ES2291029T3 - Clones infecciosos del virus de la enfermedad de newcastle, vacunas y analisis diagnosticos. - Google Patents

Clones infecciosos del virus de la enfermedad de newcastle, vacunas y analisis diagnosticos. Download PDF

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Abstract

Un cDNA de paramixovirus aviar que comprende al menos el extremo 5''-terminal del genoma del virus de la enfermedad de Newcastle (NDV) que corresponde al extremo 5''-terminal de NDV como el mostrado en la Figura 6, que permite generar una copia infecciosa de paramixovirus aviar

Description

Clones infecciosos del virus de la enfermedad de Newcastle, vacunas y análisis diagnósticos.
El invento se refiere a infecciones de aves de corral por el virus de la enfermedad de Newcastle.
El virus de la enfermedad de Newcastle (NDV; del inglés, Newcastle disease virus) es uno de los patógenos aviares más diversos y mortales. La casi simultánea aparición de la enfermedad de Newcastle en diversas áreas geográficas diferentes como una aparente enfermedad nueva y la gran variación en el tipo y la gravedad de la enfermedad han causado ciertos problemas con la nomenclatura.
La enfermedad ha sido denominada seudopeste de las aves de corral, seudoplaga de las aves de corral, peste aviar, moquillo aviar y neumoencefalitis aviar. La importancia de la enfermedad se debe principalmente al desarrollo de la industria de aves de corral durante el siglo XX hasta una industria internacional muy eficaz que depende de un comercio intensivo entre países.
Se supone generalmente que los primeros brotes de la enfermedad de Newcastle surgieron en 1926 en Java, Indonedia, y en Newcastle-upon-Tyne, Inglaterra (Kraneveld, 1926; Doyle 1927). El nombre "enfermedad de Newcastle" fue acuñado por Doyle como un nombre temporal para evitar un nombre descriptivo que pudiera llevar a confusión con otras enfermedades. Más adelante, quedó claro que virus indistinguibles del DDV causaban otras enfermedades menos graves. En EE.UU., una enfermedad respiratoria relativamente benigna fue denominada neumoencefalitis aviar, y se mostró que era causada por el NDV (Beach, 1944). En pocos años, se realizaron por todo el mundo numerosos aislamientos de NDV que causaban una enfermedad muy benigna en las gallinas o no causaban enfermedad alguna en ellas.
Se han implicado los métodos siguientes en la difusión de la enfermedad: 1) movimiento de aves vivas, aves silvestres, aves de caza, palomas de carreras y aves de corral comerciales; 2) movimiento de personas y equipos; 3) movimientos de productos avícolas; 4) difusión aérea; 5) pienso avícola contaminado; 6) agua contaminada; y 7) vacunas incompletamente inactivadas o heterogéneas. De acuerdo con la Oficina Internacional de Epizootias (OIE), la enfermedad de Newcastle es una enfermedad de aves de corral causada por un paramixovirus aviar de serotipo 1 (APMV-1; del inglés, avian paramyxovirus 1) que tiene un índice de patogenicidad intracerebral (ICPI; del inglés, intracerebral pathogenicity index) de 0,7 o más en polluelos de pocos días de edad. El virus virulento puede ser también confirmado por la presencia de múltiples aminoácidos básicos en el extremo C de la proteína F2 y de F (fenilalanina) en el resto 117 del extremo N de la proteína F1. Un fallo a la hora de demostrar esta secuencia de aminoácidos exigiría una caracterización mediante ensayos de ICPI. La frase "aves de corral" se refiere a aves domésticas, pavos, gallinas de Guinea, patos, gansos, codornices, palomas, faisanes, perdices y ratites que son criadas o mantenidas en cautividad para la cría, la producción de carne o huevos para el consumo, o la reposición de existencias para la caza.
De acuerdo con Alexander (1988), han tenido lugar tres zoonosis pandémicas de la enfermedad de Newcastle desde el primer reconocimiento de la enfermedad. El primero representaba los brotes iniciales de la enfermedad y parecía haber surgido en el sudeste asiático. Ciertos brotes aislados, tal como el de Inglaterra en 1926, fueron introducciones casuales previas a la corriente principal que se movía lentamente hacia Europa a través de Asia.
Parece que una segunda zoonosis pandémica comenzó en Oriente Medio a finales de los años 1960 y alcanzó a la mayoría de los países en 1973. La difusión más rápida de la segunda zoonosis pandémica fue probablemente causada por la mayor revolución de la industria avícola, con un considerable comercio internacional.
Una tercera zoonosis pandémica afectó esencialmente a aves domésticas tales como palomas y tórtolas (Vindevogel y Duchatel, 1988). La enfermedad surgió aparentemente en Oriente Medio a finales de los años 1970. En 1981 había alcanzado Europa y luego se extendió rápidamente a todas las partes del mundo, en gran medida como resultado del contacto entre aves en competiciones y ferias y al comercio internacional con dichas aves.
Hoy en día, la enfermedad de Newcastle está aún muy difundida en muchos países de Asia, África, América y Europa. Sólo los países de Oceanía parecen estar relativamente libres de la enfermedad (Spradbrow, 1988).
El NDV pertenece al orden Mononegavirales, familia Paramyxoviridae, subfamilia Paramyxovirinae, género Rubulavirus. Aparte del NDV, generalmente llamado paramixovirus aviar de tipo 1, se pueden distinguir otros ocho serotipos, denominados paramixovirus aviares de tipos 2 a 8, basándose en su relación antigénica en ensayos de inhibición de hemaglutinación y ensayos de neutralización sérica (Alexander, 1993).
A pesar de la consistencia del agrupamiento serológico, hay ciertas relaciones cruzadas entre virus de los diferentes serotipos.
El genoma del NDV es una molécula de RNA de cadena sencilla y polaridad negativa, complementaria de los RNAs mensajeros que codifican las proteínas virales. El RNA genómico tiene un tamaño de aproximadamente 15.200 nucleótidos (nt) y codifica los productos génicos siguientes (enumerados del extremo 3' al extremo 5' del RNA genómico): proteína de la nucleocápsida (NP; del inglés, nucleocapsid protein), fosfoproteína (P; del inglés, phosphoprotein), proteína matricial (M), proteína de fusión (F), hemaglutinina-neuraminidasa (HN) y proteína polimerasa grande (L; del inglés, large) (Chambers et al., 1986).
El RNA está complejado con las proteínas NP, P y L para formar una partícula de ribonucleocápsida (RNP; del inglés, ribonucleocapsid protein) que está rodeada por una envoltura que está interiormente revestida por la proteína M. La envoltura contiene las proteínas F y HN, que están implicadas en la fijación y penetración de la célula
huésped.
La replicación del NDV es similar a la estrategia usada por otros paramixovirinae. La fase inicial es la fijación del virus a los receptores de la célula huésped, mediada por la proteína HN. La fusión de la envoltura vírica con la membrana de la célula huésped depende de la acción tanto de la proteína HN como de la F y da lugar a la liberación de la RNP en el citoplasma, donde tiene lugar la replicación del virus.
La RNA polimerasa vírica dependiente de RNA (que es parte de la RNP) produce transcritos complementarios que actúan como mRNAs y son usados por la maquinaria de traducción de la célula para la síntesis de proteínas víricas. A causa de la acumulación de proteína NP, el complejo de RNA polimerasa cambia de transcripción a replicación para dar lugar a la síntesis de moléculas de RNA genómico y antigenómico de longitud completa.
Las RNPs recién formadas son encapsidadas en la membrana celular por la acción de la proteína M y las proteínas F y HN que se han acumulado en la membrana plasmática celular. Las partículas virales recién formadas se liberan de la célula infectada mediante un mecanismo de gemación. Para una información más detallada acerca de la replicación del NDV, véase Peeples (1988). Para una revisión reciente de la biología molecular de los Paramyxovirinae, véase Lamb y Kolakofsky (1996).
Aparte de las aves de corral domésticas comerciales (es decir, gallinas, pavos, faisanes, gallinas de Guinea, patos, gansos y palomas), una gran variedad de aves cautivas, semidomésticas y libres, incluyendo aves acuáticas migratorias, son sensibles al NDV y pueden ser fuentes de infección primaria (Kaleta y Baldauf, 1988).
La patogenicidad de las cepas de NDV difiere mucho con el huésped. Parece que las especies más resistentes son las aves acuáticas, siendo las más sensibles las aves gregarias que forman reuniones temporales o permanentes. Las gallinas son muy sensibles, pero los patos y los gansos pueden resultar infectados y no mostrar signos clínicos o mostrar unos pocos, incluso con cepas que resultan letales para las gallinas.
La enfermedad de Newcastle es complicada ya que diferentes productos de aislamiento y cepas del virus pueden provocar una enorme variación en la gravedad de la enfermedad. Beard y Hanson (1984) agruparon cepas y productos de aislamiento de NDV en diferentes patotipos que están relacionados con los síntomas morbosos que pueden verse en gallinas totalmente sensibles: 1) NDV velogénico viscerotrópico, que produce infecciones letales agudas en que destacan las lesiones hemorrágicas en el intestino; y NDV velogénico neurotrópico, que produce una elevada mortalidad precedida de síntomas respiratorios y neurológicos pero sin lesiones intestinales; 2) NDV mesogénico, que produce una baja mortalidad, enfermedad respiratoria aguda y síntomas nerviosos en ciertas aves; 3) NDV lentogénico, que produce infecciones respiratorias benignas o no evidentes, e incluso NDV entérico asintomático, virus no virulento que parece replicarse principalmente en el tracto intestinal. Se ha comunicado cierto solapamiento entre los síntomas asociados con los diferentes grupos.
El virus entra en el organismo a través de los tractos respiratorio e intestinal o a través del ojo. En la tráquea, el virus se propaga por acción ciliar y por propagación célula a célula. Después de la multiplicación inicial en el sitio de introducción, el virus es llevado al bazo, el hígado, el riñón y los pulmones durante los episodios de viremia. Los virus de ciertas cepas alcanzan órganos vitales tales como el hígado y el riñón muy rápidamente, por lo que las aves pueden morir antes de que los síntomas morbosos sean evidentes.
La mayoría de los virus alcanzan el sistema nervioso central a través de la sangre antes de que existan cantidades significativas de anticuerpo. Un estado portador asintomático y prolongado, que supuestamente se presenta en la familia Psittacidae, constituye una amenaza potencial para la industria avícola. También puede existir un estado portador de larga duración de virus tanto lentogénico como velogénicos en gallinas (Heuschele y Easterday, 1970).
Durante la replicación del NDV, es necesario que la glicoproteína Fo precursora sea escindida en F1 y F2 para que la progenie vírica sea infecciosa (Rott y Klenk, 1988). Esta escisión postraduccional es mediada por proteasas de la célula huésped. Si no tiene lugar la escisión, se producen partículas víricas no infecciosas y no puede continuar la replicación vírica. La proteína Fo de los virus virulentos puede ser escindida por una gran variedad de proteasas, pero las proteínas Fo de los virus de baja virulencia tienen su sensibilidad restringida, y estos virus sólo pueden crecer in vivo en ciertos tipos de células huésped y, en general, no pueden ser cultivados in vitro.
Los virus lentogénicos sólo se replican en zonas con enzimas de tipo tripsina, tales como los tractos respiratorio e intestinal, mientras que los virus virulentos se pueden replicar en una diversidad de tejidos y órganos para dar lugar a una infección sistémica fatal.
La secuenciación de aminoácidos del precursor Fo ha mostrado que los virus de baja virulencia tienen una sola arginina (R) que une las cadenas F2 y F1, mientras que las cepas virulentas poseen aminoácidos básicos adicionales que forman dos pares tales como K/R-X-K/R-R-F en el sitio de escisión. Además, la cadena F2 de las cepas virulentas comienza generalmente con un resto de fenilalanina mientras que la de las cepas no virulentas comienza generalmente con una leucina.
Para unas pocas cepas de NDV, la proteína HN es también producida como un precursor que requiere una escisión para ser biológicamente activa (Garten et al., 1980; Millar et al., 1988).
Además de la capacidad de escisión de las proteínas F y HN, otros factores víricos pueden contribuir a la patogenicidad. Madansky y Bratt (1978, 1981a, 1981b) han mostrado que alteraciones en la transcripción y la traducción podrían modular el crecimiento y la propagación célula a célula del virus y/o la citopatogenicidad.
La respuesta inmune inicial a la infección por NDV es mediada por células y puede ser detectable en tan sólo 2-3 días después de la infección con vacunas de cepas vivas. Esto explica probablemente la protección precoz frente a una estimulación que se ha registrado en aves vacunadas, antes de que se vea una respuesta mensurable de anticuerpos (Gough y Alexander, 1973).
Aproximadamente 1 semana después de la infección, los anticuerpos circulantes pueden proteger al huésped de una reinfección. En la fase precoz está implicada la IgM, seguida de IgG. Los títulos y la protección alcanzan el máximo después de aproximadamente 3 semanas y declinan gradualmente si no hay una inmunización de refuerzo. Esto significa que son necesarias revacunaciones para las aves más viejas.
Sólo las vacunas vivas administradas por vía respiratoria estimulan los anticuerpos en todas las superficies mucosas así como en el suero. La vacuna inactivada, incluso cuando se aplica por vía intramuscular, no provoca resistencia local en el tracto respiratorio a pesar de las altas concentraciones de anticuerpo en suero.
Esto recalca la importancia de las vacunas vivas capaces de presentar el antígeno vírico al tracto respiratorio superior para provocar una inmunidad tanto local como sistémica. Las gotitas pequeñas penetran en el tracto respiratorio inferior, provocando por ello una respuesta inmune principalmente humoral, mientras que las gotitas gruesas estimulan la inmunidad local en el tracto respiratorio superior.
Por lo tanto, los aerosoles con una gran variedad de tamaños de gotita generan las mejores inmunidades locales y humorales globales.
Sin embargo, ha de advertirse que, a pesar de la vacunación intensiva con las vacunas actuales que crean niveles elevados de títulos de anticuerpo, el virus puede ser aún recuperado de superficies mucosas.
La identificación de la enfermedad de Newcastle en EE.UU. condujo al uso de vacunas inactivadas (Hofstad, 1953). La observación de que algunos de los virus enzoóticos sólo producía una enfermedad benigna dio primero lugar al desarrollo de la vacuna viva mesogénica Roakin (Beaudette et al., 1949) y posteriormente al desarrollo de las cepas benignas Hitchner B1 (Hitchner y Johnson, 1948) y LaSota (Goldhaft, 1980), que son ahora las vacunas vivas más utilizadas.
Las vacunas vivas de NDV pueden ser divididas en dos grupos: lentogénicas y mesogénicas. Las cepas mesogénicas son solamente adecuadas para la vacunación secundaria de aves a causa de su mayor virulencia. La respuesta inmune aumenta conforme aumenta la patogenicidad de la vacuna viva. Por lo tanto, para obtener el nivel deseado de protección sin una reacción importante, se utilizan actualmente programas de vacunación que implican el uso sucesivo de vacunas progresivamente más virulentas, o de vacunas vivas seguidas de vacunas inactivadas.
Una de las ventajas principales de las vacunas vivas es que pueden ser administradas mediante técnicas baratas de aplicación masiva. Un método común de aplicación es a través del agua potable. Sin embargo, la aplicación por el agua potable debe ser cuidadosamente controlada ya que el virus puede resultar inactivado por calor y luz excesivos y por impurezas virucidas presentes en el agua.
La aplicación masiva de vacunas vivas mediante composiciones pulverizables y aerosoles es también muy popular a causa de la facilidad con que pueden vacunarse grandes cantidades de aves en poco tiempo. Es importante conseguir el correcto tamaño de partícula controlando las condiciones bajo las cuales se generan las partículas.
Las vacunas vivas actualmente utilizadas presentan varias desventajas. La vacuna puede aún causar síntomas morbosos dependiendo de las condiciones ambientales y de la presencia de infecciones que compliquen la situación. Por lo tanto, es importante usar un virus sumamente benigno para la vacunación primaria, y, como resultado, se necesitan normalmente múltiples vacunaciones. Además, anticuerpos de origen materno pueden evitar una vacunación primaria exitosa con vacunas vivas lentogénicas.
Las vacunas inactivadas se producen normalmente a partir de fluido alantoico infeccioso que es tratado con formol o beta-propiolactona para matar el virus y es mezclado con un agente adyuvante adecuado. Las vacunas inactivadas se administran mediante inyección, sea intramuscular o sea subcutáneamente. Las vacunas inactivadas son caras de producir y de aplicar.
Sin embargo, las vacunas inactivadas de emulsión oleosa no se ven tan negativamente afectadas por la inmunidad materna como las vacunas vivas y pueden ser utilizadas en polluelos de pocos días de edad. Las ventajas de las vacunas inactivadas son el bajo nivel de reacciones negativas en las aves vacunadas, el alto nivel de anticuerpos protectores y la larga duración de la protección. Ninguna de las vacunas anteriores puede ser serológicamente diferenciada del NDV de tipo silvestre.
El desarrollo de vacunas víricas recombinantes ha sido interesante para la industria avícola durante varios años. El concepto es insertar genes de epítopos inmunizantes críticos de un agente morboso de interés en un gen no esencial de un vector vírico. De este modo, la vacunación con el virus recombinante da lugar a una inmunización tanto contra el vector vírico como contra el agente morboso de interés.
Se han evaluado diversos tipos de virus en cuanto a posibles vacunas víricas vivas para aves de corral. Dos virus aviares que han recibido mucha atención son el virus de la viruela aviar (FPV; del inglés, fowlpox virus) y el herpesvirus de los pavos (HVT; del inglés, herpesvirus of turkeys). El virus de la viruela aviar es un virus DNA que tiene un genoma grande y que, en consecuencia, es considerado por tener un espacio amplio para llevar genes extraños.
Cuando está atenuado, el FPV no causa enfermedad clínica alguna y es comúnmente usado en gallinas como una vacuna. El HVT es también una virus DNA y es clasificado como serotipo III de la familia del virus de la enfermedad de Marek (MDV; del inglés, Marek's disease virus). El HVT no es patógeno para las gallinas pero ejerce protección cruzada frente al MDV y es comúnmente usado para vacunar gallinas contra la enfermedad de Marek.
Se ha mostrado que se puede provocar protección contra la enfermedad de Newcastle al utilizar vacunas de HVT o FPV recombinantes (Morgan et al., 1992, 1993; Heckert et al., 1996; Boursnell et al., 1990; Taylor et al., 1990).
Sin embargo, el inicio de la protección contra la enfermedad de Newcastle después de la vacunación con dichas vacunas recombinantes que expresan la proteína F de NDV, o tanto la proteína F como la HN, resultó gravemente retrasado en comparación con el inicio después de la vacunación con una vacuna convencional de NDV vivos o inactivados, posiblemente porque las vacunas recombinantes no proporcionan un espectro inmunológico suficientemente amplio de epítopos de NDV antigénicamente relevantes, distintos de los hallados en la proteína de NDV que es expresada por la vacuna recombinante, o aquellos no son apropiadamente presentados al sistema inmune.
Además, no se provocó eficazmente una protección local (mucosa, respiratoria o entérica) en las aves vacunadas con las vacunas recombinantes. Esto es un inconveniente grave ya que las vacunas utilizadas para la vacunación primaria contra enfermedades respiratorias deben provocar una inmunidad local para evitar la infección y propagación de los virus virulentos que infectan a las gallinas criadas bajo condiciones de campo.
Los anticuerpos contra NDV que son capaces de proteger al huésped pueden ser medidos en ensayos de neutralización vírica. Sin embargo, puesto que parece que la respuesta de neutralización va paralela a la respuesta de inhibición de la hemaglutinación (HI; del inglés, haemagglutination inhibition), se utiliza frecuentemente el segundo ensayo para evaluar la respuesta protectora, especialmente después de la vacunación.
Los anticuerpos tanto contra la proteína F como contra la HN pueden neutralizar los NDV. Sin embargo, en ensayos in vivo e in vitro, parece que los anticuerpos contra la proteína F provocan una mayor neutralización que los dirigidos contra HN (Meulemans et al., 1986).
La presencia de anticuerpos específicos hacia NDV en el suero de un ave proporciona poca información sobre la cepa infectiva de NDV y, por lo tanto, tiene un valor diagnóstico limitado.
La omnipresencia de cepas de NDV lentogénicas en aves en la mayoría de los países y el uso casi universal de vacunas vivas que no pueden ser distinguidas, al menos no serológicamente, del NDV de tipo silvestre significa que la mera demostración de una infección es una causa raras veces adecuada para que se impongan medidas de control. Puesto que la enfermedad de campo puede ser una medida poco fiable de la verdadera virulencia del virus, es necesario caracterizar más el virus que se encuentra.
En la actualidad, el único método para diagnosticar la enfermedad de Newcastle que permite la caracterización de la cepa infectiva es el aislamiento del virus seguido del análisis de la patogenicidad. En la actualidad, se utilizan tres ensayos in vivo con este fin: 1) tiempo medio de muerte (MDT; del inglés, mean death time) en los huevos; 2) índice de patogenicidad intracerebral (ICPI) en gallinas de un día de edad; y 3) índice de patogenicidad intravenosa (IVPI; del inglés, intravenous pathogenicity index) en aves de 6 semanas de edad.
Estos ensayos adolecen de diversos inconvenientes, tales como la disponibilidad de animales, la escasa reproducibilidad, y la duración relativamente grande de los ensayos. Finalmente, aunque no por ello menos importante, estos ensayos no permiten una identificación serológica sencilla de aves de corral vacunadas con una vacuna o infectadas con una cepa de tipo silvestre.
Como una alternativa a los ensayos in vivo, se ha utilizado exitosamente la reacción en cadena de la polimerasa (PCR; del inglés, polymerase chain reaction) para distinguir entre productos de aislamiento virulentos y no virulentos (Staüber et al., 1995; Kant et al., 1997); sin embargo, de nuevo no es posible la diferenciación serológica.
La cría de aves de corral y el comercio de sus productos están ahora organizados sobre una base internacional, frecuentemente bajo la dirección de compañías multinacionales. La amenaza de la enfermedad de Newcastle ha originado una gran restricción de dicho comercio.
Sólo se abordará el control exitoso de la enfermedad de Newcastle cuando todos los países comuniquen los brotes. Sin embargo, los acuerdos internacionales no son sencillos a causa de la enorme variación en el grado de vigilancia de enfermedades en los diferentes países. Algunos países no vacunan y no quieren ninguna forma de NDV introducido en las aves domésticas de corral porque las aves de corral vacunadas no pueden ser distinguidas de las infectadas con NDV de tipo silvestre.
Otros sólo permiten el uso de vacunas vivas específicas y consideran las demás vacunas como inaceptablemente virulentas. No obstante, otros países tienen la presencia continuada de virus muy virulentos circulantes, lo que no es reconocido como tal porque la enfermedad patente está enmascarada por la vacunación.
En muchos países, existe una legislación para controlar los brotes de enfermedad de Newcastle que se puedan producir. Las medidas de control nacionales están dirigidas a la prevención de la introducción y la propagación. La mayoría de los países tienen restricciones sobre el comercio de productos avícolas, huevos y aves de corral vivas. La mayoría de los países han establecido procedimientos de cuarentena para la importación, especialmente para aves de la familia Psittacidae.
Algunos países han adoptado políticas de erradicación con sacrificio obligatorio de aves infectadas, las materias con que han entrado en contacto, y sus productos. Otros exigen la vacunación profiláctica de aves incluso en ausencia de brotes, mientras que algunos tienen una política de vacunación anular alrededor de los brotes para establecer una zona de regulación.
Es evidente que existe la necesidad de mejores vacunas y mejores métodos diagnósticos que se puedan utilizar para controlar la enfermedad de Newcastle. Debido tanto a las grandes diferencias en la dosis que reciben las aves individuales durante la aplicación masiva de vacunas vivas como la variación en los niveles de inmunidad materna en las gallinas jóvenes, son inevitables las reacciones posteriores a la vacunación con vacunas vivas. Ésta es una de las principales preocupaciones de los granjeros en los países donde la vacunación es obligatoria.
Además, muchas vacunas son mezclas de subpoblaciones. Cuando se clonan, estas subpoblaciones pueden diferir significativamente entre sí en cuanto a inmunogenicidad y patogenicidad (Hanson, 1988).
Sin embargo, el mayor inconveniente de las vacunas inactivadas y vacunas vivas actualmente utilizadas es el hecho de que, con las técnicas de exploración actualmente usadas, tales como los ensayos de inhibición de la hemaglutinación y de neutralización vírica, los animales vacunados no pueden ser distinguidos de los animales infectados.
El virus de campo virulento puede aún propagarse en conjuntos animales vacunados ya que los síntomas de la enfermedad están enmascarados por la vacunación. Puesto que el aislamiento del virus y la caracterización de la virulencia mediante técnicas in vivo no son factibles a gran escala, existe la gran necesidad de nuevas y eficaces vacunas vivas atenuadas que puedan ser serológicamente discriminadas de los virus de campo.
Dichas vacunas, llamadas vacunas marcadoras de NDV (y los sistemas y métodos diagnósticos que les acompañan), que deberían proporcionar el más completo espectro inmunológico posible de epítopos de NDV antigénicamente relevantes y que, no obstante, deberían ser serológicamente distintas del NDV de tipo silvestre, no están aún disponibles.
El invento proporciona un método para modificar un genoma de paramixovirus aviar mediante modificación genética y proporciona un paramixovirus aviar genéticamente modificado y una vacuna marcadora de paramixovirus aviar.
La aparición de las técnicas modernas de biología molecular ha permitido la modificación genética de muchos virus RNA, incluyendo virus RNA de cadena negativa. A esta técnica se hace a menudo referencia como "genética inversa". Primero se obtiene un cDNA copia (longitud completa) del RNA vírico, después de lo cual se transcribe este DNA en células sensibles para producir un RNA infeccioso que puede replicarse de nuevo para producir partículas víricas infecciosas.
En general, mediante la modificación previa del cDNA con técnicas de biología molecular estándares, es posible obtener un virus RNA genéticamente modificado. Sin embargo, esto nunca se ha materializado para NDV ni para otros paramixovirus aviares, y ni siquiera ha sido posible aún generar fragmentos minigenómicos ni plásmidos de fragmentos genómicos de paramixovirus aviar para estudiar los procesos replicativos del paramixovirus aviar, para crear con ello un conocimiento de cómo construir una copia vírica infectiva.
Sorprendentemente, aunque en esta descripción se ha establecido ahora completamente que el genoma del paramixovirus aviar es el más pequeño de todos los genomas paramixovirales secuenciados hasta la fecha, especialmente la secuencia del extremo 5'-terminal del genoma de NDV es mucho más larga que la que previamente había sido establecida y se esperaba por comparación con la de otros Paramyxoviridae. El invento proporciona, ahora por vez primera, una secuencia completa del genoma de un paramixovirus aviar y proporciona el cDNA de longitud completa o longitud minigenómica de dicho virus.
El presente invento proporciona un cDNA de paramixovirus aviar que comprende al menos el extremo 5'-terminal del genoma de NDV que corresponde al extremo 5'-terminal de NDV como el mostrado en la Figura 6, que permite generar una copia infecciosa de paramixovirus aviar, comprendiendo preferiblemente dicho cDNA un cDNA de longitud completa. Sin embargo, el invento también proporciona un cDNA que comprende al menos el extremo 5'-terminal del genoma de NDV que corresponde al extremo 5'-terminal de NDV como el mostrado en la Figura 6, que permite generar un minigenoma replicante de paramixovirus aviar. Dichos minigenomas pueden ser ventajosamente utilizados para transcribir RNA y/o expresar proteína a partir de secuencias de ácido nucleico modificadas. El invento proporciona un cDNA, acorde con el invento, al menos parcialmente derivado del virus de la enfermedad de Newcastle, en que, por ejemplo, dicho virus de la enfermedad de Newcastle es un virus lentogénico, preferiblemente derivado de una cepa de vacuna, tal como la cepa LaSota ATCC VR-699.
El invento proporciona además un cDNA de acuerdo con el invento, provisto adicionalmente de una modificación, tal como una deleción, inserción, mutación, reversión u otra modificación, en un ácido nucleico. Por ejemplo, se proporciona un cDNA en que dicha modificación comprende un ácido nucleico que codifica un sitio de escisión por proteasas modificado; por ejemplo, en que dicho sitio de escisión es un sitio de escisión por proteasas de la proteína de fusión (F).
En aún otra realización, el invento proporciona un cDNA de acuerdo con el invento en que dicha modificación comprende un ácido nucleico que codifica una proteína vírica híbrida, tal como una proteína híbrida de hemaglutinina-neuraminidasa como la descrita en la parte experimental el invento. El invento también proporciona un cDNA de acuerdo con el invento en que dicha modificación comprende una deleción en un ácido nucleico que codifica una proteína vírica, tal como una proteína matricial (M).
El invento proporciona además un cDNA de acuerdo con el invento provisto adicionalmente de un ácido nucleico que codifica un antígeno heterólogo, en que dicho antígeno procede preferiblemente de un patógeno de aves de corral, tal como, por ejemplo, se describe más adelante. También se proporciona un RNA obtenido de un cDNA de acuerdo con el invento, y una proteína derivada de aquél.
En los últimos años, se han caracterizado totalmente diversos virus RNA de cadena negativa y no segmentados, y el trabajo fundamental sobre la replicación y expresión de sus genomas ha culminado en la capacidad para generar un virus infeccioso mediante la transfección completa de células con cDNA clonado de dicho virus (revisión de Conzelmann, 1996).
Hasta la fecha, el virus infeccioso procedente de virus RNA de cadena negativa y no segmentados ha sido generado a partir de cDNA clonado de, por ejemplo, virus de la rabia (Schnell et al., 1994; Conzelman; Documento EP0702085A1), virus de la estomatitis vesicular (Lawson et al., 1995; Whelan et al., 1995), virus Sendai (Garcin et al., 1995), virus del sarampión (Radecke et al., 1995; Schneider et al., 1997; Documento EP0780475A1), virus respiratorio sincitial humano (Collins et al., 1995), virus de la peste bovina (Baron y Barrett, 1997) y parainfluenzavirus humano de tipo 3 (Hoffman y Banerjee, 1997; Conzelman; Documento EP0702085A1) (Schnell et al., 1994; Documento EP0702085A1).
Sin embargo, todas las anteriores copias víricas infecciosas son capaces de desarrollarse tanto in vivo como in vitro en huéspedes, tejidos o células de diverso origen, lo que permite unas sencillas transfección y replicación de cDNA y la generación de partículas víricas infecciosas en una línea celular adecuada.
Dicha posibilidad no existe para el NDV, desde luego no para cepas de NDV lentogénicas que puedan proporcionar una vacuna. La virulencia de dicha cepa de NDV está asociada con su capacidad para replicarse en una gran variedad de células, lo que viene reflejado por el hecho de que las cepas virulentas pueden replicarse fácilmente in vitro e in vivo mientras que las cepas de vacuna sólo pueden replicarse in vivo.
Por lo tanto, con el NDV es evidente la situación de doble vínculo. Aunque los intentos para generar una copia vírica infecciosa a partir de, por ejemplo, cDNA infeccioso puede dar posiblemente lugar a un virus infeccioso, dicho virus no es en general adecuado para uso como vacuna porque el virus infeccioso así generado es, por defecto, demasiado virulento para ser usado como vacuna; el hecho de que se pueda generar y replicar después de la transfección de una línea celular con el cDNA refleja su capacidad para escindir fácilmente la proteína Fo en F1 y F2, un sello característico de la virulencia de un NDV, como se discutió anteriormente.
El uso de una cepa de vacuna como material originario para el cDNA no resolvería este problema; una cepa de vacuna, especialmente de un tipo lentogénico, no contiene una proteína Fo fácilmente escindible, lo que haría imposible que el virus de la primera generación continuara replicándose. Realmente, la célula utilizada para la transfección no será susceptible de soportar uno o más ciclos de replicación del virus de tipo vacuna con una proteína Fo no escindida.
El invento proporciona ahora elegantemente una solución a este problema y proporciona con ella una copia infecciosa de NDV para, por ejemplo, uso en una vacuna.
El invento proporciona un método para generar una copia infecciosa del virus de la enfermedad de Newcastle, que comprende transfectar células, capaces de expresar las proteínas NP, P y L víricas para complejación con el RNA vírico, con cDNA clonado de longitud completa o longitud genómica de dicho virus, y que comprende además incubar dichas células en un medio de cultivo que comprende una actividad proteolítica que permite la escisión de la proteína Fo de dicho virus.
En el presente sistema, se podría omitir la cotransfección de un plásmido que expresa NP. La NP se expresa probablemente a partir del cDNA de longitud completa porque el gen de NP es el primer gen después del extremo 5' del RNA antigenómico. Puesto que los mRNAs eucarióticos son normalmente monocistrónicos, no se espera la expresión de genes distales. Sin embargo, es posible generar un cDNA de longitud completa en que estén cambiadas las posiciones relativas de los genes del NDV. Si el primer gen de dicho cDNA es el gen P o L, no es necesario que se exprese el correspondiente producto génico a partir de un plásmido cotransfectado.
Como una alternativa al uso de cDNA de longitud completa, es posible utilizar dos o más cDNAs subgenómicos que generen RNAs subgenómicos competentes en cuanto a la replicación, y que expresen conjuntamente el complemento completo de las proteínas del paramixovirus aviar. Incluso si los RNAs están separadamente empaquetados, las partículas de tipo vírico resultantes pueden ser utilizadas para ciclos sucesivos de replicación por medio de coinfección y complementación de funciones génicas.
En una realización preferida, el invento proporciona un método en que dicha actividad proteolítica procede de una enzima, tal como una enzima de tipo tripsina, o procede de una composición que comprende dicha actividad proteolítica. En la realización muy preferida, dicho medio de cultivo comprende fluido alantoico que comprende actividad proteolítica. Para la generación del virus infeccioso se requiere la escisión de la proteína Fo. Es posible generar un virus infeccioso a partir de una cepa lentogénica sin la adición de actividad proteolítica exógena. Al inocular el sobrenadante de células transfectadas en la cavidad alantoica de huevos fecundados, la actividad proteolítica que está presente en el fluido alantoico es capaz de escindir la proteína Fo para generar el complejo F1-F2 competente en cuanto a la fusión. Los viriones con dicha proteína F activada pueden infectar células sensibles, y la replicación en las células que expresan la actividad proteolítica deseada produce una progenie infecciosa. Como una alternativa al hecho de proporcionar la actividad proteolítica deseada al sobrenadante de células transfectadas, es posible utilizar, por ejemplo, una célula que sea tolerante al NDV y que ya exprese dicha actividad proteolítica. Dicha línea celular es utilizada para producir NDV lentogénico infeccioso sin la adición de actividad proteolítica exógena. Dicha línea celular puede ser también generada al transfectar establemente una línea celular con un gen que especifica dicha actividad. Además, es posible generar una línea celular transfectada estable que exprese la proteína F de tipo silvestre en la envoltura del virus, proporcionando por ello partículas infecciosas (que en sí no están provistas de información genómica que codifique la proteína F de tipo silvestre) con medios para entrar en una célula. También es posible el rescate de un virus lentogénico infeccioso mediante la infección de las células transfectadas, con un virus auxiliar de NDV. Un requisito esencial para dicho virus auxiliar sería que pudiera ser retroseleccionado, por ejemplo, por medio de anticuerpos neutralizantes que eliminarán el virus auxiliar pero que no reaccionaran con el virus lentogénico. Finalmente, se puede construir una línea celular establemente transfectada que exprese una, dos o las tres proteínas esenciales de NDV: NP, P y L. Dichas líneas celulares requieren la coexpresión de sólo un subgrupo de las tres proteínas esenciales o ninguna coexpresión en absoluto para soportar la generación de una copia vírica infecciosa.
En una realización preferida, el invento proporciona un método en que dichas células utilizadas para la transfección proceden de líneas celulares o células primarias o secundarias de gallina. La descripción proporciona, por ejemplo, células CER o CEF, que, como generalmente la mayoría de las células in vitro, carecen de las apropiadas proteasas que son necesarias para escindir la proteína Fo de NDV, por ejemplo, de la cepa LaSota. Sin embargo, también se pueden utilizar células procedentes de, por ejemplo, otras aves.
El invento proporciona además un método para generar una copia infecciosa del virus de la enfermedad de Newcastle, que comprende transfectar células con cDNA clonado de longitud completa o longitud genómica de dicho virus como, por ejemplo, el identificado en la Figura 3, y que comprende además incubar dichas células en un medio de cultivo que comprende una actividad proteolítica que permite la escisión de la proteína Fo de dicho virus, y que comprende además recuperar el virus infeccioso cultivando dichas células e inoculando en la cavidad alantoica de huevos fecundados el material procedente de dichas células cultivadas. Dicho material comprende, por ejemplo, células o fragmentos celulares o el sobrenadante procedente de dicho cultivo celular (recolectados o congelados-descongelados).
Por ejemplo, la descripción describe un método para recuperar un virus infeccioso, en que el sobrenadante de monocapas de CEF transfectadas fue inoculado en la cavidad alantoica de huevos fertilizados. Cuatro días más tarde, el fluido alantoico fue recolectado, analizado en un ensayo de hemaglutinación y sometido a pases adicionales por huevos.
Además, el invento proporciona un método que comprende someter adicionalmente dicha copia infecciosa de virus de la enfermedad de Newcastle a pases recogiendo el fluido alantoico y volviéndolo a inocular en huevos fecundados.
En una realización preferida del invento, se proporciona un método en que dicho virus es un virus lentogénico procedente, por ejemplo, de un caso virulento de NDV de campo o de una cepa de vacuna de NDV, tal como la cepa LaSota de NDV. Además, se proporciona un método para modificar un genoma de paramixovirus aviar por medio de una modificación genética que permite la introducción de una o más mutaciones, deleciones y/o inserciones u otras modificaciones. Por ejemplo, se proporciona un método para atenuar o modificar la virulencia de un paramixovirus aviar al modificar el cDNA que, por ejemplo, codifica una proteína vírica, tal como la proteína V, y clonar dicho cDNA modificado en cDNA de longitud completa y generar una copia vírica infecciosa a partir de dicho cDNA de longitud completa, generándose de este modo nuevas cepas de NDV o nuevas vacunas vivas atenuadas con propiedades mejoradas.
Aparte de la atenuación por modificación de productos génicos, también es posible atenuar un paramixovirus aviar por modificación de secuencias de nucleótidos que están implicadas en la transcripción y/o replicación. Dichas modificaciones dan lugar a cepas atenuadas que expresan proteínas F, similares a las del tipo silvestre, que son escindibles in vitro e in vivo en una gran variedad de células y, como resultado, son más inmunogénicas que las clásicas cepas de vacuna.
En una realización preferida, el invento proporciona un método para atenuar o modificar la virulencia de un paramixovirus aviar tal como un virus de la enfermedad de Newcastle, que comprende modificar un sitio de escisión por proteasas de una proteína vírica al modificar el cDNA que codifica dicho sitio de escisión, y que comprende además clonar dicho cDNA en cDNA de longitud genómica de, por ejemplo, virus de la enfermedad de Newcastle y generar una copia infecciosa de virus de la enfermedad de Newcastle. Dicho sitio de escisión es, por ejemplo, un sitio de escisión por proteasas en la proteína F o HN del virus de la enfermedad de Newcastle. En general, la atenuación se limita a la reducción de la virulencia; sin embargo, también es posible ahora utilizar una cepa relativamente avirulenta de NDV y obtener la progenie de dicha cepa con una virulencia aumentada, por ejemplo, obteniéndola con una tendencia aumentada a replicarse en un tipo celular especificado. Por lo tanto, ahora es posible comunicar distintos atributos de virulencia al NDV.
El invento proporciona un método para modificar antigénicamente un paramixovirus aviar tal como un virus de la enfermedad de Newcastle, que comprende modificar un cDNA que codifica al menos una parte de una proteína viral que contiene al menos un epítopo inmunodominante, y que comprende además clonar dicho cDNA en cDNA de longitud genómica de virus de la enfermedad de Newcastle y generar una copia infecciosa de virus de la enfermedad de Newcastle.
Por ejemplo, el invento proporciona un método para modificar (adicionalmente) un NDV usando, por ejemplo, un método para producir una copia infecciosa de NDV (vacuna) que se ha proporcionado; se proporciona un método para producir una vacuna marcadora recombinante de NDV, una vacuna marcadora que contiene el más completo espectro inmunológico posible o necesario de epítopos de NDV antigénicamente relevantes y que, no obstante, es serológicamente distinta del NDV de tipo silvestre porque, mediante técnicas recombinantes, se ha eliminado un bien definido marcador o epítopo serológicamente relevante. El invento proporciona un método para modificar la composición antigénica de un paramixovirus aviar tal como el NDV, lo que permite la generación de, por ejemplo, una vacuna marcadora viva de NDV que puede ser serológicamente distinguida de las cepas de campo de paramixovirus aviar.
En una realización, el invento proporciona una copia infecciosa de NDV en que la proteína HN de NDV ha sido modificada al recombinar cDNA que codifica una parte de dicha proteína HN con cDNA que codifica una parte de una proteína HN procedente de un paramixovirus aviar de, por ejemplo, tipo 2 o tipo 4. Dicha proteína HN híbrida sirve como un marcador serológico para la copia infecciosa de cepa de NDV así obtenida o puede servir para cambiar el tropismo del paramixovirus aviar hacia otras células y/o tejidos. Estas así llamadas cepas marcadoras como las proporcionadas por el invento permiten la generación de vacunas que son una herramienta inestimable para evaluar la incidencia de NDV en conjuntos animales comerciales por todo el mundo. Además, la aplicación de dichas vacunas marcadoras a gran escala conducirá a la erradicación completa del NDV mediante un procedimiento de exploración intensiva y eliminación de conjuntos animales infectados.
Además, se proporciona un método para generar una copia infecciosa de cepa de NDV que exprese uno o más antígenos de otros patógenos y que pueda ser utilizada para vacunar contra múltiples enfermedades. Dicha copia infecciosa de virus NDV comprende, por ejemplo, un cDNA heterólogo que codifica una proteína heteróloga obtenida de, por ejemplo, virus de la influenza aviar (AIV; del inglés, avian influenza virus) [hemaglutinina (H5 y H7) y neuraminidasa], virus de la leucosis aviar (ALV; del inglés, avian leukosis virus) [proteína env (gp85)], virus de la anemia de los pollos (CAV; del inglés, chicken anemia virus) (VP1 + VP2), virus de la enfermedad de Marek (MDV) [glicoproteína B (gB), gH], virus de la laringotraqueítis infecciosa (ILT; del inglés, infectious laringotracheitis) (gB, gH, gD), virus de la bursitis infecciosa (IBDV; del inglés, infectious bursal disease virus) (VP2 y VP3), virus de la rinotraqueitis del pavo (TRT; del inglés, turkey rhinotracheitis) [proteína de fusión (F)], paramixovirus aviar 2, 3, 6 (PMV; del inglés, paramyxovirus) [proteína F, hemaglutinina-neuraminidasa (HN) u otras], virus de la bronquitis infecciosa (IBV; del inglés, infectious bronchitis virus) (proteína peplómera, nucleoproteína), reovirus (proteína sigma), adenovirus, neumovirus, Salmonella enteritidis, Campylobacter jejuni, Escherichia coli, Bordetella avium (previamente Alcaligenes faecalis), Haemophilus paragallinarum, Pasteurella multocida, Ornithobacterium rhinotracheale, Riemerella (previamente Pasteurella) anatipestifer, bacterias del género Mycoplasma (M. gallisepticum, M. synoviae, M. meleagridis, M. iowae) u hongos del género Aspergillus (A. flavus, A. fumigatus).
El presente invento proporciona un paramixovirus aviar, o cepas del mismo, que se pueden utilizar como un vector de vacuna para la expresión de antígenos procedentes de otros patógenos de aves de corral. Diversas propiedades hacen que el NDV sea un vector de vacuna ideal para la vacunación contra enfermedades respiratorias o intestinales: 1) el NDV puede ser fácilmente cultivado hasta títulos elevadísimos en huevos fecundados; 2) el cultivo masivo de NDV en huevos fecundados es relativamente barato; 3) las vacunas de NDV son relativamente estables y pueden ser simplemente administradas mediante métodos de aplicación masiva tales como por el agua potable o por pulverización o formación de aerosoles; 4) la vía natural de infección del NDV son los tractos respiratorio y/o intestinal, que son también las principales vías naturales de infección de muchos otros patógenos de aves de corral; y 5) el NDV puede provocar inmunidad local a pesar de la presencia de anticuerpos maternos circulantes.
Se ha mostrado que el NDV tiene unas potentes propiedades antineoplásicas así como inmunoestimulantes [para una revisión, véase Schirrmacher et al., 1998 (V. Schirrmacher, T. Ahlert, H. H. Steiner, C. Herold-Mende, R. Gerhards y E. Hagmüller, 1998, "Immunization with virus-modified tumor cells", Seminars in Oncology 25: 677-696]. Aunque no parece que el NDV sea capaz de replicarse productivamente en células humanas normales, se advirtió una muerte selectiva de células cancerosas humanas mediada por NDV. En ratones con sistema inmune suprimido, después de una terapia local con NDV se observaron oncolisis viral y remisiones completas de xenoinjertos de tumores humanos. Esto ha conducido al uso de NDV para terapia tumoral. Sin embargo, un problema es que dicha aplicación puede estar restringida a un tratamiento local.
La infección por NDV induce interferones, quimiocinas y otros productos génicos potencialmente importantes, e introduce propiedades pleiotrópicas inmunoestimulantes en las células tumorales. Este concepto ha sido usado para la producción de vacunas de células tumorales autólogas que consisten en muestras operativas frescas que han sido infectadas con NDV. Este tipo de vacuna es llamada vacuna de tumor autólogo-NDV o ATV-NDV (del inglés, autologous tumor vaccine-NDV) (Schirrmacher et al., 1988). Las células infectadas con NDV son inactivadas mediante irradiación gamma, que evita la división celular pero aún permite la replicación del NDV en el citoplasma de las células infectadas. Después de la inoculación del ATV-NDV en los pacientes, se reclutan células T por medio de quimiocinas inducidas por NDV. Algunas de estas células T pueden expresar un receptor de células T que puede interaccionar, en la superficie celular, con péptidos de antígenos tumoralmente asociados en complejo con moléculas del complejo principal de histocompatibilidad de clase I. Esta interacción da lugar a la inducción de una respuesta de células T citotóxicas que da lugar a la muerte específica de las células tumorales autólogas.
El invento proporciona la modulación del repertorio y la cantidad de quimiocinas y proteínas inmunoestimulantes, inducidas por la infección con NDV. El presente invento proporciona un método para generar un NDV recombinante que ha sido modificado para que lleve incorporado(s) y exprese un(os) gen(es) heterólogo(s). Dicho NDV recombinante puede ser utilizado para modificar el repertorio y la cantidad de proteínas inmunoestimulantes en las células infectadas. En una realización, el invento proporciona un NDV recombinante que lleva incorporados y expresa genes que codifican interferones, quimiocinas u otras proteínas inmunoestimulantes humanas. Dicho NDV recombinante es utilizado para la producción de un ATV-NDV que es más potente que el ATV-NDV convencional (por ejemplo, las citocinas IFN-\alpha y -\beta, TNF-\alpha, IL-1 e IL-6; las quimiocinas RANTES e IP-10; u otros genes tales como HSP, ACTH, endorfina, iNOS, EPA/TIMP y NF\kappaB). Las propiedades inmunoestimulantes pleiotrópicas del NDV pueden ser también utilizadas como un agente adyuvante para la vacunación de animales y seres humanos contra enfermedades infecciosas. En una realización del invento, se introducen genes extraños que codifican un(os)
antígeno(s) relevante(s) de un(os) agente(s) infeccioso(s) en el genoma de NDV, y la expresión simultánea del(de los)
antígeno(s) y las proteínas inmunoestimulantes por las células infectadas puede inducir una potente respuesta inmune contra el agente infeccioso. En otra realización del invento, las propiedades inmunoestimulantes del NDV pueden ser adicionalmente potenciadas al usar recombinantes de NDV que expresan simultáneamente antígenos y proteínas inmunoestimulantes específicas. En una realización preferida, el invento es utilizado para generar una vacuna contra el sida (síndrome de inmunodeficiencia adquirida) al usar recombinantes de NDV que expresan antígenos relevantes del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), solos o en combinación con proteínas inmunoestimulantes.
El NDV es también usado como un agente adyuvante para la vacunación de animales y seres humanos contra enfermedades infecciosas. En una realización del invento, se introducen genes heterólogos o extraños que codifican un(os) antígeno(s) relevante(s) de un(os) agente(s) infeccioso(s) en el genoma del NDV, y la expresión simultánea del(de los) antígeno(s) y las proteínas inmunoestimulantes por las células infectadas puede inducir una potente respuesta inmune contra el agente infeccioso. En otra realización del invento, las propiedades inmunoestimulantes del NDV son adicionalmente potenciadas al usar recombinantes de NDV que expresan simultáneamente antígenos y proteínas inmunoestimulantes específicas. En una realización preferida, el invento es utilizado para generar una vacuna contra el sida (síndrome de inmunodeficiencia adquirida) al usar recombinantes de NDV que expresan antígenos relevantes del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), solos o en combinación con proteínas inmunoestimulantes.
Además, se proporciona un método para generar un mutante condicional letal de NDV por deleción que puede ser usado como vacuna autolimitada no transmisible (portadora). Se generó un mutante de NDV por deleción que es incapaz de expresar la proteína matricial (M) que está implicada en la gemación del NDV en el interior de la membrana celular. El invento proporciona, por ejemplo, una cepa de NDV fenotípicamente complementada que es incapaz de expresar la proteína M y que aún es capaz de infectar células y de propagarse por medio de una transmisión de célula a célula. Sin embargo, el virus mutante es incapaz de generar una progenie infecciosa en células no complementarias. Esto demuestra que los mutantes de NDV por deleción fenotípicamente complementados pueden ser usados como vacunas autolimitadas seguras que son incapaces de propagarse por el medio ambiente. Dicha vacuna no transmisible combina la ventaja más importante de las vacunas vivas, es decir, la eficacia, con la ventaja más importante de las vacunas muertas, es decir, la seguridad.
El invento proporciona un virus de la enfermedad de Newcastle, o cepas derivadas del mismo, mediante, por ejemplo, el pase o el cultivo adicional en huevos fecundados o células apropiadas, que procede de una copia vírica infecciosa obtenible mediante un método proporcionado por el invento.
Por ejemplo, se proporciona un NDV que ha sido modificado de al menos un modo para generar una copia infecciosa del virus de la enfermedad de Newcastle que está atenuada, está modificada en cuanto a la virulencia, está antigénicamente modificada, expresa un antígeno heterólogo o no es transmisible, o combinaciones de estas propiedades.
El presente invento proporciona vacunas de NDV caracterizadas, por ejemplo, por poseer distintos atributos de virulencia o distintas características antigénicas, sean con fines de vacunas marcadoras y/o para expresar antígenos heterólogos procedentes de otros patógenos, estén en forma transmisible y/o en forma no transmisible.
Dicha vacuna puede ser una vacuna muerta o una vacuna viva. Preferiblemente, dicha vacuna es una vacuna viva; sin embargo, vacunas muertas como las proporcionadas por el invento son beneficiosas bajo aquellas circunstancias en que una vacuna viva no es aplicable o es sólo poco aplicable a causa de, por ejemplo, restricciones comerciales u otras condiciones dispuestas por las autoridades que controlan las enfermedades.
El presente invento también proporciona un método diagnóstico para detectar anticuerpos contra dicho marcador o epítopo inmunodominante serológicamente relevante, proporcionando con él métodos y medios para ejecutar un método para el control y/o la erradicación del NDV y/o otras enfermedades de las aves de corral. El invento proporciona vacunas nuevas y eficaces que pueden ser serológicamente discriminadas de los virus de campo y las vacunas de tipo antiguo. Dichas nuevas vacunas, llamadas vacunas marcadoras de NDV, proporcionan el más completo espectro inmunológico posible de epítopos de NDV antigénicamente relevantes y, no obstante, son serológicamente distinguidas del NDV de tipo silvestre mediante la aplicación de los métodos diagnósticos adjuntos.
El invento proporciona un método para distinguir animales no vacunados o animales vacunados con una vacuna de NDV de acuerdo con el invento, de los animales infectados con NDV de tipo silvestre o vacunados con una cepa de vacuna de NDV mesogénica o lentogénica no modificada, que comprende tomar al menos una muestra (tal como suero, sangre, huevos o fluido ocular) de dicho animal y determinar en dicha muestra la presencia de anticuerpos dirigidos contra un marcador o epítopo inmunodominante expresado por dicho NDV de tipo silvestre o no modificado pero no por una vacuna de acuerdo con el invento.
El invento proporciona un método en que dichos anticuerpos se dirigen contra la proteína HN o F del NDV, tal como, por ejemplo, una proteína híbrida como la descrita en la parte experimental de esta descripción. El invento proporciona, por ejemplo, un método diagnóstico en que dicho animal es seleccionado del grupo que comprende aves de corral, preferiblemente gallinas.
En una realización del invento, se usa un ensayo de hemaglutinación-inhibición sencillo y rápido para distinguir entre animales vacunados y animales infectados. Los animales vacunados con una vacuna marcadora en que el cabecero globular completo de la HN de NDV ha sido sustituido por la parte correspondiente de HN de otro serotipo no generarán anticuerpos hacia HN de NDV y, por lo tanto, no inhibirán la hemaglutinación de eritrocitos por viriones de NDV.
Al utilizarse viriones de vacuna marcadora en el ensayo de HI, los anticuerpos contra la proteína HN híbrida son detectados y pueden ser utilizados como una medida de la eficacia de la vacunación. Como una alternativa, para medir la eficacia de la vacunación se utiliza un ensayo de inmunoabsorción con enzimas ligadas (ELISA; del inglés, enzyme-linked immunosorption assay), que detecta anticuerpos contra la proteína F de NDV.
Aparte del ensayo de HI, se puede utilizar un ELISA para determinar la presencia de anticuerpos contra HN de NDV. El antígeno que se va utilizar en dicho ensayo es, por ejemplo, HN de NDV que se expresa mediante técnicas de DNA recombinante o un péptido conservado de HN de NDV.
También se puede utilizar un ELISA de bloqueo. En este caso se utilizan uno o más anticuerpos monoclonales contra epítopos conservados de HN de NDV para determinar si en las muestras de animales vacunados están presentes anticuerpos competidores. Los ensayos ELISA pueden ser ventajosamente utilizados si la vacuna marcadora sólo contiene una proteína HN quimérica o cuando están sustituidos unos pocos epítopos de HN de NDV.
El invento es adicionalmente explicado en la parte experimental de esta descripción sin que el invento se imite a ella.
Parte experimental Materiales y métodos
A menos que se afirme otra cosa, se llevaron a cabo procedimientos de clonación estándares de acuerdo con Sambrook et al. (1989). Todas las construcciones en que estaban implicados fragmentos de DNA, que fueron generadas por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), fueron verificadas por análisis de secuencias. En las secuencias de cebador indicadas más adelante, los nucleótidos subrayados corresponden a secuencias de NDV y se indica la posición en el genoma del NDV. La secuencia de nucleótidos de los sitios de restricción que se utilizaron para la clonación se indican en letra negrita.
Células y virus
Se cultivaron células CER (Smith et al., 1976) en medio GMEM/EMEM (1:1) que contenía suero de ternera fetal (FCS; del inglés, foetal calf serum) al 5% y 2% de una mezcla de antibióticos que contenía 1000 U/ml de penicilina, 1000 \mug/ml de estreptomicina, 20 \mug/ml de fungizona, 500 \mug/ml de polimixina B y 10 mg/ml de kanamicina. Se cultivaron células QT35 (Moscovici et al., 1977; Cho, 1982) en medio suministrado por GibcoBRL/Life Technologies (nº 041-91536 del catálogo; composición registrada de Fort Dodge), complementado con FCS al 5% y mezcla de antibióticos al 2%. Se cultivaron células QM5 (Antin y Ordahl) en medio M199 complementado con caldo de fosfato-triptosa al 10%, FCS al 10% y mezcla de antibióticos al 2%.
La cepa LaSota de NDV se obtuvo de la ATCC (ATCC VR-699) y fue hecha pasar dos veces por huevos fecundados. Antes de comenzar con la construcción y clonación de cDNA, el virus fue purificado en placas mediante tres ciclos de purificación sobre fibroblastos de embrión de gallina (CEF; del inglés, chicken embryo fibroblasts) primarios. Con este fin, el virus fue titulado en células CEF cultivadas en GMEM/EMEM (1:1) que contenía suero de ternera fetal al 5%, mezcla de antibióticos al 2 por ciento, fluido alantoico al 5%, MgCl_{2} 30 mM, 200 \mug/ml de DEAE-dextrano (Sigma) y agar Nobel (Difco) al 0,8%. El virus procedente del tercer ciclo de purificación en placas (designado clon E13-1) fue cultivado en huevos fecundados, y, cuatro días después de la inoculación, el fluido alantoico fue recolectado y fue guardado a -70ºC en partes alícuotas. El virus recombinante fpEFLT7pol de la viruela (Britton et al., 1996; más adelante llamado FPV-T7), que expresa RNA polimerasa de T7, fue un amable obsequio del Dr. Michael Skinner y fue cultivado en células QT35.
Aislamiento del RNA vírico
Todas las manipulaciones fueron llevadas a cabo en material de plástico o vidrio exento de RNasa, y todas las disoluciones se prepararon con agua, exenta de RNasa, que fue tratada con pirocarbonato de dietilo (DEPC) al 1% y fue esterilizada por tratamiento en autoclave. El virus fue recogido del fluido alantoico como sedimento de una centrifugación a 21.000 rpm durante 70 minutos en un rotor Beckman SW40 a 4ºC. El sedimento fue resuspendido en tampón de homogeneización [Tris-HCl 50 mM, pH de 7,5, NaCl 50 mM, EDTA 5 mM, dodecilsulfato sódico (SDS; del inglés, sodium dodecyl sulfate) al 0,5%] y fue tratado con proteinasa K (200 \mug/ml) durante 90 minutos a 37ºC con agitación constante. El lisado fue sometido dos veces a extracción con un volumen igual de fenol/cloroformo (1:1), pH 5,4, y una vez con un volumen igual de cloroformo. El RNA vírico fue precipitado de la fase acuosa mediante la adición de 0,1 volúmenes de NaOAc 3 M, pH 5,3, y 2,5 volúmenes de etanol al 100%. El precipitado fue recogido por centrifugación, lavado una vez con etanol al 70%, resuspendido en agua y almacenado en partes alícuotas a -70ºC.
Transcripción inversa
Se mezcló RNA vírico (1,5 \mug) con 500 ng de cebador en un volumen de 12 \mul y se incubó la mezcla durante 10 minutos a 70ºC. Se añadieron 4 \mul de tampón RT 5x (Tris-HCl 250 mM, pH de 8,3, KCl 375 mM, MgCl_{2} 15 mM; GibcoBRL/Life Technologies), 2 \mul de DTT 0,1 M y 2 \mul de dNTPs 10 mM (cada uno 2,5 mM) y se incubó la mezcla durante 2 minutos a 42ºC. La transcripción inversa fue llevada a cabo en un volumen final de 20 \mul mediante la adición de 200 unidades de transcriptasa inversa (Superscript II; GibcoBRL/Life Technologies), lo que fue seguido de una incubación a 42ºC durante 60 minutos.
Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
Todas las reacciones PCR que se utilizaron para determinar los extremos 3' y 5' del genoma de NDV (véase más adelante) fueron llevadas a cabo usando DNA polimerasa Taq (Perkin Elmer). Para la clonación de genes de NDV individuales o de cDNAs subgenómicos grandes, se usaron DNA polimerasa Pwo con actividad correctora de errores o mezclas de Taq y Pwo ("Expand High Fidelity Kit" o "Expand Long Template Kit") de acuerdo con las instrucciones del proveedor (Boehringer Mannheim). Todas las muestras fueron incubadas durante 2 minutos a 94ºC antes del inicio del número indicado de ciclos de PCR. Después del número indicado de ciclos de PCR, las muestras fueron incubadas a la temperatura de elongación durante al menos 3 veces la duración del tiempo de elongación del ciclo de PCR. Los fragmentos de la PCR fueron directamente purificados usando el "High Pure PCR Product Purification Kit" (Boehringer Mannheim) o, después de una electroforesis en gel de agarosa, usando el sistema de extracción Qiaex II (Qiagen), esencialmente del modo descrito por los proveedores.
Análisis de secuencias
Todas las secuencias fueron determinadas utilizando el sistema "PRISM Ready Reaction" (Perkin Elmer) para secuenciación cíclica con didesoxiterminadores marcados con colorantes. Las mezclas de reacción (5 \mul) se sometieron a 25 ciclos de multiplicación lineal (10 segundos a 94ºC, 5 segundos a 50ºC, y 4 minutos a 60ºC) en un termociclador GeneAmp 2400. Posteriormente, las mezclas de reacción fueron sometidas a precipitación con etanol, lavadas una vez con etanol al 70%, resuspendidas en 15 \mul de tampón TSR (Perkin Elmer) y calentadas durante 2 minutos a 94ºC antes de ser cargadas en un secuenciador automático Applied Biosystems AB310.
Las secuencias nucleotídicas de los cebadores que se utilizaron para secuenciar el genoma completo de la cepa LaSota de NDV procedían de secuencias publicadas o de secuencias establecidas durante este proyecto de secuenciación. Los cebadores se muestran en la Tabla 1.
Clonación y secuenciación de los extremos 3' y 5' del genoma de la cepa LaSota de NDV
Se determinó la secuencia nucleotídica de los extremos 3' y 5' del genoma de NDV utilizando procedimientos de multiplicación rápida de extremos de cDNA (RACE; del inglés, rapid amplification of cDNA ends). Se utilizó el RNA de NDV en una reacción de transcripción inversa (RT; del inglés, reverse transcription) en un volumen final de 20 \mul usando el cebador p360 (5'-GGCGATGTAATCAGCCTAGTGCTT-3'; nt 14.756-14.779), que procedía de la secuencia publicada del gen L de NDV (Yusoff et al., 1987). Se añadió el cDNA de cadena sencilla (2,5 \mul de la mezcla de RT) a 8 picomoles del cebador de anclaje ALG3 (5'-CACGAATTCACTATCGATTCTGGATCCTTC-3') y se llevó a cabo la ligación durante la noche a temperatura ambiental en 20 \mul de una mezcla de reacción que contenía Tris-HCl 50 mM, pH de 8,0, MgCl_{2} 10 mM, 10 \mug/ml de albúmina sérica bovina, PEG al 25%, HCC 1 mM, ATP 20 \muM y y 10 unidades de RNA ligasa de T4 (New Englands Biolabs), del modo descrito por Tessier et al. (1986). 1 \mul de la mezcla de reacción de ligación fue usado como molde en una reacción PCR usando los cebadores p375 (5'-CAATGAATTCAAAGGATATTACAGTAACT-3'; nt 14.964-14.983) y ALG4 (5'-GAAGGATCCAGAATCGATAG-3'). El segundo cebador es complementario del cebador de anclaje ALG3. Las condiciones de la PCR (40 ciclos) fueron las siguientes: 1 minuto a 94ºC, 1 minuto a 55ºC y 2 minutos a 72ºC. Los productos de PCR fueron purificados y clonados en el vector T pBluescript II-TSK (Ichihara y Kurosawa, 1993). Alternativamente, los productos de PCR purificados fueron tratados con DNA polimerasa I de Klenow para crear extremos romos y fueron clonados en el sitio HincII del plásmido pGEM4Z (Promega). Se secuenciaron trece clones independientes (pBluescript II-TSK 8x y pGEM4Z 5x) para determinar la secuencia de nucleótidos del extremo 5' del genoma de la cepa LaSota de NDV. La secuencia de nucleótidos del extremo 3' fue determinada mediante dos métodos independientes. En el método I, el cebador ALG3 fue ligado al extremo 3' del RNA vírico usando RNA ligasa de T4 del modo descrito por Schütze et al. (1995). La mezcla de reacción (volumen final de 10 \mul) contenía 2,5 \mug de RNA de NDV, 100 picomoles de ALG3, 1 \mul de tampón 10x para RNA ligasa de T4 (Tris-HCl 500 mM, pH de 7,8, MgCl_{2} 100 mM, DTT 100 mM, ATP 10 mM), 1 \mul de DMSO, 1 \mul de hexamina-cloruro de cobalto 10 \muM, 1 \mul de RNasin® (Promega) y 10 unidades de RNA ligasa de T4 (New Englands Biolabs). Se incubó la mezcla durante la noche a temperatura ambiental y se utilizaron 5 \mul de la mezcla de reacción de ligación como molde en una reacción de transcripción inversa, utilizando ALG4 como cebador. Se utilizó 1 \mul de la mezcla de la reacción de RT en una reacción PCR utilizando los cebadores ALG4 y p376 (5'-GAGCCTTAAGGAGCTGCTCGTACTGATC-3'; nt 137-164), que procedía de la secuencia publicada del extremo 3' de NDV (Ishida et al., 1986). Las condiciones de la PCR fueron como las descritas anteriormente para la RACE 5'. En el método II, los extremos 3' y 5' del RNA vírico de NDV fueron ligados entre sí utilizando RNA ligasa de T4 y empleando unas condiciones iguales a las anteriormente descritas para el método I. Se utilizaron 5 \mul de la mezcla de ligación como molde en una reacción de transcripción inversa usando el cebador p360. Se utilizó 1 \mul de la mezcla de la reacción de RT en una reacción PCR usando los cebadores p375 y p376 y las condiciones de PCR anteriormente descritas para la RACE 5'. Los productos de la PCR fueron tratados con DNA polimerasa I de Klenow para crear extremos romos y fueron clonados en el sitio HincII del plásmido pGEM4Z (Promega). Se secuenciaron diez clones independientes (4 del método I y 6 del método II) para determinar la secuencia de nucleótidos del extremo 3' del genoma de la cepa LaSota de NDV.
Construcción del vector de transcripción
Se construyó un vector de transcripción de bajo número de copias utilizando el plásmido pOK12 (Vieira y Messing, 1991) como replicón básico. Se sometió el plásmido pOK12 a digestión con PvuII y se aisló el fragmento de cDNA que contenía el origen de replicación y el gen de resistencia a la kanamicina. Este fragmento de DNA fue ligado a un fragmento Eco47III-AflII (el sitio AflII había sido hecho romo usando DNA polimerasa I de Klenow) del vector 2.0 de transcripción (un generoso obsequio del Dr Andrew Ball; Pattnaik et al., 1992). Del plásmido resultante se suprimió un fragmento XbaI-NheI para eliminar el mayor número posible de sitios de restricción únicos. El plásmido resultante fue denominado pOLTV5 (Figura 1). El vector de transcripción pOLTV5 contiene el promotor de RNA polimerasa de T7 dependiente de DNA, seguido de los sitios de restricción únicos StuI y SmaI, la ribozima autocatalítica del virus delta de la hepatitis (HDV; del inglés, hepatitis delta virus) y la señal de terminación de transcripción procedente del bacteriófago T7. Los fragmentos de DNA clonados entre los sitios de restricción StuI y SmaI pueden ser transcritos in vitro o in vivo usando RNA polimerasa de T7. Después de la transcripción, el extremo 5' de los transcritos resultantes contiene dos restos G codificados por el plásmido. A causa de la acción autocatalítica de la ribozima de HDV, el extremo 3' de los transcritos corresponde al nucleótido terminal exacto del fragmento de DNA clonado (Pattnaik et al., 1992).
Construcción de plásmidos minigenómicos
Con objeto de examinar los requisitos para la replicación y transcripción del NDV, se construyeron plásmidos minigenómicos que contenían las regiones terminales 3' y 5' de NDV que flanqueaban un gen informador que sustituía a todos los genes de NDV (Figura 2). Se generaron fragmentos de DNA que correspondían a las regiones terminales 3' y 5' de NDV por medio de una PCR en que se usaba DNA polimerasa Pwo (30 ciclos; 15 segundos a 94ºC, 30 segundos a 50ºC y 30 segundos a 72ºC) y se usaban plásmidos que contenían los fragmentos RACE 3' y 5' como moldes (véase más arriba).
Se generó la región 3' (nt 1-119) utilizando los cebadores 3UIT (5'-ACCAAACAGAGAATCCGTGAGTTAC
GA-3', nt 1-27) y SEAP3 (5'-ATCGATACTGGTCAGCATGC TGGCAGAAGGCTTTCTCG-3', nt 102-119). Se generó la región 5' (nt 14.973-15.186) utilizando los cebadores SEAP5 (5'-GCATGCTGACCAGTATCGAT ATTACAG
TAACTGTGACT-3', nt 14.973-14.990) y 5NDV (5'-ACCAAACAAAGATTTGGTGAATGACGA-3', nt 15.158-
15.186). Los dos fragmentos de DNA fueron unidos en una PCR de solapamiento (el solapamiento se muestra en letra cursiva en las secuencias de cebador anteriormente mostradas) usando los cebadores 3UIT y 5NDV. El fragmento de DNA resultante, que es una fusión de los extremos 3' y 5' de NDV separados por 20 nucleótidos, fue fosforilado por tratamiento con polinucleótido quinasa de T4 y fue clonado en ambas orientaciones en el plásmido de transcripción pOLTV5 (Figura 1), que fue escindido con StuI y SmaI y fue desfosforilado con fosfatasa intestinal de ternera (Boehringer Mannheim). Finalmente, el gen SEAP (que codifica fosfatasa alcalina secretada) fue recuperado del plásmido pSEAP-Basic (Clontech) por digestión con SphI y ClaI y fue clonado entre los sitios SphI y ClaI, entre los extremos 3' y 5' de NDV. Los plásmidos resultantes fueron denominados pOLTV535 y pOLTV553, respectivamente. Usando RNA polimerasa de T7, la transcripción in vivo o in vitro del plásmido pOLTV535 da lugar a RNA antigenómico ([+]-RNA), mientras que la transcripción del plásmido pOLTV553 da lugar a RNA genómico ([-]-RNA).
Se generaron los plásmidos pOLTV535N0 a -N5 y pOLTV553N0 a -N5 al insertar oligonucleótidos autocomplementarios en el sitio ClaI situado entre el gen SEAP y el extremo 5' de NDV en pOLTV535 y pOLTV553, respectivamente (véase la Figura 2). Los oligonucleótidos utilizados fueron: N0, 5'-CGCGAGCTCG-3'; N1, 5'-CGC
GAGSCTCG-3'; N2, 5'-CGCGAGCGCTCG-3'; N3, 5'-CGCGAGCWGCTCG; N4, 5'-CGCGAGCATGCTCG-3'; N5, 5'-CGCGAGCASTGCTCG-3' (W = A o T; S = C o G).
Modificación del promotor de T7 en los plásmidos pOLTV535 y pOLTV553
Para generar transcritos in vitro o in vivo que contuvieran los auténticos extremos 5'- y 3'-terminales de NDV, se modificó el promotor de T7 en los plásmidos pOLTV535 y pOLTV533 para que la transcripción comenzara en el primer nucleótido del extremo 3'- o 5'-terminal de NDV.
Se diseñaron cebadores que contenían 1) un sitio de restricción BglI, 2) la secuencia del promotor de T7 (mostrada en letra cursiva), que fue modificada para que los dos restos G situados en el extremo del promotor de T7 fueran sustituidos por un resto A, y 3) el extremo 3' (nt 1-21) o 5' (nt 15.164-15.186) de NDV. Se usaron los cebadores BGL3F2 (5'-GATATGGCCATTCAGGCTTAATACGACTCACTATA A CCAAACAGAGAATCCGTGAG-3') y SEAP3 (véase más arriba) para generar un fragmento de DNA que contenía el promotor de T7 modificado y el extremo 3' completo de NDV hasta el inicio del gen SEAP en pOLTV535. Similarmente, se generó un fragmento de DNA que contenía el promotor de T7 modificado y el extremo 5' entero de NDV hasta el final del gen SEAP en pOLTV553 utilizando los cebadores BGL5F2 (5'-GATATGGCCATTCAGGCTTAATACGACTCACTATA A CCAAA
CAAAGATTTGGTGAATG-3') y SEAP5. Los fragmentos resultantes fueron sometidos a digestión con BglI y SphI (extremo 3') o BglI y ClaI (extremo 5'), respectivamente, y fueron utilizados para sustituir el fragmento BglI-SphI en pOLTV535 o el fragmento BglI-ClaI en pOLTV553. Los plásmidos resultantes fueron denominados pOLTV735 y pOLTV753, respectivamente. Se generaron los plásmidos pOLTV735N3 y pOLTV753N3 al insertar un oligonucleótido autocomplementario (5'-CGCGAGCWGCTCG-3'; W = A o T) en el sitio ClaI situado entre el gen SEAP y el extremo 5' de NDV en pOLTV735 y pOLTV753, respectivamente.
Construcción de plásmidos de SEAP-informador
Se construyó el plásmidopCIneoSEAP clonando un fragmento XhoI-ClaI (el sitio ClaI fue hecho romo utilizando DNA polimerasa I de Klenow) que contenía el gen SEAP del plásmido pSEAP-Basic (Promega) entre los sitios XhoI y SmaI del vector de expresión eucariótica pCIneo (Promega). El segundo plásmido contiene el promotor del citomegalovirus humano (hCMV) además del promotor del bacteriófago T7. Con objeto de examinar y cuantificar la expresión de SEAP por los transcritos generados sólo a partir del promotor de T7, se construyó otro plásmido que carecía del promotor de hCMV. Con este fin, el promotor de hCMV fue suprimido de pCIneo mediante digestión parcial con HindIII seguida de digestión completa con BglII. El fragmento de DNA (nt 756-5469 de acuerdo con la numeración de Clontech) a partir del cual se suprimió el promotor de hCMV fue aislado, tratado con DNA polimerasa de T4 para generar extremo romos, y hecho de nuevo circular utilizando DNA ligasa de T4. El plásmido resultante fue denominado pCIneoD. Finalmente, el gen SEAP fue recuperado de pSEAP-Basic como un fragmento MluI-AccI y fue clonado en pCIneoD entre los sitios MluI y ClaI. El plásmido resultante fue denominado pCIneoD SEAP.
Transfecciones
Se sembraron células en placas de cultivo de 24 pocillos, se cultivaron durante la noche hasta una confluencia de 60-80% y se infectaron con FPV-T7, con una multiplicidad de infección de 1, durante una hora a 37ºC. Las células fueron transfectadas con 0,5 \mug de DNA de plásmido minigenómico usando 3 \mul de LipofectAMINE^{TM} y OptiMem esencialmente del modo descrito por el proveedor (GibcoBRL/Life Technologies). Después de una incubación durante 4 horas (células CER) o 16 horas (células QM5) a 37ºC, las células fueron infectadas con NDV (producto virulento de aislamiento holandés, nº 152608; 200 \mul por pocillo) durante 1 hora con una multiplicidad de infección de 5 o fueron dejadas sin infectar. El inoculo fue aspirado y fue sustituido por 1 ml de medio completo, y las células fueron adicionalmente incubadas a 37ºC. Para las cotransfecciones, las células fueron cultivadas en placas de cultivo de 6 pocillos y fueron infectadas con FPV-T7 del modo anteriormente descrito. Las células fueron cotransfectadas con 0,25 \mug de DNA de plásmido minigenómico, 0,4 \mug de pCIneoNP, 0,2 \mug de pCIneoP y 0,2 \mug de pCIneoL(c) o pCIneo utilizando 8 \mul de LipofectAMINE o 9 \mul de FuGene 6 (Boehringer Mannheim). Con objeto de generar el virus infeccioso, el plásmido minigenómico fue sustituido por un plásmido de transcripción que contenía el cDNA de NDV de longitud completa.
Cuantificación de la actividad SEAP
La cantidad de SEAP que fue secretada al medio de cultivo de las células transfectadas fue medida en placas desechables de 96 pocillos utilizando el ensayo Phospha-Light de genes informadores por quimioluminiscencia para el sistema de fosfatasa alcalina secretada, esencialmente del modo descrito por el proveedor (Tropix). La quimioluminiscencia fue cuantificada usando un contador de centelleo para muestras líquidas (Wallac 1450 Microbeta
PLUS).
Clonación y secuenciación de cDNAs que abarcan el genoma entero de la cepa LaSota de NDV
Para clonar y secuenciar el genoma completo de la cepa LaSota de NDV, se generaron clones de cDNA subgenómico grandes por medio de RT-PCR y se clonaron en pGEM-T. La síntesis del cDNA de la primera cadena fue llevada a cabo usando el cebador 3UIT del modo anteriormente descrito, y se usó 1 \mul de la mezcla de la reacción RT en una reacción PCR usando el sistema Expand (Boehringer Mannheim) de PCR con molde largo. La PCR consistía en 5 ciclos de 10 segundos a 94ºC, 30 segundos a 58ºC y 6 minutos a 68ºC, seguidos de 10 ciclos de 10 segundos a 94ºC, 30 segundos a 58ºC y 6 minutos a 68ºC en que el tiempo de elongación a 68ºC era aumentado 20 segundos por ciclo. Los fragmentos de la PCR fueron clonados en pGEM-T usando el sistema de clonación pGEM-T esencialmente del modo descrito por el proveedor (Promega). Se transformó la cepa SURE II de E. coli (Stratagene) con las mezclas de ligación. Se llevaron a cabo dos reacciones RT-PCR independientes (A y B) y cada una produjo un conjunto similar de clones de cDNA. Se determinó la secuencia nucleotídica de los clones de cDNA subgenómico usando cebadores específicos para NDV (Tabla 1) y mediante cebadores que flanqueaban los insertos. Después de la comparación de las secuencias nucleotídicas de las series A y B de clones, las ambigüedades que quedaban fueron resueltas al secuenciar regiones relevantes de una tercera serie independiente de cDNAs (serie C). En la Figura 3 se muestra la secuencia nucleotídica de la cepa LaSota de NDV.
Construcción de un clon de cDNA genómico de longitud completa de NDV
El cDNA de longitud completa de NDV fue ensamblado en el plásmido de transcripción pOLTV5 usando
pOLTV535 como plásmido de partida. Los fragmentos de DNA fueron unidos en solapamientos usando enzimas de restricción comunes, como se detalla en la Figura 4B. En una serie de operaciones de clonación, se construyó un plásmido (denominado p535-DI) que contenía los nucleótidos 1-3521 y 12.355-15.186 separados por un sitio ClaI que fue generado al unir los sitios ClaI en las posiciones 3521 y 12.355. En otra serie de operaciones de clonación, se construyó un plásmido (denominado pGEM-B) que contenía parte del genoma de NDV, incluyendo los nucleótidos 3521-12.355 (fragmento ClaI). Para facilitar la clonación, el último fragmento ClaI fue marcado con el gen de resistencia al cloranfenicol (Cm), procedente del plásmido pACYC184 (Chang y Cohen, 1978). Con este fin, el gen Cm fue recuperado de pACYC184 por medio de una PCR usando los cebadores CAT-F (5'-GCG-TACGTC
TAGACTGGTGTCCCTGTTGATACCGG-3') y CAT-R (5'-GCTCTAGACGTA-CGACCCTGCCCTGAACCGACG-3'). La PCR fue llevada a cabo con DNA polimerasa Pwo y consistía en 30 ciclos de 30 segundos a 94ºC, 45 segundos a 60ºC y 60 segundos a 72ºC. El fragmento de PCR resultante fue sometido a digestión con BsiWI y fue clonado en el sitio BsiWI único de pGEM-B para producir pGEM-B(CAT). El fragmento ClaI de pGEM-B(CAT) fue clonado en el sitio ClaI único de p535-DI para producir pNDFL(CAT). Finalmente, el gen Cm fue eliminado de este plásmido por digestión con BsiWI, lo que fue seguido de nueva ligación y transformación de la cepa DH5a de E. coli. El plásmido resultante fue denominado pNDFL+ y contiene la secuencia entera de cDNA de NDV clonada entre el promotor de T7 y la ribozima de HDV en el plásmido de transcripción pOLTV5.
Clonación y expresión de genes individuales de NDV
Se generaron fragmentos de DNA, cada uno de los cuales contenía los genes LaSota de NDV, por medio de RT-PCR y se clonaron en pCIneo. Después de la clonación, todos los fragmentos fueron secuenciados utilizando cebadores que flanqueaban los insertos y mediante cebadores génicamente específicos.
Gen NP: se usó el cebador 386 (5'-GAGCAATCGAAGTCGTACGGGTAGAAGGTG-3', nt 40-69) para la transcripción inversa. Se usaron los cebadores 365 (5'-GTGTGAATTCCGAGTGCGAGCCCGAAG-3': nt 77-94) y 892 (5'-TTGCATGCCTGCAGGTCAGTACCCCCAGTC-3'; nt 1577-1593) para la PCR usando DNA polimerasa Pwo. Se utilizó el siguiente perfil de PCR (30 ciclos): 30 segundos a 95ºC, 40 segundos a 65ºC y 45 segundos a 72ºC. El fragmento de DNA resultante fue sometido a digestión con EcoRI y fue clonado en pCIneo entre los sitios EcoRI y SmaI. La expresión de NP fue verificada en un ensayo de inmunoperoxidasa en monocapa (IPMA; del inglés, immunoperoxidase monolayer assay) como el descrito por Peeters et al. (1992), utilizando el anticuerpo monoclonal 38 (Russell et al., 1983).
Gene P: se usó el cebador pRT1 (5'-CAAAGAATTCAGAAAAAAGTACGGGTAGAA-3': nt 1794-1814) para la transcripción inversa. Se usaron los cebadores pRT1 y p2 (5'-GCAGTCTAGATTAGCCATTCACTGCAAGGCGC-3'; nt 3053-3071) para la PCR usando DNA polimerasa Pwo. Se utilizó el siguiente perfil de PCR (30 ciclos): 30 segundos a 95ºC, 40 segundos a 65ºC y 60 segundos a 72ºC. El fragmento de DNA resultante fue sometido a digestión con EcoRI y XbaI y fue clonado en pCIneo entre los sitios EcoRI y XbaI. La expresión de P fue verificada mediante un IPMA usando el anticuerpo monoclonal 688 (Russell et al., 1983).
Gen M: se utilizó el cebador 3UIT (5'-ACCAAACAGAGAATCCGTGAGTTACGA-3' nt 1-27) para la transcripción inversa. Se utilizaron los cebadores NDV5M (5'-GGGTGCTAGCGGAGTGCCCCAATTGTGCCAA-3'; nt 3268-3288) y NDV3M (5'-TCTCCCCGGGGCAGCTTATTTCTTAAAAGGAT-3'; nt 4368-4389) para la PCR utilizando el sistema "Expand High Fidelity". La PCR consistió en 10 ciclos de 15 segundos a 95ºC, 30 segundos a 55ºC y 2 minutos a 68ºC, seguidos de 15 ciclos en que el tiempo de elongación a 68ºC fue aumentado 20 segundos por ciclo. El fragmento de DNA resultante fue tratado con DNA polimerasa de T4 para crear extremos romos, sometido a digestión con NheI y clonado en pCIneo entre los sitios NheI y SmaI. La expresión de la proteína M fue verificada mediante un IPMA usando el anticuerpo monoclonal 424 (Russell et al., 1983).
Gen F: se utilizó el cebador 3UIT (véase más arriba) para la transcripción inversa. Se usaron los cebadores NDV5F (5'-ACGGGCTAGCGATTCTGGATCCCGGTTGG-3'; nt 4508-4526) y NDV3F (5'-ACTACCCGGGAAACCTTCG
TTCCTCAT-3': nt 6212-31) para la PCR utilizando el sistema "Expand High Fidelity" y usando las condiciones anteriormente descritas para el gen M. El fragmento de DNA resultante fue tratado con DNA polimerasa de T4 para crear extremos romos, sometido a digestión con NheI y clonado en pCIneo entre los sitios NheI y SmaI. La expresión de la proteína F fue verificada mediante un IPMA usando el anticuerpo monoclonal 8E12A8C3 (ID-DLO; departamento de Virología Aviar).
Gen H: se utilizó el cebador 3UIT para la transcripción inversa. Se utilizaron los cebadores NDV5HN (5'-GTAGGC
TAGCAAGAGAGGCCGCCCCTCAATG-3'; nt 6335-6354) y NDV3HN (5'-CGAGCCCGGGCCGGCATTCGGTTT
GATTCTTG-3': nt 8205-8227) para la PCR utilizando el sistema "Expand High Fidelity" y usando las condiciones anteriormente descritas para el gen M. El fragmento de DNA resultante fue tratado con DNA polimerasa de T4 para crear extremos romos y, después de una digestión con XmaI, fue clonado en pCIneo entre el sitio NheI hecho romo (DNA polimerasa de Klenow) y el sitio XmaI. La expresión de la proteína HN fue verificada mediante un IPMA usando el anticuerpo monoclonal 86 (Russell et al., 1983).
Gen L: el gen L fue recuperado del clon pGME-L7a de cDNA (Figura 4A) por digestión con SacII y SalI. Antes de la digestión con SalI, el sitio SacI fue hecho romo mediante tratamiento con DNA polimerasa de T4. El fragmento resultante fue clonado en pCIneo entre el sitio NheI hecho romo (DNA polimerasa de Klenow) y el sitio SalI. La región no traducida 5' situada entre el promotor de T7 y el codón ATG de inicio del gen L contenía 2 codones ATG fuera de marco que podían interferir en la expresión correcta de la proteína L. Por lo tanto, se construyó un nuevo plásmido en que el primer ATG estaba ausente y en que el segundo ATG había sido cambiado por AAG mediante una mutagénesis por PCR, del modo siguiente. Se utilizaron los cebadores 5LE(E) 5'-CAATGGAATTCAAGG
CAAAACAGCT A A G GTAAATAATACGGG-3'; nt 8332-8374) y 3LE(B) 5'-GTGAATCTAGAATGCCGGATCCG
TACGAATGC-3'; nt 8847-8870) en una reacción PCR utilizando el plásmido pGEM-L7a (Figura 4) como molde. La PCR fue llevada a cabo usando DNA polimerasa Pwo y consistía en 30 ciclos de 30 segundos a 94ºC, 45 segundos a 60ºC y 60 segundos a 72ºC. El fragmento de DNA resultante fue sometido a digestión con EcoRI y XbaI y fue clonado en pCIneo entre los sitios EcoRI y XbaI para generar el plásmido pCIneoL(N). Posteriormente, el fragmento BsiWI-SalI de pGEM-L7a, que contiene la parte restante del gen L (nt 8852-15.046), fue clonado en pCIneoL(N) entre los sitios BsiWI y SalI para generar el plásmido pCIneoL(c). Puesto que no se dispone de anticuerpos contra la proteína L, no se pudo comprobar la expresión de L por inmunoquímica.
Introducción de una etiqueta genética en el gen F
Para mostrar inequívocamente que se puede generar un virus infeccioso a partir de cDNA clonado de longitud completa, se introdujo una etiqueta genética en el gen F mediante mutagénesis por PCR. Con este fin, el gen F fue clonado utilizando dos fragmentos de PCR solapantes. El primer fragmento de PCR fue generado utilizando el cebador NDV5F (véase más arriba) y el cebador F5R (5'- AA A GCGCC G CTGTCTCC T CCC TCCAGATGTAGTCAC-3': nt 4859-4894). Los restos mostrados en letra negrita son cambios que se introdujeron en el cebador con objeto de cambiar la secuencia de aminoácidos del sitio de escisión proteolítica entre F1 y F2, de la de la cepa LaSota de NDV (GGRQGR| L)
a la del sitio de escisión de consenso para cepas de NDV virulentas (GRRQRR| F). El segundo fragmento de PCR fue generado usando los cebadores F3F (5'- GG A GGAGACAG C GGCGC T TT ATAGGCGCCATTATTGG-3'; nt 4875-4911) e IV09 (5'-CTCTGTCGACACAGACTACCAGAACTTTCAC-3'; nt 6246-6266). La PCR fue llevada a cabo con DNA polimerasa Pwo y consistía en 25 ciclos de 15 segundos a 94ºC, 30 segundos a 55ºC y 2 minutos a 72ºC. Los dos fragmentos de PCR solapantes (el solapamiento se muestra con letra cursiva en las secuencias de cebador) fueron unidos en una segunda PCR usando los cebadores NDV5F e IV09 y usando las mismas condiciones de PCR. El fragmento resultante, que contiene el marco de lectura abierto entero del gen F y que codifica un sitio de escisión virulento de consenso, fue sometido a digestión con NheI y SalI y fue clonado en pCIneo entre los sitios NheI y SalI para producir pCIneoF^{wt}. Se usó el fragmento StuI-NotI (nt 4646-4952) de pCIneoF^{wt} para sustituir el fragmento correspondiente en el plásmido p535-S que había sido construido al insertar el fragmento ClaI-ScaI (nt 3521-10311) de pGEM-B en p535DI, entre los sitios ClaI y ScaI (véase la Figura 4C). El plásmido resultante fue denominado p535-S[F^{wt}C]. Un fragmento de PCR que contenía el gen de resistencia a Cm de pACYC184 (véase más arriba) fue clonado como un fragmento XbaI en el sitio XbaI único (posición 6172 en la secuencia del NDV) del plásmido p535-S[F^{wt}C] para producir el plásmido p535-S[F^{wt}C]Cm. Posteriormente, el fragmento ApaI-SpeI marcado con Cm (nt 2285-8094) de este plásmido fue utilizado para sustituir el correspondiente fragmento del clon pNDFL+ de cDNA de longitud completa. Finalmente, el gen Cm fue eliminado de este plásmido por digestión con XbaI, seguida de recircularización usando DNA ligasa de T4. El plásmido resultante, que contiene el cDNA de NDV de longitud completa y genéticamente marcado, fue denominado pNDFL+[F^{wt}].
Generación de líneas celulares establemente transformadas que expresan genes individuales de NDV
Se usaron los plásmidos pCIneoNP, pCIneoP, pCIneM, pCIneoF, pCIneoF^{wt} y pCIneoHN para la generación de líneas celulares establemente transformadas que expresaran individualmente estas proteínas. El día anterior a la transfección, se sembraron células CER en placas de cultivo de 6 cm y se incubaron durante la noche para obtener una confluencia de 60-80%. Las células fueron transfectadas con 2 \mug de DNA plasmídico usando 12 \mul de LipofectAmine y OptiMem, esencialmente del modo descrito por el proveedor (GibcoBRL/Life Technologies). Después de 48 horas, se trataron las células con tripsina y se sembraron diluciones en placas de cultivo de 10 cm, en un medio que contenía 500 \mug/ml de G418 (Boehringer Mannheim). Cada 3 días, el medio fue sustituido por medio fresco que contenía cantidades crecientes (en pasos de 100 \mug/ml) de G418 hasta que se alcanzó una concentración de 800 \mug/ml. Se mantuvieron las células en el medio que contenía 800 \mug/ml de G418 y, tres semanas después de la transfección, se recogieron colonias individuales y se transfirieron a placas de cultivo de 96 pocillos. Las líneas celulares clonadas fueron examinadas en cuanto a la expresión del respectivo gen de NDV usando un IPMA del modo anteriormente descrito para los estudios de expresión transitoria.
Las líneas celulares que expresaban constitutivamente NP, P, M o F pudieron ser identificadas y aisladas. Sin embargo, no fue posible generar líneas celulares que expresaran la proteína HN. Quizás, la expresión constitutiva de HN sea tóxica para las células.
Generación de líneas celulares establemente transformadas que expresan RNA polimerasa de T7
El gen que codifica RNA polimerasa de T7 fue recuperado del plásmido pRT7NT (René van Gennip, ID-DLO, "Department of Mammalian Virology") por digestión con EcoRI y SalI. El fragmento resultante contiene el gen de RNA polimerasa de T7 situado detrás del promotor p10 baculovírico. El fragmento de DNA fue clonado en el plásmido pCIneo0 entre los sitios EcoRI y SalI para generar el plásmido pCIneo107. El plásmido pCIneo0 carece del promotor de T7 y fue obtenido de pCIneo por escisión con NheI seguida de escisión parcial con ScaI, compleción de los extremos pegajosos con DNA polimerasa de Klenow y recircularización utilizando DNA ligasa de T4. Las secuencias baculovirales fueron separadas de pCIneo107 por digestión con EcoRI y PacI, lo que fue seguido de un tratamiento con DNA polimerasa de T4 para generar extremo romos, y recircularización. El plásmido resultante fue denominado pCIneo007. La expresión de la RNA polimerasa de T7 fue verificada mediante la cotransfección de células con pCIneo007 y pPRh01. El segundo plásmido contiene la proteína E2 del virus de la fiebre porcina clásica, clonada detrás de un promotor de T7, y contiene un sitio interno de entrada al ribosoma (Renné van Gennip; comunicación personal). La expresión de E2 fue determinada mediante un IPMA usando el anticuerpo monoclonal V4 (Wensvoort et al., 1986). Líneas celulares CER establemente transformadas que expresaban RNA polimerasa de T7 fueron generadas y aisladas del modo anteriormente descrito salvo porque se usaron placas de cultivo de 10 cm y se transfectaron las células con 5 \mug de DNA de pCIneo007 y 25 \mul de LipofectAmine. Para examinar las líneas celulares individuales en cuanto a la expresión de RNA polimerasa de T7, se transfectaron con el plásmido pPRh01 y se determinó la expresión de E2 (que depende de la RNA polimerasa de T7) mediante un IPMA usando el anticuerpo monoclonal V4. Se identificaron diversas líneas celulares que expresaban RNA polimerasa de T7. Se usó una línea celular, denominada CER-C9, en experimentos subsiguientes.
Clonación y expresión de genes HN y genes HN híbridos
Se utilizó el cebador 3UIT para sintetizar cDNA de cadena sencilla de NDV y paramixovirus aviar de serotipos 2 y 4 (APMV2 y APMV4) del modo anteriormente descrito. Todas las reacciones PCR subsiguientes fueron llevadas a cabo utilizando 25 ciclos de 15 segundos a 94ºC, 30 segundos a 55ºC y 2 minutos a 72ºC. La región de codificación entera del gen HN de APMV2 fue recuperada por medio de una PCR usando los cebadores IV03 (5'-GGGGGAATTCCCCATTCAATGAAGGGTCTAC-3') e IV05 (5'-GATCCCCGGGTCTTAAACCAGGCTTCG
CAATG-3') que procedían de la secuencia del gen HN de APMV2 (GenBank, número de acceso: D14030). La región de codificación entera del gen HN de APMV4 fue recuperada por medio de una PCR usando los cebadores IV06 (5'-GGGGGAATTCTGGTAGGGTGGGGAAGGTAGC-3') e IV08 (5'-ATTGCCCGGGGGGTAACTAATCAGGATCT
CAG-3') que procedían de la secuencia del gen HN de APMV4 (GenBank, número de acceso: D14031). Los fragmentos de PCR resultantes fueron sometidos a digestión (directamente o después de una subclonación en pGEM-T) con EcoRI y XmaI y fueron clonados en pCIneo entre los sitios EcoRI y XmaI. Los plásmidos resultantes fueron denominados pCIneoHN2 y pCIneoHN4, respectivamente.
Se construyeron híbridos entre el gen HN de la cepa LaSota de NDV y los genes HN de APMV2 y APMV4 por medio de una PCR de solapamiento, del modo siguiente. La parte N-terminal (aa 1-141) del gen HN de la cepa LaSota de NDV fue multiplicada con DNA polimerasa Pwo usando los cebadores IV01B (5'-GTAGGAATTCAA
GAGAGGCCGCCCCTCAAT-3': nt 6325-6354) e IV10 (5'- AATGAGTTCTTTGCCTATCCCCCC -3'; nt 6811-6834). La parte C-terminal del gen HN de APMV2 (aa 142-580) fue multiplicada con DNA polimerasa Pwo utilizando los cebadores IV11B (5'-GGGGGGATAGGCAAAGAACTCATT CAAGGAGATGCATCTGCAGGC-3') e IV05. Los fragmentos de PCR resultantes fueron unidos en una PCR de solapamiento (el solapamiento se muestra en letra cursiva) usando los cebadores IV01B e IV05 y usando la mezcla enzimática "Expand High Fidelity". El fragmento de PCR resultante fue sometido a digestión (directamente o después de una subclonación en pGEM-T) con EcoRI y XmaI y fue clonado en pCIneo entre los sitios EcoRI y XmaI. El plásmido resultante, que contiene un gen HN híbrido que consiste en los aminoácidos 1-141 de NDV y los aminoácidos 142-580 de APMV2, fue denominado pCIneoHN1/2^{141}.
La parte C-terminal del gen HN de APMV4 (aa 143-569) fue multiplicada usando los cebadores IV14B (5-GGGGGGATAGGCAAAGAACTCATT GTAGATGATGCATCTGCAGGCCTAAATTTCC-3') e IV08. Este fragmento fue unido con la parte N-terminal del gen HN de NDV (véase más arriba) en una PCR de solapamiento utilizando los cebadores IV01B e IV08. El fragmento de PCR resultante fue sometido a digestión (directamente o después de una subclonación en pGEM-T) con EcoRI y XmaI y fue clonado en pCIneo entre los sitios EcoRI y XmaI. El plásmido resultante, que contiene un gen HN híbrido que consiste en los aminoácidos 1-141 de NDV y los aminoácidos 143-569 de APMV4, fue denominado pCIneoHN1/4^{141}.
Por analogía con las construcciones anteriormente descritas, se construyeron genes HN híbridos que consistían en los aminoácidos 1-143 de NDV y los aminoácidos 144-580 de APMV2, o los aminoácidos 1-143 de NDV y los aminoácidos 145-569 de APMV4. Para estas construcciones, se obtuvieron fragmentos de PCR usando los siguientes pares de cebadores. Aminoácidos 1-143 de NDV: cebadores IV01B e IV13 (5'-ATCTACAATGAGTTCTTTGCCTATC-3'; nt 6816-6840); aminoácidos 144-580 de APMV2: cebadores IV14B (5'-GGGGGGATAGGCAAAGAACTCATTGTA GAT
GATGCATCTGCAGGCCTAAATTTCC-3') e IV05; aminoácidos 145-569 de APMV4: cebadores IV15B (5'-GGGG GGATAGGCAAAGAACTCATTGTAGAT CAAACAGCTGACTACACAGCAG-3') e IV08. Los fragmentos de PCR fueron sometidos a digestión (directamente o después de una subclonación en pGEM-T) con EcoRI y XmaI y fueron clonados en pCIneo entre los sitios EcoRI y XmaI. Los plásmidos resultantes fueron denominados pCIneo1/2^{143} y pCIneo1/4^{143}, respectivamente. Para examinar la expresión de las proteínas HN, se infectaron células CER o células QM5 con FPV-T7 durante 1 hora, con una multiplicidad de infección de 1, y se transfectaron con los plásmidos pCIneoHN, pCIneoHN2, pCIneoNH4, pCIneoNH1/2^{141}, pCIneoNH1/2^{143}, pCIneoNH1/4^{141} y pCIneoNH1/4^{143}, y, 24 horas después de la transfección, las monocapas fueron cubiertas con una suspensión de eritrocitos de gallina al 1% en disolución salina tamponada con fosfato (PBS; del inglés, phosphate buffered saline), durante 45 minutos a temperatura ambiental. Posteriormente, se lavaron cuidadosamente las monocapas tres veces con PBS y se examinó microscópicamente la adhesión de los eritrocitos a las células transfectadas. Para examinar la inducción de la fusión celular después de la coexpresión de las proteínas HN y F, se cotransfectaron células CER o células QM5 con pCIneoF^{wt} junto con pCIneoHN1, pCIneoHN2, pCIneoNH4, pCIneoNH1/2^{141}, pCIneoNH1/4^{141}, pCIneoNH1/2^{143} o pCIneoNH1/4^{143}. Después de una incubación durante 2 ó 3 días, las monocapas fueron lavadas con PBS, teñidas durante 15 minutos con una disolución de Giemsa (dilución 1:30 en agua) y examinadas microscópicamente.
Clonación de genes HN híbridos en cDNA genómico de longitud completa de NDV
Se insertó un conector sintético, denominado HN12, entre los sitios NotI y SpeI de pGEM-T (Promega) usando los oligonucleótidos HN12a (5'-GGCCGCATATTCTAGAGTTAACGACTTA-3') y HN12b (5'-CTAGTAAGTCGT
TAACTCTAGAATATGC-3'). Se insertó un conector sintético, denominado HN14, entre los sitios NotI y SpeI de pGEM-T usando los oligonucleótidos HN14a (5'-GGCCGCATATTCTAGAGTTAACGA-3') y HN14b (5'-CTAGTC
GTTAACTCTAGAATATGC-3'). Los plásmidos resultantes fueron denominados pGEM-HN12 y pGEM-HN14, respectivamente. Estos plásmidos fueron sometidos a digestión con NotI y XbaI y fueron utilizados para clonar el fragmento NotI-SpeI (nt 3390-7488) del plásmido p535-S[F^{wt}c]Cm. Los plásmidos resultantes fueron denominados pGEM-HN1/2NS y pGEM-HN1/4NS, respectivamente. Los genes HN de estos plásmidos fueron sustituidos por los genes HN híbridos de los plásmidos pCIneoHN1/2^{143} y pCIneoHN1/4^{143}, respectivamente (véase la sección "Clonación y expresión de genes HN y genes HN híbridos"). Con este fin, se sometieron pCIneoHN1/2^{143} y pCIneoHN1/4^{143} a digestión con NheI y SmaI y se clonaron los fragmentos resultantes (que contenían los genes HN1/2^{143} y HN1/4^{143} híbridos) entre los sitios NheI y HpaI de los plásmidos pGEM-HN1/2NS y pGEM-HN1/4NS para dar lugar a pGEM+HN12 y pGEM+HN14, respectivamente. Los últimos plásmidos fueron utilizados para introducir los genes HN híbridos en el clon de cDNA genómico de longitud completa de NDV. Con este fin, se sometieron los plásmidos pGEM+HN12 y pGEM+HN14 a digestión con NotI y SpeI y se utilizó el fragmento que contenía el gen HN12 o HN14 para sustituir el correspondiente fragmento de pNDFL+, para producir pNDFL+HN1/2^{143} Cm y pNDFL+HN1/4^{143} Cm, respectivamente. Se eliminó el gen Cm de estos plásmidos por digestión con XbaI, seguida de recircularización usando DNA ligasa de T4. Con objeto de cumplir la "regla del seis", se insertó un conector en el sitio SpeI único de estos plásmidos usando oligonucleótidos autocomplementarios. Se insertó el conector H2 (5'-CTAGCGAGCGCTCG-3') en el plásmido pNDFL+HN1/2^{143} y se insertó el conector H3 (5'-CTAGCGAGCWGCTCG-3) en pNDFL+HN1/4^{143} para obtener los plásmidos pNDFL+HN1/2^{143}(H2) y pNDFL+HN1/2^{143}(H3), respectivamente.
Eliminación de un epítopo específico en la proteína HN de NDV LaSota
Se eliminó un epítopo específico, es decir, los aminoácidos 346 a 354 (PDEQDYQIR) de la proteína HN de NDV LaSota, que es reconocido por el anticuerpo monoclonal 4D6 (Long et al., 1986; Meulemans et al., 1986), al sustituir esta secuencia por la correspondiente secuencia de la proteína HN de APMV-2 (NRTDIQQTI) o APMV-4 (PDPLQDQIL). Con este fin, se usó el plásmido pCIneoHN (véase la sección "Clonación y expresión de genes individuales de NDV") como molde para crear fragmentos de PCR solapantes. Para la secuencia de APMV-2, se generó el primer fragmento de PCR al usar los cebadores IV01 (5'-GTAGACGCGTAAGAGAGGCCGCCCCTCAAT-3') y 3HN2 (5'-GATAGTTTGCTGTATATCAGTCCGATTGCATGTGTCATTGTATCGCTTGTATATCAC-3'). Se generó el segundo fragmento de PCR al usar los cebadores 5HN2 (5'-AATCGGACTGATATACAGCAAACTATCATGGC
CAAGTCTTCGTATAAGCCTGGAGCC-3') y NDV3-HN (5'-CGAGCCCGGGCCGGCATTCGGTTTGATTCTTG-3'). Los fragmentos resultantes fueron combinados y fueron usados como molde para una tercera PCR usando los cebadores IV01B (5'-GTAGGAATTCAAGAGAGGCCGCCCCTCAAT-3') y NDV3-HN. Para la secuencia de APMV-4, se generó el primer fragmento de PCR al usar los cebadores IV01 y 3HN4 (5'-TAAGATCTGATCTTGCAGCGGGT
CAGGGCATGTGTCATTGTATCGCTTGTATATCAC-3'). Se generó el segundo fragmento de PCR al utilizar los cebadores 5HN4 (5'-CCTGACCGCTGCAAGATCAGATCTTAATGGCCAAGTCTTCGTATAAGCCTGGAGCC-3') y NDV3-HN. Los fragmentos resultantes fueron combinados y fueron usados como molde para una tercera PCR usando los cebadores IV01B y NDV3-HN. Los cebadores 3HN2/5HN2 y 3HN4/5HN4 son parcialmente complementarios y contienen los códigos genéticos para la secuencia HN2 (NRTDIQQTI) y la secuencia HN4 (PDPLQDQIL), respectivamente. Las reacciones PCR fueron llevadas a cabo usando el sistema Expand (Boehringer Mannheim) de PCR con molde largo. La PCR consistía en 30 ciclos de 10 segundos a 94ºC, 30 segundos a 58ºC y dos minutos a 68ºC, seguidos de un ciclo de 4 minutos a 68ºC. Los fragmentos de PCR fueron sometidos a digestión con EcoNI y Bsu36I y fueron clonados entre los sitios EcoNI y Bsu36I de pCIneoHN. Los plásmidos resultantes fueron denominados pCIneoHN1(HN2e) y pCIneoHN1(HN4e), respectivamente. Estudios sobre expresión transitoria indicaban que las proteínas HN modificadas eran correctamente expresadas y transportadas a la superficie celular, según se juzgaba por estudios de hemoadsorción usando eritrocitos de gallina. Además, el anticuerpo monoclonal 6D4, que se dirige contra un epítopo lineal de HN de NDV que consiste en (o al menos incluye) los aminoácidos 346-354, no reaccionó con las proteínas HN modificadas.
Se sometieron los plásmidos pCIneoHN1(HN2e) y pCIneoHN1(HN4e) a digestión con NarI y SpeI, y los fragmentos que contenían los genes HN modificados fueron clonados entre los sitios NarI y SpeI de pGEM-HN1/2NS y pGEM-HN1/4NS, respectivamente. Los plásmidos resultantes, denominados pGEM-HN1(HN2e) y pGEM-HN1(HN4e), fueron sometidos a digestión con NotI y SpeI y fueron usados para sustituir el fragmento NotI-SpeI en pNDFL+. Los plásmidos resultantes fueron denominados pNDFL-HN(HN2e)Cm y pNDFL-HN(HN4e)Cm, respectivamente. El gen Cm fue eliminado de estos plásmidos por digestión con XbaI, seguida de religación. Los plásmidos resultantes fueron denominados pNDFL-HN(HN2e) y pNDFL-HN(HN4e), respectivamente.
Resultados Secuencia nucleotídica de los extremos 3'- y 5-terminales del genoma de la cepa LaSota de NDV
Se ha publicado la secuencia de un supuesto extremo 3' del genoma de NDV (Ishida et al., 1986), aunque de una cepa (D26) de NDV distinta a la aquí usada (LaSota). Yusoff et al. (1987) han publicado una secuencia del gen L y de una región no codificadora relativamente grande situada detrás del gen L de la cepa Beaudette C de NDV. Sin embargo, como se muestra aquí, esta secuencia no incluía el extremo 5'-terminal completo del genoma vírico, lo que hace imposible generar una copia infecciosa de NDV. Los extremos 3'- y 5'-terminales del genoma de virus RNA de cadena negativa desempeñan una función esencial en la replicación y la transcripción (Lamb y Kolakofsky, 1996). Por lo tanto, para generar un cDNA de NDV de longitud completa que pueda ser utilizado para generar un virus infeccioso por medio de genética inversa (Conzelmann, 1996), es absolutamente esencial incluir los extremos 3' y 5' correctos del genoma vírico. Por consiguiente, se determinó la secuencia nucleotídica exacta de ambos extremos, 3' y 5', del RNA genómico de la cepa LaSota de NDV usando procedimientos RACE (multiplicación rápida de extremos de cDNA) 3' y 5'. El extremo 5' fue recuperado por medio de una PCR después de la ligación de un cebador de anclaje (ALG3) de cadena sencilla a un cDNA de cadena sencilla que fue generado por transcripción inversa del extremo 5' del RNA genómico. Al utilizar un cebador (ALG4) que es complementario del cebador de anclaje y un cebador específico de NDV, se generaron productos de PCR que contenían el extremo 5'.
Para clonar el extremo 3' de NDV, el cebador de anclaje ALG3 de cadena sencilla fue ligado al extremo 3' del RNA vírico utilizando RNA ligasa de T4 y fue multiplicado por medio de una PCR en que se usó el cebador ALG4 y un cebador específico de NDV (método I). Alternativamente, los extremos 3' y 5' del RNA de NDV fueron ligados entre sí utilizando RNA ligasa de T4, y el RNA concatenado resultante fue utilizado en RT-PCR usando cebadores específicos de NDV que flanqueaban el punto de ligación (método II). Los productos de RACE 3' y 5' fueron clonados en el vector T pBluescript II-TSK (Ichihara y Kurosawa, 1993) o en pGEM4Z, y se aislaron y secuenciaron varios clones independientes. Los resultados están compilados en la Tabla 2. Para permitir la comparación directa de los extremos 3'- y 5-terminales, las secuencias se muestran en forma de cDNA y el extremo 3' de la cadena genómica es representado como extremo 5' de la cadena antigenómica. A nivel de RNA genómico, la secuencia del extremo 3' se lee 3'-UGGUUUGUCUCUUAG mientras que la secuencia del extremo 5' se lee UUUAGAAACAAACCA-5'. La secuencia del extremo 3' es casi similar a la secuencia 3'-terminal publicada de la cepa D26 de NDV (Ishida et al., 1986). Sin embargo, la secuencia del extremo 5' mostró que la cepa LaSota de NDV contiene 64 nucleótidos adicionales en comparación con la secuencia publicada del gen L de la cepa Beaudette C de NDV (Yusoff et al., 1987) (Figura 6).
Replicación de minigenomas de NDV por virus auxiliares
Para determinar si los extremos 3' y 5' de NDV son funcionales en cuanto a la replicación y la transcripción, se construyeron minigenomas que consistían en el extremo 3' de NDV (nt 1-119), un gen informador que codificaba fosfatasa alcalina secretada (SEAP), y el extremo 5' de NDV (nt 14.973-15.186) (Figura 2). Estos minigenomas fueron clonados en ambas orientaciones en el vector de transcripción pOLTV5 para generar los plásmidos pOLTV535 y pOLTV553, respectivamente (para detalles acerca de la construcción, véase "Materiales y Métodos"). El plásmido pOLTV5 (Figura 1) contiene el promotor de RNA polimerasa de T7 seguido de sitios de restricción StuI y SmaI únicos, la ribozima autocatalítica del virus delta de la hepatitis (HDV), y la señal de terminación de la transcripción del bacteriófago T7 (Pattnaik et al., 1992). Usando RNA polimerasa de T7, la transcripción in vivo o in vitro del plásmido pOLTV535 da lugar a RNA antigenómico (o [+]-RNA), mientras que la transcripción del plásmido pOLTV553 da lugar a RNA genómico (o [-]-RNA) (Figura 5).
Para examinar si los RNAs minigenómicos generados por los plásmidos pOLTV535 y pOLTV553 podían replicarse y expresarse usando NDV como virus auxiliar, se utilizaron células CER que expresaban RNA polimerasa de T7, ya fuera constitutivamente (células CER-C9; véase "Materiales y Métodos") o ya fuera después de una infección con fpEFLT7pol recombinante de viruela aviar (Britton et al., 1995; en adelante llamado FPV-T7) que expresa RNA polimerasa de T7. Las células CER-C9 y las células CER infectadas con FPV-T7 fueron transfectadas con el plásmido minigenómico pOLTV535 o pOLTV553 y, después de una incubación durante 3 horas a 37ºC, las células fueron infectadas con NDV durante 1 hora o fueron dejadas sin infectar. Aproximadamente 24 horas después de la transfección, se extrajo una muestra del medio y se analizó la actividad SEAP. Los resultados mostraron que la expresión de SEAP era muy elevada en las células infectadas con FPV-T7 que fueron transfectadas con pOLTV535. Esto no es sorprendente ya que la transcripción por RNA polimerasa de T7 genera [+]-RNA antigenómico que es terminalmente rematado por enzimas del virus de la viruela aviar y que es eficazmente traducido por la célula huésped. En las células transfectadas con pOLTV553, la transcripción por RNA polimerasa de T7 genera [-]-RNA genómico que debe ser convertido en [+]-RNA por el virus auxiliar para que sea traducido en una proteína SEAP (véase la Figura 5). En ambos casos, no se pudo observar un aumento de expresión de SEAP en las células infectadas con NDV en comparación con las células no infectadas. Por el contrario, la expresión de SEAP en las células infectadas con NDV fue consistentemente cerca de dos veces menor que en las células no infectadas (resultados no mostrados). Para las células transfectadas con pOLTV535, esto puede explicarse por el ya elevadísimo nivel de expresión de SEAP por los transcritos generados por RNA polimerasa de T7. Sin embargo, en las células transfectadas con pOLTV553, donde la expresión eficaz de SEAP depende de la conversión de [-]-RNA genómico en [+]-RNA antigenómico o mRNA por el complejo de polimerasa vírico, se había esperado un aumento de la expresión de SEAP después de la infección con NDV. Se podía pensar en dos razones por las que los minigenomas no podían ser expresados y replicados por NDV. En primer lugar, el tamaño de los RNAs minigenómicos no se ajusta a la llamada "regla del seis" (Calain y Roux, 1993; Kolakofsky et al., 1998). De acuerdo con esta regla, los genomas de paramixovirus sólo se replican eficazmente cuando tienen una longitud de 6n nucleótidos. En segundo lugar, los dos restos G extra que están presentes en el extremo 5' de los RNAs minigenómicos podrían interferir en la replicación y/o transcripción correctas por el complejo de polimerasa vírica. Para averiguar si la replicación de los genomas dependía de la regla del seis, se insertó una serie de oligonucleótidos autocomplementarios cortos, con un tamaño creciente en 1 nt, en el sitio ClaI único de los plásmidos pOLTV535 y pOLTV553 (Figura 2). Los plásmidos resultantes (pOLTV535-N0 a -N5 y pOLTV553-N0 a -N5) tenían un tamaño que difería en de 1 a 6 nt y, por lo tanto, uno de ellos debería generar un RNA minigenómico que se ajustara a la regla del seis. Los plásmidos fueron utilizados para transfectar células CER o células CER-C9 infectadas con FPV-T7 del modo anteriormente descrito. Los resultados mostraron que sólo los plásmidos pOLTV535N3 y pOLTV553N3 daban lugar a una actividad SEAP aumentada después de la infección con NDV. Se calculó que la longitud de los RNAs minigenómicos generados por RNA polimerasa de T7 a partir de estos plásmidos era 6n+2. Puesto que están presentes dos restos G extra en el extremo 5' de los RNAs minigenómicos, estos resultados sugieren que, para la regla del seis, sólo es relevante el tamaño de la secuencia de RNA que está situada entre los extremos 3' y 5' auténticos de los RNAs minigenómicos. Esto fue verificado construyendo plásmidos minigenómicos en que el inicio de la transcripción de la RNA polimerasa de T7 fue cambiado para que el primer nucleótido que se incorporara al RNA fuera el primer nucleótido del extremo 3' o 5' de NDV (véase "Materiales y Métodos"). La transfección con estos plásmidos indicó que sólo los RNAs minigenómicos generados por los plásmidos pOLTV735N3 y pOLTV753N3 se replican mediante un virus auxiliar (resultados no mostrados). Estos hallazgos indican de nuevo que la replicación de NDV depende estrictamente de la regla del seis. Además, estos hallazgos indican que la presencia de dos restos G extra en el extremo 5' de los RNAs minigenómicos no interfiere en la correcta replicación. Se han obtenido resultados similares con plásmidos minigenómicos (o plásmidos DI) procedentes de otros Paramyxoviridae (Pattnaik et al., 1992; Harty y Palese, 1995).
Empaquetamiento de minigenomas de NDV por un virus auxiliar
Para determinar si un virus auxiliar podía empaquetar RNAs minigenómicos, el medio de las células transfectadas fue transferido a monocapas frescas y, después de 1 hora de adsorción, las monocapas fueron lavadas tres veces con PBS y fueron adicionalmente incubadas en medio completo. Después de 24 horas de incubación, se midió la actividad SEAP en el medio. Los resultados mostraron que sólo estaba presente actividad SEAP en las células que habían sido tratadas con el medio procedente de células transfectadas con el plásmido minigenómico pOLTV553N3 (Tabla 4). Este hallazgo indica que RNAs minigenómicos pueden resultar empaquetados en envolturas de NDV y que estas partículas son capaces de infectar células. Además, estos resultados muestran que el empaquetamiento depende de la replicación, lo que indica que sólo las moléculas de RNA que están complejadas con las proteínas NP, P y L virales resultan empaquetadas en partículas de tipo viral.
Replicación de minigenomas de NDV por plásmidos que expresan las proteínas NP, P y L
Para determinar si los RNAs minigenómicos también se podían replicar mediante plásmidos que codificaran las proteínas esenciales NP, P y L, se llevaron a cabo experimentos de cotransfección en células infectadas con FPV-T7. Las células fueron transfectadas con una combinación de plásmidos que consistía en el plásmido minigenómico y los plásmidos pCIneo-NP, -P y -L(c), respectivamente. Como testigo negativo, se sustituyó pCIneoL(c), que codifica la proteína esencial L, por el vector plasmídico pCIneo. Los resultados (Tabla 5) indican que, en efecto, los plásmidos que codifican NP, P y L son capaces de replicar RNAs minigenómicos. Los resultados muestran además que, similarmente a la replicación de minigenomas por un virus auxiliar, la replicación por las proteínas NP, P y L también depende de la regla del seis.
Secuencia nucleotídica del genoma completo de la cepa LaSota de NDV
Por medio de RT-PCR, se construyeron fragmentos de cDNA subgenómicos que abarcaban el genoma entero de NDV (Figura 4). Para mantener el número de errores de la PCR en un valor mínimo, se utilizó una mezcla enzimática con actividad correctora de errores ("Expand Long Template"; Boehringer Mannheim), en combinación con un número limitado de ciclos de PCR (15 ciclos). Para la transcripción inversa se utilizó el cebador 3UIT, que es complementario del extremo 3' del RNA de NDV, y, para la PCR, se utilizaron cebadores génicamente específicos. Para identificar posibles errores en la PCR, se llevaron a cabo tres reacciones RT independientes que se utilizaron para generar tres conjuntos independientes de cDNAs subgenómicos. Los cDNAs, cuyo tamaño variaba de aproximadamente 4 a 7 kb, fueron clonados en pGEM-T. La secuencia nucleotídica de los dos conjuntos de cDNAs fue determinada utilizando cebadores que se dedujeron de secuencias de NDV publicadas, o mediante cebadores derivados de la secuencia de NDV que se dedujo durante este proyecto de secuenciación (Tabla 1). Las ambigüedades restantes fueron resueltas secuenciando las regiones relevantes del tercer conjunto de clones de cDNA. El genoma de la cepa LaSota de NDV consiste en 15.186 nucleótidos (Figura 3), lo que le convierte en el más pequeño de todos los genomas paramixovíricos para los que se ha establecido la secuencia entera hasta la fecha (Kolakofsky et al., 1998).
Construcción de un clon de cDNA de NDV de longitud completa en el plásmido de transcripción pOLTV5
Para construir un clon de cDNA de longitud completa de la cepa LaSota de NDV, clones de cDNA solapantes que abarcaban el genoma entero de NDV fueron unidos en sitios de restricción compartidos de acuerdo con la estrategia mostrada en la Figura 4. El cDNA de NDV entero fue ensamblado en el plásmido minigenómico pOLTV535 (véase más arriba), que procede del plásmido de transcripción pOLTV5. Como se puede ver en la Figura 4B, en el ensamblaje del cDNA de NDV completo, la última operación fue la clonación de un fragmento ClaI de aproximadamente 8,8 kb (nt 3521-12.355) procedente de pGEM-B en p535-DI que contenía las secuencias de NDV que flanquean el sitio ClaI en ambos lados (es decir, nt 1-3521 y 12355-15186, respectivamente). Se vio que esta operación era bastante difícil ya que se falló repetidamente a la hora de generar los clones correctos. Por lo tanto, el fragmento ClaI de pGEM-B fue marcado con el gen de resistencia al cloranfenicol (Cm) procedente del plásmido pACYC184. El fragmento ClaI que contiene el gen Cm fue aislado y fue clonado en el sitio ClaI de p535DI, y los transformantes fueron seleccionados en cuanto a la resistencia frente a ambos Cm. Puesto que los transformantes crecían mal, se redujo la selección por antibióticos a 15 \mug/ml de Cm y 10 \mug/ml de Km y se redujo la temperatura de incubación, de 37ºC a 32ºC. Finalmente, el gen Cm fue eliminado de este plásmido por digestión con BsiWI, lo que fue seguido de recircularización utilizando DNA ligasa de T4. Después de la transformación de E. coli, las células que contenían el plásmido deseado fueron fenotípicamente identificadas explorando la resistencia a Km y la sensibilidad a Cm. El plásmido resultante, que consistía en el cDNA de NDV de longitud completa clonado entre los sitios SmaI y StuI del plásmido de transcripción pOLTV5, fue denominado pNDFL+.
Generación de NDV infeccioso a partir de cDNA de longitud completa
Para generar totalmente NDV infeccioso a partir de cDNA clonado, se usó el plásmido pNDFL+ en experimentos de cotransfección con pCIneo-NP, -P y -L(c) del modo anteriormente descrito para los plásmidos minigenómicos. La transfección de células CER y CEF fue controlada utilizando el plásmido minigenómico pOLTV553N3 y midiendo la expresión de SEAP. Como testigo negativo, se sustituyó pCIneoL(c) por pCIneo. Después de la cotransfección, las células fueron incubadas durante un periodo de 3 a 6 días en un medio que contenía fluido alantoico al 5%. La adición de fluido alantoico es necesaria porque las células CER o CEF carecen de las apropiadas proteasas que son necesarias para escindir la proteína F de la cepa LaSota de NDV. La escisión de la proteína F es absolutamente necesaria para la propagación de célula a célula y para la generación del virus infeccioso. Después de 3 días de cultivo, se llevó a cabo una tinción inmunológica de las monocapas fijadas, utilizando un anticuerpo monoclonal contra la proteína F. Los resultados mostraron que las células que resultaron teñidas con el anticuerpo sólo estaban presentes en las monocapas que habían sido cotransfectadas con pNDFL(+), pCIneo-NP, -P y -L(c). Estos resultados indicaban que en estas células se estaban produciendo replicación y expresión de genoma. Se observaron células sin tinción cuando, en los experimentos de cotransfección, se sustituyó pCIneoL(c) por pCIneo. Para recuperar el virus infeccioso, el sobrenadante de las monocapas de CEF transfectadas fue inyectado en la cavidad alantoica de huevos fecundados. Cuatro días más tarde, el fluido alantoico fue recolectado, analizado en un ensayo de hemaglutinación y sometido a pases adicionales por huevos. Los resultados mostraron que sólo el sobrenadante de las células transfectadas con una combinación de pNDFL+ y pCIneo-NP, -P y -L(c) produjo una reacción positiva en el ensayo de hemaglutinación. El fluido alantoico que mostró una reacción de hemaglutinación positiva fue posteriormente analizado en un ensayo de inhibición de la hemaglutinación utilizando los anticuerpos monoclonales 7B7, 8C11, 5A1, 7D4 y 4D6 (Long et al., 1986), que pueden ser usados para diferenciar distintas Cepas de NDV. Los resultados de este ensayo indicaban que la cepa de NDV que fue recuperada de los huevos que habían recibido inóculo mostraba la misma reactividad que la cepa LaSota original. El virus que fue recuperado de los huevos que habían recibido inóculo fue denominado NDFL para distinguirlo de la cepa LaSota original.
Generación de NDV genéticamente modificado, a partir de cDNA de longitud completa
Para mostrar inequívocamente que el sistema de cotransfección podía ser utilizado para recuperar un virus infeccioso a partir de cDNA clonado de NDV, de longitud completa, se introdujo una etiqueta genética en el plásmido pNDFL(+). Con esta finalidad, la secuencia de aminoácidos del sitio de escisión por proteasas de la proteína Fo fue cambiada, de la secuencia de la cepa LaSota (GGRQGR| L) a la secuencia de consenso de las cepas de NDV virulentas (GRRQRR| F) por medio de mutagénesis por PCR (para detalles, véase "Materiales y Métodos"). El plásmido resultante, pNDFL+[F^{wt}], fue utilizado para generar el virus utilizando el sistema de cotransfección anteriormente descrito. El virus infeccioso, denominado NDFL[F^{wt}], fue recuperado del fluido alantoico de los huevos fecundados a los que se había inoculado el medio de células CEF cotransfectadas. En un ensayo de HI, todos los anticuerpos monoclonales, incluyendo 7D4 que es específico para la cepa LaSota, mostraron la misma reactividad con el virus recién generado que con la cepa LaSota original. La secuencia nucleotídica de la región que codifica el sitio de escisión por proteasas de la proteína F fue determinada por medio de RT-PCR. Los resultados mostraron que la secuencia nucleotídica contenía los cambios nucleotídicos exactos que se introdujeron en el cebador mutagénico que fue utilizado para modificar la secuencia original de LaSota. Este hallazgo muestra que el virus procedía del plásmido pNDFL+[F^{wt}] y demuestra que, a partir de cDNA clonado de NDV, de longitud completa, se puede generar completamente el NDV (genéticamente modificado).
El sitio de escisión por proteasas de la proteína Fo de NDV es un determinante esencial para la virulencia
Se supone generalmente que la secuencia de aminoácidos del sitio de escisión por proteasas de la proteína Fo es un determinante esencial para la virulencia de las diferentes cepas de NDV. La generación de una cepa LaSota genéticamente modificada en que la secuencia de aminoácidos del sitio de escisión por proteasas estaba cambiada, de la secuencia de una cepa de NDV lentogénica (no virulenta) a la de una velogénica (virulenta), ofrecía la oportunidad única para probar esta suposición. Por lo tanto, se determinó el índice de patogenicidad intracerebral (ICPI) del virus NDFL[F^{wt}] recién generado y se comparó con el de la cepa NDFL y con el de la cepa LaSota original (clon E13-1). Los resultados mostraron que el ICPI de la cepa NDFL[F^{wt}] era 1,3, el cual está muy por encima del valor para las cepas NDFL (ICPI = 0,0) y el clon E13-1 (ICPI = 0,3). Estos resultados muestran que, como se esperaba, la virulencia del NDV viene determinada en gran medida por la secuencia de aminoácidos del sitio de escisión por proteasas de la proteína Fo.
Introducción de un marcador serológico
Las glicoproteínas F y HN de la envoltura del NDV son las proteínas más inmunogénicas del virus. Después de una infección, tanto la proteína F como la HN provocan una potente respuesta de anticuerpos neutralizantes. La inducción de dicha respuesta de anticuerpos neutralizantes es la base de una vacunación exitosa mediante cepas de NDV no virulentas (tal como la muy utilizada cepa LaSota). Sin embargo, la respuesta de anticuerpos contra las cepas de vacuna de NDV no puede distinguirse de la respuesta de anticuerpos contra cepas de campo virulentas de NDV. Por lo tanto, las infecciones con virus de campo virulentos no pueden ser rastreadas mediante métodos serológicos. Esta situación es indeseable ya que las infecciones por virus de campo son enmascaradas por la vacunación, y los síntomas clínicos causados por las cepas de campo pueden ser pasados por alto o ser incluso atribuidos a la vacuna. Puesto que una diferenciación exitosa entre vacunación e infección es esencial para la erradicación del NDV, se puso en marcha el desarrollo de cepas de NDV genéticamente modificadas (las llamadas vacunas marcadoras) que pudieran ser utilizadas para la vacunación y que pudieran ser serológicamente distinguidas de las cepas de campo de NDV. Con objeto de desarrollar una vacuna marcadora de NDV, el virus ha de ser genéticamente modificado de modo que uno o varios epítopos inmunodominantes de uno de los antígenos (principales) sean suprimidos o modificados. La supresión de parte(s) de una proteína esencial puede conducir a la pérdida de la función biológica de esa proteína. Por lo tanto, se eligió modificar una de las proteínas de envoltura inmunodominantes del NDV de tal modo que se mantuviera la función biológica de la proteína en tanto que el repertorio de anticuerpos contra la proteína modificada difiriera del repertorio contra la proteína original. Por razones especificadas más adelante, para una realización del invento se eligió modificar la proteína HN de NDV. La infección del NDV es iniciada por la fusión de la envoltura del virión con la membrana plasmática de la célula huésped. Para este proceso, se requieren tanto la proteína F como la proteína HN. Se ha mostrado que las proteínas F y HN interaccionan físicamente y que se necesita esta interacción para la fusión de la membrana (Deng et al., 1995). Además, se ha mostrado que la interacción es específica del tipo; es decir, las proteínas F y HN deben proceder del mismo virus para que presenten actividad de fusión. El dominio interaccionante de la proteína HN de NDV ha sido localizado en la llamada región "tallo" o "tronco" de la proteína, que comprende los primeros 92 restos de aminoácido del ectodominio de la proteína HN (Deng et al., 1995). Se mostró que las proteínas HN híbridas que consisten en los aminoácidos 1-141 de NDV y los aminoácidos 141-572 del parainfluenzavirus humano de tipo 3 (hPIV3) conservan la actividad de fusión cuando se coexpresan con la proteína F de NDV. Estos hallazgos sugieren que las cepas de NDV genéticamente modificadas que contienen una proteína HN híbrida que consiste en la región tallo de NDV seguida del cabecero globular de la proteína HN de un diferente serotipo de paramixovirus aviar pueden ser viables. Además, dichas cepas provocarían una respuesta de anticuerpos anti-HN que sería diferente de la provocada por el NDV. Puesto que basta la respuesta de anticuerpos neutralizantes contra la proteína F para permitir una protección eficaz contra una infección por el virus estimulador, dichas cepas de NDV genéticamente modificadas satisfacen los dos requisitos esenciales de una vacuna marcadora, es decir, protección frente a la enfermedad y diferenciación serológica.
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Se construyeron genes HN híbridos que consistían en una fusión de los aminoácidos 1-141 de NDV y los aminoácidos 142-580 de paramixovirus aviar de tipo 2 (denominado HN1/2^{141}) o de los aminoácidos 1-143 de NDV y los aminoácidos 144-580 de APMV2 (denominado HN1/2^{143}). Similarmente, se construyeron genes HN híbridos que consistían en los aminoácidos 1-141 de NDV y los aminoácidos 143-569 de APMV4 (denominado HN1/4^{141}) o de los aminoácidos 1-143 de NDV y los aminoácidos 145-569 de APMV4 (denominado HN1/4^{143}). Los genes híbridos fueron clonados en el vector de expresión eucariótica pCIneo y fueron utilizados en experimentos de cotransfección con un plásmido que contenía la proteína F de NDV. Para este fin, la proteína F fue modificada de modo que la secuencia de aminoácidos del sitio de escisión proteolítica situado entre F2 y F1 resultara cambiada, de la secuencia de LaSota a la secuencia de consenso de cepas virulentas de NDV (F^{wt}; véase la sección "Materiales y Métodos"). Los experimentos de cotransfección en células CER y células QM5 indicaron que tanto HN1/2^{141} como HN1/2^{143}, así como HN1/4^{141} y HN1/4^{143}, inducían fusión celular cuando se coexpresaban con la proteína F^{wt}. Estos resultados indicaban que los complejos entre las proteínas HN híbridas y la proteína F eran biológicamente activos. Se utilizaron las proteínas HN híbridas HN1/2^{143} y HN1/4^{143} para sustituir el gen HN original en el clon pNDFL+ de cDNA de longitud completa, para obtener pNDFL-HN1/2^{143} y pNDFL-HN1/4^{143}. Los dos últimos plásmidos fueron posteriormente utilizados para la generación de un virus infeccioso utilizando el sistema de cotransfección anteriormente descrito. Del fluido alantoico de huevos fecundados a los que se había inoculado el sobrenadante de monocapas transfectadas se pudieron aislar virus recombinantes viables (denominados NDFL-HN1/2^{143} y NDFL-HN1/4^{143}.
La presencia del gen HN híbrido en cada uno de los dos recombinantes fue verificada por medio de RT-PCR. Ensayos de inhibición de la hemaglutinación mostraron que anticuerpos monoclonales y antisueros polivalentes contra NDV eran incapaces de inhibir la aglutinación de eritrocitos de gallina por los virus recombinantes NDFL-HN1/2^{143} y NDFL-HN1/4^{143}. Éstos resultados indican que se pueden usar las cepas NDFL-HN1/2^{143} y NDFL-HN1/4^{143} como vacunas que pueden ser serológicamente distinguidas de las vacunas de NDV clásicas.
Expresión de una proteína heteróloga a partir de NDV recombinante
Para examinar si se pueden insertar genes extraños en el genoma de NDV, se construyó un virus recombinante que llevaba el gen informador SEAP. El gen SEAP procedía del plásmido pOLTV535 y fue modificado para que incluyera las típicas cajas de parada e inicio de la transcripción de NDV. Un fragmento de DNA que contenía el gen SEAP seguido de las cajas de parada e inicio de la transcripción fue insertado en el sitio XmnI (nt 109) del plásmido pNDFL+[F^{wt}]. Se generó un virus infeccioso, denominado NDFL-AP, por medio del sistema de cotransfección y se verificó la presencia del gen SEAP por medio de RT-PCR. Las células infectadas con la cepa NDFL-AP expresaban niveles elevadísimos de la proteína SEAP. Utilizando la actividad específica de la proteína SEAP, se calculó que x% de las proteínas expresadas en células infectadas con NDFL-AP consistían en la proteína SEAP. Estos resultados muestran que, a partir de NDV recombinante, se pueden expresar genes heterólogos en niveles elevadísimos.
Generación de un mutante de NDV por deleción, en una línea celular transcomplementaria
Con objeto de anular la expresión de la proteína M de NDV, una gran parte del gen M fue suprimida por digestión de pNDFL+[F^{wt}] con BsaAI (nt 3087) seguida de digestión parcial con HindIII (nt 4252). Una vez rellenado el extremo HindIII con DNA polimerasa de Klenow, el fragmento fue recircularizado utilizando DNA ligasa de T4 y fue utilizado para transformar E. coli. El plásmido resultante, denominado pNDFL+[F^{wt}]dM, fue usado para generar un virus por medio del sistema de cotransfección en células CER-M transcomplementarias que expresaban la proteína M de NDV. El sobrenadante de las monocapas transfectadas fue sometido a tres pases por células CER-M y fue analizado en cuanto a la presencia de virus. Se obtuvo el virus, como evidenció el hecho de que el sobrenadante de cultivo del tercer pase produjera resultados positivos en los ensayos de hemaglutinación (HA) y de inhibición de la hemaglutinación (HI). El virus fue denominado NDFL-dM. Cuando se utilizó NDFL-dM para infectar monocapas de células CEF, el virus fue aún capaz de propagarse por transmisión célula a célula, como se vio en un IPMA en que se utilizaba un anticuerpo monoclonal contra la proteína F. Como se esperaba, la expresión de la proteína M no se pudo demostrar en un IPMA en que se usaban anticuerpos monoclonales contra la proteína M. Cuando se usó el sobrenadante para infectar células CEF o CER-M, no se pudo mostrar la presencia de un virus replicante en estas monocapas por medio de un IPMA. Este hallazgo indicó que el virus infeccioso no se podía generar en células CEF no complementarias. Este hallazgo fue confirmado por la observación de que la inoculación de sobrenadante de células CEF infectadas, en huevos fecundados, no daba lugar a la generación de progenie viral cuando se probaba en ensayos HA o HI.
La necesidad de vacunas de NDV mejores, y especialmente la necesidad de vacunas marcadores de NDV, impulsó el desarrollo de un sistema de genética inversa que permitiera la modificación genética del NDV. En este documento se describe la generación de NDV infeccioso enteramente a partir de cDNA clonado de longitud completa. Se muestra aquí que la virulencia del NDV puede ser drásticamente cambiada al modificar sólo 3 nucleótidos que determinan la especificidad del sitio de escisión por proteasas de la proteína F. En este caso, el sitio de escisión por proteasas fue cambiado, del sitio de la cepa LaSota al sitio de escisión de consenso de cepas virulentas de NDV. Al generarse esta cepa de NDV genéticamente modificada, se proporciona la prueba formal de que la capacidad de escisión de la proteína F es el determinante esencial (aunque no el único determinante) de la virulencia del NDV. Utilizando el mismo planteamiento de genética inversa, el sitio de escisión puede ser modificado a voluntad por cualquier otra secuencia de aminoácidos. Esto puede conducir a la generación de una serie de cepas de NDV que presenten un espectro de niveles de virulencia.
In vivo
Como ya se mencionó anteriormente, se ha mostrado que, además de la capacidad de escisión de las proteínas F y HN, otros factores víricos pueden contribuir a la patogenicidad. Alteraciones en la transcripción y la traducción pueden modular el crecimiento y la propagación célula a célula del virus y/o la citopatogenicidad. La disponibilidad de un cDNA infeccioso de NDV permite la modificación sistemática de secuencias que están implicadas en la transcripción y la replicación. Esto puede conducir al diseño de nuevas vacunas de NDV que luzcan una inmunogenicidad óptima para una virulencia casi inexistente. La seguridad es una de las propiedades más importantes de las vacunas vivas. Sin embargo, para muchas vacunas vivas, incluyendo de NDV, la inmunogenicidad está a menudo inversamente relacionada con la virulencia. Por lo tanto, una mayor atenuación de las vacunas vivas sin pérdida de inmunogenicidad es una de las alteraciones más deseadas para las que se podría utilizar la modificación genética. A este respecto, merece la pena mencionar que se ha mostrado que la eliminación de la expresión de la proteína V del virus Sendai daba lugar a una patogenicidad in vivo notablemente reducida para ratones (Kato et al., 1997). Similarmente al virus Sendai, el NDV también genera una proteína V mediante un mecanismo conocido como edición de RNA (Steward et al., 1993). Es previsible que la eliminación de la expresión de la proteína V de NDV pueda también dar lugar a un fenotipo atenuado in vivo. Aparte del cambio de la virulencia del NDV, se muestra aquí que es posible modificar la composición antigénica del NDV de tal modo que se puedan generar cepas que puedan ser serológicamente discriminadas de las cepas de campo de NDV. Éstas así llamadas vacunas marcadores son una herramienta inestimable para evaluar la incidencia de NDV en conjuntos animales comerciales por todo el mundo. Además, la aplicación de dichas vacunas marcadoras a gran escala puede conducir finalmente a la erradicación completa del NDV mediante un procedimiento de exploración intensiva y eliminación de conjuntos animales infectados. En este documento se muestra que se pueden insertar genes extraños en el genoma de NDV. Estos genes extraños se pueden expresar con niveles altísimos en células infectadas. Esto muestra que el NDV puede ser utilizado como un vector de vacuna para la expresión de antígenos procedentes de otros patógenos (de aves de corral). Diversas propiedades hacen que el NDV sea un vector de vacuna ideal para la vacunación contra enfermedades respiratorias o intestinales: 1) el NDV puede ser fácilmente cultivado hasta títulos elevadísimos en huevos fecundados; 2) el cultivo masivo de NDV en huevos fecundados es relativamente barato; 3) las vacunas de NDV son relativamente estables y pueden ser simplemente administradas mediante métodos de aplicación masiva tales como adición al agua potable o mediante pulverización o formación de aerosoles; 4) la vía natural de infección del NDV son los tractos respiratorio y/o intestinal, que son también las principales vías naturales de infección de muchos otros patógenos de aves de corral; y 5) el NDV puede provocar inmunidad local a pesar de la presencia de anticuerpos maternos circulantes.
Finalmente, se muestra aquí que se pueden generar mutantes viables de NDV por deleción, usando líneas celulares transcomplementarias. Se generó un mutante de NDV por deleción que es incapaz de expresar la proteína matricial (M) que está implicada en la gemación del NDV en el interior de la membrana celular. Se muestra que una cepa de NDV fenotípicamente complementada que es incapaz de expresar la proteína M es aún capaz de infectar células y de propagarse por medio de transmisión célula a célula. Sin embargo, el virus mutante es incapaz de generar una progenie infecciosa en células no complementarias. Este hallazgo muestra que se pueden usar mutantes de NDV por deleción, fenotípicamente complementados, como vacunas autolimitadas seguras que son incapaces de propagarse por el medio ambiente. Dicha vacuna no transmisible combina la ventaja más importante de las vacunas vivas, es decir, la eficacia, con la ventaja más importante de las vacunas muertas, es decir, la seguridad.
Leyendas Figura 1
El vector de transcripción pOLTV5 es un derivado del vector de transcripción descrito por Pattnaik et al. (1992). Véase el texto para los detalles de la construcción. El plásmido contiene el promotor de RNA polimerasa de T7 dependiente de DNA (mostrado en letra negrita), seguido por los sitios de restricción únicos StuI y SmaI y la ribozima autocatalítica del virus delta de la hepatitis (HDV). Se pueden clonar fragmentos de DNA entre los sitios StuI y SmaI y se pueden transcribir in vitro o in vivo utilizando RNA polimerasa de T7. El extremo 5' de los transcritos resultantes contiene dos restos G extra que no son codificados por el inserto. Debido a la acción de la ribozima, el extremo 3' de los transcritos corresponde exactamente al último nucleótido del inserto.
Figura 2
Estructura de los plásmidos minigenómicos pOLTV535 (Figura 2A) y pOLTV553 (Figura 2B). Los plásmidos minigenómicos se basan en el plásmido de transcripción pOLTV5 (véase la Figura 1) y contiene la región 3' (nt 1-119) y la región 5' (nt 14970-15186) de la cepa LaSota de NDV que flanquean el gen que codifica fosfatasa alcalina secretada (SEAP). La transcripción de pOLTV535 por RNA polimerasa de T7 produce RNA antigenómico (o [+]-RNA), mientras que la transcripción de pOLTV553 produce RNA genómico (o [-]-RNA). Se indican las cajas de inicio (S; del inglés, start) y fin (E; del inglés, end), que son señales de iniciación y terminación de la transcripción vírica. El codón de inicio del gen SEAP está subrayado. También se muestran las secuencias de las inserciones (N0-N5) en el sitio ClaI que generan plásmidos minigenómicos cuya longitud difiere en 1 nt (pOLTV535N0-N5 y pOLTV553N0-N5).
Figura 3
Secuencia de nucleótidos del genoma de la cepa LaSota de NDV y secuencia deducida de aminoácidos de los genes de NDV. La secuencia mostrada corresponde a la cadena antigenómica y se muestra en la dirección 5' a 3' en forma de DNA de cadena sencilla. La secuencia mostrada en esta figura es la secuencia de consenso que fue determinada al secuenciar completamente dos conjuntos independientes de cDNAs subgenómicos solapantes que abarcan el genoma entero del NDV. Las ambigüedades restantes (probablemente como resultado de errores en la PCR) fueron resueltas secuenciando regiones relevantes de un tercer conjunto independiente de clones.
La secuencia del clon pNDFL+ de cDNA de longitud completa que fue ensamblado a partir de clones subgenómicos solapantes de cDNA (véase la Figura 4) difiere de la secuencia de consenso de NDV en las posiciones siguientes (la secuencia de consenso se muestra entre paréntesis): nt 1755, G (A); nt 3766, A (G); nt 5109, G (A); nt 6999, T (C); nt 7056, G (A); nt 9337, G (A); nt 9486, A (T); nt 10195, T (C); nt 13075, A (G). Estas diferencias dan lugar a 3 cambios de aminoácido (la secuencia de consenso se muestra entre paréntesis): Proteína F, R^{189} (Q); proteína HN, S^{200} (P); proteína L, N^{369} (I).
Figura 4
(A) Estrategia global usada para el ensamblaje del cDNA de NDV de longitud completa a partir de clones subgenómicos solapantes de cDNA. El cDNA fue ensamblado en el plásmido pOLTV535 que ya contenía los extremos 3' y 5' de la cepa LaSota de NDV (véase en la Figura 2). El plásmido resultante, denominado pNDFL+, fue utilizado para la generación de NDV infeccioso.
(B) Procedimiento de clonación detallado para el ensamblaje del cDNA de NDV de longitud completa a partir de clones subgenómicos solapantes de cDNA. Cm se refiere al gen de resistencia al cloranfenicol, que fue temporalmente introducido como una etiqueta fenotípica (véase el texto para los detalles).
(C) Procedimiento de clonación detallado para la generación de cDNA de NDV de longitud completa, genéticamente modificado. La modificación consiste en 3 cambios de nucleótido que fueron introducidos en el gen F y que dan lugar a la modificación de la secuencia de aminoácidos del sitio de escisión proteolítica de la proteína F (véase el texto para los detalles).
Figura 5 (A) Serie pOLTV535
La transcripción por medio de la RNA polimerasa de T7 produce RNA antigenómico (o [+]-RNA) que puede ser directamente traducido a proteína SEAP por la célula. Después de la infección de las células por el virus auxiliar (o después de la cotransfección con los plásmidos que codifican NP, P y L), el RNA antigenómico es utilizado por el complejo vírico de polimerasa para la síntesis de RNA genómico (o [-]-RNA). El RNA genómico es luego utilizado por el complejo vírico de polimerasa para la síntesis tanto de mRNA (usando las cajas específicas de inicio [S] y fin [E] de la transcripción) como de RNA antigenómico.
(B) Serie pOLTV553
La transcripción por medio de la RNA polimerasa de T7 produce RNA genómico (o [-]-RNA) que no se puede traducir a proteína SEAP. Después de la infección de las células por el virus auxiliar (o después de la cotransfección con los plásmidos que codifican NP, P y L), el RNA genómico es utilizado por el complejo vírico de polimerasa para la síntesis tanto de mRNA (usando las cajas específicas de inicio [S] y fin [E] de la transcripción) como de RNA antigenómico.
Figura 6
Se proporciona la alineación de extremos 5'-terminales de secuencias de ácido nucleico de LaSota de NDV y otros paramixovirus como comparación de secuencias de NDV a través de los cuatro miembros del género Rubulavirus, tres miembros del género Paramyxovirus y tres miembros del género Morbillivirus. Las secuencias se presentan desde la caja terminal del gen L hasta el extremo 5' (cDNA 3' - 5').
NDV, virus de la enfermedad de Newcastle; hPIV2, parainfluenzavirus humano 2; MuV, virus de las paperas; SV5 y SV41, virus 5 y 41 de simios, respectivamente; SeV, virus Sendai; bPIV3 y hPIV3, parainfluenzavirus bovino y humano, respectivamente; CDV; virus del moquillo canino; MeV, virus del sarampión; RPV, virus de la peste bovina.
Se obtuvieron las secuencias de nucleótidos (nt) de los genomas completos del modo siguiente (nº de acceso): NDV (AF077761); hPIV2 (X57559); MuV (AB000388); SV5 (AF052755); SV41 (X64275); bPIV3 (D84095); hPIV3 (Z11575): CDV (L13194); MeV (X16565); RPV (Z30697).
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(Tabla pasa a página siguiente)
TABLA 1
1
TABLA 1 (continuación)
2
TABLA 1 (continuación)
3
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TABLA 2 Secuencia de los extremos 3'- y 5'-terminales del genoma de la cepa LaSota de NDV
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5
TABLA 3 Replicación de minigenomas por virus auxiliar de NDV
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TABLA 4 Transferencia de actividad SEAP (cps) después del tratamiento de células CER con el sobrenadante de células CER, infectadas con FPV-T7, que habían sido transfectadas con la serie pOLTV553 de plásmidos y que habían sido superinfectadas con NDV (véase la Tabla 3)
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TABLA 5 Actividad SEAP (cps) después de la cotransfección de células CER con la serie pOLTV553 de plásmidos y los plásmidos pCIneoNP, pCIneoP y pCIneoL(c) (o pCIneo como testigo negativo)
9
<110> Stichting Dienst Landbouwkundig Onderzoek
\hskip1cm Peeters, Bernardus P.H.
\hskip1cm Leeuw de, Olav S.
\hskip1cm Koch, Guus
\hskip1cm Gielkens, Arnoud L.J.
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<120> Clones infecciosos del virus de la enfermedad de Newclastle, vacunas y análisis diagnósticos
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<130> P22065PC00
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<140> PCT/NL99/00377
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<141> 1999-06-17
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<150> EP 98202054.7
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<151> 1998-06-19
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<160> 179
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<170> PatentIn Ver. 2.1
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<210> 1
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<211> 24
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(24)
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<223> /nota="Cebador 360"
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<400> 1
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\hskip-.1em\dddseqskip
ggcgatgtaa tcagcctagt gctt
\hfill
24
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<210> 2
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<211> 30
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(30)
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<223> /nota="Cebador de anclaje ALG3"
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<400> 2
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\hskip-.1em\dddseqskip
cacgaattca ctatcgattc tggatccttc
\hfill
30
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<210> 3
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<211> 29
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(29)
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<223> /nota="Cebador p375"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caatgaattc aaaggatatt acagtaact
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador ALG4"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaaggatcca gaatcgatag
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(28)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador p376"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagccttaag gagctgctcg tactgatc
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(27)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 3UIT"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
accaaacaga gaatccgtga gttacga
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(38)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador SEAP3"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atcgatactg gtcagcatgc tggcagaagg ctttctcg
\hfill
38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(38)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador SEAP5"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gcatgctgac cagtatcgat attacagtaa ctgtgact
\hfill
38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(27)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 5NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
accaaacaaa gatttggtga atgacga
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(10)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido N0"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: oligonucleótido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgcgagctcg
\hfill
10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido N1, en el que S = C o G"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: oligonucleótido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgcgagsctc g
\hfill
11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(13)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido N2"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: oligonucleótido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgcgagcgct cgd
\hfill
13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(13)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido N3, en el que W = A o T"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: oligonucleótido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgcgagcwgc tcg
\hfill
13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(14)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido N4"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: oligonucleótido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgcgagcatg ctcg
\hfill
14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido N5, en el que S = C o G"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: oligonucleótido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgcgagcast gctcg
\hfill
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(56)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador BGL3F2"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gatatggcca ttcaggctta atacgactca ctataaccaa acagagaatc cgtgag
\hfill
56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(58)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador BGL5F2"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gatatggcca ttcaggctta atacgactca ctataaccaa acaaagattt ggtgaatg
\hfill
58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(36)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador CAT-F"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gcgtacgtct agactggtgt ccctgttgat accgg
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(33)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador CAT-R"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gctctagacg tacgaccctg ccctgaaccg acg
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 386"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagcaatcga agtcgtacgg gtagaaggtg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(27)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 365"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtgtgaattc cgagtgcgag cccgaag
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 892"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ttgcatgcct gcaggtcagt acccccagtc
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador pRT1"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caaagaattc agaaaaaagt acgggtagaa
\hfill
30
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<222> (1)..(32)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
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\vskip0.400000\baselineskip
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gcagtctaga ttagccattc actgcaaggc gc
\hfill
32
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<211> 31
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(31)
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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gggtgctagc ggagtgcccc aattgtgcca a
\hfill
31
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
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<211> 32
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(32)
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
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\hskip-.1em\dddseqskip
tctccccggg gcagcttatt tcttaaaagg at
\hfill
32
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<222> (1)..(29)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
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\vskip0.400000\baselineskip
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acgggctagc gattctggat cccggttgg
\hfill
29
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<210> 28
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<211> 27
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
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<222> (1)..(27)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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acticccggg aaaccttcgt tcctcat
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<216> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
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<222> (1)..(30)
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<223> /nota="Cebador NDVSHN"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtaggctagc aagagaggcc gcccctcaat
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador NDV3HN"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgagcccggg ccggcattcg gtttgattct tg
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(43)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 5LE(E)"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caatggaatt caaggcaaaa cagctcaagg taaataatac ggg
\hfill
43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 3LE(E)"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtgaatctag aatgccggat ccgtacgaat gc
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
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<222> (1)..(33)
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<223> /nota="Cebador F5R"
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aaagcgccgc tgtctcctcc ctccagatgt agtcac
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(37)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador F3F"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggaggagaca gcggcgcttt ataggcgcca ttattgg
\hfill
37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(31)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV09"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctctgtcgac acagactacc agaactttca c
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(31)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV03"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gggggaattc cccattcaat gaagggtcta c
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV05"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gatccccggg tcttaaacca ggcttcgcaa tg
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(31)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV06"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gggggaattc tggtagggtg gggaaggtag c
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(31)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV08"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
attgcccggg gggtaactaa tcaggatctc ag
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV01B"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtaggaattc aagagaggcc gcccctcaat
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(24)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV10"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aatgagttct ttgcctatcc cccc
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(45)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV11B"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggggggatag gcaaagaact cattcaagga gatgcatctg caggc
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(54)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV14B"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggggggatag gcaaagaact attgtagatg atgcatctgc aggcctaaat ttcc
\hfill
54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(25)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV13"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atctacaatg agttctttgc ctatc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(51)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV15B"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggggggatag gcaaagaact attgtagatc aaacagctga ctacacagca g
\hfill
51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(28)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido conedtor HN12a"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggccgcatat tctagagtta acgactta
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(28)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido conector HN12b"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 47
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctagtaagtc gttaactcta gaatatgc
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(24)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido HN14a"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggccgcatat tctagagtta acga
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(24)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Oligonucleótido HN14b"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 49
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctagtcgtta actctagaat atgc
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1). (14)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Conector H2"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctagcgagcg ctcg
\hfill
14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Conector H3, en el que W = A o T"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctagcgagcw gctcg
\hfill
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> DOMINIO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(9)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Epítopo para MAb 4D6"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 52
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Pro Asp Glu Gln Asp Tyr Gln Ile Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Paramixovirus aviar 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PÉPTIDO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(9)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de la proteína HN de APMV-2 que corresponde con la SEQ ID NO 52"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asn Arg Thr Asp Ile Gln Gln Thr Ile}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Paramixovirus aviar 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PÉPTIDO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(9)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de la proteína HN de APMV-4 que corresponde con la SEQ ID NO 52"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Pro Asp Pro Leu Gln Asp Gln Ile Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV01"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtagacgcgt aagagaggcc gcccctcaat
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(57)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador IV01"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gatagtttgc tgtatatcag tccgattgca tgtgtcattg tatcgcttgt atatcac
\hfill
57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(57)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 5HN2"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aatcggactg atatacagca aactatcatg gccaagtctt cgtataagcc tggagcc
\hfill
57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(50)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 3HN4"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgatcttgca gcgggtcagg gcatgtgtca ttgtatcgct tgtatatcac
\hfill
50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(56)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 5HN4"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 59
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cctgaccgct gcaagatcag atcttaatgg ccaagtcttc gtataagcct ggagcc
\hfill
56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> RNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(24)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador 3'UIT, pos. 1-24"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 64
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
accaaacaga gaatccgtga gtta
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 65
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P386+, pos. 368-387"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 65
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtgatgagga accatgttgc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 66
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P800+, pos. 800-819"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 66
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtccgcatct tcttggttag
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 67
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P1201+, pos. 1201-1220"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 67
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagacttgga gtagagtacg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> RNA_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="extremo 3' de RNA genómico de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 60
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ugguuugucu cuuag
\hfill
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 61
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> RNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> RNA_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="extremo 5' de RNA genómico de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
uuuagaaaca aacca
\hfill
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 62
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> DOMINIO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(7)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia del sitio de escisión por proteasa en la proteína Fo de la cepa LaSota"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 62
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Arg Gln Arg Arg Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 63
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> DOMINIO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(7)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de consenso de las cepas de NDV virulentas"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 63
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Arg Arg Gln Arg Arg Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 64
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 68
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P1279+, pos. 1279-1298"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 68
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agcagcaatg aagggcctgg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 69
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P1356+, pos. 1356-1375"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 69
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aaatcggagt cctcactggg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 70
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P1683+, pos. 1664-1683"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 70
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctctatatga ccacaccctc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 71
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(31)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador PRT1, pos. 1785-1814, (tabla 1)"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 71
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caaagaattc agaaaaaagt acgggtagaa g
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 72
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P2357+, pos. 2358-2377"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 72
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggaaacagtc aggaaagacc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 73
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P2599+, pos. 2599-2618"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 73
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
taagtaaagt tgactatcag
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 74
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P2852+, pos. 2852-2618"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 74
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggcacttaat aaactttcgc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 75
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P3496+, pos. 3496-3515"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 75
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaatgaagaa gccactgtcg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 76
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P3587+, pos. 3589-3608"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 76
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cggagatctt gttgagttgg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 77
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P4267+, pos. 4270-4299"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 77
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cattatccaa gcaggtaccc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 78
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P4731+ (LS), pos. 4733-4752"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 78
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aagctcctcc cgaatctgcc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 79
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P4958+, pos. 4960-4979"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 79
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agctctgata caagccaaac
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 80
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P5266+ (LS), pos. 267-5286"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 80
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctggtgggaa tatggattac
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 81
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P5591+ (LS), pos. 5593-5612"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 81
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agtaacgttc cctatgtccc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 82
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P5616+, pos. 5616-5635"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 82
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtatttattc ctgcttgagc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 83
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P6000, pos. 6166-6190"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P9390+, pos. 9392-9411"
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial; primer
\newpage
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P9686+, pos. 9686-9705"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<221>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P9799+, pos. 9801-9820"
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\hfill
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<221> unión_cebador
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P10601+, pos. 10603-10622"
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<400> 96
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\hfill
20
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P 11006+, pos. 11008-11027"
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P11393+, pos. 11395-11414"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 98
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill
20
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\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P11798+, pos. 11800-11819"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 99
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgatacgata gaactcgtag
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 100
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(24)
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<223> /nota="Cebador L12000, pos. 12008-12031"
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 100
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
catatgtcgc cacatgtgaa ggct
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 101
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 101
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caaccaggac atatgatgag
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 102
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P12796+, pos. 12798-12817"
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
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\hskip-.1em\dddseqskip
tcgactgttc ttaccaactc
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<212> DNA
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<222> (1)..(20)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<222> (1)..(20)
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 119
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\vskip0.400000\baselineskip
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 120
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\hfill
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<222> (1)..(20)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 121
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(24)
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<223> /nota="Cebador P367, pos. 8692-8666"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 122
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\hskip-.1em\dddseqskip
agggacctca atactagcca gttc
\hfill
24
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<210> 123
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P9905-, pos. 9907-9888"
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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<400> 123
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ctctatcaag aggcgattag
\hfill
20
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<210> 124
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P10320-, pos. 10322-10303"
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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taagacagta cttttgcagg
\hfill
20
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P10684-, pos. 10687-10706"
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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gatgcaactg tgtcaacacc
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<212> DNA
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<222> (1)..(20)
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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aattgggcag gagtcagaac
\hfill
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P11510-, pos. 11512-11493"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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tgcctccatg atagcatgcg
\hfill
20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P11903-, pos. 11905-11886"
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\hskip-.1em\dddseqskip
attgcttgga agatggaacc
\hfill
20
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<210> 129
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> unión_cebador
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<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P12717-, pos. 12719-12700"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 129
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgtcatacac tattatggcg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 130
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P13141, pos. 13172-13143"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 130
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caaagagtac cgtgtacaga cagcataacc
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 131
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P13281-, pos. 13302-13283"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 131
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gacatgatag agctcacctg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 132
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Cebador P14101-, pos. 14163-14144"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 132
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
acggaatgca tggcaatcag
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 133
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P14522-, pos. 14524-14505"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 133
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gctcaccaaa ctctctgcac
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 134
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P14687-, pos. 14709-14690"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 134
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aggatctgtc tcgtgcactg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 135
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(28)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P377, pos. 14888-14861"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 135
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tttccttaag tttggtaata cctaggac
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 136
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> unión_cebador
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Cebador P359, pos. 15096-15017"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 136
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caccaagtcg acaattggcc agaaaaggag
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 137
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia del extremo 3' terminal del genoma de la cepa La Sota de NDV de los clones 04, 05, 13, 21, 26, 28, 30, 32 y 33 (representado como extremo 5' de la cadena de DNA antigenómica)"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 137
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
accaaacaga gaatc
\hfill
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 138
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia del extremo 3' terminal del genoma de la cepa La Sota de NDV del clon 31 (representado como extremo 5' de la cadena de DNA antigenómica)"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 138
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gccaaacaga gaatc
\hfill
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 139
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia del extremo 5' terminal del genoma de la cepa La Sota de NDV de los clones r3101-13, r3101-14, r3101-15, r2601-17, r2601-18, r2601-19, r2601-21, y clones pGEM4Z- (representado como DNA)"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 139
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
accaaacaaa gattt
\hfill
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 140
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1). (15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia del extremo 5' terminal del genoma de la cepa La Sota de NDV del clon r2601-20 (representado como DNA)"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 140
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aacaaggtga agata
\hfill
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 141
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(43)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Vector de transcripción pOLTV5"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 141
\vskip1.000000\baselineskip
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ttaatacgac tcactatagg cctggatctt cccgggtcgg cat
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43
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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<400> 142
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ttaatacgac tcactatagg accaaacaga ga
\hfill
32
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<210> 143
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<212> DNA
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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tctttgtttg gtgggtcggc at
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22
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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<212> DNA
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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<212> DNA
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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26
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<211> 27
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
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<223> /nota="Variantes del vector de transcripción pOLTV535 que incluyen la inserción N3 en el sitio ClaI"
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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27
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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\hfill
28
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<211> 29
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> característica_miscelánea
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<222> (1)..(29)
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<223> /nota="Variantes del vector de transcripción pOLTV535 que incluyen la inserción N5 en el sitio ClaI"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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<400> 151
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
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\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 152
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Parte del vector de transcripción pOLTV553 que incluye el promotor de T7"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 152
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32
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<210> 153
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<211> 22
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
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<222> (1)..(22)
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<223> /nota="Parte del vector de transcripción pOLTV553 que incluye el sitio de escisión de ribozima"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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tctgtgtttg gtgggtcggc at
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22
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
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<222> (1)..(25)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Parte del vector de transcripción pOLTV553 que incluye el sitio ClaI"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
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<211> 26
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<222> (1)..(26)
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<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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26
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<221> característica_miscelánea
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<222> (1)..(17)
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<223> /nota="Variantes del vector de transcripción pOLTV553 que incluyen la inserción N0 en el sitio ClaI"
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 156
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
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\hfill
17
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<210> 157
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<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(18)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Variantes del vector de transcripción pOLTV553 que incluyen la inserción N1 en el sitio ClaI"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 157
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgtaatatcc gagsctcg
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 158
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(19)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Variantes del vector de transcripción pOLTV553 que incluyen la inserción N2 en el sitio ClaI"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 158
\vskip1.000000\baselineskip
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tgtaatatcc gagcgctcg
\hfill
19
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 159
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<211> 20
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
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<223> /nota="Variantes del vector de transcripción pOLTV553 que incluyen la inserción N3 en el sitio ClaI"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 159
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\hskip-.1em\dddseqskip
tgtaatatcc gagcwgctcg
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 160
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Variantes del vector de transcripción pOLTV553 que incluyen la inserción N4 en el sitio ClaI"
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 160
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgtaatatcc gagcatgctc g
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 161
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(22)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Variantes del vector de transcripción pOLTV553 que incluyen la inserción N5 en el sitio ClaI"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia Artificial: plásmido
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 161
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgtaatatcc gagcastgct cg
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 162
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15186
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> intron
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(121)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de nucleótido de la cepa La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (122)..(1591)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota=" Secuencia de nucleótido de la cepa La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> intron
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1592)..(1886)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de nucleótido de la cepa La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1887)..(3074)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota=" Secuencia de nucleótido de la cepa La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> intron
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3075)..(3289)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de nucleótido de la cepa La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3290)..(4384)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de nucleótido de la cepa La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> intron
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (4385)..(4543)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de nucleótido de la cepa La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (4544)..(6205)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Secuencia de nucleótido de la cepa La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> intron
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (6206)..(6411)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (6412)..(8145)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> intron
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (8146)..(8380)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (8381)..(14995)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> intron
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (14996)..(15186)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 162
\vskip1.000000\baselineskip
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 163
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 489
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 163
\vskip1.000000\baselineskip
30
31
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 164
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 395
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 164
32
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 165
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 364
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 165
\vskip1.000000\baselineskip
34
35
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 166
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 553
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 166
\vskip1.000000\baselineskip
37
38
39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 167
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 577
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 167
\vskip1.000000\baselineskip
40
41
42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 168
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2204
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 168
\vskip1.000000\baselineskip
43
44
45
46
47
48
49
50
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 169
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(54)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Morbillivirus CDV alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 169
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atacgaaaaa aaacaacggt tattaataag ttatcatacc cagctttgtc tggt
\hfill
54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 170
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(51)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Morbillivirus CDV alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 170
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
attaaagaaa actttgaaaa tacgaagttt ctattcccag ctttgtctgg t
\hfill
51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 171
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(51)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Morbillivirus RDV alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 171
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
actaaagaaa acttcaaaga tgtgaagttt ctatccccag ctttgtctgg t
\hfill
51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 172
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(51)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Paramyxovirus bBIV3 alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 172
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agtaagaaaa acatataata tatatatacc aaacagagtt tttctcttgt ttggt
\hfill
55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 173
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(55)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Paramyxovirus hPIV3 alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 173
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agtaagaaaa acatgtaata tatatatacc aaacagagtt cttctcttgt ttggt
\hfill
55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 174
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 68
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(68)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Paramyxovirus SeV alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 174
100
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 175
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 124
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(124)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 175
101
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 176
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Rubulavirus hPIV2 alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 176
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tttaagaaaa acatattgat tttccccttg gt
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 177
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(35)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Rubulavirus MuV alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 177
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ttaagaaaaa attgatttta ctttctcccc ttggt
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 178
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Rubulavirus SV41 alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 178
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ttaagaaaaa atatccgttc tccccttggt
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 179
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la enfermedad de Newcastle
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(42)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota="Rubulavirus SV5 alineado con La Sota de NDV"
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 179
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ttaagaaaaa agaagaggat taatcttggt tttccccttg gt
\hfill
42

Claims (30)

1. Un cDNA de paramixovirus aviar que comprende al menos el extremo 5'-terminal del genoma del virus de la enfermedad de Newcastle (NDV) que corresponde al extremo 5'-terminal de NDV como el mostrado en la Figura 6, que permite generar una copia infecciosa de paramixovirus aviar.
2. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 1, que comprende un cDNA de longitud completa.
3. Un cDNA que comprende al menos el extremo 5'-terminal del genoma de NDV, que corresponde al extremo 5'-terminal de NDV como el mostrado en la Figura 6, que permite generar un minigenoma replicante de paramixovirus aviar.
4. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 1, 2 ó 3, al menos parcialmente derivado de virus de la enfermedad de Newcastle.
5. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 4, en que dicho virus de la enfermedad de Newcastle es un virus lentogénico, preferiblemente derivado de una cepa de vacuna.
6. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 5, en que dicha cepa de vacuna es una cepa LaSota ATCC VR-699.
7. Un cDNA de acuerdo con cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 6, provisto además de una modificación en un ácido nucleico por medio de una modificación genética, cDNA que comprende el extremo 5'-terminal como el especificado en la Reivindicación 1.
8. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 7, en que dicha modificación comprende un ácido nucleico que codifica un sitio de escisión por proteasas modificado.
9. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 8, en que dicho sitio de escisión es un sitio de escisión por proteasas de la proteína de fusión (F).
10. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 7, en que dicha modificación comprende un ácido nucleico que codifica una proteína híbrida de envoltura vírica.
11. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 10, en que dicha proteína es una proteína hemaglutinina-neuraminidasa (HN).
12. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 7, en que dicha modificación comprende una deleción en un ácido nucleico que codifica una proteína vírica.
13. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 12, en que dicha proteína vírica es una proteína matricial (M).
14. Un cDNA de acuerdo con cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 13, provisto además de un ácido nucleico que codifica un antígeno heterólogo.
15. Un cDNA de acuerdo con la Reivindicación 14, en que dicho antígeno procede de un patógeno de aves de corral.
16. Un RNA obtenido de un cDNA de acuerdo con cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 15.
17. Un método para generar una copia infecciosa de paramixovirus aviar, que comprende transfectar al menos una célula con cDNA de acuerdo con cualquiera de las Reivindicaciones 7 a 15.
18. Un método de acuerdo con la Reivindicación 17, en que dicha célula es al menos capaz de expresar la proteína de la nucleocápsida (NP), la fosfoproteína (P) o la proteína polimerasa grande (L) víricas.
19. Un método de acuerdo con la Reivindicación 17 ó 18, que comprende además permitir la escisión de la proteína de fusión de dicho virus.
20. Un método de acuerdo con cualquiera de las Revindicaciones 17 a 19, que comprende además incubar dicha célula en un medio de cultivo que comprende actividad proteolítica.
21. Un método de acuerdo con la Reivindicación 20, en que dicho medio de cultivo comprende fluido alantoico que comprende dicha actividad proteolítica.
22. Un método de acuerdo con cualquiera de las Reivindicaciones 17 a 21, en que dicha célula procede de una célula de gallina.
23. Un paramixovirus aviar infeccioso que comprende un gen heterólogo obtenible mediante un método de acuerdo con cualquiera de las Reivindicaciones 17 a 22.
24. Una vacuna que comprende un virus de acuerdo con la Reivindicación 23.
25. Una vacuna de acuerdo con la Reivindicación 24, que comprende una vacuna viva.
26. Una vacuna de acuerdo con la Reivindicación 24 ó 25, en que dicha copia infecciosa de paramixovirus aviar procede de un virus de la enfermedad de Newcastle (NDV).
27. Un método para distinguir una muestra de animales no vacunados o animales vacunados con una vacuna de NDV, de muestras de animales infectados con NDV de tipo silvestre o vacunados con una cepa de NDV no modificada o lentogénica, que comprende determinar en al menos una muestra de dichos animales la presencia de anticuerpos dirigidos contra un marcador o epítopo inmunodominante de dicho NDV de tipo silvestre o no modificado pero no de dicha vacuna, en que dicha vacuna de NDV comprende un virus que ha sido obtenido al transfectar al menos una célula con cDNA de acuerdo con la Reivindicación 10 ó 11.
28. Un método de acuerdo con la Reivindicación 27, en que dichos anticuerpos se dirigen contra la proteína HN o F de NDV.
29. Un método de acuerdo con la Reivindicación 27 ó 28, en que dicho animal es seleccionado del grupo compuesto por aves de corral, preferiblemente por gallinas.
30. Un paramixovirus aviar infeccioso de acuerdo con la Reivindicación 23, en que dicho gen heterólogo expresa proteínas inmunoestimulantes.
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