RU2018101710A - Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты - Google Patents

Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты Download PDF

Info

Publication number
RU2018101710A
RU2018101710A RU2018101710A RU2018101710A RU2018101710A RU 2018101710 A RU2018101710 A RU 2018101710A RU 2018101710 A RU2018101710 A RU 2018101710A RU 2018101710 A RU2018101710 A RU 2018101710A RU 2018101710 A RU2018101710 A RU 2018101710A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
protein
crispr
cell
modification
paragraphs
Prior art date
Application number
RU2018101710A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2752834C2 (ru
RU2018101710A3 (ru
Inventor
Фэн ЧЖАН
Лини ГАО
Бернд ЦЕТЧЕ
Йан СЛЕЙМЕЙКЕР
Original Assignee
Те Брод Инститьют, Инк.
Массачусетс Инститьют Оф Текнолоджи
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Те Брод Инститьют, Инк., Массачусетс Инститьют Оф Текнолоджи filed Critical Те Брод Инститьют, Инк.
Publication of RU2018101710A publication Critical patent/RU2018101710A/ru
Publication of RU2018101710A3 publication Critical patent/RU2018101710A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2752834C2 publication Critical patent/RU2752834C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/36—Adaptation or attenuation of cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/111—General methods applicable to biologically active non-coding nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • G—PHYSICS
    • G09—EDUCATION; CRYPTOGRAPHY; DISPLAY; ADVERTISING; SEALS
    • G09B—EDUCATIONAL OR DEMONSTRATION APPLIANCES; APPLIANCES FOR TEACHING, OR COMMUNICATING WITH, THE BLIND, DEAF OR MUTE; MODELS; PLANETARIA; GLOBES; MAPS; DIAGRAMS
    • G09B23/00—Models for scientific, medical, or mathematical purposes, e.g. full-sized devices for demonstration purposes
    • G09B23/28—Models for scientific, medical, or mathematical purposes, e.g. full-sized devices for demonstration purposes for medicine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/09—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a nuclear localisation signal
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPRs]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Educational Technology (AREA)
  • Algebra (AREA)
  • Computational Mathematics (AREA)
  • Mathematical Optimization (AREA)
  • Mathematical Physics (AREA)
  • Pure & Applied Mathematics (AREA)
  • Business, Economics & Management (AREA)
  • Educational Administration (AREA)
  • Mathematical Analysis (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Bakery Products And Manufacturing Methods Therefor (AREA)

Claims (112)

1. Сконструированный белок CRISPR, где:
белок объединяется в комплекс с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, с образованием комплекса CRISPR,
где, находясь в комплексе CRISPR, молекула нуклеиновой кислоты нацеливается на один или несколько целевых полинуклеотидных локусов,
причем белок содержит по меньшей мере одну модификацию по сравнению с немодифицированным белком,
где комплекс CRISPR, содержащий модифицированный белок, характеризуется измененной активностью по сравнению с комплексом, содержащим немодифицированный белок.
2. Сконструированный белок CRISPR по п. 1, где измененная активность предусматривает измененное свойство связывания в отношении молекулы нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или целевых полинуклеотидных локусов, измененную кинетику связывания в отношении молекулы нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или целевых полинуклеотидных локусов, или измененную специфичность связывания в отношении молекулы нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или целевых полинуклеотидных локусов по сравнению с нецелевыми полинуклеотидными локусами.
3. Сконструированный белок CRISPR по п. 1 или 2, где измененная активность предусматривает повышенную эффективность нацеливания или сниженное нецелевое связывание.
4. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 1-3, где измененная активность предусматривает модифицированную активность расщепления.
5. Сконструированный белок CRISPR по п. 4, где модифицированная активность расщепления предусматривает повышенную активность расщепления в отношении целевых полинуклеотидных локусов.
6. Сконструированный белок CRISPR по п. 4, где модифицированная активность расщепления предусматривает сниженную активность расщепления в отношении целевых полинуклеотидных локусов.
7. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 4-6, где модифицированная активность расщепления предусматривает сниженную активность расщепления в отношении нецелевых полинуклеотидных локусов.
8. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 4-6, где модифицированная активность расщепления предусматривает повышенную активность расщепления в отношении нецелевых полинуклеотидных локусов.
9. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где измененная активность предусматривает измененные кинетические свойства хеликазы.
10. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где модифицированный белок CRISPR содержит модификацию, которая изменяет связывание белка с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
11. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где модифицированный белок CRISPR содержит модификацию, которая изменяет образование комплекса CRISPR.
12. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где модифицированный белок CRISPR содержит модификацию, которая изменяет нацеливание молекулы нуклеиновой кислоты на полинуклеотидные локусы.
13. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-12, где модификация предусматривает мутацию в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты.
14. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-12, где модификация предусматривает мутацию в участке белка, который связывается с нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы.
15. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-12, где модификация предусматривает мутацию в участке белка, который связывается с нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
16. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-15, где модификация или мутация предусматривают сниженный положительный заряд в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
17. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-15, где модификация или мутация предусматривают сниженный отрицательный заряд в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
18. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-15, где модификация или мутация предусматривают повышенный положительный заряд в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
19. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-15, где модификация или мутация предусматривают повышенный отрицательный заряд в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
20. Cконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация повышают стерическое несоответствие между белком и молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
21. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают замену Lys, His, Arg, Glu, Asp, Ser, Gly или Thr.
22. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают замену на Gly, Ala, Ile, Glu или Asp.
23. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают аминокислотную замену в связывающей бороздке.
24. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где связывающая бороздка находится между доменами RuvC и HNH.
25. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают мутацию в домене RuvCI, RuvCIII, RuvCIII или HNH.
26. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают аминокислотную замену в одном или нескольких из положений 12, 13, 63, 415, 610, 775, 779, 780, 810, 832, 848, 855, 861, 862, 866, 961, 968, 974, 976, 982, 983, 1000, 1003, 1014, 1047, 1060, 1107, 1108, 1109, 1114, 1129, 1240, 1289, 1296, 1297, 1300, 1311 и 1325 в соответствии с нумерацией аминокислотных положений SpCas9.
27. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 63, 415, 775, 779, 780, 810, 832, 848, 855, 861, 862, 866, 961, 968, 974, 976, 982, 983, 1000, 1003, 1014, 1047, 1060, 1107, 1108, 1109, 1114, 1129, 1240, 1289, 1296, 1297, 1300, 1311 или 1325 предусматривают замену на аланин.
28. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 12 предусматривают замену на аспарагиновую кислоту.
29. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 13 предусматривают замену на изолейцин.
30. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 610 предусматривают замену на глицин.
31. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 799 предусматривают замену на лейцин.
32. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 1129 предусматривают замену на глутаминовую кислоту.
33. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация предусматривают K775A, E779L, Q807A, R780A, K810A, R832A, K848A, K855A, K862A, K961A, K968A, K974A, R976A, H983A, K1000A, K1014A, K1047A, K1060A, K1003A, S1109A, H1240A, K1289A, K1296A, H1297A, K1300A, H1311A или K1325A.
33. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация предусматривают R783A и A1322T, или R780A и K810A, или R780A и K855A, или R780A и R976A, или K848A и R976A, или K855A и R976A, или R780A и K848A, или K810A и K848A, или K848A и K855A, или K810A и K855A, или H982A и R1060A, или H982A и R1003A, или K1003A и R1060A, или R780A и H982A, или K810A и H982A, или K848A и H982A, или K855A и H982A, или R780A и K1003A, или K810A и R1003A, или K848A и K1003A, или K848A и K1007A, или R780A и R1060A, или K810A и R1060A, или K848A и R1060A, или R780A и R1114A, или K848A и R1114A, или R63A и K855A, или R63A и H982A, или H415A и R780A, или H415A и K848A, или K848A и E1108A, или K810A и K1003A, или R780A и R1060A, или K810A и R1060A, или K848A и R1060A.
35. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация предусматривают H982A, K1003A и K1129E, или R780A, K1003A и R1060A, или K810A, K1003A и R1060A, или K848A, K1003A и R1060A, или K855A, K1003A и R1060A, или H982A, K1003A и R1060A, или R63A, K848A и R1060A, или T13I, R63A и K810A, или G12D, R63A и R1060A.
36. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация предусматривают R63A, E610G, K855A и R1060A, или R63A, K855A, R1060A и E610G.
37. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок предусматривает белок CRISPR II типа.
38. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR предусматривает белок CRISPR от организма из рода, включающего Streptococcus, Campylobacter, Nitratifractor, Staphylococcus, Parvibaculum, Roseburia, Neisseria, Gluconacetobacter, Azospirillum, Sphaerochaeta, Lactobacillus, Eubacterium или Corynebacter.
39. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок предусматривает белок Cas9.
40. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR предусматривает химерный белок Cas9, содержащий первый фрагмент от первого ортолога Cas9 и второй фрагмент от второго ортолога Cas9, и при этом первый и второй ортологи Cas9 являются различными.
41. Сконструированный белок CRISPR по п. 40, где по меньшей мере один из первого и второго ортологов Cas9 предусматривает Cas9 от организма, включающего Streptococcus, Campylobacter, Nitratifractor, Staphylococcus, Parvibaculum, Roseburia, Neisseria, Gluconacetobacter, Azospirillum, Sphaerochaeta, Lactobacillus, Eubacterium или Corynebacter.
42. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR содержит один или несколько доменов, представляющих собой сигнал ядерной локализации (NLS).
43. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR содержит по меньшей мере два или более NLS.
44. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR содержит один или несколько гетерологичных функциональных доменов.
45. Сконструированный белок CRISPR по п. 44, где один или несколько гетерологичных функциональных доменов предусматривают один или несколько доменов активации транскрипции.
46. Сконструированный белок CRISPR по п. 45, где домен активации транскрипции предусматривает VP64.
47. Сконструированный белок CRISPR по п. 44, где один или несколько гетерологичных функциональных доменов предусматривают один или несколько доменов репрессии транскрипции.
48. Сконструированный белок CRISPR по п. 47, где домен репрессии транскрипции предусматривает домен KRAB или домен SID.
49. Сконструированный белок CRISPR по п. 44, где один или несколько гетерологичных функциональных доменов предусматривают один или несколько нуклеазных доменов.
50. Сконструированный белок CRISPR по п. 49, где нуклеазный домен предусматривает Fok1.
51. Сконструированный белок CRISPR по п. 44, где один или несколько гетерологичных функциональных доменов характеризуются одной или несколькими из следующих видов активности: метилазной активностью, деметилазной активностью, активностью в отношении активации транскрипции, активностью в отношении репрессии транскрипции, активностью фактора освобождения транскрипта, активностью в отношении модификации гистонов, нуклеазной активностью, активностью расщепления однонитевой РНК, активностью расщепления двухнитевой РНК, активностью расщепления однонитевой ДНК, активностью расщепления двухнитевой ДНК и активностью связывания нуклеиновой кислоты.
52. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR кодируется нуклеотидной последовательностью, которая является кодон-оптимизированной для экспрессии в эукариотическом организме.
53. Композиция, содержащая сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов.
54. Система, содержащая сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов и молекулу нуклеиновой кислоты, предусматривающую РНК.
55. Векторная система, содержащая один или несколько векторов, где один или несколько векторов содержат:
a) первый регуляторный элемент, функционально связанный с нуклеотидной последовательностью, кодирующей сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов; и
b) второй регуляторный элемент, функционально связанный с одной или несколькими нуклеотидными последовательностями, кодирующими одну или несколько молекул нуклеиновой кислоты, предусматривающих направляющую РНК, содержащую направляющую последовательность, tracr-последовательность и парную tracr-последовательность, где компоненты (a) и (b) находятся в одном и том же или в разных векторах.
56. Выделенная эукариотическая клетка, содержащая систему по п. 54 или 55.
57. Способ модулирования экспрессии гена, где способ включает введение сконструированного белка CRISPR или системы по любому из предыдущих пунктов в клетку.
58. Способ по п. 59, где клетка является эукариотической или прокариотической клеткой.
59. Способ по п. 59, где способ осуществляют ex vivo или in vitro.
60. Способ лечения заболевания, нарушения или инфекции у индивидуума, нуждающегося в этом, включающий введение эффективного количества сконструированного белка CRISPR или композиции по любому из предыдущих пунктов.
61. Способ изменения экспрессии представляющего интерес локуса генома в клетке млекопитающего, включающий
приведение клетки в контакт с композицией по любому из пп. 1-55, и за счет чего осуществляется доставка вектора и обеспечивается образование комплекса CRISPR-Cas и его связывание с мишенью, и
определение того, была ли изменена экспрессия локуса генома.
62. Способ по п. 6, который предусматривает обеспечение расщепления геномной ДНК, что приводит в результате к сниженной транскрипции гена.
63. Способ по п. 6, где изменение экспрессии предусматривает редактирование генома.
64. Способ по п. 6, где изменение экспрессии предусматривает повышение экспрессии продукта гена.
65. Способ по п. 6, где изменение экспрессии предусматривает модификацию продукта гена.
66. Выделенная клетка, характеризующаяся экспрессией локуса генома, измененной в результате осуществления способа по любому из пп. 6-10, где экспрессия является измененной в сравнении с клеткой, в отношении которой не осуществляли способ изменения экспрессии локуса генома.
67. Выделенная линия клеток, полученная исходя из клетки по п. 11.
68. Способ модифицирования представляющего интерес целевого локуса, причем способ включает доставку в указанный локус не встречающейся в природе или сконструированной композиции, содержащей белок Cas9 по любому из пп. 1-52 и один или несколько компонентов на основе нуклеиновой кислоты, где белок Cas9 образует комплекс с одним или несколькими компонентами на основе нуклеиновой кислоты, и после связывания комплекса с представляющим интерес целевым локусом белок Cas9 индуцирует модификацию представляющего интерес целевого локуса.
69. Способ по п. 13, где представляющий интерес целевой локус находится в клетке.
70. Способ по п. 14, где клетка является эукариотической клеткой.
71. Способ по п. 14, где клетка является клеткой животного или человека.
72. Способ по п. 14, где клетка является растительной клеткой.
73. Способ по п. 13, где представляющий интерес целевой локус содержится в молекуле ДНК in vitro.
74. Способ по любому из пп. 13-18, где указанную не встречающуюся в природе или сконструированную композицию, содержащую белок Cas9 и один или несколько компонентов на основе нуклеиновой кислоты, доставляют в клетку в виде одной или нескольких полинуклеотидных молекул.
75. Способ по любому из пп. 13-18, где белок Cas9 содержит один или несколько сигналов ядерной локализации (NLS).
76. Способ по любому из пп. 19-20, где одна или несколько полинуклеотидных молекул содержатся в одном или нескольких векторах.
77. Способ по любому из пп. 19-21, где одна или несколько полинуклеотидных молекул содержат один или несколько регуляторных элементов, функционально сконфигурированных для обеспечения экспрессии белка Cas9 и/или компонента(компонентов) на основе нуклеиновой кислоты, где один или несколько регуляторных элементов необязательно предусматривают индуцируемые промоторы.
78. Способ по любому из пп. 19-22, где одна или несколько полинуклеотидных молекул или один или несколько векторов содержатся в системе доставки.
79. Способ по любому из пп. 19-23, где систему или одну или несколько полинуклеотидных молекул доставляют посредством частиц, везикул или одного или нескольких вирусных векторов.
80. Способ по п.24, где частицы предусматривают липид, сахар, металл или белок.
81. Способ по п.24, где везикулы предусматривают экзосомы или липосомы.
82. Способ по п.24, где один или несколько вирусных векторов предусматривают одно или несколько из аденовируса, одного или нескольких лентивирусов или одного или нескольких аденоассоциированных вирусов.
83. Способ по любому из пп. 13-24, который представляет собой способ модифицирования клетки, линии клеток или организма путем манипуляции с одной или несколькими целевыми последовательностями в представляющих интерес локусах генома.
84. Клетка, полученная в результате осуществления способа по п.28, или ее потомство, где клетка содержит модификацию, не присутствующую в клетке, в отношении которой не осуществляли способ.
85. Клетка по п. 29 или ее потомство, где клетка, в отношении которой не осуществляли способ, содержит аномалию, а клетка, полученная в результате осуществления способа, характеризуется устраненной или скорректированной аномалией.
86. Продукт клетки, полученный из клетки или ее потомства по п.29, где продукт является модифицированным по своей природе или количеству по сравнению с продуктом клетки, полученным из клетки, в отношении которой не осуществляли способ.
87. Продукт клетки по п.31, где клетка, в отношении которой не осуществляли способ, содержит аномалию, и при этом продукт клетки отражает аномалию, которая устраняется или корректируется с помощью способа.
88. In vitro, ex vivo или in vivo клетка-хозяин или линия клеток или их потомство, содержащие систему, содержащую белок Cas9 по любому из пп. 1-52 и один или несколько компонентов на основе нуклеиновой кислоты, где белок Cas9 образует комплекс с одним или несколькими компонентами на основе нуклеиновой кислоты, и после связывания комплекса с представляющим интерес целевым локусом белок Cas9 индуцирует модификацию представляющего интерес целевого локуса.
89. Клетка-хозяин или линия клеток или их потомство по п.33, где клетка является эукариотической клеткой.
90. Клетка-хозяин или линия клеток или их потомство по п.34, где клетка является клеткой животного.
91. Клетка-хозяин или линия клеток или их потомство по п.34, где клетка является клеткой человека.
92. Клетка-хозяин, линия клеток или их потомство по п.34, предусматривающие стволовую клетку или линию стволовых клеток.
93. Клетка-хозяин или линия клеток или их потомство по п.34, где клетка является растительной клеткой.
94. Способ получения растения с модифицированным представляющим интерес признаком, кодируемым представляющим интерес геном, причем указанный способ включает приведение растительной клетки в контакт с системой по любому из пп. 54-55 или осуществление в отношении растительной клетки способа по любому из пп. 68-83, за счет чего обеспечивается либо модифицирование, либо введение указанного представляющего интерес гена, и регенерацию растения из указанной растительной клетки.
95. Способ идентификации представляющего интерес признака у растения, причем указанный представляющий интерес признак кодируется представляющим интерес геном, причем указанный способ включает приведение растительной клетки в контакт с системой по любому из пп. 54-55 или осуществление в отношении растительной клетки способа по любому из пп. 68-83, за счет чего обеспечивается идентификация указанного представляющего интерес гена.
96. Способ по п.40, дополнительно включающий введение идентифицированного представляющего интерес гена в растительную клетку, или линию растительных клеток, или растительную идиоплазму и получение из них растения, в результате чего растение содержит представляющий интерес ген.
97. Способ по п.41, где у растения проявляется представляющий интерес признак.
98. Частица, содержащая систему по любому из пп. 54-55.
99. Частица по п.43, где частица содержит белок Cas9 по любому из пп. 1-52, причем белок находится в комплексе с направляющей РНК.
100. Частица по п.43, где частица содержит eSpCas9(1.1) в комплексе с направляющей РНК.
101. Комплекс, молекула нуклеиновой кислоты, предусматривающая РНК, или белок по п. 1, где комплекс, молекула нуклеиновой кислоты, предусматривающая РНК, или белок конъюгированы по меньшей мере с одним сахарным фрагментом, необязательно N-ацетилгалактозамином (GalNAc), в частности, с трехразветвленным GalNAc.
102. Комплекс, компонент на основе нуклеиновой кислоты или белок по п. 68, где комплекс, компонент на основе нуклеиновой кислоты или белок конъюгированы по меньшей мере с одним сахарным фрагментом, необязательно N-ацетилгалактозамином (GalNAc), в частности, с трехразветвленным GalNAc.
103. Способ улучшения специфичности системы CRISPR путем обеспечения сконструированного белка CRISPR с модификацией по любому из пп. 1-36.
104. Применение сконструированного белка CRISPR для улучшения специфичности системы CRISPR, где белок CRISPR является модифицированным согласно любому из пп. 1-36.
RU2018101710A 2015-06-18 2016-06-17 Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты RU2752834C2 (ru)

Applications Claiming Priority (11)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562181453P 2015-06-18 2015-06-18
US62/181,453 2015-06-18
US201562207312P 2015-08-19 2015-08-19
US62/207,312 2015-08-19
US201562237360P 2015-10-05 2015-10-05
US62/237,360 2015-10-05
US201562255256P 2015-11-13 2015-11-13
US62/255,256 2015-11-13
US201562269876P 2015-12-18 2015-12-18
US62/269,876 2015-12-18
PCT/US2016/038034 WO2016205613A1 (en) 2015-06-18 2016-06-17 Crispr enzyme mutations reducing off-target effects

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2021120582A Division RU2021120582A (ru) 2015-06-18 2016-06-17 Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018101710A true RU2018101710A (ru) 2019-07-19
RU2018101710A3 RU2018101710A3 (ru) 2019-11-20
RU2752834C2 RU2752834C2 (ru) 2021-08-09

Family

ID=56345216

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2021120582A RU2021120582A (ru) 2015-06-18 2016-06-17 Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты
RU2018101710A RU2752834C2 (ru) 2015-06-18 2016-06-17 Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2021120582A RU2021120582A (ru) 2015-06-18 2016-06-17 Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты

Country Status (14)

Country Link
US (3) US10876100B2 (ru)
EP (2) EP3929287A3 (ru)
JP (3) JP7107683B2 (ru)
KR (2) KR102575342B1 (ru)
CN (2) CN108290933A (ru)
AU (2) AU2016280893B2 (ru)
CA (1) CA2989830A1 (ru)
IL (3) IL293323B2 (ru)
MX (2) MX2017016289A (ru)
RU (2) RU2021120582A (ru)
SG (1) SG10201912329YA (ru)
TW (2) TW202400626A (ru)
WO (1) WO2016205613A1 (ru)
ZA (1) ZA201708498B (ru)

Families Citing this family (163)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013066438A2 (en) 2011-07-22 2013-05-10 President And Fellows Of Harvard College Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity
US10704021B2 (en) 2012-03-15 2020-07-07 Flodesign Sonics, Inc. Acoustic perfusion devices
PT3494997T (pt) * 2012-07-25 2019-12-05 Massachusetts Inst Technology Proteínas de ligação a adn indutíveis e ferramentas de perturbação do genoma e aplicações destas
EP2931892B1 (en) 2012-12-12 2018-09-12 The Broad Institute, Inc. Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof
ES2658401T3 (es) 2012-12-12 2018-03-09 The Broad Institute, Inc. Suministro, modificación y optimización de sistemas, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias y aplicaciones terapéuticas
ES2777217T3 (es) 2013-06-17 2020-08-04 Broad Inst Inc Suministro, modificación y optimización de sistemas de guía en tándem, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias
EP3011034B1 (en) 2013-06-17 2019-08-07 The Broad Institute, Inc. Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components
WO2014204727A1 (en) 2013-06-17 2014-12-24 The Broad Institute Inc. Functional genomics using crispr-cas systems, compositions methods, screens and applications thereof
WO2014204725A1 (en) 2013-06-17 2014-12-24 The Broad Institute Inc. Optimized crispr-cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation
KR20160030187A (ko) 2013-06-17 2016-03-16 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 간의 표적화 및 치료를 위한 ＣＲＩＳＰＲ­Ｃａｓ 시스템, 벡터 및 조성물의 전달 및 용도
US9163284B2 (en) 2013-08-09 2015-10-20 President And Fellows Of Harvard College Methods for identifying a target site of a Cas9 nuclease
US9359599B2 (en) 2013-08-22 2016-06-07 President And Fellows Of Harvard College Engineered transcription activator-like effector (TALE) domains and uses thereof
US9228207B2 (en) 2013-09-06 2016-01-05 President And Fellows Of Harvard College Switchable gRNAs comprising aptamers
US9322037B2 (en) 2013-09-06 2016-04-26 President And Fellows Of Harvard College Cas9-FokI fusion proteins and uses thereof
US9526784B2 (en) 2013-09-06 2016-12-27 President And Fellows Of Harvard College Delivery system for functional nucleases
KR20160089527A (ko) 2013-12-12 2016-07-27 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 게놈 편집을 위한 ｃｒｉｓｐｒ-ｃａｓ 시스템 및 조성물의 전달, 용도 및 치료적 응용
WO2015089364A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 The Broad Institute Inc. Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof
WO2015089486A2 (en) 2013-12-12 2015-06-18 The Broad Institute Inc. Systems, methods and compositions for sequence manipulation with optimized functional crispr-cas systems
WO2015089354A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 The Broad Institute Inc. Compositions and methods of use of crispr-cas systems in nucleotide repeat disorders
US20150165054A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 President And Fellows Of Harvard College Methods for correcting caspase-9 point mutations
EP3092049A1 (en) 2014-01-08 2016-11-16 Flodesign Sonics Inc. Acoustophoresis device with dual acoustophoretic chamber
CN106164271B (zh) 2014-02-11 2020-06-02 科罗拉多州立大学董事会（法人团体） Crispr支持的多路基因组工程化
US10077453B2 (en) 2014-07-30 2018-09-18 President And Fellows Of Harvard College CAS9 proteins including ligand-dependent inteins
CA2963820A1 (en) 2014-11-07 2016-05-12 Editas Medicine, Inc. Methods for improving crispr/cas-mediated genome-editing
EP3985115A1 (en) 2014-12-12 2022-04-20 The Broad Institute, Inc. Protected guide rnas (pgrnas)
EP3265559B1 (en) 2015-03-03 2021-01-06 The General Hospital Corporation Engineered crispr-cas9 nucleases with altered pam specificity
US11377651B2 (en) 2016-10-19 2022-07-05 Flodesign Sonics, Inc. Cell therapy processes utilizing acoustophoresis
US11708572B2 (en) 2015-04-29 2023-07-25 Flodesign Sonics, Inc. Acoustic cell separation techniques and processes
JP7030522B2 (ja) 2015-05-11 2022-03-07 エディタス・メディシン、インコーポレイテッド 幹細胞における遺伝子編集のための最適化ｃｒｉｓｐｒ／ｃａｓ９システムおよび方法
WO2016201047A1 (en) 2015-06-09 2016-12-15 Editas Medicine, Inc. Crispr/cas-related methods and compositions for improving transplantation
WO2016205759A1 (en) 2015-06-18 2016-12-22 The Broad Institute Inc. Engineering and optimization of systems, methods, enzymes and guide scaffolds of cas9 orthologs and variants for sequence manipulation
AU2016280893B2 (en) * 2015-06-18 2021-12-02 Massachusetts Institute Of Technology CRISPR enzyme mutations reducing off-target effects
EP3313989A4 (en) 2015-06-29 2018-12-05 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modified crispr rna and modified single crispr rna and uses thereof
JP6799586B2 (ja) * 2015-08-28 2020-12-16 ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション 遺伝子操作ＣＲＩＳＰＲ−Ｃａｓ９ヌクレアーゼ
EP3786294A1 (en) 2015-09-24 2021-03-03 Editas Medicine, Inc. Use of exonucleases to improve crispr/cas-mediated genome editing
EP3365357B1 (en) 2015-10-23 2024-02-14 President and Fellows of Harvard College Evolved cas9 proteins for gene editing
US11597924B2 (en) 2016-03-25 2023-03-07 Editas Medicine, Inc. Genome editing systems comprising repair-modulating enzyme molecules and methods of their use
EP3433364A1 (en) 2016-03-25 2019-01-30 Editas Medicine, Inc. Systems and methods for treating alpha 1-antitrypsin (a1at) deficiency
WO2017180694A1 (en) 2016-04-13 2017-10-19 Editas Medicine, Inc. Cas9 fusion molecules gene editing systems, and methods of use thereof
US11214789B2 (en) 2016-05-03 2022-01-04 Flodesign Sonics, Inc. Concentration and washing of particles with acoustics
US10337051B2 (en) 2016-06-16 2019-07-02 The Regents Of The University Of California Methods and compositions for detecting a target RNA
AU2017280353B2 (en) 2016-06-24 2021-11-11 Inscripta, Inc. Methods for generating barcoded combinatorial libraries
WO2018005873A1 (en) * 2016-06-29 2018-01-04 The Broad Institute Inc. Crispr-cas systems having destabilization domain
US11078481B1 (en) 2016-08-03 2021-08-03 KSQ Therapeutics, Inc. Methods for screening for cancer targets
AU2017306676B2 (en) 2016-08-03 2024-02-22 President And Fellows Of Harvard College Adenosine nucleobase editors and uses thereof
AU2017308889B2 (en) 2016-08-09 2023-11-09 President And Fellows Of Harvard College Programmable Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
KR101710026B1 (ko) 2016-08-10 2017-02-27 주식회사 무진메디 Cas9 단백질 및 가이드 RNA의 혼성체를 함유하는 나노 리포좀 전달체 조성물
US11542509B2 (en) 2016-08-24 2023-01-03 President And Fellows Of Harvard College Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing
US11078483B1 (en) 2016-09-02 2021-08-03 KSQ Therapeutics, Inc. Methods for measuring and improving CRISPR reagent function
WO2018064352A1 (en) 2016-09-30 2018-04-05 The Regents Of The University Of California Rna-guided nucleic acid modifying enzymes and methods of use thereof
WO2018064371A1 (en) 2016-09-30 2018-04-05 The Regents Of The University Of California Rna-guided nucleic acid modifying enzymes and methods of use thereof
US11242542B2 (en) * 2016-10-07 2022-02-08 Integrated Dna Technologies, Inc. S. pyogenes Cas9 mutant genes and polypeptides encoded by same
CN110462034A (zh) * 2016-10-07 2019-11-15 综合Dna技术公司 化脓链球菌cas9突变基因和由其编码的多肽
SG11201903089RA (en) 2016-10-14 2019-05-30 Harvard College Aav delivery of nucleobase editors
WO2018074979A1 (en) * 2016-10-17 2018-04-26 Nanyang Technological University Truncated crispr-cas proteins for dna targeting
WO2018119359A1 (en) 2016-12-23 2018-06-28 President And Fellows Of Harvard College Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection
IT201700016321A1 (it) 2017-02-14 2018-08-14 Univ Degli Studi Di Trento Mutanti di cas9 ad alta specificita' e loro applicazioni.
WO2018165504A1 (en) 2017-03-09 2018-09-13 President And Fellows Of Harvard College Suppression of pain by gene editing
US11542496B2 (en) 2017-03-10 2023-01-03 President And Fellows Of Harvard College Cytosine to guanine base editor
EP3596217A1 (en) 2017-03-14 2020-01-22 Editas Medicine, Inc. Systems and methods for the treatment of hemoglobinopathies
IL306092A (en) 2017-03-23 2023-11-01 Harvard College Nucleic base editors that include nucleic acid programmable DNA binding proteins
JP2020515258A (ja) * 2017-03-31 2020-05-28 アジェノビア コーポレーション 抗ウイルス治療剤
BR112019022201A2 (pt) 2017-04-24 2020-05-12 Dupont Nutrition Biosciences Aps Métodos para modular a atividade de uma endonuclease cas, para aumentar a especificidade de uma endonuclease cas e complexo polinucleotídico guia, para aumentar a frequência de recombinação homóloga e para ativação ou repressão gênica, célula e célula vegetal
CN108795989A (zh) * 2017-04-26 2018-11-13 哈尔滨工业大学 SpyCas9的基因编辑活性抑制位点及其抑制剂
EP3615672A1 (en) 2017-04-28 2020-03-04 Editas Medicine, Inc. Methods and systems for analyzing guide rna molecules
WO2018204777A2 (en) 2017-05-05 2018-11-08 The Broad Institute, Inc. Methods for identification and modification of lncrna associated with target genotypes and phenotypes
EP3622070A2 (en) 2017-05-10 2020-03-18 Editas Medicine, Inc. Crispr/rna-guided nuclease systems and methods
WO2018209320A1 (en) 2017-05-12 2018-11-15 President And Fellows Of Harvard College Aptazyme-embedded guide rnas for use with crispr-cas9 in genome editing and transcriptional activation
EP3625338A4 (en) * 2017-05-19 2021-01-20 Tsinghua University ENGINEERING OF A SACAS9 MINIMUM CRISPR / CAS SYSTEM FOR GENE EDITING AND TRANSCRIPTIONAL REGULATION OPTIMIZED BY AN IMPROVED GUIDE RNA
KR102151064B1 (ko) * 2017-05-24 2020-09-02 기초과학연구원 매칭된 5' 뉴클레오타이드를 포함하는 가이드 rna를 포함하는 유전자 교정용 조성물 및 이를 이용한 유전자 교정 방법
GB201708662D0 (en) * 2017-05-31 2017-07-12 Tropic Biosciences Uk Ltd Compositions and methods for increasing shelf-life of banana
KR102541398B1 (ko) 2017-06-08 2023-06-07 고꾸리쯔 다이가꾸 호우징 오사까 다이가꾸 Dna가 편집된 진핵 세포를 제조하는 방법 및 당해 방법에 사용되는 키트
EP3635104A1 (en) 2017-06-09 2020-04-15 Editas Medicine, Inc. Engineered cas9 nucleases
CN107365793A (zh) * 2017-06-19 2017-11-21 百格基因科技（江苏）有限公司 一种适用于植物的大规模基因组编辑的方法
US10011849B1 (en) 2017-06-23 2018-07-03 Inscripta, Inc. Nucleic acid-guided nucleases
US9982279B1 (en) 2017-06-23 2018-05-29 Inscripta, Inc. Nucleic acid-guided nucleases
WO2019003193A1 (en) * 2017-06-30 2019-01-03 Novartis Ag METHODS FOR TREATING DISEASES USING GENE EDITING SYSTEMS
WO2019009682A2 (ko) * 2017-07-07 2019-01-10 주식회사 툴젠 표적 특이적 crispr 변이체
WO2019014564A1 (en) 2017-07-14 2019-01-17 Editas Medicine, Inc. SYSTEMS AND METHODS OF TARGETED INTEGRATION AND GENOME EDITING AND DETECTION THEREOF WITH INTEGRATED PRIMING SITES
JP2020534795A (ja) 2017-07-28 2020-12-03 プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ ファージによって支援される連続的進化（ｐａｃｅ）を用いて塩基編集因子を進化させるための方法および組成物
JP7159288B2 (ja) 2017-07-28 2022-10-24 ローカス アイピー カンパニー、エルエルシー 皮膚、毛髪及び頭皮の健康を改善する酵母ベースのマスク
EP3662065A4 (en) * 2017-08-04 2021-04-21 Syngenta Participations AG METHODS AND COMPOSITIONS FOR TARGETED GENOMIC INSERTION
JP2020532967A (ja) 2017-08-23 2020-11-19 ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション 変更されたＰＡＭ特異性を有する遺伝子操作されたＣＲＩＳＰＲ−Ｃａｓ９ヌクレアーゼ
WO2019139645A2 (en) 2017-08-30 2019-07-18 President And Fellows Of Harvard College High efficiency base editors comprising gam
US11713452B2 (en) * 2017-09-08 2023-08-01 University Of North Texas Health Science Center Engineered CAS9 variants
US11572574B2 (en) 2017-09-28 2023-02-07 Toolgen Incorporated Artificial genome manipulation for gene expression regulation
CN107630018B (zh) * 2017-09-30 2018-10-12 深圳三智医学科技有限公司 一种用于编辑或修复hbb基因的试剂盒
US11795443B2 (en) 2017-10-16 2023-10-24 The Broad Institute, Inc. Uses of adenosine base editors
US11629342B2 (en) * 2017-10-17 2023-04-18 President And Fellows Of Harvard College Cas9-based transcription modulation systems
US11970719B2 (en) 2017-11-01 2024-04-30 The Regents Of The University Of California Class 2 CRISPR/Cas compositions and methods of use
CA3080493A1 (en) 2017-11-01 2019-05-09 The Regents Of The University Of California Casz compositions and methods of use
MA50877A (fr) 2017-11-21 2020-09-30 Bayer Healthcare Llc Matériaux et méthodes pour le traitement de la rétinite pigmentaire autosomique dominante
EP3715454A4 (en) * 2017-11-22 2021-08-18 National University Corporation Kobe University COMPLEX FOR SAFE GENE EDITION WITH LOW SIDE EFFECTS, AND NUCLEIC ACID CODING THIS
BR112020009889A2 (pt) 2017-12-14 2020-11-03 Flodesign Sonics, Inc. acionador e controlador de transdutor acústico
US20210371877A1 (en) * 2017-12-18 2021-12-02 Spark Therapeutics, Inc. Adeno-associated virus (aav) vector lipid nanoparticle compositions and methods of use
CN108048405A (zh) * 2018-01-15 2018-05-18 上海市东方医院 稳定表达人内源性INav的细胞模型及其制备方法和用途
WO2019183150A1 (en) * 2018-03-19 2019-09-26 Casebia Therapeutics Limited Liability Partnership Novel rna-programmable endonuclease systems and uses thereof
WO2019191552A1 (en) * 2018-03-29 2019-10-03 Genentech, Inc. Modulating lactogenic activity in mammalian cells
US20190336585A1 (en) * 2018-05-03 2019-11-07 John Lawrence Mee Method for sustainable human cognitive enhancement
WO2019222423A1 (en) * 2018-05-15 2019-11-21 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Compositions and methods related to tumor cell killers and vaccines
WO2019235907A1 (ko) * 2018-06-08 2019-12-12 충남대학교 산학협력단 Crispr/cas9 시스템을 이용하여 플라보노이드 생합성 유전체를 편집하기 위한 조성물 및 이의 이용
MX2020013158A (es) * 2018-06-08 2021-04-29 Modalis Therapeutics Corp Proteina cas9 modificada y uso de la misma.
CN110684755B (zh) * 2018-07-05 2021-12-31 清华大学 基于进化信息构建嵌合SaCas9用于增强和扩展PAM位点的识别
EP3820995A1 (en) 2018-07-10 2021-05-19 Alia Therapeutics S.R.L. Vesicles for traceless delivery of guide rna molecules and/or guide rna molecule/rna-guided nuclease complex(es) and a production method thereof
EP3830301A1 (en) 2018-08-01 2021-06-09 Mammoth Biosciences, Inc. Programmable nuclease compositions and methods of use thereof
CN108949830B (zh) * 2018-08-03 2021-11-26 福州大学 一种在鱼类中实现基因组编辑、精确定点基因敲入的方法
MA53445A (fr) * 2018-08-24 2021-12-01 Flagship Pioneering Innovations Vi Llc Procédés et compositions pour la modification de plantes
CN109402115B (zh) * 2018-09-06 2024-02-02 广州普世利华科技有限公司 靶向Rett突变基因RNA的gRNA及Rett突变基因的检测方法、检测试剂盒
WO2020049158A1 (en) * 2018-09-07 2020-03-12 Astrazeneca Ab Compositions and methods for improved nucleases
JP2022504166A (ja) * 2018-10-09 2022-01-13 ザ ユニバーシティ オブ ノース カロライナ アット チャペル ヒル 調節された遺伝子編集システム
EP3880826A4 (en) * 2018-11-07 2022-08-24 Akouos, Inc. USE OF ADENO-ASSOCIATED VIRAL VECTORS TO CORRECT GENE DEFECTS/EXPRESS PROTEINS IN CILIATE AND SUPPORTING CELLS IN THE INNER EAR
WO2020097344A1 (en) * 2018-11-08 2020-05-14 Arizona Board of Regents on Behalf Arizona State University Synthetic immunomodulation with a crispr super-repressor in vivo
CN109385425A (zh) * 2018-11-13 2019-02-26 中山大学 一种高特异性ABE碱基编辑系统及其在β血红蛋白病中的应用
WO2020106772A1 (en) * 2018-11-19 2020-05-28 Exosome Therapeutics, Inc. Exosome loaded therapeutics for the treatment of non-alcoholic steatohepatitis, diabetes mellitus type 1 and type 2, atherosclerotic cardiovascular disease, and alpha 1 antitrypsin deficiency
JP2022514493A (ja) * 2018-12-14 2022-02-14 パイオニア ハイ－ブレッド インターナショナル， インコーポレイテッド ゲノム編集のための新規なｃｒｉｓｐｒ－ｃａｓシステム
CN111321171A (zh) * 2018-12-14 2020-06-23 江苏集萃药康生物科技有限公司 一种应用CRISPR/Cas9介导ES打靶技术制备基因打靶动物模型的方法
WO2020142754A2 (en) 2019-01-04 2020-07-09 Mammoth Biosciences, Inc. Programmable nuclease improvements and compositions and methods for nucleic acid amplification and detection
US20220098572A1 (en) * 2019-01-31 2022-03-31 Beam Therapeutics Inc. Nucleobase editors having reduced non-target deamination and assays for characterizing nucleobase editors
AU2020234013A1 (en) * 2019-03-12 2021-10-14 MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Cas9 variants with enhanced specificity
JP2022526908A (ja) 2019-03-19 2022-05-27 ザ ブロード インスティテュート，インコーポレーテッド 編集ヌクレオチド配列を編集するための方法および組成物
CN110009626A (zh) * 2019-04-11 2019-07-12 北京百度网讯科技有限公司 用于生成图像的方法和装置
US20230022146A1 (en) 2019-06-17 2023-01-26 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Compositions and methods for editing beta-globin for treatment of hemaglobinopathies
CN110272881B (zh) * 2019-06-29 2021-04-30 复旦大学 核酸内切酶SpCas9高特异性截短变异体TSpCas9-V1/V2及其应用
AU2020310837A1 (en) * 2019-07-08 2022-02-24 Inscripta, Inc. Increased nucleic acid-guided cell editing via a LexA-Rad51 fusion protein
US20220315914A1 (en) * 2019-07-08 2022-10-06 The Regents Of The University Of California Variant type v crispr/cas effector polypeptides and methods of use thereof
CN110600075B (zh) * 2019-08-14 2021-08-03 浙江工业大学 一种基于配体生长策略的蛋白质atp对接方法
CN110402852A (zh) * 2019-08-28 2019-11-05 浙江海洋大学 利于提高虎斑乌贼产卵数量与质量的养殖方法
CN114615880A (zh) * 2019-11-01 2022-06-10 先正达农作物保护股份公司 杂草控制方法和相关组合物及植物
KR102493904B1 (ko) * 2019-12-13 2023-01-31 한국생명공학연구원 EeCpf1에 의해 IL2Rg 유전자가 돌연변이된 면역부전 동물모델 및 그 제조방법
CN111337666B (zh) * 2020-02-12 2021-04-02 山东大学 I-motif重组介导的FRET探针及其原位成像癌细胞表面蛋白质同源二聚化的应用
WO2021163515A1 (en) * 2020-02-12 2021-08-19 Temple University - Of The Commonwealth System Of Higher Education Crispr-cas9 mediated disruption of alcam gene inhibits adhesion and trans-endothelial migration of myeloid cells
AU2021236230A1 (en) * 2020-03-11 2022-06-30 Sigma-Aldrich Co. Llc High fidelity SpCas9 nucleases for genome modification
US20230287370A1 (en) * 2020-03-11 2023-09-14 The Broad Institute, Inc. Novel cas enzymes and methods of profiling specificity and activity
WO2021202559A1 (en) * 2020-03-31 2021-10-07 Metagenomi Ip Technologies, Llc Class ii, type ii crispr systems
EP4127156A4 (en) 2020-03-31 2024-03-27 Metagenomi Inc CLASS II TYPE II CRISPR SYSTEMS
US20230332218A1 (en) * 2020-04-21 2023-10-19 Mammoth Biosciences, Inc. Casy programmable nucleases and rna component systems
AU2021267940A1 (en) 2020-05-08 2022-12-08 President And Fellows Of Harvard College Methods and compositions for simultaneous editing of both strands of a target double-stranded nucleotide sequence
WO2022018638A1 (en) 2020-07-21 2022-01-27 Crispr Therapeutics Ag Genome-editing compositions and methods to modulate faah for treatment of neurological disorders
CN111904973B (zh) * 2020-07-27 2021-12-03 中国农业科学院兰州兽医研究所 ssc-miR-122在制备调节猪繁殖与呼吸综合征病毒复制的药物中的应用
CN111979273B (zh) * 2020-08-24 2022-05-27 苏州启辰生物科技有限公司 一种制备人源化ace2小鼠模型的方法
WO2022047194A1 (en) * 2020-08-28 2022-03-03 Rau Bio Limited Approaches to simulating the interactions of biological systems through the use of modular computational workflows
US20230383273A1 (en) * 2020-10-21 2023-11-30 Emendobio Inc. Novel omni 56, 58, 65, 68, 71, 75, 78, and 84 crispr nucleases
WO2022109058A1 (en) * 2020-11-18 2022-05-27 Entrada Therapeutics, Inc. Nucleases comprising cell penetrating peptide sequences
US20230407276A1 (en) * 2020-12-02 2023-12-21 The Regents Of The University Of California Crispr-cas effector polypeptides and methods of use thereof
WO2022133246A1 (en) 2020-12-17 2022-06-23 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Compositions and methods for editing beta-globin for treatment of hemaglobinopathies
CN114807240B (zh) * 2021-01-21 2024-02-06 深圳市第二人民医院(深圳市转化医学研究院) 一种连接有适配体的模板分子及其试剂盒
EP4288086A2 (en) * 2021-02-08 2023-12-13 Emendobio Inc. Omni 90-99, 101, 104-110, 114, 116, 118-123, 125, 126, 128, 129, and 131-138 crispr nucleases
BR112023018284A2 (pt) * 2021-03-11 2023-12-12 Emendobio Inc Estratégias para knock-ins em locais de porto seguro c3
CN113249384A (zh) * 2021-04-27 2021-08-13 重庆医科大学 可靶向编辑HBV cccDNA的特异sgRNA序列及其应用
WO2022238958A1 (en) 2021-05-12 2022-11-17 Crispr Therapeutics Ag Multiplex gene editing
WO2023275892A1 (en) * 2021-06-29 2023-01-05 Council Of Scientific & Industrial Research Engineered fncas9 and uses thereof
CN113584049B (zh) * 2021-07-27 2023-02-03 杭州师范大学 Vdac1基因在调控植物开花期中的应用
CN113755498A (zh) * 2021-09-27 2021-12-07 赛业（苏州）生物科技有限公司 靶向小鼠Ube3a基因的gRNA及构建AS疾病小鼠模型的方法
WO2023077148A1 (en) 2021-11-01 2023-05-04 Tome Biosciences, Inc. Single construct platform for simultaneous delivery of gene editing machinery and nucleic acid cargo
CN114214330A (zh) * 2021-12-20 2022-03-22 杭州百凌生物科技有限公司 一种检测脊索瘤的质控品及其制备方法和应用
WO2023122764A1 (en) 2021-12-22 2023-06-29 Tome Biosciences, Inc. Co-delivery of a gene editor construct and a donor template
WO2023205744A1 (en) 2022-04-20 2023-10-26 Tome Biosciences, Inc. Programmable gene insertion compositions
WO2023215831A1 (en) 2022-05-04 2023-11-09 Tome Biosciences, Inc. Guide rna compositions for programmable gene insertion
WO2023219933A1 (en) 2022-05-09 2023-11-16 Entrada Therapeutics, Inc. Compositions and methods for delivery of nucleic acid therapeutics
WO2023225670A2 (en) 2022-05-20 2023-11-23 Tome Biosciences, Inc. Ex vivo programmable gene insertion
TW202405175A (zh) 2022-06-07 2024-02-01 美商斯奎柏治療公司 用於靶向pcsk9的組合物及方法
WO2024020587A2 (en) 2022-07-22 2024-01-25 Tome Biosciences, Inc. Pleiopluripotent stem cell programmable gene insertion
CN116987730B (zh) * 2023-09-22 2023-12-01 西北农林科技大学深圳研究院 硫氧还蛋白StCDSP32在植物抗病中的应用

Family Cites Families (185)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS501A (ru) 1973-04-28 1975-01-06
US5703055A (en) 1989-03-21 1997-12-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery
US7150982B2 (en) 1991-09-09 2006-12-19 Third Wave Technologies, Inc. RNA detection assays
US5593972A (en) 1993-01-26 1997-01-14 The Wistar Institute Genetic immunization
US5543158A (en) 1993-07-23 1996-08-06 Massachusetts Institute Of Technology Biodegradable injectable nanoparticles
US6007845A (en) 1994-07-22 1999-12-28 Massachusetts Institute Of Technology Nanoparticles and microparticles of non-linear hydrophilic-hydrophobic multiblock copolymers
US7745416B2 (en) 1995-04-11 2010-06-29 The Regents Of The University Of California Method for in vivo regulation of cardiac muscle contractility
US5622856A (en) 1995-08-03 1997-04-22 Avigen High efficiency helper system for AAV vector production
US5985309A (en) 1996-05-24 1999-11-16 Massachusetts Institute Of Technology Preparation of particles for inhalation
US5855913A (en) 1997-01-16 1999-01-05 Massachusetts Instite Of Technology Particles incorporating surfactants for pulmonary drug delivery
US5846946A (en) 1996-06-14 1998-12-08 Pasteur Merieux Serums Et Vaccins Compositions and methods for administering Borrelia DNA
US5944710A (en) 1996-06-24 1999-08-31 Genetronics, Inc. Electroporation-mediated intravascular delivery
US5869326A (en) 1996-09-09 1999-02-09 Genetronics, Inc. Electroporation employing user-configured pulsing scheme
GB9907461D0 (en) 1999-03-31 1999-05-26 King S College London Neurite regeneration
GB9710049D0 (en) 1997-05-19 1997-07-09 Nycomed Imaging As Method
US6251677B1 (en) 1997-08-25 2001-06-26 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Hybrid adenovirus-AAV virus and methods of use thereof
GB9720465D0 (en) 1997-09-25 1997-11-26 Oxford Biomedica Ltd Dual-virus vectors
CA2307016A1 (en) 1997-10-24 1999-05-06 Life Technologies, Inc. Recombinational cloning using nucleic acids having recombination sites
US7868149B2 (en) 1999-07-20 2011-01-11 Monsanto Technology Llc Plant genome sequence and uses thereof
US6603061B1 (en) 1999-07-29 2003-08-05 Monsanto Company Agrobacterium-mediated plant transformation method
GB0024550D0 (ru) 2000-10-06 2000-11-22 Oxford Biomedica Ltd
WO2002074968A1 (en) 2001-03-16 2002-09-26 Naoya Kobayashi Method for proliferating a liver cell, a liver cell obtained thereby, and use thereof
US8318173B2 (en) 2001-04-05 2012-11-27 The John Hopkins University Chimeric vaccines
BR0211111A (pt) 2001-07-12 2004-06-22 Univ Massachusetts Molécula de ácido nucleico isolada, vetor, célula hospedeira, transgene, precursor de rna engenheirado, animal transgênico não humano, e, método de induzir a interferência de ácido ribonucleico de um gene alvo em uma célula
EP1572885A2 (en) 2001-08-08 2005-09-14 Genzyme Corporation Methods for treating diabetes and other blood sugar disorders
WO2003016338A1 (en) 2001-08-15 2003-02-27 Parker Hughes Institute Crystal structure of the btk kinase domain
GB0125216D0 (en) 2001-10-19 2001-12-12 Univ Strathclyde Dendrimers for use in targeted delivery
US20090100536A1 (en) 2001-12-04 2009-04-16 Monsanto Company Transgenic plants with enhanced agronomic traits
JP2005512598A (ja) 2001-12-21 2005-05-12 オックスフォード バイオメディカ （ユーケー） リミテッド Ｅｉａｖなどのレンチウイルス発現ベクターを使用するトランスジェニック生物の作製方法
US7539579B2 (en) 2002-04-09 2009-05-26 Beattie Kenneth L Oligonucleotide probes for genosensor chips
EP1532178A4 (en) 2002-06-11 2006-10-25 Scripps Research Inst ARTIFICIAL TRANSCRIPTION FACTORS
ATE485031T1 (de) 2002-06-28 2010-11-15 Protiva Biotherapeutics Inc Verfahren und vorrichtung zur herstellung von liposomen
GB0220467D0 (en) 2002-09-03 2002-10-09 Oxford Biomedica Ltd Composition
EP1546397A4 (en) 2002-09-27 2007-10-31 Cold Spring Harbor Lab CELL-BASED RNA INTERFERENCE AND METHODS AND COMPOSITIONS RELATING THERETO
US9534224B2 (en) 2002-11-15 2017-01-03 Trustees Of Boston University Cis/trans riboregulators
US20060178297A1 (en) 2003-01-28 2006-08-10 Troy Carol M Systems and methods for silencing expression of a gene in a cell and uses thereof
WO2005007814A2 (en) 2003-07-03 2005-01-27 The Regents Of The University Of California Genome mapping of functional dna elements and cellular proteins
EP2567693B1 (en) 2003-07-16 2015-10-21 Protiva Biotherapeutics Inc. Lipid encapsulated interfering RNA
EP3222715A1 (en) 2003-08-08 2017-09-27 Sangamo BioSciences, Inc. Methods and compositions for targeted cleavage and recombination
NZ592917A (en) 2003-09-15 2012-12-21 Protiva Biotherapeutics Inc Stable polyethyleneglycol (PEG) dialkyloxypropyl (DAA) lipid conjugates
GB0325379D0 (en) 2003-10-30 2003-12-03 Oxford Biomedica Ltd Vectors
FR2862659B1 (fr) 2003-11-21 2006-02-10 Pasteur Institut Genome de legionella pneumophila souche paris- applications diagnostiques et epidemiologiques
WO2005070948A1 (en) 2004-01-23 2005-08-04 Intronn, Inc. Correction of alpha-1-antitrypsin genetic defects using spliceosome mediated rna trans splicing
WO2005074511A2 (en) 2004-01-27 2005-08-18 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods and compositions for homozygous gene inactivation using collections of pre-defined nucleotide sequences complementary to chromosomal transcripts
US20050220796A1 (en) 2004-03-31 2005-10-06 Dynan William S Compositions and methods for modulating DNA repair
US7745651B2 (en) 2004-06-07 2010-06-29 Protiva Biotherapeutics, Inc. Cationic lipids and methods of use
US7799565B2 (en) 2004-06-07 2010-09-21 Protiva Biotherapeutics, Inc. Lipid encapsulated interfering RNA
FR2872170B1 (fr) 2004-06-25 2006-11-10 Centre Nat Rech Scient Cnrse Lentivirus non interactif et non replicatif, preparation et utilisations
JP4772045B2 (ja) 2004-07-16 2011-09-14 アメリカ合衆国 Ｃｍｖ／ｒ核酸コンストラクトを含むａｉｄｓに対するワクチン
GB0422877D0 (en) 2004-10-14 2004-11-17 Univ Glasgow Bioactive polymers
WO2006116756A1 (en) 2005-04-28 2006-11-02 Benitec, Limited. Multiple-rnai expression cassettes for simultaneous delivery of rnai agents related to heterozygotic expression patterns
US7892224B2 (en) 2005-06-01 2011-02-22 Brainlab Ag Inverse catheter planning
KR101419729B1 (ko) 2005-07-26 2014-07-17 상가모 바이오사이언스 인코포레이티드 외래 핵산 서열의 표적화된 통합 및 발현
DK2336362T3 (en) 2005-08-26 2019-01-21 Dupont Nutrition Biosci Aps USE OF CRISPR-ASSOCIATED GENES (CAS)
WO2007048046A2 (en) 2005-10-20 2007-04-26 Protiva Biotherapeutics, Inc. Sirna silencing of filovirus gene expression
EP1950294B1 (en) 2005-10-28 2012-01-18 Mitsubishi Tanabe Pharma Corporation Novel cell penetrating peptide
US8101741B2 (en) 2005-11-02 2012-01-24 Protiva Biotherapeutics, Inc. Modified siRNA molecules and uses thereof
GB0526211D0 (en) 2005-12-22 2006-02-01 Oxford Biomedica Ltd Viral vectors
US8362229B2 (en) 2006-02-08 2013-01-29 Quark Pharmaceuticals, Inc. Tandem siRNAS
US9677123B2 (en) 2006-03-15 2017-06-13 Siemens Healthcare Diagnostics Inc. Degenerate nucleobase analogs
ES2874149T3 (es) 2006-05-11 2021-11-04 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones y métodos para inhibir la expresión del gen PCSK9
WO2008054544A2 (en) 2006-05-22 2008-05-08 Immune Disease Institute, Inc. Method for delivery across the blood brain barrier
US7915399B2 (en) 2006-06-09 2011-03-29 Protiva Biotherapeutics, Inc. Modified siRNA molecules and uses thereof
JP2008078613A (ja) 2006-08-24 2008-04-03 Rohm Co Ltd 窒化物半導体の製造方法及び窒化物半導体素子
WO2008093152A1 (en) 2007-02-01 2008-08-07 Cellectis Obligate heterodimer meganucleases and uses thereof
WO2008108989A2 (en) 2007-03-02 2008-09-12 Danisco A/S Cultures with improved phage resistance
PE20090064A1 (es) 2007-03-26 2009-03-02 Novartis Ag Acido ribonucleico de doble cadena para inhibir la expresion del gen e6ap humano y composicion farmaceutica que lo comprende
WO2008149176A1 (en) 2007-06-06 2008-12-11 Cellectis Meganuclease variants cleaving a dna target sequence from the mouse rosa26 locus and uses thereof
CN101970051A (zh) 2007-12-31 2011-02-09 纳诺科尔治疗公司 用于治疗心力衰竭的rna干扰
US20100081707A1 (en) 2008-02-21 2010-04-01 Ali Robin R Devices and methods for delivering polynucleotides into retinal cells of the macula and fovea
WO2009127060A1 (en) 2008-04-15 2009-10-22 Protiva Biotherapeutics, Inc. Novel lipid formulations for nucleic acid delivery
JP2011523557A (ja) 2008-06-04 2011-08-18 メディカル リサーチ カウンシル ペプチド
US8999945B2 (en) 2008-06-30 2015-04-07 Silenseed Ltd Methods, compositions and systems for local delivery of drugs
WO2010004594A1 (en) 2008-07-08 2010-01-14 S.I.F.I. Societa' Industria Farmaceutica Italiana S.P.A. Ophthalmic compositions for treating pathologies of the posterior segment of the eye
US8546553B2 (en) 2008-07-25 2013-10-01 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Prokaryotic RNAi-like system and methods of use
US20100076057A1 (en) 2008-09-23 2010-03-25 Northwestern University TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA
WO2010054108A2 (en) 2008-11-06 2010-05-14 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Cas6 polypeptides and methods of use
MX2011004859A (es) 2008-11-07 2011-08-03 Massachusetts Inst Technology Lipidoides de aminoalcohol y usos de los mismos.
US20110016540A1 (en) 2008-12-04 2011-01-20 Sigma-Aldrich Co. Genome editing of genes associated with trinucleotide repeat expansion disorders in animals
KR101803737B1 (ko) 2008-12-04 2017-12-01 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 징크 핑거 뉴클레아제를 이용한 랫트의 유전체 편집
NZ593618A (en) 2008-12-10 2013-02-22 Alnylam Pharmaceuticals Inc Gnaq targeted dsrna compositions and methods for inhibiting expression
WO2010075424A2 (en) 2008-12-22 2010-07-01 The Regents Of University Of California Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes
EP2206723A1 (en) 2009-01-12 2010-07-14 Bonas, Ulla Modular DNA-binding domains
US20110239315A1 (en) 2009-01-12 2011-09-29 Ulla Bonas Modular dna-binding domains and methods of use
WO2011036510A1 (en) 2009-09-24 2011-03-31 Cellectis Meganuclease variants cleaving the genome of the herpes simplex virus and uses thereof
JP2012529287A (ja) 2009-06-11 2012-11-22 トゥールゲン インコーポレイション 部位−特異的ヌクレアーゼを用いた標的ゲノムの再配列
CA2767127A1 (en) 2009-07-01 2011-01-06 Protiva Biotherapeutics, Inc. Novel lipid formulations for delivery of therapeutic agents to solid tumors
CA2767129C (en) 2009-07-01 2015-01-06 Protiva Biotherapeutics, Inc. Compositions and methods for silencing apolipoprotein b
SG177711A1 (en) 2009-07-24 2012-02-28 Sigma Aldrich Co Llc Method for genome editing
US9234016B2 (en) 2009-07-28 2016-01-12 Sangamo Biosciences, Inc. Engineered zinc finger proteins for treating trinucleotide repeat disorders
US8889394B2 (en) 2009-09-07 2014-11-18 Empire Technology Development Llc Multiple domain proteins
AU2010325549B2 (en) 2009-11-27 2017-04-20 Basf Plant Science Company Gmbh Optimized endonucleases and uses thereof
JP2013515697A (ja) 2009-12-23 2013-05-09 マックスプランク−ゲセルシャフト・ツール・フェーデルング・デル・ヴィッセンシャフテン・エー・ファウ インフルエンザ標的
US9255259B2 (en) 2010-02-09 2016-02-09 Sangamo Biosciences, Inc. Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules
US10087431B2 (en) 2010-03-10 2018-10-02 The Regents Of The University Of California Methods of generating nucleic acid fragments
CA2796600C (en) 2010-04-26 2019-08-13 Sangamo Biosciences, Inc. Genome editing of a rosa locus using zinc-finger nucleases
US8927514B2 (en) 2010-04-30 2015-01-06 City Of Hope Recombinant adeno-associated vectors for targeted treatment
SG185481A1 (en) 2010-05-10 2012-12-28 Univ California Endoribonuclease compositions and methods of use thereof
US8372951B2 (en) 2010-05-14 2013-02-12 National Tsing Hua University Cell penetrating peptides for intracellular delivery
EP2571512B1 (en) 2010-05-17 2017-08-23 Sangamo BioSciences, Inc. Novel dna-binding proteins and uses thereof
CN102946907A (zh) 2010-05-28 2013-02-27 牛津生物医学（英国）有限公司 慢病毒载体向脑的递送
JP2013537410A (ja) 2010-07-23 2013-10-03 シグマ−アルドリッチ・カンパニー・リミテッド・ライアビリティ・カンパニー 標的化エンドヌクレアーゼおよび一本鎖核酸を用いたゲノム編集
EP2601611B1 (en) 2010-08-02 2020-12-09 Integrated Dna Technologies, Inc. Methods for predicting stability and melting temperatures of nucleic acid duplexes
US9193827B2 (en) 2010-08-26 2015-11-24 Massachusetts Institute Of Technology Poly(beta-amino alcohols), their preparation, and uses thereof
WO2012031205A2 (en) 2010-09-03 2012-03-08 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Lipid-polymer hybrid particles
CA2814143C (en) 2010-10-12 2020-09-08 The Children's Hospital Of Philadelphia Methods and compositions for treating hemophilia b
EP2691443B1 (en) 2011-03-28 2021-02-17 Massachusetts Institute of Technology Conjugated lipomers and uses thereof
AU2012236099A1 (en) 2011-03-31 2013-10-03 Moderna Therapeutics, Inc. Delivery and formulation of engineered nucleic acids
PL3254703T3 (pl) 2011-04-22 2020-10-05 The Regents Of The University Of California Wiriony wirusa towarzyszącego adenowirusom z różnymi kapsydami i sposoby ich zastosowania
CA2834375C (en) 2011-04-27 2020-07-14 Amyris, Inc. Methods for genomic modification
US20120295960A1 (en) 2011-05-20 2012-11-22 Oxford Biomedica (Uk) Ltd. Treatment regimen for parkinson's disease
WO2012164565A1 (en) 2011-06-01 2012-12-06 Yeda Research And Development Co. Ltd. Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes
CN103917644A (zh) 2011-09-21 2014-07-09 桑格摩生物科学股份有限公司 调控转基因表达的方法和组合物
WO2013052681A1 (en) 2011-10-06 2013-04-11 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for regulating hiv infection
US20130122096A1 (en) 2011-11-14 2013-05-16 Silenseed Ltd. Compositions for drug delivery and methods of manufacturing and using same
WO2013071440A1 (en) 2011-11-18 2013-05-23 UNIVERSITé LAVAL Methods and products for increasing frataxin levels and uses thereof
US10640785B2 (en) 2011-11-22 2020-05-05 The Children's Hospital Of Philadelphia Virus vectors for highly efficient transgene delivery
US8450107B1 (en) 2011-11-30 2013-05-28 The Broad Institute Inc. Nucleotide-specific recognition sequences for designer TAL effectors
EP2791160B1 (en) 2011-12-16 2022-03-02 ModernaTX, Inc. Modified mrna compositions
GB201122458D0 (en) 2011-12-30 2012-02-08 Univ Wageningen Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof
JP6490426B2 (ja) 2012-02-29 2019-03-27 サンガモ セラピューティクス， インコーポレイテッド ハンチントン病を治療するための方法および組成物
WO2013141680A1 (en) 2012-03-20 2013-09-26 Vilnius University RNA-DIRECTED DNA CLEAVAGE BY THE Cas9-crRNA COMPLEX
US9637739B2 (en) 2012-03-20 2017-05-02 Vilnius University RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex
AU2013204327B2 (en) 2012-04-20 2016-09-01 Aviagen Cell transfection method
LT3401400T (lt) 2012-05-25 2019-06-10 The Regents Of The University Of California Būdai ir kompozicijos, skirtos rnr molekulės nukreipiamai tikslinės dnr modifikacijai ir rnr molekulės nukreipiamam transkripcijos moduliavimui
JP6431478B2 (ja) 2012-06-01 2018-11-28 ドレクセル ユニバーシティ Ｂ型肝炎ウイルスのｃｃｃｄｎａの転写の調節
US8614194B1 (en) 2012-07-25 2013-12-24 Kaohsiung Medical University Anionic cell penetrating peptide and its use for intracellular delivery
ES2824024T3 (es) 2012-10-10 2021-05-11 Sangamo Therapeutics Inc Compuestos modificadores de células T y usos de los mismos
DE202013012597U1 (de) 2012-10-23 2017-11-21 Toolgen, Inc. Zusammensetzung zum Spalten einer Ziel-DNA, umfassend eine für die Ziel-DNA spezifische guide-RNA und eine Cas-Protein-codierende Nukleinsäure oder ein Cas-Protein, sowie deren Verwendung
EP3138911B1 (en) 2012-12-06 2018-12-05 Sigma Aldrich Co. LLC Crispr-based genome modification and regulation
WO2014093479A1 (en) 2012-12-11 2014-06-19 Montana State University Crispr (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) rna-guided control of gene regulation
WO2014093694A1 (en) 2012-12-12 2014-06-19 The Broad Institute, Inc. Crispr-cas nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation in eukaryotes
ES2576128T3 (es) 2012-12-12 2016-07-05 The Broad Institute, Inc. Modificación por tecnología genética y optimización de sistemas, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias con dominios funcionales
EP4234696A3 (en) 2012-12-12 2023-09-06 The Broad Institute Inc. Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation
DK2898075T3 (en) 2012-12-12 2016-06-27 Broad Inst Inc CONSTRUCTION AND OPTIMIZATION OF IMPROVED SYSTEMS, PROCEDURES AND ENZYME COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATION
EP2931892B1 (en) 2012-12-12 2018-09-12 The Broad Institute, Inc. Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof
PT2921557T (pt) 2012-12-12 2016-10-19 Massachusetts Inst Technology Engenharia de sistemas, métodos e composições guia otimizadas para a manipulação de sequências
US8697359B1 (en) 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
PL2784162T3 (pl) 2012-12-12 2016-01-29 Broad Inst Inc Opracowanie systemów, metod oraz zoptymalizowanych kompozycji przewodnikowych do manipulacji sekwencyjnej
ES2658401T3 (es) 2012-12-12 2018-03-09 The Broad Institute, Inc. Suministro, modificación y optimización de sistemas, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias y aplicaciones terapéuticas
EP2931899A1 (en) 2012-12-12 2015-10-21 The Broad Institute, Inc. Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, knock out libraries and applications thereof
CA3081054A1 (en) 2012-12-17 2014-06-26 President And Fellows Of Harvard College Rna-guided human genome engineering
AU2014207618A1 (en) 2013-01-16 2015-08-06 Emory University Cas9-nucleic acid complexes and uses related thereto
WO2014118272A1 (en) 2013-01-30 2014-08-07 Santaris Pharma A/S Antimir-122 oligonucleotide carbohydrate conjugates
US10660943B2 (en) 2013-02-07 2020-05-26 The Rockefeller University Sequence specific antimicrobials
US9163837B2 (en) 2013-02-27 2015-10-20 Siemens Aktiengesellschaft Flow conditioner in a combustor of a gas turbine engine
KR101780885B1 (ko) 2013-03-14 2017-10-11 카리부 바이오사이언시스 인코포레이티드 핵산-표적화 핵산의 조성물 및 방법
CA2906553C (en) 2013-03-15 2022-08-02 The General Hospital Corporation Rna-guided targeting of genetic and epigenomic regulatory proteins to specific genomic loci
US9645040B2 (en) 2013-03-27 2017-05-09 Wilco Ag Method of inline inspecting and/or testing devices and apparatus to perform such method
JP6576904B2 (ja) 2013-04-04 2019-09-18 トラスティーズ・オブ・ダートマス・カレッジ ＨＩＶ−１プロウイルスＤＮＡのｉｎｖｉｖｏ切除のための組成物及び方法
CA2910489A1 (en) 2013-05-15 2014-11-20 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for treatment of a genetic condition
EP3004349B1 (en) 2013-05-29 2018-03-28 Cellectis S.A. A method for producing precise dna cleavage using cas9 nickase activity
AU2014274939B2 (en) 2013-06-04 2020-03-19 President And Fellows Of Harvard College RNA-guideded transcriptional regulation
US20140356956A1 (en) 2013-06-04 2014-12-04 President And Fellows Of Harvard College RNA-Guided Transcriptional Regulation
EP3417880A1 (en) 2013-06-05 2018-12-26 Duke University Rna-guided gene editing and gene regulation
WO2014204727A1 (en) 2013-06-17 2014-12-24 The Broad Institute Inc. Functional genomics using crispr-cas systems, compositions methods, screens and applications thereof
DK3011032T3 (da) 2013-06-17 2020-01-20 Broad Inst Inc Fremføring, modificering og optimering af systemer, fremgangsmåder og sammensætninger til målretning mod og modellering af sygdomme og forstyrrelser i postmitotiske celler
ES2777217T3 (es) 2013-06-17 2020-08-04 Broad Inst Inc Suministro, modificación y optimización de sistemas de guía en tándem, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias
KR20160030187A (ko) 2013-06-17 2016-03-16 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 간의 표적화 및 치료를 위한 ＣＲＩＳＰＲ­Ｃａｓ 시스템, 벡터 및 조성물의 전달 및 용도
EP3011034B1 (en) 2013-06-17 2019-08-07 The Broad Institute, Inc. Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components
WO2014204725A1 (en) 2013-06-17 2014-12-24 The Broad Institute Inc. Optimized crispr-cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation
CN103343120B (zh) * 2013-07-04 2015-03-04 中国科学院遗传与发育生物学研究所 一种小麦基因组定点改造方法
HRP20211563T1 (hr) 2013-07-11 2022-01-07 Modernatx, Inc. Pripravci koji sadrže sintetske polinukleotide koji kodiraju proteine srodne crispr-u i sintetske sgrna, te postupci njihove uporabe
CN103388006B (zh) 2013-07-26 2015-10-28 华东师范大学 一种基因定点突变的构建方法
US11306328B2 (en) 2013-07-26 2022-04-19 President And Fellows Of Harvard College Genome engineering
EA037850B1 (ru) 2013-08-29 2021-05-27 Тэмпл Юниверсити Оф Зе Коммонвэлс Систем Оф Хайе Эдьюкейшн Способы и композиции для рнк-направленного лечения вич-инфекции
US9526784B2 (en) 2013-09-06 2016-12-27 President And Fellows Of Harvard College Delivery system for functional nucleases
US9322037B2 (en) 2013-09-06 2016-04-26 President And Fellows Of Harvard College Cas9-FokI fusion proteins and uses thereof
US20160237455A1 (en) 2013-09-27 2016-08-18 Editas Medicine, Inc. Crispr-related methods and compositions
US10822606B2 (en) * 2013-09-27 2020-11-03 The Regents Of The University Of California Optimized small guide RNAs and methods of use
WO2015065964A1 (en) 2013-10-28 2015-05-07 The Broad Institute Inc. Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, screens and applications thereof
LT3066201T (lt) 2013-11-07 2018-08-10 Editas Medicine, Inc. Su crispr susiję būdai ir kompozicijos su valdančiomis grnr
EP3071695A2 (en) * 2013-11-18 2016-09-28 Crispr Therapeutics AG Crispr-cas system materials and methods
KR20160097327A (ko) 2013-12-12 2016-08-17 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 유전자 산물, 구조 정보 및 유도성 모듈형 ｃａｓ 효소의 발현의 변경을 위한 ｃｒｉｓｐｒ-ｃａｓ 시스템 및 방법
MX2016007327A (es) 2013-12-12 2017-03-06 Broad Inst Inc Suministro, uso y aplicaciones terapeuticas de sistemas y composiciones crispr-cas para dirigirlos a trastornos y enfermedades usando componentes para suministro de particulas.
WO2015089354A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 The Broad Institute Inc. Compositions and methods of use of crispr-cas systems in nucleotide repeat disorders
WO2015089364A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 The Broad Institute Inc. Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof
CN103668472B (zh) 2013-12-31 2014-12-24 北京大学 利用CRISPR/Cas9系统构建真核基因敲除文库的方法
WO2015113063A1 (en) 2014-01-27 2015-07-30 Georgia Tech Research Corporation Methods and systems for identifying crispr/cas off-target sites
JP6323228B2 (ja) 2014-07-18 2018-05-16 富士電機株式会社 電力変換装置
WO2016022866A1 (en) 2014-08-07 2016-02-11 Agilent Technologies, Inc. Cis-blocked guide rna
EP3180426B1 (en) 2014-08-17 2019-12-25 The Broad Institute, Inc. Genome editing using cas9 nickases
EP3265559B1 (en) 2015-03-03 2021-01-06 The General Hospital Corporation Engineered crispr-cas9 nucleases with altered pam specificity
AU2016280893B2 (en) 2015-06-18 2021-12-02 Massachusetts Institute Of Technology CRISPR enzyme mutations reducing off-target effects
JP6186470B2 (ja) 2016-04-20 2017-08-23 パイオニア株式会社 音響装置、音量制御方法、音量制御プログラム及び記録媒体

Also Published As

Publication number Publication date
US10876100B2 (en) 2020-12-29
WO2016205613A1 (en) 2016-12-22
IL293323B2 (en) 2024-01-01
JP7107683B2 (ja) 2022-07-27
CA2989830A1 (en) 2016-12-22
TWI813532B (zh) 2023-09-01
MX2017016289A (es) 2018-08-15
CN109536474A (zh) 2019-03-29
US20190010471A1 (en) 2019-01-10
JP6793699B2 (ja) 2020-12-02
EP3129393A1 (en) 2017-02-15
AU2022201165A1 (en) 2022-03-17
IL256368B (en) 2021-07-29
RU2752834C2 (ru) 2021-08-09
EP3929287A2 (en) 2021-12-29
EP3129393B1 (en) 2021-08-04
JP2019022512A (ja) 2019-02-14
IL293323B1 (en) 2023-09-01
US10494621B2 (en) 2019-12-03
KR102575342B1 (ko) 2023-09-05
IL284808A (en) 2021-08-31
KR20230132877A (ko) 2023-09-18
JP2022141778A (ja) 2022-09-29
AU2016280893A1 (en) 2018-01-18
ZA201708498B (en) 2018-11-28
RU2018101710A3 (ru) 2019-11-20
AU2016280893B2 (en) 2021-12-02
MX2022005304A (es) 2022-08-02
TW201704255A (zh) 2017-02-01
SG10201912329YA (en) 2020-02-27
KR20180034404A (ko) 2018-04-04
IL284808B (en) 2022-07-01
TW202400626A (zh) 2024-01-01
CN108290933A (zh) 2018-07-17
JP2018522546A (ja) 2018-08-16
RU2021120582A (ru) 2021-09-02
US20190032036A1 (en) 2019-01-31
IL256368A (en) 2019-08-29
US20200087641A1 (en) 2020-03-19
EP3929287A3 (en) 2022-04-13
IL293323A (en) 2022-07-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018101710A (ru) Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты
JP7020635B2 (ja) 変異ｃａｓ９タンパク質
JP6929791B2 (ja) エピゲノム編集のための組成物および方法
RU2756865C2 (ru) Направляемая рнк регуляция транскрипции
RU2634395C1 (ru) Генетическая конструкция на основе системы редактирования генома crispr/cas9, кодирующая нуклеазу cas9, специфически импортируемую в митохондрии клеток человека
RU2018101666A (ru) Новые ферменты и системы crispr
RU2022103641A (ru) Искусственная модификация генома для регуляции экспрессии гена
JP2020508685A5 (ru)
HRP20171163T1 (hr) Postupci i sastavi za rnk-usmjerenu modifikaciju ciljane dnk i rnk-usmjerene modulacije transkripcije
RU2020104969A (ru) Способы и продукты для получения и доставки нуклеиновых кислот
IL309801A (en) Use of protein domains interacting with the nucleosome to enhance targeted genome modification
CN108350454A (zh) 等位基因选择性基因编辑及其用途
JP2017510542A5 (ru)
TWI723363B (zh) 用於治療癌症之包含引導rna及內切酶的藥學組成物
KR20210069692A (ko) 조작된 유전자 조정제
CN109689677A (zh) 用于基因组编辑分子的细胞内递送的肽和纳米颗粒
RU2015128102A (ru) Компоненты системы crispr-cas, способы и композиции для манипуляции с последовательностями
JP2018534114A5 (ru)
KR20240011120A (ko) 후성유전학적 편집을 위한 조성물 및 방법
US20230183754A1 (en) Systems, methods, and compositions for correction of frameshift mutations
WO2022092317A1 (ja) エンジニアリングされたＣａｓ１２ｆタンパク質
WO2020018918A1 (en) Methods for exon skipping and gene knockout using base editors
AU2019355433A1 (en) Methods and compositions for modulation of tau proteins
KR102067675B1 (ko) CRISP/Cas 시스템에 사용하기 위한 융합 단백질, 그를 포함하는 복합체 및 그의 용도
WO2019089910A1 (en) Highly compact cas9-based transcriptional regulators for in vivo gene regulation