RU2015140276A - Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты - Google Patents

Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты Download PDF

Info

Publication number
RU2015140276A
RU2015140276A RU2015140276A RU2015140276A RU2015140276A RU 2015140276 A RU2015140276 A RU 2015140276A RU 2015140276 A RU2015140276 A RU 2015140276A RU 2015140276 A RU2015140276 A RU 2015140276A RU 2015140276 A RU2015140276 A RU 2015140276A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
cas9
protein
complex
sequence
Prior art date
Application number
RU2015140276A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2662932C2 (ru
Inventor
Эндрю Пол МЭЙ
Рейчел И. ОРВИТЦ
Дженнифер А. ДУДНА
Джеймс М. БЕРГЕР
Мэттью Мэррилл КАРТЕР
Пол ДОНОХЬЮ
Original Assignee
Карибо Биосайенсиз, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Карибо Биосайенсиз, Инк. filed Critical Карибо Биосайенсиз, Инк.
Publication of RU2015140276A publication Critical patent/RU2015140276A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2662932C2 publication Critical patent/RU2662932C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46—Hydrolases (3)
    • A61K38/465—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/54—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic compound
    • A61K47/549—Sugars, nucleosides, nucleotides or nucleic acids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/62—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being a protein, peptide or polyamino acid
    • A61K47/64—Drug-peptide, drug-protein or drug-polyamino acid conjugates, i.e. the modifying agent being a peptide, protein or polyamino acid which is covalently bonded or complexed to a therapeutically active agent
    • A61K47/645—Polycationic or polyanionic oligopeptides, polypeptides or polyamino acids, e.g. polylysine, polyarginine, polyglutamic acid or peptide TAT
    • A61K47/6455—Polycationic oligopeptides, polypeptides or polyamino acids, e.g. for complexing nucleic acids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00—Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/12—Drugs for disorders of the urinary system of the kidneys
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/02—Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02—Ophthalmic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/10—Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/0006—Modification of the membrane of cells, e.g. cell decoration
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C12Q1/6818—Hybridisation assays characterised by the detection means involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869—Methods for sequencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869—Methods for sequencing
    • C12Q1/6874—Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPRs]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/50—Physical structure
    • C12N2310/53—Physical structure partially self-complementary or closed
    • C12N2310/531—Stem-loop; Hairpin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/50—Physical structure
    • C12N2310/53—Physical structure partially self-complementary or closed
    • C12N2310/533—Physical structure partially self-complementary or closed having a mismatch or nick in at least one of the strands
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00—Nucleic acids vectors
    • C12N2800/80—Vectors containing sites for inducing double-stranded breaks, e.g. meganuclease restriction sites
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
    • C12Q2525/10—Modifications characterised by
    • C12Q2525/203—Modifications characterised by incorporating a composite nucleic acid containing a polypeptide sequence other than PNA

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)

Claims (80)

1. Композиция, содержащая
модифицированный белок Cas9, причем указанный модифицированный белок Cas9 содержит модификацию области белка Cas9 дикого типа, выбранной из группы, состоящей из области спирального мостика Cas9; высокоосновного участка Cas9 в N-концевой области Cas9; области NHN-домена Cas9; области RuvC-домена Cas9; области распознавания Р-домена Cas9; дополнительную ферментную активность, вставку, делецию или замену домена; вставку, делецию или замену структурного мотива, слияние или любую их комбинацию.
2. Композиция по п. 1, отличающаяся тем, что белок Cas9 дикого типа представляет собой белок Cas9 Streptococcus pyogene.
3. Композиция по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области белка Cas9 дикого типа, соответствующей аминокислотам 1-270 Cas9 Streptococcus pyogene.
4. Композиция по п. 3, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 50-100 Cas9 Streptococcus pyogenes.
5. Композиция по п. 4, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 65-95 Cas9 Streptococcus pyogenes.
6. Композиция по п. 3, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 22-49 Cas9 Streptococcus pyogenes.
7. Композиция по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 551-556 Cas9 Streptococcus pyogenes.
8. Композиция по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 445-507 Cas9 Streptococcus pyogenes.
9. Композиция по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 860-1100 Cas9 Streptococcus pyogenes.
10. Композиция по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 1096-1225 Cas9 Streptococcus pyogenes.
11. Композиция по п. 10, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 1105-1138 Cas9 Streptococcus pyogenes.
12. Композиция по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанная модификация содержится в области, соответствующей аминокислотам 718-757 Cas9 Streptococcus pyogenes.
13. Композиция по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанная модификация представляет собой вставку нуклеазного домена или вставку РНК-связывающего домена.
14. Композиция по п. 13, отличающаяся тем, что вставленный РНК-связывающий домен представляет собой Csy4.
15. Вектор, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую модифицированный белок Cas9 по любому из пп. 1-14.
16. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, содержащая
сконструированную CRISPR РНК (crPHK), сконструированную транс-активирующую CRISPR РНК (tracrPHK), или их комбинацию, причем (i) сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, может связываться с белком Cas9 с образованием комплекса нуклеиновая кислота, нацеленная на нуклеиновую кислоту-Cas9, способного связывать целевую ДНК, и (ii) сконструированная crPHK , сконструированная tracrPHK, или их комбинация отлична от соответствующей crPHK, tracrPHK, или обеих дикого типа; и
сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, содержит по меньшей мере одно из следующих: последовательность tracr с 3'-гибридизующимся удлинением, последовательность спейсера с удлинением, последовательность tracr с удлинением, модифицированную область петли, модифицированный Р-домен, Csy4 связывающая последовательность, с которой связывается белок Csy4 с Kd ~50 рМ, Cas5 связывающая последовательность, с которой связывается белок Cas5, Cas6 связывающая последовательность, с которой связывается белок Cas6, соединение/вариант шпильки, модифицированная структура «петля-на-стебле», содержащая функциональную группу, или их комбинации.
17. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту по п. 16, отличающаяся тем, что указанная сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, представляет собой структуру двойной направляющей нуклеиновой кислоты.
18. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту по п. 16, отличающаяся тем, что указанная сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, представляет собой структуру одинарной направляющей нуклеиновой кислоты.
19. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту по п. 16, отличающаяся тем, что указанное соединение/вариант шпильки содержит соединение «петля-на-стебле» модифицированной длины или соединение «петля» модифицированного размера по сравнению с соответствующей tracrPHK дикого типа.
20. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту по п. 16, отличающаяся тем, что указанный Р-домен начинается с 2, 3, 4, или 5 нуклеотидов в прямом направлении от последнего парного нуклеотида дуплекса, образованного crPHK и tracrPHK, и указанный Р-домен содержит 2, 3, 4, или 5 следующих друг за другом нуклеотидов.
21. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту по п. 20, отличающаяся тем, что указанный модифицированный Р-домен содержит одну или более мутаций для обеспечения гибридизации сконструированной нуклеиновой кислоты, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, с различным примыкающим к протоспейсеру мотивом по сравнению с соответствующим tracrPHK.
22. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту по п. 16, отличающаяся тем, что указанная Csy4 связывающая последовательность представляет собой Csy4-метки, представленные на фигурах фиг. 27А или фиг. 27В.
23. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, по п. 16, отличающаяся тем, что указанная последовательность tracr с удлинением дополнительно содержит функциональный фрагмент.
24. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, по п. 16, отличающаяся тем, что указанная последовательность спейсера с удлинением дополнительно содержит функциональный фрагмент.
25. Сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, по п. 16, отличающаяся тем, что сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, содержит ДНК.
26. Вектор, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую сконструированную нуклеиновую кислоту, нацеленную на нуклеиновую кислоту, по любому из пп. 16-24.
27. Композиция, содержащая композицию модифицированного белка Cas9 по любому из пп. 1-14, и сконструированную нуклеиновую кислоту, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, по любому из пп. 16-25.
28. Способ детекции того, находятся ли два комплекса поблизости друг от друга, включающий
(а) приведение первой целевой нуклеиновой кислоты в контакт с первым комплексом, при этом указанный первый комплекс содержит первый сайт-специфический полипептид, первую модифицированную нуклеиновую кислоту, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, содержащую последовательность, комплементарную первой целевой нуклеиновой кислоте, и первый эффекторный белок, причем указанный первый эффекторный белок выполнен с возможностью связывания с указанной модифицированной нуклеиновой кислотой, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, и при этом указанный первый эффекторный белок содержит негативную последовательность, которая содержит первый фрагмент комбинированной системы; и
приведение второй целевой нуклеиновой кислоты в контакт со вторым комплексом, при этом указанный второй комплекс содержит второй сайт-специфический полипептид, вторую модифицированную нуклеиновую кислоту, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, содержащую вторую последовательность нуклеиновой кислоты, комплементарную второй целевой нуклеиновой кислоте, и второй эффекторный белок, причем указанный эффекторный белок выполнен с возможностью связывания с указанной второй модифицированной нуклеиновой кислотой, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, и при этом указанный второй эффекторный белок содержит вторую ненативную последовательность, которая содержит второй фрагмент комбинированной системы; и
детекция взаимодействия между указанным первым фрагментом и указанным вторым фрагментом, причем указанная детекция показывает, что указанные первый и второй комплексы находятся поблизости друг от друга.
29. Способ по п. 28, отличающийся тем, что указанная комбинированная система содержит два или более фрагментов белка, причем указанные фрагменты белка по отдельности не являются активными, но образуемый из указанных белковых фрагментов комплекс является активным.
30. Способ по п. 28, отличающийся тем, что указанное детектирование включает обнаружение явления генетической мобильности.
31. Способ идентификации нецелевых сайтов связывания по отношению к целевой последовательности ДНК, включающий
приведение смеси фрагментов ДНК, содержащей целевую последовательность ДНК, в контакт с ферментно неактивным белком Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, причем (i) указанный белок Cas9 содержит афинную метку, нуклеиновая кислота, нацеленная на нуклеиновую кислоту, содержит афинную метку, или их комбинация, и (ii) Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, связывается с целевой последовательностью ДНК;
выделение белка Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, и связывание фрагментов ДНК с применением агента захвата, связывающегося с афинной меткой;
очистка фрагментов ДНК, которые были связаны Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту;
секвенирование фрагментов ДНК, которые были связаны Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту; и
идентификация нецелевых сайтов связывания из последовательностей фрагментов ДНК, которые были связаны Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, и не содержали последовательности связывания целевой ДНК.
32. Способ получения липких концов или разрезов с тупыми концами в двуцепочечной ДНК, содержащей целевой сайт, содержащий первую цепь и вторую цепь, включающий
приведение двуцепочечной ДНК в контакт с Cas9-никазой в комплексе с первой нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, причем Cas9-никаза в комплексе с первой нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, разрезает первую цепь целевого сайта и образует сайт разрезания первой цепи; и
приведение двуцепочечной ДНК в контакт с Cas9-никазой в комплексе со второй нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, причем Cas9-никаза в комплексе со второй нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, разрезает вторую цепь целевого сайта и образует сайт разрезания второй цепи;
причем либо (i) сайт разрезания первой цепи и сайт разрезания второй цепи находятся в одном положении целевого сайта с образованием разреза с тупым концом; либо (ii) сайт разрезания первой цепи и сайт разрезания второй цепи находятся в разных положениях целевого сайта с образованием липких концов.
33. Способ обогащения целевой нуклеиновой кислоты, включающий
приведение смеси нуклеиновых кислот, содержащих целевую нуклеиновую кислоту, в контакт с ферментативно неактивным белком Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, причем (i) белок Cas9, нуклеиновая кислота, нацеленная на нуклеиновую кислоту, или их комбинация дополнительно содержит афинную метку, и (ii) Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, связывается с целевой нуклеиновой кислотой; и
выделение целевой нуклеиновой кислоты, связанной с белком Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, с применением агента захвата, связывающегося с афинной меткой с обеспечением обогащения целевой нуклеиновой кислоты.
34. Мультиплексный направляющий генетический агент, содержащий
множество нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты, причем каждая нуклеиновая кислота, нацеленная на нуклеиновую кислоту, содержит одиночную направляющую РНК (sgPHK), причем указанная sgPHK содержит crPHK и tracrPHK, при этом указанная sgPHK может ассоциироваться с белком Cas9 с образованием sgPHK-Cas9 комплекса; и
множество ненативных последовательностей, причем каждая ненативная последовательность содержит фрагмент, последовательность, связывающую эндорибонуклеазу, или рибозим;
при этом модуль нуклеиновой кислоты содержит нуклеиновую кислоту, нацеленную на нуклеиновую кислоту, расположенную рядом с ненативной последовательностью, и множество модулей нуклеиновых кислот объединены в тандем.
35. Мультиплексный направляющий генетический агент по п. 34, отличающийся тем, что каждая ненативная последовательность содержит последовательность, связывающую эндонуклеазу, и указанная последовательность, связывающая эндонуклеазу, выбрана из группы, состоящей из сайта связывания белка Csy4, сайта связывания белка Cas5, и сайта связывания белка Cas6.
36. Комплекс для стехиометрической доставки, содержащей
сконструированный тандемный гибридный полипептид, содержащий множество белков, связывающих нуклеиновые кислоты, причем каждый белок, связывающий нуклеиновые кислоты, может связывать нуклеиновую кислоту, содержащую когнатный сайт для связывания белков, связывающих нуклеиновую кислоту, который может связываться белком, связывающим нуклеиновую кислоту.
37. Комплекс для стехиометрической доставки по п. 36, отличающийся тем, что каждый белок, связывающий нуклеиновую кислоту, представляет собой РНК-связывающий белок или ДНК-связывающий белок.
38. Комплекс для стехиометрической доставки по п. 36, отличающийся тем, что белок, связывающий нуклеиновую кислоту, связан с нуклеиновой кислотой, содержащей когнатный сайт для связывания белков, связывающих нуклеиновую кислоту.
39. Способ модификации геномной ДНК клетки, причем указанная геномная ДНК содержит целевую нуклеиновую кислоту, включающий
вставку донорного полинуклеотда в целевую нуклеиновую кислоту геномной ДНК, причем (i) белок Cas9 в комплексе с первой нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, расщепляет целевую нуклеиновую кислоту, (ii) донорный полинуклеотид интегрирован в расщепленную целевую нуклеиновую кислоту, и (iii) донорный поинуклеотид содержит интересующий генетический элемент и репортерный элемент, причем указанный репортерный элемент фланкирован 5' целевым сайтом и 3' целевым сайтом;
отбор клеток, экспрессирующих репортерный элемент; и
выделение репортерного элемента, причем (i) белок Cas9 в комплексе со второй нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, расщепляет 5' целевой сайт с образованием первого конца, и белок Cas9 в комплексе с третьей нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, расщепляет 3' целевой сайт с образованием второго конца, и (ii) первый конец и второй конец объединены.
40. Способ отслеживания развития клеточной линии в популяции клеток, включающий
мечение геномной ДНК, содержащей целевой сайт, в клетках популяции клеток посредством приведения геномной ДНК клеток в контакт с белком Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, который разрезает целевой сайт с образованием первого конца и второго конца, причем механизм клеточной репарации соединяет первый конец и второй конец и образует большое количество характерных последовательностей в большом количестве клеток;
размножение популяции клеток, содержащих характерные последовательности;
анализ клеток популяции для определения клеток, ассоциированных с каждой характерной последовательностью; и
применение характерных последовательностей для определения клеточной линии клеток в клетках популяции клеток.
41. Способ по п. 40 отслеживания развития клеточной линии в популяции клеток, дополнительно включающий приведение геномной ДНК в контакт с (i) белком Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, и (ii) донорный полинуклеотид.
42. Способ количественной оценки событий редактирования геномной ДНК в популяции клеток, причем геномная ДНК содержит целевую нуклеиновую кислоту, включающий
приведение геномной ДНК клеток в популяции в контакт с белком Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, причем (i) белок Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, может разрезать целевой сайт с образованием первого конца и второго конца, (ii) когда белок Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, разрезает целевой сайт, причем механизм клеточной репарации соединяет первый конец и второй конец с устранением целевого сайта, и (iii) указанное приведение в контакт образует множество клеток, содержащих геномную ДНК, содержащую целевой сайт, и множество клеток, содержащих геномную ДНК, где целевой сайт устранен;
выделение геномной ДНК из популяции клеток;
выполнение полимеразной цепной реакции (ПЦР) с выделенной геномной ДНК с применением праймеров, фланкирующих целевой сайт с образованием амплифицированного ПЦР-продукта;
приведение амплифицированного ПЦР-продукта в контакт с белком Cas9 в комплексе с нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту; и
количественную оценку событий редактирования генома путем сравнения количества амплифицированного ПЦР-продукта, полученного из геномной ДНК, содержащей целевой сайт в амплифицированном ПЦР-продукте с количеством амплифицированного ПЦР-продукта, полученного из геномной ДНК, целевой сайт которой устранен.
43. Способ по п. 42 для количественной оценки событий редактирования геномной ДНК, отличающийся тем, что количественная оценка выполняется с применением гель-электрофореза.
44. Композиция, содержащая
Сконструированную нуклеиновую кислоту, нацеленную на нуклеиновую кислоту, содержащую crPHK и tracrPHK, причем (i) сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, может связываться с белком Cas9 с образованием комплекса crPHK-tracrPHK-Cas9 (ii) указанная tracrPHK содержит 3' конец, (iii) указанный tracrPHK дополнительно содержит гибридизующую последовательность на 3' конце, и (iv) указанная гибридизующая последовательность содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая может гибридизоваться с донорным полинуклеотидом.
45. Композиция по п. 44, дополнительно содержащая белок Cas9.
46. Способ доставки донорного полинуклеотида к двуцепочечному разрыву в целевом сайте, включающий
приведение последовательности ДНК, содержащей целевой сайт, в контакт со сконструированной нуклеиновой кислотой, нацеленной на нуклеиновую кислоту, содержащей crPHK и tracrPHK, причем (i) сконструированная нуклеиновая кислота, которая нацелена на нуклеиновую кислоту, ассоциирована в комплексе с белком Cas9 с образованием комплекса crPHK-tracrPHK-Cas9, (ii) указанная tracrPHK содержит 3' конец, (iii) указанная tracrPHK дополнительно содержит гибридизующую последовательность на 3' конце, (iv) указанная гибридизующая последовательность содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая гибридизуется с донорным полинуклеотидом, и (v) указанный комплекс crPHK-tracrPHK-Cas9 связывается с последовательностью ДНК, содержащей целевой сайт, и разрезает указанный целевой сайт с получением двуцепочечного разрыва, и связывание указанного crPHK-tracrPHK-Cas9 комплекса доставляет указанный донорный полинуклеотид к двуцепочечному разрыву в целевом сайте.
RU2015140276A 2013-03-14 2014-03-12 Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты RU2662932C2 (ru)

Applications Claiming Priority (37)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361781598P 2013-03-14 2013-03-14
US61/781,598 2013-03-14
US201361818382P 2013-05-01 2013-05-01
US201361818386P 2013-05-01 2013-05-01
US61/818,386 2013-05-01
US61/818,382 2013-05-01
US201361822002P 2013-05-10 2013-05-10
US61/822,002 2013-05-10
US201361832690P 2013-06-07 2013-06-07
US61/832,690 2013-06-07
US201361845714P 2013-07-12 2013-07-12
US61/845,714 2013-07-12
US201361858767P 2013-07-26 2013-07-26
US61/858,767 2013-07-26
US201361859661P 2013-07-29 2013-07-29
US61/859,661 2013-07-29
US201361865743P 2013-08-14 2013-08-14
US61/865,743 2013-08-14
US201361883804P 2013-09-27 2013-09-27
US61/883,804 2013-09-27
US201361899712P 2013-11-04 2013-11-04
US61/899,712 2013-11-04
US201361900311P 2013-11-05 2013-11-05
US61/900,311 2013-11-05
US201361902723P 2013-11-11 2013-11-11
US61/902,723 2013-11-11
US201361903232P 2013-11-12 2013-11-12
US61/903,232 2013-11-12
US201361906211P 2013-11-19 2013-11-19
US201361906335P 2013-11-19 2013-11-19
US61/906,211 2013-11-19
US61/906,335 2013-11-19
US201361907216P 2013-11-21 2013-11-21
US61/907,216 2013-11-21
US201361907777P 2013-11-22 2013-11-22
US61/907,777 2013-11-22
PCT/US2014/023828 WO2014150624A1 (en) 2013-03-14 2014-03-12 Compositions and methods of nucleic acid-targeting nucleic acids

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018122288A Division RU2018122288A (ru) 2013-03-14 2014-03-12 Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2015140276A true RU2015140276A (ru) 2017-05-04
RU2662932C2 RU2662932C2 (ru) 2018-07-31

Family

ID=51580795

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018122288A RU2018122288A (ru) 2013-03-14 2014-03-12 Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты
RU2015140276A RU2662932C2 (ru) 2013-03-14 2014-03-12 Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018122288A RU2018122288A (ru) 2013-03-14 2014-03-12 Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты

Country Status (19)

Country Link
US (17) US9260752B1 (ru)
EP (2) EP3620534B1 (ru)
JP (3) JP2016519652A (ru)
KR (2) KR101780885B1 (ru)
CN (2) CN111454951A (ru)
AU (3) AU2014235794A1 (ru)
BR (1) BR112015022061B8 (ru)
CA (1) CA2905432C (ru)
DK (2) DK3620534T3 (ru)
ES (2) ES2749624T3 (ru)
GB (1) GB2527450A (ru)
HK (1) HK1213023A1 (ru)
IL (1) IL241563B (ru)
MX (1) MX2015013057A (ru)
NZ (1) NZ712727A (ru)
RU (2) RU2018122288A (ru)
SG (1) SG11201507378UA (ru)
WO (1) WO2014150624A1 (ru)
ZA (1) ZA201507006B (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2652899C1 (ru) * 2017-12-28 2018-05-03 Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора) РНК-проводники для подавления репликации вируса гепатита B и для элиминации вируса гепатита B из клетки-хозяина

Families Citing this family (291)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2401367B1 (en) 2009-02-26 2016-11-30 Transposagen Biopharmaceuticals, Inc. Hyperactive piggybac transposases
EP2734621B1 (en) 2011-07-22 2019-09-04 President and Fellows of Harvard College Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity
US11021737B2 (en) 2011-12-22 2021-06-01 President And Fellows Of Harvard College Compositions and methods for analyte detection
PL2847335T3 (pl) 2012-04-25 2019-01-31 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Celowanie dużymi wektorami do celowania wspomagane nukleazą
DE202013012597U1 (de) * 2012-10-23 2017-11-21 Toolgen, Inc. Zusammensetzung zum Spalten einer Ziel-DNA, umfassend eine für die Ziel-DNA spezifische guide-RNA und eine Cas-Protein-codierende Nukleinsäure oder ein Cas-Protein, sowie deren Verwendung
PL3138910T3 (pl) 2012-12-06 2018-01-31 Sigma Aldrich Co Llc Oparta na CRISPR modyfikacja i regulacja genomu
SG10201707569YA (en) 2012-12-12 2017-10-30 Broad Inst Inc Delivery, Engineering and Optimization of Systems, Methods and Compositions for Sequence Manipulation and Therapeutic Applications
EP3434776A1 (en) 2012-12-12 2019-01-30 The Broad Institute, Inc. Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof
WO2014099744A1 (en) 2012-12-17 2014-06-26 President And Fellows Of Harvard College Rna-guided human genome engineering
EP3919505B1 (en) 2013-01-16 2023-08-30 Emory University Uses of cas9-nucleic acid complexes
US10138509B2 (en) 2013-03-12 2018-11-27 President And Fellows Of Harvard College Method for generating a three-dimensional nucleic acid containing matrix
WO2014150624A1 (en) 2013-03-14 2014-09-25 Caribou Biosciences, Inc. Compositions and methods of nucleic acid-targeting nucleic acids
WO2014204578A1 (en) 2013-06-21 2014-12-24 The General Hospital Corporation Using rna-guided foki nucleases (rfns) to increase specificity for rna-guided genome editing
KR102210319B1 (ko) 2013-03-15 2021-02-01 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 특정 게놈 좌위에 대한 유전적 및 후성적 조절 단백질의 rna-안내 표적화
US10760064B2 (en) 2013-03-15 2020-09-01 The General Hospital Corporation RNA-guided targeting of genetic and epigenomic regulatory proteins to specific genomic loci
WO2014165825A2 (en) 2013-04-04 2014-10-09 President And Fellows Of Harvard College Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems
US9902973B2 (en) 2013-04-11 2018-02-27 Caribou Biosciences, Inc. Methods of modifying a target nucleic acid with an argonaute
HUE040575T2 (hu) 2013-04-16 2019-03-28 Regeneron Pharma A patkány genom célzott módosítása
US9873907B2 (en) 2013-05-29 2018-01-23 Agilent Technologies, Inc. Method for fragmenting genomic DNA using CAS9
JP6670743B2 (ja) * 2013-05-29 2020-03-25 セレクティスＣｅｌｌｅｃｔｉｓ Ｉｉ型ｃｒｉｓｐｒシステムにおける新規のコンパクトなｃａｓ９足場
JP7065564B2 (ja) * 2013-05-29 2022-05-12 セレクティス Ｃａｓ９ニッカーゼ活性を用いて正確なｄｎａ切断をもたらすための方法
US20140356956A1 (en) 2013-06-04 2014-12-04 President And Fellows Of Harvard College RNA-Guided Transcriptional Regulation
WO2014197568A2 (en) 2013-06-04 2014-12-11 President And Fellows Of Harvard College Rna-guideded transcriptional regulation
KR20160034901A (ko) 2013-06-17 2016-03-30 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 서열 조작에 최적화된 ｃｒｉｓｐｒ-ｃａｓ 이중 닉카아제 시스템, 방법 및 조성물
RU2716421C2 (ru) 2013-06-17 2020-03-11 Те Брод Инститьют Инк. Доставка, применение и применения в терапии систем crispr-cas и композиций для целенаправленного воздействия на нарушения и заболевания с использованием вирусных компонентов
BR112015031608A2 (pt) 2013-06-17 2017-08-22 Massachusetts Inst Technology Aplicação e uso dos sistemas crispr-cas, vetores e composições para direcionamento e terapia hepáticos
AU2014281026B2 (en) 2013-06-17 2020-05-28 Massachusetts Institute Of Technology Delivery, engineering and optimization of tandem guide systems, methods and compositions for sequence manipulation
WO2014204727A1 (en) 2013-06-17 2014-12-24 The Broad Institute Inc. Functional genomics using crispr-cas systems, compositions methods, screens and applications thereof
JP2016528890A (ja) 2013-07-09 2016-09-23 プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系を用いるゲノム編集の治療用の使用
US11306328B2 (en) 2013-07-26 2022-04-19 President And Fellows Of Harvard College Genome engineering
US9163284B2 (en) 2013-08-09 2015-10-20 President And Fellows Of Harvard College Methods for identifying a target site of a Cas9 nuclease
US9359599B2 (en) 2013-08-22 2016-06-07 President And Fellows Of Harvard College Engineered transcription activator-like effector (TALE) domains and uses thereof
EP3611268A1 (en) 2013-08-22 2020-02-19 E. I. du Pont de Nemours and Company Plant genome modification using guide rna/cas endonuclease systems and methods of use
US9526784B2 (en) 2013-09-06 2016-12-27 President And Fellows Of Harvard College Delivery system for functional nucleases
US9388430B2 (en) 2013-09-06 2016-07-12 President And Fellows Of Harvard College Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
US9340799B2 (en) 2013-09-06 2016-05-17 President And Fellows Of Harvard College MRNA-sensing switchable gRNAs
DE202014010413U1 (de) 2013-09-18 2015-12-08 Kymab Limited Zellen und Organismen
WO2015066119A1 (en) 2013-10-30 2015-05-07 North Carolina State University Compositions and methods related to a type-ii crispr-cas system in lactobacillus buchneri
DK3066201T3 (en) 2013-11-07 2018-06-06 Editas Medicine Inc CRISPR-RELATED PROCEDURES AND COMPOSITIONS WITH LEADING GRADES
AU2014350051A1 (en) * 2013-11-18 2016-07-07 Crispr Therapeutics Ag CRISPR-Cas system materials and methods
US9074199B1 (en) 2013-11-19 2015-07-07 President And Fellows Of Harvard College Mutant Cas9 proteins
MX2016007654A (es) 2013-12-11 2017-08-15 Regeneron Pharma Metodos y composiciones para la modificacion dirigida de un genoma.
US11053481B2 (en) 2013-12-12 2021-07-06 President And Fellows Of Harvard College Fusions of Cas9 domains and nucleic acid-editing domains
SG10201804974RA (en) 2013-12-12 2018-07-30 Broad Inst Inc Compositions and Methods of Use of Crispr-Cas Systems in Nucleotide Repeat Disorders
BR112016013201B1 (pt) 2013-12-12 2023-01-31 The Broad Institute, Inc. Uso de uma composição compreendendo um sistema crispr-cas no tratamento de uma doença genética ocular
WO2015089364A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 The Broad Institute Inc. Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof
EP3080271B1 (en) 2013-12-12 2020-02-12 The Broad Institute, Inc. Systems, methods and compositions for sequence manipulation with optimized functional crispr-cas systems
US10787654B2 (en) 2014-01-24 2020-09-29 North Carolina State University Methods and compositions for sequence guiding Cas9 targeting
PL3105328T3 (pl) 2014-02-11 2020-10-19 The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate Umożliwiana przez CRISPR multipleksowa modyfikacja genomu
CA3194412A1 (en) 2014-02-27 2015-09-03 Monsanto Technology Llc Compositions and methods for site directed genomic modification
WO2015134812A1 (en) 2014-03-05 2015-09-11 Editas Medicine, Inc. Crispr/cas-related methods and compositions for treating usher syndrome and retinitis pigmentosa
US11141493B2 (en) 2014-03-10 2021-10-12 Editas Medicine, Inc. Compositions and methods for treating CEP290-associated disease
US11339437B2 (en) 2014-03-10 2022-05-24 Editas Medicine, Inc. Compositions and methods for treating CEP290-associated disease
US9938521B2 (en) 2014-03-10 2018-04-10 Editas Medicine, Inc. CRISPR/CAS-related methods and compositions for treating leber's congenital amaurosis 10 (LCA10)
US11242525B2 (en) 2014-03-26 2022-02-08 Editas Medicine, Inc. CRISPR/CAS-related methods and compositions for treating sickle cell disease
JP2017512481A (ja) * 2014-04-08 2017-05-25 ノースカロライナ ステート ユニバーシティーＮｏｒｔｈ Ｃａｒｏｌｉｎａ Ｓｔａｔｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｃｒｉｓｐｒ関連遺伝子を用いた、ｒｎａ依存性の転写抑制のための方法および組成物
US20170191123A1 (en) * 2014-05-28 2017-07-06 Toolgen Incorporated Method for Sensitive Detection of Target DNA Using Target-Specific Nuclease
US10066241B2 (en) 2014-05-30 2018-09-04 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Compositions and methods of delivering treatments for latent viral infections
WO2015188056A1 (en) * 2014-06-05 2015-12-10 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for nuclease design
CA2951707A1 (en) * 2014-06-10 2015-12-17 Massachusetts Institute Of Technology Method for gene editing
ES2888976T3 (es) * 2014-06-23 2022-01-10 Massachusetts Gen Hospital Identificación no sesgada pangenómica de DSBs evaluada por secuenciación (GUIDE-Seq.)
US10077453B2 (en) 2014-07-30 2018-09-18 President And Fellows Of Harvard College CAS9 proteins including ligand-dependent inteins
US10435685B2 (en) 2014-08-19 2019-10-08 Pacific Biosciences Of California, Inc. Compositions and methods for enrichment of nucleic acids
WO2016028887A1 (en) 2014-08-19 2016-02-25 Pacific Biosciences Of California, Inc. Compositions and methods for enrichment of nucleic acids
WO2016028843A2 (en) * 2014-08-19 2016-02-25 President And Fellows Of Harvard College Rna-guided systems for probing and mapping of nucleic acids
SG11201701245QA (en) 2014-08-27 2017-03-30 Caribou Biosciences Inc Methods for increasing cas9-mediated engineering efficiency
WO2016033298A1 (en) 2014-08-28 2016-03-03 North Carolina State University Novel cas9 proteins and guiding features for dna targeting and genome editing
RU2017112324A (ru) 2014-09-12 2018-10-15 Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. Создание сайтов сайт-специфической интеграции для сложных локусов признаков в кукурузе и сое, а также способы применения
US20170306306A1 (en) * 2014-10-24 2017-10-26 Life Technologies Corporation Compositions and Methods for Enhancing Homologous Recombination
WO2016070037A2 (en) * 2014-10-31 2016-05-06 Massachusetts Institute Of Technology Massively parallel combinatorial genetics for crispr
EP3215617B1 (en) 2014-11-07 2024-05-08 Editas Medicine, Inc. Systems for improving crispr/cas-mediated genome-editing
LT3221457T (lt) 2014-11-21 2019-06-10 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Nukreipiančios genetinės modifikacijos būdai ir kompozicijos, naudojant suporuotas kreipiančiąsias rnr sekas
JP7068821B2 (ja) 2014-12-03 2022-05-17 アジレント・テクノロジーズ・インク 化学修飾を有するガイドｒｎａ
WO2016094679A1 (en) 2014-12-10 2016-06-16 Regents Of The University Of Minnesota Genetically modified cells, tissues, and organs for treating disease
EP3230452A1 (en) * 2014-12-12 2017-10-18 The Broad Institute Inc. Dead guides for crispr transcription factors
EP3985115A1 (en) 2014-12-12 2022-04-20 The Broad Institute, Inc. Protected guide rnas (pgrnas)
CN107208096B (zh) 2014-12-18 2021-02-12 综合基因技术公司 基于crispr的组合物和使用方法
EP3957745A1 (en) 2014-12-20 2022-02-23 Arc Bio, LLC Compositions and methods for targeted depletion, enrichment, and partitioning of nucleic acids using crispr/cas system proteins
US11208638B2 (en) 2015-01-12 2021-12-28 The Regents Of The University Of California Heterodimeric Cas9 and methods of use thereof
LT3250691T (lt) 2015-01-28 2023-09-11 Caribou Biosciences, Inc. Crispr hibridiniai dnr/rnr polinukleotidai ir naudojimo būdai
EP3250689B1 (en) 2015-01-28 2020-11-04 The Regents of The University of California Methods and compositions for labeling a single-stranded target nucleic acid
KR20160103953A (ko) * 2015-02-25 2016-09-02 연세대학교 산학협력단 Crispr 시스템을 이용한 다중 위치 염기서열의 동시 포획 방법
EP3858990A1 (en) 2015-03-03 2021-08-04 The General Hospital Corporation Engineered crispr-cas9 nucleases with altered pam specificity
WO2016149547A1 (en) 2015-03-17 2016-09-22 Bio-Rad Laboratories, Inc. Detection of genome editing
US10450576B2 (en) 2015-03-27 2019-10-22 E I Du Pont De Nemours And Company Soybean U6 small nuclear RNA gene promoters and their use in constitutive expression of small RNA genes in plants
CN108124453B (zh) 2015-03-31 2022-04-05 爱克莱根科技公司 用于将DNA序列靶向并入细胞或生物体的基因组中的Cas9逆转录病毒整合酶和Cas9重组酶系统
CN107787367B (zh) 2015-04-06 2021-10-26 里兰斯坦福初级大学理事会 用于crispr/cas介导的基因调控的化学修饰的引导rna
JP2018522249A (ja) 2015-04-24 2018-08-09 エディタス・メディシン、インコーポレイテッド Ｃａｓ９分子／ガイドｒｎａ分子複合体の評価
WO2016182959A1 (en) 2015-05-11 2016-11-17 Editas Medicine, Inc. Optimized crispr/cas9 systems and methods for gene editing in stem cells
EA201792663A1 (ru) 2015-05-29 2018-04-30 Норт Каролина Стейт Юниверсити Способы скрининга бактерий, архей, водорослей и дрожжей с использованием нуклеиновых кислот crispr
US10117911B2 (en) 2015-05-29 2018-11-06 Agenovir Corporation Compositions and methods to treat herpes simplex virus infections
EP3303585A4 (en) 2015-06-03 2018-10-31 Board of Regents of the University of Nebraska Dna editing using single-stranded dna
EP3303634B1 (en) 2015-06-03 2023-08-30 The Regents of The University of California Cas9 variants and methods of use thereof
EP3307887A1 (en) 2015-06-09 2018-04-18 Editas Medicine, Inc. Crispr/cas-related methods and compositions for improving transplantation
US20160362667A1 (en) 2015-06-10 2016-12-15 Caribou Biosciences, Inc. CRISPR-Cas Compositions and Methods
WO2016201138A1 (en) 2015-06-12 2016-12-15 The Regents Of The University Of California Reporter cas9 variants and methods of use thereof
EP3307872B1 (en) 2015-06-15 2023-09-27 North Carolina State University Methods and compositions for efficient delivery of nucleic acids and rna-based antimicrobials
WO2016205759A1 (en) 2015-06-18 2016-12-22 The Broad Institute Inc. Engineering and optimization of systems, methods, enzymes and guide scaffolds of cas9 orthologs and variants for sequence manipulation
CA2989830A1 (en) 2015-06-18 2016-12-22 The Broad Institute, Inc. Crispr enzyme mutations reducing off-target effects
US9790490B2 (en) 2015-06-18 2017-10-17 The Broad Institute Inc. CRISPR enzymes and systems
US20170000743A1 (en) * 2015-07-02 2017-01-05 Vindico NanoBio Technology Inc. Compositions and Methods for Delivery of Gene Editing Tools Using Polymeric Vesicles
US10456452B2 (en) 2015-07-02 2019-10-29 Poseida Therapeutics, Inc. Compositions and methods for improved encapsulation of functional proteins in polymeric vesicles
CA2993431A1 (en) 2015-07-31 2017-02-09 Regents Of The University Of Minnesota Nuclease based knockouts of immunological checkpoint genes in immune cells
AU2016301196B2 (en) 2015-08-06 2022-09-08 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Tunable endogenous protein degradation
US9580727B1 (en) * 2015-08-07 2017-02-28 Caribou Biosciences, Inc. Compositions and methods of engineered CRISPR-Cas9 systems using split-nexus Cas9-associated polynucleotides
WO2017040348A1 (en) 2015-08-28 2017-03-09 The General Hospital Corporation Engineered crispr-cas9 nucleases
US9512446B1 (en) 2015-08-28 2016-12-06 The General Hospital Corporation Engineered CRISPR-Cas9 nucleases
US9926546B2 (en) 2015-08-28 2018-03-27 The General Hospital Corporation Engineered CRISPR-Cas9 nucleases
WO2017040709A1 (en) 2015-08-31 2017-03-09 Caribou Biosciences, Inc. Directed nucleic acid repair
WO2017044776A1 (en) * 2015-09-10 2017-03-16 Texas Tech University System Single-guide rna (sgrna) with improved knockout efficiency
CN105177110A (zh) * 2015-09-11 2015-12-23 中国科学院微生物研究所 核酸的检测方法
JP2018530536A (ja) 2015-09-11 2018-10-18 ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション ヌクレアーゼＤＳＢの完全照合およびシーケンシング（ＦＩＮＤ−ｓｅｑ）
WO2017053879A1 (en) 2015-09-24 2017-03-30 Editas Medicine, Inc. Use of exonucleases to improve crispr/cas-mediated genome editing
WO2017053713A1 (en) * 2015-09-25 2017-03-30 Tarveda Therapeutics, Inc. Compositions and methods for genome editing
WO2017058751A1 (en) 2015-09-28 2017-04-06 North Carolina State University Methods and compositions for sequence specific antimicrobials
EP3356526B1 (en) 2015-09-30 2021-08-25 The General Hospital Corporation Comprehensive in vitro reporting of cleavage events by sequencing (circle-seq)
CA3000917A1 (en) 2015-10-09 2017-04-13 Monsanto Technology Llc Rna-guided nucleases and uses thereof
ES2699848T3 (es) 2015-10-23 2019-02-13 Caribou Biosciences Inc Acido nucleico CRISPR clase 2 de tipo cruzado modificado que se dirige a ácidos nucleicos
IL310721A (en) 2015-10-23 2024-04-01 Harvard College Nucleobase editors and their uses
CN108474022A (zh) 2015-11-03 2018-08-31 哈佛学院董事及会员团体 用于包含三维核酸的基质容积成像的设备和方法
CN108699542A (zh) 2015-11-13 2018-10-23 阿维利诺美国实验室股份有限公司 用于治疗角膜营养不良的方法
CA3004757C (en) * 2015-12-04 2020-07-21 Caribou Biosciences, Inc. Engineered nucleic-acid targeting nucleic acids
US11542466B2 (en) 2015-12-22 2023-01-03 North Carolina State University Methods and compositions for delivery of CRISPR based antimicrobials
JP7012645B2 (ja) 2016-01-11 2022-01-28 ザ ボード オブ トラスティーズ オブ ザ レランド スタンフォード ジュニア ユニバーシティー キメラタンパク質および免疫治療の方法
IL304088A (en) 2016-01-11 2023-08-01 Univ Leland Stanford Junior Systems containing chimeric proteins and their uses for controlling gene expression
WO2017127761A1 (en) 2016-01-20 2017-07-27 Vitrisa Therapeutics, Inc. Compositions and methods for inhibiting factor d
CN109072224B (zh) * 2016-01-30 2022-07-15 株式会社博纳克 人工单导rna及其用途
US20170218398A1 (en) * 2016-01-30 2017-08-03 Markus Alexander Brown Method to selectively target cancerous cells for genetic manipulation
WO2017139309A1 (en) 2016-02-12 2017-08-17 Ceres, Inc. Methods and materials for high throughput testing of mutagenized allele combinations
EP3881857A1 (en) 2016-02-18 2021-09-22 The Penn State Research Foundation Generating gabaergic neurons in brains
US20190249172A1 (en) 2016-02-18 2019-08-15 The Regents Of The University Of California Methods and compositions for gene editing in stem cells
WO2017147056A1 (en) 2016-02-22 2017-08-31 Caribou Biosciences, Inc. Methods for modulating dna repair outcomes
US11920174B2 (en) * 2016-03-03 2024-03-05 CureVac SE RNA analysis by total hydrolysis and quantification of released nucleosides
WO2017161043A1 (en) 2016-03-16 2017-09-21 The J. David Gladstone Institutes Methods and compositions for treating obesity and/or diabetes and for identifying candidate treatment agents
EP3433364A1 (en) 2016-03-25 2019-01-30 Editas Medicine, Inc. Systems and methods for treating alpha 1-antitrypsin (a1at) deficiency
EP3433363A1 (en) 2016-03-25 2019-01-30 Editas Medicine, Inc. Genome editing systems comprising repair-modulating enzyme molecules and methods of their use
EP3440224A4 (en) * 2016-04-08 2019-08-28 Cold Spring Harbor Laboratory MULTIPLEXED ANALYSIS OF NEURON PROJECTIONS BY SEQUENCING
MA45478A (fr) * 2016-04-11 2019-02-20 Arbutus Biopharma Corp Compositions de conjugués d'acides nucléiques ciblés
WO2017180694A1 (en) 2016-04-13 2017-10-19 Editas Medicine, Inc. Cas9 fusion molecules gene editing systems, and methods of use thereof
CA3022290A1 (en) 2016-04-25 2017-11-02 President And Fellows Of Harvard College Hybridization chain reaction methods for in situ molecular detection
EP4166661A1 (en) * 2016-04-29 2023-04-19 BASF Plant Science Company GmbH Fused donor - guide nucleic acid and methods for modification of target nucleic acids
ES2865481T3 (es) 2016-04-29 2021-10-15 Poseida Therapeutics Inc Micelas basadas en poli(histidina) para la complejación y el aporte de proteínas y ácidos nucleicos
CN116397007A (zh) * 2016-05-11 2023-07-07 伊鲁米那股份有限公司 使用argonaute系统的多核苷酸富集和扩增
CA3209273A1 (en) 2016-06-02 2017-12-07 Sigma-Aldrich Co. Llc Using programmable dna binding proteins to enhance targeted genome modification
US10767175B2 (en) 2016-06-08 2020-09-08 Agilent Technologies, Inc. High specificity genome editing using chemically modified guide RNAs
US10337051B2 (en) 2016-06-16 2019-07-02 The Regents Of The University Of California Methods and compositions for detecting a target RNA
US20190323038A1 (en) * 2016-06-17 2019-10-24 Montana State Univesity Bidirectional targeting for genome editing
LT3474669T (lt) 2016-06-24 2022-06-10 The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate Barkodu pažymėtų kombinatorinių bibliotekų generavimo būdai
EP3494220A1 (en) 2016-08-02 2019-06-12 Editas Medicine, Inc. Compositions and methods for treating cep290 associated disease
CA3032699A1 (en) 2016-08-03 2018-02-08 President And Fellows Of Harvard College Adenosine nucleobase editors and uses thereof
AU2017308889B2 (en) 2016-08-09 2023-11-09 President And Fellows Of Harvard College Programmable Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
WO2018031950A1 (en) 2016-08-12 2018-02-15 Caribou Biosciences, Inc. Protein engineering methods
WO2018035466A1 (en) * 2016-08-18 2018-02-22 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Targeted mutagenesis
WO2018039438A1 (en) 2016-08-24 2018-03-01 President And Fellows Of Harvard College Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing
WO2018048194A1 (ko) * 2016-09-07 2018-03-15 울산대학교 산학협력단 dCas9 단백질 및 표적 핵산 서열에 결합하는 gRNA를 이용한 핵산 검출의 민감도 및 특이도 향상용 조성물 및 방법
JP7063885B2 (ja) 2016-09-13 2022-05-09 ザ ジャクソン ラボラトリー 標的にされた増大するｄｎａ脱メチル化
WO2018053053A1 (en) * 2016-09-13 2018-03-22 The Broad Institute, Inc. Proximity-dependent biotinylation and uses thereof
EP3523426A4 (en) 2016-09-30 2020-01-22 The Regents of The University of California RNA GUIDED NUCLEIC ACID MODIFYING ENZYMES AND METHOD FOR USE THEREOF
KR20190072548A (ko) 2016-09-30 2019-06-25 더 리젠츠 오브 더 유니버시티 오브 캘리포니아 Rna-가이드된 핵산 변형 효소 및 이의 사용 방법
US10669539B2 (en) 2016-10-06 2020-06-02 Pioneer Biolabs, Llc Methods and compositions for generating CRISPR guide RNA libraries
CN110214180A (zh) 2016-10-14 2019-09-06 哈佛大学的校长及成员们 核碱基编辑器的aav递送
EP3529359B1 (en) 2016-10-18 2023-12-13 Regents of the University of Minnesota Tumor infiltrating lymphocytes for use in therapy
US10829729B2 (en) * 2016-11-03 2020-11-10 President And Fellows Of Harvard College Cellular poration using laser radiation
US9816093B1 (en) 2016-12-06 2017-11-14 Caribou Biosciences, Inc. Engineered nucleic acid-targeting nucleic acids
WO2018209712A1 (en) * 2017-05-19 2018-11-22 Tsinghua University Engineering of a minimal sacas9 crispr/cas system for gene editing and transcriptional regulation optimized by enhanced guide rna
EP3336546B1 (en) * 2016-12-13 2020-07-01 Miltenyi Biotec B.V. & Co. KG Reversible cell labelling with conjugates having two releasable binding sites
JP7317706B2 (ja) 2016-12-14 2023-07-31 リガンダル インコーポレイテッド 核酸およびタンパク質ペイロード送達のための方法および組成物
WO2018119359A1 (en) 2016-12-23 2018-06-28 President And Fellows Of Harvard College Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection
EP3342868B1 (en) 2016-12-30 2019-12-25 Systasy Bioscience GmbH Constructs and screening methods
US20190352710A1 (en) * 2017-01-05 2019-11-21 Virginia Commonwealth University System, method, computer-accessible medium and apparatus for dna mapping
WO2018136827A1 (en) 2017-01-20 2018-07-26 Vitrisa Therapeutics, Inc. Stem-loop compositions and methods for inhibiting factor d
BR112019015578A2 (pt) * 2017-01-30 2020-03-10 KWS SAAT SE & Co. KGaA Ligação de modelo de reparo a endonucleases para engenharia de genoma
EP3577220A2 (en) 2017-02-06 2019-12-11 Zymergen, Inc. Engineered biosynthetic pathways for production of tyramine by fermentation
TW201839136A (zh) 2017-02-06 2018-11-01 瑞士商諾華公司 治療血色素異常症之組合物及方法
JP7227912B2 (ja) 2017-02-08 2023-02-24 ダナ－ファーバー キャンサー インスティテュート，インコーポレイテッド キメラ抗原受容体の調節
US11739333B2 (en) * 2017-03-02 2023-08-29 Meiragtx Uk Ii Limited Regulation of gene expression by aptamer-modulated RNase p cleavage
EP3592853A1 (en) 2017-03-09 2020-01-15 President and Fellows of Harvard College Suppression of pain by gene editing
US11542496B2 (en) 2017-03-10 2023-01-03 President And Fellows Of Harvard College Cytosine to guanine base editor
EP3596217A1 (en) 2017-03-14 2020-01-22 Editas Medicine, Inc. Systems and methods for the treatment of hemoglobinopathies
CN110914426A (zh) 2017-03-23 2020-03-24 哈佛大学的校长及成员们 包含核酸可编程dna结合蛋白的核碱基编辑器
CN110914433A (zh) 2017-03-24 2020-03-24 库尔维科公司 编码crispr相关蛋白质的核酸及其用途
EP3526324B1 (en) 2017-03-28 2021-08-25 Locanabio, Inc. Crispr-associated (cas) protein
CN110520540B (zh) 2017-04-13 2023-10-03 Imba-莫利库尔生物技术研究所 核酸修饰和鉴定方法
CA3059956A1 (en) 2017-04-21 2018-10-25 The General Hospital Corporation Variants of cpf1 (cas12a) with altered pam specificity
US20210123045A1 (en) * 2017-04-25 2021-04-29 The Johns Hopkins University A yeast two-hybrid rna-protein interaction system based on catalytically inactivated crispr-dcas9
US11499151B2 (en) 2017-04-28 2022-11-15 Editas Medicine, Inc. Methods and systems for analyzing guide RNA molecules
WO2018209158A2 (en) 2017-05-10 2018-11-15 Editas Medicine, Inc. Crispr/rna-guided nuclease systems and methods
WO2018209320A1 (en) 2017-05-12 2018-11-15 President And Fellows Of Harvard College Aptazyme-embedded guide rnas for use with crispr-cas9 in genome editing and transcriptional activation
WO2018218166A1 (en) 2017-05-25 2018-11-29 The General Hospital Corporation Using split deaminases to limit unwanted off-target base editor deamination
US20200263186A1 (en) * 2017-05-26 2020-08-20 North Carolina State University Altered guide rnas for modulating cas9 activity and methods of use
WO2018227114A1 (en) 2017-06-09 2018-12-13 Editas Medicine, Inc. Engineered cas9 nucleases
US9982279B1 (en) 2017-06-23 2018-05-29 Inscripta, Inc. Nucleic acid-guided nucleases
US10011849B1 (en) 2017-06-23 2018-07-03 Inscripta, Inc. Nucleic acid-guided nucleases
EP3645021A4 (en) 2017-06-30 2021-04-21 Intima Bioscience, Inc. ADENO-ASSOCIATED VIRAL VECTORS FOR GENE THERAPY
CN111094561B (zh) * 2017-07-07 2024-03-12 株式会社图尔金 靶特异性crispr变体
US11866726B2 (en) 2017-07-14 2024-01-09 Editas Medicine, Inc. Systems and methods for targeted integration and genome editing and detection thereof using integrated priming sites
US11452967B2 (en) 2017-07-17 2022-09-27 Zymergen Inc. Metal-organic framework materials
WO2019022986A1 (en) * 2017-07-24 2019-01-31 Vitrisa Therapeutics, Inc. NUCLEIC ACID COMPOSITIONS AND METHODS OF INHIBITING D-FACTOR
CN111801345A (zh) 2017-07-28 2020-10-20 哈佛大学的校长及成员们 使用噬菌体辅助连续进化(pace)的进化碱基编辑器的方法和组合物
US20210087557A1 (en) * 2017-08-04 2021-03-25 Syngenta Participations Ag Methods and compositions for targeted genomic insertion
US11286468B2 (en) 2017-08-23 2022-03-29 The General Hospital Corporation Engineered CRISPR-Cas9 nucleases with altered PAM specificity
US11319532B2 (en) 2017-08-30 2022-05-03 President And Fellows Of Harvard College High efficiency base editors comprising Gam
US20190119701A1 (en) * 2017-09-08 2019-04-25 Life Technologies Corporation Methods for improved homologous recombination and compositions thereof
WO2019051097A1 (en) 2017-09-08 2019-03-14 The Regents Of The University Of California RNA-GUIDED ENDONUCLEASE FUSION POLYPEPTIDES AND METHODS OF USING SAME
US20190218532A1 (en) * 2017-09-19 2019-07-18 Massachusetts Institute Of Technology Streptococcus Canis Cas9 as a Genome Engineering Platform with Novel PAM Specificity
CA3078845A1 (en) * 2017-10-09 2019-04-18 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Type i-e crispr-cas systems for eukaryotic genome editing
WO2019075197A1 (en) 2017-10-11 2019-04-18 The General Hospital Corporation METHODS OF DETECTION OF INDIVIDUAL SITE-SPECIFIC PARASITE GENOMIC DEAMINATION BY BASE EDITING TECHNOLOGIES
AU2018352592A1 (en) 2017-10-16 2020-06-04 Beam Therapeutics, Inc. Uses of adenosine base editors
AU2018358051A1 (en) 2017-11-01 2020-05-14 The Regents Of The University Of California CasZ compositions and methods of use
US11970719B2 (en) 2017-11-01 2024-04-30 The Regents Of The University Of California Class 2 CRISPR/Cas compositions and methods of use
WO2019090237A1 (en) * 2017-11-03 2019-05-09 Genus Plc Selectively targeted dna edits in livestock
US20210002609A1 (en) 2017-12-05 2021-01-07 Caribou Biosciences, Inc. Modified lymphocytes
EP3720944A1 (en) 2017-12-07 2020-10-14 Zymergen Inc. Engineered biosynthetic pathways for production of (6e)-8-hydroxygeraniol by fermentation
US11661599B1 (en) 2017-12-14 2023-05-30 National Technology & Engineering Solutions Of Sandia, Llc CRISPR-Cas based system for targeting single-stranded sequences
WO2019126037A1 (en) * 2017-12-19 2019-06-27 City Of Hope Modified tracrrnas grnas, and uses thereof
US20210093679A1 (en) 2018-02-05 2021-04-01 Novome Biotechnologies, Inc. Engineered gut microbes and uses thereof
US20210032612A1 (en) * 2018-02-22 2021-02-04 Avellino Lab Usa, Inc. CRISPR/Cas9 Systems, and Methods of Use Thereof
WO2019173248A1 (en) 2018-03-07 2019-09-12 Caribou Biosciences, Inc. Engineered nucleic acid-targeting nucleic acids
WO2019178346A1 (en) * 2018-03-14 2019-09-19 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Enrichment of nucleic acids
BR112020018658A2 (pt) 2018-03-15 2020-12-29 KSQ Therapeutics, Inc. Composições de regulação gênica e métodos para imu-noterapia aprimorada
US11981892B2 (en) * 2018-04-16 2024-05-14 University Of Massachusetts Compositions and methods for improved gene editing
US11160260B2 (en) 2018-04-17 2021-11-02 The Curators Of The University Of Missouri Methods for protecting porcine fetuses from infection with porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV)
CN112313241A (zh) 2018-04-17 2021-02-02 总医院公司 核酸结合、修饰、和切割试剂的底物偏好和位点的灵敏体外试验
CN108588123A (zh) * 2018-05-07 2018-09-28 南京医科大学 CRISPR/Cas9载体组合在制备基因敲除猪的血液制品中的应用
KR20210045360A (ko) 2018-05-16 2021-04-26 신테고 코포레이션 가이드 rna 설계 및 사용을 위한 방법 및 시스템
AU2019284926C1 (en) 2018-06-13 2023-04-27 Caribou Biosciences, Inc. Engineered cascade components and cascade complexes
US10227576B1 (en) 2018-06-13 2019-03-12 Caribou Biosciences, Inc. Engineered cascade components and cascade complexes
EP3814488A4 (en) * 2018-06-26 2022-06-22 The Regents of The University of California RNA-GUIDED EFFECTIVE PROTEINS AND METHODS OF USE THEREOF
CN112513270A (zh) 2018-07-13 2021-03-16 加利福尼亚大学董事会 基于逆转录转座子的递送媒介物及其使用方法
WO2020028729A1 (en) 2018-08-01 2020-02-06 Mammoth Biosciences, Inc. Programmable nuclease compositions and methods of use thereof
WO2020047531A1 (en) * 2018-08-31 2020-03-05 The Children's Hospital Of Philadelphia Scalable tagging of endogenous genes by homology-independent intron targeting
WO2020068643A1 (en) * 2018-09-25 2020-04-02 Excision Biotherapeutics, Inc. CRISPRs WITH IMPROVED SPECIFICITY
EP3861120A4 (en) 2018-10-01 2023-08-16 North Carolina State University RECOMBINANT TYPE I CRISPR-CAS SYSTEM
EA202191033A1 (ru) * 2018-10-15 2021-12-21 Юниверсити Оф Массачусетс Программируемое редактирование оснований днк посредством слитых белков nme2cas9-дезаминаза
US11407995B1 (en) 2018-10-26 2022-08-09 Inari Agriculture Technology, Inc. RNA-guided nucleases and DNA binding proteins
US11434477B1 (en) 2018-11-02 2022-09-06 Inari Agriculture Technology, Inc. RNA-guided nucleases and DNA binding proteins
KR20210104068A (ko) 2018-12-14 2021-08-24 파이어니어 하이 부렛드 인터내쇼날 인코포레이팃드 게놈 편집을 위한 신규한 crispr-cas 시스템
CA3124395A1 (en) 2018-12-20 2020-06-25 Basf Plant Science Company Gmbh Native delivery of biomolecules into plant cells using ionic complexes with cell-penetrating peptides
RU2714380C1 (ru) * 2018-12-28 2020-02-14 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) Способ получения цитотоксических т-лимфоцитов, экспрессирующих химерные рецепторы
WO2020142754A2 (en) 2019-01-04 2020-07-09 Mammoth Biosciences, Inc. Programmable nuclease improvements and compositions and methods for nucleic acid amplification and detection
WO2020163396A1 (en) 2019-02-04 2020-08-13 The General Hospital Corporation Adenine dna base editor variants with reduced off-target rna editing
WO2020163856A1 (en) 2019-02-10 2020-08-13 The J. David Gladstone Institutes, A Testamentary Trust Established Under The Will Of J. David Gladstone Modified mitochondrion and methods of use thereof
WO2020176389A1 (en) 2019-02-25 2020-09-03 Caribou Biosciences, Inc. Plasmids for gene editing
DE212020000516U1 (de) 2019-03-07 2022-01-17 The Regents of the University of California CRISPR-CAS-Effektorpolypeptide
AU2020242032A1 (en) 2019-03-19 2021-10-07 Massachusetts Institute Of Technology Methods and compositions for editing nucleotide sequences
WO2020245763A2 (en) * 2019-06-06 2020-12-10 Tata Consultancy Services Limited System and method for combating mycobacterium tuberculosis infections
EP3979828A4 (en) * 2019-06-06 2023-06-28 Tata Consultancy Services Limited System and method for combating infections due to pathogens belonging to phylum proteobacteria
TW202112394A (zh) * 2019-06-06 2021-04-01 日商電化股份有限公司 以肽核酸為基礎之佐劑
US20220233637A1 (en) * 2019-06-06 2022-07-28 Tata Consultancy Services Limited System and method for combating infections due to antibiotic induced pathogens
EP3979829A4 (en) * 2019-06-06 2023-06-28 Tata Consultancy Services Limited System and method for combating pseudomonas aeruginosa and staphylococcus aureus infrctions
WO2020257684A1 (en) 2019-06-20 2020-12-24 University Of Massachusetts Compositions and methods for improved gene editing
US20230000908A1 (en) * 2019-09-11 2023-01-05 Ohio State Innovation Foundation Engineered cells and uses thereof
JP2022169813A (ja) * 2019-09-30 2022-11-10 国立研究開発法人産業技術総合研究所 Ｃａｓ９ヌクレアーゼのＤＮＡ切断活性を制御する方法
WO2021091974A1 (en) * 2019-11-08 2021-05-14 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for temporal control of cell modulation
WO2021097118A1 (en) * 2019-11-12 2021-05-20 The Broad Institute, Inc. Small type ii cas proteins and methods of use thereof
BR112022009803A2 (pt) 2019-11-20 2022-08-16 Corbion Biotech Inc Variantes de sacarose invertase
US20230002455A1 (en) 2019-11-29 2023-01-05 Basf Se Increasing resistance against fungal infections in plants
US20230075913A1 (en) 2019-12-16 2023-03-09 BASF Agricultural Solutions Seed US LLC Codon-optimized cas9 endonuclease encoding polynucleotide
WO2021122687A1 (en) 2019-12-19 2021-06-24 Basf Se Increasing space-time-yield, carbon-conversion-efficiency and carbon substrate flexibility in the production of fine chemicals
JP2023508871A (ja) 2019-12-20 2023-03-06 ビーエーエスエフ ソシエタス・ヨーロピア テルペンの毒性の低減および微生物中での生成可能性の増大
US20210284978A1 (en) * 2020-01-24 2021-09-16 The General Hospital Corporation Unconstrained Genome Targeting with near-PAMless Engineered CRISPR-Cas9 Variants
US20230086782A1 (en) * 2020-01-27 2023-03-23 Eth Zurich Base editor lacking hnh and use thereof
CN115605597A (zh) 2020-03-04 2023-01-13 巴斯夫欧洲公司（De） 用于产生赋予低至中等表达的组成型细菌启动子的方法
CN115176018A (zh) 2020-03-04 2022-10-11 巴斯夫欧洲公司 用于大肠杆菌和芽孢杆菌中表达的穿梭载体
JP2023518395A (ja) 2020-03-19 2023-05-01 インテリア セラピューティクス，インコーポレイテッド 指向性ゲノム編集のための方法及び組成物
US20230134582A1 (en) * 2020-04-09 2023-05-04 Verve Therapeutics, Inc. Chemically modified guide rnas for genome editing with cas12b
CA3177481A1 (en) 2020-05-08 2021-11-11 David R. Liu Methods and compositions for simultaneous editing of both strands of a target double-stranded nucleotide sequence
WO2022074056A2 (en) 2020-10-07 2022-04-14 Basf Se Bacillus cell with reduced lipase and/or esterase side activities
US20220145293A1 (en) 2020-10-21 2022-05-12 Massachusetts Institute Of Technology Systems, methods, and compositions for site-specific genetic engineering using programmable addition via site-specific targeting elements (paste)
WO2022101641A1 (en) 2020-11-16 2022-05-19 Pig Improvement Company Uk Limited Influenza a-resistant animals having edited anp32 genes
WO2022159585A1 (en) * 2021-01-20 2022-07-28 Arbor Biotechnologies, Inc. Cas1212 fusion molecules and uses thereof
EP4329776A1 (en) * 2021-04-30 2024-03-06 The Trustees of the University of Pennsylvania Cd-90 targeted lipid nanoparticles
US20240102007A1 (en) 2021-06-01 2024-03-28 Arbor Biotechnologies, Inc. Gene editing systems comprising a crispr nuclease and uses thereof
WO2022269084A1 (en) 2021-06-24 2022-12-29 Basf Se Improved bacillus host cell with altered rema/remb protein
EP4359423A1 (en) 2021-06-24 2024-05-01 Basf Se Bacillus licheniformis host cell for production of a compound of interest with increased purity
WO2023039586A1 (en) 2021-09-10 2023-03-16 Agilent Technologies, Inc. Guide rnas with chemical modification for prime editing
CN117999481A (zh) 2021-10-26 2024-05-07 卡里布生物科学公司 核酸外切酶偶联实时核酸内切酶活性测定
CA3237482A1 (en) 2021-11-03 2023-05-11 The J. David Gladstone Institutes, A Testamentary Trust Established Under The Will Of J. David Gladstone Precise genome editing using retrons
WO2023102329A2 (en) * 2021-11-30 2023-06-08 Mammoth Biosciences, Inc. Effector proteins and uses thereof
WO2023107899A2 (en) 2021-12-07 2023-06-15 Caribou Biosciences, Inc. A method of capturing crispr endonuclease cleavage products
US20230279442A1 (en) 2021-12-15 2023-09-07 Versitech Limited Engineered cas9-nucleases and method of use thereof
WO2023117970A1 (en) 2021-12-20 2023-06-29 Basf Se Method for improved production of intracellular proteins in bacillus
WO2023141602A2 (en) 2022-01-21 2023-07-27 Renagade Therapeutics Management Inc. Engineered retrons and methods of use
WO2023173062A2 (en) * 2022-03-11 2023-09-14 Intima Bioscience, Inc. Nucleic acid editing systems, methods, and uses thereof
WO2023230529A1 (en) 2022-05-26 2023-11-30 Caribou Biosciences, Inc. Cytokine-receptor fusions for immune cell stimulation
WO2023230316A1 (en) * 2022-05-27 2023-11-30 The Broad Institute, Inc. Ribozyme-assisted circular rnas and compositions and methods of use there of
WO2023240042A1 (en) 2022-06-06 2023-12-14 Caribou Biosciences, Inc. Treatment of autoimmune diseases with engineered immune cells
WO2024020346A2 (en) 2022-07-18 2024-01-25 Renagade Therapeutics Management Inc. Gene editing components, systems, and methods of use
WO2024044723A1 (en) 2022-08-25 2024-02-29 Renagade Therapeutics Management Inc. Engineered retrons and methods of use
WO2024073583A1 (en) 2022-09-30 2024-04-04 Caribou Biosciences, Inc. Anti-ror1 chimeric antigen receptors (cars), car-nk cells and related methods
WO2024107646A1 (en) 2022-11-14 2024-05-23 Caribou Biosciences, Inc. Anti-cll-1 chimeric antigen receptors, engineered cells and related methods

Family Cites Families (149)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
WO1988008450A1 (en) 1987-05-01 1988-11-03 Birdwell Finlayson Gene therapy for metabolite disorders
US5350689A (en) 1987-05-20 1994-09-27 Ciba-Geigy Corporation Zea mays plants and transgenic Zea mays plants regenerated from protoplasts or protoplast-derived cells
US5767367A (en) 1990-06-23 1998-06-16 Hoechst Aktiengesellschaft Zea mays (L.) with capability of long term, highly efficient plant regeneration including fertile transgenic maize plants having a heterologous gene, and their preparation
US5602240A (en) 1990-07-27 1997-02-11 Ciba Geigy Ag. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5489677A (en) 1990-07-27 1996-02-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleoside linkages containing adjacent oxygen and nitrogen atoms
FR2688514A1 (fr) 1992-03-16 1993-09-17 Centre Nat Rech Scient Adenovirus recombinants defectifs exprimant des cytokines et medicaments antitumoraux les contenant.
US5625048A (en) 1994-11-10 1997-04-29 The Regents Of The University Of California Modified green fluorescent proteins
US5968738A (en) 1995-12-06 1999-10-19 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Two-reporter FACS analysis of mammalian cells using green fluorescent proteins
US20020182673A1 (en) 1998-05-15 2002-12-05 Genentech, Inc. IL-17 homologous polypedies and therapeutic uses thereof
US6306610B1 (en) 1998-09-18 2001-10-23 Massachusetts Institute Of Technology Biological applications of quantum dots
EP1147209A2 (en) 1999-02-03 2001-10-24 The Children's Medical Center Corporation Gene repair involving the induction of double-stranded dna cleavage at a chromosomal target site
JP5002105B2 (ja) 1999-12-28 2012-08-15 リボノミックス， インコーポレイテッド 内因性のｍＲＮＡタンパク質（ｍＲＮＰ）複合体の単離および特徴付けの方法
EP1152058A1 (en) * 2000-05-03 2001-11-07 Institut Curie Methods and compositions for effecting homologous recombination
WO2002026967A2 (en) 2000-09-25 2002-04-04 Thomas Jefferson University Targeted gene correction by single-stranded oligodeoxynucleotides
CA2881568C (en) 2000-10-27 2019-09-24 Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. Nucleic acids and proteins from streptococcus groups a & b
US20060253913A1 (en) 2001-12-21 2006-11-09 Yue-Jin Huang Production of hSA-linked butyrylcholinesterases in transgenic mammals
WO2003087341A2 (en) 2002-01-23 2003-10-23 The University Of Utah Research Foundation Targeted chromosomal mutagenesis using zinc finger nucleases
EP1334979A1 (en) * 2002-02-08 2003-08-13 Kweek-en Researchbedrijf Agrico B.V. Gene conferring resistance to Phytophthera infestans (late-blight) in Solanaceae
US20030232410A1 (en) 2002-03-21 2003-12-18 Monika Liljedahl Methods and compositions for using zinc finger endonucleases to enhance homologous recombination
AU2003224897A1 (en) 2002-04-09 2003-10-27 Kenneth L. Beattie Oligonucleotide probes for genosensor chips
EP2806025B1 (en) 2002-09-05 2019-04-03 California Institute of Technology Use of zinc finger nucleases to stimulate gene targeting
US20120196370A1 (en) 2010-12-03 2012-08-02 Fyodor Urnov Methods and compositions for targeted genomic deletion
WO2005030999A1 (en) * 2003-09-25 2005-04-07 Dana-Farber Cancer Institute, Inc Methods to detect lineage-specific cells
US7282333B2 (en) 2003-10-20 2007-10-16 Promega Corporation Methods and compositions for nucleic acid analysis
US7972854B2 (en) 2004-02-05 2011-07-05 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for targeted cleavage and recombination
US7919277B2 (en) 2004-04-28 2011-04-05 Danisco A/S Detection and typing of bacterial strains
US7892224B2 (en) 2005-06-01 2011-02-22 Brainlab Ag Inverse catheter planning
CN101273141B (zh) 2005-07-26 2013-03-27 桑格摩生物科学股份有限公司 外源核酸序列的靶向整合和表达
ES2398918T3 (es) 2005-08-26 2013-03-22 Dupont Nutrition Biosciences Aps Un método y una ordenación para soportar verticalmente elementos de resistencia eléctrica pendientes
WO2007128338A1 (en) 2006-05-10 2007-11-15 Deinove Process for chromosomal engineering using a novel dna repair system
DK2426220T3 (en) 2006-05-19 2016-09-26 Dupont Nutrition Biosci Aps Labeled microorganisms, and methods for labeling
EP2019839B1 (en) 2006-05-25 2011-12-07 Sangamo BioSciences, Inc. Methods and compositions for gene inactivation
DK2034848T3 (en) 2006-06-16 2017-02-06 Dupont Nutrition Biosci Aps STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS BACTERIA
US8481272B2 (en) * 2006-08-04 2013-07-09 Georgia State University Research Foundation, Inc. Enzyme sensors, methods for preparing and using such sensors, and methods of detecting protease activity
DE102006051516A1 (de) * 2006-10-31 2008-05-08 Curevac Gmbh (Basen-)modifizierte RNA zur Expressionssteigerung eines Proteins
ES2719789T3 (es) 2007-03-02 2019-07-16 Dupont Nutrition Biosci Aps Cultivos con resistencia mejorada a fagos
KR20150143860A (ko) 2007-04-04 2015-12-23 네트바이오, 인코포레이티드 표적 핵산의 신속한 다중화 적용 방법
FR2925918A1 (fr) 2007-12-28 2009-07-03 Pasteur Institut Typage et sous-typage moleculaire de salmonella par identification des sequences nucleotidiques variables des loci crispr
WO2010011961A2 (en) 2008-07-25 2010-01-28 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Prokaryotic rnai-like system and methods of use
KR101759586B1 (ko) 2008-08-22 2017-07-19 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 표적화된 단일가닥 분할 및 표적화된 통합을 위한 방법 및 조성물
ES2738980T3 (es) 2008-09-15 2020-01-28 Childrens Medical Ct Corp Modulación de BCL11A para el tratamiento de hemoglobinopatías
US20100076057A1 (en) 2008-09-23 2010-03-25 Northwestern University TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA
US9404098B2 (en) 2008-11-06 2016-08-02 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Method for cleaving a target RNA using a Cas6 polypeptide
US10662227B2 (en) 2008-11-07 2020-05-26 Dupont Nutrition Biosciences Aps Bifidobacteria CRISPR sequences
US8129149B1 (en) * 2008-11-12 2012-03-06 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Army Rapid and sensitive method to measure endonuclease activity
CN102264895B (zh) 2008-12-12 2015-01-28 杜邦营养生物科学有限公司 用于乳品发酵的具有独特流变性质的嗜热链球菌菌株的遗传簇
WO2010075424A2 (en) 2008-12-22 2010-07-01 The Regents Of University Of California Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes
WO2010117464A1 (en) 2009-04-09 2010-10-14 Sangamo Biosciences, Inc. Targeted integration into stem cells
EA023938B1 (ru) 2009-04-30 2016-07-29 Оспедале Сан Рафаэлле С.Р.Л. Вектор гена
KR20100133319A (ko) 2009-06-11 2010-12-21 주식회사 툴젠 표적 특이적인 게놈의 재배열을 위한 표적 특이적 뉴클레아제 및 이의 용도
US20120192298A1 (en) 2009-07-24 2012-07-26 Sigma Aldrich Co. Llc Method for genome editing
JP2013500018A (ja) 2009-07-24 2013-01-07 シグマ−アルドリッチ・カンパニー・リミテッド・ライアビリティ・カンパニー ゲノム編集のための方法
EP2461819A4 (en) 2009-07-28 2013-07-31 Sangamo Biosciences Inc METHODS AND COMPOSITIONS FOR TREATING TRI-NUCLEOTIDE REPEAT DISORDERS
CA2770312A1 (en) 2009-08-11 2011-02-17 Sangamo Biosciences, Inc. Organisms homozygous for targeted modification
EP2292731B1 (en) 2009-08-13 2018-04-04 DuPont Nutrition Biosciences ApS Method for preparing complex cultures
WO2011036232A1 (en) 2009-09-25 2011-03-31 Basf Plant Science Company Gmbh Plants having enhanced yield-related traits and a method for making the same
US20110105364A1 (en) 2009-11-02 2011-05-05 Nugen Technologies, Inc. Compositions and methods for targeted nucleic acid sequence selection and amplification
JP2013511979A (ja) 2009-11-27 2013-04-11 ビーエーエスエフ プラント サイエンス カンパニー ゲーエムベーハー キメラエンドヌクレアーゼおよびその使用
US20110294114A1 (en) 2009-12-04 2011-12-01 Cincinnati Children's Hospital Medical Center Optimization of determinants for successful genetic correction of diseases, mediated by hematopoietic stem cells
AU2010327998B2 (en) 2009-12-10 2015-11-12 Iowa State University Research Foundation, Inc. TAL effector-mediated DNA modification
US20110203012A1 (en) 2010-01-21 2011-08-18 Dotson Stanton B Methods and compositions for use of directed recombination in plant breeding
WO2011100058A1 (en) 2010-02-09 2011-08-18 Sangamo Biosciences, Inc. Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules
US10087431B2 (en) 2010-03-10 2018-10-02 The Regents Of The University Of California Methods of generating nucleic acid fragments
WO2011121454A2 (en) 2010-03-31 2011-10-06 Spartan Bioscience Inc. Direct nucleic acid analysis
US20130065310A1 (en) 2010-04-13 2013-03-14 Sigma-Aldrich Co., Llc Use of endogenous promoters to express heterologous proteins
MX2012013037A (es) 2010-05-10 2013-07-29 Univ California Composiciones de endorribonucleasa y metodos de uso de las mismas.
WO2011146121A1 (en) 2010-05-17 2011-11-24 Sangamo Biosciences, Inc. Novel dna-binding proteins and uses thereof
WO2011156430A2 (en) 2010-06-07 2011-12-15 Fred Hutchinson Cancer Research Center Generation and expression of engineered i-onui endonuclease and its homologues and uses thereof
EP2580331A4 (en) * 2010-06-14 2013-11-27 Univ Iowa State Res Found Inc NUCLEASE ACTIVITY OF THE TAL EFFECTOR AND FUSION PROTEIN FOKI
CN103168101A (zh) 2010-07-23 2013-06-19 西格马-奥尔德里奇有限责任公司 使用靶向核酸内切酶和单链核酸的基因组编辑
US9081737B2 (en) 2010-08-02 2015-07-14 Integrated Dna Technologies, Inc. Methods for predicting stability and melting temperatures of nucleic acid duplexes
EA201390586A1 (ru) 2010-10-20 2014-11-28 ДюПон НЬЮТРИШН БАЙОСАЙЕНСИЗ АпС Последовательности crispr-cas lactococcus
ES2860945T3 (es) 2010-12-27 2021-10-05 Abbott Molecular Inc Cuantificación de muestras de títulos altos por PCR digital
US9347096B2 (en) 2011-01-31 2016-05-24 Hitachi High-Technologies Corporation Genetic analyzer
KR20120096395A (ko) 2011-02-22 2012-08-30 주식회사 툴젠 뉴클레아제에 의해 유전자 변형된 세포를 농축시키는 방법
WO2012138939A1 (en) * 2011-04-05 2012-10-11 Philippe Duchateau New tale-protein scaffolds and uses thereof
US20120283109A1 (en) 2011-04-08 2012-11-08 Timothy Z. Liu Method of analyzing target nucleic acid of biological samples
BR112013025567B1 (pt) 2011-04-27 2021-09-21 Amyris, Inc Métodos para modificação genômica
WO2012164565A1 (en) 2011-06-01 2012-12-06 Yeda Research And Development Co. Ltd. Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes
US8927218B2 (en) 2011-06-27 2015-01-06 Flir Systems, Inc. Methods and compositions for segregating target nucleic acid from mixed nucleic acid samples
EP2734621B1 (en) * 2011-07-22 2019-09-04 President and Fellows of Harvard College Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity
AU2012312260B2 (en) 2011-09-21 2017-08-31 Sangamo Therapeutics, Inc. Methods and compositions for regulation of transgene expression
US8450107B1 (en) 2011-11-30 2013-05-28 The Broad Institute Inc. Nucleotide-specific recognition sequences for designer TAL effectors
US11458157B2 (en) 2011-12-16 2022-10-04 Targetgene Biotechnologies Ltd. Compositions and methods for modifying a predetermined target nucleic acid sequence
GB201122458D0 (en) 2011-12-30 2012-02-08 Univ Wageningen Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof
US20130196323A1 (en) 2012-02-01 2013-08-01 The University Of North Carolina At Greensboro Methods Of Nucleic Acid Analysis
KR101833589B1 (ko) 2012-02-24 2018-03-02 프레드 헛친슨 켄서 리서치 센터 이상혈색소증 치료를 위한 조성물 및 방법
BR112014021104B1 (pt) 2012-02-29 2023-03-28 Sangamo Biosciences, Inc Proteína de fusão de ocorrência não natural compreendendo um domínio de ligação de dna de dedo de zinco manipulado que se liga a um gene htt, seu uso, método in vitro de modificação da expressão de um gene htt em uma célula, e método de geração de um sistema modelo para o estudo da doença de huntington
US9637739B2 (en) * 2012-03-20 2017-05-02 Vilnius University RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex
WO2013141680A1 (en) 2012-03-20 2013-09-26 Vilnius University RNA-DIRECTED DNA CLEAVAGE BY THE Cas9-crRNA COMPLEX
AU2013204327B2 (en) 2012-04-20 2016-09-01 Aviagen Cell transfection method
CN104245940A (zh) 2012-04-23 2014-12-24 拜尔作物科学公司 植物中的靶向基因组工程
NZ701060A (en) 2012-05-02 2016-10-28 Sangamo Biosciences Inc Targeted modification of malate dehydrogenase
RU2650819C2 (ru) 2012-05-07 2018-04-17 Сангамо Терапьютикс, Инк. Способы и композиции для опосредованной нуклеазой направленной интеграции трансгенов
WO2013169398A2 (en) 2012-05-09 2013-11-14 Georgia Tech Research Corporation Systems and methods for improving nuclease specificity and activity
DE202013012242U1 (de) * 2012-05-25 2016-02-02 Emmanuelle Charpentier Zusammensetzungen für die durch RNA gesteuerte Modifikation einer Ziel-DNA und für die durch RNA gesteuerte Modulation der Transkription
US20150376645A1 (en) 2012-05-30 2015-12-31 Baylor College Of Medicine Supercoiled minivectors as a tool for dna repair, alteration and replacement
US9102936B2 (en) 2012-06-11 2015-08-11 Agilent Technologies, Inc. Method of adaptor-dimer subtraction using a CRISPR CAS6 protein
RU2014153918A (ru) 2012-06-12 2016-07-27 Дженентек, Инк. Способы и композиции для получения условно нокаутных аллелей
EP2674501A1 (en) 2012-06-14 2013-12-18 Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation,de l'environnement et du travail Method for detecting and identifying enterohemorrhagic Escherichia coli
WO2013188638A2 (en) 2012-06-15 2013-12-19 The Regents Of The University Of California Endoribonucleases and methods of use thereof
CA2877290A1 (en) 2012-06-19 2013-12-27 Daniel F. Voytas Gene targeting in plants using dna viruses
JP6329537B2 (ja) 2012-07-11 2018-05-23 サンガモ セラピューティクス， インコーポレイテッド 生物学的薬剤の送達のための方法および組成物
WO2014011237A1 (en) 2012-07-11 2014-01-16 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for the treatment of lysosomal storage diseases
CN105188767A (zh) 2012-07-25 2015-12-23 布罗德研究所有限公司 可诱导的dna结合蛋白和基因组干扰工具及其应用
EP2880171B1 (en) 2012-08-03 2018-10-03 The Regents of The University of California Methods and compositions for controlling gene expression by rna processing
KR102218562B1 (ko) 2012-08-29 2021-02-19 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 유전적 병태를 치료하기 위한 방법 및 조성물
CN105264067B (zh) 2012-09-07 2020-11-10 美国陶氏益农公司 Fad3性能基因座及相应的能够诱导靶向断裂的靶位点特异性结合蛋白
UA118090C2 (uk) 2012-09-07 2018-11-26 ДАУ АГРОСАЙЄНСІЗ ЕлЕлСі Спосіб інтегрування послідовності нуклеїнової кислоти, що представляє інтерес, у ген fad2 у клітині сої та специфічний для локусу fad2 білок, що зв'язується, здатний індукувати спрямований розрив
UA119135C2 (uk) 2012-09-07 2019-05-10 ДАУ АГРОСАЙЄНСІЗ ЕлЕлСі Спосіб отримання трансгенної рослини
EP2906602B1 (en) 2012-10-12 2019-01-16 The General Hospital Corporation Transcription activator-like effector (tale) - lysine-specific demethylase 1 (lsd1) fusion proteins
DE202013012597U1 (de) 2012-10-23 2017-11-21 Toolgen, Inc. Zusammensetzung zum Spalten einer Ziel-DNA, umfassend eine für die Ziel-DNA spezifische guide-RNA und eine Cas-Protein-codierende Nukleinsäure oder ein Cas-Protein, sowie deren Verwendung
AU2013337951B2 (en) 2012-10-30 2019-10-03 Recombinetics, Inc. Control of sexual maturation in animals
BR112015009812A2 (pt) 2012-10-31 2017-08-22 Cellectis Método para a inserção genética específica em um genoma de planta, célula de planta transformada e seu uso, planta resistente a herbicidas, kit, vetor, e célula hospedeira
US20140127752A1 (en) 2012-11-07 2014-05-08 Zhaohui Zhou Method, composition, and reagent kit for targeted genomic enrichment
PL3138910T3 (pl) 2012-12-06 2018-01-31 Sigma Aldrich Co Llc Oparta na CRISPR modyfikacja i regulacja genomu
SG10201707569YA (en) 2012-12-12 2017-10-30 Broad Inst Inc Delivery, Engineering and Optimization of Systems, Methods and Compositions for Sequence Manipulation and Therapeutic Applications
MX2015007549A (es) * 2012-12-12 2017-01-20 Broad Inst Inc Modificaciones de sistemas, métodos y composiciones guía optimizadas para la manipulación de secuencias.
US20140189896A1 (en) 2012-12-12 2014-07-03 Feng Zhang Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation
WO2014093701A1 (en) * 2012-12-12 2014-06-19 The Broad Institute, Inc. Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, knock out libraries and applications thereof
EP3434776A1 (en) 2012-12-12 2019-01-30 The Broad Institute, Inc. Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof
US8697359B1 (en) 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
US20140186843A1 (en) 2012-12-12 2014-07-03 Massachusetts Institute Of Technology Methods, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof
JP6552965B2 (ja) 2012-12-12 2019-07-31 ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド 配列操作のための改善された系、方法および酵素組成物のエンジニアリングおよび最適化
PL2931898T3 (pl) 2012-12-12 2016-09-30 Le Cong Projektowanie i optymalizacja systemów, sposoby i kompozycje do manipulacji sekwencją z domenami funkcjonalnymi
WO2014093694A1 (en) 2012-12-12 2014-06-19 The Broad Institute, Inc. Crispr-cas nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation in eukaryotes
WO2014099744A1 (en) 2012-12-17 2014-06-26 President And Fellows Of Harvard College Rna-guided human genome engineering
EP2938184B1 (en) 2012-12-27 2018-10-31 Keygene N.V. Method for removing genetic linkage in a plant
EP3919505B1 (en) 2013-01-16 2023-08-30 Emory University Uses of cas9-nucleic acid complexes
CN103233028B (zh) 2013-01-25 2015-05-13 南京徇齐生物技术有限公司 一种无物种限制无生物安全性问题的真核生物基因打靶方法及螺旋结构dna序列
US11466306B2 (en) * 2013-02-14 2022-10-11 Osaka University Method for isolating specific genomic regions with use of molecule capable of specifically binding to endogenous DNA sequence
WO2014150624A1 (en) 2013-03-14 2014-09-25 Caribou Biosciences, Inc. Compositions and methods of nucleic acid-targeting nucleic acids
US11332719B2 (en) 2013-03-15 2022-05-17 The Broad Institute, Inc. Recombinant virus and preparations thereof
KR102210319B1 (ko) 2013-03-15 2021-02-01 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 특정 게놈 좌위에 대한 유전적 및 후성적 조절 단백질의 rna-안내 표적화
US9902973B2 (en) * 2013-04-11 2018-02-27 Caribou Biosciences, Inc. Methods of modifying a target nucleic acid with an argonaute
CN103224947B (zh) 2013-04-28 2015-06-10 陕西师范大学 一种基因打靶系统
CN105683376A (zh) 2013-05-15 2016-06-15 桑格摩生物科学股份有限公司 用于治疗遗传病状的方法和组合物
EP3778899A1 (en) * 2013-05-22 2021-02-17 Northwestern University Rna-directed dna cleavage and gene editing by cas9 enzyme from neisseria meningitidis
KR20160034901A (ko) * 2013-06-17 2016-03-30 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 서열 조작에 최적화된 ｃｒｉｓｐｒ-ｃａｓ 이중 닉카아제 시스템, 방법 및 조성물
CN103343120B (zh) 2013-07-04 2015-03-04 中国科学院遗传与发育生物学研究所 一种小麦基因组定点改造方法
WO2015089364A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 The Broad Institute Inc. Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof
EP3080271B1 (en) 2013-12-12 2020-02-12 The Broad Institute, Inc. Systems, methods and compositions for sequence manipulation with optimized functional crispr-cas systems
KR20160097327A (ko) 2013-12-12 2016-08-17 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 유전자 산물, 구조 정보 및 유도성 모듈형 ｃａｓ 효소의 발현의 변경을 위한 ｃｒｉｓｐｒ-ｃａｓ 시스템 및 방법
EP3079726B1 (en) 2013-12-12 2018-12-05 The Broad Institute, Inc. Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using particle delivery components
EP3080259B1 (en) 2013-12-12 2023-02-01 The Broad Institute, Inc. Engineering of systems, methods and optimized guide compositions with new architectures for sequence manipulation
WO2015134812A1 (en) * 2014-03-05 2015-09-11 Editas Medicine, Inc. Crispr/cas-related methods and compositions for treating usher syndrome and retinitis pigmentosa
US20150376586A1 (en) 2014-06-25 2015-12-31 Caribou Biosciences, Inc. RNA Modification to Engineer Cas9 Activity
US9512446B1 (en) * 2015-08-28 2016-12-06 The General Hospital Corporation Engineered CRISPR-Cas9 nucleases

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2652899C1 (ru) * 2017-12-28 2018-05-03 Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора) РНК-проводники для подавления репликации вируса гепатита B и для элиминации вируса гепатита B из клетки-хозяина

Also Published As

Publication number Publication date
US20170051276A1 (en) 2017-02-23
US9803194B2 (en) 2017-10-31
US11312953B2 (en) 2022-04-26
JP2021078512A (ja) 2021-05-27
KR20150126946A (ko) 2015-11-13
GB201517172D0 (en) 2015-11-11
RU2018122288A3 (ru) 2019-07-17
US20160076020A1 (en) 2016-03-17
US9909122B2 (en) 2018-03-06
SG11201507378UA (en) 2015-10-29
US9410198B2 (en) 2016-08-09
DK2971167T3 (da) 2019-11-04
AU2015101418A4 (en) 2015-11-12
HK1213023A1 (zh) 2016-06-24
ES2901396T3 (es) 2022-03-22
US20160046978A1 (en) 2016-02-18
US20140315985A1 (en) 2014-10-23
GB2527450A (en) 2015-12-23
US20240167023A1 (en) 2024-05-23
JP7008850B2 (ja) 2022-02-10
EP2971167A4 (en) 2016-03-16
US10125361B2 (en) 2018-11-13
WO2014150624A1 (en) 2014-09-25
IL241563B (en) 2020-06-30
BR112015022061B1 (pt) 2022-07-19
BR112015022061B8 (pt) 2024-02-27
US20220282244A1 (en) 2022-09-08
EP3620534A1 (en) 2020-03-11
US20160046949A1 (en) 2016-02-18
MX2015013057A (es) 2016-04-20
DK3620534T3 (da) 2021-12-06
US20160251640A1 (en) 2016-09-01
EP2971167B1 (en) 2019-07-31
EP2971167A1 (en) 2016-01-20
US20170327820A1 (en) 2017-11-16
AU2014235794A1 (en) 2015-10-22
CN111454951A (zh) 2020-07-28
US20160024568A1 (en) 2016-01-28
RU2662932C2 (ru) 2018-07-31
BR112015022061A2 (pt) 2017-11-14
RU2018122288A (ru) 2019-03-06
US20160319349A1 (en) 2016-11-03
US20160108470A1 (en) 2016-04-21
JP2016519652A (ja) 2016-07-07
US20180237770A1 (en) 2018-08-23
US20160312280A1 (en) 2016-10-27
US20160046963A1 (en) 2016-02-18
AU2015101418A6 (en) 2016-02-04
CN105980575A (zh) 2016-09-28
KR20170108172A (ko) 2017-09-26
JP2018075026A (ja) 2018-05-17
CA2905432A1 (en) 2014-09-25
EP3620534B1 (en) 2021-10-13
US9725714B2 (en) 2017-08-08
CA2905432C (en) 2021-09-14
US20160046962A1 (en) 2016-02-18
US20160068887A1 (en) 2016-03-10
NZ712727A (en) 2017-05-26
KR101780885B1 (ko) 2017-10-11
US9809814B1 (en) 2017-11-07
ES2749624T3 (es) 2020-03-23
AU2017200138A1 (en) 2017-02-02
US9260752B1 (en) 2016-02-16
ZA201507006B (en) 2017-02-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2015140276A (ru) Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты
US11459588B2 (en) Methods of use of CRISPR CPF1 hybrid DNA/RNA polynucleotides
US9587252B2 (en) Orthogonal Cas9 proteins for RNA-guided gene regulation and editing
EP3347467B1 (en) Full interrogation of nuclease dsbs and sequencing (find-seq)
US20200172935A1 (en) Modified cpf1 mrna, modified guide rna, and uses thereof
WO2017049129A2 (en) Methods of making guide rna
US20200232005A1 (en) Methods of Producing and Using Single-Stranded Deoxyribonucleic Acids and Compositions for Use in Practicing the Same
CN110835635B (zh) 不同启动子启动多个串联sgRNA表达的质粒构建方法
US20220127661A1 (en) Compositions and methods of targeted nucleic acid enrichment by loop adapter protection and exonuclease digestion
WO2023060539A1 (en) Compositions and methods for detecting target cleavage sites of crispr/cas nucleases and dna translocation
US20240182951A1 (en) Methods for targeted nucleic acid sequencing
WO2024119461A1 (en) Compositions and methods for detecting target cleavage sites of crispr/cas nucleases and dna translocation
US20230265528A1 (en) Methods for targeted depletion of nucleic acids
CA3214198A1 (en) Methods for targeted nucleic acid sequencing
JP2024509048A (ja) Ｃｒｉｓｐｒ関連トランスポゾンシステム及びその使用方法
JP2024509047A (ja) Ｃｒｉｓｐｒ関連トランスポゾンシステム及びその使用方法
CN118048343A (zh) Cas9核酸酶及其制备方法和用途

Legal Events

Date Code Title Description
HE4A Change of address of a patent owner

Effective date: 20181017