MX2014014789A - Metodos y composiciones para mejorar poblacion de microbiota intestinal. - Google Patents

Metodos y composiciones para mejorar poblacion de microbiota intestinal.

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microbiota population
plant
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MX2014014789A
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Xu Zhang
Liping Zhao
Menghui Zhang
Yufeng Zhao
Xiaoyan Pang
Xiaojun Zhang
Linghua Wang
Guang Ning
Xiaoying Li
Yifei Zhang
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Univ Shanghai Jiaotong
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Abstract

Un método y una composición para mejorar estructura de microbiota intestinal, incrementar selectivamente una primera población de microbiota intestinal mientras disminuye simultáneamente una segunda población de microbiota intestinal en un sujeto. La primera población de microbiota intestinal incluye una bacteria que produce ácido graso de cadena corta (SCFA) y la segunda población de microbiota intestinal incluye una bacteria que produce endotoxina.

Description

METODOS Y COMPOSICIONES PARA MEJORAR POBLACION DE MICROBIOTA INTESTINAL CAMPO DE LA INVENCION La presente solicitud se relaciona a composiciones y métodos para mejorar poblaciones de microbiota intestinal y aplicación relacionada en fármacos, complementos nutricionales, productos de cuidado de la salud, alimentos y bebidas.
ANTECEDENTES DE LA INVENCION A menos que se indique de otra forma, los materiales descritos en esta sección no son la téenica anterior a las reivindicaciones en esta aplicación y no se admiten para ser la técnica anterior por inclusión en esta sección.
Dentro del cuerpo humano viven un gran número de microbios simbióticos, entre los cuales la microbiota intestinal actúa como un factor ambiental importante para salud del hospedero. Hay más de 1000 especies de bacterias, cuyo número excede 10 veces el número de células humanas y cuyo número de gen es aproximadamente 150 veces aquel en células humanas. En este contexto, el cuerpo humano como un "superorganismo" hecho de células hospederas y microbios simbióticos que incluyen microbiota intestinal y el genoma que codifica un consorcio de microbios intestinales Ref. 252875 modalidad, el método incluye administrar a un sujeto una composición para incrementar una primera población de microbiota intestinal mientras disminuye simultáneamente una segunda población de microbiota intestinal en el sujeto. La primera población de microbiota intestinal puede incluir bacterias que producen ácido graso de cadena corta (SCFA por sus siglas en inglés). La segunda población de microbiota intestinal puede incluir una bacteria que produce endotoxina.
En otro aspecto, la solicitud proporciona métodos para tamizar un compuesto de prueba que puede ser activo para mejorar población de microbiota intestinal. En una modalidad, el método incluye administrar a un sujeto de control una cantidad efectiva de una composición de control para incrementar una primera población de microbiota intestinal mientras disminuye simultáneamente una segunda población de microbiota intestinal en el sujeto de control, administrar a un sujeto de prueba una cantidad de un compuesto de prueba y comparar la población de microbiota intestinal del sujeto controlado con la población de microbiota intestinal del sujeto de prueba. Una similitud de por lo menos aproximadamente 80% es indicativa de que el compuesto de prueba es activo para mejorar población de microbiota intestinal. La primera población de microbiota intestinal puede incluir una bacteria que produce ácido graso de cadena corta (SCFA, por sus siglas en inglés). La segunda población de microbiota intestinal puede incluir una bacteria que produce endotoxina.
En un aspecto adicional, la solicitud proporciona composiciones para mejorar población de microbiota intestinal. En una modalidad, la composición es capaz de incrementar selectivamente una primera población de microbiota intestinal mientras disminuye simultáneamente una segunda población de microbiota en un sujeto. La primera población de microbiota intestinal puede incluir una bacteria que produce ácido graso de cadena corta (SCFA). La segunda población de microbiota intestinal puede incluir una bacteria que produce endotoxina. En una modalidad, la composición es administrada al sujeto en una dosis de aproximadamente 50 mg/kg de peso corporal a aproximadamente 400 mg/de peso corporal y con una vez un día de administración por al menos dos semanas.
BREVE DESCRIPCION DE LAS FIGURAS Lo mencionado anteriormente y otras características de esta descripción llegarán a ser más totalmente aparentes a partir de la siguiente descripción y reivindicaciones anexas, tomadas junto con las figuras anexas. Entendiendo que estas figuras representan solamente varias modalidades dispuestas de acuerdo con la descripción y son, por lo tanto, no consideradas limitantes de su alcance, la descripción será descrita con especificidad adicional y detalle a través del uso de las figuras anexas, en las cuales.
Las Figuras 1A-1C ilustran el efecto de berberina en la estructura de microbiota intestinal de rata: Figura 1A es la gráfica de clasificación de cambios PCoA en la estructura de microbiota intestinal de rata en respuesta a alimentación HFD y administración de berberina; Figura IB muestra la aglomeración de la microbiota intestinal basada en distancias de mahalanobis calculado usando MANOVA: y la Figura 1C muestra el índice de Shannon-Wiener, calculado después de rarificar a un número igual de lecturas de secuencia para todas las muestras; La Figura 2 ilustra algunas diferencias representativas en la estructura de microbiota intestinal causadas por tratamiento de berberina usando trigráfica de distancia del RDA de microbiota intestinal; Las Figuras 3A-3D ilustran el efecto en los contenidos de ácido graso de cadena corta en heces fecales de rata cuando las ratas son alimentadas con dieta alta en grasa o dieta de comida normal; La Figura 3A muestra los niveles de ácidos grasos de cadena corta total (SCFA); La Figura 3B muestra el nivel de ácido acético; La Figura 3C muestra el nivel de ácido propiónico y la Figura 3D muestra el nivel de ácido butírico (D).
Las Figuras 4A-4C ilustran el efecto de berberina en fenotipo de obesidad e ingesta de alimento en ratas; La Figura 4A muestra el efecto de berberina en la ganancia de peso corporal; La Figura 4B muestra el efecto de berberina en el índice de adiposidad, calculado como el peso de cojincillo de grasa (suma de cojincillos de grasa epididimal y perirenal) por 100 g de peso corporal total; y la Figura 4C muestra la ingesta de alimentación de ratas durante la prueba entera; Las Figuras 5A-5E ilustran el efecto de berberina en la sensibilidad de insulina en ratas; La Figura 5A muestra el efecto de berberina en glucosa de sangre de ayuno (FBG, por sus siglas en inglés); La Figura 5B muestra el efecto de berberina en insulina de suero en ayuno (FINS, por sus siglas en inglés); La Figura 5C muestra el efecto de berberina en evaluación de homeostasis de valor resistencia de insulina (HOMA-IR por sus siglas en inglés), calculado de acuerdo a la insulina de ayuno de fórmula ((U/ml) x glucosa de ayuno (moles/1)/22.5; La Figura 5D muestra el efecto de berberina en prueba de tolerancia de glucosa oral (OGTT, por sus siglas en inglés); y la Figura 5E muestra el efecto de berberina en prueba de tolerancia a insulina intraperitoneal (ITT por sus siglas en inglés); y Las Figuras 6A-6D ilustran el efecto de berberina en el nivel de factores de inflamación en ratas; la Figura 6A muestra el efecto de berberina en proteína de enlace de lipopolisacárido sérico (LPS, por sus siglas en inglés) (LBP, por sus siglas en inglés); La Figura 6B muestra el efecto de berberina en leptina sérica; La Figura 6C muestra el efecto de berberina en MCP-1 sérico, y la Figura 6D muestra el efecto de berberina en adiponectina sérica corregida por grasa corporal.
DESCRIPCION DETALLADA DE LA INVENCION En la siguiente descripción detallada, se hace referencia a las figuras anexas las cuales forman una parte de la misma. En las figuras, símbolos similares identifican típicamente componentes similares, a menos que el contexto dicte de otra forma. Las modalidades ilustrativas descritas en la descripción detallada, figuras y reivindicaciones no son entendidas para ser limitantes. Otras modalidades pueden ser utilizadas y otros cambios pueden ser hechos, sin alejarse del espíritu o alcance de la materia objeto presentada en la presente. Será fácilmente entendido que los aspectos de la presente descripción, como se describe generalmente en la presente e ilustra en las figuras, pueden ser dispuestos, substituidos, combinados, separados y diseñados en una amplia variedad de diferentes configuraciones, todas las cuales son contempladas explícitamente en la presente.
Esta solicitud es generalmente relacionada, ínter alia, a composiciones, métodos, procesos, aparatos, sistemas, dispositivos y/o productos relacionados a mejorar la población de microbiota intestinal.
La solicitud proporciona composiciones y métodos novedosos para mejorar población de microbiota intestinal. La solicitud identifica familias de bacterias que están relacionadas cercanamente a metabolismo hospedero utilizando, por ejemplo, secuenciación de alto rendimiento y métodos estadísticos multivariados.
En un aspecto, la solicitud proporciona métodos para mejorar población de microbiota intestinal. En una modalidad, el método puede incluir enriquecer selectivamente una primera población de microbiota intestinal. La primera población de microbiota intestinal puede incluir, por ejemplo, una bacteria que produce ácido graso de cadena corta (SCFA). En una modalidad, el método puede incluir suprimir una segunda población de microbiota intestinal. La segunda población de microbiota intestinal puede incluir, por ejemplo, una bacteria que produce endotoxina.
En una modalidad, el método puede incluir la etapa de administrar a un sujeto una composición. La composición puede ser una formulación oral o parental. La composición puede incrementar selectivamente la primera población de microbiota intestinal mientras que disminuye simultáneamente la segunda población de microbiota intestinal.
El enriquecimiento de la primera población de microbiota intestinal y supresión de la segunda población de microbiota puede ser realizada simultáneamente. El método puede resultar en la prevención o tratamiento de síndrome metabólico incluyendo, sin limitación, obesidad, diabetes mellitus, resistencia a la insulina, hiperlipoproteinemia, hiperuricemia, esteatosis hepática, hipercolesterolemia, hipertrigliceridemia, inflamación y otros trastornos.
Las bacterias que producen ácido graso de cadena corta (SCFA) dentro del intestino son en su mayoría bacterias benéficas. Estas bacterias ya sea directamente o por incrementar ácido graso de cadena corta dentro del intestino, de esta forma indirectamente, realiza funciones que incluyen sin limitación anti-inflamación, proteger función de barrera intestinal y regular el metabolismo y sistema inmunológico. Estas funciones llevan a la prevención o tratamiento de obesidad, resistencia a insulina, diabetes y otras enfermedades metabólicas.
Usar los métodos descritos para mejorar población de microbiota intestinal, la población de microbiota intestinal incrementada puede incluir Alistipes, Allobaculum, Bacteroides, Barnesiella, Blautia, Butyricicoccus, Butyricimonas, Dorea, Helicobacter, Hespellia, Holdemania, Lawsonia, Oscillibacter, Parabacteroides, Phascolarctobacterium, Prevotella o Sedimentibacter. En una modalidad, la población de microbiota intestinal incrementada puede incluir Bacteroidaceae, Coriobacteriaceae, Desulfovibrionaceae, Erysipelotrichaceae, Flavobacteriaceae, Helicobacteraceae, IncertaeSedisXI, IncertaeSedis XIV, Lachnospiraceae, Porphyromonoadaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae, Ruminococcaceae o Veillonellaceae; alternativamente, las bacterias intestinales incrementadas pueden incluir Campylobacterales, Desulfovibrionales, Bacteroidales, Coriobacteriales, Flavobacteriales, Clostridiales o Erysipelotrichales, alternativamente, las bacterias intestinales incrementadas pueden incluir Episilonproteobacteria, Deltaproteobacteria, Bacteroidia, Coriobacteridae, Flavobacteria, Clostridia o Erysipelotrichi; alternativamente, las bacterias intestinales incrementadas pueden incluir Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria o Firmicutes.
Por ejemplo, la población de microbiota intestinal incrementada puede incluir una bacteria cuya región V3 de secuencia de gen rRNA 16S tiene por lo menos aproximadamente 70%, por lo menos aproximadamente 75%, por lo menos aproximadamente 80%, por lo menos aproximadamente 85%, por lo menos aproximadamente 90%, por lo menos aproximadamente 95%, por lo menos aproximadamente 98%, o por lo menos aproximadamente 99% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NO:1-93.
Las bacterias que producen endotoxina dentro del intestino son principalmente bacterias peligrosas, las cuales, ya sea directa o indirectamente por incrementar endotoxina, promueven la inflamación, daño de función de barrera intestinal e incrementan el trastorno en metabolismo y sistema inmunológico, como un resultado induciendo obesidad, resistencia a insulina, diabetes y otras enfermedades metabólicas.
De acuerdo a los métodos para mejorar población de microbiota intestinal descrita en la presente, las bacterias intestinales disminuidas incluyen Alistipes, Anaeroplasma, Barnesiella, Bifidobacterium, Butyricimonas, Butyrivibrio, Coprococcus, Fastidiosipila, Helicobacter, Hespellia, Marvinbryantia, Oribacterium, Oscillibacter, Prevotella, Roseburia, Ruminococcus o TM7_genera_incertae_sedis; alternativamente, las bacterias intestinales pueden incluir Helicobacteraceae, Lachnospiraceae, Porphyromonadaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae, Ruminococcaceae, Anaeroplasmataceae, o Bifidobacteriaceae. En una modalidad, la población de microbiota intestinal disminuida puede incluir Campylobacterales, Bacteroidales, Clostridiales, Anaeroplasmatales o Bifidobacteriales; alternativamente, las bacterias intestinales disminuidas pueden incluir Epsilonproteobacteria, Alphaaproteobacteria, Bacteroidia, Clostridia, Actinobacteridae o Mollicutes. En una modalidad, la población de microbiota intestinal disminuida puede incluir Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Firmicutes o Tenericutes.
Por ejemplo, las bacterias intestinales disminuidas pueden incluir una bacteria cuya región V3 de la secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos 70%, por lo menos aproximadamente 75%, por lo menos aproximadamente 80%, por lo menos aproximadamente 85%, por lo menos aproximadamente 90%, por lo menos aproximadamente 95%, por lo menos aproximadamente 98% o por lo menos aproximadamente 99% similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada de un grupo que consiste de SEQ ID NO:94-268.
Los métodos pueden provocar disminuir el nivel sérico de factores pro-inflamatorios. Factores proinflamatorios de ejemplo incluyen sin limitación citosinas como proteína de enlace de lipopolisacárido, proteína-1 quimoatrayente de monocitos o leptina. Adicional y opcionalmente, los métodos pueden incrementar el nivel sérico de citosina como adiponectina.
El nivel de ácidos grasos de cadena corta intestinales puede ser incrementado usando los métodos descritos. Los ácidos grasos de cadena corta pueden incluir sin limitación ácido acético, ácido propiónico, ácido butírico, ácido valérico, ácido isobutírico y ácido isovalérico.
Para mejorar la población de microbiota intestinal, las composiciones pueden ser administradas oral o parentalmente. En una modalidad, la composición puede ser un alimento, una bebida, un complemento o una formulación farmacéutica. En una modalidad, la composición puede estar en la forma de supositorio, tableta, píldora, gránulo, polvo, película, microcápsula, aerosol, espíritus, tintura, tónico, suspensión líquida o jarabe. La composición puede ser administrada en una dosis de aproximadamente 50 mg/kg de peso corporal a aproximadamente 400 mg/peso corporal.
En un ejemplo, la composición que incluye berberina es administrada a un sujeto. La población de microbiota intestinal del sujeto es entonces analizada usando téenicas de 454 piro secuenciación y el nivel de ácido graso de cadena corta es ensayado por cromatografía de gas. Los resultados demuestran que berberina es capaz de alterar población de microbiota intestinal; enriqueciendo ciertas bacterias incluyendo aquellas que producen ácido graso de cadena corta mientras simultáneamente suprimen o eliminan ciertas bacterias que incluyen aquellas que producen endotoxina. Es además demostrado que berberina administrada oralmente es capaz de incrementar el nivel de ácido graso de cadena corta dentro del intestino y el incremento es más pronunciado en individuos quienes tienen síndrome metabólico. Experimentación y observación adicional además demuestran que efectos descritos anteriores por berberina en la población de microbiota intestinal tienen resultados benéficos incluyendo sin limitación mejorar sensibilidad de insulina, reducir inflamación, controlar ganancia de peso y prevenir obesidad inducida por exceso de comida, inflamación crónica y resistencia a insulina.
En otro aspecto, la solicitud proporciona métodos para tamizar fármacos, compuestos, composiciones, extractos o formulaciones capaces de mejorar población de microbiota intestinal. Los métodos pueden ser usados en el desarrollo de fármacos, complementos nutricionales, productos de cuidado de la salud, alimentos y bebidas que mejoran la salud y/o evitan obesidad u otros síndromes metabólicos relacionados por objetivar población de microbiota intestinal en un sujeto.
En una modalidad, el método de tamización puede incluir administrar a un sujeto de control una cantidad efectiva de una composición de control para incrementar la primera población de microbiota intestinal mientras disminuyen simultáneamente la segunda población de microbiota intestinal en el sujeto de control, administrar a un sujeto de prueba una cantidad de una composición de prueba y comparar la población de microbiota intestinal del sujeto controlado y la población de microbiota intestinal de sujeto de prueba.
Como se usa en la presente, el término "sujeto" se refiere a un animal, como un mamífero, por ejemplo un humano. En algunas modalidades, el sujeto puede ser una rata. En algunas modalidades, el sujeto puede ser un ratón. En algunas modalidades, el sujeto puede ser un humano.
Si el compuesto de prueba demuestra efecto similar en microbiota intestinal como el control, el compuesto de prueba es activo para mejorar población de microbiota intestinal. Como se usa en la presente, "similar" se refiere a una similitud de por lo menos aproximadamente 75%, por lo menos aproximadamente 80%, por lo menos aproximadamente 90%, por lo menos aproximadamente 95%, por lo menos aproximadamente 98% o por lo menos aproximadamente 99%.
La composición de prueba puede ser un compuesto sencillo, una mezcla, un alimento, un aditivo alimenticio, un complemento nutricional, producto de cuidado de salud, una formulación farmacéutica o una bebida.
En un aspecto adicional, la solicitud proporciona composiciones para mejorar población de microbiota intestinal. En una modalidad, la composición puede ser capaz de incrementar selectivamente la primera población de microbiota intestinal mientras que disminuye simultáneamente la segunda población de microbiota intestinal en un sujeto.
La composición puede incluir un compuesto químico, una medicina natural, un producto natural, o un extracto herbal. En una modalidad, el compuesto químico puede incluir, sin limitación, berberina, derivados de berberina, alcaloides de isoquinolina o cualesquiera combinaciones de los mismos.
En una modalidad, la composición puede incluir medicina natural, hierba entera, fragmentada o en polvo o extracto herbal derivado de plantas de Berberís, Coptis, Scutellaria, Phellodendron, Momordica, Ilex, Sophora, Gentiana, Anemarrhena, Gardenia, Rheum o Taraxacum. En una modalidad, la composición puede incluir medicina natural, hierba entera, fragmentado o en polvo o extracto herbal derivado de plantas de Berberidaceae, Ranunculaceae , Lamiaceae, Rutaceae, Cucurbitacea, Aquifoliaceae , Leguminosae, Gentianaceae, Agavaceae, Rubiaceae, Polygonaceae, Asteraceae, Menispermaceae o Cucurbitaceae. En una modalidad, la composición puede incluir hierba medicinal natural, entera o fragmentada o extracto herbal derivado de Berberís vulgaris, Coptischinensis, Scutellariabaicalensis, PhellodendriChinensis, Momordicacharantia, Ilex kudingcha, Sophoraflavescens, Gentianascabra, Anemarrhenaasphodeloides, Gardenia jasminoides, Rheum palmatum o HerbaTAraxaci.
Los siguientes ejemplos son para ilustración de la ejecución y propiedad del método representativo de la solicitud. Estos ejemplos no se proponen para limitar el alcance de la solicitud.
Ejemplos Estos ejemplos usan ratas Wistar (8 semanas de edad, macho) como sujetos de prueba y berberina como un compuesto representativo. Se aclimatizan 40 ratas Wistar por dos semanas y son divididas subsecuentemente en forma aleatoria en cuatro grupos: grupo de dieta normal (NCD, por sus siglas en inglés), dieta normal más tratamiento con berberina (NCD + BBR, por sus siglas en inglés), dieta alta en grasa (HFD, por sus siglas en inglés) y tratamiento de berberina más dieta alta en grasas (HFD+ BBR, por sus siglas en inglés). Cada grupo continua por otras 18 semanas. Durante estas 18 semanas, el grupo NCD + BBR recibe administración intragástrica de berberina en niveles establecidos. Se recolectan muestras de heces fecales a partir de cada animal en varios puntos de tiempo. Se realiza 454 pirosecuenciación para analizar estructura de microbiota intestinal. Se usa cromatografía de gas para ensayar el nivel de ácido graso de cadena corta de las heces fecales. Además, se monitorean peso, ingesta de alimentos, sensibilidad a insulina, niveles de inflamación sistémico y se miden durante el periodo de 18 semanas. Berberina Altera Población de Microbiota Intestinal bajo tanto Condiciones de Dieta Normal y Dieta Alta en Grasas Las poblaciones de microbiota intestinal en ratas de todos los cuatro grupos experimentales son analizadas por 454 pirosecuenciación y análisis estadístico multivariado. Análisis PcoA se basa en distancia Unifrac no pesado demuestra que berberina altera estructura de microbiota intestinal en tanto el grupo de dieta normal y grupo de dieta alto en grasa en un nivel estadísticamente significativo; y berberina se cuenta para 12.6% de todos los cambios en la población de microbiota intestinal (Figura 1A). La dieta también ejerce influencia estadísticamente significativa en población de microbiota intestinal. La Figura 1A revela una diferencia estadísticamente significativa (3.7%) en población de microbiota intestinal entre dos dietas diferentes (NCD contra HFD) a lo largo del eje vertical. El análisis de varianza multivariado (MANOVA, por sus siglas en inglés) en los cuatro grupos demuestra que berberina o dieta tiene una influencia estadísticamente significativa en la microbiota intestinal (P<0.01), pero la diferencia más pronunciada deriva de la presencia de berberina (Figura IB). El parámetro Shannon-Wiener indica que berberina reduce diversidad de población de microbiota intestinal en un nivel estadísticamente significativo (P<0.05).
Berberina Enriquece las Bacterias Productoras de Ácido Graso de Cadena Corta y Reduce Bacterias Productoras de Endotoxina en Población de Microbiota Intestinal Se identifican 268 OTU relacionadas a berberina por análisis de redundancia (RDA por sus siglas en inglés) y los resultados detallados son mostrados en la Figura 2, Tabla 1 y Tabla 2, 93 OTU (SEQ_ID_NO 1-93) (Tabla 1) son enriquecidos por berberina, mientras que 175 OTU (SEQ_ID_NO 94-268) (Tabla 2) son suprimidos o eliminados.
La taxonomía de estos 268 OTU es analizada usando clasificador de RDP con secuencia representativa del OTU. Se revela que las bacterias suprimidas por berberina incluyen aquellas de Alistipes, Anaeroplasma, Barnesiella, Bifidobacterium, Butyricimonas, Butyrivibrio, Coprococcus, Fastidiosipila, Helicobacter, Hespellia, Maryinbryantia, Oribacterium, Oscillibacter, Prevotella, Roseburia, Ruminococcus, TM7_genera_incertae_sedis, y otros. Entre ellos, el Helicobacter, que pertenece a Proteobacteria phylum, es capaz de producir endotoxina altamente activa.
Además se revela que berberina incrementa bacterias incluidas aquellas de Alistipes, Allobaculum, Bacteroides, Barnesiella, Blautia, Butyricicoccus, Butyricimonas, Dorea, Helicobacter, Hespellia, Holdemania, Lawsonia, Oscillibacter, Parabacteroides, Phascolarctobacterium, Prevotella y Sedimentibacter . Entre ellos, Blautia, Allobaculum, Prevotella, Bacteroides y Butyricimonas son relativamente abundantes y son capaces de producir ácido graso de cadena corta.
Por lo tanto, cuando se administra a un sujeto, berberina es capaz de enriquecer las bacterias que producen ácido graso de cadena corta y reducir bacterias que producen endotoxina en población de microbiota intestinal. Berberina Incrementa Nivel de Ácido Graso de Cadena Corta Intestinal en Ratas Alimentadas con Dieta Normal o Dieta Alta en Grasa Se ensayan los niveles de ácido graso de cadena corta (incluyendo ácido acético, ácido propiónico, ácido butírico, ácido valérico, ácido isobutírico, ácido isovalérico, etc.) en heces fecales de ratas por cromatografía de gas. El resultado demuestra que administración oral de 100 mg/kg de peso corporal puede incrementar el nivel de ácido graso de cadena corta en ratas alimentadas con dieta normal o dieta alta en grasa. El efecto en los niveles de ácido acético y ácido propiónico es especialmente pronunciado (Figura 3). Por lo tanto, berberina es capaz de incrementar nivel de ácido graso de cadena corta en ratas alimentadas con dieta normal o dieta alta en grasa.
Berberina Reduce Fenotipo de Obesidad de Ratas Se monitorea el peso corporal de todos los cuatro grupos de ratas durante la duración de los experimentos y se analiza. Los resultados demuestran que, después de 18 semanas de dieta alta en grasas, el grupo HFD tiene peso corporal significativamente superior que el grupo de dieta normal (P<0.01); administración intragástrica de berberina en la dosis de 100 mg/kg efectivamente limita crecimiento de peso corporal de rata, especialmente para ratas alimentadas con dieta alta en grasas. El resultado es especialmente sorprendente que durante el proceso experimental total, el peso corporal del grupo HFD + BBR es limitado a un nivel similar a aquel del grupo de dieta normal, no exhibiendo diferencia estadísticamente significativa (P> 0.05). Berberina también influye, a un cierto grado, en el peso corporal de ratas alimentadas con dieta normal (Figura 4).
Al final del experimento, se sacrifican los animales. Se mide peso corporal de ayuno, peso de grasa epididimal y peso de grasa perirenal. Se muestra índice de adiposidad (peso de grasa epididimal + grasa perirenal/peso de ayuno x 100) en la Figura 4B. Después de 18 semanas de dieta alta en grasa, el índice de adiposidad del grupo HFD es significativamente superior que aquel de NCD y tratamiento de berberina reduce significativamente índice de adiposidad. Por otra parte, ni dieta alta en grasa ni berberina tienen efecto significativo en hígado y páncreas, indicando sorpresivamente que el uso a largo plazo de berberina no tiene efecto lateral obvio a función fisiológica normal de rata. Resultados de la ingesta de calorías de estas ratas demuestran que administración oral de berberina en 100 mg/kg de peso corporal tiene un efecto inhibitorio significativo en ingesta de alimentación de ratas, especialmente en ratas alimentadas con una dieta alta en grasas (Figura 4C).
Berberina Reduce Sensibilidad de Insulina en Ratas Alimentadas con Dieta Normal o Dieta Alta en Grasas Se mide la glucosa sanguínea en ayuno (FBG por sus siglas en inglés) e insulina en suero en ayuno (FINS por sus siglas en inglés para todos los cuatro grupos experimentales de ratas. Ratas alimentadas con HFD por 18 meses tienen un nivel significativamente superior de FBG que aquel de NCD. Sorpresivamente, berberina reduce efectivamente FBG en ratas NCD y HFD, especialmente en ratas HFD donde la reducción de FBG es significativa (P<0.05) (Figura 5A). El resultado del efecto berberina en nivel de insulina es mostrado en la Figura 5B. El FINS de rata alimentada con HFD es significativamente superior que al del grupo NCD; sin embargo, después del mes 18 de intervención de berberina en el nivel de 100 mg/kg de peso corporal, el nivel FINS es significativamente reducido incluso en ratas alimentadas con HFD (HFD + BBR), para alcanzar un nivel comparable con aquel de la dieta normal. La Figura 5C muestra el resultado de índice de resistencia de insulina HOMA para evaluar el estado de resistencia a insulina en ratas, lo cual demuestra que después de 18 semanas de inducción de HFD, ratas forman resistencia aparente a insulina; aún intervención de berberina en 100 mg/kg de peso corporal evita la formación de resistencia a insulina (P<0.05).
Con el fin de examinar sensibilidad a insulina, se realiza prueba de tolerancia a glucosa oral e inyección intraperitoneal de prueba de tolerancia a insulina y los resultados son mostrados en la Figura 5D y 5E, respectivamente. Consistente con el resultado de FBG y FINS, después de 18 semanas de inducir dieta alta en grasas, tolerancia a glucosa oral e inyección intraperitoneal de tolerancia a insulina son dañados significativamente, mientras tanto, intervención de berberina en 100 mg/kg de peso corporal evita significativamente la pérdida de tolerancia a glucosa y tolerancia a insulina, demostrando que la berberina puede jugar un papel importante en mejorar metabolismo de glucosa.
Berberina Reduce Nivel de Inflamación Sistémica en Ratas Alimentadas con Dieta Alta en Grasas Con el fin de evaluar los niveles de inflamación sistémica de todos los cuatro grupos experimentales de ratas, se miden los niveles de suero de proteína de enlace a lipopolisacárido (LPS, por sus siglas en inglés) (LBP, por sus siglas en inglés), proteína-1 quimioatrayente de monocito (MCP-1), leptina y adiponectina y se muestran los resultados en las Figuras 6A-6D. Los experimentos demuestran que HFD incrementa significativamente el nivel de LBP en suero; pero administrar berberina en 100 mg/kg suprime significativamente el incremento de LBP sérico (P<0.05, Figura 6A).
MCP-1 es una citosina pro-inflamatoria que funciona en quimiotaxis y activación de monocitos/macrófagos. Ocurrencia y desarrollo de muchas enfermedades relacionadas a inflamación son relacionadas cercanamente a MCP-1, incluyendo aterosclerosis, obesidad, diabetes tipo 2, artritis, sepsis e infección bacteriana crónica. Los resultados del experimento demuestran que, en el proceso del inicio gradual de obesidad y resistencia a insulina en ratas inducida por HFD, nivel de MCP-1 es elevado gradualmente; sin embargo, después de la intervención con administración de berberina, nivel de MCP- 1 es significativamente reducido y sorpresivamente, es incluso menor a aquel del grupo NCD (Figura 6B).
La leptina es una hormona secretada por tejido adiposo y participa ampliamente en metabolismo de lípido, glucosa y energía. Los resultados del experimento demuestran que nivel de leptina sérica en grupo HFD es significativamente superior a aquel del grupo NCD (P< 0.01); sin embargo, berberina reduce significativamente el nivel de leptina sérica en ratas, especialmente en ratas alimentadas con HFD (P<0.05, Figura 6C).
Se analizan los niveles de adiponectina en todos los cuatro grupos. Los resultados muestran que el nivel de adiponectina normalizado contra peso de grasa corporal, es significativamente menor en grupo HFD cuando se compara con aquel del grupo NCD (P O.OOl); sin embargo, administración de berberina incrementa significativamente nivel de adiponectina en ratas alimentadas con HFD (P O.Ol, Figura 6D). Por lo tanto, berberina mejora población de microbiota intestinal, reduce LPB, MCP-1 y nivel de leptina e incrementa secreción de adiponectina.
Tabla 1 región V3 de secuencia de gen ARNr 16S de aquellas bacterias enriquecidas por berberina.
Tabla 2 Región V3 de secuencia de gen ARNr 16S de aquellas bacterias suprimidas/eliminadas por berberina _ _ _ _ _ _ SEQ_ID_N0_136 R_U00001406 TGAGGAATATTGGTCAATGGGCGGAAGCCTGAACCAG CCAAGTCGCGTGAGGGAATAAGGCCCTAAGGGTCGTA En la descripción detallada anterior, se hace referencia a las figuras anexas, las cuales forman una parte del mismo. En las figuras, símbolos similares identifican típicamente componentes similares, a menos que el contexto dicte otra cosa. Las modalidades ilustrativas descritas en la descripción detallada, figuras y reivindicaciones no se entienden para ser limitantes. Otras modalidades pueden ser usadas y otros cambios pueden ser hechos, sin alejarse del espíritu o alcance de la materia objeto presentada aquí. Será fácilmente entendido que los aspectos de la presente descripción, como se describen generalmente en la presente e ilustran en las Figuras pueden ser dispuestas, substituidas, combinadas, separadas y diseñadas en una amplia variedad de diferentes configuraciones, todas las cuales son contempladas explícitamente en la presente.
La presente descripción no está limitada en términos de las modalidades particulares descritas en esta solicitud, las cuales son propuestas como ilustraciones de varios aspectos. Muchas modificaciones y variaciones pueden ser hechas sin alejarse de su espíritu y alcance, como será aparente para aquellos expertos en la téenica. Métodos y aparatos funcionalmente equivalentes dentro del alcance de la descripción, además de aquellos enumerados en la presente, serán aparentes para aquellos expertos en la técnica de las descripciones mencionadas anteriormente. La presente descripción es para ser limitada solamente por los términos de las reivindicaciones anexas, junto con el alcance total de equivalentes a los cuales se titula las reivindicaciones. Es para ser entendido que esta descripción no está limitada a métodos, reactivos, compuestos, composiciones o sistemas biológicos particulares, los cuales, por supuesto, pueden variar. Es también para ser entendido que la terminología usada en la presente es para el propósito de describir modalidades particulares solamente y no se propone para ser limitante.
Con respecto al uso de substancialmente cualesquiera términos plurales y/o singulares en la presente, aquellos que tienen experiencia en la téenica pueden traducir del plural al singular y/o del singular al plural como sea apropiado para el contexto y/o aplicación. Las varias permutaciones singulares/plurales pueden ser indicadas expresamente en la presente para facilidad de claridad.
Será entendido por aquellos dentro de la técnica que, en general, términos usados en la presente y especialmente en las reivindicaciones anexas (por ejemplo, cuerpos de las reivindicaciones anexadas) son generalmente propuestos como términos "abiertos" (por ejemplo, el término "que incluye" debe ser interpretado como "que incluye pero no limitado a", el término "que tiene" debe ser interpretado como "que tiene por lo menos" el término "incluye" debe ser interpretado como "incluye pero no es limitado a", etc). Será además entendido por aquellos dentro de la técnica si se propone una variedad específica de una declaración de reivindicación introducida, como un intento será descrito explícitamente en la reivindicación y en la ausencia de la descripción no está presente ningún intento. Por ejemplo, como un auxiliar para entendimiento, las siguientes reivindicaciones anexas pueden contener uso de las frases introductorias "por lo menos uno" y "uno o más" para introducir descripciones de reivindicación. Sin embargo, el uso de las frases no debe ser construido para implicar que la introducción de una descripción de reivindicación por los artículos definidos "un, una" o "uno" limita cualquier reivindicación particular que contiene la descripción de reivindicación introducida a modalidades que contienen solamente una descripción, incluso cuando la misma descripción de reivindicación introducida a modalidades que contiene solamente una descripción, incluso cuando la misma reivindicación incluye las frases introductorias "una o más" o "por lo menos una" y artículos indefinidos como "una, uno" o "un" (por ejemplo, "uno, una" y/o "un" debe ser interpretado como significar "por lo menos uno" o "uno o más"); el mismo se mantiene verdadero para el uso de artículos definidos usados para introducir descripciones de reivindicaciones. Además, incluso si un número específico de una descripción de reivindicación introducida es descrita explícitamente, aquellos expertos en la téenica reconocerán que la descripción debe ser interpretada para significar por lo menos el número descrito (por ejemplo, la descripción única de "dos descripciones" sin otros modificantes, significa por lo menos dos descripciones, o dos o más descripciones). Adicionalmente, en aquellas instancias donde un análogo de convención a "por lo menos uno de A, B y C, etc" se usa, en general como una construcción es propuesta en el sentido de que un experto en la técnica puede entender la convención (por ejemplo, "un sistema que tiene por lo menos uno de A, B y C" puede incluir pero no se limita a sistemas que tienen solo A, solo B, solo C, A y B juntos, A y C juntos, B y C juntos, y/o A, B y C juntos, etc). En aquellas instancias donde una convención análoga a "por lo menos uno de A, B o C, etc" se usa, en general se propone una construcción en el sentido que alguien que tiene experiencia en la téenica puede entender la convención (por ejemplo, "un sistema que tiene por lo menos uno de A, B o C" puede incluir pero no limitado a sistemas que tienen solo A, solo B, solo C, A y B juntos, A y C juntos, B y C juntos, y/o A, B y C juntos, etc). Será además entendido por aquellos dentro de la técnica que virtualmente cualquier palabra disyuntiva y/o frase que presenta dos o más términos alternativos, si en la descripción, reivindicaciones o figuras debe ser entendido para contemplar las posibilidades de incluir uno de los términos, ya sea de los términos o ambos términos. Por ejemplo, la frase "A o B" deberá ser entendido para incluir las posibilidades de "A" o "B" o "A y B".
Además, donde características o aspectos de la descripción son descritos en términos de grupos Markush, aquellos expertos en la técnica reconocerán que la descripción es también por lo tanto descrita en términos de cualquier miembro individual o subgrupo de miembros del grupo Markush.
Como será entendido por un experto en la téenica, para cualesquiera y todos los propósitos, como en términos de proporcionar una descripción escrita, todos los intervalos descritos en la presente también comprenden cualquier y todos los subintervalos posibles y combinaciones de subintervalos de los mismos. Cualquier intervalo enlistado puede ser fácilmente reconocido como que describe suficientemente y que permite el mismo intervalo que es roto en por lo menos mitades , cuartos, quintos, décimos iguales, etc. Como un ejemplo no limitante, cada intervalo discutido en la presente puede ser fácilmente roto en un tercer inferior, tercero medio y tercero superior, etc. Como será entendido por un experto en la técnica todo el idioma como "hasta", "por lo menos" y similares incluyen el número descrito y se refieren a intervalos los cuales pueden ser entendidos por un experto en la técnica, un intervalo incluye cada miembro individual. De esta forma, por ejemplo, un grupo que tiene 1-3 células se refiere a grupos que tienen 1, 2 ó 3 células. Similarmente, un grupo que tiene 1-5 células se refiere a grupos que tienen 1, 2, 3, 4 ó 5 células y así sucesivamente.
A partir de lo mencionado anteriormente, será apreciado que varias modalidades de la presente descripción han sido descritas en la presente para propósitos de ilustración y que varias modificaciones pueden ser hechas sin alejarse del alcance y espíritu de la presente descripción. Por consiguiente, las varias modalidades descritas en la presente no son propuestas para ser limitantes, con el alcance verdadero y espíritu que es indicado por las siguientes reivindicaciones.
Se hace constar que con relación a esta fecha, el mejor método conocido por la solicitante para llevar a la práctica la citada invención, es el que resulta claro de la presente descripción de la invención.

Claims (60)

REIVINDICACIONES Habiéndose descrito la invención como antecede, se reclama como propiedad lo contenido en las siguientes reivindicaciones:
1. Un método para mejorar población de microbiota intestinal, caracterizado porque comprende administrar a un sujeto una composición para incrementar una primera población de microbiota intestinal mientras disminuye simultáneamente una segunda población de microbiota intestinal en el sujeto, en donde la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria que produce ácido graso de cadena corta (SCFA) y en donde la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria que produce endotoxina.
2. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición comprende una medicina natural, un producto natural, una hierba, o un extracto herbal.
3. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición comprende berberina, un derivado de berberina o alcaloide de anisoquinolina.
4. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición comprende una planta o extracto de la misma, en donde la planta comprende Berberís vulgaris, Coptischinensis, Scutellariabaicalensis, PhellondendriChinensis, Momordicacharantia, Ilex kudingcha, Sophoraflavescens, Gentianascabra, Anemarrhenaasphodeloides, Gardenia jasminoides, Rheum palmatum, HerbaTaraxaci o combinaciones de las mismas.
5. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición comprende una planta o su extracto, en donde la planta es Berberís, Coptis, Scutellaria, Phellodendron, Momordica, Ilex, Sophora, Gentiana, Anemarrhena, Gardenia, Rheum o Taraxacum.
6. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición comprende una planta o su extracto, en donde la planta es Berberidaceae, Ranunculaceae, Lamiaceae, Rutaceae, Cucurbitacea, Aquifoliaceae, Leguminosae, Gentianaceae, Agavaceae, Rubiaceae, Polygonaceae, Asteraceae, Menispermaceae o Cucurbitaceae.
7. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende Alistipes, Allobaculum, Bacteroides, Barnesiella, Blautia, Butyricicoccus, Butyricimonas, Dorea, Helicobacter, Hespellia, Holdemania, Lawsonia Oscillibacter, Parabacteroides Phascolarctobacterium, Prevotella, Sedimentibacter o una combinación de las mismas.
8. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende Bacteroidaceae, Coriobacteriaceae, Desulfovibrionaceae, Erysipelotrichaceae, Flavobacteriaceae, Helicobacteraceae, IncertaeSedis XI, IncertaeSedis XIV, Lachnospiraceae, Porphyromonadaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae, Ruminococcaceae, Veillonellaceae, o una combinación de los mismos.
9. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende Campylobacterales, Desulfovibrionales, Bacteroidales, Coriobacteriales, Flavobacteriales, Clostridiales, Erysipelotrichales o una combinación de los mismos.
10. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende Epsilonproteobacteria, Deltaproteobacteria, Bacteroidia, Coriobacteridae, Flavobacteria, Clostridia, Erysipelotrichi o una combinación de los mismos.
11. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Firmicutes o una combinación de los mismos.
12. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque las bacterias que producen ácido graso de cadena corta (SCFA) comprenden Blautia, Allobaculum, Prevotella, Bacterioides, Butyricimonas, o una combinación de los mismos.
13. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de la secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos 95% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NO: 1-93.
14. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos aproximadamente 80% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada de un grupo que consiste de SEQ ID NO:1-93.
15. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende Alistipes, Anaeroplasma, Barnesiella, Bifidobacterium, Butyricimonas, Butyrivibrio, Coprococcus, Fastidiosipila, Helicobacter, Hespellia, Marvinbryantia, Oribacterium, Oscillibacter, Prevotella, Roseburia, Ruminococcus, TM7_genera_incertae_sedis o una combinación de los mismos.
16. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende Helicobacteraceae, Lachnospiraceae, Porphyromonadaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae, Ruminococcaceae, Anaeroplasmataceae, Bifidobacteriaceae o una combinación de los mismos.
17. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende Campylobacterales, Bacteroidales, Clostridiales, Anaeroplasmatales, Bifidobacteriales o una combinación de los mismos.
18. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende Epsilonproteobacteria, Alphaaproteobacteria, Bacteroidia, Clostridia, Actinobacteridae, Mollicutes o una combinación de los mismos.
19. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Firmicutes, Tenericutes o una combinación de los mismos.
20. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque las bacterias que producen endotoxina comprenden Proteobacteria.
21. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de genes ARNr 16S tiene por lo menos aproximadamente 95% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NO:94-268.
22. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos aproximadamente 80% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada de un grupo que consiste de SEQ ID NO: 94-268.
23. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición es una formulación oral o una formulación parental.
24. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición está en una forma de supositorio, tableta, píldora, gránulo, polvo, película, microcápsula, aerosol, espíritus, tintura, tónico, suspensión líquida o jarabe.
25. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición puede disminuir el nivel en suero de una primera citosina e incrementar el nivel en suero de una segunda citosina, en donde la primera citosina comprende proteína de enlace de lipopolisacárido, proteína-1 quimioatrayente de monocitos, leptina o una combinación de los mismos y en donde la segunda citosina comprende adiponectina.
26. El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la composición puede incrementar el nivel de ácidos grasos de cadena corta fecales.
27. Un método para tamizar un compuesto de prueba que es activo para mejorar población de microbiota intestinal, caracterizado porque comprende: administrar a un sujeto de control una cantidad efectiva de una composición de control para incrementar una primera población de microbiota intestinal mientras disminuye simultáneamente una segunda población de microbiota intestinal en el sujeto de control, en donde la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria que produce ácidos grasos de cadena corta (SCFA) y en donde la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria que produce endotoxinas; administrar a un sujeto de prueba una cantidad de un compuesto de prueba; comparar la población de microbiota intestinal del sujeto controlado y la población de microbiota intestinal del sujeto de prueba, en donde una similitud de por lo menos aproximadamente 80% es indicativa que el compuesto de prueba es activo para mejorar población de microbiota intestinal.
28. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque una similitud de por lo menos aproximadamente 95% es indicativa que el compuesto de prueba es activo para mejorar población de microbiota intestinal.
29. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque una similitud de por lo menos aproximadamente 75% es indicativa que el compuesto de prueba es activo para mejorar población de microbiota intestinal.
30. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la composición comprende una medicina natural, un producto natural, una hierba, o un extracto herbal.
31. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la composición comprende berberina, un derivado de berberina o un alcaloide de isoquinolina.
32. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la composición comprende una planta o extracto de la misma, en donde la planta comprende Berberís vulgaris, Coptischinensis, Scutellariabaicalensis, PhellodendriChinensis, Momordicacharantia, Ilex kudingcha, Sophorafavescens, Gentianascabra, Anemarrhenaasphodeloides, Gardenia jasminoides, Rheum palmatum, HerbaTaraxaci, o combinaciones de las mismas.
33. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la composición comprende una planta o extracto de la misma, en donde la planta es Berberís, Coptis, Scutellaria, Phellodendron, Momordica, Ilex, Sophora, Gentiana, Anemarrhena, Gardenia, Rheum o Taraxacum.
34. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la composición comprende una planta o su extracto, en donde la planta es Berberidaceae, Ranunculaceae, Lamiaceae, Rutaceae, Cucurbitacea, Aquifoliaceae, Leguminosae, Gentianaceae, Agavaceae, Rubiaceae, Polygonaceae, Asteraceae, Menispermaceae o Cucurbitaceae.
35. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende Alistipes, Allobaculum, Bacteroides, Barnesiella, Blautia, Butyricicoccus, Butyricimonas, Dorea, Helicobacter , Hespellia, Holdemania, Lawsonia, Oscillibacter , Parabacteroides, Phascolarctobacterium, Prevotella, Sedimentibacter o una combinación de las mismas.
36. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque las bacterias que producen ácido graso de cadena corta (SCFA) comprenden Blautia, Allobaculum, Prevotella, Bacterioides, Butyricimonas, o una combinación de los mismos.
37. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de la secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos 95% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NO: 1-93.
38. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos aproximadamente 80% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada de un grupo que consiste de SEQ ID NO:1-93.
39. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende Alistipes, Anaeroplasma, Barnesiella, Bifidobacterium, Butyricimonas, Butyrivibrio, Coprococcus, Fastidiosipila, Helicobacter , Hespellia, Marvinbryantia, Oribacterium, Oscillibacter , Prevotella, Roseburia, Ruminococcus , TM7_genera_incertae_sedis o una combinación de los mismos.
40. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque las bacterias que producen endotoxina comprenden Proteobacteria.
41. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de genes ARNr 16S tiene por lo menos aproximadamente 95% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NO:94-268.
42. El método de’ conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos aproximadamente 80% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada de un grupo que consiste de SEQ ID NO: 94-268.
43. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la composición puede disminuir el nivel de suero de una primera citosina e incrementar el nivel en suero de una segunda citosina, en donde la primera citosina comprende proteína de enlace de lipopolisacárido, proteína-1 quimioatrayente de monocitos, leptina o una combinación de los mismos y en donde la segunda citosina comprende adiponectina.
44. El método de conformidad con la reivindicación 27, caracterizado porque la composición puede incrementar el nivel de ácidos grasos de cadena corta intestinales.
45. Una composición para mejorar población de microbiota intestinal, caracterizada porque es capaz de incrementar selectivamente una primera población de microbiota intestinal mientras disminuye simultáneamente una segunda población de microbiota intestinal en un sujeto, en donde la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria que produce ácido graso de cadena corta (SCFA) y en donde la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria que produce endotoxina.
46. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque comprende medicina natural, producto natural, una hierba o un extracto natural.
47. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque comprende berberina, derivado de berberina u otro alcaloide de isoquinolina del mismo.
48. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque comprende una planta o extracto de la misma, en donde la planta comprende Berberís vulgaris, Coptischinensis, Scutellariabaicalensis, PhellondendriChinensis, Momordicacharantia, Ilex Kudingcha, Sophoraflavescens, Gentianascabra, Anemarrhenaasphodeloides, Gardenia jasminoides, Rheum palmatum, HerbaTaraxaci o combinaciones de los mismos.
49. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque comprende una planta o su extracto, en donde la planta es Berberís, Coptis, Scutellaria, Phellodendron, Momordica, Ilex, Sophora, Gentiana, Anemarrhena, Gardenia, Rheum o Taraxacum.
50. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque comprende una planta o su extracto, en donde la planta es Berberidaceae, Ranunculaceae, Lamiaceae, Rutaceae, Cucurbitacea, Aquifoliaceae, Leguminosae, Gentianaceae, Agavaceae, Rubiaceae, Polygonaceae, Asteraceae, Menispermaceae o Cucurbitaceae.
51. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque es un alimento, una bebida, un complemento o una formulación farmacéutica.
52. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque es capaz de incrementar selectivamente una primera población de microbiota intestinal mientras disminuye simultáneamente una segunda población de microbiota intestinal en un sujeto en una dosis de aproximadamente 50 mg/kg de peso corporal a aproximadamente 400 mg/ de peso corporal y con una vez una administración al día por al menos dos semanas, en donde la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria que produce ácido graso de cadena corta (SCFA), en donde la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria que produce endotoxina.
53. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque la primera población de microbiota intestinal comprende Alistipes, Allobaculum, Bacteroides, Barnesiella, Blautia, Butyricicoccus, Butyricimonas, Dorea, Helicobacter, Hespellia, Holdemania, Lawsonia, Oscillibacter, Parabacteroides, Phascolarctobacterium, Prevotella, Sedimentibacter o una combinación de los mismos.
54. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque las bacterias que producen ácido graso de cadena corta (SCFA) comprenden Blautia, Allobaculum, Prevotella, Bacterioides, Butyricimonas, o una combinación de los mismos.
55. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de la secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos 95% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NO: 1-93.
56. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque la primera población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos aproximadamente 80% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada de un grupo que consiste de SEQ ID NO:1-93.
57. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque la segunda población de microbiota intestinal comprende Alistipes, Anaeroplasma, Barnesiella, Bifidobacterium, Butyricimonas, Butyrivibrio, Coprococcus, Fastidiosipila, Helicobacter, Hespellia, Marvinbryantia, Oribacterium, Oscillibacter, Prevotella, Roseburia, Ruminococcus, TM7_genera_incertae_sedis o una combinación de los mismos.
58. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque las bacterias que producen endotoxina comprenden Proteobacteria.
59. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque la segunda población de microbiota intestinal gpcomprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de genes ARNr 16S tiene por lo menos 95% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada del grupo que consiste de SEQ ID NO:94-268.
60. La composición de conformidad con la reivindicación 45, caracterizada porque la segunda población de microbiota intestinal comprende una bacteria cuya región V3 de secuencia de gen ARNr 16S tiene por lo menos aproximadamente 80% de similitud con una secuencia de ácido nucleico seleccionada de un grupo que consiste de SEQ ID NO: 94-268.
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