JP5452869B2 - デンプン加工法 - Google Patents
デンプン加工法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5452869B2 JP5452869B2 JP2007548502A JP2007548502A JP5452869B2 JP 5452869 B2 JP5452869 B2 JP 5452869B2 JP 2007548502 A JP2007548502 A JP 2007548502A JP 2007548502 A JP2007548502 A JP 2007548502A JP 5452869 B2 JP5452869 B2 JP 5452869B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- seq
- polypeptide
- amylase
- starch
- amino acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 title claims description 131
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 title claims description 131
- 239000008107 starch Substances 0.000 title claims description 129
- 238000003672 processing method Methods 0.000 title 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 240
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 239
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 236
- 108090000637 alpha-Amylases Proteins 0.000 claims description 171
- 102000004139 alpha-Amylases Human genes 0.000 claims description 154
- 229940024171 alpha-amylase Drugs 0.000 claims description 142
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 139
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 138
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 99
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 91
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 91
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 claims description 88
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 claims description 75
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 71
- 102100022624 Glucoamylase Human genes 0.000 claims description 70
- 108010073178 Glucan 1,4-alpha-Glucosidase Proteins 0.000 claims description 66
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 55
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims description 48
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 46
- 108010038196 saccharide-binding proteins Proteins 0.000 claims description 42
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 claims description 37
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 claims description 37
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 31
- 241000228245 Aspergillus niger Species 0.000 claims description 29
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 26
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 claims description 25
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 claims description 25
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 24
- 241000894007 species Species 0.000 claims description 24
- 241001530056 Athelia rolfsii Species 0.000 claims description 22
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 18
- 239000004382 Amylase Substances 0.000 claims description 16
- 102000013142 Amylases Human genes 0.000 claims description 16
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 claims description 16
- 235000019418 amylase Nutrition 0.000 claims description 16
- 241000235525 Rhizomucor pusillus Species 0.000 claims description 14
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 14
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 14
- 241000222354 Trametes Species 0.000 claims description 13
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 claims description 13
- 239000008103 glucose Substances 0.000 claims description 13
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 12
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 12
- 241000959173 Rasamsonia emersonii Species 0.000 claims description 10
- 241000228341 Talaromyces Species 0.000 claims description 10
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 9
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 9
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims description 9
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 claims description 8
- 101710146708 Acid alpha-amylase Proteins 0.000 claims description 6
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 claims description 6
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 6
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 claims description 6
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 claims description 6
- 229920002774 Maltodextrin Polymers 0.000 claims description 5
- 241000969597 Pachykytospora Species 0.000 claims description 5
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 claims description 5
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000005913 Maltodextrin Substances 0.000 claims description 4
- 235000013361 beverage Nutrition 0.000 claims description 4
- 239000000446 fuel Substances 0.000 claims description 4
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 claims description 4
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 claims description 4
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 claims description 4
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 claims description 4
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N lysine Chemical compound NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229940035034 maltodextrin Drugs 0.000 claims description 4
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 claims description 3
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 3
- 235000015165 citric acid Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000006188 syrup Substances 0.000 claims description 3
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 2
- 241001484137 Talaromyces leycettanus Species 0.000 claims description 2
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 claims description 2
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 claims description 2
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 claims description 2
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 claims description 2
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 claims 6
- 241000228257 Aspergillus sp. Species 0.000 claims 1
- 241001207467 Talaromyces sp. Species 0.000 claims 1
- 241000741781 Trametes sp. Species 0.000 claims 1
- 241000223259 Trichoderma Species 0.000 claims 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 claims 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 159
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 158
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 130
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 130
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 119
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 96
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 56
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 46
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 45
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 40
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 33
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 31
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 30
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 25
- 240000006439 Aspergillus oryzae Species 0.000 description 24
- 235000002247 Aspergillus oryzae Nutrition 0.000 description 22
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 20
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 20
- 241000228143 Penicillium Species 0.000 description 19
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 19
- 241000123318 Meripilus giganteus Species 0.000 description 17
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 17
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 16
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 16
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 16
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 15
- 239000000047 product Substances 0.000 description 15
- 241001019659 Acremonium <Plectosphaerellaceae> Species 0.000 description 13
- 241001327444 Coniochaeta Species 0.000 description 13
- 241000223218 Fusarium Species 0.000 description 13
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 13
- 241000969591 Haploporus papyraceus Species 0.000 description 12
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 12
- 241000122821 Aspergillus kawachii Species 0.000 description 11
- 241000401280 Valsaria rubricosa Species 0.000 description 11
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 11
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 11
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 10
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 10
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 10
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 10
- -1 B12 Chemical compound 0.000 description 9
- 241000896533 Gliocladium Species 0.000 description 9
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 9
- 241001004161 Valsaria spartii Species 0.000 description 9
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 9
- 241000351920 Aspergillus nidulans Species 0.000 description 8
- 101000757144 Aspergillus niger Glucoamylase Proteins 0.000 description 8
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 8
- 241000228423 Malbranchea Species 0.000 description 8
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 8
- 241001108584 Trametes corrugata Species 0.000 description 8
- 108010048241 acetamidase Proteins 0.000 description 8
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 8
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 8
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 8
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 8
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 8
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 7
- 241001547157 Cryptosporiopsis Species 0.000 description 7
- 241000935926 Diplodia Species 0.000 description 7
- 241001226034 Nectria <echinoderm> Species 0.000 description 7
- 239000002585 base Substances 0.000 description 7
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 7
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 7
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N D-gluconic acid Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N 0.000 description 6
- 241000908192 Dichotomocladium Species 0.000 description 6
- 241001229742 Dinemasporium Species 0.000 description 6
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 6
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 6
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 241000228178 Thermoascus Species 0.000 description 6
- 241000223258 Thermomyces lanuginosus Species 0.000 description 6
- 235000007244 Zea mays Nutrition 0.000 description 6
- 108010019077 beta-Amylase Proteins 0.000 description 6
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 6
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 6
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 6
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 6
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 6
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 6
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 6
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 6
- 150000004804 polysaccharides Polymers 0.000 description 6
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 6
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 6
- UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 5,8-dihydroxy-2-methoxy-6-methyl-7-(2-oxopropyl)naphthalene-1,4-dione Chemical compound CC1=C(CC(C)=O)C(O)=C2C(=O)C(OC)=CC(=O)C2=C1O UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000235389 Absidia Species 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 102100026367 Pancreatic alpha-amylase Human genes 0.000 description 5
- 102000012288 Phosphopyruvate Hydratase Human genes 0.000 description 5
- 108010022181 Phosphopyruvate Hydratase Proteins 0.000 description 5
- 241000235402 Rhizomucor Species 0.000 description 5
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 5
- 241000401281 Valsaria Species 0.000 description 5
- 235000010749 Vicia faba Nutrition 0.000 description 5
- 240000006677 Vicia faba Species 0.000 description 5
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 5
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 5
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 5
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 5
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 5
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 5
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 5
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 5
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 5
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 5
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 4
- 241001468259 Anoxybacillus flavithermus Species 0.000 description 4
- 108010037870 Anthranilate Synthase Proteins 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010025880 Cyclomaltodextrin glucanotransferase Proteins 0.000 description 4
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 4
- 241000223221 Fusarium oxysporum Species 0.000 description 4
- 241000138839 Leucopaxillus giganteus Species 0.000 description 4
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 4
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 4
- AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N Riboflavin Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 4
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 4
- 241000222646 Stereum Species 0.000 description 4
- 241000187213 Streptomyces limosus Species 0.000 description 4
- 241001230654 Trametes cingulata Species 0.000 description 4
- 241000215642 Trichophaea Species 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 230000003625 amylolytic effect Effects 0.000 description 4
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 4
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 4
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 4
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 4
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 4
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 4
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 description 4
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 4
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 4
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 101150054232 pyrG gene Proteins 0.000 description 4
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 4
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 4
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 4
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 4
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 3
- 102100034044 All-trans-retinol dehydrogenase [NAD(+)] ADH1B Human genes 0.000 description 3
- 101710193111 All-trans-retinol dehydrogenase [NAD(+)] ADH4 Proteins 0.000 description 3
- 241000221832 Amorphotheca resinae Species 0.000 description 3
- 229920000945 Amylopectin Polymers 0.000 description 3
- 229920000856 Amylose Polymers 0.000 description 3
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 3
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 3
- 102100032487 Beta-mannosidase Human genes 0.000 description 3
- 229920002101 Chitin Polymers 0.000 description 3
- 108010022172 Chitinases Proteins 0.000 description 3
- 102000012286 Chitinases Human genes 0.000 description 3
- 241000741763 Coniochaeta sp. Species 0.000 description 3
- 241000222356 Coriolus Species 0.000 description 3
- RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N D-gluconic acid Natural products OCC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101710121765 Endo-1,4-beta-xylanase Proteins 0.000 description 3
- 241000221779 Fusarium sambucinum Species 0.000 description 3
- 108050008938 Glucoamylases Proteins 0.000 description 3
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 description 3
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 description 3
- 108010028688 Isoamylase Proteins 0.000 description 3
- 102100027612 Kallikrein-11 Human genes 0.000 description 3
- 241001237206 Leucopaxillus Species 0.000 description 3
- 241000209510 Liliopsida Species 0.000 description 3
- 229920000057 Mannan Polymers 0.000 description 3
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 3
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 3
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 3
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 3
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 3
- 241000235403 Rhizomucor miehei Species 0.000 description 3
- 240000006394 Sorghum bicolor Species 0.000 description 3
- 235000011684 Sorghum saccharatum Nutrition 0.000 description 3
- 241001526401 Streptomyces thermocyaneoviolaceus Species 0.000 description 3
- 241000682905 Subulispora Species 0.000 description 3
- 108700015934 Triose-phosphate isomerases Proteins 0.000 description 3
- 101710152431 Trypsin-like protease Proteins 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 108010055059 beta-Mannosidase Proteins 0.000 description 3
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 3
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 3
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- 239000000174 gluconic acid Substances 0.000 description 3
- 235000012208 gluconic acid Nutrition 0.000 description 3
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 3
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 3
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 3
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 3
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 3
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 235000020985 whole grains Nutrition 0.000 description 3
- JLIDBLDQVAYHNE-YKALOCIXSA-N (+)-Abscisic acid Chemical compound OC(=O)/C=C(/C)\C=C\[C@@]1(O)C(C)=CC(=O)CC1(C)C JLIDBLDQVAYHNE-YKALOCIXSA-N 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 2
- AEQDJSLRWYMAQI-UHFFFAOYSA-N 2,3,9,10-tetramethoxy-6,8,13,13a-tetrahydro-5H-isoquinolino[2,1-b]isoquinoline Chemical compound C1CN2CC(C(=C(OC)C=C3)OC)=C3CC2C2=C1C=C(OC)C(OC)=C2 AEQDJSLRWYMAQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JAHNSTQSQJOJLO-UHFFFAOYSA-N 2-(3-fluorophenyl)-1h-imidazole Chemical compound FC1=CC=CC(C=2NC=CN=2)=C1 JAHNSTQSQJOJLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 2
- DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N Acetamide Chemical compound CC(N)=O DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N Acetaminophen Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108010013043 Acetylesterase Proteins 0.000 description 2
- 101710197633 Actin-1 Proteins 0.000 description 2
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 2
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 2
- 241000743339 Agrostis Species 0.000 description 2
- 102000007698 Alcohol dehydrogenase Human genes 0.000 description 2
- 108010021809 Alcohol dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 101100163849 Arabidopsis thaliana ARS1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000235349 Ascomycota Species 0.000 description 2
- 102000035101 Aspartic proteases Human genes 0.000 description 2
- 108091005502 Aspartic proteases Proteins 0.000 description 2
- 241001513093 Aspergillus awamori Species 0.000 description 2
- 101000690713 Aspergillus niger Alpha-glucosidase Proteins 0.000 description 2
- 101900318521 Aspergillus oryzae Triosephosphate isomerase Proteins 0.000 description 2
- 241000222400 Athelia Species 0.000 description 2
- 101000695691 Bacillus licheniformis Beta-lactamase Proteins 0.000 description 2
- 108010029675 Bacillus licheniformis alpha-amylase Proteins 0.000 description 2
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 2
- 108050006302 Carbohydrate binding module family 20 Proteins 0.000 description 2
- 102000016748 Carbohydrate binding module family 20 Human genes 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010059892 Cellulase Proteins 0.000 description 2
- 108010084185 Cellulases Proteins 0.000 description 2
- 102000005575 Cellulases Human genes 0.000 description 2
- 229920001661 Chitosan Polymers 0.000 description 2
- 241000233652 Chytridiomycota Species 0.000 description 2
- AUNGANRZJHBGPY-UHFFFAOYSA-N D-Lyxoflavin Natural products OCC(O)C(O)C(O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PHOQVHQSTUBQQK-SQOUGZDYSA-N D-glucono-1,5-lactone Chemical compound OC[C@H]1OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O PHOQVHQSTUBQQK-SQOUGZDYSA-N 0.000 description 2
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 2
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 2
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 2
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 2
- 241001191386 Dichotomocladium hesseltinei Species 0.000 description 2
- 235000016623 Fragaria vesca Nutrition 0.000 description 2
- 240000009088 Fragaria x ananassa Species 0.000 description 2
- 235000011363 Fragaria x ananassa Nutrition 0.000 description 2
- 241000567163 Fusarium cerealis Species 0.000 description 2
- 241000223195 Fusarium graminearum Species 0.000 description 2
- 102000048120 Galactokinases Human genes 0.000 description 2
- 108700023157 Galactokinases Proteins 0.000 description 2
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 2
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 2
- 241000193385 Geobacillus stearothermophilus Species 0.000 description 2
- 101100369308 Geobacillus stearothermophilus nprS gene Proteins 0.000 description 2
- 101100080316 Geobacillus stearothermophilus nprT gene Proteins 0.000 description 2
- 229920001503 Glucan Polymers 0.000 description 2
- 108010050375 Glucose 1-Dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 102000005744 Glycoside Hydrolases Human genes 0.000 description 2
- 108010031186 Glycoside Hydrolases Proteins 0.000 description 2
- 101100295959 Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) arcB gene Proteins 0.000 description 2
- 241000223198 Humicola Species 0.000 description 2
- 241001480714 Humicola insolens Species 0.000 description 2
- 206010020649 Hyperkeratosis Diseases 0.000 description 2
- 240000000599 Lentinula edodes Species 0.000 description 2
- 229910009891 LiAc Inorganic materials 0.000 description 2
- 240000003183 Manihot esculenta Species 0.000 description 2
- 235000016735 Manihot esculenta subsp esculenta Nutrition 0.000 description 2
- 241000123315 Meripilus Species 0.000 description 2
- 102100036617 Monoacylglycerol lipase ABHD2 Human genes 0.000 description 2
- 241000221960 Neurospora Species 0.000 description 2
- 108090000913 Nitrate Reductases Proteins 0.000 description 2
- 241000233654 Oomycetes Species 0.000 description 2
- 102000007981 Ornithine carbamoyltransferase Human genes 0.000 description 2
- 101710113020 Ornithine transcarbamylase, mitochondrial Proteins 0.000 description 2
- 102100037214 Orotidine 5'-phosphate decarboxylase Human genes 0.000 description 2
- 108010055012 Orotidine-5'-phosphate decarboxylase Proteins 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 2
- 244000046052 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 2
- 235000010582 Pisum sativum Nutrition 0.000 description 2
- 240000004713 Pisum sativum Species 0.000 description 2
- 241000209504 Poaceae Species 0.000 description 2
- HLCFGWHYROZGBI-JJKGCWMISA-M Potassium gluconate Chemical compound [K+].OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C([O-])=O HLCFGWHYROZGBI-JJKGCWMISA-M 0.000 description 2
- 240000005384 Rhizopus oryzae Species 0.000 description 2
- 235000013752 Rhizopus oryzae Nutrition 0.000 description 2
- 101100097319 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) ala1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000876852 Scorias Species 0.000 description 2
- 235000007238 Secale cereale Nutrition 0.000 description 2
- 244000082988 Secale cereale Species 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- 235000019764 Soybean Meal Nutrition 0.000 description 2
- 241000399119 Spio Species 0.000 description 2
- 101100370749 Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) trpC1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000187391 Streptomyces hygroscopicus Species 0.000 description 2
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 2
- 241000223257 Thermomyces Species 0.000 description 2
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 2
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 2
- 241000259813 Trichophaea saccata Species 0.000 description 2
- 102000005924 Triose-Phosphate Isomerase Human genes 0.000 description 2
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 2
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 description 2
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000002098 Vicia faba var. major Nutrition 0.000 description 2
- IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N WHWLQLKPGQPMY Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CNC=N1 IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N 0.000 description 2
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 2
- 102000020006 aldose 1-epimerase Human genes 0.000 description 2
- 108091022872 aldose 1-epimerase Proteins 0.000 description 2
- OENHQHLEOONYIE-UKMVMLAPSA-N all-trans beta-carotene Natural products CC=1CCCC(C)(C)C=1/C=C/C(/C)=C/C=C/C(/C)=C/C=C/C=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C OENHQHLEOONYIE-UKMVMLAPSA-N 0.000 description 2
- 229940025131 amylases Drugs 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 101150008194 argB gene Proteins 0.000 description 2
- 210000004507 artificial chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 239000003637 basic solution Substances 0.000 description 2
- 235000013734 beta-carotene Nutrition 0.000 description 2
- 239000011648 beta-carotene Substances 0.000 description 2
- TUPZEYHYWIEDIH-WAIFQNFQSA-N beta-carotene Natural products CC(=C/C=C/C=C(C)/C=C/C=C(C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C)C=CC=C(/C)C=CC2=CCCCC2(C)C TUPZEYHYWIEDIH-WAIFQNFQSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 2
- 229960002747 betacarotene Drugs 0.000 description 2
- 239000003139 biocide Substances 0.000 description 2
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 239000004227 calcium gluconate Substances 0.000 description 2
- 235000013927 calcium gluconate Nutrition 0.000 description 2
- 229960004494 calcium gluconate Drugs 0.000 description 2
- NEEHYRZPVYRGPP-UHFFFAOYSA-L calcium;2,3,4,5,6-pentahydroxyhexanoate Chemical compound [Ca+2].OCC(O)C(O)C(O)C(O)C([O-])=O.OCC(O)C(O)C(O)C(O)C([O-])=O NEEHYRZPVYRGPP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 2
- 108020001778 catalytic domains Proteins 0.000 description 2
- 230000036978 cell physiology Effects 0.000 description 2
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 2
- 229940106157 cellulase Drugs 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012411 cloning technique Methods 0.000 description 2
- 239000011362 coarse particle Substances 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- PXEDJBXQKAGXNJ-QTNFYWBSSA-L disodium L-glutamate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C(=O)[C@@H](N)CCC([O-])=O PXEDJBXQKAGXNJ-QTNFYWBSSA-L 0.000 description 2
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 108010061330 glucan 1,4-alpha-maltohydrolase Proteins 0.000 description 2
- 229950006191 gluconic acid Drugs 0.000 description 2
- 235000012209 glucono delta-lactone Nutrition 0.000 description 2
- 239000000182 glucono-delta-lactone Substances 0.000 description 2
- 229960003681 gluconolactone Drugs 0.000 description 2
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 2
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 2
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 108010002685 hygromycin-B kinase Proteins 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 2
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 2
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 2
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 2
- 238000007834 ligase chain reaction Methods 0.000 description 2
- XIXADJRWDQXREU-UHFFFAOYSA-M lithium acetate Chemical compound [Li+].CC([O-])=O XIXADJRWDQXREU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 2
- 101150039489 lysZ gene Proteins 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- LVHBHZANLOWSRM-UHFFFAOYSA-N methylenebutanedioic acid Natural products OC(=O)CC(=C)C(O)=O LVHBHZANLOWSRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 2
- 101150095344 niaD gene Proteins 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 2
- 230000037039 plant physiology Effects 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 239000004224 potassium gluconate Substances 0.000 description 2
- 235000013926 potassium gluconate Nutrition 0.000 description 2
- 229960003189 potassium gluconate Drugs 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 2
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 2
- 235000019192 riboflavin Nutrition 0.000 description 2
- 239000002151 riboflavin Substances 0.000 description 2
- 229960002477 riboflavin Drugs 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 235000010352 sodium erythorbate Nutrition 0.000 description 2
- 239000004320 sodium erythorbate Substances 0.000 description 2
- 239000000176 sodium gluconate Substances 0.000 description 2
- 235000012207 sodium gluconate Nutrition 0.000 description 2
- 229940005574 sodium gluconate Drugs 0.000 description 2
- RBWSWDPRDBEWCR-RKJRWTFHSA-N sodium;(2r)-2-[(2r)-3,4-dihydroxy-5-oxo-2h-furan-2-yl]-2-hydroxyethanolate Chemical compound [Na+].[O-]C[C@@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O RBWSWDPRDBEWCR-RKJRWTFHSA-N 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 2
- 230000008961 swelling Effects 0.000 description 2
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 2
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 2
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 2
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 101150016309 trpC gene Proteins 0.000 description 2
- 230000009105 vegetative growth Effects 0.000 description 2
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 2
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 2
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 2
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 2
- OENHQHLEOONYIE-JLTXGRSLSA-N β-Carotene Chemical compound CC=1CCCC(C)(C)C=1\C=C\C(\C)=C\C=C\C(\C)=C\C=C\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C OENHQHLEOONYIE-JLTXGRSLSA-N 0.000 description 2
- IPYNIQBMIIXLIG-UHFFFAOYSA-N 1h-indol-3-ylmethyl(trimethyl)azanium Chemical compound C1=CC=C2C(C[N+](C)(C)C)=CNC2=C1 IPYNIQBMIIXLIG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4-[hydroxy(methyl)phosphoryl]butanoic acid Chemical compound CP(O)(=O)CCC(N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710163881 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Proteins 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 241000534414 Anotopterus nikparini Species 0.000 description 1
- 241001626813 Anoxybacillus Species 0.000 description 1
- 241000285802 Anoxybacillus contaminans Species 0.000 description 1
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 1
- 102000004580 Aspartic Acid Proteases Human genes 0.000 description 1
- 108010017640 Aspartic Acid Proteases Proteins 0.000 description 1
- 101000961203 Aspergillus awamori Glucoamylase Proteins 0.000 description 1
- 241001480052 Aspergillus japonicus Species 0.000 description 1
- 101900127796 Aspergillus oryzae Glucoamylase Proteins 0.000 description 1
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 1
- 235000007319 Avena orientalis Nutrition 0.000 description 1
- 244000075850 Avena orientalis Species 0.000 description 1
- 108090000145 Bacillolysin Proteins 0.000 description 1
- 101000775727 Bacillus amyloliquefaciens Alpha-amylase Proteins 0.000 description 1
- 241000193755 Bacillus cereus Species 0.000 description 1
- 241000193752 Bacillus circulans Species 0.000 description 1
- 241000194108 Bacillus licheniformis Species 0.000 description 1
- 108010045681 Bacillus stearothermophilus neutral protease Proteins 0.000 description 1
- 101900040182 Bacillus subtilis Levansucrase Proteins 0.000 description 1
- 108010023063 Bacto-peptone Proteins 0.000 description 1
- 108091005658 Basic proteases Proteins 0.000 description 1
- 241000221198 Basidiomycota Species 0.000 description 1
- 241000219310 Beta vulgaris subsp. vulgaris Species 0.000 description 1
- 102100030981 Beta-alanine-activating enzyme Human genes 0.000 description 1
- 235000011293 Brassica napus Nutrition 0.000 description 1
- 235000006008 Brassica napus var napus Nutrition 0.000 description 1
- 235000011299 Brassica oleracea var botrytis Nutrition 0.000 description 1
- 240000003259 Brassica oleracea var. botrytis Species 0.000 description 1
- 241000219193 Brassicaceae Species 0.000 description 1
- 101100520142 Caenorhabditis elegans pin-2 gene Proteins 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 206010006956 Calcium deficiency Diseases 0.000 description 1
- 102100037633 Centrin-3 Human genes 0.000 description 1
- 241000221955 Chaetomium Species 0.000 description 1
- 241000701248 Chlorella virus Species 0.000 description 1
- 241000123346 Chrysosporium Species 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 229920002261 Corn starch Polymers 0.000 description 1
- 235000007466 Corylus avellana Nutrition 0.000 description 1
- 240000007582 Corylus avellana Species 0.000 description 1
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 1
- 229920000858 Cyclodextrin Polymers 0.000 description 1
- 102000018832 Cytochromes Human genes 0.000 description 1
- 108010052832 Cytochromes Proteins 0.000 description 1
- 125000003535 D-glucopyranosyl group Chemical group [H]OC([H])([H])[C@@]1([H])OC([H])(*)[C@]([H])(O[H])[C@@]([H])(O[H])[C@]1([H])O[H] 0.000 description 1
- 125000002353 D-glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 229920001353 Dextrin Polymers 0.000 description 1
- 239000004375 Dextrin Substances 0.000 description 1
- 101100342470 Dictyostelium discoideum pkbA gene Proteins 0.000 description 1
- 241000228138 Emericella Species 0.000 description 1
- 102000010911 Enzyme Precursors Human genes 0.000 description 1
- 108010062466 Enzyme Precursors Proteins 0.000 description 1
- 101100385973 Escherichia coli (strain K12) cycA gene Proteins 0.000 description 1
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N Ethene Chemical compound C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005977 Ethylene Substances 0.000 description 1
- 241000234642 Festuca Species 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 241000145614 Fusarium bactridioides Species 0.000 description 1
- 101150108358 GLAA gene Proteins 0.000 description 1
- 101100001650 Geobacillus stearothermophilus amyM gene Proteins 0.000 description 1
- 241000973882 Geosmithia Species 0.000 description 1
- 239000005980 Gibberellic acid Substances 0.000 description 1
- 102000006395 Globulins Human genes 0.000 description 1
- 108010044091 Globulins Proteins 0.000 description 1
- 239000005561 Glufosinate Substances 0.000 description 1
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 description 1
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- 108700023372 Glycosyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 102000051366 Glycosyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 101150009006 HIS3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100246753 Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) pyrF gene Proteins 0.000 description 1
- 101000773364 Homo sapiens Beta-alanine-activating enzyme Proteins 0.000 description 1
- 101000880522 Homo sapiens Centrin-3 Proteins 0.000 description 1
- 241000223200 Humicola grisea var. thermoidea Species 0.000 description 1
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 108010029541 Laccase Proteins 0.000 description 1
- 101710094902 Legumin Proteins 0.000 description 1
- 241000222435 Lentinula Species 0.000 description 1
- 235000001715 Lentinula edodes Nutrition 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 1
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 1
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 1
- 241000209082 Lolium Species 0.000 description 1
- 241000219745 Lupinus Species 0.000 description 1
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 1
- 101150068888 MET3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710117655 Maltogenic alpha-amylase Proteins 0.000 description 1
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 1
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 240000005561 Musa balbisiana Species 0.000 description 1
- 241000221961 Neurospora crassa Species 0.000 description 1
- 101100022915 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) cys-11 gene Proteins 0.000 description 1
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 1
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 241000087027 Penicillium ludwigii Species 0.000 description 1
- 241000228168 Penicillium sp. Species 0.000 description 1
- 241000222385 Phanerochaete Species 0.000 description 1
- 241000222393 Phanerochaete chrysosporium Species 0.000 description 1
- 241000286209 Phasianidae Species 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 229920001030 Polyethylene Glycol 4000 Polymers 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 108010068086 Polyubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 241000206614 Porphyra purpurea Species 0.000 description 1
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 description 1
- 241000959199 Rasamsonia cylindrospora Species 0.000 description 1
- 102000018120 Recombinases Human genes 0.000 description 1
- 108010091086 Recombinases Proteins 0.000 description 1
- 101000968489 Rhizomucor miehei Lipase Proteins 0.000 description 1
- 241000235527 Rhizopus Species 0.000 description 1
- 101100394989 Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) hisI gene Proteins 0.000 description 1
- 101900354623 Saccharomyces cerevisiae Galactokinase Proteins 0.000 description 1
- 101100022918 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) sua1 gene Proteins 0.000 description 1
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 1
- 241000554265 Sphaerias Species 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 101100309436 Streptococcus mutans serotype c (strain ATCC 700610 / UA159) ftf gene Proteins 0.000 description 1
- 241000187432 Streptomyces coelicolor Species 0.000 description 1
- 108090000787 Subtilisin Proteins 0.000 description 1
- 235000021536 Sugar beet Nutrition 0.000 description 1
- 241000736854 Syncephalastrum Species 0.000 description 1
- 241000736855 Syncephalastrum racemosum Species 0.000 description 1
- 101100157012 Thermoanaerobacterium saccharolyticum (strain DSM 8691 / JW/SL-YS485) xynB gene Proteins 0.000 description 1
- 241001313536 Thermothelomyces thermophila Species 0.000 description 1
- 235000009430 Thespesia populnea Nutrition 0.000 description 1
- 241001494489 Thielavia Species 0.000 description 1
- 241001495429 Thielavia terrestris Species 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- 241000425897 Thysanophora <ascomycete> Species 0.000 description 1
- 102100033598 Triosephosphate isomerase Human genes 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150050575 URA3 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 1
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 1
- 235000010726 Vigna sinensis Nutrition 0.000 description 1
- 244000042314 Vigna unguiculata Species 0.000 description 1
- 241000209149 Zea Species 0.000 description 1
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 1
- 241000758405 Zoopagomycotina Species 0.000 description 1
- 102000005421 acetyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 238000001261 affinity purification Methods 0.000 description 1
- 108010050181 aleurone Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-DVKNGEFBSA-N alpha-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-DVKNGEFBSA-N 0.000 description 1
- 101150078331 ama-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 101150009206 aprE gene Proteins 0.000 description 1
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 1
- 235000021015 bananas Nutrition 0.000 description 1
- 101150103518 bar gene Proteins 0.000 description 1
- 108010051210 beta-Fructofuranosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 238000006065 biodegradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 229960005069 calcium Drugs 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 238000010924 continuous production Methods 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 239000008120 corn starch Substances 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 101150005799 dagA gene Proteins 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- FCRACOPGPMPSHN-UHFFFAOYSA-N desoxyabscisic acid Natural products OC(=O)C=C(C)C=CC1C(C)=CC(=O)CC1(C)C FCRACOPGPMPSHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019425 dextrin Nutrition 0.000 description 1
- MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N diethylene glycol Chemical compound OCCOCCO MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- NEKNNCABDXGBEN-UHFFFAOYSA-L disodium;4-(4-chloro-2-methylphenoxy)butanoate;4-(2,4-dichlorophenoxy)butanoate Chemical compound [Na+].[Na+].CC1=CC(Cl)=CC=C1OCCCC([O-])=O.[O-]C(=O)CCCOC1=CC=C(Cl)C=C1Cl NEKNNCABDXGBEN-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000035622 drinking Effects 0.000 description 1
- 238000009837 dry grinding Methods 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000007515 enzymatic degradation Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002615 epidermis Anatomy 0.000 description 1
- 239000000262 estrogen Substances 0.000 description 1
- 229940011871 estrogen Drugs 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 235000003599 food sweetener Nutrition 0.000 description 1
- 235000021433 fructose syrup Nutrition 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- IXORZMNAPKEEDV-UHFFFAOYSA-N gibberellic acid GA3 Natural products OC(=O)C1C2(C3)CC(=C)C3(O)CCC2C2(C=CC3O)C1C3(C)C(=O)O2 IXORZMNAPKEEDV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IXORZMNAPKEEDV-OBDJNFEBSA-N gibberellin A3 Chemical compound C([C@@]1(O)C(=C)C[C@@]2(C1)[C@H]1C(O)=O)C[C@H]2[C@]2(C=C[C@@H]3O)[C@H]1[C@]3(C)C(=O)O2 IXORZMNAPKEEDV-OBDJNFEBSA-N 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Polymers 0.000 description 1
- 108700014210 glycosyltransferase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920006158 high molecular weight polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000000413 hydrolysate Substances 0.000 description 1
- 239000001573 invertase Substances 0.000 description 1
- 235000011073 invertase Nutrition 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- TYQCGQRIZGCHNB-JLAZNSOCSA-N l-ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(O)=C(O)C1=O TYQCGQRIZGCHNB-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 1
- 229960000448 lactic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000021374 legumes Nutrition 0.000 description 1
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 1
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 238000003801 milling Methods 0.000 description 1
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- LPUQAYUQRXPFSQ-DFWYDOINSA-M monosodium L-glutamate Chemical compound [Na+].[O-]C(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O LPUQAYUQRXPFSQ-DFWYDOINSA-M 0.000 description 1
- 239000004223 monosodium glutamate Substances 0.000 description 1
- 235000013923 monosodium glutamate Nutrition 0.000 description 1
- 229930027945 nicotinamide-adenine dinucleotide Natural products 0.000 description 1
- BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N nicotinamide-adenine dinucleotide Chemical compound C1=CCC(C(=O)N)=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@@H](O2)N2C3=NC=NC(N)=C3N=C2)O)O1 BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N 0.000 description 1
- 101150105920 npr gene Proteins 0.000 description 1
- 101150017837 nprM gene Proteins 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 230000031787 nutrient reservoir activity Effects 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 108090000021 oryzin Proteins 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 101150019841 penP gene Proteins 0.000 description 1
- 210000002824 peroxisome Anatomy 0.000 description 1
- JTJMJGYZQZDUJJ-UHFFFAOYSA-N phencyclidine Chemical compound C1CCCCN1C1(C=2C=CC=CC=2)CCCCC1 JTJMJGYZQZDUJJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 108010082527 phosphinothricin N-acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 239000003375 plant hormone Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 238000007747 plating Methods 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 108091008395 polysaccharide binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000023848 polysaccharide binding proteins Human genes 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 235000012015 potatoes Nutrition 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 108060006613 prolamin Proteins 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 101150025220 sacB gene Proteins 0.000 description 1
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 1
- HFHDHCJBZVLPGP-UHFFFAOYSA-N schardinger α-dextrin Chemical compound O1C(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(O)C2O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC2C(O)C(O)C1OC2CO HFHDHCJBZVLPGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 239000013605 shuttle vector Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 239000010902 straw Substances 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 description 1
- 239000008399 tap water Substances 0.000 description 1
- 235000020679 tap water Nutrition 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N tungsten Chemical compound [W] WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010937 tungsten Substances 0.000 description 1
- 210000003934 vacuole Anatomy 0.000 description 1
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 1
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 1
- 230000004580 weight loss Effects 0.000 description 1
- 238000001238 wet grinding Methods 0.000 description 1
- 101150110790 xylB gene Proteins 0.000 description 1
- 229920001221 xylan Polymers 0.000 description 1
- 150000004823 xylans Chemical class 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/14—Preparation of compounds containing saccharide radicals produced by the action of a carbohydrase (EC 3.2.x), e.g. by alpha-amylase, e.g. by cellulase, hemicellulase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
- C12N9/2414—Alpha-amylase (3.2.1.1.)
- C12N9/2417—Alpha-amylase (3.2.1.1.) from microbiological source
- C12N9/242—Fungal source
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
- C12N9/2428—Glucan 1,4-alpha-glucosidase (3.2.1.3), i.e. glucoamylase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/02—Monosaccharides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/02—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
- C12P7/04—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
- C12P7/06—Ethanol, i.e. non-beverage
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01001—Alpha-amylase (3.2.1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01003—Glucan 1,4-alpha-glucosidase (3.2.1.3), i.e. glucoamylase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02E—REDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
- Y02E50/00—Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
- Y02E50/10—Biofuels, e.g. bio-diesel
Description
本発明は、炭水化物結合性モジュール (「CBM」) とα-アミラーゼ触媒ドメインとを含んでなる酵素に関する。さらに、本発明は、有効なα-アミラーゼ触媒ドメインおよび/またはCBMを含んでなる野生型α-アミラーゼポリペプチド、ならびに触媒ドメイン配列および/またはCBM配列に関する。本発明は、また、デンプンをより小さいオリゴ糖および/または多糖のフラグメントに分解するデンプン液化方法におけるこのようなポリペプチドの使用に関する。
デンプンを、甘み料としてまたは他の糖類の前駆体、例えば、フルクトースとして使用されるデンプン加水分解物、例えば、マルトース、グルコースまたは特にシロップに転化する、多数の酵素および方法が記載されてきている。また、グルコースを発酵させてエタノールまたは他の発酵生成物、例えば、クエン酸、グルタミン酸一ナトリウム、グルコン酸、グルコン酸ナトリウム、グルコン酸カルシウム、グルコン酸カリウム、グルコノデルタラクトン、エリトルビン酸ナトリウム、イタコン酸、乳酸、グルコン酸; ケトン; アミノ酸、グルタミン酸 (モノグルタミン酸ナトリウム) 、ペニシリン、テトラサイクリン; 酵素; ビタミン、例えば、リボフラビン、B12、β-カロテンまたはホルモンを生成することができる。
本発明者らは、炭水化物結合性モジュール (CBM) をある種のα-アミラーゼに添加することによって、活性および特異性を変更し、これにより種々のデンプン分解方法、例えば、生デンプン、例えば、非糊化デンプンおよび/または粒状デンプンの分解を含んでなる方法の効率を増加させることができることを驚くべきことには発見した。また、1つのCBMを他のCBMと交換することによって、活性および特異性を変更することができる。
(a) 配列番号14中のアミノ酸1〜441、配列番号18中のアミノ酸1〜471、配列番号20中のアミノ酸、配列番号20中のアミノ酸1〜450、配列番号22中のアミノ酸1〜445、配列番号26中のアミノ酸1〜498、配列番号28中のアミノ酸18〜513、配列番号30中のアミノ酸1〜507、配列番号32中のアミノ酸1〜481、配列番号34中のアミノ酸1〜495、配列番号38中のアミノ酸1〜477、配列番号42中のアミノ酸1〜449、配列番号115中のアミノ酸1〜442、配列番号117中のアミノ酸1〜441、配列番号125中のアミノ酸1〜477、配列番号131中のアミノ酸1〜446、配列番号157中のアミノ酸41〜481、配列番号159中のアミノ酸22〜626、配列番号161中のアミノ酸21〜630、配列番号163中のアミノ酸27〜602、配列番号165中のアミノ酸21〜643、配列番号167中のアミノ酸29〜566、配列番号169中のアミノ酸22〜613、配列番号171中のアミノ酸21〜463、配列番号173中のアミノ酸21〜587、配列番号175中のアミノ酸30〜773、配列番号177中のアミノ酸22〜586および配列番号179中のアミノ酸20〜582から成る群から選択される成熟ポリペプチドのアミノ酸と少なくとも75%の相同性を有するアミノ酸配列を有するポリペプチド;
それ以上の面において、本発明は、デンプンを第1、第2および/または第3の面のポリペプチドで処理する、デンプンを糖化する方法に関する。
(a) α-アミラーゼ活性を有する触媒モジュールと炭水化物結合性モジュールとを含んでなるポリペプチド、例えば、第1、第2および/または第3の面のポリペプチドをデンプンと接触させ、
(b) 前記デンプンを前記ポリペプチドとインキュベートし、
(c) 発酵させて発酵生成物を生成し、そして
(d) 必要に応じて発酵生成物を回収し、
ここでグルコアミラーゼ活性を有する酵素は不存在であるか、あるいは0.5 AGU/g DS以下またはより少ないデンプン基質の量で存在し、そして工程a、b、cおよび/またはdを同時にまたは別々に実施する。
(a) α-アミラーゼ活性を有する触媒モジュールと炭水化物結合性モジュールとを含んでなるポリペプチド、例えば、第1、第2および/または第3の面のポリペプチドを発現するように形質転換された酵母とデンプン基質を接触させ、
(b) 前記デンプン基質を前記酵母と保持し、
(c) 発酵させてエタノールを生成させ、そして
(d) 必要に応じてエタノールを回収し、
ここで工程a、b、cおよび/またはdを同時にまたは別々に実施する。好ましい態様において、前記デンプン基質の少なくとも90% w/wを発酵可能な糖に転化するために十分な時間の間および温度において、デンプン基質を前記酵母と保持する。
(i) α-アミラーゼ活性を有する触媒モジュールと炭水化物結合性モジュールとを含んでなるポリペプチド、例えば、第1、第2および/または第3の面のポリペプチドでデンプン含有物質を液化し、
(ii) 得られた液化マッシュを糖化し、そして
(iii) 工程 (ii) において得られた物質を発酵生物の存在下に発酵させ、そして必要に応じてエタノールを回収する。
用語 「粒状デンプン」 は、原料の生デンプン、すなわち、糊化されていないデンプンとして理解される。デンプンは水中に不溶性である小さい粒体として植物中で形成される。これらの粒体は初期糊化温度より低い温度においてデンプン中に保存される。冷水中に入れると、粒体は少量の液体を吸収する。50℃〜70℃まで、膨潤は可逆的であり、可逆性の程度は特定のデンプンに依存する。より高い温度において、糊化と呼ばれる不可逆的膨潤が開始する。
本発明のポリペプチドはハイブリッド酵素であることができるか、あるいはポリペプチドは既にα-アミラーゼ活性を有する触媒モジュールと炭水化物結合性モジュールとを含んでなる野生型酵素であることができる。本発明のポリペプチドは、また、このような野生型酵素の変異型であることができる。ハイブリッドは、第1アミノ酸配列をコードする第1 DNA配列および第2 アミノ酸配列をコードする第2 DNA配列の融合により製造することができるか、あるいはハイブリッドは適当なCBM、リンカーおよび触媒ドメインのアミノ酸配列の知識に基づいて完全に合成された遺伝子として製造することができる。
本明細書において言及するポリペプチドは、炭水化物結合性モジュール (CBM) を含んでなるアミノ酸配列に結合した (すなわち、共有結合した) α-アミラーゼ酵素 (EC 3.2.1.1) のアミノ酸配列を含んでなる種を包含する。
本発明は、CBM、リンカーおよび/または触媒モジュールのドナー (親アミラーゼ) として有効なα-アミラーゼポリヌクレオチドプローブに関する。本発明のポリペプチドは、野生型α-アミラーゼ酵素 (EC 3.2.1.1) であることができるか、あるいはポリペプチドは、また、野生型酵素の変異型であることができる。さらに、本発明のポリペプチドはこのような酵素のフラグメント、すなわち、酸性α-アミラーゼを有するが、CBMが野生型酵素中に存在する場合、CBM、例えば、CBMから分離されているフラグメント、すなわち、炭水化物結合性モジュールを有するフラグメントであることができる。また、フラグメントは、このようなα-アミラーゼ酵素のフラグメントを含んでなる、例えば、触媒ドメイン、リンカーおよび/または本発明のα-アミラーゼ酵素に由来するCBMを含んでなる、ハイブリッド酵素であることができる。
サーモミセス・ラヌギノスス (Thermomyces lanuginosus); 特に配列番号14中のアミノ酸1〜441を有するポリペプチド、
マルブランチケア (Malbranchea) 種; 特に配列番号18中のアミノ酸1〜471を有するポリペプチド、
リゾムコル・プシルス (Rhizomucor pusillus) ; 特に配列番号20中のアミノ酸1〜450を有するポリペプチド、
ジコトモクラジウム・ヘッセルチネイ (Dichotomocladium hesseltinei); 特に配列番号22中のアミノ酸1〜445を有するポリペプチド、
ステレウム (Stereum) 種; 特に配列番号26中のアミノ酸1〜498を有するポリペプチド、
トラメテス (Trametes) 種; 特に配列番号28中のアミノ酸18〜513を有するポリペプチド、
コリオルス・コンソルス (Coriolus consors) ; 特に配列番号30中のアミノ酸1〜507を有するポリペプチド、
クリプトスポリオプシス (Cryptosporiopsis) 種; 特に配列番号34中のアミノ酸1〜495を有するポリペプチド、
ジプロジア (Diplodia) 種; 特に配列番号38中のアミノ酸1〜477を有するポリペプチド、
グリオクラジウム (Gliocladium) 種; 特に配列番号42中のアミノ酸1〜449を有するポリペプチド、
ネクトリア (Nectria) 種; 特に配列番号115中のアミノ酸1〜442を有するポリペプチド、
フザリウム (Fusarium) 種; 特に配列番号117中のアミノ酸1〜441を有するポリペプチド、
テルモアスカス・アウランチカス (Thermoascus auranticus); 特に配列番号125中のアミノ酸1〜477を有するポリペプチド、
タミンジウム・エレガンス (Thamindium elegans); 特に配列番号131中のアミノ酸1〜446を有するポリペプチド、
アクレモニウム (Acremonium) 種; 特に配列番号159中のアミノ酸22〜626を有するポリペプチド、
コニオケタ (Coniochaeta) 種; 特に配列番号161中のアミノ酸24〜630を有するポリペプチド、
メリピルス・ギアンテウス (Meripilus giganteus); 特に配列番号163中のアミノ酸27〜602を有するポリペプチド、
ペニシリウム (Penicillium) 種; 特に配列番号165中のアミノ酸21〜643を有するポリペプチド、
ストレプトマイセス・リモスス (Streptomyces limosus) ; 特に配列番号167中のアミノ酸29〜566を有するポリペプチド、
スブリスポラ・プロクルバタ (Sublispora procurvata); 特に配列番号169中のアミノ酸22〜613を有するポリペプチド、
トラメテス・クルガタ (Trametes currgata) ; 特に配列番号173中のアミノ酸21〜587を有するポリペプチド、
トリコフェア・サッカタ (Trichophaea saccata); 特に配列番号175中のアミノ酸30〜773を有するポリペプチド、
バルサリア・ルブリコサ (Valsaria rubricosa) ; 特に配列番号177中のアミノ酸22〜586を有するポリペプチドおよびバルサリア・スパルチイ (Valsaria spartii); 特に配列番号179中のアミノ酸20〜582を有するポリペプチド。
触媒ドメイン、すなわち、α-アミラーゼ触媒ドメイン (特に酸安定性α−アミラーゼ) は、本発明の型のポリペプチドの構築に適当であり、任意の生物に由来することができ、真菌または細菌由来のものは好ましい。
アスペルギルス (Aspergillus) (配列番号2) 、アスペルギルス・オリゼ (Aspergillus oryzae) (配列番号4および配列番号6) 、トリコフェレア・サッカタ (Trichopheraea saccata) (配列番号8) 、スブリスポラ・プロクルバタ (Sublispora procurvata) (配列番号10) 、バルサリア・ルブリコサ (Valsaria rubricosa) (配列番号12) 、サーモミセス・ラヌギノスス (Thermomyces lanuginosus) (配列番号14) 、アクレモニウム (Acremonium) 種 (配列番号16) 、マルブランチケア (Malbranchea) 種 (配列番号18) 、
リゾムコル・プシルス (Rhizomucor pusillus) (配列番号20) 、ジコトモクラジウム・ヘッセルチネイ (Dichotomocladium hesseltinei) (配列番号22) 、メリピルス・ギガンテウス (Meripilus giganteus) (配列番号24) 、ステレウム (Stereum) 種AMY1179 (配列番号26) 、トラメテス (Trametes) 種 (配列番号28) 、コリオルス・センソルス (Coriolus censors) (配列番号30) 、ジネマスポリウム (Dinemasporium) 種 (配列番号32) 、クリプトスポリオプシス (Cryptosporiopsis) 種 (配列番号34) 、コニオケタ (Coniochaeta) 種 (配列番号36) 、ジプロジア (Diplodia) 種 (配列番号38) 、ネクトリア (Nectria) 種 (配列番号40) 、グリオクラジウム (Gliocladium) 種 (配列番号42) 、ストレプトマイセス・サーモシアネオビオラセウス (Streptomyces thermocyaneoviolaceus) (配列番号44) 、テルモアスカス (Thermoascus) 種II (配列番号111) 、コニオケタ (Coniochaeta) 種 (配列番号113) 、ネクトリア (Nectria) 種 (配列番号115) 、
リンカー配列は、任意の適当なリンカー配列、例えば、α-アミラーゼまたはグルコアミラーゼに由来するリンカー配列であることができる。リンカーは結合であるか、あるいは約2〜約100炭素原子、特に2〜40炭素原子を含んでなる短い結合基であることができる。しかしながら、リンカーは約2〜約100アミノ酸残基、より好ましくは4〜40アミノ酸残基、例えば、6〜15アミノ酸残基の配列である。
炭水化物結合性モジュール (CBM) 、またはしばしば言及するように、炭水化物結合性ドメイン (CBD) は、多糖またはオリゴ糖 (炭水化物) に優先的に結合し、頻繁に、しかし必ずしも独占的にではなく、それらの水不溶性 (結晶質を包含する) 形態に結合するポリペプチドアミノ酸配列である。
CBMそれ自体を構成するポリペプチドまたはタンパク質 (例えば、加水分解酵素) の部分は、典型的には約30より多くかつ約250より少ないアミノ酸残基から成る。
アスペルギルス・アワモリ (Aspergillus awamori) (SWISSPROT Q12537) 、アスペルギルス・カワチイ (Aspergillus kawachii) (SWISSPROT P23176) 、アスペルギルス・ニガー (Aspergillus niger) (SWISSPROT P04064) 、アスペルギルス・オリゼ (Aspergillus oryzae) (SWISSPROT P36914) のグルコアミラーゼ、アスペルギルス・カワチイ (Aspergillus kawachii) (EMBL: #AB008370) およびアスペルギルス・ニヅランス (Aspergillus nidulans) (NCBI AAF17100.1) のα-アミラーゼ、バシラス・セレウス (Bacillus cereus) (SWISSPROT P36924) のβ‐アミラーゼ、またはバシラス・サーキュラン (Bacillus circulans) (SWISSPROT P43379) のCGTアーゼ。
好ましい態様において、ポリペプチドは、アテリア・ロルフシイ (Athelia rolfsii) 、パチキトスポラ・パピラセア (Pachykytospora papyracea) 、バルサリア・ルブリコサ (Valsaria rubricosa) またはメリピルス・ギガンテウス (Meripilus giganteus) に由来するCBMを含んでなる。下記から成る群から選択されるCBMアミノ酸配列を含んでなるポリペプチドは好ましい: アテリア・ロルフシイ (Athelia rolfsii) グルコアミラーゼ (配列番号92) 、パチキトスポラ・パピラセア (Pachykytospora papyracea) グルコアミラーゼ (配列番号76) 、バルサリア・ルブリコサ (Valsaria rubricosa) α-アミラーゼ (配列番号84) およびメリピルス・ギアンテウス (Meripilus giganteus) α-アミラーゼ (配列番号88) 。
本発明は、また、ポリペプチド、例えば、ハイブリッド酵素、野生型酵素または遺伝的に修飾された野生型酵素をコードするDNA配列、シグナルペプチド配列、および転写および翻訳停止シグナルを含んでなることができる組換え発現ベクターに関する。前述の種々のDNA配列および調節配列を一緒に結合して組換え発現ベクターを生成することができ、このような発現ベクターは、ポリペプチドエンコーディングDNA配列の挿入または置換を可能とする、1または2以上の好都合な制限部位を含むことができる。選択的に、本発明のDNA配列は、DNA配列または前記配列を含んでなるDNA構築物を発現に適当なベクター中に挿入することによって発現させることができる。発現ベクターをつくるとき、コーディング配列が発現に、かつ可能ならば分泌に、適当なコントロール配列に作用可能に連鎖されるように、コーディング配列はベクター中に位置する。
本発明のベクターは、形質転換された細胞の容易な選択を可能とする、1または2以上の選択可能なマーカーを含有することが好ましい。選択可能なマーカーは、その生成物が殺生物剤またはウイルスの耐性、重金属に対する耐性、栄養要求性株に対するプロトトロフィー、およびその他を提供する遺伝子である。
WO 00/24883に開示されているAMA1プラスミドベクターを複製するエピソームを使用することができる。
DNA構築物を含んでなるか、あるいはポリペプチドをコードするDNA配列を含んでなる、本発明の宿主細胞は、ポリペプチド、例えば、ハイブリッド酵素、野生型酵素または遺伝的に修飾された野生型酵素の組換え産生において宿主細胞として好都合に使用される。この細胞を発現ベクターで形質転換することができる。選択的に、宿主染色体中にDNA構築物 (1または2以上のコピー) を組込むことによって、ポリペプチド、例えば、ハイブリッド酵素、野生型酵素または遺伝的に修飾された野生型酵素をコードする本発明のDNA構築物で細胞を形質転換することができる。宿主染色体中へのDNA構築物の組込みは、慣用法、例えば、相同的または異種的組換えにより実施することができる。
フィラメント状真菌宿主細胞は、この分野において知られている方法におけるプロトプラストの形成、プロトプラストの形質転換、および細胞壁の再生を包含する方法により形質転換することができる。アスペルギルス (Aspergillus) 宿主細胞に適当な形質転換手順は下記の文献に開示されている: EP 238 023、EP 184 438およびYelton 他、1984、Proceedings of the National Academy of Sciences USA 81: 1470-1474。フザリウム (Fusarium) 種に適当な形質転換法は下記の文献に開示されている: Malardier 他、1989、Gene 78: 147-156または米国特許第6,060,305号。
問題のポリペプチドをコードするDNA配列を単離またはクローニングするために使用する技術はこの分野において知られており、そしてゲノムDNAからの単離、cDNAからの調製、またはそれらの組合わせを包含する。このようなゲノムDNAからの本発明のDNA配列のクローニングは、例えば、広く知られているポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) または構造的特徴を共有するクローニングされたDNAフラグメントを検出する発現ライブラリーの抗体スクローニングを使用することによって、実施することができる。例えば、下記の文献を参照のこと:Innis 他、PCR: A Guide to Methods and Application、Academic Press、New York。他のDNA増幅手法、例えば、リガーゼ連鎖反応 (LCR) 、結合活性化転写 (LAT) およびDNA配列配列決定に基づく増幅 (NASBA) を使用することができる。
本発明は、なかでも、α-アミラーゼ活性を有する触媒モジュールのアミノ酸配列と、炭水化物結合性モジュールのアミノ酸配列とを含んでなるポリペプチド、例えば、ハイブリッド酵素、野生型酵素または遺伝的に修飾された野生型酵素をコードするDNA配列を含んでなる単離されたDNA配列に関し、ここで触媒モジュールは真菌由来である。
本発明は、なかでも、ポリペプチド、例えば、α-アミラーゼ活性を有する触媒モジュールを含んでなる第1アミノ酸配列と、炭水化物結合性モジュールを含んでなる第2 アミノ酸配列とを含んでなるハイブリッド酵素; またはα-アミラーゼ活性を有する触媒モジュールを含んでなる第1アミノ酸配列と、炭水化物結合性モジュールを含んでなる第2 アミノ酸配列とを含んでなる野生型酵素をコードするDNA配列を含んでなるDNA構築物に関する。「DNA構築物」 は、天然に存在する遺伝子から単離されるか、あるいはそうでなければ天然に存在しないような方法で組合わせかつ並置された、DNAのセグメントを含有するように修飾された、一本鎖または二本鎖のDNA分子として定義される。用語 「DNA構築物」 は、DNA構築物が本発明のコーディング配列の発現に要求されるすべての制御配列を含有するとき、用語 「発現カセット」 と同義である。
いったん親α-アミラーゼをコードするDNA配列が単離され、かつ必要な突然変異部位が同定されると、合成オリゴヌクレオチドを使用して突然変異を導入することができる。これらのオリゴヌクレオチドは必要な突然変異部位をフランキングするヌクレオチド配列を含有する。特別の方法において、α-アミラーゼ遺伝子を担持するベクター中に、DNAの1本鎖ギャップ、すなわち、α-アミラーゼエンコーディング配列をつくる。次いで、必要な突然変異を支持する合成ヌクレオチドを1本鎖DNAの相同的部分にアニールする。
ランダム突然変異誘発は、問題の親α-アミラーゼの部分に好都合に局在化することができる。これは、例えば、酵素のある領域が酵素の所定の性質について特定の重要性を有することが同定されたとき、そして、修飾された酵素が改良された性質を有する変異型を生ずることが期待されるとき、好都合であることがある。このような領域は、親酵素の三次構造が解明されかつ酵素の機能に関係づけられたとき、通常同定することができる。
炭水化物結合性モジュール (「CBM」) と、α-アミラーゼ触媒モジュールとを含んでなる野生型またはハイブリッド酵素のデンプン分解方法における性能は、タンパク質操作、例えば、位置指定突然変異誘発、局在化ランダム突然変異誘発、親野生型酵素の新しい変異型の合成、または他の適当にタンパク質操作技術により改良することができる。
制御配列と適合性の条件下に適当な宿主細胞におけるコーディング配列の発現を指令する1または2以上の制御配列に作用可能に連鎖された核酸配列を含んでなる核酸構築物中に、宿主細胞のDNA中に導入すべきヌクレオチド配列を組込むことができる。
本発明は、また、ポリペプチドの組換え製造において好都合に使用される、本発明の核酸構築物を含んでなる本発明の組換え宿主細胞に関する。本発明のヌクレオチド配列を含んでなるベクターを宿主細胞中に導入して、ベクターを染色体組込み体としてまたは前述した自己複製染色体外ベクターとして維持する。
問題のポリペプチド、例えば、ハイブリッド酵素または野生型酵素の変異型または本発明のハイブリッドをコードするDNA配列は、後述するように形質転換し、トランスジェニック植物において発現させることができる。
この分野において知られている方法に従い、問題の酵素を発現するトランスジェニック植物または植物細胞を構築することができる。簡単に述べると、植物または植物部分は、問題の酵素をコードする1または2以上の発現構築物を植物宿主ゲノム中に組込み、生ずる修飾された植物または植物細胞をトランスジェニック植物または植物細胞に増殖することによって構築される。
本発明の第1面、第2面および/または第3面のポリペプチドは、糊化デンプンまたは粒状デンプン基質を水性媒質中においてハイブリッド酵素で処理する、デンプンの液化法において使用できる。第1、第2および/または第3の面のポリペプチドは、また、液化デンプン基質の糖化方法において使用できる。好ましい使用は発酵方法においてであり、ここでデンプン基質を第1、第2および/または第3の面のポリペプチドの存在下に液化および/または糖化して、グルコースおよび/またはマルトースを製造し、これらは発酵生物、好ましくは酵母による発酵生成物への転化に適する。
前述の組成物は、0.01〜10 AFAU/g DS、好ましくは0.1〜5 AFAU/g DS、より好ましくは0.5〜3 AFAU/g DS、最も好ましくは0.3〜2 AFAU/g DSの量で存在する酸性α-アミラーゼを含んでなることが好ましい。組成物は前述の任意の方法において適用できる。
酸性α-アミラーゼ活性の決定
本発明に従い使用するとき、酸安定性α-アミラーゼの活性は、酵素標準に関して決定されるAFAU (酸性真菌α-アミラーゼ単位) で測定することができる。1 AFAUは後述する標準条件下に1時間当たり5.260 mgのデンプン乾燥固体を分解する酵素の量として定義される。
基質: デンプン、ほぼ0.17 g/L
緩衝剤: クエン酸塩、ほぼ0.03 M
ヨウ素 (I2): 0.03 g/L
CaCl2: 1.85 mM
pH: 2.50±0.05
インキュベーション温度: 40℃
反応時間: 23秒
波長: 590 nm
酵素濃度: 0.025 AFAU/mL
酵素使用範囲: 0.01〜0.04 AFAU/mL
グルコアミラーゼ活性はアミログリコシダーゼ単位 (AGU) で測定することができる。AGUは標準条件: 37℃、pH 4.3、基質: マルトース 23.2 mM、緩衝液: 酢酸塩 0.1 M、反応時間: 5分において、1分当たり1 μMのマルトースを加水分解する酵素の量として定義される。
基質: マルトース 23.2 mM
緩衝液: 酢酸塩 0.1 M
pH: 4.30±0.05
インキュベーション温度: 37℃±1
反応時間: 5分
酵素使用範囲: 0.5〜4.0 AUG/mL
GlucDH: 430 U/L
ムタロターゼ: 9 U/L
NAD: 0.21 mM
緩衝液: リン酸塩 0.12 M;
0.15 M NaCl
pH: 7.60±0.05
インキュベーション温度: 37℃±1
反応時間: 5分
波長: 340 nm
大腸菌 (E. coli) DH12S (入手先: Gibco BRL) を酵母プラスミドレスキュウーのために使用した。
10×基本溶液: 酵母窒素塩基w/oアミノ酸 (DIFCO) 66.8 g/l、コハク酸塩 100 g/l、NaOH 60 g/l。
SC-グルコース: 20%のグルコース (すなわち、2%の最終濃度 = 2 g/100 ml) 100 ml、5%のトレオニン 4 ml/l、1%のトリプトファン 10 ml/l、20%のカザミノ酸 25 ml/l、10×基本溶液 100 ml/l。この溶液を0.20 μmの孔サイズのフィルターにより滅菌する。寒天およびH2O (ほぼ761 ml) を一緒にオートクレーブ処理し、そして別々に滅菌したSC-グルコース溶液を寒天溶液に添加する。
YPD: バクトペプトン 20 g/l、酵母エキス 10 g/l、20%のグルコース 100 ml/l。
PEG/LiAc溶液: 40%のPEG4000 50 ml、5 Mの酢酸リチウム 1 ml。
特記しない限り、DNAの操作および形質転換は、下記の文献に記載されている分子生物学の標準的方法を使用して実施した: Sambrook 他 (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Laboratory、ニューヨーク州コールドスプリングハーバー; Ausubel F. M. 他 (編者) “Current Protocols in Molecular Biology”、John Wiley & Sons、1995; Harwood C. R. およびCutting S. M. (編者) 。
酵母の形質転換を酢酸リチウム法により実施した。0.5 mlのベクター (制限エンドヌクレアーゼにより消化した) および1 μlのPCRフラグメントを混合する。氷上でYNG318コンピテント細胞を融解する。100 μlの細胞、DNA混合物および10 μlの担体DNA (Clontech) を12 mlのポリプロピレン管 (Falcon 2059) 中で混合する。0.6 mlのPEG/LiAc溶液を添加し、おだやかに混合する。30℃、200 rpmにおいて30分間インキュベートする。42℃ (熱ショック) において30分間インキュベートする。エッペンドルフ管に移し、5秒間遠心する。上清を除去し、3 mlのYPD中に溶解する。この細胞懸濁液を30℃、200 rpmにおいて45分間インキュベートする。この懸濁液をSC-グルコース平板に注ぎ、30℃において3日間インキュベートしてコロニーをつくる。酵母全DNAを下記の文献に記載されているRobzykおよびKassirの方法により抽出する: Nucleic Acids Research Vol. 20、No. 14 (1992) 3790。
DNA配列決定のための大腸菌 (E. coli) 形質転換をエレクトロポレーション (BIO-RAD Gene Pulser) により実施した。アルカリ性法 (Molecular Cloning、Cold Spring Harbor) またはキット (Qiagen(商標) Plasmd Kit) により、DNAプラスミドを調製した。ゲル抽出キット (Qiagen) により、DNAフラグメントを回収した。PTC-200 DNAエンジンにより、PCRを実施した。分析装置 (ABI PRISMTM 310 Genetic Analyzer) を使用して、すべてのDNA配列を決定した。
ベクターpLA1を適当な制限エンドヌクレアーゼで消化して、アスペルギルス・ニガー (A. niger) α-アミラーゼ触媒ドメインをコードする領域を切出した。プライマーP001 (配列番号104) およびP002 (配列番号105) を使用するPCRにより、リゾムコル・プシルス (Rhizomucor pusillus) α-アミラーゼ遺伝子を増幅し、増幅されたフラグメントを配列番号19として示す。
プライマーP003 (配列番号106) およびP004 (配列番号107) を使用するPCRにより、メリピルス・ギガンテウス (Meripilus giganteus) α-アミラーゼ遺伝子を増幅した。
DNAフラグメントをQiagenゲル抽出キットによりアガロースゲルから回収した。生ずる精製されたフラグメントおよび適当な 制限エンドヌクレアーゼで消化してアスペルギルス・ニガー (A. niger) α-アミラーゼ触媒ドメインをコードする領域を切出したベクターpLA1消化物を混合した。混合した溶液を、in vivo 組換えにより発現により、サッカロマイセス・セレビシエ (Saccharomyces cerevisiae) 中に導入してプラスミドpLAV022を構築した。
実施例1および2に記載するCBMをもつα-アミラーゼ遺伝子を含んでなる構築物を使用して、それぞれ、発現ベクターpAspV019およびpAspV022を構築した。2つのプラスミドpAspV019およびpAspV022は、アスペルギルス・ニヅランス (Aspergillus nidulans) トリオースリン酸イソメラーゼ非翻訳リーダー配列 (Pne2/tpi) およびアスペルギルス・ニガー (Aspergillus niger) アミログリコシダーゼターミネーター (Tamg) に融合した、アスペルギルス・ニガー (Aspergillus niger) 中性アミラーゼIIプロモーターに基づく発現カセットから成る。
本発明のポリペプチドを製造した: 選択した触媒ドメインをアテリア・ロルフシイ (Athelia rolfsii) グルコアミラーゼのリンカー-CBM領域に融合し、そして選択したCBM領域をC003アスペルギルス・オリゼ (Aspergillus oryzae) 触媒ドメインに結合した (フンガミルPE変異型) 。
変異型V008は、アテリア・ロルフシイ (Athelia rolfsii) グルコアミラーゼのC-末端に位置するリンカーおよびCBM領域と、トリコフェレア・サッカタ (Trichopheraea saccata) α-アミラーゼからのN-末端に位置するリンカー+CBMとの両方から構成されていた。
これら変異型は、デンプン、特に粒状デンプンに対して改良された活性を有する。
異なる投与量のタラロマイセス・エメルソニイ (Talaromyces emersonii) グルコアミラーゼを使用する小規模発酵において、ポリペプチドV019の性能を評価した。デンプン基質、583.3 gの粉砕トウモロコシを912.2 gの水に添加した。この混合物に、4.5 mlの1 g/Lのペニシリン溶液を補充した。このスラリーのpHを40%のH2SO4で5.0に調節した。DSレベルは二重反復実験において34.2±0.8%であると決定された。ほぼ5 gのこのスラリーを20 mlのバイアルに添加した。
熱安定性細菌α-アミラーゼ (LIQUOZYME XTM、Novozymes A/S) で液化したコーンスターチから製造したDE 11マルトデキストリンをMilli-QTM水中に溶解し、そして乾燥固形分 (DS) を30%に調節することによって、糖化用基質を製造した。密閉した2 mlのガラス製バイアル中で60℃および初期pH 4.3において連続的に攪拌しながら、糖化実験を実施した。2つの異なる投与量のCBMα-アミラーゼV019およびV022を標準的処理に上部にタラロマイセス・エメルソニイ (Talaromyces emersonii) グルコアミラーゼ0.35 AGU/g DSおよびアスペルギルス・ニガー (A. niger) α-アミラーゼ0.04 AFAU/g DSで適用した。
生デンプンSSF処理を小規模発酵において評価した。410 gの微粉砕トウモロコシ、590 mlの水道水、3.0 mlの1 g/lのペニシリンおよび1 gの尿素を混合することによって、35% DSの粒状デンプンスラリーを調製した。このスラリーを5 N NaOHでpH 4.5に調節し、そして5 gの試料を20 mlのバイアルに分配した。適当量の酵素を投与し、バイアルを酵母とともにインキュベートした。バイアルを32℃においてインキュベートした。各処理の9回の反復発酵を実施した。
実施例7a.
酵素および使用量を下記表に示す。A-AMGはアスペルギルス・ニガー (Aspergillus niger) グルコアミラーゼ組成物である。
酵素および使用量を下記表に示す。T-AMGはタラロマイセス・エメルソニイ (Talaromyces emersonii) グルコアミラーゼ組成物である。
下記の生物学的物質はブダペスト条約に従いDSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH 、Mascheroder Weg 1b、D-38124 Braunschweig DE) に寄託され、下記の受け入れ番号を与えられた:
Claims (64)
- α−アミラーゼ活性を有する触媒モジュールを含んで成る第1アミノ酸配列、及び炭水化物−結合モジュールを含んで成る第2アミノ酸配列を含んで成るポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、配列番号20で示されるリゾムコル・プシルス(Rhizomucor pusillus)α−アミラーゼの触媒ドメインに対して少なくとも85%の相同性を有する触媒ドメイン、並びに、配列番号92で示されるアテリア・ロルフシイ(Athelia rolfsii)グルコアミラーゼの炭水化物結合モジュール(CBM)及び配列番号96で示されるアスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)グルコアミラーゼのCBMから成る群から選択されるCBMに対して少なくとも85%の相同性を有するCBMを含んで成り、そして30〜35℃の温度及び4.0〜5.0のpHにおいて生デンプンを加水分解することができることを特徴とする前記ポリペプチド。
- 前記触媒ドメインの相同性が少なくとも90%である、請求項1に記載のポリペプチド。
- 前記触媒ドメインの相同性が少なくとも95%である、請求項1に記載のポリペプチド。
- 前記CBMの相同性が少なくとも90%である、請求項1に記載のポリペプチド。
- 前記CBMの相同性が少なくとも95%である、請求項1に記載のポリペプチド。
- リンカー配列が、前記第1アミノ酸列と第2アミノ酸配列との間に位置し、前記リンカー配列が、配列番号46、配列番号48、配列番号50、配列番号54、配列番号56、配列番号58、配列番号60、配列番号62、配列番号64、配列番号66、配列番号68、配列番号70、配列番号72、配列番号74、配列番号145、配列番号147、配列番号149、配列番号151及び配列番号52から成る群から選択されたいずれかのアミノ酸配列に対して少なくとも85%の相同性を有する請求項1〜5のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、配列番号20で示される触媒ドメインアミノ酸配列、配列番号72で示されるリンカー配列、及び配列番号96で示されるCBDアミノ酸配列から成る請求項1〜6のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、配列番号20で示される触媒ドメインアミノ酸配列、配列番号68で示されるリンカー配列、及び配列番号92で示されるCBDアミノ酸配列から成る請求項1〜6のいずれか1項に記載のポリペプチド。
- 液化のための請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- 糖化のための請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- 発酵を含んで成る工程における請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- 澱粉転換工程における請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- オリゴ糖の製造工程における請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- マルトデキストリン又はグルコースシロップの製造工程における請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- 燃料又は飲料エタノールの製造工程における請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- 飲料の製造工程における請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- 有機化合物の製造のための発酵工程における請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドの使用。
- 前記有機化合物が、クエン酸、アスコルビン酸、リシン又はグルタミン酸である、請求項17に記載の使用。
- 請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドを含んで成る生成物。
- 澱粉が、請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドにより処理される、澱粉の糖化方法。
- 澱粉を、デキストロース及び/又はマルトースを含むシロップに転換することを含んで成る請求項20に記載の方法。
- 前記澱粉が糊化された又は顆粒状澱粉である請求項20又は21に記載の方法。
- 前記糖化された澱粉が、発酵生成物を生成するために、発酵生物と接触される請求項20に記載の方法。
- 前記発酵生物が酵母であり、そして前記発酵生成物がエタノールである請求項20〜23のいずれか1項に記載の方法。
- 発酵産物の製造方法において、
(a)請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドと澱粉とを接触し;
(b)前記澱粉を、前記ポリペプチドと共にインキュベートし;そして
(c)発酵生成物を生成するために発酵する;
ことを含んで成る方法であって、
この方法において、グルコアミラーゼ活性を有する酵素が存在しないか、又は澱粉基質1gのDS当り0.5以下のAGU(すなわち、0.5 AGU/g DS以下)で存在し、そして上記段階(a)、(b)及び(c)を別々に又は同時に実施する、ことを特徴とする方法。 - 前記発酵生成物を回収する段階(d)をさらに含む、請求項25に記載の方法。
- 前記グルコアミラーゼの存在量が0.4 AGU/g DS以下である、請求項25又は26に記載の方法。
- 前記グルコアミラーゼの存在量が0.3 AGU/g DS以下である、請求項25又は26に記載の方法。
- 前記グルコアミラーゼの存在量が0.1 AGU/g DS以下である、請求項25又は26に記載の方法。
- 前記グルコアミラーゼの存在量が0.05 AGU/g DS以下である、請求項25又は26に記載の方法。
- 澱粉含有材料から発酵によりエタノールを製造するための方法であって、
(i)請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドと共に、前記澱粉含有材料を液化し;
(ii)得られる液化されたマッシュを糖化し、
(iii)発酵生物の存在下で、段階(ii)において得られた材料を発酵することを含んで成る方法。 - エタノールを回収することをさらに含んで成る請求項31に記載の方法。
- 前記糖化及び発酵が、同時糖化及び発酵工程(SSF工程)として行われる請求項31又は32に記載の方法。
- 段階(iii)の間にエタノール含有率が少なくとも7%に達する請求項31〜33のいずれか1項記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも8%に達する、請求項34に記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも9%に達する、請求項34に記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも10%に達する、請求項34に記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも11%に達する、請求項34に記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも12%に達する、請求項34に記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも13%に達する、請求項34に記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも14%に達する、請求項34に記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも15%に達する、請求項34に記載の方法。
- 前記エタノールの含有率が少なくとも16%に達する、請求項34に記載の方法。
- 酸性α−アミラーゼが、g DS当たり0.01〜10 AFAUの量で存在する、請求項31〜43のいずれか1項記載の方法。
- 前記酸性α−アミラーゼの量が0.1〜5 AFAUである、請求項44に記載の方法。
- 前記酸性α−アミラーゼの量が0.3〜2 AFAUである、請求項44又は45に記載の方法。
- 前記酸性α−アミラーゼ及びグルコアミラーゼが、0.1〜10(AFAU:AGU)の比で添加される請求項31〜46のいずれか1項に記載の方法。
- 前記AFAU:AGUの比が0.30〜5である、請求項47に記載の方法。
- 前記AFAU:AGUの比が0.5〜3である、請求項47に記載の方法。
- 請求項1〜8のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードするDNA。
- 請求項50に記載のDNAを含んで成るDNA構造体。
- 請求項51に記載のDNA構造体を担持する組換え発現ベクター。
- 請求項51に記載のDNA構造体又は請求項52に記載のベクターにより形質転換される宿主細胞。
- 微生物である請求項53に記載の宿主細胞。
- 前記微生物が細菌又は菌類細胞である請求項54に記載の宿主細胞。
- 前記微生物が酵母である請求項54に記載の宿主細胞。
- 前記微生物が、アスペルギラス(Aspergillus)からの株、タラロミセス(Talaromyces)からの株、又はトリコダーマ(Trichoderma)からの株である請求項54に記載の宿主細胞。
- 前記アスペルギラス(Aspergillus)がA. ニガー(A. niger)であり、前記タラロミセス(Talaromyces)がT. エメルソニ(T. emersonii)である請求項57に記載の宿主細胞。
- 植物細胞である請求項53に記載の宿主細胞。
- 請求項1〜8のいずれか1項記載のポリペプチドを含んで成る組成物。
- 前記組成物がさらに、グルコアミラーゼを含んで成る請求項60に記載の組成物。
- 前記グルコアミラーゼが、タラロミセスsp. (Talaromyces sp.)、アスペルギラスsp. (Aspergillus sp.)、トラメテスsp. (Trametes sp.)又はパキキトスポラsp. (Pachykytospora sp.)に由来する請求項61に記載の組成物。
- 前記グルコアミラーゼが、アスペルギラス・ニガー(Aspergillus niger)、タラロミセス・レイセタマス(Talaromyces leycettanus)、タラロミセス・ドゥポンチ(Talaromyces duponti)、タラロミセス・エメルソニ(Talaromyces emersonii)、トラメテス・シンギュラタ(Trametes cingulata)及びパキキトスポラ・パピラセア(Pachykytospora papyracea)から成る群から選択された種に起因する請求項61又は62に記載の組成物。
- 糊化された、一部糊化された、又は顆粒澱粉を液化し、そして/又は糖化するための請求項60〜63のいずれか1項に記載の組成物の使用。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US63861404P | 2004-12-22 | 2004-12-22 | |
US60/638,614 | 2004-12-22 | ||
US65061205P | 2005-02-07 | 2005-02-07 | |
US60/650,612 | 2005-02-07 | ||
PCT/US2005/046725 WO2006069290A2 (en) | 2004-12-22 | 2005-12-22 | Enzymes for starch processing |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2008525036A JP2008525036A (ja) | 2008-07-17 |
JP5452869B2 true JP5452869B2 (ja) | 2014-03-26 |
Family
ID=36602341
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2007548501A Active JP5160899B2 (ja) | 2004-12-22 | 2005-12-22 | グルコアミラーゼ活性を有するポリペプチドおよびそれらをコードするポリヌクレオチド |
JP2007548502A Active JP5452869B2 (ja) | 2004-12-22 | 2005-12-22 | デンプン加工法 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2007548501A Active JP5160899B2 (ja) | 2004-12-22 | 2005-12-22 | グルコアミラーゼ活性を有するポリペプチドおよびそれらをコードするポリヌクレオチド |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (5) | US20060148054A1 (ja) |
EP (3) | EP2365068B1 (ja) |
JP (2) | JP5160899B2 (ja) |
AR (1) | AR051864A1 (ja) |
AU (2) | AU2005319073B2 (ja) |
CA (2) | CA2592104C (ja) |
DK (3) | DK2365068T3 (ja) |
ES (3) | ES2552635T3 (ja) |
MX (2) | MX2007007107A (ja) |
WO (2) | WO2006069290A2 (ja) |
Families Citing this family (155)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2004106533A1 (en) | 2003-05-30 | 2004-12-09 | Novozymes A/S | Alcohol product processes |
ATE549403T1 (de) | 2003-06-25 | 2012-03-15 | Novozymes As | Enzyme zur stärkeverarbeitung |
US20090117630A1 (en) * | 2004-12-22 | 2009-05-07 | Novozymes A/S | Fermentation product processes |
US8841091B2 (en) | 2004-12-22 | 2014-09-23 | Novozymes Als | Enzymes for starch processing |
EP2365068B1 (en) * | 2004-12-22 | 2017-03-01 | Novozymes A/S | Enzymes for starch processing |
WO2007035730A2 (en) | 2005-09-20 | 2007-03-29 | Novozymes North America, Inc. | Process of producing a fermentation product |
US20080318284A1 (en) | 2005-12-22 | 2008-12-25 | Novozymes North America, Inc. | Processes for Producing a Fermentation Product |
WO2007109750A2 (en) | 2006-03-22 | 2007-09-27 | Novozymes North America, Inc. | Fermentation processes |
MX2008013100A (es) | 2006-04-19 | 2008-10-27 | Novozymes North America Inc | Polipeptidos que tienen actividad de glucoamilasa y polinucleotidos que los codifican. |
EP2032713B1 (en) * | 2006-06-15 | 2009-11-11 | Novozymes A/S | Processes for production of a starch hydrolysate |
CA2657998A1 (en) * | 2006-06-22 | 2007-12-27 | Novozymes A/S | Preparation of dough and baked products |
CN101668863B (zh) | 2007-04-24 | 2014-12-03 | 诺维信北美公司 | 使经预处理的含木质纤维素的材料解毒 |
ES2425596T3 (es) | 2007-09-03 | 2013-10-16 | Novozymes A/S | Detoxificación y reciclaje de soluciones de lavado utilizadas en el pretratamiento de materiales con contenido de lignocelulosa |
WO2009030728A2 (en) * | 2007-09-05 | 2009-03-12 | Novozymes A/S | Enzyme compositions with stabilizing constituent |
EP2242842A1 (en) * | 2008-02-14 | 2010-10-27 | Wageningen Universiteit | Nucleotide sequences coding for cis-aconitic decarboxylase and use thereof |
EP2271765A1 (en) | 2008-03-11 | 2011-01-12 | Danisco US Inc. | Use of rhizopus amylases in granular starch hydrolysis |
CN102027004A (zh) | 2008-05-16 | 2011-04-20 | 诺维信公司 | 具有α-淀粉酶活性的多肽和编码该多肽的多核苷酸 |
US8153006B1 (en) | 2008-06-05 | 2012-04-10 | Procorp Enterprises, Llc | Anaerobic treatment process for ethanol production |
EP2364363A2 (en) | 2008-06-23 | 2011-09-14 | Novozymes A/S | Processes for producing fermentation products |
CN102186982A (zh) * | 2008-08-20 | 2011-09-14 | 诺维信公司 | 生产发酵产物的方法 |
ES2480265T3 (es) | 2008-09-30 | 2014-07-25 | Novozymes North America, Inc. | Mejora de la hidrólisis enzimática de material que contiene lignocelulosa pretratado con granos secos de destilería |
ES2526867T3 (es) | 2008-11-20 | 2015-01-16 | Novozymes Inc. | Polipéptido que tiene actividad potenciadora amilolítica y polinucleótidos que codifican el mismo |
WO2010078391A2 (en) | 2008-12-30 | 2010-07-08 | Novozymes North America, Inc. | Improvement of enzymatic hydrolysis of pretreated lignocellulose-containing material with dissolved air flotation sludge |
WO2010078392A2 (en) | 2008-12-31 | 2010-07-08 | Novozymes North America, Inc. | Processes of producing fermentation products |
WO2010088447A1 (en) * | 2009-01-30 | 2010-08-05 | Novozymes A/S | Polypeptides having alpha-amylase activity and polynucleotides encoding same |
WO2010091221A1 (en) | 2009-02-06 | 2010-08-12 | Novozymes A/S | Polypeptides having alpha-amylase activity and polynucleotides encoding same |
JP5193905B2 (ja) * | 2009-03-04 | 2013-05-08 | 麒麟麦酒株式会社 | 穀類原料からのエタノールの製造方法 |
AU2010238649B2 (en) * | 2009-04-24 | 2013-11-21 | Novozymes North America, Inc. | Antistaling process for flat bread |
CN102471784A (zh) | 2009-07-07 | 2012-05-23 | 诺维信公司 | 用酶处理底物的方法 |
MX2012000322A (es) | 2009-07-17 | 2012-02-08 | Novozymes As | Metodo de analisis del decaimiento de la celulosa en la hidrolisis del material celulosico. |
CN102665425A (zh) | 2009-09-30 | 2012-09-12 | 诺维信公司 | 馒头制备方法和馒头改进组合物 |
ES2534066T3 (es) * | 2009-11-30 | 2015-04-17 | Novozymes A/S | Polipéptidos que tienen actividad de glucoamilasa y polinucleótidos que codifican los mismos |
CA2782154C (en) | 2009-11-30 | 2018-10-16 | Novozymes A/S | Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same |
CA2782036C (en) * | 2009-12-01 | 2019-01-15 | Novozymes A/S | Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same |
WO2011087836A2 (en) | 2009-12-22 | 2011-07-21 | Novozymes A/S | Pullulanase variants and uses thereof |
CN102884183B (zh) | 2010-01-04 | 2015-09-16 | 诺维信公司 | 趋于钙耗竭和酸性pH的α-淀粉酶的稳定化 |
WO2011092136A1 (en) | 2010-01-29 | 2011-08-04 | Novozymes A/S | Biogas production process with enzymatic pre-treatment |
WO2011100161A1 (en) | 2010-02-09 | 2011-08-18 | Novozymes North America, Inc. | Addition of alpha - glucosidase and cobalt for producing fermentation products from starch |
EP3070171B1 (en) | 2010-03-30 | 2018-06-13 | Novozymes A/S | Process for enhancing by-products from fermentation processes |
MX338068B (es) | 2010-04-14 | 2016-04-01 | Novozymes As | Polipeptidos que tienen actividad de glucoamilasa y polinucleotidos que codifican los mismos. |
DK2579727T3 (en) | 2010-06-11 | 2018-11-26 | Novozymes As | Enzymatic milk correction |
CN103068988A (zh) | 2010-06-25 | 2013-04-24 | 诺维信公司 | 具有启动子活性的多核苷酸 |
CN103068978B (zh) | 2010-06-25 | 2017-01-18 | 诺维信公司 | 具有前导序列功能的多核苷酸 |
US8802412B2 (en) | 2010-06-25 | 2014-08-12 | Novozymes A/S | Polynucleotides having promoter activity |
CN103140586A (zh) | 2010-08-02 | 2013-06-05 | 诺维信北美公司 | 产生发酵产物的方法 |
EP2638154B1 (en) * | 2010-11-08 | 2016-09-14 | Novozymes A/S | Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same |
US9309505B2 (en) * | 2010-11-08 | 2016-04-12 | Novozymes North America, Inc. | Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same |
BR112013012357A2 (pt) | 2010-11-19 | 2016-10-11 | Novozymes North America Inc | processos de produzir um produto de fermentação, de produzir um açúcar, de produzir uma dextrina e de produzir sacarose, e, composição |
EP2646558B1 (en) | 2010-11-30 | 2016-07-20 | Novozymes, Inc. | Promoters for expressing genes in a fungal cell |
WO2012078712A2 (en) | 2010-12-07 | 2012-06-14 | Vnomics Corp. | System and method for measuring and reducing vehicle fuel waste |
ES2673940T3 (es) | 2010-12-22 | 2018-06-26 | Novozymes North America, Inc. | Proceso para producir productos de fermentación a partir de materiales que contienen almidón |
WO2012093041A1 (en) | 2011-01-04 | 2012-07-12 | Novozymes A/S | Process for producing biogas from pectin and lignocellulose containing material |
EP2673368B1 (en) | 2011-02-07 | 2014-12-24 | Novozymes North America, Inc. | Process for liquefying starch in the presence of pyridoxamine |
EP2527448A1 (en) | 2011-05-23 | 2012-11-28 | Novozymes A/S | Simultaneous site-specific integrations of multiple gene-copies in filamentous fungi |
EP2527432A1 (en) | 2011-05-23 | 2012-11-28 | Novozymes A/S | Bi-directional cytosine deaminase-encoding selection marker |
US20140106427A1 (en) | 2011-06-28 | 2014-04-17 | Novozymes A/S | Biogas From Enzyme-Treated Bagasse |
EA201490216A1 (ru) * | 2011-07-06 | 2014-07-30 | Новозимс А/С | Варианты альфа-амилазы и кодирующие их полинуклеотиды |
US20140147895A1 (en) | 2011-07-22 | 2014-05-29 | Novozymes A/S | Processes for Pretreating Cellulosic Material and Improving Hydrolysis Thereof |
CA2846690A1 (en) | 2011-08-26 | 2013-03-07 | Novozymes A/S | Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same |
IN2014CN02469A (ja) | 2011-09-06 | 2015-06-19 | Novozymes As | |
US9994834B2 (en) | 2011-09-09 | 2018-06-12 | Novozymes A/S | Polynucleotides encoding polypeptides having alpha-amylase activity and methods of making the same |
US9567574B2 (en) | 2011-09-09 | 2017-02-14 | Novozymes A/S | Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same |
US9909112B2 (en) | 2011-09-30 | 2018-03-06 | Novozymes A/S | Polypeptides having alpha-amylase activity and polynucleotides encoding same |
WO2013044867A1 (en) | 2011-09-30 | 2013-04-04 | Novozymes A/S | Polypeptides having alpha-amylase activity and polynucleotides encoding same |
MX351762B (es) | 2011-10-11 | 2017-10-26 | Novozymes As | Variantes de glucoamilasas y polinucleotidos que las codifican. |
IN2014CN03467A (ja) * | 2011-10-11 | 2015-10-16 | Novozymes North America Inc | |
US8697412B2 (en) | 2011-11-28 | 2014-04-15 | Novozymes A/S | Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same |
IN2014CN04905A (ja) | 2011-12-02 | 2015-09-18 | Novozymes As | |
WO2013083801A2 (en) | 2011-12-09 | 2013-06-13 | Novozymes A/S | Biogas from substrates comprising animal manure and enzymes |
EP2794899A1 (en) | 2011-12-21 | 2014-10-29 | Novozymes, Inc. | Methods for determining the degradation of a biomass material |
ES2935920T3 (es) | 2012-03-30 | 2023-03-13 | Novozymes North America Inc | Procesos de elaboración de productos de fermentación |
US9856498B2 (en) | 2012-03-30 | 2018-01-02 | Novozymes A/S | Processes of producing fermentation products |
WO2013169645A1 (en) | 2012-05-11 | 2013-11-14 | Danisco Us Inc. | Use of alpha-amylase from aspergillus clavatus for saccharification |
EP2869698A1 (en) | 2012-07-06 | 2015-05-13 | Novozymes A/S | Liquid enzyme composition and method for enzyme recovery |
WO2014028436A1 (en) * | 2012-08-16 | 2014-02-20 | Danisco Us Inc. | Method of using alpha-amylase from aspergillus clavatus and isoamylase for saccharification |
EP2885409A1 (en) | 2012-08-17 | 2015-06-24 | Novozymes A/S | Methods for co-silencing expression of genes in filamentous fungal strains and uses thereof |
CN104540394A (zh) | 2012-08-17 | 2015-04-22 | 诺维信公司 | 热稳定天冬酰胺酶变体以及对其进行编码的多核苷酸 |
EP2893009A4 (en) | 2012-09-07 | 2016-03-02 | Novozymes As | GLUCOMAMYLASE VARIANTS AND POLYNUCLEOTIDES ENCODING THE SAME AND USES THEREOF |
JP2016501512A (ja) * | 2012-10-10 | 2016-01-21 | ダニスコ・ユーエス・インク | 糖化のためにタラロミセス・エメルソニ(TALAROMYCESEMERSONII)由来のα−アミラーゼを使用する方法 |
US9765317B2 (en) | 2012-12-17 | 2017-09-19 | Novozymes A/S | Alpha-amylases and polynucleotides encoding same |
CN103275952B (zh) * | 2012-12-23 | 2014-09-24 | 北京挑战生物技术有限公司 | 一种中温酸性淀粉酶amy-8及其基因和应用 |
WO2014161876A1 (en) | 2013-04-05 | 2014-10-09 | Novozymes A/S | Method of producing a baked product with alpha-amylase, lipase and phospholipase |
DK3372680T3 (da) * | 2013-04-30 | 2021-01-11 | Novozymes As | Glucoamylasevarianter og polynukleotider, som koder for dem |
WO2014177541A2 (en) | 2013-04-30 | 2014-11-06 | Novozymes A/S | Glucoamylase variants and polynucleotides encoding same |
CN105339501A (zh) | 2013-06-24 | 2016-02-17 | 诺维信公司 | 用于从发酵产物过程中回收油的方法以及用于生产发酵产物的方法 |
DK3022300T3 (en) | 2013-07-17 | 2018-10-22 | Novozymes As | : Pullulan chimeras and polynucleotides encoding them |
BR112016003339B1 (pt) | 2013-08-30 | 2023-02-14 | Novozymes A/S | Composição de enzima, e, processo de produção de um produto de fermentação a partir de material contendo amido |
EP3063282B1 (en) | 2013-09-11 | 2020-03-25 | Novozymes A/S | Processes for producing fermentation products |
US20160264927A1 (en) | 2013-10-28 | 2016-09-15 | Danisco Us Inc. | Large Scale Genetically Engineered Active Dry Yeast |
DK3097192T3 (en) | 2014-01-22 | 2018-11-19 | Novozymes As | PULLULANASE VARIATIONS AND POLYNUCLEOTIDES CODING THEM |
RU2019134734A (ru) * | 2014-02-07 | 2019-11-18 | Новозимс А/С | Композиции для получения глюкозных сиропов |
WO2015143144A1 (en) | 2014-03-19 | 2015-09-24 | Novozymes A/S | Method for enhancing activity of an x143 polypeptide |
EP3129478B1 (en) | 2014-04-10 | 2019-03-27 | Novozymes A/S | Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same |
BE1022042B1 (nl) | 2014-09-29 | 2016-02-08 | Puratos Nv | Verbeterde cakebeslagsoorten |
ES2743515T3 (es) | 2014-10-23 | 2020-02-19 | Novozymes As | Variantes de glucoamilasa y polinucleótidos que codifican las mismas |
JP6277108B2 (ja) * | 2014-10-31 | 2018-02-07 | 日本ジフィー食品株式会社 | 粒状乾燥食品及びその製造方法 |
US20170321237A1 (en) | 2014-12-01 | 2017-11-09 | Novozymes A/S | Improved Production of Glucose Syrups |
WO2016138437A1 (en) | 2015-02-27 | 2016-09-01 | Novozymes A/S | Processes of producing ethanol using a fermenting organism |
WO2016196202A1 (en) | 2015-05-29 | 2016-12-08 | Novozymes A/S | Polypeptides having protease activity and polynucleotides encoding same |
CA2981342A1 (en) | 2015-06-18 | 2016-12-22 | Novozymes A/S | Polypeptides having trehalase activity and the use thereof in process of producing fermentation products |
US20180208916A1 (en) | 2015-07-23 | 2018-07-26 | Novozymes A/S | Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same |
WO2017087330A1 (en) | 2015-11-17 | 2017-05-26 | Novozymes A/S | Yeast strains suitable for saccharification and fermentation expressing glucoamylase and/or alpha-amylase |
WO2017112533A1 (en) | 2015-12-22 | 2017-06-29 | Novozymes A/S | Process of extracting oil from thin stillage |
EP3526336A1 (en) | 2016-10-17 | 2019-08-21 | Novozymes A/S | Methods of reducing foam during ethanol fermentation |
RU2733294C1 (ru) | 2016-11-18 | 2020-10-01 | Балтика Брюэрис - Парт Оф Зе Карлсберг Груп | Способ получения зернового солода и солодовый продукт, полученный таким способом |
US10889836B2 (en) | 2016-11-23 | 2021-01-12 | Novozymes A/S | Yeast for ethanol production |
EP3545086A1 (en) | 2016-11-23 | 2019-10-02 | Novozymes A/S | Polypeptides having protease activity and polynucleotides encoding same |
US20210292723A1 (en) | 2016-11-29 | 2021-09-23 | Novozymes A/S | Alpha-Amylase Variants and Polynucleotides Encoding Same |
WO2018222990A1 (en) | 2017-06-02 | 2018-12-06 | Novozymes A/S | Improved yeast for ethanol production |
US11584783B2 (en) | 2017-06-28 | 2023-02-21 | Novozymes A/S | Processes for producing a fermentation product |
US11220679B2 (en) | 2017-08-08 | 2022-01-11 | Novozymes A/S | Polypeptides having trehalase activity |
EP3676386A1 (en) | 2017-08-30 | 2020-07-08 | Novozymes A/S | Combined use of an endo-protease of the m35 family and an exo-protease of the s53 family in the fermentation of starch |
CN111164214A (zh) | 2017-09-15 | 2020-05-15 | 诺维信公司 | 用于改进动物饲料营养质量的酶共混物和方法 |
EP3692150A1 (en) | 2017-10-04 | 2020-08-12 | Novozymes A/S | Polypeptides having protease activity and polynucleotides encoding same |
CA3075907A1 (en) | 2017-10-23 | 2019-05-02 | Novozymes A/S | Processes for reducing lactic acid in a biofuel fermentation system |
DE102017220757A1 (de) | 2017-11-21 | 2019-05-23 | Henkel Ag & Co. Kgaa | Amylase und eine solche enthaltendes Wasch- oder Reinigungsmittel |
CA3089135A1 (en) | 2018-01-29 | 2019-08-01 | Novozymes A/S | Microorganisms with improved nitrogen utilization for ethanol production |
MX2020008309A (es) | 2018-02-15 | 2020-10-14 | Novozymes As | Levadura mejorada para produccion de etanol. |
EP3775191A1 (en) | 2018-04-09 | 2021-02-17 | Novozymes A/S | Polypeptides having alpha-amylase activity and polynucleotides encoding same |
CN108611339B (zh) * | 2018-05-11 | 2021-05-25 | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 | 葡萄糖淀粉酶TlGa15及其基因和应用 |
DE102018208444A1 (de) | 2018-05-29 | 2019-12-05 | Henkel Ag & Co. Kgaa | Verbesserte Waschleistung durch eine neue alpha-Amylase aus Trametes hirsuta (Thi) |
DE102018208446A1 (de) | 2018-05-29 | 2019-12-05 | Henkel Ag & Co. Kgaa | Verbesserte Waschleistung durch eine neue alpha-Amylase aus Fomes fomentarius (Ffo) |
DE102018208443A1 (de) | 2018-05-29 | 2019-12-05 | Henkel Ag & Co. Kgaa | Verbesserte Waschleistung durch eine neue alpha-Amylase Irpex lacteus (IIa) |
DE102018208445A1 (de) | 2018-05-29 | 2019-12-05 | Henkel Ag & Co. Kgaa | Verbesserte Waschleistung durch eine neue alpha-Amylase aus Fomitopsis pinicola (Fpi) |
EP3810785A2 (en) | 2018-05-31 | 2021-04-28 | Novozymes A/S | Processes for enhancing yeast growth and productivity |
MX2020013319A (es) | 2018-06-12 | 2021-02-22 | Novozymes As | Menos azúcar añadido en productos horneados. |
US20210269833A1 (en) | 2018-07-11 | 2021-09-02 | Novozymes A/S | Processes for producing fermentation products |
CA3107110A1 (en) | 2018-07-25 | 2020-01-30 | Novozymes A/S | Enzyme-expressing yeast for ethanol production |
WO2020076697A1 (en) | 2018-10-08 | 2020-04-16 | Novozymes A/S | Enzyme-expressing yeast for ethanol production |
CN109385413B (zh) * | 2018-10-09 | 2021-03-26 | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 | 葡萄糖淀粉酶TlGA1931及其基因和应用 |
WO2020160126A1 (en) | 2019-01-31 | 2020-08-06 | Novozymes A/S | Polypeptides having xylanase activity and use thereof for improving the nutritional quality of animal feed |
US20220154226A1 (en) | 2019-03-18 | 2022-05-19 | Novozymes A/S | Polypeptides Having Pullulanase Activity Suitable For Use In Liquefaction |
EP3947701A1 (en) | 2019-04-02 | 2022-02-09 | Novozymes A/S | Process for producing a fermentation product |
WO2021007379A1 (en) | 2019-07-09 | 2021-01-14 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | Fat coated particulate enzyme compositions |
EP4004029A1 (en) | 2019-07-26 | 2022-06-01 | Novozymes A/S | Microorganisms with improved nitrogen transport for ethanol production |
BR112022002203A2 (pt) | 2019-08-05 | 2022-09-06 | Novozymes As | Misturas de enzimas e processos para produção de um ingrediente alimentar com alto teor de proteína a partir de um subproduto de vinhaça completa |
MX2021015818A (es) | 2019-08-06 | 2022-02-03 | Novozymes As | Proteinas de fusion para mejorar la expresion de enzimas. |
WO2021046073A1 (en) | 2019-09-05 | 2021-03-11 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | Feed composition |
EP4031661A1 (en) | 2019-09-16 | 2022-07-27 | Novozymes A/S | Polypeptides having beta-glucanase activity and polynucleotides encoding same |
BR112022011271A2 (pt) | 2019-12-10 | 2022-09-06 | Novozymes As | Célula hospedeira recombinante, composição, métodos para produzir um derivado de uma célula e um produto de fermentação, e, uso de uma célula hospedeira recombinante |
AR120775A1 (es) | 2019-12-16 | 2022-03-16 | Novozymes As | Procesos para obtener productos de fermentación |
EP4103709A2 (en) | 2020-02-10 | 2022-12-21 | Novozymes A/S | Polypeptides having alpha-amylase activity and polynucleotides encoding same |
MX2023004789A (es) | 2020-11-02 | 2023-05-09 | Novozymes As | Productos horneados y precocidos con variantes amiloglucosidasas y glucan 1,4-alfa-glucosidasa (amg) termoestables. |
MX2023004938A (es) | 2020-11-02 | 2023-05-17 | Novozymes As | Variantes de glucoamilasa y polinucleotidos que codifican las mismas. |
BR112023025624A2 (pt) | 2021-06-07 | 2024-02-27 | Novozymes As | Célula de levedura recombinante, célula hospedeira recombinante, composição, cocultura, métodos de produção de um derivado de uma célula hospedeira recombinante e de produção de um produto de fermentação, e, uso de uma célula hospedeira recombinante |
CA3232987A1 (en) | 2021-09-27 | 2023-03-30 | Marion BERNARDEAU | Feed additive compositions and methods for using the same |
CN113875916A (zh) * | 2021-10-08 | 2022-01-04 | 内蒙古工业大学 | 一种燕麦饮料及其制备方法 |
WO2023079050A1 (en) | 2021-11-04 | 2023-05-11 | Dsm Ip Assets B.V. | Recombinant yeast cell |
WO2023079048A1 (en) | 2021-11-04 | 2023-05-11 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for the production of ethanol and recombinant yeast cell |
WO2023122676A1 (en) * | 2021-12-24 | 2023-06-29 | Danisco Us Inc. | Hybrid glucoamylases and methods of use thereof |
WO2023213424A1 (en) | 2022-05-04 | 2023-11-09 | Novozymes A/S | Brewing with thermostable amg variants |
WO2023225459A2 (en) | 2022-05-14 | 2023-11-23 | Novozymes A/S | Compositions and methods for preventing, treating, supressing and/or eliminating phytopathogenic infestations and infections |
WO2023225510A1 (en) | 2022-05-17 | 2023-11-23 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | Feed additive comprising enzyme combinations |
WO2024046595A1 (en) | 2022-09-01 | 2024-03-07 | Novozymes A/S | Baking with thermostable amyloglucosidase (amg) variants (ec 3.2.1.3) and low added sugar |
WO2024046594A1 (en) | 2022-09-01 | 2024-03-07 | Novozymes A/S | Baking with thermostable amg glucosidase variants (ec 3.2.1.3) and low or no added emulsifier |
Family Cites Families (76)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4009074A (en) | 1975-03-13 | 1977-02-22 | Cpc International Inc. | Preparation of levulose from granular starch |
JPS5534046A (en) | 1978-09-01 | 1980-03-10 | Cpc International Inc | Novel glucoamyrase having excellent heat resistance and production |
JPS59140896A (ja) | 1983-01-17 | 1984-08-13 | Norin Suisansyo Shokuhin Sogo Kenkyusho | カララ属のカビの生産する酵素を用いた澱粉の糖化法 |
IE840161L (en) * | 1983-01-28 | 1984-07-28 | Nat Ditillers And Chemical Cor | GLUCOAMYLASE cDNA |
NO840200L (no) | 1983-01-28 | 1984-07-30 | Cefus Corp | Glukoamylase cdna. |
DK135983D0 (da) | 1983-03-25 | 1983-03-25 | Novo Industri As | Maltogen amylaseenzymprodukt og fremgangsmade til dets fremstilling og anvendelse |
US4760025A (en) | 1984-05-29 | 1988-07-26 | Genencor, Inc. | Modified enzymes and methods for making same |
US4536477A (en) | 1983-08-17 | 1985-08-20 | Cpc International Inc. | Thermostable glucoamylase and method for its production |
DE3475209D1 (en) | 1983-09-11 | 1988-12-22 | Gist Brocades Nv | Novel enzyme product and its use in the saccharification of starch |
US4587215A (en) | 1984-06-25 | 1986-05-06 | Uop Inc. | Highly thermostable amyloglucosidase |
ATE95837T1 (de) | 1984-08-06 | 1993-10-15 | Genencor Inc | Enzymatische hydrolyse von koerniger staerke direkt bis zu glukose. |
US4628031A (en) | 1984-09-18 | 1986-12-09 | Michigan Biotechnology Institute | Thermostable starch converting enzymes |
US4885249A (en) | 1984-12-05 | 1989-12-05 | Allelix, Inc. | Aspergillus niger transformation system |
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
JPS62126989A (ja) | 1985-11-26 | 1987-06-09 | Godo Shiyusei Kk | コルテイシウム属担子菌の生産する酵素を用いた澱粉質の無蒸煮糖化法 |
DK122686D0 (da) | 1986-03-17 | 1986-03-17 | Novo Industri As | Fremstilling af proteiner |
US4727046A (en) * | 1986-07-16 | 1988-02-23 | Fairchild Semiconductor Corporation | Method of fabricating high performance BiCMOS structures having poly emitters and silicided bases |
DE3886221T3 (de) | 1987-09-04 | 2000-12-21 | Novo Nordisk As | VERFAHREN ZUR HERSTELLUNG VON PROTEINPRODUKTEN IN -i(ASPERGILLUS) UND PROMOTOREN ZUR VERWENDUNG IN -i(ASPERGILLUS). |
US5137819A (en) | 1988-07-08 | 1992-08-11 | University Of British Columbia | Cellulose binding fusion proteins for immobilization and purification of polypeptides |
US5223409A (en) | 1988-09-02 | 1993-06-29 | Protein Engineering Corp. | Directed evolution of novel binding proteins |
IL97645A (en) | 1990-03-23 | 1997-03-18 | Gist Brocades Nv | Production of enzymes in seeds and their use |
DE69107455T3 (de) | 1990-05-09 | 2004-09-23 | Novozymes A/S | Eine ein endoglucanase enzym enthaltende zellulasezubereitung. |
US5162210A (en) | 1990-06-29 | 1992-11-10 | Iowa State University Research Foundation | Process for enzymatic hydrolysis of starch to glucose |
IL99552A0 (en) | 1990-09-28 | 1992-08-18 | Ixsys Inc | Compositions containing procaryotic cells,a kit for the preparation of vectors useful for the coexpression of two or more dna sequences and methods for the use thereof |
US5231017A (en) | 1991-05-17 | 1993-07-27 | Solvay Enzymes, Inc. | Process for producing ethanol |
US5496934A (en) | 1993-04-14 | 1996-03-05 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem | Nucleic acids encoding a cellulose binding domain |
US5861271A (en) | 1993-12-17 | 1999-01-19 | Fowler; Timothy | Cellulase enzymes and systems for their expressions |
DE4343591A1 (de) | 1993-12-21 | 1995-06-22 | Evotec Biosystems Gmbh | Verfahren zum evolutiven Design und Synthese funktionaler Polymere auf der Basis von Formenelementen und Formencodes |
US5605793A (en) | 1994-02-17 | 1997-02-25 | Affymax Technologies N.V. | Methods for in vitro recombination |
ES2165420T3 (es) | 1994-06-03 | 2002-03-16 | Novozymes Biotech Inc | Lacasas myceliophthora purificadas y acidos nucleicos que las codifican. |
US6060305A (en) | 1994-06-30 | 2000-05-09 | Novo Nordisk Biotech, Inc. | Non-toxic, non-toxigenic, non-pathogenic Fusarium expression system |
CN101659926A (zh) | 1994-06-30 | 2010-03-03 | 诺沃奇梅兹有限公司 | 非毒性、非产毒性、非致病性镰孢属表达系统及所用启动子和终止子 |
ES2329528T3 (es) | 1995-02-03 | 2009-11-26 | Novozymes A/S | Metodo para diseñar mutantes alfa-amilasa con propiedades determinadas. |
AR000862A1 (es) | 1995-02-03 | 1997-08-06 | Novozymes As | Variantes de una ó-amilasa madre, un metodo para producir la misma, una estructura de adn y un vector de expresion, una celula transformada por dichaestructura de adn y vector, un aditivo para detergente, composicion detergente, una composicion para lavado de ropa y una composicion para la eliminacion del |
US6093562A (en) | 1996-02-05 | 2000-07-25 | Novo Nordisk A/S | Amylase variants |
BR9708887B1 (pt) | 1996-04-30 | 2014-10-29 | Novozymes As | "variante de uma alfa-amilase, uso da mesma, construção de dna, vetor de expressão recombinante, célula de bactéria ou fungo, aditivo e composição detergente". |
US6537792B1 (en) * | 1996-07-24 | 2003-03-25 | Iowa State University | Protein engineering of glucoamylase to increase pH optimum, substrate specificity and thermostability |
JP4091119B2 (ja) | 1996-09-19 | 2008-05-28 | ノボザイムス アクティーゼルスカブ | 新規な宿主細胞およびタンパク質生産方法 |
DE69738587T2 (de) | 1996-09-30 | 2009-04-30 | Basf Plant Science Gmbh | Einkapselung von polypeptiden in die stärkematrix |
AU4551097A (en) * | 1996-10-11 | 1998-05-11 | Novo Nordisk A/S | Alpha-amylase fused to cellulose binding domain, for starch degradation |
ATE423192T1 (de) | 1997-10-13 | 2009-03-15 | Novozymes As | Mutanten der alpha-amylase |
DK1032654T3 (da) * | 1997-11-26 | 2009-05-11 | Novozymes As | Thermostabil glucoamylase |
WO1999028248A1 (en) | 1997-12-02 | 1999-06-10 | Rockwool International A/S | Processes for the production of man-made vitreous fibres |
DE29721138U1 (de) * | 1997-12-03 | 1999-04-08 | Iro Patent Ag | Fadenbremsvorrichtung |
NZ505820A (en) | 1998-02-27 | 2002-10-25 | Novozymes As | Enzyme variants based on the 3D structure of maltogenic alpha-amylase that have an altered pH optimum, thermostability, specific activity, cleavage pattern and ability to reduce the staling of bread |
US6352851B1 (en) * | 1998-07-15 | 2002-03-05 | Novozymes A/S | Glucoamylase variants |
MXPA01000352A (es) | 1998-07-15 | 2002-06-04 | Novozymes As | Varientes de glucoamilasa. |
DE69932345T2 (de) | 1998-10-26 | 2007-07-19 | Novozymes A/S | Erstellung und durchmusterung von interessierenden dna-banken in zellen von filamentösen pilzen |
EP1141371B1 (en) | 1998-12-23 | 2008-11-19 | Novozymes A/S | Methods for producing polypeptides in aspergillus mutant cells |
CN100482801C (zh) | 1999-03-22 | 2009-04-29 | 诺沃奇梅兹有限公司 | 用于在真菌细胞中表达基因的启动子 |
ES2496568T3 (es) | 1999-03-30 | 2014-09-19 | Novozymes A/S | Variantes de alfa-amilasa |
WO2000075296A1 (en) * | 1999-06-02 | 2000-12-14 | Novozymes A/S | Novel glucoamylase |
US7135619B1 (en) | 1999-06-11 | 2006-11-14 | Wageningen Universiteit | Expression in plants of starch binding domains and/or of protein-fusions containing starch binding domains |
AU5805700A (en) | 1999-07-09 | 2001-01-30 | Novozymes A/S | Glucoamylase variant |
CN1426463A (zh) | 2000-06-02 | 2003-06-25 | 诺维信公司 | 角质酶变体 |
EP1370648A2 (en) | 2000-08-01 | 2003-12-17 | Novozymes A/S | Alpha-amylase mutants with altered properties |
ITBO20010102A1 (it) | 2001-02-26 | 2002-08-26 | Gd Spa | Metodo ed unita' per la formazione di un cordone di tabacco |
AUPR968801A0 (en) * | 2001-12-21 | 2002-01-24 | Unisearch Limited | Improvements in enzyme stability |
CA2475416A1 (en) | 2002-02-08 | 2003-08-14 | Genencor International, Inc. | Methods for producing ethanol from carbon substrates |
ES2358991T3 (es) | 2002-02-08 | 2011-05-17 | Genencor International, Inc. | Procedimientos para producir productos finales a partir de sustratos de carbono. |
WO2004011218A1 (ja) | 2002-07-29 | 2004-02-05 | Tagawasangyo Co., Ltd. | 成形体表面の模様形成方法 |
ES2278210T3 (es) * | 2002-12-17 | 2007-08-01 | Novozymes A/S | Alfa-amilasas termoestables. |
EP1592711A1 (en) | 2003-02-06 | 2005-11-09 | Novozymes A/S | Human heavy chain antibody expression in filamentous fungi |
EP2166091A3 (en) | 2003-03-10 | 2015-06-10 | Novozymes A/S | Alcohol product processes |
MXPA05009553A (es) | 2003-03-10 | 2006-03-17 | Broin And Associates Inc | Metodo para producir etanol utilizando almidon como materia prima. |
ATE441664T1 (de) | 2003-03-31 | 2009-09-15 | Novozymes Inc | Verfahren zur produktion biologischer substanzen in enzymmangelmutanten von aspergillus niger |
WO2004111218A2 (en) * | 2003-06-13 | 2004-12-23 | Novozymes A/S | Method for producing glucoamylases and their uses |
WO2005003311A2 (en) * | 2003-06-25 | 2005-01-13 | Novozymes A/S | Enzymes for starch processing |
ATE549403T1 (de) | 2003-06-25 | 2012-03-15 | Novozymes As | Enzyme zur stärkeverarbeitung |
ES2340390T3 (es) * | 2003-10-28 | 2010-06-02 | Novozymes North America, Inc. | Enzimas hibridas. |
WO2006065579A2 (en) * | 2004-12-02 | 2006-06-22 | Novozymes North America, Inc. | Desizing process |
EP1831388A1 (en) * | 2004-12-22 | 2007-09-12 | Novozymes A/S | Starch process |
US20090117630A1 (en) * | 2004-12-22 | 2009-05-07 | Novozymes A/S | Fermentation product processes |
EP2365068B1 (en) * | 2004-12-22 | 2017-03-01 | Novozymes A/S | Enzymes for starch processing |
US20060147581A1 (en) * | 2004-12-22 | 2006-07-06 | Novozymes A/S | Hybrid enzymes |
US20060257964A1 (en) * | 2005-05-16 | 2006-11-16 | Biosafe Systems L.L.C. | Method of measuring the concentration of hydrogen peroxide, peroxyacetic acid, chlorinated compounds and other aqueous oxidizer compounds |
-
2005
- 2005-12-22 EP EP11162460.7A patent/EP2365068B1/en active Active
- 2005-12-22 AR ARP050105504A patent/AR051864A1/es active IP Right Grant
- 2005-12-22 JP JP2007548501A patent/JP5160899B2/ja active Active
- 2005-12-22 US US11/316,535 patent/US20060148054A1/en not_active Abandoned
- 2005-12-22 DK DK11162460.7T patent/DK2365068T3/en active
- 2005-12-22 DK DK05855307.4T patent/DK1831384T3/en active
- 2005-12-22 EP EP05855307.4A patent/EP1831384B1/en active Active
- 2005-12-22 CA CA2592104A patent/CA2592104C/en active Active
- 2005-12-22 MX MX2007007107A patent/MX2007007107A/es active IP Right Grant
- 2005-12-22 WO PCT/US2005/046725 patent/WO2006069290A2/en active Search and Examination
- 2005-12-22 EP EP05855308.2A patent/EP1831385B1/en active Active
- 2005-12-22 MX MX2007007030A patent/MX2007007030A/es active IP Right Grant
- 2005-12-22 JP JP2007548502A patent/JP5452869B2/ja active Active
- 2005-12-22 DK DK05855308.2T patent/DK1831385T3/en active
- 2005-12-22 ES ES05855307.4T patent/ES2552635T3/es active Active
- 2005-12-22 ES ES05855308.2T patent/ES2543131T3/es active Active
- 2005-12-22 US US11/315,730 patent/US7326548B2/en active Active
- 2005-12-22 ES ES11162460.7T patent/ES2621921T3/es active Active
- 2005-12-22 CA CA2591745A patent/CA2591745C/en active Active
- 2005-12-22 WO PCT/US2005/046724 patent/WO2006069289A2/en active Application Filing
- 2005-12-22 AU AU2005319073A patent/AU2005319073B2/en active Active
- 2005-12-22 AU AU2005319074A patent/AU2005319074B2/en active Active
-
2007
- 2007-10-15 US US11/872,355 patent/US20080090271A1/en not_active Abandoned
-
2009
- 2009-12-10 US US12/634,776 patent/US8148127B2/en active Active
-
2010
- 2010-12-20 US US12/973,113 patent/US8512986B2/en active Active
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5452869B2 (ja) | デンプン加工法 | |
US10316307B2 (en) | Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same | |
DK2507372T3 (en) | Polypeptides with glucoamylase activity and polynucleotides encoding them | |
US9777304B2 (en) | Enzymes for starch processing | |
CN104169417B (zh) | 具有葡糖淀粉酶活性的多肽及其编码多核苷酸 | |
JP2007526748A (ja) | 澱粉加工用酵素 | |
EP2336308A2 (en) | Enzymes for starch processing | |
CN106397601A (zh) | 用于淀粉加工的酶 | |
MX2008013100A (es) | Polipeptidos que tienen actividad de glucoamilasa y polinucleotidos que los codifican. | |
WO2007057018A2 (en) | Glucoamylase variants | |
US20160177343A1 (en) | Polypeptides Having Glucoamylase Activity and Polynucleotides Encoding Same | |
AU2011203101B2 (en) | Enzymes for starch processing |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20080513 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20081204 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20110628 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20110927 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20111004 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20111208 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20120911 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20121210 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20121217 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20130308 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20131203 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20140106 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5452869 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |