JP2009095346A - BLySに免疫特異的に結合する抗体 - Google Patents

BLySに免疫特異的に結合する抗体 Download PDF

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Abstract

【課題】BLySに免疫特異的に結合する抗体および関連分子を提供する。
【解決手段】BLySに免疫特異的に結合する抗体および関連分子。BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントあるいは関連分子を含有する、異常なBLySの発現またはBLySの不適切な機能に関連する疾患または障害の検出または診断のための方法および組成物。BLySに免疫特異的に結合する1以上の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体あるいは関連分子の有効量を動物に投与する工程を包含する、異常なBLySの発現またはBLySの不適切な機能に関連する疾患または障害の予防、処置または寛解のための方法および組成物。
【選択図】なし

Description

(導入)
本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体および関連分子に関する。本発明はまた、異常なBLySもしくはBLySレセプター発現またはBLySもしくはBLySレセプター(BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントもしくは改変体あるいは関連分子を含む)の不適切な機能に関連した疾患または障害を検出、診断、または予後するための方法および組成物に関する。本発明はさらに、異常なBLySもしくはBLySレセプター発現、または不適切なBLyS機能もしくはBLySレセプター機能に関連する疾患または障害を予防、処置または軽減するための方法および組成物に関連し、この方法は、動物(好ましくは、ヒト)にBLySに免疫特異的に結合する有効量の1つ以上の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体あるいは関連分子を投与する工程を包含する。
(発明の背景)
Bリンパ球刺激物質(BLyS)は、インビボおよびインビトロの両方で、B細胞増殖および分化を誘導する腫瘍壊死因子(「TNF」)スーパーファミリーのメンバーである(Mooreら、Science 285:260−263(1999))。BLySは、その単球特異的遺伝子およびタンパク質発現パターンならびにその特異的レセプター分布およびBリンパ球に対する生物学的活性によって、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−13、IL−15、CD40L、またはCD27L(CD70)のような他のB細胞増殖因子およびB細胞分化因子と識別可能である。BLyS発現は、ナチュラルキラー(「NK」)細胞、T細胞またはB細胞上では検出されず、骨髄起源の細胞に制限される。休止単球上のBLyS発現は、インターフェロン−γ(IFN−γ)によって上方制御される。BLySをコードする遺伝子は、染色体13q34にマッピングされている。
BLySは、285アミノ酸のII型膜結合ポリペプチドおよび可溶性の152アミノ酸ポリペプチドとして発現される(Mooreら、1999、前出)。BLySの膜結合形態は、アミノ酸残基47とアミノ酸残基73との間に推定膜貫通スパニングドメインを有する。BLySの可溶性形態のNH末端は、BLySの膜結合形態のAla134で開始する。可溶性組換えBLySは、マウス脾臓B細胞のインビトロ増殖を誘導し、そしてこれらの細胞上の細胞表面レセプターに結合することが示されている(Mooreら、1999、前出)。マウスへの可溶性BLySの投与は、CD45RdullB細胞、Ly6Dbright(ThBとしても知られている)B細胞の比率の増加および血清IgMおよびIgAレベルの増加を生じることが示されている(Mooreら、1999、前出)。従って、BLySは、レセプター分布および生物学的活性の両方において、B細胞向性を示す。
その発現パターンおよび生物学的活性に基づいて、BLySは、B細胞と単球またはこれらの分化した子孫との間のシグナル交換に関与していることが示唆されている。BLySレセプターおよびリガンドの制限された発現パターンは、BLySが、T細胞依存抗原活性化におけるCD40およびCD40Lの調節因子に類似した様式で、T細胞独立応答の調節因子として機能し得ることを示唆する。このように、BLySに免疫特異的に結合する抗体および関連分子は、例えば、自己免疫、新生物、または免疫不全症候群に関連するB細胞障害の処置における医学的有用性を見出し得る。
(発明の要旨)
本発明は、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはそれからなる分子を含む)を含む。詳細には、本発明は、ヒトBLyS(配列番号3228および/もしくは3229)またはヒト単球上で発現されるBLyS;マウスBLyS(配列番号3230および/もしくは3231)またはマウス単球上で発現されるBLyS;ラットBLyS(配列番号3232、3233、3234および/もしくは3235または膜結合形態(例えば、ラット単球の表面上の));あるいはサルBLyS(例えば、配列番号3236および/もしくは3237のサルBLySポリペプチド、サル単球上で発現されるサルBLyS、もしくはBLySの可溶性形態)、好ましくはヒトBLyS、のポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはそれからなる分子を含む)を含む。本発明はまた、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒトにおける異常なBLySもしくはBLySレセプター発現、または不適切なBLySもしくはBLySレセプター機能に関連する疾患または障害を検出、診断または予後するための方法および組成物を包含し、この方法は、BLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはそれからなる分子を含む)の使用を含むかあるいはこれからなる。本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)を用いて検出、診断、または予後され得る疾患および障害としては、免疫障害(例えば、狼瘡、慢性関節リウマチ、多発性硬化症、筋無力症、橋本病、および免疫不全症候群)、炎症障害(例えば、喘息、アレルギー障害、および慢性関節リウマチ)、感染性疾患(例えば、AIDS)、および増殖性障害(例えば、白血病、癌、およびリンパ腫)が挙げられるがこれらに限定されない。本発明はさらに、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒトにおける異常なBLySもしくはBLySレセプター発現、または不適切な機能のBLySもしくはBLySレセプターに関連する疾患または障害を予防、処置または軽減するための方法および組成物を包含し、この方法は、上記動物にBLySに免疫特異的に結合する有効量の1つ以上の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)を投与する工程を包含するかまたはこれからなる。本発明の有効量の抗体を投与することによって予防、処置、または軽減され得る疾患および障害としては、免疫障害(例えば、狼瘡、慢性関節リウマチ、多発性硬化症、筋無力症、橋本病、および免疫不全症候群)、炎症障害(例えば、喘息、アレルギー障害、および慢性関節リウマチ)、感染性疾患(例えば、AIDS)、および増殖性障害(例えば、白血病、癌、およびリンパ腫)が挙げられるがこれらに限定されない。
ファージディスプレイ技術を使用して、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する単鎖抗体分子(「scFv」)(可溶性BLySに免疫特異的に結合するscFv、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFv、およびBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するscFvを含む)を同定した。BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するこれらのscFv(例えば、表1において参照されるアミノ酸配列のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、またはVL CDRを含む)のフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子はまた、これらのscFvをコードする核酸分子および/または分子と同様に、本発明によって包含される。
詳細には、本発明は、以下の表1において参照されるような、配列番号1〜2128、好ましくは配列番号834〜872、1570〜1595、および1886〜1908、そして最も好ましくは配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569、および1881〜1885からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むかあるいはこれらからなるscFvに関連する。特定の実施形態において、本発明は、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合するscFvに関連し、このscFvは、以下の表1に参照されるような、配列番号1563〜1569、好ましくは配列番号1570〜1595、そして最も好ましくは配列番号1563〜1569のアミノ酸配列を含むかあるいはこれらからなる。他の実施形態において、本発明はまた、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvに関し、このscFvは、以下の表1において参照されるような、配列番号1881〜2128、好ましくは配列番号1886〜1908、そして最も好ましくは1881〜1885のアミノ酸配列を含むかあるいはこれらからなる。本発明はさらに、BLySの膜結合形態および可溶性形態の両方に免疫特異的に結合するscFvに関連し、このscFvは、以下の表1において参照されるような、配列番号1〜1562、好ましくは834〜872、そして最も好ましくは配列番号1〜46および321〜329のアミノ酸配列を含むかまたはこれらからなる。BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するこれらのscFv(例えば、表1において参照されるアミノ酸配列のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、またはVL CDRを含む)のフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子はまた、これらのscFvをコードする核酸分子および/または分子と同様に、本発明によって包含される。
本発明は、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)を提供し、この抗体は、以下の表1において参照される可変重(「VH」)ドメインのいずれか1つ、または表1において参照される可変軽(「VL」)ドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれからなる。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、表1において参照されるような、配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVHドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれらからなる。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはそれからなる分子を含む)は、以下の表1において参照されるような、配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれらからなる。BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するこれらのscFv(例えば、表1において参照されるアミノ酸配列のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、またはVL CDRを含む)のフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子はまた、これらの抗体をコードする核酸分子および/または分子と同様に、本発明によって包含される。
本発明はまた、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)を提供し、この抗体は、以下の表1において参照されるVHドメインのいずれか1つ、または表1において参照されるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれからなる。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、表1に参照されるのと同じscFvに含まれるVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれらからなる。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、表1において開示されるような、配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908のscFv由来のVHドメインおよび配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908のscFv由来のVLドメインを含むかあるいはこれらからなる。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、以下の表1において開示されるような、配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908の単一のscFv由来のVHドメインおよびVLドメインを含むかあるいはこれらからなる。BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するこれらの抗体(例えば、表1において参照されるアミノ酸配列のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、またはVL CDRを含む)のフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子はまた、これらの抗体をコードする核酸分子および/または分子と同様に、本発明によって包含される。
本発明はまた、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)を提供し、この抗体は、表1において参照されるVH相補性決定領域(「CDR」)(すなわち、VH CDR1、VH CDR2、またはVH CDR3)のいずれか1つ、2つ、3つまたはそれ以上のアミノ酸配列、および/または表1において参照されるVL CDR(すなわち、VL CDR1、VL CDR2、またはVL CDR3)のいずれか1つ、2つ、3つまたはそれ以上のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれらからなる。1つの実施形態において、本発明の抗体は、表1において参照されるVH CDR1のいずれか1つおよび/または表1において参照されるVL CDR1のいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれからなる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表1において参照されるVH CDR2のいずれか1つおよび/または表1において参照されるVL CDR2のいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれからなる。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、表1において参照されるVH CDR3のいずれか1つおよび/または表1において参照されるVL CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれからなる。BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するこれらの抗体(例えば、表1において参照されるアミノ酸配列のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、またはVL CDRを含む)のフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子はまた、これらの抗体をコードする核酸分子および/または分子と同様に、本発明によって包含される。
別の実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)は、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合し、そして表1において参照されるVH CDR1のいずれか1つ、表1において参照されるVH CDR2のいずれか1つ、および/または表1において参照されるVH CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれからなる。別の実施形態において、本発明の抗体は、表1において参照されるVL CDR1のいずれか1つ、表1において参照されるVL CDR2のいずれか1つ、または表1において参照されるようなVL CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかあるいはこれからなる。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、表1において参照される同じscFvに対応する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、またはそれ以上のCDRを含むかあるいはこれらからなり、より好ましくは、VHドメインのCDR1、CDR2、およびCDR3が同じscFvに対応するか、またはVLドメインのCDR1、CDR2、およびCDR3が同じscFvに対応し、そして最も好ましくは全ての6つのCDRが表1において参照される同じscFvに対応する。BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するこれらの抗体(例えば、表1において参照されるアミノ酸配列のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、またはVL CDRを含む)のフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子はまた、これらの抗体をコードする核酸分子および/または分子と同様に、本発明によって包含される。
本発明はまた、BLyS(例えば、配列番号3228のアミノ酸134〜285からなるポリペプチドまたは単球の表面上で発現されるBLySポリペプチド)の可溶性形態に免疫特異的に結合する;BLyS(配列番号3228のアミノ酸1〜285からなるポリペプチド)の膜結合形態に免疫特異的に結合する;および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合する、抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはそれからなる分子を含む)を提供する。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合し、そしてBLySの可溶性形態に免疫特異的に結合する1つ以上のscFvに対応する、VHドメイン、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VLドメイン、VL CDR1、VL CDR2、および/またはVL CDR3を含むかあるいはこれらからなる。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合し、そしてBLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する1つ以上のscFvに対応する、VHドメイン、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VLドメイン、VL CDR1、VL CDR2、および/またはVL CDR3を含むかあるいはこれらからなる。なお別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySの可溶性形態および膜結合形態に免疫特異的に結合し、そしてBLySの可溶性形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する1つ以上のscFvに対応する、VHドメイン、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VLドメイン、VL CDR1、VL CDR2、および/またはVL CDR3を含むかあるいはこれらからなる。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、表1に開示される同じscFvに対応するVHドメインおよびVLドメインを含むかあるいはこれらからなり、この抗体は、BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合する。これらの抗体をコードする核酸分子はまた、本発明によって包含される。BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、および/またはBLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するこれらの抗体(例えば、表1において参照されるアミノ酸配列のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、またはVL CDRを含む)のフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子はまた、これらの抗体をコードする核酸分子および/または分子と同様に、本発明によって包含される。
本明細書中に開示されたアミノ酸配列のVHドメインは、抗体の抗原結合部位を示すVH/VL対形成を提供するために、本明細書中に開示されたアミノ酸配列のVLドメイン(または他のVLドメイン)と組み合わせられ得る。同様に、本明細書中に開示されたアミノ酸配列のVLドメインは、本明細書中に開示されたアミノ酸配列のVHドメイン(または他のVHドメイン)と組み合わせられ得る。さらに、本明細書中に開示された1つ以上のCDRは、VHドメインまたはVLドメインから取られ得、そして下に議論するように、適切な枠組みに組み込まれ得る。
本発明は、本明細書中に記載されるVHドメイン、VLドメインおよび/またはCDRを含むかあるいはこれらからなる抗体(抗体フラグメントまたはその改変体(誘導体を含む)を含むかあるいはそれからなる分子を含む)を提供し、この抗体は、BLyS(例えば、可溶性BLySおよび膜結合BLyS)に免疫特異的に結合し、そして当該分野で公知の方法(例えば、下に議論されるような免疫アッセイのような)を使用して、BLySに対する免疫特異的結合について慣用的にアッセイされ得る。本発明の抗体および抗体フラグメントまたは改変体(誘導体を含む)は、例えば、1つ以上のアミノ酸配列変更(アミノ酸残基の付加、欠失、置換および/または挿入)を含み得る。これらの変更は、1つ以上の枠組み領域および/または1つ以上のCDRにおいてなされ得る。本発明の抗体(抗体フラグメントおよびその改変体ならびに誘導体を含む)は、当該分野で公知の方法によって慣用的に作製され得る。VHドメイン、VH CDR、VLドメイン、およびVL CDRのいずれかのフラグメントまたは改変体(これらの配列は、本明細書中に詳細に開示される)を含むかあるいはこれからなる分子は、本発明に従って使用され得る。これらの抗体および分子(フラグメント、改変体および誘導体を含む)をコードする核酸はまた、本発明によって包含される。
本発明はまた、抗体(抗体フラグメントまたは改変体を含むかあるいはこれらからなる分子を含む)のパネルを提供し、ここで、パネルメンバーは、本発明の1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個以上の異なる抗体(例えば、抗体全体、Fab、F(ab’)フラグメント、Fdフラグメント、ジスルフィド結合Fvs(sdFv)、抗イディオタイプ(抗Id)抗体、およびscFv)に対応する。本発明はさらに、抗体の混合物を提供し、ここで、この混合物は、本発明の1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個以上の異なる抗体(例えば、抗体全体、Fab、F(ab’)フラグメント、Fdフラグメント、ジスルフィド結合Fvs(sdFv)、抗イディオタイプ(抗Id)抗体、およびscFv)に対応する。本発明はまた、本発明の1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個以上の異なる抗体(それらの抗体フラグメントまたは改変体を含むかあるいはこれらからなる分子を含む)を含むかあるいはこれらからなる組成物を提供する。本発明の組成物は、1つ以上の抗体またはこれらのフラグメントもしくは改変体の1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個以上のアミノ酸配列を含み得るかあるいはこれらからなり得る。あるいは、本発明の組成物は、本発明の1つ以上の抗体をコードする核酸分子を含み得るかあるいはこれらからなり得る。
本発明はまた、本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)および異種ペプチド(すなわち、抗体または抗体ドメインに関連していないポリペプチド)を含む融合タンパク質を提供する。これらの融合タンパク質をコードする核酸分子はまた、本発明によって包含される。本発明の組成物は、本発明の融合タンパク質の1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個以上を含み得るかまたはこれらからなり得る。あるいは、本発明の組成物は、本発明の融合タンパク質の1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個以上をコードする核酸を含み得るかまたはこれらからなり得る。
本発明はまた、本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子(例えば、scFv)を含む)をコードする核酸分子(一般には単離された核酸分子)を提供する。本発明はまた、本発明の核酸分子およびその子孫で形質転換された宿主細胞を提供する。本発明はまた、本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)を生成するための方法を提供する。本発明はさらに、核酸分子から本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)を発現するための方法を提供する。本発明のこれらおよび他の局面は、さらに以下に詳細に記載される。
本発明はまた、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒトにおける異常なBLySもしくはBLySレセプター発現または不適切なBLySまたはBLySレセプター機能に関連する疾患または障害を検出、診断および/または予後するための方法および組成物を包含し、この方法は、BLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)を使用する工程を包含する。本発明の抗体を用いて検出、診断、または予後され得る疾患および障害としては、免疫障害(例えば、狼瘡、慢性関節リウマチ、多発性硬化症、筋無力症、橋本病、および免疫不全症候群)、炎症障害(例えば、喘息、アレルギー障害、および慢性関節リウマチ)、感染性疾患(例えば、AIDS)、および増殖性障害(例えば、白血病、癌、およびリンパ腫)が挙げられるがこれらに限定されない。
特定の実施形態において、本発明は、高ガンマグロブリン血(例えば、AIDS、自己免疫疾患、およびいくつかの免疫不全)に関係する疾患または障害を検出、診断および/または予後するための方法および組成物を包含する。他の特定の実施形態において、本発明は、低ガンマグロブリン血(例えば、免疫不全)に関係する疾患または障害を検出、診断および/または予後するための方法および組成物を包含する。
本発明はさらに、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒトにおける異常なBLySもしくはBLySレセプター発現または不適切なBLySまたはBLySレセプター機能に関連する疾患または障害を予防、処置または軽減するための方法および組成物を包含し、この方法は、BLySに免疫特異的に結合する1つ以上の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいはこれからなる分子を含む)の有効量を上記動物に投与する工程を包含する。本発明の有効量の1つ以上の抗体または分子を投与することによって予防、処置、または阻害され得る疾患および障害としては、免疫障害(例えば、狼瘡、慢性関節リウマチ、多発性硬化症、筋無力症、橋本病、および免疫不全症候群)、炎症障害(例えば、喘息、アレルギー障害、および慢性関節リウマチ)、感染性疾患(例えば、AIDS)、および増殖性障害(例えば、白血病、癌、およびリンパ腫)が挙げられるがこれらに限定されない。
特定の実施形態において、本発明は、高ガンマグロブリン血症(例えば、AIDS、自己免疫疾患、およびいくつかの免疫不全症候群)と関連する疾患または障害を、予防、処置または改善するための方法および組成物(例えば、アンタゴニスト抗BLyS抗体)を含む。他の特定の実施形態において、本発明は、低ガンマグロブリン血症(例えば、免疫不全症候群)と関連する疾患または障害を、予防、処置または改善するための方法および組成物(例えば、アゴニスト抗BLyS抗体)を含む。
本発明の抗体を用いて検出、診断、予測、またはモニターされ得る自己免疫障害、自己免疫疾患または自己免疫障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性新生児血小板減少、特発性血小板減少性紫斑病、自己免疫性好中球減少症、自己免疫性血球減少症、溶血性貧血、抗リン脂質症候群、皮膚炎、グルテン感受性腸症、アレルギー性脳脊髄炎、心筋炎、再発性多発性軟骨炎、リウマチ性心疾患、糸球体腎炎(例えば、IgA ネフロパシー)、多発性硬化症、神経炎、ブドウ膜炎眼結膜炎(Uveitis Ophthalmia)、多発性内分泌腺症、紫斑(例えば、Henloch−Scoenlein紫斑)、ライター病、スティッフマン症候群、自己免疫肺炎症、心筋炎、IgA 糸球体腎炎、デンスデポジット病、リウマチ性心疾患、ギヤン−バレー症候群、インスリン依存性糖尿病、および自己免疫炎症性の眼、自己免疫甲状腺炎、甲状腺機能低下症(すなわち、橋本甲状腺炎、全身性エリテマトーデス(systemic lupus erhythematosus)、円板状狼瘡、グッドパスチャー症候群、天疱瘡、レセプター自己免疫(例えば、(a)グレーヴズ病、(b)重症筋無力症、および(c)インスリン耐性など)、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性血小板減少性紫斑病、慢性関節リウマチ、抗コラーゲン抗体を伴なう強皮症(schleroderma)、混合結合組織病、多発性筋炎/皮膚筋炎、悪性貧血、特発性アディソン病、不妊症、糸球体腎炎(例えば、原発性糸球体腎炎およびIgA ネフロパシー)、水疱性類天疱瘡、シェーグレン症候群、糖尿病、およびアドレナリン作動性薬剤耐性(喘息または嚢胞性線維症を伴なうアドレナリン作動性薬剤耐性を含む)、慢性活性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、他の内分泌腺欠損、白斑、脈管炎、post−MI、心臓切開症候群、じんま疹、アトピー性皮膚炎、喘息、炎症性ミオパシー、および他の炎症、肉芽腫性障害、変性障害、および萎縮性障害)。
本発明の抗体を用いて検出、診断、予知、またはモニターされ得る免疫不全としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:重症複合型免疫不全(SCID)−X連鎖、SCID−常染色体、アデノシンデアミナーゼ欠損症(ADA欠損症)、X連鎖無ガンマグロブリン血症(XLA)、ブルトン病、先天性無ガンマグロブリン血症、X連鎖乳児無ガンマグロブリン血症、後天性無ガンマグロブリン血症、成体発症無ガンマグロブリン血症、遅発性無ガンマグロブリン血症、異常ガンマグロブリン血症、低ガンマグロブリン血症、新生児期の一過性低ガンマグロブリン血症、特定されない低ガンマグロブリン血症、無ガンマグロブリン血症、分類不能型免疫不全(CVID)(後天性)、ヴィスコット−オールドリッチ症候群(WAS)、過剰IgMを伴なうX−連鎖免疫不全、過剰IgMを伴なう非X連鎖免疫欠損、選択的IgA欠損、IgGサブクラス欠損(IgA欠損を伴なうまたは伴なわない)、正常なIgまたは上昇したIgを伴なう抗体欠損、胸腺腫を伴なう免疫不全、Ig重鎖欠損、κ鎖欠損、B細胞リンパ増殖性(lymphoproliferative)障害(BLPD)、選択的IgM免疫不全、劣性無ガンマグロブリン血症(Swiss型)、網様発育不全、新生児好中球減少症、重症先天性白血球減少症、胸腺リンパ形成不全症−免疫不全と関連する発育不全または形成異常、毛細血管拡張性運動失調、短い四肢の小人症、X連鎖リンパ増殖性症候群(XLP)、ネゼロフ症候群−Igに関連する複合型免疫欠損、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ欠乏(PNP)、MHCクラスII欠損(不全リンパ球症候群)および重症複合型免疫欠損。
(定義)
用語「抗体」は、本明細書中に使用される場合、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分(すなわち、抗原と免疫特異的に結合する抗原結合部位を含む分子)をいう。従って、用語「抗体」は、抗体分子全体のみではなく、抗体フラグメントならびに抗体の改変体(誘導体を含む)および抗体フラグメントもまた含む。本願において用語「抗体」によって記載される分子の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:単鎖Fv(scFv)、Fabフラグメント、Fab’フラグメント、F(ab’)、ジスルフィド結合Fv(sdFv)、Fv、およびVLドメインもしくはVHドメインのいずれかを含むかあるいはこれらからなるフラグメント。用語「単鎖Fv」または「scFv」は、本明細書中に使用される場合、抗体のVHドメインに連結した抗体のVLドメインを含むポリペプチドをいう。BLySに免疫特異的に結合する抗体は、他の抗原との交差反応性を有し得る。好ましくは、BLySに免疫特異的に結合する抗体は、他の抗原と交差反応しない。BLySに免疫特異的に結合する抗体は、例えば、免疫アッセイまたは当業者に公知の他の技術(例えば、以下の実施例に記載される免疫アッセイ)によって同定され得る。
本発明の抗体は、モノクローナル抗体、多重特異的抗体、ヒト抗体またはキメラ抗体、単鎖抗体、Fabフラグメント、F(ab’)フラグメント、抗イデオタイプ抗体(抗Id)抗体(例えば、本発明の抗体に対する抗イデオタイプ抗体を含む)、および上記のいずれかのエピトープ結合フラグメント。本発明の免疫グロブリン分子は、免疫グロブリン分子の任意の型(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgAおよびIgY)、クラス(例えば、IgG、IgG、IgG、IgG、IgAおよびIgA)またはサブクラスであり得る。
好ましくは、本発明の抗体は、表1に参照されるもののうちのいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、またはVL CDR、あるいはこれらのフラグメントまたは改変体を含むか、あるいはこれらからなる。
「BLySの可溶性形態に結合する」本発明の抗体は、BLySタンパク質の152アミノ酸の可溶性形態(配列番号3228のアミノ酸134〜285)に結合する抗体である。本発明の特定の実施形態において、「BLySの可溶性形態に結合する」本発明の抗体はまた、BLySの膜結合形態または膜会合形態に結合しない。BLySの可溶性形態に対する結合を測定するアッセイとしては、実施例8および9に記載されるようなレセプター結合阻害アッセイまたは溶液からの可溶性BLySの捕獲が挙げられるが、これらに限定されない。
「BLySの膜結合形態に結合する」本発明の抗体は、膜会合(切断されていない)BLySタンパク質に結合する抗体である。本発明の特定の実施形態において、「BLySの膜結合形態に結合する」本発明の抗体はまた、BLySの可溶性形態に結合しない。ELISAにおけるHISタグ化BLySへの結合(本明細書中に記載されるような)は、抗体がBLySの膜結合形態に結合することの指標であるが、BLySの膜結合形態に対する特異性の証拠として依存されるべきではない。膜結合BLySに対する抗体の特異性の証拠として依存され得るアッセイとしては、実施例2に記載されるようなBLySを発現する原形質膜への結合が挙げられるが、これに限定されない。「BLySの可溶性形態および膜結合形態の両方に結合する」本発明の抗体は、BLySの膜結合形態および可溶性形態の両方に結合する抗体である。
用語「改変体」は、本明細書中に使用される場合、BLySポリペプチド、BLySフラグメント、抗BLyS抗体もしくはその抗体フラグメントと類似または同一の機能を保有するポリペプチドをいうが、このポリペプチドは、必ずしもBLySポリペプチド、BLySフラグメント、抗BLyS抗体もしくはその抗体フラグメントと類似または同一のアミノ酸配列を含む必要も、BLySポリペプチド、BLySフラグメント、抗BLyS抗体もしくはその抗体フラグメントと類似または同一の構造を保有する必要もない。類似のアミノ酸を有する改変体とは、以下のうちの少なくとも1つの満たすポリペプチドをいう:(a)本明細書中に記載されるBLySポリペプチド、BLySフラグメント、抗BLyS抗体もしくはその抗体フラグメント(表1に参照されるもののうちのいずれかのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VHCDR、VLドメイン、またはVLCDRを含む)のアミノ酸配列に対して、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%または少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなる、ポリペプチド;(b)その相補配列が、本明細書中に記載されるBLySポリペプチド(例えば、配列番号3228)、BLySフラグメント、抗BLyS抗体もしくはその抗体フラグメント(表1に参照されるもののうちのいずれかのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VHCDR、VLドメイン、またはVLCDRを含む)をコードするヌクレオチド配列に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされる、少なくとも5アミノ酸残基、少なくとも10アミノ酸残基、少なくとも15アミノ酸残基、少なくとも20アミノ酸残基、少なくとも25アミノ酸残基、少なくとも30アミノ酸残基、少なくとも40アミノ酸残基、少なくとも50アミノ酸残基、少なくとも60アミノ酸残基、少なくとも70アミノ酸残基、少なくとも80アミノ酸残基、少なくとも90アミノ酸残基、少なくとも100アミノ酸残基、少なくとも125アミノ酸残基、または少なくとも150アミノ酸残基のポリペプチド;ならびに(c)本明細書中に記載されるBLySポリペプチド、BLySフラグメント、抗BLyS抗体もしくはその抗体フラグメント(表1に参照されるもののうちのいずれかのアミノ酸配列を有するVHドメイン、VHCDR、VLドメイン、またはVLCDRを含む)をコードするヌクレオチド配列に、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%または少なくとも99%同一であるヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチド。本明細書中に記載されるBLySポリペプチド、BLySフラグメント、抗BLyS抗体もしくはその抗体フラグメントに類似の構造を有するポリペプチドは、本明細書中に記載されるBLySポリペプチド、BLySフラグメント、抗BLyS抗体もしくはその抗体フラグメントの類似した二次構造、三次構造、または四次構造を有するポリペプチドをいう。ポリペプチドの構造は、当業者に公知の方法によって決定され得、これには、X線結晶学、核磁気共鳴、および結晶学的電子顕微鏡が挙げられるが、これらに限定されない。
2つのアミノ酸配列間、または2つの核酸配列間の同一性パーセントを決定するために、配列を最適の比較成果のために整列する(例えば、第2のアミノ酸配列または核酸配列との最適なアライメントのために、第1のアミノ酸配列または核酸配列の配列中に、ギャップが導入され得る)。次いで、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置におけるアミノ酸残基またはヌクレオチドが、比較される。第1配列における位置が、第2配列の対応する位置において同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占有される場合、これらの分子は、その位置において同一である。2つの配列間の同一性パーセントは、配列によって共有される同一な位置の数の関数である(すなわち、同一性(%)=同一な重なり合う位置の数/位置の総数×100(%))。1つの実施形態において、2つの配列は、同じ長さである。
2つの配列間の同一性パーセントの決定は、当業者に公知の数理的アルゴリズムを用いて達成され得る。2つの配列を比較するための数理的アルゴリズムの例は、KarlinおよびAltschul Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:5873−5877(1993)のように改変された、KarlinおよびAltschul Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:2264−2268(1990)のアルゴリズムである。Altschulら、J.Mol.Biol.215:403−410(1990)のBLASTn プログラムおよびBLASTxプログラムは、このようなアルゴリズムの組込んでいる。BLASTヌクレオチド検索は、BLASTnプログラム(スコア=100、ワードレングス=12)を用いて実行され、本発明の核酸分子に相同性のヌクレオチド配列を獲得し得る。BLASTタンパク質検索は、BLASTxプログラム(スコア=50、ワードレングス=3)を用いて実行され、本発明のタンパク質分子に相同なアミノ酸を獲得し得る。比較目的でギャップの入ったアライメントを得るために、Gapped BLASTを、Altschulら、Nucleic Acids Res.25:3389−3402(1997)に記載されるように使用し得る。あるいは、PSI−BLASTを使用して、分子間の遠位関係を検出する反復検索を実行し得る(同書)。BLASTプログラム、Gapped BLASTプログラム、およびPSI−BLASTプログラムを使用する場合、代表的なプログラム(例えば、BLASTxおよびBLASTn)のデフォルト値を使用し得る。(http://www.ncbi.nlm.nih.govを参照のこと)。
配列比較のために使用される数理的アルゴリズムの別の例は、MyersおよびMiller,CABIOS(1989)のアルゴリズムである。GCG配列アライメントソフトウェアパッケージの一部であるALIGNプログラム(バージョン2.0)は、このようなアルゴリズムを組込んでいる。当該分野で公知の配列解析のための他のアルゴリズムとしては、TorellisおよびRobotti、Comput.Appl.Biosci.,10:3−5(1994)に記載されるようなADVANCEおよびADAM;ならびにPearsonおよびLipman、Proc.Natl.Acad.Sci.85:2444−8(1988)に記載されるFASTAが挙げられる。FASTAにおいて、ktupは、検索の検出感度および速度を設定するコントロールオプションである。
用語「誘導体」は、本明細書中に使用される場合、アミノ酸残基の置換、欠失または付加の導入によって変更された、BLySポリペプチド、BLySフラグメントまたはBLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体のアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなる改変体ポリペプチドをいう。用語「誘導体」はまた、本明細書中に使用される場合、例えば、ポリペプチドへのいずれかの型の分子の共有結合によって改変された、BLySポリペプチド、BLySフラグメントまたはBLySに免疫特異的に結合する抗体をいう。例えば、BLySポリペプチド、BLySフラグメントまたはBLyS抗体は、例えば、グリコシル化、アセチル化、ペグ化(pegylation)、リン酸化、アミド化、公知の保護基/ブロッキング基による誘導体化、タンパク質分解性切断、細胞性リガンドもしくは他の分子への連結などによって、改変され得るが、これらに限定されない。BLySポリペプチド、BLySフラグメントまたはBLyS抗体の誘導体は、当業者に公知の技術を用いる化学改変(特異的化学切断、アセチル化、ホルミル化、ツニカマイシンの代謝合成などが挙げられるが、これらに限定されない)によって改変され得る。BLySポリペプチド、BLySフラグメントまたはBLyS抗体の誘導体は、1つ以上の非古典的アミノ酸を含み得る。ポリペプチド誘導体は、本明細書中に記載されるBLySポリペプチド、BLySフラグメントまたはBLyS抗体と類似または同一の機能を保有する。
用語「エピトープ」は、本明細書中に使用される場合、動物(好ましくは哺乳動物)において抗原性活性または免疫原性活性を有するBLySの部分をいう。免疫原性活性を有するエピトープは、動物において抗体応答を誘発するBLySの部分である。抗原性活性を有するエピトープは、当該分野で公知の任意の方法によって決定されるように(例えば、本明細書中に記載される免疫アッセイによって決定されるように)抗体が免疫特異的に結合するBLySの部分である。抗原性エピトープは、免疫原性である必要はない。
用語「フラグメント」は、本明細書中に使用される場合、BLySまたはBLySに免疫特異的に結合する抗BLyS抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいはこれらからなる分子(例えば、scFv)を含む)のアミノ酸配列のうちの、少なくとも5アミノ酸残基、少なくとも10アミノ酸残基、少なくとも15アミノ酸残基、少なくとも20アミノ酸残基、少なくとも25アミノ酸残基、少なくとも30アミノ酸残基、少なくとも35アミノ酸残基、少なくとも40アミノ酸残基、少なくとも45アミノ酸残基、少なくとも50アミノ酸残基、少なくとも60アミノ酸残基、少なくとも70アミノ酸残基、少なくとも80アミノ酸残基、少なくとも90アミノ酸残基、少なくとも100アミノ酸残基、少なくとも125アミノ酸残基、少なくとも150アミノ酸残基、少なくとも175アミノ酸残基、少なくとも200アミノ酸残基、または少なくとも250アミノ酸残基のアミノ酸配列を含むポリペプチドをいう。
用語「融合タンパク質」は、本明細書中に使用される場合、本発明の抗BLyS抗体のアミノ酸配列および異種ポリペプチド(すなわち、抗体または抗体ドメインに無関係のポリペプチド)のアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなる、ポリペプチドをいう。
用語「宿主細胞」は、本明細書中に使用される場合、核酸分子でトランスフェクトされた特定の目的の細胞およびこのような細胞の子孫もしくは潜在的な子孫をいう。子孫は、続く世代で生じ得る変異もしくは環境の影響または宿主細胞ゲノムへの核酸分子の組込みに起因して、核酸分子でトランスフェクトされた親細胞と同一でないかもしれない。
(発明の詳細な説明)
本発明は、BLySまたはBLySのフラグメントもしくは改変体に免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいは抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)を包含する。特に、本発明は、表1において言及されるような、配列番号1〜配列番号2128のいずれか1つのアミノ酸配列を有する抗体(例えば、単鎖Fv(scFv)を提供する。特に、本発明は、以下のポリペプチド、ポリペプチドフラグメントもしくは改変体、またはエピトープに免疫特異的に結合する抗体を包含する:ヒトBLyS(配列番号3228および/もしくは3229)またはヒト単球上に発現されたBLyS;マウスBLyS(配列番号3230および/もしくは3231)またはマウス単球上に発現されたBLyS;ラットBLyS(配列番号3232、配列番号3233、配列番号3234および/もしくは配列番号3235において与えられるような可溶性形態、または例えば、ラット単球上の膜結合形態のいずれか);またはサルBLyS(例えば、配列番号3236および/もしくは配列番号3237のサルBLySポリペプチド、サルBLySの可溶性形態、またはサル単球上に発現されたBLyS)(特異的抗体−抗原結合についてアッセイするための当該分野で公知の免疫アッセイによって決定した場合)。
配列番号3228に示したポリペプチド配列は、1996年10月22日にAmerican Type Culture Collection,10801 University Boulevard,Manassas,Virginia 20110−2209に寄託され、そしてATCC登録番号97768が割り当てられたHNEDU15クローンのcDNAを配列決定および翻訳することによって得られた。寄託されたクローンは、pBluescript SK(−)プラスミド(Stratagene,La Jolla,CA)に含まれる。ATCC寄託は、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約の条項に拠って行われた。
配列番号3229に示されるポリペプチド配列は、1998年12月10日にAmerican Type Culture Collectionに寄託され、そしてATCC登録番号203518が割り当てられたHDPMC52クローンのcDNAを配列決定および翻訳することによって得られた。寄託されたクローンは、pBluescript SK(−)プラスミド(Stratagene,La Jolla,CA)に含まれる。ATCC寄託は、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約の条項に拠って行われた。
本発明の抗体によって結合されるBLySポリペプチドは、モノマーまたはマルチマー(すなわち、ダイマー、トリマー、テトラマーおよびより高次のマルチマー)であり得る。従って、本発明は、本発明のBLySポリペプチドのモノマーおよびマルチマー、それらの調製ならびにそれらを含む組成物(好ましくは、薬学的組成物)を結合する抗体に関する。特定の実施形態では、本発明の抗体は、BLySのモノマー、ダイマー、トリマーまたはテトラマーを結合する。さらなる実施形態では、本発明の抗体は、BLySの少なくともダイマー、少なくともトリマーまたは少なくともテトラマーを結合する。
本発明の抗体によって結合されるマルチマーBLySは、ホモマーまたはヘテロマーであり得る。BLySホモマーとは、BLySポリペプチド(本明細書中に記載されるような、BLySのフラグメント、改変体および融合タンパク質を含む)のみを含むマルチマーをいう。これらのホモマーは、同一または異なるアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドを含み得る。特定の実施形態では、本発明の抗体は、BLySホモダイマー(例えば、同一または異なるアミノ酸配列を有する2つのBLySポリペプチドを含む)またはBLySホモトリマー(例えば、同一または異なるアミノ酸配列を有する3つのBLySポリペプチドを含む)を結合する。好ましい実施形態では、本発明の抗体は、BLySのホモトリマーを結合する。さらなる実施形態では、本発明の抗体は、少なくともホモダイマー、少なくともホモトリマーまたは少なくともホモテトラマーである、ホモマー性BLySマルチマーを結合する。
ヘテロマー性BLySとは、本発明のBLySポリペプチドに加えて異種ポリペプチド(すなわち、異なるタンパク質のポリペプチド)を含むマルチマーをいう。特定の実施形態では、本発明の抗体は、BLySのヘテロダイマー、ヘテロトリマーまたはヘテロテトラマーを結合する。さらなる実施形態では、本発明の抗体は、少なくともヘテロダイマー、少なくともヘテロトリマーまたは少なくともヘテロテトラマーである、ヘテロマー性BLySマルチマーを結合する。高度に好ましい実施形態では、本発明の抗体は、BLySポリペプチドおよびAPRILポリペプチド(配列番号3239;GenBank登録番号AF046888;PCT国際公開番号W097/33902;J.Exp.Med.188(6):1185−1190)またはそれらのフラグメントもしくは改変体の両方を含むヘテロトリマーを結合する。他の高度に好ましい実施形態では、本発明の抗体は、1つのBLySポリペプチド(フラグメントまたは改変体を含む)および2つのAPRILポリペプチド(フラグメントまたは改変体を含む)を含むヘテロトリマーを結合する。なお他の高度に好ましい実施形態では、本発明の抗体は、2つのBLySポリペプチド(フラグメントまたは改変体を含む)および1つのAPRILポリペプチド(フラグメントまたは改変体を含む)を含むヘテロトリマーを結合する。さらなる非排他的な実施形態では、本発明の抗体によって結合されるヘテロマーは、CD40リガンドポリペプチド配列、またはその生物学的に活性なフラグメントもしくは改変体を含む。
特に好ましい実施形態では、本発明の抗体は、ホモマー性(特に、ホモトリマー性)のBLySポリペプチドを結合し、ここで、このマルチマーの個々のタンパク質成分は、BLySの成熟形態(例えば、配列番号3228のアミノ酸残基134〜285もしくは配列番号3229のアミノ酸残基134〜266)またはそのフラグメントもしくは改変体からなる。他の特定の実施形態では、本発明の抗体は、ヘテロマー性(特に、ヘテロトリマー性)のBLySポリペプチド(例えば、2つのBLySポリペプチドおよび1つのAPRILポリペプチドを含むヘテロトリマーまたは1つのBLySポリペプチドおよび2つのAPRILポリペプチドを含むヘテロトリマー)を結合し、そしてここで、BLySヘテロマーの個々のタンパク質成分は、いずれかのBLySの成熟した細胞外可溶性部分(例えば、配列番号3228のアミノ酸残基134〜285または配列番号3229のアミノ酸残基134〜266)またはそれらのフラグメントもしくは改変体、あるいはAPRILの成熟した細胞外可溶性部分(例えば、配列番号3239のアミノ酸残基105〜250)またはそのフラグメントもしくは改変体からなる。
特定の実施形態では、本発明の抗体は、BLySモノマー性タンパク質のコンホメーションエピトープを結合する。特定の実施形態では、本発明の抗体は、BLySマルチマー性(特にトリマー性)タンパク質のコンホメーションエピトープを結合する。他の実施形態では、本発明の抗体は、例えば、BLySがヘテロトリマー(例えば、APRILポリペプチド(例えば、配列番号3239)と)形成された場合またはBLySと異種ポリペプチドとの間での融合タンパク質中に存在し得る、BLySと異種ポリペプチドとの並置から生じるコンホメーションエピトープを結合する。
本発明の抗体によって結合されるBLySマルチマーは、疎水性、親水性、イオン性および/または共有結合性結合の結果であり得、そして/または例えば、リポソーム形成によって間接的に連結され得る。従って、1つの実施形態では、BLySマルチマー(例えば、ホモダイマーまたはホモトリマー)は、本発明のポリペプチドが溶液中で互いに接触した場合に形成される。別の実施形態では、BLySヘテロマルチマー(例えば、BLySヘテロトリマーまたはBLySヘテロテトラマー)は、本発明のポリペプチドが、本発明のポリペプチドに対する抗体(本発明の融合タンパク質中に異種ポリペプチド配列に対する抗体を含む)と溶液中で接触した場合に形成される。他の実施形態では、BLySマルチマーは、本発明のBLySポリペプチドとの、および/または本発明のBLySポリペプチド間での共有結合性結合によって形成される。このような共有結合性結合は、このポリペプチド配列(例えば、配列番号3228または配列番号3229に記載されるポリペプチド配列)に含まれる1以上のアミノ酸残基を含み得る。1つの例では、この共有結合性結合は、ネイティブな(すなわち、天然に存在する)ポリペプチド中で相互作用する、このポリペプチド配列内に位置するシステイン残基の間の架橋である。別の例では、この共有結合性結合は、化学的操作または組換え操作の結果である。あるいは、このような共有結合性結合は、BLyS融合タンパク質中の異種ポリペプチド配列中に含まれる1以上のアミノ酸残基を含み得る。1つの例では、共有結合性結合は、融合タンパク質中に含まれる異種配列の中に存在する(例えば、米国特許第5,478,925号を参照のこと)。特定の例では、この共有結合性結合は、BLyS−Fc融合タンパク質中に含まれる異種配列の中に存在する。別の特定の例では、本発明の融合タンパク質の共有結合性結合は、共有結合的に結合したマルチマーを形成し得る別のTNFファミリーのリガンド/レセプターメンバー(例えば、オステオプロテゲリン(oseteoprotegerin)(例えば、その内容全体が本明細書中に参考として援用される、国際公開番号WO98/49305を参照のこと)由来の異種ポリペプチド配列の中に存在する。別の特定の例では、本発明の融合タンパク質の共有結合性結合は、CD40Lまたはその可溶性フラグメント由来の異種ポリペプチド配列の中に存在する。別の実施形態では、2以上のBLySポリペプチドは、合成リンカー(例えば、ペプチド、糖質または可溶性ポリマーリンカー)を介して連結される。例としては、米国特許第5,073,627号(本明細書中に参考として援用される)に記載されるペプチドリンカーが挙げられる。ペプチドリンカーによって隔てられた複数のBLySポリペプチドを含むタンパク質は、従来の組換えDNA技術を用いて産生され得る。
1つの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号3228のアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドもしくはATCC番号97768に含まれるcDNAクローンによってコードされるようなBLySポリペプチド、または上記のポリペプチドの一部分(すなわち、フラグメント)を含むポリペプチドを免疫特異的に結合する。別の実施形態では、本発明は、配列番号3229のアミノ酸配列もしくはATCC番号203518に含まれるcDNAクローンによってコードされるアミノ酸配列を有する単離されたBLySポリペプチドを結合する抗体、または上記のポリペプチドの一部分(すなわち、フラグメント)を含むポリペプチドを結合する抗体を提供する。
本発明の抗体は、配列番号3228のアミノ酸配列、ATCC登録番号97768を有するプラスミド中に含まれるcDNAによってコードされるアミノ酸配列、またはこの寄託されたクローンに含まれるヌクレオチド配列に(例えば、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で)ハイブリダイズする核酸によってコードされるアミノ酸配列を含むかあるいはこのアミノ酸配列からなるポリペプチドに免疫特異的に結合する。本発明の抗体はまた、配列番号3228のアミノ酸配列、ATCC登録番号97768を有するプラスミド中に含まれるcDNAによってコードされるアミノ酸配列、またはこの寄託されたクローンに含まれるヌクレオチド配列に(例えば、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で)ハイブリダイズする核酸によってコードされるアミノ酸配列のフラグメントに結合する。
さらに、本発明の抗体は、配列番号3229のアミノ酸配列、ATCC登録番号203518を有するプラスミド中に含まれるcDNAによってコードされるアミノ酸配列、またはこの寄託されたクローンに含まれるヌクレオチド配列に(例えば、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で)ハイブリダイズする核酸によってコードされるアミノ酸配列を含むかあるいはこのアミノ酸配列からなるポリペプチドを結合する。本発明の抗体はまた、配列番号3229のアミノ酸配列、ATCC登録番号203518を有するプラスミド中に含まれるcDNAによってコードされるアミノ酸配列、またはこの寄託されたクローンに含まれるヌクレオチド配列に(例えば、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で)ハイブリダイズする核酸によってコードされるアミノ酸配列のフラグメントに結合する。
さらに、本発明の抗体は、配列番号3230〜配列番号3237に含まれるアミノ酸配列を含むかあるいはこのアミノ酸配列からなる、ポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントを結合する。
特定の実施形態では、本発明の抗体は、配列番号3228のアミノ酸配列、寄託されたクローンに含まれるcDNAによってコードされるアミノ酸配列、またはこの寄託されたクローンに含まれるヌクレオチド配列に(例えば、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で)ハイブリダイズする核酸によってコードされるアミノ酸配列を含むかあるいはこのアミノ酸配列からなるポリペプチドを含むポリペプチドフラグメントを免疫特異的に結合する。タンパク質フラグメントは、「独立」していてもよく、またはこのフラグメントが(最も好ましくは単一の連続した領域として)一部もしくは一領域を形成する、より大きなポリペプチドに含まれてもよい。本発明の抗体によって結合され得るポリペプチドフラグメントの代表例としては、例えば、配列番号3228のおよそのアミノ酸残基1〜50、51〜100、101〜150、151〜200、201〜250および/または251〜285を含むかあるいはこれらのアミノ酸残基からなるフラグメントが挙げられる。さらに、ポリペプチドフラグメントは、少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、175または200アミノ酸長であり得る。
特定の実施形態では、本発明の抗体は、配列番号3228のアミノ酸残基1〜46、31〜44、47〜72、73〜285、73〜83、94〜102、148〜152、166〜181、185〜209、210〜221、226〜237、244〜249、253〜265および/または277〜285を含むかあるいはこれらのアミノ酸残基からなるポリペプチドフラグメントを結合する。
配列番号3229のBLySポリペプチド配列に見出されない19個のアミノ酸残基(すなわち、配列番号3229の配列のアミノ酸残基Val−142〜Lys−160)の挿入を含む、配列番号3228のBLySポリペプチドの領域に標的化された変異が、BLySポリペプチドの観察された生物学的活性に影響を与え得ることが当業者によって認識される。より詳細には、変異について標的化され得る、BLySポリペプチド配列のこのような残基の部分的で非限定的でかつ非排他的なリストとしては、配列番号3228において示されるようなBLySポリペプチド配列の以下のアミノ酸残基が挙げられる:V−142;T−143;Q−144;D−145;C−146;L−147;Q−148;L−149;I−150;A−151;D−152;S−153;E−154;T−155;P−156;T−157;I−158;Q−159;およびK−160。従って、特定の実施形態では、配列番号3228のV−142〜K−160の領域に1以上の変異を有するBLySポリペプチドを結合する本発明の抗体が意図される。
ポリペプチドフラグメントは、「独立」していてもよく、またはこのフラグメントが(最も好ましくは単一の連続した領域として)一部もしくは一領域を形成する、より大きなポリペプチドに含まれてもよい。本発明の抗体によって結合され得るポリペプチドフラグメントの代表例としては、例えば、配列番号3228に開示されるアミノ酸配列のおよそのアミノ酸残基1〜15、16〜30、31〜46、47〜55、56〜72、73〜104、105〜163、163〜188、186〜210および210〜284を含むかあるいはこれらのアミノ酸残基からなるフラグメントが挙げられる。本発明の抗体によって結合され得るポリペプチドフラグメントのさらなる代表例としては、例えば、配列番号3229に開示されるアミノ酸配列のおよそのアミノ酸残基1〜143、1〜150、47〜143、47〜150、73〜143、73〜150、100〜150、140〜145、142〜148、140〜150、140〜200、140〜225および140〜266を含むかあるいはこれらのアミノ酸残基からなるフラグメントが挙げられる。さらに、本発明の抗体によって結合され得るポリペプチドフラグメントは、少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、175または200アミノ酸長であり得る。この状況では、「およそ」は、特に記載された範囲、およびアミノ末端およびカルボキシ末端のいずれかまたは両方においていくつも(several)、いくつか(a few)、5、4、3、2または1のアミノ酸残基さらに大きいかまたは小さい範囲を意味する。
さらなる好ましい実施形態は、以下を含むかあるいは以下からなるポリペプチドフラグメントを結合する抗体を含む:BLySの推定細胞内ドメイン(例えば、配列番号3228のアミノ酸残基1〜46)、BLySの推定膜貫通ドメイン(例えば、配列番号3228のアミノ酸残基47〜72)、BLySの推定細胞外ドメイン(例えば、配列番号3228のアミノ酸残基73〜285)、BLySの成熟可溶性細胞外ドメイン(例えば、配列番号3228のアミノ酸残基134〜285)、BLySの推定TNF保存ドメイン(例えば、配列番号3228のアミノ酸191〜284)、およびBLySの推定細胞外ドメインに融合された推定細胞内ドメイン(配列番号3228のアミノ酸残基73〜285に融合されたアミノ酸残基1〜46)を含むかまたはこれからなるポリペプチド。
なおさらなる好ましい実施形態は、以下を含むかあるいは以下からなるポリペプチドフラグメントを結合する抗体を含む:BLySの推定細胞内ドメイン(配列番号3229のアミノ酸残基1〜46)、BLySの推定膜貫通ドメイン(配列番号3229のアミノ酸残基47〜72)、BLySの推定細胞外ドメイン(配列番号3229のアミノ酸残基73〜266)、BLySの推定TNF保存されたドメイン(配列番号3229のアミノ酸172〜265)、およびBLySの推定細胞外ドメインに融合された推定細胞内ドメイン(配列番号3229のアミノ酸残基73〜266に融合されたアミノ酸残基1〜46)を含むかまたはこれからなるポリペプチド。
本発明の特定のさらなる実施形態は、配列番号3228および配列番号3229のBLySポリペプチドの推定βプリーツシート領域を含むかあるいはこの領域からなるポリペプチドフラグメントを結合する抗体を含む。BLySのβプリーツシートを含むポリペプチドフラグメントは、配列番号3228の以下のアミノ酸残基を含むかあるいは以下のアミノ酸残基からなる:Gln−144〜Ala−151、Phe−172〜Lys−173、Ala−177〜Glu−179、Asn−183〜Ile−185、Gly−191〜Lys−204、His−210〜Val−219、Leu−226〜Pro−237、Asn−242〜Ala−251、Gly−256〜Ile−263および/またはVal−276〜Leu284。別の非排他的な実施形態では、BLySのβプリーツシートを含むポリペプチドフラグメントは、配列番号3229の以下のアミノ酸残基を含むかあるいは以下のアミノ酸残基からなる:Phe−153〜Lys−154、Ala−158〜Glu−160、Asn−164〜Ile−166、Gly172〜Lys−185、His−191〜Val−200、Leu−207〜Pro−218、Asn−223〜Ala−232、Gly−237〜Ile−244および/またはVal−257〜Leu−265。
本発明の抗体によって結合され得るポリペプチドの部分的で非限定的でかつ例示的なリストとしては、本発明のアミノ酸配列の組合せを含むかあるいはこの組合せからなるポリペプチドが挙げられ、これとしては例えば、以下が挙げられる:配列番号3228の[Met−1〜Lys−113]と融合した[Leu−114〜Thr−141]と融合した[Val−142〜Lys−160]と融合した[Gly−161〜Gln−198]と融合した[Val−199〜Ala−248]と融合した[Gly−249〜Leu−285];または配列番号3228の[Met−1〜Lys−113]と融合した[Val−142〜Lys−160]と融合した[Gly−161〜Gln−198]と融合した[Val−199〜Ala−248]と融合した[Gly−249〜Leu−285];または配列番号3228の[Met−1〜Lys−113]と融合した[Leu−114〜Thr−141]と融合した[Val−142〜Lys−160]と融合した[Gly−161〜Gln−198]と融合した[Gly−249〜Leu−285]。本発明の抗体によって結合され得るアミノ酸配列の他の組合せとしては、上記の順番以外の順番のポリペプチドフラグメント(例えば、配列番号3228の[Leu−114〜Thr−141]と融合した[Val−199〜Ala−248]と融合した[Gly−249〜Leu−285]と融合した[Val−142〜Lys−160])が挙げられ得る。本発明の抗体によって結合され得るアミノ酸配列の他の組合せとしてはまた、本明細書中に記載された通りの異種ポリペプチドフラグメントおよび/または本発明の他のポリペプチドもしくはポリペプチドフラグメント(例えば、配列番号3228[Met−1〜Lys−113]と融合した[Leu−114〜Thr−141]と融合した[Val−142〜Lys−160]と融合した[Gly−161〜Gln−198]と融合した[Gly−249〜Leu−285]と融合したFLAGタグ;または配列番号3228の[Met−1〜Lys−113]と融合した配列番号3228の[Leu−114〜Thr−141]と融合した配列番号3229の[Glu−135〜Asn−165]と融合した配列番号3228の[Val−142〜Lys−160]と融合した配列番号3228の[Gly−161〜Gln−198]と融合した配列番号3228の[Val−199〜Ala−248]と融合した配列番号3228の[Gly−249〜Leu−285])が挙げられ得る。
本発明の抗体によって結合され得るポリペプチドの部分的で非限定的でかつ例示的なリストとしては、本発明のアミノ酸配列の組合せを含むかあるいはこの組合せからなるポリペプチドが挙げられ、これとしては例えば、以下が挙げられる:配列番号3229[Met−1〜Lys−113]と融合した[Leu−114〜Thr−141]と融合した[Gly−142〜Gln−179]と融合した[Val−180〜Ala−229]と融合した[Gly−230〜Leu−266];配列番号3229の[Met−1〜Lys−113]と融合した[Gly−142〜Gln−179]と融合した[Val−180〜Ala−229]と融合した[Gly−230〜Leu−266];または配列番号3229の[Met−1〜Lys−113]と融合した[Leu−114〜Thr−141]と融合した[Gly−142〜Gln−179]と融合した[Gly−230〜Leu−266]。本発明の抗体によって結合され得るアミノ酸配列の他の組合せとしては、上記の順番以外の順番のポリペプチドフラグメント(例えば、配列番号3229の[Leu−114〜Thr−141]と融合した[Val−180〜Ala−229]と融合した[Gly−230〜Leu−266]と融合した[Gly−142〜Gln−179])が挙げられ得る。本発明の抗体によって結合され得るアミノ酸配列の他の組合せとしてはまた、本発明の抗体によって結合され得るアミノ酸配列の他の組合せとしてはまた、本明細書中に記載された通りの異種ポリペプチドフラグメントおよび/または本発明の他のポリペプチドもしくはポリペプチドフラグメント(例えば、配列番号3229の[Met−1〜Lys−113]と融合した[Leu−114〜Thr−141]と融合した[Gly−142〜Gln−179]と融合した[Gly−230〜Leu−266]と融合したFLAGタグ(配列番号3238)、または配列番号3229の[Met−1〜Lys−113]と融合した配列番号3229の[Leu−114〜Thr−141]と融合した配列番号3229の[Glu−135〜Asn−165]と融合した配列番号3229の[Gly−142〜Gln−179]と融合した配列番号3229の[Val−180〜Ala−229]と融合した配列番号3229の[Gly−230〜Leu−266])が挙げられ得る。
本発明のさらなる実施形態は、本発明のポリペプチドの機能的領域(例えば、表9および表10に示し、そして本明細書中に記載されるような、Garnier−Robsonのα領域、β領域、ターン領域およびコイル領域、Chou−Fasmanのα領域、β領域およびコイル領域、Kyte−Doolittleの親水性領域および疎水性領域、Eisenbergのα両親媒性領域およびβ両親媒性領域、Karplus−Schulzの可撓性領域、Eminiの表面形成領域ならびに高い抗原性指数のJameson−Wolf領域)を含むかあるいはこれらの領域からなるBLySポリペプチドフラグメントを結合する抗体を包含する。好ましい実施形態では、本発明の抗体によって結合されるポリペプチドフラグメントは、完全な(すなわち、全長の)BLySポリペプチド(例えば、配列番号3228および3229)の抗原性部分(すなわち、Jameson−Wolfプログラムのデフォルトパラメーターを用いて同定した場合に1.5以上の抗原性指数を有する4以上連続したアミノ酸を含む)である。
上記のような、配列番号3228のBLySポリペプチドの構造的もしくは機能的寄与を示すデータ(表9)または配列番号3229のBLySポリペプチドの構造的もしくは機能的寄与を示すデータ(表10)を、デフォルトパラメーターに設定したDNASTARの種々のモジュールおよびアルゴリズムを用いて作成した。第I列は、Garnier−Robsonのαヘリックス領域分析の結果を表し;第II列は、Chou−Fasmanのαヘリックス領域分析の結果を表し;第III列は、Garnier Robsonのβシート領域分析の結果を表し;第IV列は、Chou−Fasmanのβシート領域分析の結果を表し;第V列は、Garnier−Robsonのターン領域分析の結果を表し;第VI列は、Chou−Fasmanのターン領域分析の結果を表し;第VII列は、Garnier Robsonのコイル領域分析の結果を表し;第VIII列は、Kyte−Doolittleの親水性プロットを表し;第IX列は、Hopp−Woods疎水性プロットを表し;第X列は、Eisenbergのα両親媒性領域分析の結果を表し;第XI列は、Eisenbergのβ両親媒性領域分析の結果を表し;第XII列は、Karplus−Schulzの可塑性領域分析の結果を表し;第XIII列は、Jameson−Wolf抗原性指数スコアを表し;そして第XIV列は、Emini表面確率プロットを表す。
好ましい実施形態では、表9および表10の第VIII列、第IX列、第XIII列および第XIV列に提示されるデータを用いて、配列番号3228のBLySポリペプチド(表9)または配列番号3229のBLySポリペプチド(表10)の、高い程度の抗原性可能性を示す領域を決定し得る。高抗原性領域は、抗原認識が、免疫応答の開始のプロセスにおいて起こり得る環境においてこのポリペプチドの表面上で露出されるようである、このポリペプチドの領域を表す値を選択することによって、第VIII列、第IX列、第XIII列および第XIV列に提示されるデータから決定される。
表9および表10に示される上記の好ましい領域としては、配列番号2に示されるアミノ酸配列の分析によって同定された上記の型の領域が挙げられるがこれらに限定されない。表9および表10に示されるように、このような好ましい領域としては、以下が挙げられる:Garnier−Robsonのα領域、β領域、ターン領域およびコイル領域、Chou−Fasmanのα領域、β領域およびターン領域、Kyte−Doolittleの親水性領域、Eisenbergのα両親媒性領域およびβ両親媒性領域、Karplus−Schulzの可撓性領域、高い抗原性指数のJameson−Wolf領域、ならびにEminiの表面形成領域。好ましくは、本発明の抗体は、BLySポリペプチドまたはBLySポリペプチドフラグメント、ならびに、上記ならびに表9および表10に示す同じまたは異なる領域の特徴のうちのいくつかの構造的特徴(例えば、いくつか(例えば、1、2、3または4)を組み合わせたBLyS領域を含む改変体を結合する。
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別の実施形態において、本発明は、本発明のポリペプチドのエピトープ保有部分を含むか、あるいはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体を提供する。このポリペプチド部分のエピトープは、本発明のポリペプチドの免疫原性または抗原性エピトープであり得る。「免疫原性エピトープ」は、全タンパク質が免疫原である場合、抗体応答を顕在化させるタンパク質の部分として定義される。一方、抗体が結合し得るタンパク質分子領域は、「抗原性エピトープ」として定義される。タンパク質の免疫原性エピトープの数は、一般的に抗原性エピトープの数より少ない。例えば、Geysenら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:3998−4002(1983)を参照のこと。
抗原性エピトープを保有する(すなわち、抗体が結合し得るタンパク質分子の領域を含む)ポリペプチドの選択に関して、相対的にタンパク質配列の部分を模倣する短い合成ペプチドが、部分的に模倣されたタンパク質と反応する抗血清を慣用的に顕在化し得ることは、当該分野で周知である。例えば、Sutcliffe、J.G.、Shinnick、T.M.、Green、N.およびLearner、R.A.(1983)「Antibodies that react with predetermined sites on proteins」、Science、219:660−666を参照のこと。タンパク質反応性血清を顕在化し得るペプチドは、タンパク質の一次配列において、しばしば現れ、1セットの単純な化学的ルールによって特徴付けられ得、そして、インタクトなタンパク質の主要抗原領域(すなわち、免疫原性エピトープ)またはアミノ末端もしくはカルボキシル末端のいずれにも拘束されない。従って、本発明の抗原性エピトープ保有ペプチドおよびポリペプチドは、本発明のポリペプチドに特異的に結合する抗体(モノクローナル抗体を含む)を惹起するために有用である例えば、Wilsonら、Cell 37:767−778(1984)の777頁を参照のこと。
特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySの免疫原性エピトープ保有ペプチドおよびポリペプチドを結合し、そして好ましくはBLySポリペプチドのアミノ酸配列に含まれる少なくとも4、少なくとも5、少なくとも6、少なくとも7、より好ましくは少なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも20、少なくとも25、少なくとも30、少なくとも40、少なくとも50、そして最も好ましくは、約15と約30アミノ酸の間の配列を含む。免疫原性または抗原性エピトープを含む好ましいポリペプチドは、少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、または100アミノ酸残基長である。さらなる限定されない好ましい抗原性エピトープは、本明細書中に開示される抗原性エピトープ、およびその部分を含む。
BLyS特異的抗体を産生するために使用され得、そして本発明の抗体によって結合され得る抗原性ポリペプチドまたはペプチドの非限定的な例としては、以下が挙げられる:配列番号3228の約Phe−115〜約Leu−147のアミノ酸残基を含むか、あるいはそれらからなるポリペプチド;配列番号3228の約Ile−150〜約Tyr−163のアミノ酸残基を含むか、あるいはそれらからなるポリペプチド;配列番号3228の約Ser−171〜約Phe−194のアミノ酸残基を含むか、あるいはそれらからなるポリペプチド;配列番号3228の約Glu−223〜約Tyr−246のアミノ酸残基を含むか、あるいはそれらからなるポリペプチド;ならびに図1Aおよび1B(配列番号3228)の約Ser−271〜約Phe−278のアミノ酸残基を含むか、あるいはそれらからなるポリペプチド。この文脈において、「約」は、アミノ末端およびカルボキシ末端のいずれかもしくは両方の末端において、特に記載された範囲、およびこれより数個の(少数の、5、4、3、2または1)アミノ酸残基だけ大きいかまたは小さい範囲を意味する。これらのポリペプチドフラグメントは、上の表9に開示されるようなJameson−Wolf抗原性インデックスの解析によってBLySポリペプチドの抗原性エピトープを保有するように決定されている。
BLyS特異的抗体を産生するために使用され得、そして本発明の抗体によって結合され得る抗原性ポリペプチドまたはペプチドの非限定的な例としては、以下が挙げられる:配列番号3229の約Pro−32〜約Leu−47のアミノ酸残基を含むか、またはそれらからなるポリペプチド;配列番号3229の約Glu−116〜約Ser−143のアミノ酸残基を含むか、またはそれらからなるポリペプチド;配列番号3229の約Phe−153〜約Tyr−173のアミノ酸残基を含むか、またはそれらからなるポリペプチド;配列番号3229の約Pro−218〜約Tyr−227のアミノ酸残基を含むか、またはそれらからなるポリペプチド;配列番号3229の約Ala−232〜約Gln−241のアミノ酸残基を含むか、またはそれらからなるポリペプチド;配列番号3229の約Ile−244〜約Ala−249のアミノ酸残基を含むか、またはそれらからなるポリペプチド;および配列番号3229の約Ser−252〜約Val−257のアミノ酸残基を含むか、またはそれらからなるポリペプチド。本文脈において、「約」は、アミノ末端およびカルボキシ末端のいずれかもしくは両方の末端において、特に記載された範囲、およびこれより数個の(少数の、5、4、3、2または1)アミノ酸残基だけ大きいかまたは小さい範囲を意味する。これらのポリペプチドフラグメントは、DNA*STARコンピュータプログラムのProtean成分によって生じた表10に開示されるように(上に示されるように)Jameson−Wolf抗原性インデックスの解析によってBLySポリペプチドの抗原性エピトープを保有するように決定されている。
BLySエピトープ保有ペプチドおよびポリペプチドは、任意の従来の方法によって生成され得る。例えば、Houghten、R.A.(1985)General methods for the rapid solid−phase synthesis of large numbers of peptide:specificity of antigen−antibody interaction at the level of individual amino acidsを参照のこと。Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:5131−5135;この「Simultaneous Multiple Peptide Synthesis(SMPS)」プロセスは、さらに米国特許第4、631、211号、Houghtenら(1986)に記載される。
本発明は、配列番号3228のアミノ酸配列を有するポリペプチドのエピトープ、またはATCC寄託番号97768に含まれるポリヌクレオチド配列によってコードされるか、あるいはATCC寄託番号97768に含まれるcDNA配列に(例えば、本明細書中に記載されるハイブリダイゼーション条件下で)ハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド配列のエピトープを含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドを結合する抗体を含む。
本発明はまた、配列番号3229のアミノ酸配列を有するポリペプチドのエピトープ、またはATCC寄託番号203518に含まれるポリヌクレオチド配列によってコードされるか、あるいはATCC寄託番号203518に含まれるcDNA配列に(例えば、本明細書中に記載されるハイブリダイゼーション条件下で)ハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド配列のエピトープを含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドを結合する抗体を含む。
本明細書中に使用される場合、用語「エピトープ」は、動物において、好ましくは哺乳動物において、そして最も好ましくはヒトにおいて抗原性活性または免疫原性活性を有するポリペプチドの部分をいう。好ましい実施形態において、本発明は、エピトープを含むポリペプチドを結合する抗体を含む。「免疫原性エピトープ」とは、本明細書中で使用される場合、当該分野で公知の任意の方法によって決定されるような(例えば、下記に記載される抗体を産生するための方法による)、動物における抗体応答を惹起するタンパク質の一部として定義される(例えば、Geysenら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:3998−4002(1983)を参照のこと)。用語「抗原性エピトープ」とは、本明細書中で使用される場合、当該分野で周知の任意の方法(例えば、本明細書中に記載されるイムノアッセイによる)によって決定されるような、抗体がその抗原を免疫特異的に結合し得るタンパク質の一部として定義される。免疫特異的結合は、非特異的結合は除外するが、他の抗原との交差反応を除外する必要はない。抗原性エピトープは、免疫原性である必要はない。
エピトープとして機能するBLySポリペプチドフラグメントは、任意の従来の方法によって生成され得る。任意の従来の方法によって産生され得る。(例えば、Houghten,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:5131−5135(1985)を参照のこと。これはさらに、米国特許第4,631,211号に記載される)。
本発明においては、本発明の抗体は、好ましくは、少なくとも4、少なくとも5、少なくとも6、少なくとも7、より好ましくは、少なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも20、少なくとも25、少なくとも30、少なくとも40、少なくとも50、そして最も好ましくは約15アミノ酸と約30アミノ酸との間の配列を含む抗原性エピトープを結合する。本発明の抗体によって結合され得る免疫原性エピトープまたは抗原性エピトープを含有する好ましいポリペプチドは、少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95または100アミノ酸残基の長さである。さらなる非排他的に好ましい抗原性エピトープは、本明細書中で開示される抗原性エピトープおよびその一部を含む。抗原性エピトープは、例えば、エピトープを特異的に結合する抗体(モノクローナル抗体を含む)を惹起するために有用である。好ましい抗原性エピトープは、本明細書中で開示される抗原性エピトープ、およびこれらの免疫原性エピトープの2つ、3つ、4つ、5つ以上の任意の組み合わせを含む。抗原性エピトープは、イムノアッセイにおいて、標的分子として使用され得る。(例えば、Wilsonら、Cell 37:767−778(1984);Sutcliffeら、Science 219:660−666(1983)を参照のこと)。
同様に、免疫原性エピトープを使用して、例えば、当該分野で周知の方法に従って抗体を誘導し得る。(例えば、Sutcliffeら(前出);Wilsonら(前出);Chowら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:910−914;およびBittleら、J.Gen.Virol.66:2347−2354(1985)を参照のこと)。好ましい免疫原性エピトープは、本明細書で開示された免疫原性エピトープ、ならびにこれらの免疫原性エピトープの2つ、3つ、4つ、5つ以上の任意の組み合わせを含む。BLySの1つ以上の免疫原性エピトープを含むポリペプチドは、キャリアタンパク質(例えば、アルブミン)とともに動物系(例えば、ウサギまたはマウス)に対する抗体応答を惹起するために提示され得るか、または、そのポリペプチドが十分に長い場合では(少なくとも約25アミノ酸)、このポリペプチドはキャリアなしで提示され得る。しかし、8〜10程度のわずかなアミノ酸を含む免疫原性エピトープは、変性されたポリペプチドの直鎖エピトープに(非常に少なくとも)結合し得る抗体を惹起するのに十分であることが示されている(例えば、ウエスタンブロッティングにおいて)。
本発明のエピトープ保有BLySポリペプチドは、当該分野で周知の方法に従って抗体を誘導するために使用され得る。この方法としては、インビボ免疫、インビトロ免疫、およびファージディスプレイ法が挙げられるが、それらに限定されない。例えば、Sutcliffeら,前出;Wilsonら,前出;およびBittleら,J.Gen.Virol.,66:2347−2354(1985)を参照のこと。インビボ免疫を使用する場合、動物を遊離ペプチドを用いて免疫し得る;しかし、抗ペプチド抗体力価は、高分子キャリア(例えば、キーホールリンペットヘモシアニン(hemacyanin)(KLH)または破傷風トキソイド)にペプチドを結合させることによりブーストされ得る。例えば、システイン残基を含むペプチドは、マレイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(MBS)のようなリンカーを用いてキャリアに結合され得る。その一方、他のペプチドは、より一般的な結合剤(例えば、グルタルアルデヒド)を用いてキャリアに結合され得る。ウサギ、ラット、およびマウスのような動物は、遊離のペプチドまたはキャリア結合ペプチドのいずれかを用いて、例えば、エマルジョン(約100μgのペプチドまたはキャリアタンパク質およびフロイントアジュバントまたは免疫応答を刺激すると知られる任意の他のアジュバントを含む)の腹腔内注射および/または皮内注射により免疫される。いくつかのブースター注射が、抗ペプチド抗体の有用な力価を提供するために、例えば、約2週間の間隔で、必要とされ得る。この力価は、例えば、固体表面に吸着した遊離のペプチドを用いるELISAアッセイにより検出され得る。免疫した動物由来の血清中の抗ペプチド抗体の力価は、抗ペプチド抗体の選択(例えば、当該分野で周知の方法に従う固体支持体上のペプチドの吸着および選択された抗体の溶出による)により上昇し得る。
当業者に明らかなように、そして上記で考察されるように、本発明の抗体は、他のポリペプチド配列に融合された免疫原性エピトープまたは抗原性エピトープを含むポリペプチドを結合し得る。例えば、BLySポリペプチドは、免疫グロブリン(IgA、IgE、IgG、IgM)の定常ドメインまたはそれらの部分(CH1、CH2、CH3、またはそれらの任意の組み合わせおよびそれらの部分)、あるいはアルブミン(組換えヒトアルブミンまたはそのフラグメントもしくは改変体(例えば、1999年3月2日発行の米国特許第5,876,969号、欧州特許第0 413 622号、および1998年6月16日発行の米国特許第5,766,883号(これらは、本明細書によってその全体において参考として援用される)を参照のこと)を含むが、限定はされない)と融合され得、キメラポリペプチドを生じる。このような融合タンパク質は、精製を容易にし得、そしてインビボでの半減期を増大させ得る。これは、ヒトCD4−ポリペプチドの最初の2つのドメインおよび哺乳動物の免疫グロブリンの重鎖または軽鎖の定常領域の種々のドメインからなるキメラタンパク質について示されている。例えば、EP 394,827;Trauneckerら、Nature,331:84〜86(1988)を参照のこと。上皮の障壁を横切る抗原の免疫系への増強された送達は、IgGまたはFcフラグメントのようなFcRn結合パートナーへ結合された抗原(例えば、インスリン)について実証されている(例えば、PCT公開WO96/22024および同WO99/04813を参照のこと)。IgG部分のジスルフィド結合に起因するジスルフィド結合ダイマー構造を有するIgG融合タンパク質はまた、モノマーポリペプチドまたはそれらのフラグメント単独よりも、他の分子の結合および中和においてより効率的であることが見出されている。例えば、Fountoulakisら、J.Biochem.,270:3958−3964(1995)を参照のこと。上記のエピトープをコードする核酸はまた、エピトープタグ(例えば、赤血球凝集素(「HA」)タグまたはフラッグ(flag)タグ)として目的の遺伝子と組換えられ、発現されたポリペプチドの検出および精製を補助し得る。例えば、Janknechtらによって記載される系は、ヒト細胞株中で発現される未変性融合タンパク質の容易な精製を可能にする(Janknechtら、1991、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:8972−897)。この系において、目的の遺伝子は、ワクシニア組換えプラスミドへサブクローン化され、その結果、この遺伝子のオープンリーディングフレームが、6つのヒスチジン残基からなるアミノ末端タグへ翻訳時に融合される。このタグは、融合タンパク質についてのマトリクス結合ドメインとしての機能を果たす。組換えワクシニアウイルスを用いて感染された細胞からの抽出物は、Ni2+ニトリロ酢酸−アガロースカラム上へロードされ、そしてヒスチジンタグ化タンパク質が、イミダゾール含有緩衝液を用いて選択的に溶出され得る。
別の実施形態において、本発明の抗体は、異種抗原(例えば、ポリペプチド、炭水化物、リン脂質、もしくは核酸)と融合されたBLySポリペプチドおよび/またはそれらのエピトープ保有フラグメントを結合する。特異的な実施形態において、異種抗原は、免疫原である。
より特定の実施形態において、異種抗原は、HIVのgp120タンパク質、またはそのフラグメントである。
別の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチドおよび/または別のTNFリガンドファミリーメンバーのポリペプチド配列と融合されたそれらのエピトープ保有フラグメント(または生物学的に活性なフラグメントもしくはそれらの改変体)を含む。特定の実施形態において、本発明の抗体は、CD40Lポリペプチド配列と融合された本発明のBLySポリペプチドを結合する。好ましい実施形態において、CD40Lポリペプチド配列は、可溶性である。
別の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチドをコードするポリヌクレオチドのランダム変異誘発によって、エラー傾向があるPCR、ランダムヌクレオチド挿入または組換え前の他の方法によって変異体BLySポリペプチドを結合する。別の実施形態において、本発明の抗体は、1つ以上の異種分子の1つ以上の成分、モチーフ、セクション、パーツ、ドメイン、フラグメントなどで組換えられたBLySの1つ以上の成分、モチーフ、セクション、パーツ、ドメイン、フラグメントなどを結合する。好ましい実施形態において、異種分子は、例えば、TNF−α、リンホトキシン−α(LT−α、TNF−βとしてまた公知)、LT−β(複合ヘテロダイマーLT−α2−βに見出される)、OPGL、FasL、CD27L、CD30L、CD40L、4−1BBL、DcR3、OX40L、TNF−γ(国際公開番号第WO96/14328号)、AIM−I(国際公開番号第WO97/33899号)、AIM−II(国際公開番号第WO97/34911号)、APRIL(J.Exp.Med.188(6):1185−1190)、エンドカイン(endokine)−α(国際公開番号第WO98/07880号)、OPG、OX40、および神経成長因子(NGF)、ならびにFas、CD30、CD27、CD40および4−IBBの可溶性形態、TR2(国際公開番号第WO96/34095号)、DR3(国際公開番号第WO97/33904号)、DR4(国際公開番号第WO98/32856号)、TR5(国際公開番号第WO98/30693号)、TR6(国際公開番号第WO98/30694号)、TR7(国際公開番号第WO98/41629号)、TRANK、TR9(国際公開番号第WO98/56892号)、TR10(国際公開番号第WO98/54202号)、312C2(国際公開番号第WO98/06842号)、TR12、CAD、ならびにv−FLIPである。さらなる実施形態において、異種分子は、TNFファミリーの任意のメンバーである。
別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、可溶性APRILポリペプチド(例えば、配列番号3239のアミノ酸残基105〜250)、またはそれらの生物学的に活性なフラグメントもしくは改変体と融合される本発明のBLySポリペプチド(それらの生物学的に活性なフラグメントまたは改変体を含む)を結合する。
BLySポリペプチドの特徴を改良または変更するために、タンパク質工学が利用され得る。当該分野で公知の組換えDNA技術を使用して、新規変異体タンパク質、すなわち「単一のまたは複数のアミノ酸置換、欠失、付加または融合タンパク質を含むムテイン」を作製し得る。このように改変されたポリペプチドは、例えば、高められた活性または増加した安定性を示し得る。さらに、これらは、高い収率で精製され得、そして少なくとも特定の精製および貯蔵条件下で対応する天然のポリペプチドよりもよい可溶性を示し得る。例えば、多くのタンパク質について、分泌タンパク質の細胞外ドメインまたは成熟形態を含み、1つ以上のアミノ酸が生物学的機能の実質的な損失なしにN末端またはC末端から欠失され得ることは、当該分野で公知である。例えば、3、8、または27アミノ末端アミノ酸がない場合でさえ、ヘパリン結合活性を有する改変KGFタンパク質が報告された(Ronら、J.Biol.Chem.、268:2984−2988(1993))。従って、本発明の抗体は、タンパク質工学によって生成されたBLySポリペプチド変異体または改変体を結合し得る。
本発明の場合、本発明のタンパク質は、TNFポリペプチドファミリーのメンバーであるので、配列番号3228の191位のGly(G)残基までのN末端アミノ酸の欠失は、いくつかの生物学的活性(例えば、リンパ球(例えばB細胞)増殖、分化および/または活性化を刺激する能力、ならびに適切な標的細胞に対する細胞傷害性)を維持し得る。Gly(G)残基を含むN末端欠失をさらに有するポリペプチドは、生物学的活性を維持することは期待されない。これは、TNF関連ポリペプチドにおけるこの残基が、生物学的活性に必要とされる保存ドメインの始まりだからである。しかし、タンパク質のN末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、このタンパク質の1つ以上の生物学的機能の改変または損失を生じる場合でさえ、他の機能的な活性は、まだ維持され得る。従って、短縮タンパク質が、このタンパク質の完全または細胞外ドメインを認識する抗体を誘導および/または結合する能力は、このタンパク質の完全または細胞外ドメインの主要ではない残基がN末端から除去される場合、一般的に維持される。完全タンパク質のN末端残基を欠失する特定のポリペプチドがこのような免疫学的活性を維持するか否かは、本明細書中に記載される慣用的な方法および当該分野で公知の他の方法によって容易に決定され得る。
従って、本発明はさらに、配列番号3228のBLySのアミノ酸配列(191位のグリシン残基まで)(アミノ末端からGly−191残基)のアミノ末端から1つ以上の残基を欠失したポリペプチドを結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3228の残基n〜285のアミノ酸配列を含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体を提供する。ここで、nは、配列番号3228中のアミノ酸配列のアミノ酸残基2〜190のアミノ酸位置の範囲の整数である。さらに詳細には、本発明は、配列番号3228の以下の残基からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体を提供する:
Figure 2009095346
。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一性であるアミノ酸残基の連続配列を含むか、あるいはそれらからなるBLySポリペプチドを結合する抗体に指向される。
さらに、本発明のBLySポリペプチドの推定細胞外ドメインは、それ自体生物学的活性を惹起し得るので、このポリペプチドの推定細胞外領域(配列番号3228のGln−73〜Leu−285の全位置)からのN末端およびC末端アミノ酸の欠失は、いくつかの生物学的活性(例えば、リガンド結合、リンパ球(例えば、B細胞)増殖、分化、および/または活性化の刺激、ならびに細胞複製の調節または標的細胞活性の調節)を維持し得る。しかし、BLySポリペプチドの推定細胞外ドメインのN末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失がこのポリペプチドの1つ以上の生物学的機能の改変または損失を生じる場合でさえ、他の機能的な活性は、また維持され得る。従って、短縮ポリペプチドが、このポリペプチドの完全または成熟または細胞外ドメインを認識する抗体を誘導および/あるいは結合する能力は、このポリペプチドの完全または成熟または細胞外ドメインの主要ではない残基がN末端から除去される場合、一般的に維持される。完全ポリペプチドのN末端残基を欠失する特定のポリペプチドがこのような免疫学的活性を維持するか否かは、本明細書中に記載される慣用的な方法および当該分野で公知の他の方法によって容易に決定され得る。
従って、本発明はさらに、配列番号3228に示されるBLySのアミノ酸配列(位置番号280のグリシン残基まで)のアミノ末端から1つ以上の残基を欠失したポリペプチドを結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3228の残基n〜285のアミノ酸配列を含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体を提供する。ここで、nは、配列番号3228中のアミノ酸残基73〜280のアミノ酸位置の範囲の整数であり、そして、73はBLySポリペプチド(配列番号3228に開示される)の推定細胞外ドメインのN末端から最初の残基の位置である。より詳細には、特定の実施形態において、本発明は、配列番号3228の以下の残基からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体を提供する:
Figure 2009095346
Figure 2009095346
。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一性であるアミノ酸残基の連続配列を含むか、あるいはそれらからなるBLySポリペプチドを結合する抗体に関する。
本発明の大いに好ましい実施形態は、配列番号3228の134位〜285位のアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドに少なくとも80%、85%、90%同一、そしてより好ましくは少なくとも95%、96%、97%、98%、99%または100%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体に関する。
本発明の好ましい実施形態は、配列番号3228の134位〜285位のアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドに少なくとも90%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体に関する。本発明のより好ましい実施形態は、配列番号3228の134位〜285位のアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドに少なくとも95%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体に関する。本発明のより好ましい実施形態は、配列番号3228の134位〜285位のアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドに少なくとも96%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体に関する。
さらに、本発明のより好ましい実施形態は、配列番号3228の134位〜285位のアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドに少なくとも97%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体に関する。さらに、本発明のより好ましい実施形態は、配列番号3228の134位〜285位のアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドに少なくとも98%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体に関する。さらに、本発明のより好ましい実施形態は、配列番号3228の134位〜285位のアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドに少なくとも99%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する抗体に関する。
特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySの以下のN末端欠失ポリペプチドフラグメントの1つを含むか、またはそれらからなるポリペプチドを結合する:配列番号3228のアミノ酸残基Ala−71〜Leu−285、アミノ酸残基Ala−81〜Leu−285、アミノ酸残基Ala−112〜Leu−285、アミノ酸残基Ala−134〜Leu−285、アミノ酸残基Leu−147〜Leu−285、およびアミノ酸残基Gly−161〜Leu−285。
同様に、生物学的に機能的なC末端欠失ポリペプチドの多くの例は、公知である。例えば、インターフェロンγは、このタンパク質のカルボキシ末端から8〜10個のアミノ酸残基を欠失させた後、10倍までのより高い活性を示した(Dobeliら、J.Biotechnology 7:199−216(1988))。本発明のタンパク質は、TNFポリペプチドファミリーのメンバーであるので、284位のロイシン残基までのC末端アミノ酸の欠失は、全ての生物学的活性ではないがほとんどの生物学的活性(例えば、リガンド結合、リンパ球(例えば、B細胞)増殖、分化、および/または活性化を刺激する能力、ならびに細胞複製の調節)を維持すると予測される。約10までのさらなるC末端残基の欠失(すなわち、274位のグリシン残基まで)を有するポリペプチドはまた、レセプター結合のようないくつかの活性を維持し得るが、このようなポリペプチドは、配列番号3228のLeu−284まで伸長する保存TNFドメインの部分を欠く。しかし、タンパク質のC末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失がこのタンパク質の1つ以上の生物学的機能の改変または損失を生じる場合でさえ、他の機能的な活性は、また維持され得る。従って、短縮タンパク質が、完全タンパク質または成熟タンパク質を認識する抗体を誘導および/または結合する能力は、この完全タンパク質または成熟タンパク質の主要ではない残基がC末端から除去される場合、一般的に維持される。完全タンパク質のC末端残基を欠失する特定のポリペプチドがこのような免疫学的活性を維持するか否かは、本明細書中に記載される慣用的な方法および当該分野で公知の他の方法によって容易に決定され得る。
従って、本発明はさらに、配列番号3228のBLySポリペプチドのアミノ酸配列のカルボキシ末端から、274位のグリシン残基(Gly−274)までの1つ以上の残基が欠失したポリペプチドに結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3228のアミノ酸配列の残基1−mのアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドを結合する抗体を提供し、ここで、mは、配列番号3228におけるアミノ酸残基274〜284のアミノ酸位置の範囲の任意の整数である。より詳細には、本発明は、配列番号3228の残基1〜274、1〜275、1〜276、1〜277、1〜278、1〜279、1〜280、1〜281、1〜282、1〜283および1〜284からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体を提供する。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
アミノ末端およびカルボキシ末端の両方から1つ以上のアミノ酸が欠失したBLySポリペプチドを含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体がさらに提供され、これらは、配列番号3228の残基n−mを有するように一般に記載され得、ここで、nおよびmは、上記で規定した通りの整数である。ATCC受託番号97768に含まれる寄託されたcDNAクローンによってコードされる完全BLySアミノ酸配列の部分を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体もまた含まれ、ここで、この部分は、寄託されたプラスミドにおいてcDNAクローンによってコードされる完全アミノ酸配列のアミノ末端から1〜190アミノ酸、またはC末端から1〜11アミノ酸を(あるいは、これらのN末端欠失およびC末端欠失の任意の組み合わせ)除外する。
同様に、BLySの予測される細胞外ドメインのC末端アミノ酸残基の、配列番号3228の79位のロイシン残基までの欠失は、いくつかの生物学的活性(例えば、リガンド結合、リンパ球(例えば、B細胞)の増殖、分化、および/または活性化の刺激、ならびに細胞複製の調節または標的細胞活性の調節)を保持し得る。配列番号3228のLeu−79を含むさらなるC末端欠失を有するポリペプチドは、生物学的活性を保持するとは予期されない。
しかし、ポリペプチドのC末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、このポリペプチドの1つ以上の生物学的機能の改変または損失を生じるとしても、他の機能的活性は、依然として保持され得る。従って、ポリペプチドの完全形態、成熟形態または細胞外形態を認識する抗体を誘導および/または結合するこの短縮ポリペプチドの能力は、一般に、このポリペプチドの完全形態、成熟形態または細胞外形態の残基の大部分未満がC末端から除去される場合に、保持される。予測される細胞外ドメインのC末端残基を欠失した特定のポリペプチドがこのような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の慣用的な方法によって、容易に決定され得る。
従って、本発明はさらに、配列番号3228に示されるBLySポリペプチドの予測される細胞外ドメインのアミノ酸配列のカルボキシ末端から、配列番号3228の79位のロイシン残基まで1つ以上の残基が欠失したポリペプチドに結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3228におけるアミノ酸配列の残基73−mのアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供し、ここで、mは、配列番号3228におけるアミノ酸配列のアミノ酸残基79〜285のアミノ酸位置の範囲の任意の整数であり、そして残基78は、予測されるBLySポリペプチド(配列番号3228に開示される)の細胞外ドメインのC末端での最初の残基の位置である。より詳細には、特定の実施形態において、本発明は、配列番号3228の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供する:Q−73〜Leu−285;Q−73〜L−284;Q−73〜K−283;Q−73〜L−282;Q−73〜A−281;Q−73〜G−280;Q−73〜F−279;Q−73〜F−278;Q−73〜T−277;Q−73〜V−276;Q−73〜D−275;Q−73〜G−274;Q−73〜D−273;Q−73〜L−272;Q−73〜S−271;Q−73〜I−270;Q−73〜Q−269;Q−73〜A−268;Q−73〜N−267;Q−73〜E−266;Q−73〜R−265;Q−73〜P−264;Q−73〜I−263;Q−73〜A−262;Q−73〜L−261;Q−73〜Q−260;Q−73〜L−259;Q−73〜E−258;Q−73〜D−257;Q−73〜G−256;Q−73〜E−255;Q−73〜E−254;Q−73〜L−253;Q−73〜K−252;Q−73〜A−251;Q−73〜I−250;Q−73〜G−249;Q−73〜A−248;Q−73〜S−247;Q−73〜Y−246;Q−73〜C−245;Q−73〜S−244;Q−73〜N−243;Q−73〜N−242;Q−73〜P−241;Q−73〜L−240;Q−73〜T−239;Q−73〜E−238;Q−73〜P−237;Q−73〜M−236;Q−73〜N−235;Q−73〜Q−234;Q−73〜I−233;Q−73〜C−232;Q−73〜R−231;Q−73〜F−230;Q−73〜L−229;Q−73〜T−228;Q−73〜V−227;Q−73〜L−226;Q−73〜S−225;Q−73〜L−224;Q−73〜E−223;Q−73〜D−222;Q−73〜G−221;Q−73〜F−220;Q−73〜V−219;Q−73〜H−218;Q−73〜V−217;Q−73〜K−216;Q−73〜K−215;Q−73〜R−214;Q−73〜Q−213;Q−73〜I−212;Q−73〜L−211;Q−73〜H−210;Q−73〜G−209;Q−73〜M−208;Q−73〜A−207;Q−73〜Y−206;Q−73〜T−205;Q−73〜K−204;Q−73〜D−203;Q−73〜T−202;Q−73〜Y−201;Q−73〜L−200;Q−73〜V−199;Q−73〜Q−198;Q−73〜G−197;Q−73〜Y−196;Q−73〜I−195;Q−73〜F−194;Q−73〜F−193;Q−73〜Y−192;Q−73〜G−191;Q−73〜T−190;Q−73〜E−189;Q−73〜K−188;Q−73〜V−187;Q−73〜L−186;Q−73〜I−185;Q−73〜K−184;Q−73〜N−183;Q−73〜E−182;Q−73〜K−181;Q−73〜E−180;Q−73〜E−179;Q−73〜L−178;Q−73〜A−177;Q−73〜S−176;Q−73〜G−175;Q−73〜R−174;Q−73〜K−173;Q−73〜F−172;Q−73〜S−171;Q−73〜L−170;Q−73〜L−169;Q−73〜W−168;Q−73〜P−167;Q−73〜V−166;Q−73〜F−165;Q−73〜T−164;Q−73〜Y−163;Q−73〜S−162;Q−73〜G−161;Q−73〜K−160;Q−73〜Q−159;Q−73〜I−158;Q−73〜T−157;Q−73〜P−156;Q−73〜T−155;Q−73〜E−154;Q−73〜S−153;Q−73〜D−152;Q−73〜A−151;Q−73〜I−150;Q−73〜L−149;Q−73〜Q−148;Q−73〜L−147;Q−73〜C−146;Q−73〜D−145;Q−73〜Q−144;Q−73〜T−143;Q−73〜V−142;Q−73〜T−141;Q−73〜E−140;Q−73〜E−139;Q−73〜P−138;Q−73〜G−137;Q−73〜Q−136;Q−73〜V−135;Q−73〜A−134;Q−73〜R−133;Q−73〜K−132;Q−73〜N−131;Q−73〜R−130;Q−73〜S−129;Q−73〜N−128;Q−73〜Q−127;Q−73〜S−126;Q−73〜S−125;Q−73〜N−124;Q−73〜G−123;Q−73〜E−122;Q−73〜G−121;Q−73〜P−120;Q−73〜A−119;Q−73〜P−118;Q−73〜P−117;Q−73〜E−116;Q−73〜F−115;Q−73〜I−114;Q−73〜K−113;Q−73〜L−112;Q−73〜G−lll;Q−73〜A−110;Q−73〜T−109;Q−73〜V−108;Q−73〜A−107;Q−73〜P−106;Q−73〜A−105;Q−73〜E−104;Q−73〜E−103;Q−73〜L−102;Q−73〜G−101;Q−73〜A−100;Q−73〜K−99;Q−73〜P−98;Q−73〜A−97;Q−73〜G−96;Q−73〜A−95;Q−73〜G−94;Q−73〜A−93;Q−73〜P−92;Q−73〜L−91;Q−73〜K−90;Q−73〜E−89;Q−73〜A−88;Q−73〜H−87;Q−73〜H−86;Q−73〜G−85;Q−73〜Q−84;Q−73〜L−83;Q−73〜E−82;Q−73〜A−81;Q−73〜R−80;およびQ−73〜L−79。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
本発明はまた、BLySの推定細胞外ドメインのアミノ末端およびカルボキシル末端の両方から1つ以上のアミノ酸が欠失したポリペプチドに結合する抗体を提供し、これらは、配列番号3228の残基n−mを有するように一般に記載され得、ここで、nおよびmは、上記で規定された通りの整数である。
別の実施形態において、本発明の抗体は、ATCC受託番号97768を有する寄託物に含まれるcDNAプラスミドによってコードされるBLySアミノ酸配列の細胞外ドメインの部分を含むポリペプチドに結合し、ここで、この部分は、ATCC受託番号97768を有する寄託物中に含まれるcDNAプラスミドによってコードされるアミノ酸配列の細胞外ドメインのアミノ末端から、1〜約206アミノ酸を除外するか、またはATCC受託番号97768を有する寄託物中に含まれるcDNAプラスミドによってコードされるアミノ酸の細胞外ドメインのカルボキシ末端から、1〜約206アミノ酸を除外するか、あるいはATCC受託番号97768を有する寄託物中に含まれるcDNAプラスミドによってコードされるアミノ酸配列の細胞外ドメイン全体の、上記のアミノ末端およびカルボキシ末端欠失の任意の組み合わせを除外する。
上記のように、ポリペプチドのN末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、このポリペプチドの1つ以上の機能的活性(例えば、生物学的活性)の改変または損失を生じるとしても、他の機能的活性または生物学的活性は、依然として保持され得る。従って、このポリペプチドの全長形態または成熟形態、あるいは細胞外ドメインを認識する抗体を誘導および/または結合する短縮BLySムテインの能力は、一般に、このポリペプチドの全長または成熟また細胞外ドメインの残基の大部分未満がN末端から除去される場合、保持される。完全ポリペプチドのN末端残基を欠く特定のポリペプチドがこのような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の慣用的な方法によって容易に決定され得る。多くのN末端アミノ酸残基が欠失したBLySムテインは、いくつかの機能的(例えば、生物学的または免疫原性)活性を保持し得るようである。実際に、6つほどの少ないBLySアミノ酸残基からなるペプチドは、しばしば、免疫応答を惹起し得る。
従って、本発明はさらに、配列番号3228に示されるBLySの推定全長アミノ酸配列のアミノ末端から、配列番号3228に示される配列の280位のグリシン残基までの1つ以上の残基が欠失したポリペプチド、およびこのようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3228に示される配列の残基n−285のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する抗体を提供し、ここで、nは、配列番号3228におけるアミノ酸配列のアミノ酸残基1〜280のアミノ酸位置の範囲の任意の整数である。
より詳細には、本発明は、配列番号3228の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供する:D−2〜L−285;D−3〜L−285;S−4〜L−285;T−5〜L−285;E−6〜L−285;R−7〜L−285;E−8〜L−285;Q−9〜L−285;S−10〜L−285;R−11〜L−285;L−12〜L−285;T−13〜L−285;S−14〜L−285;C−15〜L−285;L−16〜L−285;K−17〜L−285;K−18〜L−285;R−19〜L−285;E−20〜L−285;E−21〜L−285;M−22〜L−285;K−23〜L−285;L−24〜L−285;K−25〜L−285;E−26〜L−285;C−27〜L−285;V−28〜L−285;S−29〜L−285;I−30〜L−285;L−31〜L−285;P−32〜L−285;R−33〜L−285;K−34〜L−285;E−35〜L−285;S−36〜L−285;P−37〜L−285;S−38〜L−285;V−39〜L−285;R−40〜L−285;S−41〜L−285;S−42〜L−285;K−43〜L−285;D−44〜L−285;G−45〜L−285;K−46〜L−285;L−47〜L−285;L−48〜L−285;A−49〜L−285;A−50〜L−285;T−51〜L−285;L−52〜L−285;L−53〜L−285;L−54〜L−285;A−55〜L−285;L−56〜L−285;L−57〜L−285;S−58〜L−285;C−59〜L−285;C−60〜L−285;L−61〜L−285;T−62〜L−285;V−63〜L−285;V−64〜L−285;S−65〜L−285;F−66〜L−285;Y−67〜L−285;Q−68〜L−285;V−69〜L−285;A−70〜L−285;A−71〜L−285;L−72〜L−285;Q−73〜L−285;G−74〜L−285;D−75〜L−285;L−76〜L−285;A−77〜L−285;S−78〜L−285;L−79〜L−285;R−80〜L−285;A−81〜L−285;E−82〜L−285;L−83〜L−285;Q−84〜L−285;G−85〜L−285;H−86〜L−285;H−87〜L−285;A−88〜L−285;E−89〜L−285;K−90〜L−285;L−91〜L−285;P−92〜L−285;A−93〜L−285;G−94〜L−285;A−95〜L−285;G−96〜L−285;A−97〜L−285;P−98〜L−285;K−99〜L−285;A−100〜L−285;G−101〜L−285;L−102〜L−285;E−103〜L−285;E−104〜L−285;A−105〜L−285;P−106〜L−285;A−107〜L−285;V−108〜L−285;T−109〜L−285;A−110〜L−285;G−lll〜L−285;L−112〜L−285;K−113〜L−285;I−114〜L−285;F−115〜L−285;E−116〜L−285;P−117〜L−285;P−118〜L−285;A−119〜L−285;P−120〜L−285;G−121〜L−285;E−122〜L−285;G−123〜L−285;N−124〜L−285;S−125〜L−285;S−126〜L−285;Q−127〜L−285;N−128〜L−285;S−129〜L−285;R−130〜L−285;N−131〜L−285;K−132〜L−285;R−133〜L−285;A−134〜L−285;V−135〜L−285;Q−136〜L−285;G−137〜L−285;P−138〜L−285;E−139〜L−285;E−140〜L−285;T−141〜L−285;V−142〜L−285;T−143〜L−285;Q−144〜L−285;D−145〜L−285;C−146〜L−285;L−147〜L−285;Q−148〜L−285;L−149〜L−285;I−150〜L−285;A−151〜L−285;D−152〜L−285;S−153〜L−285;E−154〜L−285;T−155〜L−285;P−156〜L−285;T−157〜L−285;I−158〜L−285;Q−159〜L−285;K−160〜L−285;G−161〜L−285;S−162〜L−285;Y−163〜L−285;T−164〜L−285;F−165〜L−285;V−166〜L−285;P−167〜L−285;W−168〜L−285;L−169〜L−285;L−170〜L−285;S−171〜L−285;F−172〜L−285;K−173〜L−285;R−174〜L−285;G−175〜L−285;S−176〜L−285;A−177〜L−285;L−178〜L−285;E−179〜L−285;E−180〜L−285;K−181〜L−285;E−182〜L−285;N−183〜L−285;K−184〜L−285;I−185〜L−285;L−186〜L−285;V−187〜L−285;K−188〜L−285;E−189〜L−285;T−190〜L−285;G−191〜L−285;Y−192〜L−285;F−193〜L−285;F−194〜L−285;I−195〜L−285;Y−196〜L−285;G−197〜L−285;Q−198〜L−285;V−199〜L−285;L−200〜L−285;Y−201〜L−285;T−202〜L−285;D−203〜L−285;K−204〜L−285;T−205〜L−285;Y−206〜L−285;A−207〜L−285;M−208〜L−285;G−209〜L−285;H−210〜L−285;L−211〜L−285;I−212〜L−285;Q−213〜L−285;R−214〜L−285;K−215〜L−285;K−216〜L−285;V−217〜L−285;H−218〜L−285;V−219〜L−285;F−220〜L−285;G−221〜L−285;D−222〜L−285;E−223〜L−285;L−224〜L−285;S−225〜L−285;L−226〜L−285;V−227〜L−285;T−228〜L−285;L−229〜L−285;F−230〜L−285;R−231〜L−285;C−232〜L−285;I−233〜L−285;Q−234〜L−285;N−235〜L−285;M−236〜L−285;P−237〜L−285;E−238〜L−285;T−239〜L−285;L−240〜L−285;P−241〜L−285;N−242〜L−285;N−243〜L−285;S−244〜L−285;C−245〜L−285;Y−246〜L−285;S−247〜L−285;A−248〜L−285;G−249〜L−285;I−250〜L−285;A−251〜L−285;K−252〜L−285;L−253〜L−285;E−254〜L−285;E−255〜L−285;G−256〜L−285;D−257〜L−285;E−258〜L−285;L−259〜L−285;Q−260〜L−285;L−261〜L−285;A−262〜L−285;I−263〜L−285;P−264〜L−285;R−265〜L−285;E−266〜L−285;N−267〜L−285;A−268〜L−285;Q−269〜L−285;I−270〜L−285;S−271〜L−285;L−272〜L−285;D−273〜L−285;G−274〜L−285;D−275〜L−285;V−276〜L−285;T−277〜L−285;F−278〜L−285;F−279〜L−285;およびG−280〜L−285。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
また上記のように、タンパク質のC末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、このタンパク質の1つ以上の機能的活性(例えば、生物学的活性)の改変または損失を生じるとしても、他の機能的活性は依然として保持され得る。従って、このポリペプチドの完全形態または成熟形態、あるいは細胞外ドメインを認識する抗体を誘導および/または結合する短縮BLySムテインの能力は、一般に、このポリペプチドの完全形態または成熟形態あるいは細胞外ドメインの残基の大部分未満がC末端から除去される場合、保持される。完全ポリペプチドのC末端残基を欠く特定のポリペプチドがこのような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の慣用的な方法によって容易に決定され得る。多くのC末端アミノ酸残基が欠失したBLySムテインは、いくつかの機能的(例えば、生物学的または免疫原性)活性を保持し得るようである。実際に、6つほどの少ないBLySアミノ酸残基からなるペプチドは、しばしば、免疫応答を惹起し得る。
従って、本発明はさらに、別の実施形態において、配列番号3228において示されるBLySのアミノ酸配列のカルボキシ末端から位置番号6のグルタミン酸残基までの1つ以上の残基が欠失したポリペプチド、およびこのようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3228の残基1−mのアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する抗体を提供し、ここで、mは、配列番号3228におけるアミノ酸配列のアミノ酸残基6〜284のアミノ酸位置の範囲の整数である。
より詳細には、本発明は、配列番号3228の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供する:M−1〜L−284;M−1〜K−283;M−1〜L−282;M−1〜A−281;M−1〜G−280;M−1〜F−279;M−1〜F−278;M−1〜T−277;M−1〜V−276;M−1〜D−275;M−1〜G−274;M−l〜D−273;M−1〜L−272;M−1〜S−271;M−1〜I−270;M−1〜Q−269;M−1〜A−268;M−1〜N−267;M−1〜E−266;M−1〜R−265;M−1〜P−264;M−1〜I−263;M−1〜A−262;M−1〜L−261;M−1〜Q−260;M−1〜L−259;M−1〜E−258;M−1〜D−257;M−1〜G−256;M−1〜E−255;M−1〜E−254;M−1〜L−253;M−1〜K−252;M−1〜A−251;M−1〜I−250;M−1〜G−249;M−1〜A−248;M−1〜S−247;M−1〜Y−246;M−1〜C−245;M−1〜S−244;M−1〜N−243;M−1〜N−242;M−1〜P−241;M−1〜L−240;M−1〜T−239;M−1〜E−238;M−1〜P−237;M−1〜M−236;M−1〜N−235;M−1〜Q−234;M−1〜I−233;M−1〜C−232;M−1〜R−231;M−1〜F−230;M−1〜L−229;M−1〜T−228;M−1〜V−227;M−1〜L−226;M−1〜S−225;M−1〜L−224;M−1〜E−223;M−1〜D−222;M−1〜G−221;M−1〜F−220;M−1〜V−219;M−1〜H−218;M−1〜V−217;M−1〜K−216;M−1〜K−215;M−1〜R−214;M−l〜Q−213;M−1〜I−212;M−1〜L−211;M−1〜H−210;M−1〜G−209;M−1〜M−208;M−1〜A−207;M−1〜Y−206;M−1〜T−205;M−1〜K−204;M−1〜D−203;M−1〜T−202;M−1〜Y−201;M−1〜L−200;M−1〜V−199;M−1〜Q−198;M−1〜G−197;M−1〜Y−196;M−1〜I−195;M−1〜F−194;M−1〜F−193;M−1〜Y−192;M−1〜G−191;M−1〜T−190;M−1〜E−189;M−1〜K−188;M−1〜V−187;M−1〜L−186;M−1〜I−185;M−1〜K−184;M−1〜N−183;M−1〜E−182;M−1〜K−181;M−1〜E−180;M−1〜E−179;M−1〜L−178;M−1〜A−177;M−1〜S−176;M−1〜G−175;M−1〜R−174;M−1〜K−173;M−1〜F−172;M−1〜S−171;M−1〜L−170;M−1〜L−169;M−1〜W−168;M−1〜P−167;M−1〜V−166;M−1〜F−165;M−1〜T−164;M−1〜Y−163;M−1〜S−162;M−1〜G−161;M−1〜K−160;M−1〜Q−159;M−1〜I−158;M−1〜T−157;M−1〜P−156;M−1〜T−155;M−1〜E−154;M−1〜S−153;M−1〜D−152;M−1〜A−151;M−1〜I−150;M−1〜L−149;M−1〜Q−148;M−1〜L−147;M−1〜C−146;M−1〜D−145;M−1〜Q−144;M−1〜T−143;M−1〜V−142;M−1〜T−141;M−1〜E−140;M−1〜E−139;M−1〜P−138;M−1〜G−137;M−1〜Q−136;M−1〜V−135;M−1〜A−134;M−1〜R−133;M−1〜K−132;M−1〜N−131;M−1〜R−130;M−1〜S−129;M−1〜N−128;M−1〜Q−127;M−1〜S−126;M−1〜S−125;M−1〜N−124;M−1〜G−123;M−1〜E−122;M−1〜G−121;M−1〜P−120;M−1〜A−119;M−1〜P−118;M−1〜P−117;M−1〜E−116;M−1〜F−115;M−1〜I−114;M−1〜K−113;M−1〜L−112;M−1〜G−lll;M−1〜A−110;M−1〜T−109;M−1〜V−108;M−1〜A−107;M−1〜P−106;M−1〜A−105;M−1〜E−104;M−1〜E−103;M−1〜L−102;M−1〜G−101;M−1〜A−100;M−1〜K−99;M−1〜P−98;M−1〜A−97;M−1〜G−96;M−1〜A−95;M−1〜G−94;M−1〜A−93;M−1〜P−92;M−1〜L−91;M−1〜K−90;M−1〜E−89;M−1〜A−88;M−1〜H−87;M−1〜H−86;M−1〜G−85;M−1〜Q−84;M−1〜L−83;M−1〜E−82;M−1〜A−81;M−1〜R−80;M−1〜L−79;M−1〜S−78;M−1〜A−77;M−1〜L−76;M−1〜D−75;M−1〜G−74;M−1〜Q−73;M−1〜L−72;M−1〜A−71;M−1〜A−70;M−1〜V−69;M−1〜Q−68;M−1〜Y−67;M−1〜F−66;M−1〜S−65;M−1〜V−64;M−1〜V−63;M−1〜T−62;M−1〜L−61;M−1〜C−60;M−1〜C−59;M−1〜S−58;M−1〜L−57;M−1〜L−56;M−1〜A−55;M−1〜L−54;M−1〜L−53;M−1〜L−52;M−1〜T−51;M−1〜A−50;M−1〜A−49;M−1〜L−48;M−1〜L−47;M−1〜K−46;M−1〜G−45;M−1〜D−44;M−1〜K−43;M−1〜S−42;M−1〜S−41;M−1〜R−40;M−1〜V−39;M−1〜S−38;M−1〜P−37;M−1〜S−36;M−1〜E−35;M−1〜K−34;M−1〜R−33;M−1〜P−32;M−1〜L−31;M−1〜I−30;M−1〜S−29;M−1〜V−28;M−1〜C−27;M−1〜E−26;M−1〜K−25;M−1〜L−24;M−1〜K−23;M−1〜M−22;M−1〜E−21;M−1〜E−20;M−1〜R−19;M−1〜K−18;M−1〜K−17;M−1〜L−16;M−1〜C−15;M−1〜S−14;M−1〜T−13;M−1〜L−12;M−1〜R−ll;M−1〜S−10;M−1〜Q−9;M−1〜E−8;M−1〜R−7;およびM−1〜E−6。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
本発明はまた、BLySポリペプチドのアミノ末端およびカルボキシル末端の両方から1つ以上のアミノ酸が欠失したポリペプチドに結合する抗体を提供し、これらは、一般に配列番号3228の残基n−mを有するように記載され得、ここで、nおよびmは、上記で規定された通りの整数である。
さらに、配列番号3229のBLySポリペプチドの推定細胞外ドメインが、それ自体機能的活性(例えば、生物学的活性)を誘発し得るので、配列番号3229の位置Gln−73〜Leu−266でのポリペプチドの推定細胞外領域からのN末端およびC末端アミノ酸残基の欠失は、いくつかの機能的活性(例えば、リガンド結合、リンパ球(例えば、B細胞)の増殖、分化、および/または活性化の刺激、細胞複製の調節、標的細胞活性および/または免疫原性の調節)を保持し得る。しかし、BLySポリペプチドの推定細胞外ドメインのN末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、このポリペプチドの1つ以上の機能的活性の改変または損失を生じるとしても、他の機能的活性は依然として保持され得る。従って、このポリペプチドの完全または成熟または細胞外ドメインを認識する抗体を誘導および/または結合する短縮ポリペプチドの能力は、一般に、このポリペプチドの完全または成熟または細胞外ドメインの残基の大部分未満がN末端から除去される場合、保持される。完全ポリペプチドのN末端残基を欠く特定のポリペプチドがこのような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の慣用的な方法によって容易に決定され得る。
従って、本発明はさらに、配列番号3229に示されるBLySのアミノ酸配列のアミノ末端から、位置番号261のグリシン残基までの1つ以上の残基が欠失したポリペプチドに結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3229の残基n−266のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する抗体を提供し、ここで、nは、配列番号3229におけるアミノ酸配列のアミノ酸残基73〜261のアミノ酸位置の範囲の整数であり、そして261は、予測される細胞外ドメインBLySポリペプチド(配列番号3229に示される)のN末端からの最初の残基の位置である。
より詳細には、特定の実施形態において、本発明は、配列番号3229の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供する:Q−73〜L−266;G−74〜L−266;D−75〜L−266;L−76〜L−266;A−77〜L−266;S−78〜L−266;L−79〜L−266;R−80〜L−266;A−81〜L−266;E−82〜L−266;L−83〜L−266;Q−84〜L−266;G−85〜L−266;H−86〜L−266;H−87〜L−266;A−88〜L−266;E−89〜L−266;K−90〜L−266;L−91〜L−266;P−92〜L−266;A−93〜L−266;G−94〜L−266;A−95〜L−266;G−96〜L−266;A−97〜L−266;P−98〜L−266;K−99〜L−266;A−100〜L−266;G−101〜L−266;L−102〜L−266;E−103〜L−266;E−104〜L−266;A−105〜L−266;P−106〜L−266;A−107〜L−266;V−108〜L−266;T−109〜L−266;A−110〜L−266;G−111〜L−266;L−112〜L−266;K−113〜L−266;I−114〜L−266;F−115〜L−266;E−116〜L−266;P−117〜L−266;P−118〜L−266;A−119〜L−266;P−120〜L−266;G−121〜L−266;E−122〜L−266;G−123〜L−266;N−124〜L−266;S−125〜L−266;S−126〜L−266;Q−127〜L−266;N−128〜L−266;S−129〜L−266;R−130〜L−266;N−131〜L−266;K−132〜L−266;R−133〜L−266;A−134〜L−266;V−135〜L−266;Q−136〜L−266;G−137〜L−266;P−138〜L−266;E−139〜L−266;E−140〜L−266;T−141〜L−266;G−142〜L−266;S−143〜L−266;Y−144〜L−266;T−145〜L−266;F−146〜L−266;V−147〜L−266;P−148〜L−266;W−149〜L−266;L−150〜L−266;L−151〜L−266;S−152〜L−266;F−153〜L−266;K−154〜L−266;R−155〜L−266;G−156〜L−266;S−157〜L−266;A−158〜L−266;L−159〜L−266;E−160〜L−266;E−161〜L−266;K−162〜L−266;E−163〜L−266;N−164〜L−266;K−165〜L−266;I−166〜L−266;L−167〜L−266;V−168〜L−266;K−169〜L−266;E−170〜L−266;T−171〜L−266;G−172〜L−266;Y−173〜L−266;F−174〜L−266;F−175〜L−266;I−176〜L−266;Y−177〜L−266;G−178〜L−266;Q−179〜L−266;V−180〜L−266;L−181〜L−266;Y−182〜L−266;T−183〜L−266;D−184〜L−266;K−185〜L−266;T−186〜L−266;Y−187〜L−266;A−188〜L−266;M−189〜L−266;G−190〜L−266;H−191〜L−266;L−192〜L−266;I−193〜L−266;Q−194〜L−266;R−195〜L−266;K−196〜L−266;K−197〜L−266;V−198〜L−266;H−199〜L−266;V−200〜L−266;F−201〜L−266;G−202〜L−266;D−203〜L−266;E−204〜L−266;L−205〜L−266;S−206〜L−266;L−207〜L−266;V−208〜L−266;T−209〜L−266;L−210〜L−266;F−211〜L−266;R−212〜L−266;C−213〜L−266;I−214〜L−266;Q−215〜L−266;N−216〜L−266;M−217〜L−266;P−218〜L−266;E−219〜L−266;T−220〜L−266;L−221〜L−266;P−222〜L−266;N−223〜L−266;N−224〜L−266;S−225〜L−266;C−226〜L−266;Y−227〜L−266;S−228〜L−266;A−229〜L−266;G−230〜L−266;I−231〜L−266;A−232〜L−266;K−233〜L−266;L−234〜L−266;E−235〜L−266;E−236〜L−266;G−237〜L−266;D−238〜L−266;E−239〜L−266;L−240〜L−266;Q−241〜L−266;L−242〜L−266;A−243〜L−266;I−244〜L−266;P−245〜L−266;R−246〜L−266;E−247〜L−266;N−248〜L−266;A−249〜L−266;Q−250〜L−266;I−251〜L−266;S−252〜L−266;L−253〜L−266;D−254〜L−266;G−255〜L−266;D−256〜L−266;V−257〜L−266;T−258〜L−266;F−259〜L−266;F−260〜L−266;およびG−261〜L−266。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
同様に、配列番号3229の79位のロイシン残基までの、BLySの推定細胞外ドメインのC末端アミノ酸残基の欠失は、いくつかの機能的活性(例えば、リガンド結合、リンパ球(例えば、B細胞)の増殖、分化、および/または活性を刺激する能力、細胞複製の調節、標的細胞活性および/または免疫原性の調節)を保持し得る。配列番号3229のLeu−79を含むさらなるC末端欠失を有するポリペプチドは、生物学的活性を保有するとは予期されない。
しかし、ポリペプチドのC末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、このポリペプチドの1つ以上の機能的活性(例えば、生物学的活性)を改変または損失するとしても、他の機能的活性は依然として保持され得る。従って、このポリペプチドの完全形態、成熟形態または細胞外形態を認識する抗体を誘導および/または結合する短縮ポリペプチドの能力は、一般に、このポリペプチドの完全形態、成熟形態または細胞外形態の残基の大部分未満がC末端から除去される場合、保持される。推定細胞外ドメインのC末端残基を欠く特定のポリペプチドがこのような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の慣用的な方法によって容易に決定され得る。
従って、本発明はさらに、配列番号3229に示されるBLySの推定細胞外ドメインのアミノ酸配列のカルボキシ末端から、配列番号3229の79位のロイシン残基まで1つ以上の残基が欠失したポリペプチドに結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3229のアミノ酸配列の残基73−mのアミノ酸配列を有するポリペプチドに結合する抗体を提供し、ここで、mは、配列番号3229におけるアミノ酸配列のアミノ酸残基79〜265のアミノ酸位置の範囲の任意の整数である。
より詳細には、特定の実施形態において、本発明は、配列番号3229の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供する:Q−73〜L−265;Q−73〜K−264;Q−73〜L−263;Q−73〜A−262;Q−73〜G−261;Q−73〜F−260;Q−73〜F−259;Q−73〜T−258;Q−73〜V−257;Q−73〜D−256;Q−73〜G−255;Q−73〜D−254;Q−73〜L−253;Q−73〜S−252;Q−73〜I−251;Q−73〜Q−250;Q−73〜A−249;Q−73〜N−248;Q−73〜E−247;Q−73〜R−246;Q−73〜P−245;Q−73〜I−244;Q−73〜A−243;Q−73〜L−242;Q−73〜Q−241;Q−73〜L−240;Q−73〜E−239;Q−73〜D−238;Q−73〜G−237;Q−73〜E−236;Q−73〜E−235;Q−73〜L−234;Q−73〜K−233;Q−73〜A−232;Q−73〜I−231;Q−73〜G−230;Q−73〜A−229;Q−73〜S−228;Q−73〜Y−227;Q−73〜C−226;Q−73〜S−225;Q−73〜N−224;Q−73〜N−223;Q−73〜P−222;Q−73〜L−221;Q−73〜T−220;Q−73〜E−219;Q−73〜P−218;Q−73〜M−217;Q−73〜N−216;Q−73〜Q−215;Q−73〜I−214;Q−73〜C−213;Q−73〜R−212;Q−73〜F−211;Q−73〜L−210;Q−73〜T−209;Q−73〜V−208;Q−73〜L−207;Q−73〜S−206;Q−73〜L−205;Q−73〜E−204;Q−73〜D−203;Q−73〜G−202;Q−73〜F−201;Q−73〜V−200;Q−73〜H−199;Q−73〜V−198;Q−73〜K−197;Q−73〜K−196;Q−73〜R−195;Q−73〜Q−194;Q−73〜I−193;Q−73〜L−192;Q−73〜H−191;Q−73〜G−190;Q−73〜Q−7389;Q−73〜A−188;Q−73〜Y−187;Q−73〜T−186;Q−73〜K−185;Q−73〜D−184;Q−73〜T−183;Q−73〜Y−182;Q−73〜L−181;Q−73〜V−180;Q−73〜Q−179;Q−73〜G−178;Q−73〜Y−177;Q−73〜I−176;Q−73〜F−175;Q−73〜F−174;Q−73〜Y−173;Q−73〜G−172;Q−73〜T−171;Q−73〜E−170;Q−73〜K−169;Q−73〜V−168;Q−73〜L−167;Q−73〜I−166;Q−73〜K−165;Q−73〜N−164;Q−73〜E−163;Q−73〜K−162;Q−73〜E−161;Q−73〜E−160;Q−73〜L−159;Q−73〜A−158;Q−73〜S−157;Q−73〜G−156;Q−73〜R−155;Q−73〜K−154;Q−73〜F−153;Q−73〜S−152;Q−73〜L−151;Q−73〜L−150;Q−73〜W−149;Q−73〜P−148;Q−73〜V−147;Q−73〜F−146;Q−73〜T−145;Q−73〜Y−144;Q−73〜S−143;Q−73〜G−142;Q−73〜T−141;Q−73〜E−140;Q−73〜E−139;Q−73〜P−138;Q−73〜G−137;Q−73〜Q−136;Q−73〜V−135;Q−73〜A−134;Q−73〜R−133;Q−73〜K−132;Q−73〜N−131;Q−73〜R−130;Q−73〜S−129;Q−73〜N−128;Q−73〜Q−127;Q−73〜S−126;Q−73〜S−125;Q−73〜N−124;Q−73〜G−123;Q−73〜E−122;Q−73〜G−121;Q−73〜P−120;Q−73〜A−119;Q−73〜P−118;Q−73〜P−117;Q−73〜E−116;Q−73〜F−115;Q−73〜I−114;Q−73〜K−113;Q−73〜L−112;Q−73〜G−111;Q−73〜A−110;Q−73〜T−109;Q−73〜V−108;Q−73〜A−107;Q−73〜P−106;Q−73〜A−105;Q−73〜E−104;Q−73〜E−103;Q−73〜L−102;Q−73〜G−101;Q−73〜A−100;Q−73〜K−99;Q−73〜P−98;Q−73〜A−97;Q−73〜G−96;Q−73〜A−95;Q−73〜G−94;Q−73〜A−93;Q−73〜P−92;Q−73〜L−91;Q−73〜K−90;Q−73〜E−89;Q−73〜A−88;Q−73〜H−87;Q−73〜H−86;Q−73〜G−85;Q−73〜Q−84;Q−73〜L−83;Q−73〜E−82;Q−73〜A−81;Q−73〜R−80;Q−73〜L−79;およびQ−73〜S−78。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
本発明はまた、BLySの推定細胞外ドメインのアミノ末端およびカルボキシル末端の両方から1つ以上のアミノ酸が欠失したポリペプチドを提供し、これらは、配列番号3229の残基n−mを有するように一般に記載され得、ここでnおよびmは、上記で規定した通りの整数である。
別の実施形態において、本発明の抗体は、ATCC受託番号203518を有する寄託物に含まれるcDNAクローンによってコードされるBLySアミノ酸配列の細胞外ドメインの部分を含むポリペプチドに結合し、ここで、この部分は、ATCC受託番号203518を有する寄託物中に含まれるcDNAクローンによってコードされるアミノ酸配列の細胞外ドメインのアミノ末端から、1〜約260アミノ酸を除外するか、またはATCC受託番号203518を有する寄託物中に含まれるcDNAクローンによってコードされるアミノ酸の細胞外ドメインのカルボキシ末端から、1〜約187アミノ酸を除外するか、あるいはATCC受託番号203518を有する寄託物中に含まれるcDNAクローンによってコードされるアミノ酸配列の細胞外ドメイン全体の、上記のアミノ末端およびカルボキシ末端欠失の任意の組み合わせを除外する。
上記のように、ポリペプチドのN末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、このポリペプチドの1つ以上の機能的活性(例えば、生物学的活性)の改変または損失を生じるとしても、他の機能的活性または生物学的活性は、依然として保持され得る。従って、このポリペプチドの全長形態または成熟形態、あるいは細胞外ドメインを認識する抗体を誘導および/または結合する短縮BLySポリペプチドの能力は、一般に、このポリペプチドの全長または成熟また細胞外ドメインの残基の大部分未満がN末端から除去される場合、保持される。完全ポリペプチドのN末端残基を欠く特定のポリペプチドがこのような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の慣用的な方法によって容易に決定され得る。多くのN末端アミノ酸残基が欠失したBLySムテインは、機能的(例えば、免疫原性)活性を保持し得るようである。実際に、6つほどの少ないBLySアミノ酸残基からなるペプチドは、しばしば、免疫応答を惹起し得る。
従って、本発明はさらに、配列番号3229に示されるBLySの推定全長アミノ酸配列のアミノ末端から、配列番号3229に示される配列の位置番号261のグリシン残基まで1つ以上の残基が欠失したポリペプチド、およびこのようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3229に示される配列の残基n−266のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する抗体を提供し、ここで、nは、配列番号3229におけるアミノ酸配列のアミノ酸残基1〜261のアミノ酸位置の範囲の整数である。
より詳細には、本発明は、配列番号3229の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供する:D−2〜L−266;D−3〜L−266;S−4〜L−266;T−5〜L−266;E−6〜L−266;R−7〜L−266;E−8〜L−266;Q−9〜L−266;S−10〜L−266;R−11〜L−266;L−12〜L−266;T−13〜L−266;S−14〜L−266;C−15〜L−266;L−16〜L−266;K−17〜L−266;K−18〜L−266;R−19〜L−266;E−20〜L−266;E−21〜L−266;M−22〜L−266;K−23〜L−266;L−24〜L−266;K−25〜L−266;E−26〜L−266;C−27〜L−266;V−28〜L−266;S−29〜L−266;I−30〜L−266;L−31〜L−266;P−32〜L−266;R−33〜L−266;K−34〜L−266;E−35〜L−266;S−36〜L−266;P−37〜L−266;S−38〜L−266;V−39〜L−266;R−40〜L−266;S−41〜L−266;S−42〜L−266;K−43〜L−266;D−44〜L−266;G−45〜L−266;K−46〜L−266;L−47〜L−266;L−48〜L−266;A−49〜L−266;A−50〜L−266;T−51〜L−266;L−52〜L−266;L−53〜L−266;L−54〜L−266;A−55〜L−266;L−56〜L−266;L−57〜L−266;S−58〜L−266;C−59〜L−266;C−60〜L−266;L−61〜L−266;T−62〜L−266;V−63〜L−266;V−64〜L−266;S−65〜L−266;F−66〜L−266;Y−67〜L−266;Q−68〜L−266;V−69〜L−266;A−70〜L−266;A−71〜L−266;L−72〜L−266;Q−73〜L−266;G−74〜L−266;D−75〜L−266;L−76〜L−266;A−77〜L−266;S−78〜L−266;L−79〜L−266;R−80〜L−266;A−81〜L−266;E−82〜L−266;L−83〜L−266;Q−84〜L−266;G−85〜L−266;H−86〜L−266;H−87〜L−266;A−88〜L−266;E−89〜L−266;K−90〜L−266;L−91〜L−266;P−92〜L−266;A−93〜L−266;G−94〜L−266;A−95〜L−266;G−96〜L−266;A−97〜L−266;P−98〜L−266;K−99〜L−266;A−100〜L−266;G−101〜L−266;L−102〜L−266;E−103〜L−266;E−104〜L−266;A−105〜L−266;P−106〜L−266;A−107〜L−266;V−108〜L−266;T−109〜L−266;A−110〜L−266;G−111〜L−266;L−112〜L−266;K−113〜L−266;I−114〜L−266;F−115〜L−266;E−116〜L−266;P−117〜L−266;P−118〜L−266;A−119〜L−266;P−120〜L−266;G−121〜L−266;E−122〜L−266;G−123〜L−266;N−124〜L−266;S−125〜L−266;S−126〜L−266;Q−127〜L−266;N−128〜L−266;S−129〜L−266;R−130〜L−266;N−131〜L−266;K−132〜L−266;R−133〜L−266;A−134〜L−266;V−135〜L−266;Q−136〜L−266;G−137〜L−266;P−138〜L−266;E−139〜L−266;E−140〜L−266;T−141〜L−266;G−142〜L−266;S−143〜L−266;Y−144〜L−266;T−145〜L−266;F−146〜L−266;V−147〜L−266;P−148〜L−266;W−149〜L−266;L−150〜L−266;L−151〜L−266;S−152〜L−266;F−153〜L−266;K−154〜L−266;R−155〜L−266;G−156〜L−266;S−157〜L−266;A−158〜L−266;L−159〜L−266;E−160〜L−266;E−161〜L−266;K−162〜L−266;E−163〜L−266;N−164〜L−266;K−165〜L−266;I−166〜L−266;L−167〜L−266;V−168〜L−266;K−169〜L−266;E−170〜L−266;T−171〜L−266;G−172〜L−266;Y−173〜L−266;F−174〜L−266;F−175〜L−266;I−176〜L−266;Y−177〜L−266;G−178〜L−266;Q−179〜L−266;V−180〜L−266;L−181〜L−266;Y−182〜L−266;T−183〜L−266;D−184〜L−266;K−185〜L−266;T−186〜L−266;Y−187〜L−266;A−188〜L−266;M−189〜L−266;G−190〜L−266;H−191〜L−266;L−192〜L−266;I−193〜L−266;Q−194〜L−266;R−195〜L−266;K−196〜L−266;K−197〜L−266;V−198〜L−266;H−199〜L−266;V−200〜L−266;F−201〜L−266;G−202〜L−266;D−203〜L−266;E−204〜L−266;L−205〜L−266;S−206〜L−266;L−207〜L−266;V−208〜L−266;T−209〜L−266;L−210〜L−266;F−211〜L−266;R−212〜L−266;C−213〜L−266;I−214〜L−266;Q−215〜L−266;N−216〜L−266;M−217〜L−266;P−218〜L−266;E−219〜L−266;T−220〜L−266;L−221〜L−266;P−222〜L−266;N−223〜L−266;N−224〜L−266;S−225〜L−266;C−226〜L−266;Y−227〜L−266;S−228〜L−266;A−229〜L−266;G−230〜L−266;I−231〜L−266;A−232〜L−266;K−233〜L−266;L−234〜L−266;E−235〜L−266;E−236〜L−266;G−237〜L−266;D−238〜L−266;E−239〜L−266;L−240〜L−266;Q−241〜L−266;L−242〜L−266;A−243〜L−266;I−244〜L−266;P−245〜L−266;R−246〜L−266;E−247〜L−266;N−248〜L−266;A−249〜L−266;Q−250〜L−266;I−251〜L−266;S−252〜L−266;L−253〜L−266;D−254〜L−266;G−255〜L−266;D−256〜L−266;V−257〜L−266;T−258〜L−266;F−259〜L−266;F−260〜L−266;およびG−261〜L−266。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
また上記のように、タンパク質のC末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、このタンパク質の1つ以上の機能的活性(例えば、生物学的活性)の改変または損失を生じるとしても、他の機能的活性は依然として保持され得る。従って、このポリペプチドの完全形態または成熟形態、あるいは細胞外ドメインを認識する抗体を誘導および/または結合する短縮BLySムテインの能力は、一般に、このポリペプチドの完全形態または成熟形態あるいは細胞外ドメインの残基の大部分未満がC末端から除去される場合、保持される。完全ポリペプチドのC末端残基を欠く特定のポリペプチドがこのような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の慣用的な方法によって容易に決定され得る。多くのC末端アミノ酸残基が欠失したBLySムテインは、いくつかの機能的(例えば、免疫原性)活性を保持し得るようである。実際に、6つほどの少ないBLySアミノ酸残基からなるペプチドは、しばしば、免疫応答を惹起し得る。
従って、本発明はさらに、別の実施形態において、配列番号3229に示されるBLySのアミノ酸配列のカルボキシ末端から、位置番号6のグルタミン酸残基まで1つ以上の残基が欠失したポリペプチド、およびこのようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに結合する抗体を提供する。詳細には、本発明は、配列番号3229の残基1−mのアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する抗体を提供し、ここで、mは、配列番号3229におけるアミノ酸配列のアミノ酸残基6〜265のアミノ酸位置の範囲の整数である。
より詳細には、本発明は、配列番号3229の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供する:M−1〜L−265;M−1〜K−264;M−1〜L−263;M−1〜A−262;M−1〜G−261;M−1〜F−260;M−1〜F−259;M−1〜T−258;M−1〜V−257;M−1〜D−256;M−1〜G−255;M−1〜D−254;M−1〜L−253;M−1〜S−252;M−1〜I−251;M−1〜Q−250;M−1〜A−249;M−1〜N−248;M−1〜E−247;M−1〜R−246;M−1〜P−245;M−1〜I−244;M−1〜A−243;M−1〜L−242;M−1〜Q−241;M−1〜L−240;M−1〜E−239;M−1〜D−238;M−1〜G−237;M−1〜E−236;M−1〜E−235;M−1〜L−234;M−1〜K−233;M−1〜A−232;M−1〜I−231;M−1〜G−230;M−1〜A−229;M−1〜S−228;M−1〜Y−227;M−1〜C−226;M−1〜S−225;M−1〜N−224;M−1〜N−223;M−1〜P−222;M−1〜L−221;M−1〜T−220;M−1〜E−219;M−1〜P−218;M−1〜M−217;M−1〜N−216;M−1〜Q−215;M−1〜I−214;M−1〜C−213;M−1〜R−212;M−1〜F−211;M−1〜L−210;M−1〜T−209;M−1〜V−208;M−1〜L−207;M−1〜S−206;M−1〜L−205;M−1〜E−204;M−1〜D−203;M−1〜G−202;M−1〜F−201;M−1〜V−200;M−1〜H−199;M−1〜V−198;M−1〜K−197;M−1〜K−196;M−1〜R−195;M−1〜Q−194;M−1〜I−193;M−1〜L−192;M−1〜H−191;M−1〜G−190;M−1〜M−189;M−1〜A−188;M−1〜Y−187;M−1〜T−186;M−1〜K−185;M−1〜D−184;M−1〜T−183;M−1〜Y−182;M−1〜L−181;M−1〜V−180;M−1〜Q−179;M−1〜G−178;M−1〜Y−177;M−1〜I−176;M−1〜F−175;M−1〜F−174;M−1〜Y−173;M−1〜G−172;M−1〜T−171;M−1〜E−170;M−1〜K−169;M−1〜V−168;M−1〜L−167;M−1〜I−166;M−1〜K−165;M−1〜N−164;M−1〜E−163;M−1〜K−162;M−1〜E−161;M−1〜E−160;M−1〜L−159;M−1〜A−158;M−1〜S−157;M−1〜G−156;M−1〜R−155;M−1〜K−154;M−1〜F−153;M−1〜S−152;M−1〜L−151;M−1〜L−150;M−1〜W−149;M−1〜P−148;M−1〜V−147;M−1〜F−146;M−1〜T−145;M−1〜Y−144;M−1〜S−143;M−1〜G−142;M−1〜T−141;M−1〜E−140;M−1〜E−139;M−1〜P−138;M−1〜G−137;M−1〜Q−136;M−1〜V−135;M−l〜A−134;M−1〜R−133;M−1〜K−132;M−1〜N−131;M−1〜R−130;M−1〜S−129;M−1〜N−128;M−1〜Q−127;M−1〜S−126;M−1〜S−125;M−1〜N−124;M−1〜G−123;M−1〜E−122;M−1〜G−121;M−1〜P−120;M−1〜A−119;M−1〜P−118;M−1〜P−117;M−1〜E−116;M−1〜F−115;M−1〜I−114;M−1〜K−113;M−1〜L−112;M−1〜G−111;M−1〜A−110;M−1〜T−109;M−1〜V−108;M−1〜A−107;M−1〜P−106;M−1〜A−105;M−1〜E−104;M−1〜E−103;M−1〜L−102;M−1〜G−101;M−1〜A−100;M−1〜K−99;M−1〜P−98;M−1〜A−97;M−1〜G−96;M−1〜A−95;M−1〜G−94;M−1〜A−93;M−1〜P−92;M−1〜L−91;M−1〜K−90;M−1〜E−89;M−1〜A−88;M−1〜H−87;M−1〜H−86;M−1〜G−85;M−1〜Q−84;M−1〜L−83;M−1〜E−82;M−1〜A−81;M−1〜R−80;M−1〜L−79;M−1〜S−78;M−1〜A−77;M−1〜L−76;M−1〜D−75;M−1〜G−74;M−1〜Q−73;M−1〜L−72;M−1〜A−71;M−l〜A−70;M−1〜V−69;M−1〜Q−68;M−1〜Y−67;M−1〜F−66;M−1〜S−65;M−1〜V−64;M−1〜V−63;M−1〜T−62;M−1〜L−61;M−1〜C−60;M−1〜C−59;M−1〜S−58;M−1〜L−57;M−1〜L−56;M−1〜A−55;M−1〜L−54;M−1〜L−53;M−1〜L−52;M−1〜T−51;M−1〜A−50;M−1〜A−49;M−1〜L−48;M−1〜L−47;M−1〜K−46;M−1〜G−45;M−1〜D−44;M−1〜K−43;M−1〜S−42;M−1〜S−41;M−1〜R−40;M−1〜V−39;M−1〜S−38;M−1〜P−37;M−1〜S−36;M−1〜E−35;M−1〜K−34;M−1〜R−33;M−1〜P−32;M−1〜L−31;M−1〜I−30;M−1〜S−29;M−1〜V−28;M−1〜C−27;M−1〜E−26;M−1〜K−25;M−1〜L−24;M−1〜K−23;M−1〜M−22;M−1〜E−21;M−1〜E−20;M−1〜R−19;M−1〜K−18;M−1〜K−17;M−1〜L−16;M−1〜C−15;M−1〜S−14;M−1〜T−13;M−1〜L−12;M−1〜R−11;M−1〜S−10;M−1〜Q−9;M−1〜E−8;M−1〜R−7;およびM−1〜E−6。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
本発明はまた、BLySポリペプチドのアミノ末端およびカルボキシル末端の両方から1つ以上のアミノ酸が欠失したポリペプチドに結合する抗体を提供し、これらは、一般に配列番号3229の残基n−mを有するように記載され得、ここで、nおよびmは、上記で規定された通りの整数である。
さらなる実施形態において、本発明は、配列番号3228の残基134−mのアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する抗体を提供し、ここで、mは、140〜285の整数であり、配列番号3228におけるアミノ酸配列の位置に対応する。例えば、本発明は、配列番号3228の以下の配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドに結合する抗体を提供する:A−134〜Leu−285;A−134〜L−284;A−134〜K−283;A−134〜L−282;A−134〜A−281;A−134〜G−280;A−134〜F−279;A−134〜F−278;A−134〜T−277;A−134〜V−276;A−134〜D−275;A−134〜G−274;A−134〜D−273;A−134〜L−272;A−134〜S−271;A−134〜I−270;A−134〜Q−269;A−134〜A−268;A−134〜N−267;A−134〜E−266;A−134〜R−265;A−134〜P−264;A−134〜I−263;A−134〜A−262;A−134〜L−261;A−134〜Q−260;A−134〜L−259;A−134〜E−258;A−134〜D−257;A−134〜G−256;A−134〜E−255;A−134〜E−254;A−134〜L−253;A−134〜K−252;A−134〜A−251;A−134〜I−250;A−134〜G−249;A−134〜A−248;A−134〜S−247;A−134〜Y−246;A−134〜C−245;A−134〜S−244;A−134〜N−243;A−134〜N−242;A−134〜P−241;A−134〜L−240;A−134〜T−239;A−134〜E−238;A−134〜P−237;A−134〜M−236;A−134〜N−235;A−134〜Q−234;A−134〜I−233;A−134〜C−232;A−134〜R−231;A−134〜F−230;A−134〜L−229;A−134〜T−228;A−134〜V−227;A−134〜L−226;A−134〜S−225;A−134〜L−224;A−134〜E−223;A−134〜D−222;A−134〜G−221;A−134〜F−220;A−134〜V−219;A−134〜H−218;A−134〜V−217;A−134〜K−216;A−134〜K−215;A−134〜R−214;A−134〜Q−213;A−134〜I−212;A−134〜L−211;A−134〜H−210;A−134〜G−209;A−134〜M−208;A−134〜A−207;A−134〜Y−206;A−134〜T−205;A−134〜K−204;A−134〜D−203;A−134〜T−202;A−134〜Y−201;A−134〜L−200;A−134〜V−199;A−134〜Q−198;A−134〜G−197;A−134〜Y−196;A−134〜I−195;A−134〜F−194;A−134〜F−193;A−134〜Y−192;A−134〜G−191;A−134〜T−190;A−134〜E−189;A−134〜K−188;A−134〜V−187;A−134〜L−186;A−134〜I−185;A−134〜K−184;A−134〜N−183;A−134〜E−182;A−134〜K−181;A−134〜E−180;A−134〜E−179;A−134〜L−178;A−134〜A−177;A−134〜S−176;A−134〜G−175;A−134〜R−174;A−134〜K−173;A−134〜F−172;A−134〜S−171;A−134〜L−170;A−134〜L−169;A−134〜W−168;A−134〜P−167;A−134〜V−166;A−134〜F−165;A−134〜T−164;A−134〜Y−163;A−134〜S−162;A−134〜G−161;A−134〜K−160;A−134〜Q−159;A−134〜I−158;A−134〜T−157;A−134〜P−156;A−134〜T−155;A−134〜E−154;A−134〜S−153;A−134〜D−152;A−134〜A−151;A−134〜I−150;A−134〜L−149;A−134〜Q−148;A−134〜L−147;A−134〜C−146;A−134〜D−145;A−134〜Q−144;A−134〜T−143;A−134〜V−142;A−134〜T−141;およびA−134〜E−140。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
さらなる実施形態において、本発明の抗体は、配列番号3228の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドフラグメントを結合し得る:M−1〜C−15;D−2〜L−16;D−3〜K−17;S−4〜K−18;T−5〜R−19;E−6〜E−20;R−7〜E−21;E−8〜M−22;Q−9〜K−23;S−10〜L−24;R−11〜K−25;L−12〜E−26;T−13〜C−27;S−14〜V−28;C−15〜S−29;L−16〜I−30;K−17〜L−31;K−18〜P−32;R−19〜R−33;E−20〜K−34;E−21〜E−35;M−22〜S−36;K−23〜P−37;L−24〜S−38;K−25〜V−39;E−26〜R−40;C−27〜S−41;V−28〜S−42;S−29〜K−43;I−30〜D−44;L−31〜G−45;P−32〜K−46;R−33〜L−47;K−34〜L−48;E−35〜A−49;S−36〜A−50;P−37〜T−51;S−38〜L−52;V−39〜L−53;R−40〜L−54;S−41〜A−55;S−42〜L−56;K−43〜L−57;D−44〜S−58;G−45〜C−59;K−46〜C−60;L−47〜L−61;L−48〜T−62;A−49〜V−63;A−50〜V−64;T−51〜S−65;L−52〜F−66;L−53〜Y−67;L−54〜Q−68;A−55〜V−69;L−56〜A−70;L−57〜A−71;S−58〜L−72;C−59〜Q−73;C−60〜G−74;L−61〜D−75;T−62〜L−76;V−63〜A−77;V−64〜S−78;S−65〜L−79;F−66〜R−80;Y−67〜A−81;Q−68〜E−82;V−69〜L−83;A−70〜Q−84;A−71〜G−85;L−72〜H−86;Q−73〜H−87;G−74〜A−88;D−75〜E−89;L−76〜K−90;A−77〜L−91;S−78〜P−92;L−79〜A−93;R−80〜G−94;A−81〜A−95;E−82〜G−96;L−83〜A−97;Q−84〜P−98;G−85〜K99;H−86〜A−100;H−87〜G−101;A−88〜L−102;E−89〜E−103;K−90〜E−104;L−91〜A−105;P−92〜P−106;A−93〜A−107;G−94〜V−108;A−95〜T−109;G−96〜A−110;A97〜G−111;P−98〜L−112;K−99〜K−113;A−100〜I−114;G−101〜F−115;L−102〜E−116;E−103〜P−117;E−104〜P−118;A−105〜A−119;P−106〜P−120;A−107〜G−121;V−108〜E−122;T−109〜G−123;A−110〜N−124;G−111〜S−125;L−112〜S−126;K−113〜Q−127;I−114〜N−128;F−115〜S−129;E−116〜R−130;P−117〜N−131;P−118〜K−132;A−119〜R−133;P−120〜A−134;G−121〜V−135;E−122〜Q−136;G−123〜G−137;N−124〜P−138;S−125〜E−139;S−126〜E−140;Q−127〜T−141;N−128〜V−142;S−129〜T−143;R−130〜Q−144;N−131〜D−145;K−132〜C−146;R−133〜L−147;A−134〜Q−148;V−135〜L−149;Q−136〜I−150;G−137〜A−151;P−138〜D−152;E−139〜S−153;E−140〜E−154;T−141〜T−155;V−142〜P−156;T−143〜T−157;Q−144〜1−158;D−145〜Q−159;C−146〜K−160;L−147〜G−161;Q−148〜S−162;L−149〜Y−163;I−150〜T−164;A−151〜F−165;D−152〜V−166;S−153〜P−167;E−154〜W−168;T−155〜L−169;P−156〜L−170;T−157〜S−171;I−158〜F−172;Q−159〜K−173;K−160〜R−174;G−161〜G−175;S−162〜S−176;Y−163〜A−177;T−164〜L−178;F−165〜E−179;V−166〜E−180;P−167〜K−181;W−168〜E−182;L−169〜N−183;L−170〜K−184;S−171〜I−185;F−172〜L−186;K−173〜V−187;R−174〜K−188;G−175〜E−189;S−176〜T−190;A−177〜G−191;L−178〜Y−192;E−179〜F−193;E−180〜F−194;K−181〜I−195;E−182〜Y−196;N−183〜G−197;K−184〜Q−198;I−185〜V−199;L−186〜L−200;V−187〜Y−201;K−188〜T−202;E−189〜D−203;T−190〜K−204;G−191〜T−205;Y−192〜Y−206;F−193〜A−207;F−194〜M−208;I−195〜G−209;Y−196〜H−210;G−197〜L−211;Q−198〜I−212;V−199〜Q−213;L−200〜R−214;Y−201〜K−215;T−202〜K−216;D−203〜V−217;K−204〜H−218;T−205〜V−219;Y−206〜F−220;A−207〜G−221;M−208〜D−222;G−209〜E−223;H−210〜L−224;L−211〜S−225;I−212〜L−226;Q−213〜V−227;R−214〜T−228;K−215〜L−229;K−216〜F−230;V−217〜R−231;H−218〜C−232;V−219〜I−233;F−220〜Q−234;G−221〜N−235;D−222〜M−236;E−223〜P−237;L−224〜E−238;S−225〜T−239;L−226〜L−240;V−227〜P−241;T−228〜N−242;L−229〜N−243;F−230〜S−244;R−231〜C−245;C−232〜Y−246;I−233〜S−247;Q−234〜A−248;N−235〜G−249;M−236〜I−250;P−237〜A−251;E−238〜K−252;T−239〜L−253;L−240〜E−254;P−241〜E−255;N−242〜G−256;N−243〜D−257;S−244〜E−258;C−245〜L−259;Y−246〜Q−260;S−247〜L−261;A−248〜A−262;G−249〜I−263;I−250〜P−264;A−251〜R−265;K−252〜E−266;L−253〜N−267;E−254〜A−268;E−255〜Q−269;G−256〜I−270;D−257〜S−271;E−258〜L−272;L−259〜D−273;Q−260〜G−274;L−261〜D−275;A−262〜V−276;I−263〜T−277;P−264〜F−278;R−265〜F−279;E−266〜G−280;N−267〜A−281;A−268〜L−282;Q−269〜K−283;I−270〜L−284;およびS−271〜L−285。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
さらなる実施形態において、本発明の抗体は、配列番号3229の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドフラグメントに結合し得る:M−1〜C−15;D−2〜L−16;D−3〜K−17;S4〜K−18;T−5〜R−19;E−6〜E−20;R−7〜E−21;E−8〜M−22;Q−9〜K−23;S−10〜L−24;R−11〜K−25;L−12〜E−26;T−13〜C−27;S−14〜V−28;C−15〜S−29;L−16〜I−30;K−17〜L−31;K−18〜P−32;R−19〜R−33;E−20〜K−34;E−21〜E−35;M−22〜S−36;K−23〜P−37;L−24〜S−38;K−25〜V−39;E−26〜R−40;C−27〜S−41;V−28〜S−42;S−29〜K−43;I−30〜D−44;L−31〜G−45;P−32〜K−46;R−33〜L−47;K−34〜L−48;E−35〜A−49;S−36〜A−50;P−37〜T−51;S−38〜L−52;V−39〜L−53;R−40〜L−54;S−41〜A−55;S−42〜L−56;K−43〜L−57;D−44〜S−58;G−45〜C−59;K−46〜C−60;L−47〜L−61;L−48〜T−62;A−49〜V−63;A−50〜V−64;T−51〜S−65;L−52〜F−66;L−53〜Y−67;L−54〜Q−68;A−55〜V−69;L−56〜A−70;L−57〜A−71;S−58〜L−72;C−59〜Q−73;C−60〜G−74;L−61〜D−75;T−62〜L−76;V−63〜A−77;V−64〜S−78;S−65〜L−79;F−66〜R−80;Y−67〜A−81;Q−68〜E−82;V−69〜L−83;A−70〜Q−84;A−71〜G−85;L−72〜H−86;Q−73〜H−87;G−74〜A−88;D−75〜E−89;L−76〜K−90;A−77〜L−91;S−78〜P−92;L−79〜A−93;R−80〜G−94;A−81〜A−95;E−82〜G−96;L−83〜A−97;Q−84〜P−98;G−85〜K−99;H−86〜A−100;H−87〜G−101;A−88〜L−102;E−89〜E−103;K−90〜E−104;L−91〜A−105;P−92〜P−106;A−93〜A−107;G−94〜V−108;A−95〜T−109;G−96〜A−110;A97〜G−111;P−98〜L−112;K−99〜K−113;A−100〜I−114;G−101〜F−115;L−102〜E−116;E−103〜P−117;E−104〜P−118;A−105〜A−119;P−106〜P−120;A−107〜G−121;V−108〜E−122;T−109〜G−123;A−110〜N−124;G−111〜S−125;L−112〜S−126;K−113〜Q−127;I−114〜N−128;F−115〜S−129;E−116〜R−130;P−117〜N−131;P−118〜K−132;A−119〜R−133;P−120〜A−134;G−121〜V−135;E−122〜Q−136;G−123〜G−137;N−124〜P−138;S−125〜E−139;S−126〜E−140;Q−127〜T−141;N−128〜G−142;S−129〜S−143;R−130〜Y−144;N−131〜T−145;K−132〜F−146;R−133〜V−147;A−134〜P−148;V−135〜W−149;Q−136〜L−150;G−137〜L−151;P−138〜S−152;E−139〜F−153;E−140〜K−154;T−141〜R−155;G−142〜G−156;S−143〜S−157;Y−144〜A−158;T−145〜L−159;F−146〜E−160;V−147〜E−161;P−148〜K−162;W−149〜E−163;L−150〜N−164;L−151〜K−165;S−152〜I−166;F−153〜L−167;K−154〜V−168;R−155〜K−169;G−156〜E−170;S−157〜T−171;A−158〜G−172;L−159〜Y−173;E−160〜F−174;E−161〜F−175;K−162〜I−176;E−163〜Y−177;N−164〜G−178;K−165〜Q−179;I−166〜V−180;L−167〜L−181;V−168〜Y−182;K−169〜T−183;E−170〜D−184;T−171〜K−185;G−172〜T−186;Y−173〜Y−187;F−174〜A−188;F−175〜M−189;I−176〜G−190;Y−177〜H−191;G−178〜L−192;Q−179〜I−193;V−180〜Q−194;L−181〜R−195;Y−182〜K−196;T−183〜K−197;D−184〜V−198;K−185〜H−199;T−186〜V−200;Y−187〜F−201;A−188〜G−202;M−189〜D−203;G−190〜E−204;H−191〜L−205;L−192〜S−206;I−193〜L−207;Q−194〜V−208;R−195〜T−209;K−196〜L−210;K−197〜F−211;V−198〜R−212;H−199〜C−213;V−200〜I−214;F−201〜Q−215;G−202〜N−216;D−203〜M−217;E−204〜P−218;L−205〜E−219;S−206〜T−220;L−207〜L−221;V−208〜P−222;T−209〜N−223;L−210〜N−224;F−211〜S−225;R−212〜C−226;C−213〜Y−227;I−214〜S−228;Q−215〜A−229;N−216〜G−230;M−217〜I−231;P−218〜A−232;E−219〜K−233;T−220〜L−234;L−221〜E−235;P−222〜E−236;N−223〜G−237;N−224〜D−238;S−225〜E−239;C−226〜L−240;Y−227〜Q−241;S−228〜L−242;A−229〜A−243;G−230〜I−244;I−231〜P−245;A−232〜R−246;K−233〜E−247;L−234〜N−248;E−235〜A−249;E−236〜Q−250;G−237〜I−251;D−238〜S−252;E−239〜L−253;L−240〜D−254;Q−241〜G−255;L−242〜D−256;A−243〜V−257;I−244〜T−258;P−245〜F−259;R−246〜F−260;E−247〜G−261;N−248〜A−262;A−249〜L−263;Q−250〜K−264;I−251〜L−265;およびS−252〜L−266。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
さらなる実施形態において、本発明の抗体は、配列番号38の以下の残基からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドフラグメントに結合し得る:M−1〜F−15;D−2〜C−16;E−3〜S−17;S−4〜E−18;A−5〜K−19;K−6〜G−20;T−7〜E−21;L−8〜D−22;P−9〜M−23;P−10〜K−24;P−11〜V−25;C−12〜G−26;L−13〜Y−27;C−14〜D−28;F−15〜P−29;C−16〜I−30;S−17〜T−31;E−18〜P−32;K−19〜Q−33;G−20〜K−34;E−21〜E−35;D−22〜E−36;M−23〜G−37;K−24〜A−38;V−25〜W−39;G−26〜F−40;Y−27〜G−41;D−28〜I−42;P−29〜C−43;I−30〜R−44;T−31〜D−45;P−32〜G−46;Q−33〜R−47;K−34〜L−48;E−35〜L−49;E−36〜A−50;G−37〜A−51;A−38〜T−52;W−39〜L−53;F−40〜L−54;G−41〜L−55;I−42〜A−56;C−43〜L−57;R−44〜L−58;D−45〜S−59;G−46〜S−60;R−47〜S−61;L−48〜F−62;L−49〜T−63;A−50〜A−64;A−51〜M−65;T−52〜S−66;L−53〜L−67;L−54〜Y−68;L−55〜Q−69;A−56〜L−70;L−57〜A−71;L−58〜A−72;S−59〜L−73;S−60〜Q−74;S−61〜A−75;F−62〜D−76;T−63〜L−77;A−64〜M−78;M−65〜N−79;S−66〜L−80;L−67〜R−81;Y−68〜M−82;Q−69〜E−83;L−70〜L−84;A−71〜Q−85;A−72〜S−86;L−73〜Y−87;Q−74〜R−88;A−75〜G−89;D−76〜S−90;L−77〜A−91;M−78〜T−92;N−79〜P−93;L−80〜A−94;R−81〜A−95;M−82〜A−96;E−83〜G−97;L−84〜A−98;Q−85〜P−99;S−86〜E−100;Y−87〜L−101;R−88〜T−102;G−89〜A−103;S−90〜G−104;A−91〜V−105;T−92〜K−106;P−93〜L−107;A−94〜L−108;A−95〜T−109;A−96〜P−110;G−97〜A−111;A−98〜A−112;P−99〜P−113;E−100〜R−114;L−101〜P−115;T−102〜H−116;A−103〜N−117;G−104〜S−118;V−105〜S−119;K−106〜R−120;L−107〜G−121;L−108〜H−122;T−109〜R−123;P−110〜N−124;A−111〜R−125;A−112〜R−126;P−113〜A−127;R−114〜F−128;P−115〜Q−129;H−116〜G−130;N−117〜P−131;S−118〜E−132;S−119〜E−133;R−120〜T−134;G−121〜E−135;H−122〜Q−136;R−123〜D−137;N−124〜V−138;R−125〜D−139;R−126〜L−140;A−127〜S−141;F−128〜A−142;Q−129〜P−143;G−130〜P−144;P−131〜A−145;E−132〜P−146;E−133〜C−147;T−134〜L−148;E−135〜P−149;Q−136〜G−150;D−137〜C−151;V−138〜R−152;D−139〜H−153;L−140〜S−154;S−141〜Q−155;A−142〜H−156;P−143〜D−157;P−144〜D−158;A−145〜N−159;P−146〜G−160;C−147〜M−161;L−148〜N−162;P−149〜L−163;G−150〜R−164;C−151〜N−165;R−152〜I−166;H−153〜I−167;S−154〜Q−168;Q−155〜D−169;H−156〜C−170;D−157〜L−171;D−158〜Q−172;N−159〜L−173;G−160〜I−174;M−161〜A−175;N−162〜D−176;L−163〜S−177;R−164〜D−178;N−165〜T−179;I−166〜P−180;I−167〜A−181;Q−168〜L−182;D−169〜E−183;C−170〜E−184;L−171〜K−185;Q−172〜E−186;L−173〜N−187;I−174〜K−188;A−175〜1−189;D−176〜V−190;S−177〜V−191;D−178〜R−192;T−179〜Q−193;P−180〜T−194;A−181〜G−195;L−182〜Y−196;E−183〜F−197;E−184〜F−198;K−185〜1−199;E−186〜Y−200;N−187〜S−201;K−188〜Q−202;I−189〜V−203;V−190〜L−204;V−191〜Y−205;R−192〜T−206;Q−193〜D−207;T−194〜P−208;G−195〜I−209;Y−196〜F−210;F−197〜A−211;F−198〜M−212;I−199〜G−213;Y−200〜H−214;S−201〜V−215;Q−202〜I−216;V−203〜Q−217;L−204〜R−218;Y−205〜K−219;T−206〜K−220;D−207〜V−221;P−208〜H−222;I−209〜V−223;F−210〜F−224;A−211〜G−225;M−212〜D−226;G−213〜E−227;H−214〜L−228;V−215〜S−229;I−216〜L−230;Q−217〜V−231;R−218〜T−232;K−219〜L−233;K−220〜F−234;V−221〜R−235;H−222〜C−236;V−223〜I−237;F−224〜Q−238;G−225〜N−239;D−226〜M−240;E−227〜P−241;L−228〜K−242;S−229〜T−243;L−230〜L−244;V−231〜P−245;T−232〜N−246;L−233〜N−247;F−234〜S−248;R−235〜C−249;C−236〜Y−250;I−237〜S−251;Q−238〜A−252;N−239〜G−253;M−240〜I−254;P−241〜A−255;K−242〜R−256;T−243〜L−257;L−244〜E−258;P−245〜E−259;N−246〜G−260;N−247〜D−261;S−248〜E−262;C−249〜I−263;Y−250〜Q−264;S−251〜L−265;A−252〜A−266;G−253〜I−267;I−254〜P−268;A−255〜R−269;R−256〜E−270;L−257〜N−271;E−258〜A−272;E−259〜Q−273;G−260〜I−274;D−261〜S−275;E−262〜R−276;I−263〜N−277;Q−264〜G−278;L−265〜D−279;A−266〜D−280;I−267〜T−281;P−268〜F−282;R−269〜F−283;E−270〜G−284;N−271〜A−285;A−272〜L−286;Q−273〜K−287;I−274〜L−288;およびS−275〜L−289。本発明はまた、上記のBLySポリペプチドのアミノ酸配列に少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%または99%同一なアミノ酸残基の連続した配列を含むか、あるいはこれらからなるBLySポリペプチドに結合する抗体に関する。
BLySポリペプチドのいくつかのアミノ酸配列は、このポリペプチドの構造または機能への有意な影響なく改変され得ることが、当業者に認識される。配列におけるこのような差異が意図される場合、ポリペプチド上に活性を決定する重要な領域が存在することに留意すべきである。
従って、本発明はさらに、BLySポリペプチドの機能的活性(例えば、生物学的活性)を示すか、またはBLySポリペプチドの領域(例えば、本明細書中に記載のポリペプチドフラグメント)を含むBLySポリペプチドの変形物に結合する抗体を含む。このような変異体は、活性に対してほとんど影響を有さないような、当該分野で公知の一般的規則に従って選択された欠失、挿入、反転、反復または型置換を含む。例えば、表現型的にサイレントなアミノ酸置換を作製する方法に関するガイダンスは、Bowie,J.U.ら,「Deciphering the Message in Protein Sequences:Tolerance to Amino Acid Substitutions」,Science 247:1306−1310(1990)において提供され、ここで、著者らは、変化に対するアミノ酸配列の寛容性を研究するために、2つの主なアプローチが存在することを示す。第1の方法は、進化のプロセスに依存し、このプロセスにおいて変異は、自然選択によって受け入れられるかまたは拒絶されるかのいずれかである。第2のアプローチは、クローニングした遺伝子の特定の位置にアミノ酸変化を導入するための遺伝子操作、および機能性を維持する配列を同定するための選択またはスクリーニングを使用する。
著者らが述べるように、これらの研究によって、タンパク質がアミノ酸置換に驚くほど寛容であることが明らかになった。著者らはさらに、どのアミノ酸変化が、タンパク質中の特定のアミノ酸位置で許容されるようであるかを示す。例えば、最も埋もれているアミノ酸残基は、非極性側鎖を必要とするが、表面側鎖の特徴は、一般にほとんど保存されない。他のこのような表現型としてサイレントな置換は、Bowie,J.U.ら(前出)、および本明細書の引用文献に記載されている。保存的置換として代表的にみられるのは、脂肪族アミノ酸Ala、Val、LeuおよびIleのなかでの、一方の別のものによる置き換え;ヒドロキシル残基SerおよびThrの交換、酸性残基AspおよびGluの交換;アミド残基のAsnとGlnの間の置換、塩基性残基のLysおよびArgの交換、ならびに芳香族残基のPhe、Tyrの間の置換である。
従って、本発明の抗体は、配列番号3228のポリペプチドのフラグメント、誘導体、もしくはアナログ、または寄託されたcDNAプラスミドによってコードされるものに結合し得る。これらは例えば、以下である:(i)ポリペプチドであって、1つ以上のアミノ酸残基が、保存的アミノ酸残基もしくは非保存的アミノ酸残基(好ましくは保存的アミノ酸残基)で置換されており、そしてこのように置換されたアミノ酸残基は、遺伝子コードによってコードされたものであってもそうでなくてもよい、ポリペプチド、または(ii)ポリペプチドであって、1つ以上のアミノ酸残基が置換基を含む、ポリペプチド、または(iii)ポリペプチドであって、このポリペプチドの細胞外ドメインが、別の化合物(例えば、ポリぺプチドの半減期を増大させる化合物(例えば、ポリエチレングリコール)のような別の化合物と融合されている、ポリペプチド、または(iv)ポリペプチドであって、さらなるアミノ酸が、このポリペプチドの細胞外ドメイン(例えば、IgG Fc融合領域ペプチド、またはリーダーもしくは分泌配列、またはこのポリペプチドの細胞外ドメインもしくはプロタンパク質配列の精製のために使用される配列)と融合されている、ポリペプチド。
本発明の抗体は、配列番号3229のポリペプチドのフラグメント、誘導体、もしくはアナログ、または寄託されたcDNAプラスミドによってコードされるものに結合し得る。これらは例えば、以下である:(i)ポリペプチドであって、1つ以上のアミノ酸残基が、保存的アミノ酸残基もしくは非保存的アミノ酸残基(好ましくは保存的アミノ酸残基)で置換されており、そしてこのように置換されたアミノ酸残基は、遺伝子コードによってコードされたものであってもそうでなくてもよい、ポリペプチド、または(ii)ポリペプチドであって、1つ以上のアミノ酸残基が置換基を含む、ポリペプチド、または(iii)ポリペプチドであって、このポリペプチドの細胞外ドメインが、別の化合物(例えば、ポリぺプチドの半減期を増大させる化合物(例えば、ポリエチレングリコール)のような別の化合物と融合されている、ポリペプチド、または(iv)ポリペプチドであって、さらなるアミノ酸が、このポリペプチドの細胞外ドメイン(例えば、別のTNFリガンドファミリーメンバー(例えば、CD40リガンド)の可溶性の生物学的に活性なフラグメント、IgG Fc融合領域ペプチド、またはリーダーもしくは分泌配列、またはこのポリペプチドの細胞外ドメインもしくはプロタンパク質配列の精製のために使用される配列)と融合されている、ポリペプチド。このようなフラグメント、誘導体、およびアナログは、本明細書中の教示から、当業者の範囲内であるとみなされる。
従って、本発明の抗体は、天然の変異またはヒトの操作のいずれかに由来する、1つ以上のアミノ酸置換、欠失、または付加を含む、BLySポリペプチドに結合し得る。示されるように、変化は好ましくはわずかな性質の変化(例えば、タンパク質の折り畳みまたは活性に有意に影響しない保存的アミノ酸置換)である(表13を参照のこと)。
Figure 2009095346
本発明の1つの実施形態において、本発明の抗体は、少なくとも1つの保存的アミノ酸置換を含むが、50の保存的アミノ酸置換を超えず、さらにより好ましくは、40の保存的アミノ酸置換を超えず、なおより好ましくは、30の保存的アミノ酸置換を超えず、そしてなおさらにより好ましくは、20の保存的アミノ酸置換を超えないアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドのアミノ酸配列を含むか、あるいはこのようなアミノ酸配列からなるポリペプチドに結合する。本発明の1つの実施形態において、本発明の抗体は、少なくとも1つの保存的アミノ酸置換を含むが、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1つの保存的アミノ酸置換を超えない保存的アミノ酸置換を含むアミノ酸配列を有するBLySポリペプチドのアミノ酸配列を含むか、あるいはこれからなるポリペプチドに結合する。
例えば、BLySのアミノ酸レベルの部位指向性変化は、特定のアミノ酸の保存的置換によってなされ得る。本発明の抗体は、以下:M1(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはV);D2(以下で置換:E);D3(以下で置換:E);S4(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);T5(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);E6(以下で置換:D);R7(以下で置換:H、またはK);E8(以下で置換:D);Q9(以下で置換:N);S10(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);R11(以下で置換:H、またはK);L12(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);T13(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);S14(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L16(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);K17(以下で置換:H、またはR);K18(以下で置換:H、またはR);R19(以下で置換:H、またはK);E20(以下で置換:D);E21(以下で置換:D);M22(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはV);K23(以下で置換:H、またはR);L24(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);K25(以下で置換:H、またはR);E26(以下で置換:D);V28(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);S29(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);I30(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);L31(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);R33(以下で置換:H、またはK);K34(以下で置換:H、またはR);E35(以下で置換:D);S36(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);S38(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);V39(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);R40(以下で置換:H、またはK);S41(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);S42(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);K43(以下で置換:H、またはR);D44(以下で置換:E);G45(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);K46(以下で置換:H、またはR);L47(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L48(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A49(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);A50(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);T51(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);L52(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L53(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L54(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A55(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);L56(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L57(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);S58(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L61(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);T62(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);V63(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);V64(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);S65(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);F66(以下で置換:W、またはY);Y67(以下で置換:F、またはW);Q68(以下で置換:N);V69(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);A70(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);A71(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);L72(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Q73(以下で置換:N);G74(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);D75(以下で置換:E);L76(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A77(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);S78(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L79(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);R80(以下で置換:H、またはK);A81(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);E82(以下で置換:D);L83(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Q84(以下で置換:N);G85(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);H86(以下で置換:K、またはR);H87(以下で置換:K、またはR);A88(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);E89(以下で置換:D);K90(以下で置換:H、またはR);L91(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A93(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G94(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);A95(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G96(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);A97(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);K99(以下で置換:H、またはR);A100(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G101(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);L102(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);E103(以下で置換:D);E104(以下で置換:D);A105(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);A107(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);V108(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);T109(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);A110(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G111(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);L112(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);K113(以下で置換:H、またはR);I114(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);F115(以下で置換:W、またはY);E116(以下で置換:D);A119(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G121(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);E122(以下で置換:D);G123(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);N124(以下で置換:Q);S125(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);S126(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);Q127(以下で置換:N);N128(以下で置換:Q);S129(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);R130(以下で置換:H、またはK);N131(以下で置換:Q);K132(以下で置換:H、またはR);R133(以下で置換:H、またはK);A134(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);V135(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);Q136(以下で置換:N);G137(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);E139(以下で置換:D);E140(以下で置換:D);T141(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);V142(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);T143(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);Q144(以下で置換:N);D145(以下で置換:E);L147(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Q148(以下で置換:N);L149(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);I150(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);A151(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);D152(以下で置換:E);S153(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);E154(以下で置換:D);T155(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);T157(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);I158(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);Q159(以下で置換:N);K160(以下で置換:H、またはR);G161(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);S162(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);Y163(以下で置換:F、またはW);T164(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);F165(以下で置換:W、またはY);V166(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);W168(以下で置換:F、またはY);L169(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L170(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);S171(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);F172(以下で置換:W、またはY);K173(以下で置換:H、またはR);R174(以下で置換:H、またはK);G175(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);S176(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);A177(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);L178(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);E179(以下で置換:D);E180(以下で置換:D);K181(以下で置換:H、またはR);E182(以下で置換:D);N183(以下で置換:Q);K184(以下で置換:H、またはR);I185(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);L186(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);V187(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);K188(以下で置換:H、またはR);E189(以下で置換:D);T190(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);G191(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);Y192(以下で置換:F、またはW);F193(以下で置換:W、またはY);F194(以下で置換:W、またはY);I195(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);Y196(以下で置換:F、またはW);G197(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);Q198(以下で置換:N);V199(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);L200(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Y201(以下で置換:F、またはW);T202(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);D203(以下で置換:E);K204(以下で置換:H、またはR);T205(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);Y206(以下で置換:F、またはW);A207(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);M208(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはV);G209(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);H210(以下で置換:K、またはR);L211(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);I212(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);Q213(以下で置換:N);R214(以下で置換:H、またはK);K215(以下で置換:H、またはR);K216(以下で置換:H、またはR);V217(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);H218(以下で置換:K、またはR);V219(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);F220(以下で置換:W、またはY);G221(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);D222(以下で置換:E);E223(以下で置換:D);L224(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);S225(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L226(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);V227(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);T228(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);L229(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);F230(以下で置換:W、またはY);R231(以下で置換:H、またはK);I233(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);Q234(以下で置換:N);N235(以下で置換:Q);M23
6(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはV);E238(以下で置換:D);T239(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);L240(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);N242(以下で置換:Q);N243(以下で置換:Q);S244(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);Y246(以下で置換:F、またはW);S247(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);A248(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G249(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);I250(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);A251(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);K252(以下で置換:H、またはR);L253(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);E254(以下で置換:D);E255(以下で置換:D);G256(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);D257(以下で置換:E);E258(以下で置換:D);L259(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Q260(以下で置換:N);L261(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A262(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);I263(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);R265(以下で置換:H、またはK);E266(以下で置換:D);N267(以下で置換:Q);A268(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);Q269(以下で置換:N);I270(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);S271(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L272(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);D273(以下で置換:E);G274(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);D275(以下で置換:E);V276(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);T277(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);F278(以下で置換:W、またはY);F279(以下で置換:W、またはY);G280(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);A281(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);L282(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);K283(以下で置換:H、またはR);L284(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);および/またはL285(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV)、を含む配列番号3228のポリペプチドの保存的置換変異を含むBLySアミノ酸配列に結合し得る。
別の実施形態において、BLySのアミノ酸レベルでの部位指向性変化は、特定のアミノ酸を、保存的置換基で置換することによってなされ得る。本発明の抗体は、以下:M1(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはV);D2(以下で置換:E);D3(以下で置換:E);S4(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);T5(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);E6(以下で置換:D);R7(以下で置換:H、またはK);E8(以下で置換:D);Q9(以下で置換:N);S10(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);R11(以下で置換:H、またはK);L12(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);T13(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);S14(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L16(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);K17(以下で置換:H、またはR);K18(以下で置換:H、またはR);R19(以下で置換:H、またはK);E20(以下で置換:D);E21(以下で置換:D);M22(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはV);K23(以下で置換:H、またはR);L24(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);K25(以下で置換:H、またはR);E26(以下で置換:D);V28(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);S29(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);I30(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);L31(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);R33(以下で置換:H、またはK);K34(以下で置換:H、またはR);E35(以下で置換:D);S36(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);S38(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);V39(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);R40(以下で置換:H、またはK);S41(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);S42(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);K43(以下で置換:H、またはR);D44(以下で置換:E);G45(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);K46(以下で置換:H、またはR);L47(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L48(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A49(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);A50(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);T51(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);L52(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L53(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L54(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A55(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);L56(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L57(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);S58(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L61(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);T62(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);V63(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);V64(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);S65(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);F66(以下で置換:W、またはY);Y67(以下で置換:F、またはW);Q68(以下で置換:N);V69(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);A70(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);A71(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);L72(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Q73(以下で置換:N);G74(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);D75(以下で置換:E);L76(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A77(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);S78(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L79(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);R80(以下で置換:H、またはK);A81(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);E82(以下で置換:D);L83(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Q84(以下で置換:N);G85(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);H86(以下で置換:K、またはR);H87(以下で置換:K、またはR);A88(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);E89(以下で置換:D);K90(以下で置換:H、またはR);L91(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A93(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G94(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);A95(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G96(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);A97(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);K99(以下で置換:H、またはR);A100(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G101(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);L102(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);E103(以下で置換:D);E104(以下で置換:D);A105(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);A107(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);V108(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);T109(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);A110(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G111(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);L112(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);K113(以下で置換:H、またはR);I114(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);F115(以下で置換:W、またはY);E116(以下で置換:D);A119(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G121(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);E122(以下で置換:D);G123(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);N124(以下で置換:Q);S125(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);S126(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);Q127(以下で置換:N);N128(以下で置換:Q);S129(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);R130(以下で置換:H、またはK);N131(以下で置換:Q);K132(以下で置換:H、またはR);R133(以下で置換:H、またはK);A134(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);V135(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);Q136(以下で置換:N);G137(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);E139(以下で置換:D);E140(以下で置換:D);T141(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);G142(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);S143(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);Y144(以下で置換:F、またはW);T145(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);F146(以下で置換:W、またはY);V147(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);W149(以下で置換:F、またはY);L150(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);L151(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);S152(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);F153(以下で置換:W、またはY);K154(以下で置換:H、またはR);R155(以下で置換:H、またはK);G156(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);S157(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);A158(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);L159(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);E160(以下で置換:D);E161(以下で置換:D);K162(以下で置換:H、またはR);E163(以下で置換:D);N164(以下で置換:Q);K165(以下で置換:H、またはR);I166(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);L167(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);V168(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);K169(以下で置換:H、またはR);E170(以下で置換:D);T171(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);G172(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);Y173(以下で置換:F、またはW);F174(以下で置換:W、またはY);F175(以下で置換:W、またはY);I176(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);Y177(以下で置換:F、またはW);G178(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);Q179(以下で置換:N);V180(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);L181(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Y182(以下で置換:F、またはW);T183(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);D184(以下で置換:E);K185(以下で置換:H、またはR);T186(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);Y187(以下で置換:F、またはW);A188(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);M189(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはV);G190(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);H191(以下で置換:K、またはR);L192(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);I193(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);Q194(以下で置換:N);R195(以下で置換:H、またはK);K196(以下で置換:H、またはR);K197(以下で置換:H、またはR);V198(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);H199(以下で置換:K、またはR);V200(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);F201(以下で置換:W、またはY);G202(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);D203(以下で置換:E);E204(以下で置換:D);L205(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);S206(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L207(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);V208(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);T209(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);L210(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);F211(以下で置換:W、またはY);R212(以下で置換:H、またはK);I214(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);Q215(以下で置換:N);N216(以下で置換:Q);M217(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはV);E219(以下で置換:D);T220(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);L221(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);N223(以下で置換:Q);N224(以下で置換:Q);S225(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);Y227(以下で置換:F、またはW);S228(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);A229(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);G230(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);I231(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);A232(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);K233(以下で置換:H、またはR);L234(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);E235(以下で置
換:D);E236(以下で置換:D);G237(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);D238(以下で置換:E);E239(以下で置換:D);L240(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);Q241(以下で置換:N);L242(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);A243(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);I244(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);R246(以下で置換:H、またはK);E247(以下で置換:D);N248(以下で置換:Q);A249(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);Q250(以下で置換:N);I251(以下で置換:A、G、L、S、T、M、またはV);S252(以下で置換:A、G、I、L、T、M、またはV);L253(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);D254(以下で置換:E);G255(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);D256(以下で置換:E);V257(以下で置換:A、G、I、L、S、T、またはM);T258(以下で置換:A、G、I、L、S、M、またはV);F259(以下で置換:W、またはY);F260(以下で置換:W、またはY);G261(以下で置換:A、I、L、S、T、M、またはV);A262(以下で置換:G、I、L、S、T、M、またはV);L263(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);K264(以下で置換:H、またはR);L265(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV);および/またはL266(以下で置換:A、G、I、S、T、M、またはV):を含む配列番号3229のポリペプチドの保存的置換変異を含むBLySアミノ酸配列に結合し得る。
別の実施形態において、BLySのアミノ酸レベルの部位指向性変異は、特定のアミノ酸の保存的置換基での置換によってなされ得る。本発明の抗体は、配列番号3230〜3237のいずれか1つのポリペプチドの保存的置換変異を含むBLySアミノ酸配列に結合し得る。
機能的に必須のBLySポリペプチドにおけるアミノ酸は、部位指向性変異誘発またはアラニンスキャンニング変異誘発のような、当該分野で公知の方法によって同定され得る(CunninghamおよびWells、Science 244:1081〜1085(1989))。後者の手順は、この分子のあらゆる残基に単一のアラニン変異を導入する。次いで、得られた変異分子を、例えば、増殖、分化、および/または活性化のような、リガンド結合、およびリンパ球(例えば、B細胞)を刺激する能力のような、機能的活性について試験する。従って、本発明の抗体は、機能に必須のBLySポリペプチドにおけるアミノ酸に結合し得る。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、機能するのに必須であるBlySポリペプチドにおけるアミノ酸に結合して、BLySポリペプチド機能を阻害する。他の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、機能に必須のBlySポリペプチドにおけるアミノ酸に結合して、BlySポリペプチド機能を増強する。
特別な目的は、荷電したアミノ酸を、他の荷電したアミノ酸または中性のアミノ酸で置換して、これによって低凝集性のような、非常に所望される改善された特徴を有するタンパク質を生成し得ることである。凝集は、活性を低下させ得るだけでなく、薬学的処方物を調製する場合にも問題であり得る。なぜなら凝集物は免疫原性であり得るからである(Pinckardら、Clin.Exp.Immunol.2:331〜340(1967);Robbinsら、Diabetes 36:838〜845(1987);Clelandら、Crit.Rev.Therapeutic Drug Carrier Systems 10:307〜377(1993)。
別の実施形態において、本発明は、配列番号3228に提供されるアミノ酸配列の非保存的置換を含むアミノ酸配列を有するポリペプチドに結合する抗体を提供する。例えば、配列番号3228に提供されるBLySタンパク質配列の非保存的置換としては、以下が挙げられる:M1(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D2(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D3(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S4(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T5(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E6(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R7(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E8(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q9(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);S10(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R11(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L12(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T13(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S14(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C15(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);L16(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K17(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K18(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R19(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E20(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E21(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);M22(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K23(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L24(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K25(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E26(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C27(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);V28(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S29(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I30(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L31(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P32(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);R33(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K34(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E35(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S36(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P37(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);S38(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V39(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R40(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S41(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S42(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K43(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D44(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G45(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K46(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L47(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L48(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A49(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A50(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T51(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L52(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L53(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L54(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A55(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L56(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L57(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S58(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C59(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);C60(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);L61(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T62(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V63(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V64(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S65(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F66(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);Y67(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);Q68(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);V69(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A70(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A71(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L72(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q73(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);G74(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D75(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L76(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A77(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S78(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L79(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R80(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A81(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E82(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L83(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q84(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);G85(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);H86(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);H87(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A88(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E89(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K90(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L91(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P92(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);A93(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G94(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A95(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G96(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A97(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P98(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);K99(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A100(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G101(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L102(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E103(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E104(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A105(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P106(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);A107(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V108(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T109(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A110(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G111(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L112(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K113(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I114(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F115(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);E116(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P117(以下で置換:D、E、
H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);P118(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);A119(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P120(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);G121(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E122(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G123(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);N124(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);S125(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S126(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q127(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);N128(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);S129(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R130(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);N131(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);K132(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R133(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A134(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V135(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q136(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);G137(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P138(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);E139(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E140(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T141(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V142(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T143(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q144(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);D145(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C146(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);L147(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q148(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);L149(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I150(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A151(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D152(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S153(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E154(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T155(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P156(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);T157(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I158(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q159(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);K160(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G161(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S162(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y163(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);T164(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F165(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);V166(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P167(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);W168(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);L169(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L170(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S171(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F172(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);K173(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R174(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G175(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S176(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A177(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L178(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E179(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E180(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K181(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E182(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);N183(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);K184(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I185(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L186(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V187(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K188(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E189(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T190(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G191(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y192(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);F193(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);F194(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);I195(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y196(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);G197(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q198(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);V199(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L200(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y201(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);T202(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D203(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K204(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T205(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y206(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);A207(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);M208(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G209(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);H210(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L211(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I212(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q213(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);R214(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K215(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K216(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V217(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);H218(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V219(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F220(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);G221(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D222(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E223(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L224(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S225(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L226(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V227(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T228(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L229(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F230(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);R231(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q
、F、W、Y、P、またはC);C232(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);I233(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q234(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);N235(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);M236(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P237(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);E238(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T239(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L240(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P241(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);N242(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);N243(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);S244(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C245(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);Y246(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);S247(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A248(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G249(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I250(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A251(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K252(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L253(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E254(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E255(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G256(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D257(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E258(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L259(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q260(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);L261(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A262(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I263(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P264(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);R265(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E266(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);N267(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);A268(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q269(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);I270(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S271(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L272(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D273(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G274(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D275(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V276(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T277(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F278(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);F279(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);G280(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A281(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L282(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K283(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L284(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);および/またはL285(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC。
さらなる実施形態において、本発明の抗体は、1つより多いアミノ酸(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30および50)が、上記のような置換アミノ酸(保存的または非保存的)で置換されている、BLySアミノ酸配列を含むか、あるいはこのような配列からなる、BLySポリペプチドに結合する。
本発明の別の実施形態において、本発明の抗体は、以下:M1(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D2(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D3(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S4(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T5(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E6(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R7(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E8(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q9(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);S10(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R11(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L12(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T13(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S14(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C15(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);L16(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K17(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K18(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R19(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E20(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E21(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);M22(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K23(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L24(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K25(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E26(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C27(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);V28(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S29(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I30(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L31(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P32(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);R33(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K34(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E35(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S36(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P37(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);S38(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V39(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R40(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S41(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S42(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K43(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D44(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G45(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K46(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L47(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L48(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A49(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A50(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T51(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L52(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L53(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L54(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A55(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L56(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L57(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S58(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C59(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);C60(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);L61(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T62(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V63(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V64(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S65(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F66(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);Y67(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);Q68(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);V69(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A70(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A71(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L72(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q73(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);G74(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D75(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L76(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A77(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S78(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L79(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R80(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A81(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E82(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L83(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q84(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);G85(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);H86(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);H87(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A88(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E89(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K90(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L91(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P92(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);A93(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G94(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A95(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G96(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A97(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P98(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);K99(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A100(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G101(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L102(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E103(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E104(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A105(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P106(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);A107(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V108(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T109(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A110(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G111(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L112(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K113(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I114(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F115(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);E116(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P117(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);P118(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);A119(以下で
置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P120(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);G121(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E122(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G123(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);N124(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);S125(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S126(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q127(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);N128(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);S129(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R130(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);N131(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);K132(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R133(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A134(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V135(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q136(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);G137(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P138(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);E139(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E140(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T141(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G142(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S143(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y144(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);T145(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F146(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);V147(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P148(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);W149(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);L150(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L151(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S152(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F153(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);K154(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);R155(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G156(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S157(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A158(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L159(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E160(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E161(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K162(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E163(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);N164(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);K165(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I166(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L167(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V168(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K169(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E170(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T171(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G172(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y173(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);F174(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);F175(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);I176(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y177(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);G178(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q179(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);V180(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L181(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y182(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);T183(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D184(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K185(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T186(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Y187(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);A188(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);M189(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G190(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);H191(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L192(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I193(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q194(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);R195(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K196(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K197(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V198(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);H199(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V200(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F201(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);G202(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D203(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E204(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L205(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S206(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L207(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V208(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T209(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L210(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F211(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);R212(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C213(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);I214(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q215(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);N216(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);M217(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P218(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);E219(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T220(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L221(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P222(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);N223(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);N224(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);S225(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);C226(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはP);Y227(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);S228(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A229(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G230(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I231(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A232(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K233(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、
V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L234(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E235(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E236(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G237(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D238(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E239(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L240(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q241(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);L242(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A243(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);I244(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);P245(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、またはC);R246(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);E247(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);N248(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);A249(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);Q250(以下で置換:D、E、H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、F、W、Y、P、またはC);I251(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);S252(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L253(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D254(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);G255(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);D256(以下で置換:H、K、R、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);V257(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);T258(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);F259(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);F260(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、A、G、I、L、S、T、M、V、P、またはC);G261(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);A262(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L263(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);K264(以下で置換:D、E、A、G、I、L、S、T、M、V、N、Q、F、W、Y、P、またはC);L265(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC);および/またはL266(以下で置換:D、E、H、K、R、N、Q、F、W、Y、P、またはC):を含む、配列番号3229に提供される配列の非保存的置換を有するBLySポリペプチドに結合する。
別の実施形態において、BLySのアミノ酸レベルでの部位指向性変化は、非保存的置換による特定のアミノ酸の置換でなされ得る。本発明の抗体は、配列番号3230〜3237のいずれか1つのポリペプチドの非保存的置換変異を含むBLySアミノ酸配列に結合し得る。
さらなる実施形態において、本発明の抗体は、BLySアミノ酸配列を含むか、あるいはBLySアミノ酸配列からなるBLySポリペプチドを結合し、ここで、1より多いアミノ酸(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30および50)は、上記のように置換されたアミノ酸と置換される(保存的または非保存的のいずれか)。
アミノ酸の置換はまた、細胞表面レセプターへのリガンドの結合の選択性を改変し得る。例えば、Ostadeら、Nature 361:266〜268(1993)は、TNFレセプターの2つの公知の型の1つのみに対するTNF−αの選択的結合を生じる特定の変異を記載している。BLySは、TNFポリペプチドファミリーのメンバーであるので、TNF−αにおける変異に類似する変異は、BLySポリペプチドにおいて類似の効果を有するようである。
リガンド−レセプター結合のために重要な部位もまた、結晶化、核磁気共鳴、または光親和性標識のような構造解析によって決定され得る(Smithら、J.Mol.Biol.224:899−904(1992)およびde Vosら、Science 255:306−312(1992))。
BLySは、TNF関連タンパク質ファミリーのメンバーであるので、TNF保存ドメイン(例えば、配列番号3228のGly−191位からLeu−284位においてまたは配列番号3229のGly−172位からLeu−265位において)におけるアミノ酸をコードする配列に起こり得る変異は、BLySポリペプチドまたはそのフラグメントあるいはその改変体の機能的な活性(例えば、生物学的活性)を完全に除去するよりもむしろ調節し得る。従って、本発明の抗体は、TNF保存ドメインにおいて変異を有するBLySポリペプチドを結合し得る。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、TNF保存ドメインにおいて変異を有するBLySポリペプチドを結合し得、そしてBLySのアンタゴニストとして作用し得る。他の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、TNF保存ドメインにおいて変異を有するBLySポリペプチドを結合し得、そしてBLySアゴニストとして作用し得る。
当業者に公知の組換えDNA技術(例えば,DNAシャッフリング(上述)を参照のこと)を使用して、新規な変異タンパク質またはムテイン(単一または複数のアミノ酸置換、欠失、付加または融合タンパク質を含む)を作製し得る。このような改変されたポリペプチドは、例えば、増強された活性または増大された安定性を示し得る。さらに、これらは、より高い収率で精製され得、そして少なくとも特定の精製および保存状態下において対応する天然のポリペプチドよりもより良い安定性を示し得る。
従って、本発明はまた、宿主細胞においてBLySポリペプチド(例えば、発現、スケールアップなどにより適したBLySポリペプチド)を生成するために1つ以上のアミノ酸残基が欠失、付加または置換されたBLyS誘導体およびBLySアナログを結合する抗体を含む。例えば、システイン残基は、ジスルフィド架橋を除去するために欠失され得るか、または別のアミノ酸残基で置換され得る;N結合型グリコシル化部位は、例えば、N結合部位を高グリコシル化する(hyperglycosylate)ことが公知である酵母宿主から、より容易に回収および精製される均質な産物の発現を達成するために、改変または除去され得る。この目的のために、本発明のBLySポリペプチドの任意の1以上のグリコシル化認識配列上の第1または第3のアミノ酸位置の一方あるいは両方での種々のアミノ酸置換、および/または任意の1以上のこのような認識配列の第2位でのアミノ酸欠失は、その改変トリペプチド配列でのBLySポリペプチドのグリコシル化を妨げる(例えば、Miyajimoら、EMBO J 5(6):1193−1197を参照のこと)。非限定的な例において、酵母Pichea pastorisにおいて発現する場合、244位のセリンのアラニンへの変異は、単独かまたは位置242のアスパギンのグルタミンへの変異との組み合わせのいずれかにおいて、BLySの成熟可溶形態(例えば、配列番号3228のアミノ酸134〜285)のグリコシル化を消滅させる。変異BLySポリペプチド(ここで、位置242のアスパラギンのみが、グルタミンに変異されている)はまた、Pichea pastorisにおいて発現する場合、グリコシル化される。この変異において、グリコシル化現象は、セリン244におけるO結合化グルコシル化の活性化または非マスキングに起因し得る。グリコシル化を及ぼす類似の変異はまた、配列番号3229のBLySポリペプチド(すなわち、配列番号3229のアスパラギン−223からグルタミンおよび/またはセリン−224からアラニン)において起こる。さらに、本発明のポリペプチドの1つ以上のアミノ酸残基(例えば、アルギニン残基およびリジン残基)は、欠失されるかまたは別の残基で置換されるかして、例えば、フリンまたはケシン(kexin)のようなプロテアーゼによる所望でないプロセシングを除去する。このような変異の1つの可能性のある結果は、本発明のBLySポリペプチドが、細胞表面を開裂および細胞表面から放出されないことである。従って、本発明の抗体は、1つ以上のアミノ酸残基が欠失、付加または置換されたBLyS誘導体およびBLySアナログを結合し得る。他の実施形態において、本発明の抗体は、細胞表面から開裂することができないBLyS誘導体、改変体またはアナログを結合し得る。
特定の実施形態において、本発明の抗体は、配列番号3228において示されるBLyS配列のLys−132および/またはArg−133が、BLySを発現する細胞からのBLySの可溶性形態の放出を防止または減少する別のアミノ酸残基に変異されるか、全て欠失された、BLySポリペプチドを結合する。さらに特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチドを結合する。ここで、配列番号3228に示されるBLyS配列のLys−132は、Ala−132に変異される。別の、非例示的な特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチドを結合する。ここで、配列番号3228に示されるBLyS配列のArg−133は、Ala−133に変異される。これらは、タンパク質を変異し、そして/または例えば、エキソビボ治療または遺伝子治療において使用されて、操作された細胞の表面に保持されるBLySポリペプチドを発現する細胞を操作する。
特定の実施形態において、本発明の抗体は、配列番号3228において示されるBLyS配列のCys−146は、発現系において発現される場合、例えば、変異BLySポリペプチドのオリゴマー形成の防止または減少を助ける別のアミノ酸残基に変異されるかまたは全て欠失された、BLySポリペプチドを結合する。特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチドを結合する。ここで、Cys−146は、セリンアミノ酸残基に置換される。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチドを結合する。ここで配列番号3228に示されるBLyS配列のCys−232は、発現系において発現される場合、別のアミノ酸残基に変異されるかまたは全て欠失されて、例えば、変異BLySポリペプチドのオリゴマー形成の防止または減少を助ける。特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチドを結合する。ここで、Cys−232は、セリンアミノ酸残基に置換される。これらのポリペプチドにコードされるポリペプチドもまた、本発明に含まれる。
なお別の特定の実施形態において、本発明の抗体は、配列番号3228に示されるBLyS配列のCys−245が、発現系において発現される場合、例えば、変異BLySポリペプチドのオリゴマー形成の防止または減少を助ける別のアミノ酸残基に変異されるかまたは全て欠失されたBLySポリペプチドを結合する。特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチドを結合する。ここで、Cys−245は、セリンアミノ酸残基に置換される。これらのポリペプチドにコードされるポリペプチドもまた、本発明に含まれる。
本発明のポリペプチドは、好ましくは単離された形態で提供され、そして好ましくは実質的に精製される。BLySポリペプチドの組換え的に生成されたバージョンは、SmithおよびJohnson,Gene 67:31−40(1988)により記載される1工程方法によって、実質的に精製され得る。
本発明の抗体は、寄託されたcDNA(ATCC寄託番号97768)によってコードされる完全なポリペプチドを含むBLySポリペプチドを結合する。これは、寄託されたcDNAによってコードされるポリペプチドの細胞内ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞外ドメイン、寄託されたcDNAによってコードされる成熟可溶性ポリペプチド、タンパク質の細胞内ドメインおよび膜貫通ドメインを差し引いた細胞外ドメイン、配列番号3228の完全なポリペプチド、配列番号3228(例えば、配列番号3228のアミノ酸134〜285)の成熟可溶性ポリペプチド、配列番号3228の細胞外ドメイン、細胞内ドメインおよび膜貫通ドメインを差し引いた配列番号3228のアミノ残基73〜285、ならびに上記のこれらに少なくとも80%、85%、90%類似性、さらに好ましくは、少なくとも95%類似性およびなおさらに好ましくは、少なくとも96%、97%、98%または99%類似性を有するポリペプチドを含む。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明に含まれる。
本発明の抗体は、寄託されたcDNAによってコードされる完全なポリペプチドを含むBLySポリペプチドを結合する。これは、寄託されたcDNA(ATCC寄託番号203518)によってコードされるポリペプチドの細胞内ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞外ドメイン、寄託されたcDNAによってコードされる成熟可溶性ポリペプチド、タンパク質の細胞内ドメインおよび膜貫通ドメインを差し引いた細胞外ドメイン、配列番号3229の完全なポリペプチド、配列番号3229(例えば、配列番号3229のアミノ酸残基134〜266)の成熟可溶性ポリペプチド、配列番号3229の細胞外ドメイン、細胞内ドメインおよび膜貫通ドメインを差し引いた配列番号3229のアミノ残基73〜266、ならびに、上記のこれらに少なくとも80%、85%、90%類似性、さらに好ましくは、少なくとも95%類似性およびなおさらに好ましくは、少なくとも96%、97%、98%または99%類似性を有するポリペプチドを含む。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明に含まれる。
本発明のさらなる抗体は、寄託されたcDNA(ATCC寄託番号97768)にコードされるポリペプチドまたは配列番号3228のポリペプチドに少なくとも80%、または少なくとも85%同一、さらに好ましくは、少なくとも90%または95%同一、なおさらに好ましくは、少なくとも96%、97%、98%または99%同一であるポリペプチドを含むポリペプチドを結合し、そしてまた、少なくとも30アミノ酸およびさらに好ましくは、少なくとも50アミノ酸を有するこのようなポリペプチドの部分を結合する抗体を含む。
本発明のさらなる抗体は、寄託されたcDNA(ATCC寄託番号203518)にコードされるポリペプチドまたは配列番号3229のポリヌクレオチドに少なくとも80%、または少なくとも85%同一、さらに好ましくは、少なくとも90%または95%同一、なおさらに好ましくは、少なくとも96%、97%、98%または99%同一であるポリペプチドを含むポリペプチドを結合し、そしてまた、少なくとも30アミノ酸およびさらに好ましくは、少なくとも50アミノ酸を有するこのようなポリペプチドの部分を結合する抗体を含む。これらのポリペプチドにコードされるポリヌクレオチドもまた、本発明に含まれる。
2つのポリペプチド間の「類似性%」によって、Bestfitプログラム(Wisconsin Sequence Analysis Package,Version 8 for Unix(登録商標),Genetics Computer Group,University Research Park,575 Science Drive, Madison,WI 53711)および類似性を決定するためのデフォルト設定を使用して2つのポリペプチドのアミノ酸配列を比較することによって生じる類似性スコアが意図される。Bestfitは、SmithおよびWaterman(Advances in Applied Mathematics 2:482−489,1981)の局所同一性アルゴリズムを使用して、2つの配列間の類似性の最もよいセグメントを見出す。
BLySポリペプチドの参照アミノ酸配列に少なくとも例えば、95%「同一な」アミノ酸配列を有するポリペプチドによって、ポリペプチド配列が、BLySポリペプチドの参照アミノ酸の各100個のアミノ酸あたり5個のアミノ酸改変までを含み得ることを除いて、ポリペプチドのアミノ酸配列は、参照配列に同一であることが意図される。言い換えれば、参照アミノ酸配列に少なくとも95%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドを獲得するために、参照配列のアミノ酸残基の5%までが、欠失され得るかまたは別のアミノ酸に置換され得るか、あるいは参照配列中の全アミノ酸残基の5%までのアミノ酸の数が、参照配列に挿入され得る。参照配列のこれらの改変は、参照アミノ酸配列のアミノ末端またはカルボキシ末端あるいはこれらの末端化間(参照配列中の残基間または参照配列中の1つ以上の連続基における残基のいずれかに個々に分散された)のどこかにおいて起こり得る。
実用的な様式において、任意の特定のポリペプチドは例えば、配列番号3228のアミノ酸配列、寄託されたcDNAクローンHNEDU15(ATCC登録番号97768)によってコードされるアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントあるいは、例えば、配列番号3229のアミノ酸配列、寄託されたcDNAクローンHDPMC52(ATCC登録番号203518)によってコードされるアミノ酸配列、またはそれらのフラグメントに少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%同一であるかどうかは、Bestfitプログラム(Wisconsin Sequence Analysis Package,Version 8 for Unix(登録商標),Genetics Computer Group,University Research Park,575 Science Drive,Madison,WI 53711)のような公知のコンピュータープログラムを使用して慣習的に決定され得る。特定の配列が、本発明に従う参照配列に、例えば、95%同一であるかどうかを決定するためにBestfitまたは他の任意の配列アライメントプログラムを使用する場合、パラメーターは、もちろん同一性のパーセントが、参照配列の全長にわたって計算され、そして参照配列におけるアミノ酸残基の総数の5%までの同一性におけるギャップが可能であるように設定される。
特定の実施形態において、参照(問い合わせ)配列(本発明の配列)と対象配列(全体配列アライメントとしても称される)との間の同一性は、Brutlagら(Comp.App.Biosci.6:237−245(1990))のアルゴリズムに基づくFASTDBコンピュータープログラムを使用して決定される。FASTDBアミノ酸アライメントにおいて使用される好ましいパラメーターは、以下である:マトリクス=PAM0、k−タプル=2、ミスマッチペナルティー=1、結合ペナルティー=20、ランダム化群長=0、カットオフスコア=1、ウインドウスコア=配列長、ギャップペナルティー=5、ギャップサイズペナルティー=0.05、ウインドウサイズ=500または対象アミノ酸配列に長さ(より短いほう)。本実施形態に従って、対象配列が、N末端欠失またはC末端欠失に起因する問い合わせ配列よりも短い場合(内部欠失のせいではない)、手動の訂正は、FASTDBプログラムが、全体のパーセント同一性を計算する際、対象配列のN末端短縮またはC末端短縮を計上しないという事実を考慮れるような結果が作製される。問い合わせ配列に関連する、N末端およびC末端において短縮された対象配列は、同一性パーセントが、対応する対象の残基とマッチ/整列化しない対象配列のN末端およびC末端である問い合わせ配列の残基の数を問い合わせ配列の全体の塩基のパーセントとして、計算することによって訂正される。残基が、マッチ/整列化されるかどうかの決定は、FASTDB配列アライメントの結果によって決定される。次いで、この割合は、パーセント同一性から減算され、特定のパラメーターを使用して上のFASTDBプログラムよって計算されて、最終パーセント同一性スコアに達する。この最終パーセント同一性スコアは、この実施形態の目的のために使用されるものである。対象配列のN末端およびC末端の残基のみ(これらは、問い合わせ配列とマッチ/整列化されない)は、パーセント同一性スコアの手動での調節の目的のために考えられている。これは、対象配列の最も遠いN末端残基およびC末端残基の外側の問い合わせ残基位置のみである。例えば、90個のアミノ酸残基対象配列は、パーセント同一性を決定するために100個の残基問い合わせ配列と整列化される。欠失は、対象配列のN末端でおこり、従って、FASTDBアライメントは、N末端の最初の10残基のマッチ/アライメントを示さない。10個の不対残基は、配列の10%(問い合わせ配列中のマッチしないN末端およびC末端における残基の数/残基の総数)であるので、10%は、FASTDBプログラムによって計算された同一性パーセントスコアから減算される。残りの90個の残基が、完全にマッチする場合、最終パーセント同一性は、90%である。別の例において、90個の残基の対象配列は、100個の残基の問い合わせ配列と比較される。問い合わせとマッチ/整列化されない対象配列のN末端またはC末端において残基がないので、この時の欠失は、内部欠失である。この場合において、FASTDBによって計算されたパーセント同一性は、手動で訂正されない。もう1度、FASTDBアライメント(これは、問い合わせ配列にマッチ/整列化されない)に表示されるように、対象配列のN末端およびC末端の外側の残基位置のみは、手動で訂正される。手動以外の訂正が、本実施形態の目的のためになされる。
(BLySポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体)
本発明はまた、BLySポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいは抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)を含む。この抗体は、表1に言及されるscFVの重鎖可変ドメインおよび/または軽鎖可変ドメインの全てまたは一部を含むかあるいは表1に言及されるscFVの重鎖可変ドメインおよび/または軽鎖可変ドメインの全てまたは一部からなる。
本発明はまたは、動物、好ましくは、哺乳動物および最も好ましくは、ヒトにおける異常なBLyS発現またはBLySレセプター発現あるいは不適切なBLyS機能またはBLySレセプター機能に関連する疾患または障害を検出、診断および/または予測するための方法および/または組成物を含む。これは、BLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいは抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)を使用する工程を含む。本発明の抗体を用いて検出、診断または予測され得る疾患および障害は、以下に挙げられるがこれらに限定されない:免疫障害(例えば、狼瘡、リウマチ様動脈炎、多発性硬化症、重症筋無力症、橋本病および免疫不全症候群)、炎症性障害(例えば、ぜん息、アレルギー障害およびリウマチ様動脈炎)、感染疾患(例えば、AIDS)ならびに増殖障害(例えば、白血病、癌およびリンパ腫)。
本発明は、動物、好ましくは、哺乳動物および最も好ましくは、ヒトにおける異常なBLyS発現またはBLySレセプター発現あるいは不適切なBLyS機能またはBLySレセプター機能に関連する疾患または障害を予防、処置および/または改善するための方法および組成物をさらに含む。これは、BLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むかあるいは抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)を使用する工程を含む。有効量の1つ以上の本発明の抗体または分子を投与することによって予防、処置または阻止され得る疾患および障害は、以下に挙げられるがこれらに限定されない:免疫障害(例えば、狼瘡、リウマチ様動脈炎、多発性硬化症、重症筋無力症、橋本病および免疫不全症候群)、炎症性障害(例えば、ぜん息、アレルギー障害およびリウマチ様動脈炎)、感染疾患(例えば、AIDS)ならびに増殖障害(例えば、白血病、癌およびリンパ腫)。
(抗BLyS抗体)
本発明の抗体は、ファージディスプレイ技術を使用して部分的に発見された。ファージ粒子の表面に提示される単鎖抗体分子(「scFv」)は、スクリーニングされて、BLySに免疫特異的に結合するこれらのscFvを同定する。これらは、BLySの膜結合形態および可溶性形態を含む。本発明は、BLySに免疫特異的に結合することが同定されたscFvおよびその部分を含む。これは、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合するscFv、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvおよびBLySの可溶性形態と膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するscFvを含む。特に、本発明は、表1に言及されるような、配列番号1〜2128のアミノ酸配列を含むか、または配列番号1〜2128のアミノ酸配列からなるscFvを含む。好ましくは、本発明のscFvは、配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595または1881〜1908のアミノ酸配列を含むか、またはこれらからなる。scFvは、可溶性BLySを結合するscFv(例えば、配列番号1563〜1880のアミノ酸配列を含むか、または配列番号1563〜1880のアミノ酸配列からなるscFv)、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFv(例えば、配列番号1881〜2128のアミノ酸配列を含むか、または配列番号1881〜2128のアミノ酸配列からなるscFv)、およびBLySの可溶形態と膜結合形態に免疫特異的に結合するscFv(例えば、配列番号1〜1562のアミノ酸配列を含むか、または配列番号1〜1562のアミノ酸配列からなるscFv)を含む。BLySに免疫特異的に結合するこれらのscFvのフラグメントまたは改変体を含むか、あるいはBLySに免疫特異的に結合するこれらのscFvのフラグメントまたは改変体からなる分子はまた、これらが、scFv、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明の1つの実施形態において、BLySに免疫特異的に結合するscFvは、表1に言及されるVHドメインのいずれか1つのアミノ酸配列および/または表1に言及されるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を含む。代替の実施形態において、本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を含む。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合するscFvは、表1に言及されるVH CDRのうちの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列および/または表1に言及されるVL CDRのうちの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を含む。代替の実施形態において、本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を含む。BLySに免疫特異的に結合する表1に言及されるscFvの抗体フラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子はまた、これらが、scFv、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
(表1は、明細書の一番後に見出され得る。)
本発明の別の実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に言及される配列番号1563〜1880のアミノ酸配列を含むか、または表1に言及される配列番号1563〜1880のアミノ酸配列からなる。好ましい実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合するscFvは、配列番号1570〜1595のアミノ酸配列を含むか、または配列番号1570〜1595のアミノ酸配列からなる。なおさらに好ましい実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合するscFvは、配列番号1563〜1569のアミノ酸配列を含むか、または配列番号1563〜1569のアミノ酸配列からなる。
本発明の別の実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に言及される配列番号1881〜2128のアミノ酸配列を含むか、または表1に言及される配列番号1881〜2128のアミノ酸配列からなる。好ましい実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvは、配列番号1886〜1908のアミノ酸配列を含むか、または配列番号1886〜1908のアミノ酸配列からなる。なおさらに好ましい実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvは、配列番号1881〜1885のアミノ酸配列を含むか、または配列番号1881〜1885のアミノ酸配列からなる。
本発明の別の実施形態において、BLySの可溶性形態と膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するscFvは、表1に言及される配列番号1〜1562のアミノ酸配列を含むか、または表1に言及される配列番号1〜1562のアミノ酸配列からなる。好ましい実施形態において、BLySの可溶性形態と膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するscFvは、配列番号834〜872のアミノ酸配列を含むか、または配列番号834〜872のアミノ酸配列からなる。別の好ましい実施形態において、BLySの可溶性形態と膜結合形態の両方に免疫特異的に結合するscFvは、配列番号1〜46または配列番号321〜329のアミノ酸配列のいずれか1つを含むか、または配列番号1〜46または配列番号321〜329のアミノ酸配列からなる。BLySの可溶性形態および/またはBLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する、scFvのフラグメントまたは改変体を含むか、あるいはscFvのフラグメントまたは改変体からなる分子はまた、これらが、scFv、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明の別の実施形態において、BLySの可溶化形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に開示されるような配列番号1563〜1880に含まれるVHドメインのいずれか1つのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1563〜1880に含まれるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶化形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの可溶化形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。別の実施形態において、BLySの可溶化形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に開示されるような配列番号1563〜1880のVH CDRのうちの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1563〜1880に含まれるVL CDRのうちの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に開示されるような配列番号1563〜1880に含まれるVH CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1563〜1880に含まれるVL CDR3にいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。BLyS、好ましくは、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合するこれらのscFvのフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子は、これらが、scFv、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明の別の実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に開示されるような配列番号1881〜2128に含まれるVHドメインのいずれか1つのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1881〜2128に含まれるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶性形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。別の実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に開示されるような配列番号1881〜2128に含まれるVH CDRのうちの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1881〜2128に含まれるVL CDRのうちの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に開示されるような配列番号1881〜2128に含まれるVH CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1881〜2128に含まれるVL CDR3にいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。BLyS、好ましくは、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するこれらのscFvのフラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子は、これらが、scFv、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明の別の実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に開示されるような配列番号1〜1562に含まれるVHドメインのいずれか1つのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1〜1562に含まれるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド含む。別の実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvは、表1に開示されるような配列番号1〜1562に含まれるVH CDRのうちの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1〜1562に含まれるVL CDRのうちの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVHドメインおよびVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に開示されるような配列番号1〜1562に含まれるVH CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列および/または表1に開示されるような配列番号1〜1562に含まれるVL CDR3にいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される同じscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。代替の実施形態において、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する本発明のscFvは、表1に言及される異なるscFv由来のVH CDRおよびVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。BLyS、好ましくは、BLySの可溶化形態および膜結合形態に免疫特異的に結合するこれらのscFvのフラグメントまたは改変体あるいは分子を含むか、またはこれらからなる分子は、これらが、scFv、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明は、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、または抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)を提供する。特に、本発明は、表1に言及されるようなscFvに対応する抗体を提供し、このようなscFvは、例えば、定常領域配列を含み、そして実施例20(上述)においてさらに詳細に示されるような、免疫グロブリン分子の発現を指向するように操作される発現ベクターにscFvのVHおよび/またはVLドメインをコードするヌクレオチド配列を挿入することによって、免疫グロブリン分子に慣用的に「変換され」得る。
1つの実施形態において、本発明は、抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、または抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)を提供する。ここで、この抗体は、表1に言及される配列に含まれるVHドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、または表1に言及される配列に含まれるVHドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドからなる。本発明はまた、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的な結合する抗体を提供する。ここで、この抗体は、表1において示されるVH CDRの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、あるいは表1において示されるVH CDRの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチドからなる。BLySまたはBLySフラグメントに免疫特異的に結合する、これらの抗体、もしくは抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいはこれらの抗体、もしくは抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子はまた、これら抗体、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明の1つの実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、または抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)は、表1に言及される配列に含まれるVH CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、または表1に言及される配列に含まれるVH CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドからなる。特に本発明は、表1に開示されるような配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVH CDR1のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、あるいは表1に開示されるような配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVH CDR1のアミノ酸配列を有するポリペプチドからなる、BLySに免疫特異的に結合する抗体を提供する。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する抗体は、表1に開示されるような配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVH CDR2のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、あるいは表1に開示されるような配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVH CDR2のアミノ酸配列を有するポリペプチドからなる。好ましい実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する抗体は、表1に開示されるような配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVH CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、あるいは表1に開示されるような配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVH CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチドからなる。なお別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する抗体は、表1に開示されるような配列番号834〜872、1570〜1595または1886〜1908に含まれるVH CDR1;配列番号834〜872、1570〜1595または1886〜1908に含まれるVH CDR2;および/あるいは表1に開示されるような配列番号834〜872、1570〜1595または1886〜1908に含まれるVH CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれらからなる。好ましくは、本発明の抗体は、表1に開示されるような同じscFvから由来するVH CDRを含むか、または表1に開示されるような同じscFvから由来するVH CDRからなる。BLySに免疫特異的に結合するこれらの抗体にフラグメントまたは改変体を含むか、あるいはBLySに免疫特異的に結合するこれらの抗体にフラグメントまたは改変体からなる分子はまた、これらの抗体、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明は、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、または抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)を提供する。特に、本発明は、抗体を提供する。ここで、この抗体は、表1に言及されるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するVLドメインを含むか、または表1に言及されるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するVLドメインからなる。本発明はまた、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的な結合する抗体を提供する。ここで、この抗体は、表1に言及される配列に含まれるVL CDRの1、2、3、またはそれ以上のいずれかのアミノ酸配列を有するVL CDRを含むか、またはこれらからなる。BLySに免疫特異的に結合する、これらの抗体のフラグメントまたは改変体を含むか、あるいは抗体のフラグメントまたは改変体からなる分子はまた、これら抗体、分子、フラグメントまたは改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明の1つの実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、または抗体フラグメントまたはその改変体からなる分子を含む)は、表1に言及されるVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、または表1に言及されるVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドからなる。特に、本発明は、表1に開示されるような配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVL CDR1のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれらからなる、BLySに免疫特異的に結合する抗体を提供する。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する抗体は、表1に開示されるような配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVL CDR2のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれらからなる。好ましい実施形態において、抗体は、表1に開示される配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569または1881〜1885に含まれるVL CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれらからなる。なお別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する抗体は、表1に開示されるような配列番号834〜872、1570〜1595または1886〜1908に含まれるVH CDR1;表1に開示されるよう配列番号834〜872、1570〜1595または1886〜1908に含まれるVL CDR2;および表1に開示されるよう配列番号834〜872、1570〜1595または1886〜1908に含まれるVL CDR3のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含むか、またはこれらからなる。好ましくは、本発明の抗体は、表1に開示されるような同じscFvに由来するVL CDRを含むか、または表1に開示されるような同じscFvに由来するVL CDRからなる。BLySに免疫特異的に結合するこれらの抗体のフラグメントまたは改変体を含むか、あるいはBLySに免疫特異的に結合するこれらの抗体のフラグメントまたは改変体からなる分子はまた、これら抗体、分子、フラグメントおよび/または改変体をコードする核酸分子である場合、本発明に含まれる。
本発明はまた、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントもしくはそれらの改変体を含むか、またはこれらからなる分子を含む)を提供し、ここで、この抗体は、表1において参照されるscFvのうちの1つのVLドメインまたは他のVLドメインと結合した、表1において参照されるscFvのうちの1つのVHドメインを含むか、あるいはこれらからなる。本発明はさらに、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたはそれらの改変体を含むか、またはこれらからなる分子を含む)を提供し、ここで、この抗体は、表1において参照されるscFvのうちの1つのVHドメインまたは他のVHドメインと結合した、表1において参照されるscFvのうちの1つのVLドメインを含むか、あるいはこれらからなる。好ましい実施形態において、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908を含むVHドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、および表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908を含むVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、あるいはこれらからなる。さらに好ましい実施形態において、本発明の抗体は、表1において開示される同じscFv由来のVHドメインおよびVLドメインを含むか、あるいはこれらからなる。これらの抗体のフラグメントもしくは改変体を含むかまたはこれらからなる分子(これは免疫特異的にBLySに結合する)もまた、本発明に含まれ、これらの抗体、分子、フラグメントもしくは改変体をコードする核酸分子も同様に本発明に含まれる。
本発明はまた、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントまたは改変体を含むか、またはこれらからなる分子を含む)を提供し、ここで、この抗体は、表1に参照されるように、1、2、3、またはそれ以上のVH CDRを含むかあるいはこれらからなり、そして1、2、3、またはそれ以上のVL CDRを含むかあるいはこれらからなる。詳細には、本発明は、BLySのポリペプチドまたはポリペプチドフラグメントに免疫特異的に結合する抗体を提供し、ここで、この抗体は、VH CDR1およびVL CDR1、VH CDR1およびVL CDR2、VH CDR1およびVL CDR3、VH CDR2およびVL CDR1、 VH CDR2およびVL CDR2、VH CDR2およびVL CDR3、VH CDR3およびVH CDR1、VH CDR3およびVL CDR2、VH CDR3およびVL CDR3、または表1において参照されるVH CDRおよびVL CDRの任意の組み合わせを含むか、あるいはこれらからなる。好ましい実施形態において、1つ以上のこれらの組み合わせは、表1において開示されるように、同じscFv由来である。免疫特異的にBLySに結合する、フラグメントまたはこれらの抗体の改変体を含むかまたはこれらからなる分子もまた、本発明に含まれ、これらの抗体、分子、フラグメントもしくは改変体をコードする核酸分子もまた本発明に含まれる。
好ましい実施形態において、本発明は抗体を提供し、ここで、VH CDRX (ここで、 X=1、2、または3)およびVL CDRY (ここで、Y=1、2、または3) は、同じ特異性を有するscFv由来である(すなわち、可溶性BLySに結合するscFv由来、膜結合BLySに結合するscFv由来、または可溶性で膜結合性の両方であるBLySに結合するscFv由来)。免疫特異的にBLySに結合する、これらの抗体のフラグメントまたは改変体を含むかあるいはこれらからなる分子もまた、本発明に含まれ、これらの抗体、分子、フラグメントまたは改変体をコードする核酸分子もまた本発明に含まれる。
本明細書中で使用される場合、用語「抗体」とは、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分(すなわち、抗原を免疫特異的に結合する抗原結合部位を含む分子)をいう。このように、用語「抗体」は、抗体分子全体だけではなく、抗体フラグメント、ならびに抗体および抗体フラグメントの改変体(誘導体を含む)もまた含む。本発明の抗体としては、モノクローナル抗体、多重特異的抗体、ヒト抗体またはキメラ抗体、単鎖抗体、単鎖Fvs(scFv)、Fabフラグメント、F(ab’)フラグメント、Fdフラグメント、ジスルフィド連結Fvs(sdFvs)、抗イディオタイプ(抗Id)抗体(例えば、本発明の抗体に対する抗Id抗体が挙げられる)、および任意の上記抗体のエピトープ結合フラグメントが挙げられるが、これらに限定されない。本発明の免疫グロブリン分子は、免疫グロブリン分子の任意の型(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、およびIgY)、クラス(例えば、IgG、IgG、IgG、IgG、IgAおよびIgA)またはマン液グロブリン分子のサブクラスであり得る。本発明の抗体はまた、配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908を含むアミノ酸配列の部分のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、あるいはこれらからなる分子を含む。好ましくは、本発明の抗体は、VHドメイン、VH CDR、VLドメイン、または表1において参照される配列において含まれるいずれか1つのVL CDRのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれからなる。本発明の抗体はまた、BLySに免疫特異的に結合する上記の抗体のフラグメントまたは改変体を含むかあるいはこれらからなる分子もまた含む。
最も好ましくは、本発明の抗体は、ヒトBLySに免疫特異的に結合する抗体全体または抗体フラグメントである。ヒトBLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体フラグメントとしては、限定されないが、Fabフラグメント、Fab’フラグメントおよびF(ab’)フラグメント、Fdフラグメント、単鎖Fvs (scFv)、単鎖抗体、ジスルフィド連結Fvs (sdFvs)、 VLドメインまたはVHドメインのいずれかを含むかまたはこれらからなるフラグメント、および任意の上記のフラグメントと結合するエピトープが挙げられる。
BLyS結合抗体フラグメント(一本鎖抗体を含む)は、可変領域を、単独であるいは以下:ヒンジ領域、CH1ドメイン、CH2ドメインおよびCH3ドメインの全体または部分との組み合わせで含み得るか、またはこれらからなり得る。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySに免疫特異的に結合するポリペプチドを含むかまたはこれからなり、このポリペプチドは、表1において開示される1、2、3、4、5、6もしくはそれ以上のCDR、好ましくは、配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595もしくは1881〜1908を含むVH CDR3および/またはVL CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むかまたはこれらからなる。最も好ましくは、本発明の抗体は、表1において参照される、同じscFvからの1、2、3、4、5、6、もしくはそれ以上のCDRを含むか、またはこれらからなる。本発明の抗体は、鳥類および哺乳動物を含む任意の動物起源由来であり得る。好ましくは、この抗体は、ヒト、ネズミ(例えば、マウスおよびラット)、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ、またはニワトリである。最も好ましくは、この抗体はヒト抗体である。本明細書中で使用される場合、「ヒト」抗体は、ヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有する抗体を含み、そしてヒト免疫グロブリンライブラリーから、およびヒト抗体を産生するように遺伝的に操作された外因性マウス(xenomice)または他の生物から単離された抗体を含む。ヒト抗体およびヒトモノクローナル抗体を産生するためのこのわずかな技術ならびにそのような抗体を産生するためのプロトコールの詳細な議論については、例えば、PCT公開WO98/24893;WO92/01047;WO96/34096;WO96/33735;欧州特許第0 598 877;米国特許第5,413,923号;同第5,625,126号;同第5,633,425号;同第5,569,825号;同第5,661,016号;同第5,545,806号;同第5,814,318号;同第5,885,793号;同第5,916,771号;および同第5,939,598号;ならびにLonbergおよびHuszar、Int. Rev. Immunol. 13:65−93 (1995)を参照のこと(これらはその全体が本明細書中に参考として援用される)。ヒト抗体または「ヒト化」キメラモノクローナル抗体は、本明細書中に記載される技術またはそうでなければ当該分野で公知の技術を使用して産生され得る。例えば、キメラ抗体を産生するための方法は、当該分野で公知である。総説については、その全体が本明細書中で参考として援用される以下の文献:Morrison,Science 229:1202(1985);Oiら、BioTechniques 4:214(1986);Cabillyら、米国特許第4,816,567号;Taniguchiら、EP 171496;Morrisonら、EP 173494;Neubergerら、WO 8601533;Robinsonら、WO 8702671;Boulianneら、Nature 312:643(1984);Neubergerら、Nature 314:268(1985)を参照のこと。さらに、Abgenix、Inc. (Freemont、CA)およびGenpharm (San Jose、CA)のような会社は、上記に類似した技術を使用して、選択した抗原を指向するヒト抗体を提供するために従事し得る。
本発明の抗体は、一価、二価、三価または多価であり得る。例えば、一価scFvは、化学的にか、または別のタンパク質もしくは基質で会合することのいずれかによって、多量体化され得る。ヘキサヒスチジンタグまたはFlagタグに融合したscFvは、Ni−NTAアガロース(Qiagen)を使用してか、または抗Flag抗体 (Stratagene、Inc.)を使用して多量体化され得る。
本発明の抗体は、一重特異的、二重特異的、三重特異的またはより多価の多重特異的であり得る。多重特異的な抗体は、BLySポリペプチドもしくはそのフラグメントの異なるエピトープに対して特異的であり得るか、またはBLySポリペプチドもしくはそのフラグメントおよび異種エピトープ(例えば、異種ポリペプチドまたは固体支持体物質)の両方に特異的であり得る。例えば、PCT公開WO 93/17715;WO92/08802;WO 91/00360;WO 92/05793;Tuttら、J.Immunol.147:60−69(1991);米国特許第4,474,893号;同第4,714,681号;同第4,925,648号;同第5,573,920号;同第5,601,819号;Kostelnyら、J.Immunol.148:1547−1553(1992)を参照のこと。
本発明の抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むか、またはそれからなる分子を含む)は、マウスBLyS(例えば、ヒトBLyS(配列番号3228および/もしくは3229)のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはヒト単球で発現されるBLyS;マウスBLyS(配列番号3230および/もしくは3231)またはマウス単球で発現されるBLyS;ラットBLyS (配列番号3232、3233、3234および/もしくは3235において与えられる可溶性形態または膜会合形態(例えば、ラット単球の表面上);あるいはサルBLyS(例えば、配列番号3236および/もしくは3237のサルBLySポリペプチド(サルBLySの可溶性形態、またはサル単球を発現するBLyS))、好ましくは、本発明の抗体は、ヒトBLySに免疫特異的に結合する。好ましくは、本発明の抗体は、ヒトおよびサルBLySに免疫特異的に結合する。また、好ましくは、本発明の抗体は、ヒトBLySおよびマウスBLySに免疫特異的に結合する。より好ましくは、本発明の抗体は、マウスBLySが結合するよりも高い親和性で、ヒトBLySに免疫特異的に結合する。
本発明の抗体はまた、その交差反応性について記載または特定化され得る。本発明のポリペプチドの任意の他のアナログ、オルソログまたはホモログを結合しない抗体が、含まれる。本発明のポリペプチドに対して少なくとも95%、少なくとも90%、少なくとも85%、少なくとも80%、少なくとも75%、少なくとも70%、少なくとも65%、少なくとも60%、少なくとも55%および少なくとも50%の同一性(当該分野で公知の方法および本明細書中に記載される方法を用いて計算されるように)を有するポリペプチドを結合する抗体もまた、本発明に含まれる。特定の実施形態において、本発明の抗体は、APRIL(配列番号3239;GenBank登録番号AF046888;J.Exp.Med.188(6):1185−1190;PCT国際公開WO97/33902)と交差反応する。特定の実施形態において、本発明の抗体は、ヒトタンパク質の、マウスホモログ、ラットホモログおよび/またはウサギホモログならびに対応するそれらのエピトープと交差反応する。本発明のポリペプチドに対して95%未満、90%未満、85%未満、80%未満、75%未満、70%未満、65%未満、60%未満、55%未満および50%未満の同一性(当該分野で公知の方法および本明細書中に記載される方法を用いて計算されるように)を有するポリペプチドを結合しない抗体もまた、本発明に含まれる。特定の実施形態において、上記の交差反応性は、本明細書中に開示された、任意の単一特異的な抗原性または免疫原性ポリペプチド、あるいは2、3、4、5またはそれ以上の特異的抗原性および/または免疫原生ポリペプチドの組み合わせに関する。さらに、ハイブリダイゼーション条件下(本明細書中で記載されるような)で本発明のポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドを結合する抗体が、本発明に含まれる。
好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むか、またはそれからなる分子を含む)は、BLySに免疫特異的に結合し、そして他のいずれの抗原と交差反応しない。より好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySに免疫特異的に結合し、そしてTRAIL、APRIL、Endokine−α、TNF−α、TNF−β、Fas−LまたはLIGHTと交差反応しない。
本発明はまた、核酸分子(一般に単離され、本発明の抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むか、またはそれからなる分子を含む)をコードする)を提供する。1つの実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVHドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメインを含むかまたはこれからなる抗体をコードする。別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVH CDR1のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVH CDR1を含むかまたはそれらからなる抗体をコードする。別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVH CDR2のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVH CDR2を含むかまたはこれからなる抗体をコードする。さらに別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVH CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVH CDR3を含むかまたはこれからなる抗体をコードする。BLySに免疫特異的に結合し、そしてVHドメインおよび/もしくはVH CDRのフラグメントまたはそれらの改変体を含むかあるいはこれからなる抗体をコードする核酸分子もまた、本発明によって含まれる。
別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するVLドメインを含むかまたはこれからなる抗体(抗体フラグメントもしくはそれらの改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)をコードする。別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVL CDR1のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVL CDR1を含むかまたはこれからなる抗体をコードする。別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVL CDR2のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVL CDR2を含むかまたはこれからなる抗体をコードする。さらに別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVL CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列を有するVL CDR3を含むかまたはこれからなる抗体をコードする。免疫特異的にBLySに結合し、そしてVLドメインおよび/もしくはVLCDRのフラグメントまたは改変体を含むかあるいはこれらからなる抗体をコードする核酸分子もまた、本発明によって含まれる。
別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるVHドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するVHドメイン、および表1において参照されるVLドメインのいずれか1つのアミノ酸配列を有するVLドメインを含むか、あるいはこれらからなる抗体(抗体フラグメントもしくはそれらの改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)をコードする。別の実施形態において、本発明の核酸分子は、表1において参照されるアミノ酸配列を有する、VH CDR1、VL CDR1、VH CDR2、VL CDR2、VH CDR3、VL CDR3、もしくはこれらの任意の組み合わせを含むかまたはこれらからなる抗体をコードする。BLySに免疫特異的に結合し、そしてVLドメイン(VL and/or domains)および/またはVHCDRおよび/またはVLCDRを含むかあるいはこれらからなるフラグメントまたは改変体をコードする核酸もまた、本発明によって含まれる。
本発明はまた、本明細書中に記載されるVHドメイン、VH CDR、VLドメイン、およびVL CDRの改変体(誘導体を含む)を含むか、またはこれらからなる抗体を提供し、この抗体は、BLySに免疫特異的に結合する。当該分野で公知の標準的な技術を使用して、本発明の分子をコードする核酸配列中に変異(例えば、アミノ酸置換を生じる部位指向的な変異およびPCR介在変異を含む)を誘導し得る。好ましくは、この改変体(誘導体を含む)は、好ましくは、この改変体(誘導体を含む)は、VHドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLドメイン、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3の参照と比較して、50アミノ酸未満の置換、40アミノ酸未満の置換、30アミノ酸未満の置換、25アミノ酸未満の置換、20アミノ酸未満の置換、15アミノ酸未満の置換、10アミノ酸未満の置換、5アミノ酸未満の置換、4アミノ酸未満の置換、3アミノ酸未満の置換、または2アミノ酸未満の置換をコードする。特定の実施形態において、この改変体は、VHCDR3の置換をコードする。好ましい実施形態において、この改変体は、1つ以上の予期される非必須アミノ酸残基において、保存的アミノ酸置換を有する。「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基が、類似の電荷を有する側鎖を有するアミノ酸残基で置き換えられる置換である。類似の電荷を有する側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該分野で規定されている。これらのファミリーとしては、塩基性側鎖(例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電の極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、β−分枝した側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸が挙げられる。あるいは、変異は、コード配列(例えば、飽和変異)の全てまたは一部にそって、無作為に導入され得、そして生じた変異体は、生物学的活性についてスクリーニングされて、活性(例えば、BLySに結合する能力)を保持している変異体を同定され得る。変異形成に続いて、このコードタンパク質は、慣習的に発現され、そしてコードタンパク質の機能的活性および/または生物学的活性(例えば、BLySに免疫特異的に結合する能力)は、本明細書中に記載される技術を使用してか、または当該分野で公知の慣習的に改変された技術によって決定され得る。
本発明の抗体は、例えば、任意の型の分子の抗体に対する共有結合によって改変された誘導体(すなわち、改変体)を含み、その結果、共有結合は、BLySに免疫特異的に結合する抗体の能力に影響を与えない。例えば、これは限定の目的ではないが、本発明の誘導体は、例えば、グリコシル化、アセチル化、ペグ化、リン酸化、アミド化、既知の保護/ブロッキング基による誘導体化、タンパク質分解切断、細胞のリガンドまたは他のタンパク質に対する連結などによって、改変された抗体を含む。多数の化学的改変のいずれも、公知の技術(特異的な化学的切断、アシル化、ホルミル化、ツニカマイシンの代謝的合成などが挙げられるが、これらに限定されない)によって実行され得る。さらに、この誘導体は、1つ以上の非古典的アミノ酸を含み得る。
特定の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むか、またはそれからなる分子を含む)は、表1において参照されるVHドメインまたはVLドメインの1つをコードするヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列に、ストリンジェントな条件下で(例えば、6×塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム(SSC)中で、約45℃で、フィルター結合DNAに対してハイブリダイゼーションし、その後0.2×SSC/0.1%SDS中で、約50〜65℃で1回以上洗浄する)、高度にストリンジェントな条件下で(例えば、6×SSC中で、約45℃で、フィルター結合核酸に対してハイブリダイゼーションし、その後0.1×SSC/0.2%SDS中で、約68℃で1回以上洗浄する)、または他のストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で(これは当該分野で公知である(例えば、Ausubel,F.M.ら編、1989、Current Protocols in Molecular Biology,第I巻、Green Publishing Associates、Inc.およびJohn Wiley&Sons,Inc.New York.New York、6.3.1〜6.3.6および2.10.3頁を参照のこと)、ハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含むか、またはこれらからなる。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体は、表1において参照されるVH CDRまたはVL CDRをコードするヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列に、ストリンジェントな条件下(例えば、上記のような条件下、または当該分野で公知であるストリンジェントな他のハイブリダイゼーション条件下でのハイブリダイゼーション)でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含むか、またはこれからなる。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体は、表1において参照されるVH CDR3をコードするヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列に、ストリンジェントな条件下(例えば、上記のような条件下、または当該分野で公知であるストリンジェントな他のハイブリダイゼーション条件下でのハイブリダイゼーション)でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含むか、またはこれからなる。これらの抗体をコードする核酸分子もまた、本発明によって含まれる。
別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントもしくはそれらの改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)は、表1において参照されるVHドメインのいずれか1つに少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、もしくは少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれからなる。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体は、表1において参照されるVH CDRのいずれか1つに少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、もしくは少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれからなる。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体は、表1において参照されるVH CDR3のいずれか1つに少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、もしくは少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれからなる。これらの抗体をコードする核酸分子もまた、本発明によって含まれる。
別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むか、またはそれからなる分子を含む)は、表1において参照されるVLドメインのいずれか1つに少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、もしくは少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれからなる。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体は、表1において参照されるVL CDRのいずれか1つに少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、もしくは少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれらからなる。別の実施形態において、BLySに免疫特異的に結合する本発明の抗体は、表1において参照されるVL CDR3のいずれか1つに少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、もしくは少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むか、またはこれからなる。これらの抗体をコードする核酸分子もまた、本発明によって含まれる。
本発明の抗体(抗体フラグメントもしくはそれらの改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)はまた、BLySポリペプチドまたはBLySポリペプチドのフラグメントもしくは改変体に対するその結合親和性(例えば、BLySの可溶性形態および/またはBLySの膜結合形態に対する)について、記述されるかまたは特定化され得る。特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチド、またはそれらのフラグメントもしくは改変体に、5×10−2M、10−2M、5×l0−3M、l0−3M、5×10−4M、10−4M、5×10−5M、または10−5M以下の解離定数すなわちKで結合する。より好ましくは、本発明の抗体は、BLySポリペプチド、またはそれらのフラグメントもしくは改変体に、5×10−6M、10−6M、5×10−7M、10−75×10−8M、または10−8M以下の解離定数すなわちKで結合する。さらにより好ましくは、本発明の抗体は、BLySポリペプチド、またはそれらのフラグメントもしくは改変体に、5×l0−9M、l0−9M、5×10−10M、10−10M、5×10−11M、10−11M、5×10−12M、10−12M、5×−13M、l0−13M、5×10−14M、10−14M、5×l0−15M、もしくはl0−15M以下の解離定数すなわちKで結合する。本発明は、各々個体の列挙された値の間の範囲のいずれか1つの解離定数すなわちKでBLySポリペプチドに結合する抗体を含む。
特定の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチド、またはそれらのフラグメントもしくは改変体に、5×10−2−1、10−2−1、5×l0−3−1またはl0−3−1以下のオフ速度(off rate(koff))で結合する。より好ましくは、本発明の抗体は、BLySポリペプチド、またはそれらのフラグメントもしくは改変体に、5×10−4−1、10−4−1、5×10−5−1、または10−5−1、5×10−6−1、10−6−1、5×10−7−1または10−7−1以下のオフ速度(koff)で結合する。本発明は、各々個体の列挙された値の間の範囲のいずれか1つのオフ速度(koff)でBLySポリペプチドに結合する抗体を含む。
他の実施形態において、本発明の抗体は、BLySポリペプチド、またはそれらのフラグメントもしくは改変体に、10−1−1、5×10−1−1、10−1−1または5×10−1−1以上のオン速度(on rate (kon))で結合する。より好ましくは、本発明の抗体は、BLySポリペプチド、またはそれらのフラグメントもしくは改変体に、10−1−1、5×10−1−1、10−1−1、もしくは5×10−1−1または10−1−1以上のオン速度(kon)で結合する。本発明は、各々個体の列挙された値の間の範囲のいずれか1つのオン速度(kon)でBLySポリペプチドに結合する抗体を含む。
本発明はまた、本明細書中に記載される1つ以上の抗体と同じ1つ以上の生物学的特徴を有する抗体(抗体フラグメントもしくはそれらの改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)を含む。「生物学的特徴」によって、インビトロもしくはインビボにおける抗体の活性または特性(例えば、BLyS(例えば、BLySの可溶性形態、BLySの膜結合形態、BLySの可溶性形態および膜結合形態)、ならびに/または、BLySの抗原性領域および/もしくはエピトープ領域に結合する能力、実質的にBLyS/BLySレセプター(例えば、TACI−GenBank登録番号AAC51790および/またはBCMA−GenBank登録番号NP_001183)の結合をブロックする能力、あるいはBLyS介在生物学的活性(例えば、B細胞の増殖および免疫グロブリン産生の刺激)をブロックする能力)が意味される。必要に応じて、本発明の抗体は、本明細書中で特に言及された少なくとも1つの抗体と同じエピトープに結合する。このようなエピトープ結合は、当該分野で公知のアッセイを使用して慣習的に決定され得る。
本発明はまた、BLySまたはそのフラグメントを中和する抗体(それらの抗体フラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)を提供し、この抗体は、表1において参照されるscFvの一部(すなわち、VHドメイン、VLドメイン、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、もしくはVL CDR3)を含むかまたはそれからなり、より好ましくは、配列番号834〜872、1570〜1595、もしくは1886〜1908に含まれるアミノ酸配列を有し、そしてさらにより好ましくは、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569、または1881〜1885に含まれるアミノ酸配列またはそのフラグメントもしくは改変体を有する。「BLySまたはそのフラグメントを中和する」抗体によって、そのレセプター(例えば、TACIおよびBCMA)に結合するBLySの能力を減少または破壊して、B細胞の増殖を刺激し、B細胞による免疫グロブリン分泌を刺激し、および/またはBLySレセプターシグナル伝達カスケードを刺激する抗体が意味される。1つの実施形態において、BLySまたはそのフラグメントを中和する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVHドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の実施形態において、BLySまたはそのフラグメントを中和する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の実施形態において、BLySまたはそのフラグメントを中和する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVH CDRドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。好ましい実施形態において、BLySまたはそのフラグメントを中和する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVH CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の実施形態において、BLySまたはそのフラグメントを中和する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVL CDRドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の好ましい実施形態において、BLySまたはそのフラグメントを中和する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、もしくは1881〜1908に含まれるVL CDR3ドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。これらの抗体をコードする核酸もまた、本発明によって含まれる。
本発明はまた、例えば、実施例21および22、上記に記載されるアッセイのような当該分野で公知の方法によって決定されるように、BLyS介在B細胞増殖を阻害(すなわち、減少または破壊)する抗体(抗体フラグメントもしくはそれらの改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)を提供し、この抗体は、表1において参照される、配列番号834〜872、1570〜1595、または1886〜1908に含まれるアミノ酸配列を有するscFvの一部(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、もしくはVL CDR3)を含むかまたはそれからなり、そしてさらにより好ましくは、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569、もしくは1881〜1885に含まれるアミノ酸配列またはそのフラグメントもしくは改変体を有する。1つの実施形態において、BLyS介在B細胞増殖を阻害する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、もしくは1881〜1908に含まれるVHドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の実施形態において、BLyS介在B細胞増殖を阻害する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、もしくは1881〜1908に含まれるVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。好ましい実施形態において、BLyS介在B細胞増殖を阻害する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVH CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の好ましい実施形態において、BLyS介在B細胞増殖を阻害する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVL CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。これらの抗体をコードする核酸分子もまた、本発明によって含まれる。
本発明はまた、BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する抗体(それらの抗体フラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)を提供し、この抗体は、表1において参照される、配列番号834〜872、1570〜1595、または1886〜1908に含まれるアミノ酸配列を有するscFvの一部(すなわち、VHドメイン、VLドメイン、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、もしくはVL CDR3)を含むかまたはそれからなり、そして好ましくは、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569、または1881〜1885に含まれるアミノ酸配列、またはそのフラグメントもしくは改変体を有する。「BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する」抗体によって、そのレセプター(例えば、TACIまたはBCMA)に結合するBLySの能力を増加して、B細胞の増殖を刺激し、B細胞による免疫グロブリン分泌を刺激し、および/またはBLySレセプターシグナル伝達カスケードを刺激する抗体が意味される。1つの実施形態において、BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVHドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の実施形態において、BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の実施形態において、BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVH CDRドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。好ましい実施形態において、BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVH CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の実施形態において、BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVL CDRドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の好ましい実施形態において、BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVL CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。これらの抗体をコードする核酸分子もまた、本発明によって含まれる。
本発明はまた、例えば、実施例21および22、上記に記載されるアッセイのような当該分野で公知の方法によって決定されるように、BLyS介在B細胞増殖を刺激する抗体(それらの抗体フラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)を提供し、この抗体は、表1において参照される、配列番号834〜872、1570〜1595、もしくは1886〜1908に含まれるアミノ酸配列を有するscFvの一部(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、もしくはVL CDR3)を含むかまたはそれからなり、そしてさらにより好ましくは、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、1563〜1569、または1881〜1885に含まれるアミノ酸配列またはそのフラグメントもしくは改変体を有する。1つの実施形態において、BLyS介在B細胞増殖を刺激する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVHドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の実施形態において、BLyS介在B細胞増殖を刺激する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。好ましい実施形態において、BLyS介在B細胞増殖を刺激する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVH CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。別の好ましい実施形態において、BLyS介在B細胞増殖を刺激する抗体は、表1において開示される配列番号1〜46、321〜329、834〜872、1563〜1595、または1881〜1908に含まれるVL CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる。これらの抗体をコードする核酸分子もまた、本発明によって含まれる。
本発明はまた、BLyS、および異種ポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体(それらの抗体フラグメントもしくは改変体を含むか、またはそれらからなる分子を含む)を含むか、またはこれからなる融合タンパク質を提供する。好ましくは、抗体が融合されるこの異種ポリペプチドは、B細胞の機能のために有用であるか、またはB細胞に抗体を標的化するために有用である。代替的な好ましい実施形態において、抗体が融合される異種ポリペプチドは、単球細胞の機能のために有用であるか、または単球細胞に抗体を標的化するために有用である。別の実施形態において、抗体が融合される異種ポリペプチドは、アルブミン(組換えヒト血清アルブミンまたはそのフラグメントもしくは改変体(例えば、米国特許第5,876,969号、1999年3月2日発行、欧州特許第0 413 622号、および米国特許第5,766,883号、1998年6月16日発行(これらはその全体が参考として本明細書中に援用される)を参照のこと)が挙げられるが、これに限定されない)である。好ましい実施形態において、本発明の抗体(それらのフラグメントもしくは改変体を含む)は、ヒト血清アルブミンの成熟形態(すなわち、欧州特許第0 322 094号の図1および図2に示されるような、ヒト血清アルブミンのアミノ酸1〜585(これはその全体が本明細書中で参考として援用される))と融合される。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(それらのフラグメントもしくは改変体を含む)は、ヒト血清アルブミンのアミノ酸残基1〜x(ここで、xは、1〜585の整数であり、このアルブミンフラグメントは、ヒト血清アルブミン活性を有する)を含むかまたはこれらからなるポリペプチドフラグメントと融合される。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(それらのフラグメントもしくは改変体を含む)は、ヒト血清アルブミンのアミノ酸残基1〜z(米国特許5,766,883号(これはその全体が本明細書中で参考として援用される)に記載されるように、ここで、zは、369〜419の整数である)を含むかまたはこれらからなるポリペプチドフラグメントと融合される。本発明の抗体(それらのフラグメントもしくは改変体を含む)は、異種タンパク質(例えば、免疫グロブリンFcポリペプチドまたはヒト血清アルブミンポリペプチド)のN末端またはC末端のいずれかと融合され得る。
1つの実施形態において、本発明の融合タンパク質は、表1において言及されるVHドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列または表1において言及されるVLドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有するポリペプチドあるいはそのフラグメントもしくは改変体と、異種ポリペプチドとを含むかあるいはそれらからなる。別の実施形態において、本発明の融合タンパク質は、表1において言及されるVH CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、もしくはそれ以上のアミノ酸配列または表1において言及されるVL CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つもしくはそれ以上のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体と、異種ポリペプチド配列とを含むかあるいはそれらからなる。好ましい実施形態において、この融合タンパク質は、表1において言及されるVH CDR3のアミノ酸配列を有するポリペプチドあるいはそのフラグメントもしくは改変体と、異種ポリペプチド配列とを含むかまたはそれらからなり、この融合タンパク質は、BLySに免疫特異的に結合する。別の実施形態において、融合タンパク質は、表1において言及される少なくとも1つのVHドメインのアミノ酸配列と、表1において言及される少なくとも1つのVLドメインのアミノ酸配列を有するポリペプチドあるいはそのフラグメントもしくは改変体と、異種ポリペプチド配列とを含むかまたはそれらからなる。好ましくは、その融合タンパク質のVHドメインおよびVLドメインは、表1において言及される同じscFvに対応する。なお別の実施形態において、本発明の融合タンパク質は、表1において言及されるVH CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のアミノ酸配列、および表1において言及されるVL CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のアミノ酸配列を有するポリペプチドあるいはそのフラグメントもしくは改変体と、異種ポリペプチド配列とを含むかまたはそのポリペプチドからなる。好ましくは、そのVH CDRまたはVL CDRのいずれか1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、またはそれ以上は、表1において言及される同じscFvに対応する。これらの融合タンパク質をコードする核酸分子もまた、本発明により包含される。
本発明はまた、可溶性形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むかまたはそれからなる、分子を含む)、膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体、ならびに可溶性形態のBLySおよび膜結合形態のBLySの両方に免疫特異的に結合する抗体も提供する。
本発明の1つ実施形態において、可溶性形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むかまたはそれからなる、分子を含む)は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVHドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVLドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体(誘導体を含む)を含むかあるいはそれらからなる。好ましくは、抗体のVHドメインおよびVLドメインは、表1にて開示される同じscFvに対応する。別の実施形態において、可溶性形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体が提供され、その抗体は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVH CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVL CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体を含むかあるいはそれらからなる。好ましくは、その抗体のVH CDRおよびVL CDRのうちの2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、またはそれ以上は、表1にて開示される同じscFvに対応する。好ましい実施形態において、可溶性形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体が提供され、その抗体は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVH CDR3のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVL CDR3の任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれらからなる。好ましくは、その抗体のVHCDR3およびVLCDR3は、表1にて開示される同じscFvに対応する。これらの抗体をコードする核酸分子もまた、本発明により包含される。
本発明の別の実施形態において、膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むかまたはそれからなる、分子を含む)は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVHドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVLドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントまたは改変体(誘導体を含む)を含むかあるいはそれらからなる。好ましくは、抗体のVHドメインおよびVLドメインは、表1にて開示される同じscFvに対応する。別の実施形態において、膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体が提供され、その抗体は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVH CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、もしくはそれ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVL CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体を含むかあるいはそれらからなる。好ましくは、その抗体のVH CDRおよびVL CDRのうちの2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、またはそれ以上は、表1にて開示される同じscFvに対応する。好ましい実施形態において、膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体が提供され、その抗体は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVH CDR3のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVL CDR3のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれらからなる。好ましくは、その抗体のVHCDR3およびVLCDR3は、表1にて開示される同じscFvに対応する。これらの抗体をコードする核酸分子もまた、本発明により包含される。
本発明の別の実施形態において、可溶性形態および膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むかまたはそれからなる、分子を含む)は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVHドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVLドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれらからなる。好ましくは、その抗体のVHドメインおよびVLドメインは、表1にて開示される同じscFvに対応する。別の実施形態において、可溶性形態および膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体が提供され、その抗体は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVH CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVL CDRのうちの任意の1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体を含むかあるいはそれらからなる。好ましくは、その抗体のVH CDRおよびVL CDRのうちの2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、またはそれ以上は、表1にて開示される同じscFvに対応する。好ましい実施形態において、可溶性形態および膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する抗体が提供され、その抗体は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVH CDR3のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列、および/または表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVL CDR3のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体を含むかあるいはそれらからなる。好ましくは、その抗体のVHCDR3およびVLCDR3は、表1にて開示される同じscFvに対応する。
本発明はまた、BLySに免疫特異的に結合する抗体の混合物(scFv、およびその抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)を提供し、この混合物は、本発明の少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の抗体を有する。特に、本発明は、可溶性形態のBLyS、膜結合形態のBLyS、ならびに/または膜結合形態のBLySおよび可溶性形態のBLySの両方に免疫特異的に結合する、異なる抗体の混合物を提供する。特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する、少なくとも2個、好ましくは少なくとも4個、少なくとも6個、少なくとも8個、少なくとも10個、少なくとも12個、少なくとも15個、少なくとも20個、または少なくとも25個の異なる抗体の混合物を提供し、ここでその混合物のうちの少なくとも1個、少なくとも2個、少なくとも4個、少なくとも6個、または少なくとも10個の抗体が、本発明の抗体である。特定の実施形態において、その混合物の各抗体は、本発明の抗体である。
本発明はまた、BLySに免疫特異的に結合する抗体(scFv、およびその抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)の集団(panel)を提供し、この集団は、本発明の少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の異なる抗体を有する。特に、本発明は、可溶性形態のBLyS、膜結合形態のBLyS、ならびに/または膜結合形態のBLySおよび可溶性形態のBLySの両方に特異的に結合する、異なる抗体の集団を提供する。特定の実施形態において、本発明は、BLySについて異なる親和性を有する抗体、BLySについて異なる特異性を有する抗体、または異なる解離速度を有する抗体の集団を提供する。本発明は、少なくとも10個の抗体、好ましくは少なくとも25個の抗体、少なくとも50個の抗体、少なくとも75個の抗体、少なくとも100個の抗体、少なくとも125個の抗体、少なくとも150個の抗体、少なくとも175個の抗体、少なくとも200個の抗体、少なくとも250個の抗体、少なくとも300個の抗体、少なくとも350個の抗体、少なくとも400個の抗体、少なくとも450個の抗体、少なくとも500個の抗体、少なくとも550個の抗体、少なくとも600個の抗体、少なくとも650個の抗体、少なくとも700個の抗体、少なくとも750個の抗体、少なくとも800個の抗体、少なくとも850個の抗体、少なくとも900個の抗体、少なくとも950個の抗体、または少なくとも1000個の抗体の集団を提供する。抗体の集団は、例えば、ELISAのようなアッセイのための96ウェルプレートにて使用され得る。
本発明はさらに、1つ以上の抗体(scFv、およびその抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)を含むかまたはその抗体からなる、組成物を提供する。1つの実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVHドメインまたはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVH CDR1またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVH CDR2またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。好ましい実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVH CDR3またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。
本発明はさらに、1つ以上の抗体(scFv、およびその抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)を含む組成物を提供する。1つの実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVHドメインまたはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVH CDR1またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVH CDR2またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。好ましい実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVH CDR3またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。
本発明はさらに、1つ以上の抗体(scFv、およびその抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)を含む組成物を提供する。1つの実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVHドメインまたはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVH CDR1またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVH CDR2またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。好ましい実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVH CDR3またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。
1つ以上の抗体(scFv、および本発明の抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)を含む組成物を提供する本発明の他の実施形態が、以下に列挙される。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVLドメインまたはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVL CDR1またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVL CDR2またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。好ましい実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1563〜1880に含まれるVL CDR3またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。
1つ以上の抗体(scFv、および本発明の抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)を含む組成物を提供する本発明の他の実施形態が、以下に列挙される。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVLドメインまたはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVL CDR1またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVL CDR2またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。好ましい実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1881〜2128に含まれるVL CDR3またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。
1つ以上の抗体(scFv、および本発明の抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)を含む組成物を提供する本発明の他の実施形態が、以下に列挙される。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVLドメインまたはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVL CDR1またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVL CDR2またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。別の実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示される配列番号1〜1562に含まれるVL CDR3またはその改変体のうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含む。
好ましい実施形態において、本発明の組成物は、表1にて開示されるVHドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列またはその改変体、および表1にて開示されるVLドメインのうちの任意の1つ以上のアミノ酸配列またはその改変体を有する、ポリペプチドを含むかまたはそのポリペプチドからなる、1個、2個、3個、4個、5個、またはそれ以上の抗体を含み、そのVHドメインおよびVLドメインは、同じ特異性を有するscFvに由来する(すなわち、可溶性BLySに結合するscFv(配列番号1563〜1880)に由来する)か、膜結合性BLySに結合するscFv(配列番号1881〜2128)に由来するか、または可溶性BLySおよび膜結合性BLySの両方に結合するscFv(配列番号1〜1562)に由来する。好ましい実施形態において、本発明は、抗体を提供し、そのVH CDRX(ここで、X=1、2、または3)およびVL CDRY(ここで、Y=1,2、または3)は、同じ特異性を有するscFvに由来する(すなわち、可溶性BLySに結合するscFv(配列番号1563〜1880)に由来するか、膜結合性BLySに結合するscFv(配列番号1881〜2128)に由来するか、または可溶性BLySおよび膜結合性BLySの両方に結合するscFv(配列番号1〜1562)に由来する。なお別の実施形態において、本発明の組成物は、1つ以上の融合タンパク質を含む。
以下にさらに詳細に議論するように、本発明の組成物は、単独かまたは他の組成物と組み合わせるかのいずれかで使用され得る。この抗体(scFv、および本発明の抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)はさらに、N末端またはC末端にて異種タンパク質と組換え的に融合され得るか、またはポリペプチドもしくは他の組成物と化学的に結合(共有結合による結合および非共有結合による結合を含む)される。例えば、本発明の抗体は、検出アッセイで標識およびエフェクター分子(例えば、異種ポリペプチド、薬物、放射性核種または毒素)として有用な分子と組換え的に、融合され得るかまたは結合され得る。例えば、PCT公開WO 92/08495;同WO 91/14438;同WO 89/12624;米国特許第5,314,995号およびEP396,387を参照のこと。
本発明の抗体(scFv、および本発明の抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)は、例えば、以下のために使用され得るが、これらに限定されない:BLySを精製すること、およびBLySを検出すること、ならびに本発明のポリペプチドを膜結合性BLySまたはBLySレセプターを発現する細胞に対して標的化すること(インビトロおよびインビボでの診断方法および治療方法の両方を含む)。例えば、抗体は、生物学的サンプル中のBLySレベルを定性的に測定するための免疫アッセイおよび定量的に測定するための免疫アッセイにおける用途を有する。例えば、Harlowら、Antibodies:A Laboratory Manual、(Cold Spring Harbor Laboratory Press、第2版、1988)を参照のこと(これは、本明細書中にて全体が参考として援用される)。
(抗体作製方法)
本発明の抗体(scFv、および本発明の抗体フラグメントもしくは改変体を含むかまたはそれからなる他の分子を含む)は、抗体の合成のために当該分野で公知の任意の方法、特に化学合成、または好ましくは組換え発現技術によって、作製され得る。
表1に開示される単鎖Fvは、当該分野で公知のファージディスプレイ法を使用して生成された。さらに、BLySに免疫特異的に結合する他のscFvが、当該分野で公知のファージディスプレイ法を使用して生成され得る。ファージディスプレイ法において、機能的抗体ドメインは、これらをコードするポリヌクレオチド配列を保持するファージ粒子の表面に提示される。特に、VHドメインおよびVLドメインをコードするDNA配列は、動物cDNAライブラリー(例えば、ヒトまたはマウスの、リンパ組織のcDNAライブラリー)または化学合成cDNAライブラリーから増幅される。VHドメインおよびVLドメインをコードするDNAは、PCRによってscFvリンカーで共に結合され、ファージミドベクター(例えば、pCANTAB6またはpComb 3 HSS)中へクローン化される。このベクターは、E.coli中にエレクトロポレートされ、そしてこのE.coliはヘルパーファージに感染させられる。これらの方法で使用されるファージは、代表的には、fdおよびM13を含む線状ファージであり、そしてVHドメインおよびVLドメインは、通常、ファージ遺伝子IIIまたはファージ遺伝子VIIIのいずれかに組換え的に融合される。目的の抗原(すなわち、BLySまたはそのフラグメント)に結合する抗原結合ドメインを発現するファージは、抗原を用いて(例えば、標識された抗原または固体表面もしくはビーズに結合もしくは捕捉された抗原を使用して)選択または同定される。本発明の抗体を作製するのに使用し得るファージディスプレイ法の例としては、以下に開示された方法が挙げられるが、これらに限定されない:Brinkmanら、J.Immunol.Methods 182:41−50(1995);Amesら、J.Immunol.Methods 184:177−186(1995);Kettleborough ら、Eur.J.Immunol.24:952−958(1994);Persicら、Gene 187 9−18(1997);Burtonら、Advances in Immunology 57:191−280(1994);PCT出願番号PCT/GB91/O1 134;PCT公開WO 90/02809;PCT公開WO 91/10737;PCT公開WO 92/01047;PCT公開WO 92/18619;PCT公開WO 93/1 1236;PCT公開WO 95/15982;PCT公開WO 95/20401;PCT公開WO97/13844;ならびに米国特許第5,698,426号;同第5,223,409号;同第5,403,484号;同第5,580,717号;同第5,427,908号;同第5,750,753号;同第5,821,047号;同第5,571,698号;同第5,427,908号;同第5,516,637号;同第5,780,225号;同第5,658,727号;同第5,733,743および5,969,108号;(これらの各々は、全体が参考として本明細書中で援用される)。
上の参考文献に記載されたように、ファージ選択後、このファージ由来の抗体コード領域は、以下に記載されるように、単離され得、そして抗体(ヒト抗体を含む)全体または他の任意の所望される抗原結合フラグメントを生成するために使用され得、そして所望される任意の宿主(例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、植物細胞、酵母、細菌を含む)の中で発現され得る。Fabフラグメント、Fab’フラグメントおよびF(ab’)2フラグメントを組換え的に生成するための技術はまた、以下に開示されるような当該分野で公知の方法を用いて使用され得る:PCT公開WO 92/22324;Mullinaxら、BioTechniques 12(6):864−869(1992);Sawaiら、AJRI 34:26−34(1995);およびBetterら、Science 240:1041−1043(1988)(上記の参考文献は、全体が参考として援用される)。
抗体全体を生成するために、VHヌクレオチド配列またはVLヌクレオチド配列と、制限部位と、これらの制限部位を保護するための隣接配列とを含む、PCRプライマーが、scFvクローン中のVH配列またはVL配列を増幅するために使用され得る。当業者に公知のクローニング技術を使用して、このPCR増幅されたVHドメインは、VH定常領域(例えば、ヒトγ4定常領域)を発現するベクター中にクローニングされ得、そしてこのPCR増幅されたVLドメインは、VL定常領域(例えば、ヒトκ定常領域またはヒトλ定常領域)発現するベクター中にクローニングされ得る。好ましくは、VHドメインまたはVLドメインを発現するベクターは、選択した発現系の中で重鎖および軽鎖の発現を指向するのに適切なプロモーター、分泌シグナル、免疫グロブリン可変ドメインのためのクローニング部位、免疫グロブリン定常ドメイン、およびネオマイシンのような選択マーカーを含む。VHドメインおよびVLドメインはまた、必要な定常ドメインを発現する1つのベクター中にクローニングされ得る。次いで、重鎖変換ベクターおよび軽鎖変換ベクターは、当業者に公知の技術を使用して、全長抗体(例えば、IgG)を発現する安定細胞株または一過性細胞株を生成するために、細胞株中に同時トランスフェクトされる。
本発明のscFvのVHドメインおよびVLドメインを含む、抗体を発現する細胞株は、表2に列挙された日付に、American Type Culture Collection(「ATCC」)に寄託され、そして表2にて同定されるATCC受託番号が与えられた。このATCCは、10801 University Boulevard,Manassas,VA 20110−2209,USAに位置する。このATCC寄託は、特許手続き上の微生物の寄託についての国際的承認に関するブタベスト条約の規約に準拠してなされた。
Figure 2009095346
従って、1つの実施形態において、本発明は、本発明のscFvのVHドメインおよびVLドメインを含む抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明の抗体は、細胞株NSO−B11−15によって発現される抗体である。
好ましい実施形態において、本発明の抗体は、細胞株NSO−抗BLyS−6D08−18によって発現される抗体である。
好ましい実施形態において、本発明の抗体は、細胞株NSO−抗BLyS−116A01−60によって発現される抗体である。
好ましい実施形態において、本発明の抗体は、細胞株IO26C04Kによって発現される抗体である。
好ましい実施形態において、本発明の抗体は、細胞株IO50A12によって発現される抗体である。
好ましい実施形態において、本発明の抗体は、細胞株NSO−B11によって発現される抗体である。
他の好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを競合的に阻害する抗体を提供する。好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)を含む抗体または改変体の、BLySポリペプチドに対する結合を、競合阻害アッセイにおいて1%と10%との間だけ減少させる抗体を提供する。好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体のBLySポリペプチドに対する結合を、競合阻害アッセイにおいて1%と10%との間だけ減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて少なくとも10%から20%まで減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて少なくとも20%から30%まで減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて少なくとも30%から40%まで減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて少なくとも40%から50%まで減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて少なくとも50%から60%まで減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて少なくとも60%から70%まで減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて少なくとも70%から80%まで減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて少なくとも80%から90%まで減少させる抗体を提供する。
好ましい実施形態において、本発明は、表1に言及されるscFvの、フラグメント(例えば、VHドメイン、VLドメイン、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、またはVLCDR3)または改変体を含む抗体がBLySポリペプチドに結合することを、競合阻害アッセイにおいて90%から100%まで減少させる抗体を提供する。
他の好ましい実施形態において、本発明は、ATCC受託番号PTA−3238を有する細胞株によって産生された抗体の、BLySポリペプチドに対する結合を競合的に阻害する抗体を提供する。
他の好ましい実施形態において、本発明は、ATCC受託番号PTA−3239を有する細胞株によって産生された抗体の、BLySポリペプチドに対する結合を競合的に阻害する抗体を提供する。
他の好ましい実施形態において、本発明は、ATCC受託番号PTA−3240を有する細胞株によって産生された抗体の、BLySポリペプチドに対する結合を競合的に阻害する抗体を提供する。
他の好ましい実施形態において、本発明は、ATCC受託番号PTA−3241を有する細胞株によって産生された抗体の、BLySポリペプチドに対する結合を競合的に阻害する抗体を提供する。
他の好ましい実施形態において、本発明は、ATCC受託番号PTA−3242を有する細胞株によって産生された抗体の、BLySポリペプチドに対する結合を競合的に阻害する抗体を提供する。
他の好ましい実施形態において、本発明は、ATCC受託番号PTA−3243を有する細胞株によって産生された抗体の、BLySポリペプチドに対する結合を競合的に阻害する抗体を提供する。
ヒトにおける抗体のインビボでの使用およびインビトロでの検出アッセイを含む、いくつかの使用について、ヒト抗体またはキメラ抗体を使用することは好ましくあり得る。完全ヒト抗体が、ヒト患者の治療用途について特に望ましい。また、米国特許第4,444,887号および同第4,716,111号;ならびにPCT公開WO 98/46645、同WO 98/50433、同WO 98/24893、同WO98/16654、同WO 96/34096、同WO 96/33735、および同WO 91/10741(これらの各々は、本明細書中で全体が参考として援用される)を参照のこと。特定の実施形態において、本発明の抗体は、本発明のヒトscFvに対応する1つ以上のVHドメインおよびVLドメインおよび別の免疫グロブリン分子(好ましくはヒト免疫グロブリン分子)由来のフレームワーク領域を含む。特定の実施形態において、本発明の抗体は、本発明のヒトscFvに対応する1つ以上のCDRおよび別の免疫グロブリン分子(好ましくはヒト免疫グロブリン分子)由来のフレームワーク領域を含む。他の実施形態において、本発明の抗体は、表1に言及されたヒトscFvまたはそれらのフラグメントもしくは改変体の1つ以上に対応する、1個、2個、3個、4個、5個、6個、またはそれ以上のVL CDRもしくはVH CDRならびにヒト免疫グロブリン分子由来のフレームワーク領域(および、必要に応じて 表1のscFv由来ではないCDR)を含む。好ましい実施形態において、本発明の抗体は、表1に言及される、同じscFvもしくは異なるscFvまたはそれらのフラグメントもしくは改変体に対応する、VH CDR3、VL CDR3、または両方と、ヒト免疫グロブリンフレームワーク領域とを含む。
キメラ抗体は、その抗体の異なった部分が異なる免疫グロブリン分子に由来する分子(例えば、ヒト抗体由来の可変領域および非ヒト免疫グロブリン定常領域を有する抗体)である。キメラ抗体の生成方法は、当該分野で公知である。例えば、Morrison、Science 229:1202(1985);Oiら、BioTechniques 4:214(1986);Gilliesら、J.Immunol.Methods 125:191−202(1989);米国特許第5,807,715号;同第4,816,567号および同第4,816,397号(これらは、本明細書中で全体が参考として援用される)を参照のこと。ヒト種由来の1つ以上のCDRおよび非ヒト免疫グロブリン分子由来のフレームワーク領域(例えば、イヌ免疫グロブリン分子またはネコ免疫グロブリン分子由来のフレームワーク領域)を含むキメラ抗体は、例えば、以下を含む当該分野で公知である種々の技術を使用して、作製され得る:CDR−グラフティング(CDR−grafting)(EP 239,400;PCT公開WO 91/09967;米国特許第5,225,539号;同第5,530,101号;および同第5,585,089号)、ベニアリング(veneering)またはリサーフェシング(resurfacing)(EP 592,106;EP 519,596;Padlan,Molecular Immunology 28(4/5):489−498(1991);Studnickaら、Protein Engineering 7(6):805−814(1994);Roguskaら、PNAS 91:969−973(1994)),およびチェーンシャッフリング(Chain shuffling)(米国特許第5,565,332号)。好ましい実施形態において、キメラ抗体は、表1に言及されるVH CDR3またはVL CDR3のいずれか1つのアミノ酸配列、またはそれらの改変体を有するヒトCDR3と、表1で開示された対応するscFvのフレームワークの領域とは異なる非ヒトフレームワーク領域またはヒトフレームワーク領域とを含む。しばしば、フレームワーク領域中のフレームワーク残基は、抗原結合を変更するため、好ましくはこれを改善するために、CDRドナー抗体からの対応する残基で置換される。これらのフレームワーク置換は、当該分野で周知の方法(例えば、抗原結合にとって重要なフレームワーク残基を同定するためにCDRとフレームワーク残基との相互作用をモデリングすることおよび特定の位置の異常なフレームワーク残基を同定するための配列比較)によって同定される(例えば、Queenら、米国特許第5,585,089;Riechmannら、Nature 332:323(1988)(これらは、本明細書中で全体が参考として援用される)を参照のこと)。
さらに、本発明の抗体は、順次、当業者に周知の方法を使用して、BLySポリペプチドを「模倣する」抗イディオタイプ抗体を作製するために使用され得る(例えば、GreenspanおよびBona、FASEB J.7(5):437−444(1993);ならびにNissinoff、J.Immunol.147(8):2429−2438(1991)を参照のこと)。例えば、BLySに結合し、(例えば、以下に開示されるような当該分野で周知のアッセイで決定されるように)BLySレセプターのBLySの結合を競合的に阻害する、本発明の抗体は、抗イディオタイプ抗体を生成するために使用され得、この抗イディオタイプ抗体は、BLySリガンド/レセプター結合ドメインを「模倣」し、結果として、BLySレセプター(例えば、TACI、BCMA、およびTR20)に結合し、そしてこのBLySレセプターを中和する。このような中和抗イディオタイプ(抗体フラグメントまたは改変体(例えば、抗イディオタイプのFabフラグメント)を含むか、またはこれらからなる分子を含む)は、BLySを中和するための治療レジメンに使用され得る。例えば、このような抗イディオタイプ抗体は、BLySリガンド/レセプターに結合し、それによって、BLyS媒介性生物学的活性をブロックするために使用され得る。あるいは、BLyS結合ドメインを「模倣する」抗イディオタイプは、BLySレセプターに結合し得、そしてBLySレセプター媒介性シグナル伝達を誘導し得る(例えば、活性化T細胞の核因子(NF−AT)、核因子−κB(NF−κB)、および/またはAP−1の活性化)。このようなアゴニスト抗イディオタイプ(これらの抗イディオタイプのアゴニストFabフラグメントを含む)は、BLySレセプター媒介性シグナル伝達を誘導または増大するための治療レジメンに使用され得る。例えば、このような抗イディオタイプ抗体は、BLySリガンド/レセプターに結合し、そしてこれによって、BLyS媒介性生物学的活性(例えば、B細胞増殖および/または免疫グロブリン産生)を刺激するのに使用され得る。
一旦、本発明の抗体分子(抗体フラグメントもしくはその改変体を含むかまたはそれからなる、分子を含む)が、キメラとして合成されるか、または組換え的に発現されると、これは、免疫グロブリン(またより一般的にはタンパク質分子)の精製についての当該分野で公知の任意の方法(例えば、クロマトグラフィー(例えば、イオン交換クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー(特にプロテインA対して特異的な抗原についての親和性)、およびサイズ分画カラムクロマトグラフィー)、遠心分離、溶解度差(differential solubility))によってか、またはタンパク質を精製するための他の標準的な任意の技術で精製され得る。さらに、本発明の抗体は、本明細書で記載される異種ポリペプチド配列または、さもなければ、当該分野で公知である異種ポリペプチド配列に融合され得、精製を容易にし得る。
(抗体をコードするポリヌクレオチド)
本発明はさらに、本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むかまたはこれらからなる分子を含む)をコードするヌクレオチド配列を含むかまたはこれからなるポリヌクレオチドを提供する。本発明はまた、高いストリンジェントな条件下あるいは中程度またはより低いストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件下で(例えば、上記のような)、本発明の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体をコードするポリヌクレオチド配列を有する核酸の相補的なポリヌクレオチドに対してハイブリダイズするポリヌクレオチドを含む。
当該分野で公知の任意の方法によって、これらのポリヌクレオチドが得られ得、そしてこれらポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が、決定され得る。scFv抗体、ならびにそのVHドメイン、VLドメインおよびCDRのアミノ酸配列は既知であるので(表1に記載される)、これらの抗体をコードするヌクレオチド配列は、当該分野で周知の方法を使用して、決定され得る。すなわち、特定のアミノ酸をコードすることが知られているヌクレオチドコドンが、本発明の抗体をコードする核酸を生成するような様式で構築される。この抗体をコードするポリヌクレオチドは、化学的に合成されたオリゴヌクレオチドから構築され得(例えば、Kutmeierら、BioTechniques 17:242(1994)に記載されるように)、これは、手短に言えば、抗体をコードする配列の部分を含むオーバーラップするヌクレオチドの合成、それらのオリゴヌクレオチドのアニーリングおよび連結、ならびに次いでPCRによるこの連結されたオリゴヌクレオチドの増幅を含む。
あるいは、抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むかまたはこれらからなる分子を含む)をコードするポリヌクレオチドは、適切な供給源からの核酸から作製され得る。特定の抗体をコードする核酸を含むクローンは入手不可能だが、その抗体分子の配列が既知である場合、免疫グロブリンをコードする核酸は、化学的に合成され得るか、あるいは適切な供給源(例えば、抗体cDNAライブラリー、または抗体を発現する任意の組織もしくは細胞(例えば、本発明の抗体の発現のために選択されたハイブリドーマ細胞)から生成されたcDNAライブラリー、またはそれから単離された核酸(好ましくはポリA+RNA))を、例えば、抗体をコードするcDNAライブラリーからのcDNAクローンを同定するために、その配列の3’末端および5’末端にハイブリダイズ可能な合成プライマーを使用するPCR増幅によって、またはその特定の遺伝子配列に特異的なオリゴヌクレオチドプローブを使用するクローニングによって得られ得る。PCRによって作製された増幅された核酸は、次いで、当該分野で周知の任意の方法を用いて、複製可能なクローニングベクターにクローニングされ得る。
一旦、抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むかまたはこれらからなる分子を含む)のヌクレオチド配列が決定されると、抗体のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列の操作について当該分野で周知の方法(例えば、組換えDNA技術、部位指向性変異誘発、PCRなど(例えば、Sambrookら、1990,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,第2版、Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NYおよびAusubelら編、1998,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley&Sons,NYに記載の技術を参照のこと。これらは両方がその全体において本明細書に参考として援用される。))を用いて操作され、例えば、アミノ酸の置換、欠失、および/または挿入を生成するように異なるアミノ酸配列を有する抗体を作製し得る。
特定の実施形態では、表1を参照されるVHおよびVLドメイン、またはそれらのフラグメントもしくは改変体の1つ以上が、当該分野で公知の組換えDNA技術を使用して、フレームワーク領域内に挿入され得る。特定の実施形態において、表1に参照されるCDR、またはそれらのフラグメントもしくは改変体の1、2、3、4、5、6以上が、当該分野で公知の組換えDNA技術を使用して、フレームワーク領域内に挿入され得る。このフレームワーク領域は、天然に存在、または共通するフレームワーク領域であり得、そして好ましくはヒトフレームワーク領域であり得る(ヒトフレームワーク領域の一覧については、例えばChothiaら、J.Mol.Biol.278:457−479(1998)(この内容は、本明細書中でその全体が参考として援用される)を参照のこと)。好ましくは、フレームワーク領域およびCDRの組合せによって生成するポリヌクレオチドは、BLySに特異的に結合する抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むかまたはこれらからなる分子を含む)をコードする。好ましくは、上で考察したように、一つ以上のアミノ酸の置換を有する抗体の改変体または抗体フラグメントをコードするポリヌクレオチドが、フレームワーク領域内で起こり、そして好ましくは、このアミノ酸置換は、その抗原への抗体の結合を改善する。さらに、このような方法は、アミノ酸置換させるため、または鎖内ジスルフィド結合に関与している一つ以上の可変領域システイン残基を欠失させて、一つ以上の鎖内ジスルフィド結合が欠けた抗体分子または抗体フラグメントもしくは改変体を生成させるために、使用され得る。ポリペプチドに対する他の改変は、本発明に含まれ、そして当該分野の技術によって達成される。
(抗体の組換え発現)
本発明の抗体(scFvおよびその抗体フラグメントまたは改変体(例えば、本発明の抗体の重鎖もしくは軽鎖またはそれらの一部、あるいは本発明の一本鎖抗体)を含むかまたはこれらからなる他の分子を含む組換え発現は、抗体をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターの構築を必要とする。本発明の抗体分子(例えば、抗体全体、抗体の重鎖もしくは軽鎖、またはこれらの一部(好ましくは重鎖もしくは軽鎖の可変ドメインを含む))(しかし、必ずしも含むわけではない)をコードするポリヌクレオチドが一旦得られれば、抗体分子の産生のためのベクターは、当該分野で周知の技術を使用する組換えDNA技術によって産生され得る。従って、ヌクレオチド配列をコードする抗体を含むポリヌクレオチドの発現によってタンパク質を調製するための方法は、本明細書中に記載される。当業者に周知の方法は、抗体コード配列ならびに適切な転写および翻訳制御シグナルを含む発現ベクターを構築するために使用され得る。これらの方法は、例えば、インビトロ組換えDNA技術、合成技術、およびインビボ遺伝子組換えを含む。従って、本発明は、プロモーターに作動可能に連結された、本発明の抗体分子(例えば、抗体全体、抗体の重鎖または軽鎖、抗体の重鎖可変ドメインもしくは軽鎖可変ドメインまたはそれらの一部、あるいは重鎖CDRまたは軽鎖CDR、単鎖Fv、またはそのフラグメントもしくは改変体)をコードするヌクレオチド配列を含む複製可能なベクターを提供する。このようなベクターは、抗体分子の定常領域をコードするヌクレオチド配列を含み得(例えば、PCT国際公開第WO 86/05807号;PCT国際公開第WO 89/01036;および米国特許第5,122,464号(この内容は、本明細書中でその全体が参考として援用される)を参照のこと)、そして、この抗体の可変ドメインは、重鎖の全体、軽鎖の全体、または重鎖および軽鎖の両方の発現のためにこのようなベクター内にクローニングされ得る。
発現ベクターは、従来の技術によって宿主細胞に移入され、次いでトランスフェクト細胞は、従来の技術によって本発明の抗体を産生するために培養される。従って、本発明は、異種のプロモーターに作動可能に連結された、本発明の抗体(例えば、抗体全体、その重鎖または軽鎖、もしくはそれらの一部、もしくは本発明の単鎖抗体、あるいはそれらのフラグメントまたは改変体)をコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞を含む。抗体分子全体の発現のための好ましい実施形態では、重鎖および軽鎖の両方をコードするベクターは、下記に詳細に記載したように、免疫グロブリン分子全体の発現のための宿主細胞において同時発現され得る。
種々の宿主発現ベクター系は、本発明の抗体分子を発現させるために利用され得る。このような宿主発現系は、目的のコード配列が産生され、かつ続いて精製され得るビヒクルを表わすが、また、適切なヌクレオチドをコードする配列で形質転換またはトランスフェクトされる場合に、インサイチュで本発明の抗体分子を発現し得る細胞を表わす。これらには、以下が挙げられるが、これらに限定されない:抗体をコードする配列を含む組換えバクテリオファージDNA発現ベクター、プラスミドDNA発現ベクターまたはコスミドDNA発現ベクターを用いて形質転換された細菌(例えば、E.coli、B.subtilis)のような微生物;抗体をコードする配列を含む組換え酵母発現ベクターで形質転換された酵母(例えば、Saccharomyces、Pichia);抗体をコードする配列を含む組換えウイルス発現ベクター(例えば、バキュロウイルス)に感染した昆虫細胞系;組換えウイルス発現ベクター(例えば、カリフラワーモザイクウイルス、CaMV;タバコモザイクウイルス、TMV)に感染した植物細胞系または抗体をコードする配列を含む組換えプラスミド発現ベクター(例えば、Tiプラスミド)で形質転換された植物細胞系;あるいは哺乳動物細胞のゲノムに由来するプロモーター(例えば、メタロチオネインプロモーター)または哺乳動物のウイルスに由来するプロモーター(例えば、アデノウイルス後期プロモーター;ワクシニアウイルス7.5Kプロモーター)を含む組換え発現構築物を保有する哺乳動物細胞系(例えば、COS、CHO、BHK、293、3T3細胞)。好ましくは、Escherichia coliのような細菌細胞、そしてより好ましくは、特に、組換え抗体分子全体の発現のために真核生物細胞が、組換え抗体分子の発現のために使用される。例えば、ヒトサイトメガロウイルス由来の主要最初期遺伝子プロモーターエレメントのようなベクターと組み合わされた、チャイニーズハムスターの卵巣細胞(CHO)のような哺乳動物細胞が、抗体のための効果的な発現系である(Foeckingら、Gene 45:101(1986);Cockettら、Bio/Technology 8:2(1990))。
細菌系において、多くの発現ベクターが、抗体分子の発現を意図する使用に依存して有利に選択され得る。例えば、多量のこのようなタンパク質が産生される場合、抗体分子の薬学的組成物の生成のために、容易に精製される融合タンパク質産物の高レベルの発現を指向するベクターが所望され得る。このようなベクターには、以下が挙げられるが、これらに限定されない:抗体をコードする配列がlacZをコードする領域と共にベクターにインフレーム(in frame)で個別に連結され得、その結果、融合タンパク質が産生されるE.coli発現ベクターpUR278(Rutherら、EMBO J.2:1791(1983));pINベクター(Inouye&Inouye、Nucleic Acids Res.13:3101−3109(1985);Van Heeke&Schuster、J.Biol.Chem.24:5503−5509(1989))など。pGEXベクターもまた、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)との融合タンパク質として、外来性ポリペプチドを発現させるために使用され得る。一般に、このような融合タンパク質は可溶性であり、そして溶解した細胞から、マトリックスグルタチオン−アガロースビーズへの吸着および結合、それに続く遊離グルタチオン存在化での溶出によって容易に精製され得る。このpGEXベクターは、トロンビンまたはXa因子プロテアーゼ切断部位を含むように設計され、その結果、このクローニングされた標的遺伝子産物は、GST部分から放出され得る。
昆虫系においては、Autographa californica核多角体病ウィルス(AcNPV)は、異種遺伝子を発現するためのベクターとして使用され得る。このウイルスは、Spodoptera frugiperda細胞において増殖する。抗体をコードする配列は、このウイルスの非必須の領域(例えばポリヘドリン遺伝子)に個々にクローニングされ得、そしてAcNPVプロモーター(例えばポリヘドリンプロモーター)の制御下に配置され得る。
哺乳動物宿主細胞においては、多数のウイルスに基づく発現系が利用され得る。アデノウイルスが発現ベクターとして使用される場合においては、目的の抗体をコードする配列は、アデノウイルスの転写/翻訳制御複合体、例えば後期プロモーターおよび3つの部分に分かれるリーダー配列、に連結され得る。次いで、このキメラ遺伝子は、インビトロまたはインビボでの組換えによって、アデノウィルスゲノムに挿入され得る。ウイルスのゲノムの非必須領域(例えば、E1またはE3領域)における挿入は、生存可能で、感染した宿主において抗体分子を発現する能力のある組換えウイルスを生じる(例えば、Logan&Shenk、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:355−359(1984)を参照のこと)。特異的開始シグナルはまた、挿入された抗体をコードする配列の効率的な翻訳のために必要とされ得る。これらのシグナルは、ATG開始コドンおよび隣接する配列を含む。さらに、この開始コドンは、挿入部分全体の翻訳を確実にするために、所望されるコード配列のリーディングフレーム(reading frame)と相が同じでなければならない。これらの外因性翻訳制御シグナルおよび開始コドンは、種々の起源、天然および合成の両方であり得る。発現の効率は、適切な転写エンハンサーエレメント、転写ターミネーター、などの含有によって高められ得る(Bittnerら、Methods in Enzymol.153:51−544(1987)を参照のこと)。
さらに、宿主細胞系統は、選択され得、これは挿入配列の発現を調節し、または、所望される特異的な様式で遺伝子産物を改変し、そしてプロセシングする。タンパク質産物のこのような改変(例えばグリコシル化)およびプロセシング(例えば切断)は、タンパク質の機能のために重要であり得る。異なる宿主細胞は、タンパク質および遺伝子産物の、翻訳後プロセシングおよび改変のための、特徴的で特異的な機構を有する。適切な細胞株または宿主系は、発現された外来タンパク質の正確な改変およびプロセシングを確実にするように選択され得る。この目的のために、遺伝子産物の、第一の転写、グリコシル化、およびリン酸化の正確なプロセシングのための細胞機構を有する、真核生物宿主細胞が、使用され得る。このような哺乳動物宿主細胞は、CHO、VERY、BHK、Hela、COS、MDCK、293、3T3、WI38、そして特に、例えば、BT483、Hs578T、HTB2、BT2OおよびT47Dのような乳癌細胞株、ならびに、例えば、CRL7O3OおよびHs578Bstのような正常な乳腺細胞株を含むが、これらに限定されない。
組換えタンパク質の長期間の高収率産生、安定発現が好ましい。例えば、安定に抗体分子を発現する細胞株が操作され得る。ウイルスの複製起点を含む発現ベクターを使用するよりも、宿主細胞は、適切な発現制御エレメント(例えば、プロモーター、エンハンサー、配列、転写ターミネーター、ポリアデニル化部位、など)、および選択マーカーによって制御されるDNAで形質転換され得る。外来DNAの導入に続いて、操作された細胞は、1〜2日間富化培地で増殖させられ得、次いで、選択培地に切り替えられる。組換えプラスミドにおける選択マーカーは、選択に対する耐性を与え、そして細胞が、プラスミドをその染色体内に安定に組み込み、そして増殖して、細胞増殖巣を形成し、これを今度はクローニングし得、細胞株に拡大され得ることを可能にする。この方法は、抗体分子を発現する細胞株を操作するために、有利に使用され得る。このような操作された細胞株は、直接的または間接的に抗体分子と相互作用する化合物のスクリーニングおよび評価において、特に有用であり得る。
多数の選択系が使用され得、この選択系は、単純ヘルペスウィルスチミジンキナーゼ(Wiglerら、Cell 11:223(1977))、ヒポキサンチン−グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(Szybalska&Szybalski、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 48:202(1992))、およびアデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(Lowyら、Cell 22:817(1980))の遺伝子を含むが限定されず、これらの遺伝子は、tk−、hgprt−またはaprt−細胞においてそれぞれ使用され得る。また、代謝拮抗物質耐性は、以下の遺伝子の選択の根拠として使用され得る:dhfr、これはメトトレキサートに対する耐性を与える(Wiglerら、Natl.Acad.Sci.USA 77:357(1980);O’Hareら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:1527(1981));gpt、これはミコフェノール酸に対する耐性を与える(Mulligan&Berg、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:2072(1981));neo、これはアミノグリコシドG−418に対する耐性を与える(Clinical Pharmacy 12:488−505;Wu and Wu、Biotherapy 3:87−95(1991);Tolstoshev、Ann.Rev.Pharmacol.Toxicol. 32:573−596(1993);Mulligan、Science 260:926−932(1993);およびMorgan and Anderson、Ann.Rev.Biochem.62:191−217(1993);TIB TECH 11(5):155−215)(May、1993年);ならびにhygro、これはハイグロマイシンに対する耐性を与える(Santerreら、Gene 30:147(1984))。組換えDNA技術の分野で周知の方法は、所望の組換えクローンを選択するために、慣用的に適用され得、そしてこのような方法は、以下に記載されている:例えば、Ausubelら(編)、Current Protocols in Molecular Biology、John Wiley&Sons、NY(1993);Kriegler、Gene Transfer and Expression、A Laboratory Manual、Stockton Press、NY(1990);ならびに12章および13章、Dracopoliら(編)、Current Protocols in Human Genetics、John Wiley&Sons、NY(1994);Colberre−Garapinら、J.Mol.Biol. 150:1(1981)(これらはその全体が本明細書中に参考として援用される)。
抗体分子の発現レベルは、ベクター増幅によって増大され得る(総説として、BebbingtonおよびHentschel、The use of vectors based on gene amplification for the expression of cloned genes in mammalian cells in DNA cloning、Vol.3.(Academic Press、New York、1987)を参照のこと)。抗体を発現するベクター系におけるマーカーが、増幅可能であると、宿主細胞の培養物に存在するインヒビターのレベルにおける増加は、マーカー遺伝子のコピーの数を増加する。増幅領域は抗体遺伝子と結合しているので、抗体の産生もまた増加する(Crouseら、Mol.Cell.Biol.3:257(1983))。
宿主細胞は、本発明の二つの発現ベクター(重鎖由来のポリペプチドをコードする第一のベクターおよび軽鎖由来のポリペプチドをコードする第二のベクター)で、同時トランスフェクトされ得る。この二つのベクターは、重鎖および軽鎖のポリペプチドの等しい発現を可能にする、同一の選択マーカーを含み得る。あるいは、単一のベクターが使用され得、これは重鎖および軽鎖両方のポリペプチドをコードし、そして発現することができる。このような状況において、過剰の毒性の遊離重鎖を避けるために、重鎖の前に軽鎖が配置されるべきである(Proudfoot、Nature 322:52(1986);Kohler、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:2197(1980))。重鎖および軽鎖のためのコード配列はcDNAまたはゲノムDNAを含み得る。
一旦本発明の抗体分子が、動物によって産生されるか、化学的に合成されるか、または組換えにより発現されると、当該分野で公知の、免疫グロブリン分子の精製のための任意の方法、例えば、クロマトグラフィー(例えば、イオン交換、アフィニティー(特に、プロテインAの後に特異的抗原に対するアフィニティーによる)、およびサイズカラムクロマトグラフィー)、遠心分離、溶解度差、またはタンパク質精製のための任意の他の標準的な技術によって、精製され得る。さらに、本発明の抗体またはそのフラグメントは、本明細書中に記載されるかまたはそうでなければ当該分野において公知の、異種ポリペプチド配列に融合され得、精製を容易にする。
(抗体の特徴付け)
本発明の抗体(scFv、および抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいはこれらからなる他の分子を含む)は、種々の方法で特徴付けされ得る。特に、本発明の抗体および関連分子は、BLySまたはBLySのフラグメント(例えば、BLySの可溶性形態または膜結合形態)に免疫特異的に結合する能力について、本明細書に記載される技術または当該分野で公知の慣用的な改変技術を使用して、アッセイされ得る。本発明の組成物によって免疫特異的に結合され得るBLySまたはBLySフラグメントとしては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:ヒトBLyS(配列番号3228および/または3229)もしくはヒト単球上に発現されたBLyS;マウスBLyS(配列番号3230および/または3231)もしくはマウス単球上に発現されたBLyS;ラットBLyS(配列番号3232、3233、3234および/または3235に与えられるような可溶性形態または、例えば、ラット単球の表面上の膜会合形態のいずれか);あるいはサルBLyS(例えば、配列番号3236および/または3237のサルBLySポリペプチド、サルBLyS可溶性形態、もしくはサル単球上に発現されたBLyS)あるいはそれらのフラグメント。好ましくは、本発明の組成物は、ヒトBLyS(配列番号3228および/または3229)またはそのフラグメントに結合する。本発明の抗体がBLySまたはBLySのフラグメントに免疫特異的に結合する能力についてのアッセイが、溶液において(例えば、Houghten、Bio/Techniques 13:412−421(1992))、ビーズ上で(例えば、Lam、Nature 354:82−84(1991))、チップ上で(例えば、Fodor、Nature 364:555−556(1993))、細菌上で(例えば、米国特許第5,223,409号)、胞子上で(例えば、特許番号5,571,698;5,403,484;および5,223,409)、プラスミド上で(例えば、Cullら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:1865−1869(1992))、またはファージ上で(例えば、ScottおよびSmith、Science 249:386−390(1990);Devlin、Science 249:404−406(1990);Cwirlaら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:6378−6382(1990);ならびにFelici,J.Mol.Biol.222:301−310(1991))(これらの参考文献の各々は、その全体が、本明細書中に参考として援用される)、実施され得る。BLySまたはBLySのグラグメントに免疫特異的に結合すると同定された抗体が、次いで、本明細書に記載されるかまたはそうでなければ当該分野で公知の技術を使用するかまたは慣用的に改変して、BLySまたはBLySのフラグメントについてのそれらの特異性および親和性についてアッセイされ得る。
本発明の抗体を、当該分野で公知の任意の方法によって、BLySへの免疫特異的結合および他の抗原との交差反応性についてアッセイし得る。特に、抗体がBLySの可溶性形態または膜結合形態に免疫特異的に結合する能力および特定の種(例えば、マウス、サルまたはヒト、好ましくはヒト)由来のBLySに対する抗体、フラグメントまたは改変体の特異性を、本明細書中に記載されるかまたはそうでなければ当該分野で公知の技術を使用するまたは慣用的に改変して決定し得る。
免疫特異的結合および交差反応性を分析するために用いられ得る免疫アッセイとしては、いくつかのものについてだけ名称を挙げると、ウエスタンブロット、ラジオイムノアッセイ、ELISA(酵素結合免疫吸着アッセイ)、「サンドイッチ」免疫アッセイ、免疫沈降アッセイ、沈降反応、ゲル拡散沈降反応、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、補体結合アッセイ、免疫放射定量アッセイ、蛍光免疫アッセイ、およびプロテインA免疫アッセイのような技術を用いる競合アッセイ系および非競合アッセイ系が挙げられるが、これらに限定されない。このようなアッセイは慣用的であり、そして当該分野において周知である(例えば、その全体が本明細書中に参考として援用される、Ausubelら編,1994,Current Protocols in Molecular Biology,第1巻、John Wiley&Sons,Inc.,New Yorkを参照のこと)。例示的な免疫アッセイが、以下に簡潔に記載される(が、これらは限定を目的とすることが意図されない)。
免疫沈降プロトコルは、一般に、タンパク質ホスファターゼインヒビターおよび/またはプロテアーゼインヒビター(例えば、EDTA、PMSF、アプロチニン、バナジン酸ナトリウム)を補充したRIPA緩衝液(1% NP−40またはTriton X−100、1% デオキシコール酸ナトリウム、0.1% SDS、0.15M NaCl、0.01M リン酸ナトリウム(pH7.2)、1% Trasylol)のような溶解緩衝液中で、細胞の集団を溶解する工程、目的の抗体を細胞溶解物に添加する工程、一定時間(例えば、1〜4時間)4℃でインキュベートする工程、プロテインAセファロースビーズおよび/またはプロテインGセファロースビーズを細胞溶解物に添加する工程、約1時間以上4℃でインキュベートする工程、溶解緩衝液中でビーズを洗浄する工程、およびSDS/サンプル緩衝液中でビーズを再懸濁する工程を包含する。目的の抗体が特定の抗原を免疫沈降する能力は、例えば、ウエスタンブロット分析により、評価され得る。当業者は、抗体の抗原への結合を増加するように、そしてバックグラウンドを減少させるように改変され得るパラメータ(例えば、セファロースビーズを用いて細胞溶解物を事前にきれいにする工程)に関して、認識し得る。免疫沈降プロトコルに関するさらなる考察については、例えば、Ausubelら編,1994、Current Protocols in Molecular Biology,第1巻、John Wiley&Sons、Inc.,New York,10.16.1を参照のこと。
ウエスタンブロット分析は、一般に、タンパク質サンプルを調製する工程、ポリアクリルアミドゲル(例えば、抗原の分子量に応じた8%〜20% SDS−PAGE)中でのそのタンパク質サンプルの電気泳動、そのタンパク質サンプルをそのポリアクリルアミドゲルからニトロセルロース、PVDFまたはナイロンのような膜に転写する工程、ブロッキング溶液(例えば、3% BSAまたは脱脂粉乳を有するPBS)中でその膜をブロックする工程、洗浄緩衝液(例えば、PBS−Tween 20)中でその膜を洗浄する工程、ブロッキング緩衝液中で希釈された一次抗体(目的の抗体)を用いてその膜をブロックする工程、洗浄緩衝液中でその膜を洗浄する工程、ブロッキング緩衝液中で希釈された酵素基質(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼまたはアルカリホスファターゼ)あるいは放射性分子(例えば、32Pまたは125I)に結合体化された二次抗体(一次抗体を認識する、例えば、抗ヒト抗体)を用いて、その膜をブロックする工程、洗浄緩衝液中でその膜を洗浄する工程、ならびにその抗原の存在を検出する工程を包含する。当業者は、検出されるシグナルを増加させるように、そしてバックグラウンドノイズを減少させるように改変され得るパラメータに関して、認識し得る。ウエスタンブロットプロトコルに関するさらなる考察については、例えば、Ausubelら編,1994,Current Protocols in Molecular Biology,第1巻、John Wiley&Sons,Inc.,New York,10.8.1を参照のこと。
ELISAは、抗原を調製する工程、96ウェルマイクロタイタープレートのウェルをその抗原でコーティングする工程、酵素基質(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼまたはアルカリホスファターゼ)のような検出可能な化合物に結合体化された目的の抗体をそのウェルに添加し、そして一定時間インキュベートする工程、およびその抗原の存在を検出する工程を包含する。ELISAにおいて、目的の抗体は、検出可能な化合物に結合している必要はない;その代わり、検出可能な化合物に結合体化された第二の抗体(目的の抗体を認識する)が、ウェルに添加され得る。さらに、ウェルを抗原でコーティングする代わりに、抗体がウェルにコーティングされ得る。この場合、検出可能な分子は、酵素基質例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼまたはアルカリホスファターゼ)のような検出可能な化合物に結合体化された抗体であり得る。当業者は、検出されるシグナルを増加させるように改変され得るパラメータ、および当該分野において公知のELISAの他のバリエーションに関して、認識する。ELISAに関するさらなる考察については、例えば、Ausubelら編,1994,Current Protocols in Molecular Biology,第1巻、John Wiley & Sons,Inc.,New York,11.2.1を参照のこと。
抗原に対する抗体(scFv、および抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいはこれらからなる他の分子を含む)の結合親和性および抗体−抗原相互作用のオフレート(off−rate)が、競合結合アッセイにより決定され得る。競合結合アッセイの一つの例は、ラジオイムノアッセイであり、ラジオイムノアッセイは、漸増量の非標識抗原の存在下での、目的の抗体との標識抗原(例えば、Hまたは125I)のインキュベーション、および標識抗原に結合体化された抗体の検出を含む。BLySに対する本発明の抗体の親和性、および結合オフレートは、スキャッチャードプロット分析によるデータから決定され得る。第二の抗体との競合はまた、ラジオイムノアッセイを用いて決定され得る。この場合、BLySは、漸増量の非標識の第二の抗BLyS抗体の存在下で、標識化合物(例えば、Hまたは125I)に結合体化した目的の抗体とともにインキュベートされる。
好ましい実施形態において、BIAcore速度的分析を使用して、BLySまたはBLySのフラグメントへの抗体(scFv、および抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいはこれらからなる他の分子を含む)の結合オンおよびオフレートを決定する。BIAcore速度論的分析は、以下の実施例6、12、17、および18に詳細に記載されるように、それらの表面に固定された抗体を有するチップへのBLySの結合およびこのチップからの脱離を分析する工程を包含する。
本発明の抗体(scFv、および抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいはこれらからなる他の分子を含む)はまた、当業者に公知の技術を使用して、BLySのBLySレセプター(例えば、TAClおよびBCMA)への結合を阻害、増加、または有意に変化させないそれらの能力についてアッセイされ得る。例えば、BLySについてのレセプターを発現する細胞(例えば、IM9、REH、ARH−77細胞、Namalwa、およびRPMI−8226 B細胞腫瘍株、ならびに抹消CD20+B細胞)が、抗体の存在下または非存在下でBLySに接触され、そしてこれらの細胞へのBLySの結合を阻害、増加、または有意に変更しない抗体の能力が測定され得る。細胞に対するBLyS結合は、例えば、フローサイトメトリーまたはシンチレーションアッセイによって、測定され得る。BLySまたは抗体は、検出可能な化合物(放射性標識(例えば、32P、35S、および125I)または蛍光標識(例えば、フルオレセインイソシアネート、ローダミン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、o−フタルデヒドおよびフルオレサミン)で標識されて、BLySとBLySレセプターとの間および/またはBLySと本発明の抗体との間の相互作用を検出し得る。あるいは、BLySレセプターへのBLyS結合を阻害、増加または有意に変更しない本発明の抗体の能力が、無細胞アッセイにおいて決定され得る。例えば、ネイティブもしくは組換えBlyS(例えば、これは、配列番号3228のアミノ酸134〜285のアミノ酸配列を有する)またはそのフラグメントは、抗体と接触され得、そしてBLySレセプターへのBLyS結合を阻害、増加または有意に変更しないこの抗体の能力が、決定され得る。好ましくは、この抗体は、固体支持体上に固定され、そしてBLySまたはBLySフラグメントが、検出可能な化合物によって標識される。あるいはBLySまたはBLySフラグメントが、固体支持体上に固定され、そしてこの抗体が、検出可能な化合物で標識される。BLySは、部分的にもしくは完全に精製され得るか(例えば、他のポリペプチドを部分的にまたは完全に含まない)または細胞溶解物の一部であり得る。さらに、このBLySポリペプチドは、融合タンパク質であり得、この融合タンパク質は、BlySまたはその生物学的に活性な部分およびドメイン(例えば、免疫グロブリンFcまたはグルタチオニン−S−トランスフェラーゼ)を含む。例えば、TACI(GenBank登録番号AAC51790)のアミノ酸残基1〜154、またはBCMA(GenBank登録番号NP_001183)の1〜48は、IgG分子のFc領域に融合され得、そしてBLySレセプターへのBLyS結合を阻害、増加または有意に変更しない本発明の抗体の能力を決定するための無細胞アッセイにおいて使用され得る。あるいは、BLySは、当業者に周知の技術(例えば、ビオチン化キット、Pierce Chemicals;Rockford,IL)を使用してビオチン化され得る。
本発明の抗体(scFv、あるいは抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、またはこれらからなる他の分子を含む)はまた、当業者に公知の技術を使用して、BlyS誘導B細胞増殖を、阻害、刺激、または有意に変更しないそれらの能力について、アッセイされ得る。例えば、B細胞増殖は、H−チミジン組み込みアッセイおよびトリパンブルー細胞カウントを使用することによって、アッセイされ得る(例えば、Mooreら、Science 285:260−263(1999)を参照のこと)。さらに、本発明の抗体、またはそのフラグメントもしくは改変体は、細胞シグナル伝達分子および転写因子(例えば、カルシウム調節因子およびシクロフィリンリガンド(「CAML」)、カルシニュリン、活性化T細胞転写因子の核因子(「NF−AT」)、核因子−κB(「NF−κB」)、およびAP−1)のBLyS誘導活性化を、ブロックするか、刺激するか、または有意に変更しないそれらの能力について、当業者に公知の技術を使用して、アッセイされ得る(例えば、von BulowおよびBram,Science 278:138−141(1997)を参照のこと)。例えば、NF−AT活性は、電気移動度(electromobility)ゲルシフトアッセイによって、NF−ATによって調節されることが知られているタンパク質の発現(例えば、IL−2発現)を検出することによって、レポーター遺伝子(例えば、検出可能なマーカー(例えば、ルシフェラーゼ、β−ガラクトシダーゼまたはクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT))をコードする核酸に作動可能に連結されたNF−AT調節エレメント)の誘導を検出することによって、または細胞性応答(例えば、細胞分化、または細胞増殖)を検出することによって、決定され得る。
本発明の抗体、またはそのフラグメントもしくは改変体はまた、BLyS活性を、中和、増強、または有意に変更しないそれらの能力についてアッセイされ得る。例えば、抗体またはそのフラグメントもしくは改変体は、BLySについてのレセプターを発現する細胞へのBLySの結合を阻害するそれらの能力について慣用的に試験され得る(以下の実施例3を参照のこと)。
(可溶性BLySに免疫特異的に結合する抗体についての選択およびスクリーニング)
本発明の抗体(scFv、および抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、またはこれらからなる他の分子を含む)は、BLySの可溶形態に免疫特異的に結合するこれらの抗体を同定するための種々のアッセイにおいて、スクリーニングされ得る。1つの特定のアッセイにおいて、溶液中のBLySのビオチン化可溶性形態に結合する抗体は、ストレプトアビジンがコーティングされた磁気ビーズ上に捕獲される。このアッセイは、比較的、BLySを中和および/または結合する本発明の抗体を同定するために適用され得る。さらに、抗体は、本明細書中に記載されるかまたはそうでなければ当該分野で公知の中和アッセイにおいてアッセイされ得る(以下の実施例3を参照のこと)。例えば、抗体は、可溶性BLyS(例えば、ビオチン化BLyS)がIM9細胞に結合することを阻害するそれらの能力について試験され得る。このアッセイにおいて、標識された可溶性BLyS(例えば、ビオチン化BLyS)が、候補抗BLyS抗体とインキュベートされて、BLyS−抗BLyS抗体複合体の形成を可能にする。インキュベーションに続いて、BLyS−抗BLyS抗体サンプルのアリコートを、IM9細胞に添加される。可溶性BLySの結合は、当該分野で公知の技術を使用して決定され得る。例えば、ビオチン化BLySのIM9細胞への結合は、ストレプトアビジン−δの添加に続いて、蛍光計(fluorimeter)を使用して、検出され得る。BLySを中和する抗体によって結合されない場合、細胞に結合しないビオチン化BLySが、検出される。従って、(BLySが無関係の抗体とプレインキュベートされるかまたは全く細胞がない状態でプレインキュベートされたコントロールサンプルと比較して)IM−9細胞に結合するbio−BLySの量を減少させる抗体は、BLySの可溶性形態に結合し、そしてこの可溶性形態を中和する抗体として同定される。別のアッセイにおいて、抗体は、可溶性ビオチン化BLySに結合するが、膜結合BLyS(例えば、U937細胞由来の膜上のBLyS)には結合しない抗体について、ELISAを使用してスクリーニングされる(以下の実施例2および9を参照のこと)。これらのアッセイにおいて、可溶性BLyS(例えば、ビオチン化BLyS)および膜結合BLyS(例えば、U937膜上)は、同じ抗体とともに別個のサンプル中でインキュベートされ、そして可溶性BLyS(ビオチン化BLyS)に結合するが、膜結合BLyS(例えば、U937細胞膜上)には結合しない抗体が、捕獲され、そして同定される。
本発明の抗体(scFv、および抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、またはこれらからなる他の分子を含む)は、APRIL、エンドカイン−α、VEGI、TRAIL、TNF−α、TNF−β、Fas−L、LIGHT、およびPBSと交差反応しない抗体を同定するために試験され得る(以下の実施例4を参照のこと)。抗体はまた、例えば、BIAcore分析を使用して、BlySについてのそれらの親和性について試験され得る(以下の実施例6、12、17および18を参照のこと)。抗体はまた、当業者に公知の技術を使用して、BLyS誘導免疫グロブリン産生および/またはB細胞増殖を刺激するか、阻害するか、または変更しないそれらの能力について試験され得る。例えば、ヒトB細胞、BLySおよび抗体は、96ウェルプレート中で一緒にインキュベートされ得、そしてH−チミジン取り込みが、シンチレーションカウンタを使用して測定され得る。
(膜結合BLySに免疫特異的に結合する抗体についての選択およびスクリーニング)
本発明の抗体(scFv、および抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、またはこれらからなる他の分子を含む)は、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するこれらの抗体を同定するための種々のアッセイにおいて、スクリーニングされ得る。1つの特定のアッセイにおいて、U937膜上のBLySまたは固定化ヒスチジンタグ化BLySに結合する抗体が、捕獲される。BLySの膜結合形態に結合する抗体を試験するために有用であり得る、BLySを発現する他の細胞株としては、K−562、HL−60およびTHP−1細胞が挙げられる。別のアッセイにおいて、抗体は、U937膜上のBLySに結合するか、またはヒシチジンタグ化BLySに結合する抗体(または抗体フラグメントもしくは改変体)について、ELISAを使用して、スクリーニングされる。このアッセイにおいて、抗体が、U937膜またはヒスチジンタグ化BLySでコートされた96ウェルプレートに添加され、そしてU937膜またはヒスチジンタグ化BLySに結合する抗体または抗体フラグメントもしくは改変体が捕獲される。別のアッセイにおいて、抗体は、ビオチン化BLyS(可溶性BLyS)に結合しないが、膜結合BLyS(例えば、U937細胞由来の膜上のBLyS)には結合する抗体(またはその抗体フラグメントもしくは改変体)について、ELISAを使用してスクリーニングされる(以下の実施例2を参照のこと)。これらのアッセイにおいて、可溶性BLyS(例えば、ビオチン化BLyS)および膜結合BLyS(例えば、U937膜上)は、同じ抗体(または抗体フラグメントもしくは改変体)とともに別個のサンプル中でインキュベートされ、そして可溶性BLyS(ビオチン化BLyS)に結合しないが、膜結合BLyS(例えば、U937細胞膜上)には結合する抗体(または抗体フラグメントもしくは改変体)が、捕獲され、そして同定される。別のアッセイにおいて、抗体は、ヒシチジンタグ化BLySまたはU937由来の膜に結合する抗体(抗体フラグメントまたは改変体)のうちどれが、APRIL、エンドカイン−α、VEGI、TRAIL、TNF−α、TNF−β、Fas−L、LIGHT、およびPBSと交差反応しないのかを、決定するために、ELISAを使用してスクリーニングされる(以下の実施例4を参照のこと)。ELISAはまた、TNF−αの存在下で、ヒスチジンタグ化BLySまたはBLySに結合するU937細胞由来の膜に結合する抗体(または抗体フラグメントもしくは改変体)のどれが、BLySに結合するのかを決定するために使用され得る(以下の実施例4を参照のこと)。BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントもしくは改変体がまた、ハイスループットBIAcore分析を使用して、ヒスチジンタグ化BLySについてのそれらの親和性について試験され得る(以下の実施例14を参照のこと)。
さらに、本発明の抗体は、BLySの膜結合形態についてのそれらの特異性を決定するために、BLySの「非結合性」形態を発現するように操作された細胞に対してスクリーニングされ得る。この結果を達成し得るBLySにおける変異としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:配列番号3228に示されるBLyS配列のアミノ酸残基Lys−132および/またはArg−133の変異または欠失。典型的な変異誘発は、残基Lys−132またはArg−133の一方または両方のアラニン残基への変異を含む。そのようなBLySの「非切断性」形態を発現する細胞は、BLySの膜結合形態に結合する抗体の能力をアッセイする際に使用するための著明な試薬を提供する。
(可溶性BlySおよび膜結合BLySに免疫特異的に結合する抗体についての選択およびスクリーニング)
本発明の抗体(scFv、および抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、またはこれらからなる他の分子を含む)は、BLySの可溶性形態および膜結合形態に免疫特異的に結合するこれらの抗体または抗体フラグメントもしくは改変体を同定するための種々のアッセイにおいて、スクリーニングされ得る。1つの特定のアッセイにおいて、固定化BLySに結合する抗体が、捕獲される。別のアッセイにおいて、抗体は、上記のように、可溶性BLyS(例えば、可溶性bio−BLyS)のIM−9細胞への結合を阻害する)これらの抗体(または抗体フラグメントもしくは改変体)について、ELISAを使用して、スクリーニングされる。他のアッセイにおいて、抗体は、U937細胞由来の膜に結合するこれらの抗体について、ELISAを使用して、スクリーニングされる。さらに、さらなるELISAアッセイが、当該分野で公知の技術を使用して、どの抗体が、APRIL、エンドカイン−α、VEGI、TRAIL、TNF−α、TNF−β、Fas−L、LIGHT、およびPBSと交差反応しないのかを決定するために、またはTNF−αの存在下で、BLySに結合する抗体を決定するために、実施され得る(以下の実施例4を参照のこと)。抗体は、本明細書中に記載されるかまたはそうでなければ当該分野で公知の技術を使用して、中和アッセイにおいてアッセイされ得る。BLySの可溶性形態および膜結合形態に免疫特異的に結合する抗体がまた、ハイスループットBIAcore分析を使用して、BLySについてのそれらの親和性について試験され得る。
(抗体結合体)
本発明は、融合タンパク質を作製するための、異種ポリペプチド(またはそれらの部分、好ましくは少なくとも10、少なくとも20、少なくとも30、少なくとも40、少なくとも50、少なくとも60、少なくとも70、少なくとも80、少なくとも90、または少なくとも100個のアミノ酸のポリペプチド)に組換えで融合されたか、あるいは化学的に結合体化された抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいはそれらからなる、scFvおよび他の分子を含む)を含む。この融合は、必ずしも直接的である必要はないが、リンカー配列を介して起こり得る。例えば、本発明の抗体は、異種ポリペプチドを、インビトロまたはインビボのいずれかで、特定の細胞表面抗原(例えば、単球細胞株の細胞上の膜結合BLyS)または特定の細胞表面レセプター(例えば、B細胞上に局在するTACIおよび/またはBCMA)に結合する細胞表面抗原に特異的な本発明の抗体に融合させるかまたは結合させることによって、異種ポリペプチドを特定の細胞型(例えば、単球細胞株およびB細胞の細胞)に標的化するために使用され得る。異種ポリペプチドに融合されたかまたは結合された抗体はまた、当該分野で公知の方法を使用してインビトロイムノアッセイおよび精製方法にて使用され得る。例えば、Harborら、前出およびPCT公開WO 93/21232;EP 439,095;Naramuraら、Immunol.Lett.39:91−99(1994);米国特許第5,474,981号;Gilliesら、PNAS 89:1428−1432(1992);Fellら、J.Immunol.146:2446−2452(1991)(これらは、それらの全体において参考として援用される)を参照のこと。
1つの実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVHドメイン、および異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。別の実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVH CDR1、および異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。別の実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVH CDR2、および異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVH CDR3(すなわち、配列番号2129〜3227)、および異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。
別の実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVLドメイン、および異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。別の実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVL CDR1、および異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。なお別の実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVL CDR2、および異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。好ましい実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVL CDR3、および異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。
別の実施形態において、融合タンパク質は、表1に示されるVHドメインおよび表1に示される1以上のVLドメイン、ならびに異種ポリペプチドのいずれか1つのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。別の実施形態において、本発明の融合タンパク質は、表1に示されるVH CDRのいずれか1つ、および表1に示されるVL CDRのいずれか1つ、ならびに異種ポリペプチドのアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。
本発明はさらに、抗体フラグメントに融合されたか、または結合された異種ポリペプチドを含むか、あるいはこれらからなる組成物を含む。例えば、異種ポリペプチドは、Fabフラグメント、Fdフラグメント、Fvフラグメント、F(ab)フラグメント、またはその部分に融合され得るか、または結合され得る。ポリペプチドを抗体部分に融合する方法または結合する方法は、当該分野で公知である。例えば、米国特許第5,336,603号;同第5,622,929号;同第5,359,046号;同第5,349,053号;同第5,447,851号;同第5,112,946号;EP 307,434;EP 367,166;PCT公開WO 96/04388;WO 91/06570;Ashkenaziら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:10535−10539(1991);Zhengら、J.Immunol.154:5590−5600(1995);およびVilら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89;11337−11341(1992)(上記の参考文献は、それらの全体が参考として援用される)を参照のこと。
本発明のさらなる融合タンパク質は、遺伝子シャッフリング、モチーフシャッフリング、エキソンシャッフリング、および/またはコドンシャッフリング(総称して「DNAシャッフリング」といわれる)の技術により作製され得る。DNAシャッフリングは、抗体(抗体フラグメントまたはこれらの改変体を含むか、あるいはこれらからなるscFvおよび他の分子を含む)の活性を調節するために使用され得、このような方法を使用して変化した活性を有する抗体(より高い親和性およびより低い解離速度を有する抗体)を作製し得る。一般には、米国特許第5,605,793号;同第5,811,238号;同第5,830,721号;同第5,834,252号;および同第5,837,458号、ならびにPattenら、Curr.Opinion Biotechnol.8:724−33(1997);Harayama、Trends Biotechnol.16(2):76−82(1998);Hanssonら、J.Mol.Biol.287:265−76(1999);ならびにLorenzoおよびBlasco,Biotechniques 24(2):308−13(1998)(これらの特許および刊行物の各々は、その全体が本明細書中で参考として援用される)を参照のこと。1つの実施形態において、本発明の抗体をコードするポリヌクレオチドは、誤りがちな(error−prone)PCR、無作為ヌクレオチド挿入、または組換え前の他の方法による無作為の変異誘発に供されることによって変化され得る。別の実施形態において、その一部が免疫特異的にBLySに結合する抗体をコードするポリヌクレオチドの1以上の部分が、1以上の異種分子の1以上の成分、モチーフ、区画、一部分、ドメイン、フラグメントなどと組換えられ得る。
さらに、本発明の抗体(抗体フラグメントまたはこれらの改変体を含むか、あるいはこれらからなるscFvおよび他の分子を含む)は、精製を容易にするペプチドのような、マーカー配列と融合され得る。好ましい実施形態において、このマーカーアミノ酸配列は、とりわけ、pQEベクター(QIAGEN、Inc.,9259 Eton Avenue,Chatsworth,CA,91311)において提供されるタグのようなヘキサ−ヒスチジンペプチドであり、それらの多くは市販されている。例えば、Gentzら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:821−824(1989)に記載されるように、ヘキサ−ヒスチジンは、融合タンパク質の簡便な精製を提供する。精製に有用な他のペプチドタグとしては、インフルエンザ赤血球凝集素タンパク質由来のエピトープに対応する血球凝集素「HA」タグ(Wilsonら、Cell 37:767(1984))および「flag」タグ(DYKDDDDK、(配列番号3238)、Stratagene、La Jolla、CA)が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明はさらに、診断剤、または治療剤に結合する抗体(抗体フラグメントまたはこれらの改変体を含むか、あるいはこれらからなるscFvおよび他の分子を含む)を含む。この抗体は、例えば、臨床試験の手順の一部(例えば、所定の治療レジメの有効性を決定するための)として、腫瘍の発生または進行をモニターするために診断的に使用され得る。検出は、抗体を検出可能な物質にカップリングすることによって容易にされ得る。検出可能な物質の例としては、種々の酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質、生物発光物質、放射性物質、種々の陽電子射出断層撮影法を使用する陽電子射出金属、および非放射性常磁性金属イオンが挙げられる。検出可能な物質は、当該分野で公知の技術を使用して、直接的にか、または中間体(例えば、当該分野で公知のリンカー)を介して間接的にかのいずれかで、抗体にカップリングされ得るか、もしくは結合され得る。本発明に従う診断薬として使用するための抗体に結合され得る金属イオンとしては、例えば、米国特許第4,741,900号を参照のこと。適切な酵素の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼが挙げられ;適切な補欠分子族複合体の例としては、ストレプトアビジン/ビオチンおよびアビジン/ビオチンが挙げられ;適切な蛍光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロライドまたはフィコエリトリンが挙げられ;発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ;生物発光物質の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、およびエクオリンが挙げられ;適切な放射性物質の例としては、ヨウ素(131I、125I、123I、121I)、炭素(14C)、硫黄(35S)、トリチウム(H)、インジウム(115mIn、113mIn、112In、111In)、およびテクネチウム(99Tc、99mTc)、タリウム(201Ti)、ガリウム(68Ga、67Ga)、パラジウム(103Pd)、モリブデン(99Mo)、キセノン(133Xe)、フッ素(18F)、153Sm、177Lu、159Gd、149Pm、140La、175Yb、166Ho、90Y、47Sc、186Re、188Re、142Pr、105Rh、97Ru、68Ge、57Co、65Zn、85Sr、32P、153Gd、169Yb、51Cr、54Mn、75Se、113Sn、および117Tinが挙げられる。
さらに本発明の抗体(抗体フラグメントまたはこれらの改変体を含むか、あるいはこれらからなるscFvおよび他の分子を含む)は、細胞毒(例えば、細胞増殖抑制剤または細胞破壊剤)、治療剤または放射性金属イオン(例えば、213Biのようなα放射核)のような治療的な部分と結合され得る。特定の実施形態において、本発明の抗体は、放射性金属イオン(111In、177Lu、90Y、166Ho、および153Smが挙げられるがこれらに限定されない)のポリペプチドへの結合に有用な単環式キレート剤に結合される。好ましい実施形態において、本発明の抗体に結合される単環式キレート剤に関連する放射性金属イオンは、111Inである。好ましい実施形態において、本発明の抗体に結合される単環式キレート剤に関連する放射性金属イオンは、90Yである。特定の実施形態において、多環式キレート剤は、1,4,7,10−テトラアザシクロドデカン−N,N’,N’’,N’’’−四酢酸(DOTA)である。他の特定の実施形態において、DOTAは、リンカー分子を介して本発明の抗体に結合される。DATAのポリペプチドへの結合に有用なリンカー分子の例は、当該分野で一般的に公知である。例えば、Denardoら、Clin Cancer Res.4(10):2483〜90、1998;Petersonら、Bioconjug.Chem.10(4):553〜7、1999;ならびにZimmermanら、Nucl.Med.Biol.26(8):943〜50、1999(これらは、その全体が参考として本発明に援用される)。
細胞毒または細胞毒性剤としては、細胞に有害な任意の薬物、低分子毒素のような分子、および酵素的に活性な細菌、真菌、植物、または動物由来の毒素が挙げられる。例としては、パクリタキセル、サイトカラシンB、グラミシジンD、エチジウムブロミド、エメチン、マイトマイシン、エトポシド(VP−16)、テノポシド(tenoposide)、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンD、1−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、チミジンキナーゼ、エンドヌクレアーゼ、RNAse、およびプロマイシンならびにそれらのフラグメント、改変体もしくはホモログ挙げられるがこれらに限定されない。治療剤としては、代謝拮抗物質(例えば、メトトレキサート、6−メルカプトプリン、6−チオグアニン、シタラビン、5−フルオロウラシルデカルバジン)、アルキル化剤(例えば、メクロレタミン、チオエパ(tioepa)クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン(BSNU)およびロムスチン(CCNU)、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン(streptozotocin)、マイトマイシンC、およびシス−ジクロロジアミン白金(II)(DDP)シスプラチン)、アントラサイクリン(anthracycline)(例えば、ダウノルビシン(以前はダウノマイシン)、およびドキソルビシン)、抗生物質(例えば、ダクチノマイシン(以前は、アクチノマイシン)、ブレオマイシン、ミトラマイシン、およびアントラマイシン(anthramycin)(AMC))、ならびに抗有糸分裂剤(例えば、ビンクリスチンおよびビンブラスチン)、インプロスルファン、ピポスルファン、ベンゾドーパ、カルボコン、メツレドーパ(meturedopa)、ウレドーパ(uredopa)、アルトレタミン(altretamine)、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスフォラミド、トリエチレンチオホスフォラミド(triethylenethiophosphaoramide)、トリメチルオロメラミン、クロルナファジン、クロロホスファミド、エストラムスチン、イフォスファミド、ノベンビチン(novembichin)、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード、クロロゾトシン、ホテムスチン、ニムスチン、ラニムスチン、アクラシノマイシン、アザセリン、カクチノマイシン(cactinomycin)、カリーチアルニシン、カラビシン、カルミノマイシン、カジノフィリン、クロモマイシン、デトルビシン、6−ジアゾ−5−オキソ−L−ノルロイシン、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン(potfiromycin)、クエラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン、ストレプロニグリン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン、デノプテリン、プテロプテリン、トリメトレキサート、フルダラビン、チアミプリン、アンシタビン、アザシタジン、6−アザウリジン、カルモフール、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロキシウリジン、5−FU、カルステロン、ドロモスタノロンプロピオネート、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン、アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン、フロリニック酸(frolinic acid)、アセグラトン、アルドホスファミドグリコシド、アミノレブレニック酸、アムサクリン、ベストラブシル、ビサントレン、エダトレキサート、デホファミン(defofamine)、デルネコルシン、ジアジコン(diaziquone)、エルフォルニチン(elfornithine)、酢酸エリプリニウム(elliptiniurn acetate)、エトグルシド、硝酸ガリウム、ヒドロキシウレア、レンチナン、ロニダミン、ミトグアゾン、モピダモール(mopidamol)、ニトラクリン、ペントスタチン、フェナメット、ピラルビシン、ポドフィリニック酸、2−エチルヒドラジド、プロカルバジン、PSKO、ラゾキサン、シゾフィラン、スピロゲルマニウム、テヌアゾニック酸(tenuazonic acid)、トリアジコン、2,2’,2’’−トリクロロトリエチルアミン、ウレタン、ビンデシン、デカルバジン、マンノムスチン、ミトブロニトール、ミトラクトール、ピポブロマン、ガシトシン、アラビノシド(「Ara−C」)、タキソイド(例えば、パクリタキセル(「TAXOL」、Bristol−Myers Squibb Oncology、Princeton、NJ)、ドキセタキセル(「TAXOTERE」、Rh6ne−Poulenc Rorer、Antony、France)、ゲンシタビン、イホスファミド、ビノレルビン、ナベルビン、ノバントロン、テニポシド、アミノプテリン、キセロダ(xeloda)、イバンドロネート、CPT−I 1、トポイソメラーゼ、インヒビターRFS 2000、ジフルオロメチルオルニシン(DMFO)、レチノール酸、エスペラミシン、カペシタビンおよび上記のいずれかの薬学的に受容可能な塩、酸、または誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、タモキシフェン、ラロキシフェン、アロマターゼ阻害4(5)−イミダゾール、4−ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン、ケオキシフェン、LY117018、オナプリストン、トレミフェン(Fareston)を含む抗エステロゲン剤、ならびに例えば、フルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、ロイプロリド、およびゴセレリン、ならびに上記のいずれかの薬学的に受容可能な塩、酸または誘導体のような抗アンドロゲンのような腫瘍に作用するホルモンを調節または阻害するように作用する抗ホルモン剤もまた、本規定に含まれる。
当該分野で公知の技術が、本発明の抗体を標識するために適用され得る。このような技術として、二官能性結合剤(例えば、米国特許第5,756,065号;同第5,714,631号;同第5,696,239号;同第5,652,361号;同第5,505,931号;同第5,489,425号;同第5,435,990号;同第5,428,139号;同第5,342,604号;同第5,274,119号;同第4,994,560号;および同第5,808,003号;これらの各々の内容は、その全体が参考として本明細書中で援用される)および直接的なカップリング反応(例えば、Bolton−Hunter and Chloramine−T reaction)の使用が挙げられるが、これらに限定されない。
結合体である、本発明の抗体は、所定の生物学的応答を改変するように使用され得、治療剤または薬物部分は、古典的な化学的治療剤に限定されるように解釈されるべきではない。例えば、薬物部分は、所望の生物学的活性を有するタンパク質またはポリペプチドであり得る。このようなタンパク質として、毒素(例えば、アブリン、リシンA、α毒素、pseudomonas菌体外毒素、またはジフテリア毒素、サポリン、モモルジン、ゲロニン、アメリカヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、α−サルシン、およびコレラ毒素;腫瘍壊死因子、α−インターフェロン、β−インターフェロン、神経増殖因子、血小板由来増殖因子、組織プラスミノゲン活性化因子、アポトーシス因子(例えば、TNF−α、TNF−β、AIM I(国際公開番号WO97/33899を参照のこと)、AIM II(国際公開番号WO97/34911)、Fas Ligand(Takahasihら、Int.Immunol.,6:1567〜1574(1994))、VEGI(国際公開番号WO99/23105))、血栓剤もしくは抗血管形成剤(例えば、アンギオスタチンまたはエンドスタチン);または、生物学的応答改変剤(例えば、リンホカイン、インターロイキン−1(IL−1)、インターロイキン−2(IL−2)、インターロイキン−6(IL−6)、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、顆粒球コロニー刺激因子(G−CSF)もしくは他の増殖因子が挙げられ得るが、これらに限定されない。
本発明の抗体(抗体フラグメントまたはこれらの改変体を含むか、あるいはこれらからなるscFvおよび他の分子を含む)はまた、標的抗原のイムノアッセイまたは精製に特に有用な固体支持体に付着され得る。このような固体支持体には、ガラス、セルロース、ポリアクリルアミド、ナイロン、ポリスチレン、ポリビニルクロリドまたはポリプロピレンが挙げられるが、これらに限定されない。
治療部分を抗体に結合する技術は周知であり、例えば、Arnonら、「Monoclonal Antibodies For Immunotargeting Of Drugs In Cancer Therapy」Monoclonal Antibodies And Cancer Therapy、Reisfeldら(編)、243−56頁(Alan R.Liss,Inc.1985);Hellstromら、「Antibodies For Drug Delivery」Controlled Drug Delivery(第2版)、Robinsonら(編)、623−53頁(Marcel Dekker,Inc.1987);Thorpe、「Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy:A Review」Monoclonal Antibodies’84:Biological And Clinical Applications、Pincheraら(編)、475−506頁(1985);「Analysis,Results,And Future Prospective Of The Therapeutic Use Of Radiolabeled Antibody In Cancer Therapy」Monoclonal Antibodies For Cancer Detection And Therapy、Baldwinら(編)、303−16頁(Academic Press 1985)およびThorpeら、「The Preparation And Cytotoxic Properties Of Antibody−Toxin Conjugates」、Immunol.Rev.62:119−58(1982)を参照のこと。
あるいは、本発明の抗体は2次抗体に結合され、米国特許第4,676,980号(これは、その全体が本明細書に参考として援用される)におけるSegalによる記載のような抗体異種結合体(heteroconjugate)を形成し得る。
単独、あるいは細胞毒性因子および/またはサイトカインと組み合わせて投与される、抗体に結合する治療部分を有するかまたは有さない本発明の抗体(抗体フラグメントまたはこれらの改変体を含むか、あるいはこれらからなるscFvおよび他の分子を含む)が、治療薬として使用され得る。
(エピトープマッピングのための抗体の使用)
本発明は、BLySのエピトープを同定するために使用され得る抗体(抗体フラグメントまたはこれらの改変体を含むか、あるいはこれらからなるscFvおよび他の分子を含む)を提供する。特に、本発明の抗体を使用して、ヒトBLyS(配列番号3228および/もしくは3229)またはヒト単球で発現されたBLyS;マウスBLyS(配列番号3230および/もしくは3231)またはマウス単球で発現されたBLyS;ラットBLyS(配列番号3232、3233、3234および/もしくは3235に示される可溶性形態、または膜結合形態(例えば、ラット単球の表面上)のいずれか);あるいはサルBLyS(例えば、配列番号3236および/もしくは3237のサルBLySポリペプチド、サルBLySの可溶性形態、またはサル単球上で発現されるBLyS)のエピトープを、本明細書中に記載の技術または当該分野で公知の他の技術を用いて、決定し得る。エピトープとして機能するフラグメントは、任意の従来的な手段によって、作製され得る(例えば、Houghten、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:5131〜5135(1985)、米国特許第4,631,211号にさらに記載されるものを参照のこと)。
(抗体の診断的使用)
BLySに特異的に結合する本発明の標識された抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいは、それらからなる分子を含む)は、BLySまたはBLySレセプターの異常な発現および/または活性に関連する疾患および/もしくは障害を検出、診断、予後診断、あるいはモニターする診断的目的のために使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体由来の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、BLySの標準的なレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中の)と比較する工程を包含し、これによって標準的レベルのBLySと比較されたBLySのアッセイレベルの増加または減少が、異常な発現を示す。
「生物学的サンプル」によって、個体、体液、身体組織、身体細胞、細胞株、組織培養物、またはBLySタンパク質もしくはmRNAを含み得る他の供給源から得られた任意の体液および/もしくは細胞が意図され得る。体液として、血清、血漿、尿、骨髄液、精液、唾液、および粘液が挙げられるが、これらに限定されない。組織サンプルは、体内の実質的に任意の組織から採取され得る。組織サンプルはまた、剖検材料から得られ得る。哺乳動物から組織生検および体液を得るための方法は、当該分野で周知である。生物学的サンプルが、mRNAである場合、組織生検が、好ましい供給源である。
本発明はまた、BLySレセプターの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)可溶性BLySにのみ免疫特異的に結合するが、BLyS/BLySレセプター結合を阻害しない、1以上の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体を使用して、個体由来の生物学的サンプル中のBLySレセプターの発現をアッセイする工程(このような抗体は、溶液由来のビオチン化されたBLySを捕捉し得る(実施例8を参照のこと)が、BLySがIM−9細胞に結合するのを阻害しない(実施例3を参照のこと)抗体であるが、これは例示のみを目的とし、限定することを意味しない)、ならびに(b)BLySレセプターのレベルを、BLySレセプターの標準的なレベル(例えば、正常な組織または細胞サンプル中の)を比較する工程を包含し、これによって、BLySレセプターの標準的なレベルと比較したBLySレセプターのアッセイされたレベルの増加または減少が、異常な発現を示す。
BLySに特異的に結合する本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいは、それらからなる分子を含む)は、これらに関連する自己免疫障害および/または免疫不全、および/または疾患もしくは状態を検出、診断、予後診断、あるいはモニターする診断的目的のために使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体由来の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、BLySの標準的なレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中の)と比較する工程を包含し、これによって標準的レベルのBLySと比較されたBLySのアッセイレベルの増加または減少が、自己免疫障害もしくは疾患および/または免疫不全を示す。特定の実施形態において、BLySのアッセイされたレベルの増加は、自己免疫障害または疾患を示す。他の特定の実施形態において、BLySのアッセイされたレベルの減少は、免疫不全を示す。
BLySに特異的に結合するが、BLyS/BLySレセプター結合を阻害しない本発明の抗体(抗体フラグメントまたはその改変体を含むか、あるいは、それらからなる分子を含む)は、これらに関連する自己免疫障害および/または免疫不全、および/または疾患もしくは状態を検出、診断、予後診断、あるいはモニターする診断的目的のために使用され得る。本発明は、BLySレセプターの異常な発現を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体由来の生物学的サンプル中のBLySレセプターの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySレセプターのレベルを、BLySレセプターの標準的なレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中の)と比較する工程を包含し、これによって標準的レベルのBLySレセプターと比較されたBLySのアッセイレベルの増加または減少が、自己免疫障害もしくは疾患および/または免疫不全を示す。特定の実施形態において、BLySレセプターのアッセイされたレベルの増加は、自己免疫障害または疾患を示す。他の特定の実施形態において、BLySレセプターのアッセイされたレベルの減少は、免疫不全を示す。
本発明の抗体を使用して検出、診断、予後診断、またはモニターされ得る自己免疫障害、疾患、もしくは状態として、以下が挙げられるが、これらに限定されない:自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性新生児血小板減少、特発性血小板減少性紫斑病、自己免疫性好中球減少、自己免疫性血球減少症、溶血性貧血、抗リン脂質症候群、皮膚炎、グルテン感受性腸症、アレルギー性脳脊髄炎、再発性多発性軟骨炎、リウマチ性心疾患、糸球体腎炎(例えば、IgA腎症)、多発性硬化症、神経炎、ブドウ膜炎眼炎、多発性内分泌腺症、紫斑病(例えば、ヘーノホ−シェーンライン紫斑病)、ライター病、スティッフマン症候群、自己免疫性肺性炎症(Autoimmune Pulmonary Inflammation)、心筋炎、IgA糸球体腎炎、膜性増殖性糸球体腎炎、リウマチ性心疾患、ギヤン−バレー症候群、真性糖尿病(例えば、I型真性糖尿病またはインスリン依存性糖尿病)、若年性糖尿病(juvenile onset diabetes)、および自己免疫炎症性眼、自己免疫性甲状腺炎、甲状腺機能低下(すなわち、橋本甲状腺病、全身性エリテマトーデス、円板状エリテマトーデス、グッドパスチャー症候群、天疱瘡、レセプター自己免疫(例えば、(a)グレーブス病、(b)重症筋無力症、および(c)インスリン耐性)、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性血小板減少性紫斑病、慢性関節リウマチ、抗コラーゲン抗体を伴なう強皮症、混合結合組織病、多発性筋炎/皮膚筋炎、悪性貧血(アディソン病)、突発性アディソン病、不妊症、糸球体腎炎(例えば、原発性糸球体腎炎およびIgA腎症)、水疱性類天疱瘡、シェーグレン症候群、真性糖尿病、およびアドレナリン作動薬耐性(ぜん息または嚢胞性線維症を伴なうアドレナリン作動薬耐性を含む)、慢性活性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、他の内分泌腺不全、白斑、脈管炎、MI後(post−MI)、心臓切開症候群、じんま疹、アトピー性皮膚炎、ぜん息、炎症性ミオパシー、および他の炎症性、肉芽腫性、変性性、および萎縮性障害ならびに他の障害(例えば、炎症性皮膚疾患(乾癬および.硬化症を含む))、炎症性腸疾患に関連する応答(例えば、クローン病および潰瘍性大腸炎)、呼吸窮迫症候群(成人の呼吸窮迫症候群、ARDSを含む)、髄膜炎、脳炎、大腸炎、アレルギー性状態(例えば、湿疹)ならびに他の状態(T細胞の浸潤および慢性的な炎症性応答を含む)、アテローム性動脈硬化症、白血球接着不全、レーノー症候群、ならびに結核、サルコイドーシス、肉芽腫症および白血球漏出、中枢神経系(CNS)免疫性疾患、多発性期間損傷症候群、抗原−抗体複合体媒介性疾患、抗糸球体基底膜疾患、ランバート−イートン筋無力症症候群、Beheet病、巨細胞性動脈炎、免疫複合体腎炎、IgA腎症、IgM多発性神経障害、または自己免疫性血小板減少などを含む疾患において代表的に見出される、サイトカインおよびTリンパ球によって媒介される急性および遅延性の過敏症に関連する免疫応答が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、本発明は、高ガンマグロブリン血症(例えば、AIDS、自己免疫疾患、およびいくつかの免疫不全)に関連する疾患または障害を検出、診断、および/もしくは予後診断するための方法ならびに組成物を含む。他の特定の実施形態において、本発明は、低ガンマグロブリン血症(例えば、免疫不全)に関連する疾患または障害を検出、診断および/または予後診断するための方法ならびに組成物を含む。
本発明の抗体を使用して検出、診断、予後診断、またはモニターされ得る免疫不全として、重篤な複合型免疫欠損(SCID)−X連鎖、SCID−染色体、アデノシンデアミナーゼ欠損(ADA欠損)、X連鎖無ガンマグロブリン血症(XLA)、バートン病、X連鎖乳児無ガンマグロブリン血症、後天性無ガンマグロブリン血症、成人発症無ガンマグロブリン血症(adult onset agammaglobulinemia)、後期発症性無ガンマグロブリン血症(late−onset agammaglobulinemia)、異常ガンマグロブリン血症、低ガンマグロブリン血症、一過性乳児低ガンマグロブリン血症、非特異的低ガンマグロブリン血症、無ガンマグロブリン血症、分類不能型免疫不全(CVID)(後天的)、ヴィスコット−オールドリッチ症候群(WAS)、X連鎖過剰IgM免疫欠損(X−linked immunodeficiency with hyper IgM)、非X連鎖過剰IgM免疫欠損(non X−linked immunodeficiency with hyper IgM)、選択的IgA欠損、IgGサブクラス欠損(IgA欠損あり、またはなし)、正常なIgまたは上昇したIgを伴なう抗体欠損、胸腺腫を伴なう免疫欠損、Ig重鎖欠失、κ鎖欠損、B細胞リンパ増殖障害(BLPD)、選択的IgM免疫欠損、劣性無ガンマグロブリン血症(スイス型)、網様発育不全、新生児好中球減少症、重篤な先天性白血球減少症、胸腺リンパ形成不全症−免疫不全を伴なう発育不全または形成異常、毛細血管拡張性運動失調、短四肢小人症(short limbed dwarfism)、X連鎖リンパ増殖症候群(XLP)、ネゼロフ症候群−Igを伴なう複合免疫不全、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ欠損(PNP)、MHCクラスII欠損(不全リンパ球症候群)、および重篤な複合型免疫不全が挙げられるが、これらに限定されない。
可溶性BLySの上昇したレベルは、全身性エリテマトーデス(SLE)を有する患者の血清中に観察された。150のSLE患者の血清と、38のコントロール個体の血清の比較において、ほとんどのSLE患者が、5ng/mlを超える血清BLySを有し、30%を越えるSLE患者が、10ng/mlを超え、そしておおよそ10%のSLE患者が20ng/mlを超えるBLySレベルを有した。対照的に、ほとんどの正常コントロールは、5ng/mlよりも小さいBLySレベルを有し、そして10%よりも少ない正常コントロールが、10ng/mlよりも高いレベルを有した。血漿中のBLySタンパク質の上昇したレベルが、可溶性形態で存在し、そして抗IgM処理したB細胞をインビトロで刺激する能力によってアッセイされるような生物学的活性を有する。15ng/mlを超える血清BLySを有するSLE患者はまた、正常コントロールおよび5ng/ml未満の血漿BLySを有するSLE患者の両方と比較して、上昇した抗dsDNA抗体を有することが見出された(未公開データ)。
さらに、抗核抗体についてポジティブ(ANA+)ではあるが、SLEの分類に関するAmerican College of Rheumatology(ACR)の正式な必要条件を満たさない患者の2つのサブグループの血清が、BLySレベルについて分析された。最初のサブグループの血清は、SLEの臨床的圧痕を示さない患者由来のANA+血清であった。このグループは、わずかに上昇したレベルのBLyS(約9ng/ml BLyS)のみを有した。しかし、第二のサブグループ(これはSLEの臨床的圧痕を示す患者由来のANA+血清であった)は、有意に増加したBLySレベル(約15ng/ml)を有した。これらの結果は、上昇したレベルのBLySが、ACR判定基準を正式に満たすことに先行することを示唆する。ACR判定基準は、Tan,E.M.ら、Arthritis and Rheumatism 25:1271〜1277(1982)に記載される。
従って、特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、全身性エリテマトーデスまたはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、SLEを示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、IgA腎症またはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、IgA腎症を示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、シェーグレン症候群またはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、シェーグレン症候群を示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、HIV感染またはそれに関連する状態(例えば、AIDS)を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、HIV感染を示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、重症筋無力症またはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、重症筋無力症を示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)またはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)を示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、溶血性貧血またはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、溶血性貧血を示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、甲状腺炎またはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、甲状腺炎を示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、グッドパスチャー症候群またはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、グッドパスチャー症候群を示す。
他の特定の実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、多発性硬化症またはそれに関連する状態を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、多発性硬化症を示す。
さらなる実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、慢性関節リウマチを検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中(例えば、血清および骨髄液)のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルのBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が、慢性関節リウマチを示す。
さらなる実施形態において、BLySに特異的に結合する本発明の抗体は、慢免疫に基づくリウマチ学的疾患(例えば、SLE、慢性関節リウマチ、CREST症候群(石灰沈着症、レーノー現象、食道運動障害、強指症および毛細血管拡張症によって特徴付けられる、強皮症の改変型)、セロネガティブ脊椎関節障害(Seronegative spondyloarthropathy)(SpA)、多発性筋炎/皮膚筋炎、顕微的多発性血管炎、C型肝炎関連関節炎、高橋関節炎、および未分化結合組織障害)を検出、診断、予後診断またはモニターするための診断的目的に使用され得る。本発明は、BLySの異常な発現の検出を提供し、この検出は:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中(例えば、血清および骨髄液)のBLySの発現をアッセイする工程;および(b)このBLySのレベルを、標準的なBLySのレベル(例えば、正常な生物学的サンプル中)と比較する工程を包含し、これによって、標準レベルBLySと比較して、アッセイされたBLySのレベルの増加が免疫に基づくリウマチ学的疾患を示す。
血清BLySレベルは、71 SLE患者のサンプルを使用して、ネフローゼの範囲のタンパク尿(24時間の尿収集において3gmのタンパク尿より多い)と逆の相関があることが観察された(p=0.019)。タンパク尿は、血清BLyS決定のための静脈切開から1ヶ月以内の71 SLE患者において決定した。血清BLySは、正常なコントロールについて5%〜95%に基づいて、低位、正常、高位と分類された。ネフローゼの範囲タンパク尿は、血清ニュートロカイン−αレベルに逆に相関した。従って、特定の実施形態において、免疫に基づくリウマチ学的疾患(例えば、SLE、慢性関節リウマチ、CREST症候群(石灰沈着症、レーノー現象、食道運動性障害、強指趾症および毛細血管拡張症によって特徴付けられる種々の強皮症)、血清陰性脊椎関節症(SpA)、多発性筋炎/皮膚筋炎、顕微鏡的多発性血管炎、C型肝炎付随関節炎、高安動脈炎および未分化結合組織障害)と診断された個体における、(本発明の1つ以上の抗体を用いて決定された)BLySの血清レベルは、ネフローゼの範囲のタンパク尿のような疾患の特定の局面または症状の重症度を決定、診断、予後診断またはモニターするために使用され得る。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体は、CVIDに関連した状態(急性感染および再発性感染(例えば、肺炎、気管支炎、静脈洞炎、中耳炎、敗血症、髄膜炎、敗血症性関節炎および骨髄炎)、慢性肺疾患、自己免疫、慢性肉芽腫症、リンパ腫、癌(例えば、乳癌、胃癌、結腸癌、口癌、前立腺癌、肺癌、膣癌、卵巣癌、皮膚癌)、およびメラニン形成細胞(すなわち、黒色腫)、炎症性腸疾患(例えば、クローン病、潰瘍性大腸炎および潰瘍性大腸炎)、吸収不良、ホジキン病ならびにヴァルデンストレームマクログロブリン血症、に関連した状態が挙げられるがこれらに限定されない)を診断、予後診断、処置または予防するために使用される。
本発明は、以下の工程を包含する疾患または障害を診断または予後診断するための診断アッセイを提供する:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1つ以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySレベルについてアッセイする工程;および(b)例えば、疾患または障害を有さない患者由来の生物学的サンプル中の標準的なBLySレベルとこのBLySレベルを比較して、これによって、BLySの標準的なレベルと比較してアッセイしたBLySレベルにおける増加または減少が、特定の疾患または障害を示す、工程。癌については、個体由来の生検組織における比較的高い量のBLySの存在が、疾患の発生についての素因を示し得るか、または実際の臨床症状の現れる前に疾患を検出するための手段を提供し得る。この型のさらに最終的な診断は、健康の専門家がより早期の予防的な測定または積極的な処置をするのを可能にし得、それによって、癌の発生またはさらなる進行を予防する。
特定の実施形態において、生物学的サンプル中の比較的高い量の膜結合BLySの存在は、単球細胞に関連する白血病またはリンパ腫(例えば、急性骨髄性白血病および/またはその重症度など)の指標である。
他の特定の実施形態において、(可溶性BLySに結合するが、BLyS/BLySレセプター結合を阻害しない、本発明の抗体を使用して決定される)生物学的サンプル中の比較的高用量のBLySレセプターの存在は、B細胞に関連した白血病またはリンパ腫(例えば、急性骨髄性白血病、多発性骨髄腫、非ホジキンリンパ腫およびホジキン病)および/またはそれらの重症度の指標である。
特定の実施形態において、本発明は、全身性エリテマトーデスを診断または予後診断するための診断アッセイを提供し、このアッセイは、以下の工程を包含する:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1つ以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySレベルについてアッセイする工程;および(b)例えば、全身性エリテマトーデスを有さない患者由来の生物学的サンプル中の標準的なBLySレベルとこのBLySレベルを比較して、これによって、BLySの標準的なレベルと比較してアッセイしたBLySレベルにおける増加が、全身性エリテマトーデスの指標である、工程。
特定の実施形態において、本発明は、慢性関節リウマチを診断または予後診断するための診断アッセイを提供し、このアッセイは、以下の工程を包含する:(a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の1つ以上の抗体を使用して、個体の生物学的サンプル中のBLySレベルについてアッセイする工程;および(b)例えば、慢性関節リウマチを有さない患者由来の生物学的サンプル中の標準的なBLySレベルとこのBLySレベルを比較して、これによって、BLySの標準的なレベルと比較してアッセイしたBLySレベルにおける増加または減少が、慢性関節リウマチの指標である、工程。
本発明は、疾患または障害を診断または予後診断するための診断アッセイを提供し、このアッセイは、以下の工程を包含する:(a)可溶性BLySのみに免疫特異的に結合するが、BLyS/BLySレセプター結合を中和しない、本発明の1つ以上の抗体を使用して、個体の細胞中または組織サンプル中のBLySレセプターのレベルについてアッセイする工程;ならびに(b)例えば、疾患または障害を有さない患者由来の組織サンプル中の標準的なBLySレセプターレベルとこのBLySレセプターレベルを比較して、これによって、BLySレセプターの標準的なレベルと比較してアッセイしたBLySレセプターレベルにおける増加または減少が、特定の疾患または障害の指標である、工程。癌については、個体由来の生検組織における比較的高い量のBLySレセプターの存在が、疾患の発生についての素因が示し得るか、または実際の臨床症状の現れる前に疾患を検出するための手段を提供し得る。この型のさらに最終的な診断は、健康の専門家がより早期の予防的な測定または積極的な処置をするのを可能にし得、それによって、癌の発生またはさらなる進行を予防する。
本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)を使用して、本明細書中に記載されるか、または当業者に公知のような古典的な免疫組織学的方法を使用して生物学的サンプル中のタンパク質レベルをアッセイし得る(例えば、Jalkanenら、J.Cell.Biol.101:976−985(1985);Jalkanenら、J.Cell.Biol.105:3087−3096(1987)を参照のこと)。タンパク質遺伝子発現を検出するために有用な、抗体に基づく他の方法としては、イムノアッセイ(例えば、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)および放射免疫測定法(RIA))が挙げられる。適切な抗体アッセイ標識は、当該分野において公知であり、そして酵素標識(例えば、グルコースオキシダーゼ、アルカリホスファターゼおよび西洋わさびペルオキシダーゼ);放射性同位体(例えば、ヨウ素(121I、123I、125I、131I)、炭素(14C)、硫黄(35S)、トリチウム(H)、インジウム(111In、112In、113mIn、115mIn)、テクネチウム(99Tc、99mTc);タリウム(201Ti)、ガリウム(68Ga、67Ga)、パラジウム(103Pb)、モリブデン(99Mo)、キセノン(133Xe)、フッ素(18F)、153Sm、177Lu、159Gd、149Pm、140La、175Yb、166Ho、90Y、47Sc、186Re、188Re、142Pr、105Rh、ならびに97Ru);発光標識(例えば、ルミノール);ならびに蛍光標識(例えば、フルオレセインおよびローダミン)、ならびにビオチンが挙げられる。
本発明の1つの局面は、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒトにおける、BLySまたはBLySレセプターの異常な発現と関連する疾患または障害の検出および診断である。1つの実施形態において、診断は、以下:a)BLySに免疫特異的に結合する本発明の有効量の標識化抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)を被験体に(例えば、非経口的に、皮下に、または腹腔内に)投与する工程;b)このBLySが発現する被験体内の部位でこの標識化抗体が優先的に濃縮することを可能にするために(および結合していない標識化分子がバックグラウンドレベルまで除去されるために)投与後、時間間隔を待つ工程;c)バックグラウンドレベルを決定する工程;およびd)この被験体中の標識化抗体を検出する工程、を包含し、その結果、このバックグラウンドレベルを越え、そして疾患または障害なしに人において観察されるレベルを越えるかまたは下回る標識化抗体またはそのフラグメントの検出は、この被験体がBLySまたはBLySレセプターの異常な発現と関連する特定の疾患または障害を有することを示す。バックグラウンドレベルは、特定の系について以前に決定された標準的な値と、検出された標識化分子の量を比較する工程を包含する種々の方法により決定され得る。
被験体の大きさおよび使用される画像化システムが、診断の画像を作製するために必要である画像化部分の量を決定するということは、当該分野において理解される。放射性同位体部分の場合、ヒト被験体について、注入される放射能の量は、通常、約5〜20mキュリーの範囲の99Tcである。次いで、標識化抗体は、特定のタンパク質を含む細胞の位置で優先的に蓄積する。インビボでの腫瘍の画像化は、S.W.Burchielら、「Immunopharmacokinetics of Radiolabeled Antibodies and Their Fragments」(Tumor Imaging、第13章:The Radiochemical Detection of Cancer,S.W.BurchielおよびB.A.Rhodes編、Masson Publishing Inc.(1982)において、記載される。
使用する標識の型および投与の様式を含む、いくつかの変動に依存して、標識化分子が被験体中の部位に優先的に濃縮することを可能にするため、および結合していない標識化分子がバックグラウンドレベルまで除去されるための投与後の時間間隔は、6〜48時間または6〜24時間または6〜12時間である。別の実施形態において、投与後の時間間隔は、5〜20日間または5〜10日間である。
1つの実施形態において、疾患または障害をモニターすることは、疾患または障害を診断するための方法を繰り返すことによって実施される(例えば、最初の診断から1ヶ月後、最初の診断から6ヶ月後、最初の診断から1年後、など)。
標識化分子の存在は、インビボスキャニングについての当該分野で公知の方法を使用して患者中で検出され得る。これらの方法は、使用される標識の型に依存する。当業者は、特定の標識を決定するための適切な方法を決定することができる。本発明の診断方法において使用され得る方法およびデバイスは、コンピュータ断層撮影法(CT)、体全体のスキャン(例えば、陽子(position)放射断層撮影法(PET))、磁気共鳴画像法(MRI)、および超音波診断法を含むが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、分子を放射性同位体で標識し、そして放射応答外科的機器(radiation responsive surgical instrument)(Thurstonら、米国特許第5,441,050号)を使用して患者中で検出する。別の実施形態において、分子を蛍光化合物で標識し、そして蛍光応答スキャニング機器を使用して患者中で検出する。別の実施形態において、分子を陽電子放射金属で標識し、そして陽電子放射断層撮影法を使用して患者中で検出する。さらに別の実施形態において、分子を常磁性標識で標識し、そして磁気共鳴画像法(MRI)を使用して患者中で検出する。
(免疫表現型分類(immunophenotyping))
本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)は、BLyS発現またはBLySレセプター発現によって、細胞株および生物学的サンプルの免疫表現型分類のために利用され得る。本発明の抗体、フラグメントまたは改変体を使用する種々の技術を用いて、BLySまたはBLySレセプターを発現する細胞集団(すなわち、免疫細胞、特に、単球細胞またはB細胞)をスクリーニングし得、そしてそれらの技術には、抗体でコーティングされた磁気ビーズを用いる磁気分離、固体マトリクス(すなわち、プレート)に付着した抗体を用いる「パンニング」、ならびにフローサイトメトリー(例えば、米国特許第5,985,660号;およびMorrisonら、Cell,96:737−49(1999)を参照のこと)が挙げられる。
これらの技術は、血液学的悪性腫瘍(すなわち、急性白血病患者における最少残留疾患(minimal residual disease)(MRD))および対宿主性移植片病(GVHD)を予防するための移植術における「非自己」細胞と共に見出され得るような、細胞の特定集団のスクリーニングを可能にする。あるいは、これらの技術は、ヒト臍帯血において見出され得るような増殖および/または分化を受け得る、造血幹細胞および先祖細胞のスクリーニングを可能にする。
1つの実施形態において、本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)を使用して、単球起源またはB細胞起源の細胞を同定する。
(抗体の治療用途)
本発明はさらに、抗体ベースの治療に関し、この治療は、1つ以上の開示された疾患、障害、または状態を処置するために、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒトの患者に、本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)を投与する工程を包含する。本発明の治療化合物としては、本発明の抗体ならびに本明細書中に記載されるような本発明の抗体(ならびに抗イディオタイプ抗体)をコードする核酸が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の抗体は、BLySまたはBLySレセプターの異常な発現および/または活性に関連した疾患、障害または状態(本明細書中に記載される任意の1つ以上の疾患、障害、または状態を含むがこれらに限定されない)を処置、改善または予防するために使用され得る。BLySの異常な発現および/もしくは活性、またはBLySレセプターの異常な発現および/もしくは活性に関連した疾患、障害または状態の処置および/または予防は、それらの疾患、障害または状態に関連した症状を緩和する工程を含むが、これに限定されない。本発明の抗体は、当該分野で公知であるか、または本明細書中に記載されるように、薬学的に受容可能な組成物中に提供され得る。
BLySのアゴニストまたはアンタゴニスト、好ましくは、BLyS誘導シグナル形質導入として機能する、本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)は、BLyS発現、BLyS機能の欠失、BLySレセプターの異常な発現、またはBLySレセプター機能の欠失に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与され得る。例えば、BLySとそのレセプターとの間の相互作用を崩壊させる本発明の抗体は、異常なBLyS発現、過剰なBLyS機能、異常なBLySレセプター発現、または過剰なBLySレセプター機能に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与され得る。BLySがそのレセプターに結合するのを妨げないが、BLyS誘導シグナル形質導入を阻害またはダウンレギュレートする本発明の抗体は、BLySの異常な発現、過剰なBLyS機能、BLySレセプターの異常な発現または過剰なBLySレセプター機能に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与され得る。詳細には、未結合BLyS、レセプター結合BLyS、または未結合BLySおよびレセプター結合BLySの両方を特異的に認識することによって、BLyS誘導シグナル形質導入を防止する本発明の抗体は、BLySの異常な発現、過剰なBLyS機能、BLySレセプターの異常な発現または過剰なBLySレセプター機能に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与され得る。本発明の抗体がBLyS誘導シグナル形質導入を阻害またはダウンレギュレートする能力は、本明細書中に記載される技術か、さもなければ当該分野で公知の技術によって決定され得る。例えば、BLyS誘導レセプター活性およびシグナル伝達分子の活性は、(例えば、本明細書中に記載されるように)免疫沈降後のウエスタンブロットによってレセプターまたはシグナル伝達分子のリン酸化(例えば、チロシンまたはセリン/トレオニン)を検出することによって決定され得る。
特定の実施形態において、本発明の抗体の非存在下でのBLyS活性に対して、少なくとも95%、少なくとも90%、少なくとも85%、少なくとも80%、少なくとも75%、少なくとも70%、少なくとも60%、少なくとも50%、少なくとも45%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも35%、少なくとも30%、少なくとも25%、少なくとも20%または少なくとも10%BLyS活性を阻害またはダウンレギュレートする、本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)は、BLySの異常な発現、過剰なBLyS機能、BLySレセプターの異常な発現または過剰なBLySレセプター機能に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与され得る。別の実施形態において、抗体、抗体フラグメントおよび/または抗体改変体の非存在下でのBLyS活性に対して、少なくとも95%、少なくとも90%、少なくとも85%、少なくとも80%、少なくとも75%、少なくとも70%、少なくとも60%、少なくとも50%、少なくとも45%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも35%、少なくとも30%、少なくとも25%、少なくとも20%または少なくとも10%BLyS活性を阻害またはダウンレギュレートする、この抗体の組み合わせ、抗体フラグメントの組み合わせ、抗体改変体の組み合わせ、あるいは抗体、抗体フラグメントおよび/または抗体改変体の組み合わせは、BLySの異常な発現、過剰なBLyS機能、BLySレセプターの異常な発現または過剰なBLySレセプター機能に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与され得る。
さらに、BLyS誘導シグナル形質導入を活性化する本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)は、BLyS発現、BLyS機能の欠失、BLySレセプターの異常な発現、またはBLySレセプター機能欠失に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与され得る。これらの抗体は、例えば、BLySの多量体化および/またはレセプターの多量体化を誘導することによって、BLyS媒介レセプター活性の生物学的活性の全てまたはそれらのサブセットを増強または活性化し得る。本発明の抗体は、BLySと予め複合体化してか、または予め複合体化せずに投与され得る。特定の実施形態において、本発明の抗体の非存在下でのBLyS活性に対して、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%または少なくとも99%BLyS活性を増加させる本発明の抗体は、BLySの異常な発現、BLyS機能の欠失、BLySレセプターの異常な発現、またはBLySレセプター機能の欠失に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与され得る。別の実施形態において、この抗体または抗体フラグメントおよび/または抗体改変体の非存在下でのBLyS活性に対して、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%BLyS活性を増加させる、この抗体の組み合わせ、抗体フラグメントの組み合わせ、抗体改変体の組み合わせ、あるいは抗体、抗体フラグメントおよび/または抗体改変体の組み合わせは、BLySの異常な発現、BLyS機能の欠失、BLySレセプターの異常な発現またはBLySレセプター機能の欠失に関連した疾患または障害を処置、予防または改善するために動物に投与される。
BLySに免疫特異的に結合する本発明の1つ以上の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)は、治療剤として体内において局所的または全身的に使用され得る。本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)はまた、他のモノクローナル抗体もしくはキメラ抗体、またはリンホカインもしくは造血増殖因子(例えば、IL−2、IL−3およびIL−7)(例えば、これは、抗体と相互作用するエフェクター細胞の数または活性を増加するように作用する)と組み合わせて有益に用いられ得る。
本発明の抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)は、単独でか、または他の型の処置(例えば、放射線療法、化学療法、ホルモン療法、免疫療法、抗腫瘍剤、抗血管新生剤および抗炎症剤)と組み合わせて投与され得る。一般的に、患者と同じ種である種起源または種反応性(抗体の場合)の産物の投与が好ましい。従って、好ましい実施形態において、ヒト抗体、フラグメントまたは改変体(例えば、誘導体)、または核酸が、治療または予防のためにヒト患者に投与される。
BLySに免疫特異的に結合する本発明の高親和性および/または強力な、インビボでの阻害抗体および/または中和抗体(その抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子、を含む)、あるいは、BLySポリヌクレオチドまたはポリペプチド(それらのフラグメントを含む)に対するイムノアッセイ、およびそれらに関連した障害の治療の両方のために、BLySに免疫特異的に結合する抗体をコードするポリヌクレオチドを使用することが好ましい。このような抗体は、好ましくは、BLySおよび/またはBLySフラグメントに対して親和力を有する。好ましい結合親和力としては、5×10−2M以下、10−2M以下、5×10−3M以下、10−3M以下、5×10−4M以下、10−4M以下、5×10−5M以下または10−5M以下の解離定数すなわちKを有する結合親和力が挙げられる。より好ましくは、本発明の抗体は、5×10−6M以下、10−6M以下、5×10−7M以下、10−7M以下、5×10−8M以下または10−8M以下の解離定数すなわちKで、BLySポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体に結合する。なおより好ましくは、本発明の抗体は、5×10−9M以下、10−9M以下、5×10−10M以下、10−10M以下、5×10−11M以下、10−11M以下、5×10−12M以下、10−12M以下、5×10−13M以下、10−13M以下、5×10−14M以下、10−14M以下、5×10−15M以下または10−15M以下の解離定数すなわちKdで、BLySポリペプチドまたはそのフラグメントもしくは改変体に結合する。本発明は、個々に列挙された各値の間のいずれか1つの範囲内の解離定数すなわちKdで、BLySポリペプチドに結合する抗体を含む。
好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLyS活性を中和する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、B細胞増殖を阻害する。
好ましい実施形態において、本発明の抗体(それらの抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子を含む)は、BLySの可溶性形態の、BLySレセプターへの結合を阻害または減少する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySの可溶性形態によって誘導されるB細胞増殖を阻害または減少する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySの可溶性形態によって誘導される免疫グロブリンの産生を阻害または減少する。
好ましい実施形態において、本発明の抗体(それらの抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子を含む)は、膜結合BLySのBLySレセプターへの結合を阻害または減少し得る。別の実施形態において、本発明の抗体は、BLySの膜結合形態によって誘導されるB細胞増殖を阻害または減少する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySの膜結合形態によって誘導される免疫グロブリンの産生を阻害または減少する。
好ましい実施形態において、本発明の抗体(それらの抗体フラグメントまたは改変体を含むか、あるいはそれらからなる分子を含む)は、BLySの可溶性形態および膜結合形態の両方のBLySレセプターへの結合を阻害または減少する。別の実施形態において、本発明の抗体は、BLySのいずれかまたは両方の形態によって誘導されるB細胞増殖を阻害または減少する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体は、BLySのいずれかまたは両方の形態によって誘導される免疫グロブリンの産生を阻害または減少する。
1つの実施形態において、本発明は、本発明の抗体複合体を標的細胞(例えば、BLySの膜結合形態を発現する単球細胞、またはBLySレセプターを発現するB細胞)に送達する方法を提供する。
1つの実施形態において、本発明は、異種ポリペプチドまたは核酸に会合する本発明の分子を投与することによって、本発明の抗体および抗体複合体の細胞への特異的な送達方法を提供する。1つの例としては、本発明は、標的細胞中に治療タンパク質を送達するための方法を提供する。別の例において、本発明は、単鎖核酸(例えば、アンチセンスまたはリボザイム)または二本鎖核酸(例えば、細胞のゲノムに組み込み得るか、またはエピソームにて複製し得、そして転写され得るDNA)を、標的化細胞に送達するための方法を提供する。
別の実施形態において、本発明は、本発明の抗体または抗体複合体(例えば、ラジオアイソトープ、毒性または細胞障害性のプロドラッグと共役した抗体)を投与することによる、細胞の特異的破壊のための方法(例えば、腫瘍細胞の破壊)を提供する。特定の実施形態において、本発明は、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する、本発明の抗体または抗体複合体(例えば、ラジオアイソトープ、毒性または細胞障害性のプロドラッグと共役した抗体)を投与することによる、単球系統の細胞(例えば、白血病またはリンパ腫(例えば、急性骨髄性白血病)に関連する単球細胞)の特異的破壊のための方法を提供する。別の実施形態において、本発明は、可溶性BLySに結合するが、B細胞上のBLySレセプターに対するBLySの結合を阻害する、本発明の抗体または抗体複合体(例えば、ラジオアイソトープ、毒性または細胞障害性のプロドラッグと共役した抗体)を投与することによる、B細胞系統の細胞(例えば、白血病またはリンパ腫(例えば、慢性リンパ性白血病、多発性骨髄腫、非ホジキンリンパ腫、およびホジキン病)に関連するB細胞)の特異的破壊のための方法を提供する。
別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体を含む)は、BLySの可溶性形態によって誘導されるB細胞増殖を促進または増強する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体を含む)は、APRILの膜形態または可溶性形態によって誘導されるB細胞増殖を促進または増強する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体を含む)は、BLySの可溶性形態によって誘導される免疫グロブリン産生を増加または増強する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体を含む)は、APRILの膜結合形態または可溶性形態によって誘導される免疫グロブリン産生を増加または増強する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体を含む)は、T細胞依存性免疫原に対する免疫グロブリン産生を増加または増強する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体、ならびに抗抗体を含む)は、T細胞依存性免疫原に対する免疫グロブリン産生を増加または増強する。
別の実施形態において、本発明の治療学的組成物または薬学的組成物は、免疫障害を処置、予防または改善するために動物に投与される。免疫障害としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:自己免疫障害(例えば、関節炎、移植片拒絶、橋本甲状腺炎、インスリン依存性糖尿病、狼瘡、特発性血小板減少性紫斑病、全身性エリテマトーデスおよび多発性硬化症)、選択的IgA欠損、毛細血管拡張性運動失調、分類不能型免疫不全(CVID)、X連鎖無ガンマグロブリン血症、重症複合型免疫不全(SCID)、ヴィスコット‐オールドリッチ症候群、新生児好中球減少症(idiopathic hyper−eosinophilic syndrome)、単球性類白血病反応、単球増加症(monocytic leukocytosis)、単球減少症(monocytic leukopenia)、単球減少症(monocytopenia)、単球増加症(monocytosis)および移植片(graft)または移植片(transplant)拒絶。
本明細書中で議論されるように、本発明の抗体および抗体組成物は、哺乳動物(好ましくは、ヒト)において、種々の免疫関連障害および/またはこれらの障害に関連する状態を処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用され得る。多数の自己免疫障害が、免疫細胞による異物のように自己の不適性な認識から生じる。これらの不適性な認識は、宿主組織の破壊を導く免疫応答を生じる。従って、免疫応答(特に、B細胞の増殖および/または免疫グロブリンの産生)を阻害し得る本発明の抗体および抗体組成物の投与は、自己免疫障害を処置および/または予防する際に有効な治療法であり得る。従って、好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、自己免疫障害またはそれらの障害に関連する状態を処置、予防、改善、診断および/または予後診断するために使用される。
本発明の治療学的組成物および薬学的組成物を用いて処置、予防、改善、診断および/または予後診断され得る自己免疫障害およびこれらの障害に関連する状態としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性新生児血小板減少、特発性血小板減少性紫斑病、自己免疫好中球減少症、自己免疫性血球減少症、溶血性貧血、抗リン脂質症候群、皮膚炎、グルテン感受性腸症(gluten−sensitive enteropath)、アレルギー性脳脊髄炎、心筋炎、再発性多発性軟骨炎、リウマチ性心疾患、糸球体腎炎(例えば、IgA腎症)、多発性硬化症、神経炎、ブドウ膜炎眼炎(Uveitis Ophthalmia)、多発性内分泌腺症、紫斑病(例えば、ヘーノホ−シェーンライン紫斑病)、ライター病、スティッフマン症候群、自己免疫性肺炎症、心筋炎、IgA糸球体腎炎、膜性増殖性糸球体腎炎、リウマチ性心疾患、ギヤン‐バレー症候群、インスリン依存性真性糖尿病、および自己免疫性炎症性眼(autoimmune inflammatory eye)。
本発明の治療学的組成物および薬学的組成物を用いて処置、予防、改善、診断および/または予後診断され得るさらなる自己免疫障害およびこれらの障害に関連する状態としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:自己免疫性甲状腺炎、甲状腺機能低下不全症(すなわち、橋本甲状腺炎)(例えば、細胞媒介性細胞障害および体液性甲状腺細胞障害によってしばしば特徴付けられる)、全身性エリテマトーデス(例えば、循環して、局所的に産生された免疫複合体によってしばしば特徴付けられる)、円板状狼瘡、グッドパスチャー症候群(例えば、抗基底膜抗体によってしばしば特徴付けられる)、天疱瘡(例えば、表皮棘状抗体によってしばしば特徴付けられる)、レセプター自己免疫(例えば、(a)グレーヴズ病(例えば、TSHレセプター抗体によってしばしば特徴付けられる)、(b)重症筋無力症(例えば、アセチルコリンレセプター抗体によってしばしば特徴付けられる)および(c)インスリン抵抗性(インスリンレセプター抗体によってしばしば特徴付けられる))、自己免疫性溶血性貧血(抗体感作RBCの食菌作用によってしばしば特徴付けられる)、自己免疫血小板減少性紫斑病((抗体感作血小板の食菌作用によってしばしば特徴付けられる)。
本発明の治療学的組成物および薬学的組成物を用いて処置、予防、改善、診断および/または予後診断され得るさらなる自己免疫障害およびこれらの障害に関連する状態としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:慢性関節リウマチ(例えば、関節における免疫複合体によってしばしば特徴付けられる)、抗コラーゲン抗体を伴う強皮症(例えば、核小体および他の核抗体によってしばしば特徴付けられる)、混合結合組織病(例えば、可溶性核抗原(例えば、リボ核タンパク質)に対する抗体によってしばしば特徴付けられる)、多発性筋炎/皮膚筋炎(例えば、非ヒストンANAによってしばしば特徴付けられる)、悪性貧血(例えば、抗壁細胞、ミクロソーム、および内因子抗体によってしばしば特徴付けられる)、特発性アジソン病(例えば、体液性および細胞媒介性の副腎細胞傷害によってしばしば特徴付けられる)、不妊症(例えば、抗精子抗体によってしばしば特徴付けられる)、原発性糸球体腎炎およびIgA腎症のような糸球体腎炎(例えば、糸球体基底膜抗体または免疫複合体によってしばしば特徴付けられる)、水疱性類天疱瘡(例えば、基底膜におけるIgGおよび補体によってしばしば特徴付けられる)、シューグレン症候群(例えば、多組織抗体および/または特定の非ヒストンANA(SS−B)によってしばしば特徴付けられる)、糖尿病(例えば、細胞媒介性および体液性島細胞抗体によってしばしば特徴付けられる)、およびアドレナリン作用性薬物耐性(ぜん息または嚢胞性線維症を伴うアドレナリン作用性薬物耐性を含む)(例えば、β−アドレナリン作用性レセプター抗体によってしばしば特徴付けられる)、慢性活動性肝炎(例えば、平滑筋抗体によってしばしば特徴付けられる)、原発性胆汁性肝硬変(例えば、ミトコンドリア抗体によってしばしば特徴付けられる)、他の内分泌腺不全(例えば、いくつかの場合における特異的組織抗体によってしばしば特徴付けられる)、白斑(例えば、メラノサイト抗体によってしばしば特徴付けられる)、脈管炎(例えば、血管壁におけるIgおよび補体ならびに/または低い血清補体によってしばしば特徴付けられる)、MI後(例えば、心筋抗体によってしばしば特徴付けられる)、心臓切開症候群(例えば、心筋抗体によってしばしば特徴付けられる)、じんま疹(例えば、IgEに対するIgGおよびIgM抗体によってしばしば特徴付けられる)、アトピー性皮膚炎(IgEに対するIgGおよびIgM抗体によってしばしば特徴付けられる)、ぜん息(例えば、IgEに対するIgGおよびIgM抗体によってしばしば特徴付けられる)、炎症性筋障害、ならびに多くの他の炎症性、肉芽腫性、変性および萎縮性障害。
好ましい実施形態において、本発明の治療学的組成物および薬学的組成物は、以下の群のメンバーを処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用され得る:原発性糸球体腎炎として自己免疫性溶血性貧血、IgA糸球体腎炎、グッドパスチャー症候群、特発性血小板減少症、多発性硬化症、重症筋無力症、天疱瘡、多発性筋炎/皮膚筋炎、再発性多発性軟骨炎、慢性関節リウマチ、シェーグレン症候群、全身性エリテマトーデス、ブドウ膜炎、脈管炎、および原発性胆汁性肝硬変。
別の好ましい実施形態において、本発明の治療学的組成物および薬学的組成物は、例えば、以下のような免疫ベースのリウマチ学的疾患を処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用され得る:SLE、慢性関節リウマチ、CREST症候群(石灰沈着症、レーノー現象、食道運動性障害(esophageal motility disorders)、強指趾症および毛細血管拡張症によって特徴付けられる種々の強皮症)、血清反応陰性脊椎関節症(SpA)、多発性筋炎/皮膚筋炎、顕微鏡的多発性血管炎、C型肝炎付随性関節炎、高安動脈炎、および未分化結合組織細胞。
特定の好ましい実施形態において、本発明の治療学的組成物および薬学的組成物は、慢性関節リウマチおよび/またはそれに関連する状態を処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用され得る
例えば、本発明の抗体は、慢性関節リウマチ(RA)の臨床的診断を有する患者を処置するために使用される。処置される患者は、好ましくは、B細胞悪性腫瘍を有さない。さらに、患者は、RAを処置するために用いられる任意の1つ以上の薬剤(例えば、サリチラート;非ステロイド性抗炎症薬(例えば、インドメタシン、フェニルブタゾン、フェニル酢酸誘導体(例えば、イブプロフェンおよびフェノプロフェン)、酢酸ナフタリン(ナプロキセン)、ピロールアルカノール酸(pyrrolealkanoic acid)、トメチン(tometin)、インドール酢酸(スリンダク)、ハロゲン化アントラニル酸(メクロフェナム酸ナトリウム)、ピロキシカム、ゾメピラックおよびジフルニサル);抗マラリア薬(例えば、クロロキン);金塩;ペニシラミン;または、免疫抑制剤(例えば、このような薬物について公知の投薬量または減少した投薬量におけるメトトレキサートまたはコルチコステロイド)を用いて、必要に応じてさらに処置される。しかし、好ましくは、患者は、本発明の抗体を用いてのみ処置される。本発明の抗体は、下記のような投薬スケジュールに従って、RA患者に投与され、これは、当業者によって容易に決定され得る。一次応答は、パウルスの指標(Paulusら、Athritis Rheum. 33:477−484 (1990))(すなわち、患者および医師によって評価される、朝のこわばり、痛みの数および炎症性の関節の数、赤血球沈降速度(ESR)、ならびに疾患によって決定される5ポイントスケールの疾患重症度のうちの少なくとも2ポイントの改良点)によって決定される。本発明の抗体の投与は、上記のように処置される患者におけるRAの少なくとも1つ以上の症状を軽減する。
特定の好ましい実施形態において、本発明の治療学的組成物および薬学的組成物は、狼瘡および/またはそれに関連する医学的状態を処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用され得る。本発明の抗体組成物および抗体組成物を用いて処置、予防、改善、診断または予後診断され得る狼瘡に関連する状態としては以下が挙げられるがこれらに限定されない:血液学的障害(例えば、溶血性貧血、白血球減少症、リンパ球減少症および血小板減少症)、免疫学的障害(例えば、抗DNA抗体および抗Sm抗体)、発疹、羞明、口腔潰瘍、関節炎、発熱、疲労、体重減少、漿膜炎(例えば、胸膜炎)、腎臓障害(例えば、腎炎)、神経学的障害(例えば、発作、末梢ニューロパシー、CNS関連障害)、胃腸管系障害、レーノー現象および心膜炎。好ましい実施形態において、本発明の治療学的組成物および薬学的組成物は、全身性エリテマトーデスに関連する腎臓障害を処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用され得る。最も好ましい実施形態において、本発明の治療組成物および薬学的組成物は、全身性エリテマトーデスに関連する腎炎を処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用され得る。別の好ましい実施形態において、本発明の治療学的組成物および薬学的組成物は、狼瘡または糸球体腎炎を処置、予防または改善するために動物に投与される。
さらに特定の実施形態において、本発明の抗体は、溶血性貧血を処置、阻害、診断、予後診断または予防するために使用される。例えば、自己免疫溶血性貧血(AIHA)(例えば、クリオグロブリン血症(cryoglobinemia)またはクームス陽性貧血)と診断された患者は、本発明の抗体を用いて処置される。AIHAは、患者の赤血球と反応する自己抗体に起因する後天性溶血性貧血である。処置される患者は、好ましくは、B細胞悪性腫瘍を有していない。さらに、補助治療剤(例えば、グルココルチコイド、プレドニゾン、アザチオプリン、シクロホスファミド、ビンカラデン(vinca−laden)、血小板またはダナゾール)が抗体治療と併用され得るが、好ましくは、患者は、治療経過全体にわたり単一因子として本発明の抗体で処置される。本発明の抗体は、前記のような投薬スケジュールに従って、溶血性貧血の患者に投与され、このスケジュールは、当業者によって容易に決定され得る。全応答速度は、標準的な化学パラメータによって決定されるような血球数における改良、輸血の必要性の減少、改良したヘモグロビンレベルおよび/または溶血現象の減少に基づいて決定される。本発明の抗体の投与は、上記のように処置される患者における任意の1つ以上の溶血性貧血の症状を改良する。例えば、上記のように処置される患者は、ヘモグロビンの増加および溶血の化学パラメータにおける改良を示すか、または血清乳酸デヒドロゲナーゼおよび/もしくはビリルビンによって測定されるように正常に戻る。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療学的組成物または薬学的組成物は、シェーグレン症候群および/またはそれに関連する医学的状態を処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用される。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療学的組成物または薬学的組成物は、HIV感染および/またはそれに関連する医学的状態(例えば、AIDS)を処置、予防、改善、診断または予後診断するために使用される。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、重症筋無力症および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、IgA腎症および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、溶血性貧血および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、甲状腺炎および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、グッドパスチャー症候群および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、多発性硬化症および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、慢性リンパ球性白血病(CLL)および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、多発性骨髄腫および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、非ホジキンリンパ腫および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の治療的および薬学的組成物を用いて、ホジキン病および/またはこれに関する医学的状態を処置、予防、回復、診断、または予後判断する。
別の特定の好ましい実施形態において、本発明の抗体を用いて、成人免疫性血小板減少性紫斑病を処置、抑制、予後判断、診断、または予防する。成人免疫性血小板減少性紫斑病(ITP)は、比較的まれな血液学的障害であって、免疫媒介性の血球減少症の大部分を占める。この疾患は代表的に、骨髄における正常に増加した巨核球の存在下での急性出血に関し得、重篤な血小板減少症を伴って存在する。ITPを患うほとんどの患者は、血小板膜表面上の標的抗原に対するIgG抗体を有し、これが、脾臓における血小板壊死を生じ、血小板の細網内皮細胞破壊を加速させる(Bussell,J.B.Hematol.Oncol.Clin.North Am.(4):179(1990))。多くの治療的介入は、ITPの処置において有効であることが示されてきた。一般にステロイドは、考慮される最も重要な治療でありその後、ほとんどの患者は、免疫グロブリン静脈内投与法(intravenous immunoglobulin)(IVIG)、脾臓摘出、またはビンクリスチン、もしくは免疫抑制剤/細胞傷害因子を含む他の医学的治療法の候補となる。ITPを患う患者の80%までは、最初にステロイド過程に応答するが、ほとんどが完全寛解および持続した寛解を示さない。脾臓摘出は、ステロイド不全についての標準的な第2の重要な療法として推奨され、やがて感染に対する免疫の減少を生じ得る症例の60%近くにおいて、長期の寛解に導く。脾臓摘出は、実質的な罹患率(15%)および死亡率(2%)に関連し得る主要な外科的処置である。IVIGはまた、第2の重要な医学的療法として用いられるが、ITPを患う成人患者の小集団のみが寛解に達する。コルチコステロイド治療および/または脾臓摘出により生じる、関連する罹患率を伴わない、活性化B細胞による自己抗体の産生を阻害する治療の選択肢は、ITPを患う患者集団に対する重要な処置アプローチを提供する。ITPであると臨床診断された患者は、必要に応じてステロイド療法と組み合わして本発明の抗体(単数または複数)で処置される。処置された患者は、B細胞悪性腫瘍を有しない。本発明の抗体は、下記のような投薬スケジュールに従って、RA患者に投与され、この投薬スケジュールは、当業者によって容易に決定され得る。全体の患者の応答率は、上記のように、処置後に2週間あけた2回の連続した機会において決定される血小板数に基づいて決定される。Georgeら「Idiopathic Thrombocytopenic Purpura:A Practice Guideline Developed by Explicit Methods for The American Society of Hematology」,Blood 88:3−40(1996)(本明細書において参考として明確に援用される)を参照のこと。
別の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、動物に投与されて、IgE媒介性のアレルギー反応またはヒスタミン媒介性のアレルギー反応を処置、予防、または寛解する。アレルギー反応の例は、以下を含むがこれらに限定されない:ぜん息、鼻炎、湿疹、慢性じんま疹、およびアトピー性皮膚炎。別の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、動物に投与されて、アナフィラキシー、抗原分子に対する過敏症、または血液型不適合を処置、予防、または寛解する。別の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、動物に投与されて、炎症または炎症性障害を処置、予防、または寛解、または調節する。本発明の治療組成物または薬学的組成物を用いて処置、予防、または寛解され得る慢性および急性の炎症性障害の例は、以下を含むが、これらに限定されない:慢性前立腺炎、肉芽腫性前立腺炎、およびマラコプラキア、感染に関する炎症(例えば、敗血症性ショック、敗血症、または全身性炎症応答症候群(SIRS))、虚血再灌流傷害、エンドトキシン致死、関節炎、補体媒介性超急性拒絶、腎炎、サイトカインまたはケモカイン誘導性肺傷害、クローン病、炎症性腸疾患、慢性および急性の炎症性肺疾患、細菌感染、乾癬、敗血症、大脳マラリア、関節炎、胃腸炎、ならびに糸球体腎炎。
別の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、動物に投与されて、虚血および動脈硬化症を処置、予防、または寛解する。このような障害の例は、再灌流障害(例えば、心臓および/または脳においての)および心肥大を含むがこれらに限定されない。
本発明の治療組成物または薬学的組成物はまた、血液凝固を調節し、血液凝固障害(例えば、抗体媒介性血栓症(すなわち、抗リン脂質抗体症候群(APS))を処置または予防するため投与され得る。例えば、本発明の治療組成物または薬学的組成物はまた、抗カルジオリピン抗体の産生に関わる細胞の増殖および分化を阻害し得る。本発明のこれらの組成物を用いて、以下を含むがこれらに限定されない血栓症関連事象を処置、予防、寛解、診断、および/または予後判断し得る:発作(および反回性発作)、心臓発作、深在静脈血栓症、肺動脈塞栓症、心筋梗塞、冠状動脈疾患(例えば、抗体媒介性の冠状動脈疾患)、血栓症、心臓血管手術(例えば、冠状動脈バイパス移植)後の移植片再閉塞、再発性の胎児の損失(fetal loss)、および再発性の心臓血管血栓塞栓事象。
本発明の治療組成物または薬学的組成物はまた、器官拒絶または対宿主性移植片病(GVHD)および/またはこれらに関する状態を処置、予防、または寛解するために投与され得る。器官拒絶は、免疫応答を介した宿主免疫細胞の移植組織片破壊により生じる。同様に、免疫応答はまた、GVDHに関するが、この場合、外来性の移植免疫細胞が宿主組織を破壊する。免疫応答を阻害する本発明の抗体の投与は、器官拒絶またはGVHDを予防するのに有用な治療であり得る。
別の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、動物に投与されて、増大したアポトーシスに関する疾患または障害(AIDS、神経変性障害(例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症、色素性網膜炎、小脳変質)、脊髄形成異常症候群(例えば、再生不良性貧血)、虚血傷害(例えば、心筋梗塞、発作および再灌流傷害に起因するもの)、毒素誘導性肝疾患(例えば、アルコールに起因するもの)、敗血症性ショック、悪液質および食欲不振を含むが、これらに限定されない)を処置、予防、または寛解する。別の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、動物に投与されて、骨髄不全(例えば、再生不良性貧血および脊髄形成異常症候群)を処置、予防、または寛解する。
別の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、動物に投与されて、悪性腫瘍の増殖、進行および/または転移ならびに細胞生存の増加もしくはアポトーシスの阻害に関する増殖性障害を処置、予防、または寛解する。このような障害の例は、以下を含むがこれらに限定されない:白血病(例えば、急性白血病(例えば、急性リンパ性白血病および急性骨髄性白血病))、新形成、腫瘍(例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮腫、骨膜腫、中皮腫、ユーイング腫、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌、膵臓癌、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原生癌、腎細胞癌、肝細胞癌、胆管癌、絨毛癌、精上皮腫、胎生期癌、ウィルムス腫瘍、頚部癌、精巣癌、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、星状細胞腫、髄芽細胞腫、頭蓋咽頭腫、脳室上衣細胞腫、松果体腫、血管芽細胞腫、聴神経鞘腫、突起神経膠腫、髄膜腫、黒色腫、神経芽細胞腫、および網膜芽細胞腫)、H鎖病、転移、または制御不能な細胞増殖によって特徴付けられる任意の疾患もしくは障害を含むが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を用いて、高ガンマグロブリン血症(hpergammagloulinemia)によって特徴付けられる障害(例えば、AIDS、自己免疫疾患、およびいくつかの免疫不全)を処置または予防する。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を用いて、血清免疫グロブリン産生欠乏、反復感染、および/または免疫系不全によって特徴付けられる障害を処置または予防する。さらに、本発明の治療組成物または薬学的組成物を用いて以下を処置または予防し得る:関節の感染症、骨の感染症、皮膚の感染症および/または耳下腺の感染症、血液由来の感染症(例えば、敗血症、髄膜炎、敗血症性関節炎および/または骨髄炎)、自己免疫疾患(例えば、本明細書中で開示されるもの)、炎症性障害、および悪性疾患、および/もしくはこれらの感染症、疾患、障害および/または悪性疾患に関する任意の疾患または障害または状態(CVID、他の初期の免疫不全、HIV疾患、CLL、再発性気管支炎、静脈洞炎、中耳炎、結膜炎、肺炎、肝炎、髄膜炎、帯状疱疹(例えば、重篤な帯状疱疹)、および/またはニューモシスティス(pneumocystis carnii)を含むがこれらに限定されない)。
本発明の治療組成物または薬学的組成物を用いて、以下に関する疾患または障害または状態の1つ以上を診断、予後判断、処置、または予防し得る:初期免疫不全(immuodeficiencies)、免疫媒介性血小板減少症、川崎症候群、骨髄移植(例えば、最近の成人または子供における骨髄移植)、慢性B細胞リンパ性白血病、HIV感染症(例えば、成人または小児のHIV感染症)、慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー、および輸血後の紫斑病。
さらに、本発明の治療組成物または薬学的組成物を用いて、以下に関する疾患または障害または状態の1つ以上を診断、予後判断、処置、または予防し得る:ギヤン−バレー症候群、貧血(例えば、パルボウイルスB19に関する貧血、感染(例えば、反復性感染)に対する高い危険にある安定な多発性骨髄腫を有する患者、自己免疫性溶血性貧血(例えば、温式抗体型(warm−type)自己免疫性溶血性貧血)、血小板減少症(例えば、新生児血小板減少症)、および免疫媒介性好中球減少症)、移植(例えば、CMV陽性器官のサイトメガロウイルス(CMV)陰性レシピエント)、低ガンマグロブリン血症(例えば、感染または罹患率に対する危険因子を伴う低ガンマグロブリン血症新生児)、てんかん(例えば、難治性てんかん)、全身性脈管炎症候群、重症筋無力症(例えば、重症筋無力症における代償不全)、皮膚筋炎、および多発性筋炎。
本発明のさらなる好ましい実施形態は、以下の適用における本発明の治療組成物または薬学的組成物の使用を含むが、これらに限定されない:
免疫系をブーストして、1つ以上の抗体(例えば、IgG、IgA、IgM、およびIgE)の増大した量を産生し、より高い親和性抗体(例えば、IgG、IgA、IgM、およびIgE)の産生を誘導し、そして/または免疫応答を増大するための、動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、ハムスター、モルモット、ブタ、ミニブタ(micro−pig)、ニワトリ、ラクダ、ヤギ、ウマ、ウシ、ヒツジ、イヌ、ネコ、非ヒト霊長類、およびヒト、最も好ましくはヒト)への投与。特定の非特定的な実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を投与して、免疫系をブーストして、IgGの増大した量を産生する。別の特定の非特定的な実施形態において、本発明の抗体を投与して、免疫系をブーストして、IgAの増大した量を産生する。別の特定の非特定的な実施形態において、本発明の抗体を投与して、免疫系をブーストして、IgMの増大した量を産生する。
機能的な内因性抗体分子を産生し得ないか、またはさもなければ他の損なわれた内因性免疫系を有し得るが、別の動物由来の再構成された、または一部が再構成された免疫系によってヒト免疫グロブリン分子を産生し得る動物(上記に挙げたものおよびトランスジェニック動物もまた含むが、これらに限定されない)への投与(例えば、PCT国際公開番号WO98/24893,WO/9634096,WO/9633735,およびWO/9110741を参照のこと)。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、特定の抗原に対する免疫応答性を増大するワクチンアジュバントとして用いる。特定の実施形態において、ワクチンは、本明細書中に記載される抗体である。別の特定の実施形態において、ワクチンアジュバントは、本明細書中に記載されるポリヌクレオチドである(例えば、抗体ポリヌクレオチド遺伝子のワクチンアジュバント)。本明細書中に記載されるように、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、当該分野で公知の技術(リポソーム送達、組換えベクター送達、裸の(naked)DNAの注入、および遺伝子銃送達を含むがこれらに限定されない)を用いて投与され得る。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、腫瘍特異的免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、抗ウイルス免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いる。本発明の組成物をアジュバントとして用いて増大され得る抗ウイルス免疫応答は、本明細書中に記載されるかまたは当該分野で公知の疾患または症状に関するウイルスを含むがこれらに限定されない。特定の実施形態において、本発明の組成物は、AIDS、髄膜炎、デング熱、EBV、および肝炎(例えば、B型肝炎)からなる群から選択されるウイルス、疾患、または症状に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、以下:HIV/AIDS、RSウイルス、デング熱ウイルス、ロタウイルス、日本脳炎B型ウイルス、インフルエンザA型ウイルスおよびB型ウイルス、パラインフルエンザウイルス、麻疹ウイルス、サイトメガロウイルス、狂犬病ウイルス、フニンウイルス、チクングニヤウイルス、リフトバレー熱ウイルス、単純疱疹ウイルス、ならびに黄熱病ウイルスからなる群から選択されるウイルス、疾患、または症状に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、HIV gp120抗原に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いられる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、抗細菌または抗真菌免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いられる。本発明の組成物をアジュバントとして用いて増大され得る抗細菌または抗真菌免疫応答は、本明細書中に記載されるかまたは当該分野で公知の疾患または症状に関する細菌または真菌を含むがこれらに限定されない。特定の実施形態において、本発明の組成物は、破傷風、ジフテリア、ボツリスム、およびB型髄膜炎からなる群から選択される細菌または真菌、疾患、または症状に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いられる。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、以下:コレラ菌(Vibrio cholerae)、らい菌(Mycobacterium leprae)、チフス菌(Salmonella typhi)、パラチフス菌(Salmonella paratyphi)、髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)、肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)、B群連鎖球菌(Group B streptococcus)、赤痢菌属種(Shigella spp.)、腸毒性大腸菌(Enterotoxigenic Escherichia coli)、腸出血性大腸菌(Enterohemorrhagic E.coli)、Borrelia burgdorferi、およびプラスモディウム属(マラリア)からなる群から選択される細菌または真菌、疾患、または症状に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いられる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物は、抗寄生虫免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いられる。本発明の組成物をアジュバントとして用いて増大され得る抗寄生虫免疫応答は、本明細書中に記載されるかまたは当該分野で公知の疾患または症状に関する寄生虫を含むがこれらに限定されない。特定の実施形態において、本発明の組成物は、寄生虫に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いられる。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、プラスモディウム属(マラリア)に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして用いられる。
特定の実施形態において、本発明の組成物は、ワクチンアジュバントとして患者に投与され得る。さらなる特定の実施形態において、本発明の組成物はワクチンアジュバントとして、免疫不全に罹患した患者に投与され得る。さらなる特定の実施形態において、本発明の組成物はワクチンアジュバントとして、HIVに罹患した患者に投与され得る。
特定の実施形態において、本発明の組成物を用いて、標準ワクチンおよび実験ワクチンに対する抗原特異的抗体応答を増大または亢進し得る。特定の実施形態において、本発明の組成物を用いて、標準ワクチンおよび実験ワクチンで処置された患者におけるセロコンバージョンを亢進し得る。別の特定の実施形態において、本発明の組成物を用いて、標準ワクチンおよび実験ワクチンに対する応答における独特のエピトープを認識する抗体のレパートリーを増大し得る。
好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体、ならびに抗抗体抗体を含む)は、標準ワクチンおよび試験ワクチンに対する抗原特異的抗体応答を、BLySレセプター(例えば、BCMAおよびTACI)に対する可溶性形態BLySの結合を調節することによって、増大または亢進する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体、ならびに抗抗体抗体を含む)は、標準ワクチンおよび実験ワクチンに対する抗原特異的抗体応答を、APRILレセプター(例えば、BCMAおよびTACI)に対する可溶性形態APRILの結合を調節することによって、増大または亢進する。
好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体、ならびに抗抗体抗体を含む)は、標準ワクチンおよび実験ワクチンで処置された患者におけるセロコンバージョンを、BLySレセプター(例えば、BCMAおよびTACI)に対する可溶性形態BLySの結合を調節することによって、増大または亢進する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体、ならびに抗抗体抗体を含む)は、標準ワクチンおよび試験ワクチンで処置された患者におけるセロコンバージョンを、APRILレセプター(例えば、BCMAおよびTACI)に対する可溶性形態APRILの結合を調節することによって、増大または亢進する。
好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体、ならびに抗抗体抗体を含む)は、標準ワクチン接種および実験ワクチン接種に対する応答における独特のエピトープを認識する抗体のレパートリーを、BLySレセプター(例えば、BCMAおよびTACI)に対する可溶性形態BLySの結合を調節することによって、増大または亢進する。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体(抗体フラグメントおよび改変体、ならびに抗抗体抗体を含む)は、標準ワクチン接種および実験ワクチン接種に対する応答における独特のエピトープを認識する抗体のレパートリーを、APRILレセプター(例えば、BCMAおよびTACI)に対する可溶性形態APRILの結合を調節することによって、増大または亢進する。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、病原体に対するB細胞応答性の刺激因子として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、免疫抑制治療を受ける前の個体の免疫状態を上昇させる因子として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、より高い親和性抗体を誘導するための因子として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、血清免疫グロブリン濃度を増大するための因子として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、免疫無防備状態の個体の回復を促進するための因子として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、老齢集団における免疫応答性をブーストするための因子として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、骨髄移植および/または他の移植(例えば、同種異系または異種の器官移植)前、最中、または後に、免疫系エンハンサーとして用いる。移植に関して、本発明の組成物は、移植前、移植と同時に、または移植後に投与され得る。特定の実施形態において、本発明の組成物は、移植後に、T細胞集団の回復が始まる前に投与され得る。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、移植後に、T細胞集団の回復が始まった後であるが、B細胞集団の十分な回復前に最初に投与される。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、B細胞免疫不全の個体(例えば、部分的または完全な脾摘出術を受けた個体)における免疫応答性をブーストするための因子として用いる。本発明の抗体および/または組成物を投与することによって寛解または処置され得るB細胞免疫不全は、以下を含むがこれらに限定されない:重症複合型免疫不全(SCID)(X連鎖)、SCID(常染色体)、アデノシンデアミナーゼ欠損(ADA欠損)、X連鎖無ガンマグロブリン血症(XLA)、ブルートン(Bruton)病、先天性無ガンマグロブリン血症、X連鎖小児性無ガンマグロブリン血症、後天性無ガンマグロブリン血症、成人発症性(adult onset)無ガンマグロブリン血症、遅発性無ガンマグロブリン血症、異常ガンマグロブリン血症、低ガンマグロブリン血症、一過性乳児低ガンマグロブリン血症、不特定(unspecified)低ガンマグロブリン血症、無ガンマグロブリン血症、分類不能型免疫不全(CVID)(後天性)、ヴィスコット−オールドリッチ症候群(WAS)、過剰IgMを伴うX連鎖免疫不全、過剰IgMを伴う非X連鎖免疫不全、選択的IgA不全、IgGサブクラス不全(IgA不全を伴うかまたは伴わない)、正常Igまたは増大したIgを伴う抗体不全、胸腺腫を伴う免疫不全、Ig重鎖欠損、κ鎖欠損、B細胞リンパ球増殖性障害(BLPD)、選択的IgM免疫不全、劣性無ガンマグロブリン血症(スイス型)、細網発育不全(reticular dysgenesis)、新生児好中球減少、重篤な先天性白血球減少症、胸腺リンパ形成不全−免疫不全を伴う発育不全または形成異常、毛細血管拡張性運動失調、短肢小人症、X連鎖リンパ球増殖性症候群(XLP)、ネゼロフ症候群−Igを伴う複合型免疫欠損、プリンヌクレオチドホスホリラーゼ欠損(PNP)、MHCクラスII欠損(不全リンパ球症候群)、および重症複合型免疫不全。
特定の実施形態において、本発明の抗体および/または組成物は、選択的IgA免疫不全を処置または寛解するために投与される。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体および/または組成物は、毛細血管拡張性運動失調を処置または寛解するために投与される。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体および/または組成物は、分類不能型免疫不全を処置または寛解するために投与される。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体および/または組成物は、X連鎖無ガンマグロブリン血症を処置または寛解するために投与される。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体および/または組成物は、重症複合型免疫不全(SCID)を処置または寛解するために投与される。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体および/または組成物は、ヴィスコット−オールドリッチ症候群を処置または寛解するために投与される。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体および/または組成物は、過剰IgMを伴うX連鎖Ig不全を処置または寛解するために投与される。
後天性のB細胞機能欠損を有する個体においての免疫反応性をブーストするための因子として。本発明の抗体および/または組成物を投与することによって寛解または処置され得るB細胞機能の後天性の欠損を生じる状態は、HIV感染症、AIDS、骨髄移植、およびB細胞慢性リンパ球性白血病(CLL)を含むが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、一過性の免疫不全を有する個体における免疫応答性をブーストするための因子として用いられる。本発明の抗体および/または組成物を投与することによって寛解または処置され得る一過性の免疫不全を生じる状態は、以下を含むがこれらに限定されない:ウイルス感染(例えば、インフルエンザ)からの回復、栄養失調に関する状態、感染性単核球症からの回復、またはストレスに関する状態、麻疹からの回復、輸血からの回復、手術からの回復。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、単球、樹状細胞、T細胞、および/またはB細胞による抗原提示のレギュレーターとして用いる。1つの実施形態において、抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、インビトロまたはインビボでの抗原提示を亢進するか、抗原提示を拮抗する。さらに、関連した実施形態において、この抗原提示の亢進または阻害は、抗腫瘍処置または免疫系を調節するのに有用であり得る。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、粘膜免疫応答のメディエーターとして用いる。単球上のBLySの発現、B細胞上のBLySレセプターの発現、およびBLySに対するB細胞の応答性は、このモジュレーターが、B細胞と単球間またはこれらの分化した子孫間のシグナルの変換に関し得ることを示唆する。この活性は、いろんな点で、B細胞とT細胞間のCD40−CD154シグナル伝達に類似する。従って、本発明の抗BLyS抗体および組成物は、環境病原体に対するT細胞非依存性免疫応答のよいレギュレーターであり得る。特に、ヒトにおける粘膜部位に関連し、そして多くの先天免疫を担う非通常性のB細胞集団(CD5+)は、本発明の抗体または組成物に対して反応し得、その結果、個体の免疫状態を亢進するか阻害する。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、TH1細胞性応答とは対照的に、体液性応答(すなわち、TH2)の発生へと、個体の免疫系を指向する因子として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、腫瘍増殖を誘導、そして腫瘍を抗新形成因子に対しより感受性にする手段として用いる。例えば、多発性骨髄腫は、ゆっくりと分裂する疾患であり、従って全ての抗新形成レジメンに対して実質的に不応性である。これらの細胞がより急な増殖を強いられる場合、これらの感受性のプロフィールは変化するようである。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、細胞増殖の特異的アクチベーターまたはインヒビターが結合され得る単球細胞特異的結合タンパク質として用いる。この結果は、正常、疾患または新形成B細胞集団に対してこのようなアクチベーターまたはインヒビターの活性の焦点が当てられる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、細胞増殖の特異的アクチベーターまたはインヒビターが結合され得るB細胞特異的結合タンパク質として用いる。この結果は、正常、疾患または新形成B細胞集団に対してこのようなアクチベーターまたはインヒビターの活性の焦点が当てられる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、その特異性によって、単球細胞を検出する手段として用いる。この適用は,検出するための手段を供するために、タンパク質をビオチンまたは他の因子(例えば、本明細書中に記載されるようなもの)を用いて標識することを必要とし得る。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、その特異性によって、B系列細胞を検出する手段として用いる。この適用は,検出するための手段を供するために、タンパク質をビオチンまたは他の因子(例えば、本明細書中に記載されるようなもの)を用いて標識することを必要とし得る。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、AIDS、慢性リンパ球障害および/または分類不能型免疫不全のような症状におけるB細胞産性の刺激因子として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、細胞型の異質性混合物由来の単球を単離するための機能を備えた、単球選択装置の一部として用いる。本発明の抗体は、固相支持体に結合され得、次いでこれに単球が特異的に結合する。結合しなかった細胞は洗い流され、引き続いて、結合した細胞が溶出される。この選別の非限定的な使用は、例えば、移植前に骨髄細胞または末梢血からの腫瘍細胞の一掃を可能にする。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、細胞型の異質性混合物由来のB細胞を単離するための機能を備えた、B細胞選択装置の一部として用いる。可溶性BLySを結合する本発明の抗体(これは、BLyS/BLySレセプター相互作用を阻害しない)は、固体支持体に結合され得、次いでこれにB細胞が特異的に結合する。結合しなかった細胞は洗い流され、引き続いて、結合した細胞が溶出される。この選別の非限定的な使用は、例えば、移植前に骨髄細胞または末梢血からの腫瘍細胞の一掃を可能にする。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、手術後のリンパ組織の発生および/または再生、外傷または遺伝的不全の治療に用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、例えば、SCID患者の間で観察されるような免疫不全を生じる遺伝性疾患に対する、遺伝子ベースの治療に用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、BLyS媒介性応答を阻害または増大する抗体の産生のための抗原として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、リーシュマニアのような、単球に影響を与える寄生虫性疾患に対して防戦するように単球/マクロファージを活性化する手段として用いる。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、移植前の骨髄サンプルの前処理として用いる。このような処理は、B細胞提示を増大させ、従って再生を促進する。
特定の実施形態において、本発明の治療組成物または薬学的組成物を、BLySおよび/またはBLySレセプターによって誘導される分泌サイトカインを調節する手段として用いる。
本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、インビトロまたはインビボにおけるIgE濃度を調節し得る。
さらに、本発明の抗体ペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、IgE媒介性アレルギー反応を処置、予防および/または診断し得る。このようなアレルギー反応は、喘息、鼻炎および湿疹を含むがこれらに限定されない。
特定の実施形態において、本発明の抗体ペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、選択的IgA欠損症を処置、予防、診断および/または寛解する。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、毛細血管拡張性運動失調を処置、予防、診断および/または寛解する。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、分類不能型免疫不全を処置、予防、診断および/または寛解する。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、X連鎖無ガンマグロブリン血症を処置、予防、診断および/または寛解する。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、重症複合型免疫不全(SCID)を処置、予防、診断および/または寛解する。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、ヴィスコット−オールドリッチ症候群を処置、予防、診断および/または寛解する。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、高IgMを伴うX連鎖Ig不全を処置、予防、診断および/または寛解する。特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、高IgMを伴うX連鎖Ig不全を処置、予防、診断および/または寛解する。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、以下を処置、予防、および/または診断する:慢性骨髄性白血病、急性骨髄性白血病、白血病、細網白血病(hystiocytic leukemia)、単球性白血病(例えば、急性単球性白血病)、白血病性細網症、Shilling型単球性白血病および/または単球および/または単球細胞および/または組織に由来する他の白血病。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、例えば、結核で見られるような単球性類白血病反応を処置、予防、診断および/または寛解する。
別の特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを投与して、単球性白血球増加症、単球性白血球減少症、単球減少症および/または単球増加症を処置、予防、診断および/または寛解する。
特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、単球性障害および/または疾患および/またはこれらに関する状態を処置、予防、検出および/または診断する。
特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、原発性Bリンパ球性障害および/または疾患および/またはこれらに関する状態を処置、予防、検出および/または診断する。1つの実施形態において、このような原発性Bリンパ球性障害、疾患および/または状態は体液性免疫の完全または部分的損失によって、特徴付けられる。体液性免疫の完全または部分的損失によって特徴付けられ、本発明の組成物を用いて予防、処置、検出および/または診断し得る、原発性Bリンパ球性障害、疾患および/または状態は、X連鎖無ガンマグロブリン血症(XLA)、重症複合型免疫不全(SCID)および選択的IgA欠損症を含むが、これらに限定されない。
好ましい実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、1つ以上の任意の身体における種々の粘膜に関する疾患または障害の発症または状態を処置、予防および/または診断する。このような疾患または障害は、例えば以下を含むがこれらに限定されない:粘膜炎、粘膜破壊、粘液性結腸炎、皮膚粘膜リーシュマニア症(例えば、アメリカリーシュマニア症(American leishmaniasis、leishmaniasis americana)、鼻咽頭リーシュマニア症および新世界リーシュマニア症)、皮膚粘膜リンパ節症候群(例えば、川崎病)、小腸粘膜炎、粘液性類表皮癌、粘液類上皮腫、粘膜上皮形成異常、類粘液腺癌、ムコイド変性、ミクソイド変性(myxoid degeneration、myxomatous degeneration)、粘液腫症、ムコイド中膜変性(例えば、嚢胞性中膜壊死)、ムコリピドーシス(例えば、ムコリピドーシスI、ムコリピドーシスII、ムコリピドーシスIII、ムコリピドーシスIVを含む)、粘液溶解障害、粘液性膜性腸炎、小腸粘膜炎、ムコ多糖体症(例えば、I型ムコ多糖体沈着症(すなわちハーラー症候群)、IS型ムコ多糖体症(すなわちシャイエ症候群またはV型ムコ多糖体症)、II型ムコ多糖体症(すなわちハンター症候群)、III型ムコ多糖体症(すなわちサンフィリポ症候群)、IV型ムコ多糖体沈着症(すなわちモルキオ症候群)、VI型ムコ多糖体症(すなわちマロトー−ラミー症候群)、VII型ムコ多糖体症(すなわち、β−グリクロニダーゼ欠損に起因するムコ多糖体症)および粘液性スルファチドーシス)、ムコ多糖体尿、粘液膿性結膜炎、膿様粘液、ムコール菌症(すなわち接合真菌症)、粘膜病(すなわちウシのウイルス性下痢)、粘液性大腸結腸炎、(例えば、粘液性結腸炎(mucocolitis、 myxomembranous colitis))、およびムコビシドーシス(例えば、嚢胞性線維症、膵嚢胞性線維症、クラーク−ハッドフィールド症候群、膵線維嚢胞症、ムコビシドーシスおよび粘液過剰症)。非常に好ましい実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、特に化学療法に関する、粘膜炎を処置、予防および/または診断する。
好ましい実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、副鼻腔炎に影響する疾患もしくは障害、または副鼻腔炎に関連する状態を処置、予防および/あるいは診断するために使用される。
本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドによって処置、予防および/または診断され得るさらなる状態、疾患または症状は、骨髄炎である。
本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドによって処置、予防および/または診断され得るさらなる状態、疾患または症状は、心内膜炎である。
上記の用途の全ては、獣医用医薬に適用され得る。
本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、肺系(例えば、気管支)の疾患および障害(例えば、洞肺感染および気管支感染)、およびこのような疾患および障害に関連する状態、ならびに他の呼吸疾患および障害を処置、予防および/または診断するために使用され得る。特定の実施形態において、このような疾患および障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:気管支腺腫、気管支ぜん息、肺炎(例えば、気管支肺炎(bronchial pneumonia)、気管支肺炎(bronchopneumonia)、および結核性気管支肺炎)、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、気管支ポリープ、気管支拡張症(例えば、乾性気管支拡張症、円柱状気管支拡張症、および嚢胞状気管支拡張症)、細気管支癌(bronchiolar adenocarcinoma)、細気管支癌(bronchiolar carcinoma)、細気管支炎(例えば、滲出性細気管支炎、閉塞性線維性細気管支炎閉塞(obliterans)、および増殖性細気管支炎)、細気管支癌、気管支炎性ぜん息、気管支炎(例えば、ぜん息性気管支炎、カステラーニ気管支炎、慢性気管支炎、クループ性気管支炎、線維素性気管支炎、出血性気管支炎、鳥類の伝染性気管支炎、閉塞性気管支炎、形成性気管支炎、偽膜性気管支炎、腐敗性気管支炎、および寄生虫性気管支炎)、気管支中心性肉芽腫症、気管支浮腫、気管食道瘻、気管支原生癌、気管支性嚢胞、気管支結石症、気管支軟化症、気管支真菌症(例えば、気管支肺アスペルギルス症)、気管支肺スピロヘータ症、出血性気管支炎、気管支漏、気管支痙攣、気管支出血、気管支狭窄、ビオー呼吸、気管支呼吸、クスマウル呼吸、クスマウル−キーン呼吸、呼吸性アシドーシス、呼吸性アルカローシス、新生児呼吸窮迫症候群、呼吸機能不全、上気道硬化症、RSウイルスなど。
特定の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、慢性閉塞性肺疾患(COPD)を処置、予防および/または診断するために使用される。
別の実施形態において、本発明の抗体ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、以下が挙げられるがこれらに限定されない、線維症および線維症に関連する状態を処置、予防および/または診断するために使用される:嚢胞性線維症(膵嚢胞性線維症、クラーク−ハッドフィールド症候群、膵線維嚢胞症、ムコビシドーシス、および粘液過剰症のような線維症を含む)、心内膜心筋線維症、特発性腹膜後線維症、軟膜線維症、縦隔線維症、結節性表皮下線維組織増殖症、中心静脈周囲線維化、筋周囲線維化、パイプ軸線維症、置換性線維形成、外膜下線維症、およびシンマーズ陶製パイプ柄線維症。
別の実施形態において、本発明の治療的組成物または薬学的組成物は、感染性疾患を処置、予防または回復するために動物に投与される。感染性疾患としては、酵母感染、真菌感染、ウイルス感染および細菌感染に関連する疾患が挙げられる。本発明に従って処置または予防され得るウイルス感染を引き起こすウイルスとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:レトロウイルス(例えば、ヒトTリンパ球向性ウイルス(HTLV)I型およびII型、およびヒト免疫不全ウイルス(HIV))、ヘルペスウイルス(例えば、単純疱疹ウイルス(HSV)I型およびII型、エプスタイン−バーウイルス、HHV6−HHV8、およびサイトメガロウイルス)、アレナウイルス(例えば、ラッサ熱ウイルス)、パラミクソウイルス(例えば、麻疹ウイルス、ヒトRSウイルス、マンプス、および肺炎ウイルス)、アデノウイルス、ブンヤウイルス(例えば、ハンタウイルス)、コルナウイルス(cornaviruses)、フィロウイルス(例えば、エボラウイルス)、フラビウイルス(例えば、C型肝炎ウイルス(HCV)、黄熱病ウイルス、および日本脳炎ウイルス)、ヘパドナウイルス(例えば、B型肝炎ウイルス(HBV))、オルトポックスウイルス(例えば、インフルエンザウイルスA型、B型およびC型)、パポバウイルス(例えば、乳頭腫ウイルス)、ピコルナウイルス(例えば、ライノウイルス、エンテロウイルスおよびA型肝炎ウイルス)、ポックスウイルス、レオウイルス(例えば、ロタウイルス)、トガウイルス(例えば、風疹ウイルス)、ラブドウイルス(例えば、狂犬病ウイルス)。細菌感染を引き起こす微生物病原体としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない。Streptococcus pyogenes、Streptococcus pneumoniae、Neisseria gonorrhoea、Neisseria meningitidis、Corynebacterium diphtheriae 、Clostridium botulinum、Clostridium perfringens、Clostridium tetani、Haemophilus influenzae、Klebsiella pneumoniae、Klebsiella ozaenae、Klebsiella rhinoscleromotis、Staphylococcus aureus、Vibrio cholerae、Escherichia coli、Pseudomonas aeruginosa、Campylobacter(Vibrio)fetus、Campylobacter jejuni、Aeromonas hydrophila、Bacillus cereus、Edwardsiella tarda、Yersinia enterocolitica、Yersinia pestis、Yersinia pseudotuberculosis、Shigella dysenteriae、Shigella flexneri、Shigella sonnei、Salmonella typhimurium、Treponema pallidum、Treponema pertenue、Treponema carateneum、Borrelia vincentii、Borrelia burgdorferi、Leptospira icterohemorrhagiae、Mycobacterium tuberculosis、Toxoplasma gondii、Pneumocystis carinii、Francisella tularensis、Brucella abortus、Brucella suis、Brucella melitensis、Mycoplasma spp.、Rickettsia prowazeki、Rickettsia tsutsugumushi、Chlamydia spp.、およびHelicobacter pylori。
(遺伝子治療)
特定の実施形態において、抗体またはその機能的誘導体をコードする配列を含む核酸は、BLySおよび/またはそのレセプターの異常な発現および/または活性に関連した疾患または障害を処置、阻害または予防するために、遺伝子治療の目的で投与される。遺伝子治療とは、発現したか、または発現可能な核酸の、被験体への投与により行われる治療をいう。本発明のこの実施形態において、核酸は、それらのコードされたタンパク質を産生し、そのタンパク質は治療効果を媒介する。
当該分野で利用可能な遺伝子治療のための任意の方法は、本発明に従って使用され得る。例示的な方法が以下に記載される。
遺伝子治療の方法の一般的な概説については、Goldspielら,Clinical Pharmacy 12:488−505(1993);WuおよびWu,Biotherapy 3:87−95(1991);Tolstoshev,Ann.Rev.Pharmacol.Toxicol.32:573−596(1993);Mulligan,Science 260:926−932(1993);ならびにMorganおよびAnderson,Ann.Rev.Biochem.62:191−217(1993);May,TIBTECH 1 l(5):155−215(1993)を参照のこと。使用され得る、組換えDNA技術分野において一般的に公知である方法は、Ausubelら(編),Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,NY(1993);およびKriegler,Gene Transfer and Expression,A Laboratory Manual,Stockton Press,NY(1990)に記載される。
好ましい局面において、本発明の組成物は抗体をコードする核酸配列を含有するか、あるいはその配列からなり、上記核酸配列は、適切な宿主において、抗体、またはそのフラグメントもしくはキメラタンパク質、あるいはその重鎖もしくは軽鎖を発現する発現ベクターの一部である。特に、このような核酸は、抗体コード領域に作動可能に連結したプロモーター(好ましくは、異種プロモーター)を有し、上記プロモーターは誘導性であるかまたは構成性であり、そして必要に応じて組織特異的である。別の特定の実施形態においては、抗体をコードする配列および任意の他の所望の配列がゲノム中の所望の部位での相同組換えを促進する領域に隣接した核酸分子が使用され、従って抗体をコードする核酸の染色体内の発現を提供する(KollerおよびSmithies,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:8932−8935(1989);Zijlstraら,Nature 342:435−438(1989))。特定の実施形態において、発現したscFvは単鎖抗体であるか;あるいはこの核酸配列は、この抗体の重鎖および軽鎖の両方をコードする配列またはそのフラグメントもしくは改変体を含む。
核酸の患者への送達は、直接的(この場合、患者は核酸または核酸保有ベクターに直接的に曝される)か、または間接的(この場合、細胞は最初にインビトロで核酸で形質転換され、次いで患者に移植される)のいずれかであり得る。これらの2つのアプローチは、インビボ遺伝子治療として、またはエキソビボ遺伝子治療としてそれぞれ公知である。
特定の実施形態において、核酸配列はインビボで直接的に投与され、そこで核酸配列は発現されて、コードされた生成物を産生する。これは、当該分野で公知の多数の方法(例えば、それらを適切な核酸発現ベクターの一部分として構築し、そしてそれを細胞内になるように投与することにより(例えば、欠損性または弱毒化したレトロウイルスまたは他のウイルスベクター(米国特許第4,980,286号を参照のこと)を用いた感染により)、あるいは、裸のDNAの直接注射により、あるいは、微粒子ボンバードメント(例えば、遺伝子銃;Biolistic、Dupont)の使用により、あるいは脂質または細胞表面のレセプターでコーティングするか、もしくは薬剤をトランスフェクトすることにより、あるいは、リポソーム、微粒子、またはマイクロカプセル中へのカプセル化により、あるいは、それらを核に入ることが公知であるペプチドと結合させて投与することにより、レセプター媒介のエンドサイトーシスを受けるリガンドと結合させて投与することにより(例えば、WuおよびWu,J.Biol.Chem.262:4429−4432(1987)を参照のこと)(レセプターを特異的に発現する細胞の型を標的にするために用いられ得る)などのいずれかにより達成され得る。別の実施形態において、核酸−リガンド複合体が形成され得、ここで、リガンドはエンドソームを破壊するフソジェニック(fusogenic)ウイルス性ペプチドを含み、核酸がリソソーム分解を回避するようにする。さらに別の実施形態において、核酸は、特定のレセプターを標的とすることにより、細胞特異的な取り込みおよび発現についてインビボで標的とされ得る(例えば、PCT公開第WO92/06180号;同第WO92/22635号;同第WO92/20316号;同第WO93/14188号;同第WO93/20221号。あるいは、核酸は、細胞内部に導入され得、そして相同組換えにより、発現のために宿主細胞DNA中に組み込まれ得る(KollerおよびSmithies,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:8932−8935(1989);Zijlstraら,Nature 342:435−438(1989))。
具体的な実施形態において、本発明の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体をコードする核酸配列を含むウイルスベクターが使用される。例えば、レトロウイルスベクターが用いられ得る(Millerら,Meth.Enzymol.217:581−599(1993)を参照のこと)。これらのレトロウイルスベクターは、ウイルス性ゲノムの正確なパッケージングおよび宿主細胞DNAへの正確な組込みのために必要な構成要素を含む。遺伝子治療において使用される抗体をコードする核酸配列は、一つ以上のベクター中にクローン化され、これは、患者内への遺伝子の送達を容易にする。レトロウイルスベクターに関するさらなる詳細は、Boesenら,Biotherapy 6:291−302(1994)(これは、幹細胞を化学療法に対してより耐性にするために、mdrI遺伝子を造血性幹細胞に送達するための、レトロウイルスベクターの使用を記載する)に見出され得る。遺伝子治療におけるレトロウイルスベクターの使用を説明する他の参考文献は、以下である。:Clowesら,J.Clin.Invest.93:644−651(1994);Kieinら,Blood 83:1467−1473(1994);SalmonsおよびGunzberg,Human Gene Therapy 4:129−141(1993);ならびにGrossmanおよびWilson,Curr.Opin.in Genetics and Devel.3:110−114(1993)。
アデノウイルスは、遺伝子治療において使用され得る他のウイルスベクターである。アデノウイルスは、特に、気道上皮へ遺伝子を送達するための魅力的なビヒクルである。アデノウイルスは、自然に気道上皮に感染し、そこで軽い疾患を起こす。アデノウイルスベースの送達系の他の標的は、肝臓、中枢神経系、内皮細胞、および筋肉である。アデノウイルスは、非分裂細胞を感染することができるという利点を有する。KozarskyおよびWilson,Current Opinion in Genetics and Development 3:499−503(1993)は、アデノウイルスベースの遺伝子治療の概説を示す。Boutら,Human Gene Therapy 5:3−10(1994)は、アカゲザルの気道上皮に遺伝子を移すためのアデノウイルスベクターの使用を示した。遺伝子治療におけるアデノウイルスの使用の他の例は、Rosenfeldら,Science 252:431−434(1991);Rosenfeldら,Cell 68:143−155(1992);Mastrangeliら,J.Clin.Invest.91:225−234(1993);PCT公開第WO94/12649号;およびWangら,Gene Therapy 2:775−783(1995)に見出され得る。好ましい実施形態において、アデノウイルスベクターが使用される。
アデノ随伴ウイルス(AAV)はまた、遺伝子治療における使用が提案されてきた(Walshら,Proc.Soc.Exp.Biol.Med.204:289−300(1993);米国特許第5,436,146号)。
遺伝子治療への別のアプローチは、エレクトロポレーション、リポフェクション、リン酸カルシウム媒介トランスフェクション、またはウイルス感染のような方法により、組織培養中の細胞へ遺伝子を移入する工程を包含する。通常、移入の方法は、選択可能なマーカーの細胞への移入を含む。次いで、細胞は、移入された遺伝子を取り込みそして発現する細胞を単離するために選沢下に置かれる。次いで、それらの細胞は患者に送達される。
この実施形態においては、得られた組換え細胞のインビボ投与の前に、核酸が細胞に導入される。このような導入は、当該分野において公知の任意の方法により実施され得、それらの方法としては以下が挙げられるが、これらに限定されない:トランスフェクション、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、核酸配列を含むウイルスベクターまたはバクテリオファージベクターでの感染、細胞融合、染色体媒介の遺伝子移入、マイクロセル媒介の遺伝子移入、スフェロプラスト融合など。外来遺伝子の細胞への導入については、当該分野において多数の技術が公知であり(例えば、LoefflerおよびBehr,Meth.Enzymol.217:599−618(1993);Cohenら,Meth.Enzymol.217:618−644(1993);Clin,Pharma.Ther.29:69−92m(1985)を参照のこと)、そしてレシピエント細胞の必要な発生的および生理学的機能が破壊されないならば、本発明に従って使用され得る。この技術は、細胞への核酸の安定した移入を提供するはずであり、その結果、この核酸は、細胞により発現可能であり、好ましくは、その細胞の子孫により遺伝性でかつ発現可能である。
得られた組換え細胞は、当該分野において公知の様々な方法により、患者へ送達され得る。組換え血球(例えば、造血幹細胞または造血前駆細胞)は、好ましくは、静脈内に投与される。使用が考えられる細胞の量は、所望の効果、患者の状態などに依存し、当業者により決定され得る。
遺伝子治療の目的のために核酸が導入され得る細胞は、任意の所望の入手可能な細胞型を包含し、以下を含むがそれらに限定されない:上皮細胞、内皮細胞、ケラチノサイト、線維芽細胞、筋肉細胞、肝細胞;Tリンパ球、Bリンパ球、単球、マクロファージ、好中球、好酸球、巨核球、顆粒球のような血球;様々な幹細胞または前駆細胞、特に、造血幹細胞または造血前駆細胞(例えば、骨髄、臍帯血、末梢血、胎児の肝臓などから得られるような細胞)。
好ましい実施形態において、遺伝子治療に使用される細胞は、患者に対して自己である。
遺伝子治療において組換え細胞が使用される実施形態において、抗体をコードする核酸配列またはそのフラグメントは、細胞またはそれらの子孫により核酸配列が発現可能であるように細胞に導入され、そして次いで組み換え細胞は、治療的効果のためにインビボで投与される。具体的な実施形態において、幹細胞または前駆細胞が用いられる。インビトロで単離され得、そしてインビトロで維持され得る任意の幹細胞および/または前駆細胞は、本発明のこの実施形態に従って潜在的に使用され得る(例えば、PCT公開第WO94/08598号:StempleおよびAnderson,Cell 71:973−985(1992);Rheinwald,Meth.Cell Bio.21A:229(1980);ならびにPittelkowおよびScott,Mayo Clinic Proc.61:771(1986)を参照のこと)。
具体的な実施形態において、遺伝子治療の目的で導入されるべき核酸は、コード領域に作動可能に連結された誘導性プロモーターを含有し、その結果、核酸の発現は、適切な転写誘導因子の存在または不在を制御することにより制御可能である。
(組成物の治療的有用性または予防的有用性の証明)
本発明の化合物は、好ましくは、インビトロで試験され、次いで、ヒトにおける使用の前に、所望の治療的活性または予防的活性についてインビボで試験される。例えば、本発明の特定の抗体または組成物の投与が示されるか否かを決定するために使用され得るインビトロアッセイとしては、インビトロ細胞培養物アッセイが挙げられ、ここで患者の組織サンプルは培養物中で増殖され、本発明の抗体または組成物に暴露されるかまたはそうでなければこれを投与され、この組織サンプルに対する本発明のこのような抗体または組成物の効果が観察される。様々な特定の実施形態において、患者の障害に関与する細胞型の代表的な細胞を用いてインビトロアッセイを行い、本発明の抗体または組成物がこのような細胞型に対する所望の効果を有するか否かを決定し得る。好ましくは、本発明の抗体または組成物はまた、ヒトに投与する前に、インビトロアッセイおよび動物モデル系で試験される。
治療において使用するための本発明の抗体または組成物は、適切な動物モデル系(ラット、マウス、ニワトリ、ウシ、サルおよびウサギが挙げられるが、これらに限定されない)において、それらの毒性について試験され得る。抗体または組成物の毒性のインビボ試験について、当該分野で公知の任意の動物モデル系が使用され得る。
ウイルス感染の処置または予防における効力は、本発明の抗体または組成物の、ウイルスの複製を阻害する能力、伝染を阻害する能力、またはウイルス自体がその宿主中で確立するのを防止する能力、あるいは疾患の症状および進行を防止、回復または軽減する能力を決定することによって、証明され得る。例えば、本発明の抗体または組成物の投与後の、ウイルス負荷の減少、1つ以上の症状の回復、あるいは死亡率および/または罹患率の減少がある場合に、この治療は治療的であるとみなされる。
本発明の抗体または組成物は、細胞、好ましくはヒト細胞を、本発明の抗体または組成物、あるいは抗体またはコントロール組成物と接触させ、本発明の抗体または組成物が1つ以上のサイトカインを誘導する能力を決定することによって、IFN−γのようなサイトカインの発現を誘導する能力について試験され得る。当業者に公知の技術を使用して、サイトカインの発現レベルを測定し得る。例えば、サイトカインの発現レベルは、例えば、RT−PCRおよびノーザンブロッド分析によってサイトカインのRNAレベルを分析することによって、および例えば、免疫沈降に続くウエスタンブロッド分析およびELISAによりサイトカインのレベルを分析することによって測定され得る。好ましい実施形態において、本発明の化合物は、IFN−γの発現を誘導するその能力について試験される。
本発明の抗体または組成物は、免疫細胞、好ましくは、ヒト免疫細胞(例えば、T細胞、B細胞およびナチュラルキラー細胞)と、本発明の抗体もしくは組成物、またはコントロール化合物とを接触させ、本発明の抗体または組成物が免疫細胞の生物学的活性を調節(すなわち、増加または減少)する能力を決定することによって、免疫細胞の生物学的活性を調節する能力について試験され得る。免疫細胞の生物学的活性を調節する、本発明の抗体または組成物の能力は、抗原の発現を検出するか、免疫細胞の増殖(すなわち、B細胞増殖)を検出するか、シグナル伝達分子の活性化を検出するか、免疫細胞のエフェクター機能を検出するか、または免疫細胞の分化を検出することによって評価され得る。当業者に公知の技術は、これらの活性を測定するために使用され得る。例えば、細胞増殖は、H−チミジン組込みアッセイおよびトリパンブルー細胞カウントによってアッセイされ得る。抗原の発現は、例えば、以下を含むがこれらに限定されないイムノアッセイによってアッセイされ得る:ウエスタンブロッドのような技術を使用する競合および非競合アッセイ系、免疫組織学的ラジオイムノアッセイ、ELISA(酵素結合イムノソルベント検定法)、「サンドイッチ」イムノアッセイ、免疫沈降アッセイ、沈降反応、ゲル拡散沈降反応、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、補体結合アッセイ、イムノラジオメトリックアッセイ、蛍光イムノアッセイ、タンパク質AイムノアッセイおよびFASC分析。シグナル伝達分子の活性化は、例えば、キナーゼアッセイおよび電気泳動シフトアッセイ(EMSA)によってアッセイされ得る。好ましい実施形態において、本発明の抗体または組成物が、B細胞増殖を誘導する能力が測定される。別の好ましい実施形態において、本発明の抗体または組成物が免疫グロブリンの発現を調節する能力が測定される。
本発明の抗体または組成物は、インビトロ、エキソビボおよびインビボのアッセイにおいて、腫瘍形成を減少するその能力について試験され得る。本発明の抗体又は組成物はまた、インビトロおよびインビボアッセイにおいて、ウイルス複製を阻害する能力またはウイルス負荷を減少する能力について試験され得る。本発明の抗体または組成物はまた、当業者に公知のインビトロアッセイおよびインビボアッセイにおいて、細菌数を減少させる能力について試験され得る。本発明の抗体または組成物はまた、癌、免疫障害(例えば、炎症性疾患)、神経学的障害または感染性疾患に関連する1つ以上の症状を軽減する能力について試験され得る。本発明の抗体または組成物はまた、感染性疾患の時間経過を減少する能力について試験され得る。さらに、本発明の抗体または組成物は、癌、免疫障害または感染性疾患を含む疾患または障害に罹患している動物の生存期間を増加するそれらの能力について試験され得る。当業者に公知の技術を使用して、本発明の抗体または組成物のインビボにおける機能を分析し得る。
(治療的/予防的組成物および投与)
本発明は、被験体への有効量の本発明の抗体(またはそのフラグメントもしくは改変体)または薬学的組成物、好ましくは本発明の抗体の投与による処置、阻害および予防の方法を提供する。好ましい局面において、抗体またはそのフラグメントもしくは改変体は実質的に精製される(すなわち、その効果を制限するかまたは望ましくない副作用を生じる物質は実質的にない)。被験体は好ましくは、ウシ、ブタ、ウマ、ニワトリ、ネコ、イヌなどの動物が挙げられるがそれらに限定されない動物であり、そして好ましくは哺乳動物であり、そして最も好ましくはヒトである。
化合物が核酸または免疫グロブリンを含む場合に使用され得る処方および投与方法は、上記に記載され;さらなる適切な処方および投与経路は、本明細書中で以下に記載されたものの中から選択され得る。
様々な送達系が公知であり、そして本発明の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体を投与するために用いられ得る(例えば、リポソーム、微粒子、マイクロカプセル、この抗体または抗体フラグメントの発現が可能な組換え細胞中でのカプセル化、レセプター媒介エンドサイトーシス(例えば、WuおよびWu,J.Biol.Chem.262:4429−4432(1987)を参照のこと)、レトロウイルスまたは他のベクターの一部としての核酸の構築など)。導入方法としては、皮内、筋内、腹腔内、静脈内、皮下、鼻腔内、硬膜外、および経口経路が挙げられるがそれらに限定されない。組成物は、任意の好都合な経路により(例えば、注入またはボーラス注射により、上皮または粘膜内層(例えば、口腔粘膜、直腸粘膜および腸粘膜など)を通しての吸収により)投与され得、そして他の生物学的に活性な薬剤と一緒に投与され得る。投与は、全身的または局所的であり得る。さらに、本発明の薬学的組成物を、任意の適切な経路(脳室内注射および髄腔内注射を包含し;脳室内注射は、例えば、Ommayaリザーバのようなリザーバに取り付けられた脳室内カテーテルにより容易にされ得る)により中枢神経系に導入することが望まれ得る。例えば、吸入器または噴霧器の使用、およびエアゾール化剤を用いた処方により、肺投与もまた使用され得る。
特定の実施形態において、本発明の薬学的組成物を、処置の必要な領域に局所的に投与することが望まれ得る;これは、制限する目的ではないが、例えば、手術中の局部注入、局所適用(例えば、手術後の創傷包帯と組み合わせて)により、注射により、カテーテルにより、坐剤により、またはインプラント(このインプラントは、シアラスティック(sialastic)膜のような膜または繊維を含む、多孔性、非多孔性、または膠様材料である)により達成され得る。好ましくは、抗体を含む本発明のタンパク質を投与する際、タンパク質が吸収されない材料を使用するために注意が払われなければならない。
別の実施形態において、組成物は、小胞、特に、リポソーム中へ送達され得る(Langer,Science 249:1527−1533(1990);Treatら,Liposomes in the Therapy of Infectious Disease and Cancer,Lopez−BeresteinおよびFidler(編),Liss,New York,353〜365頁(1989);Lopez−Berestein,同書317〜327頁を参照のこと;広く同書を参照のこと)。
さらに別の実施形態において、組成物は制御された放出系中で送達され得る。1つの実施形態において、ポンプが用いられ得る(Langer,(前出);Sefton,CRC Crit.Ref.Biomed.Eng.14:201(1987);Buchwaldら,Surgery 88:507(1980);Saudekら,N.Engl.J.Med.321:574(1989)を参照のこと)。別の実施形態において、高分子材料が用いられ得る(Medical Applications of Controlled Release,LangerおよびWise(編),CRC Pres.,Boca Raton,Florida(1974);Controlled Drug Bioavailability,Drug Product Design and Performance,SmolenおよびBall(編),Wiley,New York(1984);RangerおよびPeppas,J.Macromol.Sci.Rev.Macromol.Chem.23:61(1983)を参照のこと;Levyら,Science 228:190(1985);Duringら,Ann.Neurol.25:351(1989);Howardら,J.Neurosurg.71:105(1989)もまた参照のこと)。さらに別の実施形態において、制御された放出システムは、治療標的、即ち、脳の近くに置かれ得、従って、全身用量の一部のみを必要とする(例えば、Goodson,Medical Applications of Controlled Release,(前出),第2巻,115〜138頁(1984)を参照のこと)。
他の制御された放出システムは、Langerにより総説において議論される(Science 249:1527−1533(1990))。
本発明の化合物がタンパク質をコードする核酸である、特定の実施形態において、その核酸は、それを適切な核酸発現ベクターの一部として構成し、そしてそれが細胞内になるように投与することにより(例えば、レトロウイルスベクターの使用により(米国特許第4,980,286号を参照のこと)、または直接注射により、または微粒子ボンバードメント(例えば、遺伝子銃;Biolistic,Dupont)の使用により、または脂質もしくは細胞表面レセプターもしくはトランスフェクト剤でコーティングすることにより、または核に入ることが公知であるホメオボックス様ペプチドと結合させて投与すること(例えば、Joliotら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:1864−1868(1991)を参照のこと)などにより、そのコードされたタンパク質の発現を促進するようにインビボで投与され得る。あるいは、核酸は、細胞内に導入され得、そして、発現のために相同組換えにより宿主細胞DNA内に組み込まれ得る。
本発明はまた、薬学的組成物を提供する。このような組成物は、治療有効量の抗体またはそのフラグメント、および薬学的に受容可能なキャリアを含む。特定の実施形態において、用語「薬学的に受容可能な」とは、動物における、そしてさらに特にヒトにおける使用のために、連邦規制当局もしくは米国政府により認められたか、または米国薬局方もしくは他の一般に認められた薬局方に列挙されたことを意味する。用語「キャリア」とは、治療剤とともに投与される、希釈剤、アジュバンド、賦形剤、またはビヒクルをいう。このような薬学的なキャリアは、水および油(石油起源、動物起源、植物起源、または合成起源の油(例えば、ピーナッツ油、大豆油、鉱油、ゴマ油など)を含む)のような滅菌した液体であり得る。水は、薬学的組成物が静脈内に投与される場合に、好ましいキャリアである。生理食塩水溶液、ならびにデキストロースおよびグリセロールの水溶液はまた、特に注射可能な溶液のために、液体キャリアとして使用され得る。適切な薬学的賦形剤としては、デンプン、グルコース、ラクトース、スクロース、ゼラチン、麦芽、イネ、フラワー、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン酸グリセロール、滑石、塩化ナトリウム、脱脂粉乳、グリセロール、プロピレン、グリコール、水、エタノールなどが挙げられる。組成物はまた、所望されるならば、少量の湿潤剤もしくは乳化剤、またはpH緩衝剤を含み得る。これらの組成物は、液剤、懸濁剤、乳剤、錠剤、丸剤、カプセル剤、散剤、持続放出処方物などの形態を取り得る。この組成物は、従来の結合剤およびトリグリセリドのようなキャリアとともに、坐剤として処方され得る。経口処方物は、薬学的等級のマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなどのような標準キャリアを含み得る。適切な薬学的キャリアの例は、E.W.Martinによる「Remington’s Pharmaceutical Sciences」に記載される。このような組成物は、治療有効量の抗体またはそのフラグメントを、好ましくは精製された形態で、適切な量のキャリアとともに含んで、患者への適切な投与のための形態を提供する。処方物は、投与形態に適するべきである。
好ましい実施形態において、組成物は、慣用手順に従って、ヒトへの静脈内投与のために採用された薬学的組成物として、処方される。代表的には、静脈内投与のための組成物は、滅菌等張水性緩衝液の溶液である。必要な場合、組成物はまた、可溶化剤および注射の部位での痛みを緩和するリグノカインのような局部麻酔を含み得る。一般的には、成分は、別々にかまたは単一投薬形態で一緒に混合してのどちらかで、例えば、一定量の活性薬剤を示すアンプルまたは小袋(sachette)のような密封された容器中の凍結乾燥粉末または水を含まない濃縮物として供給される。組成物が注入により投与されるべき場合には、組成物は、滅菌した薬学的等級の水または生理食塩水を含む注入ボトルに分配され得る。組成物が注射により投与される場合、成分が投与の前に混合され得るように、注射用滅菌水または生理食塩水のアンプルが提供され得る。
本発明の組成物は、中性のまたは塩の形態として処方され得る。薬学的に受容可能な塩としては、塩酸、リン酸、酢酸、シュウ酸、酒石酸などに由来するもののようなアニオンとともに形成される塩、およびナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、水酸化第2鉄、イソプロピルアミン、トリエチルアミン、2−エチルアミノエタノール、ヒスチジン、プロカインなどに由来するもののようなカチオンとともに形成される塩が挙げられる。
本発明のポリペプチドの異常な発現および/または活性と関連する疾患または障害の処置、抑制および予防において効果的である本発明の組成物の量は、標準的な臨床技術により決定され得る。さらに、インビトロアッセイを、必要に応じて使用して、最適な投薬量の範囲を同定するのを助け得る。処方において使用されるべき正確な用量はまた、投与の経路、および疾患または障害の重篤度に依存し、そして開業医の判断および各患者の状況に従って決定されるべきである。有効用量は、インビトロまたは動物モデル試験系から得られた用量反応曲線から外插され得る。
抗体に関して、患者に投与される投薬量は、代表的に、患者の体重1kgあたり0.1mg〜100mgである。好ましくは、患者に投与される投薬量は、患者の体重1kgあたり0.1mgと20mgとの間であり、より好ましくは、患者の体重1kgあたり1mg〜10mgである。一般に、ヒト抗体は、外来ポリペプチドへの免疫応答に起因して、他種由来の抗体よりもヒト体内で長い半減期を有する。従って、ヒト抗体の低い投薬量および頻度の低い投与は、しばしば可能である。さらに、本発明の治療的組成物または薬学的組成物の投与の投薬量および頻度は、改変(例えば、脂溶化(lipidation))による抗体の取り込みおよび組織浸透(例えば、脳への)を増強することにより減少され得る。
本発明の抗体および抗体組成物は、単独で、または他のアジュバントと組み合わせて投与され得る。本発明の抗体および抗体組成物とともに投与され得るアジュバントとしては、以下が挙げられるが、それらに限定されない:ミョウバン、ミョウバンおよびデオキシコール酸(ImmunoAg)、MTP−PE(Biocine Corp.)、QS21(Genentech,Inc.)、BCG、およびMPL。特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、ミョウバンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、QS−21と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物とともに投与され得るさらなるアジュバントとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:モノホスホリル脂質免疫調節剤、Adju Vax 100a、QS−21、QS−18、CRL1005、アルミニウム塩、MF−59、およびVirosomalアジュバント技術。本発明の抗体および抗体組成物とともに投与され得るワクチンとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:MMR(麻疹、流行性耳下腺炎,風疹)、ポリオ(polio)、水痘、破傷風/ジフテリア、A型肝炎、B型肝炎、B型インフルエンザ、百日咳(whooping cough)、肺炎、インフルエンザ、ライム病、ロタウイルス、コレラ、黄熱病、日本脳炎、ポリオ(poliomyelitis)、狂犬病、腸チフス、および百日咳(pertussis)に対する防御に指向するワクチンならびに/またはPNEUMOVAX−23TM。組み合わせは、例えば、混合物として同時に、別々であるが同時にもしくは並行して;または逐次的にかのいずれかで投与され得る。これは、組み合わされた薬剤が治療混合物としてともに投与される説明を含み、そして組み合わせた薬剤が、別々であるが同時に(例えば、同じ個体へ別々の静脈ラインを通じての場合)投与される手順もまた含む。「組み合わせ」投与は、第1に、続いて第2に与えられる化合物または薬剤のうちの1つを別々に投与することをさらに含む。
別の特定の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、PNEUMOVAX−23TMと組合せて使用され、感染ならびに/あるいは感染に関連する任意の疾患、障害、および/または状態を処置、予防、および/または診断する。1つの実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、PNEUMOVAX−23TMと組合せて使用されて、任意のグラム陽性菌感染ならびに/あるいはグラム陽性菌感染に関連する任意の疾患、障害、および/または状態を処置、予防、および/または診断する。別の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、PNEUMOVAX−23TMと組合せて使用されて、感染ならびに/あるいはEnterococcus属および/またはStreptococcus属の1つ以上のメンバーに関連する任意の疾患、障害、および/または状態を処置、予防、および/または診断する。別の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、PNEUMOVAX−23TMとの任意の組合せで使用されて、感染ならびに/あるいはB群連鎖球菌の1つ以上のメンバーに関連する任意の疾患、障害、および/または状態を、処置、予防、および/または診断する。別の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、PNEUMOVAX−23TMと組合せて使用され、感染ならびに/あるいはStreptococcus pneumoniaeに関連する任意の疾患、障害、および/または状態を、処置、予防、および/または診断する。
本発明の抗体および抗体組成物は、単独で、または他の治療的薬剤と組み合わせて投与され得る。本発明の抗体および抗体組成物とともに投与され得る治療的薬剤としては、以下が挙げられるが、それらに限定されない:化学療法剤、抗生物質、抗ウイルス剤、ステロイド性および非ステロイド性の抗炎症剤、従来の免疫療法剤、ならびにサイトカイン。組み合わせは、例えば、混合物として同時に、別々であるが同時にもしくは並行して;または逐次的にかのいずれかで投与され得る。これは、組み合わされた薬剤が、治療混合物としてともに投与される説明を含み、そして組み合わせた薬剤が、別々であるが同時に(例えば、同じ個体へ別々の静脈ラインを通じての場合)投与される手順もまた含む。「組み合わせ」投与は、第1に、続いて第2に与えられる化合物または薬剤のうちの1つを別々に投与することをさらに含む。
1つの実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、TNFファミリーの他のメンバーと組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物とともに投与され得るTNF、TNF関連、またはTNF様の分子としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:可溶性形態のTNF−α、リンホトキシン−α、(LT−α、TNF−βとしても公知)、LT−β(複合ヘテロトリマーLT−α2−βにおいて見出された)、OPGL、FasL、CD27L、CD30L、CD40L、4−1BBL、DcR3、OX40L、TNF−γ(国際公開番号WO96/14328)、TRAIL、AIM−II(国際公開番号WO97/34911)、APRIL(J.Exp.Med.188(6)1185−1190(1998))、エンドカイン−α(国際公開番号WO98/07880)、ニューロカイン−α(国際公開番号WO98/18921)、OPG、OX40、神経増殖因子(NGF)、ならびに可溶性形態のFas、CD30、CD27、CD40および4−IBB、TR2(国際公開番号WO96/34095)、DR3(国際公開番号WO97/33904)、DR4(国際公開番号WO98/32856)、TR5(国際公開番号WO98/30693)、TR6(国際公開番号WO98/30694)、TR7(国際公開番号WO98/41629)、TRANK、TR9(国際公開番号WO98/56892)、312C2(国際公開番号WO98/06842)、およびTR12、ならびに可溶性形態のCD154、CD70、およびCD153。
好ましい実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、CD40リガンド(CD40L)、可溶性形態のCD40(例えば、AVRENDTM)、CD40Lの生物学的に活性なフラグメント、改変体、もしくは誘導体、抗−CD40L抗体(例えば、アゴニスト抗体またはアンタゴニスト抗体)、および/または抗−CD40抗体(例えば、アゴニスト抗体またはアンタゴニスト抗体)と組合せて投与される。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、単独でかまたは抗脈管形成薬剤と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る抗脈管形成薬剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:アンジオスタチン(Entremed,Rockville,MD)、トロポニン−1(Boston Life Sciences,Boston,MA)、抗侵襲性因子、レチノイン酸およびその誘導体、パクリタキセル(タキソール)、スラミン、メタロプロテイナーゼ−1の組織インヒビター、メタロプロテイナーゼ−2の組織インヒビター、VEGI、プラスミノーゲンアクチベーターインヒビター−1、プラスミノーゲンアクチベーターインヒビター−2および種々の形態のより軽い「d群」遷移金属。
より軽い「d群」遷移金属としては、例えばバナジウム、モリブデン、タングステン、チタン、ニオブおよびタンタル種が挙げられる。そのような遷移金属種は、遷移金属錯体を形成し得る。上記の遷移金属種の適切な錯体としては、オキソ遷移金属錯体が挙げられる。
バナジウム錯体の代表的な例としては、バナデート錯体およびバナジル錯体のようなオキソバナジウム錯体が挙げられる。適切なバナデート錯体としては、例えばメタバナジン酸アンモニウム、メタバナジン酸ナトリウムおよびオルトバナジン酸ナトリウムのようなメタバナデート錯体およびオルトバナデート錯体が挙げられる。適切なバナジル錯体としては、例えばバナジルアセチルアセトネートおよび硫酸バナジル(硫酸バナジル一水和物および硫酸バナジル三水和物のような硫酸バナジル水和物を含む)が挙げられる。
タングステン錯体およびモリブデン錯体の代表的な例としてはまた、オキソ錯体が挙げられる。適切なオキソタングステン錯体としては、タングステート錯体およびタングステンオキシド錯体が挙げられる。適切なタングステート錯体としては、タングステン酸アンモニウム、タングステン酸カルシウム、タングステン酸ナトリウム二水和物およびタングステン酸が挙げられる。適切なタングステンオキシドとしては、タングステン(IV)オキシドおよびタングステン(VI)オキシドが挙げられる。適切なオキソモリブデン錯体としては、モリブデート、モリブデンオキシドおよびモリブデニル錯体が挙げられる。適切なモリブデート錯体としては、モリブデン酸アンモニウムおよびその水和物、モリブデン酸ナトリウムおよびその水和物、ならびにモリブデン酸カリウムおよびその水和物が挙げられる。適切なモリブデンオキシドとしては、モリブデン(VI)オキシド、モリブデン(VI)オキシドおよびモリブデン酸が挙げられる。適切なモリブデニル錯体としては、例えばモリブデニルアセチルアセトネートが挙げられる。他の適切なタングステン錯体およびモリブデン錯体としては、例えばグリセロール、酒石酸および糖由来のヒドロキソ誘導体が挙げられる。
広範な種々の他の抗脈管形成薬剤もまた、本発明の状況において利用され得る。代表的な例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:血小板因子4;硫酸プロタミン;硫酸化キチン誘導体(ズワイガニ(queen crab)の殻から調製される)(Murataら、Cancer Res.51:22〜26、1991);硫酸化多糖ペプチドグリカン複合体(SP−PG)(この化合物の機能は、ステロイド(例えば、エストロゲン)およびクエン酸タモキシフェンの存在によって、増強され得る);スタウロスポリン;基質代謝の調節因子(例えば、プロリンアナログ、シスヒドロキシプロリン、d,L−3,4−デヒドロプロリン、チアプロリン、α,α−ジピリジル,アミノプロピオニトリルフマレートを含む);4−プロピル−5−(4−ピリジニル)−2(3H)−オキサゾロン;メトトレキサート;ミトザントロン;ヘパリン;インターフェロン;2マクログロブリン−血清;ChIMP−3(Pavloffら、J.Bio.Chem.267:17321〜17326、1992);キモスタチン(Tomkinsonら、Biochem J.286:475〜480、1992);シクロデキストリンテトラデカサルフェート;エポネマイシン;カンプトテシン;フマギリン(Ingberら、Nature 348:555〜557、1990);チオリンゴ酸金ナトリウム(「GST」;MatsubaraおよびZiff、J.Clin.Invest.79:1440〜1446、1987);アンチコラゲナーゼ−血清;α2−抗プラスミン(Holmesら、J.Biol.Chem.262(4):1659〜1664、1987);ビサントレン(National Cancer Institute);ロベンザリット二ナトリウム(N−(2)−カルボキシフェニル−4−クロロアントロニル酸(chloroanthronilic acid)二ナトリウム、すなわち「CCA」;Takeuchiら、Agents Actions 36:312〜316、1992);およびメタロプロテイナーゼインヒビター(例えば、BB94)。
本発明の状況において同様に利用され得るさらなる抗脈管形成薬剤としては、サリドマイド(Celgene,Warren,NJ);血管拡張性ステロイド;AGM−1470(H.BremおよびJ.Folkman J Pediatr.Surg.28:445−51(1993));インテグリンαvβ3アンタゴニスト(C.Storgardら,J Clin.Invest.103:47−54(1999));カルボキシアミノイミダゾール(carboxynaminolmidazole);カルボキシアミドトリアゾール(CAI)(National Cancer Institute,Bethesda,MD);Conbretastatin A−4(CA4P)(OXiGENE,Boston,MA);Squalamine(Magainin Pharmaceuticals,Plymouth Meeting,PA);TNP−470,(Tap Pharmaceuticals,Deerfield,IL);ZD−0101 AstraZeneca(London,UK);APRA(CT2584);Benefin,Byrostatin−1(SC339555);CGP−41251(PKC 412);CM101;Dexrazoxane(ICRF187);DMXAA;エンドスタチン;Flavopridiol;Genestein;GTE;ImmTher;Iressa(ZD1839);Octreotide(ソマトスタチン);Panretin;Penacillamine;Photopoint;PI−88;Prinomastat(AG−3340)Purlytin;Suradista(FCE26644);タモキシフェン(Nolvadex);Tazarotene;テトラチオモリブデート;Xeloda(Capecitabine);および5−フルオロウラシルが挙げられる。
本発明の化合物と組み合わせて投与され得る抗脈管形成薬剤は、種々の機構を通じて作用し得、これらの機構としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:細胞外マトリックスのタンパク質分解の阻害、内皮細胞−細胞外マトリックス接着分子の機能のブロック、増殖因子のような脈管形成誘導因子の機能と拮抗すること、および増殖している内皮細胞において発現されるインテグリンレセプタ−の阻害。細胞外マトリックスタンパク質分解を妨害し、そして本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得る抗脈管形成インヒビターの例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:AG−3340(Agouron,La Jolla,CA)、BAY−12−9566(Bayer,West Haven,CT)、BMS−275291(Bristol Myers Squibb,Princeton,NJ)、CGS−27032A(Novartis,East Hanover,NJ)、Marimastat(British Biotech,Oxford,UK)およびMetastat(Aeterna,St−Foy,Quebec)。内皮細胞−細胞外マトリックス接着分子の機能をブロックすることにより作用し、そして本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得る抗脈管形成インヒビターの例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:EMD−121974(Merck KcgaA Darmstadt,Germany)およびVitaxin(Ixsys,La Jolla,CA/Medimmune,Gaithersburg,MD)。脈管形成誘導因子と直接拮抗するかまたはこの誘導因子を阻害することにより作用し、そして本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得る抗脈管形成薬剤の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:Angiozyme(Ribozyme,Boulder,CO)、抗VEGF抗体(Genentech,S.San Francisco,CA)、PTK−787/ZK−225846(Novartis,Basel,Switzerland)、SU−101(Sugen,S.San Francisco,CA)、SU−5416(Sugen/Pharmacia Upjohn,Bridgewater,NJ)、およびSU−6668(Sugen)。他の抗脈管形成薬剤は、脈管形成を間接的に阻害するように作用する。本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得る脈管形成の間接的インヒビターの例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:IM−862(Cytran,Kirkland,WA)、インターフェロン−α、IL−12(Roche,Nutley,NJ)、およびペントサンポリスルフェ−ト(Georgetown University,Washington,DC)。
特定の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組み合わせた本発明の抗体および抗体組成物の使用は、自己免疫疾患(例えば、本明細書中に記載の自己免疫疾患)の処置、予防、および/または回復のために企図される。
特定の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組み合わせた本発明の抗体および抗体組成物の使用は、関節炎の処置、予防、および/または回復のために企図される。さらに特定の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組み合わせた本発明の抗体および抗体組成物の使用は、慢性関節リウマチの処置、予防、および/または回復のために企図される。
別の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、抗凝固剤と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得る抗凝固剤は、制限されないで、ヘパリン、ワルファリン、およびアスピリンを含む。特定の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、ヘパリンおよび/またはワルファリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、ワルファリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、ワルファリンおよびアスピリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、ワルファリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、ヘパリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、ヘパリンおよびアスピリンと組み合わせて投与される。
別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗カルジオリピン抗体の産生を抑制する薬剤と組み合わせて投与される。特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、抗カルジオリピン抗体のリン脂質結合血漿タンパク質β2−糖タンパク質I(b2GPI)に結合する能力をブロックおよび/または低減する薬剤と組み合わせて投与される。
特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗レトロウイルス薬剤、ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、非ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、および/またはプロテアーゼインヒビターと組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得るヌクレオシド逆転写酵素インヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:RETROVIRTM(ジドブジン/AZT)、VIDEXTM(ジダノシン/ddI)、HIVIDTM(ザルシタビン/ddC)、ZERITTM(スタブジン/d4T)、EPIVIRTM(ラミブジン/3TC)、およびCOMBIVIRTM(ジドブジン/ラミブジン)。本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得る非ヌクレオシド逆転写酵素インヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:VIRAMUNETM(ネビラピン)、RESCRIPTORTM(デラビルジン)、およびSUSTIVATM(エファビレンズ)。本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得るプロテアーゼインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:CRIXIVANTM(インディナビル(indinavir))、NORVIRTM(リトナビル(ritonavir))、INVIRASETM(サキナビル(saquinavir))、およびVIRACEPTTM(ネルフィナビル(nelfinavir))。特定の実施形態において、抗レトロウイルス薬剤、ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、非ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、および/またはプロテアーゼインヒビターは、AIDSを処置、予防、および/または診断するため、ならびに/あるいはHIV感染を予防もしくは処置、予防、および/または診断するために、本発明の抗体および抗体組成物との任意の組み合わせで使用され得る。
他の実施形態では、本発明の抗体および抗体組成物は、抗日和見感染症薬剤と組み合わせて投与され得る。本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得る抗日和見感染症薬剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されないTRIMETHOPRIM−SULFAMETHOXAZOLETM,DAPSONETM,PENTAMIDINETM,ATOVAQUONETM,ISONIAZIDTM,RIFAMPINTM,PYRAZINAMIDETM,ETHAMBUTOLTM,RIFABUTINTM,CLARITHROMYCINTM,AZITHROMYCINTM,GANCICLOVIRTM,FOSCARNETTM,CIDOFOVIRTM,FLUCONAZOLETM,ITRACONAZOLETM,KETOCONAZOLETM,ACYCLOVIRTM,FAMCICOLVIRTM,PYRIMETHAMINETM,LEUCOVORINTM,NEUPOGENTM(フィルグラスチム(filgrastim)/G−CSF),およびLEUKINETM(サルグラモスチン(sargramostim)/GM−CSF)。特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、日和見Pneumocystis carinii肺炎感染を予防的に処置、予防、および/または診断するために、TRIMETHOPRIM−SULFAMETHOXAZOLETM、DAPSONETM、PENTAMIDINETM、および/またはATOVAQUONETMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、日和見Mycobacterium avium複合感染を予防的に処置、予防、および/または診断するために、ISONIAZIDTM、RIFAMPINTM、PYRAZINAMIDETM、および/またはETHAMBUTOLTMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、日和見Mycobacterium tuberculosis感染を予防的に処置、予防、および/または診断するために、RIFABUTINTM、CLARITHROMYCINTM、および/またはAZITHROMYCINTMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、日和見サイトメガロウイルス感染を予防的に処置、予防、および/または診断するために、GANCICLOVIRTM、FOSCARNETTM、および/またはCIDOFOVIRTMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、日和見真菌感染を予防的に処置、予防、および/または診断するために、FLUCONAZOLETM、ITRACONAZOLETM、および/またはKETOCONAZOLETMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、日和見単純ヘルペスウイルスI型および/またはII型感染を予防的に処置、予防、および/または診断するために、ACYCLOVIRTMおよび/またはFAMCICOLVIRTMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、日和見Toxoplasma gondii感染を予防的に処置、予防、および/または診断するために、PYRIMETHAMINETMおよび/またはLEUCOVORINTMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、日和見細菌感染を予防的に処置、予防、および/または診断するために、LEUCOVORINTMおよび/またはNEUPOGENTMとの任意の組み合わせで使用される。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗ウイルス薬剤との組み合わせで投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る抗ウイルス薬剤としては、アシクロビル、リバビリン、アマンタジン、およびレマンチジン(remantidine)が挙げられるが、これらに限定されない。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗生物質と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る抗生物質としては、アモキシシリン、アミノ配糖体、β−ラクタム(グリコペプチド)、β−ラクタマーゼ、クリンダマイシン、クロラムフェニコール、セファロスポリン、シプロフロキサシン、シプロフロキサシン、エリスロマイシン、フルオロキノロン、マクロライド、メトロニダゾル、ペニシリン、キノロン、リファンピン、ストレプトマイシン、スルホンアミド、テトラサイクリン、トリメトプリム、トリメトプリム−スルファメトキサゾール、およびバンコマイシンが挙げられるが、これらに限定されない。
本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得る従来の非特異的免疫抑制剤としては、ステロイド、シクロスポリン、シクロスポリンアナログ、シクロホスファミド、シクロホスファミドIV、メチルプレドニゾン、プレドニゾン、アザチオプリン、FK−506、15−デオキシスペルグアリン(15−deoxyspergualin)、および応答T細胞の機能を抑制することによって作用する他の免疫抑制剤が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、免疫抑制剤と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る免疫抑制剤調製物としては、ORTHOCLONETM(OKT3)、SANDIMMUNETM/NEORALTM/SANGDYATM(シクロスポリン)、PROGRAFTM(タクロリムス)、CELLCEPTTM(ミコフェノール酸塩)、アザチオプリン、グルコルチコステロイド類(glucorticosteroids)、およびRAPAMUNETM(シロリムス)が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、免疫抑制剤は、器官または骨髄の移植の拒絶を予防するために使用され得る。
好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、ステロイド治療と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と組み合わせて投与され得るステロイドとしては、経口コルチコステロイド、プレドニゾン、およびメチルプレドニゾロン(例えば、IVメチルプレドニゾロン)が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、プレドニゾンと組み合わせて投与される。さらなる特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、プレドニゾンおよび免疫抑制剤と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物ならびにプレドニゾンと共に投与され得る免疫抑制剤は、本明細書中に記載され、そしてこの免疫抑制剤としては、アザチオプリン、シクロホスファミド、およびシクロホスファミドIVが挙げられるが、これらに限定されない。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、メチルプレドニゾロンと組み合わせて投与される。さらなる特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、メチルプレドニゾロンおよび免疫抑制剤と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物ならびにメチルプレドニゾロンと共に投与され得る免疫抑制剤は、本明細書中に記載され、そしてこの免疫抑制剤としては、アザチオプリン、シクロホスファミド、およびシクロホスファミドIVが挙げられるが、これらに限定されない。
好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗マラリア剤と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る抗マラリア剤としては、ヒドロキシクロロキン、クロロキン、および/またはキナクリンが挙げられるが、これらに限定されない。
好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、NSAIDと組み合わせて投与される。
非限定的な実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、以下の薬物の1、2、3、4、5、10以上と組み合わせて投与され得る:NRD−101(Hoechst Marion Roussel)、ジクロフェナク(Dimethaid)、オキサプロジンカリウム(oxaprozin potassium)(Monsanto)、メカセルミン(Chiron)、T−614(Toyama)、ペムトレキシド二ナトリウム(pemetrexed disodium)(Eli Lilly)、アトレレウトン(atreleuton)(Abbott)、バルデコキシブ(valdecoxib)(Monsanto)、エルテナック(eltenac)(Byk Gulden)、カンパス(campath)、AGM−1470(Takeda)、CDP−571(Celltech Chiroscience)、CM−101(CarboMed)、ML−3000(Merckle)、CB−2431(KS Biomedix)、CBF−BS2(KS Biomedix)、IL−1Ra遺伝子治療(IL−1Ra gene therapy)(Valentis)、JTE−522(Japan Tobacco)、パクリタキセル(Angiotech)、DW−166HC(Dong Wha)、ダルブフェロンメシレート(darbufelone mesylate)(Warner−Lambert)、可溶性TNFレセプター1(synergen;Amgen)、IPR−6001(Institute for Pharmaceutical Research)、トロカード(trocade)(Hoffman−La Roche)、EF−5(Scotia Pharmaceuticals)、BIIL−284(Boehringer Ingelheim)、BIIF−1149(Boehringer Ingelheim)、Leuko Vax(Inflammatics)、MK−663(Merck)、ST−1482(Sigma−Tau)、およびブチキソコートプロピオネート(butixocort propionate)(WarnerLambert)。
好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、以下の薬物の1、2、3、4、5以上と組み合わせて投与される:メトトレキサート、スルファサラジン、アウロチオリンゴ酸ナトリウム、アウラノフィン(auranofin)、シクロスポリン、ペニシルアミン、アザチオプリン、抗マラリア薬(例えば、本明細書中で記載されるような)、シクロホスファミド、クロラムブシル、金、ENBRELTM(Etanercept)、抗TNF抗体、LJP 394(La Jolla Pharmaceutical Company,San Diego、California)およびプレドニゾロン。
より好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗マラリア剤、メトトレキサート、抗TNF抗体、ENBRELTMおよび/またはスルファサラジンと組み合わせて投与される。1つの実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、メトトレキサートと組み合わされて投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗TNF抗体と組み合わせて投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、メトトレキサートおよび抗TNF抗体と組み合わせて投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、スルファサラジンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、メトトレキサート、抗TNF抗体、およびスルファサラジンと組み合わせて投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、ENBRELTMと組み合わせて投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、ENBRELTMおよびメトトレキサートと組み合わせて投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、ENBRELTM、メトトレキサートおよびスルファサラジンと組み合わせて投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、ENBRELTM、メトトレキサートおよびスルファサラジンと組み合わせて投与される。他の実施形態において、1つ以上の抗マラリア剤は、上記の組み合わせのうちの1つと組み合わせられる。特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗マラリア剤(例えば、ヒドロキシクロロキン)、ENBRELTM、メトトレキサートおよびスルファサラジンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、抗マラリア剤(例えば、ヒドロキシクロロキン)、スルファサラジン、抗TNF抗体、およびメトトレキサートと組み合わせて投与される。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、単独でかまたは1以上の静脈内免疫グロブリン調製物と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る静脈内免疫グロブリン調製物としては、GAMMARTM、IVEEGAMTM、SANDOGLOBULINTM、GAMMAGARD S/DTMおよびGAMIMUNETMが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、移植治療(例えば、骨髄移植)において静脈内免疫グロブリン調製物と組み合わせて投与される。
CD40リガンド(CD40L)、CD40Lの可溶性形態(例えば、AVRENDTM)、CD40Lの生物学的活性フラグメント、改変体、または誘導体、抗CD40L抗体(例えば、アゴニストまたはアンタゴニスト抗体)、および/または抗CD40抗体(例えば、アゴニストまたはアンタゴニスト抗体)。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、単独でかまたは抗炎症剤と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る抗炎症剤としては、グルココルチコイドおよび非ステロイド抗炎症剤、アミノアリールカルボン酸誘導体、アリール酢酸誘導体、アリール酪酸誘導体、アリールカルボン酸、アリールプロピオン酸誘導体、ピラゾール類、ピラゾロン類、サリチル酸誘導体、チアジンカルボキサミド類、e−アセトアミドカプロン酸、S−アデノシルメチオニン、3−アミノ−4−ヒドロキシ酪酸、アミキセトリン(amixetrine)、ベンダザック、ベンジダミン、ブコローム、ジフェンピラミド、ジタゾール、エモルファゾン、グアイアズレン、ナブメトン、ニメスリド、オルゴテイン、オキサセプロール、パラニリン(paranyline)、ペリソキサール、ピフォキシム、プロカゾン、プロキサゾール、およびテニダプが挙げられるが、これらに限定されない。
別の実施形態において、本発明の組成物は、化学療法剤と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る化学療法剤としては、抗生物質誘導体(例えば、ドキソルビシン、ブレオマイシン、ダウノルビシン、およびダクチノマイシン);抗エストロゲン(例えば、タモキシフェン);抗代謝物(例えば、フルオロウラシル、5−FU、メトトレキサート、フロクスウリジン、インターフェロンα−2b、グルタミン酸、プリカマイシン(plicamycin)、メルカプトプリン、および6−チオグアニン);細胞傷害剤(例えば、カルムスチン、BCNU、ロムスチン、CCNU、シトシンアラビノシド、シクロホスファミド、エストラムスチン、ヒドロキシウレア、プロカルバジン、マイトマイシン、ブスルファン、シス−プラチン、および硫酸ビンクリスチン);ホルモン(例えば、メドロキシプロゲステロン、エストラムスチンリン酸ナトリウム、エチニルエストラジオール、エストラジオール、酢酸メゲストロール、メチルテストステロン、ジエチルスチルベストロールジホスフェート、クロロトリアニセン、およびテストラクトン);ナイトロジェンマスタード誘導体(例えば、メファレン(mephalen)、クロランブシル(chlorambucil)、メクロレタミン(ナイトロジェンマスタード)およびチオテパ);ステロイド類および組み合わせ(例えば、ベタメタゾンリン酸ナトリウム);ならびにその他(例えば、ジカルバジン(dicarbazine)、アスパラギナーゼ、ミトーテン、硫酸ビンクリスチン、硫酸ビンブラスチン、およびエトポシド)が挙げられるが、これらに限定されない。
特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、CHOP(シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、およびプレドニゾン)と組み合わせて投与されるか、CHOPの成分の任意の組み合わせで投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、Rituximabと組み合わせて投与される。さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、RituxmabおよびCHOPと共に、またはRituxmabおよびCHOPの成分の任意の組み合わせと共に投与される。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、サイトカインと組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得るサイトカインとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:GM−CSF、G−CSF、IL2、IL3、IL4、IL5、IL6、IL7、IL10、IL12、IL13、IL15、抗−CD40、CD40L、INF−α、INF−β、INF−γ、TNF−α、およびTNF−β。好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、BLyS(例えば、配列番号3228のアミノ酸134〜285)と共に投与される。別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、以下に挙げられるが、これらに限定されない任意のインターロイキンと共に投与され得る:IL−1α、IL−1β、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−11、IL−12、IL−13、IL−14、IL−15、IL−16、IL−17、IL−18、IL−19、IL−20、IL−21、およびIL−22。好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、IL4およびIL10と組み合わせて投与される。
1つの実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、1つ以上のケモカインと組み合わせて投与される。特定の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、以下からなる群より選択されるα(CxC)ケモカイン:γ−インターフェロン誘導タンパク質−10(γIP−10)、インターロイキン−8(IL−8)、血小板第4因子(PF4)、好中球活性化因子(NAP−2)、GRO−α、GRO−β、GRO−γ、好中球活性化ペプチド(ENA−78)、顆粒球化学誘導タンパク質−2(GCP−2)および間質細胞由来因子−1(SDF−1、すなわち前B細胞刺激因子(PBSF)(pre−B−cell stimulatory factor));および/または以下からなる群より選択されるβ(CC):RANTES(活性化の際に調節され、正常なT発現され、そしてT分泌される)、マクロファージ炎症タンパク質−1α(MIP−1α)、マクロファージ炎症タンパク質−1β(MIP−1β)、単球走化タンパク質−1(MCP−1)、単球走化タンパク質−2(MCP−2)、単球走化タンパク質−3(MCP−3)、単吸走化タンパク質−4(MCP−4)、マクロファージ炎症タンパク質−1γ(MIP−1γ)、マクロファージ炎症タンパク質−3α(MIP−3α)、マクロファージ炎症タンパク質−3β(MIP−3β)、マクロファージ炎症タンパク質−4(MIP−4/DC−CK−1/PARC)、エオタキシン(eotaxin)、ExodusおよびI−309;および/またはγ(C)ケモカイン、リンホタクチン(lymphotactin)と組み合わせて投与される。
別の実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、ケモカインβ−8、ケモカインβ−1、および/またはマクロファージ炎症性タンパク質−4と共に投与される。好ましい実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、ケモカインβ−8と共に投与される。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、IL−4アンタゴニストと組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得るIL−4アンタゴニストとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:可溶性IL−4レセプターポリペプチド、可溶性IL−4レセプターポリペプチドの多量体形態;IL−4によって惹起される生物学的シグナルを伝達することなくIL−4レセプターと結合する抗IL−4レセプター抗体、1種以上のIL−4レセプターとIL−4との結合をブロックする抗IL4抗体、およびIL−4によって惹起される生物学的シグナルを伝達しないIL−4レセプターと結合するIL−4のムテイン。好ましくは、本方法に従って使用される抗体は、モノクローナル抗体(例えば、本明細書中に記載されるような抗体フラグメントを含む)である。
本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドおよび/またはポリぺプチド(および/またはそのアゴニストまたはアンタゴニスト)を他の提案されたかまたは従来の造血治療と組み合わせることを包含する。従って、例えば、本発明のポリヌクレオチドおよび/またはポリぺプチド(および/またはそのアゴニストまたはアンタゴニスト)は、単独で赤血球生成刺激効果を示す化合物(例えば、エリスロポイエチン、テストステロン、前駆細胞刺激物質、インスリン様増殖因子、プロスタグランジン、セロトニン、環状AMP、プロラクチン、およびトリヨードチロニン(triiodothyzonine))と組合され得る。本発明の抗体および抗体組成物の一般的に再生不良性貧血を処置するために使用される化合物(例えば、メテノロン(methenolene)、スタノゾロール、およびナンドロロン);鉄欠乏性貧血を処置するために使用される化合物(例えば、鉄調製物);悪性貧血を処置するために使用される化合物(例えば、ビタミンB12および/または葉酸);および溶血性貧血を処置するために使用される化合物(例えば、副腎皮質ステロイド類(例えば、コルチコイド))との組み合わせもまた含まれる。例えば、Resegottiら,Panminerva Medica,23:243−248(1981);Kurtz,FEBS Letters,14a:105−108(1982);McGonigleら,Kidney Int.,25:437−444(1984);およびPavlovic−Kantera,Expt.Hematol.,8(補遺8)283−291(1980)(これらの各々の内容はその全体が本明細書中に参考として援用される)を参照のこと。
エリトロポエチンの効果を増強するか、またはエリトロポエチンと協同する化合物はまた、本明細書においてアジュバントとして有用であり、これらとしては、アドレナリン作用性アゴニスト、甲状腺ホルモン、アンドロゲン、肝エリトロポエチン因子、エリスロトロピン(erythrotropin)、およびエリスロゲニン(erythrogenin)が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、Dunn,「Current Concepts in Erythropoiesis」、John Wiley and Sons(Chichester,England,1983);Kalmani,Kidney Int.,22:383−391(1982);Shahidi,New Eng.J.Med.,289:72−80(1973);Urabeら,J.Exp.Med.,149:1314−1325(1979);Billatら,Expt.Hematol.,10:133−140(1982);Naughtonら,Acta Haemat,69:171−179(1983);Cognoteら、要約、364, Proceedings 7th Intl. Cong. of Endocrinology(Quebec City,Quebec,July 1−7,1984);およびRothmanら,1982,J.Surg.Oncol.,20:105−108(1982)を参照のこと。造血を刺激するための方法は、造血有効量の(すなわち、血球の形成をもたらす量)の、本発明のポリヌクレオチドおよび/またはポリぺプチド(および/またはそのアゴニストもしくはアンタゴニスト)を含む薬学的組成物を患者に投与する工程を包含する。本発明のポリヌクレオチドおよび/もしくはポリぺプチドならびに/またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストは、任意の適切な技術(非経口、舌下、局所的、肺内および鼻腔内を含むがこれらに限定されず、これらの技術は、本明細書中でさらに議論される)により患者に投与される。この薬学的組成物は、必要に応じて、エリトロポエチン、テストステロン、前駆細胞刺激物質、インスリン様増殖因子、プロスタグランジン、セロトニン、環状AMP、プロラクチン、トリヨードチロニン(triiodothyzonine)、メテノロン(methenolene)、スタノゾロール、およびナンドロロン鉄調製物、ビタミンB12、葉酸および/または副腎皮質ステロイドからなる群の1つ以上のメンバーを含む。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物を造血増殖因子と組み合わせて投与する。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る造血増殖因子は、LEUKINETM(SARGRAMOSTIMTM)およびNEUPOGENTM(FILGRASTIMTM)を含むが、これらに限定されない。
さらなる実施形態において、本発明の抗体および抗体組成物は、線維芽細胞の増殖因子と組み合わせて投与される。本発明の抗体および抗体組成物と共に投与され得る線維芽細胞の増殖因子としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:FGF−1、FGF−2、FGF−3、FGF−4、FGF−5、FGF−6、FGF−7、FGF−8、FGF−9、FGF−10、FGF−11、FGF−12、FGF−13、FGF−14およびFGF−15。
さらに、本発明の抗体および抗体組成物は、単独でか、または他の治療レジメン(放射線治療が挙げられるが、これらに限定されない)と組み合わせて投与され得る。このような組み合わせ治療は、連続的および/または同時的に施され得る。
(キット)
本発明はまた、本発明の薬学的組成物の1以上の成分で満たした1以上の容器を含む、薬学的パックまたは薬学的キットも提供する。このような容器は、医薬品または生物学的産物の製造、使用または販売を規制する政府機関によって定められた形式の通知(この通知は、ヒトの投与のための製造、使用または販売の機関による認可を示す)に必要に応じて関連し得る。
本発明は、上記の方法で使用され得るキットを提供する。1実施形態において、キットは、1以上の容器中に、本発明の抗体、好ましくは、精製された抗体を含む。代替の実施形態において、キットは、BLySに免疫特異的に結合する抗体フラグメントを含む。特定の実施形態において、本発明のキットは、コントロールとして、実質的に単離されたBLySポリペプチドを含む。好ましくは、本発明のキットは、BLySと反応しないコントロール抗体をさらに含む。別の特定の実施形態において、本発明のキットは、BLySと抗体との結合を結合するための手段を含む(例えば、この抗体は、蛍光化合物、酵素の基質、放射性化合物もしくは発光性化合物のような検出可能な基質に結合体化され得るか、または第1抗体を認識する第2抗体は、検出可能な基質に結合体化され得る)。特定の実施形態において、このキットは、組換えにより産生されたBLySまたは化学的に合成されたBLySを含み得る。このキットで提供されるBLySは、固体支持体に結合され得る。より詳細な実施形態において、上記のキットの検出手段は、BLySが結合する固体支持体を含む。このようなキットは、結合していないレポーター標識抗ヒト抗体を含み得る。この実施形態において、BLySと抗体との結合は、このレポーター標識抗体の結合によって検出され得る。
さらなる実施形態において、本発明は、本発明のポリペプチドの抗原を含む血清をスクリーニングする際に使用するための診断キットを含む。診断キットは、BLySと特異的に免疫反応性である実質的に単離された抗体、およびこの抗体とBLySとの結合を検出するための手段を含む。1実施形態において、この抗体は、固体支持体に結合される。特定の実施形態において、この抗体は、モノクローナル抗体であり得る。このキットの検出手段は、標識された第2モノクローナル抗体を含み得る。あるいは、またはさらに、この検出手段は、標識された競合抗原を含み得る。
1つの診断構成において、試験血清を、本発明の方法によって得られる表面結合BLySを有する固相試薬と反応させる。BLySが特定の抗体と反応した後、結合していない血清成分を洗浄により除去し、レポーター標識抗ヒト抗体を添加し、結合していない抗ヒト抗体を洗浄により除去し、そしてこの固体支持体上の結合BLyS抗体の量に比例してレポーターが試薬と結合するように、この試薬をレポーター標識抗ヒト抗体と反応させる。代表的に、このレポーターは、適切な蛍光性基質、発光性基質、または比色(colorimetric)基質の存在下で固相をインキュベートすることによって検出される酵素である。
上記アッセイでの固体表面試薬は、固体支持体材料(例えば、ポリマービーズ、ディップスティック,96ウェルプレート、または濾過材料)にタンパク質材料を結合させるための公知の技術によって調製される。これらの結合方法は、一般に、この支持体へのタンパク質の非特異的吸着、または代表的に、遊離アミノ基を介した、固体支持体上の化学的反応基(例えば、活性化カルボキシル基、ヒドロキシル基、またはアルデヒド基)へのこのタンパク質の共有結合を含む。あるいは、ストレプトアビジンでコーティングされたプレートは、ビオチン化抗原との結合体化に使用され得る。
従って、本発明は、この診断方法を実施するためのアッセイシステムまたはキットを提供する。このキットは、一般に、表面結合組換えBLySを有する支持体、および表面結合抗BLyS抗体を検出するためのレポーター標識抗ヒト抗体を含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、単鎖Fv(scFv)を含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜46、321〜329、1563〜1595、および1881〜1908のうちの1つのアミノ酸配列を有する単鎖Fv(scFv)を含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1563〜1880のうちの1つのアミノ酸配列を有する単鎖Fv(scFv)を含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1881〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する単鎖Fv(scFv)を含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜1562のうちの1つのアミノ酸配列を有する単鎖Fv(scFv)を含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含み、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜46、321〜329、1563〜1595、および1881〜1908のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1881〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含み、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySの膜結合形態と免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1563〜1880のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含み、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySの可溶性形態と免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含み、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySと免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜46、321〜329、1563〜1595、および1881〜1908のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1881〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含み、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySの膜結合形態と免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1563〜1880のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含み、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySの可溶性形態と免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含み、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySと免疫特異的に結合し、そして本発明はまた、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントを含み、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySと免疫特異的に結合し、そして本発明はまた、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含み、そしてこのVLドメインおよびVHドメインは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する同一のscFvに由来する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号2129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を含む抗体またはそのフラグメントを包含し、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明の抗体またはそのフラグメントは、免疫グロブリン分子全体である。
特定の実施形態において、本発明の抗体またはそのフラグメントは、Fabフラグメントである。
特定の実施形態において、本発明の抗体またはそのフラグメントは、Fvフラグメントである。
特定の実施形態において、本発明は、異種ポリペプチドに共有結合された、本発明の抗体またはそのフラグメントを含むキメラタンパク質を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、2つ以上の型の抗体あるいはそのフラグメントまたは改変体を含む組成物を包含し、これら型のそれぞれは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてこの型の抗体またはそのフラグメントのそれぞれが、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVHドメインを含む。
特定の実施形態において、本発明は、2つ以上の型の抗体あるいはそのフラグメントまたは改変体を含む組成物を包含し、これら型のそれぞれは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてこの型の抗体またはそのフラグメントのそれぞれが、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVLドメインを含む。
特定の実施形態において、本発明は、2つ以上の型の抗体あるいはそのフラグメントまたは改変体を含む組成物を包含し、これら型のそれぞれは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてこの型の抗体またはそのフラグメントのそれぞれが、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVLドメインを含み、そしてここでそれぞれの型の抗体またはそのフラグメントが、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVHドメインをさらに含む。
特定の実施形態において、本発明は、2つ以上の型の抗体あるいはそのフラグメントまたは改変体を含む組成物を包含し、これら型のそれぞれは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてこの型の抗体またはそのフラグメントのそれぞれが、配列番号3129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を有する、VH CDR3を含む。
特定の実施形態において、本発明は、2つ以上の型の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体のパネルを包含し、これら型のそれぞれは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてこの型の抗体またはそのフラグメントのそれぞれが、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVHドメインを含む。
特定の実施形態において、本発明は、2つ以上の型の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体のパネルを包含し、これら型のそれぞれは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてこの型の抗体またはそのフラグメントのそれぞれが、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVLドメインを含む。
特定の実施形態において、本発明は、2つ以上の型の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体のパネルを包含し、これら型のそれぞれは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてこの型の抗体またはそのフラグメントのそれぞれが、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVLドメインを含み、そしてここで抗体またはフラグメントの型のそれぞれが、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVHドメインをさらに含む。
特定の実施形態において、本発明は、2つ以上の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体のパネルを包含し、これら型のそれぞれは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてこの型の抗体またはそのフラグメントのそれぞれが、配列番号2129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を有する、異なるscFV由来のVH CDR3を含む。
特定の実施形態において、本発明の抗体パネルの抗体またはそのフラグメントは、96ウェルプレートの各ウェルに存在する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここでこの抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜46、321〜329、1563〜1595、および1881〜1908のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1881〜1908のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、この抗体またはそのフラグメントは、膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1563〜1569のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、この抗体またはそのフラグメントは、可溶性形態のBLySに免疫特異的に結合する。本発明はまた、上記の単離された核酸分子を含むベクターを包含し、これは、上記核酸分子によってコードされる抗体またはそのフラグメントの発現を調節するヌクレオチド配列を含むベクターを含む。さらに、本発明はまた、異種プロモーターに作動可能に連結された上記核酸分子を含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)、ならびに上記ベクターを含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)を包含する。さらに、本発明はまた、抗体またはそのフラグメントを産生するための方法を提供し、これは、核酸分子が発現される条件下で上記宿主細胞を培養する工程を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する。本発明はまた、上記の単離された核酸分子を含むベクターを包含し、これは、上記核酸分子によってコードされる抗体またはそのフラグメントの発現を調節するヌクレオチド配列を含むベクターを含む。さらに、本発明はまた、異種プロモーターに作動可能に連結された上記核酸分子を含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)、ならびに上記ベクターを含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)を包含する。さらに、本発明はまた、抗体またはそのフラグメントを産生するための方法を提供し、これは、核酸分子が発現される条件下で上記宿主細胞を培養する工程を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜46、321〜329、1563〜1595、および1881〜1908のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する。本発明はまた、上記の単離された核酸分子を含むベクターを包含し、これは、上記核酸分子によってコードされる抗体またはそのフラグメントの発現を調節するヌクレオチド配列を含むベクターを含む。さらに、本発明はまた、異種プロモーターに作動可能に連結された上記核酸分子を含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)、ならびに上記ベクターを含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)を包含する。さらに、本発明はまた、抗体またはそのフラグメントを産生するための方法を提供し、これは、核酸分子が発現される条件下で上記宿主細胞を培養する工程を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1881〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、膜結合形態のBLySに免疫特異的に結合する。本発明はまた、上記の単離された核酸分子を含むベクターを包含し、これは、上記核酸分子によってコードされる抗体またはそのフラグメントの発現を調節するヌクレオチド配列を含むベクターを含む。さらに、本発明はまた、異種プロモーターに作動可能に連結された上記核酸分子を含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)、ならびに上記ベクターを含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)を包含する。さらに、本発明はまた、抗体またはそのフラグメントを産生するための方法を提供し、これは、核酸分子が発現される条件下で上記宿主細胞を培養する工程を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1563〜1880のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、可溶性形態のBLySに免疫特異的に結合する。本発明はまた、上記の単離された核酸分子を含むベクターを包含し、これは、上記核酸分子によってコードされる抗体またはそのフラグメントの発現を調節するヌクレオチド配列を含むベクターを含む。さらに、本発明はまた、異種プロモーターに作動可能に連結された上記核酸分子を含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)、ならびに上記ベクターを含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)を包含する。さらに、本発明はまた、抗体またはそのフラグメントを産生するための方法を提供し、これは、核酸分子が発現される条件下で上記宿主細胞を培養する工程を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここでこの抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてまた、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインを含む。本発明はまた、上記の単離された核酸分子を含むベクターを包含し、これは、上記核酸分子によってコードされる抗体またはそのフラグメントの発現を調節するヌクレオチド配列を含むベクターを含む。さらに、本発明はまた、異種プロモーターに作動可能に連結された上記核酸分子を含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)、ならびに上記ベクターを含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)を包含する。さらに、本発明はまた、抗体またはそのフラグメントを産生するための方法を提供し、これは、核酸分子が発現される条件下で上記宿主細胞を培養する工程を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインを含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここでこの抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合し、そしてまた、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインを含み、そしてここで、このVLドメインおよびこのVHドメインは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有する同じscFV由来である。本発明はまた、上記の単離された核酸分子を含むベクターを包含し、これは、上記核酸分子によってコードされる抗体またはそのフラグメントの発現を調節するヌクレオチド配列を含むベクターを含む。さらに、本発明はまた、異種プロモーターに作動可能に連結された上記核酸分子を含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)、ならびに上記ベクターを含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)を包含する。さらに、本発明はまた、抗体またはそのフラグメントを産生するための方法を提供し、これは、核酸分子が発現される条件下で上記宿主細胞を培養する工程を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、配列番号2129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVH CDR3を含む抗体またはそのフラグメントをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を包含し、ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する。本発明はまた、上記の単離された核酸分子を含むベクターを包含し、これは、上記核酸分子によってコードされる抗体またはそのフラグメントの発現を調節するヌクレオチド配列を含むベクターを含む。さらに、本発明はまた、異種プロモーターに作動可能に連結された上記核酸分子を含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)、ならびに上記ベクターを含む宿主細胞(哺乳動物宿主細胞を含む)を包含する。さらに、本発明はまた、抗体またはそのフラグメントを産生するための方法を提供し、これは、核酸分子が発現される条件下で上記宿主細胞を培養する工程を包含する。
特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントを提供し、この抗体またはそのフラグメントは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインをコードするヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるVHドメインのアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントを提供し、この抗体またはそのフラグメントは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインをコードするヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるVLドメインのアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントを提供し、この抗体またはそのフラグメントは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインをコードするヌクレオチド配列に高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるVHドメインのアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントを提供し、この抗体またはそのフラグメントは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインをコードするヌクレオチド配列に高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるVLドメインのアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントを提供し、この抗体またはそのフラグメントは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のCDRをコードするヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるCDRのアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントを提供し、この抗体またはそのフラグメントは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のCDRをコードするヌクレオチド配列に高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるCDRのアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントを提供し、この抗体またはそのフラグメントは、配列番号2129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を有するVH CDR3をコードするヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるVH CDR3のアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態において、本発明は、BLySに免疫特異的に結合する抗体またはそのフラグメントを提供し、この抗体またはそのフラグメントは、配列番号2129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を有するVH CDR3をコードするヌクレオチド配列に高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされるVH CDR3のアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態において、本発明は、BLySの異常な発現を検出するための方法を提供し、この方法は、以下の工程を包含する:
BLySに免疫特異的に結合する1つ以上の抗体またはそのフラグメントもしくは改変体を使用して、個体の細胞または組織サンプルにおけるBLyS発現のレベルをアッセイする工程;および
細胞または組織サンプルにおいてアッセイされるBLySのレベルを、BLySの標準レベルまたは異常なBLyS発現を有さない個体由来の細胞または組織サンプルにおけるBLySのレベルと比較する工程であって、ここで、BLySの標準的レベルと比較した、BLySのアッセイされたレベルまたは異常なBLyS発現を有さない個体由来の細胞または組織におけるレベルにおける増加または減少は、異常な発現を示す、工程。
特定の実施形態において、本発明は、異常なBLyS発現または活性に関連する疾患または障害を診断するための方法を提供し、この方法は、以下の工程を包含する:
BLySに免疫特異的に結合する、有効量の標識された抗体またはそのフラグメントを被験体に投与する工程;
BLySが発現される被験体の部位に、標識された抗体またはそのフラグメントが優先的に濃縮し得るように、投与に続いてある時間間隔を待つ工程;
バックグラウンドレベルを決定する工程;および
被験体中の標識された抗体またはそのフラグメントを検出する工程であって、その結果、バックグラウンドレベルより上の標識された抗体またはそのフラグメントの検出が、その被験体がBLySの異常な発現に関連する特定の疾患または障害を有することを示す、工程。
特定の実施形態において、すぐ上に記載された2つの方法において利用される抗体またはそのフラグメントは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVHドメインを含む。
特定の実施形態において、すぐ上に記載された2つの方法において利用される抗体またはそのフラグメントは、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFV由来のVLドメインを含む。
特定の実施形態において、すぐ上に記載された2つの方法において利用される抗体またはそのフラグメントは、配列番号2129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を有するVH CDR3を含む。
特定の実施形態において、すぐ上に記載された2つの方法において利用される抗体またはそのフラグメントは、診断剤に結合される。
特定の実施形態において、すぐ上に記載された2つの方法において利用される抗体またはそのフラグメントは、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼである診断剤に結合される。
特定の実施形態において、すぐ上に記載された2つの方法において利用される抗体またはそのフラグメントは、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオロセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリンである診断剤に結合される。
特定の実施形態において、すぐ上に記載された2つの方法において利用される抗体またはそのフラグメントは、125I、131I、111In、90Yまたは99Tcである診断剤に結合される。
特定の実施形態において、すぐ上に記載された2つの方法において利用される抗体またはそのフラグメントは、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、またはエクオリンである診断剤に結合される。
配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む、少なくとも1つの抗体またはそのフラグメント(ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する)、および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメイン、そしてまた配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む、少なくとも1つの抗体またはそのフラグメント(ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する)、および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
配列番号2129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を含む、少なくとも1つの抗体またはそのフラグメント(ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する)、および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
異常なBLyS発現または活性に関連する疾患または障害を処置、予防または回復させる方法であって、この方法は、その必要がある動物に、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメイン、そしてまた配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む、少なくとも1つの抗体またはそのフラグメント(ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する)、および薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物を、この疾患または障害を処置、予防または回復させるのに有効な量で投与する工程を包含する。この方法を使用して、感染性障害、癌、および/または自己免疫疾患(例えば、狼瘡または糸球体腎炎)を処置し得る。
異常なBLyS発現または活性に関連する疾患または障害を処置、予防または回復させる方法であって、この方法は、その必要がある動物に、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメインを含む、少なくとも1つの抗体またはそのフラグメント(ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する)、ならびに薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物を、この疾患または障害を処置、予防または回復させるのに有効な量で投与する工程を包含する。この方法を使用して、感染性障害、癌、および/または自己免疫疾患(例えば、狼瘡または糸球体腎炎)を処置し得る。
異常なBLyS発現または活性に関連する疾患または障害を処置、予防または回復させる方法であって、この方法は、その必要がある動物に、配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVLドメイン、そしてまた配列番号1〜2128のうちの1つのアミノ酸配列を有するscFv由来のVHドメインを含む、少なくとも1つの抗体またはそのフラグメント(ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する)、ならびに薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物を、この疾患または障害を処置、予防または回復させるのに有効な量で投与する工程を包含する。この方法を使用して、感染性障害、癌、および/または自己免疫疾患(例えば、狼瘡または糸球体腎炎)を処置し得る。
異常なBLyS発現または活性に関連する疾患または障害を処置、予防または回復させる方法であって、この方法は、その必要がある動物に、配列番号2129〜3227のうちの1つのアミノ酸配列を含む少なくとも1つの抗体またはそのフラグメント(ここで、この抗体またはそのフラグメントは、BLySに免疫特異的に結合する)、ならびに薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物を、この疾患または障害を処置、予防または回復させるのに有効な量で投与する工程を包含する。この方法を使用して、感染性障害、癌、および/または自己免疫疾患(例えば、狼瘡または糸球体腎炎)を処置し得る。
この方法を使用して、感染性障害、癌、および/または自己免疫疾患(例えば、狼瘡または糸球体腎炎)を処置し得る。
(実施例)
(略語)
0.2M Tris−HCl、0.5mM EDTA、0.5Mスクロース(TES)
1−エチル−3−[3−ジメチルアミノプロピル]カルボジイミド塩酸塩(EDC)
100μg/mlのアンピシリンおよび2%グルコースを補充した2TY(2TYAG)
100μg/mlのアンピシリンおよび50μg/mlのカナマイシンを補充した2TY(2TYAK)
3,3’,5,5’−テトラメチルベンジジン(TMB)
50%阻害濃度(IC50
18%Marvelブロッキング溶液を含む6×PBS(6×MPBS)
吸光度(A)
ウシ血清アルブミン(BSA)
酵素結合イムノソルベント検定法(ELISA)
ウシ胎仔血清(FCS)
重鎖可変(V
ヘペス緩衝化生理食塩水(HBS)
西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)
固定化金属親和性クロマトグラフィー(IMAC)
イソプロピルβ−D−チオガラクトピラノシド(IPTG)
軽鎖可変(V
感染多重度(MOI)
N−[2−ヒドロキシエチル]ピペラジン−N’−[2−エタンスルホン酸](Hepes)
ナノモル濃度(nM)
N−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)
3%Marvelを含むPBS(MPBS)
リン酸緩衝化生理食塩水(PBS)
リン酸緩衝化生理食塩水および0.1%(v/v)Tween20(PBST)
ピコモル濃度(pM)
単鎖フラグメント可変(scFv)
腫瘍壊死因子α(TNF−α)
腫瘍壊死因子β(TNF−β)
TNF関連アポトーシス誘導リガンド(TRAIL)
(定義:)
以下の節において、「固定化BLyS」とは、プラスチックアッセイプレート(例えば、96ウェルプレート)上にコーティングされたBLySまたはビオチン化BLySの可溶性形態をいうが、プラスチックアッセイプレート上にコーティングされたヒスチジンタグ化BLySをいわない;「ビオチン化BLyS」は、ELISAプレートをコーティングするために使用された場合(この場合、これは「固定化BLyS」である)を除いて、BLySの可溶性形態である。BLySの膜結合形態としては、U937原形質膜およびP388原形質膜が挙げられるが、これらに限定されない。
(実施例1:可溶性BLySおよび膜結合BLySに免疫特異的に結合する抗体)
ファージライブラリーを、BLySの可溶性形態および膜結合形態に免疫特異的に結合するscFvをディスプレイするファージを同定するためのアッセイにおいてスクリーニングした。固定化BLySに結合するscFvをディスプレイするファージを、固定化BLySでのパニングおよび固定化BLySへの結合についてのELISAによる評価の後に同定した。これらのアッセイのためにプレート上に固定されたBLySを、Mooreら、Science 285:260〜263(これは、その全体が本明細書によって参考として援用される)に記載されるように、バキュロウイルス発現構築物を感染させたSf9細胞の上清から精製した。次いで、同定されたscFvのそれぞれを、配列決定した。特定の配列を複数回単離し、従って、それぞれ独特の配列の1つのメンバーを含むパネル(パネル1)を作製し、さらにBLySの可溶性形態および膜結合形態に免疫特異的に結合するそれらの能力についてさらに特徴付けた。
これらのscFvの誘導されたアミノ酸配列を上の表1に示す。scFvの個々のVセグメントおよびVセグメントを、V−BASE(Tomlinsonら、www.mrc−cpe.cam.ac.uk)における公知のヒト生殖系列の配列と整列させ、そして最も近い生殖系列を同定した。
(実施例2:BLySおよび膜結合BLySに対するscFvの特異性)
BLySと膜結合BLySとの両方に対するscFvのそれぞれの特異性を、ファージELISAによって決定した。BLySを、タンパク質の精製された可溶性形態としてまたはヒトマクロファージ様細胞株、U937由来の原形質膜調製物に存在する膜結合形態として、プラスチック上に固定した。
(U937細胞の維持)
U937細胞は、その原形質膜上にBLySを発現することが公知のヒト単球様組織球リンパ腫細胞株である。これらは、4mM L−グルタミン、10%FCS、10Uペニシリン、100g/mlストレプトマイシン(全ての試薬がSigma由来)を補充されたRPMI−1640中で維持された。これらの細胞を凍結ストックから解凍し、そして原形質膜調製のために使用するか、または2日後(このとき、細胞密度が1×10/mlに達する)、培養物中で1:5に分けるかのいずれかである。
(U937原形質膜の調製)
原形質膜を調製するために、1×10 U937細胞を、ベンチトップ(benchtop)遠心分離器中、4℃で5分間1000rpmでの遠心分離によって培養培地から収集した。細胞を40mlの12mM Tris、pH7.5、250mMスクロース中に再懸濁させ、そして氷上に配置した。次いで細胞を、1分間のバースト4回のために、携帯型電気ホモジナイザー(Labortechnik IKA Ultra−Turrax)を使用して溶解させる。細胞溶解が生じたことをチェックするために、10μlの細胞溶解物を、10μlのTrypanブルーに加え、そして細胞溶解物を顕微鏡下で調べた。溶解を確認した後、ホモジネートを270×gで、10分間、4℃で遠心分離して、核画分をペレット化し、そして上清を保持した。上清を8000×gで、10分間、4℃で遠心分離して、ミトコンドリア画分およびリソソーム画分をペレット化し、そして上清を保持した。次いで、上清を100000×gで、60分間、4℃で遠心分離して、原形質膜濃縮画分をペレット化した。上清を捨て、そして原形質膜ペレットを1ml PBS中に再懸濁化させ、そして−70℃で保存した。原形質膜画分のタンパク質濃度を、タンパク質定量キット(Biorad)を使用して決定した。代表的な収量は、5mgと10mgとの間の原形質膜であった。
(ファージELISA)
独特のscFvのそれぞれの特異性を決定するために、ファージELISAを、ヒトBLyS、U937原形質膜、TNFα(R&D Systems、Minneapolis、MN)、BSAおよびコーティングされていないウェルに対するそれぞれのscFvについて行った。パネル1由来の独特のscFvのうちの1つを提示するファージミドを含む個々のE.coliコロニーを、1ウェル当たり100μlの2TYAG培地を含む96ウェルプレートに播種した。プレートを振盪しながら4時間、37℃でインキュベートした。M13KO7ヘルパーファージを、10のMOIまでそれぞれのウェルに加え、そしてプレートをさらに1時間、37℃、インキュベートした。プレートをベンチトップ遠心分離器において2000rpmで10分間遠心分離した。上清を除き、そして細胞ペレットを100μlの2TYAK中に再懸濁させ、そして振盪させながら、30℃で一晩インキュベートした。次の日、プレートを2000rpmで10分間遠心分離し、そしてそれぞれのウェル由来のファージ含有上清100μlを、注意深く新鮮な96ウェルプレートに移した。20μlの6×MPBSをそれぞれのウェルに加え、そしてELISAの前にファージを予備的にブロックするために、室温で1時間インキュベートした。
可撓性96ウェルプレート(Falcon)を、PBS中のヒトBLyS(1μg/ml)、PBS中のU937原形質膜(10μg/ml)、PBS中のTNFα(1μg/ml)、PBS中のBSA(1μg/ml)、またはPBSとともに、4℃で一晩コーティングした。コーティング後、溶液をウェルから除き、そしてプレートをMPBS中室温で、1時間ブロックした。プレートをPBSで3回洗浄し、次いで、50μlの予備的にブロックしたファージを各ウェルに加えた。プレートを室温で1時間インキュベートし、次いで、PBSTを3回換えて、続いてPBSを3回換えて洗浄した。各ウェルに、MPBS中1〜5000倍の希釈で、50μlの抗遺伝子VIII−HRP結合体(Pharmacia)を加え、そしてプレートを室温で1時間インキュベートした。各プレートを、PBSTで3回洗浄し、続いてPBSで3回洗浄した。次いで、3%MPBS中の1/50で希釈した50μlのHRP標識抗マウスポリマー(DAKO En Vision)を加え、そして1時間室温でインキュベートした。次いで、各プレートをPBSTで3回洗浄し、続いてPBSで3回洗浄した。次いで、50μlのTMB基質を各ウェルに加え、そして30分間または色が発色するまで室温でインキュベートした。反応を25μlの0.5M HSOの添加によって停止した。生じたシグナルを、マイクロタイタープレートリーダー(Bio−Rad3550)を使用して、450nm(A450)での吸光度を読むことによって測定した。
3つのクローン(I006E07、I008D05およびI016F04)についての結果を、図1に示す。3つ全てのscFvは、固定化BLySおよびU937原形質膜を認識するが、TNFα、BSAまたはコーティングされていないウェル(PBSのみ)を認識しない。これらの結果は、これらのscFvが固定化BLySおよび膜結合BLySを特異的に認識することを示す。
(実施例3:ファージscFvによるインビトロレセプター結合アッセイにおける阻害)
パネル1における独特のファージscFvの全てを、IM9細胞上のその同族のレセプターに結合する可溶性BLySを阻害するそれらの能力について評価した。
(BLySのビオチン化)
100μgのヒトBLySまたはマウスBLySのいずれかを、スライド−a−ライザーカセット(slide−a−lyzer cassette)(Pierce)を使用して、50mM重炭酸ナトリウム(炭酸水素ナトリウム)pH8.5に対して一晩透析した。次の日、NHS−ビオチン(Pierce)を13.3mg/mlまでDMSO中に溶解した。次いで、これを20:1のビオチン:BLySのモル比でBLySに加え、混合し、そして2時間、氷上でインキュベートした。次いで、ビオチン化BLySを、4℃で一晩スライド−a−ライザーカセットを使用して、滅菌PBS(Sigma)に戻して透析した。ビオチン化BLySの生物学的活性を、レセプター結合阻害アッセイを使用して確認した(以下を参照のこと)。
(IM9細胞の維持)
IM9細胞は、ヒトBリンパ細胞株である。これらは、4mM L−グルタミン、10%FCS、10Uペニシリン、100g/mlストレプトマイシン(全ての試薬はSigma由来)を補充したRPMI−1640で維持した。細胞を凍結したストックから解凍し、そして5日後(このとき、これらは、4〜8×10/mlの密度に達する)に、培養物中でアッセイに使用し得る。
(レセプター結合阻害アッセイ)
パネル1由来の独特のscFvのうちの1つを提示するファージミドを含む個々のE.coliコロニーを、1ウェル当たり100μlの2TYAG培地を含む96ウェルのプレートに播種した。プレートを37℃で4時間、振盪しながらインキュベートした。M13KO7ヘルパーファージを、10のMOIまでそれぞれのウェルに加え、そしてプレートをさらに1時間37℃インキュベートした。プレートをベンチトップ遠心分離器において2000rpmで10分間遠心分離した。上清を除き、そして細胞ペレットを100μlの2TYAK中に再懸濁させ、そして振盪しながら、30℃で一晩インキュベートした。次の日、プレートを2000rpmで10分間遠心分離し、そしてそれぞれのウェル由来のファージ含有上清100μlを、注意深く新鮮な96ウェルプレートに移した。ファージを使用の前にMPBSで1/2に希釈した。
平坦な底の96ウェルのプレート(Costar)を、1時間室温で、1ウェル当たり100μlのPBS中のポリ−L−リジン(Sigma)の1:10希釈でコーティングした。次いで、プレートを水で2回洗浄し、空気乾燥し、そして4℃で一晩置いた。次いで、100μlのIM9細胞(RPMI−1640培養培地中の10/ml)を、それぞれのウェルに加えた。次いで、プレートを3200rpmで5分間遠心分離して細胞をペレット化した。培地を注意深く吸引し、そして200μlのMPBSを各ウェルに加えた。次いで、プレートを1時間室温でブロックさせた。
別の96ウェルプレートに、10μlのMPBS中ビオチン化BLyS(162.5ng/ml)を各ウェルに添加して、25ng/mlの最終濃度を与えた。55μlの各適切なファージ上清を各ウェルに添加し、そして各ウェルの最終容量は65μlであった。次いで、プレートを室温で30分間インキュベートした。
IM9をコーティングしたプレートを、PBS中で2回洗浄し、叩いて乾燥させ、そして即座に、50μlのファージ/ビオチン化BLyS混合物を添加し、そして室温で1時間インキュベートした。プレートをPBSTで3回、およびPBSで3回洗浄し、叩いて乾燥させ、そして50μlのストレプトアビジン−Delfia(Wallac)を、各ウェルに、製造業者のアッセイ緩衝液中1:1000の希釈で添加した。次いで、これらのプレートを室温で1時間インキュベートし、そしてDelfia洗浄溶液(Wallac)で6回洗浄した。これらのプレートを叩いて乾燥させた後、1ウェルあたり100μlのDelfia強化溶液(Wallac)を添加した。これらのプレートを穏やかに叩いて、ミセルの形成を促進し、室温で10分間インキュベートし、そしてWallac 1420ワークステーションで6520mMにおいて蛍光を読み取った。
ビオチン化BLySの結合を阻害した3つのファージscFv(I001C09、I018D07およびI016H07)についての結果を、図2に示す。ビオチン化BLySの、そのレセプターに対する最大の結合(bio−BLySのみ)、ビオチン化BLySの非存在下でのバックグラウンドシグナル(bio−BLySなし)、および無関係な(すなわち、BLySを認識しない)ファージ抗体を用いた結果もまた示す。3つ全てのファージscFvが、ビオチン化BLySの、IM9細胞上のそのレセプターへの結合を阻害し、これらのscFvを、BLySの可溶性形態を結合するscFvであると同定した。これらのscFvはまた、U937膜に結合し、従って、これらはまた、BLySの膜結合形態をも結合する。
パネル1からの、このアッセイにおいてファージ粒子として最も大きな阻害を示した48個のscFvを、さらなる研究のために選択した。これら48個のscFvを、表3に列挙する。
Figure 2009095346
(実施例4:抗BLyS抗体の特異性)
表3に列挙した48個のscFvの、ヒトBLySおよびマウスBLySに対する特異性を、ファージELISAを使用して決定した。
(ファージELISA)
これら48個のscFvの特異性を決定するために、ファージELISAを、ヒトBLySおよびマウスBLyS、ならびに関連するヒト抗原および関連しないヒト抗原(Fasリガンド、TRAIL、TNFα、TNFβ、およびPBS)のパネルに対して実施した。Fasリガンド、TRAIL、TNFαおよびTNFβ抗原を、R&D Systems,Minneapolis,MNから入手した。ファージミドを含む個々のE.coliコロニーを、5mlの2YTAGに接種し、そして37℃で4時間、振盪しながらインキュベートした。M13KO7ヘルパーファージ(Pharmacia)を、10のMOIまで各チューブに添加し、そして37℃で1時間(最初の30分間は静置して、そして後の30分間は穏やかに振盪しながら)インキュベートした。細胞を、3,500rpmで10分間の遠心分離によってペレット化し、そして上清を廃棄した。細胞ペレットを、5mlの2TYAKに再懸濁させ、そして30℃で一晩、振盪しながらインキュベートした。翌日、これらの細胞を3,500rpmで10分間の遠心分離によってペレット化した。ファージを含む上清(5ml)を新しいチューブに注意深く移し、1mlの6MPBSを添加し、そしてこのチューブを室温で1時間インキュベートして、ELISAの前にファージを予めブロックした。
全ての抗原を、1μg/mlでコーティングした。ELISAを、本質的に実施例2に記載のように実施した。これの唯一の例外は、この工程がHRP標識した抗マウスポリマーとのインキュベーションを含む場合に、マウスBLySに結合したファージ抗体の検出を省略したことである。マウスBLySへの結合を、実施例2の節においてと同様に、TMBを用いて検出した。
48個全てのscFvは、固定されたヒトBLySに対して特異的であり、そしてこれら48個のscFvのうちの43個が、固定されたマウスBLySと交差反応するが、試験された他のいずれの関連しない抗原または関連する抗原とも交差反応しない。I008C03、I007F11、I037E07、I037E12、およびI016H07は、マウスBLySを結合しなかった。2つのscFv(I022D01およびI031F02)についての結果を、図3に示す。これらのscFvの両方は、ヒトBLySおよびマウスBLySを特異的に認識するが、試験された他のいずれの関連しない抗原または関連する抗原も認識しない。
(実施例5:BLySの膜結合形態に対する特異性)
48個のscFvの、膜結合BLySに対する特異性を、実施例2に記載のファージELISAによって決定した。BLySを、ヒトマクロファージ様細胞株(U937)由来の原形質膜調製物に存在する膜結合形態として、プラスチックに固定した。この細胞株は、ヒトBLySの膜結合形態を発現することが公知である。
この結合が膜結合BLySに特異的であることを実証するために、競合ELISAを開発して、U937上の個々の抗体に対するELISAシグナルがBLySまたはTNFαのいずれかとの予備インキュベーションによって競合され得るか否かを決定した。膜結合BLySをも認識する抗BLyS抗体は、遊離BLySでのシグナル減少を示すが遊離TNFαでのシグナル減少を示さないことが、予測される。
(競合ELISA)
表3に列挙した48個のscFvの各々に対するファージミドを含む個々のE.coliコロニーを、5mlの2YTAGに接種し、そして37℃で4時間、振盪しながらインキュベートした。M13KO7ヘルパーファージ(Pharmacia)を、10のMOIまで各チューブに添加し、そして37℃で1時間(最初の30分間は静置して、そして後の30分間は穏やかに振盪しながら)インキュベートした。細胞を、3,500rpmで10分間の遠心分離によってペレット化し、そして上清を廃棄した。細胞ペレットを、5mlの2TYAKに再懸濁させ、そして30℃で一晩、振盪しながらインキュベートした。翌日、これらの細胞を3,500rpmで10分間の遠心分離によってペレット化した。ファージを含む上清(5ml)を新しいチューブに注意深く移した。
表3に列挙した48個のscFvの各々に対して、2アリコートの20μl 6×MPBSを、96ウェルプレート(Greiner)の別個のウェルにピペットで入れた。第1のアリコートに、0.5μg/mlの最終濃度までBLySを補充した。第2のアリコートに、0.5μg/mlの最終濃度までTNF−αを補充した。各実験を、三連で実施した。次いで、100μlの各ファージ上清を各アリコートに添加し、そして上下にピペッティングして混合した。これらのファージ(±競合抗原)を、室温で1時間インキュベートした。
可撓性の96ウェルプレート(Falcon)を、50μlの10μg/ml U937原形質膜で4℃で一晩コーティングした。コーティングの後に、これらのプレートをPBSで3回洗浄し、そして200μlのMPBSで室温で1時間ブロックした。これらのプレートをPBSで3回洗浄し、そして50μlのファージ(±競合抗原)を各適切なウェルに添加した。これらのプレートを室温で1時間インキュベートし、次いでPBSTを3回交換して洗浄し、続いてPBSを3回交換して洗浄した。各ウェルに、MPBS中1:5000に希釈した50μlのマウス抗遺伝子VIII−HRP結合体(Pharmacia)を添加し、そしてこれらのプレートを室温で1時間インキュベートした。各プレートをPBSTで3回洗浄し、続いてPBSで3回洗浄した。次いで、3%MPBS中1:50に希釈した50μlのHRP標識した抗マウスポリマー(DAKO En Vision)を添加し、そして室温で1時間インキュベートした。次いで、各プレートをPBSTで3回洗浄し、続いてPBSで3回洗浄した。次いで、50μlのTMB基質を各ウェルに添加し、そして室温で30〜60分間、または色が発生するまで、インキュベートした。25μlの0.5M HSOを添加することによって、この反応を停止させた。発生したシグナルを、マイクロタイタープレートリーダー(Bio−Rad 3550)を使用して450nmにおける吸光度(A450)を読み取ることによって、測定した。
48個全てのscFvが、U937原形質膜調製物に結合する。このシグナルは、BLySとのファージ抗体の予備インキュベーションによって競合され得るが、TNf−αとの予備インキュベーションによっては競合されない。このことは、48個のscFvが、膜結合BLySおよび可溶性BLySを特異的に認識することを示す。代表的な結果は、scFv I031F09、I050A12およびI051C04によって例示され、そして図4に示される。3つ全てのscFvは、U937原形質膜への結合を示す。この結合は、BLySと特異的に競合したが、TNF−αとは競合せず、このことは、膜結合BLySの特異的認識を実証する。
(実施例6:scFvオフ速度(off−rate)の決定)
全てのオフ速度の決定を、BIAcore 2000マシンで、BIAcore 2000 Control Softwareを使用して実施し、そしてBIAevaluation 3.0ソフトウェアを使用して評価した。
(低密度BLyS表面の調製)
500RU表面を、精製したscFvを用いる速度論的研究のために調製した。低密度BLyS表面(500 RU BLyS結合)を、フローセル2において、アミンをCM5チップに結合させることによって、調製した。新たなCM5チップを、BIAcoreに挿入し、そしてセンサグラム(sensorgram)を、5μl/分の低速でHBS緩衝液を用いて開始した。NHSカップリング溶液およびEDCカップリング溶液(BIAcore)を、製造業者の指示に従って混合し、そして30μlを、CM5表面の上に注射した。次いで、10mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH4)中1μg/mlのBLySを50μl注射し、続いて30μlのエタノールアミン−HCl溶液(BIAcore)を注射した。次いで、流速を20μl/分に調整し、そして10μlのHBS中4Mのグアニジン塩酸塩を、表面の上に注射した。この操作は、共有結合していないBLySの表面を剥離させる。
(低密度表面におけるscFvのオフ速度の速度論の測定)
低密度のBLyS表面を含むチップを、BIAcoreに挿入した。精製したscFvの希釈系列物を、HBS中に、代表的に50μg/mlから二倍の希釈で1.5μg/mlまで調製した。次いで、この希釈系列物を、以下のプログラムを使用して、低密度BLyS表面(およびブランクコントロール)の上に連続的に注射した:
Figure 2009095346
結合したscFvを、10μlのHBS中4M のGuHClをscFvサンプル間の表面の上に注射することによって、除去した。
個々のscFvに対する結合曲線を、BIAevaluationソフトウェアを使用して分析し、抗体オフ速度を決定した。代表的なscFv抗体であるI003C02についての速度論的分析を、図5に示す。I003C02は、6×10−3−1のKoffを有する。
(実施例7:インビトロレセプター結合アッセイにおけるscFv抗体による阻害)
表3に列挙した48個のscFvを精製し、そしてBLySの、IM9細胞上のそのレセプターへの結合を、scFvが阻害する能力を評価した。
(scFvの精製)
抗BLyS scFvの阻害の強さを決定するために、scFvを、まずIMACによって調製した。2TYAG(5ml)を単一のコロニーに接種し、そして30℃で一晩、振盪しながら増殖させた。次いで、この一晩の培養物を使用して、100μg/mlのアンピシリンおよび0.1%のグルコースを含む500mlの2TYを接種し、そして30℃で振盪しながら、1.0のA600に達するまで増殖させた。IPTGを1mMまで添加し、そしてこの培養物を、30℃でさらに3.5時間増殖させた。
細胞を、5,000rpmでの遠心分離によって収集し、そして10mlのTESに再懸濁させた。さらに15mLのTESの1:5希釈物(水中)を添加し、そしてこの細胞懸濁物を、回転ホイールで4℃で30分間インキュベートした。これにより、浸透圧ショックが引き起こされ、そしてscFvを含むペリプラズム抽出物が得られた。残りの細胞および破片を、9,000rpmでの4℃、20分間の遠心分離によってペレット化した。その上清を新たなチューブに移し、そして50μlの1M MgClを添加した。次いで、2mlのNi−NTAアガロース(Qiagen)(緩衝液(50mMリン酸ナトリウム(pH8)、300mM NaCl)で予め洗浄した)を、プロテアーゼインヒビター錠剤(Boehringer Mannheim)と共に、このペリプラズム抽出物に添加した。この調製物を、回転させながら4℃で一晩インキュベートした。Ni−NTAを、2,000rpmで5分間の遠心分離によってペレット化し、そしてその上清を吸引した。アガロースビーズを50mlの洗浄緩衝液で3回洗浄し、遠心分離して、各洗浄の間にアガロースを収集した。10mlの洗浄緩衝液を、最後の洗浄の後に添加し、そしてこのスラリーを、ポリプレップ(polyprep)カラム(BioRad)に充填した。2mlの溶出緩衝液(50mM NaPi(リン酸ナトリウム)(pH8)、300mM NaCl、250mMイミダゾール)を、この排出されたアガロースに添加し、そして溶出液を収集した。IMACにより精製したscFvを、製造業者の指示に従ってNap5カラム(Pharmacia)を使用して、PBS中に緩衝液交換した。A280を読み取り、そしてタンパク質濃度を、1mg/mlタンパク質=A2801.4のモル吸光係数を使用して決定した。精製したscFvを、−70℃で500μlのアリコートで貯蔵した。
(レセプター結合阻害アッセイ)
平底の96ウェルプレート(Costar)を、1ウェルあたり100μlのポリ−L−リジン(Sigma)のPBS中1:10希釈物で、室温で1時間コーティングした。次いで、これらのプレートを水で2回洗浄し、風乾し、そして4℃で一晩静置した。次いで、100mlのIM9細胞(RPMI−1640中10/ml)を各ウェルに添加した。次いで、プレートを3200rpmで5分間遠心分離して、これらの細胞をペレット化させた。培地を注意深く吸引し、そして200μlのMPBSを各ウェルに添加した。次いで、これらのプレートを静置して、室温で1時間ブロックした。
別の96ウェルプレートに、MPBS中の滴定試験用scFvを、三連で、10μg/ml〜0.001μg/mlの濃度範囲にわたって添加した。各ウェルにおける試験scFvの最終容量は、55μlであった。標識されていないBLySとの競合もまた、アッセイごとにコントロールとして含めた。MPBS中の標識されていないBLySを、代表的に、1μg/ml〜0.001μg/mlの濃度範囲にわたって三連で滴定した。10μlのMPBS中のビオチン化BLyS(162.5ng/mlにおいて)を各ウェルに添加して、25ng/mlの最終濃度を与えた。次いで、プレートを室温で30分間インキュベートした。
IM9でコーティングしたプレートを、PBSで2回洗浄し、叩いて乾燥させ、そして即座に、50μlのscFv/ビオチン化BLyS混合物を添加し、そして室温で1時間インキュベートした。プレートをPBSTで3回洗浄し、そしてPBSで3回洗浄し、叩いて乾燥させ、そして1ウェルあたり50μlのストレプトアビジン−Delfia(Wallac)(製造業者のアッセイ緩衝液中1:1000の希釈)を添加した。次いで、これらのプレートを室温で1時間インキュベートし、そしてDelfia洗浄溶液(Wallac)で6回洗浄した。これらのプレートを叩いて乾燥させた後、1ウェルあたり100μlのDelfia強化溶液(Wallac)を添加した。これらのプレートを穏やかに叩いて、ミセルの形成を促進し、室温で10分間インキュベートし、そしてWallac 1420ワークステーションで6520mMにおいて蛍光を読み取った。
2つのscFv抗体(I007F11およびI050A07)に対する代表的な滴定曲線を、図6に示す。標識されていないBLySは、そのレセプターへの結合に関して、0.8nMのIC50値で競合した。I007F11およびI050A07に対するIC50値は、それぞれ7.9nMおよび17.1nMである。このアッセイを三連で実施し、そして標準誤差バーを示す。scFvとして最大の阻害を示した9個のscFvを、表4に列挙する。このデータはまた、これら9つのscFvが、BLySの可溶性形態を認識することを確認する。
Figure 2009095346
(実施例8:BLySの可溶性形態を認識する抗体)
ファージのライブラリーをアッセイにおいてスクリーニングして、可溶性形態のBLySには免疫特異的に結合するが膜結合形態のBLySには免疫特異的に結合しないscFvを提示するファージを同定した。
ファージライブラリーを、ビオチン化BLySに結合する能力についてスクリーニングした。これらのファージをビオチン化BLySに曝露して、ある間隔の時間、ビオチン化BLySを結合させた。次いで、ファージに結合するbio−BLySを、ストレプトアビジンでコーティングした磁気ビーズ上での捕捉によって単離した。
次いで、上記スクリーニングにおいて同定されたファージ(溶液からのBio−BLySの捕捉)を、これらが固定されたBLySを結合する能力について、ELISAによってスクリーニングした。次いで、固定されたBLySを結合する、ファージによって発現されるscFvをクローニングし、そして配列決定した。再度、いくつかの配列を複数回同定し、このようにして、次いで、独自のscFvを発現する各ファージの例からなるパネル(パネル2)を、さらに特徴付けた。
これらのscFvの誘導されたアミノ酸配列を、上記表1に示す。scFvの個々のVおよびVセグメントを、V−BASE(Tomlinsonら、www.mrc−cpe.cam.ac.uk)において既知のヒト生殖細胞系列の配列と整列させ、そして最も近い生殖細胞系列を同定した。
(実施例9:可溶性BLySに対する特異性)
scFvを、ファージのライブラリーから、scFvが可溶性形態のBLySを結合する能力に基づいて単離した。簡単に言えば、ファージをビオチン化BLySと共に溶液中で予備インキュベートした。次いで、このビオチン化BLySに結合したファージを、ストレプトアビジンでコーティングした磁気ビーズを使用して単離した。
BLySおよび膜結合形態のBLySに対して独自のscFvの各々の特異性を、ファージELISAによって決定した。BLySを、精製した可溶性形態のタンパク質としてか、またはヒトマクロファージ様細胞株(U937)由来の原形質膜調製物に存在する膜結合形態として、プラスチックに固定した。U937細胞および原形質膜調製物の維持を、実施例2に詳述されるように実施した。
(ファージELISA)
scFvの各々の特異性を決定するために、ファージELISAを、ヒトBLyS、U937原形質膜、TNFα、BSAおよびコートされていないウェルに対する各抗体について実施した。抗原コーティング条件は、ヒトBLySを除いて実施例2において記載されたものである。BLySを、最初にビオチン化し(実施例3に記載のように)、そしてストレプトアビジンコーティングしたプレート(Reacti−Bind,Pierce)に、1μg/mlで室温で30分間コーティングした。次いで、これらのプレートを洗浄し、ブロックし、そしてファージELISAを、実施例2に詳述するように実施した。
BLySの可溶性形態を結合するが膜結合形態を結合しない、3つのクローン(I074B12、I075F12およびI075A02)についての結果を、図7に示す。コントロールとして、TNFαを認識するファージ抗体もまた、図7に示される。小さな非特異的バックグラウンドシグナルが、U937原形質膜上に存在し、これは、抗BLyS scFvと抗TNFαコントロールとの両方において明らかである。3つ全ての抗BLyS scFvは、BLySを認識するが、U937原形質膜、TNFα、BSAまたはコーティングされていないウェル(PBSのみ)を認識しない。このことは、scFvが、BLySの膜結合形態を結合しないことを示す。さらに、これらのscFvが、可溶性のビオチン化BLySを結合するそれらの能力に基づいて単離されたという事実は、scFvが可溶性形態のBLySを結合することを示す。これらのscFvのBLySに対する特異性のさらなる確認を、実施例10に提供する。
(実施例10:インビトロレセプター結合アッセイにおけるファージscFvによる阻害)
パネル2由来の独自のファージscFvの全てを、BLySがIM9細胞上のその同種のレセプターに結合することを阻害するこれらの能力について評価した。BLySのビオチン化、IM9細胞の維持およびレセプター結合阻害アッセイを、実施例3に記載のように実施した。
2つのファージscFv(I0025B09およびI026C04)についての結果を、図8に示す。ビオチン化BLySの、そのレセプターに対する最大の結合(bio−BLySのみ)、ビオチン化BLySの非存在下でのバックグラウンドシグナル(bio−BLySなし)、および関連しない(すなわち、BLySを認識しない)ファージ抗体を用いた結果もまた示す。両方のファージscFvが、ビオチン化BLySがIM9細胞上のそのレセプターに結合することを阻害した。パネル2由来の独自のscFvのうちの33個を、さらなる研究のために同定した。これら33個のscFvは、このアッセイにおいて、ファージ粒子として最大の阻害を示し、そして表5に列挙される。
Figure 2009095346
(実施例11:抗BLyS scFvの特異性)
33個のscFv(表5に列挙される)の、固定されたヒトBLySおよびマウスBLySに対する特異性を、ファージELISAを使用して決定した。
(ファージELISA)
これら33個のscFvの特異性を決定するために、ファージELISAを、実施例4に記載されるように、ヒトBLySおよびマウスBLyS、ならびに関連するヒト抗原のパネル(TRAIL、LIGHT、TNFα、TNFβ)およびコーティングされていないウェル(PBSのみ)に対して実施した。
2つのscFv(I067F05およびI078D02)についての代表的な結果を、図9に示す。TNFαを特異的に認識するコントロール抗体もまた示す。両方の抗BLyS scFvは、固定されたヒトBLySおよびマウスBLySを特異的に認識するが、試験した他のいずれの抗原をも認識しない。
33個全てのscFvは、ヒトBLySに対して特異的である。14/33が、マウスBLySと交差反応するが、試験された他のいずれの関連していないかまたは関連する抗原とも、交差反応しない。
(実施例12:scFvオフ速度の決定)
オフ速度の決定、低密度BLyS表面の調製および速度論的測定を、実施例6に詳述のように行った。
個々のscFvに対する結合曲線を、BIAevaluationソフトウェアを使用して分析し、抗体オフ速度を決定した。代表的なscFv抗体であるI002A01についての速度論的分析を、図10に示す。I002A01は、9×10−4−1のKoffを有する。
(実施例13:インビトロレセプター結合アッセイにおけるscFv抗体による阻害)
表5に特定した33個のscFvを、精製したscFvとして調製し、そしてBLySの、IM9細胞上のそのレセプターへの結合を、scFvが阻害する能力について評価した。scFvを精製し、そして実施例6.1.8に記載のように、レセプター結合阻害アッセイにおいて分析した。
2つのscFv抗体(I0068C06およびI074B12)に対する代表的な滴定曲線を、図11に示す。標識されていないBLySは、そのレセプターへの結合に関して、0.66nMの阻害定数50(IC50)値で競合した。I0068C06およびI074B12についてのIC50値は、それぞれ61nMおよび13nMである。このアッセイを三連で実施し、そして標準誤差バーを示す。scFvとして最大の阻害を示した7個のscFvを、表6に列挙する。
Figure 2009095346
(実施例14:膜結合BLySを認識するscFv)
ファージのライブラリーを、アッセイにおいてスクリーニングして、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合するが可溶性形態には免疫特異的に結合しないscFvを提示するファージを同定した。
出発点として、scFv抗体を発現するファージのライブラリーを、固定したHisタグ化BLySにパニングした。次いで、パニングによって単離したファージを、HISタグ化BLySに結合する能力についてスクリーニングした。HISタグ化BLySを、pQE9ベクター(Qiagen Inc.,Valencia,CA)をE.coliにおいて使用して、配列番号3228のアミノ酸71〜285を発現させ、そしてこの発現されたタンパク質を精製することによって得た。次いで、このスクリーニングによって同定されたこのファージクローンを配列決定した。配列決定の後に、HISタグ化BLySを結合する独自のscFvを各々が発現するファージのパネル(パネル3)を作製し、そしてさらに特徴付けた。
パネル3由来の独自のscFvの誘導されたアミノ酸配列を、上記表1に示す。scFvの個々のVおよびVセグメントを、V−BASE(Tomlinsonら、www.mrc−cpe.cam.ac.uk)において既知のヒト生殖細胞系列配列と整列させ、そして最も近い生殖細胞系列を同定した。
(実施例15:膜結合BLySの認識)
膜結合形態のBLySと可溶性形態のBLySとの両方に対する独自のscFvの各々の特異性を、ファージELISAによって決定した。
BLySを、精製した可溶性形態のタンパク質としてプラスチック上に直接的にか、または実施例9においてと同様に、ビオチン化してストレプトアビジンプレート上にコーティングしたかのいずれかで、固定した。HISタグ化BLySへの結合を、膜結合形態のBLySを結合するscFvに対する一次スクリーニングとして使用した(以下を参照のこと)。膜結合形態のBLySを、原形質膜調製物として、ヒトマクロファージ様細胞株、U937、またはマウス細胞株P388から提供した。
マウスモノクローナル抗体を、標準的な手順に従って、Hisタグ化BLySに対して惹起させた。これらのマウスモノクローナル抗体の特徴付けは、これらの抗体が、Hisタグ化BLySとU937細胞上の膜結合形態のBLySとの両方を特異的に認識するが、可溶性BLySを認識しないことを明らかにした。従って、Hisタグ化BLySの特異的認識を、ファージおよびscFv抗体による膜結合形態のBLySの認識に対する支持的な証拠として使用した。
(ファージELISA)
scFvの各々の特異性を決定するために、ファージELISAを、Hisタグ化ヒトBLyS、U937原形質膜、TNFα、BSAおよびコーティングされていないウェルに対する各抗体について実施した。抗原のコーティング条件は、ヒトBLySを除いて、2に記載の通りであった。BLySを、最初にビオチン化し(実施例3に記載のように)、そしてストレプトアビジンコーティングしたプレート(Reacti−Bind,Pierce)に、1μg/mlで室温で30分間コーティングした。次いで、これらのプレートを洗浄し、ブロックし、そしてファージELISAを、実施例2に詳述するように実施した。
TNFαを認識する3つのクローン(I079C01、I081C10およびI082A02)ならびにコントロールファージ抗体についての結果を、図12に示す。3つ全てのscFvは、U937原形質膜(U937)およびHisタグ化BLyS(His−BLyS)を認識するが、ビオチン化BLyS(bio−BLyS)またはコーティングされていないウェル(PBS)を認識しない。このことは、scFvが、膜結合形態のBLySを認識することを示す。
(実施例16:膜結合BLySに対する特異性)
膜結合形態のBLySのみに対するscFvの特異性(可溶性形態に対しては特異的でない)を、競合ELISAを使用して確認した。このアッセイは、試験ファージscFvが、異なる形態の競合BLySの存在下で、U937原形質膜上の膜結合形態のBLySに結合する能力を評価する。競合BLySは、Hisタグ化形態のBLySまたは可溶性BLySのいずれかであった。膜結合BLySに対して特異的なscFvは、Hisタグ化BLySとの予備インキュベーションによって競合されるが、可溶性BLySとの予備インキュベーションによっては競合されないと予測される。
U937細胞の維持および原形質膜の調製を、実施例2に詳述したように実施した。
(競合ELISA)
U937原形質膜(1ウェルあたり50μl)を、PBS中10μg/mlで、Falcon96ウェルプレートに、4℃で一晩コーティングした。
パネル3由来の独自のscFvのうちの1つを提示するファージミドを含む、個々のE.coliコロニーを、5mlの2TYAG培地を含む50mlチューブ(Falcon)内に接種した。チューブを37℃で4時間、振盪しながらインキュベートした。M13KO7ヘルパーファージを、10のMOIまで各チューブに添加し、そしてこれらのチューブを、37℃でさらに1時間インキュベートした。これらのチューブを卓上用遠心機で3500rpmで10分間遠心分離した。上清を除去し、そして細胞ペレットを5mlの2TYAK中に再懸濁させ、そして30℃で一晩、振盪しながらインキュベートした。翌日、チューブを3500rpmで10分間遠心分離し、そしてファージを含む上清を、新しいチューブに注意深く移した。
各試験ファージ抗体について、20μlの18%マーベル(marvel)/6×PBSの3つのアリコートを、96ウェルプレートの別個のウェルに移した。第1のアリコートに、Hisタグ化BLySを、60μg/mlの最終濃度まで補充した。第2のアリコートに、可溶性BLySを、60μg/mlの最終濃度まで補充した。第3のアリコートには、いかなる競合抗原をも補充しなかった。次いで、100μlのファージ上清を各アリコートに添加し、そして室温で1時間静置して、ブロックした。
抗原でコーティングしたプレートを、PBSで1回洗浄し、その後、200μl/ウェルの3%マーベル/PBSを添加した。これらのプレートを37℃で1時間静置してブロックし、次いで、PBSで1回洗浄した。50μlの予めブロックしたファージ(上記)の二連のサンプルを、これらの抗原でコーティングしたプレートに添加し、そして室温で1時間静置した。プレートを、PBS/0.1% Tween 20で3回洗浄し、次いでPBSで3回洗浄した。3% Marvel/PBS中1/5000の、50μl/ウェルのマウス抗M13 HRP(Pharmacia)を添加し、そして室温で1時間静置した。プレートを、PBS/0.1% Tween 20で3回洗浄し、次いでPBSで3回洗浄した。3%マーベル/PBS中1/50の、50μl/ウェルのHRP標識した抗マウスEnvisionポリマー(DAKO)を添加し、そして室温で1時間静置した。プレートをPBS/0.1% Tween 20で3回洗浄し、次いでPBSで3回洗浄した。次に、50μl/ウェルのTMB(Sigma)を添加し、そしてプレートを30〜60分間静置して発生させた。十分な色が発生されたら、25μl/ウェルの0.5M HSOを添加して、反応を停止させた。これらのプレートを、450nmで、マイクロタイタープレートリーダー(Bio−Rad 3550)で読み取った。
TNFαを認識する3つのクローン(I079B04、I079F08およびI080B01)、ならびにコントロールファージ抗体についての結果を、図13に示す。3つ全てのscFvが、U937原形質膜(U937)を認識する。この結合は、Hisタグ化BLyS(HIS−BLyS)の存在下ではバックグラウンドレベルまで競合される(すなわち、抗TNFαファージ抗体を用いて観察されるシグナルに匹敵する)が、ビオチン化BLyS(bio−BLyS)の存在下では、競合されない。このことは、scFvが、BLySの膜結合形態を特異的に認識するが、可溶性形態を特異的に認識しないことを確認する。
(実施例17:高親和性scFvを同定するための高スループットBIAcoreスクリーニング)
これは、試験サンプル(scFv)が、個々の抗体発現クローンの1mlのペリプラズム抽出物に由来する、96ウェルのスクリーニングである。次いで、潜在的により高い親和性のscFvが、BIAcoreにおいてHIS−BLyS表面に結合するRUのより大きな総数を与えるものとして、主として同定される。このランキングの方法は、各クローンからのおおよそ等収量のscFvを仮定する。このことは常にそうであるわけではないので、高レベルのscFvを単に発現するいくらかのscFvもまた同定され得る。これらは、scFvのさらなる特徴付けによって、より高親和性のものと区別され得る(実施例18を参照のこと)。
(1mlのE.coli培養物からのscFvの調製)
パネル3由来の独自のscFvの1つを提示するファージミドを含む、個々のE.coliコロニーを、1ウェルあたり100μlの2TYAG培地を含む96ウェルプレートに接種した。各プレートにおける8つのウェルを、陽性コントロールサンプルおよび陰性コントロールサンプルのために保存した。このプレートを、30℃で120rpmで振盪しながら一晩増殖させた。
翌日、1mlの2TYAGおよび345mM スクロースを、オートクレーブした96ディープウェルプレート(Beckman)の各ウェルに添加した。20μlの各一晩培養物を再懸濁し、そしてディープウェルプレートの適切なウェルに移した。このプレートを、250rpmで振盪しながら30℃にて約3.5時間(またはOD600=0.6まで)増殖させた。50μlの1M IPTGを5ml 2TYに添加し、そしてこの10μlを各ウェルに添加した。このプレートを、250rpmで振盪しながら30℃にて一晩増殖させた。
プレートを、この手順の残りの間、4℃で維持した。一晩増殖させたプレート(上述)を、4℃にて10分間3500rpmで遠心分離し、細胞をペレットにした。上清をデカントし、そして各ペレットを、100μl TES(0.2M TrisHCl(pH8.0)、0.5mM EDTA、0.5M スクロース)に再懸濁し、そして新しい96ウェルプレートに移した。このプレートを氷上で30分間インキュベートし、次いで4℃にて10分間3500rpmで遠心分離し、細胞の残骸をペレットにした。遠心分離の間、15μlの新たに作製したプロテアーゼインヒビターカクテル(Roche、1錠剤を溶解させた1.5mlの水)を新たな96ウェルプレートの各ウェルに添加した。次いで遠心分離したプレート由来の上清を、このプロテアーゼインヒビターを含むプレートに移した。このプレートを4℃にて10分間3500rpmで遠心分離し、そして上清をさらなる96ウェルプレートに移した。この工程を少なくとも1回以上、または遠心分離後のいかなる細胞の残骸の徴候も見られなくなるまで繰り返した。最後に、BIAcore実行中のサンプルの蒸発を防ぐために、このプレートをホイールで覆った。
(高密度HIS−BLyS表面の作製)
全てのBIAcore分析を、BIAcore2000コントロールソフトウェアを用いてBIAcore2000で実施し、BIAevaluation3.0ソフトウェアを用いて評価した。高密度HisタグBLyS表面(1000より多いRU HIS−BLyS連結)を、CM5チップに連結したアミンにより、フローセル2中で調製した。新たなCM5チップをBIAcoreに挿入し、そしてセンサーグラム(sensorgram)を流速5μl/分にてHBS緩衝液を用いてフローセル2上で開始した。NHSおよびEDC溶液を1:1で混合し、CM5表面に30μlを注入した。50μlのHIS−BLyS(酢酸ナトリウム緩衝液(pH4)中で10μg/mlにて)を注入し、そしてこの表面に連結させた。次いで、30μlのエタノールアミン−HCl溶液を、遊離のNHSエステルをブロックするために注入した。このチップを使用する前に、10μlの4M 塩酸グアニジン含有HBSをこの表面に注入し、非共有結合したBLySの表面を剥ぎ取った。ブランク表面(HIS−BLySのない表面)もまた、非特異的結合効果をHIS−BLyS結合曲線から減算し得るように、フローセル1上で調製した。
代表的に、5000RU HisタグBLyS表面をこの方法で作製し、そしてE.coliのペリプラズムから単離したscFvの96ウェル分析のために使用した。
(BIAcore分析)
ペリプラズムscFvを含む96ウェルプレートを、BIAcore内に確保した。2mlの4M 塩酸グアニジン含有HBSを、サンプル間のHIS−BLyS表面の再生のためにBIAcore内のラックに置いた。センサーグラムを、流速20μl/分にてフローセル1および2上で実行した。以下の方法を実行した:
MAIN
FLOWCELL 1,2,3,4
LOOP cycle STEP
APPROG inj %pos
ENDLOOP
APPEND CONTINUE
END
DEFINE LOOP cycle
LPARAM%pos
r1a1
r1b1
r1c1
r1d1
r1e1
r1f1etc(all wells listed until rlh12)
END
DEFINE APROG inj
PARAM%pos
FLOW20
KINJECT%pos 35 30!scfv injection
QUICKINJECT r2f3 10 !regeneration
EXTRACLEAN
END。
実行が終了した場合、BIAevaluationソフトウェアを用いて、フローセル1についてのセンサーグラムのデータを各サンプルについてのフローセル2のデータから減算した。主に表面から解離したscFvとしての全体的なRU変化により、これらのクローンを互いに比較した。さらにいくつかのscFvが潜在的に遅いオフレート(off−rate)を有することを同定した。8つのscFvについての代表的なセンサーグラムの解離セクションの例を図14に示す。BLySを認識しない抗TNFα抗体を、コントロールとして含めた。例示した8つのscFvのうち、I079F06を、この表面への相対的に高い数のRUの結合に起因して、さらなる研究のために同定した。
scFvが1200以上のRU変化を実証するか否かを主に同定し、いくつかはまた、代表的なオフレートよりも潜在的に遅いオフレートを有することを同定した。合計28クローンをこれらの評価基準において選択し、これらを表7に列挙する。
(表7:BIAcoreによる最も有意なRU変化を実証する膜結合BLySに対する28の抗体の同定)
Figure 2009095346
(実施例18:scFv親和性決定)
28のscFvの親和性(K)を、BIAcoreを用いて決定した。
(動態学研究のための低密度HIS−BLyS表面)
500RU表面を、HIS−BLySに結合している精製したscFvの動態学研究のために使用した。これらの表面を調製する方法は、実施例17に記載される方法と同一であった(少量のHIS−BLySのみを注入した)。
(scFv結合動態学の測定)
低密度HIS−BLyS表面を含むチップをBIAcoreに挿入した。28の精製したscFv(実施例6において調製された通り)の各々についての希釈シリーズを、HBS中で希釈した(代表的に、50μg/ml scFvを用いて開始し、そして1.5μg/mlまで二倍希釈した)。次いでこの希釈シリーズを、以下のプログラムを用いて、ブランクコントロール(フローセル1)および低密度HIS−BLyS表面(フローセル2)上に順次注入した:
MAIN
FLOWCELL 1,2,3,4
APROG genab r1d1 ab1
APROG genab r1d2 ab2
APROG genab r1d3 ab3
APROG genab r1d4 ab4
APROG genab r1d5 ab5
APROG genab r1d6 ab6
APPEND CONTINUE
END
DEFINE APROG genab
PARAM%Abpos%AbId
FLOW 20
KINJECT %Abpos 200 80
INJECT r2f3 10
EXTRACLEAN
END。
結合したscFvを、サンプル間の表面上に10μlの4M 塩酸グアニジン含有HBSを注入することにより除去した(上記プログラムにおける位置r2f3)。個々のscFvについての結合曲線を、BIAevaluationソフトウェアを用いて分析し、抗体のオンレートおよびオフレートを決定した。
scFv抗体I082C03について作成された結合曲線の代表的な例を、図15に示す。このクローンについてのオフレートを、2×10−3−1と算出した。I082C03の親和性を20nMと算出し、scFvの100%活性とみなした。scFvとして最も高い親和性を有する5つのscFvを表8に与える。
(表8:scFvとして最も高い親和性を有する膜結合BLySに対する5つの抗体の同定)
Figure 2009095346
(実施例19:マウス膜結合BLySの認識)
マウス膜結合BLySもまた認識する表8に列挙した5つのscFvの能力を、競合ELISAを用いて決定した。このアッセイは、異なる形態の競合するヒトBLySの存在下で、マウス細胞株P388原形質膜上のBLySの膜結合形態に結合する試験ファージscFvの能力を評価する。競合するBLySは、Hisタグ形態のBLySとして存在するか、または可溶性BLySとして存在するかのいずれかであった。マウス膜結合BLySを認識するscFvは、P388原形質膜に対して、HISタグBLySとのプレインキュベーション(可溶性BLySとのプレインキュベーションではない)により競合されるELISAシグナルを与える。
(P388.D1細胞の維持および原形質膜の調製)
P388.D1細胞は、マウス単球−マクロファージ様細胞株である。これらを、2mM L−グルタミン、10% CS、10U ペニシリン、100g/ml ストレプトマイシンを含むL−15培地中で培養した(全ての試薬をSigmaから得た)。細胞を、3〜4日毎に1:4で分割し、2〜8×10/mlの細胞密度を維持した。細胞の新しいアリコートを6週間毎に液体窒素から解凍した。原形質膜画分を、実施例2に記載されるように調製した。
(競合ELISA)
P388原形質膜(1ウェル当たり50μl)を、Falcon96ウェルプレート上に4℃にて一晩、PBS中の10μg/mlでコーティングした。この方法は、それ以外本質的に実施例16に記載される通りである。
3つのクローン(I079E02、I082H08、およびI099D03)についての結果を図16に示す。3つのscFv全てが,P388原形質膜を認識する。この結合は、HISタグBLyS(HIS−BLyS)の存在下で競合するが、ビオチン化BLyS(bio−BLyS)の存在下では競合しない。このことは、これらのscFvがまた、マウスBLySの膜結合形態を認識するが、可溶性形態を認識しないことを確証する。
(実施例20:scFvのIgG1フォーマットへの変換)
本発明者らがIgG分子への変換を望んだscFvのVHドメインおよびVLドメインを、適切な重鎖(ヒトIgG1)または軽鎖(ヒトκまたはヒトλ)定常領域のヌクレオチド配列を含むベクター中にクローニングし、その結果適切な宿主細胞中にトランスフェクトした場合、完全な重鎖または軽鎖分子をこれらのベクターから発現させ得た。さらに、クローニングされた重鎖および軽鎖が両方とも1つの細胞株において発現する(1つのベクターからか、または2つのベクターからかのいずれか)場合、それらは組み立てられて、細胞培養培地に分泌される完全な機能性抗体分子となり得る。scFvを従来の抗体分子に変換するための方法は、当該分野で周知である。
(抗BLyS抗体(IgG1)を発現するNS0細胞株の作製)
重鎖および軽鎖を含むプラスミドを、PvuI制限酵素を用いて、別々に直鎖状にした。この直鎖DNAを、フェノール−クロロホルム抽出、続くエタノール沈殿により精製し、次いでHO中に再懸濁した。増殖培地由来のNS0細胞(10)を12.5μgの直鎖状重鎖プラスミドDNAおよび37.5μgの直鎖状軽鎖DNAを含むPBS中でエレクトロポレーションした(0.25kVおよび975μF)。この細胞を、20ml 非選択培地(6mM グルタミン、アミノ酸およびペニシリン/ストレプトマイシンを補充した10%FCS含有DMEM)中で洗浄し、次いで12.5ml培地中でT75cmフラスコに移し、そして37℃、5%CO/空気にて一晩インキュベートした。トランスフェクションの次の日、細胞を、1mg/ml ジェネティシンを含む選択培地に再懸濁し、そして200μ/ウェルにて5×96ウェルプレートに分配した。37℃(5%CO/空気)での18日後、IgGを発現するコロニーを同定するために構築されたヒトIgGを検出するELISAにより、コロニー上清をスクリーニングした。およそ20のポジティブクローンを展開し、そして無血清、選択培地中での増殖に適合させた。二連のT25cmフラスコを準備した。1つのフラスコからの細胞をストックとして凍結させ、そして第2のフラスコ中の細胞を飽和するまで増殖させた。飽和した培養物の生産性を、ELISAにより評価した。次いで、最も生産性の高い細胞株を、大スケールの抗体産生のために選択した。
上述の手順を、I006D08抗BLyS抗体構築について例示する。NS0細胞のエレクトロポレーションおよび選択後、各々単一のコロニーを含む93のウェル由来の上清をELISAによりスクリーニングし、構築されたIgG1抗体を検出した。27の上清がIgGを含むことを同定した。24のポジティブウェル由来のコロニーを、24ウェルプレート中の1mlの選択培地に移し、2日間増殖させた。次いで、細胞の1ml培養物を、T25cmフラスコ中の還元型血清(0.5% FCS)を含む4ml選択培地に添加した。この培養物がコンフルーエンシー(confluency)に達した場合、1mlの細胞を、T25cmフラスコ中の4ml選択性、無血清培地に希釈した。コンフルーエンシーにおいて、このサブカルチャーレジメンを再度繰り返した。最後に、0.1% FCSを含む培養物由来の1mlの細胞を、9mlの無血清、選択培地を用いて希釈し、そして飽和培養物およびストック培養物を作るために2×T25cmに分割した。一旦培養物がコンフルーエントになったら、ストック培養物を凍結させ、そして液体窒素中で保存した。飽和培養物を、培養物の生存性が10%未満になるまで増殖させた。最初に展開させた24のコロニーのうちの23のコロニーを、無血清培地中での培養に好適に適合させた。これらの無血清適合細胞株の生産性は、飽和した5mlの無血清培地のELISA定量により、0.3〜17μg/mlの範囲であった。I006D08−32細胞株は、17μg/mlを産生した。
(大スケールIgG生成)
最も高い生産性の細胞株を凍結ストックから回復させ、次いで2リットルのローラーボトル中の選択性の無血清培地において400mlに展開した。細胞を37℃で増殖させ、そして2、3日毎にヘッドスペースを5%CO/空気で再平衡化させながら、4rpmで回転させた。最後に、この培養物を、選択性のない無血清培地(2リットルローラーボトル毎に400ml)の添加によって、4リットル容量に展開した。次いでこの培養物を飽和するまで増殖させた。
この手順をI006D08−32細胞株からのI006D08抗体の産生により例示する。I006D08−32の凍結ストックを、1mg/mlジェネティシンを含む5mlの無血清培地を含むT25 cm中に回復させ、そして5% CO/空気インキュベーター中で37℃にて増殖させた。2日間の増殖後、この培養物を7.5mlの新鮮な培地で希釈し、そしてT75cmフラスコに移した。インキュベーター中でのさらに3日後、細胞を130ml選択培地に移し、そして2リットルローラーボトルに移した。3日間の増殖後、細胞を500mlの選択培地で希釈し、そして2×2リットルローラーボトルに分割した。さらに2日間、100mlの新鮮な選択培地を、各ローラーに添加した。最後に、翌日、この培養物を、非選択培地を用いて総量4リットルに展開し、そして10×2リットルローラーボトルに分割した。3日後、この培地に6mMグルタミンを補充した。この細胞を、17日間、最終的なサブカルチャーから4リットル容量に増殖させた。細胞を、生存性が0.2×10細胞/ml未満に下降する前に3×10細胞/mlに増殖させた。この低生存度において、培養上清を収集した。ELISA分析は、この培養上清が33μg/mlのIgGを含むことを示した。従って、4リットルの培養物は、132mg IgGを含んだ。
(IgG精製)
発酵ブロスからのIgGの精製を、抗体生成のために一般的に用いられる従来技術の組み合わせを用いて実施する。代表的に、精製スキームを開始する前に、培養収集物を浄化して細胞および細胞の残骸を除去する。このことは、通常、収集物の遠心分離または濾過を用いて達成される。浄化後、代表的に抗体を捕捉し、そしてProtein A Sepharoseにおけるアフィニティークロマトグラフィーを用いて十分に精製する。この抗体を、Protein A Sepharoseに塩基性pHで結合させ、そしてこのマトリクスの洗浄後、pHの減少により溶出させる。次いで、抗体のさらなる精製を、ゲル濾過により達成する。抗体と異なる分子量を有する成分を除去する工程と同様、この工程もまた、所望の最終処方緩衝液への緩衝液の交換のために用いられ得る。
(I006D08 IgG1の精製)
収集物を0.5μmフィルターおよび0.22μmフィルターを通じた連続濾過により浄化した。次いで、浄化した収集物を、pH8.0で平衡化した組換えProtein A Sepharoseのカラムに適用し、そして平衡化緩衝液で洗浄した。I006D08抗体を、pH3.5の緩衝液の適用によりProtein A Sepharoseから溶出した。次いで、回収した抗体含有溶出物を、pH8.0の緩衝液の添加によりpH7.4に中和した。この中和した溶出物を、30kDaカットオフ膜を用いて限外濾過により濃縮した。次いで、濃縮物質を、移動相としてリン酸緩衝生理食塩水を用いてSephacryl S300HRゲル濾過により精製した。次いで、ゲル濾過カラムからの最終的な単量体IgG1画分を、30kDaカットオフ膜を用いた限外濾過により、所望の処方濃度に濃縮した。最終産物を、0.22μmフィルターを通して濾過した。
(実施例21:3HdT取り込みにより測定されるマウス脾細胞増殖の抗体中和)
抗体がBLyS媒介B細胞増殖を阻害するか否かを決定するために、脾細胞増殖アッセイを実施した。簡単にいうと、25gニードルおよび10mlの完全培地(100U/ml ペニシリン、100μg/ml ストレプトマイシン、4mM グルタミン、5×10−5M β−メルカプトエタノールを含有する10% FBSを有するRPMI 1640)を用いた完全培地による脾臓の洗い流しにより、マウス脾細胞を単離した。この細胞を、100ミクロンナイロンフィルターを通して細胞塊を除去した。次いで、細胞懸濁物を、室温にて25分間、400×gでフィコールした(1つの15mlコニカルチューブ/脾臓;3mlフィコール、10ml細胞懸濁物/脾臓;Ficol 1083(Sigma))。回収した細胞を、完全培地中で3回洗浄し、そして計数した。次いで、回収した細胞を3X濃度のSAC(3X=ストックの1:33,333希釈)(Staph.aureus Cowan株;Calbiochem)を含む完全培地中で、3×10/mlの濃度に希釈した。
各抗体について、30μg/ml、3.0μg/ml、および0.3μg/ml濃度の抗体希釈物50μlを、96ウェルプレートの個々のウェルに分割した(三連)。適切なポジティブコントロール(例えば、モノクローナル抗体15C10)もまた使用した。抗体を含まない培地(および必要な場合、(購入した)ヒトアイソタイプコントロール)を、ネガティブコントロールとして用いた。
BLySタンパク質を、完全培地中で、300ng/ml、90ng/ml、および30ng/mlの濃度に希釈した。次いで、各BLyS希釈物の50μlを、プレート中の抗体希釈物シリーズに添加した。次いで、抗体およびBLyS希釈物を含むプレートを、37℃、5% COで30分間インキュベートし、その後、SACを含む50μlの脾細胞懸濁物を、全てのウェルに添加した。次いで、プレートを72時間(37℃、5% CO)インキュベートした。
72時間後、各ウェルに、0.5μCiの3H−チミジン(6.7Ci/mM;Amersham)を含む50μlの完全培地を補充し、そして細胞をさらに20〜24時間インキュベートした(37℃、5% CO)。インキュベーション後、細胞を、Tomtec Cell Harvesterを用いて収集し、そしてTopCount Scintillation counter(Packard)を用いて濾過物を計数した。
(実施例22:BLySアンタゴニスト分子のインビトロスクリーニングのためのヒトB細胞増殖アッセイ)
推定BLySアンタゴニストの効果を評価するためにバイオアッセイを、等量のBLyS、応答細胞、および推定アンタゴニスト(これらの各々を3Xストック試薬として調製した)を混合することにより、96ウェルフォーマットにおいて三連で実施した。
Bリンパ球を、MACS(抗CD3欠損)によりヒト扁桃から精製し、洗浄し、そして3×10e6細胞/mLの濃度で完全培地(CM)(100U/ml ペニシリン、100μg/ml ストレプトマイシン、4mM グルタミン、5×10E−5M β−メルカプトエタノールを含有する10% FBSを有するRPMI 1640)中に再懸濁した。Staphylococcus aureus、Cowan I(SAC、CalBiochem)を、3X濃度(3X=ストックの1:33,333希釈)で細胞に添加した。
一方で、潜在的なアンタゴニストの8連続希釈(3倍)を、希釈されたアンタゴニストがアッセイにおいて試験されるための3X最終濃度で存在するように、CM中で調製した。抗体を、最終濃度の10μg/mLで開始し、そして約1.5ng/mLまで減少させて慣用的に試験した。
ヒトrBLySを、CM中で調製し、CM中で3X濃度(3X=300ng/mL、30ng/mL、および3ng/mL)にした。予期しない低親和性またはアンタゴニスト濃度に起因する偽ネガティブを回避するために、潜在的なインヒビターを、いくつかの濃度のBLySで慣用的に試験した。
50μLの希釈したアンタゴニストおよび50μLの希釈したBLySを、推定アンタゴニスト希釈シリーズに添加した。
次いで、細胞を、十分に加湿したチャンバー内で72時間(37℃、5% CO)インキュベートした。72時間後、細胞に0.5μCi/ウェル 3H−チミジン(6.7Ci/mmol)を補充し、そしてさらに24時間インキュベートした。Tomtec Cell Harvesterを用いてプレートを収集し、そして濾過物をTopCount Scintillation counter(Packard)中で計数した。
本出願で引用される各文献(特許、特許出願、学術誌、要約、研究マニュアル、書籍、または他の開示を含む)の開示全体は、それらの全体が、本明細書中に参考として援用される。さらに、米国仮出願第60/212,210号(2000年6月16日出願);同第60/240,816号(2000年10月17日出願;同第60/276,248号(2001年3月16日出願);同第60/277,379号(2001年3月21日出願);および同第60/293,499号(2001年5月25日出願)の明細書および配列表は全て、本明細書により、その全体において参考として援用される。
(表1:BLySに免疫特異的に結合するscFv)
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図1は、U937膜に免疫特異的に結合するが、TNFαまたはBSAとは、結合も交差反応もしない3つのscFv、I006E07、I008D05およびI016F04についてのELISAの結果である。 図2は、3つのscFv、I016H07、I001C09およびI018D07についての、レセプター阻害アッセイにおける結果である。 図3は、2つのscFv(I022D01およびI031F02)についてのELISAの結果である。これは、ヒトBLySに結合し、マウスBLySと交差反応するが、TNFリガンドファミリーの他の抗原とは、結合も交差反応もしない能力を示す。 図4は、BLySまたはTNFαのいずれかが競合因子として用いられた場合にU937形質膜に結合する、3つのscFv(I031F09、I050A12およびI051C04)についてのELISAの結果である。 図5は、scFv抗体I003C02の反応速度分析である。I003C02の段階希釈物(3nM〜825nMまで)を示す。会合および解離曲線を、BIAcore 2000およびBIAevaluation 3.0ソフトウェアを用いて作成した。 図6は、2つのscFv抗体(I007F11およびI050A07)についての代表的な力価曲線を示す。非標識BLySはそのレセプターへの結合について0.8nMのIC50値で競合した。I007F11およびI050A07のIC50値は、それぞれ7.9nMおよび17.1nMである。このアッセイを、3連で行い、標準誤差のバーを示す。 図7は、固定化BLySに免疫特異的に結合するが、U937形質膜にも、TNFαにも、BSAにも結合しない3つのscFvクローン(I074B12、I075F12およびI075A02)についてのELISA結果である。コントロールとして、TNFαを認識するファージ抗体もまた、図7に示す。 図8は、レセプター阻害アッセイにおける2つのscFv(I025B09およびI026C04)についての結果である。 図9は、2つのscFvクローン(I067F05およびI078D02)についてのELISA結果を示す。これは、固定化ヒトBLySに結合し、固定化マウスBLySと交差反応するが、TNFリガンドファミリーの他の抗原とは、結合も交差反応もしない能力を示す。 図10は、scFV抗体I002A01の反応速度分析である。I002A01の段階希釈物(3nMから1650nMまで)を示す。会合曲線および解離曲線を、BIAcore 2000およびBIAevaluation 3.0ソフトウェアを用いて作成した。 図11は、2つのscFv(I0068C06およびI074B12)についての代表的な力価曲線を示す。非標識BLySは、そのレセプターへの結合について0.66nMの阻害定数50(IC50)値で競合した。I0068C06 およびI074B12 IC50値は、それぞれ、61nMおよび13nMである。このアッセイを3連で行い、標準誤差のバーを示す。 図12は、3つのクローン(I079C01、I081C10およびI082A02)についてのELISAの結果である。これは、ヒスチジンタグ化BLyS、U937形質膜に結合するが、固定化ビオチン化ByLSには結合しない能力を示す。 図13は、ヒスチジンタグ化BLySまたはビオチン化BLySのいずれかを競合因子として用いた場合に、U937形質膜に結合する、3つのscFv(I079B04、I079F08およびI080B01)についてのELISAの結果である。 図14は、8つのscFvについての代表的センサグラムの解離部分の例を示す。BLySを認識しない抗TNFα抗体をコントロールとして含めた。例示した8つのscFvのうち、I079F06を、表面への比較的多数のRUの結合に起因して、さらなる研究のために同定した。 図15は、scFv抗体I082C03について作成した結合曲線の代表例を示す。このクローンのオフ速度(off−rate)を、2×10−3−1として計算した。I082C03の親和性を、このscFvの100%活性を想定して、20nMとして計算した。 図16は、ヒスチジンタグ化BLySまたはビオチン化BLySいずれかを競合因子として用いた場合に、P388形質膜に結合する3つのscFv(I079B04、I079F08およびI080B01)についてのELISAの結果である。

Claims (96)

  1. BLySに免疫特異的に結合する抗体であって、以下:
    (a)配列番号1〜2128のscFvのいずれか1つのVHCDRのアミノ酸配列を含むアミノ酸配列;および
    (b)配列番号1〜2128のscFvのいずれか1つのVLCDRのアミノ酸配列を含むアミノ酸配列、
    からなる群より選択される第二のアミノ酸配列に対して少なくとも約95%同一な第一のアミノ酸配列を含む、抗体。
  2. 前記第二のアミノ酸配列が、配列番号2129〜3227のscFvのいずれか1つのVHCDR3のアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の抗体。
  3. 前記第二のアミノ酸配列が、配列番号1〜2128のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の抗体。
  4. 前記VHドメインが、配列番号1〜1562のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項3に記載の抗体。
  5. 前記抗体が、BLySの可溶形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合する、請求項4に記載の抗体。
  6. 前記VHドメインが、配列番号1〜46および配列番号321〜329のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項4に記載の抗体。
  7. 前記VHドメインが、配列番号2、9および327のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項6に記載の抗体。
  8. 前記VHドメインが、配列番号834〜872のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項4に記載の抗体。
  9. 前記VHドメインが、配列番号1563〜1880のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項3に記載の抗体。
  10. 前記抗体が、BLySの可溶形態に免疫特異的に結合する、請求項9に記載の抗体。
  11. 前記VHドメインが、配列番号1563〜1569のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項9に記載の抗体。
  12. 前記VHドメインが、配列番号1570〜1595のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項9に記載の抗体。
  13. 前記VHドメインが、配列番号1881〜2128のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項3に記載の抗体。
  14. 前記抗体が、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する、請求項13に記載の抗体。
  15. 前記VHドメインが、配列番号1881〜1885のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項13に記載の抗体。
  16. 前記VHドメインが、配列番号1886〜1908のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項13に記載の抗体。
  17. 前記第二のアミノ酸配列が、配列番号1〜2128のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の抗体。
  18. 前記VLドメインが、配列番号1〜1562のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項17に記載の抗体。
  19. 前記抗体が、BLySの可溶形態および膜結合形態の両方に免疫特異的に結合する、請求項18に記載の抗体。
  20. 前記VLドメインが、配列番号1〜46および321〜329のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項18に記載の抗体。
  21. 前記VLドメインが、配列番号2、9および327のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項20に記載の抗体。
  22. 前記VLドメインが、配列番号834〜872のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項18に記載の抗体。
  23. 前記VLドメインが、配列番号1563〜1880のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項17に記載の抗体。
  24. 前記抗体が、BLySの可溶形態に免疫特異的に結合する、請求項23に記載の抗体。
  25. 前記VLドメインが、配列番号1563〜1569のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項23に記載の抗体。
  26. 前記VLドメインが、配列番号1570〜1595のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項23に記載の抗体。
  27. 前記VLドメインが、配列番号1881〜2128のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項17に記載の抗体。
  28. 前記抗体が、BLySの膜結合形態に免疫特異的に結合する、請求項27に記載の抗体。
  29. 前記VLドメインが、配列番号1881〜1885のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項27に記載の抗体。
  30. 前記VLドメインが、配列番号1881〜1908のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項27に記載の抗体。
  31. 配列番号1〜2128のいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列に少なくとも95%同一なアミノ酸配列もまた含む、請求項3に記載の抗体。
  32. 前記VHドメインおよびVLドメインが、同じscFv由来である、請求項31に記載の抗体。
  33. 前記scFvが、配列番号2のscFvである、請求項32に記載の抗体。
  34. 前記scFvが、配列番号9のscFvである、請求項32に記載の抗体。
  35. 前記scFvが、配列番号327のscFvである、請求項32に記載の抗体。
  36. 前記第一のアミノ酸配列が、前記第二のアミノ酸配列と同一である、請求項1に記載の抗体。
  37. 前記第二のアミノ酸配列が、配列番号1〜2128のscFvのいずれか1つのVHドメインのアミノ酸配列からなる、請求項36に記載の抗体。
  38. 前記第二のアミノ酸配列が、配列番号1〜2128のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列からなる、請求項36に記載の抗体。
  39. 配列番号1〜2128のscFvのいずれか1つのVLドメインのアミノ酸配列に100%同一であるアミノ酸配列もまた含む、請求項37に記載の抗体。
  40. 前記scFvが、配列番号2のscFvである、請求項39に記載の抗体。
  41. 前記scFvが、配列番号9のscFvである、請求項39に記載の抗体。
  42. 前記scFvが、配列番号327のscFvである、請求項39に記載の抗体。
  43. 前記BLySが、BLySホモ三量体である、請求項1に記載の抗体。
  44. 前記BLySホモ三量体の個々のタンパク質成分が、成熟形態のBLySからなる、請求項43に記載の抗体。
  45. 前記BLySが、BLySヘテロ三量体である、請求項1〜44のいずれか1項に記載の抗体。
  46. 前記BLySヘテロ三量体が、少なくとも1つのBLySポリペプチドおよび少なくとも1つのAPRILポリペプチドを含む、請求項45に記載の抗体。
  47. 前記BLySポリペプチドがBLySの成熟形態からなり、そして前記APRILポリペプチドがAPRILの成熟形態からなる、請求項46に記載の抗体。
  48. 請求項1〜47のいずれか1項に記載の抗体であって、ここで、該抗体が、以下:
    (a)全免疫グロブリン分子;
    (b)scFv;
    (c)モノクローナル抗体;
    (d)ヒト抗体;
    (e)キメラ抗体;
    (f)ヒト化抗体;
    (g)Fabフラグメント;
    (h)Fab’フラグメント;
    (i)F(ab’)2;
    (j)Fv;および
    (k)ジスルフィド結合Fv、
    からなる群より選択される、抗体。
  49. 請求項3または37に記載の抗体であって、以下:
    (a)ヒトIgM定常ドメイン;
    (b)ヒトIgG1定常ドメイン;
    (c)ヒトIgG2定常ドメイン;
    (d)ヒトIgG3定常ドメイン;
    (e)ヒトIgG4定常ドメイン;および
    (f)ヒトIgA定常ドメイン、
    からなる群より選択される重鎖免疫グロブリン定常ドメインもまた含む、抗体。
  50. 請求項17または38に記載の抗体であって、以下:
    (a)ヒトIgκ定常ドメイン;
    (b)ヒトIgλ定常ドメイン、
    からなる群より選択される軽鎖免疫グロブリン定常ドメインもまた含む、抗体。
  51. 請求項1〜50のいずれか1項に記載の抗体であって、以下:
    (a)10−7Mと10−8Mとの間の解離定数(K);
    (b)10−8Mと10−9Mとの間の解離定数(K);
    (c)10−9Mと10−10Mとの間の解離定数(K);
    (d)10−10Mと10−11Mとの間の解離定数(K);
    (e)10−11Mと10−12Mとの間の解離定数(K);および
    (f)10−12Mと10−13Mとの間の解離定数(K)、
    からなる群より選択される解離定数(K)を有する、抗体。
  52. 前記抗体が、検出可能な標識に結合体化される、請求項1〜51のいずれか1項に記載の抗体。
  53. 前記検出可能な標識が、放射性同位元素標識である、請求項52に記載の抗体。
  54. 前記放射性同位元素標識が、125I、131I、111In、90Y、99Tc、177Lu、166Hoまたは153Smである、請求項53に記載の抗体。
  55. 前記検出可能な標識が、酵素、蛍光標識、発光標識または生物発光標識である、請求項52に記載の抗体。
  56. 前記抗体が、ビオチン化される、請求項1〜51のいずれか1項に記載の抗体。
  57. 前記抗体が、治療剤または細胞傷害性薬剤に結合体化される、請求項1〜51のいずれか1項に記載の抗体。
  58. 請求項57に記載の抗体であって、前記治療剤または細胞傷害性薬剤が、以下:
    (a)代謝拮抗物質;
    (b)アルキル化剤;
    (c)抗生物質;
    (d)増殖因子;
    (e)サイトカイン;
    (f)抗脈管形成剤;
    (g)抗有糸分裂剤;
    (h)アントラサイクリン;
    (i)毒素;および
    (j)アポトーシス剤、
    からなる群より選択される、抗体。
  59. BLySまたはそのフラグメントを中和する、請求項1〜58のいずれか1項に記載の抗体。
  60. BLySまたはそのフラグメントがそのレセプターに結合する能力を減少または消滅させる、請求項59に記載の抗体。
  61. 前記レセプターが、TACIである、請求項60に記載の抗体。
  62. 前記レセプターが、BCMAである、請求項60に記載の抗体。
  63. BlySまたはそのフラグメントがB細胞増殖を刺激する能力を減少または消滅させる、請求項59に記載の抗体。
  64. BlySまたはそのフラグメントがB細胞による免疫グロブリン分泌を刺激する能力を減少または消滅させる、請求項59に記載の抗体。
  65. BLySまたはそのフラグメントの活性を増強する、請求項1〜58のいずれか1項に記載の抗体。
  66. BLySまたはそのフラグメントがそのレセプターに結合する能力を増大させる、請求項65に記載の抗体。
  67. 前記レセプターが、TACIである、請求項66に記載の抗体。
  68. 前記レセプターが、BCMAである、請求項66に記載の抗体。
  69. BLySまたはそのフラグメントがB細胞増殖を刺激する能力を増加させる、請求項65に記載の抗体。
  70. BLySまたはそのフラグメントがB細胞による免疫グロブリン分泌を刺激する能力を増加させる、請求項65に記載の抗体。
  71. 異種ポリペプチドに共有結合される、請求項1〜70のいずれか1項に記載の抗体。
  72. 前記異種ポリペプチドが、ヒト血清アルブミンである、請求項71に記載の抗体。
  73. 薬学的に受容可能なキャリア中の、請求項1〜72のいずれか1項に記載の抗体。
  74. 請求項1〜73のいずれか1項に記載の抗体を含む、キット。
  75. 請求項1〜74のいずれか1項に記載の抗体をコードする、単離された核酸分子。
  76. 請求項75に記載の単離された核酸分子を含む、ベクター。
  77. 前記核酸分子によってコードされる抗体の発現を調節するヌクレオチド配列もまた含む、請求項76に記載のベクター。
  78. 請求項77に記載の核酸分子を含む、宿主細胞。
  79. 請求項1〜78のいずれか1項に記載の抗体を発現するように操作された、細胞株。
  80. 請求項1〜79のいずれか1項に記載の抗体と同じエピトープに結合する、抗体。
  81. ATCC受託番号PTA−3239を有する細胞株によって産生される抗体の結合を競合的に阻害する、抗体。
  82. ATCC受託番号PTA−3240を有する細胞株によって産生される抗体の結合を競合的に阻害する、抗体。
  83. ATCC受託番号PTA−3243を有する細胞株によって産生される抗体の結合を競合的に阻害する、抗体。
  84. 第二の抗体であって、以下:
    (a)50%〜60%;
    (b)60%〜70%;
    (c)70%〜80%;
    (d)80%〜90%;および
    (e)90%〜100%、
    からなる群より選択されるパーセンテージ範囲内の増加によって、請求項1〜83のいずれか1項に記載の抗体の結合を減少させる、第二の抗体。
  85. BLySに免疫特異的に結合する抗体であって、該抗体は、配列番号1〜2128のいずれか1つのアミノ酸配列を含むscFvのVHドメインをコードするヌクレオチド配列に対して、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされる、VHドメインのアミノ酸配列を含む、抗体。
  86. BLySに免疫特異的に結合する抗体であって、該抗体は、配列番号1〜2128のいずれか1つのアミノ酸配列を含むscFv由来のVLドメインをコードするヌクレオチド配列に対して、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列によってコードされる、VLドメインのアミノ酸配列を含む、抗体。
  87. BLySタンパク質の異常な発現を検出するための方法であって、該方法は、以下:
    (a)請求項1〜86のいずれか1項に記載の1以上の抗体を使用して、個体の第一の生物学的サンプル中のBLyS発現レベルをアッセイする工程;および
    (b)生物学的サンプル中のアッセイされたBLyS発現レベルを、標準的なBLyS発現レベルまたは第二の正常な生物学的サンプル中のBLySレベルと比較する工程、を包含し、ここで、
    (c)標準的なBLyS発現レベルまたは第二の正常な生物学的サンプル中のBLySレベルと比較される、アッセイされた第一の生物学的サンプル中のBLyS発現レベルの増大または減少が、異常な発現を示す、方法。
  88. 異常なBLyS発現または活性に関連する疾患または障害を診断するための方法であって、該方法は、以下:
    (a)BLySに免疫特異的に結合する、請求項52〜58のいずれか1項に記載の標識された抗体の有効量を被験体に投与する工程;
    (b)請求項52〜58のいずれか1項に記載の標識された抗体が、該被験体のBLySが発現される部位で優先的に濃縮することを可能にするために、投与後のある時間間隔の間、待機する工程;
    (c)バックグラウンドのレベルを決定する工程;および
    (d)該被験体において、請求項52〜58のいずれか1項に記載の標識された抗体を検出する工程であって、その結果、バックグラウンドを上回るレベルの標識された抗体の検出は、該被験体がBLySの異常な発現に関連する特定の疾患または障害を有することを示す、工程、
    を包含する、方法。
  89. 異常なBLyS発現または活性に関連する疾患または障害を、処置、予防または寛解する方法であって、請求項73に記載の薬学的組成物を、該疾患または障害を処置、予防または寛解するための有効量で、それを必要とする動物に投与する工程を包含する、方法。
  90. 前記疾患または障害が、癌である、請求項89に記載の方法。
  91. 前記疾患または障害が、免疫系の疾患または障害である、
    請求項89に記載の方法。
  92. 前記免疫系の疾患または障害が、自己免疫疾患または障害である、請求項91に記載の方法。
  93. 請求項92に記載の方法であって、ここで、前記免疫系の疾患または障害が、以下:
    (a)全身性エリテマトーデス、および
    (b)慢性関節リウマチ、
    からなる群より選択される自己免疫疾患または障害である、方法。
  94. 前記免疫系の疾患または障害が、免疫不全である、請求項91に記載の方法。
  95. 前記免疫系の疾患または障害が、以下:
    (a)分類不能型免疫不全(CVID);および
    (b)AIDS、
    からなる群より選択される免疫不全である、請求項92に記載の方法。
  96. 前記免疫系の疾患または障害が、癌である、請求項91に記載の方法。
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