例如，為優化對特定宿主的密碼子表現(在人類mRNA改變密碼子成為那些細菌宿主例如E.coli所偏好者)。
在本文中所描述之包含多核苷酸的載體以及細胞亦被提供。
V. 使用方法以及藥學組成物
本發明之FOLR1結合劑(包括抗體、免疫共軛物以及多肽)在各種應用中是有用的，其包括但不限於，治療性的治療方法，例如癌症治療。在某些實施例中，試劑對於抑制腫瘤生長、誘導分化、降低腫瘤體積及/或降低腫瘤的致癌性是有用的。使用方法可能是在活體外、生物體外或活體內的方法。在某些具體實施例中，FOLR1結合劑或抗體或免疫共軛物或多肽為人類FOLR1對其結合者之拮抗劑。
在一方面，本發明之抗FOLR1抗體以及免疫共軛物在偵測生物性樣本中的FOLR1的存在是有用的。該用語「偵測」如同本文中所使用地包括定性的或定量的偵測。在某些實施例中，生物性樣本包含細胞或組織。在某些實施例中，此類組織包括正常及/或以相對於其他組織較高程度的表現FOLR1之癌組織。在某些實施例中，FOLR1過量表現偵測卵巢癌、肺癌、腦癌、乳癌、子宮癌、腎癌或胰腺癌的出現。
在一方面，本發明提供在生物性樣本中偵測FOLR1之出現的方法。在某些實施例中，方法係包含將生物樣本與抗FOLR1抗體在允許抗FOLR1抗體結合至FOLR1的條件下接觸，並且偵測抗FOLR1抗體與FOLR1之間是否生成複合物。
在一方面，本發明提供診斷與FOLR1表現增加相關之失調的方法。在某些實施例中，方法包含將測試細胞與抗FOLR1抗體接觸；經由偵測抗FOLR1抗體對FOLR1的結合而測定測試細胞之FOLR1的表現量(定量地或定性地)；以及將測試細胞之FOLR1的表現量與由控制組細胞之FOLR1的表現量比較(例如，與測試細胞相同組織來源的正常細胞或表現FOLR1的量與正常細胞相當的細胞)，其中由測試細胞FOLR1的表現量相較於控制組細胞更高表示與FOLR1增加表現相關之失調的存在。在某些實施例中，測試細胞係由懷疑帶有與FOLR1增加表現相關之失調的個體而獲得。在某些實施例中，失調為細胞增生失調，例如 癌症或腫瘤。
在某些具體實施例中，診斷或偵測的方法，例如以上所描述的那些，包含偵測抗FOLR1抗體對表現於細胞表面上的FOLR1之結合，或者由細胞表面上表現FOLR1的細胞而獲得之膜製備。在某些實施例中，方法包含將細胞與抗FOLR1抗體在容許抗FOLR1抗體結合至FOLR1的條件下接觸，並偵測抗FOLR1抗體與細胞表面上之FOLR1間是否生成複合物。用於偵測抗FOLR1抗體結合至表現於細胞表面上的FOLR1的結合之範例性試驗為「FACS」試驗。
某些其他方法可被用以偵測抗FOLR1抗體結合至FOLR1。此類方法包括但不限於，本領域所熟知的抗原結合試驗，例如西方墨點法、放射性免疫分析、ELISA(酵素連結免疫吸附分析法)、「三明治」免疫分析、免疫沉澱分析、螢光免疫分析、蛋白質A免疫分析以及免疫組織化學法(IHC)。
在某些實施例中，抗-FOLR1抗體被標記。標記包括但不限於，直接偵測的標記或基元(例如螢光、發色、電子密度、化學發光以及放射性標記)以及例如酵素或配位基的間接偵測的基元，例如，經由酵素反應或分子交互作用。
在某些實施例中，抗FOLR1抗體固定化於不溶性的基質。固定化必需將抗FOLR1抗體從在溶液中剩餘的游離FOLR1中分離。傳統地此係經由在分析試驗步驟前使抗FOLA1抗體不溶，例如經由吸附至不溶於水的基質或表面 (Bennich et al.，美國專利號3,720,760)或者經由共價耦合(舉例來說，使用戊二醛交聯)或者經由在抗FOLR1抗體以及FOLR1間的複合物生成後使抗FOLR1抗體不溶，例如，經由免疫沉澱而達成。
任何上述實施例的診斷或偵測可使用本發明之免疫共軛物取代或加上抗FOLR1抗體而完成。
在某些實施例中，以FOLR1結合劑或拮抗劑(例如huMov19抗體或免疫共軛物)所治療之疾病為癌症。在某些實施例中，癌症係以表現被FOLR1結合劑(例如，抗體)結合之葉酸受體1的腫瘤為特徵。
本發明提供治療癌症的方法，其包含以在治療上有效量之FOLR1結合劑投藥予對象的方法(例如，需要治療之對象)。在某些實施例中，癌症為選自以直腸癌、胰腺癌、肺癌、卵巢癌、肝癌、乳癌、腦癌、腎臟癌、前列腺癌、胃腸癌、黑色素癌、子宮頸癌、膀胱癌、神經膠母細胞瘤以及頭頸癌所組成的群組之癌症。在某些實施例中，癌症是卵巢癌。在某些實施例中，癌症是肺癌。在某些實施例中，對象是人類。
本發明進一步提供使用本文中所描述之抗體或其他試劑作為抑制腫瘤生長的方法。在某些實施例中，抑制腫瘤生長的方法包含在活體外將細胞與FOLR1結合劑(例如，抗體)接觸。舉例來說，將表現FOLR1之不死細胞株或癌細胞株培養於加入抗體或其他試劑之培養基中，以抑制腫瘤生長。在一些實施例中，將腫瘤細胞從病人樣本中分離 例如，舉例來說，組織生物檢體、肋膜積水或血液樣本並且培養於加入FOLR1結合劑的培養基，以抑制腫瘤生長。
在一些實施例中，抑制腫瘤生長的方法包含在活體內將腫瘤或腫瘤細胞與FOLR1結合劑(例如，抗體)接觸。在具體實施例中，將腫瘤或腫瘤細胞與FOLR1結合劑接觸係於動物模式中進行。舉例來說，FOLR1結合劑可被投藥予表現一或更多FOLR1之異體移植物，其成長於免疫不全的小鼠(例如NOD/SCID小鼠)以抑制腫瘤生長。在一些實施例中，癌症幹細胞係由病人樣本中分離例如，舉例來說，組織生物檢體、肋膜積水或血清樣本，並且注射至免疫受損的小鼠中然後投藥FOLR1結合劑以抑制腫瘤細胞生長。在一些實施例中，於引入致癌性細胞進入動物後，將FOLR1結合劑同時或短暫地投藥以防止腫瘤生長。在一些實施例中，在致癌性細胞生成至特定尺寸後，將FOLR1結合劑投藥為治療。
在某些實施例中，抑制腫瘤生長的方法包含以治療上有效量的FOLR1結合劑投藥予對象。在某些實施例中，對象為人類。在某些實施例中，對象有腫瘤或已有被切除的腫瘤。
在某些實施例中，腫瘤表現FOLR1結合劑或抗體結合之葉酸受體。在某些實施例中，腫瘤過度表現人類FOLR1。
在某些實施例中，腫瘤係選自以腦癌、直腸癌、胰腺癌、肺癌、卵巢癌、肝癌、乳癌、腎臟癌、前列腺癌、胃 腸癌、黑色素癌、子宮頸癌、膀胱癌、神經膠母細胞瘤以及頭頸癌所組成的群組之腫瘤。在某些實施例中，腫瘤是卵巢癌。
此外，本發明提供降低在一對象中的腫瘤致癌性的方法，其包含將治療上有效量之FOLR1結合劑投藥予對象。在某些實施例中，腫瘤包含癌症幹細胞。在某些實施例中，在腫瘤中癌症幹細胞的頻率藉由投藥試劑而降低。
因此，在某些實施例中，本發明提供使用huMov19抗體以及免疫共軛物治療癌症的方法。在某些實施例中，huMov19免疫共軛物是huMov19-SPDB-DM4、huMov19-磺酸基-SPP-DM1、huMov19-SPP-DM1或huMov19-PEG4-Mal-DM4。
本發明進一步提供將致癌性細胞分化為非致癌性細胞的方法，其包含將致癌性細胞與FOLR1結合劑接觸(舉例來說，藉由將FOLR1結合劑投藥予具有含致癌性細胞或已有移除此類腫瘤的對象)。在某些實施例中，致癌性細胞為卵巢腫瘤細胞。
本發明進一步提供降低在固態腫瘤基質中的肌纖維母細胞活化的方法，其包含將基質與有效量的FOLR1結合劑、多肽或抗體接觸。
本發明進一步提供含有一或更多本文中所描述之FOLR1結合劑的藥學組成物。在某些實施例中，藥學組成物進一步包含藥學上可接受之載具。發現這些藥學組成物於人類病人中抑制腫瘤生長以及治療癌症的用途。
在某些實施例中，藉由結合本發明之純化的抗體或試劑與藥學上可接受的載具(例如載體、賦形劑)以製備作為儲存與使用的配方(Remington,The Science and Practice of Pharmacy 20th Edition Mack Publishing,2000)。合適的藥學上可接受的載具包括但不限於，非毒性緩衝液例如磷酸、檸檬酸以及其他有機酸；鹽類例如氯化鈉；抗氧化劑包括抗壞血酸以及甲硫胺酸；防腐劑(例如十八烷基二甲基芐基氯化銨)；六羥季銨氯化物；氯化苯二甲烴銨；氯化苯銨；酚、丁基或芣基醇；烷基苯甲酸酯，例如甲基或丙基苯甲酸酯；鄰苯二酚；間苯二酚；環己醇；3-戊醇以及間甲酚)；低分子量多肽(例如少於約10個胺基酸殘基)；蛋白質例如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白；親水性聚合物例如聚乙烯吡咯啶；胺基酸例如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺酸、組胺酸、精胺酸或離胺酸；碳水化合物例如單醣、雙醣、葡萄糖、甘露糖或糊精；螫合劑例如EDTA；糖例如蔗糖、甘露醇、菌藻糖或山梨糖醇；鹽類生成反離子例如鈉；金屬複合物(例如Zn-蛋白質複合物)；以及非離子界面活性劑例如TWEEN或聚乙二醇(PEG)。
本發明之藥學組成物可以任何數目的方法作為局部或全身治療而投藥。投藥可以為局部的(例如至黏膜包括陰道與直腸投遞)例如皮膚貼片、軟膏、塗劑、膏狀物、凝膠、滴劑、栓劑、噴霧、液體和粉末；肺的(例如，經由粉末或噴霧劑的吸入或吹氣，包括經由霧化器；氣管的、 鼻腔的、表皮的以及經皮的)；口服的或非口服的包括靜脈內、動脈內、皮下、腹膜內或肌肉內注射或注入；或顱內(例如，鞘內或腦室內)投藥。
本發明之抗體或免疫共軛物可伴隨具有抗癌特性的第二化合物以藥學組合配方而結合，或以劑量療法作為結合療法。藥學組合配方之第二化合物或劑量療法優選地具有對結合之ADC的互補活性使得它們不會敵對地影響彼此。包含FOLR1結合劑與第二抗癌試劑之藥學組成物亦被提供。
作為疾病的治療，本發明之抗體或試劑的合適劑量依欲治療的疾病類型、嚴重程度以及疾病進程、疾病的回應性而定，不論抗體或試劑係為治療或預防的目的而投藥、先前的療法、病人的臨床歷史等皆在治療師的考量內。抗體或試劑可投藥一次或經由一連串的治療從持續數天至數月，或直到產生治癒或達成疾病狀態的減弱(例如降低腫瘤大小)。優化的劑量時程表可由在病人體內藥物累積的測量而計算並且將依個別抗體或試劑的相對強度而變化。投藥的醫師可容易地決定理想劑量、給劑方法以及重覆率。在某些實施例中，劑量係由每公斤體重0.01μg至100mg，並且可每天、每週、每月或每年一或更多次給予。在某些實施例中，每兩週一次或每三週一次給予抗體或其他FOLR1結合劑。在某些實施例中，抗體或其他FOLR1結合劑之劑量係由每公斤體重約0.1mg至約20mg。治療師可基於藥物在體液或組織中的測量停留時間以及濃度評估 給劑重覆率。
組合療法可提供「協同」以及證明為「協同的」，即當一起使用活性成分時達到的功效大於分別地使用化合物引起的效果總和。當活性成分為：(1)共同配製與投藥或者同時地以結合的、單位劑量配方而投藥；(2)經由輪流或平行為個別的配方；或(3)經由一些其他的療法時，可達到協同效果。當以交替療法投藥時，當化合物係投藥或連續地投遞時可達到協同效果，例如經由在個別的注射器之不同的注射。一般而言，在交替療法期間，每個活性成分的有效劑量係被連續地投藥，即連續地，而在結合療法中，二或更多活性成分的有效劑量被一起投藥。
VI. 包含FOLR1結合劑之套組
本發明提供包含描述於本文的抗體、免疫共軛物或其他試劑之套組，並且套組可用以完成描述於本文的方法。在某些實施例中，套組包含於一或更多的容器中至少一種對人類葉酸受體1的純化抗體。在一些實施例中，套組包含必要的及/或足以完成偵測試驗的所有成分，包括所有控制組、完成試驗的說明以及用於分析與結果呈現的任何必要軟體。本領域的技術人員將容易地認識本發明所揭露之抗體、免疫共軛物或其他試劑可輕易地併入本領域所熟知已建立之套組模式其中之一。
進一步提供的是包含FOLR1結合劑(例如，FOLR1結合抗體)以及第二抗癌試劑之套組。在某些實施例中，第 二抗癌試劑為化療試劑(例如，吉西他濱或伊立替康)。
本揭露內容之實施例可進一步由參考下列非限制性的範例而定義，其詳述本揭露內容之特定抗體的製備以及使用本揭露內容之抗體的方法。許多對材料與方法兩者之修改可在不悖離本揭露內容的範圍下而實施對本領域之技術人員是顯而易見的。
範例
可被了解的是描述於本文的範例以及實施例係僅為說明性之目的，且因其各種修改或改變將由本領域的技術人員提議並包括於此申請案的精神與範圍之內。
範例1 鼠類單株抗體Mov19之嵌合作用
對於Mov19的變異區胺基酸序列係由NCBI資料庫獲得(輕鏈(SEQ ID NO：24)的登錄號CAA68253以及重鏈(SEQ ID NO：23)的登錄號CAA68252)且然後經由Blue Heron Biotechnology將密碼子優化以及合成。輕鏈變異區被選殖入pAbKZeo質體之EcoRI與BsiWI切位，並且重鏈變異區被選殖入pAbG1Neo質體HindIII之與Apa1切位。
範例2 鼠類單株抗體Mov19以及FR1-21的人類化
將Mov19抗體按照前述的骨架表面重塑方法加以人類 化(Roguska M.et.al,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1994 Feb；91：969-973以及Roguska et al.,Protein Eng.9(10)：895-904(1996))。簡言之，使用來自PDB庫料庫中緊密相關之溶解的抗體結構計算對於每個變異區骨架殘基之平均溶劑的可親性，並且將帶有超過30%平均可親性的位置標示為表面殘基(Pedersen J.T.et.Al,J.Mol.Biol.1994；235：959-973)。經由比對Kabat資料庫中鼠類抗體序列的表面位置與人類抗體種系序列的相對應位置而選出人類表面取代序列(Johnson,G.and Wu,T.T.(2001)Nucleic Acids Research,29：205-206)。選出最同源的人類輕鏈變異區表面(選殖株DPK19，對於Mov19 IMGT之位置IGKV2D-30*01以及對於FR1-21 IMGT之位置IGKV1/OR2-0*01)以及最同源的人類重鏈變異區表面(選殖株8M27，對於Mov19 IMGT之位置IGHV1-69*08以及對於FR1-21 IMGT之位置IGHV5-51*02)以取代鼠類Mov19骨架表面位置，留下未替代的6 CDRs(表格1)。鼠類與人類Mov19以及FR1-21表面位置以及殘基提出於第1A-D圖。
沒有殘基改變會引起影響Mov19或FR1-21 CDRs與它們在葉酸受體1上之標的抗體決定基的交互作用的關注，所以對於任一抗體之人類化序列沒有表面回復突變的考量。然而表面重塑之Mov19序列確實引入於輕鏈N74上一致的N端連結醣化位置(輕鏈版本1.00)，所以製出第二個人類化輕鏈版本以移除此位置。一篇Kabat人類輕鏈序 列資料庫的回顧顯示出蘇胺酸是發現於輕鏈位置74之最普遍殘基，因此以位於位置74的蘇胺酸建立人類化Mov19輕鏈版本1.60。位置74不是表面殘基，所以此殘基取代作用對經由表面重塑之人類化不具有影響。鼠類以及人類化的Mov19以及FR1-21之變異區序列的比對提出於第2圖。
將人類化的Mov19以及FR1-21之變異區序列經由Blue Heron Biotechnology密碼子優化並合成。序列相鄰於限制酶切位，以促進單鏈哺乳動物表現質體中的各自的恆定序列同一讀框(in-frame)的選殖。將輕鏈變異區選殖至pAbKZeo質體之EcoRI與BsiWI切位。編碼huMov19輕鏈的生成質體DNAs被寄存於ATCC成為ATCC寄存編號PTA-10773與PTA-10774，並且編碼huFR1-21輕鏈的生成質體DNA被寄存為ATCC寄存編號PTA-10776。重鏈變異區被選殖至pAbG1Neo質體之HindIII與Apa1切位。編碼huMov19重鏈的生成質體DNA被寄存於ATCC成為ATCC寄存編號PTA-10772，並且編碼huFR1-21重鏈的生成質體DNA被寄存為ATCC寄存編號PTA-10775。再將這些質體如同範例3中所述轉染以產生huMov19。編碼任何一個huMov19輕鏈的質體(即，其寄存為ATCC寄存編號PTA-10773或PTA-10774)可與編碼huMov19重鏈的質體配對，根據本文所提供並且為本領域具一般技藝之技術人員熟知的方法創造huMov19抗體。
範例3 重組抗體表現
嵌合的以及人類化抗體建構物在旋轉角瓶中使用標準磷酸鈣程序於貼附性的HEK-293T細胞(BD Biosciences,CalPhos Mammalian Transfection Kit,Cat # 631312)或使用修飾的PEI程序的適懸浮性HEK-293T細胞〔Durocher Y,Perret S,Kamen A High-level and high-throughput recombinant protein production by transient transfection of suspension-growing human 293-EBNA1 cells.Nucleic Acids Res.2002 Jan 15；30(2)：E9〕暫時性地生產。除了將HEK-293T細胞生長於Freestyle 293(Invitrogen)中並且在加入PEI-DNA複合物後使培養體積為未稀釋的，將PEI暫時性轉染如同先前所述而完成(Durocher,Y.et al.,Nucleic Acids Res.30(2)：E9(2002))。將貼附性與懸浮性暫時轉染物兩者皆培養一星期，然後將澄清的上清液經由如同下述的CM管柱離子交換層析法之蛋白質A管柱純化。如同第3圖所顯示的，在轉染細胞中huMov19之表現比嵌合Mov19之表現至少高10倍。
範例4 抗體純化
使用標準方法將抗體由澄清的細胞培養上清液中純化，例如，舉例來說蛋白質A或G層析法(HiTrap Protein A or G HP,1mL,Amersham Biosciences)。簡言之，經由加入1/10體積之1M Tris/HCl緩衝液，pH 8.0而製備供層 析法的上清液。將經調整pH之上清液經由0.22μm濾膜過濾並且裝入以結合緩衝液(PBS,pH 7.3)平衡之管柱。以結合緩衝液清洗管柱直到獲得在280nm無吸光度的穩定基線。以包含0.15M NaCl,pH 2.8之0.1M醋酸緩衝液沖提抗體，使用流速0.5mL/min。收集約0.25mL之餾分並且經由加入1/10體積之1M Tris/HCl,pH 8.0加以中和。將波峰餾分對1x PBS隔夜透析兩次並且經由過濾通過0.2μm濾膜加以滅菌。以A280的吸光度定量純化的抗體。
使用離子交換層析法(IEX)及羧甲基(CM)層析法而將蛋白質A純化的餾分進一步純化。簡言之，將來自蛋白質A純化的樣本交換緩衝液至起始緩衝液(10mM磷酸鉀、10mM氯化鈉，pH 7.5)中並且過濾通過0.22μm過濾器。再將所製備的樣本裝入於流速120cm/hr、以起始緩衝液平衡之CM快速流動樹脂(GE lifesciences)。選擇管柱尺寸以具有足夠能力以結合樣本中的所有抗體。再以結合緩衝液清洗管柱直到獲得在280nm無吸光度的穩定基線。將抗體經由起始在20倍管柱體積(CV)中由10mM至500mM之梯度的氯化鈉加以沖提。收集主波峰的UV讀取高於50mAu之餾分。使用Agilent HPLC 1100系統(Agilent,Santa Clara,CA)以在TSK膠體G3000SWXL,7.8×300mm伴隨SWXL保護管，6.0×40mm(Tosoh Bioscience,Montgomeryville,PA)之尺寸排阻層析法(SEC)評估純度(單體以及可溶性高分子量聚集物之百分率)。集合帶有所希望的純度(>95%)之餾分，使用 TFF系統交換緩衝液至PBS(pH 7.4)，並且經由過濾通過0.2μm濾膜消毒。將純化的抗體進一步經由SEC測試其純度，並且使用消光係數1.47、經由在280nm之吸光度測量以測定IgG濃度。如有必要則做稀釋。替代地，可使用陶瓷羥基磷灰石(CHT)以精鍊具有改善的選擇性之鼠類與人類化抗體兩者。具有40μm顆粒大小之第II型CHT樹脂(Bio-Rad Laboratories)被使用以與IEX層析相似的計畫書以精鍊抗體。用於CHT之起始緩衝液為20mM磷酸鈉，pH 7.0，並且將抗體經由在20個CV的20-160mM梯度之磷酸鈉沖提。
範例5 鼠類抗FOLR1抗體之培育
有兩個不同的免疫接種/篩選系列。第一系列導致FR1-21選殖株的產生，第二系列造成FR1-48、FR1-49、FR1-57以及FR1-65選殖株的產生。在第一系列中將小鼠以約5x106表現FOLR1之KB細胞由皮下免疫接種(美國菌種中心，ATCC CCL-17)。在第二系列中於它們的表面表現人類FOLR1的300-19細胞被用來免疫接種小鼠。為製造這些細胞，由NCBI網站(登錄號NP_057937)獲得人類FOLR1胺基酸序列，再將其密碼子優化並由Blue Heron biotechnologies合成，與EcoRI以及Xba1限制酶切位相鄰，以幫助選殖至pSRa哺乳動物表現質體。將300-19細胞，一種源自Balb/c小鼠之B前細胞株(Reth et al., Nature,317：353-355(1985))，以pSRa-FolR1表現質體轉染以在細胞表面穩定地表現大量的人類FOLR1。將為技術人員所知的標準免疫接種計畫書，舉例來說，像是那些使用於ImmunoGen,Inc者應用於兩系列。在犧牲前三天將免疫接種小鼠追加抗原以生成融合瘤。根據標準動物計畫書收集來自小鼠的脾臟，像是舉例來說在兩片無菌、凍乾的顯微鏡玻片間研磨組織，以獲得在RPMI-1640培養液中的單一細胞懸浮液。將脾臟細胞離心、沉澱、清洗並與鼠類骨髓瘤融合，像是舉例來說使用聚乙二醇-1500(Roche 783 641)之P3X63Ag8.653細胞(Kearney et al.,J.Immunol.,123：1548-1550(1979))。將融合的細胞懸浮於包含次黃嘌呤-胺基蝶呤-胸苷(HAT)(Sigma H-0262)的RPMI-1640篩選培養基並以生長於37℃、5% CO2之96孔平底培養盤(Corning-Costar 3596，每孔0.2ml細胞懸浮液)進行篩選。在5天的培養後，將0.1ml培養懸浮液自每孔中移出並以包含次黃嘌呤-胸苷(HT)補充劑(Sigma H-0137)之0.1ml之RPMI-1640培養液取代。繼續培養於37℃及5% CO2直到融合瘤選殖株準備好進行抗體篩選。亦可使用其他免疫接種以及融合瘤生產的技術，包括那些描述於Langone et al.(Eds.,“Immunochemical Techniques,Part I”,Methods in Enzymology,Academic Press,volume 121,Florida)以及Harlow et al.(“Antibodies：A Laboratory Manual”；Cold Spring Harbor Laboratory Press,New York(1988))。
範例6 融合瘤的篩選與選擇
分別於第一以及第二系列篩選使用以人類FOLR1以及KB細胞轉染之FOLR1-300-19細胞。將來自融合瘤的培養上清液經由流式細胞計數法篩選小鼠單株抗體之分泌，其結合至FOLR1陽性細胞，例如表現FOLR1之300-19細胞或KB細胞，但不結合至FOLR1陰性細胞，例如未轉染的300-19細胞。將0.1ml之融合瘤上清液與FOLR1陽性細胞或未轉染的300-19細胞(每樣本1 x105細胞)之任一者於0.1ml之FACS緩衝液(添加2%正常羊血清之RPMI-1640培養液)培養3小時。接著，將細胞離心、沉澱、清洗並與0.1ml的PE-共軛羊抗小鼠IgG抗體培養1小時(像是例如由Jackson Laboratory獲得的，在FACS緩衝液中6μg/mL)。將細胞離心、再沉澱、以FACS緩衝液清洗並懸浮於包含1%甲醛的0.2ml PBS。使用FACSCalibur流式細胞儀伴隨HTS多孔採樣器或FACS陣列流式細胞儀以測量細胞相關的螢光並且使用CellQuest Pro分析(皆來自BD Biosciences,San Diego,US)。將陽性融合瘤選殖株經由限制稀釋而次選殖。選擇來自每個融合瘤的一個選殖株，其經由流式細胞計數法對FOLR1顯示與親代細胞相同的反應，以作為後續分析。培養穩定的次選殖株並使用市售同型試劑(Roche 1493027)識別每個分泌的抗FOLR1抗體之同型。鼠類抗體以如同上述之澄清融合瘤培養液中以蛋白質A純化。這些抗體被稱為FR-1抗體。
範例7 鼠類單株抗體純化
使用標準方法，例如，舉例來說蛋白質A或G層析法(HiTrap蛋白質A或G HP，1mL，Amersham Biosciences)由融合瘤次選殖株上清液純化出抗體。簡言之，用於層析法的上清液係經由加入1/10體積之1M Tris/HCl緩衝液(pH 8.0)而製備。將經調整pH之上清液經由0.22μm濾膜過濾通過並且裝入以結合緩衝液(PBS,pH 7.3)平衡之管柱。以結合緩衝液清洗管柱直到獲得在280nm無吸光度的穩定基線。以包含0.15M NaCl,pH 2.8之0.1M醋酸緩衝液及使用流速0.5mL/min沖提抗體。收集約0.25mL之餾分並且經由加入1/10體積之1M Tris/HCl,pH 8.0加以中和。將波峰餾分對1x PBS隔夜透析兩次並且經由過濾通過0.2μm濾膜以滅菌。以A280的吸光度定量純化的抗體。
範例8 經由流式細胞計數法之結合特徵化
使用純化的抗體並藉由流式細胞計數法測試結合專一性。證實抗FOLR1對表現FOLR1的300-19細胞之結合以及缺乏結合至親代300-19細胞的FACS直方圖顯示於第4圖。將每個抗體與表現FOLR1之300-19細胞或非轉染的300-19細胞(每樣本1 x 105細胞)之任一者於緩衝液(添加2% 正常羊血清之RPMI-1640培養液)培養3小時。接著，將細胞沉澱、清洗並以0.1ml的FITC-共軛羊抗小鼠IgG抗體(像是例如由Jackson Laboratory獲得的，在FACS緩衝液中6μg/mL)培養1小時。將細胞再沉澱、以FACS緩衝液清洗並重新懸浮於包含1%甲醛的200μL PBS。使用FACSCalibur流式細胞儀伴隨HTS多孔採樣器或FACS陣列流式細胞儀以獲取樣本並且使用CellQuest Pro分析(皆來自BD Biosciences,San Diego,US)。抗FOLR1抗體之FACS直方圖顯示螢光位移，然而親代300-19細胞則否。又，當任一細胞株僅單獨與FITC共軛之羊抗人類IgG抗體培養時，偵測不到顯著螢光位移。
範例9 muFR1-21的VL與VH區域的選殖與定序
根據製造商的計畫書使用RNeasy套組(QIAgen)由5 x 106個融合瘤細胞製備總細胞RNA。隨後使用SuperScript II cDNA合成套組(Invitrogen)由總RNA合成cDNA。衍生自融合瘤細胞的cDNA第一回合的退化性PCR反應(degenerate PCR reaction)的程序係根據描述於Wang et al.((2000)J Immunol Methods.Jan 13；233(1-2)：167-77)以及Co et al.((1992)J Immunol.Feb 15；148(4)：1149-54)的方法。使用下列退化性引子經由PCR擴增VH序列：EcoMH1 CTTCCGGAATTCSARGTNMAGCTGSAGSAGTC(SEQ ID NO：50)EcoMH2 CTTCCGGAATTCSARGTNMAGCTGSAGSAGTCWGG(SEQ ID NO： 51)以及BamIgG1 GGAGGATCCATAGACAGATGGGGGTGTCGTTTTGGC(SEQ ID NO：52)。使用下列退化性引子經由PCR擴增VL序列：SacIMK GGAGCTCGAYATTGTGMTSACMCARWCTMCA(SEQ ID NO：53)以及HindKL TATAGAGCTCAAGCTTGGATGGTGGGAAGATGGATACAGTTGGTGC(SEQ ID NO：54)。(混合鹼基定義如下：N=G+A+T+C、S=G+C、Y=C+T、M=A+C、R=A+G、W=A+T)。
再將PCR反應混合物於1%低熔融瓊脂糖凝膠分離，切取300至400bp的寬帶，使用Zymo DNA小管柱純化，並寄至Agencourt Biosciences進行定序。使用各自的5’以及3’PCR引子作為定序引子，以從兩個方向生成變異區cDNAs。經由以VectorNTI軟體轉譯DNA定序結果獲得VH以及VL區域的胺基酸序列。
為識別在初步變異區cDNA序列中5’端引子定序人工物，利用NCBI IgBlast站(www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)搜尋抗體序列所衍生之鼠類生殖細胞序列。再將清空的變異區序列與作為專一的抗體恆定區的NCBI參考序列合併以組裝所期望的全長鼠類抗體序列。再計算所期望的鼠類Fr1-21輕與重鏈的分子量並且與由液相層析/質量分光光度計(LC/MS)分析所測得的質量比較。將鼠類FR1-21重鏈比較所測質量，但輕鏈需要後續的定序工作，以測定5’端序列。設計CD37-1LClead1 PCR引子(ttttgaattcgccaccatgaagtttccttctcaacttct)以黏著至鼠類抗體之生殖細胞連結的領導序列，使得這個新的PCR反應將生成一個未被引子改變的完整變異區cDNA序列。如同 上述完成PCR反應、條帶純化(band purification)以及定序並且新的完整序列編碼與經由LC/MS測量之Fr1-21輕鏈質量配對的一個輕鏈。
範例10 參考抗體之表現
Morphotech抗FOLR1抗體、MorAb-003(Farletuzumab)、胺基酸序列從世界衛生組織(WHO)國際非專利藥品名稱(INN)清單獲得，並且由Blue Heron Biotechnology密碼子優化並合成。將輕鏈變異區序列相鄰於EcoRI與BsiWI限制酶切位，並且將重鏈變異區序列相鄰於HindIII與Apa1限制酶切位，用於選殖在單一鏈哺乳動物表現質體中與各自的恆定序列同一讀框。如同上述對於人類化Mov19以及Fr1-21完成選殖、表現以及純化。
範例11 huMov19之ADCC活性
使用乳酸去氫酶(LDH)釋放試驗以測量腫瘤細胞株的抗體依賴細胞媒介細胞毒性(ADCC)，其係使用新鮮分離之人類天然殺手(NK)細胞作為效應細胞(例如，Shields,J.Biol.Chem.,276(9)：6591-6604(2001))。首先使用對NK Isolation Kit II修改的計畫書(Miltenyi Biotech,130-091-152)將NK細胞從來自正常捐獻者(Research Blood Components,Inc.,Brighton, MA)之人類血液中分離。將血液以1x PBS稀釋2倍。將25mL的稀釋血液在50mL圓錐管中經由25mL Ficoll Paque小心地分層，並且在室溫下以400g離心45分鐘。從界面收集周邊血液單核細胞(PBMC)，轉移至新的50mL錐形管，並以1 x PBS清洗一次。將PBMC重新懸浮於2mL之NK分離緩衝液(1 x PBS,0.5% BSA,2mM EDTA)，然後將500μL之生物素-抗體雞尾酒加至細胞懸浮液。生物素-抗體雞尾酒包含結合至淋巴細胞之生物素化的抗體，除了對NK細胞外，造成NK細胞的負選擇。將混合物於4℃培養10分鐘，然後加入1.5mL of NK分離緩衝液以及1mL之抗生物素微珠。將細胞抗體混合物於4℃培養另一個15分鐘。接著，將細胞以50mL NK分離緩衝液清洗一次並重新懸浮於3mL NK分離緩衝液。接著，將MACS LS管柱安裝於autoMACS分離器(Miltenyi Biotech)並且以3mL NK分離緩衝液預先清洗。細胞懸浮液被自動地用於管柱、清洗，並且將具有未標記的NK細胞之流出餾分收集至新的50mL圓錐管。將生成之NK細胞鋪於30mL之完全RPMI培養液(添加5%胎牛血清、1%青黴素-鏈黴素、1mM HEPES、1mM丙酮酸鈉、1% 100X MEM非必需胺基酸溶液之RPMI-1640)隔夜。後續的分析以及所有稀釋係於RHBP培養液(添加20mM HEPES,pH 7.4、0.1% BSA以及1%青黴素-鏈黴素之RPMI 1640)中完成。將在RHBP培養液中各種濃度之抗體以50μL/孔二重覆分裝於圓底96孔盤。將目標細胞以106細胞/mL重新懸浮於RHBP培養液中 並以100μL/孔加至包含抗體稀釋液的每孔中。將包含目標細胞以及抗體稀釋液的盤於37℃培養30分鐘。再將NK細胞以50μL/well加至包含目標細胞的孔中。典型的比率為大約1個目標細胞對3-4個NK細胞。對於每個實驗至少建立下列控制組：僅NK細胞、僅目標細胞(自動釋放LDH)、伴隨NK細胞的目標細胞(抗體獨立性LDH釋放)、伴隨10% Triton X-100之目標細胞(最大LDH釋放)。將混合物於37℃培養4小時，以使細胞水解。將盤於1200rpm離心10分鐘，並將100μL上清液小心轉移至新的平底96孔盤。將來自細胞毒殺偵測套組(Roche 1 644 793)之LDH反應混合物(100μL/孔)加至每孔中並且於室溫下培養5至30分鐘。於490nm(OD490)測量樣本之光學密度。每個樣本之專一性水解百分比係使用下列公式測定：專一性水解百分比=(樣本數值-自動釋放)/(最大釋放-自動釋放)*100。
在人類NK效應細胞的存在下與huMov19培養引起對IGROV-1細胞良好的ADCC活性。將IGROV-1細胞的ADCC活性與huMov19、huFR-1-21、Mor003以及chTK1(同型控制組)比較(第6圖)。以0.9ng/ml huMov19處理造成約30% IGROV-1細胞裂解，與以其他抗FOLR1抗體所觀察到的活性相似。huMov19之ADCC活性具有EC50 0.20ng/mL、huFr-1-21具有EC50 0.11ng/mL、Mor003具有0.16ng/mL而chTK1不顯示任何對IGROV-1細胞的活性。
範例12 抗FOLR1免疫共軛物之製備 huMOV19v1.6-磺酸基-SPDB-DM4之製備
將範例性的2-磺酸基-SPDB連接元溶解於DMA。將huMOV19v1.6抗體以8mg/mL與12倍莫耳數之過量2-磺酸基-SPDB連接元於25℃、pH 7.5下培養約2小時。將反應混合物以使用包含50mM NaCl,2mM EDTA,pH 6.5之50mM磷酸鉀緩衝液平衡之SEPHADEXTM G25F管柱純化。將美登素衍生物DM4溶解於二甲基乙醯胺(DMA，最終濃度為5%)並且以和連接元相比1.7倍莫耳數之過量逐滴加入磺酸基-SPDB修飾之抗體。將反應混合物以1m HEPES緩衝液調整至pH 7.5。在室溫下隔夜培養後，將共軛抗體經由在以10mM組胺酸、250mM甘胺酸、1%蔗糖、pH 5.5平衡的SEPHADEXTM G25F之層析法純化。使用先前報導之對抗體與美登素衍生物之消光係數來測定每抗體分子連結之DM4分子數目(Widdison,WC,et al.J Med Chem,49：4392-4408(2006))。如同上述，測定總游離的美登素衍生物種類之百分率。每huMov19v1.6抗體中帶有3.5-4個DM4分子之共軛物係以<1%存在為未共軛之美登素衍生物而獲得。
huMOV19v1.6-SPP-DM1之製備
將示範的N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)戊酸酯(SPP)連接元溶解於乙醇。將huMOV19v1.6抗體以8 mg/mL伴隨6.5至6倍莫耳數之過量SPP連接元於室溫在包含50mM NaCl、2mM EDTA以及5%乙醇之50mM磷酸鉀緩衝液(pH 6.5)中培養約2小時。將經SPP修飾的抗體於PBS(pH 6.5)中稀釋2倍，並且經由加入在二甲基乙醯胺(DMA)中之DM1濃縮溶液(15-30mM)，以1.5倍莫耳數過量之美登素衍生物DM1修飾。將DMA濃度調整至5%並且在室溫下隔夜培養後，經由使用以10mM組胺酸、250mM甘胺酸、1%蔗糖、pH 5.5平衡的SEPHADEXTM G25F層析以純化共軛抗體。使用先前報導之對抗體與DM1之消光係數測定每抗體分子連結之DM1分子數目(Liu et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,93,8618-8623(1996))。在共軛反應後，存在的游離美登素衍生物的百分率係經由注射20-50μg共軛物至HiSepTM管柱而測定，HiSepTM管柱係於在pH 7.0、100mM醋酸銨中的25%乙腈的緩衝液中平衡，並且以乙腈沖提。總游離的美登素衍生物種類(以梯度沖提並且經由與已知標準比較沖提時間而識別)之波峰面積係使用設定至252nm波長的吸光度偵測器測量，並且與相關於被結合之美登素衍生物種類(於管柱流出的餾分被沖提出之共軛波峰)的波峰面積比較，以計算全部游離的美登素衍生物種類之百分率。每huMov19v1.6抗體中帶有3.5-4個DM1分子之共軛物係以<1%存在為未共軛之美登素衍生物而獲得。
huMOV19v1.6 SPDB-DM4之製備
將示範的N-琥珀醯亞胺4-(2-吡啶二硫代)丁酸酯(SPDB)連接元溶解於乙醇。將huMOV19v1.6抗體以8mg/mL伴隨5.5-5倍莫耳數之過量SPDB連接元於室溫在包含50mM NaCl、2mM EDTA以及3%乙醇之50mM磷酸鉀緩衝液(pH 6.5)中培養約2小時。將經SPDB修飾的抗體於PBS,pH 6.5中稀釋2倍，並且經由加入在二甲基乙醯胺(DMA)中之DM4濃縮溶液(15-30mM)以1.5倍莫耳數過量之美登素衍生物DM4修飾。在室溫下培養隔夜後，將共軛抗體經由在以10mM組胺酸、250mM甘胺酸、1%蔗糖、pH 5.5平衡的SEPHADEXTM G25F之層析法純化。使用先前報導之對抗體與美登素衍生物之消光係數測定每抗體分子連結之DM4分子數目(Widdison,WC,et al.J Med Chem,49：4392-4408(2006))。全部游離的美登素衍生物種類之百分率係如同上述而測定。每huMov19v1.6抗體中帶有3.5-4個DM4分子之共軛物係以<1%存在為未共軛之美登素衍生物而獲得。
huMOV19v1.0-3-磺酸基-mal-DM4之製備
將NHS-3-磺酸基-mal連接子以及DM4分別地溶解於DMA中。將連接子與DM4硫醇於包含40% 200mM的琥珀酸緩衝液、2mM EDTA,pH5.0的DMA溶液共同混合以得到DM4對連接子之莫耳比率1.6：1並且DM4的最終濃度等於10mM。將混合物於25℃反應2小時。將反應混合物不純化而加入，使得在最終共軛條件4mg/mL抗體、90%磷酸緩 衝液/10% DMA pH7.5(v/v)下，將9.6當量莫耳過量之連接子對抗體加至在磷酸緩衝液(pH7.5)中之huMOV19v1.0抗體溶液。於室溫下隔夜培養後，以於PBS pH7.5中平衡之SEPHADEX G25層析法純化共軛混合物。接著，將huMOV19v1.0-3-磺酸基-mal-DM4透析至包含9.55mM磷酸、139.6mM NaCl,pH6.5的緩衝液。使用先前報導之對抗體與美登素衍生物之消光係數來測定每抗體分子鍵聯之DM4分子數目(Widdison,WC,et al.J Med Chem,49：4392-4408(2006))。如上所述，測定總游離的美登素衍生物種類之百分率。每huMOV19v1.0抗體中帶有3.5-4 DM4分子之共軛物以存在<1%未共軛之美登素衍生物而獲得。
huMOV19v1.0-SMCC-DM1之製備
將NHS-磺酸基-SMCC連接子以及DM1分別地溶解於DMA中。將連接子與DM1硫醇於包含40% 200mM的琥珀酸緩衝液、2mM EDTA,pH5.0的DMA溶液共同混合以得到DM1對連接子之莫耳比率1.2：1並且DM1的最終濃度等於3.75mM。將混合物於20℃反應75分鐘。將反應混合物不純化而加入，使得在最終共軛條件4mg/mL抗體、88% 50mM磷酸鉀、50mM NaCl、2mM EDTA、pH 7.5/12% DMA pH7.5(v/v)下，將6.4當量莫耳過量之連接子對抗體加至在磷酸緩衝液(pH7.5)中之huMOV19v1.0抗體溶液。於20℃下培養2小時後，以於PBS pH7.5中平衡之 SEPHADEX G25層析法純化共軛混合物。接著，將huMOV19v1.0-SMCC-DM1透析至包含250mM甘胺酸、10mM組胺酸pH5.5的緩衝液。使用先前報導之對抗體與美登素衍生物之消光係數來測定每抗體分子鍵聯之DM1分子數目(Widdison,WC,et al.J Med Chem,49：4392-4408(2006))。如上所述，測定總游離的美登素衍生物種類之百分率。每huMOV19v1.0抗體中帶有3.5-4 DM1分子之共軛物以存在<2.8%未共軛美登素衍生物而獲得。
huMOV19v1.0-PEG4-mal-DM1之製備
將NHS-PEG4-mal-DM1 1步驟試劑溶解於DMA。於25℃下，將huMov19v1.0抗體以5mg/mL伴隨5.7倍莫耳過量之NHS-PEG4-mal-DM1在50mM Kpi、50mM NaCl、2mM EDTA,pH 7.5與10%體積的DMA中培養隔夜。以於PBS pH7.5中平衡之SEPHADEX G25層析法純化反應混合物。接著，將huMOV19v1.0-PEG4-mal-DM1透析至包含250mM甘胺酸、10mM組胺酸pH5.5的緩衝液。使用先前報導之對抗體與美登素衍生物之消光係數來測定每抗體分子鍵聯之DM1分子數目(Widdison,WC,et al.J Med Chem,49：4392-4408(2006))。如上所述，測定總全部游離的美登素衍生物種類之百分率。每huMOV19v1.0抗體中帶有3.5-4 DM1分子之共軛物以存在<1.1%未共軛美登素衍生物而獲得。
範例13 抗體與共軛物之結合親和力
以流體細胞計數法分析抗-FOLR1抗體以及其SPDB-DM4、PEG4Mal-DM4、SMCC-DM1或抗FOLR1-磺酸基-SPDB-DM4共軛物之結合親和力。將表現FOLR1的SKOV3細胞與不同濃度的抗FOLR1抗體或其共軛物培養並且如同上述而進行流式細胞計數分析。使用CellQuest Pro執行資料分析(BD Biosciences,San Diego,US)並且對每個樣本輸出對FL1的平均螢光強度(MFI)並對抗體濃度以半對數圖繪製圖形。利用非線性回歸產生劑量反應曲線，以及使用GraphPad Prism v4(GraphPad software,San Diego,CA)計算對於結合至SKOV3細胞之測試樣本的視平衡解離常數(Kd)數值並且呈現於第5圖。結果顯示經由任一所使用的連接子與無論DM1或是DM4結合，不顯著改變任一抗體(例如，huMov19)的親和力。
範例14 活體外細胞毒性試驗
使用經由Kovtun YV et al.(Cancer Res 66：3214-3221(2006))描述的方法之活體外細胞毒性分析來測量示範的muFR1-9、muFR1-13、muFR1-22、muFR1-23、huFR1-23、muFR1-21以及huFR1-21共軛物抑制細胞生長活性的能力。將各種濃度的PEG4-mal-DM4共軛物加至在96孔盤中以每孔1,000細胞於100μL完整RPMI培養基 (RPMI-1640、10%胎牛血清、2mM麩醯胺酸、1%健他黴素，所有試劑皆來自Invitrogen)中之表現FOLR1的KB細胞。使用3倍連續稀釋將抗體與共軛物稀釋至完整RPMI培養基中並於每孔加入100Ml。最終濃度典型地在3 x 10-8M至4.6 x 10-12M之間。每個分析盤包括了含有細胞與培養基但缺乏共軛物之控制組孔，以及僅含有培養基之孔。將盤在含有5% CO2的溼化環境中於37℃培養四到六天。接著，將WST-8試劑，10% v/v(Dojindo Molecular Technologies,Gaithersburg,MD,US)加至孔中並將盤於37℃培養2-6小時。藉由活細胞中的去氫酶將WST-8還原至橘色(在組織培養基中可溶的最大量甲臢產物。產生的甲臢量為與存活細胞數成正比。將盤以多孔盤讀取儀測量於450nm(A450)以及於650nm(A650)之吸光度來進行分析。首先，將A650減去細胞之乳白光(A650)的背景值，接著將產生的A*450用於測定細胞存活部分。背景A*450吸光值為帶有培養基與僅有WST-8的A*450吸光值。存活部分計算如下：存活百分比=100 x(經A*450處理的樣本-A*450背景)/(未經A*450處理的樣本-A*450背景)。將對於每個處理的存活部分數值對抗體或共軛物濃度以半對數圖繪製。接著使用GraphPad Prism v4(GraphPad software,San Diego,CA)從這些資料測定IC50數值並呈現於第5圖。於第5圖顯示的結果證實所有共軛物在對表現FOLR1的KB細胞之細胞毒性能力為相似地具活性。為進一步驗證抗FOLR1-美登素衍生物共軛物 對FOLR1之專一性，在對KB細胞過量的非共軛抗體的存在，評估其活性。加入過量競爭性非共軛抗體至共軛物以抑制它們的細胞毒性，如同第7圖所見的。這些資料表示共軛物以抗原相關方式殺害KB細胞。額外的資料證實在活體外試驗於KB細胞中huMov19-SPDB-DM4誘導的細胞週期停滯於G2/M期。
範例15 KB異體移植模式中huMov19-PEG4Mal-DM4以及huMov19-SPDB-DM4共軛物與相似的非標的共軛物相較之活體內效用
使用將KB細胞皮下植入SCID小鼠之已建立的異體移植模式，對FOLR1-標的可裂解共軛物huMov19-SPDB-DM4與非標的huC242-SPDB-DM4的比較以及將非可裂解共軛物huMov19-PEG4-Mal-DM4與非標的huC242-PEG4Mal-DM4的比較進行測試。將小鼠以體重隨機分配至治療組，並且於細胞接種後第三天以單一地(SPDB共軛物)或於細胞接種後第3、10以及17天每周三次，分別以5與10mg/kg共軛物處理。將不同治療組的中位數腫瘤體積繪圖於第8圖。與PBS相較，以無論huMov19-SPDB-DM4或huMov19-PEG4Mal-DM4之任一處理造成中位數腫瘤體積減少，而以任一者各自的非標的共軛物處理沒有產生任何顯著效果。
範例16 KB異體移植模式中抗FOLR1-PEG4Mal-DM4共軛物之活體內效用
使用將KB細胞皮下植入SCID小鼠之已建立的異體移植模式以測試示範的抗FOLR1抗體huMov19、muFR-1-9、muFR-1-13、muFR-1-22、muFR-1-23以及huFR-1-21之PEG4Mal-DM4共軛物。將小鼠以體重隨機分配至治療組，並於細胞接種後第三天以10mg/kg上面所列共軛物其中之一或僅以PBS處理一次。HuMov19-PEG4Mal-DM4顯示於上係與huMov19、muFR-1-9、muFR-1-13、muFR-1-22、muFR-1-23以及huFR-1-21之PEG4Mal-DM4共軛物於活體外其細胞毒性能力相似。HuMov19-PEG4Mal-DM4與huFR-1-21-PEG4Mal-DM4在活體內顯著地比任何其他共軛物更有效，於中位數腫瘤體積造成更顯著的減少(第9與第10圖)。強度亦證實為劑量相關的(第11圖)並且連接子的選擇亦扮演了角色(第12圖與第13圖)。
範例17 異體移植模式中抗FOLR1-磺酸基-SPDB-DM4共軛物之活體內效用
在三個卵巢漿液性腺癌異體移植OVCAR-3、IGROV-1以及OV-90中測試抗FOLR1 huMov19-磺酸基-SPDB-DM4共軛物。當於福馬林固定石蠟包埋切片使用校正免疫組織化學(IHC)染色方法以測量這些異體移植腫瘤，每一個 異體移植腫瘤顯示相當於病人腫瘤的FOLR1表現程度。將帶有已建立的皮下異體移植腫瘤(約100mm3)之小鼠以1.2、2.5以及5.0mg/kg huMov19-磺酸基-SPDB-DM4共軛物之單一靜脈注射治療(根據抗體濃度；第14-16圖以μg/kg顯示美登素衍生物共軛物濃度)。共軛物在所有三種評估的模式中皆具有活性。在OVCAR-3異體移植中，最小有效劑量(MED)為1.2mg/kg(第14圖)。較高的劑量等級為高度活性的，引起在2.5與5.0mg/kg治療組中分別4/6以及2/6的小鼠完全消失(CR)。以MED 2.5mg/kg、單一注射的共軛物治療造成在IGROV-1以及OV-90異體移植模式中優秀的抗腫瘤活性(第15與16圖)。這些資料證實huMov19-磺酸基-SPDB-DM4共軛物對帶有相當於病人腫瘤FOLR1表現程度的卵巢異體移植腫瘤優秀的抗腫瘤活性。
範例18 連接子對免疫共軛物效能之影響
將抗FOLR1抗體huMov19經由含有雙硫化物之可裂解連接子SPP、SPDB或磺酸基-SPDB或經由非裂解連接子SMCC鍵聯至DM1或DM4。檢查這些共軛物於KB、IGROV-1以及JEG-3細胞株的活體外細胞毒素活性。FACS分析指出KB(子宮頸)細胞具有每細胞>2,000,000抗體結合位點。IGROV-1(卵巢的)細胞具有每細胞260,000抗體結合位點，以及JEG-3(絨毛膜癌)細胞具有每細胞 40,000抗體結合位點。活體外的細胞毒性結果總結於下面表格2。相較於SMCC共軛物之活體外活性，可裂解共軛物展現顯著較大之活體外活性。
亦測試在FOLR1陽性KB-以及OVCAR-3-腫瘤模式之共軛物的活體內活性。第17圖顯示的結果證實可裂解的SPDB-DM4以及磺酸基-SPDB-DM4共軛物較非可裂解的SMCC-DM1共軛物在活體內為更有效。此外，在可裂解的共軛物中，SPP-DM1共軛物在兩種異體移植模式中與無論SPDB-DM4或磺酸基-SPDB-DM4共軛物相較為低活性的(第18圖)。後兩者共軛物對KB腫瘤相似地具有活性，而磺酸基-SPDB-DM4共軛物對OVCAR-3模式更有效。使用OVCAR-3模式獲得的資料總結於下面表格3。
這些資料證實包含可裂解連接子的免疫共軛物在活體外以及活體內兩者皆顯示增加的效果，以及包含磺酸基-SPDB之抗FOLR1免疫共軛物在腫瘤模式中是高度活性的。
範例19 huFR1抗體SMCC-DM1共軛物之活體外以及活體內效果
將抗FOLR1 huFR1-48、huFR1-49、huFR1-57以及huFR1-65與SMCC連接子以及DM1結合並且對KB細胞以及使用上述異體移植模式之活體內的效果如同上述分析。每個抗體在KB細胞模式中顯示相似的效果，同時huFR1-48、huFR1-49、huFR1-57以及huFR1-65免疫共軛物在異體移植模式系統中於200μg/kg劑量顯示變異但在活體內效果顯著(表格4以及第19圖)。
所有於本文引用之出版物、專利、專利申請案、網站以及登錄號/資料庫序列(包括多核苷酸與多肽序列兩者)為了所有目的在此以全文併入以作為參考，猶如每個各別的出版物、專利、專利申請案、網站以及登錄號/資料庫序列專一地且分別地所意指者之相同程度，因此併入以作為參考。
序列
SEQ ID NO：1-huMov19 vHC CDR1 GYFMN
SEQ ID NO：2-huMov19 vHC CDR2 RIHPYDGDTFYNQKFQG
SEQ ID NO：3-huMov19 vHC CDR3 YDGSRAMDY
SEQ ID NO：4-huMov19 vHC
SEQ ID NO：5-huMov19 vHC核酸序列
SEQ ID NO：6-huMov19 HC胺基酸序列
SEQ ID NO：7-huMov19 vLC CDR1 KASQSVSFAGTSLMH
SEQ ID NO：8-huMov19 vLC CDR2 RASNLEA
SEQ ID NO：9-huMov19 vLC CDR3 QQSREYPYT
SEQ ID NO：10-huMov19 vLCv1.00
SEQ ID NO：11-huMov19 vLCv1.60
SEQ ID NO：12-huMov19 LCv1.00
SEQ ID NO：13-huMov19 LCv1.60
SEQ ID NO：14-huMov19 LCv1.00核酸
SEQ ID NO：15-huMov19 LCv1.60核酸
SEQ ID NO：16-muMov19 vHC CDR2 RIHPYDGDTFYNQNFKD
SEQ ID NO：17-muMov19 vHC_CAA68252
SEQ ID NO：18-muMov19 vLC_CAA68253
SEQ ID NO：19-chMov19 HC
SEQ ID NO：20-chMov19 LC
SEQ ID NO：21-chMov19 HC核酸
SEQ ID NO：22-chMov19 LC核酸
SEQ ID NO：23-muMov19 vHC_CAA68252
SEQ ID NO：24-muMov19 vLC_CAA68253
SEQ ID NO：25-人類葉酸受體1
SEQ ID NO：26-人類葉酸受體1核酸序列
SEQ ID NO：27-FR1-21 vLC CDR1 KASDHINNWLA
SEQ ID NO：28-FR1-21 vLC CDR2 GATSLET
SEQ ID NO：29-FR1-21 vLC CDR3 QQYWSTPFT
SEQ ID NO：30-FR1-21 vHC CDR1 SSYGMS
SEQ ID NO：31-FR1-21 vHC CDR2 TISSGGSYTY
SEQ ID NO：32-FR1-21 vHC CDR3 DGEGGLYAMDY
SEQ ID NO：33-FR1-21 Kabat鼠類CDR-H2 TISSGGSYTYYPDGVKG
SEQ ID NO：34-FR1-21 Kabat人類CDR-H2 TISSGGSYTYYSPGFQG
SEQ ID NO：35-muFR1-21 vLC
SEQ ID NO：36-muFR1-21 vHC
SEQ ID NO：37-muFR1-21 vLC DNA序列
SEQ ID NO：38-muFR1-21HCvarPat
SEQ ID NO：39-muFR1-21 LC
SEQ ID NO：40-muFR1-21 HC
SEQ ID NO：41-huFR1-21 vLC
SEQ ID NO：42-huFR1-21 vHC
SEQ ID NO：43-huFR1-21VH_co
SEQ ID NO：44-huFR21VL_co
SEQ ID NO：45-huFR1-21 LC
SEQ ID NO：46-huFR1-21 HC
SEQ ID NO：47-huFR1-21LC DNA序列
SEQ ID NO：48-huFR1-21HC DNA序列
SEQ ID NO：49-huFolR1 DNA序列EcoRI到Xba1
SEQ ID NO：50-引子EcoMH1 CTTCCGGAATTCSARGTNMAGCTGSAGSAGTC
SEQ ID NO：51-引子EcoMH2 CTTCCGGAATTCSARGTNMAGCTGSAGSAGTCWGG
SEQ ID NO：52-引子BamIgG1 GGAGGATCCATAGACAGATGGGGGTGTCGTTTTGGC
SEQ ID NO：53-SacIMK GGAGCTCGAYATTGTGMTSACMCARWCTMCA
SEQ ID NO：54-HindKL TATAGAGCTCAAGCTTGGATGGTGGGAAGATGGATACAGTTGGTGC
混合的鹼基定義如下：N=G+A+T+C,S=G+C,Y=C+T,M=A+C,R=A+G,W=A+T
SEQ ID NO：55-cd37-1LClead ttttgaattcgccaccatgaagtttccttctcaacttct
SEQ ID NO：56-人類與嵌合Mov19 vHC CDR2複合物RIHPYDGDTFYNQXaa1FXaa2Xaa3 Xaa1=Q,H,K，或R Xaa2=R,Q,H，或N Xaa3=E,T,S,G,A，或V
SEQ ID NO：57-FR1-48vL CDR1 RASENIYSNLA
SEQ ID NO：58-FR1-48vL CDR2 AATNLAD
SEQ ID NO：59-FR1-48vL CDR3 QHFWASPYT
SEQ ID NO：60-FR1-48vH CDR1 TNYWMQ
SEQ ID NO：61-FR1-48vH CDR2 AIYPGNGDSR
SEQ ID NO：62-FR1-48vH CDR3 RDGNYAAY
SEQ ID NO：63-FR1-49vL CDR1 RASENIYTNLA
SEQ ID NO：64-FR1-49vL CDR2 TASNLAD
SEQ ID NO：65-FR1-49vL CDR3 QHFWVSPYT
SEQ ID NO：66-FR1-49vH CDR1 TNYWMY
SEQ ID NO：67-FR1-49vH CDR2 AIYPGNSDTT
SEQ ID NO：68-FR1-49vH CDR3 RHDYGAMDY
SEQ ID NO：69-FR1-57vL CDR1 RASQNINNNLH
SEQ ID NO：70-FR1-57vL CDR2 YVSQSVS
SEQ ID NO：71-FR1-57vL CDR3 QQSNSWPHYT
SEQ ID NO：72-FR1-57vH CDR1 SSFGMH
SEQ ID NO：73-FR1-57vH CDR2 YISSGSSTIS
SEQ ID NO：74-FR1-57vH CDR3 EAYGSSMEY
SEQ ID NO：75-FR1-65vL CDR1 KASQNVGPNVA
SEQ ID NO：76-FR1-65vL CDR2 SASYRYS
SEQ ID NO：77-FR1-65vL CDR3 QQYNSYPYT
SEQ ID NO：78-FR1-65vH CDR1 TSYTMH
SEQ ID NO：79-FR1-65vH CDR2 YINPISGYTN
SEQ ID NO：80-FR1-65vH CDR3 GGAYGRKPMDY
SEQ ID NO：81-muFR1-48 Kabat定義的HC CDR2 AIYPGNGDSRYTQKFKG
SEQ ID NO：82-huFR1-48 Kabat定義的HC CDR2 AIYPGNGDSRYTQKFQG
SEQ ID NO：130-muFR1-49 Kabat定義的HC CDR2 AIYPGNSDTTYNLKFKG
SEQ ID NO：83-huFR1-49 Kabat定義的HC CDR2 AIYPGNSDTTYNQKFQG
SEQ ID NO：84-muFR1-57 Kabat定義的HC CDR2 YISSGSSTISYADTVKG
SEQ ID NO：85-huFR1-57 Kabat定義的HC CDR2 YISSGSSTISYADSVKG
SEQ ID NO：86-muFR1-65 Kabat定義的HC CDR2 YINPISGYTNYNQKFKD
SEQ ID NO：87-huFR1-65 Kabat定義的HC CDR2 YINPISGYTNYNQKFQG
SEQ ID NO：88-muFR1-48vL
SEQ ID NO：89-muFR1-48vH
SEQ ID NO：90-muFR1-49vL
SEQ ID NO：91-muFR1-49vH
SEQ ID NO：92-muFR1-57vL
SEQ ID NO：93-muFR1-57vH
SEQ ID NO：94-muFR1-65vL
SEQ ID NO：95-muFR1-65vH
SEQ ID NO：96-huFR1-48vL
SEQ ID NO：97-huFR1-48vH
SEQ ID NO：98-huFR1-49vL
SEQ ID NO：99-huFR1-49vH
SEQ ID NO：100-huFR1-57vL
SEQ ID NO：101-huFR1-57vH
SEQ ID NO：102-huFR1-65vL
SEQ ID NO：103-huFR1-65vH
SEQ ID NO：104-muFR1-48LC
SEQ ID NO：105-muFR1-48HC
SEQ ID NO：106-muFR1-49LC
SEQ ID NO：107-muFR1-49HC
SEQ ID NO：108-muFR1-57LC
SEQ ID NO：109-muFR1-57HC
SEQ ID NO：110-muFR1-65LC
SEQ ID NO：111-muFR1-65HC
SEQ ID NO：112-huFR1-48LC
SEQ ID NO：113-huFR1-48HC
SEQ ID NO：114-huFR1-49LC
SEQ ID NO：115-huFR1-49HC
SEQ ID NO：116-huFR1-57LC
SEQ ID NO：117-huFR1-57HC
SEQ ID NO：118-huFR1-65LC
SEQ ID NO：119-huFR1-65HC
SEQ ID NO：120-huFR1-48_VL
SEQ ID NO：121-huFR1-48_VH
SEQ ID NO：122-huFR1-49_VL
SEQ ID NO：123-huFR1-49_VH
SEQ ID NO：124-huFR1-57_VL
SEQ ID NO：125-huFR1-57_VH
SEQ ID NO：126-huFR1-65_VL
SEQ ID NO：127-huFR1-65_VH
SEQ ID NO：128-Kabat定義的Mov19 HC CDR2鼠類RIHPYDGDTFYNQNFKD
SEQ ID NO：129-Kabat定義的Mov19 HC CDR2人類RIHPYDGDTFYNQKFQG
<110> 免疫遺傳股份有限公司(ImmunoGen,Inc.)
<120> 葉酸受體1抗體類和免疫共軛物類及彼等之用途
<140>
<141> 2011-02-24
<150> US 61/413,172
<151> 2010-11-12
<150> US 61/346,595
<151> 2010-05-20
<150> US 61/307,797
<151> 2010-02-24
<160> 131
<170> PatentIn版本3.5
<210> 1
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vHC CDR1
<400> 1
<210> 2
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vHC CDR2
<400> 2
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<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vHC CDR3
<400> 3
<210> 4
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vHC
<400> 4
<210> 5
<211> 440
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vHC核酸序列
<400> 5
<210> 6
<211> 448
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 HC胺基酸序列
<400> 6
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<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vLC CDR1
<400> 7
<210> 8
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vLC CDR2
<400> 8
<210> 9
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vLC CDR3
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<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vLCv1.00
<400> 10
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<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 vLCv1.60
<400> 11
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<211> 218
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 LCv1.00
<400> 12
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<211> 218
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 LCv1.60
<400> 13
<210> 14
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 LCv1.00核酸
<400> 14
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<211> 408
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> huMov19 LCv1.60核酸
<400> 15
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<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muMov19 vHC CDR2
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<210> 17
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
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<211> 441
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
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<400> 21
<210> 22
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> chMov19 LC核酸
<400> 22
<210> 23
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muMov19 vHC_CAA68252
<400> 23
<210> 24
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muMov19 vLC_CAA68253
<400> 24
<210> 25
<211> 257
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_特徵
<222> (1)..(257)
<400> 25
<210> 26
<211> 771
<212> DNA
<213> 智人
<220>
<221> misc_特徵
<222> (1)..(771)
<400> 26
<210> 27
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-21 vLC CDR1
<400> 27
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<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-21 vLC CDR2
<400> 28
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<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-21 vLC CDR3
<400> 29
<210> 30
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-21 vHC CDR1
<400> 30
<210> 31
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-21 vHC CDR2
<400> 31
<210> 32
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-21 vHC CDR3
<400> 32
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-21 Kabat鼠CDR-H2
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<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-21 Kabat人CDR-H2
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-21 vLC
<400> 35
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-21 vHC
<400> 36
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<211> 323
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-21 vLC DNA序列
<400> 37
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-21HCvarPat
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-21 LC
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-21 HC
<400> 40
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-21 vLC
<400> 41
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<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-21 vHC
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
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<400> 43
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR21VL_co
<400> 44
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-21 LC
<400> 45
<210> 46
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-21 HC
<400> 46
<210> 47
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-21LC DNA序列
<400> 47
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<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-21HC DNA序列
<400> 48
<210> 49
<211> 792
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> huFolR1 DNA序列EcoRI至Xba1
<400> 49
<210> 50
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子EcoMH1
<220>
<221> misc_特徵
<222> (13)..(13)
<223> s係g或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (15)..(15)
<223> r係a或g
<220>
<221> misc_特徵
<222> (18)..(18)
<223> n係g,a,t或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (19)..(19)
<223> m係a或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (25)..(25)
<223> s係g或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (28)..(28)
<223> s係g或c
<400> 50
<210> 51
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子EcoMH2
<220>
<221> misc_特徵
<222> (13)..(13)
<223> s係g或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (15)..(15)
<223> r係a或g
<220>
<221> misc_特徵
<222> (18)..(18)
<223> n係g,a,t或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (19)..(19)
<223> m係a或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (25)..(25)
<223> s係g或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (28)..(28)
<223> s係g或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (33)..(33)
<223> w係a或t
<400> 51
<210> 52
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子BamIgG1
<400> 52
<210> 53
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> SacIMK
<220>
<221> misc_特徵
<222> (10)..(10)
<223> y係c或t
<220>
<221> misc_特徵
<222> (17)..(17)
<223> m係a或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (19)..(19)
<223> s係g或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (22)..(22)
<223> m係a或c
<220>
<221> misc_特徵
<222> (25)..(25)
<223> r係a或g
<220>
<221> misc_特徵
<222> (26)..(26)
<223> w係a或t
<220>
<221> misc_特徵
<222> (29)..(29)
<223> m係a或c
<400> 53
<210> 54
<211> 46
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HindKL
<400> 54
<210> 55
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> cd37-1LClead
<400> 55
<210> 56
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人和嵌合型Mov19 vHC CDR2複合物
<220>
<221> MISC_特徵
<222> (14)..(14)
<223> Xaa可為Gln,His,Lys或Arg
<220>
<221> MISC_特徵
<222> (16)..(16)
<223> Xaa可為Arg,Gln,His或Asn
<220>
<221> MISC_特徵
<222> (17)..(17)
<223> Xaa可為Glu,Thr,Ser,Gly,Ala或Val
<400> 56
<210> 57
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-48vL CDR1
<400> 57
<210> 58
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-48vL CDR2
<400> 58
<210> 59
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-48vL CDR3
<400> 59
<210> 60
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-48vH CDR1
<400> 60
<210> 61
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-48vH CDR2
<400> 61
<210> 62
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-48vH CDR3
<400> 62
<210> 63
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-49vL CDR1
<400> 63
<210> 64
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-49vL CDR2
<400> 64
<210> 65
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-49vL CDR3
<400> 65
<210> 66
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-49vH CDR1
<400> 66
<210> 67
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-49vH CDR2
<400> 67
<210> 68
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-49vH CDR3
<400> 68
<210> 69
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-57vL CDR1
<400> 69
<210> 70
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-57vL CDR2
<400> 70
<210> 71
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-57vL CDR3
<400> 71
<210> 72
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-57vH CDR1
<400> 72
<210> 73
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-57vH CDR2
<400> 73
<210> 74
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-57vH CDR3
<400> 74
<210> 75
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-65vL CDR1
<400> 75
<210> 76
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-65vL CDR2
<400> 76
<210> 77
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-65vL CDR3
<400> 77
<210> 78
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-65vH CDR1
<400> 78
<210> 79
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-65vH CDR2
<400> 79
<210> 80
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> FR1-65vH CDR3
<400> 80
<210> 81
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-48 Kabat定義之HC CDR2
<400> 81
<210> 82
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-48 Kabat定義之HC CDR2
<400> 82
<210> 83
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-49 Kabat定義之HC CDR2
<400> 83
<210> 84
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-57 Kabat定義之HC CDR2
<400> 84
<210> 85
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-57 Kabat定義之HC CDR2
<400> 85
<210> 86
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-65 Kabat定義之HC CDR2
<400> 86
<210> 87
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> huFR1-65 Kabat定義之HC CDR2
<400> 87
<210> 88
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-48vL
<400> 88
<210> 89
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-48vH
<400> 89
<210> 90
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-49vL
<400> 90
<210> 91
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-49vH
<400> 91
<210> 92
<211> 109
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-57vL
<400> 92
<210> 93
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-57vH
<400> 93
<210> 94
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-65vL
<400> 94
<210> 95
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> muFR1-65vH
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<210> 96
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<223> Kabat定義之Mov19 HC CDR2鼠
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<223> Kabat定義之Mov19 HC CDR2人
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<212> PRT
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<223> muFR1-49 Kabat定義之HC CDR2
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<212> PRT
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<223> huMov19 vHC CDR2
<400> 131

Claims (40)

  1. 一種與人類葉酸受體1專一性結合之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體或其抗原結合片段包含：(a)包含SSFGMH(SEQ ID NO：72)之重鏈CDR1；包含YISSGSSTIS(SEQ ID NO：73)之重鏈CDR2；及，包含EAYGSSMEY(SEQ ID NO：74)之重鏈CDR3；及(b)包含RASQNINNNLH(SEQ ID NO：69)之輕鏈CDR1；包含YVSQSVS(SEQ ID NO：70)之輕鏈CDR2；及，包含QQSNSWPHYT(SEQ ID NO：71)之輕鏈CDR3。
  2. 如申請專利範圍第1項之抗體或其抗原結合片段，其中該重鏈CDR2包含YISSGSSTISYADSVKG(SEQ ID NO：85)。
  3. 如申請專利範圍第2項之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO：101之重鏈變異區和SEQ ID NO：100之輕鏈變異區。
  4. 如申請專利範圍第3項之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體包含SEQ ID NO：117之重鏈和SEQ ID NO：116之輕鏈。
  5. 如申請專利範圍第1項之抗體或其抗原結合片段，其中該重鏈CDR2包含YISSGSSTISYADTVKG(SEQ ID NO：84)。
  6. 如申請專利範圍第5項之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO：93之重鏈變異區和SEQ ID NO：92之輕鏈變異區。
  7. 如申請專利範圍第6項之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體包含SEQ ID NO：109之重鏈和SEQ ID NO：108之輕鏈。
  8. 如申請專利範圍第1至7項中任一項之抗體或其抗原結合片段，其係全長抗體。
  9. 如申請專利範圍第1至3、5及6項中任一項之抗體或其抗原結合片段，其係抗原結合片段。
  10. 如申請專利範圍第9項之抗體或其抗原結合片段，其中該抗原結合片段包含Fab、Fab’、F(ab’)2、單鏈Fv或scFv、雙硫化物鍵聯的Fv、內抗體、IgG-CH2、微抗體、F(ab’)3、四鏈體、三鏈體、雙鏈體、DVD-Ig、mAb2、(scFv)2或scFv-Fc。
  11. 如申請專利範圍第1至7項中任一項之抗體或其抗原結合片段，其係以1.0至10nM之Kd與人類葉酸受體1結合。
  12. 如申請專利範圍第1至7項中任一項之抗體或其抗原結合片段，其係以0.07nM至1.0nM之Kd與人類葉酸受體1結合。
  13. 一種具有式(A)-(L)-(C)或(C)-(L)-(A)之免疫共軛物，其中：(A)係如申請專利範圍第1至12項中任一項之抗體或其抗原結合片段；(L)係連接子；且(C)係細胞毒性劑，其中該連接子(L)使(A)與(C)連接。
  14. 如申請專利範圍第13項之免疫共軛物，其中該連接子選自：不可裂解連接子、親水性連接子及二羧酸為基底的連接子。
  15. 如申請專利範圍第13項之免疫共軛物，其中該連接子係可裂解連接子。
  16. 如申請專利範圍第13項之免疫共軛物，其中該連接子選自：4-(2-吡啶基二硫基)戊酸N-琥珀醯亞胺酯(SPP)、4-(2-吡啶基二硫基)-2-磺酸基戊酸N-琥珀醯亞胺酯(磺酸基-SPP)、4-(2-吡啶基二硫基)丁酸N-琥珀醯亞胺酯(SPDB)、4-(2-吡啶基二硫基)-2-磺酸基丁酸N-琥珀醯亞胺酯(磺酸基-SPDB)、4-(馬來醯亞胺基甲基)環己烷羧酸N-琥珀醯亞胺酯(SMCC)、4-(馬來醯亞胺基甲基)環己烷羧酸N-磺酸基琥珀醯亞胺酯(磺酸基-SMCC)、4-(碘乙醯基)-胺基苯甲酸N-琥珀醯亞胺酯(SIBA)及N-琥珀醯亞胺基-[(N-馬來醯亞胺基丙醯胺基)-四乙二醇]酯(NHS-PEG4-馬來醯亞胺)。
  17. 如申請專利範圍第16項之免疫共軛物，其中該連接子係N-琥珀醯亞胺基-[(N-馬來醯亞胺基丙醯胺基)-四乙二醇]酯(NHS-PEG4-馬來醯亞胺)。
  18. 如申請專利範圍第16項之免疫共軛物，其中該連接子係4-(2-吡啶基二硫基)丁酸N-琥珀醯亞胺酯(SPDB)或4-(2-吡啶基二硫基)-2-磺酸基丁酸N-琥珀醯亞胺酯(磺酸基-SPDB)。
  19. 如申請專利範圍第16項之免疫共軛物，其中該連接子係4-(馬來醯亞胺基甲基)環己烷羧酸N-琥珀醯亞胺酯(SMCC)。
  20. 如申請專利範圍第13至19項中任一項之免疫共軛物，其中該細胞毒性劑(C)選自：美登素衍生物、美登素衍生物類似物、苯并二氮呯、類紫杉醇、CC-1065、CC-1065類似物、倍癌黴素、倍癌黴素類似物、加利車黴素、多拉司他汀、多拉司他汀類似物、奧利斯汀(auristatin)、托美黴素(tomaymycin)衍生物及細黴素衍生物以及該劑之前藥。
  21. 如申請專利範圍第20項之免疫共軛物，其中該細胞毒性劑係美登素衍生物。
  22. 如申請專利範圍第21項之免疫共軛物，其中該細胞毒性劑係N(2’)-去乙醯-N(2’)-(3-巰基-1-側氧基丙基)-美登素(DM1)或N(2’)-去乙醯-N(2’)-(4-巰基-4-甲基-1-側氧基戊基)-美登素(DM4)。
  23. 如申請專利範圍第13項之免疫共軛物，其中該(A)抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO：101之重鏈變異區和SEQ ID NO：100之輕鏈變異區，該(L)連接子係N-琥珀醯亞胺基-[(N-馬來醯亞胺基丙醯胺基)-四乙二醇]酯(NHS-PEG4-馬來醯亞胺)，且該(C)細胞毒性劑係N(2’)-去乙醯-N(2’)-(4-巰基-4-甲基-1-側氧基戊基)-美登素(DM4)。
  24. 如申請專利範圍第13項之免疫共軛物，其中該(A)抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO：101之重鏈變異區和SEQ ID NO：100之輕鏈變異區，該(L)連接子係4-(2-吡啶基二硫基)丁酸N-琥珀醯亞胺酯(SPDB)，且該(C)細胞毒性劑係N(2’)-去乙醯-N(2’)-(4-巰基-4-甲基-1-側氧基戊基)-美登素(DM4)。
  25. 如申請專利範圍第13項之免疫共軛物，其中該(A)抗體或其抗原結合片段包含SEQ ID NO：101之重鏈變異區和SEQ ID NO：100之輕鏈變異區，該(L)連接子係4-(2-吡啶基二硫基)-2-磺酸基丁酸N-琥珀醯亞胺酯(磺酸基-SPDB)，且該(C)細胞毒性劑係N(2’)-去乙醯-N(2’)-(4-巰基-4-甲基-1-側氧基戊基)-美登素(DM4)。
  26. 如申請專利範圍第13項之免疫共軛物，其進一步包含2至6個(C)。
  27. 一種經分離之多核苷酸，其包含編碼如申請專利範圍第1至12項中任一項之抗體或其抗原結合片段之多核苷酸。
  28. 一種細胞，其包含如申請專利範圍第27項之多核苷酸。
  29. 一種診斷試劑，其包含如申請專利範圍第1至12項中任一項之抗體或其抗原結合片段或如申請專利範圍第13至26項中任一項之免疫共軛物。
  30. 如申請專利範圍第29項之診斷試劑，其進一步包含標記。
  31. 如申請專利範圍第30項之診斷試劑，其中該標記選自：放射性標記、螢光團、發色團、造影劑及金屬離子。
  32. 一種醫藥組成物，其包含如申請專利範圍第1至12項中任一項之抗體或其抗原結合片段或如申請專利範圍第13至26項中任一項之免疫共軛物及藥學上可接受之載體。
  33. 如申請專利範圍第32項之醫藥組成物，其中該免疫共軛物具有每個(A)平均3至4個(C)。
  34. 一種如申請專利範圍第1至12項中任一項之抗體或其抗原結合片段、如申請專利範圍第13至26項中任一項之免疫共軛物或如申請專利範圍第32或33項之醫藥組成物於製造供治療癌症的藥物之用途。
  35. 如申請專利範圍第34項之用途，其中該癌症選自：卵巢癌、腦癌、乳癌、子宮癌、子宮內膜癌、胰臟癌、腎臟癌及肺癌。
  36. 如申請專利範圍第35項之用途，其中該癌症係卵巢癌。
  37. 如申請專利範圍第35項之用途，其中該癌症係肺癌。
  38. 如申請專利範圍第35項之用途，其中該癌症係子宮內膜癌。
  39. 如申請專利範圍第35項之用途，其中該癌症係子宮癌。
  40. 如申請專利範圍第34項之用途，其中該癌症係腹膜癌。
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