CN101631861A - 作为治疗干预的靶标的miR-16调节基因和途径 - Google Patents

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CN101631861A CN200780051044A CN200780051044A CN101631861A CN 101631861 A CN101631861 A CN 101631861A CN 200780051044 A CN200780051044 A CN 200780051044A CN 200780051044 A CN200780051044 A CN 200780051044A CN 101631861 A CN101631861 A CN 101631861A
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Abstract

本发明涉及用于以下用途的方法和组合物:鉴定受miR-16调节的基因或遗传途径,使用miR-16来调节基因或基因途径,使用该表达谱来评估患者的状况,和/或使用适当的miRNA来治疗该患者。

Description

作为治疗干预的靶标的miR-16调节基因和途径
本申请要求2006年12月29日提交的美国临时申请号60/882,758和2007年12月10日提交的PCT申请PCT/US07/87038的优先权,这两个专利申请通过引用整体并入本文。
本申请涉及2005年5月31日提交的美国专利申请系列号11/141,707和2005年11月14日提交的系列号11/273,640,每个专利申请都通过引用整体并入本文。
技术领域
本发明涉及分子生物学和医药领域。更具体地说,本发明涉及治疗受miR-16微RNA、微RNA表达以及由其直接和间接调节的基因和细胞路径影响的疾病或病状的方法和组合物。
背景技术
在2001年,若干组织使用克隆方法从线虫(C.elegans)、果蝇(Drosophila)和人类分离和鉴别一大组“微RNA”(miRNA)(Lagos-Quintana等人,2001;Lau等人,2001;Lee和Ambros,2001)。已经在似乎不具有内源siRNA的植物和动物(包括人类)中鉴别到数百种miRNA。因此,尽管类似于siRNA,但miRNA是不同的。
因此至今观察到miRNA为约21-22个核苷酸长且产生自由非蛋白质编码基因所转录的较长前体。参看Carrington等人,(2003)的综述。前体形成在自我互补区中折回的结构,其接着由动物体内的核酸酶切酶或植物体内的DCL1予以加工。miRNA分子通过与其靶标的精确或不精确碱基配对而中断翻译。
许多miRNA在各种有机体之间是保守的,且这已导致有人提出miRNA在有机体一生当中都涉及在基本生物过程中(Esquela-Kerscher和Slack,2006)。具体来说,miRNA已涉及调控细胞生长、细胞和组织分化以及与癌症发展有关的细胞过程。举例来说,lin-4和miR-16皆调控线虫发育期间从一个幼体形态到另一幼体形态的传代过程(Ambros,2001)。mir-14和bantam是调控细胞死亡的果蝇miRNA,所述调控显然是通过调控细胞凋亡中所涉及的基因表达来进行(Brennecke等人,2003,Xu等人,2003)。
对miRNA的研究在不断增多,因为科学家开始认识到这些分子在真核基因表达的调控中所发挥的广泛作用。具体来说,若干最新研究已显示众多miRNA的表达水平与各种癌症有关(在Esquela-Kerscher和Slack,2006中综述)。两种miRNA的表达降低与人类的慢性淋巴细胞性白血病强烈相关,从而提供miRNA与癌症之间的可能联系(Calin等人,2002)。其他人已经评估众多miRNA在多种人类癌症中的表达模式且观察到几乎所有miRNA在众多癌症类型之间的差异表达(Lu等人,2005)。大多数研究都是仅通过间接证据将miRNA与癌症联系起来。然而,He等人,(2005)已提出更多直接证据,即miRNA可通过促使小鼠体内六种miRNA的过度表达来引起B细胞淋巴瘤的显著增加从而直接促成癌症。
其他人已证实miR-16在来自慢性淋巴细胞性白血病患者的B细胞中得到下调(Calin等人,2002)。这些miRNA在B细胞淋巴瘤中的表达降低导致miR-16靶标基因BCL2的过度表达和BCL2基因产物对细胞凋亡的随后抑制。这导致不受控制的细胞增殖和B细胞恶性肿瘤(在Calin和Croce,2006中综述)。这些数据一起表明miR-16-1似乎充当人类B细胞的肿瘤抑制因子。
发明人先前证实hsa-miR-16与代表癌症治疗和其他疾病和病症的治疗的介入点的众多细胞活性的调控有关(2005年5月31日申请的美国专利申请案第11/141,707号和2005年11月14日申请的美国专利申请案第11/273,640号)。miR-16在来自众多肺癌患者的肺肿瘤中的表达与其在来自相同患者的正常相邻肺组织中的表达相比有所减少。发明人观察到miR-16在乳房和前列腺肿瘤中的表达与其在来自相同癌症患者的相邻正常细胞中的表达相比有所增加。在人类包皮纤维母细胞中,hsa-miR-16活化编码端粒酶的催化结构域的hTert基因。超过90%的人类癌症样品具有活性端粒酶(在Dong等人,2005中综述)。Hsa-miR-16还诱导细胞进入细胞周期的S期且降低肺癌细胞(A549和HTB-57肺癌细胞)、前列腺癌细胞(22Rv1)和人类基底细胞癌(TE354T)的增殖。hsa-miR-16的抗miR抑制剂增强非恶性人类乳房上皮细胞和基底细胞癌细胞(TE354T)的增殖。此外,发明人先前观察到hsa-miR-16在朊病毒病和阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease)患者中与无所述疾病的患者中相比有所上调。由于对于癌症治疗来说情况如此,因此受hsa-miR-16表达改变的基因和路径代表某些疾病如阿尔茨海默病和朊病毒病的治疗中的治疗干预的靶标,在所述疾病中hsa-miR-16可能发挥作用。
在动物中,认为大多数miRNA通过其基因靶标的3’未翻译区内的不精确碱基配对而与靶标基因相互作用。认为miRNA对靶标基因的调控主要是通过翻译抑制来发生,但mRNA不稳定性也可能是一种机制(Reinhart等人,2000;Bagga等人,2005)。生物信息学分析表明任何给定miRNA都可与多达数百种不同基因结合且改变其表达。此外,单一基因可受若干miRNA调控。因此,每种miRNA可调控基因、基因路径和基因网络之中的复杂相互作用。涉及miRNA的这些调控路径和网络的误调控或改变很可能促成例如癌症等病症和疾病的发展。虽然生物信息学工具有助于预测miRNA结合靶标,但其都具有局限性。因为生物信息学工具与其靶标结合位点的互补性不完全,所以难以单独用生物信息学工具准确地预测miRNA靶标。此外,miRNA与靶标基因之间复杂的相互作用式调控网络使得难以准确地预测哪些基因将实际上回应给定miRNA而被误调控。
通过操控miRNA表达或通过修复miRNA误调控对基因表达误差进行修正代表着修复遗传病症和治愈疾病如癌症的有希望的方法。这种方法当前不能使用的局限性在于,如上文所述,受任何给定miRNA影响的调控路径和网络的细节大部分仍然未知。除BCL2之外,在癌细胞中受miR-16调控的基因、基因路径和基因网络大部分仍然未知。当前,这代表关于治疗其中miR-16可能起作用的癌症的显著局限性。仍然需要鉴别受hsa-miR-16表达调控或可能调控hsa-miR-16表达的基因、基因路径和基因网络。
发明内容
本发明提供解决所属领域中的问题的其它组合物和方法,其是通过鉴别癌细胞中作为hsa-miR-16调控的直接靶标或作为上游基因表达的hsa-miR-16介导修饰之后的调控的下游靶标的基因来解决问题。此外,本发明描述受hsa-miR-16影响的基因、疾病和/或生理路径和网络。这些基因和路径中有很多与各种癌症和其它疾病有关。miR-16在细胞中的表达发生变化将导致这些关键基因的表达也发生变化且促成疾病发展。将miR-16(对于其中miRNA下调的疾病)或miR-16抑制剂(对于其中miRNA上调的疾病)引入疾病细胞或组织中将引起治疗反应。受miR-16直接或间接调控的关键基因的身份和与其相关的疾病提供于本文中。在某些方面,细胞可为上皮细胞、基质细胞或粘膜细胞。细胞可为(但不限于)脑、神经胶质、神经元、血液、食道、肺、心血管、肝、乳腺、骨、甲状腺、腺、肾上腺、胰腺、胃、肠、肾、膀胱、前列腺、子宫、卵巢、睾丸、脾、皮肤、平滑肌、心肌或横纹肌细胞。在某些方面,细胞、组织或靶标可能在miRNA表达方面没有缺陷,但仍然对miRNA的表达或过度表达作出治疗反应。miR-16可用作这些疾病中任一种的治疗靶标。在某些方面,将本发明的组合物施予患有、怀疑患有或有风险罹患代谢性、免疫性、传染性、心血管、消化道、内分泌、眼睛、泌尿生殖、血液、肌肉骨骼、神经系统、先天性、呼吸道、皮肤或癌性疾病或病状的受试对象。
在特定方面,可依据一种或一种以上miRNA或mRNA的表达和/或异常表达选择受试对象或患者用于治疗。在另一方面,可依据一种或一种以上生物或生理路径的异常选择受试对象或患者用于治疗,所述异常包括一种或一种以上与路径相关的基因的异常表达或一种或一种以上由一种或一种以上与路径相关的基因编码的蛋白质的异常表达。在另一方面,可依据miRNA表达或生物和/或生理路径的异常选择受试对象或患者。可依据评估和/或分析miRNA或mRNA表达或其缺失来针对受试对象评定疗法或治疗方案的敏感性、抗性和/或功效。可在对受试对象或患者施予一种或一种以上疗法之前、期间或之后评估受试对象对特定疗法的敏感性(amenability)。评估或评定通常可通过分析miRNA和/或mRNA以及包括(但不限于)组织学、免疫组织化学、血液研究(blood work)等的其它评定方法的组合来进行。
在一些实施方式中,感染性疾病或病症包括细菌感染、病毒感染、寄生虫感染或真菌感染。这些基因和途径中有许多与各种癌症和其他疾病有关。癌性病症包括但不限于星形细胞瘤、间变性大细胞淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、喉鳞状细胞癌、肺癌、黑素瘤、成髓细胞瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、髓性白血病、多发性骨髓瘤、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头部和颈部的鳞状细胞癌、睾丸肿瘤或甲状腺癌,在这些癌性病症中对一个或多个基因的调节对于治疗反应来说是足够的。通常,癌性病症是一种异常高增殖性病症,它与生长不受控制或者不能进行包括细胞凋亡在内的细胞死亡有关。
在某些方面,癌性病症是前列腺癌,它可以是PSA阳性或阴性的,和/或雄激素依赖性或雄激素非依赖性的。前列腺的细胞需要称为雄激素的雄性激素来正确运转。雄激素包括在睾丸中产生的睾酮、在肾上腺中产生的脱氢表雄酮和在前列腺自身当中从睾酮转化而来的二氢睾酮。一些前列腺癌保持雄激素依赖性,而其他的前列腺癌不依赖于雄激素。前列腺癌筛选是一种旨在寻找意外癌症的尝试。筛选试验可引出更具特异性的后续试验如活组织检查,在活组织检查中取前列腺小片进行更密切的研究。典型的前列腺癌筛选选项包括数字直肠检查和前列腺特异性抗原(PSA)血检。前列腺癌通常是缓慢生长的癌症,在老年男人中极为常见。
细胞、组织或受试对象可以是癌细胞,可以是癌性组织,可以隐匿癌性组织,或者可以是经诊断患有某种疾病或病症或者有发展某种疾病或病症的危险的受试对象或患者。在某些方面,癌细胞是神经元细胞、神经胶质细胞、肺细胞、肝细胞、脑细胞、乳腺细胞、膀胱细胞、血液细胞、白血病细胞、结肠细胞、子宫内膜细胞、胃细胞、皮肤细胞、卵巢细胞、脂肪细胞、骨细胞、宫颈细胞、食道细胞、胰腺细胞、前列腺细胞、肾细胞、睾丸细胞或甲状腺细胞。在还一个方面,癌症包括但不限于星形细胞瘤、间变性大细胞淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、喉鳞状细胞癌、肺癌、黑素瘤、成髓细胞瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、髓性白血病、多发性骨髓瘤、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头部和颈部的鳞状细胞癌、睾丸肿瘤或甲状腺癌。
在某些方面,所调节的一种或一种以上基因包含表1、2、4和5中所标识的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、100、150、200或200种以上的基因或任何基因组合。在某些方面,基因表达受到下调或上调。在特定方面,所调节的基因以各种组合和排列包含或选自(且甚至可能排除)表1、2、4和5中所标识的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31种或全部基因。在特定实施方式中,本发明可排除或选择不包括表1、2、4和5中所标识的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、100、150、200或200种以上的基因或任何基因组合,例如BCL2、RARS(精氨酰-tRNA合成酶)、BTG2、WT1、PPM1D、PAK7和/或RAB9B。在一特定方面,所调节或经选择用于调节的基因包括表1、2、4和/或5中的一种或一种以上基因,条件是不包括RARS(精氨酰-tRNA合成酶)、BTG2、WT1、PPM1D、PAK7和/或RAB9B。
本发明的实施方式包括调节细胞、组织或受试对象的基因表达或生物或生理路径的方法,其包含对细胞、组织或受试对象施予一定量的包含miR-16核酸、模拟物或抑制剂序列的分离核酸或其模拟物,所述量足以调节受miR-16miRNA正向或负向调节的基因的表达。“miR-16核酸序列”或“miR-16抑制剂”包括miR-16的全长前体或其互补序列或miR-16的加工的(即成熟)序列和本文所述的相关序列,以及前体miRNA或其加工的序列或其互补序列的5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29个或以上个核苷酸,包括其间的所有范围和整数。在某些实施方式中,miR-16核酸序列或miR-16抑制剂含有全长加工的miRNA序列或其互补序列且称作“miR-16全长加工的核酸序列”或“miR-16全长加工的抑制剂序列”。在其它方面,miR-16核酸包含miR-16的至少一个5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、50个核苷酸(包括其间的所有范围和整数)长的片段或互补片段,其与本文所提供的SEQ ID NO具有至少75、80、85、90、95、98、99或100%同一性。通用术语miR-16包括共有成熟miR-16序列的至少一部分的miR-16家族中的所有成员。在其它方面,miR-16核酸包含至少一个5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、50个核苷酸(包括其间的所有范围和整数)长的miR-16片段,其与SEQ ID NO:1-3(SEQ ID NO:1 uagcagcacguaaauauuggcg(登记号-MIMAT0000069)、SEQ ID NO:2(hsa-mir-16-1,登记号-MI0000070)gucagcagugccuuagcagcacguaaauauuggcguuaagauucuaaaauuaucuccaguauuaacugugcugcugaaguaagguugac、SEQ ID NO:3(hsa-mir-16-2,登记号MI0000115)guuccacucuagcagcacguaaauauuggcguagugaaauauauauuaaacaccaauauuacugugcugcuuuagugugac)具有至少75、80、85、90、95、98、99或100%同一性。在某些实施方式中,所调节或经选择用于调节的基因是来自表1。在其它实施方式中,所调节或经选择用于调节的基因是来自表2。在其它实施方式中,所调节或经选择用于调节的基因是来自表4。在其它实施方式中,所调节或经选择用于调节的基因是来自表5。本发明的实施方式还可包括在选择治疗模式(例如miR-16核酸的给予)之前获得或评定靶标细胞的基因表达谱或miRNA谱。
在某些方面,miR-16核酸或其片段或模拟物将包含前体miRNA或其加工的序列的5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29个或以上个的核苷酸,包括其间的所有范围和整数。在某些实施方式中,miR-16核酸序列含有全长加工的miRNA序列且称作“miR-16全长加工的核酸序列”。在其它方面,miR-16包含至少一个5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、50个核苷酸(包括其间的所有范围和整数)长的miR-16片段,其与本文所提供的SEQ ID NO具有至少75、80、85、90、95、98、99或100%同一性。
在具体实施方式中,含有miR-16或miR-16抑制剂的核酸为hsa-miR-16或hsa-miR-16抑制剂或其变体。在另一方面,miR-16核酸或miR-16抑制剂可与1、2、3、4、5、6、7、8、9、10种或以上的miRNA或miRNA抑制剂一起给予。miRNA或其互补序列可同时、相继或以有序方式给予。在某些方面,miR-16或miR-16抑制剂可与let-7、miR-15、miR-126、miR-20、miR-21、miR-26a、miR-34a、miR-143、miR-147、miR-188、miR-200、miR-215、miR-216、miR-292-3p和/或miR-331中的一种或一种以上组合给予。所有miRNA或其抑制剂或者miRNA或其抑制剂的组合可以单一制剂形式给予。给予可在第二疗法之前、其间或之后。
miR-16核酸或其互补序列还可包括各种异源核酸序列,即在自然界中通常未发现与miR-16操作性偶联的那些序列,例如启动子、增强子等。miR-16核酸为重组核酸且可为核糖核酸或脱氧核糖核酸。重组核酸可包含miR-16或miR-16抑制剂表达盒,即当引入含有用于核酸合成的组分的环境中时表达核酸的核酸片段。在另一方面,表达盒是包含在病毒载体或质粒DNA载体或其它治疗核酸载体或运送载体(包括脂质体等)中。在一特定方面,miR-16核酸为合成核酸。此外,本发明的核酸可为完全或部分合成性核酸。在某些方面,可以1×102、1×103、1×104 1×105、1×106、1×107、1×108、1×109、1×1010、1×1011、1×1012、1×1013、1×1014pfu或病毒粒子(vp)的量施予病毒载体。
在一特定方面,miR-16核酸或miR-16抑制剂为合成核酸。此外,本发明的核酸可为完全或部分合成性核酸。在其它方面,可以0.001、0.01、0.1、1、10、20、30、40、50、100、200、400、600、800、1000、2000到4000μg或mg(包括其间的所有值和范围)的量施予本发明的核酸或编码本发明的所述核酸的DNA。在另一方面,可以每千克(kg)体重0.001、0.01、0.1、1、10、20、30、40、50、100到200μg的量施予本发明的核酸(包括合成核酸)。本文所述的各种量可经一段时间施予,包括0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10分钟、小时、天、周、月或年,包括其间的所有值和范围。
在某些实施方式中,组合物的给予可为肠内或肠胃外给予。在某些方面,肠内给予为口服。在其它方面,肠胃外给予为病灶内、血管内、颅内、胸膜内、肿瘤内、腹膜内、肌肉内、淋巴内、腺内、皮下、局部、支气管内、气管内、鼻内、吸入或滴注给予。本发明的组合物可区域性地或局部地给予且不必直接施予到病灶中。
细胞、组织或受试对象可为异常或病理病状或罹患异常或病理病状,且在细胞或组织的情况下为病理病状的组成。在某些方面,细胞、组织或受试对象为癌细胞、癌组织或隐匿癌组织或癌症患者。在特定方面,癌为神经元、神经胶质、肺、肝、脑、乳腺、膀胱、血液、白血病、结肠、子宫内膜、胃、皮肤、卵巢、食道、胰腺、前列腺、肾或甲状腺癌。到本申请案的申请日期为止,与登记号或数据库提交号所指定的所有核酸和基因有关的数据库内容是以引用的方式并入本文。
本发明的另一实施方式针对调节细胞路径的方法,其包含对细胞施予一定量的包含miR-16核酸序列的分离核酸,所述量足以调节细胞路径、尤其表2所述的路径或已知包括一种或一种以上来自表1、3、4和/或5的基因的路径的表达、功能、状况或状态。细胞路径的调节包括(但不限于)调节一种或一种以上基因的表达。基因调节可包括抑制内源miRNA的功能或向细胞、组织或受试对象提供功能性miRNA。调节是指基因或其相关基因产物或蛋白质的表达水平或活性(例如mRNA含量)可被调节或mRNA的翻译可被调节等。调节可增加或上调基因或基因产物或者其可降低或下调基因或基因产物。
另一实施方式包括治疗患有病理病状的患者的方法,其包含一个或一个以上下列步骤:(a)对患者施予一定量的包含miR-16核酸序列的分离核酸,所述量足以调节细胞路径的表达;和(b)施予第二疗法,其中细胞路径的调节使患者对第二疗法敏感。细胞路径可包括(但不限于)一种或一种以上于下文表2中所述的路径或已知包括表1、3、4和/或5的一种或一种以上基因的路径。第二疗法可包括第二miRNA或其它核酸疗法或一种或一种以上标准疗法,例如化学疗法、药物疗法、放射疗法、免疫疗法、热疗法等。
本发明的实施方式包括治疗患有病理病状的受试对象的方法,其包含一个或一个以上下列步骤:(a)测定一种或一种以上选自表1、3、4和/或5的基因的表达谱;(b)依据表达谱评定受试对象对疗法的敏感性;(c)依据所评定的敏感性选择疗法;和(d)使用所选疗法治疗受试对象。病理病状通常将以表1、3、4和/或5的一种或一种以上基因的误调控作为组成、指示或结果。
其它实施方式包括鉴别和评定表明细胞或组织中的miR-16状态的表达谱,其包含一种或一种以上来自表1、3、4和/或5的基因或其任何组合的表达评定。
术语“miRNA”是根据其普通和明显意义使用且是指在真核细胞中所发现的涉及以RNA为基础的基因调控的微RNA分子。参看例如Carrington等人,2003,其以引用的方式并入本文。所述术语可用于指代由前体加工而来的单链RNA分子或在某些情况下指代前体本身。
在一些实施方式中,其可用于了解细胞是否内源性地表达特定miRNA或所述表达是否在特定条件下受到影响或细胞何时处于特定疾病状态。因此,在本发明的一些实施方式中,方法包括分析细胞或含有细胞的样品中一种或一种以上标志基因或mRNA或表明目的基因的表达水平的其它分析物的存在。因此,在一些实施方式中,方法包括产生样品的RNA谱的步骤。术语“RNA谱”或“基因表达谱”是指与样品的一种或一种以上基因或遗传标记(例如鉴别一种或一种以上来自表1、3、4和/或5的标记的多种核酸探针)的表达模式有关的一组数据;预期可使用一组RNA且使用例如所属领域技术人员众所周知的核酸扩增或杂交技术来获得核酸谱。患者样品的表达谱与参考表达谱(例如来自正常或非病理样品的表达谱)的差异表明病理、疾病或癌性病状。包含或鉴别一段对应mRNA的核酸或探针组可包括表1、3、4和/或5中所列举或通过本文所述方法所鉴别的基因或遗传标记或代表其的核酸、mRNA或探针的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12,13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、100、200、500个或以上片段(包括其间可导出的任何整数或范围)中的全部或一部分。
本发明的某些实施方式针对用于评定、预后或治疗患者的病理病状的组合物和方法,其包含测量或测定患者样品中一种或一种以上标记的表达谱,其中患者样品的表达谱与正常样品的表达谱或参考表达谱的差异表明病理病状且尤其表明癌症。在本发明的某些方面,细胞路径、基因或遗传标记为或代表在表1、3、4和/或5中所述的一种或一种以上路径或标记,包括其任何组合且排除0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10种或以上基因。
本发明的方面包括治疗、诊断或预后病理病状或预防病理病状显现出来。举例来说,所述方法可用于筛检病理病状;评定病理病状的预后;测定病理病状的阶段;评定病理病状对疗法的反应;或作为第一疗法调节一种或一种以上基因或相关路径的表达或使受试对象对第二疗法敏感或更具反应性。在特定方面,评定患者的病理病状可为评定患者的预后。预后可包括(但不限于)估计存活时间或预期存活时间、评定对疗法的反应等。在某些方面,一种或一种以上基因或标记的表达改变对具有病理病状的患者具有预后性,其中所述标记是表1、3、4和/或5的一种或一种以上标记,包括其任何组合。
本发明的某些实施方式包括通过使用其中多种为所属领域技术人员众所周知的扩增分析、杂交分析或蛋白质分析来测定一种或一种以上标记、基因或代表其的核酸的表达。在某些方面,扩增分析可为例如定量RT-PCR等定量扩增分析。在其它方面,杂交分析可包括阵列杂交分析或液相杂交分析。来自样品的核酸可自样品标记和/或将经标记的核酸与一种或一种以上核酸探针杂交。核酸、mRNA和/或核酸探针可与载体偶联。所述载体为所属领域技术人员众所周知且包括(但不限于)玻璃、塑料、金属或乳胶。在本发明的特定方面,载体可为平面的或珠粒形式或所属领域中已知的其它几何形状或构型。蛋白质通常是通过免疫印迹法、色谱法、质谱分析或所属领域技术人员已知的其它方法来分析。
本发明的另一实施方式针对调节细胞路径的方法,其包含对细胞施予一定量的包含miR-16核酸序列或miR-16抑制剂的分离核酸。细胞、组织或受试对象为癌细胞、癌组织或隐匿癌组织或癌症患者。到本申请案的申请日期为止,与登记号或数据库提交号所指定的所有核酸和基因有关的数据库内容是以引用的方式并入本文。
本发明的另一实施方式针对调节细胞路径的方法,其包含对细胞施予一定量的包含miR-16核酸序列的分离核酸,所述量足以调节细胞路径、尤其所述路径或已知包括一种或一种以上本文所述基因的路径的表达、功能、状况或状态。细胞路径的调节包括(但不限于)调节一种或一种以上基因的表达。基因调节可包括抑制内源miRNA的功能或向细胞、组织或受试对象提供功能性miRNA。调节是指基因或其相关基因产物(例如mRNA)或蛋白质的表达水平或活性(例如mRNA含量)可被调节或mRNA的翻译可被调节等。调节可增加或上调基因或基因产物或者其可降低或下调基因或基因产物(例如蛋白质水平或活性)。
另一实施方式包括施予miRNA或其模拟物和/或治疗患有、怀疑患有或有风险罹患病理病状的受试对象或患者的方法,其包含一个或一个以上下列步骤:(a)对患者或受试对象施予一定量的包含miR-16核酸序列或miR-16抑制剂的分离核酸,所述量足以调节细胞路径的表达;和(b)施予第二疗法,其中细胞路径的调节使患者或受试对象敏感或增加第二疗法的功效。功效增强可包括毒性降低、第二疗法的剂量或持续时间减少或累加或协同作用。细胞路径可包括(但不限于)一种或一种以上本文所述的路径或已知包括本文各表中一种或一种以上的基因的路径。第二疗法可在施予分离核酸或miRNA或抑制剂之前、期间和/或之后施予。
第二疗法可包括施予例如siRNA或反义寡核苷酸等第二miRNA或治疗核酸,或可包括例如医药品、化学疗法、放射疗法、药物疗法、免疫疗法等各种标准疗法。本发明的实施方式还可包括测定或评定基因表达或基因表达谱以便选择适当疗法。在一特定方面,第二疗法为化学疗法。化学疗法可包括(但不限于)紫杉醇(paclitaxel)、顺铂(cisplatin)、卡铂(carboplatin)、阿霉素(doxorubicin)、奥沙利铂(oxaliplatin)、larotaxel、红豆杉醇(taxol)、拉帕替尼(lapatinib)、多西他塞(docetaxel)、甲氨喋呤(methotrexate)、卡培他滨(capecitabine)、长春瑞滨(vinorelbine)、环磷酰胺(cyclophosphamide)、吉西他滨(gemcitabine)、氨柔比星(amrubicin)、阿糖胞苷(cytarabine)、依托泊苷(etoposide)、喜树碱(camptothecin)、地塞米松(dexamethasone)、达沙替尼(dasatinib)、替匹法尼(tipifarnib)、贝伐单抗(bevacizumab)、西罗莫司(sirolimus)、西罗莫司脂化物(temsirolimus)、依维莫司(everolimus)、罗那法尼(lonafarnib)、西妥昔单抗(cetuximab)、埃罗替尼(erlotinib)、吉非替尼(gefitinib)、甲磺酸伊马替尼(imatinib mesylate)、利妥昔单抗(rituximab)、曲妥珠单抗(trastuzumab)、诺考达唑(nocodazole)、索拉非尼(sorafenib)、舒尼替尼(sunitinib)、硼替佐米(bortezomib)、阿仑单抗(alemtuzumab)、吉妥珠单抗(gemtuzumab)、托西莫单抗(tositumomab)或替伊莫单抗(ibritumomab)。
本发明的实施方式包括治疗患有疾病或病状的受试对象的方法,其包含一个或一个以上下列步骤:(a)测定一种或一种以上选自各表的基因的表达谱;(b)依据表达谱评定受试对象对疗法的敏感性;(c)依据所评定的敏感性选择疗法;和(d)使用所选疗法治疗受试对象。疾病或病状通常将以本文所述的一种或一种以上基因的误调控作为组成、指示或结果。
在某些方面,可顺次或以组合方式使用2、3、4、5、6、7、8、9、10种或以上miRNA。举例来说,可使用miR-16或miR-16抑制剂与另一miRNA的任何组合。其它实施方式包括鉴别和评定表明细胞或组织中的miR-16状态的表达谱,其包含一种或一种以上来自各表的基因或其任何组合的表达评定。
术语“miRNA”是根据其普通和明显意义使用且是指在真核细胞中所发现的涉及以RNA为基础的基因调控的微RNA分子。参看例如Carrington等人,2003,其以引用的方式并入本文。所述术语可用于指代由前体加工而来的单链RNA分子或在某些情况下指代前体本身。
在一些实施方式中,其可用于了解细胞是否内源性地表达特定miRNA或所述表达是否在特定条件下受到影响或细胞何时处于特定疾病状态。因此,在本发明的一些实施方式中,方法包括分析细胞或含有细胞的样品中一种或一种以上标志基因或mRNA或表明目的基因的表达水平的其它分析物的存在量。因此,在一些实施方式中,方法包括产生样品的RNA谱的步骤。术语“RNA谱”或“基因表达谱”是指与样品的一种或一种以上基因或遗传标记或miRNA(例如鉴别一种或一种以上来自各表的标记的多种核酸探针)的表达模式有关的一组数据;预期可使用一组RNA且使用例如所属领域技术人员众所周知的核酸扩增或杂交技术来获得核酸谱。患者样品中的表达谱与参考表达谱(例如一种或一种以上基因或miRNA的表达谱)的差异表明欲施予何种miRNA。
在某些方面,将miR-16或miR-16抑制剂和let-7或let-7抑制剂施予星形细胞瘤、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、黑素瘤、成髓细胞瘤、粘液纤维肉瘤、髓性白血病、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌患者。
其它方面包括将miR-16或miR-16抑制剂和miR-10或miR-10抑制剂施予星形细胞瘤、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌患者。
在另一方面,可将miR-16或miR-16抑制剂和miR-15或miR-15抑制剂施予星形细胞瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、喉鳞状细胞癌、黑素瘤、成髓细胞瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、髓性白血病、多发性骨髓瘤、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌患者。
在其它方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-20或miR-20抑制剂施予星形细胞瘤、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌患者。
在某些方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-21或miR-21抑制剂施予星形细胞瘤、乳腺癌、膀胱癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、髓性白血病、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌患者。
本发明的方面包括其中将miR-16或miR-16抑制剂和miR-26或miR-26抑制剂施予间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、肺癌、黑素瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、睾丸肿瘤患者的方法。
在其它方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-34或miR-34抑制剂施予星形细胞瘤、间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、喉鳞状细胞癌、黑素瘤、成髓细胞瘤、套细胞淋巴瘤、髓性白血病、多发性骨髓瘤、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌、睾丸肿瘤患者。
在另一方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-124或miR-124抑制剂施予星形细胞瘤、间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、喉鳞状细胞癌、黑素瘤、成髓细胞瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌、睾丸肿瘤患者。
在其它方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-126或miR-126抑制剂施予星形细胞瘤、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、髓性白血病、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌患者。
在其它方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-143或miR-143抑制剂施予星形细胞瘤、间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、黑素瘤、成髓细胞瘤、套细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌、睾丸肿瘤患者。
在另一方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-147或miR-147抑制剂施予星形细胞瘤、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌患者。
在另一方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-188或miR-188抑制剂施予星形细胞瘤、间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、肺癌、黑素瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌、睾丸肿瘤患者。
在另一方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-200或miR-200抑制剂施予间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、肺癌、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌、睾丸肿瘤患者。
在另一方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-215或miR-215抑制剂施予星形细胞瘤、间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、髓性白血病、多发性骨髓瘤、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌、睾丸肿瘤患者。
在另一方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-216或miR-216抑制剂施予星形细胞瘤、乳腺癌、宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、肺癌、髓性白血病、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、头颈鳞状细胞癌、睾丸肿瘤患者。
在其它方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-292-3p或miR-292-3p抑制剂施予星形细胞瘤、间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、肺癌、喉鳞状细胞癌、黑素瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌、睾丸肿瘤患者。
在某些方面,将miR-16或miR-16抑制剂和miR-331或miR-331抑制剂施予星形细胞瘤、间变性大细胞性淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、肺癌、喉鳞状细胞癌、黑素瘤、粘液纤维肉瘤、髓性白血病、多发性骨髓瘤、神经纤维瘤、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头颈鳞状细胞癌、甲状腺癌、睾丸肿瘤患者。
预期当将miR-16或miR-16抑制剂与一种或一种以上其它miRNA分子组合提供时,所述两种不同的miRNA或抑制剂可同时或依次提供。在一些实施方式中,用一种miRNA或抑制剂进行治疗,且在所述治疗之后1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55分钟、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24小时、1、2、3、4、5、6、7天、1、2、3、4、5周或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个月或任何此类组合用另一种miRNA或抑制剂进行治疗。
其它实施方式包括鉴别和评定表明细胞或组织中的miR-16状态的表达谱,其包含一种或一种以上来自本文各表的基因或其任何组合的表达评定。
术语“miRNA”是根据其普通和明显意义使用且是指在真核细胞中所发现的涉及以RNA为基础的基因调控的微RNA分子。参看例如Carrington等人,2003,其以引用的方式并入本文。所述术语可用于指代由前体加工而来的单链RNA分子或在某些情况下指代前体本身或其模拟物。
在一些实施方式中,其可用于了解细胞是否内源性地表达特定miRNA或所述表达是否在特定条件下受到影响或细胞何时处于特定疾病状态。因此,在本发明的一些实施方式中,方法包括分析细胞或含有细胞的样品中一种或一种以上miRNA标志基因或mRNA或表明目的基因的表达水平的其它分析物的存在量。因此,在一些实施方式中,方法包括产生样品的RNA谱的步骤。术语“RNA谱”或“基因表达谱”是指与样品的一种或一种以上基因或遗传标记(例如鉴别一种或一种以上来自各表的标记或基因的多种核酸探针)的表达模式有关的一组数据;预期可使用一组RNA且使用例如所属领域技术人员众所周知的核酸扩增或杂交技术来获得核酸谱。患者样品的表达谱与参考表达谱(例如来自正常或非病理样品的表达谱)的差异或数字化参照的差异表明病理、疾病或癌性病状。在某些方面,表达谱表明罹患所述病状的倾向或可能性(即疾病或病状的风险因子)。所述风险或倾向可指示治疗、增加监测、实施预防措施等。核酸或探针组可包含或鉴别一段对应mRNA且可包括各表中所列举或通过本文所述方法所鉴别的基因或遗传标记或代表其的核酸、mRNA或探针的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12,13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、100、200、500或500个以上片段(包括其间可导出的任何整数或范围)中的全部或一部分。
本发明的某些实施方式针对用于评定、预后或治疗患者的病理病状的组合物和方法,其包含测量或测定患者样品中一种或一种以上miRNA或标记的表达谱,其中患者样品的表达谱与正常样品的表达谱或参考表达谱的差异表明病理病状且尤其表明癌症(例如,在本发明的某些方面,miRNA、细胞路径、基因或遗传标记为或代表一种或一种以上在各表中所述的路径或标记,包括其任何组合)。
本发明的方面包括诊断、评定或治疗病理病状或预防病理病状显现出来。举例来说,所述方法可用于筛检病理病状;评定病理病状的预后;测定病理病状的阶段;评定病理病状对疗法的反应;或作为第一疗法调节一种或一种以上基因或相关路径的表达或使受试对象对第二疗法敏感或更具反应性。在特定方面,评定患者的病理病状可为评定患者的预后。预后可包括(但不限于)估计存活时间或预期存活时间、评定对疗法的反应等。在某些方面,一种或一种以上基因或标记的表达改变对具有病理病状的患者具有预后性,其中所述标记是各表的一种或一种以上标记,包括其任何组合。
本发明还涉及含有本发明的组合物或用于实施本发明方法的组合物的试剂盒。在一些实施方式中,可使用试剂盒评估一种或一种以上标志分子和/或表达一种或一种以上miRNA或miRNA抑制剂。在某些实施方式中,试剂盒含有、至少含有或至多含有1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、100、150、200或200种以上与欲评定的标记或欲表达或调节的miRNA或miRNA抑制剂有关的探针、重组核酸或合成核酸分子,且可包括其中所导出的任何范围或组合。试剂盒可包含各种组分,其可个别地包装或放置于例如管、瓶、小瓶、注射器或其它适合容器装置等容器中。单独组分也可以浓缩量在试剂盒中提供;在一些实施方式中,组分是单独地提供,浓度与其在含有其它组分的溶液中的浓度相同。组分浓度可按1x、2x、5x、10x或20x或20x以上提供。用于治疗、预后或诊断应用的本发明的探针、合成核酸、重组核酸或非合成核酸的试剂盒作为本发明的一部分。特别涵盖与据报导影响本文所述的一种或一种以上标志基因或基因路径的生物活性或表达的任何miRNA对应的任何所述分子。在某些方面,在一些试剂盒实施方式中包括阴性和/或阳性对照。对照分子可用于验证转染效率和/或监控细胞由转染诱导的变化的控制。
某些实施方式涉及一种通过样品核酸谱评定患者中病理病状或罹患病理病状的风险的试剂盒,其包括适合容器装置中的两种或两种以上核酸杂交或扩增试剂。试剂盒可包含用于标记样品中的核酸的试剂和/或核酸杂交试剂。杂交试剂通常包含杂交探针。扩增试剂包括(但不限于)扩增引物、试剂和酶。
在本发明的一些实施方式中,通过包括以下的步骤产生表达谱:(a)标记样品中的核酸;(b)使核酸与诸多探针杂交,或扩增诸多核酸;和(c)测定和/或定量核酸与探针的杂交或检测和定量扩增产物,其中产生表达谱。参看美国临时专利申请案60/575,743和美国临时专利申请案60/649,584和美国专利申请案第11/141,707号和美国专利申请案第11/273,640号,其皆以引用的方式并入本文。
本发明的方法包括依据miRNA和/或标志核酸表达谱诊断患者和/或评定患者预后。在某些实施方式中,特定基因或遗传路径或核酸组在细胞中的表达水平与其在正常或非病理细胞或组织样品中的表达水平相比的升高或降低与疾病状态或病理病状相关。此相关性允许当在所评定生物样品中测量一种或一种以上核酸的表达水平且接着与正常或非病理细胞或组织样品的表达水平相比时执行诊断和/或预后方法。特别预期可通过评估本申请案中所述的任何miRNA和/或核酸或多组miRNA和/或核酸来产生患者、尤其是怀疑患有或怀疑有倾向患有例如癌症等特定疾病或病状的患者的表达谱。自患者产生的表达谱将提供与特定疾病或病状有关的信息。在许多实施方式中,使用核酸杂交或扩增方法(例如阵列杂交或RT-PCR)产生表达谱。在某些方面,表达谱可与例如组织学、血清中的蛋白质谱和/或细胞遗传评定等其它诊断和/或预后测试组合使用。
所述方法可进一步包含一个或一个以上下列步骤,包括:(a)自患者获得样品,(b)自样品分离核酸,(c)标记自样品分离的核酸,和(d)使经标记核酸与一种或一种以上探针杂交。本发明的核酸包括一种或一种以上如下核酸,其包含至少一个具有代表各表中的一种或一种以上基因或标记的核酸的序列或互补序列的片段。
预期本文所述的任何方法或组合物皆可用本文所述的任何其它方法或组合物实施且可组合不同实施方式。特别预期本文中关于miRNA分子、miRNA、基因和代表基因的核酸所述的任何方法和组合物皆可用合成核酸实施。在一些实施方式中,使合成核酸暴露于适当条件以致其变成加工的或成熟核酸,例如在生理环境下的miRNA。最初提交的权利要求书预期涵盖多次从属于任何所提交权利要求或所提交权利要求的组合的权利要求书。
此外,涉及具体基因(包括其代表性片段)、mRNA或称为miRNA的本发明的任何实施方式也预期涵盖涉及与指定miRNA、mRNA、基因或代表性核酸的序列或成熟序列具有至少80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99%序列同一性的miRNA。
应进一步了解,除非另外指明,否则使用缩写符号,以便基因或其标记或miRNA的普通描述是指其基因家族成员(由编号加以区分)或其代表性片段中的任一种。所属领域技术人员应了解“基因家族”是指一组具有相同或类似编码序列或miRNA编码序列的基因。基因家族的miRNA成员通常由初始名称(initialdesignation)后的数字进行标识。举例来说,miR-16-1和miR-16-2是miR-16基因家族的成员且“mir-7”是指miR-7-1、miR-7-2和miR-7-3。此外,除非另外指出,否则缩写符号是指相关miRNA(由字母加以区分)。因此,“let-7”例如是指let-7a、let-7b、let-7c等。此缩写符号的例外会另外加以标识。
在本申请案通篇中论述本发明的其它实施方式。关于本发明一方面所述的任何实施方式也适用于本发明的其它方面且反之亦然。实施例和具体实施方式部分中的实施方式应理解成适用于本发明的所有方面的本发明实施方式。
术语“抑制”、“减轻”或“预防”或这些术语的任何变体当用于权利要求书和/或说明书中时包括任何可测量的降低或完全抑制以获得期望结果。
单词“一”当与术语“包含”在权利要求书和/或说明书中一起使用时可意谓“一个”,但也可与“一个或一个以上”、“至少一个”和“一个或超过一个”的意思一致。
在本申请案通篇中,术语“约”是用于指示值包括用于测定所述值的装置或方法的误差的标准差。
除非明确指明术语“或”仅指代替代物或替代物相互排斥,否则权利要求书中使用术语“或”是用于意谓“和/或”,即使揭示内容支持仅指代替代物的定义以及“和/或”。
如本说明书和权利要求书中所用,单词“包含”、“具有”、“包括”或“含有”是包括性或开放性的且并不排除其它未详述的要素或方法步骤。
本发明的其它目标、特征和优势将由以下具体实施方式变得显而易见。然而,应了解具体实施方式和具体实施例在指示本发明的具体实施方式时仅是以说明方式提供,因为在本发明的精神和范围内的各种改变和修改将由所属领域技术人员根据具体实施方式明确了解。
附图说明
以下附图构成本说明书的一部分,包括这些附图是为了进一步说明本发明的某些方面。通过参照这些附图中的一个或多个结合本文给出的具体实施方式的详细描述,可更好地理解本发明。
图1.hsa-miR-16处理的细胞相对于阴性对照miRNA处理的细胞(100%)的增殖百分数(%)。所用的细胞系包括前列腺癌细胞系PPC-1、Du145和RWPE2。缩写:miR-16,hsa-miR-16;NC,阴性对照miRNA;siEg5,抗驱动蛋白11(Eg5)这一动力蛋白的siRNA。图中标出了标准偏差。
图2.将相等数目的细胞用1.6μM hsa-miR-16或阴性对照miRNA(NC)进行电穿孔,在标准的生长培养基中生长(第0天)。在第4天和第11天对细胞重复电穿孔。在每次电穿孔事件,向6孔板的各孔分别接种5万个细胞,每隔一天收获和计数细胞。用公式PD=ln(Nf/N0)/ln 2计算群体倍增,将细胞数目外推并描绘在线性刻度(linear scale)上。电穿孔事件由箭头指示。该图显示一个代表性的实验。
具体实施方式
本发明涉及与鉴别和表征基因和生物路径有关的组合物和方法,所述生物路径通过所鉴别基因的表达显示与这些基因有关,以及与其有关的miRNA用于治疗、预后和诊断应用的用途。具体来说,本发明涉及与评定和/或鉴别病理病状相关的方法和组合物,所述病理病状与miR-16表达或其异常表达直接或间接相关。miR-16的成熟序列通常包含uagcagcacguaaauauuggcg SEQ ID NO:1(MIMAT0000069)。
在某些方面,本发明涉及评定、分析和/或治疗细胞或受试对象的方法,在所述细胞或受试对象中某些基因因为miR-16表达增加或降低而表达降低(相对于正常)和/或基因因为miR-16表达增加或降低而表达增加(相对于正常)。表达谱和/或对miR-16表达的反应或表达缺乏表明个体患有例如癌症等病理病状。
表征所列miRNA或所列标记(包括代表其的核酸)中的任一种或其组合的预后分析可用于评定患者以确定是否任何治疗方案都被证明有效。当使用上述诊断分析时,定义低表达的绝对值将取决于测量miRNA所用的平台。预后分析可使用对于诊断分析所述的相同方法。
I.治疗方法
本发明的实施方式涉及当被导入到细胞中时,能发挥内源miRNA的活性或者抑制内源miRNA的核酸。在某些方面,核酸是合成的或非合成的miRNA。各种序列特异性的miRNA抑制剂,可用来依次地或组合地抑制细胞中一个或多个内源miRNA的活性,以及受内源miRNA调节的那些基因和相关途径。
在一些实施方式中,本发明涉及在细胞中作为miRNA或作为miRNA的抑制剂起作用的短核酸分子。术语“短”指15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、50、100或150个核苷酸或更少个核苷酸的单一多核苷酸的长度,包括这些数字之间可得出的所有整数或范围。核酸分子通常是合成的。术语“合成”指经分离的而不是细胞中自然产生的核酸分子。在某些方面,序列(整个序列)和/或化学结构偏离天然核酸分子,如内源前体miRNA或miRNA分子或它们的互补序列。虽然在一些实施方式中,本发明的核酸分子不具有与天然核酸的序列相同或互补的整个序列,但这种分子可涵盖天然序列或其互补序列的全部或部分。然而考虑到,给予细胞的合成核酸分子可随后在细胞中被修饰或改变,使得其结构或序列与非合成的或天然的核酸如成熟miRNA序列相同。例如,合成核酸可具有与前体miRNA的序列不同的序列,但该序列一旦在细胞中可被改变,而与内源的加工的miRNA或其抑制剂相同。术语“(经)分离(的)”指本发明的核酸分子最初从不同类的(就序列或结构而言)和不需要的核酸分子分离,使得分离核酸的群体相对于其他多核苷酸分子而言,具有少约90%同源性,且可以是至少约95、96、97、98、99或100%同源性。在本发明的许多实施方式中,核酸之所以是分离的,是由于它是在体外合成而来,而与细胞中的内源核酸分开。然而应理解到,各分离核酸随后可混合(mix)或集合(pool)在一起。在某些方面,本发明的合成miRNA是RNA或RNA类似物。miRNA抑制剂可以是DNA或RNA或它们的类似物。本发明的miRNA和miRNA抑制剂统称“合成核酸”。
在一些实施方式中,miRNA或合成miRNA其长度在17-130个残基之间。本发明涉及其长度为、至少或至多为15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、140、145、150、160、170、180、190、200个或更多个残基的miRNA或合成miRNA分子,包括这些数字之间的任何整数或任何范围。
在某些实施方式中,合成miRNA具有(a)“miRNA区域”,其从5’到3’的序列或结合区域与成熟miRNA序列的全部或某个片段相同或互补,和(b)“互补区域”,其从5’到3’的序列与(a)的miRNA序列具有60%-100%的互补性。在某些实施方式中,这些合成miRNA也如上所述是分离的。术语“miRNA区域”指合成miRNA上的与成熟、天然miRNA序列的整个序列或其互补序列有至少75、80、85、90、95或100%同一性的区域,包括这些数字之间的所有整数。在某些实施方式中,miRNA区域与天然miRNA的序列或其互补序列有或者至少有90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、99.1、99.2、99.3、99.4、99.5、99.6、99.7、99.8、99.9或100%同一性。
术语“互补区域”或“互补序列”指核酸或模拟物的与成熟、天然miRNA序列有或者至少有60%互补性的区域。互补区域有或者至少有60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、99.1、99.2、99.3、99.4、99.5、99.6、99.7、99.8、99.9或100%的互补性,或者这些数字当中可得出的任何范围。对于单一多核苷酸序列,可能会因为miRNA区域和互补区域之间的化学键合而存在发夹环结构。在其他的实施方式中,互补区域在不同于miRNA区域的核酸分子上,在这种情况下,互补区域在互补链上,miRNA区域在活性链上。
在本发明的其他实施方式中,有的miRNA抑制剂是合成核酸。miRNA抑制剂其长度在约17-25个核苷酸之间,包含与成熟miRNA的5’-3’序列有至少90%互补性的5’-3’序列。在某些实施方式中,miRNA抑制剂分子其长度为17、18,、19、20、21、22、23、24或25个核苷酸,或者这些数字当中可得出的任何范围。此外,miRNA抑制剂可具有与成熟miRNA特别是成熟、天然miRNA的5’-3’序列有或者至少有70、75、80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、99.1、99.2、99.3、99.4、99.5、99.6、99.7、99.8、99.9或100%互补性的序列(从5’到3’),或者这些数字当中可得出的任何范围。本领域技术人员可使用与成熟miRNA的序列互补的miRNA序列的部分,作为miRNA抑制剂的序列。此外,核酸或探针序列的该部分可加以改变,但使得它仍包含与成熟miRNA的序列的适当百分比的互补性。
在本发明的一些实施方式中,合成miRNA或抑制剂含有一个或多个设计元件(design element)。这些设计元件包括但不限于(i)互补区域5’末端处的核苷酸的磷酸根或羟基的取代基团;(ii)互补区域的开头或最后1-6个残基中的一个或多个糖修饰;或者(iii)互补区域3’末端处最后1-5个残基中的一个或多个核苷酸与miRNA区域的相应核苷酸之间的非互补性。有多种设计修饰是本领域公知的,见下文。
在某些实施方式中,合成miRNA在其互补区域5’末端处具有这样的核苷酸,该核苷酸中的磷酸根和/或羟基已用另一化学基团取代(称为“取代设计”)。在一些情况中,磷酸根被取代,而在其他情况中,羟基被取代。在具体的实施方式中,取代基团是生物素、胺基、低碳烷基胺、乙酰基、2’O-Me(2’氧甲基)、DMTO(含氧4,4’-二甲氧三苯甲基(4,4’-dimethoxytrityl with oxygen))、荧光素、硫醇或吖啶,不过其他的取代基团也是本领域技术人员熟知的,也可使用。这些设计元件还可用在miRNA抑制剂上。
另外的实施方式涉及在互补区域的开头或最后1-6个残基中具有一个或多个糖修饰的合成miRNA(称为“糖取代设计”)。在某些情况中,在互补区域的开头1、2、3、4、5、6个或更多个残基中,或者这些数字当中可得出的任何范围有一个或多个糖修饰。在另外的情况中,在互补区域的最后1、2、3、4、5、6个或更多个残基中,或者这些数字当中可得出的任何范围有一个或多个糖修饰。应理解到,术语“开头”和“最后”是相对于该区域的从5’末端到3’末端的残基的顺序而言。在具体的实施方式中,糖修饰是与6’位的碳连接的羧基上的2’O-Me修饰、2’F修饰、2’H修饰、2’氨基修饰、4’硫代核糖修饰或硫代磷酸酯修饰。在另外的实施方式中,在互补区域的开头或最后2-4个残基中,或者在互补区域的开头或最后4-6个残基中,有一个或多个糖修饰,这些设计元件还可用在miRNA抑制剂上。因此,miRNA抑制剂可如上所述在5’末端处的核苷酸上具有这个设计元件和/或取代基团。
在本发明的其他实施方式中有这样的合成miRNA或抑制剂,其中互补区域3’末端处最后1-5个残基中的一个或多个核苷酸不与miRNA区域的相应核苷酸互补(“非互补性”)(称为“非互补性设计”)。非互补性可在互补miRNA的最后1、2、3、4和/或5个残基中。在某些实施方式中,在互补区域中存在至少2个核苷酸的非互补性。
考虑到,本发明的合成miRNA具有一个或多个取代设计、糖修饰设计或非互补性设计。在某些情况中,合成RNA分子具有这三种设计中的两种,而在其他情况中,这些分子适当地具有所有这三种设计。
miRNA区域和互补区域可以在同一多核苷酸上,或者在分别的多核苷酸上。在它们被包含在同一多核苷酸之上或之中的情况中,miRNA分子将被认为是单一多核苷酸。在不同的区域处在分别的多核苷酸上的实施方式中,合成miRNA将被认为是由两个多核苷酸组成。
当RNA分子是单一多核苷酸时,在miRNA区域和互补区域之间可以有接头区域。在一些实施方式中,单一多核苷酸因为miRNA区域和互补区域之间的键合,能够形成发夹环结构。接头构成发夹环。考虑到在一些实施方式中,接头区域其长度是、是至少或者是至多2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39或40个残基,或者这些数字当中可得出的任何范围。在某些实施方式中,接头的长度在3-30个残基之间(包括3个和30个)。
除了具有miRNA或抑制剂区域和互补区域外,在区域的5’末端或3’末端处还可具有侧翼序列。在一些实施方式中,在这些区域的一侧或两侧侧接有或者至少侧接有1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸,或者这些数字当中可得出的任何范围。
本发明的方法包括减少或消除细胞中的一个或多个miRNA的活性,所述方法包括向细胞中导入miRNA抑制剂(在本文中可统称为miRNA,因此有关miRNA的描述在适当的情况中也将指miRNA抑制剂);或者补充或增强细胞中一个或多个miRNA的活性。本发明还涉及通过给细胞提供特定的核酸,如特定的合成miRNA分子或合成miRNA抑制剂分子,来诱导某些细胞特性。但是,在本发明的方法中,miRNA分子或miRNA抑制剂不必需是合成的。它们可具有与天然miRNA相同的序列,或者它们可不具有任何设计修饰。在某些实施方式中,miRNA分子和/或miRNA抑制剂如上所述是合成的。
给细胞提供的特定核酸分子应理解为对应于细胞中的特定miRNA,因此细胞中的miRNA称为“相应miRNA”。在指定的miRNA分子被导入到细胞中的情况中,相应miRNA应理解为被诱导或被抑制的miRNA或者被诱导或被抑制的miRNA功能。然而考虑到,被导入到细胞中的miRNA分子不是成熟miRNA,但能够在适当的生理条件下变成成熟miRNA,或者起到成熟miRNA的作用。在特定的相应miRNA被miRNA抑制剂抑制的情况中,特定的miRNA将被称为“被靶向的miRNA”。考虑到可能有多个相应miRNA被涉及到。在具体的实施方式中,超过一个miRNA分子被导入到细胞中。此外,在其他实施方式中,超过一个miRNA抑制剂被导入到细胞中。此外,可将miRNA分子(一种或多种)和miRNA抑制剂(一种或多种)的组合导入到细胞中。本发明人考虑到,miRNA的组合可在表型异常的细胞的各细胞途径中的一个或多个位置处起作用,且这种组合可对靶细胞增加功效,而又不会不利地影响正常细胞。因此,miRNA的组合可对受治疗者或患者具有最小的不利影响,同时又能提供足够的治疗作用,如病症的改善、细胞的生长抑制、被靶向的细胞的死亡、细胞表型或生理的改变、细胞生长的减慢、对第二疗法的敏感化、对特定疗法的敏感化等等。
本发明方法包括鉴定有需要诱导这些细胞特性的细胞或患者。同样要理解到,提供给细胞或生物的合成核酸的量是“有效量”,这个有效量是指为达到期望的目标如诱导特定的细胞特性所需要的量(或者足够的量)。
本发明方法的某些实施方式包括将对应于细胞中的成熟miRNA的核酸分子,以能有效达到期望的生理结果的量提供给或导入到细胞。
此外,本发明方法可涉及提供合成的或非合成的miRNA分子。考虑到在这些实施方式中,本发明方法可限于或不限于提供仅仅一个或多个合成miRNA分子或者仅仅一个或多个非合成miRNA分子。因此在某些实施方式中,本发明方法可涉及同时提供合成的和非合成的miRNA分子。在这个情况中,一个或多个细胞很可能被提供对应于特定miRNA的合成miRNA分子和对应于另一不同miRNA的非合成miRNA分子。此外,任何采用马库什群语言(Markush grouplanguage)用一系列miRNA来描述的方法,也可不用马库什群语言而是用离散性的词(disjunctive article)(即“或”)来描述,反之亦然。
在一些实施方式中,有减少或抑制细胞增殖的方法,所述方法包括向细胞导入或提供有效量的(i)miRNA抑制剂分子或(ii)对应于miRNA序列的合成或非合成miRNA分子。在某些实施方式中,所述方法涉及向细胞中导入有效量的(i)具有与一个或多个成熟miRNA的5’-3’序列有至少90%互补性的5’-3’序列的miRNA抑制剂分子。
本发明的某些实施方式包括治疗病理状况特别是癌症例如肺癌或肝癌的方法。在一个方面,所述方法包括使靶标细胞与一个或多个包含至少一个具有miRNA序列的全部或一部分的核酸片段的核酸、合成miRNA或者miRNA相接触。该片段可以是5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30个或更多个核苷酸或核苷酸类似物,包括这些数字之间的所有整数。本发明的一个方面包括调节靶标细胞如癌细胞当中的基因表达、miRNA表达或功能或者mRNA表达或功能。
通常,在细胞中调节内源基因、miRNA或mRNA。在具体的实施方式中,核酸序列包含至少一个在核酸序列上与一个或多个miRNA或基因序列有至少70、75、80、85、90、95或100%同一性的片段。对内源基因、miRNA或mRNA的表达或加工的调节,可通过对mRNA的加工的调节来进行,所述加工包括在细胞中的转录、运输和/或翻译。调节还可通过抑制或增强细胞、组织或器官中的miRNA活性来实现。所述加工可影响被编码产物的表达或mRNA的稳定性。在其他的实施方式中,核酸序列可包含经修饰的核酸序列。在某些方面,一个或多个miRNA序列可包括或包含经修饰的核碱基或核酸序列。
应理解到,在本发明的方法中,可通过将一旦在细胞内就能起到相应miRNA的作用的核酸分子,给予细胞或生物体,,来给该细胞或其他生物物质(biologicalmatter)如生物体(包括患者)提供对应于特定miRNA的miRNA或miRNA分子。提供给细胞的分子的形式可以不是一旦在细胞内就能充当miRNA的形式。因此考虑到在一些实施方式中,提供的合成miRNA或非合成miRNA是,如一旦进入到细胞的miRNA加工机器(processing machinery)就会被加工成成熟有活性miRNA的合成miRNA或非合成miRNA。在某些实施方式中特别考虑到,提供给生物物质的miRNA分子不是成熟的miRNA分子,而是一旦进入到miRNA加工机器就会被加工成成熟miRNA的核酸分子。术语“非合成(的)”在miRNA的情形中是指miRNA不是如本文所定义的“合成(的)”。此外还考虑到,在本发明的涉及使用合成miRNA的实施方式中,相应的非合成miRNA的使用也被认为是本发明的一个方面,反之亦然。应理解到,“提供”某药剂这个术语是用来包括将该药剂“给予”患者。
在某些实施方式中,本发明方法还包括在细胞或生物体中靶向要调节的miRNA。术语“靶向要调节的miRNA”意思是要用本发明的核酸来调节选定的miRNA。在一些实施方式中,调节是用对应于被靶向的miRNA的合成或非合成miRNA来实现,该合成或非合成miRNA能有效地将被靶向的miRNA提供到细胞或生物体(正调节)。在其他实施方式中,调节是用miRNA抑制剂来实现,该抑制剂能有效抑制细胞或生物体中的被靶向miRNA(负调节)。
在一些实施方式中,被靶向以进行调节的miRNA是能影响疾病、病症或途径的miRNA。在某些实施方式中,对miRNA进行靶向是因为可通过对被靶向miRNA的负调节来提供治疗。在其他实施方式中,对miRNA进行靶向是因为可通过对被靶向miRNA或其靶标的正调节来提供治疗。
在本发明的某些方法中,还有将选定的miRNA调节物给予这样的细胞、组织、器官或生物体(统称“生物物质”)的步骤,所述生物物质需要涉及对被靶向miRNA进行调节的治疗,或者需要本文所讨论的生理或生物结果(例如就特定细胞途径或结果而言,如细胞活力的下降)。因此,在本发明的一些实施方式中,有对需要可通过miRNA调节物提供的治疗的患者进行鉴定的一个步骤。考虑到在一些实施方式中可给予有效量的miRNA调节物。在具体的实施方式中,生物物质获得治疗益处,其中“治疗益处”是指一个或多个与疾病或病症有关的情况或症状的改善,或者与该疾病有关的预后、持续时间或状态的改善。考虑到,治疗益处包括但不限于疼痛的减少、发病率的降低和症状的减轻。例如就癌症而言考虑到,治疗益处可以是肿瘤生长的抑制、阻止转移、转移数量的减少、癌细胞增殖的抑制、癌细胞中细胞死亡的诱导、癌细胞附近的血管发生的抑制、癌细胞凋亡的诱导、疼痛的减轻、复发的危险的降低、癌细胞中化学敏感性或辐射敏感性的诱导、生命的延长和/或与癌症直接或间接有关的死亡的延迟。
而且还考虑到,可将miRNA组合物作为疗法的一部分,与传统疗法或预防药剂一起给予患者。此外还考虑到,在疗法的情形中讨论到的任何方法可作为预防方法应用,特别是在经鉴定潜在需要该疗法或者有发展需要治疗的病症或疾病的危险的患者中。
另外,本发明的方法涉及采用一个或多个对应于miRNA的核酸和治疗药物。该核酸可增强该药物的作用或功效,减少任何副作用或毒性、改变它的生物利用度和/或降低所需的剂量或用药频率。在某些实施方式中,该治疗药物是癌症治疗药。因此,在一些实施方式中有治疗患者中的癌症的方法,所述方法包括给予该患者癌症治疗药和有效量的至少一个能改进癌症治疗药的功效或者保护非癌细胞的miRNA分子。癌症疗法还包括多个与基于化学的治疗和基于放射的治疗组合的疗法。组合化学疗法包括但不限于例如5-氟尿嘧啶、阿仑单抗、氨柔比星、贝伐单抗、博来霉素、硼替佐米、白消安、喜树碱、卡培他滨、顺铂(CDDP)、卡铂、西妥昔单抗、苯丁酸氮芥、顺铂(CDDP)、EGFR抑制剂(吉非替尼和西妥昔单抗)、丙卡巴肼、氮芥(mechlorethamine)、环磷酰胺、喜树碱、COX-2抑制剂(例如塞来考昔)、环磷酰胺、阿糖胞苷)、异环磷酰胺、美法仑、苯丁酸氮芥、白消安、亚硝基脲(nitrosurea)、放线菌素、达沙替尼(dasatinib)、柔红霉素、地塞米松、多西他赛、阿霉素、EGFR抑制剂(吉非替尼和西妥昔单抗)、埃洛替尼、雌激素受体结合剂、博来霉素、plicomycin、丝裂霉素、依托泊苷(VP16)、依维莫司、他莫昔芬、雷洛昔芬、雌激素受体结合剂、紫衫酚(taxol)、多烯紫杉醇、吉西他滨、诺维本、法尼基蛋白转移酶抑制剂、吉非替尼、吉西他滨、吉妥单抗、替伊莫单抗、异环磷酰胺、甲磺酸伊马替尼、larotaxel、拉帕替尼(lapatinib)、洛那法尼、氮芥、美法仑、反铂、5-氟尿嘧啶、长春新碱、长春碱和甲氨喋呤、丝裂霉素、诺维本、亚硝基脲(nitrosurea)、诺考达唑、奥沙利铂、紫杉醇(paclitaxel)、plicomycin、丙卡巴肼、雷洛昔芬、利妥昔单抗、西罗莫司、索拉非尼(sorafenib)、舒尼替尼(sunitinib)、他莫昔芬、紫衫酚(taxol)、多烯紫杉醇、西罗莫司脂化物、替吡法尼、托西莫单抗、反铂、曲妥珠单抗、长春碱、长春新碱或长春瑞滨,或者前述药剂的任何类似物或衍生变体。
通常,可给予miRNA的抑制剂以降低内源miRNA的活性。例如,可将能增加细胞增殖的miRNA分子的抑制剂提供给细胞以增加增殖,或者可将这种分子的抑制剂提供给细胞以降低细胞增殖。本发明涵盖在用本文所公开的不同miRNA分子和miRNA抑制剂所观察到的不同生理作用情形下的这些实施方式。这些包括但不限于以下生理作用:增加或减少细胞增殖、增加或减少细胞凋亡、增加转化、增加或减少细胞活力、激活或抑制激酶(例如Erk)ERK、激活/诱导或抑制hTert,抑制对促生长途径(例如Stat 3信号转导)的刺激,减少或增加活细胞数目和增加或减少细胞周期特定阶段的细胞数目。本发明的方法一般考虑到包括提供或导入一个或多个对应于一个或多个不同的miRNA分子的不同核酸分子。考虑到可提供或导入以下、至少以下或者至多以下数目的不同核酸或miRNA分子:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100,或者这些数字当中可得出的任何范围。这也适用于可提供或导入到细胞中的不同miRNA分子的数目。
II.药物制剂和递送
本发明的方法包括递送有效量的miRNA或编码它的表达构建物。药物组合物的“有效量”通常定义为足以可检测地和重复性地实现规定的期望结果的量,例如足以改善、减少、最小化或限制疾病或其症状的程度的量。其他更为严格的定义也适用,包括疾病的消除、根除或治愈。
A.给药
在某些实施方式中,期望能杀死细胞,抑制细胞生长,抑制转移,减少肿瘤或组织大小,和/或逆转或减少细胞的恶性或疾病表型。给药途径当然要随所要靶向的病灶或部位的位置和性质而变,包括例如真皮内、皮下、区域(regional)、胃肠外、静脉内、肌肉内、鼻内、全身(systemic)和口服给予和制剂。对于分散的、实体易接近的肿瘤或者其他易接近的靶区域,特地考虑到直接注射、肿瘤内注射或者向肿瘤脉管系统中的注射。局部的、区域的或全身的给药也可以是适当的。对于>4cm的肿瘤,所要给予的体积将为约4-10ml(优选10ml),而对于<4cm的肿瘤,将使用约1-3ml(优选3ml)的体积。
作为单剂量递送的多次注射包含约0.1至约0.5ml体积。本发明的组合物可以以多次注射给予肿瘤或被靶向的位点。在某些方面,各次注释可间隔大约1cm的距离。
在外科手术介入的情况中,本发明可在手术前使用,以使不宜动手术的肿瘤被切除。或者,本发明可在手术时和/或手术之后使用,以治疗残余疾病或转移性疾病。例如,可给切除后的瘤床注射或输注包含miRNA或其组合的制剂。可例如通过将导管植入在手术部位,在切除术后继续进行给药。也预想到定期进行的手术后治疗。还考虑到连续输注表达构建物或病毒构建物。
在适当的情况中,例如在肿瘤或其他不期望的受影响区域被切除和瘤床或被靶向的部位被治疗以消除残余的微小疾病(residual,microscopic disease)的情况中,连续给药也可适用。考虑到通过注射器或导管插入术进行的递送。这种连续输注可在治疗开始后进行约1-2小时、到约2-6小时、到约6-12小时、到约12-24小时、到约1-2天、到约1-2个周的时间或更长的时间。通常,通过连续输注给予的治疗组合物的剂量,要相当于单次或多次注射所给予的剂量,其在进行输注期间会随时间调整。
治疗方案也可变化,往往取决于肿瘤类型、肿瘤位置、免疫状况、靶标部位、疾病进展及患者的健康和年龄。某些肿瘤类型会要求更为积极的治疗。临床医师最适合根据治疗制剂的已知功效和毒性(如果有的话),来做出这种决定。
在某些实施方式中,被治疗的肿瘤或患病区域可能不是最初可能不是可切除的。用本发明组合物进行的治疗,因为肿瘤边缘处的收缩或者通过消除特别具有侵入性的部分,可增加肿瘤的可切除性。治疗后,切除变得可能。在切除术后进行的额外治疗可有助于消除肿瘤或被靶向部位处的微小残余疾病。
治疗可包括多个“单位剂量”。单位剂量定义为含有预定量的治疗组合物。所要给予的数量及具体的途径和剂型,是临床领域技术人员技能范围内的事情。单位剂量不需要作为单次注射来给予,而是可包括在规定时间内进行的连续输注。就本发明的病毒成分而言,单位剂量可适宜用g或mg miRNA或miRNA模拟物来描述。或者,所指定的量可以是作为平均日剂量、平均周剂量或平均月剂量来给予的量。
miRNA可以以约或者至少约0.5、1、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990、1000g或mg的剂量,或者更高的剂量,或者这些数字当中可得出的任何范围的剂量,来给予患者。或者,所指定的量可以是作为平均日剂量、平均周剂量或平均月剂量来给予的量,或者它可以用mg/kg来表示,其中kg指患者的体重,mg如上所指定。在其他的实施方式中,所指定的量是以上所述的任何数字,但以mg/m2(关于肿瘤大小或患者表面积)表示。
B.可注射组合物和制剂
在一些实施方式中,据以递送miRNA或编码其的表达构建物或它们的组合的方法,是通过全身给药来进行。但是,本文公开的药物组合物还可如5,543,158号、5,641,515号和5,399,363号美国专利(每个专利都通过引用其全文并入本文)中所述,进行胃肠外给予、皮下给予、直接给予(directly)、气管内给予、静脉内给予、真皮内给予、肌肉内给予乃至腹膜内给予。
核酸的注射可通过注射器或者任何其他用于注射溶液的方法来递送,只要核酸和任何相关的成分能通过注射所需的特定径号的针头。供用于基因疗法、能够在任何深度精确地多次注射预定量的溶液的注射器系统,也已有描述(5,846,225号美国专利)。
游离碱或药理学上可接受盐的形式的活性化合物的溶液剂,可在水中与表面活性剂如羟丙基纤维素进行适当混合来制备。还可在甘油、液体聚乙二醇、它们的混合物中,和在油类中,制备分散剂。在通常的储存和使用条件下,这些制品含有防腐剂以防止微生物的生长。适合可注射用的药物形式,包括无菌水溶液剂或分散剂,和供临时制备无菌可注射溶液剂或分散剂的无菌粉末(5,466,468号美国专利,通过引用其全文并入本文)。在所有的情况中,该剂型必须是无菌的,且流动性必须达到可容易注射的程度。它必须在制造和储存的条件下稳定,必须免受微生物如细菌和真菌的污染作用。载体可以是含有例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇和液体聚乙二醇等)、它们的混合物和/或植物油的溶剂或分散介质。可例如通过使用包衣剂(coating)如卵磷脂,通过在分散剂的情况中维持所需的颗粒大小,和通过使用表面活性剂,来维持适当的流动性。可通过各种抗细菌剂和抗真菌剂,例如对羟基苯甲酸酯类、氯丁醇、苯酚、山梨酸、硫柳汞等,来实现微生物作用的防止。在许多情况下,优选的是包括等渗剂,例如糖类或氯化钠。可通过在该组合物中使用能延迟吸收的物质,如单硬脂酸铝和明胶,来达到可注射组合物的长久吸收。
在某些制剂中应用的是水基制剂,而其他制剂可以是脂基制剂。在本发明的具体实施方式中,包含肿瘤抑制蛋白或编码其的核酸的组合物是水基制剂。在其他的实施方式中,制剂是基于脂质的。
例如对于以水溶液剂进行的胃肠外给予,溶液如有需要应当进行适当缓冲,且首先用足够的盐水或葡萄糖使液体稀释剂变得等渗。这些具体的水溶液剂特别适合于静脉内、肌肉内、皮下、肿瘤内、病灶内和腹膜内给予。就此而论,本领域技术人员根据本公开内容,将会知道可以采用的无菌含水介质。例如,可将一个剂量溶解于1ml的等渗NaCl溶液中,然后加入到1000ml的皮下输液用流体中,或者在所计划的输注部位处进行注射(参见例如″Remington′sPharmaceutical Sciences″15th Edition,1035-1038页和1570-1580页)。取决于所治疗的受治疗者的情况,在剂量上必定会出现一些变动。负责给药的人员在任何情况下,都要确定对该受治疗者个体适当的剂量。此外,对于人类给药,制品应当符合FDA生物制剂标准办公室(FDA Office of Biologics standards)关于无菌性、致热性、一般安全性和纯度的标准。
本文所用的“载体”包括任何和所有的溶剂、分散介质(dispersion media)、运载体(vehicle)、包衣剂、稀释剂、抗细菌剂和抗真菌剂、等渗剂和吸收延缓剂、缓冲液、载体溶液、悬浮液、胶体等。这些介质(media)和物剂(agent)用于药物活性物质是本领域公知的。考虑到任何常规介质或物剂都可在治疗组合物中使用,除非它与活性成分不相容。还可向组合物中掺入辅助性活性成分。
词语“药学上可接受的”指当给予人时不会产生过敏性反应或类似的不适当反应的分子实体和组合物。
核酸以与剂型相容的方式给予,和以会在治疗上有效的量给予。所要给予的数量取决于所要治疗的受治疗者,包括例如疾病或癌症的侵袭程度、任何肿瘤或病灶的大小、之前的或其他的治疗进程。要求给予的活性成分的精确量依赖于给药医师的判断。初次给药和随后给药的合适方案也是可变的,但代表性做法是初次给药后进行其他的给药。这种给药可以是全身给药,作为单剂量给药,横跨10、20、30、40、50、60分钟和/或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24小时或更多小时和/或1、2、3、4、5、6、7天或更多天的时间连续给药。此外,给药可以通过按制剂和/或给药方式执行的定时释放或缓释机制进行。
C.组合治疗
在某些实施方式中,本发明的组合物和方法涉及miRNA或编码它的表达构建物。这些miRNA组合物可与第二疗法组合使用,以增强miRNA疗法的效果或者提高所采用的另一疗法的治疗作用。这些组合物将以能有效达到期望的效果的组合量(combined amount)来提供,所述期望的效果例如杀死癌细胞和/或抑制细胞过度增殖。这个方法可涉及使细胞与miRNA或第二疗法同时或在不同时间进行接触。这可通过如下两种方式来实现:使细胞与一个或多个包括一个或多个所述药剂的组合物或药理学制剂进行接触,或者使细胞与两个或更多个不同的组合物或制剂进行接触,其中一个组合物提供(1)miRNA;和/或(2)第二疗法。可给予第二组合物或方法,其包括化学疗法、放射疗法、手术疗法、免疫疗法或基因疗法。
考虑到,可给患者提供miRNA疗法和第二疗法,这两种疗法之间相隔在约12-24小时内,更优选两种疗法之间相隔在约6-12小时内。但是,在一些情况中,将治疗时间显著延长可能是合乎需要的,在各次给药之间相隔几天(2、3、4、5、6或7天)到几个周(1、2、3、4、5、6、7或8个周)。
在某些实施方式,治疗进程将持续1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90天或更多天。考虑到,可在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89和/或90天、它们的任何组合给予一个药剂,在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89和/或90天、或它们的任何组合给予另一药剂在单独一天(24小时时间)当中,可对患者单次给予或多次给予药剂。此外,考虑到在某个疗程后有不给予治疗的一段时间。这个时间段可持续1、2、3、4、5、6、7天和/或1、2、3、4、5个周和/或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12个月或更长时间,取决于患者的情况,如他们的预后、力量、健康等。
可采用各种组合,例如miRNA疗法为“A”,第二疗法为“B”:A/B/A  B/A/B  B/B/A  A/A/B  A/B/B  B/A/A  A/B/B/B  B/A/B/BB/B/B/A  B/B/A/B  A/A/B/B  A/B/A/B  A/B/B/A  B/B/A/AB/A/B/A  B/A/A/B  A/A/A/B  B/A/A/A  A/B/A/A  A/A/B/A
本发明的任何化合物或疗法向患者的给予,要依照有关这些化合物的给予的一般方案进行,要考虑到载体或任何蛋白质或其他药剂的毒性,如果有毒性的话。因此,在一些实施方式中,有监测可归因于组合疗法的毒性的步骤。预期到,会按需重复进行治疗周期。还考虑到,各种标准的疗法以及手术介入可与所描述的疗法组合应用。
在具体的方面,考虑到将第二疗法如化学疗法、放射疗法、免疫疗法、手术疗法或其他基因疗法与本文所述的miRNA疗法组合应用。
1.化学疗法
有多种化学治疗剂可按照本发明进行使用。术语“化学疗法”指使用药物来治疗癌症。“化学治疗剂”用来表示在癌症的治疗中给予的化合物或组合物。这些药剂或药物按它们在细胞当中的活性方式归类,例如它们是否会影响细胞周期,和它们在什么阶段影响细胞周期。或者,药剂可根据其直接交联DNA、插入到DNA中或者通过影响核酸合成来诱导染色体和有丝分裂畸变的能力来表征。大多数化学治疗剂落入以下类别:烷基化剂、抗代谢物、抗肿瘤抗生素、有丝分裂抑制剂和亚硝基脲。
a.烷基化剂
烷基化剂是与基因组DNA直接发生相互作用从而防止癌细胞增殖的药物。这个类别的化学治疗药物代表着影响细胞周期的所有阶段的药剂,也就是说它们不是阶段特异性的(phase-specific)。烷基化剂可应用来治疗慢性白血病、非霍奇金淋巴瘤、霍奇金病、多发性骨髓瘤以及乳腺、肺和卵巢的特定癌症。它们包括:白消安、苯丁酸氮芥、顺铂、环磷酰胺(环磷氮芥)、达卡巴嗪、异环磷酰胺、氮芥(mustargen)和美法仑。曲格列酮(troglitazaone)可用于与这些烷基化剂中的任何一个或多个联合治疗癌症。
b.抗代谢物
抗代谢物能破坏DNA和RNA合成。与烷基化剂不同的是,它们专门影响细胞周期的S期。它们除了已被用来对付乳腺、卵巢和胃肠道的肿瘤外,还已被用来对付慢性白血病。抗代谢物包括5-氟尿嘧啶(5-FU)、阿糖胞苷(Ara-C)、氟达拉滨、吉西他滨和甲氨喋呤。
5-氟尿嘧啶(5-FU)的化学名为5-氟-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮。它的作用机制据认为是通过阻断脱氧尿苷酸向胸苷酸的甲基化反应起作用。因此,5-FU会干扰脱氧核糖核酸(DNA)的合成,和在较小程度上抑制核糖核酸(RNA)的形成。由于DNA和RNA对于细胞分裂和增殖是必需的,因此认为5-FU的作用是造成胸苷缺乏从而导致细胞死亡。因此,5-FU的作用存在于快速分裂的细胞中,快速分裂是转移性癌的特征。
c.抗肿瘤抗生素
抗肿瘤抗生素同时具有抗微生物活性和细胞毒性活性。这些药物还通过在化学上抑制酶类和有丝分裂或者改变细胞膜来干扰DNA。这些药剂不是阶段特异性的,因此它们在细胞周期的所有阶段都起作用。因此,它们被广泛用于多种癌症。抗肿瘤抗生素的实例包括博来霉素、放线菌素、柔红霉素、阿霉素和伊达比星,其中一些在下文有更详细讨论。在临床环境中广泛用来治疗肿瘤的这些化合物,是通过静脉内弹丸注射给予,剂量从阿霉素的21天时间间隔的25-75mg/m2到依托泊苷的静脉内或口服给予35-100mg/m2
d.有丝分裂抑制剂
有丝分裂抑制剂包括植物生物碱,和其他能抑制细胞分裂或有丝分裂所需的蛋白质合成的天然物质。它们在细胞周期的特定时期起作用。有丝分裂抑制剂包括多西他赛、依托泊苷(VP16)、紫杉醇(paclitaxel)、紫衫酚(taxol)、多烯紫杉醇(taxotere)、长春碱、长春新碱和长春瑞滨。
e.亚硝基脲
亚硝基脲和烷基化剂一样能抑制DNA修复蛋白。它们除了用来治疗脑肿瘤外,还用来治疗非霍奇金淋巴瘤、多发性骨髓瘤和恶性黑素瘤。实例包括卡莫司汀和洛莫司汀。
2.放射疗法
放射疗法也称放射治疗,是用电离辐射来治疗癌症和其他疾病。电离辐射会沉积能量,该能量通过损害被治疗区域的细胞的遗传材料而损伤或破坏这些细胞,使得这些细胞不可能继续生长。虽然辐射会同时损害癌细胞和正常细胞,但后者能够自我修复而正确发挥作用。放射疗法可用来治疗局部性实体瘤,如皮肤、舌、喉、脑、乳腺或宫颈的癌症。它可还用来治疗白血病和淋巴瘤(分别为造血细胞和淋巴系统的癌症)。
按照本发明使用的放射疗法,可包括但不限于射线、X射线的使用和/或放射性同位素向肿瘤细胞的定向递送。也考虑到了其他形式的DNA损害因素,如微波、质子束辐射(5,760,395号和4,870,287号美国专利)和紫外辐射。很可能的是,所有这些因素对DNA、对DNA前体、对DNA的复制和修复和对染色体的装配和维持,都产生大范围的损害。X射线的剂量范围从持续长时间(3-4周)的50-200伦琴的每日剂量,到2000-6000伦琴的单剂量。取决于同位素的半寿期、所发射的辐射的强度和类型及肿瘤细胞的吸收情况,放射疗法的剂量范围相差甚大。放射疗法可包括使用放射标记的抗体来将辐射剂量直接递送到癌症部位(放射免疫疗法)。抗体一旦注射到身体中,就积极地搜寻癌细胞,从而癌细胞受到辐射的杀细胞作用(细胞毒性)的破坏。这个方法能使对健康细胞的辐射损害的危险减至最低。
用于大脑和其他肿瘤的立体定向放射外科手术(伽玛刀)不是使用手术刀,而是使用来自几百个不同角度的非常精确靶向的伽玛放射疗法射线束。只需要一期(one sessioin)放射疗法,花费约四五个小时。为进行这个治疗,将特别制作的金属框架贴附到头上。然后,执行几次扫描和X射线,找到需要治疗的精确区域。在脑肿瘤的放射疗法过程中,患者躺卧,头放在大头盔中,头盔中有几百个孔让放射疗法射线束通过。相关的方法允许进行定位(positioning)以治疗身体其他区域的肿瘤。
3.免疫疗法
在癌症治疗的情形中,免疫治疗剂通常依靠使用免疫效应细胞和分子来靶向和破坏癌细胞。曲妥珠单抗(赫赛汀TM)是这样一个实例。免疫效应物可以例如是对肿瘤细胞表面上的某一标记有特异性的抗体。抗体可单独充当治疗的效应物,或者它可募集其他细胞来实际影响细胞杀灭。抗体还可与药物或毒素(化疗治疗剂、放射性核素、蓖麻毒蛋白A链、霍乱毒素、百日咳毒素等)缀合而仅充当靶向剂。或者,效应物可以是携带表面分子的淋巴细胞,该表面分子能与肿瘤细胞靶标直接或间接发生相互作用。各种效应细胞包括细胞毒性T细胞和NK细胞。各治疗方式(therapeutic modalities)组合也即直接细胞毒性活性与ErbB2的抑制或减少的组合,会在过量表达ErbB2的癌症的治疗中提供治疗益处。
在免疫疗法的一个方面,肿瘤或疾病细胞必须荷有某一易受靶向的标记,即在大多数其他细胞上不存在的标记。存在着许多肿瘤标记,这些标记中的任何一个在本发明的情形中都可适合靶向。通常的肿瘤标记包括癌胚抗原、前列腺特异性抗原、泌尿系统肿瘤相关抗原、胚胎抗原、酪氨酸酶(p97)、gp68、TAG-72、HMFG、唾液酸化路易斯抗原、MucA、MucB、PLAP、雌激素受体、层粘连蛋白受体、erb B和p155。免疫疗法的另外一个方面是将抗癌作用与免疫刺激作用相结合。也存在着免疫刺激分子,它们包括:细胞因子如IL-2、IL-4、IL-12、GM-CSF、γ-IFN,趋化因子如MIP-1、MCP-1、IL-8,和生长因子如FLT3配体。将免疫刺激分子——作为蛋白质或者使用基因递送——与肿瘤抑制物如MDA-7相结合,已证实能增强抗肿瘤作用(Ju等人,2000)。此外,抗任何这些化合物的抗体可用来靶向本文讨论的抗癌药剂。
目前在研究或在使用的免疫疗法的实例有:免疫佐剂,如牛分支杆菌(Mycobacterium bovis)、恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)、二硝基氯苯和芳族化合物(5,801,005号和5,739,169号美国专利;Hui和Hashimoto,1998;Christodoulides等人,1998);细胞因子疗法,如干扰素、和,IL-1、GM-CSF和TNF(Bukowski等人,1998;Davidson等人,1998;Hellstrand等人,1998)基因疗法,如TNF、IL-1、IL-2、p53(Qin等人,1998;Austin-Ward和Villaseca,1998;5,830,880号和5,846,945号美国专利)和单克隆抗体如抗神经节苷脂GM2、抗HER-2、抗p185;Pietras等人,1998;Hanibuchi等人,1998;5,824,311号美国专利)。赫赛汀(曲妥珠单抗)是嵌合(小鼠-人)单克隆抗体,它能阻断HER2-neu受体。它具有抗肿瘤活性,已被批准用于治疗恶性肿瘤(Dillman,1999)。几种已知的抗癌免疫治疗剂及其靶标的非限制性名单包括但不限于(通用名(靶标)):西妥昔单抗(EGFR)、帕尼单抗(EGFR)、曲妥珠单抗(erbB2受体)、贝伐单抗(VEGF)、阿仑单抗(CD52)、吉妥珠单抗奥唑米星(CD33)、利妥昔单抗(CD20)、托西莫单抗(CD20)、马妥珠单抗(EGFR)、替伊莫单抗(CD20)、托西莫单抗(CD20)、HuPAM4(MUC1)、MORAb-009(间皮素)、G250(碳酸酐酶IX)、mAb 8H9(8H9抗原)、M195(CD33)、Ipilimumab(CTLA4)、HuLuc63(CS1)、阿仑单抗(CD53)、依帕珠单抗(CD22)、BC8(CD45)、HuJ591(前列腺特异性膜抗原)、hA20(CD20)、来沙木单抗(TRAIL受体-2)、帕妥珠单抗(HER-2受体)、Mik-β-1(IL-2R)、RAV12(RAAG12)、SGN-30(CD30)、AME-133v(CD20)、HeFi-1(CD30)、BMS-663513(CD137)、Volociximab(抗α5β1整联蛋白)、GC1008(TGFβ)、HCD122(CD40)、希普利珠单抗(CD2)、MORAb-003(叶酸受体α)、CNTO 328(IL-6)、MDX-060(CD30)、Ofatumumab(CD20)或SGN-33(CD33)。考虑到,这些疗法中的一个或多个可与本文描述的miRNA疗法一起应用。
癌症的被动免疫疗法存在着多种不同的途径。它们可主要分成以下几类:单独注射抗体;注射与毒素或化学治疗剂偶联的抗体;注射与放射性同位素偶联的抗体;注射抗独特型抗体;最后是清除骨髓中的肿瘤细胞。
4.基因疗法
在还另一个实施方式中,组合治疗涉及基因疗法,其中在给予一个或多个治疗性miRNA之前、之后或同时给予治疗性多核苷酸。治疗性多肽或编码核酸与miRNA的联合递送,可对靶标组织具有组合的治疗作用。有多种蛋白质被涵盖在本发明范围内,其中一些在下文描述。与本发明组合的各种可被靶向以进行某种形式的基因疗法的基因,包括但不限于细胞增殖的诱导物、细胞增殖的抑制物、程序性细胞死亡的调节物、细胞因子和其他治疗性核酸或编码治疗性蛋白质的核酸。
肿瘤抑制癌基因起到抑制过度的细胞增殖的作用。这些基因的失活会破坏它们的抑制活性,从而导致不受调节的增殖。可采用肿瘤抑制物(例如治疗性多肽)p53、FHIT、p16和C-CAM。
除p53外,细胞增殖的另一抑制物是p16。真核生物细胞周期的主要转变是由细胞周期蛋白依赖性激酶或者说CDK引发的。有一种CDK,即细胞周期蛋白依赖性激酶4(CDK4),能调节通过G1的进程。这个酶的活性可能是在G1晚期使Rb磷酸化。CDK4的活性受激活性亚单位D型细胞周期蛋白和抑制性亚单位的控制。p16INK4已在生物化学上被表征为能特异性结合和抑制CDK4的蛋白质,因此可调节Rb磷酸化(Serrano等人,1993;Serrano等人,1995)。由于p16INK4蛋白是CDK4抑制剂(Serrano,1993),这个基因的缺失会提高CDK4的活性,从而导致Rb蛋白的超磷酸化。p16已知还能调节CDK6的功能。
p16INK4属于新近描述的一类CDK抑制蛋白,这类抑制蛋白还包括p16B、p19、p21WAF1和p27KIP1。p16INK4基因定位于(map to)9p21,后者是在许多肿瘤类型中常常被缺失的染色体区域。p16INK4基因的纯合缺失和突变,在人肿瘤细胞系中是时常发生的。这个证据提示p16INK4基因是肿瘤抑制基因。但是,这个解释已受到如下观察结果的挑战,即p16INK4基因改变的频率,在原发性未培养的肿瘤中比在经培养的细胞系中低得多(Caldas等人,1994;Cheng等人,1994;Hussussian等人,1994;Kamb等人,1994;Mori等人,1994;Okamoto等人,1994;Nobori等人,1995;Orlow等人,1994;Arap等人,1995)。通过用质粒表达载体进行转染恢复野生型p16INK4功能,结果减少了一些人癌细胞系的集落形成(Okamoto,1994;Arap,1995)。
其他可按照本发明应用的基因,包括Rb、APC、DCC、NF-1、NF-2、WT-1、MEN-I、MEN-II、zac1、p73、VHL、MMAC1/PTEN、DBCCR-1、FCC、rsk-3、p27、p27/p16融合体、p21/p27融合体、抗血栓基因(例如COX-1、TFPI)、PGS、Dp、E2F、ras、myc、neu、raf、erb、fms、trk、ret、gsp、hst、abl、E1A、p300、参与血管发生的基因(例如VEGF、FGF、血小板反应蛋白、BAI-1、GDAIF或者它们的受体)和MCC。
5.手术
大约有60%的癌症患者将进行某种类型的手术,包括预防性手术、诊断性手术或分期手术(staging surgery)、治疗性手术和姑息性手术。治疗性手术是一种可与其他疗法联用的癌症治疗法,所述其他疗法例如本发明的治疗法、化学疗法、放射疗法、激素疗法、基因疗法、免疫疗法和/或交替疗法(alternative therapy)。
治疗性手术包括切除术,其中全部或部分癌组织被物理去除、切离和/或破坏。肿瘤切除术指肿瘤的至少一部分的物理去除。除了肿瘤切除术外,手术治疗还包括激光手术、冷冻手术、电手术和显微控制手术(Mohs手术)。还考虑到,本发明可与浅表癌、初癌或附带数量的(incidental amounts of)正常组织的去除联合使用。
在切除部分或全部的癌性细胞、组织或肿瘤后,身体中可能形成一个空穴。可通过用另外的抗癌疗法输注、直接注射或局部涂敷该区域,来完成治疗。这种治疗可例如每1、2、3、4、5、6或7天,或者每1、2、3、4和5个周,或者每1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个月重复进行。这些治疗所用的剂量也可不同。
6.其他药剂
应该考虑到,其他药剂可与本发明组合使用,以提高治疗的疗效。这些另外的药剂包括免疫调节物、影响细胞表面受体和间隙连接(GAP junction)的上调的药剂、细胞抑制剂(cytostatic agent)和分化剂、细胞粘着的抑制剂、增加高增殖性细胞对凋亡诱导剂的敏感性的药剂或其他生物药剂。免疫调节物包括肿瘤坏死因子;干扰素α、β和γ;IL-2和其他细胞因子;F42K和其他细胞因子类似物;或者MIP-1、MIP-1β、MCP-1、RANTES和其他趋化因子。还应该考虑到,细胞表面受体或其配体如Fas/Fas配体、DR4或DR5/TRAIL(Apo-2配体)的上调,会通过建立对高增殖性细胞的自分泌或旁分泌作用,加强本发明的凋亡诱导能力。通过提高间隙连接的数目来增加细胞间信号转导,会增加对邻近的高增殖性细胞群体的抗高增殖作用。在其他的实施方式中,细胞抑制剂或分化剂可与本发明组合使用,以提高治疗的抗高增殖作用。考虑用细胞粘着的抑制剂来改进本发明的功效。细胞粘着抑制剂的实例有粘着斑激酶(FAKs)抑制剂和洛伐他汀。还考虑到,增加高增殖性细胞对凋亡的敏感性的其他药剂如抗体c225,可与本发明组合使用来提高治疗功效。
Apo2配体(Apo2L,也称TRAIL)是肿瘤坏死因子(TNF)细胞因子家族的成员。TRAIL能在多种类型的癌细胞中激活快速凋亡,但对正常细胞无毒。TRAILmRNA出现在多种组织中。大多数正常细胞似乎对TRAIL的细胞毒性作用具有抗性,这提示存在着能抗TRAIL的凋亡诱导的机制。描述的TRAIL的第一个受体称为死亡受体4(DR4),它含有细胞质“死亡结构域”;DR4能传送TRAIL所携带的凋亡信号。已鉴定出另外的能结合TRAIL的受体。有一种受体称为DR5,它与DR4非常相似,含有细胞质死亡结构域并能转导凋亡信号。DR4和DR5mRNA在许多正常组织和肿瘤细胞系中表达。最近,已鉴定出诱杀型受体如DcR1和DcR2,它们能防止TRAIL通过DR4和DR5诱导凋亡。这些诱杀型受体因此代表着直接在细胞表面处调节对促凋亡细胞因子的敏感性的新机制。这些抑制性受体在正常组织中的优先表达提示,TRAIL可用作诱导癌细胞的凋亡的抗癌剂,同时不伤害正常细胞。(Marsters等人,1999)。
在引进了细胞毒性化疗药物后,在癌症的治疗上已有许多进展。但是,化学疗法的后果之一,是抗药表型的发展/获得和多重药物抗性的发展。药物抗性的发展仍是这种肿瘤的治疗中的主要障碍,因此对另类途径如基因疗法显然有需求。
与化学疗法、放射疗法或生物疗法联用的另一形式的疗法包括高热,这是一种使患者组织暴露于高温的方法(最高达106°F)。外部或内部加热装置可涉及到施加局部的、区域性的或全身的高热。局部高热涉及到将热量施加到小区域如肿瘤。热量可由来自身体外装置的高频波靶向肿瘤外部产生。内部热量可涉及无菌探头,包括细加热丝或充入温水的中空管、植入的微波天线或者射频电极。
加热患者的器官或肢体以进行区域性治疗,这是用能产生高能量的装置如磁体来实现。或者,可移出患者的一些血液进行加热,然后输注到要进行内部加热的区域。在癌症已扩散到整个身体的情况中,也可执行全身加热。为此目的,可使用温水毯子、热蜡、感应线圈和热箱(thermal chamber)。
激素疗法也可与本发明联用或者与之前描述的任何其他癌症疗法组合使用。激素可用来治疗某些癌症,如乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌或宫颈癌,以降低某些激素如睾酮或雌激素的水平或阻断它们的作用。这个治疗往往与至少一种其他癌症疗法组合使用,作为治疗选项或者减少转移危险。
本申请将2006年2月8日提交的美国申请系列号11/349,727通过引用其全文并入本文,该申请要求了2005年2月8日提交的美国申请系列号60/650,807的优先权。
III.miRNA分子
微小RNA分子(“miRNA”)通常长度在21-22个核苷酸,不过19个和最多23个核苷酸的长度也有报道。这些miRNA各自是从更长的前体RNA分子(“前体miRNA”)加工而来。前体miRNA从非编码蛋白质的基因转录而来。前体miRNA具有两个互补性区域,使得它们能够形成茎-环结构或者折回样(fold-back-like)结构,该结构在动物中由称为切酶(Dicer)的核糖核酸酶III样核酸酶切割。被加工的miRNA通常是茎的一部分。
加工的miRNA(也称“成熟miRNA”)变成大复合体的一部分,以下调特定的靶标基因或其基因产物。动物miRNA的实例包括与靶标不完全碱基配对而使翻译停止的那些miRNA(Olsen等人,1999;Seggerson等人,2002)。siRNA也由切酶加工从长的双链RNA分子加工。siRNA不在动物细胞中天然存在,但它们能指导通过RNA诱导沉默复合体(RISC)的序列特异性切割mRNA靶标(Denli等人,2003)。
A.阵列制备
本发明的某些实施方式涉及到使用和制备mRNA或核酸阵列、miRNA或核酸阵列和/或miRNA或核酸探针阵列,这些阵列是核酸分子(探针)的大阵列或微阵列,所述核酸分子(探针)完全或几乎与来自受miR-16 miRNA调节的各种基因和基因途径的多种核酸、mRNA或miRNA分子、前体miRNA分子、或者核酸互补(在探针的整个长度上)或者相同(在探针的整个长度上),且以空间上分隔的布局布置在载体或载体材料上。大阵列通常是其上点缀着探针的硝酸纤维素或尼龙片。微阵列将核酸探针布置得更加紧密,使得最多10,000个核酸分子能容纳在通常1-4平方厘米的区域中。微阵列可通过将核酸分子如基因、寡核苷酸等点缀到基材上来制作,或者通过在基材上原位制作寡核苷酸序列来制作。点缀或制作的核酸分子,可以以多达约30个非相同核酸分子每平方厘米或更多,例如多达约100个乃至1000个每平方厘米的高密度矩阵模式来施加。与滤器阵列(filter array)的基于硝酸纤维素的材料不同,微阵列通常使用包被的玻璃作为固相载体。通过获得标记RNA和/或miRNA互补的核酸样品的有序阵列,每个样品的位置可进行跟踪并与原始样品相关联。
有多种不同的阵列装置是本领域技术人员熟知的,在这些阵列装置中众多不同的核酸探针与固相载体的表面稳定结合。有用的阵列基材包括尼龙、玻璃、金属、塑料、乳胶和硅。这些阵列可在许多不同方面有差异,包括平均探针长度、探针的序列或类型、探针和阵列表面之间的键合性质,例如共价键合或非共价键合,等等。除了探针检测miRNA或基因或代表基因的核酸外,本发明的标记和筛选方法及阵列就其任何参数而言在应用上不受限制;因此,各方法和组合物可在多种不同类型的核酸阵列上使用。
制备微阵列的代表性方法和装置已有描述,例如在以下美国专利中:5,143,854;5,202,231;5,242,974;5,288,644;5,324,633;5,384,261;5,405,783;5,412,087;5,424,186;5,429,807;5,432,049;5,436,327;5,445,934;5,468,613;5,470,710;5,472,672;5,492,806;5,525,464;5,503,980;5,510,270;5,525,464;5,527,681;5,529,756;5,532,128;5,545,531;5,547,839;5,554,501;5,556,752;5,561,071;5,571,639;5,580,726;5,580,732;5,593,839;5,599,695;5,599,672;5,610,287;5,624,711;5,631,134;5,639,603;5,654,413;5,658,734;5,661,028;5,665,547;5,667,972;5,695,940;5,700,637;5,744,305;5,800,992;5,807,522;5,830,645;5,837,196;5,871,928;5,847,219;5,876,932;5,919,626;6,004,755;6,087,102;6,368,799;6,383,749;6,617,112;6,638,717;6,720,138,以及WO93/17126;WO 95/11995;WO 95/21265;WO 95/21944;WO 95/35505;WO96/31622;WO 97/10365;WO 97/27317;WO 99/35505;WO 09923256;WO09936760;WO0138580;WO 0168255;WO 03020898;WO 03040410;WO03053586;WO 03087297;WO 03091426;WO03100012;WO 04020085;WO04027093;EP 373 203;EP 785 280;EP 799 897和UK 8 803 000,这些专利的公开内容全都通过引用并入本文。
考虑到,阵列可以是高密度阵列,使得它们含有2、20、25、50、80、100个或更多个不同的探针。考虑到,它们可含有1000、16,000、65,000、250,000或1,000,000个或更多个不同的探针。各探针可靶向一个或多个不同生物或细胞类型中的mRNA和/或miRNA靶标。寡核苷酸探针在一些实施方式中其长度在5-50个、5-45个、10-40个、9-34个或15-40个核苷酸之间。在某些实施方式中,寡核苷酸探针的长度为从5、10、15、20到20、25、30、35、40个核苷酸,包括这些数字之间的所有整数和范围。
每个不同的探针序列在阵列中的位置和序列通常是已知的。此外,大量的不同探针可占据相对较小的区域,从而提供探针密度通常大于约60、100、600、1000、5,000、10,000、40,000、100,000或400,000个不同寡核苷酸探针/cm2的高密度阵列。阵列的表面积可以是约或小于约1、1.6、2、3、4、5、6、7、8、9或10om2
此外,本领域普通技术人员能容易地分析阵列产生的数据。这种方案在上文公开,且包括见于WO 9743450;WO 03023058;WO 03022421;WO 03029485;WO 03067217;WO 03066906;WO 03076928;WO 03093810;WO 03100448A1中的信息,所有这些专利通过引用明确并入本文。
B.样品制备
考虑到,众多样品的RNA和/或miRNA可用本发明的阵列、探针索引(indexof probes)或阵列技术进行分析。虽然考虑的是将内源miRNA用在本发明的组合物和方法上,但重组miRNA——包括与内源miRNA或前体miRNA有互补性或同一性的核酸——也可按本文所述进行处理和分析。样品可以是生物样品,在这种情况中,它们可以来自活组织检查、细针吸取物、剥落物、血液、组织、器官、精液、唾液、泪液、其他体液、毛囊、皮肤或者任何含有或构成生物细胞特别是癌细胞或高增殖性细胞的样品。在某些实施方式中,样品可以是但不限于活检物或者从活检物或者其他体液或组织纯化或富集到一定程度的细胞。或者,样品可以不是生物样品,而是化学混合物,如无细胞的反应混合物(其可含有一种或多种生物酶)。
C.杂交
在制备了阵列或一组探针后,和/或在样品中核酸或探针进行了标记后,将靶标核酸群体与该阵列或探针在杂交条件下进行接触,其中所述条件可按需调整,以提供对所进行的特定测定而言最佳的特异性水平。合适的杂交条件是本领域技术人员熟知的,在Sambrook等人(2001)和WO 95/21944中有综述。在许多实施方式中特别注意的是在杂交过程中使用严格条件。严格条件是本领域技术人员熟知的。
特地考虑到,可将单个阵列或探针组与多个样品进行接触。样品可用不同的标记进行标记以区分各样品。例如,可将单一阵列与用Cy3标记的肿瘤组织样品和用Cy5标记的正常组织样品进行接触。对于与阵列上的探针对应的特定miRNA,可以很容易地确定和定量样品之间的差异。
阵列的小表面积能使杂交条件如温度调节和盐含量一致。此外,由于高密度阵列占据的面积小,杂交可在极小的流体体积中进行(例如约250 1或更小,包括约或小于约5、10、25、50、60、70、80、90、100 1或者这些数字当中可得出的任何范围)。在小体积中,杂交可进行得非常快。
D.差异表达分析
本发明的阵列可用来检测两个样品之间的差异。具体考虑的应用包括鉴定和/或定量正常组织与不正常组织之间miRNA或基因表达的差异、疾病或病症与不显示这种疾病或病症的细胞之间的差异,或者两个经不同处理的样品之间的差异。还有,可在据认为易感特定疾病或病症的样品和据认为不易感或能抵抗该疾病或病症的样品之间,比较miRNA或基因表达。不正常的样品是显示疾病或病症的表型特性或基因型特性的样品,或者据认为就该疾病或病症而言不正常的样品。它可与就该疾病或病症而言正常的细胞进行比较。表型特性包括疾病或病症的症状或者对疾病或病症的易感性,其中所述疾病或病症的某构成因素是或者可以是或者可以不是遗传的,或者由高增殖性或肿瘤性细胞引起。
阵列包含具有核酸探针的固相载体,所述核酸探针结合于载体。阵列通常包含众多不同的核酸探针,它们连接到基材表面不同的、确知的位置。这些阵列也称“微阵列”或者俗称“芯片”,在本领域中普遍有描述,例如5,143,854号、5,445,934号、5,744,305号、5,677,195号、6,040,193号、5,424,186号美国专利和Fodor等人,(1991),每个专利和文献都为了所有目的通过引用其全文并入本文。用机械合成方法合成这些阵列的技术描述于例如5,384,261号美国专利,该专利为了所有目的通过引用其全文并入本文。虽然在某些方面,使用的是平面阵列表面,但是阵列可制作在几乎任何形状的表面上乃至多个表面上。阵列可以是在珠粒、凝胶、聚合物表面、纤维如光纤、玻璃或任何其他适当的基材上的核酸,参见5,770,358号、5,789,162号、5,708,153号、6,040,193号和5,800,992号美国专利,这些专利为了所有目的整体并入本文。阵列可以以便于全包括式装置(all inclusive device)的诊断或其他操作的方式进行包装,参见例如5,856,174号和5,922,591号美国专利,这两个专利为了所有目的通过引用其全文并入本文。有关阵列及它们的制造和特性的更多信息,另参见2000年4月7日提交的美国专利申请系列号09/545,207,这个专利申请为了所有目的通过引用其全文并入本文。
具体的说,阵列可用来就病理状况如癌症和相关病症对样品评估。具体考虑到,本发明可用来评估疾病的各阶段或亚类(sub-classification)之间的差异,如良性的、癌性的和转移的组织或肿瘤之间的差异。
要评估的表型特性包括诸如以下的特征:寿命、发病率、预期存活期、对特定药物或医疗性治疗的易感性或感受性(药物功效),和药物毒性的危险。在这些表型特性方面有差异的样品,还可用所描述的组合物和方法进行评估。
在某些实施方式中,可产生miRNA和/或表达谱,以评价这些表达谱并将它们与药代动力学或疗法相关联。例如,可在患者进行治疗之前或者在治疗过程中,产生患者肿瘤和血液样品的这些表达谱并进行评估,以确定是否有其表达与患者的治疗结果相关的miRNA或基因。对差异的miRNA或基因的鉴定,可得出用以评估肿瘤和/或血液样品的诊断性测定法,以确定应给患者提供什么药物方案。另外,它可用来鉴定或选择适合特定临床试验的患者。如果表达谱经确定与药物功效或药物毒性相关,则该表达谱关系到该患者是否是接受药物、接受药物组合或者接受该药物特定剂量的适合患者。
除了上述预后性测定外,还可对患有各种疾病的患者的样品进行评估,以确定是否可基于miRNA和/或相关基因表达水平鉴定不同的疾病。可基于表达谱建立诊断性测定法,医生们可用来鉴定患有疾病的个体或者鉴定谁有发展疾病的危险。或者,可基于miRNA谱图(profiling)设计治疗方案。这种方法和组合物的实例,描述于David Brown,Lance Ford,Angie Cheng和Rich Jarvis名下的、2005年5月23日提交的、题为“Methods and Compositions Involving miRNA andmiRNA Inhibitor Molecules”(涉及miRNA和miRNA抑制剂分子的方法和组合物)的美国临时专利申请,该临时申请通过引用其全文并入本文。
E.其他测定法
除了使用阵列和微阵列外,还考虑到可采用多种不同的测定法来分析miRNA或相关基因、它们的活性和它们的作用。这些测定法包括但不限于核酸扩增、聚合酶链反应、定量PCR、RT-PCR、原位杂交、Northern杂交、杂交保护测定(HPA)(GenProbe)、分支DNA(bDNA)测定(Chiron)、滚环式扩增(RCA)、单分子杂交检测(US Genomics)、侵染测定(ThirdWave Technologies)和/或桥连测定(Bridge Litigation Assay)(Genaco)。
IV.核酸
本发明涉及核酸、经修饰的核酸或模拟核酸、miRNA、mRNA、基因及其代表性片段,它们可进行标记,用于阵列分析,或者在诊断性、治疗性或预后性应用中采用,特别是与病理状况如癌症相关的应用中。这些分子可以是已由细胞内源产生,或者已通过化学法或重组法合成或产生。它们可进行分离和/或纯化。每个miRNA在本文中都有描述,包括它们相应的SEQ ID NO和登录号。miRNA的名称往往缩写,提到时不加“hsa-”前缀,但取决于上下文而定要理解为加有“hsa-”前缀。除非另有指明,本说明书中提到的miRNA是标示为miR-X或let-X的人序列,其中X为数字和/或字母。
在某些方面,可使用由后缀“5P”或“3P”标示的miRNA探针。如sanger.ac.uk网站上所述,“5P”表示成熟miRNA衍自前体的5’末端,相应的“3P”表示它衍自前体的3’末端。此外,在一些实施方式中,使用不对应于已知的人miRNA的miRNA探针。考虑到这些非人miRNA探针可在本发明的实施方式中使用,或者考虑到可存在着与非人miRNA同源的人miRNA。在其他的实施方式中,可采用任何哺乳动物细胞、生物样品或其制品。
在本发明的一些实施方式中,涉及到miRNA的方法和组合物可涉及miRNA、标记(例如mRNA)和/或其他核酸。核酸的长度可以是、至少是或者至多是3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990或1000个核苷酸,或者这些数字当中可得出的任何范围。这些长度覆盖加工的miRNA、miRNA探针、前体miRNA、含miRNA的载体、mRNA、mRNA探针、对照核酸及其他探针和引物的长度。
在许多实施方式中,miRNA的长度为19-24个核苷酸,而miRNA探针的长度为19-35个核苷酸,取决于加工的miRNA和任何加入的侧翼区的长度。人类中的miRNA前体通常在62-110个核苷酸之间。
本发明的核酸可具有与另一核酸有同一性或互补性的区域。考虑到互补性或同一性的区域可以是至少5个毗连残基,不过具体考虑到该区域是、至少是或者至多是6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、441、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990或1000个毗连核苷酸。还要理解的是,前体miRNA或其他核酸当中的互补性长度,或者miRNA探针与miRNA或miRNA基因之间的互补性长度,是这些长度。此外,互补性可以百分数表示,意思是探针与其靶标之间的互补性在探针的整个长度上为90%或更高。在一些实施方式中,互补性是或者至少为90%、95%或100%。具体的说,这些长度可适用于任何包含任何本文所述SEQ ID No、登录号所标示的核酸序列,或者本文所公开的任何其他序列。通常,给出miRNA的常用名称(前缀表示其鉴定来源,例如“hsa”指人序列)和加工的miRNA序列。除非另有指明,不带前缀的miRNA应理解为指人miRNA。此外,miRNA名称中的小写字母可以是或可以不是小写字母;例如hsa-mir-130b也可称为miR-130B。术语“miRNA探针”指可鉴定特定的miRNA或结构上相关miRNA的核酸探针。
应理解到,一些核酸衍自基因组序列或基因。在这点上,术语“基因”是为了简便起见,用来指编码给定miRNA或基因的前体核酸或miRNA的基因组序列。但是,本发明的实施方式可涉及miRNA的、参与其表达的基因组序列,如启动子或其他调节序列。
可使用术语“重组”,这通常指已在体外进行过操作的分子,或者是这种分子的复制或表达产物。
术语“核酸”是本领域公知的。本文所用的“核酸”通常是指包含核碱基的DNA、RNA或者它们的衍生物或类似物的分子(一条或多条链)。核碱基包括例如存在于DNA(例如腺嘌呤“A”、鸟嘌呤“G”、胸腺嘧啶“T”或胞嘧啶“C”)或者RNA(例如A、G、尿嘧啶“U”或C)中的天然嘌呤或嘧啶碱基。术语“核酸”涵盖术语“寡核苷酸”和“多核苷酸”,它们各自都是术语“核酸”的亚属。
术语“miRNA”一般指单链分子,但在具体的实施方式中,在本发明中实施的分子还会涵盖这样的区域或者另外链,它部分上(在整个链长度上有10-50%互补性)、基本上(在整个链长度上有大于50%但小于100%互补性)或者完全地与同一单链分子的另一区域或者与另一核酸互补。因此,miRNA核酸可涵盖这样的分子,它包含特定序列的一个或多个互补的或自身互补的链或“互补序列(complement)”。例如,前体miRNA可具有自身互补区域,互补性最大达100%。本发明的miRNA探针或核酸可包括、可以是或者可以至少是与其靶标有60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99或100%的互补性。
应理解到,本发明的“合成核酸”意思是该核酸不具有天然核酸的全部或部分化学结构或序列。因此,应理解到,术语“合成miRNA”指在细胞中或在生理条件下起到天然miRNA的作用的“合成核酸”。
虽然本发明的实施方式可涉及合成miRNA或合成核酸,但在本发明的一些实施方式中,核酸分子不必是“合成的”。在一些实施方式中,在本发明方法和组合物中采用的非合成核酸或miRNA,可具有天然mRNA或miRNA前体或者成熟mRNA或miRNA的整个序列和结构。例如,在本发明方法和组合物中使用的非合成miRNA,可不具有一个或多个经修饰的核苷酸或核苷酸类似物。在这些实施方式中,非合成miRNA可以是或者不是重组产生的。在特定的实施方式中,本发明方法和/或组合物中的核酸专门是合成miRNA而不是非合成miRNA(非合成miRNA也即不是所谓的“合成”miRNA);然而在其他实施方式中,本发明专门涉及非合成miRNA而不是合成miRNA。任何针对合成miRNA的使用所讨论的实施方式,都可适用于非合成miRNA,反之亦然。
应理解到,术语“天然”指没有任何人类干预下的生物中存在的东西;它可指天然的野生型分子或突变分子。在一些实施方式中,合成miRNA分子不具有天然miRNA分子的序列。在其他实施方式中,合成miRNA分子可具有天然miRNA分子的序列,但该分子的化学结构,特别是与精确序列具体不相关的部分中的化学结构(非序列化学结构),与具有该序列的天然miRNA分子的化学结构不同。在一些情况中,合成miRNA具有在天然miRNA中不存在的序列化学结构和非序列化学结构。此外,合成分子的序列将确定哪个miRNA得到有效提供或抑制;内源miRNA将被称为“相应miRNA”。可在本发明情形中使用的相应miRNA序列,包括但不限于本文提供的各SEQ ID中的那些序列的全部或一部分,以及任何其他miRNA序列、miRNA前体序列或者它们的任何互补序列。在一些实施方式中,序列是或来源于或含有本文所鉴别的序列的全部或一部分,以靶向可与所述序列一起使用的特定miRNA(或miRNA组)。可选定任何1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260个或者这些数字当中的任何数字或范围的序列以排除所有非选定序列。
本文所用的“杂交”、“与...杂交”或者“能够杂交”,应理解为意指双链或三链分子或者具有部分双链或三链性质的分子的形成。本文所用的术语“退火”与“杂交”同义。术语“杂交”、“与...杂交”或者“能够杂交”涵盖术语“严格条件”或“高严格性”和术语“低严格性”或“低严格条件”。
本文所用的“严格条件”或“高严格性”是这样的条件,它们能让一个或多个含有互补序列的核酸链之间或内发生杂交,但排除随机序列的杂交。严格条件能容忍核酸和靶标链之间极少的错配,如果有错配的话。这种条件是本领域普通技术人员公知的,优选用于要求高选择性的应用中。非限制性的应用包括分离核酸如基因或其核酸片段,或者检测至少一个特异性mRNA转录物或其核酸片段,等等。
严格条件可包括低盐和/或高温条件,如由约42℃至约70℃的温度下的约0.02M至约0.5M NaCl提供的条件。应理解到,期望严格性的温度和离子强度部分上由以下因素决定:特定核酸的长度、靶标序列的长度和核碱基含量、核酸的电荷组成,杂交混合物中甲酰胺、四甲基氯化铵或其他溶剂的存在或浓度。
还应理解到,对杂交而言的这些范围、组成和条件,仅是以非限制性实例的方式提及,特定杂交反应的期望严格性,往往是通过与一个或多个阳性对照或阴性对照进行比较来经验确定。视预期的应用而定,优选的是采用不同的杂交条件,来达到核酸对靶标序列的不同程度的选择性。在非限制性实例中,可通过在低温和/或高离子强度下杂交,实现对在严格条件下不与核酸杂交的相关靶标核酸的鉴定或分离。这种条件称为“低严格性”或“低严格性条件”,低严格性的非限制性实例包括在约20℃至约50℃温度范围的约0.15M至约0.9MNaCl下进行的杂交。当然,本领域技术人员有能力进一步修正低严格性或高严格性条件,以适合特定的应用。
A.核碱基、核苷、核苷酸和经修饰的核苷酸
本文所用的“核碱基”指杂环碱基,例如在至少一种天然核酸(即DNA和RNA)中存在的天然核碱基(即A、T、G、C或U),和这种核碱基的天然或非天然衍生物和类似物。核碱基通常可与至少一个天然核碱基,以可替代天然核碱基配对(例如A和T、G和C及A和U之间的氢键键合)的方式,形成一个或多个氢键(“退火”或“杂交”)。
“嘌呤”和/或“嘧啶”核碱基涵盖天然嘌呤和/或嘧啶核碱基,还有它们的衍生物和类似物,包括但不限于被烷基、羧基烷基、氨基、羟基、卤素(即氟、氯、溴或碘)、硫醇或烷硫基部分(moiety)中的一个或多个取代的那些嘌呤或嘧啶。优选的烷基(例如烷基、羧基烷基等)部分包含约1、约2、约3、约4、约5至约6个碳原子。嘌呤或嘧啶的其他非限制性实例包括脱氮嘌呤、2,6-二氨基嘌呤、5-氟尿嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、8-溴鸟嘌呤、8-氯鸟嘌呤、溴胸腺嘧啶、8-氨基鸟嘌呤、8-羟基鸟嘌呤、8-甲基鸟嘌呤、8-硫代鸟嘌呤、氮杂鸟嘌呤、2-氨基嘌呤、5-乙基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-乙基尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-丙基尿嘧啶、硫代尿嘧啶、2-甲基腺嘌呤、甲基硫代腺嘌呤、N,N-二甲基腺嘌呤、氮杂腺嘌呤、8-溴腺嘌呤、8-羟基腺嘌呤、6-羟基氨基嘌呤、6-硫代嘌呤、4-(6-氨基己基/胞嘧啶)等。其他实例是本领域技术人员公知的。
本文所用的“核苷”指包含与核碱基连接部分(linker moiety)共价连接的核碱基的单独化学单位。“核碱基连接部分”的非限制性实例是包含5个碳原子的糖(即“5碳糖”),包括但不限于脱氧核糖、核糖、阿拉伯糖或者5碳糖的衍生物或类似物。5碳糖的衍生物或类似物的非限制性实例,包括2′-氟-2′-脱氧核糖或者其中糖环中的一个氧原子被碳取代的碳环糖。核碱基与核碱基连接部分的不同类型的共价连接,是本领域公知的(Kornberg和Baker,1992)。
本文所用的“核苷酸”指进一步包含“骨架部分”的核苷。骨架部分通常将核苷酸与另一包含核苷酸的分子共价连接,或者与另一核苷酸连接以形成核酸。天然核苷酸中的“骨架部分”通常包括与5碳糖共价连接的磷部分。骨架部分的连接通常出现在5碳糖的3′-或5′-位置。但是,其他类型的连接也是本领域公知的,特别是当核苷酸包含天然5碳糖或磷部分的衍生物或类似物时。
核酸可包含可在天然核酸中存在的核碱基、核碱基连接部分和/或骨架部分的衍生物或类似物,或者完全由这种衍生物或类似物组成。具有核酸类似物的RNA也可按本发明方法进行标记。本文所用的“衍生物”指天然分子的经化学修饰或改变的形式,而术语“模拟物”或“类似物”指这样的分子,它在结构上可能与或不与天然分子或部分类似,但具有相似的功能。本文所用的“部分(moiety)”一般指较大化学或分子结构中的较小化学或分子成分。核碱基、核苷和核苷酸类似物或衍生物为本领域公知,已有描述(参见例如Scheit,1980,通过引用并入本文)。
核苷、核苷酸或核酸的另外的非限制性实例,包括以下各号美国专利中的那些实例:5,681,947、5,652,099、5,763,167、5,614,617、5,670,663、5,872,232、5,859,221、5,446,137、5,886,165、5,714,606、5,672,697、5,466,786、5,792,847、5,223,618、5,470,967、5,378,825、5,777,092、5,623,070、5,610,289、5,602,240、5,858,988、5,214,136、5,700,922、5,708,154、5,728,525、5,637,683、6,251,666、5,480,980和5,728,525,每个专利都通过引用其全文并入本文。
本发明的标记方法和试剂盒特地考虑到使用这样的核苷酸,它们一方面经修饰以连接标记,另一方面能掺入到miRNA分子中。这种核苷酸包括可用包括荧光染料的染料或者用诸如生物素的分子进行标记的那些核苷酸。经标记的核苷酸是容易获得的;它们可从商业途径获得,或者可通过本领域技术人员公知的反应合成得到。
供用于本发明的经修饰的核苷酸不是天然核苷酸,而是指在其上具有反应性部分的经制备的核苷酸。具体的值得关注的反应性官能团包括:氨基、巯基、亚砜氧基、氨基巯基、叠氮基、环氧化物、异硫氰酸根、异氰酸根、酸酐、一氯三嗪、二氯三嗪、一卤素或二卤素取代的吡啶、一或二取代的二嗪、马来酰亚胺、环氧化物、氮丙啶、磺酰卤、酰基卤、烷基卤、芳基卤、烷基磺酸酯、N-羟基琥珀酰亚胺酯、亚胺酯、肼、叠氮基硝基苯基、叠氮化物、3-(2-吡啶基二硫代)-丙酰胺、乙二醛、醛、碘代乙酰基、氰基甲酯、对硝基苯酯、邻硝基苯酯、羟基吡啶酯、羰基咪唑和其他这类化学基团。在一些实施方式中,反应性官能团可直接与核苷酸键合,或者它可通过连接基团与核苷酸键合。官能部分和任何接头基本上不能削弱核苷酸被加到miRNA或被标记的能力。代表性的连接基团包括通常约2-18个碳原子、往往约2-8个碳原子的含碳连接基团,其中含碳连接基团可以包括或不包括一个或多个杂原子,例如S、O、N等,和可以包括或不包括一个或多个不饱和位点。在许多实施方式中特别值得关注的是烷基连接基团,通常是1-16个碳原子、往往1-4个碳原子的低碳烷基连接基团,其中该连接基团可包括一个或多个不饱和位点。用于上述官能化靶标产生方法的官能化核苷酸(或引物),可用已知的方案制备,或者可从商家购买,例如Sigma、Roche、Ambion、Biosearch Technologies和NEN。官能团可按本领域技术人员公知的方法制备,这些方法包括4,404,289号、4,405,711号、4,337,063号和5,268,486号美国专利和1,529,202号英国专利中的代表性信息,这些专利通过引用并入本文。
经胺修饰的单核苷酸在本发明的几个实施方式中使用。经胺修饰的核苷酸是具有连接标记的活性胺基团的核苷酸。考虑到任何核糖核苷酸(G、A、U或C)或脱氧核糖核苷酸(G、A、T或C)都可进行修饰以便标记。实例包括但不限于以下经修饰的核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸:5-(3-氨基烯丙基)-UTP;8-[(4-氨基)丁基]-氨基-ATP和8-[(6-氨基)丁基]-氨基-ATP;N6-(4-氨基)丁基-ATP;N6-(6-氨基)丁基-ATP,N4-[2,2-氧基-双(乙胺)]-CTP;N6-(6-氨基)己基-ATP;8-[(6-氨基)己基]-氨基-ATP;5-炔丙基氨基-CTP;5-炔丙基氨基-UTP;5-(3-氨基烯丙基)-dUTP;8-[(4-氨基)丁基]-氨基-dATP和8-[(6-氨基)丁基]-氨基-dATP;N6-(4-氨基)丁基-dATP;N6-(6-氨基)丁基-dATP,N4-[2,2-氧基-双(乙胺)]-dCTP;N6-(6-氨基)己基-dATP;8-[(6-氨基)己基]-氨基-dATP;5-炔丙基氨基-dCTP和5-炔丙基氨基-dUTP。这种核苷酸可按照本领域技术人员公知的方法制备。此外,本领域技术人员可用相同的胺修饰如5-(3-氨基烯丙基)-CTP、GTP、ATP、dCTP、dGTP、dTTP或dUTP取代5-(3-氨基烯丙基)-UTP,来制备其他的核苷酸实体。
B.核酸的制备
核酸可通过本领域普通技术人员公知的任何技术制备,例如化学合成、酶促生产或生物生产。特地考虑到,本发明的miRNA探针是化学合成的。
在本发明的一些实施方式中,从生物样品回收或分离miRNA。miRNA可以是重组的,或者它可以是细胞的天然或内源miRNA(从细胞基因组产生)。考虑到,可对生物样品进行处理,以增强小RNA分子如miRNA的回收。美国专利申请系列号10/667,126描述了这种方法,该专利申请通过引用特地结合到本文中。一般来说,这些方法涉及到用具有胍盐和去污剂的溶液裂解细胞。
或者,可按标准的方法进行核酸合成。参见例如Itakura和Riggs(1980)及4,704,362号、5,221,619号和5,583,013号美国专利,每个文献和专利都通过引用并入本文。合成核酸(例如合成寡核苷酸)的非限制性实例,包括通过如下方式进行体外化学合成制备的核酸:使用磷酸三酯、亚磷酸盐或亚磷酰胺化学法,和例如描述于EP 266,032的固相技术(通过引用并入本文),或者通过如Froehler等人,1986和5,705,629号美国专利(各自通过引用并入本文)所描述的脱氧核苷H-膦酸酯中间体。寡核苷酸合成的各种不同机制已在例如以下各号美国专利中公开:4,659,774、4,816,571、5,141,813、5,264,566、4,959,463、5,428,148、5,554,744、5,574,146、5,602,244,每个专利都通过引用并入本文。
酶促产生的核酸的非限制性实例,包括通过酶在扩增反应如PCRTM(参见例如4,683,202号和4,682,195号美国专利,每个专利通过引用并入本文)中,或者5,645,897号美国专利(通过引用并入本文)描述的寡核苷酸的合成中产生的核酸。另参见Sambrook等人,2001(通过引用并入本文)。
寡核苷酸合成是本领域技术人员公知的。寡核苷酸合成的各种不同机制已在例如以下各号美国专利中公开:4,659,774、4,816,571、5,141,813、5,264,566、4,959,463、5,428,148、5,554,744、5,574,146、5,602,244,每个专利都通过引用并入本文。
在细胞中产生核酸的重组方法是本领域技术人员公知的。这些方法包括使用载体(病毒载体和非病毒载体)、质粒、粘粒和其他介质来将核酸递送到细胞,细胞可以是靶标细胞(例如癌细胞),或者仅仅是宿主细胞(以产生大量的期望RNA分子)。或者,这种介质可在无细胞的系统的情形中使用,只要存在用以产生RNA分子的试剂。这种方法包括Sambrook,2003、Sambrook,2001和Sambrook,1989中描述的方法,这三个文献通过引用并入本文。
C.核酸的分离
核酸可用本领域技术人员公知的技术分离,不过在特定的实施方式中,可采用分离小核酸分子和/或分离RNA分子的方法。色谱法是一种常用来将核酸与蛋白质或者与其他核酸分开或分离的方法。这种方法可涉及用凝胶基质进行的电泳、过滤柱、醇沉淀和/或其他色谱法。如果细胞的miRNA要进行使用或者要进行评估,方法通常涉及用离液剂(例如异硫氰酸胍)和/或去污剂(例如N-月桂酰基肌氨酸)裂解细胞,然后执行分离特定RNA群体的过程。
在特定的将miRNA与其他核酸分离的方法中,用聚丙烯酰胺制备凝胶基质,不过也可使用琼脂糖。凝胶可以是有浓度梯度的,或者它们可以是均匀的。可以使用板材或管材保持凝胶基质以进行电泳。核酸的分离通常采用一维电泳。板材用来制备板式凝胶,而管材(通常为玻璃或橡胶)可用来制备管式凝胶。词语“管式电泳”指使用管子或管材而不是板材来形成凝胶。进行管式电泳的材料可容易地由本领域技术人员制备,或者可从例如C.B.S.Scientific Co.,Inc.或Scie-Plas购得。
方法涉及使用有机溶剂和/或醇来分离核酸,特别是用于本发明方法和组合物的miRNA。一些实施方式在美国专利申请系列号10/667,126中描述,该专利申请通过引用并入本文。大体上说,这个公开内容提供了从细胞有效分离小RNA分子的方法,所述方法包括:向细胞裂解物加入醇溶液,将醇/裂解物混合物施加到固相载体,然后将RNA分子从固相载体上洗脱下来。在一些实施方式中,加到细胞裂解物的醇的量实现约55%-60%的醇浓度。乙醇非常适用,不过也可采用别的醇。固相载体可以为任何结构,它包括珠粒、滤器和柱子,其可包含带有电负性基团的矿物质或聚合物载体。玻璃纤维滤器或柱子对于这种分离方法特别适用。
在具体的实施方式中,miRNA分离过程包括:a)用包含胍盐的裂解溶液裂解样品中的细胞,其中产生出胍盐浓度为至少约1M的裂解物;b)用包含苯酚的提取溶液从裂解物提取miRNA分子;c)向裂解物加入醇溶液以形成裂解物/醇混合物,其中混合物中醇的浓度在约35%至约70%之间;d)将裂解物/醇混合物施加到固相载体;e)用离子溶液将miRNA分子从固相载体上洗脱下来;和f)捕获miRNA分子。通常,将样品干燥,并重悬在适合后续操作的液体和体积中。
V.标记和标记技术
在一些实施方式中,本发明涉及经标记的miRNA。考虑到miRNA可在进行标记之前先进行分离和/或纯化。与其中miRNA在进行标记之前没有进行分离或纯化的样品中的其他RNA相比,这可实现能更有效地标记miRNA的反应。在本发明的许多实施方式中,标记是非放射性标记。通常,可通过加入经标记的核苷酸(一步法),或者加入核苷酸并标记所加入的核苷酸(两步法),来对核酸进行标记。
A.标记技术
在一些实施方式中,通过以催化方式向核酸加入已经标记的(一个或多个)核苷酸,来对核酸进行标记。可将一个或多个经标记的核苷酸加到miRNA分子。参见6,723,509号美国专利,其通过引用并入本文。
在其他的实施方式中,将未经标记的(一个或多个)核苷酸以催化方式加到miRNA,未经标记的核苷酸是用可使它随后能够被标记的化学部分进行修饰。在本发明的实施方式中,化学部分是活性胺,使得核苷酸是经胺修饰的核苷酸。经胺修饰的核苷酸的实例是本领域技术人员公知的,有许多可例如从Ambion、Sigma、Jena Bioscience和TriLink市售获得。
与cDNA合成过程中对其进行标记相反的是,对miRNA进行标记的问题在于如何标记已经存在的分子。本发明涉及使用能够利用三磷酸核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸作为底物,将其加到miRNA的酶。此外,在具体的实施方式中,本发明涉及使用经修饰的二磷酸或三磷酸核糖核苷酸,它被加到miRNA的3’末端。能够加入这种核苷酸的酶包括但不限于poly(A)聚合酶、末端转移酶和多核苷酸磷酸化酶。在本发明的具体实施方式中,考虑到用来加入标记的酶不是连接酶,相反,采用的是非连接酶。末端转移酶能催化核苷酸加入到核酸的3′末端。多核苷酸磷酸化酶能不需要引物就使二磷酸核苷酸发生聚合。
B.标记
miRNA或miRNA探针上的标记可以是比色(包括可见光谱和紫外光谱,包括荧光)标记、发光标记、酶促标记或正电子发射标记(包括放射性标记)。标记可直接或间接进行检测。放射性标记包括125I、32P、33P和35S。酶促标记的实例包括碱性磷酸酶、萤光素酶、辣根过氧化物酶和-半乳糖苷酶。标记也可以是具有发光性质的蛋白质,例如绿色荧光蛋白和藻红蛋白。
考虑用作缀合物的比色标记和荧光标记包括但不限于Alexa Fluor染料;BODIPY染料,如BODIPY FL;Cascade Blue;Cascade Yellow;香豆素及其衍生物,如7-氨基-4-甲基香豆素、氨基香豆素和羟基香豆素;花青染料,如Cy3和Cy5;曙红和赤藓红;荧光素及其衍生物,如异硫氰酸荧光素;镧系离子的大环螯合物,如Quantum DyeTM;Marina Blue;Oregon Green;罗丹明染料,如罗丹明红,四甲基罗丹明和罗丹明6G;Texas Red;荧光能量转移染料,如噻唑橙乙锭异型二聚体;和TOTAB。
染料的具体实例包括但不限于以上所述的染料和以下染料:Alexa Fluor350、Alexa Fluor 405、Alexa Fluor 430、Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 500、AlexaFluor 514、Alexa Fluor 532、Alexa Fluor 546、Alexa Fluor 555、Alexa Fluor568、Alexa Fluor 594、Alexa Fluor 610、Alexa Fluor 633、Alexa Fluor 647、Alexa Fluor 660、Alexa Fluor 680、Alexa Fluor 700和Alexa Fluor 750;胺反应性BODIPY染料,如BODIPY 493/503、BODIPY 530/550、BODIPY 558/568、BODIPY 564/570、BODIPY 576/589、BODIPY 581/591、BODIPY 630/650、BODIPY 650/655、BODIPY FL、BODIPY R6G、BODIPY TMR和BODIPY-TR;Cy3、Cy5、6-FAM、异硫氰酸荧光素、HEX、6-JOE、OregonGreen 488、Oregon Green 500、Oregon Green 514、Pacific Blue、REG、罗丹明绿、罗丹明红、肾造影剂、ROX、SYPRO、TAMRA、2′,4′,5′,7′-四溴砜荧光素和TET。
荧光标记的核糖核苷酸的具体实例可从Molecular Probes获得,它们包括Alexa Fluor 488-5-UTP、荧光素-12-UTP、BODIPY FL-14-UTP、BODIPYTMR-14-UTP、四甲基罗丹明-6-UTP、Alexa Fluor 546-14-UTP、Texas Red-5-UTP和BODIPY TR-14-UTP。其他的荧光核糖核苷酸可从Amersham Biosciences获得,例如Cy3-UTP和Cy5-UTP。
荧光标记的脱氧核糖核苷酸的实例包括二硝基苯基(DNP)-11-dUTP、Cascade Blue-7-dUTP、Alexa Fluor 488-5-dUTP、荧光素-12-dUTP、Oregon Green488-5-dUTP、BODIPY FL-14-dUTP、罗丹明绿-5-dUTP、Alexa Fluor 532-5-dUTP、BODIPY TMR-14-dUTP、四甲基罗丹明-6-dUTP、Alexa Fluor 546-14-dUTP、AlexaFluor 568-5-dUTP、Texas Red-12-dUTP、Texas Red-5-dUTP、BODIPYTR-14-dUTP、Alexa Fluor 594-5-dUTP、BODIPY 630/650-14-dUTP、BODIPY650/665-14-dUTP、Alexa Fluor 488-7-OBEA-dCTP、Alexa Fluor546-16-OBEA-dCTP、Alexa Fluor 594-7-OBEA-dCTP、Alexa Fluor647-12-OBEA-dCTP。
考虑到核酸可用两种不同的标记进行标记。此外,在本发明的方法中可采用荧光共振能量转移技术(FRET)(例如Klostermeier等人,2002;Emptage,2001;Didenko,2001,每个文献通过引用并入本文)。
或者,标记可以本身不是可检测的,但可以是间接可检测的,或者能使靶标核酸得以分离或分开。例如,标记可以是生物素、地高辛、多价阳离子、螯合基团和其他配体,包括抗体的配体。
C.显示技术
有多种用以显示或检测经标记的核酸的技术是现成可用的。这些技术包括显微镜检术、阵列、荧光测定术、光循环仪(Light cycler)或其他实时PCR仪;FACS分析、闪烁计数器、磷光影像分析仪、盖格计数器、MRI、CAT、基于抗体的检测方法(蛋白质印迹、免疫荧光、免疫组织化学)、组织化学技术、HPLC(Griffey等人,1997)、光谱法、毛细管凝胶电泳(Cummins等人,1996)、光谱法、质谱、放射技术和质量平衡技术(mass balance technique)。
当采用两个或多个差异着色的标记时,可采用荧光共振能量转移技术(FRET)来表征一个或多个核苷酸的缔合。此外,本领域普通技术人员熟知显示、鉴定和表征经标记的核酸的方法,因此这些方案可作为本发明的一部分使用。可使用的工具的实例还包括荧光显微镜术、BioAnalyzer、读板器、Storm(MolecularDynamics)、阵列扫描仪、FACS(荧光激活细胞分选仪)或者任何具有激发和检测荧光分子的能力的仪器。
VI.试剂盒
本文描述的任何组合可包含在试剂盒中。在非限制性的实例中,试剂盒可包括用以采用阵列、核酸扩增和/或杂交来分离miRNA、标记miRNA和/或评估miRNA群体的试剂,以及用以从血液样品制备样品的试剂。试剂盒还可包括用以产生或合成miRNA探针的试剂。试剂盒因此将在合适的容器器具中,包含用以通过掺入经标记的核苷酸或者随后被标记的未经标记的核苷酸来标记miRNA的酶。在某些方面,试剂盒可包括扩增试剂。在其他方面,试剂盒可包括各种载体,如玻璃、尼龙、聚合珠粒等,和/或用以偶联任何探针和/或靶标核酸的试剂。它还可包括一种或多种缓冲液,如反应缓冲液、标记缓冲液、洗涤缓冲液或杂交缓冲液、用以制备miRNA探针的化合物和用以分离miRNA的成分。本发明的其他试剂盒可包括用以制备包含miRNA的核酸阵列的成分,因此可包括例如固相载体。
特地考虑到用以执行本文所述的本发明方法的试剂盒。在一些实施方式中,有用以制备用于多重标记的miRNA的试剂盒,和用以制备miRNA探针和/或miRNA阵列的试剂盒。在这些实施方式中,试剂盒在合适的容器器具中包含以下成分中的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12个或更多个:(1)poly(A)聚合酶;(2)未经修饰的核苷酸(G、A、T、C和/或U);(3)经修饰的核苷酸(经标记的或未经标记的);(4)poly(A)聚合酶缓冲液;(5)至少一个微过滤器;(6)可与核苷酸连接的标记;(7)至少一个miRNA探针;(8)反应缓冲液;(9)miRNA阵列或用以制作这种阵列的成分;(10)乙酸;(11)醇;(12)用以制备、分离、富集和纯化miRNA或miRNA探针或阵列的溶液。其他的试剂包括通常用于操纵RNA的试剂,如甲酰胺、荷载染料、核糖核酸酶抑制剂和DNA酶。
在具体的实施方式中,本发明的试剂盒包括含有本申请中所述的miRNA探针的阵列。阵列可具有对应于生物的或者特定条件下特定组织或器官的所有已知miRNA的探针,或者这些探针的子集(subset)。本发明阵列上的探针子集,可以是或者包括经鉴定为与特定诊断性、治疗性或预后性应用相关的那些探针。例如,阵列可含有一个或多个指示或暗示以下方面的探针:(1)疾病或病症(急性髓性白血病);(2)对特定药物或治疗的易感性或抗性;(3)对来自药物或物质的毒性的易感性;(4)疾病或病症的发展阶段或严重性(预后);和(5)对疾病或病症的遗传易感性。
对于任何试剂盒实施方式,包括阵列,可以有含有或者可用来扩增这样的序列的核酸分子,该序列是本文描述的任何SEQ ID的全部或部分的变体,或者与本文描述的任何SEQ ID的全部或部分有同一性或互补性。在某些实施方式中,本发明的试剂盒或阵列可含有一个或多个由本文所述SEQ ID所表示的miRNA的探针。任何上文讨论的核酸都可作为试剂盒的一部分执行。
试剂盒的各成分可包装在含水介质中,或者可以以冻干形式包装。试剂盒的容器器具通常会包括至少一个其中装入某个成分、该成分优选经适当等分的小瓶、试管、烧瓶、瓶子、注射器或其他容器器具。在试剂盒中有超过一个成分(标记试剂和标记可包装在一起)的情况中,试剂盒通常还会含有其中可单独装入另外的成分的第二、第三个或其他另外容器。但是,各成分的各种组合可包含在小瓶中。本发明的试剂盒通常还会包括用来装核酸的器具,和任何其他严密密封以供商业销售的试剂容器。这种容器可包括注塑或吹塑的塑料容器,期望的小瓶保持在所述容器中。
当试剂盒的各成分是在一个和/或多个液体溶液中提供时,液体溶液是水溶液,特别优选的是无菌水溶液。
但是,试剂盒的各成分可作为干燥粉末提供。当各试剂和/或成分作为干燥粉末提供时,粉末可通过加入合适的溶剂进行重构。预想到,还可在另一容器器具中提供溶剂。在一些实施方式中,标记染料作为干燥粉末提供。考虑到,在本发明的试剂盒中提供10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、120、120、130、140、150、160、170、180、190、200、300、400、500、600、700、800、900、1000g或至少或至多这些数量的干燥染料。接着染料可重悬在任何合适的溶剂如DMSO中。
这种试剂盒还可包括有助于分离经标记的miRNA的成分。它还可包括能保藏或维持miRNA或者能使miRNA免遭降解的成分。这种成分可以是无RNA酶的,或者是受保护免遭RNA酶的影响。这种试剂盒通常会以合适的方式包含每单个试剂或溶液的不同容器。
试剂盒还会包括有关应用试剂盒各成分以及使用试剂盒中没有包括的任何其他试剂的说明书。说明书可包括可执行的各种变化方案。
本发明的试剂盒还可包括以下的一个或多个:对照RNA;无核酸酶的水;无RNA酶的容器,如1.5ml管子;无RNA酶的洗脱管;PEG或葡聚糖;乙醇;乙酸;乙酸钠;乙酸铵;胍盐;去污剂;核酸大小标记;无RNA酶的管尖;和RNA酶或DNA酶抑制剂。
考虑到这些试剂是本领域试剂盒的各实施方式。但是,这种试剂盒并不局限于以上所述的具体项目,而是可包括任何用来操纵或表征miRNA的试剂。
实施例
给出以下实施例目的是说明本发明的各个实施方式,并不意在以任何方式限制本发明。本领域技术人员会容易理解到,本发明很适合于执行本文提到的目标和获得本文提到的目的和优点,以及实现本文暗含的那些目标、目的和优点。本发明的实施例连同本文描述的方法,目前代表着优选的实施方式,是示例性的,并不意在作为对本发明范围的限制。涵盖在由权利要求书的范围所限定的本发明精神内的变化方案和其他用途,本领域技术人员是会想到的。除另有指明外,目录号指代的是可按该号码从Ambion,Inc.The RNA Company获得的产品。
实施例1
HSA-MIR-16转染后的基因表达分析
miRNA据认为主要在翻译水平上影响基因表达。翻译调节导致蛋白质表达的向上或向下变化,这一变化可导致进而受这些蛋白质调节的下游基因产物和基因的活性和表达的变化。这些调节作用会作为全局mRNA表达谱的变化来显现。此外,最近已报道,在一些情况中,miRNA可降低它们的直接靶标的mRNA水平(Bagga等人,2005;Lim等人,2005),且这种变化可在微阵列基因表达分析时观察到。进行了微阵列基因表达分析,以鉴定被hsa-miR-16误调节的基因。
对于三个时间点的每一个,将合成的前体miR-16(Ambion)反转染到A549细胞的一式四份样品中。细胞用siPORT NeoFX(Ambion),按照生产商的推荐使用以下参数进行转染:6孔板中每孔200,000个细胞、5.0 1的NeoFX、2.5ml中30nM终浓度的miRNA。转染4小时、24小时和72小时后收获细胞。总RNA用RNAqueous-4PCR(Ambion)按照生产商推荐的方案进行提取。
mRNA阵列分析由Asuragen Services(Austin,TX)按照该公司的标准操作程序进行。使用MessageAmpTM II-96aRNA Amplification Kit(Ambion,目录号1819),将2μg的总RNA用于进行靶标制备和生物素标记。cRNA产量用AgilentBioanalyzer 2100毛细管电泳方案进行定量。采用生产商的推荐和以下参数,使经标记的靶标与Affymetrix mRNA阵列(Human HG-U133A 2.0阵列)杂交。杂交是在Affymetrix Model 640杂交炉中45℃进行16小时。将阵列洗涤,在Affymetrix FS450 Fluidics station上染色,运行wash script Midi_euk2v3_450。将阵列在Affymetrix GeneChip Scanner 3000上扫描。用Affymetrix StatisticalAlgorithm MAS 5.0(GCOS v1.4),产生有关图象信号数据、组平均值、带显著性标签的p值、对数比和阵列上每个基因的基因注释的概要。在含有Affymetrix数据的文件(cabinet)和结果文件中,及在含有阵列的主要图象和经处理细胞强度的文件(cel)中,对数据进行报道。数据对两个阴性对照微小RNA序列的平均值所观察到的作用进行归一化,然后一起取平均值来表示。对其表达水平与平均阴性对照相差达至少0.7log2的基因,汇编成一览表。表1显示微阵列基因表达分析的结果。
表1.用前体miR hsa-miR-16转染人癌细胞后,表达提高(正值)或降低(负值)的基因
  基因符号   参考序列转录物ID   log2
  ABCB6///ATG9A   NM_005689///NM_024085   -0.774183
  ACOX2   NM_003500   -0.747677
  ACTR2   NM_001005386///NM_005722   0.706621
ADARB1   NM_001033049///NM_001112///NM_015833///NM_015834 1.12042
  ADRB2   NM_000024   0.822471
  ANKRD12   NM_015208   0.920296
  AOX1   NM_001159   0.71218
  ARHGDIA   NM_004309   -1.31009
  ARHGDIB   NM_001175   0.974886
  ARL2   NM_001667   -1.26863
  ARL2BP   NM_012106   1.35222
  ATP6V0E   NM_003945   1.25179
  AXL   NM_001699///NM_021913   1.17272
  BAMBI   NM_012342   -0.890685
C4BPB   NM_000716///NM_001017364///NM_001017365///NM_001017366///NM_001017367 1.48739
  CA12   NM_001218///NM_206925   -1.09634
  CCND1   NM_053056   -0.747979
  CCNG2   NM_004354   0.94188
  CDC37L1   NM_017913   -0.851037
  CDH1   NM_004360   -0.735543
  CDH17   NM_004063   -0.805907
  CDKN2C   NM_001262///NM_078626   -0.77508
  CDS2   NM_003818   -0.948554
  CFH///CFHL1   NM_000186///NM_001014975///NM_002113   -0.917773
  CGI-48   NM_016001   1.48424
  CHAF1A   NM_005483   -0.704031
  CHUK   NM_001278   -1.05995
  COL11A1   NM_001854///NM_080629///NM_080630   0.7736
  COL1A1   NM_000088   -0.705029
  CPS1   NM_001875   -0.713235
  CTGF   NM_001901   1.22906
  CYP4F11   NM_021187   -0.829511
  CYP4F3   NM_000896   -1.12563
  DDAH1   NM_012137   0.822493
  DIO2   NM_000793///NM_001007023///NM_013989   0.814143
  DSU   NM_018000   0.74556
  DUSP1   NM_004417   0.773277
  E2F8   NM_024680   -0.773773
  EEF1D   NM_001960///NM_032378   0.95742
  EFEMP1   NM_004105///NM_018894   0.882177
  ENO1   NM_001428   1.00751
  FBXO11   NM_012167///NM_018693///NM_025133   0.924295
  FGF2   NM_002006   -1.19115
  FGFR4   NM_002011///NM_022963///NM_213647   -0.872234
  FGG   NM_000509///NM_021870   -0.813252
  FLJ13910   NM_022780   0.846746
  FNBP1   NM_015033   0.743257
  GALNT7   NM_017423   -1.01457
  GBP1   NM_002053   0.807432
  HAS2   NM_005328   -0.861488
  HEG   XM_087386   0.738182
  IFI16   NM_005531   0.829221
  INHBC   NM_005538   0.797435
  INSL4   NM_002195   -0.916801
  KCNJ2   NM_000891   0.857436
  KIAA0485   ---   0.743897
  KLF4   NM_004235   -0.992125
  KRT7   NM_005556   1.17333
  LCN2   NM_005564   -0.811381
  LRP12   NM_013437   -0.882349
  MAP7   NM_003980   -0.940371
  MCL1   NM_021960///NM_182763   1.11653
  MYL9   NM_006097///NM_181526   1.15849
  NAB1   NM_005966   -0.724633
NALP1   NM_001033053///NM_014922///NM_033004///NM_033006///NM_033007 0.914964
  NF1   NM_000267   -1.03572
  NNMT   NM_006169   0.997492
  NPC1   NM_000271   0.911858
  NUCKS   NM_022731   2.31221
NUPL1   NM_001008564///NM_001008565///NM_014089 -0.908999
  PGK1   NM_000291   1.70175
  PHACTR2   NM_014721   -1.1275
  PLA2G4A   NM_024420   -0.878708
  PLSCR4   NM_020353   -1.92309
  PMCH   NM_002674   1.09088
  PODXL   NM_001018111///NM_005397   0.927375
  PPAP2C   NM_003712///NM_177526///NM_177543   -0.792886
  PRO1843   ---   1.14274
  PTENP1   ---   0.952354
  PTGS2   NM_000963   -1.72596
  PTK9   NM_002822///NM_198974   0.970336
  PTPN12   NM_002835   0.711122
QKI   NM_006775///NM_206853///NM_206854///NM_206855 0.795792
  RAB2   NM_002865   1.24122
  RAFTLIN   NM_015150   1.16163
  RBL1   NM_002895///NM_183404   -0.766312
  RDX   NM_002906   0.704751
  RHEB   NM_005614   1.07577
  RIP   NM_001033002///NM_032308   1.34286
  RPL14   NM_001034996///NM_003973   0.934016
  RPL38   NM_000999   1.3638
  RPS11   NM_001015   1.22134
  RPS6KA3   NM_004586   -0.875649
  RPS6KA5   NM_004755///NM_182398   0.806899
  S100P   NM_005980   -0.840949
  SCARB2   NM_005506   0.857602
SEPT6///N-PAC   NM_015129///NM_032569///NM_145799///NM_145800///NM_145802 0.703914
  SKP2   NM_005983///NM_032637   0.728768
  SLC11A2   NM_000617   -1.01869
  SLC4A7   NM_003615   -0.80415
  SMARCA2   NM_003070///NM_139045   0.967136
  SPARC   NM_003118   1.07583
  STC1   NM_003155   0.787502
  SULT1C1   NM_001056///NM_176825   1.12689
  SUMO2   NM_001005849///NM_006937   0.792739
SYNE1   NM_015293///NM_033071///NM_133650///NM_182961 0.852103
  TACC1   NM_006283   -1.02015
  TAGLN   NM_001001522///NM_003186   1.8698
  TFG   NM_001007565///NM_006070   0.981989
  THBD   NM_000361   0.840966
  THBS1   NM_003246   -0.872199
  THUMPD1   NM_017736   -0.721243
  TMEM45A   NM_018004   -0.874868
  TNFSF9   NM_003811   -1.13877
  TOX   NM_014729   1.16189
TPM1   NM_000366///NM_001018004///NM_001018005///NM_001018006///NM_001018007// 0.792231
  TRA1   NM_003299   2.10346
  TRIM22   NM_006074   1.24509
  TXN   NM_003329   1.37224
UBE2I   NM_003345///NM_194259///NM_194260///NM_194261 0.882609
  UBE2L6   NM_004223///NM_198183   0.709343
  USP34   NM_014709   0.818893
  VDAC3   NM_005662   1.14436
  VIL2   NM_003379   0.899532
  WISP2   NM_003881   0.703121
  XTP2   NM_015172   1.05499
  ZBED2   NM_024508   0.770913
对表1中所列的基因的表达水平的操纵,代表着针对这样的癌症和其他疾病的潜在有用疗法,在所述癌症和其他疾病中,hsa-miR-16表达的提高或降低在疾病中发挥作用。
实施例2:
受HSA-MIR-16影响的细胞路径
hsa-miR-16对基因表达的误调控(表1)影响代表癌症和其它疾病和病症的控制的潜在治疗靶标的许多细胞路径。发明人确定了受hsa-miR-16表达所诱导的调控级联影响的细胞遗传路径的身份和性质。使用Ingenuity Pathways Analysis(
Figure A20078005104400691
Systems,Redwood City,CA)执行细胞路径分析。hsa-miR-16在A549细胞中过度表达后最受影响的路径示于表2中。
表2.hsa-miR-16在人类癌细胞中过度表达后显著受影响的功能细胞路径
这些数据证明hsa-miR-16直接或间接影响众多代谢、细胞增殖、细胞发育和细胞周期相关基因的表达,且因此主要影响与细胞生长、发育和增殖相关的功能路径。这些细胞路径都在各种癌症的出现和发展中具有必不可少的作用。表2所示的细胞路径中的基因表达水平的操控代表癌症和hsa-miR-16的增加或减少表达在疾病中具有作用的其它疾病的潜在有用疗法。
实施例3:
预测的HSA-MIR-16的基因靶标
使用专有算法miRNATargetTM(Asuragen)预测用于结合hsa-miR-16-1且受hsa-miR-16-1调控的基因靶标且其示于表3中。
表3.hsa-miR-16的预测靶标基因
  基因符号   参考序列转录物  描述
  AAA1   NM_207285  AAA1蛋白同种型III
  AACS   NM_023928  乙酰乙酰辅酶A合成酶
  AADAT   NM_016228  α-氨基己二酸转氨酶
  AASDHPPT   NM_015423  氨基己二酸半醛
  AATF   NM_012138  拮抗凋亡转录因子
  ABAT   NM_000663  4-氨基丁酸转氨酶前体
  ABCA1   NM_005502  ATP结合盒,亚族A成员1
  ABCA3   NM_001089  ATP结合盒,亚族A成员3
  ABCB8   NM_007188  ATP结合盒,亚族B成员8
  ABCB9   NM_203445  ATP结合盒,亚族B(MDR/TAP)
  ABCC10   NM_033450  ATP结合盒,亚族C成员10
  ABCC13   NM_138726  ATP结合盒蛋白C13同种型a
  ABCC3   NM_020038  ATP结合盒,亚族C成员3
  ABCC5   NM_005688  ATP结合盒,亚族C成员5
  ABCF1   NM_001025091  ATP结合盒,亚族F成员1
  ABCF2   NM_005692  ATP结合盒,亚族F成员2
  ABCF3   NM_018358  ATP结合盒,亚族F(GCN20)
  ABCG4   NM_022169  ATP结合盒,亚族G成员4
  ABHD11   NM_031295  含自水解酶结构域11同种型4
  ABHD13   NM_032859  假定蛋白LOC84945
  ABHD2   NM_007011  含α/β水解酶结构域的蛋白质
  ABI3   NM_016428  NESH蛋白
  ABL1   NM_005157  v-abl Abelson鼠类白血病病毒致癌基因
  ABLIM1   NM_001003407  肌动蛋白结合LIM蛋白1同种型b
  ABTB2   NM_145804  锚蛋白重复序列和含BTB(POZ)结构域
  ACAA1   NM_001607  乙酰辅酶A酰基转移酶1
  ACACA   NM_198834  乙酰辅酶A羧化酶α同种型1
  ACACB   NM_001093  乙酰辅酶A羧化酶β
  ACAD9   NM_014049  酰基辅酶A脱氢酶家族成员9
  ACCN4   NM_018674  氨氯吡嗪脒(amiloride)敏感性阳离子通道4同种型1
  ACE   NM_152831  血管紧张素I转化酶同种型3
  ACOT11   NM_147161  硫酯酶,动物脂肪相关同种型BFIT2
  ACOT7   NM_007274  酰基辅酶A硫酯酶7同种型hBACHa
  ACOT8   NM_183385  过氧化物酶体酰基辅酶A硫酯酶1同种型b
  ACOX1   NM_004035  酰基辅酶A氧化酶同种型a
  ACOX3   NM_003501  酰基辅酶A氧化酶3,姥鲛烷酰基(pristanoyl)
  ACP2   NM_001610  溶酶体酸性磷酸酶2前体
  ACPT   NM_080789  睾丸酸性磷酸酶同种型b前体
  ACSBG1   NM_015162  脂沉积蛋白(lipidosin)
  ACSBG2   NM_030924  泡泡糖(bubblegum)相关蛋白质
  ACSL1   NM_001995  酰基辅酶A合成酶长链家族成员1
  ACSL4   NM_004458  酰基辅酶A合成酶长链家族成员4
  ACSL5   NM_016234   酰基辅酶A合成酶长链家族成员5
  ACSS2   NM_018677   酰基辅酶A合成酶短链家族成员2
  ACTR1A   NM_005736   ARP1肌动蛋白相关蛋白1同源物A,
  ACTR2   NM_001005386   肌动蛋白相关蛋白2同种型a
  ACTR3B   NM_020445   肌动蛋白相关蛋白3-β同种型1
  ACTR8   NM_022899   肌动蛋白相关蛋白8
  ACVR2A   NM_001616   激活素A受体,IIA型前体
  ADAM10   NM_001110   ADAM金属肽酶结构域10
  ADAM11   NM_002390   ADAM金属肽酶结构域11前蛋白原
  ADAM12   NM_021641   ADAM金属肽酶结构域12同种型2
  ADAMTS1   NM_006988   ADAM金属肽酶含凝血栓蛋白血小板反应蛋白I型
  ADAMTS13   NM_139028   ADAM金属肽酶含凝血栓蛋白血小板反应蛋白I型
  ADAMTS18   NM_199355   ADAM金属肽酶含凝血栓蛋白血小板反应蛋白I型
  ADAMTS3   NM_014243   ADAM金属肽酶含凝血栓蛋白血小板反应蛋白I型
  ADAMTS4   NM_005099   ADAM金属肽酶含凝血栓蛋白血小板反应蛋白I型
  ADAMTS5   NM_007038   ADAM金属肽酶含凝血栓蛋白血小板反应蛋白I型
  ADAMTS6   NM_197941   ADAM金属肽酶含凝血栓蛋白血小板反应蛋白I型
  ADAMTSL1   NM_139238   ADAMTS类1同种型1
  ADAMTSL2   NM_014694   ADAMTS类2
  ADAMTSL3   NM_207517   ADAMTS类3
  ADAR   NM_001025107   腺苷脱氨酶,RNA特异性同种型d
  ADARB1   NM_001033049   RNA特异性腺苷脱氨酶B1同种型4
  ADARB2   NM_018702   腺苷脱氨酶,RNA特异性,B2
  ADCY1   NM_021116   脑腺苷酸环化酶1
  ADCY7   NM_001114   腺苷酸环化酶7
  ADCY9   NM_001116   腺苷酸环化酶9
  ADD1   NM_001119   内收蛋白1(α)同种型a
  ADD2   NM_017482   内收蛋白2同种型b
  ADM2   NM_024866   肾上腺髓质素2前体
  ADORA1   NM_000674   腺苷A1受体
  ADORA2A   NM_000675   腺苷A2a受体
  ADPRH   NM_001125   ADP-核糖精氨酸水解酶
  ADRA1B   NM_000679   α-1B-肾上腺素能受体
  ADRA2A   NM_000681   α-2A-肾上腺素能受体
  ADRA2B   NM_000682   α-2B-肾上腺素能受体
  ADRB2   NM_000024   肾上腺素能β-2受体表面
  ADRBK1   NM_001619   β肾上腺素能受体激酶1
  ADSS   NM_001126   腺苷琥珀酸合成酶
  AEBP2   NM_153207   AE结合蛋白2
  AFAP   NM_021638   肌动蛋白纤丝相关蛋白
  AFF2   NM_002025   脆性X智力低下2
  AFF4   NM_014423   来自5q31的ALL1融合基因
  AFM   NM_001133   阿法明(afamin)前体
  AGA   NM_000027   天冬氨酰葡糖胺酶前体
  AGPAT2   NM_001012727   1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶2
  AGPAT4   NM_001012733   1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶4
  AGPAT5   NM_018361   1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶5
  AGPAT6   NM_178819   溶血磷脂酸酰基转移酶ζ
  AGPAT7   NM_153613   含PLSC结构域的蛋白质
  AGRN   NM_198576   集聚蛋白(agrin)
  AGTR2   NM_000686  血管紧张素II受体,2型
  AHCYL1   NM_006621  S-腺苷高半胱胺酸水解酶样1
  AHNAK   NM_024060  AHNAK核蛋白同种型2
  AHSA1   NM_012111  AHA1,热休克90kDa蛋白之活化因子
  AIM1   NM_001624  黑素瘤1中不存在
  AK3L1   NM_001005353  腺苷酸激酶3样1
  AKAP1   NM_003488  A-激酶锚定蛋白1同种型1前体
  AKAP11   NM_016248  A-激酶锚定蛋白11同种型1
  AKAP12   NM_005100  A-激酶锚定蛋白12同种型1
  AKAP13   NM_006738  A-激酶锚定蛋白13同种型1
  AKNA   NM_030767  AT钩转录因子
  AKR1CL1   NM_001007536  醛酮还原酶家族1,成员C样1
  AKR1D1   NM_005989  醛酮还原酶家族1,成员D1
  AKT3   NM_005465  v-akt鼠类胸腺瘤病毒致癌基因同源物3
  ALAD   NM_000031  δ-氨基乙酰丙酸脱水酶同种型b
  ALDH1A3   NM_000693  醛脱氢酶1A3
  ALDH3A2   NM_000382  醛脱氢酶3A2同种型2
  ALDH3B1   NM_000694  醛脱氢酶3B1同种型a
  ALDH5A1   NM_001080  醛脱氢酶5A1前体,同种型2
  ALKBH3   NM_139178  alkB,烷基化修复同源物3
  ALKBH5   NM_017758  假定蛋白LOC54890
  ALKBH6   NM_032878  假定蛋白LOC84964同种型2
  ALOX12   NM_000697  花生四烯酸12-脂肪氧化酶
  ALPK3   NM_020778  α-激酶3
  ALPPL2   NM_031313  胎盘样碱性磷酸酶
  ALS2   NM_020919  alsin
  ALS2CL   NM_147129  ALS2C末端样同种型1
  ALS2CR16   NM_205543  肌萎缩侧索硬化症2(青少年)
  ALS2CR2   NM_018571  肌萎缩侧索硬化症2(青少年)
  AMIGO3   NM_198722  两性蛋白(amphoterin)诱导基因和ORF3
  AMMECR1   NM_001025580  AMMECR1蛋白同种型2
  AMOT   NM_133265  血管动蛋白(angiomotin)
  AMOTL1   NM_130847  血管动蛋白样1
  AMOTL2   NM_016201  血管动蛋白样2
  AMPD2   NM_004037  腺苷单磷酸脱氨酶2(同种型L)
  AMPD3   NM_000480  红细胞腺苷单磷酸脱氨酶
  AMT   NM_000481  氨甲基转移酶(甘氨酸裂解系统)
  ANAPC11   NM_001002244  APC11后期促进复合物亚单位11
  ANAPC13   NM_015391  后期促进复合物亚单位13
  ANGEL1   NM_015305  angel同源物1
  ANK1   NM_000037  锚蛋白1同种型3
  ANK2   NM_001148  锚蛋白2同种型1
  ANK3   NM_001149  锚蛋白3同种型2
  ANKRD11   NM_013275  锚蛋白重复序列结构域11
  ANKRD12   NM_015208  锚蛋白重复序列结构域12
  ANKRD13B   NM_152345  假定蛋白LOC124930
  ANKRD13D   NM_207354  锚蛋白重复序列结构域13家族,成员D
  ANKRD15   NM_015158  锚蛋白重复序列结构域蛋白质15同种型a
  ANKRD17   NM_032217  锚蛋白重复序列结构域蛋白质17同种型a
  ANKRD19   NM_001010925  锚蛋白重复序列结构域19
  ANKRD29   NM_173505   锚蛋白重复序列结构域29
  ANKRD39   NM_016466   锚蛋白重复序列结构域39
  ANKRD46   NM_198401   锚蛋白重复序列结构域46
  ANKRD53   NM_024933   假定蛋白LOC79998
  ANKS1A   NM_015245   锚蛋白重复序列和不育α基序结构域
  ANKS4B   NM_145865   含有harmonin相互作用性锚蛋白重复序列
  ANKZF1   NM_018089   含有锚蛋白重复序列和锌指结构域
  ANLN   NM_018685   苯胺素(anillin),肌动蛋白结合蛋白(小片同源物
  ANP32E   NM_030920   酸性(富含亮氨酸)核磷蛋白32
  ANXA11   NM_001157   膜连蛋白(annexin)A11
  AP1G1   NM_001030007   衔接蛋白相关蛋白复合物1,γ1
  AP1GBP1   NM_007247   AP1γ亚单位结合蛋白1同种型1
  AP1S1   NM_001283   衔接蛋白相关蛋白复合物1,σ1
  AP1S2   NM_003916   衔接蛋白相关蛋白复合物1,σ2
  AP2A1   NM_014203   衔接蛋白相关蛋白复合物2,α1
  AP2A2   NM_012305   衔接蛋白相关蛋白复合物2,α2
  AP2B1   NM_001030006   衔接蛋白相关蛋白复合物2,β1
  AP3B1   NM_003664   衔接蛋白相关蛋白复合物3,β1
  AP3M1   NM_012095   衔接蛋白相关蛋白复合物3,μ1亚单位
  AP3S2   NM_005829   衔接蛋白相关蛋白复合物3,σ2
  APBA1   NM_001163   淀粉样蛋白βA4前体结合蛋白
  APBB3   NM_133175   淀粉样蛋白β前体结合蛋白家族
  APC2   NM_005883   结肠腺瘤性息肉病2
  APLN   NM_017413   孤儿G蛋白偶联受体APJ内源性配体(apelin)前蛋白原
  APLP2   NM_001642   淀粉样蛋白β(A4)前体样蛋白2
  APOA4   NM_000482   载脂蛋白A-IV前体
  APOA5   NM_052968   载脂蛋白AV
  APOBEC2   NM_006789   载脂蛋白BmRNA编辑酶,催化性
  APOC3   NM_000040   载脂蛋白C-III前体
  APP   NM_000484   淀粉样蛋白βA4蛋白前体,同种型a
  APPBP1   NM_001018159   淀粉样蛋白β前体蛋白结合蛋白1
  APPBP2   NM_006380   淀粉样蛋白β前体蛋白结合蛋白
  APTX   NM_017692   aprataxin同种型d
  AQP1   NM_198098   水通道蛋白(aquaporin)1
  AQP11   NM_173039   水通道蛋白11
  AQP2   NM_000486   水通道蛋白2
  AQP4   NM_001650   水通道蛋白4同种型a
  AQP8   NM_001169   水通道蛋白8
  ARC   NM_015193   活性调控,细胞骨架相关
  ARCN1   NM_001655   古蛋白(archain)
  ARF3   NM_001659   ADP核糖基化因子3
  ARFGAP1   NM_018209   ADP核糖基化因子GTPase活化
  ARFRP1   NM_003224   ADP核糖基化因子相关蛋白1
  ARHGAP1   NM_004308   Rho GTPase活化蛋白1
  ARHGAP10   NM_024605   Rho GTPase活化蛋白10
  ARHGAP12   NM_018287   Rho GTPase活化蛋白12
  ARHGAP18   NM_033515   Rho GTPase活化蛋白18
  ARHGAP19   NM_032900   Rho GTPase活化蛋白19
  ARHGAP20   NM_020809   Rho GTPase活化蛋白20
  ARHGAP22   NM_021226   Rho GTPase活化蛋白2
  ARHGAP26   NM_015071   与病灶有关的GTPase调控因子
  ARHGAP27   NM_199282   Rho GTPase活化蛋白27
  ARHGAP28   NM_001010000   Rho GTPase活化蛋白28同种型a
  ARHGAP4   NM_001666   Rho GTPase活化蛋白4
  ARHGAP5   NM_001030055   Rho GTPase活化蛋白5同种型a
  ARHGDIA   NM_004309   Rho GDP解离抑制剂(GDI)α
  ARHGDIG   NM_001176   Rho GDP解离抑制剂(GDI)γ
  ARHGEF10   NM_014629   Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子10
  ARHGEF12   NM_015313   Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)12
  ARHGEF4   NM_015320   Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子4同种型
  ARHGEF5   NM_001002861   rho鸟嘌呤核苷酸交换因子5同种型
  ARHGEF7   NM_145735   Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子7同种型
  ARHGEF9   NM_015185   Cdc42鸟嘌呤交换因子9
  ARID5A   NM_006673   富含AT的相互作用结构域5A同种型2
  ARL1   NM_001177   ADP核糖基化因子样1
  ARL10   NM_173664   ADP核糖基化因子样10
  ARL11   NM_138450   ADP核糖基化因子样11
  ARL2   NM_001667   ADP核糖基化因子样2
  ARL3   NM_004311   ADP核糖基化因子样3
  ARL5B   NM_178815   ADP核糖基化因子样8
  ARL6IP5   NM_006407   ADP核糖基化因子样6相互作用
  ARL8B   NM_018184   ADP核糖基化因子样10C
  ARMC1   NM_018120   含有阿马迪洛(armadillo)重复序列的蛋白质
  ARMC5   NM_024742   含有阿马迪洛重复序列,5
  ARMC6   NM_033415   含有阿马迪洛重复序列,6
  ARMCX1   NM_016608   含有阿马迪洛重复序列,X连锁1
  ARMCX2   NM_014782   ALEX2蛋白
  ARNT   NM_001668   芳香烃受体核转位蛋白
  ARNT2   NM_014862   芳香烃受体核转位蛋白
  ARPC1B   NM_005720   肌动蛋白相关蛋白2/3复合物亚单位1B
  ARPP-19   NM_006628   环AMP磷蛋白,19kD
  ARPP-21   NM_001025068   环AMP调控的磷蛋白,21kD
  ARRDC4   NM_183376   含有视紫红质抑制蛋白(arrestin)结构域4
  ARSD   NM_001669   芳基硫酸酯酶D同种型a前体
  ARTS-1   NM_016442   1型肿瘤坏死因子受体脱落
  ARVCF   NM_001670   阿马迪洛重复序列蛋白质
  AS3MT   NM_020682   砷(+3氧化态)甲基转移酶
  ASB1   NM_016114   含锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白质
  ASB13   NM_024701   含锚蛋白重复序列和SOCS盒蛋白质
  ASB15   NM_080928   含锚蛋白重复序列和SOCS盒15
  ASB6   NM_017873   含锚蛋白重复序列和SOCS盒6同种型
  ASCC3   NM_022091   活化信号辅整合因子1复合物亚单位
  ASCL2   NM_005170   无刚毛鳞甲(achaete-scute)复合物同源物样2
  ASNSD1   NM_019048   含天冬酰胺合成酶结构域1
  ASPH   NM_032466   天冬氨酸β-羟化酶同种型c
  ASTN   NM_004319   星形肌动蛋白(astrotactin)同种型1
  ASXL1   NM_015338   其它性梳样1
  ASXL2   NM_018263   其它性梳样2
  ATAD4   NM_024320   ATPase家族,含AAA结构域4
  ATF3   NM_004024   活化转录因子3同种型2
  ATF6   NM_007348   活化转录因子6
  ATF7IP2   NM_024997   活化转录因子7相互作用
  ATG4B   NM_013325   APG4自噬4同源物B同种型a
  ATG4D   NM_032885   APG4自噬4同源物D
  ATG9A   NM_024085   APG9自噬9样1
  ATG9B   NM_173681   一氧化氮合酶3反义
  ATHL1   NM_025092   假定蛋白LOC80162
  ATN1   NM_001007026   萎缩蛋白(atrophin)-1
  ATOH8   NM_032827   无调同源物8
  ATP11A   NM_015205   ATPase,VI类,11A型同种型a
  ATP11C   NM_001010986   ATPase,VI类,11C型同种型b
  ATP13A2   NM_022089   ATPase,13A2型
  ATP1B2   NM_001678   Na+/K+-ATPase β2亚单位
  ATP1B4   NM_012069   ATPase,(Na+)/K+转运,β4
  ATP2A1   NM_004320   ATPase,Ca++转运,快速颤搐1同种型
  ATP2A3   NM_005173   肌质网Ca2+-ATPase同种型
  ATP2B2   NM_001001331   质膜钙ATPase2同种型a
  ATP2B3   NM_001001344   质膜钙ATPase 3同种型3b
  ATP2B4   NM_001001396   质膜钙ATPase 4同种型4a
  ATP4B   NM_000705   ATPase,H+/K+交换,β多肽
  ATP6V0B   NM_004047   ATPase,H+转运,溶酶体21kDa,V0
  ATP6V0E2L   NM_145230   ATPase,H+转运,V0亚单位
  ATP6V1B2   NM_001693   液泡H+ATPase B2
  ATP6V1C1   NM_001007254   ATPase,H+转运,溶酶体42kDa,V1
  ATP6V1C2   NM_144583   液泡H+ATPaseC2同种型b
  ATP6V1G1   NM_004888   液泡H+ATPase G1
  ATP7A   NM_000052   ATPase,Cu++转运,α多肽
  ATP7B   NM_000053   ATPase,Cu++转运,β多肽
  ATP8B3   NM_138813   ATPase,I类,8B型,成员3
  ATPBD1C   NM_016301   ATP结合结构域1家族,成员C
  ATRNL1   NM_207303   引蛋白(Attractin)样1
  ATXN2   NM_002973   共济失调蛋白(ataxin)2
  ATXN7L2   NM_153340   共济失调蛋白7样2
  AURKAIP1   NM_017900   aurora-A激酶相互作用蛋白
  AVEN   NM_020371   细胞死亡调控因子aven
  AXIN2   NM_004655   轴蛋白2
  AXUD1   NM_033027   AXIN1上调1
  B3GALNT1   NM_003781   UDP-Gal:βGlcNAc β
  B3GALT5   NM_006057   UDP-Gal:βGlcNAc β
  B3GALT6   NM_080605   UDP-Gal:βGal β1,3-半乳糖基转移酶
  B3GAT1   NM_018644   β-1,3-葡糖醛酸基转移酶1
  B3GAT3   NM_012200   β-1,3-葡糖醛酸基转移酶3
  B3GNT2   NM_006577   UDP-GlcNAc:βGal
  B3GNT3   NM_014256   UDP-GlcNAc:βGal
  B3GNT4   NM_030765   UDP-GlcNAc:βGal
  B4GALT1   NM_001497   UDP-Gal:βGlcNAc β1,4-
  B4GALT2   NM_001005417   UDP-Gal:βGlcNAc β1,4-
  B4GALT4   NM_003778   UDP-Gal:βGlcNAc β1,4-
  B4GALT5   NM_004776   UDP-Gal:βGlcNAc β1,4-
  bA16L21.2.1   NM_001015882   假定蛋白LOC548645
  BAAT   NM_001701   胆汁酸辅酶A:氨基酸
  BACE1   NM_012104   β-位点APP-裂解酶1同种型A
  BACE2   NM_138992   β-位点APP-裂解酶2同种型B
  BACH1   NM_001011545   BTB和CNC同系物1同种型b
  BACH2   NM_021813   BTB和CNC同系物1,碱性亮氨酸拉链
  BAG3   NM_004281   BCL2相关抗死亡基因3
  BAG4   NM_004874   BCL2相关抗死亡基因4
  BAG5   NM_001015048   BCL2相关抗死亡基因5同种型b
  BAHD1   NM_014952   含溴邻接同源性结构域1
  BAI1   NM_001702   脑特异性血管新生抑制剂1
  BAIAP2   NM_006340   BAI1相关蛋白2同种型3
  BAP1   NM_004656   BRCA1相关蛋白-1
  BAT2D1   NM_015172   HBxAg反式活化蛋白2
  BAT4   NM_033177   HLA-B相关转录物4
  BAZ1B   NM_032408   溴结构域邻接锌指结构域,1B
  BAZ2A   NM_013449   溴结构域邻接锌指结构域,2A
  BBC3   NM_014417   BCL2结合组分3
  BCAP29   NM_001008406   B细胞受体相关蛋白BAP29同种型
  BCAP31   NM_005745   B细胞受体相关蛋白31
  BCAS1   NM_003657   乳腺癌扩增序列1
  BCAS4   NM_001010974   乳腺癌扩增序列4同种型c
  BCL11B   NM_022898   B细胞CLL/淋巴瘤11B同种型2
  BCL2   NM_000633   B细胞淋巴瘤蛋白2α同种型
  BCL2L1   NM_001191   BCL2样1同种型2
  BCL2L11   NM_006538   BCL2样11同种型6
  BCL2L12   NM_052842   BCL2样12同种型2
  BCL2L14   NM_030766   BCL2样14同种型2
  BCL2L2   NM_004050   BCL2样2蛋白
  BCL7A   NM_001024808   B细胞CLL/淋巴瘤7A同种型b
  BCL7B   NM_001707   B细胞CLL/淋巴瘤7B同种型1
  BCL9   NM_004326   B细胞CLL/淋巴瘤9
  BCL9L   NM_182557   B细胞CLL/淋巴瘤9样
  BCOR   NM_020926   BCL-6相互作用辅阻遏物同种型2
  BCORL1   NM_021946   BCL6辅阻遏物样1
  BCR   NM_004327   断裂点丛集区同种型1
  BDH2   NM_020139   3-羟基丁酸脱氢酶,2型
  BDKRB2   NM_000623   缓激肽受体B2
  BDNF   NM_001709   脑来源神经营养因子同种型a
  BET1L   NM_016526   早期于转运体1同源物中阻断(S.
  BHLHB2   NM_003670   含碱性螺旋-环-螺旋结构域类
  BHLHB3   NM_030762   含碱性螺旋-环-螺旋结构域类
  BHMT2   NM_017614   甜菜碱-高半胱胺酸甲基转移酶2
  BICD2   NM_001003800   双尾D同源物2同种型1
  BIK   NM_001197   BCL2相互作用杀手蛋白
  BIN1   NM_004305   桥连整合因子1同种型8
  BIRC5   NM_001012270   含杆状病毒IAP重复序列的蛋白5
  BLCAP   NM_006698   膀胱癌相关蛋白
  BLMH   NM_000386   博莱霉素水解酶
  BLR1   NM_001716   伯基特氏淋巴瘤(Burkitt lymphoma)受体1同种型1
  BMF   NM_001003940   Bcl2修饰因子同种型bmf-1
  BMPER   NM_133468  BMP结合内皮调控因子前体
  BMPR1A   NM_004329  IA型骨形态发生蛋白受体
  BMPR2   NM_001204  II型骨形态发生蛋白受体
  BMS1L   NM_014753  BMS1样,核糖体组装蛋白
  BMX   NM_001721  BMX非受体酪氨酸激酶
  BNIP1   NM_001205  BCL2/腺病毒E1B 19kD相互作用蛋白1
  BOLA2   NM_001031833  BolA样蛋白2同种型b
  BOLA3   NM_212552  bolA样3同种型1
  BRCA1   NM_007306  乳腺癌1,早期发生同种型
  BRD1   NM_014577  含溴结构域蛋白1
  BRD8   NM_139199  含溴结构域8同种型2
  BRF2   NM_018310  RNA聚合酶III转录起始
  BRI3   NM_015379  脑蛋白I3
  BRMS1   NM_015399  乳腺癌转移抑制因子1同种型1
  BRP44L   NM_016098  脑蛋白44样
  BRPF3   NM_015695  含溴结构域和PHD指,3
  BRS3   NM_001727  铃蟾肽(bombesin)样受体3
  BRWD1   NM_001007246  含溴结构域和WD重复序列结构域1
  BSDC1   NM_018045  含BSD结构域1
  BSN   NM_003458  巴松蛋白(bassoon protein)
  BSND   NM_057176  巴特蛋白(barttin)
  BSPRY   NM_017688  含B盒和SPRY结构域
  BTAF1   NM_003972  BTAF1RNA聚合酶II,B-TFIID转录
  BTBD14B   NM_052876  转录阻遏因子NAC1
  BTBD15   NM_014155  含BTB(POZ)结构域15
  BTBD2   NM_017797  含BTB(POZ)结构域2
  BTBD3   NM_014962  含BTB/POZ结构域蛋白3同种型a
  BTBD4   NM_025224  含BTB(POZ)结构域4
  BTBD7   NM_001002860  含BTB(POZ)结构域7同种型1
  BTF3   NM_001207  碱性转录因子3同种型B
  BTG2   NM_006763  B细胞易位基因2
  BTN1A1   NM_001732  嗜乳脂蛋白(butyrophilin),亚族1,成员A1
  BTRC   NM_003939  含β-转导蛋白(transducin)重复序列的蛋白
  BUB3   NM_004725  未受苯并咪唑抑制的BUB3出芽3
  BVES   NM_007073  血管心外膜物质
  BZW1   NM_014670  碱性亮氨酸拉链和W2结构域1
  C10orf108   NM_001012714  假定蛋白LOC414235
  C10orf26   NM_017787  假定蛋白LOC54838
  C10orf39   NM_194303  假定蛋白LOC282973
  C10orf4   NM_145246  FRA10AC1蛋白同种型FRA10AC1-1
  C10orf42   NM_138357  假定蛋白LOC90550
  C10orf46   NM_153810  假定蛋白LOC143384
  C10orf53   NM_182554  假定蛋白LOC282966
  C10orf54   NM_022153  假定蛋白LOC64115
  C10orf56   NM_153367  假定蛋白LOC219654
  C10orf6   NM_018121  假定蛋白LOC55719
  C10orf63   NM_145010  恩库蛋白(enkurin)
  C10orf67   NM_153714  假定蛋白LOC256815
  C10orf7   NM_006023  D123基因产物
  C10orf72   NM_144984  假定蛋白LOC196740同种型2
  C10orf76   NM_024541   假定蛋白LOC79591
  C10orf77   NM_024789   假定蛋白LOC79847
  C10orf81   NM_024889   假定蛋白LOC79949
  C10orf83   NM_178832   假定蛋白LOC118812
  C10orf9   NM_145012   细胞周期蛋白折叠蛋白1同种型1
  C10orf95   NM_024886   假定蛋白LOC79946
  C11orf10   NM_014206   假定蛋白LOC746
  C11orf11   NM_006133   神经干细胞来源的树突状调控因子
  C11orf17   NM_182901   染色体11开放阅读框17
  C11orf24   NM_022338   假定蛋白LOC53838
  C11orf42   NM_173525   假定蛋白LOC160298
  C11orf45   NM_145013   假定蛋白LOC219833
  C11orf46   NM_152316   假定蛋白LOC120534
  C11orf49   NM_001003676   假定蛋白LOC79096同种型1
  C11orf53   NM_198498   假定蛋白LOC341032
  C11orf55   NM_207428   假定蛋白LOC399879
  C11orf68   NM_031450   嗜碱性粒细胞白血病表达蛋白BLES03
  C12orf22   NM_030809   TGF-β诱导的凋亡蛋白12
  C12orf30   NM_024953   假定蛋白LOC80018
  C12orf34   NM_032829   假定蛋白LOC84915
  C12orf38   NM_024809   TECT2
  C12orf4   NM_020374   假定蛋白LOC57102
  C12orf47   NM_016534   凋亡相关蛋白PNAS-1
  C12orf53   NM_153685   假定蛋白LOC196500
  C13orf1   NM_020456   假定蛋白LOC57213
  C13orf18   NM_025113   假定蛋白LOC80183
  C14orf1   NM_007176   假定蛋白LOC11161
  C14orf111   NM_015962   假定蛋白LOC51077
  C14orf129   NM_016472   假定蛋白LOC51527
  C14orf132   NM_020215   假定蛋白LOC56967
  C14orf139   NM_024633   假定蛋白LOC79686
  C14orf143   NM_145231   假定蛋白LOC90141
  C14orf150   NM_001008726   假定蛋白LOC112840
  C14orf32   NM_144578   MAPK相互作用和纺锤体稳定
  C14orf37   NM_001001872   假定蛋白LOC145407
  C14orf4   NM_024496   染色体14开放阅读框4
  C14orf43   NM_194278   假定蛋白LOC91748
  C14orf45   NM_025057   假定蛋白LOC80127
  C14orf68   NM_207117   染色体14开放阅读框68
  C14orf79   NM_174891   假定蛋白LOC122616
  C15orf37   NM_175898   假定蛋白LOC283687
  C15orf39   NM_015492   假定蛋白LOC56905
  C15orf40   NM_144597   假定蛋白LOC123207
  C15orf41   NM_032499   假定蛋白LOC84529
  C15orf42   NM_152259   富含亮氨酸重复序列激酶1
  C16orf14   NM_138418   假定蛋白LOC84331
  C16orf34   NM_144570   染色体16开放阅读框34
  C16orf55   NM_153025   假定蛋白LOC124045
  C16orf56   NM_025082   假定蛋白LOC80152
  C16orf57   NM_024598   假定蛋白LOC79650
  C16orf58   NM_022744   假定蛋白LOC64755
  C16orf63   NM_144600   假定蛋白LOC123811
  C16orf7   NM_004913   染色体16开放阅读框7
  C16orf70   NM_025187   lin-10
  C17orf27   NM_020914   染色体17开放阅读框27
  C17orf32   NM_152464   假定蛋白LOC147007
  C17orf39   NM_024052   假定蛋白LOC79018
  C17orf41   NM_024857   染色体脆性相关基因1
  C17orf49   NM_174893   假定蛋白LOC124944
  C17orf54   NM_182564   假定蛋白LOC283982
  C17orf56   NM_144679   假定蛋白LOC146705
  C17orf59   NM_017622   假定蛋白LOC54785
  C17orf62   NM_001033046   假定蛋白LOC79415
  C17orf81   NM_203413   S期2蛋白同种型2
  C17orf82   NM_203425   假定蛋白LOC388407
  C18orf1   NM_001003674   假定蛋白LOC753同种型γ1
  C18orf25   NM_001008239   染色体18开放阅读框25同种型b
  C18orf34   NM_198995   假定蛋白LOC374864
  C18orf4   NM_032160   假定蛋白LOC92126
  C18orf43   NM_006553   染色体18开放阅读框43
  C18orf45   NM_032933   假定蛋白LOC85019
  C18orf54   NM_173529   假定蛋白LOC162681
  C18orf58   NM_173817   假定蛋白LOC284222
  C19orf12   NM_001031726   假定蛋白LOC83636同种型1
  C19orf23   NM_152480   假定蛋白LOC148046
  C19orf25   NM_152482   假定蛋白LOC148223
  C19orf26   NM_152769   假定蛋白LOC255057
  C19orf36   NM_001031735   假定蛋白LOC113177同种型1
  C19orf6   NM_033420   membralin同种型2
  C1orf101   NM_173807   假定蛋白LOC257044
  C1orf102   NM_145047   含硝基氧化还原酶结构域的蛋白同种型
  C1orf103   NM_001006945   受体相互作用因子1同种型2
  C1orf107   NM_014388   假定蛋白LOC27042
  C1orf113   NM_024676   假定蛋白LOC79729
  C1orf114   NM_021179   假定蛋白LOC57821
  C1orf115   NM_024709   假定蛋白LOC79762
  C1orf116   NM_023938   特异性雄激素调控蛋白
  C1orf119   NM_020141   假定蛋白LOC56900
  C1orf126   NM_182534   假定蛋白LOC200197
  C1orf130   NM_001010980   假定蛋白LOC400746
  C1orf142   NM_053052   假定蛋白LOC116841
  C1orf151   NM_001032363   染色体1开放阅读框151蛋白
  C1orf173   NM_001002912   假定蛋白LOC127254
  C1orf187   NM_198545   染色体1开放阅读框187
  C1orf188   NM_173795   假定蛋白LOC148646
  C1orf19   NM_052965   假定蛋白LOC116461
  C1orf190   NM_001013615   假定蛋白LOC541468
  C1orf2   NM_006589   假定蛋白LOC10712同种型a
  C1orf21   NM_030806   染色体1开放阅读框21
  C1orf36   NM_183059   染色体1开放阅读框36
  C1orf38   NM_004848   基膜诱导的基因同种型1
  C1orf54   NM_024579   假定蛋白LOC79630
  C1orf62   NM_152763   假定蛋白LOC254268
  C1orf69   NM_001010867   假定蛋白LOC200205
  C1orf84   NM_001012960   RP11-506B15.1蛋白同种型1
  C1orf9   NM_014283   染色体1开放阅读框9蛋白
  C1orf95   NM_001003665   假定蛋白LOC375057
  C1QA   NM_015991   互补组分1,q亚组分,A链
  C1QB   NM_000491   互补组分1,q亚组分,B链
  C1QL3   NM_001010908   互补组分1,q亚组分样3
  C1QL4   NM_001008223   假定蛋白LOC338761
  C1QTNF3   NM_030945   C1q和肿瘤坏死因子相关蛋白3
  C1QTNF5   NM_015645   C1q和肿瘤坏死因子相关蛋白5
  C1QTNF6   NM_031910   C1q和肿瘤坏死因子相关蛋白6
  C1QTNF8   NM_207419   假定蛋白LOC390664
  C20orf11   NM_017896   染色体20开放阅读框11
  C20orf117   NM_080627   假定蛋白LOC140710同种型1
  C20orf121   NM_024331   假定蛋白LOC79183
  C20orf160   NM_080625   假定蛋白LOC140706
  C20orf161   NM_033421   分拣微管连接蛋白21同种型a
  C20orf166   NM_178463   假定蛋白LOC128826
  C20orf186   NM_182519   抗微生物肽RY2G5
  C20orf23   NM_024704   驱动蛋白(kinesin)样马达蛋白C20orf23
  C20orf29   NM_018347   假定蛋白LOC55317
  C20orf3   NM_020531   染色体20开放阅读框3
  C20orf39   NM_024893   假定蛋白LOC79953
  C20orf42   NM_017671   染色体20开放阅读框42
  C20orf43   NM_016407   假定蛋白LOC51507
  C20orf44   NM_018244   碱性FGF阻遏的Zic结合蛋白同种型
  C20orf45   NM_016045   假定蛋白LOC51012
  C20orf46   NM_018354   假定蛋白LOC55321
  C20orf58   NM_152864   假定蛋白LOC128414
  C20orf71   NM_178466   假定蛋白LOC128861同种型b
  C20orf77   NM_021215   假定蛋白LOC58490
  C20orf96   NM_153269   假定蛋白LOC140680
  C21orf123   NM_199175   假定蛋白LOC378832
  C21orf125   NM_194309   假定蛋白LOC284836
  C21orf129   NM_152506   假定蛋白LOC150135
  C21orf24   NM_001001789   假定蛋白LOC400866
  C2lorf25   NM_199050   假定蛋白LOC25966
  C21orf33   NM_004649   es1蛋白同种型Ia前体
  C21orf57   NM_001006114   假定蛋白LOC54059同种型2
  C21orf58   NM_199071   假定蛋白LOC54058同种型2
  C21orf6   NM_016940   假定蛋白LOC10069
  C21orf62   NM_019596   假定蛋白LOC56245
  C21orf69   NM_058189   染色体21开放阅读框69
  C21orf84   NM_153752   假定蛋白LOC114038
  C21orf93   NM_145179   假定蛋白LOC246704
  C22orf13   NM_031444   染色体22开放阅读框13
  C22orf5   NM_012264   染色体22开放阅读框5
  C22orf9   NM_001009880  假定蛋白LOC23313同种型b
  C2orf17   NM_024293  假定蛋白LOC79137
  C2orf19   NM_001024676  染色体2开放阅读框19
  C2orf26   NM_023016  假定蛋白LOC65124
  C3orf10   NM_018462  染色体3开放阅读框10
  C3orf18   NM_016210  假定蛋白LOC51161
  C3orf19   NM_016474  假定蛋白LOC51244
  C3orf23   NM_001029839  假定蛋白LOC285343同种型2
  C3orf27   NM_007354  假定GR6蛋白
  C3orf37   NM_001006109  假定蛋白LOC56941
  C3orf56   NM_001007534  假定蛋白LOC285311
  C3orf58   NM_173552  假定蛋白LOC205428
  C4orf15   NM_024511  假定蛋白LOC79441
  C4orf19   NM_018302  假定蛋白LOC55286
  C5orf21   NM_032042  假定蛋白LOC83989
  C5orf24   NM_152409  假定蛋白LOC134553
  C6orf106   NM_022758  染色体6开放阅读框106同种型b
  C6orf128   NM_145316  假定蛋白LOC221468
  C6orf142   NM_138569  假定蛋白LOC90523
  C6orf145   NM_183373  假定蛋白LOC221749
  C6orf151   NM_152551  U11/U12 snRNP 48K
  C6orf152   NM_181714  假定蛋白LOC167691
  C6orf155   NM_024882  假定蛋白LOC79940
  C6orf168   NM_032511  假定蛋白LOC84553
  C6orf199   NM_145025  假定蛋白LOC221264
  C6orf35   NM_018452  假定蛋白LOC55836
  C6orf47   NM_021184  G4蛋白
  C6orf49   NM_013397  过度表达的乳腺肿瘤蛋白
  C6orf51   NM_138408  假定蛋白LOC112495
  C6orf55   NM_016485  假定蛋白LOC51534
  C6orf57   NM_145267  假定蛋白LOC135154
  C6orf59   NM_024929  假定蛋白LOC79992
  C6orf64   NM_018322  假定蛋白LOC55776
  C6orf71   NM_203395  染色体6开放阅读框71
  C6orf85   NM_021945  离子转运蛋白
  C7orf16   NM_006658  G底物
  C7orf19   NM_032831  假定蛋白LOC80228
  C7orf20   NM_015949  假定蛋白LOC51608
  C7orf21   NM_031434  假定蛋白LOC83590
  C7orf29   NM_138434  假定蛋白LOC113763
  C8orf30A   NM_016458  脑蛋白16
  C8orf38   NM_152416  假定蛋白LOC137682
  C8orf4   NM_020130  染色体8开放阅读框4
  C8orf42   NM_175075  假定蛋白LOC157695
  C8orf49   NM_001031839  假定蛋白LOC606553
  C8orf58   NM_001013842  假定蛋白LOC541565
  C8orf70   NM_016010  假定蛋白LOC51101
  C9orf100   NM_032818  假定蛋白LOC84904
  C9orf106   NM_001012715  假定蛋白LOC414318
  C9orf10OS   NM_198841  假定蛋白LOC158293
  C9orf114   NM_016390   假定蛋白LOC51490
  C9orf121   NM_145283   核氧化还原蛋白
  C9orf123   NM_033428   假定蛋白LOC90871
  C9orf128   NM_001012446   假定蛋白LOC392307
  C9orf150   NM_203403   假定蛋白LOC286343
  C9orf163   NM_152571   假定蛋白LOC158055
  C9orf164   NM_182635   假定蛋白LOC349236
  C9orf19   NM_022343   染色体9开放阅读框19
  C9orf25   NM_147202   假定蛋白LOC203259
  C9orf26   NM_033439   白细胞介素33
  C9orf28   NM_001011703   假定蛋白LOC89853同种型2
  C9orf3   NM_032823   氨基肽酶O
  C9orf42   NM_138333   假定蛋白LOC116224
  C9orf48   NM_194313   假定蛋白LOC347240
  C9orf5   NM_032012   假定蛋白LOC23731
  C9orf61   NM_004816   染色体9开放阅读框61
  C9orf66   NM_152569   假定蛋白LOC157983
  C9orf7   NM_017586   假定蛋白LOC11094
  C9orf74   NM_030914   假定蛋白LOC81605
  C9orf82   NM_024828   假定蛋白LOC79886
  C9orf88   NM_022833   假定蛋白LOC64855
  C9orf89   NM_032310   染色体9开放阅读框89
  C9orf91   NM_153045   假定蛋白LOC203197
  CA12   NM_001218   碳酸酐酶XII同种型1前体
  CA2   NM_000067   碳酸酐酶II
  CA8   NM_004056   碳酸酐酶VIII
  CAB39   NM_016289   钙结合蛋白39
  CAB39L   NM_030925   钙结合蛋白39样同种型2
  CABC1   NM_020247   伴侣蛋白,bc1复合物样的ABC1活性
  CABLES2   NM_031215   Cdk5和Ab1酶底物2
  CABP1   NM_001033677   钙结合蛋白1同种型3
  CABP7   NM_182527   钙结合蛋白7
  CACNA1E   NM_000721   钙通道,电压依赖性,α1E
  CACNA1I   NM_001003406   电压依赖性T型钙通道
  CACNA2D4   NM_001005737   电压门控性钙通道α(2)δ-4
  CACNB1   NM_000723   钙通道,电压依赖性,β1
  CACNB4   NM_000726   钙通道,电压依赖性,β4
  CAD   NM_004341   氨甲酰磷酸合成酶2/天冬氨酸
  CALB2   NM_001740   钙结合蛋白(calbindin)2全长蛋白同种型
  CALM1   NM_006888   钙调蛋白(calmodulin)1
  CALML4   NM_033429   钙调蛋白样4同种型2
  CALML5   NM_017422   钙调蛋白样皮肤蛋白
  CALML6   NM_138705   钙调蛋白样6
  CALN1   NM_001017440   钙营养蛋白(calneuron)1
  CALU   NM_001219   钙腔蛋白(calumenin)前体
  CAMK2A   NM_015981   钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IIA
  CAMK2G   NM_001222   钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶II
  CAMKK2   NM_006549   钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶
  CAMKV   NM_024046   CaM激酶样囊泡相关
  CAMSAP1   NM_015447   钙调蛋白调控性血影蛋白相关蛋白
 CAMSAP1L1   NM_203459   钙调蛋白调控性血影蛋白相关蛋白
 CANX   NM_001024649   钙联蛋白(calnexin)前体
 CAP1   NM_006367   腺苷酰环化酶相关蛋白
 CAP2   NM_006366   腺苷酰环化酶相关蛋白2
 CAPN12   NM_144691   钙蛋白酶(calpain)12
 CAPN3   NM_212464   钙蛋白酶3同种型g
 CAPN5   NM_004055   钙蛋白酶5
 CAPN6   NM_014289   钙蛋白酶6
 CAPS   NM_004058   钙磷蛋白(calcyphosine)同种型a
 CAPZA2   NM_006136   加帽蛋白(肌动蛋白丝)肌肉Z系
 CARD10   NM_014550   胱天蛋白酶募集结构域蛋白10
 CARD14   NM_052819   胱天蛋白酶募集结构域蛋白14同种型2
 CARD4   NM_006092   胱天蛋白酶募集结构域家族,成员4
 CARM1   NM_199141   辅活化因子相关精氨酸
 CARS   NM_001014437   半胱氨酰-tRNA合成酶同种型c
 CASKIN1   NM_020764   CASK相互作用蛋白1
 CASP10   NM_001230   胱天蛋白酶10同种型a前蛋白原
 CASP4   NM_033307   胱天蛋白酶4同种型δ
 CASQ2   NM_001232   心肌集钙蛋白(calsequestrin)2
 CASR   NM_000388   钙敏受体
 CAST   NM_173060   钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin)同种型b
 CAST1   NM_015576   细胞质基质蛋白p110
 CASZ1   NM_017766   蓖麻蛋白(castor)同源物1,锌指
 CBARA1   NM_006077   钙结合特应性相关自身抗原1
 CBFA2T2   NM_001032999   核心结合因子,runt结构域,α亚单位
 CBFA2T3   NM_005187   骨髓易位基因相关蛋白2
 CBFB   NM_001755   核心结合因子,β亚单位同种型2
 CBL   NM_005188   Cas-Br-M(鼠类)亲嗜性逆转录病毒
 CBLC   NM_012116   Cas-Br-M(鼠类)亲嗜性逆转录病毒
 CBR3   NM_001236   羰基还原酶3
 CBX2   NM_005189   色素框(chromobox)同源物2同种型1
 CBX4   NM_003655   色素框同源物4
 CC2D1B   NM_032449   含卷曲螺旋和C2结构域1B
 CCDC18   NM_206886   肉瘤抗原NY-SAR-41
 CCDC19   NM_012337   鼻咽上皮特异性蛋白1
 CCDC21   NM_022778   含卷曲螺旋结构域21
 CCDC25   NM_001031708   含卷曲螺旋结构域25同种型1
 CCDC28A   NM_015439   假定蛋白LOC25901
 CCDC3   NM_031455   含卷曲螺旋结构域3
 CCDC32   NM_052849   含卷曲螺旋结构域32
 CCDC4   NM_207406   假定蛋白LOC389206
 CCDC44   NM_016360   克隆HQ0477PRO0477p
 CCDC47   NM_020198   假定蛋白LOC57003
 CCDC52   NM_144718   含卷曲螺旋结构域52
 CCDC55   NM_001033563   假定蛋白LOC84081同种型2
 CCDC6   NM_005436   含卷曲螺旋结构域6
 CCDC68   NM_025214   CTCL肿瘤抗原se57-1
 CCDC80   NM_199511   类固醇敏感蛋白1
 CCDC81   NM_021827   假定蛋白LOC60494
 CCDC83   NM_173556   假定蛋白LOC220047
 CCDC88   NM_032251   假定蛋白LOC283234
 CCDC94   NM_018074   假定蛋白LOC55702
 CCDC95   NM_173618   含卷曲螺旋结构域95
 CCDC97   NM_052848   假定蛋白LOC90324
 CCL15   NM_004167   趋化因子(C-C基序)配体15前体
 CCL22   NM_002990   可诱导的小细胞因子A22前体
 CCND1   NM_053056   细胞周期蛋白D1
 CCND2   NM_001759   细胞周期蛋白D2
 CCND3   NM_001760   细胞周期蛋白D3
 CCNE1   NM_001238   细胞周期蛋白E1同种型1
 CCNE2   NM_057735   细胞周期蛋白E2同种型2
 CCNF   NM_001761   细胞周期蛋白F
 CCNJ   NM_019084   细胞周期蛋白J
 CCNT2   NM_001241   细胞周期蛋白T2同种型a
 CCR7   NM_001838   趋化因子(C-C基序)受体7前体
 CCR9   NM_006641   趋化因子(C-C基序)受体9同种型B
 CCRK   NM_012119   细胞周期相关激酶同种型2
 CCS   NM_005125   超氧化物歧化酶的铜伴侣蛋白
 CD151   NM_004357   CD151抗原
 CD163   NM_004244   CD163抗原同种型a
 CD164   NM_006016   CD164抗原,唾液粘蛋白
 CD180   NM_005582   CD180抗原
 CD200R1   NM_138806   CD200受体1同种型a
 CD209   NM_021155   CD209抗原
 CD22   NM_001771   CD22抗原
 CD274   NM_014143   CD274抗原
 CD276   NM_001024736   CD276抗原同种型a
 CD28   NM_006139   CD28抗原
 CD300C   NM_006678   CD300C抗原
 CD300LG   NM_145273   骨髓细胞上表达的触发受体
 CD302   NM_014880   CD302抗原
 CD37   NM_001774   CD37抗原同种型A
 CD3E   NM_000733   CD3E抗原,ε多肽(TiT3
 CD4   NM_000616   CD4抗原前体
 CD40   NM_001250   CD40抗原同种型1前体
 CD47   NM_001025079   CD47分子同种型3前体
 CD48   NM_001778   CD48抗原(B细胞膜蛋白)
 CD5   NM_014207   CD5抗原(p56-62)
 CD6   NM_006725   CD6抗原
 CD69   NM_001781   CD69抗原(p60,早期T细胞活化
 CD80   NM_005191   CD80抗原(CD28抗原配体1,B7-1
 CD82   NM_001024844   CD82抗原同种型2
 CD83   NM_004233   CD83抗原同种型a
 CD93   NM_012072   CD93抗原前体
 CD97   NM-001025160   CD97抗原同种型3前体
 CD99L2   NM_031462   CD99抗原样2同种型E3′-E4′-E3-E4
 CDADC1   NM_030911   含胞苷和dCMP脱氨酶结构域1
 CDC14A   NM_003672   CDC14同源物A同种型1
 CDC14B   NM_003671   CDC14同源物B同种型1
 CDC23   NM_004661   细胞分裂周期蛋白23
  CDC25A   NM_001789  细胞分裂周期25A同种型a
  CDC25B   NM_004358  细胞分裂周期25B同种型2
  CDC25C   NM_001790  细胞分裂周期25C蛋白同种型a
  CDC27   NM_001256  细胞分裂周期蛋白27
  CDC34   NM_004359  细胞分裂周期34
  CDC37L1   NM_017913  细胞分裂周期37同源物(S.
  CDC42   NM_044472  细胞分裂周期42同种型2
  CDC42BPA   NM_003607  CDC42结合蛋白激酶α同种型B
  CDC42BPB   NM_006035  CDC42结合蛋白激酶β
  CDC42EP2   NM_006779  Cdc42效应蛋白2
  CDC42EP4   NM_012121  Cdc42效应蛋白4
  CDC7   NM_003503  CDC7细胞分裂周期7
  CDCA4   NM_017955  细胞分裂周期相关4
  CDCA5   NM_080668  细胞分裂周期相关5
  CDCA7L   NM_018719  转录因子RAM2
  CDCP2   NM_201546  假定蛋白LOC200008
  CDH1   NM_004360  钙粘附蛋白(cadherin 1),1型前蛋白原
  CDH22   NM_021248  钙粘附蛋白22前体
  CDK10   NM_052988  细胞周期蛋白依赖性激酶10同种型3
  CDK5R1   NM_003885  细胞周期蛋白依赖性激酶5,调控亚单位1
  CDK5RAP1   NM_016082  CDK5调控亚单位相关蛋白1
  CDK5RAP3   NM_025197  CDK5调控亚单位相关蛋白3
  CDK6   NM_001259  细胞周期蛋白依赖性激酶6
  CDKN1A   NM_000389  细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A
  CDKN2A   NM_058197  细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2A同种型3
  CDKN2B   NM_078487  细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B同种型2
  CDKN2D   NM_001800  细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2D
  CDR2   NM_001802  小脑变性相关蛋白2
  CDS2   NM_003818  磷脂酸胞苷酰基转移酶2
  CDT1   NM_030928  DNA复制因子
  CDV3   NM_017548  CDV3同源物
  CDX1   NM_001804  尾型同源异形盒(caudaltypehomeobox)转录因子1
  CDX2   NM_001265  尾型同源异形盒转录因子2
  CEACAM19   NM_020219  癌胚抗原样1
  CEACAM6   NM_002483  癌胚抗原相关细胞粘附
  CEACAM7   NM_006890  癌胚抗原相关细胞粘附
  CEBPG   NM_001806  CCAAT/增强子结合蛋白γ
  CECR1   NM_017424  猫眼综合症临界区域蛋白1
  CECR6   NM_031890  猫眼综合症染色体区,候选物6
  CENTA1   NM_006869  半人马蛋白(ccntaurin),α1
  CENTD1   NM_015230  半人马蛋白δ1同种型a
  CENTG1   NM_014770  半人马蛋白,γ1
  CEP152   NM_014985  假定蛋白LOC22995
  CEP170   NM_014812  中心体(centrosomal)蛋白170kDa
  CEP27   NM_018097  假定蛋白LOC55142
  CEP350   NM_014810  中心体(centrosome)相关蛋白350
  CEP55   NM_018131  中心体蛋白55kDa
  CERK   NM_022766  神经酰胺激酶同种型a
  CERKL   NM_201548  神经酰胺激酶样同种型a
  CGGBP1   NM_001008390  CGG三联重复序列结合蛋白1
  CGI-38   NM_015964   假定蛋白LOC51673
  CGI-69   NM_016016   假定蛋白LOC51629
  CGN   NM_020770   扣带蛋白(cingulin)
  CGNL1   NM_032866   扣带蛋白样1
  CHAC1   NM_024111   假定蛋白LOC79094
  CHD5   NM_015557   染色体结构域解旋酶DNA结合蛋白5
  CHD6   NM_032221   染色体结构域解旋酶DNA结合蛋白6
  CHD7   NM_017780   染色体结构域解旋酶DNA结合蛋白7
  CHD8   NM_020920   染色体结构域解旋酶DNA结合蛋白8
  CHD9   NM_025134   染色体结构域解旋酶DNA结合蛋白9
  CHDH   NM_018397   胆碱脱氢酶
  CHEK1   NM_001274   CHK1检查蛋白同源物
  CHERP   NM_006387   钙稳态内质网
  CHFR   NM_018223   具有叉头和环指的检查蛋白
  CHGA   NM_001275   嗜铬粒蛋白(chromogranin)A前体
  CHID1   NM_023947   假定蛋白LOC66005
  CHKB   NM_152253   胆碱/乙醇胺激酶同种型b
  CHMP4B   NM_176812   染色质修饰蛋白4B
  CHMP6   NM_024591   染色质修饰蛋白6
  CHORDC1   NM_012124   富含半胱氨酸和组氨酸的结构域
  CHP   NM_007236   钙结合蛋白P22
  CHPT1   NM_020244   胆碱磷酸转移酶1
  CHRAC1   NM_017444   染色质可及性复合物1
  CHRD   NM_177978   脊索蛋白(chordin)同种型b
  CHRFAM7A   NM_139320   CHRNA7-FAM7A融合体同种型1
  CHRNA3   NM_000743   胆碱能受体,烟碱,α
  CHRNA4   NM_000744   胆碱能受体,烟碱,α4亚单位
  CHRNA5   NM_000745   胆碱能受体,烟碱,α
  CHRNB2   NM_000748   胆碱能受体,烟碱,β
  CHRNB3   NM_000749   胆碱能受体,烟碱,β
  CHRNB4   NM_000750   胆碱能受体,烟碱,β
  CHRNE   NM_000080   烟碱乙酰胆碱受体ε
  CHST10   NM_004854   HNK-1磺基转移酶
  CHST3   NM_004273   碳水化合物(软骨素6)磺基转移酶3
  CHST6   NM_021615   碳水化合物(N-乙酰葡糖胺6-O)
  CHUK   NM_001278   保守螺旋-环-螺旋广泛型激酶
  CHX10   NM_182894   含ceh-10同源异型结构域的同源物
  CIAPIN1   NM_020313   细胞因子诱导的凋亡抑制剂1
  CIB2   NM_006383   催化性DNA依赖性蛋白激酶
  CIDEB   NM_014430   细胞死亡诱导性DFFA样效应因子b
  CINP   NM_032630   细胞周期蛋白依赖性激酶2-相互作用蛋白
  CKAP5   NM_001008938   结肠和肝肿瘤过度表达的蛋白质
  CKB   NM_001823   脑肌酸激酶
  CLASP1   NM_015282   CLIP结合蛋白1
  CLASP2   NM_015097   CLIP结合蛋白2
  CLCN3   NM_001829   氯离子通道3同种型b
  CLCN4   NM_001830   氯离子通道4
  CLCN5   NM_000084   氯离子通道5
  CLCN6   NM_001286   氯离子通道6同种型ClC-6a
  CLCN7   NM_001287   氯离子通道7
  CLDN1   NM_021101   紧密连接蛋白(claudin)1
  CLDN12   NM_012129   紧密连接蛋白12
  CLDN14   NM_012130   紧密连接蛋白14
  CLDN2   NM_020384   紧密连接蛋白2
  CLDN4   NM_001305   紧密连接蛋白4
  CLDN5   NM_003277   紧密连接蛋白5
  CLDN6   NM_021195   紧密连接蛋白6
  CLEC12A   NM_201625   骨髓抑制性C型凝集素样受体
  CLEC12B   NM_205852   巨噬细胞抗原h
  CLEC2D   NM_001004419   破骨细胞抑制凝集素同种型2
  CLEC4F   NM_173535   C型凝集素,亚族成员13
  CLEC4M   NM_214677   CD299抗原同种型3
  CLIC5   NM_016929   细胞内氯离子通道5
  CLK1   NM_001024646   CDC样激酶1同种型2
  CLK4   NM_020666   CDC样激酶4
  CLLU1   NM_001025233   假定蛋白LOC574028
  CLN8   NM_018941   CLN8蛋白
  CLOCK   NM_004898   钟蛋白(clock)
  CLSTN1   NM_001009566   钙同线蛋白(calsyntenin)1同种型1
  CLTB   NM_001834   网格蛋白(clathrin),轻链多肽同种型a
  CLU   NM_001831   簇蛋白(clusterin)同种型1
  CLUAP1   NM_024793   簇蛋白相关蛋白1同种型2
  CMIP   NM_030629   c-Maf诱导蛋白Tc-mip同种型
  CMPK   NM_016308   胞苷酸激酶
  CMTM1   NM_052999   趋化因子样因子超家族1同种型13
  CMTM3   NM_144601   趋化因子样因子超家族3同种型a
  CMTM4   NM_178818   趋化因子样因子超家族4同种型1
  CMTM6   NM_017801   含CKLF样MARVEL跨膜结构域
  CNIH2   NM_182553   酸黄瓜蛋白(cornichon)同源物2
  CNIH3   NM_152495   酸黄瓜蛋白同源物3
  CNN1   NM_001299   钙调理蛋白(calponin)1,碱性,平滑肌
  CNNM2   NM_017649   细胞周期蛋白M2同种型1
  CNNM3   NM_017623   细胞周期蛋白M3同种型1
  CNOT6   NM_015455   CCR4-NOT转录复合物,亚单位6
  CNTD2   NM_024877   假定蛋白LOC79935
  CNTN3   NM_020872   接触蛋白(contactin)3
  CNTNAP1   NM_003632   接触蛋白相关蛋白1
  COBLL1   NM_014900   COBL样1
  COG3   NM_031431   高尔基转运复合物3的组分
  COG7   NM_153603   寡聚蛋白高尔基复合物7的组分
  COL11A2   NM_080679   胶原蛋白,XI型,α2同种型3
  COL12A1   NM_004370   胶原蛋白,XII型,α1长同种型
  COL23A1   NM_173465   胶原蛋白,XXIII型,α1
  COL24A1   NM_152890   胶原蛋白,XXIV型,α1
  COL3A1   NM_000090   前胶原蛋白,III型,α1
  COL4A1   NM_001845   IV型α1胶原前蛋白原
  COL6A1   NM_001848   胶原蛋白,VI型,α1前体
  COL8A2   NM_005202   胶原蛋白,型VIII,α2
  COL9A2   NM_001852   IX型α2胶原蛋白
  COLEC12   NM_030781   胶原凝集素亚族成员12同种型II
  COLQ   NM_005677   乙酰胆碱酯酶胶原蛋白样尾巴亚单位
  COMMD5   NM_014066   高血压相关钙调控基因
  COMMD9   NM_014186   含COMM结构域9
  COPA   NM_004371   外被体蛋白复合物,亚单位α
  COPG2   NM_012133   外被体蛋白复合物,亚单位γ2
  COPS2   NM_004236   COP9组成型光形态建成同源物
  COPS7A   NM_016319   COP9复合物亚单位7a
  COPS7B   NM_022730   COP9组成型光形态建成同源物
  COQ10B   NM_025147   假定蛋白LOC80219
  COQ5   NM_032314   假定蛋白LOC84274
  COQ9   NM_020312   假定蛋白LOC57017
  CORO6   NM_032854   冠蛋白6
  CORO7   NM_024535   冠蛋白7
  COX10   NM_001303   血红素A:法尼基转移酶
  COX15   NM_078470   COX15同源物同种型1前体
  CPD   NM_001304   羧肽酶D前体
  CPEB2   NM_182485   细胞质聚腺苷酸化元件结合
  CPEB3   NM_014912   细胞质聚腺苷酸化元件结合
  CPEB4   NM_030627   细胞质聚腺苷酸化元件结合
  CPLX1   NM_006651   复蛋白(complexin)1
  CPLX3   NM_001030005   复蛋白3
  CPLX4   NM_181654   复蛋白4
  CPNE1   NM_003915   Ca2+依赖性磷脂结合蛋白(copine)I
  CPSF3L   NM_032179   与CPSF亚单位s 68kDa同种型2相关
  CPT1B   NM_004377   肉毒碱棕榈酰转移酶1B同种型a
  CPXM2   NM_198148   羧肽酶X(M14家族)成员2
  CRAMP1L   NM_020825   Crm,弯曲样
  CRB2   NM_173689   Crumb同源物2
  CREB3L1   NM_052854   cAMP应答元件结合蛋白3样
  CREB5   NM_001011666   cAMP应答元件结合蛋白5
  CREBL1   NM_004381   cAMP应答元件结合蛋白样1
  CREBL2   NM_001310   cAMP应答元件结合蛋白样2
  CREG1   NM_003851   E1A刺激基因的细胞阻遏物
  CREG2   NM_153836   E1A刺激基因2的细胞阻遏物
  CRELD1   NM_001031717   富含半胱氨酸,具有EGF样结构域1同种型1
  CRHR1   NM_004382   促肾上腺皮质激素释放激素受体1
  CRIM1   NM_016441   富含半胱氨酸的运动神经元1
  CRISPLD2   NM_031476   富含半胱氨酸的分泌蛋白LCCL结构域
  CRKL   NM_005207   v-crk肉瘤病毒CT10致癌基因同源物
  CRP   NM_000567   C反应蛋白,正五聚蛋白(pentraxin)相关
  CRSP7   NM_004831   Sp1转录所必需的辅因子
  CRSP8   NM_004269   Sp1转录所必需的辅因子
  CRSP9   NM_004270   Sp1转录所必需的辅因子
  CRTAC1   NM_018058   软骨酸性蛋白1
  CRY2   NM_021117   隐花色素2(光裂合酶样)
  CRYM   NM_001014444   晶体蛋白,μ同种型2
  CRYZL1   NM_145858   晶体蛋白,ζ样1
  CSDC2   NM_014460   RNA结合蛋白pippin
  CSDE1   NM_001007553   NRAS同种型1的上游序列
  CSF2   NM_000758   集落刺激因子2前体
  CSH1   NM_022640   绒膜生长催乳激素1同种型2
  CSH2   NM_022644   绒膜生长催乳激素2同种型2
  CSNK1A1   NM_001025105   酪蛋白激酶1,α1同种型1
  CSNK1G1   NM_022048   酪蛋白激酶1,γ1同种型S
  CSNK1G2   NM_001319   酪蛋白激酶1,γ2
  CSNK2A1   NM_001895   酪蛋白激酶II α1亚单位同种型a
  CSPG4   NM_001897   黑素瘤相关硫酸软骨素
  CSPG5   NM_006574   硫酸软骨素蛋白聚糖5(神经多糖
  CST6   NM_001323   半胱氨酸蛋白酶抑制因子(cystatin)M前体
  CST9   NM_001008693   半胱氨酸蛋白酶抑制因子9
  CST9L   NM_080610   半胱氨酸蛋白酶抑制因子9样前体
  CSTA   NM_005213   半胱氨酸蛋白酶抑制因子A
  CTAGE1   NM_172241   皮肤T细胞淋巴瘤相关抗原1
  CTDP1   NM_004715   CTD(羧基端结构域,RNA聚合酶II,
  CTDSP1   NM_021198   CTD(羧基端结构域,RNA聚合酶II,
  CTDSP2   NM_005730   核LIM作用物相互作用因子2
  CTDSPL   NM_001008392   小CTD磷酸酶3同种型1
  CTH   NM_001902   胱胺醚酶同种型1
  CTNNA1   NM_001903   连环蛋白(catenin),α1
  CTNNBIP1   NM_001012329   连环蛋白,β相互作用蛋白1
  CTNND1   NM_001331   连环蛋白(粘附素相关蛋白),δ1
  CTSB   NM_001908   组织蛋白酶(cathepsin)B前蛋白原
  CTSC   NM_148170   组织蛋白酶C同种型b前体
  CTSF   NM_003793   组织蛋白酶F
  CTSO   NM_001334   组织蛋白酶O前蛋白原
  CTTN   NM_005231   皮层肌动蛋白(cortactin)同种型a
  CUL2   NM_003591   带蛋白(cullin)2
  CUL3   NM_003590   带蛋白3
  CX3CL1   NM_002996   趋化因子(C-X3-C基序)配体1
  CX3CR1   NM_001337   趋化因子(C-X3-C基序)受体1
  CXCL10   NM_001565   可诱导的小细胞因子B10前体
  CXCR3   NM_001504   趋化因子(C-X-C基序)受体3
  CXCR6   NM_006564   G蛋白偶联受体TYMSTR
  CXorf1   NM_004709   假定蛋白LOC9142
  CXorf40A   NM_178124   染色体X开放阅读框40
  CXorf40B   NM_001013845   假定蛋白LOC541578
  CXorf6   NM_005491   假定蛋白LOC10046
  CYB561   NM_001017916   细胞色素b-561同种型1
  CYB561D1   NM_182580   含细胞色素b-561结构域1
  CYB5D1   NM_144607   假定蛋白LOC124637
  CYBASC3   NM_153611   细胞色素b,抗坏血酸依赖性3
  CYBRD1   NM_024843   细胞色素b还原酶1
  CYCS   NM_018947   细胞色素c
  CYFIP1   NM_001033028   细胞质FMR1相互作用蛋白1同种型
  CYGB   NM_134268   细胞珠蛋白
  CYP1B1   NM_000104   细胞色素P450,家族1,亚族B,
  CYP26B1   NM_019885   细胞色素P450,家族26,亚族b,
  CYP27A1   NM_000784   细胞色素P450,家族27,亚族A,
  CYP27B1   NM_000785   细胞色素P450,家族27,亚族B,
  CYP2C8   NM_000770   细胞色素P450,家族2,亚族C,
  CYP2C9   NM_000771   细胞色素P450,家族2,亚族C,
  CYP2S1   NM_030622   细胞色素P450,家族2,亚族S,
  CYP2U1   NM_183075   细胞色素P450,家族2,亚族U,
  CYP4F3   NM_000896   细胞色素P450,家族4,亚族F,
  D2HGDH   NM_152783   D-2-羟基戊二酸脱氢酶
  D4S234E   NM_014392   脑神经元细胞质蛋白1
  D4ST1   NM_130468   皮肤素4磺基转移酶1
  DAB2IP   NM_032552   DAB2相互作用蛋白同种型1
  DACH1   NM_004392   dachshund同源物1同种型c
  DACT2   NM_214462   Dapper同源物2,β-连锁蛋白拮抗剂
  DAPK3   NM_001348   死亡相关蛋白激酶3
  DBF4B   NM_025104   DBF4同源物B同种型2
  DBH   NM_000787   多巴胺β-羟化酶前体
  DBNDD2   NM_033542   SCF凋亡反应蛋白1同种型2
  DCAKD   NM_024819   含脱磷酸辅酶A激酶结构域
  DCAMKL1   NM_004734   双皮层蛋白和CaM激酶样1
  DCBLD2   NM_080927   含CUB和LCCL盘状结构域2
  DCTN3   NM_024348   动力蛋白激活蛋白3同种型2
  DCTN4   NM_016221   动力蛋白激活蛋白4(p62)
  DCTN5   NM_032486   动力蛋白激活蛋白4
  DCUN1D1   NM_020640   RP42同源物
  DCUN1D2   NM_001014283   假定蛋白LOC55208同种型b
  DCUN1D4   NM_015115   DCN1,缺乏带蛋白neddylation 1,结构域
  DCX   NM_000555   双皮层蛋白同种型a
  DDEF1   NM_018482   发育和分化增强因子
  DDEF2   NM_003887   发育和分化增强
  DDHD2   NM_015214   含DDHD结构域2
  DDI1   NM_001001711   假定蛋白LOC414301
  DDX11   NM_030655   DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)盒多肽11
  DDX17   NM_006386   DEAD盒多肽17同种型p82
  DDX19A   NM_018332   DDX19样蛋白
  DDX26B   NM_182540   假定蛋白LOC203522
  DDX28   NM_018380   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽28
  DDX31   NM_138620   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽31
  DDX3X   NM_001356   DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)盒多肽3
  DDX3Y   NM_004660   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽3
  DDX52   NM_007010   ATP依赖性RNA解旋酶ROK1同种型a
  DDX54   NM_024072   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽54
  DDX59   NM_031306   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽59
  DEADC1   NM_182503   含脱氨酶结构域1
  DEC1   NM_017418   在食道癌1中缺失
  DEDD   NM_032998   含死亡效应结构域的蛋白质
  DEFB4   NM_004942   防御素(defensin),β4前体
  DENND1A   NM_020946   假定蛋白LOC57706同种型1
  DENND2C   NM_198459   含DENN/MADD结构域2C
  DENND4A   NM_005848   c-myc启动子结合蛋白
  DENR   NM_003677   密度调控蛋白
  DEPDC4   NM_152317   含DEP结构域4
  DEPDC5   NM_014662   含DEP结构域5同种型1
  DERL3   NM_001002862   德林蛋白(dcrlin)-3蛋白同种型b
  DFFB   NM_001004285   DNA断裂因子,40kD,β
  DGAT2L4   NM_001002254   二酰基甘油O-酰基转移酶2样4
  DGCR13   NM_001024733   迪乔治综合症(DiGeorge syndrome)基因H
  DGCR2   NM_005137   整合膜蛋白DGCR2
  DGCR6   NM_005675   迪乔治综合症临界区域蛋白6
  DGCR6L   NM_033257   迪乔治综合症临界区域基因6样
  DGCR8   NM_022720   迪乔治综合症临界区域基因8
  DGKD   NM_003648   二酰基甘油激酶,δ130kDa同种型1
  DHDDS   NM_024887   脱氢多萜长醇二磷酸合成酶同种型a
  DHFR   NM_000791   二氢叶酸还原酶
  DHFRL1   NM_176815   二氢叶酸还原酶样1
  DHTKD1   NM_018706   脱氢酶E1和转酮醇酶结构域
  DHX30   NM_138614   DEAH(Asp-Glu-Ala-His)盒多肽30
  DHX33   NM_020162   DEAH(Asp-Glu-Ala-His)盒多肽33
  DHX35   NM_021931   DEAH(Asp-Glu-Ala-His)盒多肽35
  DIAPH1   NM_005219   透明1
  切酶1   NM_030621   切酶1
  DIO2   NM_000793   脱碘酶,碘代甲腺原氨酸,II型同种型a
  DIP   NM_015124   死亡诱导蛋白
  DIP2A   NM_015151   DIP2样蛋白同种型a
  DIRAS1   NM_145173   小型GTP结合肿瘤抑制因子1
  DIRAS2   NM_017594   Di-Ras2
  DIRC1   NM_052952   假定蛋白LOC116093
  DISC1   NM_001012957   在精神分裂症1同种型Lv中断裂
  DISP2   NM_033510   Dispatched B
  DIXDC1   NM_033425   含DIX结构域1同种型b
  dJ341D10.1   NM_001007535   假定蛋白LOC286453
  DKC1   NM_001363   角化不良蛋白(dyskerin)
  DKFZp434I1020   NM_194295   假定蛋白LOC196968
  DKFZp434K191   NM_001029950   假定蛋白LOC29797
  DKFZp434N035   NM_032262   假定蛋白LOC84222
  DKFZp451A211   NM_001003399   假定蛋白LOC400169
  DKFZP564O0823   NM_015393   DKFZP564O0823蛋白
  DKFZP586D0919   NM_206914   假定蛋白LOC25895同种型b
  DKFZp666G057   NM_001008226   假定蛋白LOC283726
  DKFZp667M2411   NM_207323   假定蛋白LOC147172
  DKFZp686I15217   NM_207495   假定蛋白LOC401232
  DKFZp686O24166   NM_001009913   假定蛋白LOC374383
  DKFZp761E198   NM_138368   假定蛋白LOC91056
  DKFZP761H1710   NM_031297   假定蛋白LOC83459
  DKFZp761I2123   NM_031449   假定蛋白LOC83637同种型1
  DKFZp779B1540   NM_001010903   假定蛋白LOC389384
  DLEC1   NM_007335   在肺癌和食道癌中缺失1同种型
  DLEU7   NM_198989   在淋巴细胞性白血病7中缺失
  DLGAP2   NM_004745   大成虫盘(discs large)相关蛋白2
  DLGAP4   NM_014902   大成虫盘相关蛋白4同种型a
  DLK1   NM_001032997   δ样1同源物同种型2
  DLL1   NM_005618   δ样1
  DLL4   NM_019074   δ样4蛋白前体
  DLST   NM_001933   二氢硫辛酰胺S-琥珀酰转移酶(E2
  DMAP1   NM_019100  DNA甲基转移酶1相关蛋白1
  DMD   NM_000109  肌营养不良蛋白Dp427c同种型
  DMPK   NM_004409  强直性肌营养不良蛋白激酶
  DMRT2   NM_006557  双性基因和mab-3相关转录因子
  DMRTB1   NM_033067  DMRT样家族B,具有富脯氨酸C端
  DMTF1   NM_021145  细胞周期蛋白D结合myb样转录因子
  DNAJA2   NM_005880  DnaJ亚族A成员2
  DNAJA3   NM_005147  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族A,成员3
  DNAJA4   NM_018602  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族A,成员4
  DNAJB12   NM_001002762  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族B,成员12
  DNAJB14   NM_024920  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族B,成员14
  DNAJB4   NM_007034  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族B,成员4
  DNAJB5   NM_012266  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族B,成员5
  DNAJB6   NM_058246  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族B,成员6
  DNAJC18   NM_152686  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族C,成员18
  DNAJC5G   NM_173650  DnaJ(Hsp40)同源物,亚族C,成员5
  DNAJC9   NM_015190  DnaJ同源物,亚族C,成员9
  DNAL4   NM_005740  动力蛋白轻链4,纤毛轴
  DNALI1   NM_003462  纤毛轴动力蛋白轻链
  DNASE1L1   NM_001009932  脱氧核糖核酸酶I样1前体
  DNASE1L2   NM_001374  脱氧核糖核酸酶I样2
  DNM1L   NM_012062  发动蛋白(dynamin)1样蛋白同种型1
  DOCK2   NM_004946  胞质分裂提呈2的预测物
  DOCK3   NM_004947  胞质分裂提呈3
  DOCK5   NM_024940  胞质分裂提呈5
  DOK2   NM_003974  停靠蛋白2
  DOK4   NM_018110  酪氨酸激酶4的下游序列
  DOLPP1   NM_020438  长醇焦磷酸磷酸酶1
  DPF3   NM_012074  D4,锌指和双PHD指,家族3
  DPH2   NM_001384  白喉酰胺生物合成蛋白2同种型a
  DPP9   NM_139159  二肽酰肽酶9
  DPPA4   NM_018189  发育多能性相关4
  DPT   NM_001937  皮连蛋白(dermatopontin)前体
  DPY19L4   NM_181787  假定蛋白LOC286148
  DPYSL2   NM_001386  二氢嘧啶酶样2
  DPYSL3   NM_001387  二氢嘧啶酶样3
  DRD1   NM_000794  多巴胺受体D1
  DRD2   NM_000795  多巴胺受体D2长同种型
  DRD5   NM_000798  多巴胺受体D5
  DREV1   NM_016025  假定蛋白LOC51108
  DSC3   NM_024423  桥粒芯胶粘蛋白(desmocollin)3同种型Dsc3b前蛋白原
  DSCR10   NM_148676  假定蛋白LOC259234
  DSCR3   NM_006052  唐氏综合症(Down syndrome)临界区域蛋白3
  DTNA   NM_001390  短肌营养蛋白(dystrobrevin)α同种型1
  DUOX2   NM_014080  双重氧化酶2前体
  DUS1L   NM_022156  PP3111蛋白
  DUSP10   NM_007207  双特异性磷酸酶10同种型a
  DUSP13   NM_001007271  肌肉限制型双特异性磷酸酶
  DUSP2   NM_004418  双特异性磷酸酶2
  DUSP26   NM_024025  双特异性磷酸酶26
  DUSP3   NM_004090   双特异性磷酸酶3
  DUSP9   NM_001395   双特异性磷酸酶9
  DUX1   NM_012146   双同源异形盒,1
  DUXA   NM_001012729   假定蛋白LOC503835
  DVL1   NM_004421   散乱蛋白1同种型a
  DVL2   NM_004422   散乱蛋白2
  DVL3   NM_004423   散乱蛋白3
  DXYS155E   NM_005088   染色体X和Y(唯一)155上的DNA片段
  DYNC1I1   NM_004411   动力蛋白,细胞质,中间多肽1
  DYNC1LI2   NM_006141   动力蛋白,细胞质,轻链中间体
  DYNLT3   NM_006520   T复合物相关睾丸表达1样
  DYRK1A   NM_101395   双特异性酪氨酸-(Y)-磷酸化
  DYRK1B   NM_004714   双特异性酪氨酸-(Y)-磷酸化
  DZIP1   NM_014934   DAZ相互作用蛋白1同种型1
  DZIP3   NM_014648   锌指DAZ相互作用蛋白3
  E2F3   NM_001949   E2F转录因子3
  E2F7   NM_203394   E2F转录因子7
  EBI3   NM_005755   EB病毒(Epstein-Barr virus)诱导的基因3前体
  ECE2   NM_014693   内皮素转化酶2同种型A
  ECHDC1   NM_018479   含烯酰辅酶A水合酶结构域1
  ECHS1   NM_004092   线粒体短链烯酰辅酶A
  ECOP   NM_030796   EGFR共扩增且过度表达的蛋白
  EDA   NM_001005609   外胚层发育异常蛋白(ectodysplasin)A同种型EDA-A2
  EDA2R   NM_021783   X连锁外胚层发育异常蛋白受体
  EDAR   NM_022336   外胚层发育异常蛋白A受体
  EDARADD   NM_080738   EDAR相关死亡结构域同种型B
  EDG1   NM_001400   内皮分化,鞘脂
  EDN2   NM_001956   内皮素2
  EED   NM_152991   胚胎外层发育同种型b
  EEFSEC   NM_021937   硒蛋白翻译的延长因子
  EFCAB1   NM_024593   EF手形钙结合结构域1
  EFCAB4A   NM_173584   假定蛋白LOC283229
  EFCAB5   NM_198529   EF手形钙结合结构域5同种型1
  EFNA3   NM_004952   肝配蛋白(ephrin)A3
  EFNB1   NM_004429   肝配蛋白-B1前体
  EFNB2   NM_004093   肝配蛋白B2
  EFNB3   NM_001406   肝配蛋白-B3前体
  EFTUD1   NM_024580   延长因子Tu GTP结合结构域
  EGFL7   NM_016215   EGF样结构域,多重7
  EGLN1   NM_022051   Egl-9同源物1
  EGLN2   NM_017555   EGL-9(线虫)同源物2同种型2
  EGR3   NM_004430   早期生长反应3
  EHD1   NM_006795   含EH结构域1
  EHMT1   NM_024757   常染色质组蛋白甲基转移酶1
  NM_006709   HLA-B相关转录物8同种型a
  EIF1AX   NM_001412   X连锁真核翻译起始
  EIF2B2   NM_014239   真核翻译起始因子2B,
  EIF2B5   NM_003907   真核翻译起始因子2B,
  EIF2C1   NM_012199   真核翻译起始因子2C,1
  EIF2C2   NM_012154   真核翻译起始因子2C,2
  EIF2C4   NM_017629   真核翻译起始因子2C,4
  EIF2S2   NM_003908   真核翻译起始因子2β
  EIF3S10   NM_003750   真核翻译起始因子3,
  EIF3S8   NM_003752   真核翻译起始因子3,
  EIF4B   NM_001417   真核翻译起始因子4B
  EIF4E   NM_001968   真核翻译起始因子4E
  EIF4E3   NM_173359   真核翻译起始因子4E
  EIF4EBP2   NM_004096   真核翻译起始因子4E
  EIF4G1   NM_004953   真核翻译起始因子4
  EIF5A   NM 001970   真核翻译起始因子5A
  EIF5A2   NM_020390   eIF-5A2蛋白
  ELAC1   NM_018696   elaC同源物1
  ELAVL1   NM_001419   ELAV样1
  ELF4   NM_001421   E74样因子4(ets结构域转录
  ELL   NM_006532   延长因子RNA聚合酶II
  ELL2   NM_012081   延长因子,RNA聚合酶II,2
  Ells1   NM_152793   假定蛋白LOC222166
  ELMO2   NM_133171   吞噬和细胞运动性2
  ELMOD1   NM_018712   含ELMO结构域1
  ELOVL1   NM_022821   极长链脂肪酸的延长
  ELOVL2   NM_017770   极长链脂肪酸的延长
  ELOVL5   NM_021814   酵母长链多不饱和的同源物
  ELOVL6   NM_024090   ELOVL家族成员6,长链延长
  ELOVL7   NM_024930   ELOVL家族成员7,长链延长
  ELP3   NM_018091   延长蛋白3同源物
  EMCN   NM_016242   内粘蛋白(endomucin)
  EMILIN3   NM_052846   弹性微原纤维界面蛋白3
  EML5   NM_183387   棘皮动物微管相关蛋白样
  EMR2   NM_013447   含egf样模块,粘蛋白样,激素
  EMR3   NM_152939   含egf样模块粘蛋白样受体3
  EMX1   NM_004097   空孔同源物1同种型1
  EN2   NM_001427   锯齿状同源物2
  ENAH   NM_001008493   激活同源物同种型a
  ENC1   NM_003633   外胚层-神经皮层(具有BTB样结构域)
  ENG   NM_000118   内皮连蛋白(cndoglin)前体
  ENPP4   NM_014936   外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶
  ENSA   NM_207043   内磺肽α同种型2
  ENTPD6   NM_001247   外核苷三磷酸二磷酸水解酶
  ENTPD7   NM_020354   外核苷三磷酸二磷酸水解酶
  EPB41L1   NM_012156   红细胞膜蛋白带4.1样1
  EPB41L4B   NM_018424   红细胞膜蛋白带4.1样4B
  EPB41L5   NM_020909   红细胞膜蛋白带4.1样5
  EPB49   NM_001978   红细胞膜蛋白带4.9(成束蛋白)
  EPHA1   NM_005232   肝配蛋白受体EphA1
  EPHA7   NM_004440   肝配蛋白受体EphA7
  EPHB2   NM_004442   肝配蛋白受体EphB2同种型2前体
  EPHB4   NM_004444   肝配蛋白受体EphB4前体
  EPHX2   NM_001979   环氧化物水解酶2,细胞质
  EPM2AIP1   NM_014805   EPM2A相互作用蛋白1
  EPS8L2   NM_022772   表皮生长因子受体路径
 ERGIC1   NM_001031711   内质网-高尔基中间体
 ERN2   NM_033266   内质网对核信号转导2
 ESAM   NM_138961   内皮细胞粘附分子
 ESPN   NM_031475   艾斯蛋白(espin)
 ESR1   NM_000125   雌激素受体1
 ESRRA   NM_004451   雌激素相关受体α
 ESRRG   NM_001438   雌激素相关受体γ同种型1
 ET   NM_024311   假定蛋白LOC79157
 ETS1   NM_005238   v-ets成红细胞增多病病毒E26致癌基因
 ETS2   NM_005239   v-ets成红细胞增多病病毒E26致癌基因
 ETV1   NM_004956   ets变异基因1
 ETV6   NM_001987   ets变异基因6
 EVI5   NM_005665   亲嗜性病毒整合位点5
 EVL   NM_016337   Enah/Vasp样
 EXOC2   NM_018303   Sec5蛋白
 EXOC4   NM_021807   SEC8蛋白同种型a
 EXOC5   NM_006544   SEC10蛋白
 EXOC7   NM_001013839   胞吐囊复合物组分7同种型a
 EXOD1   NM_080663   假定蛋白LOC112479
 EXOSC1   NM_016046   外体核心蛋白CSL4
 EXOSC10   NM_001001998   外体组分10同种型1
 EXT2   NM_000401   外来素(exostosin)2
 EXTL3   NM_001440   Reg受体
 EYA1   NM_000503   缺眼(eyes absent)1同种型b
 EZH1   NM_001991   zeste同源物1的增强子
 F11R   NM_016946   F11受体同种型a前体
 F2RL1   NM_005242   凝血因子II(凝血酶)受体样1
 F7   NM_000131   凝血因子VII前体,同种型a
 FABP2   NM_000134   肠型脂肪酸结合蛋白2
 FADS1   NM_013402   脂肪酸去饱和酶1
 FADS2   NM_004265   脂肪酸去饱和酶2
 FADS6   NM_178128   脂肪酸去饱和酶结构域家族,成员6
 FAIM2   NM_012306   Fas凋亡抑制分子2
 FALZ   NM_004459   胎儿阿尔茨海默抗原同种型2
 FAM101A   NM_181709   假定蛋白LOC144347
 FAM102A   NM_203305   早期雌激素诱导基因1蛋白同种型b
 FAM107A   NM_007177   肾细胞癌中下调
 FAM107B   NM_031453   假定蛋白LOC83641
 FAM111A   NM_022074   假定蛋白LOC63901
 FAM116A   NM_152678   假定蛋白LOC201627
 FAM11A   NM_032508   具有序列类似性的家族11,成员A
 FAM18B   NM_016078   假定蛋白LOC51030
 FAM20B   NM_014864   具有序列类似性20的家族,成员B
 FAM29A   NM_017645   假定蛋白LOC54801
 FAM32A   NM_014077   假定蛋白LOC26017
 FAM38A   NM_014745   具有序列类似性38的家族,成员A
 FAM3A   NM_021806   家族3,成员A蛋白
 FAM43B   NM_207334   假定蛋白LOC163933
 FAM46C   NM_017709   假定蛋白LOC54855
 FAM50A   NM_004699   XAP-5蛋白
 FAM53A   NM_001013622  背神经管核蛋白
 FAM54B   NM_019557  假定蛋白LOC56181
 FAM55C   NM_145037  假定蛋白LOC91775
 FAM57B   NM_031478  假定蛋白LOC83723
 FAM58A   NM_152274  假定蛋白LOC92002
 FAM59A   NM_022751  假定蛋白LOC64762
 FAM60A   NM_021238  具有序列类似性的家族60,成员A
 FAM62A   NM_015292  具有序列类似性的家族62(C2结构域
 FAM63A   NM_018379  假定蛋白LOC55793同种型1
 FAM63B   NM_019092  假定蛋白LOC54629
 FAM70A   NM_017938  假定蛋白LOC55026
 FAM73A   NM_198549  假定蛋白LOC374986
 FAM78A   NM_033387  假定蛋白LOC286336
 FAM78B   NM_001017961  假定蛋白LOC149297
 FAM79A   NM_182752  假定蛋白LOC127262
 FAM79B   NM_198485  假定蛋白LOC285386
 FAM81A   NM_152450  假定蛋白LOC145773
 FAM84B   NM_174911  乳腺癌膜蛋白101
 FAM86B1   NM_032916  假定蛋白LOC85002
 FAM86C   NM_018172  假定蛋白LOC55199同种型1
 FAM89A   NM_198552  假定蛋白LOC375061
 FAM89B   NM_152832  小鼠乳腺肿瘤病毒受体同源物1
 FAM91A1   NM_144963  假定蛋白LOC157769
 FAM98B   NM_173611  假定蛋白LOC283742
 FAM99A   NM_001014374  假定蛋白LOC387742
 FANCA   NM_000135  范可尼贫血(Fanconi anemia),互补群A同种型
 FANCE   NM_021922  范可尼贫血,互补群E
 FARSLA   NM_004461  苯丙氨酸-tRNA合成酶样蛋白
 FASN   NM_004104  脂肪酸合成酶
 FAT2   NM_001447  FAT肿瘤抑制因子2前体
 FBLN1   NM_006487  纤蛋白(fibulin)1同种型A前体
 FBXO17   NM_024907  F盒蛋白FBG4同种型2
 FBXO21   NM_015002  F盒仅蛋白21同种型2
 FBXO22   NM_147188  F盒仅蛋白22同种型a
 FBXO24   NM_012172  F盒仅蛋白24同种型2
 FBXO27   NM_178820  F盒蛋白27
 FBXO31   NM_024735  F盒蛋白31
 FBXO33   NM_203301  F盒蛋白33
 FBXO44   NM_001014765  F盒蛋白44同种型1
 FBXW11   NM_012300  F盒和WD-40结构域蛋白1B同种型C
 FBXW4   NM_022039  F盒和WD-40结构域蛋白4
 FBXW5   NM_018998  F盒和WD-40结构域蛋白5
 FBXW7   NM_001013415  F盒蛋白FBW7同种型3
 FCHO1   NM_015122  FCH结构域仅1
 FCHSD1   NM_033449  FCH和双SH3结构域1
 FCHSD2   NM_014824  FCH和双SH3结构域2
 FCMD   NM_006731  弗库庭蛋白(fukutin)
 FCRL2   NM_030764  Fc受体样2同种型b
 FCRL5   NM_031281  Fc受体样5
 FDFT1   NM_004462  法尼基-二磷酸法尼基转移酶1
  FECH   NM_000140   铁螯合酶同种型b前体
  FEM1C   NM_020177   雌性化1同源物a
  FES   NM_002005   V-FES猫类肉瘤病毒/V-FPS弗吉纳米(fujinami)禽类
  FEZ1   NM_022549   椎骨蛋白(zygin)1同种型2
  FEZ2   NM_005102   椎骨蛋白2
  FFAR3   NM_005304   G蛋白偶联受体41
  FGD3   NM_033086   含FYVE、RhoGEF和PH结构域3
  FGF11   NM_004112   纤维母细胞生长因子11
  FGF19   NM_005117   纤维母细胞生长因子19前体
  FGF2   NM_002006   纤维母细胞生长因子2
  FGF23   NM_020638   纤维母细胞生长因子23前体
  FGF7   NM_002009   纤维母细胞生长因子7前体
  FGFR1   NM_023107   纤维母细胞生长因子受体1同种型5
  FGFR1OP   NM_007045   FGFR1致癌基因配体同种型a
  FGFR2   NM_000141   纤维母细胞生长因子受体2同种型1
  FGFR3   NM_000142   纤维母细胞生长因子受体3同种型1
  FGFR4   NM_002011   纤维母细胞生长因子受体4同种型1
  FGL1   NM_004467   纤维蛋白原样1前体
  FGR   NM_005248   加德诺-拉希德(Gardner-Rasheed)猫类肉瘤病毒(v-fgr)
  FHL1   NM_001449   4个半LIM结构域1
  FHL2   NM_001450   4个半LIM结构域2
  FIBCD1   NM_032843   含纤维蛋白原C结构域1
  FIGF   NM_004469   血管内皮生长因子D
  FIS   NM_175616   假定蛋白LOC202299
  FKBP10   NM_021939   FK506结合蛋白10,65kDa
  FKBP1A   NM_000801   FK506结合蛋白1A
  FKBP1B   NM_004116   FK506结合蛋白1B同种型a
  FKBP5   NM_004117   FK506结合蛋白5
  FKBP9   NM_007270   FK506结合蛋白9
  FKBP9L   NM_182827   FK506结合蛋白9样
  FKRP   NM_024301   fukutin蛋白相关蛋白
  FKSG44   NM_031904   FKSG44蛋白
  FLCN   NM_144997   卵巢滤泡激素(folliculin)同种型1
  FLJ10159   NM_018013   假定蛋白LOC55084
  FLJ10324   NM_018059   假定蛋白LOC55698
  FLJ10769   NM_018210   假定蛋白LOC55739
  FLJ10803   NM_018224   假定蛋白LOC55744
  FLJ10916   NM_018271   假定蛋白LOC55258
  FLJ10945   NM_018280   假定蛋白LOC55267
  FLJ11259   NM_018370   假定蛋白LOC55332
  FLJ11292   NM_018382   假定蛋白LOC55338
  FLJ11506   NM_024666   假定蛋白LOC79719
  FLJ11783   NM_024891   假定蛋白LOC79951
  FLJ11806   NM_024824   核蛋白UKp68同种型1
  FLJ12118   NM_024537   假定蛋白LOC79587
  FLJ12529   NM_024811   前mRNA裂解因子I,59kDa亚单位
  FLJ12700   NM_024910   假定蛋白LOC79970
  FLJ12716   NM_199053   假定蛋白LOC60684同种型b
  FLJ12788   NM_022492   假定蛋白LOC64427
  FLJ13841   NM_024702   假定蛋白LOC79755
  FLJ14001   NM_024677   假定蛋白LOC79730
  FLJ14107   NM_025026   假定蛋白LOC80094
  FLJ14154   NM_024845   假定蛋白LOC79903
  FLJ14213   NM_024841   假定蛋白LOC79899
  FLJ14816   NM_032845   假定蛋白LOC84931
  FLJ16008   NM_001001665   假定蛋白LOC339761
  FLJ16165   NM_001004318   假定蛋白LOC390928
  FLJ20032   NM_017628   假定蛋白LOC54790
  FLJ20186   NM_207514   差异表达于FDCP8同种型1中
  FLJ20232   NM_019008   假定蛋白LOC54471
  FLJ20298   NM_017752   假定蛋白LOC54885同种型a
  FLJ20487   NM_017841   假定蛋白LOC54949
  FLJ20551   NM_017875   假定蛋白LOC54977
  FLJ20558   NM_017880   假定蛋白LOC54980
  FLJ20699   NM_017931   假定蛋白LOC55020
  FLJ20701   NM_017933   假定蛋白LOC55022
  FLJ20758   NM_017952   假定蛋白LOC55037
  FLJ20850   NM_017967   假定蛋白LOC55049
  FLJ21125   NM_024627   假定蛋白LOC79680
  FLJ21687   NM_024859   含PDZ结构域,X染色体
  FLJ21736   NM_024922   酯酶31
  FLJ21742   NM_032207   假定蛋白LOC84167
  FLJ21945   NM_025203   假定蛋白LOC80304
  FLJ21986   NM_024913   假定蛋白LOC79974
  FLJ22349   NM_024821   假定蛋白LOC79879
  FLJ22374   NM_032222   假定蛋白LOC84182
  FLJ23436   NM_024671   假定蛋白LOC79724
  FLJ25102   NM_182626   假定蛋白LOC348738
  FLJ25143   NM_182500   假定蛋白LOC130813
  FLJ25169   NM_152568   假定蛋白LOC157848
  FLJ25222   NM_199163   假定蛋白LOC374666
  FLJ25410   NM_144605   假定蛋白LOC124404
  FLJ25476   NM_152493   假定蛋白LOC149076
  FLJ27255   NM_207501   假定蛋白LOC401281
  FLJ30294   NM_144632   假定蛋白LOC130827
  FLJ30313   NM_152757   假定蛋白LOC253868
  FLJ31132   NM_001004355   假定蛋白LOC441522
  FLJ32011   NM_182516   假定蛋白LOC148930
  FLJ32028   NM_152680   假定蛋白LOC201799
  FLJ32063   NM_153031   假定蛋白LOC150538
  FLJ32252   NM_182510   假定蛋白LOC146336
  FLJ33708   NM_173675   假定蛋白LOC285780
  FLJ35220   NM_173627   假定蛋白LOC284131
  FLJ35424   NM_173661   假定蛋白LOC285492
  FLJ35429   NM_001003807   假定蛋白LOC285830
  FLJ35530   NM_207467   假定蛋白LOC400798
  FLJ35695   NM_207444   假定蛋白LOC400359
  FLJ35740   NM_147195   FLJ35740蛋白
  FLJ35767   NM_207459   假定蛋白LOC400629
  FLJ35880   NM_153264   假定蛋白LOC256076
  FLJ36070   NM_182574   假定蛋白LOC284358
  FLJ36208   NM_176677   假定蛋白LOC283948
  FLJ36492   NM_182568   假定蛋白LOC284047
  FLJ36888   NM_178830   假定蛋白LOC126526
  FLJ37357   NM_173645   假定蛋白LOC284944
  FLJ37478   NM_178557   假定蛋白LOC339983
  FLJ37538   NM_173564   假定蛋白FLJ37538
  FLJ37543   NM_173667   假定蛋白LOC285668
  FLJ38723   NM_173805   假定蛋白FLJ38723
  FLJ38973   NM_153689   假定蛋白LOC205327
  FLJ39237   NM_198571   假定蛋白LOC375607
  FLJ39827   NM_152424   假定蛋白LOC139285
  FLJ40142   NM_207435   假定蛋白LOC400073
  FLJ40172   NM_173649   假定蛋白LOC285051
  FLJ40288   NM_173682   假定蛋白LOC286023
  FLJ40432   NM_152523   假定蛋白LOC151195
  FLJ40504   NM_173624   假定蛋白LOC284085
  FLJ41046   NM_207479   假定蛋白LOC400940
  FLJ41423   NM_001001679   假定蛋白LOC399886
  FLJ41821   NM_001001697   假定蛋白LOC401011
  FLJ41993   NM_001001694   假定蛋白LOC400935
  FLJ42102   NM_001001680   假定蛋白LOC399923
  FLJ42133   NM_001001690   假定蛋白LOC400844
  FLJ42289   NM_207383   假定蛋白LOC388182
  FLJ42291   NM_207367   假定蛋白LOC346547
  FLJ43093   NM_207498   假定蛋白LOC401258
  FLJ43339   NM_207380   假定蛋白LOC388115
  FLJ43582   NM_207412   假定蛋白LOC389649
  FLJ43980   NM_001004299   假定蛋白LOC124149
  FLJ44385   NM_207478   假定蛋白LOC400934
  FLJ44815   NM_207454   假定蛋白LOC400591
  FLJ44968   NM_198537   假定蛋白LOC374887
  FLJ45079   NM_001001685   假定蛋白LOC400624
  FLJ45121   NM_207451   假定蛋白LOC400556
  FLJ45248   NM_207505   假定蛋白LOC401472
  FLJ45300   NM_001001681   假定蛋白LOC399957
  FLJ45422   NM_001004349   假定蛋白LOC441140
  FLJ45455   NM_207386   假定蛋白LOC388336
  FLJ45537   NM_001001709   假定蛋白LOC401535
  FLJ45645   NM_198557   假定蛋白LOC375287
  FLJ45684   NM_207462   假定蛋白LOC400666
  FLJ45831   NM_001001684   假定蛋白LOC400576
  FLJ45964   NM_207483   假定蛋白LOC401040
  FLJ45966   NM_001001700   假定蛋白LOC401120
  FLJ45974   NM_001001707   假定蛋白LOC401337
  FLJ46020   NM_207472   假定蛋白LOC400863
  FLJ46026   NM_207458   假定蛋白LOC400627
  FLJ46082   NM_207417   假定蛋白LOC389799
  FLJ46154   NM_198462   FLJ46154蛋白
  FLJ46210   NM_001004315   假定蛋白LOC389152
  FLJ46230   NM_207463  假定蛋白LOC400679
  FLJ46257   NM_001001693  假定蛋白LOC400932
  FLJ46347   NM_001005303  假定蛋白LOC389064
  FLJ46358   NM_207439  假定蛋白LOC400110
  FLJ46363   NM_207434  假定蛋白LOC400002
  FLJ46365   NM_207504  假定蛋白LOC401459
  FLJ46385   NM_001001675  假定蛋白LOC390963
  FLJ46481   NM_207405  假定蛋白LOC389197
  FLJ46831   NM_207426  叉头盒I2
  FLJ46838   NM_001007546  假定蛋白LOC440865
  FLJ90166   NM_153360  假定蛋白LOC164284
  FLJ90579   NM_173591  假定蛋白LOC283310
  FLJ90650   NM_173800  拉维蛋白(laeverin)
  FLJ90709   NM_173514  假定蛋白LOC153129
  FLNA   NM_001456  细丝蛋白(filamin)1(肌动蛋白结合蛋白-280)
  FLNB   NM_001457  细丝蛋白B,β(肌动蛋白结合蛋白278)
  FLOT2   NM_004475  脂筏特异蛋白(flotillin)2
  FLRT2   NM_013231  富含纤维粘连蛋白(fibronectin)亮氨酸的跨膜蛋白
  FLT3   NM_004119  Fms相关酪氨酸激酶3
  FLYWCH1   NM_032296  FLYWCH型锌指1同种型a
  FMNL1   NM_005892  成蛋白(formin)样1
  FMNL3   NM_175736  成蛋白样3同种型1
  FN3KRP   NM_024619  果糖胺-3-激酶相关蛋白
  FNDC3A   NM_014923  含III型纤维粘连蛋白结构域3A
  FNDC3B   NM_022763  含III型纤维粘连蛋白结构域3B
  FNDC4   NM_022823  含III型纤维粘连蛋白结构域4
  FNDC5   NM_153756  含III型纤维粘连蛋白结构域5
  FNDC7   NM_173532  假定蛋白LOC163479
  FNDC8   NM_017559  假定蛋白LOC54752
  FNTA   NM_001018676  法尼基转移酶,CAAX盒,α同种型b
  FNTB   NM_002028  法尼基转移酶,CAAX盒,β
  FOLR2   NM_000803  叶酸受体2前体
  FOSB   NM_006732  FBJ鼠类骨肉瘤病毒致癌基因同源物
  FOSL1   NM_005438  FOS样抗原1
  FOSL2   NM_005253  FOS样抗原2
  FOXA3   NM_004497  叉头盒A3
  FOXF1   NM_001451  叉头盒F1
  FOXL2   NM_023067  叉头盒L2
  FOXN1   NM_003593  叉头盒N1
  FOXO1A   NM_002015  叉头盒O1A
  FOXP4   NM_001012426  叉头盒P4同种型1
  FOXRED1   NM_017547  含FAD依赖性氧化还原酶结构域
  FRAG1   NM_014489  FGF受体活化蛋白1
  FRAS1   NM_032863  弗雷泽综合症(Fraser syndrome)1同种型4
  FRAT1   NM_005479  GSK-3结合蛋白FRAT1
  FREQ   NM_014286  频蛋白(frequenin)同源物
  FRMD4A   NM_018027  含FERM结构域4A
  FRMD6   NM_152330  含FERM结构域6
  FRMPD1   NM_014907  含FERM和PDZ结构域1
  FRMPD2   NM_152428  含FERM和PDZ结构域2同种型1
 FRMPD4   NM_014728  含PDZ结构域10
 FRY   NM_023037  假定蛋白CG003
 FSD1   NM_024333  含III型纤维粘连蛋白和SPRY结构域
 FSD2   NM_001007122  含SPRY结构域1
 FSIP2   NM_173651  纤维鞘相互作用蛋白2
 FSTL1   NM_007085  抑滤泡素样1前体
 FSTL3   NM_005860  抑滤泡素样3糖蛋白前体
 FSTL4   NM_015082  抑滤泡素样4
 FUBP1   NM_003902  远上游元件结合蛋白
 FUCA1   NM_000147  岩藻糖苷酶,α-L-1,组织
 FURIN   NM_002569  弗林蛋白酶(furin)前蛋白原
 FUT1   NM_000148  岩藻糖转移酶1
 FUT2   NM_000511  岩藻糖转移酶2(包括分泌物状态)
 FUT3   NM_000149  岩藻糖转移酶3(半乳糖苷
 FUT4   NM_002033  岩藻糖转移酶4
 FVT1   NM_002035  滤泡淋巴瘤变异易位1
 FXN   NM_000144  弗氏共济失调蛋白(frataxin)同种型1前蛋白原
 FXYD2   NM_001680  含FXYD结构域的离子转运调控因子2
 FXYD6   NM_022003  含FXYD结构域的离子转运调控因子
 FYCO1   NM_024513  含FYVE和卷曲螺旋结构域1
 FZD10   NM_007197  卷曲10
 FZD4   NM_012193  卷曲4
 FZD6   NM_003506  卷曲6
 FZD7   NM_003507  卷曲7
 FZD9   NM_003508  卷曲9
 G0S2   NM_015714  假定淋巴细胞G0/G1开关基因
 G3BP2   NM_012297  Ras-GTPase活化蛋白SH3结构域结合
 G6PD   NM_000402  葡萄糖-6-磷酸脱氢酶
 GAA   NM_000152  酸性α-葡糖苷酶前蛋白原
 GAB2   NM_012296  GRB2相关结合蛋白2同种型b
 GAB3   NM_080612  Gab3蛋白
 GABARAPL1   NM_031412  GABA(A)受体相关蛋白样1
 GABBR1   NM_001470  γ-氨基丁酸(GABA)B受体1
 GABPA   NM_002040  GA结合蛋白转录因子,α
 GABRA1   NM_000806  γ-氨基丁酸(GABA)A受体,α
 GABRE   NM_004961  γ-氨基丁酸(GABA)A受体
 GABRP   NM_014211  γ-氨基丁酸(GABA)A受体,π
 GADD45G   NM_006705  生长停滞和DNA破坏诱导性,γ
 GAGE1   NM_001468  G抗原1
 GAK   NM_005255  细胞周期蛋白G相关激酶
 GALC   NM_000153  半乳糖神经酰胺酶同种型a前体
 GALM   NM_138801  半乳糖变旋酶(醛糖1-差向异构酶)
 GALNT1   NM_020474  多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶1
 GALNT11   NM_022087  GALNAC-T11
 GALNT13   NM_052917  UDP-N-乙酰基-α-D-半乳糖胺:多肽
 GALNT2   NM_004481  多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶2
 GALNT4   NM_003774  多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶4
 GALNT7   NM_017423  多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶7
 GALNT9   NM_021808  多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶9
 GAN   NM_022041  巨轴突蛋白(gigaxonin)
  GANAB   NM_198334  α葡糖苷酶IIα亚单位同种型2
  GARNL1   NM_014990  GTPase活化Rap/RanGAP结构域样1
  GARNL4   NM_015085  GTPase活化Rap/RanGAP结构域样4
  GAS2L1   NM_152237  生长停滞特异性2样1同种型b
  GAS7   NM_003644  生长停滞特异性7同种型a
  GATA2   NM_032638  GATA结合蛋白2
  GATA4   NM_002052  GATA结合蛋白4
  GATA5   NM_080473  GATA结合蛋白5
  GATAD2A   NM_017660  含GATA锌指结构域2A
  GATAD2B   NM_020699  含GATA锌指结构域2B
  GBA   NM_000157  葡糖脑苷脂酶前体
  GBF1   NM_004193  高尔基特异性布雷菲德菌素(brefeldin)A抗性因子1
  GBL   NM_022372  G蛋白β亚单位样
  GCC1   NM_024523  高尔基卷曲螺旋蛋白1
  GCC2   NM_014635  含GRIP和卷曲螺旋结构域2同种型
  GCK   NM_000162  葡糖激酶同种型1
  GCLC   NM_001498  谷氨酸-半胱氨酸连接酶,催化性亚单位
  GCM1   NM_003643  胶质细胞丢失同源物a
  GCNT3   NM_004751  葡糖胺(N-乙酰)转移酶3,粘蛋白
  GDI2   NM_001494  GDP解离抑制剂2
  GDPD2   NM_017711  成骨细胞分化促进因子
  基因符号   hsa-miR-16靶标  基因名称
  GFAP   NM_002055  胶质纤维酸性蛋白
  GFER   NM_005262  erv1样生长因子
  GFI1B   NM_004188  生长因子非依赖性1B(潜力
  GFM1   NM_024996  G延长因子,线粒体1
  GFPT1   NM_002056  葡糖胺-果糖-6-磷酸
  GFRA4   NM_022139  GDNF家族受体α4同种型a
  GGA2   NM_015044  ADP-核糖基化因子结合蛋白2
  GGA3   NM_014001  ADP-核糖基化因子结合蛋白3
  GH1   NM_022562  生长激素1同种型5
  GH2   NM_022557  生长激素2同种型2
  GHR   NM_000163  生长激素受体前体
  G1MAP5   NM_018384  GTPase,IMAP家族成员5
  GIT1   NM_014030  G蛋白偶联受体激酶结合因子因子1
  GJA4   NM_002060  间隙连接蛋白(connexin)37
  GLCE   NM_015554  D-葡糖醛酸基C5-差向异构酶
  GLIS3   NM_152629  GLIS家族锌指3
  GLRX   NM_002064  谷氧还蛋白(巯基转移酶)
  GLS   NM_014905  谷氨酰胺酶C
  GLS2   NM_013267  谷氨酰胺酶GA同种型a
  GLT1D1   NM_144669  假定蛋白LOC144423
  GLT25D2   NM_015101  含糖基转移酶25结构域2
  GLTP   NM_016433  糖脂转移蛋白
  GLUD1   NM_005271  谷氨酸脱氢酶1
  GLUD2   NM_012084  谷氨酸脱氢酶2
  GM2A   NM_000405  GM2神经节苷脂活化因子前体
  GM632   NM_020713  假定蛋白LOC57473
  GMEB2   NM_012384  糖皮质激素调节元件结合
  GNA12   NM_007353  鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白)
  GNA15   NM_002068   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),
  GNAI3   NM_006496   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),
  GNAL   NM_002071   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),
  GNAO1   NM_020988   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白,α
  GNAQ   NM_002072   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),
  GNAS   NM_016592   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白,α
  GNB1   NM_002074   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白,β-1
  GNG12   NM_018841   G-蛋白γ-12亚单位
  GNG2   NM_053064   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),
  GNG7   NM_052847   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),
  GNL3L   NM_019067   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白样3
  GOLGA   NM_018652   高尔基体蛋白(golgin)样蛋白
  GOLGA1   NM_002077   高尔基体蛋白97
  GOLGA2   NM_004486   高尔基体自身抗原,高尔基体蛋白亚族a,2
  GOLGA3   NM_005895   高尔基体自身抗原,高尔基体蛋白亚族a,3
  GOLGA4   NM_002078   高尔基体自身抗原,高尔基体蛋白亚族a,4
  GOLGA7   NM_001002296   高尔基体自身抗原,高尔基体蛋白亚族a,7
  GOLPH4   NM_014498   高尔基磷蛋白4
  GOLT1B   NM_016072   高尔基转运1同源物B
  GORASP1   NM_031899   高尔基再组装堆叠蛋白1
  GORASP2   NM_015530   高尔基再组装堆叠蛋白2
  GOSR1   NM_001007024   高尔基SNAP受体复合物成员1同种型3
  GOT2   NM_002080   天冬氨酸转氨酶2前体
  GPA33   NM_005814   跨膜糖蛋白A33前体
  GPAM   NM_020918   线粒体甘油3-磷酸
  GPATC4   NM_015590   含G补丁结构域4蛋白同种型1
  GPC1   NM_002081   磷脂酰肌醇蛋白聚糖(glypican)1前体
  GPC3   NM_004484   磷脂酰肌醇蛋白聚糖3
  GPD1   NM_005276   甘油-3-磷酸脱氢酶1(可溶)
  GPIAP1   NM_005898   膜组分染色体11表面标志物
  GPR109A   NM_177551   G蛋白偶联受体109A
  GPR109B   NM_006018   G蛋白偶联受体109B
  GPR114   NM_153837   G-蛋白偶联受体114
  GPR124   NM_032777   G蛋白偶联受体124
  GPR126   NM_001032394   G蛋白偶联受体126α2
  GPR132   NM_013345   G蛋白偶联受体132
  GPR146   NM_138445   G蛋白偶联受体146
  GPR171   NM_013308   G蛋白偶联受体171
  GPR180   NM_180989   G蛋白偶联受体180前体
  GPR23   NM_005296   G蛋白偶联受体23
  GPR26   NM_153442   G蛋白偶联受体26
  GPR30   NM_001505   G蛋白偶联受体30
  GPR55   NM_005683   G蛋白偶联受体55
  GPR6   NM_005284   G蛋白偶联受体6
  GPR63   NM_030784   G蛋白偶联受体63
  GPR68   NM_003485   G蛋白偶联受体68
  GPR78   NM_080819   G蛋白偶联受体78
  GPR83   NM_016540   G蛋白偶联受体83
  GPR88   NM_022049   G-蛋白偶联受体88
  GPR92   NM_020400   假定G蛋白偶联受体92
  GPS1   NM_004127   G蛋白路径抑制因子1同种型2
  GPSM3   NM_022107   G-蛋白信号转导调节剂3(AGS3样,C.
  GPX1   NM_000581   谷胱甘肽过氧化物酶1同种型1
  GRAMD2   NM_001012642   假定蛋白LOC196996
  GRAMD3   NM_023927   含GRAM结构域3
  GRB10   NM_001001549   生长因子受体结合蛋白10同种型
  GRB2   NM_002086   生长因子受体结合蛋白2同种型
  GRB7   NM_001030002   生长因子受体结合蛋白7
  GREM2   NM_022469   格雷穆蛋白(gremlin)2前体
  GRIA3   NM_000828   谷氨酸受体3同种型反转前体
  GRIK3   NM_000831   谷氨酸受体7前体
  GRIN1   NM_000832   NMDA受体1同种型NR1-1前体
  GRIN2B   NM_000834   N-甲基-D-天冬氨酸受体亚单位2B
  GRIN2C   NM_000835   N-甲基-D-天冬氨酸受体亚单位2C
  GRIN3A   NM_133445   谷氨酸受体,离子型
  GRK6   NM_001004106   G蛋白偶联受体激酶6同种型A
  GRM1   NM_000838   谷氨酸受体,代谢型1
  GRM7   NM_000844   谷氨酸受体,代谢型7同种型a
  GRPR   NM_005314   胃泌素释放肽受体
  GRTP1   NM_024719   生长激素调控型TBC蛋白1
  GRWD1   NM_031485   含富谷氨酸WD重复序列的1
  GSDMDC1   NM_024736   含加斯德蛋白(gasdermin)结构域1
  GSG1   NM_153823   生殖细胞相关1同种型2
  GSTT2   NM_000854   谷胱甘肽S-转移酶02
  GTDC1   NM_001006636   含糖基转移酶样结构域1
  GTF3C5   NM_012087   通用转录因子IIIC,多肽
  GTPBP1   NM_004286   GTP结合蛋白1
  GTPBP8   NM_001008235   假定蛋白LOC29083同种型3
  GUCA1B   NM_002098   鸟苷酸环化酶活化因子1B(视网膜)
  GUSBL2   NM_206910   假定蛋白LOC375513同种型2
  GYLTL1B   NM_152312   糖基转移酶样1B
  GYS1   NM_002103   糖原合成酶1(肌肉)
  H2AFJ   NM_018267   H2A组蛋白家族,成员J同种型1
  H2-A   NM_080386   α-微管蛋白同型H2-α
  H6PD   NM_004285   己糖-6-磷酸脱氢酶前体
  HADHSC   NM_005327   L-3-羟基酰基辅酶A脱氢酶
  HAPLN4   NM_023002   脑连接蛋白2
  HARSL   NM_012208   组氨酰-tRNA合成酶样
  HAS1   NM_001523   乙酰透明质酸合成酶1
  HAS2   NM_005328   乙酰透明质酸合成酶2
  HAS3   NM_005329   乙酰透明质酸合成酶3同种型a
  HCCA2   NM_053005   HCCA2蛋白
  HCFC1   NM_005334   宿主细胞因子C1(VP16-辅助蛋白)
  HD   NM_002111   亨廷顿蛋白(huntingtin)
  HDGF   NM_004494   肝癌来源的生长因子(高运动性
  HECTD1   NM_015382   含HECT结构域1
  HECW1   NM_015052   NEDD4样泛素-蛋白连接酶1
  HELZ   NM_014877   具有锌指结构域的解旋酶
  HEMK1   NM_016173   HemK甲基转移酶家族成员1
  HERC2   NM_004667   hcct结构域和RLD 2
  HERC4   NM_001017972   hect结构域和RLD 4同种型c
  HERC6   NM_001013000   hect结构域和RLD 6同种型c
  HERV-FRD   NM_207582   HERV-FRD前病毒祖先Env多聚蛋白
  HES2   NM_019089   发状分裂相关增强子同源物2
  HES5   NM_001010926   发状分裂相关增强子5
  HEXA   NM_000520   氨基己糖苷酶A前蛋白原
  HEY1   NM_012258   与YRPW基序相关的发状分裂增强子
  HEY2   NM_012259   与YRPW基序相关的发状分裂增强子
  HEYL   NM_014571   与YRPW相关的发状分裂增强子
  HIC1   NM_006497   癌症1中高甲基化
  HIC2   NM_015094   癌症2中高甲基化
  HIGD1A   NM_014056   HIG1结构域家族,成员1A
  HIP1   NM_005338   亨廷顿蛋白相互作用蛋白1
  HIRA   NM_003325   HIR(组蛋白细胞周期调控缺陷型,S.
  HIST1H2AG   NM_021064   H2A组蛋白家族,成员P
  HIST2H2BE   NM_003528   H2B组蛋白家族,成员Q
  HK1   NM_000188   己糖激酶1同种型HKI
  HK2   NM_000189   己糖激酶2
  HKR2   NM_181846   GLI-Kruppel家族成员HKR2
  HLA-DQA1   NM_002122   主要组织相容性复合物,II类,DQ
  HMBOX1   NM_024567   假定蛋白LOC79618
  HMBS   NM_000190   羟甲基胆素合成酶同种型1
  HMG20A   NM_018200   高迁移率族20A
  HMG2L1   NM_001003681   高迁移率族蛋白2样1同种型b
  HMGA1   NM_002131   高迁移率族AT-钩1同种型b
  HMGA2   NM_001015886   高迁移率族AT-钩2同种型c
  HMGB3   NM_005342   高迁移率族盒3
  HMOX2   NM_002134   血红素加氧酶(脱环)2
  HNF4A   NM_000457   肝细胞核因子4α同种型b
  HNF4G   NM_004133   肝细胞核因子4γ
  HNRPA0   NM_006805   不均一核糖核蛋白A0
  HNRPA1   NM_002136   不均一核糖核蛋白A1
  HNRPDL   NM_005463   不均一核糖核蛋白D样
  HNRPU   NM_004501   不均一核糖核蛋白U
  HOXA10   NM_018951   同源异形盒A10同种型a
  HOXA3   NM_030661   同源异形盒A3同种型a
  HOXB13   NM_006361   同源异形盒B13
  HOXB4   NM_024015   同源异形盒B4
  HOXB7   NM_004502   同源异形盒B7
  HOXC11   NM_014212   同源异形盒C11
  HOXC13   NM_017410   同源异形盒C13
  HOXC8   NM_022658   同源异形盒C8
  HOXD1   NM_024501   同源异形盒D1
  HOXD9   NM_014213   同源异形盒D9
  HPCAL4   NM_016257   海马钙结合蛋白(hippocalcin)样蛋白4
  HPS1   NM_182637   Hermansky-Pudlak综合症1蛋白同种型b
  HPS4   NM_022081   轻耳(light ear)蛋白同种型a
  HPSE2   NM_021828   肝素酶(heparanase)2
  HR   NM_005144   无毛蛋白同种型a
  HRH2   NM_022304   组氨酸受体H2
  HRH3   NM_007232   组氨酸受体H3
  HS2ST1   NM_012262   硫酸乙酰肝素2-O-磺基转移酶1
  HS6ST1   NM_004807   硫酸乙酰肝素6-O-磺基转移酶
  HS6ST2   NM_147175   硫酸乙酰肝素6-O-磺基转移酶2
  HSDL2   NM_032303   羟基类固醇脱氢酶样2
  HSF2BP   NM_007031   热休克转录因子2结合
  HSPA1B   NM_005346   热休克70kDa蛋白1B
  HSPA4L   NM_014278   热休克70kDa蛋白4样
  HSPA8   NM_006597   热休克70kDa蛋白8同种型1
  HSPB7   NM_014424   热休克27kDa蛋白家族,成员7
  HSPBAP1   NM_024610   Hspb相关蛋白1
  HSPC049   NM_014149   HSPC049蛋白
  HSPC117   NM_014306   假定蛋白LOC51493
  HSPG2   NM_005529   硫酸乙酰肝素蛋白聚糖2
  HSU79303   NM_013301   假定蛋白LOC29903
  HTF9C   NM_022727   HpaII微小片段基因座9C
  HTR2A   NM_000621   5-羟色胺(血清素)受体2A
  HTR2C   NM_000868   5-羟色胺(血清素)受体2C
  HTR4   NM_000870   血清素5-HT4受体同种型b
  HTRA2   NM_013247   HtrA丝氨酸肽酶2同种型1前蛋白原
  HTRA3   NM_053044   HtrA丝氨酸肽酶3
  HYOU1   NM_006389   氧调控型蛋白前体
  IARS   NM_002161   异亮氨酸-tRNA合成酶
  IBRDC1   NM_152553   含IBR结构域1
  IBRDC2   NM_182757   含IBR结构域2
  ICA1   NM_022307   胰岛细胞自身抗原1
  ICMT   NM_012405   异戊烯基半胱氨酸羧甲基转移酶
  ICOS   NM_012092   可诱导T细胞共刺激物前体
  ICOSLG   NM_015259   可诱导T细胞共刺激物配体
  IDH3A   NM_005530   异柠檬酸脱氢酶3(NAD+)α
  IER2   NM_004907   即刻早期反应2
  IFIT1   NM_001548   干扰素诱导蛋白
  IFNAR1   NM_000629   干扰素-α受体1前体
  IFNGR2   NM_005534   干扰素-γ受体β链前体
  IFT140   NM_014714   鞭毛内转运140
  IFT20   NM_174887   鞭毛内转运蛋白IFT20
  IFT57   NM_018010   雌激素相关受体β样1
  IFT74   NM_025103   含卷曲螺旋结构域2
  IGF1   NM_000618   胰岛素样生长因子1(生长调节素C)
  IGF1R   NM_000875   胰岛素样生长因子1受体前体
  IGF2BP1   NM_006546   胰岛素样生长因子2mRNA结合
  IGF2R   NM_000876   胰岛素样生长因子2受体
  IGFBP3   NM_000598   胰岛素样生长因子结合蛋白3
  IGSF22   NM_173588   假定蛋白LOC283284
  IGSF3   NM_001007237   免疫球蛋白超家族,成员3同种型2
  IGSF4   NM_014333   免疫球蛋白超家族,成员4D
  IHPK1   NM_001006115   肌醇六磷酸激酶1同种型2
  IHPK3   NM_054111   肌醇六磷酸激酶3
  IKBKAP   NM_003640   κ轻链多肽基因的抑制剂
  IKBKB   NM_001556   κ轻链多肽基因的抑制剂
  IKBKE   NM_014002   IKK相关激酶ε
  IKBKG   NM_003639   κ轻链多肽基因的抑制剂
  IL10RA   NM_001558   白细胞介素10受体,α前体
  IL10RB   NM_000628   白细胞介素10受体,β前体
  IL13   NM_002188   白细胞介素13前体
  IL15   NM_000585   白细胞介素15前蛋白原
  IL16   NM_004513   白细胞介素16同种型1前体
  IL17D   NM_138284   白细胞介素17D前体
  IL17E   NM_022789   白细胞介素17E同种型1前体
  IL17RB   NM_172234   白细胞介素17B受体同种型2前体
  IL17RC   NM_032732   白细胞介素17受体C同种型3前体
  IL17RD   NM_017563   白细胞介素17受体D
  IL17RE   NM_144640   白细胞介素17受体E同种型3
  IL18BP   NM_173042   白细胞介素18结合蛋白前体
  IL18R1   NM_003855   白细胞介素18受体1前体
  IL1F5   NM_012275   白细胞介素1家族,成员5
  IL1F8   NM_173178   白细胞介素1家族,成员8同种型2
  IL1F9   NM_019618   白细胞介素1家族,成员9
  IL1R1   NM_000877   白细胞介素1受体,I型前体
  IL1RAP   NM_134470   白细胞介素1受体辅助蛋白同种型
  IL1RAPL1   NM 014271   白细胞介素1受体辅助蛋白样1
  L1RL1   NM_003856   白细胞介素1受体样1同种型2
  IL20   NM_018724   白细胞介素20前体
  IL28RA   NM_170743   白细胞介素28受体,α同种型1
  IL2RA   NM_000417   白细胞介素2受体,α链前体
  IL2RB   NM_000878   白细胞介素2受体β前体
  IL3   NM_000588   白细胞介素3前体
  IL3RA   NM_002183   白细胞介素3受体,α前体
  IL6R   NM_000565   白细胞介素6受体同种型1前体
  IL9R   NM_176786   白细胞介素9受体同种型2
  ILDR1   NM_175924   含免疫球蛋白样结构域的受体
  ILF3   NM_004516   白细胞介素增强子结合因子3同种型b
  IMMP2L   NM_032549   IMP2线粒体内膜蛋白酶样
  IMPA2   NM_014214   肌醇-1(或4)-单磷酸酶2
  INCENP   NM_020238   内着丝粒蛋白抗原135/155kDa
  ING5   NM_032329   生长抑制剂家族,成员5
  INPP5A   NM_005539   肌醇聚磷酸-5-磷酸酶A
  INSM2   NM_032594   胰岛素瘤相关蛋白IA-6
  INSR   NM_000208   胰岛素受体
  INVS   NM_014425   反转素(invcrsin)同种型a
  IPO8   NM_006390   输入素(importin)8
  IPPK   NM_022755   肌醇1,3,4,5,6-五磷酸2-激酶
  IQCE   NM_152558   含IQ基序的E
  IQGAP1   NM_003870   含IQ基序的GTPase活化蛋白1
  IQGAP3   NM_178229   含IQ基序的GTPase活化蛋白3
  IRAK1   NM_001025242   白细胞介素-1受体相关激酶1
  IRAK2   NM_001570   白细胞介素-1受体相关激酶2
  IRF2BP1   NM_015649   干扰素调控因子2结合蛋白
  IRF4   NM_002460   干扰素调控因子4
  IRF5   NM_002200   干扰素调控因子5同种型a
  IRS1   NM_005544  胰岛素受体底物1
  IRS2   NM_003749  胰岛素受体底物2
  IRX3   NM_024336  易洛魁(iroquois)同源异形盒蛋白3
  ISLR   NM_005545  含免疫球蛋白超家族
  ISOC1   NM_016048  含异分支酸梅结构域1
  ISOC2   NM_024710  含异分支酸梅结构域2
  ITFG3   NM_032039  含整合素αFG-GAP重复序列的3
  ITGA10   NM_003637  整合素α10前体
  ITGA2   NM_002203  整合素α2前体
  ITGAM   NM_000632  整合素αM前体
  ITGAX   NM_000887  整合素αX前体
  ITGB4BP   NM_002212  整合素β4结合蛋白同种型a
  ITGB5   NM_002213  整合素β5
  ITGBL1   NM_004791  整合素β样1(具有EGF样重复序列
  ITIH1   NM_002215  间-α(球蛋白)抑制剂H1
  ITIH5   NM_001001851  间-α胰蛋白酶抑制剂重链
  ITK   NM_005546  IL2可诱导性T细胞激酶
  ITPK1   NM_014216  肌醇1,3,4-三磷酸5/6激酶
  ITPR1   NM_002222  肌醇1,4,5-三磷酸受体,1型
  ITSN1   NM_001001132  交叉素(intersectin)1同种型ITSN-s
  IVNS1ABP   NM_006469  流感病毒NS1A结合蛋白同种型a
  JAGN1   NM_032492  美洲虎蛋白(jagunal)同源物1
  JAK2   NM_004972  贾纳斯(Janus)激酶2
  JARID1B   NM_006618  具摩基蛋白(Jumonji),富AT相互作用结构域1B
  JARID2   NM_004973  具摩基蛋白,富AT相互作用结构域2蛋白
  JMJD2D   NM_018039  具摩基蛋白,含结构域2D
  JMJD4   NM_023007  具摩基蛋白,含结构域4
  JMJD5   NM_024773  假定蛋白LOC79831
  JOSD1   NM_014876  含约瑟芬蛋白(Josephin)结构域1
  JPH1   NM_020647  亲联蛋白(junctophilin)1
  JPH2   NM_020433  亲联蛋白2同种型1
  JUB   NM_032876  ub,ajuba同源物同种型1
  JUP   NM_002230  连接桥粒斑珠蛋白(junction plakoglobin)
  K6HF   NM_004693  II型细胞角蛋白
  K6IRS3   NM_175068  角蛋白6irs3
  K6IRS4   NM_175053  角蛋白6irs4
  KAL1   NM_000216  卡尔曼综合症(Kallmann syndrome)1蛋白
  KALRN   NM_001024660  千手白(kalirin),RhoGEF激酶同种型1
  KARS   NM_005548  赖氨酰-tRNA合成酶
  KATNAL1   NM_001014380  剑蛋白(katanin)p60亚单位A样1
  KATNB1   NM_005886  剑蛋白p80亚单位B1
  KBTBD2   NM_015483  含kelch重复序列和BTB(POZ)结构域2
  KBTBD4   NM_016506  含kelch重复序列和BTB(POZ)结构域4
  KBTBD5   NM_152393  含kelch重复序列和BTB(POZ)结构域5
  KCNA3   NM_002232  电压门控钾通道,shaker相关
  KCNAB1   NM_003471  电压门控钾通道,shaker相关
  KCNAB2   NM_003636  电压门控钾通道,shaker相关
  KCNC2   NM_139136  Shaw相关电压门控钾通道
  KCND3   NM_004980  电压门控钾通道,Shal相关
  KCNE1L   NM_012282  电压门控钾通道,Isk相关
  KCNG3   NM_133329   电压门控钾通道,亚族G,
  KCNG4   NM_133490   电压门控钾通道,亚族G,
  KCNH4   NM_012285   电压门控钾通道,亚族H,
  KCNIP1   NM_014592   Kv通道相互作用蛋白1同种型2
  KCNIP3   NM_013434   Kv通道相互作用蛋白3同种型1
  KCNJ11   NM_000525   内向整流钾通道J11
  KCNJ16   NM_018658   内向整流钾通道J16
  KCNJ2   NM_000891   内向整流钾通道J2
  KCNJ9   NM_004983   内向整流钾通道亚族
  KCNK1   NM_002245   钾通道,亚族K,成员1
  KCNK2   NM_001017424   钾通道,亚族K,成员2同种型
  KCNK7   NM_005714   钾通道,亚族K,成员7同种型
  KCNMA1   NM_001014797   大电导钙活化钾
  KCNN4   NM_002250   中等电导钙活化
  KCNQ1   NM_000218   电压门控钾通道,KQT样
  KCNQ2   NM_004518   电压门控钾通道,KQT样蛋白
  KCNQ5   NM_019842   电压门控钾通道,KQT样
  KCNRG   NM_173605   钾通道调控因子同种型1
  KCNS1   NM_002251   电压门控钾通道
  KCNT1   NM_020822   钾通道,亚族T,成员1
  KCNT2   NM_198503   钾通道,亚族T,成员2
  KCTD1   NM_198991   钾通道四聚化结构域
  KCTD12   NM_138444   钾通道四聚化结构域
  KCTD15   NM_024076   钾通道四聚化结构域
  KCTD2   NM_015353   钾通道四聚化结构域
  KCTD3   NM_016121   钾通道四聚化结构域
  KCTD5   NM_018992   钾通道四聚化结构域
  KCTD7   NM_153033   钾通道四聚化结构域
  KCTD8   NM_198353   钾通道四聚化结构域
  KGFLP1   NM_174950   假定蛋白LOC387628
  KIAA0125   NM_014792   假定蛋白LOC9834
  KIAA0143   NM_015137   假定蛋白LOC23167
  KIAA0152   NM_014730   假定蛋白LOC9761
  K1AA0174   NM_014761   假定MAPK活化蛋白PM28
  KIAA0179   NM_015056   假定蛋白LOC23076
  KIAA0182   NM_014615   假定蛋白LOC23199
  KIAA0232   NM_014743   假定蛋白LOC9778
  KIAA0240   NM_015349   假定蛋白LOC23506
  KIAA0241   NM_015060   假定蛋白LOC23080
  KIAA0247   NM_014734   假定蛋白LOC9766
  KIAA0251   NM_015027   假定蛋白LOC23042
  KIAA0265   NM_014997   假定蛋白LOC23008
  KIAA0284   NM_015005   假定蛋白LOC283638
  KIAA0286   NM_015257   假定蛋白LOC23306
  KIAA0319L   NM_024874   多囊肾病1样同种型a
  KIAA0323   NM_015299   假定蛋白LOC23351
  KIAA0329   NM_014844   假定蛋白LOC9895
  KIAA0350   NM_015226   假定蛋白LOC23274
  KIAA0355   NM_014686   假定蛋白LOC9710
  KIAA0376   NM_015330   cytospin A
  KIAA0423   NM_015091   假定蛋白LOC23116
  KIAA0427   NM_014772   假定蛋白LOC9811
  KIAA0446   NM_014655   假定蛋白LOC9673
  KIAA0494   NM_014774   假定蛋白LOC9813
  KIAA0495   NM_207306   KIAA0495
  KIAA0513   NM_014732   假定蛋白LOC9764
  KIAA0523   NM_015253   假定蛋白LOC23302
  KIAA0553   NM_001002909   假定蛋白LOC23131
  KIAA0556   NM_015202   假定蛋白LOC23247
  KIAA0562   NM_014704   甘氨酸-,谷氨酸-,
  KIAA0564   NM_001009814   假定蛋白LOC23078同种型b
  KIAA0649   NM_014811   1A6/DRIM(在癌转移中下调)
  KIAA0652   NM_014741   假定蛋白LOC9776
  KIAA0664   NM_015229   假定蛋白LOC23277
  KIAA0672   NM_014859   假定蛋白LOC9912
  KIAA0676   NM_015043   假定蛋白LOC23061同种型b
  KIAA0683   NM_016111   假定蛋白LOC9894
  KIAA0746   NM_015187   假定蛋白LOC23231
  KIAA0773   NM_014690   假定蛋白LOC9715
  KIAA0789   NM_014653   假定蛋白LOC9671
  KIAA0804   NM_001009921   假定蛋白LOC23355同种型a
  KIAA0828   NM_015328   KIAA0828蛋白
  KIAA0831   NM_014924   假定蛋白LOC22863
  KIAA0853   NM_015070   KIAA0853
  KIAA0859   NM_001007239   CGI-01蛋白同种型3
  KIAA0863   NM_014913   假定蛋白LOC22850
  KIAA0895   NM_015314   假定蛋白LOC23366
  KIAA1161   NM_020702   假定蛋白LOC57462
  KIAA1166   NM_018684   肝细胞癌相关抗原127
  KIAA1199   NM_018689   KIAA1199
  KIAA1267   NM_015443   假定蛋白LOC284058
  KIAA1274   NM_014431   KIAA1274
  K1AA1303   NM_020761   雷普特蛋白(raptor)
  KIAA1333   NM_017769   假定蛋白LOC55632
  KIAA1411   NM_020819   假定蛋白LOC57579
  KIAA1434   NM_019593   假定蛋白LOC56261
  KIAA1456   NM_020844   假定蛋白LOC57604
  KIAA1522   NM_020888   假定蛋白LOC57648
  KIAA1530   NM_020894   假定蛋白LOC57654
  KIAA1542   NM_020901   CTD结合SR样蛋白rA9
  KIAA1559   NM_020917   锌指蛋白14样
  KIAA1576   NM_020927   假定蛋白LOC57687
  KIAA1600   NM_020940   假定蛋白LOC57700
  KIAA1609   NM_020947   假定蛋白LOC57707
  KIAA1618   NM_020954   假定蛋白LOC57714
  KIAA1688   NM_025251   KIAA1688蛋白
  KIAA1715   NM_030650   Lunapark
  KIAA1727   NM_033393   假定蛋白LOC85462
  KIAA1729   NM_053042   假定蛋白LOC85460
  KIAA1737   NM_033426   KIAA1737蛋白
  KIAA1772   NM_024935 假定蛋白LOC80000
  KIAA1804   NM_032435 混合系列蛋白激酶4
  KIAA1815   NM_024896 假定蛋白LOC79956
  KIAA1853   NM_194286 KIAA1853蛋白
  KIAA1862   NM_032534 KIAA1862蛋白
  KIAA1875   NM_032529 KIAA1875蛋白
  KIAA1909   NM_052909 假定蛋白LOC153478
  KIAA1920   NM_052919 假定蛋白LOC114817
  KIAA1924   NM_145294 假定蛋白LOC197335
  KIAA1961   NM_001008738 假定蛋白LOC96459同种型2
  KIAA2022   NM_001008537 假定蛋白LOC340533
  KIF12   NM_138424 驱动蛋白家族成员12
  KIF13B   NM_015254 驱动蛋白家族成员13B
  KIF1A   NM_004321 突触囊泡的轴突运输
  KIF1B   NM_015074 驱动蛋白家族成员1B同种型b
  KIF1C   NM_006612 驱动蛋白家族成员1C
  KIF2   NM_004520 驱动蛋白重链成员2
  KIF21A   NM_017641 驱动蛋白家族成员21A
  KIF23   NM_004856 驱动蛋白家族成员23同种型2
  KIF2C   NM_006845 驱动蛋白家族成员2C
  KIF3B   NM_004798 驱动蛋白家族成员3B
  KIF5A   NM_004984 驱动蛋白家族成员5A
  KIF5B   NM_004521 驱动蛋白家族成员5B
  KIF6   NM_145027 驱动蛋白家族成员6
  KIFC3   NM_005550 驱动蛋白家族成员C3
  KIR2DS4   NM_012314 杀伤细胞免疫球蛋白样受体2
  KITLG   NM_000899 KIT配体同种型b前体
  KL   NM_004795 klotho同种型a
  KLC2   NM_022822 驱动蛋白轻链2的可能直系同源物
  KLC4   NM_201521 驱动蛋白样8同种型a
  KLF12   NM_016285 Kruppel样因子12同种型b
  KLF13   NM_015995 Kruppel样因子13
  KLHDC6   NM_207335 假定蛋白LOC166348
  KLHDC8B   NM_173546 假定蛋白LOC200942
  KLHL18   NM_025010 kclch样18
  KLHL2   NM_007246 kelch样2,Mayven
  KLHL21   NM_014851 kelch样21
  KLHL26   NM_018316 假定蛋白LOC55295
  KLHL3   NM_017415 kelch样3(果蝇)
  KLHL4   NM_019117 kelch样4同种型1
  KLK2   NM_001002231 激肽释放酶(kallikrein)2,前列腺同种型2
  KLKB1   NM_000892 血浆激肽释放酶B1前体
  KNDC1   NM_152643 激酶非催化性C叶结构域(KIND)
  KNS2   NM-005552 驱动蛋白260/70kDa同种型1
  KPNA3   NM_002267 核转运蛋白(karyopherin)α3
  KPNA4   NM_002268 核转运蛋白α4
  KRAS   NM_004985 c-K-ras2蛋白同种型b
  KRT1B   NM-175078 角蛋白1B
  KRT20   NM_019010 角蛋白20
  KRT2B   NM_015848 细胞角蛋白2
  KRTAP10-1   NM_198691   角蛋白相关蛋白10-1
  KRTAP10-12   NM_198699   角蛋白相关蛋白10-12
  KRTAP10-8   NM_198695   角蛋白相关蛋白10-8
  KRTAP11-1   NM_175858   角蛋白相关蛋白11-1
  KRTAP26-1   NM_203405   假定蛋白LOC388818
  KRTAP4-4   NM_032524   角蛋白相关蛋白4.4
  KRTAP9-2   NM_031961   角蛋白相关蛋白9.2
  KRTAP9-3   NM_031962   角蛋白相关蛋白93
  KRTAP9-4   NM_033191   角蛋白相关蛋白9-4
  KRTHA3B   NM_002279   I型毛发角蛋白3B
  KRTHB4   NM_033045   角蛋白,毛发,碱性,4
  KSR1   NM_014238   Ras激酶抑制因子
  Kua-UEV   NM_003349   泛素结合酶E2Kua-UEV同种型
  KU-MEL-3   NM_001011540   KU-MEL-3蛋白
  LAMC1   NM_002293   层粘蛋白(laminin),γ1前体
  LAMP1   NM_005561   溶酶体相关膜蛋白1
  LAMP2   NM_013995   溶酶体相关膜蛋白2
  LAMP3   NM_014398   溶酶体相关膜蛋白3
  LANCL1   NM_006055   羊毛硫氨酸(lanthionine)合成酶C样蛋白1
  LANCL2   NM_018697   LanC羊毛硫抗生素(lantibiotic)合成酶组分C样2
  LARP2   NM_032239   La核糖核蛋白结构域家族成员2
  LASP1   NM_006148   LIM和SH3蛋白1
  LASS1   NM_021267   长寿保障基因1同种型1
  LASS3   NM_178842   假定蛋白LOC204219
  LASS6   NM_203463   长寿保障同源物6
  LAT   NM_001014987   T细胞活化连接子同种型b
  LATS1   NM_004690   LATS同源物1
  LATS2   NM_014572   LATS,大肿瘤抑制因子,同源物2
  LCE1E   NM_178353   晚期角化包膜1E
  LCN2   NM_005564   脂质运载蛋白(lipocalin)2(致癌基因24p3)
  LCP1   NM_002298   L-丝束蛋白(plastin)
  LDB3   NM_007078   LIM结构域结合3
  LDLRAD2   NM_001013693   假定蛋白LOC401944
  LDLRAP1   NM_015627   低密度脂蛋白受体衔接蛋白
  LDOC1   NM_012317   亮氨酸拉链,在癌症1中下调
  LDOC1L   NM_032287   假定蛋白LOC84247
  LEMD1   NM_001001552   含LEM结构域1
  LENG12   NM_033206   假定蛋白LOC90011
  LEP   NM_000230   瘦素前体
  LETM1   NM_012318   含亮氨酸拉链-EF-手的跨膜
  LGALS8   NM_006499   半乳糖凝集素8同种型a
  LGI2   NM-018176   富含亮氨酸重复序列LGI家族,成员2
  LGI4   NM_139284   富含亮氨酸重复序列LGI家族,成员4
  LGR6   NM_001017403   含富亮氨酸重复序列的G蛋白偶联
  LHFPL5   NM_182548   脂肪瘤HMGIC融合配体样5
  LHPP   NM_022126   磷酸赖氨酸磷酸组氨酸无机
  LHX3   NM_014564   LIM同源异形盒蛋白3同种型b
  LIF   NM_002309   白血病抑制因子(胆碱能
  LIMD1   NM_014240   含LIM结构域1
  LIMS3   NM_033514   LIM和衰老细胞抗原样结构域3
  LIN28   NM_024674  lin-28同源物
  LIN28B   NM_001004317  lin-28同源物B
  LIPE   NM_005357  激素敏感脂肪酶
  LIPG   NM_006033  内皮脂肪酶前体
  LIPH   NM_139248  脂肪酶,成员H前体
  LITAF   NM_004862  LPS诱导的TNF-α因子
  LKAP   NM_014647  limkain b1
  LMAN2L   NM_030805  凝集素,甘露糖结合2样
  LMNA   NM_170707  核纤层蛋白(lamin)A/C同种型1前体
  LMO7   NM_005358  LIM结构域仅7
  LMOD1   NM_012134  平滑肌蛋白(leiomodin)1(平滑肌)
  LNX1   NM_032622  含多PDZ结构域的蛋白
  LNX2   NM_153371  含PDZ结构域的环指1
  LOC112714   NM_207312  假定蛋白LOC112714
  LOC115648   NM_145326  假定蛋白LOC115648
  LOC116143   NM_138458  单孢体(monad)
  LOC133308   NM_178833  假定蛋白LOC133308
  LOC144233   NM_181708  假定蛋白LOC144233
  LOC144363   NM_001001660  假定蛋白LOC144363
  LOC144983   NM_001011724  不均一核糖核蛋白A1样
  LOC147650   NM_207324  假定蛋白LOC147650
  LOC147804   NM_001010856  假定蛋白LOC147804
  LOC150383   NM_001008917  假定蛋白LOC150383同种型2
  LOC151194   NM_145280  假定蛋白LOC151194
  LOC153222   NM_153607  假定蛋白LOC153222
  LOC155060   NM_001004302  假定蛋白LOC155060
  LOC158381   NM_001029857  假定蛋白LOC158381
  LOC159090   NM_145284  假定蛋白LOC159090
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  LOC390980   NM_001023563   类似于锌指蛋白264
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  LOC541469   NM_001013617   假定蛋白LOC541469
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  LOC89944   NM_138342   假定蛋白LOC89944
  LOC90321   NM_001010851   假定蛋白LOC90321
  LOC90639   NM_001031617   假定蛋白LOC90639
  LOC90693   NM_138771   假定蛋白LOC90693
  LOC91461   NM_138370   假定蛋白LOC91461
  LOC91689   NM_033318   假定蛋白LOC91689
  LOC93349   NM_138402   假定蛋白LOC93349
  LOC93622   NM_138699   假定蛋白LOC93622
  LOXL2   NM_002318   赖氨酰氧化酶样2前体
  LPHN1   NM_001008701   蛛毒素受体(latrophilin)1同种型1前体
  LPHN2   NM_012302   蛛毒素受体2前体
  LPIN2   NM_014646   脂质(lipin)2
  LPIN3   NM_022896   脂质3
  LPP   NM_005578   含LIM结构域的优选易位
  LPPR2   NM_022737   脂质磷酸磷酸酶相关蛋白型
  LRCH1   NM_015116   富含亮氨酸重复序列和钙调理蛋白同一性(CH)
  LRCH4   NM_002319   富含亮氨酸重复序列和钙调理蛋白同一性(CH)
  LRIG1   NM_015541   富含亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样
  LRIG2   NM_014813   富含亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样
  LRP10   NM_014045   低密度脂蛋白受体相关蛋白
  LRP12   NM_013437   抑制致瘤性
  LRP1B   NM_018557   低密度脂蛋白相关蛋白1B
  LRP6   NM_002336   低密度脂蛋白受体相关蛋白
  LRP8   NM_001018054   低密度脂蛋白受体相关蛋白
  LRPPRC   NM_133259   含富亮氨酸PPR基序的蛋白
  LRRC1   NM_018214   含富亮氨酸重复序列的1
  LRRC14   NM_014665   含富亮氨酸重复序列的14
  LRRC15   NM_130830   含富亮氨酸重复序列的15
  LRRC21   NM_015613   视网膜特异蛋白PAL
  LRRC22   NM_001017924   含富亮氨酸重复序列的22
  LRRC25   NM_145256   含富亮氨酸重复序列的25
  LRRC27   NM_030626   含富亮氨酸重复序列的27
  LRRC3   NM_030891   含富亮氨酸重复序列的3前体
  LRRC32   NM_005512   含富亮氨酸重复序列的32前体
  LRRC47   NM_020710   含富亮氨酸重复序列的47
  LRRC55   NM_001005210   假定蛋白LOC219527
  LRRC57   NM_153260   假定蛋白LOC255252
  LRRC61   NM_023942   假定蛋白LOC65999
  LRRC8A   NM_019594   含富亮氨酸重复序列的8
  LRRFIP2   NM_017724   富含亮氨酸重复序列(FLII中)相互作用
  LRRK1   NM_024652   富含亮氨酸重复序列激酶1
  LRRN3   NM_018334   富含亮氨酸重复序列神经元3
 LRRN6A   NM_032808   富含亮氨酸重复序列神经元6A
 LRRTM2   NM_015564   富含亮氨酸重复序列跨膜神经元2
 LRSAM1   NM_001005373   富含亮氨酸重复序列和不育α基序
 LSM11   NM_173491   LSM11,U7小型核RNA相关
 LSM16   NM_025083   LSM16同源物(EDC3,酿酒酵母)
 LSM4   NM_012321   U6snRNA相关Sm样蛋白4
 LSM7   NM_016199   U6snRNA相关Sm样蛋白LSm7
 LSP1   NM_001013253   淋巴细胞特异蛋白1同种型2
 LSS   NM_002340   羊毛甾醇合成酶
 LTB   NM_009588   淋巴毒素-β同种型b
 LTBP1   NM_000627   隐匿转化生长因子β结合
 LTC4S   NM_000897   白三烯C4合成酶同种型2
 LUZP1   NM_033631   亮氨酸拉链蛋白1
 LY6E   NM_002346   淋巴细胞抗原6复合物,基因座E
 LY6G5C   NM_001002848   淋巴细胞抗原6复合物G5C同种型C
 LY6K   NM_017527   淋巴细胞抗原6复合物,基因座K
 LY86   NM_004271   MD-1,RP105相关
 LY9   NM_001033667   淋巴细胞抗原9同种型b
 LYCAT   NM_001002257   溶血心磷脂(lysocardiolipin)酰基转移酶同种型2
 LYK5   NM_001003786   蛋白激酶LYK5同种型2
 LYPD5   NM_001031749   含LY6/PLAUR结构域5
 LYPLA2   NM_007260   溶血磷脂酶II
 LYPLA3   NM_012320   溶血磷脂酶3(溶酶体磷脂酶
 LYSMD4   NM_152449   假定蛋白LOC145748
 LYST   NM_000081   溶酶体转运调控因子同种型1
 LYZL4   NM_144634   溶菌酶样4
 LZTFL1   NM_020347   亮氨酸拉链转录因子样1
 LZTR1   NM_006767   亮氨酸拉链样转录调控因子1
 LZTS1   NM_021020   亮氨酸拉链,假定肿瘤抑制因子1
 LZTS2   NM_032429   亮氨酸拉链,假定肿瘤抑制因子2
 M6PR   NM_002355   阳离子依赖性甘露糖-6-磷酸受体
 MACF1   NM_012090   微丝和肌动蛋白丝交联剂
 MADD   NM_003682   含MAP-激酶活化死亡结构域
 MAF   NM_001031804   v-maf肌腱膜纤维肉瘤致癌基因
 MAFB   NM_005461   转录因子MAFB
 MAFG   NM_002359   v-maf肌腱膜纤维肉瘤致癌基因
 MAG   NM_080600   髓磷脂相关糖蛋白同种型b
 MAGEB4   NM_002367   黑素瘤抗原家族B,4
 MAK   NM_005906   雄性生殖细胞相关激酶
 MAMDC2   NM_153267   含MAM结构域2
 MAN2A2   NM_006122   甘露糖苷酶α,2A类,成员2
 MANBAL   NM_001003897   甘露糖苷酶βA,溶酶体样
 MAP1A   NM_002373   微管相关蛋白1A
 MAP2K1   NM_002755   促分裂原活化蛋白激酶激酶1
 MAP2K1IP1   NM_021970   促分裂原活化蛋白激酶激酶1
 MAP2K2   NM_030662   促分裂原活化蛋白激酶激酶2
 MAP2K3   NM_002756   促分裂原活化蛋白激酶激酶3
 MAP2K4   NM_003010   促分裂原活化蛋白激酶激酶4
 MAP2K7   NM_145185   促分裂原活化蛋白激酶激酶7
 MAP3K14   NM_003954   促分裂原活化蛋白激酶激酶激酶
  MAP3K3   NM_002401  促分裂原活化蛋白激酶激酶激酶3
  MAP3K4   NM_005922  促分裂原活化蛋白激酶激酶激酶4
  MAP3K7   NM_003188  促分裂原活化蛋白激酶激酶激酶7
  MAP3K9   NM_033141  促分裂原活化蛋白激酶激酶激酶
  MAP4   NM_002375  微管相关蛋白4同种型1
  MAP6   NM_207577  微管相关蛋白6同种型2
  MAP7   NM_003980  微管相关蛋白7
  MAPK1   NM_002745  促分裂原活化蛋白激酶1
  MAPK14   NM_001315  促分裂原活化蛋白激酶14同种型1
  MAPK3   NM_002746  促分裂原活化蛋白激酶3同种型1
  MAPK8   NM_002750  促分裂原活化蛋白激酶8同种型2
  MAPK8IP1   NM_005456  促分裂原活化蛋白激酶8相互作用
  MAPK8IP2   NM_012324  促分裂原活化蛋白激酶8相互作用
  MAPK8IP3   NM_015133  促分裂原活化蛋白激酶8相互作用
  MAPK9   NM_002752  促分裂原活化蛋白激酶9同种型1
  MAPKAP1   NM_001006617  促分裂原活化蛋白激酶相关
  MAPKAPK2   NM_004759  促分裂原活化蛋白激酶活化
  MAPKBP1   NM_014994  促分裂原活化蛋白激酶结合蛋白
  MAPRE1   NM_012325  微管相关蛋白,RP/EB家族,
  MAPRE3   NM_012326  微管相关蛋白,RP/EB家族,
  MARCH4   NM_020814  膜相关环指(C3HC4)4
  MARCH5   NM_017824  环指蛋白153
  MARCH9   NM_138396  膜相关环-CH蛋白IX
  MARK4   NM_031417  MAP/微管亲和力调控激酶4
  MASP1   NM_001031849  甘露聚糖结合凝集素丝氨酸蛋白酶1同种型
  MAT1A   NM_000429  甲硫氨酸腺苷转移酶I,α
  MBD1   NM_002384  甲基-CpG结合结构域蛋白1同种型4
  MBD3   NM_003926  甲基-CpG结合结构域蛋白3
  MBD6   NM_052897  甲基-CpG结合结构域蛋白6
  MBNL2   NM_144778  肌盲(muscleblind)样2同种型1
  MBP   NM_001025100  Golli-mbp同种型2
  MCART1   NM_033412  线粒体载体三联重复序列1
  MCART6   NM_001012755  假定蛋白LOC401612
  MCFD2   NM_139279  多凝血因子缺乏2
  MCM2   NM_004526  微小染色体维持蛋白2
  MDGA1   NM_153487  含MAM结构域
  MECP2   NM_004992  甲基CpG结合蛋白2
  MECR   NM_001024732  核受体结合因子1同种型b
  MED11   NM_001001683  假定蛋白LOC400569
  MED9   NM_018019  RNA聚合酶II转录的介体
  MEFV   NM_000243  地中海热蛋白
  MEOX1   NM_004527  间充质同源异形盒1同种型1
  MEOX2   NM_005924  间充质同源异形盒2
  MESDC2   NM_015154  中胚层发育候选物2
  METTL4   NM_022840  甲基转移酶样4
  MFAP5   NM_003480  微原纤维相关蛋白5
  MFN2   NM_014874  线粒体融合蛋白(mitofusin)2
  MFSD2   NM_032793  含主要易化超家族结构域
  MGAT5   NM_002410  α-1,3(6)-甘露糖蛋白
  MGC10911   NM_032302  假定蛋白LOC84262
  MGC11102   NM_032325   假定蛋白LOC84285
  MGC14289   NM_080660   假定蛋白LOC92092
  MGC16385   NM_145039   假定蛋白LOC92806
  MGC17330   NM_052880   HGFL蛋白
  MGC20470   NM_145053   假定蛋白LOC143630
  MGC21675   NM_052861   假定蛋白LOC92070
  MGC21830   NM_182563   假定蛋白LOC283870
  MGC24381   NM_001001410   假定蛋白LOC115939
  MGC26694   NM_178526   假定蛋白LOC284439
  MGC26718   NM_001029999   假定蛋白LOC440482
  MGC26885   NM_152339   假定蛋白LOC124044
  MGC29671   NM_182538   假定蛋白LOC201305
  MGC3123   NM_024107   假定蛋白LOC79089同种型1
  MGC3265   NM_024028   假定蛋白LOC78991
  MGC33214   NM_153354   假定蛋白LOC153396
  MGC33556   NM_001004307   假定蛋白LOC339541
  MGC34761   NM_173619   假定蛋白LOC283971
  MGC35308   NM_175922   假定蛋白MGC35308
  MGC35361   NM_147194   假定蛋白LOC222234
  MGC3731   NM_024313   假定蛋白LOC79159
  MGC40405   NM_152789   假定蛋白LOC257415同种型1
  MGC4093   NM_030578   假定蛋白LOC80776
  MGC42105   NM_153361   假定蛋白LOC167359
  MGC4268   NM_031445   假定蛋白LOC83607
  MGC52000   NM_198943   CXYorf1相关蛋白
  MGC5242   NM_024033   假定蛋白LOC78996
  MGC57359   NM_001004351   假定蛋白LOC441272
  MGC87631   NM_001004306   假定蛋白LOC339184
  MGC9712   NM_152689   假定蛋白LOC202915
  MGC9850   NM_152705   假定蛋白MGC9850
  MGC99813   NM_001005209   假定蛋白LOC130612
  MGRN1   NM_015246   红褐蛋白(mahogunin),环指1
  MIB1   NM_020774   意识紊乱(mindbomb)同源物1
  MICB   NM_005931   MHCI类多肽相关序列B
  MID1   NM_000381   中线1同种型α
  MIER2   NM_017550   假定蛋白LOC54531
  MINK1   NM_001024937   畸形/NIK相关激酶同种型4
  MIOX   NM_017584   肌醇加氧酶
  MKL2   NM_014048   成巨核细胞白血病2蛋白
  MKNK1   NM_003684   MAP激酶相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶1
  MKX   NM_173576   假定蛋白LOC283078
  MLC1   NM_015166   巨脑性白质脑病
  MLCK   NM_182493   MLCK蛋白
  MLR1   NM_153686   转录因子MLR1
  MLXIPL   NM_032951   威廉斯综合症(Williams Beuren syndrome)染色体区域14
  MLYCD   NM_012213   丙二酰辅酶A脱羧酶
  MMAB   NM_052845   钴(I)胺素腺苷转移酶
  MMACHC   NM_015506   假定蛋白LOC25974
  MMD   NM_012329   单核细胞至巨噬细胞
  MMD2   NM_198403   单核细胞至巨噬细胞分化因子2
  MME   NM_000902  膜金属内肽酶
  MMP14   NM_004995  基质金属蛋白酶14前蛋白原
  MMP15   NM_002428  基质金属蛋白酶15前蛋白原
  MMP19   NM_001032360  基质金属蛋白酶19同种型2前体
  MMP24   NM_006690  基质金属蛋白酶24前蛋白原
  MMP3   NM_002422  基质金属蛋白酶3前蛋白原
  MMS19L   NM_022362  MMS19样(MET18同源物,酿酒酵母)
  MN1   NM_002430  脑膜瘤1
  MNT   NM_020310  MAX结合蛋白
  MOBKL2A   NM_130807  MOB-LAK
  MOBKL2B   NM_024761  MOB1,Mps One Binder激酶活化因子样2B
  MOCS1   NM_005942  钼辅因子合成步骤1蛋白
  MON1B   NM_014940  MON1同源物B
  MORF4L1   NM_006791  MORF相关基因15同种型1
  MOSC1   NM_022746  含MOCO硫化酶C端结构域1
MOV10 NM_020963  Mov10,莫洛尼氏白血病病毒(Moloney leukemia virus)10,同源物
  MOV10L1   NM_018995  MOV10样1
  MPDU1   NM_004870  甘露糖-P-长醇利用缺陷1
  MPL   NM_005373  骨髓增生白血病病毒致癌基因
  MPP2   NM_005374  棕榈酰化膜蛋白2
  MPPED1   NM_001585  假定蛋白LOC758
  MPZL1   NM_003953  髓磷脂蛋白0样1同种型a
  MRAS   NM_012219  肌肉RAS致癌基因同源物
  MRPL11   NM_170739  线粒体核糖体蛋白L11同种型c
  MRPL12   NM_002949  线粒体核糖体蛋白L12
  MRPL14   NM_032111  线粒体核糖体蛋白L14
  MRPL35   NM_016622  线粒体核糖体蛋白L35同种型a
  MRPL37   NM_016491  线粒体核糖体蛋白L37
  MRPL4   NM_146388  线粒体核糖体蛋白L4同种型b
  MRPL40   NM_003776  线粒体核糖体蛋白L40
  MRPL45   NM_032351  线粒体核糖体蛋白L45
  MRPS18A   NM_018135  线粒体核糖体蛋白S18A
  MRPS2   NM_016034  线粒体核糖体蛋白S2
  MRPS25   NM_022497  线粒体核糖体蛋白S25
  MRRF   NM_138777  线粒体核糖体再循环因子同种型
  MS4A10   NM_206893  跨膜结构域4,亚族A,成员
  MS4A2   NM_000139  跨膜结构域4,亚族A,成员
  MS4A7   NM_021201  跨膜结构域4,亚族A,成员
  MSH5   NM_002441  mutS同源物5同种型c
  MSRB2   NM_012228  甲硫氨酸亚砜还原酶B2
  MST150   NM_032947  假定小型膜蛋白NID67
  MTAP   NM_002451  5′-甲硫腺苷磷酸化酶
  MTCP1   NM_001018024  成熟T细胞增殖1同种型p8
  MTG1   NM_138384  GTP结合蛋白
  MTHFR   NM_005957  5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶
  MTM1   NM_000252  肌管素(myotubularin)
  MTMR11   NM_181873  肌管素相关蛋白11
  MTMR3   NM_021090  肌管素相关蛋白3同种型c
  MTMR4   NM_004687  肌管素相关蛋白4
  MTMR8   NM_017677  肌管素相关蛋白8
  MTMR9   NM_015458  肌管素相关蛋白9
  MTNR1B   NM_005959  退黑激素受体1B
  MTPN   NM_145808  肌侵蛋白(myotrophin)
  MTRR   NM_002454  甲硫氨酸合成酶还原酶同种型1
  MTSS1   NM_014751  转移抑制因子1
  MUC1   NM_001018021  MUC1粘蛋白同种型4前体
  MUCDHL   NM_031265  μ-原钙粘蛋白同种型4
  MULK   NM_018238  多底物脂质激酶
  MUM1   NM_032853  黑素瘤广泛型突变蛋白
  MXD3   NM_031300  MAX二聚化蛋白3
  MXD4   NM_006454  MAD4
  MYADM   NM_001020818  骨髓相关分化标志物
  MYB   NM_005375  v-myb骨髓母细胞增多症病毒致癌基因同源物
  MYBPC1   NM_002465  肌球蛋白结合蛋白C,慢型同种型1
  MYCL1   NM_001033081  1-myc-1原癌基因同种型1
  MYD88   NM_002468  髓样分化因子初次应答基因
  MYEF2   NM_016132  髓磷脂基因表达因子2
  MYH14   NM_024729  肌球蛋白,重链多肽14
  MYL1   NM_079420  骨骼肌快肌肌球蛋白碱性轻链1
  MYLK   NM_005965  肌球蛋白轻链激酶同种型6
  MYO18A   NM_078471  肌球蛋白18A同种型a
  MYO1D   NM_015194  肌球蛋白ID
  MYO1E   NM_004998  肌球蛋白IE
  MYO5C   NM_018728  肌球蛋白VC
  MYO9B   NM_004145  肌球蛋白IXB
  MYOHD1   NM_001033579  含肌球蛋白头结构域1同种型2
  MYOM3   NM_152372  肌间蛋白(myomcsin)家族,成员3
  MYOZ3   NM_133371  myozenin 3
  MYRIP   NM_015460  肌球蛋白VIIA和Rab相互作用蛋白
  MYT1L   NM_015025  髓磷脂转录因子1样
  N4BP1   NM_153029  Nedd4结合蛋白1
  N4BP3   NM_015111  Nedd4结合蛋白3
  NAALADL2   NM_207015  N-乙酰化α连接酸性二肽酶2
  NAG8   NM_014411  鼻咽癌相关基因
  NANOG   NM_024865  Nanog同源异形盒
  NANOS1   NM_001009553  nanos同源物1同种型2
  NAP1L4   NM_005969  核小体组装蛋白1样4
  NAPA   NM_003827  N-乙基马来酰亚胺敏感因子连接
  NAPE-PLD   NM_198990  N-酰基-磷脂酰乙醇胺-水解
  NARF   NM_012336  核前层蛋白A识别因子同种型a
  NARFL   NM_022493  核前层蛋白A识别因子样
  NARG1   NM_057175  NMDA受体调控1
  NARS   NM_004539  天冬酰氨酰-tRNA合成酶
  NAT10   NM_024662  N-乙酰转移酶样蛋白
  NAT11   NM_024771  假定蛋白LOC79829
  NAV1   NM_020443  神经元导向因子1
  NBEA   NM_015678  蛋白激酶锚定蛋白(neurobeachin)
  NBR1   NM_005899  BRCA1基因1的邻近物
  NCAM1   NM_181351  神经细胞粘附分子1同种型2
  NCF4   NM_013416   中性粒细胞胞质因子4(40kD)同种型2
  NCKIPSD   NM_016453   具有SH3结构域同种型的NCK相互作用蛋白
  NCOA4   NM_005437   核受体辅活化因子4
  NCOR2   NM_006312   核受体辅阻遏物2
  NDNL2   NM_138704   抑蛋白(necdin)样2
  NDOR1   NM_014434   NADPH依赖性二黄素氧化还原酶1
  NDP   NM_000266   诺林蛋白(norrin)
  NDRG2   NM_016250   N-myc下游调控基因2同种型b
  NDRG4   NM_020465   NDRG家族成员4
  NDST1   NM_001543   N-脱乙酰酶/N-磺基转移酶(乙酰肝素
  NDUFA4L2   NM_020142   NADH:泛醌氧化还原酶MLRQ亚单位
  NEBL   NM_006393   星状小体肌肌节(sarcomeric)同种型
  NECAP1   NM_015509   衔接蛋白耳结合包被相关蛋白1
  NEDD9   NM_182966   发育上细胞表达的神经前体
  NEK10   NM_001031741   NIMA(有丝分裂基因a中从未出现)相关激酶
  NEK6   NM_014397   假定丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶
  NEK8   NM_178170   NIMA相关激酶8
  NELF   NM_015537   鼻胚胎LHRH因子
  NEU4   NM_080741   唾液酸酶4
  NEURL   NM_004210   神经化样
  NEUROG3   NM_020999   神经元素(neurogenin)3
  NF2   NM_000268   神经纤维瘤蛋白(neurofibromin)2同种型1
  NFASC   NM_015090   神经束蛋白(neurofascin)前体
  NFAT5   NM_006599   活化T细胞核因子5同种型c
  NFATC3   NM_004555   活化T细胞胞质核因子
  NFATC4   NM_004554   活化T细胞胞质核因子
  NFE2L1   NM_003204   核因子(红细胞来源2)样1
  NFIC   NM_005597   核因子I/C同种型1
  NFKB1   NM_003998   核因子κ-B亚单位1
  NFKBIB   NM_001001716   κ轻链多肽基因的核因子
  NFKBIL1   NM_005007   κ轻链多肽基因的核因子
  NFKBIL2   NM_013432   I-κ-B相关蛋白
  NFS1   NM_021100   NFS1固氮作用1同种型a前体
  NFYC   NM_014223   核转录因子Y,γ
  NGFR   NM_002507   神经生长因子受体前体
  NHEJ1   NM_024782   XRCC4样因子
  NHLH1   NM_005598   无义螺旋环螺旋1
  NHS   NM_198270   白化病伴牙综合症(Nance-Horan syndrome)蛋白
  NIBP   NM_031466   NIK和IKK(β)结合蛋白
  NID1   NM_002508   巢蛋白(伊那素(cnactin))
  NIN   NM_020921   ninein同种型2
  NISCH   NM_007184   nischarin
  NKD1   NM_033119   裸角质膜同源物1
  NKIRAS2   NM_001001349   NFKB抑制剂相互作用Ras样2
  NKX2-8   NM_014360   NK2转录因子相关,基因座8
  NKX3-1   NM_006167   NK3转录因子相关,基因座1
  NLGN1   NM_014932   神经连接蛋白(neuroligin)1
  NMD3   NM_015938   NMD3同源物
  NME3   NM_002513   核苷-二磷酸激酶3
  NMNAT2   NM_015039   烟酰胺单核苷酸腺苷酰转移酶
  NMT1   NM_021079   N-肉豆蔻酰转移酶1
  NMT2   NM_004808   甘氨酰肽N-十四酰转移酶2
  NOB1   NM_014062   nin one结合蛋白
  NOC2L   NM_015658   核仁复合物相关2同源物
  NOD9   NM_024618   NOD9蛋白同种型1
  NODAL   NM_018055   小鼠节结同源物前体
  NOL3   NM_003946   核仁蛋白3
  NOMO1   NM_014287   节结调节因子1
  NOMO2   NM_173614   节结调节因子2同种型2
  NOMO3   NM_001004067   节结调节因子3
  NOS1   NM_000620   一氧化氮合酶1(神经元)
  NOS1AP   NM_014697   一氧化氮合酶1(神经元)衔接蛋白
  NOS2A   NM_000625   一氧化氮合酶2A同种型1
  NOTCH2   NM_024408   缺口2前蛋白原
  NP   NM_000270   嘌呤核苷磷酸化酶
  NPAL3   NM_020448   含NIPA样结构域3
  NPC2   NM_006432   尼曼-匹克病(Niemann-Pick disease),C2型前体
  NPEPPS   NM_006310   氨基肽酶嘌呤霉素敏感性
  NPHP4   NM_015102   nephroretinin
  NPLOC4   NM_017921   核蛋白定位4
  NPNT   NM_001033047   肾连蛋白(nephronectin)
  NPR2   NM_003995   利尿钠肽受体B前体
  NPTXR   NM_014293   神经元正五聚蛋白受体同种型1
  NR2F6   NM_005234   核受体亚族2,F组,成员6
  NR4A1   NM_002135   核受体亚族4,A组,成员1
  NR4A3   NM_173199   核受体亚族4,A组,成员3
  NR5A1   NM_004959   核受体亚族5,A组,成员1
  NRBP1   NM_013392   核受体结合蛋白
  NRG1   NM_013958   神经调节蛋白1同种型HRG-β3
  NRIP2   NM_031474   核受体相互作用蛋白2
  NRN1   NM_016588   神经突蛋白(neuritin)前体
  NRP2   NM_003872   神经纤毛蛋白(neuropilin)2同种型2前体
  NSF   NM_006178   N-乙基马来酰亚胺敏感因子
  NSUN4   NM_199044   NOL1/NOP2/Sun结构域家族4蛋白
  NT5DC3   NM_016575   假定蛋白LOC51559同种型2
  NTE   NM_006702   神经病靶标酯酶
  NTN2L   NM_006181   导蛋白(netrin)2样
  NTNG2   NM_032536   导蛋白G2
  NTRK2   NM_001007097   神经营养酪氨酸激酶2型受体
  NTSR1   NM_002531   神经降压肽受体1
  NUAK1   NM_014840   AMPK相关蛋白激酶5
  NUAK2   NM_030952   NUAK家族,SNF1样激酶2
  NUBP2   NM_012225   核苷酸结合蛋白2(MinD同源物,E.
  NUCB1   NM_006184   核结合蛋白(nucleobindin)1
  NUDCD3   NM_015332   含NudC结构域3
  NUDT1   NM_002452   nudix型基序1同种型p18
  NUDT11   NM_018159   nudix型基序11
  NUDT8   NM_181843   nudix型基序8
  NUP188   NM_015354   核孔蛋白188kDa
  NUP210   NM_024923   核孔蛋白210
  NUP35   NM_001008544   核孔蛋白35kDa同种型b
  NUP50   NM_007172   核孔蛋白50kDa同种型b
  NUP98   NM_005387   核孔蛋白98kD同种型3
  NUTF2   NM_005796   核转运因子2
  NXF5   NM_033153   核RNA输出因子5同种型c
  NXPH1   NM_152745   神经外营养蛋白(neurexophilin)1前体
  NXPH4   NM_007224   神经外营养蛋白4
  OAF   NM_178507   假定蛋白LOC220323
  OAS2   NM_001032731   2′-5′-寡腺苷酸合成酶2同种型3
  OAS3   NM_006187   2′-5′寡腺苷酸合成酶3
  OATL1   NM_001006113   鸟氨酸转氨酶样1同种型1
  OBSCN   NM_052843   遮蔽蛋白(obscurin),细胞骨架钙调蛋白和
  OCRL   NM_000276   磷脂酰肌醇聚磷酸5-磷酸酶
  ODF2   NM_153437   精子尾巴外部致密纤维2同种型2
  OGDH   NM_002541   氧化戊二酸(α-酮戊二酸)脱氢酶
  OGDHL   NM_018245   氧化戊二酸脱氢酶样
  OGFR   NM_007346   鸦片样生长因子受体
  OGT   NM_003605   O连接GlcNAc转移酶同种型3
  OIP5   NM_007280   Opa相互作用蛋白5
  OLFM2   NM_058164   嗅介蛋白(olfactomedin)2
  OMG   NM_002544   少突胶质细胞髓磷脂糖蛋白
  OPHN1   NM_002547   寡膈蛋白(oligophrenin)1
  OPRL1   NM_000913   鸦片剂(opiate)受体样1
  ORMDL1   NM_016467   ORM1样1
  ORMDL3   NM_139280   ORM1样3
  OS9   NM_001017956   在骨肉瘤扩增的同种型2前体中
  OSBPL3   NM_015550   氧固醇结合蛋白样蛋白3同种型
  OSCAR   NM_130771   破骨细胞相关受体同种型3
  OSM   NM_020530   制癌蛋白(oncostatin)M前体
  OSR1   NM_145260   odd-skipped相关1
  OSTM1   NM_014028   骨硬化病相关跨膜蛋白
  OTOF   NM_004802   耳畸蛋白(otoferlin)同种型b
  OTUB1   NM_017670   OTU结构域,泛素醛结合1
  OTUB2   NM_023112   OTU结构域,泛素醛结合2
  OTUD4   NM_199324   含OTU结构域4蛋白同种型1
  OTUD6A   NM_207320   HIN-6蛋白酶
  OTX1   NM_014562   正小齿(orthodenticle)1
  OVOL1   NM_004561   OVO样1结合蛋白
  P15RS   NM_018170   假定蛋白FLJ10656
  P18SRP   NM_173829   P18SRP蛋白
  P2RX2   NM_012226   嘌呤受体P2X2同种型I
  P2RX7   NM_177427   嘌呤受体P2X7同种型b
  P2RXL1   NM_005446   嘌呤受体P2X样1,孤儿受体
  P2RY8   NM_178129   G-蛋白偶联嘌呤受体P2Y8
  PA2G4   NM_006191   增殖相关2G4,38kDa
  PABPN1   NM_004643   多聚(A)结合蛋白,核1
  PACRG   NM_152410   PARK2共调控
  PACSIN1   NM_020804   蛋白激酶C和酪蛋白激酶底物
  PAEP   NM_001018049   生殖糖蛋白(glycodelin)前体
  PAFAH1B1   NM_000430   血小板活化因子乙酰水解酶
  PAFAH2   NM_000437  血小板活化因子乙酰水解酶2
  PAG1   NM_018440  与鞘糖脂相关的磷蛋白
  PAGE1   NM_003785  P抗原家族,成员1
  PAICS   NM_006452  磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶
  PAK2   NM_002577  p21活化激酶2
  PAK6   NM_020168  p21活化激酶6
  PAK7   NM_020341  p21活化激酶7
  PALM2-AKAP2   NM_007203  PALM2-AKAP2蛋白同种型1
  PAM   NM_000919  肽酰甘氨酸α-酰胺化单加氧酶
  PANK1   NM_138316  泛酸激酶1同种型γ
  PANX1   NM_015368  泛连接蛋白(pannexin)1
  PAPD1   NM_018109  含PAP相关结构域1
  PAPOLG   NM_022894  多聚(A)聚合酶γ
  PAPPA   NM_002581  妊娠相关血浆蛋白A
  PARD6B   NM_032521  PAR-6β
  PARD6G   NM_032510  PAR-6γ蛋白
  PARP11   NM_020367  多聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员11
  PARP12   NM_022750  含锌指CCCH型结构域1
  PARP14   NM_017554  多聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员14
  PATE   NM_138294  表达于前列腺和睾丸中
  PAX2   NM_000278  成对盒蛋白2同种型b
  PAX8   NM_003466  成对盒基因8同种型PAX8A
  PAXIP1   NM_007349  PAX相互作用蛋白1
  PBX3   NM_006195  前B细胞白血病转录因子3
  PCBP4   NM_020418  多聚(rC)结合蛋白4同种型a
  PCDH1   NM_032420  原钙粘蛋白(protocadherin)1同种型2前体
  PCDH17   NM_014459  原钙粘蛋白17
  PCDH19   NM_020766  原钙粘蛋白19
  PCDH21   NM_033100  原钙粘蛋白21前体
  PCDH9   NM_020403  原钙粘蛋白9同种型2前体
  PCDHA1   NM_018900  原钙粘蛋白α1同种型1前体
  PCDHA10   NM_018901  原钙粘蛋白α10同种型1前体
  PCDHA11   NM_018902  原钙粘蛋白α11同种型1前体
  PCDHA12   NM_018903  原钙粘蛋白α12同种型1前体
  PCDHA13   NM_018904  原钙粘蛋白α13同种型1前体
  PCDHA2   NM_018905  原钙粘蛋白α2同种型1前体
  PCDHA3   NM_018906  原钙粘蛋白α3同种型1前体
  PCDHA4   NM_018907  原钙粘蛋白α4同种型1前体
  PCDHA5   NM_018908  原钙粘蛋白α5同种型1前体
  PCDHA6   NM_018909  原钙粘蛋白α6同种型1前体
  PCDHA7   NM_018910  原钙粘蛋白α7同种型1前体
  PCDHA8   NM_018911  原钙粘蛋白α8同种型1前体
  PCDHA9   NM_031857  原钙粘蛋白α9同种型1前体
  PCDHAC1   NM_018898  原钙粘蛋白α亚族C,1同种型1
  PCDHAC2   NM_018899  原钙粘蛋白α亚族C,2同种型1
  PCGF5   NM_032373  多梳基环指5
  PCID2   NM_018386  含PCI结构域2
  PCMT1   NM_005389  蛋白质-L-异天冬氨酸(D-天冬氨酸)
  PCNXL2   NM_014801  山核桃素(pecanex)样2
  PCOLN3   NM_002768  前胶原蛋白(III型)N-内肽酶
  PCQAP   NM_001003891   阳性辅因子2,谷氨酰胺/富含Q相关
  PCSK2   NM_002594   前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/kexin2型
  PCSK6   NM_002570   成对碱性氨基酸裂解系统4
  PCSK9   NM_174936   前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/kexin 9型
  PCTK2   NM_002595   PCTAIRE蛋白激酶2
  PCTP   NM_021213   磷脂酰胆碱转移蛋白
  PCYOX1   NM_016297   异戊二烯基半胱氨酸氧化酶1
  PDAP1   NM_014891   PDGFA相关蛋白1
  PDCD1   NM_005018   程序性细胞死亡1前体
  PDCD11   NM_014976   程序性细胞死亡11
  PDCD4   NM_014456   程序性细胞死亡4同种型1
  PDCD6IP   NM_013374   程序性细胞死亡6相互作用蛋白质
  PDCD7   NM_005707   程序性细胞死亡7
  PDCL   NM_005388   磷导素(phosducin)样
  PDDC1   NM_182612   假定蛋白LOC347862
  PDE3B   NM_000922   磷酸二酯酶3B,cGMP抑制
  PDE4D   NM_006203   cAMP特异性磷酸二酯酶4D
  PDE7B   NM_018945   磷酸二酯酶7B
  PDGFRA   NM_006206   血小板衍生生长因子受体α
  PDGFRB   NM_002609   血小板衍生生长因子受体β
  PDIA6   NM_005742   蛋白质二硫化物异构酶相关6
  PDIK1L   NM_152835   PDLIM1相互作用激酶1样
  PDK2   NM_002611   丙酮酸脱氢酶激酶,同工酶2
  PDK4   NM_002612   丙酮酸脱氢酶激酶4
  PDLIM2   NM_176871   PDZ和LIM结构域2同种型1
  PDLIM5   NM_001011513   PDZ和LIM结构域5同种型b
  PDPK1   NM_002613   3-磷酸肌醇依赖性蛋白激酶-1
  PDPN   NM_001006624   肺I型细胞膜相关
  PDPR   NM_017990   丙酮酸脱氢酶磷酸酶调控
  PDRG1   NM_030815   p53和DNA损伤调控蛋白
  PDXK   NM_003681   吡哆醛激酶
  PDYN   NM_024411   β-新内啡肽-强啡肽前蛋白原
  PDZD2   NM_178140   含PDZ结构域2
  PELI2   NM_021255   皮层蛋白(pellino)2
  PELI3   NM_145065   皮层蛋白3α
  PEMT   NM_007169   磷脂酰乙醇胺N-甲基转移酶
  PER3   NM_016831   昼夜调节蛋白(period)3
  PERLD1   NM_033419   CAB2蛋白
  PERP   NM_022121   PERP,TP53凋亡效应因子
  PEX10   NM_002617   过氧化物酶体生物发生因子10同种型2
  PEX12   NM_000286   过氧化物酶体生物发生因子12
  PEX13   NM_002618   过氧化物酶体生物发生因子13
  PEX16   NM_057174   过氧化物酶体生物发生因子16同种型2
  PEX19   NM_002857   过氧化物酶体生物发生因子19
  PEX5   NM_000319   过氧化物酶体生物发生因子5
  PFKFB2   NM_006212   6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,
  PFKFB4   NM_004567   6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,
  PFKL   NM_001002021   肝磷酸果糖激酶同种型a
  PGAM5   NM_138575   Bcl-XL结合蛋白v68
  PGD   NM_002631   磷酸葡萄糖脱氢酶
  PGEA1   NM_001002880  PKD2相互作用因子,高尔基体和内质网
  PGLS   NM_012088  6-磷酸葡糖酸内酯酶
  PGM1   NM_002633  葡萄糖磷酸变位酶1
  PGM2L1   NM_173582  葡萄糖磷酸变位酶2样1
  PHACTR1   NM_030948  磷酸酶和肌动蛋白调控因子1
  PHACTR2   NM_014721  磷酸酶和肌动蛋白调控因子2
  PHACTR4   NM_023923  磷酸酶和肌动蛋白调控因子4
  PHB   NM_002634  抗增殖蛋白(prohibitin)
  PHF13   NM_153812  PHD指蛋白13
  PHF15   NM_015288  PHD指蛋白15
  PHF17   NM_024900  Jade1蛋白短同种型
  PHF19   NM_015651  PHD指蛋白19同种型a
  PHF20   NM_016436  PHD指蛋白20
  PHF20L1   NM_016018  PHD指蛋白20样1同种型1
PHIP NM_017934  血小板白细胞C激酶底物(pleckstrin)同一性结构域相互作用蛋白
  PHLDA3   NM_012396  血小板白细胞C激酶底物同一性样结构域,家族A,
  PHLDB3   NM_198850  血小板白细胞C激酶底物同一性样结构域,家族B,
  PHLPPL   NM_015020  PH结构域和富亮氨酸重复序列蛋白
  PHOX2B   NM_003924  成对样同源异形盒2b
  PHYHIP   NM_014759  植烷酰辅酶A羟化酶相互作用蛋白
  P14K2B   NM_018323  磷脂酰肌醇4-激酶II型β
  P14KII   NM_018425  磷脂酰肌醇4-激酶II型
  PIAS1   NM_016166  活化STAT,1的蛋白抑制剂
  PIB5PA   NM_001002837  磷脂酰肌醇(4,5)二磷酸
  PIGA   NM_002641  磷脂酰肌醇
  PIGB   NM_004855  磷脂酰肌醇多糖,B类
  PIGQ   NM_004204  磷脂酰肌醇多糖,Q类同种型2
  PIGR   NM_002644  聚合免疫球蛋白受体
  PIGT   NM_015937  磷脂酰肌醇多糖,T类前体
  PIK3C2B   NM_002646  磷酸肌醇-3-激酶,2类,β
  PIK3R1   NM_181504  磷酸肌醇-3-激酶,调控亚单位
  PIK3R2   NM_005027  磷酸肌醇-3-激酶,调控亚单位2
  PIK3R3   NM_003629  磷酸肌醇-3-激酶,调控亚单位3
  PIK4CB   NM_002651  磷脂酰肌醇4-激酶,催化性,β
  PILRB   NM_013440  成对免疫球蛋白样2型受体β
  PIM1   NM_002648  pim-1致癌基因
  PIM3   NM_001001852  pim-3致癌基因
  PIP3-E   NM_015553  磷酸肌醇结合蛋白PIP3-E
  PIP5K1B   NM_001031687  磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,型
  PIP5K1C   NM_012398  磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,型
  PIP5K2C   NM_024779  磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,型
  PIP5K3   NM_001002881  磷脂酰肌醇-3-
  PISD   NM_014338  磷脂酰丝氨酸脱羧酶
  PITPNA   NM_006224  磷脂酰肌醇转移蛋白,α
  PKD1   NM_000296  多囊蛋白(polycystin)1同种型2前体
  PKD1L2   NM_182740  多囊蛋白1样2同种型b
  PKHD1   NM_138694  多导蛋白(polyductin)同种型1
  PKLR   NM_000298  丙酮酸激酶,肝和RBC同种型1
  PKNOX1   NM_004571  PBX/多节1同源异形盒1同种型1
  PKP1   NM_000299   亲斑蛋白(plakophilin)1同种型1b
  PLA2G2F   NM_022819   磷脂酶A2,IIF组
  PLA2G4D   NM_178034   磷脂酶A2,IVD组
  PLAC2   NM_153375   胎盘特异性2
  PLAG1   NM_002655   多形性腺瘤基因1
  PLAGL1   NM_002656   多形性腺瘤基因样1同种型1
  PLCD1   NM_006225   磷脂酶C,δ1
  PLCXD1   NM_018390   磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C,X
  PLCXD3   NM_001005473   磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C,X
  PLD1   NM_002662   磷脂酶D1,磷脂酰胆碱特异性
  PLD2   NM_002663   磷脂酶D2
  PLDN   NM_012388   梅毒螺旋体素(pallidin)
  PLEKHA1   NM_001001974   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域,家族A
  PLEKHA5   NM_019012   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域,家族A
  PLEKHA6   NM_014935   磷酸肌醇3-磷酸结合蛋白-3
  PLEKHA7   NM_175058   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族A
  PLEKHB2   NM_017958   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族B
  PLEKHC1   NM_006832   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族C
  PLEKHG1   NM_001029884   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族G
  PLEKHG3   NM_015549   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族G,
  PLEKHG5   NM_198681   假定NFkB活化蛋白同种型b
  PLEKHH1   NM_020715   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族H
  PLEKHH2   NM_172069   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族H
  PLEKHJ1   NM_018049   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族J
  PLEKHK1   NM_145307   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族K
  PLEKHM1   NM_014798   含血小板白细胞C激酶底物同一性结构域家族M
  PLEKHQ1   NM_025201   含PH结构域的蛋白
  PLRG1   NM_002669   多效性调控因子1(PRL1同源物,
  PLS1   NM_002670   丝束蛋白(plastin)1
  PLSCR4   NM_020353   磷脂爬行酶4
  PLUNC   NM_130852   腭、肺和鼻上皮癌
  PLXDC1   NM_020405   含丛蛋白(plexin)结构域1前体
  PLXNA1   NM_032242   丛蛋白A1
  PLXNA2   NM_025179   丛蛋白A2
  PLXNB1   NM_002673   丛蛋白B1
  PLXND1   NM_015103   丛蛋白D1
  PML   NM_033239   早幼粒白血病蛋白同种型9
  PMM1   NM_002676   磷酸甘露糖酶1
  PMM2   NM_000303   磷酸甘露糖酶2
  PMP2   NM_002677   外周髓磷脂蛋白2
  PMP22   NM_000304   外周髓磷脂蛋白22
  PNKD   NM_015488   肌纤生成调节因子1同种型1
  PNLIPRP1   NM_006229   胰脂肪酶相关蛋白1
  PNMA3   NM_013364   副肿瘤性癌症-睾丸-脑抗原
  PNMA5   NM_052926   假定蛋白LOC114824
  PNMA6A   NM_032882   假定蛋白LOC84968
  PNPO   NM_018129   维生素B65′-磷酸氧化酶
  PNRC2   NM_017761   富脯氨酸核受体共活化因子2
  PODN   NM_153703   藻红蛋白单克隆抗体(podocan)
  PODXL   NM_001018111   足细胞标记蛋白(podocalyxin)样前体同种型1
  POF1B   NM_024921  卵巢早衰,1B
  POFUT1   NM_015352  蛋白O-岩藻糖转移酶1同种型1
  POFUT2   NM_015227  蛋白O-岩藻糖转移酶2同种型A
  POLD3   NM_006591  聚合酶(DNA指导),δ3
  POLDIP3   NM_032311  DNA聚合酶δ相互作用蛋白3
  POLE   NM_006231  DNA聚合酶ε催化性亚单位
  POLE4   NM_019896  DNA聚合酶ε亚单位4
  POLL   NM_013274  聚合酶(DNA指导),λ
  POLR2D   NM_004805  DNA指导RNA聚合酶II多肽D
  POLR2E   NM_002695  DNA指导RNA聚合酶II多肽E
  POLR2G   NM_002696  DNA指导RNA聚合酶II多肽G
  POLR2J   NM_006234  DNA指导RNA聚合酶II多肽J
  POLR3B   NM_018082  聚合酶(RNA)III(DNA指导)多肽
  POLR3D   NM_001722  RNA聚合酶III 53kDa亚单位RPC4
  POLR3F   NM_006466  DNA指导RNA聚合酶III 39kDa
  POM121   NM_172020  核孔膜蛋白121
  POMT2   NM_013382  假定蛋白O-甘露糖基转移酶
  POMZP3   NM_012230  POMZP3融合蛋白同种型1
  POU2AF1   NM_006235  POU结构域,2类,缔合因子1
  POU3F2   NM_005604  POU结构域,3类,转录因子2
  POU4F1   NM_006237  POU结构域,4类,转录因子1
  POU4F2   NM_004575  POU结构域,4类,转录因子2
  POU6F1   NM_002702  POU结构域,6类,转录因子1
  PPAP2A   NM_003711  磷脂酸磷酸酶2A型同种型1
  PPAP2B   NM_003713  磷脂酸磷酸酶2B型
  PPAP2C   NM_003712  磷脂酸磷酸酶2C型同种型1
  PPAPDC2   NM_203453  磷脂酸磷酸酶2型结构域
  PPAPDC3   NM_032728  磷脂酸磷酸酶2型结构域
  PPARA   NM_001001928  过氧化物酶体增殖活化受体,
  PPARD   NM_006238  过氧化物酶体增殖活化受体,
  PPARGC1A   NM_013261  过氧化物酶体增殖活化受体
  PPFIA3   NM_003660  PTPRF相互作用蛋白α3
  PPFIA4   NM_015053  蛋白酪氨酸磷酸酶,受体型,f
  PPIE   NM_006112  肽基脯氨酰异构酶E同种型1
  PPIF   NM_005729  肽基脯氨酰异构酶F前体
  PPIH   NM_006347  肽基脯氨酰异构酶H
  PPIL1   NM_016059  肽基脯氨酰异构酶样1
  PPIL2   NM_014337  肽基脯氨酰异构酶样2同种型a
  PPIL4   NM_139126  肽基脯氨酰异构酶样4
  PPL   NM_002705  周斑蛋白(periplakin)
  PPM1A   NM_021003  蛋白磷酸酶1A同种型1
  PPM1D   NM_003620  蛋白磷酸酶1D
  PPM1E   NM_014906  蛋白磷酸酶1E
  PPM1F   NM_014634  蛋白磷酸酶1F
  PPM1L   NM_139245  蛋白磷酸酶1(先前2C)样
  PPM1M   NM_144641  蛋白磷酸酶1M(含PP2C结构域)
  PPM2C   NM_018444  丙酮酸脱氢酶磷酸酶前体
  PPME1   NM_016147  蛋白磷酸酶甲酯酶-1
  PPP1CA   NM_001008709  蛋白磷酸酶1,催化性亚单位,α
  PPP1R11   NM_021959  蛋白磷酸酶1,调控(抑制剂)
  PPP1R12A   NM_002480  蛋白磷酸酶1,调控(抑制剂)
  PPP1R12B   NM_002481  蛋白磷酸酶1,调控(抑制剂)
  PPP1R12C   NM_017607  蛋白磷酸酶1,调控亚单位12C
  PPP1R13B   NM_015316  蛋白磷酸酶1,调控(抑制剂)
  PPP1R14C   NM_030949  蛋白磷酸酶1,调控(抑制剂)
  PPP1R16B   NM_015568  蛋白磷酸酶1调控抑制剂
  PPP1R1A   NM_006741  蛋白磷酸酶1,调控(抑制剂)
  PPP1R2   NM_006241  蛋白磷酸酶1,调控(抑制剂)
  PPP1R3B   NM_024607  蛋白磷酸酶1,调控(抑制剂)
  PPP2CA   NM_002715  蛋白磷酸酶2,催化性亚单位,α
  PPP2R1A   NM_014225  调控亚单位A蛋白的α同种型
  PPP2R1B   NM_002716  调控亚单位A蛋白的β同种型
  PPP2R2C   NM_020416  调控亚单位B55蛋白的γ同种型
  PPP2R2D   NM_001003656  蛋白磷酸酶2,调控亚单位B
  PPP2R4   NM_021131  蛋白磷酸酶2A,调控亚单位B′
  PPP2R5C   NM_002719  调控亚单位B56蛋白的γ同种型
  PPP3CB   NM_021132  蛋白磷酸酶3(先前2B),催化性
  PPP4R1L   NM_018498  假定蛋白LOC55370
  PPP6C   NM_002721  蛋白磷酸酶6,催化性亚单位
  PPRC1   NM_015062  PGC-1相关共活化因子
  PPT1   NM_000310  棕榈酰-蛋白硫酯酶1
  PPT2   NM_005155  棕榈酰-蛋白硫酯酶2同种型a
  PPTC7   NM_139283  T细胞活化蛋白磷酸酶2C
  PQLC1   NM_025078  含PQ环重复序列的1
  PRDM12   NM_021619  含PR结构域12
  PRDM16   NM_022114  含PR结构域16同种型1
  PRDM2   NM_001007257  视网膜母细胞瘤蛋白结合锌指
  PRDM4   NM_012406  含PR结构域4
  PRE13   NM_015387  胚胎着床前蛋白3同种型1
  PRELP   NM_002725  富含脯氨酸/精氨酸末端亮氨酸的重复序列
  PRF1   NM_005041  穿孔素(perforin)1前体
  PRH2   NM_005042  富含脯氨酸的蛋白HaeIII亚族2
  PRIC285   NM_033405  PPAR-α相互作用复合蛋白285
  PRICKLE2   NM_198859  刺(prickle)样2
  PRKAA1   NM_006251  蛋白激酶,AMP活化,α1催化性
  PRKAB2   NM_005399  AMP活化蛋白激酶β2
  PRKACA   NM_002730  cAMP依赖性蛋白激酶催化性亚单位
  PRKAR1A   NM_002734  cAMP依赖性蛋白激酶,调控
  PRKAR2A   NM_004157  cAMP依赖性蛋白激酶,调控
  PRKCA   NM_002737  蛋白激酶C,α
  PRKCBP1   NM_012408  蛋白激酶C结合蛋白1同种型b
  PRKCD   NM_006254  蛋白激酶C,δ
  PRKCG   NM_002739  蛋白激酶C,γ
  PRKCI   NM_002740  蛋白激酶C,ι
  PRKCZ   NM_001033581  蛋白激酶C,ζ同种型2
  PRKD2   NM_016457  蛋白激酶D2
  PRKD3   NM_005813  蛋白激酶D3
  PRKG1   NM_006258  蛋白激酶,cGMP依赖性,I型
  PRNT   NM_177549  朊蛋白(睾丸特异性)
  PRO0149   NM_014117  假定蛋白LOC29035
  PROK2   NM_021935  前动力蛋白(prokineticin)2
  ProSAPiP1   NM_014731  ProSAPiP1蛋白
  PROSC   NM_007198  脯氨酸合成酶共转录同源物
  PRPF38A   NM_032864  PRP38前mRNA加工因子38(酵母)
  PRPS2   NM_002765  磷酸核糖基焦磷酸合成酶2
  PRR13   NM_001005354  假定蛋白LOC54458同种型2
  PRR3   NM_025263  富含脯氨酸的蛋白3
  PRRG1   NM_000950  富含脯氨酸的Gla(G-羧基谷氨酸)1
  PRRX1   NM_006902  成对中胚层同源异形盒1同种型pmx-1a
  PRSS12   NM_003619  神经胰蛋白酶前体
  PRSS22   NM_022119  蛋白酶,丝氨酸,22
  PRSS23   NM_007173  蛋白酶,丝氨酸,23前体
  PRSS27   NM_031948  marapsin
  PRSS33   NM_152891  蛋白酶,丝氨酸,33
  PRSS7   NM_002772  肠激酶前体
  PRX   NM_020956  轴周蛋白(periaxin)同种型1
  PSAP   NM_002778  鞘脂激活蛋白原(prosaposin)
  PSAT1   NM_021154  磷酸丝氨酸转氨酶同种型2
  PSCA   NM_005672  前列腺干细胞抗原前蛋白原
  PSCD3   NM_004227  血小板白细胞C激酶底物同一性,Sec7和螺旋
  PSD3   NM_015310  ADP核糖基化因子鸟嘌呤苷酸
  PSD4   NM_012455  含血小板白细胞C激酶底物和Sec7结构域4
  PSKH1   NM_006742  蛋白丝氨酸激酶H1
  PSMB5   NM_002797  蛋白酶体β5亚单位
  PSMD13   NM_002817  蛋白酶体26S非ATPase亚单位13同种型1
  PSMD7   NM_002811  蛋白酶体26S非ATPase亚单位7
  PSMD9   NM_002813  蛋白酶体26S非ATPase亚单位9
  PSME3   NM_005789  蛋白酶体活化因子亚单位3同种型1
  PSME4   NM_014614  蛋白酶体(蛋白酶体,巨蛋白因子)活化因子
  PSORS1C2   NM_014069  SPR1蛋白
  PSRC2   NM_144982  假定蛋白LOC196441
  PTBP1   NM_002819  多嘧啶束结合蛋白1同种型
  PTCH   NM_000264  碎片
  PTD008   NM_016145  假定蛋白LOC51398
  PTDSS1   NM_014754  磷脂酰丝氨酸合成酶1
  PTER   NM_001001484  磷酸三酯酶相关
  PTGER3   NM_198718  前列腺素E受体3,亚型EP3同种型
  PTGES2   NM_198939  前列腺素E合成酶2同种型3
  PTGFRN   NM_020440  前列腺素F2受体负调控因子
  PTGIR   NM_000960  前列腺素I2(前列环素)受体(IP)
  PTGS1   NM_000962  前列腺素-内过氧化物合成酶1同种型1
  PTH   NM_000315  甲状旁腺激素前蛋白原
  PTHLH   NM_198965  甲状旁腺激素样激素同种型1
  PTK2B   NM_004103  PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β同种型a
  PTK6   NM_005975  PTK6蛋白酪氨酸激酶6
  PTK7   NM_152883  PTK7蛋白酪氨酸激酶7同种型e
  PTPDC1   NM_152422  含蛋白酪氨酸磷酸酶结构域1
  PTPLAD2   NM_001010915  假定蛋白LOC401494
  PTPN18   NM_014369  蛋白酪氨酸磷酸酶,非受体类型
  PTPN20B   NM_015605  蛋白酪氨酸磷酸酶,非受体类型
 PTPN3   NM_002829   蛋白酪氨酸磷酸酶,非受体类型
 PTPN4   NM_002830   蛋白酪氨酸磷酸酶,非受体类型
 PTPN7   NM_002832   蛋白酪氨酸磷酸酶,非受体类型
 PTPRF   NM_002840   蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,F
 PTPRM   NM_002845   蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,M
 PTPRR   NM_002849   蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,R
 PTPRT   NM_007050   蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,T
 PURA   NM_005859   富含嘌呤的元件结合蛋白A
 PURB   NM_033224   富含嘌呤的元件结合蛋白B
 PURG   NM_013357   富含嘌呤的元件结合蛋白G同种型A
 PUSL1   NM_153339   假尿苷酸合成酶样1
 PWWP2   NM_138499   含PWWP结构域2
 PXMP4   NM_007238   过氧化物酶体膜蛋白4同种型a
 PXN   NM_002859   桩蛋白(paxillin)
 PYCR1   NM_006907   吡咯啉-5-羧酸还原酶1同种型1
 PYCR2   NM_013328   吡咯啉-5-羧酸还原酶家族成员
 PYCRL   NM_023078   吡咯啉-5-羧酸还原酶样
 PYY2   NM_021093   肽YY,2(精液胞浆素)
 QK1   NM_206853   震动同源物,KH结构域RNA结合同种型
 QPRT   NM_014298   喹啉酸磷酸核糖基转移酶
 QSCN6L1   NM_181701   静止素(quiescin)Q6样1
 QTRTD1   NM_024638   喹啉(queuine)tRNA-核糖基转移酶结构域
 RAB10   NM_016131   Ras相关GTP结合蛋白RAB10
 RAB11FIP1   NM_001002814   Rab偶联蛋白同种型3
 RAB11FIP2   NM_014904   RAB11家族相互作用蛋白2(I类)
 RAB11FIP3   NM_014700   rab11家族相互作用蛋白3
 RAB11FIP4   NM_032932   RAB11家族相互作用蛋白4(II类)
 RAB11FIP5   NM_015470   RAB11家族相互作用蛋白5(I类)
 RAB15   NM_198686   Ras相关蛋白Rab-15
 RAB1A   NM_004161   RAB1A,成员RAS致癌基因家族
 RAB22A   NM_020673   RAS相关蛋白RAB-22A
 RAB23   NM_016277   Ras相关蛋白Rab-23
 RAB2B   NM_032846   RAB2B蛋白
 RAB39B   NM_171998   RAB39B,成员RAS致癌基因家族
 RAB3B   NM_002867   RAB3B,成员RAS致癌基因家族
 RAB3D   NM_004283   RAB3D,成员RAS致癌基因家族
 RAB40A   NM_080879   RAB40A,成员RAS致癌基因家族
 RAB40B   NM_006822   RAB40B,成员RAS致癌基因家族
 RAB43   NM_198490   RAB43蛋白
 RAB4B   NM_016154   Ras相关GTP结合蛋白4b
 RAB6B   NM_016577   RAB6B,成员RAS致癌基因家族
 RAB6IP2   NM_015064   RAB6相互作用蛋白2同种型α
 RAB8B   NM_016530   RAB8B,成员RAS致癌基因家族
 RAB9A   NM_004251   RAB9A,成员RAS致癌基因家族
 RABAC1   NM_006423   Rab受体1
 RABEP2   NM_024816   Rab接触蛋白(Rabaptin),RAB GTPase结合效应蛋白2
 RABL3   NM_173825   RAB,RAS致癌基因家族样3的成员
 RACGAP1   NM_013277   Rac GTPase活化蛋白1
 RAD23A   NM_005053   UV切除修复蛋白RAD23同源物A
 RAD23B   NM_002874   UV切除修复蛋白RAD23同源物B
  RAD50   NM_005732   RAD50同源物同种型1
  RAD51L1   NM_133509   RAD51样1同种型3
  RAD51L3   NM_002878   RAD51样3同种型1
  RAD9A   NM_004584   RAD9同源物
  RAET1G   NM_001001788   视黄酸早期转录物1G
  RAF1   NM_002880   v-raf-1鼠类白血病病毒致癌基因同源物
  RAGE   NM_014226   MAPK/MAK/MRK重叠激酶
  RAI14   NM_015577   视黄酸诱导14
  RAI17   NM_020338   视黄酸诱导17
  RALB   NM_002881   v-ral猿白血病病毒致癌基因同源物B
  RALBP1   NM_006788   ralA结合蛋白1
  RALGPS1   NM_014636   具有PH结构域和SH3结合基序1的Ral GEF
  RANBP10   NM_020850   RAN结合蛋白10
  RANBP3   NM_003624   RAN结合蛋白3同种型RANBP3-a
  RANGAP1   NM_002883   RanGTPase活化蛋白1
  RAP1GAP   NM_002885   RAP1,GTPase活化蛋白1
  RAP1GDS1   NM_021159   RAP1,GTP-GDP解离刺激因子1
  RAP2C   NM_021183   RAP2C,RAS致癌基因家族的成员
  RAPGEF1   NM_005312   鸟嘌呤苷酸释放因子2同种型a
  RAPGEFL1   NM_016339   Rap鸟嘌呤苷酸交换因子
  RAPH1   NM_213589   Ras缔合和血小板白细胞C激酶底物同一性结构域
  RARB   NM_000965   视黄酸受体,β同种型1
  RARG   NM_000966   视黄酸受体,γ
  RARRES2   NM_002889   视黄酸受体反应因子(他扎罗汀(tazarotene)
  RASA3   NM_007368   RAS p21蛋白活化因子3
  RASA4   NM_006989   RAS p21蛋白活化因子4
  RASAL1   NM_004658   RAS蛋白活化因子样1
  RASGEF1B   NM_152545   RasGEF结构域家族,成员1B
  RASGEF1C   NM_001031799   RasGEF结构域家族,成员1C同种型2
  RASL12   NM_016563   RAS样,家族12蛋白
  RASSF1   NM_007182   Ras相关结构域家族1同种型A
  RASSF2   NM_014737   Ras相关结构域家族2
  RASSF3   NM_178169   Ras相关(RalGDS/AF-6)结构域家族3
  RASSF4   NM_032023   Ras相关结构域家族4同种型a
  RASSF5   NM_031437   Ras相关(RalGDS/AF-6)结构域家族5
  RBBP6   NM_006910   视网膜母细胞瘤结合蛋白6同种型1
  RBED1   NM_032213   RNA结合基序和ELMO结构域1
  RBJ   NM_016544   Ras相关蛋白Rap1
  RBL2   NM_005611   视网膜母细胞瘤样2(p130)
  RBM12   NM_006047   RNA结合基序蛋白12
  RBM12B   NM_203390   假定蛋白LOC389677
  RBM16   NM_014892   RNA结合基序蛋白16
  RBM19   NM_016196   RNA结合基序蛋白19
  RBM21   NM_022830   RNA结合基序蛋白21
  RBM23   NM_018107   假定蛋白LOC55147
  RBM24   NM_153020   假定蛋白LOC221662
  RBM33   NM_001008408   假定蛋白LOC155435
  RBM35B   NM_024939   假定蛋白LOC80004
  RBM6   NM_005777   RNA结合基序蛋白6
  RBM7   NM_016090   RNA结合基序蛋白7
  RBPMS2   NM_194272   具有多剪接2的RNA结合蛋白
  RCE1   NM_001032279   异戊二烯基蛋白肽酶RCE1同种型2
  RCL1   NM_005772   RNA环化酶同源物
  RCOR3   NM_018254   REST辅阻遏物3
  RDH13   NM_138412   视黄醇脱氢酶13(全反和9-顺)
  RDM1   NM_145654   RAD52基序1同种型1
  RDS   NM_000322   视网膜变性缓慢蛋白
  RECK   NM_021111   RECK蛋白前体
  RECQL5   NM_004259   RecQ蛋白样5同种型1
  REEP1   NM_022912   受体表达增强蛋白1
  REEP3   NM_001001330   受体表达增强蛋白3
  RELN   NM_005045   颤蛋白(reelin)同种型a
  RET   NM_020975   ret原癌基因同种型a
  REXO1   NM_020695   转录延长因子B多肽3
  REXO4   NM_020385   XPMC2预防有丝分裂崩溃2同源物
  RFFL   NM_001017368   rififylin
  RFK   NM_018339   核黄素激酶
  RFT1   NM_052859   假定蛋白LOC91869
  RFWD2   NM_001001740   环指和WD重复序列结构域2同种型d24
  RFWD3   NM_018124   环指和WD重复序列结构域3
  RFX4   NM_002920   调控因子X4同种型b
  RGAG4   NM_001024455   含逆转录转座子gag结构域4
  RGL1   NM_015149   ral鸟嘌呤苷酸解离
  RGMA   NM_020211   RGM结构域家族,成员A
  RGMB   NM_001012761   RGM结构域家族,成员B同种型1前体
  RGPD5   NM_005054   含RANBP2样和GRIP结构域5同种型
  RGS11   NM_003834   G-蛋白信号转导调控因子11同种型2
  RGS12   NM_002926   G-蛋白信号转导调控因子12同种型2
  RGS22   NM_015668   G-蛋白信号转导调控因子22
  RGS3   NM_017790   G-蛋白信号转导调控因子3同种型3
  RGS5   NM_003617   G-蛋白信号转导调控因子5
  RGS9BP   NM_207391   RGS9锚定蛋白
  RHBDL3   NM_138328   菱形,小静脉样3
  RHBG   NM_020407   Rhesus血型,B糖蛋白
  RHOB   NM_004040   ras同源物基因家族,成员B
  RHOBTB2   NM_015178   含Rho相关BTB结构域2
  RHOD   NM_014578   ras同源物D
  RHOJ   NM_020663   TC10样Rho GTPase
  RHOU   NM_021205   ras同源物基因家族,成员U
  RHPN2   NM_033103   Rho结合蛋白(rhophilin)样蛋白质
  RIC8A   NM_021932   对胆碱酯酶8抑制剂的抗性
  RICTOR   NM_152756   mTOR的雷帕霉素不敏感伴侣蛋白
  RIF1   NM_018151   RAP1相互作用因子1
  RIMBP2   NM_015347   RIM结合蛋白2
  RIMS3   NM_014747   调控突触膜胞吐作用3
  RIPK4   NM_020639   锚蛋白重复序列结构域3
  RIPK5   NM_015375   受体相互作用蛋白激酶5同种型1
  RKHD2   NM_016626   锌指和含KH结构域2
  RKHD3   NM_032246   锌指和含KH结构域3
  RNASEH1   NM_002936   核糖核酸酶H1
  RNF10   NM_014868  环指蛋白10
  RNF111   NM_017610  环指蛋白111
  RNF125   NM_017831  环指蛋白125
  RNF138   NM_016271  环指蛋白138同种型1
  RNF144   NM_014746  环指蛋白144
  RNF149   NM_173647  环指蛋白149
  RNF165   NM_152470  环指蛋白165
  RNF166   NM_178841  环指蛋白166
  RNF183   NM_145051  环指蛋白183
  RNF190   NM_152598  假定蛋白LOC162333
  RNF24   NM_007219  环指蛋白24
  RNF31   NM_017999  环指蛋白31
  RNF38   NM_022781  环指蛋白38同种型1
  RNF39   NM_025236  HZFw1蛋白同种型1
  RNF41   NM_005785  环指蛋白41同种型1
  RNF43   NM_017763  环指蛋白43
  RNF44   NM_014901  环指蛋白44
  RNF8   NM_003958  环指蛋白8同种型1
  RNGTT   NM_003800  RNA鸟苷酰转移酶和5′-磷酸酶
  RNH1   NM_002939  核糖核酸酶/血管生成素抑制剂
  RNMT   NM_003799  RNA(鸟嘌呤-7-)甲基转移酶
  RNPC1   NM_017495  含RNA结合区域的蛋白1同种型
  RNPS1   NM_006711  RNA结合蛋白S1,富含丝氨酸的结构域
  ROBO4   NM_019055  回旋(roundabout)同源物4,魔力回旋
  ROGDI   NM_024589  亮氨酸拉链结构域蛋白
  RP13-15M17.2   NM_001010866  假定蛋白LOC199953
  RP1-32F7.2   NM_173698  假定蛋白LOC286499
  RP3-473B4.1   NM_138819  假定蛋白LOC159091
  RPH3AL   NM_006987  Rab亲和蛋白3A样(无C2结构域)
  RPL10   NM_006013  核糖体蛋白L10
  RPL28   NM_000991  核糖体蛋白L28
  RPL32   NM_000994  核糖体蛋白L32
  RPP14   NM_007042  核糖核酸酶P 14kDa亚单位
  RPP25   NM_017793  核糖核酸酶P 25kDa亚单位
  RPRM   NM_019845  Rcprimo,TP53依赖性G2阻滞介体
  RPRML   NM_203400  reprimo样
  RPS23   NM_001025  核糖体蛋白S23
  RPS6KA3   NM_004586  核糖体蛋白S6激酶,90kDa,多肽
  RPS6KA5   NM_004755  核糖体蛋白S6激酶,90kDa,多肽
  RPS6KB1   NM_003161  核糖体蛋白S6激酶,70kDa,多肽
  RPS6KB2   NM_001007071  核糖体蛋白S6激酶,70kDa,多肽
  RPUSD1   NM_058192  含RNA假尿苷酸合成酶结构域
  RPUSD4   NM_032795  含RNA假尿苷酸合成酶结构域
  RRAGA   NM_006570  Ras相关GTP结合A
  RRAGC   NM_022157  Ras相关GTP结合C
  RREB1   NM_001003698  Ras应答元件结合蛋白1同种型
  RRH   NM_006583  周视蛋白(peropsin)
  RRP22   NM_001007279  RAS相关染色体22同种型b
  RS1   NM_000330  X连锁青年性视网膜劈裂症蛋白
  RSBN1   NM_018364  圆形精细胞碱性蛋白1
  RSNL2   NM_024692   列斯蛋白(restin)样2
  RSPO2   NM_178565   R-脊椎蛋白(spondin)家族,成员2
  RSPO3   NM_032784   血小板反应蛋白,I型,含结构域2
  RSU1   NM_012425   Ras抑制蛋白1同种型1
  RTEL1   NM_032957   端粒延伸解旋酶1的调控因子
  RTF1   NM_015138   Paf1/RNA聚合酶II复合组分
  RTN2   NM_206902   浆膜蛋白(reticulon)2同种型D
  RTN3   NM_006054   浆膜蛋白3同种型a
  RTN4   NM_007008   浆膜蛋白4同种型C
  RTN4RL1   NM_178568   浆膜蛋白4受体样1
  RUNX1   NM_001001890   Runt相关转录因子1同种型b
  RUNX1T1   NM_004349   急性髓细胞白血病1易位1
  RUTBC1   NM_014853   含RUN和TBC1结构域1
  RXRA   NM_002957   类视黄醇X受体,α
  RYBP   NM_012234   RING1和YY1结合蛋白
  S100A5   NM_002962   S100钙结合蛋白A5
  S100A7L1   NM_176823   S100钙结合蛋白A7样1
  SACM1L   NM_014016   肌动蛋白抑制因子1
  SAE1   NM_005500   SUMO-1活化酶亚单位1
  SALL2   NM_005407   sal样2
  SALL3   NM_171999   sal样3
  SALL4   NM_020436   sal样4
  SAMD10   NM_080621   含不育α基序结构域10
  SAPS2   NM_014678   假定蛋白LOC9701
  SAPS3   NM_018312   SAPS结构域家族,成员3
  SARM1   NM_015077   含不育α和TIR基序的1
  SAT   NM_002970   亚精胺/精胺N1-乙酰转移酶
  SATB2   NM_015265   SATB家族成员2
  SAV1   NM_021818   WW45蛋白
  SBF1   NM_002972   SET结合因子1同种型a
  SCAMP1   NM_004866   分泌载体膜蛋白1同种型1
  SCAMP4   NM_079834   分泌载体膜蛋白4
  SCAMP5   NM_138967   分泌载体膜蛋白5
  SCAND2   NM_022050   含SCAN结构域的蛋白2同种型1
  SCARB1   NM_005505   清道夫受体B类,成员1
  SCARF1   NM_145349   清道夫受体F类,成员1同种型2
  SCCPDH   NM_016002   酵母氨酸脱氢酶(假定)
  SCG3   NM_013243   分泌粒蛋白(secretogranin)III
  SCMH1   NM_001031694   中足上的性梳同源物1同种型1
  SCML4   NM_198081   中足上的性梳样4
  SCN2B   NM_004588   钠通道,电压门控,IIβ型
  SCN3A   NM_006922   钠通道,电压门控,IIIα型
  SCN4A   NM_000334   电压门控钠通道,4α型
  SCN4B   NM_174934   钠通道,电压门控,IVβ型
  SCN5A   NM_000335   电压门控钠通道,Vα型
  SCOC   NM_032547   短卷曲螺旋蛋白
  SCOTIN   NM_016479   scotin
  SCRN1   NM_014766   分离蛋白(secernin)1
  SDC1   NM_001006946   多配体蛋白聚糖(syndecan)1前体
  SDCBP2   NM_015685   多配体蛋白聚糖结合蛋白2同种型b
  SDHC   NM_003001   琥珀酸脱氢酶复合物亚单位C
  SEC14L1   NM_003003   SEC14(酿酒酵母)样1同种型a
  SEC14L4   NM_174977   SEC14p样蛋白TAP3
  SEC22C   NM_004206   SEC22膜泡运输蛋白同源物C
  SEC61A1   NM_013336   Sec61α1亚单位
  SECISBP2   NM_024077   SECIS结合蛋白2
  SEH1L   NM_001013437   sec13样蛋白同种型1
  SEL1L   NM_005065   lin-12样的sel-1抑制因子
  SELE   NM_000450   选凝素(selectin)E前体
  SELENBP1   NM_003944   硒结合蛋白1
  SELI   NM_033505   硒蛋白I
  SELO   NM_031454   硒蛋白O
  SELPLG   NM_003006   选凝素P配体
  SELS   NM_018445   硒蛋白S
  SEMA3B   NM_001005914   脑信号蛋白(semaphorin)3B同种型2前体
  SEMA3D   NM_152754   脑信号蛋白3D
  SEMA3E   NM_012431   脑信号蛋白3E
  SEMA3G   NM_020163   脑信号蛋白sem2
  SEMA4B   NM_020210   脑信号蛋白4B前体
  SEMA4F   NM_004263   脑信号蛋白W
  SEMA5A   NM_003966   脑信号蛋白5A
  SEMA5B   NM_001031702   脑信号蛋白5B同种型I
  SEMA6A   NM_020796   sema结构域,跨膜结构域(TM)和
  SEMA6B   NM_032108   脑信号蛋白6B同种型3前体
  SEMA6D   NM_020858   脑信号蛋白6D同种型1前体
  SEMA7A   NM_003612   脑信号蛋白7A
  SENP1   NM_014554   泛素相关蛋白(sentrin)/SUMO特异性蛋白酶1
  SENP2   NM_021627   SUMO1/泛素相关蛋白/SMT3特异性蛋白酶2
  SEPN1   NM_020451   硒蛋白N,1同种型1前体
  SEPT11   NM_018243   隔蛋白(septin)11
  SEPT2   NM_001008491   隔蛋白2
  SEPT3   NM_019106   隔蛋白3同种型B
  SEPT9   NM_006640   隔蛋白9
  SEPW1   NM_003009   硒蛋白W,1
  SERAC1   NM_032861   含丝氨酸活性位点的1
  SERBP1   NM_001018067   SERPINE1 mRNA结合蛋白1同种型1
  SERHL   NM_170694   丝氨酸水解酶样
  SERINC2   NM_178865   肿瘤差异表达2样
  SERPINA10   NM_016186   丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂,clade
  SERPINB13   NM_012397   丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂,clade
  SERPINB2   NM_002575   丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂,clade
  SERPINB7   NM_003784   丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂,clade
  SERPINB9   NM_004155   丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂,clade
  SERPINE1   NM_000602   纤溶酶原活化因子抑制剂-1
  SERPINF2   NM_000934   α-2-纤溶酶抑制剂
  SERPING1   NM_000062   互补组分1抑制剂前体
  SESN1   NM_014454   sestrin 1
  SESN2   NM_031459   sestrin 2
  SETD3   NM_032233   假定蛋白LOC84193同种型a
  SETD4   NM_001007258   假定蛋白LOC54093同种型b
  SF1   NM_201997   剪接因子1同种型4
  SF3A1   NM_001005409   剪接因子3a,亚单位1,120kDa同种型2
  SF3A3   NM_006802   剪接因子3a,亚单位3
  SF4   NM_021164   剪接因子4同种型b
  SFRS11   NM_004768   剪接因子p54
  SFRS12   NM_139168   剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的12
  SFRS16   NM_007056   剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的16
  SFRS2   NM_003016   剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的2
  SFRS2IP   NM_004719   剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的2,
  SFRS5   NM_006925   剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的5
  SFRS8   NM_152235   剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的8同种型
  SFT2D3   NM_032740   含SFT2结构域3
  SFTPB   NM_000542   表面活性剂,肺相关蛋白B
  SFXN1   NM_022754   sideroflexin1
  SFXN2   NM_178858   sideroflexin2
  SFXN3   NM_030971   sideroflexin3
  SFXN5   NM_144579   sideroflexin5
  SGCA   NM_000023   肌聚糖,α(50kDa肌营养不良蛋白(dystrophin)相关
  SGCD   NM_000337   δ-肌聚糖同种型1
  SGK   NM_005627   血清/糖皮质激素调控激酶
  SGK2   NM_016276   血清/糖皮质激素调控激酶2同种型
  SGK3   NM_001033578   血清/糖皮质激素调控激酶3同种型
  SH2D2A   NM_003975   SH2结构域蛋白2A
  SH2D3C   NM_170600   含SH2结构域3C同种型2
  SH3BGRL2   NM_031469   富含SH3结构域结合谷氨酸的蛋白
  SH3BP2   NM_003023   SH3结构域结合蛋白2
  SH3BP4   NM_014521   SH3结构域结合蛋白4
  SH3BP5L   NM_030645   SH3结合结构域蛋白5样
  SH3GL2   NM_003026   SH3结构域GRB2样2
  SH3PX3   NM_153271   含SH3和PX结构域3
  SH3PXD2B   NM_001017995   SH3和PX结构域2B
  SHANK2   NM_012309   SH3和多锚蛋白重复序列结构域2
  SHC3   NM_016848   含src同一性2结构域的转化
  SHF   NM_138356   假定蛋白LOC90525
  SHOC2   NM_007373   透明同源物的soc-2抑制因子
  SHOX   NM_006883   矮身材同源异形盒同种型b
  SHOX2   NM_003030   矮身材同源异形盒2同种型b
  SHRM   NM_020859   shroom
  SIAH1   NM_001006610   seven in absentia同源物1同种型b
  SIAHBP1   NM_014281   Fuse结合蛋白相互作用阻遏物
  SIDT1   NM_017699   SID1跨膜家族,成员1
  SIM2   NM_005069   诚实(single-minded)同源物2长同种型
  SIPA1L2   NM_020808   信号诱导增殖相关1样
  SIRPA   NM_080792   信号调控蛋白α前体
  SIRPB1   NM_006065   信号调控蛋白β1前体
  SIRT4   NM_012240   去乙酰化酶(sirtuin)4
  SIRT5   NM_031244   去乙酰化酶(sirtuin)5同种型2
  SIX4   NM_017420   sine oculis同源异形盒同源物4
  SKI   NM_003036   v-ski肉瘤病毒致癌基因同源物
  SKIP   NM_030623   1型鞘氨醇激酶相互作用蛋白
  SLC11A2   NM_000617  溶质载体家族11(质子偶联
  SLC12A2   NM_001046  溶质载体家族12
  SLC12A5   NM_020708  溶质载体家族12成员5
  SLC12A7   NM_006598  溶质载体家族12(钾/氯化物
  SLC12A8   NM_024628  溶质载体家族12,成员8
  SLC13A1   NM_022444  溶质载体家族13(钠/硫酸盐
  SLC13A3   NM_001011554  溶质载体家族13成员3同种型b
  SLC13A5   NM_177550  溶质载体家族13(钠依赖性
  SLC15A4   NM_145648  溶质载体家族15,成员4
  SLC16A14   NM_152527  溶质载体家族16(单羧酸
  SLC16A3   NM_004207  溶质载体家族16,成员3
  SLC16A8   NM_013356  溶质载体家族16,成员8
  SLC18A1   NM_003053  溶质载体家族18(囊泡单胺)
  SLC18A3   NM_003055  溶质载体家族18(囊泡
  SLC19A2   NM_006996  溶质载体家族19,成员2
  SLC1A2   NM_004171  溶质载体家族1,成员2
  SLC20A2   NM_006749  溶质载体家族20,成员2
  SLC22A13   NM_004256  有机阳离子转运蛋白样3
  SLC22A15   NM_018420  溶质载体家族22(有机阳离子
  SLC22A17   NM_016609  溶质载体家族22(有机阳离子
  SLC22A2   NM_003058  溶质载体家族22成员2同种型a
  SLC22A7   NM_153320  溶质载体家族22成员7同种型b
  SLC24A1   NM_004727  溶质载体家族24
  SLC24A3   NM_020689  溶质载体家族24
  SLC24A4   NM_153646  溶质载体家族24成员4同种型1
  SLC24A6   NM_024959  溶质载体家族24成员6
  SLC25A12   NM_003705  溶质载体家族25(线粒体载体,
  SLC25A15   NM_014252  溶质载体家族25(线粒体载体;
  SLC25A19   NM_021734  溶质载体家族25(线粒体
  SLC25A2   NM_031947  溶质载体家族25成员2
  SLC25A22   NM_024698  线粒体谷氨酸载体1
  SLC25A29   NM_152333  溶质载体家族25,成员29同种型a
  SLC25A3   NM_213612  溶质载体家族25成员3同种型c
  SLC25A34   NM_207348  溶质载体家族25,成员34
  SLC25A35   NM_201520  溶质载体家族25,成员35
  SLC26A1   NM_022042  溶质载体家族26,成员1同种型a
  SLC26A10   NM_001018084  溶质载体家族26,成员10同种型1
  SLC26A2   NM_000112  溶质载体家族26成员2
  SLC26A4   NM_000441  潘蛋白
  SLC28A1   NM_201651  溶质载体家族28(钠偶联
  SLC29A2   NM_001532  溶质载体家族29(核苷
  SLC2A14   NM_153449  葡萄糖转运蛋白14
  SLC2A3   NM_006931  溶质载体家族2(易化葡萄糖
  SLC2A4   NM_001042  葡萄糖转运蛋白4
  SLC2A8   NM_014580  溶质载体家族2(易化葡萄糖
  SLC30A10   NM_001004433  溶质载体家族30(锌转运蛋白),
  SLC30A4   NM_013309  溶质载体家族30(锌转运蛋白),
  SLC30A8   NM_173851  溶质载体家族30成员8
  SLC31A1   NM_001859  溶质载体家族31(铜转运蛋白),
  SLC35A4   NM_080670  溶质载体家族35,成员A4
  SLC35B2   NM_178148   溶质载体家族35,成员B2
  SLC35C1   NM_018389   溶质载体家族35,成员C1
  SLC35E1   NM_024881   溶质载体家族35,成员E1
  SLC36A1   NM_078483   溶质载体家族36成员1
  SLC36A2   NM_181776   溶质载体家族36(质子/氨基酸
  SLC37A2   NM_198277   溶质载体家族37(甘油-3-磷酸
  SLC38A3   NM_006841   溶质载体家族38,成员3
  SLC38A4   NM_018018   溶质载体家族38,成员4
  SLC39A1   NM_014437   溶质载体家族39(锌转运蛋白),
  SLC39A10   NM_020342   溶质载体家族39(锌转运蛋白),
  SLC39A7   NM_006979   溶质载体家族39(锌转运蛋白),
  SLC39A9   NM_018375   溶质载体家族39(锌转运蛋白),
  SLC3A1   NM_000341   溶质载体家族3,成员1
  SLC41A2   NM_032148   溶质载体家族41,成员2
  SLC41A3   NM_001008487   溶质载体家族41,成员3同种型4
  SLC43A1   NM_003627   溶质载体家族43,成员1
  SLC44A1   NM_080546   CDW92抗原同种型2
  SLC44A2   NM_020428   CTL2蛋白
  SLC45A2   NM_001012509   膜相关转运蛋白同种型
  SLC45A3   NM_033102   前列腺特异蛋白(prostein)
  SLC4A4   NM_003759   溶质载体家族4,碳酸氢钠
  SLC4A7   NM_003615   溶质载体家族4,碳酸氢钠
  SLC6A1   NM_003042   溶质载体家族6(神经递质
  SLC6A14   NM_007231   溶质载体家族6(氨基酸
  SLC6A17   NM_001010898   溶质载体家族6,成员17
  SLC6A2   NM_001043   溶质载体家族6成员2
  SLC6A4   NM_001045   溶质载体家族6成员4
  SLC6A6   NM_003043   溶质载体家族6(神经递质
  SLC6A8   NM_005629   溶质载体家族6(神经递质
  SLC6A9   NM_001024845   溶质载体家族6成员9同种型3
  SLC7A1   NM_003045   溶质载体家族7(阳离子氨基酸
  SLC7A2   NM_001008539   溶质载体家族7,成员2同种型1
  SLC7A5   NM_003486   溶质载体家族7(阳离子氨基酸
  SLC7A6   NM_003983   溶质载体家族7(阳离子氨基酸
  SLC8A3   NM_182933   溶质载体家族8成员3同种型E
  SLC9A1   NM_003047   溶质载体家族9同种型A1
  SLC9A3R2   NM_004785   溶质载体家族9同种型3调控因子2
  SLC9A5   NM_004594   溶质载体家族9(钠/氢
  SLC9A6   NM_006359   溶质载体家族9(钠/氢
  SLC9A8   NM_015266   Na+/H+交换蛋白同种型8
  SLCO2A1   NM_005630   溶质载体有机阴离子转运蛋白家族,
  SLCO4C1   NM_180991   溶质载体有机阴离子转运蛋白家族,
  SLFN11   NM_152270   睡眠蛋白(schlafen)家族成员11
  SLFN13   NM_144682   睡眠蛋白家族成员13
  SLFNL1   NM_144990   假定蛋白LOC200172
  SLITRK1   NM_052910   Slit和trk样1蛋白
  SLITRK2   NM_032539   SLIT和NTRK样家族,成员2
  SLITRK6   NM_032229   Slit和trk样6
  SLN   NM_003063   肌脂蛋白
  SLURP1   NM_020427   ARS组分B前体
 SMAD2   NM_001003652  Sma-和Mad相关蛋白2
 SMAD3   NM_005902  MAD,decapentaplegic母系同源物3
 SMAD5   NM_001001419  SMAD,针对DPP同源物5的母本
 SMAD7   NM_005904  MAD,decapentaplegic母系同源物7
 SMAF1   NM_001018082  小脂肪细胞因子1
 SMAP1   NM_021940  基质膜关联蛋白
 SMAP1L   NM_022733  基质膜关联蛋白1样
 SMARCA1   NM_003069  SWI/SNF相关基质关联
 SMARCD2   NM_003077  SWI/SNF相关基质关联
 SMC1L1   NM_006306  染色体的SMC1结构维持
 SMC6L1   NM_024624  SMC6蛋白
 SMCR8   NM_144775  史密斯-马吉氏综合症(Smith-Magenis syndrome)染色体区域
 SMG5   NM_015327  Est1p样蛋白B
 SMG6   NM_017575  Smg-6同源物,无义介导mRNA衰减
 SMPD1   NM_000543  鞘磷脂磷酸二酯酶1,酸性
 SMPD3   NM_018667  鞘磷脂磷酸二酯酶3,中性
 SMURF1   NM_020429  Smad泛素化调控因子1同种型
 SMURF2   NM_022739  SMAD特异性E3泛素蛋白连接酶2
 SMYD1   NM_198274  含SET和MYND结构域1
 SMYD4   NM_052928  含SET和MYND结构域4
 SMYD5   NM_006062  SMYD家族成员5
 SNAP23   NM_003825  突触体相关蛋白23同种型
 SNAP25   NM_003081  突触体相关蛋白25同种型
 SNCG   NM_003087  突触核蛋白(synuclein),γ(乳腺癌特异性蛋白
 SNF1LK   NM_173354  SNF1样激酶
 SNF1LK2   NM_015191  SNF1样激酶2
 SNIP1   NM_024700  Smad核相互作用蛋白
 SNN   NM_003498  Stannin
 SNPH   NM_014723  伸展蛋白(syntaphilin)
 SNRK   NM_017719  SNF相关激酶
 SNRPA1   NM_003090  小核核糖核蛋白多肽A′
 SNRPC   NM_003093  小核核糖核蛋白多肽C
 SNRPD1   NM_006938  小核核糖核蛋白D1多肽
 SNTB2   NM_130845  碱性β2互生蛋白同种型b
 SNURF   NM_005678  SNRPN上游阅读框蛋白
 SNX1   NM_003099  分选微管连接蛋白(sorting nexin)1同种型a
 SNX11   NM_013323  分选微管连接蛋白11
 SNX16   NM_022133  分选微管连接蛋白16同种型a
 SNX19   NM_014758  分选微管连接蛋白19
 SNX6   NM_021249  分选微管连接蛋白6同种型a
 SNX9   NM_016224  分选微管连接蛋白9
 SOCS5   NM_014011  细胞因子信号转导抑制因子5
 SOCS6   NM_004232  细胞因子信号转导抑制因子6
 SOD3   NM_003102  超氧化物歧化酶3,细胞外
 SON   NM_032195  SON DNA结合蛋白同种型B
 SORBS1   NM_015385  含山梨糖(sorbin)和SH3结构域1同种型2
 SORBS2   NM_003603  含山梨糖和SH3结构域2同种型1
 SORCS1   NM_001013031  SORCS受体1同种型b
 SORCS2   NM_020777  VPS10结构域受体蛋白SORCS 2
 SORT1   NM_002959  选蛋白(sortilin)1前蛋白原
  SOST   NM_025237   硬化蛋白(sclerostin)前体
  SOX1   NM_005986   SRY(性别决定区Y)盒1
  SOX11   NM_003108   SRY盒11
  SOX13   NM_005686   SRY盒13
  SOX3   NM_005634   SRY(性别决定区Y)盒3
  SOX4   NM_003107   SRY(性别决定区Y)盒4
  SOX5   NM_006940   SRY(性别决定区Y)盒5同种型a
  SOX9   NM_000346   转录因子SOX9
  SP5   NM_001003845   Sp5转录因子
  SP8   NM_182700   Sp8转录因子同种型1
  SPATA18   NM_145263   精子发生相关18同源物
  SPATA21   NM_198546   精子发生相关21
  SPATA3   NM_139073   睾丸和精子发生细胞凋亡
  SPDEF   NM_012391   含SAM指向结构域的ets转录
  SPEN   NM_015001   spen同源物,转录调控因子
  SPFH2   NM_007175   SPFH结构域家族,成员2同种型1
  SPG20   NM_015087   斯巴蛋白(spartin)
  SPG7   NM_199367   截瘫蛋白(paraplegin)同种型2
  SPHK2   NM_020126   鞘氨醇激酶2型同种型
  SPINT2   NM_021102   丝氨酸蛋白酶抑制剂,Kunitz型,2
  SPIRE2   NM_032451   尖顶同源物2
  SPN   NM_001030288   载涎蛋白(sialophorin)
  SPOCK2   NM_014767   sparc/骨粘连蛋白,cwcv和kazal样结构域
  SPON2   NM_012445   脊椎蛋白(spondin)2,细胞外基质蛋白
  SPP2   NM_006944   分泌磷蛋白2,24kDa
  SPPL2B   NM_152988   信号肽肽酶样2B同种型2
  SPPL3   NM_139015   SPPL3蛋白
  SPRED1   NM_152594   具有EVH-1结构域的芽状(sprouty)相关蛋白1
  SPRN   NM_001012508   朊蛋白阴影
  SPRR1B   NM_003125   富含小脯氨酸的蛋白1B
  SPRY3   NM_005840   芽状同源物3
  SPRY4   NM_030964   芽状同源物4
  SPRYD3   NM_032840   假定蛋白LOC84926
  SPSB2   NM_032641   含SPRY结构域的SOCS盒蛋白SSB-2
  SPSB3   NM_080861   含SPRY结构域的SOCS盒蛋白SSB-3
  SPSB4   NM_080862   含SPRY结构域的SOCS盒蛋白SSB-4
  SPTAN1   NM_003127   血影蛋白(spectrin)α,非红细胞性1
  SPTB   NM_001024858   血影蛋白β同种型a
  SPTBN2   NM_006946   血影蛋白β,非红细胞性2
  SPTLC1   NM_006415   丝氨酸棕榈酰转移酶亚单位1同种型a
  SPTY2D1   NM_194285   假定蛋白LOC144108
  SRC   NM_005417   原癌基因酪氨酸-蛋白激酶SRC
  SRD5A2   NM_000348   3-氧代-5α-类固醇4-脱氢酶2
  SREBF1   NM_001005291   固醇调控元件结合转录
  SRP72   NM_006947   信号识别颗粒72kDa
  SRPK1   NM_003137   SFRS蛋白激酶1
  SRPR   NM_003139   信号识别颗粒受体(停靠
  SRPRB   NM_021203   信号识别颗粒受体β
  SRPX   NM_006307   含sushi重复序列的蛋白,X连锁
  SRXN1   NM_080725   硫氧还蛋白(sulfircdoxin)1同源物
  SSH3   NM_017857   slingshot同源物3同种型1
  SSR1   NM_003144   信号序列受体α
  SSRP1   NM_003146   结构特异性识别蛋白1
  SSU72   NM_014188   Ssu72RNA聚合酶II CTD磷酸酶同源物
  ST3GAL4   NM_006278   ST3β-半乳糖苷α-2,3-唾液酸转移酶
  ST3GAL5   NM_003896   唾液酰转移酶9
  ST5   NM_005418   肿瘤发生抑制5同种型1
  ST6GAL1   NM_003032   唾液酰转移酶1同种型a
  ST7L   NM_017744   肿瘤发生抑制7样同种型1
  ST8SIA3   NM_015879   ST8α-N-乙酰-神经氨酸苷
  ST8SIA5   NM_013305   ST8α-N-乙酰-神经氨酸苷
  STAC2   NM_198993   富含SH3和半胱氨酸的结构域2
  STARD13   NM_052851   含START结构域13同种型γ
  STARD3   NM_006804   类固醇生成急性调控蛋白相关
  STAT3   NM_003150   信号转导和转录活化因子
  STAT5B   NM_012448   信号转导和转录活化因子
  STC1   NM_003155   司腺钙蛋白(stanniocalcin)1前体
  STEAP2   NM_152999   6个跨膜上皮抗原
  STEAP3   NM_001008410   dudulin 2同种型b
  STIM1   NM_003156   基质交感分子1前体
  STIM2   NM_020860   基质交感分子2
  STIP1   NM_006819   应激诱导磷蛋白1
  STK10   NM_005990   丝氨酸/苏氨酸激酶10
  STK11   NM_000455   丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶11
  STK17A   NM_004760   丝氨酸/苏氨酸激酶17a
  STK19   NM_004197   丝氨酸/苏氨酸激酶19同种型1
  STK32B   NM_018401   丝氨酸/苏氨酸激酶32B
  STK32C   NM_173575   丝氨酸/苏氨酸激酶32C
  STK33   NM_030906   丝氨酸/苏氨酸激酶33
  STK35   NM_080836   丝氨酸/苏氨酸激酶35
  STK38   NM_007271   丝氨酸/苏氨酸激酶38
  STK38L   NM_015000   丝氨酸/苏氨酸激酶38样
  STOML1   NM_004809   Stomatin(EPB72)样1
  STON1   NM_006873   石蛋白(stonin)1
  STOX2   NM_020225   鹳头盒2
  STX16   NM_001001433   突触融合蛋白(syntaxin)16同种型a
  STX17   NM_017919   突触融合蛋白17
  STX1A   NM_004603   突触融合蛋白1A(脑)
  STX3   NM_004177   突触融合蛋白3A
  STX5   NM_003164   突触融合蛋白5
  STX6   NM_005819   突触融合蛋白6
  STXBP1   NM_001032221   突触融合蛋白结合蛋白1同种型b
  STXBP3   NM_007269   突触融合蛋白结合蛋白3
  STXBP4   NM_178509   突触融合蛋白结合蛋白4
  STXBP5   NM_139244   tomosyn
  SUFU   NM_016169   融合抑制因子
  SUHW3   NM_017666   毛翅同源物抑制因子3
  SUHW4   NM_001002843   毛翅同源物抑制因子4同种型2
  SULT4A1   NM_014351   磺基转移酶家族4A,成员1
  SUMO3   NM_006936   小泛素样修饰蛋白3
  SUPT16H   NM_007192   染色质特异性转录延伸
  SUPT6H   NM_003170   Ty 6同源物抑制因子
  SUPT7L   NM_014860   SPTF相关因子65γ
  SURF4   NM_033161   过量蛋白(surfeit)4
  SURF5   NM_133640   过量蛋白5同种型b
  SUSD1   NM_022486   含sushi结构域1
  SUV420H1   NM_016028   色斑4-20抑制因子同源物1同种型
  SUV420H2   NM_032701   色斑4-20抑制因子同源物2
  SUZ12   NM_015355   与JAZF1接合
  SVH   NM_031905   SVH蛋白
  SVIL   NM_003174   监理蛋白(supervillin)同种型1
  SWAP70   NM_015055   SWAP-70蛋白
  SYBL1   NM_005638   小突触泡蛋白(synaptobrevin)样1
  SYDE1   NM_033025   突触缺陷型1,Rho GTPase,同源物1
  SYN2   NM_003178   突触蛋白II同种型IIb
  SYNE1   NM_015293   nesprin1同种型β
  SYNGR1   NM_004711   突触循环蛋白(synaptogyrin)1同种型1a
  SYNGR3   NM_004209   突触循环蛋白3
  SYNJ1   NM_003895   突触小泡磷酸酶(synaptojanin)1同种型a
  SYPL1   NM_006754   突触小泡蛋白(synaptophysin)样1同种型a
  SYT10   NM_198992   突触结合蛋白(synaptotagmin)10
  SYT12   NM_177963   突触结合蛋白XII
  SYT15   NM_031912   突触结合蛋白XV同种型a
  SYT3   NM_032298   突触结合蛋白3
  SYT4   NM_020783   突触结合蛋白IV
  SYT6   NM_205848   突触结合蛋白VI
  SYT8   NM_138567   突触结合蛋白VIII
  SYTL2   NM_032379   突触结合蛋白样2同种型b
  SYTL4   NM_080737   突触结合蛋白样4(粒亲蛋白-a)
  TAB3   NM_152787   TAK1结合蛋白3同种型1
  TACC1   NM_006283   含转化性、酸性卷曲螺旋
  TAF15   NM_003487   TBP相关因子15同种型2
  TAF1C   NM_005679   TBP相关因子1C同种型1
  TAF5   NM_006951   TBP相关因子5
  TAF7   NM_005642   TATA盒结合蛋白相关因子2F
  TAF7L   NM_024885   TATA盒结合蛋白相关因子RNA
  TAF9B   NM_015975   转录相关因子9B
  TAGLN2   NM_003564   转凝蛋白(transgelin)2
  TAL1   NM_003189   T细胞急性淋巴细胞白血病1
  TAOK1   NM_020791   TAO激酶1
  TAP2   NM_000544   转运蛋白2,ATP结合盒,亚族
  TAPBP   NM_003190   甲巯蛋白(tapasin)同种型1前体
  TARBP1   NM_005646   TARRNA结合蛋白1
  TARBP2   NM_004178   TAR RNA结合蛋白2同种型b
  TASP1   NM_017714   苏氨酸天冬氨酸酶(taspase)1
  TAT   NM_000353   酪氨酸转氨酶
  TAX1BP3   NM_014604   Tax1(I型人类T细胞白血病病毒)
  TAZ   NM_000116   tafazzin同种型1
  TBC1D1   NM_015173   TBC1(tre-2/USP6,BUB2,cdc16)结构域家族,
  TBC1D10B   NM_015527   TBC1结构域家族,成员10B
  TBC1D13   NM_018201   TBC1结构域家族,成员13
  TBC1D14   NM_020773   TBC1结构域家族,成员14
  TBC1D19   NM_018317   TBC1结构域家族,成员19
  TBC1D22A   NM_014346   TBC1结构域家族,成员22A
  TBC1D22B   NM_017772   TBC1结构域家族,成员22B
  TBC1D2B   NM_015079   TBC1结构域家族,成员2B
  TBC1D3C   NM_001001418   TBC1结构域家族成员3C
  TBC1D8   NM_007063   TBC1结构域家族,成员8
  TBC1D9   NM_015130   假定蛋白LOC23158
  TBCC   NM_003192   β-微管蛋白辅因子C
  TBCCD1   NM_018138   含TBCC结构域1
  TBK1   NM_013254   TANK结合激酶1
  TBL1X   NM_005647   转导蛋白β样1X
  TBL1XR1   NM_024665   核受体辅阻遏物/HDAC3复合物
  TBL2   NM_012453   转录诱导因子(β)样2
  TBP   NM_003194   TATA盒结合蛋白
  TBPL1   NM_004865   TBP样1
  TBRG1   NM_032811   转化生长因子β调控因子1
  TBX1   NM_005992   T盒1同种型B
  TBX2   NM_005994   T盒2
  TBX6   NM_004608   T盒6同种型1
  TCAP   NM_003673   视松蛋白(telethonin)
  TCEB2   NM_007108   延伸蛋白(elongin)B同种型a
  TCF1   NM_000545   转录因子1,肝脏
  TCF21   NM_198392   转录因子21
  TCF3   NM_003200   转录因子3
  TCF7   NM_003202   转录因子7(T细胞特异性
  TCFL5   NM_006602   转录因子样5蛋白
  TCHP   NM_032300   多毛蛋白(trichoplein)
  TCL6   NM_014418   T细胞白血病/淋巴瘤6同种型TCL6a2
  TDGF1   NM_003212   畸胎瘤衍生生长因子1
  TEAD1   NM_021961   TEA结构域家族成员1
  TEDDM1   NM_172000   假定膜蛋白HE9
  TES   NM_015641   睾丸素(testin)同种型1
  TEX261   NM_144582   睾丸表达的序列261
  TFAP2A   NM_001032280   转录因子AP-2α同种型b
  TFAP2C   NM_003222   转录因子AP-2γ
  TFAP2D   NM_172238   转录因子AP-2β样1
  TFAP2E   NM_178548   转录因子AP-2ε(活化
  TFAP4   NM_003223   转录因子AP-4(活化增强子
  TFCP2LI   NM_014553   LBP-9
  TFEC   NM_001018058   转录因子EC同种型b
  TFG   NM_001007565   TRK融合基因
  TFPI2   NM_006528   组织因子路径抑制剂2
  TGFBR1   NM_004612   转化生长因子,β受体I
  TGFBR3   NM_003243   转化生长因子,β受体III
  TGIF2   NM_021809   TGFB诱导因子2
  TGIF2LY   NM_139214   TGFB诱导因子2样,Y连锁
  TGOLN2   NM_006464   反高尔基网架蛋白2
  THAP2   NM_031435   含THAP结构域,细胞凋亡相关
  THAP6   NM_144721  含THAP结构域6
  THBS2   NM_003247  血小板反应蛋白(thrombospondin)2前体
  THEM4   NM_053055  硫酯酶超家族成员4同种型a
  THSD3   NM_182509  血小板反应蛋白,含I型结构域3
  THSD4   NM_024817  假定蛋白LOC79875
  THUMPD1   NM_017736  含THUMP结构域1
  THYN1   NM_014174  胸腺细胞核蛋白1同种型1
  TIAF1   NM_004740  TGFB1诱导的抗凋亡因子1
  TIGA1   NM_053000  假定蛋白LOC114915
  TIGD6   NM_030953  假定蛋白LOC81789
  TIMM13   NM_012458  线粒体内膜转位酶13
  TIMM22   NM_013337  线粒体内膜转位酶22
  TIMM50   NM_001001563  线粒体内膜转位酶50
  TIMP2   NM_003255  金属蛋白酶2的组织抑制剂
  TK2   NM_004614  胸苷激酶2,线粒体
  TKTL1   NM_012253  转酮醇酶样1
  TLE4   NM_007005  转导蛋白样增强子蛋白4
  TLK1   NM_012290  扰动样激酶1
  TLK2   NM_006852  扰动样激酶2
  TLL1   NM_012464  tolloid样1
  TLL2   NM_012465  tolloid样2
  TLN1   NM_006289  踝蛋白(talin)1
  TLOC1   NM_003262  易位蛋白1
  TLR1   NM_003263  钟样受体1
  TLR4   NM_138554  钟样受体4前体
  TLR7   NM_016562  钟样受体7
  TLX2   NM_016170  T细胞白血病,同源异形盒2
  TM2D2   NM_001024380  含TM2结构域2同种型b
  TM4SF1   NM_014220  跨膜4超家族成员1
  TM9SF4   NM_014742  跨膜9超家族蛋白成员4
  TMCC1   NM_001017395  跨膜和卷曲螺旋结构域1同种型
  TMCC3   NM_020698  跨膜和卷曲螺旋结构域3
  TMED3   NM_007364  含跨膜emp24结构域3
  TMED9   NM_017510  跨膜emp24蛋白转运结构域
  TMEM10   NM_033207  跨膜蛋白10同种型a
  TMEM100   NM_018286  假定蛋白LOC55273
  TMEM101   NM_032376  假定蛋白LOC84336
  TMEM104   NM_017728  假定蛋白LOC54868
  TMEM105   NM_178520  假定蛋白LOC284186
  TMEM106A   NM_145041  假定蛋白LOC113277
  TMEM109   NM_024092  跨膜蛋白109
  TMEM113   NM_025222  假定蛋白PRO2730
  TMEM119   NM-181724  假定蛋白LOC338773
  TMEM123   NM_052932  前细胞胀亡受体诱导膜损伤
  TMEM127   NM_017849  假定蛋白LOC55654
  TMEM134   NM_025124  假定蛋白LOC80194
  TMEM135   NM_022918  假定蛋白LOC65084
  TMEM138   NM_016464  假定蛋白LOC51524
  TMEM139   NM_153345  假定蛋白LOC135932
  TMEM143   NM_018273  假定蛋白LOC55260
  TMEM16C   NM_031418  跨膜蛋白16C
  TMEM16F   NM_001025356  跨膜蛋白16F
  TMEM16G   NM_001001891  跨膜蛋白16G同种型NGEP长
  TMEM16K   NM_018075  假定蛋白LOC55129
  TMEM18   NM_152834  跨膜蛋白18
  TMEM20   NM_153226  跨膜蛋白20
  TMEM26   NM_178505  跨膜蛋白26
  TMEM30B   NM_001017970  跨膜蛋白30B
  TMEM33   NM_018126  跨膜蛋白33
  TMEM35   NM_021637  跨膜蛋白35
  TMEM43   NM_024334  跨膜蛋白43
  TMEM45B   NM_138788  跨膜蛋白45B
  TMEM47   NM_031442  跨膜4超家族成员10
  TMEM49   NM_030938  跨膜蛋白49
  TMEM50B   NM_006134  跨膜蛋白50B
  TMEM52   NM_178545  跨膜蛋白52
  TMEM55A   NM_018710  跨膜蛋白55A
  TMEM55B   NM_144568  跨膜蛋白55B
  TMEM63C   NM_020431  跨膜蛋白63C
  TMEM79   NM_032323  假定蛋白LOC84283
  TMEM8   NM_021259  跨膜蛋白8(5次跨膜
  TMEM85   NM_016454  假定蛋白LOC51234
  TMEM86A   NM_153347  假定蛋白LOC144110
  TMEM86B   NM_173804  假定蛋白LOC255043
  TMEM87A   NM_015497  假定蛋白LOC25963
  TMEM87B   NM_032824  假定蛋白LOC84910
  TMEPAI   NM_020182  跨膜前列腺雄激素诱导蛋白
  TMIE   NM_147196  跨膜内耳蛋白
  TMOD1   NM_003275  原肌球调节蛋白(tropomodulin)1
  TMPRSS13   NM_032046  跨膜蛋白酶丝氨酸13
  TMPRSS3   NM_024022  跨膜蛋白酶丝氨酸3同种型1
  TMPRSS4   NM_019894  跨膜蛋白酶丝氨酸4同种型1
  TMTC2   NM_152588  假定蛋白LOC160335
  TNFAIP1   NM_021137  肿瘤坏死因子α诱导蛋白1
  TNFAIP8L1   NM_152362  肿瘤坏死因子α诱导蛋白
  TNFAIP8L3   NM_207381  肿瘤坏死因子α诱导蛋白
  TNFRSF10B   NM_003842  肿瘤坏死因子受体超家族,
  TNFRSF10D   NM_003840  肿瘤坏死因子受体超家族
  TNFRSF13B   NM_012452  肿瘤坏死因子受体13B
  TNFRSF14   NM_003820  肿瘤坏死因子受体超家族
  TNFRSF19   NM_148957  肿瘤坏死因子受体超家族
  TNFRSF19L   NM_032871  肿瘤坏死因子受体超家族
  TNFSF7   NM_001252  肿瘤坏死因子配体超家族成员
  TNFSF9   NM_003811  肿瘤坏死因子(配体)超家族
  TNIP1   NM_006058  Nef相关因子1
  TNIP2   NM_024309  NF-κB活化的A20结合抑制剂2
  TNK2   NM_001010938  酪氨酸激酶,非受体,2同种型2
  TNNI1   NM_003281  肌钙蛋白(troponin)I,骨骼,缓慢
  TNRC6B   NM_001024843  含三核苷酸重复序列的6B同种型2
  TNS1   NM_022648  张力蛋白(tcnsin)
  TNS3   NM_022748  含张力蛋白样SH2结构域1
  TNT   NM_182831  假定蛋白LOC162083
  TOB2   NM_016272  ERBB2的转导因子2
  TOLLIP   NM_019009  toll互作用蛋白
  TOM1   NM_005488  myb1的靶标
  TOM1L2   NM_001033551  myb1样2同种型1的靶标
  TOMM20   NM_014765  线粒体外膜转位酶20
  TOMM34   NM_006809  线粒体外膜转位酶34
  TOR1B   NM_014506  耐扭蛋白(torsin)家族1,成员B(耐扭蛋白B)
  TOR3A   NM_022371  耐扭蛋白家族3,成员A
  TP53I11   NM_006034  p53诱导蛋白
  TP53INP2   NM_021202  肿瘤蛋白p53可诱导核蛋白2
  TP53TG3   NM_016212  假定蛋白LOC24150
  TP73L   NM_003722  肿瘤蛋白p73样
  TPCN2   NM_139075  两孔片段通道2
  TPD52L3   NM_033516  蛋白激酶NYD-SP25同种型1
  TPM1   NM_001018004  原肌球蛋白1α链同种型3
  TPM2   NM_003289  原肌球蛋白2(β)同种型1
  TPM3   NM_153649  原肌球蛋白3同种型2
  TPPP   NM_007030  脑特异蛋白p25α
  TPRX1   NM_198479  四肽重复序列同源异形盒
  TRAF1   NM_005658  TNF受体相关因子1
  TRAF4   NM_004295  TNF受体相关因子4同种型1
  TRAF5   NM_001033910  TNF受体相关因子5
  TRAF7   NM_032271  环指和WD重复序列结构域1同种型1
  TRAFD1   NM_006700  FLN29基因产物
  TRAK1   NM_014965  OGT(O-Glc-NAc转移酶)相互作用蛋白
  TRAM1   NM_014294  易位链相关膜
  TRAM2   NM_012288  易位相关膜蛋白2
  TREML2   NM_024807  触发表达于骨髓上的受体
  TRIAD3   NM_207111  TRIAD3蛋白同种型a
  TRIM10   NM_006778  含三联基序的10同种型1
  TRIM11   NM_145214  含三联基序的11
  TRIM14   NM_014788  三联基序蛋白TRIM14同种型α
  TRIM2   NM_015271  含三联基序的2
  TRIM29   NM_012101  三联基序蛋白TRIM29同种型α
  TRIM35   NM_015066  含三联基序的35同种型1
  TRIM36   NM_018700  含三联基序的36同种型1
  TRIM37   NM_015294  含三联基序的37蛋白
  TRIM56   NM_030961  含三联基序的56
  TRIM6   NM_001003818  含三联基序的6同种型1
  TRIM62   NM_018207  含三联基序的62
  TRIM68   NM_018073  环指蛋白137
  TRIM7   NM_203293  含三联基序的7同种型1
  TRIM9   NM_015163  三联基序蛋白9同种型1
  TRIP10   NM_004240  甲状腺激素受体相互作用因子10
  TRIT1   NM_017646  tRNA异戊烯转移酶1
  TRMT5   NM_020810  tRNA-(N1G37)甲基转移酶
  TRMU   NM_001008568  tRNA 5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷酸
  TRPC1   NM_003304  瞬时受体潜在阳离子通道
  TRPC4AP   NM_015638  TRPC4相关蛋白同种型a
  TRPM2   NM_001001188  瞬时受体潜在阳离子通道
  TRPV1   NM_018727  瞬时受体潜在阳离子通道
  TSC1   NM_000368  结节性硬化症1蛋白同种型1
  TSC22D1   NM_006022  TSC22结构域家族1同种型2
  TSC22D2   NM_014779  TSC22结构域家族2
  TSC22D3   NM_001015881  TSC22结构域家族,成员3同种型3
  TSGA13   NM_052933  睾丸特异性,13
  TSHR   NM_001018036  甲状腺刺激激素受体同种型2
  TSN   NM_004622  易位蛋白(translin)
  TSPAN14   NM_030927  四跨膜跨膜蛋白(tetraspanin)14
  TSPAN15   NM_012339  跨膜4超家族成员15
  TSPAN17   NM_001006616  跨膜4超家族成员17同种型c
  TSPAN18   NM_130783  四跨膜蛋白18同种型2
  TSPAN3   NM_005724  跨膜4超家族成员8同种型1
  TSPAN33   NM_178562  半影蛋白(penumbra)
  TSPAN5   NM_005723  跨膜4超家族成员9
  TSPAN9   NM_006675  四跨膜蛋白9
  TSPYL2   NM_022117  TSPY样2
  TSPYL4   NM_021648  TSPY样4
  TSPYL5   NM_033512  TSPY样5
  TSPYL6   NM_001003937  TSPY样6
  TSSK6   NM_032037  丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SSTK
  TTBK1   NM_032538  τ微管蛋白激酶1
  TTC1   NM_003314  三十四肽重复序列结构域1
  TTC13   NM_024525  三十四肽重复序列结构域13
  TTC21B   NM_024753  三十四肽重复序列结构域21B
  TTC23   NM_001018029  三十四肽重复序列结构域23同种型1
  TTC25   NM_031421  假定蛋白LOC83538
  TTLL12   NM_015140  假定蛋白LOC23170
  TTLL5   NM_015072  微管蛋白酪氨酸连接酶样家族,成员5
  TTLL9   NM_001008409  微管蛋白酪氨酸连接酶样家族,成员9
  TTYH3   NM_025250  tweety 3
  TUB   NM_003320  桶状(tubby)同种型a
  TUBA2   NM_006001  微管蛋白α2同种型1
  TUBA3   NM_006009  微管蛋白α3
  TUBB   NM_178014  微管蛋白β多肽
  TUBB3   NM_006086  微管蛋白β4
  TUFT1   NM_020127  釉丛蛋白(tuftelin)1
  TULP3   NM_003324  桶状样蛋白3
  TUSC5   NM_172367  LOST1
  TXLNA   NM_175852  滑行蛋白(taxilin)
  TXN2   NM_012473  硫氧还蛋白2前体
  TXNDC5   NM_022085  含硫氧还蛋白结构域5同种型2
  TXNIP   NM_006472  硫氧还蛋白相互作用蛋白
  TXNL4A   NM_006701  硫氧还蛋白样4A
  TYRO3   NM_006293  TYRO3蛋白酪氨酸激酶
  TYSND1   NM_173555  含胰蛋白酶结构域1同种型a
  UAP1L1   NM_207309  UDP-N-乙酰葡糖胺焦磷酸化酶1样
  UBADC1   NM_016172  含泛素相关结构域1
  UBAP1   NM_016525  泛素相关蛋白1
  UBASH3A   NM_001001895  泛素相关且含SH3结构域
  UBE2A   NM_003336  泛素结合酶E2A同种型1
  UBE2B   NM_003337  泛素结合酶E2B
  UBE2H   NM_003344  泛素结合酶E2H同种型1
  UBE2I   NM_003345  泛素结合酶E2I
  UBE2J1   NM_016021  泛素结合酶E2,J1
  UBE2J2   NM_058167  泛素结合酶E2,J2同种型2
  UBE2O   NM_022066  泛素结合酶E2O
  UBE2Q1   NM_017582  泛素结合酶E2Q
  UBE2Q2   NM_173469  泛素结合酶E2Q(假定)2
  UBE2R2   NM_017811  泛素结合酶UBC3B
  UBE2V1   NM_001032288  泛素结合酶E2变异体1
  UBE2Z   NM_023079  泛素结合酶E2Z(假定)
  UBE3C   NM_014671  泛素蛋白连接酶E3C
  UBE4A   NM_004788  泛素化因子E4A
  UBE4B   NM_006048  泛素化因子E4B
  UBL3   NM_007106  泛素样3
  UBL4A   NM_014235  泛素样4
  UBL4B   NM_203412  假定蛋白LOC164153
  UBN1   NM_016936  泛核蛋白(ubinuclein)1
  UBOX5   NM_014948  含U盒结构域5同种型a
  UBP1   NM_014517  上游结合蛋白1(LBP-1a)
  UBTD1   NM_024954  含泛素结构域1
  UBXD2   NM_014607  含UBX结构域2
  UBXD3   NM_152376  含UBX结构域3
  UBXD8   NM_014613  含UBX结构域8
  UCP2   NM_003355  解偶联蛋白2
  UHMK1   NM_175866  胞浆磷蛋白(stathmin)
  ULK1   NM_003565  unc-51样激酶1
  UMOD   NM_001008389  尿调蛋白(uromodulin)前体
  UNC13D   NM_199242  unc-13同源物D
  UNC5D   NM_080872  导蛋白(netrin)受体Unc5h4
  UNC84A   NM_025154  unc-84同源物A
  UNC84B   NM_015374  unc-84同源物B
  UNG   NM_003362  尿嘧啶-DNA糖基化酶同种型UNG1前体
  UNG2   NM_001024592  尿嘧啶-DNA糖基化酶2同种型b
  UNQ9370   NM_207447  假定蛋白LOC400454
  UPF1   NM_002911  无义转录物调控因子1
  UQCR   NM_006830  泛醌-细胞色素c还原酶,6.4kDa
  URG4   NM_017920  假定蛋白LOC55665
  UROS   NM_000375  尿卟啉原(uroporphyrinogen)III合成酶
  USH2A   NM_206933  usherin同种型B
  USP14   NM_005151  泛素特异性蛋白酶14同种型a
  USP15   NM_006313  泛素特异性蛋白酶15
  USP18   NM_017414  泛素特异性蛋白酶18
  USP19   NM_006677  泛素特异性蛋白酶19
  USP2   NM_004205  泛素特异性蛋白酶2同种型a
  USP20   NM_001008563  泛素特异性蛋白酶20
  USP25   NM_013396  泛素特异性蛋白酶25
  USP3   NM_006537   泛素特异性蛋白酶3
  USP32   NM_032582   泛素特异性蛋白酶32
  USP36   NM_025090   泛素特异性蛋白酶36
  UTX   NM_021140   泛转录三十四肽
  VAC14   NM_018052   Vac14同源物
  VAMP1   NM_014231   囊泡相关膜蛋白1同种型1
  VAMP2   NM_014232   囊泡相关膜蛋白2
  VAMP8   NM_003761   囊泡相关膜蛋白8
  VAPB   NM_004738   VAMP相关蛋白B/C
  VASH1   NM_014909   血管抑制蛋白(vasohibin)1
  VAT1   NM_006373   囊泡胺转运蛋白1
  VAV2   NM_003371   vav2致癌基因
  VAX1   NM_199131   腹前同源异形盒1
  VCL   NM_003373   粘着斑蛋白(vinculin)同种型VCL
  VDR   NM_000376   维生素D(1,25-二羟基维生素D3)受体
  VEGF   NM_001025366   血管内皮生长因子同种型a
  VEZT   NM_017599   跨膜蛋白vezatin
  VGLL2   NM_153453   残翅(vestigial)样2同种型2
  VGLL3   NM_016206   结肠癌相关蛋白
  VIL2   NM_003379   绒毛蛋白(villin)2
  VIPR2   NM_003382   血管活性肠肽受体2
  VISA   NM_020746   病毒诱导的信号转导衔接蛋白
  VIT   NM_053276   玻璃体蛋白(vitrin)
  VMD2L2   NM_153274   卵黄状黄斑营养不良2样2
  VMD2L3   NM_152439   卵黄状黄斑营养不良2样3
  VPS13B   NM_017890   液泡蛋白分选13B同种型5
  VPS13D   NM_015378   液泡蛋白分选13D同种型1
  VPS24   NM_001005753   液泡蛋白分选24同种型2
  VPS33B   NM_018668   液泡蛋白分选33B(酵母同源物)
  VPS36   NM_016075   液泡蛋白分选36
  VPS37B   NM_024667   液泡蛋白分选37B
  VPS37C   NM_017966   液泡蛋白分选37C
  VPS41   NM_014396   液泡蛋白分选41(酵母同源物)
  VPS4A   NM_013245   液泡蛋白分选因子4A
  VSIG4   NM_007268   含V-set和免疫球蛋白结构域4
  VTI1B   NM_006370   通过相互作用的囊泡转运
  VWF   NM_000552   von Willebrand因子前蛋白原
  WAPAL   NM_015045   半翼样同源物
  WARS2   NM_015836   线粒体色氨酰tRNA合成酶2
  WASF2   NM_006990   WAS蛋白家族,成员2
  WASL   NM_003941   Wiskott-Aldrich综合症基因样蛋白
  WASPIP   NM_003387   WASP相互作用蛋白
  WBP11   NM_016312   WW结构域结合蛋白11
  WBP2   NM_012478   WW结构域结合蛋白2
  WBSCR17   NM_022479   UDP-GalNAc:多肽
  WBSCR18   NM_032317   Williams Beuren综合症染色体区域18
  WBSCR19   NM_175064   Williams Beuren综合症染色体区域19
  WDFY3   NM_178583   含WD重复序列和FYVE结构域3同种型
  WDHD1   NM_001008396   WD重复序列和HMG盒DNA结合蛋白1
  WDR13   NM_017883   WD重复序列结构域13蛋白
 WDR20   NM_181291   WD重复序列结构域20同种型1
 WDR21A   NM_015604   WD重复序列结构域21A同种型1
 WDR21C   NM_152418   假定蛋白LOC138009
 WDR22   NM_003861   断裂点丛集区蛋白,子宫
 WDR31   NM_001006615   WD重复序列结构域31同种型2
 WDR33   NM_001006623   WD重复序列结构域33同种型3
 WDR37   NM_014023   WD重复序列结构域37
 WDR4   NM_018669   WD重复序列结构域4蛋白
 WDR41   NM_018268   WD重复序列结构域41
 WDR42A   NM_015726   H326
 WDR47   NM_014969   WD重复序列结构域47
 WDR59   NM_030581   WD重复序列结构域59
 WDR62   NM_173636   WD重复序列结构域62
 WDR68   NM_005828   WD重复序列蛋白
 WDR7   NM_015285   rab联结蛋白-3β同种型1
 WDR73   NM_032856   WD重复序列结构域73
 WDTC1   NM_015023   WD和三十四肽重复序列1
 WEE1   NM_003390   wcc1酪氨酸激酶
 WFDC5   NM_145652   WAP四二硫化物核心结构域5前体
 WFIKKN2   NM_175575   WFIKKN2蛋白
 WHSC1   NM_007331   Wolf-Hirschhorn综合症候选物1蛋白
 WHSC2   NM_005663   Wolf-Hirschhorn综合症候选物2蛋白
 WIBG   NM_032345   在bgcn同源物内
 WIF1   NM_007191   Wnt抑制因子-1前体
 WIPI2   NM_001033518   假定蛋白LOC26100同种型c
 WIRE   NM_133264   WIRE蛋白
 WISP1   NM_003882   WNT1可诱导信号转导路径蛋白1
 WNK3   NM_001002838   WNK赖氨酸缺乏型蛋白激酶3同种型2
 WNT2B   NM_004185   无翼型MMTV整合位点家族
 WNT3A   NM_033131   无翼型MMTV整合位点家族
 WNT5A   NM_003392   无翼型MMTV整合位点家族
 WNT5B   NM_030775   无翼型MMTV整合位点家族
 WNT7A   NM_004625   无翼型MMTV整合位点家族
 WNT8A   NM_058244   无翼型MMTV整合位点家族
 WNT9A   NM_003395   无翼型MMTV整合位点家族
 WSB1   NM_015626   WD重复序列和含SOCS盒1同种型1
 WT1   NM_000378   韦尔姆斯氏瘤(Wilms tumor)1同种型A
 WWC1   NM_015238   KIBRA蛋白
 WWP1   NM_007013   含WW结构域的E3泛素蛋白连接酶
 WWP2   NM_007014   含WW结构域的E3泛素蛋白连接酶
 XAB1   NM_007266   XPA结合蛋白1
 XKR5   NM_207411   XK相关蛋白5a
 XKR8   NM_018053   X Kell血型前体相关家族,
 XPC   NM_004628   着色性干皮病,互补群C
 XPO4   NM_022459   输出蛋白(exportin)4
 XPO5   NM_020750   输出蛋白5
 XPO6   NM_015171   输出蛋白6
 XPR1   NM_004736   异嗜性和多嗜性逆转录病毒受体
 XRN1   NM_019001   5′-3′RNA外切酶1
 XTP7   NM_138568   由B型肝炎病毒X反式活化的蛋白7
 YAF2   NM_001012424   YY1相关因子2同种型b
 YAP1   NM_006106   Yes相关蛋白1,65kD
 YARS2   NM_015936   酪氨酰-tRNA合成酶2(线粒体)
 YEATS2   NM_018023   含YEATS结构域2
 YIF1B   NM_033557   Yip1相互作用因子同源物B同种型2
 YIPF7   NM_182592   Yip1结构域家族,成员7
 YKT6   NM_006555   YKT6v-SNARE蛋白
 YOD1   NM_018566   假定蛋白LOC55432
 YPEL1   NM_013313   开心果样1
 YPEL4   NM_145008   开心果样4
 YRDC   NM_024640   缺血/再灌注可诱导蛋白
 YTHDC1   NM_001031732   剪接因子YT521-B同种型1
 YTHDF1   NM_017798   YTH结构域家族,成员1
 YWHAG   NM_012479   酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸
 YWHAH   NM_003405   酪氨酸3/色氨酸5-单加氧酶
 YWHAQ   NM_006826   酪氨酸3/色氨酸5-单加氧酶
 ZA20D2   NM_006007   锌指蛋白216
 ZA20D3   NM_019006   含锌指A20结构域3
 ZADH2   NM_175907   锌结合醇脱氢酶结构域
 ZAK   NM_133646   MLK相关激酶同种型2
 ZBED1   NM_004729   Ac样转座元件
 ZBP1   NM_030776   肿瘤基质和活化巨噬细胞蛋白
 ZBTB10   NM_023929   含锌指和BTB结构域10
 ZBTB11   NM_014415   锌指蛋白ZNF-U69274
 ZBTB2   NM_020861   含锌指和BTB结构域2
 ZBTB24   NM_014797   含锌指和BTB结构域24
 ZBTB3   NM_024784   含锌指和BTB结构域3
 ZBTB32   NM_014383   睾丸锌指蛋白
 ZBTB33   NM_006777   kaiso
 ZBTB39   NM_014830   含锌指和BTB结构域39
 ZBTB40   NM_014870   含锌指和BTB结构域40
 ZBTB41   NM_194314   含锌指和BTB结构域41
 ZBTB43   NM_014007   锌指蛋白297B
 ZBTB5   NM_014872   含锌指和BTB结构域5
 ZBTB8   NM_144621   含锌指和BTB结构域8
 ZBTB9   NM_152735   含锌指和BTB结构域9
 ZC3H11A   NM_014827   假定蛋白LOC9877
 ZC3H12B   NM_001010888   假定蛋白LOC340554
 ZC3H6   NM_198581   含锌指CCCH型结构域6
 ZCCHC2   NM_017742   含锌指CCHC结构域2
 ZCCHC3   NM_033089   含锌指CCHC结构域3
 ZCCHC5   NM_152694   含锌指CCHC结构域5
 ZCSL3   NM_181706   含锌指CSL结构域3
 ZDHHC11   NM_024786   含锌指DHHC结构域11
 ZDHHC12   NM_032799   含锌指DHHC结构域12
 ZDHHC14   NM_024630   含NEW1结构域的蛋白同种型1
 ZDHHC15   NM_144969   含锌指DHHC结构域15
 ZDHHC16   NM_032327   Abl亲和蛋白2同种型1
 ZDHHC17   NM_015336   亨廷顿蛋白(huntingtin)相互作用蛋白14
 ZDHHC18   NM_032283   含锌指DHHC结构域18
  ZDHHC22   NM_174976   含锌指DHHC结构域22
  ZDHHC23   NM_173570   含锌指DHHC结构域23
  ZDHHC9   NM_001008222   含锌指DHHC结构域9
  ZFAND3   NM_021943   睾丸表达的序列27
  ZFP106   NM_022473   锌指蛋白106同源物
  ZFP28   NM_020828   锌指蛋白28
  ZFP41   NM_173832   锌指蛋白41同源物
  ZFP95   NM_014569   锌指蛋白95同源物
  ZFYVE1   NM_021260   含锌指FYVE结构域1同种型1
  ZFYVE20   NM_022340   含FYVE指的Rab5效应蛋白
  ZFYVE28   NM_020972   含锌指FYVE结构域28
  ZHX1   NM_001017926   锌指和同源异形盒1
  ZHX3   NM_015035   锌指和同源异形盒3
  ZIC1   NM_003412   小脑锌指蛋白1
  ZKSCAN1   NM_003439   锌指蛋白36
  ZMYM6   NM_007167   锌指蛋白258
  ZMYND10   NM_015896   含锌指MYND结构域10
  ZNF10   NM_015394   锌指蛋白10
  ZNF134   NM_003435   锌指蛋白134
  ZNF135   NM_003436   锌指蛋白135(克隆pHZ-17)
  ZNF187   NM_001023560   锌指蛋白187
  ZNF192   NM_006298   锌指蛋白192
  ZNF193   NM_006299   锌指蛋白193
  ZNF198   NM_003453   锌指蛋白198
  ZNF212   NM_012256   锌指蛋白212
  ZNF213   NM_004220   锌指蛋白213
  ZNF215   NM_013250   锌指蛋白215
  ZNF236   NM_007345   锌指蛋白236
  ZNF259   NM_003904   锌指蛋白259
  ZNF264   NM_003417   锌指蛋白264
  ZNF267   NM_003414   锌指蛋白267
  ZNF282   NM_003575   锌指蛋白282
  ZNF285   NM_152354   锌指蛋白285
  ZNF289   NM_032389   锌指蛋白289,ID1调控
  ZNF295   NM_020727   锌指蛋白295
  ZNF304   NM_020657   锌指蛋白304
  ZNF306   NM_024493   锌指蛋白306
  ZNF307   NM_019110   锌指蛋白307
  ZNF313   NM_018683   锌指蛋白313
  ZNF317   NM_020933   锌指蛋白317
  ZNF319   NM_020807   锌指蛋白319
  ZNF323   NM_030899   锌指蛋白323同种型1
  ZNF326   NM_181781   锌指蛋白326同种型2
  ZNF329   NM_024620   锌指蛋白329
  ZNF343   NM_024325   锌指蛋白343
  ZNF346   NM_012279   锌指蛋白346
  ZNF365   NM_014951   锌指蛋白365同种型A
  ZNF367   NM_153695   锌指蛋白367
  ZNF395   NM_018660   锌指蛋白395
  ZNF406   NM_001029939   锌指蛋白406同种型TR-ZFAT
  ZNF417   NM_152475   锌指蛋白417
  ZNF423   NM_015069   锌指蛋白423
  ZNF436   NM_030634   锌指蛋白436
  ZNF445   NM_181489   锌指蛋白445
  ZNF449   NM_152695   锌指蛋白449
  ZNF454   NM_182594   锌指蛋白454
  ZNF488   NM_153034   锌指蛋白488
  ZNF497   NM_198458   锌指蛋白497
  ZNF498   NM_145115   锌指蛋白498
  ZNF500   NM_021646   锌指蛋白500
  ZNF501   NM_145044   锌指蛋白501
  ZNF503   NM_032772   锌指蛋白503
  ZNF512   NM_032434   锌指蛋白512
  ZNF532   NM_018181   锌指蛋白532
  ZNF536   NM_014717   锌指蛋白536
  ZNF548   NM_152909   锌指蛋白548
  ZNF569   NM_152484   锌指蛋白569
  ZNF572   NM_152412   锌指蛋白572
  ZNF592   NM_014630   锌指蛋白592
  ZNF600   NM_198457   锌指蛋白600
  ZNF609   NM_015042   锌指蛋白609
  ZNF621   NM_198484   锌指蛋白621
  ZNF622   NM_033414   锌指蛋白622
  ZNF623   NM_014789   锌指蛋白623
  ZNF626   NM_145297   锌指蛋白626
  ZNF627   NM_145295   锌指蛋白627
  ZNF650   NM_172070   锌指蛋白650
  ZNF651   NM_145166   锌指蛋白651
  ZNF660   NM_173658   锌指蛋白660
  ZNF691   NM_015911   锌指蛋白691
  ZNF694   NM_001012981   锌指蛋白694
  ZNF695   NM_020394   锌指蛋白SBZF3
  ZNF696   NM_030895   锌指蛋白696
  ZNF701   NM_018260   锌指蛋白701
  ZNF704   NM_001033723   锌指蛋白704
  ZNF705A   NM_001004328   假定蛋白LOC440077
  ZNF71   NM_021216   锌指蛋白71
  ZNF74   NM_003426   锌指蛋白74(Cos52)
  ZNF747   NM_023931   假定蛋白LOC65988
  ZNF76   NM_003427   锌指蛋白76(表达于睾丸中)
  ZNF81   NM_007137   锌指蛋白81(HFZ20)
  ZNFN1A1   NM_006060   锌指蛋白,亚族1A,1(Ikaros)
  ZNFN1A4   NM_022465   锌指蛋白,亚族1A,4
  ZNHIT3   NM_004773   甲状腺激素受体相互作用因子3同种型2
  ZNRF1   NM_032268   锌和环指蛋白1
  ZNRF2   NM_147128   锌指/环指2
  ZPLD1   NM_175056   假定蛋白LOC131368
  ZSWIM3   NM_080752   含锌指SWIM结构域3
  ZSWIM4   NM_023072   含锌指SWIM结构域4
  ZW10   NM_004724   着丝粒/动粒蛋白zw10
 ZYG11A   NM_001004339  假定蛋白LOC440590
 ZYG11BL   NM_006336  zyg-11同源物B(线虫)样
 ZYX   NM_001010972  斑联蛋白(zyxin)
 ZZEF1   NM_015113  锌指,ZZ型,具有EF手结构域1
 ZZZ3   NM_015534  含锌指ZZ结构域3
在经前体miR hsa-miR-16转染后在人类癌细胞中显示改变的mRNA表达水平的预测基因靶标示于以下表4中。
表4.在经前体miR hsa-miR-16转染后在人类癌细胞中显示改变的mRNA表达水平的预测hsa-miR-16靶标。
  基因符号   参考序列转录物   描述
  ACTR2   NM_001005386   肌动蛋白相关蛋白2同种型a
  ADARB1   NM_001033049   RNA特异性腺苷脱氨酶B1同种型4
  ADRB2   NM_000024   肾上腺素能β-2-受体表面
  ANKRD12   NM_015208   锚蛋白重复序列结构域12
  ARHGDIA   NM_004309   Rho GDP解离抑制剂(GDI)α
  ARL2   NM_001667   ADP核糖基化因子样2
  CA12   NM_001218   碳酸酐酶XII同种型1前体
  CCND1   NM_053056   细胞周期蛋白D1
  CDC37L1   NM_017913   细胞分裂周期37同源物(S
  CDH1   NM_004360   钙粘着蛋白1,1型前蛋白原
  CDS2   NM_003818   磷脂酸胞苷酰基转移酶2
  CHUK   NM_001278   保守螺旋-环-螺旋广泛型激酶
  CYP4F3   NM_000896   细胞色素P450,家族4,亚族F
  DIO2   NM_000793   脱碘酶,碘代甲腺原氨酸,II型同种型a
  FGF2   NM_002006   纤维母细胞生长因子2
  FGFR4   NM_002011   纤维母细胞生长因子受体4同种型1
  GALNT7   NM_017423   多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶7
  HAS2   NM_005328   乙酰透明质酸合成酶2
  KCNJ2   NM_000891   内向整流钾通道J2
  LCN2   NM_005564   脂质运载蛋白2(致癌基因24p3)
  LRP12   NM_013437   抑制肿瘤发生
  MAP7   NM_003980   双皮层蛋白7
  PHACTR2   NM_014721   磷酸酶和肌动蛋白调控因子2
  PLSCR4   NM_020353   磷脂爬行酶4
  PODXL   NM_001018111   足细胞标记蛋白样前体同种型1
  PPAP2C   NM_003712   磷脂酸磷酸酶2C型同种型1
  QKI   NM_206853   震动同源物,KH结构域RNA结合同种型
  RPS6KA3   NM_004586   核糖体蛋白S6激酶,90kDa,多肽
  RPS6KA5   NM_004755   核糖体蛋白S6激酶,90kDa,多肽
  SLC11A2   NM_000617   溶质载体家族11(质子偶联
  SLC4A7   NM_003615   溶质载体家族4,碳酸氢钠
  STC1   NM_003155   司腺钙蛋白1前体
 SYNE1   NM_015293   nesprin1同种型β
 TACC1   NM_006283   含转化性、酸性卷曲螺旋
 TFG   NM_001007565   TRK融合基因
 THUMPD1   NM_017736   含THUMP结构域1
 TNFSF9   NM_003811   肿瘤坏死因子(配体)超家族
 TPM1   NM_001018004   原肌球蛋白1α链同种型3
 UBE2I   NM_003345   泛素结合酶E2I
 VIL2   NM_003379   绒毛蛋白2
mRNA表达水平受hsa-miR-16影响的hsa-miR-16的预测基因靶标代表通过操控其表达水平治疗癌症和治疗其它疾病的尤其有用的候选靶标。
实施例4:
与HSA-MIR-16所改变的基因表达相关的癌症
细胞增殖和存活路径在肿瘤中通常改变(Hanahan和Weinberg,2000)。发明人已显示hsa-niR-16直接或间接调控在这些路径的调控中起关键作用的蛋白质的转录物。许多这些靶标具有内在致癌或肿瘤抑制活性。表5中显示与各种癌症类型相关的hsa-miR-16靶标。
这些靶标中有细胞周期调控因子,包括细胞周期蛋白D1、细胞周期蛋白G2和转化酸性卷曲螺旋1蛋白(TACC1)。虽然细胞周期蛋白D1与细胞周期蛋白依赖性激酶4和6(CDK 4/6)形成功能复合物且为促进细胞从G1期进入S期所必需,但不同于常规细胞周期蛋白,细胞周期蛋白G2会负调控细胞周期(Donnellan和Chetty,1998;Horne等人,1997)。细胞周期蛋白D1的生长促进活性与观察到很多种癌症显示升高含量的细胞周期蛋白D1相关联(Donnellan和Chetty,1998)。相比之下,细胞周期蛋白G2在例如口腔癌和乳头状癌等多种癌症中下调(AlevizoS等人,2001;Ito等人,2003)。因为hsa-miR-16过度表达导致细胞周期蛋白D1转录物的抑制和细胞周期蛋白G2的上调,所以hsa-miR-16可充当肿瘤抑制因子。这种观点由以下事实所支持:hsa-miR-16负调控编码位于染色体8p11上的乳腺癌扩增子内的假定致癌基因的TACC1信息(Cully等人,2005)。TACC1的过度表达诱导纤维母细胞在培养物中的致癌转化且与Ras协作在具有PTEN+/-背景的小鼠中形成肿瘤(Cully等人,2005)。
其它hsa-miR-16靶标包括纤维母细胞生长因子2(FGF-2)、纤维母细胞生长因子受体4(FGF-R4)和IκB激酶α(IKKα,CHUK),其皆为细胞内信号网络的组分。FGF-2是具有有效的促有丝分裂和血管生成活性的分泌蛋白,其通过由2-3个细胞外免疫球蛋白样结构域和1个细胞内酪氨酸激酶结构域组成的跨膜受体(FGFR)传送信号至细胞中(Chandler等人,1999)。虽然FGF-2mRNA含量在肾癌、口腔癌和非小细胞肺癌细胞中升高,但FGFR-4在许多类型的癌症中得到上调(Chandler等人,1999)。类似地,IKKα是细胞内信号级联的正调控因子且用于活化转录因子核因子κB(NFκB)(Karin等人.2002)。NFκB在数种癌症类型中受到组成性活化且促进抗凋亡和存活路径。
根据我们的数据,hsa-miR-16能负调节这些蛋白质,因此很可能起到肿瘤抑制物的作用。相反,hsa-miR-16也可能具有致癌活性。这个观点得到这样的观测结果的支持:hsa-miR-16负调节肿瘤抑制物RBL-1(p107),和诱导MCL1、硫氧还蛋白(TXN)和致癌E3泛素连接酶Skp2的上调(Gstaiger等人,2001;Huang等人,2005;Jiang等人,2005)。Skp2是多亚单位E3泛素连接酶复合物的一个成分,该复合物对进行蛋白酶体降解的蛋白质打上标志。一个得到很好表征的靶标是CDK抑制剂p27,它解释了Skp2的促细胞周期活性(Carrano等人,1999)。Skp2本质上是致癌的,在各种癌症类型中显示出升高的水平(Gstaiger等人,2001;Kamata等人,2005;Saigusa等人,2005;Einama等人,2006)。MCL1是BCL-2(B细胞淋巴瘤2)基因家族的成员MCL1能产生两个具有相反功能的可变剪接(alternatively spliced)基因产物(Bae等人,2000)。优势种是具有抗凋亡活性的MCL1-L。高水平的MCL1与卵巢癌患者的不良预后相关,并预示着白血病复发(Kaufmann等人,1998;Shigemasa等人,2002)。MCL1的RNA干扰在胃癌和肝细胞癌细胞中引起治疗反应(Schulze-Bergkamen等人,2006;Zangemeister-Wittke和Huwiler,2006)。
硫氧还蛋白(TXN)是靶向多种蛋白质和多个途径的12-kDa硫醇还原酶。硫氧还蛋白调节转录因子的活性,诱导血管生成性Hif-1α(低氧诱导因子1α)及VEGF(血管内皮生长因子),可充当增殖和抗凋亡剂(Marks,2006)。肺癌、胰腺癌、宫颈癌和肝癌都一致地显示出硫氧还蛋白水平提高。硫氧还蛋白表达还与侵袭性的肿瘤生长、不良的预后和化学抗性相关(Marks,2006)。另外,hsa-miR-16能调节具有致癌活性或生长抑制活性的基因,这取决于细胞情形:其中有结缔组织生长因子(CTGF)和嗜中性粒细胞明胶酶相关的脂质运载蛋白(NGAL),后者也称脂质运载蛋白-2(LCN2)(Croci等人,2004;Hishikawa等人,1999;Lin等人,2005;Yang等人,2005;Fernandez等人,2005;Lee等人,2006)。
总之,hsa-miR-16控制作为细胞增殖和存活的关键调控因子的蛋白质的活性。这些靶标在人类癌症中通常去调节。根据受miR-16调控的基因和相关路径的这种观点,向各种癌细胞类型中引入hsa-miR-16或抗hsa-miR-16将很可能引起治疗反应。
表5.对于治疗各种恶性肿瘤具有预后或治疗价值的被hsa-miR-16改变的肿瘤相关mRNA
  基因符号   基因名称   细胞过程   癌症类型   参考文献[PMID]
  CCND1   细胞周期蛋白D1   细胞周期   MCL、BC、SCCHN、OepC、HCC、CRC、BldC、EC、OC、M、AC、GB、GC、PaC   Donnellan和Chetty,1998
  CCNG2   细胞周期蛋白G2   细胞周期   TC、SCCHN   Ito等人,2003b;Alevizos等人,2001
  CDKN2C   CDK抑制剂2C   细胞周期   HB、MB、HCC、HL、MM   Iolascon等人,1998;Kulkarni等人,2002;Morishita等人,2004;Sanchez-Aguilera等人,2004
  CHUK   IKK α   信号转导   LSCC、BC   Cao等人,2001;Nakayama等人,2001;Romieu-Mourez等人,2001
  CTGF   CTGF/IGFBP-8   细胞粘附、迁移   BC、GB、OepC、RMS、CRC、PC   Hishikawa等人,1999;Shimo等人,2001;Koliopanos等人,2002;Pan等人,2002;Croci等人,2004;Lin等人,2005;Yang等人,2005
  FGF2   FGF-2   信号转导   BC、RCC、OC、M、NSCLC   Chandler等人,1999
  FGFR4   FGF-R4   信号转导   TC、BC、OC、PaC   Jaakkola等人,1993;Shah等人,2002;Ezzat等人,2005
  LCN2   脂质运载蛋白2/NGAL   细胞粘附   PaC、CRC、HCC、BC、OC   Bartsch和Tschesche,1995;Furutani等人,1998;Fernandez等人,2005;Lee等人,2006
  MCL1   Mcl-1   细胞凋亡   HCC,MM,TT,CLL,ALCL,BCL,PC   Krajewska等人,1996;Kitada等人,1998;Cho-Vega等人,2004;Rust等人,2005;Sano等人,2005;Wuilleme-Toumi等人,2005;Fleischer等人,2006;Sieghart等人,2006
  NF1   NF-1   信号转导   G、AC、NF、PCC、ML   Rubin和Gutmann,2005
  RBL1   p107   细胞周期   BCL、PC、CRC、TC   Takimoto等人,1998;Claudio等人,2002;Wu等人,2002;Ito等人,2003a;Rubin
  和Gutmann,2005
  SKP2   SKP-2   蛋白酶体降解   PaC、OC、BC、MFS、GB、EC、NSCLC、PC   Kamata等人,2005;Saigusa等人,2005;Shibahara等人,2005;Takanami,2005;Emama等人,2006;Huang等人,2006;Sui等人,2006;Traub等人,2006
TACC1   TACC1   细胞周期   BC、OC   Cully等人,2005;Lauffart等人,2005
  TXN   硫氧还蛋白(trx)   硫氧还蛋白氧化还原系统   LC,PaC,CeC,HCC   Marks,2006
  WISP2   WISP-2   信号转导   CRC、BC   Pennica等人,1998;Saxena等人,2001
缩写:AC,星形细胞瘤;ALCL,间变性大细胞淋巴瘤;BC,乳腺癌;BCL,B细胞淋巴瘤;BldC,膀胱癌;CeC,宫颈癌;CLL,慢性淋巴母细胞白血病;CRC,结肠直肠癌;EC,子宫内膜癌;G,神经胶质瘤;GB,成胶质细胞瘤;GC,胃癌;HB,肝母细胞瘤;HCC,肝细胞癌;HL,霍奇金淋巴瘤;LC,肺癌;LSCC,喉鳞状细胞癌;M,黑素瘤;MB,成髓细胞瘤;MCL,套细胞淋巴瘤;MFS,黏液纤维肉瘤;ML,髓性白血病;MM,多发性骨髓瘤;NF,神经纤维瘤;NSCLC,非小细胞肺癌;OC,卵巢癌;OepC,食道癌;PaC,胰腺癌;PC,前列腺癌;PCC,嗜铬细胞瘤;RCC,肾细胞癌;RMS,横纹肌肉瘤;SCCHN,头部和颈部的鳞状细胞癌;TC,甲状腺癌;TT,睾丸肿瘤。
实施例5
递送合成的HSA-mir-16能减少前列腺癌细胞的细胞增殖
本发明人之前证明,hsa-miR-16参与到多种细胞活性的调节,这些细胞活性代表着癌症疗法及其他疾病和病症的疗法的干预点(2005年5月31日提交的美国专利申请系列号11/141,707,和2005年11月14日提交的系列号11/273,640)。例如,hsa-miR-16的过量表达会降低某些正常细胞系或癌细胞系的增殖和/或活力。
本发明人用前列腺癌细胞系PPC-1、Du145和RWPE2,评估了hsa-miR-16对前列腺癌的治疗作用。将合成的hsa-miR-16(前体miRTM-hsa-miR-16,Ambion目录号AM17100)或阴性对照(NC)miRNA(前体miRTM微小RNA前体分子阴性对照#2;Ambion目录号AM17111)一式三份,按照公布的方案和以下参数,通过基于脂质的反转染进行递送:6000-7000个细胞/96孔,20μl OptiMEM(Invitrogen)中0.2μl脂质转染胺TM 2000(目录号11668-019,Invitrogen Corp.,Carlsbad,CA,USA),100μl的30nM终浓度的miRNA(0vcharenko等人,2005)。用Alamar Blue(Invitrogen)按照生产商说明书,在转染4天后评估PPC-1细胞的增殖,在转染6天后评估Du145细胞和RPWE2细胞的增殖。使用抗驱动蛋白11(也称Eg5)这个动力蛋白的siRNA,作为细胞增殖抑制的对照。Eg5对于大多数真核细胞的细胞存活是必需的,它的缺乏会导致细胞增殖降低和细胞死亡(Weil等人,2002)。siEg5用于按应用于miRNA的相同实验参数的基于脂质的转染中。将得自Alamar Blue测定的增殖百分数值(%),对自阴性对照miRNA处理的细胞的数值归一化。hsa-miR-16处理的细胞相对于阴性对照miRNA处理的细胞(100%)的增殖百分数,在表6和图1中显示。
表6.用hsa-miR-16、阴性对照miRNA(NC)或抗Eg5的siRNA(siEg5)转染后,前列腺癌细胞的增殖情况。%SD,%标准偏差。将各增殖百分数值(%)对从阴性对照miRNA转染的细胞获得的数值归一化。
Figure A20078005104401611
递送hsa-miR-16抑制前列腺癌细胞PPC-1、Du145和RWPE2的增殖(表6和图1)。平均来说,hsa-miR-16能抑制细胞增殖达25%(表6和图1)。Hsa-miR-16在PPC-1细胞中具有最大抑制活性,减少增殖达37%。由于hsa-miR-16在所有受试的前列腺癌细胞中能引起治疗反应,hsa-miR-16可对患有前列腺癌和其他恶性肿瘤的患者提供治疗益处。
为评估hsa-miR-16在长时间里的抑制表型,本发明人进行了hsa-miR-16在PPC-1细胞中存在长达22天的生长曲线实验。由于裸干扰RNA如合成的miRNA的体外转染在本质上是短暂的,且因不断进行的细胞分裂过程中寡核苷酸的稀释而受到削弱,因此在多个时间点通过电穿孔给予hsa-miR-16(Bartlett等人,2006,Bartlett等人,2007)。在第0、4和11天,应用BioRad GenePulserXcellTM仪(BioRad Laboratories,Inc.;Hercules,CA,USA),使用于200μl OptiMEM(Invitrogen)中的1.6μM合成hsa-miR-16(前体miRTM-hsa-miR-16,Ambion目录号AM17100)或阴性对照miRNA(前体miRTM微小RNA前体分子阴性对照#2;Ambion目录号AM17111),对相等数量的PPC-1细胞进行电穿孔。在第0天对100万个细胞进行电穿孔;但是,为了确保两个条件的相似处理,以及为了获得(accommodate)指数生长,将用于第二次和第三次电穿孔的细胞数目滴定降低到最低计数,即hsa-miR-16处理的细胞的计数。在每次电穿孔事件,向6孔板的各孔分别接种5万个细胞,每隔一天收获和计数细胞。用公式PD=ln(Nf/N0)/ln2计算群体倍增,将细胞数目外推并描绘在线性刻度上。
如图2所示,在22天时间里,以4-7天时间间隔给予三个等剂量的合成hsa-miR-16miRNA,与接受阴性对照miRNA的细胞相比,导致大约94.3%的PPC-1细胞生长抑制。数据显示,多次给予hsa-miR-16能增强miR-16miRNA的治疗作用,并强化了前面的数据,这表明了hsa-miR-16miRNA的治疗潜力。
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序列表
<110>麦克.拜罗姆
卢娜.帕特拉瓦拉
查尔斯.D.约翰逊
大卫.布朗
安德里斯.G.巴德
<120>作为治疗干预的靶标的miR-16调节基因和途径
<130>ASUR:021WO2
<140>未知
<141>2007-12-31
<150>PCT/US07/87038
<151>2007-12-10
<160>3
<170>PatentIn version 3.3
<210>1
<211>22
<212>RNA
<213>人
<400>1
uagcagcacg uaaauauugg cg                22
<210>2
<211>89
<212>RNA
<213>人
<400>2
gucagcagug ccuuagcagc acguaaauau uggcguuaag auucuaaaau uaucuccagu    60
auuaacugug cugcugaagu aagguugac                                      89
<210>3
<211>81
<212>RNA
<213>人
<400>3
guuccacucu agcagcacgu aaauauuggc guagugaaauauauauuaaacaccaauauu      60
acugugcugc uuuaguguga c                                              81

Claims (53)

1.一种调节细胞中的基因表达的方法,所述方法包括给予该细胞一定量的包含miR-16核酸序列的分离核酸,所述miR-16核酸序列的量足以调节表1、3、4或5中所示的一个或多个基因的表达。
2.权利要求1的方法,其中所述细胞是在患有、怀疑患有或有发展以下疾病或病症危险的受试对象中:代谢性疾病或病症、免疫性疾病或病症、感染性疾病或病症、心血管疾病或病症、消化性疾病或病症、内分泌性疾病或病症、眼睛疾病或病症、泌尿生殖器疾病或病症、血液疾病或病症、肌肉骨骼疾病或病症、神经系统疾病或病症、先天性疾病或病症、呼吸疾病或病症、皮肤疾病或病症或癌性疾病或病症。
3.权利要求2的方法,其中所述感染性疾病或病症是寄生虫感染、细菌感染、病毒感染或真菌感染。
4.权利要求2的方法,其中所述癌性病症是星形细胞瘤、间变性大细胞淋巴瘤、乳腺癌、B细胞淋巴瘤、膀胱癌、宫颈癌、慢性淋巴母细胞白血病、结肠直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝母细胞瘤、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、喉鳞状细胞癌、肺癌、黑素瘤、成髓细胞瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、髓性白血病、多发性骨髓瘤、神经纤维瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食道癌、胰腺癌、前列腺癌、嗜铬细胞瘤、肾细胞癌、横纹肌肉瘤、头部和颈部的鳞状细胞癌、睾丸肿瘤或甲状腺癌,其中一个或多个基因的调节对于治疗反应来说是足够的。
5.权利要求4的方法,其中所述癌性病症是前列腺癌。
6.权利要求5的方法,其中所述前列腺癌与可检测的前列腺特异性抗原(PSA,PSMA)相关。
7.权利要求5的方法,其中所述前列腺癌是雄激素非依赖性的。
8.权利要求1的方法,其中基因的表达被下调。
9.权利要求1的方法,其中基因的表达被上调。
10.权利要求1的方法,其中所述miR-16核酸是hsa-miR-16-1、hsa-miR-16-2或它们的片段中的一个或多个。
11.权利要求1的方法,其中所述miR-16核酸是miR-16功能的抑制剂。
12.权利要求1的方法,其中所述细胞是脑细胞、神经元细胞、血液细胞、宫颈细胞、食道细胞、神经胶质细胞、肺细胞、心血管细胞、肝细胞、淋巴细胞、乳腺细胞、骨细胞、甲状腺细胞、腺细胞、肾上腺细胞、胰腺细胞、胃细胞、肠细胞、肾细胞、膀胱细胞、前列腺细胞、子宫细胞、卵巢细胞、睾丸细胞、脾细胞、皮肤细胞、平滑肌细胞、心肌细胞或横纹肌细胞。
13.权利要求12的方法,其中所述细胞是癌细胞。
14.权利要求13的方法,其中所述癌细胞是神经元细胞、神经胶质细胞、肺细胞、肝细胞、脑细胞、乳腺细胞、膀胱细胞、血液细胞、宫颈细胞、白血病细胞、淋巴细胞、结肠细胞、子宫内膜细胞、胃细胞、皮肤细胞、卵巢细胞、食道细胞、胰腺细胞、前列腺细胞、肾细胞、睾丸细胞或甲状腺细胞。
15.权利要求1的方法,其中所述分离的miR-16核酸是重组核酸。
16.权利要求15的方法,其中所述重组核酸是RNA。
17.权利要求15的方法,其中所述重组核酸是DNA。
18.权利要求17的方法,其中所述重组核酸包含miR-16表达盒。
19.权利要求18的方法,其中所述表达盒包含在病毒载体或质粒DNA载体中。
20.权利要求19的方法,其中所述病毒载体以1x105至1x1014个病毒颗粒/剂量的剂量给予,或者所述质粒DNA载体以100mg/患者至4000mg/患者的剂量给予。
21.权利要求1的方法,其中所述miR-16核酸是合成核酸。
22.权利要求21的方法,其中所述核酸以0.01mg/kg体重至10mg/kg体重的剂量给予。
23.权利要求1的方法,其中所述核酸通过肠道给予或胃肠外给予。
24.权利要求23的方法,其中所述肠道给予是口服给予。
25.权利要求23的方法,其中所述胃肠外给予是血管内、颅内、胸膜内、肿瘤内、腹膜内、肌肉内、淋巴内、腺内、皮下、局部、支气管内、气管内、鼻内、吸入或滴注给予。
26.权利要求1的方法,其中所述核酸包含在药物制剂中。
27.权利要求26的方法,其中所述药物制剂是脂质组合物。
28.权利要求26的方法,其中所述药物制剂是纳米颗粒组合物。
29.权利要求26的方法,其中所述药物制剂由生物相容性和/或生物可降解分子组成。
30.一种调节细胞途径的方法,所述方法包括给予细胞一定量的包含miR-16核酸序列的分离核酸,所述miR-16核酸序列的量足以调节与包括表1、3、4或5中所示的一个或多个基因的细胞途径相关的基因的表达。
31.权利要求30的方法,所述方法还包括给予2、3、4、5、6种或更多种miRNA。
32.权利要求31的方法,其中所述miRNA包含在单一组合物中。
33.权利要求30的方法,其中至少两个细胞途径或生理途径受到调节。
34.权利要求31的方法,其中至少一个基因受到多种miRNA调节。
35.权利要求30的方法,其中基因的表达被下调。
36.权利要求30的方法,其中基因的表达被上调。
37.权利要求30的方法,其中所述miR-16核酸是hsa-miR-16-1、hsa-miR-16-2或它们的片段中的一个或多个。
38.权利要求30的方法,其中所述细胞是癌细胞。
39.权利要求30的方法,其中所述对细胞途径的调节导致活力降低、增殖减少、转移减少或者对疗法的敏感性提高。
40.权利要求38的方法,其中所述癌细胞是神经元细胞、神经胶质细胞、肺细胞、肝细胞、脑细胞、乳腺细胞、宫颈细胞、膀胱细胞、血液细胞、白血病细胞、淋巴细胞、结肠细胞、子宫内膜细胞、胃细胞、皮肤细胞、卵巢细胞、食道细胞、胰腺细胞、前列腺细胞、肾细胞、睾丸细胞或甲状腺细胞。
41.权利要求30的方法,其中所述分离miR-16核酸是重组核酸。
42.权利要求41的方法,其中所述重组核酸是DNA。
43.权利要求42的方法,其中所述重组核酸是病毒载体或质粒DNA载体。
44.权利要求30的方法,其中所述miR-16核酸是合成核酸。
45.权利要求30的方法,其中所述miR-16核酸是RNA。
46.一种治疗经诊断患有或者怀疑患有或者怀疑会发展与被miRNA调节的基因有关的病理状况或疾病患者的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)给予该患者一定量的包含miR-16核酸序列的分离核酸,所述miR-16核酸序列的量足以调节细胞途径或生理途径;和
(b)给予第二疗法,其中对细胞途径或生理途径的调节使得该患者对该第二疗法敏感。
47.权利要求46的方法,其中一个或多个细胞途径或生理途径包括表1、3、4和5中所示的一个或多个基因。
48.一种选择向患有、怀疑患有或者具有发展病理状况或疾病的倾向的受试对象给予的miRNA的方法,所述方法包括:
(a)测定选自表1、3、4和5的一个或多个基因的表达谱;
(b)基于所述表达谱,评估所述受试对象对miRNA疗法的敏感性;和
(c)基于评估的敏感性选择一个或多个miRNA。
49.权利要求48的方法,所述方法进一步包括用1、2、4、5、6、7、8、9、10种或更多种miRNA治疗所述受试对象。
50.权利要求49的方法,其中每个miRNA是单独给予或者以一个或多个组合给予。
51.权利要求50的方法,其中所述miRNA在单一组合物中。
52.一种评估细胞、组织或受试对象的方法,所述方法包括评估至少一个样品中miR-16的表达和评估来自表1、3、4或5的一个或多个基因的表达相组合。
53.一种评估样品中的miR-16状态的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)评估样品中来自表1、3、4或5的一个或多个基因的表达;和
(b)基于所述样品中的miR-16表达水平确定miR-16状态。
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