KR20150036004A - 장내 미생물 개체군 개선을 위한 방법 및 조성물 - Google Patents
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Abstract
장내 미생물 구조를 개선하기 위한 방법 및 조성물로, 개체에 있어서 1차 장내 미생물 개체군을 증가시키고, 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시킨다. 1차 장내 미생물 개체군은 짧은 사슬 지방산 생산 박테리움이고, 2차 장내 미생물 개체군은 내독소 생산 박테리움을 포함한다.
Description
관련 출원에 대한 상호참조
본 발명은 2012년 6월 6일 출원된 중국특허 출원번호 201210185004.2의 우선권을 주장하여, 본 명세서에 전체적으로 참조로 통합된다.
본 발명은 장내 미생물 개체군 개선을 위한 조성물 및 방법에 관한 것이고, 본 발명은 의약, 영양제, 건강관리 제품, 식품 및 음료에 관한 것이다.
본 명세서에서 달리 언급하지 않는 한, 본 부분에서 묘사된 물질은 본 발명이 종래 기술이 아니며, 본 발명에 포함됨으로써 선행기술로 인정되지 않는다.
인체 내에는 공생균(symbiotic microbe)의 많은 수가 살고 있고, 그중 장내 미생물은 숙주의 건강에 중요한 환경 인자로서 행동한다. 여기에는 1000여종이 넘는 박테리아가 있고, 이는 인체 세포의 수보다 10배는 넘는 수이고, 인간 세포의 유전자 수보다 150배가 넘는 수이다. 이와 관련해서, 인체는 숙주세포 및 장내 미생물을 포함하는 공생균으로 만들어진 "초개체(superorganism)"로서 고려되고, 2차 휴면 게놈(genome)으로서의 장내 미생물[microbes(microbiome)]의 컨소시엄(consortium)을 암호화하는 게놈은 또한 "인간 메타게놈(human metagenome)"으로 알려져 있다. 인간 건강 상태가 변할때, 공생균의 조성물은 그에 따라 변한다. 반대로, 공생균 조성물의 변화는 인간 건강 상태의 변화를 유도한다. 인간 게놈의 다양성 및 장내 미생물의 게놈은 함께 면역력, 영양, 대사, 및 인간 숙주의 건강 및 질병 상태에 영향을 준다. 그러나, 지금까지 어떤 메카니즘에 의해 장내 미생물이 병인론(disease etiology) 및 병리학(pathology)에 기여하고, 어떤 종류의 박테리아가 숙주의 건강 상태에 긍정적으로 연관이 있으며, 어떤 종류의 박테리아가 숙주의 건강 상태에 부정적으로 연관이 있는지 명확하게 밝혀지지 않았다.
요약
하기의 요약은 오직 묘사하기 위한 것이고, 어떤 방법으로도 제한하려고 하지 않는다. 상기 서술된 예시적인 양태, 실시예 및 특징, 추가적인 양태, 실시예 및 특징은 도면 및 하기의 세부적인 묘사를 참조로 더욱 명백해질 것이다.
한 측면에서, 본 발명은 장내 미생물 개체군(gut microbiota population) 개선을 위한 방법을 제공한다. 한 실시예에서, 상기 방법은 개체에 있어서 1차 장내 미생물 개체군의 증가와 동시에 2차 장내 미생물 개체군의 감소를 위한 조성물을 개체에 투여하는 단계를 포함한다. 상기 1차 장내 미생물 개체군은 짧은 사슬 지방산(short chain fatty acid; SCFA) 생산 박테리움을 포함할 것이다. 상기 2차 장내 미생물 개체군은 내독소(endotoxin) 생산 박테리움을 포함할 것이다.
다른 측면에서, 본 발명은 장내 미생물 개체군 개선 활성을 나타낼 시험 화합물(test compound)을 스트리닝하기 위한 방법을 제공한다. 한 실시예에서, 상기 방법은 대조군 개체에 1차 장내 미생물 개체군을 증가시키는 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시키기 위한 대조군 조성물의 유효한 양(effective amount)을 대조군 개체에 투여하는 단계, 시험 화합물의 양을 시험 개체에 투여하는 단계, 및 시험 개체의 장내 미생물 개체군으로 조절된 개체의 장내 미생물 개체군과 비교하는 단계를 포함한다. 적어도 80%의 유사도는 시험 화합물이 장내 미생물 개체군의 개선에 활성이 있음을 나타낸다. 1차 장내 미생물 개체군은 짧은 사슬 지방산 생산 박테리아를 포함할 것이다. 2차 장내 미생물 개체군은 내독소 생산 박테리움을 포함할 것이다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 장내 미생물 개체군 개선을 위한 조성물을 제공한다. 한 실시예에서, 상기 조성물은 개체에 있어서 1차 장내 미생물 개체군을 선택적으로 증가시키고 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시킬 수 있다. 상기 1차 장내 미생물 개체군은 짧은 사슬 지방산 생산 박테리아를 포함할 것이다. 상기 2차 장내 미생물 개체군은 내독소 생산 박테리움을 포함할 것이다. 한 실시예에서, 상기 조성물은 적어도 2주 동안 하루에 1회로 약 50 ㎎/㎏ 체중에서부터 약 400 ㎎/체중의 투여량(dosage)으로 투여량으로 개체에 투여된다.
상기 및 본 발명의 다른 특징은 첨부된 도면과 결합하여 받아들여지는 설명 및 첨부된 청구항에 의해 더욱 명백해질 것이다. 이들 도면은 본 명세서에 부합되게 오직 몇몇의 실시예를 묘사하는 것으로 이해되어야 하고, 따라서, 이는 본 발명의 범위를 제한하지 않으며, 본 발명은 하기 동반되는 도면의 용도를 통해 추가적인 특이성 및 세부사항에 의해 묘사될 것이다:
도 1은 랫의 장내 미생물 구조(gut microbiota structure)에서 베르베린의 영향을 나타내는 도이다: 도 1a는 HFD 섭취 및 베르베린(berberine) 투여에 의한 반응으로 랫의 장내 미생물 구조에 있어서 변화의 PCoA 점수(score) 구성(plot)이다; 도 1b는 MANOVA를 사용해서 계산된 마하라노비스의 거리(mahalanobis distances)에 근거하여 장내 미생물의 클러스터링(clustering)을 나타낸다; 및 도 1c는 모든 샘플에서 읽혀진 서열의 동일 수를 희박하게(rarefying) 한 후 계산된 서열 새논 위너 지수(Shannon-Wiener index)를 나타낸다;
도 2는 장내 미생물의 중복성 분석(redundancy analysis; RDA)의 거리 트리플롯(triplot)을 사용하여 베르베린의 처리에 의한 장내 소화관 구조의 일부 차이를 나타내는 도이다;
도 3은 랫이 고지방 식이(high fat diet) 또는 일반음식(normal chow) 식이를 섭취하였을 때, 랫의 배설물에서 짧은 사슬 지방산 함량에 영향을 나타내는 도이다; 도 3a는 전체 짧은 사슬 지방산의 수준을 나타낸다; 도 3b는 아세트산(acetic acid)의 수준을 나타낸다; 도 3c는 프로피온산(propionic acid)의 수준을 나타낸다; 및 도 3d는 부티르산(butyric acid)의 수준을 나타낸다(D);
도 4는 랫의 비만 표현형(phenotypes) 및 음식 섭취에서 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 4a는 체중 증가에 있어 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 4b는 전체 체중의 100 g당 지방중량(fat pad weight)으로서 계산된(부고환 및 신장 지방중량의 합) 아디포시티 지표(adiposity index)에서 베르베린의 영향을 나타낸다; 및 도 4c는 전체 기간동안 랫의 음식 섭취를 나타낸다;
도 5는 랫의 인슐린 민감성에서 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 5a는 공복혈당(fasting blood glucose; FBG)에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 5b는 공복혈청 인슐린(fasting serum insulin; FINS)에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 5c는 공복 인슐린(μU/㎖) × 공복 글루코스(mmol/ℓ)/22.5의 공식에 따라 계산된 인슐린 저항성의 항상성 평가(homeostasis assessment of insulin resistance; HOMA-IR) 값에서 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 5d는 글루코스 경구부하시험(oral glucose tolerance test; OGTT)에 대한 베르베린의 영향을 나타내는 도이다; 및 도 5e는 복강내의 인슐린 내성시험(intra-peritoneal insulin tolerance test; ITT)에 대한 베르베린의 영향을 나타내는 도이다; 및
도 6은 랫의 염증인자(inflammation factor) 수준에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 6a는 혈청내 리포다당류-결합 단백질[lipopolysaccharide(LPS)-binding protein; LBP]에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 6b는 혈청내 렙틴(leptin)에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 6c는 혈청내 MCP-1에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 및 도 6d는 체지방을 위해 교정된 혈청내 아디포넥틴(adiponectin)에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다.
도 1은 랫의 장내 미생물 구조(gut microbiota structure)에서 베르베린의 영향을 나타내는 도이다: 도 1a는 HFD 섭취 및 베르베린(berberine) 투여에 의한 반응으로 랫의 장내 미생물 구조에 있어서 변화의 PCoA 점수(score) 구성(plot)이다; 도 1b는 MANOVA를 사용해서 계산된 마하라노비스의 거리(mahalanobis distances)에 근거하여 장내 미생물의 클러스터링(clustering)을 나타낸다; 및 도 1c는 모든 샘플에서 읽혀진 서열의 동일 수를 희박하게(rarefying) 한 후 계산된 서열 새논 위너 지수(Shannon-Wiener index)를 나타낸다;
도 2는 장내 미생물의 중복성 분석(redundancy analysis; RDA)의 거리 트리플롯(triplot)을 사용하여 베르베린의 처리에 의한 장내 소화관 구조의 일부 차이를 나타내는 도이다;
도 3은 랫이 고지방 식이(high fat diet) 또는 일반음식(normal chow) 식이를 섭취하였을 때, 랫의 배설물에서 짧은 사슬 지방산 함량에 영향을 나타내는 도이다; 도 3a는 전체 짧은 사슬 지방산의 수준을 나타낸다; 도 3b는 아세트산(acetic acid)의 수준을 나타낸다; 도 3c는 프로피온산(propionic acid)의 수준을 나타낸다; 및 도 3d는 부티르산(butyric acid)의 수준을 나타낸다(D);
도 4는 랫의 비만 표현형(phenotypes) 및 음식 섭취에서 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 4a는 체중 증가에 있어 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 4b는 전체 체중의 100 g당 지방중량(fat pad weight)으로서 계산된(부고환 및 신장 지방중량의 합) 아디포시티 지표(adiposity index)에서 베르베린의 영향을 나타낸다; 및 도 4c는 전체 기간동안 랫의 음식 섭취를 나타낸다;
도 5는 랫의 인슐린 민감성에서 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 5a는 공복혈당(fasting blood glucose; FBG)에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 5b는 공복혈청 인슐린(fasting serum insulin; FINS)에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 5c는 공복 인슐린(μU/㎖) × 공복 글루코스(mmol/ℓ)/22.5의 공식에 따라 계산된 인슐린 저항성의 항상성 평가(homeostasis assessment of insulin resistance; HOMA-IR) 값에서 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 5d는 글루코스 경구부하시험(oral glucose tolerance test; OGTT)에 대한 베르베린의 영향을 나타내는 도이다; 및 도 5e는 복강내의 인슐린 내성시험(intra-peritoneal insulin tolerance test; ITT)에 대한 베르베린의 영향을 나타내는 도이다; 및
도 6은 랫의 염증인자(inflammation factor) 수준에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 6a는 혈청내 리포다당류-결합 단백질[lipopolysaccharide(LPS)-binding protein; LBP]에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 6b는 혈청내 렙틴(leptin)에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 도 6c는 혈청내 MCP-1에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다; 및 도 6d는 체지방을 위해 교정된 혈청내 아디포넥틴(adiponectin)에 대한 베르베린의 영향을 나타낸다.
하기 상세한 설명에 있어서, 본 명세서의 부분에 수반되는 도면에 의해 참조된다. 도면에 있어서, 유사한 부호는 달리 언급하지 않는 한, 유사한 요소(component)로 전형적으로 확인된다. 상세한 설명, 도면 및 청구항을 표시하기 위해 서술된 실시예는 본 발명을 제한하기 위한 것이 아니다. 다른 실시예가 사용될 수 있으며, 다른 변화는 본 명세서의 주제에 대한 사상 또는 범위를 벗어나지 않게 적용될 수 있다. 본 발명은 일반적으로 설명된 본 명세서의 측면에서 쉽게 이해될 것이고, 도면의 설명은 본 명세서에 분명하게 고려될 모든 다른 배치의 매우 다양한 정리, 치환, 결합, 분리 및 디자인될 수 있다.
본 발명은 일반적으로 나타내어지고, 장내 미생물 개체군(gut microbiota population) 개선과 관련된 그중에서(inter alia) 조성물, 방법, 절차, 기구(apparatus), 시스템, 장치, 및/또는 산물을 나타낸다.
본 발명은 장내 미생물 개체군 개선을 위한 신규한 조성물 및 방법을 제공한다. 본 발명은 숙주 대사에 밀접하게 관련된 박테리아 과(family)를 예를 들어 고속 대량 서열분석(high throughput sequencing) 및 다변량 통계분석(multivariate statistical method)을 이용하여 동정하였다.
한 측면에서, 본 발명은 장내 미생물 개체군 개선을 위한 방법을 제공한다. 한 실시예에서, 상기 방법은 1차 장내 미생물 개체군을 선택적으로 강화시키는 것을 포함할 것이다. 상기 1차 장내 미생물 개체군은 예를 들어, 짧은 사슬 지방산(short chain fatty acid; SCFA) 생산 박테리움을 포함할 수 있다. 한 실시예에서, 상기 방법은 2차 장내 미생물 개체군을 억제하는 것을 포함할 것이다. 상기 2차 장내 미생물 개체군은 예를 들어, 내독소(endotoxin) 생산 박테리움을 포함할 수 있다.
한 실시예에서, 상기 방법은 개체에 조성물을 투여하는 단계를 포함할 수 있다. 상기 조성물은 경구(oral) 또는 비경구(parenteral) 제형일 것이다. 상기 조성물은 1차 장내 미생물 개체군을 선택적으로 증가시키는 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시킬 것이다.
1차 장내 미생물 개체군의 강화 및 1차 장내 미생물 개체군의 억제는 동시에 수행될 것이다. 상기 방법은 예를 들어 비만, 당뇨, 멜리투스(mellitus), 인슐린 저항성(insulin resistance), 고리포단백혈증(hyperlipoproteinemia), 고요산혈증(hyperuricemia), 간지방증(hepatic steatosis), 과콜레스테롤혈증(hypercholesterolemia), 고중성지방혈증(hypercholesterolemia), 염증(inflammation) 및 다른 질환을 포함하고 이에 한정되지 않는 대사장애(metabolic syndrome)의 예방 또는 치료의 결과일 수 있다.
장내 짧은 사슬 지방산 생산 박테리아는 주로 유익한 박테리아이다. 상기 박테리아는 직접적으로 장내 짧은 사슬 지방산을 증가시키거나, 간접적으로 항-염증(anti-inflammation), 장 장애물 기능 보호(protecting intestinal barrier function), 및 대사조절(regulating metabolism) 및 면역 시스템(immune system)을 포함하나 이에 한정되지 않는 기능을 수행한다. 이들 기능은 비만, 인슐린 저항성, 당뇨 및 다른 대사성 질환의 예방 및 치료를 야기한다.
본 공개된 장내 미생물 개체군 개선을 위한 방법의 사용은, 증가된 장내 미생물 개체군으로 알리스팁스(alistipes), 알로바쿨룸(allobaculum), 박테로이드(bacteroides), 바네시엘라(barnesiella), 블라우티아(blautia), 부티리시코커스(butyricicoccus), 부티리시모나스(butyricimonas), 도레아(dorea), 헬리코박터(helicobacter), 헤스펠리아(hespellia), 홀데마니아(holdemania), 라우소니아(lawsonia), 오실리박터(oscillibacter), 파라박테로이드(parabacteroides), 파스콜락토박테리움(phascolarctobacterium), 프리보텔라(prevotella) 또는 세디멘티박터(sedimentibacter)를 포함할 수 있다. 한 실시예에서, 증가된 장내 미생물 개체군은 박테로이드과(bacteroidaceae), 코리오박테리움과(coriobacteriaceae), 디설포비브리오과(desulfovibrionaceae), 에리시펠로트릭스과(erysipelotrichaceae), 플라보박테리아과(flavobacteriaceae), 헬리코박테리아과(helicobacteracea), 소속 불명군 XI(incertae sedis XI), 소속 불명군 XIV(incertae sedis XIV), 라크노스피라과(lachnospiraceae), 포르피로모나스과(porphyromonadaceae), 프레보텔라과(prevotellaceae), 리케넬라과(rikenellaceae), 루미노코카과(ruminococcaceae) 또는 베이로넬라과(veillonellaceae)를 포함할 수 있다; 그렇지 않으면 증가된 장내 박테리아는 캄필로박테리아목(campylobacterales), 디설포비브리오목(desulfovibrionales), 박테로이드목(bacteroidales), 코리오박테리움목(coriobacteriales), 플라보박테리오목(flavobacteriales), 클로스트리듐목(clostridiales) 또는 에리시펠로트릭스목(erysipelotrichales)을 포함한다; 그렇지 않으면 증가된 장내 박테리아는 입실론프로테오박테리아(epsilonproteobacteria), 델타프로테오박테리아(deltaproteobacteria), 박테로이드강(bacteroidia), 코리오박테리움강(coriobacteridae), 플라보박테리아(flavobacteria), 크로스트리듐강(clostridia) 또는 에리시펠로트릭스강(erysipelotrichi)을 포함한다; 그렇지 않으면, 증가된 장내 박테리아는 프로테오박테리아(proteobacteria), 박테로이데테스(bacteroidetes), 악티노박테리아(actinobacteria) 또는 피르미쿠테스(firmicutes)를 포함한다.
예를 들어, 증가된 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분(region)이 서열번호 1 내지 93으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산(nucleic acid) 서열과 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 98%, 적어도 99%의 유사성을 갖는 박테리움(bacterium)을 포함할 수 있다.
장내 내독소 생산 박테리아는 주로 위험한 박테리아이고, 내독소 증가에 의해 직접적 또는 간접적으로 비만, 인슐린 저항성, 당뇨 및 다른 대사성 질환의 결과로서 대사 및 면역 시스템에서 염증, 장 장애물 기능 손상(damage intestinal barrier function) 및 장애의 증가(increase disorder)를 촉진한다.
본 발명의 장내 미생물 개체군 개선을 위한 방법에 의하면, 감소된 장내 박테리아는 알리스팁스, 앤에로플라스마(anaeroplasma), 바네시엘라, 비피도박테리움(bifidobacterium), 부티리시모나스, 부티리비브리오(butyrivibrio), 코프로코커스(coprococcus), 파스티디오시필라(fastidiosipila), 헬리코박터, 헤스펠리아, 마빈브리얀티아(marvinbryantia), 오리박테리움(oribacterium), 오스실리박터(oscillibacter), 프레보텔라(prevotella), 로제부리아(roseburia), 루미노코커스(ruminococcus) 또는 TM7 일반적인(genera) 소속 불명군을 포함할 것이다; 그렇지 않으면, 감소된 장내 박테리아는 헬리코박터과(Helicobacteraceae), 라크노스피라과(Lachnospiraceae), 포르피로모나스과(Porphyromonadaceae), 프레보텔라과(Prevotellaceae), 리케넬라과(Rikenellaceae), 루미노코카과, 앤에로플라스마타과(Anaeroplasmataceae) 또는 비피도박테리아과(Bifidobacteriaceae)를 포함한다; 한 실시예에서, 감소된 장내 미생물 개체군은 캄필로박테리아목, 박테로이드목, 클로스트리듐목, 앤에로플라스마타목(Anaeroplasmatales) 또는 비피도박테리아목(Bifidobacteriales)을 포함할 것이다; 그렇지 않으면, 감소된 장내 박테리아는 입실론프로테오박테리아, 알파프로테오박테리아(alphaaproteobacteria), 박테로이드강, 크로스트리듐강, 악티노박테리아강(actinobacteridae) 또는 몰리쿠테스강(mollicutes)을 포함할 것이다; 한 실시예에서, 감소된 장내 미생물 개체군은 프로테오박테리아, 박테로이데테스, 악티노박테리아, 피르미쿠테스 또는 테네리쿠테스(Tenericutes)를 포함할 것이다.
예를 들어, 감소된 장내 박테리아는 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 94 내지 268로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 98%, 적어도 99%의 유사성을 갖는 박테리아를 포함할 것이다.
상기 방법은 전염증성 인자(pro-inflammatory factor)의 혈청 수준을 감소시키는 원인이 될 수 있다. 예를 들어, 전염증성 인자는 리포다당류 결합 단백질(lipopolysaccharide binding protein), 단핵구 화학유인제 단백질-1(monocyte chemoattractant protein-1), 또는 렙틴(leptin)과 같은 사이토카인(cytokine)을 포함하나 이에 한정되지 않는다. 또한 및 선택적으로, 상기 방법은 아디포넥틴(adiponectin)과 같은 사이토카인의 혈청 수준을 증가시킬 수 있다.
장내 짧은 사슬 지방산의 수준은 본 발명의 방법을 사용하여 증가될 수 있다. 상기 짧은 사슬 지방산은 아세트산(acetic acid), 프로피온산(propionic acid), 부티르산(butyric acid), 발레르산(valeric acid), 이소부티르산(isobutyric acid) 및 이소발레르산(isovaleric acid)을 포함하나 이에 한정되지 않는다.
장내 미생물 개체군을 개선하기 위해, 상기 조성물은 경구 또는 비경구로 투여될 것이다. 한 실시예에서, 상기 조성물은 식품, 음료, 보충제 또는 약학적 제형일 수 있다. 한 실시예에서, 상기 조성물은 좌약(suppository), 타블렛(tablet), 필(pill), 과립(granule), 파우더(powder), 필름(film), 마이크로캡슐(microcapsule), 에어로졸(aerosol), 스피릿(spirit), 팅크(tincture), 토닉(tonic), 액체 현탁액(liquid suspension) 또는 시럽(syrup)의 형태일 수 있다. 상기 조성물은 약 50 ㎎/㎏ 체중에서부터 약 400 ㎎/체중의 투여량(dosage)으로 투여될 수 있다.
한 실시예에서, 상기 조성물은 베르베린을 개체에 투여하는 것을 포함한다. 개체의 장내 미생물 개체군은 그리고나서 454 파이로서열분석 기술(pyrosequencing technique)을 사용하여 분석되고, 짧은 사슬 지방산의 수준은 가스 크로마토그래피(gas chromatography)에 의해 분석된다. 결과는 베르베린이 장내 미생물 개체군을 변화시킬 수 있음을 나타낸다; 짧은 지방산을 생산하는 박테리아를 포함하는 특정 박테리아의 강화와 동시에, 내독소를 생산하는 박테리아를 포함하는 특정 박테리아를 억제 또는 제거한다. 이는 또한 베르베린의 경구투여는 장내의 짧은 사슬 지방산의 수준을 증가시킬 수 있음을 나타내고, 상기 증가는 대사장애를 갖는 개체에 있어서 더욱 확실하다. 추가적인 실험 및 관찰은 상기 서술된 장내 미생물 개체군에 대한 베르베린의 영향이 과식, 만성 염증 및 인슐린 저항성으로 유도된 인슐린 민감성 증진(improving insulin sensitivity), 염증 감소(reducing inflammation), 체중 증가 조절(controlling weight gain), 및 비만 예방(preventing obesity)을 포함하나 이에 한정되지 않는 유용한 결과를 가짐을 또한 나타낸다.
한 측면에서, 본 발명은 장내 미생물 개체군 개선이 가능한 의약, 화합물, 조성물, 추출물 또는 제형을 스크리닝하기 위한 방법을 제공한다. 상기 방법은 개체의 장내 미생물 개체군을 표적으로 하여 건강개선 및/또는 비만 또는 다른 관련된 대사장애를 예방하기 위한 의약, 영양제, 건강관리 제품, 식품 및 음료를 개발하기 위해 사용될 것이다.
한 실시예에서, 상기 스크리닝 방법은 대조군 개체에서 1차 장내 미생물 개체군을 증가시키고, 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시키기 위해 대조군 조성물을 유효한 양으로 대조군 개체에 투여하는 것, 시험 조성물의 양을 시험 개체에 투여하는 것, 조절된 개체의 장매 미생물 개체군 및 시험 개체의 장내 미생물 개체군을 비교하는 것을 포함할 것이다.
본 명세서에 사용된 바와 같이, 용어 "개체(subject)"는 포유동물, 예를 들어 인간과 같은 동물을 나타낸다. 어떤 실시예에서, 개체는 랫(rat)일 수 있고, 어떤 실시예에서, 개체는 마우스(mouse)일 수 있으며, 어떤 실시예에서, 개체는 인간일 수 있다.
만약 시험 화합물이 대조군으로서 장내 미생물에 유사한 영향을 주는 것이 확인된 경우, 상기 시험 화합물은 장내 미생물 개체군 개선에 활성이 있다. 본 명세서에 사용된 바와 같이, "유사한(similar)"은 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 98% 또는 적어도 99%의 유사성을 나타낸다.
시험 조성물은 단일 화합물, 혼합물(mixture), 식품, 식품 첨가제, 영양제, 건강관리 제품, 약학적 제형 또는 음료일 수 있다.
또다른 측면에서, 본 발명은 장내 미생물 개체군 개선을 위한 조성물을 제공한다. 한 실시예에서, 상기 조성물은 개체에서 1차 장내 미생물 개체군을 선택적으로 증가시키고, 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시킬 수 있을 것이다.
상기 조성물은 화학적 화합물, 천연물 의약품, 천연물 또는 허브 추출물을 포함할 수 있다. 한 실시예에서, 상기 화학적 화합물은 베르베린, 베르베린 유도체, 이소퀴놀린 알칼로이드(isoquinoline alkaloid) 또는 이의 어떠한 조합물을 포함할 수 있으나 이에 한정되지 않는다.
한 실시예에서, 상기 조성물은 천연물 의약품, 허브의 전체(whole), 단편(fragmented) 또는 파우더(powdered), 또는 소벽(berberis), 황련(coptis), 황금(scutellaria), 황벽(phellodendron), 여주(momordica), 감탕나무(ilex), 고삼(sophora), 용담(gentiana), 지모(anemarrhena), 치자(gardenia), 대황(rheum) 또는 민들레(taraxacum)의 식물로부터 유래된 허브 추출물을 포함할 것이다. 한 실시예에서, 상기 조성물은 천연물 의약품, 허브의 전체, 단편 또는 파우더, 또는 매자나무과(Berberidaceae), 미나리아재비과(Ranunculaceae), 꿀풀과(Lamiaceae), 운향과(Rutaceae), 박과(cucurbitacea), 감탕나무과(aquifoliaceae), 콩과(leguminosae), 용담과(gentianaceae), 용설란과(agavaceae), 꼭두서니과(rubiaceae), 마디풀과(Polygonaceae), 국화과(Asteraceae), 방기과(Menispermaceae) 또는 박과(Cucurbitaceae)의 식물로부터 유래된 허브 추출물을 포함할 것이다. 한 실시예에서, 상기 조성물은 천연물 의약품, 허브의 전체, 단편 또는 파우더, 또는 매발톱나무(berberis vulgaris), 황련(coptis chinensis), 황금(scutellaria baicalensis), 황피수(phellodendri chinensis), 여주(momordica charantia), 고정다(ilex kudingcha), 고삼(sophora flavescens), 용담(gentiana scabra), 지모(anemarrhena asphodeloides), 치자(gardenia jasminoides), 대황(rheum palmatum) 또는 포공영(herba taraxaci)의 식물로부터 유래된 허브 추출물을 포함할 것이다.
하기 실시예는 본 발명의 대표적인 방법의 수행(execution) 및 성질(property)을 예시하기 위한 것이다. 이들 실시예에 의해 본 발명의 영역(scope)이 제한되지 않는다.
실시예
본 실시예에서는 시험 개체로서 위스타 랫(Wistar rat, 8 주령, 수컷) 및 대표적인 화합물로서 베르베린을 사용하였다. 40 마리의 위스타 랫은 2주 동안 적응되어졌고, 이어서 무작위로 4군으로 나뉘었다; 일반 식이요법군(NCD), 일반 식이요법에 베르베린 처리군(NCD+BBR), 고지방 식이요법군(HFD), 고지방 식이요법에 베르베린 처리군(HFD+BBR). 각각의 군은 추가적인 18주동안 지속되었다. 18주 동안, NCD+BBR 군은 정상수준에서 베르베린을 위내로 투여(intragastric administration)받았다. 각각의 동물로부터의 배설물 샘플은 다양한 시간 포인트(time point)에서 수집되었다. 454 파이로서열분석(pyrosequencing)은 장내 미생물 구조를 분석하기 위해 수행되었다. 가스 크로마토그래피는 배설물의 짧은 사슬 지방산 수준을 분석하기 위해 사용되었다. 또한, 무게, 음식 섭취, 인슐린 민감성, 전신 염증 수준(systemic inflammation level)은 18주 기간동안 관찰 및 측정되었다.
베르베린이 일반 식이요법 및 고지방 식이요법 조건 모두에서 장내 미생물 개체군을 변화시킴
모든 네 실험군의 랫에서의 장내 미생물 개체군은 454 파이로서열분석 및 다변량 통계분석(multivariate statistical method)에 의해 분석되었다. 그 결과, PCoA는 비가중된 유니프랙 거리(unweighted Unifrac distance)에 근거하여 분석되고, 베르베린이 일반 식이요법군 및 고지방 식이요법군 모두에서 통계적으로 유의한 수준으로 장내 미생물 구조를 변화시킴을 확인되었다; 및 베르베린은 장내 미생물 개체군에서 전체 변화의 12.6%를 차지하였다(도 1a). 식이 또한 장내 미생물 개체군에 통계적으로 유의한 영향을 미쳤다. 도 1a는 수직축을 따라 두 다른 식이요법(NCD 대 HFD) 사이에서 장내 미생물 개체군의 통계적으로 유의한 차이(3.7%)를 나타낸다. 네 군의 다변 변량분석(multivariate variance analysis; MANOVA)은 베르베린 또는 식이요법이 장내 미생물에 통계적으로 유의한 영향을 가짐을 나타내나(P<0.01), 가장 명확한 차이는 베르베린의 존재에의해 나타난다(도 1b). 새논 위너 파라메터(Shannon-Wiener parameter)는 베르베린이 장내 미생물 개체군의 다양성을 통계적으로 유의한 수준으로 감소시킴을 나타낸다(P<0.05).
베르베린이 장내 미생물 개체군에서 짧은 사슬 지방산 생산 박테리아를 강화시키고, 내독소 생산 박테리아를 감소시킴
268 베르베린-관련된 OTU는 중복성 분석(redundancy analysis; RDA)에 의해 동정되었고, 자세한 결과는 도 2, 표 1 및 표 2에 나타냈다. 93 OTU(서열번호 1 내지 93)(표 1)은 베르베린에 의해 강화되었고, 175 OTU(서열번호 94 내지 268)(표 2)는 억제 또는 제거되었다.
상기 268 OTU의 분류체계(taxonomy)는 OTU의 대표 서열과 함께 RDP 분류기(classifier)를 사용하여 분석되었다. 이는 베르베린이 알리스팁스, 앤에로플라스마(anaeroplasma), 바네시엘라, 비피도박테리움(bifidobacterium), 부티리시모나스, 부티리비브리오(butyrivibrio), 코프로코커스(coprococcus), 파스티디오시필라(fastidiosipila), 헬리코박터, 헤스펠리아, 마빈브리얀티아(marvinbryantia), 오리박테리움(oribacterium), 오스실리박터(oscillibacter), 프레보텔라(prevotella), 로제부리아(roseburia), 루미노코커스(ruminococcus), TM7 일반적인(genera) 소속 불명군 및 다른 것을 포함하는 박테리아를 억제하는 것을 타나낸다. 이들 중에서, 프로피오박테리아 문(proteobacteria phylum)에 속하는 헬리코박터는 높은 활성 내독소를 생산할 수 있다. 게다가, 이는 베르베린이 알리스팁스, 알로바쿨룸, 박테로이드, 바네시엘라, 블라우티아, 부타리시코커스, 부티리시모나스, 도레아, 헬리코박터, 헤르펠리아, 홀데마니아, 라우소니아, 오실리박터, 파라박테로이드, 파스콜락토박테리움, 프리보텔라 및 세디멘티박터를 포함하는 박테리아를 증가시키는 것을 나타낸다. 이들 중에서, 블라우티아, 알로바쿨륨, 프리보텔라, 박테로이드 및 부티리시모나스가 상대적으로 풍부하였고, 이들은 짧은 사슬 지방산을 생산할 수 있다.
따라서, 개체에 투여할 때, 베르베린은 장내 미생물 개체군에서 짧은 사슬 지방산 생산 박테리아를 강화시키고, 내독소 생산 박테리아를 감소시킬 수 있다.
베르베린이 랫에서 장내 짧은 사슬 지방산 수준을 증가시킴
일반 식이요법 또는 고지방 식이용법 섭취
랫의 배설물에서 짧은 사슬 지방산(아세트산, 프로피온산, 부티르산, 발레르산, 이소부티르산, 이소발레르산 등을 포함)의 수준은 가스 크로마토그래피로 분석되었다. 그 결과는 100 ㎎/㎏ 체중으로 경구투여는 일반 식이요법 또는 고지방 식이요법을 섭취한 랫에서 장내 짧은 사슬 지방산의 수준은 증가할 수 있음을 나타내었다. 아세트산 및 프로피온산의 수준에의 영향은 더욱 명확했다(도 3). 따라서, 베르베린은 일반 식이요법 또는 고지방 식이요법을 섭취한 랫에서 짧은 사슬 지방산 증가를 가능하게 한다.
베르베린이 랫의 비만 표현형(phenotypes)을 감소시킴
네 군의 모든 랫의 체중은 실험을 지속하는 기간 동안 모니터되고, 분석되었다. 그 결과는 고지방 식이요법 18주 후, HFD군이 일반 식이요법군보다 유의적으로 높은 체중을 가짐을 나타낸다(P<0.01); 100 ㎎/㎏의 투여량으로 베르베린의 위내 투여는 효과적으로 랫의 특히, 고지방 식이요법을 섭취한 랫의 체중 증가를 억제하였다. 이 결과는 전체 실험 과정동안 HFD+BBR 군의 체중이 일반 식이요법 군의 그것과 유사한 수준으로 억제됨을 나타내어 특히 놀라웠고, 이는 통계적으로 유의적인 차이가 없었다(P>0.05). 베르베린은 또한 일반 식이요법을 섭취한 fot의 체중에도 어느정도 영향을 보였다(도 4).
실험의 끝에서 동물은 안락사시켰다. 금식 체중(fasting body weight), 부고환 지방 무게(epididymal fat weight) 및 신장 지방 무게(perirenal fat weight)가 측정되었다. 아디포시티 지표(adiposity index)([부고환 지방 무게 + 신장 지방 무게]/금식 체중 × 100)는 도 4b에 나타냈다. 고지방 식이요법 18주 후, HFD 군의 아디포시티 지표는 NCD의 그것보다 유의적으로 높았고, 베르베린 처리는 아디포시티 지표를 유의적으로 감소시켰다. 게다가, 고지방 식이요법 및 베르베린은 모두 간 및 췌장에 유의적인 영향을 주지 않았고, 이는 놀랍게도 베르베린의 장기간 사용은 랫의 일반적인 생리적 기능에 심각한 부작용을 나타내지 않음을 나타낸다. 이들 랫의 칼로리 섭취 결과는 100 ㎎/㎏ 체중으로 베르베린의 경구투여가 랫의 식품섭취, 특히 고지방 식이요법을 섭취한 랫에 유의적인 억제 효과를 나타냄을 확인하였다(도 4c).
베르베린이 일반 식이요법 또는 고지방 식이요법을 섭취한 랫의 인슐린 민감성(insulin sensitivity)을 감소시킴
공복혈당(fasting blood glucose; FBG) 및 공복혈청 인슐린(fasting serum insulin; FINS)은 랫의 모든 네 실험군에서 측정되었다. 18개월 동안 HFD를 섭취한 랫은 NCD의 그것보다 FBG가 유의적으로 높은 수준을 나타냈다. 놀랍게도, 베르베린은 NCD 및 HFD 랫에서 FBG를 효과적으로 감소시켰고, 특히 HFD 랫에서 FBG 감소는 유의적이었다(P<0.05)(도 5a). 인슐린 수준에서 베르베린의 영향 결과는 도 5b에 나타내었다. HFD를 섭취한 랫의 FINS은 NCD 군의 그것보다 유의적으로 높았다; 그러나, 100 ㎎/㎏ 체중의 수준에서 베르베린의 개입 18개월 후, FINS 수준은 HFD(HFD+BBR)을 섭취한 랫에서 유의적으로 감소하였고, 그 수치는 일반 식이요법군의 그것과 비교할 수 있을 정도로 도달했다. 도 5c는 랫에서 인슐린 저항성 상태(insulin resistance status)를 증가시키기 위한 HOMA 인슐린 저항성 지표의 결과를 나타내고, 이는 HFD 유도 18개월 후 랫이 명확하게 인슐린 저항성이 형성되었음을 나타낸다; 100 ㎎/㎏ 체중에서 베르베린의 개입은 아직 인슐린 저항성의 형성을 예방하였다(P<0.05).
추가적으로 인슐린 민감성을 평가하기 위하여, 글루코스 경구부하시험(oral glucose tolerance test) 및 인슐린 내성시험(insulin tolerance test)의 복강내 주사가 수행되었고, 그 결과는 도 5d 및 5e에 각각 나타내었다. FBG 및 FINS 결과와 일치하게, 고지방 식이요법 유도의 18주 후, 글루코스 경구부하시험 및 인슐린 내성시험의 복강내 주사는 유의적으로 손상되었고, 그 동안 100 ㎎/㎏ 체중으로 베르베린의 개입은 유의적으로 글루코스 내성(glucose tolerance) 및 인슐린 내성(insulin tolerance)의 손실을 유의적으로 예방하였고, 이는 베르베린이 글루코스 대사 개선에 중요한 역할을 할 것임을 나타낸다.
베르베린이 고지방 식이요법의 랫에서 전신 염증 수준(systemic inflammation level)을 감소시킴
랫의 모든 네 실험군의 전신 염증 수준을 평가하기 위하여, 리포다당류-결합 단백질[lipopolysaccharide(LPS)-binding protein; LBP], 단핵구 화학유인제 단백질-1(monocyte chemoattractant protein-1; MCP-1), 렙틴(leptin) 및 아디포넥틴(adiponectin)의 혈청 수준을 측정하였고, 그 결과는 도 6에 나타내었다. 상기 실험은 HFD가 혈청에서 LBP 수준을 유의적으로 증가시킴을 나타내었다; 그러나, 100 ㎎/㎏으로 베르베린의 투여는 혈청 LBP의 증가를 유의적으로 없앴다(P<0.05, 도 6a).
MCP-1은 단핵구/대식세포(macrophage)의 주화성(chemotaxis) 및 활성화(activation)에서 기능하는 전염증성(pro-inflammatory) 사이토카인이다. 많은 염증관련 질환의 발생(occurrence) 및 발달(development)는 MCP-1과 밀접하게 연관되고, 여기에는 아테롬성 동맥 경화증(atherosclerosis), 비만, 제 1형 당뇨(type 2 diabets), 관절염(arthritis), 패혈증(sepsis) 및 만성 박테리아 감염(chronic bacterial infection)을 포함한다. 실험으로부터의 결과는 HFD에 의해 유도되는 랫에서 비만 및 인슐린 저항성의 점진적 징후(gradual onset)의 과정에서 MCP-1 수준은 서서히 증가함을 나타낸다; 그러나, 베르베린 투여 개입 후, MCP-1 수준은 유의적으로 감소하였고, 놀랍게도 심지어 NCD 군의 그것보다 낮아졌다(도 6b).
렙틴은 지방조직(adipose tissue)에의해 분비되는 호르몬(hormene)이고, 지방(lipid), 글루코스(glucose) 및 에너지 대사(energy metabolism)에 광범위하게 참여한다. 실험으로부터의 결과는 HFD 군에서 혈청 렙틴 수준이 NCD 군의 그것보다 유의적으로 증가하였음을 나타낸다(P<0.01); 그러나, 베르베린이 랫, 특히 HFD 섭취한 랫에서 혈청 렙틴 수준을 유의적으로 감소시켰다(P<0.05, 도 6c).
모든 네 군에서 아디포넥틴의 수준이 분석되었다. 그 결과는 체지방 무게에 대해 표준화된 아디포넥틴 수준이 NCD 군의 그것과 비교하였을 때, HFD 군에서 유의적으로 낮음을 나타낸다(P<0.001); 그러나, 베르베린 투여는 HFD 섭취한 랫에서 아디포넥틴 수준이 유의적으로 증가하였다(P<0.01, 도 6d). 그러므로, 베르베린은 장내 미생물 개체군을 개선시키고, LPB, MCP-1 및 렙틴 수준을 감소시키며, 아디포넥틴 분비를 증가시킨다.
| 리스트 | OUT 이름 | 16S rRNA 유전자 V3 부분 서열 |
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상기 상세한 설명에서, 참조는 본 명세서의 일부를 형성하는 동반되는 도면에 의해 만들어진다. 도면에서, 유사한 부호는 달리 언급하지 않는 한, 유사한 요소(component)로 전형적으로 확인된다. 상세한 설명, 도면 및 청구항을 표시하기 위해 서술된 실시예는 본 발명을 제한하기 위한 것이 아니다. 다른 실시예가 사용될 수 있으며, 다른 변화는 본 명세서의 주제에 대한 사상 또는 범위를 벗어나지 않게 적용될 수 있다. 본 발명은 일반적으로 설명된 본 명세서의 측면에서 쉽게 이해될 것이고, 도면의 설명은 본 명세서에 분명하게 고려될 모든 다른 배치의 매우 다양한 정리, 치환, 결합, 분리 및 디자인될 수 있다.
본 공개는 본 명세서에서 서술된 특정한 실시예의 용어로 제한되지 않고, 다양한 측면의 서술로서 의도된다. 많은 수정(modification) 및 변형(variation)이 통상의 기술자에게 명백한한 본 발명의 사상 또는 범위를 벗어나지 않게 만들어질 수 있다. 본 공개의 범위내에서 기능적으로 동등한 방법 및 장치는 본 명세어에서 열거된 것들에 더하여 언급된 설명으로부터 통상의 기술자에게 명백할 것이다. 이러한 수정 및 변형은 첨부 된 청구의 범위 내에 포함된다. 본 발명은 청구된 청구항과 동등한 전체 범위내에서 첨부된 청구항의 용어에 의해서만 제한된다. 본 공개는 할수있고, 물론 다른 특정한 방법, 시약(reagent), 화합물, 조성물 또는 생물학적 시스템에 의해서 제한되지 않는다. 또한, 본 명세서에서 사용된 전문용어(terminology)는 오직 특정 실시예를 서술하기 위한 것이고, 제한하기 위한 것이 아니다.
본 명세서의 실질적인 어떠한 복수 및/또는 단수 용어의 사용과 관련하여, 이들은 통상의 기술자에게 맥락 및/또는 명세서에 적절하게 복수에서 단수로 및/또는 단수에서 복수로 번역될 수 있다. 다양한 단수/복수 치환(permutation)은 명백하게 하기 위하여 본 명세서에서 설명될 것이다.
일반적으로 본 명세서 및 특별히 첨부된 청구항(예를 들어, 첨부된 청구항의 본문)에서 사용된 용어는 "열린(open)" 용어[예를 들어, 용어 "포함하는(including)"은 "포함하나 이에 한정되지 않는(including but not limited to"로 설명되고, 용어 "갖는(having)"은 "적어도 갖는(having at least)"로 설명되며, 용어 "포함하다(includes)"는 "포함하나 이에 한정되지 않는다(includes but is not limited to)"로서 설명 등]로서 의도되는 것이 통상의 기술자에 의해 이해될 것이다. 만약, 삽입된 청구항 설명(recitation)의 특정 숫자가 의도되면, 이러한 의도는 명시적으로 청구항에서 다시 인용될 것이고, 이와 같은 설명이 없는 경우 이와같은 의도도 없다. 예를 들어, 이해를 돕기 위해 하기에 첨부된 특허 청구범위는 청구항의 설명을 소개하기 위해 "적어도 하나" 및 "하나 또는 그 이상"의 서두 문구(phase)의 용도를 포함한다. 그러나, 상기와 같은 문구의 용도는 규정되지 않은 관사 "a" 또는 "an"이 설명과 같이 오직 하나를 포함하는 실시예에 대해 도입된 청구항의 설명과 같은 것을 포함하는 어떠한 특정 청구항을 한정하지 않아, 청구항 설명의 도입을 나타내는 것으로 이해되고, 심지어 동일한 청구항은 서두 문구 "하나 또는 그 이상" 또는 "적어도 하나", 및 "a" 또는 "an"과 같은 규정되지 않은 관사를 포함한다(예를 들어, "a" 및/또는 "an"은 "적어도 하나" 또는 "하나 또는 그 이상"의 의미로 판단된다); 청구항의 설명을 도입하기 위해 사용된 규정되지 않은 관사의 용도는 동일하게 유지된다. 추가적으로, 도입된 청구항의 특정 수가 명백하게 설명되면, 통상의 당업자가 이와 같은 설명이 적어도 나열된 수를 의미함을 나타낼 것을 이해할 것이다(예를 들어, 다른 변형 없이 "두개의 설명"의 기본적인 설명은 적어도 두개의 설명, 또는 둘 또는 그 이상의 설명을 의미한다). 게다가, "적어도 하나의 A, B, 및 C, 등"의 유사한 관계가 사용되는 경우에, 일반적으로 구성은 통상의 당업자가 갖는 하나의 감각을 의도하는 것과 같이 관례대로 이해된다(예를 들어, "A, B, 및 C의 적어도 하나를 갖는 시스템"은 A 단독, B 단독, C 단독, A 및 B를 함께, A 및 C를 함께, B 및 C를 함께, 및/또는 A, B 및 C를 함께 등을 포함하나 이에 한정되지 않는다). "적어도 하나의 A, B, 또는 C, 등"의 유사한 관계가 사용되는 경우에, 일반적으로 구성은 통상의 당업자가 갖는 하나의 감각을 의도하는 것과 같이 관례대로 이해된다(예를 들어, "A, B, 또는 C의 적어도 하나를 갖는 시스템"은 A 단독, B 단독, C 단독, A 및 B를 함께, A 및 C를 함께, B 및 C를 함께, 및/또는 A, B 및 C를 함께 등을 포함하나 이에 한정되지 않는다). 이는 당업계에서 둘 또는 그 이상의 다른 용어를 나타내는 사실상 어떤 논리적인 단어 및/또는 문구도 이해되고, 발명의 상세한 설명, 청구항 또는 도면에서 용어의 하나, 용어중에 하나 또는 용어의 모두를 포함할 가능성을 고려하기 위해 이해되어야 한다. 예를 들어, 문구 "A 또는 B"는 "A" 또는 "B" 또는 "A 및 B"의 가능성을 포함하여 이해된다.
추가적으로, 본 공개의 특징 또는 영역은 마쿠시 그룹(Markush group)의 용어로 서술되고, 당업계의 기술자가 본 명세서의 어떤 각각의 구성원(member) 또는 마쿠시 그룹의 구성원의 하위집단(subgroup)의 용어로 서술된다.
당업계의 기술자에 의해 잘 이해될 것과 같이, 어떤 및 모든 목적을 위해, 서술된 설명에 제공된 용어와 같이, 본 명세서에서 공개된 모든 범위(range)는 어떤 및 모든 가능한 하위 범위(subrange) 및 이의 하위 범위의 조합을 또한 고려한다. 어떤 목록화된 범위는 적어도 동등한 절반, 1/3, 1/4, 1/5, 1/10 등으로 세분화되는 같은 범위로 충분히 서술되고, 가능할 수 있도록 쉽게 인식되어야 한다. 비-제한적인 예로써, 본 명세서에서 토의된 각각의 범위는 낮은 세번째(lower third), 중간 세번째(middle third), 높은 세번째(upper third) 등으로 쉽게 세분화될 수 있다. 통상의 기술자에 의해 모든 언어로 "~까지(up to)", "적어도(at least)"는 또한 이해되고, 이는 상기 서술한 바와 같이 하위 범위로 이어서 세분화 될 수 있는 나열된 수 및 관련된 범위를 포함한다. 결론적으로, 통상의 기술자에게 이해될 것과 같이, 범위는 각각의 구성원을 포함한다. 따라서, 예를 들어, 1 내지 3 세포를 갖는 군은 1, 2 또는 3 세포를 갖는 군을 나타낸다. 유사하게, 1 내지 5 세포를 갖는 군은 1, 2, 3, 4 또는 5 세포 등을 갖는 군을 나타낸다.
상기 서술한 바로부터, 본 공개의 다양한 실시예가 묘사하기 위하여 서술되었고, 다양한 변형이 본 발명의 범위(scope) 및 사상(spirit)에서 벗어나지 않도록 만들어 질 수 있다. 따라서, 본 명세서에서 공개된 다양한 실시예는 하기 청구항에 의해 나타내어지는 진짜 범위 및 사상을 제한하기 위한 것이 아니다.
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<212> DNA
<213> Helicobacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 1
tagggaatat tgctcaatgg gggaaaccct gaagcagcaa cgccgcgtgg aggatgaagg 60
ttttcggatt gtaaactcct tttctaagag aagattatga cggtatctta ggaataagca 120
ccggctaact ccgtgcc 137
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<212> DNA
<213> Helicobacter 16S rRNA gene V3 region
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ggggaaaccc tgaagcagca acgccgcgtg gaggatgaag gtttcggatt gtaaactcct 60
ttctaagaga agattatgac ggtatcttag gaataagcac cggctaactc cgtgcc 116
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<212> DNA
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tggggaatat tgcgcaatgg gcgaaagcct gacgcagcga cgccgcgtga gggatgaagg 60
tcctcggatc gtaaacctct gtcagggggg aagaagcgcc tgtgagcaaa tagttcatgg 120
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<212> DNA
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tgaggaatat tggtcaatgg gcgcaggcct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg 60
ccctatgggt tgtaaacttc ttttatatgg gaataaagtt ttccacgtgt ggaattttgt 120
atgtgccata tgaataagga tcggctaact ccgtgcc 157
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<212> DNA
<213> Bacteroides 16S rRNA gene V3 region
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tgaggaatat tggtcaatgg acgagagtct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg 60
ccctatgggt tgtaaacttc ttttatatgg gaataaagtg agccacgtgt ggctttttgt 120
atgtaccata cgaataagga tcggctaact ccgtgcc 157
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<213> Bacteroides 16S rRNA gene V3 region
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tgaggaatat tggtcaatgg gcgcaggcct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg 60
ccctatgggt tgtaaacttc ttttatatgg gaataaagtt ttccacgtgt ggaattttgt 120
atgtaccata tgaataagga tcggctaact ccgtgcc 157
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<212> DNA
<213> Bacteroides 16S rRNA gene V3 region
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tgaggaatat tggtcaatgg gcgcaggcct gaaccagcca agtagcgtga aggatgactg 60
ccctatgggt tgtaaacttc ttttatatgg gaataaagtt ttcctacgtg tggaattttg 120
ttatgtacca tatgaataag gatcggctaa ctccgtgcc 159
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ggagagtacc cggagaaaaa gacatcggct aactccgtgc c 161
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ccctacgggt tgtaaacctc ttttgtcagg gagcaagaac aggcacgtgt gcctgactga 120
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<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
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<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
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ccctacgggt tgtaaacctc tttttgccgg gggagcaatg cccagctcgc gagctgggaa 120
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<213> Bacteroides 16S rRNA gene V3 region
<400> 29
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ccctatgggt tgtaaacttc ttttatacgg gaataaagtg aggcacgtgt gcctttttgt 120
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<210> 30
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<212> DNA
<213> Alistipes 16S rRNA gene V3 region
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tgaggaatat tggtcaatgg acgcaagtct gaaccagcca tgccgcgtgc aggaagacgg 60
ctctatgagt tgtaaactgt cttttgtact agggtaaacg ctcttacgtg taggagcctg 120
aaagtatagt acgaataagg atcggctaac tccgtgcc 158
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<212> DNA
<213> Alistipes 16S rRNA gene V3 region
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<211> 137
<212> DNA
<213> Coriobacteriaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 32
tggggaattt tgcgcaatgg ggggaaccct gacgcagcaa cgccgcgtgc gggatgacgg 60
ccctcgggtt gtaaaccgct ttcagcaggg aagaccacga cggtacctgc agaagaagct 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 33
<211> 157
<212> DNA
<213> Flavobacteriaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 33
tgaggaatat tgggcaatgg gcggaagcct gacccagcca tgccgcgtgc aggaagacag 60
ccctatgggt cgtaaactgc ttttttagag gaagaataaa gtctacgtgt agaccgatga 120
cggtacttta agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 34
<211> 138
<212> DNA
<213> Blautia 16S rRNA gene V3 region
<400> 34
gtagggaata ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcg acgccgcgtg aaggaagaag 60
tatctcggta tgtaaacttc tatcagcagg gaagacaatg acggtacctg actaagaagc 120
cccggctaac tacgtgcc 138
<210> 35
<211> 137
<212> DNA
<213> Hespellia 16S rRNA gene V3 region
<400> 35
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga aggaagaagt 60
atttcggtat gtaaacttct atcagcaggg aagaaagtga cagtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 36
<211> 140
<212> DNA
<213> Blautia 16S rRNA gene V3 region
<400> 36
tggggaatat tgcacaatgg gggaaacccg tacgatgcag cgacgccgcg tgaaggaaga 60
agtatctcgg tatgtaaact tctatcagca gggaagataa tgacggtacc tgactaagaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 37
<211> 142
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 37
tggggaatat tgcacaatgg gggaaacccg tacgatgcag cgacgccgcg tgaaggaaga 60
agtatctcgg tatgtaaact tactatcagc agggaagata atgacggtac ctgactaaga 120
agccccggcc taactacgtg cc 142
<210> 38
<211> 114
<212> DNA
<213> Blautia 16S rRNA gene V3 region
<400> 38
aaaccctgat gcagcgacgc cgcgtgaagg aagaagtatc tcggtatgta aacttctatc 60
agcagggaag acaatgacgg tacctgacta agaacgcccg gctaactacg tgcc 114
<210> 39
<211> 137
<212> DNA
<213> Blautia 16S rRNA gene V3 region
<400> 39
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga aggaagaagt 60
atctcggtat gtaaacttct atcagcaggg aagataatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaatt acgtgcc 137
<210> 40
<211> 137
<212> DNA
<213> Blautia 16S rRNA gene V3 region
<400> 40
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga aggaagaagt 60
atctcggtat gtaaacttct atcagcaggg aagataatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 41
<211> 138
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 41
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcaa cgccgcgtgg gtgaaggagc 60
gtttcggcgc gtaaagccct gtcagcgggg aagaaaaaag acggtacccg accaagaagc 120
cccggctaac tacgtgcc 138
<210> 42
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 42
tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 43
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 43
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga aagatgaagt 60
atttcggtat gtaaacttct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 44
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 44
tggggaatat tgcacaatgg aggaaactct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagacagtga cggtacctga ctaagaagct 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 45
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 45
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgacgaagt 60
atctcggtat gtaaagctct gtcagcaggg aagaagaatg acggtacctg aagaagaagc 120
accggctaaa tacgtgcc 138
<210> 46
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 46
tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 47
<211> 140
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 47
tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga aggaagacgg 60
ttttcggatt gtaaacttct atcaataggg aagaaagaaa tgacggtacc taaataagaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 48
<211> 140
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 48
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcaa cgccgcgtga aggaagacgg 60
ttttcggatt gtaaacttct atcaataggg aagaaagaaa tgacggtacc taaataagaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 49
<211> 137
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 49
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg aggaagaagg 60
tcttcggatt gtaaactcct gtcccagggg acgataatga cggtaccctg ggaggaagca 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 50
<211> 138
<212> DNA
<213> clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 50
tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga aggaagacgg 60
ttttcggatt gtaaacttct gttcttagtg aagaagaatg acggtagcta aggagcaagc 120
cacggctaac tacgtgcc 138
<210> 51
<211> 138
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 51
tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga aggaagacgg 60
ttttcggatt gtaaacttct gttcttagtg aagaataatg acggtaacta aggagcaagc 120
cacggctaac tacgtgcc 138
<210> 52
<211> 137
<212> DNA
<213> Sedimentibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 52
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgagtga gggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaacctct gtccttggtg aagataatga cggtagccaa ggaggaagct 120
acggctaact acgtgcc 137
<210> 53
<211> 140
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 53
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gggaagacgg 60
ccttcgggtt gtaaacctct gtcgcagggg acgaaggaag tgacggtacc ctgtgaggaa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 54
<211> 136
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 54
gaatattgcg caatgggggc aaccctgacg cagcaacgcc gcgtgaagga tgaaggtttt 60
cggattgtaa acttctttta tcaaggacga aggacgtgac ggtacttgat gaataagcca 120
cggctaacta cgtgcc 136
<210> 55
<211> 141
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 55
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttaccaggg gacgaaggac gtgacggtac ctggagaaaa 120
agcaacggct aactacgtgc c 141
<210> 56
<211> 141
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 56
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct ttacctaggg acgaaggacg tgacggtacc tggagaaaaa 120
gacaacggct aactacgtgc c 141
<210> 57
<211> 140
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 57
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ttttcgggtt gtaaacttct tttaccaggg acgaaggacg tgacggtacc tggagaaaaa 120
gcaacggcta actacgtgcc 140
<210> 58
<211> 114
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 58
gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg tcgtttcggg ttagtaaact tcttttaccg 60
agggacgaag gacgtgacgg tacctggaga aaaagcaacg gctaactacg tgcc 114
<210> 59
<211> 140
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 59
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttaccaggg acgaaggacg tgacggtacc tggagaaaaa 120
gcaacggcta actacgtgcc 140
<210> 60
<211> 142
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 60
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttacctagg gacgaaggac gtgacggtac ctggagaaaa 120
agacaacggc taactacgtg cc 142
<210> 61
<211> 140
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 61
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttaccaggg acgaaggacg tgacggtacc tggagaaaag 120
acaacggcta actacgtgcc 140
<210> 62
<211> 141
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 62
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttctggggg acgaagaaag tgacggtacc ccacggaata 120
agccacggct aactacgtgc c 141
<210> 63
<211> 140
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 63
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttctggggg gcgaagaaag tgacggtacc ccaggaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 64
<211> 140
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 64
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttctggggg acgaagaaag tgacggtacc ccaggaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 65
<211> 139
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 65
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttctcgggg acgaacaaat gacggtaccc gaggaataag 120
ccacggctaa ctacgtgcc 139
<210> 66
<211> 139
<212> DNA
<213> Butyricicoccus 16S rRNA gene V3 region
<400> 66
tggggaatat tgcgcaatgg gggcaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga ttgaagaagg 60
tcttcggatt gtaaaaatct tttatcaagg acgaagaagt gacggtactt gatgaataag 120
ctccggctaa ctacgtgcc 139
<210> 67
<211> 139
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 67
tggggaatat tgggcaatgg ggggaaccct gacccagcaa cgccgcgtga gggaagaagg 60
ttttcggatc gtaaacctct gtccttggtg aagaggagaa gacggtagcc aaggaggaag 120
ccccggctaa ctacgtgcc 139
<210> 68
<211> 139
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 68
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga gggaagaagg 60
ttttcggatc gtaaacctct gtccttggtg aagagaagaa gacggtagcc aaggaggaag 120
ccccggctaa ctacgtgcc 139
<210> 69
<211> 137
<212> DNA
<213> Dorea 16S rRNA gene V3 region
<400> 69
tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga aggatgaagt 60
atttcggtat gtaaacttct atcagcaggg aagataacga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 70
<211> 140
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 70
tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga acgaagaagg 60
tcttcggatt gtaaagttct gtccttaggg aagaagaaag tgacggtacc taaggaggaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 71
<211> 109
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 71
tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctg 109
<210> 72
<211> 137
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 72
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga aggaagaagt 60
atttcggtat gtaaacttct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaatt acgtgcc 137
<210> 73
<211> 163
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 73
tagggaattt ttcgtcaatg ggcgcaagcc tgaacgagca atgccgcgtg ggcgaagaag 60
gtcttcggat cgtaaaactc tgttgcgggg gaaaaaggaa gggaagagga aatgcttttc 120
ttttgatggt accccgccag aaagtcacgg ctaactacgt gcc 163
<210> 74
<211> 163
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 74
tagggaattt ttcgtcaatg ggcgcaagcc tgaacgagca atgccgcgtg agcgaagaag 60
gtcttcggat cgtaaaactc tgttgcgggg gaaaaaggaa ggaaagagga aatgcttttc 120
ttttgatggt accccgccag aaagtcacgg ctaactacgt gcc 163
<210> 75
<211> 164
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 75
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtgg gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaaactc tgttgcgggg gaaaaaagga agggaagagg aaatgctttt 120
cttttgatgg taccccgcca gaaagtcacg gctaactacg tgcc 164
<210> 76
<211> 164
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 76
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtgg gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gtttgcgggg ggaaaaagga agggaagagg aaatgctttt 120
cttttgatgg taccccgcca gaaagtcacg gctaactacg tgcc 164
<210> 77
<211> 162
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 77
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtgg gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gttgcggggg aaaaaggaag ggaagaggaa atgcttttct 120
tttgatggta ccccgccaga aagtcacggc taactacgtg cc 162
<210> 78
<211> 161
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 78
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtga gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gttgcgggga aaaggaaggg aagaggaaat gcttttcttt 120
tgtatggtac cccgccagaa agtcacggct aactacgtgc c 161
<210> 79
<211> 162
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 79
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtgg gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gttgcggggg aaaaggaagg gaagaggaaa tgcttttctt 120
ttgtatggta ccccgccaga aagtcacggc taactacgtg cc 162
<210> 80
<211> 161
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 80
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtgg gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gttgcggggg aaaaggaagg gaagaggaaa tgcttttctt 120
ttgatggtac cccgccagaa agtcacggct aactacgtgc c 161
<210> 81
<211> 159
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 81
ggtaattttc gtcaatgggc gcaagcctga acgagcaatg ccgcgtgggc gaagaaggtc 60
ttcggatacg taaactctgt tgcgggggaa aaaggaaggg aagaggaaat gctttctttt 120
gatggtaccc cgccagaaag tcacggctaa ctacgtgcc 159
<210> 82
<211> 163
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 82
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtga gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gttgcggggg aaaaaggaag ggaagaggaa atgcttttct 120
tttgatggta ccccgcccag aaagtcacgg ctaactacgt gcc 163
<210> 83
<211> 163
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 83
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtga gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gttgcggggg aaaaaaggaa gggaagagga aatgcttttc 120
ttttgatggt accccgccag aaagtcacgg ctaactacgt gcc 163
<210> 84
<211> 162
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 84
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtga gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gttgcggggg aaaaaggaag ggaagaggaa atgcttttct 120
tttgatggta ccccgccaga aagtcacggc taactacgtg cc 162
<210> 85
<211> 163
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 85
tagggaattt ttcgtcaatg ggcgcaagcc tgaacgagca atgccgcgtg aacgaggaag 60
gtcttcggat cgtaaagttc tgttgagagg gaaaaagggt caccagagga aatgctggtg 120
aagtgatatt acctttcgag gaagtcacgg ctaactacgt gcc 163
<210> 86
<211> 162
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 86
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtga acgaggaagg 60
tcttcggatc gtaaagttct gttgagaggg aaaaagggtc accagaggaa atgctggtga 120
agtgatatta cctttcgagg aagtcacggc taactacgtg cc 162
<210> 87
<211> 160
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 87
ggtaattttc gtcaatgggc gcaagcctga acgagcaatg ccgcgtgaac gaggaaggtc 60
ttcggatcgt aaagttctgt tgagagggaa aaagggtcac cagaggaaat gctggtgaag 120
tgatattacc tttcgaggaa gtcacggcta actacgtgcc 160
<210> 88
<211> 163
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 88
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtga acgaggaagg 60
tcttcggatc gtaaagttct gttgagaggg aaaaaagggt caccagagga aatgctggtg 120
aagtgatatt acctttcgag gaagtcacgg ctaactacgt gcc 163
<210> 89
<211> 161
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 89
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtga acgaggaagg 60
tcttcggatc gtaaagttct gttgagaggg aaaagggtca ccagaggaaa tgctggtgaa 120
gtgatattac ctttcgagga agtcacggct aactacgtgc c 161
<210> 90
<211> 163
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 90
tagggaattt tcgtcaagtg ggcgcaagcc tgaacgagca atgccgcgtg aacgaggaag 60
gtcttcggat acgtaaagtt ctgttgagag gaaaaagggt caccagagga aatgctggtg 120
aagtgatatt acctttcgag gaagtcacgg ctaactacgt gcc 163
<210> 91
<211> 161
<212> DNA
<213> Allobaculum 16S rRNA gene V3 region
<400> 91
tagggaattt tcgtcaatgg gcgcaagcct gaacgagcaa tgccgcgtga gcgaagaagg 60
tcttcggatc gtaaaactct gttgcggggg aaaaggaagg gaagaggaaa tgcttttctt 120
ttgatggtac cccgccagaa agtcacggct aactacgtgc c 161
<210> 92
<211> 162
<212> DNA
<213> Holdemania 16S rRNA gene V3 region
<400> 92
tagggaattt tcggcaatgg gcgaaagcct gaccgagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg 60
ccttcgggtt gtaaagctct gttgtgaagg aagaacggct catagaggga atgctatggg 120
agtgacggta ctttaccaga aagccacggc taactacgtg cc 162
<210> 93
<211> 163
<212> DNA
<213> Phascolarctobacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 93
tggggaatct tccgcaatgg acgaaagtct gacggagcaa cgccgcgtga gtgatgaagg 60
atttcggtct gtaaagctct gttgtttatg acgaacgtgc agtgtgtgaa caatgcattg 120
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<210> 94
<211> 137
<212> DNA
<213> Alphaaproteobacteria 16S rRNA gene V3 region
<400> 94
tgaggaatat tgggcaatgg gggcaaccct gacccagcca tgccgcgtga gtgaagaagg 60
ttttcggatt gtaaagctct ttcggatgtg acgatgatga cggtagcatc taaagaagcc 120
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<210> 95
<211> 117
<212> DNA
<213> Helicobacter 16S rRNA gene V3 region
<220>
<221> misc_feature
<222> (2)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 95
gngggaaacc ctgaagcagc aacgccgcgt ggaggatgaa ggtttcggat tgtaaactcc 60
tttgttagag aagataatga cggtatctaa cgaataagca ccggctaact ccgtgcc 117
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<212> DNA
<213> Helicobacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 96
tagggaatat tgctcaatgg gggaaaccct gaagcagcaa cgccgcgtgg aggatgaagg 60
ttttcggatt gtaaactcct tttgttagag aagataatga cggtatctaa cgaataagca 120
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<212> DNA
<213> Prevotella 16S rRNA gene V3 region
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<210> 98
<211> 157
<212> DNA
<213> Prevotella 16S rRNA gene V3 region
<400> 98
tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct gaaccagcca agtagcgtgc aggatgacgg 60
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<211> 157
<212> DNA
<213> Prevotella 16S rRNA gene V3 region
<400> 99
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtagcgtgc aggatgacgg 60
ccctatgggt tgtaaactgc ttttatacgg ggataaagtt ggggacgtgt ccccatttgt 120
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<210> 100
<211> 159
<212> DNA
<213> Prevotellaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 100
tgaggaatat tggtcaatgg tcgtgagact gaaccagcca agtagcgtgc gggatgaagg 60
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<210> 101
<211> 157
<212> DNA
<213> Bacteroidales 16S rRNA gene V3 region
<400> 101
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtagcgtga aggaagactg 60
ccctatgggt tgtaaacttc ttttataagg gaataaagag cgccacgtgt ggtgtgttgt 120
atgtacctta tgaataagca tcggctaatt ccgtgcc 157
<210> 102
<211> 157
<212> DNA
<213> Bacteroidales 16S rRNA gene V3 region
<400> 102
tgaggaatat tggtcaatgg gcgtgagcct gaaccagcca agccgcgtga gggaagaagg 60
cgccaggcgt cgtaaacctc ttttgccggg gaacaaaggg cgccacgtgt ggcgttgtga 120
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<211> 157
<212> DNA
<213> Bacteroidales 16S rRNA gene V3 region
<400> 103
tgaggaatat tggtcaatgg gcgtgagcct gaaccagcca agccgcgtga gggaggaagg 60
cgccaggcgt cgtaaacctc ttttgccggg gaacaaaggg cgccacgtgt ggcgttgtga 120
gtgtacccgg agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
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<212> DNA
<213> Bacteroidales 16S rRNA gene V3 region
<400> 104
tgaggaatat tggtcaatgg gcgtgagcct gaaccagcca agccgcgtga gggaggaagg 60
cgccaggcgt cgtaaacctc ttttgccggg gaacaaaggg cgccacgtgt ggcgttgtga 120
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<211> 158
<212> DNA
<213> Bacteroidales 16S rRNA gene V3 region
<400> 105
tgaggaatat tggtcaatgg gcgtgagcct gaaccagcca agccgcgtga gggaggaagg 60
cgccaggcgt cgtaaacctc ttttgccggg gaacaaaggg cgccacgtgt ggcgttgtga 120
gtgtacccgg agaaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 106
<211> 157
<212> DNA
<213> Butyricimonas 16S rRNA gene V3 region
<400> 106
tgaggaatat tggtcaatgg gcgggagcct gaaccagcca agccgcgtga gggaataagg 60
cgccaagcgt cgtaaacctc ttttgtcagg gaacaaaagc gggcacgcgt gcccgtccga 120
gtgtacctga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
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<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 107
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agccgcgtga aggaagaagg 60
tgctaagcat tgtaaacttc ttttgtcagg gaacaaagag cgcgacgagt cgcgccgtga 120
gtgtacctga agaaaaagac atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 108
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<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 108
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agccgcgtga aggaagaagg 60
tgctaagcat tgtaaacttc ttttgtcagg gaacaaagag cgcgacgagt cgcgccgtga 120
gtgtacctga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 109
<211> 156
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 109
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agccgcgtga aggaagaagg 60
tgctaagcat tgtaaacttc ttttgtcagg gaacaaagag cgcgacgagt cgcgccgtga 120
gtgtacctga agaaaagcat cggctaactc cgtgcc 156
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<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 110
tgaggaatat tggtcaatgg tcggaagact gaaccagcca agccgcgtga aggaagaagg 60
tgctcggcat cgtaaacttc ttttgtcagg gaacaaaggg cggtacgtgt accgctgtga 120
gtgtacctga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 111
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 111
tgaggaatat tggtcaatgg tcggaagact gaaccagcca agccgcgtga aggaagaagg 60
tgctcggcat cgtaaacttc ttttgtcagg gaacaaaggg cggtacgtgt accgctgtga 120
gtgtacctga agaaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 112
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<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 112
tgaggaatat tggtcaatgg gcgtgagcct gaaccagcca agccgcgtga aggaagaagg 60
tgcagggcat cgtaaacttc ttttgccggg gaacaataag cgggactagt cccgcgacga 120
gtgtacccgg agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 113
<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 113
tgaggaatat tggtcaatgg gcgtgagcct gaaccagcca agccgcgtga aggaagaagg 60
tgcagggcat cgtaaacttc ttttgccggg gaacaataag cgggactagt cccgcgacga 120
gtgtacccgg agaaaagaca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 114
<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 114
tgaggaatat tggtcaatgg tcgggagact gaaccagcca agccgcgtga gggatggagg 60
tacagagtat cgtaaacctc ttttgtcagg gaacaaaggg cgccacgtgt ggcgctatga 120
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<212> DNA
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<210> 116
<211> 157
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 116
tgaggaatat tggtcaatgg gcgggagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
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<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 117
tgaggaatat tggtcaatgg gcgggagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
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gagtacccga agaaaaagac atcggctaac tccgtgcc 158
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<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 118
tgaggaatat tggtcaatgg gcgggagcct gaaccagcca agccgcgtga aggaagacgg 60
ccctacgggt tgtaaacttc ttttgttgca ggacaacacc ccggacgcgt ccgggcatga 120
gtgtatgcaa agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 119
<211> 157
<212> DNA
<213> Bacteroidales 16S rRNA gene V3 region
<400> 119
tgaggaatat tggtcaatgg gcgggagcct gaaccagcca agccgcgtga gggaataagg 60
ccctacgggt cgtaaacctc ttttgtcggg gaacaaaacc ggagacgagt ctccggctgc 120
gtgtacccga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 120
<211> 158
<212> DNA
<213> Bacteroidales 16S rRNA gene V3 region
<400> 120
tgaggaatat tggtcaatgg gcgggagcct gaaccagcca agccgcgtga gggaagaagg 60
cgctcagcgt cgtaaacctc tttagccggg gaacaaagag ctgctcggga agcagcgttg 120
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<210> 121
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 121
tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggacgacgg 60
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agagtacccg gagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
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<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 122
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
ccctacgggt tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagag cgccacgcgt ggcgagatga 120
gagtacccga agaaaagaca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 123
<211> 157
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 123
tgaggaatat tggtcaatgg gcgcgagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
ccctacgggt tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaggac tgccacgagt ggcagggcga 120
gagtacccga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 124
<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 124
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<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 125
tgaggaatat tggtcaatgg ccgagaggct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
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gagtacccga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
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<211> 157
<212> DNA
<213> Bacteroidales 16S rRNA gene V3 region
<400> 126
tgaggaatat tggtcaatgg ccggaaggct gaaccagcca agccgcgtga gggaggaagg 60
cgcagagcgt cgcagacctc ttttgccggg ggacaaaagg ccggactcgt ccggtcctga 120
gggtacccgg agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 127
<211> 158
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 127
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<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 128
tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgcaggg gagcaaggca cggtacgtgt accgtgaagg 120
agagtaccct gagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 129
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
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tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagcc gctcacgtgt gagcggaagg 120
agagtacccg aagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 130
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 130
tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaggacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagcc gctcacgtgt gagcggaagg 120
agagtacccg aagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 131
<211> 157
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 131
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ccctacgggt tgtaaacctc ttttgccggg gagcaaaggc ggtcactggt gaccggatga 120
gagtacccgg agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 132
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 132
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcagg gagcaaggag ggccacgagt ggcgcttcgg 120
agagtacctg aagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 133
<211> 158
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 133
tgaggaatat tggtcaatgg ccgagaggct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
ccctacgggt tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaacag cgcaacgcgc ttgcgcattg 120
agagtacccg aagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
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<211> 157
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 134
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
ccctacgggt tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagag cgccacgcgt ggcgagatga 120
gagtacccga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 135
<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 135
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
ccctatgggt tgtaaacctc ttttgccggg gagcaaagaa ccgcacgtgt gcggtctgga 120
gagtacccgg agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 136
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 136
tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaataagg 60
ccctaagggt cgtaaacctc ttttgccggg gagcaatggt tcgcttgcga gcggacaggg 120
agagtacccg gagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 137
<211> 157
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 137
tgaggaatat tggtcaatgg ccgtaaggct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
ccctacgggt tgtaaacctc ttttgccggg gagcaaaagg cgccacgcgt ggcgtttcga 120
gagtacccgg agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
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<211> 158
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 138
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ccctatgggt tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagcc gcccacgtgt gggcggaagg 120
agagtacccg aagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
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<211> 158
<212> DNA
<213> Barnesiella 16S rRNA gene V3 region
<400> 139
tgaggaatat tggtcaatgg gcgtaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
ccctatgggt tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagcc gcccacgagt gggcggaagg 120
agagtacccg aagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 140
<211> 159
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
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ccctatgggt tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagcc gcccacgagt gggcggaagg 120
agagtacccg aagaaaaaga catcggctaa ctccgtgcc 159
<210> 141
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<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 141
tgaggaatat tggtcaatgg gcgtaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
ccctatgggt tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagcc gcccacgagt gggcggaagg 120
agagtacccg aagaaaagac atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 142
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 142
tgaggaatat tggtcaatgg gcggtagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgccggg gagcaaggcc atgtacgtgt acgtggcctg 120
agagtacccg gagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
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<213> porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
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gagtacctga agaaaaagac atcggctaac tccgtgcc 158
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<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 144
tgaggaatat tggtcaatgg gcgcgagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctaaggat tgtaaacctc ttttgtcagg gagcaaggag cgccacgtgt ggcgcggcga 120
gagtacctga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 145
<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 145
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacag 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgccggg gagcaaagag cggcacgtgt gccgcgccga 120
gagtacccgg agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 146
<211> 157
<212> DNA
<213> Butyricimonas 16S rRNA gene V3 region
<400> 146
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgccggg gagcaaagag cggcacgtgt gccgcgccga 120
gagtacccgg agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 147
<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 147
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaacgaa ggcacgtgtg ccagaagcga 120
gattacccga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 148
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 148
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaacgaa ggcacgtgtg ccagaagcga 120
gattacccga agaaaaagac atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 149
<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 149
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaacgaa ggcacgtgtg cctgaagcga 120
gattacccga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 150
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 150
tgaggaatat tggtcaatgg gcgggagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagag gccacgtgtg gtcaaaagcg 120
agagtacccg aagaaaaagc atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 151
<211> 159
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 151
tgaggaatat tggtcaatgg gcgggagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaagag gccacgtgtg gtcaaaagcg 120
agagtacccg aagaaaaaga catcggctaa ctccgtgcc 159
<210> 152
<211> 157
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 152
tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaggat ccgcacgagt gcggaggcga 120
gagtacccga agaaaaagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 153
<211> 158
<212> DNA
<213> Porphyromonadaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 153
tgaggaatat tggtcaatgg gcggaagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagacgg 60
tcctatggat tgtaaacctc ttttgtcggg gagcaaggat ccgcacgagt gcggaggcga 120
gagtacccga agaaaaagac atcggctaac tccgtgcc 158
<210> 154
<211> 157
<212> DNA
<213> Butyricimonas 16S rRNA gene V3 region
<400> 154
tgaggaatat tggtcaatgg gcgagagcct gaaccagcca agtcgcgtga gggaagaatg 60
gtctatggcc tgtaaacctc ttttgtcagg gaagaataag gatgacgagt cattcgatgc 120
cagtacttga cgaataagca tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 155
<211> 157
<212> DNA
<213> Alistipes 16S rRNA gene V3 region
<400> 155
tgaggaatat tggtcaatgg acgcaagtct gaaccagcca tgccgcgtgc aggaagacgg 60
ctctatgagt tgtaaactgc ttttgtacga gggtaaaccc ggatacgtgt atccggctga 120
aagtatcgta cgaataagga tcggctaact ccgtgcc 157
<210> 156
<211> 162
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 156
ctaaggatat tccgcaacgg gcggaagccc ggcggagcga cgccgcgtgg acgaggaagg 60
ccggaaggtt gcagagtcct tttgcggggg aagaaggagc cgcggaggga atgccgcggc 120
ggcgaccgaa ccccgcgaat aaggggcggc taattacgtg cc 162
<210> 157
<211> 155
<212> DNA
<213> Bifidobacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 157
tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtgc gggatggagg 60
ccttcgggtt gtaaaccgct tttgttcaag ggcaaggcac ggcttcgggc cgtgttgagt 120
ggattgttcg aataagcacc ggctaactac gtgcc 155
<210> 158
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 158
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagccct atcagcaggg aagaaaaaga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 159
<211> 137
<212> DNA
<213> Hespellia 16S rRNA gene V3 region
<400> 159
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga aggaagaagt 60
atttcggtat gtaaacttct atcagcaggg aagaaaatga cggtatctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 160
<211> 137
<212> DNA
<213> Marvinbryantia 16S rRNA gene V3 region
<400> 160
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagccct atcagcaggg aagaaaatga cagtacctga ataagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 161
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 161
tgggggatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagccct atcagcaggg aagaaagaag acggtacctg agtaagaagc 120
cccggctaac tacgtgcc 138
<210> 162
<211> 139
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 162
tggggagtat tgcacaatgg gggaaacccg tgatgcagcg acgccgcgtg agtgaagaag 60
tatttcggta tgtaaagctc tatcagcagg gaagaaaata gacggtacct gactaagaag 120
ccccggctaa ctacgtgcc 139
<210> 163
<211> 140
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 163
tgggggatat tggacaatgg ggggaaccct gatccagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaagaaa tgacggtacc tgaccaagaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 164
<211> 142
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 164
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
aattcgttac gtaaagctct atcagcaggg aagaaaaaga aatgacggta cctgattaag 120
aagccccggc taactacgtg cc 142
<210> 165
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 165
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcaa tgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaaaag acggtacctg actaagaagc 120
cccggctaac tacgtgcc 138
<210> 166
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 166
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcaa tgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaaaag acggtacctg actaagaagc 120
cccggctaac tacgtgcc 138
<210> 167
<211> 139
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 167
tggggaatat tgcacaatgg aggaaactct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
aattcgttac gtaaagctct atcagcaggg aagaaaaaat gacggtacct gactaagaag 120
caccggctaa atacgtgcc 139
<210> 168
<211> 139
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 168
tggggaatat tgcacaatgg aggaaactct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
aattcgttac gtaaagctct atcagcaggg agaaaaaaat gacggtacct gactaagaag 120
caccggctaa atacgtgcc 139
<210> 169
<211> 137
<212> DNA
<213> Oribacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 169
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaagatga cagtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 170
<211> 137
<212> DNA
<213> Coprococcus 16S rRNA gene V3 region
<400> 170
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcaa cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagct 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 171
<211> 137
<212> DNA
<213> Ruminococcus 16S rRNA gene V3 region
<400> 171
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga tgccgcgtgg aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactcct gtcttaaagg acgataatga cggtacttta ggaggaagct 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 172
<211> 138
<212> DNA
<213> Roseburia 16S rRNA gene V3 region
<400> 172
tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaggaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaagaatg acggtacctg actaagaagc 120
accggctaaa tacgtgcc 138
<210> 173
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 173
tggggaatat tgcacaatgg agggaactct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
aattcgttat gtaaagctct gtcagcaggg aagaaagtga cggtacctga aaaagaagct 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 174
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 174
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaaat 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga gtaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 175
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 175
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
aattcgttat gtaaagctct atcagcaagg aagaaaaaag acggtacttg actaagaagc 120
cccggctaaa tacgtgcc 138
<210> 176
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 176
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagccct atcagcaggg aagaagatga cagtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 177
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 177
tgggggatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg gtgaaggagt 60
actccggtat gtaaagccct atcggcaggg aagaagatga cggtacctga ctaagaagct 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 178
<211> 137
<212> DNA
<213> Butyrivibrio 16S rRNA gene V3 region
<400> 178
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaagtga cagtacctga gtaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 179
<211> 140
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 179
tgggggatat tggacaatgg ggggaaccct gatccagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atctcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaagaaa tgacggtacc tgagtaagaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 180
<211> 140
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 180
tgggggatat tggacaatgg ggggaaccct gatccagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atctcggtat gtaaagctct gtcagcaggg aagaaagaaa tgacggtacc tgaccaagaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 181
<211> 140
<212> DNA
<213> lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 181
tgggggatat tggacaatgg ggggaaccct gatccagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct gtcagcaggg aagaaagaaa tgacggtacc tgaagaagaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 182
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 182
tgggggatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg gtgaaggagt 60
gcttcggcat gtaaagccct atcggcaggg aagaagaagg acggtacctg actaagaagc 120
cccggctaac tacgtgcc 138
<210> 183
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 183
tgggggatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg gtgaagaagc 60
gccccggcgc gtaaagccct atcggcaggg aagaagatga cggtacctgg ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 184
<211> 135
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 184
ggggatattg cacaatgggg gaacccgtga tgcagcgacg ccgcgtgggt gaagaagcgc 60
cccggcgcgt aaagccctat cggcagggaa gaagatgacg gtacctggct aagaagcccc 120
ggctaactac gtgcc 135
<210> 185
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 185
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcagga acgaagaaga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 186
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 186
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
aattcgttac gtaaagctct atcagcagga aagaaagaag acggtacctg actaagaagc 120
cccggctaac tacgtgcc 138
<210> 187
<211> 137
<212> DNA
<213> Roseburia 16S rRNA gene V3 region
<400> 187
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcgggg aagagaatga cggtacccga ctaagaagct 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 188
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 188
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaagatga cagtacctga ataagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 189
<211> 137
<212> DNA
<213> Coprococcus 16S rRNA gene V3 region
<400> 189
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gcgaggaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 190
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 190
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga gcgatgaagg 60
tcttcggatt gtaaagctct gtcgcagggg acgaagtatg acggtaccct gtaagaaagc 120
cccggcaaac tacgtgcc 138
<210> 191
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 191
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaagt 60
atctcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaagaatg acggtacctg agtaagaagc 120
accggctaaa tacgtgcc 138
<210> 192
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 192
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga acaagaagct 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 193
<211> 137
<212> DNA
<213> Coprococcus 16S rRNA gene V3 region
<400> 193
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcaa cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagca 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 194
<211> 138
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 194
tgggggatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gtgaaggagt 60
acttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaagcaag acggtacctg accaagaagc 120
cccggctaac tacgtgcc 138
<210> 195
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 195
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 196
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 196
tggggaatat tgggcaatgg aggcaactct gacccagcaa cgccgcgtga gcgatgaagg 60
tcttcggatt gtaaagctct ttaagtgggg acgaagaaag tgactgtacc cacagaataa 120
gcctcggcta actacgtgcc 140
<210> 197
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 197
tggggaatat tgggcaatgg aggaaactct gacccagcaa cgccgcgtga atgatgaagg 60
tcttcggatt gtaaagttct tttctaaggg aagaagaaag tgacggtacc ttaggaataa 120
gcctcggcta actacgtgcc 140
<210> 198
<211> 137
<212> DNA
<213> marvinbryantia 16S rRNA gene V3 region
<400> 198
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcaa tgccgcgtgg gtgaagaagt 60
accccggtat gtaaagccct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctgg ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 199
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 199
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaagg aagataatga cggtacttga ctaagaagct 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 200
<211> 140
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 200
tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct gatgcagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
gtttcggctc gtaaacttct atcaacaggg acgaaggaag tgacggtacc tgaataagaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 201
<211> 137
<212> DNA
<213> Coprococcus 16S rRNA gene V3 region
<400> 201
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcaa cgccgcgtga gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagctct atcagcaggg aagaaaatga cggtacctga ctaagaagct 120
ccggctaaat acgtgcc 137
<210> 202
<211> 137
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 202
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg aggaagaagg 60
ccctcgggtt gtaaactcct gtctttgggg acgataatga cggtacccaa ggaggaagcc 120
acggctaact acgtgcc 137
<210> 203
<211> 137
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 203
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg aggaagaagg 60
ccctcgggtt gtaaactcct gtcttcgggg acgataatga cggtacccga ggaggaagcc 120
acggctaact acgtgcc 137
<210> 204
<211> 137
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 204
tgggggatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga cgccgcgtga gcgaagaaga 60
tcttcggatt gtaaagctct gtcttagggg acgatgatga cggtaccctg agaggaagcc 120
acggctaact acgtgcc 137
<210> 205
<211> 138
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 205
tgggggatat tgcgcaatgg gggcaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga aggatgaagg 60
ttttcggatt gtaaacttct tttcttaagg acgaaatttg acggtactta aggaataagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 206
<211> 140
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 206
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttaagaggg acgaaggaag tgacggtacc tcttgaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 207
<211> 137
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 207
tgagggatat tggtcaatgg gggaaaccct gaaccagcaa cgccgcgtga gggaagacgg 60
tcttcggatt gtaaaccttt gtcctctgtg aagataatga cggtagcaga ggaggaagct 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 208
<211> 137
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 208
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
tcttcggatt gtaaactttt gtccttggtg aagataatga cggtagccaa ggaggaagct 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 209
<211> 139
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 209
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttgtcaggg aagagcagaa gacggtacct gacgaataag 120
ccacggctaa ctacgtgcc 139
<210> 210
<211> 138
<212> DNA
<213> Clostridia 16S rRNA gene V3 region
<400> 210
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtgt gggaagacgg 60
tcctctggat tgtaaaccac tgtccccagg gacgaagatg acggtacctg gggaggaagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 211
<211> 138
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 211
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga tgccgcgtgg aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactcct gtcgacagga aagaaaaagg actgtacctg tcaagaaagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 212
<211> 137
<212> DNA
<213> Ruminococcus 16S rRNA gene V3 region
<400> 212
tggggaatat tgcacaatgg ggggaaccct gatgcagcga tgccgcgtgg aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactcct gtcttaaagg acgataatga cggtacttta ggaggaagct 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 213
<211> 137
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 213
tggggaatat tgcacaatgg aggaaactct gatgcagcga tgccgcgtga gggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaacctct gtcttaaggg acgataatga cggtacctta ggaggaagct 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 214
<211> 137
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 214
tgggggatat tgcacaatgg agggaactct gatgcagcga tgccgcgtga gggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaacctct gtggacagag acgataatga cggtatctgt caaggaagcc 120
acggctaact acgtgcc 137
<210> 215
<211> 137
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 215
tgggggatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga tgccgcgtga gggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaacctct gtggaggggg acgataatga cggtacccct taaggaagcc 120
acggctaact acgtgcc 137
<210> 216
<211> 137
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 216
tgggggatat tggacaatgg gggaaaccct tatccagcga cgccgcgtga gggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaacctct gtcagcgggg acgataatga cggtacccgc ggaggaagcc 120
acggctaact acgtgcc 137
<210> 217
<211> 138
<212> DNA
<213> Fastidiosipila 16S rRNA gene V3 region
<400> 217
tggggaatat tgggcaatgg gcgaaagcct gacccagcga cgccgcgtga aggaagacgg 60
tcttcggatt gtaaacttta gtactcaggg acgaagaaat gacggtacct gaggttaagc 120
cacggctaac tacgtgcc 138
<210> 218
<211> 138
<212> DNA
<213> Ruminococcus 16S rRNA gene V3 region
<400> 218
tgggggatat tgcgcaatgg gggaaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaacttct tttattaagg acgaaagatg acggtactta atgaataagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 219
<211> 139
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 219
tggggaatat tgggcaatgg acgcaagtct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttgtcaggg aagagaagaa gacggtacct gacgaacaag 120
ccacggctaa ctacgtgcc 139
<210> 220
<211> 139
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 220
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttgacaggg aagagcagaa gacggtacct gtcgaataag 120
ccacggctaa ctacgtgcc 139
<210> 221
<211> 138
<212> DNA
<213> Ruminococcus 16S rRNA gene V3 region
<400> 221
tgggggatat tgcgcaatgg gggcaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga aggatgaagg 60
ttttcggatt gtaaacttct tttattaagg acgaattttg acggtactta atgaataagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 222
<211> 139
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 222
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttaagaggg aagagcagaa gacggtacct cttgaataag 120
ctccggctaa ctacgtgcc 139
<210> 223
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 223
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga gggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacctct tttaccaggg acgaaggacg tgacggtacc tggagaaaaa 120
gcaacggcta actacgtgcc 140
<210> 224
<211> 140
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 224
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ccttcgggtt gtaaacttct tttaccaggg acgaaggacg tgacggtacc tggagaaaaa 120
gcaacggcta actacgtgcc 140
<210> 225
<211> 140
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 225
tggggaatat tgggcaatgg gcgaaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ccttcgggtt gtaaacttct tttaagaggg acgaagaaag tgacggtacc tcttgaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 226
<211> 140
<212> DNA
<213> Fastidiosipila 16S rRNA gene V3 region
<400> 226
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttgagaggg acgaaacaaa tgacggtacc tcttgaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 227
<211> 140
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 227
tggggaatat tgggcaatgg gcggaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttcttgggg acgaagaaag tgacggtacc caaggaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 228
<211> 140
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 228
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttgaggggg acgaaggatg tgacggtacc ccttgaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 229
<211> 140
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 229
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttcttgggg acgaagaaag tgacggtacc cgaggaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 230
<211> 137
<212> DNA
<213> Marvinbryantia 16S rRNA gene V3 region
<400> 230
tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcga cgccgcgtgg gtgaagaagt 60
atttcggtat gtaaagccct atcagcaggg aagatcatga cggtacctga ctaagaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 231
<211> 140
<212> DNA
<213> Oscillibacter 16S rRNA gene V3 region
<400> 231
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttctgaggg acgaagcaag tgacggtacc ttaggaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 232
<211> 139
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 232
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ctttcgggtt gtaaacttct tttgacaggg aagaggagaa gacggtacct gtcgaataag 120
ctccggctaa ctacgtgcc 139
<210> 233
<211> 139
<212> DNA
<213> Ruminococcaceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 233
tggggaatat tgggcaatgg gcgcaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ccctcgggtt gtaaacttct tttatcaggg acgaagaagt gacggtacct gatgaataag 120
ccacggctaa ctacgtgcc 139
<210> 234
<211> 138
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 234
tggggaatat tgcgcaatgg gggaaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga ttgaagaagg 60
ccttcgggtt gtaaagatct ttaatcgggg acgaattttg acggtacccg aagaataagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 235
<211> 138
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 235
tggggaatat tgcgcaatgg gggaaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga ttgaagaagg 60
ccctcgggtt gtaaagatct ttaatcgggg acgaagaatg acggtacccg aagaataagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 236
<211> 138
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 236
tggggaatat tgcgcaatgg gggaaaccct gacgcagcaa cgccgcgtga gtgaagaagg 60
ccttcgggtt gtaaagctct ttaatcaggg acgaagaacg acggtacctg aagaataagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 237
<211> 140
<212> DNA
<213> Firmicutes 16S rRNA gene V3 region
<400> 237
tggggaatat tgggcaatgg gcgaaagcct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
tcttcggatt gtaaacttct tttatcaggg acgaaggaag tgacggtacc tgatgaataa 120
gccacggcta actacgtgcc 140
<210> 238
<211> 137
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 238
tcgggaatat tgcgcaatgg aggcaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt gtccacaggg aagaaaagga ctgtacctgt gaagaaagct 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 239
<211> 138
<212> DNA
<213> Firmicutes 16S rRNA gene V3 region
<400> 239
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt gtccacaggg aagataaaag actgtacctg tgaagaaagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 240
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 240
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt gtcgataggg aagaaaaaag actgtaccta tcaagaaagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 241
<211> 138
<212> DNA
<213> Clostridia 16S rRNA gene V3 region
<400> 241
tcgggaatat tgcgcaatgg agggaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt ttagtcaggg aagaaagcag acggtacctg aagaataagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 242
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 242
tcgggaatat tgcacaatgg aggaaactct gatgcagtga cgccgcgtgc aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactgct ttagacaggg aagaaaaaag acagtacctg tagaataagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 243
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 243
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagt 60
ttttcggaat gtaaactatt gtcgttaggg aagagaaagg acagtaccta aggaggaagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 244
<211> 138
<212> DNA
<213> Clostridia 16S rRNA gene V3 region
<400> 244
tcgggaatat tgcgcaatgg agggaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt gtcgttaggg aagaaaaaag acagtaccta aggaggaagc 120
cccggctaac tatgtgcc 138
<210> 245
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 245
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
tcttcggatt gtaaactatt gtcgttaggg aagagaaagg acagtaccta aggaggaagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 246
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 246
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtgc aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactgct ttagacaggg aagaaacaaa tgacagtacc tgtagaataa 120
gctccggcta actacgtgcc 140
<210> 247
<211> 137
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 247
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt gtcgtgaggg aagaaattga cagtacctca ggaggaagct 120
ccggctaact atgtgcc 137
<210> 248
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 248
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt gtcgttaggg aagagaaagg acagtaccta aggaggaagc 120
tccggctaac tacgtgcc 138
<210> 249
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 249
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtgc aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactgct ttagacaggg aagaaagaaa tgacggtacc tgtagaataa 120
gctccggcta actacgtgcc 140
<210> 250
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 250
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt gtcgttaggg aagataaaag actgtaccta aggaggaagc 120
cccggctaac tatgtgcc 138
<210> 251
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 251
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagt 60
ttttcggaat gtaaactatt gtcattaggg aagagaaagg acggtaccta aggaggaagc 120
cccggctaac tatgtgcc 138
<210> 252
<211> 138
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 252
tcgggaatat tgcgcaatgg aggaaactct gacgcagtga cgccgcgtat aggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaactatt gtcgttaggg aagaaaaaag acagtaccta aggaggaagc 120
cccggctaac tatgtgcc 138
<210> 253
<211> 139
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 253
ttgggaatat tggacaatgg aggaaactct gatccagtga cgccgcgtga aggaagaagg 60
tcttcggatt gtaaacttat tttgtcaggg aagaataaat gactgtacct gaagaaaaag 120
caccggctaa ctacgtgcc 139
<210> 254
<211> 140
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 254
tggggaatat tgcgcaatgg gggaaaccct gacgcagcaa cgccgcgtgc aggaagaagg 60
tcttcggatt gtaaactgtt gtcgcagggg aagaagacag tgacggtacc ctgtgagaaa 120
gtcacggcta actacgtgcc 140
<210> 255
<211> 139
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 255
tggggaatat tgggcaatgg gcgaaagcct gacccagcaa cgccgcgtgg aggaagaagg 60
ttttcggatc gtaaactcct gtcctaagag acgaggaaga gacggtatct taggaggaag 120
ccccggctaa ctacgtgcc 139
<210> 256
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 256
tggggaatat tgggcaatgg gcgaaagcct gacccagcaa cgccgcgtga gggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaacctct gtcctaagtg acgaaggaag tgacggtagc ttaggaggaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 257
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 257
tggggaatat tgggcaatgg gcgaaagcct tacccagcaa cgccgcgtga gggaagaagg 60
ttttcggatt gtaaacctct gtcctggggg acgaaggaag tgacggtacc ccgggaggaa 120
gccccggcta actacgtgcc 140
<210> 258
<211> 137
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 258
tggggaatat tgggcaatgg gggaaaccct gacccagcaa cgccgcgtga aggaagaagg 60
ttttcggatc gtaaacttct atccttggtg aaaatgatga tggtagccaa gaaggaagcc 120
ccggctaact acgtgcc 137
<210> 259
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 259
tggggaatat tgggcaatgg gcgaaagcct gacccagcaa cgccgcgtga gggaagaagg 60
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<210> 260
<211> 137
<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 260
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<210> 261
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 261
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<210> 262
<211> 140
<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 262
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<210> 263
<211> 137
<212> DNA
<213> Lachnospiraceae 16S rRNA gene V3 region
<400> 263
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<210> 264
<211> 163
<212> DNA
<213> Firmicutes 16S rRNA gene V3 region
<400> 264
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<210> 265
<211> 146
<212> DNA
<213> Anaeroplasma 16S rRNA gene V3 region
<400> 265
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<212> DNA
<213> Clostridiales 16S rRNA gene V3 region
<400> 266
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<210> 267
<211> 137
<212> DNA
<213> TM7_genera_incertae_sedis 16S rRNA gene V3 region
<400> 267
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<210> 268
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<212> DNA
<213> unknown bacterium 16S rRNA gene V3 region
<400> 268
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Claims (60)
- 개체에서 1차 장내 미생물 개체군(first gut microbiota population)을 증가시키고, 동시에 2차 장내 미생물 개체군(second gut microbiota population)을 감소시키기 위한 조성물을 개체에 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 1차 장내 미생물군은 짧은 사슬 지방산(short-chain fatty acid; SCFA) 생산 박테리아(bacterium)이로 구성되고, 여기서 2차 장내 미생물 개체군은 내독소(endotoxin) 생산 박테리아를 포함하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 천연물 의약품(natural medicine), 천연물(natural product), 허브(herb) 및 허브 추출물을 포함하는 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 베르베린(berberine), 베르베린 유도체(berberine derivative) 또는 이소퀴놀린 알칼로이드(isoquinoline alkaloid)로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 매발톱나무(berberis vulgaris), 황련(coptis chinensis), 황금(scutellaria baicalensis), 황피수(phellodendri chinensis), 여주(momordica charantia), 고정다(ilex kudingcha), 고삼(sophora flavescens), 용담(gentiana scabra), 지모(anemarrhena asphodeloides), 치자(gardenia jasminoides), 대황(rheum palmatum), 포공영(herba taraxaci), 이들의 추출물 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 식물 또는 이의 추출물이고, 여기서 상기 식물은 소벽(berberis), 황련(coptis), 황금(scutellaria), 황벽(phellodendron), 여주(momordica), 감탕나무(ilex), 고삼(sophora), 용담(gentiana), 지모(anemarrhena), 치자(gardenia), 대황(rheum) 또는 민들레(taraxacum)로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 식물 또는 이의 추출물이고, 여기서 상기 식물은 매자나무과(Berberidaceae), 미나리아재비과(Ranunculaceae), 꿀풀과(Lamiaceae), 운향과(Rutaceae), 마디풀과(Polygonaceae), 국화과(Asteraceae), 방기과(Menispermaceae) 또는 박과(Cucurbitaceae)로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 알리스팁스(alistipes), 알로바쿨룸(allobaculum), 박테로이드(bacteroides), 바네시엘라(barnesiella), 블라우티아(blautia), 부티리시코커스(butyricicoccus), 부티리시모나스(butyricimonas), 도레아(dorea), 헬리코박터(helicobacter), 헤스펠리아(hespellia), 홀데마니아(holdemania), 라우소니아(lawsonia), 오실리박터(oscillibacter), 파라박테로이드(parabacteroides), 파스콜락토박테리움(phascolarctobacterium), 프리보텔라(prevotella), 세디멘티박터(sedimentibacter) 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 박테로이드과(bacteroidaceae), 코리오박테리움과(coriobacteriaceae), 디설포비브리오과(desulfovibrionaceae), 에리시펠로트릭스과(erysipelotrichaceae), 플라보박테리아과(flavobacteriaceae), 헬리코박테리아과(helicobacteracea), 소속 불명군 XI(incertae sedis XI), 소속 불명군 XIV(incertae sedis XIV), 라크노스피라과(lachnospiraceae), 포르피로모나스과(porphyromonadaceae), 프레보텔라과(prevotellaceae), 리케넬라과(rikenellaceae), 루미노코카과(ruminococcaceae), 베이로넬라과(veillonellaceae) 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 캄필로박테리아목(campylobacterales), 디설포비브리오목(desulfovibrionales), 박테로이드목(bacteroidales), 코리오박테리움목(coriobacteriales), 플라보박테리오목(flavobacteriales), 클로스트리듐목(clostridiales), 에리시펠로트릭스목(erysipelotrichales), 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 입실론프로테오박테리아(epsilonproteobacteria), 델타프로테오박테리아(deltaproteobacteria), 박테로이드강(bacteroidia), 코리오박테리움강(coriobacteridae), 플라보박테리아(flavobacteria), 크로스트리듐강(clostridia), 에리시펠로트릭스강(erysipelotrichi) 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 프로테오박테리아(proteobacteria), 박테로이데테스(bacteroidetes), 악티노박테리아(actinobacteria), 피르미쿠테스(firmicutes) 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 짧은 사슬 지방산(SCFA) 생산 박테리아는 블라우티아(blautia), 알로바쿨룸(allobaculum), 프레보텔라(prevotella), 박테리오이데스(bacterioides), 부티리시모나스(butyricimonas) 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분(region)이 서열번호 1 내지 93으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산(nucleic acid) 서열과 적어도 95%의 유사성을 갖는 박테리움(bacterium)으로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 1 내지 93으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 80%의 유사성을 갖는 박테리아(bacteria)로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 알리스팁스, 앤에로플라스마(anaeroplasma), 바네시엘라, 비피도박테리움(bifidobacterium), 부티리시모나스, 부티리비브리오(butyrivibrio), 코프로코커스(coprococcus), 파스티디오시필라(fastidiosipila), 헬리코박터, 헤스펠리아, 마빈브리얀티아(marvinbryantia), 오리박테리움(oribacterium), 오스실리박터(oscillibacter), 프레보텔라(prevotella), 로제부리아(roseburia), 루미노코커스(ruminococcus), TM7 일반적인(genera) 소속 불명군 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 헬리코박터과(Helicobacteraceae), 라크노스피라과(Lachnospiraceae), 포르피로모나스과(Porphyromonadaceae), 프레보텔라과(Prevotellaceae), 리케넬라과(Rikenellaceae), 루미노코카과, 앤에로플라스마타과(Anaeroplasmataceae), 비피도박테리아과(Bifidobacteriaceae) 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 캄필로박테리아목, 박테로이드목, 클로스트리듐목, 앤에로플라스마타목(Anaeroplasmatales), 비피도박테리아목(Bifidobacteriales) 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 입실론프로테오박테리아, 알파프로테오박테리아(alphaaproteobacteria), 박테로이드강, 크로스트리듐강, 악티노박테리아강(actinobacteridae), 몰리쿠테스강(mollicutes) 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 프로테오박테리아, 박테로이데테스, 악티노박테리아, 피르미쿠테스, 테네리쿠테스(Tenericutes) 또는 또는 이들의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 내독소 생산 박테리아는 프로테오박테리아로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 94 내지 268로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 95%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 94 내지 268로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 80%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 경구형 제형(oral formulation) 또는 비경구형 제형(parenteral formulation)인 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 좌약(suppository), 타블렛(tablet), 필(pill), 과립(granule), 파우더(powder), 필름(film), 마이크로캡슐(microcapsule), 에어로졸(aerosol), 스피릿(spirit), 팅크(tincture), 토닉(tonic), 액체 현탁액(liquid suspension) 또는 시럽(syrup)의 형태인 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 1차 사이토카인(first cytokine)의 혈청(serum) 수준을 감소시키고, 2차 사이토카인의 혈청 수준을 증가시키며, 여기서 1차 사이토카인은 리포다당류 결합 단백질(lipopolysaccharide-binding protein), 단핵구 화학유인제 단백질-1(monocyte chemoattractant protein-1), 렙틴(leptin) 또는 이의 조합물이고, 여기서 2차 사이토카인은 아디포넥틴(adiponectin)인 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 제 1항에 있어서, 상기 조성물은 배설물의(fecal) 짧은 사슬 지방산의 수준을 증가시킬 수 있는 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 방법.
- 하기로 구성되는 장내 미생물 개체군 개선에 활성이 있는 시험 화합물(test compound)을 스크리닝하기 위한 방법:
대조군 개체에 있어서 1차 장내 미생물 개체군을 증가시키고, 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시키기 위해 대조군 조성물의 유효한 양(effective amount)을 대조군 개체에 투여하고, 여기서 1차 장내 미생물 개체군은 짧은 사슬 지방산 생산 박테리아로 구성되며, 여기서 2차 장내 미생물 개체군은 내독소 생산 박테리아로 구성;
시험 화합물(test compound)의 양을 시험 개체에 투여; 및
조절된 개체의 장내 미생물 개체군 및 시험 개체의 장내 미생물 개체군을 비교하고, 여기서 시험 화합물이 장내 미생물 개체군 개선에 활성을 나타내면 적어도 80%의 유사성을 나타냄.
- 제 27항에 있어서, 상기 적어도 95%의 유사성은 시험 화합물이 장내 미생물 개체군 개선에 활성이 있음을 나타내는 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 적어도 75%의 유사성은 시험 화합물이 장내 미생물 개체군 개선에 활성이 있음을 나타내는 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 조성물은 천연물 의약품, 천연물, 허브 또는 허브 추출물로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 조성물은 베르베린, 베르베린 유도체 또는 이소퀴놀린 알칼로이드로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 추출물은 소벽, 매발톱나무, 황련, 황금, 황피수, 여주, 고정다, 고삼, 용담, 지모, 치자, 대황, 포공영, 그들의 추출물 또는 이의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 조성물은 식물 또는 이의 추출물로 구성되고, 여기서 상기 식물은 소벽, 황련, 황금, 황벽, 여주, 감탕나무, 고삼, 용담, 지모, 치자, 대황 또는 민들레인 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 조성물은 식물 또는 이의 추출물로 구성되고, 여기서 상기 식물은 매자나무과, 미나리아재비과, 꿀풀과, 운향과, 박과(cucurbitacea), 감탕나무과(aquifoliaceae), 콩과(leguminosae), 용담과(gentianaceae), 용설란과(agavaceae), 꼭두서니과(rubiaceae), 마디풀과, 국화과, 방기과 또는 박과인 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 알리스팁스, 알로바쿨룸, 박테로이드, 바네시엘라, 블라우티아, 부타리시코커스, 부티리시모나스, 도레아, 헬리코박터, 헤르펠리아, 홀데마니아, 라우소니아, 오실리박터, 파라박테로이드, 파스콜락토박테리움, 프리보텔라, 세디멘티박터 또는 이의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 짧은 사슬 지방산 생산 박테리아는 블라우티아, 알로바쿨룸, 프리보텔라, 박테리오이데스, 박테리오이데스, 부티리시모나스 또는 이의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 1 내지 93으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 95%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 1 내지 93으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 80%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 알리스팁스, 앤에로플라스마, 바네시엘라(barnesiella), 비피도박테리움, 부티리시모나스, 부티리비브리오, 코프로코커스, 파스티디오시필라, 헬리코박터(helicobacter), 헤스펠리아(hespellia), 마빈브리얀티아, 오리박테리움, 오스실리박터, 프레보텔라, 로제부리아, 루미노코커스, TM7 일반적인 소속 불명군 또는 이의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 내독소 생산 박테리아는 프로테오박테리아로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 94 내지 268으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 95%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 94 내지 268으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 80%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 조성물은 1차 사이토카인의 혈청 수준을 감소시킬 것이고, 2차 사이토카인의 혈청 수순을 증가시키며, 여기서 1차 사이토카인은 리포다당류 결합 단백질, 단핵구 화합유인제 단백질-1, 렙틴 또는 이의 조합물로 구성되고, 여기서 2차 사이토카인은 아디포넥틴으로 구성되는 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 27항에 있어서, 상기 조성물은 장내의 짧은 사슬 지방산 수준을 감소시킬 수 있는 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물로, 여기서 상기 조성물은 개체에 있어서 1차 장내 미생물 개체군을 선택적으로 증가시킬 수 있고, 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시킬 수 있으며, 여기서 상기 1차 장내 미생물 개체군은 짧은 사슬 지방산 생산 박테리움으로 구성되고, 여기서 2차 장내 미생물 개체군은 내독소 생산 박테리움으로 구성된 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 조성물은 천연물 의약품, 천연물, 허브 또는 허브 추출물로 구성되는 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 조성물은 베르베린, 베르베린 유도체 또는 이의 다른 이소퀴놀린 알칼로이드인 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 조성물은 소벽, 매발톱나무, 황련, 황금, 황피수, 여주, 고정다, 고삼, 용담, 지모, 치자, 대황, 포공영, 그들의 추출물 또는 이의 어떤 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 조성물은 소벽, 황련, 황금, 황벽, 여주, 감탕나무, 고삼, 용담, 지모, 치자, 대황 또는 민들레인 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 조성물은 식물 또는 이의 추출물로 구성되고, 여기서 상기 식물은 매자나무과, 미나리아재비과, 꿀풀과, 운향과, 박과, 감탕나무과, 콩과, 용담과, 용설란과, 꼭두서니과, 마디풀과, 국화과, 방기과 또는 박과인 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 조성물은 식품, 음료, 보충제(supplement) 또는 약학적 제형인 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 조성물은 개체에 있어서 적어도 2주 동안 하루에 1회 약 50 ㎎/㎏ 체중에서부터 약 400 ㎎/체중의 투여량(dosage)으로 투여하여 1차 장내 미생물 개체군을 선택적으로 증가시킬 수 있고, 동시에 2차 장내 미생물 개체군을 감소시킬 수 있으며, 여기서 1차 장내 미생물 개체군은 짧은 사슬 지방산 생산 박테리움으로 구성되고, 여기서 2차 장내 미생물 개체군은 내독소 생산 박테리움으로 구성되는 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 알리스팁스, 알로바쿨륨, 박테로이드, 바네시엘라, 블라우티아, 부티리시코커스, 부티리시모나스, 도레아, 헬리코박터, 헤르펠리아, 홀데마니아, 라우소니아, 오실리박터, 파라박테로이드, 파스콜락토박테리움, 프리보텔라, 세디멘티박터 또는 이의 조합물로 구성되는 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 짧은 사슬 지방산 생산 박테리아는 블라우티아, 알로바쿨룸, 프리보텔라, 박테리오이데스, 부티리시모나드 또는 이의 조합물로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 1 내지 93으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 95%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 45항에 있어서, 상기 1차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 1 내지 93으로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 80%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 시험 화합물을 스크리닝하기 위한 방법.
- 제 45항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 알리스팁스, 앤에로플라스마, 비피도박테리움, 부티리시모나스, 부티리비브리오, 코프로코커스, 파스티디오시필라, 헬리코박터, 헤스페릴라, 마빈브리얀티아, 오리박테리움, 오스실리박터, 프레보텔라, 로제부리아, 루미노코커스, TM7 일반적인 소속 불명군 또는 이의 조합물로 구성되는 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 내독소 생산 박테리움은 프로테오박테리아로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 94 내지 268로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 95%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
- 제 45항에 있어서, 상기 2차 장내 미생물 개체군은 16S rRNA 유전자 서열의 V3 부분이 서열번호 94 내지 268로 구성된 군으로부터 선택된 핵산 서열과 적어도 80%의 유사성을 갖는 박테리움으로 구성된 것을 특징으로 하는 장내 미생물 개체군을 개선하기 위한 조성물.
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