HU219600B - Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, ennek génje, valamint eljárás aminosav előállítására - Google Patents

Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, ennek génje, valamint eljárás aminosav előállítására Download PDF

Info

Publication number
HU219600B
HU219600B HU9600240A HU9600240A HU219600B HU 219600 B HU219600 B HU 219600B HU 9600240 A HU9600240 A HU 9600240A HU 9600240 A HU9600240 A HU 9600240A HU 219600 B HU219600 B HU 219600B
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
leu
glu
alá
gly
val
Prior art date
Application number
HU9600240A
Other languages
English (en)
Other versions
HUT73690A (en
HU9600240D0 (en
Inventor
Katsura Izui
Hiroshi Matsui
Masakazu Sugimoto
Tomoko Suzuki
Tsutomu Toyama
Original Assignee
Ajinomoto Co., Inc.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=27320552&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=HU219600(B) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Ajinomoto Co., Inc. filed Critical Ajinomoto Co., Inc.
Publication of HU9600240D0 publication Critical patent/HU9600240D0/hu
Publication of HUT73690A publication Critical patent/HUT73690A/hu
Publication of HU219600B publication Critical patent/HU219600B/hu

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/08Lysine; Diaminopimelic acid; Threonine; Valine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04Alpha- or beta- amino acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/06Alanine; Leucine; Isoleucine; Serine; Homoserine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/14Glutamic acid; Glutamine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/20Aspartic acid; Asparagine

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

Escherichia coli vagy Corynebacterium sejtekbe olyan foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gént vittek be, amely az N-- terminálistólszámított 625. glutaminsavat lizinnel, a 438. arginint ciszteinnelstb. helyettesítő mutációval rendelkezett, miáltal olyan foszfo-enolpiruvát-karboxilázt állítottak elő, amelyet az aszparaginsavlényegében nem gátol, lehetővé téve az aminosavak hatékonyelőállítását. A találmány tárgya mutáns foszfo-enolpiruvát--karboxiláz, amely az aszparaginsav feedback gátlásával szembenlényegében deszenzibilizált; a mutáns foszfo-- enolpiruvát-karboxiláztkódoló gén; valamint eljárás alkalmazásukra. ŕ

Description

A találmány tárgya mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, az ezt kódoló gén, valamint eljárás aminosav előállítására. A találmány elsődleges tárgya az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlással szembeni deszenzibilizáláshoz alkalmas mutációval rendelkező gén, valamint ennek alkalmazása.
A foszfo-enolpiruvát-karboxiláz majdnem valamennyi baktériumban és valamennyi növényben megtalálható enzim, amely az aszparaginsav és glutaminsav bioszintézisében játszik szerepet, és a citromsav (trikarbonsav-) ciklusba négy szénatomos dikarbonsavat szállít, fenntartva a ciklus tumoverét. Az aminosavak mikroorganizmusok alkalmazásával végzett fermentációs előállításával kapcsolatban megjelent néhány cikk azonban nem világította meg a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz hatását (Atsushi Yokota és Isamu Shiio, Agric. Bioi. Chem., 52, 455-463,1988; Josef Cremer és munkatársai, Appl. Environ. Microbiol., 57, 1746-1752, 1991; Petra, G., Peters-Weintisch, FEMS Microbiol. Letters, 112, 269-274,1993).
Az aminosavak a sejtekben proteinek komponenseiként univerzálisan előforduló vegyületek, azonban a gazdaságos energiaforgalom és anyagcsere biztosítása érdekében szintézisük szigorúan szabályozott. Ez a szabályozás elsősorban feedback mechanizmuson alapul, melyben egy metabolikus reakcióút végterméke gátolja a reakcióút korábbi lépéseit katalizáló enzim aktivitását. A foszfo-enolpiruvát-karboxilázt, aktivitásának kifejtésében, szintén érik különböző szabályozóhatások.
Például, a Cotynebacterium vagy az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusok foszfo-enolpiruvát-karboxiláza esetében az enzimaktivitást az aszparaginsav gátolja, így a fentebb említett aminosav-bioszintézist - melyben részt vesz a foszfo-enolpiruvátkarboxiláz -, is gátolja.
Az aminosavak hatékony fermentációs előállítása érdekében korábban számos technikát fejlesztettek ki, melyeket a leucin, izoleucin, triptofán, fenil-alanin és hasonlók előállításához alkalmaztak. Ezen eljárásokban mutáns törzseket alkalmaztak, melyeket úgy alakítottak át, hogy ne legyenek érzékenyek a feedback szabályozásra. Mind ez idáig azonban nem ismert sem az aszparaginsav gátlására érzéketlen mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, sem olyan kísérlet, amelyben ezt a módosított enzimet az aszparaginsav- és a glutaminsavcsaládba tartozó aminosavak fermentációs előállításában alkalmazták volna.
Ezzel szemben, az Escherichia coli - foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódoló - ppc génjét már klónozták, és meghatározták nukleotidszekvenciáját is (Fujita, N., Miwa, T., Ishijima, S., ízűi, K. és Katsuki, H. J. Biochem., 909-916, 1984). Nem számoltak be azonban olyan mutánsról, amelyben az aszparaginsav gátlása deszenzibilizált.
Találmányunkat a fenti hiányosság kiküszöbölése céljából valósítottuk meg. A találmány tárgya mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, amely az aszparaginsav feedback gátlásával szemben lényegében deszenzibilizált; a mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódoló gén; valamint eljárás alkalmazásukra.
A fentiek megvalósítása érdekében végzett szorgalmas kutatás eredményeként felismertük, hogy az aszparaginsav által kiváltott gátlás jelentős mértékben deszenzibilálható, ha az E. coli foszfo-enolpiruvát-karboxilázának meghatározott helyén egy aminosavat egy másik aminosavval helyettesítünk, amit úgy érünk el, hogy ilyen mutáns enzimet kódoló gént hozunk létre.
A találmány egyik tárgya mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, amely Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusból származik, s olyan mutációval rendelkezik, amely az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlással szemben deszenzibilálja az enzimet. A találmány további tárgya a mutáns foszfo-enolpiruvátkarboxilázt kódoló DNS-szekvencia.
A találmány további tárgyai az említett DNS-szekvenciát tartalmazó, Escherichia vagy a Corynebacterium nemzetségbe tartozó mikroorganizmusok, valamint eljárás aminosav előállítására, melynek során az említett mikroorganizmusok valamelyikét megfelelő tápközegben tenyésztjük, és az aminosavat (mely lehet Llizin, L-treonin, L-metionin, L-izoleucin, L-gutaminsav, L-arginin vagy L-prolin) elkülönítjük a tápközegből.
A találmány leírásában a mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódoló DNS-szekvenciát vagy a kódolószekvencián kívül promotert is tartalmazó DNS-szekvenciát rendszerint a „találmány szerinti DNS-szekvencia”, „mutáns gén” vagy „foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén” kifejezéssel említjük.
A találmányt az alábbiakban írjuk le részletesen.
Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz
A találmány szerinti mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz (a továbbiakban „mutáns enzim”) az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusok foszfo-enolpiruvát-karboxiláza, amely mutáció folytán nem érzékeny az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlásra.
Az említett mutáció bármilyen mutáció lehet, feltéve, hogy a feedback gátlással szemben deszenzibilizálja az enzimet anélkül, hogy az elveszítené foszfoenolpiruvát-karboxiláz-aktivitását. E feltételnek megfelelően, példaként olyan mutációt említhetünk, amely ha a mutációval rendelkező mutáns foszfo-enolpiruvátkarboxiláz jelen van az Escherichia nemzetségbe tartozó baktériumsejtekben - a sejteket rezisztenssé teszi az alábbi tulajdonságokkal rendelkező vegyületre:
az Escherichia nemzetségbe tartozó, vad típusú foszfo-enolpiruvát-karboxilázt termelő mikroorganizmusok ellen növekedésgátló hatást mutat;
az említett növekedésgátló hatás L-glutaminsav vagy L-aszparaginsav jelenlétével visszaállítható;
gátolja a vad típusú foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aktivitását.
Közelebbről, a foszfo-enolpiruvát-karboxilázt érintő mutációk (N-terminálistól számítva) az alábbiak lehetnek:
(1) a 625. glutaminsavat lizinnel helyettesítő mutáció;
(2) a 222. arginint hisztidinnel, illetve a 223. glutaminsavat lizinnel helyettesítő mutáció;
(3) a 288. szerint fenil-alaninnal helyettesítő, a 289. glutaminsavat lizinnel, az 551. metionint izoleucinnal,
HU 219 600 Β illetve a 804. glutaminsavat lizinnel helyettesítő mutáció;
(4) a 867. alanint treoninnal helyettesítő mutáció;
(5) a 438. arginint ciszteinnel helyettesítő mutáció;
(6) a 620. lizint szerinnel helyettesítő mutáció.
Az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusok foszfo-enolpiruvát-karboxilázaként az Escherichia coli foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-génjéből (Fujita, N., Miwa, T., Ishijima, S., ízűi, K. és Katsuki, H., J. Biochem., 909-916,1984) származtatott aminosavszekvenciát a szekvencialistában 2. számú szekvenciaként mutatjuk be. Az Escherichia coli foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-génjét tartalmazó pT2 plazmid teljes nukleotidszekvenciáját (az aminosavszekvenciával együtt) a szekvencialista 1. számú szekvenciájaként mutatjuk be.
A fentebb említett mutáns enzimeket az alábbiakban leírt, találmány szerinti DNS-szekvenciák kódolják, és ezeket az enzimeket úgy állítjuk elő, hogy a DNS-szekvenciákat Escherichia coliban és hasonló baktériumokban expresszáljuk.
A találmány szerinti DNS-szekvencia, és az azt tartalmazó mikroorganizmusok
A találmány szerinti DNS-szekvencia kifejezés a fentebb említett mutáns enzimeket kódoló DNS-szekvenciákat foglalja magában. Ezek a DNS-szekvenciák az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusok foszfo-enolpiruvát-karboxilázát kódoló DNS-fragmensekben olyan mutációkat tartalmaznak, amelyek deszenzibilizálják a foszfo-enolpiruvát-karboxilázt az aszparaginsav által kifejtett feedback gátlással szemben.
Példaként olyan, foszfo-enolpiruvát-karboxilázát kódoló DNS-szekvenciákat említhetünk, amelyek a fenti (1)-(6) pontokban leírt mutációk valamelyikét tartalmazzák. Például az 1. számú szekvenciaként bemutatott nukleotidszekvenciát illetően, olyan DNS-szekvenciát hozhatunk például, amely tartalmazza az alábbi mutációk bármelyikét:
i) a 2109-2111. helyen lévő GAA bázishármast (triplett) AAA vagy AAG triplettre változtató mutáció;
ii) a 900-902. helyen lévő CGC triplettet CAT vagy CAC triplettre, illetve a 903-905. helyen lévő GAA triplettet AAA vagy AAG triplettre változtató mutáció;
iii) az 1098-1100. helyen lévő TCT triplettet TTT vagy TTC triplettre, az 1101-1103. helyen lévő GAA triplettet AAA vagy AAG triplettre, az 1887-1889. helyen lévő ATG triplettet ATT, ATC vagy ATA triplettre, illetve a 2646-2648. helyen lévő GAA triplettet AAA vagy AAG triplettre változtató mutáció;
iv) a 2835-2837. helyen lévő GCG triplettet ACT, ACC, ACA vagy ACG triplettre változtató mutáció;
v) az 1548-1550. helyen lévő CGT triplettet TGT vagy TGC triplettre változtató mutáció; és vi) a 2094-2096. helyen lévő AAA triplettet TCT, TCC, TCA vagy TCG triplettre változtató mutáció.
Ilyen mutáns gént úgy kapunk, hogy egy vad típusú (vagy egy másfajta mutációval rendelkező) enzim génjeként egy foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-génnek az adott gazdasejthez alkalmas vektor-DNS-sel való ligálásával kapott rekombináns DNS-t mutációs kezelésnek vetünk alá, hogy a transzformánsokat a rekombináns DNS-sel screenelhessük. Más módon, egy vad típusú enzimet termelő mikroorganizmust vetünk alá mutációs kezelésnek, miáltal mutáns enzimet termelő mutáns törzset kapunk, és a mutáns gént screeneljük a mutáns törzsből. A rekombináns DNS mutációs kezeléséhez hidroxilamint és hasonlókat alkalmazhatunk. Amikor magát a mikroorganizmust vetjük alá a mutációs kezelésnek, a mesterséges mutációhoz általánosan használt hatóanyagot vagy eljárást alkalmazhatunk.
Olyan eljárások alkalmazásával, mint az átfedőextenzió- (overlapping extension) eljárás (Ho, S. N., Hunt, H. D., Horton, R. M., Pulién, J. K. és Pease, L.
R. , Gene, 77, 51-59, 1989), a helyspecifikus mutáció (Kramer, W. és Frits, H. J., Meth. in Enzymol., 154, 350,1987; Kunkel, T. A. és munkatársai, Meth. in Enzymol., 154, 367, 1987) és hasonlók, a fentebb említett mutáns gén úgy is előállítható, hogy a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén - mint vad típusú gén vagy más mutációval rendelkező gén - nukleotidszekvenciájába mutációt (aminosavhelyettesítés, inszerció, deléció stb.) viszünk be. Ezen eljárások alapelve, hogy templátként nem mutált gén DNS-ét alkalmazzuk, és a primerek egyikeként a mutációs pontnál nem komplementer bázispárosodást (mismatch) tartalmazó szintetikus DNS-t alkalmazunk, hogy az említett nem mutált gén komplementer szálát hozzuk létre, miáltal a szekvenciába mutációt viszünk be. Ezen eljárások alkalmazásával egy megcélzott helyen szándékosan idézhetünk elő mutációt.
Más lehetőség szerint, olyan szekvenciát szintetizálhatunk, amely mindkét terminálisán restrikciós enzimes hasítási végekkel és egy mutációs pont mindkét oldalával rendelkezik, s ezzel a szekvenciával egy nem mutált gén megfelelő részletét helyettesítjük, miáltal mutációt idézünk elő (kazettamutációs eljárás).
A foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén (amelyet a mutáció beviteléhez vad típusú enzimgénként vagy másik mutációt tartalmazó génként alkalmazunk), bármilyen gén lehet, azzal a feltétellel, hogy az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusok foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-génjét kódolja, amit előnyösen bázisszekvenciája alapján határozunk meg, és klónozunk. Amennyiben a gént nem klónoztuk, FCR (polimerázláncreakció) és egyéb eljárások alkalmazásával ilyen gént tartalmazó DNS-fragmenst amplifikálhatunk és izolálhatunk, majd a klónozás végrehajtásához megfelelő vektort alkalmazunk.
A fent említett génként például olyan Escherichia coli gént alkalmazhatunk, amely klónozott, és bázisszekvenciája meghatározott (Fujita, N., Miwa, T., Ishijima,
S. , ízűi, K. és Katsuki, H., J. Biochem., 95, 909-916, 1984). E gén kódolórégiójának szekvenciáját az 1. számú szekvencia 237-2888. bázisai képezik.
A mutáns gént tartalmazó gazdasejt screenelését az aszparaginsav analógjának alkalmazásával hajthatjuk végre. Az analóg vegyület előnyösen az alábbi tulajdonságokkal rendelkezik: az Escherichia nemzetségbe tartozó, vad típusú foszfo-enolpiruvát-karboxilázt tartalmazó mikroorganizmusokkal szemben növekedést gát3
HU 219 600 Β ló hatást mutat, ami az L-glutaminsav vagy az L-aszparaginsav jelenlétével visszaállítható), és gátolja a vad típusú foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-aktivitást.
Ha az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusok közül (indexként a baktérium növekedésének gátlását alkalmazva) az említett analóg vegyületre rezisztens, mutáns törzset választunk ki, például a vad típusú foszfo-enolpiruvát-karboxilázt termelő Escherichia coli HB101 törzset, sokkal nagyobb a valószínűsége annak, hogy az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlással szemben deszenzibilizált foszfo-enolpiruvát-karboxilázt termelő gazdabaktériumot kapjunk.
A foszfo-enolpiruvát-karboxiláz inhibitorának általános szerkezetét tekintve alapvetően egy négy szénatomos dikarbonsavstruktúrára van szükség. Ebből kiindulva, különböző vegyületeket vizsgáltunk. Az Escherichia coli HB101 törzset LB tápközegben tenyésztettük, majd 20 pg/ml tiamint és 3-3 pg/ml leucint és prolint tartalmazó M9 tápközegbe helyeztük, amely a fentieken kívül az alábbi vegyületek valamelyikét tartalmazta: DL-2amino-4-foszfino-vajsav, bróm-borostyánkősav, mezo2,3-dibróm-borostyánkősav, 2,2-difluor-borostyánkősav, 3-bróm-piroszőlősav, α-ketovajsav, a-ketoadipinsav, DL-treo-P-hidroxi-aszparaginsav-P-metil-észter, ametil-DL-aszparaginsav, 2,3-diamino-borostyánkősav vagy aszparaginsav-P-hidrazid. A tápközeg abszorbanciáját az idő előrehaladtával 660 nm-nél mértük, miáltal nyomon követtük a növekedést.
Amikor ezek a vegyületek növekedést gátló koncentrációikban voltak jelen, azt vizsgáltuk, hogy a nukleinsavak (100-100 mg/dm3 uridin és adenozin) a glutaminsav- vagy az aszparaginsavcsaládba tartozó egyéb aminosavak (Asp: 0,025%, Met, Thr, Lys: 0,1-0,1%) hozzáadása után a gátlás megszűnt-e vagy sem.
Eredményül három vegyületet, a 3-bróm-borostyánkősavat (3BP) [(1) képlet], az aszparaginsav-p-hidrazidot (AHY) [(2) képlet] és a DL-treo-p-hidroxi-aszpartátot (βΗΑ) [(3) képlet] választottuk ki.
Az Escherichia coli szaporodásának fenti analóg vegyületek által történő gátlását az 1-3. ábrákon mutatjuk b. A 4-6. ábrákon a fentebb említett, gátlást megszüntető anyagok hozzáadása után az Escherichia coli szaporodásának visszaállítását mutatjuk be. A 7. ábrán (kontrollként) a gátlást megszüntető anyag hozzáadásakor tapasztalható szaporodást mutatjuk be, olyan esetben, amikor gátlóanyagok nem voltak jelen. A 4-7. ábrákon az 1., 2. és 3. adalék nukleinsavakat, glutaminsavat, illetve az aszparagincsaládba tartozó aminosavakat jelöl.
Vizsgáltuk a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aktivitásának analóg vegyület által történő gátlását. A nyersenzimet a The Journal of Biochemistryben (67. évfolyam, 4. szám, 1970) leírt eljárás szerint Escherichia coli HB101 törzsből állítottuk elő, az enzimaktivitást pedig az Eur. J. Biochem.-ben (202, 797-803,1991) leírt eljárás szerint mértük.
Az LB tápközegben tenyésztett HB101 Escherichia coli sejteket feltártuk, és a kapott szuszpenzió centrifugálásával kapott felülúszót nyersenzimoldatként használtuk. Az enzimaktivitást az abszorbancia 340 nm-nél mért csökkenése alapján határoztuk meg. A 2 mM kálium-foszfo-enolpiruvátot, 0,1 mM NADH-t, 0,1 M Tris-acetátot (pH=8,5), 1,5 egység malát-dehidrogenázt és a nyersenzimet tartalmazó vizsgálati rendszerben az aktivitást gátló acetil-koenzim A koncentrációja 0,1 mM volt. Az eredményeket a 8. ábrán mutatjuk be.
A bemutatott eredmények alapján nyilvánvaló, hogy a fentebb említett három vegyület gátolja az Escherichia coli növekedését (szaporodását), és ez a gátlás önmagukban alkalmazott nukleinsavakkal nem szüntethető meg, míg glutaminsav (vagy az aszparagincsaládba tartozó aminosavak) hozzáadásával megszüntethető. Következésképpen, ezek az analóg vegyületek a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz szelektív inhibitorai. Amint az alábbi példákban leíquk, találmányunkban e vegyületeket sikerrel alkalmaztuk mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázt termelő Escherichia coli szelektálásához.
Ha egy megcélzott mutáns enzimet kódoló génnel rendelkező transzformánst a fentebb említett vegyületek alkalmazásával screenelünk, és rekombináns DNS-t nyerünk ki, a mutáns enzimet kódoló gént kapjuk. Más módon, abban az esetben, ha önmagát a baktériumot vetjük alá mutációs kezelésnek, ha a megcélzott mutáns enzimet kódoló génnel rendelkező mutáns törzset a fentebb említett vegyülettel screeneljük, a törzsből a megcélzott mutáns enzim génjét tartalmazó DNS-ffagmenst izolálhatjuk, és ezt megfelelő vektorral ligáivá a mutáns enzim génjét kapjuk.
Sokrétű kutatásunk eredményeként, melynek során figyelmet fordítottunk az Escherichia coli aszpartátkötő proteinjében jelen lévő arginingyök jelentőségére (Krikos, A., Mouth, N., Boyd, A. és Simon, M. 1., Ccü, 33, 615-622, 1983; Mowbray, S. L. és Koshland, D; E., J. Bioi. Chem., 264, 15 638-15 643, 1990; Mílbum, Μ. V., Prive, G. G., Milligan, D. L., Scott, W. G., Yeh, J., Jancarik, J., Koshland, D. E. és Kim, S. H. Science, 254, 1342-1347, 1991), felismertük hogy az aszparaginsav által kiváltott gátlás lényegében deszenzibilizálható, ha a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz 438. arginingyökét ciszteingyökkel helyettesítjük. Annak érdekében, hogy a 438. arginint ciszteinre cseréljük, a foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódoló gén 438. arginint kódoló kodonját a cisztein kodonjára cseréljük. Például, az 1. számú szekvenciában az 1548-1550. helyen lévő CGT triplettet TGT vagy TGC triplettre cserélhetjük.
Ezenkívül elvégeztük a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz lizingyökeinek kémiai módosítását, melyhez 2,4,6trinitro-benzolszulfonsavat (TNBS) alkalmaztunk, amely képes a proteinek lizingyökeinek kémiai módosítására. A módosítóreakció során a foszfo-enolpiruvátkarboxiláz gátlására képes almasav is jelen volt, mert feltételeztük, hogy a foszfa-enolpiruvát-karboxiláz kötőhelyének szomszédságában jelen levő lizingyök megvédhető a kötött almasavval, miáltal a kémiai módosítás nem hat rá. Eredményként arra következtettünk, hogy a 620. lizingyök lényeges az almasav foszfo-enolpiruvát-karboxilázhoz való kötődése szempontjából, s azt találtuk, hogy a 620. lizingyököt szerinre változtatva az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlás
HU 219 600 Β deszenzibilizálható, miközben a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz enzimaktivitása fennmarad. Annak érdekében, hogy a 620. lizingyököt szerinné alakítsuk, a foszfoenolpiruvát-karboxilázt kódoló gén 620. lizint kódoló kodonját szerint kódoló kodonná változtathatjuk. Például az 1. számú szekvenciában, a 2094-2096. számú nukleotidokból álló AAA triplettet TCT, TCC, TCA, TCG, AGT vagy AGC triplettel helyettesíthetjük.
Olyan eljárások alkalmazásával, mint az átfedőextenzió- (overlapping extension) eljárás (Ho, S. N., Hunt, H. D., Horton, R. M., Pulién, J. K. és Pease, L. R., Gene, 77, 51-59, 1989), a helyspecifikus mutáció (Kramer, W. és Frits, H. J., Meth. in Enzymol., 154, 350, 1987; Kunkel, T. A. és munkatársai, Meth. in Enzymol., 154, 367, 1987) és hasonlók, a fentebb említett mutáns gén úgy is előállítható, hogy a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén - mint vad típusú gén vagy más mutációval rendelkező gén - nukleotidszekvenciájába mutációt (aminosavhelyettesítés, inszerció, deléció stb.) viszünk be. Ezen eljárások alapelve, hogy templátként nem mutált gén DNS-ét alkalmazzuk, és a primerek egyikeként a mutációs pontnál nem komplementer bázispárosodást (mismatch) tartalmazó szintetikus DNS-t alkalmazunk, hogy az említett nem mutált gén komplementer szálát hozzuk létre, miáltal a szekvenciába mutációt viszünk be. Ezen eljárások alkalmazásával egy megcélzott helyen szándékosan idézhetünk elő mutációt.
Más lehetőség szerint, olyan szekvenciát szintetizálhatunk, amely mindkét terminálisán restrikciós enzimes hasítási végekkel és egy mutációs pont mindkét oldalával rendelkezik, s ezzel a szekvenciával egy nem mutált gén megfelelő részletét helyettesítjük, miáltal mutációt idézünk elő (kazettamutációs eljárás). A foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódoló, fentiek szerint mutált DNSffagmenst megfelelő gazda-vektor rendszer alkalmazásával expresszáljuk, miáltal lehetővé válik a mutáns enzim előállítása. Más módon a megcélzott mutáns enzim úgy is előállítható, hogy a találmány szerinti DNS-fragmenst egy gazdasejt kromoszomális DNS-ébe építve transzformációt végzünk.
Gazdasejtként az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusokat, például Escherichia colit, coryneform baktériumokat és hasonlókat alkalmazhatunk. A coryneform baktériumok közé tartoznak a Corynebacterium nemzetségbe tartozó baktériumok, a Brevibacíerium nemzetségbe tartozó baktériumok (melyeket eddig a Brevibacterium nemzetségbe soroltak, de jelenleg a Corynebacterium nemzetségben egyesítenek), valamint a Brevibacterium nemzetségbe tartozó baktériumok, melyek közeli rokonságban állnak a Corynebacterium nemzetségbe tartozó baktériumokkal. Az aminosavak előállításához előnyös gazdasejteket az alábbiakban írjuk le.
Vektor-DNS-ként előnyösen plazmidvektort alkalmazunk, és azokat részesítjük előnyben, amelyek a gazdasejtben önreplikációra képesek. Amennyiben gazdasejtként Escherichia colit alkalmazunk, vektorként például a pUC19, pUC18, pBR322, pHSG299, pHSG399, RSF1010 és hasonló plazmidok alkalmazhatók. Más lehetőség szerint fág-DNS-vektort is felhasználhatunk.
Amennyiben a gazdasejt Corynebacterium, az alábbi vektorokat (és az azokat tartalmazó gazdasejteket) alkalmazhatjuk. Zárójelben feltüntetjük a deponálási számokat.
pAJ655 Escherichia coli AJ11882 (FERM BP-136);
Corynebacterium glutamicum SR8201 (ATCC 39135);
pAJ1844 Escherichia coli AJ11883 (FERM BP-137);
Corynebacterium glutamicum SR8202 (ATCC 39136);
pAJ611 Escherichia coli AJ11884 (FERM BP-138);
pAJ3148 Corynebacterium glutamicum SR8203 (ATCC 39137);
pAJ440 Bacillus subtilis AJ11901 (FERM BP-140).
A fenti vektorokat a letétbe helyezett organizmusokból az alábbiak szerint nyerhetjük ki. A logaritmikus növekedési fázisban összegyűjtött sejteket lizozim és SDS alkalmazásával bakteriolízisnek vetjük alá, és 30 000 xg-vei centrifugálva a lizátumból felülúszót kapunk, amelyhez polietilénglikolt adunk, hogy a vektorokat cézium-klorid/etidium-bromid egyensúlyi sűrűséggradiens-centrifúgálással elválasszuk és tisztítsuk.
Annak érdekében, hogy az Escherichia colit a DNS-szekvencia fentebb említett vektorba történő inzertálásával kapott rekombináns vektorral transzformáljuk, Escherichia coli transzformációjához általánosan: alkalmazott eljárást alkalmazhatunk, például olyan eljárást, melyben a sejteket a DNS permeábilitásának fokozása érdekében kalcium-kloriddal kezeljük (Mandel, M. és Higa, A., J. Mól. Bioi., 53, 159,1977) stb.
A Corynebacteriumok transzformálásához a fenti eljárást (melyben a sejteket nátrium-kloriddal kezeljük) vagy olyan eljárást alkalmazhatunk, melyben a DNSbevitelt meghatározott növekedési periódusban hajtjuk végre, amikor a sejtek képesek a DNS felvételére (Bacillus subtilisre vonatkozó leírás, Duncan, C. H. és munkatársai). A DNS-t úgy is bevihetjük a baktériumsejtekbe, hogy a DNS-recipiensekből protoplasztokat vagy szferoplasztokat hozunk létre, melyek könnyen beépítik a plazmid-DNS-t. Ezek a Bacillus subtilis, Actinomyces fajok és az élesztők esetében ismertek (Chang, S. és munkatársai, Molec. Gén. Génét., 168, 111, 1979; Bibb és munkatársai, Natúré, 274, 398, 1978; Hinnen A. és munkatársai, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 1929, 1978). A 2-207781 számú japán szabadalomban eljárást írtak le Corynebacteriumok transzformálására.
A találmány szerinti DNS-szekvencia fentebb említett gazdasejtekben történő expresszálása érdekében a baktériumban hatékonyan működő promotert (például lac, trp, PL stb.) alkalmazhatunk, vagy ha a találmány szerinti DNS-szekvencia a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén promoterét tartalmazza, úgy az is alkalmazható. Más módon, ha gazdasejtként Corynebacteriumot alkalmazunk, a Brevibacterium nemzetségbe tartozó baktériumból származó, ismert trp promoter (62-244382 számújapán szabadalom) és hasonlók is alkalmazhatók.
HU 219 600 Β
Amint fentebb említettük, a találmány szerinti DNSszekvenciát önreplikációra képes vektor DNS-be inzertálhatjuk és bevihetjük a gazdasejtbe, hogy abban plazmidként legyen jelen, továbbá az is elfogadható, hogy a találmány szerinti DNS-szekvenciát transzpozon (Berg, D. E., és Berg, C. M., Bio/Technol., 1, 417, 1983), Mu fág (2-109985 számú japán szabadalom) vagy homológ rekombináció (Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Láb., 1972) alkalmazásával végzett eljárással egy mikroorganizmus kromoszómájába integráljuk. A találmány szerinti DNS Corynebacteriumokba való beépítéséhez hőmérsékletre érzékeny plazmidot is alkalmazhatunk (5-7491 számú japán szabadalom).
A találmány szerinti DNS-szekvenciával fentiek szerint transzformált mikroorganizmust tenyésztve (és a bevitt DNS-t expresszálva) mutáns enzimet kapunk. Az enzimes reakciórendszerhez aszparaginsavat adva az enzimaktivitás mérésével kiderül, hogy a kapott mutáns enzim deszenzibilizált-e az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlással szemben. Az enzimaktivitás méréséhez spektrometriás eljárás (Yoshinage, T., ízűi, K. és Katsuki, H., J. Biochem., 68, 747-750, 1970) és hasonlók alkalmazhatók.
A találmány szerinti DNS-szekvencia mutáns enzimet kódol, amely az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlással szemben deszenzibilizált, s így az e DNSszekvenciát tartalmazó mikroorganizmus felhasználható az aszparaginsav- és glutaminsavcsaládba tartozó aminosavak hatékony fermentetatív termeléséhez.
A mutáns enzim géneket tartalmazó, alábbi példákban nyert AJ12907, AJ12908, AJ12909 és AJ12910 Escherichia coli törzseket 1993. augusztus 3-án a National Institute of Bioscience and Humán Technology of Agency of Industrial Science and Technologynál (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japán; postai irányítószám: 305) FERM P-13774, FERM P-13775, FERM P-13776, illetve FERM P-13777 deponálási számon helyeztük letétbe, illetve 1994. július 11-én, a Budapest Szerződés értelmében FERM BP-4734, FERM BP-4735, FERM BP-4736, illetve FERM BP-4737 deponálási számon nemzetközi letétbe helyeztük át.
Az aminosavak előállítási eljárása
Az aminosavak előállíthatok úgy, hogy a találmány szerinti DNS-szekvenciát tartalmazó mikroorganizmust megfelelő tápközegben tenyésztjük, és a képződött aminosavakat elkülönítjük. Az ilyen aminosavak példáiként az L-lizin, L-treonin, L-metionin, L-izoleucin, L-glutaminsav, L-arginin és L-prolin említhető.
Az alábbiakban az aminosayak előállításához alkalmazni kívánt, találmány szerinti DNS-szekvencia beviteléhez előnyben részesített gazdasejteket, valamint a tenyésztésükhöz alkalmazott eljárást írjuk le.
A találmány szerinti aminosavtermelési eljáráshoz előnyös gazdasejtek (i) A lizintermeléshez előnyösen alkalmazható gazdasejtek
A találmány szerinti lizintermeléshez alkalmazható gazdasejtek példáiként az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusokat említhetünk, előnyösen az
L-lizint termelő Escherichia colit. Közelebbről, egy lizinanalógra rezisztens mutáns törzset alkalmazhatunk. Az ilyen lizinanalóg gátolja az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusok növekedését (szaporodását), a gátlás azonban teljesen vagy részben deszenzibilizálható, feltéve, hogy az L-lizin is jelen van a tápközegben. Ilyen analógok például, az oxalizin, lizinhidroxamát, S-(2-amino-etil)-cisztein (a továbbiakban „AEC”), γ-metil-lizin, α-klór-kaprolaktám és hasonlók. Az e lizinanalógokkal szemben rezisztens mutáns törzseket úgy alakíthatjuk ki, hogy az Escherichia nemzetségbe tartozó baktériumot hagyományos mesterséges mutációs kezelésnek vetjük alá. Az L-lizin termeléséhez alkalmazható baktériumtörzsként az AJ11442 Escherichia coli törzset említhetjük (FERM P-5084, lásd 56-18596 számú japán szabadalom, 471. oldal).
Másrészről, a Corynebacteriumok különböző, L-lizin termelésére alkalmas, mesterséges mutáns törzseit is felhasználhatjuk a találmány céljaira. Ilyen mesterséges, mutáns törzsek az AEC-rezisztens mutáns törzs; a növekedéséhez aminosavat, például L-homoszerint igénylő mutáns törzs (48-28078 és 56-6499 számú japán közrebocsátási irat); az AEC-vel szemben rezisztenciát mutató mutáns törzsek, amelyek például L-leucint, L-homoszerint, L-prolint, L-szerint, L-arginint, L-alanint, L-valint és hasonló aminosavakat igényelnek (3 708 395 és 3 825 472 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalmak); L-lizint termelő mutáns törzs, amely rezisztens a DL-a-amino-a-kaprolaktámmal, aamino-lauril-laktámmal, kinoiddal, és N-lauril-leucinnal szemben; az oxálacetát-dekarboxiláz vagy a respirációs rendszer enziminhibitorára rezisztens L-lizin-termelő mutáns törzs (50-53588, 50-31093, 52-102498,. 53-86089, 55-9783, 55-9759, 56-32995 és 56-39778 számú japán szabadalmak és 53-43591 és 53-1833 számú japán közrebocsátási irat); inozitolt és ecetsavat igénylő L-lizin-termelő mutáns törzs (55-9748 és 56-8692 számú japán szabadalom); a fluor-piroszőlősavra vagy a 34 °C feletti hőmérsékletre érzékeny, L-lizin-termelő mutáns törzs; (55-9783 és 53-86090 számú japán szabadalom); és az etilénglikollal szemben rezisztens, L-lizin-termelő mutáns Brevibacterium és Corynebacterium törzs (lásd 4 411 997 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalom).
A következőkben a lizintermeléshez alkalmazható konkrét coryneform baktériumokat soroljuk fel:
Brevibacterium lactofermentum AJ 12031 (FERM-BP277), lásd 60-62994 számú japán szabadalom, 525. oldal;
Brevibacterium lactofermentum ATCC 39134, lásd 60-62994 számú japán szabadalom, 473. oldal, jobb alsó hasáb;
Brevibacterium lactofermentum AAJ3463 (FERM-P1987), lásd 51-34477 számú japán szabadalom.
A fentieken kívül, az alábbi coryneform baktériumok szintén alkalmazhatók a találmány gyakorlati megvalósításában:
Corynebacterium acetoacidophilum ATCC 13870 Corynebacterium acetoglutamicum ATCC 15806
HU 219 600 Β
Corynebacterium callunae ATCC 15991
Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
ATCC 13060 (Brevibacterium divaricatum) ATCC 14020 (Brevibacterium lactofermentum) ATCC 13869 (Corynebacterium lilium) ATCC 15990
Corynebacterium melassecola ATCC 17965
Brevibacterium saccharolyticum ATCC 14066
Brevibacterium immariophilum ATCC 14068
Brevibacterium roseum ATCC 13825
Brevibacterium flavum ATCC 13826
Brevibacterium thiogenitalis ATCC 19240
Microbacterium ammoniaphilum ATCC 15354 (ii) Az L-treonin termeléséhez előnyös gazdasejtek
Escherichia coli B-3996 (RIA 1867), lásd 3-501682 számú japán szabadalom (PCT);
Escherichia coli AJ12349 (FERM-P9574), lásd 2-458 számú japán szabadalom, 887. oldal, bal felső hasáb;
Escherichia coli AJ12351 (FERM-P9576), lásd 2-458 számú japán szabadalom, 887. oldal, jobb alsó hasáb;
Escherichia coli AJ12352 (FERM P-9577), lásd 2-458 számú japán szabadalom, 888. oldal, bal felső hasáb;
Escherichia coli AJ11332 (FERM P-4898), lásd 2-458 számú japán szabadalom, 889. oldal, bal felső hasáb;
Escherichia coli AJ1235O (FERM P-9575), lásd 2-458 számú japán szabadalom, 889. oldal, bal felső hasáb;
Escherichia coli AJ12353 (FERM P-9578), lásd 2-458 számú japán szabadalom, 889. oldal, jobb felső hasáb;
Escherichia coli AJ12358 (FERM P-9674), lásd 2-458 számú japán szabadalom, 890. oldal, bal felső hasáb;
Escherichia coli AJ12359 (FERM P-9675), lásd 2-458 számú japán szabadalom, 890. oldal, bal felső hasáb;
Escherichia coli AJ11334 (FERM P-4900), lásd 1-29559 számú japán közrebocsátási irat, 201. oldal,
6. hasáb;
Escherichia coli AJ11333 (FERM P-4899), lásd 1-29559 számú japán közrebocsátási irat, 201. oldal,
6. hasáb;
Escherichia coli AJ11335 (FERM P-4901), lásd 1-29559 számú japán közrebocsátási irat, 202. oldal,
7. hasáb.
Az alábbi baktériumtörzseket az alkalmazható coryneform baktériumok példáiként soroljuk fel:
Brevibacterium lactofermentum AJ11188 (FERM P-4190), lásd 60-87788 számú japán szabadalom, 473. oldal, jobb felső hasáb;
Corynebacterium glutamicum AJ 11682 (FERM BP-118), lásd 2-31956 számú japán közrebocsátási irat, 230. oldal, 8. hasáb);
Brevibacterium flavum AJ11683 (FERM BP-119), lásd 2-31956 számú japán közrebocsátási irat, 231. oldal, 10. hasáb).
(iii) Az L-metionin termeléséhez előnyös gazdasejtek
Az alábbi baktériumtörzseket az L-metionin termeléséhez alkalmazható baktériumok példáiként soroljuk fel:
Escherichia coli AJ11457 (FERM P-5175), lásd 56-35992 számú japán szabadalom, 552. oldal, jobb felső hasáb;
Escherichia coli AJ11458 (FERM P—5176), lásd 56-35992 számú japán szabadalom, 552. oldal, jobb felső hasáb;
Escherichia coli AJ11459 (FERM P-5177), lásd 56-35992 számú japán szabadalom, 552. oldal, jobb felső hasáb;
Escherichia coli AJ11539 (FERM P-5479), lásd 56-144092 számú japán szabadalom, 435. oldal, bal alsó hasáb;
Escherichia coli AJ11540 (FERM P-5480), lásd 56-144092 számú japán szabadalom, 435. oldal, bal alsó hasáb;
Escherichia coli AJ11541 (FERM P-5481), lásd 56-144092 számú japán szabadalom, 435. oldal, bal alsó hasáb;
Escherichia coli AJ11542 (FERM P-5482), lásd 56-144092 számú japán szabadalom, 435. oldal, bal alsó hasáb.
(iv) Az L-aszparaginsav termeléséhez előnyös gazdasejtek
Az alábbi baktériumtörzseket az L-aszparaginsav termeléséhez alkalmazható baktériumok példáiként soroljuk fel:
Brevibacterium flavum AJ3859 (FERM P-2799), lásd 51-61689 számú japán szabadalom, 524. oszlop, bal felső hasáb;
Brevibacterium lactofermentum AJ3860 (FERM: P-2800), lásd 51-61689 számú japán szabadalom, 524. oszlop, bal felső hasáb;
Corynebacterium acetoacidophilum AJ3877 (FERM P-2803), lásd 51-61689 számú japán szabadalom, 524. oszlop, bal felső hasáb;
Corynebacterium glutamicum AJ3876 (FERM P-2802), lásd 51-61689 számú japán szabadalom, 524. oszlop, bal felső hasáb.
(v) Az L-izoleucin termeléséhez előnyös gazdasejtek
Az Escherichia nemzetségbe tartozó baktériumok példájaként az Escherichia coli KX141 törzset (VKPM-B4781) (lásd 4-33027 számú japán szabadalom, 45. szakasz), míg a coryneform baktériumok példáiként a Brevibacterium lactofermentum AJ12404 törzset (FERM P—10141) (lásd 2-42988 számú japán szabadalom, 603. oldal, bal alsó hasáb) és a Brevibacterium flavum AJ12405 törzset (FERM P-10142) (lásd 2-42988 számú japán szabadalom, 524. oldal, bal alsó hasáb) említjük.
(vi) Az L-glutaminsav termeléséhez előnyös gazdasejtek
Az Escherichia nemzetségbe tartozó baktériumok példáiként az alábbi baktériumtörzseket említjük:
Escherichia coli AJ12628 (FERM P-12380), lásd 2 680 178 számú francia közrebocsátási irat (1993);
Escherichia coli AJ2624 (FERM P-12379), lásd 2 680 178 számú francia közrebocsátási irat (1993).
HU 219 600 Β
Az alábbi baktériumtörzseket a coryneform baktériumok példáiként soroljuk fel:
Brevibacterium lactofermentum AJ12745 (FERM BP-2922), lásd 3-49690 számú japán szabadalom,
561. oldal, jobb alsó hasáb;
Brevibacterium lactofermentum AJ12746 (FERM BP-2923), lásd 3-49690 számú japán szabadalom,
562. oldal, bal felső hasáb;
Brevibacterium lactofermentum AJ12747 (FERM BP-2924), lásd 3-49690 számú japán szabadalom, 562. oldal, bal felső hasáb;
Brevibacterium lactofermentum AJ12748 (FERM BP-2925), lásd 3-49690 számú japán szabadalom, 562. oldal, bal felső hasáb;
Brevibacterium flavum ATCC 14067 (lásd 5-3793 számú japán szabadalom, 3. oldal, 1. táblázat);
Brevibacterium glutamicum ATCC 21492, (lásd 5-3793 számú japán szabadalom, 3. oldal, 1. táblázat).
(vii) Az L-arginin termeléséhez előnyös gazdasejtek
Az alábbi baktériumtörzseket az Escherichia nemzetségbe tartozó baktériumok példáiként soroljuk fel:
Escherichia coli AJ11593 (FERM P-5616), lásd 57-5693 számú japán szabadalom, 468. oldal, bal felső hasáb;
Escherichia coli AJ11594 (FERM P-5617), lásd 57-5693 számú japán szabadalom, 468. oldal, jobb felső hasáb.
Az alábbi baktériumtörzseket a coryneform baktériumok példáiként említjük:
Brevibacterium flavum AJ12144 (FERM P-7642), lásd 5-27388 számú japán közrebocsátási irat, 174. oldal, 4. hasáb;
Corynebacterium glutamicum AJ12145 (FERM P-7643), lásd 5-27388 számú japán közrebocsátási irat, 174. oldal, 4. hasáb;
Brevibacterium flavum ATCC 21493, lásd 5-3793 számú japán szabadalom, 3. oldal, 1. táblázat;
Corynebacterium glutamicum ATCC 21659, lásd 5-3793 számú japán szabadalom, 3. oldal, 1. táblázat.
(viii) Az L-prolin termeléséhez előnyös gazdasejtek
Az alábbi baktériumtörzseket az Escherichia nemzetségbe tartozó baktériumok példáiként soroljuk fel:
Escherichia coli AJ11543 (FERM P-5483), lásd 56-144093 számú japán szabadalom, 435. oldal, bal alsó hasáb;
Escherichia coli AJ11544 (FERM P-5484), lásd 56-144093 számú japán szabadalom, 435. oldal, bal alsó hasáb.
Az alábbi baktériumtörzseket a coryneform baktériumok példáiként említjük:
Brevibacterium lactofermentum AJ11225 (FERM P-4370), lásd 60-87788 számú japán szabadalom, 473. oldal, bal felső hasáb;
Brevibacterium flavum AJ11512 (FERM P—5332), lásd 62-36679 számú japán szabadalom, 185. oldal, 2. hasáb;
Brevibacterium flavum AJ11513 (FERM P-5333), lásd 62-36679 számú japán szabadalom, 185. oldal, 2. hasáb;
Brevibacterium flavum AJ11514 (FERM P-5334), lásd 62-36679 számú japán szabadalom, 185. oldal, 2. hasáb;
Corynebacterium glutamicum AJ11533 (FERM P-5342), lásd 62-36679 számú japán szabadalom, 185. oldal, 2. hasáb;
Corynebacterium glutamicum AJ11523 (FERM P-5343), lásd 62-36679 számú japán szabadalom, 185. oldal, 2. hasáb.
Tenyésztési eljárás
A fentebb említett gazdasejtek tenyésztési eljárása nem különbözik lényegesen az aminosavtermelő mikroorganizmusok hagyományos tenyésztési módszerétől. A tenyésztéshez szokványos tápközeget alkalmazunk, amely szén- és nitrogénforrást, szervetlen ionokat, és adott esetben szerves tápanyag-kiegészítőket (például aminosavakat, vitaminokat és hasonlókat) tartalmaz.
Szénforrásként glükózt, szacharózt, laktózt és hasonlókat, valamint keményítőhidrolizátumot, tejsavót, melaszt és hasonlókat alkalmazhatunk. Nitrogénforrásként ammóniagázt, vizes ammóniumoldatot, ammóniumsót és hasonlókat használhatunk. Amennyiben gazdasejtként olyan mutáns törzset alkalmazunk, amely az aminosavtermeléshez tápanyag-kiegészítőket igényel, a tápanyaghoz az adott törzs által igényelt megfelelő tápanyagokat (például aminosavakat vagy hasonlókat) kell adni. A lizintermeléshez alkalmas tápközeg egy példáját az I. táblázatban mutatjuk be (a kalcium-karbonátot az elkülönített sterilizálás után adjuk a többi komponenshez).
I. táblázat
Tápközegkomponens Elegyítcsi koncentráció
Glükóz 5 g/dl
(NH4)2SO4 2,5 g/dl
kh2po4 0,2 g/dl
MgSO4-7H2O 0,1 g/dl
Élesztőkivonat 0,05 g/dl
Tiamin-hidroklorid i pg/i
Biotin 300 pg/l
FeSO4 -7 H2O 1 pg/dl
MnSO4-4H2O 1 pg/dl
Kalcium-karbonát (pH=7,0) 2,5 g/dl
A tenyésztést az aminosavak termelődésének és felhalmozódásának befejeződéséig végezzük, miközben anaerob körülmények között a tápközeg pH-ját és hőmérsékletét megfelelően szabályozzuk. A tenyésztő tápközegben felhalmozódott aminosavak összegyűjtéséhez hagyományos eljárást alkalmazhatunk.
Az ábrák rövid leírása
Az 1. ábrán a 3-bróm-piroszőlősav növekedésgátló hatását mutatjuk be.
A 2. ábrán az aszpartát-p-hidrazid növekedésgátló hatását mutatjuk be.
A 3. ábrán a DL-treo-P-hidroxi-aszpartát növekedésgátló hatását mutatjuk be.
HU 219 600 Β
A 4. ábrán a gátlást megszüntető anyagok 3-brómpiroszőlősavra gyakorolt hatását mutatjuk be.
Az 5. ábrán a gátlást megszüntető anyagok aszpartát-p-hidrazidra gyakorolt hatását mutatjuk be.
A 6. ábrán a gátlást megszüntető anyagok DL-treoβ-hidroxi-aszpartátra gyakorolt hatását mutatjuk be.
A 7. ábrán a növekedést helyreállító faktorok növekedésre gyakorolt hatását mutatjuk be.
A 8. ábrán a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz növekedésgátló anyagok által történő gátlását mutatjuk be.
A 9. ábrán a találmány szerinti foszfo-enolpiruvátkarboxiláz aszparaginsav által történő gátlását mutatjuk be.
A 10. ábrán a találmány szerinti foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aszparaginsav által történő gátlását mutatjuk be.
All. ábrán a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén mutációs módszerét mutatjuk be.
A 12. ábrán az aszparaginsav vad típusú, illetve mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz (melyben az N-terminálistól számított 438. arginint ciszteinnel helyettesítettük) aktivitására gyakorolt hatását mutatjuk be.
A 13. ábrán az aszparaginsav vad típusú, illetve mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz (melyben az N-terminálistól számított 620. lizint szérűinél helyettesítettük) aktivitására gyakorolt hatását mutatjuk be.
A továbbiakban a találmányt a példák segítségével jellemezzük részletesebben.
1. példa
A mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén előállítása
A pS2 plazmid alkalmazásával mutáns gént állítottunk elő. A pS2 plazmidot úgy kaptuk, hogy egy klónozott (és meghatározott bázisszekvenciával rendelkező) foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gént a pBR322 plazmidvektor Sáli helyére inzertáltunk. A pS2 plazmid ampicillinrezisztenciamarker-gént tartalmaz (Sabe, H. és munkatársai, Gene, 31, 279-283, 1984). A pS2 plazmidban található foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén nukleotidszekvenciája megegyezik a fentebb említett pT2 plazmidban lévő génével.
A pS2 DNS-t 75 °C-on két óra hosszat hidroxilamin-oldattal [20 pg/ml pS2 DNS, 0,05 M nátriumfoszfát (pH=6,0), 1 mM EDTA, 0,4 M hidroxil-amin] kezeltük. A pH hidroxil-aminos kezelést befolyásoló hatása miatt 1 M hidroxil-amin HC1 és 1 mM EDTA (nátrium-hidroxiddal pH=6,0-ra beállított) 80 pl oldatát, 0,1 M nátrium-foszfát (pH=6,0) és 1 mM EDTA 100 pl oldatát, és 2 pg pS2 DNS-t tartalmazó TE puffért (10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA) elegyítettünk, és az elegy térfogatát vízzel 200 pl-re egészítettük ki.
A fenti feltételek mellett a kezelés után pS2 plazmiddal transzformált Escherichia coli HB101 transzformánsok túlélési aránya 0,2% (az ampicillintartalmú tápközegben végzett kezelés előtti állapothoz viszonyítva).
A HB101 Escharichia coli törzset hidroxil-aminnal kezelt pS2 plazmiddal transzformáltuk, és a sejteket ampicillint tartalmazó szilárd táptalajra kentük, miáltal körülbelül 10 000 transzformáns telepet kaptunk. Ezeket folyékony tápközegben szuszpendáltuk, majd a szuszpenziót az aszparaginsav analógjaként (a minimális gátlókoncentrációhoz közeli mennyiségben) 3bróm-piroszőlősavat (3BP), aszpartát^-hidroxamátot (AHX), aszpartát^-hidrazidot (AHY) vagy DL-treo-βhidroxi-aszpartátot (βΗΑ) tartalmazó táptalajra kentük, csészénként 103—105 sejtmennyiségben, és a növekvő telepeket szelektáltuk.
Az így kapott 100 (analóg vegyületre rezisztens) törzsből előállított foszfo-enolpiruvát-karboxilázt a The Journal of Biochemistryben (67. évfolyam, 4. szám, 1970) leírt eljárás szerint részlegesen tisztítottuk, és vizsgáltuk az enzimaktivitás analóg vegyületek által történő gátlását. Az enzimaktivitás mérését a fentebb leírtakkal azonos módon végeztük.
A plazmidokat olyan mutáns enzimeket termelő baktériumtörzsekből izoláltuk, amelyeket az analóg vegyületek nem gátoltak, és az izolált plazmidokat a PCR1 Escherichia coli foszfo-enolpiruvát-karboxilázhiányos törzsbe vittük be (Sabe, H. és munkatársai, Gene, 31, 279-283,1984), hogy igazoljuk a mutáns enzimek termelődését.
Ilyen módon öt transzformánst kaptunk, melyek mutáns enzimgént tartalmaztak. A mutáns gének bázisszekvenciájának meghatározásával megállapítottuk, hogy két törzs azonos mutációval rendelkezett, és összesen négyféle mutáns gént kaptunk. A mutáns géneket tartalmazó transzformánsokat AJ12907, AJ12908, AJ12909 és AJ12910 jelöléssel azonosítottuk, és ezeket 1993. augusztus 3-án a National Institute of Bioscience and Humán Technology of Agency of Industrial Science and Technologynél (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japán; postai irányítószám: 305) FERNt P-13774, FERM P-13775, FERM P-13776, illetve FERM P-13777 deponálási számon helyeztük letétbe, és 1994. július 11-én, a Budapest Szerződés értelmében FERM BP-4734, FERM BP-4735, FERM BP-4736, illetve FERM BP-4737 deponálási számon nemzetközi letétbe helyeztük át. Az e törzsek által hordozott plazmidokat az előbbi sorrendben pBP5, pHA19, pBP122, illetve PR6 jelöléssel azonosítottuk. A plazmidokban lévő foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén mutációit a II. táblázatban mutatjuk be. A táblázatban feltüntetett exponens értékek az 1. számú szekvenciának megfelelő nukleotidés aminosavsorszámokat jelzik.
11. táblázat
Transzformáns Plazmid Mutáció A mutációval kapcsolatos aminosavcsere
AJ13907 pBP5 2109G-»A 625Glu->Lys
AJ12908 pHA19 ‘^'G—>A »’G+A 222Arg-»His 223Glu-»Lys
AJ12909 pBP122 109í>C->T iioig->A 1889G->A 2646G->A 288Ser—>Phe 289Glu-»Lys 551Met->IIe 804Glu->Lys
AJ12910 pR6 2835Q—>A 867Ala->Thr
HU 219 600 Β
A szelekciót az AJ12907 és AJ12909 transzformáns esetében 500 pg/ml 3BP-t tartalmazó tápközegben, az AJ12908 transzformáns esetében 1000 pg/ml βΗΑ-t tartalmazó tápközegben, míg az AJ12910 transzformáns esetében 500 pg/ml AHY-t tartalmazó tápközegben végeztük.
2. példa
Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz
Az előző példában említett négy transzformáns által termelt foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aszparaginsavra mutatott érzékenységét vizsgáltuk. Ezek a baktériumtörzsek nem tartalmaznak a gazdából származó foszfoenolpiruvát-karboxiláz-gént, így a termelődött foszfoenolpiruvát-karboxiláz a plazmidból származik.
Az aszparaginsavra mutatott érzékenységet ismert eljárás szerint vizsgáltuk (Yoshinaga, T., ízűi, K. és Katsuki, H., J. Biochem., 68, 747-750,1970). Az említett transzformánsok, illetve a pS2 plazmidot tartalmazó Escherichia coli sejtek által termelt enzimaktivitás 0,1 mM, illetve 1 mM acetil-koenzim A jelenlétében (melyről ismert, hogy aktivitásmérési rendszerben befolyásolja az aktivitást) végzett mérésével az aszparaginsavra mutatott érzékenységre a 9. és 10. ábrán látható eredményeket kaptuk.
Az eredmények alapján nyilvánvaló, hogy a vad típusú enzim nagy koncentrációjú aszparaginsav jelenlétében elveszíti aktivitását, míg a találmány szerinti mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz lényegében folyamatosan megtartja aktivitását.
3. példa
Az L-treonin fermentációs előállítása bevitt mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázzal rendelkező Escherichia coli alkalmazásával
A jelenleg ismert treonintermelő Escherichia coli baktériumok közül a B-3996 törzs (3-501682 számú japán szabadalom, PCT) rendelkezik a legnagyobb termelékenységgel. Ilyenformán a mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz értékeléséhez a B-3996 törzset alkalmaztuk gazdasejtként. A B-3996 törzset a Research Institute fór Genetics and Industrial Microorganism Breedingnél RIA 1867 deponálási számon helyezték letétbe. Az értékelni kívánt mutáns foszfo-enolpiruvátkarboxilázként a pPB5-öt választottuk ki, és ezt alkalmaztuk a kísérletekben.
A mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gént tartalmazó pBP5 plazmidot Hanahan eljárása szerint (J. Mól. Bioi., 106, 577, 1983) Escherichia coli B-3996 törzsbe vittük be, és transzformánst izoláltunk. Kontrollként Escherichia coli B-3996 törzset azonos módon pS2 plazmiddal (amely a vad típusú foszfo-enolpiruvátkarboxiláz-gént expresszálja) transzformáltunk.
Az Escherichia coli B-3996 törzset, illetve az abból származó transzformánsokat 500 ml-es Sakaguchilombikban 20 ml tápközegbe (összetételét lásd III. táblázat) helyeztük, 37 °C-on 40 óra hosszat tenyésztettük, és vizsgáltuk a termelődött L-treonin mennyiségét. A kapott eredményeket a IV. táblázatban foglaljuk össze. Az említett tápközeget két részre osztottuk: a glükóz és a
MgSO4-7 H2O, illetve a többi komponens alkotta részre, amelyek pH-ját kálium-hidroxiddal 7,0-re állítottuk be, majd 10 percig 115 °C-on autoklávoztuk, és összekeverésük után a külön sterilizált kalcium-karbonátot 30 g/dm3 mennyiségben adtuk az elegyhez.
III. táblázat
Komponens Elegyítési koncentráció (g/dm3)
Glükóz 40
(NH4)2SO4 16
kh2po4 1
MgSO4-7H2O 1
FeSO4-7H2O 0,01
MnSO4-5H2O 0,01
Élesztőkivonat (Difco) 2
L-Met 0,5
Kalcium-karbonát 30
IV. táblázat
Baktériumtörzs Treonintermelés mennyisége (g/dm3)
Escherichia coli B-3996 15,7
Escherichia coli B-3996/pS2 15,8
Escherichia coli B-3996/PBP5 16,8
Az eredmények alapján jól látható, hogy a találmány szerinti DNS-szekvenciával rendelkező mutáns enzimexpressziós plazmidot tartalmazó Escherichia coli B-3996/pBP5 törzs a vad típusú enzimet expresszáló plazmidot tartalmazó Escherichia coli B-3996/pS2 törzshöz képest fokozott treonintermelő képességet mutat.
4. példa
Az L-glutaminsav fermentációs előállítása bevitt mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázzal rendelkező Escherichia coli alkalmazásával
A jelenleg ismert glutaminsavtermelő Escherichia coli baktériumok közül az Escherichia coli AJ-12628 törzs (lásd 4-11461 számú japán szabadalom) rendelkezik a legnagyobb termelékenységgel. Ilyenformán, a mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz értékeléséhez ezt a törzset alkalmaztuk gazdasejtként.
Az AJ-12628 törzset a National Institute of Bioscience and Humán Technology of Agency of Industrial Science and Technologynál FERM BP-385 deponálási számon helyezték letétbe. Az értékelni kívánt mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázként a pBP5 plazmidot választottuk ki.
A mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gént tartalmazó pBP5 plazmidot Hanahan eljárása szerint (J. Mól. Bioi., 106, 577, 1983) Escherichia coli AJ-12628 törzsbe vittük be, és transzformánst izoláltunk. Hasonló
HU 219 600 Β módon, pS2 plazmidot tartalmazó Escherichia coli AJ-12628 transzformánst is izoláltunk.
Az Escherichia coli AJ-12628 törzset, illetve az abból származó transzformánsokat 500 ml-es Sakaguchilombikban 20 ml tápközegbe (összetételét lásd V. táblázat) helyeztük, 37 °C-on 36 óra hosszat tenyésztettük, és vizsgáltuk a termelődött L-glutaminsav mennyiségét. A kapott eredményeket a VI. táblázatban foglaljuk össze. Az említett tápközeget két részre osztottuk; glükóz és MgSO4-7 H2O, illetve a többi komponens alkotta részre, melyek pH-ját kálium-hidroxiddal 7,0-re állítottuk be, majd 10 percig 115 °C-on autoklávoztuk, és összekeverésük után a külön sterilizált kalcium-karbonátot 30 g/dm3 mennyiségben adtuk az elegyhez.
V. táblázat
Komponens Elegyítési koncentráció (g/dm3)
Glükóz 40
(NH4)2so4 16
kh2po4 1
MgSO4-7H2O 1
FeSO4-7H2O 0,01
MnSO4-5H2O 0,01
Élesztőkivonat (Difco) 2
Kalcium-karbonát 30
VI. táblázat
Baktériumtörzs Treonintcrmelés mennyisége (g/dm3)
Escherichia coli AJ-12628 18,0
Escherichia coli AJ-12628/pS2 18,3
Escherichia coli AJ-12628/pBP5 19,6
Az eredményekből jól látható, hogy a találmány szerinti DNS-szekvenciával rendelkező mutáns enzimexpressziós plazmidot tartalmazó Escherichia coli AJ- 12628/pBP5 törzs a vad típusú enzimet expresszáló plazmidot tartalmazó Escherichia coli AJ-12628/pS2 törzshöz képest javított glutaminsavtermelő képességet mutat.
5. példa
Expressziós plazmid előállítása coryneform baktériumokhoz (és L-lizin előállítása bevitt mutáns foszfoenolpiruvát-karboxilázzal rendelkező coryneform baktérium alkalmazásával)
Annak érdekében, hogy egy coryneform baktériumba mutáns gént vigyünk be, és azt expresszáljuk, egy Brevibacterium nemzetségbe tartozó baktériumból származó promotert nyertünk ki, amit expressziós plazmid előállítása érdekében a mutáns génnel ligáltunk. A kapott plazmid az L-lizin termelése érdekében Brevibacterium nemzetségbe tartozó baktériumba vihető be.
(1) Brevibacterium nemzetségbe tartozó baktériumból származó aszpartokináz (AK)-gén előállítása
Szokványos eljárással egy vad Brevibacterium lactofermentum (Corynebacterium glutamicum) törzsből (ATCC 13869) kromoszomális DNS-t készítettünk. Ebből a kromoszomális DNS-ből polimeráz-láncreakcióval (PCR; lásd White, T. J. és munkatársai, Trends Génét., 5, 185,1989) AK-gént amplifikáltunk. Az amplifikációban DNS-primerként egy 23-mer oligonukleotidot (3. számú szekvencia) és egy 21-mer oligonukleotidot (4. számú szekvencia) szintetizáltunk, hogy a Corynebacterium glutamicumban ismert szekvencia alapján [lásd Molecular Microbiology, 5 (5), 1197-1204, 1991; és Mól. Gén. Génét., 224, 317-324, 1990] egy körülbelül 1643 bp hosszúságú, AK-gént kódoló régiót amplifikáljunk.
A DNS-szintézist 380B DNS-szintetizátor (Applied Biosystems Co.) alkalmazásával a szokványos foszforamidit-eljárás alapján végeztük (lásd Tetrahedron Letters, 22, 1859, 1981). A PCR-reakcióhoz DNS Thermal Cycler PJ2000 típusú PCR-készüléket (Takara Shuzo Co., Ltd.) alkalmaztunk, és a génamplifikációt Taq polimeráz alkalmazásával, a gyártó útmutatásai szerint végeztük.
Agarózgél-elektroforézissel 1643 kb-os amplifikált génfragmenst azonosítottunk, majd a gélről kivágott fragmenst hagyományos eljárással tisztítottuk, és Nrul (Takara Shuzo Co., Ltd.) és EcoRI (Takara Shuzo Co., Ltd.) restrikciós enzimekkel hasítottuk. A génfragmens klónozóvektoraként pHSG399-et (lásd Takeshita, S. és munkatársai, Gene, 61, 63-74, 1987) alkalmaztunk. Ezt a vektort Smal (Takara Shuzo Co., Ltd.) és EcoRI restrikciós enzimekkel hasítottuk, és az amplifikált AK-gén-fragmenssel ligáltuk.
A DNS-t DNS-ligáló készlet (Takara Shuzo Co., Ltd.) alkalmazásával ligáltuk. A ligálás során olyan plazmidot állítottunk elő, amelyben a pHSG399 vektort a Brevibacterium kromoszómából amplifikált AK-génfragmenssel ligáltuk. Az ATCC 13869 deponálási számú (vad) törzsből származó AK-génnel rendelkező plazmidot p399AKY-nak neveztük el.
(2) A Brevibacterium lactofermentum AK-génje bázisszekvenciájának meghatározása
A p399AKY plazmid előállítása után Sanger és munkatársai eljárása szerint (F. Sanger és munkatársai, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74, 5463,1977) meghatároztuk az AK-gén bázissorrendjét. A szekvenálás eredményét az 5. és 7. számú szekvenciákban mutatjuk be. A DNSfragmensek két nyitott leolvasási kerettel rendelkeznek, amelyek az AK α-, illetve β-alegységének felelnek meg. Az 5. és 7. számú szekvenciában a nyitott leolvasási kereteknek megfelelő aminosavszekvenciákat a nukleotidszekvenciákkal együtt tüntetjük fel, míg a 6. és 8. számú szekvenciában a nyitott leolvasási kereteknek megfelelő aminosavszekvenciákat önmagukban mutatjuk be.
(3) Foszfo-enolpiruvát-karboxiláz expressziós plazmid előállítása
A vad típusú foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gént tartalmazó pS2 plazmidból, és a mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gént tartalmazó pBP5 plazmidból körülbelül 4,4 kb-os Sáli fragmenst vontunk ki, és ezt a
HU 219 600 Β fragmenst az Escherichia colihoz általánosan alkalmazott pHSG399 plazmidvektor Sáli helyére inszertáltuk. A kapott plazmidokat pHS2-nek (vad típus) és pHBP5nek (mutáns) neveztük el.
Annak érdekében, hogy a pHS2 és pHB5 plazmidot Brevibacteriumban expresszálható plazmiddá alakítsuk, Brevibacteriumban működőképes promotert és replikációs kezdőhelyet adtunk hozzájuk. Promoterként a bázisszekvencia 1. Nrul helyétől a 207. ApaLI helyéig teijedő ffagmensét tartalmazó génfragmenst (melyről feltételeztük, hogy a klónozott AK-gén promoterrégiója) hasítottuk ki a p399AKY plazmidból, és ezt a pHS2 és a pHBP5 strukturális génjei előtt körülbelül 60 bp távolságban lévő Aval helyre inzertáltuk, hogy a transzkripció szabályos irányban történjen.
Ezután a vektorba olyan génfragmenst építettünk be (nevezetesen a plazmid replikációs kezdőhelyét), amely lehetővé teszi a plazmid Brevibacteriumban történő autonóm replikációját. A plazmid replikációs kezdőhelyét tartalmazó génfragmenst a Brevibacteriumhoz alkalmazható pHC4 vektorból vontuk ki (lásd 5-7491 számú japán szabadalom, 10. szakasz; az ugyanezen plazmidot tartalmazó Escherichia coli AJ12039 törzset a National Institute of Bioscience and Humán Technology of Agency of Industrial Science and Technologynál FERM P-12215 deponálási számon helyeztük letétbe), és a restrikciós enzimes hasítási helyeket linkerek bevitelével mindkét terminálison PstI helyekre változtattuk.
Ezt a fragmenst a Brevibacteriumbol származó promoterrel együtt a plazmid vektorrészében lévő PstI helyre vittük be. A pS2-ből származó vad típusú foszfoenolpiruvát-karboxiláz-plazmidot pHS2B-nek, a pBP5ből származó mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázplazmidot pedig pHBP5B-nek neveztük el.
(4) L-lizin előállítása foszfo-enolpiruvát-karboxiláz expressziós plazmid alkalmazásával (referenciapélda)
A pHS2B és pHBP5B plazmidot külön-külön Llizint termelő Brevibacterium lactofermentum AJ3463 törzsbe (lásd 51-34477 számú japán közrebocsátási irat) vittük be. A gén beviteléhez elektromos impulzust alkalmazó transzformációs eljárást használtunk (lásd 2-207791 számú japán szabadalom). A gazdatörzset és a transzformánsokat 31,5 °C-on 72 óra hosszat keverve lizintermelő tápközegben (összetételét lásd VII. táblázat) tenyésztettük. A tápközeget úgy állítottuk elő, hogy a táblázatban felsorolt komponenseket, a kalciumkarbonát kivételével, 1 dm3 vízhez adtuk, és az oldat pH-ját kálium-hidroxiddal 8,0-ra állítottuk be, majd a hővel sterilizált kalcium-karbonátot is hozzáadtuk az oldathoz. Az tápközegben a tenyésztés után felhalmozódott L-lizin mennyiségét a VIII. táblázatban mutatjuk be.
VII. táblázat
Komponens Elegyítést koncentráció
Glükóz 100 g/dm3
(NH4)2SO4 55 g/dm3
Komponens Elegyítést koncentráció
Szójabab-koncentrátum* 35 ml/dm3
KH2PO4 1 g/dm3
MgSO4-7H20 1 g/dm3
Β,-vitamin 20 g/dm3
Biotin 5 g/dm3
Nikotinsavamid 5 mg/dm3
FeSO4-7H2O 0,01 g/dm3
MnSO4-5H20 0,01 g/dm3
CaCO3 50 g/dm3
* Az Ajinomoto Co., Ltd. terméke (márkanév: Mamenou).
Vili. táblázat
Baktériumtörzs Lizintermelés (g/dm3)
Brevibacterium lactofermentum AJ3463 20,0
Brevibacterium lactofermentum AJ3463/pHS2B 22,0
Brevibacterium lactofermentum AJ3463/pHBP5B 25,0
Az eredményekből látható, hogy a találmány szerinti DNS-szekvenciát tartalmazó, mutáns enzimexpressziós plazmiddal rendelkező Brevibacterium lactofermentum AJ3463/pHBP5B törzs a vad típusú enzimet expresszáló plazmidot tartalmazó Brevibacterium lactofermentum AJ3463/pHS2B törzshöz képest javított lizintermelő képességet mutat.
6. példa
A találmány szerinti mutáns foszfo-enolpiruvátkarboxiláz és az ezt kódoló gén (1)Λ mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén előállítása
A mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódoló DNS előállításához pT2 plazmidba klónozott foszfoenolpiruvát-karboxiláz-gént alkalmaztunk.
A pT2 plazmidot tartalmazó gazdaként előnyösen olyan mikroorganizmust alkalmazunk, amelyből hiányzik a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén, hogy csak a plazmidból származó foszfo-enolpiruvát-karboxilázaktivitást detektáljuk. Ilyen deficiens törzsként Escherichia coli FI5 törzset [Hfr, recAl, met, delta(ppcargECBH), TnlO] alkalmaztunk. A pT2 plazmidot tartalmazó Escherichia coli AJ-12873 törzset a National Institute of Bioscience and Humán Technology of Agency of Industrial Science and Technologynál (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken. Japán; postai irányítószám: 305) FERM P-13752 deponálási számon 1993. július 15-én helyeztük letétbe, illetve 1994.
HU 219 600 Β július 11-én, a Budapest Szerződés értelmében FERM BP-4732 deponálási számon nemzetközi letétbe helyeztük át. A pT2 teljes bázisszekvenciáját az 1. számú szekvenciában mutatjuk be.
Annak érdekében, hogy a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz 438. argininjét kódoló kodont pT2 plazmid alkalmazásával ciszteint kódoló kodonra cseréljük, polimeráz-láncreakció (PCR) felhasználásával az átfedőextenzió-eljárást (Ho, S. N., Hunt, H. D., Horton, R. M., Pulién, J. K. és Pease, L. R., Gene, 77, 51-59,1989) alkalmaztuk.
A PCR-technika olyan eljárás, melyben amplifikációs ciklusokat ismétlünk. A ciklusok során melegítéssel kétszálú DNS-t egyszálú DNS-sé denaturálunk, a hővel denaturált DNS-t az amplifikálni kívánt szekvencia két végének megfelelő oligonukleotid-primerekkel hibridizáljuk, és a fentebb említett oligonukleotidokat printerekként alkalmazva polimeráz-láncreakciót végzünk, miáltal exponenciális növekedéssel a fentebb említett DNS-szekvenciát amplifikáljuk.
All. ábrán PCR-technika alkalmazásával helyspecifikus mutációval módosított régiót mutatunk be. A találmányban négy prímért alkalmaztunk; a 438. arginin kodonja környékén elhelyezkedő szekvenciával rendelkező „c” prímért (11. számú szekvencia, amely az 1. számú szekvenciában az 1535-1554. bázisoknak felel meg); a „c” printerrel komplementer szekvenciával rendelkező „b” prímért (10. számú szekvencia); az előbbitől 5’-irányban elhelyezkedő szekvenciával rendelkező „a” prímért (9. számú szekvencia, amely az 1. számú szekvenciában az 1185-1200. bázisoknak felel meg), valamint egy 3'-szekvenciával komplementer „d” prímért (12. számú szekvencia, amely az 1. számú szekvenciában a 2327-2342. bázisoknak felel meg).
A „b” és „c” printerben a 438. arginin kodonját (CGT) ciszteint kódoló kodonnal (TGT) helyettesítettük (a helyettesítést TGC kodonnal is végezhetjük, amely szintén a ciszteint kódolja). Ezenkívül a 435. aszparagin kodonjának (AAC) citozinját (C) timinnel (T) helyettesítettük, miáltal aminosavcsere nélkül egy belső EcoRI helyet vittünk be, melynek indexként való alkalmazásával szelektálható a mutáns plazmid. Ez a mutáció azonban a találmány szempontjából nem kulcsfontosságú.
Amikor a PCR-reakciót templátként pT2 DNS, primerekként pedig „a” és „b” primer alkalmazásával végeztük, a mutációs helytől 5'-irányban kezdődő és a mutációs helyig húzódó fragmenst (all. ábrán az AB ffagmens) amplifikáltunk. Ha a PCR-reakciót a „c” és „d” primer alkalmazásával végeztük, a mutációs helytől 3'-irányban elhelyezkedő fragmenst (a 11. ábrán CD fragmens) amplifikáltunk. Amikor a hődenaturálás után valamennyi amplifikált terméket (AB, CD) ismét hibridizáltuk, a fragmensek egy fragmenssé ligálódtak (11. ábra, AD fragmens). A PCR-reakciót 30 ciklus ismétlésével végeztük, melynek során 94 °C-on 1 perces melegítés után denaturálást (94 °C, 1,5 perc), hibridizálást (50 °C, 2 perc), és polimerázzal elongációt (72 °C, 3,5 perc) végeztünk. A reakcióelegyek összetételét a IX. táblázatban mutatjuk be.
IX. táblázat
Összetétel (): végkoncentráció PCR-fragmens
AB CD AD
H2O 53,5 53,5 53,5
10-szeres reakciópuffer 10 10 10
1,25 mM dNTP-elegy 16 16 16
20 μΜ „a” primer (ΙμΜ) 5 - 5
20 μΜ „b” primer (ΙμΜ) 5 - -
20 μΜ „c” primer (ΙμΜ) - 5 -
20 μΜ „d” primer (1 μΜ) - 5 5
10 pg/μΙ pT2 (0,1 pg) 10 10 -
AB PCR-ffagmens* - - 5
CD PCR-fragmens* - - 5
2,5 egység/μΐ Taq polimeráz 0,5 0,5 0,5
Összesen 100 μΐ 100 μΐ 100 μΐ
* Az AB és CD PCR-fragmenst úgy kaptuk meg, hogy a PCR-reakció után poliakrilamid gélről mindkettőből 10-10 μΐ-t kinyertünk, és ezeket 5 μΐ TE pufferben [10 mM Tris-HCl (pH=8,0), 1 mM EDTA (pH=8,0)] feloldottuk.
A fenti módon kapott AD fragmensben az upstream (5’-) oldalon egy BssHII hely (az 1. számú szekvenciában az 1231-1236. nukleotidok), a downstream (3’-) oldalon pedig egy SplI hely (az 1. számú szekvenciában a 22 249-2254. nukleotidok) volt jelen, így ezekkel az enzimekkel teljes emésztést végeztünk, hogy az kapott fragmenssel a pT2 plazmid megfelelő régióját helyettesítsük (11. ábra).
(2) A gátlással szemben deszenzibilizált foszfoenolpiruvát-karboxiláz kiválasztása
Escherichia colit a fentiek szerint előállított plazmiddal transzformáltunk, és a transzformált törzset tenyésztettük, hogy EcoRI enzimmel hasított plazmid kiválasztásához plazmidot nyerjünk ki. A kiválasztott DNS-t illetően, didezoxieljárással meghatároztuk a fentebb leírt PCR-eljárással amplifikált régió bázisszekvenciáját, hogy meggyőződjünk arról, hogy a kívánt báziscserét sikerült megvalósítani. Ezt a plazmidot pT2R438C-nek neveztük el. Az e plazmid bevitelével kapott Escherichia coli F15 törzset (AJ12874) a National Institute of Bioscience and Humán Technology of Agency of Industrial Science and Technologynál (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japán; postai irányítószám: 305) FERM P-13753 deponálási számon 1993. július 15-én helyeztük letétbe, illetve 1994. július 11-én, a Budapest Szerződés értelmében FERM BP-4733 deponálási számon nemzetközi letétbe helyeztük át.
HU 219 600 Β
A pT2R438C plazmid bázisszekvenciájában az 1. számú szekvencia 1541. és 1550. nukleotidjait citozinról timinre cseréltük.
(3) A mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aszparaginsav által kiváltott gátlása deszenzibilizálásának igazolása
A fentebb említett, pT2R438C plazmidot tartalmazó Escherichia coli AJ12874 törzs által termelt foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aszparaginsavra mutatott érzékenységét vizsgáltuk. Mivel az Escherichia coli FI5 nem tártál- 10 máz foszfo-enolpiruvát-karboxilázt, az AAJ12874 törzs által termelt foszfo-enolpiruvát-karboxiláz a plazmidból származik.
Az aszparaginsavra mutatott érzékenységet ismert eljárással vizsgáltuk (Yoshinaga, T., ízűi, K. és Katsuki,
H., J. Biochem., 68, 747-750,1970). Az enzimaktivitás 1 mM, illetve 2 mM acetil-koenzim A jelenlétében (melyről ismert, hogy aktivitásmérési rendszerben befolyásolja az aktivitást) végzett mérésével az aszparaginsavra mutatott érzékenységre a 12. ábrán látható eredmé- 20 nyékét kaptuk.
Az eredmények alapján nyilvánvaló, hogy a vad típusú enzim nagy koncentrációjú aszparaginsav jelenlétében elveszíti aktivitását, míg a találmány szerinti mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz lényegében folyama- 25 tosan megtartja aktivitását.
(4) Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén előállítása (11)
Annak érdekében, hogy a pT2 plazmidban lévő foszfo-enolpiruvát-karboxiláz-gén 620. lizint kódoló ko- 30 donját szerint kódoló kodonnal helyettesítsük, PCRreakció alkalmazásával az átfedőextenzió-eljárást (Ho,
S. N., Hunt, H. D., Horton, R. M., Pulién, J. K. és Pease, L. R., Gene, 77, 51-59, 1989) használtuk.
A konkrét eljárást az (1) pontban leírtak szerint végez- 35 tűk. A kívánt báziscserét tartalmazó mutáns génnel rendelkező plazmidot pT2K620S-nek neveztük el.
(5) A mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aszparaginsav által kiváltott gátlása deszenzibilizálásának igazolása
A pT2K620S plazmid fentebb említett Escherichia coli FI5 törzsbe történő bevitelével előállított transzformáns által termelt foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aszparaginsavra mutatott érzékenységét vizsgáltuk. Amint fentebb említettük, mivel az Escherichia coli F15 nem 45 tartalmaz foszfo-enolpiruvát-karboxilázt, a transzformáns által termelt foszfo-enolpiruvát-karboxiláz a plazmidból származik.
Az aszparaginsavra mutatott érzékenységet ismert eljárással vizsgáltuk (Yoshinaga, T., ízűi, K. és Katsuki, H. J. Biochem., 68, 47-50, 1970). Az enzimaktivitás 1 mM, illetve 2 mM acetil-koenzim A jelenlé5 tében (melyről ismert, hogy aktivitásmérési rendszerben befolyásolja az aktivitást) végzett mérésével az aszparaginsavra mutatott érzékenységre a 13. ábrán látható eredményeket kaptuk.
Az eredmények szerint nyilvánvaló, hogy a vad típusú enzim nagy koncentrációjú aszparaginsav jelenlétében elveszíti aktivitását, míg a találmány szerinti mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz lényegében folyamatosan megtartja aktivitását.
A 13. ábrán az aszparaginsavra mutatott érzékenysé15 get két mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz esetében is ábrázoltuk; az egyikben a 650. lizint szerin helyettesíti (K650A mutáns enzim), míg a másikban a 491. lizin helyén áll szerin (K491A mutáns enzim). E mutáns enzimek az aszparaginsav által kiváltott gátlással szemben nem deszenzibilizálódtak.
Nagyüzemi alkalmazhatóság
A találmány szerinti DNS-szekvencia mutáns foszfoenolpiruvát-karboxilázt kódol, s az e DNS-szekvenciát tartalmazó mikroorganizmusok ezt az enzimet termelik.
A találmány szerinti mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz aktivitását az aszparaginsav nem gátolja jelentős mértékben, így felhasználható olyan aminosavak fermentációs termeléséhez, amelyek bioszintézisét az aszparaginsav és hasonlók szabályozzák. SZEKVENCIALISTA
SZEKVENCIÁK SZÁMA: 12 TUDNIVALÓK AZ 1. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ:
(i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 5186 (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁL: kétszálú (D) ALAK: cirkuláris (ii) MOLEKULA TÍPUSA: genom-DNS és vektor-DNS (iii) HIPOTETIKUS: nem (iv) ANTISZENSZ: nem (vi) EREDETI FORRÁS (A) ORGANIZMUS: Escherichia coli (ix) SAJÁTOS JELLEGZETESSÉG:
(A) NÉV/KÓD: kódolószekvencia/CDS (B) ELHELYEZKEDÉS: 237.. .2888 (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 1. SZÁMÚ SZEKVENCIA:
TCGACCGGCG ATTTTTTAAC ATTTCCATAA GTTACGCTTA TTTAAAGCGT CGTGAATTTA 60 ATGACGTAAA TTCCTGCTAT TTATTCGTTT GCTGAAGCGA TTTCGCAGCA TTTGAOGTCA 120 CCGCTTTTAC GTGGCTTTAT AAAAGACGAC GAAAAGCAAA GOOCGAGCAT ATTCGCGCCA 180 ATGCGACGTG AAGGATACAG GGCTATCAAA CGATAAGATG GGGTGTCTGG GGTAAT 236 ATG AAC GAA CAA TAT TOC GCA TTG CGT AGT AAT GTC AGT ATG CTC GGC 284 Met Asn Glu Gin Tyr Ser Alá Leu Arg Ser Asn Val Ser Met Leu Gly
10 15
HU 219 600 Β
AAA GTG CTG GGA GAA ACC ATC AAG GAT GCG TTG GGA GAA CAC ATT CTT 332
Lys Val Leu Gly Glu Thr Ile Lys Asp Alá Leu Gly Glu His Ile Leu
20 25 30
GAA CGC GTA GAA ACT ATC CGT AAG TTG TCG AAA TCT TCA CGC GCT GGC 380
Glu Arg Val Glu Thr Ile Arg Lys Leu Ser Lys Ser Ser Arg Alá Gly
35 40 45
AAT GAT GCT AAC CGC CAG GAG TTG CTC ACC ACC TTA CAA AAT TTG TCG 428
Asn Asp Alá Asn Arg Gin Glu Leu Leu Thr Thr Leu Gin Asn Leu Ser
50 55 60
AAC GAC GAG CTG CTG OCC GTT GCG CGT GCG TTT AGT CAG TTC CTG AAC 476
Asn Asp Glu Leu Leu Pro Val Alá Arg Alá Phe Ser Gin Phe Leu Asn
65 70 75 80
CTG GÓC AAC ACC GCC GAG CAA TAC CAC AGC ATT TCG CCG AAA GGC GAA 524
Leu Alá Asn Thr Alá Glu Gin Tyr His Ser Ile Ser Pro Lys Gly Glu
85 90 95
GCT GCC AGC AAC CCG GAA GTG ATC GCC CGC ACC CTG CGT AAA CTG AAA 572
Alá Alá Ser Asn Pro Glu Val Ile Alá Arg Thr Leu Arg Lys Leu Lys
100 105 110
AAC CAG CCG GAA CTG AGC GAA GAC ACC ATC AAA AAA GCA GTG GAA TCG 620
Asn Gin Pro Glu Leu Ser Glu Asp Thr Ile Lys Lys Alá Val Glu Ser
115 120 125
CTG TCG CTG GAA CTG GTC CTC AGG GCT CAC CCA ACC GAA ATT ACC CGT 668
Leu Ser Leu Glu Leu Val Leu Thr Alá His Pro Thr Glu Ile Thr Arg
130 135 140
CGT ACA CTG ATC CAC AAA ATG GTG GAA GTG AAC GCC TGT TTA AAA CAG 716
Arg Thr Leu Ile His Lys Met Val Glu Val Asn Alá Cys Leu Lys Gin
145 150 155 160
CTC GAT AAC AAA GAT ATC GCT GAC TAC GAA CAC AAC CAG CTG ATG CGT 764
Leu Asp Asn Lys Asp Ile Alá Asp Tyr Glu His Asn Gin Leu Met Arg
165 170 175
CGC CTG CGC CAG TTG ATC GCC CAG TCA TGG CAT ACC GAT GAA ATC CGT 812
Arg Leu Arg Gin Leu Ile Alá Gin Ser Trp His Thr Asp Glu Ile Arg
180 185 190
AAG CTG CGT CCA AGC CCG GTA GAT GAA GCC AAA TGG GGC TTT GCC GTA 860
Lys Leu Arg Pro Ser Pro Val Asp Glu Alá Lys Trp Gly Phe Alá Val
195 200 205
GTG GAA AAC AGC CTG TGG CAA GGC GTA CCA AAT TAC CTG CGC GAA CTG 908
Val Glu Asn Ser Leu Trp Gin Gly Val Pro Asn Tyr Leu Arg Glu Leu
210 215 220
AAC GAA CAA CTG GAA GAG AAC CTC GGC TAC AAA CTG OCC GTC GAA TTT 956
Asn Glu Gin Leu Glu Glu Asn Leu Gly Tyr Lys Leu Pro Val Glu Phe
225 230 235 240
GTT CCG GTC CGT TTT ACT TCG TGG ATG GGC GGC GAC CGC GAC GGC AAC 1004
Val Pro Val Arg Phe Thr Ser Trp Met Gly Gly Asp Arg Asp Gly Asn
245 250 255
CCG AAC GTC ACT GCC GAT ATC ACC CGC CAC GTC CTG CTA CTC AGC CGC 1052
Pro Asn Val Thr Alá Asp Ile Thr Arg His Val Leu Leu Leu Ser Arg
260 265 270
HU 219 600 Β
TGG AAA GCC ACC GAT TTG TTC CTG AAA GAT ATT CAG GTG CTG GTT TCT 1100
Trp Lys Alá 275 Thr Asp Leu Phe Leu 280 Lys Asp Ile Gin Val 285 Leu Val Ser
GAA CTG TCG ATG GTT GAA GCG ACC CCT GAA CTG CTG GCG CTG GTT GGC 1148
Glu Leu 290 Ser Met Val Glu Alá 295 Thr Pro Glu Leu Leu 300 Alá Leu Val Gly
GAA GAA GGT GCC GCA GAA CCG TAT CGC TAT CTG ATG AAA AAC CTG CGT 1196
Glu 305 Glu Gly Alá Alá Glu 310 Pro Tyr Arg Tyr Leu 315 Met Lys Asn Leu Arg 320
TCT CGC CTG ATG GCG ACA CAG GCA TGG CTG GAA GCG CGC CTG AAA GGC 1244
Ser Arg Leu Met Alá 325 Thr Gin Alá Trp Leu 330 Glu Alá Arg Leu Lys 335 Gly
GAA GAA CTG CCA AAA CCA GAA GGC CTG CTG ACA CAA AAC GAA GAA CTG 1292
Glu Glu Leu Pro 340 Lys Pro Glu Gly Leu 345 Leu Thr Gin Asn Glu 350 Glu Leu
TGG GAA CCG CTC TAC GCT TGC TAC CAG TCA CTT CAG GCG TGT GGC ATG 1340
Trp Glu Pro 355 Leu Tyr Alá Cys Tyr 360 Gin Ser Leu Gin Alá 365 Cys Gly Met
GGT ATT ATC GCC AAC GGC GAT CTG CTC GAC ACC CTG CGC CGC GTG AAA 1388
Gly Ile 370 Ile Alá Asn Gly Asp 375 Leu Leu Asp Thr Leu 380 Arg Arg Val Lys
TGT TTC GGC GTA CCG CTG GTC OGT ATT GAT ATC CGT CAG GAG AGC ACG 1436
Cys 385 Phe Gly Val Pro Leu 390 Val Arg Ile Asp Ile 395 Arg Gin Glu Ser Thr 400
OGT CAT ACC GAA GCG CTG GGC GAG CTG ACC CGC TAC CTC GGT ATC GGC 1484
Arg Kis Thr Glu Alá 405 Uett Gly Glu Leu Thr 410 Arg Tyr Leu Gly Ile 415 Gly
GAC TAC GAA AGC TGG TCA GAG GCC GAC AAA CAG GCG TTC CTG ATC CGC 1532
Asp Tyr Glu Ser 420 Trp Ser Glu Alá Asp 425 Lys Gin Alá Phe Leu 430 Ile Arg
GAA CTG AAC TOC AAA CGT CCG CTT CTG CCG CGC AAC TGG CAA CCA AGC 1580
Glu Leu Asn 435 Ser Lys Arg Pro Leu 440 Leu Pro Arg Asn Trp 445 Gin Pro Ser
GCC GAA ACG CGC GAA GTG CTC GAT ACC TGC CAG GTG ATT GCC GAA GCA 1628
Alá Glu 450 Thr Arg Glu Val Leu 455 Asp Thr Cys Gin Val 460 Ile Alá Glu Alá
CCG CAA GGC TCC ATT GÓC GCC TAC GTG ATC TCG ATG GCG AAA ACG CCG 1676
Pro 465 Gin Gly Ser Ile Alá 470 Alá Tyr Val Ile Ser 475 Met Alá Lys Thr Pro 480
TCC GAC GTA CTG GCT GTC CAC CTG CTG CTG AAA GAA GCG GGT ATC GGG 1724
Ser Asp Val Leu Alá 485 Val His Leu Leu Leu 490 Lys Glu Alá Gly Ile 495 Gly
TTT GCG ATG CCG GTT GCT CCG CTG TTT GAA ACC CTC GAT GAT CTG AAC 1772
Phe Alá Met Pro 500 Val Alá Pro Leu Phe 505 Glu Thr Leu Asp Asp 510 Leu Asn
HU 219 600 Β
AAC GÓC AAC GAT GTC ATG AOC CAG CTG CTC AAT ATT GAC TGG TAT CGT 1820
Asn Alá Asn Asp Val Met Thr Gin Leu Leu Asn lle Asp Trp Tyr Arg
515 520 525
GGC CTG ATT CAG GGC AAA CAG ATG GTG ATG ATT GGC TAT TCC GAC TCA 1868
Gly Leu lle Gin Gly Lys Gin Met Val Met lle Gly Tyr Ser Asp Ser
530 535 540
GCA AAA GAT GCG GGA GTG ATG GCA GCT TCC TGG GCG CAA TAT CAG GCA 1916
Alá Lys Asp Alá Gly Val Met Alá Alá Ser Trp Alá Gin Tyr Gin Alá
545 550 555 560
CAG GAT GCA TTA ATC AAA ACC TGC GAA AAA GCG GGT ATT GAG CTG ACG 1964
Gin Asp Alá Leu lle Lys Thr Cys Glu Lys Alá Gly lle Glu Leu Thr
565 570 575
TTG TTC CAC GGT CGC GGC GGT TCC ATT GGT CGC GGC GGC GCA CCT GCT 2012
Leu Phe His Gly Arg Gly Gly Ser lle Gly Arg Gly Gly Alá Pro Alá
580 585 590
CAT GCG GCG CTG CTG TCA CAA CCG CCA GGA AGC CTG AAA GGC GGC CTG 2060
HÍS Alá Alá Leu Leu Ser Gin Pro Pro Gly Ser Leu Lys Gly Gly Leu
595 600 605
CGC GTA ACC GAA CAG GGC GAG ATG ATC CGC TTT AAA TAT GGT CTG CCA 2108
Arg Val Thr Glu Gin Gly Glu Met He Arg Phe Lys Tyr Gly Leu Pro
610 615 620
GAA ATC AOC GTC AGC AGC CTG TCG CTT TAT ACC GGG GCG ATT CTG GAA 2156
Glu lle Thr Val Ser Ser Leu Ser Leu Tyr Thr Gly Alá lle Leu Glu
625 630 635 640
GÓC AAC CTG CTG CCA CCG OCG GAG CCG AAA GAG AGC TGG CGT CGC ATT 2204
Alá Asn Leu Leu Pro Pro Pro Glu Pro Lys Glu Ser Trp Arg Arg lle
645 650 655
ATG GAT GAA CTG TCA GTC ATC TCC TGC GAT GTC TAC CGC GGC TAC GTA 2252
Met Asp Glu Leu Ser Val lle Ser Cys Asp Val Tyr Arg Gly Tyr Val
660 665 670
CGT GAA AAC AAA GAT TTT GTG CCT TAC TTC CGC TCC GCT ACG CCG GAA 2300
Arg Glu Asn Lys Asp Phe Val Pro Tyr Phe Arg Ser Alá Thr Pro Glu
675 680 685
CAA GAA CTG GGC AAA CTG OCG TTG GGT TCA CGT CCG GCG AAA CGT CGC 2348
Gin Glu Leu Gly Lys Leu Pro Leu Gly Ser Arg Pro Alá Lys Arg Arg
690 695 700
CCA ACC GGC GGC CTC GAG TCA CTA CGC GCC ATT CCG TGG ATC TTC GCC 2396
Pro Thr Gly Gly Val Glu Ser Leu Arg Alá lle Pro Trp lle Phe Alá
705 710 715 720
TGG ACG CAA AAC CGT CTG ATG CTC OCC GCC TGG CTG GGT GCA GGT ACG 2444
Trp Thr Gin Asn Arg Leu Met Leu Pro Alá Trp Leu Gly Alá Gly Thr
725 730 735
GCG CTG CAA AAA GTG GTC GAA GAC GGC AAA CAG AGC GAG CTG GAG GCT 2492
Alá Leu Gin Lys Val Val Glu Asp Gly Lys Gin Ser Glu Leu Glu Alá
740 745 750
ATG TGC CGC GAT TGG CCA TTC TTC TCG ACG CGT CTC GGC ATG CTG GAG 2540
Met Cys Arg Asp Trp Pro Phe Phe Ser Thr Arg Leu Gly Met Leu Glu
755 760 765
HU 219 600 Β
ATG GTC TTC GCC AAA GCA GAC CTG TGG CTG GCG GAA TAC TAT GAC CAA 2588
Met Val 770 Phe Alá Lys Alá Asp 775 Leu Trp Leu Alá Glu Tyr 780 Tyr Asp Gin
CGC CTG GTA GAC AAA GCA CTG TGG CCG TTA GGT AAA GAG TTA CGC AAC 2636
Arg Leu Val Asp Lys Alá Leu Trp Pro Leu Gly Lys Glu Leu Arg Asn
785 790 795 800
CTG CAA GAA GAA GAC ATC AAA GTG GTG CTG GCG ATT GCC AAC GAT TCC 2684
Leu Gin Glu Glu Asp Ile Lys Val Val Leu Alá Ile Alá Asn Asp Ser
805 810 815
CAT CTG ATG GCC GAT CTG CCG TGG ATT GCA GAG TCT ATT CAG CTA CGG 2732
Hls Leu Met Alá Asp Leu Pro Trp Ile Alá Glu Ser Ile Gin Leu Arg
820 825 830
AAT ATT TAC ACC GAC CCG CTG AAC GTA TTG CAG GCC GAG TTG CTG CAC 2780
Asn Ile Tyr Thr Asp Pro Leu Asn Val Leu Gin Alá Glu Leu Leu Hls
835 840 845
CGC TCC CGC CAG GCA GAA AAA GAA GGC CAG GAA CCG GAT CCT CGC GTC 2828
Arg Ser Arg Gin Alá Glu Lys Glu Gly Gin Glu Pro Asp Pró Arg Val
850 855 860
GAA CAA GCG TTA ATG GTC ACT ATT GCC GGG ATT GCG GCA GGT ATG CGT 2876
Glu Gin Alá Leu Met Val Thr Ile Alá Gly Ile Alá Alá Gly Met Arg
865 870 875 880
AAT ACC GGC TAATCTTCCT CTTCTGCAAA COCTCGTGCT TTTGOGCGAG 2925
Asn Thr Gly
GGTTTTCTGA AATACTTCTG TTCTAACAOC CTCGTTTTCA ATATATTTCT GTCTGCATTT 2985 TATTCAAATT CTGAATATAC CTTCAGATAT CCTTAAGGGC CTCGTGATAC GCCTATTTTT 3045 ATAGGTTAAT GTCATGATAA TAATGGTTTC TTAGACGTCA GGTGGCACTT TTOGGGGAAA 3105 TGTGOGCGGA AOCCCTATTT GTTTATTTTT CTAAATACAT TCAAATATGT ATCCGCTCAT 3165 GAGACAATAA CCCTGATAAA TGCTTCAATA ATATTGAAAA AGGAAGAGTA TGAGTATTCA 3225 ACATTTCOGT GTCGCCCTTA TTOCCTTTTT TGOGGCATTT TGCCTTCCTG TTTTTGCTCA 3285 CCCAGAAACG CTGGTGAAAG TAAAAGATGC TGAAGATCAG TTGGGTGCAC GAGTGGGTTA 3345 CATCGAACTG GATCTCAACA GOGGTAAGAT CCTTGAGAGT TTTCGCCCCG AAGAACGTTT 3405 TCCAATGATG AGCACTTTTA AAGTTCTGCT ATGTGGCGCG GTATTATCCC GTATTGACGC 3465 CGGGCAAGAG CAACTOGGTC GCOGCATACA CTATTCTCAG AATGACTTGG TTGAGTACTC 3525 ACCAGTCACA GAAAAGCATC TTAOGGATGG CATGACAGTA AGAGAATTAT GCAGTGCTGC 3585 CATAACCATG AGTGATAACA CTGCGGCCAA CTTACTTCTG ACAACGATCG GAGGACCGAA 3645 GGAGCTAACC GCTTTTTTGC ACAACATGGG GGATCATGTA ACTCGCCTTG ATCGTTGGGA 3705 ACCGGAGCTG AATGAAGCCA TACCAAACGA CGAGCGTGAC ACCACGATGC CTGTAGCAAT 3765 GGCAACAACG TTGCGCAAAC TATTAACTGG CGAACTACTT ACTCTAGCTT CCCGGCAACA 3825 ATTAATAGAC TGGATGGAGG CGGATAAAGT TGCAGGACCA CTTCTGCGCT CGGCCCTTCC 3885 GGCTGGCTGG TTTATTGCTG ATAAATCTGG AGCCGGTGAG CGTGGGTCTC GOGGTATCAT 3945 TGCAGCACTG GGGCCAGATG GTAAGCCCTC CCGTATCGTA GTTATCTACA CGACGGGGAG 4005 TCAGGCAACT ATGGATGAAC GAAATAGACA GATCGCTGAG ATAGGTGCCT CACTGATTAA 4065 GCATTGGTAA CTGTCAGACC AAGTTTACTC ATATATACTT TAGATTGATT TAAAACTTCA 4125 TTTTTAATTT AAAAGGATCT AGGTGAAGAT CCTTTTTGAT AATCTCATGA CCAAAATCCC 4185 TTAACGTGAG TTTTCGTTCC ACTGAGCGTC AGAOOCCGTA GAAAAGATCA AAGGATCTTC 4245 TTGAGATCCT TTTTTTCTGC GCGTAATCTG CTGCTTGCAA ACAAAAAAAC CAOCGCTACC 4305 AGCGGTGGTT TGTTTGCCGG ATCAAGAGCT ACCAACTCTT TTTCCGAAGG TAACTGGCTT 4365 CAGCAGAGOG CAGATAOCAA ATACTGTCCT TCTAGTGTAG OCGTAGTTAG GCCACCACTT 4425
HU 219 600 Β
CAAGAACTCT GTAGCACCGC CTACATACCT CGCTCTGCTA ATCCTGTTAC CAGTGGCTGC 4485 TGCCAGTGGC GATAAGTCGT GTCTTACCGG GTTGGACTCA AGACGATAGT TACCGGATAA 4545
GGOGCAGOQG TCGGGCTGAA OGGGGGGTTC GTGCACACAG CCCAGCTTGG AGCGAACGAC 4605 CTACACCGAA CTGAGATACC TACAGCGTGA GCATTGAGAA AGCGCCACGC TTCCCGAAGG 4665 GAGAAAGGCG GACAGGTATC CGGTAAGCGG CAGGGTCGGA ACAGGAGAGC GCACGAGGGA 4725 GCTTCCAGGG GGAAACGCCT GGTATCTTTA TAGTCCTGTC GGGTTTCGCC ACCTCTGACT 4785 TGAGCGTCGA TTTTTGTGAT GCTCGTCAGG GGGGCGGAGC CTATGGAAAA ACGCCAGCAA 4845 CGCGGCCTTT TTAOGGTTCC TGGCCTTTTG CTGGCCTTTT GCTCACATGT TCTTTCCTGC 4905 GTTATCCCCT GATTCTGTGG ATAAOCGTAT TACCGCCTTT GAGTGAGCTG ATAOCGCTOG 4965 CCGCAGCCGA ACGACCGAGC GCAGCGAGTC AGTGAGCGAG GAAGCGGAAG AGCGCCCAAT 5025 ACGCAAAOOG CCTCTCCCCG OGOGTTGGOC GATTCATTAA TGCAGAAGGG TTGGTTTGCG 5085 CATTCACAGT TCTCCGCAAG AATTGATTGG CTCCAATTCT TGGAGTGGTG AATCCGTTAG 5145 CGAGGTGCCG CCGGCTTCCA TTCAGGTCGA GGTGGCCCGG G 5186
TUDNIVALÓK A 2. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ: 20 (D) ALAK: lineáris (i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK: (ii) MOLEKULA TÍPUSA: protein (A) HOSSZÚSÁG: 883 aminosav (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 2. SZÁMÚ SZEK-
(B) TÍPUS: aminosav VENCIA:
Met Asn 1 Glu Gin Tyr Ser Alá Leu Arg 5 Ser Asn Val Ser Met Leu Gly 10 15
Lys Val Leu Gly Glu Thr Ile Lys Asp 20 25 Alá Leu Gly Glu His Ile Leu 30
Glu Arg Val Glu Thr Ile Arg Lys Leu 35 40 Ser Lys Ser Ser Arg Alá Gly 45
Asn Asp 50 Alá Asn Arg Gin Glu Leu Leu 55 Thr Thr Leu Gin Asn Leu Ser 60
Asn Asp 65 Glu Leu Leu Pro Val Alá Arg 70 Alá Phe Ser Gin Phe Leu Asn 75 80
Leu Alá Asn Thr Alá Glu Gin Tyr His 85 Ser Ile Ser Pro Lys Gly Glu 90 95
Alá Alá Ser Asn Pro Glu Val Ile Alá 100 105 Arg Thr Leu Arg Lys Leu Lys 110
Asn Gin Pro Glu Leu Ser Glu Asp Thr 115 120 Ile Lys Lys Alá Val Glu Ser 125
Leu Ser 130 Leu Glu Leu Val Leu Thr Alá 135 His Pro Thr Glu Ile Thr Arg 140
Arg Thr 145 Leu Ile His Lys Met Val Glu 150 Val Asn Alá Cys Leu Lys Gin 155 160
Leu Asp Asn Lys Asp Ile Alá Asp Tyr 165 Glu His Asn Gin Leu Met Arg 170 175
Arg Leu Arg Gin Leu Ile Alá Gin Ser Trp His Thr Asp Glu Ile Arg 180 185 190
Lys Leu Arg Pro Ser Pro Val Asp Glu Alá Lys Trp Gly Phe Alá Val 195 200 205
Val Glu Asn Ser Leu Trp Gin Gly Val Pro Asn Tyr Leu Arg Glu Leu 210 215 220
HU 219 600 Β
Asn Glu Gin Leu Glu Glu Asn Leu Gly Tyr Lys Leu Pro Val Glu Phe
225 230 235 240
Val Pro Val Arg Phe Thr Ser Trp Met Gly Gly Asp Arg Asp Gly Asn
245 250 255
Pro Asn Val Thr Alá Asp Ile Thr Arg His Val Leu Leu Leu Ser Arg
260 265 270
Trp Lys Alá Thr Asp Leu Phe Leu Lys Asp Ile Gin Val Leu Val Ser
275 280 285
Glu Leu Ser Met Val Glu Alá Thr Pro Glu Leu Leu Alá Leu Val Gly
290 295 300
Glu Glu Gly Alá Alá Glu Pro Tyr Arg Tyr Leu Met Lys Asn Leu Arg
305 310 315 320
Ser Arg Leu Met Alá Thr Gin Alá Trp Leu Glu Alá Arg Leu Lys Gly
325 330 335
Glu Glu Leu Pro Lys Pro Glu Gly Leu Leu Thr Gin Asn Glu Glu Leu
340 345 350
Trp Glu Pro Leu Tyr Alá Cys Tyr Gin Ser Leu Gin Alá Cys Gly Met
355 360 365
Gly He ile Alá Asn Gly Asp Leu Leu Asp Thr Leu Arg Arg Val Lys
370 375 380
Cys Phe Gly Val Pro Leu Val Arg Ile Asp Ile Arg Gin Glu Ser Thr
385 390 395 400
Arg His Thr Glu Alá Leu Gly Glu Leu Thr Arg Tyr Leu Gly Ile Gly
405 410 415
Asp Tyr Glu Ser Trp Ser Glu Alá Asp Lys Gin Alá Phe Leu Ile Arg
420 425 430
Glu Leu Asn Ser Lys Arg Pro Leu Leu Pro Arg Asn Trp Gin Pro Ser
435 440 445
Alá Glu Thr Arg Glu Val Leu Asp Thr Cys Gin Val Ile Alá Glu Alá
450 455 460
Pro Gin Gly Ser Ile Alá Alá Tyr Val Ile Ser Met Alá Lys Thr Pro
465 470 475 480
Ser Asp Val Leu Alá Val His Leu Leu Leu Lys Glu Alá Gly Ile Gly
485 490 495
Phe Alá Met Pro Val Alá Pro Leu Phe Glu Thr Leu Asp Asp Leu Asn
500 505 510
Asn Alá Asn Asp Val Met Thr Gin Leu Leu Asn Ile Asp Trp Tyr Arg
515 520 525
Gly Leu Ile Gin Gly Lys Gin Met Val Met Ile Gly Tyr Ser Asp Ser
530 535 540
Alá Lys Asp Alá Gly Val Met Alá Alá Ser Trp Alá Gin Tyr Gin Alá
545 550 555 560
Gin Asp Alá Leu Ile Lys Thr Cys Glu Lys Alá Gly Ile Glu Leu Thr
565 570 575
Leu Phe His Gly Arg Gly Gly Ser Ile Gly Arg Gly Gly Alá Pro Alá
580 585 590
His Alá Alá Leu Leu Ser Gin Pro Pro Gly Ser Leu Lys Gly Gly Leu
595 600 605
HU 219 600 Β
Arg Val Thr Glu Gin Gly Glu Met Ile Arg Phe Lys Tyr Gly Leu Pro
610 615 620
Glu He Thr Val Ser Ser Leu Ser Leu Tyr Thr Gly Alá Ile Leu Glu
625 630 635 640
Alá Asn Leu Leu Pro Pro Pro Glu Pro Lys Glu Ser Trp Arg Arg Ile
645 650 655
Met Asp Glu Leu Ser Val Ile Ser Cys Asp Val Tyr Arg Gly Tyr Val
660 665 670
Arg Glu Asn Lys Asp Phe Val Pro Tyr Phe Arg Ser Alá Thr Pro Glu
675 680 685
Gin Glu Leu Gly Lys Leu Pro Leu Gly Ser Arg Pro Alá Lys Arg Arg
690 695 700
Pro Thr Gly Gly Val Glu Ser Leu Arg Alá Ile Pro Trp Ile Phe Alá
705 710 715 720
Trp Thr Gin Asn Arg Leu Met Leu Pro Alá Trp Leu Gly Alá Gly Thr
725 730 735
Alá Leu Gin Lys Val Val Glu Asp Gly Lys Gin Ser Glu Leu Glu Alá
740 745 750
Met Cys Arg Asp Trp Pro Phe Phe Ser Thr Arg Leu Gly Met Leu Glu
755 760 765
Met Val Phe Alá Lys Alá Asp Leu Trp Leu Alá Glu Tyr Tyr Asp Gin
770 775 780
Arg Leu Val Asp Lys Alá Leu Trp Pro Leu Gly Lys Glu Leu Arg Asn
785 790 795 800
Leu Gin Glu Glu Asp Ile Lys Val Val Leu Alá Ile Alá Asn Asp Ser
805 810 815
His Leu Met Alá Asp Leu Pro Trp Ile Alá Glu Ser Ile Gin Leu Arg
820 825 830
Asn Ile Tyr Thr Asp Pro Leu Asn Val Leu Gin Alá Glu Leu Leu His
835 840 845
Arg Ser Arg Gin Alá Glu Lys Glu Gly Gin Glu Pro Asp Pro Arg Val
850 855 860
Glu Gin Alá Leu Met Val Thr Ile Alá Gly Ile Alá Alá Gly Met Arg
865 870 875 880
Asn Thr Gly
TUDNIVALÓK A 3. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ:
(i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 23 (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁL: egyszálú 50 (D) ALAK: lineáris (ii) MOLEKULA TÍPUSA: szintetikus DNS (iii) HIPOTETIKUS: nem (xi) SZÉKVENCIALEÍRAS: 3. SZÁMÚ SZEKVENCIA: 55
TCGCGAAGTA GCACCTGTCA CTT 23
TUDNIVALÓK A 4. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ:
(i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 21 (B) TÍPUS: nukleinsav 60 (C) SZÁL: egyszálú (D) ALAK: lineáris (ii) MOLEKULA TÍPUSA: szintetikus DNS (iii) HIPOTETIKUS: nem (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 4. SZÁMÚ SZÉK VENCIA:
ACGGAATTCA ATCTTACGGC C 21
TUDNIVALÓK AZ 5. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ:
(i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 1643 (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁL: kétszálú (D) ALAK: lineáris (ii) MOLEKULA TÍPUSA: genom-DNS (iii) HIPOTETIKUS: nem
HU 219 600 Β (iv) ANTISZENSZ: nem (vi) EREDETI FORRÁS:
(A) ORGANIZMUS: Corynebacterium glutamicum (C) TÖRZS: ATCC 13869 5 (ix) SAJÁTOS JELLEGZETESSÉG:
(A) NÉV/KÓD: érett peptid (B) ELHELYEZKEDÉS: 217...1482 (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 5. SZÁMÚ SZEKVENCIA:
TCGCGAAGTA GCACCTGTCA CTTTTGTCTC AAATATTAAA TCGAATATCA ATATACGGTC TGTTTATTGG AAOGCATOOC AGTGGCTGAG ACGCATCCGC TAAAGCOOCA GGAAOCCTGT GCAGAAAGAA AACACTCCTC TGGCTAGGTA GACACAGTTT ATAAAGGTAG AGTTGAGCGG GTAACTGTCA GCACGTAGAT CGAAAGGTGC ACAAAG GTG GÓC CTG GTC GTA CAG
Met Alá Leu Val Val Gin 1 5
AAA TAT GGC GGT TCC TCG CTT GAG AGT GCG GAA CGC ATT AGA AAC GTC
Lys Tyr Gly Gly Ser Ser Leu 10 Glu Ser Alá Glu Arg 15 lle Arg Asn Val 20
GCT GAA CGG ATC GTT GCC ACC AAG AAG GCT GGA AAT GAT GTC GTG GTT
Alá Glu Arg lle Val Alá Thr 25 Lys Lys Alá Gly Asn 30 Asp Val Val Val 35
GTC TGC TCC GCA ATG GGA GAC ACC ACG GAT GAA CTT CTA GAA CTT GCA
Val Cys 40 Ser Alá Met Gly Asp 45 Thr Thr Asp Glu Leu 50 Leu Glu Leu Alá
GCG GCA GTG AAT CCC GTT CCG CCA GCT OGT GAA ATG GAT ATG CTC CTG
Alá Alá 55 Val Asn Pro Val Pro 60 Pro Alá Arg Glu Met 65 Asp Met Leu Leu 70
ACT GCT GGT GAG CGT ATT TCT AAC GCT CTC GTC GÓC ATG GCT ATT GAG
Thr Alá Gly Glu Arg lle Ser 75 Asn Alá Leu Val Alá 80 Met Alá lle Glu 85
TCC CTT GGC GCA GAA GCT CAA TCT TTC ACT GGC TCT CAG GCT GGT GTG
Ser Leu Gly Alá Glu Alá Gin 90 Ser Phe Thr Gly Ser 95 Gin Alá Gly Val 100
CTC ACC ACC GAG CGC CAC GGA AAC GCA CGC ATT GTT GAC GTC ACA CCG
Leu Thr Thr Glu Arg His Gly Asn Alá Arg lle Val Asp Val Thr Pro
GGT OGT GTG CGT GAA GCA CTC GAT GAG GGC AAG ATC TGC ATT GTT GCT
Gly Arg 120 Val Arg Glu Alá Leu 125 Asp Glu Gly Lys lle 130 cys He Val Alá
GGT TTT CAG GGT GTT AAT AAA GAA ACC CGC GAT GTC ACC ACG TTG GGT
Gly Phe 135 Gin Gly Val Asn Lys 140 Glu Thr Arg Asp Val 145 Thr Thr Leu Gly 150
CGT GGT GGT TCT GAC ACC ACT GCA GTT GCG TTG GCA GCT GCT TTG AAC
Arg Gly Gly Ser Asp Thr Thr 155 Alá Val Alá Leu Alá 160 Alá Alá Leu Asn 165
GCT GAT GTG TGT GAG ATT TAC TCG GAC GTT GAC GGT GTG TAT ACC GCT
Alá Asp Val Cys Glu lle Tyr 170 Ser Asp Val Asp Gly 175 Val Tyr Thr Alá 180
GAC CCG CGC ATC GTT CCT AAT GCA CAG AAG CTG GAA AAG CTC AGC TTC
Asp Pro Arg lle Val Pro Asn 185 Alá Gin Lys Leu Glu 190 Lys Leu Ser Phe 195
GAA GAA ATG CTG GAA CTT GCT GCT GTT GGC TCC AAG ATT TTG GTG CTG
GlU Glu 200 Met Leu Glu Leu Alá 205 Alá Val Gly Ser Lys 210 lle Leu Val Leu
120
180
234
282
330
378
426
474
522
570
618
666
714
762
810
858
HU 219 600 Β
CGC AGT GTT GAA TAC GCT CGT GCA TTC AAT GTG CCA CTT CGC GTA CGC 906
Arg 215 Ser Val Glu Tyr Alá 220 Arg Alá Phe Asn Val Pro Leu Arg Val Arg 225 230
TCG TCT TAT AGT AAT GAT CCC GGC ACT TTG ATT GCC GGC TCT ATG GAG 954
Ser Ser Tyr Ser Asn Asp 235 Pro Gly Thr Leu Ile Alá Gly Ser Met Glu 240 245
GAT ATT CCT GTG GAA GAA GCA GTC CTT ACC GGT GTC GCA ACC GAC AAG 1002
Asp Ile Pro Val 250 Glu Glu Alá Val Leu Thr Gly Val Alá Thr Asp Lys 255 260
TCC GAA GCC AAA GTA ACC GTT CTG GGT ATT TCC GAT AAG CCA GGC GAG 1050
Ser Glu Alá Lys 265 Val Thr Val Leu Gly Ile Ser Asp Lys Pro Gly Glu 270 275
GCT GCC AAG GTT TTC CGT GCG TTG GCT GAT GCA GAA ATC AAC ATT GAC 1098
Alá Alá Lys Val 280 Phe Arg Alá 285 Leu Alá Asp Alá Glu Ile Asn Ile Asp 290
ATG GTT CTG CAG AAC GTC TCC TCT GTG GAA GAC GGC ACC ACC GAC ATC 1146
Met 295 Val Leu Gin Asn Val 300 Ser Ser Val Glu Asp Gly Thr Thr Asp Ile 305 310
AGG TTC ACC TGC CCT CGC GCT GAC GGA CGC CGT GCG ATG GAG ATC TTG 1194
Thr Phe Thr Cys Pro Arg 315 Alá Asp Gly Arg Arg Alá Met Glii Ile Leu 320 325
AAG AAG CTT CAG GTT CAG GGC AAC TGG ACC AAT GTG CTT TAC GAC GAC 1242
Lys Lys Leu Gin 330 Val Gin Gly Asn Trp Thr Asn Val Leu Tyr Asp Asp 335 340
CAG GTC GGC AAA GTC TCC ere GTG GGT GCT GGC ATG AAG TCT CAC CCA 129G
Gin Val Gly Lys 345 Val Ser Leu Val Gly Alá Gly Met Lys Ser His Pro 350 355
GGT GTT ACC GCA GAG TTC ATG GAA GCT CTG CGC GAT GTC AAC GTG AAC 1338
Gly Val Thr Alá 360 Glu Phe Met 365 Glu Alá Leu Arg Asp Val Asn Val Asn 370
ATC GAA TTG ATT TCC ACC TCT GAG ATC CGC ATT TCC GTG CTG ATC CGT 1386
Ile 375 Glu Leu Ile Ser Thr 380 Ser Glu Ile Arg Ile Ser Val Leu Ile Arg 385 390
GAA GAT GAT CTG GAT GCT GCT GCA CGT GCA TTG CAT GAG CAG TTC CAG 1434
Glu Asp Asp Leu Asp Alá 395 Alá Alá Arg Alá Leu His Glu Gin Phe Gin 400 405
CTG Leu GGC GGC GAA Gly Gly Glu 410 GAC GAA Asp Glu GCC Alá GTC GTT TAT GCA GGC ACC GGA CGC TAA Val Val Tyr Alá Gly Thr Gly Arg 415 420 1482
AGTTTTAAAG GAGTAGTTTT ACAATGACCA TCGGCCAGGT TATGCGCACC CTTTTGGAAG TCTTTGCTTC CCCGCGTTCC GCAGGCCGTA
CCATCGCAGT
AGCGCAATTT
AGATTGAATT
TGTTGGTQCA ACCGGCCAGG CCCAGCTGAC ACTGTTCGTT C
1542
1602
1643
HU 219 600 Β
TUDNIVALÓK A 6. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ: (D) ALAK: lineáris (i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK: (ii) MOLEKULA TÍPUSA: protein (A) HOSSZÚSÁG: 421 aminosav (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 6. SZÁMÚ SZÉK (B) TÍPUS: aminosav VENCIA:
Met 1 Alá Leu Val Val Gin Lys Tyr Gly Gly Ser Ser Leu Glu Ser Alá
5 10 15
Glu Arg Ile Arg Asn Val Alá Glu Arg Ile Val Alá Thr Lys Lys Alá
20 25 30
Gly Asn Asp Val Val Val Val Cys Ser Alá Met Gly Asp Thr Thr Asp
35 40 45
Glu Leu Leu Glu Leu Alá Alá Alá Val Asn Pro Val Pro Pro Alá Arg
50 55 60
Glu Met Asp Met Leu Leu Thr Alá Gly Glu Arg Ile Ser Asn Alá Leu
65 70 75 80
Val Alá Met Alá Ile Glu Ser Leu Gly Alá Glu Alá Gin Ser Phe Thr
85 90 95
Gly Ser Gin Alá Gly Val Leu Thr Thr Glu Arg His Gly Asn Alá Arg
100 105 110
Ile Val Asp Val Thr Pro Gly Arg Val Arg Glu Alá Leu Asp Glu Gly
115 120 125
Lys Ile Cys Ile Val Alá Gly Phe Gin Gly Val Asn Lys Glu Thr Arg
130 135 140
Asp Val Thr Thr Leu Gly Arg Gly Gly Ser Asp Thr Thr Alá Val Alá
145 150 155 160
Leu Alá Alá Alá Leu Asn Alá Asp Val Cys Glu Ile Tyr Ser Asp Val
165 170 175
Asp Gly Val Tyr Thr Alá Asp Pro Arg Ile Val Pro Asn Alá Gin Lys
180 185 190
Leu Glu Lys Leu Ser Phe Glu Glu Met Leu Glu Leu Alá Alá Val Gly
195 200 205
Ser Lys Ile Leu Val Leu Arg Ser Val Glu Tyr Alá Arg Alá Phe Asn
210 215 220
Val Pro Leu Arg Val Arg Ser Ser Tyr Ser Asn Asp Pro Gly Thr Leu
225 230 235 240
Ile Alá Gly Ser Met Glu Asp Ile Pro Val Glu Glu Alá Val Leu Thr
245 250 255
Gly Val Alá Thr Asp Lys Ser Glu Alá Lys Val Thr Val Leu Gly Ile
260 265 270
Ser Asp Lys Pro Gly Glu Alá Alá Lys Val Phe Arg Alá Leu Alá Asp
275 280 285
Alá Glu Ile Asn Ile Asp Met Val Leu Gin Asn Val Ser Ser Val Glu
290 295 300
Asp Gly Thr Thr Asp Ile Thr Phe Thr Cys Pro Arg Alá Asp Gly Arg
305 310 315 320
Arg Alá Met Glu Ile Leu Lys Lys Leu Gin Val Gin Gly Asn Trp Thr
325 330 335
Asn Val Leu Tyr Asp Asp Gin Val Gly Lys Val Ser Leu Val Gly Alá
340 345 350
HU 219 600 Β
Gly Met Lys Ser His Pro Gly Val Thr Alá Glu Phe Met Glu Alá Leu 355 360 365
Arg Asp Val Asn Val Asn Ile Glu Leu Ile Ser Thr Ser Glu Ile Arg 370 375 380
Ile Ser Val Leu Ile Arg Glu Asp Asp Leu Asp Alá Alá Alá Arg Alá
385 390 395 400
Leu His Glu Gin Phe Gin Leu Gly Gly Glu Asp Glu Alá Val Val Tyr
405 410 415
Alá Gly Thr Gly Arg
420
TUDNIVALÓK A 7. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ: 15 (i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 1643 (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁL: kétszálú (D) ALAK: lineáris 20 (ii) MOLEKULA TÍPUSA: genom-DNS (iv) ANTISZENSZ: nem (vi) EREDETI FORRÁS:
(A) ORGANIZMUS : Corynebacterium glutamicum (C) TÖRZS: ATCC 13869 (ix) SAJÁTOS JELLEGZETESSÉG:
(A) NÉV/KÓD: érett peptid (B) ELHELYEZKEDÉS: 964...1482 (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 7. SZÁMÚ SZEKVENCIA:
TCGCGAAGTA GCACCTGTCA CTTTTGTCTC AAATATTAAA TCGAATATCA ATATAOGGTC 60 TGTTTATTGG AACGCATCCC AGTGGCTGAG ACGCATCCGC TAAAGCCCCA GGAAOCCTGT 120 GCAGAAAGAA AACACTCCTC TGGCTAGGTA GACACAGTTT ATAAAGGTAG AGTTGAGCGG 180 GTAACTGTCA GCACGTAGAT CGAAAGGTGC ACAAAGGTGG CCCTGGTCGT ACAGAAATAT 240 GGCGGTTCCT CGCTTGAGAG TGCGGAACGC ATTAGAAAOG TCGCTGAACG GATCGTTGCC 300 ACCAAGAAGG CTGGAAATGA TGTCGTGGTT GTCTGCTCOG GAATGGGAGA CACCACGGAT 360 GAACTTCTAG AACTTGCAGC GGCAGTGAAT CCCGTTCCGC CAGCTOGTGA AATGGATATG 420 CTCCTGACTG CTGGTGAGCG TA1TTCTAAC GCTCTCGTCG CCATGGCTAT TGAGTCCCTT 480 GGCGCAGAAG CTCAATCTTT CACTGGCTCT CAGGCTGGTG TGCTCACCAC CGAGCGCCAC 540 GGAAACGCAC GCATTGTTGA CGTCACACCG GGTCGTGTGC GTGAAGCACT CGATGAGGGC 600 AAGATCTGCA TTGTTGCTGG TTTTCAGGGT GTTAATAAAG AAACCCGCGA TGTCACCACG 660 TTGGGTCGTG GTGGTTCTGA CACCACTGCA GTTGCGTTGG CAGCTGCTTT GAAOGCTGAT 720 GTGTGTGAGA TTTACTOGGA OGTTGACGGT GTGTATAOOG CTGACCCGCG CATOGTTOCT 780 AATGCACAGA AGCTGGAAAA GCTCAGCTTC GAAGAAATGC TGGAACTTGC TGCTGTTGGC 840 TCCAAGATTT TGGTGCTGCG CAGTGTTGAA TACGCTCGTG CATTCAATGT GOCACTTOGC 900 GTACGCTCGT CTTATAGTAA TGATCCCGGC ACTTTGATTG OOGGCTCTAT GGAGGATATT 960 CCT GTG GAA GAA GCA GTC CTT ACC GGT GTC GCA ACC GAC AAG TCC GAA 1008
Met Glu Glu Alá Val Leu Thr Gly Val Alá Thr Asp Lys Ser Glu
1 5 10 15
GCC AAA GTA ACC GTT CTG GGT ATT TCC GAT AAG CCA GGC GAG GCT GÓC 1056
Alá Lys Val Thr Val Leu Gly Ile Ser Asp Lys Pro Gly Glu Alá Alá
20 25 30
AAG GTT TTC CGT GCG TTG GCT GAT GCA GAA ATC AAC ATT GAC ATG GTT 1104
Lys Val Phe Arg Alá Leu Alá Asp Alá Glu Ile Asn Ile Asp Met Val
35 40 45
CTG CAG AAC GTC TCC TCT GTG GAA GAC GGC ACC ACC GAC ATC ACG TTC 1152
Leu Gin Asn Val Ser Ser Val Glu Asp Gly Thr Thr Asp Ile Thr Phe
50 55 60
HU 219 600 Β
ACC TGC CCT CGC GCT GAC GGA CGC CGT GCG ATG GAG ATC TTG AAG AAG 1200
Thr Cys 65 Pro Arg Alá Asp Gly 70 Arg Arg Alá Met Glu 75 Ile Leu Lys Lys
CTT CAG GTT CAG GGC AAC TGG ACC AAT GTG CTT TAC GAC GAC CAG GTC 1248
Leu Gin Val Gin Gly Asn Trp Thr Asn Val Leu Tyr Asp Asp Gin Val
80 85 90 95
GGC AAA GTC TCC CTC GTG GGT GCT GGC ATG AAG TCT CAC CCA GGT GTT 1296
Gly Lys Val Ser Leu Val Gly Alá Gly Met Lys Ser His Pro Gly Val
100 105 110
ACC GCA GAG TTC ATG GAA GCT CTG CGC GAT GTC AAC GTG AAC ATC GAA 1344
Thr Alá Glu Phe Met Glu Alá Leu Arg Asp Val Asn Val Asn Ile Glu
115 120 125
TTG ATT TCC ACC TCT GAG ATC CGC ATT TCC GTG CTG ATC CGT GAA GAT 1392
Leu Ile Ser Thr Ser Glu Ile Arg Ile Ser Val Leu Ile Arg Glu Asp
130 135 140
GAT CTG GAT GCT GCT GCA CGT GCA TTG CAT GAG CAG TTC CAG CTG GGC 1440
ASp Leu Asp Alá Alá Alá Arg Alá Leu His Glu Gin Phe Gin Leu Gly
145 150 155
GGC GAA GAC GAA GCC GTC GTT TAT GCA GGC ACC GGA CGC TAAAGTTTTAA 1490
Gly Glu Asp Glu Alá Val Val Tyr Alá Gly Thr Gly Arg
160 165 170 172
AGGAGTAGTT TTACAATGAC CAOCATCGCA GTTGTTGGTG CAACCGGCCA GGTCGGCCAG 1550 GTTATGCGCA CCCTTTTGGA AGAGCGCAAT TTOOCAGCTG ACACTGTTCG TTTCTTTGCT 1610 TCCCCGCGTT CCGCAGGCCG TAAGATTGAA TTC 1643
TUDNIVALÓK A 8. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ: (D) ALAK: lineáris (i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK: 35 (ii) MOLEKULA TÍPUSA: protein (A) HOSSZÚSÁG: 172 aminosav (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 8. SZÁMÚ SZEK(B) TÍPUS: aminosav VENCIA:
Met Glu Glu Alá Val Leu Thr Gly Val Alá Thr Asp Lys Ser Glu Alá 15 10 15
Lys Val Thr Val Leu Gly Ile Ser Asp Lys Pro Gly Glu Alá Alá Lys 20 25 30
Val Phe Arg Alá Leu Alá Asp Alá Glu Ile Asn Ile Asp Met Val Leu 35 40 45
Gin Asn Val Ser Ser Val Glu Asp Gly Thr Thr Asp Ile Thr Phe Thr 50 55 60
Cys Pro Arg Alá Asp Gly Arg Arg Alá Met Glu Ile Leu Lys Lys Leu 65 70 75 80
Gin Val Gin Gly Asn Trp Thr Asn Val Leu Tyr Asp Asp Gin Val Gly
90 95
Lys Val Ser Leu Val Gly Alá Gly Met Lys Ser His Pro Gly Val Thr 100 105 110
Alá Glu Phe Met Glu Alá Leu Arg Asp Val Asn Val Asn Ile Glu Leu 115 120 125
HU 219 600 Β
Ile Ser Thr Ser Glu Ile Arg Ile Ser Val Leu Ile Arg Glu Asp Asp 130 135 140
Leu Asp Alá Alá Alá Arg Alá Leu His Glu Gin Phe Gin Leu Gly Gly 145 150 155 160
Glu Asp Glu Alá Val Val Tyr Alá Gly Thr Gly Arg
165 170
TUDNIVALÓK A 9. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ: 10 (i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 16 (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁL: egyszálú (D) ALAK: lineáris 15 (ii) MOLEKULA TÍPUSA: szintetikus DNS (iii) HIPOTETIKUS: nem (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 9. SZÁMÚ SZEKVENCIA:
AAAAACCTGC GTTCTC 16 20
TUDNIVALÓK A 10. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ:
(i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 20 (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁL: egyszálú 25 (D) ALAK: lineáris (ii) MOLEKULA TÍPUSA: szintetikus DNS (iii) HIPOTETIKUS: nem (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 10. SZÁMÚ SZEKVENCIA: 30
TGACTTAAG GTTTACAGGCC 20
TUDNIVALÓK A 11. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ:
(i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 20 (B) TÍPUS: nukleinsav 35 (C) SZÁL: egyszálú (D) ALAK: lineáris (ii) MOLEKULA TÍPUSA: szintetikus DNS (iii) HIPOTETIKUS: nem (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 11. SZÁMÚ SZÉK- 40 VENCIA:
ACTGAATTCC AAATGTCCGC 20
TUDNIVALÓK A 12. SZÁMÚ SZEKVENCIÁHOZ:
(i) SZEKVENCIAJELLEMZŐK:
(A) HOSSZÚSÁG: 16 45 (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁL: egyszálú (D) ALAK: lineáris (ii) MOLEKULA TÍPUSA: szintetikus DNS (iii) HIPOTETIKUS: nem 50 (xi) SZEKVENCIALEÍRÁS: 12. SZÁMÚ SZEKVENCIA:
AAGTGCAGG CCGTTT 16

Claims (14)

    SZABADALMI IGÉNYPONTOK
  1. (1) a 625. helyzetben levő glutaminsav helyett lizin, (2) a 222. helyzetben levő arginin helyett hisztidin és a 223. helyzetben levő glutaminsav helyett lizin, (3) a 288. helyzetben levő szerin helyett fenil-alanin, a 289. helyzetben levő glutaminsav helyett lizin, az 551. helyzetben levő metionin helyett izoleucin és a 804. helyzetben levő glutaminsav helyett lizin, (4) a 867. helyzetben levő alanin helyett treonin, (5) a 438. helyzetben levő arginin helyett cisztein, (6) a 620. helyzetben levő lizin helyett szerin.
    (1) a 625. helyzetben levő glutaminsavat ettől eltérő aminosavval helyettesítő mutáció, (2) a 222. helyzetben levő arginint ettől eltérő aminosavval, valamint a 223. helyzetben levő glutaminsavat ettől eltérő aminosavval helyettesítő mutáció, (3) a 288. helyzetben levő szerint ettől eltérő aminosavval, a 289. helyzetben levő glutaminsavat ettől eltérő aminosavval, az 551. helyzetben levő metionint ettől eltérő aminosavval, valamint a 804. helyzetben levő glutaminsavat ettől eltérő aminosavval helyettesítő mutáció, (4) a 867. helyzetben levő alanint ettől eltérő aminosavval helyettesítő mutáció, (5) a 438. helyzetben levő arginint ettől eltérő aminosavval helyettesítő mutáció, (6) a 620. helyzetben levő lizint ettől eltérő aminosavval helyettesítő mutáció.
    1. Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, amely az Escherichia nemzetségbe tartozó mikroorganizmusból származik, és olyan mutációval rendelkezik, amely de- 60 szenzibilizálja az enzimet az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlással szemben, és amely mutációként az alábbiak valamelyikét tartalmazza a foszfo-enolpiruvát-karboxiláz N-terminálisától számított megadott helyzetben:
  2. 2. Az 1. igénypont szerinti foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, amely mutációként az alábbi aminosavcserék valamelyikét tartalmazza:
  3. 3. DNS-fragmens, amely az 1. vagy 2. igénypont szerinti foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódolja.
  4. 4. Escherichia vagy Corynebacterium nemzetségbe tartozó mikroorganizmus, amely egy, a 3. igénypont szerinti DNS-fragmenssel, a kromoszomális DNS-be integrált formában van transzformálva.
  5. 5 hogy egy, a 8. igénypont szerinti eljárással szelektált E. coliból mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódoló DNS-fragmenst izolálunk.
    5. Rekombináns DNS, amely egy, a 3. igénypont szerinti DNS-fragmens és egy, az Escherichia vagy Corynebacterium nemzetségbe tartozó mikroorganizmus sejtjeiben autonóm replikációra képes vektor ligálásával van kialakítva.
  6. 6. Escherichia vagy Corynebacterium nemzetségbe tartozó mikroorganizmus, amely egy, az 5. igénypont szerinti rekombináns DNS-sel van transzformálva.
  7. 7. Eljárás aminosav előállítására, azzal jellemezve, hogy valamely a 4. vagy 6. igénypont szerinti mikroorganizmust alkalmas tápközegen tenyésztünk, és a tápkö27
    HU 219 600 Β zegból L-lizint, L-treonint, L-metionint, L-izoleucint, Lglutaminsavat, L-arginint vagy L-prolint különítünk el.
  8. 8. Eljárás olyan mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázt termelő E. coli szelektálására, amely az enzimet az aszparaginsav által kiváltott feedback gátlással szemben deszenzibilizáló mutációval rendelkezik, azzal jellemezve, hogy az E. colit 3-bróm-piroszőlősav, aszpartinsav-|3-hidrazid vagy DL-treo-p-hidroxi-aszpartinsav jelenlétében tenyésztjük.
  9. 9. A 8. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az 1. vagy 2. igénypont szerinti mutáns foszfoenolpiruvát-karboxilázt termelő E. colit szelektálunk.
  10. 10. Eljárás aminosav előállítására, azzal jellemezve, hogy egy, a 8. igénypont szerinti eljárással szelektált E. colit alkalmas tápközegen tenyésztünk, és a tápközegből L-lizint, L-treonint, L-metionint, L-izoleucint, Lglutaminsavat, L-arginint vagy L-prolint különítünk el.
  11. 11. Eljárás mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz előállítására, azzaljellemezve, hogy egy, a 8. igénypont szerinti eljárással szelektált E. coliból foszfo-enolpiruvátkarboxilázt különítünk el.
  12. 12. Eljárás mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázt kódoló DNS-fragmens előállítására, azzal jellemezve,
  13. 13. Eljárás mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxilázt termelő mikroorganizmus előállítására, azzal jellemezik ve, hogy egy Escherichia vagy Corynebacterium nemzetségbe tartozó mikroorganizmusba egy, a 12. igénypont szerinti eljárással előállított DNS-fragmenst viszünk be.
  14. 14. Eljárás aminosav előállítására, azzal jellemezve, 15 hogy egy, a 13. igénypont szerinti eljárással előállított mikroorganizmust alkalmas tápközegen tenyésztünk, és a tápközegből L-lizint, L-treonint, L-metionint, L-izoleucint, L-glutaminsavat, L-arginint vagy L-prolint különítünk el.
HU9600240A 1993-08-24 1994-08-17 Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, ennek génje, valamint eljárás aminosav előállítására HU219600B (hu)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP20977693 1993-08-24
JP20977593 1993-08-24
JP15387694 1994-07-05
PCT/JP1994/001365 WO1995006114A1 (fr) 1993-08-24 1994-08-17 Allele de phosphenolpyruvate carboxylase, gene de cet allele et procede de production de l'acide amine

Publications (3)

Publication Number Publication Date
HU9600240D0 HU9600240D0 (en) 1996-03-28
HUT73690A HUT73690A (en) 1996-09-30
HU219600B true HU219600B (hu) 2001-05-28

Family

ID=27320552

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU9600240A HU219600B (hu) 1993-08-24 1994-08-17 Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, ennek génje, valamint eljárás aminosav előállítására

Country Status (15)

Country Link
US (2) US5876983A (hu)
EP (1) EP0723011B1 (hu)
KR (2) KR100337959B1 (hu)
CN (1) CN1179043C (hu)
AT (1) ATE220099T1 (hu)
AU (1) AU682547B2 (hu)
BR (1) BR9407625A (hu)
CA (1) CA2169170C (hu)
CZ (1) CZ289051B6 (hu)
DE (1) DE69430919T2 (hu)
HU (1) HU219600B (hu)
MY (1) MY112250A (hu)
PL (1) PL181380B1 (hu)
SK (1) SK283369B6 (hu)
WO (1) WO1995006114A1 (hu)

Families Citing this family (73)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6969782B2 (en) 1993-10-06 2005-11-29 Ajinomoto Co., Inc. Method of producing transgenic plants having improved amino acid composition
JPH09285294A (ja) * 1996-04-23 1997-11-04 Ajinomoto Co Inc 発酵法によるl−グルタミン酸の製造法
EP1584679B1 (en) * 1997-07-18 2008-12-10 Ajinomoto Co., Inc. Method for producing purine nucleosides by fermentation
WO1999018228A2 (de) 1997-10-04 1999-04-15 Forschungszentrum Jülich GmbH Verfahren zur mikrobiellen herstellung von aminosäuren der aspartat- und/oder glutamatfamilie und im verfahren einsetzbare mittel
AU756507B2 (en) * 1998-03-18 2003-01-16 Ajinomoto Co., Inc. L-glutamic acid-producing bacterium and method for producing L-glutamic acid
ATE458040T1 (de) * 1998-04-13 2010-03-15 Univ Georgia Pyruvate carboxylase überexpression zur verstärkten produktion von oxalacetat abgeleiteten verbindungen in mikrobiellen zellen
US20030087381A1 (en) * 1998-04-13 2003-05-08 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Metabolically engineered organisms for enhanced production of oxaloacetate-derived biochemicals
WO2000039305A1 (en) * 1998-12-23 2000-07-06 Massachusetts Institute Of Technology PYRUVATE CARBOXYLASE FROM $i(CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM)
US6171833B1 (en) 1998-12-23 2001-01-09 Massachusetts Institute Of Technology Pyruvate carboxylase from corynebacterium glutamicum
US6599732B1 (en) 1999-06-29 2003-07-29 Archer-Daniels-Midland Company Regulation of carbon assimilation
KR20020015708A (ko) * 1999-06-29 2002-02-28 추후제출 탄소 동화의 조절
DE60027161D1 (de) 1999-07-02 2006-05-18 Ajinomoto Kk Für das saccharose-pts-enzym ii kodierende dna
DE19931314A1 (de) * 1999-07-07 2001-01-11 Degussa L-Lysin produzierende coryneforme Bakterien und Verfahren zur Herstellung von Lysin
WO2001027258A2 (en) * 1999-10-13 2001-04-19 The University Of Georgia Research Foundation, Inc. High yield protein expression system and methods
US6727411B2 (en) 1999-12-13 2004-04-27 Ajinomoto Co., Inc. Method of producing transgenic plants having improved amino acid composition
CN1230525C (zh) * 1999-12-24 2005-12-07 味之素株式会社 生产l-氨基酸的方法和新型基因
US6927046B1 (en) * 1999-12-30 2005-08-09 Archer-Daniels-Midland Company Increased lysine production by gene amplification using coryneform bacteria
ES2313878T3 (es) 2000-01-21 2009-03-16 Ajinomoto Co., Inc. Procedimiento para la produccion de l-lisina.
KR100397423B1 (ko) * 2001-02-13 2003-09-13 씨제이 주식회사 L-쓰레오닌의 제조방법
US7368266B2 (en) 2001-02-13 2008-05-06 Cj Corporation Method for L-threonine production
US20030115638A1 (en) * 2001-08-17 2003-06-19 Ajinomoto Co., Inc. Plants having increased amino acids content and methods for producing the same
AU2003205041A1 (en) * 2002-07-12 2004-01-29 Ajinomoto Co., Inc. Method for producing target substance by fermentation
BR0304860A (pt) * 2002-11-11 2004-08-31 Ajinomoto Kk Método para produzir uma substância alvo pela utilização de uma-bactéria pertencente ao gênero escherichia
KR100498971B1 (ko) * 2003-04-04 2005-07-04 씨제이 주식회사 염색체 내 tdcBC 및 pckA 유전자가 불활성화된 미생물 및 이를 이용하여 L-쓰레오닌을 제조하는 방법
JP2007532114A (ja) * 2004-04-09 2007-11-15 ジェネンコー・インターナショナル・インク バチルスにおけるpckA修飾および増強されたタンパク質発現
KR100768748B1 (ko) 2004-12-30 2007-10-19 씨제이 주식회사 외래의 nadp 의존적 글리세르알데히드-3-포스페이트디히드로게나제 유전자를 포함하는 에세리키아 종 또는코리네박리움 종 미생물 및 그를 이용하여 l-라이신을생산하는 방법
WO2007017710A1 (en) 2005-08-11 2007-02-15 Metabolic Explorer Process for the preparation of aspartate and derived amino acids like lysine, threonine, isoleucine, methionine, homoserine, or valine employing a microorganism with enhanced isocitrate lyase and/or malate synthase expression
WO2007086618A1 (en) 2006-01-30 2007-08-02 Ajinomoto Co., Inc. L-amino acid producing bacterium and method of producing l-amino acid
JP2009118740A (ja) 2006-03-03 2009-06-04 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸の製造法
JP2010017082A (ja) 2006-10-10 2010-01-28 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸の製造法
JP2010041920A (ja) 2006-12-19 2010-02-25 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸の製造法
JP2010515465A (ja) * 2007-01-12 2010-05-13 ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティー オブ コロラド,ア ボディー コーポレート 微生物によって生成される有機化学物質の生成に対する耐性を高めるための組成物および方法
JP2010088301A (ja) 2007-02-01 2010-04-22 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸の製造法
JP2010110216A (ja) 2007-02-20 2010-05-20 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸または核酸の製造方法
US8883453B2 (en) * 2007-04-30 2014-11-11 University Of Maryland Codon specific mutagenesis
EP2192170B1 (en) 2007-09-04 2017-02-15 Ajinomoto Co., Inc. Amino acid-producing microorganism and method of producing amino acid
US8048624B1 (en) 2007-12-04 2011-11-01 Opx Biotechnologies, Inc. Compositions and methods for 3-hydroxypropionate bio-production from biomass
JP2011067095A (ja) 2008-01-10 2011-04-07 Ajinomoto Co Inc 発酵法による目的物質の製造法
KR20100120663A (ko) 2008-01-23 2010-11-16 아지노모토 가부시키가이샤 L-아미노산의 제조법
JP5598329B2 (ja) 2008-09-08 2014-10-01 味の素株式会社 L−アミノ酸を生産する微生物及びl−アミノ酸の製造法
JP2012029565A (ja) 2008-11-27 2012-02-16 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸の製造法
CN102471790B (zh) 2009-07-29 2014-10-29 味之素株式会社 产生l-氨基酸的方法
JP2012223091A (ja) 2009-08-25 2012-11-15 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸の製造法
JP2012223092A (ja) 2009-08-28 2012-11-15 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸の製造法
GB2473755B (en) 2009-09-27 2011-09-07 Opx Biotechnologies Inc Method for producing 3-hydroxypropionic acid and other products
US8809027B1 (en) 2009-09-27 2014-08-19 Opx Biotechnologies, Inc. Genetically modified organisms for increased microbial production of 3-hydroxypropionic acid involving an oxaloacetate alpha-decarboxylase
JP2013013329A (ja) 2009-11-06 2013-01-24 Ajinomoto Co Inc L−アミノ酸の製造法
WO2011063363A2 (en) * 2009-11-20 2011-05-26 Opx Biotechnologies, Inc. Production of an organic acid and/or related chemicals
US9084467B2 (en) 2010-02-11 2015-07-21 Metabolix, Inc. Process for gamma-butyrolactone production
US9605285B2 (en) 2011-01-25 2017-03-28 Cargill, Incorporated Compositions and methods for succinate production
WO2012103263A2 (en) * 2011-01-25 2012-08-02 Finley Kenneth R Compositions and methods for malate and fumarate production
EP2495317A1 (en) 2011-03-01 2012-09-05 Technische Universität Hamburg-Harburg Modified phosphoenolpyruvate carboxylase from Corynebacterium glutamicum and uses thereof
WO2012170793A1 (en) 2011-06-08 2012-12-13 Metabolix, Inc. Biorefinery process for thf production
WO2013023140A1 (en) 2011-08-10 2013-02-14 Metabolix, Inc. Post process purification for gamma-butyrolactone production
US9850507B2 (en) 2012-07-25 2017-12-26 Cargill, Incorporated Yeast cells having reductive TCA pathway from pyruvate to succinate and overexpressing an exogenous NAD(P)+ transhydrogenase enzyme
CN109182238A (zh) 2012-08-10 2019-01-11 嘉吉有限公司 用于生产脂肪酸和脂肪酸衍生产物的微生物及方法
CA2905602A1 (en) 2013-03-15 2014-09-18 Sarah M. Hoyt Flash evaporation for product purification and recovery
WO2014146026A1 (en) 2013-03-15 2014-09-18 Opx Biotechnologies, Inc. Bioproduction of chemicals
CN105008532B (zh) 2013-05-13 2017-07-21 味之素株式会社 L‑氨基酸的制造方法
JP2016165225A (ja) 2013-07-09 2016-09-15 味の素株式会社 有用物質の製造方法
WO2015010103A2 (en) 2013-07-19 2015-01-22 Opx Biotechnologies, Inc. Microorganisms and methods for the production of fatty acids and fatty acid derived products
US11408013B2 (en) 2013-07-19 2022-08-09 Cargill, Incorporated Microorganisms and methods for the production of fatty acids and fatty acid derived products
JP2016192903A (ja) 2013-09-17 2016-11-17 味の素株式会社 海藻由来バイオマスからのl−アミノ酸の製造方法
BR112016007286B1 (pt) 2013-10-02 2021-07-20 Ajinomoto Co., Inc Métodos de controle de amônia e para produção de uma substância alvo, e, aparelho para controle de amônia
WO2015060314A1 (ja) 2013-10-21 2015-04-30 味の素株式会社 L-アミノ酸の製造法
JP6519476B2 (ja) 2013-10-23 2019-05-29 味の素株式会社 目的物質の製造法
EP2993228B1 (en) 2014-09-02 2019-10-09 Cargill, Incorporated Production of fatty acid esters
CN105132388B (zh) * 2015-09-06 2018-02-23 江南大学 一种酶活性提高的丙酮酸羧化酶突变体r485p及其应用
CN105907730B (zh) * 2016-05-11 2019-06-21 江南大学 一种酶活性提高的丙酮酸羧化酶突变体n1078f及其应用
CN110494566A (zh) 2017-02-02 2019-11-22 嘉吉公司 产生c6-c10脂肪酸衍生物的经遗传修饰的细胞
CN111094571B (zh) * 2017-09-01 2023-10-27 国立大学法人新潟大学 龙涎香醇的有效制备方法
CN116113699A (zh) * 2020-12-24 2023-05-12 武汉远大弘元股份有限公司 改造的磷酸烯醇丙酮酸羧化酶及其在提高谷氨酸棒杆菌氨基酸产量中的应用
CN115806962A (zh) * 2021-09-15 2023-03-17 中国科学院天津工业生物技术研究所 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶突变体及其应用

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB2223754B (en) * 1988-09-12 1992-07-22 Degussa Dna encoding phosphoenolpyruvate carboxylase
JPH07108228B2 (ja) * 1990-10-15 1995-11-22 味の素株式会社 温度感受性プラスミド

Also Published As

Publication number Publication date
HUT73690A (en) 1996-09-30
PL181380B1 (pl) 2001-07-31
MY112250A (en) 2001-05-31
EP0723011A4 (en) 1996-05-21
CN1179043C (zh) 2004-12-08
DE69430919T2 (de) 2003-02-27
WO1995006114A1 (fr) 1995-03-02
SK283369B6 (sk) 2003-06-03
CZ52496A3 (en) 1996-06-12
CN1133615A (zh) 1996-10-16
DE69430919D1 (de) 2002-08-08
KR960704029A (ko) 1996-08-31
KR100337959B1 (ko) 2002-11-23
CA2169170C (en) 2007-01-09
ATE220099T1 (de) 2002-07-15
EP0723011A1 (en) 1996-07-24
AU682547B2 (en) 1997-10-09
AU8099194A (en) 1995-03-21
CA2169170A1 (en) 1995-03-02
EP0723011B1 (en) 2002-07-03
US5919694A (en) 1999-07-06
HU9600240D0 (en) 1996-03-28
BR9407625A (pt) 1997-01-21
CZ289051B6 (cs) 2001-10-17
US5876983A (en) 1999-03-02
PL313119A1 (en) 1996-06-10
SK20496A3 (en) 1996-11-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
HU219600B (hu) Mutáns foszfo-enolpiruvát-karboxiláz, ennek génje, valamint eljárás aminosav előállítására
AU783684B2 (en) Increased lysine production by gene amplification
US6221636B1 (en) Method for producing L-lysine
HU222503B1 (hu) Eljárás L-lizin termelésére
KR101934615B1 (ko) 위케라모미세스 시페리이로부터의 아세틸트랜스퍼라제
TW200533748A (en) Gene variants coding for proteins of the metabolic pathway of fine chemicals
CN107223152A (zh) 具有改变的一氧化碳脱氢酶(codh)活性的遗传工程细菌
US7141664B2 (en) Genes coding carbon metabolism and energy-producing proteins
JP3013711B2 (ja) 変異型ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼとその遺伝子及びアミノ酸の製造方法
KR20150112575A (ko) GlnD 또는 GlnK의 활성이 증가되도록 유전적으로 조작된 박테리아 세포 및 그를 이용하여 유기산을 생산하는 방법
CA2437656C (en) Polynucleotide constructs for increased lysine production
EP3015547B1 (en) Rna polymerase sigma factor 32 variant and production method for l-threonine using a microorganism expressing the variant
JPH10234371A (ja) 新規遺伝子
KR20150051880A (ko) 철에 의해 조절되는 abc 트란스포터의 활성이 증가된 미생물 및 이를 이용한 히드록시카르복실산의 제조방법

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of definitive patent protection due to non-payment of fees