JPH04211379A - ニトリルヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子dna、これを含有する形質転換体 - Google Patents
ニトリルヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子dna、これを含有する形質転換体Info
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Abstract
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Description
ロウス(Rhodo− coccus rhodoch
rous) J−1株に由来し、ニトリル類を対応する
アミド類に変換する能力を有するニトリルヒドラターゼ
活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子DNA、
このDNAを含む組換え体DNA及び該組換え体DNA
により形質転換された形質転換体に関する。 【0002】 【従来の技術】ニトリル類を水和して相当するアミド類
を生成させる酵素はニトリラ−ゼまたはニトリルヒドラ
タ−ゼとして知られており、該酵素を産生する微生物と
して、例えばバチルス属、バクテリジュ−ム属、マイク
ロコカス属及びブレビバクテリウム属(特公昭62−2
1519号公報参照)、コリネバクテリウム属及びノカ
ルジア属(特公昭56−17918号公報参照)、シュ
−ドモナス属(特公昭59−37951号公報参照)及
びロドコッカス属、アルスロバクタ−属及びミクロバク
テリウム属(特開昭61−192193 号公報参照)
、及びロドコッカス。ロドクロウス(特開平2−470
号公報参照)等の微生物を挙げることができる。 【0003】 【発明が解決しようとする課題】遺伝子組換えの方法で
クロ−ン化されたニトリルヒドラタ−ゼ遺伝子によるニ
トリル類の水和では、菌体内に同遺伝子を多コピ−存在
させることができるため、微生物の触媒能力を従来の方
法に比して飛躍的に増大させることが期待できる。 【0004】この遺伝子組換え方法に関し、ロドコッカ
スsp. N−774株(微工研条寄第1936号)に
由来し、ニトリル類を対応するアミド類に変換する能力
、すなわちニトリルヒドラタ−ゼ活性を有するポリペプ
チドをコ−ドする遺伝子DNAに係る発明が先に本発明
者の一人らによって提案されている(特願昭63−20
2779号) 。本発明は、さらに芳香族ニトリル類の
水和に対しても極めて高いニトリルヒドラタ−ゼ活性を
有するロドコッカス ロドクロウス J−1株前記
特開平2−470 号公報記載からニトリルヒドラター
ゼ活性を有するポリペプチドをコードするDNAを取り
出し、これをベクターに組み込んで組換え体DNAとし
、さらに微生物に形質転換し形質転換体を得て、本発明
を完成するに至った。 【0005】 【課題を解決するための手段】本発明は、1. 配列番
号1のサブユニットα(H)及び配列番号2のサブユニ
ットβ(H)のアミノ酸配列を有しニトリルヒドラター
ゼ活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子DNA
(H)、 2. 配列番号3のサブユニットα(L)及び配列番号
4のサブユニットβ(L)のアミノ酸配列を有しニトリ
ルヒドラターゼ活性を有するポリペプチドをコードする
遺伝子DNA(L)、 3.サブユニットα(H)及びサブユニットβ(H)が
配列番号5及び配列番号6のDNA配列を有するもので
ある上記1記載の遺伝子DNA(H)、 4. サブユニットα(L)及びサブユニットβ(L)
が配列番号7及び配列番号8のDNA配列を有する上記
2記載の遺伝子DNA(L)、 5. 上記1〜4記載のH遺伝子DNA又はL遺伝子D
NAをベクターに組み込んだ組換え体DNA、6. 上
記5記載の組換え体DNAで形質転換された形質転換体
、 7.上記6記載の形質転換体を培地に培養し、培養物か
らニトリルヒドラターゼを採取することを特徴とするニ
トリルヒドラターゼの製造法、 8.上記6記載の形質転換体を培地に培養し、得られる
ニトリルヒドラターゼの作用によりニトリル類を対応す
るアミド類に転換するアミド類の製造法、9.上記6記
載の形質転換体を培養し、得られる形質転換体の培養液
、分離菌体、菌体処理物又はこれらの固定化物をニトリ
ル類に作用させ対応するアミド類を製造することを特徴
とするアミド類の製造法、に関する。 【0006】以下に本発明を詳細に説明する。本発明は
、下記(1) 〜(8) の工程により実施されるもの
である。 (1) ニトリルヒドラタ−ゼの抽出精製とアミノ
酸配列の部分的決定: 培養集菌したロドコッカス ロドクロウスJ−1(微
工研条寄第1478号)株からその中に含有される2種
類のニトリルヒドラタ−ゼ(H酵素とL酵素と呼称する
。)を抽出精製し、それぞれの酵素をさらに高速液体ク
ロマトグラフィーを用いて各2つのサブユニット(α、
β)に分離する。そして、これらのサブユニットのN末
端のアミノ酸配列の一部を決定する。各アミノ酸配列は
配列番号9〜12に示す通りである。 (2) ニトリルヒドラタ−ゼのDNAプロ−ブの
作製:本発明においては、前記特願昭63−20277
9号明細書記載のロドコッカス sp. N−774株
のニトリルヒドラタ−ゼのβサブユニットのアミノ酸配
列が上記各βサブユニットと高い相同性を示したことよ
り、同明細書記載の形質転換体JM105/pYUK1
21(微工研条寄第1937号)を用いて、DNAプロ
ーブの作製を行った。すなわち、培養集菌したpYUK
121 を含有する形質転換体からpYUK121 を
抽出し、その中に含まれるロドコッカス sp.N−7
74 株由来のニトリルヒドラタ−ゼ遺伝子 (配列番
号13) を含むDNA断片を制限酵素SphI及びS
alIで切断後抽出精製し、これを放射性同位元素でラ
ベルし、プロ−ブを作製する。 (3) ニトリルヒドラターゼ染色体DNAを含む
DNA断片の調製: ロドコッカス ロドクロウス J−1株から染色体D
NAを分離し、これを制限酵素で切断後、サザンハイブ
リダイゼーション法〔Southern, E.M.,
J. Mol. Biol.98, 503(19
75) 、以下同様〕により目的遺伝子を含有するDN
A断片を上記(2)のプロ−ブを用いて検出する。 【0007】この工程で、プローブとハイブリダイズす
る鎖長の異なる2種類のDNA断片が選別される。 (4) 染色体DNA断片のベクターへの挿入:工
程(3) で調製した染色体DNA断片をそれぞれベク
ターに挿入し、組換え体DNAのライブラリーを作製す
る。 (5) 形質転換体の作製及び組換え体DNAの選
別:工程(4) で調製した組換え体DNAライブラリ
−による形質転換体を作製し、その中から工程(2)
で作製したプローブを用いてコロニーハイブリダイゼイ
ション法〔R.Bruce Wallace,et a
l., Nuc. Aci. Res.9, 879(
1981) 、以下同様〕により目的の組換え体DNA
を含む形質転換体を選別する。更にサザンハイブリダイ
ゼーションにより、目的組換え体DNAの再確認を行う
。 【0008】選別された目的のプラスミドを各々 pN
HJ10H及び pNHJ20Lと称する。 (6) 組換え体DNAの精製と制限酵素地図の作
成:工程(5) で得られた pNHJ10H及び p
NHJ20Lを精製した後それを用いて制限酵素地図
(図1) を作成し、目的遺伝子の含まれている箇所を
決定する。 (7) 塩基配列の決定: 工程(5) で得られた pNHJ10H及び pNH
J20Lの親株由来の染色体DNA断片から不要部分を
制限酵素を用いて除去し、得られたDNA断片の全塩基
配列 (配列番号14、15) を決定し、工程(1)
で決定したアミノ酸配列から予想される塩基配列を含
むことを再確認する。 (8) 形質転換体を用いたニトリルヒドラターゼの生
産とニトリル類のアミド類への変換: 工程(5) で作製した形質転換体を培養し、得られた
ニトリルヒドラターゼ酵素を含む菌体をニトリル類を含
む基質溶液と混合し、アミド類を生成させる。 【0009】なお、ロドコッカス ロドクロウス
J−1株は微工研に微工研条寄第1478号(FERM
BP−1478)として、及び工程(5) で作製し
た pNHJ10Hを含有する形質転換体TG1/pN
HJ10H は微工研に微工研条寄第2777号(FE
RM BP−2777)としてまた同じく工程(5)
で作製したpNHJ20L を含有する形質転換体TG
1/pNHJ20L は微工研に微工研条寄第2778
号(FERM BP−2778)として寄託されている
。 【0010】また、上記工程で用いるベクターとしては
プラスミドベクター (例えば pAT153, pM
P9, pHC624, pKC7等) 、ファージベ
クター(例えばλgt11 (東洋紡績社製), Ch
aron 4A(Amersham社製)等)のいずれ
もが用いられる。また、上記工程で用いられる制限酵素
としては、SphI、SalI、EcoRI、BamH
I、SacI等であり、これらはいずれも市販(宝酒造
社製)されているものが用いられる。また、形質転換に
用いる宿主生物としては E.coli JM105株
あるいは E.coliTG1 株が挙げられるが、特
にこれらに限定されるものではなく、他の宿主生物を用
いることができる。 【0011】形質転換体の培養に用いる培地は通常の培
地が用いられる。ニトリル類のアミドへの変換には、上
記形質転換体の培養により得られるニトリルヒドラター
ゼの他に形質転換体の培養液、分離菌体、菌体処理物、
粗酵素液が用いられる。また、本発明で対象とするニト
リルとしては、例えば、前記特開平2−470 号公報
記載の芳香環を形成する炭素数が4〜10の芳香族ニト
リルおよび炭素数2〜6の脂肪族ニトリルであり、具体
的には、例えば4−、3−および2−シアノピリジン、
ベンゾニトリル、2,6−ジフルオロベンゾニトリル、
2−チオフェンカルボニトリル、2−フロニトリル、シ
アノピラジン、アクリロニトリル、メタクリロニトリル
、クロトニトリル、アセトニトリルおよび3−ヒドロキ
シプロピオニトリルなどを挙げることができる。 【0012】以下、実施例により詳細に説明する。但し
、本発明はこれらの実施例により限定されるものでない
。なお、実施例において下記の略語を用いた。 TE:Tris−HCl(10mM,pH7.8),E
DTA(1mM,pH8.0)TNE:Tris−HC
l(50mM,pH8.0),EDTA(1mM,pH
8.0),NaCl(50mM) STE:Tris−HCl(50mM,pH8.0),
EDTA(5mM,pH8.0),Sucrose(3
5mM) 2xYT 培地
: 1.6%トリプトン、1.0%酵母エキス,0.5
%NaCl 【0013】 【実施例】 (1) ニトリルヒドラタ−ゼの抽出精製とアミノ
酸配列の部分的決定: ロドコッカス ロドクロウス J−1株を培地(酵
母エキス3g/L、KH2PO4 0.5 g/ L、
K2HPO40.5 g/L、MgSO4・4H2O
0.5 g/L、CoCl2 0.01g/L、 クロ
トンアミド3g/L、pH7.2)に28℃で80時間
培養した後、集菌し、この細胞(50g)を破砕し、硫
安分画し、透析後遠心して上清みをとり、DEAE・セ
ルロファインクロマトグラフィー、フェニル・セファロ
ースクロマトグラフィー、セファデックスG−150
クロマトグラフィー、オクチル・セファロース・クロマ
トグラフィーにかけ、2種類の活性画分を得て、これを
透析して酵素液を得た。そして、この酵素液をそれぞれ
高速液体クロマトグラフィーで逆相カラム(Sensh
u Pak VP−304−1251)〔(株)センシ
ュウ科学製〕を用いて二つのサブユニット (α, β
) に分離した。このサブユニットのN末端からのアミ
ノ酸配列(α1(H), β1(H), α1(L),
β1(L)) をアミノ酸シーケンサー〔アプライド
バイオシステム社製 470A 〕を用いて決定した。 【0014】このアミノ酸配列の結果は配列番号9〜1
2に示す通りである。 (2) ニトリルヒドラタ−ゼのDNAプロ−ブの
作製:pYUK121 を含有するE.coli JM
105株(微工研条寄第1937号)を2xYT(50
μg/mlアンピシリン含有)培地 100mlで30
℃で一夜 (12時間) 培養後、集菌し、TNEを加
え再度集菌し、STEを8ml、リゾチームを10mg
加え、0℃で5分間反応させ、0.25M EDTA4
ml加えて、更に室温で10% SDS 2ml、5M
NaCl 5mlを加え、0〜4℃で3時間放置した
。 それを超遠心し、その上澄みに30%のPEG6000
を1/2 当量加え、0〜4℃で一夜 (12時間)
放置し、再度遠心した後TNE に溶解して7.5m
lとし、CsClを加えて遠心して除蛋白後、臭化エチ
ジウム溶液を300〜500mg/ml加えシールチュ
ーブに移し、熱シールし超遠心した。そして、ペリスタ
ポンプで cccDNAを取り出し水飽和イソプロピル
アルコールを等量以上加えて臭化エチジウムを除き、T
Eで透析し、精製したプラスミドpYUK121 約3
mlを得た。 【0015】このpYUK121 を制限酵素 Sph
Iと SalIで切断し、作製したロドコッカス sp
.N−774 株由来のニトリルヒドラタ−ゼ遺伝子を
含む2.07kbのDNA断片を抽出精製した。そして
、このDNA断片を32Pで放射能ラベルし、プロ−ブ
を作製した。なお、このプローブの塩基配列は配列番号
13に示す通りである。 (3) ニトリルヒドラターゼ染色体DNAを含む
DNA断片の調製: ロドコッカス ロドクロウス J−1株を培地 (
グルコース10g/L、KH2PO4 0.5g/L、
K2HPO4 0.5g/L、MgSO4・7H2O
0.5g/L、酵母エキス1g/L、 ペプトン 7.
5g/L、CoCl2 0.01g/L、尿素7.5g
/L、 グリシン1%又はアンピシリン 0.2μg/
ml、水1L、 pH7.2) 100mlに植菌して
培養後、集菌し、TNEで洗浄後、TE10mlに懸濁
し、0.25M EDTA4ml、リゾチーム10〜2
0mg、アクロモプロテアーゼ10〜20mg及び10
×SDS 10mlを加え、37℃で3時間放置した。 次にフェノールを15ml加え、室温で15分間放置し
、遠心し、その上層を採った。そして2.5M酢酸ナト
リウム溶液0.7ml、ジエチルエーテルを加え遠心し
、その上層を捨て、下層に2容量のエタノールを加え、
棒でDNAを巻き取った。これをTE:エタノール(容
積比)の2:8, 1:9及び0:10の各溶液に5分
間づつひたし、2〜4mlのTE(37℃) に溶かし
、37℃で RNase AとT1の混合物を10μL
加えた。次にフェノールを等量加え、遠心後その上層を
採り、エーテルを等量以上加え、また遠心し上層を捨て
、下層をクロロホルムを少量添加した2LのTEで一晩
透析した。更に2回目の透析を3〜4時間かけて行い、
粗染色体DNA標品約4mlを得た。 【0016】次に、粗染色体DNA標品15μLに制限
酵素SacI 2μL、該酵素用緩衝液(10倍濃度)
3μL及びTE 10μLを加え37℃で1時間反応
させた後、アガロースゲル電気泳動(60V,3時間)
に供した。そして工程(2) で合成したDNAプロ
ーブを用いてサザンハイブリダイゼ−ションを行った。 その結果約 6.0Kbと 9.4Kbの位置に上記プ
ローブが強くハイブリダイズするDNA断片があること
が見出された。 【0017】そこで、粗染色体DNA標品15μLを前
述と同様の方法で制限酵素 SacIで切断した後、ア
ガロースゲル電気泳動を行い、 6.0Kbと 9.4
KbのDNA断片を含むゲルを切り出した。これを、そ
れぞれ3倍容量の8M NaClO4溶液を加えて可溶
化した後、6mm 径のGF/C濾紙 (Whatma
n製)の上にDNAを吸着させ、次いで6M NaCl
O4含有TE 100μLを10回、更に95%エタノ
ール 100μLを10回滴下し、 3分間風乾させた
。そして、これを 0.5mlエッペンドルフのチュー
ブに移しTE 40μLを添加し、47 ℃, 30分
間放置した後、遠心してその上澄み約40μLを分取し
た。この溶液の中に目的のニトリルヒドラターゼ染色体
DNAを含む 6.0KbDNA断片と 9.4KbD
NA断片がそれぞれ回収されたことになる。 【0018】次の各工程の具体例は 6.0KbDNA
断片の例を述べるが、 9.4KbDNA断片の場合も
同様である。 (4) 染色体DNA断片のベクターへの挿入:プ
ラスミド pUC19 10μLに対し、制限酵素Sa
cI2μL、該酵素用緩衝液(10倍濃度)3μL及び
TE10μLを加え30℃で1時間反応させ、次に 0
.25MEDTA2μLを添加して反応をとめ、更に1
M Tris−HCl(pH9) を7μL、BAP(
細菌性アルカリホスファターゼ) 3μL加えて65℃
で1時間反応させた。これに TE を加えて全体を
100μLとし、等量のフェノールで3回抽出し、これ
にエーテルを等量加えて、下層を採り、これに3M酢酸
ナトリウム溶液10μLとエタノール 250μLを加
え、−80℃で30分放置後遠心し、乾燥してTEに溶
解した。 【0019】この様に SacIで切断し、BAP 処
理した pUC195μLと工程(3) で回収した
6.0KbDNA断片溶液40μLを混合し、連結緩衝
液6μL、6mg/ml ATP溶液6μL及びT4−
DNAリガーゼ3μLとを加え、4℃で一夜 (12時
間) 反応させることによって目的遺伝子を含有する
6.0KbDNA断片を pUC19に挿入した組換え
体プラスミド約60μLを作製してDNAライブラリー
とした。 (5) 形質転換体の作製及び組換え体DNAの選別
:E.coli TG1株(Amersham社製)を
2xYT培地10mlに37℃で植菌して12時間培養
後、それを新規な2xYT培地に1%植菌し、37℃で
2時間培養した。そして遠心集菌後、冷 50mM
CaCl2 溶液を5ml加え、0℃で40分放置後、
再度遠心して、冷 50mM CaCl2 溶液0.2
5ml及び工程(4) で調製した組換え体プラスミド
を含有する溶液60μLを加え、0℃で40分放置後、
42℃で2分間ヒートショックを与え0℃で5分放置し
て、2xYT培地10mlを加え、37℃で90分間振
とう培養した後、遠心集菌した。これに2xYT培地
1ml添加し菌体を充分懸濁させた後、その懸濁液を1
0μLずつアンピシリン50μg/ml含有2xYT培
地寒天2プレートに分注し、37℃で培養した。そして
、プレート上に生育した形質転換体コロニーをコロニー
ハイブリダイゼーション法にてニトリルヒドラターゼ遺
伝子を持つ形質転換体を選抜した。すなわちプレート中
に培養した形質転換体をニトロセルロースフィルター上
に移し、菌体を溶かしてDNAを固定した後、これを工
程(2) 作製のプローブで処理し、オートラジオグラ
フ法で目的の組換え体DNAを含むコロニーを選択した
。更に、この選択したコロニーから組換え体プラスミド
を抽出し、サザンハイブリダイゼーションによって上述
のプローブとハイブリダイズさせ、選抜したコロニーが
目的遺伝子を含む形質転換体であることを再確認した。 (6) 組換え体プラスミドの精製と制限酵素地図
の作成: 工程(5) で選択した形質転換体を2xYT (50
μg/mlアンピシリン含有) 培地 100mlに植
菌し、37℃で一夜 (12時間) 培養後、集菌し、
TNE を加え再度集菌し、STEを8ml、リゾチー
ムを10mg加え、0℃で5分間反応させ、0.25M
EDTA4ml加えて、更に室温で10% SDS
2ml、5M NaCl 5mlを加え、0〜4℃で3
時間放置した。それを超遠心し、その上澄みに30%の
PEG6000 を1/2 当量加え、0〜4℃で一夜
(12時間) 放置し、再度遠心した後TNE に溶解
して7.5mlとし、CsClを加えて遠心して除蛋白
後、臭化エチジウム溶液を 300〜500mg/ml
加えシールチューブに移し、熱シールし超遠心した。そ
して、ペリスタポンプで cccDNAを取り出し水飽
和イソプロピルアルコールを等量以上加えて臭化エチジ
ウムを除き、TEで透析し、精製した組換え体プラスミ
ド約3mlを得た。これを pNHJ10Hと命名した
。なお、9.4kb DNA断片の場合はpNHJ20
L)と命名した。 【0020】この組換え体プラスミドを、制限酵素 E
coRI、BamHI、PstI、SacI及び Sa
lI等を用いて切断し、図1に示される制限酵素地図を
作製した。 (7) 塩基配列の決定: pNHJ10H の親株由来のDNA断片のどの部分に
目的遺伝子が位置しているかを工程(6) で作成した
制限酵素地図とサザンハイブリダイゼーションによって
決め、不要部分を制限酵素 PstIと SalI(p
NHJ20L の場合は EcoRIとSacI)にて
切り縮め、6.0Kb の鎖長を1.97Kb(pNH
J20L の場合は9.4Kb を1.73Kb)とし
た。そしてこの得られたDNA断片の全塩基配列をM1
3ファージベクターを用いたサンガー法 Sanger
, F.Science 214, 1205−121
0 (1981) により決定した。その結果、この親
株由来のDNA断片の塩基配列は配列番号14(pNH
J20Lの場合は配列番号15)に示す通りであった。 【0021】なお、この塩基配列から予想されるアミノ
酸配列は、工程(1)で決定したアミノ酸配列と完全に
一致することが確認され、このDNA断片にα,βサブ
ユニット遺伝子の両方が存在することが明らかとなった
。 (8) 形質転換体を用いたニトリルヒドラターゼ生産
とニトリル類のアミド類への変換: TG1/pNHJ10H およびTG1/pNHJ20
L 株をそれぞれ2xYT (50μg/mlアンピシ
リン含有)培地10mlに接種し30℃で一夜 (12
時間) 培養し、この培養物を2xYT(50 μg/
mlアンピシリン、0.1g/l CoCl2・6H2
O含有)培地10mlに1%宛接種し、30℃で4時間
培養し、これに終濃度が1mMとなるようにIPTGを
添加し、更に30℃で10時間培養した。集菌後、この
菌体を0.1Mリン酸緩衝液(pH 7.5)5mlに
懸濁し、5分間超音波処理により菌体を破砕後、遠心分
離(12,000G 30分)した。得られた上清液、
50mMリン酸カルシウム緩衝液(pH7.5) およ
び6mMベンゾニトリルを含有する混合液(12ml)
を20℃、30分反応後、0.2ml 1MHCl を
添加して反応を止めた。なお、対照試験として、上記形
質転換体に代えて、E.coli TG1株のみを用い
て同様に行った。反応終了後、反応液中の生成ベンズア
ミドを高速液体クロマトグラフィーを用いて検出した。 その結果、宿主E.coli TG1株ではベンズアミ
ドが検出できなかったが、形質転換体TG1/pNHJ
10H およびTG1/pNHJ20L 株では、それ
ぞれ、1.75×10−3および6.99×10−3
units/mg の酵素活性が認められた。 【0022】ここで、unitはベンゾニトリルからベ
ンズアミドを1Mモル/分の速度で生成させる酵素活性
として定義される。 【0023】 【発明の効果】本発明により、ロドコッカス ロドク
ロウス J−1株の持つサブユニットα及びサブユニ
ットβのアミノ酸配列を有し、ニトリルヒトラターゼ活
性を有する2種類のポリペプチドをコードするDNA配
列が明らかにされた。そして、このDNAを含むプラス
ミドで形質転換された形質転換体が作出された。以上に
より、このニトリルヒトラターゼ遺伝子を菌体内に多コ
ピー存在させ、菌体内酵素量を従来に比して飛躍的に増
大させることができる。 【0024】 【配列表】 (1) 配列番号:1 (i) 配列の長さ:203 (ii) 配列の型:アミノ酸 (iii) トポロジー:直鎖状 (iv) 配列の種類:ペプタイド (v) 起源 (a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロウス(b)
株名:J−1 (FERM BP−1478)(vi)
配列の特徴
(a) 他の情報:α(H) −サブユニット (v
ii) 配列:
5 10
15
MetSerGluHisValA
snLysTyrThrGluTyrGluAlaAr
gThr
20 25
30
LysAlaIleGluThrLeuLeuTyrG
luArgGlyLeuIleThrPro
35
40
45 AlaAlaVal
AspArgValValSerTyrTyrGluA
snGluIleGly
50
55 60
ProMetGlyGlyAlaLys
ValValAlaLysSerTrpValAspP
ro
65 70
75 Gl
uTyrArgLysTrpLeuGluGluAsp
AlaThrAlaAlaMetAla
80
85 9
0 SerLeuGlyTy
rAlaGlyGluGlnAlaHisGlnIle
SerAlaVal
95 1
00 105
PheAsnAspSerGlnThrHi
sHisValValValCysThrLeuCys
110 115
120 SerC
ysTyrProTrpProValLeuGlyLe
uProProAlaTrpTyr
125
130 135
LysSerMetGluT
yrArgSerArgValValAlaAspPr
oArgGly
140 145
150
ValLeuLysArgAspPheGlyP
heAspIleProAspGluValGlu
15
5 160
165 ValArg
ValTrpAspSerSerSerGluIleA
rgTyrIleValIle
170
175 180
ProGluArgProAla
GlyThrAspGlyTrpSerGluGluG
luLeu
185 190
195
ThrLysLeuValSerArgAspSer
MetIleGlyValSerAsnAla
200
LeuThrPr
oGlnGluValIleVal【0025】 (2) 配列番号:2 (i) 配列の長さ:229 (ii) 配列の型:アミノ酸 (iii) トポロジー:直鎖状 (iv) 配列の種類:ペプタイド (v) 起源 (a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロウス(b)
株名:J−1 (FERM BP−1478)(vi)
配列の特徴 (a) 他の情報:β(H) −サブユニット (v
ii) 配列:
5 10
15 MetAs
pGlyIleHisAspThrGlyGlyMet
ThrGlyTyrGlyPro
20
25 30
ValProTyrGlnLy
sAspGluProPhePheHisTyrGlu
TrpGlu
35 40
45
GlyArgThrLeuSerIleLeuTh
rTrpMetHisLeuLysGlyIle
50
55
60 SerTrpT
rpAspLysSerArgPhePheArgGl
uSerMetGlyAsn
65
70 75
GluAsnTyrValAsnG
luIleArgAsnSerTyrTyrThrHi
sTrp
80 85
90
LeuSerAlaAlaGluArgIleLeuV
alAlaAspLysIleIleThr
95
100
105 GluGluGlu
ArgLysHisArgValGlnGluIleL
euGluGlyArg
110
115 120
TyrThrAspArgLysPro
SerArgLysPheAspProAlaGlnI
le
125 130
135 Gl
uLysAlaIleGluArgLeuHisGlu
ProHisSerLeuAlaLeu
140
145 15
0 ProGlyAlaGl
uProSerPheSerLeuGlyAspLys
IleLysVal
155 1
60 165
LysSerMetAsnProLeuGl
yHisThrArgCysProLysTyrVal
170 175
180 ArgA
snLysIleGlyGluIleValAlaTy
rHisGlyCysGlnIle
185
190 195
TyrProGluSerS
erSerAlaGlyLeuGlyAspAspPr
oArgPro
200 205
210
LeuTyrThrValAlaPheSerA
laGlnGluLeuTrpGlyAspAsp
21
5 220
225 GlyAsn
GlyLysAspValValCysValAspL
euTrpGluProTyr
LeuIleSerAla
【0026】 (3) 配列番号:3 (i) 配列の長さ:207 (ii) 配列の型:アミノ酸 (iii) トポロジー:直鎖状 (iv) 配列の種類:ペプタイド (v) 起源 (a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロウス(b)
株名:J−1 (FERM BP−1478)(vi)
配列の特徴 (a) 他の情報:α(L) −サブユニット (v
ii) 配列:
5 10
15 MetTh
rAlaHisAsnProValGlnGlyThr
LeuProArgSerAsn
20
25 30
GluGluIleAlaAl
aArgValLysAlaMetGluAlaIle
LeuVal
35 40
45
AspLysGlyLeuIleSerThrAs
pAlaIleAspHisMetSerSer
50
55
60 ValTyrG
luAsnGluValGlyProGlnLeuGl
yAlaLysIleVal
65
70 75
AlaArgAlaTrpValA
spProGluPheLysGlnArgLeuLe
uThr
80 85
90
AspAlaThrSerAlaCysArgGluM
etGlyValGlyGlyMetGln
95
100
105 GlyGluGlu
MetValValLeuGluAsnThrGlyT
hrValHisAsn
110
115 120
MetValValCysThrLeu
CysSerCysTyrProTrpProValL
eu
125 130
135 Gl
yLeuProProAsnTrpTyrLysTyr
ProAlaTyrArgAlaArg
140
145 15
0 AlaValArgAs
pProArgGlyValLeuAlaGluPhe
GlyTyrThr
155 1
60 165
ProAspProAspValGluIl
eArgIleTrpAspSerSerAlaGlu
170 175
180 LeuA
rgTyrTrpValLeuProGlnArgPr
oAlaGlyThrGluAsn
185
190 195
PheThrGluGluG
lnLeuAlaAspLeuValThrArgAs
pSerLeu
200 205
IleGlyValSerValProThrT
hrProSerLysAla 【
0027】 (4) 配列番号:4 (i) 配列の長さ:226 (ii) 配列の型:アミノ酸 (iii) トポロジー:直鎖状 (iv) 配列の種類:ペプタイド (v) 起源 (a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロウス(b)
株名:J−1 (FERM BP−1478)(vi)
配列の特徴 (a) 他の情報:β(L) −サブユニット (v
ii) 配列:
5 10
15 MetAs
pGlyIleHisAspLeuGlyGlyArg
AlaGlyLeuGlyPro
20
25 30
IleLysProGluSe
rAspGluProValPheHisSerAsp
TrpGlu
35 40
45
ArgSerValLeuThrMetPhePr
oAlaMetAlaLeuAlaGlyAla
50
55
60 PheAsnL
euAspGlnPheArgGlyAlaMetGl
uGlnIleProPro
65
70 75
HisAspTyrLeuThrS
erGlnTyrTyrGluHisTrpMetHi
sAla
80 85
90
MetIleHisHisGlyIleGluAlaG
lyIlePheAspSerAspGlu
95
100
105 LeuAspArg
ArgThrGlnTyrTyrMetAspHisP
roAspAspThr
110
115 120
ThrProThrArgGlnAsp
ProGlnLeuValGluThrIleSerG
ln
125 130
135 Le
uIleThrHisGlyAlaAspTyrArg
ArgProThrAspThrGlu
140
145 15
0 AlaAlaPheAl
aValGlyAspLysValIleValArg
SerAspAla
155 1
60 165
SerProAsnThrHisThrAr
gArgAlaGlyTyrValArgGlyArg
170 175
180 ValG
lyGluValValAlaThrHisGlyAl
aTyrValPheProAsp
185
190 195
ThrAsnAlaLeuG
lyAlaGlyGluSerProGluHisLe
uTyrThr
200 205
210
ValArgPheSerAlaThrGluL
euTrpGlyGluProAlaAlaPro
21
5 220
225 AsnVal
ValAsnHisIleAspValPheGluP
roTyrLeuLeuPro
Ala
【0028】 (5) 配列番号:5 (i) 配列の長さ:609 (ii) 配列の型:核酸 (iii) 鎖の数:一本鎖 (iv) トポロジー:直鎖状 (v) 配列の種類: GenomicDNA
(iv) 起源 (a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロウス(b)
株名:J−1 (FERM BP−1478)(vii
) 配列の特徴 (a) 他の情報:α(H) −サブユニット (v
iii)配列:
15 30
45 GTGAG
CGAGCACGTCAATAAGTACACGGAG
TACGAGGCACGTACC
60
75 90
AAGGCGATCGAAAC
CTTGCTGTACGAGCGAGGGCTCATC
ACGCCC
105 120
135
GCCGCGGTCGACCGAGTCGTTTC
GTACTACGAGAACGAGATCGGC
150
165
180 CCGATGG
GCGGTGCCAAGGTCGTGGCCAAGTC
CTGGGTGGACCCT
195
210 225
GAGTACCGCAAGTGGC
TCGAAGAGGACGCGACGGCCGCGAT
GGCG
240 255
270
TCATTGGGCTATGCCGGTGAGCAGG
CACACCAAATTTCGGCGGTC
285
300
315 TTCAACGAC
TCCCAAACGCATCACGTGGTGGTGT
GCACTCTGTGT
330
345 360
TCGTGCTATCCGTGGCCG
GTGCTTGGTCTCCCGCCCGCCTGGT
AC
375 390
405 AA
GAGCATGGAGTACCGGTCCCGAGTG
GTAGCGGACCCTCGTGGA
420
435 45
0 GTGCTCAAGCG
CGATTTCGGTTTCGACATCCCCGAT
GAGGTGGAG
465 4
80 495
GTCAGGGTTTGGGACAGCAG
CTCCGAAATCCGCTACATCGTCATC
510 525
540 CCGG
AACGGCCGGCCGGCACCGACGGTTG
GTCCGAGGAGGAGCTG
555
570 585
ACGAAGCTGGTGA
GCCGGGACTCGATGATCGGTGTCAG
TAATGCG
600
CTCACACCGCAGGAAGTGATCG
TA 【
0029】 (6) 配列番号:6 (i) 配列の長さ:687 (ii) 配列の型:核酸 (iii) 鎖の数:一本鎖 (iv) トポロジー:直鎖状 (v) 配列の種類: GenomicDNA
(vi) 起源
(a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロウス(b)
株名:J−1 (FERM BP−1478)(vii
) 配列の特徴 (a) 他の情報:β(H) −サブユニット (v
iii)配列:
15 30
45 ATGGA
TGGTATCCACGACACAGGCGGCATG
ACCGGATACGGACCG
60
75 90
GTCCCCTATCAGAA
GGACGAGCCCTTCTTCCACTACGAG
TGGGAG
105 120
135
GGTCGGACCCTGTCAATTCTGAC
TTGGATGCATCTCAAGGGCATA
150
165
180 TCGTGGT
GGGACAAGTCGCGGTTCTTCCGGGA
GTCGATGGGGAAC
195
210 225
GAAAACTACGTCAACG
AGATTCGCAACTCGTACTACACCCA
CTGG
240 255
270
CTGAGTGCGGCAGAACGTATCCTCG
TCGCCGACAAGATCATCACC
285
300
315 GAAGAAGAG
CGAAAGCACCGTGTGCAAGAGATCC
TTGAGGGTCGG
330
345 360
TACACGGACAGGAAGCCG
TCGCGGAAGTTCGATCCGGCCCAGA
TC
375 390
405 GA
GAAGGCGATCGAACGGCTTCACGAG
CCCCACTCCCTAGCGCTT
420
435 45
0 CCAGGAGCGGA
GCCGAGTTTCTCTCTCGGTGACAAG
ATCAAAGTG
465 4
80 495
AAGAGTATGAACCCGCTGGG
ACACACACGGTGCCCGAAATATGTG
510 525
540 CGGA
ACAAGATCGGGGAAATCGTCGCCTA
CCACGGCTGCCAGATC
555
570 585
TATCCCGAGAGCA
GCTCCGCCGGCCTCGGCGACGATCC
TCGCCCG
600 615
630
CTCTACACGGTCGCGTTTTCCG
CCCAGGAACTGTGGGGCGACGAC
64
5 660
675 GGAAAC
GGGAAAGACGTAGTGTGCGTCGATC
TCTGGGAACCGTAC
CTGATCTCTGCG
【0030】 (7) 配列番号:7 (i) 配列の長さ:621 (ii) 配列の型:核酸 (iii) 鎖の数:一本鎖 (iv) トポロジー:直鎖状 (v) 配列の種類: GenomicDNA
(vi) 起源
(a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロウス(b)
株名:J−1 (FERM BP−1478)(vii
) 配列の特徴 (a) 他の情報:α(L) −サブユニット (v
iii)配列:
15 30
45 ATGAC
CGCCCACAATCCCGTCCAGGGCACG
TTGCCACGATCGAAC
60
75 90
GAGGAGATCGCCGC
ACGCGTGAAGGCCATGGAGGCCATC
CTCGTC
105 120
135
GACAAGGGCCTGATCTCCACCGA
CGCCATCGACCACATGTCCTCG
150
165
180 GTCTACG
AGAACGAGGTCGGTCCTCAACTCGG
CGCCAAGATCGTC
195
210 225
GCCCGCGCCTGGGTCG
ATCCCGAGTTCAAGCAGCGCCTGCT
CACC
240 255
270
GACGCCACCAGCGCCTGCCGTGAAA
TGGGCGTCGGCGGCATGCAG
285
300
315 GGCGAAGAA
ATGGTCGTGCTGGAAAACACCGGCA
CGGTCCACAAC
330
345 360
ATGGTCGTATGTACCTTG
TGCTCGTGCTATCCGTGGCCGGTTC
TC
375 390
405 GG
CCTGCCACCCAACTGGTACAAGTAC
CCCGCCTACCGCGCCCGC
420
435 45
0 GCTGTCCGCGA
CCCCCGAGGTGTGCTGGCCGAATTC
GGATATACC
465 4
80 495
CCCGACCCTGACGTCGAGAT
CCGGATATGGGACTCGAGTGCCGAA
510 525
540 CTTC
GCTACTGGGTCCTGCCGCAACGCCC
AGCCGGCACCGAGAAC
555
570 585
TTCACCGAAGAAC
AACTCGCCGACCTCGTCACCCGCGA
CTCGCTC
600 615
ATCGGCGTATCCGTCCCCACCA
CACCCAGCAAGGCC 【
0031】 (8) 配列番号:8 (i) 配列の長さ:678 (ii) 配列の型:核酸 (iii) 鎖の数:一本鎖 (iv) トポロジー:直鎖状 (v) 配列の種類: GenomicDNA
(vi) 起源
(a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロウス(b)
株名:J−1 (FERM BP−1478)(vii
) 配列の特徴 (a) 他の情報:β(L) −サブユニット (v
iii)配列:
15 30
45 ATGGA
TGGAATCCACGACCTCGGTGGCCGC
GCCGGCCTGGGTCCG
60
75 90
ATCAAGCCCGAATC
CGATGAACCTGTTTTCCATTCCGAT
TGGGAG
105 120
135
CGGTCGGTTTTGACGATGTTCCC
GGCGATGGCGCTGGCCGGCGCG
150
165
180 TTCAATC
TCGACCAGTTCCGGGGCGCGATGGA
GCAGATCCCCCCG
195
210 225
CACGACTACCTGACCT
CGCAATACTACGAGCACTGGATGCA
CGCG
240 255
270
ATGATCCACCACGGCATCGAGGCGG
GCATCTTCGATTCCGACGAA
285
300
315 CTCGACCGC
CGCACCCAGTACTACATGGACCATC
CGGACGACACG
330
345 360
ACCCCCACGCGGCAGGAT
CCGCAACTGGTGGAGACGATCTCGC
AA
375 390
405 CT
GATCACCCACGGAGCCGATTACCGA
CGCCCGACCGACACCGAG
420
435 45
0 GCCGCATTCGC
CGTAGGCGACAAAGTCATCGTGCGG
TCGGACGCC
465 4
80 495
TCACCGAACACCCACACCCG
CCGCGCCGGATACGTCCGCGGTCGT
510 525
540 GTCG
GCGAAGTCGTGGCGACCCACGGCGC
GTATGTCTTTCCGGAC
555
570 585
ACCAACGCACTCG
GCGCCGGCGAAAGCCCCGAACACCT
GTACACC
600 615
630
GTGCGGTTCTCGGCGACCGAGT
TGTGGGGTGAACCTGCCGCCCCG
64
5 660
675 AACGTC
GTCAATCACATCGACGTGTTCGAAC
CGTATCTGCTACCG
GCC
【0032】 (9) 配列番号:9 (i) 配列の長さ:26 (ii) 配列の型:アミノ酸 (iii) トポロジー:直鎖状 (iv) 配列の種類:ペプタイド (v) 起源
(a) 生物名:ロドコッカス・ロド
クロウス(b) 株名:J−1 (FERM BP−1
478)(vi) 配列の特徴 (a) 他の情報:α(H) −サブユニット:α1(
H) (vii) 配列:
5 1
0 15
Ser−Glu−His−Val−
Asn−Lys−Tyr−Thr−Glu−Tyr−G
lu−Ala−Arg−Thr−Lys
20
25
Ala−Ile−Glu−T
hr−Leu−Leu−Tyr−Glu−Arg−Gl
y−Leu 【0033】 (10) 配列番号:10 (i) 配列の長さ:28 (ii) 配列の型:アミノ酸 (iii) トポロジー:直鎖状 (iv) 配列の種類:ペプタイド (v) 起源
(a) 生物名
:ロドコッカス・ロドクロウス(b) 株名:J−1
(FERM BP−1478)(vi) 配列の特徴 (a) 他の情報:β(H) −サブユニット:β1(
H) (vii) 配列:
5 1
0 15
Met−Asp−Gly−Ile−
His−Asp−Thr−Gly−Gly−Met−T
hr−Gly−Tyr−Gly−Pro
20
25
Val−P
ro−Tyr−Gln−Lys−Asp−Glu−Pr
o−Phe−Phe−His−Tyr−Glu 【00
34】 (11) 配列番号:11 (i) 配列の長さ:15 (ii) 配列の型:アミノ酸 (iii) トポロジー:直鎖状 (iv) 配列の種類:ペプタイド (v) 起源
(a) 生物名
:ロドコッカス・ロドクロウス(b) 株名:J−1
(FERM BP−1478)(vi) 配列の特徴 (a) 他の情報:α(L) −サブユニット:α1(
L) (vii) 配列:
5
10 15
Thr−Ala−His−Asn
−Pro−Val−Gln−Gly−Thr−Leu−
Pro−Arg−?−Asn−Glu 【0035】 (12) 配列番号:12 (i) 配列の長さ:19 (ii) 配列の型:アミノ酸 (iii) トポロジー:直鎖状 (iv) 配列の種類:ペプタイド (v) 起源
(a) 生物名
:ロドコッカス・ロドクロウス(b) 株名:J−1
(FERM BP−1478)(vi) 配列の特徴 (a) 他の情報:β(L) −サブユニット:β1(
L) (vii) 配列:
5
10 15
Met−Asp−Gly−Ile−
His−Asp−Leu−Gly−Gly−Arg−A
la−?−Leu−?−Pro
Ile−Lys−Pro
−Glu 【0036】 (13) 配列番号:13 (i) 配列の長さ:2070 (ii) 配列の型:核酸 (iii) 鎖の数:一本鎖 (iv) トポロジー:直鎖状 (v) 配列の種類: GenomicDNA(v
i) 起源
(a) 生物名:ロドコッカス sp (
b) 株名:N−774 (FERM BP−1936
)(vii) 配列の特徴 No.675〜1295:サブユニットαNo.122
5 〜1960:サブユニットβ (viii)配列
: SphI .
. .
.
GCATGCTTTCCACATCT
GGAACGTGATCGCCACGGACGGTGG
TG .50
. . .
CCTACC
AGATGTTGGACGGCAACGGATACGG
CATGAACGCCGAAG
. .100 .
. .
GTTTGTACGATCCGGAACT
GATGGCACACTTTGCTTCTCGACGC
A .
.150 . .
TTCAGCA
CGCCGACGCTCTGTCCGAAACCGTC
AAACTGGTGGCCC .
. .200
. .
TGACCGGCCACCACGGCATC
ACCACCCTCGGCGGCGCGAGCTACG
.
. .250 .
GCAAAGCC
CGGAACCTCGTACCGCTTGCCCGCG
CCGCCTACGACA .
. .
.300 .
CTGCCTTGAGACAATTCGACG
TCCTGGTGATGCCAACGCTGCCCT
.
. . .350
ACGTCGCAT
CCGAATTGCCGGCGAAGGACGTAGA
TCGTGCAACCT .
. .
. .400
TCATCACCAAGGCTCTCGGGAT
GATCGCCAACACGGCACCATTCG
. .
. .
ACGTGACCGG
ACATCCGTCCCTGTCCGTTCCGGCC
GGCCTGGTGA .450
. .
. .
ACGGGGTTCCGGTCGGAATGATG
ATCACCGGCAGACACTTCGACG
.500 .
. HindIII
ATGCGACAGT
CCTTCGTGTCGGACGCGCATTCGAA
AAGCTTCGCG .
.550 .
. .
GCCGGTTTCCGACGCCGGCCGAA
CGCGCCTCCAACTCTGCACCAC
. .6
00 . .
AACTCAGCCCC
GCCTAGTCCTGACGCACTGTCAGAC
AACAAATTC .
. .650
. .
CACCGATTCACACATGATCAGCCC
ACATAAGAAAAGGTGAACCAG
. .
.700 .
ATGTCAGTAACG
ATCGACCACACAACGGAGAACGCCG
CACCGGCC MetSer
ValThrIleAspHisThrThrGluA
snAlaAlaProAla
. Subunitα .
.750 .
CAGGCGGCGGTCTCCGACCG
GGCGTGGGCACTGTTCCGCGCACTC
GlnAlaAlaValSe
rAspArgAlaTrpAlaLeuPheArg
AlaLeu .
KpnI .
.800 GAC
GGTAAGGGATTGGTACCCGACGGTT
ACGTCGAGGGATGGAAG
AspGlyLysGlyLeuValProA
spGlyTyrValGluGlyTrpLys
.
. . .
850 AAGACCTCCG
AGGAGGACTTCAGTCCAAGGCGCGG
AGCGGAATTG LysT
hrSerGluGluAspPheSerProAr
gArgGlyAlaGluLeu
. .
. PvuII
GTAGCGCGCGCATGGACC
GACCCCGAGTTCCGGCAGCTGCTTC
TC ValAlaArgAla
TrpThrAspProGluPheArgGlnL
euLeuLeu .900
KpnI . .
. A
CCGACGGTACCGCCGCAGTTGCCCA
GTACGGATACCTGGGCCCC
ThrAspGlyThrAlaAlaVa
lAlaGlnTyrGlyTyrLeuGlyPro
.950
. . .
CAGGCGGC
CTACATCGTGGCAGTCGAAGACACC
CCGACACTCAAG Gl
nAlaAlaTyrIleValAlaValGlu
AspThrProThrLeuLys
. .1000 .
. .
AACGTGATCGTGTGC
TCGCTGTGTTCATGCACCGCGTGGC
CCATC AsnValIle
ValCysSerLeuCysSerCysThrA
laTrpProIle
. .1050 .
.
CTCGGTCTGCCACCCACCTGGT
ACAAGAGCTTCGAATACCGTGCG
LeuGlyLeuProProT
hrTrpTyrLysSerPheGluTyrAr
gAla .
. .1100 .
. CGCG
TGGTCCGCGAACCACGGAAGGTTCT
CTCCGAGATGGGAACC
ArgValValArgGluProArgLy
sValLeuSerGluMetGlyThr
. .
.1150 .
GAGATCGCGTC
GGACATCGAGATTCGCGTCTACGAC
ACCACCGCC GluIl
eAlaSerAspIleGluIleArgVal
TyrAspThrThrAla
. . .
.1200 .
GAAACTCGCTACATGGTC
CTCCCGCAGCGTCCCGCCGGCACCG
AA GluThrArgTyr
MetValLeuProGlnArgProAlaG
lyThrGlu .
. PstI .
.1250 G
GCTGGAGCCAGGAACAACTGCAGGA
AATCGTCACCAAGGACTGC
GlyTrpSerGlnGluGlnLe
uGlnGluIleValThrLysAspCys
. .
. .
.1300 CTGATCGG
GGTTGCAATCCCGCAGGTTCCCACC
GTCTGATCACCC Le
uIleGlyValAlaIleProGlnVal
ProThrValTRM
. .
. .
CGACAAGAAGGAAGC
ACACC−ATGGATGGAGTACACGATC
TTGCC
MetAspGlyValH
isAspLeuAla
Subunit
β
.1350 . .
. .
GGAGTACAAGGCTTCGG
CAAAGTCCCGCATACCGTCAACGCC
GAC GlyValGlnGl
yPheGlyLysValProHisThrVal
AsnAlaAsp
.1400 . .
.
ATCGGCCCCACCTTTCACGCCGAA
TGGGAACACCTGCCCTACAGC
IleGlyProThrPheHis
AlaGluTrpGluHisLeuProTyrS
er . .
1450 . .
SalI CTGATGT
TCGCCGGTGTCGCCGAACTCGGGGC
CTTCAGCGTCGAC L
euMetPheAlaGlyValAlaGluLe
uGlyAlaPheSerValAsp
. .150
0 . .
GAAGTGCGATACGT
CGTCGAGCGGATGGAGCCGGGCCAC
TACATG GluValAr
gTyrValValGluArgMetGluPro
GlyHisTyrMet .
. .1550
. .
ATGACCCCGTACTACGAGAGG
TACGTCATCGGTGTCGCGACATTG
MetThrProTyrTyr
GluArgTyrValIleGlyValAlaT
hrLeu .
. .1600
. ATG
GTCGAAAAGGGAATCCTGACGCAGG
ACGAACTCGAAAGCCTT
MetValGluLysGlyIleLeuT
hrGlnAspGluLeuGluSerLeu
. .
. .1650
. GCGGGGGGAC
CGTTCCCACTGTCACGGCCCAGCGA
ATCCGAAGGG AlaG
lyGlyProPheProLeuSerArgPr
oSerGluSerGluGly
. .
. .1700
CGGCCGGCACCCGTCGA
GACGACCACCTTCGAAGTCGGGCAG
CGA ArgProAlaPr
oValGluThrThrThrPheGluVal
GlyGlnArg .
. .
. .1750
GTACGCGTACGCGACGAGTACGTT
CCGGGGCATATTCGAATGCCT
ValArgValArgAspGlu
TyrValProGlyHisIleArgMetP
ro .
. . .
GCATAC
TGCCGTGGACGAGTGGGAACCATCT
CTCATCGAACTACC
AlaTyrCysArgGlyArgValGlyT
hrIleSerHisArgThrThr
.1800 .
. . .
GAGAAGTGGCCGT
TTCCCGACGCAATCGGCCACGGGCG
CAACGAC GluLysT
rpProPheProAspAlaIleGlyHi
sGlyArgAsnAsp
.1850 .
. .
GCCGGCGAAGAACCGACGTA
CCACGTGAAGTTCGCCGCCGAGGAA
AlaGlyGluGluPr
oThrTyrHisValLysPheAlaAla
GluGlu .
.1900 . .
SalI TTG
TTCGGTAGCGACACCGACGGTGGAA
GCGTCGTTGTCGACCTC
LeuPheGlySerAspThrAspG
lyGlySerValValValAspLeu
.
.1950 . .
TTCGAGGGTT
ACCTCGAGCCTGCGGCCTGATCTTC
CAGCATTCCA PheG
luGlyTyrLeuGluProAlaAlaTR
M
. . .2
000 . .
GGCGGCGGTCACGCGAT
CACAGCGGTTCGTGCGACCGCCGCC
TGA .
. .2050
. TCACC
ACGATTCACTCATTCGGAAGGACAC
TGGAAATCATGGTCG
SalI
【0037
】 (14) 配列番号:14 (i) 配列の長さ:1970 (ii) 配列の型:核酸 (iii) 鎖の数:一本鎖 (iv) トポロジー:直鎖状 (v) 配列の種類: GenomicDNA(v
i) 起源
(a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロ
ウス(b) 株名:J−1 (FERM BP−147
8)(vii) 配列の特徴 No.408〜1094:サブユニットβ(H)
No.1111 〜1719:サブユニッ
トα(H) (viii)配列: 10 20
30 40
50 60CT G
CAGCTCGAACATCGAAGGGTGCGAG
CCGAGAGATCGGAGACGCAGACACC
CGGAGGG
70
80 90 100
110 120
AACTTAGCCTCCCGGACCGATG
CGTGTCCTGGCAACGCCTCAAAATT
CAGTGCAAGCGAT
130
140 150
160 170 180
TCAATCTTGTTACTTCCA
GAACCGAATCACGTCCCCGTAGTGT
GCGGGGAGAGCGCCCGA
190 200 210
220 230
240 ACGCAGGGATGGTA
TCCATGCGCCCCTTCTCTTTTCGAA
CGAGAACCGGCCGGTACAGCC
250 260 2
70 280 290
300 GACCCGGAGA
CACTGTGACGCCGTTCAACGATTGT
TGTGCTGTGAAGGATTCACCCAAGC
310 320
330 340 35
0 360 CAACTG
ATATCGCCATTCCGTTGCCGGAACA
TTTGACACCTTCTCCCTACGAGTAG
AAGC
370 380
390 400
410 420 CA
GCTGGACCCCTCTTTGAGCCCAGCT
CCGATGAAAGGAATGAGGAAATGGA
TGGTATCC
MetAspGlyIle
H
Subunit β(H)
430 440
450 460 470
480 ACGACAC
AGGCGGCATGACCGGATACGGACCG
GTCCCCTATCAGAAGGACGAGCCCT
TCT isAspThrGlyGly
MetThrGlyTyrGlyProValProT
yrGlnLysAspGluProPheP
490 500
510 520
530 540 TCC
ACTACGAGTGGGAGGGTCGGACCCT
GTCAATTCTGACTTGGATGCATCTC
AAGGGCA heHisTyrGl
uTrpGluGlyArgThrLeuSerIle
LeuThrTrpMetHisLeuLysGlyI
550
560 570 580
590 600
TATCGTGGTGGGACAAGTCGCGGT
TCTTCCGGGAGTCGATGGGGAACGA
AAACTACGTCA leSerT
rpTrpAspLysSerArgPhePheAr
gGluSerMetGlyAsnGluAsnTyr
ValA 610
620 630 6
40 650 660
ACGAGATTCGCAACTCGTAC
TACACCCACTGGCTGAGTGCGGCAG
AACGTATCCTCGTCG sn
GluIleArgAsnSerTyrTyrThrH
isTrpLeuSerAlaAlaGluArgIl
eLeuValA 67
0 680 690
700 710 72
0 CCGACAAGATCATCAC
CGAAGAAGAGCGAAAGCACCGTGTG
CAAGAGATCCTTGAGGGTC
laAspLysIleIleThrGluGlu
GluArgLysHisArgValGlnGluI
leLeuGluGlyA
730 740 750
760 770
780 GGTACACGGACA
GGAAGCCGTCGCGGAAGTTCGATCC
GGCCCAGATCGAGAAGGCGATCG
rgTyrThrAspArgLysPr
oSerArgLysPheAspProAlaGln
IleGluLysAlaIleG
790 800
810 820 830
840 AACGGCTT
CACGAGCCCCACTCCCTAGCGCTTC
CAGGAGCGGAGCCGAGTTTCTCTCT
CG luArgLeuHisGluP
roHisSerLeuAlaLeuProGlyAl
aGluProSerPheSerLeuG
850 860
870 880
890 900 GTGA
CAAGATCAAAGTGAAGAGTATGAAC
CCGCTGGGACACACACGGTGCCCGA
AATATG lyAspLysIle
LysValLysSerMetAsnProLeuG
lyHisThrArgCysProLysTyrV
910 9
20 930 940
950 960
TGCGGAACAAGATCGGGGAAATCGT
CGCCTACCACGGCTGCCAGATCTAT
CCCGAGAGCA alArgAs
nLysIleGlyGluIleValAlaTyr
HisGlyCysGlnIleTyrProGluS
erS 970
980 990 100
0 1010 1020
GCTCCGCCGGCCTCGGCGACG
ATCCTCGCCCGCTCTACACGGTCGC
GTTTTCCGCCCAGG erS
erAlaGlyLeuGlyAspAspProAr
gProLeuTyrThrValAlaPheSer
AlaGlnG 1030
1040 1050
1060 1070 1080
AACTGTGGGGCGACGAC
GGAAACGGGAAAGACGTAGTGTGCG
TCGATCTCTGGGAACCGT
luLeuTrpGlyAspAspGlyAsnG
lyLysAspValValCysValAspLe
uTrpGluProT
1090 1100 1110
1120 1130
1140 ACCTGATCTCTGC
GTGAAAGGAATACGATAGTGAGCGA
GCACGTCAATAAGTACACGGAG
yrLeuIleSerAla
MetSerGluHisVal
AsnLysTyrThrGlu
Subunit α(H)
1150
1160 1170
1180 1190 1200
TACGAGGCACGTACCAA
GGCGATCGAAACCTTGCTGTACGAG
CGAGGGCTCATCACGCCC
TyrGluAlaArgThrLysAlaIle
GluThrLeuLeuTyrGluArgGlyL
euIleThrPro
1210 1220 11230
1240 1250
1260 GCCGCGGTCGACC
GAGTCGTTTCGTACTACGAGAACGA
GATCGGCCCGATGGGCGGTGCC
AlaAlaValAspArgValVa
lSerTyrTyrGluAsnGluIleGly
ProMetGlyGlyAla
1270 1280 1
290 1300 1310
1320 AAGGTCGTG
GCCAAGTCCTGGGTGGACCCTGAGT
ACCGCAAGTGGCTCGAAGAGGACGC
G LysValValAlaLysS
erTrpValAspProGluTyrArgLy
sTrpLeuGluGluAspAla
1330 1340
1350 1360 13
70 1380 ACGGC
CGCGATGGCGTCATTGGGCTATGCC
GGTGAGCAGGCACACCAAATTTCGG
CGGTC ThrAlaAlaMet
AlaSerLeuGlyTyrAlaGlyGluG
lnAlaHisGlnIleSerAlaVal
1390 140
0 1410 1420
1430 1440 T
TCAACGACTCCCAAACGCATCACGT
GGTGGTGTGCACTCTGTGTTCGTGC
TATCCGTGG PheAsnAs
pSerGlnThrHisHisValValVal
CysThrLeuCysSerCysTyrProT
rp 1450
1460 1470 1480
1490 1500
CCGGTGCTTGGTCTCCCGCCCG
CCTGGTACAAGAGCATGGAGTACCG
GTCCCGAGTGGTA ProV
alLeuGlyLeuProProAlaTrpTy
rLysSerMetGluTyrArgSerArg
ValVal 1510
1520 1530
1540 1550 1560
GCGGACCCTCGTGGAGTG
CTCAAGCGCGATTTCGGTTTCGACA
TCCCCGATGAGGTGGAG
AlaAspProArgGlyValLeuLysA
rgAspPheGlyPheAspIleProAs
pGluValGlu 1
570 1580 1590
1600 1610 1
620 GTCAGGGTTTGGGA
CAGCAGCTCCGAAATCCGCTACATC
GTCATCCCGGAACGGCCGGCC
ValArgValTrpAspSerSer
SerGluIleArgTyrIleValIleP
roGluArgProAla
1630 1640 16
50 1660 1670
1680 GGCACCGACG
GTTGGTCCGAGGAGGAGCTGACGAA
GCTGGTGAGCCGGGACTCGATGATC
GlyThrAspGlyTrpSe
rGluGluGluLeuThrLysLeuVal
SerArgAspSerMetIle
1690 1700
1710 1720 173
0 1740 GGTGTC
AGTAATGCGCTCACACCGCAGGAAG
TGATCGTATGAGTGAAGACACACTC
ACTG GlyValSerAsnA
laLeuThrProGlnGluValIleVa
l
1750 1760
1770 1780
1790 1800 AT
CGGCTCCCGGCGACTGGGACCGCCG
CACCGCCCCGCGACAATGGCGAGCT
TGTATTCA
1810
1820 1830 1840
1850 1860
CCGAGCCTTGGGAAGCAACGGCA
TTCGGGGTCGCCATCGCGCTTTCGG
ATCAGAAGTCGT
1870
1880 1890 1
900 1910 1920
ACGAATGGGAGTTCTTCCG
ACAGCGTCTCATTCACTCCATCGCT
GAGGCCAACGGTTGCG
19
30 1940 1950
1960 1970
AGGCATACTACGAGAG
CTGGACAAAGGCGCTCGAGGCCAGC
GTGGTCGAC 【0038
】 (15) 配列番号:15 (i) 配列の長さ:1731 (ii) 配列の型:核酸 (iii) 鎖の数:一本鎖 (iv) トポロジー:直鎖状 (v) 配列の種類: GenomicDNA(v
i) 起源
(a) 生物名:ロドコッカス・ロドクロ
ウス(b) 株名:J−1 (FERM・BP)
(vii) 配列の特徴
No.171〜84
8 :サブユニットβ(L) No.915
〜1535:サブユニットα(L) (vii
i)配列: 10 2
0 30 40
50 60 GAG
CTCCCTGGAGCCACTCGCGCCGACG
CATCCACGCTCGGACAGCCCACGGT
GCGGATC
70
80 90 1
00 110 120
ACCCCTGTTCGTCGGTAA
CAGAACAGTAACATGTCATCAGGTC
ATGACGTGTTGACGCAT
130 140 1
50 160 170
180 TAGACGAG
GGCACATAGGGTTGGTGACTCACGG
CACAAGGAGAGCATTTCATGGATGG
AA
MetAspGlyI
Subunit β(L)
190 200
210 220 23
0 240 TCCA
CGACCTCGGTGGCCGCGCCGGCCTG
GGTCCGATCAAGCCCGAATCCGATG
AACCTG leHisAspL
euGlyGlyArgAlaGlyLeuGlyPr
oIleLysProGluSerAspGluPro
V 250
260 270 28
0 290 300
TTTTCCATTCCGATTGGGA
GCGGTCGGTTTTGACGATGTTCCCG
GCGATGGCGCTGGCCG
alPheHisSerAspTrpGluArgS
erValLeuThrMetPheProAlaMe
tAlaLeuAlaG
310 320 33
0 340 350
360 GCGCGTTCA
ATCTCGACCAGTTCCGGGGCGCGAT
GGAGCAGATCCCCCCGCACGACTAC
C lyAlaPheAsnLeu
AspGlnPheArgGlyAlaMetGluG
lnIleProProHisAspTyrL
370 38
0 390 400
410 420
TGACCTCGCAATACTACGAGCACT
GGATGCACGCGATGATCCACCACGG
CATCGAGGCGG euTh
rSerGlnTyrTyrGluHisTrpMet
HisAlaMetIleHisHisGlyIleG
luAlaG 43
0 440 450
460 470 48
0 GCATCTTCGATTCC
GACGAACTCGACCGCCGCACCCAGT
ACTACATGGACCATCCGGACG
lyIlePheAspSerAspGl
uLeuAspArgArgThrGlnTyrTyr
MetAspHisProAspA
490 500
510 520 53
0 540 ACAC
GACCCCCACGCGGCAGGATCCGCAA
CTGGTGGAGACGATCTCGCAACTGA
TCACCC spThrThrP
roThrArgGlnAspProGlnLeuVa
lGluThrIleSerGlnLeuIleThr
H 550
560 570 58
0 590 600
ACGGAGCCGATTACCGACG
CCCGACCGACACCGAGGCCGCATTC
GCCGTAGGCGACAAAG
isGlyAlaAspTyrArgArgProT
hrAspThrGluAlaAlaPheAlaVa
lGlyAspLysV
610 620 63
0 640 650
660 TCATCGTGC
GGTCGGACGCCTCACCGAACACCCA
CACCCGCCGCGCCGGATACGTCCGC
G alIleValArgSer
AspAlaSerProAsnThrHisThrA
rgArgAlaGlyTyrValArgG
670 68
0 690 700
710 720
GTCGTGTCGGCGAAGTCGTGGCGA
CCCACGGCGCGTATGTCTTTCCGGA
CACCAACGCAC lyAr
gValGlyGluValValAlaThrHis
GlyAlaTyrValPheProAspThrA
snAlaL 73
0 740 750
760 770 78
0 TCGGCGCCGGCGAA
AGCCCCGAACACCTGTACACCGTGC
GGTTCTCGGCGACCGAGTTGT
euGlyAlaGlyGluSerPr
oGluHisLeuTyrThrValArgPhe
SerAlaThrGluLeuT
790 800
810 820 83
0 840 GGGG
TGAACCTGCCGCCCCGAACGTCGTC
AATCACATCGACGTGTTCGAACCGT
ATCTGC rpGlyGluP
roAlaAlaProAsnValValAsnHi
sIleAspValPheGluProTyrLeu
L 850
860 870 88
0 890 900
TACCGGCCTGACCAGGTCA
TCCGGTCCACCCAGCGAGACGTCCC
TTCACCACAGACAGAA
euProAla
910 920 93
0 940 950
960 ACGAGCCCA
CCCCGATGACCGCCCACAATCCCGT
CCAGGGCACGTTGCCACGATCGAAC
G
MetThrAlaHisAsnProValGlnG
lyThrLeuProArgSerAsnG
Subun
it α(L)
970 980
990 1000 1010
1020 AGGAG
ATCGCCGCACGCGTGAAGGCCATGG
AGGCCATCCTCGTCGACAAGGGCCT
GATCT luGluIleAl
aAlaArgValLysAlaMetGluAla
IleLeuValAspLysGlyLeuIleS
1030
1040 1050 1060
1070 1080
CCACCGACGCCATCGACCAC
ATGTCCTCGGTCTACGAGAACGAGG
TCGGTCCTCAACTCG
erThrAspAlaIleAspHisMetSe
rSerValTyrGluAsnGluValGly
ProGlnLeuG
1090 1100 1110
1120 1130
1140 GCGCCAAGAT
CGTCGCCCGCGCCTGGGTCGATCCC
GAGTTCAAGCAGCGCCTGCTCACCG
lyAlaLysIleValA
laArgAlaTrpValAspProGluPh
eLysGlnArgLeuLeuThrA
1150 1160
1170 1180
1190 1200
ACGCCACCAGCGCCTGCCGTGAAAT
GGGCGTCGGCGGCATGCAGGGCGAA
GAAATGGTCG spAla
ThrSerAlaCysArgGluMetGlyV
alGlyGlyMetGlnGlyGluGluMe
tValV 1210
1220 1230
1240 1250 1260
TGCTGGAAAACACCG
GCACGGTCCACAACATGGTCGTATG
TACCTTGTGCTCGTGCTATC
alLeuGluAsnThrGlyThr
ValHisAsnMetValValCysThrL
euCysSerCysTyrP
1270 1280
1290 1300 1310
1320 CGTGG
CCGGTTCTCGGCCTGCCACCCAACT
GGTACAAGTACCCCGCCTACCGCGC
CCGCG roTrpProVa
lLeuGlyLeuProProAsnTrpTyr
LysTyrProAlaTyrArgAlaArgA
1330
1340 1350 1360
1370 1380
CTGTCCGCGACCCCCGAGGT
GTGCTGGCCGAATTCGGATATACCC
CCGACCCTGACGTCG
laValArgAspProArgGlyValLe
uAlaGluPheGlyTyrThrProAsp
ProAspValG
1390 1400 1410
1420 1430
1440 AGATCCGGAT
ATGGGACTCGAGTGCCGAACTTCGC
TACTGGGTCCTGCCGCAACGCCCAG
luIleArgIleTrpA
spSerSerAlaGluLeuArgTyrTr
pValLeuProGlnArgProA
1450 1460
1470 1480
1490 1500
CCGGCACCGAGAACTTCACCGAAGA
ACAACTCGCCGACCTCGTCACCCGC
GACTCGCTCA laGly
ThrGluAsnPheThrGluGluGlnL
euAlaAspLeuValThrArgAspSe
rLeuI 1510
1520 1530
1540 1550 1560
TCGGCGTATCCGTCC
CCACCACACCCAGCAAGGCCTGACA
TGCCCCGACTCAACGAACAA
leGlyValSerValProThr
ThrProSerLysAla
1570 1580
1590 1600 1610
1620 CCCCA
CCCGGGTCTCGAAGCCAACCTCGGC
GACCTGGTACAGAATCTGCCGTTCA
ACGAA
1630
1640 1650 1660
1670 1680
CGAATCCCCCGCCGCTCCGG
CGAGGTCGCCTTCGATCAGGCCTGG
GAGATCCGCGCCTTC
1690 1700 1710
1720 1730
AGCATTGCCA
CCGCATTGCATGGCCAGGGCCGATT
CGAATGGGACGAATTC
NHJ20Lの制限酵素地図。
Claims (9)
- 【請求項1】 配列番号1のサブユニットα(H)及
び配列番号2のサブユニットβ(H)のアミノ酸配列を
有しニトリルヒドラターゼ活性を有するポリペプチドを
コードする遺伝子DNA(H)。 - 【請求項2】 配列番号3のサブユニットα(L)及
び配列番号4のサブユニットβ(L)のアミノ酸配列を
有しニトリルヒドラターゼ活性を有するポリペプチドを
コードする遺伝子DNA(L)。 - 【請求項3】 サブユニットα(H)及びサブユニッ
トβ(H)が配列番号5及び配列番号6のDNA配列を
有するものである請求項1記載の遺伝子DNA(H)。 - 【請求項4】 サブユニットα(L)及びサブユニッ
トβ(L)が配列番号7及び配列番号8のDNA配列を
有する請求項2記載の遺伝子DNA(L)。 - 【請求項5】 請求項1〜4記載のH遺伝子DNA又
はL遺伝子DNAをベクターに組み込んだ組換え体DN
A。 - 【請求項6】 請求項5記載の組換え体DNAで形質
転換された形質転換体。 - 【請求項7】 請求項6記載の形質転換体を倍地に培
養し、培養物からニトリルヒドラターゼを採取すること
を特徴とするニトリルヒドラターゼの製造法。 - 【請求項8】 請求項6記載の形質転換体を培地に培
養し、得られるニトリルヒドラターゼの作用によりニト
リル類を対応するアミド類に転換するアミド類の製造法
。 - 【請求項9】 請求項6記載の形質転換体を培養し、
得られる形質転換体の培養液、分離菌体、菌体処理物又
はこれらの固定化物をニトリル類に作用させ対応するア
ミド類を製造することを特徴とするアミド類の製造法。
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