JP2018502097A - 二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法 - Google Patents

二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法 Download PDF

Info

Publication number
JP2018502097A
JP2018502097A JP2017534302A JP2017534302A JP2018502097A JP 2018502097 A JP2018502097 A JP 2018502097A JP 2017534302 A JP2017534302 A JP 2017534302A JP 2017534302 A JP2017534302 A JP 2017534302A JP 2018502097 A JP2018502097 A JP 2018502097A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
alkyl
certain embodiments
compound
cancer
independently
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
JP2017534302A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2018502097A5 (ja
JP6815318B2 (ja
Inventor
ジェイムス ブラドナー
ジェイムス ブラドナー
デニス バックリー
デニス バックリー
ジョージ ウィンター
ジョージ ウィンター
Original Assignee
ダナ ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド
ダナ ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ダナ ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド, ダナ ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド filed Critical ダナ ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド
Publication of JP2018502097A publication Critical patent/JP2018502097A/ja
Publication of JP2018502097A5 publication Critical patent/JP2018502097A5/ja
Priority to JP2020181254A priority Critical patent/JP6970802B2/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP6815318B2 publication Critical patent/JP6815318B2/ja
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D495/00Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having sulfur atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D495/02Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having sulfur atoms as the only ring hetero atoms in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D495/04Ortho-condensed systems
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/16Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for liver or gallbladder disorders, e.g. hepatoprotective agents, cholagogues, litholytics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/18Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for pancreatic disorders, e.g. pancreatic enzymes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/08Drugs for disorders of the urinary system of the prostate
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/10Drugs for disorders of the urinary system of the bladder
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/12Drugs for disorders of the urinary system of the kidneys
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P15/00Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D401/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom
    • C07D401/02Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing two hetero rings
    • C07D401/04Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing two hetero rings directly linked by a ring-member-to-ring-member bond
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D401/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom
    • C07D401/14Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing three or more hetero rings
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D471/04Ortho-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/12Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains three hetero rings
    • C07D471/14Ortho-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D475/00Heterocyclic compounds containing pteridine ring systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D487/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00
    • C07D487/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D487/04Ortho-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D495/00Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having sulfur atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D495/12Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having sulfur atoms as the only ring hetero atoms in which the condensed system contains three hetero rings
    • C07D495/14Ortho-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07JSTEROIDS
    • C07J43/00Normal steroids having a nitrogen-containing hetero ring spiro-condensed or not condensed with the cyclopenta(a)hydrophenanthrene skeleton
    • C07J43/003Normal steroids having a nitrogen-containing hetero ring spiro-condensed or not condensed with the cyclopenta(a)hydrophenanthrene skeleton not condensed

Landscapes

  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Reproductive Health (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)
  • Plural Heterocyclic Compounds (AREA)
  • Heterocyclic Carbon Compounds Containing A Hetero Ring Having Oxygen Or Sulfur (AREA)
  • Steroid Compounds (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本願は、タンパク質分解誘導部分として作用する二官能性化合物を提供する。本願は、増殖性障害の治療に利用することができる、セレブロン結合部分と標的タンパク質に結合することが可能なリガンドとを連結した二官能性化合物の使用による内因性タンパク質の標的化分解の方法にも関する。本願は本願の化合物及びその中間体を作製する方法も提供する。【選択図】なし

Description

[関連出願の相互参照]
本出願は2014年12月23日に出願の米国仮出願第62/096,318号、2015年3月4日に出願の米国仮出願第62/128,457号、2015年4月17日に出願された米国仮出願第62/149,170号、2015年5月8日に出願された米国仮出願第62/159,048号及び2015年7月7日に出願の米国仮出願第62/189,502号の恩典及び優先権を主張し、その全体が引用することにより本明細書の一部をなす。
ユビキチン−プロテアソーム経路(UPP)は主要調節タンパク質を調節し、ミスフォールドした又は異常なタンパク質を分解する重要な経路である。UPPは多数の細胞過程の中核を成し、欠損するか又は不均衡である場合に様々な疾患の病因となる。特異的タンパク質基質へのユビキチンの共有結合的付着は、E3ユビキチンリガーゼの作用によって達成される。これらのリガーゼは500種を超える異なるタンパク質を含み、それらのE3機能活性の構造要素によって規定される多数のクラスに分類される。
セレブロン(CRBN)は損傷DNA結合タンパク質1と相互作用し、カリン4とE3ユビキチンリガーゼ複合体を形成し、これが基質受容体として機能して、CRBNによって認識されるタンパク質がユビキチン化され、プロテアソームによって分解され得る。不必要な又は損傷したタンパク質のプロテアソーム媒介性分解は細胞生存、増殖及び成長等の細胞の正常な機能の維持において非常に重要な役割を果たす。CRBNの新たな役割が特定されている。すなわち、免疫調節薬(IMiD)、例えばサリドマイドのCRBNへの結合が現在、多発性骨髄腫患者の治療に広く使用されるレナリドミドを含むIMiDの催奇形性、更には細胞毒性と関連付けられている。CRBNは骨髄腫細胞の機能の維持に関与する因子の結合、ユビキチン化及び分解における中心的存在と考えられる。IMiD作用におけるCRBNの役割に関するこれらの新たな発見は、細胞の正常な機能の維持に関与するCRBNの下流の因子の徹底した調査を促している(非特許文献1)。
UPPは、標的タンパク質を人工的にユビキチン化するための融合タンパク質の使用及びプロテアソーム依存性分解を誘導するための合成小分子プローブの使用を含む、選択的タンパク質分解の誘導に使用されている。タンパク質分解誘導キメラ(Proteolysis Targeting Chimeras;PROTAC)である、標的タンパク質結合リガンド及びE3ユビキチンリガーゼリガンドから構成されるヘテロ二官能性化合物は、選択タンパク質のプロテアソーム媒介性分解をE3ユビキチンリガーゼへのそれらの動員及びその後のユビキチン化によって誘導した。これらの薬物様分子はタンパク質発現の時間的制御の可能性をもたらす。かかる化合物は、細胞に添加するか又は動物若しくはヒトに投与した際に対象のタンパク質の不活性化を誘導することが可能であり、生化学用試薬として有用であり、病原性又は発癌性タンパク質を除去することによる疾患の治療の新たなパラダイムをもたらし得る(非特許文献2、非特許文献3)。
Chang X. Int J Biochem Mol Biol. 2011; 2(3): 287-294 Crews C., Chemistry & Biology, 2010, 17(6):551-555 Schnnekloth JS Jr., Chembiochem, 2005, 6(1):40-46
癌等の様々な腫瘍性及び免疫学的障害の治療の成功は、未だほとんど満たされていない要求である。したがって、タンパク質分解技術を伴う療法の開発を含む、かかる障害を治癒又は治療する代替アプローチの進展の継続が依然として強い関心を集めている。潜在的標的及び異なる細胞株又は異なるin vivo系に関して既存の方法よりも一般的な性質の新規の方法が、将来の治療的処置の開発をもたらす可能性がある。
本願は、分解のために標的タンパク質をE3ユビキチンリガーゼへと動員するように機能する新規の二官能性化合物、並びにそれを調製及び使用する方法に関する。
本願は、セレブロン結合部分と標的タンパク質に結合するリガンドとを連結した二官能性分子を含む二官能性分子の使用によるタンパク質の標的化分解に更に関する。
本願は以下の構造:
デグロン−リンカー−標的指向性リガンド
を有する二官能性化合物であって、リンカーが少なくとも1つのデグロン及び少なくとも1つの標的指向性リガンドに共有結合し、デグロンがE3ユビキチンリガーゼ(例えばセレブロン)等のユビキチンリガーゼに結合することが可能な化合物であり、標的指向性リガンドが標的タンパク質(複数の場合もある)に結合することが可能である、二官能性化合物にも関する。
本願はサイズが小さく、分解のために標的タンパク質を動員する上で極めて効果的な新規の分解誘導部分、すなわちデグロンにも関する。
本願は式D0、D、D0’、D’、D1、D3、D’1、D’3、D0’I若しくはD0’II:
(式中、
、X、X、X、Y、R、R、R’、R、R、t、m及びnは各々本明細書で規定される通りである)を有する化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体に更に関する。
本願は式L0:
(式中、p1、p2、p3、W、Q及びZは各々本明細書で規定される通りである)を有するリンカー又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体に更に関し、該リンカーはQの隣の、
でデグロンに共有結合し、Zの隣の、
で標的指向性リガンドに共有結合する。
本願は、式TL−I〜TL−VIIの化合物を含む本明細書に記載される標的指向性リガンドに更に関する。
本願は式X0、X0’、X、XI、I、II、III、IV、X0’I若しくはX0’II:
(式中、リンカーは標的指向性リガンドに共有結合する基であり、Y及び標的指向性リガンドは標的タンパク質に結合することが可能であるか又は結合し、
、X、X、X、Y、R、R、R’、R、R、t、m及びnは各々本明細書で規定される通りである)の二官能性化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー、立体異性体若しくは薬学的に許容可能な塩に更に関する。
本願は、治療有効量の式X0、X0’、X、XI、I、II、III、IV、X0’I又はX0’IIの二官能性化合物と薬学的に許容可能な担体とを含む医薬配合物に更に関する。
本願は、治療有効量の式X0、X0’、X、XI、I、II、III、IV、X0’I又はX0’IIの二官能性化合物を、それを必要とする被験体に投与することによる標的タンパク質によって調節される疾患又は病態を治療する方法にも関する。或る特定の実施の形態では、疾患又は病態は標的指向性リガンドによる治療に耐性を示す。
本願は、標的タンパク質によって調節される疾患又は病態の治療のための式X0、X0’、X、XI、I、II、III、IV、X0’I又はX0’IIの二官能性化合物又は本願の医薬配合物の使用にも関する。或る特定の実施の形態では、疾患又は病態は標的指向性リガンドによる治療に耐性を示す。
本願は、標的タンパク質によって調節される疾患又は病態の治療のための薬剤の製造における式X0、X0’、X、XI、I、II、III、IV、X0’I若しくはX0’IIの二官能性化合物又は本願の医薬配合物の使用にも関する。或る特定の実施の形態では、疾患又は病態は標的指向性リガンドによる治療に耐性を示す。
本願は、治療有効量の式X0、X0’、X、XI、I、II、III、IV、X0’I又はX0’IIの二官能性化合物を、それを必要とする被験体に投与することによって癌を治療する方法にも関する。或る特定の実施の形態では、癌は標的指向性リガンドによる治療に耐性を示す。
本願は、癌の治療のための式X0、X0’、X、XI、I、II、III、IV、X0’I若しくはX0’IIの二官能性化合物又は本願の医薬配合物の使用にも関する。或る特定の実施の形態では、癌は標的指向性リガンドによる治療に耐性を示す。
本願は、癌の治療のための薬剤の製造における式X0、X0’、X、XI、I、II、III、IV、X0’I若しくはX0’IIの二官能性化合物又は本願の医薬配合物の使用にも関する。或る特定の実施の形態では、癌は標的指向性リガンドによる治療に耐性を示す。
本願の化合物及び方法は、例えば癌等の病原性又は発癌性の内因性タンパク質が役割を果たす疾患又は障害の治療における満たされていない要求に対処するものである。
他に規定のない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本願が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書において、文脈上明らかに他の指示がない限り単数形は複数形も含む。本明細書に記載されるものと同様又は同等の方法及び材料を本願の実施又は試験に用いることができるが、好適な方法及び材料を下記に説明する。本明細書で言及される全ての刊行物、特許出願、特許及び他の参照文献は引用することにより本明細書の一部をなす。本明細書で引用される参照文献は本願に対する従来技術であると認められるものではない。抵触の場合は、定義を含む本明細書が優先される。加えて、材料、方法及び例は一例にすぎず、限定を意図するものではない。
本願の他の特徴及び利点が以下の発明を実施するための形態及び特許請求の範囲から明らかである。
本願の上記の発明の概要及び以下の発明を実施するための形態は、添付の図面と併せて読むことでより良好に理解される。
dBET1の設計及び特性化を示す図である。図1AはJQ1(S)、JQ1(R)及びフタルイミドの化学構造を示す。図1BはdBET1の化学構造を示す。図1Cは指定の化合物についてAlphaScreenによって測定されたDMSO正規化BRD4結合シグナルを示す(値は三連分析の平均±標準偏差を表す)。図1DはBRD4のブロモドメイン1に結合したdBET1の結晶構造を示す。図1Eは公表されているDDB1−CRBN構造への図1D中の構造のドッキングを示す。図1Fは、指定の濃度のdBET1によるMV4−11細胞の18時間の処理後のBRD4及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図1GはBRD4に結合したJQ1の構造と重ね合わせた、BRD4に結合したdBET1の結晶構造を示す。図1Hは、増大濃度の本願の二官能性化合物dBET1での細胞の処理によるBRD4の分解及びc−MYCの低減の程度を示すウエスタンブロットである。 図2Aは、指定の濃度のdBET1(R)で18時間のMV4−11細胞の処理後のBRD4についてのイムノブロット分析を示す。図2Bは、指定の濃度のdBET1及びdBET1(R)で18時間処理したSUM149細胞において高含量アッセイによって決定される細胞数正規化BRD4レベルを示す(値は、DMSO処理細胞に対して正規化し、図2C中のイムノブロットに基づいてベースライン補正した三連分析の平均±標準偏差を表す)。図2Cは、指定の濃度のdBET1及びdBET1(R)で18時間のSUM149細胞の処理後のBRD4及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図2Dは、指定の時点で100nMのdBET1によるMV4−11細胞の処理後のBRD4及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図2Eは、ATPレベルによって決定されるMV4−11において24時間のdBET1及びJQ1処理の細胞生存能力用量応答を示す(値は四連分析の平均±標準偏差を表す)。図2Fは、MV4−11又はDHL4細胞における24時間の処理後のDMSO処理対照に対するcaspase gloアッセイによって判断されたアポトーシスの倍数増加の棒グラフ描写である(値は四連分析の平均±標準偏差を表す)。図2Gは、指定の濃度のdBET1による24時間の初代患者細胞の処理後のBRD4及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図2Hは、指定の濃度のdBET1又はJQ1のいずれかによる24時間の処理後のアネキシンV陽性初代患者細胞の画分の棒グラフ描写である(値は二連の平均及びエラーバーとしての範囲を表す)(代表的なカウンタープロット(counter plots)を図2L及び図2Mに示す)。図2I及び図2Jは、それぞれSUM159及びMOLM13における指定の濃度でのdBET1処理の18時間後のBRD4及びビンキュリンを示すイムノブロット分析である。図2Kは、100nMのdBET1による細胞の処理後の種々の時点でのBRD2、BRD3及びBRD4並びにc−Mycのイムノブロット分析を示す。図2Lは、指定の濃度のJQ1及びdBET1で24時間処理した初代患者細胞のアネキシンV/PIデータを示す一連のフローサイトメトリープロットである。図2Mは、指定の濃度のdBET1又はJQ1による処理後のアネキシンV陽性MV4−11細胞の棒グラフ描写である(データは三連分析の平均±標準偏差を表す)。図2Nは、指定の濃度のdBET1及びJQ1による24時間の処理後の切断カスパーゼ3、PARP切断及びビンキュリンのイムノブロット分析である。図2Oは、処理対照に対するアポトーシス(Caspase−GLO)へのBET分解の動態的利点を示す棒グラフである:MV4−1細胞を指定の濃度のJQ1又はdBET1で4時間又は8時間処理し、続いて薬物ウォッシュアウトを行った後、薬物無含有培地に24時間プレーティングした。図2Pは、caspase gloアッセイによって判断されたDMSO処理対照に対する指定の濃度のJQ1又はdBET1により4時間又は8時間処理したMV4−11細胞のアポトーシスの倍数増加の棒グラフ描写である(薬物をPBS(3×)でウォッシュアウトした後、24時間の最終処理期間にわたって薬物無含有培地にプレーティングした)。図2Qは、図2P中と同一の処理条件後の切断カスパーゼ3、PARP切断及びビンキュリンのイムノブロット分析である。 図3A〜図3DはBRD4のdBET1媒介性分解の化学的及び遺伝的救済(chemical and genetic rescue:化学的及び遺伝的保護)を示す。図3Aは、指定の濃度のdBET1、JQ1及びサリドマイドによる24時間のMV4−11細胞の処理後のBRD4及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図3Bは、DMSO、カルフィルゾミブ(0.4μM)、JQ1(10μM)又はサリドマイド(10μM)のいずれかによる4時間の前処理に続く、100nM濃度での2時間のdBET1処理後のBRD4及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図3Cは、1μM MLN4924による4時間の前処理に続く、指定の濃度での2時間のdBET1処理後のBRD4及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図3Dは、MM1SWT又はMM1SCRBN−/−の指定の濃度でのdBET1による18時間の処理後のBRD4、CRBN及びチューブリンについてのイムノブロット分析を示す。図3Eは、様々な濃度のサリドマイド、JQ1及びdBET1で処理した細胞におけるBRD4の濃度を比較するイムノブロット分析である。図3Fは、カルフィルゾミブ(400nM)、JQ1(20uM)又はサリドマイド(20uM)で4時間、指示通りにdBET1(100nM)で2時間処理した細胞におけるBRD4の濃度を示すイムノブロット分析である。 図4A〜図4Eは、発現プロテオミクスによる選択的BETブロモドメイン分解を示す:MV4−11細胞をDMSO、250nM dBET1又は250nM JQ1で2時間処理した。図4Aは、JQ1とDMSO処理とを比較する7429種のタンパク質の存在度の倍数変化、及びそれらのそれぞれのp値(T検定)を示す(三連分析からのデータ)。図4Bは、250nM dBET1とDMSO処理とを比較する7429種のタンパク質の存在度の倍数変化を示す(三連分析からのデータ)。図4Cは、DMSOに対して正規化されて示される選択タンパク質のタンパク質レベルにおける変化の棒グラフ描写である(値は三連の平均±標準偏差を表す)。図4DはDMSO、250nM dBET1又は250nM JQ1によるMV4−11細胞の2時間の処理後のBRD2、BRD3、BRD4、MYC、PIM1及びVINCのイムノブロット分析を示す。図4EはDMSO、250nM dBET1又は250nM JQ1によるMV4−11細胞の2時間の処理後のBRD2、BRD3、BRD4、MYC及びPIM1の転写レベルのqRT−PCR分析の棒グラフ描写である(値は三連の平均±標準偏差を表す)。図4Fは、MM1S細胞株におけるサリドマイド又は指定の濃度のdBET1による24時間の処理後のIKZF3及びビンキュリンについてのイムノブロット分析である。 図5Aは、100nMの本願の二官能性化合物dBET1と比較した様々な濃度のJQ1−Revで処理した細胞におけるBRD4の濃度を示すウエスタンブロットである。図5BはJQ1−Rev(JQI−11−079)の化学構造の図である。 図6A及び図6Bは、様々な濃度のJQ1又はdBETで処理した細胞の2時間(図6A)又は4時間(図6B)後にqRT−PCRによりアッセイしたBRD4の転写レベルを示す一連のグラフである。 増大濃度の本願の二官能性化合物dBET1でのヒト細胞株MM1S及びセレブロンが欠乏したヒト細胞株MM1Sの処理によるBRD4の分解の程度を示すウエスタンブロットである。 増大濃度の本願の二官能性化合物dBET2での細胞の処理によるBRD4の分解の程度を示すウエスタンブロットである。 図9Aは、増大濃度の本願の二官能性化合物dBET2での細胞の処理によるPLK1の低減を示すウエスタンブロットである。図9Bは、DMSO処理細胞におけるPLK強度に対するパーセンテージとしてdBET2処理細胞におけるPLK強度を示す棒グラフである。 FKBP12のdFKBP−1及びdFKBP−2媒介性分解を示す図である。図10AはdFKBP−1及びdFKBP−2の化学構造を示す。図10Bは、指定の化合物による18時間の処理後のFKBP12及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図10Cは、MV4−11細胞におけるDMSO、カルフィルゾミブ(400nM)、MLN4924(1μM)、SLF(20μM)又はサリドマイド(10μM)のいずれかによる4時間の前処理に続く、1μM濃度での4時間のdFKBP−1処理後のFKBP12及びビンキュリンについてのイムノブロット分析を示す。図10Dは、指定の濃度のdFKBP12による18時間の293FTWT又は293FTCRBN−/−の処理後のFKBP12、CRBN及びチューブリンについてのイムノブロット分析を示す。 図11Aは、シングルポイントスクリーニング(BromoScan)によって決定される他のヒトブロモドメインと比較したBETへの結合に対するdBET1の選択性を示す図である。図11Bは、組み換えBRD4ブロモドメインと組み換えCRBN−DDB1との間の(111nMでの)dBET1誘導近接性を測定する二量化アッセイからの結果を示す(値は四連分析の平均±標準偏差を表し、DMSOに対して正規化される)。図11Cは、全て最終濃度1μMのDMSO(ビヒクル)、JQ1(S)、thal−(−)、JQ1(R)及びthal−(+)の存在下でのdBET1誘導近接性の競合を示す棒グラフである(値は四連分析の平均±標準偏差を表し、DMSOに対して正規化される)。 図12Aは、14日間の処理期間にわたるビヒクル処理マウス(n=5)又は濃度50mg/kgのdBET1で処理したマウス(n=6)の腫瘍体積を示す棒グラフである。図12Bは、図12Aに示される14日目の実験終了後の腫瘍重量を比較する棒グラフである。図12Cはビヒクル処理対照と比較した、4時間で1回又は22時間及び4時間で2回のいずれかで処理したマウスからの腫瘍溶解物を用いたBRD4、MYC及びビンキュリンについてのイムノブロット分析である。図12Dは、dBET1処理マウス及び対照処理マウスの代表的な腫瘍のBRD4、MYC及びKi67についての免疫組織化学染色を示す。図12Eは、その切片内の3つの独立した領域に基づく図12D中の染色の定量化を示す棒グラフである(データは三連分析の平均±標準偏差を表し、DMSOに対して正規化される)。 CD1マウスにおけるdBET1の薬物動態研究を示す図である。図13Aは、水中0.5%MCで配合したdBET1の腹腔内注射後のCD1マウスにおけるdBET1の濃度を示すグラフである。図13Bは、図13Aのマウスにおける薬物動態パラメーターを示す表である。図13Cは、50mg/kg q.d.のdBET1又はビヒクルで処理したマウスの体重の変化を示すグラフである。図13Dは、図13CのマウスにおけるHTC、WBC又はPLTの変化を示す棒グラフである。 指定の濃度の本願の二官能性化合物による4時間の処理後の細胞(293FTWT又は293FTCRBN−/−)におけるBRD4レベルを測定する高含量アッセイを示す図である。図14A及び図14B:指定の濃度のJQ1による4時間の処理後の293FTWT(図14A)又は293FTCRBN−/−(図14B)におけるBRD4レベル。図14C及び図14D:指定の濃度のdBET1による4時間の処理後の293FTWT(図14C)又は293FTCRBN−/−(図14D)におけるBRD4レベル。図14E及び図14F:指定の濃度のdBET2による4時間の処理後の293FTWT(図14E)又は293FTCRBN−/−(図14F)におけるBRD4レベル。図14G及び図14H:指定の濃度のdBET3による4時間の処理後の293FTWT(図14G)又は293FTCRBN−/−(図14H)におけるBRD4レベル。図14I及び図14J:指定の濃度のdBET4による4時間の処理後の293FTWT(図14I)又は293FTCRBN−/−(図14J)におけるBRD4レベル。図14K及び図14L:指定の濃度のdBET5による4時間の処理後の293FTWT(図14K)又は293FTCRBN−/−(図14L)におけるBRD4レベル。図14M及び図14N:指定の濃度のdBET6による4時間の処理後の293FTWT(図14M)又は293FTCRBN−/−(図14N)におけるBRD4レベル。図14O及び図14P:指定の濃度のdBET7による4時間の処理後の293FTWT(図14O)又は293FTCRBN−/−(図14P)におけるBRD4レベル。図14Q及び図14R:指定の濃度のdBET8による4時間の処理後の293FTWT(図14Q)又は293FTCRBN−/−(図14R)におけるBRD4レベル。図14S及び図14T:指定の濃度のdBET9による4時間の処理後の293FTWT(図14S)又は293FTCRBN−/−(図14T)におけるBRD4レベル。図14U及び図14V:指定の濃度のdBET10による4時間の処理後の293FTWT(図14U)又は293FTCRBN−/−(図14V)におけるBRD4レベル。図14W及び図14X:指定の濃度のdBET15による4時間の処理後の293FTWT(図14W)又は293FTCRBN−/−(図14X)におけるBRD4レベル。図14Y及び図14Z:指定の濃度のdBET17による4時間の処理後の293FTWT(図14Y)又は293FTCRBN−/−(図14Z)におけるBRD4レベル。図14AA及び図14BB:指定の濃度のdBET18による4時間の処理後の293FTWT(図14AA)又は293FTCRBN−/−(図14BB)におけるBRD4レベル。 様々な濃度の本願の二官能性化合物で処理した細胞におけるBRDレベルのイムノブロットを示す図である。図15Aは、指定の濃度のdBET1又はdBET6で16.5時間処理したBAF3_K−RAS細胞におけるBRD4レベルを示すイムノブロットである。図15Bは、指定の濃度のdBET1で16.5時間処理したBAF3_K−RAS又はSEMK2細胞におけるBRD4レベルを示すイムノブロットである。図15Cは、指定の濃度のdBET1又はdBET6で16.5時間処理したSEMK2細胞におけるBRD4レベルを示すイムノブロットである。図15Dは、指定の濃度のdBET1又はdBET6で16時間処理したMonomac1細胞におけるBRD4レベルを示すイムノブロットである。図15Eは、50nMのdBET6で処理したMV4−11細胞における様々な時点でのBRD4、BRD2及びBRD3のレベルを示すイムノブロットである。図15Fは、指定の濃度のdBET6で16時間処理したMM1SWT又はMM1SCRBN−/−細胞におけるBRD4レベルを示すイムノブロットである。 本願の二官能性化合物で処理した細胞におけるタンパク質レベルのイムノブロットを示す図である。図16Aは1μMのdBET2、dBET7、dBET8又はdBET10で処理した細胞(WT又はCRBN−/−)におけるBRD4及びPLK1のレベルを示すイムノブロットである。図16Bは細胞を100nM dBET18で処理した後の指定の時点でのBRD4レベルを示すイムノブロットである。 本願の二官能性化合物による処理後の細胞生存能力を示す図である。図17A及び図17Bは、様々な細胞株における本願の二官能性化合物の細胞生存能力EC50値を示す。図17C〜図17Eは漸増濃度のJQ1、dBET1、dBET6、dBET7又はdBET8による処理後の細胞生存能力を示す。 漸増濃度のdBET化合物で処理した後のMOLT4(図18A)、DND41(図18B)及びCUTLL1(図18C)細胞の生存能力を示す図である。 指定の濃度のdGR3で処理した細胞におけるGRレベルを示すイムノブロットである。 漸増濃度のJQ1又はdBET6による処理後の様々なタイプの細胞の生存能力を示す一連のグラフである。 漸増濃度のJQ1又はdBET6による処理後の様々なタイプの細胞の生存能力を示す一連のグラフである。 漸増濃度のJQ1又はdBET6による処理後の様々なタイプの細胞の生存能力を示す一連のグラフである。 漸増濃度のJQ1又はdBET6による処理後の様々なタイプの細胞の生存能力を示す一連のグラフである。 漸増濃度のJQ1又はdBET6による処理後の様々なタイプの細胞の生存能力を示す一連のグラフである。 図25A及び図25Bは漸増濃度のJQ1(図25A)又はdBET6(図25B)のいずれかとの4時間のインキュベーション後のNGP細胞におけるBRD4及びMYCNのレベルを表示するウエスタンブロットである。図25Cは、250nM dBET6とのインキュベーション後の指定の時点でのNGP細胞におけるBRD2、BRD3、BRD4及びMYCNのレベルを示すウエスタンブロットである。図25Dは、RT−PCRによって判断される250nM dBET6とのインキュベーション後の指定の時点でのNGP細胞におけるMYCNの相対mRNA発現を示す棒グラフである。
小分子アンタゴニストはタンパク質標的の個別の生化学的特性を無効にする。マルチドメインタンパク質標的については、薬物作用の薬理学的結果は1つのドメインに特異的な活性の選択的破壊によって制限される。また、標的阻害は標的エンゲージメントの耐久性及び程度によって動力学的に制限される。従来の薬物分子のこれらの特徴は、マルチドメイン生体分子スキャホールドとして機能し、概して急速な会合及び解離動態を特徴とする転写因子及びクロマチン結合性エピジェネティックタンパク質を標的化する阻害剤の開発にとって難点となる。化学的戦略が、セレブロンE3ユビキチンリガーゼ複合体の機能を乗っ取る誘導体化フタルイミドとの化学的コンジュゲーションによるリガンド依存性標的タンパク質分解を促すために考案された。このアプローチを用いて、BETブロモドメインをクロマチンから外すアセチル−リシン競合的アンタゴニスト(JQ1)が、即時のセレブロン依存性BETタンパク質分解を促すフタルイミドコンジュゲートリガンド(dBET1)へと変換された。発現プロテオミクスにより、検出された7429種のタンパク質のうちBETファミリーメンバーBRD2、BRD3及びBRD4の高い特異性が確認された。BETブロモドメインの分解は、in vivoでの初代ヒト白血病性芽球及びヒト白血病異種移植片においてブロモドメイン阻害と比較してより急速かつ強固なアポトーシス応答と関連する。このアプローチに続いて、分解のために他のタンパク質を標的化するFKBP12等の付加的な一連のフタルイミドコンジュゲートリガンドも開発された。以前は扱いにくかったタンパク質標的を含む標的タンパク質の安定性を制御する容易な新たな戦略が本明細書に記載される。
上記で論考されるように、腫瘍性及び免疫学的障害を含む様々な障害の治療のための新規の療法を開発する必要性が依然として存在する。本願は2つのタンパク質間の複合体の形成を誘導し、所望の生物学的効果をもたらす一般式Iの新規の化合物を提供する。これらの化合物は従来の合成法を用いて調製し、被験体へ薬物として与えることによって使用することができる。
本願は、癌及び他の増殖性病態の治療に有用な新規のクラスの化合物を提供する。
本願は、癌を含む様々な疾患を治療する治療法として用いることができる、標的タンパク質リガンドに様々な長さ及び機能性のリンカーを介して共有結合的に連結する小分子E3リガーゼリガンド(デグロン)に関する。本願は、互いにリンカーを介して接続したサリドマイド様デグロン及び標的指向性リガンドを含む二官能性小分子を用いてユビキチン化及びその後のプロテアソーム分解のために標的タンパク質をE3リガーゼ、例えばCRBNへと導く技術プラットホームにも関する。
この技術プラットホームは、分解による標的タンパク質レベルの低下に基づく療法を提供する。新規の技術により、潜在的標的及び異なる細胞株又は異なるin vivo系に関して既存の方法よりも一般的な性質の標的分解が生じることが可能となる。
本願の化合物は、特に対象のタンパク質によって調節した疾患状態及び病態の治療のために患者に対して重要な臨床的利益をもたらし得る。
本願の化合物
本願は標的タンパク質、特にポリペプチドの阻害剤、又は本願の二官能性化合物によって分解される及び/又は別の形で阻害されるタンパク質を含む化合物のユビキチン化及びプロテアソーム分解の調節因子として有用な二官能性化合物に関する。特に、本願はセレブロン等のユビキチンリガーゼに結合することが可能なリガンド、例えば小分子リガンド(すなわち2000ダルトン、1000ダルトン、500ダルトン又は200ダルトン未満の分子量を有する)、例えばサリドマイド様リガンドと、標的タンパク質が該タンパク質の分解(及び/又は阻害)を達成するためにユビキチンリガーゼに近接して位置するように標的タンパク質に結合することが可能な部分とを含有する化合物に関する。
概して、本願は全体構造:
デグロン−リンカー−標的指向性リガンド
を有する化合物を提供し、ここでリンカーは少なくとも1つのデグロン及び少なくとも1つの標的指向性リガンドに共有結合し、デグロンはE3ユビキチンリガーゼ(例えばセレブロン)等のユビキチンリガーゼに結合することが可能な化合物であり、標的指向性リガンドは標的タンパク質(複数の場合もある)に結合することが可能である。
或る特定の実施形態では、本願は式X0:
(式中、
リンカーは標的指向性リガンド及びYに共有結合する基であり、
標的指向性リガンドは標的タンパク質に結合することが可能であるか又は結合し、
、Y、R、R、R’、R、R、t、m及びnは各々本明細書で規定される通りである)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー、立体異性体若しくは薬学的に許容可能な塩を提供する。
或る特定の実施形態では、本願は式X0’:
(式中、
リンカーは標的指向性リガンド及びYに共有結合する基であり、
標的指向性リガンドは標的タンパク質に結合することが可能であるか又は結合し、
、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々本明細書で規定される通りである)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー、立体異性体若しくは薬学的に許容可能な塩を提供する。
或る特定の実施形態では、本願は式X又はXI:
(式中、
リンカーは標的指向性リガンド及びYに共有結合する基であり、
標的指向性リガンドは標的タンパク質に結合することが可能であるか又は結合し、
、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々本明細書で規定される通りである)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー、立体異性体若しくは薬学的に許容可能な塩を提供する。
或る特定の実施形態では、本願は式I、III又はX0’I:
(式中、
リンカーは標的指向性リガンド及びYに共有結合する基であり、
標的指向性リガンドは標的タンパク質に結合することが可能であるか又は結合し、
X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々本明細書で規定される通りである)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー、立体異性体若しくは薬学的に許容可能な塩を提供する。
或る特定の実施形態では、本願は式II、IV又はX0’II:
(式中、
リンカーは標的指向性リガンド及びYに共有結合する基であり、
標的指向性リガンドは標的タンパク質に結合することが可能であるか又は結合し、
、X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々本明細書で規定される通りである)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー、立体異性体若しくは薬学的に許容可能な塩を提供する。
デグロン
デグロンは、プロテアソーム分解のために標的タンパク質をリンカー及び標的指向性リガンドを介してユビキチンリガーゼに連結する働きをする化合物である。或る特定の実施形態では、デグロンはユビキチンリガーゼに結合することが可能な又は結合する化合物である。更なる実施形態では、デグロンはE3ユビキチンリガーゼに結合することが可能な又は結合する化合物である。更なる実施形態では、デグロンはセレブロンに結合することが可能な又は結合する化合物である。更なる実施形態では、デグロンはサリドマイド又はその誘導体若しくは類似体である。
或る特定の実施形態では、前記デグロンが式D0:
(式中、
は、
であり、
Yは結合、Y、O、NH、NR、C(O)O、OC(O)、C(O)NR’、NR’C(O)、Y−O、Y−NH、Y−NR、Y−C(O)、Y−C(O)O、Y−OC(O)、Y−C(O)NR’又はY−NR’C(O)であり、ここでYはC〜Cアルキレン、C〜Cアルケニレン又はC〜Cアルキニレンであり、
XはC(O)又はC(Rであり、
−XはC(R)=N又はC(R−C(Rであり、
は各々独立してハロゲン、ニトロ、NH、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル又はC〜Cアルコキシであり、
はC〜Cアルキル、C〜Cアルケニル、C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C(O)−C〜Cアルキル、C(O)−C〜Cアルケニル、C(O)−C〜Cシクロアルキル又はC(O)−3員〜8員のヘテロシクロアルキルであり、Rはハロゲン、N(R、NHC(O)R、NHC(O)OR、OR、C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールの1つ以上で任意に置換され、ここで前記C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に更に置換され、
’はH、C〜Cアルキル、C〜Cアルケニル、C〜Cシクロアルキル又は3員〜8員のヘテロシクロアルキルであり、R’はHでない場合、ハロゲン、N(R、NHC(O)R、NHC(O)OR、OR、C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールの1つ以上で任意に置換され、ここで前記C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に更に置換され、
は各々独立してH、又はC〜C10アリール若しくは5員〜10員のヘテロアリールで任意に置換されたC〜Cアルキルであり、
’は各々独立してC〜Cアルキルであり、
は各々独立してH若しくはC〜Cアルキルであるか、又は2つのRが、それらが付着する炭素原子とともにC(O)、C〜C炭素環、若しくはN及びOから選択される1つ若しくは2つのヘテロ原子を含む4員、5員若しくは6員の複素環を形成し、
はH、C〜Cアルキル、F又はClであり、
は各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
はH又はトシルであり、
tは0又は1であり、
mは0、1、2又は3であり、
nは0、1又は2である)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体であり、
前記化合物が、
を介して別の部分(例えば化合物又はリンカー)に共有結合する。
或る特定の実施形態では、デグロンは式D0’:
(式中、
、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々上記で式D0において規定される通りである)を有する化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体である。
式D0若しくは式D0’の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体は、適用可能な場合に以下の特徴の1つ以上を有し得る。
或る特定の実施形態では、デグロンは式D:
を有する化合物である。
或る特定の実施形態では、デグロンは式D’:
を有する化合物である。
或る特定の実施形態では、
は、
である。
或る特定の実施形態では、
は、
である。
或る特定の実施形態では、XはC(O)である。
或る特定の実施形態では、XはC(Rであり、各RはHである。或る特定の実施形態では、XはC(Rであり、Rの1つがHであり、他はメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。或る特定の実施形態では、XはC(Rであり、Rは各々独立してメチル、エチル及びプロピルから選択される。
或る特定の実施形態では、X−XはC(R)=Nである。或る特定の実施形態では、X−XはCH=Nである。或る特定の実施形態では、X−XはC(R)=Nであり、Rはメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。或る特定の実施形態では、X−XはC(CH)=Nである。
或る特定の実施形態では、X−XはC(R−C(Rであり、各RはHである。或る特定の実施形態では、X−XはC(R−C(Rであり、Rの1つがHであり、他の3つのRが独立して、メチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。或る特定の実施形態では、X−XはC(R−C(Rであり、Rの2つがHであり、他の2つのRが独立してメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。或る特定の実施形態では、X−XはC(R−C(Rであり、Rの3つがHであり、残りのRがメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、Yは結合である。
或る特定の実施形態では、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH、又は(CHである。或る特定の実施形態では、Yは(CH、(CH、又は(CHである。或る特定の実施形態では、Yは(CH又は(CHである。
或る特定の実施形態では、YはOである。
或る特定の実施形態では、YはY−Oであり、Y又はOのいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。例えば、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH又は(CHである。例えば、YはCH−O、(CH−O、(CH−O、(CH−O、(CH−O又は(CH−Oである。或る特定の実施形態では、YはCH−O、(CH−O又は(CH−Oである。或る特定の実施形態では、YはCH−Oである。
或る特定の実施形態では、YはC(O)である。
或る特定の実施形態では、YはC(O)Oであり、O又はC(O)のいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。
或る特定の実施形態では、YはY−C(O)であり、Y又はC(O)のいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。例えば、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH又は(CHである。例えば、Yは、(CH1〜6−C(O)である。
或る特定の実施形態では、YはY−(CO)Oであり、Y又はOのいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。例えば、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH又は(CHである。例えば、Yは、(CH1〜6−C(O)Oである。
或る特定の実施形態では、YはY−OC(O)であり、Y又はC(O)のいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。例えば、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH又は(CHである。例えば、Yは、(CH1〜6−OC(O)である。
或る特定の実施形態では、YはC(O)NR’である。
或る特定の実施形態では、YはY−C(O)NR’であり、Y又はNR’のいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。例えば、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH又は(CHである。例えば、YはCH−C(O)NR’、(CH−C(O)NR’、(CH−C(O)NR’、(CH−C(O)NR’、(CH−C(O)NR’又は(CH−C(O)NR’である。或る特定の実施形態では、YはCH−C(O)NR’、(CH−C(O)NR’又は(CH−C(O)NR’である。或る特定の実施形態では、YはCH−C(O)NR’である。
或る特定の実施形態では、YはNR’C(O)である。
或る特定の実施形態では、YはY−NR’C(O)であり、Y又はC(O)のいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。例えば、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH又は(CHである。例えば、YはCH−NR’C(O)、(CH−NR’C(O)、(CH−NR’C(O)、(CH−NR’C(O)、(CH−NR’C(O)又は(CH−NR’C(O)である。或る特定の実施形態では、YはCH−NR’C(O)、(CH−NR’C(O)又は(CH−NR’C(O)である。或る特定の実施形態では、YはCH−NR’C(O)である。
或る特定の実施形態では、R’はHである。或る特定の実施形態では、R’はメチル、エチル、プロピル、ブチル、i−ブチル、t−ブチル、ペンチル、i−ペンチル、及びヘキシルから選択される。或る特定の実施形態では、R’はメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、R’はハロゲン、N(R、NHC(O)R、NHC(O)OR、OR、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール、又は5員〜10員のヘテロアリールの1つ以上で置換されたC〜Cアルキルであり、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ、又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に更に置換されている。
或る特定の実施形態では、R’はC〜Cアルケニルである。
或る特定の実施形態では、YはNHである。
或る特定の実施形態では、YはY−NHであり、Y又はNHのいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。例えば、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH又は(CHである。例えば、YはCH−NH、(CH−NH、(CH−NH、(CH−NH、(CH−NH又は(CH−NHである。或る特定の実施形態では、YはCH−NH、(CH−NH又は(CH−NHである。或る特定の実施形態では、YはCH−NHである。
或る特定の実施形態では、YはNRである。
或る特定の実施形態では、YはY−NRであり、Y又はNRのいずれかがYが接続するフェニル環の近位にある。例えば、Yは線形又は分岐C〜Cアルキレンである。例えば、Yは(CH、CH(CH)、C(CH、(CH、(CH、CHCH(CH)、CHC(CH、(CH、(CH又は(CHである。例えば、YはCH−NR、(CH−NR、(CH−NR、(CH−NR、(CH−NR又は(CH−NRである。或る特定の実施形態では、YはCH−NR、(CH−NR又は(CH−NRである。或る特定の実施形態では、YはCH−NRである。
或る特定の実施形態では、Rはメチル、エチル、プロピル、ブチル、i−ブチル、t−ブチル、ペンチル、i−ペンチル、及びヘキシルから選択される。或る特定の実施形態では、Rはメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、Rはハロゲン、OH又はORの1つ以上で置換されたC〜Cアルキルである。例えば、RはCHCHF、CHCHCHF、CF、CHCF、CHCHCF、CHCHOH、CHCHO−トシル、又はCH(OH)CHOHである。
或る特定の実施形態では、RはN(R、NHC(O)R、又はNHC(O)ORの1つ以上で置換されたC〜Cアルキルである。例えば、RはCHCHNH又はCHCHNHC(O)O−t−ブチルである。
或る特定の実施形態では、Rは3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールで置換されたC〜Cアルキルであり、ここで3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に更に置換される。例えば、Rは3員〜8員のヘテロシクロアルキル(例えばオキシラン、オキセタン、アゼチジン、テトラヒドロフラン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン又はモルホリン)で置換されたC〜Cアルキルであり、これは1つ以上のC〜Cアルキルで任意に更に置換される。例えば、RはCH−オキシラン、CHCH−ピペラジン又はCHCH−4−メチルピペラジンである。例えば、Rはフェニル又は5員〜10員のヘテロアリール(例えばピリジル、インドリル、フリル又はイミダゾリル)で置換されたC〜Cアルキルであり、これらは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル及びC〜Cアルコキシから選択される1つ以上の置換基で任意に更に置換される。
或る特定の実施形態では、RはC〜Cアルケニル、例えばエテニル、プロペニル、及びブテニルである。
或る特定の実施形態では、RはC〜Cシクロアルキル、例えばシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル及びシクロヘプチルである。或る特定の実施形態では、Rはシクロペンチル、シクロヘキシル又はシクロヘプチルである。
或る特定の実施形態では、Rは3員〜8員のヘテロシクロアルキル(例えば、オキシラン、オキセタン、アゼチジン、テトラヒドロフラン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン、又はモルホリン)である。或る特定の実施形態では、Rはオキセタンである。
或る特定の実施形態では、RはC(O)−メチル、C(O)−エチル、C(O)−プロピル、C(O)−ブチル、C(O)−i−ブチル、C(O)−t−ブチル、C(O)−ペンチル、C(O)−i−ペンチル、及びC(O)−ヘキシルから選択される。或る特定の実施形態では、RはC(O)−メチル、C(O)−エチル、及びC(O)−プロピルから選択されるC(O)−C〜Cアルキルである。或る特定の実施形態では、Rは1つ以上のハロゲンで置換されたC(O)−C〜Cアルキル(例えば、C(O)−CHCl)である。
或る特定の実施形態では、RはC(O)−C〜Cアルケニル、例えばC(O)−エテニルである。
或る特定の実施形態では、RはC(O)−シクロプロピル、C(O)−シクロブチル、C(O)−シクロペンチル、C(O)−シクロヘキシル及びC(O)−シクロヘプチルから選択される。或る特定の実施形態では、RはC(O)−シクロプロピルである。或る特定の実施形態では、RはC(O)−シクロペンチル、C(O)−シクロヘキシル又はC(O)−シクロヘプチルである。
或る特定の実施形態では、RはC(O)−3員〜8員のヘテロシクロアルキル(例えば、オキシラン、オキセタン、アゼチジン、テトラヒドロフラン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン、又はモルホリン)である。或る特定の実施形態では、RはC(O)−オキシランである。
或る特定の実施形態では、RはHである。
或る特定の実施形態では、Rはメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。或る特定の実施形態では、Rはメチルである。
或る特定の実施形態では、Rはフェニル又は5員若しくは6員のヘテロアリールで置換されたC〜Cアルキルである。或る特定の実施形態では、Rはベンジルである。
或る特定の実施形態では、nは0である。
或る特定の実施形態では、nは1である。
或る特定の実施形態では、nは2である。
或る特定の実施形態では、R’は各々独立してメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、mは0である。
或る特定の実施形態では、mは1である。
或る特定の実施形態では、mは2である。
或る特定の実施形態では、mは3である。
或る特定の実施形態では、Rは各々独立してハロゲン(例えば、F、Cl、Br、及びI)、OH、C〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、i−ブチル、t−ブチル、ペンチル、i−ペンチル、及びヘキシル)、及びC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ、i−ブトキシ、t−ブトキシ、及びペントキシ)から選択される。更なる実施形態では、Rは各々独立してF、Cl、OH、メチル、エチル、プロピル、ブチル、i−ブチル、t−ブチル、メトキシ、及びエトキシから選択される。
或る特定の実施形態では、各RはHである。
或る特定の実施形態では、Rの1つがHであり、他のRがメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、Rは各々独立してメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、2つのRはそれらが付着する炭素原子とともにC(O)を形成する。
或る特定の実施形態では、2つのRはそれらが付着する炭素原子とともにシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシルを形成する。
或る特定の実施形態では、2つのRが、それらが付着する炭素原子とともにオキセタン、アゼチジン、テトラヒドロフラン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン及びモルホリンから選択される4員、5員又は6員の複素環を形成する。或る特定の実施形態では、2つのRが、それらが付着する炭素原子とともにオキセタンを形成する。
或る特定の実施形態では、RはH、重水素又はC〜Cアルキルである。更なる実施形態では、Rは(S)配置又は(R)配置にある。更なる実施形態では、Rは(S)配置にある。或る特定の実施形態では、化合物は(S)−R及び(R)−Rのラセミ混合物を含む。
或る特定の実施形態では、RはHである。
或る特定の実施形態では、Rは重水素である。
或る特定の実施形態では、Rはメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。或る特定の実施形態では、Rはメチルである。
或る特定の実施形態では、RはF又はClである。更なる実施形態では、Rは(S)配置又は(R)配置にある。更なる実施形態では、Rは(R)配置にある。或る特定の実施形態では、化合物は(S)−R及び(R)−Rのラセミ混合物を含む。或る特定の実施形態では、RはFである。
、X、X、X、Y、Y、R、R、R’、R、R’、R、R、t、m及びnの1つについて規定される部分は各々、
、X、X、X、Y、Y、R、R、R’、R、R’、R、R、t、m及びnの他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、デグロンは式D1若しくは式D’1:
(式中、X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々上記で式D0において規定される通りである)を有する化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体である。
X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々、上記の式D0中の部分から選択することができる。X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnの1つについて規定される部分は各々上記の式D0のようにX、Y、R、R、R’、R、R、m及びnの他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、デグロンは式D0’III:
(式中、R、R’、Y、m及びnは各々上記で規定される通りであり、上記の任意の部分又はその組合せから選択することができる)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体である。
或る特定の実施形態では、デグロンは式D2:
(式中、R、R’、m及びnは各々上記で規定される通りであり、上記の任意の部分又はその組合せから選択することができる)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体である。
或る特定の実施形態では、デグロンは以下の構造:
の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体である。
或る特定の実施形態では、デグロンは式D3又は式D’3:
(式中、X、X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々上記で式D0において規定される通りである)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体である。
、X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnは各々、上記の式D0中の部分から選択することができる。X、X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnの1つについて規定される部分は各々、上記の式D0のようにX、X、Y、R、R、R’、R、R、m及びnの他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、デグロンは以下の表D中のものから選択され、ここでXはH、重水素、C〜Cアルキル又はハロゲンであり、Rはリンカーである。
或る特定の実施形態では、デグロンは以下の表D1中のものから選択される。
或る特定の実施形態では、デグロンは以下の表D2中のものから選択される。
或る特定の実施形態では、デグロンは以下の表D3中のものから選択される。
或る特定の実施形態では、デグロンは以下の表D4中のものから選択される。
(ここで、R100は、
である)及び、
(ここで、
は、
である)
或る特定の実施形態では、本願のデグロンはリンカーを介して標的指向性リガンドに結合することなく、(例えば、ユビキチン化経路による)分解についてタンパク質を標的化する、タンパク質分解を誘導する又はタンパク質を分解することが可能である。或る特定の実施形態では、本願のデグロンは1つ以上の細胞タンパク質(例えばIKZF1)を細胞に投与した後に分解することが可能である。或る特定の実施形態では、1つ以上の細胞タンパク質(例えばIKZF1)を分解することが可能な本願のデグロンは表D、表D1、表D2、表D3及び表D4から選択される。或る特定の実施形態では、1つ以上の細胞タンパク質(例えばIKZF1)を分解することが可能な本願のデグロンは表D3から選択される。或る特定の実施形態では、1つ以上の細胞タンパク質(例えばIKZF1)を分解することが可能な本願のデグロンはD−1〜D−5、D−8〜D−11、D−13〜D−19及びD−21〜D−27から選択される。或る特定の実施形態では、1つ以上の細胞タンパク質(例えばIKZF1)を分解することが可能な本願のデグロンはD−3、D−4、D−8、D−9、D−16〜D−19及びD−21〜D−23から選択される。
リンカー
リンカーは、標的指向性リガンドとデグロンとを連結する働きをする結合又は炭素鎖である。或る特定の実施形態では、炭素鎖は任意にN、O及びSから選択される1つ、2つ、3つ又はそれ以上のヘテロ原子を含む。或る特定の実施形態では、炭素鎖は飽和鎖炭素原子のみを含む。或る特定の実施形態では、炭素鎖は任意に2つ以上の不飽和鎖炭素原子(例えば、
)を含む。或る特定の実施形態では、炭素鎖中の1つ以上の鎖炭素原子は1つ以上の置換基(例えばオキソ、C〜Cアルキル、C〜Cアルケニル、C〜Cアルキニル、C〜Cアルコキシ、OH、ハロゲン、NH、NH(C〜Cアルキル)、N(C〜Cアルキル)、CN、C〜Cシクロアルキル、ヘテロシクリル、フェニル及びヘテロアリール)で任意に置換される。
或る特定の実施形態では、リンカーは少なくとも5個の鎖原子(例えばC、O、N及びS)を含む。或る特定の実施形態では、リンカーは20個未満の鎖原子(例えばC、O、N及びS)を含む。或る特定の実施形態では、リンカーは5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個又は19個の鎖原子(例えばC、O、N及びS)を含む。或る特定の実施形態では、リンカーは5個、7個、9個、11個、13個、15個、17個又は19個の鎖原子(例えばC、O、N及びS)を含む。或る特定の実施形態では、リンカーは5個、7個、9個又は11個の鎖原子(例えばC、O、N及びS)を含む。或る特定の実施形態では、リンカーは6個、8個、10個、12個、14個、16個又は18個の鎖原子(例えばC、O、N及びS)を含む。或る特定の実施形態では、リンカーは6個、8個、10個又は12個の鎖原子(例えばC、O、N及びS)を含む。
或る特定の実施形態では、リンカーは鎖に沿って1つ以上(例えば1つ、2つ又は3つ)の炭素環及び複素環を含む(例えば、1つ以上の鎖原子が例えばC〜Cシクロアルキレン、3員〜8員のヘテロシクロアルキレン、C〜C10アリーレン又は5員〜10員のヘテロアリーレンに置き換えられ、ここでC〜Cシクロアルキレン、3員〜8員のヘテロシクロアルキレン、C〜C10アリーレン又は5員〜10員のヘテロアリーレンは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に置換される)。
或る特定の実施形態では、リンカーは嵩高くない(non-bulky)置換基(例えばオキソ、C〜Cアルキル、C〜Cアルケニル、C〜Cアルキニル、C〜Cアルコキシ、OH、ハロゲン、NH、NH(C〜Cアルキル)、N(C〜Cアルキル)及びCN)で任意に置換された炭素鎖である。或る特定の実施形態では、嵩高くない置換はデグロンの近位にある鎖炭素原子上に位置する(すなわち、炭素原子はデグロンが結合している炭素原子とはリンカー中の少なくとも3つ、4つ又は5つの鎖原子によって隔てられている)。
或る特定の実施形態では、前記リンカーが式L0:
(式中、
p1は0〜12から選択される整数であり、
p2は0〜12から選択される整数であり、
p3は0〜6から選択される整数であり、
Wは各々独立して存在しないか、CH、O、S、NH又はNRであり、
Zは存在しないか、CH、O、NH又はNRであり、
は各々独立してC〜Cアルキルであり、
Qはp3が1〜6から選択される整数である場合に存在しないか、−C(O)NH−、−C(O)O−、−CHC(O)NH−若しくは−CHC(O)O−であり、又はQはp3が0〜6から選択される整数である場合にQ、−C〜Cアルキレン−Q又はQ−C〜Cアルキレン−Qであり、ここでQ及びQは各々独立してC〜Cシクロアルキレン、3員〜8員のヘテロシクロアルキレン、C〜C10アリーレン又は5員〜10員のヘテロアリーレンであり、それらは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に置換される)のリンカー又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体であり、
前記リンカーがQの隣の、
で前記デグロンに共有結合し、Zの隣の、
で前記標的指向性リガンドに共有結合する。
或る特定の実施形態では、リンカー中の鎖原子(QがQ又はQ−C〜Cアルキレン−Qである場合の全ての環原子を含む)の総数は約30以下(例えば、約20以下又は20未満)である。
或る特定の実施形態では、リンカー−標的指向性リガンド(TL)は式L1〜L9:
(式中、
p1は0〜12から選択される整数であり、
p2は0〜12から選択される整数であり、
p3は1〜6から選択される整数であり、
Wは各々独立して存在しないか、CH、O、S、NH又はNRであり、
Zは存在しないか、CH、O、NH又はNRであり、
は各々独立してC〜Cアルキルであり、
及びQは各々独立してC〜Cシクロアルキレン、3員〜8員のヘテロシクロアルキレン、C〜C10アリーレン又は5員〜10員のヘテロアリーレンであり、それらは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に置換され、
TLは標的指向性リガンドであり、
ここでリンカーは、
によってデグロンに共有結合する)のいずれかの構造又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体を有する。
或る特定の実施形態では、p1は0〜10から選択される整数である。
或る特定の実施形態では、p1は2〜10から選択される整数である。
或る特定の実施形態では、p1は1、2、3、4、5及び6から選択される。
或る特定の実施形態では、p1は1、3及び5から選択される。
或る特定の実施形態では、p1は1、2及び3から選択される。
或る特定の実施形態では、p1は3である。
或る特定の実施形態では、p2は0〜10から選択される整数である。
或る特定の実施形態では、p2は0、1、2、3、4、5及び6から選択される。
或る特定の実施形態では、p2は0及び1から選択される整数である。
或る特定の実施形態では、p3は1〜5から選択される整数である。
或る特定の実施形態では、p3は2、3、4及び5から選択される。
或る特定の実施形態では、p3は1、2及び3から選択される。
或る特定の実施形態では、p3は2及び3から選択される。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのWはCHである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのWはOである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのWはSである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのWはNHである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのWはNRであり、Rはメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、WはOである。
或る特定の実施形態では、Zは存在しない。
或る特定の実施形態では、ZはCHである。
或る特定の実施形態では、ZはOである。
或る特定の実施形態では、ZはNHである。
或る特定の実施形態では、ZはNRであり、Rはメチル、エチル及びプロピルから選択されるC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、Zはリンカーに結合した標的指向性リガンドの一部である、すなわちZは標的指向性リガンドの官能基とリンカーとの反応によって形成される。
或る特定の実施形態では、WはCHであり、ZはCHである。
或る特定の実施形態では、WはOであり、ZはCHである。
或る特定の実施形態では、WはCHであり、ZはOである。
或る特定の実施形態では、WはOであり、ZはOである。
或る特定の実施形態では、QはC〜Cシクロアルキレン、3員〜8員のヘテロシクロアルキレン(例えばオキシラン、オキセタン、アゼチジン、テトラヒドロフラン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン又はモルホリン)、C〜C10アリーレン(例えばフェニル)又は5員〜10員のヘテロアリーレン(例えばピリジル、インドリル、フリル又はイミダゾリル)であり、それらは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に置換される。例えば、Qは3員〜8員のヘテロシクロアルキレン(例えばオキシラン、オキセタン、アゼチジン、テトラヒドロフラン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン又はモルホリン)であり、1つ以上のC〜Cアルキルで任意に置換される。例えば、Qはピペラジン又は4−メチルピペラジンである。例えば、Qはフェニル又は5員〜10員のヘテロアリール(例えばピリジル、インドリル、フリル又はイミダゾリル)であり、それらは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル及びC〜Cアルコキシから選択される1つ以上の置換基で任意に置換される。
或る特定の実施形態では、QはC〜Cシクロアルキレン、3員〜8員のヘテロシクロアルキレン(例えばオキシラン、オキセタン、アゼチジン、テトラヒドロフラン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン又はモルホリン)、C〜C10アリーレン(例えばフェニル)又は5員〜10員のヘテロアリーレン(例えばピリジル、インドリル、フリル又はイミダゾリル)であり、それらは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に置換される。例えば、Qは3員〜8員のヘテロシクロアルキレン(例えばオキシラン、オキセタン、アゼチジン、テトラヒドロフラン、ピロリジン、ピペリジン、ピペラジン又はモルホリン)であり、1つ以上のC〜Cアルキルで任意に置換される。例えば、Qはピペラジン又は4−メチルピペラジンである。例えば、Qはフェニル又は5員〜10員のヘテロアリール(例えばピリジル、インドリル、フリル又はイミダゾリル)であり、それらは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル及びC〜Cアルコキシから選択される1つ以上の置換基で任意に置換される。
或る特定の実施形態では、Qは任意に置換されたフェニルであり、Qは任意に置換された5員若しくは6員のヘテロシクロアルキレン、又は5員〜10員のヘテロアリールである。或る特定の実施形態では、Qは任意に置換されたフェニルであり、Qは任意に置換された5員若しくは6員のヘテロシクロアルキレン、又は5員〜10員のヘテロアリールである。
或る特定の実施形態では、リンカー−標的指向性リガンドは表L:
(式中、Z、TL、p1、p2及びp3は各々上記の通りであり、RはO、CHR、CH、N又はNRであり、RはH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシである)から選択される構造を有する。
本明細書に記載されるデグロンのいずれか1つが本明細書に記載されるリンカーのいずれか1つに共有結合していてもよい。
或る特定の実施形態では、本願は以下の構造:
(式中、可変部分は各々上記の式D0及び式L0において記載される通りであり、標的指向性リガンドがZの隣の、
によってDLに共有結合する)を有するデグロン−リンカー(DL)に関する。
或る特定の実施形態では、本願は以下の構造:
(式中、可変部分は各々上記の式D0及び式L0において記載される通りであり、標的指向性リガンドがZの隣の、
によってDLに共有結合する)を有するデグロン−リンカー(DL)に関する。
或る特定の実施形態では、本願は以下の構造:
(式中、pは1〜19であり、X及びRは上記の通りである)を有するデグロン−リンカー(DL)中間体又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体に関する。
或る特定の実施形態では、DLは以下の構造:
(式中、pは1〜19である)又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体を有する。
或る特定の実施形態では、DL中間体は以下の構造:
を有する。
本願の一部の実施形態は以下の構造:
(式中、可変部分は各々上記の式D0及び式L0において記載される通りであり、標的指向性リガンドは本明細書で下記に記載される)を有する二官能性化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体に関する。
本願の更なる実施形態は以下の構造:
(式中、可変部分は各々上記の式D0及び式L0において記載される通りであり、標的指向性リガンドは本明細書で下記に記載される)を有する二官能性化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体に関する。
本願の或る特定の実施形態は以下の構造:
の1つを有する二官能性化合物に関する。
或る特定の実施形態では、リンカーは約1〜約12のエチレングリコール単位、1〜約10のエチレングリコール単位、約2〜約6のエチレングリコール単位、約2〜5のエチレングリコール単位、約2〜4のエチレングリコール単位というサイズ範囲のポリエチレングリコール基であり得る。
或る特定の実施形態では、リンカーはリンカーの付着位置に関する標的指向性リガンドのSAR(構造−活性相関)及びX線結晶構造解析に基づいて設計及び最適化される。
或る特定の実施形態では、最適なリンカー長及び組成は標的によって異なり、その標的に結合した元の標的指向性リガンドのX線構造に基づいて推定することができる。リンカー長及び組成は代謝的安定性及び薬物動態(PK)及び薬力学(PD)パラメーターを調節するように変更することもできる。
或る特定の実施形態では、標的リガンドが多数の標的に結合する場合、選択性はリガンドが異なる結合ポケット、例えば他よりも深い又は浅い結合ポケット中のその標的の一部に結合するリンカー長を変更することによって達成することができる。
標的指向性リガンド
標的指向性リガンド(TL)(又は標的タンパク質部分若しくは標的タンパク質リガンド若しくはリガンド)は、対象の標的タンパク質に結合することが可能な又は結合する小分子である。
本願の一部の実施形態はHsp90阻害剤、キナーゼ阻害剤、MDM2阻害剤、ヒトBETブロモドメイン含有タンパク質を標的化する化合物、細胞質シグナル伝達タンパク質FKBP12を標的化する化合物、HDAC阻害剤、ヒトリシンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、血管形成阻害剤、免疫抑制化合物、及び芳香族炭化水素受容体(aryl hydrocarbon receptor:アリール炭化水素受容体)(AHR)を標的化する化合物を含むが、これらに限定されないTLに関する。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドはキナーゼ、BETブロモドメイン含有タンパク質、細胞質シグナル伝達タンパク質(例えばFKBP12)、核タンパク質、ヒストンデアセチラーゼ、リシンメチルトランスフェラーゼ、血管形成を調節するタンパク質、免疫応答を調節するタンパク質、芳香族炭化水素受容体(AHR)、エストロゲン受容体、アンドロゲン受容体、グルココルチコイド受容体又は転写因子(例えばSMARCA4、SMARCA2、TRIM24)に結合することが可能な又は結合する化合物である。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが結合することが可能な又は結合するキナーゼとしては、チロシンキナーゼ(例えば、AATK、ABL、ABL2、ALK、AXL、BLK、BMX、BTK、CSF1R、CSK、DDR1、DDR2、EGFR、EPHA1、EPHA2、EPHA3、EPHA4、EPHA5、EPHA6、EPHA7、EPHA8、EPHA10、EPHB1、EPHB2、EPHB3、EPHB4、EPHB6、ERBB2、ERBB3、ERBB4、FER、FES、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FGR、FLT1、FLT3、FLT4、FRK、FYN、GSG2、HCK、IGF1R、ILK、INSR、INSRR、IRAK4、ITK、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KSR1、LCK、LMTK2、LMTK3、LTK、LYN、MATK、MERTK、MET、MLTK、MST1R、MUSK、NPR1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PDGFRA、PDGFRB、PLK4、PTK2、PTK2B、PTK6、PTK7、RET、ROR1、ROR2、ROS1、RYK、SGK493、SRC、SRMS、STYK1、SYK、TEC、TEK、TEX14、TIE1、TNK1、TNK2、TNNI3K、TXK、TYK2、TYRO3、YES1、又はZAP70)、セリン/スレオニンキナーゼ(例えば、カゼインキナーゼ2、プロテインキナーゼA、プロテインキナーゼB、プロテインキナーゼC、Rafキナーゼ、CaMキナーゼ、AKT1、AKT2、AKT3、ALK1、ALK2、ALK3、ALK4、Aurora A、Aurora B、Aurora C、CHK1、CHK2、CLK1、CLK2、CLK3、DAPK1、DAPK2、DAPK3、DMPK、ERK1、ERK2、ERK5、GCK、GSK3、HIPK、KHS1、LKB1、LOK、MAPKAPK2、MAPKAPK、MNK1、MSSK1、MST1、MST2、MST4、NDR、NEK2、NEK3、NEK6、NEK7、NEK9、NEK11、PAK1、PAK2、PAK3、PAK4、PAK5、PAK6、PIM1、PIM2、PLK1、RIP2、RIP5、RSK1、RSK2、SGK2、SGK3、SIK1、STK33、TAO1、TAO2、TGF−β、TLK2、TSSK1、TSSK2、ULK1、又はULK2)、サイクリン依存性キナーゼ(例えば、Cdk1〜Cdk11)、及びロイシンリッチリピートキナーゼ(例えば、LRRK2)が挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが結合することが可能な又は結合するBETブロモドメイン含有タンパク質としては、BRD1、BRD2、BRD3、BRD4、BRD5、BRD6、BRD7、BRD8、BRD9、BRD10及びBRDTが挙げられるが、これらに限定されない。或る特定の実施形態では、BETブロモドメイン含有タンパク質はBRD4である。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが結合することが可能な又は結合する核タンパク質としては、BRD2、BRD3、BRD4、アンテナペディアホメオドメインタンパク質、BRCA1、BRCA2、CCAATエンハンサー結合タンパク質、ヒストン、ポリコーム群タンパク質、高移動度群タンパク質、テロメア結合タンパク質、FANCA、FANCD2、FANCE、FANCF、肝細胞核因子、Mad2、NF−κB、核内受容体コアクチベーター、CREB結合タンパク質、p55、p107、p130、Rbタンパク質、p53、c−fos、c−jun、c−mdm2、c−myc及びc−relが挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドはキナーゼ阻害剤、BETブロモドメイン含有タンパク質阻害剤、細胞質シグナル伝達タンパク質FKBP12リガンド、HDAC阻害剤、リシンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、血管形成阻害剤、免疫抑制化合物及び芳香族炭化水素受容体(AHR)阻害剤から選択される。
TLの非限定的な例を下記に示すが、これらは或る特定のタイプの対象のタンパク質の標的指向性リガンドである。
或る特定の実施形態では、本願は表1に示されるTL部分を含有する化合物に関する。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが式TL−I:
(式中、
は、
であり、
はS又はC=Cであり、
はNRa又はOであり、
nn1は0、1又は2であり、
Raは各々独立してC〜Cアルキル、(CH0〜3−CN、(CH0〜3−ハロゲン、(CH0〜3−OH、(CH0〜3−C〜Cアルコキシ、C(O)NRaL、OL、NRaL又はLであり、
RaはH、C〜Cアルキル、(CH0〜3−ヘテロシクリル、(CH0〜3−フェニル又はLであり、ここで前記ヘテロシクリルは1つの飽和した5員又は6員の環並びにN、O及びSから選択される1つ又は2つのヘテロ原子を含み、C〜Cアルキル、L又はC(O)Lで任意に置換され、ここで前記フェニルはC〜Cアルキル、CN、ハロゲン、OH、C〜Cアルコキシ又はLで任意に置換され、
nn2は0、1、2又は3であり、
Raは各々独立してC〜Cアルキル、(CH0〜3−CN、(CH0〜3−ハロゲン、L又はC(O)NRaLであり、
RaはC〜Cアルキルであり、
RaはH又はC〜Cアルキルであり、
Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩であるが、
但し、前記式TL−Iの化合物は1つのLでのみ置換される。
或る特定の実施形態では、
は、
である。
或る特定の実施形態では、
は、
である。
或る特定の実施形態では、AはSである。
或る特定の実施形態では、AはC=Cである。
或る特定の実施形態では、AはNRaである。更なる実施形態では、RaはHである。他の実施形態では、RaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、Raはメチルである。
或る特定の実施形態では、AはOである。
或る特定の実施形態では、nn1は0である。
或る特定の実施形態では、nn1は1である。
或る特定の実施形態では、nn1は2である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaはメチルである。更なる実施形態では、2つのRaはメチルである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはCN、(CH)−CN、(CH−CN、又は(CH−CNである。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaは(CH)−CNである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)、(CH)−ハロゲン、(CH−ハロゲン、又は(CH−ハロゲンである。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaはCl、(CH)−Cl、(CH−Cl、又は(CH−Clである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはOH、(CH)OH、(CH−OH、又は(CH−OHである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)、(CH)−C〜Cアルコキシ、(CH−C〜Cアルコキシ、又は(CH−C〜Cアルコキシである。或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはメトキシである。
或る特定の実施形態では、1つのRaはC(O)NRaLである。更なる実施形態では、RaはHである。他の実施形態では、RaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、1つのRaはOLである。
或る特定の実施形態では、1つのRaはNRaLである。更なる実施形態では、RaはHである。他の実施形態では、RaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Raはメチルである。
或る特定の実施形態では、1つのRaはLである。
或る特定の実施形態では、RaはHである。
或る特定の実施形態では、Raは直鎖C〜C又は分岐C〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、i−プロピル、ブチル、i−ブチル、t−ブチル、ペンチル、又はヘキシル)である。更なる実施形態では、Raはメチル、エチル、又はt−ブチルである。
或る特定の実施形態では、Raはヘテロシクリル、(CH)−ヘテロシクリル、(CH−ヘテロシクリル、又は(CH−ヘテロシクリルである。更なる実施形態では、Raは(CH−ヘテロシクリルである。更なる実施形態では、ヘテロシクリルは、ピロリジニル、ピラゾリジニル、イミダゾリジニル、オキサゾリジニル、イソキサゾリジニル、チアゾリジニル、イソチアゾリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、ヘキサヒドロピリミジニル、モルホリニル、及びチオモルホリニルから選択される。更なる実施形態では、ヘテロシクリルはピペラジニルである。
或る特定の実施形態では、ヘテロシクリルはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)で置換されている。
或る特定の実施形態では、ヘテロシクリルはC(O)Lで置換されている。
或る特定の実施形態では、ヘテロシクリルはLで置換されている。
或る特定の実施形態では、Raはフェニル、(CH)−フェニル、(CH−フェニル、又は(CH−フェニルである。更なる実施形態では、Raはフェニルである。
或る特定の実施形態では、フェニルはC〜Cアルキル(例えばメチル、エチル、プロピル又はi−プロピル)で置換される。或る特定の実施形態では、フェニルはCNで置換される。或る特定の実施形態では、フェニルはハロゲン(例えばF、Cl又はBr)で置換される。或る特定の実施形態では、フェニルはOHで置換される。或る特定の実施形態では、フェニルはC〜Cアルコキシ(例えばメトキシ、エトキシ又はプロポキシ)で置換される。
或る特定の実施形態では、フェニルはLで置換される。
或る特定の実施形態では、RaはLである。
或る特定の実施形態では、nn2は0である。
或る特定の実施形態では、nn2は1である。
或る特定の実施形態では、nn2は2である。
或る特定の実施形態では、nn2は3である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaはメチルである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはCN、(CH)−CN、(CH−CN、又は(CH−CNである。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaはCNである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)、(CH)−ハロゲン,(CH−ハロゲン、又は(CH−ハロゲンである。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaはCl、(CH)−Cl、(CH−Cl、又は(CH−Clである。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaはClである。
或る特定の実施形態では、1つのRaがLである。
或る特定の実施形態では、1つのRaがC(O)NRaLである。更なる実施形態では、RaはHである。他の実施形態では、RaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、Raはメチルである。
或る特定の実施形態では、RaはHである。
或る特定の実施形態では、RaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、Raはメチルである。
、T、T、T、T、A、A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2の1つについて規定される部分は各々、T、T、T、T、T、A、A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、
は、
であり、AはSである。
或る特定の実施形態では、
は、
であり、AはC=Cである。
或る特定の実施形態では、
は、
であり、AはC=Cである。
或る特定の実施形態では、AはNHであり、Raは(CH0〜3−ヘテロシクリルである。更なる実施形態では、Raは(CH−ヘテロシクリルである。更なる実施形態では、ヘテロシクリルはピペラジニルである。更なる実施形態では、ヘテロシクリルはC〜Cアルキル、L、又はC(O)Lで置換されている。
或る特定の実施形態では、AはNHであり、Raは(CH0〜3−フェニルである。更なる実施形態では、Raはフェニルである。更なる実施形態では、フェニルはOH又はLで置換されている。
或る特定の実施形態では、AはNHであり、RaはLである。
或る特定の実施形態では、AはNHであり、RaはH又はC〜Cアルキルである。更なる実施形態では、RaはC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、AはOであり、RaはH又はC〜Cアルキルである。更なる実施形態では、RaはC〜Cアルキルである。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I1:
(式中、A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2は各々上記の式TL−Iにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2は各々上記の式TL−I中の部分から選択することができる。A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2の1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−IのようにA、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I1a〜TL−I1d:
(式中、
Raは各々独立してC〜Cアルキル、(CH0〜3−CN、(CH0〜3−ハロゲン、(CH0〜3−OH又は(CH0〜3−C〜Cアルコキシであり、
Raは(CH0〜3−ヘテロシクリル、(CH0〜3−フェニル又はLであり、ここでヘテロシクリルは1つの飽和した5員又は6員の環、並びにN、O及びSから選択される1つ又は2つのヘテロ原子を含み、L又はC(O)Lで置換され、フェニルはLで置換され、
RaはH、C〜Cアルキル、(CH0〜3−ヘテロシクリル又は(CH0〜3−フェニルであり、ここでヘテロシクリルは1つの飽和した5員又は6員の環、並びにN、O及びSから選択される1つ又は2つのヘテロ原子を含み、C〜Cアルキルで任意に置換され、フェニルはC〜Cアルキル、CN、ハロゲン、OH又はC〜Cアルコキシで任意に置換され、
Ra10はC〜Cアルキル、(CH0〜3−CN又は(CH0〜3−ハロゲンであり、
、Ra、Ra、nn1及びLは各々上記の式TL−Iにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
或る特定の実施形態では、nn1は0である。
或る特定の実施形態では、nn1は1である。
或る特定の実施形態では、nn1は2である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaはメチルである。更なる実施形態では、2つのRaはメチルである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはCN、(CH)−CN、(CH−CN、又は(CH−CNである。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaは(CH)−CNである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)、(CH)−ハロゲン,(CH−ハロゲン、又は(CH−ハロゲンである。更なる実施形態では、少なくとも1つのRaはCl、(CH)−Cl、(CH−Cl、又は(CH−Clである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはOH、(CH)OH、(CH−OH、又は(CH−OHである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)、(CH)−C〜Cアルコキシ、(CH−C〜Cアルコキシ、又は(CH−C〜Cアルコキシである。或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRaはメトキシである。
或る特定の実施形態では、Raはヘテロシクリル、(CH)−ヘテロシクリル、(CH−ヘテロシクリル、又は(CH−ヘテロシクリルである。更なる実施形態では、Raは(CH−ヘテロシクリルである。更なる実施形態では、ヘテロシクリルはピロリジニル、ピラゾリジニル、イミダゾリジニル、オキサゾリジニル、イソキサゾリジニル、チアゾリジニル、イソチアゾリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、ヘキサヒドロピリミジニル、モルホリニル、及びチオモルホリニルから選択される。更なる実施形態では、ヘテロシクリルはピペラジニルである。
或る特定の実施形態では、ヘテロシクリルはC(O)Lで置換される。
或る特定の実施形態では、ヘテロシクリルはLで置換される。
或る特定の実施形態では、Raはフェニル、(CH)−フェニル、(CH−フェニル、又は(CH−フェニルである。更なる実施形態では、Raはフェニルである。
或る特定の実施形態では、RaはLである。
或る特定の実施形態では、RaはHである。
或る特定の実施形態では、Raは直鎖C〜C又は分岐C〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、i−プロピル、ブチル、i−ブチル、t−ブチル、ペンチル、又はヘキシル)である。更なる実施形態では、Raはメチル、エチル、又はt−ブチルである。
或る特定の実施形態では、Raはヘテロシクリル、(CH)−ヘテロシクリル、(CH−ヘテロシクリル、又は(CH−ヘテロシクリルである。更なる実施形態では、Raは(CH−ヘテロシクリルである。更なる実施形態では、ヘテロシクリルは、ピロリジニル、ピラゾリジニル、イミダゾリジニル、オキサゾリジニル、イソキサゾリジニル、チアゾリジニル、イソチアゾリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、ヘキサヒドロピリミジニル、モルホリニル、及びチオモルホリニルから選択される。更なる実施形態では、ヘテロシクリルはピペラジニルである。
或る特定の実施形態では、ヘテロシクリルはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)で置換されている。
或る特定の実施形態では、Raはフェニル、(CH)−フェニル、(CH−フェニル、又は(CH−フェニルである。更なる実施形態では、Raはフェニルである。
或る特定の実施形態では、フェニルはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)で置換されている。或る特定の実施形態では、フェニルはCNで置換されている。或る特定の実施形態では、フェニルはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)で置換されている。或る特定の実施形態では、フェニルはOHで置換されている。或る特定の実施形態では、フェニルはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)で置換されている。
或る特定の実施形態では、Ra10はC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、Ra10はCN、(CH)−CN、(CH−CN、又は(CH−CNである。
或る特定の実施形態では、Ra10はハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)、(CH)−ハロゲン、(CH−ハロゲン、又は(CH−ハロゲンである。更なる実施形態では、Ra10はCl、(CH)−Cl、(CH−Cl、又は(CH−Clである。更なる実施形態では、Ra10はClである。
、Ra、Ra及びnn1は各々上記の式TL−I中の部分から選択することができる。A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra10及びnn1の1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−Iに記載されるようにA、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra10及びnn1の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I2:
(式中、A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2は各々上記の式TL−Iにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2は各々上記の式TL−I中の部分から選択することができる。A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2の1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−Iに記載されるようにA、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I2a〜TL−I2c:
(式中、A、Ra、Ra、nn1及びLは各々上記の式TL−Iにおいて規定される通りであり、Ra、Ra、Ra及びRa10は各々上記の式TL−I1a〜TL−I1dにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
、Ra、Ra及びnn1は各々上記の式TL−I中の部分から選択することができ、Ra、Ra、Ra及びRa10は各々上記の式TL−I1a〜TL−I1d中の部分から選択することができる。A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra10及びnn1の1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−I及びTL−I1a〜TL−I1dにおいて記載されるようにA、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra10及びnn1の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I3:
の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2は各々上記の式TL−Iにおいて規定される通りである。A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2は各々上記の式TL−I中の部分から選択することができる。A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2の1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−Iにおいて記載されるようにA、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、nn1及びnn2の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I3a〜TL−I3c:
(式中、
RaはC(O)NRaL、OL、NRaL又はLであり、
、Ra、Ra、nn1及びLは各々上記の式TL−Iにおいて規定される通りであり、
Ra、Ra、Ra及びRa10は各々上記の式TL−I1a〜TL−I1dにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
或る特定の実施形態では、RaはC(O)NRaLである。更なる実施形態では、RaはHである。他の実施形態では、RaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RaはOLである。
或る特定の実施形態では、RaはNRaLである。更なる実施形態では、RaはHである。他の実施形態では、RaはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Raはメチルである。
或る特定の実施形態では、RaはLである。
、Ra、Ra及びnn1は各々上記の式TL−I中の部分から選択することができ、Ra、Ra、Ra及びRa10は各々上記の式TL−I1a〜TL−I1d中の部分から選択することができる。A、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra10及びnn1の1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−I及びTL−I1a〜TL−I1dにおいて記載されるようにA、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra、Ra10及びnn1の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが式TL−II:
(式中、
はCRb又はNであり、
Rb、Rb及びRbは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
RbはC〜Cシクロアルキルであり、
Rbは各々独立してH、C〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
nn3は0、1、2又は3であり、
Rbは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
RbはC(O)NRbL、OL、NRbL又はLであり、
RbはH又はC〜Cアルキルであり、
Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
或る特定の実施形態では、TはCRbである。
或る特定の実施形態では、TはNである。
或る特定の実施形態では、RbはHである。或る特定の実施形態では、RbはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、Rbはメチルである。
或る特定の実施形態では、RbはHである。或る特定の実施形態では、RbはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、Rbはメチル又はエチルである。
或る特定の実施形態では、RbはHである。或る特定の実施形態では、RbはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、Rbはシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシルである。更なる実施形態では、Rbはシクロペンチルである。
或る特定の実施形態では、RbはHである。
或る特定の実施形態では、RbはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RbはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)である。
或る特定の実施形態では、RbはCNである。
或る特定の実施形態では、Rbはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)である。
或る特定の実施形態では、nn3は0である。
或る特定の実施形態では、nn3は1である。
或る特定の実施形態では、nn3は2である。
或る特定の実施形態では、nn3は3である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRbはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRbはメチルである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRbはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRbはメトキシである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRbはCNである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRbはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)である。
或る特定の実施形態では、RbはC(O)NRbLである。更なる実施形態では、RbはHである。他の実施形態では、RbはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RbはOLである。
或る特定の実施形態では、RbはNRbLである。更なる実施形態では、RbはHである。他の実施形態では、RbはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Rbはメチルである。
或る特定の実施形態では、RbはLである。
、Rb、Rb、Rb、Rb、Rb、Rb、Rb、Rb及びnn3の1つについて規定される部分は各々、T、Rb、Rb、Rb、Rb、Rb、Rb、Rb、Rb及びnn3の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、Rbはシクロペンチルであり、RbはC(O)NRbLである。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−II1:
(式中、T、Rb、Rb、Rb、Rb及びRbは各々上記の式TL−IIにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
、Rb、Rb、Rb、Rb及びRbは各々上記の式TL−IIにおいて記載される部分から選択することができる。T、Rb、Rb、Rb、Rb及びRbの1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−IIにおいて記載されるようにT、Rb、Rb、Rb、Rb及びRbの他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−II1a:
(式中、T、Rb及びRbは各々上記の式TL−IIにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
、Rb及びRbは各々上記の式TL−IIにおいて記載される部分から選択することができる。T、Rb及びRbの1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−IIにおいて記載されるようにT、Rb及びRbの他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが式TL−III:
(式中、
nn4は0又は1であり、
RcはC(O)NRcL、OL、NRcL又はLであり、
RcはH、C〜Cアルキル、C(O)NRcL、OL、NRcL又はLであり、
RcはH、C〜Cアルキル、C(O)L又はLであり、
nn5は0、1又は2であり、
Rcは各々独立してC〜Cアルキル又はC〜Cアルコキシであり、
Rcは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
Rcは独立してH又はC〜Cアルキルであり、
Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩であるが、
但し、前記式TL−IIIの化合物は1つのLでのみ置換される。
或る特定の実施形態では、nn4は0である。
或る特定の実施形態では、nn4は1である。
或る特定の実施形態では、RcはC(O)NRcLである。更なる実施形態では、RcはHである。他の実施形態では、RcはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RcはOLである。
或る特定の実施形態では、RcはNRcLである。更なる実施形態では、RcはHである。他の実施形態では、RcはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Rcはメチルである。
或る特定の実施形態では、RcはLである。
或る特定の実施形態では、RcはHである。
或る特定の実施形態では、RcはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、Rcはメチルである。
或る特定の実施形態では、RcはC(O)NRcLである。更なる実施形態では、RcはHである。他の実施形態では、RcはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RcはOLである。
或る特定の実施形態では、RcはNRcLである。更なる実施形態では、RcはHである。他の実施形態では、RcはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Rcはメチルである。
或る特定の実施形態では、RcはLである。
或る特定の実施形態では、RcはHである。
或る特定の実施形態では、RcはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RcはC(O)Lである。
或る特定の実施形態では、RcはLである。
或る特定の実施形態では、nn5は0である。
或る特定の実施形態では、nn5は1である。
或る特定の実施形態では、nn5は2である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRcはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRcはメチルである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRcはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRcはメトキシである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRcはHである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRcはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRcはメチルである。更なる実施形態では、2つのRcがメチルである。
Rc、Rc、Rc、Rc、Rc、Rc、nn4及びnn5の1つについて規定される部分は各々、Rc、Rc、Rc、Rc、Rc、Rc、nn4及びnn5の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−III1〜TL−III3:
(式中、Rc、Rc、Rc、Rc及びnn5は各々上記の式TL−IIIにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
Rc、Rc、Rc、Rc及びnn5は各々上記の式TL−IIIにおいて記載される部分から選択することができる。Rc、Rc、Rc、Rc及びnn5の1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−IIIにおいて記載されるようにRc、Rc、Rc、Rc及びnn5の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが式TL−IV:
(式中、
Rdは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
nn6は0、1、2又は3であり、
nn7は0、1、2又は3であり、
Rdは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
RdはC(O)NRdL、OL、NRdL又はLであり、
RdはH又はC〜Cアルキルであり、
Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
或る特定の実施形態では、RdはHである。
或る特定の実施形態では、RdはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、Rdはメチルである。
或る特定の実施形態では、nn6は0である。
或る特定の実施形態では、nn6は1である。
或る特定の実施形態では、nn6は2である。
或る特定の実施形態では、nn6は3である。
或る特定の実施形態では、nn7は0である。
或る特定の実施形態では、nn7は1である。
或る特定の実施形態では、nn7は2である。
或る特定の実施形態では、nn7は3である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRdはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRdはメチルである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRdはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRdはメトキシである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRdはCNである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRdはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)である。
或る特定の実施形態では、RdはC(O)NRdLである。更なる実施形態では、RdはHである。他の実施形態では、RdはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RdはOLである。
或る特定の実施形態では、RdはNRdLである。更なる実施形態では、RdはHである。他の実施形態では、RdはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Rdはメチルである。
或る特定の実施形態では、RdはLである。
Rd、Rd、Rd、Rd、nn6及びnn7の1つについて規定される部分は各々、Rd、Rd、Rd、Rd、nn6及びnn7の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−IV1:
(式中、Rdは上記の式TL−IVにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
Rdは上の式TL−IVに記載の部分から選択することができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが式TL−V:
(式中、
Reは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
nn8は0、1、2又は3であり、
nn9は0、1、2又は3であり、
Reは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
ReはNH−(CH1〜3−C(O)NReL、C(O)NReL、OL、NReL又はLであり、
ReはH又はC〜Cアルキルであり、
Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
或る特定の実施形態では、ReはHである。
或る特定の実施形態では、ReはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、Reはメチルである。
或る特定の実施形態では、nn8は0である。
或る特定の実施形態では、nn8は1である。
或る特定の実施形態では、nn8は2である。
或る特定の実施形態では、nn8は3である。
或る特定の実施形態では、nn9は0である。
或る特定の実施形態では、nn9は1である。
或る特定の実施形態では、nn9は2である。
或る特定の実施形態では、nn9は3である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのReはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのReはメチルである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのReはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのReはメトキシである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのReはCNである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのReはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)である。
或る特定の実施形態では、ReはNH−CH−C(O)NReL、NH−(CH−C(O)NReL、又はNH−(CH−C(O)NReLである。更なる実施形態では、ReはNH−CH−C(O)NReLである。更なる実施形態では、ReはHである。他の実施形態では、ReはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、ReはC(O)NReLである。更なる実施形態では、ReはHである。他の実施形態では、ReはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、ReはOLである。
或る特定の実施形態では、ReはNReLである。更なる実施形態では、ReはHである。他の実施形態では、ReはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Reはメチルである。
或る特定の実施形態では、ReはLである。
Re、Re、Re、Re、nn8及びnn9の1つについて規定される部分は各々、Re、Re、Re、Re、nn8及びnn9の他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−V1:
(式中、Reは上記の式TL−Vにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
Reは上の式TL−Vに記載の部分から選択することができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが式TL−VI:
(式中、
RfはC(O)NRfL、OL、NRfL又はLであり、
Rfは独立してH又はC〜Cアルキルであり、
Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
或る特定の実施形態では、RfはC(O)NRfLである。更なる実施形態では、RfはHである。他の実施形態では、RfはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RfはOLである。
或る特定の実施形態では、RfはNReLである。更なる実施形態では、RfはHである。他の実施形態では、RfはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Rfはメチルである。
或る特定の実施形態では、RfはLである。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが式TL−VII:
(式中、
はCH又はCHCHであり、
RgはC(O)Rg、又はRgで置換されたC〜Cアルキルであり、
nn10は0、1、2又は3であり、
nn11は0、1、2又は3であり、
Rgは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
RgはC(O)NRgL、OL、NRgL、L、O−(CH1〜3−C(O)NRgL又はNHC(O)−(CH1〜3−C(O)NRgLであり、
RgはH又はC〜Cアルキルであり、
RgはC〜Cアルキルであり、
RgはC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンで任意に置換されたフェニルであり、
Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
或る特定の実施形態では、TはCHである。
或る特定の実施形態では、TはCHCHである。
或る特定の実施形態では、RgはC(O)Rgである。
或る特定の実施形態では、Rgは(CH)−Rg、(CH−Rg、(CHRg)−CH、(CH−Rg、(CHRg)−CHCH、又はCH−(CHRg)−CHである。或る特定の実施形態では、Rgは(CH)−Rgである。或る特定の実施形態では、Rgは(CHRg)−CHCHである。
或る特定の実施形態では、Rgは直鎖C〜C又は分岐C〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、i−プロピル、ブチル、i−ブチル、t−ブチル、ペンチル、又はヘキシル)である。
或る特定の実施形態では、Rgは非置換フェニルである。
或る特定の実施形態では、Rgは、C〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)、C〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)、CN、及びハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)から独立して選択される1つ、2つ、3つ、又はそれ以上の置換基で置換されたフェニルである。
或る特定の実施形態では、nn10は0である。
或る特定の実施形態では、nn10は1である。
或る特定の実施形態では、nn10は2である。
或る特定の実施形態では、nn10は3である。
或る特定の実施形態では、nn11は0である。
或る特定の実施形態では、nn11は1である。
或る特定の実施形態では、nn11は2である。
或る特定の実施形態では、nn11は3である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRgはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRgはメチルである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRgはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)である。更なる実施形態では、少なくとも1つのRgはメトキシである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRgはCNである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRgはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)である。
或る特定の実施形態では、RgはC(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはHである。他の実施形態では、RgはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RgはOLである。
或る特定の実施形態では、RgはNRgLである。更なる実施形態では、RgはHである。他の実施形態では、RgはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。他の実施形態では、Rgはメチルである。
或る特定の実施形態では、RgはLである。
或る特定の実施形態では、RgはO−(CH)−C(O)NRgL、O−(CH−C(O)NRgL、又はO−(CH−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはO−(CH)−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはHである。他の実施形態では、RgはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RgはNHC(O)−(CH)−C(O)NRgL、NHC(O)−(CH−C(O)NRgL、又はNHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはNHC(O)−(CH)−C(O)NRgL、NHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはNHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはHである。他の実施形態では、RgはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
、nn10、nn11、Rg、Rg、Rg、Rg、Rg及びRgの1つについて規定される部分は各々、T、nn10、nn11、Rg、Rg、Rg、Rg、Rg及びRgの他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−VII1:
(式中、T、Rg、Rg、Rg、Rg、Rg及びRgは各々上記の式TL−VIIにおいて規定される通りである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
、Rg、Rg、Rg、Rg、Rg及びRgは各々上記の式TL−VIIにおいて記載される部分から選択することができる。T、Rg、Rg、Rg、Rg、Rg及びRgの1つについて規定される部分は各々、上記の式TL−VIIにおいて記載されるようにT、Rg、Rg、Rg、Rg、Rg及びRgの他について規定される部分のいずれかと組み合わせることができる。
或る特定の実施形態では、TはCHである。
或る特定の実施形態では、TはCHCHである。
或る特定の実施形態では、RgはC(O)Rgである。
或る特定の実施形態では、Rgは(CH)−Rg、(CH−Rg、(CHRg)−CH、(CH−Rg、(CHRg)−CHCH、又はCH−(CHRg)−CHである。或る特定の実施形態では、Rgは(CH)−Rgである。或る特定の実施形態では、Rgは(CHRg)−CHCHである。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRgはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)である。更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシである。
或る特定の実施形態では、RgはO−(CH)−C(O)NRgL、O−(CH−C(O)NRgL、又はO−(CH−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはO−(CH)−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはHである。他の実施形態では、RgはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RgはNHC(O)−(CH)−C(O)NRgL、NHC(O)−(CH−C(O)NRgL、又はNHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはNHC(O)−(CH)−C(O)NRgL、NHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはNHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。更なる実施形態では、RgはHである。他の実施形態では、RgはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHであり、RgはC(O)Rgである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHであり、RgはC(O)Rgであり、RgはO−(CH)−C(O)NRgLである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHであり、RgはC(O)Rgであり、RgはNHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHであり、Rgは(CHRg)−CHCHである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHであり、Rgは(CHRg)−CHCHであり、RgはO−(CH)−C(O)NRgLである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHであり、Rgは(CHRg)−CHCHであり、RgはNHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHCHであり、RgはC(O)Rgである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHCHであり、RgはC(O)Rgであり、RgはO−(CH)−C(O)NRgLである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHCHであり、RgはC(O)Rgであり、RgはNHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHCHであり、Rgは(CHRg)−CHCHである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHCHであり、Rgは(CHRg)−CHCHであり、RgはO−(CH)−C(O)NRgLである。
更なる実施形態では、Rgは両方ともメトキシであり、TはCHCHであり、Rgは(CHRg)−CHCHであり、RgはNHC(O)−(CH−C(O)NRgLである。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドが式TL−VIII:
(式中、
Rhは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
nn12は0、1、2又は3であり、
Rhは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
RhはC(O)L又はC(O)−(CH1〜3−C(O)NRhLであり、
RhはH又はC〜Cアルキルであり、
RhはH又はC〜Cアルキルであり、
RhはC〜Cアルキルであり、
Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である。
或る特定の実施形態では、RhはHである。他の実施形態では、RhはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、nn12は0である。
或る特定の実施形態では、nn12は1である。
或る特定の実施形態では、nn12は2である。
或る特定の実施形態では、nn12は3である。
或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRhはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRhはC〜Cアルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、又はプロポキシ)である。或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRhはCNである。或る特定の実施形態では、少なくとも1つのRhはハロゲン(例えば、F、Cl、又はBr)である。
或る特定の実施形態では、RhはC(O)Lである。
或る特定の実施形態では、RhはC(O)−(CH)−C(O)NRhL、C(O)−(CH−C(O)NRhL、C(O)−(CH−C(O)NRhLである。或る特定の実施形態では、RhはC(O)−(CH−C(O)NRhLである。
或る特定の実施形態では、RhはHである。他の実施形態では、RhはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。
或る特定の実施形態では、RhはHである。他の実施形態では、RhはC〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、又はi−プロピル)である。或る特定の実施形態では、Rhはメチルである。
或る特定の実施形態では、Rhは直鎖C〜C又は分岐C〜Cアルキル(例えば、メチル、エチル、プロピル、i−プロピル、ブチル、i−ブチル、t−ブチル、ペンチル、又はヘキシル)である。或る特定の実施形態では、Rhはt−ブチルである。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは以下の表T:
(式中、Rはリンカーである)中から選択される。
或る特定の実施形態では、TL又は標的はリンカーに適合し得る機能的位置を有する強力かつ選択的なリガンドを呈する存在(既知の標的タンパク質結合部分)及び能力に基づいて選ばれる。一部の実施形態は、化合物の選択性又は標的IDの尺度としてのプロテオミクスに加えて分解によって利益を得る可能性がある、より選択性の低い標的に関する。かかる場合としては、a)阻害によって標的化されることができない多数の機能性を有する標的;b)それらの結合を変更することなく阻害剤に耐性を示す標的;c)標的の機能を変更しないリガンドを有する標的;及びd)不可逆的阻害によって利益を得るが、共有結合性リガンドにより標的化され得る反応残基を欠いた標的が挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態では、本願はタンパク質機能の阻害剤に対して多数の利点を有し、a)或る特定の場合に耐性を克服し、b)再合成を必要とするタンパク質を破壊することによって小分子が代謝された後であっても薬物効果の動態を延長し、c)特定の触媒活性又は結合事象ではなくタンパク質の全ての機能を一度に標的化し、d)活性が小分子阻害剤、アンタゴニスト又はアゴニストの影響を受ける可能性があるタンパク質ではなくリガンドを呈し得る全てのタンパク質を含めることによって薬物標的の数を増やし、e)小分子が触媒的に作用する可能性のために阻害剤と比較して増大した効力を有することができるタンパク質分解の小分子誘導物質に関する。
本願の一部の実施形態は、30%〜100%の標的タンパク質の分解又は喪失に関する。或る特定の実施形態は、50%〜100%の標的タンパク質の喪失に関する。他の実施形態は、75%〜95%の標的タンパク質の喪失に関する。
本願の一部の実施形態は、表Iに示されるような以下の構造を有する二官能性化合物、それらの合成及び使用方法に関する。
或る特定の実施形態では、本願の二官能性化合物(例えば、本明細書に記載される式のいずれかの二官能性化合物、又は本明細書に記載される任意の二官能性化合物から選択される二官能性化合物)は、二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合した標的指向性リガンドよりも疾患又は病態(例えば癌)の治療に有効である。或る特定の実施形態では、本願の二官能性化合物(例えば、本明細書に記載される式のいずれかの二官能性化合物、又は本明細書に記載される任意の二官能性化合物から選択される二官能性化合物)は、二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合した標的指向性リガンドに耐性を示す疾患又は病態(例えば癌)を治療することが可能である。
或る特定の実施形態では、(二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合した)標的指向性リガンドよりも疾患若しくは病態の治療に有効であるか、又はそれに耐性を示す疾患若しくは病態を治療することが可能な本願の二官能性化合物は、標的指向性リガンド、本明細書に記載されるリンカー及び式D0、D、D0’、D’、D1、D2、D3、D’1、D’3、D0’I、D0’II又はD0’IIIのデグロンを含む。更なる実施形態では、二官能性化合物は標的指向性リガンド及び本明細書に記載されるリンカー及び式D1のデグロンを含む。更なる実施形態では、デグロンは表Dから選択される。更なる実施形態では、デグロンは表D1から選択される。更なる実施形態では、デグロンは表D2から選択される。更なる実施形態では、デグロンは表D3中のもの及びその誘導体から選択される。更なる実施形態では、デグロンは表D4中のもの及びその誘導体から選択される。更なる実施形態では、デグロンは、
(式中、Rはリンカーである)である。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンド(二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合する)よりも疾患若しくは病態の治療に有効であるか、又はそれに耐性を示す疾患若しくは病態を治療することが可能な本願の二官能性化合物は標的指向性リガンド、本明細書に記載されるデグロン及び式L0〜L9のいずれかのリンカーを含む。更なる実施形態では、リンカーは表Lから選択される。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンド(二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合する)よりも疾患若しくは病態の治療に有効であるか、又はそれに耐性を示す疾患若しくは病態を治療することが可能な本願の二官能性化合物は標的指向性リガンド、並びにDL、DLa及びDLbから選択されるデグロン−リンカーを含む。更なる実施形態では、デグロン−リンカーはDLa1、DLa2及びDLa3から選択される。更なる実施形態では、デグロン−リンカーはDLa1A又はDLa2Aである。更なる実施形態では、デグロン−リンカーはDL1〜DL7から選択される。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンド(二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合する)よりも疾患若しくは病態の治療に有効であるか、又はそれに耐性を示す疾患若しくは病態を治療することが可能な本願の二官能性化合物はリンカー、並びに本明細書に記載されるデグロン、並びにHsp90阻害剤、キナーゼ阻害剤、MDM2阻害剤、ヒトBETブロモドメイン含有タンパク質を標的化する化合物、細胞質シグナル伝達タンパク質FKBP12を標的化する化合物、HDAC阻害剤、ヒトリシンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、血管形成阻害剤、免疫抑制化合物、及び芳香族炭化水素受容体(AHR)を標的化する化合物から選択される標的指向性リガンドを含む。更なる実施形態では、標的指向性リガンドはキナーゼ、BETブロモドメイン含有タンパク質、細胞質シグナル伝達タンパク質(例えばFKBP12)、核タンパク質、ヒストンデアセチラーゼ、リシンメチルトランスフェラーゼ、血管形成を調節するタンパク質、免疫応答を調節するタンパク質、芳香族炭化水素受容体(AHR)、エストロゲン受容体、アンドロゲン受容体、グルココルチコイド受容体、又は転写因子(例えばSMARCA4、SMARCA2、TRIM24)に結合することが可能な又は結合する化合物である。更なる実施形態では、標的指向性リガンドはBETブロモドメイン含有タンパク質又は細胞質シグナル伝達タンパク質に結合することが可能な又は結合する化合物である。更なる実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I〜TL−VIIのいずれか1つである。更なる実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I1、TL−I1a〜TL−I1d、TL−I2、TL−I2a〜TL−I2c、TL−I3、TL−I3a〜TL−I3c、TL−II1、TL−II1a、TL−III1〜TL−III3、TL−IV1及びTL−V1のいずれか1つである。更なる実施形態では、標的指向性リガンドは式TL−I1、TL−I1a〜TL−I1d、TL−I2、TL−I2a〜TL−I2c、TL−I3及びTL−I3a〜TL−I3cのいずれか1つである。更なる実施形態では、標的指向性リガンドはTL1〜TL7のいずれか1つから選択される。更なる実施形態では、標的指向性リガンドはTL2である。或る特定の実施形態では、標的指向性リガンドは表Tから選択される。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンド(二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合する)よりも疾患若しくは病態の治療に有効であるか、又はそれに耐性を示す疾患若しくは病態を治療することが可能な本願の二官能性化合物はdBET1〜dBET16、dGR1〜dGR3及びdFKBP1〜dFKBP9から選択される。更なる実施形態では、二官能性化合物はdBET1〜dBET16から選択される。更なる実施形態では、二官能性化合物はdBET6である。
或る特定の実施形態では、標的指向性リガンド(二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合する)よりも疾患若しくは病態の治療に有効であるか、又はそれに耐性を示す疾患若しくは病態を治療することが可能な本願の二官能性化合物は、細胞(例えば癌細胞)の成長の阻害又は細胞(例えば癌細胞)の生存能力の減少の点で標的指向性リガンドよりも強力である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物は、細胞の成長を阻害する又は生存能力を減少させるための標的指向性リガンドのIC50よりも低いIC50で細胞(例えば癌細胞)の成長を阻害するか、又は細胞(例えば癌細胞)の生存能力を減少させる。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のIC50は標的指向性リガンドのIC50の最大でも90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、8%、5%、4%、3%、2%、1%、0.8%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%又は0.1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のIC50は標的指向性リガンドのIC50の最大でも50%、40%、30%、20%、10%、8%、5%、4%、3%、2%、1%、0.8%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%又は0.1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のIC50は標的指向性リガンドのIC50の最大でも30%、20%、10%、8%、5%、4%、3%、2%、1%、0.8%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%又は0.1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のIC50は標的指向性リガンドのIC50の最大でも10%、8%、5%、4%、3%、2%、1%、0.8%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%又は0.1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のIC50は標的指向性リガンドのIC50の最大でも5%、4%、3%、2%、1%、0.8%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%又は0.1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のIC50は標的指向性リガンドのIC50の最大でも2%、1%、0.8%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%又は0.1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のIC50は標的指向性リガンドのIC50の最大でも1%、0.8%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%又は0.1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物は、細胞の成長を阻害する又は生存能力を減少させる標的指向性リガンドのEmaxよりも低いEmaxで細胞(例えば癌細胞)の成長を阻害するか、又は細胞(例えば癌細胞)の生存能力を減少させる。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のEmaxは標的指向性リガンドのEmaxの最大でも90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、8%、5%、4%、3%、2%又は1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のEmaxは標的指向性リガンドのEmaxの最大でも50%、40%、30%、20%、10%、8%、5%、4%、3%、2%又は1%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のEmaxは標的指向性リガンドのEmaxの最大でも90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%又は10%である。或る特定の実施形態では、二官能性化合物のEmaxは標的指向性リガンドのEmaxの最大でも90%、80%、70%、60%、50%、40%又は30%である。
或る特定の実施形態では、本願の二官能性化合物は標的指向性リガンド(二官能性化合物中のリンカー及びデグロンに共有結合する)よりも疾患若しくは病態の治療に有効であるか、又はそれに耐性を示す疾患若しくは病態を治療することが可能であり、該疾患又は病態は癌(例えば、本明細書に記載される癌)である。更なる実施形態では、癌は膀胱癌、脳癌、乳癌、結腸癌、胃癌、腎臓癌、肝臓癌、肺癌、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、星状細胞腫、神経膠芽腫、白血病、リンパ腫、黒色腫、及び神経芽細胞腫から選択される。更なる実施形態では、癌は乳癌、胃癌、肺癌、膵臓癌、星状細胞腫、リンパ腫、黒色腫、及び神経芽細胞腫から選択される。
上述の化合物の一部は1つ以上の不斉中心を含んでいてもよく、したがって様々な異性体、例えば立体異性体及び/又はジアステレオマーで存在し得る。このため、本発明の化合物及びその医薬組成物は個々のエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは幾何異性体の形態であっても、又は立体異性体の混合物の形態であってもよい。或る特定の実施形態では、本願の化合物はエナンチオピュアな(enantiopure)化合物である。或る特定の他の実施形態では、立体異性体又はジアステレオマーの混合物が提供される。
さらに、本明細書に記載される或る特定の化合物は他に指定のない限り、1つ以上の二重結合を有していてもよく、Z異性体又はE異性体として存在し得る。本願は付加的に、実質的に他の異性体を含まない個々の異性体として、また代替的には、様々な異性体の混合物、例えば立体異性体のラセミ混合物として化合物を包含する。上述の化合物自体に加えて、本願はこれらの化合物の薬学的に許容可能な誘導体、及び1つ以上の本願の化合物と1つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤又は添加剤とを含む組成物も包含する。
本開示は、本発明の化合物中に生じる原子の全ての同位体を含むことを意図したものである。同位体は同じ原子番号を有するが、異なる質量数を有する原子を含む。一般的な例として、限定されるものではないが、水素の同位体は三重水素及び重水素を含み、炭素の同位体はC−13及びC−14を含む。例えば、本明細書に開示される式のいずれかの或る特定の可変部分(例えばR’、R、R及びRのいずれか)はH、すなわち水素であり、水素又は重水素のいずれかであってもよい。
本願の化合物は異なる条件下での化合物の結晶化によって調製することができ、本願の一部を形成する化合物の多形の1つ又は組合せとして存在し得る。例えば、異なる多形は異なる溶媒又は異なる溶媒の混合物を再結晶化に用いること、異なる温度で結晶化を行うこと、又は結晶化中に非常に急速な冷却から非常に緩徐な冷却に及ぶ様々な冷却様式を使用することによって特定及び/又は調製することができる。多形は化合物を加熱又は融解し、続いて徐々に又は急速に冷却することによっても得ることができる。多形の存在は固体プローブNMR分光法、IR分光法、示差走査熱量測定、粉末X線回折及び/又は他の技法によって決定することができる。このため、本願は本発明の化合物、それらの誘導体、それらの互変異性体形態、それらの立体異性体、それらの多形、それらの薬学的に許容可能な塩、それらの薬学的に許容可能な溶媒和物、及びそれらを含有する薬学的に許容可能な組成物を包含する。
或る特定の実施形態では、本願の化合物は抗癌剤として有用であるため、腫瘍細胞死を達成するか又は腫瘍細胞の成長を阻害することによる癌の治療に有用であり得る。或る特定の例示的な実施形態では、開示される抗癌剤は癌及び他の増殖性障害の治療に有用であり、このような障害には乳癌、子宮頸癌、結腸及び直腸癌、白血病、肺癌、黒色腫、多発性骨髄腫、非ホジキンリンパ腫、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、胃癌、白血病(例えば、骨髄(myeloid)、リンパ球性、骨髄球性(myelocytic)及びリンパ芽球性の白血病)、悪性黒色腫、T細胞リンパ腫が挙げられるが、これらに限定されない。
本願の化合物の合成
本願の二官能性化合物を調製する例示的な合成スキームを下記に示す。
本願の一態様では、或る特定の化合物のデグロン−リンカー部分のコア構造を合成する方法であって、
a)tert−ブチル(2−アミノエチル)カルバメート又はその類似体(例えばn=1〜20)(1)又はその類似体(例えばn=1〜20)と塩化クロロアセチルとを好適な条件下で反応させ、tert−ブチル(2−(2−クロロアセトアミド)エチル)カルバメート又はその類似体(例えばn=1〜20)(2)を生成する工程と、
b)tert−ブチル(2−(2−クロロアセトアミド)エチル)カルバメート又はその類似体(2)とジメチル3−ヒドロキシフタレートとを好適な条件下で反応させ、ジメチル3−(2−((2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)エチル)アミノ)−2−オキソエトキシ)フタレート又はその類似体(3)を得る工程と、
c)ジメチル3−(2−((2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)エチル)アミノ)−2−オキソエトキシ)フタレート又はその類似体(3)と強塩基、続いて3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩とを反応させ、tert−ブチル(2−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)エチル)カルバメート又はその類似体(4)を生成する工程と、
d)化合物(4)を脱保護し、ジアミノエチル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテート又はその類似体(5)を得る工程と、
を含む、方法を提供する。
ジアミノブチル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートは、Fischer et al. Nature, 2014, 512, 49-53の手順に従って調製することができる。
本願の別の態様では、例示的な二官能性化合物を合成する方法であって、デグロン−リンカー部分、例えば化合物(5)と標的リガンドR−化合物の酸誘導体(6)とを好適な条件下で反応させ、二官能性化合物(7)を得ることを含む、方法を提供する。
当業者には、本教示及び当該技術分野で既知の教示に基づいて、本願の化合物のいずれかを調製することができることが認められる。
本願のまた別の態様では、或る特定の本願の化合物の調製に有用な中間体を作製する方法が提供される。
本願の幾つかの態様では、デグロン−リンカー中間体は以下の工程に従って調製することができる:
DL5:
DL6:
DL7:
本願の他の態様では、二官能性化合物dBET1〜dBET6は以下のスキームに従い、ブロモドメインを標的化する部分を使用して調製することができる:
dBET1:
dBET2:
dBET3:
dBET4:
dBET5:
dBET6:
本願の他の態様では、二官能性化合物dGR1及びdGR2は以下のスキームに従い、TL4標的部分(デキサメタゾン)を使用して調製することができる:
dGR1:
dGR2:
本開示の他の実施形態では、二官能性化合物dFKBP−1及びdFKBP−2は以下のスキームに示されるようにTL5標的部分(AP1479)を使用し、上記に例示される一般的方法に従って調製することができる:
dFKBP−1:
dFKBP−2:
アミノ酸−サリドマイドリンカーの合成スキーム
或る特定の実施形態では、上記の方法は溶液相中で行われる。或る特定の他の実施形態では、上記の方法は固相上で行われる。或る特定の実施形態では、合成法はハイスループット法又はコンビナトリアル化学に一般に用いられる技法に適している。
医薬組成物
したがって、本願の別の態様では、本明細書に記載される化合物のいずれか(又はそのプロドラッグ、薬学的に許容可能な塩若しくは他の薬学的に許容可能な誘導体)を含み、任意に薬学的に許容可能な担体を含む医薬組成物が提供される。或る特定の実施形態では、これらの組成物は任意に1つ以上の付加的な治療剤を更に含む。代替的には、本願の化合物は、それを必要とする患者に1つ以上の他の治療剤の投与と組み合わせて投与することができる。例えば、共同投与(conjoint administration)又は本願の化合物とともに医薬組成物に加えるための付加的な治療剤は、例えば承認済みの化学療法剤であっても、又は最終的に細胞過剰増殖と関連する任意の障害の治療についての認可が得られる、アメリカ食品医薬品局において認可を受けようとしている多数の作用物質のいずれか1つであってもよい。或る特定の他の実施形態では、付加的な治療剤は本明細書でより詳細に論考されるように抗癌剤である。
或る特定の本願の化合物が治療のための遊離形態で、又は適切な場合にはその薬学的に許容可能な誘導体として存在し得ることも認識される。本願によると、薬学的に許容可能な誘導体としては、本願の化合物の薬学的に許容可能な塩、エステル、かかるエステルの塩又は必要性を有する患者へ投与することで、本明細書に記載される別の形で若しくはその代謝産物若しくは残基として直接若しくは間接的に化合物をもたらすことが可能なプロドラッグ、若しくは他の付加物若しくは誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容可能な塩」という用語は、堅実な医学的判断の範囲内で過度の毒性、炎症、アレルギー応答等なしにヒト及び下等動物の組織と接触させて使用するのに好適であり、妥当なベネフィット/リスク比に見合った塩を指す。アミン、カルボン酸及び他のタイプの化合物の薬学的に許容可能な塩は当該技術分野で既知である。例えば、S. M. Berge, et al.は、J Pharmaceutical Sciences, 66:1-19 (1977)(引用することにより本明細書の一部をなす)において薬学的に許容可能な塩を詳細に記載している。塩は本願の化合物の最終単離及び精製中にin situで、又は下記に概説されるように遊離塩基若しくは遊離酸官能基と好適な試薬とを反応させることによって別個に調製することができる。例えば、遊離塩基官能基を好適な酸と反応させることができる。さらに、本願の化合物が酸性部分を保有する場合、好適なその薬学的に許容可能な塩としては、アルカリ金属塩、例えばナトリウム塩又はカリウム塩、及びアルカリ土類金属塩、例えばカルシウム塩又はマグネシウム塩等の金属塩を挙げることができる。薬学的に許容可能な非毒性の酸付加塩の例は、塩酸、臭化水素酸、リン酸、硫酸及び過塩素酸等の無機酸によって、又は酢酸、シュウ酸、マレイン酸、酒石酸、クエン酸、コハク酸若しくはマロン酸等の有機酸によって、又はイオン交換等の当該技術分野で用いられる他の方法を使用することにより生成されるアミノ基の塩である。他の薬学的に許容可能な塩としては、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グルコへプトン酸塩、グリセロリン酸塩、グルコン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ヨウ化水素酸塩、2−ヒドロキシ−エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3−フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸、p−トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩等が挙げられる。代表的なアルカリ金属塩又はアルカリ土類金属塩としては、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウム等の塩が挙げられる。更なる薬学的に許容可能な塩としては、適切な場合、ハロゲン化物イオン、水酸化物イオン、カルボン酸イオン、硫酸イオン、リン酸イオン、硝酸イオン、低級アルキルスルホン酸イオン及びアリールスルホン酸イオン等の対イオンを用いて生成される非毒性のアンモニウム、第四級アンモニウム及びアミンのカチオンが挙げられる。
付加的に、本明細書で使用される場合、「薬学的に許容可能なエステル」という用語は、in vivoで加水分解するエステルを指し、ヒト体内で容易に分解されて親化合物を離れるもの又はその塩を含む。好適なエステル基としては、例えば各々のアルキル又はアルケニル部分が有利には6つを超えない炭素原子を有する、薬学的に許容可能な脂肪族カルボン酸、特にアルカン酸、アルケン酸、シクロアルカン酸及びアルカンジオール酸に由来するものが挙げられる。特定のエステルの例としては、ホルメート、アセテート、プロピオネート、ブチレート、アクリレート及びエチルスクシネートが挙げられる。
さらに、「薬学的に許容可能なプロドラッグ」という用語は本明細書で使用される場合、堅実な医学的判断の範囲内で過度の毒性、炎症、アレルギー応答等なしにヒト及び下等動物の組織と接触させて使用するのに好適であり、妥当なベネフィット/リスク比に見合い、それらの使用目的に効果的な本願の化合物のプロドラッグ、並びに可能な場合に本願の化合物の双性イオン形態を指す。「プロドラッグ」という用語は、例えば血中での加水分解によってin vivoで急速に変換され、上記の式の親化合物をもたらす化合物を指す。十分な論考がT. Higuchi and V. Stella, Pro-drugs as Novel Delivery Systems, Vol. 14 of the A.C.S. Symposium Series及びEdward B. Roche, ed., Bioreversible Carriers in Drug Design, American Pharmaceutical Association and Pergamon Press, 1987(どちらも引用することにより本明細書の一部をなす)に提示される。
上記のように、本願の医薬組成物は薬学的に許容可能な担体を付加的に含み、これには本明細書で使用される場合、所望の特定の投薬形態に適した任意の全ての溶媒、希釈剤又は他の液体ビヒクル、分散液又は懸濁助剤、界面活性剤、等張剤、増粘剤又は乳化剤、防腐剤、固体結合剤、滑沢剤等が含まれる。Remington's Pharmaceutical Sciences, Sixteenth Edition, E. W. Martin (Mack Publishing Co., Easton, Pa., 1980)は、医薬組成物の配合及びその調製のための既知の技法に使用される様々な担体を開示している。任意の従来の担体媒体が、例えば任意の望ましくない生物学的効果を生じるか、又は医薬組成物の任意の他の構成成分(複数の場合もある)と別の形で有害に相互作用することで本願の化合物と不適合である場合を除いて、その使用が本願の範囲内であると企図される。薬学的に許容可能な担体として働くことができる物質の幾つかの例としては、限定されるものではないが、ラクトース、グルコース及びスクロース等の糖;トウモロコシデンプン及びジャガイモデンプン等のデンプン;カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース及び酢酸セルロース等のセルロース及びその誘導体;トラガカント末;モルト;ゼラチン;タルク;ココアバター及び坐剤ワックス等の賦形剤;ピーナッツ油、綿実油等の油;紅花油、ゴマ油;オリーブ油;トウモロコシ油及びダイズ油;プロピレングリコール等のグリコール;オレイン酸エチル及びラウリン酸エチル等のエステル;寒天;水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウム等の緩衝剤;アルギン酸;発熱性物質除去水;等張食塩水;リンガー液;エチルアルコール、及びリン酸緩衝液、並びにラウリル硫酸ナトリウム及びステアリン酸マグネシウム等の他の非毒性の相溶性のある滑沢剤、並びに着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味剤、香料剤及び着香剤、防腐剤及び抗酸化剤が挙げられ、これらは配合者の判断に従って組成物中に存在していてもよい。
経口投与用の液体投薬形態としては、薬学的に許容可能なエマルション、マイクロエマルション、溶液、懸濁液、シロップ及びエリキシルが挙げられるが、これらに限定されない。活性化合物の他に、液体投薬形態は、例えば水、又はエチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、1,3−ブチレングリコール、ジメチルホルムアミド、油(特に綿実油、落花生油、トウモロコシ油、胚芽油、オリーブ油、ヒマシ油及びゴマ油)、グリセロール、テトラヒドロフルフリルアルコール、ポリエチレングリコール及びソルビタンの脂肪酸エステル等の他の溶媒、可溶化剤及び乳化剤、並びにそれらの混合物等の当該技術分野で一般的に使用される不活性希釈剤を含有することができる。不活性希釈剤の他に、経口組成物には湿潤剤、乳化剤及び懸濁化剤、甘味剤、香料剤、並びに着香剤等の補助剤が含まれていてもよい。
注射用調製物、例えば滅菌注射用水性又は油性懸濁液は既知の技術に従い、好適な分散剤又は湿潤剤及び懸濁化剤を使用して配合することができる。滅菌注射用調製物は非毒性の非経口的に許容可能な希釈剤又は溶媒中の、例えば1,3−ブタンジオール溶液としての滅菌注射用溶液、懸濁液又はエマルションであってもよい。用いることができる許容可能なビヒクル及び溶媒には、水、リンガー液、U.S.P.及び生理食塩液がある。加えて、滅菌不揮発性油が溶媒又は懸濁媒として従来用いられている。この目的で、合成モノグリセリド又はジグリセリドを含む任意の無刺激不揮発性油を用いることができる。加えて、オレイン酸等の脂肪酸が注射剤の調製に使用される。
注射用配合物は、例えば細菌保持フィルターを通した濾過によって、又は滅菌水若しくは他の滅菌注射用媒体に使用前に溶解若しくは分散させることができる滅菌固体組成物の形態で滅菌剤を組み込むことによって滅菌することができる。
薬物の効果を持続させるために、皮下注射又は筋肉内注射からの薬物の吸収を遅らせることが望ましいことが多い。これは液体懸濁液、又は低水溶性の結晶性物質若しくは非晶質物質の使用によって達成することができる。この場合、薬物の吸収速度はその溶解速度によって決まり、ひいては結晶サイズ及び結晶形によって決まり得る。代替的には、非経口的に投与される薬物形態の遅延吸収は、薬物を油ビヒクルに溶解又は懸濁することによって達成される。注射用デポー形態は、ポリラクチド−ポリグリコリド等の生分解性ポリマー中で薬物のマイクロカプセルマトリクスを形成することによって作製される。薬物とポリマーとの比率及び用いられる特定のポリマーの性質に応じて、薬物放出速度を制御することができる。他の生分解性ポリマーの例としては、ポリ(オルトエステル)及びポリ(無水物)が挙げられる。デポー注射用配合物は、薬物を体組織に適合するリポソーム又はマイクロエマルションに封入することによっても調製される。
直腸投与又は膣内投与用の組成物は好ましくは坐剤であり、これは本願の化合物と、常温で固体であるが、体温では液体となるため、直腸又は膣腔内で融解して活性化合物を放出するココアバター、ポリエチレングリコール又は坐剤ワックス等の好適な非刺激性賦形剤又は担体とを混合することによって調製することができる。
経口投与用の固形投薬形態としては、カプセル、錠剤、丸薬、粉末及び顆粒が挙げられる。このような固体投薬形態では、活性化合物が、クエン酸ナトリウム若しくはリン酸二カルシウム等の少なくとも1つの不活性な薬学的に許容可能な賦形剤若しくは担体、及び/又はa)デンプン、ラクトース、スクロース、グルコース、マンニトール及びケイ酸等の充填剤若しくは増量剤、b)例えばカルボキシメチルセルロース、アルギン酸塩、ゼラチン、ポリビニルピロリジノン、スクロース及びアラビアゴム等の結合剤、c)グリセロール等の保湿剤、d)寒天、炭酸カルシウム、ジャガイモデンプン若しくはタピオカデンプン、アルギン酸、或る特定のケイ酸塩及び炭酸ナトリウム等の崩壊剤、e)パラフィン等の溶解遅延剤、f)第四級アンモニウム化合物等の吸収促進剤、g)例えばセチルアルコール及びモノステアリン酸グリセロール等の湿潤剤、h)カオリン及びベントナイトクレイ等の吸収剤、並びにi)タルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、ポリエチレングリコール固体、ラウリル硫酸ナトリウム等の滑沢剤、並びにそれらの混合物と混合されている。カプセル、錠剤及び丸薬の場合、投薬形態には緩衝剤が含まれていてもよい。
同様のタイプの固体組成物をラクトース又は乳糖、並びに高分子量ポリエチレングリコール等の賦形剤を用いる軟ゼラチンカプセル及び硬ゼラチンカプセル中の充填剤としても用いることができる。錠剤、糖衣錠、カプセル、丸薬及び顆粒の固形投薬形態は、腸溶コーティング及び医薬配合技術で既知の他のコーティング等のコーティング及びシェルを用いて調製することができる。これらの固形投薬形態は乳白剤を任意に含有していてもよく、活性成分(複数の場合もある)を腸管の或る特定の部分でのみ又は優先的に、任意に遅延的に放出する組成物であってもよい。
使用することができる包埋組成物の例としては、ポリマー物質及びワックスが挙げられる。同様のタイプの固体組成物をラクトース又は乳糖、並びに高分子量ポリエチレングリコール等の賦形剤を用いる軟ゼラチンカプセル及び硬ゼラチンカプセル中の充填剤としても用いることができる。
活性化合物は上述の1つ以上の賦形剤を含むマイクロカプセル化形態であってもよい。錠剤、糖衣錠、カプセル、丸薬及び顆粒の固形投薬形態は腸溶コーティング、放出制御コーティング及び医薬配合技術で既知の他のコーティング等のコーティング及びシェルを用いて調製することができる。かかる固形投薬形態では、活性化合物をスクロース、ラクトース及びデンプン等の少なくとも1つの不活性希釈剤と混ぜることができる。かかる投薬形態は通常の慣行と同様に不活性希釈剤以外の付加的な物質、例えばステアリン酸マグネシウム及び微結晶性セルロース等の錠剤化滑沢剤及び他の錠剤化助剤を含んでいてもよい。カプセル、錠剤及び丸薬の場合、投薬形態は緩衝剤を含んでいてもよい。これらの投薬形態は乳白剤を任意に含有していてもよく、活性成分(複数の場合もある)を腸管の或る特定の部分でのみ又は優先的に、任意に遅延的に放出する組成物であってもよい。使用することができる包埋組成物の例としては、ポリマー物質及びワックスが挙げられる。
本願は本発明の化合物の薬学的に許容可能な局所配合物を包含する。「薬学的に許容可能な局所配合物」という用語は本明細書で使用される場合、配合物を表皮に適用することによる本願の化合物の皮内投与に薬学的に許容可能な任意の配合物を意味する。本願の或る特定の実施形態では、局所配合物は担体系を含む。薬学的に効果的な担体としては、溶媒(例えばアルコール、ポリアルコール、水)、クリーム、ローション、軟膏、油、硬膏、リポソーム、粉末、エマルション、マイクロエマルション及び緩衝液(例えば、低張食塩水又は緩衝食塩水)又は医薬品を局所的に投与するための当該技術分野で既知の任意の他の担体が挙げられるが、これらに限定されない。当該技術分野で既知の担体のより完全なリストは当該技術分野で標準的な参照テキスト、例えばRemington's Pharmaceutical Sciencesの第16版(1980年)及び第17版(1985年)(どちらもMack Publishing Company, Easton, Pa.により出版されている;その開示全体が引用することにより本明細書の一部をなす)に提示される。或る特定の他の実施形態では、本願の局所配合物は賦形剤を含み得る。当該技術分野で既知の任意の薬学的に許容可能な賦形剤を、本発明の薬学的に許容可能な局所配合物を調製するために使用することができる。本願の局所配合物に含まれ得る賦形剤の例としては、防腐剤、抗酸化剤、保湿剤、皮膚軟化剤、緩衝剤、可溶化剤、他の浸透剤、皮膚保護剤、界面活性剤及び噴射剤、及び/又は本発明の化合物と併用される更なる治療剤が挙げられるが、これらに限定されない。好適な防腐剤としては、アルコール、第四級アミン、有機酸、パラベン及びフェノールが挙げられるが、これらに限定されない。好適な抗酸化剤としては、アスコルビン酸及びそのエステル、重亜硫酸ナトリウム、ブチル化ヒドロキシトルエン、ブチル化ヒドロキシアニソール、トコフェロール、並びにEDTA及びクエン酸のようなキレート剤が挙げられるが、これらに限定されない。好適な保湿剤としては、グリセリン、ソルビトール、ポリエチレングリコール、尿素、及びプロピレングリコールが挙げられるが、これらに限定されない。本願での使用に適した緩衝剤としては、クエン酸、塩酸及び乳酸バッファーが挙げられるが、これらに限定されない。好適な可溶化剤としては、第四級アンモニウム塩化物、シクロデキストリン、安息香酸ベンジル、レシチン、及びポリソルベートが挙げられるが、これらに限定されない。本願の局所配合物に使用することができる好適な皮膚保護剤としては、ビタミンEオイル、アラントイン、ジメチコン、グリセリン、ワセリン、及び酸化亜鉛が挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態では、本願の薬学的に許容可能な局所配合物は少なくとも本願の化合物と浸透促進剤とを含む。局所配合物の選択は治療対象の病態、本発明の化合物及び存在する他の賦形剤の物理化学的特徴、配合物中でのそれらの安定性、利用可能な製造装置及び費用制約条件を含む幾つかの要因によって決まる。本明細書で使用される場合、「浸透促進剤」という用語は薬理活性化合物を、好ましくは体内吸収を殆ど又は全く生じずに角質層を介して表皮又は真皮へと輸送することが可能な作用物質を意味する。皮膚を介した浸透速度を高めるそれらの有効性に関して広範な化合物が評価されている。例えば、様々な皮膚浸透促進剤の使用及び試験を調査しているPercutaneous Penetration Enhancers, Maibach H. I. and Smith H. E. (eds.), CRC Press, Inc., Boca Raton, Fla. (1995)、及びBuyuktimkin et al., Chemical Means of Transdermal Drug Permeation Enhancement in Transdermal and Topical Drug Delivery Systems, Gosh T. K., Pfister W. R., Yum S. I. (Eds.), Interpharm Press Inc., Buffalo Grove, Ill. (1997)を参照されたい。或る特定の例示的な実施形態では、本願で用いられる浸透剤としては、トリグリセリド(例えば、ダイズ油)、アロエ組成物(例えば、アロエベラジェル)、エチルアルコール、イソプロピルアルコール、オクチルフェニルポリエチレングリコール、オレイン酸、ポリエチレングリコール400、プロピレングリコール、N−デシルメチルスルホキシド、脂肪酸エステル(例えば、ミリスチン酸イソプロピル、ラウリン酸メチル、モノオレイン酸グリセロール、及びモノオレイン酸プロピレングリコール)、及びN−メチルピロリドンが挙げられるが、これらに限定されない。
或る特定の実施形態では、組成物は軟膏、ペースト、クリーム、ローション、ジェル、粉末、溶液、噴霧剤、吸入剤又はパッチの形態とすることができる。或る特定の例示的な実施形態では、本願による組成物の配合物はクリームであり、これにはステアリン酸、パルミチン酸、オレイン酸、パルミト−オレイン酸、セチルアルコール又はオレイルアルコール等の飽和又は不飽和脂肪酸が含有されていてもよいが、ステアリン酸が特に好ましい。本願のクリームは非イオン性界面活性剤、例えばポリオキシ−40−ステアレートも含有し得る。或る特定の実施形態では、活性成分を滅菌条件下で薬学的に許容可能な担体及び必要とされる任意の防腐剤又は必要に応じて緩衝剤と混ぜる。眼科用配合物、点耳剤及び点眼剤も本願の範囲内であるとして企図される。付加的に、本願は身体に対する化合物の制御送達をもたらすという追加の利点を有する経皮パッチの使用を企図する。かかる投薬形態は化合物を適当な媒体中に溶解又は分注することによって作製される。上記で論考されるように、皮膚を介した化合物の流動を増大するために浸透促進剤を使用してもよい。その速度は速度制御膜を設けるか、又は化合物をポリマーマトリクス若しくはゲル中に分散させることによって制御することができる。
本願の化合物及び医薬組成物を配合し、併用療法に用いることができる、すなわち化合物及び医薬組成物を1つ以上の他の所望の治療法又は医療処置と同時に、その前に又はその後に配合するか又は投与することができることも認識される。併用レジメンに用いるための療法(治療法又は処置)の特定の組合せは、所望の治療法及び/又は処置の適合性及び達成すべき所望の治療効果を考慮に入れる。用いられる療法が同じ障害に対する所望の効果を達成するものであってもよく(例えば、本発明の化合物は別の免疫調節剤若しくは抗癌剤と同時に投与することができる)、又はそれらが異なる効果(例えば、任意の有害作用の制御)を達成するものであってもよいことも認識される。
例えば、本願の化合物と併用することができる他の療法又は抗癌剤としては、数例挙げると外科手術、放射線療法、内分泌療法、生体応答調節剤(数例挙げると、インターフェロン、インターロイキン、及び腫瘍壊死因子(TNF))、温熱療法及び寒冷療法、任意の有害作用を減弱する作用物質(例えば、制吐剤)、並びにアルキル化薬(メクロレタミン、クロラムブシル、シクロホスファミド、メルファラン、イホスファミド)、代謝拮抗薬(メトトレキサート)、プリン拮抗薬及びピリミジン拮抗薬(6−メルカプトプリン、5−フルオロウラシル、シタラビン、ゲムシタビン)が挙げられるが、これらに限定されない他の認可済み化学療法薬、紡錘体毒(ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビノレルビン、パクリタキセル)、ポドフィロトキシン(エトポシド、イリノテカン、トポテカン)、抗生物質(ドキソルビシン、ブレオマイシン、マイトマイシン)、ニトロソウレア(カルムスチン、ロムスチン)、無機イオン(シスプラチン、カルボプラチン)、酵素(アスパラギナーゼ)、並びにホルモン(タモキシフェン、ロイプロリド、フルタミド、及びメゲストロール)が挙げられる。最新の癌療法のより包括的な論考については、The Merck Manual, Seventeenth Ed. 1999(その内容全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい。国立癌研究所(CNI)のウェブサイト(www.nci.nih.gov)、及びFDAの承認済みの抗腫瘍薬(oncology drugs)のリストについてはアメリカ食品医薬品局(FDA)のウェブサイト(www.fda.gov/cder/cancer/druglistframe)も参照されたい。
或る特定の実施形態では、本願の医薬組成物は1つ以上の付加的な治療活性成分(例えば、化学療法薬及び/又は苦痛緩和剤)を更に含む。本願の目的上、「苦痛緩和剤」という用語は疾患の症状及び/又は治療計画の副作用の緩和に重点を置くが、治癒的でない治療を指す。例えば、苦痛緩和治療は鎮痛剤、制嘔吐剤及び吐き気止め薬(anti-sickness drugs)を包含する。加えて、化学療法、放射線療法及び外科手術は全て姑息的に(palliatively)(すなわち治癒することなく症状を低減するために、例えば腫瘍を縮小し、苦痛(pressure)、出血、疼痛及び癌の他の症状を低減するために)用いることができる。
付加的に、本願は本発明の化合物の薬学的に許容可能な誘導体、及びこれらの化合物、その医薬組成物又は1つ以上の付加的な治療剤と組み合わせたこれらのいずれかを使用して被験体を治療する方法を提供する。
或る特定の本願の化合物が治療のための遊離形態で、又は適切な場合にはその薬学的に許容可能な誘導体として存在し得ることも認識される。本願によると、薬学的に許容可能な誘導体としては、本願の化合物の薬学的に許容可能な塩、エステル、かかるエステルの塩、又は必要性を有する患者へ投与することで、本明細書に記載される別の形で若しくはその代謝産物若しくは残基として直接若しくは間接的に化合物をもたらすことが可能なプロドラッグ、若しくは他の付加物若しくは誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。
治療方法
概して、本願の化合物を使用する方法は、それを必要とする被験体に治療有効量の本願の化合物を投与することを含む。本願の化合物は概して標的タンパク質分解の誘導物質である。
或る特定の実施形態では、本願の化合物は増殖性疾患(例えば癌、良性新生物、炎症性疾患及び自己免疫疾患)の治療に有用である。或る特定の実施形態では、本願の治療方法に従って、本明細書に記載されるように上記細胞と本発明の化合物又は組成物とを接触させることによって対象の細胞タンパク質、例えば病原性及び発癌性タンパク質のレベルを調節するか、又はそれらの成長を阻害する。他の実施形態では、化合物は癌の治療に有用である。或る特定の実施形態では、増殖性疾患(例えば癌、良性新生物、炎症性疾患及び自己免疫疾患)は、本明細書に記載されるように標的指向性リガンド治療に耐性を示す。
「標的指向性リガンドに耐性を示す」、「標的指向性リガンドに対する耐性」又は「標的指向性リガンド耐性」は本明細書で使用される場合、疾患又は病態を標的指向性リガンドによって治療することができないことを意味する。例えば、標的指向性リガンドは疾患若しくは病態の悪化を防ぐ、又は疾患若しくは病態の1つ以上の症状を軽減若しくは低減する、又は疾患若しくは病態を患う患者の生活の質を改善することができない。例えば、標的指向性リガンドは標的細胞(例えば癌細胞)の成長若しくは増殖を低減若しくは阻害する、又は標的細胞(例えば癌細胞)の死を誘導することができない。例えば、標的指向性リガンドは標的細胞(例えば癌細胞)における標的タンパク質の分解を誘導することができない。別の例では、標的指向性リガンドは高濃度(例えば、非耐性疾患又は病態において標的指向性リガンドが必要とされる濃度よりも高い(例えば少なくとも2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、20倍、30倍、50倍、100倍、150倍、200倍又は500倍高い)濃度)でしか、疾患若しくは病態の悪化を防ぐ、又は疾患若しくは病態の1つ以上の症状を軽減若しくは低減する、又は疾患若しくは病態を患う患者の生活の質を改善する、又は標的細胞(例えば癌細胞)の成長若しくは増殖を低減若しくは阻害する、又は標的細胞(例えば癌細胞)の死を誘導する、又は標的細胞(例えば癌細胞)における標的タンパク質の分解を誘導することができない。別の例では、標的指向性リガンドは高濃度(例えば、本願の二官能性化合物よりも高い(例えば少なくとも2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、20倍、30倍、50倍、100倍、150倍、200倍又は500倍高い)濃度)でしか、疾患若しくは病態の悪化を防ぐ、又は疾患若しくは病態の1つ以上の症状を軽減若しくは低減する、又は疾患若しくは病態を患う患者の生活の質を改善する、又は標的細胞(例えば癌細胞)の成長若しくは増殖を低減若しくは阻害する、又は標的細胞(例えば癌細胞)の死を誘導する、又は標的細胞(例えば癌細胞)における標的タンパク質の分解を誘導することができない。
このため、本願の別の態様では、本明細書に記載されるような治療有効量の本発明の化合物を、それを必要とする被験体に投与することを含む、癌を治療する方法が提供される。或る特定の実施形態では、治療有効量の本発明の化合物又は本発明の化合物を含む医薬組成物を、それを必要とする被験体に所望の結果を達成するために必要とされるような量及び時間で投与することを含む、癌を治療する方法が提供される。好ましくは、本願の化合物は経口投与又は静脈内投与される。本願の或る特定の実施形態では、本発明の化合物又は医薬組成物の「治療有効量」は、腫瘍細胞を死滅させるか又はその成長を阻害するのに効果的な量である。本願の方法による化合物及び組成物は、腫瘍細胞を死滅させるか又はその成長を阻害するのに効果的な任意の量及び任意の投与経路を用いて投与することができる。このため、「腫瘍細胞を死滅させるか又はその成長を阻害するのに効果的な量」という表現は本明細書で使用される場合、腫瘍細胞を死滅させるか又はその成長を阻害するのに十分な作用物質の量を指す。必要とされる正確な量は被験体の種、年齢及び全身状態、感染の重症度、特定の抗癌剤、その投与方法等に応じて被験体によって異なる。本願の或る特定の実施形態では、本発明の化合物又は医薬組成物の「治療有効量」は標的タンパク質のレベルを低減するのに効果的な量である。本願の或る特定の実施形態では、化合物又は医薬組成物の「治療有効量」は、皮膚細胞を死滅させるか又はその成長を阻害するのに効果的な量である。
或る特定の実施形態では、本方法は治療有効量の化合物又はその薬学的に許容可能な誘導体を、それを必要とする被験体(ヒト又は動物を含むが、これらに限定されない)に投与することを含む。或る特定の実施形態では、二官能性化合物は、癌(神経膠芽腫、網膜芽細胞腫、乳癌、子宮頸癌、結腸及び直腸癌、白血病、リンパ腫、肺癌(小細胞肺癌が挙げられるが、これに限定されない)、黒色腫及び/又は皮膚癌、多発性骨髄腫、非ホジキンリンパ腫、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌及び胃癌、膀胱癌、子宮癌、腎臓癌、精巣癌、胃癌、脳癌、肝臓癌、又は食道癌が挙げられるが、これらに限定されない)の治療に有用である。
或る特定の実施形態では、本発明の抗癌剤は、乳癌、子宮頸癌、結腸及び直腸癌、白血病、肺癌、黒色腫、多発性骨髄腫、非ホジキンリンパ腫、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、並びに胃癌が挙げられるが、これらに限定されない癌及び他の増殖性障害の治療に有用である。或る特定の実施形態では、本発明の抗癌剤は固形腫瘍に対して活性がある。
或る特定の実施形態では、本発明の化合物は血管形成術及びステント留置術等の外傷を受ける血管の再狭窄の予防にも用いられる。例えば、本願の化合物がチューブ、シャント、カテーテル、人工移植物、ピン等の埋め込み医療機器、ペースメーカー等の電気インプラント、及び特にバルーン拡張ステントを含む動脈ステント又は静脈ステントのコーティングとして有用であることが企図される。或る特定の実施形態では、本発明の化合物を埋め込み型医療機器に結合させても、又は代替的には埋め込み型機器の表面に受動的に吸着させてもよい。或る特定の他の実施形態では、本発明の化合物は手術用若しくは医療用の機器若しくはインプラント、例えばステント、縫合糸、留置カテーテル、プロテーゼ等内に含有されるか、又はそれによる放出に適合するように配合することができる。例えば、抗増殖活性及び抗炎症活性を有する薬物がステントコーティングとして評価されており、再狭窄の予防における見込みが示されている(例えば、Presbitero P. et al., "Drug eluting stents do they make the difference?", Minerva Cardioangiol, 2002, 50(5):431-442、Ruygrok P. N. et al., "Rapamycin in cardiovascular medicine", Intern. Med. J., 2003, 33(3):103-109、及びMarx S. O. et al., "Bench to bedside: the development of rapamycin and its application to stent restenosis", Circulation, 2001, 104(8):852-855(これらの参照文献は各々その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)。したがって、任意の特定の理論に束縛されることを望むものではないが、本出願人は抗増殖効果を有する本発明の化合物をステントコーティングとして及び/又はステント薬物送達機器、とりわけ再狭窄の予防又は再狭窄率の低減のために使用することができることを提案する。好適なコーティング及びコーティングされる埋め込み型機器の一般的な作製は米国特許第6,099,562号、同第5,886,026号及び同第5,304,121号に記載されている。コーティングは通例、ヒドロゲルポリマー、ポリメチルジシロキサン、ポリカプロラクトン、ポリエチレングリコール、ポリ乳酸、エチレン酢酸ビニル及びそれらの混合物等の生体適合性ポリマー材料である。制御放出特徴を組成物に付与するためにコーティングは任意にフルオロシリコーン、多糖類、ポリエチレングリコール、リン脂質又はそれらの組合せの好適なトップコートによって更に覆われていてもよい。再狭窄を予防するためのステントコーティング及び/又は局所的ステント薬物送達に関した様々な組成物及び方法が当該技術分野で既知である(例えば、米国特許第6,517,889号、同第6,273,913号、同第6,258,121号、同第6,251,136号、同第6,248,127号、同第6,231,600号、同第6,203,551号、同第6,153,252号、同第6,071,305号、同第5,891,507号、同第5,837,313号及び米国特許出願公開第2001/0027340号(各々その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)。例えば、ステントをポリマー−薬物溶液に浸漬するか、又はステントにかかる溶液を吹き付けることによってステントをポリマー−薬物複合体でコーティングすることができる。或る特定の実施形態では、埋め込み型機器に好適な材料は生体適合性及び非毒性の材料を含み、ニッケル−チタン合金、スチール等の金属、又は生体適合性ポリマー、ヒドロゲル、ポリウレタン、ポリエチレン、エチレン酢酸ビニルコポリマー等から選ぶことができる。或る特定の実施形態では、本発明の化合物はバルーン血管形成術後に動脈又は静脈に挿入されるステントにコーティングされる。
本願の化合物又はその薬学的に許容可能な組成物はプロテーゼ、人工弁、人工血管、ステント及びカテーテル等の埋め込み型医療機器のコーティングのための組成物に組み込むこともできる。したがって、本願は別の態様では、上記に概説される本願の化合物、並びに本明細書中のクラス及びサブクラス、並びに上記埋め込み型機器のコーティングに好適な担体を含む埋め込み型機器のコーティングのための組成物を含む。更に別の態様では、本願は上記に概説される本願の化合物、並びに本明細書中のクラス及びサブクラス、並びに上記埋め込み型機器のコーティングに好適な担体を含む組成物でコーティングされる埋め込み型機器を含む。
付加的に、本願は本発明の化合物の薬学的に許容可能な誘導体、及びこれらの化合物、その医薬組成物又は1つ以上の付加的な治療剤と組み合わせたこれらのいずれかを用いて被験体を治療する方法を提供する。
本願の別の態様は、患者において増殖障害と関連する疾患又は病態を治療する又はその重症度を軽減する方法であって、上記患者に式Iの化合物又は該化合物を含む組成物を投与する工程を含む、方法を提供する。
本願の方法による化合物及び組成物を、細胞過剰増殖と関連する癌及び/又は障害の治療に効果的な任意の量及び任意の投与経路を用いて投与することができることが認識される。例えば、本発明の化合物を癌の治療に用いる場合、「有効量」という表現は本明細書で使用される場合、細胞増殖を阻害するのに十分な作用物質の量を指すか、又は癌の影響を低減するのに十分な量を指す。必要とされる正確な量は被験体の種、年齢及び全身状態、疾患の重症度、特定の抗癌剤、その投与方法等に応じて被験体によって異なる。
本願の化合物は投与の簡便性及び投与量の均一性のために投薬単位形態に配合するのが好ましい。「投薬単位形態」という表現は本明細書で使用される場合、治療される患者に適切な治療剤の物理的に別個の単位を指す。しかしながら、本願の化合物及び組成物の総1日使用量が主治医によって堅実な医学的判断の範囲内で決定されることが理解される。任意の特定の患者又は生物に対する特定の治療上効果的な用量レベルは、治療対象の障害及び障害の重症度;用いられる特定の化合物の活性;用いられる特定の組成物;患者の年齢、体重、全身健康状態、性別及び食生活;投与時間、投与経路及び用いられる特定の化合物の排出速度;治療期間;用いられる特定の化合物と組み合わせて又は同時に使用される薬物;並びに医学分野で既知の同様の要因を含む様々な要因によって決まる(例えば、Goodman and Gilman's, "The Pharmacological Basis of Therapeutics", Tenth Edition, A. Gilman, J. Hardman and L. Limbird, eds., McGraw-Hill Press, 155-173, 2001(その全体が引用することにより本明細書の一部をなす)を参照されたい)。
さらに、適切な薬学的に許容可能な担体と所望の投与量で配合した後、本願の医薬組成物はヒト及び他の動物に例えば経口で、直腸内に、非経口的に、嚢内に、膣内に、腹腔内に、局所的に(粉末、軟膏、クリーム又は点滴剤として(as by))、口腔内に、口腔又は鼻腔用スプレーとして、治療される感染の重症度に応じて投与することができる。或る特定の実施形態では、本願の化合物は所望の治療効果を得るために1日当たり約0.001mg/kg〜約50mg/kg、約0.01mg/kg〜約25mg/kg又は約0.1mg/kg〜約10mg/kg(被験体の体重)の投与量レベルで1日1回以上投与することができる。0.001mg/kg未満又は50mg/kg超(例えば50mg/kg〜100mg/kg)の投与量を被験体に投与することができることも認識される。或る特定の実施形態では、化合物は経口で又は非経口的に投与される。
また、本願は、かかる治療を必要とする被験体に治療有効量の本願の化合物又はその薬学的に許容可能な塩、プロドラッグ、代謝産物、多形若しくは溶媒和物を投与することによって、それを必要とする被験体における細胞増殖性障害を治療する方法を提供する。細胞増殖性障害は癌又は前癌状態であり得る。本願は、細胞増殖性障害の治療に有用な薬剤の調製のための本願の化合物又はその薬学的に許容可能な塩、プロドラッグ、代謝産物、多形若しくは溶媒和物の使用を更に提供する。
本願は、かかる治療を必要とする被験体に治療有効量の本願の化合物又はその薬学的に許容可能な塩、プロドラッグ、代謝産物、多形若しくは溶媒和物を投与することによって、それを必要とする被験体において細胞増殖性障害を防ぐ方法を提供する。細胞増殖性障害は癌又は前癌状態であり得る。本願は、細胞増殖性障害の予防に有用な薬剤の調製のための本願の化合物又はその薬学的に許容可能な塩、プロドラッグ、代謝産物、多形若しくは溶媒和物の使用も提供する。
本明細書で使用される場合、「それを必要とする被験体」は細胞増殖性障害を有する被験体、又は全集団と比較して細胞増殖性障害を発症するリスクが増大している被験体である。それを必要とする被験体は前癌状態を有し得る。それを必要とする被験体は癌を有するのが好ましい。「被験体」は哺乳動物を含む。哺乳動物は例えば任意の哺乳動物、例えばヒト、霊長類、鳥類、マウス、ラット、家禽、イヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヤギ、ラクダ、ヒツジ又はブタであり得る。哺乳動物はヒトであるのが好ましい。
本明細書で使用される場合、「細胞増殖性障害」という用語は、細胞の無秩序若しくは異常な成長又はその両方が、癌性であっても又は癌性でなくてもよい望ましくない病態又は疾患の発症を引き起こし得る病態を指す。本願の例示的な細胞増殖性障害は、細胞分裂が脱調節されている様々な病態を包含する。細胞増殖性障害の例としては、新生物、良性腫瘍、悪性腫瘍、前癌状態、上皮内腫瘍、被包(encapsulated)腫瘍、転移性腫瘍、液性腫瘍、固形腫瘍、免疫腫瘍、血液腫瘍、癌、癌腫、白血病、リンパ腫、肉腫、及び急速に分裂する細胞が挙げられるが、これらに限定されない。「急速に分裂する細胞」という用語は本明細書で使用される場合、同じ組織内の隣接又は並列細胞間で予想又は観察される速度を超える又は上回る速度で分裂する任意の細胞として規定される。細胞増殖性障害は前癌又は前癌状態を含む。細胞増殖性障害は癌を含む。本明細書で提供される方法は癌を治療するか又はその症状を軽減するのに用いられるのが好ましい。「癌」という用語は固形腫瘍、並びに血液学的腫瘍及び/又は悪性血液疾患を含む。「前癌細胞」又は「前癌性細胞」は前癌又は前癌状態である細胞増殖性障害を呈する細胞である。「癌細胞」又は「癌性細胞」は癌である細胞増殖性障害を呈する細胞である。任意の再現可能な測定手段を用いて癌細胞又は前癌性細胞を同定することができる。癌細胞又は前癌性細胞は、組織サンプル(例えば生検サンプル)の組織学的分類又はグレーディングによって同定することができる。癌細胞又は前癌性細胞は適切な分子マーカーを使用することで同定することができる。
非癌状態又は障害の例としては、関節リウマチ;炎症;自己免疫疾患;リンパ増殖性病態;先端巨大症;リウマチ性脊椎炎;骨関節炎;痛風、他の関節炎病態;敗血症;敗血症性ショック;内毒素ショック;グラム陰性敗血症;毒素性ショック症候群;喘息;成人呼吸窮迫症候群;慢性閉塞性肺疾患;慢性肺炎;炎症性腸疾患;クローン病;乾癬;湿疹;潰瘍性大腸炎;膵線維症;肝線維症;急性及び慢性腎疾患;過敏性腸症候群;発熱(pyresis);再狭窄;脳性マラリア;脳卒中及び虚血性傷害;神経外傷;アルツハイマー病;ハンチントン病;パーキンソン病;急性及び慢性疼痛;アレルギー性鼻炎;アレルギー性結膜炎;慢性心不全;急性冠症候群;悪液質;マラリア;らい病;リーシュマニア症;ライム病;ライター症候群;急性滑膜炎;筋変性、滑液包炎;腱炎;腱滑膜炎;ヘルニア性、破裂性、又は脱出性椎間板症候群;大理石骨病;血栓症;再狭窄;ケイ肺症;肺筋肉瘤腫;骨粗鬆症等の骨吸収疾患;移植片対宿主反応;多発性硬化症;狼瘡;線維筋痛症;AIDS、並びに帯状疱疹、I型又はII型単純ヘルペス、インフルエンザウイルス及びサイトメガロウイルス等の他のウイルス疾患;並びに真性糖尿病が挙げられるが、これらに限定されない。
癌の例としては、副腎皮質癌、AIDS関連癌、AIDS関連リンパ腫、肛門癌、肛門直腸癌、肛門管の癌、虫垂癌、小児小脳星状細胞腫、小児大脳星状細胞腫、基底細胞癌、皮膚癌(非黒色腫)、胆管癌、肝外胆管癌、肝内胆管癌、膀胱癌、尿膀胱癌、骨関節癌、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、脳癌、脳腫瘍、脳幹神経膠腫、小脳星状細胞腫、大脳星状細胞腫/悪性神経膠腫、上衣腫、髄芽腫、テント上原始神経外胚葉腫瘍、視経路及び視床下部神経膠腫、乳癌、気管支腺腫/カルチノイド、カルチノイド腫瘍、胃腸神経系癌、神経系リンパ腫、中枢神経系癌、中枢神経系リンパ腫、子宮頸癌、小児癌、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性障害、結腸癌、結腸直腸癌、皮膚T細胞リンパ腫、リンパ系新生物、菌状息肉腫、セザリー症候群、子宮内膜癌、食道癌、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝外胆管癌、眼癌、眼内黒色腫、網膜芽細胞腫、胆嚢癌、胃の(胃)癌、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、胚細胞腫瘍、卵巣胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛腫瘍神経膠腫、頭頸部癌、肝細胞(肝臓)癌、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、眼内黒色腫、眼の癌、膵島細胞腫瘍(内分泌性膵臓)、カポジ肉腫、腎臓癌、腎臓の癌、腎臓癌、喉頭癌、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、有毛細胞白血病、口唇癌、肝臓癌、肺癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、AIDS関連リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症、髄芽腫、黒色腫、眼内(眼)黒色腫、メルケル細胞癌、悪性中皮腫、中皮腫、転移性頸部扁平上皮がん、口癌、舌の癌、多発性内分泌腺腫症候群、菌状息肉腫、骨髄異形性症候群、骨髄異形成性/骨髄増殖性疾患、慢性骨髄性白血病、急性骨髄白血病、多発性骨髄腫、慢性骨髄増殖性障害、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、口の癌、口腔癌、口咽頭癌、卵巣癌、卵巣上皮癌、卵巣低悪性度腫瘍、膵臓癌、膵島細胞膵臓癌、副鼻腔及び鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、松果体芽腫及びテント上原始神経外胚葉腫瘍、下垂体腫瘍、形質細胞新生物/多発性骨髄腫、胸膜胚芽腫、前立腺癌、直腸癌、腎盂及び尿管の移行上皮癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、ユーイング肉腫ファミリー腫瘍、カポジ肉腫、軟組織肉腫、子宮癌、子宮肉腫、皮膚癌(非黒色腫)、皮膚癌(黒色腫)、メルケル細胞皮膚癌、小腸癌、軟組織肉腫、扁平上皮癌、胃(胃の)癌、テント上原始神経外胚葉腫瘍、精巣癌、咽喉癌、胸腺腫、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、腎盂及び尿管及び他の泌尿器官の移行上皮癌、妊娠性絨毛腫瘍、尿道癌、子宮内膜子宮癌、子宮肉腫、子宮体癌、膣癌、外陰癌、並びにウィルムス腫瘍が挙げられるが、これらに限定されない。
「血液系の細胞増殖性障害」は血液系の細胞を侵す細胞増殖性障害である。血液系の細胞増殖性障害としては、リンパ腫、白血病、骨髄系新生物(myeloid neoplasms)、肥満細胞新生物、骨髄異形成、良性単クローン性免疫グロブリン血症、リンパ腫様肉芽腫症、リンパ腫様丘疹症、真性赤血球増加症、慢性骨髄球性白血病、原発性骨髄化生及び本態性血小板血症を挙げることができる。血液系の細胞増殖性障害には血液系の細胞の過形成、異形成及び化生が含まれ得る。好ましくは、本願の組成物を本願の血液癌又は本願の血液学的細胞増殖性障害からなる群から選択される癌を治療するために使用することができる。本願の血液癌には、多発性骨髄腫、リンパ腫(ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、小児リンパ腫、並びにリンパ球及び皮膚起源のリンパ腫を含む)、白血病(小児白血病、有毛細胞白血病、急性リンパ球性白血病、急性骨髄球性白血病、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄球性白血病、慢性骨髄性白血病、及び肥満細胞白血病を含む)、骨髄系新生物及び肥満細胞新生物が含まれ得る。
「肺の細胞増殖性障害」は肺の細胞を侵す細胞増殖性障害である。肺の細胞増殖性障害には、肺細胞に影響を与える全ての形態の細胞増殖性障害が含まれ得る。肺の細胞増殖性障害には、肺癌、肺の前癌又は前癌状態、肺の良性成長又は病変、及び肺の悪性成長又は病変、並びに肺以外の体内の組織及び器官の転移性病変が含まれ得る。好ましくは、本願の組成物を肺癌又は肺の細胞増殖性障害を治療するために使用することができる。肺癌には全ての形態の肺の癌が含まれ得る。肺癌には、悪性肺新生物、上皮内癌、定型カルチノイド腫瘍、及び非定型カルチノイド腫瘍が含まれ得る。肺癌には、小細胞肺癌(「SCLC」)、非小細胞肺癌(「NSCLC」)、扁平上皮癌、腺癌、小細胞癌、大細胞癌、腺扁平上皮癌、及び中皮腫が含まれ得る。肺癌には、「瘢痕癌」、気管支肺胞上皮癌、巨細胞癌、紡錘細胞癌、及び大細胞神経内分泌癌が含まれ得る。肺癌には、組織学的かつ超微細構造の異種性を備える肺新生物(例えば、混合細胞型)が含まれ得る。
肺の細胞増殖性障害には、肺細胞に影響を与える全ての形態の細胞増殖性障害が含まれ得る。肺の細胞増殖性障害には肺癌、肺の前癌状態が含まれ得る。肺の細胞増殖性障害には肺の過形成、化生及び異形成が含まれ得る。肺の細胞増殖性障害としては、アスベスト誘導過形成、扁平上皮化生及び良性反応性中皮化生を挙げることができる。肺の細胞増殖性障害には、重層扁平上皮による円柱上皮の置換え及び粘膜異形成が含まれ得る。タバコの煙及びアスベスト等の吸入性の有害な環境作用物質に曝露された個体は、肺の細胞増殖性障害を発症するリスクが増大している可能性がある。個体が肺の細胞増殖性障害を発症する素因となり得る先行肺疾患としては、慢性間質性肺疾患、壊死性肺疾患、強皮症、リウマチ性疾患、サルコイドーシス、間質性肺炎、結核、反復性肺炎、特発性肺線維症、肉芽腫、石綿症、線維化性肺胞炎及びホジキン病が挙げられる。
「結腸の細胞増殖性障害」は結腸の細胞を侵す細胞増殖性障害である。結腸の細胞増殖性障害は結腸癌であるのが好ましい。好ましくは、本願の組成物を結腸癌又は結腸の細胞増殖性障害を治療するために使用することができる。結腸癌には全ての形態の結腸の癌が含まれ得る。結腸癌には散発性結腸癌及び遺伝性結腸癌が含まれ得る。結腸癌には悪性結腸新生物、上皮内癌、定型カルチノイド腫瘍、及び非定型カルチノイド腫瘍が含まれ得る。結腸癌には腺癌、扁平上皮癌、及び腺扁平上皮癌が含まれ得る。結腸癌は遺伝性非ポリポーシス結腸直腸癌、家族性腺腫性ポリポーシス、ガードナー症候群、ポイツ−ジェガース症候群、ターコット症候群及び若年性ポリポーシスからなる群から選択される遺伝症候群に関連するものとすることができる。結腸癌は遺伝性非ポリポーシス結腸直腸癌、家族性腺腫性ポリポーシス、ガードナー症候群、ポイツ−ジェガース症候群、ターコット症候群及び若年性ポリポーシスからなる群から選択される遺伝症候群により引き起こされるものとすることができる。
結腸の細胞増殖性障害には結腸細胞に影響を与える全ての形態の細胞増殖性障害が含まれ得る。結腸の細胞増殖性障害としては、結腸癌、結腸の前癌状態、結腸の腺腫性ポリープ及び結腸の異時性病変を挙げることができる。結腸の細胞増殖性障害には腺腫が含まれ得る。結腸の細胞増殖性障害は結腸の過形成、化生及び異形成によって特性化することができる。個体が結腸の細胞増殖性障害を発症する素因となり得る先行結腸疾患には先行結腸癌が含まれ得る。個体が結腸の細胞増殖性障害を発症する素因となり得る現行疾患としては、クローン病及び潰瘍性大腸炎を挙げることができる。結腸の細胞増殖性障害はp53、ras、FAP及びDCCからなる群から選択される遺伝子の突然変異と関連し得る。個体はp53、ras、FAP及びDCCからなる群から選択される遺伝子の突然変異の存在のために結腸の細胞増殖性障害を発症するリスクが上昇している可能性がある。
「膵臓の細胞増殖性障害」は膵臓の細胞を侵す細胞増殖性障害である。膵臓の細胞増殖性障害には、膵臓細胞に影響を与える全ての形態の細胞増殖性障害が含まれ得る。膵臓の細胞増殖性障害には膵臓癌、膵臓の前癌又は前癌状態、膵臓の過形成及び膵臓の異形成、膵臓の良性成長又は病変、及び膵臓の悪性成長又は病変、並びに膵臓以外の体内の組織及び器官の転移性病変が含まれ得る。膵臓癌には全ての形態の膵臓の癌が含まれる。膵臓癌には、管状腺癌、腺扁平上皮癌、多形性巨細胞癌、粘液腺癌、破骨細胞様巨細胞癌、粘液性嚢腺癌、腺房癌、分類不能型大細胞癌、小細胞癌、膵芽腫、乳頭新生物、粘液性嚢胞腺腫、乳頭嚢胞新生物、及び漿液性嚢胞腺腫が含まれ得る。膵臓癌には、組織学的かつ超微細構造の異種性を備える膵臓新生物(例えば、混合細胞型)も含まれ得る。
「前立腺の細胞増殖性障害」は前立腺の細胞を侵す細胞増殖性障害である。前立腺の細胞増殖性障害には、前立腺細胞に影響を与える全ての形態の細胞増殖性障害が含まれ得る。前立腺の細胞増殖性障害には前立腺癌、前立腺の前癌又は前癌状態、前立腺の良性成長又は病変、及び前立腺の悪性成長又は病変、並びに前立腺以外の体内の組織及び器官の転移性病変が含まれ得る。前立腺の細胞増殖性障害には前立腺の過形成、化生及び異形成が含まれ得る。
「皮膚の細胞増殖性障害」は皮膚の細胞を侵す細胞増殖性障害である。皮膚の細胞増殖性障害は、皮膚細胞に影響を与える全ての形態の細胞増殖性障害が含まれ得る。皮膚の細胞増殖性障害には皮膚の前癌又は前癌状態、皮膚の良性成長又は病変、黒色腫、悪性黒色腫、及び他の皮膚の悪性成長又は病変、並びに皮膚以外の体内の組織及び器官の転移性病変が含まれ得る。皮膚の細胞増殖性障害には皮膚の過形成、化生及び異形成が含まれ得る。
「卵巣の細胞増殖性障害」は卵巣の細胞を侵す細胞増殖性障害である。卵巣の細胞増殖性障害には、卵巣の細胞に影響を与える全ての形態の細胞増殖性障害が含まれ得る。卵巣の細胞増殖性障害には卵巣の前癌又は前癌状態、卵巣の良性成長又は病変、卵巣癌、卵巣の悪性成長又は病変、並びに卵巣以外の体内の組織及び器官の転移性病変が含まれ得る。皮膚の細胞増殖性障害には卵巣の細胞の過形成、化生及び異形成が含まれ得る。
「乳房の細胞増殖性障害」は乳房の細胞を侵す細胞増殖性障害である。乳房の細胞増殖性障害には、乳房細胞に影響を与える全ての形態の細胞増殖性障害が含まれ得る。乳房の細胞増殖性障害には乳癌、乳房の前癌又は前癌状態、乳房の良性成長又は病変、及び乳房の悪性成長又は病変、並びに乳房以外の体内の組織及び器官の転移性病変が含まれ得る。乳房の細胞増殖性障害には乳房の過形成、化生及び異形成が含まれ得る。
治療対象の癌は対癌米国合同委員会(AJCC)のTNM分類体系に従ってステージングすることができ、ここで腫瘍(T)ではTX、T1、T1mic、T1a、T1b、T1c、T2、T3、T4、T4a、T4b、T4c又はT4dのステージが割り当てられ、所属リンパ節(N)ではNX、N0、N1、N2、N2a、N2b、N3、N3a、N3b又はN3cのステージが割り当てられ、遠隔転移(M)ではMX、M0又はM1のステージを割り当てることができる。治療対象の癌は、対癌米国合同委員会(AJCC)分類に従ってステージI、ステージIIA、ステージIIB、ステージIIIA、ステージIIIB、ステージIIIC又はステージIVとしてステージングすることができる。治療対象の癌には、AJCC分類に従って悪性度GX(例えば、悪性度を判断することができない)、悪性度1、悪性度2、悪性度3又は悪性度4として悪性度を割り当てることができる。治療対象の癌はpNX、pN0、PN0(I−)、PN0(I+)、PN0(mol−)、PN0(mol+)、PN1、PN1(mi)、PN1a、PN1b、PN1c、pN2、pN2a、pN2b、pN3、pN3a、pN3b又はpN3cというAJCCの病理学的分類(pN)に従ってステージングすることができる。
治療対象の癌は直径が約2センチメートル以下であると決定された腫瘍を含み得る。治療対象の癌は直径が約2センチメートル〜約5センチメートルであると決定された腫瘍を含み得る。治療対象の癌は直径が約3センチメートル以上であると決定された腫瘍を含み得る。治療対象の癌は直径が5センチメートル超であると決定された腫瘍を含み得る。治療対象の癌は顕微鏡像によって高分化、中分化、低分化又は未分化として分類することができる。治療対象の癌は、顕微鏡像によって有糸分裂数(例えば細胞分裂の量)又は核多形性(例えば細胞の変化)に関して分類することができる。治療対象の癌は、顕微鏡像によって壊死領域(例えば、瀕死又は変性細胞の領域)を伴うとして分類することができる。治療対象の癌は異常な核型を有する、異常な染色体数を有する又は外観が異常な1つ以上の染色体を有するとして分類することができる。治療対象の癌は異数体、3倍体、4倍体であるとして又は倍数性変化を有するとして分類することができる。治療対象の癌は染色体転座、又は染色体全体の欠失若しくは重複、又は染色体の一部の欠失、重複若しくは増幅の領域を有するとして分類することができる。
治療対象の癌はDNAサイトメトリー、フローサイトメトリー又はイメージサイトメトリーによって評価することができる。治療対象の癌は細胞の10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%が細胞分裂の合成段階(例えば細胞分裂のS期)にあるとしてタイピングすることができる。治療対象の癌は低S期画分又は高S期画分を有するとしてタイピングすることができる。
本明細書で使用される場合、「正常細胞」は「細胞増殖性障害」の一部として分類することができない細胞である。正常細胞には、望ましくない病態又は疾患の発症を引き起こす可能性がある無秩序若しくは異常な成長又はその両方が見られない。好ましくは、正常細胞は通常は機能的な細胞周期チェックポイント制御機構を有する。
本明細書で使用される場合、「細胞を接触させる」は問題の化合物又は他の組成物を細胞と直接、又は細胞内で所望の生物学的効果を誘導するのに十分なほど近く接触させる状態を指す。
本明細書で使用される場合、「治療する("treating" or "treat")」は疾患、病態又は障害と闘う目的での患者の管理及びケアを表し、疾患、病態若しくは障害の症状若しくは合併症を軽減するか、又は疾患、病態若しくは障害を解消するための本願の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩、プロドラッグ、代謝産物、多形若しくは溶媒和物の投与を含む。
本願の化合物、又はその薬学的に許容可能な塩、プロドラッグ、代謝産物、多形若しくは溶媒和物は疾患、病態又は障害を予防するためにも使用することができる。本明細書で使用される場合、「予防する("preventing" or "prevent")」は疾患、病態又は障害の症状又は合併症の発現を低減又は解消することを表す。
本明細書で使用される場合、「軽減する」という用語は障害の兆候又は症状の重症度を減少させるプロセスを表すことを意図する。重要なことには、兆候又は症状は解消されないまでも軽減することができる。好ましい実施形態では、本願の医薬組成物の投与は兆候又は症状の解消をもたらすが、解消する必要はない。効果的な投与量は兆候又は症状の重症度を減少させるように予想される。例えば、多数の位置の少なくとも1つにおいて癌の重症度を減少させることで、多数の位置で生じ得る癌等の障害の兆候又は症状が軽減される。
本明細書に記載される化合物(例えば二官能性化合物)は作製後に、当業者に既知の様々なアッセイを用いて特性化し、化合物が所望の生物活性を有するか否かを決定することができる。例えば、分子を下記のアッセイを含むが、これに限定されない従来のアッセイによって特性化し(例えば、セレブロンが欠乏しているMV4−11細胞、ヒト細胞株MM1S又はヒト細胞株MM1S等の対象の細胞を試験化合物で処理した後、BRD2、BRD3及びBRD4等の指定のタンパク質に対するイムノブロッティングを行うか、又は対象の或る特定の細胞を試験化合物で処理した後、qRT−PCRによってBRD4転写レベルを測定する)、予測される活性、結合活性及び/又は結合特異性を有するか否かを決定することができる。
当業者は本明細書で論考される既知の技法又は同等の技法の詳細な説明について一般参照文書を参照することができる。これらの文書としては、Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, Inc. (2005)、Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual (3rdedition), Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York (2000)、Coligan et al., Current Protocols in Immunology, John Wiley & Sons, N.Y.、Enna et al., Current Protocols in Pharmacology, John Wiley & Sons, N.Y.、Fingl et al., The Pharmacological Basis of Therapeutics (1975)、Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, PA, 18th edition (1990)が挙げられる。これらの文書は、当然ながら本願の態様を行う又は用いるためにも参照することができる。
定義
本願の或る特定の化合物及び特定の官能基の定義も下記により詳細に記載する。
化合物が本明細書に記載されるように、任意の数の置換基又は官能部分で置換されていてもよいことが認識される。概して、「任意に」という用語が前に付くか否かに関わらず、「置換された」という用語及び本願の式中に含有される置換基は、指定した置換基のラジカルによる所与の構造内の水素ラジカルの置換えを指す。任意の所与の構造内の2つ以上の位置が指定した基から選択される2つ以上の置換基で置換され得る場合、置換基は全ての位置で同じであっても又は異なっていてもよい。本明細書で使用される場合、「置換された」という用語は、有機化合物の全ての許容可能な置換基を含むことが企図される。広範な態様では、許容可能な置換基には有機化合物の非環式及び環式、分岐及び非分岐、炭素環式及び複素環式、芳香族及び非芳香族置換基が含まれる。本願の目的上、窒素等のヘテロ原子は、ヘテロ原子の原子価を満たす本明細書に記載される有機化合物の水素置換基及び/又は任意の許容可能な置換基を有し得る。
「リンカー」又は「リンカー基」("Linker", "linker", "Linker group" or "linker group")という用語は本明細書で使用される場合、対象の化合物の一部を対象の別の化合物に付着するために利用される化学的部分を指す。これらの本願の結合部分は、ユビキチン化及び分解のためにユビキチンリガーゼに近接して標的タンパク質(タンパク質標的部分が結合する)を提示するために、ユビキチンリガーゼ結合部分に好ましくはリンカーを介して連結する。例示的なリンカーは本明細書に記載される。
「化合物」又は「化学化合物」という用語は本明細書で使用される場合、有機金属化合物、有機化合物、金属、遷移金属複合体及び小分子を含み得る。或る特定の好ましい実施形態では、ポリヌクレオチドが化合物の定義から除外される。他の好ましい実施形態では、ポリヌクレオチド及びペプチドが化合物の定義から除外される。特に好ましい実施形態では、化合物という用語は小分子(例えば、好ましくは非ペプチド性及び非オリゴマー性)を指し、ペプチド、ポリヌクレオチド、遷移金属複合体、金属及び有機金属化合物が除外される。
本明細書で使用される場合、「小分子」という用語は研究室内で合成されるか、又は自然界に見られる非ペプチド性、非オリゴマー性の有機化合物を指す。小分子は本明細書で使用される場合、「天然産物様の」化合物を指していてもよいが、「小分子」という用語は「天然産物様の」化合物に限定されない。むしろ、小分子は通例、幾つかの炭素−炭素結合を含有し、2000g/mol未満、好ましくは1500g/mol未満の分子量を有することを特徴とするが、この特性化は本願の目的を限定することを意図するものではない。或る特定の他の好ましい実施形態では、合成小分子が利用される。
「独立して」という用語は、独立して適用される、適用によって独立して異なる原子又は官能基等の可変部分を示すように本明細書で使用される。例えば、2つ以上の置換基又は原子(炭素、又は酸素(O)、硫黄(S)若しくは窒素(N)等のヘテロ原子)が生じる場合に、各々の置換基又は原子は別の置換基又は原子とは独立し、かかる置換基又は原子も交換することができる。
化学の分野では、「誘導体」は同様の化合物から幾つかの化学的又は物理的プロセスによって誘導される化合物である。これは1つの原子が別の原子又は原子群に置き換えられる場合に、化合物が別の化合物から生じ得ることを意味するためにも使用される。「構造類似体」という用語もこの意味で使用することができる。
「構造類似体」という用語又は「類似体」という用語は常に構造的類似性及び機能的類似性を表すために使用されている。薬物まで拡張すると、この定義は既存の薬物分子の類似体が元の化合物と構造的及び薬理学的類似性を有することを意味する。形式上、この定義により薬物類似体の3つのカテゴリー:化学的及び薬理学的類似性を有する類似体(直接類似体);構造的類似性のみを有する類似体(構造類似体);並びに同様の薬理学的特性を有する化学的に異なる化合物(機能的類似体)が確立される。例えば、レナリドミド及びポマリドミドはサリドマイド類似体に含まれ、同様に作用すると考えられる。
「E3ユビキチンリガーゼ」又は「ユビキチンリガーゼ」(UL)という用語は、本願による二官能性化合物中の標的酵素(複数の場合もある)のユビキチンリガーゼ部分の結合部位を表すために本明細書で使用される。E3 ULは、E2ユビキチン結合酵素と組み合わせて、プロテアソームによる分解のためのE3ユビキチンリガーゼ標的特異的タンパク質基質である標的タンパク質上のリシンへのユビキチン付着を引き起こすタンパク質である。このため、E3ユビキチンリガーゼは単独で又はE2ユビキチン結合酵素と複合して、標的タンパク質へのユビキチンの転移に関与する。概して、ユビキチンリガーゼは第2のユビキチンが第1のユビキチンに付着し、第3のユビキチンが第2のユビキチンに付着する等のようなポリユビキチン化に関与する。ポリユビキチン化によりプロテアソームによる分解のためにタンパク質が標識される。しかしながら、モノユビキチン化に制限される幾つかのユビキチン化事象が存在し、単一のユビキチンのみがユビキチンリガーゼによって基質分子に付加される。モノユビキチン化タンパク質はプロテアソームの分解に標的化されないが、代わりに例えばユビキチンを結合することが可能なドメインを有する他のタンパク質の結合によってそれらの細胞位置又は機能が変更され得る。問題を更に複雑にしているのは、ユビキチン上の異なるリシンがE3によって標的化され、鎖を作製し得ることである。最も一般的なリシンはユビキチン鎖上のLys48である。これはプロテアソームによって認識されるポリユビキチンの作製に使用されるリシンである。
「タンパク質標的部分」又は「標的タンパク質リガンド」という用語は、標的タンパク質又は対象の他のタンパク質若しくはポリペプチドに結合することが可能であり又は結合し、ユビキチンリガーゼによるタンパク質又はポリペプチドの分解が生じ得るように該タンパク質又はポリペプチドをユビキチンリガーゼに近接して配置/提示する小分子を記載するために本明細書で使用される。タンパク質標的部分に結合することができ、ユビキチンリガーゼによって作用又は分解される任意のタンパク質は、本願による標的タンパク質である。概して、標的タンパク質としては、例えば構造タンパク質、受容体、酵素、細胞表面タンパク質、細胞の統合機能に関するタンパク質を挙げることができ、これらのタンパク質には、触媒活性、アロマターゼ活性、運動活性、ヘリカーゼ活性、代謝プロセス(同化作用及び異化作用)、酸化防止活性、タンパク質分解、生合成に関わるタンパク質;キナーゼ活性、オキシドレダクターゼ活性、トランスフェラーゼ活性、ヒドロラーゼ活性、リアーゼ活性、イソメラーゼ活性、リガーゼ活性、酵素調節因子活性、シグナル伝達因子活性、構造分子活性、結合活性(タンパク質、脂質、炭水化物)、受容体活性、細胞運動、膜融合、細胞伝達、生物学的プロセスの調節、発生、細胞分化、刺激に対する応答を伴うタンパク質;行動タンパク質(behavioral proteins);細胞接着タンパク質;細胞死に関わるタンパク質;輸送(タンパク質輸送体活性、核輸送活性、イオン輸送体活性、チャネル輸送体活性、キャリア活性、パーミアーゼ活性、分泌活性、電子輸送体活性、発病、シャペロン調節因子活性、核酸結合活性、転写調節因子活性、細胞外組織化及び生合成活性、翻訳調節因子活性を含む)に関わるタンパク質が含まれる。対象のタンパク質には、薬物療法の標的としてのヒト、家畜を含む他の動物、抗生物質及び他の抗微生物物質用の標的の決定のための微生物、並びに植物、更にはウイルス他多数を含む真核生物及び原核生物由来のタンパク質が含まれ得る。小分子標的タンパク質が結合する部分の非限定的な例としては、Hsp90阻害剤、キナーゼ阻害剤、MDM2阻害剤、ヒトBETブロモドメイン含有タンパク質を標的化する化合物、HDAC阻害剤、ヒトリシンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、血管形成阻害剤、免疫抑制化合物、及び芳香族炭化水素受容体(AHR)を標的化する化合物他多数が挙げられる。下記の組成物はこれらの小分子標的タンパク質の幾つかのメンバーを例示するものである。
本明細書で使用される場合、「BRD4」又は「Brd4」という用語は、ヒトにおいてBRD4遺伝子によってコードされるタンパク質であるブロモドメイン含有タンパク質4に関する。BDR4はBRD2、BRD3及びBRDTとともにBET(ブロモドメイン及び余剰末端ドメイン(extra terminal domain))ファミリーのメンバーである。BRD4は、そのBETファミリーメンバーと同様に、アセチル化リシン残基を認識する2つのブロモドメインを含有する。Brd4発現の増大は、in vivoでRNAポリメラーゼII(RNAPII)CTDのP−TEFb依存性リン酸化及びプロモーターからの転写の刺激の増大をもたらす。逆に、siRNAによるBrd4発現の低減はCTDリン酸化及び転写を低減し、Brd4がP−TEFbの陽性調節成分であることが明らかとなった。クロマチン免疫沈降(ChIP)アッセイでは、プロモーターへのP−TEFbの動員はBrd4に依存し、クロマチンアセチル化の増大によって増強された。総合すると、P−TEFbはBrd4及び阻害サブユニットと交互に相互作用し、細胞における機能的平衡を維持する。
BRD4は例示的な非酵素タンパク質標的である。BRD4は動的転写活性化及び伸長に関与する転写コアクチベーターである。BRD4は、ツインアセチル−リシン結合モジュール又はブロモドメインによるヒストンタンパク質及び転写因子(TF)上の側鎖アセチル化リシンの認識によって標的遺伝子に隣接したエンハンサー及びプロモーター領域に結合する。近年、BETブロモドメイン(JQ1)の最初の直接作用型阻害剤が開発されており(P. Filippakopoulos et al., Nature 468, 1067-1073 (2010))、これはBRD4をクロマチンから外し、主要調節TFからRNAポリメラーゼIIへのシグナル伝達の障害をもたらす(B. Chapuy et al., Cancer Cell 24, 777-790 (2013)、J. E. Delmore et al., Cell 146, 904-917 (2011)、J. Loven et al., Cell 153, 320-334 (2013))。JQ1によるBRD4ブロモドメインの分子認識は立体特異的であり、(+)−JQ1エナンチオマー(JQ1S;以下、JQ1)のみが活性であり、(−)−JQ1エナンチオマー(JQ1R)は不活性である。MM及び急性骨髄白血病(AML)のネズミ及びヒトモデルにおけるRNA干渉によるBRD4発現のサイレンシングは、MYC癌遺伝子の急速な転写下方調節及び強力な抗増殖性応答を誘発した(J. E. Delmore et al., Cell 146, 904-917 (2011)、J. Zuber et al., Nature 478, 524-528 (2011))。癌、炎症(E. Nicodeme et al., Nature 468, 1119-1123 (2010))及び心臓病(P. Anand et al., Cell 154, 569-582 (2013)、J. D. Brown et al., Mol. Cell 56, 219-231 (2014))におけるこれら及び他の研究から、選択的分解のためにBRD4を標的化する望ましい機構的及び翻訳目的が確立される。
本明細書で使用される場合、「FKBP」という用語は、プロリルイソメラーゼ活性を有し、シクロフィリンと機能の点で関連するが、アミノ酸配列の点では関連しないタンパク質のファミリーに関する(Siekierka et al. Nature 341 (6244): 755-7 (1989))。FKBPは酵母からヒトに及ぶ多くの真核生物で同定されており、プロリン残基を含有するタンパク質のタンパク質フォールディングシャペロンとして機能する。シクロフィリンとともに、FKBPはイムノフィリンファミリーに属する(Balbach et al. Mechanisms of protein folding (2nd ed.). Oxford: Oxford University Press. pp. 212-237 (2000))。細胞質シグナル伝達タンパク質FKBP12はヒトにおいて免疫抑制分子タクロリムス(本来FK506と表される)に結合することで知られ、臓器移植後の患者及び自己免疫障害を患う患者の治療に使用される(Wang et al. Science 265 (5172): 674-6 (1994))。タクロリムスは、関連治療であるシクロフィリンに結合する薬物シクロスポリンよりも臓器拒絶反応のエピソードを低減することが見出されている(Mayer et al. Transplantation 64(3): 436-43 (1997))。FKBP−タクロリムス複合体及びシクロスポリン−シクロフィリン複合体の両方が、カルシニューリンと呼ばれるホスファターゼを阻害することにより、T−リンパ球形質導入経路におけるシグナル伝達を遮断する(Liu et al. Cell 66(4): 807-15 (1991))。この治療的役割はプロリルイソメラーゼ活性とは関連しない。AP1497(表1、TL5)は、FKBP12によって認識されるように設計された合成ピペコリルα−ケトアミドである(Holt et al., J.Am. Chem. Soc.115, 9925 (1993))。
本明細書で使用される場合、「CREBBP」という用語はCREB結合タンパク質に関する。この遺伝子は普遍的に発現され、多くの異なる転写因子の転写同時活性化に関与する。cAMP−応答要素結合タンパク質(CREB)に結合する核タンパク質として初めて単離され、この遺伝子は現在、クロマチンリモデリングを転写因子認識と連結することによって胚発生、成長制御及び恒常性において重要な役割を果たすことが知られている。この遺伝子が関与する染色体転座は急性骨髄白血病と関連付けられている。
本明細書で使用される場合、「SMARCA4」という用語は、ヒトにおいてSMARCA4遺伝子によってコードされるタンパク質であるATP依存性ヘリカーゼSMARCA4としても知られる転写活性化因子BRG1に関する。この遺伝子の突然変異はヒト肺癌細胞株において初めて認められた。BRG1が肺癌及び他の腫瘍型のレチノイン酸及びグルココルチコイド誘導性細胞分化において役割を果たすことが実証されている。
本明細書で使用される場合、「核内受容体」という用語は、ステロイド及び甲状腺ホルモン並びに或る特定の他の分子の感知に関与する細胞内に見られるタンパク質クラスに関する。それに応じて、これらの受容体は特定の遺伝子の発現を調節するように他のタンパク質とともに働き、それにより生物の発生、恒常性及び代謝を制御する。多数の遺伝子の発現は核内受容体によって調節されるため、これらの受容体を活性化するリガンドは生物に対して顕著な効果を有し得る。
以下の代表的な実施例は本願の説明を助けることを意図し、本願の範囲を限定することを意図するものでも、そう解釈すべきものでもない。実際に、本願の様々な変更及びその多くの更なる実施形態が本明細書に示され、記載されるものに加えて、以下の実施例及び本明細書で引用される科学文献及び特許文献の参照を含む本文献の全内容から当業者に明らかとなる。他に指定のない限り、本明細書で引用される参照文献の各々の全内容が、現行の技術水準の説明を助けるために引用することにより本明細書の一部をなすことが更に認められるものとする。以下の実施例は、その様々な実施形態及びその均等物において本願の実施に適合し得る重要な付加的な情報、例示及び指針を含む。
本願のこれら及び他の態様は、本願の或る特定の実施形態を説明することを意図するが、特許請求の範囲によって規定されるその範囲を限定することを意図するものではない以下の実施例を考慮することで更に理解される。
合成法の概要
本明細書で引用される様々な参照文献は、対象となり得る本明細書に記載される本発明の化合物と同様の化合物又は関連中間体の調製に関する有益な背景情報、並びにかかる化合物の配合、使用及び投与に関する情報を与える。
さらに、実践者は様々な例示的な化合物及びその中間体に関して本文献中に提示される具体的な指針及び例に導かれる。
本願によると、任意の利用可能な技法を用いて、本発明の化合物又はそれを含む組成物を作製又は調製することができる。例えば、下記で詳細に論考されるもののような様々な組み合わせ技法、平行合成及び/又は固相合成法を用いることができる。代替的又は付加的には、本発明の化合物は当該技術分野で既知の様々な溶液相合成法を用いて調製することができる。
本願の出発物質、中間体及び化合物は濾過、蒸留、結晶化、クロマトグラフィー等を含む従来の技法を用いて単離及び精製することができる。これらは物理定数及びスペクトルデータを含む従来の方法を用いて特性化することができる。
IMiD誘導体及びデグロンの合成
基本手順I:IMiD縮合
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ヒドロキシイソインドリン−1,3−ジオン(D−1)
20mL容のガラスバイアル内で、酢酸(10.2mL、0.3M)中の3−ヒドロキシフタル酸無水物(500mg、3.05mmol、1当量)、酢酸カリウム(927mg、9.44mmol、3.1当量)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(552mg、3.35mmol、1.1当量)の混合物を90℃に一晩加熱した。黒色の反応混合物を室温まで冷却し、水で20mLに希釈し、続いて氷上で30分間冷却した。得られるスラリーを50mL容のファルコンチューブに移し、これを3500rpmで5分間遠心分離した。上清を捨て、黒色の固体をメタノールの入った250mL容のRBFに移し、真空で濃縮した。残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(9:1))によって精製し、表題化合物を白色の固体(619mg、74%)として得た。H NMR(400MHz,DMSO−d)δ11.07(s,1H)、7.65(dd,J=8.4、6.8Hz,1H)、7.31(d,J=6.8Hz,1H)、7.24(d,J=8.4Hz,1H)、5.06(dd,J=12.8、5.4Hz,1H)、2.94〜2.82(m,1H)、2.64〜2.43(m,2H)、2.08〜1.97(m,1H);C1311[M+H]のMS(ESI)算出値275.07、実測値275.26。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ニトロイソインドリン−1,3−ジオン(D−10)
3−ニトロフタル酸無水物(300mg、1.55mmol、1当量)、酢酸カリウム(473mg、4.82mmol、3.1当量)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(281mg、1.71mmol、1.1当量)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(9:1))による精製後に表題化合物を淡黄色の固体(280mg、59%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.17(s,1H)、8.35(d,J=8.1Hz,1H)、8.24(d,J=7.5Hz,1H)、8.14〜8.10(m,1H)、5.20(dd,J=12.9、5.5Hz,1H)、2.93〜2.84(m,1H)、2.64〜2.45(m,2H)、2.11〜2.04(m,1H);C1310[M+H]のMS(ESI)算出値304.06、実測値304.19。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−ニトロイソインドリン−1,3−ジオン(D−2)
4−ニトロフタル酸無水物(300mg、1.55mmol)、酢酸カリウム(473mg、4.82mmol)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(281mg、1.71mmol)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(30:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(409mg、87%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.18(s,1H)、8.68(dd,J=8.1、1.9Hz,1H)、8.56(d,J=1.9Hz,1H)、8.19(d,J=8.1Hz,1H)、5.24(dd,J=12.9、5.4Hz,1H)、2.90(ddd,J=17.2、13.9、5.5Hz,1H)、2.69〜2.48(m,2H)、2.14〜2.05(m,1H);C1310[M+H]のMS(ESI)算出値304.06、実測値304.19。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−6)
無水フタル酸(155mg、1.05mmol)、酢酸カリウム(318mg、3.24mmol)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(189mg、1.15mmol)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(15:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(235mg、87%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.13(s,1H)、8.00〜7.76(m,4H)、5.16(dd,J=12.8、5.4Hz,1H)、2.89(ddd,J=16.8、13.7、5.4Hz,1H)、2.65〜2.42(m,2H)、2.12〜1.99(m,1H);C1311[M+H]のMS(ESI)算出値259.07、実測値259.23。
2−(2,5−ジオキソピロリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−7)
無水フタル酸(90mg、0.608mmol)、酢酸カリウム(185mg、1.88mmol)及び3−アミノピロリジン−2,5−ジオン塩酸塩(101mg、0.668mmol)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(14:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(95mg、64%)として得た。C12[M+H]のMS(ESI)算出値245.06、実測値245.26。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボン酸(D−13)
1,2,4−ベンゼントリカルボン酸無水物(200mg、1.04mmol)、酢酸カリウム(317mg、3.23mmol)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(188mg、1.15mmol)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(9:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(178mg、57%)として得た。C1411[M+H]のMS(ESI)算出値303.06、実測値303.24。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(D−14)
3−フルオロフタル酸無水物(200mg、1.20mmol)、酢酸カリウム(366mg、3.73mmol)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(218mg、1.32mmol)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(50:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(288mg、86%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.15(s,1H)、7.96(ddd,J=8.3、7.3、4.5Hz,1H)、7.82〜7.71(m,2H)、5.17(dd,J=13.0、5.4Hz,1H)、2.90(ddd,J=17.1、13.9、5.4Hz,1H)、2.65〜2.47(m,2H)、2.10〜2.04(m,1H)、C1310FN[M+H]のMS(ESI)算出値277.06、実測値277.25。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−メチルイソインドリン−1,3−ジオン(D−19)
3−メチルフタル酸無水物(150mg、0.925mmol)、酢酸カリウム(281mg、2.87mmol)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(167mg、1.02mmol)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(15:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(168mg、67%)として得た。C1413[M+H]のMS(ESI)算出値273.09、実測値273.24。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(D−24)
4−フルオロフタル酸無水物(200mg、1.20mmol)、酢酸カリウム(366mg、3.73mmol)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(218mg、1.32mmol)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(15:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(254mg、76%)として得た。C1310FN[M+H]のMS(ESI)算出値277.06、実測値277.24。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−4−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−43)
無水フタル酸(60mg、0.311mmol)、酢酸カリウム(95mg、0.963mmol)及び4−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(56mg、0.342mmol)を用いて基本手順Iに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(9:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(40mg、43%)として得た。C1311[M+H]のMS(ESI)算出値259.07、実測値259.18。
基本手順II:芳香族ニトロ基の還元
4−アミノ−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−4)
THF:水(8:1)(5.7mL、0.1M)中の2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ニトロイソインドリン−1,3−ジオン(173mg、0.854mmol)、Pd(OAc)(12.8mg、0.0854mmol、10mol%)及びフッ化カリウム(66mg、1.71mmol、2当量)の溶液を室温で撹拌した。トリエチルシラン(365μL、3.41mmol、4当量)をゆっくりと添加し、得られる黒色の溶液を室温で1時間撹拌した。反応混合物をセライトパッドを通して濾過し、これを酢酸エチルで過剰に洗浄した。濾液を真空で濃縮し、残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(7:1))によって精製して、表題化合物を黄色の粉末(72mg、46%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.08(s,1H)、7.47(dd,J=8.5、7.0Hz,1H)、7.06〜6.95(m,1H)、6.59〜6.44(m,1H)、5.04(dd,J=12.7、5.4Hz,1H)、2.93〜2.82(m,1H)、2.64〜2.45(m,2H)、2.05〜1.98(m,1H);C1311[M+H]のMS(ESI)算出値274.08、実測値274.23。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−ニトロイソインドリン−1,3−ジオン(D−8)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−ニトロイソインドリン−1,3−ジオン(100mg、0.330mmol)、Pd(OAc)(7.4mg、0.033mmol)、フッ化カリウム(38mg、0.660mmol)及びトリエチルシラン(211μL、1.32mmol)を用いて基本手順IIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(9:1))による精製後に表題化合物を黄色の固体(33mg、37%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.05(s,1H)、7.52(d,J=8.2Hz,1H)、6.94(d,J=2.0Hz,1H)、6.83(dd,J=8.2、2.0Hz,1H)、6.55(s,2H)、5.01(dd,J=12.8、5.4Hz,1H)、2.86(ddd,J=16.9、13.9、5.5Hz,1H)、2.68〜2.43(m,2H)、2.03〜1.93(m,1H);C1312[M+H]のMS(ESI)算出値274.08、実測値274.59。
4−アミノ−2−(1−ベンジル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−12)
2−(1−ベンジル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ニトロイソインドリン−1,3−ジオン(48mg、0.122mmol)、Pd(OAc)(2.7mg、0.0122mmol)、フッ化カリウム(14mg、0.244mmol)及びトリエチルシラン(78μL、0.488mmol)を用いて基本手順IIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0%→100%のEtOAc)による精製後に表題化合物を黄色の固体(7mg、16%)として得た。C2018[M+H]のMS(ESI)算出値364.13、実測値364.34。
3−(5−アミノ−2−メチル−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(D−17)
3−(2−メチル−5−ニトロ−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(21mg、0.0664mmol)、Pd(OAc)(1.5mg、0.0066mmol)、フッ化カリウム(7.7mg、0.133mmol)及びトリエチルシラン(42μL、0.266mmol)を用いて基本手順IIに従い、分取HPLCによる精製後に表題化合物を白色の固体(7mg、37%)として得た。C1415[M+H]のMS(ESI)算出値287.11、実測値287.30。
3−(7−アミノ−1−オキソイソインドリン−2−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(D−41)
3−(7−ニトロ−1−オキソイソインドリン−2−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(11mg、0.038mmol)、Pd(OAc)(0.9mg、0.0038mmol)、フッ化カリウム(4.4mg、0.076mmol)及びトリエチルシラン(24μL、0.152mmol)を用いて基本手順IIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の固体(2mg、21%)として得た。C1314[M+H]のMS(ESI)算出値260.10、実測値260.52。
基本手順III:アニリンのアシル化
N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−イル)アセトアミド(D−5)
4mL容のガラスバイアル内で、THF(1.8mL、0.1M)中の5−アミノ−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.110mmol、1当量)及び塩化アセチル(26μL、0.220mmol、2当量)の混合物を一晩加熱還流した。反応混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOで洗浄し、表題化合物を白色の固体(27mg、47%)として得て、これを更に精製することなく使用した。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.11(s,1H)、10.63(s,1H)、8.24(d,J=1.5Hz,1H)、7.91〜7.83(m,2H)、5.11(dd,J=12.8、5.4Hz,1H)、2.88(ddd,J=17.0、13.8、5.4Hz,1H)、2.63〜2.46(m,2H)、2.13(s,3H)、2.09〜2.00(m,1H);C1514[M+H]のMS(ESI)算出値316.09、実測値316.23。
N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アセトアミド(D−3)
4−アミノ−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(50mg、0.183mmol)及び塩化アセチル(26μL、0.366mmol)を用いて基本手順IIIに従い、表題化合物を白色の固体(10mg、17%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.14(s,1H)、9.73(s,1H)、8.44(d,J=8.4Hz,1H)、7.83(dd,J=8.4、7.3Hz,1H)、7.62(d,J=7.2Hz,1H)、5.14(dd,J=12.9、5.4Hz,1H)、2.90(ddd,J=17.1、13.9、5.4Hz,1H)、2.66〜2.45(m,2H)、2.19(s,3H)、2.14〜2.00(m,1H);C1514[M+H]のMS(ESI)算出値316.09、実測値316.27。
2−クロロ−N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−イル)アセトアミド(D−32)
5−アミノ−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(10mg、0.0366mmol)及び塩化アセチル(6μL、0.0732mmol)を用いて基本手順IIIに従い、表題化合物を白色の固体(7.1mg、55%)として得た。C1513ClN[M+H]のMS(ESI)算出値350.05、実測値350.23。
2−クロロ−N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)アセトアミド(D−34)
3−(4−アミノ−1−オキソイソインドリン−2−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(20mg、0.0771mmol)及び塩化クロロアセチル(12μL、0.154mmol)を用いて基本手順IIIに従い、表題化合物を白色の固体(14.9mg、56%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.02(s,1H)、10.20(s,1H)、7.81(dd,J=7.7、1.3Hz,1H)、7.65〜7.47(m,2H)、5.16(dd,J=13.3、5.1Hz,1H)、4.45〜4.34(m,2H)、4.33(s,2H)、3.00〜2.85(m,1H)、2.68〜2.56(m,1H)、2.41〜2.28(m,1H)、2.09〜1.97(m,1H);C1515ClN[M+H]のMS(ESI)算出値336.07、実測値336.31。
N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)アクリルアミド(D−35)
3−(4−アミノ−1−オキソイソインドリン−2−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(20mg、0.0771mmol)及び塩化アクリロイル(13μL、0.154mmol)を用いて基本手順IIIに従い、表題化合物を白色の固体(18mg、76%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ15.77(s,1H)、14.81(s,1H)、12.65(dd,J=7.4、1.6Hz,1H)、12.37〜12.18(m,2H)、11.28(dd,J=17.0、10.2Hz,1H)、11.06(dd,J=17.0、1.9Hz,1H)、10.57(dd,J=10.2、1.9Hz,1H)、9.91(dd,J=13.3、5.1Hz,1H)、9.24〜9.05(m,2H)、7.67(ddd,J=17.2、13.7、5.5Hz,1H)、7.36(dt,J=17.3、3.8Hz,1H)、7.20〜7.03(m,1H)、6.83〜6.72(m,1H);C1616[M+H]のMS(ESI)算出値314.11、実測値314.24。
N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−イル)アクリルアミド(D−36)
5−アミノ−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(10mg、0.0366mmol)及び塩化アクリロイル(6μL、0.0732mmol)を用いて基本手順IIIに従い、表題化合物を白色の固体(8.8mg、73%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.12(s,1H)、10.83(s,1H)、8.33(d,J=1.8Hz,1H)、7.99(dd,J=8.2、1.9Hz,1H)、7.90(d,J=8.2Hz,1H)、6.48(dd,J=17.0、10.1Hz,1H)、6.36(dd,J=17.0、1.9Hz,1H)、5.88(dd,J=10.0、1.9Hz,1H)、5.13(dd,J=12.8、5.5Hz,1H)、2.95〜2.84(m,1H)、2.67〜2.46(m,2H)、2.09〜2.01(m,1H);C1614[M+H]のMS(ESI)算出値328.09、実測値328.23。
N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)アセトアミド(D−37)
3−(4−アミノ−1−オキソイソインドリン−2−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(20mg、0.0771mmol)及び塩化アセチル(11μL、0.154mmol)を用いて基本手順IIIに従い、表題化合物を白色の固体(17mg、71%)として得た。C1516[M+H]のMS(ESI)算出値302.11、実測値301.99。
N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)シクロプロパンカルボキサミド(D−38)
3−(4−アミノ−1−オキソイソインドリン−2−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(20mg、0.0771mmol)及び塩化シクロプロパンカルボニル(14μL、0.154mmol)を用いて基本手順IIIに従い、表題化合物を白色の固体(19mg、75%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.01(s,1H)、10.06(s,1H)、7.84(dd,J=7.2、1.9Hz,1H)、7.66〜7.38(m,2H)、5.14(dd,J=13.3、5.1Hz,1H)、4.52〜4.30(m,2H)、2.92(ddd,J=17.3、13.6、5.4Hz,1H)、2.64〜2.54(m,1H)、2.45〜2.27(m,1H)、2.08〜1.95(m,1H)、1.93〜1.83(m,1H)、0.90〜0.75(m,4H);C1718[M+H]のMS(ESI)算出値328.13、実測値328.00。
基本手順IV:キナゾリノン縮合
3−(2−メチル−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(D−9)
20mL容のガラスバイアル内で、ピリジン(1.0uL、0.7M)中のアントラニル酸(100mg、0.729mmol、1当量)、酢酸(42μL、0.729mmol、1当量)及びP(OPh)(479μL、1.82mmol、2.5当量)を90℃に加熱した。4時間後に反応混合物を室温に冷却し、3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(144mg、0.875mmol、1.2当量)を添加した。反応混合物を90℃に1.5時間再加熱し、その後すぐに室温で一晩撹拌した。反応混合物をEtOAc(15mL)及び水(15mL)中に取った。有機層をブライン(2×25mL)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、真空で濃縮した。残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→5%のMeOH)によって精製して、表題化合物を白色の固体(79mg、40%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.03(s,1H)、8.03(dd,J=7.9、1.5Hz,1H)、7.82(ddd,J=8.5、7.1、1.6Hz,1H)、7.62(dd,J=8.3、1.1Hz,1H)、7.50(ddd,J=8.1、7.1、1.1Hz,1H)、5.27(dd,J=11.5、5.7Hz,1H)、2.92〜2.78(m,1H)、2.73〜2.56(m,5H)、2.26〜2.06(m,1H);C1414[M+H]のMS(ESI)算出値272.10、実測値272.33。
3−(2−メチル−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピロリジン−2,5−ジオン(D−11)
アントラニル酸(200mg、1.46mmol)、酢酸(84μL、1.46mmol)、P(OPh)(959μL、3.65mmol)及び3−アミノピロリジン−2,5−ジオン塩酸塩(263mg、1.75mmol)を用いて基本手順IVに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl:MeOH(15:1))による精製後に表題化合物を白色の固体(25mg、7%)として得た。C1312[M+H]のMS(ESI)算出値258.09、実測値258.22。
3−(5−フルオロ−2−メチル−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(D−66)
6−フルオロアントラニル酸(100mg、0.645mmol)、酢酸(37μL、0.644mmol)、P(OPh)(424μL、1.61mmol)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(127mg、0.774mmol)を用いて基本手順IVに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を白色の固体(70mg、38%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.03(s,1H)、7.84〜7.76(m,1H)、7.44(dd,J=8.2、1.0Hz,1H)、7.25(ddd,J=11.1、8.2、1.0Hz,1H)、5.24(dd,J=11.3、5.7Hz,1H)、2.90〜2.75(m,1H)、2.62(s,3H)、2.61〜2.56(m,2H)、2.20〜2.12(m,1H);C1413FN[M+H]のMS(ESI)算出値290.09、実測値290.27。
3−(2−メチル−5−ニトロ−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(D−67)
6−ニトロアントラニル酸(100mg、0.549mmol)、酢酸(31μL、0.549mmol)、P(OPh)(361μL、1.37mmol)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(108mg、0.659mmol)を用いて基本手順IVに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を白色の固体(29mg、17%)として得た。C1413[M+H]のMS(ESI)算出値317.09、実測値317.58。
基本手順V:アミドカップリング
N−ベンジル−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボキサミド(D−15)
4mL容のガラスバイアル内で、DMF(331μL、0.1M)中の2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボン酸(10mg、0.033mmol、1当量)、HATU(13mg、0.033mmol、1当量)、DIPEA(17μL、0.099mmol、3当量)及びベンジルアミン(4μL、0.036mmol、1.1当量)を室温で一晩撹拌した。反応混合物をMeOHで4mLに希釈し、濾過した後、分取HPLCによって精製して、表題化合物を白色の固体(6mg、46%)として得た。C2118[M+H]のMS(ESI)算出値392.12、実測値392.33。
基本手順VI:芳香族求核置換
4−(ベンジルアミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−16)
4mL容のガラスバイアル内で、NMP(362μL、0.1M)中の2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(10mg、0.036mmol、1当量)、ベンジルアミン(4.4μL、0.040mmol、1.1当量)及びDIPEA(13μL、0.072mmol、2当量)を90℃に一晩加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、EtOAc(15mL)中に取った。有機層をNaHCO(水溶液)(15mL)、水(15mL)及びブライン(3×15mL)で洗浄し、続いてNaSOで乾燥させ、真空で濃縮した。残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0%→100%のEtOAc)によって精製して、表題化合物を黄色の膜(5mg、38%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.10(s,1H)、7.44(dd,J=8.5、7.1Hz,1H)、7.40〜7.25(m,5H)、7.12(d,J=7.1Hz,1H)、6.84(d,J=8.5Hz,1H)、6.71(t,J=5.9Hz,1H)、4.93(dd,J=12.3、5.3Hz,1H)、4.51(d,J=5.9Hz,2H)、2.93〜2.66(m,3H)、2.21〜2.07(m,1H);C2018[M+H]のMS(ESI)算出値364.13、実測値364.31。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−(イソプロピルアミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(D−18)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.109mmol)、イソプロピルアミン(10μL、0.119mmol)及びDIPEA(21μL、0.119mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0%→100%のEtOAc)による精製後に表題化合物を黄色の膜(11mg、32%)として得た。C1618[M+H]のMS(ESI)算出値316.13、実測値316.65。
4−(ジエチルアミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−21)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.109mmol)、ジエチルアミン(11μL、0.130mmol)及びDIPEA(32μL、0.181mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0%→100%のEtOAc)による精製後に表題化合物を黄色の膜(28mg、97%)として得た。C1720[M+H]のMS(ESI)算出値330.14、実測値330.62。
5−(ベンジルアミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−25)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.109mmol)、ベンジルアミン(13μL、0.119mmol)及びDIPEA(38μL、0.217mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0%→100%のEtOAc)による精製後に表題化合物を黄色の膜(6mg、15%)として得た。C2018[M+H]のMS(ESI)算出値364.13、実測値364.34。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−(イソプロピルアミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(D−26)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.109mmol)、イソプロピルアミン(11μL、0.130mmol)及びDIPEA(38μL、0.217mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0%→100%のEtOAc)による精製後に表題化合物を黄色の膜(6mg、17%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.00(s,1H)、7.53(d,J=8.3Hz,1H)、6.87(d,J=2.1Hz,1H)、6.64(dd,J=8.3、2.2Hz,1H)、4.86(dd,J=12.3、5.4Hz,1H)、4.30(d,J=7.8Hz,1H)、2.86〜2.58(m,3H)、2.12〜2.01(m,1H)、1.26〜1.15(m,6H);C1618[M+H]のMS(ESI)算出値316.13、実測値316.30。
5−(ジエチルアミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−27)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.109mmol)、ジエチルアミン(14μL、0.130mmol)及びDIPEA(38μL、0.217mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン中0%→100%のEtOAc)による精製後に表題化合物を黄色の膜(6mg、31%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.08(s,1H)、7.57(d,J=8.6Hz,1H)、6.98(d,J=2.4Hz,1H)、6.72(dd,J=8.7、2.4Hz,1H)、4.90〜4.80(m,1H)、3.40(q,J=7.1Hz,4H)、2.89〜2.61(m,3H)、2.11〜2.01(m,1H)、1.16(t,J=7.1Hz,6H);C1720[M+H]のMS(ESI)算出値330.14、実測値330.69。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−((フラン−2−イルメチル)アミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(D−28)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(50mg、0.181mmol)、フルフリルアミン(18μL、0.199mmol)及びDIPEA(63μL、0.362mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→5%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(8mg、13%)として得た。C1816[M+H]のMS(ESI)算出値354.11、実測値354.25。
tert−ブチル(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エチル)カルバメート(D−29)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(50mg、0.181mmol)、1−Boc−エチレンジアミン(32mg、0.199mmol)及びDIPEA(63μL、0.362mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(31mg、41%)として得た。H NMR(500MHz,CDCl)δ8.08(bs,1H)、7.50(dd,J=8.5、7.1Hz,1H)、7.12(d,J=7.1Hz,1H)、6.98(d,J=8.5Hz,1H)、6.39(t,J=6.1Hz,1H)、4.96〜4.87(m,1H)、4.83(bs,1H)、3.50〜3.41(m,2H)、3.41〜3.35(m,2H)、2.92〜2.66(m,3H)、2.16〜2.09(m,1H)、1.45(s,9H);C2025[M+H]のMS(ESI)算出値417.18、実測値417.58。
tert−ブチル(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−イル)アミノ)エチル)カルバメート(D−30)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−5−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(50mg、0.181mmol)、1−Boc−エチレンジアミン(32mg、0.199mmol)及びDIPEA(63μL、0.362mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(22mg、29%)として得た。C2025[M+H]のMS(ESI)算出値417.18、実測値417.32。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−((フラン−2−イルメチル)アミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(D−31)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(19.5mg、0.0706mmol)、フルフリルアミン(7μL、0.078mmol)及びDIPEA(25μL、0.141mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→2.5%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(19mg、76%)として得た。C1816[M+H]のMS(ESI)算出値354.11、実測値354.27。
3−(5−(ベンジルアミノ)−2−メチル−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(D−39)
反応混合物を90℃の代わりに170℃に加熱したことを除いて、3−(5−フルオロ−2−メチル−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(30mg、0.104mmol)、ベンジルアミン(13μL、0.114mmol)及びDIPEA(36μL、0.207mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を白色の固体(15mg、38%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.73(t,J=5.7Hz,1H)、8.39(s,1H)、7.41(t,J=8.1Hz,1H)、7.39〜7.19(m,5H)、6.77(d,J=7.7Hz,1H)、6.41(d,J=8.3Hz,1H)、4.67(dd,J=11.5、5.9Hz,1H)、4.43(d,J=5.7Hz,2H)、3.03〜2.79(m,2H)、2.72〜2.61(m,1H)、2.60(s,3H)、2.15〜2.07(m,1H);C2121[M+H]のMS(ESI)算出値377.16、実測値377.02。
3−(5−(イソプロピルアミノ)−2−メチル−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(D−40)
反応混合物を90℃の代わりに170℃に加熱したことを除いて、3−(5−フルオロ−2−メチル−4−オキソキナゾリン−3(4H)−イル)ピペリジン−2,6−ジオン(30mg、0.104mmol)、イソプロピルアミン(10μL、0.114mmol)及びDIPEA(36μL、0.207mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を白色の固体(5mg、15%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.31(s,1H)、8.21(d,J=7.2Hz,1H)、7.50〜7.37(m,1H)、6.70(dd,J=7.9、0.9Hz,1H)、6.47(d,J=8.4Hz,1H)、4.65(dd,J=11.4、5.9Hz,1H)、3.69〜3.56(m,1H)、3.03〜2.80(m,3H)、2.58(s,3H)、2.14〜2.03(m,1H)、1.27(d,J=2.7Hz,3H)、1.26(d,J=2.7Hz,3H);C1721[M+H]のMS(ESI)算出値329.16、実測値329.97。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−((2−ヒドロキシエチル)アミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(D−68)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.109mmol)、アミノエタノール(7μL、0.119mmol)及びDIPEA(38μL、0.217mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→5%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(6mg、18%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.26(s,1H)、7.50(dd,J=8.5、7.1Hz,1H)、7.12(d,J=7.0Hz,1H)、6.95(d,J=8.5Hz,1H)、6.50(t,J=5.9Hz,1H)、4.97〜4.85(m,1H)、3.94〜3.79(m,2H)、3.47(q,J=5.5Hz,2H)、3.03〜2.68(m,3H)、2.19〜2.04(m,1H);C1516[M+H]318.11、実測値318.22のMS(ESI)算出値。
4−(シクロプロピルアミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D47)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(20mg、0.0724mmol)、シクロプロピルアミン(6μL、0.080mmol)及びDIPEA(25μL、0.141mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→5%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(16mg、70%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.05(s,1H)、7.53(dd,J=8.5、7.1Hz,1H)、7.33〜7.21(m,1H)、7.15(dd,J=7.1、0.7Hz,1H)、6.44(bs,1H)、4.95〜4.85(m,1H)、2.98〜2.66(m,3H)、2.62〜2.50(m,1H)、2.19〜2.06(m,1H)、0.92〜0.78(m,2H)、0.67〜0.56(m,2H);C1616[M+H]のMS(ESI)算出値314.11、実測値314.54。
4−((2−(1H−インドール−3−イル)エチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−48)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(20mg、0.0724mmol)、トリプタミン(13mg、0.080mmol)及びDIPEA(25μL、0.144mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(10mg、33%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.14(s,1H)、8.11(s,1H)、7.65〜7.55(m,1H)、7.45(dd,J=8.6、7.1Hz,1H)、7.37(dt,J=8.2、0.9Hz,1H)、7.21(ddd,J=8.2、7.0、1.2Hz,1H)、7.16〜7.04(m,3H)、6.88(d,J=8.5Hz,1H)、6.34(t,J=5.6Hz,1H)、4.89(dd,J=12.4、5.4Hz,1H)、3.59(td,J=6.8、5.5Hz,2H)、3.19〜3.03(m,2H)、2.93〜2.64(m,3H)、2.14〜2.04(m,1H);C2321[M+H]のMS(ESI)算出値417.16、実測値417.26。
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−((4−ヒドロキシフェネチル)アミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(D−49)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(20mg、0.0724mmol)、チラミン(11mg、0.080mmol)及びDIPEA(25μL、0.144mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→5%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(15mg、54%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.20(s,1H)、7.51(dd,J=8.5、7.1Hz,1H)、7.17〜7.08(m,2H)、6.90(d,J=8.5Hz,1H)、6.85〜6.72(m,2H)、4.95〜4.90(m,1H)、3.52〜3.46(m,2H)、2.97〜2.87(m,2H)、2.86〜2.72(m,2H)、2.21〜2.09(m,1H);C2120[M+H]のMS(ESI)算出値394.14、実測値394.25。
4−((2−(1H−イミダゾール−2−イル)エチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−50)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(20mg、0.0724mmol)、ヒスタミン(15mg、0.080mmol)及びDIPEA(25μL、0.144mmol)を用いて基本手順VIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を黄色の膜(5mg、19%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.19(s,1H)、7.61(d,J=1.2Hz,1H)、7.47(dd,J=8.5、7.1Hz,1H)、7.07(d,J=6.9Hz,1H)、6.96〜6.83(m,2H)、6.39(t,J=5.7Hz,1H)、4.97〜4.79(m,1H)、3.59(q,J=6.5Hz,2H)、2.95(t,J=6.6Hz,2H)、2.92〜2.62(m,2H)、2.16〜2.04(m,1H);C1818[M+H]のMS(ESI)算出値368.14、実測値368.47。
基本手順VII:第一級アミンのアシル化
N−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)メチル)シクロプロパンカルボキサミド(D−22)
4mL容のガラスバイアル内で、MeCN(250μL、0.35M)中の4−(アミノメチル)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(25mg、0.087mmol、1当量)及びDIPEA(30μL、0.174mmol、2当量)を0℃に冷却した。シクロプロパンカルボニルクロリド(8.7μL、0.096mmol)をゆっくりと添加し、反応混合物を室温で一晩撹拌した。生成物を濾過によって単離し、表題化合物を白色の固体(4.8mg、15%)として得て、これを更に精製することなく使用した。C1818[M+H]のMS(ESI)算出値356.12、実測値356.32。
N−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)メチル)アセトアミド(D−23)
4−(アミノメチル)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(25mg、0.087mmol)、DIPEA(30μL、0.174mmol)及び塩化アセチル(7μL、0.096mmol)を用いて基本手順VIIに従い、表題化合物を白色の固体(4.5mg、16%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.13(s,1H)、8.47(t,J=6.0Hz,1H)、7.88〜7.76(m,2H)、7.70(dt,J=7.3、1.1Hz,1H)、5.15(dd,J=12.7、5.4Hz,1H)、4.69(d,J=6.0Hz,2H)、2.90(ddd,J=16.8、13.8、5.4Hz,1H)、2.64〜2.44(m,2H)、2.15〜2.01(m,1H)、1.92(s,3H);C1616[M+H]のMS(ESI)算出値330.11、実測値330.05。
2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エタン−1−アミニウム2,2,2−トリフルオロアセテート(D−33)
ジクロロメタン(2.25mL)中のtert−ブチル(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エチル)カルバメート(205mg、0.492mmol、1当量)の撹拌溶液をトリフルオロ酢酸(0.250mL)に添加した。反応混合物を室温で4時間撹拌し、その後すぐに揮発性物質を真空で除去した。表題化合物を黄色の固体(226mg、95%超)として得て、これを更に精製することなく使用した。H NMR(500MHz,MeOD)δ7.64(d,J=1.4Hz,1H)、7.27〜7.05(m,2H)、5.10(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、3.70(t,J=6.0Hz,2H)、3.50〜3.42(m,2H)、3.22(t,J=6.0Hz,1H)、2.93〜2.85(m,1H)、2.80〜2.69(m,2H)、2.17〜2.10(m,1H);C1517[M+H]のMS(ESI)算出値317.12、実測値317.53。
基本手順VIII:フェノールアルキル化
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−((4−(モルホリノメチル)ベンジル)オキシ)イソインドリン−1,3−ジオン(D−45)
4mL容のガラスバイアル内で、DMF(365μL、0.3M)中の2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ヒドロキシイソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.109mmol、1当量)及びKCO(15mg、0.109mmol、1当量)を室温で撹拌した。DMF(200μL)中の4−(4−(ブロモメチル)ベンジル)モルホリン(30mg、0.109mmol、1当量)を添加し、反応混合物を室温で4日間撹拌した。反応混合物を水(15mL)及びEtOAc(15mL)中に取り、有機層をブライン(3×15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、真空で濃縮した。残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)によって精製して、表題化合物を白色の固体(20mg、40%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.10(s,1H)、7.82(dd,J=8.5、7.2Hz,1H)、7.60(d,J=8.5Hz,1H)、7.50〜7.42(m,3H)、7.35(d,J=8.1Hz,2H)、5.35(s,2H)、5.09(dd,J=12.8、5.5Hz,1H)、3.64〜3.51(m,4H)、3.46(s,2H)、2.88(ddd,J=17.0、14.1、5.4Hz,1H)、2.63〜2.47(m,2H)、2.38〜2.31(m,4H)、2.07〜1.99(m,1H);C2526[M+H]のMS(ESI)算出値464.18、実測値464.00。
4−(ベンジルオキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−46)
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ヒドロキシイソインドリン−1,3−ジオン(30mg、0.109mmol)、KCO(15mg、0.109mmol)及び臭化ベンジル(8μL、0109mmol)を用いて基本手順VIIIに従い、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)による精製後に表題化合物を白色の固体(8mg、20%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.10(s,1H)、7.83(dd,J=8.5、7.3Hz,1H)、7.60(d,J=8.5Hz,1H)、7.53〜7.50(m,2H)、7.47(d,J=7.2Hz,1H)、7.45〜7.39(m,2H)、7.38〜7.32(m,1H)、5.38(s,2H)、5.09(dd,J=12.8、5.5Hz,1H)、2.88(ddd,J=16.9、13.8、5.5Hz,1H)、2.64〜2.46(m,2H)、2.07〜1.99(m,1H);C2017[M+H]のMS(ESI)算出値365.11、実測値365.21。
2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エチル4−メチルベンゼン−スルホネート(D−44)
4mL容のガラスバイアル内で、CHCl(200μL)中の2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−((2−ヒドロキシエチル)アミノ)イソインドリン−1,3−ジオン(7mg、0.0221mmol、1当量)及びEtN(3μL、0.033mmol、1.5当量)を室温で撹拌した。CHCl(100μL)中の塩化トシル(6mg、0.026mmol、1.2当量)を添加し、反応混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物を真空で濃縮し、残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH)によって精製して、表題化合物を白色の固体(4mg、40%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.13(s,1H)、7.64〜7.59(m,2H)、7.46(dd,J=8.6、7.1Hz,1H)、7.33〜7.27(m,2H)、7.04〜6.93(m,2H)、6.58(t,J=6.4Hz,1H)、5.09(dd,J=12.7、5.4Hz,1H)、4.15(t,J=5.1Hz,2H)、3.65〜3.52(m,2H)、2.97〜2.83(m,1H)、2.67〜2.46(m,2H)、2.27(s,3H)、2.12〜2.02(m,1H);C2222S[M+H]のMS(ESI)算出値472.12、実測値472.39。
(R)−4−ヒドロキシ−2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−52)
ヒドロキシイソベンゾフラン−1,3−ジオン(147.08mg、0.896mmol、1当量)を(R)−3−アミノ−3−メチルピペリジン−2,6−ジオン塩酸(127.32mg、0.896mmol、1当量)に添加した。次いで、ピリジン(3.584ml、0.25M)を混合物に添加し、これを110℃で17時間撹拌した。混合物をメタノールで希釈し、減圧下で濃縮した。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、24gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(110.9mg、収率42.63%)を得た。H NMR(400MHz,DMSO−d)δ10.95(s,1H)、7.61(dd,J=8.4、7.2Hz,1H)、7.27〜7.14(m,2H)、2.73〜2.63(m,1H)、2.57〜2.51(m,1H)、2.04〜1.97(m,1H)、1.86(s,3H)。LCMS289(M+H)。
(S)−4−ヒドロキシ−2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−53)
4−ヒドロキシイソベンゾフラン−1,3−ジオン(148.99mg、0.907mmol、1当量)を(S)−3−アミノ−3−メチルピペリジン−2,6−ジオン塩酸(128.97mg、0.907mmol、1当量)に添加した。次いで、ピリジン(3.628ml、0.25M)を混合物に添加し、これを110℃で17時間撹拌した。混合物をメタノールで希釈し、減圧下で濃縮した。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、24gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(150mg、収率57.4%)を得た。H NMR(400MHz,DMSO−d)δ10.95(s,1H)、7.62(dd,J=8.4、7.2Hz,1H)、7.27〜7.16(m,2H)、2.75〜2.62(m,1H)、2.55(dd,J=14.0、4.3Hz,1H)、2.05〜1.96(m,1H)、1.86(s,3H)。LCMS289(M+H)。
(S)−2−((2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸(D−55)
TFA(0.63ml、0.1M)をtert−ブチル(S)−2−((2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセテート(25.4mg、0.063mmol、1当量)に添加し、混合物を50℃で1時間撹拌した。次いで、混合物をメタノールで希釈し、減圧下で濃縮し、白色の粉末(20.5mg、収率93.9%)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.81〜7.75(m,1H)、7.50(d,J=7.3Hz,1H)、7.45(d,J=8.6Hz,2H)、7.43〜7.37(m,3H)、5.09(dd,J=12.8、5.5Hz,1H)、4.76(s,2H)、4.63(dd,J=9.1、5.2Hz,1H)、3.66〜3.55(m,30H)、3.51〜3.41(m,5H)、2.90〜2.83(m,1H)、2.79〜2.71(m,2H)、2.69(s,3H)、2.43(s,3H)、2.14(ddt,J=10.5、5.5、3.2Hz,1H)、1.69(s,3H)。LCMS347(M+H)。
(R)−2−((2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸(D−54)
TFA(1.78ml、0.1M)をtert−ブチル(R)−2−((2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセテート(71.3mg、0.178mmol、1当量)に添加し、混合物を50℃で1時間撹拌した。次いで、混合物をメタノールで希釈し、減圧下で濃縮し、白色の粉末(47.2mg、収率76.63%)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.72(ddd,J=8.5、7.3、5.0Hz,1H)、7.46〜7.42(m,1H)、7.30(dd,J=8.6、4.5Hz,1H)、4.94(d,J=5.3Hz,2H)、2.81〜2.56(m,2H)、2.24〜2.07(m,1H)、2.00(s,2H)、0.90(t,J=6.5Hz,2H)。LCMS347(M+H)。
4,7−ジクロロ−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(D−51)
4,7−ジクロロイソベンゾフラン−1,3−ジオン(434.6mg、2.002mmol、1当量)を3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸(362.6mg、2.203mmol、1.1当量)に添加した。次いで、酢酸カリウム(609.07mg、6.206mmol、3.1当量)及び酢酸(6.67ml、0.3M)を混合物に添加し、これを90℃で18時間撹拌した。混合物を室温まで冷却し、DI水で希釈し、5分間遠心分離した。沈殿をメタノールで希釈し、減圧下で濃縮した。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、12gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の粉末(160.4mg、収率24.5%)を得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.15(s,1H)、7.91(s,2H)、5.17(dd,J=12.9、5.4Hz,1H)、2.88(ddd,J=17.2、13.9、5.4Hz,1H)、2.68〜2.54(m,1H)、2.05(ddd,J=10.5、5.4、2.7Hz,1H)。LCMS328(M+H)。
例示的な化合物の合成
他に指定のない限り、出発物質は市販されているか、又は当該技術分野に適度に精通している者によって研究室合成により容易に利用可能である。概説される本明細書のサブクラス及び種の化合物の合成の手順及び一般的な指針が下記に概説される。
実施例1:dBET1の合成
(1)JQ−酸の合成
JQ1(1.0g、2.19mmol、1当量)をギ酸(11mL、0.2M)に室温で溶解し、75時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮し、黄色の固体(0.99g、定量的収率)を得て、これを精製することなく使用した。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.50〜7.36(m,4H)、4.59(t,J=7.1Hz,1H)、3.51(d,J=7.1Hz,2H)、2.70(s,3H)、2.45(s,3H)、1.71(s,3H)。LCMS401.33(M+H)。
N−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートを、既に公表されている手順(Fischer et al. Nature 2014, 512, 49)に従って合成した。
(2)dBET1の合成
JQ−酸(11.3mg、0.0281mmol、1当量)及びN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(14.5mg、0.0281mmol、1当量)をDMF(0.28mL、0.1M)に室温で溶解した。次いで、DIPEA(14.7マイクロリットル、0.0843mmol、3当量)及びHATU(10.7mg、0.0281mmol、1当量)を添加し、混合物を19時間撹拌した。次いで、混合物を分取HPLCによって精製して、dBET1を黄色の固体(15.90mg、0.0202mmol、72%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.77(dd,J=8.3、7.5Hz,1H)、7.49(d,J=7.3Hz,1H)、7.47〜7.37(m,5H)、5.07(dd,J=12.5、5.4Hz,1H)、4.74(s,2H)、4.69(dd,J=8.7、5.5Hz,1H)、3.43〜3.32(m,3H)、3.29〜3.25(m,2H)、2.87〜2.62(m,7H)、2.43(s,3H)、2.13〜2.04(m,1H)、1.72〜1.58(m,7H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.41、172.33、171.27、171.25、169.87、168.22、167.76、166.73、166.70、156.26、138.40、138.23、137.44、134.83、133.92、133.40、132.30、132.28、131.97、131.50、129.87、121.85、119.31、118.00、69.53、54.90、50.54、40.09、39.83、38.40、32.12、27.74、27.65、23.61、14.42、12.97、11.57。LCMS785.44(M+H)。
実施例2:dBET4の合成
DMF(0.438mL、0.0438mmol、1.2当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(R)−JQ−酸(JQ−酸に類似した方法で(R)−JQ1から調製した)(14.63mg、0.0365mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(19.1マイクロリットル、0.1095mmol、3当量)及びHATU(15.3mg、0.0402mmol、1.1当量)を添加し、混合物を24時間撹拌した後、MeOHで希釈し、減圧下で濃縮した。粗物質を分取HPLCによって精製して、黄色の固体(20.64mg、0.0263mmol、72%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.79(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.51(d,J=7.3Hz,1H)、7.47〜7.39(m,5H)、5.11〜5.06(m,1H)、4.75(s,2H)、4.68(dd,J=8.8、5.5Hz,1H)、3.47〜3.31(m,5H)、2.83〜2.65(m,7H)、2.44(s,3H)、2.13〜2.06(m,1H)、1.68(s,3H)、1.67〜1.60(m,4H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.43、172.40、171.29、169.92、168.24、167.82、166.71、156.31、153.14、138.38、138.24、137.54、134.88、133.86、133.44、132.29、132.00、131.49、129.88、122.46、121.90、119.38、118.02、69.59、54.96、50.55、40.09、39.84、38.45、32.14、27.75、27.65、23.62、14.41、12.96、11.56.MS785.48(M+H)。
実施例3:dBET3の合成
DMF(0.475mL、0.0475mmol、1.2当量)中のN−(2−アミノエチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(15.86mg、0.0396mmol、1当量)に室温で添加した。次いで、DIPEA(20.7マイクロリットル、0.1188mmol、3当量)及びHATU(16.5mg、0.0435mmol、1.1当量)を添加し、混合物を24時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、黄色の固体(22.14mg、0.0292mmol、74%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.82〜7.75(m,1H)、7.52〜7.32(m,6H)、5.04(dd,J=11.6、5.5Hz,1H)、4.76(d,J=3.2Hz,2H)、4.66(d,J=6.6Hz,1H)、3.58〜3.35(m,6H)、2.78〜2.58(m,6H)、2.48〜2.41(m,3H)、2.11〜2.02(m,1H)、1.70(d,J=11.8Hz,3H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.38、171.26、171.19、170.26、168.86、168.21、167.76、166.72、156.27、153.14、138.44、138.36、138.19、134.87、133.71、132.31、131.57、131.51、129.90、129.86、121.81、119.36、117.95、69.48、54.83、50.52、40.09、39.76、38.30、32.09、23.63、14.40、11.61。LCMS757.41(M+H)。
実施例4:dBET5の合成
DMF(0.247mL、0.0247mmol、1当量)中のN−(6−アミノヘキシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(9.9mg、0.0247mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(12.9マイクロリットル、0.0741mmol、3当量)及びHATU(9.4mg、0.0247mmol、1当量)を添加し、混合物を21時間撹拌した後、MeOHで希釈し、減圧下で濃縮した。粗物質を分取HPLCによって精製して、黄色の固体(13.56mg、0.0167mmol、67%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.82〜7.78(m,1H)、7.53(dd,J=7.3、2.0Hz,1H)、7.49〜7.37(m,5H)、5.10(dt,J=12.4、5.3Hz,1H)、4.76(s,2H)、4.70(dd,J=8.7、5.5Hz,1H)、3.42〜3.33(m,2H)、3.25(dt,J=12.3、6.0Hz,3H)、2.87〜2.67(m,7H)、2.48〜2.42(m,3H)、2.14〜2.09(m,1H)、1.69(d,J=4.8Hz,3H)、1.58(s,4H)、1.42(d,J=5.2Hz,4H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.51、171.31、171.26、169.82、168.27、168.26、167.75、156.26、150.46、138.20、134.92、133.92、133.47、132.34、132.01、131.52、129.88、121.69、119.34、117.95、111.42、69.39、54.97、50.56、40.39、40.00、38.40、32.15、30.46、30.16、27.58、27.48、23.64、14.41、12.96、11.55。LCMS813.38。
実施例5−1:dBET6の合成
DMF(0.191mL、0.0191mmol、1当量)中のN−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(7.66mg、0.0191mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(10マイクロリットル、0.0574mmol、3当量)及びHATU(7.3mg、0.0191mmol、1当量)を添加し、混合物を22時間撹拌した後、MeOHで希釈し、減圧下で濃縮した。粗物質を分取HPLCによって精製して、クリーム色の固体(8.53mg、0.0101mmol、53%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.80(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.53(d,J=7.4Hz,1H)、7.49〜7.36(m,5H)、5.10(dt,J=12.3、5.3Hz,1H)、4.75(s,2H)、4.69(dd,J=8.8、5.3Hz,1H)、3.42(dd,J=15.0、8.9Hz,1H)、3.30〜3.18(m,4H)、2.90〜2.64(m,7H)、2.45(s,3H)、2.13(dtt,J=10.8、5.2、2.6Hz,1H)、1.71(d,J=4.4Hz,3H)、1.56(d,J=6.2Hz,4H)、1.33(d,J=17.1Hz,8H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.50、172.38、171.30、169.81、168.28、167.74、166.64、156.25、138.38、138.20、137.55、134.92、133.88、133.42、132.27、132.02、131.50、129.85、121.66、119.30、117.95、69.37、55.01、50.58、40.51、40.12、38.44、32.18、30.46、30.33、30.27、30.21、27.91、27.81、23.63、14.42、12.96、11.55。LCMS841.64(M+H)。
実施例5−2:dBET6の合成
工程1:2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ヒドロキシイソインドリン−1,3−ジオンの合成
3−ヒドロキシフタル酸無水物(1.641g、10mmol、1当量)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(1.646g、10mmol、1当量)をピリジン(40mL、0.25M)に溶解し、110℃に加熱した。14時間後に混合物を室温まで冷却し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、24gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM)による精製によって、所望の生成物を黄褐色の固体(2.424g、8.84mmol、88%)として得た。H NMR(400MHz,DMSO−d)δ11.08(s,2H)、7.65(dd,J=8.4、7.2Hz,1H)、7.36〜7.28(m,1H)、7.25(dd,J=8.4、0.6Hz,1H)、5.07(dd,J=12.8、5.4Hz,1H)、2.88(ddd,J=17.3、14.0、5.4Hz,1H)、2.63〜2.50(m,2H)、2.08〜1.95(m,1H)。
工程2:tert−ブチル2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセテートの合成
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ヒドロキシイソインドリン−1,3−ジオン(1.568g、5.71mmol、1当量)を、DMF(57mL、0.1M)に室温で溶解した。次いで、炭酸カリウム(1.19g、8.58mmol、1.5当量)及びtert−ブチルブロモアセテート(0.843mL、5.71mmol、1当量)を添加した。2時間後に混合物をEtOAcで希釈し、水で1回、次いでブラインで2回洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、24gシリカカラム、0%→100%のEtOAc/ヘキサン、21分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をクリーム色の固体(2.06g、5.30mmol、93%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ7.94(s,1H)、7.67(dd,J=8.4、7.3Hz,1H)、7.52(d,J=6.8Hz,1H)、7.11(d,J=8.3Hz,1H)、4.97(dd,J=12.3、5.3Hz,1H)、4.79(s,2H)、2.95〜2.89(m,1H)、2.85〜2.71(m,2H)、2.14(dtd,J=10.2、5.0、2.7Hz,1H)、1.48(s,9H)。LCMS389.33(M+H)。
工程3:2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸の合成
tert−ブチル2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセテート(2.06g、5.30mmol、1当量)を、TFA(53mL、0.1M)に室温で溶解した。4時間後に溶液をDCMで希釈し、減圧下で濃縮した。得られたクリーム色の固体(1.484g、4.47mmol、84%)は十分に純粋であるとみなされ、更に精製することなく次の工程に続行した。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.11(s,1H)、7.79(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.48(d,J=7.2Hz,1H)、7.39(d,J=8.6Hz,1H)、5.10(dd,J=12.8、5.4Hz,1H)、4.99(s,2H)、2.93〜2.89(m,1H)、2.63〜2.51(m,2H)、2.04(ddd,J=10.5、5.4、3.1Hz,1H)。LCMS333.25(M+H)。
工程4:tert−ブチル(8−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)オクチル)カルバメートの合成
Boc−1,8−ジアミノオクタン(2.10g、8.59mmol、1.1当量)をDMF(86mL)に溶解した。別のフラスコ内で、2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸(2.60g、7.81mmol、1当量)をDMF(78mL)に溶解した。次いで、DMF中のBoc−1,8−ジアミノオクタンの溶液、続いてDIPEA(4.08mL、23.4mmol、3当量)及びHATU(2.97g、7.81mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で19時間撹拌した後、EtOAc(600mL)で希釈した。有機層を200mLの半飽和塩化ナトリウム、200mLの10%クエン酸(水溶液)、200mLの半飽和塩化ナトリウム、200mLの飽和重炭酸ナトリウム(水溶液)、200mLの水で順次、更に200mLのブラインで2回洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、40gカラム、0%→5%のMeOH/DCM、35分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(3.53g、6.32mmol、81%)として得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.49(s,1H)、7.74(dd,J=8.3、7.4Hz,1H)、7.55(d,J=7.2Hz,1H)、7.39(t,J=5.3Hz,1H)、7.19(d,J=8.4Hz,1H)、4.97(dd,J=12.4、5.3Hz,1H)、4.63(d,J=2.2Hz,2H)、4.59(d,J=10.0Hz,1H)、3.36(q,J=6.9Hz,2H)、3.12〜3.03(m,2H)、2.95〜2.72(m,3H)、2.16(ddt,J=10.3、5.2、2.7Hz,1H)、1.59(p,J=7.1Hz,2H)、1.37(d,J=67.6Hz,19H)。LCMS559.47(M+H)。
工程5:N−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの合成
tert−ブチル(8−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)オクチル)カルバメート(3.53g、6.32mmol、1当量)をTFA(63mL、0.1M)に溶解し、50℃に加熱した。1時間後に混合物を室温まで冷却し、MeOHで希釈し、減圧下で濃縮した。粗物質をジエチルエーテルでトリチュレートし(triturated)、真空下で乾燥させて、白色の固体(2.93g、5.12mmol、81%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.82(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.55(d,J=7.2Hz,1H)、7.44(d,J=8.4Hz,1H)、5.14(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.76(s,2H)、3.33(dd,J=6.8、1.8Hz,1H)、3.30(s,1H)、2.94〜2.85(m,3H)、2.80〜2.69(m,2H)、2.19〜2.11(m,1H)、1.60(dq,J=24.8、7.0Hz,4H)、1.37(s,8H)。LCMS459.45(M+H)。
工程6:dBET6の合成
(S)−2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)酢酸(0.894g、2.23mmol、1当量)及びN−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(1.277g)を、DMF(22.3mL、0.1M)に室温で溶解した。DIPEA(1.17mL、6.69mmol、3当量)、続いてHATU(0.848g、2.23mmol、1当量)を添加した。混合物を23時間撹拌した後、EtOAcで希釈した。有機層を飽和重炭酸ナトリウム、水、更にブラインで3回洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウム下で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、40gカラム、4%→10%のMeOH/DCM、35分間の勾配)による精製によって、dBET6をクリーム色の固体(1.573g、1.87mmol、84%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.80(dd,J=8.3、7.5Hz,1H)、7.53(d,J=7.3Hz,1H)、7.46〜7.37(m,5H)、5.11(ddd,J=12.6、8.2、5.5Hz,1H)、4.75(s,2H)、4.63(dd,J=9.0、5.2Hz,1H)、3.41(ddd,J=14.9、9.0、2.2Hz,1H)、3.30〜3.14(m,5H)、2.86(ddt,J=19.8、14.6、5.2Hz,1H)、2.78〜2.66(m,5H)、2.44(s,3H)、2.13(ddq,J=15.3、7.7、4.8、3.8Hz,1H)、1.69(s,3H)、1.61〜1.51(m,4H)、1.35(s,8H)。13C NMR(126MHz,MeOD)δ174.49、172.65、171.30、169.80、168.28、167.74、166.18、157.03、156.24、152.18、138.19、138.08、137.97、134.92、133.52、133.23、132.02、131.99、131.33、129.76、121.65、119.30、117.94、69.36、55.27、50.57、40.49、40.13、38.84、32.19、30.49、30.34、30.31、30.22、27.92、27.82、23.64、14.42、12.92、11.60。LCMS841.48(M+H)。
実施例6:dBET9の合成
DMF(0.321mL、0.0321mmol、1当量)中のN−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(12.87mg、0.0321mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(16.8マイクロリットル、0.0963mmol、3当量)及びHATU(12.2mg、0.0321mmol、1当量)を添加し、混合物を24時間撹拌し、MeOHで希釈し、減圧下で濃縮した。粗物質を分取HPLCによって精製して、黄色の油(16.11mg、0.0176mmol、55%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.79(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.52(d,J=7.2Hz,1H)、7.49〜7.36(m,5H)、5.10(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.78〜4.67(m,3H)、3.64〜3.52(m,11H)、3.48〜3.32(m,6H)、2.94〜2.64(m,7H)、2.52〜2.43(m,3H)、2.18〜2.08(m,1H)、1.81(p,J=6.3Hz,4H)、1.73〜1.67(m,3H)。LCMS918.45(M+H)。
実施例7:dBET17の合成
DMF(0.281mL、0.0281mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−2−(4−(4−シアノフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)酢酸(11mg、0.0281mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(14.7マイクロリットル、0.0843mmol、3当量)及びHATU(10.7mg、0.0281mmol、1当量)を添加し、混合物を24時間撹拌し、EtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM)による精製によって、白色の固体(14.12mg、0.0182mmol、65%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.82〜7.72(m,3H)、7.61(dd,J=8.5、2.0Hz,2H)、7.51(d,J=7.9Hz,1H)、7.44〜7.40(m,1H)、5.11〜5.05(m,1H)、4.76(s,2H)、4.66(dd,J=9.0、5.1Hz,1H)、3.48〜3.32(m,4H)、3.30〜3.23(m,1H)、2.87〜2.61(m,7H)、2.43(s,3H)、2.10(dt,J=10.7、5.2Hz,1H)、1.70〜1.59(m,7H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.42、172.65、171.27、169.92、168.25、167.80、165.88、156.31、143.55、138.24、134.88、133.92、133.50、133.39、131.72、131.46、130.55、121.93、119.39、119.21、118.02、115.17、69.59、55.50、50.55、40.10、39.83、38.86、32.11、27.78、27.67、23.62、14.41、12.91、11.64。LCMS776.39(M+H)。
実施例8:dBET15の合成
N−(6−アミノヘキシル)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボキサミドトリフルオロアセテート(13.29mg、0.258mmol、1当量)及びJQ−酸(10.3mg、0.0258mmol、1当量)を、DMF(0.26mL)に溶解した。DIPEA(13.5マイクロリットル、0.0775mmol、3当量)、続いてHATU(9.8mg、0.0258mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で撹拌した。24時間後に物質をDCMで希釈し、カラムクロマトグラフィー(ISCO、0%→15%のMeOH/DCM)、続いて分取HPLCによって精製して、薄黄色の固体(11.44mg、0.0146mmol、57%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ8.29〜8.23(m,2H)、7.93(dd,J=8.1、4.2Hz,1H)、7.50〜7.34(m,4H)、5.17〜5.11(m,1H)、4.75〜4.69(m,1H)、3.53〜3.32(m,6H)、3.25(dd,J=13.8、6.7Hz,1H)、2.90〜2.67(m,6H)、2.49〜2.38(m,3H)、2.18〜2.10(m,1H)、1.64(d,J=22.4Hz,6H)、1.47(s,4H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.48、171.17、168.05、168.03、167.99、167.70、166.63、141.81、138.40、137.47、135.09、134.77、134.74、133.96、133.94、133.38、132.24、132.05、131.44、129.85、124.57、123.12、123.09、54.98、50.78、40.88、40.08、38.37、32.13、30.40、30.23、27.34、27.26、23.58、14.40、12.96、11.54。LCMS783.43(M+H)。
実施例9:dBET2の合成
(1)(R)−エチル4−((8−シクロペンチル−7−エチル−5−メチル−6−オキソ−5,6,7,8−テトラヒドロプテリジン−2−イル)アミノ)−3−メトキシベンゾエートの合成
(R)−2−クロロ−8−シクロペンチル−7−エチル−5−メチル−7,8−ジヒドロプテリジン−6(5H)−オン(44.2mg、0.15mmol、1当量)、エチル4−アミノ−3−メトキシベンゾエート(35.1mg、0.18mmol、1.2当量)、Pddba(6.9mg、0.0075mmol、5mol%)、XPhos(10.7mg、0.0225mmol、15mol%)及び炭酸カリウム(82.9mg、0.60mmol、4当量)をtBuOH(1.5mL、0.1M)に溶解し、100℃に加熱した。21時間後に混合物を室温まで冷却し、セライトを通して濾過し、DCMで洗浄し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、18分間の勾配にわたって0%→100%のEtOAc/ヘキサン)による精製によって、黄色の油(52.3mg、0.115mmol、77%)を得た。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ8.57(d,J=8.5Hz,1H)、7.69(td,J=6.2、2.9Hz,2H)、7.54(d,J=1.8Hz,1H)、4.52(t,J=7.9Hz,1H)、4.37(q,J=7.1Hz,2H)、4.23(dd,J=7.9、3.7Hz,1H)、3.97(s,3H)、3.33(s,3H)、2.20〜2.12(m,1H)、2.03〜1.97(m,1H)、1.86(ddd,J=13.9、7.6、3.6Hz,4H)、1.78〜1.65(m,4H)、1.40(t,J=7.1Hz,3H)、0.88(t,J=7.5Hz,3H)。LCMS454.32(M+H)。
(2)(R)−4−((8−シクロペンチル−7−エチル−5−メチル−6−オキソ−5,6,7,8−テトラヒドロプテリジン−2−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸の合成
(R)−エチル4−((8−シクロペンチル−7−エチル−5−メチル−6−オキソ−5,6,7,8−テトラヒドロプテリジン−2−イル)アミノ)−3−メトキシベンゾエート(73.8mg、0.163mmol、1当量)及びLiOH(11.7mg、0.489mmol、3当量)を、MeOH(0.82mL)THF(1.63mL)及び水(0.82mL)に溶解した。20時間後に更に0.82mLの水を添加し、混合物を更に24時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、クリーム色の固体(53mg、0.125mmol、76%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.97(d,J=8.4Hz,1H)、7.67(dd,J=8.3、1.6Hz,1H)、7.64〜7.59(m,2H)、4.38(dd,J=7.0、3.2Hz,1H)、4.36〜4.29(m,1H)、3.94(s,3H)、3.30(s,3H)、2.13〜1.98(m,2H)、1.95〜1.87(m,2H)、1.87〜1.76(m,2H)、1.73〜1.57(m,4H)、0.86(t,J=7.5Hz,3H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ168.67、163.72、153.59、150.74、150.60、130.95、127.88、125.97、123.14、121.68、116.75、112.35、61.76、61.66、56.31、29.40、29.00、28.68、28.21、23.57、23.41、8.69。LCMS426.45(M+H)。
(3)dBET2の合成
DMF(0.183mL、0.0183mmol、1.2当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(R)−4−((8−シクロペンチル−7−エチル−5−メチル−6−オキソ−5,6,7,8−テトラヒドロプテリジン−2−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(6.48mg、0.0152mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(7.9マイクロリットル、0.0456mmol、3当量)及びHATU(6.4mg、0.0168mmol、1.1当量)を添加し、混合物を23時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、黄色の固体(9.44mg、0.0102mmol、67%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.84〜7.77(m,2H)、7.58(d,J=1.8Hz,2H)、7.53〜7.46(m,2H)、7.42(d,J=8.4Hz,1H)、5.11〜5.05(m,1H)、4.76(s,2H)、4.48(dd,J=6.5、3.1Hz,1H)、4.33〜4.24(m,1H)、3.95(s,3H)、3.49〜3.35(m,4H)、2.97(d,J=10.5Hz,3H)、2.89〜2.65(m,5H)、2.17〜1.99(m,4H)、1.89(dd,J=14.5、7.3Hz,2H)、1.69〜1.54(m,6H)、1.36(dt,J=7.6、3.9Hz,1H)、0.85(t,J=7.5Hz,3H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ176.52、174.48、173.05、171.34、169.99、168.91、168.25、167.80、164.58、156.34、154.48、153.10、150.63、138.22、134.89、133.96、129.53、123.93、121.87、120.78、119.36、117.99、111.54、69.55、63.29、63.10、56.68、50.55、40.71、39.86、32.15、29.43、29.26、28.73、28.63、27.81、27.77、24.25、23.63、8.47。LCMS810.58(M+H)。
実施例10:dBET7の合成
DMF(0.186mL、0.0186mmol、1当量)中のN−(6−アミノヘキシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(R)−4−((8−シクロペンチル−7−エチル−5−メチル−6−オキソ−5,6,7,8−テトラヒドロプテリジン−2−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(7.9mg、0.0186mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.7マイクロリットル、0.0557mmol、3当量)及びHATU(7.1mg、0.0186mmol、1当量)を添加し、混合物を19時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望のトリフルオロ酢酸塩(trifluoracetate salt)を黄色の固体(13.62mg、0.0143mmol、77%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.80(t,J=8.3Hz,2H)、7.61〜7.57(m,2H)、7.55〜7.49(m,2H)、7.42(d,J=8.4Hz,1H)、5.13(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.75(s,2H)、4.48(dd,J=6.5、3.2Hz,1H)、4.33〜4.24(m,1H)、3.97(s,3H)、3.40(t,J=7.1Hz,2H)、3.34(d,J=6.7Hz,2H)、3.30(s,3H)、2.98(d,J=8.5Hz,1H)、2.89〜2.82(m,1H)、2.79〜2.63(m,3H)、2.17〜2.00(m,4H)、1.91(dt,J=14.4、7.1Hz,3H)、1.61(dt,J=13.4、6.6Hz,7H)、1.47〜1.41(m,3H)、0.86(t,J=7.5Hz,3H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.54、171.37、169.84、168.84、168.27、167.74、164.59、156.26、154.47、153.18、150.69、138.19、134.91、134.05、129.47、124.78、124.01、121.65、120.77、119.29、117.92、117.86、111.55、69.34、63.31、63.13、56.67、50.53、40.97、39.96、32.16、30.42、30.19、29.42、29.26、28.72、28.62、27.65、27.46、24.26、23.65、8.47。LCMS838.60(M+H)。
実施例11:dBET8の合成
DMF(0.186mL、0.0186mmol、1当量)中のN−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(R)−4−((8−シクロペンチル−7−エチル−5−メチル−6−オキソ−5,6,7,8−テトラヒドロプテリジン−2−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(7.9mg、0.0186mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.7マイクロリットル、0.0557mmol、3当量)及びHATU(7.1mg、0.0186mmol、1当量)を添加し、混合物を16時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望のトリフルオロ酢酸塩をオフホワイト色の固体(7.15mg、0.007296mmol、39%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.83〜7.77(m,2H)、7.61〜7.56(m,2H)、7.55〜7.50(m,2H)、7.42(d,J=8.5Hz,1H)、5.13(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.75(s,2H)、4.49(dd,J=6.6、3.3Hz,1H)、4.33〜4.24(m,1H)、3.97(s,3H)、3.39(t,J=7.1Hz,2H)、3.34〜3.32(m,2H)、3.30(s,3H)、3.01〜2.83(m,2H)、2.82〜2.65(m,3H)、2.17〜2.01(m,4H)、1.91(dt,J=14.2、7.4Hz,1H)、1.68〜1.54(m,7H)、1.37(s,7H)、0.86(t,J=7.5Hz,3H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.52、171.35、169.81、168.85、168.28、167.74、164.58、156.27、154.47、153.89、150.64、138.19、134.93、134.18、129.52、129.41、124.91、123.83、121.67、120.76、119.31、117.95、117.89、111.57、69.37、63.37、63.17、56.67、50.58、41.12、40.12、32.19、30.43、30.28、30.22、30.19、29.40、29.25、28.71、28.62、27.94、27.75、24.29、23.65、8.46。LCMS866.56(M+H)。
実施例12:dBET10の合成
DMF(0.172mL、0.0172mmol、1当量)中のN−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(R)−4−((8−シクロペンチル−7−エチル−5−メチル−6−オキソ−5,6,7,8−テトラヒドロプテリジン−2−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(7.3mg、0.0172mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.0マイクロリットル、0.0515mmol、3当量)及びHATU(6.5mg、0.0172mmol、1当量)を添加し、混合物を23時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望のトリフルオロ酢酸塩をオフホワイト色の油(10.7mg、0.0101mmol、59%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.78(d,J=8.3Hz,1H)、7.75(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.56〜7.51(m,2H)、7.49〜7.44(m,2H)、7.36(d,J=8.4Hz,1H)、5.08(dd,J=12.4、5.4Hz,1H)、4.69(s,2H)、4.44(dd,J=6.7、3.2Hz,1H)、4.30〜4.21(m,1H)、3.92(s,3H)、3.59〜3.42(m,12H)、3.35(t,J=6.7Hz,2H)、3.25(s,3H)、2.95〜2.64(m,5H)、2.13〜1.95(m,4H)、1.91〜1.71(m,7H)、1.65〜1.48(m,4H)、0.81(t,J=7.5Hz,3H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.50、171.35、169.83、168.77、168.25、167.68、164.57、156.26、154.47、153.05、150.59、138.19、134.92、133.89、129.53、124.57、123.98、121.72、120.75、119.26、117.95、117.86、111.54、71.51、71.46、71.28、71.20、70.18、69.65、69.41、63.27、63.07、56.71、50.57、38.84、37.59、32.17、30.41、30.32、29.46、29.26、28.73、28.64、24.27、23.65、8.49。LCMS942.62(M+H)。
実施例13:dBET16の合成
DMF(0.402mL、0.0402mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(R)−4−((4−シクロペンチル−1,3−ジメチル−2−オキソ−1,2,3,4−テトラヒドロピリド[2,3−b]ピラジン−6−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(16.55mg、0.0402mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(21マイクロリットル、0.1206mmol、3当量)及びHATU(15.3mg、0.0402mmol、1当量)を添加し、混合物を21時間撹拌した後、分取HPLC、続いてカラムクロマトグラフィー(ISCO、12g NH−シリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、20分間の勾配)によって精製して、褐色の固体(10.63mg、0.0134mmol、33%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ8.22(d,J=8.4Hz,1H)、7.78(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.73〜7.68(m,1H)、7.49(d,J=7.4Hz,2H)、7.46〜7.39(m,2H)、6.98(d,J=8.8Hz,1H)、5.97〜5.87(m,1H)、5.06(dd,J=12.6、5.4Hz,1H)、4.76(s,2H)、3.98(s,3H)、3.61(s,2H)、3.44〜3.36(m,4H)、2.92(s,1H)、2.78(dd,J=14.3、5.2Hz,1H)、2.68(ddd,J=17.7、8.2、4.5Hz,2H)、2.36〜2.26(m,2H)、2.10〜1.90(m,5H)、1.76〜1.62(m,6H)、1.31(d,J=16.0Hz,4H)。LCMS795.38(M+H)。
実施例14:dBET11の合成
(1)エチル4−((5,11−ジメチル−6−オキソ−6,11−ジヒドロ−5H−ベンゾ[e]ピリミド[5,4−b][1,4]ジアゼピン−2−イル)アミノ)−3−メトキシベンゾエートの合成
2−クロロ−5,11−ジメチル−5H−ベンゾ[e]ピリミド[5,4−b][1,4]ジアゼピン−6(11H)−オン(82.4mg、0.30mmol、1当量)、エチル4−アミノ−3−メトキシベンゾエート(70.3mg、0.36mmol、1.2当量)、Pddba(13.7mg、0.015mmol、5mol%)、XPhos(21.5mg、0.045mmol、15mol%)及び炭酸カリウム(166mg、1.2mmol、4当量)をtBuOH(3.0mL)に溶解し、100℃に加熱した。17時間後に混合物を室温まで冷却し、セライトを通して濾過した。混合物をカラムクロマトグラフィー(ISCO、12gシリカカラム、0%→100%のEtOAc/ヘキサン、19分間の勾配)によって精製して、オフホワイト色の固体(64.3mg、0.148mmol、49%)を得た。
H NMR(400MHz,50%cdod/cdcl)δ8.51(d,J=8.5Hz,1H)、8.17(s,1H)、7.73(ddd,J=18.7、8.1、1.7Hz,2H)、7.52(d,J=1.8Hz,1H)、7.46〜7.41(m,1H)、7.15〜7.10(m,2H)、4.34(q,J=7.1Hz,4H)、3.95(s,3H)、3.47(s,3H)、3.43(s,3H)、1.38(t,J=7.1Hz,3H)。13C NMR(100MHz,50%cdod/cdcl)δ169.28、167.39、164.29、155.64、151.75、149.73、147.45、146.22、133.88、133.18、132.37、126.44、124.29、123.70、123.36、122.26、120.58、118.05、116.83、110.82、61.34、56.20、38.62、36.25、14.51。LCMS434.33(M+H)。
(2)4−((5,11−ジメチル−6−オキソ−6,11−ジヒドロ−5H−ベンゾ[e]ピリミド[5,4−b][1,4]ジアゼピン−2−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸の合成
エチル4−((5,11−ジメチル−6−オキソ−6,11−ジヒドロ−5H−ベンゾ[e]ピリミド[5,4−b][1,4]ジアゼピン−2−イル)アミノ)−3−メトキシベンゾエート(108.9mg、0.251mmol、1当量)及びLiOH(18mg)を、THF(2.5mL)及び水(1.25mL)に溶解した。24時間後にMeOH(0.63mL)を溶解性の改善のために添加し、更に24時間撹拌した後、MeOHで希釈し、分取HPLCによって精製して、淡黄色の固体(41.31mg)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ8.51(d,J=8.5Hz,1H)、8.22(s,1H)、7.73(ddd,J=11.8、8.1、1.7Hz,2H)、7.57(d,J=1.8Hz,1H)、7.49〜7.44(m,1H)、7.19〜7.11(m,2H)、3.97(s,3H)、3.48(s,3H)、3.45(s,3H)。LCMS406.32(M+H)。
(3)dBET11の合成
DMF(0.190mL、0.0190mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、4−((5,11−ジメチル−6−オキソ−6,11−ジヒドロ−5H−ベンゾ[e]ピリミド[5,4−b][1,4]ジアゼピン−2−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(7.71mg、0.0190mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.9マイクロリットル、0.0571mmol、3当量)及びHATU(7.2mg、0.0190mmol、1当量)を添加し、混合物を22時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望のトリフルオロ酢酸塩をクリーム色の固体(6.72mg、0.00744mmol、39%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ8.46(d,J=8.3Hz,1H)、8.21(s,1H)、7.79〜7.73(m,2H)、7.52(d,J=7.1Hz,1H)、7.50〜7.43(m,3H)、7.33(d,J=8.2Hz,1H)、7.15(dd,J=7.7、5.9Hz,2H)、4.98(dd,J=12.0、5.5Hz,1H)、4.69(s,2H)、3.97(s,3H)、3.49(s,3H)、3.46〜3.34(m,7H)、2.81〜2.67(m,3H)、2.13〜2.08(m,1H)、1.69(dt,J=6.6、3.5Hz,4H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ173.40、170.10、169.68、169.00、168.85、167.60、167.15、164.77、156.01、155.42、151.83、150.03、148.21、137.82、134.12、133.48、132.58、132.52、128.11、126.72、124.54、122.33、121.06、120.63、118.77、118.38、117.94、117.62、109.67、68.90、56.33、49.96、40.16、39.48、38.72、36.34、31.82、27.24、23.16。LCMS790.48(M+H)。
実施例15:dBET12の合成
DMF(0.186mL、0.0186mmol、1当量)中のN−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、4−((5,11−ジメチル−6−オキソ−6,11−ジヒドロ−5H−ベンゾ[e]ピリミド[5,4−b][1,4]ジアゼピン−2−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(7.53mg、0.0186mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.7マイクロリットル、0.0557mmol、3当量)及びHATU(7.1mg、0.0186mmol、1当量)を添加し、混合物を22時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望のトリフルオロ酢酸塩をクリーム色の固体(7.50mg、0.00724mmol、39%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ8.46(d,J=8.9Hz,1H)、8.21(s,1H)、7.73(dd,J=15.2、7.8Hz,2H)、7.50〜7.42(m,3H)、7.28(d,J=8.5Hz,1H)、7.15(t,J=7.7Hz,2H)、5.01(dd,J=11.8、5.8Hz,1H)、4.68(s,2H)、3.97(s,3H)、3.67〜3.58(m,7H)、3.58〜3.43(m,10H)、3.39(t,J=6.8Hz,2H)、3.35(s,2H)、2.97(s,1H)、2.84〜2.70(m,3H)、2.16〜2.07(m,1H)、1.93〜1.76(m,4H)。LCMS922.57(M+H)。
実施例16:dBET13の合成
DMF(0.501mL、0.0501mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、2−((2−(4−(3,5−ジメチルイソオキサゾール−4−イル)フェニル)イミダゾ[1,2−a]ピラジン−3−イル)アミノ)酢酸(McKeown et al, J. Med. Chem, 2014, 57, 9019と同様に合成した)(18.22mg、0.0501mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(26.3マイクロリットル、0.150mmol、3当量)及びHATU(19.0mg、0.0501mmol、1当量)を添加し、混合物を21時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望のトリフルオロ酢酸塩を暗黄色の油(29.66mg、0.0344mmol、69%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ9.09(s,1H)、8.65(d,J=5.2Hz,1H)、8.14〜8.06(m,2H)、7.94〜7.88(m,1H)、7.80〜7.74(m,1H)、7.59〜7.47(m,3H)、7.40(dd,J=8.4、4.7Hz,1H)、5.11〜5.06(m,1H)、4.72(d,J=9.8Hz,2H)、3.90(s,2H)、3.25〜3.22(m,1H)、3.12(t,J=6.4Hz,1H)、2.96(s,2H)、2.89〜2.79(m,1H)、2.76〜2.62(m,2H)、2.48〜2.42(m,3H)、2.29(s,3H)、2.10(ddq,J=10.2、5.3、2.7Hz,1H)、1.49〜1.45(m,2H)、1.37(dd,J=6.7、3.6Hz,2H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.45、171.98、171.35、169.88、168.17、167.85、167.40、159.88、156.28、141.82、138.26、135.85、134.82、133.09、132.06、130.75、129.67、122.07、121.94、119.30、118.98、118.06、117.24、69.56、50.56、40.05、39.73、32.13、27.53、23.62、18.71、17.28、11.64、10.85。LCMS748.49(M+H)。
実施例17:dBET14の合成
DMF(0.510mL、0.0510mmol、1当量)中のN−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、2−((2−(4−(3,5−ジメチルイソオキサゾール−4−イル)フェニル)イミダゾ[1,2−a]ピラジン−3−イル)アミノ)酢酸(McKeown et al, J. Med. Chem, 2014, 57, 9019と同様に合成した)(18.52mg、0.0510mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(26.6マイクロリットル、0.153mmol、3当量)及びHATU(19.4mg、0.0510mmol、1当量)を添加し、混合物を22時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望のトリフルオロ酢酸塩を暗黄色の油(32.63mg、0.0328mmol、64%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ9.09(s,1H)、8.66(d,J=5.4Hz,1H)、8.17〜8.08(m,2H)、7.92(d,J=5.6Hz,1H)、7.77(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.60〜7.47(m,3H)、7.39(d,J=8.4Hz,1H)、5.09(dd,J=12.4、5.5Hz,1H)、4.71(s,2H)、3.91(s,2H)、3.62〜3.46(m,10H)、3.38(dt,J=16.0、6.4Hz,3H)、3.18(t,J=6.8Hz,2H)、2.97(s,1H)、2.89〜2.81(m,1H)、2.78〜2.66(m,2H)、2.47(s,3H)、2.31(s,3H)、2.16〜2.08(m,1H)、1.79(dt,J=12.8、6.5Hz,2H)、1.64(t,J=6.3Hz,2H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.48、171.88、171.34、169.80、168.22、167.69、167.42、159.87、156.24、141.87、138.21、135.89、134.88、133.13、132.04、130.76、129.67、122.08、121.69、119.20、117.94、117.23、71.44、71.22、71.10、69.92、69.62、69.38、50.57、49.64、38.11、37.55、32.16、30.30、30.20、23.63、11.67、10.88。LCMS880.46(M+H)。
実施例18:dBET18の合成
(1)(S)−tert−ブチル4−(3−(2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)アセトアミド)プロピル)ピペラジン−1−カルボキシレートの合成
JQ−酸(176.6mg、0.441mmol、1当量)をDMF(4.4mL)に室温で溶解した。HATU(176mg、0.463mmol、1.05当量)、続いてDIPEA(0.23mL)、1.32mmol、3当量)を添加した。10分後にtert−ブチル4−(3−アミノプロピル)ピペラジン−1−カルボキシレート(118mg、0.485mmol、1.1当量)をDMF溶液(0.44mL)として添加した。24時間後に混合物を半飽和重炭酸ナトリウムで希釈し、DCMで2回及びEtOAcで1回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、24gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、23分間の勾配)による精製によって、黄色の油(325.5mg、定量的収率)を得た。
H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.67(t,J=5.3Hz,1H)、7.41〜7.28(m,4H)、4.58(dd,J=7.5、5.9Hz,1H)、3.52〜3.23(m,8H)、2.63(s,9H)、2.37(s,3H)、1.80〜1.69(m,2H)、1.64(s,3H)、1.42(s,9H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ171.41、164.35、155.62、154.45、150.20、136.92、136.64、132.19、131.14、130.98、130.42、129.98、128.80、80.24、56.11、54.32、52.70、38.96、37.85、28.42、25.17、14.43、13.16、11.82。LCMS626.36(M+H)。
(2)(S)−2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)−N−(3−(ピペラジン−1−イル)プロピル)アセトアミドの合成
(S)−tert−ブチル4−(3−(2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)アセトアミド)プロピル)ピペラジン−1−カルボキシレート(325.5mg)を、DCM(5mL)及びMeOH(0.5mL)に溶解した。ジオキサン(1mL)中の4M HClの溶液を添加し、混合物を16時間撹拌した後、窒素流下で濃縮し、黄色の固体(231.8mg)を得て、これを更に精製することなく使用した。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.64〜7.53(m,4H)、5.05(t,J=7.1Hz,1H)、3.81〜3.66(m,6H)、3.62〜3.33(m,9H)、3.30(p,J=1.6Hz,1H)、2.94(s,3H)、2.51(s,3H)、2.09(dq,J=11.8、6.1Hz,2H)、1.72(s,3H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ171.78、169.38、155.83、154.03、152.14、140.55、136.33、134.58、134.53、133.33、132.73、130.89、130.38、56.07、53.54、41.96、37.22、36.23、25.11、14.48、13.14、11.68。LCMS526.29(M+H)。
(3)(S)−tert−ブチル(6−(4−(3−(2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)アセトアミド)プロピル)ピペラジン−1−イル)−6−オキソヘキシル)カルバメートの合成
(S)−2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)−N−(3−(ピペラジン−1−イル)プロピル)アセトアミド(62.1mg)及び6−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)ヘキサン酸(24.0mg、0.1037mmol、1当量)をDMF(1mL)に溶解した。DIPEA(72.2マイクロリットル、0.4147mmol、4当量)、続いてHATU(39.4mg、0.1037mmol、1当量)を添加し、混合物を25時間撹拌した。混合物を半飽和重炭酸ナトリウムで希釈し、DCMで3回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、15分間の勾配)による精製によって、黄色の油(71.75mg、0.0970mmol、94%)を得た。
H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.61(s,1H)、7.43〜7.28(m,4H)、4.63(s,1H)、4.61〜4.56(m,1H)、3.82〜3.21(m,10H)、3.11〜3.01(m,2H)、2.61(d,J=24.3Hz,9H)、2.38(s,3H)、2.28(t,J=7.4Hz,2H)、1.73(dq,J=13.8、7.4Hz,2H)、1.63〜1.55(m,2H)、1.53〜1.24(m,14H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ171.63、171.11、164.34、156.17、155.66、150.21、136.96、136.72、132.25、131.14、131.01、130.47、130.00、128.85、79.11、56.42、54.46、53.06、52.82、45.04、41.02、40.47、39.29、38.33、33.00、29.90、28.54、26.60、25.29、24.86、14.47、13.20、11.86。LCMS739.37(M+H)。
(4)(S)−N−(3−(4−(6−アミノヘキサノイル)ピペラジン−1−イル)プロピル)−2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)アセトアミドの合成
(S)−tert−ブチル(6−(4−(3−(2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)アセトアミド)プロピル)ピペラジン−1−イル)−6−オキソヘキシル)カルバメート(71.75mg、0.0970mmol、1当量)を、DCM(2mL)及びMeOH(0.2mL)に溶解した。ジオキサン(0.49mL)中の4M HClの溶液を添加し、混合物を2時間撹拌した後、窒素流下、続いて真空で濃縮し、黄色の発泡体(59.8mg、0.0840mmol、87%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.68〜7.53(m,4H)、5.04(d,J=6.6Hz,1H)、4.66(d,J=13.6Hz,1H)、4.23(d,J=13.6Hz,1H)、3.63〜3.34(m,7H)、3.29〜3.00(m,5H)、2.95(d,J=6.0Hz,5H)、2.51(d,J=9.2Hz,5H)、2.08(s,2H)、1.77〜1.62(m,7H)、1.45(dt,J=15.3、8.6Hz,2H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ173.77、171.84、169.35、155.85、153.99、140.56、136.40、134.58、133.35、132.70、130.39、55.83、53.57、52.92、52.70、43.57、40.55、39.67、37.33、36.25、33.17、28.26、26.94、25.33、25.26、14.49、13.15、11.65。LCMS639.35(M+H)。
(5)dBET18の合成
(S)−N−(3−(4−(6−アミノヘキサノイル)ピペラジン−1−イル)プロピル)−2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)アセトアミド二塩酸塩(20.0mg、0.0281mmol、1当量)及び2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸(9.32mg、0.0281mmol、1当量)をDMF(0.281mL)に溶解した。DIPEA(19.6マイクロリットル、0.1124mmol、4当量)、続いてHATU(10.7mg、0.0281mmol、1当量)を添加した。24時間後に混合物をMeOHで希釈し、分取HPLCによって精製して、所望のトリフルオロ酢酸塩を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.83〜7.79(m,1H)、7.54(d,J=7.1Hz,1H)、7.45(q,J=8.8Hz,5H)、5.12(dd,J=12.5、5.4Hz,1H)、4.76(s,2H)、4.68(t,J=7.3Hz,1H)、3.59〜3.32(m,8H)、3.28〜3.18(m,4H)、2.87(ddd,J=19.0、14.7、5.3Hz,2H)、2.80〜2.65(m,6H)、2.44(d,J=6.8Hz,5H)、2.33〜2.25(m,1H)、2.14(dd,J=9.8、4.9Hz,1H)、2.06〜1.89(m,3H)、1.70(s,3H)、1.61(dq,J=14.4、7.3、6.9Hz,4H)、1.45〜1.37(m,2H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.52、173.97、173.69、171.44、169.88、168.26、167.83、166.72、156.36、138.28、137.84、134.89、133.52、132.12、131.83、131.38、129.89、121.87、119.32、118.01、69.52、55.64、55.03、52.79、50.58、43.69、39.77、38.57、36.89、33.47、32.16、29.93、27.34、25.76、25.45、23.63、14.39、12.94、11.66。LCMS953.43(M+H)。
実施例19:dBET19の合成
DMF(235マイクロリットル、0.0235mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−2−(4−(4−クロロフェニル)−2−(シアノメチル)−3,9−ジメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)酢酸(10mg、0.0235mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(12.3マイクロリットル、0.0704mmol、3当量)及びHATU(8.9mg、0.0235mmol、1当量)を添加し、混合物を18.5時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(12.96mg、0.0160mmol、68%)として得た。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.80(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.55〜7.37(m,6H)、5.14〜5.06(m,1H)、4.77(d,J=1.5Hz,2H)、4.64(dd,J=8.0、5.6Hz,1H)、3.45〜3.32(m,5H)、3.29〜3.21(m,2H)、2.83〜2.66(m,6H)、2.58(s,3H)、2.14〜2.06(m,1H)、1.71〜1.57(m,4H)。LCMS810.30、M+H)。
実施例20:dBET20の合成
3−((2−((4−(4−(4−アミノブタノイル)ピペラジン−1−イル)フェニル)アミノ)−5−メチルピリミジン−4−イル)アミノ)−N−(tert−ブチル)ベンゼンスルホンアミドトリフルオロアセテート(7.41mg、0.0107mmol、1当量)及び2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸(3.6mg、0.0107mmol、1当量)を、DMF(214マイクロリットル、0.05M)に室温で溶解した。DIPEA(5.6マイクロリットル、0.0321mmol、3当量)及びHATU(4.1mg、0.0107mmol、1当量)を添加した。22.5時間後に混合物をMeOHで希釈し、分取HPLCによって精製して、所望の生成物を褐色の残渣(6.27mg、0.00701mmol、65%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ8.06(s,1H)、7.84〜7.75(m,3H)、7.65(s,1H)、7.55(t,J=7.8Hz,2H)、7.45(d,J=8.4Hz,1H)、7.25〜7.20(m,2H)、6.99(d,J=8.8Hz,2H)、5.11(dd,J=12.5、5.4Hz,1H)、4.78(s,2H)、3.79〜3.66(m,4H)、3.40(t,J=6.6Hz,2H)、3.24〜3.13(m,4H)、2.82〜2.68(m,3H)、2.52(t,J=7.4Hz,2H)、2.24〜2.19(m,3H)、2.12(dd,J=10.2、5.1Hz,1H)、1.92(dd,J=13.4、6.4Hz,2H)、1.18(s,9H)。LCMS895.63(M+H)。
実施例21:dBET21の合成
DMF(232マイクロリットル、0.0232mmol、1当量)中の4−((10−アミノデシル)オキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオントリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(9.3mg、0.0232mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(12.1マイクロリットル、0.0696mmol、3当量)及びHATU(8.8mg、0.0232mmol、1当量)を添加し、混合物を18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。分取HPLC、続いてカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をオフホワイト色の残渣(1.84mg、0.00235mmol、10%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.77〜7.73(m,1H)、7.50〜7.33(m,6H)、5.09(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.62(s,1H)、4.21(t,J=6.4Hz,2H)、3.36(s,2H)、2.87〜2.67(m,6H)、2.44(s,3H)、1.88〜1.82(m,2H)、1.70(s,3H)、1.58(s,4H)、1.29(s,8H)。LCMS784.51(M+H)。
実施例22:dBET22の合成
DMF(247マイクロリットル、0.0247mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−4−(4−クロロフェニル)−6−(2−メトキシ−2−オキソエチル)−3,9−ジメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−2−カルボン酸(10.98mg、0.0247mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(12.9マイクロリットル、0.0740mmol、3当量)及びHATU(9.4mg、0.0247mmol、1当量)を添加した。次いで、混合物を21時間撹拌した後、EtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(9.79mg、0.0118mmol、48%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.80(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.51(dd,J=7.1、1.5Hz,1H)、7.48〜7.34(m,5H)、5.11(ddd,J=12.4、5.4、3.5Hz,1H)、4.76(s,2H)、4.69(td,J=7.2、1.4Hz,1H)、3.76(s,3H)、3.55(d,J=7.2Hz,2H)、3.48〜3.33(m,4H)、2.93〜2.82(m,1H)、2.78〜2.64(m,5H)、2.14〜2.07(m,1H)、1.96(d,J=0.9Hz,3H)、1.66(s,4H)。LCMS829.39(M+H)。
実施例23:dBET23の合成
DMF(220マイクロリットル、0.0220mmol、1当量)中のN−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−4−(4−クロロフェニル)−6−(2−メトキシ−2−オキソエチル)−3,9−ジメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−2−カルボン酸(9.87mg、0.0220mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(11.5マイクロリットル、0.0660mmol、3当量)及びHATU(8.4mg、0.0220mmol、1当量)を添加した。次いで、混合物を21時間撹拌した後、EtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(8.84mg、0.00998mmol、45%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.81(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.53(d,J=7.3Hz,1H)、7.50〜7.39(m,5H)、5.12(dd,J=12.6、5.4Hz,1H)、4.75(s,2H)、4.68(t,J=7.2Hz,1H)、3.76(s,3H)、3.54(d,J=7.2Hz,2H)、3.39〜3.32(m,3H)、3.29(s,1H)、2.90〜2.83(m,1H)、2.79〜2.68(m,5H)、2.14(dd,J=8.9、3.7Hz,1H)、1.99(s,3H)、1.65〜1.53(m,4H)、1.36(d,J=6.5Hz,8H)。LCMS885.47(M+H)。
実施例24:dBET24の合成
工程1:tert−ブチル(2−(2−(2−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)エトキシ)エトキシ)エチル)カルバメートの合成
2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸(200mg、0.602mmol、1当量)をDMF(6.0mL、0.1M)に溶解した。HATU(228.9mg、0.602mmol、1当量)、DIPEA(0.315mL、1.81mmol、3当量)及びN−Boc−2,2’−(エチレンジオキシ)ジエチルアミン(0.143mL、0.602mmol、1当量)を順次添加した。6時間後に付加的なHATU(114mg、0.30mmol、0.5当量)を添加して、反応の完全性を確保した。更に24時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、更にブラインで2回洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、12gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、15分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を黄色の油(0.25g、0.44mmol、74%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.82〜7.75(m,1H)、7.51(d,J=7.4Hz,1H)、7.41(d,J=8.5Hz,1H)、5.13(dd,J=12.4、5.5Hz,1H)、4.76(s,2H)、3.66〜3.58(m,6H)、3.53〜3.45(m,4H)、3.19(t,J=5.6Hz,2H)、2.95〜2.83(m,1H)、2.80〜2.67(m,2H)、2.19〜2.12(m,1H)、1.41(s,9H)。LCMS563.34(M+H)。
工程2:N−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの合成
tert−ブチル(2−(2−(2−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)エトキシ)エトキシ)エチル)カルバメート(0.25g、0.44mmol、1当量)をTFA(4.5mL)に溶解し、50℃に加熱した。3時間後に混合物を室温まで冷却し、MeOHで希釈し、減圧下で濃縮した。分取HPLCによる精製によって、所望の生成物を黄褐色の固体(0.197g、0.342mmol、77%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.81(ddd,J=8.4、7.4、1.1Hz,1H)、7.55〜7.50(m,1H)、7.43(d,J=8.5Hz,1H)、5.13(dd,J=12.7、5.5Hz,1H)、4.78(s,2H)、3.74〜3.66(m,6H)、3.64(t,J=5.4Hz,2H)、3.52(t,J=5.3Hz,2H)、3.14〜3.08(m,2H)、2.89(ddd,J=17.5、13.9、5.2Hz,1H)、2.80〜2.66(m,2H)、2.16(dtd,J=13.0、5.7、2.7Hz,1H)。LCMS463.36(M+H)。
工程2:dBET24の合成
DMF(0.324mL、0.0324mmol、1当量)中のN−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(13.0mg、0.324mmol、1当量)に添加した。次いでDIPEA(16.9マイクロリットル、0.0972mmol、3当量)及びHATU(12.3mg、0.0324mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をオフホワイト色の固体(20.0mg、0.0236mmol、73%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.77〜7.72(m,1H)、7.49(d,J=7.4Hz,1H)、7.45〜7.35(m,5H)、5.09(ddd,J=12.3、5.4、3.7Hz,1H)、4.76(s,2H)、4.60(dd,J=8.9、5.3Hz,1H)、3.68〜3.62(m,6H)、3.59(t,J=5.6Hz,2H)、3.54〜3.48(m,2H)、3.47〜3.35(m,4H)、2.84(ddd,J=19.4、9.9、4.6Hz,1H)、2.77〜2.69(m,2H)、2.68(d,J=1.8Hz,3H)、2.43(s,3H)、2.12(dt,J=9.8、5.3Hz,1H)、1.68(s,3H)。LCMS845.39(M+H)。
実施例25:dBET25の合成
DMF(183マイクロリットル、0.0183mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−4−(4−クロロフェニル)−6−(2−メトキシ−2−オキソエチル)−2,9−ジメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−3−カルボン酸(8.16mg、0.0183mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.6マイクロリットル、0.0550mmol、3当量)及びHATU(7.0mg、0.0183mmol、1当量)を添加した。次いで、混合物を23時間撹拌した後、EtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を黄色の固体(4.39mg、0.00529mmol、29%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.82(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.55(d,J=7.3Hz,1H)、7.45(d,J=8.2Hz,1H)、7.43〜7.31(m,4H)、5.16〜5.10(m,1H)、4.77(d,J=1.5Hz,2H)、4.56(s,1H)、3.74(d,J=1.8Hz,3H)、3.66〜3.60(m,1H)、3.50(dd,J=16.5、7.3Hz,1H)、3.37〜3.32(m,1H)、3.28(s,3H)、2.85(t,J=7.2Hz,2H)、2.75(d,J=7.8Hz,1H)、2.71(d,J=0.9Hz,3H)、2.59(d,J=1.0Hz,3H)、2.18〜2.10(m,1H)、1.36〜1.24(m,4H)。LCMS829.38(M+H)。
実施例26:dBET26の合成
DMF(186マイクロリットル、0.0186mmol、1当量)中のN−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−4−(4−クロロフェニル)−6−(2−メトキシ−2−オキソエチル)−2,9−ジメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−3−カルボン酸(8.26mg、0.0186mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.7マイクロリットル、0.0557mmol、3当量)及びHATU(7.1mg、0.0186mmol、1当量)を添加した。次いで、混合物を23時間撹拌した後、EtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をクリーム色の固体(6.34mg、0.00716mmol、38%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.83〜7.78(m,1H)、7.53(dd,J=7.3、2.2Hz,1H)、7.45〜7.38(m,3H)、7.32(dd,J=8.5、1.3Hz,2H)、5.16〜5.08(m,1H)、4.76(s,2H)、4.56(s,1H)、3.75(s,3H)、3.66(dd,J=15.9、8.7Hz,1H)、3.50(dd,J=16.9、6.9Hz,1H)、3.32(d,J=2.8Hz,4H)、2.84〜2.74(m,3H)、2.70(d,J=1.1Hz,3H)、2.66〜2.54(m,3H)、2.14(d,J=5.3Hz,1H)、1.62〜1.22(m,12H)。LCMS885.48(M+H)。
実施例27:dBET27の合成
DMF(257マイクロリットル、0.0257mmol、1当量)中の4−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオントリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(10.3mg、0.0257mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(13.4マイクロリットル、0.0771mmol、3当量)及びHATU(9.8mg、0.0257mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(14.53mg、0.0195mmol、76%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.75(ddd,J=8.5、7.3、1.3Hz,1H)、7.47〜7.30(m,6H)、5.00(ddd,J=25.4、12.2、5.2Hz,1H)、4.61(td,J=9.4、5.0Hz,1H)、4.36(q,J=4.8Hz,2H)、3.96〜3.89(m,2H)、3.74(q,J=5.6Hz,2H)、3.53〜3.41(m,3H)、3.30〜3.24(m,1H)、2.78〜2.53(m,6H)、2.41(d,J=3.9Hz,3H)、2.09〜1.98(m,1H)、1.67(d,J=5.0Hz,3H)。
実施例28:dBET28の合成
DMF(202マイクロリットル、0.0202mmol、1当量)中の4−(4−アミノブトキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオントリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.1mg、0.0202mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(10.6マイクロリットル、0.0606mmol、3当量)及びHATU(7.7mg、0.0202mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で18.5時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をクリーム色の固体(10.46mg、0.0144mmol、71%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.76(t,J=7.5Hz,1H)、7.43(td,J=6.5、2.5Hz,4H)、7.34(t,J=8.8Hz,2H)、5.08〜4.98(m,1H)、4.64(td,J=9.1、5.0Hz,1H)、4.26(t,J=5.3Hz,2H)、3.57〜3.32(m,4H)、2.84〜2.59(m,6H)、2.45〜2.37(m,3H)、2.08〜2.01(m,1H)、2.00〜1.91(m,2H)、1.82(dq,J=13.8、6.9Hz,2H)、1.68(d,J=11.7Hz,3H)。LCMS728.38(M+H)。
実施例29:dBET29の合成
DMF(205マイクロリットル、0.0205mmol、1当量)中の4−((6−アミノヘキシル)オキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオンの0.1M溶液を、JQ−酸(8.2mg、0.0205mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(10.7マイクロリットル、0.0614mmol、3当量)及びHATU(7.8mg、0.0205mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で19時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(8.04mg、0.0106mmol、52%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.75〜7.71(m,1H)、7.51〜7.34(m,6H)、5.07(ddd,J=12.1、5.4、2.4Hz,1H)、4.62(dd,J=9.0、5.2Hz,1H)、4.22(t,J=6.4Hz,2H)、3.44〜3.32(m,2H)、3.29〜3.21(m,2H)、2.88〜2.65(m,6H)、2.43(s,3H)、2.13〜2.06(m,1H)、1.86(dt,J=13.9、6.7Hz,2H)、1.68(s,3H)、1.59(dq,J=14.2、7.0Hz,4H)、1.54〜1.45(m,2H)。LCMS756.40(M+H)。
実施例30:dBET30の合成
DMF(163マイクロリットル、0.0163mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−4−(4−クロロフェニル)−3,9−ジメチル−6−(2−((3−(4−メチルピペラジン−1−イル)プロピル)アミノ)−2−オキソエチル)−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−2−カルボン酸(9.31mg、0.0163mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(8.5マイクロリットル、0.0490mmol、3当量)及びHATU(6.2mg、0.0163mmol、1当量)を添加した。次いで、混合物を23.5時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望の生成物を黄色の油(11.48mg、0.0107mmol、66%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.82〜7.78(m,1H)、7.54〜7.35(m,6H)、5.09(td,J=12.7、5.4Hz,1H)、4.77〜4.70(m,3H)、3.56〜3.31(m,12H)、3.23(dd,J=8.0、6.0Hz,3H)、3.05(d,J=3.2Hz,2H)、2.93〜2.81(m,5H)、2.78〜2.63(m,5H)、2.15〜2.05(m,2H)、1.96〜1.86(m,4H)、1.68(s,4H)。LCMS954.55(M+H)。
実施例31:dBET31の合成
DMF(153マイクロリットル、0.0153mmol、1当量)中のN−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−4−(4−クロロフェニル)−3,9−ジメチル−6−(2−((3−(4−メチルピペラジン−1−イル)プロピル)アミノ)−2−オキソエチル)−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−2−カルボン酸(8.7mg、0.0153mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(7.9マイクロリットル、0.0458mmol、3当量)及びHATU(5.8mg、0.0153mmol、1当量)を添加した。次いで、混合物を25時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、所望の生成物をきれいな褐色(汚い(poop)褐色ではなく、煉瓦のような褐色)の油(9.52mg、0.00847mmol、55%)として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.81(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.59〜7.40(m,6H)、5.12(dd,J=12.5、5.4Hz,1H)、4.75(s,2H)、4.71(t,J=7.4Hz,1H)、3.53〜3.34(m,8H)、3.29〜3.11(m,6H)、3.03〜2.61(m,13H)、2.15(s,1H)、2.01〜1.84(m,5H)、1.59(s,4H)、1.37(s,8H)。LCMS1010.62(M+H)。
実施例32:dBET32の合成
DMF(180マイクロリットル、0.0180mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、4−(4−(4−((4−((3−(N−(tert−ブチル)スルファモイル)フェニル)アミノ)−5−メチルピリミジン−2−イル)アミノ)フェニル)ピペラジン−1−イル)−4−オキソブタン酸(10.7mg、0.0180mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.4マイクロリットル、0.0539mmol、3当量)及びHATU(6.8mg、0.0180mmol、1当量)を添加し、混合物を19時間撹拌した。次いで、混合物をメタノールで希釈し、分取HPLCによって精製して、所望の生成物を褐色の油(4.40mg、0.00449mmol、25%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ8.08(d,J=13.6Hz,1H)、7.84〜7.76(m,3H)、7.63(s,1H)、7.57〜7.51(m,2H)、7.41(d,J=8.4Hz,1H)、7.22(td,J=6.7、2.2Hz,2H)、7.03〜6.97(m,2H)、5.14(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.76(d,J=16.8Hz,2H)、3.72(dt,J=10.0、5.2Hz,4H)、3.34〜3.33(m,1H)、3.23〜3.12(m,5H)、2.97(dd,J=8.8、4.0Hz,3H)、2.80〜2.69(m,4H)、2.64(dd,J=7.6、5.5Hz,1H)、2.50(t,J=6.8Hz,1H)、2.22(dd,J=2.4、0.9Hz,3H)、2.17〜2.11(m,1H)、1.67〜1.52(m,4H)、1.18(d,J=0.8Hz,9H)。LCMS980.64(M+H)。
実施例33:dBET33の合成
DMF(188マイクロリットル、0.0188mmol、1当量)中のN−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、4−(4−(4−((4−((3−(N−(tert−ブチル)スルファモイル)フェニル)アミノ)−5−メチルピリミジン−2−イル)アミノ)フェニル)ピペラジン−1−イル)−4−オキソブタン酸(10.8mg、0.0188mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.8マイクロリットル、0.0564mmol、3当量)及びHATU(7.1mg、0.0188mmol、1当量)を添加し、混合物を23時間撹拌した。次いで、混合物をメタノールで希釈し、分取HPLCによって精製して、所望の生成物を褐色の残渣(7.41mg、0.00715mmol、38%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ8.06(s,1H)、7.80(ddd,J=10.5、7.6、3.2Hz,3H)、7.65(d,J=4.5Hz,1H)、7.57〜7.51(m,2H)、7.41(dd,J=8.4、2.9Hz,1H)、7.25(td,J=6.7、2.9Hz,2H)、7.02(t,J=8.0Hz,2H)、5.16〜5.09(m,1H)、4.75(d,J=9.5Hz,2H)、3.76(dq,J=16.0、5.3Hz,4H)、3.29〜3.12(m,7H)、3.00〜2.67(m,7H)、2.51(t,J=6.8Hz,1H)、2.22(d,J=3.1Hz,3H)、2.13(dtd,J=10.4、5.7、3.1Hz,1H)、1.59〜1.52(m,2H)、1.51〜1.43(m,2H)、1.32(t,J=16.6Hz,8H)、1.18(d,J=1.3Hz,9H)。LCMS1036.69(M+H)。
実施例34:dBET34の合成
DMF(173マイクロリットル、0.0173mmol、1当量)中のN−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、4−(4−(4−((4−((3−(N−(tert−ブチル)スルファモイル)フェニル)アミノ)−5−メチルピリミジン−2−イル)アミノ)フェニル)ピペラジン−1−イル)−4−オキソブタン酸(10.3mg、0.0173mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(9.0マイクロリットル、0.0519mmol、3当量)及びHATU(6.6mg、0.0173mmol、1当量)を添加し、混合物を25時間撹拌した。次いで、混合物をメタノールで希釈し、分取HPLCによって精製して、所望の生成物を褐色の残渣(7.99mg、0.00718mmol、42%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ8.06(s,1H)、7.83〜7.76(m,3H)、7.65(s,1H)、7.58〜7.50(m,2H)、7.43(dd,J=17.7、8.4Hz,1H)、7.27〜7.21(m,2H)、7.02(t,J=8.0Hz,2H)、5.13(dt,J=12.7、5.2Hz,1H)、4.76(d,J=12.4Hz,2H)、3.73(q,J=6.3Hz,4H)、3.63〜3.49(m,10H)、3.41(q,J=6.6Hz,2H)、3.27〜3.15(m,5H)、3.01〜2.81(m,4H)、2.79〜2.63(m,5H)、2.50(t,J=6.8Hz,1H)、2.22(d,J=2.3Hz,3H)、2.17〜2.11(m,1H)、1.88〜1.70(m,4H)、1.18(d,J=1.2Hz,9H)。LCMS1112.74(M+H)。
実施例35:dBET35の合成
DMF(185マイクロリットル、0.0185mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)アミノ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(7.4mg、0.0185mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(9.6マイクロリットル、0.0554mmol、3当量)及びHATU(7.0mg、0.0185mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(2.71mg、0.00351mmol、19%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.48〜7.37(m,4H)、7.34(t,J=7.8Hz,1H)、7.14(dd,J=7.4、2.4Hz,1H)、6.67(d,J=8.1Hz,1H)、5.14(td,J=13.5、5.2Hz,1H)、4.66〜4.60(m,1H)、4.59(d,J=8.3Hz,2H)、4.43〜4.31(m,2H)、3.88(s,2H)、3.25(dd,J=14.8、7.1Hz,4H)、2.94〜2.72(m,3H)、2.68(d,J=4.9Hz,3H)、2.49〜2.40(m,4H)、2.21〜2.12(m,1H)、1.68(s,3H)、1.53(s,4H)。LCMS770.51(M+H)。
実施例36:dBET36の合成
DMF(222マイクロリットル、0.0222mmol、1当量)中のN−(4−アミノブチル)−2−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオオキソイソインドリン−4−イル)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.9mg、0.0222mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(11.6マイクロリットル、0.0666mmol、3当量)及びHATU(8.4mg、0.0222mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で17.5時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(12.42mg、0.0156mmol、70%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.80〜7.74(m,2H)、7.68(d,J=6.8Hz,1H)、7.42(q,J=8.7Hz,4H)、5.11(dt,J=12.3、4.6Hz,1H)、4.63(dd,J=8.8、5.5Hz,1H)、4.10〜4.00(m,2H)、3.39(ddd,J=14.9、8.8、2.5Hz,1H)、3.30〜3.21(m,5H)、2.88〜2.76(m,1H)、2.74〜2.65(m,5H)、2.44(s,3H)、2.15〜2.08(m,1H)、1.69(s,3H)、1.63〜1.55(m,4H)。LCMS769.49(M+H)。
実施例37:dBET37の合成
DMF(195マイクロリットル、0.0195mmol、1当量)中の6−アミノ−N−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)メチル)ヘキサンアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(7.8mg、0.0195mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(10.2マイクロリットル、0.0584mmol、3当量)及びHATU(7.4mg、0.0195mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(11.83mg、0.0151mmol、77%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.78〜7.74(m,2H)、7.71(dd,J=5.3、3.5Hz,1H)、7.42(q,J=8.5Hz,4H)、5.13(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.82(s,2H)、4.63(dd,J=8.8、5.5Hz,1H)、3.40(ddd,J=15.0、8.8、1.6Hz,1H)、3.30〜3.21(m,3H)、2.86(ddd,J=18.4、14.6、4.8Hz,1H)、2.74(ddd,J=13.8、10.1、2.8Hz,2H)、2.69(s,3H)、2.44(s,3H)、2.30(t,J=7.4Hz,2H)、2.13(dtd,J=12.9、4.9、2.3Hz,1H)、1.74〜1.64(m,5H)、1.59(p,J=7.0Hz,2H)、1.46〜1.38(m,2H)。LCMS783.47(M+H)。
実施例38:dBET38の合成
工程1:tert−ブチル(3−(3−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)プロポキシ)プロピル)カルバメートの合成
tert−ブチル(3−(3−アミノプロポキシ)プロピル)カルバメート(134.5mg、0.579mmol、1当量)をDMF(5.79ml、0.05M)に溶解した後、2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸(192.38mg、0.579mmol、1当量)に添加した。DIPEA(0.28ml、1.74mmol、3当量)及びHATU(153.61mg、0.579mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、黄色の油(157.1mg)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、12gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(121.3mg、0.222mmol、38.27%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.78(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.50(d,J=7.3Hz,1H)、7.41(d,J=8.5Hz,1H)、5.13(dd,J=12.4、5.5Hz,1H)、4.75(s,2H)、3.53〜3.37(m,6H)、3.14〜3.07(m,2H)、2.94〜2.88(m,1H)、2.79〜2.68(m,2H)、2.16(ddd,J=12.8、6.6、2.7Hz,1H)、1.81(p,J=6.4Hz,2H)、1.73〜1.65(m,2H)、1.40(s,9H)。LCMS547.6(M+H)。
工程2:N−(3−(3−アミノプロポキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロ酢酸塩の合成
TFA(2.22ml、0.1M)をtert−ブチル(3−(3−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)プロポキシ)プロピル)カルバメート(121.3mg、0.222mmol、1当量)に添加し、混合物を50℃で2時間撹拌した。次いで、混合物をMeOHに溶解し、減圧下で濃縮し、褐色の油(114.1mg)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.81〜7.74(m,1H)、7.50(d,J=7.3Hz,1H)、7.41(d,J=8.5Hz,1H)、5.12(dd,J=12.7、5.5Hz,1H)、4.76(s,2H)、3.57〜3.52(m,2H)、3.48(t,J=5.9Hz,2H)、3.40(t,J=6.6Hz,2H)、3.06(t,J=6.5Hz,2H)、2.87(ddd,J=14.1、10.1、7.0Hz,1H)、2.79〜2.65(m,2H)、2.15(dtd,J=12.8、5.5、2.6Hz,1H)、1.92(dt,J=11.7、5.9Hz,2H)、1.81(p,J=6.3Hz,2H)。LCMS447.2(M+H)。
工程3:dBET38の合成
DMF(0.215mL、0.0215mmol、1当量)中のN−(3−(3−アミノプロポキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.6mg、0.0215mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(11.2マイクロリットル、0.0644mmol、3当量)及びHATU(8.2mg、0.0215mmol、1当量)を添加した。19時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をクリーム色の固体(10.6mg、0.0127mmol、59%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.79〜7.74(m,1H)、7.50(d,J=8.1Hz,1H)、7.46〜7.36(m,5H)、5.11(ddd,J=12.4、5.5、1.7Hz,1H)、4.73(s,2H)、4.62(ddd,J=8.7、5.4、1.4Hz,1H)、3.50(q,J=6.3Hz,4H)、3.43(t,J=6.5Hz,2H)、3.41〜3.32(m,3H)、3.29〜3.24(m,1H)、2.85(ddd,J=18.3、14.6、4.2Hz,1H)、2.77〜2.65(m,5H)、2.43(s,3H)、2.17〜2.09(m,1H)、1.80(h,J=6.4Hz,4H)、1.68(s,3H)。LCMS829.32(M+H)。
実施例39:dBET39の合成
DMF(0.212mL、0.0212mmol、1当量)中の4−((10−アミノデシル)オキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオントリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.5mg、0.0212mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(11.1マイクロリットル、0.0636mmol、3当量)及びHATU(8.1mg、0.0212mmol、1当量)を添加した。19時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、25分間の勾配)及び分取HPLCによる精製によって、所望の生成物(0.39mg、0.00048mmol、2.3%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.77〜7.73(m,1H)、7.56〜7.31(m,6H)、5.11〜5.06(m,1H)、4.62(dd,J=9.2、5.0Hz,1H)、4.58(s,2H)、4.21(t,J=6.3Hz,2H)、3.42〜3.38(m,1H)、3.24〜3.20(m,1H)、2.90〜2.68(m,6H)、2.45(d,J=6.7Hz,3H)、2.11(s,1H)、1.83(dd,J=14.7、6.6Hz,2H)、1.70(s,3H)、1.61〜1.49(m,4H)、1.32(d,J=23.2Hz,10H)。LCMS812.60(M+H)。
実施例40:dBET40の合成
DMF(0.242mL、0.0242mmol、1当量)中の4−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオントリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(9.7mg、0.0242mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(12.6マイクロリットル、0.0726mmol、3当量)及びHATU(9.2mg、0.0242mmol、1当量)を添加した。22時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)及び分取HPLCによる精製によって、所望の生成物を褐色の油(4.74mg、0.00601mmol、25%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.77〜7.67(m,1H)、7.52〜7.36(m,5H)、5.09〜5.03(m,1H)、4.64(d,J=4.8Hz,1H)、4.40〜4.32(m,2H)、3.97〜3.88(m,2H)、3.81〜3.74(m,2H)、3.69〜3.60(m,5H)、3.55〜3.38(m,4H)、2.89〜2.54(m,6H)、2.45(d,J=5.9Hz,3H)、2.11(s,1H)、1.70(d,J=8.6Hz,3H)。LCMS788.42(M+H)。
実施例41:dBET41の合成
工程1:tert−ブチル(4−((2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)メチル)ベンジル)カルバメートの合成
tert−ブチル(4−(アミノメチル)ベンジル)カルバメート(183.14mg、0.755mmol、1当量)をDMF(15.1ml、0.05M)に溶解し、2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸(250.90mg、0.755mmol、1当量)に添加した。DIPEA(0.374ml、2.265mmol、3当量)及びHATU(296.67mg、0.755mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で20時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、淡褐色の油を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、12gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、淡褐色の油(373.1mg、0.678mmol、89.8%)を得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.10(s,2H)、8.48(t,J=5.8Hz,1H)、7.80(dd,J=8.4、7.3Hz,1H)、7.49(d,J=7.2Hz,1H)、7.40(d,J=8.6Hz,1H)、7.26〜7.08(m,4H)、5.11(dd,J=12.9、5.4Hz,1H)、4.86(s,2H)、4.33(d,J=3.9Hz,2H)、4.09(d,J=5.3Hz,2H)、2.65〜2.51(m,3H)、2.07〜1.99(m,1H)、1.38(s,9H)。LCMS551.5(M+H)。
工程2:N−(4−(アミノメチル)ベンジル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロ酢酸塩の合成
TFA(6.77ml、0.1M)をtert−ブチル(4−((2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)メチル)ベンジル)カルバメート(373.1mg、0.677mmol、1当量)に添加し、混合物を50℃で1.5時間撹拌した。次いで、混合物をMeOHに溶解し、減圧下で濃縮し、褐色の油(270.29mg)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.11(s,1H)、8.55(t,J=6.2Hz,1H)、8.07(s,3H)、7.81(dd,J=8.5、7.3Hz,1H)、7.51(d,J=7.2Hz,1H)、7.40(dd,J=14.9、8.3Hz,3H)、7.31(d,J=8.2Hz,2H)、5.11(dd,J=12.9、5.4Hz,1H)、4.87(s,2H)、4.37(d,J=6.1Hz,2H)、4.01(q,J=5.8Hz,2H)、2.66〜2.51(m,3H)、2.07〜1.99(m,1H)。LCMS451.3(M+H)。
工程3:dBET41の合成
DMF(0.237mL、0.0237mmol、1当量)中のN−(4−(アミノメチル)ベンジル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(9.5mg、0.0237mmol、1当量)に室温で添加した。23時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をクリーム色の固体(11.8mg、0.0142mmol、60%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.80〜7.75(m,1H)、7.51(dd,J=7.3、1.5Hz,1H)、7.41(d,J=8.4Hz,1H)、7.36(d,J=2.2Hz,4H)、7.34〜7.28(m,4H)、5.10〜5.00(m,1H)、4.82(s,2H)、4.67〜4.64(m,1H)、4.61〜4.42(m,4H)、4.34(dd,J=14.9、12.8Hz,1H)、3.49(ddd,J=14.8、9.5、5.2Hz,1H)、2.83〜2.75(m,1H)、2.73〜2.61(m,5H)、2.44〜2.39(m,3H)、2.06(ddq,J=9.8、4.7、2.6Hz,1H)、1.66(d,J=4.2Hz,3H)。LCMS832.92(M+H)。
実施例42:dBET42の合成
DMF(222マイクロリットル、0.0222mmol、1当量)中の5−アミノ−N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)ペンタンアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.9mg、0.0222mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(11.6マイクロリットル、0.0666mmol、3当量)及びHATU(8.4mg、0.0222mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で24時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインを洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を白色の固体(12.23mg、0.0165mmol、74%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.76〜7.71(m,1H)、7.66〜7.62(m,1H)、7.51(td,J=7.8、2.5Hz,1H)、7.45〜7.35(m,4H)、5.11(ddd,J=13.2、11.3、5.2Hz,1H)、4.63(ddd,J=8.8、5.7、3.2Hz,1H)、4.47(s,2H)、3.45〜3.32(m,3H)、3.30〜3.27(m,1H)、2.90〜2.80(m,1H)、2.73〜2.63(m,4H)、2.49(t,J=7.4Hz,2H)、2.46〜2.38(m,4H)、2.11(ddtd,J=12.8、10.5、5.3、2.3Hz,1H)、1.84〜1.75(m,2H)、1.66(dd,J=16.2、7.6Hz,5H)。LCMS741.46(M+H)。
実施例43:dBET43の合成
DMF(227マイクロリットル、0.0227mmol、1当量)中の7−アミノ−N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)ペンタンアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(9.1mg、0.0227mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(11.9マイクロリットル、0.0681mmol、3当量)及びHATU(8.6mg、0.0227mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で25.5時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインを洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をオフホワイト色の固体(12.58mg、0.0164mmol、72%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.71(d,J=7.9Hz,1H)、7.64(d,J=7.4Hz,1H)、7.51(t,J=7.8Hz,1H)、7.46〜7.38(m,4H)、5.14(ddd,J=13.3、5.2、2.2Hz,1H)、4.62(ddd,J=8.6、5.6、2.1Hz,1H)、4.49〜4.45(m,2H)、3.39(ddd,J=14.9、8.7、1.3Hz,1H)、3.30〜3.24(m,3H)、2.93〜2.83(m,1H)、2.79〜2.65(m,4H)、2.50〜2.40(m,6H)、2.16(ddq,J=9.9、5.2、2.6Hz,1H)、1.78〜1.70(m,2H)、1.68(d,J=2.1Hz,3H)、1.63〜1.57(m,2H)、1.50〜1.42(m,4H)。LCMS769.55(M+H)。
実施例44:dBET44の合成
DMF(217マイクロリットル、0.0217mmol、1当量)中の8−アミノ−N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)オクタンアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.7mg、0.0217mmol、1当量)に添加した。次いで、DIPEA(11.3マイクロリットル、0.0651mmol、3当量)及びHATU(8.3mg、0.0217mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で20.5時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインを洗浄した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をクリーム色の固体(14.28mg、0.0182mmol、84%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.72〜7.68(m,1H)、7.64(d,J=7.5Hz,1H)、7.51(t,J=7.7Hz,1H)、7.46〜7.39(m,4H)、5.14(dt,J=13.3、5.0Hz,1H)、4.62(dd,J=8.8、5.4Hz,1H)、4.48〜4.44(m,2H)、3.40(ddd,J=14.9、8.8、0.9Hz,1H)、3.26(dt,J=13.2、6.9Hz,3H)、2.88(ddd,J=18.7、13.5、5.4Hz,1H)、2.75(dddd,J=17.6、7.1、4.5、2.4Hz,1H)、2.68(d,J=2.2Hz,3H)、2.49〜2.39(m,6H)、2.17(ddt,J=9.8、5.3、2.3Hz,1H)、1.76〜1.70(m,2H)、1.70〜1.67(m,3H)、1.61〜1.54(m,2H)、1.42(s,6H)。LCMS783.53(M+H)。
実施例45:dBET45の合成
DMF(268マイクロリットル、0.0268mmol、1当量)中のN−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(R)−4−((4−シクロペンチル−1,3−ジメチル−2−オキソ−1,2,3,4−テトラヒドロピリド[2,3−b]ピラジン−6−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(11.0mg、0.0268mmol、1当量)に室温で添加した。次いで、DIPEA(14.0マイクロリットル、0.0804mmol、3当量)及びHATU(10.2mg、0.0268mmol、1当量)を添加し、混合物を18.5時間撹拌した。次いで、混合物をメタノールで希釈し、分取HPLCによって精製して、所望の生成物を暗褐色の固体(10.44mg、0.0108mmol、40%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ8.38(d,J=8.4Hz,1H)、7.80〜7.75(m,1H)、7.55〜7.48(m,1H)、7.48〜7.35(m,3H)、7.27(d,J=8.3Hz,1H)、6.45(d,J=8.2Hz,1H)、5.12(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.72(d,J=5.1Hz,2H)、4.53(s,1H)、4.28(d,J=6.8Hz,1H)、3.98(d,J=4.1Hz,3H)、3.48〜3.33(m,4H)、2.90〜2.82(m,1H)、2.80〜2.69(m,2H)、2.18〜2.01(m,4H)、1.88〜1.52(m,10H)、1.34(d,J=42.9Hz,10H)、1.17(d,J=6.8Hz,3H)。LCMS851.67(M+H)。
実施例46:dBET46の合成
DMF(256マイクロリットル、0.0256mmol、1当量)中のN−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(R)−4−((4−シクロペンチル−1,3−ジメチル−2−オキソ−1,2,3,4−テトラヒドロピリド[2,3−b]ピラジン−6−イル)アミノ)−3−メトキシ安息香酸(10.5mg、0.0256mmol、1当量)に室温で添加した。次いで、DIPEA(13.4マイクロリットル、0.0767mmol、3当量)及びHATU(9.7mg、0.0256mmol、1当量)を添加し、混合物を20時間撹拌した。次いで、混合物をメタノールで希釈し、分取HPLCによって精製して、所望の生成物を暗褐色の固体(13.69mg、0.0132mmol、51%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ8.28〜8.24(m,1H)、7.74〜7.71(m,1H)、7.49(dd,J=7.3、3.7Hz,1H)、7.39〜7.34(m,2H)、7.28〜7.25(m,1H)、7.14〜7.10(m,1H)、6.34(d,J=8.3Hz,1H)、5.01〜4.97(m,1H)、4.62(s,2H)、4.25(q,J=6.7Hz,1H)、3.95(d,J=5.4Hz,3H)、3.60(ddd,J=9.0、6.1、1.6Hz,8H)、3.53〜3.46(m,6H)、3.40〜3.37(m,2H)、2.78(td,J=11.1、6.6Hz,3H)、2.16〜2.00(m,4H)、1.84(ddt,J=33.5、13.0、6.4Hz,7H)、1.75〜1.60(m,6H)、1.17(d,J=6.8Hz,3H)。LCMS927.74(M+H)。
実施例47:dBET50の合成
DMF(200マイクロリットル、0.0200mmol、1当量)中のN−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−4−(4−クロロフェニル)−6−(2−メトキシ−2−オキソエチル)−3,9−ジメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−2−カルボン酸(8.9mg、0.020mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(10.5マイクロリットル、0.060mmol、3当量)及びHATU(7.6mg、0.020mmol、1当量)を添加した。次いで、混合物を17時間撹拌した後、EtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をクリーム色の固体(9.31mg、0.00968mmol、48%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.82〜7.78(m,1H)、7.52(dd,J=7.1、1.6Hz,1H)、7.49〜7.40(m,5H)、5.10(ddd,J=12.8、5.5、2.9Hz,1H)、4.74(s,2H)、4.67(t,J=7.1Hz,1H)、3.76(s,3H)、3.62〜3.50(m,14H)、3.49〜3.43(m,2H)、3.40(q,J=6.5Hz,2H)、2.87(ddd,J=17.6、14.0、5.3Hz,1H)、2.79〜2.67(m,5H)、2.12(ddq,J=10.3、5.4、2.9Hz,1H)、2.00(s,3H)、1.86(q,J=6.3Hz,2H)、1.80(p,J=6.4Hz,2H)。LCMS961.67(M+H)。
実施例48:dBET51の合成
DMF(200マイクロリットル、0.0200mmol、1当量)中のN−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、(S)−4−(4−クロロフェニル)−6−(2−メトキシ−2−オキソエチル)−3,9−ジメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−2−カルボン酸(8.9mg、0.020mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(10.5マイクロリットル、0.060mmol、3当量)及びHATU(7.6mg、0.020mmol、1当量)を添加した。次いで、混合物を17時間撹拌した後、EtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物をオフホワイト色の固体(8.38mg、0.00942mmol、47%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.80(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.52(dd,J=7.2、1.3Hz,1H)、7.48〜7.38(m,5H)、5.08(ddd,J=12.7、5.5、1.6Hz,1H)、4.74(d,J=2.7Hz,2H)、4.66(t,J=7.1Hz,1H)、3.75(d,J=3.0Hz,3H)、3.65(t,J=4.1Hz,6H)、3.59(t,J=5.3Hz,2H)、3.57〜3.49(m,4H)、3.49〜3.40(m,2H)、2.93〜2.84(m,1H)、2.78〜2.64(m,5H)、2.15〜2.09(m,1H)、2.00(d,J=0.9Hz,3H)。LCMS889.58(M+H)。
実施例49:dBET52の合成
DMF(200マイクロリットル、0.020mmol、1当量)中のN−(2−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.0mg、0.020mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(10.5マイクロリットル、0.060mmol、3当量)及びHATU(7.6mg、0.020mmol、1当量)を添加した。17.5時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を無色の残渣(9.12mg、0.01025mmol、51%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.77(t,J=7.9Hz,1H)、7.50(dd,J=7.3、1.5Hz,1H)、7.47〜7.36(m,5H)、5.09(ddd,J=13.0、7.6、5.5Hz,1H)、4.76(s,2H)、4.62(dd,J=9.1、5.1Hz,1H)、3.62(ddt,J=17.3、11.2、6.5Hz,12H)、3.52〜3.41(m,5H)、3.28(d,J=5.1Hz,1H)、2.90〜2.81(m,1H)、2.79〜2.66(m,5H)、2.44(s,3H)、2.16〜2.09(m,1H)、1.69(s,3H)。LCMS889.38(M+H)。
実施例50:dBET53の合成
DMF(200マイクロリットル、0.020mmol、1当量)中のN−(14−アミノ−3,6,9,12−テトラオキサテトラデシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.0mg、0.020mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(10.5マイクロリットル、0.060mmol、3当量)及びHATU(7.6mg、0.020mmol、1当量)を添加した。17.5時間後に付加的なHATU(7.6mg)及びDIPEA(10.5マイクロリットル)を添加し、混合物を更に5時間撹拌した。混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物(3.66mg)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.79(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.51(d,J=7.3Hz,1H)、7.45(d,J=7.7Hz,2H)、7.43〜7.36(m,3H)、5.08(ddd,J=12.7、5.5、2.2Hz,1H)、4.78〜4.74(m,2H)、4.62(dd,J=9.1、5.1Hz,1H)、3.70〜3.51(m,16H)、3.50〜3.41(m,5H)、3.27(dd,J=5.1、2.3Hz,1H)、2.87(ddt,J=18.2、9.5、4.9Hz,1H)、2.78〜2.66(m,5H)、2.44(s,3H)、2.16〜2.09(m,1H)、1.69(s,3H)。LCMS933.43(M+H)。
実施例51:dBET54の合成
DMF(200マイクロリットル、0.020mmol、1当量)中のN−(17−アミノ−3,6,9,12,15−ペンタオキサヘプタデシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.0mg、0.020mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(10.5マイクロリットル、0.060mmol、3当量)及びHATU(7.6mg、0.020mmol、1当量)を添加した。16時間後、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物(6.27mg、0.00641mmol、32%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.81〜7.76(m,1H)、7.51(d,J=7.1Hz,1H)、7.47〜7.38(m,5H)、5.09(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.77(s,2H)、4.62(dd,J=8.8、5.0Hz,1H)、3.67〜3.55(m,20H)、3.46(ddd,J=20.1、10.2、4.7Hz,5H)、3.28(d,J=5.1Hz,1H)、2.91〜2.83(m,1H)、2.78〜2.68(m,5H)、2.44(s,3H)、2.16〜2.10(m,1H)、1.72〜1.66(m,3H)。LCMS977.50(M+H)。
実施例52:dBET55の合成
DMF(200マイクロリットル、0.020mmol、1当量)中のN−(29−アミノ−3,6,9,12,15,18,21,24,27−ノナオキサノナコシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.0mg、0.020mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(10.5マイクロリットル、0.060mmol、3当量)及びHATU(7.6mg、0.020mmol、1当量)を添加した。18時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物(10.55mg、0.00914mmol、46%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.82(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.55(d,J=7.0Hz,1H)、7.49〜7.41(m,5H)、5.13(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.80(s,2H)、4.65(dd,J=9.1、5.1Hz,1H)、3.68〜3.58(m,36H)、3.53〜3.44(m,5H)、2.94〜2.86(m,1H)、2.81〜2.70(m,5H)、2.46(s,3H)、2.19〜2.13(m,1H)、1.74〜1.69(m,3H)。LCMS1153.59(M+H)。
実施例53:dBET56の合成
DMF(200マイクロリットル、0.020mmol、1当量)中のN−(35−アミノ−3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33−ウンデカオキサペンタトリアコンチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液を、JQ−酸(8.0mg、0.020mmol、1当量)に室温で添加した。DIPEA(10.5マイクロリットル、0.060mmol、3当量)及びHATU(7.6mg、0.020mmol、1当量)を添加した。20時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、所望の生成物を油状残渣(9.03mg、0.00727mmol、36%)として得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.81(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.53(d,J=7.1Hz,1H)、7.50〜7.40(m,5H)、5.11(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.78(s,2H)、4.68(dd,J=8.6、5.0Hz,1H)、3.69〜3.56(m,44H)、3.52〜3.43(m,5H)、3.34(dd,J=7.9、3.5Hz,1H)、2.88(ddd,J=18.0、14.0、5.2Hz,1H)、2.79〜2.68(m,5H)、2.46(s,3H)、2.17〜2.12(m,1H)、1.71(s,3H)。LCMS1241.60(M+H)。
実施例54:dBET57の合成
工程1:2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオンの合成
AcOH(4.0mL、0.3M)中の4−フルオロイソベンゾフラン−1,3−ジオン(200mg、1.20mmol、1当量)の溶液を、2,6−ジオキソピペリジン−3−アミン塩酸塩(218mg、1.32mmol、1.1当量)及び酢酸カリウム(366mg、3.73mmol、3.1当量)に添加した。反応混合物を90℃に一晩加熱し、その後すぐに水で20mLに希釈し、氷上で30分間冷却した。得られるスラリーを濾過し、黒色の固体をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中2%のMeOH、R=0.3)によって精製して、表題化合物を白色の固体(288mg、86%)として得た。H NMR(500MHz,DMSO−d)δ11.15(s,1H)、7.96(ddd,J=8.3、7.3、4.5Hz,1H)、7.82〜7.71(m,2H)、5.17(dd,J=13.0、5.4Hz,1H)、2.90(ddd,J=17.1、13.9、5.4Hz,1H)、2.65〜2.47(m,2H)、2.10〜2.04(m,1H)、C1310FN[M+H]のMS(ESI)算出値277.06、実測値277.25。
工程2:tert−ブチル(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エチル)カルバメートの合成
DMF(6.3mL、0.1M)中の2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−フルオロイソインドリン−1,3−ジオン(174mg、0.630mmol、1当量)の撹拌溶液を、DIPEA(220μL、1.26mmol、2当量)及び1−Boc−エチレンジアミン(110μL、0.693mmol、1.1当量)に添加した。反応混合物を90℃に一晩加熱し、その後すぐに室温まで冷却し、EtOAc(30mL)及び水(30mL)中に取った。有機層をブライン(3×20mL)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、真空で濃縮した。残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0→10%のMeOH)によって精製して、表題化合物を黄色の固体(205mg、79%)として得た。H NMR(500MHz,CDCl3)δ8.08(bs,1H)、7.50(dd,J=8.5、7.1Hz,1H)、7.12(d,J=7.1Hz,1H)、6.98(d,J=8.5Hz,1H)、6.39(t,J=6.1Hz,1H)、4.96〜4.87(m,1H)、4.83(bs,1H)、3.50〜3.41(m,2H)、3.41〜3.35(m,2H)、2.92〜2.66(m,3H)、2.16〜2.09(m,1H)、1.45(s,9H);C2025[M+H]のMS(ESI)算出値417.18、実測値417.58。
工程3:2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エタン−1−アミニウム2,2,2−トリフルオロアセテートの合成
ジクロロメタン(2.25mL)中のtert−ブチル(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エチル)カルバメート(205mg、0.492mmol、1当量)の撹拌溶液を、トリフルオロ酢酸(0.250mL)に添加した。反応混合物を室温で4時間撹拌し、その後すぐに揮発性物質を真空で除去した。表題化合物が黄色の固体(226mg、95%超)として得られ、これを更に精製することなく使用した。H NMR(500MHz,MeOD)δ7.64(d,J=1.4Hz,1H)、7.27〜7.05(m,2H)、5.10(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、3.70(t,J=6.0Hz,2H)、3.50〜3.42(m,2H)、3.22(t,J=6.0Hz,1H)、2.93〜2.85(m,1H)、2.80〜2.69(m,2H)、2.17〜2.10(m,1H);C1517[M+H]のMS(ESI)算出値317.12、実測値317.53。
工程2:dBET57の合成
JQ−酸(8.0mg、0.0200mmol、1当量)及び2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エタン−1−アミニウム2,2,2−トリフルオロアセテート(8.6mg、0.0200mmol、1当量)を、DMF(0.200mL、0.1M)に室温で溶解した。次いで、DIPEA(17.4μL、0.100mmol、5当量)及びHATU(7.59mg、0.0200mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物をEtOAc(15mL)中に取り、飽和NaHCO(水溶液)(15mL)、水(15mL)及びブライン(3×15mL)で洗浄した。有機層をNaSOで乾燥させ、真空で濃縮した。残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0%→10%のMeOH、R=0.3(CHCl中10%のMeOH))によって精製して、表題化合物を明るい黄色の固体(11.2mg、80%)として得た。H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.49(bs,0.6H)、8.39(bs,0.4H)、7.51〜7.43(m,1H)、7.38(d,J=7.8Hz,2H)、7.29(dd,J=8.8、1.7Hz,2H)、7.07(dd,J=7.1、4.9Hz,1H)、6.97(dd,J=8.6、4.9Hz,1H)、6.48(t,J=5.9Hz,1H)、6.40(t,J=5.8Hz,0.6H)、4.91〜4.82(m,0.4H)、4.65〜4.60(m,1H)、3.62〜3.38(m,6H)、2.87〜2.64(m,3H)、2.63(s,3H)、2.40(s,6H)、2.12〜2.04(m,1H)、1.67(s,3H)、回転異性体;C3432ClNS[M+H]のMS(ESI)算出値700.19、実測値700.34。
実施例55:dGR1の合成
実施例56:dGR2の合成:
実施例57:dGR3の合成:
実施例58:dFKBP−1の合成
(1)SLF−スクシネートの合成
SLF(25mg、2.5mLの10mg/mL MeOAc溶液、0.0477mmol、1当量)をDMF(0.48mL、0.1M)及び無水コハク酸(7.2mg、0.0715mmol、1.5当量)と合わせ、室温で24時間撹拌した。低変換が観察され、混合物をN流下に置き、MeOAcを除去した。更に0.48mLのDMFを、付加的な7.2mgの無水コハク酸及びDMAP(5.8mg、0.0477mmol、1当量)と共に添加した。次いで、混合物を更に24時間撹拌した後、分取HPLCによって精製して、SLF−スクシネートを黄色の油(24.06mg、0.0385mmol、81%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.62(d,J=10.7Hz,1H)、7.44(d,J=8.0Hz,1H)、7.26(td,J=7.9、2.7Hz,1H)、7.07〜6.97(m,1H)、6.80(dd,J=8.1、2.1Hz,1H)、6.74〜6.66(m,2H)、5.73(dd,J=8.1、5.5Hz,1H)、5.23(d,J=4.8Hz,1H)、3.83(s,3H)、3.81(s,3H)、3.39〜3.29(m,4H)、3.21(td,J=13.2、3.0Hz,1H)、2.68〜2.50(m,5H)、2.37〜2.19(m,2H)、2.12〜2.02(m,1H)、1.79〜1.61(m,4H)、1.49〜1.30(m,2H)、1.27〜1.05(m,6H)、0.82(dt,J=41.2、7.5Hz,3H)。LCMS624.72(M+H)。
(2)dFKBP−1の合成
N−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(9.9mg、0.0192mmol、1当量)を、SLFスクシネート(11.98mg、0.0192mmol、1当量)に0.192mLのDMF溶液(0.1M)として添加した。DIPEA(10.0マイクロリットル、0.0575mmol、3当量)、続いてHATU(7.3mg、0.0192mmol、1当量)を添加した。混合物を17時間撹拌した後、MeOHで希釈し、分取HPLCによって精製して、dFKBP−1(7.7mg、0.00763mmol、40%)を黄色の固体として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.81(s,1H)、7.77〜7.70(m,1H)、7.55〜7.49(m,2H)、7.26(dd,J=8.0、5.3Hz,2H)、7.05〜6.99(m,1H)、6.77(d,J=8.8Hz,1H)、6.66(d,J=6.8Hz,2H)、5.77〜5.72(m,1H)、5.24(d,J=4.8Hz,1H)、4.99(dd,J=12.3、5.7Hz,1H)、4.68〜4.59(m,2H)、3.82(s,3H)、3.81(s,3H)、3.32(dt,J=3.3、1.6Hz,4H)、3.26〜3.14(m,3H)、2.79(dd,J=18.9、10.2Hz,3H)、2.64〜2.48(m,5H)、2.34(d,J=14.4Hz,1H)、2.22(d,J=9.2Hz,1H)、2.14〜2.02(m,2H)、1.78〜1.49(m,9H)、1.43〜1.30(m,2H)、1.20〜1.04(m,6H)、0.90〜0.76(m,3H)。13C NMR(100MHz,cd3od)δ208.51、173.27、172.64、171.63、169.93、169.51、168.04、167.69、167.09、166.71、154.92、149.05、147.48、140.76、138.89、137.48、133.91、133.67、129.36、122.19、120.61、120.54、119.82、118.41、118.12、117.79、112.12、111.76、68.54、56.10、55.98、51.67、46.94、44.57、39.32、39.01、38.23、32.64、31.55、31.43、26.68、26.64、25.08、23.52、23.21、22.85、21.27、8.76。LCMS1009.66(M+H)。
実施例59:dFKBP−2の合成
(1)tert−ブチル(1−クロロ−2−オキソ−7,10,13−トリオキサ−3−アザヘキサデカン−16−イル)カルバメートの合成
tert−ブチル(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)カルバメート(1.0g、3.12mmol、1当量)をTHF(31mL、0.1M)に溶解した。DIPEA(0.543mL、3.12mmol、1当量)を添加し、溶液を0℃まで冷却した。塩化クロロアセチル(0.273mL、3.43mmol、1.1当量)を添加し、混合物をゆっくりと室温まで温めた。24時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮し、黄色の油(1.416g)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。
H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.24(s,1H)、5.00(s,1H)、3.98〜3.89(m,2H)、3.54(dddt,J=17.0、11.2、5.9、2.2Hz,10H)、3.47〜3.40(m,2H)、3.37〜3.31(m,2H)、3.17〜3.07(m,2H)、1.79〜1.70(m,2H)、1.67(p,J=6.1Hz,2H)、1.35(s,9H)。13C NMR(100MHz,cdcl3)δ165.83、155.97、78.75、70.49、70.47、70.38、70.30、70.14、69.48、42.61、38.62、38.44、29.62、28.59、28.40。LCMS397.37(M+H)。
(2)ジメチル3−((2,2−ジメチル−4,20−ジオキソ−3,9,12,15−テトラオキサ−5,19−ジアザヘニコサン−21−イル)オキシ)フタレートの合成
tert−ブチル(1−クロロ−2−オキソ−7,10,13−トリオキサ−3−アザヘキサデカン−16−イル)カルバメート(1.41g、3.12mmol、1当量)をMeCN(32mL、0.1M)に溶解した。ジメチル3−ヒドロキシフタレート(0.721g、3.43mmol、1.1当量)及び炭酸セシウム(2.80g、8.58mmol、2.75当量)を添加した。フラスコに還流冷却器を取り付け、80℃に19時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、水で希釈し、クロロホルムで1回及びEtOAcで2回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、24gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、22分間の勾配)によって精製して、黄色の油(1.5892g、2.78mmol、2工程で89%)を得た。
H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.52(d,J=7.8Hz,1H)、7.35(t,J=8.1Hz,1H)、7.04(d,J=8.3Hz,1H)、7.00(t,J=5.3Hz,1H)、5.06(s,1H)、4.46(s,2H)、3.83(s,3H)、3.78(s,3H)、3.47(ddd,J=14.9、5.5、2.8Hz,8H)、3.39(dt,J=9.4、6.0Hz,4H)、3.29(q,J=6.5Hz,2H)、3.09(d,J=6.0Hz,2H)、1.70(p,J=6.5Hz,2H)、1.63(p,J=6.3Hz,2H)、1.31(s,9H)。13C NMR(100MHz,cdcl3)δ167.68、167.36、165.45、155.93、154.41、130.87、129.60、125.01、123.20、117.06、78.60、70.40、70.17、70.06、69.39、68.67、68.25、52.77、52.57、38.38、36.58、29.55、29.20、28.34。LCMS571.47(M+H)。
(3)N−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの合成
ジメチル3−((2,2−ジメチル−4,20−ジオキソ−3,9,12,15−テトラオキサ−5,19−ジアザヘニコサン−21−イル)オキシ)フタレート(1.589g、2.78mmol、1当量)をEtOH(14mL、0.2M)に溶解した。3M NaOH水溶液(2.8mL、8.34mmol、3当量)を添加し、混合物を80℃に22時間加熱した。次いで、混合物を室温まで冷却し、50mLのDCM及び20mLの0.5M HClで希釈した。層を分離し、有機層を25mLの水で洗浄した。水層を合わせ、50mLのクロロホルムで3回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮し、1.53gの物質を得て、これを更に精製することなく繰り越した。LCMS553.44。
得られた物質(1.53g)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(0.480g、2.92mmol、1当量)をピリジン(11.7mL、0.25M)に溶解し、110℃に17時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、減圧下で濃縮し、粗tert−ブチル(1−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)−2−オキソ−7,10,13−トリオキサ−3−アザヘキサデカン−16−イル)カルバメートを黒色のスラッジ(3.1491g)として得て、これを更に精製することなく繰り越した。LCMS635.47。
粗tert−ブチル(1−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)−2−オキソ−7,10,13−トリオキサ−3−アザヘキサデカン−16−イル)カルバメート(3.15g)をTFA(20mL)に溶解し、50℃に2.5時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、MeOHで希釈し、減圧下で濃縮した。物質を分取HPLCによって精製して、N−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(1.2438g、1.9598mmol、3工程で71%)を暗赤色の油として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.77(dd,J=8.3、7.5Hz,1H)、7.49(d,J=7.3Hz,1H)、7.40(d,J=8.5Hz,1H)、5.12(dd,J=12.8、5.5Hz,1H)、4.75(s,2H)、3.68〜3.51(m,12H)、3.40(t,J=6.8Hz,2H)、3.10(t,J=6.4Hz,2H)、2.94〜2.68(m,3H)、2.16(dtd,J=12.6、5.4、2.5Hz,1H)、1.92(p,J=6.1Hz,2H)、1.86〜1.77(m,2H)。13C NMR(100MHz,cd3od)δ173.17、169.97、168.48、166.87、166.30、154.82、136.89、133.41、120.29、117.67、116.58、69.96、69.68、69.60、68.87、68.12、67.92、49.19、38.62、36.14、30.80、28.92、26.63、22.22。LCMS536.41(M+H)。
(4)dFKBP−2の合成
N−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(12.5mg、0.0193mmol、1当量)を、SLF−スクシネート(12.08mg、0.0193mmol、1当量)に0.193mLのDMF溶液(0.1M)として添加した。DIPEA(10.1マイクロリットル、0.0580mmol、3当量)及びHATU(7.3mg、0.0193mmol、1当量)を添加し、混合物を19時間撹拌した。次いで、混合物をMeOHで希釈し、分取HPLCによって精製して、dFKBP−2(9.34mg、0.00818mmol、42%)を黄色の油として得た。
H NMR(400MHz,50%MeOD/クロロホルム−d)δ7.76〜7.70(m,1H)、7.58〜7.45(m,3H)、7.26(t,J=8.2Hz,2H)、7.05〜6.98(m,1H)、6.77(d,J=7.9Hz,1H)、6.71〜6.63(m,2H)、5.73(dd,J=8.1、5.6Hz,1H)、5.23(d,J=5.4Hz,1H)、5.03〜4.95(m,1H)、4.64(s,2H)、3.82(s,3H)、3.80(s,3H)、3.62〜3.52(m,8H)、3.47(t,J=6.1Hz,2H)、3.44〜3.33(m,3H)、3.27〜3.14(m,3H)、2.84〜2.70(m,3H)、2.64〜2.47(m,6H)、2.34(d,J=14.1Hz,1H)、2.24(dd,J=14.3、9.3Hz,2H)、2.13〜2.00(m,2H)、1.83(p,J=6.3Hz,2H)、1.67(dtd,J=38.4、16.8、14.8、7.0Hz,7H)、1.51〜1.26(m,3H)、1.22〜1.05(m,6H)、0.80(dt,J=39.8、7.5Hz,3H)。13C NMR(100MHz,cdcl3)δ208.64、173.39、173.01、171.76、170.11、169.62、168.24、167.92、167.36、166.69、155.02、149.23、147.66、140.94、139.18、137.57、134.09、133.91、129.49、122.32、120.75、120.52、119.93、118.42、117.75、112.33、111.98、70.77、70.51、70.40、69.45、69.04、68.48、56.20、56.10、51.88、47.09、44.78、38.40、37.48、36.91、32.80、32.71、31.70、31.59、31.55、29.53、29.30、26.77、25.22、23.63、23.33、22.98、21.43。LCMS1141.71(M+H)。
実施例60:dFKBP−3の合成
SLF−スクシネートをdFKBP−1の合成の工程(1)に従って調製した。
N−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液(0.233mL、0.0233mmol、1当量)を、2−(3−((R)−3−(3,4−ジメトキシフェニル)−1−(((S)−1−(3,3−ジメチル−2−オキソペンタノイル)ピロリジン−2−カルボニル)オキシ)プロピル)フェノキシ)酢酸(13.3mg、0.0233mmol、1当量)に添加した。DIPEA(12.2マイクロリットル、0.0700mmol、3当量)、続いてHATU(8.9mg、0.0233mmol、1当量)を添加した。混合物を23時間撹拌した後、MeOHで希釈し、分取HPLCによって精製して、白色の固体(10.72mg、0.0112mmol、48%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.79〜7.74(m,1H)、7.52(d,J=7.4Hz,1H)、7.33(d,J=8.4Hz,1H)、7.26(t,J=8.1Hz,1H)、6.97〜6.90(m,2H)、6.89〜6.84(m,1H)、6.79(dd,J=8.2、1.9Hz,1H)、6.73〜6.64(m,2H)、5.73〜5.65(m,1H)、5.07〜4.99(m,1H)、4.67(s,2H)、4.57〜4.51(m,1H)、4.48(dd,J=5.7、2.5Hz,2H)、3.82(d,J=1.9Hz,3H)、3.80(s,3H)、3.66〜3.39(m,3H)、2.88〜2.48(m,6H)、2.42〜1.87(m,9H)、1.73〜1.51(m,6H)、1.19〜0.92(m,6H)、0.75(dt,J=56.7、7.5Hz,3H)。LCMS954.52(M+H)。
実施例61:dFKBP−4の合成
SLF−スクシネートをdFKBP−1の合成の工程(1)に従って調製した。
N−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液(0.182mL、0.0182mmol、1当量)を、2−(3−((R)−3−(3,4−ジメトキシフェニル)−1−(((S)−1−(3,3−ジメチル−2−オキソペンタノイル)ピペリジン−2−カルボニル)オキシ)プロピル)フェノキシ)酢酸(10.6mg、0.0182mmol、1当量)に添加した。DIPEA(9.5マイクロリットル、0.0545mmol、3当量)、続いてHATU(6.9mg、0.0182mmol、1当量)を添加した。混合物を26時間撹拌した後、MeOHで希釈し、分取HPLCによって精製して、白色の固体(9.74mg、0.01006mmol、55%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.75(dd,J=8.3、7.4Hz,1H)、7.53(d,J=2.3Hz,1H)、7.33〜7.25(m,2H)、7.00〜6.84(m,3H)、6.79(dd,J=8.1、2.5Hz,1H)、6.72〜6.65(m,2H)、5.75〜5.70(m,1H)、5.23(d,J=4.9Hz,1H)、5.05〜4.96(m,1H)、4.66(s,2H)、4.46(s,2H)、3.82(s,3H)、3.81(s,3H)、3.39〜3.32(m,4H)、3.20〜3.12(m,1H)、2.82〜2.69(m,3H)、2.62〜2.49(m,2H)、2.37〜2.00(m,5H)、1.78〜1.30(m,11H)、1.24〜1.08(m,6H)、0.81(dt,J=32.9、7.5Hz,3H)。LCMS968.55(M+H)。
実施例62:dFKBP−5の合成
SLF−スクシネートをdFKBP−1の合成の工程(1)に従って調製した。
N−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの0.1M溶液(0.205mL、0.0205mmol、1当量)を、2−(3−((R)−3−(3,4−ジメトキシフェニル)−1−(((S)−1−(2−フェニルアセチル)ピペリジン−2−カルボニル)オキシ)プロピル)フェノキシ)酢酸(11.8mg、0.0205mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.7マイクロリットル、0.0615mmol、3当量)、続いてHATU(7.8mg、0.0205mmol、1当量)を添加した。混合物を29時間撹拌した後、MeOHで希釈し、分取HPLCによって精製して、白色の固体(10.62mg、0.01106mmol、54%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.77〜7.72(m,1H)、7.52(s,1H)、7.31〜7.11(m,7H)、6.92〜6.77(m,4H)、6.68〜6.62(m,2H)、5.70〜5.64(m,1H)、5.38(d,J=3.8Hz,1H)、4.99(d,J=4.6Hz,1H)、4.65(s,2H)、4.45〜4.39(m,2H)、3.80(dd,J=6.7、2.4Hz,8H)、3.13〜3.03(m,1H)、2.83〜2.68(m,3H)、2.63〜2.45(m,3H)、2.34〜1.93(m,6H)、1.71〜1.52(m,7H)、1.34〜1.20(m,3H)。LCMS960.54(M+H)。
実施例63:dFKBP−6の合成
N−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(11.9mg、0.0231mmol、1当量)を、2−(3−((R)−3−(3,4−ジメトキシフェニル)−1−(((S)−1−((S)−2−(3,4,5−トリメトキシフェニル)ブタノイル)ピペリジン−2−カルボニル)オキシ)プロピル)フェノキシ)酢酸(16.0mg、0.0231mmol、1当量)に0.231mLのDMF溶液(0.1M)として添加した。DIPEA(12.1マイクロリットル、0.0692mmol、3当量)及びHATU(8.8mg、0.0231mmol、1当量)を添加し、混合物を21時間撹拌した。混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、dFKBP−6を白色の固体(17.3mg、0.0161mmol、70%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.78(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.51(d,J=7.3Hz,1H)、7.39(dd,J=8.3、2.1Hz,1H)、7.26〜7.17(m,1H)、6.91〜6.83(m,2H)、6.80(dd,J=8.1、4.8Hz,1H)、6.77〜6.69(m,2H)、6.63(d,J=8.2Hz,2H)、6.13(dd,J=8.3、5.8Hz,1H)、5.40(s,1H)、5.12(td,J=12.6、5.4Hz,1H)、4.71(d,J=3.0Hz,2H)、4.56(dd,J=14.9、1.6Hz,1H)、4.41(dd,J=14.9、1.4Hz,1H)、4.12(d,J=13.9Hz,1H)、3.90〜3.64(m,14H)、3.22(dd,J=17.7、5.7Hz,3H)、2.92〜2.79(m,2H)、2.74(dd,J=12.6、4.0Hz,2H)、2.68〜2.53(m,2H)、2.53〜2.40(m,2H)、2.24(d,J=12.4Hz,1H)、2.16〜2.08(m,1H)、2.08〜1.97(m,2H)、1.95〜1.86(m,1H)、1.73(dd,J=13.8、7.0Hz,1H)、1.69〜1.61(m,2H)、1.56(s,2H)、1.48(s,4H)、1.37〜1.12(m,3H)、0.93〜0.79(m,3H)。LCMS1078.50(M+H)。
実施例64:dFKBP−7の合成
N−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(12.3mg、0.0189mmol、1当量)を、2−(3−((R)−3−(3,4−ジメトキシフェニル)−1−(((S)−1−((S)−2−(3,4,5−トリメトキシフェニル)ブタノイル)ピペリジン−2−カルボニル)オキシ)プロピル)フェノキシ)酢酸(13.1mg、0.0189mmol、1当量)に0.189mLのDMF溶液(0.1M)として添加した。DIPEA(9.9マイクロリットル、0.0566mmol、3当量)及びHATU(7.2mg、0.0189mmol、1当量)を添加し、混合物を17時間撹拌した。混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、dFKBP−7を白色の固体(17.2mg、0.0142mmol、75%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.81〜7.76(m,1H)、7.52(d,J=7.4Hz,1H)、7.40(d,J=8.5Hz,1H)、6.87(q,J=6.2、5.5Hz,2H)、6.84〜6.81(m,1H)、6.78〜6.73(m,2H)、6.67〜6.62(m,2H)、6.12(dd,J=8.1、5.8Hz,1H)、5.41(d,J=3.9Hz,1H)、5.11(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.73(s,2H)、4.54(d,J=15.0Hz,1H)、4.41(d,J=15.0Hz,1H)、4.12(d,J=13.6Hz,1H)、3.86(t,J=7.3Hz,1H)、3.83〜3.64(m,13H)、3.59〜3.45(m,9H)、3.44〜3.33(m,4H)、3.25(dq,J=13.3、6.8Hz,2H)、2.88〜2.80(m,1H)、2.77〜2.59(m,3H)、2.56〜2.40(m,2H)、2.30〜2.22(m,1H)、2.17〜1.88(m,5H)、1.87〜1.53(m,8H)、1.41〜1.14(m,6H)、0.91〜0.84(m,3H)。LCMS1210.72(M+H)。
実施例65:dFKBP−8の合成
N−(6−アミノヘキシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(12.7mg、0.0233mmol、1.3当量)を、2−(3−((R)−3−(3,4−ジメトキシフェニル)−1−(((S)−1−((S)−2−(3,4,5−トリメトキシフェニル)ブタノイル)ピペリジン−2−カルボニル)オキシ)プロピル)フェノキシ)酢酸(12.4mg、0.0179mmol、1当量)に0.233mLのDMF溶液(0.1M)として添加した。DIPEA(9.3マイクロリットル、0.0537mmol、3当量)及びHATU(6.8mg、0.0179mmol、1当量)を添加し、混合物を22時間撹拌した。混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、15分間の勾配)による精製によって、dFKBP−8を白色の固体(3.58mg、0.00324mmol、18%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.84〜7.77(m,1H)、7.53(d,J=7.2Hz,1H)、7.42(d,J=8.5Hz,1H)、7.26〜7.19(m,1H)、6.88(t,J=7.2Hz,1H)、6.81(d,J=8.2Hz,1H)、6.78〜6.71(m,2H)、6.64(d,J=14.8Hz,2H)、6.14〜6.09(m,1H)、5.41(s,1H)、5.12(d,J=5.2Hz,1H)、4.74(s,2H)、4.55(d,J=4.4Hz,1H)、4.42(d,J=17.2Hz,1H)、4.11(s,1H)、3.91〜3.60(m,12H)、3.27(d,J=7.0Hz,2H)、3.15(s,1H)、2.89〜2.42(m,7H)、2.23(s,1H)、2.16〜1.88(m,5H)、1.78〜1.16(m,14H)、0.91〜0.78(m,3H)。LCMS1106.69(M+H)。
実施例66:dFKBP−9の合成
N−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(10.4mg、0.0181mmol、1当量)を、2−(3−((R)−3−(3,4−ジメトキシフェニル)−1−(((S)−1−((S)−2−(3,4,5−トリメトキシフェニル)ブタノイル)ピペリジン−2−カルボニル)オキシ)プロピル)フェノキシ)酢酸(12.5mg、0.0181mmol、1当量)に0.181mLのDMF溶液(0.1M)として添加した。DIPEA(9.5マイクロリットル、0.0543mmol、3当量)及びHATU(6.9mg、0.0181mmol、1当量)を添加し、混合物を22時間撹拌した。混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、dFKBP−9を白色の固体(11.1mg、0.00982mmol、54%)として得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.80(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.53(d,J=7.3Hz,1H)、7.42(dd,J=8.4、4.1Hz,1H)、7.26〜7.20(m,1H)、6.89(t,J=7.5Hz,2H)、6.82(d,J=8.2Hz,1H)、6.79〜6.71(m,2H)、6.68〜6.60(m,2H)、6.12(dd,J=8.0、6.0Hz,1H)、5.41(s,1H)、5.15〜5.08(m,1H)、4.74(d,J=4.2Hz,2H)、4.61〜4.54(m,1H)、4.42(d,J=15.0Hz,1H)、4.12(d,J=13.3Hz,1H)、3.90〜3.58(m,14H)、3.30(d,J=2.8Hz,2H)、3.14(t,J=5.9Hz,2H)、2.91〜2.68(m,4H)、2.68〜2.40(m,4H)、2.25(d,J=13.8Hz,1H)、2.17〜2.08(m,1H)、2.08〜1.87(m,3H)、1.78〜1.43(m,8H)、1.42〜1.13(m,11H)、0.87(t,J=7.3Hz,3H)。LCMS1134.62(M+H)。
実施例67:dFKBPの合成
FKBP−酸(14.0mg、0.0202mmol、1当量)及び2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アミノ)エタン−1−アミニウム2,2,2−トリフルオロアセテート(8.7mg、0.0202mmol、1当量)を、DMF(0.202mL、0.1M)に室温で溶解した。次いで、DIPEA(17.6μL、0.101mmol、5当量)及びHATU(7.6mg、0.0200mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物をEtOAc(15mL)中に取り、飽和NaHCO(水溶液)(15mL)、水(15mL)及びブライン(3×15mL)で洗浄した。有機層をNaSOで乾燥させ、真空で濃縮した。残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(CHCl中0→10%のMeOH、R=0.6(CHCl中10%のMeOH))によって精製して、表題化合物を明るい黄色の固体(11.8mg、84%)として得た。H NMR(500MHz,MeOD)δ7.60〜7.45(m,1H)、7.28〜7.19(m,1H)、7.10〜7.00(m,2H)、6.95〜6.87(m,2H)、6.82〜6.69(m,3H)、6.68〜6.62(m,2H)、6.59〜6.51(m,1H)、6.21〜6.15(m,1H)、5.48(d,J=5.4Hz,0.4H)、5.42(d,J=5.4Hz,0.6H)、5.08(dd,J=12.5、5.4Hz,0.6H)、4.99(dd,J=12.6、5.4Hz,0.6H)、4.70(dd,J=15.1、8.9Hz,0.4H)、4.62(d,J=15.0Hz,1H)、4.58〜4.46(m,0.4H)、4.43(dd,J=14.9、3.2Hz,1H)、4.11(t,J=14.5Hz,1H)、3.88〜3.70(m,15H)、3.59〜3.48(m,1H)、3.43〜3.29(m,2H)、2.85〜2.74(m,1H)、2.74〜2.61(m,2H)、2.56〜2.35(m,3H)、2.23(d,J=13.6Hz,1H)、2.10〜1.98(m,3H)、1.98〜1.87(m,1H)、1.80〜1.70(m,1H)、1.68〜1.57(m,2H)、1.57〜1.38(m,2H)、1.26〜1.10(m,2H)、0.88(t,J=7.3Hz,3H)、回転異性体;C536214[M+H]のMS(ESI)算出値992.43、実測値992.58。
実施例68:ジアミノエチル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートの合成
(1)tert−ブチル(2−(2−クロロアセトアミド)エチル)カルバメートの合成
tert−ブチル(2−アミノエチル)カルバメート(0.40mL、2.5mmol、1当量)を、THF(25mL、0.1M)及びDIPEA(0.44mL、2.5mmol、1当量)に0℃で溶解した。塩化クロロアセチル(0.21mL、2.75mmol、1.1当量)を添加し、混合物を室温まで温めた。22時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮し、白色の固体(0.66g、定量的収率)を得て、これを更に精製することなく次の工程に繰り越した。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.16(s,1H)、4.83(s,1H)、4.04(s,2H)、3.42(q,J=5.4Hz,2H)、3.32(q,J=5.6Hz,2H)、1.45(s,9H)。LCMS237.30(M+H)。
(2)ジメチル3−(2−((2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)エチル)アミノ)−2−オキソエトキシ)フタレートの合成
tert−ブチル(2−(2−クロロアセトアミド)エチル)カルバメート(0.66g、1当量)をMeCN(17mL、0.15M)に溶解した。次いで、ジメチル3−ヒドロキシフタレート(0.578g、2.75mmol、1.1当量)及び炭酸セシウム(2.24g、6.88mmol、2.75当量)を添加した。フラスコに還流冷却器を取り付け、80℃に32時間加熱した。次いで、混合物を室温まで冷却し、EtOAcで希釈し、水で3回洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、15分間の勾配にわたって0%→15%のMeOH/DCM)による精製によって、黄色の固体(0.394g、0.960mmol、2工程にわたって38%)を得た。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.65〜7.56(m,1H)、7.50〜7.41(m,1H)、7.27(s,1H)、7.11(dd,J=8.4、4.1Hz,2H)、5.17(s,1H)、4.57(d,J=6.3Hz,2H)、3.94(s,2H)、3.88(s,2H)、3.40(p,J=5.8Hz,4H)、3.32〜3.19(m,4H)、1.39(d,J=5.7Hz,13H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ168.37、168.23、165.73、156.13、154.71、131.24、130.09、124.85、123.49、117.24、79.42、68.48、53.22、52.83、40.43、39.54、28.44。LCMS411.45(M+H)。
(3)ジアミノエチル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートの合成
ジメチル3−(2−((2−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)エチル)アミノ)−2−オキソエトキシ)フタレート(0.39g、0.970mmol、1当量)をEtOH(9.7mL、0.1M)に溶解した。3M NaOH水溶液(0.97mL、2.91mmol、3当量)を添加し、混合物を80℃に3時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、50mLのDCM、5mLの1M HCl及び20mLの水で希釈した。層を分離し、有機層を20mLの水で洗浄した。次いで、合わせた水層を50mLのクロロホルムで3回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮し、黄色の固体(0.226g)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。LCMS383.36。
得られた黄色の固体(0.226g)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(0.102g、0.6197mmol、1当量)をピリジン(6.2mL、0.1M)に溶解し、110℃に16時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、減圧下で濃縮し、tert−ブチル(2−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)エチル)カルバメートを難溶性の黒色のタール(0.663g)として得て、これを(難溶性のために)精製することなく繰り越した。LCMS475.42(M+H)。
粗tert−ブチル(2−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)エチル)カルバメートをTFA(10mL)に溶解し、50℃に3.5時間加熱した後、減圧下で濃縮した。分取HPLCによる精製によって、赤色の油(176.7mg、0.362mmol、3工程で37%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.85〜7.76(m,1H)、7.57〜7.50(m,1H)、7.48〜7.41(m,1H)、5.13(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.81(s,2H)、3.62(td,J=5.6、1.8Hz,2H)、3.14(t,J=5.8Hz,2H)、2.97(s,1H)、2.80〜2.66(m,2H)、2.15(dddd,J=10.1、8.0、5.8、2.8Hz,1H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ173.09、170.00、169.99、166.78、166.62、154.93、136.88、133.46、120.71、117.93、116.77、68.29、49.17、39.37、38.60、30.73、22.19。LCMS375.30(遊離塩基についてM+H)。
実施例69:ジアミノブチル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートの合成
ジアミノブチル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートを、Fischer et al. Nature, 2014, 512, 49-53の手順に従って調製した。
実施例70:ジアミノヘキシル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートの合成
(1)tert−ブチル(6−(2−クロロアセトアミド)ヘキシル)カルバメートの合成
tert−ブチル(6−アミノヘキシル)カルバメート(0.224mL、1.0mmol、1当量)をTHF(10mL、0.1M)に溶解した。DIPEA(0.17mL、1.0mmol、1当量)を添加し、混合物を0℃に冷却した。塩化クロロアセチル(88マイクロリットル、1.1mmol、1.1当量)を添加し、混合物を室温まで温め、18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、白色の固体(0.2691g、0.919mmol、92%)を得た。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ6.60(s,1H)、4.51(s,1H)、4.05(s,2H)、3.30(q,J=6.9Hz,2H)、3.11(d,J=6.7Hz,2H)、1.57〜1.46(m,4H)、1.44(s,9H)、1.38〜1.32(m,4H)。LCMS293.39(M+H)。
(2)ジメチル3−(2−((6−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)ヘキシル)アミノ)−2−オキソエトキシ)フタレートの合成
tert−ブチル(6−(2−クロロアセトアミド)ヘキシル)カルバメート(0.2691g、0.919mmol、1当量)をMeCN(9.2mL、0.1M)に溶解した。ジメチル3−ヒドロキシフタレート(0.212g、1.01mmol、1.1当量)及び炭酸セシウム(0.823g、2.53mmol、2.75当量)を添加した。フラスコに還流冷却器を取り付け、80℃に14時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、EtOAcで希釈し、水で3回希釈し、EtOAcで1回逆抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、12gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、15分間の勾配)によって精製して、黄色の油(0.304g、0.651mmol、71%)を得た。
H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.66〜7.58(m,1H)、7.44(td,J=8.2、1.6Hz,1H)、7.15〜7.08(m,1H)、6.96(s,1H)、4.56(s,2H)、3.92(t,J=1.6Hz,3H)、3.88(t,J=1.6Hz,3H)、3.27(q,J=6.9Hz,2H)、3.10〜3.00(m,2H)、1.41(s,13H)、1.33〜1.22(m,4H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ167.97、167.37、165.58、155.95、154.37、130.97、129.74、124.94、123.26、116.81、78.96、68.04、52.89、52.87、52.69、52.67、40.41、38.96、29.88、29.13、28.39、26.33、26.30。LCMS467.49。
(3)ジアミノヘキシル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートの合成
ジメチル3−(2−((6−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)ヘキシル)アミノ)−2−オキソエトキシ)フタレート(0.304g、0.651mmol、1当量)をEtOH(6.5mL、0.1M)に溶解した。3M NaOH水溶液(0.65mL、1.953mmol、3当量)を添加し、混合物を80℃に18時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、50mLのDCM及び10mLの0.5M HClで希釈した。層を分離し、有機層を20mLの水で洗浄した。次いで、合わせた水層をクロロホルムで3回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮し、黄色の発泡体(0.290g)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。LCMS439.47。
得られた黄色の固体(0.290g)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(0.113g、0.69mmol、1当量)をピリジン(6.9mL、0.1M)に溶解し、110℃に17時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、減圧下で濃縮し、tert−ブチル(6−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)ヘキシル)カルバメートを黒色の固体(0.4216g)として得て、これを(難溶性のために)精製することなく繰り越した。LCMS531.41(M+H)。
粗tert−ブチル(6−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)ヘキシル)カルバメート(0.4216g)をTFA(10mL)に溶解し、50℃に2時間加熱した。混合物を減圧下で濃縮した。分取HPLCによる精製によって、褐色の固体(379.2mg)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.79(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.52(d,J=7.2Hz,1H)、7.42(d,J=8.4Hz,1H)、5.13(dd,J=12.6、5.5Hz,1H)、4.75(s,2H)、3.32(t,J=7.6Hz,2H)、2.96〜2.89(m,2H)、2.89〜2.65(m,3H)、2.16(ddt,J=10.4、5.4、2.9Hz,1H)、1.63(dp,J=20.6、7.1Hz,4H)、1.51〜1.34(m,4H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.57、171.42、169.90、168.24、167.79、156.23、138.23、134.87、121.69、119.22、117.98、69.36、50.53、40.64、39.91、32.14、30.01、28.44、27.23、26.96、23.63。LCMS431.37(M+H)。
実施例71:ジアミノオクチル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートの合成
(1)tert−ブチル(8−(2−クロロアセトアミド)オクチル)カルバメートの合成
オクタン−1,8−ジアミン(1.65g、11.45mmol、5当量)をクロロホルム(50mL)に溶解した。クロロホルム(10mL)中の二炭酸ジ−tert−ブチル(0.54g、2.291mmol、1当量)の溶液を室温でゆっくりと添加し、16時間撹拌した後、減圧下で濃縮した。固体物質をDCM、MeOH、EtOAc及び0.5N NH(MeOH)の混合物に再懸濁し、セライトを通して濾過し、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、12g NH−シリカカラム、15分間の勾配にわたって0%→15%のMeOH/DCM)による精製によって、所望の生成物と出発物質との混合物(1.75g)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。
この混合物をTHF(72mL)及びDIPEA(1.25mL、7.16mmol)に溶解し、0℃に冷却した。塩化クロロアセチル(0.63mL、7.88mmol)を添加し、混合物を室温まで温めた。16時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水及びブラインで洗浄した。得られた混合物をカラムクロマトグラフィー(ISCO、シリカへのドライロード(dry load)、24gカラム、21分間の勾配にわたって0%→100%のEtOAc/ヘキサン)によって精製して、白色の固体(0.56g、1.745mmol、2工程にわたって76%)を得た。
H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ6.55(s,1H)、4.48(s,1H)、4.05(s,2H)、3.30(q,J=6.9Hz,2H)、3.10(d,J=6.2Hz,2H)、1.44(s,12H)、1.31(s,9H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ165.86、156.14、77.36、42.86、40.73、40.00、30.18、29.44、29.26、28.59、26.86、26.82。LCMS321.34(M+H)。
(2)ジメチル3−(2−((8−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)オクチル)アミノ)−2−オキソエトキシ)フタレートの合成
tert−ブチル(8−(2−クロロアセトアミド)オクチル)カルバメート(0.468g、1.46mmol、1当量)をMeCN(15mL、0.1M)に溶解した。ジメチル3−ヒドロキシフタレート(0.337g、1.60mmol、1.1当量)及び炭酸セシウム(1.308g、4.02mmol、2.75当量)を添加した。フラスコに還流冷却器を取り付け、80℃に18時間加熱した。混合物を室温まで冷却し水で希釈し、クロロホルムで1回及びEtOAcで2回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。
粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、24gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、20分間の勾配)によって精製して、黄色の油(0.434g、0.878mmol、60%)を得た。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.57(dd,J=7.9、0.8Hz,1H)、7.40(t,J=8.1Hz,1H)、7.07(dd,J=8.4、0.7Hz,1H)、6.89(t,J=5.3Hz,1H)、4.63(s,1H)、4.52(s,2H)、3.88(s,3H)、3.83(s,3H)、3.22(q,J=6.9Hz,2H)、3.01(q,J=6.4Hz,2H)、1.36(s,12H)、1.20(s,9H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ167.89、167.29、165.54、155.97、154.38、130.95、129.69、124.96、123.23、116.86、78.82、68.05、52.83、52.82、52.66、52.64、40.54、39.06、29.97、29.19、29.10、29.06、28.40、26.66、26.61。LCMS495.42(M+H)。
(3)ジアミノオクチル−アセチル−O−サリドマイドトリフルオロアセテートの合成
ジメチル3−(2−((8−((tert−ブトキシカルボニル)アミノ)オクチル)アミノ)−2−オキソエトキシ)フタレート(0.434g、0.878mmol、1当量)をEtOH(8.8mL、0.1M)に溶解した。3M NaOH水溶液(0.88mL、2.63mmol、3当量)を添加し、混合物を80℃に24時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、50mLのDCM及び10mLの0.5M HClで希釈した。層を分離し、有機層を20mLの水で洗浄した。次いで、合わせた水層をクロロホルムで3回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮し、黄色の固体(0.329g)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。LCMS467.41。
得られた黄色の固体(0.329g)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(0.121g、0.734mmol、1当量)をピリジン(7.3mL、0.1M)に溶解し、110℃に20時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、減圧下で濃縮し、tert−ブチル(8−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)オクチル)カルバメートを黒色のタール(0.293g)として得て、これを(難溶性のために)精製することなく繰り越した。LCMS559.45(M+H)。
粗tert−ブチル(8−(2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド)オクチル)カルバメート(0.293g)をTFA(10mL)に溶解し、50℃に4時間加熱した。混合物を減圧下で濃縮した。分取HPLCによる精製によって、褐色の残渣(114.69mg、3工程で23%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.84〜7.78(m,1H)、7.54(d,J=7.3Hz,1H)、7.43(d,J=8.5Hz,1H)、5.13(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.76(s,2H)、3.32(d,J=4.1Hz,1H)、3.30(d,J=3.3Hz,1H)、2.94〜2.84(m,3H)、2.80〜2.70(m,2H)、2.19〜2.12(m,1H)、1.67〜1.55(m,4H)、1.40〜1.34(m,8H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ174.57、171.37、169.85、168.26、167.78、156.26、138.22、134.91、121.70、119.28、117.97、69.37、50.57、40.76、40.08、32.17、30.19、30.05、30.01、28.52、27.68、27.33、23.63。LCMS459.41(M+H)。
実施例72:N−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの合成
(1)tert−ブチル(1−クロロ−2−オキソ−7,10,13−トリオキサ−3−アザヘキサデカン−16−イル)カルバメートの合成
tert−ブチル(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)カルバメート(1.0g、3.12mmol、1当量)をTHF(31mL、0.1M)に溶解した。DIPEA(0.543mL、3.12mmol、1当量)を添加し、溶液を0℃に冷却した。塩化クロロアセチル(0.273mL、3.43mmol、1.1当量)を添加し、混合物を室温までゆっくりと温めた。24時間後に混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮し、黄色の油(1.416g)を得て、これを更に精製することなく繰り越した。
H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.24(s,1H)、5.00(s,1H)、3.98〜3.89(m,2H)、3.54(dddt,J=17.0、11.2、5.9、2.2Hz,10H)、3.47〜3.40(m,2H)、3.37〜3.31(m,2H)、3.17〜3.07(m,2H)、1.79〜1.70(m,2H)、1.67(p,J=6.1Hz,2H)、1.35(s,9H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ165.83、155.97、78.75、70.49、70.47、70.38、70.30、70.14、69.48、42.61、38.62、38.44、29.62、28.59、28.40。LCMS397.37(M+H)。
(2)ジメチル3−((2,2−ジメチル−4,20−ジオキソ−3,9,12,15−テトラオキサ−5,19−ジアザヘニコサン−21−イル)オキシ)フタレートの合成
tert−ブチル(1−クロロ−2−オキソ−7,10,13−トリオキサ−3−アザヘキサデカン−16−イル)カルバメート(1.41g、3.12mmol、1当量)をMeCN(32mL、0.1M)に溶解した。ジメチル3−ヒドロキシフタレート(0.721g、3.43mmol、1.1当量)及び炭酸セシウム(2.80g、8.58mmol、2.75当量)を添加した。フラスコに還流冷却器を取り付け、80℃に19時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、水で希釈し、クロロホルムで1回及びEtOAcで2回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、24gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、22分間の勾配)によって精製して、黄色の油(1.5892g、2.78mmol、2工程で89%)を得た。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ7.52(d,J=7.8Hz,1H)、7.35(t,J=8.1Hz,1H)、7.04(d,J=8.3Hz,1H)、7.00(t,J=5.3Hz,1H)、5.06(s,1H)、4.46(s,2H)、3.83(s,3H)、3.78(s,3H)、3.47(ddd,J=14.9、5.5、2.8Hz,8H)、3.39(dt,J=9.4、6.0Hz,4H)、3.29(q,J=6.5Hz,2H)、3.09(d,J=6.0Hz,2H)、1.70(p,J=6.5Hz,2H)、1.63(p,J=6.3Hz,2H)、1.31(s,9H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ167.68、167.36、165.45、155.93、154.41、130.87、129.60、125.01、123.20、117.06、78.60、70.40、70.17、70.06、69.39、68.67、68.25、52.77、52.57、38.38、36.58、29.55、29.20、28.34。LCMS571.47(M+H)。
(3)N−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテートの合成
ジメチル3−((2,2−ジメチル−4,20−ジオキソ−3,9,12,15−テトラオキサ−5,19−ジアザヘニコサン−21−イル)オキシ)フタレート(1.589g、2.78mmol、1当量)をEtOH(14mL、0.2M)に溶解した。3M NaOH水溶液(2.8mL、8.34mmol、3当量)を添加し、混合物を80℃に22時間加熱した。次いで、混合物を室温まで冷却し、50mLのDCM及び20mLの0.5M HClで希釈した。層を分離し、有機層を25mLの水で洗浄した。水層を合わせ、50mLのクロロホルムで3回抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮し、1.53gの物質を得て、これを更に精製することなく繰り越した。LCMS553.44。
得られた物質(1.53g)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(0.480g、2.92mmol、1当量)をピリジン(11.7mL、0.25M)に溶解し、110℃に17時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、減圧下で濃縮し、粗tert−ブチル(1−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)−2−オキソ−7,10,13−トリオキサ−3−アザヘキサデカン−16−イル)カルバメートを黒色のスラッジ(3.1491g)として得て、これを更に精製することなく繰り越した。LCMS635.47。
粗tert−ブチル(1−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)−2−オキソ−7,10,13−トリオキサ−3−アザヘキサデカン−16−イル)カルバメート(3.15g)をTFA(20mL)に溶解し、50℃に2.5時間加熱した。混合物を室温まで冷却し、MeOHで希釈し、減圧下で濃縮した。物質を分取HPLCによって精製して、N−(3−(2−(2−(3−アミノプロポキシ)エトキシ)エトキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミドトリフルオロアセテート(1.2438g、1.9598mmol、3工程で71%)を暗赤色の油として得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.77(dd,J=8.3、7.5Hz,1H)、7.49(d,J=7.3Hz,1H)、7.40(d,J=8.5Hz,1H)、5.12(dd,J=12.8、5.5Hz,1H)、4.75(s,2H)、3.68〜3.51(m,12H)、3.40(t,J=6.8Hz,2H)、3.10(t,J=6.4Hz,2H)、2.94〜2.68(m,3H)、2.16(dtd,J=12.6、5.4、2.5Hz,1H)、1.92(p,J=6.1Hz,2H)、1.86〜1.77(m,2H)。13C NMR(100MHz,cdod)δ173.17、169.97、168.48、166.87、166.30、154.82、136.89、133.41、120.29、117.67、116.58、69.96、69.68、69.60、68.87、68.12、67.92、49.19、38.62、36.14、30.80、28.92、26.63、22.22。LCMS536.41(M+H)。
実施例73:N−(6−アミノヘキシル)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボキサミドの合成
(1)2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボン酸の合成
1,3−ジオキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(0.192g、1mmol、1当量)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(0.165g、1mmol、1当量)をDMF(2.5mL)及び酢酸(5mL)に溶解し、80℃に24時間加熱した。次いで、混合物を減圧下で濃縮し、EtOHで希釈すると、沈殿物がゆっくりと形成された。沈殿物をEtOHで2回洗浄して、白色の固体(84.8mg、0.28mmol、28%)を得た。H NMR(400MHz,DMSO−d)δ13.74(s,1H)、11.12(s,1H)、8.39(dd,J=7.8、1.4Hz,1H)、8.26(s,1H)、8.04(d,J=7.8Hz,1H)、5.18(dd,J=12.8、5.4Hz,1H)、2.93〜2.88(m,1H)、2.84(d,J=4.7Hz,0H)、2.66〜2.50(m,2H)、2.12〜1.99(m,1H)。LCMS303.19(M+H)。
(2)tert−ブチル(6−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボキサミド)ヘキシル)カルバメートの合成
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボン酸(22.7mg、0.0751mmol、1当量)及びHATU(31.4mg、0.0826mmol、1.1当量)をDMF(0.75mL)に溶解した。5分後にDIPA(39.2マイクロリットル、0.225mmol、3当量)を添加した。更に5分後にtert−ブチル(6−アミノヘキシル)カルバメート(19.5mg、0.0901mmol、1.2当量)をDMF溶液(0.75mL)として添加した。混合物を20時間撹拌した後、EtOAcで希釈した。有機層をブラインで3回洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下で濃縮した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、4gカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)による精製によって、黄色の油(17.18mg、0.03432mmol、46%)を得た。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ8.29(d,J=6.2Hz,2H)、8.16(s,1H)、7.94(d,J=8.4Hz,1H)、6.91(s,1H)、5.00(dd,J=12.4、5.3Hz,1H)、4.58(s,1H)、3.47(q,J=6.7Hz,2H)、3.14(q,J=8.5、7.3Hz,2H)、2.97〜2.69(m,3H)、2.17(ddd,J=10.4、4.8、2.6Hz,1H)、1.65(p,J=6.9Hz,2H)、1.53〜1.32(m,15H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ174.69、170.77、167.86、166.67、165.27、156.49、141.06、133.95、133.71、132.13、124.21、122.27、77.36、49.71、39.75、31.54、30.27、29.22、28.57、25.70、25.37、22.73。LCMS501.28(M+H)。
(3)N−(6−アミノヘキシル)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボキサミドの合成
tert−ブチル(6−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−5−カルボキサミド)ヘキシル)カルバメート(17.18mg、0.343mmol、1当量)をTFA(1mL)に溶解し、50℃に2時間加熱した。混合物を減圧下で濃縮し、黄色の油(13.29mg)を得たが、これは更に精製することなく十分に純粋であるとみなされた。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ8.27(dd,J=9.3、1.3Hz,2H)、7.99(d,J=7.6Hz,1H)、5.18(dd,J=12.5、5.4Hz,1H)、3.48〜3.40(m,2H)、2.96〜2.84(m,3H)、2.76(ddd,J=17.7、8.1、3.7Hz,2H)、2.20〜2.12(m,1H)、1.75〜1.63(m,4H)、1.53〜1.43(m,4H)。LCMS401.31(M+H)。
実施例74:2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸の合成
(1)2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ヒドロキシイソインドリン−1,3−ジオンの合成
4−ヒドロキシイソベンゾフラン−1,3−ジオン(0.773g、4.71mmol、1当量)及び3−アミノピペリジン−2,6−ジオン塩酸塩(0.775g、4.71mmol、1当量)をピリジン(19mL)に溶解し、110℃に16時間加熱した。混合物を減圧下で濃縮し、カラムクロマトグラフィー(ISCO、12gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、オフホワイト色の固体(1.14g、4.16mmol、88%)を得た。H NMR(400MHz,DMSO−d)δ11.19(s,1H)、11.07(s,1H)、7.65(dd,J=8.3、7.3Hz,1H)、7.31(d,J=7.2Hz,1H)、7.24(d,J=8.4Hz,1H)、5.07(dd,J=12.8、5.4Hz,1H)、2.88(ddd,J=17.7、14.2、5.4Hz,1H)、2.63〜2.50(m,2H)、2.11〜1.95(m,1H)。LCMS275.11(M+H)。
(2)tert−ブチル2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセテートの合成
2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−4−ヒドロキシイソインドリン−1,3−ジオン(218.8mg、0.798mmol、1当量)をDMF(8mL)に溶解した。炭酸カリウム(165.9mg、1.20mmol、1.5当量)、続いてtert−ブチルブロモアセテート(118マイクロリットル、0.798mmol、1当量)を添加し、混合物を室温で3時間撹拌した。混合物をEtOAcで希釈し、水で1回及びブラインで2回洗浄した。カラムクロマトグラフィー(ISCO、12gシリカカラム、0%→100%のEtOAc/hex、17分間の勾配)による精製によって、白色の固体(0.26g、0.669mmol、84%)を得た。H NMR(400MHz,クロロホルム−d)δ8.74(s,1H)、7.61(dd,J=8.4、7.3Hz,1H)、7.46〜7.41(m,1H)、7.06(d,J=8.3Hz,1H)、4.98〜4.92(m,1H)、4.74(s,2H)、2.83〜2.69(m,3H)、2.12〜2.04(m,1H)、1.43(s,9H)。13C NMR(100MHz,cdcl)δ171.58、168.37、166.96、166.87、165.49、155.45、136.27、133.89、119.78、117.55、116.83、83.05、66.52、49.20、31.37、28.03、22.55。LCMS411.23(M+Na)。
(3)2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)酢酸の合成
tert−ブチル2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセテート(47.5mg、0.122mmol、1当量)をTFA(1.3mL)に室温で溶解した。3時間後に混合物をDCMで希釈し、減圧下で濃縮し、白色の固体(42.27mg)を得たが、これは更に精製することなく十分に純粋であるとみなされた。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.76(dd,J=8.5、7.3Hz,1H)、7.50(d,J=7.3Hz,1H)、7.34(d,J=8.5Hz,1H)、5.11(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.96(s,2H)、2.87(ddd,J=17.8、14.2、5.0Hz,1H)、2.80〜2.65(m,2H)、2.18〜2.09(m,1H)。LCMS333.15(M+H)。
実施例75:dBET1処理はBRD4レベルを下方調節する
dBET1はBRD4の第1のブロモドメインに対して強力な結合を示したが(BRD4(1);IC50=20nM)、エピマーdBET1(R)は比較的不活性であった(IC50=6.9μM)(図1C)。比較すると、IC50 JQ1及びJQ1−Rはそれぞれ20nM及び8.8μMである(図1C)。選択性プロファイリングにより、ファージディスプレイ及び置換によって研究した32個のブロモドメインにおいて強力かつBET特異的な標的エンゲージメントが確認された(図11A)(表2)。
BRD4(1)に結合したdBET1の高分解能結晶構造(1.0Å)により、JQ1に匹敵する分子認識様式が確認された(図1D及び図1G)。dBET1リガンドの規則的な密度はブタンスペーサーの最初の2つの炭素原子にのみ見られ、コンジュゲートしたフタルイミドの配座柔軟性が示唆された。dBET1−BRD4(1)結晶構造及び近年報告されたサリドマイドに結合するCRBNの構造(E. S. Fischer et al., Nature 512, 49-53 (2014))を用いて、三重複合体形成の実現性をコンピューターによりモデル化した。dBET1の拡張立体配座は、破壊的な立体相互作用なしに多数の抽出された立体配座において規則的なBRD4(1)及びCRBNを架橋することが可能であった(図1E)。CRL複合体のモジュール性質から、BRD4の化学的動員がCRBN依存性分解をもたらし得ることが示唆される(E. S. Fischer et al., Cell 147, 1024-1039 (2011)、M. D. Petroski, R. J. Deshaies, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 6, 9-2)。
dBET1の化学アダプター機能を、AlphaScreen技術を用いた組み換えヒトCRBN−DDB1及びBRD4の均一な近接アッセイによって判断した。図11Bに示されるように、アクセプタ(CRBN結合)及びドナー(BRD4結合)ビーズの近接性から生じる発光は低い(10nM〜100nM)濃度のdBET1の存在下で増大した。より高いdBET1濃度(例えば1μM)では、過剰なdBET1によるCRBN及びBRD4結合部位の独立した占有率と一致して発光は減少した(フック効果)。化学アダプター機能の阻害は、各々立体特異的な遊離JQ1又はサリドマイドとの競合的コインキュベーションによって達成された(図11C)。
細胞におけるBRD4に対するdBET1の影響を機能的に判断するために、ヒトAML細胞株(MV4−11)を漸増濃度のdBET1で18時間処理し、イムノブロットにより内因性BRD4レベルについてアッセイした。明白なBRD4の喪失(85%超)が100nMと低いdBET1の濃度とともに観察された(図1F)。MV4−11細胞をDMSO又は漸増濃度のdBET1で24時間処理し、RIPAバッファーに溶解させた。イムノブロッティングを指定のタンパク質に対して行った。加えて、BRD4及びc−MYCレベルを漸増濃度のdBET1で処理した細胞におけるビンキュリンレベルに対して定量化した(図1H)。特に、BRD4と物理的に相互作用するタンパク質であるJMJD6は影響を受けなかった(図1H)。さらに、通常は転写制御機構によりBRD4阻害剤処理後に増大するHEXIM1レベルは同様にやや減少した(図1H)。
JQ1によるBRD4ブロモドメインの分子認識は立体特異的であり、(+)−JQ1エナンチオマーのみが活性であり、(−)−JQ1エナンチオマー(JQ1R)は不活性である(図1A〜図1C及び図5)。エピマーdBET1(R)化合物はBRD4結合を欠き(相同アッセイにおいて300倍超弱い結合)、不活性であり、BRD4分解が標的タンパク質エンゲージメントを必要とすることが実証された(図2A)。
実施例76:dBET1によるBRD2、BRD3及びBRD4の分解
MV4−11細胞をDMSO又は100nM dBET1で1時間〜24時間の様々な時点について処理した。細胞をRIPAバッファーに溶解させた。イムノブロッティングを行った。BRD3及びBRD4は同等の動態を示したが、BRD2レベルはより遅い時点でより急速に平衡化した。結果を図2Kに示す。
BRD4タンパク質安定性に対する用量反応性効果を定量化するために、細胞数正規化免疫蛍光ベース高含量アッセイを接着性ヒト癌細胞株(SUM149乳癌細胞)において開発した(図2B)。総BRD4の強力な下方調節が、dBET1(R)に対する明らかな活性なしにdBET1について観察された(EC50=430nM)。これらの観察結果をSUM149においてイムノブロットによって確認し、アッセイのベースライン正規化に用いた(図2C)。付加的な培養接着性及び非接着性ヒト癌細胞株は同等の応答を示した(SUM159、MOLM13)(図2I及び図2J)。
BRD4分解の動態を、経時的実験でMV4−11細胞において100nM dBET1を用いて決定した。BRD4の著しい減少が1時間で観察され、完全な分解が2時間の処理で観察された(図2D)。dBET1によるBRD4の分解は、24時間でMV4−11細胞増殖に対する強力な阻害効果と関連していた(ATP含量によって測定される、IC50=0.14μM、IC50=1.1μMと比較される(図2E)、この及び他のMLL再構成を伴う白血病のモデルにおいて報告されているBRD4のRNAサイレンシングの顕著な阻害効果と一致する(J. Zuber et al., Nature 478, 524-528 (2011))。さらに、dBET1はカスパーゼ切断の活性化(Caspase−GLO)(図2F)、ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ(PARP)の切断及びカスパーゼ−3の切断(図2N)及びアネキシンV染色(図2M)によって測定されるようにMV4−11において強力なアポトーシス結果を誘導した。dBET1に対するアポトーシス応答がDHL4(B細胞リンパ腫)を含む付加的な培養ヒト細胞株において確認された(図2F)。次いで、アポトーシス応答の動態研究を4時間又は8時間培養し、続いて薬物ウォッシュアウトを行ったMV4−11細胞において行った。アポトーシスの誘導を24時間の時点で判断した。JQ1によるパルス処理(pulsed treatment)は顕著なアポトーシス応答をもたらさなかったが、僅か4時間のdBET1処理後にアポトーシスの顕著な増大が観察され、8時間の時点で増強された(図2P及び図2Q)。
培養細胞株のdBET1に対する急速な生化学的活性及び強固なアポトーシス応答により、初代ヒトAML細胞に対する影響を判断する実現性が確立された(ex vivo増殖は短期培養では無視することができる)。初代白血病患者芽球のdBET1への曝露により、BRD4の用量比例減少(イムノブロット)(図2G)及びアポトーシスの誘導(アネキシンV染色)(図2H及び図2L)が誘発された。重要なことには、dBET1によるBRD4分解の影響は、初代AML細胞及びAML細胞株においてJQ1によるBRD4の置換よりも顕著に大きなアポトーシス応答を誘発した(図2H)。総合すると、これらのデータからリガンド依存性標的タンパク質分解が実証され、標的分解がドメイン特異的標的阻害よりも顕著な生物学的結果を誘発し得ることが支持された。
BRD4分解の治療効果を、確立されたヒトMV4−11白血病細胞のネズミ異種移植片モデルにおいて反復投与dBET1の耐容性及び抗腫瘍有効性を評価することによってin vivoで判断した。担腫瘍マウスを、腹腔内注射(1日50mg/kg)によって投与されるdBET1又はビヒクル対照で処理した。14日間の療法後に初めの腫瘍が腫瘍サイズの制度的限界に達し、有効性並びにBRD4安定性及び機能の調節の相対評価のために研究を終了した。dBET1の投与は、連続容積測定によって決定されるように腫瘍進行を軽減し(図12A)、事後分析によって判断される腫瘍重量を減少させた(図12B)。MYCの下方調節に伴ったBRD4の急性薬力学的分解が、dBET1(50mg/kg IP)による1回目又は2回目の毎日治療の4時間後にイムノブロットによって観察された(図12C)。結果をdBET1に対する14日間の反復投与曝露後にBRD4及びMYCについて定量的免疫組織化学によって確認した(図12D)。統計的に有意なBRD4の不安定化、MYCの下方調節及び増殖の阻害(Ki67染色)が、切除腫瘍においてビヒクル対照と比較してdBET1により観察された(図12D及び図12E)。dBET1(50mg/kg IP)の薬物動態研究により、in vitroで観察されるBRD4ノックダウンについてのEC50(100nM未満)を超えるin vivoでの適切な薬物曝露(Cmax=392nM;図13B)が裏付けられた。特に、2週間のdBET1は体重、白血球数、ヘマトクリット値又は血小板数に対する大幅な影響なしにマウスによる良好な耐容性を示した(図13C及び図13D)。
実施例77:分解はdBET1に特異的である
dBET1誘導性BRD4分解の機構を批判的に判断するために、プロテアソーム機能、BRD4結合及びCRBN結合に対する要件を化学的遺伝及び遺伝子編集アプローチを用いて検討した。JQ1又はサリドマイドのいずれか単独による処理は、MV4−11細胞においてBRD4分解を誘導するのに不十分であった(図3A及び図3E)。BRD4安定性は不可逆的プロテアソーム阻害剤カルフィルゾミブ(0.4μM)での前処理によって救済され、プロテアソーム機能がdBET1媒介性BRD4分解において必要とされることが示された(図3B及び図3F)。過剰なJQ1又はサリドマイドによる前処理はdBET1誘導性BRD4分解を無効にし、BRD4及びCRBNの両方に対する要件が更に確認された(図3B及び図3F)。カリンベースのユビキチンリガーゼは、前進型E3リガーゼ活性及び標的ポリユビキチン化のためにカリンサブユニットのNEDD化を必要とする(G. Lu, et al., Science 343, 305-309 (2014)、R. I. Sufan, M. Ohh, Neoplasia 8, 956-963 (2006))。選択的NAE1阻害剤MLN4924(29)による前処理はdBET1曝露からBRD4安定性を救済し、活性RING E3リガーゼ活性に対する依存性が更に支持された(図3C)。さらに、CRISPR/Cas9技術によるCRBNの改変ノックアウトを特徴とする近年公表されているヒトMM細胞株(MM1.S−CRBN−/−)を用いて(G. Lu, et al., Science 343, 305-309 (2014))、CRBNの細胞要件が確認された(図3D)。これらのデータから、dBET1によるBRD4のCRBN依存性プロテアソーム分解が示された。
実施例78:発現プロテオミクスによる高選択的BETブロモドメイン分解
不偏性プロテオームワイドアプローチを、タンパク質安定性に対するdBET1処理の細胞結果を判断するために選択した。MV4−11細胞におけるタンパク質安定性に対するdBET1処理(250nM)による急性的影響を、JQ1(250nM)及びビヒクル(DMSO 0.0025%)対照と比較した。2時間のインキュベーションを、小分子作用の主要な即時の結果を捕捉し、BRD4標的遺伝子のトランス活性化の抑制に対して予想される交絡効果を緩和するために選択した。3つの生体サンプル反復試験片を各処理条件について、1タンパク質当たり少なくとも2つの同定スペクトルのより低いカットオフを用いた7429種のタンパク質の検出を可能にするアイソバリックタギング(isobaric tagging)を用いて調製した。JQ1によるBETブロモドメイン阻害に続いて、僅かなプロテオーム変化が観察される(図4A)。MYCのみが2時間のJQ1処理後に2倍を超えて顕著に減少し、AMLにおいてMYC発現に対して報告されているBETブロモドメイン阻害の急速かつ選択的な効果が示された(図4A及び図4C)(J. Zuber et al., Nature 478, 524-528 (2011))。JQ1処理により癌タンパク質PIM1も下方調節された(図4A及び図4C)。
dBET1による処理はMYC及びPIM1発現に対して同等の穏やかな影響を誘発した。BRD2、BRD3及びBRD4の3つの付加的なタンパク質のみが、dBET1処理細胞において有意に(p<0.001)及び顕著に(5倍超)減少することが特定された(図4B及び図4C)。BRD2、BRD3、BRD4、MYC及びPIM1の直交検出を、dBET1又はJQ1によるMV4−11白血病細胞の処理後のイムノブロットによって行った。BETファミリーメンバーはdBET1によってのみ分解され、MYC及びPIM1の存在度はdBET1及びJQ1の両方によってより低い程度まで減少した(図4D)。Ikaros TF発現に対する影響はいずれの処理条件においても観察されなかった(図4F)。MYC及びPIM1はエピゲノムプロファイリングによって下方調節の転写機構を示唆する大きな隣接エンハンサー遺伝子座と関連することが多いため(B. Chapuy et al., Cancer Cell 24, 777-790 (2013)、J. Loven et al., Cell 153, 320-334 (2013))、各々の減少した遺伝子産物についてmRNA転写産物量を測定した(図4E)。JQ1又はdBET1のいずれかによる処理はMYC及びPIM1転写を下方調節し、二次的な転写効果が示唆された。BRD4及びBRD3の転写は転写後効果と一致して影響を受けなかった。BRD2の転写はJQ1及びdBET1の影響を受け、BRD2遺伝子産物のタンパク質安定性はdBET1によってのみ影響され、転写及び転写後結果が示された。これらのデータから、プロテオームワイドの標的タンパク質安定性に対するdBET1の極めて選択的な効果が実証された。
実施例79:陰性SAR JQ1−Rev(JQI−II−079)
MV4−11細胞をDMSO、dBET1(100nM)又はRIPAバッファーに溶解した指定の濃度のJQ1−REV(JQ−II−079)のいずれかで24時間処理し、BRD4及びローディング対照としてのビンキュリンについてイムノブロットした。BRD4レベルはdBET1処理により顕著に減少したが、JQ1−Rev処理は任意の測定可能な効果を生じなかった。結果を図5に示す。
実施例80:BRD4タンパク質レベルの減少はBRD4転写レベルの測定可能な減少を生じる
MV4−11細胞を各々100nM又は1uMのdBET1又はJQ1で2時間及び4時間処理した。RNAをQiagenのRNAeasyキットを用いて単離し、VILO Superscript逆転写酵素を用いてcDNAに変換した。BRD4転写レベルをqRT−PCRによってアッセイした。結果を図6に示す。
実施例81:BRD4のdBET1媒介性分解はCRBNアベイラビリティに依存する
CBRN発現の高い野生型MM1S(MM1S WT)並びにCRBN発現を欠損するMM1S(MM1S CRBN−/−)をdBET1で8時間処理した。CRBN欠損同系細胞株は他に報告されている(Lu et al. Science 2014)。細胞をRIPAバッファーで溶解させ、BRD4及びローディング対照としてのチューブリンについてイムノブロットした。結果を図7に示す。
実施例82:BRD4発現レベルに対するdBET2の影響
MV4−11細胞をDMSO又は漸増濃度のdBET2で8時間処理し、RIPAバッファーに溶解させ、イムノブロッティングをBRD4及びローディング対照としてのチューブリンに対して行った。結果を図8に示す。
実施例83:PLK1発現レベルに対するdBET2の影響
(A)MV4−11細胞をDMSO又は漸増濃度のdBET2で8時間処理し、RIPAバッファーに溶解させ、イムノブロッティングをPLK1及びローディング対照としてのチューブリンに対して行った。(B)(A)の定量化。PLK1バンドの強度を、それぞれのチューブリンローディング対照バンドに対して定量化した。結果を図9に示す。
実施例84:dBET1はin vivoで分解を媒介した
短期治療研究を、担腫瘍マウスによりヒトMV4−11白血病ネズミ異種移植片モデルを用いて行った。定着腫瘍を有するマウスにdBET1(50mg/kg)、JQ1(50mg/kg)又はビヒクル対照を2日間にわたって1日1回投与した。BRD4安定性に対する薬力学的効果を、2回目の薬物曝露の4時間後にイムノブロットによって決定した。dBET1による処理は、JQ1及びビヒクル対照と比較してBRD4の明らかな抑制と関連していた(図2O)。細胞株及び初代患者細胞において観察される薬理学的利点を立証するように、PARP及びカスパーゼ切断についてのイムノブロッティングによって測定されるin vivoでのdBET1処理に続くアポトーシス応答の増大が観察された(図2O)。
実施例85:dFKBP−1及びdFKBP−2はFKBP12の分解を媒介した
細胞質シグナル伝達タンパク質FKBP12に対するフタルイミドコンジュゲートリガンドを合成した。FKBP12は心臓発生、リアノジン受容体機能、発癌性シグナル伝達及び他の生物学的表現型において役割を果たすことが特定されている。FKBP12指向性リガンドAP1497上の既知の許容可能な部位に、2つの化学的スペーサーを位置させ、コンジュゲートフタルイミドdFKBP−1及びdFKBP−2を作製した(図10A)。どちらもMV4−11細胞においてFKBP12存在度を強力に減少させ(図10B)、0.1μMで80%を超えるFKBP12の低減及び0.01μMで50%の低減、25μMで活性を示すコンジュゲートPROTACリガンドと比較して1000倍の効力の改善をもたらした。dBET1のように、dFKBP−1によるFKBP12の不安定化はカルフィルゾミブ、MLN4924、遊離AP1497又は遊離サリドマイドによる前処理によって救済された(図10C)。CRBN依存性分解は、CRBNについて野生型(293FT−WT)又は欠損(293FT−CRBN−/−)である既に公表されている同系293FT細胞株を用いて確立された(G. Lu, et al., Science 343, 305-309 (2014))。dFKBP−1による293FT−WT細胞の処理は、FKBP12の強力な用量依存的分解を誘導したが、293FT−CRBN−/−は影響を受けなかった(図10D)。
実施例86:dBETによるBRDタンパク質の分解
1ウェル当たり10000細胞(293T WT又は293 CRBN−/−)を、384ウェルプレートを用いて播種した。翌日、dBET化合物を様々な濃度で添加した。dBET化合物で4時間処理した後、細胞をホルムアルデヒドで固定し、0.1%tritonを用いて透過処理し、LiCorのブロッキングバッファーでブロッキングし、一次抗体(BRD4、1:1000)とともに一晩インキュベートした。翌日、細胞を洗浄し(5×TBST)、Odysee Cell Stain(1:500)を用いて染色した。ウサギBRD4抗体を認識する二次抗体を同時に添加した(1:800)。画像をLiCORの撮像装置を用いて定量化した。dBET処理後の細胞におけるBRD4レベルを図14A〜図14BBに示した。
様々な細胞(BAF3_K−RAS、SEMK2、Monomac1、MM1SWT、MM1SCRBN−/−)を漸増濃度のdBET1又はdBET6で約16時間処理した。細胞を溶解させ、溶解物をイムノブロットしてBRD4のレベルを測定した。結果を図15A〜図15D及び図15Fに示す。
MV4−11細胞を50nM dBET6又は200nM dBET18で処理した。その後24時間にわたって、BRD4又はBRD4、BRD2及びBRD3のレベルをイムノブロッティングにより様々な時点で検出した。結果を図15E及び図16Bに示す。
実施例87:dBETによるBRD及び他のタンパク質の分解
293T WT又は293 CRBN−/−を1μMのdBET2、dBET7、dBET8又はdBET10で16時間処理した。次いで、細胞を溶解させ、溶解物をイムノブロットしてBRD4及びPLK1のレベルを測定した。結果を図16Aに示す。
実施例88:dBET化合物で処理した細胞の生存能力
様々な細胞株(T−ALL(MOLT4、DND41、CUTLL1)、LOUCY、MV4−11及びRS4−11)を384ウェルプレートに1000細胞/ウェルでプレーティングした。次いで、dBET化合物を細胞に添加し、48時間インキュベートした。細胞生存能力の代わりとしてATP含量をATPlite(Promega)を用いて測定した。結果を図17A〜図17E及び図18A〜図18Cに示した。
実施例89:dGR媒介性グルココルチコイド受容体分解
DND41細胞を培養プレートにおいて成長させた。dGR3を様々な濃度で添加し、16時間インキュベートした。次いで、細胞を溶解させ、溶解物をイムノブロットしてGRレベルを測定した。結果を図19に示す。
実施例90:dBET6で処理したJQ1耐性細胞の生存能力
様々な細胞株を1ウェル当たり2000細胞の密度、50μL/ウェルの容量で384ウェル組織培養物処理プレートに播種した。JQ1又はdBET6を、JANUSワークステーション(PerkinElmer)により384ウェルピンヘッドツールを用いて1ウェル当たり100nLの薬物で添加した。72時間のインキュベーション後に細胞を生細胞数の代わりとしてATP含量を用いて、ATPlite(PerkinElmer) Luminescence Assay Kitを使用し、製造業者の取扱説明書に従って細胞生存能力について分析した。発光をEnVision 2104 Multilabel Plate Reader(PerkinElmer)で読み取った。非線形用量応答曲線をGraphpad Prismソフトウェアを用いてデータに適合し、図20〜図24に示す。dBET6のIC50及びEmaxを表3中にJQ1と比較して示す。
実施例91:JQ1耐性細胞におけるdBET6によるタンパク質分解
NGP細胞を様々な濃度のJQ1又はdBET6とともに4時間インキュベートした。BRD4、MYCN及びビンキュリン(ローディング対照として)のタンパク質レベルをBRD4(Bethyl antibodies、A301−985)、MYCN(Santa Cruz、sc−56729)及びビンキュリン(Santa Cruz、sc−25336)についてイムノブロッティングを用いて判断した。MYCNレベルをImageStudioソフトウェア(LiCor BioSciences)を用いて定量化した。パーセンテージレベルをビンキュリンレベル及びDMSOに対して正規化した。図25A及び図25Bに示されるように、JQ1ではなくdBET6がNGP細胞においてBRD4を効果的に分解する。
実施例92:JQ1耐性細胞におけるdBET6によるタンパク質分解
NGP細胞を250nM dBET6とともに0.5時間、1時間、2時間、4時間、6時間、8時間、16時間又は24時間インキュベートした。BRD2、BRD3、BRD4、MYCN及びビンキュリン(ローディング対照として)のタンパク質レベルをBRD4(Bethyl、A301−985)、BRD3(abcam、ab56342)、BRD2(Bethyl、A302−582A)、(MYCN(Santa Cruz、sc−56729)及びビンキュリン(Santa Cruz、sc−25336)についてイムノブロッティングを用いて判断した。パーセンテージレベルをビンキュリンレベル及びDMSOに対して正規化した。図25C及び図25Dに示されるように、dBET6はNGP細胞においてBRD2、BRD3、BRD4及びCMYNを効果的に分解する。
実施例93:dFKBP13〜dFKBP21及びdFKBP24〜dFKBP38の合成
(1)dFKBP13
4−((6−アミノヘキシル)オキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(5.59mg、0.015mmol、1当量)を151.63μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(10.52mg、0.015mmol、1当量)に添加した。DIPEA(7.43μl、0.045mmol、3当量)、続いてHATU(5.70mg、0.015mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(14mg、収率88.9%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(9.6mg、収率61%)を得た。
H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.77〜7.70(m,1H)、7.42〜7.36(m,2H)、7.23(ddd,J=8.9、7.5、1.7Hz,1H)、6.88(dd,J=8.6、6.0Hz,2H)、6.81〜6.78(m,2H)、6.72(d,J=2.0Hz,1H)、6.63〜6.60(m,3H)、6.11(dd,J=8.3、5.9Hz,1H)、5.39(d,J=5.4Hz,1H)、5.07(ddd,J=12.3、5.4、3.3Hz,1H)、4.41(dt,J=14.9、2.0Hz,1H)、4.21〜4.05(m,3H)、3.88〜3.74(m,9H)、3.71〜3.64(m,10H)、3.23〜3.09(m,2H)、2.80(s,2H)、2.76〜2.66(m,1H)、2.48(td,J=13.8、7.4Hz,1H)、2.11〜1.89(m,3H)、1.80〜1.54(m,2H)、1.45〜1.35(m,3H)、1.32〜1.22(m,4H)、0.86(dtd,J=9.2、7.3、2.2Hz,4H)、LCMS1050(M+H)
(2)dFKBP14
4−((10−アミノデシル)オキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(9.45mg、0.022mmol、1当量)を220μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(15.58mg、0.022mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.9μl、0.066mmol、3当量)、続いてHATU(8.36mg、0.022mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(10.2mg、収率49.5%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→15%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(9.8mg、収率40%)を得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ7.67(t,J=7.9Hz,1H)、7.45(d,J=7.3Hz,1H)、7.20(dd,J=12.2、8.2Hz,1H)、6.86(t,J=7.2Hz,1H)、6.76(dq,J=14.3、9.1、7.0Hz,3H)、6.67(d,J=9.8Hz,3H)、6.48(s,2H)、5.49(d,J=9.4Hz,2H)、4.95(dd,J=12.3、5.4Hz,1H)、4.67〜4.38(m,3H)、4.14(dt,J=24.8、6.6Hz,2H)、3.87〜3.82(m,12H)、3.79(s,2H)、3.70(d,J=2.0Hz,5H)、3.49(s,6H)、3.23(d,J=17.5Hz,3H)、3.01〜2.71(m,2H)、2.55(q,J=13.2Hz,1H)、2.13〜2.02(m,1H)、1.88(dt,J=14.9、7.9Hz,1H)、1.65(d,J=13.2Hz,2H)、1.44(d,J=9.3Hz,2H)、1.27〜1.19(m,16H)、0.90〜0.82(m,4H)、0.79(t,J=7.2Hz,1H)。LCMS1106(M+H)
(3)dFKBP15
4−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(8.91mg、0.022mmol、1当量)を220μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(15.58mg、0.022mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.91μl、0.066mmol、3当量)、続いてHATU(8.36mg、0.022mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で20時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、ピンク色の油(16.6mg、収率69.8%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、ピンク色の油(13.21mg、収率55.54%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.40(dd,J=7.3、2.3Hz,1H)、7.36〜7.31(m,1H)、7.22(ddd,J=8.7、7.4、1.7Hz,1H)、6.91〜6.87(m,2H)、6.81(dd,J=8.1、4.4Hz,1H)、6.76〜6.70(m,2H)、6.66〜6.61(m,3H)、4.29〜4.20(m,2H)、3.88(t,J=7.3Hz,1H)、3.80〜3.77(m,7H)、3.71〜3.68(m,9H)、3.57〜3.39(m,1H)、3.37(s,3H)、3.24(q,J=7.4Hz,1H)、2.86〜2.76(m,1H)、2.75〜2.60(m,3H)、2.56〜2.38(m,1H)、2.30〜2.16(m,2H)、2.09〜1.86(m,2H)、1.74(dt,J=13.9、7.0Hz,1H)、1.69〜1.53(m,2H)、1.42〜1.36(m,4H)、1.30(s,6H)、1.17(d,J=6.2Hz,1H)、0.90(dt,J=12.0、6.8Hz,5H)。LCMS1082(M+H)
(4)dFKBP16
5−アミノ−N−(2−2(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)ペンタンアミド(7.84mg、0.0219mmol、1当量)を219μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(15.23mg、0.0219mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.87μl、0.065mmol、3当量)、続いてHATU(8.32mg、0.0219mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(16.22mg、収率71.6%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(10.44mg、収率46.1%)を得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.74〜8.62(m,2H)、7.75(dd,J=17.7、7.9Hz,1H)、7.67(d,J=7.5Hz,1H)、7.44(t,J=7.6Hz,1H)、7.19(t,J=7.8Hz,1H)、6.92(dd,J=15.6、6.8Hz,1H)、6.77(t,J=9.6Hz,2H)、6.71〜6.62(m,2H)、6.43(s,1H)、5.45(d,J=18.1Hz,1H)、5.23〜5.10(m,1H)、4.61〜4.38(m,4H)、3.91〜3.75(m,13H)、3.65(s,4H)、2.90〜2.77(m,2H)、2.21(ddt,J=18.3、12.3、5.8Hz,2H)、2.10〜1.99(m,2H)、1.76〜1.52(m,18H)、1.44(ddd,J=25.9、12.5、6.9Hz,1H)、1.31〜1.18(m,3H)、0.86(t,J=7.4Hz,3H)、0.60(dt,J=34.9、7.3Hz,1H)。LCMS1035(M+H)
(5)dFKBP17
N−(3−(3−アミノプロポキシ)プロピル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(10.27mg、0.023mmol、1当量)を230μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(15.66mg、0.023mmol、1当量)に添加した。DIPEA(11.07μl、0.067mmol、3当量)、続いてHATU(8.74mg、0.023mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(19.94mg、収率77.26%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(11.49mg、収率44.5%)を得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ7.59(t,J=5.0Hz,1H)、7.55(dt,J=7.3、2.3Hz,1H)、7.22〜7.16(m,2H)、6.90〜6.82(m,1H)、6.80〜6.72(m,3H)、6.70〜6.63(m,2H)、6.50〜6.46(m,2H)、6.14(dd,J=8.0、6.0Hz,1H)、5.48(d,J=5.8Hz,1H)、5.03〜4.94(m,1H)、4.63(s,2H)、4.57〜4.49(m,1H)、3.87〜3.82(m,11H)、3.80〜3.77(m,3H)、3.70(d,J=2.7Hz,6H)、3.57(t,J=7.2Hz,1H)、3.50〜3.42(m,4H)、3.38(td,J=6.4、1.9Hz,1H)、3.34〜3.26(m,1H)、2.91〜2.70(m,3H)、2.55(ddd,J=23.7、11.0、4.3Hz,1H)、2.45(dd,J=9.0、6.6Hz,1H)、2.23(d,J=13.6Hz,1H)、1.84〜1.57(m,11H)、1.46(dd,J=20.8、6.6Hz,1H)、1.26(s,2H)、0.91〜0.84(m,3H)、0.81〜0.73(m,1H)。LCMS1123(M+H)
(6)dFKBP18
4−(4−アミノブトキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(5.31mg、0.0154mmol、1当量)を153.94μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(10.68mg、0.0154mmol、1当量)に添加した。DIPEA(7.63μl、0.046mmol、3当量)、続いてHATU(5.85mg、0.0154mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で21時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(10.5mg、収率66.77%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(5.68mg、収率36%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.40(dd,J=7.3、2.3Hz,1H)、7.36〜7.31(m,1H)、7.22(ddd,J=8.7、7.4、1.7Hz,1H)、6.91〜6.87(m,2H)、6.81(dd,J=8.1、4.4Hz,1H)、6.76〜6.70(m,2H)、6.66〜6.61(m,3H)、4.29〜4.20(m,2H)、3.88(t,J=7.3Hz,1H)、3.80〜3.77(m,7H)、3.71〜3.68(m,9H)、3.57〜3.39(m,1H)、3.37(s,3H)、3.24(q,J=7.4Hz,1H)、2.86〜2.76(m,1H)、2.75〜2.60(m,3H)、2.56〜2.38(m,1H)、2.30〜2.16(m,2H)、2.09〜1.86(m,2H)、1.74(dt,J=13.9、7.0Hz,1H)、1.69〜1.53(m,2H)、1.42〜1.36(m,4H)、1.30(s,6H)、1.17(d,J=6.2Hz,1H)、0.90(dt,J=12.0、6.8Hz,5H)。LCMS1122(M+H)
(7)dFKBP19
4−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(5.77mg、0.016mmol、1当量)を158.98μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(11.03mg、0.016mmol、1当量)に添加した。DIPEA(7.93μl、0.048mmol、3当量)、続いてHATU(6.08mg、0.016mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で20時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(9.8mg、収率59.06%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(5.55mg、収率33%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.40(dd,J=7.3、2.3Hz,1H)、7.36〜7.31(m,1H)、7.22(ddd,J=8.7、7.4、1.7Hz,1H)、6.91〜6.87(m,2H)、6.81(dd,J=8.1、4.4Hz,1H)、6.76〜6.70(m,2H)、6.66〜6.61(m,3H)、4.29〜4.20(m,2H)、3.88(t,J=7.3Hz,1H)、3.80〜3.77(m,7H)、3.71〜3.68(m,9H)、3.57〜3.39(m,1H)、3.37(s,3H)、3.24(q,J=7.4Hz,1H)、2.86〜2.76(m,1H)、2.75〜2.60(m,3H)、2.56〜2.38(m,1H)、2.30〜2.16(m,2H)、2.09〜1.86(m,2H)、1.74(dt,J=13.9、7.0Hz,1H)、1.69〜1.53(m,2H)、1.42〜1.36(m,4H)、1.30(s,6H)、1.17(d,J=6.2Hz,1H)、0.90(dt,J=12.0、6.8Hz,5H)。LCMS1038(M+H)
(8)dFKBP20
8−アミノ−N−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)オクタンアミド(8.8mg、0.022mmol、1当量)を220μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(15.48mg、0.022mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.91μl、0.066mmol、3当量)、続いてHATU(8.36mg、0.022mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(19.65mg、収率83%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(10.3mg、収率43.5%)を得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ8.76〜8.68(m,1H)、8.38(d,J=9.8Hz,1H)、7.69(d,J=7.7Hz,1H)、7.49〜7.37(m,1H)、7.17(dt,J=20.1、7.0Hz,2H)、6.90〜6.71(m,4H)、6.66(d,J=9.1Hz,2H)、6.48(d,J=9.8Hz,2H)、6.35(d,J=5.6Hz,1H)、6.15〜6.09(m,1H)、5.48(t,J=6.5Hz,1H)、5.15(dt,J=13.3、5.2Hz,1H)、4.65〜4.36(m,5H)、3.89〜3.76(m,13H)、3.70(d,J=6.0Hz,5H)、3.27〜3.15(m,1H)、2.79(ddd,J=25.5、10.2、4.6Hz,2H)、2.50〜2.29(m,2H)、2.27〜2.10(m,1H)、2.05(s,2H)、1.94(tt,J=14.4、7.2Hz,1H)、1.81〜1.53(m,9H)、1.51〜1.36(m,2H)、1.33〜1.10(m,8H)、0.87(t,J=7.3Hz,3H)、0.69(dt,J=28.4、7.3Hz,1H)。LCMS1077(M+H)
(9)dFKBP21
N−(4−(アミノメチル)ベンジル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(9.9mg、0.022mmol、1当量)を220μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(15.31mg、0.022mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.91μl、0.066mmol、3当量)、続いてHATU(8.36mg、0.022mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で16時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(23mg、収率92.8%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(12.31mg、収率49.7%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.40(dd,J=7.3、2.3Hz,1H)、7.36〜7.31(m,1H)、7.22(ddd,J=8.7、7.4、1.7Hz,1H)、6.91〜6.87(m,2H)、6.81(dd,J=8.1、4.4Hz,1H)、6.76〜6.70(m,2H)、6.66〜6.61(m,3H)、4.29〜4.20(m,2H)、3.88(t,J=7.3Hz,1H)、3.80〜3.77(m,7H)、3.71〜3.68(m,9H)、3.57〜3.39(m,1H)、3.37(s,3H)、3.24(q,J=7.4Hz,1H)、2.86〜2.76(m,1H)、2.75〜2.60(m,3H)、2.56〜2.38(m,1H)、2.30〜2.16(m,2H)、2.09〜1.86(m,2H)、1.74(dt,J=13.9、7.0Hz,1H)、1.69〜1.53(m,2H)、1.42〜1.36(m,4H)、1.30(s,6H)、1.17(d,J=6.2Hz,1H)、0.90(dt,J=12.0、6.8Hz,5H)。LCMS1127(M+H)
(10)dFKBP24
N−(14−アミノ−3,6,9,12−テトラオキサテトラデシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(15.93mg、0.024mmol、1当量)を240μlのDMF溶液(0.1M)として、FKBP酸(16.76mg、0.024mmol、1当量)に添加した。DIPEA(11.90μl、0.072mmol、3当量)、続いてHATU(9.125mg、0.024mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、無色の油(15mg、収率51.02%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、無色の油(12mg、収率40.8%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.79(s,1H)、7.52(dd,J=7.3、1.3Hz,1H)、7.41(d,J=8.4Hz,1H)、7.24(td,J=7.8、1.7Hz,1H)、6.90(d,J=8.0Hz,2H)、6.84(d,J=8.2Hz,1H)、6.77〜6.75(m,2H)、6.68(d,J=1.9Hz,1H)、6.64(d,J=0.8Hz,2H)、5.46〜5.42(m,1H)、5.12(ddd,J=12.4、5.5、1.9Hz,1H)、4.76(d,J=1.2Hz,2H)、4.62〜4.54(m,2H)、3.84〜3.78(m,9H)、3.70(d,J=6.0Hz,9H)、3.64〜3.59(m,7H)、3.59〜3.47(m,11H)、3.33(p,J=1.7Hz,9H)、2.79〜2.60(m,4H)、2.51(d,J=41.0Hz,1H)、2.27(t,J=10.2Hz,1H)、2.18〜2.10(m,1H)、1.78〜1.66(m,4H)、1.60(d,J=12.8Hz,2H)、1.31(s,1H)、0.90(t,J=7.3Hz,3H)。LCMS1227(M+H)
(11)dFKBP25
N−(29−アミノ−3,6,9,12,15,18,21,24,27−ノナオキサノナコシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(22.1mg、0.025mmol、1当量)を250μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(17.51mg、0.025mmol、1当量)に添加した。DIPEA(12.4μl、0.075mmol、3当量)、続いてHATU(9.5mg、0.025mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で19時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、無色の油(15.1mg、収率41.7%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、無色の油(14.9mg、収率42%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.84〜7.78(m,1H)、7.54(d,J=7.3Hz,1H)、7.44(d,J=8.5Hz,1H)、7.28〜7.21(m,1H)、6.91(d,J=8.3Hz,2H)、6.85(d,J=8.2Hz,1H)、6.77(dt,J=3.8、2.2Hz,2H)、6.69(dd,J=8.2、2.0Hz,1H)、6.64(s,2H)、5.53〜5.40(m,1H)、5.14(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.78(s,2H)、4.58(d,J=14.1Hz,2H)、4.47(d,J=14.9Hz,1H)、3.89(t,J=7.3Hz,1H)、3.82(dd,J=7.9、5.9Hz,8H)、3.70(d,J=6.0Hz,8H)、3.64(d,J=4.9Hz,5H)、3.62〜3.58(m,21H)、3.58(s,3H)、3.54(q,J=2.1Hz,2H)、3.51(td,J=5.5、2.1Hz,4H)、3.44〜3.36(m,1H)、3.33(p,J=1.6Hz,6H)、2.81〜2.69(m,2H)、2.48(q,J=7.2、6.5Hz,1H)、2.15(ddq,J=10.2、6.0、2.8Hz,1H)、2.02(dddd,J=25.8、15.0、13.3、7.6Hz,2H)、1.68(s,1H)、0.90(t,J=7.3Hz,3H)。LCMS1447(M+H)
(12)dFKBP26
N−(2−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(12.4mg、0.02mmol、1当量)を200μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(14.4mg、0.02mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.29μl、0.062mmol、3当量)、続いてHATU(7.6mg、0.02mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(10.2mg、収率44.4%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(9.38mg、収率39.67%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.78(t,J=7.9Hz,1H)、7.51(d,J=7.4Hz,1H)、7.40(d,J=8.4Hz,1H)、7.23(t,J=7.7Hz,1H)、6.89(q,J=7.3、6.5Hz,2H)、6.83(d,J=8.0Hz,1H)、6.76(d,J=6.8Hz,2H)、6.67(d,J=8.3Hz,1H)、6.64(s,2H)、6.15(dd,J=8.1、5.7Hz,1H)、5.44(d,J=5.3Hz,1H)、5.12(dd,J=12.4、5.4Hz,1H)、4.75(d,J=1.9Hz,2H)、4.63〜4.51(m,2H)、4.45(d,J=14.9Hz,1H)、4.13(d,J=13.6Hz,1H)、3.88(t,J=7.2Hz,1H)、3.83〜3.77(m,9H)、3.69(d,J=6.3Hz,9H)、3.59(d,J=3.9Hz,6H)、3.53〜3.46(m,4H)、3.33(p,J=1.7Hz,5H)、2.86(ddd,J=18.8、14.2、5.3Hz,1H)、2.80〜2.62(m,3H)、2.50(ddt,J=48.5、14.5、8.2Hz,2H)、2.26(dd,J=19.8、10.4Hz,1H)、2.18〜2.09(m,1H)、2.07〜1.96(m,1H)、1.78〜1.64(m,3H)、1.63〜1.55(m,2H)、1.31(s,1H)、0.90(t,J=7.3Hz,4H)。LCMS1183(M+H)
(13)dFKBP27
N−(17−アミノ−3,6,9,12,15−ペンタオキサヘプタデシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−l,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(13.87mg、0.019mmol、1当量)を196μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(13.65mg、0.0196mmol、1当量)に添加した。DIPEA(9.75μl、0.059mmol、3当量)、続いてHATU(7.45mg、0.0196mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で16時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、無色の油(12mg、収率48.2%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、無色の油(9.16mg、収率36.8%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.80(dd,J=8.5、7.3Hz,1H)、7.52(d,J=7.3Hz,1H)、7.42(d,J=8.5Hz,1H)、7.24(ddd,J=8.5、7.6、1.7Hz,1H)、6.89(t,J=7.7Hz,2H)、6.85(d,J=8.2Hz,1H)、6.76(dp,J=3.2、1.6Hz,2H)、6.68(dd,J=8.2、2.0Hz,1H)、6.64(s,2H)、6.15(dd,J=8.1、5.7Hz,1H)、5.46〜5.42(m,1H)、5.13(ddt,J=12.4、5.6、1.9Hz,1H)、4.77(s,2H)、4.62〜4.54(m,2H)、4.46(d,J=14.9Hz,1H)、3.84〜3.79(m,8H)、3.77(d,J=7.3Hz,1H)、3.70(d,J=6.1Hz,8H)、3.64〜3.58(m,8H)、3.57(d,J=8.6Hz,5H)、3.54〜3.48(m,7H)、3.45〜3.35(m,1H)、2.92〜2.81(m,1H)、2.81〜2.61(m,2H)、2.58〜2.40(m,1H)、2.31〜2.23(m,1H)、2.15(ddq,J=13.1、5.8、3.2、2.7Hz,1H)、2.02(dddt,J=21.8、19.0、13.9、7.4Hz,2H)、1.77〜1.56(m,5H)、1.31(d,J=4.2Hz,1H)、0.90(t,J=7.3Hz,3H)。LCMS1271(M+H)
(14)dFKBP28
dFKBP28(SD−2−90)
N−(23−アミノ−3,6,9,12,15,18,21−ヘプタオキサトリコシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(16.71mg、0.021mmol、1当量)を210μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(14.46mg、0.021mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.33μl、0.062mmol、3当量)、続いてHATU(7.98mg、0.021mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(13.5mg、収率47.3%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(11.96mg、収率41.9%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.81(t,J=7.7Hz,1H)、7.53(d,J=7.1Hz,1H)、7.43(d,J=8.3Hz,1H)、7.28〜7.21(m,1H)、6.94〜6.83(m,3H)、6.76(td,J=6.4、5.4、3.3Hz,2H)、6.71〜6.57(m,4H)、5.44(d,J=5.5Hz,1H)、5.13(dt,J=11.7、5.8Hz,1H)、4.77(d,J=6.0Hz,2H)、4.61〜4.53(m,3H)、4.53〜4.41(m,1H)、4.14(d,J=13.8Hz,1H)、3.89(t,J=7.2Hz,1H)、3.84〜3.78(m,9H)、3.71〜3.67(m,10H)、3.65〜3.61(m,6H)、3.60〜3.56(m,14H)、3.55〜3.48(m,6H)、3.39(dq,J=14.1、7.1、6.3Hz,1H)、2.93〜2.63(m,5H)、2.51(ddt,J=47.5、14.4、6.5Hz,2H)、2.34〜2.24(m,1H)、2.15(dd,J=12.1、5.8Hz,1H)、2.09〜1.87(m,3H)、1.80〜1.57(m,6H)、1.50(dtd,J=14.3、10.2、9.4、4.8Hz,1H)、1.30(d,J=6.2Hz,1H)、0.90(t,J=7.3Hz,4H)。LCMS1358(M+H)
(15)dFKBP29
N−(35−アミノ−3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33−ウンデカオキサペンタトリアコンシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(19.36mg、0.0199mmol、1当量)を199μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(13.83mg、0.0199mmol、1当量)に添加した。DIPEA(9.88μl、0.059mmol、3当量)、続いてHATU(7.56mg、0.0199mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で16時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、無色の油(10mg、収率32.76%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、無色の油(8.9mg、収率29.15%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.82(t,J=7.9Hz,1H)、7.55(d,J=7.3Hz,1H)、7.45(d,J=8.4Hz,1H)、7.28〜7.21(m,1H)、6.93〜6.83(m,3H)、6.79〜6.75(m,2H)、6.69(dd,J=8.2、2.0Hz,1H)、6.64(s,2H)、5.45(d,J=5.4Hz,1H)、5.16〜5.10(m,1H)、4.79(s,2H)、4.61〜4.55(m,2H)、4.47(d,J=15.0Hz,1H)、4.13(t,J=10.1Hz,2H)、3.88(t,J=7.2Hz,1H)、3.82(dd,J=7.5、5.4Hz,8H)、3.77(d,J=8.4Hz,1H)、3.70(d,J=6.3Hz,9H)、3.67〜3.48(m,50H)、3.41(dd,J=12.4、5.7Hz,1H)、3.37(s,4H)、2.92〜2.73(m,3H)、2.66(td,J=13.3、3.2Hz,1H)、2.61〜2.42(m,1H)、2.29(d,J=13.4Hz,1H)、2.19〜2.12(m,2H)、2.04(q,J=5.5、4.3Hz,2H)、1.79〜1.65(m,3H)、1.61(d,J=12.4Hz,1H)、1.50(d,J=13.2Hz,1H)、1.31〜1.22(m,1H)、0.90(t,J=7.4Hz,3H)。LCMS1534(M+H)
(16)dFKBP30
N−(4−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(11.04mg、0.022mmol、1当量)を220μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(15.07mg、0.022mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.91μl、0.066mmol、3当量)、続いてHATU(8.36mg、0.022mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(10.9mg、収率46.5%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(14.4mg、収率61.5%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.51〜7.42(m,2H)、7.23(t,J=7.9Hz,1H)、7.13(d,J=7.8Hz,1H)、6.91〜6.84(m,2H)、6.84〜6.80(m,1H)、6.79〜6.72(m,2H)、6.62(t,J=2.4Hz,3H)、6.09(dd,J=8.3、6.0Hz,1H)、5.39(d,J=5.3Hz,1H)、5.13(dd,J=13.3、5.1Hz,1H)、4.64(d,J=4.2Hz,2H)、4.59〜4.44(m,3H)、4.38(d,J=14.9Hz,1H)、4.12(d,J=13.2Hz,1H)、3.85(q,J=7.3Hz,1H)、3.76(qd,J=9.5、8.6、1.3Hz,9H)、3.69(q,J=5.0、4.0Hz,9H)、3.62〜3.50(m,1H)、3.20(q,J=12.2、9.1Hz,3H)、3.08(dd,J=13.1、7.1Hz,1H)、2.92〜2.80(m,1H)、2.71(ddd,J=17.6、4.6、2.4Hz,1H)、2.60(td,J=13.4、13.0、3.2Hz,1H)、2.48(hept,J=7.0Hz,2H)、2.37〜2.19(m,2H)、2.17〜1.85(m,4H)、1.73(dt,J=13.8、7.0Hz,1H)、1.66〜1.44(m,3H)、1.39(dt,J=13.5、6.3Hz,3H)、1.17(t,J=13.6Hz,1H)、0.86(q,J=6.5、5.7Hz,4H)。LCMS1065(M+H)
(17)dFKBP31
N−(8−アミノオクチル)−2−(2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(8.56mg、0.0154mmol、1当量)を154μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(10.7mg、0.0154mmol、1当量)に添加した。DIPEA(7.6μl、0.046mmol、3当量)、続いてHATU(4.05mg、0.0154mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(11.9mg、収率69%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(5.4mg、収率31.4%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.81〜7.72(m,2H)、7.68(dd,J=7.5、1.2Hz,1H)、7.23(td,J=7.8、1.7Hz,1H)、6.89(t,J=7.9Hz,2H)、6.82(d,J=8.2Hz,1H)、6.78〜6.73(m,2H)、6.67〜6.61(m,3H)、6.12(dd,J=8.2、6.0Hz,1H)、5.41(d,J=5.4Hz,1H)、5.15〜5.08(m,1H)、4.57(d,J=15.1Hz,1H)、4.42(d,J=15.0Hz,1H)、4.13(d,J=13.8Hz,1H)、4.05(d,J=4.0Hz,2H)、3.87(t,J=7.3Hz,1H)、3.82〜3.77(m,9H)、3.75(d,J=7.5Hz,1H)、3.69(d,J=5.7Hz,9H)、3.19〜3.09(m,4H)、2.85(ddd,J=18.0、14.3、5.2Hz,1H)、2.77〜2.70(m,2H)、2.68〜2.41(m,4H)、2.29〜2.22(m,1H)、2.16〜2.08(m,1H)、2.03(dt,J=12.8、7.3Hz,2H)、1.97〜1.87(m,1H)、1.73(dq,J=13.8、7.1Hz,1H)、1.69〜1.53(m,3H)、1.47(p,J=7.2Hz,3H)、1.37(p,J=7.1Hz,1H)、1.29(s,2H)、1.21(tdd,J=22.3、8.9、6.0Hz,2H)、0.88(q,J=7.3、6.4Hz,4H)。LCMS1119(M+H)
(18)dFKBP32
N−(8−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(11.8mg、0.0212mmol、1当量)を212μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(14.75mg、0.0212mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.5μl、0.063mmol、3当量)、続いてHATU(8.06mg、0.0212mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で16時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(19.1mg、収率80.4%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(13.6mg、収率57%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.51〜7.42(m,2H)、7.23(td,J=7.9、1.7Hz,1H)、7.13(dd,J=8.0、4.9Hz,1H)、6.91〜6.85(m,2H)、6.82(d,J=8.0Hz,1H)、6.79〜6.73(m,2H)、6.67〜6.61(m,3H)、6.12(dd,J=8.2、6.0Hz,1H)、5.41(d,J=5.3Hz,1H)、5.15(dd,J=13.3、5.1Hz,1H)、4.65(d,J=3.9Hz,2H)、4.60〜4.50(m,3H)、4.42(d,J=15.0Hz,1H)、4.13(d,J=13.7Hz,1H)、3.86(t,J=7.2Hz,1H)、3.82〜3.76(m,8H)、3.74(d,J=7.7Hz,1H)、3.69(d,J=5.9Hz,9H)、3.24(t,J=7.1Hz,2H)、3.18〜3.07(m,2H)、2.97(s,1H)、2.93〜2.84(m,1H)、2.75(ddd,J=17.6、4.6、2.3Hz,1H)、2.67〜2.40(m,4H)、2.28〜2.20(m,1H)、2.15(dtd,J=10.6、5.4、3.0Hz,1H)、2.07〜1.87(m,3H)、1.72(dt,J=13.9、7.1Hz,1H)、1.64(ddt,J=9.1、5.6、3.1Hz,1H)、1.59〜1.41(m,4H)、1.36(t,J=6.4Hz,2H)、1.29(s,1H)、1.21(dt,J=14.7、5.8Hz,8H)、0.88(q,J=7.4、6.5Hz,3H)。LCMS1121(M+H)
(19)dFKBP33
N−(8−アミノブチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)アミノ)アセトアミド(12.23mg、0.022mmol、1当量)を220μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(15.33mg、0.022mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.9μl、0.066mmol、3当量)、続いてHATU(8.36mg、0.022mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、黄色の油(16.4mg、収率66.6%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(5.42mg、収率22%)を得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ7.36(dt,J=22.5,7.5Hz,3H)、7.20(t,J=7.9Hz,1H)、6.87(q,J=6.2、4.9Hz,1H)、6.80〜6.73(m,3H)、6.72〜6.63(m,3H)、6.49(d,J=6.9Hz,2H)、6.39(s,1H)、6.14(d,J=2.7Hz,1H)、5.49(d,J=5.0Hz,1H)、5.20(dd,J=13.4、5.1Hz,1H)、4.64〜4.50(m,2H)、4.46〜4.32(m,2H)、4.21(dd,J=15.7、10.0Hz,1H)、3.91〜3.81(m,13H)、3.79(s,4H)、3.70(d,J=5.1Hz,6H)、3.61〜3.55(m,1H)、3.22(ttd,J=29.2、16.4、14.9、8.1Hz,6H)、2.92〜2.76(m,2H)、2.67〜2.39(m,3H)、2.35〜1.99(m,4H)、1.92(d,J=8.5Hz,1H)、1.77(dq,J=12.8、6.5Hz,1H)、1.55(d,J=12.8Hz,1H)、1.49〜1.36(m,6H)、1.26(d,J=2.7Hz,1H)、1.24〜1.19(m,6H)、0.88(t,J=7.3Hz,3H)。LCMS1120(M+H)
(20)dFKBP34
N−(4−アミノブチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(9.68mg、0.0212mmol、1当量)を212μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(14.75mg、0.0212mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.52μl、0.063mmol、3当量)、続いてHATU(8.06mg、0.0212mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、黄色の油(18.4mg、収率85%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(15.14mg、収率70%)を得た。1H NMR(500MHz,メタノール−d4)δ7.52(dd,J=8.5、7.1Hz,1H)、7.25〜7.19(m,1H)、7.02(d,J=7.2Hz,1H)、6.98(dd,J=8.6、2.3Hz,1H)、6.91〜6.85(m,2H)、6.80〜6.70(m,3H)、6.64(d,J=3.9Hz,2H)、6.62〜6.58(m,1H)、5.52〜5.40(m,1H)、4.58(d,J=14.9Hz,1H)、4.42(d,J=14.8Hz,1H)、4.10(d,J=13.7Hz,1H)、3.84(td,J=7.3、2.2Hz,1H)、3.78〜3.73(m,9H)、3.70(dd,J=3.5、1.3Hz,9H)、3.68(d,J=3.3Hz,1H)、3.24〜3.15(m,5H)、2.91〜2.80(m,1H)、2.76〜2.66(m,2H)、2.46(q,J=7.2Hz,2H)、2.23(d,J=14.2Hz,1H)、2.11〜1.98(m,4H)、1.92(dt,J=9.4、4.5Hz,1H)、1.71(dq,J=13.8、6.8Hz,1H)、1.63〜1.56(m,2H)、1.55〜1.43(m,5H)、0.90〜0.82(m,4H)。LCMS1121(M+H)
(21)dFKBP35
5−((4−アミノブチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(9.78mg、0.0214mmol、1当量)を214μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(14.89mg、0.0214mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.64μl、0.064mmol、3当量)、続いてHATU(8.13mg、0.0214mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、黄色の油(15.5mg、収率71%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(14.1mg、収率64.6%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.53(d,J=8.2Hz,1H)、7.23(t,J=7.5Hz,1H)、6.92〜6.85(m,2H)、6.73(d,J=6.8Hz,2H)、6.66〜6.59(m,4H)、6.11(dd,J=8.3、5.9Hz,1H)、5.51〜5.45(m,1H)、5.39(s,2H)、5.06〜4.99(m,1H)、4.58(dd,J=15.0、7.8Hz,1H)、4.43(dt,J=14.9、3.8Hz,1H)、4.11(s,2H)、3.79〜3.76(m,11H)、3.70(s,3H)、3.68〜3.65(m,8H)、3.24〜3.13(m,1H)、3.08(s,3H)、2.85(ddd,J=17.9、13.6、5.4Hz,1H)、2.77〜2.67(m,1H)、2.62(s,1H)、2.48(ddt,J=28.9、14.3、7.2Hz,2H)、2.23(d,J=13.8Hz,2H)、2.05(ddd,J=28.5、13.4、6.3Hz,2H)、1.96〜1.86(m,1H)、1.72(dt,J=13.7、6.9Hz,1H)、1.62(s,3H)、0.87(dd,J=8.6、6.1Hz,5H)。LCMS1021(M+H)
(22)dFKBP36
4−((8−アミノオクチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(10.41mg、0.0203mmol、1当量)を203μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(14.15mg、0.0203mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.06μl、0.061mmol、3当量)、続いてHATU(7.72mg、0.0203mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、黄色の油(15.6mg、収率71.4%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(6.3mg、収率28.8%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.58〜7.50(m,1H)、7.23(td,J=7.9、1.7Hz,1H)、7.02(dd,J=7.8、6.5Hz,2H)、6.89(t,J=7.5Hz,2H)、6.82(t,J=8.5Hz,1H)、6.79〜6.75(m,1H)、6.73(d,J=2.1Hz,1H)、6.66〜6.63(m,1H)、6.61(s,2H)、6.38(q,J=9.0、7.5Hz,1H)、6.12(dd,J=8.2、5.9Hz,1H)、5.40(d,J=5.4Hz,1H)、5.08〜5.01(m,1H)、4.57(d,J=15.0Hz,1H)、4.42(dd,J=14.9、1.2Hz,1H)、4.11(d,J=13.8Hz,1H)、3.85(t,J=7.3Hz,1H)、3.81〜3.72(m,11H)、3.71〜3.63(m,11H)、3.28(d,J=6.9Hz,2H)、3.14(td,J=6.9、4.5Hz,2H)、2.89〜2.83(m,1H)、2.81(s,2H)、2.77〜2.68(m,2H)、2.66〜2.41(m,3H)、2.24(d,J=12.9Hz,1H)、2.12〜1.98(m,2H)、1.97〜1.88(m,1H)、1.72(dt,J=13.8、7.0Hz,1H)、1.63(dp,J=14.7、6.9、6.4Hz,4H)、1.57〜1.42(m,1H)、1.38(p,J=7.2Hz,3H)、1.29(s,1H)、1.24〜1.15(m,1H)、0.87(t,J=7.4Hz,4H)。LCMS1077(M+H)
(23)dFKBP37
5−((2−(2−(2−(2−アミノエトキシ)エトキシ)エチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(11.56mg、0.0206mmol、1当量)を206μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(14.31mg、0.0206mmol、1当量)に添加した。DIPEA(10.21μl、0.0618mmol、3当量)、続いてHATU(7.83mg、0.0206mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で22時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、黄色の油(13mg、収率57%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(5.4mg、収率23.32%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.53(dd,J=8.4、1.1Hz,1H)、7.21(ddd,J=10.6、6.2、2.3Hz,1H)、7.01(t,J=1.8Hz,1H)、6.90〜6.79(m,4H)、6.74(tt,J=4.1、2.4Hz,2H)、6.68〜6.64(m,1H)、6.62(d,J=2.4Hz,2H)、5.42(d,J=5.4Hz,1H)、5.06〜4.98(m,1H)、4.59〜4.51(m,1H)、4.48〜4.39(m,1H)、4.12(d,J=13.3Hz,2H)、3.86(t,J=7.1Hz,1H)、3.81〜3.75(m,10H)、3.69〜3.65(m,11H)、3.65〜3.62(m,2H)、3.57(d,J=4.6Hz,3H)、3.55〜3.50(m,2H)、3.48(dd,J=6.2、2.2Hz,1H)、3.38〜3.34(m,2H)、2.83(ddd,J=17.7、11.4、3.9Hz,1H)、2.76〜2.60(m,2H)、2.57〜2.39(m,2H)、2.30〜2.16(m,2H)、2.08〜1.89(m,2H)、1.77〜1.54(m,3H)、1.46(d,J=13.2Hz,1H)、1.29(s,2H)、0.91〜0.85(m,5H)。LCMS1025(M+H)
(24)dFKBP38
N−(3−(アミノメチル)フェニル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(7.35mg、0.0134mmol、1当量)を134μlのDMF溶液(0.1M)としてFKBP酸(9.35mg、0.0134mmol、1当量)に添加した。DIPEA(6.68μl、0.0404mmol、3当量)、続いてHATU(5.09mg、0.0133mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で20時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、黄色の粉末(11.8mg、収率79%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の粉末(7.1mg、収率47.6%)を得た。1H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ9.53〜9.37(m,1H)、7.82〜7.68(m,3H)、7.58(d,J=7.3Hz,1H)、7.41(dd,J=31.3、15.5Hz,1H)、7.24(dt,J=8.3、2.9Hz,1H)、7.21〜7.14(m,1H)、6.93〜6.77(m,3H)、6.76〜6.68(m,1H)、6.65〜6.58(m,2H)、6.46(d,J=4.1Hz,2H)、6.38(d,J=2.1Hz,1H)、5.44〜5.40(m,1H)、5.09〜5.01(m,1H)、4.79〜4.66(m,2H)、4.65〜4.48(m,2H)、3.84〜3.78(m,10H)、3.76(d,J=2.1Hz,2H)、3.67(d,J=2.9Hz,4H)、3.53(t,J=7.3Hz,1H)、2.89(s,1H)、2.84〜2.76(m,2H)、2.53〜2.43(m,1H)、2.17(s,2H)、2.10〜1.97(m,1H)、1.74(dtd,J=13.9、7.1、2.8Hz,1H)、1.53(s,14H)、0.87(dt,J=14.7、7.0Hz,5H)、0.79〜0.74(m,1H)。LCMS1112(M+H)
実施例94:本願の化合物の合成
(1)
5−((4−アミノブチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(233.07mg、0.051mmol、1当量)を510μlのDMF溶液(0.1M)としてJQ1−酸(20.46mg、0.051mmol、1当量)に添加した。DIPEA(25.28μl、0.153mmol、3当量)、続いてHATU(19.39mg、0.051mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で20時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(31.3mg、収率84.4%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(16.7mg、収率45%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.51(dd,J=8.4、1.3Hz,1H)、7.44〜7.39(m,2H)、7.36〜7.30(m,2H)、6.95(t,J=2.0Hz,1H)、6.81(ddd,J=8.4、2.2、1.2Hz,1H)、5.01(ddd,J=12.7、5.5、3.0Hz,1H)、4.64(dd,J=9.0、5.2Hz,1H)、3.47〜3.34(m,2H)、3.25(tt,J=9.7、6.2Hz,2H)、2.88〜2.79(m,1H)、2.77〜2.70(m,1H)、2.68(s,3H)、2.42(s,4H)、2.07(ddq,J=10.3、5.4、2.8Hz,1H)、1.75〜1.68(m,5H)、1.67〜1.63(m,3H)、1.29(s,1H)。LCMS728(M+H)
(2)
4−((8−アミノオクチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(23.59mg、0.046mmol、1当量)を460μlのDMF溶液(0.1M)としてJQ1−酸(18.68mg、0.046mmol、1当量)に添加した。DIPEA(23.1μl、0.139mmol、3当量)、続いてHATU(17.49mg、0.046mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で18時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の粉末(26mg、収率72.18%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(17.1mg、収率47.4%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.52(dd,J=8.6、7.2Hz,1H)、7.46〜7.43(m,2H)、7.39(d,J=8.6Hz,2H)、7.00(dd,J=7.6、2.0Hz,2H)、5.03(dd,J=12.5、5.5Hz,1H)、4.62(dd,J=9.0、5.2Hz,1H)、3.40(dd,J=14.9、9.0Hz,1H)、3.28(d,J=6.8Hz,2H)、3.27〜3.17(m,2H)、2.89〜2.79(m,1H)、2.74(dd,J=4.4、2.6Hz,1H)、2.68(s,3H)、2.43(s,4H)、2.13〜2.01(m,1H)、1.68(s,3H)、1.63(q,J=7.2Hz,1H)、1.56(q,J=7.0Hz,2H)、1.46〜1.34(m,9H)、1.29(s,1H)。LCMS784(M+H)
(3)
4−((4−アミノブチル)アミノ)−2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)イソインドリン−1,3−ジオン(22.71mg、0.0497mmol、1当量)を497μlのDMF溶液(0.1M)としてJQ1−酸(19.95mg、0.0497mmol、1当量)に添加した。DIPEA(24.67μl、0.149mmol、3当量)、続いてHATU(18.89mg、0.0497mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で17時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(30.4mg、収率72%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の油(26.6mg、収率63.6%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.51(ddd,J=8.3、7.1、0.8Hz,1H)、7.45〜7.41(m,2H)、7.34(dd,J=8.7、3.4Hz,2H)、7.06〜7.00(m,2H)、5.01(ddd,J=12.9、10.8、5.5Hz,1H)、4.62(ddd,J=9.0、5.3、2.3Hz,1H)、3.44〜3.33(m,3H)、3.27(ddd,J=14.7、5.2、2.2Hz,1H)、2.83(ddd,J=14.2、5.4、2.6Hz,1H)、2.76〜2.70(m,2H)、2.43(s,3H)、2.07(dtt,J=12.9、5.4、2.9Hz,1H)、1.76〜1.68(m,5H)、1.66(s,3H)。LCMS728(M+H)
(4)
N−(23−アミノ−3,6,9,12,15,18,21−ヘプタオキサトリコシル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(60.49mg、0.076mmol、1当量)を760μlのDMF溶液(0.1M)としてJQ1−酸(30.80mg、0.076mmol、1当量)に添加した。DIPEA(38μl、0.23mmol、3当量)、続いてHATU(28.89mg、0.076mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で20時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(42.8mg、収率52.8%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(36.6mg、収率45.2%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.81〜7.75(m,1H)、7.50(d,J=7.3Hz,1H)、7.45(d,J=8.6Hz,2H)、7.43〜7.37(m,3H)、5.09(dd,J=12.8、5.5Hz,1H)、4.76(s,2H)、4.63(dd,J=9.1、5.2Hz,1H)、3.66〜3.55(m,30H)、3.51〜3.41(m,5H)、2.90〜2.83(m,1H)、2.79〜2.71(m,2H)、2.69(s,3H)、2.43(s,3H)、2.14(ddt,J=10.5、5.5、3.2Hz,1H)、1.69(s,3H)。LCMS1065(M+H)
(5)
N−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)アミノ)アセトアミド(28.9mg、0.052mmol、1当量)を524μlのDMF溶液(0.1M)としてJQ1−酸(21.01mg、0.052mmol、1当量)に添加した。DIPEA(524μl、0.157mmol、3当量)、続いてHATU(19.77mg、0.052mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で20時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の粉末(33.7mg、収率78%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の粉末(13.8mg、収率32%)を得た。H NMR(500MHz,クロロホルム−d)δ7.39(dd,J=8.2、4.7Hz,3H)、7.31(dd,J=8.5、3.5Hz,3H)、7.23(dd,J=7.6、3.8Hz,1H)、6.65(dd,J=8.0、3.4Hz,1H)、5.20〜5.00(m,2H)、4.63(q,J=7.1Hz,2H)、3.87(d,J=5.6Hz,1H)、3.52(ddd,J=29.5、14.8、7.8Hz,1H)、3.37〜3.13(m,6H)、2.71〜2.54(m,7H)、2.39(d,J=3.3Hz,5H)、1.66(d,J=5.7Hz,5H)、1.52(t,J=7.1Hz,1H)、1.43(dt,J=17.8、5.3Hz,3H)、1.35〜1.21(m,3H)。LCMS827(M+H)
(6)
N−(8−アミノオクチル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1−オキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(29.52mg、0.053mmol、1当量)を536μlのDMF溶液(0.1M)としてJQ1−酸(12.51mg、0.053mmol、1当量)に添加した。DIPEA(26.6μl、0.161mmol、3当量)、続いてHATU(20.15mg、0.053mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で20時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の油(27.4mg、収率62.5%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の油(19.6mg、収率44.7%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.50〜7.41(m,4H)、7.41〜7.37(m,2H)、7.12(dd,J=7.9、1.4Hz,1H)、5.14(dt,J=11.4、3.2Hz,1H)、4.66〜4.60(m,3H)、4.58〜4.47(m,2H)、3.44〜3.34(m,1H)、3.30〜3.20(m,4H)、2.94〜2.84(m,1H)、2.76(ddq,J=17.7、5.0、2.5Hz,1H)、2.68(s,3H)、2.53〜2.45(m,1H)、2.43(s,3H)、2.17(ddt,J=10.0、4.9、2.6Hz,1H)、1.68(s,3H)、1.53(dp,J=21.0、6.8Hz,4H)、1.39〜1.24(m,9H)。LCMS827(M+H)
(7)
N−(9−アミノノニル)−2−((2−(2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)アセトアミド(7.5mg、0.0135mmol、1当量)を135μlのDMF溶液(0.1M)としてJQ1−酸(5.41mg、0.0135mmol、1当量)に添加した。DIPEA(6.7μl、0.0405mmol、3当量)、続いてHATU(5.13mg、0.0135mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で19時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、白色の粉末(10.5mg、収率94.3%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、白色の粉末(6.8mg、収率61%)を得た。H NMR(500MHz,メタノール−d)δ7.81〜7.73(m,2H)、7.67(dd,J=7.5、1.2Hz,1H)、7.47〜7.43(m,2H)、7.40(d,J=8.7Hz,2H)、5.11(dd,J=12.7、5.5Hz,1H)、4.63(dd,J=8.9、5.3Hz,1H)、4.10(q,J=7.1Hz,1H)、4.04(d,J=4.1Hz,2H)、3.41(dd,J=14.9、9.0Hz,1H)、3.29〜3.20(m,2H)、3.17(td,J=6.9、2.0Hz,2H)、2.90〜2.80(m,1H)、2.78〜2.70(m,2H)、2.44(s,3H)、2.12(ddd,J=7.8、5.7、2.7Hz,1H)、2.01(s,1H)、1.70(s,3H)、1.56(q,J=7.3Hz,2H)、1.49(q,J=6.8Hz,2H)、1.38〜1.28(m,11H)、1.24(t,J=7.1Hz,1H)、0.95〜0.81(m,1H)。LCMS839(M+H)
(8)
(R)−N−(4−アミノブチル)−2−((2−(3−メチル−2,6−ジオキソピペリジン−3−イル)−1,3−ジオキソイソインドリン−4−イル)オキシ)アセトアミド(47.1mg、0.113mmol、1当量)を1.13mlのDMF溶液(0.1M)としてJQl−酸(45.3mg、0.113mmol、1当量)に添加した。DIPEA(56.02μl、0.339mmol、3当量)、続いてHATU(42.96mg、0.113mmol、1当量)を添加した。混合物を室温で21時間撹拌した。次いで、混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム、水、次いでブラインで洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮して、黄色の粉末(49.2mg、収率54.5%)を得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(ISCO、4gシリカカラム、0%→10%のMeOH/DCM、25分間の勾配)によって精製して、黄色の粉末(20.1mg、収率22%)を得た。H NMR(400MHz,メタノール−d)δ7.77(dd,J=8.4、7.4Hz,1H)、7.47(s,1H)、7.44(d,J=2.1Hz,1H)、7.42(d,J=1.3Hz,2H)、7.40(d,J=2.3Hz,2H)、7.38(d,J=2.6Hz,1H)、4.73(s,2H)、4.66〜4.61(m,1H)、3.45〜3.34(m,3H)、2.98(s,2H)、2.68(d,J=11.1Hz,5H)、2.44(dd,J=8.2、0.9Hz,4H)、1.96(s,3H)、1.69〜1.62(m,7H)、0.95〜0.81(m,4H)。LCMS799(M+H)
実施例95:本願の化合物の生物活性
実施例94に記載の手順のような本願に開示の生物学的アッセイを用いることで、本願の化合物が、例えば下記表に示されるようなタンパク質標的への結合、タンパク質分解の媒介等の強力な生物活性を有することが実証された。
実施例96:実験手順
タンパク質精製及び結晶構造
pNIC28Bsa4ベクター(Addgene)中の残基44〜168を含むヒトBRD4の構築物をLB培地中、50mg/mlのカナマイシンの存在下で大腸菌(E. coli)BL21(DE3)において過剰発現させた。細胞を37℃でOD 0.8まで成長させ、500μMイソプロピル−1−チオ−D−ガラクトピラノシドにより誘導し、17℃で一晩インキュベートし、遠心分離によって収集し、−80℃で保管した。細胞ペレットをバッファーA(50mM hepes 7.5+300mM NaCl+10%グリセロール+10mM イミダゾール+3mM BME)中で超音波処理し、得られる溶解物を35000×gで40分間遠心分離した。Ni−NTAビーズ(Qiagen)を溶解物上清と30分間混合し、バッファーAで洗浄した。ビーズをFPLC−適合カラムに移し、結合タンパク質を15%バッファーB(50mM hepes 7.5+300mM NaCl+10%グリセロール+300mM イミダゾール+3mM BME)で洗浄し、100%バッファーBで溶出させた。TEVを溶出タンパク質に添加し、4℃で一晩インキュベートした。次いで、サンプルをバッファーA(イミダゾールを含まない)で平衡化した脱塩カラム(26/10カラム)に通し、溶出タンパク質を第2のNi−NTA工程に供して、His−タグ及びTEVを除去した。溶離液を濃縮し、20mM hepes 7.5+150mM NaCl+1mM DTT中でSuperdex−200 10/300カラムに通した。画分をプールし、14mg/mlまで濃縮し、−80℃で凍結した。
結晶化、データ収集及び構造決定
1.5倍過剰の10mM dBET1(DMSO中)を500μMタンパク質と混合し、以下の結晶化バッファー:15%PEG3350、0.1Mスクシネート中20℃でシッティングドロップ蒸気拡散によって結晶化させた。結晶を25%グリセロールを含有する結晶化バッファーに簡単に移した後、液体窒素中で急速凍結した。複合結晶からの回折データをAdvanced Photon Source(Argonne National Laboratory)のNE−CATのビームライン24ID−Cで収集し、データセットをXDSを用いて統合及びスケーリングした(Kabsch, W. Acta crystallographica Section D, Biological crystallography 2010, 66, 133)。構造をプログラムPhaserを用いた分子置換(Mccoy et al., Journal of Applied Crystallography 2007, 40, 658)及び検索モデルPDBエントリXXXXによって解明した。Busterを用いてリガンドを自動的に位置付け及び詳細化した(Smart et al. Acta crystallographica Section D, Biological crystallography 2012, 68, 368)。Phenix(Adams et al. Acta crystallographica Section D, Biological crystallography 2010, 66, 213)及びCoot(Emsley, P.; Cowtan, K. Acta crystallographica Section D, Biological crystallography 2004, 60, 2126)を用いた繰り返しモデル構築及び詳細化により、表4に示される統計値を有するモデルが得られた。
BRD4 AlphaScreen
製造業者のプロトコル(PerkinElmer,USA)を僅かに変更してアッセイを行った。全ての試薬を50mM HEPES、150mM NaCl、0.1%(w/v) BSA、0.01%(w/v) Tween20(pH7.5)で希釈し、プレートへの添加前に室温に平衡化した。マスター溶液へのAlphaビーズの添加後に、その後の全工程を微光条件下で行った。BRD4の最終濃度が40nMの構成成分の2倍溶液、10μg/mLのNiコーティングAcceptor Bead及び20nM ビオチン化JQ1(Anders et al. Nature Biotechnology 2013, 32, 92)を384ウェルプレート(AlphaPlate−384、PerkinElmer,USA)に10μL添加した。プレートを150×gで遠沈し、ストックプレートからDMSO中100nLの化合物を、Janus Workstation(PerkinElmer,USA)を用いてピン転写(pin transfer)によって添加した。ストレプトアビジンコーティングドナービーズ(最終10μg/mL)を、これまでと同様に2倍の10μL容量の溶液として添加した。この添加に続いて、光への曝露及び蒸発を防ぐためにプレートをホイルで密閉した。プレートを再度150×gで遠沈した。プレートを室温で1時間インキュベートした後、Envision 2104(PerkinElmer,USA)で製造業者のプロトコルを用いて読み取った。PRISM Graphpad v6を用いてデータを分析し、IC50値を得た。
BRD4デュアルルシフェラーゼアッセイ
ナノルシフェラーゼ(Nluc)及び別個のホタルルシフェラーゼ(Fluc)に隣接した融合BRD4を含有するレンチウイルス構築物を293FT細胞において作製し、293FT細胞の形質導入に使用した。形質導入細胞をピューロマイシンによって選択し、増殖させた。アッセイのために、細胞を白色384ウェル培養プレートに1000細胞/ウェルで20μL分注した。細胞をプレートに一晩付着させた後、JANUSワークステーション(PerkinElmer)を用いてDMSO中100nLの化合物をピンで添加した(pinned)。細胞を化合物とともに37℃、5%COで4時間インキュベートした後、室温まで冷却した。各プレートに25μLのFlucバッファー(200mM Tris、15mM MgSO、100uM EDTA、1mM DTT、1mM ATP、200uM補酵素A、400uM D−ルシフェリン、0.1%Trition X−100)を添加した。プレートを室温で15分間インキュベートした後、Envision 2104(PerkinElmer)で発光を読み取った。次いで、25μLのNlucバッファー(25mM Na4PPi、10mM NaOAc、15mM EDTA、500mM NaSO、500mM NaCl、16uMセレンテラジン、50μM 4−(6−メチル−1,3−ベンゾチアゾール−2−イル)アニリン(Santa Cruz Biotechnology、sc−276812))を各ウェルに添加し、プレートを室温で15分間インキュベートした後、発光を読み取った。各プレートについての各々の読取りの発光値をDMSO対照に対して正規化した後、Nluc/Flucシグナルの比率を各ウェルについて取得した。これらのデータをPRISM Graphpad v6を用いて更に分析し、IC50及び最大分解値を得た(例えば、表4−3の「Emaxでの濃度(uM)」、「最大分解(デュアルルシフェラーゼ)」及び「pDC50(デュアルルシフェラーゼ)」を参照されたい)。
IKZF1デュアルルシフェラーゼアッセイ
ナノルシフェラーゼ(Nluc)及び別個のホタルルシフェラーゼ(Fluc)に隣接した融合IKZF1を含有するレンチウイルス構築物を293FT細胞において作製し、293FT細胞の形質導入に使用した。形質導入細胞を2μg/mLのピューロマイシンにより選択し、増殖させた。アッセイのために、細胞を白色384ウェル培養プレートに1000細胞/ウェルで20μL分注した。細胞をプレートに一晩付着させた後、JANUSワークステーション(PerkinElmer)を用いてDMSO中100nLの化合物をピンで添加した。細胞を化合物とともに37℃、5%COで4時間インキュベートした後、室温まで冷却した。各プレートに25μLのFlucバッファー(200mM Tris、15mM MgSO、100uM EDTA、1mM DTT、1mM ATP、200uM補酵素A、400uM D−ルシフェリン、0.1%Trition X−100)を添加した。プレートを室温で15分間インキュベートした後、Envision 2104(PerkinElmer)で発光を読み取った。次いで、25μLのNlucバッファー(25mM Na4PPi、10mM NaOAc、15mM EDTA、500mM NaSO、500mM NaCl、16uMセレンテラジン、50μM 4−(6−メチル−1,3−ベンゾチアゾール−2−イル)アニリン(Santa Cruz Biotechnology,sc−276812))を各ウェルに添加し、プレートを室温で15分間インキュベートした後、発光を読み取った。各プレートについての各々の読取りの発光値をDMSO対照に対して正規化した後、Nluc/Flucシグナルの比率を各ウェルについて取得した。これらのデータをPRISM Graphpad v6を用いて更に分析し、IC50及び最大分解値を得た(例えば表6を参照されたい)。
FKBPデュアルルシフェラーゼアッセイ
野生型293FT細胞又はセレブロン突然変異293FT細胞(CRBN−/−)に、FKBP12と同じ多シストロン性転写産物に由来するナノルシフェラーゼ(NLuc;HAタグ付き)及びホタルルシフェラーゼ(FLuc)との融合を発現するレンチウイルスベクター、又は突然変異FKBP12と同じ多シストロン性転写産物に由来するナノルシフェラーゼ(NLuc;HAタグ付き)及びホタルルシフェラーゼ(FLuc)との融合を発現するレンチウイルスベクターを形質導入した。細胞を漸増濃度の様々なdFKBPで4時間処理した。NLuc及びFLucの量を測定し、FKBP12−HA−NLucの存在度を、NLuc/FLucのシグナル比を算出することによって定量化した。
FKBP12(WT及び36V)リガンド置換AlphaScreenアッセイ
384ウェルAlphaPlate(Perkin Elmer)において、90nM GST−FKBP12(WT又は36V)及び62.5nMビオチン−SLFを、競合化合物又はDMSOを含有する20uLのアッセイバッファー(0.1%BSA及び0.01%Triton X−100を含有するPBS)に希釈した。30分間のインキュベーションに続いて、アッセイバッファーで20ng/uLに希釈したストレプトアビジンドナービーズ及びグルタチオンアクセプタビーズを含有する20uLの検出溶液を各ウェルに添加した。室温で1時間のインキュベーションの後、発光をEnvision 2104プレートリーダーで測定した。パーセント活性値を、平均バックグラウンド(タンパク質を含まないウェル)を0%、平均DMSOウェルを100%活性と設定することによって算出した。標準偏差を少なくとも4回の反復測定から化合物濃度について決定した。GraphPad PRISM v6を用いてデータを分析及びプロットし、IC50値を「log(阻害剤)対正規化応答−可変傾斜」分析モジュールを用いて決定した(例えば表5を参照されたい)。
CRBN−DDB1の発現及び精製
CRBN−DDB1の発現及び精製を、Sf9細胞(Invitrogen)を用いてFischer, E. S. et al., Nature 512, 49 (2014)に記載のように行った。ヒトCRBN及びDDB1をコードするpFastBacベクターをタンパク質の発現に使用した。
CRBN−DDB1/BRD4二量化アッセイ
AlphaScreen技術を用いて、dBET分子によって誘導されるCRBN−DDB1/BRD4二量化を検出した。簡潔に述べると、GST−BRD4[49−170](Sigma Aldrich)及びCRBN−DDB1(6×HISタグ付き)を、それぞれアッセイバッファー(50mM HEPES(pH7.4)、200mM NaCl、1mM TCEP及び0.1%BSA)で125nM及び250nMに希釈し、20uLのタンパク質混合物を384ウェルAlphaPlate(PerkinElmer)の各ウェルに添加した。次いで、化合物をDMSOストックプレートからJanus Workstation(PerkinElmer)を用いて1ウェル当たり100nLで添加した。室温で1時間のインキュベーション後に、Nickel Chelate AlphaLISA(商標) Acceptor及びGlutathione AlphaLISA(商標) Donorビーズ(PerkinElmer)をアッセイバッファーで2倍濃度(20ng/ul)に希釈し、1ウェル当たり20uLで添加した。Envision 2104プレートリーダー(PerkinElmer)での発光検出の前に、プレートを室温で1時間インキュベートした。競合アッセイのために、GST−BRD4[49−170]及びCRBN−DDB1を上記のように111nM dBET1の存在下で希釈した。化合物の添加及びその後の検出を上記のように行った。
GraphPad PRISM v6を用いてデータを分析及びプロットした。二量体増幅、二量体平均及び二量体SD値を「ガウス」分析モジュールを用いて決定した(例えば表4−3を参照されたい)。
CRBN−DDB1リガンド置換AlphaScreenアッセイ
サリドマイド競合AlphaScreenアッセイを用いて、CRBN−DDB1に対するサリドマイドコンジュゲート及び新規のIMiDの結合親和性(IC50)を測定した。384ウェルAlphaPlate(Perkin Elmer)において、50nM CRBN−DDB1及び125nMビオチン−サリドマイドを、競合化合物又はDMSOを含有する20uLのアッセイバッファー(50mM HEPES(pH7.4)、200mM NaCl、1mM TCEP及び0.1%BSA)に希釈した。30分間のインキュベーションに続いて、アッセイバッファーで20ng/uLに希釈したストレプトアビジンドナービーズ及びNickel Chelate AlphaLISA(商標) Acceptor Beadsを含有する20uLの検出溶液を各ウェルに添加した。室温で1時間のインキュベーションの後、発光をEnvision 2104プレートリーダーで測定した。パーセント活性値を、平均バックグラウンド(タンパク質を含まないウェル)を0%、平均DMSOウェルを100%活性と設定することによって算出した。標準偏差を少なくとも4回の反復測定から化合物濃度について決定した。GraphPad PRISM v6及びCRBN Alphaを用いてデータを分析及びプロットし、IC50値を「log(阻害剤)対正規化応答−可変傾斜」分析モジュールを用いて決定した(例えば、表4−3の「THAL ALPHA(IC50)」及び表6を参照されたい)。
細胞内CRBNエンゲージメントアッセイ
ナノルシフェラーゼ(Nluc)及び別個のホタルルシフェラーゼ(Fluc)に隣接した融合FKBP(36V)を含有するレンチウイルス構築物を293FT細胞において作製し、293FT細胞の形質導入に使用した。アッセイのために、細胞を白色384ウェル培養プレートに4000細胞/ウェルで20μL分注した。細胞をプレートに一晩付着させた後、JANUSワークステーション(PerkinElmer)を用いてDMSO中100nLの競合化合物をピンで添加し、続いて80nM dFKBP7を添加した。細胞を化合物とともに37℃、5%COで3時間インキュベートした後、30分間室温まで冷却した。各プレートに25μLのFlucバッファー(200mM Tris、15mM MgSO、100uM EDTA、1mM DTT、1mM ATP、200uM補酵素A、400uM D−ルシフェリン、0.1%Trition X−100)を添加し、プレートを室温で15分間インキュベートした後、Envision 2104(PerkinElmer)で発光を読み取った。次いで、25μLのNlucバッファー(25mM Na4PPi、10mM NaOAc、15mM EDTA、500mM NaSO、500mM NaCl、16uM セレンテラジン、50uM 4−(6−メチル−1,3−ベンゾチアゾール−2−イル)アニリン(sc−276812))を各ウェルに添加し、プレートを室温で15分間インキュベートした後、発光を読み取った。Nluc/Flucシグナルの比率を各ウェルについて取得し、これらの値をdFKBP7のみのウェルを0%、DMSOのみのウェルを100%に設定することによって正規化した。GraphPad PRISM v6を用いてデータを更に分析及びプロットし、IC50値を「log(アゴニスト)対正規化応答−可変傾斜」分析モジュールを用いて決定した(例えば、表4−3「FKBP7救済(EC50)」及び表5を参照されたい)。
細胞株
293FT及び293FTCRBN−/−は、10%FCS及び1%ペニシリン/ストレプトマイシンを添加したDMEM中で培養した。MV4−11、MOLM13、MM1S及びMM1SCRBN−/−は、10%FCS及び1%ペニシリン/ストレプトマイシンを添加したRPMI中で培養した。SUM149細胞は、1%ペニシリン/ストレプトマイシンを含むDMEM F12(corning cellgro、10−090−CV)(1:1)及び最終5%FCSを添加したHUMEC培地(cell application、815−500)中で培養した。
初代患者物質の培養
細胞を新たに融解し、IL−3(20)、IL−6(20)、FLT3L(100)、SCF(100)及びGSCF(20)(全てng/ml最終濃度)を添加したStemSpan SFEM培地(Stemcell)中で24時間成長させた。その後、細胞を新たなサイトカインを含む指定の濃度のdBET1又はJQ1で24時間処理した。続いて、細胞をイムノブロット分析又はFACS分析のいずれかに使用した。
フローサイトメトリーによるアポトーシス細胞の分析
各々のサンプルについて、細胞を500μLのPBSで洗浄し、400×gで5分間遠沈し、培地を吸引除去した。次いで、細胞をアネキシンV結合バッファー:140mM NaCl、10mM HEPES、2.5mM CaCl(pH7.4)に再懸濁し、500μLの各サンプルを5mLのポリスチレンFACSチューブ(Falconカタログ番号352054)に移した。細胞を400×gで5分間遠沈し、バッファーを吸引除去した。各サンプルに、250ng/mL FITC−アネキシンV及び500ng/mLヨウ化プロピジウムを含む400μLのアネキシンV結合バッファーを染色のために添加した。次いで、細胞をBD LSRFortessaで選別し、FlowJo V10ソフトウェア(Tree Star, Inc)を用いて分析した。
Caspase gloアッセイによるアポトーシス細胞の分析
Caspasegloアッセイ(Promega)を製造業者の推奨に従って行った。細胞を5000細胞/ウェルの密度で、それぞれの化合物又はビヒクル対照処理を含む白色384ウェルプレート(Thermo Scientific Nunc、#164610)に40ulの総容量で播種した。24時間のインキュベーションの後、1ウェル当たり30ulのCaspaseglo基質を添加した。プレートを暗所で90分間インキュベートし、Envisionプレートリーダー(Perkin Elmer)で読み取った。
BRD4高含量アッセイ
SUM149細胞を、96ウェルプレートの内側の60ウェルを使用して3×10細胞/ウェルの密度でプレーティングした。24時間後に化合物をそれぞれの濃度で添加した。製造業者のプロトコル(LICORのIn−Cell Western Assay Kit)を僅かに変更してアッセイを行った。簡潔に述べると、細胞をPBS中の3.7%ホルムアルデヒドにおいて室温で20分間固定し(1ウェル当たり200ul)、続いて0.1%Triton X−100を含む1×PBSを用いて透過処理した(1ウェル当たり5×200ul)。次いで、細胞を100ulの1:1希釈Odyssey Blocking Buffer(LICOR)を用いて室温で90分間ブロッキングした。次に、細胞をOdyssey Blocking Buffer(LICOR)で1:1000希釈したBRD4抗体(1ウェル当たり50ul)とともに4℃で一晩インキュベートした。翌日、プレートをTBST(1ウェル当たり200ul)で5回洗浄した。次いで、プレートを細胞正規化のために1:800希釈のIRDye 800CWヤギ抗ウサギ抗体(LICOR)及び同時にCellTag 700 Stain(1:500、LICOR)で染色する。プレートを暗所、室温で1時間インキュベートし、TBST(1ウェル当たり200ul)で5回洗浄し、Odyssey CLx Imager(LI-COR)で撮像した。
qRT−PCR
RNAをRNeasy Plus Mini Kit(Qiagen)を用いて単離し、1サンプル当たり500ngの総RNAをSuperScript Reverse Transcriptase(Life Technologies)を用いる逆転写に使用した。cDNAを1:9希釈し、2ulをSYBR Selectマスターミックスを用いるqRT−PCRに鋳型として使用した。以下のプライマーを使用した:
GAPDH(F):CCACTCCTCCACCTTTGAC 配列番号1
GAPDH(R):ACCCTGTTGCTGTAGCCA 配列番号2
BRD2(F):GTGGTTCTCGGCGGTAAG 配列番号3
BRD2(R):GGTTGACACCCCGGATTAC 配列番号4
BRD3(F):TTGGCAAACCTCATCTCAAA 配列番号5
BRD3(R):GATGTCCGGCTGATGTTCTC 配列番号6
BRD4(F):CTCCGCAGACATGCTAGTGA 配列番号7
BRD4(R):GTAGGATGACTGGGCCTCTG 配列番号8
c−MYC(F):CACCGAGTCGTAGTCGAGGT 配列番号9
c−MYC(R):GCTGCTTAGACGCTGGATTT 配列番号10
PIM1(F):TCATACAGCAGGATCCCCA 配列番号11
PIM1(R):CCGTCTACACGGACTTCGAT 配列番号12
定量的質量分析のサンプル調製
サンプルを以前に記載のように以下の変更を加えて調製した(Weekes, M. P. et al., Cell 157, 1460 (2014))。全ての溶液は最終濃度として報告する。溶解バッファー(8M尿素、1%SDS、50mM Tris(pH8.5)、プロテアーゼ及びホスファターゼ阻害剤、Roche製)を細胞ペレットに添加し、タンパク質濃度が2mg/mL〜8mg/mLの細胞溶解物を得た。micro−BCAアッセイ(Pierce)を用いて細胞溶解物における最終タンパク質濃度を決定した。タンパク質を以前に記載のように還元及びアルキル化した。メタノール/クロロホルムを用いてタンパク質を沈殿させた。簡潔に述べると、4容量のメタノール、続いて1容量のクロロホルム、最後に3容量の水を細胞溶解物に添加した。混合物をボルテックスし、遠心分離してクロロホルム相を水相から分離した。沈殿タンパク質を1容量の氷冷メタノールで洗浄した。洗浄した沈殿タンパク質を風乾させた。沈殿タンパク質を4M尿素、50mM Tris(pH8.5)に再懸濁した。タンパク質を初めにLysC(1:50;酵素:タンパク質)により25℃で12時間消化した。LysC消化物(digestion)を1M尿素、50mM Tris(pH8.5)で希釈した後、トリプシン(1:100;酵素:タンパク質)により25℃で更に8時間消化した。ペプチドをC18固相抽出カートリッジを用いて脱塩した。乾燥ペプチドを200mM EPPS(pH8.0)に再懸濁した。micro−BCAアッセイ(Pierce)を用いてペプチド定量化を行った。各条件の同量のペプチドをタンデム質量タグ(TMT)試薬(1:4;ペプチド:TMT標識)(Pierce)で標識した。10連標識化反応を25℃で2時間行った。TMTによるチロシン残基の修飾を25℃で15分間の5%ヒドロキシルアミンの添加によって逆転させた。反応を0.5%TFAでクエンチし、サンプルを1:1:1:1:1:1:1:1:1:1の比率で合わせた。合わせたサンプルを脱塩し、以前に記載されるように24個の画分にオフライン分画した。
液体クロマトグラフィー−MS3分光分析(LC−MS/MS)
基本逆相工程(その他全ての画分)からの24個のペプチド画分のうち12個を、オンラインサンプル処理及びペプチド分離のためのProxeon Easy nLC 1000を備えるOrbitrap Fusion質量分析計(Thermo Fisher Scientific)でLC−MS3データ収集戦略によって分析した(McAlister, G. C. et al., Anal. Chem. 86, 7150 (2014))。5%ギ酸+5%アセトニトリルに再懸濁したおよそ5μgのペプチドを、5μm未満の内径に引かれるニードルチップを有する内径100μmの融合シリカミクロキャピラリーにロードした。カラムは35cmの長さまでC18逆相樹脂(GP118樹脂1.8μm、120Å、Sepax Technologies)により社内で充填した。ペプチドを、カラムにわたる流速600nL/分でのバッファーA(3%ACN+0.125%ギ酸)で平衡化した3%→25%のバッファーB(100%ACN+0.125%ギ酸)の120分間の線形勾配を用いて分離した。Fusion Orbitrapのスキャン配列はMS1スペクトルで開始した(Orbitrap分析、分解能120000、400m/z〜1400m/zのスキャン範囲、AGC標的2×105、最大射出時間100ms、75秒間の動的排除)。「Top N」(上位10個の前駆体)を、CID(0.5Daに設定した四重極単離及びイオントラップ分析、AGC4×103、NCE 35、最大射出時間150ms)からなるMS2分析について選択した。各々のMS2スキャンからの上位10個の前駆体をMS3分析のために選択し(同期的前駆体選択)、前駆体をHCDによって断片化した後、Orbitrap分析を行った(NCE 55、最大AGC5×104、最大射出時間150ms、単離窓2.5Da、分解能60000)。
LC−MS3データ分析
社内ソフトウェアツールのスイートを、以前に記載のようにRAWファイル処理、並びにペプチド及びタンパク質レベル偽発見率の制御、ペプチドからのタンパク質の組立て、並びにペプチドからのタンパク質の定量化に使用した。MS/MSスペクトルを、フォワード及びリバース配列の両方を用いてUniprotヒトデータベース(2014年2月)に対して検索した。データベース検索基準は以下の通りである:2つの切断の失敗を有するトリプシン性、50ppmの前駆体質量許容差、1.0Daのフラグメントイオン質量許容差、システインの静的アルキル化(57.02146Da)、リシン残基及びペプチドのN末端の静的TMT標識化(229.162932Da)、並びにメチオニンの可変酸化(15.99491Da)。TMTレポーターイオン強度を、MS3スキャンにおける各レポーターイオンの理論m/z前後の0.003Da窓を用いて測定した。低品質MS3スペクトルのペプチドスペクトルマッチを定量化から除外した(10チャネルにわたる200未満の積算シグナル対ノイズ及び0.5未満の前駆体単離特異性)。
MV4−11異種移植片実験
1マウス(NSG)当たり1×10 MV4−11細胞を200ul容量のPBS中で皮下注射した。生着の成功を生物発光及びキャリパー測定によってモニタリングした。MV4−11細胞の注射の11日後に腫瘍は触知可能であり、マウスを対照(ビヒクル)群又はdBET1処理群のいずれかに割り当てた。マウスを50mg/kgのdBET1又はビヒクル(captisol)で腹腔内注射によって1日1回処理した。腫瘍体積をキャリパー測定によって記録した。ビヒクル処理マウスの腫瘍サイズが制度的限界に達した処理開始から14日後に研究を終了した。
発現プロテオミクス
5×10細胞をDMSO、250nM dBET1又は250nM JQ1により三連で2時間処理し、氷冷PBSで3回洗浄し、液体N中で急速凍結した。次に、サンプルを溶解バッファー(8M尿素、1%SDS、50mM Tris(pH8.5)、プロテアーゼ及びホスファターゼ阻害剤)中で機械的にホモジナイズし、タンパク質定量化をmicro−BCAキット(Pierce)を用いて行った。タンパク質定量化の後、溶解物を即座にDTTで還元し、ヨードアセトアミドでアルキル化した。600μgのタンパク質をメタノール/クロロホルムによって沈殿させ、LysC及びトリプシンを用いて消化を行った。50μgの各サンプルをタンデム質量タグ(TMT、Thermo Scientific)試薬で標識し、全プロテオーム分析のために分画した。
逆相分画を以下の条件下で行った:バッファーA:5%ACN、50mM AmBic(pH8.0)、バッファーB:90%ACN、50mM AmBic(pH8.0)(画分サイズ−37秒(約300μL))。
タンパク質をbRPによって分画し、各12画分の2つのセットに収集した。HPRPからの1つの完全なセット(12画分)をOrbitrap Fusion質量分析計で分析した。ペプチドを200分間にわたる0.125%ギ酸中3%→25%のアセトニトリルの勾配を用いて分離した。ペプチドを検出し(MS1)、Orbitrapにおいて定量化し(MS3)、ペプチドをイオントラップにおいてシークエンシングした(MS2)。MS2スペクトルを、その逆相補体及び既知の汚染物質を含有するヒトプロテオームに由来するUniprot複合体データベースに対するSEQUESTアルゴリズムを用いて検索した。全てのペプチドスペクトルマッチを、線形判別分析と組み合わせた標的−デコイ戦略を用いて1%偽発見率(FDR)までフィルタリングした。タンパク質を、200以上の積算SN閾値及び0.5のMS2単離特異性を有するペプチドのみから定量化した。
イムノブロッティング
細胞を、プロテアーゼ阻害剤カクテル(Roche)及び0.1%ベンゾナーゼ(Novagen)を添加したRIPAバッファーを用いて氷上で15分間溶解した。溶解物を4℃、16000×gで15分間遠心し、タンパク質濃度をBCAアッセイ(Pierce)を用いて決定した。以下の一次抗体をこの研究に使用した:BRD2(Bethyl labs)、BRD3(abcam)、BRD4(Bethyl labs)、MYC、チューブリン及びビンキュリン(全てSanta Cruz)、並びにPIM1(Cell Signaling Technology)及びIKZF3(Novus Biologicals)。ブロットを蛍光標識二次抗体(LI-COR)を用いてOdysseyCLxImager(LI-COR)で撮像した。バンド強度の定量化をOdysseyCLxソフトウェア(LI-COR)を用いて行った。
免疫組織化学
BRD4染色をA301−985A抗体(Bethyl labs)を用い、濃度1:2000での推奨パラメーターに従って行った。MYC及びKi67染色を以前に記載のように行った。陽性染色核の定量化をaperioソフトウェア(Leica Biosystems)を用いて行った。
均等物
当業者は単なる日常実験を用いて、具体的な実施形態及び本明細書に記載される方法の多くの均等物を認識するか又は確認することが可能である。かかる均等物は本願の範囲に包含されることを意図するものである。
本明細書で引用される全ての特許、特許出願及び文献参照は引用することにより明白に本明細書の一部をなす。

Claims (25)

  1. 構造:
    デグロン−リンカー−標的指向性リガンド
    を有する二官能性化合物であって、前記リンカーが少なくとも1つのデグロン及び少なくとも1つの標的指向性リガンドに共有結合し、前記デグロンがユビキチンリガーゼに結合可能な化合物であり、前記標的指向性リガンドが標的タンパク質に結合することが可能である、二官能性化合物。
  2. 前記デグロンがE3ユビキチンリガーゼに結合することが可能な化合物である、請求項1に記載の化合物。
  3. 前記デグロンがセレブロンに結合することが可能な化合物である、請求項2に記載の化合物。
  4. 前記デグロンが式D0:
    (式中、
    は、
    であり、
    Yは結合、Y、O、NH、NR、C(O)O、C(O)NR’、Y−O、Y−NH、Y−NR、Y−C(O)、Y−C(O)O、Y−OC(O)、Y−C(O)NR’又はY−NR’C(O)であり、ここでYはC〜Cアルキレン、C〜Cアルケニレン又はC〜Cアルキニレンであり、
    XはC(O)又はC(Rであり、
    −XはC(R)=N又はC(R−C(Rであり、
    は各々独立してハロゲン、ニトロ、NH、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル又はC〜Cアルコキシであり、
    はC〜Cアルキル、C〜Cアルケニル、C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C(O)−C〜Cアルキル、C(O)−C〜Cアルケニル、C(O)−C〜Cシクロアルキル又はC(O)−3員〜8員のヘテロシクロアルキルであり、Rはハロゲン、N(R、NHC(O)R、NHC(O)OR、OR、C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールの1つ以上で任意に置換され、ここで前記C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に更に置換され、
    ’はH、C〜Cアルキル、C〜Cアルケニル、C〜Cシクロアルキル又は3員〜8員のヘテロシクロアルキルであり、R’はHでない場合、ハロゲン、N(R、NHC(O)R、NHC(O)OR、OR、C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールの1つ以上で任意に置換され、ここで前記C〜Cシクロアルキル、3員〜8員のヘテロシクロアルキル、C〜C10アリール又は5員〜10員のヘテロアリールは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に更に置換され、
    は各々独立してH、又はC〜C10アリール若しくは5員〜10員のヘテロアリールで任意に置換されたC〜Cアルキルであり、
    ’は各々独立してC〜Cアルキルであり、
    は各々独立してH若しくはC〜Cアルキルであるか、又は2つのRが、それらが付着する炭素原子とともにC(O)、C〜C炭素環、若しくはN及びOから選択される1つ若しくは2つのヘテロ原子を含む4員、5員若しくは6員の複素環を形成し、
    はH、C〜Cアルキル、F又はClであり、
    は各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
    はH又はトシルであり、
    tは0又は1であり、
    mは0、1、2又は3であり、
    nは0、1又は2である)の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体であり、
    前記化合物が、
    を介して前記リンカーに共有結合する、請求項3に記載の化合物。
  5. 前記デグロンが式D1:
    の化合物又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体である、請求項4に記載の化合物。
  6. 前記デグロンが表D、D1、D2、D3又はD4から選択される、請求項4に記載の化合物。
  7. 前記デグロンが、
    (式中、Rはリンカーである)から選択される、請求項6に記載の化合物。
  8. 前記デグロンが、
    から選択される、請求項7に記載の化合物。
  9. 前記デグロンが、
    である、請求項8に記載の化合物。
  10. 前記リンカーが結合、又はC、O、N及びSから選択される少なくとも5つの鎖原子を含む炭素鎖である、請求項1に記載の化合物。
  11. 前記リンカーが式L0:
    (式中、
    p1は0〜12から選択される整数であり、
    p2は0〜12から選択される整数であり、
    p3は0〜6から選択される整数であり、
    Wは各々独立して存在しないか、CH、O、S、NH又はNRであり、
    Zは存在しないか、CH、O、NH又はNRであり、
    は各々独立してC〜Cアルキルであり、
    Qはp3が1〜6から選択される整数である場合に存在しないか、−C(O)NH−、−C(O)O−、−CHC(O)NH−若しくは−CHC(O)O−であり、又はQはp3が0〜6から選択される整数である場合にQ、−C〜Cアルキレン−Q又はQ−C〜Cアルキレン−Qであり、ここでQ及びQは各々独立してC〜Cシクロアルキレン、3員〜8員のヘテロシクロアルキレン、C〜C10アリーレン又は5員〜10員のヘテロアリーレンであり、それらは各々ハロゲン、NH、CN、ニトロ、OH、C(O)OH、C〜Cアルキル、C〜Cハロアルキル、C〜Cアルコキシ又はC〜Cハロアルコキシの1つ以上で任意に置換される)のリンカー又はそのエナンチオマー、ジアステレオマー若しくは立体異性体であり、
    前記リンカーがQの隣の、
    で前記デグロンに共有結合し、Zの隣の、
    で前記標的指向性リガンドに共有結合し、前記リンカー中の鎖原子の総数が30未満である、請求項10に記載の化合物。
  12. 前記標的指向性リガンドが式TL−I:
    (式中、
    は、
    であり、
    はS又はC=Cであり、
    はNRa又はOであり、
    nn1は0、1又は2であり、
    Raは各々独立してC〜Cアルキル、(CH0〜3−CN、(CH0〜3−ハロゲン、(CH0〜3−OH、(CH0〜3−C〜Cアルコキシ、C(O)NRaL、OL、NRaL又はLであり、
    RaはH、C〜Cアルキル、(CH0〜3−ヘテロシクリル、(CH0〜3−フェニル又はLであり、ここで前記ヘテロシクリルは1つの飽和した5員又は6員の環並びにN、O及びSから選択される1つ又は2つのヘテロ原子を含み、C〜Cアルキル、L又はC(O)Lで任意に置換され、ここで前記フェニルはC〜Cアルキル、CN、ハロゲン、OH、C〜Cアルコキシ又はLで任意に置換され、
    nn2は0、1、2又は3であり、
    Raは各々独立してC〜Cアルキル、(CH0〜3−CN、(CH0〜3−ハロゲン、L又はC(O)NRaLであり、
    RaはC〜Cアルキルであり、
    RaはH又はC〜Cアルキルであり、
    Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩であるが、
    但し、前記式TL−Iの化合物は1つのLでのみ置換される、請求項1に記載の化合物。
  13. 前記標的指向性リガンドが式TL−I1、TL−I2又はTL−I3:
    の化合物である、請求項12に記載の化合物。
  14. 前記標的指向性リガンドが式TL−II:
    (式中、
    はCRb又はNであり、
    Rb、Rb及びRbは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
    RbはC〜Cシクロアルキルであり、
    Rbは各々独立してH、C〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
    nn3は0、1、2又は3であり、
    Rbは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
    RbはC(O)NRbL、OL、NRbL又はLであり、
    RbはH又はC〜Cアルキルであり、
    Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である、請求項1に記載の化合物。
  15. 前記標的指向性リガンドが式TL−III:
    (式中、
    nn4は0又は1であり、
    RcはC(O)NRcL、OL、NRcL又はLであり、
    RcはH、C〜Cアルキル、C(O)NRcL、OL、NRcL又はLであり、
    RcはH、C〜Cアルキル、C(O)L又はLであり、
    nn5は0、1又は2であり、
    Rcは各々独立してC〜Cアルキル又はC〜Cアルコキシであり、
    Rcは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
    Rcは独立してH又はC〜Cアルキルであり、
    Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩であるが、
    但し、前記式TL−IIIの化合物は1つのLでのみ置換される、請求項1に記載の化合物。
  16. 前記標的指向性リガンドが式TL−IV:
    (式中、
    Rdは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
    nn6は0、1、2又は3であり、
    nn7は0、1、2又は3であり、
    Rdは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
    RdはC(O)NRdL、OL、NRdL又はLであり、
    RdはH又はC〜Cアルキルであり、
    Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である、請求項1に記載の化合物。
  17. 前記標的指向性リガンドが式TL−V:
    (式中、
    Reは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
    nn8は0、1、2又は3であり、
    nn9は0、1、2又は3であり、
    Reは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
    ReはNH−(CH1〜3−C(O)NReL、C(O)NReL、OL、NReL又はLであり、
    ReはH又はC〜Cアルキルであり、
    Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である、請求項1に記載の化合物。
  18. 前記標的指向性リガンドが式TL−VI:
    (式中、
    RfはC(O)NRfL、OL、NRfL又はLであり、
    Rfは独立してH又はC〜Cアルキルであり、
    Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である、請求項1に記載の化合物。
  19. 前記標的指向性リガンドが式TL−VII:
    (式中、
    はCH又はCHCHであり、
    RgはC(O)Rg、又はRgで置換されたC〜Cアルキルであり、
    nn10は0、1、2又は3であり、
    nn11は0、1、2又は3であり、
    Rgは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
    RgはC(O)NRgL、OL、NRgL、L、O−(CH1〜3−C(O)NRgL又はNHC(O)−(CH1〜3−C(O)NRgLであり、
    RgはH又はC〜Cアルキルであり、
    RgはC〜Cアルキルであり、
    RgはC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンで任意に置換されたフェニルであり、
    Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である、請求項1に記載の化合物。
  20. 前記標的指向性リガンドが式TL−VIII:
    (式中、
    Rhは各々独立してH又はC〜Cアルキルであり、
    nn12は0、1、2又は3であり、
    Rhは各々独立してC〜Cアルキル、C〜Cアルコキシ、CN又はハロゲンであり、
    RhはC(O)L又はC(O)−(CH1〜3−C(O)NRhLであり、
    RhはH又はC〜Cアルキルであり、
    RhはH又はC〜Cアルキルであり、
    RhはC〜Cアルキルであり、
    Lはリンカーである)の化合物又はその薬学的に許容可能な塩である、請求項1に記載の化合物。
  21. 前記二官能性化合物が、
    の構造を有する、請求項1に記載の化合物。
  22. 前記二官能性化合物が表Iから選択される、請求項1に記載の化合物。
  23. 疾患又は病態を治療する方法であって、それを必要とする被験体に治療有効量の請求項1〜22のいずれか一項に記載の二官能性化合物を投与することを含む、方法。
  24. 疾患又は病態を治療するための薬剤の製造における請求項1〜22のいずれか一項に記載の二官能性化合物の使用。
  25. 疾患又は病態の治療に使用される、請求項1〜22のいずれか一項に記載の二官能性化合物。
JP2017534302A 2014-12-23 2015-12-23 二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法 Active JP6815318B2 (ja)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2020181254A JP6970802B2 (ja) 2014-12-23 2020-10-29 二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法

Applications Claiming Priority (11)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201462096318P 2014-12-23 2014-12-23
US62/096,318 2014-12-23
US201562128457P 2015-03-04 2015-03-04
US62/128,457 2015-03-04
US201562149170P 2015-04-17 2015-04-17
US62/149,170 2015-04-17
US201562159048P 2015-05-08 2015-05-08
US62/159,048 2015-05-08
US201562189502P 2015-07-07 2015-07-07
US62/189,502 2015-07-07
PCT/US2015/000274 WO2016105518A1 (en) 2014-12-23 2015-12-23 Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2020181254A Division JP6970802B2 (ja) 2014-12-23 2020-10-29 二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法

Publications (3)

Publication Number Publication Date
JP2018502097A true JP2018502097A (ja) 2018-01-25
JP2018502097A5 JP2018502097A5 (ja) 2019-02-14
JP6815318B2 JP6815318B2 (ja) 2021-01-20

Family

ID=55168339

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2017534302A Active JP6815318B2 (ja) 2014-12-23 2015-12-23 二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法
JP2020181254A Active JP6970802B2 (ja) 2014-12-23 2020-10-29 二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2020181254A Active JP6970802B2 (ja) 2014-12-23 2020-10-29 二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法

Country Status (5)

Country Link
US (3) US10125114B2 (ja)
EP (1) EP3256470B1 (ja)
JP (2) JP6815318B2 (ja)
CN (1) CN107257800B (ja)
WO (1) WO2016105518A1 (ja)

Cited By (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2019513746A (ja) * 2016-04-06 2019-05-30 ザ リージェンツ オブ ザ ユニヴァシティ オブ ミシガン リガンド依存性の標的タンパク質分解のための単官能性中間体
JP2019514883A (ja) * 2016-04-22 2019-06-06 デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,インコーポレイテッド サイクリン依存性キナーゼ4/6(cdk4/6)阻害剤のe3リガーゼリガンドとのコンジュゲーションによるcdk4/6の分解および使用法
JP2021512059A (ja) * 2018-01-29 2021-05-13 ダナ−ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド ブルトン型チロシンキナーゼ(btk)阻害剤のe3リガーゼリガンドとのコンジュゲーションによるbtkの分解および使用方法
JP2021514958A (ja) * 2018-02-23 2021-06-17 デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,インコーポレイテッド 選択的なタンパク質分解を誘導するための低分子およびその使用法
JP2021519337A (ja) * 2018-03-26 2021-08-10 シー4 セラピューティクス, インコーポレイテッド Ikarosの分解のためのセレブロン結合剤
JP2021520350A (ja) * 2018-04-01 2021-08-19 アルビナス・オペレーションズ・インコーポレイテッドArvinas Operations, Inc. Brm標的化化合物および関連使用方法
JP2021529807A (ja) * 2018-07-05 2021-11-04 アイカーン スクール オブ メディスン アット マウント シナイ タンパク質チロシンキナーゼ6(ptk6)分解/破壊化合物および使用方法
JP2022504762A (ja) * 2018-10-16 2022-01-13 ダナ-ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド Lrrk2の野生型および変異型の分解誘導剤
JP2022513360A (ja) * 2018-10-09 2022-02-07 ユーブラス バイオセラピューティクス インコーポレーテッド 標的プロテアーゼ分解プラットフォーム(ted)
JP2022523738A (ja) * 2019-02-02 2022-04-26 シーエスピーシー ゾンチー ファーマシューティカル テクノロジー(シージアチュアン)カンパニー,リミテッド 標的ユビキチン化分解brd4タンパク質化合物、その調製方法および応用
JP2023517393A (ja) * 2020-03-17 2023-04-25 メッドシャイン ディスカバリー インコーポレイテッド タンパク質分解調整剤およびその使用方法
JP2023520940A (ja) * 2020-04-09 2023-05-22 ユーブラス バイオセラピューティクス インコーポレーテッド 標的プロテアーゼ分解(ted)プラットフォーム
JP7512306B2 (ja) 2019-04-09 2024-07-08 ラノック セラピューティクス (ハンジョウ) カンパニー リミテッド 標的タンパク質分解のための方法および組成物

Families Citing this family (175)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
HUE035308T2 (en) 2006-09-26 2018-05-02 Celgene Corp 5-substituted quinazoline derivatives as anticancer agents
DK2683708T3 (da) 2011-03-11 2018-01-29 Celgene Corp Faste former af 3-(5-amino-2-methyl-4-oxo-4h-quinazolin-3-yl)-piperidin-2,6-dion og farmaceutiske sammensætninger og anvendelser deraf
CN104755472A (zh) 2012-09-04 2015-07-01 细胞基因公司 3-(5-氨基-2-甲基-4-氧代喹唑啉-3(4h)-基)哌啶-2,6-二酮的同位素体及其制备方法
KR102053484B1 (ko) 2012-12-21 2019-12-06 국립연구개발법인 양자과학기술연구개발기구 뇌 안에 축적된 타우 단백질을 이미징하기 위한 신규한 화합물
KR20160115953A (ko) 2014-01-31 2016-10-06 다나-파버 캔서 인스티튜트 인크. 디아미노피리미딘 벤젠술폰 유도체 및 그의 용도
JP2017504651A (ja) 2014-01-31 2017-02-09 ダナ−ファーバー キャンサー インスティテュート, インコーポレイテッド ジアゼパン誘導体の使用
US9694084B2 (en) 2014-12-23 2017-07-04 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
CN107257800B (zh) 2014-12-23 2020-06-30 达纳-法伯癌症研究所股份有限公司 通过双功能分子诱导靶蛋白降解的方法
US20170327469A1 (en) 2015-01-20 2017-11-16 Arvinas, Inc. Compounds and methods for the targeted degradation of androgen receptor
JP6817962B2 (ja) * 2015-01-20 2021-01-20 アルビナス・オペレーションズ・インコーポレイテッドArvinas Operations, Inc. ターゲティングされたアンドロゲン受容体分解のための化合物および方法
CN108601764A (zh) 2015-03-18 2018-09-28 阿尔维纳斯股份有限公司 用于靶蛋白的增强降解的化合物和方法
WO2017007612A1 (en) 2015-07-07 2017-01-12 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
CA2995036A1 (en) * 2015-08-06 2017-02-09 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Tunable endogenous protein degradation
US9809603B1 (en) 2015-08-18 2017-11-07 Deuterx, Llc Deuterium-enriched isoindolinonyl-piperidinonyl conjugates and oxoquinazolin-3(4H)-yl-piperidinonyl conjugates and methods of treating medical disorders using same
WO2017030814A1 (en) 2015-08-19 2017-02-23 Arvinas, Inc. Compounds and methods for the targeted degradation of bromodomain-containing proteins
SG10202007099TA (en) 2015-09-11 2020-08-28 Dana Farber Cancer Inst Inc Acetamide thienotriazoldiazepines and uses thereof
JP2018526421A (ja) * 2015-09-11 2018-09-13 ダナ−ファーバー キャンサー インスティテュート, インコーポレイテッド シアノチエノトリアゾロジアゼピンおよびこれらの使用
EP3380100A4 (en) 2015-11-25 2019-10-02 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. BIVALENT BROMODOMAIN INHIBITORS AND USES THEREOF
US11001566B2 (en) 2016-01-14 2021-05-11 Kangpu Biopharmaceuticals, Ltd. Quinazolinone derivative, preparation method therefor, pharmaceutical composition, and applications
MX2018011216A (es) 2016-03-16 2019-08-29 H Lee Moffitt Cancer Ct & Res Moléculas pequeñas contra cereblon para mejorar la función efectora de los linfocitos t.
EP3443001A4 (en) 2016-04-11 2020-04-29 Obsidian Therapeutics, Inc. REGULATED BIOCIRCUIT SYSTEMS
EP3892272B1 (en) 2016-04-22 2024-07-24 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Bifunctional molecules for degradation of egfr and methods of use
CN109153675B (zh) * 2016-04-22 2023-05-02 达纳-法伯癌症研究所公司 细胞周期蛋白依赖性激酶9通过cdk9抑制剂与e3连接酶配体的缀合的降解及使用方法
CN109790143A (zh) 2016-05-10 2019-05-21 C4医药公司 用于靶蛋白降解的胺连接的c3-戊二酰亚胺降解决定子体
WO2017197036A1 (en) 2016-05-10 2017-11-16 C4 Therapeutics, Inc. Spirocyclic degronimers for target protein degradation
CN109562107A (zh) 2016-05-10 2019-04-02 C4医药公司 用于靶蛋白降解的杂环降解决定子体
CN109641874A (zh) 2016-05-10 2019-04-16 C4医药公司 用于靶蛋白降解的c3-碳连接的戊二酰亚胺降解决定子体
US10702504B2 (en) 2016-06-23 2020-07-07 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Degradation of tripartite motif-containing protein 24 (TRIM24) by conjugation of TRIM24 inhibitors with E3 ligase ligand and methods of use
CN107586315B (zh) * 2016-07-08 2020-03-31 成都海创药业有限公司 一种嵌合分子
WO2018010142A1 (en) * 2016-07-14 2018-01-18 Shanghai Meton Pharmaceutical Co., Ltd Iso-citrate dehydrogenase (idh) inhibitor
US20180072711A1 (en) 2016-09-15 2018-03-15 Arvinas, Inc. Indole derivatives as estrogen receptor degraders
WO2018064589A1 (en) 2016-09-29 2018-04-05 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Targeted protein degradation using a mutant e3 ubiquitin ligase
PL3660004T3 (pl) 2016-10-11 2023-10-02 Arvinas Operations, Inc. Związki i sposoby do ukierunkowanej degradacji receptora androgenowego
AU2017346845B2 (en) * 2016-10-18 2021-12-02 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Pyrimido-diazepinone kinase scaffold compounds and methods of treating DCLK1/2-mediated disorders
KR20190084063A (ko) 2016-10-28 2019-07-15 이칸 스쿨 오브 메디슨 엣 마운트 시나이 Ezh2-매개성 암 치료용 조성물 및 방법
AU2017361156A1 (en) * 2016-11-15 2019-06-06 Tokyo University Of Science Foundation Molecular kinetics evaluation method and screening method
AU2017363257B2 (en) 2016-11-22 2021-08-19 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Degradation of protein kinases by conjugation of protein kinase inhibitors with E3 ligase ligand and methods of use
JP7038712B2 (ja) * 2016-11-22 2022-03-18 デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,インコーポレイテッド ブルトン型チロシンキナーゼ(btk)阻害剤のe3リガーゼリガンドとのコンジュゲーションによるbtkの分解および使用法
US10647698B2 (en) 2016-12-01 2020-05-12 Arvinas Operations, Inc. Tetrahydronaphthalene and tetrahydroisoquinoline derivatives as estrogen receptor degraders
CN110267659A (zh) * 2016-12-08 2019-09-20 西奈山伊坎医学院 用于治疗cdk4/6介导的癌症的组合物和方法
US11173211B2 (en) 2016-12-23 2021-11-16 Arvinas Operations, Inc. Compounds and methods for the targeted degradation of rapidly accelerated Fibrosarcoma polypeptides
EP3558994A4 (en) 2016-12-23 2021-05-12 Arvinas Operations, Inc. COMPOUNDS AND METHODS FOR TARGETED DEGRADATION OF RAPIDLY ACCELERATED FIBROSARCOMA POLYPEPTIDES
JP2020505327A (ja) * 2016-12-23 2020-02-20 アルビナス・オペレーションズ・インコーポレイテッドArvinas Operations, Inc. Egfrタンパク質分解標的化キメラ分子およびその関連する使用方法
US11034667B2 (en) 2017-01-09 2021-06-15 Shuttle Pharmaceuticals, Inc. Selective histone deacetylase inhibitors for the treatment of human disease
US11584733B2 (en) 2017-01-09 2023-02-21 Shuttle Pharmaceuticals, Inc. Selective histone deacetylase inhibitors for the treatment of human disease
US11654157B2 (en) 2017-01-09 2023-05-23 Shuttle Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for cancer therapies that include delivery of halogenated thymidines and thymidine phosphorylase inhibitors in combination with radiation
AU2018211975B2 (en) 2017-01-26 2022-05-26 Arvinas Operations, Inc. Modulators of estrogen receptor proteolysis and associated methods of use
KR20190116315A (ko) * 2017-01-31 2019-10-14 아비나스 오퍼레이션스, 인코포레이티드 세레블론 리간드 및 이를 포함하는 이작용성 화합물
CN111386263A (zh) * 2017-02-08 2020-07-07 达纳-法伯癌症研究所有限公司 调节嵌合抗原受体
JP7273713B2 (ja) * 2017-02-08 2023-05-15 ダナ-ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド ヘテロ二官能性化合物を用いた調整可能な内因性タンパク質分解
US10357493B2 (en) 2017-03-10 2019-07-23 Selenity Therapeutics (Bermuda), Ltd. Metalloenzyme inhibitor compounds
US11261179B2 (en) 2017-04-14 2022-03-01 University Of Dundee Small molecules
US10787443B2 (en) 2017-04-28 2020-09-29 Zamboni Chem Solutions Inc. RAF-degrading conjugate compounds
WO2018237026A1 (en) 2017-06-20 2018-12-27 C4 Therapeutics, Inc. N / O-LINKED DEGRONS AND DEGRONIMERS FOR DEGRADATION OF PROTEINS
CA3069181A1 (en) * 2017-07-12 2019-01-17 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Compounds for tau protein degradation
CN118108706A (zh) 2017-09-04 2024-05-31 C4医药公司 戊二酰亚胺
EP3679028A1 (en) 2017-09-04 2020-07-15 C4 Therapeutics, Inc. Dihydroquinolinones
EP3679027A1 (en) 2017-09-04 2020-07-15 C4 Therapeutics, Inc. Dihydrobenzimidazolones
IL295603B2 (en) 2017-09-22 2024-03-01 Kymera Therapeutics Inc Protein compounds and their uses
US11358948B2 (en) 2017-09-22 2022-06-14 Kymera Therapeutics, Inc. CRBN ligands and uses thereof
WO2019079701A1 (en) * 2017-10-20 2019-04-25 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. HETEROBIFUNCTIONAL COMPOUNDS HAVING IMPROVED SPECIFICITY FOR BRD4 BROMODOMAINE
WO2019099868A2 (en) 2017-11-16 2019-05-23 C4 Therapeutics, Inc. Degraders and degrons for targeted protein degradation
EP3724180B1 (en) 2017-12-13 2023-02-22 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Compounds for the degradation of stk4 and treatment of hematologic malignancies
EP3724216A1 (en) * 2017-12-15 2020-10-21 Dana Farber Cancer Institute, Inc. Stabilized peptide-mediated targeted protein degradation
CN111491933A (zh) 2017-12-18 2020-08-04 豪夫迈·罗氏有限公司 具有e3泛素连接酶部分的egfr双功能抑制剂
AU2018396142A1 (en) * 2017-12-26 2020-07-16 Kymera Therapeutics, Inc. IRAK degraders and uses thereof
EP3737675A4 (en) 2018-01-12 2022-01-05 Kymera Therapeutics, Inc. CRBN LIGANDS AND THEIR USES
EP3737666A4 (en) * 2018-01-12 2022-01-05 Kymera Therapeutics, Inc. PROTEIN DEGRADANTS AND USES THEREOF
TW201945357A (zh) 2018-02-05 2019-12-01 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 化合物
AU2019220632B2 (en) 2018-02-14 2024-02-22 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. IRAK degraders and uses thereof
US20200377477A1 (en) * 2018-02-20 2020-12-03 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Degraders of egfr and methods of use thereof
AU2019225811A1 (en) * 2018-02-20 2020-07-09 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Degraders of EGFR and methods of use thereof
US11472799B2 (en) 2018-03-06 2022-10-18 Icahn School Of Medicine At Mount Sinai Serine threonine kinase (AKT) degradation / disruption compounds and methods of use
KR20240095318A (ko) * 2018-04-04 2024-06-25 아비나스 오퍼레이션스, 인코포레이티드 단백질분해 조절제 및 연관된 사용 방법
CN118480030A (zh) * 2018-04-13 2024-08-13 阿尔维纳斯运营股份有限公司 小脑蛋白配体和包括其的双官能化合物
WO2019204354A1 (en) 2018-04-16 2019-10-24 C4 Therapeutics, Inc. Spirocyclic compounds
EP3556760A1 (en) 2018-04-19 2019-10-23 F. Hoffmann-La Roche AG Spiro compounds
PL3784663T3 (pl) 2018-04-23 2023-12-27 Celgene Corporation Podstawione związki 4-aminoizoindolino-1,3-dionowe i ich zastosowanie do leczenia chłoniaka
EP3578561A1 (en) 2018-06-04 2019-12-11 F. Hoffmann-La Roche AG Spiro compounds
WO2020010177A1 (en) 2018-07-06 2020-01-09 Kymera Therapeutics, Inc. Tricyclic crbn ligands and uses thereof
WO2020014489A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 H. Lee Moffitt Cancer Center And Research Institute, Inc. Dimeric immuno-modulatory compounds against cereblon-based mechanisms
JP7515175B2 (ja) 2018-07-31 2024-07-12 ファイメクス株式会社 複素環化合物
JP7297053B2 (ja) 2018-08-20 2023-06-23 アルビナス・オペレーションズ・インコーポレイテッド 神経変性疾患を治療するためのe3ユビキチンリガーゼ結合活性を有するキメラ(protac)化合物を標的とし、アルファ-シヌクレインタンパク質を標的とするタンパク質分解
WO2020051235A1 (en) 2018-09-04 2020-03-12 C4 Therapeutics, Inc. Compounds for the degradation of brd9 or mth1
WO2020064002A1 (zh) * 2018-09-30 2020-04-02 中国科学院上海药物研究所 异吲哚啉类化合物、其制备方法、药物组合物及用途
EP3867263B1 (en) 2018-10-16 2023-03-08 Boehringer Ingelheim International GmbH Proteolysis targeting chimera (protacs) as degraders of smarca2 and/or smarca4
US10844039B2 (en) 2018-11-13 2020-11-24 Biotheryx, Inc. Substituted isoindolinones
CA3119773A1 (en) 2018-11-30 2020-06-04 Kymera Therapeutics, Inc. Irak degraders and uses thereof
JP7494181B2 (ja) 2018-12-19 2024-06-03 セルジーン コーポレイション 置換3-((3-アミノフェニル)アミノ)ピペリジン-2,6-ジオン化合物、その組成物、及びそれを用いた治療方法
AU2019404022A1 (en) 2018-12-19 2021-07-08 Celgene Corporation Substituted 3-((3-aminophenyl)amino)piperidine-2,6-dione compounds, compositions thereof, and methods of treatment therewith
WO2020132561A1 (en) 2018-12-20 2020-06-25 C4 Therapeutics, Inc. Targeted protein degradation
US11098025B2 (en) 2019-01-30 2021-08-24 Montelino Therapeutics, Inc. Bi-functional compounds and methods for targeted ubiquitination of androgen receptor
US11547759B2 (en) 2019-01-30 2023-01-10 Montelino Therapeutics, Inc. Bi-functional compounds and methods for targeted ubiquitination of androgen receptor
US11493519B2 (en) 2019-02-08 2022-11-08 Dewpoint Therapeutics, Inc. Methods of characterizing condensate-associated characteristics of compounds and uses thereof
CN109879877B (zh) * 2019-03-04 2021-08-10 吉林大学 一种可降解plk1和brd4蛋白的化合物及其应用
CN113557235A (zh) 2019-03-06 2021-10-26 C4医药公司 用于药物治疗的杂环化合物
EP3941528A1 (en) 2019-03-21 2022-01-26 Codiak BioSciences, Inc. Extracellular vesicle conjugates and uses thereof
US20220153722A1 (en) 2019-04-04 2022-05-19 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Cdk2/5 degraders and uses thereof
CA3135802A1 (en) 2019-04-05 2020-10-08 Kymera Therapeutics, Inc. Stat degraders and uses thereof
CA3132348A1 (en) * 2019-04-10 2020-10-15 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Degraders of fibroblast growth factor receptor 2 (fgfr2)
CN110028439B (zh) * 2019-04-25 2020-11-13 四川大学 邻苯二甲酰亚胺类衍生物及其制备方法和用途
WO2020233512A1 (zh) * 2019-05-17 2020-11-26 成都海创药业有限公司 一种芳香胺类靶向ar和bet的蛋白降解嵌合体化合物及用途
CA3144062A1 (en) * 2019-06-27 2020-12-30 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Compounds, compositions, and methods for protein degradation
WO2020264499A1 (en) 2019-06-28 2020-12-30 Kymera Therapeutics, Inc. Irak degraders and uses thereof
JP7548992B2 (ja) 2019-07-17 2024-09-10 アルビナス・オペレーションズ・インコーポレイテッド タウタンパク質標的化化合物および関連する使用方法
WO2021011871A1 (en) * 2019-07-17 2021-01-21 Kymera Therapeutics, Inc. Mertk degraders and uses thereof
CN115246821A (zh) * 2019-07-31 2022-10-28 休斯敦大学系统 多激酶降解剂
US10947253B2 (en) 2019-08-05 2021-03-16 Ankh Life Sciences Limited Fused polycyclic dimers
CN114222588A (zh) 2019-08-12 2022-03-22 雷杰纳荣制药公司 巨噬细胞刺激1受体(mst1r)变体及其用途
CN112409376A (zh) * 2019-08-20 2021-02-26 华东师范大学 一种基于dcaf15的蛋白降解靶向嵌合体及其制备方法和应用
TWI758832B (zh) * 2019-08-23 2022-03-21 中國商北京泰德製藥股份有限公司 抑制並誘導降解egfr和alk的化合物
CN114729941A (zh) 2019-09-18 2022-07-08 露点治疗公司 筛选凝聚物相关特异性的方法及其用途
CN112574174B (zh) * 2019-09-27 2021-12-07 恩瑞生物医药科技(上海)有限公司 蛋白降解靶向嵌合体类化合物及其制备方法和医药用途
US20220378919A1 (en) * 2019-09-27 2022-12-01 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Erk5 degraders as therapeutics in cancer and inflammatory diseases
US20220378923A1 (en) * 2019-09-30 2022-12-01 Kyowa Kirin Co., Ltd. Bet degrader
JP2023511472A (ja) * 2019-10-29 2023-03-20 エフ・ホフマン-ラ・ロシュ・アクチェンゲゼルシャフト がんの治療のための二官能性化合物
WO2021092153A1 (en) * 2019-11-06 2021-05-14 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Selective dual histone deacetylase 6/8 (hdac6/8) degraders and methods of use thereof
CA3161455A1 (en) 2019-11-13 2021-05-20 Aprinoia Therapeutics Limited Compounds for degrading tau protein aggregates and uses thereof
WO2021127283A2 (en) 2019-12-17 2021-06-24 Kymera Therapeutics, Inc. Irak degraders and uses thereof
JP2023509366A (ja) 2019-12-17 2023-03-08 カイメラ セラピューティクス, インコーポレイテッド Irak分解剤およびそれらの使用
TW202136240A (zh) 2019-12-19 2021-10-01 美商亞文納營運公司 用於靶向降解雄激素受體之化合物及方法
BR112022011827A2 (pt) 2019-12-20 2022-08-30 C4 Therapeutics Inc Composto, composição farmacêutica, uso de um composto, métodos para tratamento ou profilaxia de câncer e para tratar um paciente com um distúrbio mediado por receptor do fator de crescimento epidérmico, e, invenção
CA3162502A1 (en) 2019-12-23 2021-07-01 Yi Zhang Smarca degraders and uses thereof
IL295709A (en) 2020-03-05 2022-10-01 C4 Therapeutics Inc Compounds for targeted knockdown of brd9
CN113387932B (zh) * 2020-03-14 2023-05-09 成都先导药物开发股份有限公司 一种诱导brd4蛋白降解的双功能化合物
BR112022018678A2 (pt) 2020-03-19 2022-11-01 Kymera Therapeutics Inc Degradadores de mdm2 e usos dos mesmos
CA3181782A1 (en) 2020-05-09 2021-11-18 Arvinas Operations, Inc. Methods of manufacturing a bifunctional compound, ultrapure forms of the bifunctional compound, and dosage forms comprising the same
TW202210483A (zh) 2020-06-03 2022-03-16 美商凱麥拉醫療公司 Irak降解劑之結晶型
WO2021262693A1 (en) * 2020-06-22 2021-12-30 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Methotrexate analogs and methods of use
US11839659B2 (en) 2020-07-02 2023-12-12 Northwestern University Proteolysis-targeting chimeric molecules (PROTACs) that induce degradation of indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO) protein
CA3186944A1 (en) * 2020-08-07 2022-02-10 Francis Barany Therapeutic composition of cure-pro compounds for targeted degradation of bet domain proteins, and methods of making and usage
WO2022033548A1 (zh) * 2020-08-14 2022-02-17 上海科技大学 免疫调节化合物及其抗肿瘤应用
WO2022065962A1 (ko) * 2020-09-28 2022-03-31 한국화학연구원 Mlkl 결합 또는 분해용 화합물 및 이들의 의약 용도
US20240025902A1 (en) * 2020-09-30 2024-01-25 Beigene, Ltd. Bifunctional compounds for degradation of egfr and related methods of use
WO2022072538A1 (en) * 2020-09-30 2022-04-07 Biotheryx, Inc. Antibody-drug conjugates, pharmaceutical compositions thereof, and their therapeutic applications
WO2022078350A1 (en) * 2020-10-14 2022-04-21 Ranok Therapeutics (Hangzhou) Co. Ltd. Methods and compositions for targeted protein degradation
CA3194351A1 (en) * 2020-10-14 2022-04-21 Christopher G. Nasveschuk Tricyclic compounds to degrade neosubstrates for medical therapy
IL302669A (en) * 2020-11-06 2023-07-01 Prelude Therapeutics Inc BRM-targeted compounds and related methods of use
CA3201418A1 (en) * 2020-11-09 2022-05-12 The General Hospital Corporation Bifunctional compounds and methods of using the same
WO2022120355A1 (en) 2020-12-02 2022-06-09 Ikena Oncology, Inc. Tead degraders and uses thereof
TW202237095A (zh) 2020-12-03 2022-10-01 德商艾斯巴赫生物有限公司 Alc1抑制劑及與parpi之協同性
MX2023008296A (es) 2021-01-13 2023-09-29 Monte Rosa Therapeutics Inc Compuestos de isoindolinona.
EP4288434A1 (en) 2021-02-02 2023-12-13 Les Laboratoires Servier Selective bcl-xl protac compounds and methods of use
EP4317146A1 (en) 2021-03-29 2024-02-07 Jiangsu Hengrui Pharmaceuticals Co., Ltd. Tetrahydronaphthalene compound, and preparation method therefor and use thereof in medicine
EP4323340A2 (en) 2021-04-13 2024-02-21 President and Fellows of Harvard College E3 ligase binders and uses thereof
CN117279910A (zh) 2021-04-16 2023-12-22 阿尔维纳斯运营股份有限公司 Bcl6蛋白水解的调节剂和其相关使用方法
US20240261417A1 (en) * 2021-04-23 2024-08-08 Shanghai Leadingtac Pharmaceutical Co. Ltd. Sos1 degrading agent and preparation method therefor and application thereof
US11981678B2 (en) 2021-04-29 2024-05-14 Northwestern University Substituted [1,2,4]triazolo[4,3-c]pyrimidin-5-amines and proteolysis-targeting chimeric derivatives thereof (PROTACs) that induce degradation of embryonic ectoderm development (EED) protein
US12042543B2 (en) 2021-04-30 2024-07-23 Northwestern University Substituted 3-amino-5-phenylbenzamide compounds as covalent inhibitors of enhancer zeste homolog 2 (EZH2) and proteolysis-targeting chimeric derivatives thereof (PROTACs) that induce degradation of EZH2
CA3216280A1 (en) * 2021-05-03 2022-11-10 Eric S. FISCHER Class iia histone deacetylase (hdac) degrader ligands and methods of use thereof
AU2022268977A1 (en) 2021-05-05 2023-11-30 Biogen Ma Inc. Compounds for targeting degradation of bruton's tyrosine kinase
WO2023283130A1 (en) 2021-07-04 2023-01-12 Newave Pharmaceutical Inc. Isoquinoline derivatives as mutant egfr modulators and uses thereof
WO2023283372A1 (en) 2021-07-07 2023-01-12 Biogen Ma Inc. Compounds for targeting degradation of irak4 proteins
TW202321236A (zh) 2021-07-07 2023-06-01 美商百健Ma公司 用於靶向irak4蛋白降解之化合物
IL309666A (en) 2021-07-09 2024-02-01 Plexium Inc Aryl compounds and pharmaceutical preparations that modulate IKZF2
CR20240080A (es) 2021-08-18 2024-04-09 Gilead Sciences Inc Degradadores bifuncionales de quinasas asociadas al receptor de interleucina 1 y usos terapéuticos de los mismos
CN113735824B (zh) * 2021-09-07 2023-06-20 中国科学院成都生物研究所 靶向降解酪氨酸酶的protac及其应用
US11981672B2 (en) 2021-09-13 2024-05-14 Montelino Therapeutics Inc. Bi-functional compounds and methods for targeted ubiquitination of androgen receptor
CA3236262A1 (en) 2021-10-25 2023-05-04 Isaac Marx Tyk2 degraders and uses thereof
WO2023133260A2 (en) * 2022-01-07 2023-07-13 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Chemical targeting swi/snf related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4 (smarca4) and use in diffuse intrinsic pontine glioma (dipg)
WO2023138607A1 (en) * 2022-01-18 2023-07-27 Beigene , Ltd. Degradation of (egfr) by conjugation of egfr inhibitors with e3 ligase ligand and methods of use
IL314437A (en) 2022-01-31 2024-09-01 Kymera Therapeutics Inc IRAK joints and their uses
CN114656451A (zh) * 2022-03-29 2022-06-24 海南医学院 一类苯甲酰胺衍生物及制备方法、应用
WO2023213833A1 (en) 2022-05-02 2023-11-09 Eisbach Bio Gmbh Use of alc1 inhibitors and synergy with parpi
WO2023220577A1 (en) * 2022-05-10 2023-11-16 Prelude Therapeutics, Incorporated 6,6a,7,8,9,10-hexahydro-5h-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazine derivatives as smarca4 protein degraders for the treatment of cancer
WO2023220722A2 (en) * 2022-05-13 2023-11-16 Institute For Cancer Research D/B/A The Research Institute Of Fox Chase Cancer Center Pak1 degraders and methods of use thereof
CN114890989B (zh) * 2022-05-25 2024-03-22 广东晨康生物科技有限公司 一种含氮衍生物为Linker的HDAC8降解剂其制备方法和应用
WO2024006776A1 (en) 2022-06-27 2024-01-04 Relay Therapeutics, Inc. Estrogen receptor alpha degraders and medical use thereof
WO2024006781A1 (en) 2022-06-27 2024-01-04 Relay Therapeutics, Inc. Estrogen receptor alpha degraders and use thereof
WO2024050016A1 (en) 2022-08-31 2024-03-07 Oerth Bio Llc Compositions and methods for targeted inhibition and degradation of proteins in an insect cell
US11957759B1 (en) 2022-09-07 2024-04-16 Arvinas Operations, Inc. Rapidly accelerated fibrosarcoma (RAF) degrading compounds and associated methods of use
WO2024064358A1 (en) 2022-09-23 2024-03-28 Ifm Due, Inc. Compounds and compositions for treating conditions associated with sting activity
WO2024072178A1 (ko) * 2022-09-30 2024-04-04 (주)사이러스테라퓨틱스 표적 단백질 분해를 위한 화합물 및 이의 용도
WO2024081913A1 (en) * 2022-10-14 2024-04-18 76Bio, Inc. Dual-specific bifunctional fusion proteins for ubiquitin-mediated degradation
CN116585322B (zh) * 2023-01-16 2023-10-13 中山大学中山眼科中心 Bet蛋白降解剂在预防和治疗视网膜退行性改变相关疾病中的应用

Citations (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1336602A1 (en) * 2002-02-13 2003-08-20 Giovanni Scaramuzzino Nitrate prodrugs able to release nitric oxide in a controlled and selective way and their use for prevention and treatment of inflammatory, ischemic and proliferative diseases
JP2004525889A (ja) * 2000-12-27 2004-08-26 セルジーン・コーポレーション イソインドール−イミド化合物、組成物、およびそれらの使用
WO2005016326A2 (en) * 2003-07-11 2005-02-24 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Analogs of thalidomide as potential angiogenesis inhibitors
JP2006520741A (ja) * 2002-11-08 2006-09-14 ティーエス ファルマ 生物医学的及び医学的使用のための新規な両親媒性(ampiphilic)フッ素化炭化水素分子ベクター
JP2008546797A (ja) * 2005-06-22 2008-12-25 プレキシコン,インコーポレーテッド キナーゼ調節のための化合物および方法,およびその適応症
JP2010502627A (ja) * 2006-08-30 2010-01-28 セルジーン・コーポレーション 5−置換イソインドリン化合物
JP2011522803A (ja) * 2008-05-30 2011-08-04 セルジーン コーポレイション 5−置換イソインドリン化合物
WO2012082436A2 (en) * 2010-12-03 2012-06-21 Epizyme, Inc. Modulators of histone methyltransferase, and methods of use thereof
WO2013106646A2 (en) * 2012-01-12 2013-07-18 Yale University Compounds and methods for the inhibition of vcb e3 ubiquitin ligase
WO2014004990A2 (en) * 2012-06-29 2014-01-03 Celgene Corporation Methods for determining drug efficacy using cereblon-associated proteins
WO2014026198A1 (en) * 2012-08-10 2014-02-13 Epizyme, Inc. Inhibitors of protein methyltransferase dot1l and methods of use thereof
WO2014106643A2 (en) * 2013-01-04 2014-07-10 Danmarks Tekniske Universitet - Dtu Inlet stratification device
JP2017513862A (ja) * 2014-04-14 2017-06-01 アルビナス インコーポレイテッド イミド系タンパク質分解モジュレーター及び関連する使用方法

Family Cites Families (60)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5304121A (en) 1990-12-28 1994-04-19 Boston Scientific Corporation Drug delivery system making use of a hydrogel polymer coating
US5886026A (en) 1993-07-19 1999-03-23 Angiotech Pharmaceuticals Inc. Anti-angiogenic compositions and methods of use
US6231600B1 (en) 1995-02-22 2001-05-15 Scimed Life Systems, Inc. Stents with hybrid coating for medical devices
US6099562A (en) 1996-06-13 2000-08-08 Schneider (Usa) Inc. Drug coating with topcoat
US5837313A (en) 1995-04-19 1998-11-17 Schneider (Usa) Inc Drug release stent coating process
US5635517B1 (en) 1996-07-24 1999-06-29 Celgene Corp Method of reducing TNFalpha levels with amino substituted 2-(2,6-dioxopiperidin-3-YL)-1-oxo-and 1,3-dioxoisoindolines
CN1109037C (zh) 1996-09-13 2003-05-21 三菱制药株式会社 噻吩并-三唑并二氮杂䓬化合物及其医药用途
ZA9710342B (en) 1996-11-25 1998-06-10 Alza Corp Directional drug delivery stent and method of use.
US6273913B1 (en) 1997-04-18 2001-08-14 Cordis Corporation Modified stent useful for delivery of drugs along stent strut
US5891507A (en) 1997-07-28 1999-04-06 Iowa-India Investments Company Limited Process for coating a surface of a metallic stent
TR200101501T2 (tr) 1998-03-16 2002-06-21 Celgene Corporation 2-(2,6-dioksopiperidin-3-il)izoindolin türevleri, bunların hazırlanması ve enflamatuar sitokinlerin inhibitörleri olarak kullanımı.
US6153252A (en) 1998-06-30 2000-11-28 Ethicon, Inc. Process for coating stents
US6248127B1 (en) 1998-08-21 2001-06-19 Medtronic Ave, Inc. Thromboresistant coated medical device
US6306663B1 (en) 1999-02-12 2001-10-23 Proteinex, Inc. Controlling protein levels in eucaryotic organisms
US6258121B1 (en) 1999-07-02 2001-07-10 Scimed Life Systems, Inc. Stent coating
US6203551B1 (en) 1999-10-04 2001-03-20 Advanced Cardiovascular Systems, Inc. Chamber for applying therapeutic substances to an implant device
US6251136B1 (en) 1999-12-08 2001-06-26 Advanced Cardiovascular Systems, Inc. Method of layering a three-coated stent using pharmacological and polymeric agents
WO2002020740A2 (en) 2000-09-08 2002-03-14 California Institute Of Technology Proteolysis targeting chimeric pharmaceutical
US7208157B2 (en) 2000-09-08 2007-04-24 California Institute Of Technology Proteolysis targeting chimeric pharmaceutical
WO2003020722A1 (de) * 2001-09-04 2003-03-13 Boehringer Ingelheim Pharma Gmbh & Co. Kg Neue dihydropteridinone, verfahren zu deren herstellung und deren verwendung als arzneimittel
US6517889B1 (en) 2001-11-26 2003-02-11 Swaminathan Jayaraman Process for coating a surface of a stent
US7189740B2 (en) 2002-10-15 2007-03-13 Celgene Corporation Methods of using 3-(4-amino-oxo-1,3-dihydro-isoindol-2-yl)-piperidine-2,6-dione for the treatment and management of myelodysplastic syndromes
US6861422B2 (en) * 2003-02-26 2005-03-01 Boehringer Ingelheim Pharma Gmbh & Co. Kg Dihydropteridinones, processes for preparing them and their use as pharmaceutical compositions
US20060035903A1 (en) * 2004-08-14 2006-02-16 Boehringer Ingelheim International Gmbh Storage stable perfusion solution for dihydropteridinones
EP2491926B1 (en) 2005-03-22 2018-05-09 President and Fellows of Harvard College Treatment of protein degradation disorders
CA2642273C (en) 2006-02-14 2016-09-20 President And Fellows Of Harvard College Bifunctional histone deacetylase inhibitors
WO2008122038A1 (en) 2007-04-02 2008-10-09 President And Fellows Of Harvard College Regulating autophagy
CA2710740C (en) 2007-12-28 2016-07-19 Shinji Miyoshi Thienotriazolodiazepine compound as antitumor agent
GB0807451D0 (en) * 2008-04-24 2008-05-28 Chroma Therapeutics Ltd Inhibitors of PLK
US20120329803A1 (en) * 2010-02-17 2012-12-27 Boehringer Ingelheim International Gmbh Dihydropteridinones, method for production and use thereof
PT2571503E (pt) 2010-05-14 2015-04-29 Dana Farber Cancer Inst Inc Composições e a sua utilização no tratamento de neoplasia, doença inflamatória e outros distúrbios
US9765019B2 (en) 2010-06-30 2017-09-19 Brandeis University Small-molecule-targeted protein degradation
WO2012075456A1 (en) 2010-12-02 2012-06-07 Constellation Pharmaceuticals Bromodomain inhibitors and uses thereof
CN103502275A (zh) 2010-12-07 2014-01-08 耶鲁大学 融合蛋白的小分子疏水性标记和引起的其降解
WO2012079022A1 (en) 2010-12-10 2012-06-14 Concert Pharmaceuticals, Inc. Substituted dioxopiperidinyl phthalimide derivatives
BRPI1100318A2 (pt) 2011-02-18 2013-05-21 Univ Estadual Paulista Jelio De Mesquita Filho processo de obtenÇço de compostos derivados derivados de anti-inflamatàrios esteràides (aies), composiÇÕes farmacÊuticas contendo tais compostos e seus usos no tratamento de doenÇas de carÁter inflamatàrio.
US20150197497A1 (en) 2011-06-24 2015-07-16 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Selective inhibitors of histone deacetylase isoform 6 and methods thereof
EP3608317A1 (en) * 2012-01-12 2020-02-12 Yale University Compounds & methods for the enhanced degradation of targeted proteins & other polypeptides by an e3 ubiquitin ligase
US20150119435A1 (en) 2012-05-11 2015-04-30 Yale University Compounds useful for promoting protein degradation and methods using same
USRE48175E1 (en) 2012-10-19 2020-08-25 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Hydrophobically tagged small molecules as inducers of protein degradation
BR112015021222A2 (pt) 2013-03-13 2017-07-18 Dana Farber Cancer Inst Inc inibidores de ras e usos dos mesmos
KR20150128842A (ko) 2013-03-14 2015-11-18 글락소스미스클라인 인털렉츄얼 프로퍼티 (넘버 2) 리미티드 브로모도메인 억제제로서의 퓨로피리딘
CN103421061A (zh) * 2013-08-14 2013-12-04 中国药科大学 来那度胺衍生物、其制法及其医药用途
US20160058872A1 (en) 2014-04-14 2016-03-03 Arvinas, Inc. Imide-based modulators of proteolysis and associated methods of use
US20160022642A1 (en) 2014-07-25 2016-01-28 Yale University Compounds Useful for Promoting Protein Degradation and Methods Using Same
US10071164B2 (en) 2014-08-11 2018-09-11 Yale University Estrogen-related receptor alpha based protac compounds and associated methods of use
WO2016065139A1 (en) 2014-10-24 2016-04-28 Fl Therapeutics Llc 3-substituted piperidine-2, 6-diones and non-covalent complexes with albumin
US9694084B2 (en) 2014-12-23 2017-07-04 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
CN107257800B (zh) 2014-12-23 2020-06-30 达纳-法伯癌症研究所股份有限公司 通过双功能分子诱导靶蛋白降解的方法
WO2017007612A1 (en) 2015-07-07 2017-01-12 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
WO2017024317A2 (en) 2015-08-06 2017-02-09 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
CA2995036A1 (en) 2015-08-06 2017-02-09 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Tunable endogenous protein degradation
WO2017117474A1 (en) 2015-12-30 2017-07-06 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Bifunctional compounds for her3 degradation and methods of use
EP3892272B1 (en) 2016-04-22 2024-07-24 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Bifunctional molecules for degradation of egfr and methods of use
WO2017197056A1 (en) 2016-05-10 2017-11-16 C4 Therapeutics, Inc. Bromodomain targeting degronimers for target protein degradation
CN109562107A (zh) 2016-05-10 2019-04-02 C4医药公司 用于靶蛋白降解的杂环降解决定子体
CN109790143A (zh) 2016-05-10 2019-05-21 C4医药公司 用于靶蛋白降解的胺连接的c3-戊二酰亚胺降解决定子体
WO2017197036A1 (en) 2016-05-10 2017-11-16 C4 Therapeutics, Inc. Spirocyclic degronimers for target protein degradation
CN109641874A (zh) 2016-05-10 2019-04-16 C4医药公司 用于靶蛋白降解的c3-碳连接的戊二酰亚胺降解决定子体
WO2018064589A1 (en) * 2016-09-29 2018-04-05 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Targeted protein degradation using a mutant e3 ubiquitin ligase

Patent Citations (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2004525889A (ja) * 2000-12-27 2004-08-26 セルジーン・コーポレーション イソインドール−イミド化合物、組成物、およびそれらの使用
EP1336602A1 (en) * 2002-02-13 2003-08-20 Giovanni Scaramuzzino Nitrate prodrugs able to release nitric oxide in a controlled and selective way and their use for prevention and treatment of inflammatory, ischemic and proliferative diseases
JP2006520741A (ja) * 2002-11-08 2006-09-14 ティーエス ファルマ 生物医学的及び医学的使用のための新規な両親媒性(ampiphilic)フッ素化炭化水素分子ベクター
WO2005016326A2 (en) * 2003-07-11 2005-02-24 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Analogs of thalidomide as potential angiogenesis inhibitors
JP2008546797A (ja) * 2005-06-22 2008-12-25 プレキシコン,インコーポレーテッド キナーゼ調節のための化合物および方法,およびその適応症
JP2010502627A (ja) * 2006-08-30 2010-01-28 セルジーン・コーポレーション 5−置換イソインドリン化合物
JP2011522803A (ja) * 2008-05-30 2011-08-04 セルジーン コーポレイション 5−置換イソインドリン化合物
WO2012082436A2 (en) * 2010-12-03 2012-06-21 Epizyme, Inc. Modulators of histone methyltransferase, and methods of use thereof
WO2013106646A2 (en) * 2012-01-12 2013-07-18 Yale University Compounds and methods for the inhibition of vcb e3 ubiquitin ligase
WO2014004990A2 (en) * 2012-06-29 2014-01-03 Celgene Corporation Methods for determining drug efficacy using cereblon-associated proteins
WO2014026198A1 (en) * 2012-08-10 2014-02-13 Epizyme, Inc. Inhibitors of protein methyltransferase dot1l and methods of use thereof
WO2014106643A2 (en) * 2013-01-04 2014-07-10 Danmarks Tekniske Universitet - Dtu Inlet stratification device
JP2017513862A (ja) * 2014-04-14 2017-06-01 アルビナス インコーポレイテッド イミド系タンパク質分解モジュレーター及び関連する使用方法

Non-Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BR PI1100318−9 A2(BR 2011000318 A2), JPN7019003720, ISSN: 0004157542 *
CONTINO-PEPIN, CHRISTIANE; PARAT, AUDREY; PERINO, SANDRINE; LENOIR, CHRISTINE; VIDAL, MICHEL; GALONS: "Preliminary biological evaluations of new thalidomide analogues for multiple sclerosis application", BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS, vol. 19(3), JPN6019044883, 2009, pages 878 - 881, ISSN: 0004294126 *
ERIC S. FISCHER: "Srructure of the DDB1-CRBN N3 ubiquitin ligase in complex with thalidmaid", NATURE, vol. 512(7512), JPN6019044881, 2014, pages 49 - 53, ISSN: 0004294123 *
LIU, KAI; ZHANG, DATONG; CHOJNACKI, JEREMY; DU, YUHONG; FU, HAIAN; GRANT, STEVEN; ZHANG, SHIJUN: "Design and biological characterization of hybrid compounds of curcumin and thalidomide for multiple", ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY, vol. 11(29), JPN6019044888, 2013, pages 4757 - 4763, ISSN: 0004294125 *
PERINO, SANDRINE; CONTINO-PEPIN, CHRISTIANE; SATCHI-FAINARO, RONIT; BUTTERFIELD, CATHERINE; PUCCI, B: "Inhibition of angiogenesis by THAM-derived cotelomers endowed with thalidomide moieties", BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS, vol. 14(2), JPN6019044890, 2004, pages 421 - 425, ISSN: 0004294124 *
SHOJI, ATSUSHI; KUWAHARA, MASAYASU; OZAKI, HIROAKI; SAWAI, HIROAKI: "Modified DNA Aptamer That Binds the (R)-Isomer of a Thalidomide Derivative with High Enantioselectiv", JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, vol. 129(5), JPN6019044885, 2007, pages 1456 - 1464, ISSN: 0004294127 *

Cited By (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP7001614B2 (ja) 2016-04-06 2022-02-03 ザ リージェンツ オブ ザ ユニヴァシティ オブ ミシガン リガンド依存性の標的タンパク質分解のための単官能性中間体
JP2019513746A (ja) * 2016-04-06 2019-05-30 ザ リージェンツ オブ ザ ユニヴァシティ オブ ミシガン リガンド依存性の標的タンパク質分解のための単官能性中間体
JP2019514883A (ja) * 2016-04-22 2019-06-06 デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,インコーポレイテッド サイクリン依存性キナーゼ4/6(cdk4/6)阻害剤のe3リガーゼリガンドとのコンジュゲーションによるcdk4/6の分解および使用法
JP2021512059A (ja) * 2018-01-29 2021-05-13 ダナ−ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド ブルトン型チロシンキナーゼ(btk)阻害剤のe3リガーゼリガンドとのコンジュゲーションによるbtkの分解および使用方法
US11712458B2 (en) 2018-01-29 2023-08-01 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Degradation of Bruton's tyrosine kinase (BTK) by conjugation of BTK inhibitors with E3 ligase ligand and methods of use
JP2021514958A (ja) * 2018-02-23 2021-06-17 デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,インコーポレイテッド 選択的なタンパク質分解を誘導するための低分子およびその使用法
JP7472026B2 (ja) 2018-02-23 2024-04-22 デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,インコーポレイテッド 選択的なタンパク質分解を誘導するための低分子およびその使用法
US11802132B2 (en) 2018-02-23 2023-10-31 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Small molecules for inducing selective protein degradation and uses thereof
JP2021519337A (ja) * 2018-03-26 2021-08-10 シー4 セラピューティクス, インコーポレイテッド Ikarosの分解のためのセレブロン結合剤
JP2021520350A (ja) * 2018-04-01 2021-08-19 アルビナス・オペレーションズ・インコーポレイテッドArvinas Operations, Inc. Brm標的化化合物および関連使用方法
JP2021529807A (ja) * 2018-07-05 2021-11-04 アイカーン スクール オブ メディスン アット マウント シナイ タンパク質チロシンキナーゼ6(ptk6)分解/破壊化合物および使用方法
JP2022513360A (ja) * 2018-10-09 2022-02-07 ユーブラス バイオセラピューティクス インコーポレーテッド 標的プロテアーゼ分解プラットフォーム(ted)
JP2022504762A (ja) * 2018-10-16 2022-01-13 ダナ-ファーバー キャンサー インスティテュート,インコーポレイテッド Lrrk2の野生型および変異型の分解誘導剤
JP2022523738A (ja) * 2019-02-02 2022-04-26 シーエスピーシー ゾンチー ファーマシューティカル テクノロジー(シージアチュアン)カンパニー,リミテッド 標的ユビキチン化分解brd4タンパク質化合物、その調製方法および応用
JP7394140B2 (ja) 2019-02-02 2023-12-07 シーエスピーシー ゾンチー ファーマシューティカル テクノロジー(シージアチュアン)カンパニー,リミテッド 標的ユビキチン化分解brd4タンパク質化合物、その調製方法および応用
JP7512306B2 (ja) 2019-04-09 2024-07-08 ラノック セラピューティクス (ハンジョウ) カンパニー リミテッド 標的タンパク質分解のための方法および組成物
JP2023517393A (ja) * 2020-03-17 2023-04-25 メッドシャイン ディスカバリー インコーポレイテッド タンパク質分解調整剤およびその使用方法
JP2023520940A (ja) * 2020-04-09 2023-05-22 ユーブラス バイオセラピューティクス インコーポレーテッド 標的プロテアーゼ分解(ted)プラットフォーム

Also Published As

Publication number Publication date
WO2016105518A1 (en) 2016-06-30
US20180009779A1 (en) 2018-01-11
US10125114B2 (en) 2018-11-13
CN107257800A (zh) 2017-10-17
US11059801B2 (en) 2021-07-13
EP3256470B1 (en) 2023-07-26
JP2021020957A (ja) 2021-02-18
US20200317635A1 (en) 2020-10-08
CN107257800B (zh) 2020-06-30
US10669253B2 (en) 2020-06-02
JP6970802B2 (ja) 2021-11-24
US20190071415A1 (en) 2019-03-07
JP6815318B2 (ja) 2021-01-20
EP3256470A1 (en) 2017-12-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6970802B2 (ja) 二官能性分子によって標的化タンパク質分解を誘導する方法
US10464925B2 (en) Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
US11583586B2 (en) Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
WO2017024317A2 (en) Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
KR101528688B1 (ko) 헤테로사이클릭 유도체, 이의 제조 방법 및 이의 의학적 용도
JP5635396B2 (ja) 抗がん活性を有する化合物
JP7320263B2 (ja) Ezh2阻害剤及びその使用
JP2011526295A (ja) 5員および6員複素環化合物
US20230391765A1 (en) Heterobifunctional compounds as degraders of enl
Jiang et al. Discovery of potent glycogen synthase kinase 3/cholinesterase inhibitors with neuroprotection as potential therapeutic agent for Alzheimer’s disease
EP3242661B1 (en) Myc g-quadruplex stabilizing small molecules and their use
JP4794445B2 (ja) キノリンカリウムチャネル阻害剤
Peng et al. Discovery of novel benzohydroxamate-based histone deacetylase 6 (HDAC6) inhibitors with the ability to potentiate anti-PD-L1 immunotherapy in melanoma
JP2008517065A (ja) Brca2−rad51相互作用の破壊のための組成物及び方法
WO2016067012A1 (en) Compounds as sirt2 inhibitors
CN109134433B (zh) 一种抑制rock的化合物及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
RD01 Notification of change of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7426

Effective date: 20181019

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20181225

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20181225

A977 Report on retrieval

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007

Effective date: 20191010

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20191126

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20200225

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20200526

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20200528

A02 Decision of refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02

Effective date: 20200630

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20201029

C60 Trial request (containing other claim documents, opposition documents)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C60

Effective date: 20201029

A911 Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911

Effective date: 20201109

C21 Notice of transfer of a case for reconsideration by examiners before appeal proceedings

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C21

Effective date: 20201110

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20201208

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20201222

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Ref document number: 6815318

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250