本発明は、KRas G12Cの阻害剤に関する。特に本発明は、KRas G12Cの活性を不可逆的に阻害する化合物、治療上有効量の当該化合物を含む医薬組成物、およびそれらの使用方法に関する。
本明細書で使用する場合、「KRas G12C」は、アミノ酸位置12でのグリシンからシステインへのアミノ酸置換を含む変異型の哺乳動物KRasタンパク質を指す。ヒトKRasのアミノ酸コドンおよび残基位置の割り当ては、ユニプロットKB/スイスプロットP01116:バリアントp.Gly12Cysにより同定されたアミノ酸配列に基づく。
本明細書で使用する場合、「KRas G12C阻害剤」は、本明細書に記載の式(I)で表される本発明の化合物を指す。これらの化合物は、KRas G12Cの酵素活性の全てまたは一部を負に調節するかまたは阻害することができる。本発明のKRas G12C阻害剤は、KRas G12Cと相互作用し、位置12のシステイン残基のスルフヒドリル側鎖と共有結合付加体を形成することによりこれに非可逆的に結合し、KRas G12Cの酵素活性を阻害する。
本明細書で使用する場合、「KRas G12Cに関連する疾患または障害」は、KRas G12C変異に関連するか、またはそれにより媒介されるか、またはそれを有する疾患または障害を指す。KRas G12Cに関連する疾患または障害の非限定的な例は、KRas G12Cに関連するがんである。
本明細書で使用する場合、用語「対象」、「個体」、または「患者」は互換的に使用され、任意の動物を指し、マウス、ラット、その他のげっ歯動物、ウサギ、イヌ、ネコ、ブタ、牛、ヒツジ、ウマ、霊長類、およびヒトなどの哺乳動物が含まれる。いくつかの実施形態では、患者はヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、処置および/または予防される疾患または障害の少なくとも1つの症状を経験および/または呈している。いくつかの実施形態では、対象は、KRas G12C変異を有すると特定または診断されている(例えば、規制当局に認可された、例えばFDAに認可されたアッセイまたはキットを用いて判定して)。いくつかの実施形態では、対象は、KRas G12C変異に対し陽性である腫瘍を有する(例えば、規制当局に認可されたアッセイまたはキットを用いて判定して)。対象は、KRas G12C変異に対し陽性である腫瘍(単一または複数)を有する対象であり得る(例えば、規制当局に認可された、例えばFDAに認可されたアッセイまたはキットを使用して陽性であると特定される)。対象は、腫瘍がKRas G12C変異を有する対象であり得る(例えば、腫瘍は、規制当局に認可された、例えばFDAに認可されたキットまたはアッセイを用いてそのように特定されている)。いくつかの実施形態では、対象は、KRas G12C遺伝子に関連するがんを有すると疑われている。いくつかの実施形態では、対象は、KRas G12C変異を有する腫瘍があることを示す臨床記録を有している(および場合により、臨床記録は、対象が、本明細書で提供される組成物のいずれかで処置されるべきであることを示している)。
本明細書に記載の方法または使用のいずれかのいくつかの実施形態では、患者(例えば、KRas G12Cに関連するがんを有すると疑われる患者、KRas G12Cに関連するがんの1つもしくは複数の症状を有している患者、および/またはKRas G12Cに関連するがんを発症する危険性が高い患者)由来の試料(例えば、生物学的試料または生検試料(例えば、パラフィン包埋生検試料)を使用して、患者がKRas G12C変異を有しているかどうかを決定するために使用されるアッセイには、例えば、次世代シークエンシング、免疫組織化学的検査、蛍光顕微鏡法、break apart FISH分析、サザンブロッティング、ウェスタンブロッティング、FACS分析、ノーザンブロッティング、およびPCR系増幅(例えばRT-PCRおよび定量的リアルタイムRT-PCR)が含まれ得る。当技術分野で周知の通り、当該アッセイは通常、例えば、少なくとも1種の標識核酸プローブまたは少なくとも1種の標識抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて実施される。
本明細書で用いられる用語「アルキル」は、1、2または3個の置換基で所望により置換されている、1~12個の炭素原子、1~8個の炭素原子、1~6個の炭素原子、または1~3個の炭素原子を有する直鎖および分枝鎖脂肪族基を指す。アルキル基の例には、限定されないが、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、ペンチル、およびヘキシルが挙げられる。
用語「ハロアルキル」は、1個以上の水素がハロゲンにより置換されているアルキル鎖を指す。ハロアルキルの例は、トリフルオロメチル、ジフルオロメチルおよびフルオロメチルである。
「アルキレン」基は、上記で定義のアルキル基で、2つの他の化学基の間に位置し、それらを連結するように機能するアルキル基である。アルキレン基の例には、限定されないが、メチレン、エチレン、プロピレン、およびブチレンが挙げられる。
本明細書で用いられる用語「シクロアルキル」には、3~12個の炭素、例えば、3~8個の炭素、さらなる例として、3~6個の炭素を有する飽和および部分不飽和環状炭化水素基が含まれ、シクロアルキル基は、さらに所望により置換されている。シクロアルキル基の例には、限定されないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロヘプチル、およびシクロオクチルが挙げられる。
用語「ヘテロアルキル」は、本明細書で定義されたアルキル基で、鎖中の1個以上の炭素原子がO、S、およびNからなる群より選択されるヘテロ原子により置換されているアルキル基を指す。
「アラルキル」または「アリールアルキル」基は、アルキル基に共有結合したアリール基を含み、これらのどちらも、独立して、所望により置換されてもまたは非置換であってもよい。アラルキル基の一例は、(C1-C6アルキル(C6-C10)アリールであり、これには、限定されないが、ベンジル、フェネチル、およびナフチルメチルが含まれる。置換アラルキルの一例は、アルキル基がヒドロキシアルキルで置換されているものである。
「ヘテロシクリル」または「ヘテロ環」基は、約3~約12個の原子、例えば、4~8個の原子を有する環構造であり、1個以上の原子がN、O、およびSからなる群より選択され、環原子の残りは炭素である。ヘテロシクリルは、単環式、二環式、スピロ環または架橋環系であってよい。ヘテロ環基は、1つまたは複数の位置の炭素または窒素上で、R7で所望により置換されており、R7は式Iに対して定義されている。ヘテロ環基はまた、独立して、窒素上で、アルキル、アリール、アラルキル、アルキルカルボニル、アルキルスルホニル、アリールカルボニル、アリールスルホニル、アルコキシカルボニル、アラルコキシカルボニルで所望により置換されているか、または硫黄上で、オキソもしくは低級アルキルで所望により置換されている。ヘテロ環基の例には、限定されないが、エポキシ、アゼチジニル、アジリジニル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロピラニル、ピロリジニル、ピロリジノニル、ピペリジニル、ピペラジニル、イミダゾリジニル、チアゾリジニル、ジチアニル、トリチアニル、ジオキソラニル、オキサゾリジニル、オキサゾリジノニル、デカヒドロキノリニル、ピペリドニル、4-ピペリジノニル、チオモルホリニル、チオモルホリニル、1,1-ジオキシド、モルホリニル、オキサゼパニル、アザビシクロヘキサン、アザビシクロヘプタンおよびオキサアザビシクロヘプタンが挙げられる。この用語の範囲から特に排除されるのは、隣接する環状Oおよび/またはS原子を有する化合物である。
用語の「ヘテロシクリルアルキル」は、アルキルリンカーを介して分子の残りの部分に連結された本明細書で定義のヘテロシクリル基を指し、ヘテロシクリルアルキルのアルキルリンカーは、ヒドロキシまたはヒドロキシアルキルで所望により置換されていてもよい。
本明細書で使用する場合、「ヘテロアリール」という用語は、5~14個の環原子、好ましくは5、6、9、または10個の環原子を有し;環状配列中で共有される6、10、または14個のπ電子を有し;炭素原子に加えて、N、O、およびSからなる群より選択される環あたり1~3個のヘテロ原子を有する基を指す。ヘテロアリール基の例には、アクリジニル、アゾシニル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンゾチオフラニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾオキサゾリル、ベンズチアゾリル、ベンズトリアゾリル、ベンズテトラゾリル、ベンゾイソオキサゾリル、ベンゾイソチアゾリル、ベンゾイミダゾリニル、カルバゾリル、4aH-カルバゾリル、カルボリニル、クロマニル、クロメニル、シンノリニル、フラニル、フラザニル、イミダゾリニル、イミダゾリル、1H-インダゾリル、インドレニル、インドリニル、インドリジニル、インドリル、3H-インドリル、イソベンゾフラニル、イソクロマニル、イソインダゾリル、イソインドリニル、イソインドリル、イソキノリニル、イソチアゾリル、イソオキサゾリル、メチレンジオキシフェニル、ナフチリジニル、オクタヒドロイソキノリニル、オキサジアゾリル、1,2,3-オキサジアゾリル、1,2,4-オキサジアゾリル、1,2,5-オキサジアゾリル、1,3,4-オキサジアゾリル、オキサゾリジニル、オキサゾリル、オキサゾリジニル、ピリミジニル、フェナントリジニル、フェナントロリニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサチイニル、フェノキサジニル、フタラジニル、ピペロニル、プテリジニル、プリニル、ピラニル、ピラジニル、ピラゾリジニル、ピラゾリニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリドオキサゾール、ピリドイミダゾール、ピリドチアゾール、ピリジニル、ピリジル、ピリミジニル、ピロリニル、2H-ピロリル、ピロリル、キナゾリニル、キノリニル、4H-キノリジニル、キノキサリニル、キヌクリジニル、テトラヒドロイソキノリニル、テトラヒドロキノリニル、テトラゾリル、6H-1,2,5-チアジアジニル、1,2,3-チアジアゾリル、1,2,4-チアジアゾリル、1,2,5-チアジアゾリル、1,3,4-チアジアゾリル、チアントレニル、チアゾリル、チエニル、チエノチアゾリル、チエノオキサゾリル、チエノイミダゾリル、チオフェニル、トリアジニル、1,2,3-トリアゾリル、1,2,4-トリアゾリル、1,2,5-トリアゾリル、1,3,4-トリアゾリル、およびキサンテニルが挙げられる。
「ヘテロアリールアルキル」基は、アルキル基に共有結合したヘテロアリール基を含み、ラジカルはアルキル基上にあり、これらのどちらも、独立して、所望により置換されているか、または非置換である。ヘテロアリールアルキル基の例には、C1-C6アルキル基に結合した5、6、9、または10環原子を有するヘテロアリール基が含まれる。ヘテロアラルキル基の例には、ピリジルメチル、ピリジルエチル、ピロリルメチル、ピロリルエチル、イミダゾリルメチル、イミダゾリルエチル、チアゾリルメチル、チアゾリルエチル、ベンゾイミダゾリルメチル、ベンゾイミダゾリルエチル キナゾリニルメチル、キノリニルメチル、キノリニルエチル、ベンゾフラニルメチル、インドリニルエチル、イソキノリニルメチル、イソイノジルメチル、シンノリニルメチル、およびベンゾチオフェニルエチルが挙げられる。この用語の範囲から特に排除されるのは、隣接する環状Oおよび/またはS原子を有する化合物である。
本明細書で使用する場合、「有効量」の化合物は、KRas G12Cの活性を負に調節するまたは阻害するのに十分な量である。このような量は、一回用量として投与してよく、または投与計画に従って投与してよく、それにより、この量は効果的である。
本明細書で使用する場合、「治療上有効量」の化合物は、症状を緩和する、または症状を何らかの方法で減らす、または病気の進行を停止するまたは食い止める、またはKRas G12Cの活性を負に調節するまたは阻害するのに十分な量である。このような量は、一回用量として投与してよく、または投与計画に従って投与してよく、それにより、この量は効果的である。
本明細書で使用する場合、処置は、病気、障害または疾患の症状または病態を緩和するかあるいは有利に変化させる任意の方法を指す。処置はまた、本明細書の組成物の任意の薬学的使用を包含する。
本明細書で使用する場合、特定の医薬組成物の投与による特定の障害の症状の緩和は、永久的であっても一時的であっても、持続的であっても一過性であっても、組成物の投与に起因し得るまたはその投与に関連し得る、何らかの軽減を指す。
一実施形態では、アリールは1個以上のハロゲンで所望により置換されているナフチルである。一実施形態では、アリールは、ヒドロキシルおよびトリフルオロメチルまたはC1-C3アルキルで置換されているナフチルである。一実施形態では、アリールは、ヒドロキシルで置換されているナフチルである。
一実施形態では、Xは飽和架橋環系である。架橋環系の非限定的例には、ジアザビシクロヘプタンおよびジアザビシクロオクタンが挙げられる。ある種の実施形態では、Xは飽和架橋環系である場合、R1は-C(O)CH=CH2である。一実施形態では、架橋環系は、R8から独立して選択される1個または2個の基で置換され、R8は式Iで定義されている通りである。一実施形態では、架橋環系は非置換である。一実施形態では、架橋環系は、ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-イルまたはジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-3-イルである。
一実施形態では、ヘテロシクリルアルキルのヘテロシクリル部分は、N-メチルピロリジニルである。一実施形態では、ヘテロシクリルアルキルのヘテロシクリル部分は、3,3-ジフルオロ-1-メチルピロリジニルである。
一実施形態では、アリールは1個以上のハロゲンで所望により置換されているナフチルである。一実施形態では、アリールは、ヒドロキシルおよびトリフルオロメチルまたはC1-C3アルキルで置換されているナフチルである。一実施形態では、アリールは、ヒドロキシルで置換されているナフチルである。
一実施形態では、式Iの化合物には、上記化合物のトリフルオロ酢酸塩が含まれる。式(I)、式I-A、式I-B、式(II)、式II-A、または式II-Bの化合物は、医薬組成物に製剤化され得る。
担体の特性は投与経路に依存するであろう。本明細書で使用する場合、用語「薬学的に許容される」は、細胞、細胞培養、組織、または生物などの生体系に適合可能であり、活性成分(複数可)の生物活性の有効性に干渉しない非毒性材料を指す。したがって、本発明による組成物は、阻害剤に加えて、希釈剤、フィラー、塩、緩衝剤、安定剤、可溶化剤、および当該技術分野において周知のその他の材料を含み得る。薬学的に許容される製剤の調製は、例えば、Remington’s Pharmaceutical Sciences,18th Edition,ed.A.Gennaro,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,1990に記載されている。
本明細書で使用する場合、用語の薬学的に許容される塩は、上記で特定した化合物の所望の生物活性を保持し、最小限の望ましくない毒性作用を示すか、または望ましくない毒性作用を示さない塩を指す。かかる塩の例としては、無機酸(例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、硝酸など)により形成される酸付加塩、ならびに酢酸、シュウ酸、酒石酸、コハク酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、安息香酸、タンニン酸、パモ酸、アルギン酸、ポリグルタミン酸、ナフタレンスルホン酸、ナフタレンジスルホン酸、およびポリガラクツロ酸などの有機酸により形成される酸が挙げられるがこれらに限定されない。化合物はまた、当業者に公知の薬学的に許容される四級塩としても投与され得、これには特に式-NR+Z-の四級アンモニウム塩が含まれ、Rは、水素、アルキル、またはベンジルであり、Zは対イオンで、これには、クロリド、ブロミド、ヨージド、-O-アルキル、トルエンスルホネート、メチルスルホネート、スルホネート、ホスフェート、またはカルボキシレート(例えば、ベンゾエート、スクシネート、アセテート、グリコレート、マレエート、マレート、シトレート、タルトレート、アスコルベート、ベンゾエート、シンナモエート、マンデロエート、ベンジロエート、およびジフェニルアセテート)が含まれる。
活性化合物は、処置される患者に深刻な毒性作用を引き起こすことなく治療上有効量を患者に送達するのに十分な量で、薬学的に許容される担体または希釈剤中に含まれる。一実施形態では、すべての上記条件について、活性化合物の用量は、1日当たり約0.01~300mg/kg、例えば、1日当たり、0.1~100mg/kgの範囲であり、さらなる例としては、1日当たり、レシピエントのキログラム体重当たり0.5~約25mgの範囲である。典型的な局所投与量は、好適な担体中の0.01~3%wt/wtの範囲である。薬学的に許容される誘導体の有効投与量範囲は、送達される親化合物の重量を基準にして計算され得る。誘導体がそれ自体で活性を示す場合は、有効投与量は誘導体の重量を使用して上記のように推定され得、または当業者に公知の他の手段で推定され得る。
本明細書で使用する場合、用語「接触させること」は、インビトロ系またはインビボ系中で、示した部分を一緒にすることを指す。例えば、KRas G12Cを本明細書で提供される化合物と「接触させること」は、KRas G12Cを有するヒトなどの個体または患者への本明細書で提供される化合物の投与、ならびに、例えば、KRas G12Cを含む細胞調製物または精製された調製物を含む試料中に本明細書で提供される化合物を導入することを含む。
一実施形態では、KRas G12C活性の阻害が望ましい細胞を、有効量の式(II)、式II-Aまたは式II-Bの化合物と接触させて、KRas G12C活性を負に調節する。他の実施形態では、治療上有効量の薬学的に許容される塩または式(II)、式II-A、または式II-Bの化合物を含有する医薬組成物が使用され得る。
本明細書に記載の方法は、KRas G12Cの活性を負に調節することにより、細胞内の増強されたKRas G12C活性に起因する望ましくない細胞増殖を阻害するように設計される。細胞は、特定の治療計画に従って単一用量または複数用量で接触され、所望のKRas G12Cの負の調節を達成し得る。KRas G12Cの共有結合修飾の程度は、下記実施例Aに記載の方法を含む、周知の方法を使用してインビトロでモニタリングされ得る。さらに、細胞中の代表的化合物の阻害活性は、例えば、下記実施例Bに記載のものを含むリン酸化ERKの量によりKRas G12C活性の阻害を測定し、処置の有効性を評価することによってモニタリングされ得、したがって、投与量は主治医により調節され得る。
別の態様では、がんの処置を必要とする患者のがんを処置する方法であって、治療上有効量の式(II)、式II-Aもしくは式II-Bの化合物、それらの薬学的に許容される塩、または当該化合物もしくはその薬学的に許容される塩を含む医薬組成物を当該患者に投与することを含む方法が提供される。
本明細書で提供される組成物および方法は、KRas G12Cに関連するがんの処置を必要とする患者のKRas G12Cに関連するがんの処置であって、治療上有効量の式(II)、式II-A、もしくは式II-Bの化合物、それらの薬学的に許容される塩、または当該化合物もしくはその薬学的に許容される塩を含む医薬組成物を当該患者に投与することを含む処置に使用され得るが提供され得る。一実施形態では、KRas G12Cに関連するがんは肺癌である。
本明細書で提供される組成物および方法は、例えば肺癌、前立腺癌、乳癌、脳腫瘍、皮膚癌、子宮頸癌、精巣癌などの腫瘍を含む多種多様ながんの処置に使用され得る。より具体的には、本発明の組成物および方法により処置され得る癌としては、星細胞腫、乳癌、子宮頸癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌、食道癌、胃癌、頭頸部癌、肝細胞癌、喉頭癌、肺癌、口腔癌、卵巣癌、前立腺癌および甲状腺癌ならびに肉腫などの腫瘍型が挙げられるがこれらに限定されない。より具体的には、これらの化合物は以下の処置に使用することができる:心臓:肉腫(血管肉腫、線維肉腫、横紋筋肉腫、脂肪肉腫)、粘液腫、横紋筋腫、線維腫、脂肪腫、および奇形腫;肺:気管支原性癌(扁平上皮細胞、未分化小細胞、未分化大細胞、腺癌)、肺胞(細気管支)癌、気管支腺腫、肉腫、リンパ腫、軟骨性過誤腫、中皮腫;消化管:食道(扁平上皮細胞癌、腺癌、平滑筋肉腫、リンパ腫)、胃(がん腫、リンパ腫、平滑筋肉腫)、膵臓(導管腺癌、インスリノーマ、グルカゴノーマ、ガストリノーマ、カルチノイド腫瘍、ビポーマ)、小腸(腺癌、リンパ腫、カルチノイド腫瘍、カポジ肉腫、平滑筋腫、血管腫、脂肪腫、神経線維腫、線維腫)、大腸(腺癌、管状腺腫、絨毛腺腫、過誤腫、平滑筋腫);尿生殖路:腎臓(腺癌、ウィルムス腫瘍(腎芽細胞腫)、リンパ腫、白血病)、膀胱および尿道(扁平上皮細胞癌、移行上皮癌、腺癌)、前立腺(腺癌、肉腫)、精巣(精上皮腫、奇形腫、胎児性がん、奇形がん、絨毛がん、肉腫、間質細胞がん、線維腫、線維腺腫、類腺腫瘍、脂肪腫);肝臓:肝臓癌(肝細胞癌)、胆管癌、肝芽腫、血管肉腫、肝細胞腺腫、血管腫;胆管:胆嚢癌、乳頭部癌、胆管癌;骨:骨原性肉腫(骨肉腫)、線維肉腫、悪性線維性組織球腫、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性リンパ腫(細網肉腫)、多発性骨髄腫、悪性巨大細胞腫瘍脊索腫、骨軟骨腫(骨軟骨性外骨症)、良性軟骨腫、軟骨芽細胞腫、軟骨粘液線維腫、類骨腫、および巨細胞腫;神経系:頭蓋(骨腫、血管腫、肉芽腫、黄色腫、変形性骨炎)、髄膜(髄膜腫、髄膜肉腫、神経膠腫症)、脳(星状細胞腫、髄芽腫、神経膠腫、上衣腫、胚細胞腫(松果体腫)、多形膠芽腫、乏突起細胞腫、シュワン腫、網膜芽細胞腫、先天性腫瘍)、脊髄神経線維腫、髄膜腫、神経膠腫、肉腫);婦人科:子宮(子宮内膜癌)、頸部(子宮頸癌、前腫瘍子宮頸部異形成)、卵巣(卵巣癌(漿液性嚢胞腺癌、粘液性嚢胞腺癌、未分類がん腫)、顆粒膜卵胞膜細胞腫、セルトリ-ライディッヒ細胞腫、未分化胚細胞腫、悪性奇形腫)、外陰(扁平上皮細胞癌、上皮内癌、腺癌、線維肉腫、黒色腫)、膣(明細胞癌、扁平上皮細胞癌、ブドウ状肉腫(胎児性横紋筋肉腫)、卵管(がん腫);血液学的:血液(骨髄性白血病(急性および慢性)、急性リンパ性白血病、慢性リンパ性白血病、骨髄増殖性疾患、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群)、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫(悪性リンパ腫);皮膚:悪性黒色腫、基底細胞癌、扁平上皮細胞癌、カポジ肉腫、異形成母斑、脂肪腫、血管腫、皮膚線維腫、ケロイド、乾癬;ならびに副腎:神経芽腫。ある種の実施形態では、がんは非小細胞肺癌である。
投与濃度および患者への投与経路は、処置されるがんに応じて異なるであろう。化合物、その薬学的に許容される塩、ならびにかかる化合物および塩を含む医薬組成物はまた、他の抗新生物化合物、例えば、化学療法剤と共に同時投与され得るか、または照射もしくは外科的介入などの他の処置と組み合わせて、術前または術後に補助剤として使用され得る。
また、治療に使用するために本明細書で定義される、式(II)、式II-Aもしくは式II-Bの化合物、またはそれらの薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物、またはそれらの医薬組成物も本明細書で提供される。
また、癌の処置に使用するために本明細書で定義される、式(I)、式I-Aもしくは式I-Bの化合物、またはそれらの薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物、またはそれらの医薬組成物も本明細書で提供される。
また、KRas G12Cの阻害に使用するための、式(I)、式I-A、式I-B、式(II)、式II-A、もしくは式II-Bの化合物、またはそれらの薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物も本明細書で提供される。
また、KRas G12Cに関連する疾患または障害の処置に使用するために本明細書で定義される、式(I)、式I-A、式I-B、式(II)、式II-A、もしくは式II-Bの化合物、またはそれらの薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物、またはそれらの医薬組成物も本明細書で提供される。
また、癌の処置のための薬剤の製造における本明細書で定義される、式(I)、式I-A、式I-B、式(II)、式II-A、もしくは式II-Bの化合物、またはそれらの薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物の使用も本明細書で提供される。
また、KRas G12Cの活性を阻害するための薬剤の製造における本明細書で定義される、式(I)、式I-A、式I-B、式(II)、式II-A、もしくは式II-Bの化合物、またはそれらの薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物の使用も本明細書で提供される。
また、KRas G12Cに関連する疾患または障害の処置のための薬剤の製造における本明細書で定義される、式(I)、式I-A、式I-B、式(II)、式II-A、もしくは式II-Bの化合物、またはそれらの薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物の使用も本明細書で提供される。
また、がんの処置を必要としている患者のがんを処置する方法であって、(a)がんがKRas G12C変異に関連する(例えば、KRas G12Cに関連するがんである)ことを判定すること(例えば、規制当局に認可された、例えばFDAに認可されたアッセイまたはキットを使用して判定される);および(b)治療上有効量の式(I)、式I-A、式I-B、式(II)、式II-A、もしくは式II-Bの化合物またはそれらの薬学的に許容される塩、またはそれらの医薬組成物を当該患者に投与することを含む方法も本明細書で提供される。
当業者は、一般に許容される適切な既知の細胞および/または動物モデルを使用するインビボ試験およびインビトロ試験の両方により、試験化合物の所与の障害を処置または防止する能力が予測されることを理解するであろう。
さらに当業者は、健康な患者および/または所与の障害に罹患している患者におけるファースト・イン・ヒューマン試験、用量範囲探索試験および有効性試験を含むヒト臨床試験が、臨床分野および医療分野で周知の方法に従って完了され得ることを理解するであろう。
反応スキームおよび実施例
本発明の化合物は、本明細書に記載の合成法および反応スキームを使用して市販の試薬から、または他の試薬および当業者に公知の従来法を使用して調製され得る。
例えば、本発明の化合物は、一般反応スキームIおよびIIに従って調製され得る。
LおよびYが結合であり、R
2が水素であり、R
4がアリールまたはヘテロアリールである式Iの化合物は、スキームIに従って調製できる。ステップAでは、適切に官能化したジヒドロピリドピリミジン(1)を、1つの求核性アミン種を含むヘテロ環とカップリングさせ、他方を保護基に結合させて、化合物(2)を得る。このカップリングは、ジクロロメタンなどの溶媒中、トリエチルアミンまたはヒューニッヒ塩基などの塩基の存在下で進行する。ステップBでは、化合物(2)のBoc基が、当該技術分野において公知の条件を使用して、例えば、ジクロロメタンなどの溶媒中でトリフルオロ酢酸を用いて、除去され、化合物(3)が得られる。ステップCでは、好適な官能化アリールまたはヘテロアリール系、例えば、アリールトリフレートを使用して、ナトリウムtert-ブトキシドなどの塩基を加えたトルエンなどの溶媒中、Pd
2DBA
3/キサントホスなどのパラジウム触媒の存在下で、パラジウムカップリングにより置換基R
4を導入して、化合物(4)を得る。ステップDでは、例えば、EtOH/THFなどの極性溶媒中、H
2の存在下で、Pd/Cによる水素化分解により環X化合物(4)の保護基を除去して、化合物(5)を得る。最終ステップEでは、R
1を、例えば、式Cl-C(O)C(R
A)
C(R
B)
pもしくはCl-SO
2C(R
A)
C(R
B)
pを有する酸塩化物、または式C(R
B)
p
C(R
A)C(O)OC(O)C(R
A)
C(R
B)
pを有する無水物で処理することにより導入して、式Iの化合物を得る。式中、R
A、R
Bおよびpは、式Iで定義された通りである。例えば、R
1がアクリロイル基の場合には、この反応は、例えば、塩化メチレンなどの溶媒中、塩化アクリロイルまたはアクリロイル無水物およびヒューニッヒ塩基などの塩基の存在下で進行する。場合によっては、化学種R
4はまた、保護基を含むことがあるが、これは、合成手順のその後のステップで除去できる。
スキーム1について上記で示し、記載した化合物(1)、(2)、(3)、(4)および(5)は、式Iの化合物を調製するための中間体として有用であり、また、本発明のさらなる態様として提供される。
スキームII
Lが結合であり、-Y-R
2が水素以外であり、R
4がアリールまたはヘテロアリールである式Iの化合物は、スキームIIに従って調製できる。ステップAでは、適切に官能化したジヒドロピリドピリミジン(6)を、1つの求核性アミン種を含むヘテロ環とカップリングさせ、他方を保護基に結合させて、化合物(7)を得る。このカップリングは、ジクロロメタンなどの溶媒中、トリエチルアミンまたはヒューニッヒ塩基などの塩基の存在下で進行する。ステップBでは、求核試薬、例えば、ジオキサンなどの極性溶媒中で(S)-1-(ジメチルアミノプロパン)-2-オールによる塩素の置換により置換基-Y-R
2を導入し、化合物(8)を得る。ステップCでは、Boc基が、当該技術分野において公知の条件を使用して、例えば、ジクロロメタンなどの溶媒中でトリフルオロ酢酸を用いて除去され、化合物(9)が得られる。ステップDでは、好適な官能化アリールまたはヘテロアリール系、例えば、アリールトリフレートを使用して、ナトリウムtert-ブトキシドなどの塩基を加えたトルエンなどの溶媒中、Pd
2DBA
3/BINAPなどのパラジウム触媒の存在下で、パラジウムカップリングにより置換基R
4を導入して、化合物(10)を得る。ステップEでは、例えば、EtOH/THFなどの極性溶媒中、H
2の存在下でPd/Cによる水素化分解により環Xの保護基を除去して、化合物(11)を得る。ステップFでは、R
1を、例えば、式Cl-C(O)C(R
A)
C(R
B)
pもしくはCl-SO
2C(R
A)
C(R
B)
pを有する酸塩化物、または式C(R
B)
p
C(R
A)C(O)OC(O)C(R
A)
C(R
B)
pを有する無水物で処理することにより導入して、式Iの化合物を得る。式中、R
A、R
Bおよびpは、式Iで定義された通りである。例えば、R
1がアクリロイル基の場合には、この反応は、例えば、塩化メチレンなどの溶媒中、塩化アクリロイルアクリロイル無水物、およびヒューニッヒ塩基などの塩基の存在下で進行する。場合によっては、化学種R
4およびR
2はまた、保護基を含むことがあるが、これは、合成手順のその後のステップで除去できる。
スキーム2について上記で示し、記載した化合物(6)、(7)、(8)、(9)、(10)および(11)は、式I、式I-Aまたは式I-Bの化合物を調製するための中間体として有用であり、また、本発明のさらなる態様として提供される。
したがって、式Iの化合物の調製プロセスも提供され、当該プロセスは、
(a)Yは結合であり、R
2は水素である式Iの化合物のために、式5
(式中、X、R
3およびR
4は、式Iで定義された通り)の化合物を、式Cl-C(O)C(R
A)
C(R
B)
pもしくはCl-SO
2C(R
A)
C(R
B)
pを有する酸塩化物または式C(R
B)
p
C(R
A)C(O)OC(O)C(R
A)
C(R
B)
p(式中、R
A、R
Bおよびpは、式Iで定義された通り)を有する無水物と塩基の存在下で反応させること;または
(b)Lが結合であり、-Y-R
2が水素以外である式Iの化合物のために、式(11)
(式中、Lは結合であり、-Y-R
2は水素以外であり、X、R
3およびR
4は式Iで定義された通り)の化合物を、式Cl-C(O)C(R
A)
C(RB)pもしくはCl-SO
2C(R
A)
C(R
B)
pを有する酸塩化物、または式C(R
B)
p
C(R
A)C(O)OC(O)C(R
A)
C(R
B)
p(式中、R
A、R
Bおよびpは、式Iで定義された通り)を有する無水物と塩基の存在下で反応させること;および
所望により、式Iの化合物の塩を成形すること、を含む。
本発明の化合物は、1個以上のキラル中心を有し得、立体異性体混合物、同一の構成でそれらの原子の空間的配置が異なる異性体として合成され得る。化合物は、混合物として使用され得るか、または市販の試薬を使用して、および当業者によく知られた立体異性体およびエナンチオマーの従来の単離方法、例えば、CHIRALPAK(登録商標)(Sigma-Aldrich)またはCHIRALCEL(登録商標)(Diacel Corp)キラルクロマトグラフHPLCカラムを使用して、製造者の使用説明書に従って、個々の成分/異性体が分離され得る。あるいは、本発明の化合物は、個々の異性体またはエナンチオマーを調製するための光学的に純粋なキラル試薬および中間体を使用して合成され得る。特に明記しない限り、全てのキラル(エナンチオマーおよびジアステレオマー)およびラセミ体は、本発明の範囲内にある。特に明記しない限り、特許請求の範囲を含む本明細書が本発明の化合物に言及する際はいつでも、用語「化合物」は、全てのキラル(エナンチオマーおよびジアステレオマー)およびラセミ体を包含するものと理解されるべきである。
以下に示す実施例は、さらなる特定の本発明の実施形態を例示することを意図するものであり、本発明の範囲を限定するものではない。
中間体1
3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート
3-ヒドロキシナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート(13.101g、44.831mmol)をジクロロメタン(100mL)に溶解し、0℃で撹拌した。この溶液にクロロ(メトキシ)メタン(3.7456ml、49.315mmol)およびヒューニッヒ塩基(11.745mL、67.247mmol)を加えた。この反応物を0℃で4時間撹拌した。反応物を1M HClで分配し、飽和重炭酸ナトリウムで洗浄した。合わせた有機層を硫酸マグネシウム上で乾燥し、真空下で濃縮した。濃縮物質を120gのRediSep(登録商標)goldシリカゲルカラムにジクロロメタンと共にロードし、順相クロマトグラフィー(CombiFlash(登録商標)、溶出液:0%~20%酢酸エチル/ヘキサン)により精製して、3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート(11.785g、35.045mmol、78.171%収率)を得た。
中間体2
2-ブロモ-7-(メトキシメトキシ)ナフタレン
7-ブロモナフタレン-2-オール(2.0g、9.0mmol)のジメチルアセトアミド(40mL)中溶液に、クロロ(メトキシ)メタン(1.4g、18mmol)および炭酸セシウム(5.8g、18mmol)を加え、反応混合物を室温で一晩撹拌した。反応物を水で希釈し、水層を酢酸エチルで洗浄した。合わせた有機層を水およびブラインで洗浄し、硫酸マグネシウム上で乾燥し、真空下で濃縮した。粗製物を、5~50%酢酸エチル/ヘキサンを溶出液として使用した順相クロマトグラフィーで精製し、2-ブロモ-7-(メトキシメトキシ)ナフタレン(1.0g、3.7mmol、42%収率)を得た。
中間体3
2-ブロモ-1-フルオロ-3-(メトキシメチル)ベンゼン
2-ブロモ-3-フルオロフェノール(1422mg、7.445mmol)の22mLのテトラヒドロフラン中、窒素下、室温での撹拌溶液に、未希釈NaH(327.6mg、8.190mmol)を固体として何度かに分けて加えた。15分後、溶液が形成された。クロロ(メトキシ)メタン(678.6μL、8.934mmol)をシリンジで加えた。2時間撹拌後、反応を飽和塩化アンモニウム溶液でクエンチした後、酢酸エチル(30mL)と水(30mL)との間で分配した。合わせた有機層を単離し、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。最小限のジクロロメタン中の粗生成物をヘキサンで予め濡らした40グラムRediSep(登録商標)カラムにロードし、酢酸エチル/ヘキサン勾配液(0%→20%酢酸エチル)で溶出した。生成物を含む画分を合わせ、濃縮して、生成物を透明油として得た(1.45g、83%)。
中間体4
2-ブロモ-1-フルオロ-4-(メトキシメトキシ)ベンゼン
3-ブロモ-4-フルオロフェノール(327mg、1.71mmol)の5.1mLのテトラヒドロフラン中、窒素下、室温での撹拌溶液に、未希釈NaH(75.3mg、1.88mmol)を固体として何度かに分けて加えた。15分後、溶液が形成された。クロロ(メトキシ)メタン(156μL、2.05mmol)をシリンジで加えた。2時間撹拌後、反応を飽和塩化アンモニウム溶液でクエンチし、酢酸エチルと水との間で分配した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。最小限のジクロロメタン中の粗生成物をヘキサンで予め濡らした24グラムRediSep(登録商標)カラムにロードし、酢酸エチル/ヘキサン勾配液(0%→20%酢酸エチル)で溶出した。生成物を含む画分を合わせ、濃縮して、生成物を透明油として得た(120mg、29.8%)。
中間体5
4-ブロモ-5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール
4-ブロモ-5-メチル-1H-インダゾール(0.7g、3.3mmol)のジメチルアセトアミド(30mL)中、0℃に冷却した溶液に、NaH(0.19g、4.6mmol)を少しずつ分けて加え、反応混合物を窒素でパージした。反応物を20分間撹拌した後、(2-(クロロメトキシ)エチル)トリメチルシラン(0.83g、5.0mmol)を加え、反応物を2時間撹拌し、その間に室温まで温めた。水中に注ぎ込むことにより、反応物をクエンチし、水層を酢酸エチル中に抽出した。合わせた有機層を水およびブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。粗製物を、10~50%酢酸エチル/ヘキサンを溶出液として使用したクロマトグラフィーで精製し、4-ブロモ-5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール(0.87g、79%)を得た。
中間体6
(R)-1-(ピロリジン-1-イル)プロパン-2-オール
シールドチューブ中で、R-(+)-プロピレンオキシド(3.69mL、52.7mmol)を-78℃に冷却した後、無水ジメチルアミンで数分間スパージした。反応混合物を70℃に16時間加熱した。反応物を冷却し、減圧下で20分間濃縮し、(R)-1-(ピロリジン-1-イル)プロパン-2-オール(5.35g、41.4mmol、98.2%収率)を得た。
中間体7
(R)-1-モルホリノプロパン-2-オール
シールドチューブ中で、R-(+)-プロピレンオキシド(2.111mL、30.13mmol)およびモルホリン(1.490mL、17.22mmol)を、70℃に20時間加熱した。反応物を冷却し、減圧下で濃縮し、(R)-1-モルホリノプロパン-2-オール(2.47g、17.01mmol、98.80%収率)を得た。
中間体8
(R)-1-(ジメチルアミノ)ブタン-2-オール
シールドチューブ中で、R-(+)-プロピレンオキシド(4.00g、55.5mmol)およびジメチルアミン(1.00g、22.2mmol)を、65℃に18時間加熱した。反応物を冷却し、真空下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(DCM中0~12%MeOH)で精製し、(R)-1-(ジメチルアミノ)ブタン-2-オール(1.38g、11.8mmol、53.1%収率)を得た。
中間体9
(R)-1-((R)-3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-オール
シールドチューブ中で、R-(3)-メトキシピロリジン塩酸塩(1.00g、7.27mmol)、TEA(2.03mL、14.5mmol)およびR-(+)-プロピレンオキシド(1.27mL、18.2mmol)を、65℃に18時間加熱した。反応物を冷却し、真空下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(DCM中0~12%MeOH)で精製し、(R)-1-((R)-3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-オール(775mg、4.87mmol、67.0%収率)を得た。
中間体10
(R)-1-((S)-3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-オール
シールドチューブ中で、(S)-3-メトキシピロリジン塩酸塩(1.00g、7.27mmol)、TEA(2.03mL、14.5mmol)およびR-(+)-プロピレンオキシド(1.27mL、18.2mmol)を、65℃に18時間加熱した。反応物を冷却し、真空下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(DCM中0~12%MeOH)で精製し、(R)-1-((S)-3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-オール(781mg、4.90mmol、67.5%収率)を得た。
中間体11
(R)-1-((S)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-イル)プロパン-2-オール
シールドチューブ中で、R-(+)-プロピレンオキシド(0.609mL、8.69mmol)および(S)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン(1.00g、4.97mmol)を、70℃に20時間加熱した。反応物を冷却し、減圧下で濃縮して、(R)-1-((S)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-イル)プロパン-2-オール(1.29g、4.20mmol、84.6%収率)を得た。
中間体12
tert-ブチル 2-(ヒドロキシメチル)-4-メチルピペラジン-1-カルボキシレート
塩化リチウム(246mg、5.81mmol)および水素化ホウ素リチウム(126mg、5.81mmol)のエタノール(9mL)中の懸濁液に、窒素下、0℃で、1-(tert-ブチル) 2-メチル 4-メチルピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(750mg、2.90mmol)の乾燥THF(6mL)中溶液を滴加した。反応物を一晩撹拌し、白色沈殿物を形成した。沈殿物を濾過し、エタノールで洗浄した。合わせた濾液および有機抽出物を濃縮し、白色残留物を得て、これを酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層を飽和塩化ナトリウム溶液で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥して、減圧下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(無勾配のDCM中10%MeOH+0.2%NH4OH)で精製し、tert-ブチル 2-(ヒドロキシメチル)-4-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(104mg、0.452mmol、15.6%収率)を得た。
中間体13
(S)-2-(2-メチルピペリジン-1-イル)エタン-1-オール
(S)-2-メチルピペリジン(100mg、1.01mmol)、2-ブロモエタノール(78μL、139mg、1.11mmol、1.1当量)、ヨウ化ナトリウム(151mg、1当量)、炭酸カリウム(418mg、3当量)およびアセトニトリル(1mL)の4mLのバイアル中混合物を、窒素でパージし、密閉して室温で2日間撹拌した。反応混合物をジエチルエーテル(15mL)と水(2mL)との間で分配した。エーテル層をブライン(2mL)で洗浄し、TFAで酸性化後、高真空下で2日間乾燥した。残留物をエーテル(3mL)で洗浄し、水(0.5mL)希釈後、10MのNaOH(0.2mL)で塩基化した。層を分離させ、上層をNaOHで注意深く乾燥した。エーテル溶液を窒素下で留去し、粗製(S)-2-(2-メチルピペリジン-1-イル)エタン-1-オール(100mg、0.698mmol、69.24%収率)を無色油として得た。
中間体14
(R)-2-(2-メチルピペリジン-1-イル)エタン-1-オール
(S)-2-メチルピペリジンの代わりに、(R)-2-メチルピペリジン(99mg、1mmol)を使用して、中間体13の方法に従って合成した。
中間体15
(S)-2-(3-メトキシペピリジン-1-イル)エタン-1-オール
(S)-2-メチルピペリジンの代わりに、(S)-3-メトキシピペリジン(173mg、1.50mmol)を使用して、中間体13の方法に従って合成した。
中間体16
(R)-2-(3-メトキシペピリジン-1-イル)エタン-1-オール
(S)-2-メチルピペリジンの代わりに、(R)-3-メトキシピペリジン(173mg、1.50mmol)を使用して、中間体13の方法に従って合成した。
中間体17
3-(1,4-オキサゼパン-4-イル)プロパン-1-オール
ホモモルホリン(0.250g、2.472mmol)、アセトニトリル(4.943mL、2.472mmol)および3-ブロモ-1-プロパノール(0.2459mL、2.719mmol)をバイアルに加えた。炭酸カリウム(0.6832g、4.943mmol)を加え、混合物を50℃に温め、6時間撹拌した。混合物を周囲温度に冷却し、DCMで希釈し、濾過して、集めた固体をDCMで洗浄した。濾液を減圧下で濃縮し、粗製油をカラムクロマトグラフィー(Biotage Isolera、12g Isco RediSep Gold、10~20%MeOH/DCM+0.2%NH4OH)により精製して3-(1,4-オキサゼパン-4-イル)プロパン-1-オール(0.272g、1.708mmol)を無色油として得た。
中間体18
3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オール
ホモモルホリンの代わりに、(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン(0.250g、2.522mmol)を使用して、中間体17の方法に従って合成した。
中間体19
2-(4-メトキシペピリジン-1-イル)エタン-1-オール
(S)-2-メチルピペリジンの代わりに、4-メトキシピペリジン(173mg、1.50mmol)を使用して、中間体13の方法に従って合成した。
中間体20
2-(4,4-ジフルオロピペリジン-1-イル)エタン-1-オール
(S)-2-メチルピペリジンの代わりに、4,4-ジフルオロピペリジン塩酸塩(173mg、1.50mmol)を使用して、中間体13の方法に従って合成した。
中間体21
(S)-2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エタン-1-オール
(S)-2-メチルピペリジンの代わりに、S-3-フルオロピペリジン塩酸塩(209mg、1.50mmol)を使用して、中間体13の方法に従って合成した。
中間体22
ベンジル 4-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(メチルスルフィニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップA:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-(メチルチオ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:1-tert-ブチル 4-エチル 3-オキソピペリジン-1,4-ジカルボキシレート(50.0g、184mmol、1.00当量)のMeOH(1.00L)中、窒素下、25℃での撹拌溶液に、NaOMe(49.8g、921mmol、5.00当量)、続けて、2-メチルイソチオ尿素(62.4g、331mmol、1.80当量、H2SO4)を固体として加えた。この反応混合物を25℃で16時間撹拌した。反応混合物をHCl(2M)でpH5に調節し、混合物を減圧下で濃縮してMeOHを除去した。残留物を300mLの酢酸エチルおよび300mLの水に懸濁させ、高速で撹拌した。懸濁液を濾過し、白色固体を収集した。濾液を分離させ、有機層を水(1×300mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。合わせた有機層を単離し、Na2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮して、tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、138mmol、75.4%収率、81.0%純度)を白色固体として得て、これをさらに精製することなく次のステップで直接使用した。ESI MS m/z 298.2[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、171mmol、1.00当量)のDCM(500mL)中の0℃での撹拌懸濁液に、DIEA(44.3g、343mmol、59.9mL、2.00当量)、続けて、トリフルオロメタンスルホン酸無水物(72.6g、257mmol、42.4mL、1.50当量)を窒素下で加えた。直ちに褐色の溶液が形成された。25℃で16時間撹拌後、反応物を濃縮して褐色油を得た。褐色油をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0→10:1)で精製してtert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol、62.4%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 430.2[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol、1.00当量)のDMF(500mL)中の撹拌溶液に、DIEA(27.7g、214mmol、37.4mL、2.00当量)、続けて、ベンジルピペラジン-1-カルボキシレート(25.9g、117mmol、22.7mL、1.10当量)を加えた。反応物を窒素雰囲気下、100℃に1時間加熱した。反応混合物を酢酸エチル(300mL)中に注ぎ込み、H2O(300mL×3)およびブライン(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0→5:1)で精製してtert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、96.9mmol、90.5%収率、92%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 500.3[M+H]+。
ステップD:ベンジル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(25.0g、50.0mmol、1.00当量)のDCM(50.0mL)中溶液に、TFA(85.6g、750mmol、55.6mL、15.0当量)を加えた。25℃で1時間撹拌後、反応混合物を減圧下で濃縮した。残留物を300mLの酢酸エチルおよび300mLの水に溶解し、高速で撹拌した。混合物をNa2CO3でpH8に調節した。有機層を水(1×300mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮してベンジル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(19.0g、46.6mmol、93.2%収率、98.0%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 400.2[M+H]+。
ステップE:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(16.3g、52.1mmol、1.30当量)、ベンジル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0g、40.1mmol、1.00当量)、Cs2CO3(32.6g、100mmol、2.50当量)、Pd2(dba)3(5.50g、6.01mmol、0.15当量)および2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(3.74g、8.01mmol、0.20当量)のジオキサン(300mL)中混合物を、脱気と窒素によるパージを3回繰り返した。混合物を窒素雰囲気下、85℃で5時間撹拌した。0℃で水(200mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、酢酸エチル(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×150mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、減圧下濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=10/1→5/1)で精製してベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0g、22.8mmol、56.9%収率、90.0%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 632.5[M+H]+。
ステップF:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(8.00g、12.7mmol、1.00当量)のDCM(200mL)中撹拌溶液に、m-CPBA(2.73g、12.7mmol、80.0%純度、1.00当量)を窒素下、0℃で加えた。窒素雰囲気下、0℃で2時間撹拌後、0℃でNa2S2O3(10.0mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、水(100mL)で希釈し、DCM(200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=1/0→10/1)で精製してベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.50g、4.92mmol、38.8%収率、91.0%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 648.5[M+H]+。
中間体23
(R)-1-(4-(2-ヒドロキシプロピル)ピペラジン-1-イル)エタン-1-オン
ステップA:1-[4-[(2R)-2-ヒドロキシプロピル]ピペラジン-1-イル]エタノン:(2R)-2-メチルオキシラン(1.00g、17.2mmol、1.20mL、1.00当量)および1-ピペラジン-1-イルエタノン(8.00g、62.4mmol、3.62当量)をマイクロ波チューブに入れた。シールドチューブを150℃で1時間マイクロ波下で加熱した。混合物をDCM(80.0mL)に溶解し、(Boc)2O(3.62当量、13.6g)を加え、20℃で1時間撹拌した。残留物をカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH=100/1→10/1)で精製して1-[4-[(2R)-2-ヒドロキシプロピル]ピペラジン-1-イル]エタノン(3.80g、13.5mmol、78.2%収率、66.0%純度)を黄色油として得た。
中間体24
1-(ベンジルオキシ)-3-ブロモ-5-シクロプロピルベンゼン
ステップA:1-ベンジルオキシ-3,5-ジブロモベンゼン:3,5-ジブロモフェノール(1.50g、5.95mmol、1.00当量)およびK2CO3(2.47g、17.9mmol、3.00当量)のMeCN(30.0mL)中混合物に、ベンジルブロミド(1.07g、6.25mmol、742μL、1.05当量)を加え、反応混合物を80℃で2時間撹拌した。反応混合物を濾過、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:1)で精製して1-ベンジルオキシ-3,5-ジブロモベンゼン(1.60g、4.68mmol、78.6%収率)を無色油として得た。
ステップB:1-ベンジルオキシ-3-ブロモ-5-シクロプロピルベンゼン:1-ベンジルオキシ-3,5-ジブロモベンゼン(1.20g、3.51mmol、1.00当量)およびシクロプロピルボロン酸(392mg、4.56mmol、1.30当量)のH2O(4.00mL)およびジオキサン(20.0mL)中混合物に、Pd(dppf)Cl2(513mg、702μmol、0.20当量)およびCs2CO3(2.29g、7.02mmol、2.00当量)を加えた。反応混合物を、N2下、90℃で12時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)に加え、酢酸エチル(2×15mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:1)で精製して1-ベンジルオキシ-3-ブロモ-5-シクロプロピルベンゼン(270mg、890μmol、25.4%収率)を無色油として得た。
中間体25
ベンジル 4-(2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップA:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:3-モルホリノプロパン-1-オール(5.46g、37.6mmol、2.00当量)のTHF(100mL)中混合物に、NaH(2.26g、56.4mmol、60.0%純度、3.00当量)を0℃で少しずつ分けて加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌後、tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(10.0g、18.8mmol、1.00当量)のTHF(100mL)中溶液を加え、反応混合物をN2下、0℃で1.5時間撹拌した。混合物をNH4水溶液(300mL)中に注ぎ込み、DCM(2×200mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50:1→10:1)で精製してtert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(7.70g、12.8mmol、67.8%収率、98.8%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 597.4[M+H]+。
ステップB:ベンジル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(7.70g、12.9mmol、1.00当量)のDCM(80.0mL)中混合物に、TFA(119g、1.04mol、76.9mL、80.6当量)を加え、反応混合物を15℃で1時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、次いでDCM(100mL)で希釈し、NaOH水溶液でpH8に調節した。有機層を分離し、Na2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮して、ベンジル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(6.00g、11.2mmol、86.9%収率、92.8%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 497.4[M+H]+。
中間体26
4-(ベンジルオキシ)-2-ブロモ-1-フルオロベンゼン
3-ブロモ-4-フルオロフェノール(4.00g、20.9mmol、1.00当量)およびK2CO3(8.68g、62.8mmol、3.00当量)のACN(80.0mL)中溶液に、ベンジルブロミド(3.65g、21.4mmol、2.54mL、1.02当量)を加え、反応混合物を60℃で2時間撹拌した。反応混合物を濾過し、真空中で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル;勾配液1:0→10:1)で精製して、4-ベンジルオキシ-2-ブロモ-1-フルオロベンゼン(5.02g、17.0mmol、81.0%収率、95%純度)を白色固体として得た。
中間体27
2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エタン-1-オール
ステップA:tert-ブチル 3-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 3-ヒドロキシピロリジン-1-カルボキシレート(10.0g、53.4mmol、1.00当量)のDCM(150.00mL)中溶液に、ジエチルアミノサルファートリフルオリド(DAST)(12.9g、80.1mmol、10.6mL、1.50当量)を窒素雰囲気下、-40℃で加えた。-40℃で2時間撹拌後、混合物を20℃に温め、16時間撹拌した。混合物を5%重炭酸ナトリウム水溶液(200mL)中に注ぎ込み、ジクロロメタン(2×100mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100:1→5:1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮してtert-ブチル 3-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(4.30g、22.7mmol、42.6%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.27(t,J=3.6Hz,0.5H),5.13(t,J=3.6Hz,0.5H),3.77-3.38(m,4H),2.26-2.15(m,1H),2.08-1.85(m,1H),1.46(s,9H)。
ステップB:3-フルオロピロリジン:tert-ブチル 3-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(4.30g、22.7mmol、1.00当量)のDCM(50.00mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、35.0mL、6.16当量)を0℃で滴加した。混合物を20℃に温め、1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をジイソプロピルエーテル(20mL)を使用してトリチュレートし、沈殿物を濾過し、真空下で乾燥して、3-フルオロピロリジン(2.70g、21.5mmol、94.6%収率、HCl)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=5.51(t,J=3.6Hz,0.5H),5.38(t,J=3.6Hz,1H),3.66-3.27(m,5H),2.45-2.12(m,2H)。
ステップC:メチル 2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)アセテート:3-フルオロピロリジン(2.70g、21.5mmol、1.00当量、HCl)のDCM(27.00mL)中の懸濁液を0℃に冷却した。トリエチルアミン(5.44g、53.8mmol、7.45mL、2.50当量)およびメチル 2-ブロモ酢酸(3.62g、23.7mmol、2.23mL、1.10当量)を加え、反応混合物を20℃で16時間撹拌した。反応混合物をCH2Cl2(100mL)および水(50mL)で希釈した。有機層を5%クエン酸水溶液(1×50mL)で洗浄した。水層を飽和炭酸ナトリウム水溶液(20mL)で塩基化し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥して、減圧下で濃縮して、メチル 2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)アセテート(2.20g、13.7mmol、63.5%収率)を得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.22-5.02(m,1H),3.66(s,3H),3.35(s,2H),3.07-2.93(m,1H),2.91-2.77(m,2H),2.67(dt,J=5.2,8.4Hz,1H),2.21-1.93(m,2H)。
ステップD:2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エタノール:LiAlH4(706mg、18.6mmol、1.50当量)のTHF(20mL)中溶液に、メチル 2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)アセテート(2.00g、12.4mmol、1.00当量)のTHF(10mL)中溶液を0℃で滴加した。混合物を20℃まで温め、3時間撹拌した。混合物を飽和硫酸ナトリウム水溶液(1mL)でクエンチした。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。生成物をシリカゲルクロマトグラフィーにより、DMC中5%MeOHを使用して精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エタノール(1.20g、9.01mmol、72.6%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.28-5.05(m,1H),3.68-3.61(m,2H),2.99-2.73(m,4H),2.72-2.67(m,2H),2.58-2.45(m,1H),2.28-1.97(m,2H)。
中間体28
1-(tert-ブチル)3-メチルピペラジン-1,3-ジカルボキシレート
ステップA:メチルピペラジン-2-カルボキシレート:1-tert-ブチル 2-メチルピペラジン-1.2-ジカルボキシレート(5.0g、22.6mmol、1.00当量)のMeOH(50.0mL)中混合物に、HCl/ジオキサン(4.0M、134mL)を加えた。反応混合物に対し、脱気と窒素によるパージを3回行い、混合物を窒素雰囲気下、25℃で12時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固して、メチルピペラジン-2-カルボキシレート(4.89g、2HCl、粗製)を白色固体として得て、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップB:1-(tert-ブチル)3-メチルピペラジン-1,3-ジカルボキシレート:メチルピペラジン-2-カルボキシレート(4.30g、粗製)およびTEA(8.02g、79.2mmol、11.0mL)のMeOH(50.0mL)中溶液にジ-tert-ブチルジカルボネート(4.32g、19.8mmol、4.55mL)を添加した。25℃で12時間撹拌後、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=1:0→20:1)で精製して1-(tert-ブチル) 3-メチルピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(4.80g、19.7mmol、2ステップで99.0%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.10-3.85(m,1H),3.73(s,3H),3.71-3.65(m,1H),3.47-3.38(m,1H),3.10-2.98(m,2H),2.78-2.66(m,1H),2.17(s,1H),1.46(s,9H)。
ステップA:2,4-ジブロモナフタレン-1-アミン:Br2(246g、1.54mmol、79.3mL、2.18当量)のAcOH(750mL)中溶液に、ナフタレン-1-アミン(101g、705mmol、99.0mL、1.00当量)のAcOH(500mL)中溶液を周囲温度で加え、反応物を70℃で1時間撹拌した。反応混合物を、室温で冷却し、濾過した。濾過ケーキをAcOH(300mL)で洗浄し、次いで20%のNaOH水溶液(1.2L)に加えた。混合物を20分間撹拌し、濾過した。単離した固体を水(1L)で洗浄し、真空下で乾燥して2,4-ジブロモナフタレン-1-アミン(200g、664mmol、94.2%収率)を灰色固体として得た。ESI MS m/z 301.9[M+H]+。
ステップB:4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート:2,4-ジブロモナフタレン-1-アミン(60.0g、199mmol、1.00当量)のAcOH(900mL)およびプロピオン酸(150mL)中溶液に、NaNO2(16.5g、239mmol、13.0mL、1.20当量)を5~8℃で30分間かけて何度かに分けて加え、その後、反応混合物を5~8℃で30分間撹拌した。反応混合物を氷水(4000mL)中に注ぎ込み、得られた固体を集め、水(2×50mL)で洗浄して、4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート(150g、湿潤粗製物)を灰色固体として得て、これを直接に次のステップで使用した。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.12-8.10(d,J=8.4Hz,1H),7.62-7.58(t,J=7.6Hz,1H),7.41-7.37(t,J=7.6Hz,1H),7.31-7.29(d,J=8.0Hz,1H),7.20(s,1H)。
ステップC:4-ブロモナフタレン-2-オール:4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート(100g、402mmol、1.00当量)のEtOH(2.00L)中溶液に、NaBH4(30.4g、803mmol、2.00当量)を13~15℃で1時間かけて何度かに分けて加え、反応混合物を15~18℃で3時間撹拌した。反応物を濾過し、濃縮乾固した。残留物をDCM(1000mL)に溶解し、水(500mL×2)で洗浄した。有機相をNa2SO4上で乾燥させて、濃縮乾固した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフにより、ジエチルエーテル/酢酸エチル(60:1→10:1)で溶出して精製した。単離生成物を、逆相HPLCでさらに精製して、4-ブロモナフタレン-2-オール(40.0g、139mmol、17.3%収率、77.4%純度)を灰色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.07-8.05(d,J=8.0Hz,1H),7.60-7.58(d,J=7.6Hz,1H),7.41-7.36(m,3H),7.07(s,1H)。
ステップD:3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン:4-ブロモナフタレン-2-オール(30.0g、134mmol、1.00当量)、ベンジルブロミド(25.3g、148mmol、17.6mL、1.10当量)およびK2CO3(55.7g、403mmol、3.00当量)のMeCN(500mL)中混合物を、80℃で1時間加熱した。反応混合物を濾過し、濃縮乾固した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより、ジエチルエーテル/酢酸エチル(100:1→60:1)で溶出して精製し、3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-ナフタレン(40.0g、128mmol、95%収率)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.19-8.17(d,J=8.0Hz,1H),7.75-7.32(d,J=8.8Hz,1H),7.64-7.63(d,J=2.4Hz,1H),7.52-7.37(m,7H),7.23-7.21(d,J=2.0Hz,1H),5.2(s,2H)。
中間体30
3-メトキシナフタレン-1-イル トリフルオロメタンスルホネート
ステップA:3-メトキシナフタレン-1-オール:ナフタレン-1,3-ジオール(3.00g、18.7mmol、1.00当量)のMeOH(60.0mL)中溶液に、HCl/MeOH(4M、60.0mL、12.8当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で60時間撹拌した。真空下で溶媒を除去した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=10:1→5:1)で精製して、3-メトキシナフタレン-1-オール(2.10g、12.1mmol、64.4%収率)を褐色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3-d6)δ=8.10-8.08(d,J=8.4Hz,1H).7.73-7.71(d,J=8.4Hz,1H),7.47-7.45(m,1H),7.38-7.35(m,1H),6.80-6.79(d,J=2.0Hz,1H),6.56-6.55(d,J=2.4Hz,1H),3.92(s,3H)。
ステップB:(3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート:3-メトキシナフタレン-1-オール(2.10g、12.0mmol、1.00当量)のDCM(40.0mL)中溶液に、DIEA(7.79g、60.3mmol、10.5mL、5.00当量)およびトリフルオロメタンスルホン酸無水物(5.10g、18.1mmol、2.98mL、1.50当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物をDCM(30mL)および水(10mL)で希釈し、DCM(20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=20:1→10:1)で精製して、(3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(3.00g、8.52mmol、70.7%収率、87.0%純度)を褐色油として得た。ESI MS m/z 307.1[M+H]+。
中間体31
7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン
ステップA:7-ベンジル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール:EtOH(600mL)に、Na(5.56g、241mmol、5.73mL、2.40当量)を少しずつ加えた。反応混合物を1時間撹拌した。この混合物に、エチル 1-ベンジル-3-オキソピペリジン-4-カルボキシレート(30.0g、100mmol、1.00当量、HCl)および尿素(14.5g、242mmol、13.0mL、2.40当量)を加えた。反応混合物を75℃で36時間撹拌し、次いで真空下で溶媒を除去した。残留物を水(50mL)に溶解し、HCl(120mL、2M)で酸性化した。溶液から沈殿した白色固体を濾過により収集した。濾過ケーキを真空下で乾燥し、7-ベンジル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(22.0g、83.8mmol、83.2%収率、98%純度)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=10.97(br s,1H),10.66(br s,1H),7.55-6.95(m,5H),3.81-3.50(m,2H),3.26-2.91(m,2H),2.77-2.58(m,2H),2.34-2.09(m,2H)。
ステップB:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:DIEA(30.1g、233mmol、40.7mL、3.00当量)のPOCl3(330g、2.15mmol、200mL)中溶液に、7-ベンジル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(20.0g、77.7mmol、1.00当量)を加えた。この反応混合物を110℃で5時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をDCM(400mL)に溶解し、飽和NaHCO3(200mL)中に注ぎ込んだ。混合物をDCM(2×400mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:DCM=10:1→0:1)で精製して、7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(7.70g、26.2mmol、33.7%収率)を褐色油として得た。1H NMR(300MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.28(m,5H),3.73(s,2H),3.66(br s,2H),2.84(br s,4H)。
中間体32
tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-(メチルスルホニル)-5,6-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(8H)-カルボキシレート
ステップA:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:1-tert-ブチル 4-エチル-3-オキソピペリジン-1,4-ジカルボキシレート(44.0g、162mmol、1.00当量)のMeOH(1.00mL)中、窒素下、25℃での撹拌溶液に、NaOMe(35.0g、649mmol、4.00当量)のMeOH(600mL)中溶液をシリンジで加え、続けて、2-メチルイソチオ尿素(61.1g、324mmol、2.00当量、H2SO4)を加えた。25℃で16時間撹拌後、反応混合物を減圧下で濃縮し、MeOHを除去した。残留物を500mLの酢酸エチルおよび500mLの水に懸濁させ、高速で撹拌した。反応混合物をHCl(2M)でpH5に調節した。沈殿物を濾過し、白色固体を酢酸エチルで洗浄し、真空下で乾燥して、tert-ブチル4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(33.0g、103mmol、63.8%収率、93.2%純度)を白色固体として得て、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=4.19(s,2H),3.49(br s,2H),2.46(s,3H),2.35(br t,J=5.2Hz,2H),1.42(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(15.0g、50.4mmol、1.00当量)のDCM(200mL)中の撹拌懸濁液に、DIEA(26.1g、202mmol、35.2mL、4.00当量)を窒素下、0℃で加え、続けて、トリフルオロメタンスルホン酸無水物(28.5g、101mmol、16.6mL、2.00当量)をシリンジにより加えた。直ちに褐色の溶液が形成された。この反応混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0→10:1)で精製してtert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(16.7g、35.7mmol、70.9%収率、91.9%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 374.0[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(16.7g、38.9mmol、1.00当量)のDCM(100mL)中撹拌溶液に、DIEA(10.0g、77.9mmol、2.00当量)およびベンジル ピペラジン-1-カルボキシレート(9.41g、42.8mmol、1.10当量)を加えた。反応物を100℃に加熱し、窒素雰囲気下で1時間撹拌した。反応混合物を水(150mL)で希釈し、反応混合物をHCl(2M)でpH5に調節し、DCM(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和NaHCO3(3×150mL)、ブライン(3×150mL)およびH2O(3×150mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(18.1g、36.2mmol、93.0%収率、94.1%純度)を黄色固体として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ESI MS m/z 500.1[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2- メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(14.4g、28.9mmol、1.00当量)のDCM(150mL)中の窒素下、0℃での撹拌溶液に、メタ-クロロペルオキシ安息香酸(17.4g、101mmol、3.50当量)を固体として加えた。窒素雰囲気下、0℃で2時間撹拌後、反応混合物を水(300mL)で希釈し、反応混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH8に調節し、DCM(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、減圧下濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10:1→1:2)で精製して、tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(11.0g、19.7mmol、68.6%収率、95.4%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 532.1[M+H]+。
中間体33
tert-ブチル(1-ブロモイソキノリン-3-イル)カルバメート
ステップA:1-ブロモイソキノリン-3-アミン(400mg、1.79mmol、1.00当量)およびtert-ブトキシカルボニル tert-ブチルカーボネート(3.91g、17.9mmol、4.12mL、10.0当量)の混合物を70℃で16時間撹拌した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、ジエチルエーテル/酢酸エチル=5:1)で精製して、tert-ブチル N-(1-ブロモ-3-イソキノリル)カルバメート(400mg、1.24mmol、69.2%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 322.1、324.1[M+H]+。
中間体34
3-メトキシ-6-メチルナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート
ステップA:3-メトキシナフタレン-1-オール:ナフタレン-1,3-ジオール(40.0g、250mmol、1.00当量)のMeOH(800mL)中溶液に、HCl(4M、750mL、12.0当量、MeOH中の4M)を0℃で加えた。混合物を18℃まで温め、30時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→1/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、3-メトキシナフタレン-1-オール(17.7g、96.5mmol、38.6%収率、95%純度)を赤色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.17(d,J=8.4Hz,1H),7.74(d,J=8.0Hz,1H),7.50(ddd,J=1.2,6.8,8.0Hz,1H),7.38(ddd,J=1.2,6.8,8.0Hz,1H),6.81(d,J=2.0Hz,1H),6.76(br s,1H),6.62(d,J=2.4Hz,1H),3.91(s,3H)。
ステップB:tert-ブチル-[(3-メトキシ-1-ナフチル)オキシ]ジメチルシラン:3-メトキシナフタレン-1-オール(20.0g、115mmol、1.00当量)およびイミダゾール(23.5g、344mmol、3.00当量)のTHF(400mL)中の溶液に、TBSCl(26.0g、172mmol、21.1mL、1.50当量)を0℃で滴加した。混合物を25℃まで温め、16時間撹拌した。混合物を石油エーテル(600mL)および酢酸エチル(200mL)で希釈し、次いで、水(1×200mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→10/1)で精製した。tert-ブチル-[(3-メトキシ-1-ナフチル)オキシ]ジメチル-シラン(28.0g、97.1mmol、84.6%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.01(d,J=8.4Hz,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.35(dt,J=1.2,7.6Hz,1H),7.24(dt,J=1.2,7.6Hz,1H),6.71(d,J=2.0Hz,1H),6.48(d,J=2.4Hz,1H),3.82(s,3H),1.02(s,9H),0.23(s,6H)。
ステップC:tert-ブチル[[3-メトキシ-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1-ナフチル]オキシ]ジメチルシランおよびtert-ブチル((3-メトキシ-7-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ナフタレン-1-イル)オキシ)ジメチルシラン:tert-ブチル[(3-メトキシ-1-ナフチル)オキシ]ジメチルシラン(26.0g、90.1mmol、1.00当量)、4,4,5,5-テトラメチル-2-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,3,2-ジオキサボロラン(45.8g、180mmol、2.00当量)、(1Z,5Z)-シクロオクタ-1,5-ジエン;2,4-ジメチル-ブラービシクロ[1.1.0]ブタン(2.39g、3.61mmol、0.04当量)および4-tert-ブチル-2-(4-tert-ブチル-2-ピリジル)ピリジン(1.45g、5.41mmol、0.06当量)のヘキサン(500mL)中混合物を、窒素雰囲気下、100℃で16時間撹拌した。混合物を、水(500mL)および酢酸エチル(1000mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×500mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→10/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、tert-ブチル[[3-メトキシ-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1-ナフチル]オキシ]ジメチルシランおよびtert-ブチル((3-メトキシ-7-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ナフタレン-1-イル)オキシ)ジメチルシランの混合物(38.0g、85.3mmol、94.6%収率、93%純度)を淡黄色油として得た。ESI MS m/z 415.5[M+H]+。
ステップD:8-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-6-メトキシ-ナフタレン-2-オール:tert-ブチル[[3-メトキシ-6-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1-ナフチル]オキシ]-ジメチル-シランおよびtert-ブチル((3-メトキシ-7-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ナフタレン-1-イル)オキシ)ジメチルシランの混合物(36.0g、86.9mmol、1.00当量)のアセトン(400mL)中の溶液に、オキソン(58.7g、95.6mmol、1.10当量)のH2O(400mL)中の溶液を0℃で加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。混合物を5%チオ硫酸ナトリウム水溶液(50mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×300mL)で抽出した。抽出物を合わせて、水(1×200mL)、ブライン(1×200mL)で洗浄し、硫酸マグネシウム上で乾燥し、濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 200/1→20/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、8-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-6-メトキシ-ナフタレン-2-オール(9.00g、28.4mmol、32.7%収率、96%純度)を無色油として、および5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-ナフタレン-2-オール(9.00g、29.0mmol、33.4%収率、98%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 305.2[M+H]+。
ステップE:[5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-2-ナフチル]トリフルオロメタンスルホネート:5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-ナフタレン-2-オール(11.0g、36.1mmol、1.00当量)およびDIEA(14.0g、108mmol、18.9mL、3.00当量)のDCM(150mL)中溶液に、Tf2O(12.2g、43.4mmol、7.15mL、1.20当量)を-40℃で滴加した。混合物を1時間撹拌した。混合物をジクロロメタン(200mL)で希釈し、水(1×200mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→10/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、[5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-2-ナフチル]トリフルオロメタンスルホネート(13.0g、29.8mmol、82.4%収率、100%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 436.9[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル[(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)オキシ]ジメチルシラン:[5-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ-7-メトキシ-2-ナフチル]トリフルオロメタンスルホネート(12.5g、28.6mmol、1.00当量)およびK2CO3(11.9g、85.9mmol、3.00当量)のジオキサン(160mL)中溶液に、Pd(PPh3)4(3.31g、2.86mmol、0.10当量)およびトリメチルボロキシン(14.4g、57.3mmol、16.0mL、2.00当量)を窒素雰囲気下で加えた。反応物を100℃に16時間加熱した。混合物を酢酸エチル(200mL)で希釈し、次いで水(1×200mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→5/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、tert-ブチル[(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)オキシ]ジメチルシラン(8.00g、24.6mmol、85.9%収率、93%純度)を無色油として赤色固体として得た。ESI MS m/z 303.2[M+H]+。
ステップG:3-メトキシ-6-メチル-ナフタレン-1-オール:tert-ブチル-[(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)オキシ]ジメチルシラン(8.00g、26.5mmol、1.00当量)のTHF(100mL)中溶液に、TBAF(10.4g、39.7mmol、1.50当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で3時間撹拌した。混合物を、水(100mL)および酢酸エチル(200mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 50/1→5/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、3-メトキシ-6-メチル-ナフタレン-1-オール(4.70g、25.0mmol、94.4%収率)を赤色固体として得た。ESI MS m/z 188.4[M+H]+。
ステップH:3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチルトリフルオロメタンスルホネート:3-メトキシ-6-メチル-ナフタレン-1-オール(4.70g、25.0mmol、1.00当量)およびDIEA(9.68g、74.9mmol、13.1mL、3.00当量)のDCM(3.00mL)中溶液に、Tf2O(8.45g、30.0mmol、4.94mL、1.20当量)を-40℃で滴加した。混合物を1時間撹拌した。混合物をジクロロメタン(200mL)で希釈し、水(1×200mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→10/1)で精製した。3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチルトリフルオロメタンスルホネート(7.70g、24.0mmol、96.2%収率、99.9%純度)を無色油として得た。ESI MS m/z 320.7[M+H]+。
次の中間体は、2-ブロモ-3-フルオロフェノールを適切なフェノールで置換して、中間体3の調製に従って調製した。
中間体44
2-ブロモ-3-フルオロ-1-(メトキシメトキシ)-4-メチルベンゼン
ステップ1:3-フルオロ-4-メチルフェノール(1.016g、8.055mmol)を、Cs2(3.9mL、64.44mmol)中に入れ、0oCに冷却した。Br2(0.4150mL、8.055mmol)を加え、混合物を室温で2時間撹拌した。10%のNa2S2O2を加え、混合物をDCMで抽出した。有機層を合わせ、乾燥、濾過して、2-ブロモ-3-フルオロ-4-メチルフェノール(1.389g、6.775mmol、84.10%収率)を得て、これを次のステップに直接使用した。
ステップ2:2-ブロモ-3-フルオロフェノールの代わりに2-ブロモ-3-フルオロ-4-メチルフェノールを使用して、中間体8の手順に従って2-ブロモ-3-フルオロ-1-(メトキシメトキシ)-4-メチルベンゼンを調製した。
中間体45
2-ブロモ-1-イソプロポキシ-4-(メトキシメトキシ)ベンゼン
ステップ1:4-イソプロポキシフェノール(1.00g、6.57mmol)およびTEA(1.83mL、13.1mmol)をDCM(25mL)中に入れた。アセチルクロリド(7.56mL、7.56mmol)を滴加し、反応物を室温で2時間撹拌した。水を加え、混合物をDCMで抽出した。有機層を乾燥後、濾過、濃縮して、4-イソプロポキシフェニルアセテート(1.24g、6.38mmol、97.2%収率)を得て、これを次のステップに直接使用した。
ステップ2:4-イソプロポキシフェニルアセテート(1.24g、6.585mmol)をACN(20mL)中に入れ、N-ブロモスクシンイミド(1.173g、6.590mmol)を加えた。混合物を18時間撹拌した。水を加え、混合物をエーテルで抽出した。有機層を合わせ、乾燥、濃縮して、3-ブロモ-4-イソプロポキシフェニルアセテート(1.584g、5.800mmol、88.00%収率)を得て、これを次のステップに直接使用した。
ステップ3:3-ブロモ-4-イソプロポキシフェニルアセテート(500mg、1.83mmol)をMeOH(7mL)中に入れた。KOH(111mg、1.98mmol)の水(2mL)中溶液を、混合物に加え、室温で1時間撹拌した。反応混合物を1N HClを加えてpH3に調節した。混合物をDCMで抽出した。抽出物を合わせ、乾燥、濾過、濃縮して、粗製3-ブロモ-4-イソプロポキシフェノールを得て、これを直接次の反応に使用した。
ステップ4:2-ブロモ-3-フルオロフェノールの代わりに3-ブロモ-4-イソプロポキシフェノールを使用して、中間体8の手順に従って、2-ブロモ-1-イソプロポキシ-4-(メトキシメトキシ)ベンゼンを調製した。
中間体46
1-ブロモ-3-クロロ-2-イソプロピル-5-(メトキシメトキシ)ベンゼン
ステップ1:1-ブロモ-3-クロロ-2-イソプロピル-5-メトキシベンゼン(952mg、3.61mmol)をDCM(3mL)中に入れ、0℃に冷却した。BBr3(9030μL、9.03mmol)を加え、反応物を0℃で2時間撹拌した。水を加え、混合物をDCMで抽出した。抽出物を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(ヘキサン中0~20%EtOAc)で精製し、3-ブロモ-5-クロロ-4-イソプロピルフェノール(575mg、2.30mmol、63.8%収率)を得た。
ステップ2:2-の代わりに3-ブロモ-5-クロロ-4-イソプロピルフェノールを使用して、中間体8の手順に従って、1-ブロモ-3-クロロ-2-イソプロピル-5-(メトキシメトキシ)ベンゼンを調製した。
中間体47
1-ヨード-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン
4-ヨードナフタレン-2-オール(0.80g、3.0mmol)のDCM(20mL)中溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(1.1mL、5.9mmol)およびクロロ(メトキシ)メタン(0.29g、3.6mmol)を加え、反応物を室温で4時間撹拌した。この撹拌中、2時間後に、追加のクロロ(メトキシ)メタン(0.15g)を加えた。反応物をブラインで洗浄し、減圧下で濃縮した。この物質を、0→10%EtOAc/ヘキサンの勾配液を溶出液として使用してクロマトグラフィーで精製し、1-ヨード-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン(0.80g、2.5mmol、86%収率)を得た。
中間体48
3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン
ステップA:2,4-ジブロモナフタレン-1-アミン:Br
2(246g、1.54mmol、79.3mL)のAcOH(750mL)中溶液に、ナフタレン-1-アミン(101g、705mmol、99.0mL)のAcOH(500mL)中溶液を室温で加え、反応物を70℃で1時間撹拌した。反応混合物を、室温に冷却し、濾過した。濾過ケーキをAcOH(300mL)で洗浄した。次に、その固体を20%のNaOH水溶液(1.2L)中に懸濁させた。混合物を20分間撹拌し、濾過した。固体を水(1L)で洗浄し、真空下で乾燥して2,4-ジブロモナフタレン-1-アミン(200g、664mmol、94.2%収率)を灰色固体として得た。ES+APCI MS m/z 301.9[M+H]
+。
ステップB:4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート:2,4-ジブロモナフタレン-1-アミン(60.0g、199mmol)のAcOH(900mL)およびプロピオン酸(150mL)中溶液に、NaNO
2(16.5g、239mmol、13.0mL)を5~8℃で30分間かけて何度かに分けて加え、反応混合物を5~8℃で30分間撹拌した。反応混合物を氷水(4000mL)中に注ぎ込み、スラリーを濾過し、固体を水(2×50mL)で洗浄して、4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート(150g、湿潤粗製物)を得て、これを次のステップで粗製物として直接使用した。
1H NMR(400MHz,CDCl
3)δ8.12-8.10(d,J=8.4Hz,1H),7.62-7.58(t,J=7.6Hz,1H),7.41-7.37(t,J=7.6Hz,1H),7.31-7.29(d,J=8.0Hz,1H),7.20(s,1H)。
ステップC:4-ブロモナフタレン-2-オール:4-ブロモ-1-ジアゾニオ-ナフタレン-2-オレート(100g、402mmol)のEtOH(2.00L)中溶液に、NaBH
4(30.4g、803mmol)を13~15℃で1時間かけて何度かに分けて加え、反応物を15~18℃で3時間撹拌した。反応物を濾過し、濃縮乾固した。残留物をDCM(1000mL)に溶解し、水(500mL×2)で洗浄した。有機成分をNa
2SO
4上で乾燥させて、濃縮乾固した。残留物を、石油エーテル/EtOAc(60/1→10/1)で溶出するクロマトグラフィーで精製し、物質を逆相HPLCで再精製して、4-ブロモナフタレン-2-オール(40.0g、139mmol、17.3%収率、77.4%純度)を灰色固体として得た。
1H NMR(400MHz,CDCl
3)δ8.07-8.05(d,J=8.0Hz,1H),7.60-7.58(d,J=7.6Hz,1H),7.41-7.36(m,3H),7.07(s,1H)。
ステップD:3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン:4-ブロモナフタレン-2-オール(30.0g、134mmol)、BnBr(25.3g、148mmol、17.6mL)およびK2CO3(55.7g、403mmol)のMeCN(500mL)中混合物を、80℃で1時間加熱した。反応混合物を濾過し、濃縮乾固した。残留物を、PE/EA(100/1→60/1)で溶出するシリカゲルカラムにより精製して、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(40.0g、128mmol、95%収率)を得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.19-8.17(d,J=8.0Hz,1H),7.75-7.32(d,J=8.8Hz,1H),7.64-7.63(d,J=2.4Hz,1H),7.52-7.37(m,7H),7.23-7.21(d,J=2.0Hz,1H),5.2(s,2H)。
中間体49
ベンジル 4-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(メチルスルフィニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップA:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:1-tert-ブチル 4-エチル 3-オキソピペリジン-1,4-ジカルボキシレート(50.0g、184mmol)のMeOH(1.00L)中の溶液に、窒素下で、NaOMe(49.8g、921mmol)および2-メチルイソチオ尿素(62.4g、331mmol、H
2SO
4)を加えた。この反応混合物を25℃で16時間撹拌した。pHが約5になるまで、反応混合物にHCl(2M)を加えた後、混合物を減圧下濃縮した。残留物を300mLの酢酸エチルおよび300mLの水に懸濁させた。懸濁液を濾過した。有機相を水(1×300mL)、ブライン(1×200mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、138mmol、75.4%収率、81.0%純度)を得て、これを直接次の反応に使用した。ES+APCI MS m/z 298.2[M+H]
+。
ステップB:tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、171mmol)のDCM(500mL)中溶液に、DIEA(44.3g、343mmol、59.9mL)およびTf
2O(72.6g、257mmol、42.4mL)を窒素下、0℃で順次加えた。反応混合物を25℃まで温め、16時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、残留物をEtOAc/石油 0→10%で溶出するカラムクロマトグラフィーで精製して、tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol、62.4%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 430.2[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol)のDMF(500mL)中溶液に、DIEA(27.7g、214mmol、37.4mL)およびベンジルピペラジン-1-カルボキシレート(25.9g、117mmol、22.7mL)を加えた。反応物をN
2雰囲気下、100℃に1時間加熱した。反応混合物を酢酸エチル(300ml)に注ぎ込んだ。混合物をH
2O(300mL×3)で洗浄した。有機相をブライン(200mL)で洗浄し、無水Na
2SO
4上で乾燥させ、減圧下で濃縮した。残留物を、0→20%EtOAc/石油を溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、96.9mmol、90.5%収率、92.0%純度)を得た。ES+APCI MS m/z 500.3[M+H]
+。
ステップD:ベンジル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(25.0g、50mmol)のDCM(50mL)中溶液に、TFA(85.6g、750mmol、55.6mL)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮し、残留物を300mLの酢酸エチルおよび300mLの水に溶解し、pHが約8になるまでNa
2CO
3を加えた。有機層を水(1×300mL)、ブライン(1×200mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、ベンジル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートを得た。この生成物は、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 400.2[M+H]
+。
ステップE:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(16.3g、52.1mmol)、ベンジル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0g、40.1mmol)、Cs
2CO
3(32.6g、100mmol)、Pd
2(dba)
3(5.50g、6.01mmol)およびRuPhos(3.74g、8.01mmol)のジオキサン(300mL)中混合物を、脱気とN
2によるパージを3回繰り返し、混合物をN
2雰囲気下、85℃で5時間撹拌した。0℃で水(200mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、EtOAc(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×150mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥後、濾過し、減圧下濃縮した。残留物を、10→20%MeOH/DCMで溶出するカラムクロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0g、22.8mmol、56.9%収率、90.0%純度)を得た。ES+APCI MS m/z 632.5[M+H]
+。
ステップF:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(8.00g、12.7mmol)のDCM(200mL)中溶液に、m-CPBA(2.73g、12.7mmol、80.0%純度)を窒素雰囲気下、0℃で加えた。反応混合物を0℃で2時間撹拌した。0℃でNa2S2O3(10mL)を加えることにより反応混合物をクエンチした後、水(100mL)で希釈し、DCM(200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を、0→10%MeOH/DCMで溶出するカラムクロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.50g、4.92mmol、38.8%収率、91.0%純度)を得た。ES+APCI MS m/z 648.5[M+H]+。
中間体50
tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート
ステップA:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(14.4g、28.9mmol)のDCM(150mL)中の撹拌溶液に、m-CPBA固体(17.4g、101mmol)を窒素下、0℃で加えた。0℃で2時間撹拌後、反応混合物を水(300mL)で希釈し、飽和NaHCO3水溶液で約pH8に塩基化した後、DCM(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10/1→1/2)で精製して、tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(11.0g、19.7mmol、68.6%収率、95.4%純度)を得た。ES+APCI MS m/z 532.1[M+H]+。
中間体51
4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール
ステップA:4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール:4-ブロモ-5-メチル-1H-インダゾール(3g、14.2mmol)および3,4-ジヒドロ-2H-ピラン(2.39g、28.4mmol、2.60mL)のDCM(30mL)中混合物に、TsOH・H2O(270mg、1.42mmol)を加え、混合物を15℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮し、残留物を、5→20%EtOAc/石油エーテルを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(4g、13.6mmol、95.3%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.01(s,1H),7.47(d,J=8.4Hz,1H),7.25(d,J=8.4Hz,1H),5.70(dd,J=2.8,9.2Hz,1H),4.05-3.96(m,1H),3.79-3.70(m,1H),2.66-2.44(m,4H),2.25-2.04(m,2H),1.84-1.56(m,3H)。
中間体52
4-ブロモ-5-メトキシ-1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-インダゾール
中間体51の後、ステップAで4-ブロモ-5-メチル-1H-インダゾールの代わりに4-ブロモ-5-メトキシ-1H-インダゾールを使用して、4-ブロモ-5-メトキシ-1-(テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-インダゾールを調製した。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.00(s,1H),7.53(d,J=9.2Hz,1H),7.16(d,J=9.2Hz,1H),5.70(dd,J=2.8,9.2Hz,1H),4.04-3.98(m,1H),3.96(s,3H),2.55-2.49(m,1H),2.23-2.05(m,2H),1.83-1.69(m,3H)。
中間体53
3-(ベンジルオキシ)-1-ブロモ-2-メチルナフタレン
ステップA:エチル 2-メチル-3-オキソ-4-フェニル-ブタノエート。乾燥した250mlの三つ口フラスコに、エチル 3-オキソ-4-フェニル-ブタノエート(4.00g、19.4mmol)、THF(50.0mL)、水素化ナトリウム(931mg、23.3mmol)を加え、反応物を0℃で0.5時間撹拌した。次に、ヨウ化メチル(3.03g、21.3)の溶液を滴加した。添加が完了したら、反応混合物を20℃に温め、20℃で2時間撹拌した。20℃の水(10.0mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、次いで酢酸エチル(20.0mL)で希釈し、層を分離させた。次に、水層を酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30.0mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥後、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル 20:1→10:1)で精製して、エチル 2-メチル-3-オキソ-4-フェニル-ブタノエート(3.60g、16.3mmol、84.3%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.38-7.28(m,3H),7.25-7.19(m,2H),4.22-4.15(m,2H),3.87(d,J=2.0Hz,2H),3.65(q,J=7.2Hz,1H),1.34(d,J=7.2Hz,3H),1.30-1.26(m,3H)。
ステップB:2-メチルナフタレン-1,3-ジオール。エチル 2-メチル-3-オキソ-4-フェニル-ブタノエート(3.60g、16.3mmol)の濃硫酸(19.9g、203mmol)中溶液を、15℃で12時間撹拌した。反応混合物を氷水(30.0mL)中に注ぎ込み、得られた固体を濾過により集め、真空下で乾燥して、2-メチルナフタレン-1,3-ジオール(1.80g、10.3mmol、63.2%収率)を赤色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.02(d,J=8.0Hz,1H),7.65-7.54(m,1H),7.41(t,J=7.2Hz,1H),7.36-7.31(m,1H),6.80(s,1H),4.29-4.20(s,2H),2.41-2.24(s,3H)。
ステップC:3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン-1-オール。2-メチルナフタレン-1,3-ジオール(1.70g、9.76mmol)を、HCl/MeOH(2M、35.0mL)に加え、得られた混合物を30℃で3日間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、残留物を、分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 1:1)で精製し、3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン-1-オール(800mg、4.25mmol、43.5%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.02(d,J=8.4Hz,1H),7.69(d,J=8.4Hz,1H),7.44-7.38(m,1H),7.37-7.31(m,1H),6.79(s,1H),5.14(s,1H),3.94(s,3H),2.29(s,3H)。
ステップD:(3-メトキシ-2-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン-1-オール(800mg、4.25mmol)およびピリジン(504mg、6.38mmol)のDCM(10.0mL)中混合物に、無水トリフルオロ酢酸(1.44g、5.10mmol)をN2雰囲気下、0℃で滴加した。混合物を20℃に温め、さらに5時間撹拌した。真空下で溶媒を除去し、残留物を分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 1:1)により精製して、(3-メトキシ-2-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.30g、4.06mmol、95.5%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.97(d,J=7.6Hz,1H),7.79-7.74(m,1H),7.52-7.43(m,2H),7.14(s,1H),3.99(s,3H),2.42(s,3H)。
ステップE:1-ブロモ-3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン:シールドチューブに、トルエン(10.0mL)中の、(3-メトキシ-2-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(466mg、1.45mmol)、t-Bu-ブレットホス(154mg、290μmol)、臭化カリウム(259mg、2.17mmol)、PEG-200(175mg)、2-ブタノン(157mg、2.17mmol)およびPd2(dba)3(133mg、145μmol)を加え、混合物をN2で5分間脱気した。次に、トリイソブチルアルミニウム(431mg、2.17mmol)を20℃で滴加した。反応物を100℃に24時間加熱した反応混合物を水(30.0mL)中に注ぎ込み、水層を酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(30.0mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、減圧下で濃縮して残留物を得て、これをカラムクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル 10:1)で予備精製し、次いで、分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 10:1)により精製して、1-ブロモ-3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン(700mg、2.79mmol、64.1%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.26-8.17(m,1H),7.73-7.69(m,1H),7.47-7.40(m,2H),7.09(s,1H),3.98-3.95(m,3H),2.56(s,3H)。
ステップF:4-ブロモ-3-メチル-ナフタレン-2-オール:1-ブロモ-3-メトキシ-2-メチル-ナフタレン(580mg、2.31mmol)およびテトラブチルアンモニウムヨージド(2.13g、5.78mmol)のDCM(11.0mL)中の-78℃に冷却した溶液に、BCl3(1M、5.78mL)の溶液をN2下で10分かけて滴加した。反応混合物を0℃に温め、室温で2時間撹拌した。その後、真空下で溶媒を除去し、残留物を分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 5:1)で精製して、4-ブロモ-3-メチル-ナフタレン-2-オール(500mg、2.11mmol、91.3%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.26-8.15(m,1H),7.63(dd,J=3.6,6.0Hz,1H),7.45-7.38(m,2H),7.11(s,1H),5.09(s,1H),2.60(s,3H),1.56(s,3H)。
ステップG:3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-2-メチル-ナフタレン。4-ブロモ-3-メチル-ナフタレン-2-オール(265mg、1.12mmol)およびベンジルブロミド(201mg、1.18mmol)のアセトニトリル(3.00mL)中混合物に、炭酸カリウム(310mg、2.24mmol)をN2下、20℃で1度に加えた。次に、混合物を60℃で2時間撹拌した。真空下で溶媒を除去し、残留物を分取TLC(石油エーテル:酢酸エチル 5:1)により精製して、3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-2-メチルナフタレン(250mg、695μmol、31.0%収率、91.0%純度)を白色固体として得た。ES+APCI MS m/z 327.0、329.0[M+H]+。
中間体54
tert-ブチル-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップA:(4-ブロモ-2-ナフチル)2,2-ジメチルプロパノエート。4-ブロモナフタレン-2-オール(10g、44.8mmol)およびTEA(9.07g、89.7mmol)のDCM(200mL)中溶液に、0℃で、2,2-ジメチルプロパノイルクロリド(8.11g、67.2mmol)を加えた。反応混合物を0℃で10分間撹拌した。水(50mL)を添加することにより反応混合物をクエンチし、層を分離させた。有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA=1:0→100:1)により精製して、(4-ブロモ-2-ナフチル)2,2-ジメチルプロパノエート(9g、29.3mmol、65.4%収率)を赤色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22(d,J=8.0Hz,1H),7.83-7.77(m,1H),7.63-7.49(m,4H),1.41(s,9H)。
中間体55
tert-ブチル 4-(2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。
ステップA:7-ベンジル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール。EtOH(600mL)に、Na(5.56g、241mmol)を少しずつ分けて加え、混合物を1時間撹拌した。この溶液に、エチル 1-ベンジル-3-オキソピペリジン-4-カルボキシレート(30.0g、100mmol)および尿素(14.5g、242mmol)を加え、反応混合物を75℃で36時間撹拌した。真空下で溶媒を除去し、残留物を水(50mL)に溶解し、HCl(120mL、2M)を加えて酸性化し、この時点で固体が沈殿した。その固体を濾過し、濾過ケーキを真空下で乾燥し、7-ベンジル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(22.0g、83.8mmol)を得た。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=10.97(br s,1H),10.66(br s,1H),7.55-6.95(m,5H),3.81-3.50(m,2H),3.26-2.91(m,2H),2.77-2.58(m,2H),2.34-2.09(m,2H)。
ステップB:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。DIEA(30.1g、233mmol)のPOCl3(330g、2.15mmol)中溶液に、7-ベンジル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(20.0g、77.7mmol)を加え、反応混合物を110℃で5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をDCM(400mL)に溶解し、飽和NaHCO3(200mL)中に注ぎ込み、層を分離させた。水層をDCM(2×400mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/DCM=10/1→0/1)で精製して、7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(7.70g、26.2mmol)を得た。1H NMR(300MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.28(m,5H),3.73(s,2H),3.66(br s,2H),2.84(br s,4H)。
ステップC:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(17.3g、58.8mmol)のDMSO(200mL)中溶液に、DIEA(19.0g、147mmol)およびtert-ブチル ピペラジン-1-カルボキシレート(11.5g、61.7mmol)を加え、混合物を55℃で10時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(200ml)に注ぎ込み、水(3×200mL)で洗浄した。合わせた有機成分をブライン(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をMTBE(200mL)でトリチュレートして精製し、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(24g、52.9mmol)を得た。ES+APCI MS m/z 444.2[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。3-モルホリノプロパン-1-オール(11.8g、81.1mmol)、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(18g、40.5mmol)、BINAP(5.05g、8.11mmol)、t-BuONa(9.74g、101mmol)およびPd2(dba)3(3.71g、4.05mmol)のトルエン(300mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、混合物をN2雰囲気下、110℃で3時間撹拌した。反応混合物をH2O(200mL)中に注ぎ込み、水層を酢酸エチル(3×300mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1→5/1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(14g、22.5mmol)を得た。ES+APCI MS m/z 553.4[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(14g、25.3mmol)のMeOH(1L)中溶液に、乾燥Pd/C(3g、10%純度)をN2下で加えた。懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で10時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1TFA)/アセトニトリル]で精製して、tert-ブチル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(6.5g、13.9mmol)を得た。ES+APCI MS m/z 463.4[M+H]+。
ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート。三つ口フラスコ中で、α-ナフトール(4g、27.74mmol)をDCM(200mL)に溶解した。反応物を水浴で10℃に冷却した。N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(4.846ml、27.74mmol)およびトリフルオロメタンスルホン酸無水物(4.668ml、27.74mmol)をその溶液に滴加した。反応物を10℃で2時間撹拌した。TLC(25%EtOAc、UV vis)により反応が完了したことが示された。有機成分を水(2×)およびブライン(2×)で洗浄した。有機成分をMgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。濃縮物をCombiFlashの順相クロマトグラフィー(0%~12% EtOAc:ヘキサン)を使用して精製した。純粋な生成物を含有する全画分を合わせ、減圧下で濃縮して、ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート(6.77g、24.51mmol、88.34%収率)を得た。
中間体57
tert-ブチル(S)-2-(ヒドロキシメチル)-4-メチルピペラジン-1-カルボキシレート
(S)-1-Boc-2-ヒドロキシメチルピペラジン(1.0g、4.62mmol)のDCE(92.47mL、4.624mmol)中溶液に、ホルムアルデヒド(3.474ml、46.24mmol)(37%水溶液)を加え、続けて、トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム(4.9g、23.12mmol)を加えた。混合物を室温で2.5時間、強く撹拌した。混合物を飽和重炭酸ナトリウム(30mL)で処理し、10分間撹拌し、次いでDCM(3×10ml)で抽出した。合わせた有機相を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、濃縮した。ES+APCI MS m/z 231.1[M+H]+。
中間体58
tert-ブチル(R)-2-(ヒドロキシメチル)-4-メチルピペラジン-1-カルボキシレート
(S)-1-Boc-2-ヒドロキシメチルピペラジンの代わりに、tert-ブチル(R)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、中間体57に記載のようにして標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 231.1[M+H]+。
中間体59
1-ブロモ-3-クロロ-2-フルオロ-5-(メトキシメトキシ)ベンゼン
丸底フラスコに、THF(8.87ml、4.44mmol)、続けて、鉱物油中60%分散体の水素化ナトリウム、(0.213g、5.32mmol)を加えた。混合物を0℃に冷却した後、3-ブロモ-5-クロロ-4-フルオロフェノール(1.0g、4.44mmol)を何度かに分けて添加した。バブリングが止んだら、得られた暗色混合物を0℃で30分間撹拌した。次いで、クロロメチルメチルエーテル(0.421ml、5.54mmol)を加え、混合物を周囲温度に温め、2時間撹拌した。塩化アンモニウム飽和水溶液を加え、混合物をDCMで抽出した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過、濃縮した。粗製物をクロマトグラフ処理して(ヘキサン中の0~15%EtOAc)、生成物を透明油として得た。
中間体60
4-ブロモ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール
ステップA:4-ブロモ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール:4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール(500mg、1.89mmol、1当量)のDCM(10mL)中溶液に、3,4-ジヒドロ-2H-ピラン(476mg、5.66mmol、517μL、3当量)および%TsOH・H2O(35.9mg、188μmol、0.1当量)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=10:1→1:1)で精製して、4-ブロモ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール(480mg、1.37mmol、72.9%収率)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.20(s,1H),7.69-7.63(m,2H),5.70(dd,J=2.8,8.8Hz,1H),4.05-3.96(m,1H),3.79-3.70(m,1H),2.56-2.50(m,1H),2.27-2.04(m,2H),1.80-1.74(m,2H),1.60-1.54(m,1H)。
8-ブロモ-6-(メトキシメトキシ)キノリン:8-ブロモキノリン-6-オール(1.00g、4.46mmol)のDCM(20mL)中の撹拌懸濁液を、0℃に冷却し、ジイソプロピルエチルアミン(1.2mL、6.7mmol、1.5当量)を加え、続けてクロロ(メトキシ)メタン(0.41mL、5.4mmol、1.2当量)を滴加し、反応混合物を室温に一晩温めた。次に、濃アンモニア水溶液(0.5mL、約5mmol)を加え、得られた混合物を室温で1時間撹拌した。混合物を減圧下で留去して、シリカゲル、RediSep 40gを用い、20%EtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理し、無色粉末(0.52g、44%)を得た。ES+APCI MS m/z 268.0,[M+H]+。
ブタ-3-エンニトリル(80.0g、1.19mol、96.4mL、1.00当量)のtert-ブタノール(130mL)および石油エーテル(480mL)中溶液に、Br2(191g、1.19mol、61.5mL、1.00当量)のtert-ブタノール(130mL)中溶液を加えた。混合物を10℃で4時間撹拌した。混合物は、なんらの精製を行わずに次のステップで使用した。
上記の混合物(274mL)に、N,N´-ジベンジルエタン-1,2-ジアミン(160g、445mmol、157mL、2HOAc)およびEt3N(178g、1.76mol、245mL)のトルエン(300mL)中溶液を加えた。110℃で2時間撹拌した後、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を、カラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1)で精製し、2-(1,4-ジベンジルピペラジン-2-イル)アセトニトリル(75.0g、246mmol、2ステップで55.7%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:306。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.37-7.23(m,10H),3.80(d,J=13.2Hz,1H),3.60-3.42(m,3H),3.06-2.96(m,1H),2.95-2.83(m,1H),2.69-2.53(m,4H),2.52-2.35(m,3H)。
2-(1,4-ジベンジルピペラジン-2-イル)アセトニトリル(160g、524mmol、1.00当量)のジクロロエタン(1.50L)中溶液に、1-クロロエチルカルボノクロリデート(300g、2.10mol、4.00当量)を15℃で加えた。85℃で48時間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。次いで、残留物をメタノール(1.50L)に入れ、1時間加熱還流した。混合物を濃縮した。固体をメチルtert-ブチルエーテル(1.00L)で処理し、2-ピペラジン-2-イルアセトニトリル(中間体62、90.0g、454mmol、86.7%収率、2HCl)を白色固体として得、さらに精製することなく次のステップで使用した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=10.19(br s,2H),4.01-3.73(m、1H),3.69-3.41(m、4H),3.32(dt,J=2.8,13.2Hz,1H),3.27-3.10(m、3H)。
tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(80.0g、370mmol、1.0当量)の酢酸エチル(1400mL)中溶液に、NaHCO3(93.2g、1.11mol、43.2mL、3.0当量)、H2O(700mL)、およびベンジルカルボノクロリデート(82.0g、481mmol、68.4mL、1.30当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、有機相を分離し、水(500mL×2)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過した。溶媒は、残留物を生じさせるために、真空下で除去した。残留物を、カラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=40/1→1/1)で精製した。生成物である1-ベンジル 4-tert-ブチル(2R)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(85.0g、235mmol、64%収率、96%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M-99]:251。
1-ベンジル 4-tert-ブチル(2R)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(20.0g、57.1mmol、1.0当量)の2-メチルテトラヒドロフラン(240mL)中溶液に、TEA(17.3g、171.23mmol、23.8mL、3.0当量)およびメタンスルホニルクロリド(7.74g、67.6mmol、5.23mL、1.18当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。20℃で150mLのH2Oを加えることによって反応混合物をクエンチした。反応混合物を酢酸エチル(300mL×2)で抽出した。有機層を、H2O(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過した。真空下で溶媒を除去した。1-ベンジル 4-tert-ブチル(2R)-2-(メチルスルホニルオキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(22.0g、粗製物)を黄色油として得た。この粗生成物を、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。
1-ベンジル 4-tert-ブチル(2R)-2-(メチルスルホニルオキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(22.0g、51.3mmol)のDMA(150mL)中溶液に、NaCN(10.4g、211mmol)を加えた。混合物を60℃で12時間撹拌した。真空下で溶媒を除去し、残油を得た。残留物をH2O(40.0mL)で希釈し、酢酸エチル(50.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(80.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を、カラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=40/1→5/1)で精製した。生成物である1-ベンジル 4-tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(18.5g、46.4mmol,2ステップでの収率72%)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:360。
1-ベンジル 4-tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(18.5g、43.3mmol、1.00当量)のジオキサン(40.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、54.1mL、5.0当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。次いで、反応混合物にNaHCO3をpH>7となるまで加え、減圧下で濃縮して、ジオキサンを除去した。残留物をH2O(50.0mL)で希釈し、酢酸エチル(50.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層を、H2O(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。生成物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体63、11.5g、91.8%純度、95%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:260。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=7.37-7.31(m,5H),5.14(s,2H),4.49(br,s,1H),3.93(br,s,1H),3.07-2.81(m,5H),2.78-2.54(m,2H)。
tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.81g、8.87mmol、1.0当量)、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体63、2.30g、8.87mmol、1.0当量)、DIEA(3.44g、26.6mmol、4.63mL、3.0当量)のDMF(20.0mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで混合物をN2雰囲気下、100℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→1:1)で精製して、tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.6g、6.16mmol、69%収率、92.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:539。
tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5Hピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(6.0g、11.1mmol、1.0当量)、TFA(30.8g、270mmol、20.0mL、24.3当量)のDCM(20.0mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで混合物をN2雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、飽和NaHCO3溶液(500mL)で反応混合物をクエンチした。混合物を酢酸エチル(3×300mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過した。真空下で溶媒を除去し、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.8g、粗製物)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。
ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.8g)、1-ブロモナフタレン(3.8g、18.35mmol、2.55mL)、Pd2(dba)3(1.0g、1.09mmol)、RuPhos(1.02g、2.19mmol)、およびCs2CO3(12.0g、36.8mmol)のトルエン(30.0mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回行い、混合物をN2雰囲気下、100℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過した。有機溶媒を真空下で除去して、残油を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=5/1→3:1)で精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.2g、3.31mmol、85.3%純度、2ステップでの収率30%)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:565。
ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.8g、3.97mmol、1.0当量)、m-CPBA(1.05g、5.16mmol、1.3当量)のDCM(4.0mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回行い、次いで混合物をN2雰囲気下、0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、飽和Na2SO3溶液(50mL)を加えることによって反応物をクエンチした。混合物を酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過した。溶媒を除去して、残油を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、メタノール/酢酸エチル=1/20→1:10)で精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、1.5g、2.35mmol、59%収率、90.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:581。
tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(24.3g、45.0mmol、1.0当量)の酢酸エチル(480mL)中溶液に、m-CPBA(8.69g、42.8mmol、85%純度、0.95当量)を0℃で何度かに分けて加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を、水(50.0mL)で希釈し、酢酸エチル(2×300mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。混合物を飽和炭酸水素ナトリウム溶液で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、酢酸エチル(3×1000mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(22.8g、39.3mmol、87%収率、95.8%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ7.37-7.23(m,5H),5.12(s,2H),4.75-4.41(m,3H),4.17-4.05(m,2H),3.86(d,J=11.6Hz,1H),3.81-3.62(m,1H),3.46-3.18(m,3H),3.10(d,J=3.6,12.0Hz,1H),2.81(d,J=3.2Hz,3H),2.77-2.56(m,4H),1.42(s,9H)。
tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(5.0g、9.01mmol、1.0当量)および[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(1.82g、15.8mmol、1.88mL、1.75当量)のトルエン(50.0mL)中溶液に、t-BuONa(1.73g、18.0mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物に冷水(50.0mL)を加え、酢酸エチル(5×50.0mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=10:1→EA:MeOH=5:1)で精製して、tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.80g、4.62mmol、51.0%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ7.44-7.35(m,5H),5.21(s,2H),4.73-4.54(m,2H),4.44-4.33(m,2H),4.22-4.10(m,2H),3.41-3.93(m,1H),3.82(br d,J=11.6Hz,2H),3.39-3.22(m,3H),3.11(br t,J=7.8Hz,1H),2.99(d,J=3.6,12.8Hz,1H),2.90-2.56(m,5H),2.49(s,3H),2.35-2.25(m,1H),2.07-2.02(m,1H),1.91-1.76(m,3H),1.50(s,9H)。
tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.40g、3.96mmol、1.0当量)のDCM(8.0mL)中溶液に、TFA(13.9g、122mmol、9.0mL、30.7当量)を加えた。混合物を15℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濃縮した。残留物に、飽和NaHCO3水溶液(20.0mL)を加え、DCM(5×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、1.40g、2.77mmol、70%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:506。
ステップA:7-ベンジル-4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(20.0g、65.4mmol、1当量)のDCE(200mL)中溶液に、1-クロロエチルカルボノクロリデート(28.1g、196mmol、3当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で30分し、70℃で15時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をMeOH(200mL)に溶解し、70℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物をメチルtert-ブチルエーテル(60mL)でトリチュレートした。沈殿物を濾過により集め、メチルtert-ブチルエーテル(20mL)で洗浄し、真空下で乾燥して、4-クロロ-2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(17.2g、粗製物、HCl)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=4.35(s,2H),3.60(t,J=6.4Hz,2H),3.05(t,J=6.4Hz,2H),2.55(s,3H)。
ステップB:4-クロロ-2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(16.5g、粗製物、HCl)およびTEA(20.0g、196mmol、27.3mL)のTHF(400mL)中溶液に、ベンジルカルボノクロリデート(16.7g、98.1mmol、13.9mL)を0℃で滴加した。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(80mL)で希釈し、有機層を分離した。水相をEtOAc(200mL)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 80/1→5/1)で精製して、ベンジル 4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(19.6g、50.4mmol、2ステップで86%収率、90%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(300MHz,クロロホルム-d)δ=7.37(s,5H),5.18(s,2H),4.63(s,2H),3.877(d,J=8.0,2H),2.80(br s,2H),2.54(s,3H)。
ステップC:ベンジル 4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(21.5g、55.3mmol、1.00当量)のDMF(400mL)中溶液に、DIEA(35.7g、277mmol、48.2mL、5.00当量)および2-[(2S)-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(6.92g、55.3mmol、1.00当量)を加えた。80℃で2時間撹拌した後、(Boc)2O(60.4g、277mmol、63.5mL、5.00当量)を上記混合物に加え、さらに80℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(800mL)で希釈し、EtOAc(2×400mL)で抽出した。有機層をブライン(300mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 10/1→1/1)で精製して、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(24.3g、43.0mmol、78%収率、95%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=7.43-7.29(m,5H),5.18(s,2H),4.76-4.54(m,2H),4.46(br d,J=18.4Hz,1H),4.08-3.69(m,4H),3.53-3.35(m,1H),3.34-3.03(m,2H),3.03-2.89(m,1H),2.81-2.55(m,4H),2.50(s,3H),1.51(s,9H)。
ステップD:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(24.3g、45.1mmol、1当量)のEtOAc(480mL)中溶液に、m-CPBA(8.70g、42.9mmol、85%純度、0.95当量)を0℃で何度かに分けて加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(800mL)で希釈した。NaHCO3でpH8に調整し、有機層を分離した。水相をEtOAc(2×400mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EtOAc/MeOH 100/1→10/1)で精製して、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(20.9g、36.4mmol、81%収率、96%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:555。
ステップE:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(20.9g、37.6mmol、1当量)および[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(8.67g、75.3mmol、8.94mL、2当量)のトルエン(400mL)中溶液に、t-BuONa(7.23g、75.3mmol、2当量)を0℃で加えた。0℃で10分間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(200mL)で希釈し、EtOAc(2×400mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。混合物は、飽和炭酸水素ナトリウム溶液によって中和されて、MeCNを除去するために真空下で濃縮して、EtOAc(2×1000mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(13.5g、20.5mmol、54%収率、92%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:606。
ステップF:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.50g、5.78mmol、1当量)のMeOH(60.0mL)中溶液に、NH3/MeOH(60.0mL)、Pd/C(1.00g、10%純度)をN2下で加えた。懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、触媒を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、2.33g、4.55mmol、79%収率、92%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=4.58(br s,1H),4.34(dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.11(dd,J=6.8,10.8Hz,1H),4.08-3.88(m,4H),3.84(br d,J=12.8Hz,1H),3.25-3.03(m,4H),3.01-2.88(m,2H),2.82-2.51(m,5H),2.47(s,3H),2.27(dt,J=7.2,9.2Hz,1H),2.11-1.97(m,1H),1.92-1.75(m,3H),1.50(s,9H)。
中間体67
tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート
ステップA:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。1-tert-ブチル 4-エチル 3-オキソピペリジン-1,4-ジカルボキシレート(50.0g、184mmol、1.00当量)のMeOH(1.00L)中の窒素下、25℃での攪拌溶液に、NaOMe(49.8g、921mmol、5.00当量)を加え、続いて2-メチルイソチオ尿素(62.4g、331mmol、1.80当量、H2SO4)を固形として加えた。この反応混合物を25℃で16時間撹拌した。反応混合物を約pH5までHCl(2M)で酸性化し、次いで、混合物を減圧下で濃縮してMeOHを除去した。残留物を300mLの酢酸エチルおよび300mLの水に懸濁させ、高速で撹拌した。懸濁液を濾過し、白色固体を収集した。濾液を分離し、有機成分を水(1×300mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄した。有機成分を単離し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、白色固体に濃縮した。tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、138mmol、75.4%収率、81%純度)を白色固体として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[M+1]:298。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.33(s,2H),3.61(t,J=5.6Hz,2H),2.68-2.49(m,5H),1.50(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-ヒドロキシ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(51.0g、171mmol、1.00当量)のDCM(500mL)中の0℃での撹拌懸濁液に、DIEA(44.3g、343mmol、59.9mL、2.00当量)を加え、続いて窒素下でTf2O(72.6g、257mmol、42.4mL、1.50当量)を加えた。直ちに褐色の溶液が形成された。25℃で16時間撹拌後、反応物を濃縮して褐色油を得た。褐色油をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→10/1)で精製した。標記化合物であるtert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(46.0g、107mmol、62%収率)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:430。
中間体68
tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート
ステップA:tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.81g、8.87mmol、1.0当量)、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体63、2.30g、8.87mmol、1.0当量)、DIEA(3.44g、26.6mmol、4.63mL、3.0当量)のDMF(20.0mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで混合物をN2雰囲気下、100℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3:1→1:1)で精製して、標記化合物であるtert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.6g、6.16mmol、69%収率、92.2%純度)を黄色固体として得た。
ステップA:1-ブロモ-8-メチル-ナフタレン。1,8-ジブロモナフタレン(1g、3.50mmol、1当量)のTHF(20mL)中溶液に、MeLi(ジエチルエーテル中1.6M、2.62mL、1.2当量)を0℃で滴加した。0℃で30分間撹拌した後、ヨードメタン(3.38g、23.8mmol、1.48mL、6.81当量)を滴加した。混合物を25℃まで温め、さらに3時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)でクエンチし、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10um;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウム(v/v))→ACN];B%:45%→70%、28分;40%分)で精製した。標記化合物である1-ブロモ-8-メチルナフタレン(340mg、1.49mmol、43%収率、97%純度)を凍結乾燥後に黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75(dd,J=0.8,7.2Hz,1H),7.69(dd,J=0.8,8.0Hz,1H),7.66-7.59(m,1H),7.30-7.22(m,2H),7.13(t,J=8.0Hz,1H),3.05(s,3H)。
ステップA:1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン。ナフタレン-1,8-ジアミン(100g、632mmol、1当量)のAcOH(200mL)およびEtOH(1000mL)中溶液に、冷水浴下で18~21℃に温度を制御しながら、亜硝酸イソアミル(72.6g、619mmol、83.4mL、0.98当量)を2時間かけて滴加した。添加後、得られた赤色懸濁液を25℃で16時間撹拌した。固体を濾過により集め、エタノール(2×500mL)で洗浄し、真空下で乾燥した。化合物である1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン(84g、496mmol、79%収率)を赤色結晶質固体として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:170。
ステップB:8-クロロナフタレン-1-アミン。1H-ナフト[1,8-de][1,2,3]トリアジン(84g、496mmol、1当量)のHCl(1.5L)中溶液に、Cu(2.10g、33.1mmol、234μL、0.0665当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。得られた混合物を水(500mL)で希釈し、85℃で30分間加熱した。得られたほぼ透明な水溶液を、濾過し、冷却し、アンモニア水で(リトマス試験紙が青色なるまで)塩基化し、溶液をエーテルアセテート(2×1000mL)で抽出した。合わせた抽出物をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=200/1→5/1)で精製した。化合物である8-クロロナフタレン-1-アミン(57g、259mmol、52%収率、81%純度)を赤色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:178。
ステップC:1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン。8-クロロナフタレン-1-アミン(57g、320mmol、1当量)およびTsOH・H2O(219g、1.16mol、3.6当量)のMeCN(1000mL)中溶液に、NaNO2(39.8g、577mmol、1.8当量)およびCuBr(138g、963mmol、29.3mL、3当量)のH2O(120mL)中溶液を-5℃で加え、次いで、反応混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物に飽和Na2SO3溶液(100mL)を加え、15分間撹拌し、次いで、酢酸エチル(1000mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(500mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル)により精製した。標記化合物である1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン(56g、229mmol、72%収率、99%純度)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=7.93(dd,J=1.2,7.6Hz,1H),7.82(dd,J=1.2,8.4,1H),7.79(dd,J=1.2,8.4,1H),7.67(dd,J=1.2,7.6Hz,1H),7.37(t,J=8.0Hz,1H),7.28(t,J=8.0Hz,1H)。
中間体71
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.5g、791μmol、1当量)のジオキサン(5mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、5.00mL、25.3当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、不純生成物(500mg、粗製物、HCl)を褐色固体として得た。60mgの不純生成物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10um;移動相:[水(0.04%のNH3・H2O+10mMのNH4HCO3)→ACN];B%:50%→80%、10min)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル・ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(19.3mg、36.1μmol、34%精製収率、99.2%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:532。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=7.75(d,J=8.4Hz、1H),7.60(dd,J=1.6,8.0Hz,1H),7.52(dd,J=0.8,7.2Hz,1H),7.44(dt,J=3.6,7.6Hz,1H),7.36-7.29(m,1H),7.22(t,J=6.8Hz,1H),4.46-4.34(m,2H),4.15(td,J=6.4,10.6Hz,1H),4.04(br d,J=12.4 Hz,0.5H),3.95-3.79(m,2H),3.74(br d,J=12.8 Hz,0.5H),3.63-3.48(m,1H),3.40-2.99(m,7H),2.98-2.80(m,2H),2.73-2.61(m,1H),2.60-2.49(m,3H),2.47(d,J=2.4Hz,3H),2.32-2.23(m,1H),2.10-1.99(m,1H),1.82-1.68(m,3H)。
中間体72
2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.22g、1.98mmol、1.0当量)、1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼン(1.10g、5.93mmol、802μL、3.0当量)、Cs2CO3(1.93g、5.93mmol、3当量)、RuPhos(185mg、396μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(181mg、198μmol、0.1当量)のトルエン(8mL)中混合物を、脱気し、次いでN2下で90℃に12時間加熱した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(20mL)で希釈し、EtOAc(3×30mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。集めた目的の画分を、飽和重炭酸ナトリウム水溶液で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、次いで、EtOAc(3×50mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(380mg、623μmol、32%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:610。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。NH3をMeOH(20mL)中に-70℃で30分間バブリングした。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(380mg、623μmol、1.0当量)の溶液に、上記溶液を加え、続いてN2下でPd/C(200mg、10%純度)を加えた。懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。反応物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、触媒を濾過し、濾液を濃縮して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、459μmol、74%収率、95%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=7.11(t,J=8.0Hz、1H),6.96(d,J=8.0Hz、2H),4.39(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.14(dd,J=7.2,9.6Hz,1H),4.02-3.95(m,3H),3.84-3.78(m,1H),3.31-3.19(m,1H),3.17-3.04(m,5H),3.04-2.95(m,1H),2.89(dd,J=9.2,11.6Hz,1H),2.76-2.62(m,3H),2.58-2.50(m,2H),2.48(s,3H),2.30(s,3H),2.29-2.23(m,4H),2.12-2.00(m,1H),1.89-1.76(m,3H)。
tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.60g、3.96mmol、1.0当量)、1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼン(1.61g、8.70mmol、1.18mL、2.20当量)、Pd2(dba)3(362mg、395μmol、0.10当量)、RuPhos(369mg、791μmol、0.20当量)、およびCs2CO3(3.87g、11.9mmol、3.0当量)のトルエン(8.0mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で12時間撹拌した。有機溶媒を水(20.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(80.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:メタノール=10:1)により精製した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(900mg、1.59mmol、40%収率、90%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:509。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ7.11(t,J=15.6Hz,1H),6.95(d,J=8.0Hz,2H),4.63(br s,1H),4.10-3.93(m,4H),3.89(br d,J=4.8Hz,1H),3.27(dd,J=3.6Hz,J=13.6Hz,1H),3.24-3.05(m,3H),3.05-2.95(m,1H),2.89-2.67(m,4H),2.52(s,3H),2.30(s,3H),2.28(s,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、983μmol、1.0当量)、3-クロロベンゼンカルボぺルオキソ酸(200mg、983μmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、混合物をN2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。有機溶媒を水(10.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:メタノール=10:1)により精製した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、793μmol、81%収率、93%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:525。
ステップC:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.52mmol、1.0当量)、[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(369mg、3.20mmol、380μL、2.10当量)、t-BuONa(293mg、3.05mmol、2.0当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。反応物を水(20.0mL)でクエンチした。粗製混合物を酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(80.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=5:1→ジクロロメタン:メタノール=10:1)により精製した。標記化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(740mg、1.22mmol、80%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:576。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ7.10(t,J=15.2Hz、1H),6.95(d,J=8.0Hz、2H),4.61(br s,1H),4.39(dd,J=4.8Hz,J=9.6Hz,1H),4.13-4.00(m,4H),3.89(br d,J=12.4Hz 1H),3.27-3.13(m,3H),3.13-2.95(m,3H),2.87-2.65(m,5H),2.49(s,3H),2.30(s,3H),2.27(s,3H),2.09-2.06(m,1H),2.06-2.04(m,1H),1.93-1.62(m,4H),1.51(s,9H)。
実施例1
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:2mLのジメチルアセトアミドを、tert-ブチル 4-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.0g、3.7mmol)、トリエチルアミン(1.0mL、7.4mmol)およびベンジル 1-ピペラジンカルボキシレート(0.86mL、4.4mmol)と混合した。反応容器を密閉し、撹拌を加えながら、反応混合物を90℃に加熱した。5時間後、反応物をブラインで希釈し、メチル-t-ブチルエーテルで抽出した。合わせた有機層を飽和塩化アンモニウムおよびブラインで順次洗浄し、MgSO4上で乾燥させて、減圧下で濃縮して濃厚油を得た。この油を1:1の酢酸エチル/ヘキサンで溶出するクロマトグラフ処理(RediSep(登録商標)、24g)に供し、tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.3g、2.9mmol、77%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 454.2[M+H]+。
ステップB:ベンジル 4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.58g、3.484mmol)のジクロロメタン(11.61mL、3.484mmol)中溶液に、トリフルオロ酢酸(2.668mL、34.84mmol)を加え、反応物を室温で3時間撹拌した。反応物を真空下で濃縮し、残留物をジクロロメタンに入れた。この溶液を、1M NaOHおよびブラインで順次洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。粗生成物をカラムクロマトグラフィー(Biotage Isolera、24G Isco RediSep(登録商標)Gold、10%→20% メタノール/ジクロロメタン)により精製して、生成物(1.1g、89%)をオフホワイトの発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 354.2[M+H]+。
ステップC:ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(0.0069g、0.0075mmol)、ラセミ-2,2’-ビス(ジフェニルホスフィノ)-1,1’-ビナフチル(0.0096g、0.015mmol)およびトルエン(0.62mL、0.19mmol)をバイアルに加えた。混合物中にアルゴンで5分間バブリングした後、バイアルをキャッピングし、混合物を100℃に15分間加熱した。混合物を周囲温度まで冷却し、次いで、ナトリウム tert-ブトキシド(0.036g、0.37mmol)を加え、続けて、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン(0.050g、0.19mmol)およびベンジル 4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.13g、0.37mmol)を加えた。バイアルをキャッピングし、混合物を100℃に20時間加熱した。混合物を周囲温度まで冷却し、ジクロロメタンで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。濾液を濃縮し、カラムクロマトグラフィー(Biotage Isolera、12G Isco RediSep(登録商標)、10%~50%酢酸エチル/ジクロロメタン)により精製して、生成物(0.062g、61%)をオフホワイトの発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 540.3[M+H]+。
ステップD:7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン:ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.061g、0.11mmol)のエタノール(1.1mL、0.11mmol)およびテトラヒドロフラン(1.1mL、0.11mmol)中溶液に、パラジウム(0.024g、0.011mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加えた。真空によりH2雰囲気を反応容器中に導入し、次いで反応混合物をH2雰囲気下で維持した。混合物を周囲温度で2.5時間撹拌し、次いでメタノールで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。無色濾液を真空下でトルエンを用いて濃縮し、オフホワイトの発泡体(0.048g、105%)を得て、これを次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 406.2[M+H]+。
ステップE:1-(4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(0.046g、0.11mmol)のジクロロメタン(1.1mL、0.11mmol)中の懸濁液に、周囲温度で、塩化アクリロイル(1.2mL、0.12mmol)(新たに調製したジクロロメタン中の0.1M溶液)、続けて、トリエチルアミン(0.032mL、0.23mmol)を加えた。反応物を周囲温度で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、この生成物を、カラムクロマトグラフィー(Biotage Isolera、12G Isco RediSep(登録商標)、酢酸エチル)により精製して、生成物(0.042g、79%)をオフホワイトの硬質発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 460.2[M+H]+。
ステップF:1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:1-(4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(0.034g、0.074mmol)の酢酸エチル(0.74mL、0.074mmol)中の溶液に、塩酸(2-プロパノール中の5または6N溶液、0.44mL、2.2mmol)を加えた。混合物を周囲温度で5時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(10mL)で希釈し、ポリプロピレンフィルターを通して濾過し、収集した固体を酢酸エチルおよびヘキサンで洗浄し、生成物をHCl塩として得た。この不純物を含む物質を1mLの水酸化アンモニウム/メタノールで処理して、酸をクエンチし、混合物を濃縮した。残留物を10%のメタノール/ジクロロメタンに溶解し、カラムクロマトグラフィー(Biotage Isolera、12G Isco RediSep(登録商標)、2→5% メタノール/酢酸エチル)により精製して、生成物(0.008g、25%)をオフホワイトの固体として得た。ES+APCI MS m/z 416.2[M+H]+。
1H NMR(CD3OD,400MHz)δ8.49(s,1H),8.07(app d,J=8.2Hz,1H),7.61(app d,J=8.2Hz,1H),7.35(m,1H),7.25(m,1H),6.80(m,3H),6.23(dd,J=16.8,1.6Hz,1H),5.77(dd,J=10.6,2.0Hz,1H),4.22(br s,2H),3.80(app t,J=4.7Hz,4H),3.63(br s,4H),3.35(br s,2H),3.03(br s,2H)。
実施例2
1-(4-(7-(7-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例1の方法に従い、ステップCで、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに2-ブロモ-7-(メトキシメトキシ)ナフタレンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 416.1[M+H]+。
実施例3
1-(4-(7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例1の方法に従い、ステップCで、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに1-ヨードナフタレンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 400.2[M+H]+。
実施例4
1-(4-(7-(2-フルオロ-6-ヒドロキシフェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例1の方法に従い、ステップCで、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに2-ブロモ-1-フルオロ-3-(メトキシメチル)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 384.2[M+H]+。
実施例5
1-(4-(7-(2-フルオロ-5-ヒドロキシフェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例1の方法に従い、ステップCで、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに2-ブロモ-1-フルオロ-4-(メトキシメトキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 384.2[M+H]+。
実施例6
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA~C:ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:実施例1のステップA~Cの方法に従い、ステップAで、4-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル 4-クロロ-6-メチル-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレートを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 430.2[M+H]+。
ステップD1:ベンジル 4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.05g、0.09mmol)のイソプロパノール(10mL)中の溶液に、塩酸(イソプロパノール中の5~6M)(0.02mL、0.09mmol)を加え、反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を真空下で濃縮し、濃縮物を酢酸エチルと水の間で分配し、その物質を遊離塩基に変換した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥させて、真空下で濃縮し、ベンジル 4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.005g、0.010mmol、11%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 510.3[M+H]+。
ステップD2:4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-オール:実施例1、ステップDの方法に従って調製した。
ステップE:1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例1、ステップEの方法に従って調製した。
実施例7
1-(4-(7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA~D:ベンジル 4-(7-(5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:一般スキーム1のステップCの1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに、4-ブロモ-5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾールを使用して、ステップA~Cに従って合成した。
ステップD1:ベンジル 4-(7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(7-(5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.16g、0.26mmol)のジクロロメタン(10mL)中の溶液に、2,2,2-トリフルオロ酢酸(0.89g、7.8mmol)、続けて、アニソール(0.028g、0.26mmol)を加え、反応物を室温で3時間撹拌した。反応物を真空下で濃縮し、濃縮物質を酢酸エチルに溶解し、塩基性ブラインで洗浄した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。粗製物を、0→10%メタノール/ジクロロメタンを溶出液として使用するクロマトグラフ処理を行い、ベンジル 4-(7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.05g、38%)を得た。ES+APCI MS m/z 484.2[M+H]+。
ステップD2:7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン:実施例1、ステップDの方法に従って調製した。
ステップE:1-(4-(7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例1、ステップEの方法に従って調製した。
実施例8
(S)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル 1-ピペラジンカルボキシレート(1.268g、6.575mmol)およびtert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,6-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(8H)-カルボキシレート(2g、6.575mmol)をジメチルアセトアミド(10mL)に溶解し、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(3.445mL、19.73mmol)で処理した。この反応混合物を85℃で2時間撹拌した。反応混合物を室温に冷却し、酢酸エチルで希釈し、水およびブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥した後、濾過、濃縮した。濃縮物を、0%~50%酢酸エチル:ヘキサンを溶出液として用いてクロマトグラフィー(CombiFlash(登録商標))で精製し、生成物(2.69g、83%)を得た。ES+APCI MS m/z 488.2、490.2[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(235mg、0.482mmol)、および(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オール(497mg、4.82mmol)をジオキサン(0.5mL)に加え、100℃に3日間加熱した。反応物を濃縮し、得られた残留物をシリカゲル(Biotage Isolera、ジクロロメタン中0~12%メタノール)で精製し、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(200mg、0.361mmol、74.9%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 555.3[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(200g、0.3606mmol)のジクロロメタン(1202μL、0.3606mmol)中溶液に、トリフルオロ酢酸(828.3μL、10.82mmol)を加え、反応物を室温で3時間撹拌した。反応物を真空下で濃縮し、残留物をジクロロメタンに入れた。この溶液を、1M NaOH、続けて、ブラインで洗浄した後、Na2SO4上で乾燥し、濾過後、真空下で濃縮した。粗生成物をカラムクロマトグラフィー(Biotage Isolera、24G Isco RediSep(登録商標)Gold、10%→20% メタノール/ジクロロメタン)により精製して、生成物(0.135g、83%)をオフホワイトの発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 455.2[M+H]+。
ステップD:ベンジル(S)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(21.8mg、0.0238mmol)、ラセミ-2,2’-ビス(ジフェニルホスフィノ)-1,1’-ビナフチル(30.4mg、0.0488mmol)およびトルエン(991μL、0.297mmol)をバイアルに加えた。混合物中にアルゴンで5分間バブリングした後、バイアルをキャッピングし、混合物を100℃に15分間加熱した。混合物を周囲温度まで冷却し、ナトリウム tert-ブトキシド(57.2mg、0.595mmol)を加え、続けて、3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート(100mg、0.297mmol)およびベンジル(S)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(135mg、0.297mmol)を加えた。バイアルをキャッピングし、混合物を100℃に18時間加熱した。混合物を冷却し、濃縮した。粗製物をシリカゲル(Biotage Isolera、0~11%メタノール/ジクロロメタン)で精製し、ベンジル(S)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(68mg、0.106mmol、35.7%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 641.3[M+H]+。
ステップE:(S)-2-((7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパン-1-アミン:ベンジル(S)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(68mg、0.11mmol)のエタノール(1061μL、0.11mmol)およびテトラヒドロフラン(1061μL、0.11mmol)中溶液に、パラジウム(113mg、0.053mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加えた。真空によりH2雰囲気を導入した後、反応容器をH2雰囲気下で維持した。混合物を周囲温度で3時間撹拌した。混合物をメタノールで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。無色濾液を濃縮し、(S)-2-((7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパン-1-アミン(54mg、100%収率)を得て、これを精製することなしに次のステップで使用した。ES+APCI MS m/z 507.3[M+H]+。
ステップF:(S)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:(S)-2-((7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパン-1-アミン(54mg、0.11mmol)のジクロロメタン(1066μL、0.11mmol)中の懸濁液に、周囲温度で、塩化アクリロイル(1279μL、0.13mmol)(新たに調製したDCM中の0.1M溶液)、続けて、トリエチルアミン(30μL、0.21mmol)を加えた。反応物を周囲温度で20分間撹拌した。混合物を濃縮し、この生成物を、カラムクロマトグラフィー(Biotage Isolera、12G Isco RediSep(登録商標)、0~15%メタノール/ジクロロメタン)により精製して、(S)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(51mg、0.091mmol、85%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 561.3[M+H]+。
ステップG:1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:(S)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(51mg、0.091mmol)を、350μLのメタノールおよび数滴のテトラヒドロフランを含むバイアルに加え、反応バイアルをキャッピングした。HCl(379μL、2.3mmol)(6M水溶液)を撹拌しながら加え、混合物を55℃に3時間加熱した。反応物を冷却し、真空下で濃縮した。飽和重炭酸塩溶液を加え、反応物を、ジクロロメタン中の10%メタノールで抽出した。有機層を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(Biotage Isolera、1%の濃塩化アンモニウム含有ジクロロメタン中の4~20%メタノール)で精製し、標記生成物(25.3mg、54%)を得た。ES+APCI MS m/z 517.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.90(d,1H,J=8.314Hz),7.54(d,1H,J=8.021),7.34(m,1H),7.24(m,1H),6.72(m,1H),6.56-6.48(m,2H),6.32(dd,1H,J=16.726,1.858),5.73(dd,1H,J=10.368,1.858),5.45(m,1H),4.09-3.94(m,2H),3.63(bs,2H),3.47(bs,2H),3.31(m,4H),3.16(bs,2H),2.84(m,1H),2.60(bs,2H),2.45(m,1H),2.43(s,6H),1.31(d,3H,J=6.162Hz)。
実施例9
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ジメチルアミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 503.2[M+H]+。
実施例10
1-(4-(2-(3-(ジメチルアミノ)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-(ジメチルアミノ)プロパン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.3[M+H]+。
実施例11
1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.3[M+H]+。
実施例12
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(4-メチルピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに1-メチルピペラジンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 514.3[M+H]+。
実施例13
1-(4-(2-(3-(ジメチルアミノ)ピロリジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりにN,N-ジメチルピロリジン-3-アミンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 528.3[M+H]+。
実施例14
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジルピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル(S)-2-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用し、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ジメチルアミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.3[M+H]+。
実施例15
(R)-1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジルピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル(R)-2-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用し、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ジメチルアミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.3[M+H]+。
実施例16
1-(6-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジルピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-カルボキシレートを使用し、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ジメチルアミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 515.3[M+H]+。
実施例17
1-(4-(2-(4-(ジメチルアミノ)ピペリジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりにN,N-ジメチルピペリジン-4-アミンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 580.3[M+H]+。
実施例18
1-(6-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジル ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-カルボキシレートを使用し、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例19
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.3[M+H]+。
実施例20
1-(6-(2-(3-(ジメチルアミノ)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジルピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-カルボキシレートを用い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-(ジメチルアミノ)プロパン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例21
1-(4-(2-((4-(ジメチルアミノ)ブタン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに4-(ジメチルアミノ)ブタン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 531.3[M+H]+。
実施例22
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-4-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに1-メチルピペリジン-4-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例23
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-3-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに1-メチルピロリジン-3-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 515.3[M+H]+。
実施例24
1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールを使用し、ステップDで、3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル トリフルオロメタンスルホネートの代わりに1-ブロモナフタレンを使用し、さらにステップGを省いて合成した。ES+APCI MS m/z 501.3[M+H]+。
実施例25
1-(4-(2-(3-(ジメチルアミノ)プロポキシ)-7-(1-フェニルエチル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-(ジメチルアミノ)プロパン-1-オールを使用し、ステップDで、3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル トリフルオロメタンスルホネートの代わりに(1-ブロモエチル)ベンゼンを使用し、さらにステップGを省いて合成した。ES+APCI MS m/z 559.3[M+H]+。
実施例26
1-(4-(2-(4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ピペラジン-1-イル)酢酸エチルを使用して合成した。ステップDの後に、次の鹸化反応を実施した:ベンジル 4-(2-(4-(2-アセトキシエチル)ピペラジン-1-イル)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートをTHF(5mL)に入れ、2MのLiOH(1mL)を加えた。混合物を周囲温度で24時間撹拌した。飽和NH4Clを加え、反応物をDCMで抽出した。合わせた有機層を濃縮し、得られた残留物をシリカゲル(Biotage Isolera Gold、DCM中0~10%MeOHで溶出)で精製し、ベンジル 4-(2-(4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートを得た。合成の残りの部分は、実施例8、ステップEと同様にして進めた。ES+APCI MS m/z 544.3[M+H]+。
実施例27
1-((S)-4-(2-(((R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジル ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル(S)-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用し、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 531.3[M+H]+。
実施例28
(S)-1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジルピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル(S)-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用し、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ジメチルアミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.2[M+H]+。
実施例29
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-モルホリノエトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-モルホリノエタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 545.2[M+H]+。
実施例30
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-モルホリノ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりにモルホリンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 501.3[M+H]+。
実施例31
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(ピロリジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりにピロリジンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 485.2[M+H]+。
実施例32
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-(ピロリジン-1-イル)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-(ピロリジン-1-イル)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 543.4[M+H]+。
実施例33
1-(4-(2-(2-(1,1-ジオキシドチオモルホリノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロ酢酸塩
ステップA:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、463.12μmol、1.00当量)および2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エタノール(166mg、926μmol、2.00当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に、NaOBu-t(133mg、1.39mmol、3.00当量)、BINAP(57.7mg、92.6μmol、0.20当量)、Pd2(dba)3(42.4mg、46.3μmol、0.10当量)を加えた。反応混合物を、N2下、90℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをDCM(3×10mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆フラッシュクロマトグラフィー(水(0.1%TFA)中の40%MeCN)で精製してベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、301μmol、65.1%収率)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 763.5[M+H]+。
ステップB:4-[2-[2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(190mg、249μmol、1.00当量)のMeOH(10.0mL)中溶液に、N2下でPd/C(100mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(15psi)下、40℃で4時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、4-[2-[2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(90.0mg、167μmol、67.1%収率)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 539.4[M+H]+。
ステップC:1-[4-[2-[2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[2-[2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(90.0mg、167μmol、1.00当量)およびDIEA(64.8mg、501μmol、87.5μL、3.00当量)のDCM(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(19.0mg、150μmol、0.90当量)を-40℃で加えた。反応混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を1mLのMeOHでクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLCカラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*、10μ;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:12%~42%、11分、により精製して、1-[4-[2-[2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロ酢酸塩(32.6mg、50.2μmol、30.0%収率、91.3%純度)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 593.5[M+H]+。
実施例34
1-(4-(2-(3-(1,1-ジオキシドチオモルホリノ)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロ酢酸塩
実施例33の方法に従い、ステップAで、2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エタノールの代わりに3-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)プロパン-1-オールを使用して合成した。ESI MS m/z 607.5[M+H]+。
実施例35
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(4-モルホリノブトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロ酢酸塩
実施例33の方法に従い、ステップAで、2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エタノールの代わりに4-モルホリノブタン-1-オールを使用して合成した。ESI MS m/z 573.4[M+H]+。
実施例36
(R)-1-(4-(2-((1-(4-アセチルピペラジン-1-イル)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例33の方法に従い、ステップAで、2-(1,1-ジオキソ-1,4-チアジナン-4-イル)エタノールの代わりに1-[4-[(2R)-2-ヒドロキシプロピル]ピペラジン-1-イル]エタノンを使用して合成した。ESI MS m/z 600.6[M+H]+。
実施例37
1-(4-(2-(2-(4-アセチルピペラジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[2-[2-(4-アセチルピペラジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:1-[4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル]エタノン(277mg、1.61mmol、2.60当量)のTHF(8.00mL)中溶液に、NaH(49.4mg、1.23mmol、60%純度、2.00当量)を0℃で加えた。反応混合物を0℃で15分間撹拌した。この混合物に、THF(2.00mL)中の、ベンジル-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、618μmol、1.00当量)を加えた。反応混合物を0℃で20分間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Cl(6mL)および水(6mL)でクエンチした。反応混合物を酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮し、ベンジル 4-[2-[2-(4-アセチルピペラジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、534μmol、86.5%収率、89.7%純度)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 756.3[M+H]+。
ステップB:1-[4-[2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]エチル]ピペラジン-1-イル]エタノン:ベンジル 4-[2-[2-(4-アセチルピペラジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、264μmol、1.00当量)のTHF(10.0mL)中溶液に、N2下でPd/C(100mg、10%純度)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(15psi)下、40℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをTHF(3×5mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、1-[4-[2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]エチル]ピペラジン-1-イル]エタノン(80.0mg、150μmol、56.9%収率)を褐色固体として得た。
ステップC:1-[4-[2-[2-(4-アセチルピペラジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]エチル]ピペラジン-1-イル]エタノン(80.0mg、150μmol、1.00当量)およびDIEA(58.3mg、451μmol、78.8μL、3.00当量)のDCM(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(14.2mg、113μmol、0.75当量)を-40℃で0.5時間かけて加えた。反応混合物をMeOH(1mL)でクエンチし、DCM(20mL)で希釈し、次に水(5mL)で洗浄した。合わせた有機層をブライン(5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。反応混合物を分取HPLC:Phenomenex Gemini 150*25mm*、10μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:30%~55%、10分、により精製して、1-[4-[2-[2-(4-アセチルピペラジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(13.8mg、23.3μmol、15.5%収率、98.7%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 586.3[M+H]+。
実施例38
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-(ピペリジン-1-イル)プロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例37の方法に従い、ステップAで、1-[4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル]エタノンの代わりに3-(1-ピペリジル)プロパン-1-オールを使用して合成した。ESI MS m/z 557.5[M+H]+。
実施例39
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-(ピロリジン-1-イル)プロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例37の方法に従い、ステップAで、1-[4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル]エタノンの代わりに3-ピロリジン-1-イルプロパン-1-オールを使用して合成した。ESI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例40
1-(4-(2-(4-(ジメチルアミノ)ブトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例37の方法に従い、ステップAで、1-[4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル]エタノンの代わりに4-(ジメチルアミノ)ブタン-1-オールを使用して合成した。ESI MS m/z 531.4[M+H]+。
実施例41
1-(4-(7-(3-シクロプロピル-5-ヒドロキシフェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロ酢酸塩
ステップA:4-[7-(3-ベンジルオキシ-5-シクロプロピル-フェニル)-2-(3- モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、805μmol、1.00当量)および1-ベンジルオキシ-3-ブロモ-5-シクロプロピルベンゼン(268mg、886μmol、1.10当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に、2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(75.2mg、161μmol、0.20当量)、Pd2(dba)3(111mg、121μmol、0.15当量)およびCs2CO3(656mg、2.01mmol、2.50当量)を加えた。反応混合物を、N2下、90℃で12時間撹拌した。混合物を水(15mL)に加え、DCM(2×15mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3:1→ジクロロメタン:メタノール=10:1)で精製してベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-5-シクロプロピル-フェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(170mg、230μmol、28.5%収率、97.2%純度)を褐色油として得た。ESI MS m/z 719.6[M+H]+。
ステップB:3-シクロプロピル-5-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]フェノール:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-5-シクロプロピル-フェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、209μmol、1.00当量)のMeOH(10.0mL)中混合物に、Pd/C(150mg、10%純度)およびCH3COOH(25.1mg、417.3μmol、23.9μL、2.00当量)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(15psi)下、40℃で2時間撹拌した。反応混合物をCelite(登録商標)を通して濾過し、濾液を濃縮した。生成物である3-シクロプロピル-5-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]フェノール 二酢酸塩(80.0mg、130μmol、62.4%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 495.2[M+H]+。
ステップC:1-[4-[7-(3-シクロプロピル-5-ヒドロキシ-フェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:3-シクロプロピル-5-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]フェノール 二酢酸塩(80.0mg、130μmol、1.00当量)のDCM(2.00mL)中溶液に、DIEA(168mg、1.30mmol、227μL、10.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(13.1mg、104μmol、0.80当量)を-78℃で加え、反応混合物を-78℃で0.5時間撹拌した。反応混合物をMeOH(2当量、10mg)でクエンチし、次いで濃縮した。残留物を分取HPLC(測定器:GX-K;カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*、10μ;条件:水(0.1%TFA)-ACN;開始B:8;最終B:38;勾配時間(分):11;100%B 保持時間(分):2;流速(mL/分):25)により精製した。単離生成物を凍結乾燥により濃縮した。生成物である1-[4-[7-(3-シクロプロピル-5-ヒドロキシ-フェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロ酢酸塩(21.5mg、31.1μmol、23.9%収率、95.8%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 549.5[M+H]+。
実施例42
1-(4-(7-(2-フルオロ-5-ヒドロキシフェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例41の方法に従い、ステップAで、1-ベンジルオキシ-3-ブロモ-5-シクロプロピルベンゼンの代わりに4-(ベンジルオキシ)-2-ブロモ-1-フルオロベンゼンを使用して合成した。ESI MS m/z 527.4[M+H]+。
実施例43
1-(4-(7-(3-ヒドロキシ-6-メチルナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、1.01mmol、1.00当量)、(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(483mg、1.51mmol、1.50当量)、Cs2CO3(820mg、2.52mmol、2.50当量)、2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(93.9mg、201.3μmol、0.20当量)およびPd2(dba)3(92.2mg、100μmol、0.10当量)のトルエン(3.00mL)中混合物を、90℃で10時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(50.0mL)で希釈した。沈殿物を濾過により除去し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(0.1%TFA含有水/アセトニトリル)で精製した。目的の画分を合わせ、重炭酸ナトリウム飽和水溶液(2.00mL)で塩基化した後、真空下で濃縮した。残留物を酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、ベンジル 4-[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、599μmol、59.4%収率、100%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 667.6[M+H]+。
ステップB:4-[3-[[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン:ベンジル 4-[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(370mg、554μmol、1.00当量)のMeOH(10.0mL)中溶液に、Pd-C(100mg、10%純度)およびAcOH(66.6mg、1.11mmol、2.00当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(15psi)下、40℃で2時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して、4-[3-[[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン(295mg、553μmol、99.8%収率)を黄色固体として得て、これを精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 533.6[M+H]+。
ステップC:1-[4-[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(56.8mg、450μmol、0.80当量)およびDIEA(727mg、5.63mmol、983μL、10.0当量)のDCM(2.00mL)中混合物に、4-[3-[[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン(300mg、563μmol、1.00当量)のDCM(1.00mL)中溶液を窒素雰囲気下、-40℃で加えた。混合物を1時間撹拌した。反応混合物を-40℃でMeOH(50μL)の添加によりクエンチし、水(10.0mL)で希釈し、DCM(10.0mL)で抽出し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、1-[4-[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(270mg、460μmol、81.7%収率)を得た。ESI MS m/z 587.6[M+H]+。
ステップD:1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-6-メチル-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[7-(3-メトキシ-6-メチル-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(100mg、170μmol、1.00当量)のDCM(3.00mL)中溶液に、BBr3(213mg、852μmol、82.1μL、5.00当量)を-78℃で加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。混合物を-78℃に冷却し、DCM(20.0mL)で希釈し、飽和重炭酸ナトリウム溶液(5.00mL)の添加によりクエンチし、-78℃で10分間撹拌し、次いで0℃に温めた。混合物をDCM(2×15.0mL)で抽出し、ブライン(1×20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、真空下濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*,10μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:27%~57%、12分)により精製して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-6-メチル-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(11.0mg、18.6μmol、10.9%収率、97.0%純度)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 573.6[M+H]+。
実施例44
1-(4-(7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、1.01mmol、1.00当量)、2-[(4-ブロモ-5-メチル-インダゾール-1-イル)メトキシ]エチル-トリメチルシラン(448mg、1.31mmol、1.30当量)、Cs2CO3(822mg、2.53mmol、2.50当量)、Pd2(dba)3(138mg、151μmol、0.15当量)および2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(94.3mg、202μmol、0.20当量)のトルエン(20.0mL)中混合物を、脱気と、窒素によるパージを3回繰り返し、窒素雰囲気下、90℃で10時間撹拌した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×50.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下濃縮した。残留物を逆相HPLC(0.1%TFA含有水/アセトニトリル)で精製して、ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]- 2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(420mg、554μmol、54.9%収率)を黄色油として得た。ESI MS m/z 757.6[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(370mg、488μmol、1.00当量)のMeOH(10.0mL)中溶液に、トリエチルアミン(98.9mg、977μmol、135μL、2.00当量)、Pd/C(100mg、10%純度)およびtert-ブトキシカルボニル tert-ブチルカーボネート(213mg、977μmol、224μL、2.00当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(15psi)下、40℃で2時間撹拌した。反応混合物を濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=1:0→10:1)で精製してtert-ブチル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(340mg、470μmol、96.2%収率)を褐色油として得た。ESI MS m/z 723.5[M+H]+。
ステップC:4-[3-[[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン トリフルオロ酢酸塩:tert-ブチル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、207μmol、1.00当量)のDCM(500μL)中溶液に、TFA(354mg、3.11mmol、230μL、15.0当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮して、4-[3-[[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン トリフルオロ酢酸塩(125mg、206μmol、99.3%収率)を褐色油として得て、これを精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 493.4[M+H]+。
ステップD:1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[3-[[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン トリフルオロ酢酸塩(120mg、197μmol、1.00当量、TFA)およびDIEA(255mg、1.98mmol、345μL、10.0当量)のジクロロメタン(2.00mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(19.9mg、158μmol、0.80当量)のジクロロメタン(1.00mL)中溶液を窒素雰囲気下、-40℃で加えた。混合物を1時間撹拌した。反応混合物を-40℃でMeOH(50.0μL)の添加によりクエンチし、水(10.0mL)で希釈し、ジクロロメタン(10.0mL)で抽出し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*、10μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:30%~60%、10分)により精製して、1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(19.0mg、34.4μmol、17.4%収率、99.0%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 547.5[M+H]+。
実施例45
1-((1R,5S)-3-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 3-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(920mg、3.13mmol、1.00当量)およびtert-ブチル 3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(677mg、3.19mmol、1.02当量)のDMSO(18.0mL)中混合物に、DIEA(1.21g、9.39mmol、1.64mL、3.00当量)を加えた。反応混合物を60℃で1時間撹拌した。混合物をEtOAc(3×20mL)で希釈し抽出し、水(10mL)、1N HCl(5mL)、NaHCO3(15mL)、およびブライン(15mL)で洗浄した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥後、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 3-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(1.30g、2.41mmol、76.9%収率、87.0%純度)を褐色油として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ESI MS m/z 470.2[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 3-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート:1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オール(857mg、8.31mmol、942μL、3.00当量)のTHF(40.0mL)中溶液に、NaH(222mg、5.54mmol、60.0%純度、2.00当量)をN2下、15℃で加えた。15℃で0.5時間撹拌後、tert-ブチル 3-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(1.30g、2.77mmol、1.00当量)を加えた。シールドチューブ中で混合物を100℃で12時間撹拌した。反応物を水(3ml)でゆっくりクエンチした後、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH 60:1→10:1)で精製して、tert-ブチル 3-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(700mg、1.07mmol、38.8%収率、82.4%純度)を黄色油として得た。
ステップC:tert-ブチル 3-[2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート:tert-ブチル 3-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(700mg、1.30mmol、1.00当量)のMeOH(30.0mL)中溶液に、N2下でPd/C(200mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを4回実施した。混合物を水素(50psi)下、40℃で12時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH 50:1→5:1)で精製して、tert-ブチル 3-[2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(500mg、952μmol、73.2%収率、85.0%純度)を黄色油として得た。
ステップD:tert-ブチル 3-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート:Pd2(dba)3(84.1mg、91.8μmol、0.10当量)を、tert-ブチル 3-[2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(410mg、918μmol、1.00当量)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(293mg、936μmol、1.02当量)、2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(85.7mg、184μmol、0.20当量)およびCs2CO3(897mg、2.75mmol、3.00当量)のジオキサン(9.00mL)中溶液に加えた。反応混合物をN2下、100℃で7時間撹拌し、次いで真空下で濃縮した。残留物を水(5mL)で希釈し、DCM(2×20ml)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH 100:1→20:1)で精製して、tert-ブチル 3-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(317mg、441μmol、48.1%収率、94.5%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 679.2[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル 3-[2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート:tert-ブチル 3-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(340mg、501μmol、1.00当量)のMeOH(6.80mL)中溶液に、Pd/C(120mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを4回実施した。混合物を水素(15psi)下、40℃で1.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、tert-ブチル 3-[2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(210mg、316μmol、63.1%収率、88.6%純度)を黄色固体として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 589.3[M+H]+。
ステップF:4-[4-(3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-3-イル)-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール トリフルオロ酢酸塩:tert-ブチル 3-[2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレート(180mg、306μmol、1.00当量)のDCM(230μL)中溶液に、TFA(349mg、3.06mmol、226μL、10.0当量)を加えた。反応混合物を18℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、4-[4-(3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-3-イル)-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール トリフルオロ酢酸塩(528mg、粗製)を赤色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 489.2[M+H]+。
ステップG:1-[3-[2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[4-(3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-3-イル)-2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール トリフルオロ酢酸塩(149mg、306μmol、1.00当量)およびDIEA(1.36g、10.5mmol、1.84mL、34.5当量)のDCM(1.50mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(30.9mg、245μmol、0.80当量)を-50℃で滴加した。混合物を-40℃で、次いで-20℃で30分間撹拌した。反応物をMeOH(19.6mg)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(DCM/MeOH 7:1)で精製して、1-[3-[2-[2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-イル]プロパ-2-エン-1-オン(18.9mg、32.8μmol、10.7%収率、94.3%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例46
1-((1R,5S)-8-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-3-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例4の方法に従い、ステップAで、tert-ブチル 3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-8-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル(1R,5S)-3,8-ジアザビシクロ[3.2.1]オクタン-3-カルボキシレートを使用して合成した。ESI MS m/z 543.4[M+H]+。
実施例47
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-8-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:エチル 2-(ベンジルアミノ)プロパノエート:エチル 2-ブロモプロパノエート(30.0g、165mmol、21.6mL、1.00当量)、BnNH2(23.1g、215mmol、23.6mL、1.30当量)のMeCN(600mL)中の溶液に、K2CO3(45.8g、331mmol、2.00当量)を加えた。混合物を80℃で2時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをDCM(300mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=10:1→4:1)で精製して、エチル 2-(ベンジルアミノ)プロパノエート(34.0g、163mmol、98.4%収率、99.4%純度)を無色油として得た。
ステップB:エチル 4-[ベンジル-(2-エトキシ-1-メチル-2-オキソ-エチル)アミノ]ブタノエート:エチル 2-(ベンジルアミノ)プロパノエート(31.0g、150mmol、1.00当量)およびエチル 4-ブロモブタノエート(87.5g、449mmol、64.4mL、3.00当量)のMeCN(600mL)および水(60.0mL)中の溶液に、Cs2CO3(97.5g、299.12mmol、2.00当量)およびKI(4.97g、29.9mmol、0.20当量)を加えた。反応混合物を80~90℃で40時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをDCM(2×100mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物をDCM(300mL)に溶解し、ブライン(80mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥して、真空下で濃縮した。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=1:0→20:1)で精製して、エチル 4-[ベンジル-(2-エトキシ-1-メチル-2-オキソ-エチル)アミノ]ブタノエート(28.0g、87.1mmol、58.3%収率)を黄色油として得た。
ステップC:エチル 1-ベンジル-2-メチル-3-オキソ-ピペリジン-4-カルボキシレート:エチル 4-[ベンジル-(2-エトキシ-1-メチル-2-オキソ-エチル)アミノ]ブタノエート(28.0g、87.1mmol、1.00当量)のTHF(600mL)中溶液に、tBuOK(19.6g、174mmol、2.00当量)を加えた。反応混合物を18℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)でクエンチし、MTBE(3×300mL)およびDCM(2×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=100:1→20:1)で精製して、エチル 1-ベンジル-2-メチル-3-オキソ-ピペリジン-4-カルボキシレート(20.0g、58.8mmol、67.5%収率、81.0%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 276.0[M+H]+。
ステップD:7-ベンジル-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール:EtOH(400mL)に、Na(3.76g、163mmol、3.88mL、2.50当量)を加えた。反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。この混合物に、エチル 1-ベンジル-2-メチル-3-オキソ-ピペリジン-4-カルボキシレート(18.0g、65.4mmol、1.00当量)および尿素(9.82g、163mmol、8.77mL、2.50当量)を加え、反応混合物を80℃で80時間撹拌した。真空下で溶媒を除去した。残留物を水(100mL)に溶解し、MTBE(3×50mL)で洗浄した。水相をHCl(15mL、12M)でpH6~7に調整した。混合物を濾過し、濾過ケーキを水(30mL)で洗浄し、真空下で乾燥して、7-ベンジル-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(12.0g、44.2mmol、67.7%収率、100%純度)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 272.0[M+H]+。
ステップE:ベンジル-2,4-ジクロロ-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:7-ベンジル-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(5.00g、18.4mmol、1.00当量)のPOCl3(305g、1.99mol、185mL、108当量)中混合物を、110℃に12時間加熱した。真空下で溶媒を除去した。残留物をDCM(500mL)に溶解し、飽和NaHCO3(200mL)中に注ぎ込み、その間、pHを7未満に保持した。有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥した。溶液をシリカゲルパッドを通して濾過し、濾過ケーキをDCM(3×400mL)で洗浄した。合わせた有機層を真空下で濃縮して、7-ベンジル-2,4-ジクロロ-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(4.50g、14.6mmol、79.2%収率)を褐色油として得た。
ステップF:4-(7-ベンジル-2-クロロ-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(3.00g、9.73mmol、1.00当量)およびDIEA(2.52g、19.5mmol、3.40mL、2.00当量)のジオキサン(60.0mL)中溶液に、tert-ブチル ピペラジン-1-カルボキシレート(1.90g、10.2mmol、1.05当量)を加えた。この反応混合物を60℃で12時間撹拌した。真空下で溶媒を除去した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=2:1)で精製して、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.30g、7.15mmol、73.5%収率、99.3%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 458.1[M+H]+。
ステップG:tert-ブチル-4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:2-(ジメチルアミノ)エタノール(583mg、6.54mmol、655μL、3.00当量)のトルエン(20.0mL)中溶液に、Pd(OAc)2(48.9mg、218μmol、0.10当量)、tert-ブチル-4-(7-ベンジル-2-クロロ-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、2.18mmol、1.00当量)、Cs2CO3(2.13g、6.54mmol、3.00当量)およびBINAP(272mg、436μmol、0.20当量)を加えた。反応混合物を、N2下、110℃で3時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(10mL)に溶解し、DCM(3×40mL)で抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=5:1→2:1、その後、DCM:MeOH=50:1→5:1)で精製して、エチル tert-ブチル-4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(900mg、1.76mmol、80.8%収率)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 511.2[M+H]+。
ステップH:tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.57mmol、1.00当量)のMeOH(20.0mL)中溶液に、N2下でPd/C(100mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(50psi)下、40℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3×200mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、1.07mmol、68.2%収率)を褐色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 421.3[M+H]+。
ステップI:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(380mg、904μmol、1.00当量)および3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(311mg、994μmol、1.10当量)のジオキサン(8.00mL)中の混合物に、Cs2CO3(883mg、2.71mmol、3.00当量)および2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(84.3mg、181μmol、0.20当量)およびPd2(dba)3(82.7mg、90.4μmol、0.10当量)を加えた。反応混合物をN2下、90℃で12時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をDCM(50mL)と水(20mL)との間で分配した。反応混合物をDCM(50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジエチルエーテル:酢酸エチル=5:1、次いで、DCM:MeOH=100:1→5:1)で精製し、続いて、分取TLC(DCM:MeOH=10:1)による単離生成物の精製により、tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、306μmol、33.9%収率)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 653.4[M+H]+。
ステップJ:4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール ビス-トリフルオロアセテート:tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、177μmol、1.00当量)のDCM(130.00μL)中溶液に、TFA(202mg、1.78mmol、132μL、10.00当量)を加えた。反応混合物を20℃で1時間撹拌した。溶媒を真空下で除去し、4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール ビス-トリフルオロアセテート(175.00mg)を褐色油として得て、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップK:1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-8-メチル-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール ビス-トリフルオロアセテート(97.4mg、141μmol、1.00当量)のDCM(500.00μL)中溶液に、DIEA(222mg、1.72mmol、300μL、12.2当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(14.2mg、113μmol、0.80当量)を-40℃で加えた。反応混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。反応混合物をMeOHの滴下によりクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(DCM:MeOH=10:1)で精製し、次いで、分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*、10μ;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%、13分)により精製して、1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-8-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(10.7mg、20.7μmol、3ステップで6.8%収率)を褐色油として得た。ESI MS m/z 517.2[M+H]+。
実施例48
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロ酢酸塩
ステップA:エチル 4-[ベンジル-(2-エトキシ-2-オキソ-エチル)アミノ]ペンタノエート:エチル 4-オキソペンタノエート(47.0g、326mmol、46.5mL、1.50当量)、エチル 2-(ベンジルアミノ)アセテート(42.0g、217.3mmol、1.00当量)およびAcOH(13.0g、217mmol、12.4mL、1.00当量)のDCM(800mL)中の溶液を、12~18℃で30分撹拌し、次いで0~5℃に冷却し、NaBH(OAc)3(138g、652mmol、3.00当量)を何度かに分けて加えた。混合物を10~18℃に温め、16時間撹拌した。反応混合物を水(1000mL)でクエンチし、DCM(2×500mL)で抽出した。合わせた有機相を乾燥し、濃縮乾固した。残留物を、ジエチルエーテル/酢酸エチル(60:1→40:1)で溶出するシリカゲルカラムにより精製し、エチル 4-[ベンジル-(2-エトキシ-2-オキソ-エチル)アミノ]ペンタノエート(42.0g、91.5mmol、42.1%収率、70%純度)を無色油として得た。ESI MS m/z 322.2[M+H]+。
ステップB:エチル 1-ベンジル-2-メチル-5-オキソ-ピペリジン-4-カルボキシレート:エチル 4-[ベンジル-(2-エトキシ-2-オキソエチル)アミノ]ペンタノエート(37.00g、115.12mmol、1.00当量)およびt-BuOK(16.8g、150mmol、1.30当量)のトルエン(30.0mL)中溶液を25℃で5時間撹拌した。反応物を水(50mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×30mL)で抽出した。合わせた有機抽出物を乾燥し、濃縮乾固して、エチル 1-ベンジル-2-メチル-5-オキソ-ピペリジン-4-カルボキシレート(14.6g、53.0mmol、46%収率)を黄色油として得て、これを次のステップに直接使用した。
ステップC:7-ベンジル-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール:Na(3.05g、133mmol、3.14mL、2.50当量)をEtOH(280mL)に溶解し、次いで、エチル 1-ベンジル-2-メチル-5-オキソ-ピペリジン-4-カルボキシレート(14.6g、53.0mmol、1.00当量)および尿素(7.96g、133mmol、7.11mL、2.50当量)を加えた。反応混合物をN2下で16時間、加熱還流(78℃)した。反応混合物を濃縮乾固した。残留物を水(100mL)に溶解し、MTBE(100mL)で洗浄した。6NのHCl(2mL)で水相のpHを6~7に調節した。得られた固体を濾過により集め、真空下,60℃で乾燥して、7-ベンジル-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(5.00g、17.1mmol、32.3%収率、93%純度)を淡黄色固体として得た。
ステップD:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:POCl3(49.5g、323mmol、30.0mL、58.4当量)および7-ベンジル-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2,4-ジオール(1.50g、5.53mmol、1.00当量)を100℃に12時間加熱還流した。反応物を濃縮乾固してPOCl3を除去した。残留物をDCM(40mL)に溶解し、飽和NaHCO3水溶液/飽和Na2CO3水溶液(1/1、60mL)で洗浄した。混合物を濾過し、有機層をNa2SO4上で乾燥後、濾過し、真空下で濃縮して、7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(2.08g、粗製)を褐色固体として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ESI MS m/z 307.9、309.9[M+H]+。
ステップE:4-(7-ベンジル-2-クロロ-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(2.50g、8.11mmol、1.00当量)およびtert-ブチル ピペラジン-1-カルボキシレート(1.54g、8.27mmol、1.02当量)のジオキサン(50.0mL)中混合物に、DIEA(3.14g、24.3mmol、4.25mL、3.00当量)を加えた。混合物を60℃で20時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(20mL)で希釈し、DCM(2×80mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を自動化フラッシュクロマトグラフィーシステム(ジエチルエーテル/酢酸エチル=50:1→2:1)で精製して、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.59g、5.29mmol、65.2%収率、93.5%純度)を黄色固体として得た。
ステップF:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:2-(ジメチルアミノ)エタノール(701mg、7.86mmol、788μL、3.00当量)のTHF(45.0mL)中溶液に、NaH(210mg、5.24mmol、60.0%純度、2.00当量)をN2下、15℃で加えた。15℃で0.5時間撹拌後、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.20g、2.62mmol、1.00当量)を加えた。シールドチューブ中で混合物を110℃で18時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をAl2O3カラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH 100:1→10:1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.38g、2.36mmol、90.3%収率、87.5%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 511.3[M+H]+。
ステップG:tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.50g、2.94mmol、1.00当量)のMeOH(80.0mL)中溶液に、N2下でPd/C(450mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを4回実施した。混合物を水素(50psi)下、40℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH=40/1→10/1)で精製して、tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.15g、2.46mmol、83.7%収率、90.0%純度)を黄色油として得た。
ステップH:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:Pd2(dba)3(109mg、119μmol、0.10当量)を、tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、1.19mmol、1.00当量)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(410mg、1.31mmol、1.10当量)、2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(111mg、238μmol、0.20当量)およびCs2CO3(1.16g、3.57mmol、3.00当量)のジオキサン(10.0mL)中溶液に加えた。反応混合物を、N2下、90℃で12時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(5mL)で希釈し、DCM(2×20ml)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。残留物をAl2O3カラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH 100:1→10:1)、および分取TLC(DCM/MeOH 5:1)で精製し、tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(309mg、453μmol、38.1%収率、95.8%純度)を黄色油として得た。
ステップI:tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(340mg、521μmol、1.00当量)のMeOH(6.80mL)中溶液に、N2下でPd/C(120mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを4回実施した。混合物を水素(15psi)下、40℃で1.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、312μmol、59.8%収率、83.5%純度)を桃色固体として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 563.3[M+H]+。
ステップJ:4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール トリフルオロ酢酸塩:tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、320μmol、1.00当量)のDCM(240μL)中溶液に、TFA(365mg、3.20mmol、237μL、10.0当量)を加えた。混合物を18℃で0.5時間撹拌した。混合物を減圧真空下で濃縮して、4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール トリフルオロ酢酸塩(273mg)を黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
ステップK:1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6-メチル-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール トリフルオロアセテート(148mg、320μmol、1.00当量)およびDIEA(494mg、3.83mmol、668μL、12.0当量)のDCM(500μL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(32.3mg、256μmol、0.80当量)を-50℃で滴加した。混合物を-40℃~-20℃で30分間撹拌した。反応物をMeOH(20.5mg)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*、10μ;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:8%~38%、13分)により精製して、1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6-メチル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロアセテート(73.7mg、113μmol、35.2%収率、96.3%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 517.3[M+H]+。
実施例49
1-(4-(2-(2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エタノール(401mg、3.01mmol、1.60当量)、tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-メチルスルホニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.00g、1.88mmol、1.00当量)、Cs2CO3(1.84g、5.64mmol、3.00当量)、Pd(OAc)2(42.2mg、188μmol、0.10当量)およびBINAP(234mg、376μmol、0.20当量)のトルエン(50.00mL)中混合物を110℃で3時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 10:1→100:1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.20g、1.07mmol、56.8%収率、52%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 585.3[M+H]+。
ステップB:ベンジル 4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.20g、2.05mmol、1.00当量)のDCM(10.00mL)中溶液に、TFA(3.51g、30.8mmol、2.28mL、15.00当量)を0℃で加えた。混合物を25℃に温め、16時間撹拌した。混合物を水(100mL)で希釈し、溶液を酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。水層を飽和炭酸ナトリウム水溶液(50mL)で塩基化し、次いで酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥後、濾過した。濾液を真空下で濃縮して、ベンジル 4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.65mmol、80.4%収率)を黄色ゴムとして得た。ESI MS m/z 485.3[M+H]+。
ステップC:ベンジル 4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(750mg、1.55mmol、1.00当量)、(3-メトキシ-1ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(949mg、3.10mmol、2.00当量)、2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(144.66mg、310.00μmol、0.20当量)、Pd2(dba)3(141.94mg、155.00μmol、0.10当量)およびCs2CO3(1.52g、4.65mmol、3.00当量)のトルエン(70.00mL)中混合物を、110℃で16時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、次いで、酢酸エチル(100mL)および水(100mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 10:1→酢酸エチル/メタノール 10:1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、ベンジル 4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、961μmol、62.0%収率、88%純度)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 641.3[M+H]+。
ステップD:2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:ベンジル 4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(700.00mg、1.09mmol、1.00当量)のMeOH中混合物を、無水Pd/C(140mg)を触媒として用いて40℃で4時間にわたり水素添加(15psi)した。触媒をCelite(登録商標)ペレットを通して濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(500mg、987μmol、90.6%収率)を褐色固体として得た。
ステップE:1-[4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(500mg、987μmol、1.00当量)およびDIEA(255mg、1.97mmol、345μL、2.00当量)のジクロロメタン(8mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(124mg、987μmol、1.00当量)のジクロロメタン(2mL)中溶液を窒素雰囲気下、-40℃で加えた。混合物を25℃に温め、1時間撹拌した。混合物を水(20mL)およびジクロロメタン(30mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×30mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ジクロロメタン/メタノール 100/1→10/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、1-[4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(450mg、714μmol、72.4%収率、89%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 561.2[M+H]+。
ステップF:1-[4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(400mg、713μmol、1.00当量)のDCM(2.00mL)中溶液に、BBr3(1.30g、5.19mmol、500μL、7.27当量)を窒素雰囲気下、-70℃で加えた。混合物を0℃に温め、1時間撹拌した。混合物をジクロロメタン(20mL)で希釈し、次いで重炭酸ナトリウム飽和水溶液(20mL)でクエンチした。分離した有機層をブライン(1×10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(Phenomenex Synergi C18 150*25*、10μ;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:18%~48%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、1-[4-[2-[2-(3-フルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(40.0mg、63.7μmol、8.92%収率、87%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 547.3[M+H]+。
実施例50
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:1-tert-ブチル 2-メチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(2.00g、6.80mmol、1.00当量)のDMSO(40.0mL)中溶液に、DIEA(1.76g、13.6mmol、2.38mL、2.00当量)および1-tert-ブチル 2-メチルピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(1.74g、7.14mmol、1.05当量)を加えた。混合物を55℃で16時間撹拌した。混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、ジエチルエーテル/酢酸エチル=1:0→3:1)で精製して、1-tert-ブチル 2-メチル-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(3.10g、5.70mmol、83.8%収率、92.3%純度)を黄色半固体として得た。ESI MS m/z 502.2[M+H]+。
ステップB:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル 2-メチル-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(3.00g、5.98mmol、1.00当量)、2-(ジメチルアミノ)エタノール(1.07g、12.0mmol、1.20mL、2.00当量)、Cs2CO3(4.87g、15.0mmol、2.50当量)、Pd(OAc)2(201mg、897μmol、0.15当量)およびBINAP(744mg、1.20mmol、0.20当量)のトルエン(60.0mL)中混合物を脱気および窒素によるパージを3回実施した後、混合物を窒素雰囲気下、110℃で3時間撹拌した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=1:0→5:1)で精製して、1-tert-ブチル 2-メチル-4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(3.10g、4.45mmol、80.4%収率、86.0%純度)を黒色油として得た。ESI MS m/z 555.3[M+H]+。
ステップC:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル 2-メチル-4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチル アミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(2.33g、4.20mmol、1.00当量)のMeOH(50.0mL)中溶液に、N2下でPd/C(233mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(50psi)下、40℃で36時間撹拌した。反応混合物を濾過し、有機相を濃縮乾固して、1-tert-ブチル-2-メチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(1.50g、粗製)を無色油として得て、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップD:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル-2-メチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(1.50g、粗製)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(1.49g、4.76mmol、1.30当量)、Cs2CO3(2.98g、9.15mmol、2.50当量)、Pd2(dba)3(503mg、549μmol、0.15当量)および2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(342mg、732μmol、0.20当量)のジオキサン(100mL)中混合物を脱気および窒素によるパージを3回実施し、混合物を窒素雰囲気下、85℃で5時間撹拌した。0℃で水(50mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、DCM(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×150mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=10:1→5:1)で精製して、1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(1.72g、2.25mmol、53.5%収率、91%純度)を黄色として得た。ESI MS m/z 697.3[M+H]+。
ステップE:メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-カルボキシレート:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(1.32g、1.89mmol、1.00当量)のDCM(20.0mL)中溶液に、TFA(4.31g、37.8mmol、2.80mL、20.0当量)を0℃で加え、反応混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固した。残留物をDCM(50mL)およびH2O(20mL)に溶解し、反応混合物を飽和NaHCO3でpH8に調節した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、濾過し、減圧下で濃縮して、メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-カルボキシレート(1.12g、1.87mmol、69.6%収率、70%純度)を褐色油として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ESI MS m/z 597.4[M+H]+。
ステップF:[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]メタノール:メチル-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-カルボキシレート(400mg、0.670mmol)のTHF(5.00mL)中混合物に、LiAlH4(102mg、2.68mmol、4.00当量)を0℃で加えた。反応混合物に対し、脱気と窒素によるパージを3回行い、窒素雰囲気下、0℃で2時間撹拌した。0℃でNa2SO4・10H2O(0.5g)を加えることにより反応混合物をクエンチし、次いでDCM(50mL)で希釈した。合わせた有機層を濾過し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]メタノール(280mg、0.493mmol、73.6%収率)を黄色半固体として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ESI MS m/z 569.3[M+H]+。
ステップG:2-[[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-4-[3-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン:[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]メタノール(250mg、440μmol、1.00当量)およびNaH(176mg、4.40mmol、60.0%純度10.0当量)のTHF(10.0mL)中撹拌溶液に、tert-ブチルジメチルシリルクロリド(232mg、1.54mmol、189μL、3.50当量)を0℃で加えた。混合物を窒素雰囲気下、25℃で12時間撹拌した。0℃で水(25mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、DCM(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物を分取TLC(SiO2、DCM/MeOH=10:1)で精製して、2-[[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-4-[3-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチル-エタンアミン(128mg、180μmol、40.9%収率、96.0%純度)を無色半固体として得た。ESI MS m/z 683.3[M+H]+。
ステップH:1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:2-[[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-4-[3-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチル-エタンアミン(128mg、187μmol、1.00当量)およびトリエチルアミン(47.4mg、469μmol、65.0μL、2.50当量)のDCM(5.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(35.5mg、281μmol、1.50当量)を-40℃で滴加し、30分間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固した。残留物を分取TLC(SiO2、DCM/MeOH=10:1)で精製して、1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(92.0mg、101μmol、54.0%収率、81.0%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 737.3[M+H]+。
ステップI:1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(92.0mg、125μmol、1.00当量)のDCM(8.00mL)中混合物に、BBr3(17.0mg、67.8μmol、6.53μL、10.0当量)を加えた。混合物を窒素雰囲気下、-40℃で30分間撹拌し、次いで25℃で減圧下濃縮乾固した。残留物に、飽和NaHCO3水溶液(0.5mL)を加えた。溶液を0℃でpH7に調節し、次いでMeOH(2.0mL)を加えた。溶液を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*、10μ;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%、11分)により精製した。目的の画分を集め、減圧下濃縮してMeCNを除去し、凍結乾燥して、1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(6.30mg、11.2μmol、9.00%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 533.2[M+H]+。
実施例51
1-アクリロイル-4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-N,N-ジメチルピペラジン-2-カルボキサミド
ステップA:4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-tert-ブトキシカルボニルピペラジン-2-カルボン酸:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(300mg、431μmol、1.00当量)のTHF(4.00mL)およびH2O(1.00mL)中溶液に、NaOH(68.9mg、1.72mmol、4.00当量)を加えた。混合物を窒素雰囲気下、25℃で12時間撹拌した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、反応混合物をHCl(6M)でpH6に調節し、次いでDCM(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥後、濾過し、減圧下で濃縮乾固して、4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-tert-ブトキシカルボニルピペラジン-2-カルボン酸(310mg、粗製)を黄色固体として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ESI MS m/z 683.3[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ジメチルカルバモイル)ピペラジン-1-カルボキシレート:4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-tert-ブトキシカルボニルピペラジン-2-カルボン酸(310mg、粗製)およびDIEA(352mg、2.72mmol、476μL)のDCM(10.0mL)中混合物にHATU(259mg、681μmol)を0℃で何度かに分けて加えた。30分撹拌後、N-メチルメタンアミン(130mg、1.59mmol、146μL、HCl)を1度に加えた。反応混合物に対し、脱気と窒素によるパージを3回行った。窒素雰囲気下、25℃で12時間撹拌後、反応混合物を0℃で水(50mL)で希釈し、DCM(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をHCl(1M)でpH6に調節し、ブライン(3×50mL)および水(3×50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮乾固して、tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ジメチルカルバモイル)ピペラジン-1-カルボキシレート(345mg、428μmol、2ステップで94.2%収率、88.0%純度)を黄色半固体として得た。ESI MS m/z 710.3[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ジメチルカルバモイル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ジメチルカルバモイル)ピペラジン-1-カルボキシレート(345mg、486μmol、1.00当量)のMeOH(5.00mL)中溶液に、N2下でPd/C(80.0mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(15psi)下、25℃で8時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮乾固して、tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ジメチルカルバモイル)ピペラジン-1-カルボキシレート(197mg、粗製)を褐色固体として得て、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 620.3[M+H]+。
ステップD:4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-N,N-ジメチル-ピペラジン-2-カルボキサミド:tert-ブチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ジメチルカルバモイル)ピペラジン-1-カルボキシレート(197mg、粗製)のDCM(5.00mL)中の混合物に、HCl/ジオキサン(4M、1.61mL)を0℃で加えた。反応混合物に対し、脱気と窒素によるパージを3回行い、窒素雰囲気下、25℃で2時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*、10μ;移動相:[水(0.05%HCl)-ACN];B%:10%~30%、7.8分)により精製した。集めた水相を凍結乾燥して乾固し、4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-N,N-ジメチル-ピペラジン-2-カルボキサミド(90.0mg、171μmol、53.1%収率、99.0%純度)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 520.2[M+H]+。
ステップE:4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-N,N-ジメチル-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-カルボキサミド:4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-N,N-ジメチル-ピペラジン-2-カルボキサミド(70.0mg、135μmol、1.00当量)のDMAC(500μL)中溶液に、トリエチルアミン(40.9mg、404μmol、56.0μL、3.00当量)を0℃で加えた、次いでプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(2.55mg、20.2μmol、0.15当量)を加えた。混合物を窒素雰囲気下、0℃で2時間撹拌した。反応混合物を濾過し、集めた有機層を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*、10μ;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%、12分)により精製した。集めた水相を凍結乾燥し、4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-N,N-ジメチル-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-カルボキサミド(10.0mg、16.5μmol、12.2%収率、94.6%純度)を黄色半固体として得た。ESI MS m/z 574.2[M+H]+。
実施例52
1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:2-(1-ピペリジル)エタノール(872mg、6.75mmol、899μL、3.00当量)のトルエン(40.0mL)中溶液に、Pd(OAc)2(50.5mg、225μmol、0.10当量)、Cs2CO3(2.20g、6.75mmol、3.00当量)、BINAP(280mg、450μmol、0.20当量)およびtert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、2.25mmol、1.00当量)を加えた。混合物をN2下、110℃で12時間撹拌し、次いで真空下で濃縮した。残留物を水(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(3×20mL)で抽出し、ブライン(1×50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=10:1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、1.30mmol、58.0%収率)を赤色固体として得た。ESI MS m/z 537.3[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-[2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.12mmol、1.00当量)のMeOH(50.0mL)中混合物に、Pd/C(67.2mg、10%)を加えた。50psiのH2下、混合物を40℃で24時間撹拌した。混合物を濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、粗製)を褐色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。ESI MS m/z 447.3[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg)、(3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(343mg、1.12mmol)のトルエン(6.00mL)中溶液に、2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(52.3mg、112μmol)、Pd2(dba)3(32.19mg、55.98μmol)およびCs2CO3(548mg、1.68mmol)を加えた。N2下、110℃で72時間撹拌後、混合物を真空下で濃縮し、水(20.0mL)で希釈して、酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出し、ブライン(1×50.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=10:1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、232μmol、2ステップで41.5%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 603.3[M+H]+。
ステップD:7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、199μmol、1.00当量)およびTFA(340mg、2.99mmol、221μL、15.0当量)のDCM(1.00mL)中混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン ビス-トリフルオロアセテート(145mg、粗製)を黄色固体として得て、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。ESI MS m/z 503.3[M+H]+。
ステップE:1-[4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン ビス-トリフルオロアセテート(145mg、粗製)およびEt3N(221mg、2.18mmol、303μL)のDCM(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(25.0mg、198μmol)を-78℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌後、混合物をMeOHでクエンチし、真空下で濃縮した。混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=10:1)で精製して、1-[4[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(90.0mg、162μmol、2ステップで81.5%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 557.3[M+H]+。
ステップF:1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(90.0mg、162μmol、1.00当量)のDCM(2.00mL)中溶液に、BBr3(405mg、1.62mmol、156μL、10.0当量)を-78℃で加えた。0℃で1時間撹拌後、-78℃で混合物を飽和重炭酸ナトリウム溶液でクエンチし、0℃で0.5時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出し、ブライン(1×40.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、真空下濃縮した。反応混合物を分取HPLC(Phenomenex Gemini 150*25mm*、10μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、10分)により精製して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(6.19mg、10.8μmol、6.71%収率、95%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 543.2[M+H]+。
実施例53
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(3.00g、10.2mmol、1.00当量)、1-tert-ブチル-3-メチルピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(2.62g、10.7mmol、1.05当量)、DIEA(3.30g、25.5mmol、4.45mL、2.50当量)のDMSO(50.0mL)中混合物の、脱気および窒素によるパージを3回行った。混合物を窒素雰囲気下、100℃で12時間撹拌した。反応混合物をDCM(200mL)で希釈し、ブライン(3×50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10:1→3:1)で精製して、1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(2.10g、3.81mmol、37.4%収率、91.0%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 502.1[M+H]+。
ステップB:1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-ベンジル-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(2.10g、4.17mmol、1.00当量)、2-(ジメチルアミノ)エタノール(929mg、10.4mmol、1.04mL、2.50当量)、Pd(OAc)2(140mg、625μmol、0.15当量)、BINAP(519mg、833μmol、0.20当量)およびCs2CO3(3.39g、10.4mmol、2.50当量)のトルエン(60.0mL)中混合物を、脱気および窒素によるパージを3回実施した。混合物を窒素雰囲気下、110℃で3時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=30:1→10:1)で精製して、1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-ベンジル-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(1.30g、1.67mmol、40.0%収率、71.4%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 555.3[M+H]+。
ステップC:1-tert-ブチル 3-メチル 4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-ベンジル-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(1.30g、2.34mmol、1.00当量)のMeOH(15.0mL)中溶液に、N2下でPd/C(300mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と水素によるパージを数回実施した。混合物を水素(50psi)下、45℃で48時間撹拌した。触媒を濾過し、濾液を減圧下で濃縮して、1-tert-ブチル 3-メチル 4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(780mg、粗製)を無色油として得て、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップD:1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル 3-メチル 4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(780mg、粗製)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(684mg、2.18mmol)、Pd2(dba)3(231mg、252μmol)、Cs2CO3(1.37g、4.20mmol)および2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル(RuPhos)(157mg、336μmol)のジオキサン(20.0mL)中混合物を、脱気および窒素によるパージを3回実施した。混合物を窒素雰囲気下、85℃で5時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=10:1→5:1)で精製して、1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(750mg、1.02mmol、2ステップで43.6%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.10(d,J=8.0Hz,1H),7.73(d,J=8.0Hz,1H),7.58-7.31(m,8H),7.00(d,J=2.0Hz,1H),6.89(d,J=2.0Hz,1H),5.18(s,2H),4.75(br s,1H),4.45(br d,J=13.2Hz,1H),4.42-4.34(m,1H),4.34-4.28(m,1H),4.15(br s.,2H),4.13-3.91(m,1H),3.85-3.70(m,5H),3.49-3.33(m,2H),3.31-3.07(m,2H),2.99(br s,1H),2.83-2.68(m,3H),2.35(s,6H),1.48(s,9H)。
ステップE:メチル 1-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-カルボキシレート:1-tert-ブチル 3-メチル 4-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,3-ジカルボキシレート(200mg、287μmol、1.00当量)のDCM(5.00mL)中溶液に、TFA(770mg、6.75mmol、500μL、23.5当量)を0℃で加えた。混合物を窒素雰囲気下、25℃で2時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固した。残留物をDCM(100mL)および水(50mL)に溶解し、溶液を飽和Na2CO3水溶液でpH8に調節した後、DCM(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮し、メチル 1-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-カルボキシレート(171mg、263μmol、91.6%収率、91.7%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 597.2[M+H]+。
ステップF:(1-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)メタノール:メチル 1-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-カルボキシレート(171mg、287μmol、1.00当量)のTHF(5.00mL)中混合物に、LiAlH4(65.3mg、1.72mmol、6.00当量)を0℃で加えた。25℃で2時間撹拌後、0℃で水(30mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、DCM(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×30mL)で洗浄した。集めた有機相を、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、(1-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)メタノール(160mg、281μmol、98.2%収率、100%純度)を無色半固体として得た。ESI MS m/z 569.2[M+H]+。
ステップG:2-((7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(2-(((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルエタンアミン:(1-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)メタノール(160mg、281μmol、1.00当量)のTHF(5.00mL)中混合物に、NaH(94.0mg、2.35mmol、60.0%純度8.00当量)を0℃で加えた。30分撹拌後、tert-ブチルジメチルシリルクロリド(133mg、881μmol、108μL,3.00当量)を滴加した。混合物を窒素雰囲気下、25℃で6時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して、2-((7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(2-(((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルエタンアミン(133mg、165μmol、56.1%収率、84.6%純度)を黄色がかった固体として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 683.2[M+H]+。
ステップH:1-(4-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-(((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:2-((7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(2-(((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルエタンアミン(133mg、165μmol、1.00当量)およびTEA(39.4mg、389μmol、54.0μL、2.00当量)のDCM(3.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(31.9mg、253μmol、1.30当量)を-40℃で加えた。-40℃で2時間撹拌後、反応混合物をMeOH(1M)でクエンチし、減圧下で濃縮して、1-(4-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-(((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(140mg、粗製)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 737.2[M+H]+。
ステップI:1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:1-(4-(7-(3-(ベンジルオキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-(((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)メチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(140mg、粗製)のDCM(5.00mL)中溶液に、BBr3(476mg、1.90mmol、183μL)を-40℃で加えた。窒素雰囲気下、-40℃で2時間撹拌後、混合物を減圧下濃縮乾固した。水(0.5mL)およびMeOH(2.5mL)を加え、得られた溶液を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:27%~57%、11分)で精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(4.32mg、7.94μmol、4.18%収率、97.9%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 533.4[M+H]+。
実施例54
1-[4-[7-(3-アミノ-1-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:Na(4.24g、184mmol、4.37mL、2.50当量)のEtOH(400mL)中溶液に、1-tert-ブチル 4-エチル 3-オキソピペリジン-1,4-ジカルボキシレート(20.0g、73.7mmol、1.00当量)および酢酸メタンイミドアミド(11.5g、111mmol、1.50当量)をN2下で加えた。混合物を70℃で5時間撹拌した。反応混合物をHCl(1N)でpH7に調節し、DCM(3×200mL)で抽出し、ブライン(1×400mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮して、tert-ブチル 4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(16.0g、63.7mmol、86.4%収率)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 274.0[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(16.0g、63.7mmol、1.00当量)のDMF(4.00mL)中溶液に、DBU(29.1g、191mmol、28.8mL、3.00当量)およびベンゾトリアゾール-1-イル-オキシトリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスフェート(PYBOP)(39.8g、76.4mmol、1,20当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。ベンジル ピペラジン-1-カルボキシレート(21.0g、95.5mmol、18.5mL、1.50当量)を加え、反応混合物を25℃で16時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(500mL)で希釈し、水(3×400mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過して、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、ジエチルエーテル/酢酸エチル=1:1)で精製して、tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.00g、4.41mmol、6、93%収率)を黄色油として得た。ESI MS m/z 454.3[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-(4-ベンジルオキシカルボニルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.20g、2.65mmol、1.00当量)およびTFA(4.53g、39.7mmol、2.94mL、15.0当量)のDCM(2.00mL)中混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。濃縮物質を飽和NaHCO3水溶液でpH8に調節し、次いで酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出し、ブライン(1×100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、ベンジル 4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、2.26mmol、85.4%収率)を黄色油として得た。ESI MS m/z 354.3[M+H]+。
ステップD:ベンジル 4-[7-[3-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-1-イソキノリル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル N-(1-ブロモ-3-イソキノリル)カルバメート(330mg、1.02mmol、1.00当量)、DIEA(264mg、2.04mmol、357μL、2.00当量)およびベンジル 4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(541mg、1.53mmol、1.50当量)のDMSO(3.00mL)中混合物を80℃で10時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(3×20mL)で抽出した。合わせた抽出物を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相カラム(TFA、0.1%)で精製して、ベンジル 4-[7-[3-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-1-イソキノリル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、665μmol、65.2%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 596.3[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル N-[1-(4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル)-3-イソキノリル]カルバメート:ベンジル 4-[7-[3-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-1-イソキノリル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、403μmol、1.00当量)、KOH(36.2mg、645μmol、1.60当量)のH2O(2.40mL)およびn-ブチルアルコール(2.40mL)中混合物を100℃で12時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(3×5.00mL)で希釈し、ブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル N-[1-(4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル)-3-イソキノリル]カルバメート(150mg、325μmol、80.7%収率)を黄色油として得た。ESI MS m/z 462.3[M+H]+。
ステップF:1-(4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル)イソキノリン-3-アミン トリフルオロアセテート:tert-ブチル N-[1-(4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル)-3-イソキノリル]カルバメート(150mg、325μmol、1.00当量)およびTFA(556mg、4.87mmol、361μL、15.0当量)のDCM(360μL)中溶液を25℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、1-(4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル)イソキノリン-3-アミン トリフルオロアセテート(154.52mg、粗製)を黄色固体として得て、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
ステップG:1-[4-[7-(3-アミノ-1-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-(4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル)イソキノリン-3-アミン トリフルオロアセテート(150mg、粗製)およびEt3N(319mg、3.15mmol、437μL)のDCM(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(31.8mg、252μmol)を-40℃で加えた、次いで-40℃で0.5時間撹拌した。混合物をMeOH(20.22mg、630.96μmol)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(Phenomenex Gemini 150*25mm*、10μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:26%~56%、10分)により精製して、1-[4-[7-(3-アミノ-1-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(35.4mg、82.5μmol、26.2%収率、96.8%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 416.3[M+H]+。
実施例55
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)-3-ヒドロキシプロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ジメチルアミノ)プロパン-1,3-ジオールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 533.3[M+H]+。
実施例56
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-モルホリノプロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-モルホリノプロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 559.3[M+H]+。
実施例57
(S)-5-(((4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-2-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(S)-5-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-2-オンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例58
(R)-5-(((4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-2-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-5-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-2-オンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.2[M+H]+。
実施例59
N-(2-((4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)エチル)アセトアミド
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりにN-(2-ヒドロキシエチル)アセトアミドを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.3[M+H]+。
実施例60
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)ブタン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-(ジメチルアミノ)ブタン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 545.3[M+H]+。
実施例61
(S)-6-(((4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピペリジン-2-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに6-(ヒドロキシメチル)ピペリジン-2-オンを使用して合成し、生成物をキラルクロマトグラフィーにより分離した。ピーク2は、(S)立体化学に割り当てたが、これは確認しなかった。ES+APCI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例62
(R)-6-(((4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピペリジン-2-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに6-(ヒドロキシメチル)ピペリジン-2-オンを使用して合成し、キラルクロマトグラフィーにより分離した。ピーク1を(R)立体化学に割り当てたが、この立体化学を確認することはしなかった。ES+APCI MS m/z 543.2[M+H]+。
実施例63
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-((R)-3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-((R)-3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例64
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-((S)-3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-((S)-3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例65
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-((S)-3-ヒドロキシピロリジン-1-イル)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-((S)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-イル)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 559.3[M+H]+。
実施例66
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-3-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(S)-1-メチルピペリジン-3-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例67
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-3-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-メチルピペリジン-3-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例68
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに1-ヨードナフタレンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 501.3[M+H]+。
実施例69
1-(4-(7-(イソキノリン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例1の方法に従い、ステップCで、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに4-ブロモイソキノリンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 401.2[M+H]+。
実施例70
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-(メチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに1-(メチルアミノ)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 503.3[M+H]+。
実施例71
1-(4-(7-(2-ヒドロキシ-1-フェニルエチル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例1の方法に従い、ステップCで、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-フェニルエチルメタンスルホネートを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 394.2[M+H]+。
実施例72
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(1-メチルピペリジン-3-イル)メタノールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例73
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ジメチルアミノ)プロパン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.2[M+H]+。
実施例74
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-モルホリノプロパン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 559.3[M+H]+。
実施例75
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-(ピペリジン-1-イル)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-(ピペリジン-1-イル)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 557.3[M+H]+。
実施例76
(R)-1-(4-(7-(3-クロロ-5-ヒドロキシ-2-イソプロピルフェニル)-2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに1-ブロモ-3-クロロ-2-イソプロピル-5-(メトキシメトキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 545.3[M+H]+。
実施例77
1-(4-(2-(2-((1S,4R)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-((1S,4R)-2-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 555.2[M+H]+。
実施例78
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(5-ヒドロキシ-2-(トリフルオロメトキシ)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-4-(メトキシメトキシ)-1-(トリフルオロメトキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 551.2[M+H]+。
実施例79
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(5-ヒドロキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-4-(メトキシメトキシ)-1-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 535.2[M+H]+。
実施例80
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((4-メチルピペラジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(4-メチルピペラジン-2-イル)メタノールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 544.3[M+H]+。
実施例81
1-(2-((4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)エチル)ピペリジン-4-カルボニトリル
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに1-(2-ヒドロキシエチル)ピペリジン-4-カルボニトリルを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 568.2[M+H]+。
実施例82
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-(4-メチルピペラジン-1-イル)プロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-(4-メチルピペラジン-1-イル)プロパン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 572.4[M+H]+。
実施例83
1-(4-(2-(2-((2-ヒドロキシエチル)(メチル)アミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-((2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)(メチル)アミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 533.3[M+H]+。
実施例84
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(2-フルオロ-6-ヒドロキシ-3-メチルフェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-3-フルオロ-1-(メトキシメトキシ)-4-メチルベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 499.3[M+H]+。
実施例85
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピロリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ピロリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.2[M+H]+。
実施例86
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(2-ヒドロキシ-5-(トリフルオロメトキシ)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-1-(メトキシメトキシ)-4-(トリフルオロメトキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 551.2[M+H]+。
実施例87
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-フルオロ-2-ヒドロキシ-6-メチルフェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-4-フルオロ-3-(メトキシメトキシ)-1-メチルベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 499.2[M+H]+。
実施例88
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(2-メチルピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(S)-2-(2-メチルピペリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 557.2[M+H]+。
実施例89
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(1-メチルピロリジン-3-イル)メタノールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例90
1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2-(トリフルオロメトキシ)フェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-モルホリノプロパン-1-オールを使用し、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-4-(メトキシメトキシ)-1-(トリフルオロメトキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 593.2[M+H]+。
実施例91
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシ-5-(トリフルオロメトキシ)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに3-ブロモ-1-(メトキシメトキシ)-5-(トリフルオロメトキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 551.2[M+H]+。
実施例92
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(4-メチルピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(4-メチルピペリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 557.2[M+H]+。
実施例93
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((4-モルホリノブタン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに4-モルホリノブタン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例94
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(5-ヒドロキシ-2-メトキシフェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに3-ブロモ-1-(メトキシメトキシ)-4-メトキシベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 497.2[M+H]+。
実施例95
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(2-ヒドロキシ-6-メチルフェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-1-(メトキシメトキシ)-3-メチルベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 481.2[M+H]+。
実施例96
1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2-イソプロポキシフェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-モルホリノプロパン-1-オールを使用し、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-4-(メトキシメトキシ)-1-(イソプロポキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 567.2[M+H]+。
実施例97
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(2-メチルピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-2-(2-メチルピペリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 557.3。
実施例98
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(3-メトキシピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステッBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(S)-2-(3-メトキシピペリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 557.3[M+H]+。
実施例99
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(3-メトキシピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-2-(3-メトキシピペリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 557.3[M+H]+。
実施例100
1-(4-(2-((1-シクロプロピルピペリジン-4-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(1-シクロプロピルピペリジン-4-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 555.3[M+H]+。
実施例101
1-(4-(2-(3-(1,4-オキサゼパン-4-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(3-(1,4-オキサゼパン-4-イル)プロパン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例102
1-(4-(2-(3-(1,4-オキサゼパン-4-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに、2-(ジエチルアミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 531.3[M+H]+。
実施例103
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに、(1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-3-イル)メタノールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例104
1-(4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 571.3[M+H]+。
実施例105
1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2-メチルフェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-モルホリノプロパン-1-オールを使用し、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-4-(メトキシメトキシ)-1-メチルベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 523.3[M+H]+。
実施例106
1-(4-(7-(4-ヒドロキシ-2-(トリフルオロメトキシ)フェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-モルホリノプロパン-1-オールを使用し、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに2-ブロモ-5-(メトキシメトキシ)-1-(トリフルオロメトキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 593.2[M+H]+。
実施例107
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-((2-メトキシエチル)(メチル)アミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-((2-メトキシエチル)(メチル)アミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 547.3[M+H]+。
実施例108
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(4-メトキシピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(4-メトキシピペリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例109
1-(4-(2-(2-(4,4-ジフルオロピペリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(4,4-ジフルオロピペリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 579.2[M+H]+。
実施例110
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-(1-メチルピロリジン-3-イル)メタノールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例111
(S)-1-(4-(2-(2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(S)-2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 561.3[M+H]+。
実施例112
1-(4-(7-(3-(ジフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-モルホリノプロパン-1-オールを使用し、ステップDで、(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネートの代わりに1-ブロモ-3-(ジフルオロメチル)ナフタレン(0.129g、0.503mmol)を使用して合成した。ES+APCI MS m/z 593.2[M+H]+。
実施例113
4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-7,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-6(5H)-オン
ステップA:tert-ブチル 4-(6-フルオロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:4-クロロ-6-フルオロピリド[3,4-d]ピリミジン(1.07g、5.83mmol)のDCM(20mL)中溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(2.09mL、11.7mmol)、続けて、tert-ブチル ピペラジン-1-カルボキシレート(1.19g、6.41mmol)を加え、反応物を室温で2時間撹拌した。反応混合物をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル 4-(6-フルオロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.8g、92.6%)を得て、これを次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 334.1[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-(6-(ベンジルオキシ)ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:フェニルメタノール(0.65g、6.0mmol)のDMA(10mL)中溶液に、水素化ナトリウム(0.24g、6.0mmol)を少しずつ加え、窒素で脱気し、反応混合物を室温で30分間撹拌した。反応物にtert-ブチル 4-(6-フルオロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.0g、3.0mmol)を固体として加え、反応混合物を室温で3時間撹拌した。反応物を水(300mL)中に注ぎ込み、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。粗製物を、0→100%酢酸エチル/DCMの勾配液を溶出液として用いてクロマトグラフ処理して、tert-ブチル 4-(6-(ベンジルオキシ)ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.4g、0.95mmol、32%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 422.2[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-(6-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(6-(ベンジルオキシ)ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.40g、0.95mmol)の95%エタノール(30mL)中の窒素でパージした溶液に、Pd/C(0.10g、0.95mmol)を加えた。反応物に対する、真空による排気と水素による充填を3回行った。3回目の充填後、反応混合物を室温で4時間撹拌した。反応物を再度窒素で脱気し、スラリーをセライト(登録商標)を通して濾過し、濾液を減圧下で濃縮して、tert-ブチル 4-(6-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.4g、126%)を得た。ES+APCI MS m/z 334.4[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-6-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:シールドチューブ中の、tert-ブチル 4-(6-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.28g、0.84mmol)のジオキサン(4mL)中溶液に、リン酸カリウム(0.36g、1.7mmol)、N1,N2-ジメチルエタン-1,2-ジアミン(0.074g、0.84mmol)および1-ヨード-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン(0.53g、1.7mmol)を加えた。反応物をアルゴンで20分間スパージし、続けて、銅(I)ヨージド(0.16g、0.84mmol)を加えた。反応容器を密閉し、100℃に一晩加熱した。反応物を水で希釈し、水層を酢酸エチル(2×150mL)で抽出した。有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。その物質を、0→100%酢酸エチル/DCMの勾配液を溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、tert-ブチル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-6-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.30g、0.58mmol、69%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 520.2[M+H]+。
ステップE:7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-7,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-6(5H)-オン:tert-ブチル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-6-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.30g、0.58mmol)のメタノール(10mL)中溶液に、塩化水素水溶液(0.38mL、2.3mmol)を加え、反応物を50℃で一晩撹拌した。反応物を減圧下で濃縮して、7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-7,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-6(5H)-オンをビスHCl塩(0.26g、100%)として得た。ES+APCI MS m/z 376.1[M+H]+。
ステップF:4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-7,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-6(5H)-オン:7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-7,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-6(5H)-オン ジヒドロクロリド(0.26g、0.58mmol)のDCM/アセトニトリル(10mL)の1:1溶液中のスラリーに、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.45g、3.5mmol)および塩化アクリロイル(0.052g、0.58mmol)を加え、反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、逆分取HPLC(5→95%ACN/水の勾配液を使用して)により精製して、4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-7,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-6(5H)-オン(0.038g、0.088mmol、15%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 430.2[M+H]+。
実施例114
4-(6-アクリロイル-2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-7,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-6(5H)-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、tert-ブチル ピペラジン-1-カルボキシレート(1.19g、6.41mmol)の代わりにtert-ブチル 2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-カルボキシレートヒドロクロリド(305mg、1.54mmol)を使用して合成した。ES+APCI MS m/z 442.2[M+H]+。
実施例115
1-((S)-4-(2-(((R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジル 1-ピペラジンカルボキシレートの代わりに、ベンジル (S)-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(1.155g、4.931mmol)を使用して合成した。ES+APCI MS m/z 531.3[M+H]+。
実施例116
(S)-1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップAで、ベンジル 1-ピペラジンカルボキシレートの代わりにベンジル (S)-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(1.155g、4.931mmol)を使用し、また、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-(ジメチルアミノ)エタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 517.3[M+H]+。
実施例117
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-モルホリノエトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに2-モルホリノエタン-1-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 545.2[M+H]+。
実施例118
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-モルホリノ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりにモルホリンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 501.3[M+H]+。
実施例119
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(ピロリジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりにピロリジンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 485.2[M+H]+。
実施例120
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-(ピロリジン-1-イル)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-(ピロリジン-1-イル)プロパン-2-オールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 543.4[M+H]+。
実施例121
4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,7-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-8(5H)-オン
ステップA:tert-ブチル 2,4-ジクロロ-8-オキソ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:丸底フラスコに、tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,6-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(8H)-カルボキシレート(1.0g、3.29mmol)およびEtOAc(16.4mL)を加えた。過ヨウ素酸ナトリウム(2.11g、9.86mmol)の水(16.4mL)中溶液を加えた。塩化ルテニウム(III)(0.102g、0.493mmol)を加え、混合物を緩くキャッピングして撹拌し、周囲温度で6時間強く撹拌した。混合物を、水とEtOAcとの間で分配し、層を分離させた。水層をEtOAc(2×20mL)でさらに抽出し、合わせた抽出物をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗生成物をカラムクロマトグラフィー(10%~30% EtOAc/ヘキサン、CH2Cl2でロード)により精製して、生成物(0.864g、82%)をオフホワイトの固体として得た。
ステップB:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-8-オキソ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2,4-ジクロロ-8-オキソ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(0.400g、1.26mmol)のCH2Cl2(5.0mL)中溶液に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.325g、2.51mmol)、続けて、ベンジル 1-ピペラジンカルボキシレート(0.255mL、1.32mmol)を加え、反応物を周囲温度で1.5時間撹拌した。反応混合物を、CH2Cl2(10mL)で希釈し、0.5M KHSO4溶液(5mL)、続けて、飽和NaHCO3水溶液およびブラインで洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗生成物を10mLのMTBE中で超音波処理し、得られた固体を真空濾過により単離した。固体を減圧下で乾燥して、0.507g(80%)の目的の生成物をオフホワイトの固体として得て、これを次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 502.1[M+H]+。
ステップC:ベンジル 4-(2-クロロ-8-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-8-オキソ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(0.255g、0.5080mmol)のCH2Cl2(1.0mL)中溶液を0℃に冷却した。トリフルオロ酢酸(0.3890ml、5.080mmol)を加え、混合物を周囲温度に温めた。1時間後、混合物をCH2Cl2で希釈し、混合物にブライン(10mL)および3.0MのNaOH水溶液(1.7mL、5.080mmol)を加えた。層を合わせて、飽和NaHCO3水溶液でpH8に調節した。層を分離させ、水層をCH2Cl2(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。標記化合物(0.223g、定量収率)を黄色/オレンジ発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 402.1[M+H]+。
ステップD:ベンジル 4-(2-(3-モルホリノプロポキシ)-8-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:バイアルに、N-ヒドロキシプロパニルモルホリン(0.687g、4.73mmol)およびベンジル 4-(2-クロロ-8-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.190g、0.473mmol)、続けて、ジオキサン(1.6mL)を加えた。炭酸セシウム(0.462g、1.42mmol)を加え、混合物を65℃で15時間撹拌した。混合物をCHCl3で希釈し、濾過して、固体を、さらなるCHCl3で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮し、カラムクロマトグラフィー(2~10%MeOH/DCM+1%NH4OH)により精製して、0.061g(25%)の目的の生成物を濃密な無色油として得た。ES+APCI MS m/z 511.2[M+H]+。
ステップE:ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-8-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:バイアルに、ベンジル 4-(2-(3-モルホリノプロポキシ)-8-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.060g、0.12mmol)、N,N-ジメチルエチレンジアミン(0.010g、0.12mmol)および1-ヨード-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン(0.074g、0.24mmol)、続けて、ジオキサン(0.78mL)および三塩基性リン酸カリウム(0.050g、0.24mmol)を加えた。反応物をArを10分間バブリングしてパージした後、ヨウ化銅(I)(0.022g、0.12mmol)を加え、バイアルを密閉した。混合物を110℃に加熱し、16時間撹拌した。混合物を周囲温度まで冷却し、水で希釈して、EtOAc(3×10ml)で抽出した。合わせた有機抽出物をNa2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。混合物をカラムクロマトグラフィー(2%~8% MeOH/DCM)により精製して、0.062g(76%)の生成物を黄褐色発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 697.3[M+H]+。
ステップF:7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-6,7-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-8(5H)-オン:ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-8-オキソ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.062g、0.089mmol)のEtOH(0.44mL)およびTHF(0.44mL)中溶液に、パラジウム炭素(0.038g、0.018mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加えた、次いで真空に続く、バルーン圧により水素雰囲気を導入した。混合物を周囲温度で1.5時間撹拌し、次いで45℃に温め、1時間撹拌した。混合物をEtOAcで希釈し、ナイロンフィルターを通して濾過した。濾液を減圧下で濃縮して、淡黄褐色発泡体(0.052g)を得て,これを一晩乾燥させて、上記と同じ反応条件を再度実行した。周囲温度で5時間撹拌後、追加のPd/C(0.050g)を加え、反応物を周囲温度でさらに2時間撹拌した。混合物をEtOAcで希釈し、ナイロンフィルターを通して濾過した。固体をEtOAcおよびMeOHで洗浄し、濾液を減圧下で濃縮して、0.029g(58%)の目的の生成物を淡黄褐色発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 563.3[M+H]+。
ステップG:4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,7-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-8(5H)-オン:7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-6,7-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-8(5H)-オン(0.028g、0.050mmol)のCH2Cl2(0.50mL)中溶液に、-78℃でトリエチルアミン(0.014mL、0.100mmol)を加えた。塩化アクリロイル(0.55mL、0.055mmol、新しく調製した0.1M CH2Cl2)を加え、次いで反応物を0.5時間撹拌した。混合物をCHCl3で希釈し、飽和NH4Cl水溶液を加えた。層を分離し、水層をCHCl3(2×10mL)で抽出した。合わせた有機抽出物をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗生成物をカラムクロマトグラフィー(4%~6% MeOH/DCM)により精製して、0.018g(59%)の標記化合物をオフホワイトの発泡固体として得た。ES+APCI MS m/z 617.3[M+H]+。
ステップH:4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,7-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-8(5H)-オン:4-(4-アクリロイルピペラジン-1-イル)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,7-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-8(5H)-オン(0.018g、0.0292mmol)の1/1のMeOH/THF(0.6ml)中溶液に、HCl(0.0486mL、0.292mmol、6N水溶液)を加えた。混合物を35℃で7時間撹拌した。混合物をブラインで希釈し、飽和NaHCO3水溶液でpH8に調節した。混合物を10%IPA/CHCl3(2×10mL)およびCHCl3(10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。粗生成物をカラムクロマトグラフィー(6%~10% MeOH/DCM)により精製して、0.012g(71%)の生成物をオフホワイトの固体として得た。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例122
(R,E)-4-(ジメチルアミノ)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン ビス-トリフルオロアセテート
ステップA~E:実施例8のステップA~ステップEの方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに(R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールを使用して、(R)-2-((7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパン-1-アミンを合成した。
ステップF:(R)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-イル)ナフタレン-2-オール ジヒドロクロリド:(R)-2-((7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパン-1-アミン(75mg、0.15mmol)のDCM(2.9mL)中溶液に、iPrOH中の6N HCl(247μl、1.5mmol)を加え、混合物を周囲温度で1時間撹拌した。反応混合物を濃縮乾固して、(R)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-イル)ナフタレン-2-オール ジヒドロクロリドを得て、これを次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 463.2[M+H]+。
ステップG:(R,E)-4-(ジメチルアミノ)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン ビス-トリフルオロアセテート:(R)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-イル)ナフタレン-2-オール ジヒドロクロリド(7mg、0.01mmol)、HATU(6.2mg、0.02mmol)、(2E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エン酸(2.1mg、0.02mmol)、DIEA(6.9μl、0.04mmol)のDCM(131μl)中溶液を周囲温度で1時間撹拌した。残留物を濾過し、濾液を、5~95%アセトニトリル/0.1%TFA添加物含有の水で溶出するGilson C18分取HPLCに直接ロードした。目的の生成物を含む画分を濃縮して、(R,E)-4-(ジメチルアミノ)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン ビストリフルオロアセテートを得た。ES+APCI MS m/z 574.2[M+H]+。
実施例123
1-(4-(2-(2-ヒドロキシ-3-モルホリノプロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-モルホリノプロパン-1,2-ジオールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 575.2[M+H]+。
実施例124
(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(4-フルオロ-3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル(R)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(221mg、0.345mmol)をACN(2mL)中に入れ、混合物を0℃に冷却した。セレクトフルオール(183mg、0.517mmol)を加え、反応物を室温で30分間撹拌した。水を加え、混合物をDCMで抽出した。有機層を合わせ、濃縮した。得られた残留物を逆相クロマトグラフィー(5~95%ACN:0.1%TFA含有水)で精製し、ベンジル(R)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(4-フルオロ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート トリフルオロアセテート(48mg、0.0729mmol、21.1%収率)を得た。
ステップB:実施例33のステップD~Fで、ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりに(R)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(4-フルオロ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート トリフルオロアセテートを使用して、(R)-1-(4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(4-フルオロ-3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 535.2[M+H]+。
実施例125
(R)-1-(4-(7-(4-クロロ-3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル(R)-4-(2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(83mg、0.130mmol)およびNCS(21.6mg、0.162mmol)を、ACN(2mL)中に入れ、室温で3時間撹拌した。水を加え、混合物をDCM(3×15mL)で抽出した。有機層を合わせ、濃縮した。得られた残留物を逆相クロマトグラフィー(5~95%ACN:0.1%TFA含有水)で精製し、(R)-4-(7-(4-クロロ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート トリフルオロアセテート(17mg、0.0252mmol、19.4%収率)を得た。
ステップB:実施例33のステップD~Fで、ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりに(R)-4-(7-(4-クロロ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート トリフルオロアセテートを使用し、ステップDでTHFを溶媒として使用して、(R)-1-(4-(7-(4-クロロ-3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 551.2[M+H]+。
実施例126
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロアセテート
ステップA:ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、0.35mmol)のジオキサン中スラリーに、マイクロ波中で、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.45g、3.5mmol)、Cs2CO3(0.34g、1.0mmol)および2-(ピリジン-2-イル)エタン-1-オール(0.43g、3.5mmol)を加え、反応物をマイクロ波中で15℃に1時間加熱した。反応物をEtOAcで希釈し、水、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。その物質を、0→100%EtOAc/DCMの勾配液を溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.16g、0.24mmol、70%収率)を得た。
ステップB:4-(4-(ピペラジン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-イル)ナフタレン-2-オール:固体の、ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.12g、0.18mmol)に、MeOH(20mL)を加えた。溶液を窒素で5分間脱気し、続けて、Pd/C(0.058g、0.54mmol)を加えた。反応容器を、真空による排気とH2による充填を行った。この手順を3回実施し、3度目の充填後、スラリーを水素雰囲気下で1時間撹拌した。反応物を、窒素で5分間再度脱気した。次に、スラリーをセライト(登録商標)を通して濾過し、セライト(登録商標)をMeOH(100mL)で洗浄した。合わせた有機抽出物を濃縮し、10mLの1:1のTFA/DCMで2時間処理した。反応物を再度減圧下で濃縮して、4-(4-(ピペラジン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-イル)ナフタレン-2-オール(0.096g、0.20mmol、110%収率)を得た。
ステップC:1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:4-(4-(ピペラジン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-イル)ナフタレン-2-オール(0.096g、0.20mmol)のDCM中溶液に、ヒューニッヒ塩基(0.17mL、0.99mmol)および塩化アクリロイル(0.018g、0.20mmol)を加え、反応物を室温で30分間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、粗製物を逆分取HPLCにより精製して、1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピリジン-2-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン トリフルオロアセテート(0.0057g、0.011mmol、5.3%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 537.2[M+H]+。
実施例127
(S)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン
ステップA:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(8g、26.30mmol)のDMA(263.0ml、26.30mmol)中の溶液に、ベンジル ピペラジン-1-カルボキシレート(5.793g、26.30mmol)およびN-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(4.721ml、26.30mmol)を加え、反応物を室温で2時間撹拌した。TLC(20%EtOAc/DCM)、UV可視化により反応が完了したことが示された。次に、反応物を水に注ぎ込み、DCMで抽出した。次に、有機成分を水(2×)、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。濃縮物を220g RegiSepカラムにロードし、CombiFlash(0%~10%、EtOAc:DCM)でクロマトグラフ処理した。目的の生成物を含む全画分を合わせて濃縮して、tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(9.768g、20.02mmol、76.11%収率)を白色発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 488.2[M+H]
+。
ステップB:ベンジル 4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(9.768g、20.02mmol)をジクロロメタン(200.2mL、20.02mmol)に溶解し、2,2,2-トリフルオロ酢酸(15.33ml、200.2mmol)で処理した。反応混合物を室温で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、次に反応物を減圧下で濃縮し、EtOAcに入れ、有機成分を1M NaOH(2×)、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。ベンジル 4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(7.406g、19.09mmol、95.39%収率)を粗生成物として次の反応で使用した。ES+APCI MS m/z 388.2[M+H]
+。
ステップC:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート、BINAP(0.275g、0.442mmol)、およびPd2(dba)3(0.203g、0.221mmol)に、アルゴン下で、トルエン(221ml、11.1mmol)を加え、反応物をArで10分間バブリングし,続けて、100℃に10分間加熱した。次に、反応物を室温まで冷却し、ベンジル 4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.29g、11.1mmol)およびナトリウムtert-ブトキシド(2.13g、22.1mmol)を固体として暗色溶液に加えた。最終的に、3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート(7.44g、22.1mmol)を加え(油として)、反応物を100℃に1時間加熱した。反応物を室温に冷却し、減圧下で濃縮した。濃縮物をEtOAcに溶解し、水およびブラインで洗浄した。合わせた有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。次いで、残留物をCombiFlashにロードして、0%→50% ヘキサン:EtOAcを溶出液として使用してクロマトグラフ処理した。不純物を含まない生成物を含む画分を合わせ、減圧下で濃縮して、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.6g、4.53mmol、40.9%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 574.2[M+H]
+。
ステップD:ベンジル(S)-4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:マイクロ波チューブ中で、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、0.523mmol)をジオキサン(6532μl、0.523mmol)中に溶解し、炭酸セシウム(511mg、1.57mmol)、ヒューニッヒ塩基(913μl、5.23mmol)およびN-メチル-L-プロリノール(421mg、3.66mmol)で処理した。その後、チューブをキャッピングし、170℃で3時間マイクロ波加熱した。反応物をGF/F濾紙を通して濾過した。濾液を減圧下で濃縮し、残留物を12g RegiSep goldカラムにロードし、CombiFlash(0%~15%、DCM:MeOH)でクロマトグラフ処理した。不純物を含まない生成物を含む全画分を合わせ、減圧下で濃縮して、ベンジル(S)-4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(220mg、0.337mmol、64.5%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 653.3[M+H]
+。
ステップE:(S)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン:ベンジル(S)-4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(220mg、0.337mmol)のEtOH(3370μl、0.337mmol)およびTHF(3370μl、0.337mmol)中溶液を、N2で5分間パージした。この溶液に、パラジウム炭素(179mg、0.0843mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)を加え、すぐにキャッピングして、N2でさらに5分間パージした。次いで、溶液を、真空に続くバルーン圧により導入したH2下で撹拌した。次いで、混合物を周囲温度で一晩撹拌した。LC/MSにより反応の完了が示された。混合物をMeOHで希釈し、充填セライト通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮し、(S)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(91mg、0.175mmol、52.1%収率)を粗生成物として次のステップに進めた。ES+APCI MS m/z 519.3[M+H]
+。
ステップF:(S)-1-(4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:(S)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(92mg、0.18mmol)のジクロロメタン(1774μl、0.18mmol)中の懸濁液に、周囲温度で、塩化アクリロイル(1774μl、0.18mmol)、続けて、ヒューニッヒ塩基(62μl、0.35mmol)を加えた。次いで、反応物を周囲温度で1時間撹拌した。次いで、混合物を濃縮し、4g RegiSep goldカラムにロードし、CombiFlash(0%~15%、DCM:MeOH)でクロマトグラフ処理した。不純物を含まない生成物を含む全画分を合わせ、減圧下で濃縮して、(S)-1-(4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(74mg、0.13mmol、73%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]
+。
ステップG:(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:(S)-1-(4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(74mg、0.13mmol)を、メタノール(4307μl、0.13mmol)に溶解し、塩化水素(1077μl、6.5mmol)(水溶液)で処理した。反応物を55℃で1時間撹拌した。反応混合物を、減圧下で濃縮し、1.5mLのMeOH中に再懸濁させた。懸濁液を、Gilson(分取HPLC)にロードし、水/0.1%TFA中の、5→95%ACN/0.1%TFAで溶出した。不純物を含まない生成物を含む全画分を合わせ、一晩凍結乾燥して、(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(26mg、0.049mmol、38%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例128
1-(4-(2-(3-(ジメチルアミノ)アゼチジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-(2-(3-(ジメチルアミノ)アゼチジン-1-イル)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、0.35mmol)のジオキサン中溶液に、N,N-ジメチルアゼチジン-3-アミン ヒドロクロリド(0.24g、1.7mmol)およびN-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.45g、3.5mmol)を加え、反応物を80℃に72時間加熱した。反応物を減圧下で濃縮して、残留物を0→20%MeOH/DCMを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、ベンジル 4-(2-(3-(ジメチルアミノ)アゼチジン-1-イル)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.25g、105%)を得た。ES+APCI MS m/z 638.3[M+H]+。
実施例127に従って、ステップEで、ベンジル(S)-4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 4-(2-(3-(ジメチルアミノ)アゼチジン-1-イル)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、1-(4-(2-(3-(ジメチルアミノ)アゼチジン-1-イル)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 514.2[M+H]+。
実施例129
1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル(2R)-2-[(1R)-1-ヒドロキシエチル]ピロリジン-1-カルボキシレート:BH
3-Me
2S(10M、549μL)および(3aS)-1-メチル-3,3-ジフェニル-3a,4,5,6-テトラヒドロピロロ[1,2-c][1,3,2]オキサザボロール(1.00M、844μL)のTHF(10mL)中混合物を15℃で1時間撹拌した。この混合物に、tert-ブチル(2R)-2-アセチルピロリジン-1-カルボキシレート(0.90g、4.22mmol)のTHF(10mL)中溶液を加え、混合物を15℃で1時間撹拌した。メタノール(2.00mL)を添加することにより混合物をクエンチし、反応物を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/エーテルアセテート=50/1~5/1)で精製してtert-ブチル(2R)-2-[(1R)-1-ヒドロキシエチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(0.60g、2.79mmol、66.0%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,CD
3OD)δ=5.18(br s,1H),3.73(dt,J=4.8,8.0Hz,1H),3.70-3.43(m,2H),3.28(td,J=6.64,10.8Hz,1H),1.96(qd,J=7.2,12.8Hz,1H),1.89-1.68(m,2H),1.62(br s,J=6.4Hz,1H),1.47(s,9H),1.15(d,J=6.0Hz,3H)。
ステップB:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.70g、1.08mmol)およびtert-ブチル(2R)-2-[(1R)-1-ヒドロキシエチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(349mg、1.62mmol)のTHF(10mL)中溶液に、t-BuONa(312mg、3.24mmol)を加え、混合物を10℃で1時間撹拌した。混合物を水(10mL)で希釈し、水層を酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(20mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/エーテルアセテート=3/1)で精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.35g、412μmol、38.1%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 799.4[M+H]
+。
ステップC:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-ピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.30g、375μmol)およびTFA(642mg、5.63mmol、417μL)のジクロロメタン(0.42mL)中混合物を10℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-ピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(305mg)を得た。LCMS[M+1]:ES+APCI MS m/z 699.2[M+H]
+。
ステップD:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)- ピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.30g、粗製)、ホルムアルデヒド(210mg、1.85mmol、192μL、37%水)およびAcOH(22.16mg、369μmol、21.1μL)のメタノール(3.00mL)中混合物を15℃で0.5時間撹拌した。この混合物に、NaBH
3CN(58.0mg、923μmol)を加え、混合物を15℃で48時間撹拌した。0℃でH
2O(5mL)を加えることにより混合物をクエンチし、水層をエーテルアセテート(3×10mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(15.0mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.10%ギ酸)/アセトニトリル]で精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.10g、126μmol)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 713.4[M+H]
+。
ステップE:4-[2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール:-78℃でメタノール(3mL)中にアンモニアを30分間バブリングした。次に、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.09g、126μmol)および無水10%Pd/C(0.10g)を加えて、H
2(15psi)下、混合物を10℃で1時間撹拌した。反応物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、4-[2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(0.04g、粗製)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 489.2[M+H]
+。
ステップF:1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(0.04g)およびEt3N(124mg、1.23mmol、171μL)の-40℃のDCM(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(7.23mg、57.3μmol)を加え、反応物を-40℃で0.5時間撹拌した。メタノール(0.10mL)を添加することにより混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:10%~37%、10分間)により精製して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(9.13mg、15.5μmol)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 543.4[M+H]+。
実施例130
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((S)-1-((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例129に従って、ステップAで、(3aS)-1-メチル-3,3-ジフェニル-3a,4,5,6-テトラヒドロピロロ[1,2-c][1,3,2]オキサザボロールの代わりに(3aR)-1-メチル-3,3-ジフェニル-3a,4,5,6-テトラヒドロ ピロロ[1,2-c][1,3,2]オキサザボロールを使用し、またステップAで、tert-ブチル(2R)-2-アセチルピロリジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル(2S)-2-アセチルピロリジン-1-カルボキシレートを使用して、1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((S)-1-((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 543.4[M+H]+。
実施例131
1-[4-[2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチルエトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:(2R)-1-[エチル(メチル)アミノ]プロパン-2-オール:(2R)-2-メチルオキシラン(540mg、9.31mmol、651μL)を、MeOH(10mL)中のN-メチルエタンアミン(500mg、8.46mmol、725μL)に加えた。得られた溶液をシールドチューブ中、80℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、(2R)-[エチル(メチル)アミノ]プロパン-2-オール(260mg、粗製)を淡黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
ステップB:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:(2R)-1-[エチル(メチル)アミノ]プロパン-2-オール(217mg、1.85mmol)のトルエン(20mL)中溶液に、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、617μmol)、Pd
2(dba)
3(56.6mg、61.8μmol)、BINAP(76.9mg、124μmol)およびNaOtBu(178mg、1.85mmol)を加え、混合物をN2で15分間脱気し、次いでN
2下、90℃に16時間加熱した。加熱が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相クロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(110mg、153μmol、24.8%収率、97.5%純度)を得た。ES+APCI MS m/z 701.4[M+H]
+。
ステップC:4-[2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチルエトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、143μmol)のMeOH(3.00mL)中溶液に、HCl/MeOH(4M、143μL)続けて、N
2下でPd(OH)
2/C(50mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH
2によるパージを数回実施した。混合物をH
2(15psi)下、40℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮して、4-[2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチルエトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(76.0mg、125μmol、87.5%収率、90.3%純度、2HCl)を得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 477.2[M+H]
+。
ステップD:1-[4-[2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチルエトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチルエトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(70mg、127μmol、2HCl)およびDIEA(98.8mg、764μmol、133μL)のDCM(1.50mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(12.9mg、102μmol)を-50℃で滴下した。混合物を-40℃~-20℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、MeOH(17.0mg)を添加することにより混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を水(1mL)で希釈し、DCM(3×6ml)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:48%~78%、10分)により精製して、1-[4-[2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチルエトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(9.23mg、17.2μmol、13.5%収率、98.7%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 531.3[M+H]+。
実施例132
1-[4-[2-[(1-シクロヘキシルピロリジン-3-イル)メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:1-シクロヘキシルピロリジン-3-カルボキシレート:メチルピロリジン-3-カルボキシレート(1.00g、6.04mmol、HCl)およびDIEA(780mg、6.04mmol、1.05mL)の溶液に、シクロヘキサノン(652mg、6.64mmol、686μL)およびHOAc(725mg、12.1mmol、691μL)を0℃で加えた。反応混合物を0℃で0.5時間撹拌した。この反応混合物にNaBH(OAc)
3(3.84g、18.12mmol)を0℃で少しずつ加えた。反応混合物を0~15℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(5mL)を添加することにより反応混合物をクエンチし、有機成分を真空下で濃縮した。水層をDCM(10mL×2)で抽出し、飽和NaHCO
3(10mL)およびNa
2CO
3(2mL)でpH>8にpHを調節した。有機層を合わせて、Na
2SO
4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をMTBE/石油エーテル(1:3、20mL)でトリチュレートし、濾液を真空下で濃縮して、メチル 1-シクロヘキシルピロリジン-3-カルボキシレート(1.00g、4.73mmol、78.4%収率)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 212.2[M+H]
+。
ステップB:(1-シクロヘキシルピロリジン-3-イル)メタノール:1-シクロヘキシルピロリジン-3-カルボキシレート(1.00g、4.73mmol)のTHF(20mL)中の溶液に、LiAlH4(413mg、10.9mmol)を-10℃で加えた。反応混合物を-10℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2SO4(2mL)の添加によりクエンチし、混合物を濾過後、濾過ケーキをTHF(3×50mL)で洗浄した。合わせた有機成分を真空下で濃縮して、(1-シクロヘキシルピロリジン-3-イル)メタノール(800mg、4.36mmol、92.3%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.71(dd,J=4.1,10.0Hz,1H),3.53(dd,J=4.4,10.0Hz,1H),2.90(dt,J=4.4,8.8Hz,1H),2.74(dd,J=3.2,8.8Hz,1H),2.53(dd,J=6.8,8.8Hz,1H),2.36-2.24(m,2H),2.04-1.93(m,2H),1.90(br s,2H),1.78-1.64(m,3H),1.61-1.52(m,1H),1.33-1.12(m,5H)。
実施例131に従って、ステップBで(2R)-1-[エチル(メチル)アミノ]プロパン-2-オールの代わりに(1-シクロヘキシルピロリジン-3-イル)メタノールを使用して、1-[4-[2-[(1-シクロヘキシルピロリジン-3-イル)メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 597.4[M+H]+。
実施例133
1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロピルアミノ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロピルアミノ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、617μmol)および3-モルホリノプロパン-1-アミン(534mg、3.70mmol、540μL)のDMSO(4.00mL)中溶液を、100℃に12時間加熱した。加熱が完了したら、混合物を水(4mL)で希釈し、EtOAc(3×20ml)で抽出した。有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を酢酸エチル/石油エーテル(20→100%)で溶出するAl2O3カラムクロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロピルアミノ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(245mg、320μmol、51.8%収率、95.0%純度)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 728.6[M+H]+。
実施例131に従って、ステップCでベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロピルアミノ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロピルアミノ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 558.6[M+H]+。
実施例134
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(ピペリジン-3-イルメトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペリジン-1-カルボキシレート:[(3R)-3-ピペリジル]メタノール(1.0g、8.68mmol)のTHF(25.0mL)中溶液に、TEA(1.76g、17.4mmol、2.42mL)を加え、続けて、Boc
2O(1.89g、8.68mmol、1.99mL)のTHF(5mL)中溶液を15℃で加えた。混合物を15℃で12時間撹拌した。真空下で溶媒を除去し、残留物を酢酸エチル(50mL)およびH
2O(30mL)に溶解した。溶液をHCl(6M)でpH約6に酸性化し、層を分離させた。有機成分をブライン(3×50mL)で洗浄し、合わせた有機成分を濃縮乾固して、tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペリジン-1-カルボキシレート(1.68g、7.80mmol、89.9%収率、100%純度)を無色結晶として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.73(br s,2H),3.51(br d,J=6.8Hz,2H),3.05(br s,2H),1.83-1.71(m,2H),1.62(br s,1H),1.46(s,9H),1.44-1.37(m,1H),1.35-1.22(m,1H)。
ステップB:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-tert-ブトキシカルボニル-3-ピペリジル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペリジン-1-カルボキシレート(332mg、1.54mmol)のTHF(5ml)中溶液に、t-BuONa(223mg、2.32mmol)を加えた。次に、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチル スルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、772μmol)のTHF(5mL)中溶液を加え、混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を石油エーテル/酢酸エチル(10/1→3/1)で溶出するカラムクロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-tert-ブトキシカルボニル-3-ピペリジル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(510mg、628μmol、81.4%収率、98.4%純度)を白色固体として得た。ES+APCI MS m/z 799.4[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピペリジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-tert-ブトキシカルボニル-3-ピペリジル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、313μmol)のMeOH(5mL)中溶液を、NH
3(10%、w/w)でパージし、次いで10%Pd/C(50mg)を加えた。懸濁液を真空下で脱気し、混合物をH
2(15psi)下、15℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固して、tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピペリジン-1-カルボキシレート(126mg、211μmol、67.4%収率、96.2%純度)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z 575.5[M+H]
+。
ステップD:tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイル ピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピペリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピペリジン-1-カルボキシレート(126mg、219μmol)およびTEA(33.3mg、329μmol、45.8μL)のDCM(5.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(24.9mg、197μmol)を-40℃で滴加し、反応物を-40℃で30分間撹拌した。反応混合物をMeOH(0.5mL)の添加によりクエンチし、濃縮乾固した。残留物をEtOAc(50mL)およびH
2O(20mL)に溶解した。得られた溶液をHCl(1M)でpH約6に酸性化し、層を分離させた。合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥後、濾過し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイル ピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピペリジン-1-カルボキシレート(120mg、172μmol、78.5%収率、90.2%純度)を黄色油として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ES+APCI MS m/z 629.6[M+H]
+。
ステップE:1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-3-ピペリジル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピペリジン-1-カルボキシレート(120mg、191μmol)のDCM(3.0mL)中溶液に、TFA(326mg、2.86mmol、212μL)を0℃で加えた。混合物をN2雰囲気下、15℃で2時間撹拌した。反応混合物をNH3(水中30%、3滴)で塩基化し、濃縮乾固した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:5%~35%、10分)により精製して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-3-ピペリジル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(24.5mg、38.9μmol、20.4%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 529.4[M+H]+。
実施例135
1-[4-[2-[3-(4-アセチルピペラジン-1-イル)プロポキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:1-[4-(3-ヒドロキシプロピル)ピペラジン-1-イル]エタノン:1-ピペラジン-1-イルエタノン(2.00g、15.6mmol)およびK2CO3(4.31g、31.2mmol)のCH3CN(50.0mL)中溶液に、3-ブロモプロパン-1-オール(3.25g、23.4mmol)を加えた。混合物を80℃で5時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を留去して、1-[4-(3-ヒドロキシプロピル)ピペラジン-1-イル]エタノン(2.00g、10.7mmol、68.8%収率)を無色油として得た。
実施例131に従って、ステップCでベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりに1-[4-(3-ヒドロキシプロピル)ピペラジン-1-イル]エタノンを使用して、1-[4-[2-[3-(4-アセチルピペラジン-1-イル)プロポキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 600.3[M+H]+。
実施例136
1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エタノール:3-メトキシピロリジン(450mg、3.27mmol、HCl)および2-ブロモエタノール(408mg、3.27mmol)のCH3CN(10mL)中溶液に、K2CO3(1.36g、9.81mmol)を加えた。混合物を80℃で3時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を留去して、2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エタノール(450mg、3.10mmol、94.8%収率)を無色油として得た。
ステップB:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、771μmol)、2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エタノール(224mg、1.54mmol)、およびt-BuONa(222mg、2.32mmol)のトルエン(10mL)中混合物を、N2雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。混合物を、0℃に冷却し、pH約7までHCl(2M)を加えた。混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、0→10%MeOH/DCMを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(110mg、147.9μmol、19.1%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 729.2[M+H]+。
実施例131に従って、ステップCでベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 559.3[M+H]+。
実施例137
1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[3-(3-メトキシピロリジン-1-イル)プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:(3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-1-オール:3-メトキシピロリジン(500mg、3.63mmol、HCl)および3-ブロモプロパン-1-オール(505mg、3.63mmol)のCH3CN(10mL)中溶液に、K2CO3(1.51g、10.9mmol)を加えた。混合物を20℃で5時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を留去して、3-(3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-1-オール(540mg、3.39mmol、93.3%収率)を得た。
実施例131に従って、ステップBで(2R)-1-[エチル(メチル)アミノ]プロパン-2-オールの代わりに(3-メトキシピロリジン-1-イル)プロパン-1-オールを使用して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[3-(3-メトキシピロリジン-1-イル)プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例138
1-[4-[2-[2-(3,3-ジフルオロアゼチジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:2-(3,3-ジフルオロアゼチジン-1-イル)エタノール:3,3-ジフルオロアゼチジン(500mg、3.86mmol、HCl)および2-ブロモエタノール(482mg、3.86mmol、274μL)のCH3CN(10mL)中溶液に、K2CO3(1.60g、11.5mmol)を加え、反応物を80℃で16時間撹拌した。反応物を濾過し、濾液を留去して、2-(3,3-ジフルオロアゼチジン-1-イル)エタノール(300mg、2.19mmol、56.7%収率)を得た。
実施例131に従って、ステップBで、(2R)-1-[エチル(メチル)アミノ]プロパン-2-オールの代わりに2-(3,3-ジフルオロアゼチジン-1-イル)エタノールを使用して、1-[4-[2-[2-(3,3-ジフルオロアゼチジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 551.4[M+H]+。
実施例139
1-[4-[2-[2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:メチル 2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)アセテート:メチル 2-ブロモアセテート(1.17g、7.67mmol、723μL)の0℃のDCM(10mL)中懸濁液に、TEA(1.76g、17.4mmol、2.42mL)および3,3-ジフルオロピロリジン(1.00g、6.97mmol、HCl)を加え、反応混合物を20℃で16時間撹拌した。反応物を濾過し、濾液を留去した。残留物を、0.5%→20%MeOH/DCMを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、メチル 2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)アセテート(580mg、3.24mmol、46.4%収率)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.73(s,3H),3.38(s,2H),3.11(t,J=13.6Hz,2H),2.92(t,J=6.8Hz,2H),2.36-2.26(m,2H)。
ステップB:2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)エタノール:LiAlH4(184mg、4.86mmol)のTHF(5.0mL)中溶液に、メチル 2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)アセテート(580mg、3.24mmol)のTHF(5.0mL)中溶液を0℃で滴加した。混合物を20℃に温め、3時間撹拌した。混合物を飽和硫酸ナトリウム水溶液(1.50mL)でクエンチした。反応物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)エタノール(330mg、2.18mmol、67.4%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.64(t,J=5.2Hz,2H),2.97(t,J=13.2Hz,2H),2.82(t,J=7.2Hz,2H),2.68(t,J=5.2Hz,2H),2.49(br.s,1H),2.34-2.24(m,2H)。
実施例131に従って、ステップBで、(2R)-1-[エチル(メチル)アミノ]プロパン-2-オールの代わりに2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)エタノールを使用して、1-[4-[2-[2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 565.3[M+H]+。
実施例140
2-[3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-イル]-N,N-ジメチルアセトアミド
ステップA:メチル 1-[2-(ジメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]ピロリジン-3-カルボキシレート:メチル ピロリジン-3-カルボキシレート(1.00g、6.04mmol、HCl)およびNaHCO3(1.01g、12.1mmol、470μL)のACN(200.0mL)中溶液を10℃で5分間撹拌した。次に、2-ブロモ-N,N-ジメチル-アセトアミド(1.00g、6.04mmol)のACN(5.00mL)中溶液を10℃で加え、反応物を10℃で6時間撹拌し、続いて、50℃で2時間撹拌した。混合物を濾過し、固体をDCM(3×15mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮し、残留物を、0→10%MeOH/DCMを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、メチル 1-[2-(ジメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]ピロリジン-3-カルボキシレート(480mg、2.02mmol、33.4%収率)を得た。
ステップB:2-[3-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-イル]-N,N-ジメチル-アセトアミド:メチル 1-[2-(ジメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]ピロリジン-3-カルボキシレート(500mg、2.33mmol)のTHF(10mL)中の溶液に、LiAlH
4(203mg、5.36mmol)を-60℃で加え、反応混合物を-60℃で10分間撹拌した。飽和Na
2SO
4(0.4mL)を添加することにより反応混合物をクエンチし、スラリーを濾過した。濾過ケーキをTHF(3×50mL)で洗浄し、濾液を真空下で濃縮して、2-[3-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-イル]-N,N-ジメチルアセトアミド(400mg、2.15mmol、92.2%収率)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 187.1[M+H]
+。
ステップC:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[1-[2-(ジメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]ピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、772μmol)、2-[3-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-イル]-N,N-ジメチルアセトアミド(216mg、1.16mmol)、およびNaOBu-t(148mg、1.54mmol)のトルエン(10mL)中混合物を、15℃で15分間撹拌した。反応混合物を、20→100%EtOAc/石油エーテルを使用するシリカゲルクロマトグラフィーにより直接精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[1-[2-(ジメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]ピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(310mg、395μmol、51.1%収率、98%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 770.4[M+H]+。
実施例131に従って、ステップCで、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-2-[エチル(メチル)アミノ]-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[1-[2-(ジメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]ピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、2-[3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-イル]-N,N-ジメチルアセトアミドを調製した。ES+APCI MS m/z 600.3[M+H]+。
実施例141
1-[4-[2-[[1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:メチル ピロリジン-3-カルボキシレート:1-(tert-ブチル)3-メチルピロリジン-1,3-ジカルボキシレート(10.0g、43.6mmol)のDCM(50mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、109mL)を0℃で加え、0℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、メチル ピロリジン-3-カルボキシレート(7.00g、粗製、HCl)を褐色油として得た。
1H NMR(400MHz,メタノール-d
4)δ=3.77(s,3H),3.56-3.53(m,2H),3.41-3.37(m,3H),2.40-2.24(m,2H)。
ステップB:メチル 1-(2-ベンジルオキシエチル)ピロリジン-3-カルボキシレート:メチル ピロリジン-3-カルボキシレート(3.0g、18.1mmol、HCl)、Cs
2CO
3(17.7g、54.3mmol)およびKI(301mg、1.81mmol)のMeCN(60mL)中溶液を15℃で5分間撹拌した。次いで、2-ブロモエトキシメチルベンゼン(4.67g、21.7mmol、3.43mL)のACN(15mL)中溶液を15℃でその混合物に加え、15℃で1時間撹拌した。次に、混合物を50℃に温め、50℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをDCM(3×30mL)で洗浄し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:10ACN%-40ACN%、30分40%分)で精製して、メチル 1-(2-ベンジルオキシエチル)ピロリジン-3-カルボキシレート(1.48g、5.06mmol、27.9%収率、90.0%純度)を褐色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.36-7.28(m,5H),4.56(s,2H),3.70(s,3H),3.61-3.58(t,J=6.0Hz,2H),3.02-3.00(m,2H),2.78-2.67(m,4H),2.58-2.49(m,1H),2.11-2.08(m,2H)。
ステップC:(1-(2-(ベンジルオキシ)エチル)ピロリジン-3-イル)メタノール:メチル 1-(2-ベンジルオキシエチル)ピロリジン-3-カルボキシレート(1.38g、5.24mmol)のTHF(27mL)中の溶液に、LiAlH4(457mg、12mmol)を-10℃で加え、-10℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2SO4(1mL)によりクエンチし、濾過して、濾過ケーキをTHF(5×30mL)で洗浄し、濾液を真空下で濃縮して、(1-(2-(ベンジルオキシ)エチル)ピロリジン-3-イル)メタノール(1.30g、3.31mmol、63.3%収率、60.0%純度)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 236.1[M+H]+。
実施例136に従って、ステップBで、2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エタノールの代わりに(1-(2-(ベンジルオキシ)エチル)ピロリジン-3-イル)メタノールを使用して、1-[4-[2-[[1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 559.3[M+H]+。
実施例142
1-[4-[2-(2-ヒドロキシエトキシ)-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
実施例136に従って、ステップBで、2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エタノールの代わりに2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエタノールを使用して、1-[4-[2-(2-ヒドロキシエトキシ)-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 476.2[M+H]+。
実施例143
1-[4-[2-(2,3-ジヒドロキシプロポキシ)-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
実施例136に従って、ステップBで、2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エタノールの代わりに(2,2-ジメチル-1,3-ジオキソラン-4-イル)メタノールを使用して、1-[4-[2-(2,3-ジヒドロキシプロポキシ)-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 506.3[M+H]+。
実施例144
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート:NaH(2.38g、59.6mmol、60%純度)のTHF(50mL)中スラリーに、0℃でtert-ブチル(2S)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(10g、49.69mmol)のTHF(50mL)中溶液を加え、混合物を10℃で1時間撹拌した。ブロモメチルベンゼン(12.8g、74.5mmol、8.85mL)を0℃で滴加し、混合物を10℃で16時間撹拌した。混合物を飽和塩化アンモニウム水溶液(20mL)の添加によりクエンチし、次いで、酢酸エチル(200mL)および水(100mL)で希釈した。分離した有機層を水(100mL)とブライン(100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→5/1)で精製し、tert-ブチル(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(8.2g、28.06mmol、56.5%収率,99.7%純度)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z 192.1[M+H-Boc]
+。
ステップB:(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン:tert-ブチル(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(8.2g、28.14mmol)のCH
2Cl
2(28mL)中溶液に、TFA(43.1g、378mmol、28.0mL)を窒素雰囲気下、0℃で滴加した。混合物を15℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をジクロロメタン(100mL)で希釈し、次いで水層のpHが約10に達するまで、1Mの水酸化ナトリウム水溶液(10mL)で洗浄した。分離した有機層をブライン(2×20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン(4g、20.9mmol、74.3%収率)を得た。LCMS ES+APCI MS m/z 192.2[M+H]
+。
ステップC:(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン:1-ブロモ-2-メトキシエタン(0.9g、6.48mmol、608μL)、(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン(1.24g、6.48mmol)およびK
2CO
3(2.68g、19.4mmol)のCH
3CN(20mL)中混合物を15℃で1時間撹拌し、次いで78℃で12時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(50mL)および水(50mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル/ジクロロメタン/メタノール:1/1/0→10/10/2)で精製して、(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン(900mg、3.61mmol、55.7%収率)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z 250.2[M+H]
+。
ステップD:(S)-(1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル)メタノール:(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン(900mg、3.61mmol)のMeOH(20mL)中の溶液に10%Pd/C(721.88μmol)を加え、スラリーをH
2(50psi)下、10℃で16時間撹拌した。反応物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、(S)-(1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル)メタノール(450mg、2.83mmol、78.30%収率)を得た。
ステップE:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メタノール(245mg、1.54mmol)、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、772μmol)、およびt-BuONa(223mg、2.32mmol)のTHF(5mL)中混合物を、N
2雰囲気下、20℃で0.5時間撹拌した。反応混合物をH
2O(30mL)中に注ぎ込み、水層を酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(30mL)で洗浄し、無水Na
2SO
4上で乾燥し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、DCM/MeOH=300/1→10:1)で精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(260mg、349μmol、45.3%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 743.4[M+H]
+。
ステップF:tert-ブチル 4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、323μmol)および(Boc)
2O(141mg、646μmol、148μL)のMeOH(150mL)中溶液に、N
2雰囲気下で10%Pd/C(100mg)を加えた。この懸濁液に対し、脱気とH
2によるパージを3回実施した。混合物をH
2(15PSI)下、40℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮して、tert-ブチル 4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(215mg、粗製)を得た。ES+APCI MS m/z 619.1[M+H]
+。
ステップG:4-[2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール:tert-ブチル 4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(215mg、347μmol)のDCM(500μL)中溶液に、TFA(594mg、5.21mmol、385μL)を加え、混合物を15℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、4-[2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(219mg、346μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 519.4[M+H]
+。
ステップH:1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(219mg、346μmol)およびDIEA(447mg、3.46mmol、603μL)の-40℃に冷却したジクロロメタン(4.00mL)中の混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(34.9mg、276.92μmol)のジクロロメタン(1.00mL)中溶液を窒素雰囲気下で加えた。混合物を-40℃で1時間撹拌した。飽和NaHCO3(2.00mL)を添加することにより反応物をクエンチし、混合物を氷水(20mL)中に注ぎ込み、ジクロロメタン(20mL×2)で抽出した。合わせた有機成分を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:32%~62%、12分)により精製して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(27mg、46.7μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
実施例145
1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(2S)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(1.24g、6.17mmol)およびベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2g、3.09mmol)のTHF(50mL)中溶液に、t-BuONa(890mg、9.26mmol)を加え、反応物を15℃で0.5時間撹拌した。反応混合物をH
2O(100mL)中に注ぎ込み、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(50mL)で洗浄し、無水Na
2SO
4上で乾燥し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1→1:1)で精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.62g、2.02mmol、65.5%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 785.6[M+H]
+。
ステップB:(2S)-2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート:15℃でNH
3をMeOH(50mL)中に30分間バブリングした。この溶液に、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.6g、2.04mmol)、続けて、N
2下で無水10%Pd/C(500mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH
2によるパージを数回実施した。混合物をH
2(15psi)下、40℃で1時間撹拌した。次いで、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(1.00g、1.78mmol)を得た。ES+APCI MS m/z 561.5[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル(2S)-2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-[4-(2,2,2-トリフルオロアセチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(2S)-2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(800mg、1.43mmol)のDCM(5.00mL)中溶液に、0℃で、TFAA(599mg、2.85mmol)およびDIEA(737mg、5.71mmol)を加え、反応物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物をH
2O(50mL)中に注ぎ込み、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(30mL)で洗浄し、無水Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-[4-(2,2,2-トリフルオロアセチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(1.5g、粗製)を得た。ES+APCI MS m/z 657.5[M+H]
+。
ステップD:2,2,2-トリフルオロ-1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]エタノン:tert-ブチル(2S)-2-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-[4-(2,2,2-トリフルオロアセチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(300mg、粗製)のDCM(500μL)中溶液に、TFA(521mg、4.57mmol、338μL)を加え、混合物を15℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、2,2,2-トリフルオロ-1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]エタノン(306mg)を得た。ES+APCI MS m/z 557.3[M+H]
+。
ステップE:2,2,2-トリフルオロ-1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]エタノン:アセトン(132mg、2.28mmol、167μL)および2,2,2-トリフルオロ-1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]エタノン(306mg、粗製、TFA)のMeOH(5.00mL)中溶液に、AcOH(54.8mg、912μmol、52.2μL)およびNaBH
3CN(115mg、1.83mmol)を加え、混合物を15℃で16時間撹拌した。反応混合物をH
2O(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(10mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、2,2,2-トリフルオロ-1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]エタノン(300mg、粗製)を得た。ES+APCI MS m/z 599.5[M+H]
+。
ステップF:4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール:2,2,2-トリフルオロ-1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]エタノン(300mg、粗製)のMeOH(10mL)中溶液に、K
2CO
3(346mg、2.51mmol)を加え、混合物を15℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を濃縮して、4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(250mg)を得た。ES+APCI MS m/z 503.3[M+H]
+。
ステップG:1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(250mg、粗製)およびDIEA(643mg、4.97mmol、866μL)の-40℃に冷却したDCM(5.00mL)中の混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(50.2mg、398μmol)のDCM(1mL)中溶液を窒素雰囲気下で加えた。混合物を-40℃で1時間撹拌した。飽和NaHCO3(2.00mL)を添加することにより反応物をクエンチした。混合物を氷水(20mL)中に注ぎ込み、DCM(20mL×2)で抽出した。合わせた有機成分を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:52%~78%、12分)により精製した。1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(10mg、17.6μmol)。ES+APCI MS m/z 557.3[M+H]+。
実施例146
1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-ピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.50g、772μmol)、tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(311mg、1.54mmol)、およびt-BuONa(223mg、2.32mmol)のTHF中(10mL)中混合物を、20℃で1時間撹拌した。混合物を水(10mL)で希釈し、水層をエーテルアセテート(3×20mL)で抽出した。合わせた有機成分を飽和塩化ナトリウム(1×30mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/エーテルアセテート=3/1)で精製して、ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.40g、499μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 785.2[M+H]
+。
ステップB:tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート:-78℃でNH
3をメタノール(10mL)中に30分間バブリングした。ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.25g、319μmol)および10%Pd/C(0.10g)を混合物に加えて、H
2(15psi)下、混合物を10℃で1時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(0.17g、303μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 561.3[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(0.17g、303μmol)およびEt
3N(153mg、1.52mmol、211μL)の-40℃に冷却したジクロロメタン(4.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(26.8mg、212μmol)を加え、-40℃で0.5時間撹拌した。メタノール(0.10mL)を添加することにより混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al
2O
3、ジクロロメタン/メタン=10/1)で精製して、tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(0.12g、189μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 615.5[M+H]
+。
ステップD:1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-ピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:tert-ブチル(3R)-3-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(0.10g、163μmol)およびTFA(278mg、2.44mmol、181μL)のジクロロメタン(0.20mL)中混合物を10℃で1時間撹拌した。NH3・H2Oを添加することにより混合物をクエンチし、pHが7になるまで調節した。混合物を分取HPLC(カラム:Venusil XBP C8 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:15%~45%、10分)により精製して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-ピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(22.8mg、42.9μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 515.4[M+H]+。
実施例147
2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:(Z)および(E)-4-ブロモブタ-2-エンニトリル:ブタ-3-エンニトリル(98g、1.46mol、118mL)のtert-ブタノール(150mL)および石油エーテル(575mL)中溶液に、Br
2(233g、1.46mol、75.3mL)のtert-ブタノール(150mL)中溶液を15℃で加え、反応物を30分間撹拌した。次に、この反応物に、ナトリウムエトキシドのエタノール溶液(100g、0.6mol、850mL)を加えた。反応混合物を15℃で2時間撹拌した。次に、反応物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を、2→20%酢酸エチル/石油エーテルを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、(Z)および(E)-4-ブロモブタ-2-エンニトリル(141g、E/Z=2.5/1、粗製)を黄色がかった油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d,)(E),δ=6.79(td,J=7.2,16.0Hz,1H),5.63(d,J=16.0Hz,1H),4.00(dd,J=1.2,6.8Hz,2H);(Z),δ=6.66(td,J=8.0,10.8Hz,1H),5.44(d,J=10.8Hz,1H),4.16(dd,J=0.8,8.0Hz,2H)。
ステップB:2-(1,4-ジベンジルピペラジン-2-イル)アセトニトリル:N,N’-ジベンジルエタン-1,2-ジアミン(115g、480mmol、113mL)およびTEA(97.0g、959mmol、133mL)のトルエン(1L)中混合物に、4-ブロモブタ-2-エンニトリル(70g、粗製)を0℃で滴加し、反応物を15℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、5→50%EtOAc/石油エーテルを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、2-(1,4-ジベンジルピペラジン-2-イル)アセトニトリル(82g、240mmol、2ステップで37%収率、89.3%純度)を黄色がかった半固体を得た。ES+APCI MS m/z 306.3[M+H]
+。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40-7.23(m,10H),3.85-3.76(m,1H),3.54-3.44(m,3H),3.07-2.96(m,1H),2.94-2.84(m,1H),2.68-2.35(m,7H)。
ステップC:2-ピペラジン-2-イルアセトニトリル:2-(1,4-ジベンジルピペラジン-2-イル)アセトニトリル(164g、536mmol)のDCE(1500mL)中溶液に、1-クロロエチル カルボノクロリダート(306g、2.14mol)を0℃で滴加した。添加後、反応混合物を85℃に約48時間加熱した。ジクロルエタンを留去し、残留物をMeOH(1500mL)に入れ、70℃に1時間加熱した。反応混合物を減圧下で濃縮し、固体をMTBE(3×3L)でトリチュレートし、固体を減圧下で乾燥して、2-ピペラジン-2-イルアセトニトリルを得た。粗生成物をエタノールと水(8:1、v:v)を用いた再結晶化により精製して、2-ピペラジン-2-イルアセトニトリルをオフホワイトの固体として得た(53g、428mmol、40.0%収率、96.4%純度、2HCl)。ES+APCI MS m/z 126.2[M+H]
+。
1H NMR(400MHz,D
2O)δ=4.01-3.96(m,1H),3.81-3.67(m,3H),3.46-3.27(m,3H),3.09(d,J=6.0Hz,2H)。
ステップD:2-[4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(1.2g、4.08mmol)および2-ピペラジン-2-イルアセトニトリル(808mg、4.08mmol、2HCl)のジオキサン(24mL)中混合物に、DIEA(2.64g、20.4mmol、3.55mL)を加えた。この反応混合物を50℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(50mL)で希釈し、水層をEtOAc(3×80mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、真空下で濃縮して、2-[4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.56g、4.07mmol、100%収率)を褐色固体として得た。
ステップE:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:2-[4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.56g、4.07mmol)に、(Boc)
2O(9.50g、43.5mmol、10mL)を加え、混合物を50℃に2時間加熱した。加熱が完了したら、反応混合物を、10→50%EtOAc/石油エーテルを溶出液として使用するシリカゲルクロマトグラフィーで精製して、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.2g、2.44mmol、59.9%収率、98.3%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 483.3[M+H]
+。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.39-7.27(m,5H),4.59(br s,1H),4.06(br d,J=13.6Hz,2H),3.90(br d,J=11.6Hz,1H),3.74-3.49(m,4H),3.29(dd,J=4.0,13.6Hz,1H),3.18(br s,1H),3.10-3.00(m,1H),2.85-2.55(m,6H),1.53-1.45(m,9H)。
ステップF:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(655.74mg、5.69mmol、676μL)のTHF(25mL)中の溶液に、NaH(182mg、4.55mmol、60%純度)を0℃で加え、反応混合物を0℃で0.5時間撹拌した。この混合物に、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.1g、2.28mmol)を加え、シールドチューブ中でN
2下、反応混合物を70℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和NH
4Cl(20mL)の添加によりクエンチし、水層をEtOAc(2×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.1g、1.86mmol、81.7%収率、95%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 562.4[M+H]
+。
ステップG:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:アンモニアをMeOH(30mL)中に5分間バブリングした。この溶液に、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(950mg、1.69mmol)および10%Pd/C(200mg)を加えた。懸濁液を真空下での脱気と、H
2によるパージを数回繰り返し、混合物をH
2(15psi)下、40℃で9時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:15%-40%、30;58%分)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、830μmol、49.1%収率、97.8%純度)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 472.4[M+H]
+。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.59(br s,1H),4.43-4.28(m,1H),4.18-4.09(m,1H),4.07-3.90(m,4H),3.88-3.78(m,1H),3.21(br dd,J=3.2,13.6Hz,2H),3.16-3.05(m,2H),3.03-2.90(m,2H),2.82-2.55(m,4H),2.48(s,3H),2.33-2.22(m,1H),2.11-2.00(m,1H),1.91-1.62(m,4H),1.51(s,9H)。
ステップH:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、318μmol)、1-ブロモナフタレン(98.8mg、477μmol,66.3μL)、Cs
2CO
3(311mg、954μmol)、およびRuPhos(29.7mg、63.6μmol)のトルエン(3mL)中溶液に、Pd
2(dba)
329.1mg、31.8μmol)を加え、懸濁液に対して真空下での脱気およびN
2によるパージを3回実施した。この反応混合物を100℃で12時間撹拌した。混合物を、水(10mL)とEtOAc(20mL)との間で分配し、層を分離させた。その後、水層をEtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(20mL)で洗浄し、無水Na
2SO
4上で乾燥し、濾過後、減圧下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュで精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(70mg、111μmol、35.0%収率、95.0%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 598.6[M+H]
+。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.21-8.20(m,1H),7.87-7.85(m,1H),7.61-7.59(d,J=8.0Hz,1H),7.51-7.49(m,2H),7.45-7.41(t,J=7.6Hz,1H),7.15-7.13(d,J=7.2Hz,1H),4.63(br s,1H),4.46(br s,1H),4.33-4.28(m,4H),4.10-4.07(m,2H),3.97-3.94(br d,J=11.6Hz,1H),3.46(br s,1H),3.31-3.27(br d,J=14.0Hz,1H),3.07-3.01(m,2H),2.77(br s,3H),2.55(br s,3H),2.35(br s,1H),1.82(br s,7H),1.52(s,9H)。
ステップI:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(60mg、100μmol)のDCM(0.1mL)中溶液に、TFA(154mg、1.35mmol、0.1mL)を15℃で加え、15℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(50mg)を褐色油として得た。
ステップJ:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(50mg、81.8μmol、TFA)およびDIEA(106mg、817μmol、142μL)のDCM(0.2mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(11.3mg、89.9μmol)を0℃で加え、反応物を0~15℃で1.5時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:15%-45%、10.5分)で精製して、2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(9.16mg、15.1μmol、18.5%収率、98.7%純度)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 552.5[M+H]+。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.45(br s,1H),8.22-8.19(m,1H),7.87-7.85(m,1H),7.62-7.60(d,J=8.0Hz,1H),7.51-7.49(m,2H),7.45-7.43(t,J=7.6Hz,1H),7.15-7.13(d,J=7.2Hz,1H),6.60(br s,1H),6.42-6.38(m,1H),5.84-5.82(br d,J=10.8Hz,1H),5.08(br s,1H),4.78-4.53(br dd,J=6.8,11.6Hz,2H),4.42-4.40(m,1H),4.27(br s,2H),4.21-4.18(br d,J=14.0Hz,1H),4.12-3.78(br d,J=12.8Hz,2H),3.68-3.07(m,7H),3.05-2.84(m,3H),2.77(d,J=1.6Hz,3H),2.71-2.64(m,1H),2.26-2.17(m,1H),2.11-2.03(m,1H),2.02-1.88(m,2H)。
実施例148
2-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イルインダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、424μmol)、4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(188mg、636μmol)、RuPhos(39.6mg、84.8μmol)およびCs
2CO
3(414mg、1.27mmol)のトルエン(6mL)中溶液に、Pd
2(dba)
3(38.8mg、42.4μmol)を加え、反応物を、N
2下、100℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=3:1→0:1)で直接精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イルインダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、149μmol、35.1%収率、85.0%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 686.6[M+H]
+。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.04(d,J=2.0Hz,1H),7.33-7.29(m,2H),5.70(dd,J=2.4,9.2Hz,1H),4.62(br s,1H),4.39(br s,1H),4.34-4.28(m,2H),4.20-4.14(m,1H),4.05(br d,J=12.0Hz,2H),3.91(br d,J=12.4Hz,1H),3.81-3.72(m,1H),3.53(br t,J=4.8Hz,2H),3.27(br d,J=10.8Hz,2H),3.10(br d,J=6.8Hz,1H),3.06-2.96(m,1H),2.90-2.65(m,5H),2.59(br d,J=10.2Hz,1H),2.50(s,3H),2.43(s,3H),2.35-2.26(m,1H),2.23-2.15(m,1H),2.11(br s,2H),1.90-1.65(m,7H),1.54(s,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イルインダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、219μmol)のDCM(0.2mL)中溶液に、TFA(616mg、5.40mmol、0.4mL)を加え、反応混合物を15℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、真空下で溶媒を除去し、2-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(159mg、218μmol、99.6%収率、2TFA)を赤色油として得た。
ステップC:2-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(159mg、218μmol、2TFA)およびDIEA(366mg、2.83mmol、493μL)のDCM(4mL)中溶液に、-40℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(24.7mg、196μmol)を加え、反応混合物を-20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(2mL)を添加することにより反応混合物をクエンチし、水層を分離させ、DCM(2×10mL)で逆抽出した。合わせた有機成分を真空下で濃縮し、残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM:MeOH=50:1→5:1)で精製し、続けて、逆分取HPCL(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:4%~34%、10分間)で精製して、2-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.77mg、3.10μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 556.5[M+H]+。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.00(s,1H),7.18(br s,1H),7.16-7.11(m,1H),6.52(br s,1H),6.37-6.21(m,1H),5.75(br d,J=10.4Hz,1H),4.99(br s,1H),4.67(br dd,J=6.4,11.6Hz,1H),4.34(br dd,J=3.9,11.6Hz,1H),4.24(s,2H),4.11(br d,J=12.8Hz,1H),3.94(br s,1H),3.57-3.40(m,4H),3.29(br d,J=13.8Hz,1H),3.19(br s,1H),3.02(br dd,J=12.4,19.7Hz,2H),2.87(br dd,J=8.4,16.4Hz,2H),2.76-2.58(m,6H),2.35(s,3H),2.22-2.10(m,1H),2.01(br d,J=8.4Hz,1H),1.89(br s,2H)。
実施例149
2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:トルエン(3.00mL)中の、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、276μmol)、2-[[4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-1-イル]メトキシ]エチルトリメチルシラン(120mg、303μmol)、Pd
2(dba)
3(50.5mg、55.1μmol)、RuPhos(51.5mg、110μmol)、Cs
2CO
3(225mg、689μmol)をN
2で脱気し、次いでN
2下で90℃に12時間加熱した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を分取TLC(EtOAc/MeOH 8/1)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、169μmol、61.4%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 786.3[M+H]
+。
ステップB:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、178μmol)のDCM(3.00mL)中溶液に、2,6-ジメチルピリジン(229mg、2.14mmol)およびTMSOTf(238mg、1.07mmol)を0℃で加えた。混合物を15℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(0.5mL)の添加によりクエンチし、真空下で濃縮して、2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、粗製)を黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 686.6[M+H]
+。
ステップC:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(122mg、178μmol)およびDIEA(138mg、1.07mmol、186μL)のDCM(3.00mL)中溶液に、0℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(18.0mg、143μmol)を滴加した。混合物を20℃で1.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(0.5mL)で希釈し、EtOAc(2×5ml)で抽出した。有機層をNa
2SO
4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(EA/MeOH 10/1)、および分取HPLC(カラム:Boston pH-lex 150*25 10μm;移動相[水(0.1%TFA)-ACN]:B%:39%-69%、10分)で精製して、2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(54.0mg、43.8μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 740.6[M+H]
+。
ステップD:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(20mg、27.0μmol)のDCM(60μL)中溶液に、TFA(30.8mg、270μmol)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。反応が完了しなかったので、追加のTFA(30.8mg)を加え、反応物を20℃でさらに0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物のNaHCO3飽和水溶液(1mL)を加えてpHを8に調節し、水層をEtOAc(2×5mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をMeOH(0.5mL)で希釈し、NH3・H2O(0.5mL)を加え、混合物を20℃で0.5時間撹拌した。混合物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:15%-45%、10.5分)で精製して、2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(2.68mg、3.99μmol)を白色固体として得た。ES+APCI MS m/z 610.5[M+H]+。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22(s,1H),7.68(d,J=9.2Hz,1H),7.45(d,J=8.8Hz,1H),6.60(br s,1H),6.45-6.35(m,1H),5.84(br d,J=11.2Hz,1H),5.09(br s,1H),4.71-4.60(m,1H),4.42-4.27(m,3H),4.17(br d,J=11.2Hz,1H),4.01(br d,J=12.4Hz,2H),3.78-3.31(m,5H),3.23-3.03(m,2H),3.02-2.75(m,4H),2.71(s,3H),2.66-2.57(m,1H),2.27-2.12(m,1H),2.10-2.03(m,3H)。ES+APCI MS m/z 610.1[M+H]+。
実施例150
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、1.04mmol)、(2R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オール(214mg、2.07mmol)およびナトリウムtert-ブトキシド(298mg、3.11mmol)のトルエン(20mL)中溶液に、BINAP(129mg、207μmol)およびPd
2(dba)
3(94.8mg、104μmol)を加え、混合物を窒素でスパージし、続いて90℃に5時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(100mL)および水(100mL)で希釈し、有機層を分離させ、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュクロマトグラフィー[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和炭酸ナトリウム水溶液(5mL)で中和し、10%MeOH/DCM(2×50mL)で抽出した。合わせた有機成分を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、480μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 550.4[M+H]
+。
ステップB:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.1g、2.00mmol)のMeOH(10mL)中溶液に、NH
3(792mg、46.5mmol)のMeOH(3.96g、123.56mmol、5mL)中溶液,続けて、10%Pd/C(500mg)を加えた。混合物をH
2(15psi)下、40℃で12時間撹拌した。反応物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮乾固して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(756mg、粗製)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 460.3[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:(4-ブロモ-2-ナフチル)2,2-ジメチルプロパノエート(304mg、990μmol)、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(350mg、761μmol)、[2-(2-アミノエチル)フェニル]クロロ-パラジウム,ジシクロヘキシル[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン(84.4mg、114μmol)およびCs
2CO
3(620mg、1.90mmol)のトルエン(10mL)中混合物を、N
2で3回パージし、混合物をN
2雰囲気下、70℃で16時間撹拌した。反応混合物をH
2O(50mL)中に注ぎ込み、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(30mL)で洗浄し、無水Na
2SO
4上で乾燥し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、303μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 686.4[M+H]
+。
ステップD:[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、306μmol)のジクロロメタン(300μL)中溶液に、TFA(523mg、4.59mmol、340μL)を加え、混合物を15℃で2時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(214mg、305μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 586.4[M+H]
+。
ステップE:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(214mg、305μmol、TFA)およびDIEA(395mg、3.06mmol、532μL)の-40℃に冷却したジクロロメタン(5.00mL)中の混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(38.6mg、305μmol)のジクロロメタン(1.00mL)中溶液を窒素雰囲気下で加えた。混合物を0℃に温め、1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%トリフルオロ酢酸)/アセトニトリル]で精製して、[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル]-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(100mg、156μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 640.7[M+H]
+。
ステップF:2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(90mg、141μmol)の0℃に冷却したTHF(500μL)中溶液に、NaOH(2M、281.34μL)を加え、混合物を15℃で16時間撹拌した。20%のギ酸溶液の添加により、混合物のpHを7に調節した。次に、この水溶液をジクロロメタン(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:7%~37%、10分)により精製して、2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(5mg、8.82μmol、6.27%収率、98%純度)を得た。ES+APCI MS m/z 556.3[M+H]+。1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=8.54(br s,0.6H),8.07(d,J=8.4Hz,1H),7.63(d,J=8.4Hz,1H),7.37(t,J=7.2Hz,1H),7.30-7.21(m,1H),6.91-6.72(m,3H),6.29(br d,J=16.4Hz,1H),5.84(br d,J=11.2Hz,1H),5.48(br s,1H),5.26-4.96(m,1H),4.57(br s,1H),4.24-4.09(m,4H),3.74-3.54(m,1H),3.48(m,2H),3.22(m,2H),3.10-2.86(m,5H),2.78(br d,J=14.4Hz,1H),2.53(br s,6H),1.37(dd,J=2.0,6.4Hz,3H)。
実施例151
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例150に従って、ステップFで、(4-ブロモ-2-ナフチル)2,2-ジメチルプロパノエートの代わりに1-ブロモナフタレンを使用して、2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-イル)オキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを調製した。ES+APCI MS m/z 540.3[M+H]+.1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=8.51(s,1H),8.26-8.19(m,1H),7.90-7.84(m,1H),7.62(d,J=8.0Hz,1H),7.53-7.47(m,2H),7.46-7.39(m,1H),7.25-7.18(m,1H),6.82(br s,1H),6.30(br d,J=17.2Hz,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.62-5.53(m,1H),5.08(br s,1H),4.70-4.39(m,1H),4.26-4.11(m,4H),3.94-3.59(m,1H),3.48-3.34(m,2H),3.28-3.18(m,3H),3.13-2.92(s,5H),2.79-2.61(s,6H),1.48(dd,J=2.0,6.0Hz,3H)。
実施例152
2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イルインダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.50g、1.09mmol)、4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(482mg、1.63mmol)、t-BuONa(314mg、3.26mmol)および[2-(2-アミノエチル)フェニル]クロロ-パラジウム;ジシクロヘキシル-[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン(80.4mg、109μmol)のトルエン(30mL)中混合物を、70℃で10時間撹拌した。混合物を水(10mL)で希釈し、水層を酢酸エチル(3×20mL)で抽出した。有機層を飽和塩化ナトリウム溶液(30mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(ギ酸、0.1%)/アセトニトリル]で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.40g、522μmol、48.0%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 674.3[M+H]
+。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.03(d,J=1.6Hz,1H),7.31-7.27(m,2H),5.68(dd,J=2.4,9.6Hz,1H),5.31(br s,1H),4.61(br s,1H),4.28(s,2H),4.08-3.94(m,3H),3.86(br d,J=11.6Hz,1H),3.79-3.71(m,1H),3.52(br t,J=4.8Hz,2H),3.24(br d,J=12.8Hz,2H),3.04-2.91(m,1H),2.87-2.67(m,5H),2.65-2.47(m,2H),2.41(s,3H),2.32(br s,6H),2.17(br d,J=4.0Hz,1H),2.09(br s,1H),1.77(br t,J=10.8Hz,3H),1.52(s,9H),1.36(d,J=6.0Hz,3H)。
ステップB:2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.38g、564μmol)のジクロロメタン(10mL)中溶液に、TMSOTf(752mg、3.38mmol)および2,6-ジメチルピリジン(725mg、6.77mmol)を0℃で加え、混合物を10℃で1時間撹拌した。メタノール(0.10mL)を添加することにより混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を逆相クロマトグラフィー[水(ギ酸、0.1%)/アセトニトリル]で精製した。集めた画分を合わせ、飽和炭酸水素ナトリウム溶液の添加により、pHを7超に調節し、水層をジクロロメタン/メタノール(10/1)(3×10mL)で抽出した。抽出物を飽和塩化ナトリウム溶液(10mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.30g、粗製)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 574.1[M+H]
+。
ステップC:2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.20g、粗製)およびTEA(176mg、1.74mmol、243μL)のジクロロメタン(1.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(44.0mg、349μmol)を0℃で加え、反応物を0℃で0.5時間撹拌した。メタノール(0.10mL)を添加することにより混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(ギ酸、0.1%)/アセトニトリル]で精製した。集めた画分を合わせ、飽和炭酸水素ナトリウム溶液の添加により、pHを7超に調節し、水層をジクロロメタン/メタノール(10/1)(3×5.00mL)で抽出した。抽出物を飽和塩化ナトリウム溶液(1×10mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.10g、127μmol、2ステップで36.6%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 628.6[M+H]
+。
ステップD:2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(40mg、63.7μmol)およびTsOH(1.10mg、6.37μmol)のアセトニトリル(3mL)中混合物を、90℃で1時間撹拌した。飽和炭酸水素ナトリウム(2mL)を0℃で添加することにより混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、ジクロロメタン/メタノール=5/1)で精製した。集めた目的の画分を真空下で濃縮して白色固体を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:35%~65%、3分)および(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN]B%:15%~45%、10分)により精製した。所望の画分をプールし、凍結乾燥して、2-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチルエトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(2.99mg、5.50μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 544.5[M+H]+。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.36(br s,1H),8.09(s,1H),7.29(br s,1H),7.24-7.20(m,1H),6.62(br d,J=13.6Hz,1H),6.47-6.24(m,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.50(br s,1H),5.08(br s,1H),4.60(br s,1H),4.31(s,2H),4.12(br d,J=14.4Hz,1H),3.99(br d,J=10.8Hz,1H),3.55(br t,J=5.6Hz,2H),3.42-3.29(m,1H),3.10(br s,1H),3.00-2.68(m,7H),2.49(s,6H),2.43(s,3H),1.39(d,J=6.0Hz,3H)。
実施例153
2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、773μmol)および3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロパン-1-オール(219mg、1.39mmol)のトルエン(10mL)中溶液に、N
2下で、tBuONa(111mg、1.16mmol)を加えた。反応混合物を18℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=3:1→0:1、次に、EA:MeOH=50:1→10:1)で精製して、続いて、逆相フラッシュクロマトグラフィー(50%→90%の水中MeCN、塩基条件)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、156μmol、20.5%収率、97.9%純度)を褐色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.19-8.12(m,1H),7.83-7.77(m,1H),7.55-7.43(m,2H),7.29(d,J=1.6Hz,1H),6.84(d,J=2.0Hz,1H),4.64(br s,1H),4.42-4.35(m,3H),4.26(br d,J=5.2Hz,2H),4.12-4.03(m,3H),3.96(br d,J=12.8Hz,1H),3.62(dd,J=1.6,7.6Hz,1H),3.50(br s,2H),3.31(br d,J=13.6Hz,3H),3.11-2.97(m,2H),2.94(br d,J=8.8Hz,1H),2.89-2.69(m,5H),2.54(br d,J=9.8Hz,1H),2.00-1.92(m,2H),1.90-1.83(m,1H),1.73(br d,J=10.0Hz,1H),1.53(s,9H),1.41(s,9H)。
ステップB:4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、162μmol)のTFA(370mg、3.24mmol、240μL)中溶液を18℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、真空下で溶媒を除去し、4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(140mg、161μmol、99.5%収率、2TFA)を褐色油として得た。
ステップC:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(140mg、161μmol)およびDIEA(167mg、1.29mmol、225μL)のDCM(2mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(30.5mg、242μmol)を0℃で加えた。反応混合物を18℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(5mL)を添加することにより反応混合物をクエンチし、水層をDCM(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa
2SO
4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュで(塩基条件、MeCN/水中NH
3・H
2O:50%→80%)精製して、[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(60mg、86.5μmol、53.6%収率)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22-8.13(m,1H),7.84-7.78(m,1H),7.56-7.45(m,2H),7.31(d,J=2.0Hz,1H),6.86(d,J=2.4Hz,1H),6.62(br s,1H),6.47-6.37(m,1H),5.92-5.79(m,1H),5.24-4.88(m,1H),4.75(br s,1H),4.45-4.36(m,3H),4.31-4.20(m,2H),4.15(br d,J=13.6Hz,1H),4.10-4.01(m,2H),3.64(dd,J=1.6,7.6Hz,2H),3.51(br s,2H),3.38(br s,2H),3.14(br s,1H),3.08-2.73(m,7H),2.56(br d,J=10.0Hz,1H),2.03-1.93(m,2H),1.88(br d,J=9.6Hz,1H),1.78-1.70(m,1H),1.61(s,9H),1.43(s,9H)。
ステップD:2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(60mg、86.5μmol)のTHF(0.5mL)中溶液に、NaOH(2M、600μL)を加えた。この反応混合物を18℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、4滴のHCOOH(水中20%)を添加することにより反応混合物を酸性化し、水層をDCM(5×8mL)で抽出した。合わせた有機成分をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:10%-40%、10分)で精製して、2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(19.8mg、28.3μmol、32.8%収率、93.8%純度、ギ酸塩)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 610.5[M+H]+。
実施例154
2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3g、7.42mmol)、1-ブロモナフタレン(3.07g、14.8mmol、2.06mL)およびCs
2CO
3(7.25g、22.2mmol)のトルエン(60mL)中溶液に、XPhos palladacycle gen 3(628mg、742μmol)をN
2下で加え、懸濁液に対して真空下での脱気およびN
2によるパージを数回実施した。混合物を70℃に温め、70℃で10時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAc(3×20mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で濃縮し、残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 50:1→3:1)で精製して、(tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.55g、6.02mmol、81.2%収率、90.0%純度)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 531.4[M+H]
+。
ステップB:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.95g、5.56mmol)のDCM(60mL)中溶液に、m-CPBA(1.13g、5.56mmol、85.0%純度)を0℃で加え、0℃で1時間撹拌した。0℃で飽和Na
2S
2O
3(20mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、層を分離し、水相を水(20mL)で希釈し、EtOAc(60mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%ギ酸)=100%)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.7g、2.80mmol、50.3%収率、90.0%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 574.4[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、549μmol)および3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロパン-1-オール(160mg、1.02mmol)のトルエン(6mL)中溶液に、tBuONa(79.1mg、823μmol)を加えた。反応混合物を18℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA=3:1→0:1、次に、EA:MeOH=50:1→10:1)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、249μmol、45.3%収率、79.6%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 640.5[M+H]
+。
ステップD:2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、313μmol)のTFA(770mg、6.75mmol、500μL)中の反応混合物を18℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、真空下で溶媒を除去し、2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(271mg、粗製)を褐色油として得た。
ステップE:2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(271mg、502μmol)およびDIEA(323mg、2.50mmol、0.435mL)のDCM(6mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(60mg、476μmol)を0℃で加え、反応混合物を18℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、一滴の水を添加することにより反応混合物をクエンチし、シリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=3:1→0:1)、次いで分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:33%-63%、12分)で精製して、2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(23.8mg、40.0μmol、7.97%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 594.5[M+H]+。
実施例155
(S)-1-(4-(7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(4.15g、36.0mmol、4.28mL)のTHF(100mL)中混合物に、NaH(2.16g、54.06mmol、60%純度)を0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で1時間撹拌後、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(8.0g、18.02mmol)のTHF(60mL)中溶液を加え、混合物を70℃で11時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をNH
4Cl水溶液(160mL)中に注ぎ込み、水層をEtOAc(2×100mL)で抽出した。合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥して、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル/メタノール=10:1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(4.9g、8.70mmol、48.3%収率、92.8%純度)を灰色の固体として得た。ES+APCI MS m/z 523.2[M+H]
+。
ステップB:tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.20g、4.21mmol)のMeOH(30mL)中混合物に、Pd(OH)
2/C(700mg、10%純度)を加え、混合物に真空下での脱気と、H
2によるパージを数回繰り返し、反応物をH
2(15psi)下、40℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトを通して濾過し、濾液を濃縮して、tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.80g、4.02mmol、95.6%収率、96.7%純度)を黒色固体として得た。ES+APCI MS m/z 433.1[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、462μmol)および4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(204mg、694μmol)のトルエン(4mL)中混合物に、Pd
2(dba)
3(63.5mg、69.4μmol)、RuPhos(43.2mg、92.5μmol)およびCs
2CO
3(301mg、925μmol)を加え、混合物を、N
2下、110℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10mL)とEtOAcとの間で分配し、層を分離させた。その後、水層を酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/酢酸エチル=5/1→酢酸エチル/MeOH=10/1)で精製して、tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、310μmol、67.1%収率、83.6%純度)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 647.6[M+H]
+。
ステップD:7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、371μmol)のDCM(1mL)中混合物に、TFA(1.54g、13.5mmol、1mL)を加え、混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(250mg、309μmol、83.4%収率、85.5%純度、2TFA)を褐色固体として得て、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。ES+APCI MS m/z 463.4[M+H]
+。
ステップE:1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(250mg、362μmol、2TFA)のDCM(2mL)中混合物に、DIEA(702mg、5.43mmol、946μL)を加え、混合物を-50℃に冷却した。-50℃でプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(36.5mg、289μmol)を少しずつ反応物に加え、混合物を-50℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、MeOH(1mL)を添加することにより反応混合物をクエンチし、混合物を濃縮した。残留物を、DCM(10mL)に入れ、有機成分をH2O(2×8mL)で洗浄した。有機成分をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を分取HPLC(測定器:gx-l;カラム:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10μm;条件:水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN;開始B:32;終了B:62;勾配時間(分):12;100%Bホールド時間(分):2;流速(ml/分):25)により精製して、1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾールー4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(48.6mg、92.9μmol、25.7%収率、98.7%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 517.5[M+H]+。
実施例156
(S)-1-(4-(2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例155に従って、ステップCで、4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾールの代わりに4-ブロモ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール(中間体60)を使用して、(S)-1-(4-(2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 571.4[M+H]+。
実施例157
(S)-1-(4-(7-(5-メトキシ-1H-インダゾール-4-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例155に従って、ステップCで、4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾールの代わりに4-ブロモ-5-メトキシ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾールを使用して、(S)-1-(4-(7-(5-メトキシ-1H-インダゾール-4-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 533.4[M+H]+。
実施例158
1-[4-[7-(2-イソプロピルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-[7-(2-イソプロピルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:トルエン(4.00mL)中の、tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、462μmol)、1-ブロモ-2-イソプロピルベンゼン(120mg、601μmol)、Cs2CO3(452mg、1.39mmol)およびXPHOS PALLADACYCLE GEN 3(78.3mg、92.5μmol)をN2で脱気し、次いでN2下で100℃に10時間加熱した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を濃縮した。粗生成物を、EtOAc/MeOH=50/1→5/1で溶出するシリカゲルクロマトグラフィーで精製して、tert-ブチル 4-[7-(2-イソプロピルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(84.6mg、134μmol、28.9%収率、87.0%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 551.2[M+H]+。
実施例155に従って、ステップDで、tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル 4-[7-(2-イソプロピルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、1-[4-[7-(2-イソプロピルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 505.6[M+H]+。
実施例159
(S)-1-(4-(2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例155に従って、ステップCで、4-ブロモ-5-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾールの代わりに1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して、(S)-1-(4-(2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 531.5[M+H]+。
実施例160
1-(4-(7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-(3-(ピペリジン-1-イル)プロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[2-メチルスルファニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.15g、7.88mmol)、2-[(4-ブロモ-5-メチルインダゾール-1-イル)メトキシ]エチル-トリメチルシラン(3.50g、10.2mmol)、Cs
2CO
3(6.42g、19.70mmol)、Pd
2(dba)
3(1.08g、1.18mmol)およびRuPhos(735mg、1.58mmol)のトルエン(50mL)中混合物を、脱気とN
2によるパージを3回繰り返し、混合物をN
2雰囲気下、90℃で10時間撹拌した。水(100mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、水層を酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(50mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を、1→33%EtOAc/石油エーテルを使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[2-メチルスルファニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.30g、2.93mmol、37.1%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 660.3[M+H]
+。
ステップB:ベンジル 4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-メチルスルファニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.30g、3.49mmol)のDCM(20mL)中撹拌溶液に、m-CPBA(601mg、3.49mmol)を0℃で加えた。反応混合物をN2雰囲気下、0℃で1時間撹拌した。0℃でNa
2S
2O
3(10mL)を加えることにより反応混合物をクエンチした後、水(100mL)で希釈し、水層をDCM(200mL)で抽出した。合わせた有機成分をブライン(200mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を、1→10%MeOH/DCMを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.00g、2.84mmol、81.4%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 676.3[M+H]
+。
ステップC:ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-[3-(1-ピペリジル)プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、739μmol)および3-(1-ピペリジル)プロパン-1-オール(211mg、1.48mmol)のTHF中(10mL)中混合物に、t-BuONa(213mg、2.22mmol)を何度かに分けて加え、混合物をN
2雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。混合物を、0℃に冷却し、pH約7までHCl(2M)を加えた。混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、5→95%水(0.5%TFA)/アセトニトリルを溶出液として使用する逆相フラッシュで精製して、ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-[3-(1-ピペリジル)プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、385μmol、52.1%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 755.4[M+H]
+。
ステップD:7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-2-(3-(ピペリジン-1-イル)プロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン:ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-[3-(1-ピペリジル)プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、397μmol)のMeOH(20mL)中溶液に、HCl/MeOH(4M、1.99mL)およびPd(OH)
2(200mg、10%純度)をN
2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH
2によるパージを数回実施した。混合物をH
2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を濃縮して、7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-2-(3-(ピペリジン-1-イル)プロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(250mg、360μmol、90.7%収率)を得た。
ステップE:1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[3-(1-ピペリジル)プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-2-(3-(ピペリジン-1-イル)プロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(250mg、360μmol、2HCl)およびDIEA(465mg、3.60mmol、629μL)のDCM(8.00mL)中の混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(36.3mg、288μmol)のDCM(2.00mL)中溶液を窒素雰囲気下、-40℃で加え、反応物を1時間撹拌した。-40℃でNaHCO3(500μL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、次いで水(10mL)で希釈し、水層をDCM(10mL)で抽出した。有機成分をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH 1/0→5/1)で精製し、さらに分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:8%~28%、10分)により精製して、1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[3-(1-ピペリジル)プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(16.0mg、29.1μmol、8.07%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 545.3[M+H]+。
実施例161
1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[(1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
実施例160に従って、ステップCで、3-(1-ピペリジル)プロパン-1-オールの代わりに(1-メチルピロリジン-3-イル)メタノールを使用して、1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[(1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 517.4[M+H]+。
実施例162
1-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:トルエン中の(2R)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オール(183mg、1.78mmol)(8.00mL)、ベンジル 4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、592μmol)およびNaOtBu(114mg、1.18mmol)の混合物を、15℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をAl
2O
3カラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 10/1→0/1)で精製して、ベンジル 4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、352μmol)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.08(s,1H),7.46-7.39(m,5H),7.38-7.33(m,2H),5.76(s,2H),5.43-5.33(m,1H),5.24(s,2H),4.35(s,2H),3.72-3.67(m,4H),3.64-3.56(m,4H),3.55-3.47(m,4H),2.87-2.80(m,2H),2.74(dd,J=6.8,12.8Hz,1H),2.49(s,3H),2.47-2.40(m,1H),2.36(s,6H),1.42(d,J=6.4Hz,3H),0.98-0.92(m,2H),0.00(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル 4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、280μmol)および(Boc)
2O(122mg、559μmol、129μL)のMeOH(6.00mL)中溶液に、N
2下で10%Pd/C(80mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH
2によるパージを数回実施した。混合物をH
2(15psi)下、25℃で1時間および35℃で1時間、撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートおよび(2R)-N,N-ジメチル-2-[[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロパン-1-アミンの混合物(110mg)を得た。ES+APCI MS m/z 681.3[M+H]
+。
ステップC:(2R)-N,N-ジメチル-2-[[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロパン-1-アミン:(2R)-N,N-ジメチル-2-[[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロパン-1-アミン(TFA)および[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-5-メチル-インダゾール-1-イル]メタノール。tert-ブチル 4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートおよび(2R)-N,N-ジメチル-2-[[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロパン-1-アミンの110mgの混合物のTFA(3.08g、27.0mmol)中溶液を30℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、(2R)-N,N-ジメチル-2-[[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロパン-1-アミンおよび[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-5-メチル-インダゾール-1-イル]メタノールの260mgの混合物を得た。ES+APCI MS m/z 451.3[M+H]
+。
ステップD:1-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:-50℃に冷却したDCM(1.00mL)中の、(2R)-N,N-ジメチル-2-[[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロパン-1-アミンおよび[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-5-メチル-インダゾール-1-イル]メタノールの260mgの混合物に、DIEA(594mg、4.59mmol)、続けて、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(18.0mg、143μmol)を滴加し、混合物を-50℃~-40℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、1-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンおよび1-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[1-(ヒドロキシメチル)-5-メチル-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンの100mgの混合物を得た。ES+APCI MS m/z 505.4[M+H]
+。
ステップE:1-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:THF(22mL)および水(550μL)中の、1-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンおよび1-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-[1-(ヒドロキシメチル)-5-メチル-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンの100mgの混合物に、NaOH(44.8mg、1.12mmol)を加え、混合物を10℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(1mL)で希釈し、DCM(3×5ml)で抽出した。合わせた有機成分をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:10%~40%、12分)により精製して、1-[4-[2-[(1R)-2-(ジメチルアミノ)-1-メチル-エトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(16.2mg、29.2μmol、99.0%純度、ギ酸塩)をオフホワイトの固体として得た。ES+APCI MS m/z 505.2[M+H]+。
実施例163
1-(4-(2-(2-(ジエチルアミノ)エトキシ)-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、739μmol)および2-(ジエチルアミノ)エタノール(173mg、1.48mmol、197μL)のTHF中(10mL)中混合物に、t-BuONa(213mg、2.22mmol)を加え、混合物をN
2雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。混合物を0℃に冷却し、pH約7までHCl(2M)を加えた。混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、0→10%MeOH/DCMを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、不純物を含む物質を得、これを逆相クロマトグラフィーでさらに精製して、ベンジル 4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(220mg、295μmol、39.9%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 729.3[M+H]
+。
ステップB:N,N-ジエチル-2-[[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]エタンアミン:ベンジル 4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、164μmol)のMeOH(10mL)中溶液に、Pd(OH)
2(99.4mg、10%純度)およびHCl/MeOH(4M、823.05μL)をN
2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH
2によるパージを数回実施した。混合物をH
2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮して、N,N-ジエチル-2-[[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]エタンアミン(105mg、157.24μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 595.4[M+H]
+。
ステップC:1-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:N,N-ジエチル-2-[[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]エタンアミン(105mg、158μmol、2HCl)およびDIEA(204mg、1.58mmol、276μL)の-40℃のDCM(8mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(15.9mg、126.4μmol)のDCM(2mL)中溶液を窒素雰囲気下で加え、反応物を1時間撹拌した。-40℃でNaHCO
3(500μL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、次いで水(10mL)で希釈した。水層をDCM(10ml)で抽出し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を、0→20%MeOH/DCMを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、1-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(60.0mg、71.2μmol、45.0%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 649.3[M+H]
+。
ステップD:1-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(50mg、77.0μmol)のDCM(500μL)中溶液に、TFA(175mg、1.54mmol、114μL)を加えた。混合物を15℃で16時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮し、残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:32%~62%、12分)により精製して、1-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(16.0mg、30.2μmol、39.2%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 519.3[M+H]+。
実施例164
1-(4-(7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-(2-(ピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)エタノン
ステップA:ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、739μmol)および2-(1-ピペリジル)エタノール(191mg、1.48mmol、197μL)のトルエン(20mL)中溶液に、t-BuONa(213mg、2.22mmol)を加えた。混合物をN
2雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。混合物を0℃に冷却し、pH約7までHCl(2M)を加えた。混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、0→10%MeOH/DCMを溶出液として使用するカラムクロマトグラフィーで精製して、ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、404μmol、54.7%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 741.4[M+H]
+。
ステップB:7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:ベンジル 4-[7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、337μmol)のTFA(10mL)中溶液を80℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮して、7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(200mg、283μmol、84.1%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 477.3[M+H]
+。
ステップC:1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-ピペラジン-1-イル-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(200mg、283μmol、2TFA)およびDIEA(366mg、2.84mmol、495μL)のDCM(8mL)中の混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(28.6mg、227μmol)のDCM(2mL)中溶液を窒素雰囲気下、-40℃で加え、反応物を1時間撹拌した。-40℃でNaHCO3(500μL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、次いで水(10mL)およびDCM(10mL)で希釈した。分離した有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:30%~60%、12分)により精製した。1-[4-[7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(6.00mg、11.1μmol、3.94%収率、99.0%純度)。ES+APCI MS m/z 531.4[M+H]+。
実施例165
1-[4-[7-(2-フルオロ-3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:3-メトキシナフタレン-1-オ-ル:ナフタレン-1,3-ジオール(20g、125mmol)のMeOH(150mL)中溶液に、HCl/MeOH(4M、250mL)を0℃で加えた。混合物を18℃まで温め、36時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→1/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、3-メトキシナフタレン-1-オ-ル(11g、62.5mmol、50.1%収率、99%純度)を淡黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 175.1[M+H]+。
ステップB:4-ブロモ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール:3-メトキシナフタレン-1-オ-ル(0.50g、2.87mmol)のTHF(10mL)中溶液に、0℃でNBS(562mg、3.16mmol)のTHF(3.00mL)中溶液を加えた。0℃で2時間撹拌後、混合物を真空下で濃縮して、H2O(5mL)で希釈し、ジクロロメタン(3×10mL)で抽出した。合わせた抽出物を飽和塩化ナトリウム(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/エーテルアセテート=3/1)で精製して、4-ブロモ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール(0.43g、1.43mmol、49.7%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 253[M+H]+。
ステップC:4-ブロモ-2-フルオロ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール:4-ブロモ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール(4.00g、15.8mmol)のアセトニトリル(20mL)中溶液に、-40℃で、1-(クロロメチル)-4-フルオロ-1,4-ジアゾニアビシクロ[2.2.2]オクタン;ジテトラフルオロボレート(6.72g、19.0mmol)中のアセトニトリル(20mL)中溶液を加えた。-40℃で1時間、10℃で3時間撹拌後、混合物を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/エーテルアセテート=3/1)で精製して、4-ブロモ-2-フルオロ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール(4.00g、10.6mmol、67.2%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 271.0[M+H]+。
ステップD:2-フルオロ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール:4-ブロモ-2-フルオロ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール(2.00g、7.38mmol)および10%Pd/C(0.01g)の酢酸エチル(20mL)中混合物を、15psiのH2下、10℃で1時間撹拌した。混合物を濾過し、真空下で濃縮して、2-フルオロ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール(1.60g、粗製)を黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。ES+APCI MS m/z 193.0[M+H]+。
ステップE:(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート:2-フルオロ-3-メトキシ-ナフタレン-1-オール(1.60g、粗製)およびTEA(1.85g、18.3mmol、2.55mL)のジクロロメタン(30mL)中溶液に、トリフルオロメチルスルホニル トリフルオロメタンスルホネート(2.35g、8.33mmol、1.37mL)を-78℃で1時間かけて加えた。混合物を飽和塩化アンモニウム(30mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×20mL)で抽出して、飽和塩化ナトリウム(1×50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/エーテルアセテート=3/1)で精製して、(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.10g、2.07mmol、2ステップで24.9%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 324.9[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル 4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.40g、865μmol)、(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(561mg、1.73mmol)、RuPhos(80.7mg、173μmol)、Pd2(dba)3(79.2mg、86.5μmol)およびt-BuONa(249mg、2.59mmol)のトルエン(10mL)中混合物を、N2雰囲気下、110℃で5時間撹拌した。混合物を水(10mL)で希釈し、エーテルアセテート(3×10mL)で抽出した。抽出物を飽和塩化ナトリウム(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュクロマトグラフィー[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]で精製して、tert-ブチル 4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.35g、495μmol、57.2%収率)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 637.1[M+H]+。
ステップG:4-[3-[[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン:tert-ブチル 4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.40g、628μmol)およびTFA(1.07g、9.42mmol、698μL)のジクロロメタン(0.70mL)中混合物を10℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、4-[3-[[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン(0.41g、粗製、TFA)を黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。ES+APCI MS m/z 537.5[M+H]+。
ステップH:1-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[3-[[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン(0.41g、粗製、TFA塩)およびTEA(635mg、6.27mmol、873μL)のジクロロメタン(5.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(79.1mg、627μmol)を-40℃で加えた。-40℃で0.5時間撹拌後、混合物をメタノール(0.10mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、ジクロロメタン/メタノール=10/1)で精製して、1-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(0.25g、411μmol、2ステップで65.5%収率)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 591.0[M+H]+。
ステップI:1-[4-[7-(2-フルオロ-3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(0.20g、339μmol)のジクロロメタン(4.00mL)中溶液に、BBr3(424mg、1.69mmol、163μL)を-78℃で0.5時間かけて加え、0℃で2時間撹拌した。-78℃で飽和重炭酸ナトリウム溶液(5mL)で混合物をクエンチし、0℃で0.5時間撹拌した。混合物をジクロロメタン(3×10mL)で抽出し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:13%~45%、7分)により精製して、1-[4-[7-(2-フルオロ-3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(35.2mg、60.8μmol、17.9%収率、99.4%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 577.0[M+H]+。
実施例166
1-[4-[7-(6-ヒドロキシ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:4-トリイソプロピルシリルオキシアニリン:4-アミノフェノール(5.00g、45.8mmol、7.14mL)のDCM(50.0mL)中溶液に、イミダゾール(4.06g、59.6mmol)を加えた。この混合物に、TIPSCl(13.3g、68.7mmol、14.7mL)を滴加した。混合物を15℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を自動化フラッシュクロマトグラフィーシステム(PE/EA 100/1→3/1)で精製して、4-トリイソプロピルシリルオキシアニリン(9.46g、33.9mmol、73.9%収率、95.0%純度)を黒色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.74-6.71(m,1H),6.71-6.69(m,1H),6.60-6.58(m,1H),6.58-6.55(m,1H),3.66-2.98(m,2H),1.28-1.16(m,3H),1.11-1.06(m,18H)。
ステップB:2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシ-アニリン:4-トリイソプロピルシリルオキシアニリン(7.30g、27.5mmol)のDCM(73.0mL)およびMeOH(73.0mL)中溶液に、DCM(5mL)中のBr2(11.0g、68.8mmol、3.55mL)を0℃で滴下した。混合物を15℃で5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を亜硫酸ナトリウム溶液(60mL)で希釈し、DCM(3×200ml)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(PE/EA 50/1→1/1)で精製して、2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシ-アニリン(10.8g、23.2mmol、84.4%収率、90.8%純度)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 423.9[M+H]+。
ステップC:N-(2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシ-フェニル)アセトアミド:2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシ-アニリン(10.4g、24.6mmol)およびCH3COOH(52mL)の溶液に、無水酢酸(10.9g、107mmol、10mL)を加えた。反応混合物を90℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(100mL)およびDCM(200mL)を加え、層分離させた。水相をDCM(100mL×2)で抽出した。合わせた抽出物を5%Na2CO3(80mL)およびブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(PE/EA 50/1→1/1)で精製して、N-(2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシ-フェニル)アセトアミド(7.32g、14.2mmol、57.6%収率、90.0%純度)を褐色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.16(s,1H),7.11(s,2H),2.21(s,3H),1.28-1.24(m,3H),1.12-1.09(m,18H)。
ステップD:N-(2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシフェニル)チオアセトアミド:N-(2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシ-フェニル)アセトアミド(7.22g、15.5mmol)のトルエン(116mL)中溶液に、ローソン試薬(3.14g、7.76mmol)を加えた。混合物を110℃に2時間加熱した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(PE/EA 100/1→1/1)で精製して、N-(2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシフェニル)チオアセトアミド(5.41g、8.40mmol、54.1%収率、74.7%純度)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 481.9[M+H]+。
ステップE:4-ブロモ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-6-オール:CuI(94.2mg、494μmol)を、N-(2,6-ジブロモ-4-トリイソプロピルシリルオキシフェニル)チオアセトアミド(2.38g、4.94mmol)、1,10-フェナントロリン(134mg、741μmol)およびCs2CO3(4.83mg、14.8mmol)のDMF(48.0mL)中溶液に加えた。次いで反応混合物を、N2下、80℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(PE/EA 50/1→0/1)で精製して、4-ブロモ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-6-オール(1.33g、3.54mmol、71.7%収率、65.0%純度)を褐色油として得た。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=7.33(d,J=2.4Hz,1H),7.14(d,J=2.4Hz,1H),3.40-3.33(m,1H),2.72(s,3H)。
ステップF:6-ベンジルオキシ-4-ブロモ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール:4-ブロモ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-6-オール(1.28g、5.24mmol)およびK2CO3(2.17g、15.72mmol)のACN(26.0mL)中混合物に、BnBr(988mg、5.76mmol、685μL)を加えた。反応混合物を45℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(PE/EA 200/1→10/1)で精製して、6-ベンジルオキシ-4-ブロモ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール(1.10g、3.13mmol、59.7%収率、95.0%純度)を淡黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 336.2[M+H]+。
ステップG:ベンジル 4-[7-(6-ベンジルオキシ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:トルエン(16mL)中の、ベンジル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、805μmol)、6-ベンジルオキシ-4-ブロモ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール(323mg、967μmol)、RuPhos(75.2mg、161μmol)、Cs2CO3(787mg、2.42mmol)およびPd2(dba)3(73.8mg、80.6μmol)をN2下、85℃で16時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物をAl2O3カラムクロマトグラフィー(PE/EA 10/1→0/1)で精製して、ベンジル 4-[7-(6-ベンジルオキシ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(340mg、408μmol、50.7%収率、90.0%純度)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 750.5[M+H]+。
ステップH:2-メチル-4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ベンゾチアゾール-6-オール:ベンジル 4-[7-(6-ベンジルオキシ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(160mg、213μmol)のMeOH(4mL)中溶液に、HCl/MeOH(4M、533μL)続けて、N2下でPd(OH)2/C(80mg、533μmol)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で8時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮して、2-メチル-4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ベンゾチアゾール-6-オール(110mg、126μmol、59.2%収率、68.7%純度、2HCl)を黄色固体として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 526.2[M+H]+。
ステップI:1-[4-[7-(6-ヒドロキシ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:2-メチル-4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ベンゾチアゾール-6-オール(110mg、184μmol、2HCl)およびDIEA(143mg、1.10mmol、193μL)のDCM(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(18.5mg、147μmol)を-50℃で滴加した。混合物を-40℃~-20℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、MeOH(0.5mL)により混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を水(2mL)で希釈し、DCM(3×6ml)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をAl2O3カラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH 20/1→10/1)、分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:21%~51%、12分)により精製して、1-[4-[7-(6-ヒドロキシ-2-メチル-1,3-ベンゾチアゾール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(32.4mg、55.4μmol、30.2%収率、99.1%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 580.4[M+H]+。
実施例167
1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:2-ブロモ-4-メトキシアニリン:-10℃で、4-メトキシアニリン(100g、812mmol)のTHF(3L)中の溶液に、N-ブロモスクシンイミド(152g、853mmol)を3回に分けて添加し、混合物を同じ温度で30分間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=15/1)で精製して、2-ブロモ-4-メトキシアニリン(30.58g、18.6%収率)を赤色油として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.01(d,J=2.4Hz,1H),6.74-6.70(m,2H),3.85-3.74(m,2H),3.73(s,3H)。
ステップB:1-(2-アミノ-3-ブロモ-5-メトキシフェニル)-2-クロロプロパン-1-オン:2-ブロモ-4-メトキシアニリン(15.0g、74.2mmol)の0℃の1,1-ジクロルエタン(220mL)中溶液に、三塩化ホウ素(1.00M、89.1mL)、2-クロロプロパンニトリル(9.97g、111mmol)および四塩化チタン(16.9g、89.1mmol)を加えた。混合物を85℃で24時間加熱した。混合物を氷塩酸(20%、300mL)中に0℃で注ぎ込み、濃縮し、残留物を0.5時間還流した。この混合物を0℃で水酸化ナトリウム(飽和水容液、120mL)で、pHが4になるまで塩基化し、次いで、酢酸エチル(300mL×2)で抽出した。合わせた有機抽出物をブライン(200mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル/ジクロロメタン=50/1/1)で精製して、1-(2-アミノ-3-ブロモ-5-メトキシフェニル)-2-クロロプロパン-1-オン(18.7g、86.3%収率)を黄色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.37(d,J=2.8Hz,1H),7.32(d,J=2.8Hz,1H),6.60(brs,2H),5.25(q,J=6.4Hz,1H),3.80(s,3H),1.74(d,J=6.4Hz,3H)。
ステップC:7-ブロモ-5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール:1-(2-アミノ-3-ブロモ-5-メトキシ-フェニル)-2-クロロ-プロパン-1-オン(18.7g、64.1mmol)のジオキサン(500mL)およびH2O(50mL)中溶液に、NaBH4(2.67g、70.5mmol)を加え、この混合物を100℃で15時間撹拌した。混合物を冷却し、塩酸(水溶液、0.10M、100mL)で希釈し、ジクロロメタン(300mL×2)で抽出した。有機成分をブライン(200mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=25/1)で精製して、7-ブロモ-5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール(7.01g、45.6%収率)を黄色固体として得た。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=7.91(brs,1H),7.03-6.91(m,2H),6.23(d,J=1.2Hz,1H),3.84(s,3H),2.46(s,3H)。
ステップD:tert-ブチル 4-(7-(5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(275mg、594μmol)および7-ブロモ-5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール(130mg、540μmol)の2-メチル-2-ブタノール(15.0mL)中混合物に、tBuONa(104mg、1.08mmol)およびクロロ(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)[2-(2-アミノエチルフェニル)]パラジウム(II)メチル-t-ブチル エーテル付加物(44.1mg、54.0μmol)を加えた。この混合物をN2雰囲気下、90℃で8時間撹拌した。混合物を濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取TLC(ジクロロメタン/メタノール 10/1)で精製して、tert-ブチル 4-(7-(5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(131mg、36.8%収率)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 622.4[M+H]+。
ステップE:4-[3-[[7-(5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン:tert-ブチル 4-[7-(5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(131mg、211μmol)の0℃のジクロロメタン(10mL)中溶液に、トリフルオロ酢酸(2.00mL)を滴加し、反応物を15℃で3時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮し、残留物をさらなる精製を行わないで次のステップに使用した。(126mgの粗生成物)。ES+APCI MS m/z 522.4[M+H]+。
ステップF:1-(4-(7-(5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:4-[3-[[7-(5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン(74mg、116μmol、トリフルオロ酢酸塩)の-60℃のジクロロメタン(5mL)中溶液に、ジイソプロピルエチルアミン(45.1mg、349μmol、60.8μL)を加え、混合物を同じ温度で10分間撹拌した。混合物をクエン酸(水溶液、1.00mL)でクエンチし、ジクロロメタン(10mL×2)で抽出し、ブライン(15mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空下で濃縮した。残留物を分取TLCで精製して、1-(4-(7-(5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(31mg、39.2%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 576.4[M+H]+。
ステップG:1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[7-(5-メトキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(26mg、45.2μmol)の-78℃のジクロロメタン(5mL)中溶液に、三臭化ホウ素(56.6mg、226μmol、21.8μL)を加えた。反応物を0℃まで温め12時間撹拌した。混合物をNaHCO3(水溶液、3mL)で中和し、ジクロロメタン(5mL×2)で抽出して、ブライン(10mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLCにより精製し、1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(8.16mg、29.1%収率、90.3%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 562.5[M+H]+。
実施例168
1-(3-(ヒドロキシメチル)-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.50g、16.2mmol)のTHF(30mL)中溶液に、0℃でNaH(3.24g、80.9mmol、60.0%純度)を加えた。30分撹拌後、TBDPSCl(6.67g、24.3mmol、6.23mL)を1度に加えた。混合物を10℃に温め、N2雰囲気下で12時間撹拌した。0℃で水を加えることにより反応混合物をクエンチし、次いで、DCM(200mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→1/2)で精製して、tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(6.34g、12.1mmol、74.8%収率、86.8%純度)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z455.3[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(7.25g、13.9mmol)、7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(3.89g、13.2mmol)およびDIEA(4.27g、33.0mmol、5.77mL)のDMSO(60mL)中混合物を、N2雰囲気下、55℃で24時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(300mL)で希釈し、ブライン(3×150mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→3/1)で精製して、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(4.50g、5.91mmol、44.7%収率、93.5%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 721.3[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.00g、2.81mmol)、3-モルホリノプロパン-1-オール(815mg、5.62mmol)、Pd(OAc)2(94.6mg、422μmol)、BINAP(350mg、562μmol)およびt-BuONa(674mg、7.03mmol)のトルエン(30mL)中混合物を、脱気と、N2でのパージとを3回繰り返し、次いで混合物を110℃に加熱し、N2雰囲気下で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=70/1→20/1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.50g、1.69mmol、60.0%収率、92.3%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 821.4[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.50g、1.83mmol)のMeOH(20mL)中溶液に、Pd-C(10%、1.5g)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(50psi)下、50℃で24時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(988mg、1.21mmol、66.1%収率、89.5%純度)を無色油として得て、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 731.5[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(731mg、1.00mmol)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(783mg、2.50mmol)、[2-(2-アミノフェニル)フェニル]パラジウム(1+);ジシクロヘキシル-[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン;メタンスルホネート(169mg、200μmol)、Cs2CO3(815mg、2.50mmol)のトルエン(15mL)中混合物を、脱気と、N2でのパージを3回繰り返し、次いで混合物をN2雰囲気下、60℃で24時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固し、カラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=70/1→30/1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、188μmol、18.8%収率、72.3%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 963.4[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、188μmol)のMeOH(3mL)中溶液に、10%Pd/C(0.25g)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、50℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固して、tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、128μmol、68.1%収率、62.0%純度)を暗黄色固体として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ES+APCI MS m/z 873.4[M+H]+。
ステップG:4-[4-[2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、149μmol)、ピリジンフッ化水素(123mg、744μmol、112μL、60.0%純度)のTHF(1.5mL)中混合物を、N2雰囲気下、25℃で12時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固した。残留物を逆相HPLC(TFA条件;H2O中のMeCN;0~30%、流速;40mL/分)で精製した。目的の画分を減圧下濃縮して、4-[4-[2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(84mg、104μmol、69.6%収率、94.1%純度、2TFA)を黄色半固体として得た。ES+APCI MS m/z 535.3[M+H]+。
ステップH:1-[3-(ヒドロキシメチル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[4-[2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(84.0mg、114μmol、2TFA)、DIEA(36.9mg、285μmol、49.8μL)のDCM(3mL)中混合物に、-40℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(8.63mg、68.44μmol)を滴加し、次いでN2雰囲気下、-40℃で0.5時間撹拌した。反応混合物をMeOH(0.5mL)の添加によりクエンチし、減圧下で濃縮乾固した。残留物を分取HPLC(カラム:Venusil XBP C8 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:10%~40%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥乾固して、1-[3-(ヒドロキシメチル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(9.75mg、14.5μmol、12.7%収率、94.4%純度、ギ酸塩)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 589.3[M+H]+。
実施例169
1-[3-(ヒドロキシメチル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(495mg、694μmol)、[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(160mg、1.39mmol、165μL)およびナトリウムtert-ブトキシド(200mg、2.08mmol)のトルエン(25mL)中混合物に、BINAP(86.5mg、139μmol)およびPd
2(dba)
3(63.6mg、69.5μmol)を加えた。混合物を窒素雰囲気でバブリングし、80℃で6時間撹拌した。反応混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(2×15mL)で抽出した。合わせた有機層を水(2×30mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/酢酸エチル=30/1→1:1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(207mg、262μmol、37.7%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.62-7.53(m,4H),7.43-7.28(m,11H),4.42-4.29(m,1H),4.26-3.87(m,4H),3.81(br d,J=13.2Hz,2H),3.75-3.60(m,4H),3.44(dd,J=1.6,17.2Hz,1H),3.24-3.04(m,3H),2.96(br s,1H),2.75(br s,3H),2.49(s,3H),2.43-2.28(m,2H),2.10-1.96(m,2H),1.91-1.80(m,1H),1.80-1.67(m,2H),1.43(s,9H),1.02-0.89(m,9H)。
ステップB:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:-40℃でNH
3をメタノール(30mL)中に30分間バブリングした。tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(530mg、670μmol)の上記混合物中溶液に、無水10%Pd/C(0.30g)をN
2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH
2によるパージを数回実施した。混合物をH
2(15psi)下、40℃で10時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固して、tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(394mg、427μmol、63.8%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.57(br t,J=6.0Hz,4H),7.43-7.33(m,6H),4.43(br dd,J=5.2,10.4Hz,1H),4.32-4.00(m,4H),3.99-3.89(m,2H),3.88-3.65(m,4H),3.27-2.89(m,6H),2.81(br d,J=8.4Hz,2H),2.56-2.50(m,3H),2.42(br d,J=16.8Hz,2H),2.13-2.03(m,1H),1.88(br d,J=6.8Hz,1H),1.79(br d,J=5.2Hz,2H),1.43(s,9H),0.95(br s,9H)。
ステップC:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.16g、228μmol)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(143mg、457μmol)、[2-(2-アミノエチル)フェニル]-クロロ-パラジウム;ジシクロヘキシル-[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン(16.9mg、22.8μmol)およびt-BuONa(43.9mg、457μmol)のトルエン(4mL)中混合物を、N
2下、70℃で12時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、エーテルアセテート(3×10mL)で抽出した。合わせた有機成分を飽和塩化ナトリウム(10mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(ギ酸、0.1%)/アセトニトリル]で精製して、tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.15g、157μmol、68.9%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 933.1[M+H]
+。
ステップD:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:-78℃でNH
3をメタノール(10mL)中に30分間バブリングした。tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.10g、107μmol)および無水10%Pd/C(0.01g)を加え、混合物をH
2(15psi)下、10℃で1時間撹拌した。スラリーをセライトパッドを通して濾過し、濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.09g、粗製)を黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。ES+APCI MS m/z 843.0[M+H]
+。
ステップE:4-[4-[2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール:tert-ブチル 3-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.04g、粗製)およびピリジンフッ化水素(118mg、712μmol、106μL)のジクロロメタン(2mL)中混合物を0℃で1時間撹拌し、10℃で12時間撹拌した。飽和炭酸水素ナトリウム溶液(3.00mL)の添加により混合物のpHを7超に調節し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al
2O
3、ジクロロメタン/メタノール=5/1)で精製して、4-[4-[2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(0.04g、粗製)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 505.2[M+H]
+。
ステップF:1-[3-(ヒドロキシメチル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[4-[2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(0.02g、粗製)およびTEA(40.1mg、396μmol、55.17μL)のジクロロメタン(2mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(999μg、7.93μmol)を-40℃で加え、次いで混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。メタノール(0.10mL)を添加することにより混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、ジクロロメタン/メタノール=5/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:38%~68%、3分)により精製した。所望の画分を集め、凍結乾燥して、1-[3-(ヒドロキシメチル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(1.08mg、1.73μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 559.5[M+H]+。
実施例170
2-(1-アクリロイル-4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:1-(tert-ブチル)2-メチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(5.00g、17.0mmol)および1-tert-ブチル 2-メチルピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(4.24g、17.3mmol)のDMSO(80mL)中溶液に、DIEA(5.49g、42.5mmol、7.42mL)を加えた。55℃で12時間撹拌後、混合物を酢酸エチル(100mL)で希釈し、ブライン(3×150mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE/EA=3/1)で精製して、1-tert-ブチル 2-メチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(8.00g、15.9mmol、93.8%収率)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 502.1[M+H]+。
ステップB:1-(tert-ブチル)2-メチル 4-(7-ベンジル-2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル 2-メチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(8.00g、15.9mmol)、2-(ジメチルアミノ)エタノール(2.84g、31.9mmol、3.19mL)、Cs2CO3(13.0g、39.8mmol)、Pd(OAc)2(537mg、2.39mmol)およびBINAP(1.98g、3.19mmol)のトルエン(30mL)中混合物を、窒素下、110℃で3時間撹拌した。混合物を水(30mL)で希釈し、次いで酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮した。残留物を逆相HPLC(TFA、0.1%)で精製して、1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(6.00g、10.8mmol、67.9%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 555.3[M+H]+。
ステップC:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(6.00g、10.8mmol)および10%Pd/C(600mg、10.8mmol)のMeOH(100mL)中混合物を、50psiのH2下、40℃で12時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、1-tert-ブチル 2-メチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(4.50g、粗製)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 465.3[M+H]+。
ステップD:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(2.90g、6.24mmol)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(2.54g、8.12mmol)、Pd2(dba)3(857mg、936μmol)、RuPhos(728mg、1,56mmol)およびCs2CO3(5.08g、15.6mmol)の1,4-ジオキサン(150mL)中混合物を、N2下、85℃で5時間撹拌した。混合物を水(100mL)で希釈し、DCM(1×200mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×300mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮した。残留物を逆相HPLC(TFA、0.1%)で精製して、1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(3.50g、5.02mmol、2ステップで72.5%収率)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 697.3[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:1-tert-ブチル 2-メチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1,2-ジカルボキシレート(1.00g、1.44mmol)のTHF(10mL)中の溶液に、LiAlH4(219mg、5.76mmol)を-60℃で少しずつ加えた。2時間撹拌後、混合物を飽和硫酸ナトリウム溶液(0.3mL)でクエンチし、濾過し、濾過ケーキをDCM(100mL)で洗浄した。合わせた濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(750mg、1.12mmol、77.8%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 669.3[M+H]+。
ステップF:2-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、149μmol)、TBAI(11.1mg、29.9μmol)、1-(p-トリルスルホニル)イミダゾール(79.9mg、359μmol)、NaCN(0.12g、2.45mmol)、およびTEA(37.8mg、374μmol、51.8μL)のDMF中混合物を、155℃で6時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、水(1×5mL)で希釈し、次いで酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~70%、28分)により精製して、2-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(160mg、277μmol、37.1%収率)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 578.5[M+H]+。
ステップG:2-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60mg、104μmol)およびDIEA(67.1mg、519μmol、90.7μL)のDCM(2mL)中溶液に、0℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(13.1mg、104μmol)を加えた。10℃で4時間の撹拌後、混合物をMeOH(0.1mL)でクエンチし、次いで真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH 10/1)で精製して、2-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(40.0mg、63.3μmol、61.0%収率)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 632.3[M+H]+。
ステップH:2-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(30mg、47.5μmol)のDCM(2mL)中の溶液に、-78℃でBBr3(35.7mg、142μmol、13.7μL)を0.5時間かけて加えた。混合物を0℃まで温め、2時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、次いで-78℃~0℃で飽和炭酸水素ナトリウム溶液でクエンチした。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、DCM/MeOH=5/1)により精製し、次いで分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:30%~60%、12分)でさらに精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(810μg、1.46μmol、3.07%収率、97.5%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 542.5[M+H]+。
実施例171
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:エチル 2-(3-オキソピペラジン-2-イル)アセテート:ジエチル(E)-ブタ-2-エンジオエート(30.2g、175mmol、28.8mL)のi-PrOH(300mL)中溶液に、エタン-1,2-ジアミン(11.0g、183mmol、12.2mL)を加えた。25℃で12時間撹拌後、反応混合物を減圧下で濃縮乾固した。粗製白色固体をMTBE(500mL)で洗浄し、真空下で乾燥して、エチル 2-(3-オキソピペラジン-2-イル)アセテート(26.0g、140mmol、79.6%収率、100%純度)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.55(br s,1H),4.15(q,J=6.8Hz,2H),3.80-3.72(m,1H),3.47(dt,J=4.8,11.2Hz,1H),3.36-3.22(m,1H),3.18-3.08(m,1H),3.07-2.95(m,2H),2.76-2.70(m,1H),1.25(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップB:エチル 2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]-3-オキソ-ピペラジン-2-イル]アセテート:エチル 2-(3-オキソピペラジン-2-イル)アセテート(23.6g、127mmol)のメタノール(400mL)中の混合物に、4-メトキシベンズアルデヒド(18.9g、139mmol、16.9mL)およびとCH3COOH(15.2g、253mmol、14.5mL)を0℃で加えた。0℃で1時間撹拌後、反応混合物を-10℃に冷却した。NaBH3CN(23.9g、380mmol)を混合物に少しずつ加え、反応混合物を15℃まで温め、さらに11時間撹拌した。水(400mL)を加えることにより反応物をクエンチし、DCM(2×300mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。残留物を酢酸エチル(300mL)で再溶解し、次いで0.5MのHCl溶液(2×200mL)で洗浄した。水層をNa2CO3の固体でpH7~8に調節し、次いでDCM(2×300mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、エチル 2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]-3-オキソ-ピペラジン-2-イル]アセテート(27.2g、87.6mmol、69.0%収率、98.5%純度)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z 307.1[M+H]+。
ステップC:2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エタノール:エチル 2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]-3-オキソ-ピペラジン-2-イル]アセテート(27.2g、88.8mmol)のTHF(500mL)中溶液に、LiAlH4(10.1g、266mmol)を0℃で少しずつ分けて加えた。0℃で1時間撹拌後、反応混合物を70℃に加熱し、11時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を飽和Na2SO4水溶液(40mL)でクエンチし、濾過し、濃縮した。生成物である2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エタノール(20g、粗製)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 251.1[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル[2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エトキシ]ジフェニルシラン:2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エタノール(20g、粗製)のTHF(300mL)中混合物に、NaH(15.9g、399mmol、60.0%純度)を0℃で少しずつ加えた、次いでTBDPSCl(65.9g、239mmol、61.6mL)のTHF(100mL)中溶液を加えた。混合物を15℃まで温め、さらに12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をNH4Cl水溶液(300mL)中に注ぎ込み、DCM(2×300mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル 3/1→ジクロロメタン/メタノール 10/1)で精製して、tert-ブチル[2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エトキシ]ジフェニルシラン(29.5g、59.9mmol、2ステップで35%収率、99.2%純度)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 489.4[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル[2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エトキシ]ジフェニルシラン(11.0g、22.5mmol)のMeOH(200mL)中混合物に、TEA(6.83g、67.5mmol、9.36mL)および(Boc)2O(9.82g、45.0mmol、10.3mL)を加えた。15℃で3時間撹拌後、反応物を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル 1/0→5/1)で精製して、tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(11.0g、18.7mmol、82.9%収率、100%純度)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z 589.4[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(9.00g、15.3mmol)のMeOH(150mL)中混合物に、10%Pd/C(849μmol)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを3回実施した。混合物をH2(50psi)下、40℃で18時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトプラグを通して濾過し、濾液を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル 10/1→3:1)で精製して、tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(5.80g、12.2mmol、79.5%収率、98.2%純度)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z 469.4[M+H]+。
ステップG:2-[4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エトキシ-tert-ブチルジフェニルシラン:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(4.00g、13.6mmol)、tert-ブチル[2-[1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エトキシ]ジフェニルシラン(6.98g、14.3mmol)およびDIEA(4.39g、34.0mmol、5.93mL)のDMSO(80mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、混合物を55℃に加熱し、N2雰囲気下で12時間撹拌した。反応混合物を水(300mL)で希釈し、酢酸エチル(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、濾過し、減圧下濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル 1/0→3/1)で精製して、2-[4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エトキシ-tert-ブチルジフェニルシラン(9.00g、11.7mmol、86.0%収率、97.0%純度)を黄色油として得た。ES+APCI MS m/z 746.4[M+H]+。
ステップH:2-[[7-ベンジル-4-[3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン:2-(ジメチルアミノ)エタノール(2.39g、26.8mmol、2.69mL)、2-[4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-2-イル]エトキシ-tert-ブチルジフェニルシラン(8.00g、10.7mmol)、Pd(OAc)2(361mg、1.61mmol)、BINAP(1.34g、2.14mmol)およびCs2CO3(8.73g、26.8mmol)のトルエン(100mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返した。混合物を110℃に加熱し、N2雰囲気下で3時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH 50/1→10/1)で精製して、2-[[7-ベンジル-4-[3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(6.50g、粗製)を黄色半固体として得た。ES+APCI MS m/z 799.4[M+H]+。
ステップI:2-[4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]エタノール:2-[4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]エタノール:2-[[7-ベンジル-4-[3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[(4-メトキシフェニル)メチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(6.50g、粗製)のTFA(80mL)中溶液を80℃で12時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固し、残留物をDCM(300mL)に再溶解し、水(200mL)で洗浄した。水相を集め、NaHCO3飽和水溶液で約pH8に塩基化した後、DCM(3×200mL)で抽出した。合わせた有機相をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、2-[4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]エタノール(3.00g、粗製)を黄色半固体として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。
ステップJ:2-[[7-ベンジル-4-[3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン:2-[4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]エタノール(3.0g、粗製)のTHF(40mL)中溶液に、0℃でNaH(1.36g、34.1mmol、60.0%純度)を加えた。30分撹拌後、TBDPSCl(2.81g、10.2mmol、2.63mL)を少しずつ加えた。混合物を25℃に温め、N2雰囲気下でさらに2時間撹拌した。0℃で水(30mL)を加えることにより反応混合物をクエンチし、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮乾固して、2-[[7-ベンジル-4-[3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(6.00g、粗製)を黄色油として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ES+APCI MS m/z 679.4[M+H]+。
ステップK:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:2-[[7-ベンジル-4-[3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(6.0g、粗製)、Boc2O(18.5g、84.8mmol、19.5mL)のMeOH(3mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返した。混合物を80℃に加熱し、N2雰囲気下で3時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH 1/0→10/1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.10g、3.28mmol、4ステップで30.7%収率、82.2%純度)を半固体として得た。ES+APCI MS m/z 779.4[M+H]+。
ステップL:tert-ブチル 2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.10g、3.28mmol、82.2%純度)のMeOH(60mL)中溶液に、Pd-C(10%、2g)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを3回実施した。混合物をH2(50psi)下、50℃で36時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固して、tert-ブチル 2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.20g、2.75mmol、83.8%収率、86.0%純度)を黄色固体として得て、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 689.4[M+H]+。
ステップM:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.85g、2.69mmol)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(1.09g、3.49mmol)、Cs2CO3(2.19g、6.71mmol)、[2-(2-アミノフェニル)フェニル]パラジウム(1+);ジシクロヘキシル-[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン;メタンスルホネート(341mg、403μmol)のトルエン(40mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、混合物をN2雰囲気下、65℃で10時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH 1/0→10/1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.85g、1.69mmol、63.2%収率、84.3%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 922.5[M+H]+。
ステップN:1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、543μmol)、2,6-ルチジン(700mg、6.51mmol、759μL)のDCM(10mL)中溶液に、TMSOTf(724mg、3.26mmol、588μL)を加えた。N2雰囲気下、40℃で2時間撹拌後、反応混合物を-40℃に冷却し、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(137mg、1.09mmol)を何度かに分けて加えた。反応混合物を25℃に温め、N2雰囲気下でさらに12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH 30/1→10/1)で直接精製して、1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(256mg、226μmol、41.6%収率、77.2%純度)を半固体として得た。ES+APCI MS m/z 875.5[M+H]+。
ステップO:1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(133mg、152μmol)のDCM(5.00mL)中溶液に、BBr3(571mg、2.28mmol、220μL)を-40℃で滴加した。反応混合物を0℃に温め、3時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮乾固した。粗製物をMTBE(25mL)で洗浄し、固体を集めた。固体を飽和NaHCO3溶液(0.5mL)を使用して、0℃でpH約8まで洗浄し、次いでMeOH(3mL)に溶解した。混合物を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:15%-39%、10分)により直接精製して、1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(16.7mg、28.2μmol、18.5%収率、99.9%純度、ギ酸塩)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 547.3[M+H]+。
実施例172
1-(4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(3.04g、10.3mmol)、tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(5.08g、10.8mmol)、DIEA(3.34g、25.8mmol、4.51mL)のDMSO(60mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回行った。混合物を55℃に加熱し、N2雰囲気下で16時間撹拌した。室温に冷却後、反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル 1/0→3/1)で精製して、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.50g、4.53mmol、43.9%収率、94.0%純度)を黄色半固体として得た。ES+APCI MS m/z 726.4[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:2-(ジメチルアミノ)エタノール(1.07g、12.1mmol、1.21mL)、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.50g、4.82mmol)、Pd(OAc)2(162mg、723μmol)、BINAP(600mg、964μmol)およびCs2CO3(3.92g、12.1mmol)のトルエン(40mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返した。混合物を110℃に加熱し、N2雰囲気下で3時間撹拌した。室温に冷却後、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=1/0→10/1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.30g、2.57mmol、53.3%収率、87.0%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 779.5[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.30g、2.95mmol)のMeOH(40mL)中溶液に、Pd-C(10%、1.5g)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。H2(50psi)下、50℃で36時間撹拌後、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.58g、1.83mmol、61.9%収率、79.6%純度)を無色油として得て、これをさらに精製することなく直接次のステップに使用した。ES+APCI MS m/z 689.4[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.48g、2.15mmol)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモナフタレン(875mg、2.80mmol)、Cs2CO3(1.75g、5.38mmol)、[2-(2-アミノフェニル)フェニル]パラジウム(1+);ジシクロヘキシル-[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン;メタンスルホネート(273mg、323μmol)のトルエン(30mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで混合物をN2雰囲気下、65℃で24時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、DCM/MeOH=1/0→20/1)で精製して、tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.20g、1.07mmol、49.7%収率、82.0%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 921.4[M+H]+。
ステップE:2-[[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-4-[2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン:tert-ブチル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、326μmol)および2,6-ルチジン(419mg、3.91mmol、455μL)のDCM(10mL)中混合物に、TMSOTf(434mg、1.95mmol、353μL)を何度かに分けて0℃で加えた。混合物を10℃に温め、N2雰囲気下で12時間撹拌した。反応混合物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、DCM/MeOH 1/0→50/1)で直接精製して、2-[[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-4-[2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(210mg、229μmol、70.3%収率、89.5%純度)を黄色半固体として得た。ES+APCI MS m/z 821.5[M+H]+。
ステップF:1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:2-[[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-4-[2-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(210mg、256μmol)およびDIEA(49.6mg、384μmol、67.0μL)のDCM(10mL)中混合物に、-40℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(33.9mg、269μmol)を窒素雰囲気下、何度かに分けて加えた。同じ温度で30分間の撹拌後、反応混合物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、DCM/MeOH 1/0→50/1)で直接精製して、1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(221mg、214μmol、83.6%収率、84.7%純度)を黄色がかった半固体として得た。ES+APCI MS m/z 875.4[M+H]+。
ステップG:1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-[2-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシエチル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(221mg、253μmol)のDCM(10mL)中混合物に、BBr3(949mg、3.79mmol、365μL)を-40℃で加えた。混合物をN2雰囲気下、0℃で3時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮乾固した。粗生成物をMTBE(25mL)、飽和NaHCO3溶液(0.5mL)を用いて0℃でpH約8まで洗浄し、MeOH(3mL)に溶解した。得られた溶液を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:11%-41%、10分)により精製して、1-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(26.7mg、44.0μmol、17.4%収率、97.8%純度、ギ酸塩)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 547.3[M+H]+。
実施例173
1-(4-(7-(3-ヒドロキシ-2-メチルナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
1-[4-[7-(2-フルオロ-3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製する実施例165に従って、ステップFで、(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネートの代わりに(3-メトキシ-2-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネートを使用して、1-(4-(7-(3-ヒドロキシ-2-メチルナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを調製し、目的の生成物である(1-(4-(7-(3-ヒドロキシ-2-メチルナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン)を黄色固体(10.4mg、13.1%収率、98.1%純度)として得た。ES+APCI MS m/z 573.5[M+H]+。
実施例174
(R)-1-(4-(2-((5,5-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル(5R)-5-(ヒドロキシメチル)-2,2-ジメチル-ピロリジン-1-カルボキシレート:(2R)-1-tert-ブトキシカルボニル-5,5-ジメチル-ピロリジン-2-カルボン酸(500mg、2.06mmol)の無水THF(4mL)中溶液に、BH3-Me2S(2M、1.23mL)を15℃で滴加した。反応物を50℃で5分間加熱した。氷浴中で冷却後、混合物にメタノール(20mL)を加えた。25℃で反応混合物を減圧下濃縮した。tert-ブチル(5R)-5-(ヒドロキシメチル)-2,2-ジメチル-ピロリジン-1-カルボキシレート(400mg、1.74mmol、84.9%収率)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=3.97-3.81(m,1H),3.62(dd,J=3.6,10.8Hz,1H),3.45-3.33(m,1H),2.02-1.79(m,3H),1.79-1.67(m,1H),1.49-1.41(m,12H),1.32(s,3H)。
ステップB:ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニル-5,5-ジメチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(5R)-5-(ヒドロキシメチル)-2,2-ジメチル-ピロリジン-1-カルボキシレート(212mg、926μmol)およびベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、463μmol)のTHF(10mL)中溶液に、tBuONa(133mg、1.39mmol)を加えた。15℃で1時間撹拌後、反応混合物をH2O(20mL)中に注ぎ込み、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。有機相をブライン(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させて、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニル-5,5-ジメチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(110mg、129μmol、28.1%収率、96%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 813.5[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル(5R)-5-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]-2,2-ジメチルピロリジン-1-カルボキシレート:-40℃でNH3をMeOH(30mL)中に30分間バブリングした。ベンジル 4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニル-5,5-ジメチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、246μmol)の上記混合物(NH3/MeOH)中溶液に、無水Pd-C(10%、100mg)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。触媒を濾別し、濾液を濃縮して、生成物であるtert-ブチル(5R)-5-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]-2,2-ジメチルピロリジン-1-カルボキシレート(150mg、244μmol、99.4%収率、96%純度)を黄色固体として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 589.3[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル(5R)-5-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]-2,2-ジメチルピロリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(5R)-5-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]-2,2-ジメチルピロリジン-1-カルボキシレート(130mg、221μmol)およびDIEA(285mg、2.21μmol、385μL)のジクロロメタン(3mL)中の混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(22.3mg、176μmol)のジクロロメタン(1mL)中溶液を窒素雰囲気下、-40℃で加えた。混合物を-40℃で1時間撹拌した。飽和NaHCO3水溶液(2mL)を添加することにより反応物をクエンチした。次いで、混合物を水(20mL)中に注ぎ込み、ジクロロメタン(20mL×2)で抽出した。合わせた有機成分を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、ジクロロメタン/メタノール=1/0→10/1)で精製した。tert-ブチル(5R)-5-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]-2,2-ジメチルピロリジン-1-カルボキシレート(140mg、217μmol、98.6%収率)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 643.6[M+H]+。
ステップE:1-[4-[2-[[(2R)-5,5-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:tert-ブチル(5R)-5-[[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]-2,2-ジメチルピロリジン-1-カルボキシレート(120mg、187μmol)のジクロロメタン(200μL)中溶液に、TFA(212mg、1.87mmol、138μL)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮し、次いで、ジクロロメタン(5mL)で希釈し、飽和NaHCO3水溶液の添加によりpH=7に調節した。混合物をジクロロメタン(10mL×3)で抽出した。合わせた有機相を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)により精製した。凍結乾燥により、1-[4-[2-[[(2R)-5,5-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(30mg、53.6μmol、28.7%収率、97%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 543.5[M+H]+。
実施例175
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシ-2-メチルナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例165の手順に従って、ステップFで、tert-ブチル 4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用し、(3-メトキシ-2-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネートの代わりに、(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネートを使用して、(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシ-2-メチルナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オンを合成し、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-2-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(10.2mg、17.3μmol、21.4%収率、100%純度、ギ酸塩)を白色固体として得た。ES+APCI MS m/z 543.4[M+H]+。
実施例176
2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(3aR)-1-オキソ-3a,4,6,7-テトラヒドロ-3H-オキサチアゾロ[3,4-a]ピラジン-5-カルボキシレート:イミダゾール(15.7g、231mmol)のDCM(100mL)中溶液に、SOCl2(8.25g、69.4mmol、5.03mL)を0℃で加えた。反応混合物を15℃で1時間撹拌した。この混合物に、DCM(100mL)中の、tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(5g、23.1mmol)を-70℃で加えた。反応混合物を15℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和NH4Cl(100mL)でクエンチし、分離させ、水層をDCM(40mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル(3aR)-1-オキソ-3a,4,6,7-テトラヒドロ-3H-オキサチアゾロ[3,4-a]ピラジン-5-カルボキシレート(5.8g、22.1mmol、95.6%収率)を褐色固体として得た。
ステップB:tert-ブチル(3aR)-1,1-ジオキソ-3a,4,6,7-テトラヒドロ-3H-オキサチアゾロ[3,4-a]ピラジン-5-カルボキシレート:tert-ブチル(3aR)-1-オキソ-3a,4,6,7-テトラヒドロ-3H-オキサチアゾロ[3,4-a]ピラジン-5-カルボキシレート(7.5g、28.6mmol)のMeCN(225mL)中溶液に、水(75mL)中のNaIO4(7.95g、37.2mmol、2.06mL)、続けて、RuCl3・H2O(129mg、572μmol)を0℃で加えた。反応混合物を15℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和NH4Cl(10mL)でクエンチし、EtOAc(20mL)|で抽出した。有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=3:1→1:1)により精製して、tert-ブチル(3aR)-1,1-ジオキソ-3a,4,6,7-テトラヒドロ-3H-オキサチアゾロ[3,4-a]ピラジン-5-カルボキシレート(7g、25.2mmol、88.0%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.64(dd,J=6.4,8.0Hz,1H),4.36-3.94(m,3H),3.64(ddt,J=3.6,6.0,9.2Hz,1H),3.46(br d,J=11.6Hz,1H),3.13(br s,1H),2.96(dt,J=3.2,11.2Hz,2H),1.48(s,9H)。
ステップC:tert-ブチル(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(3aR)-1,1-ジオキソ-3a,4,6,7-テトラヒドロ-3H-オキサチアゾロ[3,4-a]ピラジン-5-カルボキシレート(5g、18.0mmol)のDMF(100mL)中溶液に、KCN(1.04g、16.0mmol、684.94μL)を加えた。反応混合物を50℃に16時間加熱した。加熱が完了したら、反応混合物をHCl(2M、50mL)によりクエンチし、15℃で1時間撹拌した。混合物をNaOH(40%、10mL)で塩基化し、EtOAc(3×100mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=3:1→0.1、続けて、EtOAc:MeOH=100:1→10:1)で精製し、tert-ブチル(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.1g、4.88mmol、27.2収率)を褐色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.05-3.71(m,2H),3.08-2.88(m,3H),2.84-2.62(m,2H),2.56-2.37(m,2H),1.47(s,9H)。
ステップD:2-[(2S)-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(850mg、3.77mmol)およびHCl/ジオキサン(4M、20mL)の反応混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、真空下で溶媒を除去し、2-[(2S)-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(740mg、3.74mmol、99.0%収率、2HCl)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=4.04-3.90(m,1H),3.81-3.70(m,2H),3.69-3.61(m,2H),3.53-3.36(m,2H),3.13(d,J=6.4Hz,2H)。
ステップE:2-[(2S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(1.3g、4.42mmol)および2-[(2S)-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.17g、5.91mmol、2HCl)のジオキサン(25mL)中混合物に、DIEA(2.86g、22.1mmol、3.85mL)を加えた。この反応混合物を50℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(50mL)で希釈し、EtOAc(3×80mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.69g、4.41mmol、100%収率)を褐色固体として得た。
ステップF:tert-ブチル(2S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:2-[(2S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.69g、4.41mmol)および(Boc)2O(10.3g、47.2mmol、10.8mL)の混合物を、50℃に2時間加熱した。加熱が完了したら、反応混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=10:1→1:1)で精製して、tert-ブチル(2S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.1g、2.12mmol、48.0%収率、93%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 483.4[M+H]+。
ステップG:tert-ブチル(2S)-4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:2-(ジメチルアミノ)エタノール(415mg、4.66mmol、468μL)のTHF(20mL)中の溶液に、NaH(149mg、3.73mmol、60%純度)を0℃で加えた。反応混合物を0℃で0.5時間撹拌した。この混合物に、tert-ブチル(2S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(900mg、1.86mmol)を加えた。反応混合物をN2下のシールドチューブ中、70℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10mL)でクエンチし、EtOAc(3×40mL)で抽出した。合わせた有機層を活性炭で処理し、濾過した。濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.12mmol、60.1%収率)を褐色固体として得た。
ステップH:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:MeOH(20mL)中にNH3を5分間バブリングした。この溶液に、tert-ブチル(2S)-4-[7-ベンジル-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.12mmol)および10%Pd/C(200mg)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で16時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3×30mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna(2) C18 250*50 10μm;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:%-%、30分;60%分)で精製して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(167mg、331μmol、29.6%収率、88.3%純度)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z 446.3[M+H]+。
ステップI:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、404μmol)、(4-ブロモ-2-ナフチル)2,2-ジメチルプロパノエート(248mg、808μmol)およびCs2CO3(395mg、1.21mmol)のトルエン(6mL)中溶液に、XPHOS Palladacycle Gen 3(34.20mg、40.4μmol)を加えた。反応混合物を、N2下、70℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA=5:1→0:1で精製して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、272μmol、67.3%収率、91.3%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 672.0[M+H]+。
ステップJ:[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、298μmol)のDCM(0.3mL)中溶液に、TFA(420mg、3.68mmol、273μL)を加えた。反応混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮して、[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(238mg、298μmol、99.9%収率、2TFA)を褐色油として得た。
ステップK:[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(238mg、298μmol、2TFA)およびDIEA(308mg、2.38mmol、415μL)のDCM(5mL)中溶液に、0℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(56.3mg、446μmol)を加えた。反応混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を一滴の水によりクエンチした。混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=1:1→0.1、次いで、EtOAc:MeOH=50:1→3:1)で精製して、[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(300mg、粗製)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 626.4[M+H]+。
ステップL:2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル:[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(300mg、479μmol)のTHF(3mL)中溶液に、水中のNaOH(2M、3mL)を加えた。反応混合物を15℃で8時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を0.5mLのギ酸(水中20%)によりpH=7に酸性化し、DCM(5×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。
残留物を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:25%-49%、10分)により精製して、2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル(18.3mg、30.2μmol、2ステップで10.1%収率、96.7%純度、ギ酸塩)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 542.5[M+H]+。
実施例177
2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、549μmol)および[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(126mg、1.10mmol)のトルエン(6mL)中溶液に、t-BuONa(79.1mg、823μmol)を18℃で加え、反応混合物を18℃で0.5時間撹拌した。次いで、混合物にEtOAc(20mL)および水(15mL)を加え、次いでEtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%ギ酸)=42%)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、331μmol、60.4%収率、99.0%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 598.3[M+H]+。
ステップB:2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、334μmol)およびTFA(763mg、6.69mmol、495μL)の混合物を18℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(250mg、粗製、2TFA)を褐色油として得た。
ステップC:2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(250mg、344μmol、2TFA)およびDIEA(356mg、2.76mmol、480μL)のDCM(5mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(65.2mg、517μmol)を0℃で加え、混合物を18℃で1.5時間撹拌した。反応混合物を水(3mL)でクエンチし、次いで、DCM(3×6mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:30%~60%、3分)により精製して、2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(9.98mg、17.0μmol、4.94%収率、94.1%純度)を白色固体として得た。ES+APCI MS m/z 552.5[M+H]+。
実施例178
2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール:MeOH(1000mL)およびNa(22.0g、957mmol、22.7mL)の懸濁液を30分間撹拌した。この混合物に、エチル 1-ベンジル-3-オキソピペリジン-4-カルボキシレート(50g、191mmol)および2-メチルイソチオ尿素(47.9g、344mmol、0.5H2SO4)を15℃で加えた。この反応混合物を15℃で30時間撹拌した。反応混合物をHCl(2M)(300mL)でpH=6になるまで酸性化し、減圧下で濃縮した。残留物を200mLの水中に懸濁させ、高速で撹拌した。懸濁液を濾過し、白色固体を収集し、酢酸エチルで洗浄した。7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(68g、151mmol、79.1%収率、64.0%純度)を白色固体として得た。
ステップB:7-ベンジル-4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(50g、174mmol)のCHCl3(1000mL)中溶液に、POCl3(166g、1.08mol、100mL)を加え、混合物を80℃で13時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をEtOAc(500mL)で希釈し、飽和Na2CO3(800mL)によりpH=7に塩基化した。混合物を酢酸エチル(3×400mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA 100:1→80:1)で精製して、7-ベンジル-4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(21.7g、67.4mmol、38.7%収率、95.0%純度)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 306.1[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:7-ベンジル-4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(2.6g、8.50mmol)および2-ピペラジン-2-イルアセトニトリル(1.68g、8.50mmol、2HCl)のDMSO(52mL)中溶液に、DIEA(5.49g、42.5mmol、7.40mL)を加えた。混合物を80℃に温め、80℃で6時間撹拌した。この混合物に、(Boc)2O(18.5g、85.0mmol、19.5mL)を加え、混合物を80℃で1時間撹拌した。水(150mL)を加え、混合物を酢酸エチル(3×200mL)で抽出した。合わせた有機相をブライン(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA 10:1→0:1)で精製して、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.74g、5.26mmol、61.9%収率、95.0%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 495.4[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.51g、5.07mmol)およびDIEA(1.97g、15.2mmol、2.65mL)のDCE(50mL)中溶液に、1-クロロエチルカルボノクロリデート(1.81g、12.7mmol)を0℃で加え、混合物を15℃で3時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をMeOH(50mL)に溶解し、反応混合物を70℃で1.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:23%-48%、30;50%分)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.13g、2.51mmol、49.5%収率、90.0%純度)を桃色固体として得た。ES+APCI MS m/z 405.3[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(730mg、1.80mmol)、(4-ブロモ-2-ナフチル) 2,2-ジメチルプロパノエート(832mg、2.71mmol)およびCs2CO3(1.76g、5.41mmol)のトルエン(18mL)中溶液に、[2-(2-アミノフェニル)フェニル]パラジウム(1+);ジシクロヘキシル-[2-(2,4,6-トリイソプロピルフェニル)フェニル]ホスファン-メタンスルホネート(153mg、180μmol)を加え、懸濁液の真空下での脱ガス、およびN2によるパージを数回行った。この反応混合物を70℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物に水(20mL)を加えた。得られた混合物をEtOAc(4×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 30:1→0:1)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(740mg、1.15mmol、63.7%収率、98.0%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 631.5[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、158μmol)のDCM(2mL)中溶液に、0℃で、m-CPBA(32.2mg、158μmol、85.0%純度)を加え、混合物を0℃で1時間撹拌した。0℃で飽和Na2S2O3(4mL)により反応混合物をクエンチし、単離し、次いで、水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(10mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA 10:1→0:1)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(90mg、125μmol、79.0%収率、90.0%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 647.5[M+H]+。
ステップG:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(560mg、866μmol)および[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(199mg、1.73mmol)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(125mg、1.30mmol)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。混合物を、EtOAc(20mL)と水(15mL)との間で分配し、分離させた。次いで、水層をEtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラムで精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(340mg、481μmol、55.5%収率、98.7%純度)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 698.4[M+H]+。
ステップH:[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、201μmol)のDCM(0.2mL)中溶液に、TFA(229mg、2.01mmol、148μL)を15℃で加え、混合物を15℃で5時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮して、[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(170mg、粗製、2TFA)を褐色油として得た。
ステップI:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(170mg、206μmol、2TFA)およびDIEA(213mg、1.65mmol、287μL)のDCM(0.3mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(38.9mg、309μmol)を0℃で加え、この混合物を15℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(0.5mL)によりクエンチし、次いで、真空下で濃縮した。残留物(DCM:MeOH=10:1)をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=2:1→EtOAc:MeOH=0:1)で精製して、[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(170mg、182μmol、88.7%収率、70.0%純度)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 652.6[M+H]+。
ステップJ:2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(170mg、261μmol)のTHF(1.5mL)中溶液に、NaOH(2M、1.5mL)を加え、反応物を15℃で6時間撹拌した。反応混合物をHCOOH(20%、0.1mL)でpH=7に中和した。得られた混合物をDCM(3×5mL)で抽出し、合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%ギ酸)-ACN];B%:12%-39%、10分)で精製して、2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(6.88mg、11.6μmol、4.44%収率、95.6%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 568.5[M+H]+。
実施例179
2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール:tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(1g、4.97mmol)のTHF(40mL)中の溶液に、LiAlH4(377mg、9.94mmol)を0℃で加え、次いで混合物を70℃に温め、70℃で4時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2SO4(3mL)によりクエンチし、濾過し、濾過ケーキをTHF(5×20mL)で洗浄した。合わせた有機相を真空下で濃縮して、[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(820mg、粗製)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.66-3.62(dd,J=4.8,10.0Hz,1H),3.53-3.49(dd,J=5.6,10.0Hz,1H),3.35-3.18(m,1H),2.77-2.68(m,1H),2.59-2.53(m,1H),2.52-2.45(m,1H),2.40-2.33(m,1H),2.32(s,3H),2.31-2.26(m,1H),2.04-1.93(m,1H),1.69-1.59(m,1H)。
ステップB:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、773μmol)および[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(178mg、1.55mmol)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(111mg、1.16mmol)を加え、この混合物を15℃で0.5時間撹拌した。この混合物に、酢酸エチル(20mL)および水(15mL)を加え、次いで酢酸エチル(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%ギ酸)=42%)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、245μmol、31.7%収率、95.0%純度)を褐色固体として得た。ES+APCI MS m/z 698.6[M+H]+。
ステップC:[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、258μmol)およびTFA(588mg、5.16mmol、382μL)の混合物を20℃で1.5時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮して、[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(200mg、粗製、2TFA)を褐色油として得た。
ステップD:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(200mg、242μmol、2TFA)およびDIEA(470mg、3.63mmol、633μL)のDCM(0.6mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(30.5mg、242μmol)を0℃で加え、この反応物を15℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA=2:1~0:1→DCM:MeOH=50:1~1:1)で精製して、[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(630mg、粗製)を褐色油として得た。ES+APCI MS m/z 652.6[M+H]+.
ステップE:2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(630mg、966μmol)のTHF(3mL)中溶液に、NaOH(2M、3mL)を18℃で加え、混合物を18℃で2時間撹拌した。反応混合物をHCOOH(20%、0.5mL)でpH=7に中和した。得られた混合物をDCM(3×5mL)で抽出し、合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:35%~65%、3分)により精製して、2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(9.4mg、15.8μmol、1.64%収率、95.5%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 568.5[M+H]+。
実施例180
4-(3-(4-(ピペラジン-1-イル)-7-(5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イルオキシ)プロピル)モルホリン
ステップA:2-[[4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-1-イル]メトキシ]エチルトリメチルシラン:4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール(650mg、2.45mmol、1当量)のDMF(30mL)中溶液に、NaH(117.71mg、2.94mmol、60%純度、1.2当量)を0℃で加えた。0℃で1時間撹拌後、2-(クロロメトキシ)エチルトリメチルシラン(531.56mg、3.19mmol、564.29μL、1.3当量)のDMF(10mL)中溶液を滴加した。混合物を15℃に温め、2時間撹拌した。混合物を塩化アンモニウム飽和水溶液(50.0mL)でクエンチし、水(100.0mL)で希釈し、次いで酢酸エチル(3×100.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル 10:1)で精製した。2-[[4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-1-イル]メトキシ]エチルトリメチルシラン(680mg、1.70mmol、69.44%収率、99.0%純度)を無色油として得た。ES+APCI MS m/z 395.0[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:2-[[4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-1-イル]メトキシ]エチルトリメチルシラン(444.35mg、1.12mmol、1.3当量)、tert-ブチル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、864.71μmol、1当量)、RuPhos(80.70mg、172.94μmol、0.2当量)、Pd2(dba)3(118.77mg、129.71μmol、0.15当量)、およびCs2CO3(845。21mg、2.59mmol、3当量)のトルエン(40mL)中混合物を、脱気とN2でのパージを3回繰り返し、混合物を窒素下、90℃で12時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮してトルエンを除去した。残留物を水100mLで希釈し、酢酸エチル300mL(100mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水300mL(100mL×3)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/CH3OH=30:1→20:1)で精製した。tert-ブチル 4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、446.87μmol、51.68%収率、86.8%純度)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 773.3[M+H]+。
ステップC:4-[3-[[4-ピペラジン-1-イル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン:tert-ブチル-4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、111.72μmol、1当量)のDCM(2mL)中溶液に、TFA(254.77mg、2.23mmol、165.43μL、20当量)を25℃で加えた。この反応混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物を、減圧下で濃縮した。4-[3-[[4-ピペラジン-1-イル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン(200mg、粗製、TFA)を褐色油として得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。ES+APCI MS m/z 547.5[M+H]+。
ステップD:1-[4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:4-[3-[[4-ピペラジン-1-イル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]プロピル]モルホリン(200mg、TFA)およびDIEA(600mg、4.64mmol、808.63μL)のDCM(2mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(13mg、103.08μmol)を-50℃で滴加した。混合物を-50℃で30分間撹拌した。混合物を水でクエンチし、酢酸エチル(50mL)で抽出し、有機層を水(1×20mL)およびブライン(1×20mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(FA条件)カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:15%-36%、10分]で精製した。1-[4-[2-(3-モルホリノプロポキシ)-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(18.26mg、28.12mmol、2ステップで23%収率、99.6%純度、FA)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 601.4[M+H]+。
実施例181
1-(4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オール(107mg、681μmol)のTHF(2mL)中溶液に、t-BuONa(98.1mg、1.02mmol)、続けて、ベンジル 4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-メチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、340μmol)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。混合物を水(10mL)中に注ぎ込み、DCM(2×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:25%~55%、12分)により精製して、ベンジル 4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(110mg、143μmol、42.0%収率)を黄色固体として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.08-8.01(m,1H),7.45-7.43(m,4H),7.37-7.31(m,3H),5.76(s,2H),5.24(s,2H),4.76-4.63(m,1H),4.60-4.45(m,3H),4.42(s,2H),4.36-4.24(m,1H),3.96-3.83(m,2H),3.79-3.65(m,8H),3.64-3.53(m,6H),3.12-2.92(m,1H),2.90-2.77(m,2H),2.48(s,3H),2.44-2.41(m,1H),2.36-2.12(m,3H),0.98-0.93(m,2H),0.01--0.03(m,9H)。
ステップB:tert-ブチル 4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(90mg、117μmol)およびBOC2O(51.1mg、234.1μmol、53.8μL)のMeOH(2mL)中の溶液に、Pd/C(10%、50mg)をN2雰囲気下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で12時間撹拌した。混合物を濾過し、濃縮した。残留物を分取TLC(SiO2、DCM/MeOH=10:1)で精製して、tert-ブチル 4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(30mg、40.8μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 735.6[M+H]+。
ステップC:(1S,4S)-5-(3-((7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)プロピル)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン:tert-ブチル 4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(30mg、40.8μmol)のDCM(0.5mL)中溶液に、TFA(770mg、6.75mmol)を滴加した。混合物を15℃で2時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、(1S,4S)-5-(3-((7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)プロピル)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン(30mg、粗製)を得た。ES+APCI MS m/z 505.5[M+H]+。
ステップD:1-(4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:(1S,4S)-5-(3-((7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-4-(ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)プロピル)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン(20mg、39.6μmol、1当量)およびDIEA(30.7mg、238μmol、41.4μL、6当量)のDCM(2mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(4.00mg、31.7μmol、0.8当量)を-50℃で加えた。混合物を-40℃~-20℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:35%~65%、12分)により精製した。生成物である1-(4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(5-メチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(6.48mg、11.2μmol、2ステップで28.3%収率、96.8%純度)を白色固体として得た。ES+APCI MS m/z 559.5[M+H]+。
実施例182
2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(190mg、403μmol)、(4-ブロモ-2-ナフチル)2,2-ジメチルプロパノエート(248mg、806μmol)およびCs2CO3(394mg、1.21mmol)のトルエン(5mL)中混合物に、XPHOS Palladacycle Gen 3(34.1mg、40.29μmol)を加え、反応混合物をN2下、70℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA=3:1→0:1で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(95mg、118μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 698.4[M+H]+。
ステップB:[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(40mg、57.3μmol)のDCM(0.1mL)中溶液に、TFA(154mg、1.35mmol)を15℃で加えた。反応混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、真空下で溶媒を除去し、[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(47mg、56.9μmol)を得た。
ステップC:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート:[4-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(47mg、56.9μmol)およびDIEA(58.9mg、455μmol)のDCM(1mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(10.8mg、85.4μmol)を0℃で加えた。反応混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を一滴の水の添加によりクエンチした。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=3:1→EtOAc:MeOH=3:1)で精製して、[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(130mg、粗製)を得た。ES+APCI MS m/z 652.5[M+H]+。
ステップD:2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:[4-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(250mg、384μmol)のTHF(1.5mL)中溶液に、水中のNaOH(2M、1.5mL)を加えた。この反応混合物を15℃で9時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を2滴のギ酸(水中20%)の添加によりpH=7に酸性化して、水層をDCM(5×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%-47%、10分)により精製して、2-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(13.1mg、21.2μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 568.5[M+H]+。
実施例183
2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、549μmol)および[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(126mg、1.10mmol、130μL)のトルエン(6.00mL)中溶液に、t-BuONa(105mg、1.10mmol)を加えた。混合物を20℃で0.25時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EA/MeOH 50/1→10/1)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、427μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 598.6[M+H]+。
ステップB:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(270mg、452μmol)のDCM(330μL)中溶液に、TFA(515mg、4.52mmol)を加えた。混合物を20℃で0.5時間撹拌し、真空下で濃縮した。次いで、TFA(334μL)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(400mg、粗製)を得た。ES+APCI MS m/z 498.4[M+H]+。
ステップC:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(276mg、451μmol)およびDIEA(1.46mg、11.3mmol)のDCM(4.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(51.2mg、406μmol)を0℃で滴加した。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(0.5mL)で希釈し、EtOAc(2×10ml)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製して、2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(37.1mg、66.3μmol)を得た。ES+APCI MS m/z 552.4[M+H]+。
実施例184
1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-ヒドロキシプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
実施例136に従って、ステップBで、2-(3-メトキシピロリジン-1-イル)エタノールの代わりに、3-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシプロパン-1-オールを使用して、1-[4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-(3-ヒドロキシプロポキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オンを調製した。ES+APCI MS m/z 490.3[M+H]+。
実施例185
1-(4-(2-(3-((1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:3-((1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オール:(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン・HCl塩(0.250g、2.522mmol)、CH3CN(5.04mL)および3-ブロモ-1-プロパノール(0.274mL、3.026mmol)をバイアルに加えた。次いで、K2CO3(1.05g、7.57mmol)を加え、混合物を50℃に温め、16時間撹拌した。次いで、混合物を周囲温度まで冷却し、CH2Cl2で希釈し、濾過し、固体をCH2Cl2で洗浄した。次いで、濾液を濃縮し、粗製油をカラムクロマトグラフィー(5%MeOH/DCM+0.2%NH4OH)により精製して、生成物を無色油として得た。
ステップB:1-(4-(2-(3-((1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで概要を述べた手順の代わりに、以下の手順を使用して合成した。バイアルに、3-((1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オール(0.171g、1.09mmol)およびベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.125g、0.218mmol)、続けて、ジオキサン(0.435mL)を加えた。次いで、Cs2CO3(0.213g、0.653mmol)を加え、混合物を15時間にわたり100℃に加熱した。反応物をCH2Cl2で希釈して、濾過し、残留固体をCH2Cl2で洗浄した。次いで、濾液をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗製残留物を、粗製油をカラムクロマトグラフィー(4%MeOH/DCM+0.2%NH4OH)により精製して、生成物を黄色発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 571.2[M+H]+。
実施例186
ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-(モルホリノメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート
ベンジル 4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-(モルホリノメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:実施例127に従って、ステップDで概要を述べた手順の代わりに、以下の手順を使用して合成した。ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.150g、0.261mmol)および3-(4-モルホリノメチル)フェニルボロン酸ピナコールエステル塩酸塩(0.266g、0.784mmol)のジオキサン(2.61mL)中溶液に、Na2CO3(0.523mL、1.0452mmol、2.0M水溶液)を加えた。混合物をアルゴンによる5分間のバブリングにより脱気した。次いで、テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)(0.030g、0.026mmol)を加え、混合物を95℃に加熱し、7時間撹拌した。反応を周囲温度に冷却し、次いでCH2Cl2で希釈し、濾過した。固体をCH2Cl2で洗浄した。次いで、濾液をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗製残留物を、カラムクロマトグラフィー(30-50%EtOAc/DCM)により精製して、生成物を黄色発泡体として得た。ES+APCI MS m/z 591.3[M+H]+。
実施例187
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりにN-メチル-D-プロリノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 529.3[M+H]+。
実施例188
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに、(3S)-(1-メチル-ピロリジン-3-イル)-メタノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 529.2[M+H]+。
実施例189
1-(4-(2-((1-ベンジルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
1-(4-(2-((1-ベンジルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに(1-ベンジルピロリジン-3-イル)メタノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 605.3[M+H]+。
実施例190
1-(4-(2-((1-シクロプロピルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
1-(4-(2-((1-シクロプロピルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに(1-シクロプロピル-3-ピロリジニル)メタノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 555.3[M+H]+。
実施例191
1-((2S,6R)-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,6-ジメチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-((3S,5R)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-3,5-ジメチルピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート500mg、1.48mmol)、tert-ブチル cis-2,6-ジメチルピペラジン-1-カルボキシレート(349mg、1.63mmol)およびDIEA(0.26mL)のN,N-ジメチルアセトアミド(1mL)中の懸濁液を、室温で一晩撹拌した。反応混合物を、EtOAc(15mL)と1MのNaHCO
3(5mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層を2MのNa
2CO
3およびブライン(それぞれ2mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、シリカゲル RediSep 24gカラムを用い、ヘキサン中20%~50%のEtOAcを溶出液として使用するクロマトグラフ処理を行い、無色固体(0.440g、58%)を得た。ES+APCI MS m/z 516.2[M+H]
+。
ステップB:ベンジル 4-((3S,5R)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-3,5-ジメチルピペラジン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル 4-((3S,5R)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-3,5-ジメチルピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(400mg、0.775mmol)、3-モルホリノプロパン-1-オール(400mg、2.33mmol、5当量)、炭酸セシウム(1.26g、3.88mmol、5当量)およびジオキサン(3mL)の4mLのバイアル中混合物を、窒素でパージした。バイアルをキャッピングし、混合物を110℃で20時間撹拌し、次いで120℃で一晩撹拌した。反応物を冷却し、EtOAc(10mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、減圧下で留去した。生成物を、2~10%MeOH/DCM+0.2%NH
4OHを溶出液として使用する、シリカ、RediSep 40gによるクロマトグラフィーで精製して、淡黄色非晶質固体(272mg、56%)を得た。
ステップC:tert-ブチル(2S,6R)-2,6-ジメチル-4-(2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-((3S,5R)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-3,5-ジメチルピペラジン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(272mg、0.095mmol)、パラジウム炭素(50mg、デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)、EtOH(5mL)およびTHF(5mL)の混合物を水素でパージし、H
2雰囲気下(ゴムバルーン)で3時間撹拌した。反応混合物をEtOH(3mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、セライトをEtOH(2×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下留去し、高真空下で2日間にわたり乾燥して、オフホワイトの発泡体(205mg、96%)を得た。ES+APCI MS m/z 491.3[M+H]
+。
ステップD:tert-ブチル(2S,6R)-4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,6-ジメチルピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(19mg、0.020mmol)の脱気した無水トルエン(0.5mL)中の撹拌懸濁液に、窒素下、室温で、(+/-)-2,2’-ビス(ジフェニルホスフィノ)-1,1’-ビナフチル(24mg、0.038mmol)を加えた。次いで、混合物を100℃に15分間加熱した。得られた暗色混合物を室温まで冷却し、固体のナトリウム-t-ブトキシド(39mg、0.41mmol)を加え、続けて、3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート(82mg、0.25mmol)およびtert-ブチル(2S,6R)-2,6-ジメチル-4-(2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、0.20mmol)の脱気した無水トルエン(0.5mL)中溶液を加えた。フラスコを密閉し、撹拌しながら100℃に30分加熱した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配した。有機層を単離し、ブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去した。生成物を、DCM中の4%MeOH+0.1%NH
4OHを溶出液として使用する、シリカ、RediSep 40gによるクロマトグラフィーで精製し、無色固体(87mg、63%)を得た。ES+APCI MS m/z 684.3[M+H]
+。
ステップE:1-((2S,6R)-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,6-ジメチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:tert-ブチル(2S,6R)-4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,6-ジメチルピペラジン-1-カルボキシレート(87mg、0.129mmol)を1MのTFA/DCMに溶解した。反応混合物は、赤褐色になり、次いで、暗赤色になった。LCMSは、BocおよびMOMの非選択的脱保護を示した。室温で30分間撹拌後、0.2mLの追加のTFAを加え、反応混合物を室温でさらに30分間放置した。得られた2相混合物を減圧下で留去し、水(5mL)とDCM(10mL)+NEt3(0.5mL)の間で分配し、有機層を分離させた。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、減圧下で留去した。残留物を、6%MeOH/DCM+0.2%NH4OHを溶出液として使用する、シリカ、RediSep 40gによるクロマトグラフィーで精製して、別の残留物を得、これを逆相(C18、5~95%MeCN-H2O+0.1%TFA)で精製して、TFAのビス塩と考えられる生成物(1.35mg、1.3%)を得た。ES+APCI MS m/z 587.3[M+H]+。
実施例192
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに、3-ピペリジンメタノール,1-メチル-,(3R)-を使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例193
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに(4-メチル-2-モルホリニル)メタノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 545.3[M+H]+。
実施例194
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに4-メチル-3-(ヒドロキシメチル)モルホリンを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 545.2[M+H]+。
実施例195
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(R)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに(R)-(1-メチルピペリジン-2-イル)メタノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例196
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(S)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに(S)-(1-メチルピペリジン-2-イル)メタノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 543.2[M+H]+。
実施例197
(S)-1-(4-(2-((1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(S)-1-(4-(2-((1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに[(2S)-1-エチル-2-ピロリジニル]メタノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例198
(S,E)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン
(S,E)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップFで、塩化アクリロイルの代わりにtrans-クロトニルクロリドを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 543.2[M+H]+。
実施例199
(S,E)-4-(ジメチルアミノ)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン
(S,E)-4-(ジメチルアミノ)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップFの代わりに、下記の手順を使用して、この化合物を調製した。7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-4-(ピペラジン-1-イル)-4a,5,6,7,8,8a-ヘキサヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(150mg、0.288mmol)をDCM(5mL)中に溶解し、(2E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エン酸(74.4mg、0.576mmol)およびヒューニッヒ塩基(252μl、1.44mmol)で処理した。この混合物に、EDC(55.2mg、0.288mmol)およびHOBT(38.9mg、0.288mmol)を未希釈の粉末として加えた。この反応混合物を室温で1時間撹拌し、35℃にさらに3時間加熱した。反応混合物を、減圧下で濃縮し、CombiFlash(0%~15%DCM/MeOH+1%NH4OH修飾剤)で精製した。不純物を含まない目的の生成物を含む全画分を合わせ、減圧下で濃縮して、(E)-4-(ジメチルアミノ)-1-(4-(7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-4a,5,6,7,8,8a-ヘキサヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン(105mg、0.166mmol、57.7%収率)を得た。結果として、実施例127の残りの部分による生成物として、(S,E)-4-(ジメチルアミノ)-1-(4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ブタ-2-エン-1-オン(14.8mg、0.025mmol、15.2%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 586.3[M+H]+。
実施例200
(S)-1-(4-(2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(S)-1-(4-(2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップCで、3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル トリフルオロメタンスルホネートの代わりにナフタレン-1-イル トリフルオロメタンスルホネートを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 513.3[M+H]+。
実施例201
1-((R)-2-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
1-((R)-2-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップAで、ベンジル ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりに、(R)-ベンジル 2-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用し、ステップCで、3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル トリフルオロメタンスルホネートの代わりに、ナフタレン-1-イル トリフルオロメタンスルホネートを使用して、さらにステップFを実施せずに、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 527.3[M+H]+。
実施例202
1-((S)-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
1-((S)-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップAで、ベンジル ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル (S)-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例203
1-((S)-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
1-((S)-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチルピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例127に従って、ステップAで、ベンジル ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル (S)-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用し、ステップDのN-メチル-L-プロリノールの代わりに、N-メチル-D-プロリノールを使用してこの化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 543.3[M+H]+。
実施例204
1-(4-(2-((1-シクロプロピルピペリジン-4-イル)アミノ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-(2-((1-シクロプロピルピペリジン-4-イル)アミノ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(75mg、0.13mmol)、1-シクロプロピルピペリジン-4-アミン(55mg、0.39mmol)およびジオキサン(0.5mL)の混合物を、120℃に36時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(10mL)と水(3mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去し、残留物を、DCM中の6→10%MeOH+0.2%NH
4OHを溶出液として使用して、シリカ、RediSep 24gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(43mg、49%)を得た。ES+APCI MS m/z 678.3[M+H]
+。
ステップB:1-(4-(2-((1-シクロプロピルピペリジン-4-イル)アミノ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:ベンジル 4-(2-((1-シクロプロピルピペリジン-4-イル)アミノ)-7-(3-(メトキシメトキシ)-ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(43mg、0.063mmol)、パラジウム炭素(20mg、デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)、EtOH(1.5mL)およびTHF(1.5mL)の混合物を、水素でパージし、H
2雰囲気下(ゴムバルーン)で3時間撹拌した。混合物をEtOH(3mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、セライトをEtOH(2×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去した。残留物をDCM(5mL)に溶解し、氷塩浴で撹拌を加えながら冷却した。次に、トリエチルアミン(0.03mL)を1度に加え、続けて、塩化アクリロイル(10μL)を加えた。-5℃で1分後、反応物をNH
4OH(0.05mL)でクエンチし、減圧下で留去した。残留物をDCM(5mL)と5分間撹拌し、濾過し、DCM中の6→20%MeOH+0.2%NH
4OHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(22mg、48%)を得た。ES+APCI MS m/z 598.3[M+H]
+。
ステップC:1-(4-(2-((1-シクロプロピルピペリジン-4-イル)アミノ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:1-(4-(2-((1-シクロプロピルピペリジン-4-イル)アミノ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(22mg、0.037mmol)のMeOHとTHF(1:1)の混合物(3mL)中の撹拌溶液に、6MのHCl水溶液(0.3mL、34当量)を全て1度に加え、得られた溶液を撹拌を加えながら50℃で1.5時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(15mL)と0.5MのNa2CO3(10mL)との間で分配し、有機層を分離させた。合わせた有機成分をブライン(3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、DCM中の8~10%MeOH+0.2%NH4OHを溶出液として使用して、シリカ、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(15mg、74%)を得た。ES+APCI MS m/z 554.3[M+H]+。
実施例205
1-(4-(7-(6-ヒドロキシキノリン-8-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-(7-(6-(メトキシメトキシ)キノリン-8-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(17mg、0.019mmol)の脱気した無水トルエン(0.5mL)中の撹拌懸濁液に、窒素下、室温で、(+/-)-2,2’-ビス(ジフェニルホスフィノ)-1,1’-ビナフチル(24mg、0.038mmol)を加え、混合物を100℃に15分間加熱した。暗色混合物を室温まで冷却し、次に、固体のナトリウム-t-ブトキシド(36mg、0.38mmol)を加え、次いで8-ブロモ-6-(メトキシメトキシ)キノリン(61mg、0.23mmol)およびベンジル 4-(2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(94mg、0.19mmol)の脱気した無水トルエン(0.5mL)中溶液を加えた。フラスコを密閉し、100℃に1時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(15mL)と水(5mL)との間で分配し、有機層を分離させた。有機層をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、ジクロロメタン中の4~10%MeOH+0.2%NH
4OHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 24gによりクロマトグラフ処理し、黄色固体(28mg、22%)を得た。ES+APCI MS m/z 684.3[M+H]
+。
ステップB:1-(4-(7-(6-(メトキシメトキシ)キノリン-8-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:ベンジル 4-(7-(6-(メトキシメトキシ)キノリン-8-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(28mg、0.095mmol)、Pd/C(15mg、デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)、EtOH(2mL)およびTHF(2mL)の混合物を水素でパージし、H
2雰囲気下(ゴムバルーン)で2時間撹拌した。反応混合物をEtOH(3mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、セライトをEtOH(2×2mL)で洗浄し、合わせた有機成分を減圧下で留去した。得られた固体をDCM(5mL)に溶解し、撹拌を加えながら氷塩浴で冷却した。次いで、トリエチルアミン(0.04mL、3当量)を1度に加え、続けて、塩化アクリロイル(16μL、2当量)を加えた。-5℃で1分後、反応物をNH
4OH(0.05mL)でクエンチし、減圧下で留去した。混合物を綿プラグを通して濾過し、6~10%MeOH/DCM+0.2%NH
4OHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理して別の残留物を得て、これを、逆相(C18、5~95%MeCN+0.1%HCO
2H)で精製して、ビスギ酸塩と考えられる生成物(12mg、42%)を黄色固体として得た。ES+APCI MS m/z 604.2[M+H]
+。
ステップC:1-(4-(7-(6-ヒドロキシキノリン-8-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:1-(4-(7-(6-(メトキシメトキシ)キノリン-8-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(12mg、0.017mmol)のMeOHとTHF(1:1)の混合物(1mL)中の撹拌溶液に、6MのHCl水溶液(0.1mL、35当量)を1度に加え、溶液を撹拌しながら50℃で1.5時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(15mL)と0.5Mのリン酸ナトリウム緩衝液(pH8)(5mL)との間で分配し、層を分離させた。合わせた有機成分をブライン(1mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。生成物を、DCM中の7~10%MeOH+0.2%NH4OHを溶出液として使用して、シリカ、RediSep 12gで精製して残留物を得て、これを逆相クロマトグラフィー(C18、5→95%MeOH+0.1%TFA)で再精製して、トリスTFA塩の生成物(4.87mg、31%)を無色固体として得た。ES+APCI MS m/z 560.3[M+H]+。
実施例206
1-(4-(2-(3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロパン-1-オール:3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン塩酸塩(200mg、1.67mmol)、3-ブロモプロパン-1-オール(166μL、1.84mmol、1.1当量)、K
2CO
3(0.69g、5.02mmol、3当量)、NaI(251mg、1.67mmol、1当量)およびアセトニトリル(2mL)の4mLのバイアル中混合物を、N
2でフラッシングした。バイアルをキャッピングし、室温で2日間撹拌した。混合物を水(2mL)で希釈し、エーテル(15ml)で抽出した。エーテル溶液をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、ナシフラスコ中にデカントし、トリフルオロ酢酸(128μL、1当量)を加え、混合物を約5mLまで濃縮した。上部のエーテルを含んだ層をデカントし、廃棄し、残った油状液体を真空下で一晩乾燥した。油状液体を水(0.5mL)で希釈し、次いでエーテル(10mL)を撹拌しながら加え、続けて、50%NaOH(0.2mL、2.5mmol、2当量)を加えた。層を分離させ、有機溶液をKOH上で乾燥し、窒素下で注意深く濃縮し、粗製3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロパン-1-オールを無色油として得た。さらに精製することなく、次のステップで使用した。
ステップB:ベンジル 4-(2-(3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロポキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)-ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(75mg、0.13mmol)、粗製3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロパン-1-オール(55mg、0.39mmol、3当量)、Cs
2CO
3(213mg、0.65mmol、5当量)およびジオキサン(0.5mL)の1.7mLのバイアル中混合物を、窒素でパージした。バイアルをキャッピングし、120℃で週末にかけて撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(15mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥して、減圧下で留去し、残留物を、4~10%MeOH+1%NH
4OHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 24gによりクロマトグラフ処理して生成物を得た。ES+APCI MS m/z 679.3[M+H]
+。
ステップC:1-(4-(2-(3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロポキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:ベンジル 4-(2-(3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロポキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)-ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(49mg、0.072mmol)、パラジウム炭素(12mg、デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)、EtOH(1.5mL)およびTHF(1.5mL)の混合物を、水素でパージし、H
2雰囲気下(ゴムバルーン)で3時間撹拌した。反応混合物をEtOH(3mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、セライトをEtOH(2×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去した。得られた無色固体をDCM(5mL)に溶解し、氷塩浴で撹拌しながら冷却し、トリエチルアミン(0.04mL、3当量)を1度に加え、続けて、塩化アクリロイル(16μL、2当量)を加えた。-5℃で1分後、反応物をNH
4OH(0.05mL)でクエンチし、減圧下で留去した。粗生成物をDCM(5mL)に溶解し、綿プラグを通して濾過して、DCM中の6~10%MeOH+0.2%NH
4OHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(30mg、69%)を得た。ES+APCI MS m/z 599.3[M+H]
+。
ステップD:1-(4-(2-(3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:1-(4-(2-(3-(3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサン-3-イル)プロポキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(30mg、0.050mmol)のMeOHおよびTHF(1:1)の混合物(3mL)中の撹拌溶液に、6MのHCl水溶液(0.3mL、36当量)を加え、溶液を撹拌を加えながら50℃で1.5時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(20mL)および0.5MのNa2CO3(5mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層をブライン(1mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥して、減圧下で留去した。残留物を、DCM中の6%MeOH+0.2%NH4OHを溶出液として使用して、シリカ、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(20.62mg、74%)を得た。ES+APCI MS m/z 555.4[M+H]+。
実施例207
(R)-1-(4-(2-(2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:(R)-2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エタン-1-オール:R-3-フルオロピペリジン塩酸塩(209mg、1.50mmol)、2-ブロモエタン-1-オール(117μL、1.65mmol、1.1当量)、K
2CO
3(0.62g、4.5mmol、3当量)、ヨウ化ナトリウム(225mg、1.5mmol、1当量)およびアセトニトリル(2mL)の4mLのバイアル中混合物を、N
2でフラッシングした。バイアルをキャッピングし、室温で2日間撹拌した。得られた懸濁液を水(2mL)で希釈し、エーテル(15ml)で抽出した。エーテル溶液をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、ナシフラスコ中にデカントし、トリフルオロ酢酸(115μL、1当量)を加え、混合物を約5mLまで濃縮した。上部のエーテルを含んだ層をデカントして、残った油状液体を真空下で一晩乾燥した。油状液体を水(0.5mL)で希釈し、エーテル(10mL)を撹拌しながら加え、続けて、50%NaOH(0.2mL、2.5mmol、2当量)を加えた。層を分離させ、有機溶液をKOH上で乾燥し、濾過し、窒素下で注意深く濃縮し、粗製アミノアルコール(120mg、54%)を無色油として得た。
ステップB:ベンジル(R)-4-(2-(2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(75mg、0.13mmol)、粗製(R)-2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エタン-1-オール(58mg、0.39mmol)、Cs
2CO
3(213mg、0.65mmol)、およびジオキサン(0.5mL)の1.7mLのバイアル中混合物を、窒素でパージした。バイアルをキャッピングし、110℃で48時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(1mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、セライトをEtOAc(2×2mL)で洗浄し、合わせた有機成分を減圧下で留去した。残留物を、DCM中の6%MeOH+0.2%NH
4OHを溶出液として使用して、シリカ、RediSep 24gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(30mg、34%)を得た。ES+APCI MS m/z 685.4[M+H]
+。
ステップC:(R)-1-(4-(2-(2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:ベンジル(R)-4-(2-(2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)-ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(30mg、0.044mmol)、パラジウム炭素(10mg、デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)、EtOH(1.5mL)およびTHF(1.5mL)の混合物を、水素でパージし、H
2雰囲気下(ゴムバルーン)で2時間撹拌した。反応混合物をEtOH(3mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、セライトをEtOH(2×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去した。残留物をDCM(3mL)に溶解し、撹拌を加えながら氷塩浴で冷却した。次に、トリエチルアミン(0.02mL、3当量)を1度に加え、続けて、塩化アクリロイル(7μL、2当量)を加えた。-10℃で1分後、反応物をNH
4OH(0.03mL)でクエンチし、減圧下で留去した。残留物をDCM(5mL)に溶解し、濾過し、DCM中の6~10%MeOH+0.2%NH
4OHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(22mg、83%)を得た。ES+APCI MS m/z 605.3[M+H]
+。
ステップD:(R)-1-(4-(2-(2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:(R)-1-(4-(2-(2-(3-フルオロピペリジン-1-イル)エトキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(22mg、0.036mmol)のMeOHおよびTHF(1:1)の混合物(3mL)中の撹拌溶液に、6MのHCl水溶液(0.3mL)を加え、溶液を撹拌を加えながら50℃で1.5時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(20mL)および0.5MのNa2CO3(5mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層をブライン(1mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥して、減圧下で留去した。残留物を、DCM中の6%MeOH+0.2%NH4OHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(16.86mg、83%)を得た。ES+APCI MS m/z 561.2[M+H]+。
実施例208
1-(4-(2-(3-((3R,4S)-3,4-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:3-((3R,4S)-3,4-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロパン-1-オール:(3R、4S)-3,4-ジフルオロピロリジン塩酸塩(200mg、1.39mmol)、3-ブロモプロパン-1-オール(126μL、1.39mmol、1.0当量)、炭酸カリウム(577mg、4.18mmol、3当量)、ヨウ化ナトリウム(209mg、1.39mmol、1当量)およびアセトニトリル(2mL)の7mLのバイアル中混合物を、N
2でフラッシングした。バイアルをキャッピングし、反応混合物を室温で2日間撹拌した。混合物を水(2mL)で希釈し、エーテル(15ml)で抽出した。エーテル溶液をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、ナシフラスコ中にデカントした。次に、トリフルオロ酢酸(107μL、1当量)を加え、混合物を留去し、減圧下で乾燥した。残留物を水(0.5mL)で希釈し、エーテル(5mL)で洗浄した。水層に、ジエチルエーテル(15mL)、続けて、10MのNaOH(0.2mL、5mmol)を加え、混合物を1時間撹拌した。有機層を分離させ、固体KOH上で乾燥し、綿プラグを通して濾過して、N
2下で留去して、無色油(80mg、35%)を得て、これを粗製物として次の反応に使用した。
ステップB:ベンジル 4-(2-(3-((3R,4S)-3,4-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(75mg、0.13mmol)、粗製2-(4,4-ジフルオロピペリジン-1-イル)エタン-1-オール(65mg、0.39mmol)、炭酸セシウム(213mg、0.65mmol、5当量)およびジオキサン(0.5mL)の1.7mLのバイアル中混合物を、窒素でパージした。バイアルをキャッピングし、110℃で週末にかけて撹拌した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(15mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去した。生成物を、DCM中の3%MeOHを溶出液として使用して、シリカ、RediSep 24gによるクロマトグラ処理により精製し、無色固体(46mg、50%)を得た。ES+APCI MS m/z 703.3[M+H]
+。
ステップC:1-(4-(2-(3-((3R,4S)-3,4-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:ベンジル 4-(2-(3-((3R,4S)-3,4-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(46mg、0.065mmol)、パラジウム炭素(15mg、デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)、EtOH(1mL)およびTHF(1mL)の混合物を水素でパージし、H
2雰囲気下(ゴムバルーン)で3時間撹拌した。反応混合物をEtOH(3mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、セライトをEtOH(2×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去した。残留物をDCM(3mL)に溶解し、撹拌を加えながら氷塩浴で冷却した。次に、トリエチルアミン(0.02mL)を加え、続けて、塩化アクリロイル(7μL、2当量)を加えた。-10℃で1分後、反応物をNH
4OH(0.03mL)でクエンチし、減圧下で留去した。残留物をDCM(3mL)に溶解し、濾過し、DCM中の5%MeOHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(29mg、71%)を得た。ES+APCI MS m/z 623.3[M+H]
+。
ステップD:1-(4-(2-(3-((3R,4S)-3,4-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:1-(4-(2-(3-((3R,4S)-3,4-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-7-(3-(メトキシメトキシ)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン(29mg、0.047mmol)のMeOHおよびTHF(1:1)の混合物(2mL)中の撹拌溶液に、6MのHCl水溶液(0.2mL)を加え、溶液を撹拌を加えながら50℃で1.5時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(15mL)と0.5MのNa2CO3(10mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層をブライン(3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、DCM中の5%MeOHを溶出液として使用して、シリカ、RediSep 12gによりクロマトグラフ処理し、無色固体(12.87mg、48%)を得た。ES+APCI MS m/z 579.2[M+H]+。
実施例209
1-(4-(7-(5-メチル-1H-インドール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:4-ブロモ-5-メチル-1-(トリイソプロピルシリル)-1H-インドール:4-ブロモ-5-メチル-1H-インドール(100mg、0.476mmol)の無水THF(2mL)中溶液を、窒素下、撹拌しながら氷塩浴で冷却した。水素化ナトリウム(23mg 油中60%、0.57mg、1.2当量)を加え、混合物を-5℃で30分間撹拌し、次いで室温で1時間撹拌した(気体放出が停止した)。クロロトリイソプロピルシラン(0.10mL、0.48mmol、1当量)を次に加え、反応混合物を室温で2時間撹拌した。反応物をEtOAc(15mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層を水(5mL)、ブライン(5mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥して、減圧下で留去した。残留物は、ヘキサンを溶出液として使用して、シリカゲルで精製し、生成物を得た。(107mg、63%)。
ステップB:ベンジル 4-(7-(5-メチル-1-(トリイソプロピルシリル)-1H-インドール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(17mg、0.019mmol)および(+/-)-2,2’-ビス(ジフェニルホスフィノ)-1,1’-ビナフチル(24mg、0.038mmol)の脱気した無水トルエン(0.5mL)中の撹拌混合物を、窒素下、100℃に15分間加熱した。混合物を室温まで冷却し、固体のナトリウム-t-ブトキシド(37mg、0.38mmol)を加え、続けて、4-ブロモ-5-メチル-1-(トリイソプロピルシリル)-1H-インドール(90mg、0.25mmol)およびベンジル 4-(2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(94mg、0.19mmol)の脱気した無水トルエン(0.5mL)中溶液を加えた。反応フラスコを密閉し、100℃に一晩加熱した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(15mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去した。生成物を、ジクロロメタン中の3~5%MeOHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 24gによるクロマトグラフ処理により精製し、淡黄色固体(28mg、19%)を得た。ES+APCI MS m/z 782.3[M]
+。
ステップC:1-(4-(7-(5-メチル-1H-インドール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:ベンジル 4-(7-(5-メチル-1-(トリイソプロピルシリル)-1H-インドール-4-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(46mg、0.065mmol)、パラジウム炭素(35mg、デグサタイプ、10重量%、50%H2O)のEtOH(1mL)およびTHF(1mL)中の混合物を水素でパージし、H2雰囲気下(ゴムバルーン)で一晩撹拌した。反応混合物をジオキサン(3mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、セライトをジオキサン(2×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去し、高真空下で乾燥した。N2下で残留物をTHF(1mL)に溶解し、次いでTHF(0.07mL、2当量)中の1Mのテトラ-n-ブチルアンモニウムフルオリドを撹拌しながら加え、溶液を0℃で15分撹拌した。反応混合物をエーテル(15mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層を水(3mL)、ブライン(3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、窒素下で留去した。粗生成物をDCM(3mL)に溶解し、撹拌を加えながら氷塩-ドライアイス浴(-20℃)で冷却した。次に、トリエチルアミン(10μL、2当量)を加え、続けて、塩化アクリロイル(2μL、0.75当量)を加えた。-20℃で10分後、反応物をNH4OH(0.03mL)でクエンチし、減圧下留去した。生成物を、5%MeOH/DCM+0.1%NH4OHを溶出液として使用して、シリカゲルカラムによるクロマトグラフィーで精製し、無色固体(3.69mg、19%)を得た。ES+APCI MS m/z 546.3[M+H]+。
実施例210
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-クロロ-4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(8.00g、26.3mmol)、ヒューニッヒ塩基(22.9ml、132mmol)および2-(ピペラジン-2-イル)アセトニトリルジヒドロクロリド(5.21g、26.3mmol)を、DMA(75mL)中に加え、室温で20分撹拌した。反応物に水を加え、混合物をEtOAc(3×100mL)で抽出した。抽出物を合わせ、水(3×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮して、粗製物を得、これをそのまま使用した。ES+APCI MS m/z 393.3[M+H]
+。
ステップB:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2-クロロ-4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(10.5g、26.7mmol)およびTEA(5.6ml、40.1mmol)を、THF(100mL)中に加え、0℃に冷却した。ベンジルカルボノクロリデート(5.7ml、40.1mmol)を加え、反応物を0℃で30分間撹拌した。反応物に水を加え、混合物をDCM(3×50mL)で抽出し、抽出物を合わせ、濃縮した。残留物をシリカゲル(ヘキサン中の0~60%EtOAcを溶出液として)により精製して、tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(12.9g、24.5mmol、92%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 527.1[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:シールドチューブ中で、tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.50g、2.85mmol)をジオキサン(1.42ml、2.85mmol)に溶解し、粉砕炭酸セシウム(1.85g、5.69mmol)および[(2S)-1-エチル-2-ピロリジニル]メタノール(1.64g、14.2mmol)で処理した。次いで、チューブをキャッピングし、90℃に24時間加熱した。反応物を室温まで冷却し、水を加えた。混合物をDCM(3×25mL)で抽出し、合わせた有機成分を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲル(DCM中0~12%MeOH+0.2%NH
4OHを溶出液として)で精製し、tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(831mg、1.37mmol、48%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 606.2[M+H]
+。
ステップD:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(831mg、1.37mmol)をDCM(15mL)に加え、TFA(2114μL、27.4mmol)を加えて、反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を濃縮した。飽和重炭酸塩を加え、混合物をDCM(3×25mL)で抽出した。抽出物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(665mg、1.32mmol、96%収率)を得、これをそのまま使用した。ES+APCI MS m/z 506.2[M+H]
+。
ステップE:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:炭酸セシウム(103mg、0.316mmol)、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(80mg、0.158mmol)、Ruphos Pd G3(13.2mg、0.016mmol)、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(53.4mg、0.237mmol)および1,4-ジオキサン(1582μL、0.158mmol)をバイアルに加え、バイアルをArで脱気し、密閉し、次いで70℃に24時間加熱した。反応物に水および飽和NH
4Clを加え、混合物をDCMで抽出した。有機層を減圧下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(DCM中0~12%MeOH+0.2%NH
4OHを溶出液として)で精製し、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(20.5mg、0.032mmol、20%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 650.3[M+H]
+。
ステップF:2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(20.5mg、0.032mmol)のEtOH(316μL、0.0316mmol)およびTHF(316μL、0.032mmol)中溶液に、パラジウム(16.8mg、0.008mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)を加え、次いで真空に続く、バルーン圧によりH
2雰囲気を導入し、2時間撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。次いで、濾液を濃縮し、目的の生成物を得て、これをそのまま使用した。ES+APCI MS m/z 516.2[M+H]
+。
ステップG:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(16.3mg、0.032mmol)およびトリエチルアミン(13.2μL、0.095mmol)をCH2Cl2(316μL、0.032mmol)に加え、0℃に冷却した。塩化アクリロイル(632μL、0.063mmol)(新たに調製したDCM中0.1M溶液)を加え、反応物を0℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、得られた残留物を逆相クロマトグラフィー(0~50%ACN:水+0.1%TFA)で精製し、目的の生成物(18.9mg、0.027mmol、87%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 570.3[M+H]+。
実施例211
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメトキシ)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモ-2-(トリフルオロメトキシ)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 586.3[M+H]+。
実施例212
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに3-ブロモ-4-(トリフルオロメチル)ピリジンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 571.3[M+H]+。
実施例213
1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2,3-ジメチルフェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:3-ブロモ-4,5-ジメチルフェノール:シールドチューブ中の、DPPE(0.431g、1.08mmol)、4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン(1.73g、13.5mmol)、(1,5-シクロオクタジエン)-eta5-インデニル)イリジウム(I)(0.449g、1.08mmol)および1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼン(1.00g、5.40mmol)をシクロヘキサン(6mL)に加え、100℃に50時間加熱した。反応物を濃縮し、アセトン(5mL)中に加え、oxzone(3.32g、5.40mmol)を加えて、10分間撹拌した。飽和NaHSO3で反応物をクエンチし、DCM(3×20ml)で抽出した。抽出物をブライン、水で洗浄し、濃縮した。残留物をDCMでシリカプラグを通過させて溶出し、3-ブロモ-4,5-ジメチルフェノール(238mg、1.18mmol、22%収率)を得た。
ステップB:1-ブロモ-5-(メトキシメトキシ)-2,3-ジメチルベンゼン:2-ブロモ-3-フルオロフェノールの代わりに、3-ブロモ-4,5-ジメチルフェノールを使用して、中間体3の調製法に従って調製した。
ステップC:1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2,3-ジメチルフェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン 2,2,2-トリフルオロアセテート:実施例1のステップC~Fに従って、ステップCで、ベンジル 4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりに、中間体25を用い、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに、1-ブロモ-5-(メトキシメトキシ)-2,3-ジメチルベンゼンを使用して調製した。ES+APCI MS m/z 537.3[M+H]+。
実施例214
1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2-((トリフルオロメチル)チオ)フェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:3-ブロモ-4-((トリフルオロメチル)チオ)フェノール:シールドチューブ中で、3-ブロモフェノール(575mg、3.32mmol)およびN,4-ジメチル-N-(トリフルオロメチル)ベンゼンスルホンアミド(1010mg、3.99mmol)を無水DCE(6mL)に加えた。トリフル酸(295μL、3.32mmol)ゆっくり加え、次いで反応物を80℃に18時間加熱した。反応物を冷却し、溶媒を真空下で除去し、得られた残留物をシリカゲル(ヘキサン中0~20%EtOAc)で精製し、3-ブロモ-4-((トリフルオロメチル)チオ)フェノール(650mg、2.38mmol、72%収率)を得た。
ステップB:(2-ブロモ-4-(メトキシメトキシ)フェニル)(トリフルオロメチル)スルファン:2-ブロモ-3-フルオロフェノールの代わりに、3-ブロモ-4-((トリフルオロメチル)チオ)フェノールを使用して、中間体3の調製法に従って調製した。
ステップC:1-(4-(7-(5-ヒドロキシ-2-((トリフルオロメチル)チオ)フェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:実施例1のステップC~Fに従って、ステップCで、ベンジル 4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりに、中間体25を使用し、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに、(2-ブロモ-4-(メトキシメトキシ)フェニル)(トリフルオロメチル)スルファンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 609.2[M+H]+。
実施例215
(R)-1-(4-(2-(2-ヒドロキシ-3-モルホリノプロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
Phenomenex OZ-Hカラム(4.6mm×250mm、5μ)を使用し、40~60%MeOH:IPA:DEA(80:20:1)を用いて4mL/分で溶出して、実施例123のSFCキラル分割により標記化合物を得た。第1の溶出ピークを集め、目的の化合物を得て、立体化学を適宜割り当てた。ES+APCI MS m/z 575.2[M+H]+。
実施例216
(S)-1-(4-(2-(2-ヒドロキシ-3-モルホリノプロポキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
Phenomenex OZ-Hカラム(4.6mm×250mm、5μ)を使用し、40~60%MeOH:IPA:DEA(80:20:1)を用いて4mL/分で溶出して、実施例123のSFCキラル分割により標記化合物を得た。第2の溶出ピークを集め、目的の化合物を得て、立体化学を適宜割り当てた。ES+APCI MS m/z 575.2[M+H]+。
実施例217
1-(4-(2-((1-ヒドロキシ-3-モルホリノプロパン-2-イル)オキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例8の方法に従い、ステップBで、(S)-1-(ジメチルアミノ)プロパン-2-オールの代わりに3-モルホリノプロパン-1,2-ジオールを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 575.2[M+H]+。
実施例218
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-(2-(((2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:密閉したバイアルに、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、0.27mmol)のジオキサン(2712μL、0.27mmol)中溶液を、アルゴンでスパージし、(2S,4R)-4-{[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ}-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(270mg、0.81mmol)、Cs2CO3(265mg、0.81mmol)、Rhuphos Pd G3(22.7mg、0.027mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で2時間加熱した。水を加え、混合物をDCM(3×15mL)で抽出した。抽出物をあわせて濃縮し、得られた残留物をシリカゲル(ヘキサン中0~40%EtOAc)で精製し、ベンジル 4-(2-(((2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(113mg、0.13mmol、49%収率)を得た。
ステップB:tert-ブチル(2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-2-(((4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-(((2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(113mg、0.133mmol)のEtOH(1.3mL、0.133mmol)およびTHF(1.3mL、0.133mmol)中溶液に、パラジウム(70.9mg、0.033mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、次いで真空に続く、バルーン圧によりH2雰囲気を導入した。次いで、混合物を周囲温度で2時間撹拌した。次いで、混合物を1:1のMeOH:THFで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。次いで濾液を濃縮して、粗生成物を得て、これをそのまま使用した。
ステップC:tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-2-(((4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(95mg、0.13mmol)およびトリエチルアミン(56μL、0.40mmol)をCH2Cl2(1331μL、0.13mmol)に加え、0℃に冷却した。塩化アクリロイル(2661μL、0.27mmol)(新たに調製したDCM中0.1M溶液)を加え、反応物を0℃で30分間撹拌した。反応物に水を加え、混合物をDCM(3×15mL)で抽出した。抽出物を合わせ、濃縮して粗製物を得て、これをそのまま使用した。
ステップD:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-カルボキシレート(92mg、0.12mmol)をDCM(3mL)に加え、TFA(92μL、1.2mmol)を加えて、反応物を室温で2時間撹拌した。反応物に飽和重炭酸塩を加え、混合物をDCM(3×15mL)で抽出した。抽出物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮して、粗製物を得、これをそのまま使用した。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(80mg、0.12mmol)、ホルムアルデヒド(45.0μL、0.60mmol)およびNa(OAc)3BH(50.8mg、0.24mmol)を、THF(2mL)中に加え、2時間撹拌した。飽和重炭酸塩を加え、混合物をDCM中10%MeOH(3×15mL)で抽出した。抽出物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥し、濃縮して粗製物を得て、これをそのまま使用した。
ステップF:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル 2,2,2-トリフルオロアセテート:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(81mg、0.119mmol)をDCM(5mL)に加え、HCl(594μL、2.38mmol)を加えて、反応物を1時間撹拌した。反応物を濃縮し、物質を逆相クロマトグラフィー(0~50%ACN:水+0.1%TFA)で精製し、2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(38.9mg、0.057mmol、48%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 568.3[M+H]+。
実施例219
1-(4-(2-((1,4-ジメチルピペラジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例127と同様にして、ステップDで、N-メチル-L-プロリノールの代わりに(1,4-ジメチル-2-ピペラジニル)メタノールを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 558.3[M+H]+。
実施例220
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(4.00g、7.59mmol)のDCM(25.3ml、7.59mmol)中の溶液に、トリフルオロ酢酸(17.4ml、227.7mmol)を加え、反応物を室温で3時間撹拌した。反応物を濃縮して濃厚油とした。飽和重炭酸塩を加え、混合物をゆっくり加え、混合物をDCM中10%MeOH(3×50mL)で抽出した。抽出物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥し、濃縮して目的の生成物(3.24g、7.6mmol、100%収率)を得て、これをそのまま使用した。ES+APCI MS m/z 506.2[M]
+。
ステップB:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:丸底フラスコに、炭酸セシウム(8.01g、24.6mmol)、ベンジル 4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.5g、8.2mmol)および1-ブロモナフタレン(4.6ml、32.8mmol)、Ruphos Pd G3(1.0g、1.23mmol)を加えた。フラスコを排気後、1,4-ジオキサン(82.0ml、8.20mmol)を、アルゴン流下でセプタムを通して添加した。アルゴンを混合物中に5分間バブリングし、次いで混合物を70℃に一晩加熱した。反応物を冷却し、水を加え、酢酸エチルで抽出して、有機成分を減圧下で濃縮した。黄色固体を最小限のDCMに溶解し、シリカクロマトグラフィー(ヘキサン中の25~60%EtOAc)で精製して、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.0g、3.6mmol、44.1%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 553.2[M]
+。
ステップC:ベンジル 4-(2-(((2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-フルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:バイアル中で、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、0.22mmol)をジオキサン(108μl、0.217mmol)中に溶解し、炭酸セシウム(141mg、0.434mmol)、および(2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-フルオロ-2-ヒドロキシメチルピロリジン(47.6mg、0.217mmol)で処理した。次いで、チューブをキャッピングし、90℃に12時間加熱した。反応物をGF/F濾布を通して濾過し、濃縮した。残留物をシリカクロマトグラフィー(DCM中の0~6%MeOH)により精製した。ES+APCI MS m/z 736.3[M+H]
+。
ステップD:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-(((2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-フルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(125mg、0.170mmol)のDCM(170μL、0.170mmol)中溶液に、トリフルオロ酢酸(195μL、2.55mmol)を加え、反応物を室温で2時間撹拌した。有機成分を炭酸水素ナトリウムで洗浄し、水層をDCMで逆抽出した。合わせた有機層を濃縮し、さらに精製することなく使用した。ES+APCI MS m/z 636.3[M+H]
+。
ステップE:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(105mg、0.1652mmol)のDCE(3303μL、0.1652mmol)中溶液に、ホルムアルデヒド(124.1μL、1.652mmol)(37%水溶液)を加え、続けて、トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム(175.0mg、0.8258mmol)を加えた。混合物を室温で2.5時間、強く撹拌した。混合物を飽和重炭酸ナトリウム(30mL)で処理し、10分間撹拌し、次いでDCM(3×10ml)で抽出した。合わせた有機相を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、濃縮して、これを次の反応にそのまま使用した。ES+APCI MS m/z 650.3[M+H]
+。
ステップF:2-(4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(85mg、0.13mmol)のEtOH(1308μL、0.13mmol)およびTHF(1308μL、0.13mmol)中溶液に、パラジウム(70mg、0.033mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)を加え、次いで真空に続く、バルーン圧によりH
2雰囲気を導入した。次いで、混合物を周囲温度で一晩撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。次いで、濾液を濃縮して、2-(4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを得た。ES+APCI MS m/z 516.3[M+H]
+。
ステップG:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(65mg、0.126mmol)のDCM(1261μL、0.126mmol)中の懸濁液に、0℃で、塩化アクリロイル(2521μL、0.252mmol)(新たに調製したDCM中の0.1M溶液)、続けて、トリエチルアミン(35.1μL、0.252mmol)を加えた。次いで、反応混合物を0℃で45分間撹拌した。反応物を濃縮し、逆相クロマトグラフィー(0~50%CAN:水+0.1%TFA)で精製し、標記化合物を得た。ES+APCI MS m/z 570.3[M+H]+。
実施例221
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4S)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例220の方法のステップC~Gに従って、ステップCで、tert-ブチル(2S,4R)-4-フルオロ-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートの代わりに、tert-ブチル(2S,4S)-4-フルオロ-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 570.3[M+H]+。
実施例222
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4S)-4-メトキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例220(ステップC~G)に従って、ステップCで、(2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-フルオロ-2-ヒドロキシメチルピロリジンの代わりにtert-ブチル(2S,4S)-2-(ヒドロキシメチル)-4-メトキシピロリジン-1-カルボキシレートを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 582.3[M+H]+。
実施例223
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルピペラジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA~F:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルピペラジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例220(ステップC~G)に従って、ステップCで、(2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-フルオロ-2-ヒドロキシメチルピロリジンの代わりにtert-ブチル (S)-2-(ヒドロキシメチル)-4-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 567.3[M+H]+。
実施例224
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルピペラジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例220(ステップC~G)に従って、ステップCで、tert-ブチル (S)-2-(ヒドロキシメチル)-4-メチルピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル(R)-2-(ヒドロキシメチル)-4-メチルピペラジン-1-カルボキシレートを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 567.3[M+H]+。
実施例225
2-(1-アクリロイル-4-(7-(5-フルオロ-2-(トリフルオロメトキシ)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに2-ブロモ-4-フルオロ-1-(トリフルオロメトキシ)ベンゼンを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 604.3[M+H]+。
実施例226
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに3-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ピリジンを使用して、標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 571.3[M+H]+。
実施例227
2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-フルオロフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモ-2-フルオロベンゼンを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 520.3[M+H]+。
実施例228
2-(1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼンを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 530.3[M+H]+。
実施例229
2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-クロロフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモ-2-クロロベンゼンを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 536.2[M]+。
実施例230
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して、標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 588.3[M+H]+。
実施例231
2-(1-アクリロイル-4-(2-(3-ヒドロキシプロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(3-ヒドロキシプロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:実施例220のステップCに従って、(2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-フルオロ-2-ヒドロキシメチルピロリジンの代わりにプロパン-1,3-ジオールを使用して標記化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 593.3[M+H]
+。
ステップB:ベンジル 4-(2-(3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(3-ヒドロキシプロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(77.6mg、0.131mmol)をバイアルに加え、これをDCM(655μL、0.131mmol)に溶解した。混合物を、0℃に冷却し、次いでトリエチルアミン(36.5μL、0.262mmol)を加え、続けて4-(ジメチルアミノ)ピリジン(4.80mg、0.04mmol)を加えた。tert-ブチルジメチルシリルクロリド(29.6mg、0.196mmol)を加え、混合物を一晩撹拌し、この間、室温に温めた。反応混合物を飽和ブライン溶液(5mL)上に注ぎ込み、混合物をEtOAc(10mL)で2回抽出した。有機相を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗反応産物をそのまま使用した。ES+APCI MS m/z 707.4[M+H]+。
ステップC:2-(4-(2-(3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 4-(2-(3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(106mg、0.150mmol)のEtOH(1499μL、0.150mmol)およびTHF(1499μL、0.150mmol)中溶液に、パラジウム(79.8mg、0.0375mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)を加え、次いで真空に続く、バルーン圧によりH
2雰囲気を導入した。次いで、混合物を周囲温度で一晩撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。次いで、濾液を濃縮して、無色固体を得て、これをさらに精製することなく使用した。ES+APCI MS m/z 573.3[M+H]+。
ステップD:2-(1-アクリロイル-4-(2-(3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(4-(2-(3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(75mg、0.131mmol)の-78℃のDCM(1309μL、0.131mmol)中の懸濁液に、塩化アクリロイル(2619μL、0.262mmol)(新たに調製したDCM中の0.1M溶液)、続けて、トリエチルアミン(36.5μL、0.262mmol)を加えた。次いで、反応混合物を0℃で30分間撹拌した。反応物を濃縮し、粗生成物を次の反応に使用した。ES+APCI MS m/z 627.4[M+H]+。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(3-ヒドロキシプロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(1-アクリロイル-4-(2-(3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)プロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(90mg、0.14mmol)のDCM(1436μL、0.14mmol)中溶液に、塩酸(4.0M、1,4-ジオキサン)(359μL、1.4mmol)を0℃で加えた。反応物を30分間撹拌し、この時点で、飽和重炭酸ナトリウムでクエンチし、CHCl3中の10%IPA(3×15ml)で抽出した。合わせた有機層を濃縮し、残留物を逆相クロマトグラフィー[0~95%ACN:H2O+0.1TFA]で精製した。ES+APCI MS m/z 513.2[M+H]+。
実施例232
1-(4-(7-(3-クロロ-2-フルオロ-5-ヒドロキシフェニル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
実施例1のステップC~Fに従って、ステップCで、ベンジル 4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりに、中間体25を使用し、1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレンの代わりに、1-ブロモ-3-クロロ-2-フルオロ-5-(メトキシメトキシ)ベンゼンを使用して調製した。ES+APCI MS m/z 561.2[M]+。
実施例233
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例147に従って、ステップFで、[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノールの代わりに(S)-(1-エチルピロリジン-2-イル)メタノールを使用して、この化合物を調製した。ES+APCI MS m/z 566.3[M+H]+。
実施例234
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:(R)-1-Boc-3-ヒドロキシメチルピペラジン(5.00g、23.1mmol)およびNaHCO3(5.83g、69.4mmol)の0℃の酢酸エチル(46.2mL)および水(46.2mL)中の撹拌2相溶液に、ベンジルクロロホルメート(4.95ml、34.7mmol)を滴加した。反応混合物を周囲温度で一晩撹拌した。反応混合物をEtOAc(50.0ml)で希釈し、有機層を分離し、乾燥(Na2SO4)して濃縮した。粗生成物を10~50%EtOAc/ヘキサン勾配液で溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、標記化合物(7.62g、21.7mmol、94.1%)を得た。ESI MS m/z 251.1[M-Boc+H]+。
ステップB:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(1.69g、4.83mmol)およびトリエチルアミン(1.01ml、7.25mmol)の0℃のCH2Cl2(32.2mL)中溶液に、未希釈のMsCl(0.561ml、7.25mmol)を滴加し、得られた混合物を室温で10分間撹拌した。反応混合物を分液漏斗に注ぎ込み、酢酸エチルで希釈し、次いで1N HCl、水、NaHCO3(飽和)、およびブラインで順次洗浄し、標記化合物(1.9g、約100%、次のステップで粗製物として使用)を得た。ESI MS m/z 329.1[M-Boc+H]+。
ステップC:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(2.10g、4.90mmol)、シアン化ナトリウム(0.480g、9.80mmol)のDMA(49.0ml)中溶液を、55℃で1日加熱した。HPLCにより反応を追跡した(15分法)。混合物をEtOAc/ブライン間で分配し、有機層をブライン(3×)で洗浄し、MgSO4上で乾燥させ、濃縮した。残留物を0~100%EtOAc/ヘキサン勾配液で溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、標記化合物(1.40g、3.90mmol、79.5%)を得た。水層を塩基化し、シアニド廃水流で処分した。ESI MS m/z 260.1[M-Boc+H]+。
ステップD:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(5.32g、14.8mmol)をCH2Cl2(25mL)に加え、HCl(ジオキサン中4.0N、18.5ml、74.0mmol)を加え、周囲温度で反応物を1日撹拌した。反応混合物を濃縮して、標記化合物(4.3g、99%)を得た。ESI MS m/z 260.1[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.01g、3.89mmol)、tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,6-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(8H)-カルボキシレート(1.18g、3.89mmol)およびDIEA(1.36ml、7.79mmol)のDMSO(19.5ml)中溶液を、50℃で1日加熱した。反応混合物を酢酸エチルとブラインとの間で分配し、有機成分を分離した。有機相をブライン(3×)で洗浄し、MgSO4上で乾燥し、濃縮して、標記化合物(1.63g、3.09mmol、79.4%)を得た。ESI MS m/z 527.2[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:PTFEスクリューキャップを備えた250mLの厚肉丸底フラスコに、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.64g、3.11mmol)のジオキサン(31.1mL)中溶液を加え、混合物をアルゴンでスパージした。この混合物に、アルゴン下で、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(1.08g、9.34mmol)、Cs2CO3(3.04g、9.34mmol)およびRuPhos-Pd Gen3触媒(0.260g、0.311mmol)を順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で1日加熱した。反応混合物を酢酸エチルで希釈し、有機成分をブライン(2×)で洗浄した。有機相をブラインをMgSO4上で乾燥し、濃縮して残留物を得て、これを、DCM中0~20%(MeOH+2%NH4OH)で溶出するフラッシュクロマトグラフィーで精製して標記化合物(1.42g、2.34mmol、75.3%)を得た。ESI MS m/z 606.3[M+H]+。
ステップG:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート ビス-トリフルオロ酢酸塩:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(38mg;0.063mmol)のCH2Cl2(627μl)およびTFA(242μL;3.1mmol)中溶液を、室温で1日撹拌した。反応混合物を濃縮し、ビスTFA塩として次の反応で使用した(46mg、0.063mmol、100%)。ESI MS m/z 506.3[M+H]+。
ステップH:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート ビストリフルオロ酢酸塩(46mg、0.063mmol)、1-ブロモナフタレン(39.3mg、0.190mmol)およびCs2CO3(61.9mg、0.190mmol)のジオキサン(633μl)中の懸濁液を、アルゴンで5分間スパージした。この混合物に、RuPhos Pd Gen3(5.29mg、0.006mmol)を加え、得られた懸濁液をさらに1分間アルゴンでスパージした。バイアルをキャッピングし、100℃で2時間加熱した。反応混合物をEtOAcと水の間で分配し、水層をEtOAc(3×)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、濃縮した。残留物を5%MeOH/1%NH4OH/CH2Cl2無勾配液で溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、標記化合物(31.9mg、0.050mmol、79.8%)を得た。ESI MS m/z 632.3[M+H]+。
ステップI:2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(31mg、0.049mmol)の窒素でスパージしたメタノール(981μl)およびTHF(981μl)中の溶液に、Pd/C(10.4mg、0.00491mmol)を加え、混合物をH2のバルーン圧雰囲気下で1日撹拌した。反応混合物をPTFEシリンジフィルター(25mm)を通して濾過し、濾液を濃縮して、標記化合物(23.4mg、0.047mmol、95.8%)を得た。ESI MS m/z 498.3[M+H]+。
ステップJ:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(23.4mg、0.047mmol)のCH2Cl2(470μL)中溶液に、DIEA(41.1μL、0.235mmol)を加え、次いで、塩化アクリロイル(12μl、0.141mmol)を加えた。得られた混合物を周囲温度で15分間撹拌した。反応混合物をEtOAcと2NのK2CO3とブラインの間で分配した。水層をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、濃縮した。残留物をCH2Cl2中の5%MeOH/1%NH4OHで溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、標記化合物(19.2mg、0.035mmol、74.0%)を得た。ESI MS m/z 552.3[M+H]+。
実施例235
2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップIからの、2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(25mg、0.0502mmol)、(2E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エン酸(13.0mg、0.100mmol)、DIEA(43.9μl、0.251mmol)のCH2Cl2(502μl)中溶液に、HATU(28.7mg、0.0754mmol)を加え、得られた混合物を周囲温度で1時間撹拌した。反応混合物をEtOAcとブラインとの間で分配した。水層をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、濃縮した。残留物を5~95%ACN/H2O+0.1%TFAで溶出する分取C18により精製した。目的の画分をEA/2MのK2CO3の間で分配した。水層をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、濃縮して、標記化合物(19.0mg、0.031mmol、62.1%)を得た。ESI MS m/z 609.4[M+H]+。
実施例236
2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(E-4-(ピペリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:実施例235に従って、(2E)-4-(1-ピペリジニル)-2-ブテン酸 HCl塩を代わりに使用して、2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(E-4-(ピペリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを調製し、標記化合物(30mg、0.046mmol、92.0%)を得た。ESI MS m/z 649.3[M+H]+。
実施例237
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル 2,2,2-トリフルオロアセテート
1-ブロモナフタレンの代わりに、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して実施例234に従って合成した。ES+APCI MS m/z 570.3[M+H]+。
実施例238
2-(1-アクリロイル-4-(7-(6-メチル-1H-インダゾール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:7-ブロモ-6-メチル-2-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-2H-インダゾール:7-ブロモ-6-メチル-1H-インダゾール(200mg、0.948mmol)のテトラヒドロフラン(2mL、0.948mmol)中溶液を、撹拌しながら氷浴で冷却した。水素化ナトリウム(45.5mg、1.14mmol)を何度かに分けて混合物に加え、反応物を0℃で1時間撹拌した。次に、(2-(クロロメトキシ)エチル)トリメチルシラン(0.201ml、1.14mmol)を加え、反応物を2時間撹拌し、その間に室温まで温めた。混合物をEtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層を水(2×10mL)、ブライン(10mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥して、減圧下で留去した。生成物を、20~40%EtOAc/ヘキサンを溶出液として使用するシリカゲルクロマトグラフィーで精製し、7-ブロモ-6-メチル-2-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-2H-インダゾール(46mg、14%)を、異性体の7-ブロモ-6-メチル-1-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-1H-インダゾール(214mg、66%)と一緒に得た。ES+APCI MS m/z 341.1[M]
+。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(6-メチル-2-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-2H-インダゾール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(50mg、0.099mmol)、7-ブロモ-6-メチル-2-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-2H-インダゾール(46mg、0.13mmol)、Cs
2CO
3(97mg、0.30mmol)、Ruphos Pd G3(83mg、0.099mmol)およびジオキサン(1mL)の混合物を、窒素でパージし、70℃で6時間撹拌した。反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層を水(5mL)、ブライン(5mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥して、減圧下で留去した。生成物を、2~20%MeOH/DCMを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 24gによるクロマトグラフィーにより精製し、無色固体(50mg、66%)を得た。ES+APCI MS m/z 766.4[M]
+。
ステップC:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(6-メチル-1H-インダゾール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:未希釈のベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(6-メチル-2-((2-(トリメチルシリル)エトキシ)メチル)-2H-インダゾール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(10mg、0.0131mmol)をトリフルオロ酢酸(1ml、13.1mmol)に溶解し、黄褐色溶液を室温で1.5時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(20mL)に注ぎ込み、有機成分を2MのNa
2CO
3(10mL、20mmol)、水(2×3mL)、ブライン(5mL)で注意深く洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去して、黄色がかった固体(8mg、96%)を得た。ES+APCI MS m/z 636.3[M+H]
+。
ステップD:2-(1-アクリロイル-4-(7-(6-メチル-1H-インダゾール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(6-メチル-1H-インダゾール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16mg、0.02517mmol)、メタノール(1.5ml、0.02517mmol)、テトラヒドロフラン(1.815mg、0.02517mmol)およびパラジウム炭素(10mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の撹拌混合物を、脱気し、水素雰囲気下で1時間撹拌した。混合物をセライト(2mL)を通して濾過後、セライトをTHF(3×3mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で約0.5mLまで濃縮し、DCM(5mL)溶解し、EtOH-H2O-CO2浴で撹拌を加えながら-30℃に冷却した。次に、トリエチルアミン(0.02mL、5当量)を加え、続けて、塩化アクリロイル(0.006134ml、0.07550mmol)を加えて、反応混合物を-30℃で1分間撹拌した。反応物をNH4OH(0.03mL)でクエンチし、減圧下で濃縮した。残留物を、1MのNaHCO3(3mL)とEtOAc(15mL)との間で分配し、層を分離させた。有機層を水(3mL)、ブライン(3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥して、減圧下で留去した。生成物を、10~20%MeOH/DCM+0.2%NH4OHを溶出液として使用して、シリカゲル、RediSep 12gによるクロマトグラフィーにより精製し、無色固体(5.96mg、43%)を得た。ES+APCI MS m/z 556.3[M+H]+。
実施例239
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン 臭化水素酸塩を使用して合成した。ES+APCI MS m/z 571.3[M+H]+。
実施例240
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(2,2,2-トリフルオロエチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモ-2-(2,2,2-トリフルオロエチル)ベンゼンを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 584.3[M+H]+。
実施例241
ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-2-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップA:バイアル中で、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、0.198mmol)をジオキサン(98.9μl、0.198mmol)に溶解し、炭酸セシウム(129mg、0.396mmol)および2-フルオロ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン(163mg、0.989mmol)で処理した。次いで、チューブをキャッピングし、90℃に12時間加熱した。反応物をGF/F濾布を通して濾過し、濃縮した。残留物をシリカクロマトグラフィー(DCM中の0~12%MeOH)により精製した。
ステップB:実施例210のステップF~Gに従って、ステップFで、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-2-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して合成した。ES+APCI MS m/z 571.3[M+H]+。
実施例242
2-(1-(ブタ-2-イノイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
0℃で、N,N-ジメチルホルムアミド(603μL、0.06mmol)を含有する25mLのRBFに、2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.06mmol)およびトリエチルアミン(12.2mg、0.12mmol)を加えた。反応混合物を強く撹拌し、同時に、2-ブチン酸(6.08mg、0.07mmol)を1度に加えた。次に、1-プロパンホスホン酸環状無水物(26.9μL、0.09mmol)を撹拌混合物に加えた。反応物を0℃で2時間撹拌した。水を加え、混合物をEtOAc(2×25mL)で抽出した。有機層を飽和LiCl、NaCl、および水で洗浄した(それぞれ10mLで洗浄)。乾燥し、濃縮して固体とし、逆相分取HPLC(5~95%ACN:H2O+0.1%TFA)で精製し、標記化合物を得た。
実施例243
2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイルピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.05g、2.60mmol)、2-[[4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-1-イル]メトキシ]エチルトリメチルシラン(1.13g、2.86mmol)、RuPhos(484mg、1.04mmol)およびCs2CO3(2.11g、6.49mmol)のトルエン(20mL)中溶液に、Pd2(dba)3(475mg、519μmol)をN2下で加え、懸濁液に対し真空下での脱気およびN2によるパージを数回行った。混合物を90℃に温め、90℃で7時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAc(3×20mL)で洗浄した。合わせた有機層を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EA 30:1→4:1)で精製し、次いで、逆相フラッシュカラム(ACN:100%)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(850mg、1.12mmol、43.3%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 719.5[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(850mg、1.18mmol)のDCM(17mL)中溶液に、m-CPBA(240mg、1.18mmol、85.0%純度)を0℃で加え、0℃で1時間撹拌した。0℃で飽和Na2S2O3(15mL)により反応混合物をクエンチし、次いで単離し、水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(30mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=80%)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(730mg、944μmol、79.8%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 735.5[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、408μmol)および[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(94.0mg、816μmol)のトルエン(6mL)中溶液に、t-BuONa(58.8mg、612μmol)を15℃で加え、15℃で0.5時間撹拌した。混合物にEtOAc(15mL)および水(5mL)を加え、次いでEtOAc(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=54%)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(216mg、261μmol、64.0%収率、95.0%純度)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 786.6[M+H]+。
ステップD:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(190mg、242μmol)および2,6-ジメチルピリジン(311mg、2.90mmol、338μL)のDCM(4mL)中溶液に、TMSOTf(645mg、2.90mmol、524μL)を0℃で加え、20℃で1時間撹拌した。反応混合物をMeOH(1mL)によりクエンチし、次いで真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=40%)で精製した。2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(85mg、123μmol、50.8%収率、99.0%純度)を白色固体として得た。ESI MS m/z 686.5[M+H]+。
ステップE:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(85.0mg、124μmol)、DIEA(96.1mg、744μmol、130μL)のDCM(2mL)中溶液に、0℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(23.4mg、186μmol)を加え、混合物を20℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(2mL)によりクエンチした。得られた混合物をDCM(3×5mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=48%)で精製して、2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(45mg、54.7μmol、44.2%収率、90.0%純度)を白色固体として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.16(s,1H),7.71(d,J=8.8Hz,1H),7.52(d,J=8.8Hz,1H),6.59(br s,1H),6.45-6.36(m,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.76(s,2H),5.12(s,1H),4.44-4.28(m,3H),4.21-4.08(m,2H),3.98(br d,J=12.0Hz,1H),3.63-3.54(m,2H),3.48-3.39(m,2H),3.32(br s,1H),3.10(br s,2H),2.99-2.86(m,2H),2.80(br s,2H),2.73-2.58(m,2H),2.49(s,3H),2.28(br s,1H),2.05(br s,1H),1.77(br s,4H),0.94-0.88(m,2H),-0.04(s,9H)。
ステップF:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(45mg、60.8μmol)のDCM(0.15mL)中溶液に、TFA(208mg、1.82mmol、135μL)を加え、混合物を20℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3(2mL)でpH=8に塩基化した。得られた混合物をDCM:MeOH(10:1)(3×5mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%~40%、10.5分)により精製して、2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(8.2mg、12.0μmol、19.8%収率、96.2%純度、FA)を黄色油として得た。ESI MS m/z 610.4[M+H]+。
実施例244
2-[4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、445μmol)、8-ブロモイソキノリン(185mg、891μmol)、RuPhos(41.6mg、89.1μmol)およびCs2CO3(435mg、1.34mmol)のトルエン(4.5mL)中溶液に、Pd2(dba)3(40.8mg、44.5μmol)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、90℃で12時間撹拌した。混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAc(3×10mL)で洗浄した。合わせた有機層を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=20%)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(160mg、240μmol、54.0%収率、90.0%純度)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 599.4[M+H]+。
ステップB:2-[4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(190mg、317μmol)およびTFA(724mg、6.35mmol、470μL)の溶液を20℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、粗製、2TFA)を褐色油として得た。
ステップC:2-[4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、316μmol、2TFA)およびDIEA(409mg、3.17mmol、551μL)のDCM(5mL)中溶液に、0℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(47.9mg、380μmol)を加え、次いで混合物を20℃で1時間撹拌した。混合物に水(5mL)を加えた。得られた混合物をDCM(3×5mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:1%~20%、10分)により精製して、2-[4-[7-(8-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(12.5mg、19.7μmol、6.23%収率、94.5%純度、FA)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 553.2[M+H]+。
実施例245
2-[4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:(7-メチル-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート:7-メチルテトラリン-1-オン(2.00g、12.5mmol)およびDIPEA(4.84g、37.5mmol、6.52ml)のDCM(30mL)中溶液に、Tf2O(5.28g、18.7mmol、3.09mL)を-5℃で滴加した。混合物を20℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EA 1/0→100/1)で精製して、(7-メチル-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(1.53g、4.45mmol、35.6%収率、85.0%純度)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.17(s,1H),7.11-7.05(m,2H),6.01(t,J=4.8Hz,1H),2.83(t,J=8.0Hz,2H),2.50(dt,J=4.8,8.0Hz,2H),2.36(s,3H)。
ステップB:(7-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート:(7-メチル-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロ メタンスルホネート(1.40g、4.79mmol)およびDDQ(2.17g、9.58mmol)のジオキサン(28mL)中混合物を、105℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EA 1/0→100/1)で精製して、(7-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.10g、3.41mmol、71.2%収率、90.0%純度)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.87-7.79(m,3H),7.49-7.38(m,3H),2.59(s,3H)。
ステップC:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(10g、34.0mmol)、2-ピペラジン-2-イルアセトニトリル(10.1g、51.0mmol、2HCl)およびDIEA(17.6g、136mmol、23.7mL)のジオキサン(100mL)中混合物を50℃で2時間撹拌した。Boc2O(14.8g、68.0mmol、15.6mL)を加え、混合物を50℃で2時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、残留物を酢酸エチル(500mL)で希釈した。分離した有機層を水(1×300mL)、ブライン(1×200mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を酢酸エチル(100mL)でトリチュレートした。沈殿物を濾過し、濾過ケーキを酢酸エチル(50mL)で洗浄し、真空下で乾燥して灰色固体を得た。濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 100/1→1/2)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して固体を得、次いで、上記固体と合わせて、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(15g、29.10mmol、85.6%収率、93.7%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 483.1[M+H]+。
ステップD:4-[7-ベンジル-2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(1.19g、10.4mmol、1.23mL、2.5当量)のTHF(30.0mL)中溶液に、NaH(331mg、8.28mmol、鉱物油中の60%純度、2.00当量)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.00g、4.14mmol、1.00当量)を混合物に加え、混合部を80℃で4時間撹拌した。混合物を氷水(100mL)中に注ぎ込み、エーテルアセテート(3×150mL)で抽出した。有機層を飽和塩化ナトリウム溶液(1×200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.86g、粗製)を黒色油として得て、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。ESI MS m/z 562.3[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:-78℃でNH3をメタノール(70.0mL)中に30分間バブリングした。tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.00g、粗製)およびPd/C(0.20g、10%純度)を混合物に加えた。15psiのH2下、混合物を40℃で24時間撹拌した。混合物を濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.1%)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を飽和炭酸水素ナトリウム溶液(5.00mL)によりpHを7超に調節し、水層をエーテルアセテート(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.40g、845μmol、2ステップで29.4%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 472.2[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(185mg、392μmol)、(7-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(159mg、549μmol)、Pd2(dba)3(35.9mg、39.2μmol)、RuPhos(36.6mg、78.5μmol)およびCs2CO3(320mg、981μmol)のトルエン(30mL)中溶液をN2で脱気し、次いで、N2下で90℃に12時間加熱した。加熱が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%NH3・H2O/アセトニトリル)]で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、283μmol、72.1%収率、96.1%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 612.6[M+H]+。
ステップG:2-[4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、294μmol)のTFA(671mg、5.88mmol、436μL)中溶液を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.37g、粗製、TFA)を黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
ステップH:2-[4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(189mg、粗製、TFA)およびDIEA(976mg、7.55mmol、1.32mL)のDCM(4mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(38.1mg、302μmol)を0℃で滴加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、水(1mL)で希釈して、DCM(3×5ml)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:15%~45%、10.5分)により精製して、2-[4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(13.2mg、21.3μmol、2ステップで14.2%収率、98.4%純度、FA)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 566.5[M+H]+。
実施例246
2-[4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
実施例147の方法に従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-4-フルオロナフタレンを使用して合成した。ESI MS m/z 570.5[M+H]+。
実施例247
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(キノリン-8-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例147の方法に従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに8-ブロモキノリンを使用して合成した。ESI MS m/z 553.2[M+H]+。
実施例248
(S)-1-(4-(7-(5-イソプロピル-1H-インダゾール-4-イル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:2-(2-ブロモ-4-フルオロ-フェニル)プロパン-2-オール:1-(2-ブロモ-4-フルオロ-フェニル)エタノン(10g、46.1mmol)のTHF(100mL)中溶液にMeMgBr(エーテル中)(3M、46.08mL)を-50℃で加えた。混合物を0℃まで温め、3時間撹拌した。-50℃で、混合物を飽和塩化アンモニウム水溶液(10mL)でクエンチした。混合物を15℃まで温め、次いで、酢酸エチル(500mL)で希釈した。分離した有機層を水(1×500mL)、ブライン(1×500mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-(2-ブロモ-4-フルオロ-フェニル)プロパン-2-オール(10g、36.5mmol、79.2%収率、85%純度)を無色油として得た。
ステップB:2-ブロモ-4-フルオロ-1-イソプロピルベンゼン:2-(2-ブロモ-4-フルオロ-フェニル)プロパン-2-オール(9g、38.6mmol)のジクロロメタン(100mL)中溶液に、Et3SiH(8.98g、77.2mmol、12.3mL)およびTFA(65.1g、571mmol、42.3mL)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌し、次いで50℃に1時間、加熱した。反応混合物を真空下で濃縮し、次いで、酢酸エチル(100mL)で希釈した。飽和NaHCO3水溶液の添加により水層のpHをpH=7に調節し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機相をブライン(30mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 1/0→100/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮した。2-ブロモ-4-フルオロ-1-イソプロピルベンゼン(7g、32.2mmol、83.5%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.36-7.27(m,2H),7.09-7.02(m,1H),3.46-3.31(m,1H),1.28(d,J=6.8Hz,6H)。
ステップC:2-ブロモ-6-フルオロ-3-イソプロピルベンズアルデヒド:2-ブロモ-4-フルオロ-1-イソプロピルベンゼン(7g、32.2mmol)のTHF(100mL)中混合物に、LDA(トルエン中2M、24.2mL)を窒素雰囲気下、-70℃で加えた。混合物を0.5時間撹拌し、次いで、DMF(7.07g、96.7mmol、7.44mL)を加えた。混合物を-70℃で2時間撹拌した。反応物を水(100mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE/EA=1/0→10/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、2-ブロモ-6-フルオロ-3-イソプロピルベンズアルデヒド(2.4g、9.79mmol、30.4%収率)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.41(s,1H),7.48(dd,J=5.6,8.8Hz,1H),7.13(t,J=9.2,1H),3.57-3.46(m,1H),1.26(d,J=7.2Hz,6H)。
ステップD:4-ブロモ-5-イソプロピル-1H-インダゾール:DMSO(3mL)中の2-ブロモ-6-フルオロ-3-イソプロピルベンズアルデヒド(2.4g、9.79mmol)にN2H4・H2O(15.4g、302mmol、15mL、98%純度)を加え、混合物を110℃に加熱し、16時間撹拌した。反応混合物をH2O(10mL)中に注ぎ込み、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。有機相をブライン(10mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させて、真空下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→5/1)で精製して、4-ブロモ-5-イソプロピル-1H-インダゾール(650mg、2.72mmol、27.8%収率)を黄色固体として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.24(br s,1H),8.08(d,J=0.8Hz,1H),7.43(d,J=8.8Hz,1H),7.34(d,J=8.8Hz,1H),3.56(td,J=6.8,13.6Hz,1H),1.29(d,J=6.8Hz,6H)。
ステップE:4-ブロモ-5-イソプロピル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール:3,4-ジヒドロ-2H-ピラン(457mg、5.44mmol、497μL、2当量)のジクロロメタン(15mL)中溶液に、TsOH・H2O(51.7mg、271μmol)および4-ブロモ-5-イソプロピル-1H-インダゾール(650mg、2.72mmol)を加えた。混合物を20℃で3時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×2)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→5/1)で精製し、逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]でさらに精製して、4-ブロモ-5-イソプロピル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(170mg、494μmol、18.2%収率、94%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 323.0[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル 4-[7-(5-イソプロピル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:4-ブロモ-5-イソプロピル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(136mg、420μmol)、tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、323μmol)、RuPhos(15.1mg、32.4μmol)、RuPhos-Pd-G2(25.1mg、32.4μmol)およびt-BuONa(77.7mg、809μmol)のトルエン(3mL)中混合物を、脱気とN2によるパージを3回繰り返し、混合物をN2雰囲気下、90℃で12時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、水(20mL)で洗浄した。有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を、カラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=100/1→10/1)で精製し、目的の画分を集め、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[7-(5-イソプロピル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(70mg、96.5μmol、29.8%収率、93%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 675.3[M+H]+。
ステップG:7-(5-イソプロピル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:tert-ブチル 4-[7-(5-イソプロピル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(40mg、59.3μmol)のジクロロメタン(100μL)中溶液に、TFA(101mg、889μmol、65.8μL)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、7-(5-イソプロピル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(42mg、58.4μmol、98.6%収率、2TFA)を褐色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 491.4[M+H]+。
ステップH:1-[4-[7-(5-イソプロピル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:7-(5-イソプロピル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(42mg、58.4μmol)およびDIEA(75.5mg、584μmol、102μL)のジクロロメタン(2mL)中の混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(7.37mg、58.4μmol、1当量)のジクロロメタン(1mL)中溶液を窒素雰囲気下、-40℃で加えた。混合物を-40℃で1時間撹拌した。飽和NaHCO3水溶液(2mL)を添加することにより反応物をクエンチした。次いで、混合物を水(20mL)中に注ぎ込み、ジクロロメタン(20mL×2)で抽出した。合わせた有機成分を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:5%-38%、10分)で精製して、1-[4-[7-(5-イソプロピル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(4.5mg、7.93μmol、13.6%収率、96%純度)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 545.2[M+H]+。
実施例249
1-[4-[7-(2-フルオロ-3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.50g、1.16mmol)、(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(562mg、1.73mmol)、RuPhos(108mg、231μmol)、Pd2(dba)3(106mg、116μmol)およびt-BuONa(333mg、3.47mmol)のトルエン(7mL)中混合物を、窒素雰囲気下、110℃で3時間撹拌した。混合物を冷却し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液の添加により水層のpHを7に調節し、水層をエーテルアセテート(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和塩化ナトリウム溶液で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、ジクロロメタン/メタノール=10/1)で精製し、混合物を濃縮して、tert-ブチル 4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、274μmol、11.8%収率)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 607.0[M+H]+。
ステップB:7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:tert-ブチル 4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、330μmol)およびTFA(564mg、4.94mmol、366μL)のジクロロメタン(0.4mL)中混合物を10℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(205mg、粗製)を黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。ESI MS m/z 507.0[M+H]+。
ステップC:1-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(0.20g、粗製)およびTEA(399mg、3.95mmol、549μL)のジクロロメタン(5mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(49.8mg、394μmol)を-40℃で加え、次いで、-40℃で0.5時間撹拌した。メタノール(0.10mL)で混合物をクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%TFA)/アセトニトリル]で精製した。飽和炭酸水素ナトリウム溶液の添加により、水層のpHを7にし、水層をジクロロメタン/メタノール(10/1)(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和塩化ナトリウム(1×5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、1-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(0.10g、174μmol、44.1%収率)を黄色油として得た。ESI MS m/z 561.5[M+H]+。
ステップD:1-[4-[7-(2-フルオロ-3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:1-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(0.10g、174μmol)のジクロロメタン(3mL)中溶液に、BBr3(223mg、892μmol、85.9μL)を-78℃で加えた。混合物を-78℃で0.5時間および0℃で2時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、ジクロロメタン(3mL)および水で希釈し、-78℃~0℃で飽和炭酸水素ナトリウム溶液を添加して水層のpHを7超に調節した。次に、水層をジクロロメタン(3×5.00mL)で抽出した。合わせた有機成分を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、ジクロロメタン/メタノール=10/1)で精製し、混合物を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:30%~60%、3分)で精製し、さらに、分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%-50%、10分)で精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、1-[4-[7-(2-フルオロ-3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(1.59mg、2.91μmol、1.63%収率、100%純度、FA)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 547.2[M+H]+。
実施例250
1-[4-[7-(5-クロロ-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:4-ブロモ-5-クロロ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール:4-ブロモ-5-クロロ-1H-インダゾール(100mg、432.0μmol)のDCM(3mL)中溶液に、TsOH・H
2O(8.22mg、43.2μmol)および3,4-ジヒドロ-2H-ピラン(72.7mg、864μmol、79.0μL)を加えた。混合物を20℃で2時間撹拌した。反応物を水(20mL)洗浄し、水層を酢酸エチル(20mL×2)で抽出した。合わせた有機成分をNa
2SO
4で乾燥し、真空下で溶媒を除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/酢酸エチル=10:1)で精製して、4-ブロモ-5-クロロ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(270mg、810μmol、93.8%収率)を白色固体として得た。ESI MS m/z 547.2[M+H]
+。
ステップB:tert-ブチル-4-[7-(5-クロロ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(123mg、284.4μmol)、4-ブロモ-5-クロロ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(135mg、427μmol)、Pd2(dba)3(26.0mg、28.4μmol)、RuPhos(20.0mg、42.9μmol)およびCs2CO3(278mg、853μmol)のジオキサン(10mL)中混合物を、脱気し、N2でパージし、次いで、混合物をN2雰囲気下、100℃で12時間撹拌した。水(20mL)を添加することにより反応物をクエンチした。混合物を酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機成分をNa2SO4で乾燥し、真空下で溶媒を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=10/1)で精製して、tert-ブチル-4-[7-(5-クロロ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130.0mg、188.4μmol、66.3%収率)を白色固体として得た。ESI MS m/z 668.2[M+H]+。
ステップC:7-(5-クロロ-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン:tert-ブチル 4-[7-(5-クロロ-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(50.0mg、74.9μmol、1当量)のDCM(2mL)中溶液に、TFA(1.95mL)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去して、7-(5-クロロ-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(40.0mg、粗製、2TFA)を黄色油として得て、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。ESI MS m/z 483.4[M+H]+。
ステップD:1-[4-[7-(5-クロロ-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン:7-(5-クロロ-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(40.0mg、2TFA)およびDIEA(50mg、387μmol、67.4μL)のDCM(3mL)中溶液に、アクリル酸無水物(9.0mg、71.4μmol)をN2雰囲気下で滴加した。混合物を-70℃で15分間撹拌した。水(10mL)を添加することにより反応物をクエンチした。混合物を酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、真空下で溶媒を除去した。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%-37%、10分)で精製し、凍結乾燥して、1-[4-[7-(5-クロロ-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(11.9mg、20.8μmol、2ステップで27.3%収率、100%e.e.)を黄色固体として得た。ESI MS m/z 537.2[M+H]+。
実施例251
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:マイクロ波チューブ中で、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.362mmol)をジオキサン(181μl、0.362mmol)に溶解し、炭酸セシウム(236mg、0.723mmol)、および(S)-tert-ブチル 2-(ヒドロキシメチル)-2-メチルピロリジン-1-カルボキシレート(389mg、1.81mmol)で処理した。次いで、チューブをキャッピングし、90℃に2時間加熱した。LC/MSにより反応の完了が示された。反応混合物を、室温に冷却し、GF/F濾紙を通して濾過した。濾液を減圧下で濃縮し、CombiFlash(0%~10%、DCM:MeOH)でクロマトグラフ処理した。不純物を含まない生成物を含有する全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(264mg、0.361mmol、99.7%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 732.4[M+H]
+。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(264mg、0.361mmol)を、ジクロロメタン(3607μL、0.361mmol)に溶解し、TFA(556μL、7.21mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。LC/MSにより反応の完了が示された。反応物を、減圧下で濃縮し、飽和重炭酸塩で処理した。水層をDCM(2×)で抽出し、合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥させ、減圧下で濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、0.332mmol、92.2%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 632.3[M+H]
+。
ステップC:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(105mg、0.1662mmol)を、ギ酸(94.05μL、2.493mmol)に溶解し、ホルムアルデヒド(1868μl、24.93mmol)で処理した。反応混合物を85℃で1時間撹拌した。LC/MSにより反応の完了が示された。反応物を室温に冷却し、飽和重炭酸塩で処理して、混合物をDCM(2×)で抽出し、有機成分を合わせ、Na
2SO
4上で乾燥した。合わせた有機成分を減圧下で濃縮し、CombiFlash(0%~10%、DCM:MeOH)でクロマトグラフ処理した。不純物を含まない生成物を含む全画分を合わせ、減圧下で濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(75mg、0.1161mmol、69.88%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 646.4[M+H]
+。
ステップD:2-(4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(117mg、0.181mmol)のEtOH(1812μl、0.181mmol)およびTHF(1812μl、0.181mmol)中溶液を、N2で5分間パージした。この溶液に、パラジウム(96.4mg、0.0453mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、すぐにキャッピングして、N2でさらに5分間パージした。次いで、溶液をH2雰囲気下で1時間撹拌した。LC/MSにより不純物のない目的の生成物であることが示された。混合物をMeOHで希釈し、充填セライト通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、2-(4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(88mg、0.172mmol、94.9%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 512.3[M+H]+。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(88mg、0.17mmol)の周囲温度のジクロロメタン(1720μl、0.17mmol)中の懸濁液に、塩化アクリロイル(14μl、0.17mmol)、続けて、ヒューニッヒ塩基(60μl、0.34mmol)を加えた。次いで、反応物を周囲温度で30分間撹拌した。LC/MSにより反応の完了が示された。反応混合物を、減圧下で濃縮した。濃縮物を60:40のACN:H2O混合物中に再懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%ACNを溶出液として使用して、Gilson(分取HPLC)で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩を用いて塩基を遊離させて、有機成分をDCMで抽出した。有機成分をMgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(14mg、0.025mmol、14%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 566.3[M+H]+。
実施例252
tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップA:(S)-ピロリジン-2-イルメタノール:(S)-tert-ブチル 2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2g、9.94mmol)のCH2Cl2(40mL)中溶液に、HCL(ジオキサン中4M、49.69mL)を窒素雰囲気下、0℃で加えた。15℃で30分間撹拌後、混合物を真空下で濃縮した。(S)-ピロリジン-2-イルメタノール(1.37g、9.96mmol、100%収率、HCl)を黄色固体として得た。
ステップB:[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メタノール:[(2S)-ピロリジン-2-イル]メタノール(750mg、7.41mmol、724μL)およびアセトン(4.31g、74.2mmol、5.46mL)のMeOH(20mL)中混合物を、Pd/C(100mg、7.41mmol、10%純度)を用いて、H2(30psi)下、15℃で3時間水素添加した。混合物を濾過し、真空下で濃縮した。[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メタノール(0.821g、5.73mmol、77.3%収率)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=3.54(dd,J=4.0,10.8Hz,1H),3.40-3.35(m,1H),2.99-2.86(m,3H),2.60-2.50(m,1H),1.94-1.82(m,1H),1.82-1.66(m,3H),1.15(d,J=6.4Hz,3H),1.08(d,J=6.4Hz,3H)。
ステップC:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、549μmol)および[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メタノール(157mg、1.10mmol)のTHF(5ml)中混合物に、t-BuONa(158mg、1.65mmol)を加えた。20℃で0.5時間撹拌後、溶液温度を0℃に保持しながら、HCl(1M)で反応混合物をpH=7に中和し、次いで、混合物を減圧下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%TFA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3水溶液で中和し、酢酸エチル(200mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(174mg、278μmol、50.7%収率、100%純度)を黄色油として得た。ESI MS m/z 626.2[M+H]+。
ステップD:2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(174mg、278μmol)のCH2Cl2(5mL)中溶液に、TFA(7.70g、67.5mmol、5.00mL)を窒素雰囲気下、0℃で加えた。15℃で0.5時間撹拌後、混合物を真空下で濃縮した。2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(178mg、粗製、TFA)を黄色油として得た。ESI MS m/z 526.1[M+H]+。
ステップE:2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル:2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(178mg、粗製、TFA塩)およびDIEA(360mg、2.78mmol、485μL)のCH2Cl2(5mL)中混合物に、0℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(28.1mg、223μmol)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。0℃でNaHCO3飽和溶液(5mL)により反応混合物をクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN]B%:27%~54%、10分)により精製した。2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(11.7mg、18.3μmol、2ステップで6.58%収率、97.9%純度、FA)を褐色固体として得た。ESI MS m/z 580.2[M+H]+。
実施例253
2-(1-アクリロイル-4-(7-(7-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:(7-クロロ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート:7-クロロテトラリン-1-オン(2g、11.1mmol、1当量)およびDIEA(4.29g、33.2mmol、5.79ml)のDCM(35mL)中混合物に、Tf2O(4.69g、16.6mmol、2.74mL)を、N2下、0℃で1度に加えた。混合物を25℃で5時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=200/1→50/1)で精製した。(7-クロロ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(2.25g、7.02mmol、63.4%収率、97.6%純度)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.32(d,J=2.0Hz,1H),7.24(dd,J=2.0,8.0Hz,1H),7.12(d,J=8.0Hz,1H),6.10(t,J=4.8Hz,1H),2.88-2.80(m,2H),2.53(dt,J=4.8,8.0Hz,2H)。
ステップB:(7-クロロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート:(7-メチル-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロ メタンスルホネート(1.57g、5.02mmol)のジオキサン(35mL)中混合物に、DDQ(2.28g、10.0mmol)をN2下で1度に加えた。混合物を25℃で30分間撹拌し、次いで、105℃に加熱し、5時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して1,4-ジオキサンを除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=200/1→50/1)で精製した。(7-クロロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.24g、3.94mmol、78.5%収率、98.7%純度)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.05(d,J=2.0Hz,1H),7.87-7.83(m,2H),7.57-7.47(m,3H)。
実施例210ステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに、(7-クロロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネートを使用し、またステップGで塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 586.1[M+H]+。
実施例254
2-[4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
実施例210ステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに、1-ブロモ-5-フルオロナフタレンを使用し、ステップGで塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 570.3[M+H]+.
実施例255
2-[4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:(7-メトキシ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート:7-メトキシテトラリン-1-オン(1g、5.67mmol)およびDIEA(2.20g、17.0mmol、2.97mL)のDCM(15mL)中溶液に、Tf2O(2.40g、8.51mmol、1.40mL)を滴加し、次いで、混合物を20℃で12時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 1:0→100:1)で精製して、(7-メトキシ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(1.7g、5.24mmol、92.3%収率、95.0%純度)を黄色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.06(d,J=8.4Hz,1H),6.75(dd,J=2.4,8.4Hz,1H),6.66(d,J=2.4Hz,1H),6.45(s,1H),3.80(s,3H),3.04-2.96(m,2H),2.68(t,J=8.4Hz,2H)。
ステップ2:(7-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート:(7-メトキシ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(1.7g、5.51mmol)およびDDQ(2.50g、11.0mmol)のジオキサン(30mL)中混合物を、105℃で12時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 1:0→50:1)で精製して、(7-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.41g、4.14mmol、75.1%収率、90.0%純度)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.84(d,J=9.2Hz,1H),7.78(d,J=8.8Hz,1H),7.65(d,J=2.4Hz,1H),7.24-7.21(m,2H),7.15(d,J=2.4Hz,1H),3.94(s,3H)。
実施例210ステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに(7-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネートを使用し、ステップGで塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 582.4[M+H]+。
実施例256
1-(2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(メトキシメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.715g、3.10mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(3ml)中の溶液を、撹拌しながら氷浴で冷却し、固体のベンジル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.00g、2.96mmol)を少しずつ加え、続けて、DIPEA(0.57mL、3.25mmol、1.1当量)を加えた。得られた溶液を1時間かけて室温まで温め、次いで、水(15mL)とMTBE(50mL)との間で分配した。有機層を水(2×10mL)、ブライン(10mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥して、減圧下で留去し、黄色固体(1.54g、98%)を得た。ES+APCI MS m/z 532.3,[M+H]
+。
ステップB:ベンジル 4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(メトキシメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:粗製のベンジル 4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(メトキシメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(500mg、0.940mmol)、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(216mg、1.88mmol)、Cs
2CO
3(612mg、1.88mmol)、およびジオキサン(0.5mL)の混合物を、窒素でフラッシングした。バイアルをキャッピングし、120℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、有機層を水とブライン(それぞれ5mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去した。化合物を、4~10%MeOH/DCM+0.2%NH
4OHで溶出するシリカゲルクロマトグラフィー、RediSep 40gで精製して、黄色固体(197mg、34%)を得た。ES+APCI MS m/z 611.4[M+H]
+。
ステップC:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(メトキシメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(197mg、0.323mmol)、メタノール(10mL)およびパラジウム炭素(10mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を、脱気し、水素雰囲気(バルーン)下で1時間撹拌した。反応混合物をセライト(2mL)を通して濾過し、MeOH(3×3mL)で洗浄し、減圧下で留去し、減圧下および高真空下でトルエンと共に蒸発させて乾燥して、無色固体(150mg、98%)を得た。ES+APCI MS m/z 477.2[M+H]
+。
ステップD:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド-[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、0.315mmol)、Cs
2CO
3(308mg、0.944mmol)、ジオキサン(1mL)、1-ヨードナフタレン(0.0689ml、0.472mmol)およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2-アミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(26.3mg、0.0315mmol)(Ruphos Pd G3)の混合物を、窒素でパージし、フラスコをキャッピングして、70℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(15mL)と水(5mL)との間で分配し、有機層を水およびブライン(それぞれ5mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で留去した。化合物を、4~10%MeOH+0.5%NH
4OHを溶出液として使用するシリカゲルクロマトグラフィー、RediSep 40gで精製して、無色固体、131mgを得た。ES+APCI MS m/z 603.3[M+H]
+。
ステップE:1-(2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、0.2157mmol)をDCM中1Mのトリフルオロ酢酸に溶解し、得られた溶液を室温で1時間放置した。反応混合物を2MのNa2CO3(5mL)とDCM(15mL)との間で分配し、有機層を減圧下留去した。固体残留物をDCM(5mL)に溶解し、撹拌しながら氷-EtOH-CO2浴上で-30℃に冷却し、トリエチルアミン(0.09ml、0.64mmol)を加え、続けて、塩化アクリロイル(0.035ml、0.43mmol)を加えた。-30℃で1分後、反応混合物をNH4OH(0.05mL)でクエンチし、減圧下留去し、高真空下で乾燥した。残留物をDCM(5mL)に溶解し、綿プラグを通して濾過し、5~10%MeOH/DCM+0.25%NH4OHで溶出するシリカゲルクロマトグラフィー(RediSep 40g)により精製し、無色固体(19.6mg、16%)を得た。ES+APCI MS m/z 557.3,[M+H]+。
実施例257
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:コニカルボトムバイアル中で、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.362mmol)のジオキサン(3616μL、0.362mmol)中溶液を、アルゴンで5分間スパージした。(S)-(1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メタノール(168mg、1.08mmol)、Cs
2CO
3(353mg、1.08mmol)、Rhuphos Pd G3(30.2mg、0.0362mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で1時間加熱した。LC/MSにより反応の完了が示された。EtOAcを加えて、ブライン(2×)で洗浄した。合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。濃縮物を、0~20%DCM/MeOH+2%NH
4OHで溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。不純物を含まない目的の生成物を含む全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(90mg、0.134mmol、37.0%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 672.4[M+H]
+。
ステップB:2-(4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(90mg、0.13mmol)のEtOH(1340μL、0.13mmol)およびTHF(1340μL、0.13mmol)中溶液を、N
2で5分間パージした。この溶液に、パラジウム(36mg、0.033mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)を加え、すぐにキャッピングして、N
2でさらに5分間パージした。次いで、真空に続く、バルーン圧により導入したH
2下で溶液を撹拌した。次いで、混合物を周囲温度で1時間撹拌した。LC/MSにより目的の生成物であることが示された。混合物をMeOHで希釈し、充填セライト通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、2-(4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(71mg、0.13mmol、99%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 538.3[M+H]
+。
ステップC:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(71mg、0.132mmol)のジクロロメタン(1320μl、0.132mmol)中の懸濁液に、周囲温度で、塩化アクリロイル(10.7μl、0.132mmol)、続けて、ヒューニッヒ塩基(46.1μl、0.264mmol)を加えた。次いで、反応物を周囲温度で1時間撹拌した。LC/MSにより反応の完了が示された。反応混合物を、減圧下で濃縮した。濃縮物を60:40のACN:H2O混合物中に再懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%ACNで溶出するGilson(分取HPLC)で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩を用いて塩基を遊離させて、有機成分をDCMで抽出した。有機成分をMgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(15.7mg、0.0265mmol、20.1%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 592.4[M+H]+。
実施例258
2-[4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
実施例210のステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに、1-ブロモイソキノリンを使用し、ステップGで塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 553.3[M+H]+。
実施例259
2-[4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:(6-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート:6-フルオロナフタレン-1-オール(0.10g、617μmol)およびDIEA(159mg、1.23mmol、215μL)のジクロロメタン(3mL)中溶液に、トリフルオロメチルスルホニル トリフルオロメタンスルホネート(191mg、678μmol、112μL)を0℃で加えた。0℃で1時間の撹拌後、混合物を水(5mL)で希釈し、ジクロロメタン(3×5ml)で抽出した。有機層をブライン(1×5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1)で精製して、(6-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(0.17g、543μmol、88.1%収率)を無色油として得た。1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.10(dd,J=5.2,8.8Hz,1H),7.83(d,J=8.4Hz,1H),7.58-7.50(m,2H),7.48-7.40(m,2H)。
実施例210ステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに(6-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネートを使用し、ステップGで塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 570.3[M+H]+。
実施例260
2-[4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
実施例210ステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに4-ブロモイソキノリンを使用し、ステップGで塩化アクリロイルの代わりに、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 553.1[M+H]+。
実施例261
2-[1-(2-メチルプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
実施例210ステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモナフタレンを使用し、またステップGで塩化アクリロイルの代わりに、2-メチルプロパ-2-エノイルクロリドを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 566.4[M+H]+。
実施例262
2-[4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
実施例210ステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに5-ブロモイソキノリンを使用し、ステップGで塩化アクリロイルの代わりに、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 553.4[M+H]+。
実施例263
2-[1-[(E)-ブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
実施例210ステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに、1-ブロモナフタレンを使用し、ステップGで塩化アクリロイルの代わりに(E)-ブタ-2-エノイルクロリドを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 566.4[M+H]+。
実施例264
2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
実施例210のステップE~Gと同様にして、ステップEで1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに、5-ブロモイソキノリンを使用し、またステップGで塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して標記化合物を調製した。ESI MS m/z 553.4[M+H]+。
実施例265
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 584.3[M+H]+。
実施例266
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例147のステップF~Jに従って、ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(S)-(1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル)メタノールを使用して標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 596.3[M+H]+。
実施例267
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例234に従って、ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(R)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 552.3[M+H]+。
実施例268
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-メトキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例220(ステップC~G)に従って、ステップCで、(2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-フルオロ-2-ヒドロキシメチルピロリジンの代わりにtert-ブチル(2S,4R)-2-(ヒドロキシメチル)-4-メトキシピロリジン-1-カルボキシレートを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 582.3[M+H]+。
実施例269
2-(1-アクリロイル-4-(2-(2-(ジメチルアミノ)-2-メチルプロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例147に従って、ステップFで、(S)-(1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに2-ジメチルアミノ-2-メチル-1-プロパノールを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 554.4[M+H]+。
実施例270
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例147のステップF~Jに従って、ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(R)-N-Boc-2-ヒドロキシメチルモルホリンを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 568.3[M+H]+。
実施例271
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例147のステップF~Jに従って、ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(S)-N-Boc-2-ヒドロキシメチルモルホリンを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 568.3[M+H]+。
実施例272
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例147のステップF~Jに従って、ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりにtert-ブチル(R)-3-(ヒドロキシメチル)モルホリン-4-カルボキシレートを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 568.3[M+H]+。
実施例273
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例147のステップF~Jに従って、ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりにtert-ブチル (S)-3-(ヒドロキシメチル)モルホリン-4-カルボキシレートを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 568.3[M+H]+。
実施例274
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例234のステップG~Jに従って、ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(R)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールを使用し、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 588.3[M+H]+。
実施例275
2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-フルオロ-6-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモナフタレンの代わりに2-ブロモ-1-フルオロ-3-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 588.3[M+H]+。
実施例276
2-(1-アクリロイル-4-(7-(4-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-4-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して、標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 588.3[M+H]+。
実施例277
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gに従って、ステップEで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用し、ステップFで、EtOH/THFの代わりにTHFを使用して標記化合物を合成した。ES+APCI MS m/z 604.3[M+H]+。
実施例278
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(キノリン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210のステップE~Gと同様にして、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに4-ブロモイソキノリンを使用し、またステップGで、塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して、標記化合物を調製した。
実施例279
2-(1-アクリロイル-4-(2-(2-(ジメチルアミノ)エトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210と同様にして、ステップCで、[(2S)-1-エチル-2-ピロリジニル]メタノールの代わりにN,N-ジメチルエタノールアミンを使用し、ステップGで、塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して、標記化合物を調製した。
実施例280
2-(4-(2-(3-((1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-アクリロイルピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210と同様にして、ステップCで、[(2S)-1-エチル-2-ピロリジニル]メタノールの代わりに3-((1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オールを使用し、またステップGで、塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して、標記化合物を調製した。
実施例281
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210と同様にして、ステップCで、[(2S)-1-エチル-2-ピロリジニル]メタノールの代わりに(R)-(1-メチルピロリジン-3-イル)メタノールを使用し、ステップGで、塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して、標記化合物を調製した。
実施例282
2-(1-(3-メチルブタ-2-エノイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210と同様にして、ステップEで、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモナフタレンを使用し、ステップGで塩化アクリロイルの代わりに3-メチルブタ-2-エノイルクロリドを使用して、標記化合物を調製した。
実施例283
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210と同様にして、ステップCで、[(2S)-1-エチル-2-ピロリジニル]メタノールの代わりに[(2R)-1-エチル-2-ピロリジニル]メタノールを使用し、またステップGで、塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して、標記化合物を調製した。
実施例284
2-(1-アクリロイル-4-(2-(2-(ジエチルアミノ)エトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例210と同様にして、ステップCで、[(2S)-1-エチル-2-ピロリジニル]メタノールの代わりにN,N-ジメチルエタノールアミンを使用し、ステップGで、塩化アクリロイルの代わりにプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートを使用して、標記化合物を調製した。
実施例285
tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップ1:(S)-ピロリジン-2-イルメタノール。(S)-tert-ブチル 2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2g、9.94mmol、1当量)のCH2Cl2(40mL)中溶液に、HCl(ジオキサン中4M、49.69mL、20当量)を窒素雰囲気下、0℃で加えた。15℃にて30分間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。化合物である(S)-ピロリジン-2-イルメタノール(1.37g、9.96mmol、100%収率、HCl)を黄色固体として得た。
ステップ2:[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メタノール。[(2S)-ピロリジン-2-イル]メタノール(750mg、7.41mmol、724μL、1当量)およびアセトン(4.31g、74.2mmol、5.46mL、10当量)のMeOH(20mL)中混合物を、Pd/C(100mg、7.41mmol、10%純度、1当量)を触媒として用いて、H2(30psi)下、15℃で3時間水素添加した。混合物を濾過し、真空下で濃縮した。化合物である[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メタノール(0.821g、5.73mmol、77.3%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=3.54(dd,J=4.0,10.8Hz,1H),3.40-3.35(m,1H),2.99-2.86(m,3H),2.60-2.50(m,1H),1.94-1.82(m,1H),1.82-1.66(m,3H),1.15(d,J=6.4Hz,3H),1.08(d,J=6.4Hz,3H)。
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、549μmol、1当量)および[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メタノール(157mg、1.10mmol、2当量)のTHF(5ml)中混合物に、t-BuONa(158mg、1.65mmol、3当量)を加えた。20℃で0.5時間撹拌後、HCl(1モル/L)で反応混合物を0℃でpH=7に中和し、次いで、混合物を減圧下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%TFA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3水溶液で中和し、酢酸エチル(200mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(174mg、278μmol、50.7%収率、100%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:626。
ステップB:2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(174mg、278μmol、1当量)のCH2Cl2(5mL)中溶液に、TFA(7.70g、67.5mmol、5.00mL、243当量)を窒素雰囲気下、0℃で加えた。15℃で0.5時間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(178mg、粗製、TFA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:526。
ステップC:2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(178mg、粗製、TFA)およびDIEA(360mg、2.78mmol、485μL)のCH2Cl2(5mL)中混合物に、0℃で、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(28.1mg、223μmol)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。0℃でNaHCO3飽和溶液(5mL)により反応混合物をクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN]B%:27%~54%、10分)により精製した。標記化合物である2-[4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(11.7mg、18.3μmol、2ステップで6.58%収率、97.9%純度、FA)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:580。
1H NMR(400MHz,酢酸-d4)δ=8.28-8.19(m,1H),8.08(s,1H),7.91-7.83(m,1H),7.63(d,J=8.4Hz,1H),7.56-7.47(m,2H),7.44(t,J=7.6Hz,1H),7.20(d,J=7.2Hz,1H),6.94-6.71(m,1H),6.38(br d,J=16.8Hz,1H),5.87(br d,J=10.4Hz,1H),5.15(br s,1H),4.92-4.54(m,4H),4.42(br d,J=12.0Hz,1H),4.34(br s,2H),4.13(br s,2H),3.95(br s,1H),3.85-3.21(m,7H),3.20-2.84(m,3H),2.42-2.25(m,1H),2.24-2.07(m,3H),1.43(d,J=6.4Hz,3H),1.39(d,J=6.4Hz,3H)。
実施例286
2-(1-アクリロイル-4-(7-(7-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップ1:(7-クロロ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート。7-クロロテトラリン-1-オン(2g、11.1mmol、1当量)およびDIEA(4.29g、33.2mmol、5.79ml、3当量)のDCM(35mL)中混合物に、Tf2O(4.69g、16.6mmol、2.74mL、1.5当量)を、N2下、0℃で1度に加えた。混合物を25℃で5時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=200/1→50/1)で精製した。化合物である(7-クロロ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(2.25g、7.02mmol、63.4%収率、97.6%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.32(d,J=2.0Hz,1H),7.24(dd,J=2.0,8.0Hz,1H),7.12(d,J=8.0Hz,1H),6.10(t,J=4.8Hz,1H),2.88-2.80(m,2H),2.53(dt,J=4.8,8.0Hz,2H)。
ステップ2:(7-クロロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。(7-クロロメチル-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(1.57g、5.02mmol、1当量)のジオキサン(35mL)中混合物に、DDQ(2.28g、10.0mmol、2当量)をN2下で1度に加えた。混合物を25℃で30分間撹拌し、次いで、105℃に加熱し、5時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して1,4-ジオキサンを除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=200/1→50/1)で精製した。化合物である(7-クロロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.24g、3.94mmol、78.5%収率、98.7%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.05(d,J=2.0Hz,1H),7.87-7.83(m,2H),7.57-7.47(m,3H)。
ステップA:tert-ブチル 4-[7-(7-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、424μmol、1当量)および(7-クロロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(264mg、848μmol、2当量)のトルエン(20mL)中混合物に、Pd2(dba)3(38.8mg、42.4μmol、0.1当量)、RuPhos(39.6mg、84.8μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(414mg、1.27mmol、3当量)をN2下で加えた。混合物を110℃に加熱し、5時間撹拌した。混合物を、水(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(3×15.0mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%TFA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液で中和し、酢酸エチル(1×30mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル 4-[7-(7-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、316μmol、74.6%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:632。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.20(d,J=2.0Hz,1H),7.80(d,J=8.8Hz,1H),7.59(d,J=8.2Hz,1H),7.48-7.38(m,2H),7.18(d,J=7.2Hz,1H),4.63(br s,1H),4.43(br dd,J=4.8,10.3Hz,1H),4.29-4.16(m,3H),4.09-3.89(m,2H),3.42(br s,1H),3.35-3.20(m,3H),3.17-2.65(m,7H),2.52(s,3H),2.33(br d,J=7.6Hz,1H),2.14-2.06(m,1H),1.88-1.71(m,4H)。
ステップB:2-[4-[7-(7-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 4-[7-(7-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、316μmol、1当量)のDCM(2.5mL)中混合物に、TFA(541mg、4.75mmol、351μL、15当量)をN2下、0℃で一度に加えた。次いで、混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮した。化合物である2-[4-[7-(7-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(204mg、316μmol、99.8%収率、TFA)を、褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:532。
ステップC:2-[4-[7-(7-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(7-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(204mg、316μmol、1当量、TFA)およびTEA(160mg、1.58mmol、220μL、5当量)のDCM(1.5mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(39.8mg、316μmol、1当量)を0℃で1度に加えた。25℃で1時間撹拌後、反応混合物を飽和NaHCO3溶液(1mL)で0℃でクエンチし、次いで、水(2mL)で希釈し、DCM(5mL×3)で抽出した。合わせた有機層を、水(5mL×1)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を、分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150×30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:30%~54%、10分)により精製した。標記化合物である2-[4-[7-(7-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(36.0mg、56.1μmol、17.8%収率、98.7%純度、FA)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:586。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.42(br s,1H),8.19(d,J=1.6Hz,1H),7.80(d,J=8.8Hz,1H),7.60(d,J=8.0Hz,1H),7.47-7.41(m,2H),7.19(d,J=7.2Hz,1H),6.61(br s,1H),6.40(br d,J=16.8Hz,1H),5.84(br d,J=10.8Hz,1H),5.08(br s,1H),4.91-4.75(m,2H),4.48(td,J=4.4,12.0Hz,1H),4.23(br s,3H),4.07(br d,J=11.2Hz,1H),3.82-3.58(m,2H),3.56-3.08(m,6H),3.08-2.92(m,2H),2.89(d,J=1.6Hz,3H),2.85-2.70(m,2H),2.28(qd,J=8.4,12.5Hz,1H),2.22-2.11(m,1H),2.11-1.94(m,2H)。
実施例287
2-[4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、424μmol、1.30当量)および1-ブロモ-5-フルオロ-ナフタレン(73.4mg、326μmol、1.0当量)のトルエン(5.0mL)中溶液に、Cs2CO3(319mg、979μmol、3.0当量)、Pd2(dba)3(29.9mg、32.6μmol、0.10当量)、およびRuPhos(22.8mg、48.9μmol、0.15当量)を加えた。混合物を110℃で12時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮してトルエンを除去した。残留物をH2O(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(10.0mL*3)で抽出した。合わせた有機層をH2O(10.0mL)で洗浄し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を、逆相フラッシュ[水(0.100%ギ酸)/アセトニトリル]により精製した。化合物であるtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、211μmol、64.5%収率)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
ステップB:2-[4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、211μmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、TFA(3.08g、27.0mmol、2.00mL、128当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、25℃で1時間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去した。化合物である2-[4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、粗製)を黄色油として得た。この粗生成物を、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:517。
ステップC:2-[4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、TFA)のDCM(3.0mL)中溶液に、Et3N(200mg、1.98mmol、275μL)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(40.0mg、317のμmol)を0℃で加えた。混合物を20℃で2時間撹拌した。反応物を水(10.0mL)で洗浄した。粗製混合物を酢酸エチル(20.0mL*3)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:26%~53%、10分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[4-[7-(5-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(48.4mg、82.6μmol、2ステップで40.0%収率、FA)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.41(s,1H),7.91(d,J=7.6Hz,1H),7.80(d,J=8.4Hz,1H),7.42(t,J=7.8Hz,1H),7.38-7.32(m,1H),7.13-7.07(m,2H),6.54-6.52(m,1H),6.33(m,1H),5.76(d,J=10.4Hz,1H),5.10-4.98(br,4H),4.74-4.69(m,1H),4.41-4.36(m,1H),4.16(m,3H),3.99(d,J=12.0Hz,1H),3.61-3.60(m,1H),3.14-3.29(m,4H),3.11(br,2H),2.92-2.85(m,1H),2.78(s,3H),2.74-2.67(m,2H),2.21-2.16(m,1H),2.09-2.04(m,1H),1.98-1.91(m,2H)。
実施例288
2-[4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:(7-メトキシ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート。7-メトキシテトラリン-1-オン(1g、5.67mmol、1当量)、DIEA(2.20g、17.0mmol、2.97mL、3当量)のDCM(15mL)中溶液に、Tf2O(2.40g、8.51mmol、1.40mL、1.5当量)を滴加し、次いで、混合物を20℃で12時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 1:0→100:1)で精製して、(7-メトキシ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(1.7g、5.24mmol、92.3%収率、95.0%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.06(d,J=8.4Hz,1H),6.75(dd,J=2.4,8.4Hz,1H),6.66(d,J=2.4Hz,1H),6.45(s,1H),3.80(s,3H),3.04-2.96(m,2H),2.68(t,J=8.4Hz,2H)。
ステップ2:(7-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。(7-メトキシ-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(1.7g、5.51mmol、1当量)およびDDQ(2.50g、11.0mmol、2当量)のジオキサン(30mL)中混合物を、105℃で12時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 1:0→50:1)で精製して、(7-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.41g、4.14mmol、75.1%収率、90.0%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.84(d,J=9.2Hz,1H),7.78(d,J=8.8Hz,1H),7.65(d,J=2.4Hz,1H),7.24-7.21(m,2H),7.15(d,J=2.4Hz,1H),3.94(s,3H)。
ステップA:tert-ブチル2-(シアノメチル)-4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、200mg、424μmol、1当量)、(7-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(260mg、848μmol、2当量)、RuPhos(39.6mg、84.8μmol、0.2当量)、Cs2CO3(414mg、1.27mmol、3当量)のトルエン(6mL)中溶液に、Pd2(dba)3(38.8mg、42.4μmol、0.1当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、90℃で12時間撹拌した。水(5mL)を混合物に加えた。得られた混合物をEtOAc(5mL)で希釈し、EtOAc(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=34%)で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、151μmol、35.7%収率、95.0%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:628。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=7.69(d,J=9.2Hz,1H),7.63(d,J=8.8Hz,1H),7.17(dd,J=2.4,9.2Hz,1H),7.09(d,J=2.0Hz,1H),7.03(d,J=2.4Hz,1H),6.96(dd,J=2.4,8.8Hz,1H),4.61(br s,1H),4.52-4.30(m,3H),4.20(ddd,J=3.2,6.8,10.4Hz,1H),4.02(br d,J=13.6Hz,2H),3.92(s,3H),3.87(br d,J=13.2Hz,1H),3.76-3.68(m,1H),3.55-3.43(m,1H),3.25(br dd,J=3.6,13.6Hz,2H),3.12(br t,J=7.6Hz,1H),3.05-2.94(m,1H),2.92-2.77(m,3H),2.76-2.65(m,2H),2.51(s,3H),2.35-2.26(m,1H),2.14-2.06(m,1H),1.92-1.74(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、159μmol、1当量)およびTFA(363mg、3.19mmol、236μL、20当量)の混合物を、18℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、粗製、2TFA)を褐色油として得た。
ステップC:2-[4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、159μmol、1当量、2TFA)、DIEA(205mg、1.59mmol、276μL、10当量)のDCM(2.5mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(24.0mg、190μmol、1.2当量)を0℃で加え、18℃で1時間撹拌した。水(5mL)を混合物に加えた。得られた混合物をDCM(3×5mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、10分)により精製して、標記化合物を2-[4-[7-(7-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(10.6mg、17.8μmol、2ステップで11.2%収率、97.6%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:582。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(d,J=8.8Hz,z,1H),7.63(d,J=8.8Hz,1H),7.17(dd,J=2.4,8.8Hz,1H),7.09(d,J=2.0Hz,1H),7.03(d,J=2.4Hz,1H),6.97(dd,J=2.4,8.8Hz,1H),6.57(br d,J=10.4Hz,1H),6.43-6.36(m,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.09(br s,1H),4.52-4.31(m,3H),4.25-4.15(m,1H),4.08(br d,J=12.4Hz,1H),3.96(br s,1H),3.92(s,3H),3.72(br d,J=12.4Hz,1H),3.54(br d,J=5.6Hz,2H),3.30(br d,J=12.4Hz,1H),3.22-2.95(m,3H),2.93(br d,J=8.4Hz,1H),2.86(br d,J=4.8Hz,2H),2.79-2.65(m,1H),2.51(s,3H),2.36-2.26(m,1H),2.16-2.02(m,1H),1.91-1.67(m,4H)。
実施例289
2-[4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、424μmol、1.00当量)、1-ブロモイソキノリン(132mg、636μmol、1.50当量)、およびDIEA(109mg、848μmol、148μL、2.00当量)のDMSO(4.00mL)中混合物を、110℃で3時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(3×5.00mL)で抽出した。有機層をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和炭酸水素ナトリウム溶液(6.00mL)でpH>7に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄済し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.15g、233μmol、54.9%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:599。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.17-8.11(m,2H),7.78(d,J=8.0Hz,1H),7.64(t,J=7.2Hz,1H),7.57-7.51(m,1H),7.28(s,1H),4.69-4.55(m,3H),4.42-4.35(m,1H),4.15-4.01(m,3H),3.96-3.81(m,2H),3.57(ddd,J=4.0,8.0,16.8Hz,1H),3.27(dd,J=4.0,13.6Hz,1H),3.18-3.16(m,1H),3.16-2.95(m,3H),2.91-2.73(m,3H),2.70-2.62(m,1H),2.48(s,3H),2.34-2.24(m,1H),2.07-2.01(m,1H),1.91-1.73(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.15g、250.53μmol、1.00当量)およびTFA(428mg、3.76mmol、278μL、15.0当量)のジクロロメタン(0.40mL)中混合物を、15℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(153mg、粗製、TFA)を黒色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:499。
ステップC:2-[4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(153mg、粗製、TFA)およびTEA(253mg、2.50mmol、348μL)のジクロロメタン(4.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(31.5mg、250μmol)を0℃で加え、次いで、15℃で1時間撹拌した。混合物を飽和炭酸水素ナトリウム溶液(1.00mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を、分取HPLCカラム:(Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%、FA)-ACN];B%:10%~24%(7分))および(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%、FA)-ACN];B%:10%~24%(7分))により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[4-[7-(1-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(31.2mg、52.1μmol、2ステップで20.9%収率、FA)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:553。
1H NMR(400MHz,酢酸)δ=8.44(d,J=8.4Hz,1H),8.04-7.95(m,2H),7.89(d,J=6.4Hz,1H),7.82(br t,J=6.8Hz,1H),7.49(d,J=6.8Hz,1H),6.91-6.69(m,1H),6.37(br d,J=16.4Hz,1H),5.87(br d,J=9.2Hz,1H),5.10(br s,2H),4.78(br s,3H),4.53(br d,J=10.8Hz,1H),4.32(br d,J=12.8Hz,1H),4.13(br s,3H),3.90(br s,2H),3.79-3.40(m,3H),3.26(br s,3H),3.12(br s,3H),3.07-2.84(m,2H),2.45-2.34(m,1H),2.23-2.09(m,3H)。
実施例290
2-[4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:(6-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。6-フルオロナフタレン-1-オール(0.10g、617μmol、1.00当量)およびDIEA(159mg、1.23mmol、215μL、2.00当量)のジクロロメタン(3.00mL)中溶液に、トリフルオロメチルスルホニルトリフルオロメタンスルホネート(191mg、678μmol、112μL、1.10当量)を0℃で加えた。0℃で1時間撹拌後、混合物を水(5.00mL)で希釈し、ジクロロメタン(3×5.00mL)で抽出した。有機層をブライン(1×5.00mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1)により精製して、(6-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(0.17g、543μmol、88.1%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.10(dd,J=5.2,8.8Hz,1H),7.83(d,J=8.4Hz,1H),7.58-7.50(m,2H),7.48-7.40(m,2H)。
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、424μmol、1.00当量)、(6-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(150mg、509μmol、1.20当量)、RuPhos(39.6mg、84.8μmol、0.20当量)、Pd2(dba)3(38.8mg、42.4μmol、0.10当量)、およびCs2CO3(415mg、1.27mmol、3.00当量)のトルエン(2.00mL)中混合物を、N2下、110℃で3時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(3×5.00mL)で抽出した。有機層をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和炭酸水素ナトリウム溶液(5.00mL)でpH>7に調整し、次いで、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出し、有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、322μmol、75.8%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22(dd,J=5.6,9.2Hz,1H),7.57-7.52(m,1H),7.48-7.42(m,2H),7.29-7.24(m,1H)7.10(d,J=7.6Hz,1H),4.62(br s,1H),4.39(br dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.31-4.22(m,2H),4.14-4.00(m,3H),3.95 (br d,J = 12.8 Hz,1H),3.44(br s,1H),3.35-3.25(m,2H),3.23-2.90(m,4H),2.86-2.63(m,4H),2.49(s,3H),2.33-2.24(m,1H),2.13-2.00(m,1H) 1.89-1.74(m,3H),1.53(s,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、322μmol、1.00当量)およびTFA(556mg、4.87mmol、361μL、15.0当量)のジクロロメタン(0.40mL)中混合物を、15℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(205mg、粗製、TFA)を黒色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップC:2-[4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(205mg、粗製、TFA)およびTEA(328mg、3.24mmol、451μL)のジクロロメタン(4.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(40.9mg、324μmol)を0℃で加え、次いで、15℃で1時間撹拌する。混合物を飽和炭酸水素ナトリウム溶液(1.00mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%、FA)-ACN];B%:17%~44%、9分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[4-[7-(6-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(85.6mg、139μmol、42.8%収率、FA)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
1H NMR(400MHz,酢酸)δ=8.28(dd,J=5.6,9.2Hz,1H),7.60(d,J=8.0Hz,1H),7.55-7.45(m,2H),7.31(dt,J=2.4,8.8Hz,1H),7.18(d,J=7.2Hz,1H),6.94-6.68(m,1H),6.38(br d,J=16.8Hz,1H),5.87(br d,J=10.0Hz,1H),5.16(br s,1H),4.84(br s,2H),4.74-4.54(m,1H),4.42(br d,J=12.8Hz,1H),4.33(br s,2H),4.25-4.08(m,1H),3.92(br s,2H),3.81-3.47(m,3H),3.46-3.16(m,4H),3.11(br s,3H),3.08-2.87(m,3H),2.46-2.32(m,1H),2.25-2.11(m,3H)。
実施例291
2-[4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.15g、318μmol、1.00当量)、4-ブロモイソキノリン(99.3mg、477μmol、1.50当量)、RuPhos(29.7mg、63.6μmol、0.20当量)、Pd2(dba)3(29.1mg、31.8μmol、0.10当量)、およびCs2CO3(311mg、954μmol、3.00当量)のトルエン(5.00mL)中混合物を、N2下、110℃で3時間撹拌した。混合物を水(6.00mL)に希釈し、酢酸エチル(3×5.00mL)で抽出した。有機層をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.1%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和炭酸水素ナトリウム溶液(5.00mL)でpH>7に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.17g、273μmol、85.9%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:599。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.03(s,1H),8.26(s,1H),8.14(d,J=8.4Hz,1H),8.00(d,J=8.0Hz,1H),7.73(dt,J=1.2,7.2Hz,1H),7.67-7.60(m,1H),4.63(br s,1H),4.44-4.31(m,3H),4.15-4.03(m,2H),3.95(br d,J=12.8Hz,1H),3.59-3.49(m,1H),3.40(br d,J=7.2Hz,1H),3.34-3.19(m,2H),3.18-2.93(m,4H),2.90-2.79(m,2H),2.77-2.66(m,2H),2.50(s,3H),2.35-2.24(m,1H),2.10-2.02(m,1H),1.92-1.79(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.15g、251μmol、1.00当量)およびTFA(428mg、3.76mmol、278μL、15.0当量)のジクロロメタン(0.30mL)中混合物を、15℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(153mg、粗製、TFA)を黒色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:499。
ステップC:2-[4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(153mg、粗製、TFA)およびEt3N(254mg、2.51mmol、349μL)のジクロロメタン(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(31.6mg、251μmol)を-40℃で加えた。15℃で1時間撹拌後、混合物を飽和炭酸水素ナトリウム溶液(0.10mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/1)および分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%、FA)-ACN];B%:12%~36%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[4-[7-(4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(28.3g、43.4μmol、2ステップで17.3%収率、FA)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:553。
1H NMR(400MHz,酢酸)δ=9.45(s,1H),8.51-8.36(m,3H),8.17(br t,J=8.0Hz,1H),8.03-7.97(m,1H),6.92-6.67(m,1H),6.37(br d,J=16.0Hz,1H),5.87(br d,J=10.0Hz,1H),5.14(br s,1H),4.82(br s,2H),4.66-4.48(m,3H),4.40(br d,J=12.0Hz,1H),4.22-3.80(m,3H),3.79-3.49(m,4H),3.32-3.09(m,7H),3.07-2.88(m,2H),2.47-2.36(m,1H),2.24-2.11(m,3H)。
実施例292
2-[4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(6.00mL)中のtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、424μmol、1.00当量)、5-ブロモイソキノリン(115mg、551μmol、1.30当量)、RuPhos(39.6mg、84.8μmol、0.20当量)、Cs2CO3(415mg、1.27mmol、3.00当量)、およびPd2(dba)3(38.8mg、42.4μmol、0.10当量)を、脱気し、次いで、N2下で90℃まで12時間加熱した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(217mg、344μmol、81.0%収率、94.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:599。
ステップB:2-[4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(217mg、362μmol、1.00当量)のTFA(620mg、5.44mmol、403μL、15.0当量)中溶液を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(222mg、粗製、TFA)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:499。
ステップC:2-[4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(222mg、362μmol、TFA)およびTEA(367mg、3.62mmol、504μL)のDCM(4.50mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(45.7mg、362μmol)を0℃滴加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、水(2mL)で希釈し、EtOAc(2×5mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:4%~20%、8分)により精製し、凍結乾燥して、標記化合物である2-[4-[7-(5-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(73.0mg、117μmol、2ステップで32.2%収率、95.6%純度、FA)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:553。
1H NMR(400MHz,酢酸)δ=9.71(s,1H),8.69(d,J=6.4Hz,1H),8.53(d,J=6.8Hz,1H),8.15(d,J=8.0Hz,1H),7.91(t,J=7.8Hz,1H),7.78(d,J=7.2Hz,1H),6.97-6.68(m,1H),6.38(br d,J=16.8Hz,1H),5.87(br d,J=10.4Hz,1H),5.15(br s,1H),4.81(br d,J=4.4Hz,2H),4.67-4.51(m,1H),4.49-4.31(m,3H),4.28-4.04(m,1H),3.91(br s,2H),3.78-3.64(m,1H),3.63-3.37(m,4H),3.36-3.20(m,1H),3.11(br s,5H),3.08-2.86(m,2H),2.46-2.33(m,1H),2.24-2.10(m,3H)。
実施例293
2-[1-[(E)-ブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、212μmol、1.0当量)、Pd2(dba)3(19.4mg、21.2μmol、0.10当量)、RuPhos(14.8mg、31.8μmol、0.15当量)、およびCs2CO3(207mg、636μmol、3.0当量)のトルエン(3.0mL)中混合物に、1-ブロモナフタレン(65.9mg、318μmol、44.2μL、1.5当量)を滴加した。反応混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、混合物をN2雰囲気下、110℃で4時間撹拌した。反応物を水(20.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%FA、0~80%MeCN)により精製した。化合物であるtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(80.0mg、116μmol、54.6%収率)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:598。
ステップB:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(80.0mg、134μmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、TFA(3.08g、27.0mmol、2.0mL、202当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、20℃で30分間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去した。粗生成物である2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(110mg、粗製、2TFA)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:498。
ステップC:2-[1-[(E)-ブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(110mg、152μmol、2TFA)のDCM(2.00mL)中溶液に、DIEA(100mg、774μmol、135μL)および(E)-ブタ-2-エノイルクロリド(35.0mg、335μmol、32.1μL)を0℃で加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応物を水(10.0mL)でクエンチした。粗製混合物を酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を、分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%~50%、10分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[1-[(E)-ブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(13.3mg、23.4μmol、99.7%純度、FA)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:566。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.37(s,1H),8.14-8.13(m,1H),7.80-7.78(m,1H),7.54(d,J=8.0Hz,1H),7.46-7.42(m,2H),7.36(m,1H),7.07(d,J=7.6Hz,1H),6.95-6.90(m,1H),6.22(d,J=15.6Hz,1H),5.05-4.91(br,1H),4.67-4.63(m,1H),4.37-4.32(m,1H),4.24-4.20(m,2H),4.12(d,J=14.8Hz,1H),3.96(d,J=11.6Hz,1H),3.51-3.49(m,1H),3.39-3.29(m,2H),3.18-3.12(m,7H),2.90-2.76(m,2H),2.71(s,3H),2.65-2.58(m,1H),2.18-2.12(m、1H),2.00-1.95(m,1H),1.90-1.86(m,5H)。
実施例294
2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(6.00mL)中のtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[(1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、424μmol、1.00当量)、5-ブロモキノリン(115mg、551μmol、1.30当量)、RuPhos(39.6mg、84.8μmol、0.20当量)、Cs2CO3(415mg、1.27mmol、3.00当量)、およびPd2(dba)3(38.8mg、42.4μmol、0.10当量)を、脱気し、次いで、N2下で90℃まで12時間加熱した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]により精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、315μmol、74.4%収率、94.4%純度)を褐色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:599。
ステップB:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、334μmol、1.00当量)のTFA(571mg、5.01mmol、371μL、15.0当量)中溶液を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(204mg、粗製、TFA)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:499。
ステップC:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(204mg、333μmol、1.00当量、TFA)およびTEA(337mg、3.33mmol、463μL)のDCM(4.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(42.0mg、333μmol)を0℃で滴加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、水(2mL)で希釈し、EtOAc(2×5mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物は、分取TLC(DCM/MeOH 8/1)および分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:7%~34%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(49.1mg、79.5μmol、2ステップで23.9%収率、96.9%純度、FA)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:553。
1H NMR(400MHz,酢酸)δ=9.22(d,J=4.8Hz,1H),9.15(d,J=8.4Hz,1H),8.09(d,J=8.8Hz,1H),7.98(d,J=8.0Hz,1H),7.96-7.90(m,1H),7.50(d,J=7.6Hz,1H),6.98-6.71(m,1H),6.37(br d,J=17.2Hz,1H),5.88(br d,J=10.4Hz,1H),5.15(br s,1H),4.81(br s,2H),4.77-4.52(m,1H),4.50-4.33(m,3H),4.14(br d,J=12.4Hz,1H),3.91(br s,2H),3.79-3.66(m,1H),3.65-3.32(m,4H),3.12(br s,6H),3.05(br d,J=16.8Hz,2H),2.46-2.34(m,1H),2.23-2.09(m,3H)。
実施例295
2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、0.15g、318μmol、1.00当量)、4-ブロモキノリン(99.3mg、477μmol、1.50当量)、RuPhos(29.7mg、63.6μmol、0.20当量)、Pd2(dba)3(29.1mg、31.8μmol、0.10当量)、およびCs2CO3(311mg、954μmol、3.00当量)のトルエン(5mL)中混合物を、N2下、100℃で3時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(3×5.00mL)で抽出した。有機層をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.1%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和重炭酸ナトリウム(5.00mL)でpH>7に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.17g、269μmol、84.8%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:599。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.77(d,J=4.8Hz,1H),8.07(dd,J=8.0,16.0Hz,2H),7.70(dt,J=1.2,7.2Hz,1H),7.56-7.50(m,1H),6.92(d,J=4.8Hz,1H),4.62(br s,1H),4.44-4.33(m,3H),4.15-4.04(m,2H),3.95(br d,J=12.0Hz,1H),3.74-3.64(m,1H),3.46(br d,J=7.2Hz,1H),3.37-3.21(m,2H),3.18-2.93(m,4H),2.93-2.79(m,2H),2.72(br dd,J=6.0,16.8Hz,2H),2.51(s,3H),2.36-2.26(m,1H),2.13-2.06(m,1H),1.93-1.79(m,3H),1.53(s,9H)。
ステップB:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(165mg、276μmol、1.00当量)およびTFA(471mg、4.13mmol、306μL、15.0当量)のジクロロメタン(0.30mL)中混合物を、15℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(168mg、粗製、TFA)を黒色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:499。
ステップC:2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(168mg、粗製、TFA)およびEt3N(277mg、2.74mmol、382μL)のジクロロメタン(3.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(34.6mg、274.22μmol)を-40℃で加えた。15℃で1時間撹拌後、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(0.10mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を、カラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/1)および分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:1%~21%(7分))により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-キノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例295、23.4mg、39.6μmol、2ステップで13.4%収率、93.6%純度、FA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:553。
SFC条件:OD-3S_3_40_3 ML カラム:Chiralcel OD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz、酢酸)δ=8.65(d、J=7.2Hz,1H)、8.35(d、J=8.4Hz,1H)、8.15(s、1H)、7.99(t、J=7.2Hz,1H)、7.77(t、J=7.6Hz,1H)、7.28(d、J=6.8Hz,1H)、6.74(dd、J=10.8、16.8Hz、1H)、6.32(dd、J=1.2、16.8Hz、1H)、5.85(dd、J=1.2、10.8Hz、1H)、5.01(br s、1H)、4.85-4.74(m、2H)、4.42(br d、J=14.0Hz,1H)、4.35-4.19(m、3H)、4.16-3.76(m、4H)、3.66(br d、J=14.0Hz,2H)、3.51-3.40(m、1H)、3.39-3.16(m、4H)、3.13(s、3H)、3.07-2.90(m、2H)、2.49-2.39(m、1H)、2.26-2.17(m、3H)。
実施例296
2-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、266μmol、1.0当量)および2-(ジメチルアミノ)エタノール(47.4mg、531μmol、53.3μL、2.0当量)のトルエン(1.0mL)中溶液に、t-BuONa(51.1mg、531μmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10.0mL)に加え、EA(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物を、逆相フラッシュカラム(C18、水中の0.1%FA、0~40%MeCN)により精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、次いで、真空下で濃縮した。残った液体をEA(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物であるtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、254μmol、95.8%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:590。
ステップB:2-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、254μmol、1.0当量)のDCM(1.0mL)中溶液に、TFA(29.0mg、254μmol、18.8μL、1.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物を飽和NaHCO3水溶液(5mL)に加え、DCM(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮し、2-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、粗製)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:490。
ステップC:2-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(125mg、255μmol、1.0当量)およびDIEA(198mg、1.53mmol、267μL、6.0当量)のDCM(1.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(32.2mg、255μmol、1.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%~40%、10分)により精製した。次いで、濃縮し、凍結乾燥した。生成物である2-[4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例296、30.7mg、51.8μmol、20.3%収率、99.5%純度、FA)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:544。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.45(br s,1H),7.67(br d,J=8.0Hz,1H),7.57(t,J=7.2Hz,1H),7.41(d,J=8.0Hz,1H),7.30(d,J=7.6Hz,1H),6.71-6.49(m、1H),6.47-6.29(m,1H),5.82(br d,J=10.4Hz,1H),5.07-4.97(m,1H),4.54(t,J=5.4Hz,2H),4.12(br d,J=13.6Hz,1H),4.07(s,2H),3.98(br d,J=12.0Hz,1H),3.40-3.30(m,2H),3.22-3.09(m,4H),3.05(t、J=5.4Hz,2H),2.92(dd,J=8.0,16.8Hz,1H),2.86-2.81(m,1H),2.79-2.70(m,2H),2.56(s,6H)。
実施例297
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、354μmol、1.0当量)および3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロパン-1-オール(中間体18、111mg、708μmol、2.0当量)のトルエン(3.0mL)中溶液に、t-BuONa(68.1mg、708μmol、2.0当量)を0℃で加え、反応物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10mL)に加え、次いで、EA(2×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中60%のMeCN)により精製し、得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液でpH約8に調整し、次いで、濃縮し、EA(2×10.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し、濃縮して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、197μmol、55.7%収率、99.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:658。
ステップB:2-[4-[2-[3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(70.0mg、106μmol、1.0当量)のDCM(0.5mL)中混合物に、TFA(770mg、6.75mmol、0.5mL、63.5当量)を加えた。反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、2-[4-[2-[3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(83.0mg、粗製、2TFA)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:558。
ステップC:2-[4-[2-[3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(83.0mg、106μmol、1.0当量、2TFA)のDCM(1.0mL)中混合物に、DIEA(81.9mg、634μmol、110μL、6.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(13.3mg、106μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、濃縮した。残留物を分取HPLC((機器:ACSWH-GX-G;カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;条件:水(0.225%FA)-ACN;開始B:12;最終B:42;勾配時間(分):10.5;100%B保持時間(分):2;流速(ml/min):2)により精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。生成物である2-[4-[2-[3-[(1R,4R)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例297、17.6mg、26.3μmol、2ステップ収率で24.9%収率、98.1%純度、FA)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:612。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.69(d,J=7.6Hz,1H),7.59(t,J=7.6Hz,1H),7.42(d,J=7.6Hz,1H),7.31(t,J=7.6Hz,1H),6.72-6.52(m 1H),6.40(d,J=16.4Hz,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.16-5.02(m,1H),4.58-4.51(m,1H),4.38(br t,J=5.8Hz,2H),4.21(br d,J=9.2Hz,1H),4.18-4.06(m,4H),3.99(br d,J=11.6Hz,1H),3.74(br d,J=8.4Hz,1H),3.42-3.29(m,2H),3.27-3.04(m,6H),3.04-2.61(m,6H),2.28-2.07(m,3H),2.04-1.92(m,1H)。
実施例298
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール。tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2.0g、9.94mmol、1.0当量)のTHF(30.0mL)中溶液に、LiAlH4(754mg、19.9mmol、2.0当量)を0℃で少しずつ加えた。添加後、反応物を70℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(2.4mL)でクエンチし、次いで、酢酸エチル(100mL)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過した。真空下で溶媒を除去し、[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(1.0g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ3.64(dd,J=4.8,10.0Hz,1H),3.52(dd,J=5.6,10.0Hz,1H),2.78-2.67(m,1H),2.60-2.45(m,2H),2.42-2.23(m,5H),2.08-1.91(m,1H),1.72-1.57(m,1H)。
ステップB:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、177μmol、1.0当量)および[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(61.2mg、531μmol、3.0当量)のトルエン(1.0mL)中溶液に、t-BuONa(34.0mg、354μmol、2.0当量)を0℃で加え、反応物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10.0mL)に加え、酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中50%のMeCN)により精製した。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(40.0mg、63.4μmol、35.8%収率、97.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
ステップC:2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(40.0mg、64.9μmol、1.0当量)のDCM(0.5mL)中混合物に、TFA(770mg、6.75mmol、500μL、104当量)を加えた。反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮し、2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(48.0mg、粗製、2TFA)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップD:2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(48.0mg、64.6μmol、1.0当量、2TFA)のDCM(1.0mL)中混合物に、DIEA(25.0mg、194μmol、33.7μL、3.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(8.14mg、64.6μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をメタノール(0.5mL)でクエンチし、濃縮した。残留物を分取HPLC((機器:ACSWH-GX-M;カラム:Gemini 150*25 5μ;条件:水(0.04%NH3H2O)-ACN;開始B:60;最終B:81;勾配時間(分):10;100%B保持時間(分):3;流速(ml/min):25)により精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥して、2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(5.48mg、9.26μmol、14.4%収率、96.3%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.50(t,J=7.6Hz,1H),7.33(d,J=7.6Hz,1H),7.22(t,J=7.6Hz,1H),6.54-6.44(m,1H),6.32(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.75(br d,J=10.8Hz,1H),5.12-4.92(m,1H),4.13(d,J=6.8Hz,2H),4.07-3.97(m,3H),3.92-3.84(m,1H),3.62-3.42(m,1H),3.31-3.22(m,1H),3.16-2.95(m,3H),2.89-2.49(m,7H),2.47-2.35(m,2H),2.28(s,3H),2.05-1.92(m,1H),1.57-1.46(m,2H)。
実施例299
2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.70g、9.15mmol、1.0当量)、Pd2(dba)3(1.26g、1.37mmol、0.15当量)、RuPhos(854mg、1.83mmol、0.2当量)、およびCs2CO3(7.45g、22.9mmol、2.50当量)のトルエン(74.0mL)中溶液に、1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(4.12g、18.3mmol、2.49mL、2.0当量)を加えた。混合物を100℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(100mL)に加え、酢酸エチル(100mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(C18、水中0.1%のFA、0~90%MeCN)により精製した。生成物であるtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.90g、3.46mmol、37.8%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.69(d,J=8.0Hz,1H),7.57(t,J=7.6Hz,1H),7.46-7.37(m,2H),7.22-7.11(m,1H),4.67-4.55(m,1H),4.03(br d,J=13.6Hz,2H),3.88(br d,J=12.0Hz,1H),3.68-3.47(m,1H),3.30-3.08(m,4H),3.02(dt,J=3.2,12.4Hz,1H),2.94-2.69(m,4H),2.51(s,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.50g、2.46mmol、1.0当量)のDCM(15.0mL)中溶液に、m-CPBA(593mg、2.75mmol、1.12当量、80%純度)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和Na2S2O3水溶液(30.0mL)に加え、酢酸エチル(30.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(C18、水中0.1%FA、0~90%MeCN)により精製して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.16g、2.05mmol、83.6%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:565。
ステップC:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル (2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、354μmol、1.0当量)のトルエン(3.0mL)中溶液に、[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(81.6mg、708.4μmol、2.0当量)およびt-BuONa(68.1mg、708μmol、2.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で20分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を水(10.0mL)でクエンチした。粗製混合物を酢酸エチル(15mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、濾過した。次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%FA、0~80%MeCN)により精製した。化合物であるtert-ブチル (2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(170mg、275μmol、77.7%収率)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)8.08(s,1H),7.61(d,J=7.6Hz,1H),7.51(t,J=7.7Hz,1H),7.34(d,J=8.0Hz,1H),7.25-7.19(m,1H),5.02-4.78(m,1H),4.58-4.43(m,2H),4.17(br t,J=12.5Hz,1H),4.08-3.86(m,5H),3.64-3.51(m,1H),3.23(br dd,J=3.8,13.8Hz,1H),3.11-3.01(m,3H),2.96(s,3H),2.84-2.58(m,4H),2.31-2.03(m,2H),2.02-1.94(m,3H),1.44(s,9H),1.19(t,J=7.2Hz,1H)。
ステップD:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(170mg、276μmol、1.0当量)のDCM(1.50mL)中溶液に、TFA(2.31g、20.3mmol、1.50mL、73.4当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、20℃で15分間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を真空下で除去した。粗生成物である2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(240mg、粗製、2TFA)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップE:2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(240mg、2TFA)のDCM(3.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(40.0mg、317μmol)およびDIEA(130mg、1.01mmol、175μL)を0℃で加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。反応物を水(20.0mL)でクエンチした。粗製混合物を酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、濾過した。次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150×25mm×10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、3分)により精製した。化合物である2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例299、10.2mg、16.8μmol、94.3%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.68(d,J=7.2Hz,1H),7.58(t,J=7.6Hz,1H),7.41(d,J=8.0Hz,1H),7.30(d,J=7.6Hz,1H),6.59(br s,1H),6.40(d,J=16.4Hz,1H),5.83(d,J=10.4Hz,1H),5.07(br s,1H),4.85(d,J=7.1Hz,1H),4.66-4.39(m,1H),4.20(d,J=11.1Hz,1H),4.13-3.95(m,4H),3.70-3.55(m,2H),3.45-3.20(m,2H),3.16-2.99(m,3H),2.98-2.91(m,4H),2.85-2.70(m,4H),2.33-2.14(m,2H),2.10-2.01(m,2H)。
実施例300
2-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、354μmol、1.0当量)および2-(ジエチルアミノ)エタノール(83.0mg、708μmol、93.9μL、2.0当量)のトルエン(3.0mL)中溶液に、t-BuONa(68.1mg、708μmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10.0mL)に加え、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(C18、水中0.1%FA、0~40%MeCN)により精製した。生成物であるtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、291μmol、82.3%収率)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:618。
ステップB:2-(4-(2-(2-(ジエチルアミノ)エトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-(2-(2-(ジエチルアミノ)エトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、291μmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、TFA(33.2mg、291μmol、21.6μL、1.0当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を酢酸エチル(10.0mL)に加え、飽和NaHCO3溶液でpH>7に調整した。混合物を酢酸エチル(30ml×3)で抽出し、有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過した。真空下で溶媒を除去した。生成物である2-(4-(2-(2-(ジエチルアミノ)エトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(150mg、粗製)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:518。
ステップC:2-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)のDCM(3.0mL)中溶液に、DIEA(129mg、1.0mmol、174μL)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(44.1mg、0.35mmol)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、20℃でメタノール(10.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチした。反応混合物に水(10.0mL)を加え、DCM(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.04%NH3H2O)-ACN];B%:65%~83%、10分)により精製した。生成物である2-[4-[2-[2-(ジエチルアミノ)エトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例300、41.6mg、72.7μmol、100%純度、2ステップで収率25.0%)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:572。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.68(d,J=7.8Hz,1H),7.58(t,J=7.4Hz,1H),7.41(d,J=8.0Hz,1H),7.32-7.28(m,1H),6.70-6.49(m,1H),6.39(dd,J=1.2,16.8Hz,1H),5.82(d,J=10.8Hz,1H),5.08(br,s,1H),4.39(t,J=6.8Hz,2H),4.14-4.00(m,3H),4.02-3.84(m,1H),3.32(br d,J=12.0Hz,1H),3.24-3.16(m,1H),3.15-3.04(m,2H),2.96-2.88(m,4H),2.87-2.70(m,1H),2.68-2.61(m,4H),1.89(br s,3H),1.07(t,J=7.0Hz、6H)。
実施例301
2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(5S)-5-(ヒドロキシメチル)-2,2-ジメチル-ピロリジン-1-カルボキシレート。(2S)-1-tert-ブトキシカルボニル-5,5-ジメチル-ピロリジン-2-カルボン酸(400mg、1.64mmol、1.00当量)の無水THF(7.00mL)中溶液に、BH3・Me2S(10M、493μL、3.00当量)を25℃で滴加した。反応物を50℃で5分間加熱した。撹拌が完了したら、氷浴により冷却した後、混合物をメタノール(10mL)でクエンチした。反応混合物を減圧下で濃縮して、tert-ブチル (5S)-5-(ヒドロキシメチル)-2,2-ジメチル-ピロリジン-1-カルボキシレート(360mg、1.57mmol、95.9%)を無色油として得、これをさらに精製することなく次にステップに直接使用した。
ステップB:tert-ブチル 4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(20g、46.5mmol、1.00当量)のDMF(300mL)中の攪拌溶液に、DIEA(18.1g、139mmol、24.3mL、3当量)および2-ピペラジン-2-イルアセトニトリル(10.2g、51.2mmol、495μL、1.10当量、2HCl)を加えた。反応物を100℃まで加熱し、N2雰囲気下で1時間撹拌した。tert-ブチル 4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(18.8g、粗製)を得、分離および精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップC:tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(18.8g、粗製)のDMF(200mL)中の溶液に、DIEA(12.0g、92.9mmol、16.2mL)およびベンジルカルボノクロリデート(11.9g、69.7mmol、9.91mL)を加えた。混合物を50℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(300mL)で希釈し、酢酸エチル(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=30/1→3/1)で精製した。tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(20g、31.6mmol、2ステップで68.0%収率、85%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:539。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40-7.36(m,5H),5.21-5.15(m,2H),4.73-4.55(m,2H),4.39(d,J=18.8Hz,1H),3.97(d,J=12.8Hz,1H),3.90-3.69(m,2H),3.41-3.16(m,3H),3.00(dt,J=3.6,12.4Hz,1H),2.86-2.53(m,5H),2.51(s,3H),1.49(s,9H)。
ステップD:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(11g、20.4mmol、1.00当量)のジオキサン(100mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、102mL、20当量)を加えた。25℃で1時間撹拌後、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を300mLの酢酸エチルおよび300mLの水に溶解し、高速で撹拌した。次いで、飽和Na2CO3水溶液をpH約9まで加えた。有機成分を水(1×300mL)およびブライン(1×200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(8.2g、15.2mmol、74.2%収率、81%純度)を黄色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:439。
ステップE:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(5.07g、11.6mmol、1.1当量)、1-ブロモナフタレン(2.83g、13.7mmol、1.90mL、1.3当量)、Cs2CO3(8.57g、26.3mmol、2.50当量)、Pd2(dba)3(1.45g、1.58mmol、0.15当量)およびRuPhos(982mg、2.11mmol、0.20当量)のジオキサン(100mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、85℃で5時間撹拌した。反応混合物を水(200mL)で希釈し、酢酸エチル(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1→2/1)で精製した。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.6g、4.65mmol、40.1%収率、73%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:565。
ステップF:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルファニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.1g、5.49mmol、1当量)のメチルテトラヒドロフラン(50mL)中の窒素下、0℃での攪拌溶液に、未希釈のm-CPBA(1.18g、5.49mmol、80%純度、1当量)を固形分として加えた。N2雰囲気下、0℃で1時間撹拌した後、10%Na2S2O3水溶液(100mL)を0℃で加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、水(200mL)で希釈し、酢酸エチル(200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)により精製し、逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル)]によりさらに精製した。目的の画分を、飽和NaHCO3水溶液を加えることによってpH=7に調整し、酢酸エチル(100mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.3g、2.19mmol、39.9%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:581。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22-8.13(m,1H),7.92-7.83(m,1H),7.63(d,J=8.0Hz,1H),7.56-7.48(m,2H),7.45(t,J=8.0Hz,1H),7.41-7.32(m,5H),7.15(d,J=7.2Hz,1H),5.22(s,2H),4.70(br s,1H),4.54-4.36(m,2H),4.34-4.17(m,2H),4.12-4.04(m,1H),3.58-3.17(m,5H),3.01(m,2H),2.93(d,J=2.8Hz,3H),2.90-2.79(m,1H),2.77-2.65(m,1H)。
ステップG:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(430mg、741μmol、1.00当量)およびtert-ブチル(5S)-5-(ヒドロキシメチル)-2,2-ジメチルピロリジン1-カルボキシレート(340mg、1.48mmol、2.00当量)のトルエン(8.00mL)中溶液に、t-BuONa(142mg、1.48mmol、2.00当量)を加えた。混合物を20℃で0.25時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製して、ベンジル 4-[2-[[(2S)-1-tert-ブトキシカルボニル-5,5-ジメチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、318μmol、43.0%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:746。
ステップH:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-5,5-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 4-[2-[[(2S)-1-tert-ブトキシカルボニル-5,5-ジメチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、268μmol、1.00当量)のジオキサン(4.00mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、4.00mL、59.7当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮し、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-5,5-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、251μmol、93.5%収率、95.0%純度、HCl)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップI:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-5,5-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、264μmol、1.00当量、HCl)およびホルムアルデヒド(107mg、1.32mmol、98.2μL、5.00当量、水中37%)のMeOH(3.00mL)溶液中に、CH3COOH(31.7mg、528μmol、30.2μL、2.00当量)およびNaBH3CN(66.3mg、1.06mmol、4.00当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を1MのHCl(0.2mL)でクエンチし、水(1mL)で希釈し、EtOAc(3×6mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(96.0mg、131μmol、49.6%収率、90.0%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.23-8.17(m,1H),7.89-7.83(m,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.53-7.47(m,2H),7.46-7.42(m,1H),7.42-7.33(m,5H),7.14(d,J=7.2Hz,1H),5.27-5.16(m,2H),4.70(br s,1H),4.41(dd,J=4.4,10.4Hz,1H),4.34-4.22(m,2H),4.20-4.01(m,3H),3.95(br d,J=11.2Hz,1H),3.40-3.21(m,3H),3.13-2.91(m,2H),2.91-2.69(m,3H),2.32(s,3H),2.13-1.96(m,1H),1.75-1.54(m,5H),1.15(s,3H),0.92(s,3H)。
ステップJ:2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-40℃でNH3をMeOH(6.00mL)中に3分間バブリングした。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.10g、152μmol、1.00当量)のMeOH(6.00mL)中溶液に、NH3溶液およびPd/C(0.05g、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。反応物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、触媒を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮して、2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(63.0mg、103μmol、68.0%収率、86.0%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:526。
ステップK:2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチル・ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(75.0mg、143μmol、1.00当量)およびTEA(72.2mg、713μmol、99.3μL、5.00当量)のDCM(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(18.0mg、143μmol、1.00当量)を0℃で滴加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、水(2mL)で希釈し、EtOAc(2×5mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(EtOAc/MeOH 9/1)および分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、12分)により精製し、凍結乾燥して、2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,5,5-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例301、14.7mg、25.3μmol、17.8%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:580。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.25-8.17(m,1H),7.90-7.83(m,1H),7.61(d,J=8.4Hz,1H),7.55-7.48(m,2H),7.44(t,J=7.6Hz,1H),7.14(d,J=7.2Hz,1H),6.60(br s,1H),6.45-6.36(m,1H),5.84(br d,J=10.8Hz,1H),5.10(br s,1H),4.44(br s,1H),4.34-4.19(m,2H),4.17-3.80(m,4H),3.79-3.21(m,4H),3.19-2.63(m,6H),2.34(br s,3H),2.15-2.03(m,1H),1.69(br s,3H),1.16(br s,3H),0.94(s,3H)。
実施例302
2-[4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-2-ピペリジル]アセトニトリル
挿入物:(7-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。7-フルオロナフタレン-1-オール(250mg、1.54mmol、1当量)およびDIEA(598mg、4.63mmol、806μL、3当量)のDCM(10mL)中溶液に、Tf2O(652mg、2.31mmol、382μL、1.5当量)を-5℃で滴加した。混合物を20℃で3時間撹拌した。その後、混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=100/1→10/1)により精製した。(7-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(450mg、1.53mmol、99.2%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=8.08(dd,J=5.6,9.2Hz,1H),8.01(d,J=8.4Hz,1H),7.73-7.39(m,4H)。
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(182mg、386μmol、1当量)、(7-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(227mg、772μmol、2当量)、Pd2(dba)3(35.3mg、38.6μmol、0.1当量)、RuPhos(36.0mg、77.2μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(377mg、1.16mmol、3当量)のトルエン(20mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で16時間撹拌した。混合物をH2O(30mL)でクエンチし、次いで、混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液で中和し、酢酸エチル(1×100mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(158mg、257μmol、66.5%収率、100%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.92-7.79(m,2H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.40(t,J=7.8Hz,1H),7.30-7.25(m,1H),7.19(d,J=7.2Hz,1H),4.63(br d,J=2.1Hz,1H),4.40(br dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.24(br s,2H),4.20-4.00(m,4H),3.95(br d,J=12.4Hz,1H),3.52-3.37(m,1H),3.36-3.16(m,3H),3.15-2.63(m,6H),2.50(s,3H),2.36-2.22(m,1H),2.12-2.05(m,1H),1.92-1.70(m,3H),1.53(s,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、162μmol、1当量)のジオキサン(10mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、1.62mL、40当量)を窒素雰囲気下、0℃で加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。その後、混合物を真空下で濃縮した。2-[4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、粗製、HCl)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップC:2-[4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-2-ピペリジル]アセトニトリル。2-[4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、粗製、HCl)およびDIEA(234mg、1.81mmol、315μL)のDMF(5mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(18.3mg、145μmol)を0℃で加えた。25℃で1時間撹拌した後、反応混合物をNaHCO3飽和溶液(5mL)でクエンチし、次いで、酢酸エチル(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(酢酸エチル/MeOH=50/1→1/1)により精製した。集めた液体を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%のFA)-ACN];B%:12%~42%、10分)および(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製した。2-[4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-2-ピペリジル]アセトニトリル(実施例302、4.23mg、7.19μmol、2ステップで4.29%収率、96.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.93-7.77(m,2H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.40(t,J=7.8Hz,1H),7.32-7.25(m,1H),7.19(d,J=7.3Hz,1H),6.59(br d,J=10.8Hz,1H),6.41(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.23-4.52(m,1H),4.40(dd,J=4.8,10.6Hz,1H),4.24(br s,2H),4.21-4.11(m,2H),4.03(br d,J=12.0Hz,2H),3.86-3.04(m,6H),3.03-2.58(m,5H),2.49(s,3H),2.37-2.23(m,1H),2.16-1.98(m,1H),1.91-1.69(m,3H)。
実施例303
2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。2-(1-ピペリジル)エタノール(89.0mg、689μmol、91.5μL、2.0当量)のトルエン(2.0mL)中溶液に、t-BuONa(66.2mg、689μmol、2.0当量)を0℃で加えた。次いで、混合物をベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、344μmol、1.0当量)に加え、混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10.0mL)に加え、EA(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=10:1→EA:MeOH=20:1)により精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、296μmol、86%収率、95.7%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-78℃でNH3をMeOH(10.0mL)中に30分間バブリングした。次いで、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、279μmol、1.0当量)およびPd/C(100mg、10.0%純度)を、上記液体にN2雰囲気下で加えた。懸濁液に対してH2による脱気とパージを3回繰り返した。混合物をH2(15Psi)下、20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をセライトで濾過し、真空下で濃縮した。得られた生成物を、逆相フラッシュカラム(C18、水中の0.1%FA、0~40%MeCN)により精製して、2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90.0mg、176μmol、63%収率)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップC:2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90.0mg、176μmol、1.0当量)およびDIEA(136mg、1.06mmol、184μL、6.0当量)のDCM(1.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(22.2mg、176μmol、1.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(20.0mg)でクエンチし、真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、12分)により精製して、2-[4-[7-(1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例303、11.2mg、19.7μmol、11%収率、99.5%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:566。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.24-8.19(m,1H),7.89-7.84(m,1H),7.62(d,J=8.4Hz,1H),7.55-7.47(m,2H),7.44(t,J=8.0Hz,1H),7.15(d,J=7.6Hz,1H),6.70-6.53(m,1H),6.41(dd,J=1.2,16.8Hz,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.19-5.01(m,1H),4.47(br t,J=6.0Hz,2H),4.33-4.21(m,2H),4.12(br d,J=14.0Hz,1H),4.06-3.98(m,1H),3.55-3.45(m,1H),3.43-3.24(m,2H),3.22-3.09(m,1H),3.04-2.72(m,6H),2.68-2.42(m,4H),1.61-1.56(m,6H),1.50-1.40(m,2H)。
実施例304
2-[4-[2-[[(2R)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール。[(2R)-ピロリジン-2-イル]メタノール(0.70g、6.92mmol、673μL、1.00当量)、2-ブロモエトキシ-tert-ブチル-ジメチルシラン(1.66g、6.92mmol、1.00当量)、およびK2CO3(4.78g、34.6mmol、5.00当量)のアセトニトリル(70.0mL)中混合物を、83℃で12時間還流した。次いで、混合物を濾過し、濾過ケーキをメタノールで洗浄した。有機層を真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(酢酸エチル/メタノール=50/1→1/1)により精製した。化合物である[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール(1.40g、5.40mmol、78.0%収率、100%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.68(dd,J=5.2,6.4Hz,2H),3.57(dd,J=3.6,10.8Hz,1H),3.42-3.25(m,1H),3.23-2.96(m,2H),2.95-2.82(m,1H),2.72-2.61(m,1H),2.48(td,J=5.2,12.8Hz,1H),2.40-2.27(m,1H),1.90-1.77(m,1H),1.77-1.62(m,3H),0.83(s,9H),0.00(s,6H)。
ステップA:ベンジル 4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、861μmol、1当量)および[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール(447mg、1.72mmol、2当量)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(248mg、2.58mmol、3当量)を25℃で1度に加え、混合物を25℃で0.5時間撹拌した。混合物を1MのHCl溶液でpH=8に酸性化し、混合物を酢酸エチル(100mL)および水(10mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル/メタノール100/1→10/1)により精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、ベンジル 4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(480mg、582μmol、68%収率、94.1%純度)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:776。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.28-8.11(m,1H),7.95-7.77(m,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.55-7.29(m,8H),7.14(d,J=7.2Hz,1H),5.29-5.15(m,2H),4.70(br s,1H),4.41-3.88(m,7H),3.83-3.68(m,2H),3.57-2.69(m,12H),2.67-2.49(m,1H),2.37(q,J=8.4Hz,1H),2.03-1.93(m,1H),1.83-1.74(m,3H),1.00-0.79(m,9H),0.13-0.01(m,6H)。
ステップB:2-[4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-78℃でNH3をメタノール(60.0mL)中に30分間バブリングした。ベンジル 4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、258μmol、1.00当量)およびPd/C(0.10g、10.0%純度)を、混合物に加えた。15psiのH2下、混合物を20℃で1時間撹拌した。次いで、混合物を濾過し、真空下で濃縮して、2-[4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.15g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:642。
ステップC:2-[4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.15g、粗製)およびEt3N(236mg、2.34mmol、325μL)のジクロロメタン(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(29.5mg、234μmol)を0℃で加えた。20℃で1時間撹拌後、混合物を飽和炭酸水素ナトリウム溶液(0.50mL)でクエンチして、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/10)により精製し、2-[4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.10g、135μmol、2ステップで52.3%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:696。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.25-8.18(m,1H),7.90-7.82(m,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.54-7.47(m,2H),7.43(t,J=7.6Hz,1H),7.15(d,J=7.2Hz,1H),6.59(br d,J=12.0Hz,1H),6.40(dd,J=1.2,16.8Hz,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.22-4.94(m,1H),4.36(td,J=3.6,10.4Hz,1H),4.31-4.20(m,2H),4.15-4.05(m,2H),4.04-3.97(m,1H),3.75(t,J=6.8Hz,2H),3.63(br s,1H),3.46(br s,1H),3.35(br d,J=11.2Hz,2H),3.21-3.15(m,1H),3.08-2.99(m,2H),2.99-2.92(m,2H),2.63-2.54(m,1H),2.42-2.33(m,1H),2.04-1.95(m,1H),1.84-1.73(m,3H),1.66(br s,4H),0.88(s,9H),0.05(s,6H)。
ステップD:2-[4-[2-[[(2R)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.09g、129μmol、1当量)およびTBAF(THF中1.00M、1.29mL、10当量)のTHF(0.10mL)中混合物を、10℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.1%)/アセトニトリル]、カラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/3)、および分取HPLC(カラム:Boston pH-lex 150*25 10μm;移動相:[水(0.10%TFA)-ACN];B%:22%~52%、10分およびカラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:47%~77%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[4-[2-[[(2R)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(23.9mg、41.0μmol、31.7%収率、99.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:582。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.25-8.18(m,1H),7.89-7.83(m,1H),7.61(d,J=8.4Hz,1H),7.54-7.47(m,2H),7.43(t,J=7.6Hz,1H),7.14(d,J=7.2Hz,1H),6.59(br s,1H),6.44-6.35(m,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.10-4.50(m,1H),4.38-4.24(m,3H),4.22-4.09(m,2H),4.00(br d,J=11.5Hz,2H),3.73-3.57(m,2H),3.45(br s,1H),3.36(br d,J=12.0Hz,2H),3.23-2.77(m,9H),2.62(td,J=3.6,12.4Hz,1H),2.38-2.26(m,1H),2.05-1.99(m,1H),1.90-1.73(m,3H)。
実施例305
3-(4-((S)-4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(8H)-イル)イソニコチノニトリル
ステップA:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-シアノ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、791μmol、1.0当量)および3-ブロモピリジン-4-カルボニトリル(289mg、1.58mmol、2.0当量)のトルエン(10.0mL)中溶液に、Cs2CO3(516mg、1.58mmol、2.0当量)、Pd2(dba)3(72.4mg、79.1μmol、0.1当量)、およびRuPhos(73.8mg、158μmol、0.2当量)を加え、反応混合物をN2下、100℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(15mL)に加え、次いで、EA(2×15.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=5/1→石油エーテル/酢酸エチル/メタノール=5/1/0.1)により精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-シアノ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、266μmol、34%収率、80.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:608。
ステップB:3-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ピリジン-4-カルボニトリル。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-シアノ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(170mg、226μmol、1.0当量)のMeOH(5.0mL)中溶液に、NH3・MeOH(49.4ug、49.4μmol、5.0mL)およびPd/C(150mg、10%純度)を加え、この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15Psi)下、20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をセライトで濾過し、濾液を濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中30%のMeCN)により精製し、得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液でpH約8に調整し、次いで、溶媒がなくなるまで濃縮し、次いで、固形分をDCM(10.0mL)に加え、20℃で0.5時間撹拌し、固形分を濾過し、濾液を濃縮して、3-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチル・ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ピリジン-4-カルボニトリル(35.0mg、73.9μmol、33%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:474。
ステップC:3-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2yl]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ピリジン-4-カルボニトリル。3-[4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ピリジン-4-カルボニトリル(35.0mg、73.9μmol、1.0当量)のDCM(1.0mL)中混合物に、DIEA(28.7mg、222μmol、38.6μL、3.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(9.32mg、73.9μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、濃縮した。残留物を分取HPLC((機器:ACSWH-GX-M;カラム:Gemini 150*25 5μ;条件:水(0.04%NH3・H2O)-ACN;開始B:32;最終B:56;勾配時間(分):10;100%B保持時間(分):3;流速(ml/min):100)により精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。生成物である3-[4-[3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ピリジン-4-カルボニトリル(実施例305、13.0mg、24.5μmol、33%収率、99.3%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:528。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.52(s,1H),8.33(d,J=4.8Hz,1H),7.46(d,J=4.8Hz,1H),6.69-6.53(m,1H),6.42(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.85(br d,J=11.6Hz,1H),5.19-5.01(m,1H),4.48-4.36(m,3H),4.27-4.08(m,2H),4.07-3.81(m,3H),3.78-3.33(m,3H),3.23-2.99(m,3H),2.97-2.83(m,2H),2.81-2.61(m,2H),2.52(s,3H),2.40-2.27(m,1H),2.16-1.99(m,1H),1.95-1.76(m,3H)。
実施例306
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。1-tert-ブチル 2-メチル(2S,4R)-4-フルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(5.0g、20.2mmol、1.0当量)のTHF(100mL)中溶液に、LiAlH4(1.53g、40.4mmol、2.0当量)を0℃で少しずつ加えた。反応混合物をN2下、0℃で1時間撹拌後、反応混合物を70℃まで加熱し、N2下、70℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(4.5mL)でクエンチし、次いで、濾過し、濾液を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=5/1→石油エーテル/酢酸エチル/メタノール=3/1/0.1)により精製して、[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.5g、11.3mmol、56%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ5.24-4.97(m,1H),3.73(dd,J=3.2,11.2Hz,1H),3.61-3.40(m,2H),2.86-2.74(m,1H),2.69(ddd,J=0.8,2.8,12.0Hz,1H),2.61(dd,J=2.4,12.0Hz,1H),2.41(s,3H),2.18-1.98(m,2H)。
ステップB:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、800mg、1.38mmol、1.0当量)および[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(367mg、2.76mmol、2.0当量)のトルエン(15.0mL)中溶液に、t-BuONa(265mg、2.76mmol、2.0当量)を0℃で加え、反応物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(30mL)に加え、次いで、EA(2×15mL)で抽出し、合わせた有機層を飽和ブライン(1×30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=5/1→石油エーテル/酢酸エチル/メタノール=3/1/0.1)により精製し、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(720mg、997μmol、72%収率、90.0%純度)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:650。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(670mg、1.03mmol、1.0当量)のMeOH(15.0mL)中溶液に、NH3・MeOH(1.03mmol、15.0mL、1.0当量)およびPd/C(400mg、10%純度)を加え、この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15Psi)下、20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をセライトで濾過し、濾液を濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(260mg、478μmol、46%収率、94.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(260mg、504μmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中混合物に、DIEA(196mg、1.51mmol、263μL、3.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(63.6mg、504μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(5mL)でクエンチし、濃縮した。残留物を分取HPLC((機器:ACSWH-GX-H;カラム:Gemini 150*25 5μ;条件:水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN;開始B:42;最終B:72;勾配時間(分):12;100%B保持時間(分):1.8;流速(ml/min):25)により精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。生成物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例306、65.6mg、115μmol、23%収率、99.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.27-8.17(m,1H),7.92-7.84(m,1H),7.63(d,J=8.0Hz,1H),7.56-7.49(m,2H),7.45(t,J=8.0Hz,1H),7.17(d,J=6.8Hz,1H),6.68-6.56(m,1H),6.42(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.86(br d,J=10.4Hz,1H),5.30-4.99(m,2H),4.45(dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.35-4.21(m,3H),4.15(br d,J=13.6Hz,1H),4.03(br d,J=11.6Hz,2H),3.70-2.72(m,11H),2.68-2.56(m,1H),2.54(s,3H),2.41-2.27(m,1H),2.10-1.90(m,1H)。
実施例307
2-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、300mg、636μmol、1.00当量)、1-ブロモ-2-フルオロ-3-メトキシ-ベンゼン(261mg、1.27mmol、2.00当量)、Pd2(dba)3(117mg、127μmol、0.20当量)、RuPhos(89.1mg、191μmol、0.30当量)、およびCs2CO3(622mg、1.91mmol、3.00当量)のトルエン(30mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で16時間撹拌した。反応混合物にH2O(200mL)および酢酸エチルは(250mL)を加えた。分離した有機相をブライン(1×200mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液で中和し、酢酸エチル(100mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、353μmol、55.4%収率、100%純度)を薄黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:596。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.00(dt,J=1.6,8.4Hz,1H),6.74-6.56(m,2H),4.61(br s,1H),4.44-4.34(m,1H),4.28-4.10(m,3H),4.01(br d,J=13.6Hz,1H),3.90(s,4H),3.56-3.40(m,1H),3.25(br dd,J=3.6,13.6Hz,2H),3.12(br t,J=7.6Hz,1H),2.98(dt,J=2.8,12.4Hz,1H),2.89-2.63(m,5H),2.50(s,3H),2.35-2.26(m,1H),2.21-2.06(m,3H),1.90-1.68(m,3H),1.60-1.42(m,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、168μmol、1.00当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(1.63g、14.3mmol、1.06mL、85.0当量)を窒素雰囲気下、0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌し、次いで、混合物を真空下で濃縮した。2-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(210mg、粗製、TFA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:496。
ステップC:2-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(102mg、粗製TFA)およびDIEA(216mg、1.67mmol、291μL)のDCM(3mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(16.9mg、134μmol)を0℃で加えた。25℃で1時間撹拌後、反応混合物を0℃で飽和NaHCO3溶液(5mL)でクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:38%~68%、12分)により精製した。2-[4-[7-(2-フルオロ-3-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例307、7.47mg、13.6μmol、2ステップで17%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:550。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.07-6.95(m,1H),6.74-6.51(m,3H),6.45-6.34(m,1H),5.83(br d,J=10.6Hz,1H),5.08(br s,1H),4.38(dd,J=4.8,10.5Hz,1H),4.31-4.12(m,3H),4.07(br d,J=13.6Hz,1H),4.03-3.82(m,5H),3.68-3.44(m,2H),3.39-3.21(m,2H),3.10(br t,J=7.8Hz,2H),2.95-2.61(m,5H),2.48(s,3H),2.33-2.23(m,1H),2.13-1.99(m,1H),1.92-1.62(m,3H)。
実施例308
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-メトキシフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(3-フルオロ-2-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、300mg、636μmol、1当量)、1-ブロモ-3-フルオロ-2-メトキシ-ベンゼン(261mg、1.27mmol、2当量)、Pd2(dba)3(117mg、127μmol、0.2当量)、RuPhos(89.1mg、191μmol、0.3当量)、およびCs2CO3(622mg、1.91mmol、3当量)のトルエン(30mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で16時間撹拌した。反応混合物にH2O(200mL)および酢酸エチル(250mL)を加えた。有機相を分離し、ブライン(200mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液で中和し、酢酸エチル(1×100mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(3-フルオロ-2-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(170mg、277μmol、43.6%収率、97.1%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:596。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.96(dt,J=6.0,8.0Hz,1H),6.83-6.69(m,1H),6.83-6.68(m,1H),4.60(br s,1H),4.39(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.31-4.14(m,3H),4.04(br d,J=13.6Hz,2H),3.94(d,J=0.8Hz,4H),3.62-3.47(m,1H),3.26(br dd,J=4.0,13.6Hz,2H),3.12(br t,J=7.6Hz,1H),2.99(dt,J=2.8,12.0Hz,1H),2.88-2.64(m,5H),2.50(s,3H),2.36-2.24(m,1H),2.22-2.07(m,2H),1.94-1.64(m,3H),1.56-1.46(m,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(3-フルオロ2メトキシ・フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(3-フルオロ-2-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(170mg、285μmol、1当量)のDCM(2.50mL)中混合物に、TFA(651mg、5.71mmol、423μL、20当量)をN2下、0℃で1度に加えた。25℃で2時間撹拌後、反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物を、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。化合物である2-[4-[7-(3-フルオロ-2-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(173mg、284μmol、99.4%収率、TFA)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:496。
ステップC:2-[4-[7-(3-フルオロ-2-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(3-フルオロ-2-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(173mg、284μmol、1当量、TFA)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(35.8mg、284μmol、1当量)のDCM(3mL)中混合物に、TEA(144mg、1.42mmol、198μL、5当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。25℃で0.5時間撹拌後、0℃で飽和NaHCO3(1.5mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、水(2mL)で希釈し、DCM(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(15mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=100/1→MeOH/EA=1/2)により精製した。目的の画分を集め、減圧下で濃縮した。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150×25mm×10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:48%~78%、12分)により精製した。標記化合物である2-[4-[7-(3-フルオロ-2-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例308、28.2mg、50.4μmol、17.8%収率、98.1%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:550。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.97(dt,J=6.0,8.4Hz,1H),6.83-6.76(m,1H),6.72(d,J=8.0Hz,1H),6.57(br d,J=12.0Hz,1H),6.40(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.07(br s,1H),4.56(br s,1H),4.39(br dd,J=5.2,10.4Hz,1H),4.30-4.18(m,2H),4.18-4.06(m,2H),4.04-3.96(m,1H),3.95(d,J=0.8Hz,3H),3.73-3.46(m,2H),3.38-3.22(m,2H),3.16-2.99(m,2H),2.96-2.59(m,5H),2.50(s,3H),2.36-2.22(m,1H),2.16-1.98(m,1H),1.94-1.68(m,3H)。
実施例309
2-(1-アクリロイル-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
挿入物:1-ブロモ-8-メチルナフタレン。1,8-ジブロモナフタレン(1g、3.50mmol、1当量)のTHF(20mL)中溶液に、MeLi(ジエチルエーテル中1.6M、2.62mL、1.2当量)を0℃で滴加した。0℃で30分間撹拌した後、ヨードメタン(3.38g、23.8mmol、1.48mL、6.81当量)を滴加した。混合物を25℃まで温め、さらに3時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)でクエンチし、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウム(v/v))→ACN];B%:45%→70%、28分;40%分)で精製した。1-ブロモ-8-メチルナフタレン(340mg、1.49mmol、43%収率、97%純度)を凍結乾燥後に黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75(dd,J=0.8,7.2Hz,1H),7.69(dd,J=0.8,8.0Hz,1H),7.66-7.59(m,1H),7.30-7.22(m,2H),7.13(t,J=8.0Hz,1H),3.05(s,3H)。
ステップA:tert-ブチル2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。1-ブロモ-8-メチルナフタレン(122mg、551μmol、1.3当量)、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、200mg、424μmol、1当量)、Cs2CO3(345mg、1.06mmol、2.5当量)、RuPhos(39.6mg、84.8μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(77.7mg、84.8μmol、0.2当量)のトルエン(10mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、110℃で3時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。混合物を、飽和NaHCO3水溶液を加えることによってpH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、224μmol、53%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:612。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.60(m,2H),7.42(dd,J=8.0,16.0Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.16(m,2H),4.61(br s,1H),4.40(br s,1H),4.30-4.16(m,2H),4.10-3.71(m,4H),3.58-3.45(m,1H),3.43-3.25(m,1H),3.23-3.04(m,4H),3.03-2.85(m,5H),2.83-2.55(m,4H),2.49(br s,3H),2.40-2.20(m,1H),2.14-2.06(m,1H),1.92-1.71(m,2H),1.55-1.44(m,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(110mg、179μmol、1当量)のDCM(200μL)中溶液に、TFA(307mg、2.70mmol、199μL、15当量)を加えた。25℃で1時間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。2-[4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(112mg、179μmol、100%収率、TFA)を黄色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップC:2-[4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(112mg、179μmol、1当量、TFA)のDCM(2mL)中溶液に、TEA(181mg、1.79mmol、249μL、10当量)を0℃で加えた。次いで、DCM(1mL)中のプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(18.1mg、143μmol、0.8当量)を0℃で滴加した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(1mL)でクエンチし、水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(20mLの×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=10/1→1/3)により精製し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)によりさらに精製した。標記化合物である2-[4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例309、16.2mg、28.4μmol、16%収率、99%純度)を凍結乾燥後に白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:566。
SFC条件:「OJ-3S_5_5_40_3ML カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中エタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.0Hz,1H),7.65(t,J=8.4Hz,1H),7.46-7.38(m,1H),7.34(t,J=6.4Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),6.68-6.52(m J=9.9Hz,1H),6.46-6.35(m,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.08(br s,1H),4.59(br s,1H),4.41-4.33(m,1H),4.32-4.21(m,1H),4.20-4.04(m,3H),4.03-3.82(m,2H),3.85-3.67(m,1H),3.61-3.33(m,2H),3.24-2.99(m,4H),2.92(s,3H),2.87-2.77(m,1H),2.71-2.59(m,2H),2.47(d,J=4.0Hz,3H),2.34-2.20(m,1H),2.13-1.98(m,1H),1.85-1.74(m,3H)。
実施例310
2-(1-アクリロイル-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
挿入物:1-ブロモ-8-クロロナフタレン。ヘキサクロロエタン(1.66g、6.99mmol、792μL、1当量)のTHF(30mL)中溶液に、n-BuLi(ヘキサン中2.5M、4.20mL、1.5当量)を-78℃で滴加した。-78℃でさらに10分間撹拌後、THF(10mL)中の1,8-ジブロモナフタレン(2g、6.99mmol、1当量)を加えた。混合物を25℃まで温め、3時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)でクエンチし、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物は、分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:ACN41%~ACN71%、30分;50%分)により精製した。混合物を、飽和NaHCO3水溶液を加えることによってPH=7に調整し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、1-ブロモ-8-クロロナフタレン(850mg、3.52mmol、50%収率、100%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.92(dd,J=1.2,7.2Hz,1H),7.80(ddd,J=0.8,8.0,12.4Hz,2H),7.67(dd,J=1.2,7.6Hz,1H),7.38(t,J=8.0Hz,1H),7.32-7.25(t,J=8.0Hz,1H)。
ステップA:tert-ブチル 4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン(133mg、551μmol、1.3当量)、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、424μmol、1当量)、Cs2CO3(345mg、1.06mmol、2.5当量)、RuPhos(39.6mg、84.8μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(77.7mg、84.8μmol、0.2当量)のトルエン(10mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、110℃で3時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。混合物を、飽和NaHCO3水溶液を加えることによってpH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル 4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、237μmol、56%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:632。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.4Hz,1H),7.61(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.39(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,1H),4.61(br s,1H),4.51-4.33(m,2H),4.22-4.15(m,1H),4.10-3.77(m,4H),3.57(br s,1H),3.41-3.01(m,6H),3.01-2.86(m,1H),2.85-2.63(m,3H),2.62-2.43(m,4H),2.31(br s,1H),2.13-2.06(m,1H),1.78(br s,2H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、237μmol、1当量)のDCM(200μL)中溶液に、TFA(405mg、3.56mmol、263μL、15当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(153mg、236μmol、100%収率、TFA)を黄色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:532。
ステップC:2-[4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(153mg、237μmol、1当量、TFA)のDCM(2mL)中溶液に、TEA(239mg、2.37mmol、329μL、10当量)を0℃で加えた。添加後、DCM(1mL)中のプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(23.9mg、189μmol、0.8当量)を0℃で滴加した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(1mL)でクエンチし、水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:52%~82%、12分)により精製した。標記化合物である2-[4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例310、37mg、61.2μmol、26%収率、97%純度)を、凍結乾燥後に白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:586。
SFC条件:「AD-3S_4_40_3MLカラム:Chiralpak AD-3 100×4.6mm I.D.、3μm 移動相:CO2中の40%イソプロパノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.2Hz,1H),7.53(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.39(m,1H),7.34(t,J=8.0Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),6.59(br s,1H),6.45-6.35(m,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.07(s,1H),4.84-4.25(m,3H),4.22-3.72(m,5H),3.71-3.53(m,1H),3.50-3.34(m,1H),3.32-2.96(m,5H),2.91-2.76(m,1H),2.70-2.52(m,2H),2.48(d,J=2.8Hz,3H),2.33-2.20(m,1H),2.13-1.96(m,1H),1.86-1.72(m,3H)。
実施例311
2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップ1:2-フルオロナフタレン-1-オール。ナフタレン-1-オール(2g、13.9mmol、5.00mL、1当量)のCH3CN(50mL)中溶液に、Select-F(4.91g、13.9mmol、1当量)を加えた。混合物を20℃で3時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物は、カラムクロマトグラフィー(SiO2、PE/EA=3/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:40%~70%、10分)によりさらに精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でPH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。化合物である2-フルオロナフタレン-1-オール(400mg、2.44mmol、18%収率、99%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.21(d,J=8.4Hz,1H),7.80(d,J=8.4Hz,1H),7.52(t,J=7.2Hz,1H),7.47(t,J=7.6Hz,1H),7.39(dd,J=5.2,8.8Hz,1H),7.31(d,J=9.6Hz,1H),5.58(br s,1H)。
ステップ2:(2-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。2-フルオロナフタレン-1-オール(400mg、2.47mmol、1当量)のDCM(10mL)中溶液に、Tf2O(765mg、2.71mmol、448μL、1.1当量)およびDIEA(637mg、4.93mmol、859μL、2当量)を0℃で加えた。0℃で1時間撹拌後、反応混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、水(20mL×3)で洗浄した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1→3/1)で精製した。化合物である(2-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(500mg、1.65mmol、67%収率、97%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.07(d,J=8.4Hz,1H),7.95-7.85(m,2H),7.70(t,J=7.6Hz,1H),7.62-7.54(m,1H),7.41(t,J=9.2Hz,1H)。
ステップA:tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(2-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。(2-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(243mg、827μmol、1.3当量)、tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、636μmol、1当量)、Cs2CO3(518mg、1.59mmol、2.5当量)、RuPhos(59.4mg、127μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(116mg、127μmol、0.2当量)のトルエン(10mL)中混合物に対してを脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で3時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。混合物を、飽和NaHCO3水溶液を加えることによってPH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(2-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、155μmol、25%収率、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.33(br s,1H),7.84(d,J=7.76Hz,1H),7.75-7.64(m,1H),7.57-7.41(m,2H),7.25-7.21(m,1H),4.63(br s,1H),4.47-4.16(m,4H),4.13-3.82(m,4H),3.61-3.25(m,3H),3.20-2.90(m,4H),2.81-2.56(m,4H),2.49(s,3H),2.38-2.19(m,1H),2.14-2.06(m,1H),1.88-1.69(m,2H),1.53(s,9H)。
ステップB:2-[4-[7-(2-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[7-(2-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、162μmol、1当量)のDCM(200μL)中溶液に、TFA(278mg、2.44mmol、180μL、15当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[4-[7-(2-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(102mg、162μmol、100%収率、TFA)を黄色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップC:2-[4-[7-(2-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[7-(2-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(102mg、197μmol、1当量、TFA)のDCM(2mL)中溶液に、TEA(200mg、1.98mmol、275μL、10当量)を0℃で加えた。添加後、DCM(1mL)中のプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(19.9mg、158μmol、0.8当量)を、0℃で滴加した。25℃で1時間撹拌後、反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(1mL)でクエンチし、水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:52%~82%、12分)により精製した。標記化合物である2-[4-[7-(2-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例311、11mg、18.9μmol、9.6%収率、98%純度)を、凍結乾燥後に白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
SFC条件:OD-3S_3_40_3 ML カラム:Chiralcel OD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.34(br s,1H),7.84(d,J=8.0Hz,1H),7.69(dd,J=4.4,8.8Hz,1H),7.52(t,J=7.2Hz,1H),7.47(t,J=6.8Hz,1H),7.29-7.25(m,1H),6.65-6.50(m,J=10.5Hz,1H),6.40(dd,J=1.2,16.8Hz,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.11(br s,1H),4.65(s,1H),4.43-3.85(m,7H),3.81-3.30(m,3H),3.24-2.95(m,3H),2.94-2.56(m,4H),2.47(s,3H),2.36-2.20(m,1H),2.13-1.97(m,1H),1.93-1.75(m,3H)。
実施例312
2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:メチル(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシピロリジン-2-カルボキシレート。メチル(2S,4R)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボキシレート(10g、55.1mmol、1当量、HCl)の酢酸エチル(10mL)中溶液に、イミダゾール(7.50g、110mmol、2当量)およびTBDPSCl(16.7g、60.6mmol、15.6mL、1.1当量)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。沈殿物を濾過して取り除いた。濾液を減圧下で濃縮し、残留物を酢酸エチル(200mL)および水(100mL)で溶解した。有機相をブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸マグネシウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 10/1→1/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、メチル(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシピロリジン-2-カルボキシレート(2.9g、7.41mmol、13%収率、98%純度)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:384。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.64(dt,J=1.2,7.2Hz,4H),7.47-7.35(m,6H),4.40(td,J=2.4,4.8Hz,1H),4.07(t,J=8.0Hz,1H),3.70(s,3H),3.03-2.96(m,1H),2.96-2.89(m,1H),2.17-2.07(m,1H),1.84-1.77(m,1H),1.07(s,9H)。
ステップB:メチル(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-カルボキシレート。メチル(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシピロリジン-2-カルボキシレート(2.7g、7.04mmol、1当量)およびホルムアルデヒド(37%水溶液、2.86g、35.2mmol、2.62mL、5当量)のMeOH(20mL)中溶液に、CH3COOH(423mg、7.04mmol、403μL、1当量)およびNaBH3CN(1.77g、28.2mmol、4当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(200mL)で希釈し、水(2×100mL)およびブライン(1×100mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 20/1→3/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、メチル(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-カルボキシレート(2.4g、5.71mmol、81%収率、94.6%純度)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:398。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.63(ddd,J=1.2,4.0,7.6Hz,4H),7.46-7.32(m,6H),4.47-4.39(m,1H),3.71(s,3H),3.32(t,J=8.4Hz,1H),3.24(dd,J=6.0,9.6Hz,1H),2.43-2.40(m,1H),2.40(s,3H),2.23-2.00(m,2H),1.07(s,9H)。
ステップC:[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。メチル(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-カルボキシレート(2.20g、5.53mmol、1.00当量)のTHF(40mL)中溶液に、LiAlH4(840mg、22.1mmol、4.00当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。混合物を、水(1.00mL)、水酸化ナトリウム溶液(15.0%、2.00mL)、および水(3.00mL)でクエンチした。沈殿物を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/10)により精製し、[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.70g、4.55mmol、82%収率)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:370。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.68-7.61(m,4H),7.46-7.35(m,6H),4.35-4.26(m,1H),3.62(dd,J=3.2,10.8Hz,1H),3.34(dd,J=2.0,10.8Hz,1H),3.14(dd,J=5.6,10.0Hz,1H),2.78-2.70(m,1H),2.43(dd,J=6.0,9.6Hz,1H),2.33(s,3H),2.02-1.93(m,1H),1.92-1.84(m,1H),1.06(s,9H)。
ステップD:tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.30g、531μmol、1.00当量)および[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(295mg、797μmol、1.50当量)のTHF(5mL)中溶液に、t-BuONa(102mg、1.06mmol、2.00当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌後、混合物をHCl溶液(1.00M、0.40mL)によりpH=7に調整し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=1/3)により精製して、tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.22g、238μmol、45%収率)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:870。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.68(br d,J=8.0Hz,1H),7.66-7.61(m,4H),7.57(br t,J=7.2Hz,1H),7.44-7.34(m,7H),7.33-7.28(m,1H),4.61(br s,1H),4.45-4.28(m,2H),4.09-3.95(m,4H),3.87(br d,J=12.8Hz,1H),3.28-3.15(m,4H),3.10(ddd,J=3.6,7.2,12.0Hz,2H),3.02-2.93(m,1H),2.88-2.67(m,4H),2.48(s,3H),2.45-2.34(m,2H),2.14-2.07(m,1H),1.94-1.80(m,1H),1.52(s,9H),1.06(s,9H)。
ステップE:2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.08g、91.9μmol、1.00当量)およびTFA(157mg、1.38mmol、102μL、15.0当量)のジクロロメタン(150μL)中混合物を、10℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(81.3mg、粗製、TFA)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:770。
ステップF:2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.08g、粗製、TFA)およびEt3N(91.6mg、905μmol、125.96μL)のジクロロメタン(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(11.4mg、90.5μmol)を-40℃で加えた。20℃で0.5時間撹拌後、混合物を水(0.20mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/10)により精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮し、2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.06g、65.5μmol、2ステップで72%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M/2+1]:412。
ステップG:2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.05g、60.7μmol、1.00当量)およびTBAF(1.00M、607μL、10.0当量)のTHF(0.50mL)中混合物を、20℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、酢酸エチル/メタノール=3/1)および逆相フラッシュ[水(FA、0.10%)/アセトニトリル]により精製し、次いで、分取HPLCカラム:Boston pH-lex 150*25 10μm;移動相:[水(0.10%、TFA)-ACN];B%:31%~61%、10分およびカラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:42%~72%、12分によりさらに精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[4-[2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例312、3.70mg、6.30μmol、10%収率、99.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:586。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.69(d,J=8.0Hz,1H),7.58(t,J=8.0Hz,1H),7.41(d,J=8.0Hz,1H),7.30(t,J=8.0Hz,1H),6.57(br d,J=10.8Hz,1H),6.39(dd,J=1.6,16.4Hz,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.06(br s,1H),4.49-4.42(m,1H),4.37(ddd,J=3.2,4.8,10.8Hz,1H),4.25-4.17(m,1H),4.15-4.06(m,3H),3.97(br d,J=10.8Hz,1H),3.60(br s,1H),3.43(dd,J=6.0,10.0Hz,1H),3.33(br s,1H),3.23-3.16(m,1H),3.15-3.06(m,2H),3.04-2.89(m,3H),2.88-2.66(m,4H),2.48(s,3H),2.33(dd,J=6.0,10.0Hz,1H),2.13-1.93(m,2H)。
実施例313
2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[[4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-1-イル]メトキシ]エチルトリメチルシラン。4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール(1g、3.77mmol、1当量)のDMF(45mL)中溶液に、NaH(181mg、4.53mmol、60.0%純度、1.2当量)を0℃で加えた。0℃で1時間撹拌後、SEM-Cl(818mg、4.91mmol、868μL、1.3当量)のDMF(15mL)中溶液を滴加した。混合物を20℃に温め、1時間撹拌した。混合物を塩化アンモニウム飽和水溶液(50mL)でクエンチし、水(100mL)で希釈し、次いで、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 1:0~100:1)により精製して、2-[[4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-1-イル]メトキシ]エチルトリメチルシラン(430mg、1.03mmol、27.4%収率、95.0%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.18(s,1H),7.74-7.66(m,1H),7.63-7.56(m,1H),5.76(s,2H),3.59-3.49(m,2H),0.93-0.86(m,2H),-0.01--0.08(m,9H)。
ステップB:tert-ブチル 4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.59g、8.36mmol、1当量)、2-ピペラジン-2-イルアセトニトリル(中間体62、1.99g、10.0mmol、1.2当量、2HCl)のDMF(30mL)中溶液に、DIEA(2.16g、16.7mmol、2.91mL、2当量)を加え、次いで、混合物を80℃まで加熱し、80℃で2時間撹拌した。水(80mL)を混合物に加えた。得られた混合物をEtOAc(20mL)で希釈し、EtOAc(5×60mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(80mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=40%)で精製して、tert-ブチル 4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.37g、5.27mmol、63.1%収率、90.0%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:405。
ステップC:tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.37g、5.86mmol、1当量)、EtOAc(30mL)中のNaHCO3(1.48g、17.6mmol、684μL、3当量)、および水(15mL)の溶液に、CbzCl(2.00g、11.7mmol、1.67mL、2当量)を滴加し、次いで、混合物を25℃で13時間撹拌した。混合物をEtOAc(15mL)で希釈し、EtOAc(2×15mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(15mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=20:1~0:1)により精製して、tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.91g、5.13mmol、87.6%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:539。
ステップD:tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.91g、5.40mmol、1当量)のEtOAc(60mL)およびACN(20mL)中溶液に、m-CPBA(1.10g、5.40mmol、85.0%純度、1当量)を0℃で加え、次いで、混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2S2O3(30mL)により0℃でクエンチし、次いで、EtOAc(50mL)で抽出した。有機層を、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%NH3・H2O)=62%)により精製して、tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.65g、4.73mmol、87.6%収率、99.0%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:555。
ステップE:tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.2g、3.97mmol、1当量)、[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(914mg、7.93mmol、2当量)のトルエン(44mL)中溶液に、t-BuONa(572mg、5.95mmol、1.5当量)を0℃で加え、次いで、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。水(15mL)を混合物に加えた。得られた混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=45%)により精製して、tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.64g、2.52mmol、63.5%収率、93.0%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:605。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.44-7.31(m,5H),5.19(s,2H),4.71-4.54(m,2H),4.35(br d,J=19.2Hz,1H),4.24-4.16(m,2H),4.11-3.92(m,2H),3.79(br d,J=12.4Hz,2H),3.28(br d,J=12.8Hz,3H),2.98(dt,J=3.2,12.4Hz,1H),2.87-2.44(m,8H),2.36(s,3H),2.12-2.06(m,1H),1.87(br s,2H),1.49(s,9H)。
ステップF:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.64g、2.71mmol、1当量)のジオキサン(30mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、30mL、44.32当量)を0℃で加え、次いで、混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=35.5%)により精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.95g、1.78mmol、65.9%収率、95.0%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:506。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.32(m,5H),5.19(s,2H),4.66(br s,1H),4.25-4.07(m,3H),4.01-3.91(m,3H),3.83(br d,J=13.6Hz,1H),3.38-3.18(m,2H),3.16-3.07(m,1H),3.03-2.92(m,2H),2.81(br s,1H),2.75-2.65(m,3H),2.60(br d,J=5.6Hz,3H),2.55-2.45(m,2H),2.36(s,3H),2.14-1.97(m,1H),1.68-1.54(m,2H)。
ステップG:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(510mg、1.01mmol、1当量)、2-[[4-ブロモ-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-1-イル]メトキシ]エチルトリメチルシラン(399mg、1.01mmol、1当量)、RuPhos(188mg、403μmol、0.4当量)、およびCs2CO3(986mg、3.03mmol、3当量)のトルエン(10mL)中溶液に、Pd2(dba)3(185mg、202μmol、0.2当量)をN2下で加え、この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物を90℃に温め、90℃で14時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAc(2×15mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=55%)により精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(365mg、423μmol、41.9%収率、95.0%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:820。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.15(s,1H),7.70(d,J=8.8Hz,1H),7.52(d,J=8.8Hz,1H),7.42-7.33(m,5H),5.76(s,2H),5.24-5.16(m,2H),4.70(br s,1H),4.42-4.27(m,2H),4.21(br d,J=6.8Hz,2H),4.06(br d,J=10.8Hz,1H),3.90(br d,J=12.4Hz,1H),3.61-3.54(m,2H),3.50-3.38(m,2H),3.31(br d,J=11.6Hz,2H),3.10-2.99(m,1H),2.86(br s,2H),2.81-2.66(m,4H),2.65-2.57(m,1H),2.56-2.44(m,2H),2.36(s,3H),2.12-2.06(m,1H),2.04-1.96(m,1H),1.69-1.56(m,1H),0.95-0.87(m,2H),-0.03--0.10(m,9H)。
ステップH:2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。NH3をMeOH(6mL)中に5分間バブリングした。この溶液に、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(310mg、378μmol、1当量)、Pd/C(150mg、10.0%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、28℃で1時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。化合物である2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(165mg、240μmol、63.6%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:686。
ステップI:2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(190mg、277μmol、1当量)、DIEA(107mg、831μmol、145μL、3当量)のDCM(4mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(41.9mg、332μmol、1.2当量)を0℃で加え、次いで、混合物を28℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(1mL)によりクエンチし、DCM(3×4mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。化合物である2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、233μmol、84.2%収率、75.0%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:740。
ステップJ:2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(220mg、297μmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(1.70g、14.9mmol、1.10mL、50当量)を加え、混合物を28℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3(12mL)によりPH=8に塩基化した。得られた混合物をDCM:MeOH(10:1)(3×15mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EtOAc:MeOH=100:1~10:1)により精製し、残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:44%~74%、12分)により精製して、2-[4-[2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-7-[5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例313、1.23mg、2.01μmol、6.74e-1%収率、99.4%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:610。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=8.38(s,1H),7.70(d,J=8.8Hz,1H),7.57(d,J=8.8Hz,1H),6.84(br s,1H),6.31(br d,J=16.8Hz,1H),5.86(br d,J=10.8Hz,1H),5.13(br s,1H),4.62(br s,1H),4.37-4.20(m,5H),4.14(br d,J=11.6Hz,1H),3.64(br s,1H),3.50(br d,J=4.8Hz,2H),3.41-3.34(m,1H),3.29-3.16(m,2H),3.03(br d,J=6.4Hz,1H),2.94(br s,2H),2.88-2.80(m,1H),2.80-2.72(m,1H),2.69(br t,J=6.8Hz,2H),2.58-2.51(m,1H),2.43(s,3H),2.17-2.06(m,1H),1.75-1.64(m,1H)。
実施例314
2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、900mg、1.78mmol、1.0当量)、Pd2(dba)3(245mg、267μmol、0.15当量)、RuPhos(166mg、356μmol、0.20当量)、およびCs2CO3(1.16g、3.56mmol、2.0当量)のトルエン(10.0mL)中溶液に、(3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(中間体30、1.09g、3.56mmol、2.0当量)を加えた。混合物を100℃で5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(20.0mL)に加え、EA(20mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=10:1→EA:MeOH=10:1)により精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.0g、1.42mmol、79%収率、93.8%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.08(d,J=8.4Hz,1H),7.74(d,J=8.0Hz,1H),7.48-7.32(m,7H),6.91(d,J=2.0Hz,1H),6.80(d,J=2.0Hz,1H),5.27-5.15(m,2H),4.70(br s,1H),4.51-4.33(m,1H),4.30-4.03(m,5H),3.94-3.87(m,3H),3.53-3.40(m,1H),3.32(br d,J=12.4Hz,3H),3.16(br t,J=7.6Hz,1H),3.06(dt,J=3.6,12.6Hz,1H),2.97-2.72(m,6H),2.52(s,3H),2.39-2.28(m,1H),2.15-2.06(m,1H),1.93-1.74(m,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。NH3をMeOH(50.0mL)中に-60℃で30分間バブリングした。次いで、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.0g、1.51mmol、1.0当量)およびPd/C(1.0g、10%純度)を、上記液体にN2雰囲気下で加えた。懸濁液に対してH2による脱気とパージを3回繰り返した。混合物をH2(15Psi)下、20℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をセライトで濾過し、真空下で濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(600mg、粗製)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:528。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(600mg、1.14mmol、1.0当量)およびDIEA(882mg、6.82mmol、1.19mL、6.0当量)のDCM(6.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(143mg、1.14mmol、1.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(100mg)でクエンチし、真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:52%~80%、12分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例314、90.5mg、155μmol、14.0%収率、99.5%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:582。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.09(d,J=8.4Hz,1H),7.75(d,J=8.4Hz,1H),7.45(t,J=7.2Hz,1H),7.36(t,J=7.6Hz,1H),6.91(d,J=2.0Hz,1H),6.81(d,J=2.4Hz,1H),6.68-6.53(m,1H),6.41(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.19-4.50(m,1H),4.40(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.31-4.08(m,4H),4.07-3.85(m,5H),3.79-3.41(m,2H),3.41-3.22(m,2H),3.20-3.04(m,2H),3.02-2.75(m,4H),2.72-2.65(m,1H),2.49(s,3H),2.33-2.24(m,1H),2.11-2.01(m,1H),1.90-1.71(m,3H)。
実施例315
2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、0.90g、1.55mmol、1.00当量)および[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(687mg、1.86mmol、1.20当量)のTHF(20.0mL)中溶液に、t-BuONa(298mg、3.10mmol、2.00当量)を0℃で加えた。25℃で1時間撹拌した後、混合物を酢酸エチル(50.0mL)で希釈し、水(30.0mL)およびブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/10)により精製して、ベンジル(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.90g、873μmol、56%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M/2+1]:443。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.24-8.18(m,1H),7.90-7.83(m,1H),7.71-7.57(m,5H),7.53-7.47(m,2H),7.45-7.35(m,12H),7.14(br d,J=7.6Hz,1H),5.21(s,2H),4.68(br s,1H),4.43-4.36(m,1H),4.33(br dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.26(br s,2H),4.16-4.03(m,3H),3.93(br d,J=12.8Hz,1H),3.47(br s,1H),3.30(br d,J=10.4Hz,3H),3.17(br dd,J=6.0,10.0Hz,1H),3.11-2.96(m,3H),2.84(br s,2H),2.78-2.70(m,1H),2.48-2.37(m,4H),2.11(ddd,J=4.8,8.4,12.8Hz,1H),1.96-1.82(m,1H),1.06(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-60℃でNH3をメタノール(50mL)中に0.5時間バブリングした。混合物に、ベンジル(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.90g、1.02mmol、1.00当量)およびPd/C(0.10g、10.0%純度)を加えた。15psiのH2下、20℃で1時間撹拌後、混合物を濾過し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(763mg、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:752。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.76g、粗製)およびEt3N(511mg、5.05mmol、703μL)のジクロロメタン(5.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(127mg、1.01mmol)を-40℃で加えた。20℃で1時間撹拌した後、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(0.20mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/10)により精製して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.50g、552μmol、2ステップで55%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:806。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=8.25-8.17(m,1H),7.90-7.82(m,1H),7.68-7.58(m,5H),7.50(td,J=2.4,5.2Hz,2H),7.46-7.35(m,7H),7.14(d,J=7.6Hz,1H),6.67-6.51(m,1H),6.46-6.31(m,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.08(br s,1H),4.43-4.31(m,2H),4.27(br s,2H),4.16-4.00(m,4H),3.67-3.55(m,1H),3.46(br s,1H),3.31(br dd,J=8.4,14.4Hz,2H),3.17(br dd,J=6.0,9.6Hz,1H),3.11-2.73(m,6H),2.47(s,3H),2.42(br dd,J=6.0,9.6Hz,1H),2.11(tt,J=4.0,8.4Hz,1H),1.96-1.84(m,1H),1.06(s,9H)。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.40g、496μmol、1.00当量)、KF(57.7mg、992μmol、23.3μL、2.00当量)、および18-クラウン-6(262mg、992μmol、2.00当量)のTHF(10.0mL)中混合物を、30℃で24時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(TFA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を飽和重炭酸ナトリウム(2.00mL)によりpH>7に調整し、酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:37%~67%、12分)により精製した。目的の画分を濃縮し、凍結乾燥して、標記化合物2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例315、51.5mg、90.7μmol、18%収率、96.3%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:568。
SFC:「AS-3S_3_5_40_3ML カラム:Chiralpak AS-3 100×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中のメタノール(0.05%、DEA) 流速:3ml/min 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.26-8.17(m,1H),7.91-7.83(m,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.55-7.48(m,2H),7.44(t,J=8.0Hz,1H),7.15(d,J=7.2Hz,1H),6.59(br s,1H),6.47-6.36(m,1H),5.84(br d,J=10.8Hz,1H),5.11(br s,1H),4.52-4.43(m,1H),4.39(dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.34-4.20(m,3H),4.15(br d,J=14.0Hz,1H),4.02(br d,J=12.0Hz,2H),3.61(br s,1H),3.53-3.41(m,2H),3.34(br s,2H),3.12(br s,1H),3.05-2.89(m,3H),2.88-2.66(m,2H),2.50(s,3H),2.34(dd,J=5.6,10.0Hz,1H),2.16-1.94(m,2H)。
実施例316
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(4-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、1.0g、1.98mmol、1.0当量)および1-ブロモ-4-フルオロ-ナフタレン(2.23g、9.89mmol、5.0当量)のトルエン(20.0mL)中溶液に、Cs2CO3(1.93g、5.93mmol、3.0当量)、XPhos-Pd-G3(335mg、396μmol、0.2当量)を加え、反応混合物をN2下、70℃で24時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を水(20.0mL)に加え、EA(2×20.0mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=20:1)により精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(680mg、957μmol、48%収率、91.4%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:650。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(650mg、1.0mmol、1.0当量)のMeOH(15mL)中溶液に、NH3・MeOH(1.0mmol、15.0mL、1.0当量)およびPd/C(500mg、10%純度)を加え、この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15Psi)下、20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をセライトで濾過し、濾液を濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(460mg、824μmol、82%収率、92.4%純度)を白色固体として得て、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(460mg、892μmol、1.0当量)のDCM(10mL)中混合物に、DIEA(461mg、3.57mmol、622μL、4.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(113mg、892μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(5.0mL)でクエンチし、濃縮した。残留物を分取HPLC(Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:53%~83%、12分)により精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例316、100mg、175μmol、20%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.28-8.22(m,1H),8.17-8.10(m,1H),7.63-7.55(m,2H),7.14-7.05(m,2H),6.70-6.55(m,1H),6.42(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.86(br d,J=10.4Hz,1H),5.20-4.48(m,1H),4.41(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.33-4.10(m,4H),4.09-3.92(m,2H),3.78-3.20(m,4H),3.19-3.07(m,2H),3.05-2.64(m,5H),2.50(s,3H),2.36-2.25(m,1H),2.13-2.02(m,1H),1.92-1.73(m,3H)。
実施例317
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、880mg、1.87mmol、1.0当量)および(4-ブロモ-2-ナフチル)2,2-ジメチルプロパノエート(中間体54、745mg、2.43mmol、1.3当量)のトルエン(20.0mL)中混合物に、Cs2CO3(1.22g、3.73mmol、2.0当量)、RuPhos(174mg、373μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(171mg、187μmol、0.1当量)を加え、混合物をN2下、90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(30mL)に加え、次いで、EA(2×20mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=20/1)により精製して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(750mg、774μmol、41%収率、72.9%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:698。
ステップB:[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(750mg、774μmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中溶液に、TFA(7.70g、67.5mmol、5.0mL、87.3当量)を加え、反応混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を濃縮して、[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(550mg、粗製、TFA)を褐色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:598。
ステップC:[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート。[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(550mg、773μmol、1.0当量、TFA)のDCM(5mL)中混合物に、TEA(469mg、4.64mmol、645μL、6.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(97.5mg、773μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(5.0mL)でクエンチし、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル/メタノール=10/1)により精製して、[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(270mg、323μmol、42%収率、78.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:652。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。[4-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]2,2-ジメチルプロパノエート(270mg、323μmol、1.0当量)のTHF(2.0mL)中混合物に、NaOH(38.8mg、969μmol、3.0当量)のH2O(2.0mL)中溶液を加え、反応混合物を20℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10mL)に加え、次いで、EA(2×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna Phenyl-Hexyl 150_30_5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:35%~62%、3分)により精製し、得られた生成物を濃縮し、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例317、26.6mg、46.3μmol、14%収率、98.8%純度)を桃色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:568。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.01-7.93(m,1H),7.64(br d,J=8.4Hz,1H),7.41(br t,J=7.2Hz,1H),7.33-7.29(m,2H),6.88(s,1H),6.66-6.50(m,2H),6.39(br d,J=16.4Hz,1H),5.84(br d,J=10.8Hz,1H),5.04-4.89(br s,1H),4.64-4.49(m,1H),4.32-4.21(m,1H),4.11(br s,2H),4.00(br d,J=14.0Hz,1H),3.94-3.71(m,2H),3.47-3.08(m,4H),2.93-2.61(m,10H),2.47-2.33(m,1H),2.25-2.06(m,1H),2.00-1.89(m,3H)。
実施例318
2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(中間体64、500mg、901μmol、1.00当量)および[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(208mg、1.80mmol、2.00当量)のトルエン(10.0mL)中溶液に、t-BuONa(173mg、1.80mmol、2.00当量)を加えた。混合物を0℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(5mL)で希釈し、EtOAc(2×30mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。飽和炭酸水素ナトリウム溶液でpHを7に調整し、混合物を酢酸エチル(2×30mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(340mg、505μmol、56%収率、90.0%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.45-7.32(m,5H),5.28-5.12(m,2H),4.70-4.55(m,2H),4.42-4.29(m,2H),4.15-3.93(m,3H),3.90-3.75(m,2H),3.43-3.16(m,3H),3.09(br t,J=7.6Hz,1H),2.98(dt,J=3.6,12.4Hz,1H),2.89-2.54(m,5H),2.47(s,3H),2.33-2.22(m,1H),2.05-1.96(m,1H),1.90-1.74(m,3H),1.49(s,9H)。
ステップB:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(340mg、561μmol、1.00当量)のジオキサン(4.00mL)中溶液にHCl/ジオキサン(4M、4.00mL)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。pHを飽和重炭酸ナトリウム水溶液で8に調整し、混合物を混合溶媒(DCM/i-PrOH 2/1、2×9mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(255mg、444μmol、79%収率、88.0%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:506。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(2.00mL)中のベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、366μmol、1.00当量)、1-ブロモ-4-フルオロ-ナフタレン(247mg、1.10mmol、3.00当量)、RuPhos(68.2mg、146μmol、0.40当量)、t-BuONa(87.8mg、914μmol、2.50当量)、およびPd2(dba)3(66.9mg、73.1μmol、0.20当量)を、脱気し、次いで、N2下で90℃まで15時間加熱した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮し、水(3mL)で希釈し、EtOAc(2×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。混合物を飽和炭酸水素ナトリウム溶液で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、175μmol、48%収率、95.0%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.23(dd,J=2.0,4.4Hz,1H),8.16-8.08(m,1H),7.60-7.52(m,2H),7.44-7.33(m,5H),7.14-7.02(m,2H),5.28-5.16(m,2H),4.69(br s,1H),4.39(dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.29-4.14(m,4H),4.07(br s,1H),3.95(br d,J=12.4Hz,1H),3.54-3.15(m,4H),3.14-3.03(m,2H),3.00-2.61(m,5H),2.48(s,3H),2.35-2.23(m,1H),1.97-2.05(m,1H),1.92-1.83(m,3H)。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-40℃でNH3をMeOH(5.00mL)中に3分間バブリングした。この溶液に、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、185μmol、1.00当量)のMeOH(5.00mL)中溶液およびPd/C(60.0mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。反応物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80.0mg、147μmol、79%収率、94.6%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップE:2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80.0mg、155μmol、1.00当量)およびTEA(78.5mg、776μmol、108μL、5.00当量)のDCM(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(19.6mg、155μmol、1.00当量)を0℃で滴加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、水(2mL)で希釈し、EtOAc(2×5mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物は、分取TLC(EtOAc/MeOH 7/1)および分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%の水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:52%-82%(12の分))によって精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例318、21.0mg、36.7μmol、24%収率、99.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
SFC条件:OD-3S_3_40_3 ML カラム:Chiralcel OD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.33-8.22(m,1H),8.16-8.08(m,1H),7.62-7.52(m,2H),7.14-7.02(m,2H),6.59(br s,1H),6.46-6.36(m,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.10(br s,1H),4.87-4.33(m,2H),4.30-4.10(m,4H),4.09-3.78(m,2H),3.77-3.23(m,2H),3.22-2.53(m,8H),2.48(s,3H),2.34-2.23(m,1H),2.13-2.00(m,1H),1.92-1.76(m,3H)。
実施例319
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(1.31g、11.4mmol、3当量)のTHF(10mL)中溶液に、NaH(304mg、7.59mmol、鉱油中60%純度、2当量)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2g、3.79mmol、1当量)を混合物に加え、混合物を80℃で3時間撹拌した。反応混合物を氷水(20mL)でクエンチし、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1g、1.60mmol、42%収率、97%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:606。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.31(m,5H),5.19(s,2H),4.75-4.64(m,1H),4.59(br s,1H),4.44(d,J=18.8Hz,1H),4.35(br s,1H),4.21-4.11(m,1H),4.07-3.64(m,4H),3.43(br s,1H),3.30-3.15(m,2H),3.10(br t,J=7.6Hz,1H),3.03-2.91(m,1H),2.83-2.55(m,5H),2.53-2.42(m,3H),2.35-2.22(m,1H),2.11-2.01(m,1H),1.88-1.74(m,3H),1.51(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。-60℃でNH3をMeOH(100mL)中に30分間バブリングした。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(900mg、1.49mmol、1当量)の上記混合物中溶液に、無水Pd/C(500mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(650mg、1.24mmol、84%収率、90%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:472。
ステップC:tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。1-ブロモ-3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(1.32g、5.09mmol、4当量)、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.27mmol、1当量)、Cs2CO3(1.04g、3.18mmol、2.5当量)、Pd2(dba)3(233mg、254μmol、0.2当量)、およびRuPhos(118mg、254μmol、0.2当量)のトルエン(10mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で3時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=100/1~10:1)により精製し、逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル)]によりさらに精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でPH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(370mg、569μmol、45%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:650
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40(t,J=8.0Hz,1H),7.30-7.24(m,1H),7.19(d,J=8.4Hz,1H),4.61(br s,1H),4.40(br s,1H),4.24-4.14(m,1H),4.13-3.98(m,4H),3.95-3.80(m,1H),3.39-2.95(m,6H),2.93-2.62(m,5H),2.52(br s,3H),2.32(br s,1H),2.14-2.05(m,1H),1.85-1.71(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(370mg、569μmol、1当量)のDCM(700μL)中溶液に、TFA(973mg、8.54mmol、632μL、15当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(377mg、567μmol、99%収率、TFA)を黄色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:550。
ステップE:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(377mg、567μmol、1当量、TFA)のDCM(5mL)中溶液に、TEA(574mg、5.68mmol、790μL、10当量)を0℃で加えた。添加後、DCM(1mL)中のプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(57.3mg、454μmol、0.8当量)を、0℃で滴加した。25℃で1時間撹拌した後、反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(1mL)でクエンチした。次いで、水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、EA/MeOH=100/1→10:1)により精製して、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)によりさらに精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例319、95mg、154μmol、27%収率、98%純度)を凍結乾燥後に白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:604。
SFC条件:「OD-3S_3_5_40_3ML カラム:Chiralcel OD-3 100×4.6mm I.D.3μm 移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロ
ロホルム-d)δ=7.40(d,J=8.0Hz,1H),7.29-7.25(m,1H),7.19(d,J=8.0Hz,1H),6.71-6.51(m,1H),6.45-6.34(m,1H),5.83(d,J=10.4Hz,1H),5.25-4.52(m,1H),4.38(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.22-4.04(m,4H),3.96(br d,J=11.6Hz,2H),3.74-3.02(m,5H),2.99-2.61(m,6H),2.48(s,3H),2.35-2.23(m,1H),2.14-1.97(m,1H),1.92-1.79(m,3H)。
実施例320
2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、300mg、517μmol、1.0当量)([(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メタノール(148mg、1.03mmol、2.0当量))のトルエン中(15.0mL)混合物に、t-BuONa(99.3mg、1.03mmol、2.0当量)を0℃で少しずつ加え、反応混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を水(10.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%FA、0~60%MeCN)により精製した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液でpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、272μmol、53%収率、99.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:660。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-60℃でNH3をメタノール(20.0mL)中に30分間バブリングした。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、197μmol、1.0当量)およびPd/C(80.0mg、197μmol、10%純度、1.0当量)を上記混合物に加え、次いで、混合物に対してH2による脱気とパージを3回繰り返し、次いで、混合物をH2雰囲気下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、粗製混合物をセライトパッドで濾過した。ケーキをメタノール(30.0mL)で洗浄し、濾液を高真空下で乾燥した。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(75.0mg、132μmol、67%収率、92.6%純度)を灰色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:526。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、190μmol、1.0当量)のDCM(5.00mL)中溶液に、DIEA(73.8mg、571μmol、99.4μL、3.0当量)を加え、N2雰囲気下、0℃でプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(36.0mg、285μmol、1.50当量)を滴加した。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を水(10.0mL)でクエンチした。粗製混合物を酢酸エチル(3×15.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(30.0mL)で洗浄し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna Phenyl-Hexyl 150_30_5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:52%~82%、3分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-イソプロピルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例320、21.3mg、36.1μmol、19%収率、98.1%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:580。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.24-8.21(m,1H),7.89-7.87(m,1H),7.63(d,J=8.0Hz,1H),7.54-7.50(m,2H),7.45(t,J=7.8Hz,1H),7.16(d,J=7.2Hz,1H),6.65-6.57(m,1H),6.42(dd,J=1.8,16.8Hz,1H),5.86(d,J=10.0Hz,1H),5.16-4.51(m,1H),4.35-4.22(m,3H),4.15-3.95(m,4H),3.68-3.47(m,1H),3.42-2.77(m,11H),2.58-2.52(m,1H),1.90-1.75(m,3H),1.17(d,J=6.4Hz,3H),1.10(d,J=6.4Hz,3H)。
実施例321
1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-ヒドロキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル(3S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(2g、6.80mmol、1当量)、tert-ブチル(3S)-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(1.50g、7.48mmol、1.1当量)、DIEA(1.76g、13.6mmol、2.37mL、2当量)のNMP(40mL)中溶液を100℃で7時間撹拌した。水(80mL)を混合物に加えた。得られた混合物をEtOAc(20mL)で希釈し、EtOAc(3×80mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAc(3×5mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物を(PE:EtOAc=3:1、20mL)でトリチュレートし、濾過し、濾過ケーキを(PE:EtOAc=3:1、40mL)で洗浄した。化合物であるtert-ブチル(3S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1.44g、3.14mmol、46.2%収率)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:458。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.39-7.28(m,5H),4.29-4.20(m,1H),4.16-3.81(m,2H),3.76(br s,1H),3.73(br s,1H),3.68(s,2H),3.61(d,J=10.4Hz,2H),3.37-3.28(m,1H),3.11(br s,2H),2.73-2.58(m,4H),1.48(s,9H),1.23(d,J=6.8Hz,3H)。
ステップB:tert-ブチル(3S)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(830mg、7.21mmol、855μL、2.5当量)のTHF(25mL)中溶液に、NaH(230mg、5.76mmol、60%純度、2当量)を0℃で加え、0℃で0.5時間撹拌した。次いで、tert-ブチル(3S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1.32g、2.88mmol、1当量)を、混合物に加えた。反応混合物をチューブ中でN2下で70℃まで12時間加熱した。反応混合物を水(10mL)でクエンチした。得られた混合物をEtOAc(20mL)で希釈し、EtOAc(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=40%)により精製して、tert-ブチル(3S)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1.35g、2.39mmol、82.9%収率、95%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:537。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40-7.27(m,5H),4.37(br dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.22-4.14(m,2H),4.07-3.73(m,2H),3.71-3.64(m,3H),3.63-3.49(m,2H),3.34-3.24(m,1H),3.21-2.92(m,3H),2.79-2.64(m,2H),2.63-2.56(m,3H),2.51(s,3H),2.33(br d,J=7.6Hz,1H),2.12-2.05(m,1H),1.92-1.69(m,3H),1.48(s,9H),1.20(d,J=6.8Hz,3H)。
ステップC:tert-ブチル(3S)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(3S)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1.43g、2.66mmol、1当量)のMeOH(28mL)中溶液に、Pd(OH)2/C(500mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で4時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3×20mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=40%)により精製し、tert-ブチル(3S)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(810mg、1.72mmol、64.7%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:447。
ステップD:tert-ブチル(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(3S)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、1.12mmol、1当量)、2-ブロモ-1-フルオロ-3-メトキシ-ベンゼン(459mg、2.24mmol、2当量)、およびt-BuONa(323mg、3.36mmol、3当量)のトルエン(10mL)中溶液に、BrettPhos-Pd-G3(304mg、336μmol、0.3当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、90℃で16時間撹拌した。水(10mL)を混合物に加えた。得られた混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 2:1~0:1からEtOAc:MeOH 1:0~5:1)により精製し、次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:32%~57%、30;80%分)により精製して、tert-ブチル(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、300μmol、26.8%収率、95.0%純度)を褐色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:571。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.02(dt,J=6.4,8.4Hz,1H),6.75-6.65(m,2H),4.36(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.27(s,2H),4.24-4.17(m,1H),4.12-4.09(m,1H),3.84(s,3H),3.74-3.65(m,1H),3.38-3.27(m,3H),3.24-2.94(m,3H),2.67(br d,J=4.4Hz,3H),2.48(s,3H),2.32-2.23(m,1H),2.08(br d,J=3.2Hz,1H),2.04-1.98(m,1H),1.87-1.69(m,4H),1.49(s,9H),1.25-1.21(m,3H)。
ステップE:7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-4-[(2S)-2-メチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、368μmol、1当量)およびTFA(839mg、7.36mmol、545μL、20当量)の溶液を、25℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。化合物である7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-4-[(2S)-2-メチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(260mg、粗製、2TFA)を黄色油として得た。
ステップF:1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-4-[(2S)-2-メチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(260mg、粗製、2TFA)、DIEA(481mg、3.72mmol、648μL)のDCM(5mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(46.9mg、372μmol)を0℃で加え、次いで、混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を水でクエンチした(1mL)。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=33%)により精製して、1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(130mg、235μmol、63.2%収率、95.0%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:525。
ステップG:3-ブロモ-1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-ヒドロキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパン-1-オン。1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-メトキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(80mg、152μmol、1当量)のPhBr(2mL)中溶液に、BBr3(764mg、3.05mmol、294μL、20当量)を加えた。この反応混合物を90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮した。残留物を飽和NaHCO3
(2mL)でクエンチし、EtOAc(2×20mL)で抽出した。3-ブロモ-1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-ヒドロキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパン-1-オン(90mg、粗製)を褐色油として得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップH:1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-ヒドロキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。3-ブロモ-1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-ヒドロキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパン-1-オン(90mg、152μmol、1当量)のTHF(2mL)中溶液に、TEA(154mg、1.52mmol、212μL、10当量)を加えた。この反応混合物を20℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(DCM:MeOH=10:1)、次いで、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:48%~78%、12分)により精製して、標記化合物である1-[(3S)-4-[7-(2-フルオロ-6-ヒドロキシ-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例321、10.6mg、20.1μmol、13%収率、96.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:511。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=7.17-6.97(m,1H),6.93-6.76(m,1H),6.71(d,J=8.4Hz,1H),6.61(dd,J=8.8,11.2Hz,1H),6.29(br dd,J=4.8,16.4Hz,1H),5.82(br d,J=10.8Hz,1H),4.58-4.27(m,4H),4.20-4.04(m,3H),4.03-3.87(m,1H),3.68-3.39(m,2H),3.30(br s,2H),3.25-3.05(m,2H),2.82(br s,2H),2.75(td,J=6.8,13.6Hz,1H),2.51(s,3H),2.36(q,J=9.2Hz,1H),2.13-2.08(m,1H),1.89-1.78(m,2H),1.77-1.67(m,1H),1.28(br d,J=5.2Hz,3H)。
実施例322
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(4-フルオロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(40.0mL)中のベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.00g、4.56mmol、1.00当量)、1-ブロモ-4-フルオロ-ナフタレン(1.54g、6.84mmol、1.50当量)、Pd2(dba)3(418mg、456μmol、0.100当量)、RuPhos(426mg、912μmol、0.20当量)、および炭酸セシウム(4.46g、13.7mmol、3.00当量)を脱気し、次いで、N2雰囲気下で110℃まで3時間加熱した。20℃で水(20.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、酢酸エチル(30mL)で希釈し、酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50.0mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/1→0/1)により精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.00g、3.43mmol、75.2%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.24(dt,J=1.6,4.8Hz,1H),8.16-8.08(m,1H),7.64-7.53(m,2H),7.47-7.34(m,5H),7.15-7.03(m,2H),5.22(s,2H),4.72(br s,1H),4.29-4.17(m,2H),4.12-4.04(m,1H),3.95(br d,J=12.0Hz,1H),3.51-3.19(m,3H),3.14-2.68(m,5H),2.54(s,3H)。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.06g、1.82mmol、1.00当量)の酢酸エチル(33.0mL)中混合物に、m-CPBA(332mg、1.64mmol、85.0%純度、0.90当量)をN2雰囲気下、20℃で1度に加えた。混合物を20℃で5時間撹拌した。反応物を飽和チオ硫酸ナトリウム(20.0mL)によりクエンチし、次いで、酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出し、合わせた有機相をブライン(30.0mL)により洗浄し、濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、1.67mmol、91.8%の収率)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[M+1]:599.1。
ステップC:ベンジル-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、835.16μmol、1.00当量)および[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メタノール(216mg、1.67mmol、2.00当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に、ナトリウムtert-ブトキシド(120mg、1.25mmol、1.50当量)をN2雰囲気下、0℃で1度に加えた。混合物を0℃で30分間撹拌し、0℃で水(10.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20.0mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得、これを分取HPLC(TFA条件)により精製して、ベンジル-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、292μmol、35.0%収率、97.0%純度)を無色固体として得た。LCMS[M+1]:664.5。
ステップD:2-[4-[2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。0℃でNH3(g)をメタノール(2mL)中に5分間バブリングし、次いで、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、301μmol、1.00当量)のメタノール(2.00mL)中溶液に加え、次いで、Pd/C(100mg、10%純度)をN2雰囲気下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、20℃で1時間撹拌した。濾過し、濃縮して、2-[4-[2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、粗製)を黒色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[M+1]:530.5。
ステップE:2-[4-[2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[4-[2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、189μmol、1.00当量)およびDIEA(73.2mg、566μmol、98.7μL、3.00当量)のDCM(2.00mL)中混合物に、DCM(1.00mL)中のプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(47.6mg、378μmol、2.00当量)をN2雰囲気下、0℃で滴加した。混合物を20℃で30分間撹拌し、メタノール(1.00mL)を反応混合物に加え、次いで、溶媒を除去して残留物を得、これを分取TLC(SiO2、DCM:MeOH=10:1、1滴のNH4OHを加えた)により精製して、粗生成物を得た。次いで、分取HPLC(塩基条件)により、標記化合物である2-[4-[2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(4-フルオロ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(14.9mg、25.0μmol、13.2%収率、97.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:584.5。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ=8.25(dd,J=2.4,4.8Hz,1H),8.19-8.08(m,1H),7.63-7.54(m,2H),7.15-7.03(m,2H),6.61(br s,1H),6.47-6.38(m,1H),5.86(br d,J=10.2Hz,1H),5.12(br s,1H),4.38(dd,J=4.4,10.6Hz,1H),4.24(br s,2H),4.20-4.10(m,2H),4.04(br d,J=12.0Hz,2H),3.76-2.67(m,12H),2.52-2.37(m,1H),2.32-2.21(m,1H),2.09-1.97(m,1H),1.90-1.74(m,3H),1.16(t,J=7.2Hz,3H)。
実施例323
2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:メチル(2R,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-カルボキシレート。メチル(2R,4S)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボキシレート(3g、20.7mmol、1当量、HCl)およびホルムアルデヒド(8.39g、103mmol、7.69mL、37%純度、5当量)のMeOH(30mL)中溶液に、AcOH(1.24g、20.7mmol、1.18mL、1当量)を15℃で加えた。30分間撹拌後、NaBH3CN(3.25g、51.7mmol、2.5当量)を加えた。混合物を撹拌16時間した。飽和炭酸ナトリウム水溶液(50mL)を混合物に加え、次いで、ジクロロメタン/メタノール 10/1(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。メチル(2R,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-カルボキシレート(2g、12.6mmol、61%収率)を黄色油として得た。
ステップB:メチル(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチルピロリジン2-カルボキシレート。メチル(2R,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-カルボキシレート(1.70g、10.7mmol、1.00当量)のDMF(10.0mL)中溶液に、イミダゾール(1.67g、24.6mmol、2.30当量)およびtert-ブチルクロロジフェニルシラン(3.52g、12.8mmol、3.29mL、1.20当量)を加えた。混合物を20℃で10時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(20.0mL)で希釈し、ブライン(3×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/10)により精製して、メチル(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチルピロリジン-2-カルボキシレート(3.00g、7.24mmol、68%収率)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:398。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.63(ddd,J=1.6,3.6,7.6Hz,4H),7.46-7.35(m,6H),4.47-4.40(m,1H),3.71(s,3H),3.32(t,J=8.4Hz,1H),3.25(dd,J=6.0,10.0Hz,1H),2.42(br d,J=5.2Hz,1H),2.40(s,3H),2.18-2.01(m,2H),1.07(s,9H)。
ステップC:[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。メチル(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-カルボキシレート(1.50g、3.77mmol、1.00当量)のTHF(10.0mL)中溶液に、LiAlH4(573mg、15.1mmol、4.00当量)を-40℃で加えた。-40℃で1時間撹拌した後、混合物を水(0.50mL)、NaOH溶液(15.0%、1.00mL)、水(1.50mL)でクエンチした。形成された沈殿を濾過して取り除き、濾過ケーキを酢酸エチル(40.0mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル1/10)により精製して、[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.20g、3.18mmol、84%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:370。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.67-7.62(m,4H),7.46-7.36(m,6H),4.37-4.24(m,1H),3.63(dd,J=3.2,11.2Hz,1H),3.35(dd,J=2.0,10.8Hz,1H),3.15(dd,J=6.0,9.6Hz,1H),2.76(br t,J=8.0Hz,1H),2.44(dd,J=6.0,9.6Hz,1H),2.33(s,3H),2.04-1.85(m,2H),1.06(s,9H)。
ステップD:ベンジル(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(305mg、827μmol、1.20当量)のTHF(5.00mL)中溶液に、t-BuONa(132mg、1.38mmol、2.00当量)を0℃で加え、続いて、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、0.40g、689μmol、1.00当量)を加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、混合物を酢酸エチル(30.0mL)で希釈し、水(1×20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=1/3)により精製して、ベンジル(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.35g、328μmol、48%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M/2+1]:444。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.24-8.18(m,1H),7.90-7.84(m,1H),7.69-7.59(m,5H),7.52-7.48(m,2H),7.44-7.36(m,12H),7.14(d,J=7.2Hz,1H),5.21(s,2H),4.68(br s,1H),4.42-4.36(m,1H),4.32(br dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.26(br d,J=6.8Hz,2H),4.17-4.06(m,3H),3.98-3.88(m,1H),3.47(br s,1H),3.29(br d,J=10.8Hz,3H),3.16(br dd,J=6.0,9.6Hz,1H),3.11-2.95(m,3H),2.91-2.73(m,3H),2.47-2.36(m,4H),2.11(ddd,J=4.8,8.4,13.2Hz,1H),1.95-1.82(m,1H),1.06(s,9H)。
ステップE:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-78℃でNH3をメタノール(40.0mL)中に0.5時間バブリングした。この混合物に、ベンジル(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.32g、361μmol、1.00当量)およびPd/C(0.10g、10.0%純度)を加えた。15psiのH2下、25℃で1時間撹拌した後、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.27g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M/2+1]:377。
ステップF:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.27g、粗製)およびTEA(182mg、1.80mmol、250μL)のジクロロメタン(2.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(45.3mg、359μmol)を0℃で加えた。25℃で0.5時間撹拌後、混合物をメタノール(0.10mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=1/3)により精製して、2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.16g、171μmol、2ステップで48%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:806。
ステップG:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.16g、198μmol、1.00当量)、KF(46.1mg、794μmol、18.6μL、4.00当量)、および18-クラウン-6(210mg、794μmol、4.00当量)のTHF(2.00mL)中混合物を40℃で12時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(TFA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和重炭酸ナトリウム(2.00mL)によりpH>7に調整し、次いで、酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:38%~66%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例323、36.3mg、63.9μmol、32%収率、98.1%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:568。
SFC:「OJ-3S_3_5_40_3ML カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.25-8.18(m,1H),7.91-7.83(m,1H),7.62(d,J=8.0Hz,1H),7.55-7.48(m,2H),7.44(t,J=8.0Hz,1H),7.15(d,J=7.2Hz,1H),6.60(br s,1H),6.46-6.35(m,1H),5.84(br d,J=9.6Hz,1H),5.20-4.53(m,1H),4.47(quin,J=5.6Hz,1H),4.41(dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.34-4.19(m,3H),4.14(br d,J=13.2Hz,1H),4.02(br d,J=11.6Hz,2H),3.63(br s,1H),3.46(br dd,J=6.0,9.6Hz,2H),3.36(br s,2H),3.12(br s,1H),3.07-2.90(m,3H),2.90-2.67(m,2H),2.51(s,3H),2.35(dd,J=5.2,9.6Hz,1H),2.14-2.04(m,1H),2.04-1.96(m,1H)。
実施例324
2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、300mg、593μmol、1.00当量)、1-ブロモ-3-メトキシ-2-トルエン(239mg、1.19mmol、2当量)、Cs2CO3(580mg、1.78mmol、3当量)、Pd2(dba)3(109mg、119μmol、0.2当量)、およびRuPhos(83.1mg、178μmol、0.3当量)のトルエン(30mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃でに16時間撹拌した。反応混合物に、H2O(1×200mL)および酢酸エチル(1×250mL)を加えた。有機相を分離し、ブライン(1×200mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液でpH=7に中和し、酢酸エチル(100mL)で抽出した。抽出物を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(170mg、270μmol、45%収率、99.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:626。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.33(m,5H),7.16(t,J=8.0Hz,1H),6.72(d,J=8.0Hz,1H),6.68(d,J=8.0Hz,1H),5.20(s,2H),4.80(br dd,J=6.8,11.6Hz,1H),4.68(br s,1H),4.45(br dd,J=4.4,12.0Hz,1H),4.21-4.08(m,3H),4.05(s,2H),3.94(br d,J=12.8Hz,1H),3.85(s,3H),3.67-3.56(m,1H),3.32(br d,J=11.2Hz,3H),3.24-3.01(m,3H),2.95-2.67(m,8H),2.32-2.10(m,5H),2.00(br s,1H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(260mg、416μmol、1.00当量)、Pd/C(130mg、10%純度)、およびNH3のMeOH(50mL)中混合物に対してH2による脱気とパージを3回繰り返し、次いで、混合物を15psi圧のH2雰囲気下、25℃で1時間撹拌した。その後、触媒を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、376μmol、91%収率、92.4%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:492。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、407μmol、1.00当量)およびTEA(206mg、2.03mmol、283μL、5.00当量)のDCM(10mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(41.0mg、325μmol、0.800当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。0℃でNaHCO3飽和溶液(5mL)により反応混合物をクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(酢酸エチル/メタノール=20/1→3/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:48%~78%、12分)によりさらに精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-メトキシ-2-メチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例324、35.2mg、63.6μmol、16%収率、98.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:546。
SFC条件:OD-3S_3_40_3 ML カラム:Chiralcel OD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.17(t,J=8.4Hz,1H),6.73(d,J=8.0,1H)6.68(d,J=8.4,1H),6.59(br s,1H),6.46-6.34(m,1H),5.83(br d,J=10.0Hz,1H),5.10(br s,1H),4.39(dd,J=5.2,10.4Hz,1H),4.20-4.09(m,2H),4.06(s,2H),4.02-3.92(m,2H),3.85(s,3H),3.59(br s,1H),3.31(br d,J=12.0Hz,1H),3.22(br d,J=11.6Hz,1H),3.17-3.02(m,3H),3.02-2.62(m,6H),2.49(s,3H),2.36-2.25(m,1H),2.22(s,3H),2.13-1.99(m,1H),1.91-1.70(m,2H)。
実施例325
2-(1-アクリロイル-4-(7-(7-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4[7-(2-シアノフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、320mg、633μmol、1当量)および2-ブロモベンゾニトリル(230mg、1.27mmol、2当量)のトルエン(30mL)中混合物に、Cs2CO3(619mg、1.90mmol、3当量)、RuPhos(59.1mg、127μmol、0.2当量)、Pd2(dba)3(58.0mg、63.3μmol、0.1当量)を1度に加えた。混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、90℃まで加熱し、5時間撹拌した。反応混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(30mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液(5mL)で中和し、酢酸エチル(100mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4[7-(2-シアノフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(139mg、210μmol、33%収率、91.5%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:607。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.62(dd,J=1.2,7.6Hz,1H),7.56-7.49(m,1H),7.42-7.33(m,5H),7.09-7.00(m,2H),5.21(s,2H),4.68(br s,1H),4.38(br dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.26(s,2H),4.19-4.01(m,3H),3.92(br d,J=11.6Hz,1H),3.78(br d,J=12.0Hz,1H),3.44-3.21(m,3H),3.15-2.95(m,3H),2.85-2.61(m,4H),2.49(s,3H),2.34-2.23(m,1H),2.12-2.00(m,1H),1.92-1.72(m,3H)。
ステップB:2-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ベンゾニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2-シアノフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(160mg、264μmol、1当量)のMeOH(12mL)中溶液に、NH3・MeOH(20mL)およびPd/C(20mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除き、濾液を減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物を精製せずに次のステップに直接使用した。化合物である2-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ベンゾニトリル(119mg、粗製)を緑色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:473。
ステップC:2-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ベンゾニトリル。2-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ベンゾニトリル(119mg、粗製)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(31.8mg、252μmol)のDCM(5mL)中混合物に、TEA(127mg、1.26mmol、175μL)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を25℃まで加熱し、0.5時間撹拌した。飽和NaHCO3(5mL)を0℃で加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、DCM(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(15mL×1)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:43%~73%、12分)により精製した。標記化合物である2-[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ベンゾニトリル(実施例325、35.1mg、65.1μmol、2ステップで25%収率、97.5%純度)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:527。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.62(d,J=8.0Hz,1H),7.54(t,J=8.4Hz,1H),7.10-7.00(m,2H),6.59(br s,1H),6.45-6.34(m,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.09(br s,1H),4.38(dd,J=5.2,10.4Hz,1H),4.27(s,2H),4.21-4.08(m,2H),3.99(br d,J=12.0Hz,2H),3.86-3.52(m,2H),3.39(br s,2H),3.18-2.99(m,3H),2.97-2.59(m,5H),2.49(s,3H),2.37-2.21(m,1H),2.17-1.98(m,1H),1.94-1.79(m,2H)。
実施例326
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(7-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:(メチル-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート。7-メチルテトラリン-1-オン(2.5g、15.6mmol、1.0当量)のDCM(40mL)中溶液に、DIEA(6.05g、46.8mmol、8.15mL、3.0当量)およびTf2O(6.60g、23.4mmol、3.86mL、1.5当量)を0℃で少しずつ加え、反応混合物をN2下、0~20℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を氷水(40mL)にゆっくりと加え、有機層を分離し、次いで、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0)により精製して、(7-メチル-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(4.0g、13.7mmol、88%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.18(s,1H),7.12-7.06(m,2H),6.02(t,J=4.8Hz,1H),2.85(t,J=8.2Hz,2H),2.54-2.45(m,2H),2.37(s,3H)。
ステップB:(7-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。(7-メチル-3,4-ジヒドロナフタレン-1-イル)トリフルオロメタンスルホネート(4.0g、13.7mmol、1.0当量)のジオキサン(80.0mL)中溶液に、DDQ(6.21g、27.4mmol、2.0当量)を加え、反応混合物を105℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を濃縮した。残留物は、カラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:0)により精製した。生成物である(7-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(3.4g、11.7mmol、86%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.89-7.81(m,3H),7.49-7.40(m,3H),2.60(s,3H)。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、1.20g、2.37mmol、1.0当量)および(7-メチル-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.03g、3.56mmol、1.50当量)のトルエン(20.0mL)中混合物に、Cs2CO3(1.55g、4.75mmol、2.0当量)およびXphos-Pd-G3(301mg、356μmol、0.15当量)を加え、混合物をN2下、70℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(20.0mL)に加え、次いで、酢酸エチル(2×15.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=20:1)により精製した。生成物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(820mg、1.22mmol、51%収率、95.9%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(790mg、1.22mmol、1.0当量)のMeOH(15.0mL)中溶液に、NH3・MeOH(1.22mmol、15.0mL、1.0当量)およびPd/C(500mg、10%純度)を加え、この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15Psi)下、20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトパッドを通して濾過し、濾過ケーキをDCM(2×20mL)で洗浄し、濾液を濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(490mg、934μmol、76%収率、97.5%純度)を白色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップE:2-[(2S)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(490mg、958μmol、1.0当量)のDCM(8.0mL)中混合物に、DIEA(495mg、3.83mmol、667μL、4.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(121mg、958μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(5.0mL)でクエンチし、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基Al2O3、酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製し、取得された粗生成物を濃縮し、分取HPLC((カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10
μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:57%~87%、12分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(7-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例326、133mg、235μmol、25%収率、99.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:566。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.00(s,1H),7.78(d,J=8.4Hz,1H),7.59(d,J=8.0Hz,1H),7.43-7.32(m,2H),7.13(d,J=7.2Hz,1H),6.69-6.49(m,1H),6.42(dd,J=1.2,16.8Hz,1H),5.85(br d,J=10.8Hz,1H),5.20-4.52(m,1H),4.42(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.36-4.24(m,2H),4.22-4.10(m,2H),4.06-3.95(m,2H),3.76-3.22(m,4H),3.21-3.07(m,2H),3.04-2.63(m,5H),2.56(s,3H),2.51(s,3H),2.35-2.26(m,1H),2.14-2.02(m,1H),1.92-1.75(m,3H)。
実施例327
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-メトキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップ1:1-tert-ブチル 2-メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート。1-tert-ブチル 2-メチル(2S,4R)-4-ヒドロキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(9g、36.7mmol、1当量)のCH3CN(150mL)溶液に、Ag2O(25.5g、110mmol、3当量)およびCH3I(54.3g、383mmol、23.8mL、10.4当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過を濃縮した。残留物を、カラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20/1→3/1)で精製した。化合物である1-tert-ブチル 2-メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(9g、34.7mmol、95%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.94-3.79(m,1H),3.66(dd,J=3.2,11.2Hz,1H),3.44-3.34(m,2H),3.28(s,3H),2.92-2.53(m,2H),2.40-2.25(m,4H),2.12-1.99(m,1H),1.89-1.79(m,1H)。
ステップ2:[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。1-tert-ブチル 2-メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(5g、19.28mmol、1当量)のTHF(100mL)溶液に、LiAlH4(2.20g、57.8mmol、3当量)を加えた。混合物を80℃で2時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(6mL)でクエンチした。次いで、混合物を濾過し、濾液を濃縮した。化合物である[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.8g、12.4mmol、64%収率)を無色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.43-4.23(m,1H),3.45-3.90(m,1H),3.78-3.69(m,3H),3.68-3.43(m,2H),3.32(s,3H),2.43-2.24(m,1H),2.12-1.95(m,1H),1.52-1.33(m,9H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(600mg、4.13mmol、3当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.38mmol、1当量)のTHF(10mL)中溶液に、t-BuONa(397mg、4.13mmol、3当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(30mL)で希釈し、水(20mL)で洗浄した。有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=200/1→20:1)により精製した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(910mg、1.28mmol、93%収率、93%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:662。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-60℃でNH3をMeOH(80mL)中に10分間バブリングした。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(850mg、1.28mmol、1当量)のMeOH(30mL)中溶液に、NH3・MeOH(20mL)および無水Pd/C(500mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過を濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(620mg、1.18mmol、91%収率)を無色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:528。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(620mg、1.18mmol、1当量)のジクロロメタン(10mL)中溶液に、TEA(1.19g、11.7mmol、1.64mL、10当量)を0℃で加えた。添加後、ジクロロメタン(1mL)中のプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(118mg、940μmol、0.8当量)を0℃で滴加した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(1mL)でクエンチした。次いで、水(20mL)で希釈し、ジクロロメタン(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、EA/MeOH=100/1→10:1)により精製し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)によりさらに精製した。凍結乾燥により標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(101mg、167μmol、14%収率、96.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:582。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.26-8.17(m,1H),7.91-7.82(m,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.55-7.47(m,2H),7.44(t,J=8.0Hz,1H),7.15(d,J=7.6Hz,1H),6.60(br s,1H),6.41(d,J=16.8Hz,1H),5.84(br d,J=10.8Hz,1H),5.21-4.53(m,1H),4.42(dd,J=4.4,10.4Hz,1H),4.34-4.17(m,3H),4.13(br d,J=13.6Hz,1H),4.04-3.93(m,2H),3.70-3.42(m,3H),3.31(s,5H),3.22-2.69(m,7H),2.48(s,3H),2.33(dd,J=5.6,9.6Hz,1H),2.14-2.04(m,1H),2.02-1.91(m,1H)。
実施例328
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.0g、1.98mmol、1.0当量)および1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(2.88g、11.9mmol、6.0当量)のトルエン(20.0mL)中混合物に、Cs2CO3(1.29g、3.96mmol、2.0当量)、RuPhos(185mg、396μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(272mg、297μmol、0.15当量)を加え、混合物をN2下、100℃で18時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(30.0mL)に加え、次いで、酢酸エチル(2×20.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=20:1)により精製した。次いで、得られた生成物を再度逆相フラッシュ(C18、MeCN中の0.1%FA)により精製し、得られた生成物をNaHCO3固体でpH約7に調整し、混合物を酢酸エチル(2×15.0mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(160mg、236μmol、12%収率、98%純度)を褐色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:668。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(460mg、689μmol、1.0当量)のMeOH(10mL)中溶液に、Pd/C(300mg、10%純度)およびNH3・MeOH(10mL)を加え、この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15Psi)下、20℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をセライトパッドを通して濾過し、濾液を濃縮して、2-[(2S)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(320mg、591μmol、86%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:534。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(320mg、599μmol、1.0当量)のDCM(8.0mL)中混合物に、DIEA(310mg、2.40mmol、418μL、4.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(75.6mg、599μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(5.0mL)でクエンチし、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基Al2O3、酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製し、次いで、得られた生成物を濃縮し、分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:51%~81%、12分)により再び精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(86.8mg、145μmol、24%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:588。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.55-7.45(m,1H),7.08(d,J=8.4Hz,1H),7.02-6.91(m,1H),6.68-6.53(m,1H),6.41(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.85(br d,J=10.8Hz,1H),5.11-4.52(m,1H),4.39(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.17(dd,J=6.8,10.4Hz,1H),4.14-4.07(m,3H),3.98(br d,J=11.6Hz,1H),3.72-3.52(m,1H),3.42-3.25(m,2H),3.23-2.58(m,9H),2.49(s,3H),2.35-2.25(m,1H),2.13-2.01(m,1H),1.91-1.73(m,3H)。
実施例329
2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール。[(2R)-ピロリジン-2-イル]メタノール(0.50g、4.94mmol、481μL、1.00当量)、2-ブロモエトキシ-tert-ブチル-ジメチルシラン(1.18g、4.94mmol、1.00当量)、およびK2CO3(3.42g、24.7mmol、5.00当量)のアセトニトリル(30.0mL)中混合物に、83℃で12時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=10/1)により精製して、[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール(0.50g、1.93mmol、39%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.70(t,J=6.0Hz,2H),3.60(dd,J=3.6,10.8Hz,1H),3.36(dd,J=3.6,10.8Hz,1H),3.20(td,J=4.4,9.2Hz,1H),2.89(td,J=6.4,12.8Hz,1H),2.74-2.65(m,1H),2.50(td,J=5.2,12.8Hz,1H),2.42-2.32(m,1H),1.92-1.81(m,1H),1.78-1.66(m,3H),0.90(d,J=0.8Hz,9H),0.07(d,J=0.4Hz,6H)。
ステップA:ベンジル(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール(344mg、1.33mmol、1.10当量)のTHF(10.0mL)中溶液に、t-BuONa(232mg、2.41mmol、2.00当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、0.70g、1.21mmol、1.00当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌後、混合物を酢酸エチル(10.0mL)で希釈し、水(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、酢酸エチル/石油エチル=3/1)により精製して、ベンジル(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.60g、704μmol、58%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:776。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.23-8.18(m,1H),7.90-7.83(m,1H),7.61(d,J=8.4Hz,1H),7.54-7.47(m,2H),7.46-7.34(m,6H),7.14(d,J=7.2Hz,1H),5.21(s,2H),4.70(br s,1H),4.34(br dd,J=4.2,10.6Hz,1H),4.30-4.20(m,2H),4.17-3.89(m,4H),3.75(t,J=6.8Hz,2H),3.49(br d,J=8.4Hz,1H),3.38-3.13(m,4H),3.10-2.90(m,4H),2.89-2.70(m,3H),2.63-2.52(m,1H),2.41-2.31(m,1H),2.04-1.94(m,1H),1.87-1.73(m,3H),0.88(s,9H),0.05(d,J=1.2Hz,6H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-78℃でNH3をメタノール(50.0mL)中に10分間バブリングした。ベンジル(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.60g、773μmol、1.00当量)およびPd/C(0.1g、10%純度)を上記溶液に加えた。15psiのH2下、25℃で1時間撹拌した後、触媒を濾過して取り除き、濾過ケーキをTHF(10.0mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.50g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M/2+1]:321。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.50g、粗製)およびTEA(394mg、3.89mmol、542μL)のジクロロメタン(5.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(98.2mg、779μmol)を-40℃で加えた。25℃で1時間撹拌した後、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(0.10mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=10/1)により精製して、2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.35g、427μmol、2ステップで55%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:696。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.35g、503μmol、1.00当量)、KF(146mg、2.51mmol、58.9μL、5.00当量)、および18-クラウン-6(665mg、2.51mmol、5.00当量)のTHF(5.00mL)中混合物を40℃で12時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(TFA、0.10%)/アセトニトリル]および分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例329、146mg、245μmol、49%収率、97.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:582。
SFC条件:「カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%のDEA)、流速:3mL/分、波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.29-8.18(m,1H),7.95-7.82(m,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),7.56-7.47(m,2H),7.44(t,J=7.6Hz,1H),7.15(d,J=7.2Hz,1H),6.60(br s,1H),6.46-6.31(m,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.19-4.47(m,1H),4.38-4.22(m,3H),4.21-4.09(m,2H),4.02(br d,J=11.2Hz,2H),3.71-3.57(m,2H),3.53-3.27(m,3H),3.22-2.76(m,9H),2.62(td,J=3.6,12.4Hz,1H),2.41-2.28(m,1H),2.11-1.95(m,1H),1.89-1.77(m,3H)。
実施例330
2-[(2S)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:1-ブロモ-3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン。MeOH(264mg、8.23mmol、333μL、2.00当量)のDMF(25.0mL)中溶液に、NaH(329mg、8.23mmol、鉱油中60%純度、2.00当量)を加えた。1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(1.00g、4.12mmol、1.00当量)を加えた後、この溶液を室温(25℃)で30分間混合した。次いで、この溶液を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(50mL)で希釈し、EtOAc(2×50mL)で抽出した。有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 1/0~100/1)により精製して、1-ブロモ-3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(880mg、3.11mmol、収率75%、90.0%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.34-7.27(m,2H),6.99(br d,J=7.2Hz,1H),3.91(s,3H)。
ステップA:(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(30.0mL)中のベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、550mg、1.09mmol、1.00当量)、1-ブロモ-3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(416mg、1.63mmol、1.50当量)、RuPhos(152mg、326μmol、0.30当量)、Cs2CO3(1.06g、3.26mmol、3.00当量)、およびPd2(dba)3(149mg、163μmol、0.15当量)を脱気し、次いで、N2下で90℃まで12時間加熱した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(10mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。集めた目的の画分を飽和炭酸水素ナトリウム溶液で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×100mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、321μmol、30%収率、94.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:680。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、338μmol、1.00当量)のMeOH(4.00mL)中溶液に、NH3/MeOH(7M、4.00mL)、Pd/C(70.0mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、触媒を濾過して取り除き、濾液を濃縮して、2-[(2S)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、242μmol、72%収率、88.1%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:546。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、242μmol、1.00当量)およびTEA(122mg、1.21mmol、168μL、5.00当量)のDCM(3.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(30.5mg、242μmol、1.00当量)を0℃で滴加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(0.1mL)および水(2mL)でクエンチした。層を分離した。水相をEtOAc(2×8mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(EtOAc/MeOH 7/1)および次いで、分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製し、凍結乾燥して、2-[(2S)-4-[7-[3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例330、28.2mg、45.6μmol、19%収率、96.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:600。
SFC条件:カラム:Chiralcel OD-3 100×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.42(t,J=8.4Hz,1H),6.84(d,J=8.0Hz,1H),6.79(d,J=8.4Hz,1H),6.59(br s,1H),6.46-6.34(m,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.09(br s,1H),4.37(dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.21-4.02(m,4H),4.01-3.77(m,5H),3.75-3.21(m,3H),3.20-2.98(m,3H),2.97-2.56(m,5H),2.48(s,3H),2.35-2.23(m,1H),2.12-1.98(m,1H),1.91-1.72(m,3H)。
実施例331
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(700mg、1.16mmol、1.00当量、2HCl)およびTEA(1.76g、17.4mmol、2.42mL、15.0当量)の無水DCM(17.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(146mg、1.16mmol、1.00当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(1mL)および水(10mL)でクエンチした。分離した水相をEtOAc(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル2/1→0/1)、次いで、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:52%~82%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例331、122mg、205μmol、18%収率、98.5%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:586。
SFC条件:カラム:Chiralpak AD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%イソプロパノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(br d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.45(td,J=7.6,13.2Hz,1H),7.37-7.31(m,1H),7.27-7.17(m,1H),6.59(br s,1H),6.45-6.33(m,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.08(br s,1H),4.49-4.30(m,2H),4.22-3.66(m,5H),3.63-3.32(m,2H),3.32-2.97(m,5H),2.91-2.52(m,4H),2.48(d,J=2.4Hz,3H),2.36-2.21(m,1H),2.12-1.96(m,1H),1.86-1.70(m,3H)。
実施例332
2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、751μmol、1.0当量)および[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(218mg、1.50mmol、2.0当量)のトルエン(20.0mL)中溶液に、t-BuONa(144mg、1.50mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で10分間撹拌した。20℃でH2O(10.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、反応混合物をEA(20.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/1→EA/MeOH=10/1)により精製した。生成物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.30g、413μmol、55%収率、93.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:680。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(270mg、397μmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、TFA(3.08g、27.0mmol、2.0mL、68.1当量)を加えた。混合物を20℃で10分間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。生成物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、粗製、2TFA)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:580。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、371μmol、1.0当量、2TFA)のDCM(3.0mL)中溶液に、DIEA(480mg、3.71mmol、647μL、10.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。20℃でMeOH(10.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(27.6mg、43.5μmol、2ステップで10%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:634。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.44-7.37(m,1H),7.32-7.40(m,1H)7.19(d,J=8.4Hz,1H),6.57(br,d,J=14.1Hz,1H),6.44-6.37(m,1H),5.84(br,d,J=10.8Hz,1H),5.1(br,s,1H),4.45-4.35(m,1H),4.19(br,dd,J=5.9,10.9Hz,1H),4.10(s,3H),4.00-3.90(m,2H),3.75-3.4(m,2H),3.40-3.00(m,8H),3.00-2.65(m,5H),2.45(s,3H),2.38-2.28(m,1H),2.15-2.00(m,1H),2.00-1.90(m,1H)。
実施例333
2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:(7-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート。7-フルオロナフタレン-1-オール(980mg、6.04mmol、1当量)およびDIEA(2.34g、18.1mmol、3.16mL、3当量)のDCM(40mL)中溶液に、Tf2O(2.56g、9.07mmol、1.50mL、1.5当量)を-5℃で滴加した。混合物を25℃で3時間撹拌した。次いで、混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=100/1→10/1)により精製した。化合物である(7-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(1.63g、5.54mmol、92%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.92(dd,J=5.6,9.0Hz,1H),7.87(d,J=8.0Hz,1H),7.70(dd,J=2.4,9.9Hz,1H),7.56-7.50(m,1H),7.49-7.43(m,1H),7.42-7.34(m,1H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、330mg、463μmol、1当量)、(7-フルオロ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(273mg、927μmol、2当量)、Pd2(dba)3(84.9mg、92.7μmol、0.2当量)、RuPhos(64.9mg、139μmol、0.3当量)、およびCs2CO3(453mg、1.39mmol、3当量)のトルエン(30mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で6時間撹拌した。反応混合物をH2O(1×200mL)および酢酸エチル(1×250mL)に加えた。有機相を分離し、ブライン(1×200mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液でpH=7に中和し、次いで、酢酸エチル(1×200mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、308μmol、100%純度、67%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:650。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.80-7.70(m,2H),7.53(d,J=8.4Hz,1H),7.36-7.24(m,6H),7.24-7.16(m,1H),7.10(d,J=7.2Hz,1H),5.19-5.09(m,2H),4.62(br s,1H),4.51(dd,J=6.0,11.2Hz,1H),4.26(dd,J=5.6,11.3Hz,1H),4.15(s,2H),4.11-3.99(m,2H),3.90(br d,J=12.8Hz,1H),3.38-3.11(m,5H),3.08-2.95(m,2H),2.93-2.71(m,3H),2.70-2.62(m,1H),2.60(s,3H),2.53-2.42(m,1H),2.15-2.02(m,1H),1.96-1.75(m,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(810mg、1.25mmol、1当量)、Pd/C(400mg、10%純度)、およびNH3のMeOH(7M、150mL)中混合物に対してH2による脱気とパージを3回繰り返し、次いで、混合物を15psi圧のH2雰囲気下、25℃で0.5時間撹拌した。混合物を濾過し、真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(600mg、1.16mmol、93%収率、99.4%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:516。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.89-7.79(m,2H),7.61(br d,J=8.4Hz,1H),7.40(t,J=7.8Hz,1H),7.32-7.24(m,1H),7.19(br d,J=7.6Hz,1H),4.51(dd,J=5.6,10.9Hz,1H),4.30-4.19(m,3H),4.05(br d,J=12.4Hz,1H),3.88(br d,J=12.0Hz,1H),3.37-3.21(m,4H),3.19-3.09(m,2H),3.06-2.84(m,5H),2.61-2.53(m,5H),2.47-2.36(m,1H),2.19-2.08(m,1H),1.97-1.76(m,3H)。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(600mg、1.16mmol、1当量)およびTEA(589mg、5.82mmol、810μL、5当量)のDCM(30mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(117mg、931μmol、0.8当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3溶液(10mL)により0℃でクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3;酢酸エチル/メタノール=20/1→3/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:waters xbridge 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、10分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例333、139mg、244μmol、21%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
SFC条件:「カラム:Chiralpak AD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.92-7.80(m,2H),7.63(d,J=8.0Hz,1H),7.42(t,J=7.6Hz,1H),7.33-7.25(m,1H),7.20(d,J=7.2Hz,1H),6.62(br s,1H),6.47-6.37(m,1H),5.85(br d,J=10.8Hz,1H),5.27-4.52(m,1H),4.41(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.25(br s,2H),4.22-4.10(m,2H),4.09-3.87(m,2H),3.77-3.25(m,2H),3.24-3.06(m,3H),3.05-2.59(m,6H),2.50(s,3H),2.38-2.23(m,1H),2.15-2.00(m,1H),1.99-1.81(m,3H)。
実施例334
2-(1-アクリロイル-4-(7-(7-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート。NaH(1.11g、27.8mmol、60%純度、1.2当量)のTHF(80mL)中溶液に、tert-ブチル(2R)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(4.67g、23.2mmol、1当量)のTHF(20mL)中溶液を0℃で加え、混合物を0℃で1時間撹拌した。BnBr(5.95g、34.8mmol、4.13mL、1.5当量)を0℃で滴加し、混合物を25℃で4時間撹拌した。反応混合物を飽和塩化アンモニウム溶液(20mL)により0℃でクエンチし、次いで、酢酸エチル(2×100mL)で希釈した。有機層を水(1×150mL)およびブライン(1×150mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1→2/1)により精製した。化合物であるtert-ブチル(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(5.03g、17.3mmol、74%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.37-7.14(m,5H),4.47(br s,2H),4.07-3.77(m,1H),3.67-3.07(m,4H),2.08-1.68(m,4H),1.38(s,9H)。
ステップB:(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン。tert-ブチル(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(4g、13.7mmol、1当量)のジオキサン(80mL)中混合物に、HCl/ジオキサン(4M、120mL、35当量)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。化合物である(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン(3.13g、粗製、HCl)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=9.76(br s,1H),9.11(br s,1H),7.43-7.23(m,5H),4.55(s,2H),3.75-3.61(m,3H),3.13(br d,J=4.4Hz,2H),2.07-1.76(m,3H),1.66-1.56(m,1H)。
ステップC:(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-エチル-ピロリジン。(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン(3g、粗製、HCl)およびヨードエタン(2.05g、13.2mmol、1.05mL)のCH3CN(65mL)中混合物に、K2CO3(1.82g、13.2mmol)を25℃で少しずつ加えた。混合物を25℃で1時間撹拌し、次いで、78℃に加熱し、11時間撹拌する。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(30mL×2)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1→酢酸エチル/メタノール=5/1)により精製した。化合物である(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-エチル-ピロリジン(2.41g、10.4mmol、2ステップで79%収率、95%純度)を褐色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.30-7.18(m,5H),4.47(s,2H),3.46(dd,J=4.8,9.2Hz,1H),3.30(dd,J=6.4,9.2Hz,1H),3.10(ddd,J=2.4,6.8,8.8Hz,1H),2.88(qd,J=7.6,12.4Hz,1H),2.62-2.49(m,1H),2.24(qd,J=7.2,12.4Hz,1H),2.14-2.03(m,1H),1.92-1.80(m,1H),1.78-1.51(m,3H),1.04(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップD:[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メタノール。(2R)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-エチルピロリジン(2g、9.12mmol、1当量)のMeOH(60mL)中溶液に、HCl/MeOH(4M、30mL、13.2当量)を加えてpHを3~4に調整し、次いで、Pd(OH)2/C(300mg、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを3回繰り返した。混合物をH2(50psi)下、25℃で12時間撹拌した。触媒を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物を、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。化合物である[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メタノール(1.68g、粗製、HCl)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=3.88(dd,J=3.6,12.4Hz,1H),3.75-3.45(m,4H),3.21-3.08(m,2H),2.30-1.82(m,4H),1.37(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップE:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メタノール(334mg、2.01mmol、1.95当量、HCl)を飽和炭酸ナトリウム溶液(5mL)に溶解し、次いで、酢酸エチル(2×10mL)で抽出した。抽出物を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、600mg、1.03mmol、1当量)および上記残留物のトルエン(35mL)中混合物に、t-BuONa(298mg、3.10mmol、3当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を25℃まで暖め、10分間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、2MのHClにより0℃でPHを8~9に調整し、次いで、酢酸エチル(20mL×2)で抽出した。合わせた有機層を水(15mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液(3ml)で中和し、酢酸エチル(100mL×2)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(350mg、526μmol、51%収率、97.1%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
ステップF:2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(305mg、472μmol、1当量)のMeOH(40mL)およびNH3・MeOH(20mL)中溶液に、Pd/C(300mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを3回繰り返した。混合物をH2(15psi)下、25℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(240mg、粗製)を緑色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップG:2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(240mg、粗製)のDCM(10mL)中混合物に、TEA(237mg、2.35mmol、326μL)を加え、次いで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(59.2mg、469μmol)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を25℃に温め、0.5時間撹拌した。飽和NaHCO3溶液(2mL)を0℃で加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、DCM mL(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(15mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=50/1→酢酸エチル/メタノール=5/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:59%~89%、12分)によりさらに精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例334、44.2mg、75.2μmol、2ステップで16%収率、96.4%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:566。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.24-8.18(m,1H),7.90-7.83(m,1H),7.62(d,J=8.0Hz,1H),7.54-7.48(m,2H),7.44(t,J=7.6Hz,1H),7.15(d,J=7.6Hz,1H),6.60(br s,1H),6.47-6.35(m,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.11(br s,1H),4.39(br d,J=8.4Hz,1H),4.35-4.21(m,2H),4.19-4.09(m,2H),4.02(br d,J=12.4Hz,1H),3.47(br s,2H),3.34(br s,2H),3.26-3.07(m,3H),3.05-2.63(m,5H),2.44(br dd,J=6.8,12.0Hz,1H),2.26(br d,J=8.0Hz,1H),2.12-1.94(m,1H),1.80(br d,J=4.0Hz,4H),1.15(br t,J=7.2Hz,3H)。
実施例335
2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-2-カルボキシレート。O1-tert-ブチル-O2-メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(5.00g、19.3mmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中溶液に、TFA(7.70g、67.5mmol、5.0mL、3.50当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濃縮した。生成物であるメチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-2-カルボキシレート(3.0g、粗製、TFA)を黄色油として得た。
ステップ2:メチル(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-カルボキシレート。メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-2-カルボキシレート(3.0g、11.0mmol、1.0当量、TFA)およびK2CO3(4.55g、32.9mmol、3.0当量)のMeCN(30.0mL)中溶液に、ヨードエタン(1.71g、11.0mmol、878μL、1.0当量)を少しずつ加えた。混合物を25℃で1時間撹拌し、78℃まで加熱し、78℃で11時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=10:1→EA:MeOH=10:1)により精製し、メチル(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-カルボキシレート(1.20g、6.41mmol、2ステップで33%収率)を黄色油としてを得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ4.04-3.95(m,1H),3.73(s,3H),3.55-3.33(m,2H),3.29(s,3H),2.83-2.70(m,1H),2.53-2.35(m,2H),2.14(dd,J=5.6,8.0Hz,2H),1.09(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップ3:[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メタノール。メチル(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-カルボキシレート(1.20g、6.41mmol、1.0当量)のTHF(15.0mL)中溶液に、LiAlH4(730mg、19.2mmol、3.0当量)を加えた。混合物を-78℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和Na2SO4水溶液(0.30mL)でクエンチし、濾過し、THF(10.0mL)で洗浄した。母液を濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=10:1→EA:MeOH=5:1)により精製して、[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メタノール(600mg、3.77mmol、59%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ3.92-3.83(m,1H),3.66(dd,J=3.2,10.8Hz,1H),3.49-3.35(m,2H),3.30(s,3H),2.89-2.76(m,2H),2.40-2.27(m,2H),2.07-1.97(m,1H),1.93-1.82(m,1H),1.08(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メタノール(266mg、1.67mmol、2.00当量)のTHF(5.0mL)中溶液に、t-BuONa(241mg、2.50mmol、3.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。次いで、tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、835μmol、1.0当量)を上記液体に加えた。添加後、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10.0mL)に加え、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=20:1→EA:MeOH=10:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(440mg、513μmol、62%収率、81%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:694。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.41(t,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=8.0Hz,1H),7.20(d,J=8.4Hz,1H),4.63(br s,1H),4.42(br dd,J=4.4,10.8Hz,1H),4.18-4.06(m,4H),4.06-3.96(m,2H),4.06-3.96(m,1H),3.92-3.86(m,1H),3.36-3.20(m,6H),3.18-2.96(m,4H),2.94-2.66(m,4H),2.58-2.39(m,1H),2.37-2.30(m,1H),2.14-2.07(m,1H),2.02-1.91(m,1H),1.53(s,9H),1.13(t,J=7.4Hz,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(390mg、455μmol、1.0当量)のDCM(1.00mL)中溶液に、TFA(1.54g、13.5mmol、1.0mL、29.7当量)を加えた。混合物を25℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(400mg、粗製、2TFA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:594。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(400mg、487μmol、1.0当量、2TFA)のDCM(2.0mL)中溶液に、DIEA(629mg、4.87mmol、847μL、10.0当量)を-30℃で加えた。次いで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(92.0mg、730μmol、1.50当量)を上記液体に-30℃で加え、混合物を-30℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(0.50mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。標記化合物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製して、2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-1-エチル-4-メトキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例335、120mg、182μmol、2ステップで28%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:648。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.42(t,J=8.0Hz,1H),7.29(d,J=6.4Hz,1H),7.21(d,J=8.0Hz,1H),6.68-6.55(m,1H),6.42(dd,J=1.6(16.4Hzの1H)),5.85(br d,J=10.8Hz,1H),5.20-4.51(m,1H),4.42(dd,J=4.4,10.8Hz,1H),4.19-4.04(m,4H),4.04-3.72(m,3H),3.70-3.41(m,2H),3.39-3.22(m,5H),3.20-2.79(m,7H),2.76(br s,1H),2.50-2.40(m,1H),2.33(dd,J=5.2,10.0Hz,1H),2.15-2.05(m,1H),2.03-1.90(m,1H),1.13(t,J=7.2Hz,3H)。
実施例336
1-[(2R,5S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル(2R,5S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(2.70g、9.18mmol、1.00当量)、tert-ブチル(2R,5S)-2,5-ジメチルピペラジン-1-カルボキシレート(1.77g、8.26mmol、0.90当量)、およびDIEA(2.37g、18.4mmol、3.20mL、2.00当量)のNMP(30.0mL)中溶液を100℃で7時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(50.0mL)で希釈し、ブライン(3×100mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1)により精製して、tert-ブチル(2R,5S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(2.80g、5.69mmol、62%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:472。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40-7.29(m,5H),4.45-4.19(m,2H),3.71-3.61(m,4H),3.54-3.43(m,3H),3.41-3.36(m,1H),2.81-2.67(m,2H),2.64-2.49(m,2H),1.48(s,9H),1.20(d,J=6.8Hz,3H),1.17(d,J=6.8Hz,3H)。
ステップB:tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(854mg、7.41mmol、880μL、2.50当量)のTHF(20.0mL)中溶液に、NaH(237mg、5.93mmol、60.0%純度、2.00当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌後、tert-ブチル(2R,5S)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1.40g、2.97mmol、1.00当量)を加えた。混合物を80℃で4時間撹拌した。混合物を水(20.0mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出し、有機層をブライン(1×40.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=1/10)により精製して、tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1.55g、2.56mmol、86%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:551。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.39-7.28(m,5H),4.31(br dd,J=4.8,10.4Hz,2H),4.16-4.08(m,1H),3.72-3.62(m,4H),3.61-3.56(m,1H),3.52-3.43(m,2H),3.38(br s,1H),3.08(br t,J=8.0Hz,1H),2.81-2.48(m,6H),2.45(s,3H),2.33-2.20(m,1H),2.04-1.95(m,1H),1.78-1.65(m,3H),1.48(s,9H),1.17(br d,J=6.4Hz,6H)。
ステップC:tert-ブチル(2R,5S)-2,5-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。-78℃でNH3をメタノール(150mL)中に15分間バブリングした。この混合物に、tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(2.80g、5.08mmol、1.00当量)およびPd/C(0.50g、10.0%純度)を加えた。15psiのH2下、40℃で5時間撹拌後、混合物を濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2R,5S)-2,5-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.20g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:461。
ステップD:tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2R,5S)-2,5-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、粗製)、3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-ナフタレン(1.02g、3.26mmol、1.50当量)、RuPhos(203mg、434μmol)、Pd2(dba)3(199mg、217μmol)、およびCs2CO3(2.12g、6.51mmol)のトルエン(30.0mL)中混合物を、N2下、110℃で5時間撹拌した。混合物を水(20.0mL)で希釈し、酢酸エチル(3×40.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×50.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(TFA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和重炭酸ナトリウム(5.00mL)によりpH>7に調整し、次いで、酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1.06g、1.47mmol、2ステップで68%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M/2+1]:347。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.11(d,J=8.4Hz,1H),7.77-7.71(m,1H),7.52-7.40(m,5H),7.39-7.33(m,2H),6.99(d,J=2.0Hz,1H),6.90(d,J=2.0Hz,1H),5.18(s,2H),4.48-4.42(m,1H),4.38(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.32-4.25(m,1H),4.20(br d,J=5.6Hz,1H),4.16-4.09(m,1H),3.76(br s,1H),3.70-3.61(m,1H),3.60-3.52(m,1H),3.45(br s,2H),3.24(br s,1H),3.10(br t,J=7.6Hz,1H),2.93(br s,1H),2.80-2.61(m,2H),2.49(s,3H),2.33-2.25(m,1H),2.12-2.03(m,1H),1.91-1.76(m,4H),1.50(s,9H),1.27-1.22(m,6H)。
ステップE:tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(0.90g、1.30mmol、1.00当量)およびPd/C(0.10g、10.0%純度)のメタノール(40.0mL)中混合物を、15psiのH2下、25℃で1時間撹拌した。混合物を濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(0.72g、粗製)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:603。
ステップF:4-[4-[(2S,5R)-2,5-ジメチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール。tert-ブチル(2R,5S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(0.70g、粗製)およびTFA(1.99g、17.42mmol、1.29mL)のジクロロメタン(1.20mL)中混合物を、25℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、4-[4-[(2S,5R)-2,5-ジメチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(849mg、粗製、2TFA)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:503。
ステップG:1-[(2R,5S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。4-[4-[(2S,5R)-2,5-ジメチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]ナフタレン-2-オール(0.84g、粗製、2TFA)およびTEA(1.16g、11.5mmol、1.60mL)のジクロロメタン(3.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(102mg、805μmol)を-40℃で加えた。-40℃で0.5時間撹拌後、混合物を水(0.10mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%TFA)-アセトニトリル]および分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna Phenyl-Hexyl 150_30_5μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:45%~75%、3分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である1-[(2R,5S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2,5-ジメチル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例336、55.8mg、94.1μmol、3ステップで8.2%収率、93.9%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:557。
SFC:「カラム:Chiralpak AS-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.97(br d,J=8.0Hz,1H),7.63(d,J=8.0Hz,1H),7.40-7.34(m,1H),7.26(dt,J=1.6,8.4Hz,1H),6.90(d,J=1.6Hz,1H),6.65(br s,1H),6.61-6.43(m,1H),6.39-6.26(m,1H),5.73(br t,J=8.8Hz,1H),4.83(br s,1H),4.55(br d,J=5.6Hz,1H),4.43-4.04(m,4H),3.91(br d,J=17.2Hz,1H),3.77-3.26(m,5H),3.19(br t,J=8.0Hz,1H),3.06-2.68(m,3H),2.63(br s,3H),2.57(br d,J=13.2Hz,1H),2.41-2.33(m,1H),2.15-1.83(m,4H),1.11-0.96(m,6H)。
実施例337
2-[(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:1-(2-ブロモ-6-クロロ-フェニル)エタノール。N2下の磁気攪拌棒を備えた火炎乾燥した100mLの丸底フラスコに、2-ブロモ-6-クロロ-ベンズアルデヒド(10.0g、45.6mmol、1当量)およびTHF(100mL)を加えた。混合物を0℃まで冷却し、次いで、MeMgBr(Et2O中の3M、22.8mL、1.5当量)を20分にわたって滴加した。得られた懸濁液を0℃で2時間撹拌した。飽和NH4Cl水溶液(10mL)の滴加によって反応混合物をクエンチした。混合物を冷却し、水(150mL)を含む100mLの分液漏斗に注ぎ込み、混合物を酢酸エチル(2×150mL)で抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=100/1→10/1)により精製した。化合物である1-(2-ブロモ-6-クロロ-フェニル)エタノール(8.00g、32.6mmol、72%収率、96%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M-17]:219。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.46(br d,J=8.0Hz,1H),7.31(br d,J=8.0Hz,1H),7.07-6.96(m,1H),5.68-5.44(m,1H),3.24(br d,J=8.0Hz,1H),1.61(d,J=4.4Hz,3H)。
ステップ2:1-ブロモ-3-クロロ-2-エチルベンゼン。1-(2-ブロモ-6-クロロ-フェニル)エタノール(8.00g、34.0mmol、1当量)のDCE(150mL)中混合物に、BF3・Et2O(14.5g、102mmol、12.6mL、3当量)およびEt3SiH(19.8g、170mmol、27.1mL、5当量)を0℃で少しずつ加えた。混合物を50℃で6時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(2×75mL)および飽和ブライン(1×75mL)で洗浄し、次いで、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:ACN65%~ACN95%、30分;60%分)により精製した。化合物である1-ブロモ-3-クロロ-2-エチルベンゼン(1.50g、6.83mmol、20%収率、100%純度)を黄色油として得た。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、300mg、636μmol、1当量)、1-ブロモ-3-クロロ-2-エチルベンゼン(279mg、1.27mmol、2当量)、Pd2(dba)3(117mg、127μmol、0.2当量)、RuPhos(89.1mg、191μmol、0.3当量)、およびCs2CO3(622mg、1.91mmol、3当量)のトルエン(30mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で6時間撹拌した。反応混合物をH2O(1×200mL)および酢酸エチル(1×250mL)に加えた。有機相を分離し、ブライン(1×200mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液でpH=7に中和し、酢酸エチル(1×200mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(155mg、0.254mmol、100%純度、40%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:610。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.20-7.16(m,1H),7.13(t,J=8.0Hz,1H),7.07-7.03(m,1H),4.61(br s,1H),4.39(dd,J=5.2,10.6Hz,1H),4.16(dd,J=6.8,10.4Hz,1H),4.09-3.95(m,4H),3.91(br d,J=13.2Hz,1H),3.26(dd,J=3.6,13.7Hz,1H),3.22-2.96(m,5H),2.90(q,J=7.4Hz,2H),2.84-2.63(m,5H),2.48(s,3H),2.35-2.23(m,1H),2.13-2.00(m,1H),1.83-1.70(m,3H),1.52(s,9H),1.22(t,J=7.4Hz,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(310mg、508μmol、1当量)のDCM(600μL)中溶液に、TFA(869mg、7.62mmol、564μL、15当量)を窒素雰囲気下、0℃で加た。混合物を25℃で1時間撹拌した。その後、混合物を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(850mg、粗製、2TFA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:510。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(850mg、粗製、2TFA)およびプロパ-2-エノイルクロリド(59.8mg、660μmol、53.8μL)のDCM(8mL)中混合物に、TEA(514mg、5.08mmol、707μL)を少しずつ加えた。混合物を40℃で30分間撹拌した。反応混合物をNaHCO3飽和溶液(2mL)により0℃でクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×30mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3;酢酸エチル/メタノール=20/1→3/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.04%のNH3・H2O)-ACN];B%:65%~95%、10分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-クロロ-2-エチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例337、142mg、252μmol、2ステップで50%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:564。
SFC条件:「カラム:Chiralpak AD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,dmso-d6)δ=7.21(s,3H),6.78(dd,J=10.4,16.8Hz,1H),6.15(dd,J=2.0,16.8Hz,1H),5.74(dd,J=2.0,10.6Hz,1H),4.84(br s,1H),4.28(dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.23-4.07(m,2H),4.05-3.90(m,4H),3.39(br s,1H),3.27(br dd,J=3.6,13.6Hz,1H),3.20-3.05(m,3H),2.99-2.93(m,2H),2.93-2.76(m,4H),2.61-2.52(m,2H),2.40-2.31(m,3H),2.22(q,J=8.4Hz,1H),2.00-1.87(m,1H),1.77-1.54(m,3H),1.19(t,J=7.2Hz,3H)。
実施例338
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(8-フルオロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
挿入物:1-ブロモ-8-フルオロ-ナフタレン。1,8-ジブロモナフタレン(2g、6.99mmol、1当量)のTHF(50mL)中溶液に、n-BuLi(ヘキサン中の2.5M、4.20mL、1.5当量)を-78℃で滴加した。-78℃で10分間撹拌後、N-(ベンゼンスルホニル)-N-フルオロ-ベンゼンスルホンアミド(4.41g、13.9mmol、2当量)のTHF(10mL)中溶液を滴加した。混合物を25℃まで温め、3時間撹拌した。反応混合物を水(10mL)でクエンチて、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:50%~75%、25分)により精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液を加えることによってpH=7に調整し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。1-ブロモ-8-フルオロ-ナフタレン(560mg、2.46mmol、35%収率、99%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.81(d,J=7.2Hz,2H),7.66(d,J=8.4Hz,1H),7.49-7.39(m,1H),7.31(t,J=7.6Hz,1H),7.23(td,J=0.8,5.2Hz,1H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。1-ブロモ-8-フルオロ-ナフタレン(310mg、1.38mmol、1.3当量)、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、500mg、1.06mmol、1当量)、Cs2CO3(863mg、2.65mmol、2.5当量)、RuPhos(98.9mg、212μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(194mg、212μmol、0.2当量)のトルエン(10mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、100℃でに3時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(370mg、570μmol、54%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.64(d,J=7.6Hz,1H),7.56(br d,J=8.8Hz,1H),7.47-7.42(m,1H),7.20-7.08(m,3H),4.64(br s,1H),4.47-4.27(m,2H),4.23-4.14(m,2H),4.11-3.82(m,3H),3.81-3.65(m,1H),3.44-3.23(m,2H),3.19-3.07(m,2H),3.02-2.79(m,3H),2.77-2.66(m,2H),2.56(br s,1H),2.50(s,3H),2.34-2.25(m,1H),2.13-2.06(m,1H),1.82-1.72(m,3H),1.53(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(370mg、600μmol、1当量)のDCM(600μL)中溶液に、TFA(1.03g、9.01mmol、667μL、15当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(378mg、600μmol、99%収率、TFA)を黄色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(261mg、506μmol、1当量、TFA)のDCM(5mL)中溶液に、TEA(512mg、5.07mmol、705μL、10当量)を0℃で加えた。添加後、DCM(1mL)中のプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(51.1mg、405μmol、0.8当量)を0℃で滴加した。25℃で1時間撹拌した後、反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(1mL)でクエンチし、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:48%~78%、12分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-フルオロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例338、93.5mg、163μmol、32%収率、99.4%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
SFC条件:「OD-3_MeOH(DEA)_40_3mL-35T カラム:Chiralcel OD-3 50×4.6mm I.D.、3μm 移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.64(d,J=8.0Hz,1H),7.56(d,J=8.4Hz,1H),7.47-7.35(m,2H),7.19-7.09(m,2H),6.60(br s,1H),6.40(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.30-4.48(m,1H),4.46-4.28(m,2H),4.27-3.85(m,5H),3.73(br s,1H),3.56-2.54(m,10H),2.49(s,3H),2.37-2.21(m,1H),2.12-1.97(m,1H),1.95-1.79(m,3H)。
実施例339
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート。NaH(1.19g、49.6mmol、2.0当量)のTHF(50.0mL)中溶液に、tert-ブチル(2S)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1カルボキシレート(5.00g、24.8mmol、1.0当量)のTHF(50.0mL)中溶液を0℃で加え、混合物を10℃で1時間撹拌した。ブロモメチルベンゼン(6.38g、37.3mmol、4.43mL、1.50当量)を上記混合物に0℃で滴加し、この混合物を10℃で16時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NH4Cl水溶液(20.0mL)でクエンチし、酢酸エチル(50.0ml)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=10:1~3:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(6.60g、10.4mmol、42%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ7.44-7.26(m,5H),4.53(s,2H),4.00-3.85(m,1H),3.61-3.39(m,2H),3.38-3.33(m,2H),2.04-1.77(m,4H),1.50-1.36(m,9H)。
ステップB:(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン。tert-ブチル(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(6.60g、22.7mmol、1.0当量)のDCM(23.0mL)中溶液に、TFA(34.7g、304mmol、22.5mL、13.4当量)を、窒素雰囲気下、0℃で滴加した。混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン(10.0g、粗製、TFA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:192。
ステップC:(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-エチルピロリジン。(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)ピロリジン(2.0g、6.55mmol、1.0当量、TFA)およびアセトアルデヒド(1.44g、32.8mmol、1.84mL、5.0当量)のMeOH(30.0mL)中溶液に、CH3COOH(787mg、13.1mmol、749μL、2.0当量)およびNaBH3CN(1.65g、26.2mmol、4.0当量)を加えた。混合物を20℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、1MのHCl水溶液(15.0mL)によりpHを3に調整し、真空下で濃縮してMeOHを除去した。混合物を混合溶媒(PE/EA=10:1、2×60.0mL)で抽出した。水相を飽和Na2CO3水溶液(10.0mL)でpH約9に調整し、混合溶媒(EA/MeOH=10:1、4×60.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。得られた生成物を逆相フラッシュ(0.1%のTFA条件)により精製して、(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-エチルピロリジン(707mg、3.18mmol、49%収率、99.0%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.36-7.31(m,4H),7.31-7.26(m,1H),4.58-4.54(s,2H),3.52(dd,J=4.8,9.2Hz,1H),3.37(dd,J=6.4,9.2Hz,1H),3.20-3.12(m,1H),3.01-2.89(m,1H),2.66-2.58(m,1H),2.35-2.25(m,1H),2.21-2.05(m,1H),2.03-1.87(m,1H),1.83-1.62(m,3H),1.11(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップD:[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メタノール。(2S)-2-(ベンジルオキシメチル)-1-エチルピロリジン(860mg、3.92mmol、1.00当量)のMeOH(3.00mL)中溶液に、HCl・MeOH(4M、0.80mL)およびPd(OH)2/C(300mg、20%純度)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(50psi)下、25℃で16時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濃縮した。生成物である[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メタノール(460mg、3.56mmol、91%収率)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:130。
ステップE:tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、668μmol、1.0当量)および[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メタノール(173mg、1.34mmol、2.0当量)のトルエン(8.0mL)中溶液に、t-BuONa(128mg、1.34mmol、2.0当量)を0℃で加え、反応物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(30.0mL)に加え、EA(2×20.0mL)で抽出し、合わせた有機層を飽和ブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=5/1→酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、353μmol、53%収率、97.6%純度)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:664。
ステップF:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、361μmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、TFA(3.08g、27.0mmol、2.0mL、74.8当量)を加え、混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(280mg、粗製、2TFA)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:564。
ステップG:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(280mg、496μmol、1.0当量、2TFA)のDCM(5.0mL)中混合物に、DIEA(642mg、4.96mmol、865μL、10.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(62.6mg、496μmol、1.0当量)を0℃で加え、反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(5.0mL)でクエンチし、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基Al2O3、酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製し、粗生成物を濃縮し、分取HPLC((カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-エチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例339、31.9mg、50.2μmol、10%収率、97.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:618。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.37-7.29(m,1H),7.23-7.18(m,1H),7.11(d,J=8.0Hz,1H),6.58-6.46(m,1H),6.32(dd,J=0.8,16.4Hz,1H),5.76(br d,J=10.4Hz,1H),5.11-4.37(m,1H),4.28(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.09-3.96(m,4H),3.89(br d,J=12.4Hz,2H),3.69-3.41(m,1H),3.33-2.51(m,12H),2.38-2.28(m,1H),2.20-2.11(m,1H),2.00-1.80(m,3H),1.06(t,J=7.2Hz,3H)。
実施例340
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(4-メトキシピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-メトキシ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(580mg、1.23mmol、1.0当量)、3-ブロモ-4-メトキシ-ピリジン(694mg、3.69mmol、3.0当量)、Pd2(dba)3(113mg、123μmol、0.1当量)、RuPhos(115mg、246μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(1.20g、3.69mmol、3.0当量)のトルエン(25.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で6時間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を真空下で除去し、水(20.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(2×30.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュHPLC[C18、水中0.1%のFA、0~70%のMeCN]により精製した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液によりpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(2×50.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-メトキシ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、397μmol、32%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:579。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(4-メトキシ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-メトキシ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(350mg、605μmol、1.0当量)のジオキサン(3.0mL)中溶液に、4MのHCl/ジオキサン(5.0mL)を加え、混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮し、DCM(10.0mL)で抽出し、有機層を飽和NaHCO3水溶液(2×10.0mL)で洗浄し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(4-メトキシ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(260mg、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:479。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(4-メトキシ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(4-メトキシ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(260mg、543μmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中混合物に、TEA(220mg、2.17mmol、302μL、4.0当量)およびプロパ-2-エノイルクロリド(63.9mg、706μmol、57.6μL、1.3当量)を-60℃で加え、反応混合物を-60℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(2.0mL)でクエンチし、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製し、次いで、粗生成物を濃縮し、分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.04%のNH3H2O)-ACN];B%:30%~54%、10分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(4-メトキシ-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例340、83.6mg、155μmol、29%収率、98.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:533。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.25(d,J=5.2Hz,1H),8.17(s,1H),6.82(d,J=5.2Hz,1H),6.38(dd,J=1.2,16.8Hz,1H),6.44-6.33(m,1H),5.82(br d,J=10.4Hz,1H),5.21-4.52(m,1H),4.37(dd,J=4.8Hz,10.4Hz,1H),4.33-4.26(m,1H),4.24-4.13(m,2H),4.06(br d,J=13.6Hz,1H),4.02-3.88(m,5H),3.72-3.37(m,2H),3.36-3.23(m,2H),3.16-3.02(m,2H),2.98-2.88(m,1H),2.87-2.72(m,3H),2.70-2.60(m,1H),2.47(s,3H),2.33-2.27(m,1H),2.10-1.99(m,1H),1.91-1.69(m,3H)。
実施例341
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール。[(2S)-ピロリジン-2-イル]メタノール(500mg、4.94mmol、481μL、1当量)および2-ブロモエトキシ-tert-ブチル-ジメチルシラン(1.30g、5.44mmol、1.1当量)のMeCN(30mL)中混合物に、K2CO3(3.42g、24.7mmol、5当量)をN2下で少しずつ加えた。混合物を50℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3;酢酸エチル/メタノール=100/1→5/1)により精製した。化合物である[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール(437mg、1.68mmol、34.0%収率)を褐色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.71(dd,J=5.2,6.4Hz,2H),3.63-3.58(m,1H),3.37(dd,J=3.2,10.8Hz,1H),3.21(td,J=4.8,10.0Hz,1H),2.90(td,J=6.4,12.8Hz,1H),2.74-2.67(m,1H),2.52(td,J=5.2,10.4Hz,1H),2.41-2.31(m,1H),1.97-1.80(m,1H),1.79-1.55(m,3H),0.92-0.87(m,9H),0.11-0.00(m,6H)。
ステップA:ベンジル(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メタノール(447mg、1.72mmol、2当量)のトルエン(35mL)中混合物に、t-BuONa(248mg、2.58mmol、3当量)を少しずつ加え、次いで、この溶液に、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、500mg、861μmol、1当量)を0℃で加えた。混合物を25℃に温め、1時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル20mLで希釈し、2MのHClにより0℃でPHを8~9に調整し、次いで、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(15mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1~1/2)により精製した。化合物であるベンジル(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、494μmol、57.4%収率、95.8%純度)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:776。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(380mg、490μmol、1当量)のMeOH(30mL)中溶液に、Pd/C(230mg、490μmol、10%純度、1.00当量)およびNH3・MeOH(25mL)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを3回繰り返した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(314mg、489μmol、99.9%収率)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:642。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(314mg、489μmol、1当量)のDCM(15mL)中混合物に、TEA(148mg、1.47mmol、204μL、3当量)およびプロパ-2-エノイルクロリド(57.6mg、636μmol、51.9μL、1.3当量)をN2下、-40℃で少しずつ加えた。混合物を-40℃で30分間撹拌した。-40℃で飽和NaHCO3溶液を3mL加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、DCM(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(15mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=100/1→1/3)により精製した。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(210mg、300μmol、61.4%収率、99.5%純度)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:696。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-[2-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシエチル]ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(205mg、295μmol、1当量)のTHF(3mL)中混合物に、KF(171mg、2.95mmol、69.0μL、10当量)および18-クラウン-6(779mg、2.95mmol、10当量)を少しずつ加えた。混合物を40℃で2時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例341、43.4mg、71.6μmol、24.3%収率、95.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:582。
SFC:「OJ-3S_3_5_40_3ML カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.24-8.18(m,1H),7.89-7.83(m,1H),7.61(d,J=8.4Hz,1H),7.54-7.47(m,2H),7.44(t,J=7.2Hz,1H),7.15(d,J=6.8Hz,1H),6.60(br s,1H),6.40(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.84(br d,J=10.4Hz,1H),5.11(br s,1H),4.36-4.22(m,3H),4.16(dd,J=6.8,10.4Hz,2H),4.01(br d,J=11.6Hz,1H),3.72-3.55(m,3H),3.53-3.26(m,3H),3.24-2.68(m,10H),2.62(td,J=4.0,12.5Hz,1H),2.39-2.28(m,1H),2.07-1.96(m,1H),1.90-1.75(m,3H)。
実施例342
2-[(2S)-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル]-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.00g、5.57mmol、1.00当量)のジオキサン(30.0mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4.00M、30.0mL、21.6当量)を0℃で加えた。25℃で1時間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(4.00mL)で希釈し、飽和重炭酸ナトリウム(10.0mL)によりpH>8に調整し、酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出した。抽出物をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、メタノール/酢酸エチル=10/1)により精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.10g、4.02mmol、72%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:439。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.46-7.30(m,5H),5.25-5.14(m,2H),4.66(br s,1H),4.14-4.05(m,1H),4.04-3.90(m,3H),3.84(br d,J=12.4Hz,1H),3.26(br d,J=11.6Hz,2H),3.12(td,J=5.2,12.4Hz,1H),3.05-2.91(m,2H),2.79(br s,1H),2.74-2.56(m,3H),2.49(s,3H)。
ステップB:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.00g、4.56mmol、1.00当量)、1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(1.66g、6.84mmol、1.50当量)、Pd2(dba)3(418mg、456μmol、0.10当量)、RuPhos(426mg、912μmol、0.20当量)、およびCs2CO3(2.97g、9.12mmol、2.00当量)のトルエン(30.0mL)中混合物を90℃で5時間撹拌した。混合物を水(20.0mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×40.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(TFA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和重炭酸ナトリウム(5.00mL)によりpH>7に調整し、酢酸エチル(3×30.0mL)で抽出し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.00g、2.90mmol、64%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:601。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.53-7.44(m,1H),7.43-7.29(m,5H),7.07(d,J=8.0Hz,1H),7.00-6.91(m,1H),5.26-5.13(m,2H),4.69(br s,1H),4.16-4.10(m,3H),4.04(br d,J=13.2Hz,1H),3.87(br d,J=12.4Hz,1H),3.39-3.22(m,3H),3.19-3.09(m,1H),3.04(dt,J=3.6,12.4Hz,1H),2.83(br s,2H),2.76-2.67(m,2H),2.51(s,3H)。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.90g、3.16mmol、1.00当量)の酢酸エチル(50.0mL)中溶液に、m-CPBA(610mg、3.01mmol、85%純度、0.95当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、混合物を水(30.0mL)で希釈し、飽和重炭酸ナトリウム(10.0mL)によりpH>7に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×40.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/3)により精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.20g、1.73mmol、55%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:617。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.55-7.47(m,1H)(7.44-7.33(m,5H)),7.08(d,J=8.0Hz,1H),7.03-6.94(m,1H),5.20(s,2H),4.68(br s,1H),4.31-4.09(m,4H),4.02(br d,J=12.0Hz,1H),3.46(br d,J=13.2Hz,1H),3.40-3.09(m,4H),2.90(br d,J=2.8Hz,6H),2.74-2.64(m,1H)。
ステップD:ベンジル(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(145mg、392μmol、1.10当量)のTHF(5.00mL)中溶液に、t-BuONa(68.6mg、714μmol、2.00当量)を0℃で加えた。次いで、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.22g、357μmol、1.00当量)をこの混合物に加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、混合物を酢酸エチル(10.0mL)および水(10.0mL)で希釈し、次いで、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=1/3)により精製して、ベンジル(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.18g、185μmol、52%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M/2+1]:462。
ステップE:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。-78℃でNH3をメタノール(30.0mL)中に15分間バブリングした。ベンジル(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.18g、195μmol、1.00当量)およびPd/C(0.10g、10%純度)を、この混合物に加えた。15psiのH2下、40℃で1時間撹拌した後、触媒を濾過して取り除き、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.13g、粗製)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M/2+1]:395。
ステップF:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。(E)-4-ブロモブタ-2-エン酸(0.50g、3.03mmol、1.00当量)およびシュウ酸ジクロリド(3.85g、30.31mmol、2.65mL、10.0当量)のジクロロメタン(5mL)中混合物を、0℃で0.5時間および40℃で2時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。上記残留物(93.0mg、粗製)を、2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80.0mg、粗製)およびPy(80.3mg、1.02mmol、82.0μL)のジクロロメタン(0.50mL)中混合物に、0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、N-メチルメタンアミン(69.4mg、508μmol、77.9μL)を加え、混合物を20℃で1時間撹拌した。次いで、混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(TFA、0.10%)]により精製した。目的の画分を、飽和重炭酸ナトリウム(1×5.00mL)によりpH>7に調整し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.06g、48.05μmol、2ステップで65%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:899。
ステップG:2-[(2S)-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル]-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.06g、66.7μmol、1.00当量)、KF(38.8mg、667μmol、15.6μL、10.0当量)、および18-クラウン-6(176mg、667μmol、10.0当量)のTHF(0.10mL)中混合物を、40℃で12時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(TFA、0.10%/アセトニトリル)]および分取HPLCカラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:30%~60%(12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル]-4-[7-[3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例342、4.60mg、6.91μmol、10%収率、99.2%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:661。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.52-7.44(m,1H),7.07(d,J=8.4Hz,1H),7.00-6.90(m,2H),6.46(br d,J=15.2Hz,1H),5.07(br s,1H),4.50-4.42(m,1H),4.36(dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.22(dd,J=5.6,10.8Hz,1H),4.16-4.06(m,3H),3.96(br d,J=11.6Hz,2H),3.60(br s,1H),3.43(dd,J=6.0,10.0Hz,1H),3.39-3.23(m,2H),3.20-3.05(m,4H),3.05-2.79(m,4H),2.78-2.62(m,2H),2.48(s,3H),2.35-2.26(m,7H),2.12-1.92(m,2H)。
実施例343
(S)-7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-((1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-4-(4-(ビニルスルホニル)ピペラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン
ステップA:7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル 4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(350mg、652μmol、1.0当量)のジオキサン(3.0mL)中溶液に、4MのHCl/ジオキサン(5.0mL)を加え、混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮し、次いで、DCM(10.0mL)を加え、有機層を飽和NaHCO3水溶液(2×10.0mL)で洗浄し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(280mg、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:437。
ステップB:7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-(4-ビニルスルホニルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(280mg、641μmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中混合物に、TEA(195mg、1.92mmol、268μL、3.0当量)およびエテンスルホニルクロリド(122mg、962μmol、1.5当量)を-60℃で加え、反応混合物を-60℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeOH(1.0mL)でクエンチし、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製し、次いで、粗生成物を濃縮し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:62%~92%、12分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-(4-ビニルスルホニルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(実施例343、98.2mg、185μmol、29%収率、99.3%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:527。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.12(t,J=7.6Hz,1H),7.00-6.94(m,2H),6.47(dd,J=10.0Hz,16.8Hz,1H),6.30(d,J=16.8Hz,1H),6.11(d,J=10.0Hz,1H),4.39(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.15(dd,J=6.8,10.4Hz,1H),4.03(s,2H),3.62(t,J=4.6Hz,4H),3.30(t,J=4.6Hz,4H),3.19-3.05(m,3H),2.80-2.62(m,3H),2.49(s,3H),2.32-2.25(m,7H),2.13-2.00(m,1H),1.92-1.72(m,3H)。
実施例344
2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(101mg、874μmol、1.2当量)のトルエン(15mL)中溶液に、t-BuONa(140mg、1.46mmol、2当量)を0℃で10分未満で加えた。次いで、この混合物に、ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、500mg、728μmol、1当量)のトルエン(10mL)中溶液を0℃で滴加した。0℃で0.5時間撹拌した後、反応混合物をH2O(1×7mL)および酢酸エチル(1×25mL)で希釈した。有機相を分離し、ブライン(1×20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3;石油エーテル/酢酸エチル=10/1→0/1)により精製した。化合物であるベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(390mg、489μmol、67%収率、92.6%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:738。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.09(d,J=8.4Hz,1H),7.74(d,J=8.0Hz,1H),7.50(d,J=7.2Hz,2H),7.46-7.34(m,10H),7.00(d,J=2.0Hz,1H),6.89(d,J=2.4Hz,1H),5.24-5.15(m,4H),4.70(br s,1H),4.39(dd,J=4.8,10.7Hz,1H),4.33-4.22(m,2H),4.20-4.11(m,3H),3.93(br d,J=12.0Hz,1H),3.56-3.19(m,4H),3.14-2.61(m,7H),2.48(s,3H),2.34-2.23(m,1H),2.11-2.06(m,1H),1.84-1.69(m,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。NH3をMeOH(100mL)中に-60℃で20分間バブリングした。ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(360mg、488μmol、1当量)のMeOH(25mL)中溶液に、Pd/C(300mg、10%純度)および上記溶液(NH3・MeOH、25mL)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除き、真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、粗製)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:514。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、粗製)およびTEA(453mg、4.48mmol、623μL)のDCM(8mL)中混合物に、プロパ-2-エノイルクロリド(40.5mg、448μmol、36.5μL)を-40℃で少しずつ加えた。混合物を-40℃で30分間撹拌した。0℃でNaHCO3飽和溶液(2mL)により反応混合物をクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×30mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3;酢酸エチル/メタノール=20/1→3/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:38%~68%、12分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例344、25.6mg、44.8μmol、2ステップで9.2%収率、99.5%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:568。
SFC条件:「AS-3_MeOH(DEA)_5_40_3mL-35T カラム:Chiralpak AS-3 50×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,酢酸)δ=8.08(d,J=8.4Hz,1H),7.66(d,J=8.0Hz,1H),7.39(t,J=7.6Hz,1H),7.29(t,J=7.2Hz,1H),6.96(s,1H),6.90-6.68(m,2H),6.38(br d,J=17.6Hz,1H),5.87(br d,J=10.8Hz,1H),5.17(br s,1H),4.82(br s,2H),4.59(br s,1H),4.45-4.25(m,3H),4.21-3.61(m,4H),3.60-3.19(m,5H),3.17-2.83(m,7H),2.45-2.31(m,1H),2.23-2.10(m,3H)。
実施例345
2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、1.48mmol、1.0当量)、4-クロロ-3-ピコリン(379mg、2.97mmol、2.0当量)、Pd2(dba)3(204mg、223μmol、0.15当量)、RuPhos(139mg、297μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(1.45g、4.45mmol、3.0当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で12時間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去し、水(15.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×25.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(60.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュHPLC[C18、水中0.1%のFA、0~45%のMeCN]により精製した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液によりpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(3×50.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(270mg、475μmol、32%収率、99.0%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:563。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、355μmol、1.0当量)のジオキサン(3.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、3.0mL、33.8当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、25℃で30分間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液によりpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(3×15.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗生成物である2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(125mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:463。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(125mg、粗製)のDCM(3.0mL)中溶液に、TEA(137mg、1.35mmol、188μL)およびプロパ-2-エノイルクロリド(36.7mg、405μmol、33.1μL)を-60℃で加えた。混合物を-60℃で30分間撹拌した。反応物をメタノール(10.0mL)でクエンチし、混合物を真空下で除去した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:32%~62%、12分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例345、25.3mg、48.4μmol、18%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:517。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.33-8.29(m,2H),6.83(d,J=5.6Hz,1H),6.65-6.50(m,1H),6.38(dd,J=1.6Hz,J=16.8Hz,1H),5.82(d,J=10.8Hzの1H),5.41(br s,1H),4.36(dd,J=4.8Hz,J=10.4Hz,1H),4.20-4.06(m,4H),4.97(br d,J=11.6Hzの2H),3.68-3.45(m,1H),3.40-3.31(m,2H),3.26-3.15(m,1H),3.15-3.03(m,2H),2.97-2.60(m,5H),2.31(s,3H),2.29-2.21(m,3H)2.15-2.10(m,1H),2.09-2.00(m,1H)1.88-1.70(m,3H)。
実施例346
2-[4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:(E)-4-ブロモブタ-2-エン酸(1.0g、6.06mmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中溶液に、(COCl)2(8.70g、68.5mmol、6mL、11.3当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、60℃で16時間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去した。粗生成物である(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(1.3g、粗製)を黄色液体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.30g、2.17mmol、1.0当量)および[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(500mg、4.34mmol、515μL、2.0当量)のトルエン(20.0mL)中溶液に、t-BuONa(417mg、4.34mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で10分間撹拌した。20℃で飽和ブライン(30mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、EA(3×30.0mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→EA/MeOH=10/1)により精製した。生成物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.10g、1.62mmol、収率75%、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:650。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、308μmol、1.0当量)のジオキサン(2.0mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、2.0mL、26.0当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、25℃で30分間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液によりpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗生成物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(130mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:551。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-モルホリノブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、1812μmol、1.0当量)およびピリジン(115mg、1.45mmol、117μL、8.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(133mg、727μmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。出発材料が消費された後、モルホリン(79.2mg、909μmol、80.0μL、5.0当量)を上記混合物に加え、0℃で3.5時間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液によりpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(3×15.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-モルホリノブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例346、21.7mg、30.6μmol、16.9%収率、99%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:703。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40(t,J=8.0Hz,J=8.0Hzの1H),7.28(s,1H),7.19(d,J=8.0Hz,1H),7.00-6.93(m,1H),6.59(br s,1H),6.57-6.40(m,1H),5.18-5.03(m,1H),4.38(dd,J=4.8Hz,J=10.4Hz,1H),4.16(d d,J=6.8Hz,J=10.4Hz,1H),4.14-4.04(m,3H),4.04-3.88(m,2H),3.74(t,J=4.4Hz,J=4.8Hz,4H),3.52(br s,1H),3.41-3.23(m,2H),3.18(d,J=5.6Hz,3H),3.12-3.08(m,2H),2.95-2.85(m,2H),2.30-2.15(m,3H),2.55-2.45(m,7H),2.34-2.24(m,1H),2.13-2.00(m,1H),1.90-1.75(m,3H)。
実施例347
2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ピロリジン-1-イルブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド。(E)-4-ブロモブタ-2-エン酸(1.00g、6.06mmol、1.00当量)の(COCl)2(14.5g、114mmol、10.0mL、18.9当量)中溶液およびDCM(10.0mL)を70℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。生成物(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(1.00g、粗製)を黄色油として得た。粗製化合物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、1.08mmol、1.0当量)のジオキサン(5.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、7.0mL、26.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濃縮し、飽和NaHCO3水溶液によりpH約7に調整し、次いで、EA(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(400mg、669μmol、62%収率、92%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:550。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、364μmol、1.00当量)およびピリジン(230mg、2.91mmol、235μL、8.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(267mg、1.45mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10.0mL)に加え、DCM(10.0mL×2)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、粗製)を褐色油として得た。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ピロリジン-1-ylbut-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ピロリジン(306mg、4.30mmol、359μL、10.0当量)、K2CO3(297mg、2.15mmol、5.0当量)、およびKI(21.4mg、129μmol、0.30当量)のTHF(2.0mL)中溶液に、2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、430μmol、1.0当量)を0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(10.0mL)を混合物に加え、DCM(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:70%~100%、3分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ピロリジン-1-イルブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例347、17.1mg、24.5μmol、2ステップで7%収率、99%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:687。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.41(t,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=8.0Hz,1H),7.20(d,J=8.4Hz,1H),7.06-6.95(m,1H),6.47(br d,J=14.0Hz,1H),5.20-4.60(m,1H),4.39(dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.22-4.07(m,4H),3.97(br d,J=12.0Hz,2H),3.42-3.23(m,3H),3.21-3.04(m,3H),2.96-2.86(m,2H),2.79-2.64(m,5H),2.62-2.54(m,4H),2.49(s,3H),2.35-2.25(m,1H),2.13-2.01(m,1H),1.83-1.70(m,7H)。
実施例348
2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:tert-ブチル(2R)-2-[(1R)-1-ヒドロキシエチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。BH3・Me2S(DMS中の10M、610μL、1.3当量)および(3aS)-1-メチル-3,3-ジフェニル-3a,4,5,6-テトラヒドロピロロ[1,2-c][1,3,2]オキサザボロール(トルエン中の1M、938μL、0.2当量)のTHF(10mL)中混合物を、25℃で1時間撹拌した。次いで、tert-ブチル(2R)-2-アセチルピロリジン-1-カルボキシレート(1.00g、4.69mmol、1当量)のTHF(10mL)中溶液を加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物をMeOH(4mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE/EtOAC=50/1→5/1)により精製した。tert-ブチル(2R)-2-[(1R)-1-ヒドロキシエチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(690mg、3.21mmol、68%収率)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.19(br s,1H),3.79-3.59(m,2H),3.49(br s,1H),3.35-3.18(m,1H),2.04-1.90(m,1H),1.88-1.68(m,3H),1.47(d,J=0.8Hz,9H),1.20-1.11(m,3H)。
ステップA:ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2R)-2-[(1R)-1-ヒドロキシエチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(263mg、1.22mmol、1.2当量)のトルエン(15mL)中溶液に、t-BuONa(196mg、2.04mmol、2当量)を0℃で10分かけて加えた。この混合物に、トルエン(15mL)中のベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、1.02mmol、1当量)を0℃で滴加した。0℃で0.5時間撹拌した後、反応混合物をH2O(1×7mL)および酢酸エチル(1×35mL)に加えた。有機相を分離し、ブライン(1×20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液でpH=7に中和し、酢酸エチル(1×100mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(470mg、536μmol、53%収率、95.6%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:838。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.09(d,J=8.4Hz,1H),7.73(d,J=8.0Hz,1H),7.53-7.48(m,2H),7.46-7.31(m,10H),7.00(d,J=1.6Hz,1H),6.89(d,J=2.0Hz,1H),5.78-5.44(m,1H),5.30-5.08(m,4H),4.70(br s,1H),4.35-4.20(m,3H),4.08-3.79(m,2H),3.72-3.13(m,7H),3.12-2.64(m,4H),2.01-1.71(m,5H),1.46(s,9H),1.26-1.23(m,3H)。
ステップB:ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-ピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、537μmol、1当量)のDCM(600μL)中溶液に、TFA(918mg、8.05mmol、596μL、15当量)を窒素雰囲気下、0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。次いで、混合物を真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-ピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、粗製、TFA)を黄色油として得た。
ステップC:ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-ピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(650mg、763μmol、1当量、TFA)、ホルムアルデヒド(310mg、3.81mmol、284μL、5当量、水中37%)、およびAcOH(45.8mg、763μmol、43.6μL、1当量)のMeOH(15mL)中混合物を25℃で0.5時間撹拌した。次いで、NaBH3CN(120mg、1.91mmol、2.5当量)を加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物をH2O(10mL)により0℃でクエンチし、次いで、酢酸エチル(3×15mL)で抽出し、ブライン(1×15mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液でpH=7に中和し、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(260mg、339μmol、2ステップで68%収率、97.9%純度)を黄色固体として得た。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。NH3をMeOH(100mL)中に-60℃で20分間バブリングした。ベンジル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(260mg、346μmol、1当量)のMeOH(15mL)中溶液に、Pd/C(200mg、10%純度)および上記混合物(NH3・MeOH、15mL)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除き、真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、300μmol、87%収率、88.0%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:528。
ステップE:2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、341μmol、1当量)およびTEA(345mg、3.41mmol、475μL、10当量)のDCM(8mL)中混合物に、プロパ-2-エノイルクロリド(30.9mg、341μmol、27.8μL、1当量)を-40℃で少しずつ加え、混合物を-40℃で30分間撹拌した。0℃でNaHCO3飽和溶液(2mL)により反応混合物をクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×30mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3;酢酸エチル/メタノール=20/1→3/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:42%~72%、12分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[(1R)-1-[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例348、23.5mg、39.9μmol、12%収率、99.0%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:582。
SFC条件:「OJ-3S_3_5_40_3MLカラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=8.09(d,J=8.4Hz,1H),7.64(d,J=8.0Hz,1H),7.39(t,J=7.6Hz,1H),7.32-7.23(m,1H),6.98-6.74(m,3H),6.31(br d,J=16.4Hz,1H),5.85(br d,J=10.4Hz,1H),5.27-5.15(m,1H),5.11(br s,1H),4.62(br s,1H),4.33-4.00(m,5H),3.75-3.38(m,2H),3.27-2.81(m,7H),2.75-2.62(m,1H),2.55(s,3H),2.47-2.31(m,1H),2.11-1.96(m,1H),1.86-1.69(m,3H),1.34(d,J=6.4Hz,3H)。
実施例349
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2,6-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップ1:2-ブロモ-6-フルオロ-3-メチル-ベンズアルデヒド。2-ブロモ-4-フルオロ-1-トルエン(10g、52.9mmol、1当量)のTHF(200mL)中溶液に、LDA(トルエン中の2M、31.7mL、1.2当量)を窒素雰囲気下、-78℃で加えた。-78℃で2時間撹拌した後、DMF(4.64g、63.5mmol、4.88mL、1.2当量)の溶液を-78℃で加えた。混合物を25℃まで慎重に暖め、0.5時間撹拌した。混合物を水(5mL)でクエンチし、混合物を石油エーテル/酢酸エチル(50mL/5mL)および水(50mL)で希釈した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物である2-ブロモ-6-フルオロ-3-メチル-ベンズアルデヒド(11.5g、52.9mmol、100%収率)を無色油として得た。
ステップ2:(2-ブロモ-6-フルオロ-3-メチルフェニル)メタノール。2-ブロモ-6-フルオロ-3-メチルベンズアルデヒド(11.5g、52.9mmol、1当量)のMeOH(100mL)中溶液に、NaBH4(2.20g、58.2mmol、1.1当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。混合物を0℃で水でクエンチし、混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 50/1→3/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮した。化合物である(2-ブロモ-6-フルオロ-3-メチルフェニル)メタノール(8.5g、38.4mmol、73%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M-17]:201。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.20(dd,J=6.4,8.4Hz,1H),6.98(t,J=8.8Hz,1H),4.88(d,J=2.0Hz,2H),2.41(s,3H),2.35-2.11(m,1H)。
ステップ3:3-2-(ブロモメチル)-1ブロモ-フルオロ-4-トルエン。(2-ブロモ-6-フルオロ-3-メチルフェニル)メタノール(5g、22.8mmol、1当量)のTHF(100mL)中混合物に、PBr3(12.4g、45.6mmol、2当量)を0℃で少しずつ加えた。25℃で1時間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。残留物を酢酸エチル(100mL)で希釈し、氷水(1×50mL)、10%の重炭酸ナトリウム水溶液(2×50mL)、およびブライン(1×20mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→10/1)で精製した。化合物である3-ブロモ-2-(ブロモメチル)-1-フルオロ-4-トルエン(5.6g、19.9mmol、87%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.20(dd,J=6.4,8.0Hz,1H),6.97(t,J=8.8Hz,1H),4.70(d,J=2.0Hz,2H),2.41(s,3H)。
ステップ4:3-ブロモ-1-フルオロ-2,4-キシレン。3-ブロモ-2-(ブロモメチル)-1-フルオロ-4-トルエン(5.6g、19.9mmol、1当量)のDMF(50mL)中溶液に、NaBH4(1.50g、39.7mmol、2当量)およびAgNO3(6.75g、39.7mmol、6.68mL、2当量)を25℃で加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。混合物を減圧下で濃縮した。化合物である3-ブロモ-1-フルオロ-2,4-キシレン(2.1g、9.93mmol、50%収率、96%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.05(dd,J=6.0,8.4Hz,1H),6.91(t,J=8.8Hz,1H),2.38(s,3H),2.35(d,J=2.4Hz,3H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-フルオロ-2,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、1.06mmol、1当量)、3-ブロモ-1-フルオロ-2,4-ジメチル-ベンゼン(430mg、2.12mmol、2当量)、RuPhos-Pd-G3(177mg、212μmol、0.2当量)、Cs2CO3(863mg、2.65mmol、2.5当量)のトルエン(10mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、70℃で12時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)により精製し、逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル)]によりさらに精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-フルオロ-2,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(20mg、28.6μmol、3%収率、85%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:594。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(3-フルオロ-2,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-フルオロ-2,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(20mg、33.7μmol、1当量)のDCM(100μL)中溶液に、TFA(57.6mg、505μmol、37.4μL、15当量)を加えた。25℃で1時間撹拌した後、反応混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-フルオロ-2,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(20.5mg、33.7μmol、100%収率、TFA)を黄色油として得た。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(3-フルオロ-2,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-フルオロ-2,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(20.5mg、33.7μmol、1当量、TFA)のDCM(1mL)中溶液に、TEA(34.1mg、337μmol、46.9μL、10当量)を-40℃で加えた。次いで、DCM(1mL)中のプロパ-2-エノイルクロリド(3.05mg、33.7μmol、2.75μL、1当量)を滴加し、混合物を-40℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(0.1mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(SiO2、ジクロロメタン/メタノール=10/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%のFA)-ACN];B%:16%~43%、9分)によりさらに精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-フルオロ-2,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例349、0.39mg、0.693μmol、2%収率、97.3%純度)を無色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:548。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.06-6.92(m,1H),6.84(t,J=8.8Hz,1H),6.70-6.49(m,1H),6.42(d,J=15.2Hz,1H),5.85(d,J=10.4Hz,1H),5.09(br s,1H),4.60(br s,1H),4.39-4.27(m,1H),4.25-3.83(m,5H),3.75-3.22(m,5H),3.19-2.47(m,10H),2.34-2.21(m,6H),2.21-1.89(m,4H)。
実施例350
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-ヒドロキシナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。3-ベンジルオキシ-1-ブロモ-ナフタレン(中間体29、1.01g、3.21mmol、1.3当量)、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、1g、2.47mmol、1当量)、Cs2CO3(2.01g、6.18mmol、2.5当量)、RuPhos(230mg、494μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(452mg、494μmol、0.2当量)のトルエン(50mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で5時間撹拌した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1→3/1)で精製した。化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.2g、1.71mmol、69%収率、91%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:637。
ステップB:tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.2g、1.88mmol、1当量)の酢酸エチル(50mL)中溶液に、m-CPBA(382mg、1.88mmol、85%純度、1当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、反応混合物を飽和Na2S2O3水溶液(20mL)でクエンチし、次いで、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=100/1→10/1)により精製した。化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(900mg、1.30mmol、69%収率、94%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:653。
ステップC:tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチル・ピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(793mg、1.22mmol、1当量)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(350mg、3.65mmol、3当量)および[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(420mg、3.65mmol、3当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10/1→0/1)で精製した。化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチル・ピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、944μmol、78%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:704。
ステップD:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。NH3をMeOH(100mL)中に-60℃で10分間バブリングした。tert-ブチル(2S)-4-[7-(3-ベンジルオキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、994μmol、1当量)のMeOH(20mL)中溶液に、無水Pd/C(300mg、10%純度)および上記NH3・MeOH溶液(20mL)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、619μmol、62%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:614。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.02(d,J=8.4Hz,1H),7.62(d,J=8.4Hz,1H),7.38(t,J=7.2Hz,1H),7.29(t,J=7.2Hz,1H),6.88(d,J=2.0Hz,1H),6.70(d,J=2.0Hz,1H),4.57(br s,1H),4.36-4.22(m,2H),4.17-4.14(m,1H),4.02(br d,J=13.6Hz,2H),3.85(br d,J=12.8Hz,1H),3.47-3.08(m,3H),3.07-2.64(m,12H),2.56(s,3H),2.27-2.14(m,1H),1.89-1.75(m,1H),1.52(s,9H)。
ステップE:2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、651μmol、1当量)のDCM(500μL)中溶液に、TFA(743mg、6.52mmol、482μL、10当量)を加えた。25℃で1時間撹拌した後、反応混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(409mg、粗製、TFA)を褐色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:514。
ステップF:2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(409mg、651μmol、1当量、TFA)のDCM(10mL)中溶液に、TEA(659mg、6.52mmol、907μL、10当量)を0℃で加えた。添加後、DCM(1mL)中のプロパ-2-エノイルクロリド(53.1mg、586μmol、47.8μL、0.9当量)を-40℃で滴加した。得られた混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(1mL)でクエンチし、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=100/1→5/1)により精製して、分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:11%~41%、10分)によりさらに精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=8に調整し、ジクロロメタン(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例350、25.5mg、39.9μmol、6%収率、89%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:568。
1H NMR(400MHz,酢酸-d4)δ=8.07(d,J=8.4Hz,1H),7.66(d,J=8.0Hz,1H),7.39(t,J=7.2Hz,1H),7.29(t,J=7.2Hz,1H),6.96(d,J=2.0Hz,1H),6.87(d,J=1.6Hz,1H),6.75(br s,1H),6.38(d,J=16.8Hz,1H),5.87(d,J=10.0Hz,1H),5.23-5.01(m,1H),4.98-4.49(m,4H),4.43(s,1H),4.33(s,2H),4.23-4.00(m,1H),3.99-3.51(m,5H),3.50-3.23(m,4H),3.17-2.91(m,8H),2.63-2.24(m,1H)。
実施例351
2-[(2S)-4-[2-(1H-イミダゾール-2-イルメトキシ)-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:エチル 1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-カルボキシレート。エチル 1H-イミダゾール-2-カルボキシレート(5g、35.7mmol、1当量)、DHP(33.0g、392mmol、35.9mL、11.0当量)、およびPTSA・H2O(400mg、2.32mmol、6.51e-2当量)のTHF(100mL)中混合物を60℃(オイルバス温度)で16時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮し、次いで、酢酸エチル(100mL)および水(100mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル20/1→1/1)により精製し、エチル 1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-カルボキシレート(6.2g、26.0mmol、73%収率、94%純度)を淡黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40(d,J=0.8Hz,1H),7.16(d,J=0.8Hz,1H),6.21(dd,J=2.0,10.0Hz,1H),4.39(dq,J=0.8,7.2Hz,2H),4.20-4.10(m,1H),3.71(dt,J=2.8,11.6Hz,1H),2.13-2.03(m,1H),2.03-1.88(m,1H),1.80-1.55(m,4H),1.42(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップ2:(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メタノール。エチル 1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-カルボキシレート(2g、8.92mmol、1当量)のTHF(40mL)中溶液を、LiAlH4(758mg、20.0mmol、2.24当量)に0℃で3回に分けて加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和Na2SO4水溶液(2.89mL)でクエンチし、濾過し、濾液を濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 1/0→10/1)により精製して、(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メタノール(1.57g、7.75mmol、87%収率、90%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=7.27(d,J=1.6Hz,1H),6.89(d,J=1.2Hz,1H),5.54(dd,J=2.4,10.0Hz,1H),4.74-4.61(m,2H),4.15-3.99(m,1H),3.76-3.68(m,1H),2.06-1.88(m,3H),1.84-1.60(m,3H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-メチルスルフィニル-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体64、380mg、654μmol、1当量)および(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メタノール(238mg、1.31mmol、2当量)のトルエン(0.4mL)中溶液に、t-BuONa(126mg、1.31mmol、2当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で20分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(10mL)で希釈し、EtOAc(2×20mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(SiO2、PE/EtOAc 3/1→1/3)により精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(270mg、363.19μmol、56%収率、94%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:699。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。NH3をMeOH(3mL)中に-40℃で10分間バブリングした。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(260mg、372μmol、1当量)のMeOH(3mL)中溶液を、上記溶液に加え、次いで、N2下でPd/C(100mg、10%純度)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを6回繰り返した。反応物をH2(15psi)下、28℃で1時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(160mg、275μmol、74%収率、97%純度)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:565。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(160mg、283μmol、1.00当量)およびDIEA(73.2mg、567μmol、98.7μL、2.00当量)のDCM(3mL)中溶液に、プロパ-2-エノイルクロリド(38.5mg、425μmol、34.7μL、1.50当量)を-40℃で滴加した混合物を-40℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、この混合物にNaHCO3飽和水溶液(1mL)および水(3mL)を加えた。層を分離した。水相をEtOAc(2×5mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 50/1→10/1)により精製し、2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80mg、101μmol、36%収率、78%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:619。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-(1H-イミダゾール-2-イルメトキシ)-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-2-[(1-テトラヒドロピラン-2-イルイミダゾール-2-イル)メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(67mg、84.5μmol、1当量)およびTsOH・H2O(48.2mg、253μmol、3当量)のMeCN(1.5mL)中溶液を60℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をNaHCO3飽和水溶液(1mL)により0℃でクエンチした。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%NH3・H2O)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。粗生成物を分取HPLC(カラム:PhenomenexSynergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%~50%、10.5分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-(1H-イミダゾール-2-イルメトキシ)-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例351、2.55mg、4.22μmol、5.4%収率、96%純度、FA)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:535。
SFC条件:カラム:Chiralpak AS-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3ml/分 波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.26-8.20(m,1H),7.92-7.82(m,1H),7.63(d,J=8.4Hz,1H),7.56-7.48(m,2H),7.45(t,J=8.0Hz,1H),7.17(d,J=7.2Hz,1H),7.08-6.99(m,2H),6.69-6.52(m,1H),6.46-6.32(m,1H),5.84(br d,J=11.2Hz,1H),5.56-5.44(m,2H),5.24-4.90(m,1H),4.88-4.14(m,4H),4.14-3.79(m,2H),3.79-3.37(m,3H),3.35-2.64(m,4H),2.61-2.49(m,1H)。
実施例352
2-[(2S)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
3-ブロモ-4-シクロプロピル-ピリジン。3,4-ジブロモピリジン(3.0g、12.7mmol、1.0当量)、シクロプロピルボロン酸(1.09g、12.7mmol、1.0当量)、Pd(dppf)Cl2(927mg、1.27mmol、0.10当量)、K3PO4(8.06g、38.0mmol、3.0当量)のDMF(15.0mL)およびH2O(3.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、60℃で6時間撹拌した。有機溶媒を水(80.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(300mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=30:1→20:1)により精製した。化合物である3-ブロモ-4-シクロプロピル-ピリジン(630mg、3.17mmol、25%収率、99.6%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:198。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.69-8.61(m,1H),8.39-8.32(m,1H),6.75-6.71(m,1H),2.29-2.18(m,1H),1.20-1.12(m,2H),0.84-0.77(m,2H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、500mg、1.06mmol、1.0当量)、3-ブロモ-4-シクロプロピル-ピリジン(315mg、1.59mmol、1.50当量)、Pd2(dba)3(97.09mg、106μmol、0.10当量)、RuPhos(99.0mg、212μmol、0.20当量)、およびCs2CO3(1.04g、3.18mmol、3.0当量)のトルエン(5.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で12時間撹拌した。有機溶媒を水(15.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×20mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュHPLC[C18、水中0.1%のNH3・H2O、0~60%のMeCN]により精製した。次いで、得られた生成物を濃縮し、水相をEA(3×50mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、260μmol、24.5%収率、85%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:589。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(30.0mg、43.3μmol、1.0当量)のジオキサン(1.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、1.0mL、92.4当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、25℃で30分間撹拌した。有機溶媒を真空下で除去した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液によりpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗生成物である2-[(2S)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(30.0mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:489。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(30.0mg、61.4μmol、1.0当量)のDCM(1.50mL)中溶液に、TEA(31.1mg、307μmol、42.7μL、5.0当量)およびプロパ-2-エノイルクロリド(8.34mg、92.1μmol、7.51μL、1.50当量)を-60℃で加えた。混合物をN2雰囲気下、-60℃で30分間撹拌した。反応物をメタノール(6.0mL)でクエンチし、真空下で除去した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:33%~63%、12分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(4-シクロプロピル-3-ピリジル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例352、2.71mg、4.97μmol、8.1%収率、99.5%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:543。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.29(s 1H),8.26(d,J=5.2Hz,1H),6.68(d,J=5.2Hz,1H),6.64-6.53(m,1H),6.40(dd,J=0.8Hz,J=16.8Hz,1H),5.52(d,J=10.4Hz,1H),5.07(br s,1H),4.39(dd,J=4.8Hz,J=10.4Hz,1H),4.29-4.23(m,1H),4.21-4.15(m,2H),4.13-4.07(m,1H),4.00-3.95(m,1H),3.57(br s,1H),3.44-3.24(m,4H),3.17-3.03(m,2H),2.94(dd,J=8.8Hz,J=16.8Hz,1H),2.87-2.80(m,2H),2.73-2.64(m,1H),2.49(s,3H),2.35-2.22(m,3H),2.11-2.00(m,1H),1.89-1.76(m,3H),1.17-1.11(m,2H),0.90-0.77(m,3H)。
実施例353
1-[(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル(3R)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(1.5g、5.10mmol、1当量)、tert-ブチル(3R)-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(1.12g、5.61mmol、1.1当量)、DIEA(1.32g、10.2mmol、1.78mL、2当量)のNMP(30mL)中溶液を、100℃で7時間撹拌した。水(90mL)を混合物に加えた。得られた混合物をEtOAc(20mL)で希釈し、EtOAc(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を(PE:EtOAc=3:1、20mL)でスラリー化し、濾過し、濾過ケーキを(PE:EtOAc=3:1、40mL)で洗浄して、tert-ブチル(3R)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(0.9g、1.73mmol、34%収率、88.0%純度)を灰色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:458。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.38-7.27(m,5H),4.28-4.18(m,1H),4.16-3.80(m,2H),3.74(br d,J=13.6Hz,1H),3.68(s,2H),3.65-3.52(m,2H),3.41-3.27(m,1H),3.21-2.89(m,2H),2.74-2.58(m,4H),1.48(s,9H),1.23(d,J=6.8Hz,3H)。
ステップB:tert-ブチル(3R)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(566mg、4.91mmol、583μL、2.5当量)のTHF(20mL)中溶液に、NaH(157mg、3.93mmol、60.0%純度、2当量)を0℃で加え、0℃で0.5時間撹拌した。次いで、この混合物に、tert-ブチル(3R)-4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(900mg、1.97mmol、1当量)を加えた。反応混合物をチューブ中でN2下で70℃まで12時間加熱した。混合物を水(15mL)でクエンチした。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=35%)により精製して、tert-ブチル(3R)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(680mg、1.14mmol、58%収率、90.0%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:537。
ステップC:tert-ブチル(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(3R)-4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-メチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(680mg、1.27mmol、1当量)のMeOH(14mL)中溶液に、Pd(OH)2/C(340mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で4時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3×10mL)で洗浄し、濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(540mg、1.09mmol、86%収率、90.0%純度)を褐色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
ステップD:tert-ブチル(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(520mg、1.16mmol、1当量)、1-ブロモナフタレン(482mg、2.33mmol、324μL、2当量)、RuPhos(109mg、233μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(1.14g、3.49mmol、3当量)のトルエン(11mL)中溶液に、Pd2(dba)3(107mg、116μmol、0.1当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、105℃で7時間撹拌した。水(10mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 5:1→0:1)により精製した。次いで、残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=61%)により精製した。化合物であるtert-ブチル(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(330mg、547μmol、47%収率、95.0%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:573。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=8.26-8.18(m,1H),7.89-7.84(m,1H),7.60(d,J=8.4Hz,1H),7.54-7.47(m,2H),7.43(t,J=7.6Hz,1H),7.14(d,J=7.2Hz,1H),4.41(dd,J=5.2,10.4Hz,1H),4.26(s,3H),4.18-4.14(m,1H),4.03-3.68(m,2H),3.45-3.00(m,6H),2.84(br s,2H),2.69(br d,J=6.4Hz,1H),2.50(s,3H),2.35-2.24(m,1H),2.12-2.06(m,1H),1.91-1.70(m,4H),1.50(s,9H),1.32-1.27(m,3H)。
ステップE:4-[(2R)-2-メチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(330mg、576μmol、1当量)およびTFA(657mg、5.76mmol、427μL、10当量)の混合物を、30℃で40分間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、4-[(2R)-2-メチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(340mg、粗製、TFA)を褐色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
ステップF:1-[(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。4-[(2R)-2-メチルピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(340mg、粗製、TFA)、TEA(586mg、5.80mmol、807μL)のDCM(6mL)中溶液に、プロパ-2-エノイルクロリド(78.7mg、869μmol、70.9μL)を-40℃で加え、混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。混合物を飽和NaHCO3(2mL)によりクエンチした。混合物をEtOAc(5mL)で希釈し、EtOAc(10mL)で抽出した。有機層を、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製して、標記化合物である1-[(3R)-3-メチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例353、85.5mg、162μmol、2ステップで28%収率、99.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:527。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.23(br d,J=9.2Hz,1H),7.90-7.84(m,1H),7.61(d,J=8.4Hz,1H),7.55-7.47(m,2H),7.44(t,J=7.6Hz,1H),7.15(d,J=7.2Hz,1H),6.70-6.52(m,1H),6.37(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.77(br d,J=10.0Hz,1H),4.66-4.31(m,3H),4.27(s,2H),4.14(dd,J=6.8,10.4Hz,1H),4.02-3.73(m,2H),3.64-3.25(m,4H),3.24-2.99(m,2H),2.86(br s,2H),2.74-2.63(m,1H),2.49(s,3H),2.34-2.24(m,1H),2.13-2.00(m,1H),1.90-1.74(m,3H),1.28(br d,J=4.4Hz,3H)。
実施例354
1-[3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,3-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。7-ベンジル-2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(1.5g、5.10mmol、1当量)およびtert-ブチル3,3-ジメチルピペラジン-1-カルボキシレート(4.37g、20.4mmol、4当量)の溶液を、130℃で22時間撹拌した。残留物を直接使用して精製した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 1:0→10:1)により精製した。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*80mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:30%~60%、35分、60%分)により精製して、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,3-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1g、2.12mmol、42%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:472。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.39-7.28(m,5H),4.01(t,J=5.6Hz,2H),3.69(s,2H),3.55-3.44(m,6H),2.78-2.66(m,4H),1.51(s,6H),1.48(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,3-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(610mg、5.30mmol、629μL、2.5当量)のTHF(20mL)中溶液に、NaH(169mg、4.24mmol、60%純度、2当量)を0℃で加え、0℃で0.5時間撹拌した。次いで、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,3-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1g、2.12mmol、1当量)を混合物に加えた。反応混合物をチューブ中でN2下で70℃まで12時間加熱した。反応混合物を水(10mL)でクエンチした。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(2×30mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~50%、30;79%分)により精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,3-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(980mg、1.69mmol、80%収率、95.0%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:551。
ステップC:tert-ブチル 3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3,3-ジメチル-ピペラジン-1-カルボキシレート(980mg、1.78mmol、1当量)のMeOH(20mL)中溶液に、Pd(OH)2/C(500mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で4時間撹拌した。混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3×10mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル 3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(780mg、1.69mmol、95%収率、100%純度)を無色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:461。
ステップD:tert-ブチル 3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、868μmol、1当量)、1-ブロモナフタレン(360mg、1.74mmol、241μL、2当量)、Cs2CO3(849mg、2.61mmol、3当量)、およびRuPhos(81.0mg、174μmol、0.2当量)のトルエン(8mL)中溶液に、Pd2(dba)3(79.5mg、86.8μmol、0.1当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、95℃で8時間撹拌した。水(10mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=10:1~0:1)により精製した。次いで、残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=52%)により精製して、tert-ブチル 3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、340μmol、39%収率、95.0%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:587。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22(dd,J=3.2,6.4Hz,1H),7.87-7.82(m,1H),7.58(d,J=8.4Hz,1H),7.51-7.45(m,2H),7.42(t,J=7.6Hz,1H),7.15(d,J=7.6Hz,1H),4.39-4.27(m,2H),4.12-4.05(m,3H),3.60-3.26(m,6H),3.14(br t,J=7.6Hz,1H),2.79(br s,2H),2.74-2.65(m,1H),2.53(s,3H),2.39-2.28(m,1H),2.05-2.00(m,1H),1.92-1.70(m,4H),1.58(br d,J=4.0Hz,6H),1.49(s,9H)。
ステップE:4-(2,2-ジメチルピペラジン-1-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル 3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、358μmol、1当量)およびTFA(408mg、3.58mmol、265μL、10当量)の溶液を、30℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、4-(2,2-ジメチルピペラジン-1-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(210mg、粗製、TFA)を褐色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
ステップF:1-[3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。4-(2,2-ジメチルピペラジン-1-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(210mg、粗製、TFA)およびTEA(531mg、5.24mmol、730μL)のDCM(4mL)中溶液に、プロパ-2-エノイルクロリド(47.5mg、524μmol、42.8μL)を-40℃で加え、混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。混合物を水(2mL)でクエンチした。混合物をEtOAc(5mL)で希釈し、EtOAc(10mL)で抽出した。有機層を、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:73%~100%、12分)により精製して、標記化合物である1-[3,3-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例354、104mg、189μmol、53%収率、98.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:541。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.26-8.18(m,1H),7.85(dd,J=3.2,6.4Hz,1H),7.58(d,J=8.0Hz,1H),7.48(dd,J=3.2,6.4Hz,2H),7.42(t,J=7.6Hz,1H),7.15(br d,J=7.2Hz,1H),6.65-6.52(m,1H),6.48-6.33(m,1H),5.79-5.70(m,1H),4.37-4.26(m,2H),4.21(br t,J=5.6Hz,1H),4.17-4.06(m,3H),3.80(s,1H),3.78-3.69(m,2H),3.61(s,1H),3.39(br s,2H),3.13(br t,J=7.6Hz,1H),2.80(br s,2H),2.73-2.65(m,1H),2.52(s,3H),2.37-2.28(m,1H),2.09-1.99(m,1H),1.94-1.68(m,3H),1.62(br s,6H)。
実施例355
1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。7-ベンジル-4-クロロ-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(5.0g、16.4mmol、1.0当量)およびtert-ブチルピペラジン-1-カルボキシレート(4.57g、24.5mmol、1.50当量)のDMSO(20.0mL)中溶液に、DIEA(6.34g、49.1mmol、8.54mL、3.0当量)を加えた。混合物を60℃で5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(200mL)に加え、EA(200mL×3)で抽出した。有機層をブライン(500mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=50:1~5:1)により精製して、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(7.0g、15.4mmol、93%収率)を淡褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:456。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.40-7.27(m,5H),3.68(s,2H),3.58(s,2H),3.54-3.48(m,4H),3.47-3.38(m,4H),2.65(s,4H),1.48(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(7.0g、15.4mmol、1.0当量)およびDIEA(5.96g、46.1mmol、8.03mL、3.0当量)のDCE(100mL)中溶液に、1-クロロエチルカルボノクロリデート(5.49g、38.4mmol、2.5当量)を0℃で加えた。混合物を15℃で2時間撹拌した。次いで、混合物を濃縮した。残留物をMeOH(100mL)で溶解し、70℃まで加熱し、反応混合物を70℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。得られた生成物を、逆相フラッシュカラム(C18、水中の0.1%FA、0~50%MeCN)により精製して、tert-ブチル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.6g、12.6mmol、82%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:366。
ステップC:tert-ブチル 4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.60g、9.85mmol、1.0当量)、(3-メトキシ-1-ナフチル)トリフルオロメタンスルホネート(中間30、7.54g、24.6mmol、2.50当量)、RuPhos(919mg、1.97mmol、0.20当量)、およびCs2CO3(9.63g、29.6mmol、3.0当量)のトルエン(30.0mL)中溶液に、Pd2(dba)3(1.35g、1.48mmol、0.15当量)を加えた。この混合物に対し、真空下での脱気とN2によるパージを3回実施した。次いで、混合物を90℃で8時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(50.0mL)に加え、EA(50.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=20:1~EA:MeOH=10:1)により精製して、tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(4.60g、8.82mmol、89%の収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:522。
ステップD:tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(3.80g、7.28mmol、1.0当量)のEA(40.0mL)中溶液に、m-CPBA(1.41g、6.56mmol、0.90当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NaHSO3水溶液(30.0mL)でクエンチし、EA(50.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物を、逆相フラッシュカラム(C18、水中の0.1%FA、0~60%MeCN)により精製して、tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.70g、5.02mmol、69%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.07(d,J=8.4Hz,1H),7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.52-7.42(m,1H),7.39-7.33(m,1H),6.92(d,J=2.0Hz,1H),6.81(d,J=2.0Hz,1H),4.42(br s,2H),3.93(s,3H),3.61(br d,J=4.0Hz,8H),3.52-3.34(m,2H),3.08-2.81(m,5H),1.50(s,9H)。
ステップE:tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.49mmol、1.0当量)およびt-BuONa(286mg、2.98mmol、2.0当量)のトルエン(8.0mL)中溶液に、[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(396mg、2.98mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10.0mL)に加え、EA(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物を、逆相フラッシュカラム(C18、水中の0.1%FA、0~60%MeCN)により精製して、tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(670mg、1.10mmol、74%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.09(d,J=8.4Hz,1H),7.75(d,J=8.0Hz,1H),7.48-7.41(m,1H),7.38-7.31(m,1H),6.90(d,J=2.0Hz,1H),6.81(d,J=2.4Hz,1H),5.29-5.06(m,1H),4.44(dd,J=4.4,10.8Hz,1H),4.27-4.20(m,3H),3.92(s,3H),3.66-3.43(m,9H),3.36(br s,2H),3.11-2.99(m,1H),2.85(br s,2H),2.70-2.55(m,1H),2.52(s,3H),2.40-2.26(m,1H),2.05-1.91(m,1H),1.50(s,9H)。
ステップF:2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(650mg、1.07mmol、1.0当量)のDCM(1.50mL)中溶液に、TFA(2.39g、21.0mmol、1.55mL、19.6当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。黄色油としての生成物である2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(780mg、粗製、2TFA)。LCMS[ESI,M+1]:507。
ステップG:1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(780mg、1.06mmol、1.0当量、2TFA)およびDIEA(1.65g、12.7mmol、2.22mL、12.0当量)のDCM(8.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(201mg、1.59mmol、1.50当量)を-50℃で加えた。混合物を-50℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(1mL)でクエンチし、次いで、真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:46%~76%、12分)により精製して、標記化合物である1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例355、300mg、528μmol、2ステップで49%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:561。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.10(d,J=8.4Hz,1H),7.75(d,J=8.0Hz,1H),7.49-7.42(m,1H),7.40-7.32(m,1H),6.91(d,J=2.4Hz,1H),6.81(d,J=2.4Hz,1H),6.61(dd,J=10.8,16.8Hz,1H),6.36(dd,J=2.0,16.8Hz,1H),5.77(dd,J=1.6,10.4Hz,1H),5.28-5.07(m,1H),4.44(dd,J=4.8,11.2Hz,1H),4.30-4.19(m,3H),3.93(s,3H),3.84(br s,2H),3.72(br s,2H),3.65-3.50(m,5H),3.37(br s,2H),3.10-3.01(m,1H),2.87(br s,2H),2.70-2.55(m,1H),2.52(s,3H),2.42-2.26(m,1H),2.07-1.90(m,1H)。
実施例356
1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。O1-tert-ブチルO2-メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(1.8g、6.94mmol、1.0当量)のTHF(30.0mL)中溶液に、LiAlH4(790mg、20.8mmol、3.0当量)を加えた。混合物を-40℃で1時間撹拌した。次いで、混合物をN2雰囲気下、80℃で2時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(6.0mL)でクエンチした。次いで、混合物を濾過し、濾液を濃縮した。化合物である[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.1g、6.82mmol、98%収率、90%純度)を無色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ3.90-3.82(m,1H),3.66(dd,J=3.2Hz,10.8Hz,1H),3.46-3.37(m,2H),3.28(s,3H),2.77-2.65(m,1H),2.64-2.57(m,1H),2.35-2.30(m,4H),2.11-2.01(m,1H),1.90-1.79(m,1H)。
ステップB:tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.49mmol、1.0当量)、[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(454mg、3.12mmol、2.1当量)、t-BuONa(286mg、2.98mmol、2.0当量)のトルエン(5.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(15.0mL)に加え、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュHPLC[C18、水中0.1%のFA、0~60%MeCN]により精製した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液によりpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相をEA(3×50.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。化合物であるtert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、808μmol、54%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:619。
ステップC:2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、727μmol、1.0当量)のDCM(6.0mL)中溶液に、TFA(6.93g、60.8mmol、4.50mL、83.6当量)を加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を真空下で除去して、2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(540mg、粗製、2TFA)を黄色油として得たた。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:519。
ステップD:1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(540mg、2TFA)のDCM(6.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(130mg、1.03mmol)およびDIEA(800mg、6.19mmol、1.08mL)をN2雰囲気下で滴加した。混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をメタノール(10.0mL)でクエンチし、混合物を真空下で除去した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:48%~78%、12分)により精製し、凍結乾燥した。標記化合物である1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-メトキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例356、112mg、196μmol、99%純度、18%収率)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:573。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.09(d,J=8.4Hz,1H),7.75(d,J=8.0Hz,1H),7.48-7.44(m,1H),7.38-7.34(m,1H),6.91(d,J=2.4Hz,1H),6.81(d,J=2.4Hz,1H),6.61(dd,J=10.4Hz,16.8Hz,1H),6.35(dd,J=2.0Hz,16.8Hz,1H),5.76(dd,J=1.6Hz,9.6Hz,1H),4.41(dd,J=4.8Hz,10.8Hz,1H),4.24(s,2H),4.22-4.16(m,1H),4.00-3.94(m,1H),3.92(s,3H),3.83-3.67(m,4H),3.62-3.48(m,4H),3.47-3.42(m,1H),3.40-3.33(m,2H),3.30(s,3H),2.94-2.82(m,3H),2.47(s,3H),2.33(dd,J=6.0Hz,10.0Hz,1H),2.12-2.04(m,1H),2.01-1.93(m,1H)。
実施例357
1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(631mg、4.74mmol、3.76当量)のTHF(7.0mL)中溶液に、NaH(126mg、3.16mmol、60%純度、2.51当量)を0℃で加えた。次いで、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。次いで、tert-ブチル 4-(7-ベンジル-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、1.26mmol、1.0当量)を上記混合物に加えた。添加後、混合物を70℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NH4Cl水溶液(15.0mL)でクエンチし、EA(3×20.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、ジクロロメタン:メタノール=20:1→10:1)により精製して、tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(530mg、980μmol、78%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:541。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.24-7.13(m,5H),5.08-4.91(m,1H),4.23(dd,J=4.4Hz,10.8Hz,1H),4.04(dd,J=6.0Hz,10.8Hz,1H),3.53(s,2H),3.45-3.42(m,2H),3.38-3.33(m,5H),3.31-3.27(m,4H),2.90-2.84(m,1H),2.52-2.46(m,3H),2.35(s,3H),2.21-2.09(m,1H),1.87-1.73(m,3H),1.34(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-ベンジル-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(480mg、887μmol、1当量)のMeOH(6.0mL)中溶液に、Pd(OH)2/C(270mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15Psi)下、20℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、EA/MeOH=20:1→10:1)により精製した。生成物であるtert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(350mg、706μmol、79%収率、91%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:451。
ステップC:tert-ブチル 4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、621μmol、1.0当量)、Pd2(dba)3(85.3mg、93.2μmol、0.15当量)、RuPhos(58.0mg、124.3μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(404mg、1.24mmol、2.0当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に、(4-ブロモ-2-ナフチル)2,2-ジメチルプロパノエート(中間体54、572mg、1.86mmol、3.0当量)を加えた。混合物をN2下、110℃で5時間撹拌した。混合物を水(15.0mL)でクエンチし、EA(3×20.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュHPLC(18C、水中0.1%のFA、0~70%MeCN)により精製した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液によりpH-8に調整し、次いで、濃縮し、水相をEA(3×40.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。化合物であるtert-ブチル 4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(190mg、272μmol、44%収率、97%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:677。
ステップD:[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]-2,2-ジメチルプロパノエート。tert-ブチル 4-[7-[3-(2,2-ジメチルプロパノイルオキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(110mg、162μmol、1.0当量)のDCM(1.5mL)中混合物に、TFA(2.31g、20.2mmol、1.5mL、124当量)をN2下、25℃で少しずつ加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]-2,2-ジメチルプロパノエート(200mg、粗製、2TFA)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:577。
ステップE:[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]-2,2-ジメチルプロパノエート。[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]-2,2-ジメチルプロパノエート(200mg、2TFA)およびTEA(493mg、4.87mmol、678μL)のDCM(2.0mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(40.9mg、324μmol)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。完了後、反応混合物を0℃でMeOH(3.0mL)でクエンチし、次に減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、EA/MeOH=20:1→10:1)により精製した。化合物である[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]-2,2-ジメチルプロパノエート(100mg、153μmol、97%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:631。
ステップF:1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-2-ナフチル]-2,2-ジメチルプロパノエート(39.0mg、61.8μmol、1.0当量)およびNaOH(61.8mg、1.55mmol、25.0当量)のTHF(1.5mL)およびH2O(1.5mL)中混合物を、25℃で14時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水でクエンチし(10.0mL)、次いで、EA(3×15.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B:38%~68%、12分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である1-[4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例357、10.1mg、18.4μmol、30%収率、99%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:547。
SFC条件:100%ee。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.04(d,J=8.4Hz,1H),7.65(d,J=8.4Hz,1H),7.42(t,J=7.2Hz,1H),7.30-7.34(m,1H),6.88(d,J=1.6Hz,1H),6.72(d,J=2.0Hz,1H),6.60(dd,J=10.4Hz,16.8Hz,1H),6.37(dd,J=1.6Hz,16.8Hz,1H),5.79(dd,J=2.0Hz,10.2Hz,1H),5.28-5.14(m,1H),4.46(dd,J=4.8Hz,11.2Hz,1H),4.32(dd,J=5.2Hz,11.2Hz,1H),4.18(s,2H),3.82-3.68(m,2H),3.66-3.55(m,4H),3.52-3.42(m 4H),3.35-3.21(m,2H),3.17-3.10(m,1H),2.82-2.68(m,2H),2.63-2.74(m,1H),2.61(s,3H),2.40-2.25(m,1H),2.13-1.94(m,1H)。
実施例358
1-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-プロパ-2-イニル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ペント-4-イン酸。(2S)-2-アミノペント-4-イン酸(5g、44.2mmol、1当量)のTHF(15mL)中懸濁液に、H2O(15mL)、K2CO3(18.3g、133mmol、3当量)、およびBoc2O(11.1g、50.8mmol、11.7mL、1.15当量)を加えた。さらの水を加えて溶液を生成し、これを25℃で12時間撹拌した。次いで、有機溶媒を留去し、水溶液をt-ブチルジメチルエーテルで洗浄し、次いで、1N HCl酸でpH=3に酸性化した。溶液を酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。溶媒を留去して、(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ペント-4-イン酸(8g、37.5mmol、85%収率)を無色油として得、さらに精製することなく使用した。LCMS[ESI,M+1]:589。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(br d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.45(td,J=8.0,13.2Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),5.10(br s,1H),4.49-4.33(m,2H),4.21-4.01(m,3H),3.96-3.79(m,2H),3.60(br d,J=6.8Hz,1H),3.44(br d,J=13.6Hz,1H),3.32-2.97(m,5H),2.88-2.53(m,4H),2.48(d,J=2.8Hz,3H),2.29(br d,J=8.8Hz,1H),2.11-2.00(m,1H),1.87-1.71(m,3H)。
ステップB:エチル 2-[ベンジル-[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ペント-4-イノイル]アミノ]アセテート。(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ペント-4-イン酸(7.75g、36.4mmol、1当量)、エチル 2-(ベンジルアミノ)アセテート(7.02g、36.4mmol、1当量)、およびHATU(16.6g、43.5mmol、1.20当量)のDMF(50mL)中溶液に、TEA(7.35g、72.7mmol、10.1mL、2.00当量)を25℃で加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(150mL)で希釈し、水(3×200mL)およびブライン(1×100mL)で洗浄した。分離した有機層を水(1×100mL)およびブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をさらに精製することなく次のステップに使用した。化合物であるエチル 2-[ベンジル-[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ペント-4-イノイル]アミノ]アセテート(13.7g、32.1mmol、88.3%収率、91%純度)を赤色油として得、これは25℃で16時間静置すると赤色固体になった。LCMS[ESI,M-99]:289。
ステップC:(3S)-1-ベンジル-3-プロパ-2-イニル-ピペラジン-2,5-ジオン。エチル 2-[ベンジル-[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ペント-4-イノイル]アミノ]アセテート(11.7g、30.1mmol、1当量)のDCM(40mL)中溶液に、TFA(46.2g、405mmol、30mL、13.5当量)を0℃で加え、混合物を25℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、トルエン(30mL)を加えた。100℃で1時間撹拌した後、混合物を減真空下で濃縮した。残留物を酢酸エチル(200mL)に溶解し、飽和炭酸ナトリウム水溶液によりpH=8に塩基化した。分離した有機層を水(1×200mL)およびブライン(1×100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を(酢酸エチル/石油エーテル 1/5、100mL)でトリチュレートし、沈殿物を濾過した。濾過ケーキを真空下で乾燥した。化合物である(3S)-1-ベンジル-3-プロパ-2-イニル-ピペラジン-2,5-ジオン(5g、20.5mmol、68%収率、99.5%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:243。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.46-7.20(m,5H),6.59(br s,1H),4.76(d,J=14.4Hz,1H),4.50(d,J=14.4Hz,1H),4.20(br d,J=4.4Hz,1H),4.04-3.90(m,1H),3.89-3.76(m,1H),2.95-2.69(m,2H),2.05(t,J=2.8Hz,1H)。
ステップD:(3S)-1-ベンジル-3-プロパ-2-イニル-ピペラジン。(3S)-1-ベンジル-3-プロパ-2-イニル-ピペラジン-2,5-ジオン(5.00g、20.6mmol、1.00当量)のTHF(50.0mL)中混合物に、LiAlH4(3.13g、82.6mmol、4.00当量)を25℃で加えた。65℃で12時間撹拌した後、混合物を濾過して取り除き、濾過ケーキを酢酸エチル(100mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、(3S)-1-ベンジル-3-プロパ-2-イニル-ピペラジン(4.10g、19.1mmol、93%収率)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.37-7.24(m,5H),3.55-3.47(m,2H),3.03-2.86(m,3H),2.85-2.78(m,1H),2.73(br d,J=11.2Hz,1H),2.33-2.20(m,2H),2.13-2.04(m,1H),2.02(t,J=2.8Hz,1H),1.90-1.83(m,1H)。
ステップE:tert-ブチル(2S)-4-ベンジル-2-プロパ-2-イニル-ピペラジン-1-カルボキシレート。(3S)-1-ベンジル-3-プロパ-2-イニル-ピペラジン(2.00g、9.33mmol、1.00当量)、TEA(2.83g、28.0mmol、3.90mL、3.00当量)、および(Boc)2O(10.2g、46.7mmol、10.7mL、5.00当量)のTHF(20.0mL)中混合物を、25℃で1時間撹拌した。混合物を水(1×20.0mL)で希釈し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた有機層は、ブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=5/1)により精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-4-ベンジル-2-プロパ-2-イニル-ピペラジン-1-カルボキシレート(1.50g、4.20mmol、45%収率、88%純度)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:315。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.38-7.27(m,5H),4.26(br s,1H),3.99-3.74(m,1H),3.59-3.45(m,2H),3.08-2.89(m,2H),2.79-2.68(m,2H),2.62-2.53(m,1H),2.11(dd,J=3.6,11.2Hz,1H),2.06-1.98(m,1H),1.89(t,J=2.8Hz,1H),1.48-1.45(m,9H)。
ステップF:(2S)-2-プロパ-2-イニルピペラジン。tert-ブチル(2S)-4-ベンジル-2-プロパ-2-イニルピペラジン-1-カルボキシレート(1.40g、4.45mmol、1.00当量)、1-クロロ-1-(1-クロロビニルオキシ)エタン(2.51g、17.8mmol、4.00当量)のDCE(20.0mL)中混合物を、85℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物をメタノール(20.0mL)で溶解し、65℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、石油エーテル(10.0mL)でトリチュレートして、(2S)-2-プロパ-2-イニルピペラジン(0.80g、粗製、2HCl)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=4.56-4.44(m,1H),3.88-3.80(m,1H),3.79-3.73(m,1H),3.62-3.34(m,4H),2.87-2.76(m,3H)。
ステップG:4-ベンジルオキシ-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。4-ベンジルオキシ-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(2.00g、5.64mmol、1.00当量)、1-ブロモナフタレン(1.75g、8.46mmol、1.18mL、1.50当量)、Pd2(dba)3(517mg、564μmol、0.10当量)、RuPhos(527mg、1.13mmol、0.20当量)、およびCs2CO3(3.68g、11.3mmol、2.00当量)のトルエン(20.0mL)中混合物を、N2下、110℃で3時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(3×5.00mL)で抽出した。有機層をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(TFA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和重炭酸ナトリウム(5.00mL)によりpH>7に調整し、次いで、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮して、4-ベンジルオキシ-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(1.34g、2.78mmol、49%収率、99.6%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:481。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22-8.16(m,1H),7.89-7.82(m,1H),7.59(d,J=8.0Hz,1H),7.51-7.45(m,4H),7.45-7.33(m,4H),7.14(dd,J=0.8,7.2Hz,1H),5.49(s,2H),4.45(dd,J=5.6,10.4Hz,1H),4.27-4.18(m,3H),3.55-3.24(m,2H),3.12(br t,J=7.6Hz,1H),2.89(br s,2H),2.76-2.65(m,1H),2.50(s,3H),2.35-2.24(m,1H),2.14-2.06(m,1H),1.91-1.78(m,3H)。
ステップH:2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール。4-ベンジルオキシ-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(1.30g、2.70mmol、1.00当量)およびPd/C(0.20g、10%純度)のメタノール(200mL)中混合物を、15psiのH2下、25℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮して、2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(1.00g、1.90mmol、70%収率、74%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:391。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.24-8.16(m,1H),7.90-7.81(m,1H),7.59(d,J=8.4Hz,1H),7.54-7.47(m,2H),7.42(t,J=7.6Hz,1H),7.14(d,J=7.6Hz,1H),4.43-4.31(m,2H),4.05(s,2H),3.38(br s,2H),3.18-3.10(m,1H),2.79(br s,2H),2.70-2.54(m,2H),2.47(s,3H),2.32(dt,J=7.2,9.6Hz,1H),2.02-1.96(m,1H),1.91-1.75(m,3H)。
ステップI:[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート。2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(0.40g、1.02mmol、1.00当量)およびTEA(207mg、2.05mmol、285μL、2.00当量)のジクロロメタン(10.0mL)中溶液に、Tf2O(318mg、1.13mmol、186μL、1.10当量)を-40℃で加えた。-40℃で0.25時間撹拌した後、混合物を水(3.00mL)で希釈し、次いで、酢酸エチル(3×5.00mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×5.00mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=10/1)により精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート(0.40g、528μmol、52%収率、69%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:523。
ステップJ:2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-4-[(3S)-3-プロパ-2-イニルピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート(0.38g、727μmol、1.00当量)、(2S)-2-プロパ-2-イニルピペラジン(350mg、粗製、2HCl)、およびDIEA(939mg、7.27mmol、1.27mL、10.0当量)のDMF(4.00mL)中混合物を、100℃で0.25時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.1%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-4-[(3S)-3-プロパ-2-イニルピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(0.20g、336μmol、46%収率、99%純度、2FA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:497。
ステップK:1-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-プロパ-2-イニル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-4-[(3S)-3-プロパ-2-イニルピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(145mg、246μmol、1.00当量、2FA)およびTEA(374mg、3.69mmol、514μL、15.0当量)のジクロロメタン(4.00mL)中溶液に、プロパ-2-エノイルクロリド(22.3mg、246μmol、20.1μL、1.00当量)を-40℃で加えた。25℃で0.25時間撹拌した後、混合物を水(3.00mL)で希釈し、次いで、ジクロロメタン(3×3.00mL)で抽出した。抽出物をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:57%~87%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である1-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-プロパ-2-イニル-ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例358、25.6mg、46.3μmol、19%収率、99.5%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:551。
SFC条件:OD-3S_3_40_3 ML カラム:Chiralcel OD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.21(m,1H),7.91-7.81(m,1H),7.60(br d,J=8.0Hz,1H),7.54-7.47(m,2H),7.46-7.39(m,1H),7.14(d,J=7.2Hz,1H),6.65(br s,1H),6.36(br d,J=16.8Hz,1H),5.77(dd,J=2.0,10.8Hz,1H),5.00-4.52(m,1H),4.46-4.36(m,1H),4.34-3.81(m,6H),3.47(m,1H),3.38-3.21(m,2H),3.19-2.90(m,4H),2.84(br s,1H),2.73-2.52(m,3H),2.48(s,3H),2.34-2.24(m,1H),2.10-2.03(m,1H),1.90-1.70(m,4H)。
実施例359
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。1-ブロモ-8-メチルナフタレン(中間体69、507mg、1.65mmol、1.3当量)、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、600mg、1.27mmol、1当量)、Cs2CO3(1.04g、3.18mmol、2.5当量)、RuPhos(118mg、254μmol、0.2当量)、およびPd2(dba)3(233mg、254μmol、0.2当量)のトルエン(10mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、100℃で2時間撹拌した。反応混合物を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、酢酸エチル(20mLの×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(310mg、501μmol、39%収率、99%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:612。
1HNMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.60(m,2H),7.46-7.37(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.16(m,2H),4.61(br s,1H),4.43-4.33(m,1H),4.30-4.14(m,2H),4.10-3.72(m,4H),3.60-3.44(m,1H),3.38(br dd,J=3.6,13.6Hz,1H),3.24-3.04(m,4H),3.03-2.84(m,5H),2.82-2.53(m,4H),2.52-2.42(m,3H),2.29(br s,1H),2.05-1.95(m,1H),1.91-1.69(m,2H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(310mg、506μmol、1当量)のDCM(500μL)中溶液に、TFA(866mg、7.60mmol、562μL、15当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(317mg、506μmol、99%収率、TFA)を黄色油として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(317mg、506μmol、1当量、TFA)のDCM(5mL)中溶液に、TEA(512mg、5.07mmol、705μL、10当量)を0℃で加えた。添加後、DCM(1mL)中のプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(51.1mg、405μmol、0.8当量)を0°Cで滴加した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(1mL)でクエンチし、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例359、60.2mg、105μmol、21%収率、99.5%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:566。
SFC条件:「OJ-3S_5_5_40_3ML カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中エタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75-7.60(m,2H),7.46-7.38(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),6.57(s,1H),6.46-6.33(m,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.07(br s,1H),4.64(br s,1H),4.44-4.32(m,1H),4.31-4.21(m,1H),4.20-4.03(m,3H),3.98-3.83(m,1H),3.78-3.62(m,1H),3.60-3.36(m,2H),3.23-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.88-2.74(m,1H),2.73-2.55(m,2H),2.47(d,J=4.4Hz,3H),2.35-2.21(m,1H),2.13-1.97(m,1H),1.90-1.74(m,3H)。
代替法として、実施例359は、以下の通りに調製され得る。
ステップA:tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(18.8g、61.7mmol、1当量)のDMF(200mL)中溶液に、DIEA(15.9g、123mmol、21.5mL、2当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体63、16.0g、61.7mmol、1当量)を加えた。80℃で1.5時間撹拌した後、反応混合物を酢酸エチル(200mL)で希釈し、水(200mL×3)で洗浄した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1→2/1)で精製した。化合物であるtert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(26g、48.8mmol、79%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:527。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.34(m,5H),5.20(s,2H),4.73-4.60(m,2H),4.45(d,J=19.2Hz,1H),4.13-4.02(m,2H),3.94-3.75(m,2H),3.45-3.25(m,3H),3.11(td,J=3.6,12.4Hz,1H),2.88-2.59(m,4H),1.60(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(10.5g、91.1mmol、10.8mL、2当量)、tert-ブチル4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(24g、45.6mmol、1当量)、Pd2(dba)3(6.18g、6.84mmol、0.15当量)、RuPhos(4.26g、9.12mmol、0.2当量)、およびCs2CO3(37.1g、114mmol、2.5当量)のトルエン(450mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で5時間撹拌した。反応混合物を水(200mL)で希釈し、酢酸エチル(500mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、酢酸エチル/メタノール=1/0→10/1)により精製した。化合物であるtert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(25g、35.9mmol、79%収率、87%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:606。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(16g、26.4mmol、1当量)のジオキサン(100mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、99.1mL、15当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。ジオキサンをデカントし、固形分を集めた。固体残留物を水(50mL)およびジクロロメタン(200mL)で希釈し、次いで、飽和Na2CO3水溶液でpH=8に調整し、酢酸エチル(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、13.5g、24.5mmol、93%収率、91.6%純度)を黄色油として得、精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:506。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.45-7.31(m,5H),5.19(s,2H),4.65(br s,1H),4.40-4.31(m,1H),4.14-4.04(m,2H),4.03-3.91(m,3H),3.91-3.77(m,1H),3.24(d,J=13.2Hz,2H),3.16-3.05(m,2H),3.04-2.89(m,2H),2.81(br s,1H),2.75-2.51(m,4H),2.47(s,3H),2.35-2.22(m,1H),2.08-2.00(m,1H),1.92-1.76(m,3H)。
ステップD:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(10g、19.8mmol、1当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(中間体69、5.68g、25.7mmol、1.3当量)、RuPhos(2.77g、5.93mmol、0.3当量)、Cs2CO3(16.1g、49.5mmol、2.5当量)、およびPd2(dba)3(3.62g、3.96mmol、0.2当量)のトルエン(100mL)中混合物に対してを脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で6時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(500mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(9g、12.9mmol、33%収率、93%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
1H NMR(400MHz,C2D2Cl4)δ=7.32(d,J=8.0Hz,1H),7.26(t,J=8.0Hz,1H),7.08-6.93(m,7H),6.91-6.78(m,2H),4.81(s,2H),4.30(s,1H),4.13-3.95(m,1H),3.88-3.33(m,6H),3.22-2.87(m,2H),2.86-2.65(m,4H),2.65-2.42(m,5H),2.41-2.32(m,1H),2.30-2.13(m,2H),2.07(d,J=7.2Hz,3H),1.92(br s,1H),1.72-1.45(m,4H)。
ステップE:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(8g、12.4mmol、1当量)のMeOH(100mL)中溶液に、Pd/C(2g、10%純度)およびNH3・MeOH(50mL、15%)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(5.7g、10.0mmol、81%収率、90%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:512。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.69(d,J=8.0Hz,1H),7.64(dd,J=3.2,7.6Hz,1H),7.40(td,J=4.4,7.6Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.19(m,2H),4.46-4.34(m,1H),4.25-4.03(m,2H),3.97-3.69(m,3H),3.49-3.44(m,1H),3.39-3.07(m,5H),3.06-2.83(m,6H),2.76-2.63(m,1H),2.62-2.51(m,3H),2.48(d,J=3.2Hz,3H),2.35-2.22(m,1H),2.13-1.98(m,1H),1.83-1.69(m,3H)。
ステップF:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(6.4g、12.5mmol、1当量)のジクロロメタン(120mL)中溶液に、TEA(19g、187mmol、26mL、15当量)を-40℃で加えた。添加後、プロパ-2-エノイルクロリド(1.70g、18.8mmol、1.53mL、1.5当量)のジクロロメタン(2mL)中溶液を-40℃で滴加した。-40℃で0.5時間撹拌後、反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(10mL)でクエンチし、次いで、水(50mL)で希釈し、ジクロロメタン(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM/MeOH=100/1→10/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Kromasil 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%~50%、28分)によりさらに精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、ジクロロメタン(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例359、2.3g、4.03mmol、32%収率、99%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:566。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.59(m,2H),7.46-7.36(m,1H),7.33(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.15(m,2H),6.70-6.47(s,1H),6.39(d,J=16.4Hz,1H),5.82(d,J=10.4Hz,1H),5.16-4.47(m,1H),4.44-4.32(m,1H),4.30-3.62(m,6H),3.58-3.26(m,2H),3.25-2.95(m,5H),2.91(s,3H),2.86-2.55(m,4H),2.48(d,J=5.2Hz,3H),2.36-2.21(m,1H),2.13-2.02(m,1H),1.92-1.67(m,3H)。
実施例360
2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:1-ブロモ-8-エチル-ナフタレン。1,8-ジブロモナフタレン(2.0g、6.99mmol、1.0当量)およびPd(dppf)Cl2(367mg、501μmol、7.16e-2当量)のTHF(15.0mL)中溶液に、ジエチル亜鉛(トルエン中1.0M、3.50mL、0.50当量)を-78℃で加えた。混合物を-78~20℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(30.0mL)に加え、EA(30.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をPE(60.0mL)によりトリチュレートし、濾過した。濾過ケーキをPE(10.0mL×2)で洗浄し、母液を濃縮した。得られた生成物を逆相フラッシュカラム(C18、水中0.1%のFA、0~100%のMeCN)により精製して、1-ブロモ-8-エチル-ナフタレン(600mg、2.45mmol、35%収率、96%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.72-7.63(m,2H),7.58(dd,J=2.4,7.2Hz,1H),7.30-7.23(m,2H),7.13-7.04(m,1H),3.43(q,J=7.6Hz,2H),1.22(t,J=7.6Hz,3H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、300mg、636μmol、1.0当量)、t-BuONa(183mg、1.91mmol、3.0当量)、RuPhos(59.4mg、127μmol、0.2当量)、およびRuPhos-Pd-G3(106mg、127μmol、0.20当量)のトルエン(5.0mL)中溶液に、1-ブロモ-8-エチル-ナフタレン(299mg、1.27mmol、2.0当量)を加えた。混合物を90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10.0mL)に加え、EA(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物を逆相フラッシュカラム(C18、水中0.1%のFA、0~60%のMeCN)により精製して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、221μmol、34%収率、98%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:626。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、208μmol、1.0当量)のDCM(1.0mL)中溶液に、TFA(1.54g、13.5mmol、1.0mL、65.0当量)を加えた。混合物を25℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製、2TFA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:526。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、199μmol、1.0当量、2TFA)およびDIEA(309mg、2.39mmol、416μL、12.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(37.7mg、299μmol、1.50当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(1.0mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%の水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:53%~83%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例360、20.0mg、33.8μmol、17%収率、98%純度)を桃色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:580。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.74-7.64(m,2H),7.46-7.35(m,2H),7.27-7.20(m,2H),6.64-6.60(m,1H),6.46-6.36(m,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.20-4.50(m,1H),4.45-4.33(m,1H),4.31-4.19(m,1H),4.17-3.96(m,3H),3.93-3.84(m,1H),3.74(br d,J=18.0Hz,1H),3.65-3.39(m,3H),3.37-2.92(m,7H),2.88-2.76(m,1H),2.71-2.57(m,2H),2.47(br d,J=4.8Hz,3H),2.34-2.23(m,1H),2.11-1.98(m,1H),1.80-1.72(m,3H),1.17(t,J=7.4Hz,3H)。
実施例361
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール。tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(1.0g、4.97mmol、1.0当量)のTHF(20.0mL)中溶液に、LiAlH4(377mg、9.94mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌し、次いで、70℃に加熱し、70℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(1.0mL)でクエンチし、濾過した。濾過ケーキをTHF(10.0mL)で洗浄した。次いで、母液を濃縮して、[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(500mg、4.34mmol、87%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ3.65(dd,J=4.8,10.0Hz,1H),3.52(dd,J=5.6,10.0Hz,1H),3.05-2.69(m,2H),2.63-2.53(m,1H),2.51-2.44(m,1H),2.40-2.25(m,5H),2.04-1.94(m,1H),1.72-1.59(m,1H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(178mg、1.55mmol、3.0当量)のトルエン(3.0mL)中溶液に、t-BuONa(124mg、1.29mmol、2.50当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。次いで、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、516μmol、1.0当量)を上記混合物に加えた。添加後、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10.0mL)に加え、EA(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%FA、0~60%MeCN)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(220mg、342μmol、66%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:632。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(360mg、569μmol、1.0当量)のDCM(1.50mL)中溶液に、TFA(2.31g、20.3mmol、1.50mL、35.6当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(450mg、粗製、2TFA)を黄色油として得た。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(450mg、592μmol、1.0当量、2TFA)およびDIEA(918mg、7.10mmol、1.24mL、12.0当量)のDCM(4.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(112mg、888μmol、1.50当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(1.0mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.04%のNH3・H2O)-ACN];B%:70%~82%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例361、32.6mg、53.8μmol、9%収率、97%純度)を灰色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:586。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.68(br d,J=8.0Hz,1H),7.54(t,J=7.6Hz,1H),7.45(d,J=7.2Hz,1H),7.41-7.32(m,1H),7.26(t,J=8.0Hz,1H),7.18-7.11(m,1H),6.60-6.43(m,1H),6.32(br d,J=16.4Hz,1H),5.75(br d,J=10.8Hz,1H),5.15-4.50(m,1H),4.41-4.28(m,1H),4.18-4.10(m,2H),4.09-3.88(m,2H),3.87-3.68(m,2H),3.57-3.45(m,1H),3.42-3.26(m,1H),3.25-2.87(m,5H),2.86-2.74(m,1H),2.73-2.57(m,3H),2.56-2.47(m,2H),2.46-2.37(m,2H),2.28(s,3H),2.07-1.90(m,1H)。LCMS[ESI,M+1]:586。
実施例362
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。2-(1-ピペリジル)エタノール(133mg、1.03mmol、137μL、3.0当量)のトルエン(2.0mL)中溶液に、t-BuONa(66.2mg、688μmol、2.0当量)を0℃で加えた。混合物を20℃で0.5時間撹拌した。次いで、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、344μmol、1.0当量)を0℃で上記液体に加えた。添加後、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(5.0mL)に加え、EA(5.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=3:1→EA:MeOH=10:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、221μmol、64%収率、95%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.61(t,J=7.8Hz,1H),7.53(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.33(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.17(m,1H),4.64-4.61(m,1H),4.48-4.36(m,3H),4.14-3.92(m,3H),3.90-3.76(m,1H),3.63-3.54(m,1H),3.36(br dd,J=3.6,13.6Hz,1H),3.26-3.06(m,3H),3.01-2.86(m,1H),2.82-2.76(m,2H),2.71(br d,J=6.8Hz,1H),2.64-2.58(m,1H),2.58-2.50(m,4H),2.48-2.42(m,1H),2.06(d,J=6.4Hz,1H),1.64-1.57(m,5H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、387μmol、1.0当量)のDCM(1.0mL)中溶液に、TFA(1.54g、13.5mmol、1.0mL、34.9当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、粗製、2TFA)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:546。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、388μmol、1.0当量、2TFA)およびDIEA(601mg、4.65mmol、810μL、12.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(73.3mg、581μmol、1.5当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(1.0mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例362、54.0mg、88.1μmol、23%収率、98%純度)を無色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:600。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.39(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),6.58-6.62(m,1H),6.44-6.36(m,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.15-4.55(m,1H),4.51-4.36(m,3H),4.20-3.97(m,2H),3.95-3.75(m,2H),3.66-3.54(m,1H),3.51-3.37(m,1H),3.34-2.97(m,4H),2.94-2.67(m,4H),2.65-2.57(m,1H),2.55-2.48(m,4H),1.65-1.60(m,4H),1.49-1.39(m,2H)。
実施例363
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メタノール。tert-ブチル(2R)-2-(ヒドロキシメチル)モルホリン-4-カルボキシレート(1.50g、6.90mmol、1.0当量)のTHF(20.0mL)中溶液に、LiAlH4(524mg、13.8mmol、2.0当量)を0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌し、次いで、60℃に加熱し、60℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(1.50mL)でクエンチし、濾過した。ケーキをTHF(20.0mL×2)で洗浄した。次いで、母液を濃縮して、[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メタノール(800mg、6.10mmol、88%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ3.92-3.86(m,1H),3.73-3.52(m,4H),2.84-2.56(m,3H),2.27(s,3H),2.11(dt,J=3.6,11.6Hz,1H),1.93(t,J=10.8Hz,1H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メタノール(203mg、1.55mmol、3.0当量)のトルエン(4.0mL)中溶液に、t-BuONa(99.2mg、1.03mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。次いで、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、516μmol、1.0当量)を上記混合物に加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10.0mL)に加え、EA(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた生成物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、PE:EA=3:1→EA:MeOH=10:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、366μmol、71%収率、95%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:648。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.75(d,J=8.0Hz,1H),7.61(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.39(m,1H),7.33(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.17(m,1H),4.68-4.53(m,1H),4.48-4.31(m,2H),4.29-4.19(m,1H),4.16-4.01(m,3H),4.00-3.82(m,4H),3.79-3.69(m,1H),3.63-3.53(m,1H),3.36(br dd,J=3.6,13.6Hz,1H),3.29-3.06(m,3H),3.01-2.86(m,2H),2.83-2.64(m,3H),2.63-2.45(m,1H),2.36-2.28(m,3H),2.19(dt,J=3.6,11.6Hz,1H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、370μmol、1.0当量)のDCM(1.0mL)中溶液に、TFA(1.54g、13.5mmol、1.0mL、36.5当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、粗製、2TFA)を薄赤色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:548。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、387μmol、1.0当量、2TFA)およびDIEA(599mg、4.64mmol、808μL、12.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(73.1mg、580μmol、1.50当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(1.0mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5u;移動相:[水(0.04%のNH3・H2O)-ACN];B%:45%~75%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-4-メチルモルホリン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例363、42.7mg、70.4μmol、18%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:602。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.2Hz,1H),7.55-7.50(m,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),6.65-6.52(m,1H),6.39(br d,J=16.8Hz,1H),5.83(br d,J=10.8Hz,1H),5.25-4.53(m,1H),4.48-4.32(m,2H),4.30-4.21(m,1H),4.19-4.00(m,2H),3.99-3.89(m,3H),3.88-3.76(m,1H),3.75-3.68(m,1H),3.64-3.55(m,1H),3.52-3.35(m,1H),3.31-2.98(m,4H),2.92-2.55(m,5H),2.31(s,3H),2.18(dt,J=3.2,11.4Hz,1H),2.02(dt,J=1.6,10.8Hz,1H)。
実施例364
2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:1-ブロモ-3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン。MeOH(1.32g、41.2mmol、1.67mL、2当量)のDMF(125mL)中溶液に、NaH(1.65g、41.2mmol、60.0%純度、2当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。次いで、混合物に、1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(5g、20.6mmol、1当量)を加え、25℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を氷水(20mL)でクエンチした。水(300mL)を混合物に加え、MTBE(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を水(50mL)およびブライン(50mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE)により精製して、1-ブロモ-3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(5.28g、18.6mmol、91.0%収率、90.0%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.34-7.28(m,2H),7.01-6.97(m,1H),3.91(s,3H)。
ステップ2:1-メトキシ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン。1-ブロモ-3-メトキシ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(5.28g、20.7mmol、1当量)、Cs2CO3(20.2g、62.1mmol、3当量)、メチルボロン酸(6.20g、104mmol、5当量)のジオキサン(105mL)および水(21mL)中溶液に、Pd(dppf)Cl2(2.27g、3.11mmol、0.15当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、100℃で6時間撹拌した。水(50mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(30mL)で希釈し、EtOAc(100mL)で抽出した。有機層を、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE)により精製して、1-メトキシ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(3.2g、15.1mmol、73.1%収率、90.0%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.33(t,J=8.0Hz,1H),6.87(br d,J=8.4Hz,1H),6.83(d,J=7.2Hz,1H),3.88(s,3H),2.49(q,J=3.6Hz,3H)。
ステップ3:3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェノール。1-メトキシ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(3.2g、16.8mmol、1当量)のDCE(65mL)中溶液に、BBr3(21.1g、84.1mmol、8.11mL、5当量)を-40℃で加え、混合物を-40℃~-10℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)でクエンチした。混合物をEtOAc(20mL)で希釈し、EtOAc(2×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 1:0→50:1)により精製して、3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェノール(740mg、4.08mmol、24.2%収率、97.0%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.29-7.24(m,1H),6.87-6.77(m,2H),5.95(q,J=6.4Hz,1H),2.46(q,J=2.8Hz,3H)。
ステップ4:[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]トリフルオロメタンスルホネート。3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェノール(600mg、3.41mmol、1当量)、TEA(1.38g、13.6mmol、1.90mL、4当量)のEtOAc(12mL)中溶液に、Tf2O(1.44g、5.11mmol、843μL、1.5当量)を-40℃で加え、混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。混合物を水(10mL)でクエンチした。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(30mL)で抽出した。有機層をブライン(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させて、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc 1:0~100:1)により精製して、[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]トリフルオロメタンスルホネート(590mg、1.82mmol、53.0%収率、95.0%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.53-7.47(m,1H),7.33(d,J=7.6Hz,1H),7.29(d,J=8.4Hz,1H),2.57(q,J=2.8Hz,3H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、600mg、973μmol、1当量)、[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]トリフルオロメタンスルホネート(450mg、1.46mmol、1.5当量)、Cs2CO3(951mg、2.92mmol、3当量)、およびRuPhos(90.8mg、195μmol、0.2当量)のトルエン(12mL)中溶液に、Pd2(dba)3(89.1mg、97.3μmol、0.1当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、90℃で4時間撹拌した。水(15mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(30mL)で抽出した。有機層をブライン(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させて、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=5:1~1:1→EtOAc:MeOH=1:0~20:1)により精製した。次いで、残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=50.0%)により精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、354μmol、36%収率、98.0%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:664。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.41-7.35(m,6H),7.18(d,J=8.0Hz,1H),7.07(d,J=7.6Hz,1H),7.10-7.04(m,1H),5.20(s,2H),4.69(br s,1H),4.38(dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.16(t,J=3.2Hz,1H),4.05(s,2H),3.89(br d,J=12.0Hz,1H),3.30(br s,2H),3.21-2.95(m,5H),2.92-2.62(m,6H),2.52(q,J=3.6Hz,3H),2.48(s,3H),2.33-2.24(m,1H),2.05-2.00(m,1H),1.90-1.79(m,3H)。
ステップB:NH3をMeOH(5mL)中に5分間バブリングした。この溶液に、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、362μmol、1当量)、Pd/C(50mg、10.0%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、30℃で0.5時間撹拌した。反応混合物は濾過した、濾液は真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、336μmol、93.0%収率、99.0%純度)を褐色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:530。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(170mg、321μmol、1当量)およびTEA(97.4mg、963μmol、134μL、3当量)のDCM(3.5mL)中溶液に、プロパ-2-エノイルクロリド(43.6mg、482μmol、39.3μL、1.5当量)を-40℃で加え、混合物を-40℃~30℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(2mL)によりクエンチして、分離した。水相をEtOAc(4mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例364、110mg、188μmol、58.0%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:584。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.35(m,1H),7.19(d,J=8.4Hz,1H),7.08(d,J=7.6Hz,1H),6.59(br s,1H),6.40(dd,J=1.6,16.8Hz,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.09(br s,1H),4.64(br s,1H),4.37(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.18-4.08(m,2H),4.06(s,2H),3.96(br d,J=12.4Hz,1H),3.60(br s,1H),3.30(br s,1H),3.22-3.01(m,4H),2.98-2.62(m,5H),2.52(q,J=3.2Hz,3H),2.48(s,3H),2.33-2.23(m,1H),2.11-1.99(m,1H),1.90-1.68(m,3H)。
実施例365
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロパン-1-オール。(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン(500mg、3.69mmol、1.0当量、HCl)、3-ブロモプロパン-1-オール(513mg、3.69mmol、333μL、1.0当量)のCH3CN(6.0mL)中溶液に、K2CO3(1.53g、11.1mmol、3.0当量)を加えた。混合物を50℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を留去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル:MeOH=50:1~20:1)により精製して、3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロパン-1-オール(195mg、1.12mmol、30%収率、90%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ4.42(s,1H),3.99(d,J=8.0Hz,1H),3.82(t,J=5.6Hz,2H),3.65-3.61(m,1H),3.53-3.45(m,2H),2.99-2.92(m,2H),2.84-2.77(m,1H),2.67-2.61(m,1H),1.86-1.80(m,1H),1.79-1.58(m,3H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロパン-1-オール(325mg、2.06mmol、3.0当量)、t-BuONa(198mg、2.06mmol、3.0当量)のトルエン(2.0mL)中混合物に、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体71、ステップA、400mg、688μmol、1.0当量)のトルエン(2.0mL)中溶液を少しずつ加え、混合物をN2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を水(10.0mL)に加えた。水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:MeOH=20:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(320mg、432μmol、62%収率、91%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:674。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(340mg、504μmol、1.0当量)のジオキサン(3.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4.0M、3.0mL、23.8当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、25℃で15分間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を真空下で除去した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液(10mL)により調整し、酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(270mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:574。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(270mg、470μmol、1.0当量)のDCM(4.0mL)中溶液に、TEA(143mg、1.41mmol、196μL、3.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(178mg、1.41mmol、3.0当量)を0℃で加えた。混合物をN2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→1:1)により精製し、次いで、粗生成物を濃縮して、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)により再精製し、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例365、43.1mg、67.7μmol、14%収率、98%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:628。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=9.6Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.50(d,J=6.4Hz,1H),7.47-7.40(m,1H),7.34(t,J=8.0Hz,1H),7.26-7.16(m,1H),6.67-6.54(m,1H),6.40(d,J=16.8Hz,1H),5.82(d,J=10.8Hz,1H),5.16-5.03(m,1H),4.48-4.40(m,1H),4.38-4.34(m,3H),4.22-4.08(m,1H),4.07-3.99(m,2H),3.97-3.74(m,2H),3.64-3.55(m,2H),3.54-3.35(m,2H),3.31-3.20(m,1H),3.19-3.14(m,1H),3.13-2.99(m,2H),2.92(d,J=10.4Hz,1H),2.89-2.81(m,1H),2.80-2.76(m,1H),2.75-2.68(m,1H),2.64-2.57(m,1H),2.52(d,J=10.0Hz,1H),1.98-1.89(m,2H),1.85(d,J=9.2Hz,1H),1.74-1.70(m,2H)。
実施例366
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:O1-tert-ブチルO2-メチル(2S)-4,4-ジフルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(300mg、1.13mmol、1.0当量)のTHF(8.0mL)中溶液に、LiAlH4(129mg、3.39mmol、3.0当量)を加えた。混合物を-40℃で1時間撹拌した。次いで、混合物をN2雰囲気下、80℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(6.0mL)でクエンチし、Na2SO4で乾燥した。次いで、混合物を濾過し、濾液を濃縮した。[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(165mg、粗製)を無色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(156mg、1.03mmol、3.0当量)のトルエン(2.0mL)中溶液にt-BuONa(99.2mg、1.03mmol、3.0当量)を0℃で加え、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、344μmol、1.0当量)のトルエン(1.0mL)中溶液をN2下、0℃で滴加した。反応混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を水(10.0mL)に加え、酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(20.0mL)洗浄し、Na2SO4で乾燥し、濾過し、濾液を濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=5:1:1→1:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(160mg、230μmol、67%収率、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:668。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(137mg、205μmol、1.0当量)のジオキサン(1.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、1.0mL、19.5当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、25℃で15分間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を真空下で除去した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液(10mL)により調整し、酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(110mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:568。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(110mg、194μmol、1.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、TEA(196mg、1.94mmol、270μL、10.0当量)およびプロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(73.3mg、581μmol、3.0当量)を0℃で加えた。混合物をN2雰囲気下、0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をメタノール(6.0mL)でクエンチし、混合物を真空下で除去した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150×25mm×10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製し、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例366、34.1mg、54.5μmol、28%収率、99%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:622。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=7.2Hz,1H),7.50(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.42(m,1H),7.34(t,J=8.0Hz,1H),7.26-7.19(m,1H),6.63-6.57(m,1H),6.40(d,J=16.8Hz,1H),5.84(d,J=10.4Hz,1H),5.02-4.98(m,1H),4.49-4.37(m,2H),4.31-4.22(m,1H),4.19-3.97(m,2H),3.96-3.89(m,1H),3.88-3.77(m,1H),3.76-3.65(m,1H),3.64-3.55(m,1H),3.52-3.37(m,2H),3.36-3.10(m,3H),3.07-2.95(m,2H),2.94-2.80(m,1H),2.79-2.48(m,4H),2.47-2.45(m,3H),2.36-2.24(m,1H)。
実施例367
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-モルホリノブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体71、ステップA、200mg、316μmol、1.0当量)のジオキサン(1.5mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、1.5mL、19.0当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を真空下で除去した。得られた生成物を飽和NaHCO3水溶液(10mL)により調整し、酢酸エチル(3×10mL)で抽出し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濾液を濃縮した。粗生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(130mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:532。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、282μmol、1.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、ピリジン(446mg、5.64mmol、455μL、20.0当量)および(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(155mg、846μmol、3.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濃縮した。粗生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(190mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:680。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-モルホリノブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(190mg、280μmol、1.0当量)、KI(9.29mg、56.0μmol、0.20当量)、およびK2CO3(387mg、2.80mmol、10.0当量)のDCM(5.0mL)中溶液に、モルホリン(146mg、1.68mmol、148μL、6.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をメタノール(10.0mL)でクエンチし、混合物を真空下で除去した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、12分)により精製し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-モルホリノブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例367、31.6mg、45.2μmol、16%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:685。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.78-7.73(m,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.55-7.51(m,1H),7.48-7.41(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),7.02-6.91(m,1H),6.55-6.42(m,1H),5.15-5.01(m,1H),4.47-4.34(m,2H),4.20-4.13(m,1H),4.12-4.04(m,1H),3.95-3.79(m,2H),3.78-3.65(m,5H),3.62-3.63(m,1H),3.52-3.36(m,1H),3.30-3.14(m,4H),3.13-2.97(m,3H),2.88-2.77(m,1H),2.73-2.53(m,3H),2.52-2.46(m,7H),2.34-2.22(m,1H),2.11-1.99(m,1H),1.88-1.70(m,3H)。
実施例368
2-((2S,5S)-1-アクリロイル-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:((2R,5S)-5-メチルピペラジン-2-イル)メタノール:シクロ(L-Ala-L-Ser)(400mg、2.53mmol)をボラン-テトラヒドロフラン錯体(18716μl、18.7mmol)で希釈し、窒素下に置き、70℃まで加熱した。12時間撹拌後、反応物を放冷した。反応物を氷浴中で0℃まで冷却し、続いてMeOH(5116μl、126mmol)をゆっくり滴加し、HCl(1096μl、6.58mmol)を添加した。1時間撹拌後、反応物を濃縮して、((2R,5S)-5-メチルピペラジン-2-イル)メタノール(328mg、2.52mmol、99.6%収率)を得た。
ステップB:tert-ブチル(6S,8aR)-6-メチル-3-オキソテトラヒドロ-3H-オキサゾロ[3,4-a]ピラジン-7(1H)-カルボキシレート:((2R,5S)-5-メチルピペラジン-2-イル)メタノール(500mg、3.84mmol)をメタノール(5mL)で希釈し、窒素下に置き、0℃まで冷却した。TEA(2141μl、15.4mmol)を加え、続いて、BOC無水物(2675μl、11.5mmol)(メタノール5mL中、15分にわたって)を加えた。反応物を<10℃に1時間維持し、次いで、アイスバスを取り除いた。さらに1時間後、反応物を50℃まで加熱した。50℃で12時間撹拌後、反応物を濃縮して、tert-ブチル(6S,8aR)-6-メチル-3-オキソテトラヒドロ-3H-オキサゾロ[3,4-a]ピラジン-7(1H)-カルボキシレート(980mg、3.82mmol、99.6%収率)を得た。
ステップC:tert-ブチル(2S,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-2-メチルピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(6S,8aR)-6-メチル-3-オキソテトラヒドロ-3H-オキサゾロ[3,4-a]ピラジン-7(1H)-カルボキシレート(980mg、3.82mmol)をエタノール(10047μl、172mmol)で希釈し、続いて、NaOH(9559μl、19.1mmol)を添加した。反応物を窒素下の置き、95℃まで加熱し、4時間撹拌した。KMNO4によるTLC染色(メタノール/DCM/NH4OH、10/89/1)は、わずかにより高いrfスポットの消失を示した。反応物を放冷して、次いで、氷浴中に置いた。2N HClによりpHを約9に調整し、次いで、DCMで2回抽出した。DCMをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、tert-ブチル(2S,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-2-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(850mg、3.69mmol、96.5%収率)を得た。
ステップD:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5S)-2-(ヒドロキシメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:tert-ブチル(2S,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-2-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(350mg、1.52mmol)をTHF(4mL)で希釈し、窒素下に置き、0℃まで冷却した。NaOH(1672μl、1.67mmol)を加え、続いて、ベンジルクロロホルメート(228μl、1.52mmol)を加えた。2時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび水で希釈した。水をさらに2回抽出し、酢酸エチルを合わせ、MgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質をシリカゲル上で精製し、10~80%の酢酸エチル/ヘキサンにより溶出して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5S)-2-(ヒドロキシメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(300mg、0.823mmol、54.2%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 265.1[M+H]+(-boc)。
ステップE:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5S)-5-メチル-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5S)-2-(ヒドロキシメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(300mg、0.823mmol)をDCM(4mL)で希釈し、窒素下に置き、0℃まで冷却した。DIEA(216μl、1.23mmol)を加え、続いてメタンスルホニルクロリド(70.1μl、0.905mmol)を加えた。0℃で2時間撹拌後、反応物をDCMおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質をシリカゲル上で精製して、10~50%の酢酸エチル/ヘキサンにより溶出して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5S)-5-メチル-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(290mg、0.655mmol、79.6%収率)を得た。
ステップF:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2S,5S)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5S)-5-メチル-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(290mg、0.655mmol)をDMA(4mL)で希釈し、続いて、NaCN(64.2mg、1.31mmol)を加えた。反応物を55℃まで加熱し、12時間撹拌した。反応物を放冷し、MTBEで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水およびブラインで洗浄した。MTBEをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質をシリカゲル上で精製し、10~50%の酢酸エチル/ヘキサンによって溶出して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2S,5S)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(200mg、0.536mmol、81.7%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 274.2[M+H]+(-boc)。
ステップG:ベンジル(2S,5S)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2S,5S)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(200mg、0.536mmol)をDCM(2mL)で希釈し、続いて、HCl(669μl、2.68mmol)を加えた。3時間撹拌後、反応物を濃縮して、ベンジル(2S,5S)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(146mg、0.534mmol、99.7%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 274.1[M+H]+。
ステップH:tert-ブチル 4-((2S,5S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-5-(シアノメチル)-2-メチルピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,6-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(8H)-カルボキシレート(211mg、0.695mmol)をDMA(4mL)で希釈し、続いて、ベンジル(2S,5S)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(190mg、0.695mmol)およびDIEA(364μl、2.09mmol)を加えた。反応物を周囲温度で12時間撹拌させた。ごくわずかな生成物しか、検出されなかったため、反応物を75℃までさらに12時間加熱した。反応物を放冷し、酢酸エチルおよび水で希釈した。酢酸エチルを水、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質をシリカゲル上で精製し、10~50%の酢酸エチル/ヘキサンにより溶出して、tert-ブチル 4-((2S,5S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-5-(シアノメチル)-2-メチルピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(53mg、0.0980mmol、14.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 541.2[M+H]+。
ステップI:ベンジル(2S,5S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-((2S,5S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-5-(シアノメチル)-2-メチルピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(53mg、0.098mmol)をDCMで希釈し、続いて、HCl(122μl、0.49mmol)を加えた。4時間撹拌後、反応物を濃縮して、ベンジル(2S,5S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(43mg、0.098mmol、100%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 441.1[M+H]+。
ステップJ:ベンジル(2S,5S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(2S,5S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(43mg、0.0975mmol)、1-ヨードナフタレン(124mg、0.488mmol)、Cs2CO3(95.3mg、0.293mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(12.5mg、0.0146mmol)をDMA(600μL)で希釈し、アルゴンによりパージし、密閉し、92℃まで加熱した。12時間撹拌後、反応物を放冷し、酢酸エチルおよび水で希釈した。層は分離し、酢酸エチルをブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質をシリカゲル上で精製し、10~50%の酢酸エチル/ヘキサンによって溶出して、ベンジル(2S,5S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(26.5mg、0.0467mmol、47.9%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 567.2[M+H]+。
ステップK:2-((2S,5S)-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(2S,5S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(26.5mg、0.0467mmol)、(s)-(ジシクロヘキシル(2’,6’-ジイソプロポキシ-[1,1’-ビフェニル]-2-イル)-l5-ホスファニル)(2’-(メチルアミノ)-[1,1’-ビフェニル]-2-イル)パラジウム(III)メタンスルホネート(7.96mg、0.00935mmol)、およびCs2CO3(76.1mg、0.234mmol)をDMA(300μL)で希釈し、続いて、N-メチル-l-プロリノール(21.5mg、0.187mmol)を加えた。反応物をアルゴンによりパージし、密閉し、90℃まで加熱した。12時間撹拌後、反応物を放冷し、酢酸エチルおよび水で希釈した。酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質をシリカゲル上で精製し、10%のメタノール/DCM(1%のNH4OH)により溶出して、ベンジル(2S,5S)-2-(シアノメチル)-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(8mg、0.0124mmol、26.5%収率)および2-((2S,5S)-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(10mg、0.0195mmol、41.8%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 512.3[M+H]+。
ステップL:2-((2S,5S)-1-アクリロイル-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((2S,5S)-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(10mg、0.020mmol)をDCM(200μL)で希釈し、続いて、DIEA(6.8μl、0.039mmol)を加えた。反応物を窒素下に置き、0℃まで冷却した。塩化アクリロイル(1.8μl、0.021mmol)を加え、反応物を2時間撹拌した。反応物を10%の炭酸水素ナトリウム溶液中に注ぎ込み、DCMで抽出した。DCMをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質をシリカゲル上で精製し、10%のメタノール/DCM(1%のNH4OH)により溶出して、標記化合物である2-((2S,5S)-1-アクリロイル-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例368、6mg、0.011mmol、54%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 566.3[M+H]+。
実施例369
2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-アクリロイルピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(10g、34mmol)をDMA(68ml、34mmol)に溶解した。次に、この溶液に、tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(9.3g、30mmol)を加え、続いて、ヒューニッヒ塩基(24ml、135mmol)を加え、反応物を室温にて1時間撹拌した。次に、反応物を塩基性水中に注ぎ込み、MTBEで抽出した。有機成分をさらなる水、ブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。物質を10%~70%のEtOAc:ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(12g、23mmol、67%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 527.2[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1g、2mmol)をDCM(19ml、2mmol)に溶解し、塩酸(1,4-ジオキサン中4.0Mの溶液)(2ml、9mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、DCM中に再懸濁した。懸濁液を1MのNaOHで洗浄した。水層をDCM(2×)で抽出した。合わせた有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.8g、2mmol、99%収率)を粗生成物として次のステップに使用した。ESI+APCI MS m/z 427.1[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(343mg、0.375mmol)および2-(ジシクロヘキシルホスフィノ)-2’,4’,6’-トリ-i-プロピル-1,1’-ビフェニル(357mg、0.750mmol)を、1,4-ジオキサン(18740μl、1.87mmol)中に溶解し、アルゴン下で5分間パージした。反応物をアルゴン下、100℃でさらに15分間撹拌した。反応物に、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.87mmol)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(1243mg、5.62mmol)、および炭酸セシウム(1832mg、5.62mmol)を、アルゴン下で加えた。反応物をアルゴン下でキャッピングし、100℃で一晩撹拌した。反応混合物を、室温に冷却し、GF/F濾紙を通して濾過した。濾液を減圧下で濃縮して、0%~15%のDCM:MeOH(+2%のNH4OH調節剤)により溶出するCombiFlash上での順相クロマトグラフィーにより精製して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(378mg、0.667mmol、35.6%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 567.2[M+H]+。
ステップD:ベンジル(S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:丸底フラスコ中で、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.3g、0.529mmol)のジオキサン(5.29ml、0.529mmol)中溶液を、アルゴンによりスパージした。3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オール(0.250g、1.59mmol)、Cs2CO3(0.517g、1.59mmol)、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(0.0969g、0.106mmol)、および9,9-ジメチル-4,5-ビス(ジフェニル-ホスフィノ)キサンテン(0.122g、0.212mmol)を、アルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で2時間加熱した。反応物をGF/F濾紙で濾過し、減圧下で濃縮した。濃縮物をシリカゲルにより精製し、2%のNH4OHを含有するDCM中の0~12%のMeOHにより溶出して、ベンジル(S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.155g、0.225mmol、42.6%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 688.3[M+H]+。
ステップE:2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(155mg、0.225mmol)のEtOH(2253μl、0.225mmol)およびTHF(2253μl、0.225mmol)およびEtOH(2253μl、0.225mmol)中溶液を、N2により5分間パージした。この溶液に、パラジウム(60.0mg、0.0563mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、直ちにキャッピングし、N2によりさらに5分間パージした。次いで、この溶液をH2雰囲気下で撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、充填セライトを通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(98mg、0.177mmol、78.5%収率)を得た。これを粗生成物として次のステップに使用した。ESI+APCI MS m/z 554.3[M+H]+。
ステップF:2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-アクリロイルピペラジン-2-イル)アセトニトリル:周囲温度の2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(98mg、0.177mmol)のジクロロメタン(1770μl、0.177mmol)中懸濁液に、塩化アクリロイル(14.4μl、0.177mmol)を加え、続いて、ヒューニッヒ塩基(61.8μl、0.354mmol)を加えた。次いで、反応物を周囲温度で2時間撹拌した。反応混合物を、減圧下で濃縮した。濃縮物を60:40のACN:H2O混合物中に再懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%ACNで溶出するGilson(逆分取HPLC)で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩とDCMとの間で分配した。水層をさらに2回、DCMで抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-アクリロイルピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例369、63.5mg、0.104mmol、59.0%収率)を得た。ESI+APCIMS m/z 608.3[M+H]+。
実施例370
(S)-2-(1-アクリロイル-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
(S)-2-(1-アクリロイル-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(3-モルホリノプロポキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ステップDで、3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オールの代わりにN-ヒドロキシプロパニルモルホリンを使用し、また、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)および9,9-ジメチル-4,5-ビス(ジフェニル-ホスフィノ)キサンテンの代わりにメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)使用して、実施例369に従って標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 596.3[M+H]+。
実施例371
(S)-3-((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパンアミド
(S)-3-((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパンアミド:実施例369に従って、ステップDで、3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロパン-1-オールの代わりに3-ヒドロキシ-N,N-ジメチルプロパンアミドを使用して、また、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)および9,9-ジメチル-4,5-ビス(ジフェニル-ホスフィノ)キサンテンの代わりにメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)を使用して、標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 568.3[M+H]+。
実施例372
2-((S)-1-((E)-ブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-((E)-ブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.05863mmol)および3-(E)-ブタ-2-エン酸(6.562mg、0.07622mmol)をDMF(400μL)で希釈し、続いて、DIEA(20.48μl、0.1173mmol)および1-プロピルホスホン酸環状無水物(52.35μl、0.08795mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質をシリカゲル上で精製し、10%のメタノール/DCM(1%のNH4OH)により溶出して、標記化合物である2-((S)-1-((E)-ブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例372、10mg、0.01725mmol、29.42%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 580.3[M+H]+。
実施例373
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-2-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-2-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:マイクロ波チューブ中で、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、0.198mmol)をジオキサン(98.9μl、0.198mmol)に溶解し、炭酸セシウム(129mg、0.396mmol)および2-フルオロ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン(163mg、0.989mmol)で処理した。次いで、チューブをキャッピングし、90℃に12時間加熱した。反応物を冷却し、GF/F濾紙で濾過し、濾液を濃縮した。残留物をシリカクロマトグラフィー(0.25%のNH4OHを含有するDCM中の0~12%MeOH)により精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-2-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(70mg、0.11mmol、54%)を得た。
ステップB:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-2-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップF~Gに従って、実施例375ステップFで、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-2-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 571.3[M+H]+。
実施例374
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(2,2,2-トリフルオロエチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(2,2,2-トリフルオロエチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例375のステップE~Gに従って、ステップEで、4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン臭化水素酸塩の代わりに1-ブロモ-2-(2,2,2-トリフルオロエチル)ベンゼンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 584.3[M+H]+。
実施例375
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 2-クロロ-4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(8.0g、26.3mmol)、ヒューニッヒ塩基(22.9ml、132mmol)、および2-(ピペラジン-2-イル)アセトニトリル・ジヒドロクロリド(5.21g、26.3mmol)をDMA(75mL)中に入れ、室温で20分間撹拌した。水を加え、混合物をEtOAc(3×100mL)で抽出した。抽出物を合わせ、水(3×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。固形分を濾過し、濾液を濃縮して、粗生成物であるtert-ブチル 2-クロロ-4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレートを得た。ESI+APCI MS m/z 337.1[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2-クロロ-4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(10.50g、26.725mmol)およびTEA(5.5876ml、40.088mmol)を、THF(100mL)中に入れ、0℃まで冷却した。ベンジルカルボノクロリデート(5.6518ml、40.088mmol)を加え、反応物を30分間0℃で撹拌した。水を加え、混合物をDCM(3×50mL)で抽出した。抽出物を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(ヘキサン中0~60%のEtOAc)により精製して、tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(12.939g、24.551mmol、91.865%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 527.2[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:コニカルボトムバイアル中で、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(3.28g、6.22mmol)のジオキサン(62.2ml、6.22mmol)中溶液をアルゴンでスパージし、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(2.15g、18.7mmol)、Cs2
CO3(6.08g、18.7mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.795g、0.934mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で18時間加熱した。反応物を冷却し、水を加えた。混合物をDCM(3×15mL)で抽出し、抽出物を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(0.25%NH4OHを含有するDCM中0~12%のMeOH)により精製して、tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(2.65g、4.37mmol、70.3%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 606.3[M+H]+。
ステップD:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(0.6g、1.0mmol)をジクロロメタン(10ml、1.0mmol)に溶解し、塩酸(1、4-ジオキサン(1ml、5mmol)中4.0Mの溶液)で処理し、反応物を室温にて1時間撹拌した。次に、反応物を減圧下で濃縮し、物質をEtOAcと塩基性水との間で分配し、層を分離した。次に、有機成分をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.4g、0.8mmol、80%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 506.2[M+H]+。
ステップE:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:バイアルに、炭酸セシウム(193mg、0.593mmol)、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(60mg、0.119mmol)、およびRhuphos Pd G3(9.92mg、0.0119mmol)、および4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン臭化水素酸塩(93.4mg、0.356mmol)を加えた。バイアルを密閉し、1,4-ジオキサン(1187μl、0.119mmol)をセプタムを通して添加した。アルゴンを混合物中に5分間バブリングし、次いで混合物を70℃に7時間加熱した。反応物を冷却し、定性濾紙で濾過し、濃縮した。黄色固体を最小限のDCMに溶解し、シリカクロマトグラフィー(DCM中0~12%のMeOH)により精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(35mg、0.0541mmol、45.6%)を得た。ESI+APCI MS m/z 551.3[M+H]+。
ステップF:2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(35.2mg、0.0541mmol)のEtOH(541μl、0.0541mmol)およびTHF(541μl、0.0541mmol)中溶液に、パラジウム(28.8mg、0.0135mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、次いで、H2雰囲気を真空に続く、バルーン圧により導入した。次いで、混合物を周囲温度で1時間撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。次いで、濾液を濃縮して、2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(26.4mg、0.0511mmol、94.5%収率)を得た。
ステップG:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(26.4mg、0.0511mmol)の-78℃のCH2Cl2(511μl、0.0511mmol)中懸濁液に、塩化アクリロイル(1022μl、0.102mmol)(新たに調製されたDCM中0.1Mの溶液)を加え、続いて、トリエチルアミン(14.2μl、0.102mmol)を加えた。次いで、反応物を0℃で45分間撹拌した。LC-MSは、生成物の形成を示した。反応物を濃縮し、分取HPLCにより精製して、標記化合物である2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例375、3mg、0.00526mmol、10.3%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 571.3[M+H]+。
実施例376
2-(1-(ブタ-2-イノイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル 2,2,2-トリフルオロアセテート
ステップA:tert-ブチル 2-クロロ-4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(8.0g、26.3mmol)、ヒューニッヒ塩基(22.9ml、132mmol)、および2-(ピペラジン-2-イル)アセトニトリルジヒドロクロリド(5.21g、26.3mmol)をDMA(75mL)中に入れ、室温で20分間撹拌した。水を加え、混合物をEtOAc(3×100mL)で抽出した。抽出物を合わせ、水(3×50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。固形分を濾過し、濾液を濃縮して、粗生成物であるtert-ブチル 2-クロロ-4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレートを得た。ESI+APCI MS m/z 337.1[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2-クロロ-4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(10.50g、26.73mmol)およびTEA(5.59ml、40.0mmol)を、THF(100mL)に入れ、0℃まで冷却した。ベンジルカルボノクロリデート(5.65ml、40.0mmol)を加え、反応物を0℃で30分間間撹拌した。水を加え、混合物をDCM(3×50mL)で抽出した。抽出物を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(ヘキサン中0~60%のEtOAc)により精製して、tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(12.94g、24.6mmol、92%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 527.2[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:コニカルボトムバイアル中で、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(3.28g、6.22mmol)のジオキサン(62.2ml、6.22mmol)中溶液をアルゴンによりスパージし、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(2.15g、18.7mmol)、Cs2CO3(6.08g、18.7mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.795g、0.934mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で18時間加熱した。反応物を冷却し、水を加えた。混合物をDCM(3×15mL)で抽出し、抽出物を合わせ、濃縮した。得られた残留物は、シリカゲル(0.25%のNH4OHを含有するDCM中0~12%のMeOH)により精製して、tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(2.65g、4.37mmol、70%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 606.3[M+H]+。
ステップD:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(0.6g、1.0mmol)をジクロロメタン(10ml、1.0mmol)に溶解し、塩酸(1,4-ジオキサン(1ml、5mmol)中4.0Mの溶液)で処理し、反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、物質をEtOAcと塩基性水との間で分配し、層を分離した。有機成分をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.4g、0.8mmol、80%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 506.2[M+H]+。
ステップE:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:バイアルに、炭酸セシウム(193mg、0.59mmol)、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(60mg、0.12mmol)、およびRhuphos Pd G3(9.92mg、0.012mmol)、および1-ブロモナフタレン(49.8μl、0.36mmol)を加えた。バイアルを密閉し、1,4-ジオキサン(1187μl、0.12mmol)をセプタムを通して添加した。アルゴンを混合物中に5分間バブリングし、次いで混合物を70℃に7時間加熱した。反応物を冷却し、定性濾紙で濾過し、濃縮した。黄色固体を最小限のDCMに溶解し、シリカクロマトグラフィー(DCM中0~12%のMeOH)により精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(28mg、0.044mmol、37%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 632.4[M+H]+。
ステップF:2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(45mg、0.071mmol)のEtOH(712μl、0.071mmol)およびTHF(712μl、0.071mmol)中溶液に、パラジウム(38mg、0.018mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、次いで、H2雰囲気を真空に続く、バルーン圧により導入した。次いで、混合物を周囲温度で1時間撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。次いで、濾液を濃縮して、2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.060mmol、85%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 498.3[M+H]+。
ステップG:2-(1-(ブタ-2-イノイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル2,2,2-トリフルオロアセテート:N,N-ジメチルホルムアミド(603μl、0.060mmol)を含有する25mLのRBFに、2-(4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.060mmol)およびトリエチルアミン(12.2mg、0.12mmol)を0℃で加えた。反応混合物を強く撹拌し、同時に、2-ブチン酸(6.08mg、0.072mmol)を1度に加えた。1-プロピルホスホン酸環状無水物(26.9μl、0.090mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を0℃で2時間撹拌させた。水を加え、混合物をEtOAc(2×25mL)で抽出した。有機層を飽和LiCl、NaCl、および水で洗浄した(それぞれ10mLで洗浄)。固体に乾燥および濃縮し、分取HPLC(5~95%のACN:H2O、TFA)により精製して、標記化合物である2-(1-(ブタ-2-イノイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル2,2,2-トリフルオロアセテート(実施例376、11.2mg、0.02mmol、33%収率)を得た。ESI+APCIMS m/z 564.3[M+H]+。
実施例377
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.30g、0.54mmol)のジオキサン中溶液に、(S)-(1-メチルピペリジン-2-イル)メタノール(0.49g、3.8mmol)およびCs2CO3(0.53g、1.6mmol)を加え、反応物をアルゴンにより15分間脱気し、続いて、Rhuphos Pd G3(0.068g、0.081mmol)を加え、反応物を100℃まで一晩加熱した。反応物を冷却し、GFF濾紙を通して濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。次に残留物を2%の水酸化アンモニウムを含有する1→15%のMeOH/DCMを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.23g、0.45mmol、83%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 512.3[M+H]+。
ステップB:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.23g、0.45mmol)の0℃まで冷却したDCM(20mL)中溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.16ml、0.90mmol)を加え、続いて、塩化アクリロイル(0.037ml、0.45mmol)(10mLのDCM中)溶液を加え、反応物を0℃で10分間撹拌した。次に反応物に1mLのメタノールを加え、反応物を減圧下で濃縮した。次に物質を、2%のNH4OHを含有する1→10%のMeOH/DCMを溶出液として使用して2回クロマトグラフ処理して固体を得、これを、調節剤として0.1%のTFAを含有する5→95%のACN/水を使用した逆分取HPLCによりさらに精製して、標記化合物である2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例377、0.030g、0.053mmol、12%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 566.3[M+H]+。
実施例378
2-((2S,5R)-1-アクリロイル-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5R)-2-(ヒドロキシメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:tert-ブチル(2R,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-2-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(1.0g、4.34mmol)を水(50mL)に溶解し、続いてEtOAc(6.68ml、4.34mmol)および炭酸水素ナトリウム(1.09g、13.0mmol)を加え、反応物を3分間撹拌した。反応物に、ベンジルカルボノクロリデート(0.648ml、4.56mmol)を1度に加え(19→25℃の内部温度)、反応物を室温にて一晩撹拌する。次に層を分離し、有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物を、10→70%のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5R)-2-(ヒドロキシメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(1.2g、3.29mmol、75.8%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 265.2[M+H-boc]+。
ステップB:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5R)-5-メチル-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5R)-2-(ヒドロキシメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(1.2g、3.3mmol)の0℃まで冷却したDCM中溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.64g、4.9mmol)およびメタンスルホニルクロリド(0.30ml、3.6mmol)を加え、反応物を0℃で2時間撹拌した。次に有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。次に物質を、10→70%のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5R)-5-メチル-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(1.3g、2.9mmol、89%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 343.1[M+H-boc]+。
ステップC:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2S,5R)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2R,5R)-5-メチル-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(1.3g、2.9mmol)のDMA(20mL)中溶液に、シアン化ナトリウム(0.29g、5.9mmol)を加え、反応物を55℃で48時間撹拌した。次に反応物を塩基性水(220mL)で希釈し、水層をMTBEで抽出した。次に有機成分を水(2×50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。次に物質を、10→50%のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2S,5R)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(0.90g、2.4mmol、82%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 274.1[M+H-boc]+。
ステップD:ベンジル(2S,5R)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(2S,5R)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(0.90g、2.4mmol)のDCM中溶液に、塩化水素(3.0ml、12mmol)を加え、反応物を室温で2時間撹拌した(1時間時点でさらに5当量のHClを添加した)。次に反応物を減圧下で濃縮し、物質を粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 274.2[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル 4-((2R,5S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-5-(シアノメチル)-2-メチルピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:固体のベンジル(2S,5R)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(0.75g、2.4mmol)およびtert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(0.74g、2.4mmol)に、DMA(10mL)を加え、続いて、ヒューニッヒ塩基(1.3ml、7.3mmol)を加え、反応物を室温で一晩撹拌した。次に反応物を水中に注ぎ込み、水層をMTBEで抽出した。MTBE層を水、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。物質を、10→70%のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用したカラムクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル 4-((2R,5S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-5-(シアノメチル)-2-メチルピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(0.72g、1.3mmol、55%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 541.3[M+H]+。
ステップF:ベンジル(2S,5R)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-((2R,5S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-5-(シアノメチル)-2-メチルピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(0.72g、1.3mmol)のDCM(20mL)中溶液に、塩化水素(1.7ml、6.7mmol)(ジオキサン中4M)を加え、反応物を室温で1時間撹拌した。次に反応物を減圧下で濃縮し、残留物をEtOAcと塩基性水をの間で分配した。有機成分を分離し、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。物質を粗生成物として次のrxnに使用した。ESI+APCI MS m/z 441.2[M+H]+。
ステップG:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(2S,5R)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(0.48g、1.1mmol)のジオキサン(40mL)中溶液に、1-ヨードナフタレン(1.4g、5.4mmol)およびCs2CO3(1.1g、3.3mmol)を加え、反応物をアルゴンにより15分間脱気し、続いて、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.14g、0.16mmol)を加え、反応物を100℃まで5時間加熱した。次に反応物を冷却し、GFF濾紙で濾過し、減圧下で濃縮した。次に物質を10→70のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.8g、5.1mmol、64%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 567.2[M+H]+。
ステップH:2-((2S,5R)-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(2S,5R)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)-5-メチルピペラジン-1-カルボキシレート(0.48g、0.85mmol)のジオキサン(40mL)中溶液に、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(0.39g、3.4mmol)およびCs2CO3(1.4g、4.2mmol)を加え、反応物をアルゴンにより15分間脱気し、続いて、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.11g、0.13mmol)を加え、反応物を100℃まで一晩加熱した。次に反応物を冷却し、GFF濾紙で濾過し、減圧下で濃縮した。次に物質を1→15%(MeOH+2%NH4OH)/DCMを使用してクロマトグラフ処理して、ベンジル(2S,5R)-2-(シアノメチル)-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、0.31mmol、37%収率)および2-((2S,5R)-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.14g、0.27mmol、32%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 512.3[M+H]+。
ステップI:2-((2S,5R)-1-アクリロイル-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((2S,5R)-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.14g、0.274mmol)の0℃まで冷却した溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.0982ml、0.547mmol)を加え、続いて、塩化アクリロイル(0.0225ml、0.274mmol)を加え、反応物を0℃で10分間撹拌した。1mLのメタノールを反応物に加え、反応物を減圧下で濃縮した。次に物質を、調節剤として0.1%TFAを含有する5→95%のACN/水により溶出するgilson reverse prep 2 HPLCにより2回精製した。合わせた画分をEtOAcと塩基性水との間で分配し、層を分離した。次に有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-((2S,5R)-1-アクリロイル-5-メチル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例378、0.0118g、0.0209mmol、7.62%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 566.3[M+H]+。
実施例379
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 570.3[M+H]+。
実施例380
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例375のステップC~Gに従って、ステップCで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(S)-(1-(2-メトキシエチル)ピロリジン-2-イル)メタノールを使用して、ステップEで、4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン臭化水素酸塩の代わりに1-ブロモナフタレンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 596.3[M+H]+。
実施例381
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-メトキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-メトキシピロリジン-1-カルボキシレート:実施例375のステップC~Fに従って、ステップCで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりにtert-ブチル(2S,4R)-2-(ヒドロキシメチル)-4-メトキシピロリジン-1-カルボキシレートを使用し、ステップEで、4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン臭化水素酸塩の代わりに1-ブロモナフタレンを使用して調製した。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((2S,4R)-4-メトキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-(((2S,4R)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-メトキシピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(27.0mg、0.04mmol)、ホルムアルデヒド(15.7μl、0.2mmol)、Na(OAc)3BH(17.7mg、0.08mmol)をTHF(2mL)に入れ、2時間撹拌した。飽和重炭酸塩を加え、混合物をDCM中10%MeOH(3×15mL)で抽出した。抽出物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥し、濃縮して粗製物を得て、これをそのまま使用した。
ステップC:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-メトキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを、実施例375のステップFおよびGに従って、ステップFで、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((2S,4R)-4-メトキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 582.3[M+H]+。
実施例382
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップF~Jに従って、ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(R)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールを使用し、ステップH、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 588.3[M+H]+。
実施例383
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに3-ブロモ-5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 589.3[M+H]+。
実施例384
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5.37g、10.2mmol)をDCM(75mL)に入れ、0℃まで冷却した。HCl(12.7ml、50.9mmol)を加え、反応物を室温まで暖め、2時間撹拌した。反応物を濃縮し、DCM中に加えた。飽和重炭酸塩を加え、混合物をDCM(3×50mL)で抽出した。有機層を合わせ、乾燥し、濃縮して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.33g、10.1mmol、99%収率)を得、これをそのまま使用した。
ステップB:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:炭酸セシウム(2.29g、7.0mmol)、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、2.3mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.30g、0.35mmol)、3-ブロモ-5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン(1.29g、5.3mmol)、および1,4-ジオキサン(15.6ml、2.3mmol))をバイアルに加え、バイアルをアルゴンにより脱気し、密閉し、次いで、90℃まで24時間加熱した。反応物を冷却し、水および飽和NH
4Clを加え、混合物をDCMで抽出した。有機層を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(ヘキサン中5~75%のEtOAc)により精製して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(634mg、1.1mmol、46%収率)を得た。
ステップC:tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-((S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート:コニカルボトムバイアル中で、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(634mg、1.07mmol)のジオキサン(10746μl、1.07mmol)中溶液をアルゴンによりスパージした。tert-ブチル(2S,4R)-4-フルオロ-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(942mg、4.30mmol)、Cs
2CO
3(1050mg、3.22mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(137mg、0.161mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で18時間加熱した。反応物を冷却し、水を加えた。混合物をDCM(3x20mL)で抽出し、抽出物を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(0~10%のMeOH)により精製して、tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-((S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(579mg、0.907mmol、84%収率)を得た。
ステップD:tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-((S)-4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-((S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(579mg、0.907mmol)、トリエチルアミン(379μl、2.72mmol)をCH
2Cl
2(9066μl、0.907mmol)に入れ、0℃まで冷却した。塩化アクリロイル(6044μl、1.81mmol)を加え(DCM中の新たに調製された0.3Mの溶液)、反応物を0℃で45分間撹拌した。水を加え、混合物をDCM(3×15mL)で抽出した。層を合わせ、濃縮し、粗製物を得、これをそのまま使用した。
ステップE:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:密閉容器中で、tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-((S)-4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-フルオロピロリジン-1-カルボキシレート(628mg、0.91mmol)をMeOH(2mL)中に入れた。HCl(756μl、4.53mmol)(6M水溶液)を加え、混合物を5時間室温で撹拌した。飽和重炭酸塩をゆっくりと加えてpH約9にした。混合物をDCM(3×20mL)で抽出した。抽出物を合わせ、乾燥し、濾過し、濃縮して、粗製物を得、これをそのまま使用した。
ステップF:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(175mg、0.30mmol)、ホルムアルデヒド(111μl、1.48mmol)、Na(OAc)3BH(125mg、0.59mmol)をTHF(2mL)中に入れ、2時間撹拌した。飽和重炭酸塩を加え、混合物をDCM中10%MeOH(3×15mL)で抽出した。抽出物を合わせ、硫酸ナトリウムで乾燥し、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(0.25%のNH4OHを含有するDCM中4~13%のMeOH)により精製して、2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(69.7mg、0.115mmol、39%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 607.2[M+H]+。
実施例385
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-クロロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-クロロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで1-ブロモナフタレンの代わりに3-ブロモ-5-クロロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジンを使用し、ステップIで、MeOHの代わりにTHFを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 605.3[M+H]+。
実施例386
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-イソプロピルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-イソプロピルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを、実施例384のステップFの調製に従って、ステップFで、ホルムアルデヒドの代わりにプロパン-2-オンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 635.3[M+H]+。
実施例387
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-クロロ-4-メチルピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-クロロ-4-メチルピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに3-ブロモ-5-クロロ-4-メチルピリジンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 551.2[M+H]+。
実施例388
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-メチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-メチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-フルオロ-2-メチルベンゼンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 534.3[M+H]+。
実施例389
2-((S)-1-(ブタ-2-イノイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:3Lフラスコ中で、tert-ブチル(R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(76.0g、351mmol)に水(500mL)を加え、物質が完全に溶解するまでスラリーを撹拌した。この混合物にEtOAc(541ml、351mmol)を加え、続いてNaHCO3(88.6g、1.05mol)を加え、得られた混合物を3分撹拌した(内部温度=20℃)。この混合物にCbz-Cl(52.5ml、369mmol)を3分にわたって加え(20℃~25℃の内部温度、この時点でオフガスが観察された)、反応物を室温で1日撹拌した。反応混合物を分液漏斗に移し、有機層をブラインで洗浄し、乾燥し(MgSO4)、減圧下で濃縮した。残留物を、10~70%のEtOAc/ヘキサンにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(114.6g、327.0mmol、93%収率)を得た。ESI+APCIMS m/z 251.1[M-Boc+H]+。
ステップB:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(32g、91.3mmol)の0℃まで冷却したCH2Cl2(457mL、0.2M)中溶液に、DIEA(24.6ml、137mmol)を加え、続いて、メタンスルホニルクロリド(7.77ml、100mmol)を1分間にわたって加え、混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を分液漏斗に移し、1:1の水/ブライン(500mL)で洗浄した。有機層を集め、乾燥し(MgSO4)、減圧下で濃縮した。残留物を10~60%のEtOAc/ヘキサンにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(33g、77.0mmol、84.3%収率)を得た。ESI+APCIMS m/z 329.1[M-Boc+H]+。
ステップC:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(R)-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(12.6g、29.4mmol)のDMA(368ml、73.5mmol)中溶液を、アルゴンによりスパージした。この溶液にシアン化ナトリウム(3.60g、73.5mmol)を加え、反応の完了を判定するためにHPLC(ロングメソッド)によりモニタリングしながら、反応物を55℃で1日撹拌した。反応混合物を分液漏斗に移し、0.5MのNaOH(800mL)で希釈し、次いで、MTBE(2×)で抽出した。次に合わせた有機層を塩基性水(2×200mL)、ブライン(100mL)で洗浄し、乾燥し(MgSO4)、減圧下で濃縮した。残留物を、溶出液としての10→60%のEtOAc/ヘキサンにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(7.9g、22.0mmol、75%収率)を得た。ESI+APCIMS m/z 260.1[M-Boc+H]+。
ステップD:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩:1-ベンジル 4-(tert-ブチル)(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(20.4g、56.8mmol)のDCM(50mL)中溶液に、塩化水素(99.3ml、397mmol)(ジオキサン中4.0Mの溶液)を加え、反応物室温で1.5時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮し、真空下で乾燥して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(16.8g、56.8mmol、100%収率)を発泡体として得た。ESI+APCI MS m/z 260.1[M+H]+。
ステップE:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(16.8g、56.8mmol)のDMA(114ml、56.8mmol)中溶液に、tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(15.5g、51.1mmol)を加え、続いて、DIEA(39.7ml、227mmol)を加え、反応混合物を室温で1時間撹拌した。反応混合物を1Lの水で希釈し、MTBE(2×)で抽出した。合わせた有機成分を水(2×200mL)、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮する。残留物を、溶出液としての10~60%のEtOAc/ヘキサンにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(22.8g、43.3mmol、76%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 527.2[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:PTFEスクリューキャップを備えた250mLの肉厚RBF中で、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5.55g、10.5mmol)のジオキサン(60.2ml、10.5mmol)中溶液をアルゴンによりスパージし、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(3.64g、31.6mmol)、Cs2CO3(10.3g、31.6mmol)、Ruphos Pd G3(0.881g、1.05mmol)を順次加え、得られた混合物をアルゴンによりさらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で1日加熱した。出発材料が消費されたら、反応混合物を周囲温度に冷却し、Cbz加水分解生成物を標記化合物に変換する必要に応じてCbz-Clを加えた。次いで、反応混合物をEtOAc/10%ブライン間で分配した。水層をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機層を乾燥し(MgSO4)、濃縮した。残留物を1.5%MeOH/0.15%NH4OH/DCM→11.25%MeOH/1.125%NH4OH/DCMの勾配(DCM中のプレミックス15%MeOH/1.5%NH4OHおよびDCM中のこの混合物の10~75%の勾配)により溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、標記化合物(4.51g、7.45mmol、71%)を得た。ESI MS m/z 606.3[M+H]+。
ステップG:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(7.2g、12mmol)のDCM(1.0g、12mmol)中溶液に、HCl(ジオキサン中4M、15ml、59mmol)を加えた。混合物を室温で2時間撹拌した。反応混合物をビスHCl塩に濃縮した。残留物をDCM/NaHCO3(飽和)間に分配し、水層をDCM(3×)で抽出した。合わせた有機層を乾燥し、濃縮して、標記化合物4.72g(0.009mmol、79%)を得た。ESI MS m/z 506.3[M+H]+。
ステップH:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:炭酸セシウム(967mg、2.97mmol)、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、0.989mmol)、Rhuphos Pd G3(124mg、0.148mmol)、1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼン(915mg、4.94mmol)、および1,4-ジオキサン(9889μl、0.989mmol)を、バイアルに加え、バイアルをアルゴンにより脱気し、密閉し、次いで、75℃まで24時間加熱した。水および飽和NH4Clを加え、混合物をDCMで抽出した。有機層を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(DCM中0~12%のMeOH+0.25%のNH4OH)により精製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(505mg、0.828mmol、83.7%収率)を得た。ESI MS m/z 610.4[M+H]+。
ステップI:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(505mg、0.828mmol)のEtOH(8282μl、0.828mmol)およびTHF(8282μl、0.828mmol)中溶液に、パラジウム(441mg、0.207mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、次いで、H2雰囲気を真空に続く、バルーン圧により導入した。次いで、混合物を周囲温度で2時間撹拌した。次いで、混合物をMeOH:THF 1:1で希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。次いで濾液を濃縮して、粗生成物を得て、これをそのまま使用した。ESI MS m/z 476.3[M+H]+。
ステップJ:2-((S)-1-(ブタ-2-イノイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:N,N-ジメチルホルムアミド(4415μl、0.4415mmol)を含む25mLのRBFに、2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(210mg、0.44mmol)およびトリエチルアミン(122.7μl、0.88mmol)を0℃で加えた。ブタ-2-イン酸(44.54mg、0.53mmol)を1度に加えると共に、反応混合物を強く撹拌した。1-プロピルホスホン酸環状無水物(197.1μl、0.66mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を0℃で2時間撹拌させた。水を加え、固形分を濾過した。固形分をシリカゲル(0.25%のNH4OHを含有するDCM中5~18%のMeOH)により精製して、標記化合物である2-((S)-1-(ブタ-2-イノイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例389、144mg、0.27mmol、60%)を得た。ESI+APCI MS m/z 542.3[M+H]+。
実施例390
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,3S)-3-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(2-(((2R,3S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:実施例400のステップC~Eに従って、ステップCで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりにtert-ブチル(2R,3S)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。
ステップB:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,3S)-3-ヒドロキシピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:tert-ブチル(2R,3S)-2-(((4-((S)-4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-カルボキシレート(363mg、0.473mmol)を、MeOH(10mL)中に入れた。6MのHCl水溶液を加え、室温で6時間撹拌した。反応物を0℃まで冷却し、飽和重炭酸塩をゆっくりと加えた。混合物をDCM(3×20ml)で抽出した。抽出物を合わせ、乾燥し、濾過し、濃縮して、粗製物を得、これをそのまま使用した。
ステップC:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,3S)-3-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例384のステップFに従って、2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルの代わりに2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,3S)-3-ヒドロキシピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを使用して調製した。ESI+APCI MS m/z 568.3[M+H]+。
実施例391
2-((S)-1-(ブタ-2-イノイル)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-(ブタ-2-イノイル)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例389のステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼンの代わりに1-ブロモ-8-クロロナフタレンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 598.2[M+H]+。
実施例392
2-((S)-1-(シクロブト-1-エン-1-カルボニル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-(シクロブト-1-エン-1-カルボニル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例389のステップJに従って、ブタ-2-イン酸の代わりにシクロブト-1-エン-1-カルボン酸を使用して調製した。ESI+APCI MS m/z 556.3[M+H]+。
実施例393
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、0.22mmol)、K2CO3(329μl、0.66mmol)、2,4,6-トリメチル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリボリナン(82.6mg、0.658mmol)、およびテトラキス(25.3mg、0.022mmol)をジオキサン(731μl、0.22mmol)中に入れ、90℃まで18時間加熱した。水を加え、混合物をDCM中10%のMeOH(3×15mL)で抽出した。抽出物を合わせ、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(0.25%のNH4OHを含有するDCM中2~80%のMeOH)により精製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(75mg、0.11mmol、52%収率)を得た。
ステップB:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234、ステップIおよびJに従って、ステップIで、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(3-メチル-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 584.3[M+H]+。
実施例394
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 530.3[M+H]+。
実施例395
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:マイクロ波チューブ中で、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.362mmol)をジオキサン(181μl、0.362mmol)に溶解し、炭酸セシウム(236mg、0.723mmol)、および(S)-tert-ブチル 2-(ヒドロキシメチル)-2-メチルピロリジン-1-カルボキシレート(389mg、1.81mmol)で処理した。次いで、チューブをキャッピングし、90℃に2時間加熱した。反応混合物を、室温に冷却し、GF/F濾紙を通して濾過した。濾液を減圧下で濃縮して、0%~10%のDCM:MeOHにより溶出するCombiFlash上でクロマトグラフ処理した。不純物を含まない生成物を含有する全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(264mg、0.361mmol、99.7%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 732.4[M+H]
+。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(264mg、0.361mmol)を、ジクロロメタン(3607μL、0.361mmol)に溶解し、TFA(556μL、7.21mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を、減圧下で濃縮し、飽和重炭酸塩で処理した。水層をDCM(2×)で抽出し、合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥した。有機成分を減圧下で濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、0.332mmol、92.2%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 632.3[M+H]
+。
ステップC:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-2-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(105mg、0.1662mmol)を、ギ酸(94.05μL、2.493mmol)に溶解し、ホルムアルデヒド(1868μl、24.93mmol)で処理した。反応混合物を85℃で1時間撹拌した。反応物を室温まで冷却し、飽和重炭酸塩で処理した。水層をDCM(2×)で抽出した。合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥し、減圧下で濃縮し、0%~10%のDCM:MeOHで溶出するCombiFlash上でクロマトグラフ処理した。不純物を含まない生成物を含む全画分を合わせ、減圧下で濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(75mg、0.1161mmol、69.88%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 646.3[M+H]
+。
ステップD:2-(4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(117mg、0.181mmol)のEtOH(1812μl、0.181mmol)およびTHF(1812μl、0.181mmol)中溶液を、N
2で5分間パージした。この溶液に、パラジウム(96.4mg、0.0453mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)を加え、すぐにキャッピングして、N
2でさらに5分間パージした。次いで、この溶液をH
2雰囲気下で撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、充填セライトを通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、2-(4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(88mg、0.172mmol、94.9%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 512.3[M+H]
+。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(88mg、0.17mmol)の周囲温度のジクロロメタン(1720μl、0.17mmol)中の懸濁液に、塩化アクリロイル(14μl、0.17mmol)、続けて、ヒューニッヒ塩基(60μl、0.34mmol)を加えた。次いで、反応物を周囲温度で30分間撹拌した。次いで、反応混合物を減圧下で濃縮した。濃縮物を、ACN:H2Oの60:40の混合物中に懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%のACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩とDCMとの間で分配した。水層をさらに2回、DCMで抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(14mg、0.025mmol、14%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 566.3[M+H]+。
実施例396
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:コニカルボトムバイアル中で、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.362mmol)のジオキサン(3616μl、0.362mmol)中溶液を、アルゴンによりスパージし、(S)-(1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メタノール(168mg、1.08mmol)、Cs
2CO
3(353mg、1.08mmol)、Rhuphos Pd G3(30.2mg、0.0362mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で1時間加熱した。反応混合物を室温に冷却した。EtOAcを加えて、ブライン(2×)で洗浄した。合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。濃縮物を、0~20%DCM/MeOH+2%NH
4OHで溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。不純物を含まない目的の生成物を含む全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(90mg、0.134mmol、37.0%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 672.4[M+H]
+。
ステップB:2-(4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(90mg、0.13mmol)のEtOH(1340μL、0.13mmol)およびTHF(1340μL、0.13mmol)中溶液を、N2で5分間パージした。この溶液に、パラジウム(36mg、0.033mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、すぐにキャッピングして、N2でさらに5分間パージした。次いで、この溶液をH2雰囲気下で撹拌した。混合物をMeOHで希釈し、充填セライト通して濾過した。濾液を減圧下で濃縮して、粗生成物である2-(4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(71mg、0.13mmol、99%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 538.3[M+H]+。
ステップC:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(71mg、0.132mmol)のジクロロメタン(1320μl、0.132mmol)中の懸濁液に、周囲温度で、塩化アクリロイル(10.7μl、0.132mmol)、続けて、ヒューニッヒ塩基(46.1μl、0.264mmol)を加えた。反応物を周囲温度で1時間撹拌した。反応混合物を、減圧下で濃縮した。濃縮物を、ACN:H2Oの60:40の混合物中に懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%のACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩とDCMとの間で分配した。水層をさらに2回、DCMで抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例396、15.7mg、0.0265mmol、20.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 592.4[M+H]+。
実施例397
2-(1-アクリロイル-4-(2-(2-(ジメチルアミノ)-2-メチルプロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(2-(2-(ジメチルアミノ)-2-メチルプロポキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例396に従って、ステップAで、(S)-(1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに2-ジメチルアミノ-2-メチル-1-プロパノールを使用して、標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 554.4[M+H]+。
実施例398
2-((2S)-2-(((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-イル)-N,N-ジメチルアセトアミド
ステップA:2-ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:マイクロ波チューブ中で、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.362mmol)を、ジオキサン(181μl、0.362mmol)中に溶解し、炭酸セシウム(236mg、0.723mmol)およびN-tert-ブトキシカルボニル-L-プロリノール(364mg、1.81mmol)で処理した。次いで、チューブをキャッピングし、90℃に一晩加熱した。反応混合物は、GF/F濾紙室温まで冷却して、濾過されて、減圧下で濃縮した。濃縮物を、0%~10%のDCM:MeOHにより溶出するCombiFlash上でクロマトグラフ処理した。不純物を含まない生成物を含有する全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(225mg、0.313mmol、86.7%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 718.4[M+H]
+。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((S)-ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(225mg、0.313mmol)を、ジクロロメタン(3134μl、0.313mmol)に溶解し、TFA(483μl、6.27mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、有機成分を飽和重炭酸塩で洗浄した。有機成分をDCM(3×)で抽出した。合わせた有機成分をNa
2SO
4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((S)-ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(111mg、0.180mmol、57.3%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 618.3[M+H]
+。
ステップC:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(2-(ジメチルアミノ)-2-オキソエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((S)-ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(111mg、0.1797mmol)を、ジクロロメタン(1797μl、0.1797mmol)に溶解し、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(156.9μl、0.8984mmol)およびクロロアセチルジメチルアミン(46.20μl、0.4492mmol)で処理した。反応物を室温にて30分間撹拌した。さらに2当量の塩基を加え、反応物をさらに3時間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、0%~15%のDCM/MeOH+0.5%のNH
4OH調節剤により溶出するCombiFlash上でクロマトグラフ処理した。不純物を含まない目的の生成物を含む全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(2-(ジメチルアミノ)-2-オキソエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(73mg、0.1039mmol、57.80%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 703.3[M+H]
+。
ステップD:2-((2S)-2-(((4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-イル)-N、N-ジメチルアセトアミド:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-(2-(ジメチルアミノ)-2-オキソエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(73mg、0.10mmol)のEtOH(1039μl、0.10mmol)およびTHF(1039μl、0.10mmol)中溶液を、N
2により5分間パージした。この溶液に、パラジウム(28mg、0.026mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H
2O)を加え、直ちにキャッピングし、N
2によりさらに5分間パージした。次いで、この溶液をH
2雰囲気下で撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、充填セライトを通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、2-((2S)-2-(((4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-イル)-N、N-ジメチルアセトアミド(43mg、0.076mmol、73%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 569.3[M+H]
+。
ステップE:2-((2S)-2-(((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-イル)-N,N-ジメチルアセトアミド:2-((2S)-2-(((4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-イル)-N、N-ジメチルアセトアミド(43mg、0.0756mmol)の周囲温度のジクロロメタン(756μl、0.0756mmol)中懸濁液に、塩化アクリロイル(6.14μl、0.0756mmol)を加え、続いて、ヒューニッヒ塩基(26.4μl、0.151mmol)を加えた。次いで、反応物を周囲温度で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮し、ACN:H2Oの60:40の混合物中に再懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%のACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩とDCMとの間で分配した。水層をさらに2回、DCMで抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、2-((2S)-2-(((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-イル)-N,N-ジメチルアセトアミド(14.9mg、0.0239mmol、31.6%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 623.3[M+H]+。
実施例399
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例396に従って、ステップAで、(S)-(1-(シクロプロピルメチル)ピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(3R)-(1-メチル-ピロリジン-3-イル)-メタノールを使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 552.3[M+H]+。
実施例400
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5.0g、9.5mmol)のDCM(50mL)中溶液に、塩化水素(12ml、47mmol、ジオキサン中4Mの溶液)を加え、反応物を室温で1時間撹拌した。次に反応物を濃厚スラリーに濃縮し、EtOAc/水の混合物を加えた。水層を1MのNaOHで塩基化し、水層をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.0g、9.4mmol、99%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 427.1[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(3.4g、8.0mmol)のジオキサン(40mL)中溶液に、1-ヨードナフタレン(6.0ml、40mmol)および炭酸セシウムは(5.2g、16mmol)を加え、反応物をアルゴンにより15分間脱気し、続いて、Rhuphos Pd G3(1.00g、1.2mmol)を加え、反応物を100℃に一晩加熱した。次に反応物を、GF/F濾紙で濾過し、減圧下で濃縮した。次に物質を、10→70のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.8g、5.1mmol、64%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 553.2[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:コニカルボトムバイアル中で、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、0.452mmol)のジオキサン(4520μl、0.452mmol)中溶液を、アルゴンにより5分間スパージした。(3R)-(1-エチル-ピロリジン-3-イル)-メタノール(175mg、1.36mmol)、Cs2CO3(442mg、1.36mmol)、Rhuphos Pd G3(37.8mg、0.0452mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で1時間加熱した。反応物を室温まで冷却し、酢酸エチルを加えた。有機成分をブライン(2×)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。濃縮物を、0~20%(MeOH+2%NH4OH)/DCMにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。不純物を含まない目的の生成物を含有する全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(118mg、0.183mmol、40.4%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 646.3[M+H]+。
ステップD:2-((S)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(237mg、0.367mmol)のEtOH(3670μl、0.367mmol)およびTHF(3670μl、0.367mmol)中溶液を、N2により5分間パージした。この溶液に、パラジウム(97.6mg、0.0917mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、すぐにキャッピングして、N2でさらに5分間パージした。次いで、この溶液をH2雰囲気下で撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、充填セライトを通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、2-((S)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(155mg、0.303mmol、82.5%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 512.3[M+H]+。
ステップE:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(226mg、0.442mmol)の周囲温度のジクロロメタン(4417μl、0.442mmol)中懸濁液に、塩化アクリロイル(35.9μl、0.442mmol)を加え、続いてヒューニッヒ塩基(154μl、0.883mmol)を加えた。反応物を周囲温度で2時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮し、12g RediSep Goldカラム上にロードし、CombiFlash(0%~15%のDCM:MeOH+1%NH4OH調節剤)上でクロマトグラフ処理した。生成物を含有する全画分を合わせ、減圧下で濃縮した。濃縮物を、ACN:H2Oの60:40の混合物中に懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%のACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩とDCMとの間で分配した。水層をさらに2回、DCMで抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例400、136mg、0.240mmol、54.4%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 566.2[M+H]+。
実施例401
2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(150mg、0.293mmol)、(2E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エン酸(75.7mg、0.586mmol)、DIEA(256μl、1.47mmol)のDCM(2932μl、0.293mmol)中溶液に、HATU(167mg、0.440mmol)を加え、得られた混合物を室温で5時間撹拌した。反応混合物をEtOAcとブラインとの間で分配した。水層をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。濃縮物を60:40のACN:H2O中に希釈し、水/0.1%TFA中の5→95%のACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩とDCMとの間で分配した。水層をさらに2回、DCMで抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(2-(((S)-1-エチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例401、27.6mg、0.0443mmol、15.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 623.4[M+H]+。
実施例402
2-((S)-2-(((4-((S)-4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-イル)-N,N-ジメチルアセトアミド
2-((S)-2-(((4-((S)-4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-イル)-N,N-ジメチルアセトアミド:実施例398に従って、ステップAで、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 623.3[M+H]+。
実施例403
ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((S)-3-(ジメチルアミノ)ピロリジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート
ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((S)-3-(ジメチルアミノ)ピロリジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:実施例400に従って、ステップCで、(3R)-(1-エチル-ピロリジン-3-イル)-メタノールの代わりに(3S)-(-)-3-(ジメチルアミノ)ピロリジンを使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 551.3[M+H]+。
実施例404
2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
ステップA:2-tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:丸底フラスコ中で、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5g、9.487mmol)のジオキサン(94.87ml、9.487mmol)中溶液を、アルゴンによりスパージし、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(3.278g、28.46mmol)、Cs2CO3(9.273g、28.46mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.8078g、0.9487mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で一晩加熱した。反応物をGF/F濾紙で濾過し、減圧下で濃縮した。濃縮物をCombi Flash(2%NH4OHを含有するDCM中の0~12%MeOH)上で精製して、tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5.425g、8.508mmol、89.68%の収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 606.4[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5.4g、8.915mmol)をジクロロメタン(89.15ml、8.915mmol)に溶解し、塩酸(1,4-ジオキサン中4.0Mの溶液)(11.14ml、44.57mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。次に反応物をより多くのDCMおよび1MのNaOHで希釈し、層を分離した。次に有機成分をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.364g、8.631mmol、96.82%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 506.3[M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:丸底フラスコ中で、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.364g、8.631mmol)のジオキサン(43.15ml、8.631mmol)中溶液を、アルゴンにより5分間スパージした。1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼン(5.851ml、43.15mmol)、Cs2CO3(14.06g、43.15mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.7348g、0.8631mmol)を、アルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で一晩加熱した。反応液を室温まで冷却する。酢酸エチルを加え、反応物をGF/F濾紙を通して濾過し、減圧下で濃縮した。濃縮物を、2%NH4OHを含有するDCM中0~15%のMeOHを溶出液として使用したCombiFlash上での順相クロマトグラフィーにより2回精製した。目的の生成物を含有する画分を集め、減圧下で濃縮して、2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.411g、0.8641mmol、100.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 476.3[M+H]+。
ステップD:2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(95mg、0.200mmol)、(2E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エン酸(51.6mg、0.399mmol)、DIEA(174μl、0.999mmol)のDCM(1997μl、0.200mmol)中溶液に、HATU(114mg、0.300mmol)を加え、得られた混合物を室温で5時間撹拌した。反応混合物はブラインで洗浄し、水層をDCM(2×)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濃縮し、60:40のACN:H2O中に希釈し、水/0.1%TFA中の5%~95%ACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩を用いて塩基を遊離させて、有機成分をDCMで抽出した。有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(38mg、0.0648mmol、32.4%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 587.4[M+H]+。
実施例405
2-((2S)-1-アクリロイル-4-(2-(3-(ジメチルアミノ)ピペリジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((2S)-1-アクリロイル-4-(2-(3-(ジメチルアミノ)ピペリジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例400に従って、ステップCで、(3R)-(1-エチル-ピロリジン-3-イル)-メタノールの代わりにN,N-ジメチルピペリジン-3-アミンを使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 565.4[M+H]+。
実施例406
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2-クロロ-3-フルオロフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2-クロロ-3-フルオロフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234に従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-2-クロロ-3-フルオロベンゼンを使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 554.2[M+H]+。
実施例407
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジフルオロフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジフルオロフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234に従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-2,3-ジフルオロベンゼンを使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 538.2[M+H]+。
実施例408
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)アミノ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)アミノ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、0.542mmol)をジオキサンに溶解し、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタンアミン(356μl、2.71mmol)で処理した。反応物を80℃で3時間撹拌した。反応物を室温まで冷却し、水とEtOAcとの間で分配した。水層をEtOAc(2X)で抽出した。合わせた有機成分を水およびブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過した。濾液を減圧下で濃縮し、0%~15%のDCM:MeOH+2%NH4OHにより溶出するCombiFlash上でクロマトグラフ処理して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)アミノ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート・アセトニトリル(146mg、0.231mmol、42.7%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 631.3[M+H]+。標記化合物の合成の残りは、実施例396のステップB~Cに従って実行された。ESI+APCIMS m/z 551.3[M+H]+。
実施例409
(S)-2-(1-アクリロイル-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
(S)-2-(1-アクリロイル-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(2-(ピペリジン-1-イル)エトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例400に従って、ステップCで、(3R)-(1-エチル-ピロリジン-3-イル)-メタノールの代わりに1-ピペリジンエタノールを使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 556.3[M+H]+。
実施例410
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例400に従って、ステップCで、(3R)-(1-エチル-ピロリジン-3-イル)-メタノールの代わりに(R)-3-(ヒドロキシメチル)-1-メチルピロリジンを使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 552.3[M+H]+。
実施例411
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-メチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-メチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例375のステップE~Gに従って、ステップEで、4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン臭化水素酸塩の代わりに1-ブロモ-3-フルオロ-2-メチルベンゼンを使用して調製した。ESI+APCI MS m/z 534.3[M+H]+。
実施例412
2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-フルオロ-6-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-フルオロ-6-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例375のステップE~Gに従って、ステップEで、4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン臭化水素酸塩の代わりに2-ブロモ-1-フルオロ-3-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して調製した。ESI+APCI MS m/z 588.3[M+H]+。
実施例413
2-(1-アクリロイル-4-(7-(4-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(7-(4-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例375ステップE~Gに従って、ステップEで、4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン臭化水素酸塩の代わりに1-ブロモ-4-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用して調製した。ESI+APCI MS m/z 588.3[M+H]+。
実施例414
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例375ステップE~Gに従って、ステップEで、4-ブロモ-3-(トリフルオロメチル)ピリジン臭化水素酸塩の代わりに1-ブロモ-3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用し、ステップFでMeOHの代わりにTHFを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 604.2[M+H]+。
実施例415
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((2R,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:バイアルに、炭酸セシウム(4.01g、12.3mmol)、ベンジル 4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.75g、4.10mmol)、およびRhuphos Pd G3(0.343g、0.410mmol)、および1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(4.98g、20.5mmol)を加えた。バイアルを密閉し、1,4-ジオキサン(41.0ml、4.10mmol)をセプタムを通して添加した。アルゴンを混合物中に5分間バブリングし、次いで混合物を70℃に7時間加熱した。反応物を冷却し、定性濾紙で濾過し、濃縮した。黄色固体を最小限のDCMに溶解し、シリカクロマトグラフィー(DCM中0~12%のMeOH)により精製して、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.3g、2.21mmol、54%収率)を得た。
ステップB:ベンジル 4-(2-(((2R,4S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(2-クロロ-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、0.255mmol)のジオキサン(2547μl、0.255mmol)中溶液をアルゴンによりスパージし、(2S,4R)-4-{[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ}-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(211mg、0.637mmol)、Cs2CO3(249mg、0.76mmol)、Rhuphos Pd G3(21.3mg、0.026mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で4時間加熱した。混合物をGF/F濾紙で濾過し、濃縮し、残留物をDCMに溶解し、水で洗浄し、水相を分離し、DCM(3×15mL)で抽出した。抽出物は合わせ、濃縮し、得られた残留物をシリカゲル(0~50%のEtOAc/ヘキサン20CV、50%のEA/ヘキサン2CV、50~100%のEA/ヘキサン10CV)により精製して、ベンジル 4-(2-(((2R,4S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(95mg、0.107mmol、42%収率)を得た。
ステップC:tert-ブチル(2R,4S)-2-(((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-カルボキシレート:実施例375のステップFおよびGの調製に従って、ステップFで、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-(トリフルオロメチル)ピリジン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル 4-(2-(((2R,4S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。
ステップD:2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((2R,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例390、ステップBおよびCに従って、ステップBで、tert-ブチル(2R,3S)-2-(((4-((S)-4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-3-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル(2R,4S)-2-(((4-(4-アクリロイル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ピロリジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。ESI+APCI MS m/z 604.3[M+H]+。
実施例416
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((2R,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((2R,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例415のステップB~Dに従って、ステップBで、(2S,4R)-4-{[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ}-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル(2R,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 604.3[M+H]+。
実施例417
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2R,4S)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2R,4S)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例415、ステップB~Dに従って、ステップBで、(2S,4R)-4-{[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ}-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル(2R,4S)-4-フルオロ-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 606.2[M+H]+。
実施例418
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1,2-ジメチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例415、ステップB~Dに従って、ステップBで、(2S,4R)-4-{[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ}-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル(R)-2-(ヒドロキシメチル)-2-メチルピロリジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 602.3[M+H]+。
実施例419
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((2S,4S)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例415のステップA~Dに従って、ステップAで、1-ブロモ-3-フルオロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンの代わりに1-ブロモナフタレンを使用し、ステップBで、(2S,4R)-4-{[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシ}-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートの代わりにtert-ブチル(2S,4S)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 568.3[M+H]+。
実施例420
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-メチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-メチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234、ステップH-Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-クロロ-2-メチルベンゼンを使用し、ステップIで、MeOHの代わりにTHFを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 550.3[M+H]+。
実施例421
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジクロロフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジクロロフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-2,3-ジクロロベンゼンを使用し、ステップIで、MeOHの代わりにTHFを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 570.2[M+H]+。
実施例422
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-メトキシフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-メトキシフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234、ステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-クロロ-2-メトキシベンゼンを使用し、ステップIで、MeOHの代わりにTHFを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 566.2[M+H]+。
実施例423
2-((S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ステップFで、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(R)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールを使用し、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用し、ステップIで、MeOHの代わりにTHFを使用する実施例234のステップF~I。
ステップB:2-((S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:N,N´-ジイソプロピルエチルアミン(29.5μl、0.166mmol)およびO-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N´,N´-テトラメチルウロニウムPF6 HATU(25.2mg、0.066mmol)を、トランス-4-ジメチルアミノクロトン酸(6.42mg、0.05mmol)および2-((S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル 2,2,2-トリフルオロアセテート(22mg、0.033mmol)のジクロロメタン(331μl、0.033mmol)中溶液に加えた。反応物を室温で18時間撹拌した。混合物をブラインで洗浄し、30%のiPrOH/CHCl3(3×)で抽出し、抽出物を合わせ、濃縮した。得られた残留物を逆相クロマトグラフィー(0.1%TFAを含有する5~95%のACN/H2O)により精製し、次いで、DCMおよび水性重炭酸塩を使用して塩基を遊離させて、標記化合物である2-((S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例423、10mg、0.015mmol、46%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 661.3[M+H]+。
実施例424
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(4-フルオロ-2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(4-フルオロ-2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-4-フルオロ-2,3-キシレンを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 548.3[M+H]+。
実施例425
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2-クロロ-3-メチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2-クロロ-3-メチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-2-クロロ-3-メチルベンゼンを使用し、ステップIで、MeOHの代わりにTHFを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 550.2[M+H]+。
実施例426
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(メチルチオ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(741mg、1.38mmol)のジクロロメタン(9171μl、1.38mmol)中混合物を塩酸(1720μl、6.88mmol)で0℃で処理し、室温に暖めた後、1時間撹拌した。混合物を飽和NaHCO3でクエンチし、水相を分離し、DCM(3×)で抽出した。合わせた抽出物を乾燥し、濾過し、濃縮して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(608mg、1.39mmol、100%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 439.2[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:バイアルに、1,4-ジオキサン(11.2ml、1.69mmol)中の炭酸セシウム(1.65g、5.06mmol)、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.74g、1.69mmol)、および1-ブロモ-3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(0.876g、3.37mmol)を加えた。混合物をアルゴンにより10分間パージし、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II) RuPhos Pd G4(0.215g、0.253mmol)で処理した。混合物をアルゴンにより10分間パージし、得られた混合物を100℃に4時間加熱した。反応物を濃縮し、水で処理し、30%のiPrOH/CHCl3(3×)で抽出し、乾燥し、濾過し、濃縮し、得られた残留物をシリカゲル(0.25%NH4OHを含有するDCM中2~16%のMeOH)により精製して、ベンジル(S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(388mg、0.63mmol、37%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 617.2[M+H]+。
ステップC:ベンジル(2S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(メチルスルフィニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(メチルチオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(388mg、0.566mmol)のジクロロメタン(5659μl、0.566mmol)中溶液に、m-クロロ過安息香酸(117.6mg、0.680mmol)を0℃で加えた。混合物をこの温度で90分間撹拌した。混合物を飽和Na2S2O3でクエンチし、水層を分離し、EtOAc(3×)で抽出した。抽出物を合わせ、乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(0~100%のEA/ヘキサン)により精製して、ベンジル(2S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(メチルスルフィニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(282mg、0.445mmol、79%収率)を得た。
ステップD:((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール:メチル(2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-カルボキシレート(3.65g、13.3mmol)の窒素下、0℃のテトラヒドロフラン(66.7ml、13.3mmol)中懸濁液に、水素化ホウ素リチウム(13.3ml、26.7mmol)をゆっくりと加えた。反応物を室温に温め、混合物を室温で18時間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Clでゆっくりとクエンチし、水で希釈し、EtOAc(20mL)で2回抽出した。合わせた有機相を乾燥し、濾過し、濃縮し、シリカゲル(0~80%のEA/ヘキサン)により精製して、((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(1.8g、5.87mmol、44%収率)を得た。
ステップE:ベンジル(S)-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:(2S,4R)-1-boc-4-(tert-ブチルジメチルシリルオキシ)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン(144mg、0.587mmol)およびベンジル(2S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(メチルスルフィニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート 2,2,2-トリフルオロアセテート(258mg、0.294mmol)のトルエン(2935μl、0.294mmol)中溶液に、ナトリウム-t-ブトキシド(42.3mg、0.440mmol)を加えた。反応物を室温で1時間撹拌した。混合物を水で洗浄し、30%のiPrOH/CHCl3(3×)で抽出し、抽出物を合わせ、乾燥し、濾過し、濃縮した。得られた残留物をシリカゲル(0~100%のEA/ヘキサン20CV)により精製して、ベンジル(S)-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(57mg、0.070mmol、23%収率)を得た。
ステップF:2-((S)-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(56mg、0.069mmol)のTHF(688μl、0.069mmol)中溶液に、パラジウム(29mg、0.028mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、次いで、H2雰囲気を真空に続く、バルーン圧により導入し、6時間撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、GF/F濾紙を通して濾過した。次いで、濾液を濃縮し、目的の生成物を得て、これをそのまま使用した。
ステップG:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((2S,4R)-4-ヒドロキシ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例384のステップDおよびEに従って、ステップDで、tert-ブチル(2S,4R)-2-(((4-((S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(5-フルオロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-4-フルオロピロリジン-1-カルボキシレートの代わりに2-((S)-4-(2-(((2S,4R)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 620.2[M+H]+。
実施例427
2-((S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234に従って、ステップAで、(R)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 661.3[M+H]+。
実施例428
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例234のステップH~Jに従って、ステップHで、1-ブロモナフタレンの代わりに1-ブロモ-3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)ベンゼンを使用し、ステップIで、MeOHの代わりにTHFを使用して調製した。ESI+APCIMS m/z 604.2[M+H]+。
実施例429
1-(2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:ベンジル 4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(メトキシメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.715g、3.10mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(3ml、2.96mmol)中攪拌溶液をアイスバスで冷却し、次いで、固体のベンジル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.00g、2.96mmol)を少しずつ加え、続いて、DIPEA(0.57mL、3.25mmol)を加えた。得られた溶液を室温に暖め、1時間撹拌した。反応混合物を水(15mL)とMTBE(50mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水(2*10mL)、ブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去し、粗生成物を次の反応に使用した。
ステップB:ベンジル 4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(メトキシメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:粗製のベンジル 4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(メトキシメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(500mg、0.940mmol)、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(216mg、1.88mmol)、Cs2CO3(612mg、1.88mmol)、およびジオキサン(0.5mL)の混合物を窒素でフラッシングし、バイアルをキャッピングし、100℃で2時間撹拌し、次いで、120℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4→10%MeOH/DCM+0.2%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(197mg、34%)を得た。ESI+APCI MS m/z 611.4[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(メトキシメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(197mg、0.323mmol)、メタノール(10mL)、およびパラジウム炭素(10mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を脱気し、水素雰囲気下で1時間撹拌した。混合物をセライト(2mL)を通して濾過し、セライトをMeOH(3×3mL)で洗浄した。合わせた濾液を減圧下で留去し、蒸発によりトルエンと共沸し、高真空下で乾燥して、生成物(150mg、98%)を得た。ESI+APCI MS m/z 477.2[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、0.315mmol)、Cs2CO3(308mg、0.944mmol)、ジオキサン(1mL)、1-ヨードナフタレン(0.0689ml、0.472mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2-アミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G3、0.1当量、26.3mg、0.0315mmol)の混合物を窒素によりパージし、フラスコをキャッピングし、反応物を70℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(15mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4~10%のMeOH+0.5%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけ、生成物(131mg、69%)を得た。ESI+APCI MS m/z 603.3[M+H]+。
ステップE:1-(2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:tert-ブチル 2-(メトキシメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、0.2157mmol)を1MのTFA/DCMに溶解し、溶液を室温で1時間撹拌した。溶液を2MのNa2CO3(5mL)とDCM(15mL)との間で分配し、層を分離し、有機層を減圧下で濃縮した。残留物をDCM(5mL)に溶解し、撹拌しながら-30℃まで冷却し、トリエチルアミン(0.09018ml、0.6470mmol)を加え、続いて、塩化アクリロイル(0.03504ml、0.4313mmol)を加えた。-30℃で1分後、反応混合物をNH4OH(0.05mL)でクエンチし、減圧下留去し、高真空下で乾燥した。残留物をDCM(5mL)に溶解し、綿プラグを通して濾過し、5~10%のMeOH/DCM+0.25%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例429、19.55mg、16%)を得た。ESI+APCI MS m/z 557.3[M+H]+。
実施例430
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(イソキノリン-8-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(イソキノリン-8-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(125mg、0.247mmol)、Cs2CO3(242mg、0.742mmol)、8-ブロモイソキノリン(77.2mg、0.371mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2-アミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G3、0.1当量、20.7mg、0.0247mmol)の2mLのジオキサン中混合物を窒素によりパージし、フラスコをキャッピングし、80℃で2.5時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%のMeOH/DCM+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(100mg、64%)を得た。ESI+APCI MS m/z 633.3[M+H]+。
ステップB:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(イソキノリン-8-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(イソキノリン-8-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、0.1580mmol)のMeOH-THF(1:1;3mL)中溶液に、パラジウム炭素(30mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)を加え、混合物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で2時間撹拌した。反応物をセライト(2mL)を通して濾過し、セライトをEtOH(3*2mL)により洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去して、残留物をDCM(10mL)に溶解し、溶液を撹拌しながら-30℃まで冷却した。この溶液に、NEt3(0.14mL)を加え、続いて、塩化アクリロイル(0.02568ml、0.3161mmol)を加え、反応混合物を-30℃で1分間撹拌した。NH4OH(0.05mL)を加えることによって反応物をクエンチし、減圧下で濃縮した。残留物をDCM(5mL)に溶解し、綿プラグを通して濾過し、6~10%のMeOH/DCM+0.6%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例430、22.19mg、25%)を得た。ESI+APCI MS m/z 553.3[M+H]+。
実施例431
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(フタラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(フタラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(101mg、0.200mmol)、1-クロロフタラジン(65.8mg、0.400mmol)、およびN-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.0696ml、0.400mmol)の1,4-ジオキサン(0.5ml、0.200mmol)中混合物を、窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、80℃で16時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物を、6%MeOH/DCM+0.6%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(53mg、42%)を得た。ESI+APCI MS m/z 634.3[M+H]+。
ステップB:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(フタラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(フタラジン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(60mg、0.09467mmol)、メタノール(2ml)、およびパラジウム炭素(20mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で4時間撹拌した。反応物をセライト(2mL)を通して濾過し、セライトをMeOH(3×3mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去した。残留物をDCM(5mL)に溶解し、撹拌しながら-30℃まで冷却した。次に、この溶液にトリエチルアミン(0.06598ml、0.4734mmol)を加え、続いて、塩化アクリロイル(0.02308ml、0.2840mmol)を加え、反応物を-30℃で5分間撹拌した。飽和NaHCO3(1mL)を添加することにより反応物をクエンチした。混合物を室温に暖め、水を加え(2mL)、層は分離した。有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で留去し、残留物を、4~10%MeOH+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、不純生成物を得、これを、水+0.1%TFA中の5~95%アセトニトリルにより溶出するGilson逆分取HPCLで精製した。生成物を含有する画分をDCMと飽和Na2CO3との間で分配し、層を分離した。次に有機成分をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物(実施例431、1.1mg、2%)を得た。ESI+APCI MS m/z 554.2[M+H]+。
実施例432
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(2-(((R)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、0.452mmol)、(R)-(1-メチルピペリジン-2-イル)メタノール(175mg、1.36mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(19.2mg、0.0226mmol)の1,4-ジオキサン(2mL)中混合物を、窒素によりパージし、80℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、MTBE(20mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物をMeOH(5mL)に溶解し、続いて、パラジウム炭素(70mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)を加えた。反応混合物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物をH2雰囲気下で1.5時間撹拌した。反応物をセライトを通して濾過し(2mL)、セライトをMeOH(3×3mL)で洗浄し、減圧下で濃縮して、生成物を得、これを粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 512.3[M+H]+。
ステップB:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:粗製の2-((S)-4-(2-(((R)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(292mg、0.57068mmol)をDCM(10mL)に溶解し、続いて、トリエチルアミン(238.63μl、1.7120mmol)を加え、溶液を-30℃まで冷却した。次に反応物に塩化アクリロイル(92.728μl、1.1414mmol)を滴加し、混合物-30℃で10分間撹拌した。次にEtOH(0.1mL)を加え、反応物を0℃まで暖めた。混合物は、5%MeOH+0.5%NH4OH/DCMを溶出液として使用して直接シリカクロマトグラフィーにかけ、続いて、同じ溶出液条件を使用して物質を再精製して、標記化合物(実施例432、107.47mg、33%)を得た。ESI+APCI MS m/z 566.3[M+H]+。
実施例433
1-((S)-2-(2-メトキシエチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:4-ベンジル 1-(tert-ブチル)(S)-2-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:固体の(S)-tert-ブチル-2-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(500mg、1.874mmol)およびNaHCO3(629.8mg、7.497mmol)にEtOAcおよび水(各10mL)を加え、混合物を0℃まで冷却し、続いて、ベンジルカルボノクロリデート(0.4013ml、2.811mmol)を滴加し、反応混合物を室温に暖めながら一晩撹拌した。次に層を分離し、有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。次に物質を、20%~40%EtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(578mg、85%)を得た。ESI+APCIMS m/z 256.2[M-Boc+H]+。
ステップB:4-ベンジル 1-(tert-ブチル)(S)-2-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート:4-ベンジル 1-(tert-ブチル)(S)-2-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(270mg、0.741mmol)のN2下のN,N-ジメチルホルムアミド(3ml、0.741mmol)中攪拌溶液を、-20℃まで冷却し、続いて、水素化ナトリウム(44.4mg、1.11mmol)を1度に加えた。次に反応物にヨードメタン(0.138ml、2.22mmol)を加え、反応混合物を1時間にわたって室温に暖め、室温で1時間撹拌し続けた。氷(約5g)を加えることによって反応物をクエンチし、混合物をMTBE(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、生成物を得、これを粗生成物として次の反応に使用した(252mg、90%)。ESI+APCIMS m/z 279.1[M-Boc+H]+。
ステップC:tert-ブチル(S)-2-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:4-ベンジル 1-(tert-ブチル)(S)-2-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1,4-ジカルボキシレート(252mg、0.666mmol)のメタノール(5ml)中混合物に、パラジウム炭素(50mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)を加え、反応物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で3時間撹拌した。スラリーをセライト(2mL)を通して濾過し、セライトをMeOH(3×3mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で濃縮して、高真空下で乾燥し、生成物(140mg、86%)を得た。ESI+APCI MS m/z 245.2[M+H]+。
ステップD:ベンジル(S)-4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:粗製のtert-ブチル(S)-2-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、0.573mmol)およびN,N-ジメチルアセトアミド(0.5ml、0.573mmol)の溶液を0℃まで冷却し、ベンジル 2,4-ジクロロ-5,6-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(8H)-カルボキシレート(194mg、0.573mmol)を1度に加えた。反応混合物を一晩撹拌し、続いて、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.150ml、0.859mmol)を加え、反応物を室温で1時間撹拌した。反応混合物をMTBE(20mL)と飽和NaHCO3(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物を2%MeOH/DCMを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(190mg、61%)を得た。
ステップE:ベンジル 4-((S)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル(S)-4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(190mg、0.348mmol)、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(120mg、1.04mmol)、Cs2CO3(340mg、1.04mmol)、および1,4-ジオキサン(0.5ml)のN2雰囲気下の混合物を、120℃に20時間加熱した。反応物を冷却し、EtOAc(3mL)で希釈し、セライトを通して濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を、4~8%のMeOH/DCM+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけ、生成物(77mg、35%)を得た。ESI+APCI MS m/z 625.3[M+H]+。
ステップF:tert-ブチル(S)-2-(2-メトキシエチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル 4-((S)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-3-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(77mg、0.12mmol)のメタノール(5ml)中混合物に、パラジウム炭素(20mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)を加え、スラリーを真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で一晩撹拌した。スラリーをセライト(2mL)を通して濾過し、セライトをMeOH(3×3mL)で洗浄した。合わせた有機成分を真空下で濃縮して、トルエン(2×2mL)と共沸して、生成物を得、粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 491.3[M+H]+。
ステップG:tert-ブチル(S)-2-(2-メトキシエチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:粗製のtert-ブチル(S)-2-(2-メトキシエチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(60mg、0.122mmol)、Cs2CO3(120mg、0.367mmol)、ジオキサン(2mL)、1-ヨードナフタレン(0.0268ml、0.183mmol)(1.5当量)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2-アミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G3、0.1当量、10.2mg、0.0122mmol)の混合物を窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、80℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、5%MeOH/DCM+0.5%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(56mg、74%)を得た。ESI+APCI MS m/z 617.4[M+H]+。
ステップH:4-((S)-3-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン:固体のtert-ブチル(S)-2-(2-メトキシエチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(56mg、0.091mmol)に、塩化水素(0.5ml、2.0mmol)を加え、反応物を0℃で撹拌し、続いて、室温に15分間暖め、この時点で、固体が形成された。有機成分をデカントし、固形分をDCM(12mL)と2MのNa2CO3(1mL)との間に分配し、層を分離した。有機層をK2CO3上で乾燥し、減圧下で濃縮して粗生成物を得た。ESI+APCI MS m/z 517.3[M+H]+。
ステップI:1-((S)-2-(2-メトキシエチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン。粗製の4-((S)-3-(2-メトキシエチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン(39mg、0.07548mmol)をDCM(10mL)に溶解し、続いて、トリエチルアミン(31.56μl、0.2264mmol)を加え、この溶液を-40℃まで冷却し、5分間撹拌し、続いて、塩化アクリロイル(12.26μl、0.1510mmol)を滴加した。反応混合物を-30℃で10分間撹拌し、続いて、MeOH(0.05mL)を加えた。混合物を0℃に暖め、有機成分を0.5MのNa2CO3で洗浄した。有機層を減圧下で留去し、DCM中の5%MeOH+0.5%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例433、25.45mg、59%)を得たESI+APCI MS m/z 571.3[M+H]+。
実施例434
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イルトリフルオロメタンスルホネート:8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-オール(500mg、2.36mmol)の0℃のDCM(10mL)中攪拌溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(616μl、3.53mmol)を加え、続いて、トリフルオロメタンスルホン酸無水物(475μl、2.83mmol)を滴加し、反応混合物を室温に暖めながら1時間撹拌した。次に反応物をヘキサン(20mL)およびMTBE(5mL)で希釈し、有機成分を飽和NaHCO3、水、およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物をヘキサン中の10%EtOAc/10%DCMに溶解し、物質をシリカゲルプラグを通して濾過した。有機成分を濃縮し、5~10%のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、不純物を含む物質を得た。最後に固体をヘキサンから結晶化し、固体を少量の冷ヘキサンで洗浄して、生成物(482mg、59%)を得た。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:粗製のベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、1.38mmol)、Cs2CO3(1353mg、4.15mmol)、トルエン(7ml)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2-アミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G4、0.1当量、116mg、0.138mmol)、および8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル・トリフルオロメタンスルホネート(715mg、2.08mmol)の混合物を窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、90℃で5時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(50mL)と水(20mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各10mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%のMeOH/DCM+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(86mg、9%)を得た。ESI+APCI MS m/z 700.3[M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(86mg、0.123mmol)、メタノール(3ml、74.2mmol)、およびパラジウム炭素(30mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物をH2雰囲気下で1時間撹拌した。次に反応物をセライトを通して濾過し(2mL)、セライトをMeOH(3×3mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で濃縮して、粗生成物(60mg、86%)を得た。
ステップD:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(50mg、0.08839mmol)をDCM(10mL)中に溶解し、続いて、トリエチルアミン(36.96μl、0.2652mmol)を加え、この溶液を-40℃まで冷却し、5分間撹拌し、続いて、塩化アクリロイル(14.36μl、0.1768mmol)を滴加した。反応混合物を-30℃で10分間撹拌し、続いて、0.01mLの塩化アクリロイルを加えた。次にMeOH(0.05mL)を反応物に加え、混合物を0℃に暖めた。次に反応物を0.5MのNa2CO3でで洗浄し、有機成分を分離した。有機成分を減圧下で留去し、DCM中の5%MeOH+0.5%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例434、39mg、71%)を得た
実施例435
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジヒドロベンゾフラン-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
ステップA:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(2,3-ジヒドロベンゾフラン-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.396mmol)、Cs2CO3(387mg、1.19mmol)、ジオキサン(0.5mL)、7-ブロモ-2,3-ジヒドロベンゾフラン(118mg、0.593mmol、1.5当量)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G4、0.1当量、33.7mg、0.0396mmol)の混合物を窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、80℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、次いで、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%のMeOH/DCM+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(97mg、39%)を得た。ESI+APCI MS m/z 624.3[M+H]+。
ステップB:2-((S)-4-(7-(2,3-ジヒドロベンゾフラン-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(2,3-ジヒドロベンゾフラン-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(97mg、0.16mmol)、メタノール(4ml)、THF(4mL)、およびパラジウム炭素(30mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を、真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で一晩撹拌した。残留物をセライトを通して濾過し(1mL)、セライトをMeOH(3×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去して、粗生成物を得た。ESI+APCI MS m/z 490.3[M+H]+。
ステップC:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジヒドロベンゾフラン-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(2,3-ジヒドロベンゾフラン-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(69mg、0.1409mmol)のDCM(5mL)中溶液を、撹拌しながら-30℃まで冷却した。トリエチルアミン(58.93μl、0.4228mmol)を加え、続いて、塩化アクリロイル(22.90μl、0.2818mmol)を加え、反応物を-30℃で5分間撹拌した。次にMeOH(0.05mL)を加えることによって反応物をクエンチし、反応物を室温に暖めた。有機成分を0.5MのNa2CO3(4mL)で洗浄し、K2CO3上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、5%MeOH+0.5%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例435、45.85mg、60%)を得た。ESI+APCI MS m/z 544.3[M+H]+。
実施例436
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(1-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
ステップA:7-ヨード-1-メチル-1H-インドール:7-ヨード-1H-インドール(4.11ml、2.06mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(4ml、51.9mmol)中攪拌溶液を、-20℃まで冷却し、水素化ナトリウム(123mg、3.09mmol)を少しずつ加え、続いて、ヨードメタン(0.256ml、4.11mmol)を加え、混合物を2時間にわたって室温に暖めた。混合物をMTBE(40mL)と氷水混合物(20mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水(2×20mL)、ブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。固体をMTBE(1mL)で洗浄した。固体をMTBEから再結晶化して、生成物(0.31g、59%)を得た。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(1-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.396mmol)、Cs2CO3(387mg、1.19mmol)、ジオキサン(0.5mL)、7-ヨード-1-メチル-1H-インドール(153mg、0.593mmol)(1.5当量)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G4、0.1当量、33.7mg、0.0396mmol)の混合物を窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、90℃で5時間撹拌し、次いで、80℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%のMeOH/DCM+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(65mg、26%)を得た。ESI+APCI MS m/z 635.3[M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(7-(1-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(1-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(65mg、0.10mmol)、メタノール(6ml)、およびパラジウム炭素(30mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を真空により脱気し、水素で充填し、混合物を水素雰囲気下で一晩撹拌した。スラリーをセライトを通して濾過し(1mL)、セライトをMeOH(3×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去して、粗生成物を得た。ESI+APCI MS m/z 501.3[M+H]+。
ステップD:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(1-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(1-メチル-1H-インドール-7-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(51mg、0.1019mmol)のDCM(5mL)中溶液を撹拌しながら-30℃まで冷却し、続いて、トリエチルアミン(42.60μl、0.3056mmol)および塩化アクリロイル(16.55μl、0.2037mmol)を加えた。-30℃で5分間撹拌後、反応混合物をMeOH(0.05mL)でクエンチし、室温に暖めた。有機成分を0.5MのNa2CO3(4mL)で洗浄し、K2CO3上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を5%MeOH+0.5%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例436、36mg、64%)を得たESI+APCI MS m/z 555.3[M+H]+。
実施例437
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(50mg、0.1013mmol)のDCM(5mL)中溶液を-30℃まで冷却し、続いて、トリエチルアミン(42.35μl、0.3039mmol)および塩化アクリロイル(16.46μl、0.2026mmol)を加えた。-30℃で5分間撹拌した後、反応混合物をMeOH(0.05mL)でクエンチし、室温に暖めた。有機成分を0.5MのNa2CO3(4mL)で洗浄し、K2CO3上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を4%MeOH+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例437、34mg、61%)を得たESI+APCI MS m/z 548.3[M+H]+。
実施例438
2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:DCM(1mL)の2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(50mg、0.1013mmol)の攪拌溶液に、(2E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エン酸(26.17mg、0.2026mmol)、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.03529ml、0.2026mmol)およびO-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N´,N´-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(57.77mg、0.1519mmol)を加え、反応混合物を室温で4時間撹拌した。次に水(1mL)を加え、反応混合物を5分間撹拌した。混合物をEtOAc(10mL)と飽和NaHCO3(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機層をNaHCO3、ブラインで洗浄し、K2CO3上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、5%MeOH+0.5%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例438、45mg、74%)を得たESI+APCI MS m/z 605.3[M+H]+。
実施例439
2-(4-アクリロイル-1-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:DCM(20mL)およびiPrOH(10mL)の混合物中の2-(ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.2g、1.278mmol)の攪拌溶液を-30℃まで冷却し、ベンジルカルボノクロリデート(0.2190ml、1.534mmol)を滴加し、反応物を室温に暖めながら1時間撹拌した。有機成分を緩慢なN2流下で留去した。残留物をN,N-ジメチルアセトアミド(1ml、1.278mmol)に溶解し、続いて、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.3340ml、1.917mmol)およびtert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(0.3888g、1.278mmol)を加えた。反応混合物を70℃に2時間加熱し、続いて、室温で4日間撹拌した。反応物を水(5mL)とMTBE(20mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を40~100%のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(134mg、20%)を得た。ESI+APCI MS m/z 527.2[M+H]+。
ステップB:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(134mg、0.254mmol)、Cs2CO3(249mg、0.763mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(21.6mg、0.0254mmol)、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(146mg、1.27mmol)、および1,4-ジオキサン(2ml、0.254mmol)の混合物を、N2によりパージし、反応物をキャッピングし、80℃で3時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分をブライン(5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を4%MeOH+0.4%NH4OH/DCMを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(60mg、39%)を得たESI+APCI MS m/z 606.3[M+H]+。
ステップC:ベンジル 3-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:未希釈の(tert-ブチル 4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(60mg、0.09905mmol)をDCM(0.2mL)で希釈した。反応物を0℃まで冷却し、ジオキサン(0.50mL、20当量)中の4MのHClを撹拌しながら加えた。反応混合物を室温まで暖め、冷蔵庫に一晩置き、この時点で固体が沈殿した。液相をデカントし、固体をDCM(10mL)と2MのNa2CO3(0.5mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分をK2CO3上で乾燥し、N2流下で留去した。生成物を粗生成物として次の反応に使用した。
ステップD:ベンジル 3-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:粗製のベンジル 3-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(50mg、0.0989mmol)、Cs2CO3(96.7mg、0.297mmol)、ジオキサン(0.5mL)、1-ヨードナフタレン(37.7mg、0.148mmol、1.5当量)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G4、0.1当量、8.42mg、0.00989mmol)の混合物を窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、80℃で2時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を4%MeOH/DCM+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカクロマトグラフ処理して、不純生成物を得、これを、5~95%のMeCN/水+0.1%TFA(第1の溶出する化合物)により溶出する逆分取HPLCクロマトグラフィーにより精製した。目的の画分を2MのNa2CO3で希釈し、水層をDCM(3×20mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(15mL)で洗浄し、K2CO3上で乾燥し、減圧下で留去して、生成物(26mg、42%)を得た。ESI+APCI MS m/z 632.3[M+H]+。
ステップE:2-(1-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル 3-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(26mg、0.041mmol)、メタノール(2ml)、およびパラジウム炭素(10mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で1.5時間撹拌した。反応物をセライト(2mL)を通して濾過し、セライトをMeOH(3×3mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去して、生成物を得、これを粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 498.3[M+H]+。
ステップF:2-(4-アクリロイル-1-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-(1-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(15mg、0.03014mmol)のDCM(5mL)中溶液を、撹拌しながら-30℃まで冷却し、続いて、トリエチルアミン(12.60μl、0.09043mmol)および塩化アクリロイル(4.898μl、0.06028mmol)を加えた。-30℃で5分間撹拌した後、MeOH(0.05mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、室温まで暖めた。有機成分を0.5MのNa2CO3(4mL)で洗浄し、Na2CO3上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を4%MeOH+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例439、8.43mg、51%)を得たESI+APCI MS m/z 552.2[M+H]+。
実施例440
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,3R)-3-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:(2R,3R)-3-フルオロピロリジン-2-カルボン酸:固体の(2R,3R)-1-Boc-3-フルオロピロリジン-カルボン酸(400mg、1.71mmol)に、4Mの塩化水素(2144μl、8.57mmol)を滴加し、反応混合物を室温で1.5時間撹拌した。反応混合物を減圧下で留去し、続いて、固体のNaHCO3(173mg、2.06mmol)およびメタノール(1715μl、1.71mmol)を加え、懸濁液を室温で一晩撹拌した。混合物に追加分のMeOH(10mL)を加え、反応混合物を30分間撹拌し、半固体の完全な分散体が得られるまで超音波処理した。このスラリーを粗生成物として次の反応に使用した。
ステップB:(2R,3R)-3-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-カルボン酸:粗製の(2R,3R)-3-フルオロピロリジン-2-カルボン酸(228mg、1.71mmol)のMeOH(12mL)中撹拌懸濁液に、パラジウム炭素(30mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)を加え、続いて、ホルムアルデヒド水溶液(159μl、2.14mmol)を加え、反応混合物を水素で脱気し、水素下で一晩撹拌した。反応混合物をセライトを通して濾過し、セライトをMeOH(3×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去した。半固体をジオキサン中に入れ、N2下で週末にわたって留去した。生成物を粗生成物として次の反応に使用した。
ステップC:((2R,3R)-3-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール:粗製の1-Boc-2-(S)-ピロリジンジカルボン酸、3-(R)-フルオロ-(252mg、1.71mmol)の窒素下のTHF中の撹拌懸濁液を0℃に冷却し、続いて、2.4Mの水素化アルミニウムリチウム(0.999ml、2.40mmol)を滴加し、反応物を室温に暖めながら30分間撹拌した。反応物を超音波処理し、続いて、追加部分のTHF中の水素化アルミニウムリチウム(0.999ml、2.40mmol)を加え、反応混合物を室温で撹拌した。スラリーを0℃に冷却し、水(0.18mL)、15%NaOH(0.18mL)、および水(0.54mL)を連続添加することによってクエンチした。スラリーをエーテル(20mL)で希釈し、沈殿物を分離した。反応混合物をセライトを通して濾過し、セライトをエーテル(3×3mL)で洗浄した。合わせた有機成分に、4MのHCl/ジオキサン(0.45mL、1.1当量)を加えた。混合物は、無色の懸濁液から赤みがかった沈殿物に変わった。上澄液を減圧下で留去した。残った赤色固体を最小限の水で抽出し、綿プラグを通して濾過し、綿プラグを少量の水で洗浄した。合わせた水溶液をKOHで飽和し、エーテル(3×7mL)で抽出した。合わせた抽出物をNaOH上で乾燥し、窒素下で部分的に留去して、エーテル中の溶液として生成物を得た(エーテル中の40%溶液としての340mg、60%)。
ステップD:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((2R,3R)-3-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、0.2712mmol)、Cs2CO3(265.1mg、0.8137mmol)、1,4-ジオキサン(1ml)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(23.09mg、0.02712mmol)、およびRuPhos(9.492mg、0.02034mmol)の混合物を窒素により脱気し、70℃で1.5時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、DCM中の3%MeOH+0.3%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(108mg、61%)を得た。ESI+APCI MS m/z 650.3[M+H]+。
ステップE:2-((S)-4-(2-(((2R,3R)-3-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((2R,3R)-3-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(108mg、0.166mmol)、メタノール(5ml)、およびパラジウム炭素(35mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で1.5時間撹拌した。反応混合物をセライトを通して濾過し(2mL)、セライトをMeOH(3×3mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去し、粗生成物を得、次の反応に使用した。
ステップF:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,3R)-3-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(2-(((2R,3R)-3-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(78mg、0.1513mmol)のDCM(5mL)中溶液を-30℃まで冷却し、続いて、トリエチルアミン(63.25μl、0.4538mmol)および塩化アクリロイル(24.58μl、0.3025mmol)を加えた。-30℃で5分間撹拌した後、反応混合物をMeOH(0.05mL)でクエンチし、室温に暖めた。混合物を0.5MのNa2CO3(4mL)で洗浄し、Na2CO3上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%~10%のMeOH溶出液を使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例440、63mg、73%)を得た。ESI+APCI MS m/z 570.3[M+H]+。
実施例441
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート。tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(500mg、0.949mmol)、(D)-(R)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(328mg、2.85mmol)(3当量)、Cs2CO3(927mg、2.85mmol)、ジオキサン(1mL)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2-アミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G3、0.1当量、79.3mg、0.0949mmol)の混合物を窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、70℃で5時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4~10%のMeOH+0.5%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけ、生成物(150mg、26%)を得た。ESI+APCI MS m/z 606.3[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(296mg、0.489mmol)のDCM(2.5mL)中溶液をドライアイス上で冷却し、続いて、ジオキサン(1.2mL)中4MのHClを加え、反応物を室温に暖めながら3時間撹拌し、この時点で沈殿物が形成された。液体層をデカントし、沈殿物をDCM(2mL)で洗浄した。次いで、固体をDCM(20mL)および2MのNa2CO3(3mL)の混合物と共に1時間撹拌した。層を分離し、有機成分をNa2CO3上で乾燥し、濾過し、減圧下で留去した。物質を粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 506.3[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:粗製のベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(247mg、0.489mmol)、Cs2CO3(477mg、1.47mmol)、ジオキサン(2mL)、1-ヨードナフタレン(107μl、0.733mmol、1.5当量)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2-アミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G3、0.1当量、40.9mg、0.0489mmol)の混合物を窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、80℃で一晩撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を5%MeOH/DCM+0.25%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(216mg、70%)を得た。ESI+APCI MS m/z 632.3[M+H]+。
ステップD:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(216mg、0.3419mmol)のMeOH-THF(1:1、3mL)中攪拌溶液に、パラジウム炭素(50mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)を加え、混合物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で4時間撹拌した。反応混合物をセライトを通して濾過し(2mL)、セライトをEtOH(3×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去し、残留物をDCM(10mL)に溶解した。溶液を-30℃まで撹拌しながら冷却し、続いて、NEt3(0.28mL、1.71mmol)、塩化アクリロイル(0.08333ml、1.026mmol)を加え、反応物を-30で1分間撹拌した。NH4OH(0.05mL)を加えることによって反応物をクエンチし、室温まで暖めた。溶液を減圧下で留去した。残留物をDCM(10mL)に溶解し、綿プラグを通して濾過し、DCM中5~10%のMeOH+0.25%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例441、109mg、58%)を得た。ESI+APCI MS m/z 552.3[M+H]+。
実施例442
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(インドリジン-5-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
ステップA:5-ヨードインドリジン:インドリジン(5.69ml、1.71mmol)およびN1,N1,N2,N2-テトラメチルエタン-1,2-ジアミン(0.282ml、1.88mmol)の-80℃まで冷却された無水テトラヒドロフラン(5.7ml、1.71mmol)中の攪拌溶液に、ブチルリチウムの溶液(120mg、1.88mmol)を滴加した。反応混合物を-20℃まで暖め、-20℃で2時間維持した。混合物を-80℃まで冷却し、無水THF(3mL)中のヨード溶液(433mg、1.71mmol)を加えた。反応混合物を室温まで暖め、塩化アンモニウムの飽和溶液で処理した。有機層を分離し、水層をヘキサンで抽出した。合わせた有機成分を無水Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。粗生成物を、ヘキサンを溶出液として使用したシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、生成物(216mg)を得た。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(インドリジン-5-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:粗製のベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、0.198mmol)、Cs2CO3(193mg、0.593mmol)、ジオキサン(0.5mL)、5-ヨードインドリジン(72.1mg、0.297mmol)(1.5当量)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G4、0.1当量、16.8mg、0.0198mmol)の混合物を窒素によりパージし、反応物をキャッピングし、80℃で4時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(10mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%のMeOH/DCM+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(74mg、60%)を得た。ESI+APCI MS m/z 621.3[M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(7-(インドリジン-5-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(インドリジン-5-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(74mg、0.12mmol)、メタノール(5ml)、およびパラジウム炭素(20mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を真空下で脱気し、水素で充填し、反応物を水素雰囲気下で2時間撹拌した。スラリーをセライトを通して濾過し(1mL)、セライトをMeOH(3×2mL)で洗浄した。合わせた有機成分を減圧下で留去して、生成物を得、これを粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 487.3[M+H]+。
ステップD:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(インドリジン-5-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(インドリジン-5-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(50mg、0.1027mmol)のDCM(5mL)中溶液を-30℃まで冷却し、続いて、トリエチルアミン(42.96μl、0.3082mmol)および塩化アクリロイル(16.70μl、0.2055mmol)を加えた。-30℃で5分間撹拌後、反応混合物を飽和NaHCO3(1mL)でクエンチし、室温まで暖め、続いて水(2mL)を加えた。層を分離し、有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%MeOH+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例442、33mg、59%)を得た。ESI+APCI MS m/z 571.3[M+H]+。
実施例443
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2R)-2-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート:実施例375のステップCの手順に従って、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(65mg、0.118mmol)と(R)-N-Boc-2-ヒドロキシメチルモルホリン(76.6mg、0.353mmol)を代わりに使用して調製し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(2R)-2-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(49mg、0.0668mmol、56.8%収率)を得た。ESI+MS m/z 734.3 (100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-モルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩:実施例375のステップDの手順に従って、tert-ブチル(2R)-2-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(49mg、0.067mmol)を代わりに使用して調製し、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-モルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(45mg、0.067mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 634.3 (100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-モルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(45mg、0.067mmol)、ホルムアルデヒド(54mg、0.67mmol)(MeOH/水中の37重量%))のDCM(671μl、0.067mmol)およびTHF(671μl、0.067mmol)中溶液に、NaBH(OAc)3(142mg、0.67mmol)を加え、得られた混合物を室温で15分間撹拌した。反応混合物を酢酸エチルと1N NaOHとの間で分配した。水層を酢酸エチル(1×)で抽出した。合わせた有機層を乾燥し(MgSO4)、濃縮して、残留物を得、これを、DCM中の10%MeOH/1%NH4OH/DCM混合物の25~50%の勾配により溶出するフラッシュにより精製した。生成物を含有する分画を濃縮して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(22mg、0.034mmol、51%)を得た。ESI+MS m/z 648.3 (100%)[M+H]+。
ステップD:2-(4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(22mg、0.034mmol)を代わりに使用して調製して、2-(4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(15.9mg、0.031mmol、91%)を得た。ESI+MS m/z 514.3 (100%)[M+H]+。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-(4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(16mg、0.031mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例443、8.0mg、0.014mmol、46%)を得た。ESI+MS m/z 568.3 (100%)[M+H]+。
実施例444
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート:実施例375のステップCの手順に従って、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(65mg、0.118mmol)およびtert-ブチル(S)-2-(ヒドロキシメチル)モルホリン-4-カルボキシレート(76.6mg、0.353mmol)を代わりに使用して調製し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(2S)-2-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(43mg、0.059mmol、49.9%収率)を得た。ESI+MS m/z 734.3 (100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-モルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩:実施例375のステップDの手順に従って、tert-ブチル(2S)-2-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(43mg、0.059mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-モルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(39mg、0.058mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 634.3 (100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例443のステップCの手順に従って、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-モルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(39mg、0.067mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(17mg、0.026mmol、45%)を得た。ESI+MS m/z 648.3 (100%)[M+H]+。
ステップD:2-(4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(17mg、0.026mmol)を代わりに使用して調製して、2-(4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(13.5mg、0.026mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 514.3 (100%)[M+H]+。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-(4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(13.5mg、0.026mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例444、9.5mg、0.017mmol、65%)を得た。ESI+MS m/z 568.3 (100%)[M+H]+。
実施例445
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(3S)-3-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート。実施例375のステップCの手順に従って、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(65mg、0.118mmol)およびtert-ブチル(R)-3-(ヒドロキシメチル)モルホリン-4-カルボキシレート(76.6mg、0.353mmol)を代わりに使用して調製し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(3S)-3-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(80mg、0.109mmol、92.8%収率)を得た。ESI+MS m/z 734.3 (100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-モルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩。実施例375のステップDの手順に従って、tert-ブチル(3S)-3-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(80mg、0.11mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-モルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(73mg、0.11mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 634.3 (100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例443のステップCの手順に従って、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-モルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(73mg、0.109mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(27.6mg、0.042mmol、39%)を得た。ESI+MS m/z 648.3 (100%)[M+H]+。
ステップD:2-(4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(27.6mg、0.042mmol)を代わりに使用して調製して、2-(4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20.2mg、0.039mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 514.3 (100%)[M+H]+。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-(4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20.2mg、0.0393mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-(1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例445、15mg、0.026mmol、67%)を得た。ESI+MS m/z 568.3 (100%)[M+H]+。
実施例446
2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(3R)-3-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート。実施例375のステップCの手順に従って、ベンジル 4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(65mg、0.118mmol)およびtert-ブチル(S)-3-(ヒドロキシメチル)モルホリン-4-カルボキシレート(76.6mg、0.353mmol)を代わりに使用して調製し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(3R)-3-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(50mg、0.068mmol、58.0%収率)を得た。ESI+MS m/z 734.3 (100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-モルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩。実施例375のステップDの手順に従って、tert-ブチル(3R)-3-(((4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(50mg、0.068mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-モルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(46mg、0.068mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 634.3 (100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例443のステップCの手順に従って、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-モルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(73mg、0.109mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(23.0mg、0.036mmol、52%)を得た。ESI+MS m/z 648.3 (100%)[M+H]+。
ステップD:2-(4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(23.0mg、0.036mmol)を代わりに使用して調製して、2-(4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(18.2mg、0.036mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 514.3 (100%)[M+H]+。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-(4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(18.2mg、0.036mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-3-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例446、14mg、0.025mmol、69%)を得た。ESI+MS m/z 568.3 (100%)[M+H]+。
実施例447
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4,4-ジフルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例375のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(50mg、0.090mmol)およびtert-ブチル(S)-4,4-ジフルオロ-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(64.3mg、0.271mmol)を代わりに使用して調製し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4,4-ジフルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(15mg、0.020mmol、22.0%収率)を得た。ESI+MS m/z 754.3 (100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩。実施例375のステップDの手順に従って、ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-4,4-ジフルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(18mg、0.024mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(16mg、0.023mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 654.3 (100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例443のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16mg、0.023mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0mg、0.024mmol、52%)を得た。ESI+MS m/z 668.3 (100%)[M+H]+。
ステップD:2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0mg、0.024mmol)を代わりに使用して調製して、2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8.0mg、0.015mmol、63%)を得た。ESI+MS m/z 534.3 (100%)[M+H]+。
ステップE:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8.0mg、0.015mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例447、4mg、0.007mmol、45%)を得た。ESI+MS m/z 588.3 (100%)[M+H]+。
実施例448
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(R)-6-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-4-カルボキシレート。実施例375のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(25mg、0.045mmol)およびtert-ブチル(R)-6-(ヒドロキシメチル)-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-4-カルボキシレート(33.0mg、0.136mmol)を代わりに使用して調製し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(R)-6-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-4-カルボキシレート(35mg、0.0461mmol、100%収率)を得た。ESI+MS m/z 760.3 (100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-4-(2-(((R)-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩。実施例375のステップDの手順に従って、tert-ブチル(R)-6-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-4-カルボキシレート(35mg、0.046mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-4-(2-(((R)-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(32mg、0.046mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 660.3 (100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例443のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-4-(2-(((R)-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(32mg、0.046mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(31mg、0.046mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 674.3 (100%)[M+H]+。
ステップD:2-((S)-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(31.0mg、0.046mmol)を代わりに使用して調製して、2-((S)-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(18.0mg、0.033mmol、72%)を得た。ESI+MS m/z 540.3 (100%)[M+H]+。
ステップE:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-((S)-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(18.0mg、0.033mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例448、5.8mg、0.010mmol、29%)を得た。ESI+MS m/z 594.3 (100%)[M+H]+。
実施例449
2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-(ジフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(2-(ジフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(30mg、0.0593mmol)、1-ブロモ-2-ジフルオロメチルベンゼン(36.8mg、0.178mmol)、BINAP Palladacycle Gen.3(5.9mg、0.006mmol)、Cs2CO3(77.3mg、0.237mmol)のジオキサン(593μl、0.0593mmol)中混合物を、アルゴンにより5分間スパージし、次いで、密閉し、100℃で1日間加熱した。反応混合物をシリカゲルサンプレット上にロードし、1~10%のMeOH/DCM(1%NH4OH)勾配により溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(2-(ジフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(12mg、0.019mmol、32%)を得た。ESI+MS m/z 632.3 (100%)[M+H]+。
ステップB:2-((S)-4-(2-(((R)-4-メチル-7-オキサ-4-アザスピロ[2.5]オクタン-6-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(2-(ジフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(12.0mg、0.019mmol)を代わりに使用して調製して、2-(4-(7-(2-(ジフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(9.5mg、0.019mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 498.3 (100%)[M+H]+。
ステップC:2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-(ジフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-(4-(7-(2-(ジフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(9.5mg、0.019mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-(1-アクリロイル-4-(7-(2-(ジフルオロメチル)フェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例449、4.2mg、0.008mmol、40%)を得た。ESI+MS m/z 552.3(100%)[M+H]+。
実施例450
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート。実施例443のステップAの手順に従って、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(95mg、0.172mmol)および(R)-N-Boc-2-ヒドロキシメチルモルホリン(112mg、0.515mmol)を代わりに使用して調製し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(126mg、0.172mmol、100%の収率)を得た。ESI+MS m/z 734.3(100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-モルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩:実施例375のステップDの手順に従って、tert-ブチル(R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)モルホリン-4-カルボキシレート(126mg、0.172mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-モルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(109mg、0.172mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 634.3(100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例443のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(109mg、0.172mmol)を代わりに使用して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(76mg、0.117mmol、68%)を得た。ESI+MS m/z 648.3(100%)[M+H]+。
ステップD:2-((S)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(76mg、0.117mmol)を代わりに使用して調製して、2-((S)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(57.1mg、0.111mmol、95%)を得た。ESI+MS m/z 514.3(100%)[M+H]+。
ステップE:2-(1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-((S)-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(56mg、0.11mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((R)-4-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例450、50mg、0.088mmol、81%)を得た。ESI+MS m/z 568.3(100%)[M+H]+。
実施例451
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2R,5R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-5-メチルモルホリン-4-カルボキシレート。実施例375のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(95mg、0.172mmol)およびtert-ブチル(2R,5R)-2-(ヒドロキシメチル)-5-メチルモルホリン-4-カルボキシレート(119mg、0.515mmol)を代わりに使用し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(2R,5R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-5-メチルモルホリン-4-カルボキシレート(128mg、0.171mmol、100%収率)を得た。ESI+MS m/z 748.3(100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((2R,5R)-5-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例375のステップDの手順に従って、tert-ブチル(2R,5R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-5-メチルモルホリン-4-カルボキシレート(128mg、0.171mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((2R,5R)-5-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(111mg、0.171mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 648.3(100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例443のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((2R,5R)-5-メチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(111mg、0.171mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(56mg、0.085mmol、49%)を得た。ESI+MS m/z 662.3(100%)[M+H]+。
ステップD:2-((S)-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(56mg、0.085mmol)を代わりに使用して調製して、2-((S)-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(44.3mg、0.084mmol、99%)を得た。ESI+MS m/z 528.3(100%)[M+H]+。
ステップE:2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップGの手順に従って、2-((S)-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(43mg、0.081mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((2R,5R)-4,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例451、32mg、0.055mmol、68%)を得た。ESI+MS m/z 582.3(100%)[M+H]+。
実施例452
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-5,5-ジメチルモルホリン-4-カルボキシレート。実施例375のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(95mg、0.172mmol)およびtert-ブチル(R)-2-(ヒドロキシメチル)-5,5-ジメチルモルホリン-4-カルボキシレート(126mg、0.515mmol)を代わりに使用し、25~100%のヘキサン/EtOAcにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-5,5-ジメチルモルホリン-4-カルボキシレート(131mg、0.172mmol、100%の収率)を得た。ESI+MS m/z 762.3(100%)[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-5,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例375のステップDの手順に従って、tert-ブチル(R)-2-(((4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)-5,5-ジメチルモルホリン-4-カルボキシレート(131mg、0.172mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-5,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(114mg、0.172mmol、100%)を得た。ESI+MS m/z 662.3(100%)[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。実施例443のステップCの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((R)-5,5-ジメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(114mg、0.172mmol)を代わりに使用して調製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(77mg、0.114mmol、66%)を得た。ESI+MS m/z 676.3(100%)[M+H]+。
ステップD:2-((S)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例375のステップFの手順に従って、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(77mg、0.114mmol)を代わりに使用して調製して、2-((S)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(47mg、0.087mmol、77%)を得た。ESI+MS m/z 542.3 (100%)[M+H]+。
ステップE:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。実施例1のステップGの手順に従って、2-((S)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(46mg、0.085mmol)を代わりに使用して調製して、標記化合物である2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-2-(((R)-4,5,5-トリメチルモルホリン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例452、36mg、0.060mmol、71%)を得た。ESI+MS m/z 582.3(100%)[M+H]+。
実施例453
1-[4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップ1:3-ブロモ-1,2,4-トリメチル-5-ニトロベンゼン。1,2,4-トリメチル-5-ニトロベンゼン(10g、60mmol、1当量)のDCE(200mL)中溶液に、FeBr3(358mg、1.21mmol、0.02当量)、Fe(879mg、15.7mmol、0.26当量)を加え、続いて、Br2(11.6g、72.6mmol、3.74mL、1.2当量)を滴加した。25℃で1時間撹拌した後、反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物を水でスラリー化し、濾過により集めた。3-ブロモ-1,2,4-トリメチル-5-ニトロベンゼン(8.6g、34.9mmol、58%収率、99%純度)を白色固体として得た。
ステップ2:3-ブロモ-2,4,5-トリメチル-アニリン。3-ブロモ-1,2,4-トリメチル-5-ニトロベンゼン(5.2g、21.3mmol、1当量)のEtOH(100mL)中溶液に、Fe(5.95g、107mmol、5当量)およびAcOH(12.8g、213mmol、12.2mL、10当量)を加えた。混合物を60℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸含有水)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3飽和水溶液で中和し、次いで、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×100mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、3-ブロモ-2,4,5-トリメチル-アニリン(3.4g、14.3mmol、67%収率、90%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.51(s,1H),3.56(br s,2H),2.32(s,3H),2.31(s,3H),2.26(s,3H)。
ステップ3:4-ブロモ-5,6-ジメチル-1H-インダゾール。3-ブロモ-2,4,5-トリメチル-アニリン(200mg、934.14μmol、1当量)を、トリフルオロボラン;フッ化水素(1.69g、7.71mmol、1.20mL、8.25当量、水中40%)液滴に0℃で溶解した。NaNO2(96.7mg、1.40mmol、1.5当量)の冷却した水溶液(飽和水溶液に対する最小限の水中)。添加後、混合物を0℃で1時間および25℃で0.5時間撹拌した。NaNO2(64mg、飽和水溶液に対する最小限の水)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。次いで、得られた沈殿物を濾過し、(i-Pr)2O(40mL)で洗浄し、真空下で濃縮して、これをKOAc(183mg、1.87mmol、2当量)および18-クラウン-6(12.4mg、46.7μmol、0.05当量)のCHCl3(8mL)中撹拌混合物にN2下で1度に直接加えた。混合物を35℃で0.5時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 100/1~5/1)により精製して、4-ブロモ-5,6-ジメチル-1H-インダゾール(70mg、280μmol、30%収率、90%純度)を黄色固体として得た。
ステップ4:4-ブロモ-5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール。4-ブロモ-5,6-ジメチル-1H-インダゾール(290mg、1.29mmol、1当量)のDCM(6mL)中溶液に、TsOH・H2O(24.5mg、129μmol、0.1当量)を加え、続いて、DHP(217mg、2.58mmol、236μL、2当量)およびMeCN(1mL)を加えた。混合物を25℃で5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NaHCO3水溶液(5mL)でクエンチし、水(20mL)で希釈した。層を分離し、水相をEtOAc(2×200mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 100/1~25/1)により精製して、4-ブロモ-5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(320mg、828μmol、64%収率、80%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:309。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.94(s,1H),7.33(s,1H),5.66(dd,J=2.8,9.2Hz,1H),4.06-3.97(m,1H),3.79-3.67(m,1H),2.47(s,3H),2.44(s,3H),2.16(qd,J=4.4,7.6Hz,1H),2.06(qd,J=3.2,13.2Hz,1H),1.83-1.64(m,4H)。
ステップA:tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(30mL)中のtert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(385mg、890μmol、1当量)、4-ブロモ-5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(303mg、979μmol、1.10当量)、Pd2(dba)3(163mg、178μmol、0.2当量)、RuPhos(166mg、356μmol、0.4当量)、およびCs2CO3(725mg、2.23mmol、2.5当量)を脱気し、次いで、N2下で90℃に8時間加熱した。加熱が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EtOAc/MeOH 100/1~5/1)により精製して、tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、275μmol、31%収率、91%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:661。
ステップB:7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(190mg、288μmol、1当量)のDCM(0.4mL)中溶液に、TFA(924mg、8.10mmol、0.6mL、28.2当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(220mg、粗製、2TFA)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップC:1-[4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(200mg、284μmol、1当量、2TFA)およびTEA(574mg、5.68mmol、790μL、20当量)のDCM(4mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(35.8mg、284μmol、1当量)を-40℃で滴加した。混合物を-40℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、水(5mL)で希釈し、次いで、DCM(2×10mL)で抽出した。抽出物をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 100/1~10/1)および分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%の水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:35%~65%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥し、標記化合物である1-[4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例453、45.3mg、85.2μmol、2ステップで30%収率、99.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:531。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.84(br s,1H),8.02(s,1H),7.13(s,1H),6.59(dd,J=10.4,16.8Hz,1H),6.34(dd,J=1.2,16.8Hz,1H),5.79-5.68(m,1H),4.40(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.26(s,2H),4.17(dd,J=6.8,10.4Hz,1H),3.90-3.39(m,10H),3.09(br t,J=7.6Hz,1H),2.89-2.62(m,3H),2.47(s,3H),2.39(s,3H),2.33(s,3H),2.30-2.23(m,1H),2.09-1.97(m,1H),1.91-1.69(m,3H)。
実施例454
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:4,4-ジフルオロピペリジン。tert-ブチル 4,4-ジフルオロピペリジン-1-カルボキシレート(2.0g、9.04mmol、1.0当量)のDCM(0.50mL)中溶液に、TFA(770mg、6.75mmol、0.50mL、7.47e-1当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮して、生成物である4,4-ジフルオロピペリジン(1.50g、粗製、TFA)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップ2:1-(2-ベンジルオキシエチル)-4,4-ジフルオロ-ピペリジン。4,4-ジフルオロピペリジン(1.50g、6.38mmol、1.0当量、TFA)のMeCN(20.0mL)中溶液に、NaOH(765mg、19.1mmol、3.0当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。次いで、2-ブロモエトキシメチルベンゼン(1.65g、7.65mmol、1.21mL、1.20当量)およびKI(212mg、1.28mmol、0.20当量)を上記液体に加え、混合物を90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(20.0mL)に加え、次いで、EA(3×20.0mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4により乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=10:1~0:1)により精製して、1-(2-ベンジルオキシエチル)-4,4-ジフルオロ-ピペリジン(600mg、2.35mmol、2ステップで37%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.41-7.29(m,5H),4.54(s,2H),3.82-3.72(m,2H),3.33-2.94(m,6H),2.37-2.15(m,4H)。
ステップ3:2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エタノール。1-(2-ベンジルオキシエチル)-4,4-ジフルオロピペリジン(400mg、1.57mmol、1.0当量)およびPd/C(200mg、10%純度)のEtOH(5.0mL)中溶液を、H2(15Psi)雰囲気下、25℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトを通して濾過し、濾過ケーキをTHF(10.0mL)で洗浄した。濾液を集め、濃縮して、生成物である2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エタノール(170mg、1.03mmol、66%収率)を無色油として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ3.84-3.70(m,2H),2.98-2.89(m,4H),2.86-2.80(m,3H),2.24-2.11(m,4H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エタノール(102mg、619μmol、3.0当量)のトルエン(3.0mL)中溶液およびtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、206μmol、1.0当量)に、t-BuONa(39.7mg、413μmol、2.0当量)を加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10.0mL)に加え、EA(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、0.1%NH3・H2O、0~60%MeCN)により精製して、生成物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(90.0mg、132μmol、64%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:682。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(30.0mg、44.0μmol、1.0当量)のDCM(0.5mL)中溶液に、TFA(770mg、6.75mmol、0.50mL、154当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濃縮した。残留物を飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、次いで、EA(3×5.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(26.0mg、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:582。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(26.0mg、44.7μmol、1.0当量)およびDIEA(69.3mg、536μmol、93.4μL、12.0当量)のDCM(1.0mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(8.45mg、67.0μmol、1.50当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、MeOH(1.0mL)を加えることによって混合物をクエンチし、次いで、濃縮して、残留物を得た。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:47%~77%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(4,4-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例454、6.35mg、9.82μmol、2ステップで22%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:636。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=7.2Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.17(m,1H),6.67-6.54(m,1H),6.40(br d,J=16.4Hz,1H),5.83(br d,J=11.2Hz,1H),5.20-4.56(m,1H),4.50-4.35(m,3H),4.22-4.01(m,2H),3.98-3.75(m,2H),3.66-3.57(m,1H),3.53-3.36(m,1H),3.31-2.98(m,4H),2.91-2.80(m,3H),2.79-2.49(m,6H),2.09-1.94(m,4H)。
実施例455
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:1-(2-ベンジルオキシエチル)-3,3-ジフルオロピペリジン。3,3-ジフルオロピペリジン(1.0g、6.35mmol、1.0当量、HCl)のMeCN(6.0mL)中溶液に、NaOH(761mg、19.0mmol、3.0当量)を25℃で1度に加えた。混合物を25℃で5分間撹拌し、次いで、2-ブロモエトキシメチルベンゼン(1.64g、7.61mmol、1.20mL、1.20当量)およびKI(211mg、1.27mmol、0.20当量)を加えた。混合物を90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をH2O(15.0mL)に加え、次いで、EA(3×20.0mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4により乾燥し、濾過し、濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10:1~5:1)により精製して、1-(2-ベンジルオキシエチル)-3,3-ジフルオロピペリジン(1.40g、5.48mmol、86%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.38-7.31(m,5H),4.56(s,2H),3.64(t,J=5.8Hz,2H),2.79-2.73(m,4H),2.55(t,J=5.4Hz,2H),1.85-1.85(m,2H),1.82-1.76(m,2H)。
ステップ2:2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エタノール。1-(2-ベンジルオキシエチル)-3,3-ジフルオロピペリジン(400mg、1.57mmol、1.0当量)のMeOH(5.0mL)中溶液に、Pd/C(200mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、濃縮して、2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エタノール(240mg、1.45mmol、93%収率)を無色油として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ3.64(t,J=5.4Hz,2H),2.73(t,J=11.2Hz,2H),2.63(t,J=5.4Hz,2H),2.54(t,J=5.2Hz,2H),1.97-1.87(m,2H),1.82-1.76(m,2H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、396μmol、1.0当量)、2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エタノール(196mg、1.19mmol、3.0当量)、t-BuONa(114mg、1.19mmol、3.0当量)のトルエン(5.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をH2O(5.0mL)によりクエンチし、EA(3×10.0mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和NaCl水溶液(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3:1~0:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、344μmol、87%収率、94%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.77(d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=8.0Hz,1H),7.54(d,J=7.2Hz,1H),7.50-7.42(m,1H),7.37-7.33(m,1H),7.27-7.20(m,1H),4.67-4.64(m,1H),4.48-4.39(m,3H),4.06(d,J=12.8Hz,1H),4.01-3.80(m,3H),3.60(d,J=4.0Hz,1H),3.37(dd,J=3.6,13.6Hz,1H),3.27-3.10(m,3H),2.97-2.90(m,3H),2.84-2.78(m,3H),2.61-2.57(m,2H),1.89-1.85(m,3H),1.72-1.54(m,3H),1.53(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、293μmol、1.0当量)のDCM(1.50mL)中混合物に、TFA(2.31g、20.3mmol、1.50mL、69.0当量)をN2下、25℃で1度に加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(400mg、粗製、2TFA)を黄色固体として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:582。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(400mg、494μmol、粗製、2TFA)およびTEA(727mg、7.18mmol、1.0mL)のDCM(2.0mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(100mg、793μmol)をN2下、0℃で1度に加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、MeOH(3.0mL)を0℃で加えることによって混合物をクエンチし、次いで、濃縮して、残留物を得た。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10.0mMのNH4HCO3)-ACN];B%:57%~87%、10分)により精製し、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[2-(3,3-ジフルオロ-1-ピペリジル)エトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例455、48.4mg、75.8μmol、26%収率、99%純度)を白色固体として得た。
SFC条件:100%e.e.。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.78(d,J=8.0Hz,1H),7.64(t,J=7.4Hz,1H),7.54(d,J=7.6Hz,1H),7.50-7.43(m,1H),7.36(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.21(m,1H),6.60-6.58(m,1H),6.44-6.39(m,1H),5.85(d,J=10.4Hz,1H),5.10-4.66(m,1H),4.49-4.40(m,3H),4.18-4.08(m,2H),3.94-3.89(m,1H),3.85-3.73(m,1H),3.63-3.60(m,1H),3.50-3.41(m,1H),3.33-3.02(m,4H),2.94-2.76(m,6H),2.64-2.61(m,3H),1.95-1.85(m,2H),1.80-1.78(m,2H)。LCMS[ESI,M+1]:636。
実施例456
5,6-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-2-オン
挿入物ステップ1:2-ブロモ-3,4-ジメチル-6-ニトロアニリン。4,5-ジメチル-2-ニトロアニリン(5g、30.1mmol、1当量)のCHCl3(100mL)中溶液に、Br2(7.21g、45.1mmol、2.33mL、1.5当量)を10℃で滴加した。反応混合物を10℃で30分間および25℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和NaHCO3水溶液(80mL)で洗浄した。水相をCHCl3(30mL)で抽出した。合わせた有機相をNa2SO4上で乾燥し、シリカゲルパッドを通して濾過し、次いで、濃縮乾固した。2-ブロモ-3,4-ジメチル-6-ニトロアニリン(7g、28.5mmol、95%収率、99.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI、M+3]:247
ステップ2:3-ブロモ-1,2-ジメチル-4,5-ジニトロベンゼン。2-ブロモ-3,4-ジメチル-6-ニトロアニリン(7g、28.6mmol、1当量)のTFA(50mL)中溶液に、過酸化水素(25.9g、229mmol、22.0mL、30%純度、8.0当量)を10℃で滴加した。反応混合物を10℃で30分間および25℃で30分間撹拌し、次いで、40℃でさらに2時間撹拌した。反応混合物を5~10℃まで冷却し、次いで、濾過した。濾過ケーキをPE(3×20mL)で洗浄した。次いで、固体を減圧下、50℃で乾燥した。3-ブロモ-1,2-ジメチル-4,5-ジニトロベンゼン(5g、18.2mmol、64%収率)を黄色固体として得た。
ステップA:tert-ブチル 4-[7-(2,3-ジメチル-5,6-ジニトロフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、578μmol、1当量)、3-ブロモ-1,2-ジメチル-4,5-ジニトロベンゼン(318mg、1.16mmol、2当量)、Pd2(dba)3(52.9mg、57.8μmol、0.1当量)、RuPhos(40.5mg、86.7μmol、0.15当量)、およびCs2CO3(377mg、1.16mmol、2当量)のトルエン(25mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で8時間撹拌した。反応混合物をH2O(100mL×1)および酢酸エチル(100mL×2)で希釈した。分離した有機相をブライン(100mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=50/1~3/1)および逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液で中和し、酢酸エチル(1×100mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。tert-ブチル 4-[7-(2,3-ジメチル-5,6-ジニトロフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(22.0mg、140μmol、6%収率、99.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:627。
ステップB:tert-ブチル 4-[7-(2,3-ジアミノ-5,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-(2,3-ジメチル-5,6-ジニトロフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、191μmol、1当量)のMeOH(10mL)中溶液に、Pd/C(24.0mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と、H2によるパージを数回繰り返した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮した。tert-ブチル 4-[7-(2,3-ジアミノ-5,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、粗製)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:567。
ステップC:tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-2-オキソ-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-(2,3-ジアミノ-5,6-ジメチル-フェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、176μmol、1当量)のTHF(10mL)中溶液に、CDI(57.2mg、353μmol、2当量)を加えた。50℃で1時間撹拌した後、CDI(171mg)を加え、混合物を70℃でさらに3時間撹拌した。反応混合物をH2O(3mL×1)でクエンチし、次いで、酢酸エチル(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:17%~47%、10分)により精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液で中和し、酢酸エチル(1×30mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-2-オキソ-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(20.0mg、33.7μmol、2ステップで19%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:593。
ステップD:5,6-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-2-オン。tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-2-オキソ-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(16.0mg、27.0μmol、1当量)のジオキサン(2mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、101μL、15当量)を0℃で加えた。25℃で0.5時間撹拌した後、混合物を真空下で濃縮した。5,6-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-2-オン(20.0mg、粗製、HCl)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:493。
ステップE:5,6-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-2-オン。5,6-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-2-オン(20.0mg、37.8μmol、1当量、HCl)およびTEA(38.3mg、378μmol、52.6μL、10当量)のDCM(2mL)中混合物に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(4.77mg、37.8μmol、1当量)を-40℃で少しずつ加えた。-40℃で30分間撹拌した後、反応混合物を飽和NaHCO3溶液(0.5mL)により0℃でクエンチし、次いで、CH2Cl2(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%~37%、9分)により精製した。目的の画分を集め、減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である5,6-ジメチル-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-(4-プロパ-2-エノイルピペラジン-1-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-イル]-1,3-ジヒドロベンズイミダゾール-2-オン(実施例456、3.15mg、5.25μmol、2ステップで14%収率、98.8%純度、HCOOH)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:547。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)6.90-6.81(m,1H),6.80-6.72(m,1H),6.28(br d,J=16.8Hz,1H),5.82(br d,J=10.4Hz,1H),4.72-4.46(m,2H),4.32-4.01(m,2H),3.93-3.53(m,10H),3.53-3.38(m,1H),3.21-3.02(m,2H),2.98(s,3H),2.95-2.58(m,2H),2.48-2.32(m,1H),2.31(br s,3H),2.29(br s,3H),2.19-1.94(m,3H)。
実施例457
1-[4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン
ステップ1:(E)-2-(2-ブロモ-3,4-ジメチル-6-ニトロフェニル)-N,N-ジメチル-エテンアミン。3-ブロモ-1,2,4-トリメチル-5-ニトロベンゼン(2g、8.19mmol、1当量)のDMF(20mL)中溶液に、DMFDMA(5.86g、49.2mmol、6.53mL、6当量)を加えた。混合物を130℃で10時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、(E)-2-(2-ブロモ-3,4-ジメチル-6-ニトロフェニル)-N,N-ジメチル-エテンアミン(2.5g、粗製)を褐色油として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップ2:4-ブロモ-5,6-ジメチル-1H-インドール。(E)-2-(2-ブロモ-3,4-ジメチル-6-ニトロフェニル)-N,N-ジメチル-エテンアミン(2.5g、8.36mmol、1当量)のEtOH(50mL)中溶液に、Fe(2.33g、41.8mmol、5当量)およびAcOH(5.02g、83.6mmol、4.78mL、10当量)を加えた。混合物を60℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を濃縮した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(50mL×2)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 1/0~50/1)により精製して、4-ブロモ-5,6-ジメチル-1H-インドール(380mg、1.46mmol、2ステップで収率18%、86%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.12(br s,1H),7.20-7.10(m,2H),6.59-6.52(m,1H),2.47(s,3H),2.43(s,3H)。
ステップ3:2-[(4-ブロモ-5,6-ジメチル-インドール-1-イル)メトキシ]エチルトリメチルシラン。4-ブロモ-5,6-ジメチル-1H-インドール(450mg、2.01mmol、1当量)のTHF(9mL)中溶液に、NaH(161mg、4.02mmol、60%純度、2当量)を0℃で加えた。反応物をN2下、0℃で15分間撹拌した。反応物を25℃まで温め、0.5時間撹拌した。再び反応物を0℃まで冷却した。THF(100μL)中のSEM-Cl(502mg、3.01mmol、533μL、1.5当量)を0℃で滴加した。5分間撹拌後、混合物を室温(25℃)に暖め、さらに5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を塩化アンモニウム飽和水溶液(20mL)でクエンチし、水(10mL)で希釈し、次いで、酢酸エチル(2×30mL)で抽出した。抽出物をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 1/0~50/1)により精製して、2-[(4-ブロモ-5,6-ジメチル-インドール-1-イル)メトキシ]エチルトリメチルシラン(440mg、1.18mmol、59%収率、95%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.25(s,1H),7.11(d,J=3.2Hz,1H),6.51(d,J=2.8Hz,1H),5.43(s,2H),3.52-3.40(m,2H),2.47(s,3H),2.46(s,3H),0.92-0.87(m,2H)-0.01--0.08(m,9H)。
ステップA:tert-ブチル 4-[7-[5,6-ジメチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インドール-4-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(30mL)中のtert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体66、450mg、1.04mmol、1当量)、2-[(4-ブロモ-5,6-ジメチル-インドール-1-イル)メトキシ]エチルトリメチルシラン(406mg、1.14mmol、1.1当量)、Pd2(dba)3(191mg、208μmol、0.2当量)、RuPhos(194mg、416μmol、0.4当量)、およびCs2CO3(847mg、2.60mmol、2.5当量)を脱気し、次いで、N2下で90℃に8時間加熱した。加熱が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EtOAc/MeOH 50/1~10/1)により精製して、tert-ブチル 4-[7-[5,6-ジメチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インドール-4-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(106mg、135μmol、13%収率、90%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:706。
ステップB:tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[7-[5,6-ジメチル-1-(2-トリメチルシリルエトキシメチル)インドール-4-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(70mg、99.2μmol、1当量)のDMF(0.35mL)中溶液に、TBAF(THF中1M、496μL、5当量)を加え、続いて、エタン-1,2-ジアミン(8.94mg、149μmol、9.95μL、1.5当量)を加えた。混合物を85℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をEtOAc(3mL)および水(2mL)で希釈した。分離した有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(DCM/MeOH 10/1)により精製して、tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(50mg、60.8μmol、61%収率、70%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:576。
ステップC:7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル 4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(45mg、78.2μmol、1当量)のDCM(70μL)中溶液に、TFA(89.1mg、782μmol、57.9μL、10当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(60mg、粗製、2TFA)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップD:1-[4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン。7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-4-ピペラジン-1-イル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(55mg、78.2μmol、1当量、2TFA)およびTEA(158mg、1.56mmol、218μL、20当量)のDCM(1mL)中溶液に、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエート(9.86mg、78.2μmol、1当量)を-40℃で滴加した。混合物を-40℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をMeOH(0.5mL)でクエンチし、水(5mL)で希釈し、次いで、DCM(2×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 100/1~10/1)および分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:16%~43%、12分)により精製した。目的の画分を集め、NaHCO3飽和水溶液で中和し、DCM(2×15mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、標記化合物である1-[4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-イル]プロパ-2-エン-1-オン(実施例457、9.81mg、18.3μmol、2ステップで23%収率、98.8%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:530。
SFC条件:OJ-3S_3_5_40_3MLカラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22(br s,1H),7.09(s,1H),7.07-7.03(m,1H),6.60(dd,J=10.8,16.8Hz,1H),6.53-6.48(m,1H),6.34(dd,J=2.0,16.9Hz,1H),5.76(dd,J=2.0,10.4Hz,1H),4.49-4.10(m,4H),3.81(br s,2H),3.76-3.38(m,8H),3.13(br t,J=7.2Hz,1H),3.02-2.56(m,3H),2.50(s,3H),2.39(s,3H),2.36(s,3H),2.34-2.25(m,1H),2.13-2.06(m,1H),1.84-1.71(m,3H)。
実施例458
2-((S)-1-(ブタ-2-イノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
ステップA:1-ブロモ-8-メチルナフタレン:1,8-ジブロモナフタレン(33.8g、118mmol)の-78℃まで冷却したTHF(200mL)中溶液に、ブチルリチウム(49.6ml、124mmol)を内部温度が-69℃を超えない速度で加えた。添加が完了したら、反応物を-78℃まで冷却し、ヨウ化メチル(14.8ml、236mmol)を内部温度が-40℃に増加するように1度に加えた。ヨウ化メチル添加後、ドライアイス/アセトンバスを取り除き、反応物を室温まで暖めた。次に反応物をブライン中に注ぎ込み、水層をEtOAc(300mL)で抽出し、有機成分を分離した。次に有機成分をMgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮し、残留物を、ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、白色固体(24g)を得た。次に固体をIPA(約60mL)中でスラリー化し、スラリーを60℃まで加熱し、この時点で固形分が溶解した。2時間にわたる加熱および室温への冷却により溶液を除去した。得られたスラリーを濾過し、固形分を減圧下で乾燥して、>95%純度の1-ブロモ-8-メチルナフタレン(16g、72.4mmol、61%収率)を得た。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:キサントホス(4.5g、7.8mmol)およびPd2(dba)3(3.5g、3.9mmol)のジオキサン(100mL)中溶液をアルゴンにより15分間脱気し、続いて、溶液を100℃で20分間加熱した。溶液を室温に冷却し、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(9.8g、19mmol)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(13g、58mmol)、およびCs2CO3(32g、97mmol)、Pd2(dba)3(3.5g、3.9mmol)を溶液に加え、混合物をアルゴンでさらに20分間脱気し、反応物を100℃に一晩加熱した。次に反応物を室温まで冷却し、GFF濾紙を通して濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。次に残留物を、1→10%(MeOH+2%NH4OH)/DCMを使用して3回クロマトグラフ処理して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(7.8g、12mmol、62%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 646.3[M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(7.8g、12mmol)の1:1のEtOH/THF(100mL)中溶液を、N2により5分間脱気し、続いて、Pd/C(2.6g、2.4mmol)を加えた。次にスラリーを真空下で脱気し、H2(3×)で充填した。3回目の充填時に、混合物を水素バルーン下で一晩撹拌した。スラリーをN2で再び脱気し、スラリーをセライトを通して濾過した。合わせた濾液を減圧下で濃縮し、固形分を1→10%(MeOH+2%NH4OH)/DCMを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(5.0g、9.8mmol、81%収率)を得た。
ステップD:2-((S)-1-(ブタ-2-イノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:N,N-ジメチルホルムアミド(1954μl、0.391mmol)を含有する25mLのRBFに、2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(200mg、0.391mmol)およびトリエチルアミン(136μl、0.977mmol)を0℃で加えた。ブタ-2-イン酸(49.3mg、0.586mmol)を1度に加えると共に、反応混合物を強く撹拌した。1-プロピルホスホン酸環状無水物(175μl、0.293mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を室温で18時間撹拌させた。水を加え、固形分を濾過した。固形分をシリカゲル(0.25%NH4OHを含有するDCM中の5~18%MeOH)により精製して、標記化合物である2-((S)-1-(ブタ-2-イノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例458、110mg、0.190mmol、49%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 578.3[M+H]+。
実施例459
2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
ステップA:2-((S)-1-((E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(100mg、0.1954mmol)、(E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エン酸(37.86mg、0.2932mmol)、およびN,N-ジメチルホルムアミド(2mL、25.58mmol)の撹拌混合物を氷塩浴上で冷却し、トリエチルアミン(0.02724mL、0.1954mmol)を1度に加え、続いて、EtOAc中50%の2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン 2,4,6-三酸化物(0.1745mL、0.2932mmol)を加えた。反応混合物を5分にわたって室温に暖め、次いで、室温で3時間撹拌した。反応混合物をEtOAc(50mL)と0.5MのNa2CO3(20mL)との間で分配し、有機成分を分離し、有機層を水およびブライン(各10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。DCM中の5~10%MeOH+0.5%NH4OHでのシリカゲルクロマトグラフィーにより粗生成物を得、これを逆相、Gilson、水中5~95%のMeCN+0.1%TFAで精製した。目的の画分を合わせ、2MのNa2CO3で塩基化し、DCM(3*20mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。固体残留物をDCM(3mL)に溶解し、濾過し、留去して、所望の標記化合物(実施例459、40mg、33%)を無色固体として得た。ESI+APCI MS m/z 623.3[M+H]+。
実施例460
2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-モルホリノブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、500mg、989μmol、1.0当量)、Pd2(dba)3(181mg、198μmol、0.20当量)、キサントホス(172mg、297μmol、0.30当量)、およびCs2CO3(967mg、2.97mmol、3.0当量)のトルエン(5.0mL)中溶液に、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(中間体69、284mg、1.29mmol、1.30当量)を加えた。混合物を90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10.0mL)に加え、酢酸エチル(10.0mL×4)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(C18、ギ酸中0.1%、0~70%アセトニトリル)により精製して、生成物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、619μmol、63%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(700mg、1.08mmol、1.0当量)およびNH3・MeOH(20.0mL、30%純度)のメタノール(20.0mL)中溶液にPd/C(200mg、10%純度)を加えた。混合物を窒素により3回パージした。次いで、混合物を水素雰囲気下、25℃で1時間撹拌した(15Psi)。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトを通して濾過し、濾過ケーキをテトラヒドロフラン(20.0mL)で洗浄した。母液を集め、真空下で濃縮して、生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(500mg、977μmol、90%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.70(d,J=8.0Hz,1H),7.64(dd,J=3.2,7.2Hz,1H),7.43-7.37(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.19(m,2H),4.43-4.33(m,1H),4.22(dd,J=6.8,18.0Hz,1H),4.17-4.08(m,1H),4.07-3.89(m,1H),3.89-3.70(m,2H),3.52-3.45(m,2H),3.38-3.20(m,1H),3.19-3.04(m,4H),3.03-2.94(m,2H),2.93-2.82(m,4H),2.70-2.60(m,1H),2.60-2.49(m,3H),2.47(d,J=2.4Hz,3H),2.31-2.22(m,1H),2.11-2.00(m,1H),1.88-1.76(m,3H)。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(250mg、489μmol、1.0当量)およびピリジン(309mg、3.91mmol、316μL、8.0当量)のジクロロメタン(4.0mL)中溶液に(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(359mg、1.95mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(330mg、粗製)を黄色油として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:658。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-モルホリノブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、粗製)およびK2CO3(630mg、4.55mmol、10.0当量)のジクロロメタン(2.0mL)中溶液に、モルホリン(238mg、2.73mmol、241μL、6.0当量)を加えた。混合物を0℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10.0mL)に加え、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-モルホリノブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例460、48.2mg、72.5μmol、16%収率)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:665。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.70(br d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.4Hz,1H),7.41(dd,J=7.6(15.2Hzの1H)),7.35(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),7.02-6.91(m,1H),6.55-6.39(m,1H),5.23-4.47(m,1H),4.40-4.33(m,1H),4.31-4.19(m,1H),4.19-4.09(m,2H),4.07-3.83(m,2H),3.81-3.64(m,5H),3.59-3.40(m,2H),3.24-3.13(m,4H),3.12-2.94(m,3H),2.92(s,3H),2.86-2.76(m,1H),2.75-2.54(m,3H),2.50(br s,4H),2.48-2.45(m,3H),2.33-2.22(m,1H),2.10-2.00(m,1H),1.87-1.71(m,3H)。
実施例461
2-[(2R)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 2,4-ジクロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3g、9.86mmol、1当量)のDMAc(60mL)中溶液に、DIEA(3.82g、29.6mmol、5.15mL、3当量)および2-ピペラジン-2-イルアセトニトリル(中間体62、2.15g、10.9mmol、1.1当量、2HCl)を0℃で加えた。混合物を25℃で1.5時間撹拌した。次いで、DIEA(2.55g、19.7mmol、3.43mL、2当量)およびベンジルクロロホルメート(2.52g、14.8mmol、2.10mL、1.5当量)を溶液に0℃で加えた。混合物を25℃でさらに2.5時間撹拌した。反応混合物にH2O(40mL)および酢酸エチルは(100mL)を加えた。分離した有機相を5%のクエン酸水溶液(40mL×1)、飽和Na2CO3水溶液(40mL×1)、およびブライン(40mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過した。濾液を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をメチルtert-ブチルエーテル(25mL)でトリチュレートし、純粋な生成物を得た。tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(4.10g、7.62mmol、79%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:527。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.43-7.29(m,5H),5.17(s,2H),4.71-4.55(m,2H),4.48-4.37(m,1H),4.21-3.97(m,2H),3.92-3.67(m,2H),3.40-3.20(m,3H),3.09(dt,J=3.6,12.4Hz,1H),2.88-2.57(m,4H),1.47(s,9H)。
SFC条件(40935):カラム:Chiralcel OD-3 50×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分、波長:220nm。
ステップB:tert-ブチル 4-[(3R)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.20g、4.17mmol、1当量)をSFC(カラム:OD(250mm*30mm、10μm);移動相:[0.1%NH3H2O MeOH];B%:40%~40%、3.1分:180分)により分離した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、tert-ブチル 4-[(3R)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(940mg、1.78mmol、43%収率、99.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:527。
SFC条件:カラム:Chiralcel OD-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%のDEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
ステップC:tert-ブチル 4-[(3R)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3R)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(290mg、550μmol、1当量)、[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(127mg、1.10mmol、131μL、2当量)、Pd2(dba)3(60.5mg、66.0μmol、0.12当量)、RuPhos(51.4mg、110μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(448mg、1.38mmol、2.5当量)のトルエン(20mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で7時間撹拌した。反応混合物に、H2O(25mL×1)および酢酸エチル(25mL×2)を加えた。分離した有機相をブライン(100mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、次いで、濾過した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を酢酸エチル(50mL)で希釈し、HCl水溶液(1モル/L)でpH=3~4に酸性化した。分離した水層に酢酸エチル(60mL)を加え、飽和Na2CO3水溶液でpH=8~9に塩基化した。有機相を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。tert-ブチル 4-[(3R)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(225mg、0.36mmol、66%収率、97.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:606。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.47-7.30(m,5H),5.19(s,2H),4.73-4.52(m,2H),4.44-4.26(m,2H),4.22-4.14(m,1H),4.03-3.74(m,3H),3.41-3.21(m,3H),3.08(br t,J=7.6Hz,1H),2.97(dt,J=3.6,12.4Hz,1H),2.89-2.53(m,5H),2.46(s,3H),2.38-2.10(m,2H),2.08-2.03(m,1H),1.89-1.65(m,3H),1.48(s,9H)。
SFC条件:カラム:Chiralpak AD-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm。
ステップD:ベンジル(2R)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3R)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(620mg、1.02mmol、1当量)のジオキサン(12mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、12.4mL、48.5当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。液体をデカントし、残留物を真空下で濃縮した。ベンジル(2R)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(470mg、粗製、HCl)を黄色油として得、DCM(10mL)中に溶解した。混合物を飽和炭酸ナトリウム水溶液でpH=9に塩基化した有機相を分離し、ブライン(5mL×1)で洗浄し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得、これはさらに精製しなくても十分に純粋であった。ベンジル(2R)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、718μmol、77%収率、90.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:506。
ステップE:ベンジル(2R)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2R)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、415μmol、1当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(中間体69、119mg、540μmol、1.3当量)Pd2(dba)3(76.1mg、83.1μmol、0.2当量)、Cs2CO3(406mg、1.25mmol、3当量)、およびキサントホス(72.1mg、125μmol、0.3当量)のトルエン(7mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で8時間撹拌した。H2O(20mL×1)を反応混合物に加え、混合物を酢酸エチル(20mL×2)で抽出した。抽出物を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を酢酸エチル(50mL)で希釈し、HCl水溶液(1モル/L)でpH=3~4に酸性化した。水層に酢酸エチル(60mL)を加え、飽和Na2CO3水溶液でpH=8~9に塩基化した。有機相を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール50/1~5/1)により精製した。ベンジル(2R)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(86mg、0.128mmol、31%収率、96.0純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
ステップE:2-[(2R)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2R)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、201μmol、1当量)のMeOH(15mL)中溶液に、Pd/C(25mg、15.5μmol、10%純度)およびNH3・MeOH(15.5μmol、15mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と、H2によるパージを数回繰り返した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。触媒をセライトパッドを通して濾過して取り除いた。濾液を真空下で濃縮した。2-[(2R)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、0.183mmol、91%収率、93.5%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップF:2-[(2R)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2R)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、195μmol、1当量)およびTEA(198mg、1.95mmol、272μL、10当量)のDCM(10mL)中混合物に、プロパ-2-エノイルクロリド(17.7mg、195μmol、15.9μL、1当量)を少しずつ加えた。-40℃で30分間撹拌した後、混合物をMeOH(2mL)でクエンチし、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、ジクロロメタン/メタノール=10/1~10/1)により精製した。残留物は、分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~45%、7.8分)および(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:57%~87%、12分)により精製した。目的の画分を減圧下で濃縮してアセトニトリルを除去し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2R)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例461、17.6mg、31.0μmol、16%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:566。
SFC条件:「カラム:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm」。
1H NMR(400MのHz,クロロホルム-d)δ=7.77-7.63(m,2H),7.48-7.32(m,2H),7.31-7.18(m,2H),6.61(br s,1H),6.48-6.37(m,1H),5.85(br d,J=10.0Hz,1H),5.27-4.49(m,1H),4.45-4.33(m,1H),4.33-4.06(m,4H),4.05-3.62(m,3H),3.61-3.34(m,2H),3.33-2.99(m,5H),2.94(s,3H),2.88-2.77(m,1H),2.75-2.57(m,2H),2.54-2.44(m,3H),2.30(br d,J=7.2Hz,1H),2.15-1.95(m,1H),1.95-1.79(m,3H)。
実施例462
2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.27mmol、1当量)、4-ブロモ-5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(511mg、1.65mmol、1.3当量)、RuPhos(237mg、509μmol、0.4当量)、Cs2CO3(1.04g、3.18mmol、2.5当量)、およびPd2(dba)3(233mg、254μmol、0.2当量)のトルエン(20mL)中混合物を脱気し、次いで、N2下、90℃まで8時間加熱した。加熱が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3飽和水溶液で中和した。混合物を真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×50mL)で抽出した。有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(365mg、469μmol、37%収率、90%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:700。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.99(s,1H),7.22(s,1H),5.66(dd,J=2.8,9.6Hz,1H),4.61(br s,1H),4.40(br dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.26(br s,2H),4.09-3.97(m,3H),3.90(br d,J=11.6Hz,1H),3.80-3.71(m,1H),3.50(br t,J=4.8Hz,2H),3.25(br s,2H),3.09(br t,J=7.6Hz,1H),2.99(br t,J=11.2Hz,1H),2.83-2.51(m,6H),2.48(s,3H),2.43(s,3H),2.33(s,3H),2.31-2.24(m,1H),2.21-2.13(m,1H),2.11-2.06(m,1H),1.90-1.69(m,8H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(720mg、1.03mmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(4.62g、40.5mmol、3mL、39.4当量)を加えた。混合物を20℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をDCM(10mL)で希釈し、NaHCO3飽和水溶液で中和した。次いで、水相をEtOAc(2×30mL)で抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(880mg、粗製)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:516。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)およびTEA(177mg、1.75mmol、243μL)のDCM(4mL)中溶液に、プロパ-2-エノイルクロリド(13.2mg、145μmol、11.9μL)を-40℃で滴加した。-40℃で30分間撹拌後、混合物をNaHCO3飽和水溶液(1mL)でクエンチし、DCM(2×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 1/0~10/1)に続く、分取HPLC(カラム:Gemini 200*30 10μ;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:40%~70%、6.0分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である(2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-プロパ-2-エノイル-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例462、15.6mg、27.2μmol、2ステップ15%収率、99.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.26(br s,1H),8.03(s,1H),7.14(s,1H),6.57(br d,J=9.6Hz,1H),6.39(dd,J=1.2,16.4Hz,1H),5.83(br d,J=10.4Hz,1H),5.12-4.38(m,2H),4.28(s,2H),4.23-3.84(m,4H),3.73-3.40(m,3H),3.32(br s,1H),3.10(br t,J=7.6Hz,2H),2.98-2.61(m,5H),2.48(s,3H),2.41(s,3H),2.34(s,3H),2.32-2.24(m,1H),2.11-1.99(m,1H),1.91-1.78(m,3H)。
実施例463
(S,E)-3-((4-(3-(シアノメチル)-4-(4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパンアミド
ステップA:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート塩酸塩(10g、34mmol)をDMA(68ml、34mmol)に溶解した。次に、この溶液に、tert-ブチル 2,4-ジクロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(9.3g、30mmol)を加え、続いて、ヒューニッヒ塩基(24ml、135mmol)を加え、反応物を室温にて1時間撹拌した。次に、反応物を塩基性水中に注ぎ込み、MTBEで抽出した。有機成分をさらなる水、ブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。次いで、濃縮物を、10→70%のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してクロマトグラフ処理して、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(12g、67%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 580.3[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(1.5g、2.8mmol)をDCM(28ml、2.8mmol)に溶解し、塩酸溶液(1,4-ジオキサン中4.0M)(3.6ml、14mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。有機成分を1MのNaOHで洗浄した。水層をDCM(2×)で抽出した。合わせた有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮し、粗製のベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.2g、99%収率)として次のステップに使用した。ESI+APCI MS m/z 427.2[M+H]+。
ステップC:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(0.51g、0.56mmol)およびキサントホス(0.54g、1.1mmol)を1,4-ジオキサン(28ml、2.8mmol)に溶解し、アルゴン下で5分間パージし、続いて、アルゴン下、100℃で15分間撹拌した。次に反応物を室温に冷却した。反応物に、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.2g、2.8mmol)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(1.9g、8.4mmol)、および炭酸セシウム(2.7g、8.4mmol)をアルゴン下で加えた。反応物をアルゴン下でキャッピングし、100℃で一晩撹拌した。反応物を室温に冷却し、GF/F濾紙で濾過した。濾液を減圧下で濃縮し、0%→75%のヘキサン/EtOAcを溶出液として使用したCombiFlash上での順相クロマトグラフィーにより精製して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.45g、28%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 567.2[M+H]+。
ステップD:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(3-(ジメチルアミノ)-3-オキソプロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,4-ジヒドロピラジン-1(2H)-カルボキシレート:マイクロ波チューブで、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、0.441mmol)のジオキサン(4408μl、0.441mmol)中溶液をアルゴンにより5分間スパージした。3-ヒドロキシ-N,N-ジメチルプロパンアミド(155mg、1.32mmol)、炭酸セシウム(431mg、1.32mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(37.5mg、0.0441mmol)をアルゴン下で順次加え、反応物をアルゴンでさらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で1時間加熱した。反応物を室温まで冷却し、酢酸エチルを加えた。反応物をGF/F濾紙を通して濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、0→20%MeOH+2%NH4OH/DCMにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。不純物を含まない目的の生成物を含有する全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(3-(ジメチルアミノ)-3-オキソプロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-3,4-ジヒドロピラジン-1(2H)-カルボキシレート(140mg、49.2%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 648.3[M+H]+。
ステップE:(S)-3-((4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパンアミド:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(3-(ジメチルアミノ)-3-オキソプロポキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、0.216mmol)のEtOH(2161μl、0.216mmol)およびTHF(2161μl、0.216mmol)中溶液を、N2により5分間パージした。この溶液に、パラジウム(57.5mg、0.0540mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、反応物をキャッピングし、N2によりさらに5分間パージした。溶液をH2雰囲気下で一晩撹拌した。混合物をMeOHで希釈し、充填セライト通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、粗製の(S)-3-((4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパンアミド(111mg、100.0%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 514.3[M+H]+。
ステップF:(S,E)-3-((4-(3-(シアノメチル)-4-(4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパンアミド:0℃まで冷却したジクロロメタン(2161μl、0.216mmol)を含む25mLの丸底フラスコに、(S)-3-((4-(3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパンアミド(111mg、0.216mmol)およびヒューニッヒ塩基(226μl、1.30mmol)を加えた。(E)-4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エン酸(167mg、1.30mmol)を1度に加えると共に、反応混合物を強く撹拌した。次に、1-プロパンホスホン酸環状無水物(772μl、1.30mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を0℃で2時間撹拌した。反応物を塩基性水で処理し、水層をEtOAc(3×)で抽出した。合わせた有機成分を減圧下で濃縮し、5→95%ACN+0.1%TFA/水+0.1%TFAにより溶出するGilson(分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、1MのNaOHで希釈し、水層をDCMで抽出した。有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である(S,E)-3-((4-(3-(シアノメチル)-4-(4-(ジメチルアミノ)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)-N,N-ジメチルプロパンアミド(17.6mg、13.0%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 625.4[M+H]+。
実施例464
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.396mmol)、Cs2CO3(644mg、1.98mmol)、1,8-ジブロモナフタレン(339mg、1.19mmol)、Pd2(dba)3(72.4mg、0.0791mmol)、およびキサントホス(91.6mg、0.158mmol)を、トルエン(1582μl、0.396mmol)で希釈した。反応物をアルゴンによりパージし、密閉し、100℃まで加熱した。23時間撹拌後、反応物を冷却し、酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を1~10%のメタノール/DCM(添加剤としての1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、ベンジル(S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(68mg、24.2%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 712.2[M+H]+。
ステップB:2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(25mg、0.035mmol)を、TFA(2mL)で希釈し、窒素下に置き、90℃まで加熱した。2時間撹拌後、反応物を冷却し、濃縮した。物質をDCMで希釈し、飽和重炭酸ナトリウムで洗浄した。DCMをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を10%のメタノール/DCM(添加剤としての1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8mg、39%収率)を得た。ESI-APCI MS m/z 578.2[M+H]+。
ステップC:2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8mg、0.014mmol)をDCM(200μL)で希釈し、続いて、塩化アクリロイル(1.4mg、0.015mmol)およびDIEA(4.8μl、0.028mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を飽和炭酸ナトリウムで希釈し、DCMで2回抽出した。DCMをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を10%のメタノール/DCM(添加剤としての1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例464、6mg、69%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 632.2[M+H]+。
実施例465
(R)-4-アクリロイル-1-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-カルボニトリル
ステップA:ベンジル(R)-4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-2-シアノピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル 2,4-ジクロロ-5,6-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(8H)-カルボキシレート(700mg、2.07mmol)、R-1-N-Boc-3-シアノピペラジン(656mg、3.10mmol)、N,N-ジメチルアセトアミド(1ml)、およびN-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.433ml、2.48mmol)の混合物を、窒素雰囲気下、60℃で48時間撹拌した。反応混合物を冷却し、MTBE(50mL)と0.2MのNa2CO3(15mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各10mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、減圧下で留去した。MTBE(5mL)での希釈により物質が結晶化した。母液をデカントし、固体をMTBE(2*1mL)で洗浄し、続いて、40~60%のEtOAc/ヘキサンを溶出液として使用してシリカゲル上で精製して、生成物(308mg、29%)を得た。ESI+APCI MS m/z 513.2[M+H]+。
ステップB:ベンジル 4-((R)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-2-シアノピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:ベンジル(R)-4-(4-(tert-ブトキシカルボニル)-2-シアノピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(308mg、0.600mmol)、Cs2CO3(587mg、1.80mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G4、51.1mg、0.0600mmol)、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(346mg、3.00mmol)、および1,4-ジオキサン(4ml)の混合物をN2によりパージし、バイアルをキャッピングし、反応物を70℃で2時間撹拌した。反応混合物を、水(5mL)とEtOAc(20mL)との間で分配し、有機層を分離した。有機成分を水およびブライン(各3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%MeOH+0.4%NH4OH/DCMを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、異性体混合物(約60%純度の214mg、36%)として生成物を得た。ESI+APCI MS m/z 592.3[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル(R)-3-シアノ-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:粗製のベンジル 4-((R)-4-(tert-ブトキシカルボニル)-2-シアノピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(214mg、0.362mmol)、メタノール(7ml、0.362mmol)、およびパラジウム炭素(20mg、5%、デグサタイプ E101 NO/W)の混合物を、脱気し、水素雰囲気下で1.5時間撹拌した。反応混合物をセライトを通して濾過し(2mL)、セライトをMeOH(3*3mL)で洗浄し、合わせた有機成分を減圧下で留去して、生成物を得、これを粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 458.3[M+H]+。
ステップD:tert-ブチル(R)-3-シアノ-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(R)-3-シアノ-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(165mg、0.361mmol)、Cs2CO3(352mg、1.08mmol)、ジオキサン(0.5mL)、1-ヨードナフタレン(0.0790ml、0.541mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(RuPhos-Pd-G4、0.1当量、30.7mg、0.0361mmol)の混合物を窒素によりパージし、フラスコをキャッピングし、70℃で1.5時間撹拌した。反応混合物を冷却し、EtOAc(20mL)と水(5mL)との間で分配し、層を分離した。有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%MeOH+0.4%NH4OH/DCMを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、生成物(120mg、57%)を得た。ESI+APCI MS m/z 584.3[M+H]+。
ステップE:(R)-1-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-カルボニトリル:(tert-ブチル(R)-3-シアノ-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(120mg、0.206mmol)をジクロロメタン(0.5ml)に溶解し、0℃まで冷却し、続いて、4Mの塩化水素(1.03ml、4.11mmol)を加え、反応物を室温に暖めながら1時間撹拌した。混合物を減圧下で留去し、残留物をDCM(10mL)と2MのNa2CO3(0.5mL)との間で分配し、層を分離した。有機成分をNa2CO3上で乾燥し、濾過し、減圧下で留去した。物質を粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 484.2[M+H]+。
ステップF:(R)-4-アクリロイル-1-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-カルボニトリル:(R)-1-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-カルボニトリル(79mg、0.1634mmol)のDCM(5mL)中溶液を撹拌しながら-30℃まで冷却し、続いて、トリエチルアミン(68.31μl、0.4901mmol)および塩化アクリロイル(26.54μl、0.3267mmol)を加えた。-30℃で5分後、MeOH(0.05mL)を加えることによって反応物をクエンチし、反応物を室温に暖めた。次に、有機成分を分離し、0.5MのNa2CO3(4mL)で洗浄し、Na2CO3上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、4%MeOH+0.4%NH4OH/DCMを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例465、17mg、19%)を得た。ESI+APCI MS m/z 538.3[M+H]+。
実施例466
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:標記化合物を、実施例454に従って、ステップAで、tert-ブチル 4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりに中間体66を使用して調製する。
実施例467
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:標記化合物を、実施例447に従って、実施例447のステップAで、実施例447のステップAのベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。
実施例468
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:標記化合物を、実施例447に従って、実施例447のステップAで、実施例447のステップAのベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートの代わりにベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して調製した。
実施例469
(S)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(S)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:標記化合物を、実施例457に従って、中間体66のステップEの調製で、[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノールの代わりに実施例139のステップBの生成物である2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)エタノールを使用し、次いで、実施例457のステップB~Dに従って調製した。
実施例470
(S)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン
(S)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパ-2-エン-1-オン:標記化合物を、実施例453に従って、中間体66のステップEの調製で、[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノールの代わりに実施例139のステップBの生成物である2-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)エタノールを使用し、次いで、実施例453のステップB~Cに従って調製した。
実施例471
2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド。(E)-4-ブロモブタ-2-エン酸(500mg、3.03mmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、(COCl)2(4.35g、34.3mmol、3.0mL、11.3当量)を加えた。混合物を60℃で12時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物である(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(500mg、粗製)を褐色油として得た。
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.30g、2.17mmol、1.0当量)および[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(500mg、4.34mmol、515μL、2.0当量)のトルエン(20.0mL)中溶液に、t-BuONa(417mg、4.34mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で10分間撹拌した。20℃で飽和ブライン(30.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、EA(3×30.0mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→EA/MeOH=10/1)により精製した。生成物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.1g、1.62mmol、収率75%、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:650。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、154μmol、1.00当量)のジオキサン(0.5mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、1.00mL、26.0当量)を加えた。混合物を0℃で10分間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮してジオキサンを除去した。残留物を飽和NaHCO3水溶液(10.0mL)で希釈し、EA(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。粗生成物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90.0mg、粗製)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:550。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80.0mg、145μmol、1.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、Py(115mg、1.45mmol、117μL、10.0当量)およびDCM(3.0mL)中の(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(107mg、582μmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。出発材料が消費された後、次いで、3,3-ジフルオロピロリジン(156mg、1.45mmol、10.0当量)のDCM(6.0mL)中溶液を反応混合物に加えた。混合物を0℃で2時間に撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:62%→92%、12分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-[3-クロロ-2-(トリフルオロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例471、15.4mg、20.8μmol、14%収率、97.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:723。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40(t,J=8.2Hz,1H),7.30-7.26(m,1H),7.19(d,J=8.0Hz,1H),7.05-6.90(m,1H),6.60-6.40(m,1H),5.08(br s,1H),4.39(br dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.17(br dd,J=6.8,10.8Hz,1H),4.1(br s,2H),4.12-4.05(m,1H),3.97(br d,J=10.8Hz,2H),3.70-3.53(m,1H),3.35-3.25(m,3H),3.17-3.07(m,2H),2.96(br t,J=13.2Hz,3H),2.90-2.85(m,1H),2.81(br t,J=6.8Hz,3H),2.75-2.65(m,2H),2.50(s,3H),2.40-2.27(m,3H),2.15-1.95(m,1H),1.95-1.72(m,5H)。
実施例472
2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
2-クロロプロパ-2-エノイルクロリド。2-フルオロプロパ-2-エン酸(400mg、4.44mmol、1.0当量)のDCM(1.50mL)中溶液に、(COCl)2(846mg、6.66mmol、583μL、1.50当量)およびDMF(32.5mg、444μmol、34.2μL、0.10当量)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。2-クロロプロパ-2-エノイルクロリド(400mg、粗製)を次のステップに直接使用した。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル (2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、347μmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、TFA(3.08g、27.0mmol、2.0mL、77.8当量)を加えた。混合物を20℃で10分間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。生成物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、粗製、TFA)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、339μmol、1.0当量、TFA)のDCM(2.0mL)中溶液に、DIEA(1.11g、8.61mmol、1.50mL、25.4当量)およびDCM(2.0mL)中の2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリド(200mg、1.84mmol、5.43当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%→83%、12分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例472、120mg、217μmol、2ステップで62%収率、98.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:548。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.11(t,J=7.8Hz,1H),7.01-6.91(m,2H),5.52-5.32(m,1H),5.26(dd,J=3.2,16.8Hz,1H),5.08-4.70(br s,1H),4.39(dd,J=5.2,10.4Hz,1H),4.25-4.02(m,5H),3.97(d,J=12.8Hz,1H),3.43-3.73(br s,1H)3.32(d,J=13.2Hz,1H),3.25-3.16(m,1H),3.15-3.02(m,3H),3.01-2.91(m,1H),2.90-2.80(m,2H)2.79-2.60(m,2H),2.49(s,3H),2.31-2.28(m,7H),2.13-1.97(m,1H),1.90-1.70(m,3H)。
実施例473
2-[(2S)-1-(2-クロロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
2-クロロアクリロイルクロリド。2-クロロプロパ-2-エン酸(400mg、3.76mmol、1.0当量)および(COCl)2(715mg、5.63mmol、493μL、1.50当量)のDCM(1.0mL)中溶液を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を分離せずに、次のステップに直接使用した。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体73、400mg、695μmol、1.0当量)のDCM(0.50mL)中溶液に、TFA(3.08g、27.0mmol、2.0mL、38.9当量)を加えた。混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濃縮し、飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、次いで、DCM(5.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(400mg、粗製)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップB:2-[(2S)-1-(2-クロロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、631μmol、1.0当量)およびDIEA(245mg、1.89mmol、330μL、3.0当量)のDCM(1.0mL)中溶液に、2-クロロプロパ-2-エノイルクロリド(236mg、1.89mmol、3.0当量)を-78℃で加えた。混合物を-78℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NaHCO3水溶液(2.0mL)に加え、EA(10.0mL×3)で抽出した。得られた生成物を、分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:53%~83%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-クロロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例473、4.72mg、8.35μmol、2ステップで1%収率、99.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:564。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.11(t,J=7.8Hz,1H),6.98-6.94(m,2H),5.86-5.78(m,1H),5.77-5.72(m,1H),5.15-4.78(m,1H),4.45-4.30(m,1H),4.21-4.12(m,1H),4.10-4.03(m,3H),3.96(br d,J=12.4Hz,2H),3.30(br dd,J=3.2,13.6Hz,1H),3.23-3.04(m,4H),3.04-2.54(m,6H),2.50(br s,3H),2.34-2.23(m,7H),2.12-2.02(m,1H),1.91-1.66(m,3H)。
実施例474
2-((S)-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体65、1g、1.58mmol、1当量)および1-ブロモナフタレン(655mg、3.16mmol、440μL、2当量)のトルエン(20mL)中混合物に、Pd2(dba)3(145mg、158μmol、0.1当量)、RuPhos(148mg、316μmol、0.2当量)、Cs2CO3(1.55g、4.75mmol、3当量)を1度に加えた。混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、90℃まで加熱し、2時間撹拌した。反応混合物を水(15mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(50mL×1)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%TFA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液(6mL)で中和し、酢酸エチル(100mLの×2)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(515mg、726μmol、45.9%収率、89.1%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:632。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1g、1.58mmol、1当量)のMeOH(60mL)中溶液に、Pd/C(500mg、10%純度)およびNH3・MeOH(20%、50mL)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを3回繰り返した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮した。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(680mg、1.26mmol、80%収率、92.3%純度)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:498。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.26-8.19(m,1H),7.89-7.83(m,1H),7.60(d,J=8.4Hz,1H),7.53-7.47(m,2H),7.43(t,J=7.6Hz,1H),7.16-7.12(m,1H),4.41(dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.26(s,2H),4.16(dd,J=7.2,10.8Hz,1H),4.01(br d,J=12.4Hz,1H),3.95-3.82(m,1H),3.44-3.21(m,3H),3.18-2.97(m,4H),2.95-2.76(m,3H),2.74-2.63(m,1H),2.55(dd,J=1.2,5.6Hz,2H),2.51-2.46(m,3H),2.33-2.22(m,1H),2.12-1.99(m,1H),1.88-1.80(m,3H)。
ステップC:2-[(2S)-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。4-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシブタ-2-イン酸(172mg、803μmol、2当量)およびDIEA(155mg、1.21mmol、210μL、3当量)のMeCN(5mL)中溶液に、MsCl(92.1mg、803μmol、62.2μL、2当量)を0℃で加えた。0℃で20分間撹拌した後、混合物に、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、402μmol、1当量)を加え、混合物を25℃で2時間撹拌した。次いで、反応混合物を80℃まで加熱し、10時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~45%、10分)により精製し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)によりさらに精製した。標記化合物である2-[(2S)-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例474、1.43mg、2.39μmol、1%収率、96.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:580。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.22(d,J=6.8Hz,1H),7.90-7.82(m,1H),7.61(d,J=8.4Hz,1H),7.55-7.47(m,2H),7.44(t,J=7.6Hz,1H),7.15(d,J=7.2Hz,1H),5.26-4.89(m,1H),4.60-4.34(m,4H),4.33-4.16(m,3H),4.14-3.96(m,1H),3.95-3.80(m,1H),3.78-3.50(m,2H),3.50-3.28(m,2H),3.27-3.07(m,3H),3.06-2.82(m,3H),2.80-2.64(m,2H),2.51(d,J=12.4Hz,3H),2.38-2.24(m,1H),2.14-2.00(m,1H),1.97-1.85(m,2H)。
実施例475
2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2,3,3-トリジュウテリオプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2,3,3-トリジュウテリオプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ジュウテリオ 2,3,3-トリジュウテリオプロパ-2-エノエート(68.8mg、904μmol、3当量)およびDIEA(234mg、1.81mmol、315μL、6当量)のMeCN(3mL)中溶液に、MsCl(69.1mg、603μmol、46.7μL、2当量)を5℃で0.5時間かけて加えた。得られた反応物に、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、301μmol、1当量)を加えた。反応混合物を5℃で1時間撹拌した。次いで、反応混合物を80℃まで12時間加熱した。撹拌が完了したら、反応混合物を水でクエンチした(0.5mL)。残留物混合物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2,3,3-トリジュウテリオプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例475、34.2mg、60.2μmol、20%収率、97.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:555。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.28-8.16(m,1H),7.91-7.83(m,1H),7.63(d,J=8.0Hz,1H),7.56-7.48(m,2H),7.45(t,J=7.6Hz,1H),7.16(d,J=7.2Hz,1H),5.28-4.94(m,1H),4.41(dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.36-4.24(m,2H),4.23-4.11(m,2H),4.04(br d,J=11.6Hz,2H),3.73-3.25(m,3H),3.22-2.74(m,7H),2.69(td,J=6.4,13.2Hz,1H),2.50(s,3H),2.36-2.24(m,1H),2.15-2.02(m,1H),1.83-1.77(m,3H)。
実施例476
2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド。(E)-4-ブロモブタ-2-エン酸(1.0g、6.06mmol、1.0当量)の(COCl)2(14.5g、114mmol、10.0mL、18.9当量)およびDCM(10.0mL)中溶液を70℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。生成物(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(1.0g、粗製)を黄色油として得た。粗製化合物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(中間体73、200mg、347μmol、1.0当量)のジオキサン(2.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4.0M、2.0mL、23.0当量)を加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、EA(5.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。生成物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(160mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(160mg、336μmol、1.0当量)のDCM(6.0mL)中溶液に、Py(532mg、6.73mmol、543μL、20.0当量)およびDCM(2.0mL)中の(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(246mg、1.35mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、0℃でMeOH(5.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、減圧下で濃縮して残留物を得た。生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、粗製)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:622。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、321μmol、1.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、K2CO3(88.8mg、642μmol、2.0当量)、KI(2.67mg、16.1μmol、0.05当量)、および3-フルオロピロリジン(403mg、3.21mmol、10.0当量、HCl塩)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を、飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、EA(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.04%NH3H2O)-ACN];B%:60%~84%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮し、次いで、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例476、123mg、193μmol、3ステップで56%収率、99.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:631。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.16-7.07(m,1H),7.02-6.92(m,3H),6.59-6.41(m,1H),5.31-5.10(m,1H),5.09-4.46(m,1H),4.38(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.26-3.83(m,6H),3.80-3.45(m,1H),3.42-3.24(m,3H),3.23-3.15(m,1H),3.14-3.03(m,3H),3.02-2.83(m,4H),2.82-2.62(m,4H),2.54-2.49(m,1H),2.47(s,3H),2.32-2.26(m,6H),2.25-2.17(m,1H),2.16-2.09(m,1H),2.08-2.02(m,1H),1.92-1.78(m,4H)。
実施例477
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2,3,3-トリジュウテリオプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2,3,3-トリジュウテリオプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ジュウテリオ 2,3,3-トリジュウテリオプロパ-2-エノエート(56.6mg、744μmol、3当量)およびDIEA(481mg、3.72mmol、648μL、15当量)のACN(3mL)中溶液に、MsCl(56.8mg、496μmol、38.4μL、2当量)を5℃で加え、混合物を5℃で0.5時間撹拌した。次いで、混合物に、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、150mg、248μmol、1当量、2HCl)を加え、得られた混合物を5℃で1時間撹拌した。次いで、混合物を80℃まで加熱し、80℃で12時間撹拌した。混合物を水(0.5mL)でクエンチした。反応混合物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%→80%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2,3,3-トリジュウテリオプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例477、13.0mg、21.6μmol、9%収率、98.2%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:589。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(br d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.45(td,J=8.0,13.2Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),5.10(br s,1H),4.49-4.33(m,2H),4.21-4.01(m,3H),3.96-3.79(m,2H),3.60(br d,J=6.8Hz,1H),3.44(br d,J=13.6Hz,1H),3.32-2.97(m,5H),2.88-2.53(m,4H),2.48(d,J=2.8Hz,3H),2.29(br d,J=8.8Hz,1H),2.11-2.00(m,1H),1.87-1.71(m,3H)。
実施例478
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリド。2-フルオロプロパ-2-エン酸(400mg、4.44mmol、1当量)のDCM(4mL)中溶液に、(COCl)2(846mg、6.66mmol、583μL、1.5当量)およびDMF(32.5mg、444μmol、34.2μL、0.1当量)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒の一部を除去し、DCM中の残留物を得た。化合物である2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリド(400mg、粗製)を黄色の液体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、528μmol、1当量、HCl)のDCM(5mL)中溶液に、DIEA(1.73g、13.4mmol、2.33mL、25.4当量)およびDCM(5mL)中の2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリド(286mg、2.64mmol、5当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、ジクロロメタン/メタノール=10/1~10/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%~50%、10.5分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例478、24.1mg、36.7μmol、7%収率、99.1%純度、FA)を褐色固体として得た。
SFC条件:「AD-3S_3_5_40_3MLカラム:Chiralpak AD-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,酢酸)δ=7.82(d,J=8.0Hz,1H),7.69(d,J=8.0Hz,1H),7.56(d,J=7.6Hz,1H),7.49(t,J=7.6Hz,1H),7.41-7.30(m,2H),5.58-5.25(m,2H),5.17-4.59(m,4H),4.57-4.28(m,3H),4.24-3.78(m,4H),3.67-3.13(m,7H),3.08(br d,J=2.4Hz,3H),2.98(br d,J=6.4Hz,1H),2.83-2.61(m,1H),2.45-2.29(m,1H),2.24-2.08(m,3H)。
実施例479
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:エチル(E)-4-フルオロブタ-2-エノエート。エチル(E)-4-ブロモブタ-2-エノエート(2.00g、10.4mmol、1.43mL、1.00当量)およびAgF(3.94g、31.1mmol、674μL、3.00当量)のアセトニトリル(20.0mL)中混合物を、25℃で12時間撹拌した。混合物を濾過し、THF(10.0mL)で洗浄し、次いで、真空下で濃縮して、エチル(E)-4-フルオロブタ-2-エノエート(2.50g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.04-6.89(m,1H),6.12(qd,J=2.0,16.0Hz,1H),5.14-4.94(m,2H),4.22(q,J=6.8Hz,2H),1.30(t,J=6.8Hz,3H)。
ステップB:(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸。エチル(E)-4-フルオロブタ-2-エノエート(0.10g、粗製)およびNaOH(121mg、3.03mmol)のTHF(1.00mL)およびH2O(1.00mL)中混合物を、25℃で2時間撹拌した。pH値をHCl(1N、5.00mL)により1~3に調整し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(0.02g、192mmol、2ステップで46%)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.37-7.31(m,1H),7.15-7.01(m,1H),6.15(dd,J=1.6,16.0Hz,1H),5.22-4.96(m,2H)。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(7.32mg、70.4μmol、2当量)およびPy(8.35mg、106μmol、8.52μL、3.00当量)のアセトニトリル(1.00mL)中溶液に、MsCl(8.06mg、70.4μmol、5.45μL、2.00当量)を0℃で加えた。0℃で1時間撹拌した後、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.02g、35.2μmol、1.00当量、HCl)を混合物に加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(3×5.00mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例479、3.01mg、4.82μmol、14%収率、98.9%純度)を褐色固体として得。LCMS[ESI,M+1]:618。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(br d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.2Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.45(td,J=7.6,12.8Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.17(m,1H),7.09-6.91(m,1H),6.59(br d,J=15.6Hz,1H),5.19-5.05(m,2H),4.49-4.36(m,2H),4.22-3.79(m,5H),3.76-2.96(m,8H),2.92-2.55(m,4H),2.48(d,J=2.4Hz,3H),2.29(br d,J=9.6Hz,1H),2.06(br d,J=10.0Hz,1H),1.83-1.71(m,3H)。
実施例480
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド。(E)-4-ブロモブタ-2-エン酸(930mg、5.64mmol、1.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、(COCl)2(2.90g、22.9mmol、2.0mL、4.05当量)を加えた。混合物を60℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。生成物である(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(650mg、粗製)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップA:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、150mg、282μmol、1.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、Py(446mg、5.64mmol、455μL、20.0当量)およびDCM(1.0mL)中の(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(207mg、1.13mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)を褐色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:680。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、221μmol、1.0当量)のDCM(10.0mL)中溶液に、K2CO3(366mg、2.65mmol、12.0当量)、KI(1.83mg、11.0μmol、0.05当量)、および3-フルオロピロリジン(277mg、2.21mmol、10.0当量、HCl)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、EA(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.04%NH3・H2O)-ACN];B%:60%~84%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮し、次いで、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロピロリジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例480、9.67mg、14.0μmol、6%収率、99.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:687。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.8Hz,1H),7.26(br d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.17(m,1H),7.05-6.92(m,1H),6.57-6.42(m,1H),5.32-5.11(m,1H),5.10-4.50(m,1H),4.47-4.35(m,2H),4.19-4.00(m,2H),3.95-3.75(m,2H),3.65-3.55(m,1H),3.47-3.28(m,3H),3.24-3.05(m,4H),3.04-2.86(m,4H),2.85-2.71(m,2H),2.70-2.50(m,3H),2.47-2.45(m,3H),2.32-2.15(m,2H),2.14-2.02(m,2H),1.87-1.67(m,4H)。
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド。(E)-4-ブロモブタ-2-エン酸(1g、6.06mmol、1.0当量)のDCM(5.0mL)中溶液に、シュウ酸ジクロリド(7.25g、57.1mmol、5.0mL、9.4当量)を加えた。混合物を60℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(850mg、粗製)を黄色油として得た、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップA:中間体71、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(310mg、414μmol、1.0当量)のジオキサン(4.0mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4.0M、4.0mL、39.0当量)を25℃で加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、飽和NaHCO3水溶液(20.0mL)により反応混合物をクエンチし、次いで、EA(3×40.0mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和NaCl水溶液(100.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、残留物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(250mg、粗製)を黄色固体として得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:532。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、150mg、282μmol、1.0当量、粗製)のDCM(6.0mL)中溶液に、Py(446mg、5.6mmol、455μL、20.0当量)およびDCM(1.0mL)中の(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(207mg、1.2mmol、4.0当量、粗製)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。次いで、K2CO3(779mg、5.6mmol、20.0当量)、KI(4.6mg、28.2μmol、0.1当量)、および3-フルオロアゼチジン(472mg、4.2mmol、15.0当量、HCl)を0℃で加えた。次いで、混合物を25℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10.0mMのNH4HCO3)-ACN];B%:55%~85%、10分)および凍結乾燥により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例481、10.8mg、15.7μmol、6%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:673。
SFC条件:100%e.e.。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.77(d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=7.8Hz,1H),7.54(d,J=7.2Hz,1H),7.50-7.43(m,1H),7.35(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.21(m,1H),6.89(d,J=15.2Hz,1H),6.42(d,J=14.8Hz,1H),5.26-4.62(m,1H),5.11(t,J=5.2Hz,1H),4.80-4.37(m,2H),4.20-4.08(m,2H),3.92(br d,J=17.6Hz,1H),3.86-3.71(m,3H),3.60(s,1H),3.52-3.47(m,1H),3.45-3.33(m,1H),3.28-3.21(m,3H),3.16-3.11(m,3H),3.03(dd,J=8.4,16.8Hz,1H),2.82-2.60(m,4H),2.49(d,J=2.8Hz,3H),2.37-2.25(m,1H),2.09-2.03(m,1H),1.86-1.83(m,1H),1.78-1.76(m,3H)。
実施例482
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-[メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ]ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
挿入物:(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド。(E)-4-ブロモブタ-2-エン酸(600mg、3.64mmol、1.0当量)の(COCl)2(10.2g、80.0mmol、7.0mL、22.0当量)およびDCM(7.0mL)中溶液を70℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(500mg、粗製)を黄色油として得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップA:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、188μmol、1.0当量)およびピリジン(119mg、1.50mmol、121μL、8.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(138mg、752μmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(130mg、粗製)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:678、680。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-[メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ]ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(128mg、189μmol、1.0当量)、K2CO3(130mg、943μmol、5.0当量)、およびKI(9.39mg、56.6μmol、0.30当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、2,2,2-トリフルオロ-Nメチル-エタンアミン(213mg、1.88mmol、10.0当量)を少しずつ加えた。混合物を0~25℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。得られた生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.04%のNH3・H2O)-ACN];B%:70%~100%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-[メチル(2,2,2-トリフルオロエチル)アミノ]ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例482、2.87mg、3.84μmol、2%収率、95%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:711。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=7.6Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),6.95-6.79(m,1H),6.54-6.38(m,1H),5.12-4.50(m,1H),4.48-4.35(m,2H),4.24-3.99(m,3H),3.96-3.78(m,2H),3.77-3.64(m,1H),3.61-3.53(m,1H),3.52-3.34(m,3H),3.33-2.97(m,7H),2.92-2.76(m,1H),2.75-2.65(m,1H),2.63-2.55(m,1H),2.51(s,3H),2.49(br d,J=3.2Hz,3H),2.35-2.25(m,1H),2.13-1.99(m,1H),1.89-1.67(m,3H)。
実施例483
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。4-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシブタ-2-イン酸(129mg、564μmol、1.50当量)およびDIEA(194mg、1.50mmol、262μL、4.00当量)のDMF(2.00mL)中溶液に、HATU(214mg、564μmol、1.50当量)を0℃で加えた。0℃で10分間撹拌した後、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.20g、376μmol、1.00当量)を混合物に加えた。25℃で12時間撹拌した後、混合物を酢酸エチル(10.0mL)で希釈し、ブライン(3×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、飽和重炭酸ナトリウム(5.00mL)でpH>7に中和し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%、FA)-ACN];B%:10%~40%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例483、10.1mg、15.3μmol、4.1%収率、99.6%純度、FA)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:614。
1H NMR(400MHz,酢酸-d4)δ=7.82(d,J=8.4Hz,1H),7.69(d,J=8.4Hz,1H),7.56(d,J=7.6Hz,1H),7.49(t,J=7.6Hz,1H),7.42-7.31(m,2H),5.14-4.73(m,4H),4.70-4.23(m,5H),4.01-3.81(m,3H),3.80-3.51(m,3H),3.49-3.17(m,4H),3.09(m,5H),2.81-2.63(m,1H),2.45-2.34(m,1H),2.22-2.08(m,3H)。
実施例484
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:4,4-ジフルオロ-3-ヒドロキシ-ブタノエート。エチル 4,4-ジフルオロ-3-オキソ-ブタノエート(5.00g、30.1mmol、1.00当量)のトルエン(150mL)中溶液に、NaBH4(1.20g、31.7mmol、1.05当量)を0℃で加えた。25℃で4時間撹拌した後、混合物を水(50.0mL)により0℃で希釈し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮して、エチル 4,4-ジフルオロ-3-ヒドロキシブタノアート(4.30g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=6.05-5.87(m,1H),5.86-5.72(m,1H),4.11-4.01(m,2H),2.57(dd,J=4.0,15.6Hz,1H),2.38(dd,J=9.2,15.6Hz,1H),1.21-1.17(m,3H)。
ステップ2:エチル(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノエート。エチル 4,4-ジフルオロ-3-ヒドロキシブタノアート(3.00g、粗製)のジクロロメタン(20.0mL)中溶液に、TEA(1.81g、17.8mmol、2.48mL)およびMsCl(3.68g、32.1mmol、2.49mL)を0℃で加えた。4時間撹拌した後、混合物に、TEA(3.61g、35.68mmol、4.97mL、2当量)を0℃で加えた。25℃まで暖め、12時間撹拌した後、混合物を水(10.0mL)で希釈し、HCl(1N、1×20.0mL)およびブライン(1×20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、エチル(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノエート(1.40g、9.33mmol、2ステップで44%収率)を無色油として得、さらに精製して次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.81(m,1H),6.29(dt,J=2.8,1.6Hz,1H),6.23(dd,J=4.0,55.2Hz,1H),4.25(q,J=7.2Hz,2H),1.31(t,J=7.2Hz,3H)。
ステップ3:(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エン酸。エチル(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノエート(1.30g、8.66mmol、1.00当量)およびNaOH(1.39g、34.6mmol、4.00当量)のTHF(5.00mL)およびH2O(5.00mL)中混合物を25℃で2時間撹拌した。混合物をHCl(2N、20.0mL)によりpH=1~3に酸性化し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エン酸(0.35g、2.87mmol、33%収率)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.92(m,1H),6.32(dtd,J=0.8,2.8,16.8Hz,1H),6.27(dtd,J=1.2,54.8Hz,4.0,1H)。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エン酸(68.8mg、564μmol、1.50当量)、EDCI(108mg、564μmol、1.50当量)、およびHOBt(50.8mg、376μmol、1.00当量)のPy(3mL)中混合物を0℃で15分間撹拌し、次いで、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、0.20g、376μmol、1.00当量)を混合物に加えた。0℃で1時間および25℃で1時間撹拌した後、混合物を水(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(1×10.0mL)で抽出した。抽出物をブライン(1×10.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.10%)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(5.00mL)で中和し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例484、66.9mg、104μmol、28%収率、98.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:636。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.2Hz,1H),7.52(d,J=7.2Hz,1H),7.45(td,J=7.6,12.8Hz,1H),7.37-7.31(m,1H),7.27-7.18(m,1H),6.88-6.71(m,2H),6.45-6.12(m,1H),5.17-4.59(m,1H),4.55-4.41(m,1H),4.40-4.33(m,1H),4.21-3.69(m,5H),3.64-3.32(m,2H),3.31-2.97(m,5H),2.96-2.52(m,4H),2.47(d,J=1.6Hz,3H),2.33-2.23(m,1H),2.11-2.00(m,1H),1.90-1.77(m,3H)。
実施例485
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:1-(2-(エトキシカルボニル)アリル)-1,4-ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン-1-イウムブロミド。THF(5mL)中のエチル 2-(ブロモメチル)プロパ-2-エノエート(15g、77.7mmol、1当量)に、DABCO(10.5g、93.6mmol、10.3mL、1.20当量)を加え、得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。沈殿物を形成し、窒素雰囲気下で濾過した。濾過ケーキを集め、1-(2-(エトキシカルボニル)アリル)-1,4-ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン-1-イウムブロミド(15g、49.6mmol、64%収率)を淡黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップ2:エチル 2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノエート。1-(2-(エトキシカルボニル)アリル)-1,4-ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン-1-イウムブロミド(15g、49.6mmol、1当量)およびTEA(10.5g、104mmol、14.5mL、2.09当量)のMeOH(150mL)中混合物を25℃で16時間撹拌した。溶媒を真空下で留去した(25℃)。残留物をDCM(40ml)中に溶解し、次いで、5%クエン酸水溶液(1×40mL)および飽和重炭酸ナトリウム水溶液(1×40mL)で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、25℃で真空下で濃縮して、エチル 2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノエート(5.3g、36.8mmol、74%収率)を黄色の液体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップ3:2-(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸。エチル 2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノエート(5.1g、35.4mmol、1当量)のTHF(71mL)中溶液に、H2O(71mL)中の水酸化ナトリウム溶液(5.66g、142mmol、4当量)を5℃で加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、THFを真空下で留去した。混合物を、1MのHClでpH3に調整し、EtOAc(3×70mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、2-(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸(3.4g、26.4mmol、収率75%、90%純度)を淡黄色液体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.45(d,J=1.2Hz,1H),5.98(q,J=1.6Hz,1H),4.16(t,J=1.2Hz,2H),3.42(s,3H)。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸(175mg、1.50mmol、2当量)およびDIEA(389mg、3.01mmol、524μL、4当量)のDCM(8mL)中溶液に、HATU(429mg、1.13mmol、1.5当量)を-40℃で加えた。-40℃で10分間撹拌した後、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、400mg、752μmol、1当量)を混合物に加えた。混合物を、-40℃で20分間、0℃で0.5時間、および25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物に水(10mL)を加え、DCM(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 100/1~40/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[2-(メトキシメチル)プロパ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例485、73.0mg、116μmol、15%収率、98.9%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:630。
SFC条件:カラム:Chiralpak AS-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3ml/分 波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(br d,J=8Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=7.6Hz,1H),7.45(td,J=7.6,13.2Hz,1H),7.37-7.30(m,1H),7.26-7.17(m,1H),5.51(s,1H),5.32(br s,1H),5.19-4.58(m,1H),4.48-4.34(m,2H),4.23-4.07(m,4H),4.06-3.78(m,3H),3.64-3.55(m,1H),3.39(s,3H),3.36-2.72(m,8H),2.71-2.53(m,2H),2.47(s,3H),2.35-2.22(m,1H),2.14-1.98(m,1H),1.90-1.73(m,3H)。
実施例486
2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート丸底フラスコ中で、tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5g、9.487mmol)のジオキサン(94.87ml、9.487mmol)中溶液を、アルゴンによりスパージし、(S)-(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノール(3.278g、28.46mmol)、Cs
2CO
3(9.273g、28.46mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.8078g、0.9487mmol)をアルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で一晩加熱した。反応物をGF/F濾紙で濾過し、減圧下で濃縮した。濃縮物をCombi Flash(2%NH
4OHを含有するDCM中の0~12%MeOH)上で精製して、tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5.425g、8.508mmol、89.68%の収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 606.4[M+H]
+。
ステップB:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(5.4g、8.915mmol)をジクロロメタン(89.15ml、8.915mmol)に溶解し、塩酸(1,4-ジオキサン中4.0Mの溶液)(11.14ml、44.57mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。反応物をより多くのDCMおよび1MのNaOHで希釈し、層を分離した。次に有機成分をブラインで洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.364g、8.631mmol、96.82%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 506.3[M+H]
+。
ステップC:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:丸底フラスコ中で、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(4.364g、8.631mmol)のジオキサン(43.15ml、8.631mmol)中溶液を、アルゴンにより5分間スパージした。1-ブロモ-2,3-ジメチルベンゼン(5.851ml、43.15mmol)、Cs
2CO
3(14.06g、43.15mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(0.7348g、0.8631mmol)を、アルゴン下で順次加え、さらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で一晩加熱した。反応液を室温まで冷却する。酢酸エチルを加え、反応物をGF/F濾紙を通して濾過し、減圧下で濃縮した。濃縮物を、2%NH
4OHを含有するDCM中0~15%のMeOHを溶出液として使用したCombiFlash上での順相クロマトグラフィーにより2回精製した。目的の生成物を含有する画分を集め、減圧下で濃縮して、2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.411g、0.8641mmol、100.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 476.3[M+H]
+。
ステップD:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(200mg、0.420mmol)、4,4,4-トリフルオロクロトン酸(118mg、0.841mmol)、DIEA(367μl、2.10mmol)のDCM(4205μl、0.420mmol)中溶液に、HATU(240mg、0.631mmol)を加え、得られた混合物を室温にて5時間撹拌した。反応混合物はブラインで洗浄し、水層をDCM(2×)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濃縮し、60:40のACN:H2O中に希釈し、水/0.1%TFA中の5→95%のACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩を用いて塩基を遊離させて、有機成分をDCMで抽出した。有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例486、28mg、0.0468mmol、11.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 598.3[M+H]+。
実施例487
2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-(トリフルオロメチル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-(トリフルオロメチル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例486に従って、ステップDで、4,4,4-トリフルオロクロトン酸の代わりに2-(トリフルオロメチル)プロペン酸を使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 598.3[M+H]+。
実施例488
2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-(ヒドロキシメチル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-(ヒドロキシメチル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例486に従って、ステップDで、4,4,4-トリフルオロクロトン酸の代わりに2-(ヒドロキシメチル)プロパ-2-エン酸を使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 560.3[M+H]+。
実施例489
2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(50mg、0.1051mmol)のDCM(1mL)中溶液に、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(24.41mg、0.2102mmol)、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.03662ml、0.2102mmol)、およびO-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N´,N´-テトラメチルウロニウムPF6(59.96mg、0.1577mmol)を加え、反応混合物室温で4時間撹拌した。次に水(1mL)を加え、反応混合物を5分間撹拌した。混合物を、EtOAc(10mL)と0.5MのNaHCO3(5mL)との間で分配し、層を分離させた。有機成分をブライン(3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、3%MeOH+0.3%NH4OH→4%MeOH+0.4%NH4OHを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、標記化合物(実施例489、26mg、43%)を得た。ESI+APCI MS m/z 574.4[M+H]+。
実施例490
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.6g、1.2mmol)のジオキサン(10mL)中溶液に、1-ブロモ-8-クロロナフタレン(0.37g、1.5mmol)を加え、反応物をアルゴンにより15分間脱気し、続いて、Cs2CO3(1.2g、3.6mmol)、Pd2(dba)3(0.22g、0.24mmol)、および2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル(0.11g、0.24mmol)を加え、反応物を100℃まで一晩加熱した。次に反応物をGFF濾紙を通して濾過し、濾過し、減圧下で濃縮した。次に残留物を、1→10%(MeOH+2%NH4OH)/DCMを使用してクロマトグラフ処理して、ベンジル(S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.20g、0.30mmol、25%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 666.2[M+H]+。
ステップB:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(0.17g、0.255mmol)のTHF(30mL)中溶液をN2によりパージし、続いて、Pd/C(0.0272g、0.255mmol)を加えた。反応物を真空で排気し、H2で3回充填し、混合物を室温で3日間撹拌した。反応物をN2で再びパージし、続いて、セライトを通して濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。物質を粗生成物として次の反応に使用した。ESI+APCI MS m/z 532.2[M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.055g、0.10mmol)のDCM(20mL)中溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.040g、0.31mmol)、(E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エン酸(0.017g、0.12mmol)、および1-プロパンホスホン酸環状無水物(0.033g、0.10mmol)を加え、反応物を室温で30分間撹拌した。次にTEP3および酸(0.24mmol)を加え、反応物をさらに1時間。次に有機成分を1N NaOH、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。物質を、順相シリカ(1→10%(MeOH+2%NH4OH)/DCM)上で2回クロマトグラフ処理し、続いて、0.1%のTFAを添加剤として含有する5→95%ACN/水を使用したgilson逆分取HPLCにより精製した。不純物を含まない画分を、塩基性水中に注ぎ込み、EtOAc中に抽出した。有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例490、0.0094g、0.014mmol、14%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 654.2[M+H]+。
実施例491
2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:N,N-ジメチルホルムアミド(2932μl、0.293mmol)を含む25mLのRBFに、2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(150mg、0.293mmol)およびヒューニッヒ塩基(102μl、0.586mmol)を0℃で加えた。(E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エン酸(49.3mg、0.352mmol)を1度に加えると共に、反応混合物を強く撹拌した。次に、1-プロパンホスホン酸環状無水物(262μl、0.440mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を0℃で2時間撹拌した。反応物を塩基性水で処理し、水層をEtOAc(3×)で抽出した。合わせた有機成分を、減圧下で濃縮し、ACN:H2Oの60:40の混合物中に再懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%のACN/0.1%TFAにより溶出するGilson(逆分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、飽和重炭酸塩とDCMとの間で分配した。水層をさらに2回、DCMで抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例491、74.5mg、0.118mmol、40.1%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 634.3[M+H]+。
実施例492
2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-(トリフルオロメチル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-(トリフルオロメチル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例491に従って、ステップAで、(E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エン酸の代わりに2-(トリフルオロメチル)アクリル酸を使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 634.2[M+H]+。
実施例493
2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-3-(ピリジン-2-イル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-3-(ピリジン-2-イル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例491に従って、ステップAで、(E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エン酸の代わりに3-(ピリジン-2-イル)アクリル酸を使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 643.3[M+H]+。
実施例494
2-((S)-1-((E)-3-(1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル)アクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-((E)-3-(1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル)アクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例491に従って、ステップAで、(E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エン酸の代わりに(2E)-3-(1-メチル-1H-ピラゾール-4-イル)アクリル酸を使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 646.4[M+H]+。
実施例495
2-((S)-1-((E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-((E)-4,4-ジフルオロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例491に従って、ステップAで、(E)-4,4,4-トリフルオロブタ-2-エン酸の代わりに4,4-ジフルオロブタ-2-エン酸を使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 616.3[M+H]+。
実施例496
2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピペリジン-2-イル)メトキシ)-7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-3-(ピリジン-3-イル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.12g、0.23mmol)のDCM(10mL)中溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.13ml、0.70mmol)、(E)-3-(ピリジン-3-イル)アクリル酸(0.070g、0.47mmol)、および2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン 2,4,6-三酸化物(0.30g、0.47mmol)、反応物を室温で3時間撹拌した。次に反応物を1N NaOH中に注ぎ込み、層を分離した。次に有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。次に物質を、調節剤として0.1%TFAを含有する5→95のACN/水により溶出するGilson逆分取HPLCにより精製した。生成物を含有する画分を1N NaOH中に注ぎ込み、水層をEtOAc(3×)で抽出した。合わせた有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-3-(ピリジン-3-イル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例496、0.040g、0.062mmol、27%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 643.3[M+H]+。
実施例497
2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(3-オキソシクロペンタ-1-エン-1-カルボニル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(3-オキソシクロペンタ-1-エン-1-カルボニル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.05863mmol)および3-オキソシクロペンタ-1-エンカルボン酸(9.612mg、0.07622mmol)をDMF(400μL)に希釈し、続いて、DIEA(20.48μl、0.1173mmol)および1-プロピルホスホン酸環状無水物(52.35μl、0.08795mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(3-オキソシクロペンタ-1-エン-1-カルボニル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例497、2.3mg、0.003711mmol、6.329%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 620.3[M+H]+。
実施例498
2-((S)-1-((E)-4-クロロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-((E)-4-クロロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.05863mmol)およびγ-クロロクロトン酸(10.60mg、0.08795mmol)をDMF(400μL)で希釈し、続いて、DIEA(20.48μl、0.1173mmol)および1-プロピルホスホン酸環状無水物(55.84μl、0.09381mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である2-((S)-1-((E)-4-クロロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例498、4.5mg、0.007327mmol、12.50%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 614.3[M+H]+。
実施例499
(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-オキソブタ-2-エナミド
ステップA:エチル(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エノエート:フマル酸モノエチルエステル(442mg、3.07mmol)をDCM(5mL)で希釈し、続いて、塩化オキサリル(1533μl、3.07mmol)および1滴のDMFを加えた。15分間撹拌後、ジメチルアミン(4600μl、9.20mmol)を加え、反応物を3時間撹拌した。反応物を酢酸エチルおよび水で希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10~70%の酢酸エチル/ヘキサンにより溶出するシリカゲル上で精製して、エチル(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エノエート(382mg、2.23mmol、72.8%の収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 172.1[M+H]+。
ステップB:(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エン酸:エチル(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エノエート(382mg、2.23mmol)をメタノール(8mL)で希釈し、続いて、NaOH(4463μl、8.93mmol)を加えた。4時間撹拌後、反応物を2N HCl(4.5mL)で希釈し、酢酸エチルで抽出した。酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エン酸を得た。
ステップC:(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-オキソブタ-2-エナミド:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.05863mmol)をDMFで希釈し、続いて、(E)-4-(ジメチルアミノ)-4-オキソブタ-2-エン酸(10.07mg、0.07036mmol)、DIEA(20.48μl、0.1173mmol)、および1-プロピルホスホン酸環状無水物(52.35μl、0.08795mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-オキソブタ-2-エナミド(実施例499、3.7mg、0.005810mmol、9.910%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 637.3[M+H]+。
(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エナミド
ステップA:エチル(E)-3-シアノアクリル酸:エチル シス(β-シアノ)アクリレート(1.0g、7.99mmol)をACN(30mL)で希釈し、窒素下に置き、3日間加熱還流した。反応物を放冷し、次いで、濃縮した。物質をヘキサンにより溶出するシリカゲル上で精製して、エチル(E)-3-シアノアクリル酸(300mg、2.40mmol、30.0%収率)を得た。
ステップB:(E)-4-アミノ-4-オキソブタ-2-エン酸:エチル(E)-3-シアノアクリル酸(300mg、2.40mmol)をHCl(3996μl、24.0mmol)で希釈した。反応物を窒素下に置き、100℃まで4時間加熱した。反応物を放冷し、次いで、濃縮して、(E)-4-アミノ-4-オキソブタ-2-エン酸(214mg、1.86mmol、77.6%収率)を得た。
ステップC:(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エナミド:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20mg、0.039mmol)、HATU(30mg、0.078mmol)、および(E)-4-アミノ-4-オキソブタ-2-エン酸(9.0mg、0.078mmol)をDMF(400μL)で希釈し、続いて、DIEA(14μl、0.078mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エナミド(実施例500、2.9mg、0.0048mmol、12%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 609.3[M+H]+。
実施例501
(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル
ステップA:エチル(E)-3-シアノアクリル酸:エチル シス(β-シアノ)アクリレート(1.0g、7.99mmol)をACN(30mL)で希釈し、窒素下に置き、3日間加熱還流した。反応物を放冷し、次いで、濃縮した。物質をヘキサンにより溶出するシリカゲル上で精製して、エチル(E)-3-シアノアクリル酸(300mg、2.40mmol、30.0%収率)を得た。
ステップB:(E)-3-シアノアクリル酸:エチル(E)-3-シアノアクリル酸(10mg、0.080mmol)をHCl(133μl、0.80mmol)で希釈し、窒素下に置き、100℃まで加熱した。15分間撹拌後、反応物を濃縮して、(E)-3-シアノアクリル酸(7.5mg、0.077mmol、97%収率)を得た。
ステップC:(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20mg、0.03909mmol)および(E)-3-シアノアクリル酸(5.312mg、0.05472mmol)をDMF(400μL)で希釈し、続いて、DIEA(13.65μl、0.07817mmol)および1-プロピルホスホン酸環状無水物(34.90μl、0.05863mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である(E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル(実施例501、3.5mg、0.005925mmol、15.16%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 591.3[M+H]+。
実施例502
(Z)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル
ステップA:(Z)-3-シアノアクリル酸:エチル シス(β-シアノ)アクリレート(50mg、0.40mmol)をHCl(200μl、1.2mmol)で希釈し、窒素下に置き、100℃まで加熱した。1分間撹拌後、反応物を冷却し、濃縮して、(Z)-3-シアノアクリル酸(35mg、0.36mmol、90%収率)を得た。
ステップB:(Z)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20mg、0.03909mmol)および(Z)-3-シアノアクリル酸(6.071mg、0.06254mmol)をDMF(400μL)で希釈し、続いて、DIEA(13.65μl、0.07817mmol)および1-プロピルホスホン酸環状無水物(39.56μl、0.06645mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である(Z)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エンニトリル(実施例502、2.1mg、0.003555mmol、9.095%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 591.3[M+H]+。
実施例503
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)-2-フルオロ-ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:(E)-4-[tert-ブトキシカルボニル(メチル)アミノ]-2-フルオロ-ブタ-2-エン酸。エチル 2-ジエトキシホスホリル-2-フルオロ-アセテート(2g、8.26mmol、1.68mL、1当量)およびtert-ブチル Nメチル-N-(2-オキソエチル)カルバメート(2.15g、12.4mmol、1.5当量)のTHF(40mL)中溶液に、NaH(661mg、16.5mmol、60%純度、2当量)を加えた。混合物を25℃で1.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和NH4Cl(8mL)によりクエンチし、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20ACN%~50ACN%、30分;50%分)により精製して、(E)-4-[tert-ブトキシカルボニル(メチル)アミノ]-2-フルオロ-ブタ-2-エン酸(820mg、3.16mmol、38.3%収率、90%純度)を褐色油として得た。
ステップA:tert-ブチル N-[(E)-4-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-3-フルオロ-4-オキソ-ブタ-2-エニル]-Nメチル-カルバメート。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、300mg、564μmol、1当量)、(E)-4-[tert-ブトキシカルボニル(メチル)アミノ]-2-フルオロ-ブタ-2-エン酸(600mg、2.57mmol、4.56当量)、およびDIEA(729mg、5.64mmol、982μL、10当量)のDCM(10mL)中溶液に、HATU(643mg、1.69mmol、3当量)を0℃で加えた。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(3mL)でクエンチし、DCM(3×8mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆フラッシュクロマトグラフィー(FA条件:水中の60%MeCN(0.1%FA))により精製して、tert-ブチル N-[(E)-4-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-3-フルオロ-4-オキソ-ブタ-2-エニル]-Nメチル-カルバメート(330mg、404μmol、72%収率、91.5%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:747。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-2-フルオロ-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル N-[(E)-4-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-3-フルオロ-4-オキソ-ブタ-2-エニル]-Nメチル-カルバメート(300mg、401μmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(915mg、8.03mmol、594μL、20当量)を加えた。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をDCM(10mL)により希釈し、飽和NaHCO3(8mL)により塩基化した。混合物をDCM(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-2-フルオロ-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(240mg、356μmol、89%収率、95.9%純度)を褐色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:647。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)-2-フルオロ-ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-2-フルオロ-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、185μmol、1当量)、およびパラホルムアルデヒド(83.5mg、927μmol、5当量)、HCOOH(26.7mg、556μmol、3当量)のMeOH(5mL)中溶液に、NaBH3CN(35.0mg、556μmol、3当量)を加えた。この反応混合物を25℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(0.5mL)でクエンチし、濾過した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EA:MeOH:NH3・H2O=50:1:0~10:1:0.1)、次いで、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:50%~100%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(ジメチルアミノ)-2-フルオロ-ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例503、26.7mg、40.2μmol、22%収率、99.5%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:661。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.68(d,J=8.0Hz,1H),7.54(t,J=7.2Hz,1H),7.45(d,J=7.2Hz,1H),7.37(td,J=7.6,12.8Hz,1H),7.26(t,J=8.0Hz,1H),7.19-7.08(m,1H),5.81-5.60(m,1H),5.04-4.41(m,1H),4.40-4.25(m,2H),4.16-3.91(m,3H),3.88-3.71(m,2H),3.66-3.46(m,2H),3.36(br d,J=10.8Hz,1H),3.27-2.69(m,9H),2.64-2.56(m,1H),2.55-2.46(m,1H),2.40(d,J=2.4Hz,3H),2.27-2.15(m,7H),2.06-1.90(m,1H),1.85-1.72(m,3H)。
実施例504
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[2-(トリフルオロメチル)プロパ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[2-(トリフルオロメチル)プロパ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-(トリフルオロメチル)プロパ-2-エン酸(39.5mg、282μmol、1.50当量)、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、0.10g、188μmol、1.00当量)、およびDIEA(48.6mg、376μmol、65.5μL、2.00当量)のジクロロメタン(0.20mL)中溶液に、HATU(107mg、282μmol、1.50当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、混合物を水で希釈し、層を分離した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.1%)/アセトニトリル]および分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:56%~86%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[2-(トリフルオロメチル)プロパ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例504、13.1mg、19.6μmol、10.5%収率、97.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:654。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%のDEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.4Hz,1H),7.65-7.59(m,1H),7.55-7.50(m,1H),7.45(td,J=7.6,10.0Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),6.18(br s,1H),5.86(br s,1H),5.11(br s,1H),4.57-4.36(m,2H),4.33-4.10(m,2H),4.04(br d,J=12.8Hz,1H),3.97-3.79(m,2H),3.66-3.54(m,1H),3.50-3.33(m,1H),3.29-3.07(m,4H),3.04-2.72(m,4H),2.63-2.50(m,4H),2.45-2.32(m,1H),2.15-2.04(m,1H),1.90(br s,3H)。
実施例505
2-((S)-1-((Z)-3-クロロアクリロイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-((Z)-3-クロロアクリロイル)-4-(7-(2,3-ジメチルフェニル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例389のステップJに従って、ブタ-2-イン酸の代わりに(Z)-3-クロロアクリル酸を使用して調製した。ESI+APCI MS m/z 564.3[M+H]+。
実施例506
2-((S)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:N,N-ジメチルホルムアミド(3909μl、0.39mmol)を含む25mLのRBFに、2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(200mg、0.391mmol)およびトリエチルアミン(136μl、0.98mmol)を0℃で加えた。(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(61.0mg、0.59mmol)を1度に加えると共に反応混合物を強く撹拌した。次に、1-プロパンホスホン酸環状無水物(175μl、0.59mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を室温で18時間撹拌した。水を加え、混合物をEtOAc(3×15mL)で抽出した。抽出物を合わせ、水(1×10mL)で洗浄し、濃縮した。残留物をシリカゲル(0.25%NH4OHを含有するDCM中の5~18%MeOH)により精製して、標記化合物である2-((S)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例506、89.3mg、0.15mmol、38%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 598.3[M+H]+。
実施例507
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:
ステップA:2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8g、15.63mmol)をDMF(78.17ml、15.63mmol)で希釈し、窒素下に置き、0℃まで冷却した。DIEA(6.827ml、39.09mmol)を加え、続いて、2-フルオロアクリル酸(2.112g、23.45mmol)を加え、1-プロパンホスホン酸環状無水物(9.307ml、15.63mmol)を滴加した。反応物を0℃で6時間撹拌し、さらに10時間撹拌させ、周囲温度まで暖めた。反応物を5%の炭酸水素ナトリウム溶液中に注ぎ込み、酢酸エチルで2回抽出した。酢酸エチルを水、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を、1~10%のメタノール/DCM(添加剤としての1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、標記化合物である2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例507、6.6g、11.31mmol、72.32%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 584.3[M+H]+。
実施例508
2-((S)-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-(4-ヒドロキシブタ-2-イノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例458のステップDに従って、ブタ-2-イン酸の代わりに4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ブタ-2-イン酸を使用して調製した。ESI+APCI MS m/z 594.3[M+H]+。
実施例509
2-((S)-1-((E)-4-(1H-ピラゾール-1-イル)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:(E)-4-(1H-ピラゾール-1-イル)ブタ-2-エン酸。4-ブロモクロトン酸(100mg、0.606mmol)およびピラゾール(37.1mg、0.546mmol)のアセトニトリル(1ml、19.1mmol)中溶液を、密閉したバイアル中で撹拌しながら48時間60℃に加熱した。得られた明緑色の溶液を、水(5mL)とEtOAc(15mL)との間で分配し、有機成分を分離し、有機層をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。物質を、2~5%のMeOH/DCM+0.2%TFA中でシリカゲルクロマトグラフィーにかけた。得られた固体を、最小限量の6M HClに溶解し、緩慢なN2流下で留去した。この物質をそれ以上精製せずに次のステップで使用した。
ステップB:2-((S)-1-((E)-4-(1H-ピラゾール-1-イル)ブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(42.37mg、0.08281mmol)、(E)-4-(1H-ピラゾール-1-イル)ブタ-2-エン酸(12.6mg、0.08281mmol)、およびN,N-ジメチルホルムアミド(1mL、12.79mmol)の撹拌混合物を撹拌しながら氷塩浴上で冷却し、トリエチルアミン(0.03463mL、0.2484mmol)を1度に加え、続いて、EtOAc(0.07395mL、0.1242mmol)中50%の2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン 2,4,6-三酸化物を加えた。反応混合物を5分にわたって室温まで温め、室温で一晩撹拌した。反応混合物を0.5MのNa2CO3(5mL)とEtOAc(10mL)との間で分配し、有機成分を分離し、有機層を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。生成物を、DCM中の5%MeOH+0.5%NH4OHを使用したシリカゲルクロマトグラフィーにより精製して、標記化合物を無色固体として得た(実施例509、11.46mg、23%)。ESI+APCI MS m/z 646.3[M+H]+。
実施例510
2-((S)-1-((E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エン酸。4-ブロモクロトン酸(4824mg、29.24mmol)の水(48mL)中撹拌懸濁液に、水酸化カリウム(4.921g、87.72mmol)の2Mの溶液を滴加し、得られた溶液を5分間加熱還流した。反応混合物をN2流下に置き、冷却および濃縮した。残留物をアイスバス上で冷却し、4MのH2SO4でpH1~2に酸性化し、得られた懸濁液を減圧下で半分だけ留去し、次いで、EtOAc(3*60mL)で抽出した。合わせた抽出物をNa2SO4上で乾燥し、で、減圧下で留去した。物質を、2~5%MeOH+0.2%TFAを使用したクロマトグラフィーにより精製して、目的の酸を無色結晶(2.165g、73%)として得た。
ステップB:2-((S)-1-((E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(100mg、0.1954mmol)、(2E)-4-ヒドロキシブタ-2-エン酸(39.90mg、0.3909mmol)、およびN-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(0.06809ml、0.3909mmol)のDCM(5mL)中攪拌溶液に、O-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N´,N´-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(111.5mg、0.2932mmol)を1度に加え、反応混合物を室温で4時間撹拌した。水(1mL)を加え、反応混合物を5分間撹拌し、EtOAc(10mL)と飽和NaHCO3(5mL)との間で分配した。有機層を分離し、NaHCO3、ブライン(各5mL)で洗浄し、K2CO3上で乾燥し、減圧下で留去した。残留物を、5%MeOH+0.5%NH4OHでシリカゲルクロマトグラフィーにかけた。無色固体としての標記化合物(実施例510、29mg、25%)。ESI+APCI MS m/z 596.3[M+H]+。
実施例511
2-((S)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(250mg、0.4886mmol)、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(85.10mg、0.7329mmol)、およびN,N-ジメチルホルムアミド(2mL、25.58mmol)の撹拌混合物を氷塩浴上で冷却し、トリエチルアミン(0.2043mL、1.466mmol)を1度に加え、続いて、EtOAc(0.4363mL、0.7329mmol)中50%の2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン 2,4,6-三酸化物を加えた。反応混合物を室温で5分にわたって温め、室温で2時間撹拌した。得られた溶液を0.5MのNa2CO3(10mL)とEtOAc(30mL)との間で分配し、有機層を分離し、水およびブライン(各10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。物質を、DCM中の5%MeOH+0.5%NH4OHを使用したシリカゲルクロマトグラフィーにより精製した。物質を、逆相クロマトグラフィー、Gilson、25→75%のMeCN/H2O+0.1%TFAによりさらに精製した。目的の画分を過剰の2M Na2CO3で塩基化し、DCM(3*50mL)で抽出した。合わせた有機抽出物をブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。淡黄色固体としての標記化合物(実施例511、123mg、41%)。ESI+APCI MS m/z 610.3[M+H]+。
実施例512
2-[(2S)-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:メチル 2,2-ジメトキシプロパノエート。エチル 2-オキソプロパノエート(4.00g、34.5mmol、3.81mL、1.00当量)およびトリメトキシメタン(4.75g、44.8mmol、4.91mL、1.30当量)のメタノール中(10.0mL)溶液に、H2SO4(33.8mg、344μmol、18.4μL、0.01当量)を加えた。65℃で4時間撹拌した後、KOH(20.0mLの水中120mg)によりpH値を>7に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を油ポンプ下、60℃で蒸留して、メチル 2,2-ジメトキシプロパノエート(4.00g、27.0mmol、78%収率)を無色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.81(s,3H),3.28(s,6H),1.52(s,3H)。
ステップB:メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート。メチル 2,2-ジメトキシプロパノエート(2.00g、13.5mmol、1.00当量)のDMF(20.0mL)中溶液に、P2O5(1.05g、7.42mmol、458μL、0.55当量)を少しずつ加えた。100℃に1時間加熱した後、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(20.0mL)で希釈し、イソプロピルエーテル(3×30.0mL)で抽出し、ブライン(3×40.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を油ポンプ下で蒸留して、メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート(0.65g、5.60mmol、41%収率)を無色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
ステップC:2-メトキシプロパ-2-エン酸。メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート(0.60g、5.17mmol、1.00当量)およびNaOH(827mg、20.7mmol、4.00当量)のH2O(5.00mL)およびTHF(5.00mL)中混合物を、60℃で1時間撹拌した。濃HCl(10.0mL)により混合物をpH<3に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-メトキシプロパ-2-エン酸(0.40g、1.96mmol、38%収率、50%純度)を淡紅色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.63(br s,1H),5.52(d,J=2.8Hz,1H),4.75(d,J=2.8Hz,1H),3.70(s,3H)。
ステップD:2-[(2S)-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.14g、274μmol、1.00当量)、2-メトキシプロパ-2-エン酸(112mg、1.09mmol、4.00当量)、およびDIEA(141mg、1.09mmol、191μL、4.00当量)のジクロロメタン(5.00mL)中溶液に、HATU(208mg、547μmol、2.00当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌後、混合物を水(3.00mL)で希釈した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(FA、0.10%)/アセトニトリル]および分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例512、10.27mg、17.22μmol、6.3%収率、99.9%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:596。
SFC条件:「IC-3S_3_40_3ML カラム:Chiralpak IC-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.72-7.61(m,2H),7.45-7.31(m,2H),7.27-7.17(m,2H),5.05-4.61(m,1H),4.48(br s,1H),4.37(td,J=4.4,10.0Hz,1H),4.30-3.98(m,4H),3.96-3.74(m,2H),3.69(br s,3H),3.59-3.28(m,2H),3.27-2.93(m,6H),2.92(s,3H),2.88-2.51(m,4H),2.47(d,J=3.2Hz,3H),2.33-2.23(m,1H),2.11-1.98(m,1H),1.89-1.74(m,3H)。
実施例513
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:エチル(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノエート。(E)-4-エトキシ-4-オキソ-ブタ-2-エン酸(1.0g、7.29mmol、1.0当量)のTHF(6.0mL)中溶液に、BH3-Me2S(10.0M、692μL、0.95当量)のTHF(8.0mL)中溶液を-10℃で1時間にわたって滴加した。反応混合物を25℃まで段階的に暖め、17時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(30.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、酢酸エチル(30.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層を、ブライン(30.0mL×2)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。化合物であるエチル(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノエート(900mg、粗製)を無色油として得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップ2:(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノエート。エチル(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノエート(900mg、粗製)、[クロロ(ジフェニル)メチル]ベンゼン(2.89g、10.4mmol)、DMAP(84.5mg、692μmol)、TEA(1.4g、13.8mmol、1.9mL)のDCM(5.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、H2O(10.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20:1→15:1)により精製した。化合物であるエチル(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノエート(340mg、913μmol、13%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.38-7.35(m,6H),7.26-7.22(m,6H),7.18-7.15(m,3H),6.88(dt,J=15.6,3.6Hz,1H),6.29(dt,J=15.6,2.2Hz,1H),4.16(q,J=7.1Hz,2H),3.72(dd,J=2.4,2.0Hz,2H),1.25(t,J=7.0Hz,3H)。
ステップ3:(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸。エチル(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノエート(170mg、456μmol、1.0当量)のMeOH(1.0mL)中溶液に、NaOH(54.5mg、1.37mmol、3.0当量)のH2O(0.5mL)中溶液を加え、次いで、混合物をN2雰囲気下、40℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、0℃で1MのHClをpH=5まで加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(8.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3:1→1:1)により精製した。化合物である(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸(113mg、328μmol、72%収率)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.38-7.36(m,6H),7.26-7.24(m,5H),7.20-7.16(m,4H),7.0(dt,J=15.6,3.6Hz,1H),6.32(dt,J=15.6,2.0Hz,1H),3.76(dd,J=3.2,2.4Hz,2H)。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(中間体71、60.0mg、113μmol、1.0当量)、(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸(77.8mg、226μmol、2.0当量)、およびDIEA(73.0mg、564μmol、98μL、5.0当量)のDCM(2.0mL)中溶液に、HATU(64mg、169μmol、1.5当量)をN2下、0℃で1度に加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、H2O(8.0mL)を加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)を黄色固体として得、粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:858。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)のDCM(1.0mL)中溶液に、TFA(1.0ml、13.5mmol)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、0℃でNaHCO3水溶液をpH=8まで加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:48%~72%、10分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例513、8.21mg、13.3μmol、7.6%収率、99.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
SFC条件:100%e.e.。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.68(d,J=8.0Hz,1H),7.70-7.33(m,1H),7.49(dd,J=6.8,0.8Hz,1H),7.37(dt,J=11.98,7.82Hz,1H),7.26(t,J=11.8Hz,1H),7.19-7.11(m,1H),6.99(dt,J=14.8,3.4Hz,1H),6.56(br s,1H),5.02-4.57(m,1H),4.39-4.29(m,4H),4.12-4.06(m,1H),4.03-3.99(m,2H),3.85-3.72(m,2H),3.67-3.36(m,3H),3.24-3.09(m,2H),3.03-2.89(m,3H),2.73(br s,1H),2.63-2.61(m,1H),2.50(br s,1H),2.41(s,3H),2.25-2.19(m,1H),2.03-1.92(m,1H),1.70-1.60(m,3H)。
実施例514
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:メチル 2,2-ジメトキシプロパノエート。エチル 2-オキソプロパノエート(4.00g、34.5mmol、3.81mL、1.00当量)およびトリメトキシメタン(4.75g、44.8mmol、4.91mL、1.30当量)のメタノール中(10.0mL)溶液に、H2SO4(33.8mg、344μmol、18.4μL、0.01当量)を加えた。65℃で4時間撹拌後、反応混合物をpH値に調整し、KOH水溶液(20.0mLの水中の120mg)により>7に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をブライン(1×30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を真空下、60℃で蒸留し、メチル 2,2-ジメトキシプロパノエート(4.00g、27.0mmol、78%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.81(s,3H),3.28(s,6H),1.52(s,3H)。
ステップ2:メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート。メチル 2,2-ジメトキシプロパノエート(2.00g、13.5mmol、1.00当量)のDMF(20.0mL)中溶液に、P2O5(1.05g、7.42mmol、458μL、0.55当量)を少しずつ加えた。100℃で1時間撹拌後、混合物を飽和重炭酸ナトリウム(20.0mL)で希釈し、イソプロピルエーテル(3×30.0mL)で抽出した。抽出物をブライン(3×40.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を真空下で蒸留して、メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート(0.65g、5.60mmol、41%収率)を無色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.36(d,J=2.8Hz,1H),4.63(d,J=2.8Hz,1H),3.81(s,3H),3.66(s,3H)。
ステップ3:2-メトキシプロパ-2-エン酸。メチル 2-メトキシプロパ-2-エノエート(0.60g、5.17mmol、1.00当量)およびNaOH(827mg、20.7mmol、4.00当量)のH2O(5.00mL)およびTHF(5.00mL)中混合物を、60℃で1時間撹拌した。濃HCl(10.0mL)により混合物をpH<3に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-メトキシプロパ-2-エン酸(0.40g、1.96mmol、38%収率、50%純度)を淡紅色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.63(br s,1H),5.52(d,J=2.8Hz,1H),4.75(d,J=2.8Hz,1H),3.70(s,3H)。
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(0.20g、376μmol、1.00当量)、2-メトキシプロパ-2-エン酸(153mg、1.50mmol、4.00当量)、およびDIEA(194mg、1.50mmol、262μL、4.00当量)のジクロロメタン(5.00mL)中溶液に、HATU(286mg、752μmol、2.00当量)を0℃で加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、反応物を逆相フラッシュ[水(FA、0.1%)/アセトニトリル]、分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~45%。7.8分)、およびさらなる分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~79%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥し、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-メトキシプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例514、30.1mg、48.9μmol、13%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
SFC条件:「AS-3_MeOH(DEA)_5_40_3mL-35T カラム:Chiralpak AS-3 50×4.6mm I.D.、3μm 移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(br d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=7.2Hz,1H),7.44(td,J=7.6,13.6Hz,1H),7.34(t,J=8.0Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),5.07-4.63(m,1H),4.57-4.29(m,4H),4.21-3.96(m,3H),3.95-3.77(m,2H),3.69(br s,3H),3.59(br d,J=11.2Hz,1H),3.51-3.32(m,1H),3.30-3.02(m,5H),2.89-2.50(m,4H),2.47(d,J=2.0Hz,3H),2.32-2.23(m,1H),2.11-2.00(m,1H),1.89-1.72(m,3H)。
実施例515
2-[(2S)-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、293μmol、1.0当量)およびピリジン(186mg、2.35mmol、189μL、8.0当量)のジクロロメタン(4.0mL)中溶液に(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(215mg、1.17mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、粗製)を黄色油として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:658。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、228μmol、1.0当量)およびK2CO3(315mg、2.28mmol、10.0当量)のアセトニトリル(2.0mL)中溶液に、3-フルオロアゼチジン(152mg、1.37mmol、6.0当量、HCl)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(5.0mL)に加え、酢酸エチル(5.0mL×4)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例515、45.0mg、66μmol、29%収率、96%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:653。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.70(br d,J=8.0Hz,1H),7.65(t,J=8.4Hz,1H),7.41(dd,J=7.6,15.2Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.18(m,2H),6.92-6.82(m,1H),6.52-6.31(m,1H),5.28-5.08(m,1H),5.07-4.46(m,1H),4.41-4.33(m,1H),4.32-4.01(m,4H),4.01-3.79(m,2H),3.79-3.56(m,3H),3.55-3.37(m,2H),3.36-3.31(m,2H),3.30-3.24(m,1H),3.23-3.18(m,2H),3.17-3.15(m,1H),3.14-3.06(m,2H),3.05-2.95(m,1H),2.92(s,3H),2.86-2.75(m,1H),2.71-2.57(m,2H),2.47(d,J=4.0Hz,3H),2.33-2.22(m,1H),2.11-1.99(m,1H),1.88-1.67(m,3H)。
実施例516
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(5.5g、10.4mmol、1当量)、[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(2.40g、20.9mmol、2.25mL、2当量)、Pd2(dba)3(1.91g、2.09mmol、0.2当量)、RuPhos(1.95g、4.17mmol、0.4当量)、およびCs2CO3(8.50g、26.1mmol、2.5当量)のトルエン(100mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で5時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を酢酸エチル(100mL)および水(50mL)で希釈した。次いで、混合物を1MのHCl水溶液でPH約4に酸性化した。水相を分離し、飽和Na2CO3水溶液でPH約8に塩基化し、次いで、混合物を酢酸エチル(50mL×2)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(4g、5.55mmol、53%収率、84%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.46-7.31(m,5H),5.23(s,2H),4.74-4.49(m,2H),4.43-4.27(m,2H),4.21-3.70(m,5H),3.42-3.17(m,3H),3.09(t,J=7.6Hz,1H),2.98(td,J=3.6,12.4Hz,1H),2.86-2.74(m,1H),2.74-2.54(m,4H),2.47(s,3H),2.35-2.21(m,1H),2.05-1.97(m,1H),1.90-1.74(m,3H),1.49(s,9H)。
ステップB:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.7g、6.11mmol、1当量)のジオキサン(20mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、22.9mL、15当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。液体をデカントし、固形分を集めた。固体残留物を水(50mL)およびジクロロメタン(100mL)で希釈し、混合物を飽和Na2CO3水溶液でpH約8に塩基化し、ジクロロメタン(100mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.6g、4.89mmol、80%収率、95%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:506。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2.3g、4.55mmol、1当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(中間体69、1.31g、5.91mmol、1.3当量)、Cs2CO3(3.71g、11.4mmol、2.5当量)、Pd2(dba)3(833mg、909μmol、0.2当量)、およびキサントホス(1.05g、1.82mmol、0.4当量)のトルエン(50mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で6時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)により精製した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.6g、2.48mmol、54%収率)を黄色固体として得た。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.60g、2.48mmol、1.00当量)のMeOH(20.0mL)およびNH3(MeOH中20%w/w、7mL)中混合物を、H2(4.99mg、2.48mmol、1.00当量、15psi)下、25℃で触媒としてのPd/C(100mg、2.48mmol、10%純度、1.00当量)により3時間水素添加した。触媒をセライトパッドを通して濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮した。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.20g、2.35mmol、95%収率)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップE:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(140mg、274μmol、1.00当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(73.9mg、821μmol、3.00当量)のジクロロメタン(3.00mL)中混合物に、DIEA(212mg、1.64mmol、286μL、6.00当量)、HATU(312mg、821μmol、3.00当量)をN2下、0℃で1度に加えた。0℃で30分間撹拌後、反応混合物を水(10.0mL)で希釈し、ジクロロメタン(2×10.0mL)で抽出した。合わせた有機層を水(1×10.0mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%のNH3H2O+10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:55%~85%、10分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例516、48.7mg、82.1μmol、30%収率、98.4%純度)を白色固体として得た。
SFC条件:「カラム:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm」。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.62(m,2H),7.45-7.31(m,2H),7.27-7.17(m,2H),5.53-5.34(m,1H),5.26(dd,J=3.6,17.2Hz,1H),4.88(br s,1H),4.41-4.32(m,1H),4.31-4.22(m,1H),4.21-4.10(m,2H),4.10-4.02(m,1H),3.89(br d,J=18.0Hz,1H),3.78(d,J=18.4Hz,1H),3.59-3.40(m,2H),3.27-3.15(m,2H),3.14-3.04(m,2H),3.03-2.90(m,4H),2.90-2.73(m,2H),2.72-2.56(m,2H),2.47(d,J=4.8Hz,3H),2.33-2.23(m,1H),2.11-1.98(m,1H),1.90-1.74(m,3H)。
実施例517
2-((S)-1-((E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、234μmol、1当量)、TEA(142mg、1.41mmol、195μL、6当量)、および(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸(96.9mg、281μmol、1.2当量)の酢酸エチル(2mL)中溶液に、T3P(448mg、703μmol、418μL、EtOAc中50%純度、3当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(5mL)で希釈し、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=200/1→10/1)により精製した。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90mg、103μmol、44%収率、96%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:838。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80mg、95.5μmol、1当量)のジクロロメタン(200μL)中溶液に、TFA(218mg、1.91mmol、141μL、20当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(5mL)で希釈して、NaHCO3水溶液(2mL)でpH約8に塩基化した。混合物をジクロロメタン(5mL×3)で抽出した。合わせた有機層を、ブライン(3mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製した。混合物を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例517、10.2mg、16.8μmol、18%収率、98.5%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:596。
SFC条件:カラム:Chiralcel OD-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:CO2中の40%メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.61(m,2H),7.46-7.30(m,2H),7.27-7.16(m,2H),7.06(d,J=14.8Hz,1H),6.62(br d,J=13.6Hz,1H),5.25-4.53(m,1H),4.48-4.32(m,3H),4.30-3.95(m,4H),3.93-3.82(m,1H),3.81-3.61(m,1H),3.59-3.39(m,2H),3.30-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.87-2.53(m,4H),2.47(d,J=4.0Hz,3H),2.34-2.21(m,1H),2.13-1.99(m,1H),1.98-1.82(m,3H)。
実施例518
2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:O1-tert-ブチル O2-メチル(2R,4R)-4-フルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート。(2R,4R)-1-tert-ブトキシカルボニル-4-フルオロ・ピロリジン-2-カルボン酸(300mg、1.29mmol、1.0当量)およびK2CO3(533mg、3.86mmol、3.0当量)のDMF(2.0mL)中溶液に、MeI(4.80g、33.8mmol、2.11mL、26.3当量)を加えた。混合物を20℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(5.0mL)に加え、酢酸エチル(10.0ml×2)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=10:1~1:1)により精製して、生成物であるO1-tert-ブチル O2-メチル(2R,4R)-4-フルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(300mg、1.21mmol、94%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ5.30-5.10(m,1H),4.58-4.37(m,1H),3.94-3.76(m,1H),3.75(s,3H),3.72-3.55(m,1H),2.54-2.23(m,2H),1.52-1.40(m,9H)。
ステップ2:[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール:O1-tert-ブチル O2-メチル(2R,4R)-4-フルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(300mg、1.21mmol、1.0当量)のTHF(3.0mL)中溶液に、LiAlH4(138mg、3.64mmol、3.0当量)を-40℃で加えた。混合物をこの温度で1時間撹拌し、次いで、70℃に加熱し、70℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2SO4水溶液(0.30mL)でクエンチし、次いで、濾過した。母液を集め、真空下で濃縮して、生成物である[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(130mg、976μmol、80%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ5.18-4.98(m,1H),3.76-3.70(m,1H),3.54-3.43(m,1H),3.38-3.28(m,1H),2.51-2.44(m,1H),2.42-2.37(m,1H),2.35(s,3H),2.34-2.26(m,1H),2.21-2.09(m,1H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(103mg、773μmol、2.0当量)およびt-BuONa(55.8mg、580μmol、1.50当量)のトルエン(2.0mL)中溶液に、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、387μmol、1.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10.0mL)に加え、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュHPLC(C18、水中0.1%FA、0~60%MeCN)により精製して、生成物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(210mg、316μmol、82%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:664。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.70(br d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.6Hz,1H),7.45-7.32(m,7H),7.26-7.17(m,2H),5.24-5.02(m,3H),4.73-4.61(m,1H),4.53-4.42(m,1H),4.30-4.18(m,2H),4.11-3.96(m,2H),3.94-3.81(m,1H),3.81-3.67(m,1H),3.58-3.47(m,1H),3.46-3.29(m,2H),3.24-3.06(m,3H),3.05-2.96(m,1H),2.92(s,3H),2.82-2.71(m,2H),2.70-2.51(m,2H),2.50-2.47(m,4H),2.45-2.35(m,1H),2.12-2.05(m,1H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、301μmol、1.0当量)およびNH3・MeOH(2.0mL、20%純度)のメタノール(4.0mL)中溶液に、Pd/C(80mg、10%純度)を加えた。混合物をN2により3回パージした、次いで、H2雰囲気下(15Psi)、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトを通して濾過した。母液を真空下で濃縮して、生成物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(140mg、264μmol、88%収率)を黄色油として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:664。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、226μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(61.2mg、680μmol、3.0当量)、およびDIEA(176mg、1.36mmol、238μL、6.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、HATU(258.44mg、679.69μmol、3当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(5.0mL)に加え、酢酸エチル(5.0mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例518、37.9mg、60.1μmol、27%収率、96%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:602。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.70(br d,J=8.0Hz,1H),7.65(t,J=8.2Hz,1H),7.45-7.37(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.18(m,2H),5.53-5.32(m,1H),5.30-5.22(m,1H),5.21-5.03(m,1H),4.97-4.68(m,1H),4.52-4.42(m,1H),4.29-4.20(m,2H),4.18-4.03(m,2H),3.95-3.68(m,2H),3.60-3.41(m,2H),3.39-3.30(m,1H),3.26-3.15(m,2H),3.15-2.95(m,2H),2.92(s,3H),2.90-2.54(m,4H),2.53-2.46(m,4H),2.45-2.35(m,1H),2.13-1.97(m,1H)。
実施例519
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップ1:O1-tert-ブチル O2-メチル(2R,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート。O1-tert-ブチル O2-メチル(2R,4R)-4-ヒドロキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(2.1g、8.56mmol、1当量)のMeCN(42mL)中溶液に、Ag2O(5.95g、25.7mmol、3当量)およびCH3I(7.75g、54.6mmol、3.40mL、6.38当量)を加えた。この反応混合物を33℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=8/1~5/1)により精製して、O1-tert-ブチル O2-メチル(2R,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(1.88g、6.89mmol、80%収率、95.0%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.45-4.26(m,1H),3.96-3.89(m,1H),3.72(s,3H),3.68-3.55(m,1H),3.54-3.43(m,1H),3.27(s,3H),2.38-2.17(m,2H),1.51-1.37(m,9H)。
ステップ2:[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。O1-tert-ブチル O2-メチル(2R,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(2.98g、11.5mmol、1当量)のTHF(60mL)中溶液に、LiAlH4(872mg、23.0mmol、2当量)を0℃で加え、混合物を0℃で1時間撹拌した。次いで、反応混合物を80℃まで加熱し、2時間撹拌した。混合物を飽和Na2SO4水溶液(3mL)でクエンチし、次いで、濾過し、濾過ケーキをTHF(3×20mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.53g、10.0mmol、87%収率、95.0%純度)を褐色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.82-3.76(m,1H),3.69(dd,J=3.2,11.2Hz,1H),3.45(dd,J=1.6,10.8Hz,1H),3.29(s,3H),3.18(d,J=10.4Hz,1H),2.62(br s,1H),2.42(tdd,J=2.8,6.4,9.2Hz,1H),2.38-2.33(m,1H),2.32(s,3H),2.16(ddd,J=6.8,8.8,14.0Hz,1H),1.92(tdd,J=1.6,6.8,14.0Hz,1H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(1.37g、9.42mmol、2.8当量)のトルエン(40mL)中溶液に、t-BuONa(970mg、10.1mmol、3当量)を0℃で加え、次いで、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2g、3.36mmol、1当量)を0℃で加え、反応混合物を0℃で0.5時間撹拌した。水(20mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=57%)により精製して、(ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1.8g、2.53mmol、75%収率、95.0%純度))を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:676。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.60(m,2H),7.47-7.31(m,7H),7.27-7.16(m,2H),5.21(s,2H),4.67(br s,1H),4.45(br dd,J=4.4,10.0Hz,1H),4.24-4.16(m,2H),4.10-3.96(m,2H),3.96-3.65(m,3H),3.59-3.40(m,2H),3.29(d,J=1.6Hz,3H),3.25-3.06(m,4H),3.00(dt,J=3.6,12.4Hz,1H),2.91(s,3H),2.81-2.55(m,4H),2.45(d,J=6.0Hz,3H),2.42-2.29(m,2H),1.88-1.68(m,2H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(2g、2.96mmol、1当量)およびNH3・MeOH(20mL、20%純度)のMeOH(40mL)中溶液に、Pd/C(1g、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、20℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.29g、2.26mmol、76%収率、95%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:542。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、277μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(74.8mg、831μmol、3当量)、およびTEA(336mg、1.66mmol、462μL、50%純度、6当量)のEtOAc(3mL)中溶液に、T3P(264mg、831μmol、247μL、3当量)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。水(4mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(3×8mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=32%)により精製した。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例519、59.5mg、97.0μmol、35%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:614。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.0Hz,1H),7.45-7.38(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),5.53-5.33(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.88(br s,1H),4.50-4.41(m,1H),4.30-3.99(m,4H),3.96-3.71(m,3H),3.59-3.40(m,2H),3.30(s,3H),3.25-3.15(m,3H),3.14-2.94(m,2H),2.92(s,3H),2.90-2.74(m,2H),2.73-2.55(m,2H),2.45(d,J=5.6Hz,3H),2.42-2.29(m,2H),1.81(br dd,J=7.2,14.4Hz,1H)。
実施例520
2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(609.98mg、4.04mmol、3.0当量)およびt-BuONa(388mg、4.04mmol、3.0当量)のトルエン(2.0mL)中溶液に、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.35mmol、1.0当量)のトルエン(4.0mL)中溶液を0℃で滴加した。反応混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(15.0mL)で洗浄し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(50.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、濾過し、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュHPLC[C18、水中0.1%のFA、0~80%MeCN]により精製した。次いで、得られた生成物を濃縮し、水相を酢酸エチル(3×50.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(750mg、1.08mmol、80.1%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:682。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(650mg、953μmol、1.0当量)およびPd/C(200mg、10%純度)を、MeOH(8.0mL)およびNH3・MeOH(8.0mL、20%純度)中に加え、次いで、混合物に対してH2による脱気とパージを3回繰り返し、次いで、混合物をH2(15psi)雰囲気下、20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、粗製混合物をセライトパッドで濾過した。ケーキをMeOH(50.0mL)で洗浄し、濾液を高真空下で乾燥した。化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(420mg、736μmol、77.2%収率、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:548。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(420mg、822μmol、1.0当量)およびピリジン(520mg、6.57mmol、531μL、8.0当量)のDCM(6.0mL)中溶液に、(E)-4-ブロモブタ-2-エノイルクロリド(603mg、3.29mmol、4.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。生成物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(500mg、粗製)を黄色油として得た。この粗生成物を、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:695。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-[(E)-4-ブロモブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(500mg、720μmol、1.0当量)およびK2CO3(995mg、7.20mmol、10.0当量)のMeCN(12.0mL)中溶液に、3-フルオロアゼチジン(482mg、4.32mmol、6.0当量、HCl)を0℃で加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を水(10.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:メタノール=100:1)により精製し、次いで、粗生成物を濃縮し、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150×25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~79%、10分];B%:45%~75%、12分)および凍結乾燥により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例520、45.8mg、66.5μmol、9.24%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:689。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.63(m,2H),7.47-7.32(m,2H),7.27-7.18(m,2H),6.88(br d,J=15.3Hz,1H),6.42(br d,J=15.4Hz,1H),5.27-5.05(m,1H),4.64(br s,1H),4.48-4.41(m,1H),4.31-4.18(m,2H),4.16-3.95(m,2H),3.94-3.84(m,1H),3.82-3.66(m,3H),3.54(br d,J=7.6Hz,1H),3.50-3.36(m,2H),3.34(br d,J=3.8Hz,2H),3.30-3.24(m,1H),3.24-3.08(m,4H),3.07-2.95(m,2H),2.92(s,3H),2.86-2.76(m,1H),2.76-2.57(m,3H),2.57-2.47(m,1H),2.46(d,J=4.5Hz,3H),2.34-2.17(m,1H)。
実施例521
2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(720mg、1.03mmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(4.62g、40.5mmol、3mL、39.4当量)を加えた。混合物を20℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をDCM(10mL)で希釈し、NaHCO3飽和水溶液で中和した。次いで、水相をEtOAc(2×30mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(880mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(500mg、粗製)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(61.1mg、679μmol)、およびTEA(294mg、2.91mmol、405μL)のDMF(10mL)中溶液に、T3P(926mg、1.45mmol、865μL、EtOAc中50%純度)を-40℃で加えた。次いで、混合物を-40℃で0.5時間および0℃でさらに0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(20mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3飽和水溶液により中和し、EtOAc(2×70mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex SynergiC18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%~40%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例521、52.5mg、79.8μmol、2ステップ15%収率、96.4%純度、FA)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:588。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.03(s,1H),7.15(s,1H),5.53-5.34(m,1H),5.25(br dd,J=3.2,16.8Hz,1H),5.02-4.61(m,3H),4.43(dd,J=4.8,11.6Hz,1H),4.27(s,2H),4.19(br d,J=13.2Hz,1H),4.01(br d,J=12.4Hz,1H),3.68-3.56(m,1H),3.55-3.50(m,2H),3.49-3.21(m,3H),3.14(br s,1H),2.98(br s,1H),2.91-2.61(m,7H),2.41(s,3H),2.34(s,3H),2.23(qd,J=8.4,12.4Hz,1H),2.14-1.95(m,3H)。
実施例522
2-((S)-4-(2-(((2R,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、378μmol、1.0当量)、(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸(169mg、491μmol、1.3当量)、およびDIEA(293mg、2.27mmol、395μL、6.0当量)のDCM(3.0mL)中溶液に、HATU(431mg、1.13mmol、3.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10mL)に加え、酢酸エチル(2×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=20:1)により精製した。生成物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(290mg、339μmol、90%収率)を黄色固体として得た。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(290mg、339μmol、1.0当量)のジクロロメタン(1.5mL)中溶液に、TFA(2.31g、20.3mmol、1.5mL、59.8当量)を加え、混合物を20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮して、次いで、ジクロロメタン(10.0mL)を加え、有機層を飽和NaHCO3水溶液(2×10.0mL)で洗浄し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=20:1)により精製した。次いで、粗生成物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例522、61.3mg、99.9μmol、29%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:614。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.73-7.61(m,2H),7.46-7.31(m,2H),7.27-7.18(m,2H),7.06(br d,J=14.8Hz,1H),6.62(br d,J=14.8Hz,1H),5.27-4.97(m,1H),4.74-4.55(m,1H),4.52-4.34(m,3H),4.31-4.16(m,2H),4.15-3.96(m,2H),3.94-3.58(m,3H),3.56-3.48(m,1H),3.46-3.41(m,1H),3.36-3.29(m,1H),3.26-3.07(m,3H),3.04-2.97(m,1H),2.92(s,3H),2.85-2.57(m,4H),2.49(d,J=4.8Hz,3H),2.45-2.34(m,1H),2.29-1.91(m,2H)。
実施例523
2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、369μmol、1当量)、(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エン酸(254mg、738μmol、2当量)、およびTEA(374mg、3.69mmol、514μL、10当量)のEtOAc(4mL)中溶液に、T3P(705mg、1.11mmol、659μL、50%純度、3当量)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。水(10mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(5mL)で希釈し、EtOAc(15mL)で抽出した。有機層をブライン(10mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させて、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=70%)により精製して、2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、262μmol、71%収率、99%純度)を黄色固体として得た。
ステップB:2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-トリチルオキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(230mg、265μmol、1当量)のDCM(2.3mL)中溶液に、TFA(3.54g、31.1mmol、2.3mL、117当量)を加え、混合物を15℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO3(30mL)によりPH=7~8に塩基化し、次いで、DCM(2×15mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=32%)により精製した。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:37%~67%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例523、41.7mg、66.6μmol、25%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:626。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.0Hz,1H),7.45-7.38(m,1H),7.37-7.31(m,1H),7.27-7.17(m,2H),7.07(br d,J=14.8Hz,1H),6.62(br d,J=14.0Hz,1H),5.07(br s,1H),4.85-4.55(m,1H),4.51-4.37(m,3H),4.30-3.97(m,4H),3.94-3.65(m,2H),3.58-3.40(m,2H),3.29(d,J=1.6Hz,3H),3.25-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.86-2.54(m,4H),2.45(d,J=4.8Hz,3H),2.42-2.28(m,2H),1.81(br dd,J=8.9,13.6Hz、1H)。
実施例524
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(100mg、0.1879mmol)、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(32.73mg、0.2819mmol)、およびN,N-ジメチルホルムアミド(1mL、12.79mmol)の撹拌混合物を、0℃まで冷却し、続いて、トリエチルアミン(0.07859mL、0.5638mmol)およびEtOAc(0.1678mL、0.2819mmol)中50%の2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン 2,4,6-三酸化物を加えた。反応混合物を室温に暖めながら2時間撹拌した。混合物を0.5MのNa2CO3(5mL)とEtOAc(15mL)との間で分配し、有機成分を分離した。次に有機成分を水およびブライン(各5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で留去した。次に残留物を、4%MeOH+0.4%NH4OH/DCMを溶出液として使用してシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、不純物を含む物質を得、これを5~75%のACN+0.1%TFA/H2O+0.1%TFAにより溶出するGilson逆分取HPLCによりさらに精製した。不純物を含まない生成物を含有する画分を合わせ、DCMと飽和Na2CO3溶液との間で分配し、層を分離した。次に有機成分をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、不純物を含まない標記化合物(実施例524、33mg、28%)を得た。ESI+APCI MS m/z 630.3[M+]。
実施例525
N-(3-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-3-オキソプロパ-1-エン-2-イル)アセトアミド
ステップA:N-(3-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-3-オキソプロパ-1-エン-2-イル)アセトアミド:0℃まで冷却したジクロロメタン(2932μl、0.2932mmol)を含む25mL丸底フラスコに、2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(150mg、0.2932mmol)およびヒューニッヒ塩基(307.2μl、1.759mmol)を加えた。2-アセトアミドアクリル酸(227.1mg、1.759mmol)を1度に加えると共に、反応混合物を強く撹拌した。次に、1-プロパンホスホン酸環状無水物(1047μl、1.759mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を0℃で2時間撹拌した。反応物を塩基性水で処理し、水層をEtOAc(3×)で抽出した。合わせた有機成分を減圧下で濃縮し、5→95%ACN+0.1%TFA/水+0.1%TFAにより溶出するGilson(分取HPLC)上で精製した。生成物を含有する画分を合わせ、1MのNaOHにより塩基化し、水層をDCM(2×)で抽出した。有機成分をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、標記化合物であるN-(3-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-3-オキソプロパ-1-エン-2-イル)アセトアミド(実施例525、124.2mg、68.03%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 623.3[M+H]+。
実施例526
2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-3-(ピリジン-4-イル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-3-(ピリジン-4-イル)アクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例525に従って、ステップAで、2-アセトアミドアクリル酸の代わりにtrans-3-(4-ピリジル)アクリル酸を使用して標記化合物を調製した。ESI+APCIMS m/z 643.3[M+H]+。
実施例527
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
1-ブロモ-5-フルオロ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン。1-ブロモ-5-フルオロ-2-ヨード-3-トルエン(2g、6.35mmol、1当量)のDMF(40mL)中溶液に、CuI(7.26g、38.1mmol、6当量)およびメチル 2,2-ジフルオロ-2-フルオロスルホニル-アセテート(7.32g、38.1mmol、4.85mL、6当量)を加えた。混合物を60℃で12時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、水(20mLの×3)で洗浄した。有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→10/1)で精製した。1-ブロモ-5-フルオロ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(1.3g、3.74mmol、59%収率、74%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.33(dd,J=2.4,7.6Hz,1H),6.95(dd,J=2.0,8.8Hz,1H),2.54(q,J=3.6Hz,3H)。
2-ブロモ-6-フルオロ-4-メチル-3-(トリフルオロメチル)ベンズアルデヒド。1-ブロモ-5-フルオロ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(900mg、3.50mmol、1当量)のTHF(20mL)中混合物に、LDA(THF中2M、3.50mL、2当量)を窒素雰囲気下、-60℃で加えた。0.5時間撹拌後、混合物に、DMF(768mg、10.5mmol、808μL、3当量)を加えた。混合物を-60℃で1時間撹拌した。反応物を飽和NH4Cl水溶液(10mL)でクエンチし、次いで、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機相をブライン(10mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させて、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=200/1→5/1)で精製した。2-ブロモ-6-フルオロ-4-メチル-3-(トリフルオロメチル)ベンズアルデヒド(700mg、2.46mmol、70%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.35(s,1H),7.08(d,J=10.4Hz,1H),2.66-2.58(m,3H)。
4-ブロモ-6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール。2-ブロモ-6-フルオロ-4-メチル-3-(トリフルオロメチル)ベンズアルデヒド(600mg、2.11mmol、1当量)およびヒドラジン一水和物(2.11g、42.1mmol、2.05mL、20当量)のDMSO(8mL)中溶液を60℃で2時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(50mL)で希釈し、水(3×50mL)およびブライン(1×50mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をさらに精製することなく次のステップに使用した。4-ブロモ-6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール(550mg、1.97mmol、94%収率)を白色固体として得た。
4-ブロモ-6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール。4-ブロモ-6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール(500mg、1.79mmol、1当量)のDCM(10mL)中溶液に、4-メチルベンゼンスルホン酸水和物(34.1mg、1791μmol、0.1当量)1を加え、続いて、DHP(603mg、7.17mmol、655μL、4当量)のCH3CN(2mL)中溶液を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(100mL)で希釈し、水(2×100mL)およびブライン(1×50mL)で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 20/1→3/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、4-ブロモ-6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール(600mg、1.54mmol、86%収率、93%純度)を淡黄色ゴムとして得た。LCMS[MSI,M+1]:363。
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、848μmol、1当量)、4-ブロモ-6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール(431mg、1.19mmol、1.4当量)、Pd2(dba)3(155mg、170μmol、0.2当量)、RuPhos(158mg、339μmol、0.4当量)、およびCs2CO3(691mg、2.12mmol、2.5当量)のトルエン(20mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、100℃で16時間撹拌した。混合物に、H2O(20mL×1)および酢酸エチル(20mL×1)を加えた。有機相を分離し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(酢酸エチル/メタノール=50/1→2/1)により精製した。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、535μmol、32%収率、80.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[MSI,M+1]:754。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(470mg、503μmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(2.29g、20.1mmol、1.49mL、40当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物にジクロロメタン(5mL)を加え、飽和NaHCO3水溶液によりpH=8~9に塩基化した。有機相を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(420mg、453μmol、90%収率、61.4%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[MSI,M+1]:570。
ステップC:2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(380mg、410μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(18.4mg、205μmol、0.5当量)、およびTEA(124mg、1.23mmol、171μL、3当量)のDMF(8mL)中溶液に、T3P(391mg、614μmol、365μL、DMF中50%の純度、1.5当量)を-40℃で加えた。次いで、混合物を-40℃で0.5時間および0℃でさらに0.5時間撹拌した。2-フルオロプロパ-2-エン酸(11mg)およびT3P(100μL)を加え、混合物を-40℃でさらに0.5時間撹拌した。混合物を水(15mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:22%~42%、7.8分)および(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:50%~68%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(実施例527)を白色固体として得た。
実施例528
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-(3-フルオロアゼチジン-1-イル)ブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
標記化合物を、実施例520に従って、中間体66のステップEで、(1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールの代わりに(S)-(4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メタノールを使用することにより中間体66を修飾し、修飾された中間体66を中間体71のステップAの条件を使用して脱保護し、次いで、実施例520のステップAで中間体66の代わりに使用して調製した。
実施例529
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例467に従って、塩化アクリロイルの代わりに(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸を使用し、実施例479のステップCの条件を使用して標記化合物を調製した。LCMS[ESI,M+1]:634。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.0Hz,1H),7.66(t,J=8.0Hz,1H),7.45-7.38(m,1H),7.38-7.32(m,1H),7.27-7.18(m,2H),7.09-6.93(m,1H),6.60(br d,J=14.8Hz,1H),5.32-4.93(m,3H),4.64(br s,1H),4.45(td,J=5.2,11.2Hz,1H),4.32-3.63(m,6H),3.58-3.36(m,3H),3.25-2.96(m,5H),2.93(s,3H),2.88-2.77(m,1H),2.75-2.50(m,3H),2.46(d,J=4.4Hz,3H),2.34-2.15(m,1H)。
SFC条件:カラム:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA)、流速:3mL/分、波長:220nm。
実施例530
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例467に従って、塩化アクリロイルの代わりに2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリドを使用し、実施例478のステップAの条件を使用して、標記化合物を調製した。LCMS[ESI,M+1]:620。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.63(m,2H),7.46-7.33(m,2H),7.27-7.18(m,2H),5.54-5.33(d,J=47.6Hz,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.05-4.62(m,1H),4.58-4.37(m,1H),4.31-4.13(m,3H),4.12-4.05(m,1H),3.97-3.73(m,1H),3.59-3.36(m,3H),3.27-2.95(m,6H),2.92(s,3H),2.89-2.49(m,5H),2.46(d,J=4.4Hz,3H),2.34-2.17(m,1H)。
SFC条件:「カラム:Chiralcel OJ-3 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%のDEA)、流速:3mL/分、波長:220nm」。
実施例531
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例467に従って、塩化アクリロイルの代わりに(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸を使用し、実施例489のステップAの条件を使用して、標記化合物を調製した。
実施例532
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例467に従って、塩化アクリロイルの代わりに4-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシブタ-2-イン酸を使用し、実施例483のステップAの条件を使用して、標記化合物を調製した。
実施例533
(S,E)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-フルオロブタ-2-エン-1-オン
標記化合物を、実施例469に従って、実施例479のステップCで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸を使用して調製した。
実施例534
(S,E)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-メトキシブタ-2-エン-1-オン
標記化合物を、実施例469に従って、実施例489のステップAで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに2-(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸を使用して調製した。
実施例535
(S)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-2-フルオロプロパ-2-エン-1-オン
実施例469に従って、実施例478のステップAで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに2-フルオロアクリル酸を使用して標記化合物を調製した。
実施例536
(S,E)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-ヒドロキシブタ-2-エン-1-オン
実施例469に従って、実施例469のステップDで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに4-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシブタ-2-イン酸を使用し、実施例483のステップAの手順に従って、標記化合物を調製した。
実施例537
(S)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-2-フルオロプロパ-2-エン-1-オン
実施例470に従って、実施例478のステップAで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸を使用して標記化合物を調製した。
実施例538
(S,E)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-フルオロブタ-2-エン-1-オン
標記化合物を、実施例470に従って、実施例479のステップCで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸を使用して調製した。
実施例539
(S)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-2-フルオロプロパ-2-エン-1-オン
実施例470に従って、実施例478のステップAで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに2-フルオロアクリル酸を使用して標記化合物を調製した。
実施例540
(S,E)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-メトキシブタ-2-エン-1-オン
標記化合物を、実施例470に従って、実施例489のステップAで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに2-(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸を使用して調製した。
実施例541
(S,E)-1-(4-(2-((4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-ヒドロキシブタ-2-エン-1-オン
実施例470に従って、実施例470のステップCで、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに4-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシブタ-2-イン酸を使用し、実施例483のステップAの手順に従って、標記化合物を調製した。
実施例542
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例468に従って、塩化アクリロイルの代わりに2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリドを使用し、実施例479のステップCの条件を使用して標記化合物を調製した。LCMS[ESI,M+1]:655。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=7.2Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.50-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),7.08-6.94(m,1H),6.60(br d,J=14.8Hz,1H),5.26-5.03(m,2H),4.90-4.58(m,1H),4.52-4.38(m,2H),4.31-4.21(m,1H),4.19-3.98(m,2H),3.97-3.72(m,2H),3.66-7.56(m,1H),3.53-3.37(m,2H),3.34-3.11(m,3H),3.07-2.92(m,2H),2.89-2.79(m,1H),2.77-2.48(m,4H),2.47(d,J=2.4Hz,3H),2.35-2.18(m,1H)。
実施例543
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例468に従って、塩化アクリロイルの代わりに2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリドを使用し、実施例478のステップAの条件を使用して標記化合物を調製した。LCMS[ESI,M+1]:640。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=7.2Hz,1H),7.53(d,J=7.6Hz,1H),7.45(td,J=7.6,12.4Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.19(m,1H),5.54-5.33(dd,J=2.8,47.6Hz,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.85(br s,1H),4.51-4.38(m,2H),4.31-3.77(m,4H),3.69-3.54(m,1H),3.41(m,2H),3.35-2.48(m,11H),2.47(d,J=2.4Hz,3H),2.35-2.16(m,1H)。
SFC:「カラム:Cellucoat 50×4.6mm I.D.、3μm、移動相:5%~40%のCO2中メタノール(0.05%DEA) 流速:3mL/分 波長:220nm」。
実施例544
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例468に従って、塩化アクリロイルの代わりに(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸を使用し、実施例489のステップAの条件を使用して、標記化合物を調製した。
実施例545
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例468に従って、塩化アクリロイルの代わりに4-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシブタ-2-イン酸を使用し、実施例483のステップAの条件を使用して、標記化合物を調製した。
実施例546
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例527に従って、塩化アクリロイルの代わりに2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリドを使用し、実施例479のステップCの条件を使用して、標記化合物を調製した。
実施例547
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例527に従って、塩化アクリロイルの代わりに2-フルオロプロパ-2-エノイルクロリドを使用し、実施例478のステップAの条件を使用して標記化合物を調製した。
実施例548
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例527に従って、塩化アクリロイルの代わりに(メトキシメチル)プロパ-2-エン酸を使用し、実施例489のステップAの条件を使用して、標記化合物を調製した。
実施例549
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-ヒドロキシブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
実施例527に従って、塩化アクリロイルの代わりに4-[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシブタ-2-イン酸を使用し、実施例483のステップAの条件を使用して、標記化合物を調製した。
実施例550
2-((S)-4-(7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-1-アクリロイル-4-(7-(5,6-ジメチル-1H-インドール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:実施例466に従って、実施例478のステップAに記載のように、プロパ-2-エノイル プロパ-2-エノエートの代わりに2-フルオロアクリル酸を使用して標記化合物を調製した。
実施例551
2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、378μmol、1.0当量)、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(110mg、944μmol、2.5当量)のDMF(3.0mL)中溶液に、TEA(382mg、3.78mmol、526μL、10.0当量)およびT3P(721mg、1.13mmol、674μL、50%純度、3.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を水(10.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、濾過した。次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=10:1~1:1)により精製し、次いで、粗生成物を濃縮し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150×25mm×10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:48%~78%、9~10分)および凍結乾燥により再精製して、標記化合物を得、2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例551、50mg、79.6μmol、21%収率、99.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:628。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.62(m,2H),7.45-7.31(m,2H),7.27-7.18(m,2H),7.05-6.94(m,1H),6.55(br d,J=15.0Hz,1H),5.23-5.03(m,1H),4.66(br s,1H),4.52-4.42(m,1H),4.30-4.18(m,2H),4.18-3.94(m,4H),3.93-3.84(m,1H),3.83-3.65(m,1H),3.54(br d,J=6.7Hz,1H),3.44(s,3H),3.42-3.26(m,2H),3.25-3.15(m,2H),3.05(br dd,J=8.5,16.4Hz,2H),2.92(s,3H),2.88-2.58(m,4H),2.57-2.35(m,5H),2.14-1.96(m,1H)。
実施例552
2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、277μmol、1当量)、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(64.3mg、554μmol、2当量)、およびTEA(280mg、2.77mmol、385μL、10当量)のDMF(3mL)中溶液に、T3P(529mg、831μmol、494μL、50%純度、3当量)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。水(10mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(5mL)で希釈し、EtOAc(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=35%)により精製した。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~74%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例552、37.1mg、57.2μmol、21%収率、98.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:640。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.72-7.61(m,2H),7.45-7.31(m,2H),7.27-7.17(m,2H),6.99(br d,J=14.8Hz,1H),6.55(br d,J=15.2Hz,1H),5.07(br s,1H),4.51-4.40(m,1H),4.31-4.04(m,5H),3.95-3.68(m,3H),3.63-3.47(m,2H),3.44(s,3H),3.42-3.35(m,1H),3.30(d,J=1.2Hz,3H),3.24-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.76(br dd,J=8.0,16.8Hz,1H),2.72-2.52(m,3H),2.45(d,J=5.2Hz,3H),2.41-2.27(m,2H),1.81(br dd,J=7.2,14.0Hz,1H)。
実施例553
2-((S)-1-((E)-4-メトキシブタ-2-エノイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((R)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:メチル 3-ヒドロキシ-4-メトキシ-ブタノエート。メチル 4-メトキシ-3-オキソ-ブタノエート(20g、137mmol、1.0当量)のトルエン(300mL)中溶液に、NaBH4(5.44g、144mmol、1.05当量)を0℃で加えた。次いで、混合物を20℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(100mL)により0℃で希釈し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。抽出物をブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下濃縮して、メチル 3-ヒドロキシ-4-メトキシ-ブタノエート(7.5g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.23-4.15(m,1H),3.70(s,3H),3.44-3.38(m,2H),3.37(s,3H),3.04(br s,1H),2.51(d,J=6.4Hz,2H)。
ステップB:メチル(E)-4-メトキシブタ-2-エノエート。メチル 3-ヒドロキシ-4-メトキシ-ブタノエート(7.5g、粗製)のDCM(50.0mL)中溶液に、TEA(5.12g、50.6mmol、7.05mL)およびMsCl(8.70g、75.9mmol、5.88mL)を0℃で加えた。4時間撹拌した後、混合物にTEA(10.2g、101mmol、14.1mL)を0℃で加えた。混合物を20℃まで温め、12時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(50.0mL)で希釈し、HCl(1N、15.0mL)およびブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~50:1)により精製して、メチル(E)-4-メトキシブタ-2-エノエート(1.7g、11.8mmol、2ステップで8.6%収率、90%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.93(td,J=4.3,15.8Hz,1H),6.04(td,J=2.0,15.8Hz,1H),4.06(dd,J=2.0,4.3Hz,2H),3.72(s,3H),3.36(s,3H)。
ステップC:(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸。メチル(E)-4-メトキシブタ-2-エノエート(300mg、2.31mmol、1.0当量)およびKOH(517mg、9.22mmol、4.0当量)のMeOH(2.0mL)およびH2O(2.0mL)中混合物を、20℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をHCl(2N、5.0mL)によりpH=1~3に酸性化し、酢酸エチル(2×20mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(200mg、1.55mmol、67.3%収率、90%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=11.13(br s,1H),7.06(td,J=4.1,15.7Hz,1H),6.08(td,J=2.0,15.7Hz,1H),4.12(dd,J=2.0,4.1Hz,2H),3.40(s,3H)。
ステップD:2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、391μmol、1当量)、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(113mg、977μmol、2.5当量)、TEA(395mg、3.91mmol、544μL、10当量)のDMF(4mL)中溶液に、T3P(746mg、1.17mmol、697μL、50%純度、3当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.3時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、水(10mL×3)で洗浄した。有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=100/1~10:1)により精製し、分取HPLC(カラム:Boston pH-lex 150*25 10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:35%~59%、8分)によりさらに精製した。混合物を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(実施例553、37.5mg、60.4μmol、15%収率、98.2%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:610。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.77-7.57(m,2H),7.46-7.37(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),6.99(br d,J=14.4Hz,1H),6.55(br d,J=14.8Hz,1H),5.24-4.49(m,1H),4.46-4.32(m,1H),4.32-3.74(m,7H),3.73-3.25(m,6H),3.25-2.94(m,5H),2.92(s,3H),2.86-2.54(m,4H),2.49(d,J=5.6Hz,3H),2.38-2.23(m,1H),2.11-2.00(m,1H),1.93-1.65(m,3H)。
実施例554
2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(850mg、1.80mmol、1.0当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(1.20g、5.41mmol、3.0当量)、Pd2(dba)3(330mg、360μmol、0.20当量)、キサントホス(417mg、721μmol、0.40当量)、およびCs2CO3(1.76g、5.41mmol、3.0当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2下、90℃で8時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を2N HCl(2×15.0mL)で洗浄した。水相を固体のNaHCO3でpH約7に塩基化し、酢酸エチル(2×50.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュHPLC[C18、水中0.1%FA、0~65%MeCN]により精製し、固体のNaHCO3によりpH約7に調整し、酢酸エチル(2×150mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(650mg、1.03mmol、57%収率、97%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:612。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.72-7.61(m,2H),7.44-7.37(m,1H),7.36-7.30(m,1H),7.27-7.16(m,2H),4.63-4.52(m,1H),4.46-4.36(m,1H),4.30-4.15(m,2H),4.09-3.95(m,2H),3.93-3.73(m,2H),3.57-3.47(m,1H),3.42-3.27(m,1H),3.22-3.04(m,4H),3.02-2.94(m,1H),2.92(s,3H),2.81-2.54(m,4H),2.53-2.47(m,3H),2.40-2.26(m,1H),2.12-2.05(m,1H),1.92-1.71(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、981μmol、1.0当量)のジオキサン(3.0mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、3.0mL、12.2当量)を25℃で加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をNaHCO3飽和水溶液(8.0mL)により0℃でクエンチし、次いで、H2O(5.0mL)で希釈し、酢酸エチル(3×15.0mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(410mg、粗製)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、293μmol、1.0当量)、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(102mg、880μmol、3.0当量)の酢酸エチル(3.0mL)中溶液に、TEA(237mg、2.35mmol、326μL、8.0当量)およびT3P(560mg、880μmol、523μL、50%純度、3.0当量)を0℃で加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(5.0mL)を加えた。有機層を分離し、水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4により乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:メタノール=50:1)により精製して、粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:50%~77%、10分)および凍結乾燥により再精製した。化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(38.6mg、62.4μmol、21%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップD:2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、293μmol、1.0当量)、(E)-4-メトキシブタ-2-エン酸(102mg、880μmol、3.0当量)の酢酸エチル(3.0mL)中溶液に、TEA(237mg、2.35mmol、326μL、8.0当量)およびT3P(560mg、880μmol、523μL、50%純度、3.0当量)を0℃で加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(5.0mL)を加えた。有機層を分離し、水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4により乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:メタノール=50:1)により精製して、粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:50%~77%、10分)および凍結乾燥により再精製した。化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-メトキシブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(38.6mg、62.4μmol、21%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:610。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.73-7.62(m,2H),7.45-7.31(m,2H),7.26-7.17(m,2H),6.99(br d,J=15.2Hz,1H),6.55(br d,J=15.6Hz,1H),5.20-4.50(m,1H)4.43-4.33(m,1H),4.29-3.96(m,6H),3.94-3.83(m,1H),3.81-3.63(m,1H),3.58-3.37(m,5H),3.23-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.87-2.54(m,4H),2.52-2.43(m,3H),2.33-2.24(m,1H),2.13-2.01(m,1H),1.87-1.72(m,3H)。
実施例555
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
1-ブロモ-5-フルオロ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン。1-ブロモ-5-フルオロ-2-ヨード-3-トルエン(2g、6.35mmol、1当量)のDMF(40mL)中溶液に、CuI(7.26g、38.1mmol、6当量)およびメチル 2,2-ジフルオロ-2-フルオロスルホニル-アセテート(7.32g、38.1mmol、4.85mL、6当量)を加えた。混合物を60℃で12時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、水(20mLの×3)で洗浄した。有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→10/1)で精製した。1-ブロモ-5-フルオロ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(1.3g、3.74mmol、59%収率、74%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.33(dd,J=2.4,7.6Hz,1H),6.95(dd,J=2.0,8.8Hz,1H),2.54(q,J=3.6Hz,3H)。
2-ブロモ-6-フルオロ-4-メチル-3-(トリフルオロメチル)ベンズアルデヒド。1-ブロモ-5-フルオロ-3-メチル-2-(トリフルオロメチル)ベンゼン(900mg、3.50mmol、1当量)のTHF(20mL)中混合物に、LDA(THF中の2M、3.50mL、2当量)を窒素下、-60℃で加えた。0.5時間撹拌後、混合物に、DMF(768mg、10.5mmol、808μL、3当量)を加えた。混合物を-60℃で1時間撹拌した。反応物を飽和NH4Cl水溶液(10mL)でクエンチし、次いで、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機相をブライン(10mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させて、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=200/1→5/1)で精製した。2-ブロモ-6-フルオロ-4-メチル-3-(トリフルオロメチル)ベンズアルデヒド(700mg、2.46mmol、70%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.35(s,1H),7.08(d,J=10.4Hz,1H),2.66-2.58(m,3H)。
4-ブロモ-6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール。2-ブロモ-6-フルオロ-4-メチル-3-(トリフルオロメチル)ベンズアルデヒド(600mg、2.11mmol、1当量)およびヒドラジン一水和物(2.11g、42.1mmol、2.05mL、20当量)のDMSO(8mL)中溶液を60℃で2時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(50mL)で希釈し、水(3×50mL)およびブライン(1×50mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をそれ以上精製せずに次のステップで使用した。4-ブロモ-6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール(550mg、1.97mmol、94%収率)を白色固体として得た。
4-ブロモ-6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール。4-ブロモ-6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール(500mg、1.79mmol、1当量)のDCM(10mL)中溶液に、4-メチルベンゼンスルホン酸水和物(34.1mg、1791μmol、0.1当量)を加え、続いて、DHP(603mg、7.17mmol、655μL、4当量)のCH3CN(2mL)中溶液を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。混合物を酢酸エチル(100mL)で希釈し、水(2×100mL)およびブライン(1×50mL)で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル 20/1→3/1)で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、4-ブロモ-6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール(600mg、1.54mmol、86%収率、93%純度)を淡黄色ゴムとして得た。LCMS[MSI,M+1]:363。
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、848μmol、1当量)、4-ブロモ-6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール(431mg、1.19mmol、1.4当量)、Pd2(dba)3(155mg、170μmol、0.2当量)、RuPhos(158mg、339μmol、0.4当量)、およびCs2CO3(691mg、2.12mmol、2.5当量)のトルエン(20mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、N2下、100℃で16時間撹拌した。混合物に、H2O(20mL×1)および酢酸エチル(20mL×1)を加えた。有機相を分離し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(酢酸エチル/メタノール=50/1→2/1)により精製した。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、535μmol、32%収率、80.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[MSI,M+1]:754。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-5-(トリフルオロメチル)インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(470mg、503μmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(2.29g、20.1mmol、1.49mL、40当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物にジクロロメタン(5mL)を加え、NaHCO3飽和水溶液によりpH=8~9に塩基化した。有機相を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(420mg、453μmol、90%収率、61.4%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[MSI,M+1]:570。
ステップC:2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(380mg、410μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(18.4mg、205μmol、0.5当量)、およびTEA(124mg、1.23mmol、171μL、3当量)のDMF(8mL)中溶液に、T3P(391mg、614μmol、365μL、DMF中50%の純度、1.5当量)を-40℃で加えた。次いで、混合物を-40℃で0.5時間および0℃でさらに0.5時間撹拌した。2-フルオロプロパ-2-エン酸(11mg)およびT3P(100μL)を加え、混合物を-40℃でさらに0.5時間撹拌した。混合物を水(15mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%のFA)-MeCN];B%:22%~42%、7.8分)および(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mMのNH4HCO3)-MeCN];B%:50%~68%、12分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチル-5-(トリフルオロメチル)-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:642。
実施例556
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
3-ブロモ-1-(メトキシメトキシ)ナフタレン。4-ブロモナフタレン-2-オール(3.50g、15.7mmol、1.0当量)のDMF(35.0mL)中溶液に、NaH(941mg、23.5mmol、60%純度、1.50当量)を加えた。添加後、混合物をこの温度で0.5時間撹拌し、次いで、クロロ(メトキシ)メタン(5.90g、73.3mmol、5.57mL、4.67当量)を0℃で滴加した。混合物を30℃まで暖め、さらに1時間撹拌した。撹拌が完了したら、合わせた反応混合物を水(100mL)で希釈し、EtOAc(3×50.0mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1/0→100/1)で精製した。化合物である3-ブロモ-1-(メトキシメトキシ)ナフタレン(3.50g、13.1mmol、84%収率)を赤色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.19-8.12(m,1H),7.78-7.71(m,1H),7.61-7.57(m,1H),7.52-7.44(m,2H),7.40(d,J=2.0Hz,1H),5.29(s,2H),3.53(s,3H)。
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(メトキシメトキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(800mg、1.70mmol、1.0当量)および1-ブロモ-3-(メトキシメトキシ)ナフタレン(680mg、2.54mmol、1.50当量)のトルエン(10.0mL)中溶液に、Cs2CO3(2.21g、6.79mmol、4.00当量)、RuPhos(158mg、339μmol、0.20当量)、およびPd2(dba)3(233mg、254μmol、0.15当量)を加えた。混合物を90℃で6時間撹拌した。反応混合物を100mLのH2Oで希釈し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を減圧下で濃縮し、残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル)]によりさらに精製した。混合物をNaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(3×50.0mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、生成物を得た。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(メトキシメトキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、426μmol、25%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:658。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ8.09(d,J=8.0Hz,1H),7.75(d,J=8.2Hz,1H),7.45(t,J=7.0Hz,1H),7.40-7.34(m,1H),7.16(d,J=2.0Hz,1H),6.87(d,J=2.4Hz,1H),5.30(s,2H),4.63(br s,1H),4.40(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.33-4.22(m,2H),4.21-4.16(m,1H),4.09-3.86(m,3H),3.54(s,3H),3.51-3.40(m,1H),3.37-3.17(m,3H),3.15-2.96(m,3H),2.89-2.73(m,3H),2.72-2.64(m,1H),2.49(s,3H),2.33-2.25(m,1H),2.13-2.05(m,1H),1.91-1.78(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-[3-(メトキシメトキシ)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(260mg、395μmol、1.0当量)のジオキサン(2.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、98.8μL、1.0当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和ブライン(30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。化合物である2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、373μmol、94%収率、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:514。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、389μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(105mg、1.17mmol、3.0当量)のDMF(4.00mL)中溶液に、TEA(158mg、1.56mmol、217μL、4.0当量)およびT3P(743mg、1.17mmol、695μL、50%純度、3.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をH2O(10.0mL)で希釈し、DCM(3×10.0mL)で抽出した。合わせた有機層を、飽和ブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=10/1→DCM/MeOH=5/1)により精製し、残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mMのNH4HCO3)-MeCN];B%:45%~75%、12分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(3-ヒドロキシ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(50.0mg、85.0μmol、22%収率、99.6%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:586。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.94(br d,J=8.4Hz,1H),7.62(d,J=8.0Hz,1H),7.40(t,J=7.2Hz,1H),7.31-7.26(m,1H),6.86(s,1H),6.52(br s,1H),5.51-5.29(m,1H),5.25(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.95-4.35(m,2H),4.24(dd,J=4.4,11.2Hz,1H),4.15-3.93(m,3H),3.85-3.69(m,1H),3.45-3.26(m,1H),3.25-3.18(m,2H),3.17-2.95(m,2H),2.94-2.73(m,3H),2.72-2.62(m,5H),2.60-2.50(m,1H),2.45-2.35(m,1H),2.15-2.06(m,1H),2.01-1.93(m,1H),1.88-1.74(m,3H)。
実施例557
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(934mg、8.11mmol、3.0当量)およびt-BuONa(780mg、8.11mmol、3.0当量)のトルエン(15.0mL)中溶液に、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.5g、2.70mmol、1.0当量)のトルエン(10.0mL)中溶液を0℃で滴加した。反応混合物を0℃でさらに0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物を水(30.0mL)でクエンチした。粗製混合物を酢酸エチル(2×50.0mL)で抽出した。合わせた抽出物をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物を逆相フラッシュHPLC[C18、水中0.1%のFA、0~65%MeCN]により精製し、NaHCO3によりpH=8に酸性化し、酢酸エチル(2×150mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(820mg、1.26mmol、47%収率、93%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:606。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.42-7.29(m,5H),5.18(s,2H),4.69(br d,J=18.6Hz,1H),4.59(br s,1H),4.44(d,J=18.8Hz,1H),4.34(br s,1H),4.05-3.69(m,4H),3.42(br s,1H),3.24(br d,J=13.0Hz,2H),3.09(br t,J=7.6Hz,1H),3.02-2.90(m,1H),2.81-2.56(m,5H),2.47(s,3H),2.28(dt,J=7.2,9.4Hz,1H),2.05-1.99(m,1H),1.89-1.67(m,4H),1.51(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。-70℃でNH3をMeOH(10.0mL)中に0.5時間バブリングした。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(820mg、1.35mmol、1.0当量)およびPd/C(250mg、10%純度)を上記混合物に加え、MeOH(10.0mL)、次いで、混合物に対して脱気とH2によるパージを3回実施し、次いで、混合物をH2(15psi)下、20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、粗製混合物をセライトパッドで濾過した。ケーキをMeOH(50.0mL)で洗浄し、濾液を高真空下で乾燥した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.27mmol、94%収率、100%純度)を白色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:472。
ステップC:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(550mg、1.17mmol、1.0当量)、1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン(845mg、3.50mmol、3.0当量)、Pd2(dba)3(160mg、175μmol、0.15当量)、キサントホス(135mg、233μmol、0.20当量)、およびCs2CO3(1.14g、3.50mmol、3.0当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に対し、脱気とN2によるパージを3回実施し、次いで、混合物をN2下、90℃で8時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応物をHCl水溶液(2N、2×15mL)で洗浄した。水相をNaHCO3でpH8に塩基化し、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュHPLC[C18、水中0.1%のFA、0~65%MeCN]により精製し、NaHCO3によりpH=8に酸性化し、酢酸エチル(2×150mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、930μmol、80%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:632。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.75(br d,J=8.2Hz,1H),7.61(t,J=8.0Hz,1H),7.52(d,J=7.5Hz,1H),7.44(td,J=7.8,15.2Hz,1H),7.33(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.17(m,1H),4.61(br s,1H),4.48-4.34(m,2H),4.10-3.91(m,3H),3.90-3.78(m,1H),3.63-3.53(m,1H),3.34(br dd,J=3.6,13.8Hz,1H),3.30-3.01(m,5H),2.95(dt,J=3.5,12.3Hz,1H),2.89-2.75(m,1H),2.70(br s,2H),2.57(br d,J=14.2Hz,1H),2.53-2.46(m,3H),2.35-2.25(m,1H),2.13-2.06(m,1H),1.93-1.66(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、316μmol、1.0当量)のジオキサン(2.0mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、2.0mL、25.3当量)を加えた。混合物をN2下、20℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を真空下で除去した。得られた生成物をNaHCO3飽和水溶液でPh=8に調整し、次いで、濃縮した。水相を酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。粗生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(145mg、259μmol、82%収率、95%純度)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:532
ステップE:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(125mg、235μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(42.3mg、470μmol、2.0当量)の酢酸エチル(2.0mL)中溶液に、TEA(190mg、1.88mmol、262μL、8.0当量)およびT3P(449mg、705μmol、419μL、50%純度、3.0当量)を0℃で加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、有機溶媒を水(5.0mL)で洗浄した。水相を酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機抽出物をブライン(20.0mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し、次いで、溶媒を真空下で除去した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:メタノール=50:1)により精製し、次いで、粗生成物を濃縮し、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150×25mm×10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:55%~85%、11.5分)および凍結乾燥により再精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(22.5mg、37.1μmol、16%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:605。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),5.51-5.32(m,1H),5.26(br dd,J=3.2,16.8Hz,1H),4.90(br s,1H),4.49-4.34(m,2H),4.24-4.01(m,3H),3.97-3.78(m,2H),3.64-3.55(m,1H),3.44(br s,1H),3.32-2.95(m,5H),2.94-2.43(m,7H),2.38-2.20(m,1H),2.14-1.99(m,1H)1.91-1.71(m,3H)。
実施例558
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((2R,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(169mg、1.27mmol、1.5当量)のトルエン(4.0mL)中溶液に、t-BuONa(163mg、1.69mmol、2.0当量)を0℃で加え、反応混合物を0℃で0.5時間撹拌した後、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(470mg、847μmol、1.0当量)を混合物に加え、反応混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(10mL)に加え、次いで、酢酸エチル(2×10.0mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製して、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(330mg、484μmol、57%収率、92%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:624。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.40-7.30(m,5H),5.24-5.03(m,3H),4.69(d,J=18.8Hz,1H),4.61-4.53(m,1H),4.51-4.38(m,2H),4.23(dd,J=7.6,10.4Hz,1H),4.08-3.73(m,4H),3.52-3.11(m,4H),3.04-2.91(m,1H),2.81-2.57(m,5H),2.55-2.36(m,5H),2.11-1.99(m,1H),1.51(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(330mg、529μmol、1.0当量)のメタノール(3.0mL)およびNH3・MeOH(529μmol、3mL、20%純度、1.0当量)中溶液に、Pd/C(50mg、529μmol、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濾過ケーキをTHF(2×3.0mL)で洗浄し、濾液を濃縮した。残留物を逆相フラッシュクロマトグラフィー(MeCN中0.1%のFA)により精製した。混合物を固体のNaHCO3でpH約8に調整し、次いで、濃縮した。水層(20.0mL)を酢酸エチル(2×15.0mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、299μmol、58%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:490。
ステップC:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、306μmol、1.0当量)および1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン(148mg、618μmol、2.0当量)のトルエン(3.0mL)中溶液に、キサントホス(35.5mg、61.3μmol、0.2当量)、Pd2(dba)3(42.1mg、45.9μmol、0.15当量)、およびCs2CO3(399mg、1.23mmol、4.0当量)を加え、反応混合物を、N2下、90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトを通して濾過し、濾液を1N HCl水溶液(2×10.0mL)で洗浄し、水層を固体Na2CO3でpH約8に調整し、次いで、酢酸エチル(2×15.0mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュクロマトグラフィー(MeCN中0.1%のFA)により精製した。得られた生成物を固体のNaHCO3でpH約8に調整し、濃縮した。水層(20mL)を酢酸エチル(2×15.0mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(85mg、129μmol、43%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI、M+1、M+23]:650、672。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=8.0Hz,1H),7.52(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.17(m,1H),5.24-5.03(m,1H),4.67-4.55(m,1H),4.52-4.36(m,2H),4.23(dd,J=7.6,10.4Hz,1H),4.13-3.77(m,4H),3.65-3.52(m,1H),3.43-2.86(m,7H),2.84-2.64(m,3H),2.62-2.38(m,5H),2.16-1.98(m,1H),1.52(s,9H)。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(85.0mg、131μmol、1.0当量)のジオキサン(1.0mL)中溶液に、4M HCl/ジオキサン(1.0mL)を加え、反応混合物を20℃で4時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮し、混合物をジクロロメタン(10mL)に加え、次いで、飽和Na2CO3水溶液でpH約8に調整し、有機層を分離し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90mg、粗製)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:550。
ステップE:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((2R,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90.0mg、120μmol、73%純度、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(21.7mg、241μmol、2.0当量)の酢酸エチル(2.0mL)中溶液に、T3P(230mg、361μmol、215μL、50%純度、3.0当量)およびTEA(97.6mg、962μmol、134μL、8.0当量)を加え、反応混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(10.0mL)を加えて、有機層を分離し、水層を酢酸エチル(2×10.0mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:メタノール=10:1)により精製した。粗生成物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mMのNH4HCO3)-MeCN];B%:48%~78%、12分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、次いで、凍結乾燥した。生成物標記化合物である2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((2R,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(10.9mg、17.3μmol、14%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:622。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.41(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),5.50-5.34(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.22-5.04(m,1H),4.98-4.72(m,1H),4.54-4.37(m,2H),4.30-4.02(m,3H),3.96-3.75(m,2H),3.66-3.54(m,1H),3.51-2.99(m,6H),2.98-2.67(m,3H),2.64-2.36(m,6H),2.14-1.97(m,1H)。
実施例559
2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:2-[(7-ベンジル-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン。7-ベンジル-2-クロロ-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(5g、17.3mmol、1当量)、2-(ジメチルアミノ)エタノール(3.08g、34.5mmol、3.46mL、2当量)、Cs2CO3(5.62g、17.3mmol、1当量)、およびBINAP(2.15g、3.45mmol、0.2当量)のトルエン(100mL)中溶液に、Pd(OAc)2(387mg、1.73mmol、0.1当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、100℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過した。濾液にHCl(2M、200mL)を加え、次いで、分離した。水相をNaHCO3およびK2CO3でPH=8~9に塩基化し、次いで、EtOAc(5×80mL)で抽出した。合わせた有機相をブライン(100mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、2-[(7-ベンジル-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(4.8g、12.6mmol、73%収率、90%純度)を褐色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40-7.28(m,5H),4.40(t,J=6.0Hz,2H),3.96(s,3H),3.69(s,2H),3.50(s,2H),2.76-2.69(m,4H),2.62-2.56(m,2H),2.32(s,6H)。
ステップB:2-[(4-メトキシ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン。2-[(7-ベンジル-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(4.8g、14.0mmol、1当量)のMeOH(100mL)中溶液に、Pd(OH)2/C(2g、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で18時間撹拌した。HCl/MeOH(4M、7.01mL、2当量)を混合物に加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、40℃で2時間撹拌した。混合物を濾過し、濾過ケーキをNH3・MeOH(10%、3×30mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。残留物を水(10mL)およびEtOAc(10mL)で溶解し、混合物をK2CO3でpH=11に塩基化した。混合物をEtOAc(8×20mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[(4-メトキシ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(2.58g、8.69mmol、62%収率、85%純度)を褐色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:253。
ステップC:2-[[4-メトキシ-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン。2-[(4-メトキシ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(2.28g、7.68mmol、1当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(2.55g、11.5mmol、1.5当量)、Cs2CO3(7.51g、23.0mmol、3当量)、およびキサントホス(889mg、1.54mmol、0.2当量)のトルエン(70mL)中溶液に、Pd2(dba)3(703mg、768μmol、0.1当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、100℃で16時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=10:1~0:1→EtOAc:MeOH=1:0~10:1)により精製して、2-[[4-メトキシ-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(3.2g、7.34mmol、95%収率、90%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:393。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.69(d,J=8.0Hz,1H),7.64(d,J=7.6Hz,1H),7.40(t,J=7.6Hz,1H),7.33(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.22(m,2H),4.44(t,J=6.4Hz,2H),4.17-4.05(m,1H),4.03(s,3H),3.81(d,J=17.6Hz,1H),3.57-3.48(m,1H),3.20(dt,J=4.0,11.2Hz,1H),2.94-2.82(m,4H),2.75(t,J=6.4Hz,2H),2.67(br d,J=16.4Hz,1H),2.34(s,6H)。
ステップD:2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール。EtSH(1.96g、31.5mmol、2.33mL、3.64当量)のDMF(60mL)中溶液に、NaH(693mg、17.3mmol、60%純度、2当量)を加え、混合物を10℃で0.5時間撹拌した。次いで、DMF(10mL)中の2-[[4-メトキシ-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシ]-N,N-ジメチルエタンアミン(3.4g、8.66mmol、1当量)を加え、混合物を60℃まで加熱し、1時間撹拌した。混合物を氷水(200mL)中に注ぎ込み、EtOAc(30mL)で抽出した。水相をHCl(2M)でPH=7~8に酸性化し、次いで、EtOAc(6×80mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をPE:EtOAc=5:1でトリチュレートして、2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(2.4g、6.28mmol、72%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:379。
ステップE:[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート。2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(1g、2.64mmol、1当量)およびTEA(668mg、6.61mmol、919μL、2.5当量)のDCM(20mL)中溶液に、Tf2O(1.12g、3.96mmol、654μL、1.5当量)を-40℃で加え、混合物を-40℃で10分間撹拌した。混合物に水(10mL)を加え、次いで、分離した。水相をEtOAc(20mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=5:1~0:1)により精製して、[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート(650mg、1.15mmol、43%収率、90%純度)を褐色油として得た。
ステップF:2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート(350mg、685μmol、1当量)および2-[(2S)-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(111mg、754μmol、1.1当量)のDMAC(4mL)中溶液に、DIEA(177mg、1.37mmol、239μL、2当量)を加え、混合物を10℃で10分間撹拌した。混合物を逆相フラッシュカラム(MeCN/水(0.1%FA)=40%)により精製して、2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60mg、121μmol、18%収率、98%純度)を褐色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:486。
ステップF:2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60mg、123μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(22.2mg、247μmol、2当量)、およびTEA(100mg、988μmol、138μL、8当量)のEtOAc(1.2mL)中溶液に、T3P(236mg、370μmol、220μL、50%純度、3当量)を0℃で加え、混合物を10℃で0.5時間撹拌した。水(5mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(2×8mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をAl2O3クロマトグラフィー(EtOAc:MeOH=1:0~20:1)により精製した。次いで、残留物を分取HPLC(カラム:Gemini 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:53%~83%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(39.5mg、70.4μmol、57%収率、99.4%純度)を灰色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:558。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.0Hz,1H),7.46-7.38(m,1H),7.35(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.18(m,2H),5.52-5.33(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.88(br s,1H),4.47-4.37(m,2H),4.31-4.18(m,1H),4.17-4.01(m,2H),3.94-3.84(m,1H),3.77(d,J=18.0Hz,1H),3.58-3.41(m,2H),3.25-2.95(m,4H),2.92(s,3H),2.90-2.77(m,2H),2.77-2.70(m,2H),2.68-2.56(m,1H),2.34(d,J=3.6Hz,6H)。
実施例560
2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
1-tert-ブチル-2-メチル(2S,4R)-4-フルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート。(2S,4R)-1-tert-ブトキシカルボニル-4-フルオロ-ピロリジン-2-カルボン酸(2.0g、8.58mmol、1.0当量)およびAg
2O(3.97g、17.2mmol、2.0当量)のCH
3CN(20.0mL)中溶液に、MeI(2.43g、17.2mmol、1.07mL、2.0当量)を0℃で少しずつ加え、反応混合物を15℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(30.0mL)に加え、有機層を分離し、水相を酢酸エチル(30.0mL×2)で抽出し、合わせた有機層をNa
2SO
4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル:酢酸エチル=3:1→酢酸エチル:メタノール=10:1)により精製した。生成物である1-tert-ブチル-2-メチル(2S,4R)-4-フルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(1.98g、8.01mmol、93%収率)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ5.29-5.15(m,1H),4.49-4.38(m,1H),3.92-3.74(m,1H),3.68(s,3H),3.60-3.56(m,1H),2.63-2.54(m,1H),2.17-2.05(m,1H),1.44(d,J=18.0Hz,9H)。
[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。1-tert-ブチル-2-メチル(2S,4R)-4-フルオロピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(1.98g、8.0mmol、1.0当量)のTHF(20.0mL)中溶液に、LiAlH4(912mg、24.0mmol、3.0当量)を-40℃でゆっくりと加え、添加が完了したら、混合物を-40℃で0.5時間撹拌し、次いで、混合物を70℃まで暖め、この温度で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、Na2SO4溶液(6.0mL)を0℃で加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、THF(10.0mL)で希釈し、次いで、濾過し、固体を酢酸エチル(30.0mL)で洗浄した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下濃縮して、[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(800mg、6.01mmol、収率75%)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ5.13-4.97(m,1H),3.67-3.63(m,1H),3.51-3.37(m,2H),2.95(s,1H),2.74-2.68(m,1H),2.63-2.51(m,1H),2.33(s,3H),2.07-2.02(m,1H),1.99-1.95(m,1H)。
ステップA:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(480mg、3.6mmol、2.0当量)およびt-BuONa(295mg、3.1mmol、1.7当量)のトルエン(8.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、混合物を0℃で撹拌し、次いで、トルエン(8.0mL)中のベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1g、1.8mmol、1.0当量)を加えた。混合物をN2下、0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、H2O(25.0mL)を加えることによって混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(30.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュHPLC(18C、水中0.1%のFA、0~60%MeCN)により精製した。得られた生成物をNaHCO3飽和水溶液でpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水層を酢酸エチル(100.0mL×3)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(860mg、1.38mmol、76%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:624。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.31-7.25(m,5H),5.15-5.02(m,3H),4.63-4.58(m,1H),4.51(br s,1H),4.39-4.31(m,2H),4.16-4.12(m,1H),3.99-3.88(m,3H),3.71(br d,J=11.2Hz,1H),3.52-3.41(m,1H),3.36(br s,1H),3.19-3.16(m,2H),2.99-2.86(m,2H),2.71-2.48(m,5H),2.43(s,3H),2.76-2.17(m,1H),1.96-1.80(m,1H),1.74(br s,1H),1.43(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル-(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(860mg、1.4mmol、1.0当量)のMeOH(20.0mL)およびNH3・MeOH(10.0mL、50%w/w)中溶液に、Pd/C(200mg、10%純度、1.0当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して、tert-ブチル-(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(620mg、粗製)を白色固体として得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:490。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ5.16-5.02(m,1H),4.51(br s,1H),4.31(dd,J=4.8,11.2Hz,1H),4.13(dd,J=6.0,11.2Hz,1H),3.87(s,2H),3.76(d,J=12.4Hz,1H),3.52-3.41(m,1H),3.14(dd,J=3.6,13.6Hz,2H),3.06-3.03(m,1H),2.99-2.88(m,3H),2.74-2.48(m,6H),2.43(s,3H),2.29-2.18(m,1H),1.96-1.80(m,1H),1.68-1.59(m,2H),1.44(s,9H)。
ステップC:tert-ブチル-(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル-(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.2mol、1.0当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(812mg、3.7mmol、3.0当量)、Pd2(dba)3(168mg、184μmol、0.15当量)、Cs2CO3(1.2g、3.7mmol、3.0当量)、およびキサントホス(142mg、246μmol、0.2当量)のトルエン(5.0mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2下、90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得、次いで、残留物を15.0mLのEAに溶解し、次いで、0.5MのHClでpH約2に調整した。有機層をH2O(15.0mL×3)で洗浄し、次いで、固体のNaHCO3を合わせた水相にpHが8に達するまで加え、その後、水相を酢酸エチル(50.0mL×3)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュHPLC(18C、水中0.1%のTFA、0~50%MeCN)により精製した。得られた生成物をNaHCO3飽和水溶液でpH-8に調整し、次いで、濃縮し、水層をEA(100.0mL×3)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、tert-ブチル-(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、467μmol、35%収率、99%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:630。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル-(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、318μmol、1.0当量)のジオキサン(1.5mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、2.0mL、25.0当量)を25℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、NaHCO3飽和水溶液(6.0mL)を0℃で加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、10.0mLのH2Oで希釈し、EA(15.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)を黄色油として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:530。
ステップE:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、283μmol、1.0当量)の酢酸エチル(1.0mL)中溶液に、2-フルオロプロパ-2-エン酸(42.9mg、476μmol、1.68当量)の酢酸エチル(0.5mL)中溶液を加え、次いで、TEA(1.93g、19mmol、2.65mL、67.0当量)およびT3P(455mg、715μmol、425μL、50%純度、2.5当量)を加え、混合物を0℃で撹拌し、その後、反応混合物を20℃まで暖め、1時間撹拌した。撹拌が完了したら、10.0mLのH2Oにより反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(15.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:58%~88%、11.5分)および凍結乾燥により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(50.1mg、82.9μmol、2ステップで26%収率、99.5%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:602。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.72(d,J=8.4Hz,1H),7.67(t,J=8.0Hz,1H),7.46-7.43(m,2H),7.26-7.21(m,2H),5.50-5.38(m,1H),5.30-5.11(m,2H),4.89(br s,1H),4.45-4.40(m,1H),4.30-4.20(m,2H),4.19-4.13(m,1H),4.10-4.05(m,1H),3.92-3.88(m,1H),3.82-3.77(m,1H),3.62-3.46(m,3H),3.25-3.18(m,2H),3.15-3.09(m,1H),3.08-2.98(m,2H),2.94(s,3H),2.90-2.77(m,2H),2.67-2.56(m,2H),2.51(d,J=4.8Hz,3H),2.38-2.27(m,1H),2.07-1.89(m,1H)。
実施例561
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
1-tert-ブチル-2-メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート。(2S,4R)-1-tert-ブトキシカルボニル-4-ヒドロキシ-ピロリジン-2-カルボン酸(2g、8.65mmol、1当量)およびAg2O(6.01g、26.0mmol、3当量)のMeCN(40mL)中溶液に、CH3I(10.0g、70.8mmol、4.41mL、8.19当量)を加え、混合物を30℃で14時間撹拌した。混合物にCH3I(13.2g、93.1mmol、5.80mL、10.8当量)を加え、混合物を30℃で6時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=20:1~10:1)により精製して、1-tert-ブチル-2-メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(1.85g、6.99mmol、81%収率、98%純度)を黄色油として得た。
[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール。O1-tert-ブチル O2-メチル(2S,4R)-4-メトキシピロリジン-1,2-ジカルボキシレート(1.85g、7.13mmol、1当量)のTHF(50mL)中溶液に、LiAlH4(542mg、14.3mmol、2当量)を0℃で加え、混合物を0℃で0.5時間撹拌した。次いで、混合物を70℃まで加熱し、3時間撹拌した。次いで、LiAlH4(542mg、14.27mmol、2当量)を10℃で加え、混合物を80℃まで加熱し、6時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2SO4(5mL)によりクエンチし、次いで、濾過した。濾過ケーキをTHF(3×30mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(840mg、5.21mmol、73%収率、90%純度)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.93-3.83(m,1H),3.68(dd,J=3.2,11.2Hz,1H),3.48-3.36(m,2H),3.30(s,3H),2.67-2.58(m,1H),2.40-2.30(m,4H),2.08(td,J=8.0,13.2Hz,1H),1.90-1.79(m,1H)。
ステップA:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(367mg、2.52mmol、2当量)のトルエン(18mL)中溶液に、t-BuONa(364mg、3.79mmol、3当量)を0℃で加え、次いで、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(700mg、1.26mmol、1当量)を0℃で加え、反応混合物を8℃で1時間撹拌した。水(30mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(10mL)で希釈し、EtOAc(2×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュカラム(MeCN/水(0.1%FA)=30%)により精製して、ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(450mg、694μmol、55%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:636。
ステップB:tert-ブチル-(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(490mg、771μmol、1当量)およびNH3・MeOH(5mL、25%純度)のMeOH(5mL)中溶液に、Pd/C(100mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3×5mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(360mg、682μmol、88%収率、95%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
ステップC:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(360mg、718μmol、1当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(238mg、1.08mmol、1.5当量)、Cs2CO3(701mg、2.15mmol、3当量)、およびキサントホス(83.0mg、143μmol、0.2当量)のトルエン(8mL)中溶液に、Pd2(dba)3(65.7mg、71.8μmol、0.1当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、90℃で12時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=5:1~1:1→EtOAc:MeOH=1:0~20:1)により精製した。次いで、残留物を逆相フラッシュカラム(ACN/水(0.1%FA)=45%)により精製して、tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、414μmol、58%収率、95%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:642。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.60(m,2H),7.45-7.37(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),4.61(br s,1H),4.39(ddd,J=4.8,6.8,11.2Hz,1H),4.30-4.20(m,1H),4.16-4.11(m,1H),4.11-3.89(m,4H),3.88-3.68(m,1H),3.56-3.47(m,1H),3.46-3.32(m,2H),3.30(d,J=2.4Hz,3H),3.21-3.05(m,3H),3.01-2.85(m,5H),2.81-2.67(m,2H),2.65-2.54(m,1H),2.46(d,J=4.0Hz,3H),2.35-2.26(m,1H),2.11-2.05(m,1H),2.00-1.88(m,1H),1.52(s,9H)。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、436μmol、1当量)のジオキサン(1mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、1.64mL、15当量)を加え、10℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。混合物を飽和NaHCO3でPH=8~9に塩基化し、EtOAc(3×15mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(210mg、349μmol、80%収率、90%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:542。
ステップE:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、185μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(33.2mg、369μmol、2当量)、およびTEA(149mg、1.48mmol、206μL、8当量)のEtOAc(2mL)中溶液に、T3P(352mg、554μmol、329μL、50%純度、3当量)を0℃で加え、混合物を10℃で0.5時間撹拌した。水(3mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(2×3mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:52%~82%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(28.1mg、45.5μmol、25%収率、99.4%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:614。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.65-7.54(m,2H),7.38-7.30(m,1H),7.27(t,J=7.6Hz,1H),7.19-7.10(m,2H),5.46-5.26(m,1H),5.18(br dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.83(br s,1H),4.37-4.27(m,1H),4.23-3.94(m,4H),3.92-3.85(m,1H),3.84-3.76(m,1H),3.70(br d,J=18.0Hz,1H),3.46(br d,J=8.8Hz,1H),3.42-3.31(m,2H),3.22(d,J=2.0Hz,3H),3.18-3.07(m,2H),3.06-2.87(m,2H),2.87-2.64(m,6H),2.59-2.49(m,1H),2.38(d,J=4.4Hz,3H),2.24(ddd,J=3.2,6.0,9.6Hz,1H),2.04-1.94(m,1H),1.93-1.81(m,1H)。
実施例562
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール。tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1カルボキシレート(0.5g、2.48mmol、1当量)のTHF(20mL)中溶液に、LiAlH4(189mg、4.97mmol、2当量)を0℃で加え、次いで、混合物を70℃まで暖め、70℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2SO4(1mL)でクエンチした。沈殿物を濾過して取り除き、濾過ケーキをTHF(3×20mL)で洗浄した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(220mg、1.72mmol、69%収率、90%純度)を無色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=3.67-3.57(m,1H),3.50(dd,J=6.0,10.0Hz,1H),3.45-3.18(m,1H),2.70(dt,J=4.8,8.8Hz,1H),2.56-2.44(m,2H),2.42-2.24(m,5H),2.04-1.90(m,1H),1.68-1.54(m,1H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、841μmol、1当量)および[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(194mg、1.68mmol、2当量)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(162mg、1.68mmol、2当量)を加える。混合物を0℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EtOAc/MeOH 50/1→3/1)により精製して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(290mg、427μmol、51%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.72-7.61(m,2H),7.45-7.37(m,5H),7.37-7.30(m,2H),7.27-7.16(m,2H),5.28-5.15(m,2H),4.68(br s,1H),4.30-4.01(m,6H),4.00-3.73(m,2H),3.56-3.31(m,2H),3.26-3.06(m,3H),3.05-2.94(m,2H),2.91(s,3H),2.82-2.70(m,4H),2.70-2.57(m,2H),2.47(d,J=4.4Hz,3H),2.20-2.07(m,1H),1.80-1.67(m,1H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(290mg、449μmol、1当量)のMeOH(4mL)中溶液に、NH3・MeOH(2mL、15%純度)、Pd/C(100mg、449μmol、10%純度、1当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、279μmol、62%収率、95%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、235μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(42.2mg、469μmol、2当量)、およびTEA(71.2mg、704μmol、97.9μL、3当量)のDMF(2mL)中溶液に、T3P(224mg、352μmol、209μL、EtOAc中50%純度、1.5当量)を-40℃で加えた。次いで、混合物を-40℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(2mL)で希釈し、混合溶媒(EtOAc/MeOH 10/1、5×5mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 50/1~20/1)により精製し、続いて、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini 150*25mm*10μm;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:50%~100%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(16.0mg、26.5μmol、11%収率、96.5%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:584。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.61(m,2H),7.45-7.38(m,1H),7.35(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),5.55-5.32(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.88(br s,1H),4.33-4.02(m,5H),4.01-3.65(m,2H),3.61-3.36(m,2H),3.27-2.97(m,4H),2.92(s,3H),2.90-2.74(m,2H),2.74-2.56(m,4H),2.55-2.42(m,2H),2.36(d,J=2.4Hz,3H),2.14-1.99(m,1H),1.66-1.52(m,1H)。
実施例563
2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(260mg、508μmol、1.0当量)の酢酸エチル(1.5mL)中溶液に、(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(106mg、1.02mmol、2.0当量)の酢酸エチル(0.5mL)中溶液、TEA(206mg、2.03mmol、283μL、4.0当量)、およびT3P(647mg、1.02mmol、605μL、50%純度、2.0当量)を加え、混合物を-40℃で撹拌し、1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をH2O(10.0mL)によりクエンチし、酢酸エチル(3×15.0mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~45%、7.8分)により精製した。得られた生成物をNaHCO3飽和水溶液でpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水層を酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(132mg、220μmol、43%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:598。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.70-7.62(m,2H),7.43-7.38(m,1H),7.36-7.31(m,1H),7.26-7.19(m,2H),7.04-6.94(m,1H),6.59(d,J=14.4Hz,1H),5.17-4.60(m,3H),4.41-4.35(m,1H),4.28-3.44(m,9H),3.20-3.08(m,4H),3.05-2.99(m,1H),2.92(s,3H),2.83-2.77(m,1H),2.72-2.62(m,2H),2.47(d,J=4.8Hz,3H),2.32-2.25(m,1H),2.09-2.01(m,1H),1.88-1.70(m,3H)。
実施例564
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(800mg、1.44mmol、1当量)のトルエン(20mL)中溶液に、t-BuONa(277mg、2.88mmol、2当量)および3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロパン-1-オール(340mg、2.16mmol、1.5当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]で精製した。混合物をNaHCO3飽和水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(500mg、725μmol、50%収率、94%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:648。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.44-7.30(m,5H),5.19(s,2H),4.79-4.53(m,2H),4.51-4.30(m,4H),4.09-3.71(m,5H),3.67-3.58(m,1H),3.54-3.36(m,2H),3.32-3.12(m,2H),3.04-2.87(m,2H),2.85-2.46(m,7H),2.00-1.89(m,2H),1.85(d,J=9.2Hz,1H),1.72(d,J=9.2Hz,1H),1.51(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル 4-[(3S)-4-tert-ブトキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(900mg、1.39mmol、1当量)のMeOH(30mL)中溶液に、Pd/C(100mg、10%純度)およびNH3・MeOH(20mL、25%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、20℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除き、濾液を真空下で濃縮した。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(650mg、1.06mmol、77%収率、84%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:514。
ステップC:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、350μmol、1当量)、1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン(127mg、526μmol、1.5当量)、Cs2CO3(342mg、1.05mmol、3当量)、およびRuPhos(65.4mg、140μmol、0.4当量)のトルエン(6mL)中溶液に、Pd2(dba)3(64.2mg、70.1μmol、0.2当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、90℃で10時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE:EtOAc=5:1~1:1→EtOAc:MeOH=1:0~20:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、173μmol、50%収率、90%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:674。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、222μmol、1当量)のジオキサン(0.6mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、556μL、10当量)を加え、混合物を10℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(15mL)およびEtOAc(10mL)に溶解し、次いで、分離した。水相を固体のNaHCO3によりPH=8~9に塩基化し、EtOAc(2×15mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、162μmol、73%収率、93%純度)を褐色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:574。
ステップE:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、174μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(31.4mg、348μmol、2当量)、およびTEA(141mg、1.39mmol、194μL、8当量)のEtOAc(2mL)中溶液に、T3P(332mg、522μmol、311μL、50%純度、3当量)を0℃で加え、混合物を10℃で0.5時間撹拌した。水(3mL)を混合物に加えた。混合物をEtOAc(2×3mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 10μ 250mm*50mm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(26.5mg、41μmol、24%収率、99.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.2Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.45(td,J=7.6,12.4Hz,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),5.53-5.32(m,1H),5.25(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.12-4.64(m,1H),4.49-4.31(m,4H),4.21-3.98(m,3H),3.95-3.76(m,2H),3.68-3.55(m,2H),3.52-3.36(m,2H),3.33-2.97(m,4H),2.95-2.66(m,5H),2.64-2.49(m,2H),1.93(m,2H),1.84(br d,J=8.4Hz,1H),1.71(br d,J=10.0Hz,1H)。
実施例565
2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(350mg、681μmol、1当量)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(226mg、1.02mmol、1.5当量)、キサントホス(78.9mg、136μmol、0.2当量)、Pd2(dba)3(62.4mg、68.1μmol、0.1当量)、およびCs2CO3(555mg、1.70mmol、2.5当量)のトルエン(10mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2下、90℃で12時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=300/1→10/1)により精製した。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(270mg、379μmol、56%収率、92%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:654。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75-7.61(m,2H),7.45-7.37(m,1H),7.34(t,J=7.2Hz,1H),7.26-7.15(m,2H),4.62(br s,1H),4.45-4.31(m,3H),4.30-4.16(m,1H),4.10-3.70(m,5H),3.61(br d,J=7.6Hz,1H),3.57-3.44(m,2H),3.43-3.25(m,1H),3.24-3.05(m,3H),3.03-2.86(m,5H),2.84-2.67(m,4H),2.66-2.48(m,2H),2.00-1.88(m,2H),1.84(d,J=9.6Hz,1H),1.72(d,J=9.6Hz,1H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、382μmol、1当量)のジオキサン(2mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、1.91mL、1.00当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(20mL)で希釈し、次いで、混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=7に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(260mg、粗製)を黄色油として得、精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:554。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、216μmol、1当量)、TEA(87.7mg、866μmol、121μL、4当量)、および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(45.1mg、433μmol、2当量)の酢酸エチル(2mL)中溶液に、T3P(276mg、433μmol、258μL、50%純度、2当量)を-70℃で加えた。混合物を-70℃で0.5時間撹拌した。反応混合物をクエンチし、HCl(1N、1mL)で希釈し、次いで、水(20mL)で希釈した。混合物を酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:40%~70%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(14.5mg、22.5μmol、10%収率、99.3%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:640。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(d,J=8.4Hz,1H),7.65(t,J=8.0Hz,1H),7.45-7.30(m,2H),7.27-7.16(m,2H),7.09-6.91(m,1H),6.59(d,J=15.2Hz,1H),5.29-4.48(m,3H),4.44-4.31(m,3H),4.29-3.72(m,6H),3.71-3.40(m,4H),3.28-2.96(m,4H),2.95-2.88(m,4H),2.87-2.56(m,5H),2.52(d,J=10.0Hz,1H),1.99-1.87(m,2H),1.84(d,J=9.6Hz,1H),1.71(d,J=9.6Hz,1H)。
実施例566
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、181μmol、1当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(32.5mg、361μmol、2当量)のDCM(1mL)中溶液に、HATU(137mg、361μmol、2当量)およびDIEA(93.4mg、722μmol、126μL、4当量)を加えた。0℃で0.5時間撹拌した後、反応混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をTLC(DCM/MeOH=10/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Xtimate C18 10μ 250mm*50mm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、12分)によりさらに精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(12mg、19.1μmol、11%収率、99.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:626。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.63(d,J=8.0Hz,1H),7.58(t,J=8.4Hz,1H),7.39-7.23(m,2H),7.19-7.09(m,2H),5.35(d,J=48.8Hz,1H),5.18(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.04-4.40(m,1H),4.37-3.89(m,7H),3.86-3.61(m,2H),3.59-3.32(m,4H),3.20-2.40(m,14H),1.95-1.81(m,2H),1.78(d,J=9.6Hz,1H),1.65(d,J=9.6Hz,1H)。
実施例567
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-[8-(ヒドロキシメチル)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
8-ブロモナフタレン-1-カルバルデヒド。1,8-ジブロモナフタレン(5g、17.5mmol、1当量)のTHF(100mL)中溶液に、n-BuLi(2.5M、9.09mL、1.3当量)を-70℃で滴加した。-70℃で30分間撹拌後、DMF(12.8g、175mmol、13.5mL、10当量)を滴加した。混合物を12℃まで暖め、さらに0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NH4Cl水溶液(20mL)でクエンチした。分離した水相をEtOAc(2×50mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、8-ブロモナフタレン-1-カルバルデヒド(4.5g、粗製)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=11.4(s,1H),8.04-7.92(m,2H),7.90(d,J=8.0Hz,2H),7.60-7.55(m,1H),7.39(t,J=8.0Hz,1H)。
(8-ブロモ-1-ナフチル)メタノール。8-ブロモナフタレン-1-カルバルデヒド(4.5g、19.1mmol)のMeOH(80mL)中混合物に、NaBH4(2.90g、76.6mmol)を0℃で1度に加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物に水(1mL)を加え、混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(10mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 30/1~3/1)により精製して、(8-ブロモ-1-ナフチル)メタノール(3.3g、12.5mmol、2ステップ72%収率、90%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.92-7.82(m,3H),7.71(d,J=6.8Hz,1H),7.49(t,J=7.6Hz,1H),7.32-7.27(m,1H),5.48(br s,2H)。
2-[(8-ブロモ-1-ナフチル)メトキシ]テトラヒドロピラン。(8-ブロモ-1-ナフチル)メタノール(0.5g、2.11mmol、1当量)のDCM(10mL)中溶液に、DHP(355mg、4.22mmol、386μL、2当量)を加え、続いて、TsOH・H2O(40.1mg、211μmol、0.1当量)を12℃で加えた。混合物を12℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NaHCO3水溶液(2mL)でクエンチし、水(5mL)で希釈した。分離した水相をEtOAc(10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 500/1~100/1)により精製して、2-[(8-ブロモ-1-ナフチル)メトキシ]テトラヒドロピラン(560mg、1.57mmol、74%収率、90%純度)を無色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.94-7.88(m,2H),7.85(t,J=8.4Hz,2H),7.56-7.50(m,1H),7.36-7.28(m,1H),5.63(s,2H),4.92(t,J=3.6Hz,1H),4.07-3.97(m,1H),3.69-3.61(m,1H),2.08-1.76(m,4H),1.75-1.65(m,2H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(20mL)中の2-[(8-ブロモ-1-ナフチル)メトキシ]テトラヒドロピラン(476mg、1.48mmol、1.5当量)、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、989μmol、1当量)、Cs2CO3(806mg、2.47mmol、2.5当量)、(5-ジフェニルホスファニル-9,9-ジメチル-キサンテン-4-イル)-ジフェニルホスファン(229mg、396μmol、0.4当量)、およびPd2(dba)3(181mg、198μmol、0.2当量)を脱気し、次いで、N2下で90℃まで10時間加熱した。撹拌が完了したら、混合物をセライトパッドを通して濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3飽和水溶液で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×30mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、338μmol、34%収率、90%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:746。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、375μmol、1当量)のMeOH(6mL)中溶液に、NH3/MeOH(4mL、20%純度)、Pd/C(120mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気と、H2によるパージを数回繰り返した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をセライトパッドを通して濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(200mg、294μmol、78%の収率、90%の純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:612。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、294μmol、1当量)、T3P(562mg、883μmol、525μL、EtOAc中50%純度、3当量)、およびTEA(238mg、2.35mmol、328μL、8当量)のEtOAc(4mL)中溶液に、2-フルオロプロパ-2-エン酸(53.0mg、588μmol、2当量)を0℃で加えた。混合物を15℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(4mL)で希釈し、EtOAc(3×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×100mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(160mg、227μmol、77%収率、97%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:684。
ステップD:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-[8-(ヒドロキシメチル)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-[8-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)-1-ナフチル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、219μmol、1当量)のDCM(160μL)中溶液に、TFA(250mg、2.19mmol、162μL、10当量)を加えた。混合物を15℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をジクロロメタン(3mL)で希釈し、飽和Na2CO3水溶液でpH=9に調整した。分離した水相をDCM(5mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:42%~72%、8分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-[8-(ヒドロキシメチル)-1-ナフチル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(62.0mg、103μmol、47%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:600。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.84(d,J=8.0Hz,1H),7.79(dd,J=3.2,7.2Hz,1H),7.55-7.44(m,3H),7.44-7.38(m,1H),5.55-5.32(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.21-4.94(m,2H),4.89(br t,J=13.2Hz,1H),4.41-3.90(m,7H),3.66-3.39(m,2H),3.37-3.00(m,5H),3.00-2.58(m,4H),2.50-2.43(m,3H),2.33-2.22(m,1H),2.11-1.98(m,1H),1.90-1.73(m,3H)。
実施例568
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 2-メチルスルファニル-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(20.0g、46.6mmol、1.00当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(13.3g、51.2mmol、1.10当量)のDMAc(250mL)中混合物に、DIEA(18.1g、140mmol、24.3mL、3当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を50℃まで加熱し、1時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(3×300mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×500mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1→1/1)で精製した。化合物であるtert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(23.0g、42.7mmol、92%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:539。
ステップB:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(23.0g、42.7mmol、1.00当量)のジオキサン(200mL)中混合物に、HCl/ジオキサン(4M、192mL、18.0当量)を加えた。20℃で0.5時間撹拌した後、反応混合物を濾過し、濾過ケーキを酢酸エチル(200mL)中に溶解した。飽和Na2CO3溶液でpH8~9に調整し、次いで、水(20.0mL)で希釈した。分離した水層を酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16.1g、34.5mmol、81%収率、94%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.42-7.33(m,5H),5.25-5.12(m,2H),4.66(br s,1H),4.11-4.04(m,1H),4.03-3.90(m,3H),3.84(br d,J=13.6Hz,1H),3.34-3.17(m,2H),3.11(td,J=5.2,10.4Hz,1H),3.04-2.93(m,2H),2.88-2.76(m,1H),2.75-2.56(m,3H),2.50(s,3H)。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(16.1g、36.7mmol、1.00当量)および1-ブロモ-8-メチルナフタレン(10.6g、47.7mmol、1.30当量)のトルエン(350mL)中混合物に、Pd2(dba)3(6.72g、7.34mmol、0.20当量)、キサントホス(8.50g、14.7mmol、0.40当量)、およびCs2CO3(35.9g、110mmol、3.00当量)を加えた。混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し。90℃で8時間撹拌した後、反応混合物を水(1×100mL)で希釈し、酢酸エチル(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層を水(1×300mL)およびブライン(1×300mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=100/1~2/1)により精製し、減圧下で濃縮して残留物を得た。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(15.3g、26.5mmol、72%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.68-7.55(m,2H),7.40-7.28(m,7H),7.22(s,2H),5.22-5.09(m,2H),4.64(br s,1H),4.27-4.14(m,1H),4.05-3.84(m,2H),3.83-3.68(m,1H),3.55-3.30(m,2H),3.18-3.03(m,3H),3.01-2.79(m,5H),2.78-2.50(m,3H),2.45(d,J=4.8Hz,3H)。
ステップD:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(13.3g、23.0mmol、1.00当量)のEtOAc(200mL)中混合物に、m-CPBA(4.67g、23.0mmol、85%純度、1.00当量)をN2下、0℃で加えた。0℃で30分間撹拌後、反応混合物を飽和Na2S2O3(100mL)により0℃でクエンチした。分離した有機層を水(1×100mL)で希釈し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1→0/1)で精製した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(9.60g、15.3mmol、67%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:595。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.63(m,2H),7.47-7.31(m,7H),7.27-7.17(m,2H),5.25-5.17(m,2H),4.67(br s,1H),4.48-4.21(m,2H),4.10-3.88(m,2H),3.66-3.46(m,2H),3.42-3.04(m,4H),3.02-2.83(m,6H),2.81-2.60(m,1H),2.81-2.60(m,3H)。
ステップE:tert-ブチル(2S)-4-[2-[[(2S)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、841μmol、1.00当量)およびtert-ブチル(2S)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(338mg、1.68mmol、2.00当量)のトルエン(10.0mL)中混合物に、t-BuONa(242mg、2.52mmol、3.00当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。0℃で30分間撹拌後、2mLの塩酸(1M)を0℃で、および水(10mL)を添加することによって反応混合物をクエンチした。混合物を酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(30mL×1)およびブライン(30mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1→0/1)で精製した。化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[2-[[(2S)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(330mg、473μmol、56%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.61(m,2H),7.47-7.31(m,7H),7.26-7.15(m,2H),5.27-5.14(m,2H),4.68(br s,1H),4.42-4.17(m,3H),4.07-3.73(m,3H),3.58-3.29(m,5H),3.25-2.88(m,8H),2.86-2.51(m,3H),2.03-1.76(m,4H),1.44(d,J=4.8Hz,9H)。
ステップF:tert-ブチル(2S)-2-[[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[2-[[(2S)-1-tert-ブトキシカルボニルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(330mg、473μmol、1.00当量)のMeOH(15mL)中混合物に、NH3・MeOH(15mL、20%純度)、Pd(OH)2/C(80mg、20%純度)をN2下で1度に加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを3回実施した。混合物をH2(15psi)下、20℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除き、濾液を減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップに直接使用した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-[[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(200mg、335μmol、71%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:598。
ステップG:tert-ブチル(2S)-2-[[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-[[4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-7-(8つの-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(190mg、318μmol、1.00当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(42.9mg、477μmol、1.50当量)のDCM(15.0mL)中混合物に、DIEA(123mg、954μmol、166μL、3.00当量)およびHATU(181mg、477μmol、1.50当量)をN2下、0℃で1度に加えた。0℃で30分間撹拌後、反応混合物を水(10mL)で希釈した。分離した有機層をブライン(1×10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、DCM:MeOH=50:1~5:1)により精製した。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-[[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(210mg、292μmol、92%収率、93%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:670。
ステップH:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-[[4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(210mg、314μmol、1.00当量)のDCM(5.00mL)中混合物に、TFA(1.07g、9.41mmol、696μL、30.0当量)をN2下下、20℃で1度に加えた。20℃で30分間撹拌した後、反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150×30mm×4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%~50%、5分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(75.5mg、122μmol、39%収率、99.8%純度、FA)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:570。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.72-7.61(m,2H),7.44-7.30(m,2H),7.27-7.14(m,2H),6.49-5.98(m,1H),5.55-5.32(m,1H),5.25(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.58-4.42(m,2H),4.36-3.87(m,5H),3.86-3.67(m,1H),3.64-3.37(m,2H),3.35-3.26(m,2H),3.25-2.94(m,4H),2.92-2.70(m,5H),2.66-2.51(m,1H),2.18-1.81(m,4H)。
実施例569
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
(5S)-5-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)ピロリジン-2-オン。(5S)-5-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-2-オン(5.00g、43.4mmol、1.00当量)およびDHP(3.65g、43.4mmol、3.97mL、1.00当量)のDCM(80.0mL)中混合物に、TsOH・H2O(826mg、4.34mmol、0.10当量)を加えた。混合物を15℃で12時間撹拌した。反応混合物をブライン(30.0mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20/1→0:1)により精製した。化合物である(5S)-5-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)ピロリジン-2-オン(5.70g、28.6mmol、66%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=6.36-6.01(m,1H),4.66-4.47(m,1H),3.92-3.71(m,2.5H),3.64-3.43(m,2H),3.24(dd,J=8.0,9.6Hz,0.5H),2.42-2.10(m,3H),1.86-1.64(m,3H),1.62-1.48(m,4H)。
(5S)-1-メチル-5-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)ピロリジン-2-オン。(5S)-5-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)ピロリジン-2-オン(5.60g、28.1mmol、1.00当量)のDMF(60.0mL)中混合物に、NaH(1.35g、33.7mmol、60%純度、1.20当量)をN2下、-40℃で少しずつ加えた。混合物を-40℃で30分間撹拌し、次いで、CH3I(6.58g、46.4mmol、2.89mL、1.65当量)を加え、0℃で2.5時間撹拌した。飽和NaHSO3水溶液(30.0mL)を添加することによって反応混合物をクエンチし、EA(3×50.0mL)で抽出した。合わせた有機相をNa2SO4上で乾燥し、濃縮乾固した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10/1→0/1)で精製した。化合物である(5S)-1-メチル-5(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)ピロリジン-2-オン(4.40g、20.6mmol、73%収率)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.59(td,J=3.2,13.6Hz,1H),3.93-3.73(m,2H),3.63-371(m,1H),3.57-3.44(m,2H),2.88(d,J=4.4Hz,3H),2.54-2.40(m,1H),2.38-2.24(m,1H),2.07-2.20(m,1H),1.93-1.53(m,7H)。
(5S)-5-(ヒドロキシメチル)-1-メチル-ピロリジン-2-オン。(5S)-1-メチル-5-(テトラヒドロピラン-2-イルオキシメチル)ピロリジン-2-オン(2.20g、10.3mmol、1.00当量)のDCM(20.0mL)中混合物に、TFA(23.5g、206mmol、15.3mL、20.0当量)を加えた。混合物を15℃で30分間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップで直接使用した。化合物である(5S)-5-(ヒドロキシメチル)-1-メチル-ピロリジン-2-オン(2.60g、粗製)を赤色油として得た。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。(5S)-5-(ヒドロキシメチル)-1-メチル-ピロリジン-2-オン(543mg、4.20mmol、5.00当量)のTHF(30.0mL)中混合物に、t-BuONa(808mg、8.41mmol、10.0当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で30分間撹拌し、次いで、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、841μmol、1.00当量)を加え、15℃まで暖め、0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(50mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%TFA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液(10.0mL)で中和し、酢酸エチル(50.0mLの×2)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(162mg、243μmol、29%収率、99%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:660。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、197μmol、1.00当量)のMeOH(2.00mL)中混合物に、NH3・MeOH(1.00mL、20%純度)およびPd/C(35.0mg、10%純度)を加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップで直接使用した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(70.0mg、粗製)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:526。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60.0mg、114μmol、1.00当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(20.6mg、228μmol、2.00当量)のEA(1.00mL)中混合物に、TEA(92.4mg、913μmol、127μL、8.00当量)、T3P(218mg、342μmol、204μL、50%純度、3.00当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。反応混合物を水(5.00mL)で希釈し、酢酸エチル(10.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(10.0mLの×1)およびブライン(10.0mLの×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150×25mm×5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:42%~72%、10分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(26.8mg、43.9μmol、2ステップで26%収率、98%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:598。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.62(m,2H),7.46-7.38(m,1H),7.38-7.32(m,1H),7.27-7.17(m,2H),5.55-5.32(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.08-4.63(m,1H),4.53-4.39(m,1H),4.37-4.26(m,1H),4.25-4.00(m,3H),3.97-3.71(m,3H),3.59-3.35(m,2H),3.29-2.98(m,4H),2.91(d,J=5.6Hz,8H),2.69-2.58(m,1H),2.57-2.45(m,1H),2.42-2.29(m,1H),2.28-2.14(m,1H),2.06-1.91(m,1H)。
実施例570
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
(2R)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-3-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-プロパン酸。(2R)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-3-ヒドロキシ-プロパン酸(27g、132mmol、1当量)のDMF(270mL)中溶液に、イミダゾール(45.4g、667mmol、5.07当量)を窒素下、0℃で加えた。溶液が透明になった後、TBDPSCl(90.4g、329mmol、84.5mL、2.5当量)を加えた。反応物を15℃まで暖めた。15℃で24時間撹拌後、反応混合物を真空下で濃縮し、エーテル(250ml)で希釈し、飽和NaCl(100mL)中に注ぎ込んだ。分離した有機層を10%HCl(25mL)および飽和NaCl(50mL)の混合物で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮した。残留物をアセトニトリルで希釈し、次いで、白色沈殿物が形成された。沈殿物を濾過し、濾過ケーキを真空下で乾燥し、(2R)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-3-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-プロパン酸(45g、90mmol、69%収率、89%純度)を白色固体として得た。
tert-ブチルN-[(1R)-1-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-2-(2,2-ジメチル-4,6-ジオキソ-1,3-ジオキサン-5-イル)-2-オキソ-エチル]カルバメート。(2R)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-3-[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシ-プロパン酸(24g、54.1mmol、1当量)の0℃のDCM(400mL)中攪拌溶液に、2,2-ジメチル-1,3-ジオキサン-4,6-ジオン(8.19g、56.8mmol、1.05当量)およびDMAP(16.0g、131mmol、2.42当量)を加え、続いて、BOP(25.1g、56.8mmol、1.05当量)を少しずつ加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を1N KHSO4(2×360mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、室温で真空下で濃縮して、tert-ブチル N-[(1R)-1-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-2-(2,2-ジメチル-4,6-ジオキソ-1,3-ジオキサン-5-イル)-2-オキソ-エチル]カルバメート(35g、粗製)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
tert-ブチル(2R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-3,5-ジオキソ-ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル N-[(1R)-1-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-2-(2,2-ジメチル-4,6-ジオキソ-1,3-ジオキサン-5-イル)-2-オキソ-エチル]カルバメート(35g、61.43mmol、1当量)を77℃のEtOAc(600mL)中で1時間還流した。還流が完了したら、混合物を真空下で濃縮して、tert-ブチル(2R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-3,5-ジオキソ-ピロリジン-1-カルボキシレート(30g、粗製)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。
tert-ブチル(2R,3R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-3-ヒドロキシ-5-オキソ-ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-3,5-ジオキソ-ピロリジン-1-カルボキシレート(30g、64.2mmol、1当量)をDCM(480mL)中に0℃で溶解し、続いて、NaBH4(3.78g、99.9mmol、1.56当量)を少しずつ。懸濁液を18℃で16時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(300ml)中に注ぎ込み、固体が無くなるまで撹拌した。分離した有機層を水(150mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 10/1~2/1)、続いて、逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、NaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、次いで、DCM(2×50mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2R,3R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-3-ヒドロキシ-5-オキソ-ピロリジン-1-カルボキシレート(2.13g、3.99mmol、3ステップで7.6%収率、88%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=7.72(dd,J=1.6,8.0Hz,2H),7.59(dd,J=1.2,8.0Hz,2H),7.47-7.39(m,6H),5.67(d,J=4.0Hz,1H),4.57-4.46(m,1H),4.09-3.97(m,2H),3.83(dd,J=2.8,10.0Hz,1H),2.75-2.65(m,1H),2.62-2.53(m,1H),1.38(s,9H),0.93(s,9H)。
tert-ブチル(2R,3R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2R,3R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-3-ヒドロキシ-5-オキソ-ピロリジン-1-カルボキシレート(2.55g、5.43mmol、1当量)のDCM(50mL)中溶液に、DHP(913mg、10.9mmol、993μL、2当量)を加え、続いて、TsOH・H2O(103mg、543μmol、0.1当量)を20℃で加えた。混合物を20℃で16時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NaHCO3水溶液(10mL)でクエンチし、水(5mL)で希釈し、DCM(2×40mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc 15/1~7/1)により精製して、tert-ブチル(2R,3R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-1-カルボキシレート(2.62g、4.64mmol、85%収率、98%純度)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75(td,J=1.2,7.6Hz,2H),7.66(td,J=1.6,8.0Hz,2H),7.47-7.34(m,6H),4.75-4.68(m,1H),4.63-4.51(m,1H),4.20-4.17(m,1H),3.99-3.88(m,2H),3.87-3.74(m,1H),3.60-3.50(m,1H),3.23-3.01(m,1H),2.76(ddd,J=8.8,10.4,16.8Hz,1H),2.01-1.80(m,2H),1.79-1.62(m,4H),1.45(s,9H),1.02(d,J=8.0Hz,9H)。
(4R,5R)-5-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン。tert-ブチル(2R,3R)-2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-1-カルボキシレート(2.62g、4.73mmol、1当量)のMeCN(50mL)中溶液に、Mg(ClO4)2(211mg、946μmol、95.6μL、0.2当量)を加えた。この反応混合物を70℃で12時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、(4R,5R)-5-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン(1.14g、2.29mmol、48%収率、91%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:454。
(4R,5R)-5-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-1-メチル-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン。(4R,5R)-5-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン(0.95g、2.09mmol、1当量)のTHF(20mL)中溶液に、NaH(168mg、4.19mmol、鉱油中60%純度、2当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で30分間撹拌し、次いで、CH3I(594mg、4.19mmol、261μL、2当量)を加えた。0℃でさらに0.5時間撹拌した後、混合物を水(10mL)でクエンチし、EtOAc(2×30mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、(4R,5R)-5-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-1-メチル-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン(820mg、1.67mmol、80%収率、95%純度)を褐色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75-7.70(m,2H),7.70-7.65(m,2H),7.48-7.36(m,6H),4.68-4.60(m,1H),4.59-4.48(m,1H),4.07-3.77(m,2H),3.77-3.66(m,1H),3.65-3.56(m,1H),3.55-3.40(m,1H),2.89-2.79(m,3H),2.79-2.53(m,2H),1.90-1.69(m,2H),1.68-1.53(m,4H),1.09-1.03(m,9H)。
(4R,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-1-メチル-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン。(4R,5R)-5-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-1-メチル-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン(1.07g、2.29mmol、1当量)のDMSO(10mL)中混合物に、CsF(1.04g、6.86mmol、253μL、3当量)を加えた。混合物を65℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 50/1~5/1)により精製して、(4R,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-1-メチル-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン(380mg、1.49mmol、65%収率、90%純度)を黄色油として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=4.80-4.52(m,2H),3.98-3.81(m,3H),3.72-3.61(m,1H),3.60-3.48(m,1H),2.87(d,J=9.6Hz,3H),2.67(d,J=7.2Hz,1H),2.60-2.46(m,1H),1.86-1.74(m,2H),1.67-1.51(m,4H)。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、471μmol、1当量)および(4R,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-1-メチル-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン(140mg、612μmol、1.3当量)のトルエン(6mL)中溶液に、t-BuONa(90.5mg、942μmol、2当量)を0℃で加えた。0℃で10分間撹拌した後、混合物を水(5mL)で希釈し、EtOAc(2×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×20mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、258μmol、55%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:760。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.63(m,2H),7.47-7.31(m,7H),7.27-7.17(m,2H),5.21(s,2H),4.84-4.43(m,5H),4.30-3.70(m,8H),3.59-3.34(m,3H),3.25-2.98(m,4H),2.96-2.90(m,6H),2.81-2.56(m,4H),1.83-1.63(m,2H),1.60-1.47(m,4H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、197μmol、1当量)のMeOH(3mL)中溶液に、NH3/MeOH(3mL、20%純度)、Pd/C(75mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、20℃で1時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、144μmol、73%収率、90%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:626。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、160μmol、1当量)のDCM(100μL)中溶液に、TFA(273mg、2.40mmol、177μL、15当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をDCM(5mL)で希釈し、飽和重炭酸ナトリウム水溶液でpH=8に塩基化した。分離した水層をEtOAc(3×5mL)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80mg、126μmol、79%収率、85%純度)を黄色油として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。
ステップD:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80mg、148μmol、1当量)、TEA(44.8mg、443μmol、61.7μL、3当量)、および2-フルオロプロパ-2-エン酸(26.6mg、295μmol、2当量)のEA(3mL)中溶液に、T3P(141mg、222μmol、132μL、EtOAc中50%純度、1.5当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NaHCO3水溶液(5mL)でクエンチし、EtOAc(2×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 1/0~10/1)、続いて、分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:34%~64%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(11.8mg、19.1μmol、13%収率、99.3%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:614。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.71(d,J=8.0Hz,1H),7.69-7.63(m,1H),7.41(q,J=7.6Hz,1H),7.35(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.19(m,2H),5.55-5.33(m,1H),5.27(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.86(dd,J=5.6,12.0Hz,1H),4.79(dd,J=5.6,12.0Hz,1H),4.63-4.49(m,2H),4.39-3.94(m,3H),3.89-3.77(m,2H),3.76-3.63(m,1H),3.61-3.44(m,2H),3.38-2.99(m,4H),2.91(d,J=7.2Hz,6H),2.89-2.70(m,2H),2.70-2.55(m,2H),2.46(dt,J=5.2,16.0Hz,1H)。
実施例571
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-((S)-ピロリジン-2-イルメトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-[(7-ベンジル-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。7-ベンジル-2-クロロ-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(4.00g、13.8mmol、1.00当量)およびtert-ブチル(2S)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(5.56g、27.6mmol、2.00当量)のトルエン(80.0mL)中溶液に、BINAP(1.72g、2.76mmol、0.20当量)、Pd(OAc)2(310mg、1.38mmol、0.10当量)、およびCs2CO3(13.5g、41mmol、3.00当量)を加えた。混合物を110℃で8時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をH2O(200mL)および酢酸エチル(200mL)で希釈した。混合物をHCl水溶液(2N)でpH約3に酸性化した。水相を分離し、酢酸エチル(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20/1→1/1)により精製して、tert-ブチル(2S)-2-[(7-ベンジル-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(3.80g、8.26mmol、60%収率、99%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:455。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.37-7.27(m,5H),4.50-4.35(m,1H),4.25-4.16(m,1H),3.98(s,3H),3.69(s,2H),3.50(s,2H),3.43-3.33(m,2H),2.76-2.72(m,2H),2.62-2.57(m,2H),2.04-1.90(m,3H),1.85-1.76(m,1H),1.61-1.54(m,1H),1.45(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(2S)-2-[(4-メトキシ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-[(7-ベンジル-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(3.80g、8.36mmol、1.00当量)のメタノール(100mL)中溶液に、Pd(OH)2/C(1.00g、10.3mmol、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを3回繰り返した。混合物をH2(45psi)下、40℃で24時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。化合物であるtert-ブチル(2S)-2-[(4-メトキシ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(2.70g、7.17mmol、86%収率、97%純度)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:365。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ4.54-4.35(m,1H),4.25-4.10(m,2H),3.98(s,3H),3.86(s,2H),3.48(s,1H),3.43-3.33(m,2H),3.13-3.04(m,2H),2.56-2.46(m,2H),2.10-1.93(m,3H),1.87-1.82(m,1H),1.45(s,9H)。
ステップC:tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-[(4-メトキシ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(2.5g、6.86mmol、1.0当量)および1-ブロモ-8-クロロ-ナフタレン(3.31g、13.7mmol、2.0当量)のトルエン(50mL)中溶液に、Pd2(dba)3(1.26g、1.37mmol、0.2当量)、Cs2CO3(5.59g、17.2mmol、2.5当量)、およびRuPhos(1.28g、2.74mmol、0.4当量)を加え、反応混合物を、N2下、90℃で12時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をセライトを通して濾過し、濾液を飽和ブライン(1×80mL)で洗浄し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10/1→3/1)により精製した。淡黄色固体としての生成物であるtert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(1.3g、2.46mmol、36%収率、99%純度)。LCMS[ESI,M+1]:525。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.74(d,J=8.4Hz,1H),7.60(br d,J=8.0Hz,1H),7.51(d,J=7.6Hz,1H),7.43(t,J=7.8Hz,1H),7.33(t,J=7.8Hz,1H),7.23(br d,J=7.6Hz,1H),4.60-4.37(m,1H),4.34-4.16(m,3H),4.03(s,3H),3.87(br d,J=17.2Hz,1H),3.63-3.57(m,1H),3.45-3.30(m,2H),3.21-3.10(m,1H),2.99(br s,1H),2.62(br d,J=16.8Hz,1H),2.07-1.79(m,4H),1.45(s,9H)。
ステップD:tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。NaH(168mg、4.19mmol、60%純度、2.0当量)のDMF(15mL)中溶液に、EtSH(391mg、6.29mmol、465μL、3.0当量)を15℃で少しずつ加えた。0.5時間撹拌後、tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-メトキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(1.1g、2.10mmol、1.0当量)のDMF(7.0mL)中溶液を混合物に加え、反応混合物を60℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を氷水(10mL)中に注ぎ込み、混合物を1N HCl水溶液でpH7~8に調整し、混合物を濾過し、濾過ケーキをジクロロメタン(10mL)で溶解し、飽和ブライン(2×15mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=10:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(670mg、1.28mmol、61%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:511。
ステップE:tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(640mg、1.25mmol、1.0当量)のDCM(10mL)中溶液に、TEA(380mg、3.76mmol、523μL、3.0当量)、4A分子篩(500mg)、およびTf2O(530mg、1.88mmol、310μL、1.5当量)を-40℃で加え、反応混合物を-40℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、水を-40℃で少しずつ加え(10mL)、次いで、反応混合物を15℃まで暖め、有機層を分離し、飽和ブライン(1×10mL)で洗浄し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10/1→3/1)により精製した。生成物であるtert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(400mg、616μmol、49%収率、99%純度)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:643。
ステップF:tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-(トリフルオロメチルスルホニルオキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(400mg、622μmol、1.0当量)のDMAC(4.0mL)中溶液に、2-[(2S)-ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(86.5mg、622μmol、1.0当量)およびDIEA(161mg、1.24mmol、217μL、2.0当量)を加え、反応混合物を15℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を氷水(10mL)中に注ぎ込み、沈殿した固体を濾過し、酢酸エチル(15mL)で溶解し、有機層を飽和ブライン(2×15mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(0.1%のFA条件、水中20%~30%のMeCN)により精製し、得られた生成物を固体のNaHCO3でpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(2×15mL)で抽出し、有機層を飽和ブライン(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物であるtert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(300mg、480μmol、77%収率、99%純度)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:618。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.75(d,J=8.0Hz,1H),7.61(br d,J=8.0Hz,1H),7.52(d,J=6.8Hz,1H),7.47-7.42(m,1H),7.33(t,J=7.8Hz,1H),7.23(br t,J=6.2Hz,1H),4.71-4.31(m,2H),4.29-4.06(m,3H),3.95-3.69(m,2H),3.63-3.28(m,4H),3.26-2.82(m,7H),2.72-2.46(m,3H),2.02-1.79(m,4H),1.45(s,9H)。
ステップG:tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(3S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(100mg、162μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(29.1mg、324μmol、2.0当量)の酢酸エチル(1.5mL)中溶液に、TEA(131mg、1.29mmol、180μL、8.0当量)およびT3P(309mg、485μmol、289μL、50%純度、3.0当量)を0℃で少しずつ加え、反応混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(10ml)を加えて、有機層を分離し、水相を酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→1/1)により精製した。生成物であるtert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(110mg、粗製)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:690。
ステップH:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-((S)-ピロリジン-2-イルメトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-[[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(3S)-3-(シアノメチル)-4-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル]オキシメチル]ピロリジン-1-カルボキシレート(90.0mg、130.40μmol、1.0当量)のジクロロメタン(0.5mL)中溶液に、TFA(770mg、6.75mmol、0.5mL、51.8当量)を加え、反応混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮し、次いで、酢酸エチル(10mL)で溶解し、次いで、飽和Na2CO3水溶液(1×10mL)で洗浄し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=10:1)により精製し、次いで、分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%~50%、10分)により精製し、得られた生成物を濃縮し、凍結乾燥した。標記化合物である2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-((S)-ピロリジン-2-イルメトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(24.7mg、38.1μmol、29%収率、98%純度、FA)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:590。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.0Hz,1H),7.56-7.49(m,1H),7.54-7.50(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.17(m,1H),5.53-5.32(m,1H),5.25(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.89-4.52(m,1H),4.64-4.45(m,2H),4.42-4.23(m,2H),4.17-3.92(m,4H),3.89-3.78(m,2H),3.51-3.42(m,1H),3.35-3.05(m,5H),2.95-2.73(m,2H),2.62-2.51(m,1H),2.21-1.84(m,4H)。
実施例572
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。(5S)-5-(ヒドロキシメチル)-1-メチル-ピロリジン-2-1(556mg、4.30mmol、5.00当量)のTHF(20.0mL)中混合物に、t-BuONa(827mg、8.60mmol、10.0当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で30分間撹拌し、次いで、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、860μmol、1.00当量)を添加した。混合物を15℃に温め、0.5時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(50.0mL)で希釈し、水(30mL×2)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%TFA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液(10.0mL)で中和し、酢酸エチル(50.0mL×3)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(125mg、193μmol、22%収率)を黄色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75(d,J=8.0Hz,1H),7.61(dd,J=4.8,8.0Hz,1H),7.52(dd,J=0.8,7.2Hz,1H),7.45(q,J=8.0Hz,1H),7.37-7.28(m,1H),7.23(br d,J=7.6Hz,1H),4.70-4.31(m,3H),4.10-3.82(m,4H),3.65-3.51(m,1H),3.46-2.99(m,5H),2.98-2.82(m,3H),2.79-2.37(m,5H),2.22(br d,J=8.0Hz,1H),1.93-1.59(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、155μmol、1.00当量)のジオキサン(1.50mL)中混合物に、HCl/ジオキサン(4M、967μL、25.0当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を酢酸エチル(10.0mL)で溶解し、飽和NaHCO3溶液(3.00mL)でpH=8に塩基化し、酢酸エチル(5.00mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10.0mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップで直接使用した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80.0mg、粗製)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:546。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60.0mg、110μmol、1.00当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(19.8mg、220μmol、2.00当量)のEA(1mL)中混合物に、TEA(89.0mg、879μmol、122μL、8.00当量)、T3P(210mg、330μmol、196μL、酢酸エチル中50%の純度、3.00当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。反応混合物を水(5mL)で希釈し、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層を水(10mL×1)およびブライン(10mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150×25mm×5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:35%~65%、10分)により精製した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(11.3mg、18.2μmol、17%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:618。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.77(d,J=8.0Hz,1H),7.63(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=6.8Hz,1H),7.46(td,J=8.0,10.4Hz,1H),7.35(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.20(m,1H),5.52-5.34(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.92(br s,1H),4.52-4.31(m,3H),4.27-3.77(m,5H),3.61(br d,J=10.8Hz,1H),3.46(br d,J=12.0Hz,1H),3.36-2.94(m,5H),2.92(s,3H),2.90-2.79(m,1H),2.64-2.48(m,2H),2.41-2.31(m,1H),2.28-2.17(m,1H),2.05-1.95(m,1H)。
実施例573
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、482μmol、1当量)および(4R,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-1-メチル-4-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-オン(144mg、626μmol、1.3当量)のトルエン(6mL)中溶液に、t-BuONa(92.6mg、964μmol、2当量)を加えた。混合物を0℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(5mL)で希釈し、EtOAc(2×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×20mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、345μmol、72%収率、92%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:746。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(br d,J=8.0Hz,1H),7.66-7.57(m,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.50-7.41(m,1H),7.37-7.31(m,1H),7.27-7.18(m,1H),4.88-4.69(m,1H),4.68-4.47(m,4H),4.46-4.35(m,1H),4.11-3.74(m,6H),3.65-3.48(m,2H),3.44-2.99(m,5H),2.96(dd,J=2.8,8.4Hz,3H),2.91-2.51(m,5H),1.81-1.64(m,2H),1.52(s,13H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-1-メチル-5-オキソ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、268μmol、1当量)のDCM(0.15mL)中溶液に、TFA(458mg、4.02mmol、298μL、15当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をDCM(5mL)で希釈し、飽和重炭酸ナトリウム水溶液でpH=8に塩基化した。分離した水層をEtOAc(5×5mL)で抽出した。合わせた有機層をMgSO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、230μmol、86%収率、86%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:562。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、267μmol、1当量)、TEA(81.0mg、801μmol、111μL、3当量)、および2-フルオロプロパ-2-エン酸(48.1mg、534μmol、2当量)のEtOAc(4mL)中溶液に、T3P(255mg、400μmol、238μL、EtOAc中50%の純度、1.5当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を飽和NaHCO3水溶液(5mL)でクエンチし、EtOAc(2×10mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 1/0→20/1)により精製し、続いて、分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:33%~63%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,3R)-3-ヒドロキシ-1-メチル-5-オキソ-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(22.0mg、34.5μmol、13%収率、99.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:634。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.77(d,J=8.4Hz,1H),7.64(dd,J=4.4,8.0Hz,1H),7.54(d,J=7.6Hz,1H),7.46(dt,J=6.0,8.0Hz,1H),7.35(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.21(m,1H),5.54-5.33(m,1H),5.27(dd,J=2.8,17.2Hz,1H),4.88(dd,J=1.6,12.0Hz,1H),4.80(dd,J=6.0,12.0Hz,1H),4.64-4.48(m,2H),4.47-3.94(m,4H),3.91-3.65(m,3H),3.64-3.43(m,2H),3.37-2.98(m,4H),2.91(d,J=7.6Hz,3H),2.89-2.76(m,1H),2.70-2.53(m,2H),2.46(dt,J=5.2,16.4Hz,1H)。
実施例574
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(275mg、2.06mmol、2.0当量)のトルエン(12.0mL)中混合物に、t-BuONa(198mg、2.06mmol、2.0当量)を0℃で少しずつ加え、0℃で0.5時間撹拌後、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.03mmol、1.0当量)を加え、0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(15.0mL)を加え、得られた混合物を酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%TFA、30%~50%MeCN)により精製し、得られた生成物を固体のNaHCO3でpH=8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(2×15mL)で抽出し、有機層を飽和ブライン(20.0mL)で洗浄し、次いで、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(510mg、769μmol、75%収率、98%純度)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:650。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.80-7.72(m,1H),7.62(t,J=7.8Hz,1H),7.56-7.50(m,1H),7.46-7.40(m,1H),7.37-7.31(m,1H),7.26-7.17(m,1H),5.29-5.07(m,1H),4.65-4.57(m,1H),4.50-4.34(m,2H),4.30-4.17(m,1H),4.06-3.76(m,3H),3.65-3.47(m,2H),3.41-2.86(m,7H),2.84-2.45(m,7H),2.40-2.24(m,1H),2.04-1.86(m,1H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、769μmol、1.0当量)のジオキサン(5.0mL)中溶液に、4NのHCl・ジオキサン(5.0mL)を加え、反応混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濾過し、固体をジクロロメタン(15.0mL)で溶解し、有機層を飽和ブライン(1×15mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(360mg、635μmol、85%収率、97%純度)を淡黄色固体として得た。.LCMS[ESI,M+1]:550。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(120mg、218μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(39.3mg、436μmol、2.0当量)の酢酸エチル(1.2mL)中溶液に、TEA(177mg、1.75mmol、243μL、8.0当量)およびT3P(416mg、654μmol、389μL、50%純度、3.0当量)を0℃で加え、反応混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和ブライン(10.0mL)に加え、次いで、酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル:メタノール=20/1)により精製し、粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、10分];B%:45%~75%、10分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(50.9mg、81.0μmol、37%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:622。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.4Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.41(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),5.55-5.33(m,1H),5.30-5.07(m,2H),5.01-4.66(m,1H),4.53-4.35(m,2H),4.29-3.98(m,3H),3.96-3.78(m,2H),3.73-3.33(m,3H),3.32-2.98(m,5H),2.94-2.71(m,2H),2.68-2.53(m,2H),2.51(d,J=2.8Hz,3H),2.39-2.23(m,1H),2.08-1.87(m,1H)。
実施例575
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(297mg、2.58mmol、2.50当量)のトルエン(6.0mL)中溶液に、t-BuONa(198mg、2.06mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。次いで、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.03mmol、1.0当量)を上記液体に加えた。添加後、混合物を0℃でさらに0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(20.0mL)を加え、得られた混合物を酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%FA、0~60%MeCN)により精製して、化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(430mg、680μmol、66%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:632。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.75(d,J=8.0Hz,1H),7.61(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=7.2Hz,1H),7.48-7.39(m,1H),7.33(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.15(m,1H),4.67-4.55(m,1H),4.50-4.35(m,1H),4.27-4.17(m,2H),4.08-3.75(m,4H),3.65-3.50(m,1H),3.39-3.02(m,5H),3.00-2.86(m,1H),2.81-2.64(m,4H),2.62-2.46(m,4H),2.35(s,3H),2.15-2.05(m,1H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、632μmol、1.0当量)のジオキサン(2.0mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、2.0mL、12.6当量)を加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮した。残留物をNaHCO3飽和水溶液(10.0mL)でpH約7に調整し、次いで、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(240mg、451μmol、71%収率)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:532。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80.0mg、150μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(27.1mg、301μmol、2.0当量)、およびTEA(122mg、1.20mmol、167μL、8.0当量)の酢酸エチル(2.0mL)中溶液に、T3P(287mg、451μmol、268μL、酢酸エチル中50%の純度、3.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をHCl(12.0M、2.0mLの水中60.0μL)でクエンチした。混合物をNaHCO3飽和水溶液でpH約8に調整し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~45%、8分)により精製し、次いで、濃縮した。水層をNaHCO3飽和水溶液でpH約8に調整し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(35.9mg、57.5μmol、38%収率、96.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:604。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.78-7.73(d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.2Hz,1H),7.52(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=8.0Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),5.54-5.32(m,1H),5.30-5.21(m,1H),5.04-4.75(m,1H),4.48-4.36(m,1H),4.27-4.17(m,2H),4.16-3.96(m,2H),3.89-3.75(m,1H),3.64-3.55(m,1H),3.51-3.32(m,1H),3.30-2.98(m,4H),2.96-2.67(m,4H),2.66-2.46(m,4H),2.37(d,J=2.0Hz,3H),2.14-2.06(m,1H),1.70-1.57(m,1H)。
実施例576
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、516μmol、1当量)のトルエン(5.00mL)中溶液に、t-BuONa(124mg、1.29mmol、2.5当量)および[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(149mg、1.03mmol、2当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10:1)により精製した。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、265μmol、51%収率、88%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:662。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、302μmol、1当量)のジオキサン(1.00mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、1.13mL、1.00当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空下で濃縮し、水(20mL)で希釈した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=8に調整し、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(110mg、154.60μmol、70%収率、79%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:562。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(110mg、195μmol、1当量)の酢酸エチル(1.00mL)中溶液に、2-フルオロプロパ-2-エン酸(35.3mg、391μmol、2当量)、T3P(374mg、587μmol、349μL、50%純度、3当量)、およびTEA(158mg、1.57mmol、218μL、8当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)により、およびさらに分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(17mg、26.7μmol、14%収率、99.8%純度)を白色ガムとして得た。LCMS[ESI,M+1]:634。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),5.42(d,J=49.2Hz,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.91(br s,1H),4.54-4.34(m,2H),4.27-4.00(m,3H),3.96-3.77(m,2H),3.67-3.54(m,1H),3.51-3.37(m,1H),3.37-2.96(m,9H),2.95-2.64(m,3H),2.63-2.53(m,1H),2.52-2.27(m,5H),1.91-1.74(m,1H)。
実施例577
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(300mg、2.06mmol、2.0当量)およびt-BuONa(149mg、1.55mmol、1.50当量)のトルエン(7.0mL)中溶液に、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(600mg、1.03mmol、1.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(20.0mL)を加え、得られた混合物を酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%FA、0~60%MeCN)により精製して、化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、652μmol、63%収率、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:662。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.4Hz,1H),7.61(t,J=7.8Hz,1H),7.52(d,J=7.6Hz,1H),7.48-7.40(m,1H),7.35(t,J=7.8Hz,1H),7.27-7.16(m,1H),4.63-4.56(m,1H),4.50-4.35(m,2H),4.23-4.15(m,1H),4.12-3.91(m,4H),3.90-3.75(m,1H),3.65-3.53(m,1H),3.50-3.39(m,1H),3.38-3.32(m,1H),3.30(d,J=2.0Hz,3H),3.28-3.06(m,3H),3.02-2.85(m,2H),2.83-2.64(m,2H),2.62-2.52(m,1H),2.47(d,J=2.8Hz,3H),2.35-2.29(m,1H),2.11-2.06(m,1H),2.03-1.91(m,1H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、680μmol、1.0当量)のジオキサン(4.0mL)中溶液に、HCl・ジオキサン(4M、4.0mL、23.6当量)を加えた。混合物を15℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮した。残留物をNaHCO3飽和水溶液(10.0mL)でpH約7に調整し、次いで、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(300mg、粗製)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:562。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90.0mg、160μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(28.8mg、320μmol、2.0当量)、およびTEA(130mg、1.28mmol、178μL、8.0当量)のEA(3.0mL)中溶液に、T3P(306mg、480μmol、286μL、50%純度、3.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(10.0mL)を加え、得られた混合物を酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、10分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(32.0mg、50.3μmol、31%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:635。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.17(m,1H),5.54-5.32(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.10-4.70(m,1H),4.52-4.34(m,2H),4.27-3.80(m,6H),3.69-3.54(m,1H),3.50-3.37(m,2H),3.30(d,J=1.6Hz,3H),3.28-3.02(m,4H),2.98-2.68(m,3H),2.65-2.53(m,1H),2.47(d,J=2.4Hz,3H),2.37-2.28(m,1H),2.13-2.03(m,1H),2.02-1.90(m,1H)。
実施例578
2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、840μmol、1.00当量)のトルエン(10.0mL)中溶液に、t-BuONa(202mg、2.10mmol、2.50当量)および[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(224mg、1.68mmol、2.00当量)を加えた。0℃で1時間撹拌した後、反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)により精製した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(340mg、502μmol、60%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:664。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、301μmol、1.00当量)のMeOH(15.0mL)中溶液に、Pd/C(30.0mg、10%純度)およびNH3/MeOH(5.00mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15Psi)下、15℃で0.5時間撹拌した。触媒を濾過して取り除いた。濾液を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(159mg、294μmol、98%収率、98%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:530。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(140mg、264μmol、1.00当量)および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(82.5mg、793μmol、3.00当量)の酢酸エチル(2.00mL)中溶液に、TEA(160mg、1.59mmol、220μL、6.00当量)およびT3P(505mg、793μmol、472μL、50%純度、3.00当量)を-70℃で加えた。混合物を-70℃で1時間撹拌した。HCl(12N、2mLの水中130μL)により反応混合物を-70℃でクエンチした。混合物を0℃まで暖め、飽和NaHCO3水溶液でpH=8に塩基化し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:45%~75%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(34.5mg、55.8μmol、21%収率、99.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:616。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.74-7.62(m,2H),7.46-7.31(m,2H),7.27-7.17(m,2H),7.09-6.93(m,1H),6.59(d,J=15.2Hz,1H),5.30-4.51(m,4H),4.48-4.35(m,1H),4.30-3.66(m,6H),3.63-3.34(m,3H),3.24-2.96(m,5H),2.92(s,3H),2.87-2.53(m,4H),2.50(d,J=4.4Hz,3H),2.40-2.22(m,1H),2.10-1.86(m,1H)(m,3H)。
実施例579
2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、841μmol、1当量)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(242mg、2.52mmol、3当量)および[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(194mg、1.68mmol、2当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=100/1→10/1)により精製した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、338μmol、40%収率、91%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、372μmol、1当量)のMeOH(15mL)中溶液に、Pd/C(30mg、10%純度)およびNH3・MeOH(5mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除いた。濾液を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、352μmol、95%収率)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、195μmol、1当量)および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(40.7mg、391μmol、2当量)のEtOAc(2mL)中溶液に、TEA(79.1mg、782μmol、109μL、4当量)およびT3P(249mg、391μmol、232μL、EtOAc中50%の純度、2当量)を-70℃で加えた。混合物を-70℃で1時間撹拌した。反応混合物をHCl(2mLの水中60μL(12M))でクエンチした。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=8に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~45%、7.8分)により精製し、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:52%~79%、10分)によりさらに精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(16.6mg、27.7μmol、14%収率、99.6%純度)を黄色ゴムとして得た。LCMS[ESI,M+1]:598。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.72-7.62(m,2H),7.45-7.32(m,2H),7.27-7.16(m,2H),7.07-6.93(m,1H),6.60(d,J=15.6Hz,1H),5.26-4.51(m,3H),4.39(s,1H),4.31-3.33(m,9H),3.27-2.97(m,5H),2.92(s,3H),2.87-2.76(m,1H),2.65(m,2H),2.49(br d,J=4.6Hz,3H),2.29(m,1H),2.15-1.96(m,1H),1.92-1.67(m,3H)。
実施例580
2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、841μmol、1当量)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(242mg、2.52mmol、3当量)および[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(194mg、1.68mmol、2当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/MeOH=100/1→10/1)により精製した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、338μmol、40%収率、91%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:646。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、372μmol、1当量)のMeOH(15mL)中溶液に、Pd/C(30mg、10%純度)およびNH3・MeOH(5mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。触媒を濾過して取り除いた。濾液を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、352μmol、95%収率)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、195μmol、1当量)および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(40.7mg、391μmol、2当量)のEtOAc(2mL)中溶液に、TEA(79.1mg、782μmol、109μL、4当量)およびT3P(249mg、391μmol、232μL、EtOAc中50%の純度、2当量)を-70℃で加えた。混合物を-70℃で1時間撹拌した。反応混合物をHCl(2mLの水中60μL(12M))でクエンチした。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH=8に調整し、酢酸エチル(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 150*25 5μ;移動相:[水(0.225%FA)-MeCN];B%:25%~45%、7.8分)により精製し、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:52%~79%、10分)によりさらに精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(16.6mg、27.7μmol、14%収率、99.6%純度)を黄色ゴムとして得た。LCMS[ESI,M+1]:628。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.62(m,2H),7.45-7.32(m,2H),7.27-7.17(m,2H),7.08-6.93(m,1H),6.60(br d,J=16.0Hz,1H),5.26-4.54(m,3H),4.40(m,1H),4.31-3.69(m,7H),3.61-3.36(m,3H),3.30(d,J=2.0Hz,3H),3.24-2.96(m,4H),2.92(s,3H),2.91-2.55(m,4H),2.47(d,J=4.8Hz,3H),2.37-2.26(m,1H),2.13-2.03(m,1H),2.01-1.89(m,1H)。
実施例581
2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(450mg、757μmol、1当量)および[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メタノール(131mg、1.13mmol、1.5当量)のトルエン(9mL)中溶液に、t-BuONa(145mg、1.51mmol、2当量)を加えた。混合物を0℃で10分間撹拌した。撹拌が完了したら、水(15mL)を加え、得られた混合物を酢酸エチル(30mL×2)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×50mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮し、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、455μmol、60%収率、98%純度)を淡紅色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.60(m,2H),7.45-7.37(m,5H),7.37-7.30(m,2H),7.26-7.16(m,2H),5.21(s,2H),4.68(br s,1H),4.30-3.78(m,7H),3.59-3.29(m,2H),3.25-2.94(m,4H),2.91(s,3H),2.82-2.62(m,4H),2.62-2.53(m,2H),2.53-2.42(m,2H),2.35(s,3H),2.05(s,1H),1.66-1.51(m,1H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、465μmol、1当量)のMeOH(4mL)中溶液に、Pd/C(150mg、10%純度)、NH3/MeOH(4mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(210mg、369μmol、80%収率、90%純度)を淡紅色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:512。
ステップC:2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(70mg、137μmol、1当量)、TEA(41.5mg、410μmol、57.1μL、3当量)、および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(28.5mg、274μmol、2当量)のEtOAc(2mL)中溶液に、T3P(131mg、205μmol、122μL、EtOAc中50%の純度、1.5当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を1MのHCl(0.4mL)により-40℃でクエンチし、氷が無くなるまで撹拌した。分離した水層を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-MeCN];B%:20%~50%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、標記化合物である2-[(2S)-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(13.7mg、20.8μmol、15%収率、97.7%純度、FA)を灰色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:598。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.66-7.59(m,1H),7.59-7.51(m,1H),7.32(td,J=7.6,11.6Hz,1H),7.26(t,J=7.6Hz,1H),7.19-7.07(m,2H),7.00-6.83(m,1H),6.52(br d,J=14.8Hz,1H),5.21-4.31(m,3H),4.29-3.96(m,3H),3.94-3.53(m,7H),3.45(br d,J=6.8Hz,4H),3.15-2.88(m,7H),2.84(s,3H),2.81-2.74(m,1H),2.61-2.47(m,2H),2.18(br s,1H),1.85(br s,1H)。
実施例582
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、327μmol、1.0当量)および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(102mg、982μmol、3.0当量)の溶液に、TEA(265mg、2.62mmol、364μL、8.0当量)およびT3P(833mg、1.31mmol、778μL、50%純度、4.0当量)を加え、反応混合物を-65℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を-65℃で2N HClによりpH約7にクエンチし、有機層を分離し、水相を酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製し、粗生成物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:50%~80%、8分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、凍結乾燥した。標記化合物である2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(72.2mg、113μmol、34%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:637。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.79-7.73(m,1H),7.62(t,J=7.0Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.41(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.18(m,1H),7.08-6.93(m,1H),6.59(br d,J=14.8Hz,1H),5.29-5.03(m,3H),4.54-4.52(m,1H),4.50-4.35(m,2H),4.30-3.78(m,5H),3.76-3.35(m,3H),3.32-2.96(m,5H),2.91-2.54(m,4H),2.51(d,J=3.2Hz,3H),2.39-2.23(m,1H),2.08-1.86(m,1H)。
実施例583
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、267μmol、1.0当量)、(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(55.6mg、534μmol、2.0当量)、およびTEA(108mg、1.07mmol、149μL、4.0当量)の酢酸エチル(4.0mL)中溶液に、T3P(340mg、534μmol、317μL、50%純度、2.0当量)を加えた。混合物を-70℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をHCl(12M、2.0mLの水中60.0μL)でクエンチした。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約8に調整し、酢酸エチル(3×20.0mL)で抽出した。合わせた有機層は、飽和ブライン(60.0mL)、Na2SO4上で乾燥し、濃縮する濾過されたおよびで洗浄した。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:50%~80%、8分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S,4R)-4-メトキシ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(39.6mg、60.9μmol、23%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:619。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=8.0Hz,1H),7.27-7.17(m,1H),7.08-6.94(m,1H),6.67-6.54(m,1H),5.25-5.03(m,2H),4.80-4.60(m,1H),4.48-4.34(m,2H),4.21-3.77(m,5H),3.65-3.55(m,1H),3.51-3.37(m,1H),3.31-2.97(m,5H),2.88-2.54(m,4H),2.48(d,J=3.6Hz,3H),2.34-2.24(m,1H),2.11-2.01(m,1H),1.90-1.69(m,3H)。
実施例584
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、188μmol、1.0当量)、(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(39.1mg、376μmol、2.0当量)、およびTEA(95.1mg、940μmol、131μL、5.0当量)の酢酸エチル(3.0mL)中溶液に、T3P(179mg、282μmol、168μL、50%純度、1.50当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をHCl(12M、5.0当量)により-40℃でクエンチした。混合物をNaHCO3飽和水溶液でpH約8に調整し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-MeCN];B%:30%~50%、8分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(3R)-1-メチルピロリジン-3-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(15.7mg、24.9μmol、13%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:619。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(d,J=8.4Hz,1H),7.65-7.59(m,1H),7.56-7.49(m,1H),7.48-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.6Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),7.08-6.92(m,1H),6.74-6.46(m,1H),5.25-4.95(m,3H),4.75-4.55(m,1H),4.47-4.36(m,1H),4.35-4.26(m,2H),4.14-3.92(m,2H),3.91-3.76(m,1H),3.64-3.55(m,1H),3.53-3.35(m,1H),3.33-3.04(m,7H),3.03-2.72(m,4H),2.67(d,J=4.0Hz,3H),2.64-2.51(m,1H),2.31-2.19(m,1H),1.98-1.85(m,1H)。
実施例585
2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロパン-1-オール(150mg、954μmol、1.85当量)のトルエン(3.0mL)中混合物に、t-BuONa(99.2mg、1.03mmol、2.0当量)を0℃で少しずつ加え、0℃で0.5時間撹拌後、tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、516μmol、1.0当量)を混合物に加え、0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(15mL)を加え、得られた混合物を酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%TFA、30%~50%MeCN)により精製し、得られた生成物を固体のNaHCO3でpH約8に調整し、次いで、濃縮し、水相を酢酸エチル(2×15mL)で抽出し、有機層を飽和ブライン(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、267μmol、52%収率、100%純度)を淡黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:674。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.4Hz,1H),7.61(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=7.2Hz,1H),7.48-7.40(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.17(m,1H),4.66-4.54(m,1H),4.50-4.29(m,4H),4.08-3.77(m,5H),3.65-3.54(m,2H),3.51-3.44(m,1H),3.39-3.31(m,1H),3.29-3.02(m,4H),3.00-2.87(m,2H),2.84-2.46(m,6H),1.99-1.82(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、222μmol、1.0当量)のジオキサン(1.0mL)中溶液に、4NのHCl・ジオキサン(1.0mL)を加え、反応混合物を15℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮し、ジクロロメタン(10mL)を添加し、次いで、飽和Na2CO3水溶液(1×10mL)で洗浄し、有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。生成物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、172μmol、77%収率、98%純度)を褐色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:574。
ステップC:2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[3-[(1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル]プロポキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90.0mg、157μmol、1.0当量)および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(48.9mg、470μmol、3.0当量)の酢酸エチル(1.0mL)中溶液に、TEA(127mg、1.25mmol、175μL、8.0当量)およびT3P(399mg、627μmol、373μL、50%純度、4.0当量)を-65℃で少しずつ加え、反応混合物を-65℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を-65℃で2N HClによりpH約7にクエンチし、有機層を分離し、水相を酢酸エチル(2×10mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(塩基性Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=3/1→酢酸エチル/メタノール=20/1)により精製し、粗生成物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:44%~74%、8分)により再精製し、得られた生成物を濃縮し、凍結乾燥した。標記化合物である2-((S)-4-(2-(3-((1S,4S)-2-オキサ-5-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン-5-イル)プロポキシ)-7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(10.6mg、16.0μmol、10%収率、99%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:660。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.4Hz,1H),7.62(t,J=7.4Hz,1H),7.53(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.41(m,1H),7.34(t,J=7.8Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),7.09-6.93(m,1H),6.60(br d,J=14.0Hz,1H),5.26-5.01(m,2H),4.76-7.54(m,1H),4.52-4.29(m,4H),4.19-3.97(m,3H),3.95-3.69(m,2H),3.66-3.37(m,4H),3.33-2.99(m,4H),2.97-2.67(m,5H),2.65-2.48(m,2H),2.01-1.90(m,2H),1.90-1.82(m,1H),1.76-1.69(m,1H)。
実施例586
2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メタノール(99.1mg、860μmol、2.50当量)のトルエン(5.0mL)中溶液に、t-BuONa(66.2mg、688μmol、2.0当量)およびtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、344μmol、1.0当量)を少しずつ加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、水(20.0mL)を加え、得られた混合物を酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュ(C18、水中0.1%FA、0~60%MeCN)により精製して、化合物であるtert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、313μmol、91%収率、99%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:632。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.77-7.73(m,1H),7.61(t,J=7.6Hz,1H),7.54-7.50(m,1H),7.49-7.39(m,1H),7.33(t,J=7.6Hz,1H),7.27-7.16(m,1H),4.67-4.56(m,1H),4.47-4.35(m,2H),4.23-4.15(m,1H),4.09-3.89(m,3H),3.88-3.77(m,1H),3.63-3.53(m,1H),3.41-3.30(m,1H),3.22-3.03(m,4H),3.01-2.85(m,1H),2.74-2.67(m,2H),2.63-2.51(m,2H),2.49(d,J=4.4Hz,3H),2.36-2.25(m,1H),2.11-2.05(m,1H),1.90-1.74(m,3H),1.52(s,9H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4.0-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、316μmol、1.0当量)のジオキサン(3.0mL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、3.0mL、37.9当量)を加えた。混合物を15℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を濃縮した。残留物をNaHCO3飽和水溶液(10.0mL)でpH約7に調整し、次いで、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、粗製)を黄色固体として得た。生成物をさらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:532。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、188μmol、1.0当量)および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(39.1mg、376μmol、2.0当量)の酢酸エチル(2.0mL)中溶液に、TEA(76.1mg、752μmol、105μL、4.0当量)およびT3P(239mg、376μmol、224μL、50%純度、2.0当量)を-70℃で加えた。混合物を-70℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をHCl(12.0M、2.0mLの水中60.0μL)でクエンチした。混合物をNaHCO3飽和水溶液でpH=8に調整し、酢酸エチル(3×10.0mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30.0mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-MeCN];B%:598%~89%、8分)により精製して、標記化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2R)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(13.97mg、22.2μmol、12%収率、98.4%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:619。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ7.76(br d,J=8.0Hz,1H),7.62(t,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=7.6Hz,1H),7.49-7.40(m,1H),7.34(t,J=8.0Hz,1H),7.27-7.17(m,1H),7.08-6.94(m,1H),6.67-6.54(m,1H),5.25-5.03(m,2H),4.80-4.60(m,1H),4.48-4.34(m,2H),4.21-3.77(m,5H),3.65-3.55(m,1H),3.51-3.37(m,1H),3.31-2.97(m,5H),2.88-2.54(m,4H),2.48(d,J=3.6Hz,3H),2.34-2.24(m,1H),2.11-2.01(m,1H),1.90-1.69(m,3H)。
実施例587
N-((E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エン-1-イル)-N-メチルアセトアミド
ステップA:エチル(E)-4-(N-メチルアセトアミド)ブタ-2-エノエート:エチル(E)-4-アセトアミドブタ-2-エノエート(140mg、0.818mmol)をDMF(4mL)で希釈し、続いて、NaH(21.6mg、0.900mmol)およびMeI(56.2μl、0.900mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、有機層をMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を10~70%の酢酸エチル/ヘキサンにより溶出するシリカゲル上で精製して、エチル(E)-4-(N-メチルアセトアミド)ブタ-2-エノエート(120mg、0.648mmol、79.2%収率)を得た。
ステップB:(E)-4-(N-メチルアセトアミド)ブタ-2-エン酸:エチル(E)-4-(N-メチルアセトアミド)ブタ-2-エノエート(20mg、0.11mmol)をメタノール(1mL)で希釈し、続いて、NaOH(270μl、0.54mmol)を加えた。4時間撹拌後、2N HClにより反応物をpH約4まで希釈し、水層を酢酸エチルで抽出した。酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、(E)-4-(N-メチルアセトアミド)ブタ-2-エン酸(15mg、0.095mmol、88%収率)を得た。
ステップC:N-((E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エン-1-イル)-N-メチルアセトアミド:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(20mg、0.039mmol)をDMFで希釈し、続いて、DIEA(13.65μl、0.07817mmol)を加えた。(E)-4-(N-メチルアセトアミド)ブタ-2-エン酸(9.83mg、0.0625mmol)を加え、続いて、1-プロパンホスホン酸環状無水物(39.6μl、0.0664mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、N-((E)-4-((S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタ-2-エン-1-イル)-N-メチルアセトアミド(2.1mg、0.0032mmol、8.2%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 651.4[M+H]+。
実施例588
2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、0.277mmol)、1,8-ジブロモナフタレン(238mg、0.831mmol)、Pd2(dba)3(25.4mg、0.0277mmol)、Cs2CO3(451mg、1.38mmol)、およびキサントホス(32.0mg、0.0554mmol)をトルエン(111μl、0.277mmol)で希釈した。反応物をアルゴンによりパージし、密閉し、撹拌しながら110℃まで12時間加熱した。反応物を放冷し、酢酸エチルおよび水で希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を1~10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、ベンジル(S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(80mg、0.113mmol、40.7%収率)を得た。
ステップB:2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(80mg、0.11mmol)をTFA(2mL)で希釈し、窒素下に置き、90℃まで加熱した。2時間撹拌後、反応物を冷却し、濃縮した。物質をDCMで希釈し、飽和重炭酸ナトリウムで洗浄した。DCMをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(23mg、0.040mmol、35%収率)を得た。
ステップC:2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(23mg、0.040mmol)をDMF(350μL)で希釈し、続いて、DIEA(22μl、0.13mmol)および2-フルオロアクリル酸(5.4mg、0.060mmol)を加えた。2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン 2,4,6-三酸化物(25mg、0.040mmol)を加え、反応物を室温で12時間撹拌した。反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、2-((S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(9mg、0.014mmol、35%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 650.2[M+H]+。
実施例589
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(24mg、0.042mmol)をDMF(400μL)で希釈し、DIEA(19μl、0.11mmol)を加え、続いて、2-フルオロアクリル酸(6.1mg、0.068mmol)を加え、2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン 2,4,6-三酸化物(30μl、0.047mmol)を加えた。反応物を周囲温度で10時間撹拌した。反応物を5%の炭酸水素ナトリウム溶液中に注ぎ込み、酢酸エチルで2回抽出した。酢酸エチルを水、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を1~10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-(トリフルオロメチル)ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(5mg、0.0078mmol、18%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 638.3[M+H]+。
実施例590
2-((S)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-4-(7-(8-ブロモナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(30mg、0.042mmol)およびジクロロ[1,1’-ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン]パラジウム(II)ジクロロメタン付加物(14mg、0.017mmol)をシクロヘキシル亜鉛ブロミド(253μl、0.13mmol)で希釈した。反応物をアルゴンによりパージし、密閉し、90℃まで加熱した。12時間撹拌後、反応物を放冷し、酢酸エチルおよび水で希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(7mg、0.010mmol、25%収率)を得た。
ステップB:2-((S)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(9mg、0.01mmol)をメタノール(1mL)で希釈し、続いて、Pd-C(1mg、0.01mmol)を加えた。反応物に水素バルーンを設置し、3回パージし、続いて、水素雰囲気下で4時間撹拌した。固形分を濾過により集め、メタノールでリンスし、合わせた有機相を濃縮して、2-((S)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(7mg、0.01mmol、97%収率)を得た。
ステップC:2-((S)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(10mg、0.019mmol)をDMF(500μL)で希釈し、続いて、DIEA(11μl、0.065mmol)、2-フルオロアクリル酸(2.5mg、0.028mmol)、および2,4,6-トリプロピル-1,3,5,2,4,6-トリオキサトリホスフィナン 2,4,6-三酸化物(13μl、0.020mmol)を加えた。12時間撹拌後、反応物を酢酸エチルおよび飽和重炭酸ナトリウムで希釈した。層を分離し、酢酸エチルをMgSO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。物質を10%のメタノール/DCM(1%NH4OH)により溶出するシリカゲル上で精製して、2-((S)-4-(7-(8-シクロプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(0.9mg、0.0015mmol、7.9%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 610.3[M+H]+。
実施例591
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-イソプロピルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップAで、シクロプロピル亜鉛ブロミドの代わりにイソプロピル亜鉛ブロミドを使用して、実施例590と同様に合成した。ESI+APCIMS m/z 612.3[M+H]+。
実施例592
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(1-メチルイソキノリン-8-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップAで、1,8-ジブロモナフタレンの代わりに8-ブロモ-1-メチルイソキノリンを使用し、実施例588と同様に合成した。ESI+APCIMS m/z 585.3[M+H]+。
実施例593
2-((S)-4-(7-(5-クロロイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップAで1,8-ジブロモナフタレンの代わりに4-ブロモ-5-クロロイソキノリンを使用し、実施例588と同様に合成した。ESI+APCIMS m/z 605.2[M+H]+。
実施例594
2-((S)-4-(7-(8-ブロモイソキノリン-1-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップAで1,8-ジブロモナフタレンの代わりに8-ブロモ-1-クロロイソキノリンを使用し、実施例588と同様に合成した。ESI+APCIMS m/z 651.2[M+H]+。
実施例595
2-((S)-4-(7-(1-クロロイソキノリン-8-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップAで1,8-ジブロモナフタレンの代わりに8-ブロモ-1-クロロイソキノリンを使用し、実施例589と同様に合成した。ESI+APCIMS m/z 605.3[M+H]+。
実施例596
2-((S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(3g、5.7mmol)をDCM(57ml、5.7mmol)中に溶解し、塩酸溶液(1,4-ジオキサン中の4.0M)(7.1ml、28mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を1MのNaOHで洗浄した。水相を追加のDCM(2×)で抽出し、合わせた有機相をMgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.4g、5.6mmol、99%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 427.2[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(1.030g、1.124mmol)および9,9-ジメチル-4,5-ビス(ジフェニルホスフィノ)キサンテン(1.301g、2.249mmol)を1,4-ジオキサン(56.22ml、5.622mmol)中に溶解し、アルゴン下で5分間パージした。反応物をアルゴン下、100℃で15分間撹拌し、反応物を室温に冷却した。反応物に、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.4g、5.622mmol)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(3.729g、16.87mmol)、および炭酸セシウム(5.495g、16.87mmol)をアルゴン下で加えた。反応物をアルゴン下でキャッピングし、100℃で一晩撹拌した。反応物を室温に冷却し、固形分を濾過によって除去した。濾液を減圧下で濃縮し、0→75%のヘキサン/EtOAcを溶出液として使用したCombiFlash上での順相クロマトグラフィー(2×)により精製して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.532g、4.465mmol、79.42%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 567.2[M+H]+。
ステップC:2-((S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:マイクロ波チューブ中で、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、0.441mmol)のジオキサン(2204μl、0.441mmol)中溶液をアルゴンにより5分間スパージした。(S)-(-)-1-ベンジル-2-ピロリジンメタノール(169mg、0.882mmol)、Cs2CO3(431mg、1.32mmol)、メタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(37.5mg、0.0441mmol)をアルゴン下で順次加え、反応物をアルゴンによりさらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で2時間加熱した。反応物を室温まで冷却し、酢酸エチルを加えた。固形分を濾過により除去し、濾液を濃縮し、0→20%のDCM/MeOH+2%NH4OHにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。目的の生成物を含有する全画分を合わせ、濃縮して、2-((S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(120mg、0.204mmol、77.2%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 722.4[M+H]+。
ステップD:2-((S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、0.277mmol)のEtOH(2770μl、0.277mmol)およびTHF(2770μl、0.277mmol)中溶液をN2により5分間パージした。この溶液に、パラジウム(73.7mg、0.0693mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、直ちにキャッピングし、N2によりさらに5分間パージした。次いで、溶液をH2雰囲気下で1時間撹拌した。混合物をMeOHで希釈し、充填セライト通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、粗製の2-((S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(160mg、0.272mmol、98.3%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 588.4[M+H]+。
ステップE:2-((S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:0℃のジクロロメタン(2722μl、0.272mmol)を含む25mLのRBFに、2-((S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(160mg、0.272mmol)およびヒューニッヒ塩基(95.1μl、0.544mmol)を加えた。2-フルオロアクリル酸(98.1mg、1.09mmol)を1度に加えると共に、反応混合物を強く撹拌した。次に、1-プロパンホスホン酸環状無水物(243μl、0.408mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を0℃で2時間撹拌した。反応物を塩基性水で処理し、水層をDCM(3×)で抽出した。合わせた有機相を減圧下で濃縮し、残留物をMeCN:H2Oの60:40の混合物中に再懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%のMeCN/0.1%TFAにより溶出して精製(分取HPLC)して生成物を得た。不純物を含まない画分をプールし、EtOAcおよび1N NaOHで希釈し、層を分離した。合わせた有機相をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、2-((S)-4-(2-(((S)-1-ベンジルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8mg、0.0121mmol、4.45%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 660.4[M+H]+。
実施例597
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-(2-フルオロエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(2g、3.795mmol)をDCM(37.95ml、3.795mmol)中に溶解し、塩酸溶液(1,4-ジオキサン中4.0M)(4.744ml、18.97mmol)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。反応物を1MのNaOHで洗浄し、水層をDCM(2×)で抽出した。有機相を合わせ、Na2SO4上で乾燥し、濃縮して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.619g、3.792mmol、99.93%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 427.2[M+H]+。
ステップB:ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(0.6946g、0.7585mmol)および9,9-ジメチル-4,5-ビス(ジフェニルホスフィノ)キサンテン(0.8778g、1.517mmol)を1,4-ジオキサン(37.92ml、3.792mmol)中に溶解し、アルゴン下で5分間パージし、アルゴン下、100℃で15分間撹拌し、反応物を室温に冷却した。混合物に、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.619g、3.792mmol)、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(2.515g、11.38mmol)、および炭酸セシウム(3.707g、11.38mmol)をアルゴン下で加えた。反応物をアルゴン下でキャッピングし、100℃で一晩撹拌した。反応物を室温まで冷却し、濾過により固形分を除去した。濾液を減圧下で濃縮し、0→75%のヘキサン/EtOAcを溶出液として使用した順相クロマトグラフィー(2×)により精製して、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(958mg、1.689mmol、44.54%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 567.2[M+H]+。
ステップC:tert-ブチル(S)-2-(((4-((S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート:マイクロ波チューブで、ベンジル(S)-4-(2-クロロ-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、0.441mmol)のジオキサン(2204μl、0.441mmol)中溶液をアルゴンにより5分間スパージした。(S)-(-)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-2-ピロリジンメタノール(222mg、1.10mmol)、Cs2CO3(431mg、1.32mmol)、およびメタンスルホナト(2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジ-i-プロポキシ-1,1’-ビフェニル)(2’-メチルアミノ-1,1’-ビフェニル-2-イル)パラジウム(II)(37.5mg、0.0441mmol)をアルゴン下で順次加え、反応物をアルゴンによりさらに5分間スパージした。反応混合物をキャッピングし、100℃で2時間加熱した。反応物を室温まで冷却し、酢酸エチルを加えた。固形分を濾過により除去し、濾液を濃縮し、0→20%のDCM/MeOH+2%NH4OHにより溶出するフラッシュクロマトグラフィーによって精製した。目的の生成物を含有する全画分を合わせ、濃縮し、ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(306mg、0.418mmol、94.8%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 598.3[M+H]+。
ステップD:ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-2-(((4-((S)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-2-イル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(93mg、0.1556mmol)をジクロロメタン(1556μl、0.1556mmol)中に溶解し、ヒューニッヒ塩基(135.9μl、0.7779mmol)およびベンジルカルボノクロリデート(33.31μl、0.2334mmol)で処理した。反応物を室温で2時間撹拌した。反応物をDCMと水との間で分配し、層を分離した。水層をDCM(2×)で抽出した。合わせた有機相をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮し、残留物を0→15%のDCM/MeOH+2%NH4OHを溶出液として使用したクロマトグラフィーにより精製した。生成物を含有する全画分を合わせ、濃縮して、ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(367mg、0.5014mmol、322.3%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 732.4[M+H]+。
ステップE:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(tert-ブトキシカルボニル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(367mg、0.501mmol)をDCM(5014μl、0.501mmol)中に溶解し、TFA(193μl、2.51mmol)で処理し、反応物を室温で1時間撹拌した。反応は、観察されなかった。混合物を減圧下で濃縮し、DCM中に再懸濁した。これにHCl(ジオキサン(500μL)中4M)を加え、室温で1時間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、残留物を1MのNaOHとDCMとの間で分配した。合わせた有機相を減圧下で濃縮して、粗製のベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(192mg、0.304mmol、60.6%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 632.3[M+H]+。
ステップF:ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-(((S)-ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、0.23742mmol)の2.5mLのDMF中の攪拌溶液に水素化ナトリウム(鉱油中の60%分散体(8.5465mg、0.35614mmol))を加えた。15分後、(2-ブロモエトキシ)(tert-ブチル)ジメチルシラン(142.00mg、0.59356mmol)を加え、反応物を75℃まで3.5時間加熱した。反応物を水とEtOAcとの間で分配し、室温まで冷却し、層を分離した。水層をEtOAcで抽出し、合わせた有機相をより多くの水およびブラインで洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、粗製のベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(187mg、0.237mmol、99.7%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 790.4[M+H]+。
ステップG:2-((S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(187mg、0.237mmol)のEtOH(2367μl、0.237mmol)およびTHF(2367μl、0.237mmol)中溶液をN2により5分間パージした。この溶液に、パラジウム(63.0mg、0.0592mmol)(デグサタイプ、10重量%、50%H2O)を加え、直ちにキャッピングし、N2によりさらに5分間パージした。次いで、溶液をH2雰囲気下で一晩撹拌した。混合物をMeOHで希釈し、充填セライト通して濾過した。次いで、濾液を減圧下で濃縮して、粗製の2-((S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(134mg、0.204mmol、86.3%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 656.4[M+H]+。
ステップH:2-((S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:N,N-ジメチルホルムアミド(2043μl、0.204mmol)を含む25mLのRBFに、2-((S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(134mg、0.204mmol)およびヒューニッヒ塩基(71.4μl、0.409mmol)を0℃で加えた。2-フルオロアクリル酸(22.1mg、0.245mmol)を1度に加えると共に、反応混合物を強く撹拌した。次に、1-プロパンホスホン酸環状無水物(182μl、0.306mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を0℃で1時間撹拌した。反応物をNaOH水溶液で処理し、水層をEtOAc(3×)で抽出した。合わせた有機相を減圧下で濃縮して、粗製の2-((S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(120mg、0.165mmol、80.7%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 728.4[M+H]+。
ステップI:2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(2-(((S)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(2-(((S)-1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(50mg、0.069mmol)をジクロロメタン(687μl、0.069mmol)中に溶解し、塩化水素(52μl、0.21mmol)(ジオキサン中4M)で処理した。反応物を室温で1時間撹拌した。次いで、反応物を減圧下で濃縮し、MeCN:H2Oの60:40の混合物中に再懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%のMeCN/0.1%TFAにより溶出して精製(分取HPLC)した。生成物を含有する画分を合わせ、1MのNaOHとDCMとの間で分配し、層を分離し、水層を追加のDCMで抽出した。合わせた有機相をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(2-(((S)-1-(2-ヒドロキシエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(2.7mg、0.0044mmol、6.4%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 614.3[M+H]+。
実施例598
2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-(2-フルオロエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-(2-フルオロエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(30mg、0.0508mmol)をアセトニトリル(508μl、0.0508mmol)中に溶解し、炭酸セシウム(19.9mg、0.0610mmol)を1度に加えた。次いで、1-フルオロ-2-ヨードエタン(3.72μl、0.0458mmol)をこの混合物に加え、反応物を60℃で一晩撹拌した。反応物を室温まで冷却し、固形分を濾過により除去し、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を60:40のMeCN:水中に再懸濁し、水/0.1%TFA中の5→95%のMeCN/0.1%TFAにより溶出して精製(分取HPLC)した。目的の生成物を含有する画分を合わせ、EtOAcと1MのNaOHとの間で分配し、層を分離した。水層を追加のEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機相をNa2SO4上で乾燥し、減圧下で濃縮して、2-((S)-4-(7-(8-クロロナフタレン-1-イル)-2-(((S)-1-(2-フルオロエチル)ピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(4.8mg、0.00755mmol、14.8%収率)を得た。ESI+APCI MS m/z 636.3[M+H]+。
実施例599
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(S)-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-2-(ヒドロキシメチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(3.0g、14.91mmol)の0℃まで冷却したDCM(74.53ml、14.91mmol)中溶液に、N-エチル-N-イソプロピルプロパン-2-アミン(4.01ml、22.36mmol)を加え、続いて、メタンスルホニルクロリド(1.38ml、17.89mmol)を1分間にわたって加え、反応物を0℃で1時間撹拌した。次に反応物を1:1の水/ブライン(10mL)で洗浄し、層を分離した。次に合わせた有機相をMgSO
4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。次に物質をDCM中0~10%のMeOHを溶出液として使用したクロマトグラフィーにより精製して、tert-ブチル(S)-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(3.786g、13.55mmol、90.9%収率)を得た。
ステップB:tert-ブチル(S)-2-(((3-メトキシ-3-オキソプロピル)チオ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル(S)-2-(((メチルスルホニル)オキシ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2.00g、7.16mmol)およびCs
2CO
3(4.665g、14.32mmol)をジオキサン(10mL)中に入れ、室温で3時間撹拌した。NaOH(0.5M)を加え、混合物をDCMで抽出した。合わせた有機相を濃縮し、残留物をシリカゲル(0.25%NH
4OHを含有するDCM中の0~12%MeOH)により精製して、tert-ブチル(S)-2-(((3-メトキシ-3-オキソプロピル)チオ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2.172g、7.16mmol、99%収率)を得た。
ステップC:メチル(S)-3-(((1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)プロパノエート:バイアルに、ギ酸(6.751ml、179.0mmol)中のtert-ブチル(S)-2-(((3-メトキシ-3-オキソプロピル)チオ)メチル)ピロリジン-1-カルボキシレート(2.172g、7.16mmol)を加え、続いて、ホルムアルデヒド(10.76ml、143.2mmol)(37%水溶液)を加えた。次いで、混合物を65℃まで加熱し、18時間撹拌した。反応物を冷却し、飽和重炭酸塩をゆっくりと加え、混合物をDCM中の10%MeOH(3×20mL)で抽出した。抽出物を合わせ、MgSO
4上で乾燥し、濃縮した。残留物をシリカゲル(0.25%NH
4OHを含有するDCM中5~20%のMeOH)により精製して、メチル(S)-3-(((1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)プロパノエート(186mg、0.86mmol、12%収率)を得た。
ステップD:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート:メチル(S)-3-(((1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)プロパノエート(186mg、0.854mmol)をジオキサン(5mL)中に入れた。KOtBu(1708μl、1.71mmol)を加え、混合物を30分間撹拌した。tert-ブチル(S)-4-(4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-クロロ-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(300mg、0.569mmol)を加え、混合物を80℃に24時間加熱した。混合物を冷却し、水で希釈し、DCM(3×15mL)で抽出した。抽出物を合わせ、濃縮した。残留物をシリカゲル(0.25%NH
4OHを含有するDCM中0~15%のMeOH)により精製して、tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(72mg、0.116mmol、20.3%収率)を得た。
ステップE:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:tert-ブチル 4-((S)-4-((ベンジルオキシ)カルボニル)-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,8-ジヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-7(6H)-カルボキシレート(72mg、0.12mmol)をDCM(5mL)中に入れ、0℃まで冷却した。HCl(145μl、0.58mmol)を加え、反応物を18時間撹拌し、室温まで暖めた。反応物を濃縮し、DCM中に加えた。飽和重炭酸塩を加え、混合物をDCM(3×20mL)で抽出した。有機層を合わせ、MgSO
4上で乾燥し、濃縮して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(61mg、0.12mmol)を得た。
ステップF:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(61mg、0.12mmol)のトルエン(2mL)中溶液に、1-ブロモ-8-メチルナフタレン(78mg、0.35mmol)を加え、反応物をアルゴンにより15分間脱気し、続いて、Cs
2CO
3(190mg、0.58mmol)、Pd
2(dba)
3(21mg、0.023mmol)、およびキサントホス(27mg、0.047mmol)を加え、反応物を100℃まで18時間加熱した。固形分を濾過により除去し、濾液を減圧下で濃縮して、次に残留物を、2%NH
4OHを添加剤として含有する1→12%MeOH/DCMを使用したクロマトグラフィーにより精製して、ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(54mg、0.082mmol、70%収率)を得た。
ステップG:2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:ベンジル(S)-2-(シアノメチル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(54mg、0.082mmol)をDCM(10mL)中に入れ、反応物を0℃まで冷却した。AcOH(14.01μl、0.244mmol)およびTMS-I(69.67μl、0.490mmol)を加え、反応物を室温までゆっくりと暖め、1時間撹拌した。飽和重炭酸塩を加え、混合物をDCMで抽出した。抽出物を濃縮し、残留物を逆相クロマトグラフィー(0.1%TFAを含有する水中の5~95%のMeCN)により精製した。次いで、単離生成物を、DCM中に加え、飽和重炭酸塩を加えることによって塩基を遊離させた。有機層を分離し、MgSO4上で乾燥し、濃縮して、2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8mg、0.15mmol、19%)を得た。
ステップH:2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル:N,N-ジメチルホルムアミド(152μl、0.015mmol)の0℃溶液に、2-((S)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(8.0mg、0.015mmol)およびトリエチルアミン(7.37μl、0.053mmol)を加えた。2-フルオロアクリル酸(4.10mg、0.046mmol)を1度に加えると共に、反応混合物を強く撹拌した。次に、1-プロパンホスホン酸環状無水物(13.5μl、0.023mmol)を撹拌混合物にゆっくりと加えた。反応物を室温にて20分間撹拌した。水を加え、混合物をDCMで抽出し、抽出物を濃縮した。残留物をシリカゲル(0.25%NH4OHを含有するDCM中の0~12%のMeOH)により精製して、2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-2-((((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メチル)チオ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(2.3mg、0.0038mmol、25.3%収率)を得た。ES+APCI MS m/z 600.3[M+H]+。
実施例600
2-((S)-4-(7-(5-クロロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
2-((S)-4-(7-(5-クロロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジン-3-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリルを、実施例359に従って、ステップAで、1-ブロモ-8-メチルナフタレンの代わりに3,5-ジクロロ-4-(トリフルオロメチル)ピリジンを使用して調製した。ES+APCI MS m/z 623.2[M+H]+。
実施例601
2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、841μmol、1当量)および[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(191mg、1.26mmol、1.5当量)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(162mg、1.68mmol、2当量)を加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10mL)で希釈し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、NaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×100mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、418μmol、50%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:682。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(260mg、381μmol、1当量)のMeOH(4mL)中溶液に、Pd/C(120mg、10%純度)、NH3/MeOH(3mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、296μmol、78%収率、90%純度)を黄色固体として得、さらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:548。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(150mg、274μmol、1当量)、TEA(222mg、2.19mmol、305μL、8当量)、および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(57.0mg、548μmol、2当量)のEA(3mL)中溶液に、T3P(523mg、822μmol、489μL、EA中50%の純度、3当量)を-70℃で加えた。混合物を-70℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を1MのHCl(2.2mL)により-70℃でクエンチし、氷が無くなるまで撹拌した。層を分離した。有機層を飽和NaHCO3水溶液でpH=8に塩基化し、酢酸エチル(15mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、EtOAc/MeOH 1/0~20/1)、続いて、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(50.6mg、78μmol、29%収率、98%の純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:634。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.0Hz,1H),7.66(t,J=8.0Hz,1H),7.45-7.38(m,1H),7.38-7.32(m,1H),7.27-7.18(m,2H),7.09-6.93(m,1H),6.60(br d,J=14.8Hz,1H),5.32-4.93(m,3H),4.64(br s,1H),4.45(td,J=5.2,11.2Hz,1H),4.32-3.63(m,6H),3.58-3.36(m,3H),3.25-2.96(m,5H),2.93(s,3H),2.88-2.77(m,1H),2.75-2.50(m,3H),2.46(d,J=4.4Hz,3H),2.34-2.15(m,1H)。
実施例602
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、593μmol、1.0当量)、1-ブロモナフタレン(184mg、890μmol、124μL、1.5当量)、Pd2(dba)3(54.3mg、59.3μmol、0.1当量)、Cs2CO3(483mg、1.48mmol、2.5当量)、およびRuPhos(55.4mg、119μmol、0.2当量)のトルエン(10mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で3時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(1×50mL)で抽出し、有機層を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相HPLC(0.1%FA条件)により精製した。残留物を、飽和NaHCO3水溶液でpH約8に塩基化し、次いで、酢酸エチル(2×25mL)で抽出した。有機相を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、317μmol、53%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:632。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、158μmol、1.0当量)のMeOH(10mL)中溶液に、Pd/C(20mg、10%純度)およびNH3・MeOH(8mL、20%純度)をN2下で加えた。.この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(70mg、粗製)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:498。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60mg、121μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(21.7mg、241μmol、2.0当量)、およびEt3N(97.6mg、965μmol、134μL、8.0当量)の酢酸エチル(6mL)中溶液に、T3P(230mg、362μmol、215μL、50%純度、3.0当量)を0℃で加えた。混合物を0~25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(6mL)で希釈した。有機層を分離し、ブライン(1×10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=20/1→5/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~78%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(7.23mg、12.7μmol、11%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:571。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.27-8.16(m,1H),7.91-7.81(m,1H),7.61(d,J=8.4Hz,1H),7.55-7.47(m,2H),7.43(t,J=7.6Hz,1H),7.15(d,J=7.2Hz,1H),5.56-5.33(m,1H),5.26(dd,J=3.2,16.8Hz,1H),4.85(br s,1H),4.41(dd,J=5.2,10.8Hz,1H),4.34-4.24(m,2H),4.22-3.96(m,4H),3.75-3.21(m,4H),3.12(br t,J=6.8Hz,2H),3.04-2.92(m,2H),2.87(m,2H),2.70(m,1H),2.50(s,3H),2.38-2.23(m,1H),2.15-1.99(m,1H),1.94-1.73(m,3H)。
実施例603
2-[(2S)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。シクロペンチルメタノール(50.5mg、504μmol、54.6μL、3.0当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、168μmol、1.0当量)のトルエン(5mL)中溶液に、t-BuONa(48.5mg、504μmol、3.0当量)を-10℃で加えた。混合物を-10℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(5mL)により-10℃でクエンチし、次いで、酢酸エチル(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1→3/1)で精製した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(58mg、91.6μmol、54%収率、99.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:631。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.72-7.61(m,2H),7.46-7.30(m,7H),7.26-7.16(m,2H),5.27-5.15(m,2H),4.69(br s,1H),4.32-3.72(m,7H),3.59-3.30(m,2H),3.24-2.87(m,7H),2.87-2.30(m,4H),1.90-1.76(m,2H),1.64(m,2H),1.57-1.51(m,1H),1.42-1.21(m,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(58mg、92.0μmol、1.0当量)のMeOH(3mL)中溶液に、Pd/C(20mg、10%純度)およびNH3・MeOH(2mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(34mg、粗製)を黄色油として得、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:497。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(30mg、60.4μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(16.3mg、181μmol、3.0当量)、およびEt3N(55.0mg、544μmol、75.7μL、9.0当量)のEA(2.0mL)中溶液に、T3P(154mg、242μmol、144μL、50%純度、4.0当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(6mL)で希釈した。有機層を分離し、ブライン(1×10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20/1→1/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:65%~95%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[2-(シクロペンチルメトキシ)-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(8.85mg、15.3μmol、2ステップで17%収率、98.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:569。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.70(br d,J=8.0Hz,1H),7.67-7.61(m,1H),7.46-7.36(m,1H),7.36-7.31(m,1H),7.27-7.17(m,2H),5.56-5.32(m,1H),5.25(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.89(br s,1H),4.33-3.98(m,5H),3.95-3.72(m,2H),3.60-3.39(m,2H),3.30-2.96(m,4H),2.92(s,3H),2.91-2.73(m,2H),2.69-2.54(m,1H),2.45-2.29(m,1H),1.93-1.74(m,2H),1.69-1.62(m,2H),1.60-1.53(m,2H),1.45-1.25(m,2H)。
実施例604
2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(1g、1.98mmol、1当量)、4-ブロモ-5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(795mg、2.57mmol、1.3当量)、RuPhos(369mg、791μmol、0.4当量)、Cs2CO3(1.61g、4.94mmol、2.5当量)、およびPd2(dba)3(362mg、396μmol、0.2当量)のトルエン(20mL)中混合物を、脱気し、次いで、N2下で90℃まで8時間加熱した。加熱が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、固体のNaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×40mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(900mg、1.23mmol、62%収率、100%純度)を褐色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.98(s,1H),7.43-7.33(m,5H),7.22(s,1H),5.66(dd,J=2.8,9.6Hz,1H),5.20(s,2H),4.68(br s,1H),4.39(dd,J=4.8,10.0Hz,1H),4.25(s,2H),4.18-4.14(m,1H),4.04(br d,J=12.0Hz,2H),3.95-3.84(m,1H),3.75(dt,J=2.8,10.8Hz,1H),3.50(br t,J=5.2Hz,2H),3.30(br s,2H),3.13-2.98(m,2H),2.95-2.52(m,6H),2.47(s,3H),2.43(s,3H),2.32(s,3H),2.30-2.23(m,1H),2.22-2.11(m,1H),2.07(br d,J=3.2Hz,1H),1.89-1.63(m,8H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(0.9g、1.23mmol、1当量)のMeOH(20mL)中溶液に、NH3・MeOH(20mL、20%純度)、Pd/C(0.45g、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、セライトプラグを通して濾過することにより触媒を除去した。減圧下で溶媒を除去した。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(620mg、1.03mmol、84%収率、100%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:600。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(600mg、1.00mmol、1当量)のDMF(8mL)中溶液に、EA(4mL)中の2-フルオロプロパ-2-エン酸(180mg、2.00mmol、2当量)およびTEA(304mg、3.00mmol、414μL、3当量)を加え、続いて、T3P(955mg、1.50mmol、892μL、EtOAc中50%の純度、1.5当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(20mL)で希釈し、EtOAc(3×20mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、固体のNaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(3×100mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(380mg、554μmol、55%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:672。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.98(s,1H),7.22(s,1H),5.66(dd,J=2.4,9.2Hz,1H),5.51-5.32(m,1H),5.25(br dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.09-4.59(m,1H),4.44-4.33(m,1H),4.26(br s,2H),4.19-4.14(m,1H),4.05(br d,J=14.4Hz,2H),4.00-3.91(m,1H),3.76(dt,J=2.4,11.2Hz,1H),3.59-3.39(m,3H),3.37-3.21(m,1H),3.14-3.02(m,2H),2.90-2.52(m,6H),2.48(s,3H),2.43(s,3H),2.33(s,3H),2.29-2.23(m,1H),2.22-2.08(m,2H),1.90-1.69(m,8H)。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(360mg、536μmol、1当量)のDCM(0.4mL)中溶液に、TFA(1.22g、10.7mmol、794μL、20当量)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物をDCM(10mL)で希釈し、NaHCO3飽和水溶液で中和した。分離した水層をDCM(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、固体のNaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、EtOAc(2×15mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:40%~70%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(73.3mg、120μmol、22%収率、96.6%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:588。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.97(br s,1H),8.04(s,1H),7.15(s,1H),5.55-5.31(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),5.08-4.50(m,1H),4.39(dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.29(s,2H),4.20-3.68(m,4H),3.65-3.27(m,4H),3.10(br t,J=7.8Hz,2H),3.02-2.72(m,4H),2.71-2.60(m,1H),2.48(s,3H),2.42(s,3H),2.34(s,3H),2.31-2.24(m,1H),2.12-2.01(m,1H),1.93-1.73(m,3H)。
実施例605
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。2-ピリジルメタノール(55.1mg、504μmol、48.7μL、3.0当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、168μmol、1.0当量)のトルエン(5.00mL)中溶液に、t-BuONa(48.5mg、504μmol、3.0当量)を-10℃で加えた。混合物を-10℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(5.00mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=50/1→1/1)で精製した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(64.0mg、98.8μmol、59%収率、98.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:641。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(64.0mg、100μmol、1.0当量)のMeOH(3.00mL)中溶液に、Pd/C(20.0mg、10%純度)およびNH3・MeOH(2.00mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、ジクロロメタン/メタノール=100/1→8/1)により精製した。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(15.0mg、19.3μmol、19%収率、64.9%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:506。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(10.0mg、19.8μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(5.34mg、59.3μmol、3.0当量)、およびEt3N(18.0mg、178μmol、24.8μL、9.0当量)のEtOAc(2.00mL)中溶液に、T3P(50.3mg、79.1μmol、47.1μL、酢酸エチル中50%の純度、4.0当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(3.00mL)で希釈した。有機層を分離し、ブライン(1×10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=50/1→10/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:50%~80%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-(2-ピリジルメトキシ)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(1.41mg、2.44μmol、12%収率、99.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:579。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.61-8.55(m,1H),7.74-7.62(m,3H),7.55-7.48(m,1H),7.45-7.32(m,2H),7.26-7.17(m,3H),5.52-5.48(m,2H),5.47-5.33(m,1H),5.25(dd,J=3.6,17.2Hz,1H),4.79(br s,1H),4.38-3.73(m,6H),3.61-3.41(m,2H),3.26-3.12(m,2H),3.09-2.95(m,2H),2.92(s,3H),2.85-2.56(m,2H)。
実施例606
2-((S)-4-(7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-(((2S,4R)-4-フルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(5.0g、11.4mmol、1.0当量)、4-ブロモ-5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(7.05g、22.8mmol、2.0当量)、Pd2(dba)3(2.09g、2.28mmol、0.2当量)、RuPhos(2.13g、4.56mmol、0.4当量)、およびCs2CO3(9.29g、28.5mmol、2.5当量)のトルエン(100mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で8時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20/1→2/1)により精製し、逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル)]によりさらに精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を、ブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、生成物を得た。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(4.90g、7.20mmol、63%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:667。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.98(s,1H),7.50-7.31(m,5H),7.22(s,1H),5.66(dd,J=2.4,9.6Hz,1H),5.27-5.13(m,2H),4.69(br s,1H),4.27(s,2H),4.13-3.97(m,3H),3.89(d,J=11.6Hz,1H),3.81-3.68(m,1H),3.51(t,J=5.2Hz,2H),3.30(br s,2H),3.04(t,J=11.6Hz,1H),2.93-2.66(m,4H),2.62-2.48(m,4H),2.43(s,3H),2.32(s,3H),2.23-2.12(m,1H),2.11-2.05(m,1H),1.85-1.67(m,3H)。
ステップB:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、749μmol、1.0当量)のトルエン(10mL)中溶液に、m-CPBA(152mg、749μmol、85%純度、1.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。混合物を水(10mL)で希釈し、飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整した。次いで、混合物を酢酸エチル(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、539μmol、72%収率、92%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:683。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(350mg、512μmol、1.0当量)のトルエン(10mL)中溶液に、t-BuONa(148mg、1.54mmol、3.0当量)および[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(136mg、1.03mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]で精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(280mg、372μmol、73%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:752。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、306μmol、1.0当量)のメタノール(2.0mL)中溶液に、無水Pd/C(50.0mg、10%純度)およびNH3/メタノール(1.00mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(180mg、285μmol、93%収率、98%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:618。
ステップD:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(30mg、48.6μmol、1.0当量)のジクロロメタン(300μL)中溶液に、TFA(221mg、1.94mmol、144μL、40当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、水(10mL)で希釈した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約8に調整し、ジクロロメタン(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150×25mm×5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:26%~56%、1分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(7.08mg、13.1μmol、27%収率、98.5%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:534。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.14(br s,1H),8.04(d,J=0.8Hz,1H),7.14(s,1H),5.32-5.03(m,1H),4.44(dd,J=4.4,11.2Hz,1H),4.33-4.19(m,3H),4.00(br d,J=12.8Hz,1H),3.82(br d,J=12.0Hz,1H),3.65-3.41(m,3H),3.27(br d,J=6.4Hz,1H),3.17-2.95(m,4H),2.90(br dd,J=10.0,12.4Hz,1H),2.83-2.47(m,8H),2.41(s,3H),2.38-2.23(m,4H),2.09-1.90(m,1H)。
ステップE:2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、187μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(25.3mg、281μmol、1.5当量)の酢酸エチル(2.0mL)中溶液に、T3P(477mg、749μmol、446μL、酢酸エチル中50%の純度、4.0当量)およびTEA(114mg、1.12mmol、156μL、6.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)および分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:38%~68%、10分)によるさらなる精製により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-2-[[(2S,4R)-4-フルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(8mg、12.8μmol、7%収率、96.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:606。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.03(br s,1H),8.04(s,1H),7.15(s,1H),5.42(dd,J=6.4Hz,J=47.2Hz 1H),5.31-5.05(m,2H),5.04-3.76(m,9H),3.65-3.47(m,3H),3.42-3.25(m,1H),3.20-2.70(m,6H)2.70-2.55(m,1H),2.51(s,3H),2.42(s,3H),2.38-2.25(m,4H),2.10-1.87(m,1H)。
実施例607
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(6-メチルイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(6-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(250mg、530μmol、1.0当量)、4-ブロモ-6-メチルイソキノリン(235mg、1.06mmol、2.0当量)、RuPhos(98.9mg、212μmol、0.4当量)、Pd2(dba)3(97.1mg、106μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(432mg、1.33mmol、2.5当量)のトルエン(5mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回実施し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で8時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル]で精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(6-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(230mg、349μmol、66%収率、93%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:613。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(6-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(6-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(50mg、81.6μmol、1.0当量)のジオキサン(400μL)中溶液に、HCl/ジオキサン(4M、408μL)を加えた。混合物を25℃で0.3時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、水(10mL)で希釈した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約8に調整し、ジクロロメタン(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:28%~58%、1分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[7-(6-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(19mg、37μmol、45%収率、99.9%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:513。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.94(s,1H),8.20(s,1H),7.92-7.83(m,2H),7.45(dd,J=1.2,8.4Hz,1H),4.40(dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.29(s,2H),4.17(dd,J=6.8,10.8Hz,1H),4.03(br d,J=12.8Hz,1H),3.86(br d,J=12.4Hz,1H),3.42(br t,J=5.2Hz,2H),3.33-3.22(m,1H),3.17-2.80(m,7H),2.72-2.63(m,1H),2.61-2.52(m,5H),2.47(s,3H),2.33-2.23(m,1H),2.11-2.06(m,1H),1.89-1.68(m,3H)。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(6-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(6-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、195μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(35.1mg、390μmol、2.0当量)の酢酸エチル(2mL)中溶液に、T3P(372mg、585μmol、348μL、酢酸エチル中50%の純度、3.0当量)およびTEA(158mg、1.56mmol、217μL、8.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)および分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:38%~62%、10分)によるさらなる精製により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(6-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(11mg、18.6μmol、9%収率、98.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:585。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.96(s,1H),8.22(s,1H),7.93-7.85(m,2H),7.46(dd,J=1.2,8.4Hz,1H),5.49-5.36(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.88(br s,1H),4.50-4.29(m,3H),4.27-3.96(m,4H),3.61-3.30(m,4H),3.22-3.06(m,2H),3.04-2.77(m,4H),2.75-2.65(m,1H),2.59(s,3H),2.49(s,3H),2.31-2.29(m,1H),2.15-1.97(m,1H),1.80-1.77(m,3H)。
実施例608
2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(240mg、508.91μmol、1当量)、t-BuONa(146.72mg、1.53mmol、3当量)、RuPhos(47.50mg、101.78μmol、0.2当量)、およびRuPhos Pd G3(85.13mg、101.78μmol、0.2当量)のトルエン(5mL)中溶液に、1-ブロモ-8-エチル-ナフタレン(239.31mg、1.02mmol、2当量)を加えた。混合物を90℃で12時間撹拌した。混合物を水(10mL)に加え、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を逆相フラッシュHPLC(C18、水中0.1%のFA、0~45%MeCN)により精製した。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(113mg、180.57μmol、35.48%収率、100%純度)の生成物を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:626。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。tert-ブチル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(103mg、164.59μmol、1当量)のDCM(2mL)中溶液に、TFA(2mL)を25℃で加えた。反応混合物を25℃で0.5時間撹拌した。25℃で飽和NaHCO3水溶液(20mL)をpH=8まで加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下濃縮した。2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(81mg、粗製)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:526。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.66-7.55(m,2H),7.37-7.25(m,2H),7.25-7.20(m,1H),7.19-7.14(m,1H),4.36-4.26(m,1H),4.21-4.02(m,2H),4.00-3.62(m,3H),3.56-2.73(m,11H),2.65-2.34(m,7H),2.26-2.14(m,1H),2.02-1.88(m,1H),1.82-1.62(m,4H),1.13-1.02(m,3H)。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(61mg、116.04μmol、1当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(20.90mg、232.08μmol、2当量)のDMF(10mL)中溶液に、TEA(281.81mg、2.78mmol、387.63μL、24当量)およびT3P(332.29mg、1.04mmol、310.55μL、9当量)を-40℃で加えた。添加後、混合物を0℃で2時間撹拌した。混合物を水(3×20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×20mL)で希釈した。有機層をブライン(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、10分)により精製した。混合物を水(3×20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×20mL)で希釈した。有機層をブライン(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮して、2-[(2S)-4-[7-(8-エチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(7mg、11.63μmol、10.02%収率、99.3%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:598。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.67-7.54(m,2H),7.39-7.26(m,2H),7.25-7.20(m,1H),7.15(s,1H),5.45-5.24(m,1H),5.23-5.12(m,1H),4.95-4.58(m,1H),4.33-4.25(m,1H),4.25-3.63(m,6H),3.57-3.33(m,3H),3.21-2.49(m,10H),2.44-2.35(m,3H),2.27-2.15(m,1H),2.03-1.90(m,1H),1.82-1.66(m,3H),1.13-1.04(m,3H)。
実施例609
2-[(2S)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、791μmol、1.0当量)、4-ブロモ-6-フルオロ-イソキノリン(215mg、949μmol、1.2当量)、Cs2CO3(773mg、2.37mmol、3.0当量)、およびRuPhos(148mg、316μmol、0.4当量)のトルエン(10mL)中混合物に、Pd2(dba)3(145mg、158μmol、0.2当量)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とN2によるパージを数回実施した。混合物をN2下、90℃で10時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、固体のNaHCO3で塩基化し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、酢酸エチル(2×40mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(140mg、204μmol、26%収率、95%純度)を黄色固体として得た。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(30mg、46.1μmol、1.0当量)およびNH3・MeOH(0.3mL、20%純度)のMeOH(0.3mL)中混合物に、Pd/C(10mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1.5時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:30%~60%、1分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[(2S)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(9.78mg、18.9μmol、41%収率、99.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:517。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.00(s,1H),8.27(s,1H),8.02(dd,J=5.6,9.2Hz,1H),7.74(dd,J=2.4,10.4Hz,1H),7.39(dt,J=2.4,8.8Hz,1H),4.41(dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.28(s,2H),4.18(dd,J=6.8,10.4Hz,1H),4.02(br d,J=12.4Hz,1H),3.91-3.82(m,1H),3.47-3.35(m,2H),3.33-3.24(m,1H),3.18-3.07(m,3H),3.07-2.97(m,1H),2.93(dd,J=9.6,12.8Hz,1H),2.85(br s,2H),2.73-2.64(m,1H),2.56(dd,J=2.4,6.4Hz,2H),2.49(s,3H),2.34-2.24(m,1H),2.13-2.00(m,1H),1.91-1.76(m,3H)。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80mg、155μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(41.8mg、464μmol、3.0当量)、およびTEA(235mg、2.32mmol、323μL、15当量)の酢酸エチル(1.5mL)およびDMF(1mL)中混合物に、T3P(493mg、774μmol、460μL、50%純度、5.0当量)を0℃で加え、混合物を25℃で1時間撹拌した。水(10mL)を混合物に加えた。混合物を酢酸エチル(30mL)で希釈し、酢酸エチル(2×5mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:40%~70%、1分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[(2S)-4-[7-(6-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(17.4mg、29.3μmol、19%収率、99.2%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:589。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.01(s,1H),8.28(s,1H),8.03(dd,J=5.6,8.8Hz,1H),7.73(dd,J=2.4,10.4Hz,1H),7.40(dt,J=2.4,8.8Hz,1H),5.52-5.35(m,1H),5.27(dd,J=3.6,17.2Hz,1H),5.02-4.62(m,1H),4.46-4.38(m,1H),4.36-4.25(m,2H),4.24-4.07(m,3H),4.02(br d,J=13.2Hz,1H),3.62-3.29(m,4H),3.13(br s,2H),3.03-2.93(m,2H),2.91-2.77(m,2H),2.72(br s,1H),2.51(s,3H),2.32(br d,J=8.4Hz,1H),2.13-2.02(m,1H),1.92-1.70(m,3H)。
実施例610
(S)-2-(1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(ナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:tert-ブチル 4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。O1-tert-ブチル O4-エチル 3-オキソピペリジン-1,4-ジカルボキシレート(5.00g、18.4mmol、1.00当量)のn-BuOH(30.0mL)中混合物に、酢酸;メタンイミドアミド(9.59g、92.2mmol、5.00当量)を少しずつ加えた。混合物を120℃で12時間撹拌した。混合物を濃縮して溶媒を除去した。残留物を水(30.0mL)に加え、濾過した。沈殿物を水(30.0mL)で洗浄し、濃縮した。粗生成物をさらに精製することなく次のステップで直接使用した。化合物であるtert-ブチル 4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(4.10g、16.1mmol、87%収率、98.4%純度)を褐色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:196。
ステップB:tert-ブチル 4-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-ヒドロキシ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(3.30g、13.1mmol、1.00当量)のDCE(60.0mL)中混合物に、PPh3(6.89g、26.3mmol、2.00当量)、CCl4(6.06g、39.4mmol、3.79mL、3.00当量)をN2下で少しずつ加えた。混合物を70℃で3時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を、カラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20/1→1/1)で精製した。化合物であるtert-ブチル 4-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(2.54g、9.42mmol、72%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:214。
ステップC:tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート。tert-ブチル 4-クロロ-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.30g、4.82mmol、1.00当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、3.86mmol、0.80当量)のDMAc(30.0mL)中混合物に、DIEA(3.11g、24.1mmol、4.20mL、5.00当量)をN2下で加えた。混合物を100℃で2時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(100mL)で希釈した。有機層を水(30mL×2)およびブライン(30mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20:1→0:1)により精製した。化合物であるtert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.18g、2.30mmol、48%収率、96%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:493。
ステップD:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-[(3S)-4-ベンジルオキシカルボニル-3-(シアノメチル)ピペラジン-1-イル]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-7-カルボキシレート(1.20g、2.44mmol、1.00当量)のアセトニトリル(10.0mL)中混合物に、HCl/ジオキサン(4.00M、12.2mL、20.0当量)をN2下、25℃で少しずつ加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮して残留物を得た。粗生成物をさらに精製することなく次のステップで直接使用した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(883mg、2.16mmol、89%収率、96%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:393。
ステップE:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、764μmol、1.00当量)および1-ブロモナフタレン(317mg、1.53mmol、212μL、2.00当量)のトルエン(15.0mL)中混合物に、Pd2(dba)3(140mg、153μmol、0.20当量)、RuPhos(143mg、306μmol、0.40当量)、Cs2CO3(747mg、2.29mmol、3.00当量)をN2下で1度に加えた。混合物を90℃で5時間撹拌した。反応混合物を水(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20.0mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液(5.00mL)で中和し、酢酸エチル(50.0mLの×2)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、289μmol、38%収率)を黄色固体として得た。
ステップF:2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(50.0mg、96.4μmol、1.00当量)のMeOH(3.00mL)中溶液に、Pd/C(30.0mg、10%純度)、NH3・MeOH(0.50mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:waters xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:35%~59%、10分)により精製した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(8.63mg、22.4μmol、23%収率、99.8%純度)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:385。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.63(s,1H),8.26-8.19(m,1H),7.91-7.84(m,1H),7.62(d,J=8.0Hz,1H),7.54-7.48(m,2H),7.45(t,J=7.6Hz,1H),7.17(d,J=7.2Hz,1H),4.35(s,2H),3.99(br d,J=12.8Hz,1H),3.83(br d,J=12.8Hz,1H),3.53-3.23(m,3H),3.20-3.07(m,2H),3.07-2.90(m,4H),2.63-2.49(m,2H)。
ステップG:2-[(2S)-4-[7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60.0mg、156μmol、1.00当量)の酢酸エチル(0.60mL)中混合物に、2-フルオロプロパ-2-エン酸(56.2mg、624μmol、4.00当量)、TEA(253mg、2.50mmol、348μL、16.0当量)、およびT3P(596mg、936μmol、557μL、50%純度、6.00当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。水(1.00mL)を0℃で加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(5.00mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:waters xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:40%~70%、10分)により精製した。化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(15.2mg、32.8μmol、21%収率、98.9%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:457。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.67(s,1H),8.26-8.18(m,1H),7.91-7.84(m,1H),7.63(d,J=8.0Hz,1H),7.56-7.49(m,2H),7.45(t,J=7.6Hz,1H),7.18(d,J=6.8Hz,1H),5.54-5.34(m,1H),5.27(dd,J=4.0,17.2Hz,1H),4.91(br s,1H),4.46-4.29(m,2H),4.14(br d,J=13.6Hz,1H),3.99(br d,J=13.2Hz,1H),3.63-3.32(m,4H),3.16(br t,J=11.2Hz,2H),2.99(br dd,J=8.0,16.4Hz,3H),2.90-2.77(m,1H)。
実施例611
(S)-2-(1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(8-メチルナフタレン-1-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、255μmol、1.00当量)および1-ブロモ-8-メチルナフタレン(113mg、510μmol、10.6μL、2.00当量)のトルエン(8.00mL)中混合物に、Pd2(dba)3(46.7mg、51.0μmol、0.20当量)、RuPhos(47.6mg、102μmol、0.40当量)、Cs2CO3(249mg、764μmol、3.00当量)をN2下で1度に加えた。混合物を90℃で5時間撹拌した。反応混合物を水(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20.0mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残渣を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液(5.00mL)で中和し、酢酸エチル(50.0mLの×2)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、粗製)を黄色固体として得た。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(50.0mg、93.9μmol、1.00当量)のメタノール(1.00mL)中溶液に、NH3・MeOH(93.9μmol、0.2mL、20%純度、1.00当量)、Pd/C(15.0mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:waters xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:38%~62%、10分)により精製した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(6.13mg、15.3μmol、16%収率、99.5%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:399。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.61(d,J=4.8Hz,1H),7.74-7.63(m,2H),7.41(dt,J=2.8,7.6Hz,1H),7.37-7.31(m,1H),7.27-7.22(m,2H),4.32(br d,J=18.0Hz,1H),4.07-3.92(m,1H),3.92-3.86(m,1H),3.86-3.67(m,1H),3.56-3.48(m,1H),3.30-3.24(m,1H),3.24-3.18(m,1H),3.18-2.96(m,4H),2.94(d,J=2.4Hz,3H),2.92(br s,1H),2.92-2.83(m,1H),2.69-2.59(m,1H),2.57-2.53(m,2H)。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60.0mg、151μmol、1.00当量)の酢酸エチル(1.00mL)中混合物に、2-フルオロプロパ-2-エン酸(54.2mg、602μmol、4.00当量)、TEA(244mg、2.41mmol、335μL、16.0当量)、およびT3P(575mg、903μmol、537μL、50%純度、6.00当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。水(1.00mL)を0℃で加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(5mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残渣を得た。残留物を分取HPLC(カラム:waters xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:40%~70%、10分)により精製した。化合物である2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(8.97mg、18.7μmol、12%収率、98.2%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:492。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.64(d,J=7.2Hz,1H),7.74-7.64(m,2H),7.47-7.39(m,1H),7.39-7.32(m,1H),7.29(br d,J=1.2Hz,1H),7.26-7.19(m,1H),5.53-5.33(m,1H),5.26(dd,J=3.6,17.2Hz,1H),4.87(br s,1H),4.33(br dd,J=14.8,18.0Hz,1H),4.19(br d,J=13.6Hz,1H),4.12-3.97(m,2H),3.95-3.84(m,1H),3.61-3.42(m,2H),3.27-3.04(m,4H),2.92(d,J=2.4Hz,3H),2.89-2.62(m,3H)。
実施例612
(S)-2-(4-(7-(5-クロロイソキノリン-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-4-[7-(5-クロロ-4-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、764μmol、1.00当量)および4-ブロモ-5-クロロ-イソキノリン(371mg、1.53mmol、10.6μL、2.00当量)のトルエン(15.0mL)中混合物に、Pd2(dba)3(140mg、153μmol、0.20当量)、RuPhos(143mg、306μmol、0.40当量)、Cs2CO3(747mg、2.29mmol、3.00当量)をN2下で1度に加えた。混合物に対して脱気とN2によるパージを3回実施し、90℃で5時間撹拌した。反応混合物を水(10.0mL)で希釈し、酢酸エチル(20.0mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20.0mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残渣を得た。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和NaHCO3溶液(5mL)で中和し、酢酸エチル(50mLの×2)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥した後、濾過し、真空下で濃縮した。化合物であるベンジル(2S)-4-[7-(5-クロロ-4-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、223μmol、29%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:554。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(5-クロロ-4-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-4-[7-(5-クロロ-4-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(30.0mg、54.2μmol、1.00当量)のメタノール(3.00mL)中溶液に、NH3・MeOH(0.50mL、20%純度)、Pd/C(35.0mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(カラム:waters xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:22%~46%、10分)により精製した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(5-クロロ-4-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(8.51mg、20.1μmol、37%収率、99.4%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:420。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.02(s,1H),8.60(d,J=4.4Hz,1H),8.35(d,J=1.6Hz,1H),7.91(dd,J=1.2,8.4Hz,1H),7.75(dd,J=1.2,7.2Hz,1H),7.50(t,J=7.6Hz,1H),4.54(br d,J=17.2Hz,1H),4.06-3.61(m,4H),3.41-3.08(m,5H),3.07-2.85(m,2H),2.72-2.59(m,1H),2.58-2.49(m,2H)。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(5-クロロ-4-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(5-クロロ-4-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(60.0mg、143μmol、1.00当量)の酢酸エチル(0.80mL)中混合物に、2-フルオロプロパ-2-エン酸(25.7mg、286μmol、2.00当量)、TEA(86.8mg、857μmol、119μL、6.00当量)、およびT3P(273mg、429μmol、255μL、50%純度、3.00当量)をN2下、0℃で少しずつ加えた。混合物を25℃で30分間撹拌した。水(1.00mL)を0℃で加えることによって反応混合物をクエンチし、次いで、酢酸エチル(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(5.00mL×1)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残渣を得た。残留物を分取HPLC(カラム:waters xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:22%~52%、10分)により精製した。化合物である2-[(2S)-4-[7-(5-クロロ-4-イソキノリル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(7.88mg、16.0μmol、11%収率、100%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:492。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.04(d,J=3.6Hz,1H),8.65(d,J=6.4Hz,1H),8.35(d,J=11.6Hz,1H),7.96-7.88(m,1H),7.76(dd,J=1.2,7.2Hz,1H),7.56-7.47(m,1H),5.55-5.33(m,1H),5.26(dd,J=3.2,16.8Hz,1H),5.03-4.70(m,1H),4.55(br dd,J=6.4,18.0Hz,1H),4.23-3.84(m,4H),3.69(br d,J=6.4Hz,1H),3.50(br d,J=13.6Hz,1H),3.35-3.19(m,3H),3.16-3.00(m,1H),2.97-2.61(m,3H)。
実施例613
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-(2-フルオロアクリロイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-(2-メチルスルファニル-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(5.0g、11.4mmol、1.0当量)、4-ブロモ-5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール(7.05g、22.8mmol、2.0当量)、Pd2(dba)3(2.09g、2.28mmol、0.2当量)、RuPhos(2.13g、4.56mmol、0.4当量)、およびCs2CO3(9.29g、28.5mmol、2.5当量)のトルエン(100mL)中混合物に対して脱気とN2によるパージを3回繰り返し、次いで、混合物をN2雰囲気下、90℃で8時間撹拌した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=20/1→2/1)により精製し、逆相フラッシュ[水(0.1%ギ酸)/アセトニトリル)]によりさらに精製した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整し、酢酸エチル(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を、ブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、生成物を得た。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(4.90g、7.20mmol、63%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:667。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.98(s,1H),7.50-7.31(m,5H),7.22(s,1H),5.66(dd,J=2.4,9.6Hz,1H),5.27-5.13(m,2H),4.69(br s,1H),4.27(s,2H),4.13-3.97(m,3H),3.89(d,J=11.6Hz,1H),3.81-3.68(m,1H),3.51(t,J=5.2Hz,2H),3.30(br s,2H),3.04(t,J=11.6Hz,1H),2.93-2.66(m,4H),2.62-2.48(m,4H),2.43(s,3H),2.32(s,3H),2.23-2.12(m,1H),2.11-2.05(m,1H),1.85-1.67(m,3H)。
ステップB:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルファニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、749μmol、1.0当量)のトルエン(10mL)中溶液に、m-CPBA(152mg、749μmol、85%純度、1.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。混合物を水(10mL)で希釈し、飽和NaHCO3水溶液でpH約7に調整した。次いで、混合物を酢酸エチル(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、539μmol、72%収率、92%純度)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:683。
ステップC:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(900mg、1.32mmol、1.0当量)のトルエン(20mL)中溶液に、t-BuONa(379mg、3.95mmol、3.0当量)および[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メタノール(398mg、2.64mmol、2.0当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10:1)により精製した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(630mg、793μmol、60%収率、97%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:770。
ステップD:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(400mg、519μmol、1.0当量)のメタノール(2mL)中溶液に、無水Pd/C(50mg、10%純度)およびNH3/メタノール(1mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(330mg、519μmol、99%収率)を黄色固体として得、精製することなく次のステップに直接使用した。LCMS[ESI,M+1]:636。
ステップE:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1-テトラヒドロピラン-2-イル-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(50mg、78.6μmol、1.0当量)のジクロロメタン(50μL)中溶液に、TFA(359mg、3.15mmol、233μL、40当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、水(10mL)で希釈した。混合物を飽和NaHCO3水溶液でpH約8に調整し、ジクロロメタン(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して生成物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)および分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:30%~60%、10分)によるさらなる精製により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(7.29mg、13.2μmol、17%収率、99.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:552。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.95(br s,1H),8.04(s,1H),7.15(s,1H),4.48(dd,J=4.4,10.8Hz,1H),4.33-4.19(m,3H),4.00(br d,J=11.6Hz,1H),3.83(br d,J=11.6Hz,1H),3.51(t,J=5.2Hz,2H),3.42(dt,J=5.6,11.7Hz,1H),3.26(br s,1H),3.17-2.95(m,4H),2.94-2.85(m,1H),2.84-2.62(m,3H),2.61-2.49(m,3H),2.47(s,3H),2.42(s,3H),2.35(s,3H),2.32-2.18(m,1H)。
ステップF:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、181μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(24.5mg、272μmol、1.5当量)のDMF(2mL)中溶液に、T3P(461mg、725μmol、431μL、酢酸エチル中50%の純度、4.0当量)およびTEA(147mg、1.45mmol、202μL、8.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を、水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)および分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:38%~68%、10分)によるさらなる精製により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(11mg、17.5μmol、10%収率、99.2%純度、100%ee)をオフホワイトの固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:624。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.27-9.49(s,1H),8.04(s,1H),7.16(s,1H),5.55-5.34(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.86(br s,1H),4.46(dd,J=4.8,10.8Hz,1H),4.34-3.88(m,6H),3.66-3.25(m,5H),3.19-2.62(m,7H),2.60-2.45(m,4H),2.42(s,3H),2.35(s,3H),2.32-2.19(m,1H)。
実施例614
2-((S)-4-(2-(((S)-4,4-ジフルオロ-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)-1-((E)-4-フルオロブタ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、181μmol、1.0当量)および(E)-4-フルオロブタ-2-エン酸(28.3mg、272μmol、1.5当量)のDMF(2mL)中溶液に、T3P(461mg、725μmol、431μL、酢酸エチル中50%の純度、4.0当量)およびTEA(147mg、1.45mmol、202μL、8.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:40%~70%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[2-[[(2S)-4,4-ジフルオロ-1-メチル-ピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(5,6-ジメチル-1H-インダゾール-4-イル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-[(E)-4-フルオロブタ-2-エノイル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(12mg、18.3μmol、10%収率、97.3%純度、95%ee)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:638。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=10.06(br s,1H),8.05(s,1H),7.17(s,1H),7.07-6.97(m,1H),6.61(br d,J=14.8Hz,1H),5.20-5.07(m,3H),4.48(dd,J=4.8,11.2Hz,1H),4.31-4.27(m,3H),4.20-3.80(m,3H),3.55(br t,J=5.2Hz,3H),3.49-3.27(m,2H),3.13(br s,1H),3.05-2.63(m,6H),2.62-2.46(m,4H),2.43(s,3H),2.36(s,3H),2.33-2.21(m,1H)。
実施例615
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メタノール(217mg、1.51mmol、68.2μL、3当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、504μmol、1当量)のトルエン(15mL)中溶液に、t-BuONa(145mg、1.51mmol、3当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。目的の画分を集め、飽和Na2CO3溶液(10mL)で中和し、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。分離した有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(180mg、267μmol、53%収率、99.8%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:675。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73-7.60(m,2H),7.27(s,9H),5.21(s,2H),4.68(br s,1H),4.47-4.34(m,1H),4.30-4.15(m,2H),4.13-4.04(m,1H),3.95-3.69(m,2H),3.56-3.34(m,2H),3.28-2.48(m,13H),2.47-2.33(m,3H),2.22-2.11(m,1H),1.88(br dd,J=8.4,12.6Hz,1H),1.56(ddd,J=4.6,7.8,12.6Hz,1H),1.16(d,J=4.0Hz,3H),1.10-0.98(m,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、193μmol、1当量)のMeOH(4mL)中溶液に、NH3・MeOH(2mL、15%純度)およびPd/C(26mg、10%の純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で0.5時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、159μmol、85.9%純度)を黄色固体として得、これをさらに精製せずに次のステップに使用した。LCMS[ESI,M+1]:540。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90mg、143μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(38.7mg、430μmol、3当量)、およびEt3N(130mg、1.29mmol、179μL、9当量)の酢酸エチル(15mL)中溶液に、T3P(365mg、573μmol、341μL、酢酸エチル中50%の純度、4当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(3mL)で希釈した。有機層を分離し、ブライン(1×10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=20/1→10/1)により精製した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:62%~89%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1,4,4-トリメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(12.7mg、20.6μmol、99.7%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:612。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.79-7.56(m,2H),7.51-7.31(m,2H),7.27-7.08(m,2H),5.65-5.08(m,2H),4.85(br s,1H),4.49-4.32(m,1H),4.30-3.96(m,4H),3.95-3.71(m,1H),3.59-3.35(m,2H),3.28-2.54(m,13H),2.42(br s,3H),2.16(br d,J=8.8Hz,1H),1.96-1.81(m,1H),1.63-1.45(m,1H),1.15(br s,3H),1.06(br s,3H)。
実施例616
2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メタノール(326mg、2.52mmol、68.2μL、3当量)およびベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(8-メチル-1-ナフチル)-2-メチルスルフィニル-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(500mg、841μmol、1当量)のトルエン(20mL)中溶液に、t-BuONa(242mg、2.52mmol、3当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物を水(10mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残留物を逆相HPLC(0.1%FA条件)により精製した。残留物を飽和NaHCO3水溶液でpH=8に塩基化し、酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。有機相を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(328mg、461μmol、55%収率、92.7%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:661。
ステップB:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(100mg、151μmol、1当量)のMeOH(4mL)中溶液に、NH3・MeOH(2mL、20%純度)およびPd/C(20mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で0.5時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:13%~43%、10分)により精製した。その後、残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(13.9mg、26.4μmol、17%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:526。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.69(d,J=8.2Hz,1H),7.64(dd,J=2.6,7.6Hz,1H),7.40(dt,J=4.0,7.8Hz,1H),7.36-7.31(m,1H),7.26-7.19(m,2H),4.43(dt,J=4.8,10.2Hz,1H),4.28-4.11(m,2H),4.07-3.70(m,3H),3.48(br d,J=11.8Hz,1H),3.38-2.82(m,11H),2.80-2.64(m,2H),2.61-2.53(m,3H),2.49(t,J=8.6Hz,1H),2.42(d,J=2.4Hz,3H),2.35-2.15(m,2H),1.39-1.25(m,1H),1.08(d,J=6.8Hz,3H)。
ステップC:2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(100mg、190μmol、1当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(51.4mg、571μmol、3当量)、およびEt3N(173mg、1.71mmol、238μL、9当量)のDMF(10mL)中溶液に、T3P(484mg、761μmol、452μL、50%純度、4当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、残留物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1×20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。混合物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、ジクロロメタン/メタノール=10/1)により精製した。その後、残留物を分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、10分)により精製した。残留物を減圧下で濃縮してACNを除去し、次いで、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[2-[[(2S,4S)-1,4-ジメチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-7-(8-メチル-1-ナフチル)-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(22.2mg、37.1μmol、19%収率、99.8%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:598。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.72-7.61(m,2H),7.45-7.37(m,1H),7.37-7.31(m,1H),7.26-7.17(m,2H),5.53-5.32(m,1H),5.26(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.86(br s,1H),4.48-4.35(m,1H),4.30-3.99(m,4H),3.95-3.73(m,1H),3.60-3.39(m,2H),3.29-2.94(m,5H),2.93-2.67(m,7H),2.66-2.56(m,1H),2.55-2.47(m,1H),2.43(d,J=4.6Hz,3H),2.35-2.13(m,2H),1.36-1.25(m,1H),1.09(dd,J=3.0,6.8Hz,3H)。
実施例617
2-((S)-1-(2-フルオロアクリロイル)-4-(7-(3-メチルイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、593μmol、1.0当量)、4-ブロモ-3-メチルイソキノリン(198mg、890μmol、1.5当量)、Cs2CO3(483mg、1.48mmol、2.5当量)、BINAP-Pd-G3(118mg、119μmol、0.2当量)のジオキサン(6mL)中混合物に対し、脱気とN2によるパージを3回実施した。混合物を110℃で12時間加熱した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10:1)により精製した。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(200mg、303μmol、51%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:647。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[7-(3-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(50mg、77.3μmol、1.0当量)のメタノール(2mL)中溶液に、無水Pd/C(10mg、10%純度)およびNH3/MeOH(1mL、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(15psi)下、25℃で0.5時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:waters xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:30%~60%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(7.81mg、14.9μmol、19%収率、98.3%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:513。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.07(s,1H),8.14(d,J=8.4Hz,1H),7.97(d,J=8.0Hz,1H),7.65(dt,J=1.2,7.6Hz,1H),7.58-7.47(m,1H),4.41(br dd,J=4.8,10.4Hz,1H),4.3(s,2H),4.16(dd,J=6.8,10.8Hz,1H),4.10-3.93(m,1H),3.91-3.77(m,1H),3.57-3.37(m,2H),3.36-3.21(m,1H),3.18-2.85(m,6H),2.75-2.61(m,5H),2.56(br d,J=6.8Hz,2H),2.48(s,3H),2.33-2.22(m,1H),2.12-1.98(m,1H),1.94-1.80(m,3H)。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(3-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(3-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(80mg、156μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(28.1mg、312μmol、2.0当量)のDMF(2mL)中溶液に、T3P(297mg、468μmol、278μL、酢酸エチル中50%の純度、3.0当量)およびTEA(126mg、1.25mmol、173μL、8.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、水(3×20mL)で洗浄した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:35%~65%、10分)によりさらに精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(3-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(12mg、19.9μmol、13%収率、97.4%純度、100%ee)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:585。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.08(s,1H),8.26-8.04(m,1H),7.97(br d,J=7.6Hz,1H),7.73-7.60(m,1H),7.58-7.49(m,1H),5.42(d,J=47.6Hz,1H),5.27(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.85(br s,1H),4.45-3.92(m,7H),3.83-3.25(m,4H),3.22-2.59(m,10H),2.49(s,3H),2.36-2.24(m,1H),2.13-1.99(m,1H),1.92-1.76(m,3H)。
実施例618
(S)-ベンジル-2-(シアノメチル)-4-(7-(7-フルオロイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート
ステップA:(S)-ベンジル-2-(シアノメチル)-4-(7-(7-フルオロイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート。ベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、0.59mmol、1.0当量)のトルエン(10.0mL)中溶液に、4-ブロモ-7-フルオロ-イソキノリン(268mg、1.19mmol、2.0当量)、RuPhos(111mg、237μmol、0.40当量)、Cs
2CO
3(483mg、1.48mmol、2.5当量)、およびPd
2(dba)
3(109mg、118μmol、0.20当量)を25℃で加え、混合物を90℃で16時間撹拌した。反応混合物を水(5.0mL)で希釈し、酢酸エチル(3×5.0mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3×5.0mL)で洗浄し、Na
2SO
4上で乾燥し、濾過し、濾液を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO
2、石油エーテル/酢酸エチル=1/1→石油エーテル/酢酸エチル/EtOH(2%NH
3H
2O)=4/3/1)により精製した。次いで、粗生成物を逆相HPLC(0.1%FA条件)により精製した。目的の画分を集め、真空下で濃縮して、(S)-ベンジル-2-(シアノメチル)-4-(7-(7-フルオロイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(105mg、160μmol、27%収率、99%の純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:651。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=2.04-2.08(m,4H),2.69(d,J=5.64Hz,1H),2.73(d,J=5.52Hz,1H),2.81-2.85(m,3H),2.87-3.02(m,3H),3.09-3.19(m,1H),3.32-3.45(m,3H),3.45-3.55(m,1H),3.57-3.68(m,1H),3.99(br d,J=12.52Hz,1H),4.09-4.17(m,1H),4.28-4.34(m,1H),4.31(m,1H),4.46(dd,J=11.84,4.31Hz,1H),4.63-4.74(m,1H),4.80(br dd,J=11.32,6.82Hz,1H),5.20-5.23(m,2H),5.30-5.32(m,2H),7.35-7.42(m,5H),7.47-7.53(m,1H),7.60(dd,J=8.68,2.56Hz,1H),8.16(dd,J=9.24,5.25Hz,1H),8.22-8.25(m,1H),8.95-9.00(m,1H)。
ステップB:2-((S)-4-(7-(7-フルオロイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル。(S)-ベンジル 2-(シアノメチル)-4-(7-(7-フルオロイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-カルボキシレート(30.0mg、46.1μmol、1.0当量)のMeOH(1.0mL)中溶液に、NH3/MeOH(46.1μmol、1.5mL、15%純度、1.0当量)およびPd/C(20.0mg、46.1μmol、10%純度、1.0当量)をN2下で加えた。懸濁液に対して真空下での脱気とH2(93.1ug、46.1μmol、1.0当量)によるパージを数回繰り返した。混合物をH2(15psi)下、25℃で1時間撹拌した。反応混合物をセライトを通して濾過し、MeOH(20mL)で洗浄した。濾液を45℃で減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物を分取HPLC(塩基性条件)(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:43%~73%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-((S)-4-(7-(7-フルオロイソキノリン-4-イル)-2-(((S)-1-メチルピロリジン-2-イル)メトキシ)-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-2-イル)アセトニトリル(7mg、13.3μmol、28.8%収率、98%純度)を黄色固体として得た。LCMS[M+1]:517。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=1.75-1.90(m,3H),1.99-2.13(m,1H),2.24-2.34(m,1H),2.45-2.51(m,3H),2.53-2.58(m,2H),2.64-2.74(m,1H),2.80-2.88(m,2H),2.89-2.96(m,1H),2.97-3.06(m,1H),3.07-3.18(m,3H),3.22-3.33(m,1H),3.38-3.48(m,2H),3.82-3.89(m,1H),4.03(br d,J=12.36Hz,1H),4.18(dd,J=10.56,6.69Hz,1H),4.30(s,2H),4.40(dd,J=10.64,4.75Hz,1H),7.49(ddd,J=9.16,8.35,2.63Hz,1H),7.60(dd,J=8.76,2.50Hz,1H),8.17(dd,J=9.24,5.38Hz,1H),8.24(s,1H),8.96(s,1H)。
ステップC:2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(90.7mg、175μmol、1.0当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(31.6mg、351μmol、2.0当量)のDMF(2mL)中溶液に、T3P(335mg、526μmol、313μL、酢酸エチル中50%の純度、3.0当量)およびTEA(142mg、1.40mmol、195μL、8.0当量)を0℃で加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(20mL)で希釈し、水(3×20mL)で洗浄した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過し、濾液を減圧下で濃縮して残留物を得た。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、酢酸エチル/メタノール=100/1→10/1)により精製し、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:32%~59%、10分)によりさらに精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥した。2-[(2S)-4-[7-(7-フルオロ-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(8mg、13.4μmol、7.6%収率、98.3%純度、100%ee)を白色固体として得た。LCMS[M+1]:589。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=8.97(s,1H),8.24(s,1H),8.16(dd,J=5.2,9.2Hz,1H),7.60(dd,J=2.4,8.8Hz,1H),7.54-7.40(m,1H),5.55-5.33(m,1H),5.27(dd,J=3.6,16.8Hz,1H),4.87(br s,1H),4.44-3.94(m,7H),3.72-3.28(m,4H),3.22-3.06(m,2H),3.04-2.93(m,2H),2.93-2.74(m,2H),2.72-2.66(m,1H),2.49(s,3H),2.36-2.24(m,1H),2.13-2.03(m,1H),1.92-1.76(m,3H)。
実施例619
2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル
ステップA:ベンジル(2S)-4-[7-(1-クロロ-5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。トルエン(10mL)中のベンジル(2S)-2-(シアノメチル)-4-[2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-5,6,7,8-テトラヒドロピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-1-カルボキシレート(300mg、593μmol、1.0当量)、4-ブロモ-1-クロロ-5-メチルイソキノリン(198mg、771μmol、1.3当量)、Pd2(dba)3(109mg、119μmol、0.2当量)、およびCs2CO3(483mg、1.48mmol、2.5当量)、キサントホス(137mg、237μmol、0.4当量)を脱気し、次いで、N2下で95℃まで10時間加熱した。加熱が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル 2/1→0/1)に続いて、逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]により精製した。目的の画分を集め、固体のNaHCO3で中和し、真空下で濃縮してMeCNを除去し、酢酸エチル(2×15mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮して、ベンジル(2S)-4-[7-(1-クロロ-5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(150mg、209μmol、35%収率、95%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:681。
1H NMR(400MHz、クロロホルム-d)δ=8.27(d,J=8.0Hz,1H),8.08-7.99(m,1H),7.60-7.51(m,2H),7.44-7.36(m,5H),5.25-5.17(m,2H),4.74-4.60(m,1H),4.41-4.32(m,1H),4.28-4.14(m,2H),4.08-3.88(m,2H),3.83(br d,J=17.6Hz,1H),3.61-3.51(m,1H),3.50-3.36(m,1H),3.31-2.94(m,6H),2.91(d,J=2.4Hz,3H),2.81-2.59(m,4H),2.46(d,J=4.0Hz,3H),2.33-2.21(m,1H),2.06-1.97(m,1H),1.92-1.72(m,3H)。
ステップB:2-[(2S)-4-[7-(5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。ベンジル(2S)-4-[7-(1-クロロ-5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-2-(シアノメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(130mg、191μmol、1当量)のMeOH(3mL)中溶液に、NH3・MeOH(2mL、20%純度)、Pd/C(65mg、10%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物を25℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、セライトプラグを通して濾過することにより触媒を除去した。溶媒を減圧下で除去して80mgの粗生成物を得た。20mgの粗生成物を取ることを分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:28%~58%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[(2S)-4-[7-(5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(10.8mg、21.0μmol、44%収率、99.9%純度)を得た。LCMS[ESI,M+1]:513。
ステップC:2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル。2-フルオロプロパ-2-エン酸(24.6mg、273μmol、2.0当量)およびDIEA(70.6mg、546μmol、95.1μL、4.0当量)のDCM(1.4mL)中溶液に、HATU(77.9mg、205μmol、1.5当量)を0℃で加えた。0℃で20分間撹拌後、2-[(2S)-4-[7-(5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(70mg、137μmol、1.0当量)を混合物に加えた。混合物を25℃で40分間撹拌した。撹拌が完了したら、混合物は、水(2mL)で希釈して、ジクロロメタン(6×5mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をクロマトグラフィー(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル 1/1→酢酸エチル/メタノール 10/1)、続いて、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:35%~65%、10分)により精製した。目的の画分を集め、凍結乾燥して、2-[(2S)-1-(2-フルオロプロパ-2-エノイル)-4-[7-(5-メチル-4-イソキノリル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]ピペラジン-2-イル]アセトニトリル(20.6mg、34.3μmol、25%収率、97.3%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:585。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.03(d,J=6.0Hz,1H),8.30(d,J=16.8Hz,1H),7.83(br d,J=7.6Hz,1H),7.55-7.44(m,2H),5.54-5.32(m,1H),5.31-5.18(m,1H),5.09-4.48(m,1H),4.43-4.34(m,1H),4.32-4.07(m,4H),4.06-3.81(m,2H),3.64-3.42(m,2H),3.35-3.26(m,1H),3.25-2.96(m,4H),2.92(d,J=2.8Hz,3H),2.90-2.73(m,2H),2.72-2.61(m,2H),2.51-2.42(m,3H),2.34-2.23(m,1H),2.13-1.99(m,1H),1.92-1.73(m,3H)。
実施例620
1-[4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-イル]-2-フルオロ-プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル 4-ベンジル-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-ベンジル-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.5g、4.90mmol、1当量)のDCM(40mL)中溶液に、DAST(3.95g、24.48mmol、3.23mL、5当量)を0℃で滴加し、混合物を20℃で5時間撹拌した。混合物を飽和NaHCO3(30mL)に加え、酢酸エチル(30mL×2)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE:EA=20~5:1)により精製して、tert-ブチル 4-ベンジル-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート(980mg、3.18mmol、64.91%収率)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:309。
ステップB:tert-ブチル6-フルオロ-1、4-ジアゼパン-1-カルボキシレート。tert-ブチル 4-ベンジル-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート(900.00mg、2.92mmol、1当量)およびPd/C(200mg、2.92mmol、10%純度、1当量)およびPd(OH)2(179.92mg、1.28mmol、4.39e-1当量)のMeOH(20mL)中溶液に、混合物をH2(50psi)下、40℃で12時間撹拌した。混合物を濾過し、濃縮して、tert-ブチル 6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート(630mg、2.89mmol、98.90%収率)を無色油として得た。
ステップC:[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート。7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(700mg、1.65mmol、1当量)、およびTEA(500.09mg、4.94mmol、687.88μL、3当量)、4A分子篩(500mg)のDCM(7mL)中溶液に、Tf2O(697.18mg、2.47mmol、407.71μL、1.5当量)を-40℃で加え、0℃で30分間撹拌した。混合物を水(2mL)に加え、DCM(5mL)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE:EA=10~1:1)により精製して、[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート(470mg、843.83μmol、51.22%収率)を赤色油として得たLCMS[ESI,M+1]:557。
ステップD:tert-ブチル 4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート。[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]、トリフルオロメタンスルホネート(440mg、789.97μmol、1当量)、およびtert-ブチル-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート(258.64mg、1.18mmol、1.5当量)のDMAC(5mL)中溶液に、DIEA(306.29mg、2.37mmol、412.79μL、3当量)を加え、混合物を25℃で30分間撹拌した。混合物を、逆シリカゲルカラムクロマトグラフィーカラム(0.001FA)により精製して、tert-ブチル 4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート(260mg、415.88μmol、52.65%収率)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:625。
ステップE:7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-(6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル 4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-カルボキシレート(240.00mg、383.89μmol、1当量)のDCM(3mL)中溶液に、TFA(12.32g、108.05mmol、8.00mL、281.45当量)を加え、混合物を20℃で30分間撹拌した。混合物を濃縮し、DCM(10mL)を加え、飽和Na2CO3(5mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮して、7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-(6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(200mg、粗製)を黄色固体として得た。この物質の一部(160mg、304.73μmol)を次のステップに直接使用した。粗生成物のうちの40mgを、分取HPLC(分取HPLC(カラム:Shim-pack C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:4%~34%、10分)により精製する)により精製し、次いで、残留物は分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:60%~90%、10分)であり、7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-(6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(9mg、16.99μmol)を得た。LCMS[ESI,M+1]:523。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.07Hz,1H)7.61(t,J=8.38Hz,1H)7.52(br d,J=7.46Hz,1H)7.44(dt,J=15.86,7.90Hz,1H)7.34(t,J=7.76Hz,1H)7.25-7.18(dd,J=7.46Hz,1H)4.80-5.24(m,1H)4.31-4.46(m,2H)4.08-4.30(m,2H)3.71-4.04(m,3H)3.50-3.68(m,2H)2.81-3.37(m,7H)2.46-2.73(m,5H)2.25-2.35(m,1H)2.01-2.14(m,1H),1.82-1.91(m,3H)。
ステップF:1-[4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-イル]-2-フルオロ-プロパ-2-エン-1-オン。7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-(6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-イル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(150.00mg、285.68μmol、1当量)および2-フルオロプロパ-2-エン酸(51.45mg、571.36μmol、2当量)のEA(2mL)中溶液に、T3P(50M、17.14μL、3当量)およびTEA(231.27mg、2.29mmol、318.11μL、8当量)を-40℃で加え、混合物を-40℃で30分間撹拌した。混合物を水(2mL)で希釈し、酢酸エチル(2mL×2)で抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥し、濾過し、濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Shim-pack C18 150*25*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:18%~48%、10分)により精製して、1-[4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-6-フルオロ-1,4-ジアゼパン-1-イル]-2-フルオロ-プロパ-2-エン-1-オン(90mg、140.78μmol、49.28%収率、93.4%純度)を黄色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:597。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.76(d,J=8.19Hz,1H)7.58-7.66(m,1H)7.50-7.56(m,1H)7.38-7.50(m,1H)7.31-7.37(m,1H)7.24-7.16(m,1H)4.90-5.55(m,3H)4.32-4.48(m,2H)3.48-4.27(m,11H)3.21-3.43(m,1H)2.80-3.16(m,2H)2.44-2.73(m,5H)2.25-2.36(m,1H)2.00-2.14(m,1H),1.77-1.91(m,3H)。
実施例621
1-[(3R)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-イル]-2-フルオロ-プロパ-2-エン-1-オン
ステップA:tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(3R)-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(10g、46.2mmol、1当量)、BnBr(8.70g、50.9mmol、6.04mL、1.1当量)、およびTEA(7.02g、69.36mmol、9.65mL、1.5当量)のMeCN(100mL)中の反応混合物を、80℃まで12時間加熱した。撹拌が完了したら、反応混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(30mL)および酢酸エチル(50mL)に溶解した。混合物を酢酸エチル(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥後、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=5:1→3:1)により精製した。tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(9g、29.4mmol、64%の収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:307。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.28-7.20(m,5H),3.95(br d,J=13.2Hz,1H),3.79(dd,J=5.6,11.6Hz,1H),3.61(br dd,J=3.2,13.6Hz,1H),3.52(br dd,J=4.0,11.2Hz,2H),3.35(br d,J=13.3Hz,2H),3.09(br s,1H),2.77-2.65(m,1H),2.51(br s,1H),2.20(ddd,J=3.2,8.4,12.0Hz,1H),1.38(s,9H)。
ステップB:tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-ホルミル-ピペラジン-1-カルボキシレート。DMSO(13.8g、176mmol、13.8mL、6.0当量)を(COCl)2(11.2g、88.1mmol、7.71mL、3.0当量)の-65℃のジクロロメタン(90mL)中溶液に加えた。10分後、tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-(ヒドロキシメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(9g、29.4mmol、1当量)のジクロロメタン(40mL)中溶液を15分にわたってゆっくりと導入した。-65℃で1時間撹拌後、TEA(29.7g、294mmol、40.9mL、10.0当量)を加えた。混合物を30分間にわたって28℃まで暖め、次いで、その温度でさらに30分間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(5mL)でクエンチし、分離した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、真空下で濃縮した。tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-ホルミル-ピペラジン-1-カルボキシレート(8.9g、29mmol)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
ステップC:tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-ホルミル-ピペラジン-1-カルボキシレート(8.9g、29.2mmol、1.0当量)のジクロロメタン(180mL)中溶液に、DAST(9.43g、58.5mmol、7.73mL、2当量)を0℃で加えた。この反応混合物を0℃で2時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和NaHCO3(150mL)によりクエンチし、酢酸エチル(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(60mL)で洗浄し、真空下で濃縮した。残留物(石油エーテル:酢酸エチル=5:1)をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=1:0→10:1)により精製した。tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.5g、4.48mmol、2ステップで15%収率、97.5%純度)を黄色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:327。
ステップD:tert-ブチル(3R)-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。tert-ブチル(3R)-4-ベンジル-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.5g、4.60mmol、1.0当量)のMeOH(10mL)中溶液に、Pd/C(150mg、10%純度)、Pd(OH)2/C(150mg、20%純度)をN2下で加えた。この懸濁液に対し、真空下での脱気とH2によるパージを数回実施した。混合物をH2(50psi)下、40℃で12時間撹拌した。攪拌が完了したら、混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。tert-ブチル(3R)-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.0g、4.23mmol、92%収率)を黄色油として得、これをさらに精製せずに次のステップに直接使用した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=5.91-5.43(m,1H),4.17-3.78(m,2H),3.13-2.66(m,5H),1.48(s,9H)。
ステップE:[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート。7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-オール(1.0g、2.35mmol、1当量)、4A分子篩(1.0g)、およびTEA(953mg、9.41mmol、1.31mL、4.0当量)のジクロロメタン(20mL)中溶液に、Tf2O(996mg、3.53mmol、582μL、1.5当量)を-40℃で加え、0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水でクエンチした(15mL)。混合物をセライトパッドを通して濾過した。濾液を分離し、水層をジクロロメタン(30mL)で抽出した。有機層をブライン(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル:酢酸エチル=5:1→0:1)により精製して、[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート(1.0g、1.63mmol、69%収率、91%純度)を褐色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:557。
ステップF:tert-ブチル(3R)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート。[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]トリフルオロメタンスルホネート(1.0g、1.80mmol、1.0当量)およびtert-ブチル(3R)-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(780mg、3.30mmol、1.84当量)の反応混合物を90℃で5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物をMeCN(5mL)中に溶解した。反応混合物を逆相フラッシュ[水(0.1%FA)/アセトニトリル]で精製した。画分を固体のNaHCO3によりpH>7に塩基化し、真空下で濃縮した。水層を酢酸エチル(3×20mL)で抽出し、真空下で濃縮した。残留物を分取TLC(ジクロロメタン:MeOH=7:1)により精製して、tert-ブチル(3R)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(80mg、122μmol、7%収率、98%純度)を褐色油として得た。LCMS[ESI,M+1]:643。
ステップG:7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(2R)-2-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン。tert-ブチル(3R)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(20mg、31.1μmol、1当量)のジクロロメタン(0.05mL)中溶液に、TFA(70.9mg、622μmol、46.0μL、20当量)を加えた。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を飽和Na2CO3(4mL)によりクエンチし、ジクロロメタン:MeOH(10:1、3×8mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(10mMのNH4HCO3)-ACN];B%:43%~73%、10分)により精製した。画分を濃縮し、凍結乾燥した。7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(2R)-2-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(4.22mg、7.77μmol、25%収率、100%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:543。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.81-7.74(m,1H),7.66-7.59(m,1H),7.56-7.52(m,1H),7.50-7.40(m,1H),7.35(t,J=7.6Hz,1H),7.28-7.16(m,1H),6.69-6.09(m,1H),4.68-4.54(m,1H),4.51-4.34(m,2H),4.30-4.11(m,1H),4.07-3.68(m,2H),3.63-3.46(m,2H),3.44-3.31(m,2H),3.30-3.21(m,1H),3.20-2.97(m,4H),2.92-2.83(m,1H),2.78-2.67(m,1H),2.58-2.49(m,3H),2.38-2.26(m,1H),2.15-2.02(m,1H),1.94-1.73(m,3H)。
ステップH:1-[(3R)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-イル]-2-フルオロ-プロパ-2-エン-1-オン。7-(8-クロロ-1-ナフチル)-4-[(2R)-2-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-イル]-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン(45mg、82.9μmol、1.0当量)、2-フルオロプロパ-2-エン酸(22.4mg、249μmol、3.0当量)の酢酸エチル(1mL)中溶液に、4A分子篩(100mg)を加えた。25℃で0.5時間撹拌後、TEA(126mg、1.24mmol、173μL、15当量)およびT3P(211mg、331μmol、197μL、50%純度、4当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で0.5時間撹拌した。撹拌が完了したら、反応混合物を水(1mL)でクエンチし、酢酸エチル(3×5mL)で抽出した。合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥し、真空下で濃縮した。残留物をカラム(Al2O3、石油エーテル/酢酸エチル=3:1→0:1)、続いて、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25 5μ;移動相:[水(0.05%水酸化アンモニウムv/v)-ACN];B%:55%~85%、10分)により精製して、1-[(3R)-4-[7-(8-クロロ-1-ナフチル)-2-[[(2S)-1-メチルピロリジン-2-イル]メトキシ]-6,8-ジヒドロ-5H-ピリド[3,4-d]ピリミジン-4-イル]-3-(ジフルオロメチル)ピペラジン-1-イル]-2-フルオロ-プロパ-2-エン-1-オン(5.98mg、9.72μmol、11%収率、99.4%純度)を白色固体として得た。LCMS[ESI,M+1]:615。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.81-7.75(m,1H),7.67-7.61(m,1H),7.55(td,J=1.2,7.6Hz,1H),7.51-7.41(m,1H),7.36(t,J=7.6Hz,1H),7.28-7.17(m,1H),6.48-5.83(m,1H),5.47-5.31(m,1H),5.27-5.19(m,1H),4.88-4.65(m,1H),4.59-4.31(m,4H),4.21-4.10(m,1H),4.04-3.76(m,2H),3.69-3.44(m,3H),3.33-2.92(m,4H),2.75-2.64(m,1H),2.61-2.52(m,1H),2.49-2.48(m,3H),2.36-2.25(m,1H),2.13-2.02(m,1H),1.88-1.72(m,3H)。
表1に列挙される実施例622~678は、市販の中間体および/または本明細書に開示される中間体を使用し、一般反応スキームで概要を述べた方法および例示した実施例の教示に従って調製される。
実施例A
KRas G12C修飾アッセイ
この実施例は、本発明の代表的化合物がKRas G12Cに共有結合することを、その代表的化合物とKRas G12Cとの共有結合付加物を検出するLCMSアッセイを使用して示す。
GDPをロードしたK-Ras(1~169)G12C、C51S、C80L、C118SおよびGTPをロードしたK-Ras(1~169)G12C、C51S、C80L、C118S,Q61Hのタンパク質濃度を、K-Rasアッセイ緩衝液(25mMのHEPES、150mMのNaCl、5mMのMgCl2、および10mMのオクチルβ-グルコピラノシド、pH7.5)中で2μMに調節した。次いで、各タンパク質溶液の10μLのアリコートを、384ウエルマイクロタイタープレートに移した。最初の化合物ストックは、DMSO中で目的の最終アッセイ濃度の50倍で調製した。
式(I)の代表的化合物をK-Rasアッセイ緩衝液で25倍に希釈し、最終的にそれらの最終濃度の2倍とした。次いで、各希釈化合物溶液の10μLのアリコートを、ウエルマイクロタイタープレート中のタンパク質溶液の各々に加え、反応を開始した。典型的な、最終化合物濃度は、3.0、5.0および25.0μMとした。各時点で、20μLの25mMの酢酸溶液で反応物をクエンチした。通常のアッセイ終点は、15、180および1440分とした。全ての反応をクエンチしたら、プレートをヒートシールし、データ取得のために試料をLC/MSシステムに注入した。
データ収集は、Agilent 6520 Q-TOF Accurate Mass Spectrometerで行った。試料を液相でC-3逆相カラムに注入し、アッセイ緩衝液を除去し、質量分析計用の試料を調製した。アセトニトリル勾配液を使用してタンパク質をカラムから溶出し、質量分析計に直接供給した。最初の生データ解析は、Agilent Mass Hunterソフトウェアによりデータ取得直後に行った。
インタクトなタンパク質の生データ解析は、Mass Hunterに付属の最大エントロピーデコンボリューションを使用した、溶液中の各タンパク質の多価チャージ状態のデコンボリューションのみとした。複雑さを最小限にするために、限られた質量範囲を超えるデータのみを分析のために考慮し、1ダルトン質量ステップ間隔を最小とした。生データ解析中に特定された全ての質量の高さは、Spotfire(登録商標)データ解析ソフトウエアでさらに分析するために出力された。
最終データ解析はSpotfire(登録商標)データ解析ソフトウエアパッケージにおける多段階プロセスであった。簡単に説明すると、各タンパク質質量は、その試料の総シグナルのパーセントとして計算され、そのパーセントは、その後、反応性化合物の非存在下でのタンパク質のシグナルのパーセンテージに対し正規化された。これらの正規化シグナルは、正規化コントロールパーセント(POC)として報告された。増大したPOC値は、所与の条件で、同一条件下のその他の化合物に比較して、より高い程度の修飾を示す化合物を示す。5μMの濃度で3時間試験した式(I)および式(II)の代表的化合物の結果を表2に示す。凡例:「A」≦25%POC;「B」>25%POC~≦50%POC;「C」>50%POC、およびND=測定せず。
実施例B
KRas G12C依存性細胞増殖の阻害
この実施例は、本発明の化合物の代表的化合物がKRas G12Cを発現する腫瘍細胞株の増殖を阻害することを示す。
本発明の化合物の代表的化合物によるKRas G12Cの細胞阻害を、KRas活性の下流マーカーであるリン酸化ERK(「ホスホERK」)の量を測定することにより決定した。
NCI-H358細胞(ATCC CRL-5807)は、KRas G12Cを発現しており、10%ウシ胎仔血清、ペニシリン/ストレプトマイシンおよび10mMのHEPESを補足したRPMI培地中で増殖させた。細胞をポリ-D-リシンコート96ウェルプレートに50,000細胞/ウェルの濃度で播き、8~12時間付着させた。次いで、0.5%DMSOの最終濃度の希釈した化合物を加えた。3時間後、培地を取り除き、150μLの4%ホルムアルデヒドを加え、プレートを20分間インキュベートした。プレートをPBSで洗浄し、150μLの氷冷した100%のメタノールを使用して10分間透過処理を行った。100μLのLicorブロッキング緩衝液(Li-Cor Biotechnology,Lincoln NE)を室温で1時間使用してプレートに対する非特異的抗体結合をブロックした。基本的には、陽性対照試料および細胞を含まない試料を、試験試料と並列処理した。
ホスホERKの量は、リン酸化型のERKに特異的な抗体を使用して、GAPDHの量と比較して決定された。検出に使用される一次抗体は、次のように添加された:1:500に希釈されたホスホERK(Cell Signalingのcs9101)およびLicor block+0.05%ツイーン20中で1:5000に希釈されたGAPDH(MilliporeのMAB374)。プレートを室温で2時間インキュベートした。プレートを、PBS+0.05%のツイーン20で洗浄した。
一次抗体を可視化するために使用される二次抗体は、以下のように添加された:1:1000に希釈された抗ウサギ680、およびLicor block+0.05%ツイーン20で1:1000に希釈され、室温で1時間インキュベートされた抗マウス800。プレートを、PBS+0.05%のツイーン20で洗浄した。100μlの分取量のPBSを各ウエルに加え、プレートをLICOR AERIUSプレートリーダーで読み取った。
pERK(Thr202/Tyr204)シグナルをGAPDHシグナルで正規化し、DMSOコントロール値のパーセントを計算した。用量反応曲線の4パラメーターフィットを使用してIC
50値を生成した。式(I)、式(II)の代表的化合物の結果を表3に示す。凡例:「A」≧0.0001~≦1μM;「B」>1μM;ND=測定せず。
実施例C
RAまたはRBでの置換を有する化合物の全血における改善したインビトロ安定性
この実施例は、RAまたは少なくとも1つのRBでの置換を含む本発明の代表的化合物が、RAおよび両方のRB置換基が水素である化合物と比較して改善した全血安定性を示すことを示す。
材料:以下の試薬をそのまま使用した:アセトニトリル(HPLCグレード、Burdick & Jackson、Madison、WI)、リン酸緩衝食塩水(PBS)、pH 7.4(Sigma-Aldrich,Co.、St.Louis、MO)、水(HPLCグレード、JT Baker、Phillipsburg、NJ)、DMSO(EM Science、Merck KGaA、Darmstadt、Germany)、およびイソプロパノール(IPA、試薬グレード、EMD Chemicals、Gibbstown、NJ)。プロパンテリンおよびエスモロール(Sigma-Aldrich)を、アッセイにおいて陽性対照化合物として使用した。ジアゼパム(Sigma-Aldrich)を、定量化のための内部標準として使用した。ヒト全血は、BioIVT(Westbury、NY)から入手し、男性のものであった。全ての他の試薬および溶媒は、Sigma(St.Louis、MO)により供給された最高分析グレードのものであり、そのまま使用した。
血液インキュベーション:全血の存在下での本発明の代表的なKRas G12C阻害剤化合物のインビトロ安定性を以下の様に実施した。血液および血漿中のエステラーゼによってエステル加水分解を受けることが知られているエスモロールまたはプロパンテリンを、アッセイにおいて陽性対照として使用した。プロパンテリン、エスモロール、またはDMSO中の本発明の化合物の10mMの原液を、DMSOで500μMまで希釈した。全血(600μL)のアリコートを、ポリプロピレン96ディープウエルプレート(Axygen Scientific、CA Union City)の適切なウェルに三連で入れた。血液をPBS(pH7.4、600μL)を使用して50%まで希釈した。希釈した血液を37℃で15分間プレインキュベートした。各ウェルに、5μMの最終試験濃度となるように500μMのDMSOストック12μLを同時に添加した。プレートを、プレートシェーカー(IKA MTS 2/4 Digital Microtiter Shaker、VWR)上で、600rpmで10秒間混合した。全血の各ウェルからの100μLのアリコートを、0、60、または240分とラベル付けされた3つの別個の96ディープウエルプレートに移した。指定された各時点の終了時に、赤血球を100μLの水で溶解し、600rpmで1分間混合し、IS(0.625μMのジアゼパム)を含有する800μLのアセトニトリルで停止させた。プレートを、プレートシェーカー上で600rpmで1分間混合し、Allegraベンチトップ遠心分離機(Beckman Coulter、Fullerton、CA)を使用して2095×gで室温にて7分間遠心分離機で遠心した。上澄み(100μL)を、液体試料ハンドリングシステム(Apricot、Perkin-Elmer、Boston、MA)を使用して浅型96ウェルプレート(Costar)に移した。100μLの水を、200μLの最終容量となるように各上澄み試料に添加した。プレートを密閉し、各ウェルの内容物はLC-MS/MSにより解析した。
定量解析:LC-MS/MSシステムは、HTS-PALオートサンプラー(Leap Technologies、Carrboro、NC)、HP1200 HPLC(Agilent、Palo Alto、CA)、およびAPI4000トリプル四重極質量分析計(PE Sciex、Applied Biosystems部門、Foster City、CA)で構成された。分析物および内部標準のクロマトグラフ分離は、移動相A(1%イソプロピルアルコールを有する0.1%ギ酸水溶液)およびB(アセトニトリル中の0.1%ギ酸)を使用する勾配条件と共にC18カラム(Kinetex(登録商標)、30×3.0mm、2.6μm粒子サイズ、Phenomenex、Torrance、CA)を使用して、室温で達成された。単一注入での再平衡化を含む総実行時間は、2分であった。分析物の質量分析検出は、ESI+イオン化モードを使用して達成された。イオン流は、プロパンテリン、エスモロール、または代表的な試験化合物の原液注入の間に最適化された。ISを含む分析物応答を、各化合物に特有の遷移の多重反応モニタリング(MRM)により測定した。
計算:データを取得し、Analyst 1.6.2ソフトウェア(Sciex)を使用して試験化合物および内部標準についてピーク面積を計算した。各試料について各試験化合物およびISのピーク面積比(n=3)を平均することによって、平均ピーク面積比を計算した。
ピーク面積表を、分析物対内部標準の平均ピーク面積比を使用して残留率(%REM)および半減期(t1/2)を計算するBioAssay Enterprise(CambridgeSoft、Cambridge、MA)にエクスポートした。残留率(f)は、ゼロ時点の試料のピーク面積比に対する各時点でのピーク面積比の比を決定することによって計算した。t1/2は、ln(2)をkmで除算して決定された。試験化合物の減少率(km)は、時間対-ln(f(t))の線形回帰により決定された。回帰は式「y=mx」を使用した。従って、このモデルは100%残留の切片を強制し、代謝は一次速度論に従うと仮定した。
陽性対照化合物、プロパンテリンまたはエスモロール、および本発明の代表的KRas G12C阻害剤化合物を、37℃にてヒト全血の存在下で240分のインキュベーション期間にわたりインキュベートした。プロパンテリン、エスモロール、および各試験化合物の37℃で240分間のインキュベーション後の半減期を、表4に示す。凡例:「A」≦200分;「B」>200分~≦1000分;「C」>1000分~≦2000分;および「D」>2000分
結果:予想通り、陽性対照のプロパンテリンは、98分の短い半減期を示した。比べると、RAまたはRBの置換を含む例示的KRas G12C阻害剤化合物のヒト全血における半減期は、非置換化合物、例えば、実施例331および359と比較して、一部の例では、4倍超または3倍超に増加し、これらの化合物の薬力学的特性および薬物動態特性の大きな改善をもたらし、より高いインビボ安定性および生物学的利用能の増加をもたらした。
本発明をその特定の実施形態と関連付けて説明してきたが、その実施形態はさらに修正が可能であり、本出願は、一般的に、本発明の原理に従った本発明の任意の変形、使用、または改変を包含することが意図され、本発明が属する技術内の既知のまたは日常的な実施の範囲に入り、上記に示されるおよび以下の添付の請求項の範囲に入る本質的な特徴に適用され得る本開示からの乖離を含むものと理解されよう。