ES2313878T3 - Procedimiento para la produccion de l-lisina. - Google Patents

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Abstract

Bacteria Escherichia en la que: (1) son aumentadas las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa, la aspartocinasa y la dihidrodipicolinato reductasa, (2) es aumentada la actividad intracelular de la diaminopimelato deshidrogenasa, o son aumentadas las actividades intracelulares de la tetrahidrodipicolinato succinilasa y la succinil diaminopimelato deacilasa, y (3) es aumentada la actividad intracelular de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa o la fosfoenolpiruvato carboxilasa, en la que las actividades intracelulares de las enzimas son aumentadas mediante la introducción de un plásmido que presenta un gen de la enzima, mediante el incremento del número de copias de un gen de la enzima en el cromosoma, o mediante la modificación de una secuencia de promotor de un gen de la enzima en el cromosoma.

Description

Procedimiento para la producción de L-lisina.
Campo técnico
La presente invención se refiere al campo de los microbios. Más específicamente, la presente invención se refiere a un procedimiento para la producción de L-lisina mediante fermentación y a un microorganismo utilizado para el procedimiento de producción.
Antecedentes de la técnica
En la producción de la L-lisina mediante fermentación, se han utilizado convencionalmente las cepas aisladas de mutantes naturales o artificiales de los mismos para mejorar la productividad. Son conocidas muchas cepas mutantes artificiales que producen L-lisina y muchas de ellas son cepas resistentes de S-2-aminoetilcisteína (AEC) y pertenecen al género Brevibacterium, Corynebacterium, Bacillus o Escherichia. Además, se han descrito diversas técnicas para incrementar la producción de aminoácido, por ejemplo, la utilización de un transformante obtenido utilizando ADN recombinante.
En cuanto a las bacterias Escherichia, por ejemplo, se han descrito los procedimientos para la producción de L-lisina utilizando una cepa en la que se aumenta la actividad de dihidrodipicolinato sintasa (DDPS) en la solicitud de patente japonesa abierta al público (kokai) nº 56-18596, en la patente US nº 4.346.170 y en Applied Microbiology and Biotechnology, 15, págs. 227-331 (1982). Además, se ha descrito en la publicación de patente coreana nº 92-8382 un procedimiento para la producción de L-lisina utilizando una bacteria Escherichia en la que se introduce una forma de DDPS derivada de la bacteria Corynebacterium. Además, se describe en la publicación internacional nº WO95/16042 un procedimiento para la producción de L-lisina utilizando una cepa que se transforma con un plásmido que contiene ADN que codifica la dihidrodipicolinato sintasa que proviene de una bacteria Escherichia que posee una mutación para la insensibilización de la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina, ADN que codifica la aspartocinasa cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza, ADN que codifica la dihidrodipicolinato reductasa y ADN que codifica la diaminopimelato deshidrogenasa derivada de una bacteria corineforme.
En cuanto a las bacterias Brevibacterium, la publicación internacional nº WO95/11985 describe que la productividad de la L-lisina se puede mejorar mediante el aumento de la actividad de la dinucleótido nicotinamida adenina transhidrogenasa intracelular. Además, se describe en la publicación de patente japonesa abierta al público (kokai) nº 60-87788 y en la publicación de patente japonesa (kokoku) nº 6-102028, respectivamente, un procedimiento para la producción de la L-lisina utilizando una cepa en la que se aumenta únicamente la actividad de la fosfoenolpiruvato carboxilasa y un procedimiento para la producción de la L-lisina utilizando una cepa en la que se aumenta únicamente la actividad de la deshidrogenasa aspartato-semialdehído.
En la producción industrial de aminoácidos mediante fermentación, la producción se lleva a cabo a gran escala. Por lo tanto, incluso la mejora en el rendimiento de distintos porcentajes puede proporcionar un valor industrial significativo, y de este modo se desea la mejora del rendimiento independientemente del grado de mejoría.
Descripción de la invención
Un objetivo de la presente invención consiste en proporcionar un procedimiento mejorado para la producción de la L-lisina mediante fermentación comparado con los procedimientos convencionales.
Los presentes inventores estudiaron diligentemente para conseguir el objetivo mencionado anteriormente. Como resultado, descubrieron que, si la actividad de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa o de la fosfoenolpiruvato carboxilasa aumentaba en una bacteria Escherichia que posee una propiedad especifica y si aumentaban la actividad o actividades de una enzima o enzimas específicas además de las enzimas mencionadas anteriormente en tal bacteria Escherichia, se podría mejorar la productividad de la bacteria para L-lisina y llevaron a cabo la presente invención basándose en estos descubrimientos.
Esto es, la presente invención proporciona: en un primer aspecto, una bacteria Escherichia en la que (1) se aumentan las actividades intracelulares de dihidrodipicolinato sintasa, la aspartocinasa y la dihidrodipicolinato reductasa y (2) aumenta/n, la actividad intracelular de la diaminopimelato deshidrogenasa o las actividades intracelulares de la tetrahidrodipicolinato succinilasa y la succinildiaminopimelato deacilasa, en la que aumenta la actividad intracelular de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa o la fosfoenolpiruvato carboxilasa;
en un segundo aspecto, una bacteria Escherichia en la que (1) aumentan las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa, la aspartocinasa y la dihidrodipicolinato reductasa y (2) aumenta/n la actividad intracelular de la diaminopimelato deshidrogenasa o las actividades intracelulares de la tetrahidrodipicolinato succinilasa y la succinildiaminopimelato deacilasa, en la que aumentan la actividad intracelular de la fosfoenolpiruvato carboxilasa y la actividad intracelular de la nicotinamida adenina dinucleótido transhidrogenasa o la aspartato-semialdehído deshidrogenasa; y en un tercer aspecto, una bacteria Escherichia en la que (1) aumentan las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa, la aspartocinasa y la dihidrodipicolinato reductasa y (2) aumenta/n la actividad intracelular de la diaminopimelato deshidrogenasa o las actividades intracelulares de la tetrahidrodipicolinato succinilasa y succinildiaminopimelato deacilasa, en la que se aumentan las actividades intracelulares de la fosfoenolpiruvato carboxilasa y la nicotinamida adenina dinucleótido transhidrogenasa y la actividad intracelular de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa o la aspartasa (en adelante se hará referencia a las bacterias según los tres aspectos mencionados anteriormente en conjunto como las "bacterias de la presente invención").
En las bacterias de la presente invención, resulta preferido que aumenten las actividades intracelulares de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa y aspartasa.
Además, en las bacterias de la presente invención, se prefiere que la aspartocinasa, la dihidrodipicolinato reductasa, la tetrahidrodipicolinato succinilasa, la succinildiaminopimelato deacilasa, la fosfoenolpiruvato carboxilasa y la aspartato-semialdehído deshidrogenasa deriven cada una de una bacteria Escherichia, la nicotinamida adenina dinucleótido transhidrogenasa y la aspartasa, si están presentes, deriven cada una de una bacteria Escherichia, la dihidrodipicolinato sintasa derive cada una de una bacteria Escherichia o de una bacteria Brevibacterium y la diaminopimelato deshidrogenasa derive de una bacteria Brevibacterium.
En las bacterias de la presente invención resulta preferido que la actividad intracelular de la enzima cuya actividad intracelular se aumenta, se aumente mediante uno de los puntos siguientes o cualquier combinación de los mismos.
(1) introducción de un plásmido que posee un gen de la enzima.
(2) incrementar un número de copia de un gen de la enzima en el cromosoma.
(3) modificación de una secuencia de un promotor de un gen de la enzima en el cromosoma.
Además, en las bacterias de la presente invención, resulta preferido que las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa y la aspartocinasa aumenten mediante el hospedaje de la dihidrodipicolinato sintasa cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza y la aspartocinasa cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza y la actividad intracelular de diaminopimelato deshidrogenasa aumenta mediante la introducción de un gen de diaminopimelato deshidrogenasa.
La presente invención proporciona asimismo un procedimiento para la producción de L-lisina, que comprende cultivar cualquiera de las bacterias de la presente invención en un medio adecuado para producir y acumular la L-lisina en el cultivo y recoger la L-lisina del cultivo (al que en adelante se hará referencia asimismo como el "procedimiento de producción de la presente invención").
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Breve explicación de los dibujos
La fig. 1 representa un procedimiento para la producción del plásmido RSF24P derivado de RSF1010 que contiene dapA*24.
La fig. 2 representa un procedimiento para la producción del plásmido RSFD80 que contiene dapA*24 y lysC*80.
La fig. 3 representa un procedimiento para la producción del plásmido pCAB1 que contiene dapA*24, lysC*80 y dapB.
La fig. 4 representa un procedimiento para la producción del plásmido pCABD2 que contiene dapA*24, lysC*80, dapB y ddh.
La fig. 5 representa un procedimiento para la producción del plásmido pCABDE1 que contiene dapA*24, lysC*80, dapB, dapD y dapE.
La fig. 6 representa una estructura de plásmido pppc que contiene ppc.
La fig. 7 representa una estructura de plásmido pasd que contiene asd.
La fig. 8 representa un procedimiento para la producción del plásmido pMW::THY que contiene pntAB (pntA y pntB).
La fig. 9 representa un procedimiento para la producción del plásmido pMW118::aspA que contiene aspA.
La fig. 10 representa un procedimiento para la producción del plásmido ppcd que contiene ppc y asd.
La fig. 11 representa un procedimiento para la producción del plásmido pPTS que contiene ppc y pntAB.
La fig. 12 representa un procedimiento para la producción del plásmido pAPW que contiene ppc y aspA.
La fig. 13 representa un procedimiento para la producción del plásmido pPTd que contiene ppc, pntAB y asd.
La fig. 14 representa un procedimiento para la producción del plásmido pAPT que contiene ppc, pntAB y aspA.
La fig. 15 representa un procedimiento para la producción del plásmido pAPTK que contiene ppc, pntAB y aspA.
La fig. 16 representa un procedimiento para la producción del plásmido pSd que contiene asd.
La fig. 17 representa un procedimiento para la producción del plásmido pKD que contiene ppc, pntAB, aspA y asd.
La fig. 18 representa un procedimiento para la producción del plásmido pUTES que contiene tet^{pro}.
La fig. 19 representa un procedimiento para la producción del plásmido pUEBL3, que contiene tet^{pro} y dapA derivados de Brevibacterium lactofermentum descendente de tet^{pro}.
La fig. 20 representa un procedimiento para la producción del plásmido pCABD(B) que contiene dapA derivado de Brevibacterium lactofermentum (Brev. dapA), lysC, dapB y ddh.
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Mejor modo de poner en práctica la invención <1> Bacterias de la presente invención
Las bacterias de la presente invención son bacterias Escherichia en las que (1) aumentan las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa, la aspartocinasa y la dihidrodipicolinato reductasa y (2) aumenta/n la actividad intracelular de diaminopimelato deshidrogenasa o las actividades intracelulares de tetrahidrodipicolinato succinilasa y succinildiaminopimelato deacilasa y aumentan también las actividades intracelulares de las enzimas siguientes:
(1)
aspartato-semialdehído deshidrogenasa o fosfoenolpiruvato carboxilasa,
(2)
fosfoenolpiruvato carboxilasa y nicotinamida adenina dinucleótido transhidrogenasa a la que en adelante se hará referencia asimismo como "transhidrogenasa" o aspartato-semialdehído deshidrogenasa, o
(3)
fosfoenolpiruvato carboxilasa y transhidrogenasa y aspartato-semialdehído deshidrogenasa o aspartasa.
Las bacterias de la presente invención son preferentemente bacterias Escherichia en las que aumentan también las actividades intracelulares de la fosfoenolpiruvato carboxilasa, de la transhidrogenasa, de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa y de la aspartasa.
Las bacterias de la presente invención pertenecen preferentemente a Escherichia coli (E. coli).
En la presente memoria, la expresión de "aumenta la actividad intracelular" significa que incrementa la actividad enzimática intracelular comparada con la de una cepa salvaje (por ejemplo, cepa W3110 de E. coli) o con la de una cepa madre (cepa en la que no aumentan las actividades intracelulares de todas las enzimas incluidas en las combinaciones específicas de la presente invención) y significa también que una bacteria que posee una actividad enzimática que no la posee una cepa salvaje o una cepa madre. Son conocidos estos procedimientos de medición para las actividades de las enzimas mencionadas anteriormente y el aumento de las actividades intracelulares se puede confirmar fácilmente por los expertos en la materia.
Los medios para aumentar las actividades intracelulares incluyen los medios siguientes y las combinaciones de los mismos, pero no está limitado a éstos.
En primer lugar, se pueden mencionar los medios para incrementar la cantidad de expresión de las enzimas.
Específicamente, como medios para el incremento de la cantidad de expresión de las enzimas, se pueden mencionar los medios siguientes.
(1) Introducción de un plásmido que contiene el gen de la enzima
Se puede utilizar como el plásmido, el vector autónomamente replicable en una célula de bacteria Escherichia. Se puede introducir de una forma conocida. Esto es, se puede insertar un gen de interés en el vector y se puede transformar con ese vector una bacteria Escherichia. Este vector es preferentemente un plásmido de tipo multicopia.
Los genes se pueden transportar mediante el mismo plásmido o plásmidos diferentes. Algunos de los genes se pueden transportar mediante el mismo plásmido. Cuando se utilizan dos o más clases de plásmidos, resulta preferido utilizar plásmidos que presenten sistemas de partición estables que capaciten la coexistencia estable de estos plásmidos en una célula. El orden de introducción de los genes no está limitado particularmente.
(2) Incremento del número de copias de un gen de la enzima en el cromosoma
El número de copias se puede incrementar mediante la amplificación del ADN en el ADN del cromosoma utilizando el fago Mu o similar.
El ADN en el ADN del cromosoma puede ser uno de los que originalmente posea la bacteria Escherichia o uno incorporado en un cromosoma de un microorganismo huésped mediante un procedimiento que utiliza la transducción, transposón (Berg, D.E. and Berg C.M., Bio/Technol., 1, 417 (1983)), fago Mu (solicitud de patente japonesa abierta al público nº 2-109985) o una recombinación homóloga (Experiments in Molecular Genetics and Cold Spring Harbor Lab. (1972)).
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(3) Modificación de una secuencia de promotor de un gen de la enzima
Se puede modificar una secuencia de promotor para incrementar la cantidad de transcripción de un gen y de este modo incrementar la cantidad de expresión. Por ejemplo, se puede aumentar un promotor mediante la introducción de una mutación en el promotor para incrementar la cantidad de transcripción de un gen localizado descendente en el promotor. Más que la introducción de una mutación en el promotor, se puede introducir nuevamente un promotor que puede funcionar en las bacterias Escherichia tal como lac, trp, tac, trc y PL. Alternativamente, la cantidad de transcripción de un gen se puede incrementar mediante la introducción nuevamente de un aumentador. Aunque la secuencia de promotor puede ser una para un gen de la enzima en el cromosoma o una para un gen de la enzima en un plásmido, resulta preferida una para el gen de la enzima en el cromosoma. La introducción de genes tales como los promotores en el ADN de cromosoma se describe en la solicitud de patente japonesa abierta al público nº 1-215280, por ejemplo.
Los orígenes de los genes para las enzimas mencionadas anteriormente no están limitados particularmente, y las obtenidas de diversos orígenes se pueden utilizar siempre que se puedan expresar los genes y los productos genéticos puedan funcionar en las bacterias Escherichia.
En adelante, se ejemplificarán los procedimientos para la obtención de los genes del sistema de biosíntesis de la L-lisina y el gen de la transhidrogenasa de E. coli y los genes de la dihidrodipicolinato sintasa y de la diaminopimelato deshidrogenasa de Brevibacterium lactofermentum.
Se puede obtener un gen de fosfoenolpiruvato carboxilasa (ppc) del plásmido pS2 (Sabe, H. et al., Gene, 31, 279, (1984)) o pT2, que contiene este gen. Se puede obtener un fragmento de ADN que contiene ppc mediante la digestión de pS2 con AatII y AflII. Además, se puede obtener también un fragmento de ADN que contiene ppc mediante la digestión de pT2 con SmaI y ScaI. Se depositó una cepa F15 de E. coli que hospeda pT2 (AJ12873) en el National Institute of Bioscience and Human Technology, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry (código postal 305-8566, 1-3 Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japón) el 15 de julio de 1993 y se le asignó un número de registro de entrada FERM P-13752. A continuación, se transfirió a un depósito internacional bajo las disposiciones del Tratado de Budapest del 11 de julio de 1994 y recibió el número de registro de entrada FERM BP-4732.
Se puede obtener un gen de la aspartocinasa (lysC) mediante la amplificación por PCR utilizando ADN de cromosoma de E. coli como plantilla y dos clases de cebadores de oligonucleótidos preparados basándose en la secuencia de nucleótido conocida de lysC (Cassan, M., Parsot, C., Cohen, G. N., y Patte, J.C., J. Biol. Chem., 261, 1052 (1986) (por ejemplo, los mencionados en la publicación internacional nº WO95/16042, nº de id. de sec. 5
y 6).
Se puede obtener un gen de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa (asd) a partir del plásmido pAD20 (Haziza, C. et al., EMBO, 1, 379 (1982)), que contiene este gen. Si se digiere pAD20 con AseI y ClaI se obtendrá un fragmento de ADN que contiene asd.
Se puede obtener un gen de la dihidrodipicolinato sintasa (dapA) mediante la amplificación por PCR utilizando ADN de cromosoma de E. coli como plantilla y dos clases de cebadores de oligonucleótidos (por ejemplo, los de los nº de id. de sec. 1 y 2 mencionados anteriormente en la publicación internacional nº WO95/16042 preparados basándose en la secuencia de nucleótidos conocida de dapA (Richaud, F. et al., J. Bacteriol., 297 (1986)).
Se puede obtener un gen de la dihidrodipicolinato reductasa (dapB) mediante la amplificación por PCR utilizando ADN de cromosoma de E. coli como plantilla y dos clases de cebadores de oligonucleótido (por ejemplo, los de los nº de id. de sec. 9 y 10 mencionados en la publicación internacional nº WO95/16042) preparados basándose en la secuencia de nucleótido conocida de dapB (Bouvier, J. et al., J. Biol. Chem., 259, 14829 (1984)).
Se puede obtener un gen de la tetrahidrodipicolinato succinilasa (dapD) mediante la amplificación por PCR utilizando ADN de cromosoma de E. coli como plantilla y dos clases de cebadores de oligonucleótido (por ejemplo, los de los nº id. de sec. 15 y 16 mencionados en la publicación internacional nº WO95/16042) preparados basándose en la secuencia de nucleótidos conocida de dapD (Richaud, C. et al., J. Biol. Chem., 259, 14824 (1984)).
Se puede obtener un gen de la succinildiaminopimelato deacilasa (dapE) mediante la amplificación por PCR utilizando ADN de cromosoma de E. coli como plantilla y dos clases de cebadores de oligonucleótidos (por ejemplo, los de los nº de id. de sec. 17 y 18 mencionados en la publicación internacional nº WO95/16042) preparados basándose en la secuencia de nucleótidos conocida de dapE (Bouvier, J. et al., J. Bacteriol., 174, 5265 (1992)).
Se puede obtener un gen de aspartasa (aspA) mediante la amplificación por PCR utilizando ADN de cromosoma de E. coli como plantilla y dos clases de cebadores de oligonucleótidos (por ejemplo, los de los nº de id. de sec. 5 y 6 mencionados en el listado de secuencias de la presente invención) preparados basándose en la secuencia de nucleótidos conocida aspA (Woods, S.A. et al., Biochem. J. 237 (2), 547-557 (1986)).
Se puede preparar un gen de la transhidrogenasa (pntAB) basándose en la secuencia de nucleótido conocida del gen de la transhidrogenasa (D.M. Clarke et al., Eur. J. Biochem., 158, 647-653 (1986)). En la E. coli, la transhidrogenasa está compuesta por dos subunidades, que se codifican por pntA y pntB, respectivamente (D.M. Clarke et al., supra). Por lo tanto, se preparan ambos genes (ver, por ejemplo, publicación internacional nº WO95/11985).
Se puede obtener asimismo a partir de un plásmido que contiene pntAB. Al igual que el plásmido que contiene pntAB, se puede mencionar el plásmido pMW::THY mencionado en la publicación internacional nº WO/9511985. Este plásmido es un plásmido recombinante obtenido ligando un fragmento de ADN de 3,0 kb de una cepa MC1061 K-12 de E. coli, que contiene pntA y pntB y un fragmento BamHI y HindIII del vector de plásmido pMW118. Se diseñó una cepa JM109 de Escherichia coli que hospeda pMW::THY como cepa AJ12929 y se depositó en el National Institute of Bioscience and Human-Technology, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry (código postal 305-0046, 1-3 Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japón) el 4 de octubre de 1993 y se le asignó un número de registro de entrada FERM P-13890. A continuación, se transfirió a un depósito internacional bajo las disposiciones del Tratado de Budapest del 11 de septiembre de 1994 y se le asignó un número de registro de entrada FERM BP-4798.
Se puede obtener un gen de la dihidrodipicolinato sintasa (dapA) de Brevibacterium lactofermentum mediante amplificación por PCR utilizando un ADN de cromosoma de Brevibacterium lactofermentum como plantilla y dos clases de cebadores de oligonucleótidos (por ejemplo, los de los nº id. de sec. 3 y 4 mencionados en la lista de secuencias de la presente invención) preparados basándose en la secuencia de nucleótido de dapA (Bonassie, S. et al., N.A.R., 18 (21), 6421 (1990)).
Se puede obtener un gen de la diaminopimelato deshidrogenasa (ddh) de Brevibacterium lactofermentum mediante amplificación por PCR utilizando un ADN de cromosoma de Brevibacterium lactofermentum como plantilla y dos clases de cebadores de oligonucleótido (por ejemplo los de los nº de id. de sec. 11 y 12 mencionados en la publicación internacional nº WO95/16042) preparados basándose en la secuencia de nucleótidos conocida de ddh de Corynebacterium glutamicum (Ishino, S. et al., Nucleic Acids Res., 15, 3917 (1987)).
Como medios para el aumento de las actividades intracelulares, se pueden mencionar asimismo los medios para el incremento de las actividades específicas de las enzimas. Estos medios se pueden combinar con los medios para el incremento de las cantidades de expresión de las enzimas.
En cuanto a los medios para el incremento de las actividades específicas de las enzimas, se pueden mencionar la introducción de una enzima que posee una mutación para incrementar la actividad específica, la inclusión de una enzima en la que se insensibilize su inhibición por retroalimentación, cuando la enzima reciba la inhibición por retroalimentación y así sucesivamente.
Los ejemplos de la enzima cuya inhibición por retroalimentación se insensibiliza incluyen la dihidrodipicolinato sintasa (DDPS) cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza y la aspartocinasa (AK) cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza.
La expresión "la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina" se insensibiliza significa que la insensibilización sustancial de la inhibición es suficiente y no se requiere que la inhibición se debería insensibilizar completamente. Además, se incluye asimismo en la enzima cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza una enzima derivada de un organismo diferente de las bacterias Escherichia, independientemente de si es una enzima de tipo salvaje o mutante del organismo, si el grado de la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina es inferior al de la enzima de tipo salvaje derivado de una bacteria Escherichia. Por lo tanto, está incluida también una enzima que está libre originalmente de la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina tal como DDPS derivada de las bacterias Brevibacterium.
El grado de la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se puede evaluar mediante procedimientos conocidos tales como los procedimientos descritos en la publicación Internacional nº WO95/16042, ejemplos 1 y 2.
Como la DDPS cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza (DDPS insensibilizada) y la AK cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza (AK insensibilizada), se pueden mencionar las descritas en la publicación internacional nº WO95/16042 y la solicitud de patente japonesa abierta al público nº 10-113183.
Esto es, los ejemplos de la DDPS insensibilizada incluyen los que poseen una mutación insensibilizadora de la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina encontrada en la DDPS de tipo salvaje. Como la DDPS de tipo salvaje, se pueden mencionar la derivada de la bacteria Escherichia, especialmente la DDPS derivada de E. coli. Ejemplos de la mutación que insensibiliza la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina de DDPS incluyen:
(1)
mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de alanina en la posición 81 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de valina),
(2)
mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de histidina en la posición 118 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de tirosina), y
(3)
mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de alanina en la posición 81 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de valina) y para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de histidina en la posición 118 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de tirosina) en la secuencia de aminoácido de DDPS mostrada como el nº de id. de sec. 4 en la publicación internacional nº WO95/16042 en la que la posición es considerada a partir del N terminal de la DDPS. Es bien conocido que pueden existir entre las especies o cepas las diferencias en la secuencia de aminoácido que no afectan la actividad y los expertos en la materia podrán reconocer fácilmente un residuo de aminoácido que corresponde a los residuos de aminoácido específicos mencionados anteriormente.
Otros ejemplos de la DDPS insensibilizada incluye la DDPS derivada de las bacterias corineformes, por ejemplo, Brevibacterium lactofermentum (Cremer J. et al., J. Gen. Microbiol., 134, 3221-3229 (1988)).
Para hacer insensible la DDPS que se va a hospedar en las bacterias Escherichia, por ejemplo, se puede introducir el ADN que codificada la DDPS insensibilizada.
Ejemplos de ADN que codifican la DDPS insensibilizada incluyen los correspondientes al ADN que codifica una DDPS de tipo salvaje que posee una mutación para insensibilizar la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina de la DDPS codificada.
En adelante, un procedimiento para la obtención de ADN que codifica la DDPS insensibilizada (gen de DDPS insensibilizado) se explicará mediante la ejemplificación de la DDPS derivada de las bacterias Escherichia. En cuanto a la DDPS de otros organismos, se puede obtener ADN de forma similar. Además, si la DDPS de tipo salvaje derivada de otro organismo es una DDPS insensibilizada, el ADN que la codifica se puede utilizar tal como es.
El ADN que codifica la DDPS de tipo salvaje no se limita de forma particular siempre que codifique la DDPS derivada de la bacteria Escherichia. Específicamente, se puede mencionar el ADN que codifica la secuencia de aminoácido que se muestra en la publicación internacional nº WO95/16042, nº de id. de sec. 4. Más específicamente, se puede mencionar la secuencia representada por los números de nucleótido 272-1147 dentro de la secuencia de nucleótido mostrada en el nº de id. de sec. 3 de la misma. En estas secuencias, una que posee una mutación de la secuencia de nucleótido que causa la sustitución de los residuos de aminoácido mencionados anteriormente es el ADN que codifica una DDPS insensibilizada. Además, el tipo de codon que corresponde al residuo de aminoácido no se limita particularmente, siempre que codifique el residuo de aminoácido. Además, se espera asimismo que exista una ligera diferencia en la secuencia de aminoácido de la DDPS contenida entre las especies y cepas de bacterias. Sin embargo, las que poseen tal diferencia que causa la sustitución, la deleción o la inserción de residuos de aminoácido en las posiciones que no afectan la actividad de la enzima están comprendidas dentro del alcance del gen DDPS
insensibilizado.
Tal gen de DDPS insensibilizado se puede obtener, por ejemplo, como se expone a continuación. En primer lugar, el ADN que contiene un gen de la DDPS de tipo salvaje u otro gen de la DDPS que posee una mutación se somete a un tratamiento de mutación in vitro y el ADN experimenta el tratamiento de mutación y se liga un ADN de vector compatible con un huésped para preparar un ADN recombinante. El ADN recombinante se introduce en los microorganismos huésped para obtener transformantes y se selecciona de entre los transformantes un transformante que llega a expresar una DDPS insensibilizada. Tal transformante se hospeda el gen de la DDPS insensibilizado. Alternativamente, se pueden ligar el ADN que contiene un gen de la DDPS de tipo salvaje u otro gen de DDPS que posee un mutación y un ADN de vector compatible con un huésped para preparar un ADN recombinante. A continuación, el ADN recombinante se puede someter a un tratamiento de mutación in vitro e introducirse en microorganismos huésped para obtener transformantes y se puede seleccionar un transformante que llega a expresar una DDPS insensibilizada. Tal transformante hospeda asimismo el gen de la DDPS insensibilizado.
Además, un microorganismo que produce una DDPS de tipo salvaje se puede someter a un tratamiento de mutación para preparar una cepa de mutante que produce una DDPS insensibilizada y a continuación un gen de DDPS insensibilizado se puede obtener a partir de la cepa mutante. De forma alternativa, si un transformante, en el cual se introduce un ADN recombinante ligado con un gen de tipo salvaje, se somete a un tratamiento de mutación para preparar una cepa de mutante que produce una DDPS insensibilizada y a continuación se recoge un ADN recombinante a partir de una cepa mutante, se crea un gen de la DDPS insensibilizado en ese ADN.
Los ejemplos de agentes para el tratamiento de la mutación in vitro de ADN incluyen hidroxilamina y así sucesivamente. La hidroxilamina es un agente de tratamiento de mutación químico que causa la sustitución de la citosina con tiamina mediante el cambio de citosina en N^{4}-hidroxicitosina. Cuando un microorganismo en sí mismo se somete a un tratamiento de mutación, se lleva a cabo el tratamiento con irradiación ultravioleta o un agente mutagenizante habitualmente utilizado para la mutación artificial tal como N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (NTG) y ácido nitroso.
Como bacteria donadora del ADN que contiene un gen DDPS de tipo salvaje u otro gen de DDPS que contiene una mutación, se puede utilizar cualquiera de los microorganismos que pertenecen al género Escherichia. Específicamente, se pueden utilizar los mencionados en la literatura de Neidhardt et al. (Neidhardt, F.C. et al., Escherichia coli and Salmonella Typhimurium, American Society for Microbiology, Washington D.C., 1208, tabla 1). Por ejemplo, se pueden mencionar la cepa JM109 y la cepa MC1061 de E. coli. Cuando se utiliza una cepa salvaje como un donador de ADN que contiene un gen de DDPS, se puede obtener el ADN que contiene un gen de DDPS de tipo
salvaje.
Los ejemplos de la AK insensibilizada incluyen los que poseen una mutación insensibilizadora de la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina encontrada en la AK de tipo salvaje. En cuanto a la AK de tipo salvaje, se pueden mencionar las derivadas de las bacterias Escherichia, especialmente la aspartocinasa III (AKIII) derivada de E. coli. Los ejemplos de la mutación que insensibiliza la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina de AKIII incluyen:
(a)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de glicina en la posición 323 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de aminoácido aspártico),
(b)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de glicina en la posición 323 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de aminoácido aspártico) y la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de glicina en la posición 408 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de aminoácido aspártico),
(c)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de arginina en la posición 34 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de cisteína) y la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de glicina en la posición 323 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de aminoácido aspártico),
(d)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de leucina en la posición 325 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de fenilalanina),
(e)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de metionina en la posición 318 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de isoleucina),
(f)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de metionina en la posición 318 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de isoleucina) y la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de valina en la posición 349 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de metionina),
(g)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de serina en la posición 345 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de leucina),
(h)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de valina en la posición 347 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de metionina),
(i)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de treonina en la posición 352 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de isoleucina),
(j)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de treonina en la posición 352 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de isoleucina) y la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de serina en la posición 369 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de fenilalanina),
(k)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de ácido glutámico en la posición 164 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de lisina),
(l)
la mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de metionina en la posición 417 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de isoleucina) y la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de cisteína en la posición 419 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de tirosina) en la secuencia de aminoácido AKIII que se muestra como el nº de id. de sec. 8 en la publicación internacional WO95/16042 en la que la posición se cuenta desde el N terminal de AKIII. Además, se puede mencionar una mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de glicina en la posición 323 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de ácido aspártico) y la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de metionina en la posición 318 con otro residuo de aminoácido (preferentemente el residuo de isoleucina) (solicitud de patente japonesa abierta al público nº 10-113183). Es bien conocido que la diferencia en la secuencia de aminoácido que no afecta la actividad puede ocurrir entre especies o cepas y se puede reconocer fácilmente por los expertos en la materia un residuo de aminoácido que corresponde a los residuos de aminoácido específicos mencionados anteriormente.
Otros ejemplos de la AK insensibilizada incluyen la AK de tipo mutante derivada de las bacterias corineformes (solicitud de patente japonesa abierta al público nº 6-62866).
Para hacer una AK insensibilizada que se va a hospedar mediante bacterias Escherichia, por ejemplo, el ADN que codifica la AK insensibilizada se puede introducir en las bacterias Escherichia.
Los ejemplos del ADN que codifica la AK insensibilizada incluyen los correspondientes al ADN que codifica una AK de tipo salvaje que posee una mutación para la insensibilización de la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina para la AK codificada.
En adelante, se explicará un procedimiento para la obtención de ADN que codifica una AK insensibilizada mediante la ejemplificación de AKIII derivada de las bacterias Escherichia. En cuanto a la AK de otros organismos, se puede obtener el ADN de forma similar. Además, si la AK de tipo salvaje derivada de otro organismo es una AK insensibilizada, el ADN que la codifica se puede utilizar tal como es.
El ADN que codifica una AKIII de tipo salvaje no está limitado particularmente. Por ejemplo, se puede mencionar el ADN que codifica la AKIII derivada de una bacteria Escherichia, especialmente E. coli. Específicamente, se pueden mencionar el ADN que codifica la secuencia de aminoácido que se muestra en la publicación internacional nº WO95/16042, nº de id. de sec. 8 y la secuencia representada por los números de nucleótidos 584-1930 dentro de la secuencia de nucleótido del nº de id. de sec. 7 en la misma. La AKIII de E. coli se codifica mediante el gen
lysC.
Entre estas secuencias, una que posee una mutación que causa la sustitución de los residuos de aminoácido mencionados anteriormente es el ADN que codifica una AKIII de tipo mutante. Además, el tipo de codon que corresponde al residuo de aminoácido sustituido no está limitado particularmente, siempre que codifique el residuo de aminoácido. Además, se espera asimismo que exista una ligera diferencia en la secuencia de aminoácido de la AKIII contenida entra las especies y cepas bacterianas. Sin embargo, las que poseen tal diferencia causante de la sustitución, deleción o inserción de los residuos de aminoácido en las posiciones que no afectan la actividad de la enzima caen dentro del alcance del gen de AKIII mutante. Por ejemplo, la secuencia de nucleótido del gen lysC de tipo salvaje obtenido en el ejemplo 2 mencionado a continuación (publicación internacional nº WO95/16042, nº de id. de sec. 7) posee diferencias en la secuencia en las posiciones 6 con respecto a la secuencia de nucleótido ya publicada de lysC de la cepa K-12 JC411 de E. coli (Cassan M., Parsot, C., Cohen, G.N., y Patte, J.C., J. Biol. Chem., 261, 1052 (1986)), entre los cuales dos de las diferencias proporcionan diferentes residuos de aminoácido codificados (lysC de la cepa JC411 proporciona la sustitución del residuo de glicina en la posición 58 con un residuo de cisteína y la sustitución del residuo de glicina en la posición 401 con un residuo de alanina en la secuencia de aminoácido codificada por lysC mostrada en el nº de id. de sec 8 de la publicación internacional nº WO95/16042 en la que la posición se cuenta a partir del N terminal del mismo). Se espera que incluso lysC que posee la misma secuencia que lysC de la cepa JC411 K-12 de la E. coli pueda proporcionar lysC que posee una mutación que insensibiliza la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina, si se introduce cualquiera de las mutaciones mencionadas en los anteriores (a) a (I) o una mutación para la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de glicina en la posición 323 con otro residuo de aminoácido (preferentemente residuo de ácido aspártico) y la sustitución de un residuo de aminoácido que corresponde al residuo de metionina en la posición 318 con otro residuo de aminoácido.
Se puede obtener tal ADN que codifica una AKIII de tipo mutante cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza, por ejemplo, como se expone a continuación. En primer lugar, el ADN que contiene un gen de AKIII de tipo salvaje u otro gen de AKIII que posee una mutación se somete a un tratamiento de mutación in vitro y el ADN experimenta el tratamiento de mutación y se liga un ADN vector compatible con un huésped para preparar un ADN recombinante. El ADN recombinante se puede introducir en los microorganismos huésped para obtener transformantes y se puede seleccionar de entre los transformantes un transformante que logre expresar una AKIII de tipo mutante. Tal transformante hospeda el gen de tipo mutante. De forma alternativa, el ADN que contiene un gen AKIII de tipo salvaje y otro gen AKIII que posee una mutación y un ADN vector compatible con un huésped se pueden ligar para preparar un ADN recombinante. A continuación, el ADN recombinante se puede someter a un tratamiento de mutación in vitro e introducirse en microorganismos huéspedes para obtener transformantes y se puede seleccionar de entre los transformantes un transformante que logre expresar una AKIII de tipo mutante. Tal transformante hospeda asimismo el gen de tipo mutante.
Además, un microorganismo que produce una enzima de tipo salvaje se puede someter a tratamiento de mutación para preparar una cepa mutante que produce una enzima de tipo mutante y a continuación se puede obtener a partir de la cepa mutante un gen de tipo mutante. Los ejemplos de agentes para someter directamente ADN a un tratamiento de mutación incluyen hidroxilamina y así sucesivamente. La hidroxilamina es un agente de tratamiento de mutación químico que causa la sustitución de citosina con tiamina cambiando la citosina en N^{4}-hidroxicitosina. Cuando un microorganismo en si mismo se somete a un tratamiento de mutación, el tratamiento se lleva a cabo con irradiación ultravioleta o un agente mutagenizante habitualmente utilizado para la mutación artificial tal como N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (NTG).
Como bacteria donadora de ADN que contiene un gen AKIII de tipo salvaje u otro gen AKIII que posee una mutación, se pueden utilizar cualquiera de los microorganismos que pertenecen al género Escherichia. De forma específica, se pueden utilizar los mencionados en la literatura de Neidhardt et al. (Neidhardt, F.C. et al., Escherichia coli and Salmonella Typhimurium, American Society for Microbiology, Washington D.C., 1208, tabla 1). Por ejemplo, se pueden mencionar la cepa JM109, la cepa MC1061 de E. coli y así sucesivamente.
En las bacterias de la presente invención, resulta preferido que la aspartocinasa, dihidrodipicolinato reductasa, tetrahidrodipicolinato succinilasa, succinildiaminopimelato deacilasa, fosfoenolpiruvato carboxilasa y aspartato-semialdehído deshidrogenasa deriven cada una de las bacterias Escherichia, nicotinamida adenina dinucleótido transhidrogenasa y aspartasa, si están presentes, deriven cada una de las bacterias Escherichia, dihidrodipicolinato sintasa derive de una bacteria Escherichia o de una bacteria Brevibacterium y diaminopimelato deshidrogenasa derive de la bacteria Brevibacterium.
Los ejemplos de las bacterias Brevibacterium incluyen, además de Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium divaricatum, Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium lilium y así sucesivamente.
Además, en las bacterias de la presente invención, resulta preferido que aumenten las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa y la aspartocinasa mediante la inclusión de dihidrodipicolinato sintasa cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza y la aspartocinasa cuya inhibición por retroalimentación mediante L-lisina se insensibiliza y la actividad intracelular de diaminopimelato deshidrogenasa aumenta mediante la introducción de un gen de diaminopimelato deshidrogenasa. Tales bacterias preferidas de la presente invención se pueden obtener mediante la introducción de los plásmido pCABD2 o pCABDE1 mencionados en la publicación internacional nº WO95/16042 en una bacteria Escherichia.
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<2> Procedimiento para la producción de la presente invención
La L-lisina se puede producir de forma eficiente mediante el cultivo de las bacterias de la presente invención obtenida según se ha descrito anteriormente en un medio adecuado para producir y acumular la L-lisina en el cultivo y recoger la L-lisina del cultivo.
El medio utilizado para el cultivo de las bacterias según la presente invención puede ser un medio habitual que contiene una fuente de carbono, una fuente de nitrógeno, iones inorgánicos y otros nutrientes traza orgánicos según se requiera.
Como fuente de carbono, es posible utilizar azúcares tales como glucosa, lactosa, galactosa, fructosa e hidrolizado de almidón; alcoholes tales como glicerol y sorbitol; o ácidos orgánicos tales como ácido fumárico, ácido cítrico y ácido succínico.
Como fuente de nitrógeno, es posible utilizar sales de amonio inorgánico tales como sulfato de sodio, cloruro de amonio o fosfato de amonio, nitrógeno orgánico tal como hidrolizado de soja; gas amoníaco o amoníaco acuoso.
En cuanto a los nutrientes traza orgánicos, se prefiere añadir sustancias requeridas tales como la vitamina B_{1} y L-isoleucina, extracto de levadura y así sucesivamente en una cantidad adecuada. Además de estos, se añadió una pequeña cantidad de fosfato de potasio, sulfato de magnesio, iones de hierro, iones de manganeso y así sucesivamente.
El cultivo se lleva a cabo preferentemente bajo una condición aeróbica durante 16-72 horas. La temperatura de cultivo se puede controlar para que sea de 20ºC a 45ºC y el pH se puede controlar para que sea de 5 a 8 durante el cultivo. Se pueden utilizar para el ajuste de pH las sustancias inorgánicas u orgánicas, ácidas o alcalinas además del gas amoníaco y así sucesivamente.
La recogida de la L-lisina a partir del licor de fermentación se lleva a cabo habitualmente mediante una combinación de un procedimiento de resina de intercambio iónico, un procedimiento de precipitación y otras técnicas conocidas.
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Ejemplos
La presente invención se explicará adicionalmente de forma específica en adelante haciendo referencia a los ejemplos siguientes.
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Ejemplo 1
<1> Preparación de las bacterias Escherichia que poseen diversas propiedades
Los plásmidos mostrados a continuación se introdujeron en E. coli W3110 (tyrA).
Nombre del plásmido
Gen contenido
RSF24P
dapA*
RSFD80
dapA*, lysC*
pCAB1
dapA*, lysC*, dapB
pCABD2
dapA*, lysC*, dapB, ddh
pCABD(B)
Brev. dapA, lysC*, dapB, ddh
pCABDE1
dapA*, lysC*, dapB, dapD, dapE
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Las abreviaciones utilizadas para los genes poseen los significados siguientes.
ppc: fosfoenolpiruvato carboxilasa
lysC: aspartocinasa III
lysC*: aspartocinasa III insensibilizada a la inhibición
asd: aspartato-semialdehído deshidrogenasa
dapA: dihidrodipicolinato sintasa
dapA*: dihidrodipicolinato sintasa insensibilizada a la inhibición
Brev. dapA: dihidrodipicolinato sintasa insensibilizada a la inhibición (derivada de Brevibacterium lactofermentum)
dapB: dihidrodipicolinato reductasa
dapD: tetrahidrodipicolinato succinilasa
dapE: succinildiaminopimelato deacilasa
ddh: diaminopimelato deshidrogenasa (derivada de Brevibacterium lactofermentum)
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Los plásmidos RSF24P, RSFD80, pCAB1, pCABD2 y pCABDE1 se describen en la publicación internacional nº WO95/16042. Las construcciones de los mismos se describen asimismo en la publicación internacional nº WO95/16042 y se describen a continuación.
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(1) RSF24P
Basándose en la secuencia de nucleótido conocida dapA de E. coli (J. Bacteriol., 166, 297 (1986)), se amplificó mediante PCR un fragmento que contenía la secuencia SD y el marco de lectura abierto (ORF) de dapA. El fragmento amplificado se ligó a un vector de clonación pCR1000 para obtener un plásmido pdapA2, en el que dapA se ligó de forma que la dirección de transcripción de dapA fuese al revés de la dirección de transcripción mediante el promotor lacZ en el pCR1000. El plásmido pdapA2 se sometió a un tratamiento de mutagénesis utilizando hidroxilamina y el pdapA2 sometido a un tratamiento de mutagénesis se introdujo en W3110 de E. coli. A partir de los transformantes, se seleccionaron los que muestran la resistencia AEC. Además, se midió el grado de inhibición mediante L-lisina de DDPS codificada mediante los plásmidos hospedados por las cepas resistentes seleccionadas y se seleccionó una cepa que se insensibilizó a la inhibición mediante L-lisina. El plásmido pdapA24, que se confirmó que poseía el cambio de 597ºC a T mediante la secuenciación, se ligó a pVIC40 en una posición descendente del promotor del gen de resistencia a la tetraciclina para obtener RSF24P (fig. 1).
Una cepa JM109 de E. coli a la que se introdujo RSF24P se designó como AJ12395 y se depositó en el National Institute of Bioscience and Human-Technology, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry (código postal 305-8566, 1-3 Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japón) el 28 de octubre de 1993 y recibió el número de registro de entrada FERM P-13935. A continuación, se transfirió a un depósito internacional bajo las disposiciones del Tratado de Budapest del 1 de noviembre de 1994 y recibió el número de registro de entrada FERM BP-4858.
(2) RSFD80
Basándose en la secuencia de nucleótido conocida lysC de E. coli (J. Biol. Chem, 261, 1052 (1986)), se amplificó mediante PCR un fragmento que contenía la secuencia SD y ORF de lysC. El fragmento amplificado se ligó a un vector multicopia pUC18 para obtener un plásmido pLYSC1, en el que se ligó lysC de forma que la dirección de transcripción de lysC era al revés de la dirección de transcripción mediante el promotor lacZ en pUC18. El plásmido pLYSC1 se sometió a un tratamiento de mutagénesis utilizando hidroxilamina y el pLYSC1 sometido a un tratamiento de mutagénesis se introdujo en GT3 de E. coli. A partir de los transformantes, se seleccionaron las que mostraban resistencia a AEC y resistencia a la L-lisina. Adicionalmente, pLYSC1 se introdujo en MC1061 de E. coli, a continuación las células se sometieron a un tratamiento de mutagénesis mediante la utilización de hidroxilamina y se seleccionaron los que mostraban resistencia a AEC y a la L-lisina. Además, se midió el grado de inhibición mediante L-lisina y la estabilidad térmica de la AK codificada por los plásmidos hospedados por las cepas resistentes seleccionadas y se seleccionó una cepa que se insensibilizó a la inhibición mediante L-lisina y que mostró una estabilidad superior. El plásmido pLYSC1*80, que se confirmó que había cambiado a 352ºC a T mediante la secuenciación, se ligó a pHSG399 en una posición descendente a partir del promotor lacZ para obtener pLLC*80. A partir de pLLC*80 y RSF24P, se construyó RSFD80 según se muestra en la fig. 2.
Una cepa JM109 de E. coli a la que se introdujo RSFD80 se designó como AJ12396 y se depositó en el National Institute of Bioscience and Human-Technology, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry (código postal 305-8566, 1-3 Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japón) el 28 de octubre de 1993 y recibió el número de registro de entrada FERM P-13936. A continuación, se transfirió a un depósito internacional bajo las disposiciones del Tratado de Budapest del 1 de noviembre de 1994 y recibió el número de registro de entrada FERM BP-4859.
(3) pCAB1
Basándose en la secuencia de nucleótido conocida dapA (Bouvier, J. et al., J. Biol. Chem, 259, 14829 (1984)), dapA se amplificó a partir del ADN de cromosoma de la cepa W3110 de E. coli. El fragmento de ADN amplificado obtenido se digirió con AseI y DraI y se hicieron los extremos romos al fragmento obtenido y se insertó en el sitio SmaI de pMW119 para obtener un plásmido pdapB. Posteriormente, se introdujo dapB en RSFD80 según se muestra en la fig. 3 para obtener pCAB1.
(4) pCABD2
Basándose en la secuencia de nucleótido conocida ddh de Corynebacterium glutamicum (Ishino, S. et al., Nucleic Acids Res., 15, 3917 (1987)), se amplificó mediante PCR la ddh a partir del ADN de cromosoma de Brevibacterium lactofermentum ATCC13869. El fragmento de ADN amplificado obtenido se digirió con EcoT22I y AvaI y se hicieron los extremos romos al fragmento obtenido y se insertó en el sitio SmaI de pMW119 para obtener el plásmido pddh. Posteriormente, se introdujo ddh en pCAB1 según se muestra en la fig. 4 para obtener el plásmido pCABD2.
(5) pCABDE1
Basándose en la secuencia de nucleótido conocida dapD (Richaud, C. et al., J. Biol. Chem., 259,14824 (1984)), se amplificó mediante PCR la dapD a partir de ADN de cromosoma de la cepa W3110 de E. coli. El fragmento de ADN amplificado obtenido se digirió con Eco0109I y SacI, se hicieron los extremos romos del fragmento obtenido y se insertó en el sitio SmaI de pMW118 para obtener un plásmido pdapD. Adicionalmente, basándose en la secuencia de nucleótido conocida dapE (Bouvier, J. et al., J. Bacteriol., 174, 5265 (1992)) se amplificó dapE mediante PCR a partir de ADN de cromosoma de la cepa W3110 de E. coli. El fragmento de ADN amplificado obtenido se digirió con MunI y Bg1II, se hicieron romos los extremos del fragmento obtenido y se insertó en el sitio SmaI de pMW118 para obtener un plásmido pdapE. Adicionalmente, se extirpó dapE a partir de pdapE y se insertó en pdapD para obtener un plásmido pMWdapDE1 que contenía tanto dapE como dapD. Según se muestra en la fig. 5 un fragmento que contenía dapE y dapD se extirpó de pMWdapDE1 y se insertó en pCAB1 para obtener pCABDE1.
Se construyó un plásmido pCABD(B) como se expone a continuación.
En primer lugar, un fragmento de ADN que contenía un promotor de sitio del gen de resistencia Tet se amplificó a partir de pBR322 mediante cebadores que poseían las secuencias siguientes.
5'-TCAAGAATTCTCATGTTTGA-3' (Nº DE ID. DE SEC.: 1)
5'-GTTAGATTTGGTACCCGGTGCCTGACTGCGTTAGC-3' (Nº DE ID. DE SEC.: 2)
El fragmento de ADN amplificado se digirió con KpnI y EcoRI y se insertó entre los sitios de escisión KpnI y EcoRI de pUC18 para obtener pUTES (fig. 18).
A continuación, el gen dpaA de Brev. se amplificó utilizando cebadores que poseían las secuencias siguientes y el ADN de cromosoma de la cepa Brevibacterium lactofermentum Ysr como plantilla.
5'- GGTTGTGGTACCCCCAAATGAGGGAAGAAG-3' (Nº DE ID. DE SEC.: 3)
5'- TGGAACCTCTGTTGCTGCAG-3' (Nº DE ID. DE SEC.: 4)
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El gen dapA de Brev. amplificado se digirió con KpnI y BamHI y se insertó entre los sitios de escisión KpnI y BamHI de pUTES para obtener pUEBL3 (fig. 19).
A continuación, pUEBL3 se digirió con EcoRI y XbaI y se hicieron romos ambos extremos para obtener un fragmento que contenía dapA Brev. A continuación, pCABD2 mencionado en la publicación internacional nº WO95/16042 se digirió con NheI y SpeI y se hicieron romos ambos extremos. Se recogió un fragmento que contenía lysC, dapB y ddh y a continuación se le insertó el fragmento obtenido previamente que contenía dapA Brev. para obtener pCABD(B) (fig. 20).
Mientras W3110 de E. coli (tyrA) se detalla en la publicación de patente europea nº 488424, el procedimiento de preparación se explicará por lo tanto brevemente a continuación. La cepa W3110 de E. coli se obtuvo a partir del National Institute of Genetics (Shizuoka-ken, Mishima-shi). La cepa se inoculó en una placa LB que contenía estreptomicina y se seleccionó la cepa que formaba una colonia para obtener una cepa resistente a la estreptomicina. La cepa resistente a la estreptomicina seleccionada y la cepa ME8424 K-12 de E. coli se mezclaron y se cultivaron en un medio completo (L-Broth: 1% de Bactotriptona, 0,5% de extracto de levadura, 0,5% de NaCl) como cultivo estacionario a 37ºC durante 15 minutos para inducir la conjugación. La cepa ME8424 K-12 de E. coli posee unas características genéticas de HfrPO45, thi, relA1, tyrA::Tn10, ung-1 y nadB y se puede obtener a partir del National Institute of Genetics.
A continuación, se inoculó el cultivo en un medio completo (L-Broth: 1% de Bacto trypton, 0,5% de extracto de levadura, 0,5% de NaCl, 1,5% de agar), que contenía estreptomicina, tetraciclina y L-tirosina y se seleccionó una cepa que formó una colonia. Esta cepa se designó como cepa W3110 (tyrA) de E. coli.
Muchas cepas formadas mediante la introducción de un plásmido en la cepa W3110 (tyrA) se describen en la publicación de patente europea nº 488424. Por ejemplo, se designó una cepa obtenida mediante la introducción de un plásmido pHATerm como cepa W3110 (tyrA) de E. coli/pHATerm (cepa AJ12662 de E. coli) y se depositó en el National Institute of Bioscience and Human-Technology, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry (código postal 305-8566, 1-3 Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japón) de 16 de noviembre de 1991 como un depósito internacional y recibió un número de registro de entrada FERM BP-3653. La cepa (tyrA) W3110 se puede obtener asimismo mediante la eliminación del plásmido pHATerm a partir de la cepa W3110 (tyrA) de E. coli/ pHATerm. La eliminación de plásmido se puede llevar a cabo de una forma
convencional.
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<2> Introducción del gen aspartato-semialdehído deshidrogenasa (asd), gen fosfoenolpiruvato carboxilasa (ppc) o gen aspartato (aspA) y evaluación de la productividad de la L-lisina
Como plásmido que contiene asd y como plásmido que contiene ppc, se utilizaron pasd y pppc descritos en la publicación internacional nº WO95/16042. Las construcciones de estos plásmidos se detallaron en la publicación internacional nº WO95/16042. Los esquemas son como se exponen a continuación.
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(1) pasd
Se obtuvo el plásmido asd a partir de un plásmido pAD20 (Haziza, C. et al., EMBO, 1, 379, (1982)) que contenía el gen. El plásmido pAD20 se digirió con AseI y ClaI, se hicieron los extremos romos y se insertó en el sitio SmaI de pMW118 para obtener un plásmido pasd (fig. 8).
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(2) pppc
El plásmido pppc se obtuvo a partir de un plásmido pT2 que contenía el gen. El plásmido pT2 se digirió con SmaI y ScaI, se hicieron los extremos romos y se insertó en el sitio SmaI de pMW118 para obtener un plásmido pppc (fig. 9). Se depositó una cepa F15 de E. coli (AJ12873) que hospeda pT2 en el National Institute of Bioscience and Human-Technology, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry (código postal 305-8566, 1-3 Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japón) del 15 de julio de 1993 y recibió el número de registro de entrada FERM P-13752. A continuación, se transfirió a un depósito internacional bajo las disposiciones del Tratado de Budapest del 11 de julio de 1994 y recibió el número de registro de entrada FERM BP-4732.
Se construyó como sigue un plásmido que contenía aspA.
El gen aspA de E. coli se amplificó utilizando cebadores que poseen las secuencias siguientes.
5'-TGATCAGCGAAACACTTTTA-3' (Nº DE ID. DE SEC.: 5)
5'-CAGCAAACTATGATGAGAA-3' (Nº DE ID. DE SEC.: 6)
A continuación, el fragmento amplificado obtenido se insertó en el sitio de escisión SmaI de pMW118 (Nippon Gene) para obtener pMW118::aspA (fig. 9).
Cada uno de pMW118 (plásmido de control), pasd, pppc y pMW118::aspA (plásmido comparativo) se introdujeron en cada una de W3110 de E. coli (tyrA) y los transformantes que se obtuvieron en el <1> mencionado anteriormente. Los transformantes obtenidos, excepto los obtenidos mediante la introducción de pMW118, pasd, pppc o pMW118::aspA en W3110 de E. coli (tyrA), contenían dos clases de plásmidos, es decir, uno de pMW118, pasd, pppc y pMW118::aspA y uno de RSF24P, RSFD80, pCAB1, pCABD2, pCABD(B) y pCABDE1. Se examinaron estos transformantes para ver la productividad de L-lisina mediante el procedimiento descrito en la publicación internacional nº WO95/16042. El procedimiento específico fue como sigue.
Las células se cultivaron en 20 ml de un medio que poseía la composición siguiente contenida en un matraz Sakaguchi de 500 ml a una temperatura de 37ºC durante 30 horas con agitación a 114-116 rpm.
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(Composición del medio)
Glucosa
40 g/l
MgSO_{4}\cdot7H_{2}O
1 g/l
(NH_{4})_{2}SO_{4}
16 g/l
KH_{2}PO_{4}
1 g/l
FeSO_{4}\cdot7H_{2}O
0,01 g/l
MnSO_{4}\cdot5H_{2}O
0,01 g/l
Extracto de levadura (Difco)
2 g/l
L-tirosina
0,1 g/l
\vskip1.000000\baselineskip
Se ajustaron a un pH de 7,0 con KOH, y se pusieron en un autoclave a 115ºC durante 10 min (glucosa y
MgSO_{4}\cdot7H_{2}O se esterilizaron de forma separada).
CaCO_{3}
25 g/l
(según la farmacopea de Japón, esterilizado mediante aire seco a 180ºC durante 2 días).
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Antibiótico (20 mg/l de estreptomicina, 50 mg/l de ampicilina o 25 mg/l de canamicina dependiendo de la clase de plásmido que se va a introducir).
La L-lisina en el caldo de cultivo (medio posterior al cultivo) se cuantificó utilizando el Biotech Analyzer AS210 fabricado por Asahi Chemical Industry Co., Ltd.
\newpage
Los resultados se muestran en la tabla 1. En la tabla, la cantidad de L-lisina se indica en términos de mg por el del medio.
TABLA 1
1
Según se puede ver a partir de los resultados que se muestran en la tabla 1, cuando asd o ppc aumentaron cada uno solos o juntos con dapA (RSF24P), dapA + lysC (RSFD80) o dapA + lysC + dapB (pCAB1) en E. coli, la cantidad de producción de L-lisina (cantidad acumulada) no cambió o solo cambió ligeramente y, en cuanto a asd, se podría reducir comparada con el caso en que asd o ppc no aumentaron (de -180 a 20 mg/dl en cuanto a asd, de 10 a 30 mg/dl en cuanto a ppc). En contraste, si se aumentaron juntos con dapA + lysC + dapB + ddh (pCABD2) o dapA + lysC + dapB + dapD + dapE (pCABDE1) se observó un incremento notable de la cantidad de la producción de la L-lisina comparada con el caso en que asd o ppc no aumentó (70 mg/dl en cuanto a asd, 90 mg/dl en cuanto a ppc). Sin embargo, cuando aspA se incrementó con dapA + lysC + dapB + ddh (pCABD2) no se observó un notable incremento de la cantidad de producción de L-lisina. Además, incluso cuando se utilizó dapA derivado de Brevibacterium lactofermentum en lugar de dapA derivado de Escherichia coli (pCABD (B)), se obtuvo el mismo efecto que el caso en que se utilizó dapA derivado de Escherichia coli (pCABD2). Por lo tanto, el origen de los genes no se considera importante, pero es importante la combinación de los mismos.
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Ejemplo 2
<1> Construcción de plásmidos que contienen el gen fosfoenolpiruvato carboxilasa (ppc) y el gen aspartato-semialdehído deshidrogenasa (asd), el gen transhidrogenasa (pntAB) o el gen aspartasa (aspA)
Se construyeron como sigue un plásmido que contenía ppc y asd, un plásmido que contenía ppc y pntAB y un plásmido que contenía ppc y aspA.
(1) Plásmido que contiene ppc y asd (ppcd)
El plásmido pasd descrito en la publicación internacional nº WO95/16042 se digirió con KpnI y SphI y se hicieron romos ambos extremos del fragmento de ADN que contenía asd. A continuación, el ppc descrito en la publicación internacional nº WO95/16042 se digirió con XbaI y se hicieron romos ambos extremos y el fragmento asd obtenido anteriormente se insertó en el mismo para obtener ppcd (fig. 10).
(2) Plásmido que contiene ppc y pntAB (pPTS)
El plásmido pMW::THY descrito en la publicación internacional nº WO95/11985 se digirió con SmaI y HindIII y se recogió el fragmento de ADN que contenía pntAB. A continuación, el ppc descrito en la publicación internacional nº WO95/16042 se digirió con XbaI, se hicieron romos ambos extremos y se digirió con HindIII y el fragmento pntAB obtenido anteriormente se insertó en el sitio de escisión para obtener pPTS (fig. 11).
La construcción del plásmido pMW::THY se detalló en la publicación internacional nº WO95/11985. Se describirá a continuación.
Basándose en las secuencias de nucleótidos conocidas pntA y pntB de E. coli (D. M. Clarke et al., Eur. J. Biochem., 158, 647-653 (1986)), se amplificó mediante PCR un fragmento que contenía ambos genes incluyendo las regiones que poseían actividad de promotor. El fragmento de ADN amplificado se digirió con BamHI y HindIII y el fragmento de ADN obtenido se ligó al vector plásmido pMW118 (Nippon Gene) digerido con BamHI y HindIII para obtener pMW::THY (fig. 8).
La cepa JM109 de E. coli en la que se introdujo pMW118::THY se designó como AJ12929 y se depositó en el Nacional Institute of Bioscience and Human-Technology, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of Internacional Trade and Industry (código postal 305-8566, 1-3 Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japón) el 4 de octubre de 1993 y recibió el número de entrada FERM P-13890. A continuación, se transfirió a un depósito internacional bajo las disposiciones del Tratado de Budapest del 14 de septiembre de 1994, y recibió el número de registro de entrada FERM BP-4798.
(3) Plásmido que contiene ppc y aspA (pAPW)
El plásmido pMW118::aspA descrito en el ejemplo 1 mencionado anteriormente se digirió con SacI, se hicieron romos ambos extremos y a continuación se digirió con HindIII para obtener un fragmento de ADN que contenía aspA. A continuación, el pppc descrito en la publicación internacional nº WO95/16042 se digirió con XbaI, se hicieron romos ambos extremos y a continuación se digirió con HindIII y el fragmento aspA obtenido anteriormente se insertó en el sitio de escisión de HindIII para obtener pAPW (fig. 12).
<2> Introducción de dos clases de genes y evaluación de la productividad de L-lisina
Se introdujeron pppc (plásmido de referencia), ppcd, pPTS y pAPW (plásmido comparativo) cada uno en un transformante introducido en pCABD2 que se obtuvo en el ejemplo 1 mencionado anteriormente. Los transformantes obtenidos contenían dos clases de plásmidos, es decir, uno de pppc, ppcd, pPTS, pAPW y pCABD2. Estos transformantes se examinaron para la productividad de L-lisina de la misma manera que en el ejemplo 1 <2>.
Los resultados se muestran en la tabla 2.
TABLA 2
2
Según se ve claramente a partir de los resultados que se muestran en la tabla 2, cuando asd o pntAB se aumentaron junto con dapA + lysC + dapB + ddh + ppc (ppcd o pPTS), se observó un notable incremento de la cantidad de producción de L-lisina (80 mg/dl en cuanto a asd, 70 mg/dl en cuanto a pntAB). En cuanto a aspA, sin embargo, incluso cuando aspA se incrementó junto con dapA + lysC + dapB + ddh + ppc (pAPW), no se observó un notable aumento de la cantidad de producción de la L-lisina.
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Ejemplo 3
<1> Construcción de plásmidos que contienen el gen de fosfoenolpiruvato carboxilasa (ppc), el gen transhidrogenasa (pntAB) y el gen aspartato-semialdehído deshidrogenasa (asd) o el gen de aspartasa (aspA)
Se construyó tal como sigue un plásmido que contenía los genes de ppc, pntAB y asd y un plásmido que contenía ppc, pntAB y aspA.
(1) Plásmido que contiene ppc, pntAB y asd (pPTd)
El plásmido pasd descrito en la publicación internacional nº WO95/16042 se digirió con KpnI y SphI y se hicieron romos ambos extremos en el fragmento de ADN que contenía asd. A continuación, pPTS descrito en el ejemplo 2 mencionado anteriormente se digirió con HindIII y se hicieron romos los extremos y se insertó el fragmento asd obtenido anteriormente en el sitio de escisión de HindIII para obtener pPTd (fig. 13).
(2) Plásmido que contiene ppc, pntAB y aspA (pAPT)
El plásmido pMW::THY descrito en la publicación internacional nº WO95/11985 se digirió con SmaI y HindIII para obtener un fragmento de ADN que contenía pntAB. A continuación, el pAPW descrito en el ejemplo 2 mencionado anteriormente se digirió con XbaI, se hicieron romos ambos extremos y se digirió además con HindIII. El fragmento obtenido anteriormente que contenía pntAB se insertó en el sitio de escisión de HindIII para obtener pAPT (fig. 14).
<2> Introducción de tres clases de genes y evaluación de la productividad de la L-lisina
Se introdujeron pPTS (plásmido de referencia), pPTd o pAPT en un transformante introducido en un pCABD2 que se obtuvo en el ejemplo 1 mencionado anteriormente. Los transformantes obtenidos contenían dos clases de plásmidos, es decir, uno de pPTS, pPTd y pAPT y pCABD2. Estos transformantes se examinaron para la productividad de la L-lisina de la misma manera que en el ejemplo 1 <2>.
Los resultados se muestran en la tabla 3.
TABLA 3
3
Según se aprecia claramente a partir de los datos que se muestran en la tabla 3, cuando asd o aspA se aumentaron juntos con dapA + lysC + dapB + ddh + ppc + pntAB (pPTd o pAPT) se apreció un notable incremento de la cantidad de producción de L-lisina (60 mg/dl en cuanto a asd, 50 mg/dl en cuanto a aspA).
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Ejemplo 4
<1> Construcción de plásmidos que contienen el gen de fosfoenolpiruvato carboxilasa (ppc), el gen transhidrogenasa (pntAB), el gen aspartato-semialdehído deshidrogenasa (asd) y el gen aspartasa (aspA)
Se construyó un plásmido que contenía ppc, pntAB, asd y aspA como sigue.
El plásmido pAPT descrito en el ejemplo 3 mencionado anteriormente se digirió con HindIII, se hicieron romos ambos extremos y se digirió adicionalmente con SmaI para obtener un fragmento de ADN que contenía ppc, aspA y pntAB. A continuación, pMW218 (Nippon gene) se digirió con EcoRI y se hicieron romos ambos extremos y el fragmento de ADN obtenido anteriormente que contenía ppc, aspA y pntAB se insertó en el sitio de escisión de EcoRI de extremos romos para obtener pAPTK (fig. 15).
A continuación, el pasd descrito en la publicación internacional nº WO95/16042 se digirió con KpnI, se hicieron romos ambos extremos y se digirió a continuación con BamHI para obtener un fragmento de ADN que contenía asd. A continuación, pSTV29 se digirió con PstI, se hicieron romos ambos extremos y se insertó con el fragmento asd obtenido anteriormente en el sitio de escisión de BamHI para obtener pSd (fig. 16).
A continuación, pSd se digirió con SphI, se hicieron romos ambos extremos y se digirió a continuación con XbaI para obtener un fragmento de ADN que contenía asd otra vez. A continuación, pAPTK se digirió con SacI y se hicieron romos ambos extremos, y el fragmento asd obtenido anteriormente se insertó en el sitio de escisión de XbaI para obtener pKD (fig. 17).
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<2> Introducción de cuatro clases de genes y evaluación de la productividad de la L-lisina
Se introdujeron en un transformante en el que se habían introducido pCABD2, pCABD(B) o pCABDE1, que se habían obtenido en el ejemplo 1 mencionado anteriormente, pAPT (plásmido de referencia 1), pAPTK (plásmido de referencia 2) o pKD. Los transformantes obtenidos contenían las dos clases de plásmidos, es decir, uno de pAPT, pAPTK y pKD y uno de pCABD2, pCABD(B) y pCABDE1. Estos transformantes se examinaron para la productividad de la L-lisina de la misma manera que en el ejemplo 1 <2>.
Los resultados se muestran en la Tabla 4.
TABLA 4
4
Según se puede ver claramente a partir de los resultados que se muestran en la tabla 4, cuando asd se aumentó junto con dapA + lysC + dapB + ddh + ppc + pntAB + aspA, se observó un notable incremento de la cantidad de producción de L-lisina. Se obtuvo un resultado similar cuando pCABD(B) o pCABDE1 se utilizó en lugar de pCABD2.
El plásmido pAPTK mencionado anteriormente en la tabla 4 correspondía a pAPT del cual el gen de la resistencia al fármaco se cambió del de la ampicilina al de canamicina (porque el vector se cambió de pMW118 a pMW218). Ya que pKD se preparó mediante la inserción de asd en pAPTK se consideró que como control de pKD, pAPTK era mucho más adecuado que pAPT. Por lo tanto, se muestran asimismo los datos de pAPTK. Se confirmó asimismo que no se influenciaba la cantidad de producción de L-lisina incluso si el gen de resistencia al fármaco se cambiaba.
Aplicabilidad industrial
La presente invención proporciona bacterias Escherichia coli con una productividad de L-lisina elevada y la L-lisina se puede obtener con un rendimiento elevado utilizando estas bacterias.
<110> Ajinomoto Co., Ltd.
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<120> Procedimiento para la producción de L-lisina
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<130> EPA-_53933
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<160> 6
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<210> 1
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Cebador para la amplificación de una porción de promotor de tet
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\hskip1cm
5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
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<211> 35
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador para la amplificación de una porción de promotor de tet
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<400> 2
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6
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<210> 3
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<211> 30
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador para la amplificación de dapA
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<400> 3
\hskip1cm
7
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<210> 4
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador para la amplificación de dapA
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<400> 4
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8
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<210> 5
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> Cebador para la amplificación de aspA
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<400> 5
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9
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<210> 6
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<211> 19
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador para la amplificación de aspA
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\hskip1cm
10

Claims (8)

1. Bacteria Escherichia en la que:
(1)
son aumentadas las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa, la aspartocinasa y la dihidrodipicolinato reductasa,
(2)
es aumentada la actividad intracelular de la diaminopimelato deshidrogenasa, o son aumentadas las actividades intracelulares de la tetrahidrodipicolinato succinilasa y la succinil diaminopimelato deacilasa, y
(3)
es aumentada la actividad intracelular de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa o la fosfoenolpiruvato carboxilasa, en la que las actividades intracelulares de las enzimas son aumentadas mediante la introducción de un plásmido que presenta un gen de la enzima, mediante el incremento del número de copias de un gen de la enzima en el cromosoma, o mediante la modificación de una secuencia de promotor de un gen de la enzima en el cromosoma.
2. Bacteria Escherichia en la que:
(1)
son aumentadas las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa, la aspartocinasa y la dihidrodipicolinato reductasa,
(2)
es aumentada la actividad intracelular de la diaminopimelato deshidrogenasa, o son aumentadas las actividades intracelulares de la tetrahidrodipicolinato succinilasa y la succinil diaminopimelato deacilasa, y
(3)
es aumentada la actividad intracelular de la fosfoenolpiruvato carboxilasa, y es aumentada la actividad intracelular de la nicotinamida adenina dinucleótido transhidrogenasa o la aspartato-semidaldehído deshidrogenasa, en la que son aumentadas las actividades intracelulares de las enzima mediante la introducción de un plásmido que presenta un gen de la enzima, mediante el aumento del número de copias de un gen de la enzima en el cromosoma, o mediante la modificación de una secuencia de promotor de un gen de la enzima en el cromosoma.
3. Bacteria Escherichia en la que:
(1)
son aumentadas las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa, la aspartocinasa y la dihidrodipicolinato reductasa,
(2)
es aumentada la actividad intracelular de la diaminopimelato deshidrogenasa, o son aumentadas las actividades intracelulares de la tetrahidrodipicolinato succinilasa y la succinildiaminopimelato deacilasa, y
(3)
son aumentadas las actividades intracelulares de la fosfoenolpiruvato carboxilasa y de la nicotinamida adenina dinucleótido transhidrogenasa, y es aumentada la actividad intracelular de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa o aspartasa, en la que las actividades intracelulares de las enzimas son aumentadas mediante la introducción de un plásmido que presenta un gen de la enzima, mediante el incremento del número de copias de un gen de la enzima en el cromosoma, o mediante la modificación de una secuencia de promotor de un gen de la enzima en el cromosoma.
4. Bacteria según la reivindicación 3, en la que son aumentadas las actividades intracelulares de la aspartato-semialdehído deshidrogenasa y la aspartasa.
5. Bacteria según la reivindicación 3 ó 4, en la que la aspartocinasa, la dihidrodipicolinato reductasa, la tetrahidrodipicolinato succinilasa, la succinil diaminopimelato deacilasa, la fosfoenolpiruvato carboxilasa y la aspartato-semialdehído deshidrogenasa provienen cada una de una bacteria Escherichia, la nicotinamida adenina dinucleótido transhidrogenasa y la aspartasa, si están presentes, provienen cada una de la bacteria Escherichia, la dihidrodipicolinato sintasa provienen de una bacteria Escherichia o de una bacteria Brevibacterium y la diaminopimelato deshidrogenasa proviene de una bacteria Brevibacterium.
6. Bacteria según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, en la que son aumentadas las actividades intracelulares de la dihidrodipicolinato sintasa y la aspartocinasa mediante el hospedaje de la dihidrodipicolinato sintasa cuya inhibición por retroalimentación por la L-lisina es insensibilizada y la aspartocinasa cuya inhibición por retroalimentación por la L-lisina es insensibilizada, y la actividad intracelular de la diaminopimelato deshidrogenasa es aumentada mediante la introducción de un gen de la diaminopimelato deshidrogenasa.
7. Bacteria según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, que es la Escherichia coli.
8. Procedimiento para la producción de L-lisina, que comprende cultivar la bacteria según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, en un medio adecuado para producir y acumular la L-lisina en el cultivo, y recoger la L-lisina del cultivo.
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