DE3125706C2 - Polypeptide mit der Aminosäuresequenz eines reifen Human-Leukozyten-Interferons ohne Präsequenz, deren Herstellung und Verwendung - Google Patents

Polypeptide mit der Aminosäuresequenz eines reifen Human-Leukozyten-Interferons ohne Präsequenz, deren Herstellung und Verwendung

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Description

Die vorliegende Erfindung betrifft das Gebiet der rekombinanten DNS-Technologie, d. h. Verfahren, die auf diesem Gebiet verwendet werden und Produkte, die mit die­ sen Verfahren erhalten werden.
Genauer gesagt, betrifft die vorliegende Erfindung Polypeptide mit der Aminosäuresequenz eines reifen Human-Leukozyten-Interferons, diese enthaltende pharmazeutische Präparate und ein Ver­ fahren zu deren Herstellung, das darin besteht, daß man eine Kultur eines Mikroorganismus, der mit einem zur Ex­ pression eines solchen Polypeptids befähigten, replikablen Vektor transformiert ist, zur Expression anregt und das Polypeptid isoliert. Die vorliegende Erfindung betrifft ebenfalls die Expressions-Vektoren (im folgenden kurz Vektoren genannt), die in diesem Verfahren verwendet wer­ den und die neuen Mikroorganismen, die diese Vektoren ent­ halten, sowie Verfahren zu deren Herstellung. Schließlich betrifft die Erfindung DNS-Sequenzen, die die Aminosäure­ sequenzen von reifen Human-Leukozyten-Interferonen kodieren.
Hintergrund der Erfindung
Human-Leukozyten-Interferon (LeIF) wurde zuerst von Isaacs und Lindenmann (Proc.R.Soc.B 147, 258-267 [1957]; U.S.P. 3.699.222) entdeckt und in Form der rohen Präzipitate hergestellt. Die seit dieser Zeit andauernden Anstrengungen, das Material zu reinigen und zu charakterisieren, haben zur Herstellung relativ homogener natürlich vorkommender Leukozyten- Interferone aus normalen Leukozyten oder aus Leukozyten von leukami­ schen Spendern geführt (z. B. Deutsche Offenlegungsschrift Nr. 29 47 134 und Französische Offenlegungsschrift Nr. 2442054). Diese Interferone gehö­ ren zu einer Familie von Proteinen, die die bekannte Eigenschaft besitzen, bestimmten Zellen einen Virus-resistenten Zustand zu verleihen. Darüber hinaus kann Interferon die Zell-Proliferation hemmen und die Immunant­ wort modulieren. Diese Eigenschaften haben dazu geführt, daß Leukozy­ ten-Interferon klinisch als therapeutisches Mittel zur Behandlung viraler Infektionen und Krankheiten eingesetzt wurde.
In der Vergangenheit wurden Leukozyten-Interferone im wesentlichen bis zur Homogenität gereinigt (Rubinstein et al., Proc.Natl.Acad.Sci. USA 76, 640-644 [1979]; Zoon et al., ibid. 76, 5601-5605 [1979]). Die berichteten Mole­ kulargewichte liegen im Bereich von etwa 17 500 bis etwa 21 000. Die spezifi­ schen Aktivitäten dieser Präparate sind bemerkenswert hoch mit 2×10⁸ bis 1×10⁹ Einheiten pro mg Protein, aber die aus den Zellkulturen erhaltenen Ausbeuten sind bisher entmutigend niedrig. Trotzdem gelang durch ver­ feinerte Proteinsequenzierungsmethoden die Bestimmung von Aminosäure­ partialsequenzen (Zoon et al., Sience 207) 527 [1980]; Levy et al., Proc.Natl. Acad.Sci. USA 77, 5102-5104 [1980]). Die Frage der Glycosylierung der ver­ schiedenen Leukozyten-Interferone ist bis jetzt noch nicht völlig abgeklärt, aber es ist soviel klar, daß Unterschiede in den Molekulargewichten nicht allein durch Glykosylierung hervorgerufen werden. Der Einfluß von Glyko­ sylierungsinhibitoren auf die Produktion und Eigenschaften natürlich vor­ kommender Interferone wird z. B. in Virology 97, 473-474 [1979] beschrieben und mittels SDS-Polyacrylamid-Gelelektrophorese analysiert. Es ist auch klar, daß die Leukozyten-Interferone deutlich unterschieden sind voneinander durch unterschiedliche Amino­ säurezusammensetzung und -sequenz und die Aminosäurehomologie ist in manchen Fällen niedriger als 80%.
Während das aus Spender-Leukozyten isolierte homogene Leukozyten- Interferon ausreichte zur partiellen Charakterisierung und zu limitierten klinischen Studien, reicht diese Quelle bei weitem nicht aus für die Gewinnung diejenigen Mengen an Interferon, die für breite klinische Prüfungen und die anschließende prophylaktische und/oder therapeuti­ sche Verwendung notwendig sein werden. Tatsächlich bediente man sich bei den bisherigen klinischen Untersuchungen zur Evaluation des Human- Leukozyten-Interterons in Antitumor- und antiviralen Testen haupt­ sächlich rohen Materials (Reinheit < 1%) und die langen Zeiten, die nötig sind, um genügende Mengen reinen Materials zu erhalten, haben zu einer starken Verzögerung von Untersuchungen in größerem Maßstab geführt.
Durch rekombinante DNS-Technologie ist es jedoch inzwischen gelungen, eine große Anzahl wertvoller Polypeptide kontrolliert mikrobiell herzustellen. So existieren inzwischen bereits Bakterien, die durch diese Technologie so modifiziert wurden, daß sie die Herstellung von Polypeptiden wie Somatestatin, den A und B Ketten des Human-Insulins und Human-Wachstumshormon gestatten (Itakura et al., Science 198, 1056- 1063 [1977]; Goeddel et al., Nature 281, 544-548 [1979]). Kürzlich gelang durch die Anwendung der rekombinanten DNS-Technik die bakterielle Herstellung von Proinsulin und Thymosin alpha 1 und verschiedene Autoren haben berichtet, daß es ihnen gelungen ist, Human-Leukozyten- Interferonaktivität zu erhalten (Nagata et al., Nature 284, 316-320 [1980]; Mantei et al., Gene 10, 1-10 [1980]; Taniguchi et al., Nature 285, 547-549 [1980]). Aus der Europäischen Patentanmeldung Nr. 32134 sind ebenfalls Human-Leukozyten-Interferon kodierende DNS und entsprechende Proteine mit Leukozyten-Interferonaktivität bekannt. Es fehlt jedoch die Offenbarung in den vorstehenden wissenschaftlichen Publikationen und in den prioritätsbegründenden Anmeldungen der vorstehenden europäischen Patentanmeldung wie reifes Interferon, d. h. ohne Präsequenz hergestellt werden kann.
Das Zugpferd der rekombinanten DNS-Technologie ist das Plasmid, eine nicht-chromosomale Schleife doppelsträngiger DNS, die in Bakterien und anderen Mikroben oft in vielen Kopien pro Zelle vorliegt. Die in der Plasmid-DNS ent­ haltene Information umfaßt diejenige zur Reproduktion des Plasmids in Tochterzellen (d. h. ein "Replicon") und gewöhn­ lich ein oder mehrere Selektions-Charakteristiken wie, im Fall von Bakterien, die Resistenz gegenüber Antibiotika, die es erlauben, Klone der Wirts-Zelle, die das interes­ sierende Plasmid enthalten, zu erkennen und in einem ausgewählten Medium selektiv zu züchten. Die Nützlichkeit der Plasmide liegt in der Tatsache, daß sie spezifisch durch die eine oder andere Restriktions-Endonuclease (auch Restriktionsenzym genannt) gespalten werden können, wobei jede Endonuclease eine andere Stelle der Plasmid-DNS er­ kennt. Heterologe Gene oder Genfragmente können in das Plasmid an den Spaltstellen oder anschließend an die Spaltstellen rekonstruierte Enden eingefügt werden. Die DNS-Rekombination wird außerhalb der Zelle durchgeführt aber das erhaltene rekombinante Plasmid wird durch einen Vorgang, der als Transformation bekannt ist, in die Zelle eingeführt und große Mengen an heterologe Gene enthalten­ den, rekombinierten Plasmiden können durch Kultivierung der transformierten Zellen erhalten werden. Ist das hetero­ loge Gen in richtiger Weise (d. h. operabel) bezüglich der­ jenigen Teile des Plasmids eingefügt, die für die Transcrip­ tion und Translation der kodierten DNS-Nachricht verant­ wortlich sind, dann kann das erhaltene rekombinierte Plasmid (Expressionsvektor, Vektor) zur Herstellung des Polypeptids verwendet werden, das durch das heterologe Gen kodiert wird. Dieser Prozeß wird als Expression be­ zeichnet.
Die Expression wird ausgelöst in der Promoter-Region, die durch RNS-Polymerase erkannt und gebunden wird. In einigen Fällen, wie z. B. beim Tryptophan- oder "trp"-pro­ moter, der in Zusammenhang mit der vorliegenden Erfindung bevorzugt ist, werden Promotor-Regionen von sogenannten Operator-Regionen überlappt und bilden dann einen kombi­ nierten Promotor-Operator. Operatoren sind DNS-Sequenzen, die von sogenannten Repressor-Proteinen erkannt werden, die wiederum die Frequenz des Transkriptionsbeginns an einem speziellen Promotor regulieren. Die Polymerase wan­ dert an der DNS entlang und überschreibt die Information, die der kodierende Strang enthält, vom 5′- zum 3′-Ende in mRNS, die dann wiederum in das Polypeptid mit der durch die DNS kodierten Aminosäuresequenz übersetzt wird. Jede Amino­ säure eines Polypeptids wird innerhalb des sogenannten Strukturgens durch ein Nukleotid-Triplett oder Codon kodiert. Nach der Bindung an den Promotor transkribiert die RNS- Polymerase zunächst Nukleotide, die eine Ribosomen-Bindungs­ stelle kodieren, dann ein Translations-Startsignal (ge­ wöhnlich ATG, das in der mRNS zu AUG wird) und schließlich die Nukleotid Sequenzen des Strukturgens selbst. Am Ende des Strukturgens werden sogenannte Stopcodons transkribiert, nach denen die Polymerase noch weitere mRNS-Sequenzen bilden kann, die aber wegen des vorhandenen Stopsignals von den Ribosomen nicht mehr übersetzt werden. Die Ribosomen lagern sich an die vorgesehene Bindungsstelle der mRNS an, in Bakterien gewöhnlich während diese entsteht, und stellen dann ihrerseits das kodierte Polypeptid her, beginnend am Translations-Startsignal und endend mit dem bereits er­ wähnten Stopsignal. Das gewünschte Produkt wird hergestellt, wenn die Sequenzen, die die Ribosomen-Bindungsstelle kodieren richtig liegen in Bezug auf das AUG-Startsignal und wenn alle übrigen Kodons mit dem Startsignal in Phase sind. Das gewünschte Polypeptid kann erhalten werden durch Lyse der Wirts-Zelle, Abtrennung von anderen Bakterien­ proteinen und Reinigung in üblicher Weise.
Der vorliegenden Erfindung lag der Gedanke zugrunde, daß die Anwendung der rekombinanten DNS-Technologie (d. h. die Einfügung von Interferongenen in mikrobielle Vektoren und deren Expression unter der Kontrolle mikrobiel­ ler genregulatorischer Elemente) der wirkungsvollste Weg zur Gewinnung großer Mengen Leukozyten-Interferon wäre, welches trotz der Tatsache, daß es nicht glykosyliert ist, wie vielleicht das natürliche, zur klinischen Behand­ lung vieler viraler und neoplastischer Erkrankungen ver­ wendet werden könnte.
Ein erstes Leukozyten-Interferon-Gen wurde erfindungs­ gemäß durch die folgenden Maßnahmen erhalten:
  • (1) Aminosäurepartialsequenzen von homogenem Human­ leukozyten-Interferon wurden verwendet, um synthetische DNS-Sonden zu konstruieren, deren Codons insgesamt alle möglichen Nucleotidkombinationen repräsentierten, durch die die Aminosäurepartialsequenzen kodiert werden können.
  • (2) Es wurden Bänke von Bakterienkolonien herge­ stellt, die komplementäre DNS (cDNS) aus induzierter mRNS enthielten. Andere induzierte und radioaktiv markierte mRNS wurde mit Plasmid-cDNS aus dieser Bank hybridisiert. Hybridisierende mRNS wurde eluiert und auf Translation in Interferon im Oozyten-Test getestet. Plasmid-DNS aus Kolonien, die in diesem Test Interferonaktivität besaßen, wurden ferner auf Hybridisierung mit Sonden die nach (1) erhalten wurden, getestet.
  • (3) Parallel zu dem Vorgehen unter (2) wurde mittels induzierter mRNS erhaltene cDNS in Plasmiden dazu verwendet, eine unabhängige Bank transformierter Kolonien zu bilden. Die gemäß (1) erhaltenen Sonden wurden als Starter für die Synthese radiomarkierter einsträngiger cDNS verwendet, die wiederum als Hybridisierungssonden benutzt wurden. Die synthetischen Sonden hybridisierten mit induzierter mRNS als Matrize und wurden ferner mittels reverser Transkrip­ tion dazu verwendet, induzierte, radiomarkierte cDNS zu bilden. In dieser Weise erhaltene Klone der Koloniebank, die mit radiomarkierter cDNS hybridisierten, wurden weiter­ hin untersucht auf das Vorliegen eines Interferon voll­ ständig kodierenden Gens. Jedes gemäß (1) oder (2) er­ haltene, möglicherweise eine Teilsequenz des Interferons kodierende Genfragment kann als Sonde für ein ungekürztes Gen verwendet werden.
  • (4) Das so erhaltene ungekürzte Gen wurde maßge­ schneidert unter Verwendung synthetischer DNS, um jegliche Leader-Sequenz, die die mikrobielle Expression des reifen Polypeptids Verhindern könnte, auszuschließen und um es in einem Vektor in die richtige Position bringen zu können bezüglich der Startsignale und der Ribosomenbindungsstelle eines mikrobiellen Promoters. Das exprimierte Interferon wurde soweit gereinigt, daß es charakterisiert und seine Aktivität bestimmt werden konnte.
  • (5) Das auf diese Weise erhaltene Interferon-Gen­ fragment konnte seinerseits als Sonde für die Isolierung (mittels Hybridisierung) von weiteren Genen für andere, teilweise homologe Leukozyten-Interferone verwendet werden.
Durch die Anwendung der vorstehend kurz beschriebenen Methoden der rekombinanten DNS-Technologie, wurde die mikrobielle Herstellung der Familie homologer Leukozyten- Interferone (in nicht-glykosylierter Form) als reife Polypeptide, d. h. im wesentlichen frei von entsprechenden Präsequenzen oder Teilen davon, erreicht. Diese Interferone können direkt exprimiert, isoliert und soweit gereinigt werden, daß sie für die Verwendung zur Behandlung viraler und bösartiger Krankheiten von Tieren und Menschen ge­ eignet sind.
Einzelne Glieder der Interferon-Familie, soweit sie exprimiert wurden, waren in in vitro-Tests wirksam und, in einem ersten derartigen Versuch, ebenfalls in einem in vivo-Test, wobei es sich bei letzterem um die Prüfung des ersten mikrobiell hergestellten reifen Leukozyten-Interferons handelte.
Der Ausdruck "reifes Leukozyten-Interferon", der im Zusammenhang mit der vorliegenden Anmeldung verwendet wird, definiert ein mikrobiell (z. B. bakteriell) hergestelltes Interferonmolekül, das keine Glykosylgruppen trägt. Reifes Leukozyten-Interferon, gemäß vorliegender Erfindung, wird von einem Translations-Startsignal (ATG) direkt vor dem ersten Aminosäurecodon des natürlichen Produktes exprimiert. Das "reife" Polypeptid kann daher als erste Aminosäure seiner Sequenz Methionin (für das ATG codiert) enthalten, ohne daß damit sein Charakter wesentlich geändert würde. Andererseits kann der mikrobielle Wirt aus dem unmittel­ baren Translationsprodukt das Methionin abspalten. Reifes Leukozyten-Interferon kann zusammen mit einem konjugierten Protein, das nicht ein üblicher Leader ist exprimiert werden, wobei das Konjugat spezifisch intra- oder extra­ zellulär gespalten werden kann (vergleiche britische Patentanmeldung Nr. 2007676A). Schließlich kann das reife Interferon zusammen mit einem mikrobiellen "Signal-Peptid" hergestellt werden, das das Konjugat an die Zellwand transportiert, wo die Signalsequenz abgespalten und das reife Polypeptid sezerniert wird. Expression von reifem Leukozyten-Interferon bedeutet bakterielle oder andere mikrobielle Herstellung eines Interferonmoleküls, das weder Glykosylgruppen noch eine Präsequenz enthält.
Die Aminosäuresequenzen der einzelnen Leukozyten- Interferone (Fig. 4 und 9) wurden auf Grund der DNS- Sequenzen der entsprechenden Gene (Fig. 3 und 8) er­ mittelt. Für alle diese einzelnen Leukozyten-Interferone existieren natürliche, von Individuum zu Individuum unter­ schiedliche allelische Varianten. Diese Varianten können gekennzeichnet sein durch Austausch (Substitution, Inver­ sion), Deletion oder Insertion einzelner oder mehrerer Aminosäuren in der Sequenz. Derartige allelische Variationen der erfindungsgemäßen Leukozyten-Interferone A bis J sind von den jeweiligen Formeln (LeIF A bis LeIF J) mitumfaßt und ebenfalls Gegenstand der vorliegenden Erfindung.
Beschreibung der Figuren
Fig. 1 beschreibt zwei Aminosäurepartialsequenzen, die allen Interferonspezies, die aus menschlichen Leuko­ zyten isoliert und bis zur Homogenität gereinigt wurden, gemeinsam sind. Sie sind als T-1 und T-13 bezeichnet. Es sind alle möglichen mRNS-Sequenzen, die diese Peptide kodieren, dargestellt, ebenso wie die entsprechenden cDNS-Sequenzen. Die Buchstaben A, T, G, C und U bezeichnen die Nucleotide mit den Basen Adenin, Thymin, Guanin, Cytosin und Uracil. Der Buchstabe N bedeutet A, G, C oder U. Die Polynucleotide sind vom 5′-Ende (links) zum 3′-Ende (rechts) angegeben und wo sie doppelsträngig dargestellt sind, ist die untere DNS (nicht-kodierender Strang) von 3′- in 5′-Richtung wieder­ gegeben.
Fig. 2 stellt ein Autoradiogramm dar, das die Hybri­ disierung von möglichen LeIF-Plasmiden mit ³²P-markierten synthetischen Deoxyoligonukleotiden zeigt.
Fig. 3 gibt die Nukleotidsequenzen (kodierende Stränge) von acht isolierten Genfragmenten (bezeichnet A-H) wieder, die für die Expression von Leukozyten-Interferonen verwendet werden können. Der ATG Translations-Start-Codon und die Stoptripletts für jedes LeIF sind unterstrichen. Auf die Stoptripletts folgen unübersetzte Sequenzen. Dem vollständigen Gen für LeIF A fehlt ein Codon in der Posi­ tion 200 bis 202, der bei den anderen LeIFs vorhanden ist. Vor der Leader-Sequenz liegen ebenfalls unübersetzte Se­ quenzen. Dem isolierten Fragment E fehlt die volle Leader- Präsequenz, aber es enthält das vollständige Gen für ein etwaiges reifes LeIF E. Dem isolierten Fragment G hinge­ gen fehlt ein Teil der kodierenden Sequenz.
Fig. 4 gibt einen Überblick über die aus den be­ stimmten Nukleotidsequenzen abgeleiteten Aminosäure­ sequenzen von 8 Leukozyten-Interferonen (A bis H). Die für die Bezeichnung der einzelnen Aminosäuren verwendeten großen Buchstaben sind die von der IUPAC-IUB Kommission für biochemische Nomenklatur empfohlenen. Es bedeuten: A Alanin; C Cystein; D Asparaginsäure; E Glutaminsäure; F Phenylalanin; G Glycin; H Histidin; I Isoleucin; K Lysin; L Leucin; M Methionin; N Asparagin; P Prolin; Q Glutamin; R Arginin; S Serin; T Threonin; V Valin; W Tryptophan; und Y Tyrosin. Die Zahlen geben die Position der Aminosäuren an (S bezieht sich auf das Signal-Peptid). Der Bindestrich in der 165 Aminosäuren umfassenden Sequenz von LeIF A in Position 44 wurde eingeführt, um die Sequenz des LeIF A in Übereinstimmung mit den 166 Aminosäuren der anderen Leukozyten-Interferone zu bringen. Für die Festlegung der Aminosäuresequenz des LeIF E wurde das Nukleotid in Position 187 (Fig. 3) nicht berücksichtigt. Die Sterne (Sequenz von LeIF E) stellen in-Phase-befindliche Stopcodons dar. Amino­ säuren, die allen LeIFs (mit Ausnahme des Pseudogens LeIF E) gemeinsam sind, sind in Zeile "All" dargestellt. Die unterstrichenen Reste sind Aminosäuren, die auch im Human- Fibroblasten-Interferon vorkommen.
Fig. 5 gibt die Restriktionsendonuclease-Karten der klonierten cDNSs von 8 verschiedenen Leukozyten-Interferonen wieder (A bis H). Die hybriden Plasmide wurden nach der dC : dG-Tailing-Methode (Goeddel, D.V. et al, Nature 287, 411-416 [1980)) hergestellt. Die cDNS-Einsätze können daher mit PstI herausgeschnitten werden. Die Linien an den Enden jedes cDNS-Einsatzes stellen die anschließenden homopolymeren dC : dG-Schwänze dar. Die Lage der PvuII-, EcoRI- und BglII-Restriktionsstellen sind angegeben. Schattierte Regionen in der Figur stellen kodierende Se­ quenzen für reife LeIFs dar; die schräg-gestrichelten Re­ gionen bezeichnen kodierende Sequenzen für Signalpeptide, während die weißen Regionen nicht-kodierende Sequenzen darstellen.
In Fig. 6 wird schematisch die Konstruktion eines Gens, das die direkte mikrobielle Synthese von reifem LeIF A kodiert, dargestellt. Es werden die Restriktionsstellen (PstI, usw.) sowie die verwendeten Bruchstücke gezeigt. Die Abkürzung "b.p." bedeutet Basenpaare.
Fig. 7 (nicht maßstabsgerecht) stellt schematisch die Restriktions-Karte von 2 Genfragmenten dar, die zur Expression von reifem LeIF B verwendet wurden. Die be­ zeichneten Nukleotid-Codons sind die Enden der kodierenden Stränge, die durch Behandlung mit dem Restriktionsenzym Sau3a in den beiden dargestellten Fällen entstehen.
Die Fig. 8 und 9 geben die DNS- und Aminosäurese­ quenzen der Leukozyten-Interferone A, C, H, I und J wieder. In Fig. 9 bedeutet der Stern einen Stopcodon in der ent­ sprechenden DNS-Sequenz, während der Bindestrich in der Se­ quenz von LeIF A die benachbarten Aminosäuren, Phenyl­ alanin und Glycin miteinander verbindet.
Beschreibung der bevorzugten Ausführungsformen A. Die verwendeten Mikroorganismen
Die beiden folgenden Mikroorganismen wurden verwendet:
E. coli x 1776, wie beschrieben in U.S.P. 4.190.495, und E. coli K-12 Stamm 294 (end A, thi, hsr-, hsm⁺k), wie in der britischen Patentanmeldung Nr. 2055382 A beschrieben. Beide Organismen wurden bei der American Type Culture Collection deponiert unter den ATCC Nr. 31537 und 31446. Die gesamte Arbeit wurde unter Beachtung der Richtlinien des National Institute of Health durchgeführt.
Außer den beiden oben genannten E. coli-Stämmen können aber auch andere Stämme, beispielsweise E. coli B oder weitere Mikroben-Stämme, verwendet werden, von denen die meisten an einem Depositorium, wie der American Type Culture Collection, hinterlegt worden sind und allgemein zugänglich sind. Vergleiche auch Deutsche Offenlegungs­ schrift 26 44 432. Weitere Mikroorganismen, die erfindungs­ gemäß verwendet werden können, sind z. B. Bacilli, wie Bacillus subtilis und andere Enterobacteriaceae, unter denen vor allem Salmonella typhimurium und Serratia marcescens zu nennen wären, die unter Verwendung von replikablen Plas­ miden heterologe Gene zur Expression bringen können. Auch in Hefen, beispielsweise in Saccharomyces cerevisiae, können Interferongene zur Expression gebracht werden unter der Kontrolle eines Hefepromotors.
B. Quelle und Reinigung von LeIF mRNS
LeIF mRNS kann von Human-Leukozyten (normalerweise von CML-Patienten), die zur Produktion von Interferon mit Sendai-Virus oder NDV, wie beispielsweise in der deutschen Offenlegungsschrift Nr. 29 47 134 beschrieben, angeregt wurden, erhalten werden. Eine besonders bevorzugte und für die vorliegende Arbeit verwendete Quelle ist eine Zellinie, die KG-1 bezeichnet ist und sich von einem Patienten mit akuter myelogener Leukämie ableitet. Die Zellinie, beschrieben von Koeffler, H.P. und Golde, D.W., Science 200, 1153 (1978), wächst schnell in einem Medium enthaltend RPMI (Rosewell Park Memorial Institute) 1640 mit 10% FCS (fötales Kälber­ serum), hitzeinaktiviert, 25 mM HEPES-Puffer (N-2-Hydroxy­ ethyl-piperazin-N′-2-ethan-sulfonsäure) und 50 µg/ml Gentamycin. Die Zellen können in dem vorstehend beschriebenen Medium nach Zusatz von 10% Dimethylsulfoxid eingefroren werden. Die KG-1 Linie ist bei der American Type Culture Collection unter der ATCC Nr. CRL 8031 deponiert worden.
Die KG-1-Zellen wurden nach der von Rubinstein et al. in (Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 76, 640-644 [1979]) be­ schriebenen Weise mit Sendai-Virus oder NDV zur Produktion von Leukozyten-Interferon-mRNS angeregt. Die Zellen wurden 5 Stunden nach der Induktion geerntet und die mRNS wurde nach der Guanidinthiocyanat-Guanidinhydrochlorid-Methode (Chirgwin et al., Biochemistry 18, 5294-5299 [1979]) herge­ stellt. RNS aus nicht-induzierten Zellen wurde in der gleichen Weise isoliert. Oligo-deoxythymidin (dT)-Cellulose- Chromatographie und Saccharose-Gradient-Ultrazentrifugation wurden benutzt, um die 12S Fraktion von Poly(A)-mRNS, wie von Green et al. (Arch. Biochem. Biophys. 172, 74-89 [1976]) und Okuyuma et al. (Arch. Biochem. Biophys. 188, 98-104 [1989]) beschrieben, zu erhalten. Diese mRNS hatte einen Interferontiter von 8000-10 000 Einheiten pro Microgramm im Xenopus laevis Oozytentest (Cavalieri et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74, 3287-3291 (1977])).
C. Herstellung von Koloniebänken, die LeIF-cDNS- Sequenzen enthalten.
5 µg mRNS wurde zur Herstellung doppelsträngiger cDNS nach Standardmethoden (Wickens et al., J. Biol. Chem. 253, 2483-2495 (1978) und Goeddel et al., Nature 281, 544-548 [1979]) verwendet. Die cDNS wurde der Größe nach fraktioniert durch Elektrophorese an einem 6% Polyacryl­ amidgel und 230 ng des Materials mit 500-1500 Basenpaaren wurden durch Elektroelution isoliert. 100 ng dieser cDNS wurden mit Deoxycytidin (dC)-Resten nach der von Chang et al. (Nature 275, 617-624 [1978]) beschriebenen Methode verlängert, verbunden mit 470 ng des Plasmids pBR322, welches mit Deoxyguanosin (dG)-Resten an der PstI-Spaltstelle (Bolivar et al., Gene 2, 95-113 [1977)) verlängert worden war und zur Transformation von E. coli x 1776 verwendet. Es wurden etwa 130 Tetracyclin-resistente, Ampicillin-empfind­ liche Transformanten pro ng cDNS erhalten.
In einem zweiten ähnlichen Experiment wurden etwa 1000 Tetracyclin-resistente, Ampicillin-empfindliche E. coli K-12 Stamm 294-Transformanten pro ng cDNS erhalten. In diesem Falle lag die Größe des fraktionierten cDNS-Materials zwischen 600 und 1300 Basenpaaren. Es wurde durch Elektro­ elution für die Verlängerung mit Deoxycytidin (dC) gewonnen.
D. Herstellung synthetischer Oligonucleotide und deren Verwendung
Die Kenntnis der Aminosäuresequenzen verschiedener tryptischer Fragmente von humanen Leukozyten-Interferonen erlaubte die Synthese von Deoxyoligonukleotiden, die be­ stimmten Regionen der LeIF mRNS komplementär waren. Die beiden tryptischen Peptide T1 und T13 wurden ausgewählt, weil ihre Aminosäuresequenzen die Synthese von nur 12 bzw. 4 Undecameren erforderte, um alle möglichen Nucleotid­ sequenzen zu erfassen (Fig. 1). 4 Sätze von Deoxynukle­ otidsonden wurden für jede Sequenz synthetisiert, die ent­ weder 3 (T-1A, B, C, D) oder ein (T-13A, B, C, D) Oligo­ nucleotid enthielten. Die bezeichneten komplementären Deoxy­ oligonucleotide aus jeweils 11 Basen wurden chemisch synthe­ tisiert nach der Phosphortriestermethode (Crea et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 75, 5765-5769 [1978)). In der T-13 Serie wurden 4 individuelle Sonden hergestellt. Die zwölf T-1 Sonden wurden in vier Pools zu 3 Sonden, wie in Fig. 1 gezeigt, hergestellt.
Die vier individuellen Sonden der T-13 Serie und die zwölf T-1 Sonden, hergestellt in je vier Gruppen zu 3 Sonden, wurden verwendet, um die Synthese radiomarkierter ein­ strängiger cDNS zum Gebrauch als Hybridisierungssonden zu starten. Die Matrizen-mRNS war entweder 12S RNS von mit Sendai-Virus induzierten KG-1 Zellen (8000 Einheiten IF- Aktivität per µg) oder gesamte Poly(A)-mRNS aus nicht induzierten Leukozyten ( 10 Einheiten pro µg). ³²P-mar­ kierte cDNS wurde aus diesen Startern hergestellt unter Verwendung bekannter Reaktionsbedingungen (Noyes et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 76, 1770-1774 [1979]). Die 60 µl-Reaktionen wurden durchgeführt in 20 mM Tris-HCl (pH 8,3), 20 mM KCl, 8 mM MgCl₂ und 30 mM β-Mercaptoethanol, jeweils mit 1 µg jedes Starters (d. h. 12 µg insgesamt für die T-1 Serie, 4 µg insgesamt für die T-13 Serie), 2 µg induzierter 12S mRNS (oder 10 µg nicht induzierter Poly (A)-mRNS), 0,5 mM dATP, dCTP, dTTP, 200 µCi (α³²P)dCTP (Amersham, 2-3000 Ci/mmole) und 60 Einheiten reverser Transkriptase (Bethesda Research Laboratories). Das Pro­ dukt wurde von nicht-markiertem Material durch Gelfiltra­ tionen an einer 10 ml-Sephadex® G-50 Säule getrennt, 30 Minuten bei 70°C mit 0,3 N NaOH, zur Zerstörung der RNS, behandelt und mit HCl neutralisiert. Die Hybridisierungen wurden wie von Kafatos et al. (Nucleic Acids Res. 7, 1541-1552 [1979]) beschrieben, durchgeführt.
E. Identifizierung der Klone pL1-pL30
Die Methode von Birnboim et al., Nucleic Acids Res. 7, 1513-1523 (1979), zur schnellen Isolierung von Plasmiden wurde verwendet, um 1 µg Plasmid-DNS aus jeder der 500 individuellen E. coli K-12 Stamm 294-Transformanten (vergleiche C) zu gewinnen. Jede DNS-Probe wurde dena­ turiert und auf Nitrocellulosefilter in dreifacher Aus­ führung, nach der Methode von Kafatos et al. (siehe oben), aufgebracht.
Die drei Sätze der Nitrocellulosefilter, die 500 Plasmidproben enthielten, wurden hybridisiert mit
  • a) induzierter cDNS, gestärkt mit einem T-1 Startersatz,
  • b) T-13 gestarteter induzierter cDNS und
  • c) nicht induzierter cDNS, hergestellt unter Verwendung beider Startersätze. Klone wurden als positiv angesehen, wenn sie stärker hybridisierten mit einer oder beiden der induzierten cDNS-Sonden als mit der gesamten nicht induzierten Sonde. 30 positive Klone (pL1-pL30) wurden aus den 500 zur weiteren Analyse ausgesucht.
F. Identifikation der Klone pL-31-pL39. Isolierung eines Plasmids (Nr. 104), das ein LeIF-Gen­ fragment enthielt
Transformanten von E. coli x 1776 wurden nach der Koloniehybridisierungsmethode von Grunstein und Hogness (Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 72, 3961-3965 [1975]) ge­ testet, unter Verwendung von ³²P-markierter induzierter mRNS als Sonde (Lillenhaug et al., Biochemistry, 15, 1858-1865 [1976]). Nichtmarkierte mRNS von nicht-induzierten Zellen wurde mit der Sonde in einem Verhältnis von 200 : 1 gemischt, um zu konkurrieren mit in dem ³²P-markierten Präparat vor­ handener nicht-induzierter mRNS. Die Hybridisierung markierter mRNS sollte vorwiegend bei Kolonien erfolgen, die induzierte Sequenzen enthalten. Drei Klassen von Transformanten wurden erhalten:
  • (1) 2-3% der Kolonien hybridisierten sehr stark mit ³²P- mRNS,
  • (2) 10% hybridisierten signifikant schwächer als die erste Klasse und
  • (3) der Rest lieferte kein erkennbares Hybridisierungs­ signal.
Die positiven Kolonien (Klassen (1) und (2)) wurden auf die Anwesenheit Interferon-spezifischer Sequenzen mittels eines Assays geprüft, der auf der spezifischen Hybridi­ sierung von Interferon-mRNS an Plasmid-DNS beruht. Zunächst wurden 60 der stark positiven Kolonien (Klasse (1)) indi­ viduell in 100 ml M9-Medium, das ergänzt war mit Tetra­ cyclin (20 µg/ml), Diaminopimelinsäure (100 µg/ml), Thymidin (20 µg/ml) und d-Biotin (1 µg/ml), gezüchtet. Das M9-Medium enthält pro Liter: Na₂HPO₄ (6 g), KH₂PO₄ (3 g), NaCl (0,5 g) und NH₄Cl (1 g). Nach Autoklavieren wurde 1 ml steriles 1M MgSO₄ und 10 ml steriles 0,01 M CaCl₂ zugesetzt. Jeweils 10 der 60 Kulturen wurden zusammengefaßt und die Plasmid- DNS wurde, wie von Clewell et al., Biochemistry 9, 4428- 440 [1970], beschrieben, isoliert. 10 µg jedes Plasmid- DNS-Pools wurden mit HindIII gespalten, denaturiert und kovalent an DBM-Papier (Diazobenzyloxymethylpapier) ge­ bunden. 1 µg gereinigter mRNS aus induzierten Zellen wurde an jedes Filter hybridisiert. Nicht-hybridisierte mRNS wurde durch Waschen entfernt. Die spezifisch hybridi­ sierte mRNS wurde eluiert und in Xenopus laevis Oozyten überführt. In diesem Assay waren alle sechs Pools negativ. Aus 59 schwach positiven Kolonien (Klasse (2)) wurden fünf Pools zu je 10 Kolonien und 1 Pool zu 9 Kolonien gebildet und nach der oben beschriebenen Methode geprüft. Unter den sechs Pools hybridisierte einer (K10) jedesmal, wenn er ge­ prüft wurde, signifikant stärker als die übrigen. Um den spezifischen Interferon-cDNS-Klon zu identifizieren, wurde aus jeder der im Pool K10 zusammengefaßten neun Kolonien Plasmid-DNS hergestellt und individuell geprüft. Zwei der neun Plasmide (Nr. 101 und 104) banden Interferon-mRNS stärker als die anderen. Aus dem Plasmid Nr. 104 wurde ein besonderes Bgl II-Restriktionsfragment, das 260 Basen­ paare enthielt, isoliert, ³²P-markiert nach der von Taylor et al., Biochim. Biophys. Acta 442, 324-330 (1976), beschrie­ benen Methode und als Sonde verwendet, um 400 E. coli 294- Transformanten nach einem in situ-Kolonie-Screeningver­ fahren (Grunstein und Hogness, Proc. Natl. Sci. U.S.A. 72, 3961-3965 [1975)) zu testen. Neun Kolonien (pL31-pL39) wurden identifiziert, die in verschieden starkem Maße mit dieser Sonde hybridisierten.
Zusätzlich wurde das markierte 260-Basenpaar-Fragment verwendet, um 4000 E. coli 294-Transformanten in derselben Weise zu testen. 50 Kolonien konnten identifiziert wer­ den, die in unterschiedlichem Maße mit dieser Sonde hy­ bridisierten. Eine enthielt das LeIF G-Fragment, eine enthielt das LeIF H-Fragment und eine enthielt ein Fragment, das als LeIF H1 bezeichnet wurde (offensichtlich ein Allel von LeIF H). Die hybriden Plasmide, die erhalten wurden, wurden "LeIF G", "pLeIF H", usw., bezeichnet.
G. Isolierung und Sequenzierung eines ersten vollständigen LeIF Gens.
Plasmid DNS wurde aus allen 39 potentiellen LeIF- cDNS-Klonen hergestellt und nochmals mit der gleichen 260 Basenpaare-enthaltenden DNS-Sonde getestet, unter Ver­ wendung des Hybridisierungsprozederes von Kafatos et al. (siehe oben). Drei Plasmide (pL4, pL31, pL34) gaben sehr starke Hybridisierungssignale, vier (pL13, pL30, pL32, pL36) hybridisierten mittelmäßig, während drei (pL6, pL8, pL14) nur schwach mit der Sonde hybridisierten.
Die 39 potentiellen LeIF cDNS Rekombinant-Plasmide wurden ebenfalls unter Verwendung der ³²P-markierten syn­ thetischen Undecameren (individuelle T-1 Starterpools oder individuelle T-13 Starter) als Hybridisierungssonden ge­ testet. Die Hybridisierungsbedingungen wurden so ausge­ wählt, daß eine perfekte Basen-Paarung notwendig war, um feststellbare Hybridisierungssignale zu erhalten (Wallace et al., Nucleic Acids Res. 6, 3543-3557 [1979]). Auf diese Weise wurde Plasmid-DNS aus den 39 Klonen nach einer Stan­ dardmethode (Clewell et al., siehe oben) hergestellt und mittels Biorad Agarose A-50 Säulenchromatographie ge­ reinigt. Proben von je 3 µg jedes Präparats wurden durch Behandlung mit EcoRI linearisiert, mit Alkali denaturiert und auf 2 Nitrocellulosefilter getüpfelt (1,5 µg/Fleck) wie von Kafatos et al., (siehe oben) beschrieben. Die individuellen synthetischen Deoxyoligonucleotid-Starter und Starterpools wurden mit (γ³² P)ATP folgendermaßen phosphoryliert: 50 pmol Oligonucleotid und 100 pMol γ³² P ATP (New England Nuclear, 2500 Ci/mMol) wurden mit 30 µl 50 mMol Tris-HCl, 10 mMol MgCl₂ und 15 mMol β-Mercaptoethanol versetzt. Es wurden 2 Einheiten T4 Polynucleotid-Kinase zugesetzt und nach 30 Minuten bei 37°C wurden die ³²P-markierten Starter durch Chromato­ graphie an 10 ml Sephadex® G-50-Säulen gereinigt. Die Hybridisierungen wurden unter Verwendung von 10⁶ cpm Starter T-13C oder 3×10⁶ cpm Starterpool T-1C durchgeführt und zwar bei 15°C während 14 Stunden in 6 × SSC [1 × SSC = 0,15 M NaCl, 0,015 M Natriumcitrat, pH 7,2], 10 × Denhardt′s Lösung [0,2% Rinderserumalbumin, 0,2% Polyvinylpyrolidon, 0,2% Ficoll), wie von Wallace et al. (siehe oben) beschrieben. Die Filter wurden während 5 Minu­ ten bei 0°C in 6 × SSC gewaschen, getrocknet und Röntgen­ film ausgesetzt. Die Ergebnisse sind in Fig. 2 für ³²P- Starterpool T-13C und Starter T-1C dargestellt. Die Plasmid-DNS aus Klon 104 lieferte bemerkenswerte Hybridisation mit Starterpool T-1C und Starter T-13C, während Hybridisation mit den anderen Undecameren nicht festgestellt werden konnte. Wie in Fig. 2 dargestellt, hybridisierten verschiedene der 39 potentiellen LeIF- Plasmide (pL2, 4, 13, 17, 20, 30, 31, 34) mit diesen beiden Sonden. Die Restriktionsanalyse zeigte jedoch, daß nur 1 der Plasmide, pL31, auch ein 260 Basenpaare-enthaltendes BglII-Fragment enthielt. PstI-Behandlung von pL31 zeigte, daß die Größe des cDNS-Abschnittes etwa 1000 Basenpaare war.
Der gesamte PstI Abschnitt von pL31 wurde sowohl nach der chemischen Methode von Maxam-Gilbert (Methods Enzymol. 65, 499-560 [1980]) wie nach der Dideoxy-Kettenbruchmethode (Smith, Methods Enzymol. 65, 560-580 [1980]) durchgeführt, nachdem die Sau3a-Fragmente in einen M13-Vektor unter­ kloniert worden waren. Die DNS-Sequenz ist in Fig. 3 ("A") gezeigt. Aus dieser Sequenz wurde die gesamte Amino­ säuresequenz des LeIF A vorhergesagt, einschließlich des Prä- oder Signalpeptids. Der erste ATG Translations-Start­ codon befindet sich 60 Nukleotide vom 5′-Ende der Sequenz entfernt und wird nach 188 Codons von einem TGA Stop­ triplett gefolgt. Es gibt 342 nicht übersetzte Nucleotide am 3′-Ende, die schließlich von einer Poly (A)-Sequenz gefolgt werden. Das mutmaßliche Signalpeptid (wahrscheinlich beteiligt an der Sekretion von reifem LeIF aus Leukozyten) ist 23 Aminosäuren lang. Das aus 165 Aminosäuren bestehende reife LeIF A hat ein berechnetes Molekulargewicht von 19,390. Der Fig. 4 kann entnommen werden, daß die trypti­ schen Peptide T-1 und T-13 den Aminosäuren 145-149 und 57-61 des LeIF A entsprechen. Die tatsächlichen DNS-Sequenzen, die in diesen beiden Regionen gefunden wurden, werden durch den Starterpool T1-C und den Starter T13-C (Fig. 8) dargestellt).
H. Direkte Expression von reifem Leukozyten-Interferon A (LeIF A) 1. Allgemeines
Die Methode, nach der das reife LeIF A direkt exprimiert wurde, ist eine Variante der früher bereits für das menschliche Wachstumshormon angewandten (Goeddel et al., Nature 281, 544-548 [1979]), insofern es eine Kombination von synthetischer (N-terminal) und komplementärer DNS darstellte. Die von Goeddel et al. offenbarte Strategie funktioniert nur dann, wenn geeignete Schnittstellen für bestimmte Restriktionsendonukleasen vorhanden sind. Da aber die für reifes Leukozyteninterferon kodierende DNA solche geeigneten Schnittstellen nicht aufweist, kann die von Goeddel et al. offenbarte Strategie nicht direkt, sondern nur in modifizierter Form auf die Herstellung von reifem Leukozyteninterferon übertragen werden.
Wie in Fig. 6 gezeigt, befindet sich zwischen den Codons 1 und 3 von LeIF A eine Sau3a-Restriktionsendonuclease-Stelle. Es wurden 2 syntheti­ sche Deoxyolinucleotide geschaffen, die ein ATG-Translations-Startcodon enthalten, den Codon für die Aminosäure 1 (Cystein) wiederherstellen und ein EcoRI kohäsives Ende schaffen. Diese Oligomeren wurden an ein Sau3a- AvaII Fragment von pL31, das aus 34 Basenpaaren bestand, gehängt. Das entstandene 45 Basenpaare-enthaltende Produkt wurde an 2 zusätzliche DNS-Fragment gehängt, so daß ein künstlich-natürliches Hybridgen aus 865 Basenpaaren entstand, das LeIF A kodierte und welches durch EcoRI- und PstI-Restriktionsstellen begrenzt ist. Dieses Gen wurde zwischen die EcoRI- und PstI-Restriktionsstellen des Plasmids pBR322 eingefügt und lieferte das Plasmid pLeIF A1.
2. Konstruktion des Tryptophan-Kontrollelements (enthaltend den E.coli trp Promoter, Operator und die trp-Leader-Ribosomenbin­ dungsstelle ohne die ATG-Sequenz für den Translationsbeginn)
Das Plasmid pGMI trägt das E. coli-Tryptophan-Operon mit der Dele­ tion ΔE1413 (Miozzari et al., J. Bateriology 133, 1457-1466 [1978]) und exprimiert daher ein Fusionsprotein mit den ersten 6 Aminosäuren des trp- Leaders und etwa dem letzten Drittel des trp E-Polypeptids (im fol­ genden LE′ genannt), sowie dem vollständigen trp D-Polypeptid, und zwar unter der Kontrolle des trp-Promotor-Operator- Systems. Das Plasmid (20 µg) wurde mit dem Restriktions­ enzym PvuII an 5 Stellen gespalten. Die Genfragmente wurden dann mit EcoRI-Verbindungssequenzen (bestehend aus einer selbstkomplementären Polynukleotidsequenz pCATGAATTCATG) kombiniert, um eine EcoRI-Spaltstelle für das spätere Klonieren in ein Plasmid mit einer solchen EcoRI- Spaltstelle zu schaffen. Die 20 µg der aus pGM1 erhaltenen DNS-Fragmente wurden mit 10 Einheiten T₄ DNS-Ligase in Gegenwart von 200 pMol des 5′-phosphorylierten synthetischen Oligonucleotids pCATGAATTCATG in 20 µl T₄ DNS-Ligase-Puffer (20 mMol Tris, pH 7,6, 0,5 mMol ATP, 10 mMol MgCl₂, 5 mMol Dithiothreit) bei 4°C über Nacht behandelt. Die Lösung wurde dann 10 Minuten auf 70°C erwärmt. Die Verbindungsse­ quenzen wurden mit EcoRI gespalten und die Fragmente, die nun EcoRI-Enden enthielten, wurden mittels 5% Polyacrylamid­ gelelektrophorese (PAGE) aufgetrennt. Die drei größten Fragmente wurden aus dem Gel isoliert. Dazu wurde zunächst mit Ethidiumbromid angefärbt, die lokalisierten Fragmente wurden unter UV-Licht ausgemacht und die betreffenden Regionen aus dem Gel herausgeschnitten. Jedes Gelfragment wurde mit 300 Microliter 0,1 × TBE in eine Dialysetasche gebracht und während 1 Stunde in 0,1 × TBE-Puffer der 5 Elektrophorese bei 100 Volt ausgesetzt (TBE-Puffer enthält: 10,8 g Tris-Base, 5,5 g Borsäure, 0,09 g Na₂EDTA in 1 Liter H₂O). Die wäßrige Lösung wurde gesammelt, mit Phenol extrahiert, mit Chloroform extrahiert und 0,2 M an Natriumchlorid gemacht. Die DNS wurde nach Ethanolfällung in wäßriger Lösung erhalten. Das den trp-Promoter-Operator enthaltende Gen mit EcoRI kohäsiven Enden wurde nach der im folgenden beschriebenen Methode identifiziert, die darin besteht, daß man Fragmente in ein Tetracyclin-empfind­ liches Plasmid einbaut, die durch Einbau eines Promotor- Operators Tetracyclin-resistent werden.
Das Plasmid pBRHI (Rodriguez et al., Nucleic Acids Res. 6, 3267-3287 [1979]) exprimiert Ampicillinresistenz und enthält das Gen für Tetracyclinresistenz, aber, weil kein zugehöriger Promoter existiert, exprimiert diese Resistenz nicht. Das Plasmid ist daher Tetracyclin­ empfindlich. Durch Einfügung eines Promoter-Operator- Systems an der EcoRI-Spaltstelle kann das Plasmid Tetra­ cyclin-resistent gemacht werden.
pBRHI wurde mitEcoRI behandelt und das Enzym durch Phenolextraktion und Chloroformextraktion entfernt. Das nach Ethanolpräzipitation in Wasser erhaltene DNS-Molekül wurde in getrennten Reaktionsgemischen kombiniert mit jedem der drei DNS-Fragmente, die oben erhalten wurden und mit T₄ DNS-Ligase,wie bereits beschrieben, verbunden. Die DNS des Reaktionsgemischs wurde zur Transformation kompetenter E. coli K-12 Stamm 294-Organismen nach Standardmethoden (Hershfield et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 71, 3455-3459 [1974]) verwendet. Die Bakterien wurden auf LB (Luria-Bertani)- Platten gebracht, die 20 µg/ml Ampicillin und 5 µg/ml Tetra­ cyclin enthielten. Es wurden verschiedene Tretacyclin-resti­ stente Kolonien ausgewählt, die Plasmid-DNS isoliert und das Vorhandensein des gewünschten Fragmentes durch Restriktions­ enzymanalysen bestätigt. Das entstandene Plasmid wurde pBRHtrp genannt.
Ein EcoRI und BamHI Digestionsprodukt des Genoms des Hepatitis B-Virus wurde nach bekannten Methoden erhalten und in die EcoRI und BamHI Spaltstellen des Plasmids pGH6 einge­ fügt (Goeddel et al., Nature 281, 544 [1979]), wodurch das Plasmid pHS32 entstand. Das Plasmid pHS32 wurde mit XbaI ge­ spalten, mit Phenol extrahiert, mit Chloroform extrahiert und der Ethanolpräzipitation unterworfen. Es wurde dann mit 1 µl E. coli DNS-Polymerase I, Klenow Fragment (Boehringer-Mannheim), in 30 µl Polymerase-Puffer (50 mM Kaliumphosphat,pH 7.4, 7 mM MgCl₂, 1 mM β-Mercaptoethanol), enthaltend 0,1 mM dTTP und 0,1 mM dCTP, während 30 Minuten bei 0°C und 2 Stunden bei 37°C be­ handelt. Durch diese Behandlung wurde die XbaI Spaltstelle folgendermaßen verändert:
Dieser lineare Rest dem Plasmids pH332 (nach Phenol- und Chloroform-Extraktion und Ethanolpräzipitation in Wasser) wurde mit EcoRI gespalten. Das große Plasmidfragment wurde vom kleinen EcoRI-XbaI-Fragment abgetrennt durch PAGE und nach Elektroelution isoliert. Dieses DNS-Fragment von pHS32 (0,2 µg) wurde unter ähnlichen Bedingungen wie den obenbeschrie­ benen an das EcoRi-TagI-Fragment des Tryptophanoperons (etwa 0,01 µg) aus pBRHtrp gebunden. Dabei geschieht folgendes:
mit der ungewöhnlichen Basenpaarung T-C. Ein Teil des Reak­ tionsgemisches wurde in E. coli 294-Zellen transformiert, hitzebehandelt und auf LB-Platten, die Ampicillin enthielten, gebracht. Es wurden 24 Kolonien ausgewählt, in 3 ml LB-Medium aufgezogen und das Plasmid isoliert. Es wurde festgestellt, daß sechs davon die XbaI-Spaltstellen im E. coli durch kata­ lysierte DNS-Ausbesserung und Replikation regeniert hatten in folgender Weise:
Diese Plasmide konnten auch mit EcoRI und HpaI gespalten wer­ den und lieferten die erwarteten Restriktionsfragmente. Ein Plasmid, pTrp14 bezeichnet, wurde für die Expression heterolo­ ger Peptide, wie im folgenden beschrieben, verwendet.
Das Plasmid pHGH 107 (Goeddel et al., Nature 281, 544, [1979]) enthält ein Gen für das menschliche Wachstumshormon) bestehend aus 23 synthetisch hergestellten Aminosäurecodons und 153 Aminosäurecodons, die von cDNS über reverse Transcrip­ tion der mRNS erhalten wurde. Dieses Gen, obgleich es den Codon der Präsequenz des menschlichen Wachstumshormons nicht enthält, besitzt ein ATG-Translations-Startcodon. Das Gen wurde aus 10 µg pHGH 107 isoliert nach Behandlung mit EcoRI und E. coli DNA Polymerase I Klenow-Fragment, sowie dTTP und dATP, wie oben beschrieben. Nach Phenol- und Chloroform­ extraktion sowie Ethanolpräzipitation wurde das Plasmid mit BamHI behandelt.
Das das HGH-Gen enthaltende Fragment wurde durch PAGE und Elektroelution isoliert. Das erhaltene DNS-Frag­ ment enthält auch die ersten 350 Nukleotide des Tetra­ cyclineresistenz-verleihenden Strukturgens, aber es fehlt ihm das Tetracyclin Promoter-Operator-System, so daß, wenn es anschließend in ein Expressionsplasmid kloniert wird, die­ jenigen Plasmide, die diesen Abschnitt enthalten, durch die wiedergewonnene Tetracyclinresistenz identifiziert werden können. Weil das EcoRI-Ende des Fragments aufgefüllt wurde nach dem Klenow-Polymerase I-Verfahren, hat das Fragment ein stumpfes Ende und ein kohäsives Ende, wodurch die rich­ tige Orientierung gesichert ist, wenn es später in ein Expres­ sionsplasmid eingefügt wird.
Als nächstes wurde das Plasmid pTrp14 für den Empfang des das HGH-Gen enthaltende Fragment, das oben hergestellt wurde, vorbereitet. pTrp14 wurde mit XbaI behandelt und die entstehenden kohäsiven Enden wurden nach dem Klenow-Poly­ merase I-Verfahren unter Verwendung von dATP, dTTP, dGTP und dCTP aufgefüllt. Nach Phenol- und Chloroform-Extraktion so­ wie Ethanolpräzipitation wurde die erhaltene DNS mit BamHI behandelt und das entstandene große Plasmidfragment wurde durch PAGE und Elektroelution eluiert. Dieses Fragment besaß ein stumpfes und ein kohäsives Ende und erlaubte die Rekombi­ nation in der richtigen Richtung mit dem das HGH-Gen enthal­ tenden Fragment, dessen Herstellung oben beschrieben wurde.
Das das HGH-Gen enthaltende Fragment und das pTrp14 ΔXba-BamHI-Fragment wurden kombiniert und miteinander verbun­ den unter ähnlichen Bedingungen wie diejenigen, die vorstehend beschrieben sind. Durch die Verbindung der aufgefüllten XbaI- und EcoRI-Enden wurden die XbaI- und EcoRI-Restriktionsstellen wieder hergestellt:
Durch diese Konstruktion wurde auch das Tetracyclinresistenz- Gen wiederhergestellt. Weil das Plasmid pHGH 107 Tetracyclin­ resistenz von einem Promoter, der stromaufwärts vom HGH-Gen (Lac-Promoter) liegt, exprimiert, erlaubt das vorstehend konstruierte Plasmid, bezeichnet pHGH 207, die Expression des Gens für Tetracyclinresistenz unter der Kontrolle des Tryptophan-Promoter-Operators. Das erhaltene Gemisch wurde in E. coli 294 transformiert und die Kolonien wurden auf LB- Platten, die 5 µg/ml Tetracyclin enthielten, selektioniert.
Das Plasmid pHGH 207 wurde mit EcoRI behandelt und ein 300 Basenpaare-enthaltendes Fragment wurde durch PAGE und Elektroelution erhalten, das den trp-Promoter, Operator und die trp-Leader-Ribosomenbindungsstelle enthielt, dem aber eine ATG-Sequenz für den Start der Translation fehlte. Dieses DNS- Fragment wurde in die EcoRI-Spaltstelle von pLeIF A kloniert. Expressionsplasmide, die das so modifizierte trp-Regulon (E. coli-Operon, dem die Attenuator-Sequenz fehlt, so daß die Expression erhöht ist) können bis zu vorgegebenen Konzentra­ tionen herangezüchtet werden in einem Medium, das genügend Tryptophan enthält, um das Promoter-Operatorsystem zu unter­ drücken. Wird dann das Tryptophan entzogen und das System entblockiert, so wird das gewünschte Produkt exprimiert.
Im vorliegenden Fall und wie in Fig. 6 dargestellt, wurden 250 µg des Plasmids pL31 mit PstI behandelt und das 1000 Basenpaare-enthaltende Teilstück durch Gelelektrophorese an einem 6% Polyacrylamidgel isoliert. Es wurden etwa 40 µg des Teilstücks aus den Gel durch Elektroelution erhalten und in 3 gleiche Teile für die weitere Behandlung aufgeteilt: a) Eine 16 µg-Probe des Fragments wurde teilweise gespalten mit 40 Einheiten von BglII während 45 Minuten bei 37°C und das Reaktionsgemisch wurde an einem 6% Polyacrylamidgel gereinigt. Etwa 2 µg des gewünschten 670 Basenpaare-enthaltenden Frag­ ments wurden erhalten. b) Eine andere Probe (8 µg) des 1000 Basenpaare-enthaltenden PstI-Bruchstücks wurde mit AvaII und BglII behandelt. 1 µg des in Fig. 6 gezeigten 150 Basenpaare enthaltenden Fragments wurden nach Gelelektrophorese erhal­ ten. c) 16 µg des 1000 Basenpaare-enthaltenden Fragments wur­ den mit Sau3a und AvaII behandelt. Nach Elektrophorese an 10% Polyacrylamidgel wurden etwa 0,25 µg (10 pMol) des 34 Basen­ paare-enthaltenden Fragments erhalten. Die zwei angegebenen Deoxyolinucleotide, 5′-dAATTCATGTGT (Fragment 1) und 5′- dGATCACACATG (Fragment 2) wurden nach der Phosphotriesterme­ thode synthetisiert. Das Fragment 2 wurde folgendermaßen phosphoryliert: 200 µl (etwa 40 pM) von (γ³²P) ATP (Amersham, 5000 Ci/mM) wurden zur Trockne gebracht und in 30 µl 60 mM Tris-HCl (pH 8), 10 mM MgCl₂, 15 mM β-Mercaptoethanol, 100 pM des DNS-Fragments und 2 Einheiten T4 Polynukleotid-Kinase re­ suspendiert. Nach 15 Minuten bei 37°C wurde 1 µl 10 mM ATP hinzusetzt und die Reaktion weitere 15 Minuten laufengelassen. Das Gemisch wurde dann während 15 Minuten auf 70°C erwärmt, mit 100 pM des 5′-OH-Fragments 1 und 10 pM des 34 Basenpaare- enthaltenden Sau3a-AvaII-Fragments versetzt. Die Verbindung wurde bei 4°C während 5 Stunden in 50 ml 20 mM Tris-HCl (pH 7,5), 10 mM Mg Cl₂, 10 mM Dithiothreit, 0,5 mM ATP und 10 Einheiten T4 DNS-Ligase hergestellt. Das Gemisch wurde der Elektrophorese an einem 6% Polyacrylamidgel unterworfen und das 45 Basenpaare-enthaltende Produkt wurde durch Elektroelu­ tion erhalten. Etwa 30 ng (1 pM) des 45 Basenpaare-enthalten­ den Produkts wurden mit 0,5 µg (5 pM) des 150 Basenpaare-ent­ haltenden AvaII - BglII-Fragments und 1 µg (2 pM) des 670 Ba­ senpaare-enthaltenden BglII - PstI-Fragments vereint. Die Bin­ dung wurde bei 20°C während 16 Stunden unter Verwendung von 20 Einheiten T4 DNS-Ligase hergestellt. Die Ligase wurde dann durch Erhitzen auf 65°C während 10 Minuten inaktiviert und das Gemisch wurde mit EcoRI und PstI behandelt zwecks Spal­ tung von Polymeren des Gens. Das Gemisch wurde dann durch PAGE (6%) gereinigt. Es wurden etwa 20 ng (0,04 pM) des 865 Basenpaare-enthaltenden Produkts isoliert. Eine Hälfte davon (10 ng) wurde zwischen die EcoRI- und PstI-Spaltstellen von pBR322 (0,3 µg) eingefügt. Die Transformation von E. coli 294 lieferte 70 Tetracyclin-resistente, Ampicillin-empfindliche Transformanten.
Die aus 18 dieser Transformanten isolierte Plasmid-DNS wurde mit EcoRI und PstI behandelt. 16 der 18 Plasmide be­ saßen ein EcoRI-PstI-Fragment, das 865 Basenpaare lang war. 1 µg eines dieser Plasmide (pLeIF Al) wurde mit EcoRI behandelt und an das 300 Basenpaare enthaltende EcoRI- Fragment (0,1 µg), das den E. coli trp-Promoter und die trp- Leader-Ribosomenbindungsstelle enthielt, gebunden. Die den trp-Promoter enthaltenden Transformanten wurden unter Ver­ wendung einer trp-Sonde nach der Grunstein-Hogness Kolonie- Screening-Methode identifiziert. Eine asymmetrisch sitzende XbaI-Spaltstelle in dem trp-Fragment erlaubte die Bestimmung von Rekombinanten, in denen der trp-Promoter in der Richtung des LeIF A-Gens orientiert war.
In vitro und in vivo Aktivität von LeIF A
Extrakte für den IF-Assay wurden folgendermaßen her­ gestellt: 1 ml-Kulturen wurden in L-Brühe, enthaltend 5 µg/ml Tetracyclin, bis zu einem A₅₅₀-Wert von etwa 1,0 auf­ gezogen, dann mit 25 ml M9-Medium, enthaltend 5 µg/ml Tetra­ cyclin verdünnt. Wenn der A₅₅₀-Wert 1,0 erreicht hatte, wur­ den jeweils 10 ml-Proben zentrifugiert und die Zellkuchen in 1 ml 15%iger Saccharose, 50 mM-Tris-HCl (pH 8,0) und 50 mM EDTA suspendiert. 1 mg Lysozym wurde zugesetzt und nach 5­ minütiger Aufbewahrung bei 0°C wurden die Zellen durch Ultrabeschallung zerstört. Es wurde 10 Minuten zentrifugiert (15,000 U/Min) und die Interferon-Aktivität im Überstand wurde bestimmt durch Vergleich mit LeIF-Standard nach dem CPE-Hemmtest. Zur Bestimmung der Anzahl von IF-Molekülen pro Zelle wurde eine spezifische LeIF-Aktivität von 4 × 10⁸ Ein­ heiten pro mg verwendet.
Wie in Tabelle 1 gezeigt, liefert Klon pLeIF A trp 25, in dem der trp-Promoter in der richtigen Richtung orientiert ist, hohe Aktivitäten (bis zu 2,5 × 10⁸ Einheiten pro- Liter). Wie in Tabelle 2 gezeigt, verhält sich das von E. coli K-12 Stamm 294/pLeIF A trp 25 hergestellte Interferon wie authen­ tisches Human-LeIF; es ist bei pH 2 stabil und wird durch Kaninchen-anti-Human-Leukozyten-Antikörper neutralisiert. Das Interferon hat ein scheinbares Molekulargewicht von etwa 20 000.
Der Nachweis von in vivo-Aktivität von Interferon macht die Gegenwart von Makrophagen und natürlichen Killer­ zellen (NK) notwendig, und es scheint, daß diese Zellen stimuliert werden. Es war daher möglich, daß das von E. coli 294/pLeIF A 25 produzierte Interferon, das im Zellkultur-Assay antivirale Aktivität zeigte, an infizierten Tieren inaktiv ist. Ferner ist es durchaus möglich, daß sich die antivirale in vivo-Aktivität des bakteriell hergestellten, nicht-glykosy­ lierten LeIF A von der des glykosylierten Interferons, das aus menschlichen Leukozyten gewonnen wird, unterscheidet. Es wurden daher die biologischen Aktivitäten von bakteriell her­ gestelltem LeIF A (2% rein) und von aus Leukozyten isoliertem LeIF (8% rein) miteinander verglichen und zwar an Hand der lethalen Enzephalomyocarditis (EMC) bei Totenkopfäffchen (Tabelle 3).
Tabelle 1
Interferon-Aktivität in Extrakten von E. coli
Tabelle 2
Vergleich der Aktivität von Extrakten aus E. coli 294/pLelF A 25 mit Standard-LeIF *)
*) Der 250 000 E/ml enthaltende Extrakt von E. coli 294/ pLeIF A trp 25 , der in Tabelle 1 beschrieben wird, wurde auf das 500fache verdünnt mit Minimalmedium, so daß er eine spezifische Aktivität von 500 E/ml aufwies. Ein vorher gegen NIH-Leukozyten-Interferon-Standard titrierter Leuko­ cyten-Interferon-Standard (Wadley Institute) wurde ebenfalls auf eine Endkonzentration von 500 E/ml verdünnt. Aliquote Teile (jeweils 1 ml) wurden mit 1N HCl auf pH 2 gebracht, 52 Stunden bei 4°C inkubiert, durch Zusatz von NaOH neutra­ lisiert und die IF-Aktivität nach dem Standard- CPE-Hemmtest bestimmte Aliquote Teile (25 µl) der 500 E/ml-Proben(unbehandelt) wurden mit 25 µl Kaninchen-anti-Human-Leukozyten-Interferon während 60 Minuten bei 37°C inkubiert, zentrifugiert mit 12,000 × g während 5 Minuten und der Überstand getestet.
Tabelle 3
Antiviraler Effekt verschiedener LeIF-Präparate gegen EMC Virus-Infektionen bei Totenkopfäffchen
Alle Affen waren männlichen Geschlechts (mittleres Gewicht 713 g) und besaßen keine EMC Virus-Antikörper vor der Infektion. Die Affen wurden intramuskulär mit 100 × LD₅₀ EMC-Virus (bestimmt an Mäusen) infiziert. Die Kontrolltiere starben 134, 158 und 164 Stunden nach der Infektion. Die Interferon-Behandlung mit 10⁶ Einheiten erfolgte intravenös und zwar -4, +2, 23, 29, 48, 72, 168 und 240 Stunden nach der Infektion. Bei dem bakteriellen Leukozyten-Interferon handelte es sich um eine Säulenchromatographie-Fraktion eines Lysats aus E. coli 294/pLeIF A 25 mit einer spezifischen Akti­ vität von 7,4 × 10⁶ E/mg Protein. Die bei den Kontrollen verwendeten Bakterien-Proteine waren der Säulenfraktion des Lysats von E. coli 294/pBR322 bei doppelter Gesamtprotein­ konzentration äquivalent. Bei dem Leukozyten-Interferon- Standard handelte es sich um durch Sendai-Virus induziertes Interferon aus normalen menschlichen Zellen, das chromato­ graphisch auf eine spezifische Aktivität von 32 × 10⁶ E/mg Protein gereinigt war.
Die Kontrolltiere verloren das Gleichgewicht, zeigten progressive Lethargie, schlaffe Lähmung der hinteren Glied­ massen und wässerige Augen, beginnend etwa 8 Stunden vor dem Tod. Die mit Interferon behandelten Affen zeigten keine die­ ser Abnormalitäten: sie blieben während der gesamten Zeit aktiv und entwickelten keine Virämie. Der eine Affe der Kon­ trollgruppe, der innerhalb von 4 Tagen keine Virämie ent­ wickelte, starb zuletzt (164 Stunden nach der Infektion), aber zeigte nach dem Tode hohe Virus-Titer im Herzen und Ge­ hirn. Die Interferon-behandelten Affen entwickelten keine Antikörper gegen EMC-Viren, was 14 und 21 Tage nach der In­ fektion festgestellt wurde. Die Ergebnisse zeigen somit, daß der antivirale Effekt der LeIF-Präparate an den infizierten Tieren lediglich der Wirkung des Interferons zugeschrieben werden kann, da die kontaminierenden Proteine des bakteriel­ len und des aus Leukozyten gewonnenen Interferons völlig un­ terschiedlich sind. Außerdem deuten die Ergebnisse darauf­ hin, daß für eine in vivo antivirale Aktivität von LeIF A eine Glykosylierung nicht notwendig ist.
J. Isolierung von cDNS für weitere Leukozyten-Interferone
DNS aus dem Plasmid, das DNS für das vollständige LeIF A enthält, wurde mit PstI herausgeschnitten, elektro­ phoretisch isoliert und mit ³²P markiert. Die erhaltene radioaktiv markierte DNS wurde als Sonde für das Screening von zusätzlichen E. coli 294-Transformanten verwendet die in der gleichen Weise, wie in Teil C beschrieben, er­ halten wurden [nach der in-situ-Kolonie-Testmethode von Grunstein und Hogness (siehe oben)]. Die mit der Sonde hybridisierenden Kolonien wurden isoliert. Plasmid-DNS aus diesen Kolonien sowie aus den zehn hybridisierenden Kolonien, die in Teil G oben erwähnt wurden, wurden durch Behandlung mit PstI herausgeschnitten und nach drei verschiedenen Methoden charakterisiert. Zunächst wurden diese PstI- Fragmente durch die Abbauprodukte, die durch Behandlung mit der Restiktions-Endonucleasen BglII, PvuII und EcoRI entstanden, charakterisiert. Die Analyse erlaubte die Klassifizierung von mindestens acht unterschiedlichen Typen (LeIF A, LeIF B, LeIF C, LeIF D, LeIF E, LeIF F, LeIF G und LeIF H, dargestellt in Fig. 5, wie einen Überblick über die Lage der verschiedenen Restriktions­ stellen relativ zu der bis jetzt bekannten Präsequenz und der kodierenden Sequenz von LeIF A gibt. Ein Typ von diesen, LeIF D, ist anscheinend identisch mit dem von Nagata et al., Nature 284, 316-320 (1980), beschriebenen LeIF.
Ferner wurden verschiedene DNSs mit dem von Cleveland et al. (Cell 20, 95-105 [1980]) beschriebenen Hybridisations- Selektions-Test untersucht auf ihre Fähigkeit, LeIF-mRNS selektiv von Poly-A enthaltender RNS aus KG-1 Zellen zu entfernen. In diesem Test waren LeIF A, B, C und F positiv. Schließlich wurden letztere PstI-Fragmente in Plasmide eingefügt, E. coli 294 wurde mit diesen Plasmiden trans­ formiert und die Fragmente wurden exprimiert. Die expri­ mierten Produkte, von denen man annahm, daß sie Präinter­ ferone wären, waren im CPE-Assay auf Interferon-Aktivität alle positiv, wobei nur das LeIF F-Fragement geringfügige Aktivität aufwies. Im übrigen wurden alle LeIF-Typen sequenziert.
K. Direkte Expression eines zweiten reifen Leukozyten- Interferons (LeIF B)
Die Sequenz des isolierten DNS-Fragements, welches das Gen für reifes LeIF B enthält, zeigt, daß die ersten vierzehn Nucleotide für LeIF A und B identisch sind. Folglich wurde ein Fragment aus pLeIF A25, das den trp-Promoter-Operator, die Ribosomenbindungsstelle und den Beginn des LeIF A (=B)-Gens enthielt, isoliert und mit dem Rest der B-Sequenz in einem Expressions-Plasmid kombiniert. Die Restriktionskarten für die Pst-Fragmente von pL4 (ein Plasmid, enthaltend das LeIF B-Gen aus Fig. 5) und pLeIF A25 sind in den Fig. 7a und 7b dargestellt.
Um das etwa 950 (=Basenpaare) lange Sau3a-PstI-Frag­ ment aus der Sequenz, die in Fig. 7a dargestellt ist, zu erhalten, waren mehrere Schritte notwendig wegen des Vorkommens weiterer, in diesem Bereich liegender Sau3a- Restriktionsstellen. Es wurde folgendermaßen vorgegangen:
  • 1. Die folgenden Fragmente wurden isoliert:
    • a) 110 b.p. aus Sau3a-EcoRI;
    • b) 132 b.p. aus EcoRI-Xba;
    • c) 700 b.p. aus Xba-Pst.
  • 2. Die Fragmente (1a) und (1b) wurden miteinander ver­ bunden und mit Xba und BglII behandelt, um Selbstpoly­ merisation über die Sau3a- und Xba-Enden zu verhindern (die entsprechende Sau3a-Spaltstelle lag innerhalb einer BglII-Spaltstelle; BglII-Schnitte hinterlassen ein Sau3a kohäsives Ende). Es wurde ein 242 b.p. enthaltendes Fragment isoliert.
  • 3. Das Produkt von (2) wurde mit (1c) verbunden und mit PstI und BglII behandelt, wieder um Selbstpolymeri­ sation zu verhindern. Ein etwa 950 b.p. enthaltendes Frag­ ment, Sau3a-PstI (siehe Fig. 7a) wurde isoliert. Dieses Fragment enthielt denjenigen Teil des LeIF B-Gens, der keine Entsprechung beim LeIF A hatte.
  • 4. Ein etwa 300 b.p. enthaltendes Fragment (HindIII- Sau3a), das den trp-Promoter-Operator, die Ribosomen­ bindungsstelle, das ATG-Startsignal und den Cystein-Codon von LeIF A enthielt, wurde aus pLeIF A25 isoliert.
  • 5. Ein etwa 3600 b.p. enthaltendes Fragment (PstI- HindIII) wurde aus pBR322 isoliert. Es enthielt das Replikon, das Tetracyclin-Resistenz, nicht aber Ampicillin- Resistenz kodiert.
  • 6. Die Fragmente, die gemäß 3, 4 und 5 erhalten wurden, wurden miteinander verbunden und mit dem resul­ tierenden Plasmid wurde E. coli K-12 Stamm 294 trans­ formiert.
Die Transformanten wurden einem Minitest unterzogen (Birnboim et al., Nucleic Acids Res. 7, 1513-1523 [1979]) und Plasmidproben wurden mit EcoRI behandelt. Der Abbau lieferte folgende drei Fragmente: 1) Ein EcoRI-EcoRI trp Promoter-Fragment; 2) das innere EcoRI-EcoRI-Fragment von pL4 und 3) das Fragment vom Translations-Startsignal bis zur EcoRI-Spaltstelle von pL4.
Im CPE-Assay zeigen Bakterienextrakte aus Klonen, die in der vorstehend beschriebenen Weise erhalten werden, Aktivitäten von 10 × 10⁶ Einheiten Interferon pro Liter bei A₅₅₀ = 1. Ein repräsentativer Klon, der in dieser Weise hergestellt wurde, ist E. coli 294/pLeIF B trp 7.
L. Direkte Expression weiterer reifer Leukozyten Interferone (LeIF C, D, F, H, I und J)
Weitere Genfragmente in voller Länge von anderen LeIF-Typen können geschneidert und in Vektoren eingebaut werden zwecks Expression in Analogie zu der für das LeIF A beschriebenen Weise. Durch vollständige Sequenzie­ rung in konventioneller Weise kann festgestellt werden, ob eine Restriktionsstelle genügend nahe an dem ersten Aminosäurecodon des reifen Interferons liegt, so daß die im Teil H beschriebene Methode für die Expression von reifem LeIF A verwendet werden kann, d. h. die Eliminierung der Präsequenz durch einen Restriktionsschnitt und Ersatz der aminoendständig zusammen mit der Präsequenz verlorenen Aminosäurecodons durch Anhängen eines synthetischen DNS- Fragments. Sollte dies nicht der Fall sein, so kann die folgende Methode angewandt werden. Hierbei wird das die Präsequenz kodierende Fragment präzis an der Stelle abge­ trennt, an der der Codon für die erste Aminosäure des reifen Polypeptids beginnt, und zwar dadurch, daß
  • 1. in der Umgebung dieses Punktes die doppel­ strängige DNS in einsträngige DNS übergeführt wird;
  • 2. die im ersten Schritt gebildete einsträngige Region mit einer komplementären Starter-Sequenz einer einsträngigen DNS hybridisiert wird, deren 5′-Ende gegenüber dem Nukleotid liegt, das an die beabsichtigte Spaltstelle grenzt;
  • 3. derjenige Teil des in 3′-Richtung des Starters liegenden zweiten Stranges, der in (1) eli­ miniert wurde, durch Umsetzung mit DNS-Poly­ merase in Gegenwart von Adenin-, Thymin-, Guanin- und Cytosin-haltigen Deoxynucelotid-triphos­ phaten wieder hergestellt wird und
  • 4. die verbleibende einsträngige DNS-Sequenz, die über die beabsichtigte Spaltstelle hinausreicht, abgebaut wird.
Eine kurze synthetische DNS-Sequenz, die am 3′-Ende des kodierenden Stranges mit dem Translations-Startsignal ATG endet, kann dann verbunden werden, z. B. über stumpfe Enden, mit dem zurechtgeschnittenen Gen für die reifen Interferone. Die Gene können in ein Plasmid eingefügt und unter die Kontrolle eines Promoters und seiner zugehörigen Ribosomenbindungsstelle gebracht werden.
In ähnlicher Weise, wie es in Abschnitt K oben be­ schrieben ist, wurden Genfragmente, die für LeIF C und LeIF B kodieren aufgebaut, zwecks direkter Expression in Bakterien. Bei der Strategie, die zur Expression dieser weiteren Leukozyten-Interferone führte, wurde in jedem Falle auf das etwa 300 Basenpaare-enthaltende Fragment (HindIII-Sau3a), das den trp-Promoter-Operator, die Ribosomenbindungsstelle, das ATG Startsignal und den Cystein-Codon von LeIF A aus PLeIF A25 enthielt, zurück­ gegriffen. Dieses Fragment wurde kombiniert mit den Frag­ menten anderer Interferone, die die entsprechenden Amino­ säuresequenzen, die auf den allen gemeinsamen Cysteinrest folgen, kodieren. Jedes erhaltene Plasmid wurde zur Trans­ formation von E. coli K-12 Stamm 294 verwendet.
Für die einzelnen Gene waren folgende Schritte not­ wendig:
LeIF C
Isolierung der folgenden Fragmente aus pLeIF C:
  • (a) ein 35 Basenpaare-enthaltendes Fragment Sau3a-Sau96;
  • (b) ein mehr als 900 Basenpaare-enthaltendes Fragment Sau96-Pst I;
  • (c) Isolierung eines etwa 300 Basenpaare-ent­ haltenden Fragments (HindIII-Sau3a) aus pLeIF A-25, wie in Teil K (4) oben be­ schrieben;
  • (d) Isolierung des etwa 3600 Basenpaare-ent­ haltenden Fragments aus Abschnitt K (5) oben.
Konstruktion
  • (1) Verbindung von (a) mit (c). Spaltung mit BglII, HindIII und Isolierung des etwa 335 Basenpaare-enthaltenden Produktes.
  • (2) Verbindung der unter (1), (b) und (d) erhaltenen Bruchstücke und Transformierung von E. coli mit dem re­ sultierenden Plasmid.
Ein repräsentativer Klon der auf diese Weise erhalten wurde, ist E. coli K-12 Stamm 294/pLeIF C trp 35.
LeIF D
Aus pLeIF D wurden isoliert:
  • a) ein 35 Basenpaare-enthaltendes Fragment (Sau3a-AvaII);
  • b) ein 150 Basenpaare-enthaltendes Fragment (AvaII-BglII) und
  • c) ein etwa 700 Basenpaare-enthaltendes Fragment (BglII-PstI).
Aus pLeIF A25 wurde isoliert:
  • d) ein 300 Basenpaare-enthaltendes Fragment (HindIII-Sau3a).
Aus pBR322 wurde isoliert:
  • e) ein etwa 3600 Basenpaare-enthaltendes Fragment (HindIII-PstI).
Konstruktion
  • (1) Die Verbindung von (a) mit (b), Spaltung mit BglII und Reinigung liefert ein 185 Basenpaare-enthaltendes Produkt.
  • (2) Die Verbindung von (1) mit (d), Spaltung mit HindIII und BglII und Reinigung liefert ein etwa 500 Basenpaare enthaltendes Produkt.
  • (3) Die Fragmente (2), (c) und (e) wurden miteinander verbunden und E. coli mit dem erhaltenen Plasmid trans­ formiert.
Ein in dieser Weise erhaltener repräsentativer Klon ist E. coli K-12 Stamm 294/pLeIF D trp 11.
LeIF F
Bei der Konstruktion eines vollständigen LeIF F Gens und der direkten Expression des entsprechenden Interferons kann man sich die Homologie der Aminosäuren 1-13 zwischen LeIF B und LeIF F zunutze machen. Ein den trp Promotor ent­ haltendes Fragment (A) mit geeignet konstruierten Enden wird aus pHGH207 erhalten, das oben beschrieben ist, über die Behandlung mit PstI und XbaI und anschließende Isolierung eines ca. 1050 Basenpaaren enthaltenden Fragments. Ein zwei­ tes Fragment (B) steht in dem größeren der beiden durch Be­ handlung des Plasmids pHky 10 mit PstI und BglII entstande­ nen Fragmente zur Verfügung. Das Fragment A enthält etwa das halbe die Ampicillinresistenz kodierende Gen, während Frag­ ment B den Rest dieses Gens und das vollständige Gen für die Tetracyclinresistenz bis auf den zugehörigen Promotor ent­ hält. Die Fragmente A und B werden mittels T4 Ligase kombi­ niert und das erhaltene Produkt wird mit XbaI und BglII behandelt, um Dimerisierungen auszuschließen. So entsteht das Fragment (c), welches den trp Promoter-Operator, sowie die Gene für die Tetracyclin- und Ampicillin-Resistenz enthält.
Ein Fragment (d) mit etwa 580 Basenpaaren wird durch Behandlung von pLeIF F mit AvaII und BglII erhalten. Dieses Fragment enthält die Codons für die Aminosäuren 14-166 von LeIF F.
Ein Fragment (e) (49 Basenpaare) wird durch Behandlung von pLeIF B mit XbaI und AvaII erhalten. Dieses Fragment kodiert die Aminosäuren 1-13 von LeIF F.
Die Fragmente (c), (d) und (e) werden in Gegenwart von T4 Ligase miteinander verbunden. Die kohäsiven Enden der entsprechenden Fragmente sind so beschaffen, daß das ent­ stehende Plasmid in der richtigen Weise gebildet wird, wo­ bei das Gen für Tetracyclin-Resistenz unter die Kontrolle des trp Promoter-Operators gebracht wird, zusammen mit dem Gen für reifes LeIF F, so daß die damit transformierten Bakterien auf Grund ihrer Tetracyclin-Resistenz selektio­ niert werden können. Ein auf diese Weise erhaltener reprä­ sentativer Klon ist E. coli K-12 Stamm 294 pLeIF F trp 1.
LeIF H
Das für die Expression von reifem LeIF H geeignete Gen kann folgendermaßen hergestellt werden:
  • 1. Plasmid pLeIF H wird der Behandlung mit HaeII und RsaI unterworfen und ein 816 Basenpaare-enthaltendes Frag­ ment wird isoliert, welches den Bereich von der Aminosäure 10 des Signalpeptids bis zur 3′ nicht codierenden Region kodiert.
  • 2. Das Fragment wird denaturiert und der Reparatursyn­ these mit dem Klenow-Fragment der DNA Polymerase I (Klenow et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 65, 168 [1970]) unter­ worfen, bei der der synthetische Deoxyribooligonucleotid- Starter 5′-dATG TGT AAT CTG TCT verwendet wird.
  • 3. Das erhaltene Produkt wird mit Sau3a gespalten und ein 452 Basenpaare-enthaltendes Fragment, das die Amino­ säuren 1-150 kodiert, wird isoliert.
  • 4. Die Behandlung von pLeIF H mit Sau3a und PstI und die Isolierung eines 500 Basenpaare-enthaltenden Frag­ ments führt zu einem Gen, das die Aminosäuren 150 bis zum Ende der Sequenz kodiert.
  • 5. Die in (3) und (4) isolierten Fragmente werden verbunden zu dem folgenden Fragment das die 166 Aminosäuren des LeIF H kodiert.
  • 6. pLeIF A trp 25 wird zunächst mit XbaI, dann mit DNA Polymerase I und schließlich mit PstI behandelt. Das resultierende große Fragment kann isoliert und mit dem Produkt aus (5) verbunden werden zu einem Plasmid, mit dem E. coli K-12 Stamm 294 oder ein anderes Bakterium transformiert werden kann, das dann in der Lage ist, reifes LeIF H zu exprimieren.
LeIF I
Die von Lawn et al., (Cell 15, 1157 1978) konstruierte Genbibliothek des menschlichen Genoms im Phagen R Charon 4A wurde nach Leukozyten-Interferon-Genen untersucht, wobei die von Lawn et al. (siehe oben) und Maniatis et al. (Cell 15, 687 [1978]) angegebenen Verfahren verwendet wurden. Eine von der cDNS des LeIF A-Klons abgeleitete radioaktive LeIF- Sonde wurde verwendet, und etwa 5 000 000 Plaques zu testen. Sechs LeIF-Klone wurden bei diesem Screening erhalten. Nach noch­ maligem Screening und Plaque-Reinigung wurde einer dieser Klone, HLeIF2, für die weitere Analyse ausgewählt.
Unter Verwendung der oben beschriebenen Methode können andere Sonden verwendet werden, um weitere pLeIF- Klone aus dem menschlichen Genom zu isolieren. Diese wiederum können verwendet werden, um weitere Leukozyten-Interferon- Proteine gemäß der vorliegenden Erfindung herzustellen.
  • 1. Das 2000 Basenpaare-enthaltende EcoRI-Fragment des Klons HLeIF2 wurde an der EcoRI-Spaltstelle in pBR325 kloniert. Das resultierende Plasmid LeIF E wurde mit EcoRI gespalten und das 2000 Basenpaare-enthaltende Frag­ ment isoliert. Das Deoxyoligonukleotid dAATTCTGCAG (ein EcoRI-PstI-Konverter) wurde an das 2000 Basenpaare-ent­ haltende EcoRI-Fragment gebunden und das resultierende Fragment mit PstI gespalten, so daß man bin 2000 Basenpaare­ enthaltendes Fragment mit PstI-Enden erhielt. Dieses wurde mit Sau96 gespalten und ein Fragment aus 1100 Basenpaaren wurde isoliert, welches ein PstI- und ein Sau96-Ende be­ saß.
  • 2. Das Plasmid pLeIF C trp 35 wurde mit PstI und XbaI behandelt. Das große Fragment wurde isoliert.
  • 3. Das kleine XbaI-PstI-Fragment aus pLeIF C trp 35 wurde mit XbaI und Sau96 behandelt. Ein 40 Basenpaare-ent­ haltendes XbI-Sau96-Fragment wurde isoliert.
  • 4. Die unter (1), (2) und (3) isolierten Fragmente wurden verbunden zu dem Plasmid pLeIF I trp 1.
LeIF J
  • 1. Das Plasmid pLeIF J enthält ein aus 3800 Basen be­ stehendes HindIII-Fragment des menschlichen Genoms, welches die LeIF J Gensequenz umfaßt. Ein 760 Basenpaare-enthal­ tendes DdeI - RsaI-Fragment wurde aus diesem Plasmid iso­ liert.
  • 2. Das Plasmid pLeIF B trp 7 wurde mit HindIII und DdeI gespalten und ein 340 Basenpaare-enthaltendes HindIII- DdeI-Fragment isoliert.
  • 3. Das Plasmid pBR322 wurde mit PstI gespalten, die Enden wurden abgespalten durch Inkubation mit DNA-Poly­ merase I (Klenow Fragment) und schließlich wurde mit HindIII behandelt. Das große, etwa 3600 Basenpaare-ent­ haltende Fragment wurde isoliert.
  • 4. Die Fragmente aus (1), (2) und (3) wurden mitein­ ander verbunden zu dem Plasmid pLeIF J trp 1.
M. Reinigung
Der Leukozyten-Interferon-Gehalt von Bakterienextrakten kann durch die folgenden Maßnahmen in der angegebenen Reihen­ folge erhöht werden:
  • 1. Polyethyleniminfällung, bei der der größte Teil der cellulären Proteine, einschließlich des Interferons, im Überstand verbleibt.
  • 2. Amoniumsulfatfraktionierung, wobei das Interferon bei einer Sättigung von 55% mit Ammoniumsulfat aus der Lösung ausfällt.
  • 3. Suspendierung des Ammoniumsulfatkuchens in 0,06 M Kaliumphosphat, 10 mM Tris-HCl (pH 7,2) und Dialyse gegen 25 mM Tris-HCl (pH 7,9), wobei die Interferonaktivität in der Lösung bleibt.
  • 4. Chromatographie des Überstandes, auf ein pH von 8,5 eingestellt, an einer DEAE-Cellulose-Säule (Elution mit einem linearen Gradienten von 0 bis 0,2 M NaCl in 25 mM Tris-HCl, pH 8,5).
  • 5. Adsorption an Cibachrom Blau-Agarose bzw. Hydroxyl­ apatit und Elution mit 1,5 M KCl bzw. 0,2 M Phosphatlösung (fakultativ).
  • 6. Fraktionierung an einer Sephadex® G-75 Säule.
  • 7. Kationenaustauschchromatographie an CM-Cellulose in 25 mM Ammoniumacetat bei pH 5,0 mit einem Ammonium­ acetatgradienten (bis zu 0,2 M Ammoniumacetat).
Nach dem vorstehend angegebenen Verfahren erhält man ein Material von einer Reinheit mit über 95%.
Das Material kann auch gereinigt werden durch Größen­ ausschluß-Chromatographie, HPLC an umgekehrten Phasen (RP-8) oder Affinitätschromatographie an immobilisierten Antiinterferon-Antikörpern.
Ferner kann das nach Absatz 4 oben erhaltene Material auf eine Säule monoklonaler Antikörper gebracht werden, die, wie von Milstein in Scientific American 243, 66 (1980) beschrieben, hergestellt wird und mit 0,2 M Essigsäure, 0,1% Triton und 0,15 M NaCl eluiert werden. In einem anderen, bevorzugten Verfahren kann das er­ findungsgemäß erhaltene Interferon folgendermaßen ge­ reinigt werden:
  • 1. Gefrorenes Zellmaterial wird mechanisch zerkleiniert. Die teilweise aufgetauten Zellen werden in dem vierfachen Volumen des Puffers A, enthaltend 0,1 M Tris (pH 7,5-8,0), pH 7,5-8,0), 10% (w/v) Saccharose, 0,2 M NaCl 5 mM EDTA, 0,1 mM PMSF und 10-100 mM MgCl₂, suspendiert. Die Sus­ pension wird dann 2 × bei 4°C unter einem Druck von etwa 400 und weniger als 70 Atmosphären durch einen Homogenisa­ tor gegeben und schließlich in einem Eisbad gekühlt.
  • 2. Dem Homogenisat wird langsam Polyethylenimin bis zu einer Konzentration von etwa 0,35% zugesetzt. Das Ge­ misch wird stehengelassen und die Feststoffe werden durch Zentrifugieren und Filtration getrennt. Bei diesem Schritt wird die Temperatur unter 10°C gehalten. Der Überstand (bzw. das Filtrat) wird durch Ultrafiltration auf etwa ein Zehntel des ursprünglichen Volumens konzentriert. Die Lösung wird notfalls noch einmal durch eine mikro­ poröse Membran filtriert.
  • 3. Die klare Lösung wird direkt auf eine Säule mono­ klonaler Antikörper bei einer Durchflußrate von 5-8 cm/ Stunde (z. B. 25-40 ml pro Stunde bei einem Säulendurch­ messer von 2,6 cm) gegeben. Es wird mit dem etwa zehn­ fachen Säulenvolumen einer Lösung, die 25 mM Tris-HCl (pH 7,5-8,5), 0,5 M NaCl und 0,2% eines Detergenzes, wie Triton X-100 enthält, gewaschen. Anschließend wird mit dem etwa zehnfachen Säulenvolumen einer Lösung, die 0,15 M NaCl und 0,1% eines Detergenzes, wie Triton X-100, enthält gespült. Die Säule wird dann mit 0,2 M Essigsäure, ent­ haltend 0,1% eines Detergenzes, wie Triton X-100, eluiert. Die proteinhaltigen Fraktionen werden zusammengefaßt und mit 1 N NaOH oder 1,0 M Tris-Base auf einen pH von etwa 4,5 gebracht.
  • 4. Diese Fraktion wird dann auf einen Kationenaus­ tauscher, beispielsweise Whatmann CM52-Cellulose, der vor­ her mit einem geeigneten Puffer, beispielsweise Ammonium­ acetat, pH 4,5 (50 mM), äquilibriert wurde, gebracht. Es wurde dann mit dem Puffer so lange gewaschen, bis die UV- Absorption im Eluat konstant war. Die Säule wurde dann mit 25 mM Ammoniumacetat/0,12 M Natriumchlorid eluiert und das Eluat wurde in üblicherweise aufgearbeitet.
Die in der bevorzugten Ausführungsform verwendeten monoklonalen Antikörper können nach dem von Staehelin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 78, 1848-52 (1981) beschriebenen Verfahren hergestellt werden. Die Reinigung und Bindung der monoklonalen Antikörper an Affigel-10 wird im folgenden beschrieben.
Gewinnung und Reinigung monoklonaler Antikörper aus Aszites-Flüssigkeit
Fünf weibliche Balb/c Mäuse wurden jeweils mit 5-10 × 10⁶ Hybriddomzellen aus der Mitte der logarithmischen Wachstumsphase inokuliert. Weitere Mäuse (10 oder mehr) wurden jeweils mit 5 × 10⁶ lebensfähigen Zellen, die aus der von inokulierten Mäusen hergestellten Flüssigkeit ge­ wonnen wurden, intraperitoneal inokuliert.
Die Aszites-Flüssigkeit jeder Maus wurde gesammelt. Die Flüssigkeit wurde zunächst 15 Minuten mit 500-1000 × g und dann 90 Minuten mit 18 000 Umdrehungen pro Minute zentrifugiert. Der Überstand wurde gefroren und bei -20°C aufbewahrt. Nach dem Auftauen wurde weiteres festes Material durch 90minütiges Zentrifugieren mit 35 000 Umdrehungen pro Minute entfernt. Die von jeder Maus erhaltenen ein­ zelnen Batches wurden auf spezifische Antikörperaktivität nach einem Festphasenantikörperbindungstest (Staehelin et al. , siehe oben) getestet und, wenn möglich, zusammen­ gefaßt.
Die Proteinkonzentrationen der Lösungen wurden an­ näherungsweise bestimmt, wobei man davon ausging, daß in einer 1 cm-Küvette 1 mg Protein eine Absorption von 1,2 bei 280 nm lieferte. Aszites-Flüssigkeiten mit einem hohen Antikörpergehalt enthielten 30-35 mg Protein/ml. Dies entspricht etwa 4-7 mg spezifischem Antikörper/ml. Die Flüssigkeit wurde verdünnt mit PBS (0,01 M Natrium­ phosphat, pH 7,3, 0,15 M NaCl) auf eine Proteinkonzentration von 10-12 mg/ml.
Zu je 100 ml der verdünnten Lösungen wurden bei 0°C unter starkem Rühren langsam 90 ml von bei Zimmertemperatur gesättigter Ammoniumsulfatlösung gegeben. Die Suspension wurde während 40-70 Minuten in Eis aufbewahrt, dann während 15 Minuten bei 4°C mit 10 000 Umdrehungen pro Minute zentri­ fugiert. Der Überstand wurde dekantiert. Der Protein­ kuchen wurde in 0,02 M Tris-HCl (pH 7,9)/0,04 M NaCl (Puffer I) gelöst und die Proteinlösung während 16-18 Stunden bei Raumtemperatur gegen 100 Volumina des Puffers I dialysiert. Die dialysierte Lösung wurde 10 Minuten mit 15 000 Umdrehungen pro Minute zentrifugiert. Etwa 30-35% des ursprünglichen Gesamtproteingehalts der Aszites-Flüs­ sigkeit wurde wiedergefunden mittels Messung der Absorption bei 280 nm.
Eine Lösung, enthaltend 30-40 mg Protein/ml wurde dann auf eine DEAE-Cellulosesäule, die mit Puffer I äquilibriert war, gegeben, wobei für jeweils 1 g Protein mindestens ein Säulenvolumen von 100 ml verwendet wurde. Der Anti­ körper wurde von der Säule mit einem linearen NaCl-Gra­ dienten (0,04 M-0,5 M) in 0,02 M Tris-HCl (pH 7,9) eluiert. Die Fraktionen mit einem NaCl-Gehalt von 0,06- 0,1 M wurden zusammengefaßt, konzentriert und mit bei Zimmertemperatur gesättigter Ammoniumsulfatlösung versetzt. Es wurde zentrifugiert, der Proteinkuchen wurde in 0,2 M NaHCO₃ (pH etwa 8,0)/0,3 M NaCl (Puffer II) gelöst und bei Raumtemperatur gegen diesen Puffer dialysiert. Die dia­ lysierte Lösung wurde 15 Minuten lang mit 20 000 × g zentrifugiert und der Proteingehalt wurde auf 20-25 mg/ml mit Puffer II eingestellt.
Herstellung von Immunadsorbentien
Affigel-10 (BioRad Laboratories, Richmond, Kalifornien) wurde auf einem gesinterten Glasfilter dreimal mit eiskaltem Isopropanol und dreimal mit eiskaltem destilliertem Wasser gewaschen. Das Gel, das noch etwa 50% Wasser enthielt, wurde in Plastikröhrchen übergeführt und durch kurzes Zentrifugieren sedimentiert. Der Überstand wurde verdunstet. Das gepackte Gel wurde mit einem gleichen Volumen gereinigter Antikörper­ lösung gemischt und während 5 Stunden bei 4°C Ende-über- Ende rotieren gelassen. Nach der Reaktion wurde das Gel zentrifugiert und zweimal mit Puffer III (0,1 M NaHCO₃/ 0,15 M NaCl) gewaschen, um nicht-gebundene Antikörper zu entfernen. Die Proteinbestimmung zeigte, daß mehr als 90% des Antikörpers an das Gel gebunden worden war.
Um noch freie, reaktive Bindungsstellen abzusättigen, wurde das Gel mit einem gleichen Volumen 0,1 M Ethanolamin- HCl (pH 8) gemischt und während 60 Minuten bei Raum­ temperatur Ende-über-Ende rotieren gelassen. Schließlich wurde das Gel mit PBS gewaschen und bei 4°C in PBS in Ge­ genwart von 0,02% (w/v) Natriumazid aufbewahrt.
N. Parenterale Applikation
LeIF kann parenteral verabreicht werden an Individuen, die eine Antitumor- oder antivirale Behandlung benötigen und an solche, die immunsuppresive Zustände aufweisen. Die Dosierung der erfindungsgemäßen Interferone kann sich an die des zur Zeit in klinischer Prüfung befindlichen Materials, das aus menschlichen Leukozyten gewonnen wurde, anlehnen und kann z. B. etwa 1-10 × 10⁶ Einheiten pro Tag, im Fall von Material mit einer Reinheit, die größer ist als 1%, bis zu etwa 5 × 10⁷ Einheiten pro Tag betragen.
Ein für die parenterale Applikation geeignetes Prä­ parat kann beispielsweise dadurch hergestellt werden, daß man 3 mg bakteriell hergestelltes LeIF mit einer spezifischen Aktivität von etwa 2 × 10⁸ Einheiten pro mg in 25 ml 5 N humanem Serumalbumin löst, die Lösung durch ein bakteriolo­ gisches Filter gibt und die filtrierte Lösung aseptisch in 100 Ampullen abfüllt, von denen jede 6 × 10⁶ Einheiten reines Interferon enthält. Die Ampullen werden vorzugsweise in der Kälte (-20°C) aufbewahrt.
Die Herstellung pharmazeutischer Präparate, die er­ findungsgemäße Verbindungen enthalten, kann nach den all­ gemein bekannten Methoden der Galenik unter Verwendung der üblichen Hilfs- und Trägermaterialien, wie sie in der einschlägigen Literatur beschrieben sind, erfolgen.

Claims (29)

1. Polypeptide mit der Aminosäuresequenz eines reifen Human-Leukozyten-Interferons ohne Präsequenz, die keine Glykosylgruppen enthalten.
2. Polypeptide mit der Aminosäuresequenz eines amino­ endständig um Methionin verlängerten reifen Human-Leukozy­ ten-Interferons.
3. Polypeptide gemäß einem der Ansprüche 1 oder 2 mit der Aminosäurepartialsequenz Cys-Ala-Trp-Glu-Val-Val-Arg- Ala-Glu-Ile-Met-Arg-Ser.
4. Polypeptide gemäß einem der Ansprüche 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet, daß sie die in der folgenden Figur in Zeile "All" angegebenen Aminosäuren an den angegebenen Stellen der Aminosäuresequenz enthalten
6. Ein mikrobiell hergestelltes Polypeptid oder Human- Leukozyten-Interferon gemäß einem der Ansprüche 1-5.
7. Ein bakteriell hergestelltes Polypeptid oder Human- Leukozyten-Interferon gemäß einem der Ansprüche 1-5.
8. Ein durch E. coli hergestelltes Polypeptid oder Human-Leukozyten-Interferon gemäß einem der Ansprüche 1-5.
9. Eine DNS-Sequenz, die die Aminosäuresequenz eines reifen Human-Leukozyten-Interferons ohne Präsequenz gemäß Anspruch 1 codiert.
10. Eine DNS-Sequenz, die die Aminosäuresequenz eines aminoendständig um Methionin verlängerten reifen Human- Leukozyten-Interferons ohne Präsequenz codiert.
11. Eine DNS-Sequenz gemäß einem der Ansprüche 9 oder 10, die eine die Aminosäuresequenz Cys-Ala-Trp-Glu-Val- Val-Arg-Ala-Glu-Ile-Met-Arg-Ser codierende Partialsequenz enthält.
12. Eine DNS-Sequenz gemäß einem der Ansprüche 9 oder 10 die Codons enthält, die die in Zeile "All" der Figur gemäß Anspruch 4 angegebenen Aminosäuren an den entspre­ chenden Stellen der Aminosäuresequenz codieren.
13. Eine DNS-Sequenz gemäß einem der Ansprüche 9-12, die ein Polypeptid aus der Gruppe der reifen Human-Leuko­ zyten-Interferone (LeIF) codiert, dadurch gekennzeichnet, daß sie die in den Fig. 3 oder 8 ausgegebene DNS-Sequenz aufweist, wobei die Fig. 3 und 8 Bestandteil dieses Anspruches sind, und für reifes Human-Leukozyten-Interferon A (LeIF A)
oder für reifes Human-Leukozyten-Interferon B (LeIF B)
oder für reifes Human-Leukozyten-Interferon C (LeIF C)
oder für reifes Human-Leukozyten-Interferon D (LeIF D)
oder für reifes Human-Leukozyten-Interferon F (LeIF F)
oder für reifes Human-Leukozyten-Interferon H (LeIF H)
oder für reifes Human-Leukozyten-Interferon I (LeIF I)
oder für reifes Human-Leukozyten-Interferon J (LeIF J) kodiert.
14. Eine DNS-Sequenz gemäß einem der Ansprüche 9-13, die operabel verbunden ist mit einer DNS-Sequenz, die die mikrobielle Expression eines Polypeptids gemäß einem der Ansprüche 1-5 bewirken kann.
15. Eine DNS-Sequenz gemäß einem der Ansprüche 9-13, die operabel verbunden ist mit einer DNS-Sequenz, die die bakterielle Expression eines Polypeptids gemäß einem der Ansprüche 1-5, insbesondere in E. coli, bewirken kann.
16. Ein replikabler Vektor, der in einem transformierten Mikroorganismus ein Polypeptid gemäß einem der Ansprüche 1-5 zur Expression bringen kann.
17. Ein replikabler Vektor, der in einem transformierten Bakterium, insbesondere in E. coli, ein Polypeptid gemäß einem der Ansprüche 1-5 zur Expression bringen kann.
18. Ein Vektor gemäß einem der Ansprüche 16 oder 17, der ein Plasmid, insbesondere ein Plasmid aus der Gruppe pLeIF A trp 25, pLeIF B trp 7, pLeIF F trp 1, pLeIF C trp 35, pLeIF D trp 11, pLeIF H, pLeIF I trp 1 und pLeIF J trp 1 ist.
19. Ein mit einem Vektor gemäß den Ansprüchen 16-18 transformierter Mikroorganismus.
20. Ein mit einem Vektor gemäß einem der Ansprüche 16-18 transformiertes Bakterium.
21. Ein mit einem Vektor gemäß einem der Ansprüche 16-18 transformierter Stamm von E. coli, insbesondere der E. coli K-12 Stamm 294.
22. pharmazeutische Präparate auf der Basis eines reifen Human-Leukozyten-Interferons gemäß einem der Ansprüche 1-8.
23. pharmazeutische Präparate gemäß Anspruch 22 zur parenteralen Applikation.
24. Pharmazeutische Präparate nach Anspruch 22 oder 23 Tumore und virale Infektionen.
25. Die Verwendung von DNS-Sequenzen gemäß einem der Ansprüche 9-15 zur mikrobiellen Herstellung von Verbindun­ gen gemäß einem der Ansprüche 1-5.
26. Die Verwendung eines Vektors gemäß einem der An­ sprüche 16-18 zur mikrobiellen Herstellung einer Verbindung gemäß einem der Ansprüche 1-5.
27. Die Verwendung eines Mikroorganismus gemäß einem der Ansprüche 19-21 zur Herstellung einer Verbindung gemäß einem der Ansprüche 1-5.
28. Verfahren zur Herstellung einer Verbindung gemäß einem der Ansprüche 1-5, dadurch gekennzeichnet, daß man eine Kultur eines Mikroorganismus, der mit einem zur Ex­ pression einer solchen Verbindung befähigten replikablen Vektor transformiert ist, zur Expression anregt und diese Verbindung isoliert.
29. Verfahren zur Herstellung eines Mikroorganismus der zur Expression einer Verbindung gemäß einem der Ansprüche 1-5 fähig ist, dadurch gekennzeichnet, daß man einen Mikro­ organismus mit einem die Expression dieser Verbindung bewir­ kenden, replikablen Vektor transformiert und kultiviert.
30. Verfahren zur Herstellung eines replikablen, in einem Mikroorganismus die Expression einer Verbindung ge­ mäß einem der Ansprüche 1-5 bewirkenden Vektors, dadurch gekennzeichnet, daß man eine diese Verbindung codierende DNS-Sequenz operabel mit einer DNS-Sequenz, die die für die Expression notwendigen Codons enthält, verbindet.
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