本発明の1つ以上の実施形態の詳細が、下記の添付の説明に示される。本発明の実施または試験においては、本明細書に記載されるものと同様のまたは等価な任意の材料および方法を使用し得るが、ここでは好ましい材料および方法について説明する。本発明の他の特徴、目的および利点は、この説明から明らかになるであろう。説明においては、文脈上特に明確に指示されない限り、単数形は複数形も含む。特に定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって広く理解されているものと同じ意味を有する。矛盾が生じた場合、本説明が優先するものとする。
I.本発明の組成物
アデノ随伴ウイルス(AAV)およびAAV粒子
パルボウイルス科のウイルスは、一本鎖DNAゲノムによって特徴付けられる小型非エンベロープ二十面体カプシドウイルスである。パルボウイルス科ウイルスは、2つの亜科:脊椎動物に感染するパルボウイルス亜科および無脊椎動物に感染するデンソウイルス亜科で構成される。このウイルスファミリーは、その構造が比較的で単純であり、標準的分子生物学技法を使用して容易に操られるため、生物学的ツールとして有用である。ウイルスのゲノムは、所望のペイロードが担持されているかまたは所望のペイロードを発現もしくは送達するように操作されている機能的組換えウイルスまたはウイルス粒子をアセンブリするための最低限の成分を含有するように修飾することができ、所望のペイロードを、標的細胞、組織、臓器、または生物に送達することができる。
パルボウイルスおよびパルボウイルス科の他のメンバーは、ケネス I.ベルン(Kenneth I.Berns)、「パルボウイルス科:ウイルスおよびそれらの複製(The Viruses and Their Replication)」、フィールズ・バイロロジー(FIELDS VIROLOGY)(第3版、1996年)の第69章に概説されている。その内容は全体として参照により援用される。
パルボウイルス科は、限定はされないが、ヒト、霊長類、ウシ、イヌ、ウマ、およびヒツジ種を含む脊椎動物宿主において複製可能なアデノ随伴ウイルス(AAV)を含むディペンドウイルス属を含む。
AAVウイルスゲノムは、およそ5,000ヌクレオチド(nt)長の線状一本鎖DNA(ssDNA)分子である。AAVウイルスゲノムは、ペイロード領域および少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)またはITR領域を含み得る。ITRは、伝統的には、非構造タンパク質(Rep遺伝子によってコードされる)および構造タンパク質(カプシド遺伝子またはCap遺伝子によってコードされる)のコードヌクレオチド配列に隣接する。理論によって束縛されることを望むものではないが、AAVウイルスゲノムは、典型的には、2つのITR配列を含む。AAVベクターゲノムは、エネルギー的に安定した二本鎖領域を形成するssDNAの5’末端および3’末端の自己相補的な末端145ntによって規定される特徴的なT形ヘアピン構造を含む。二本鎖ヘアピン構造は、限定はされないが、宿主ウイルス複製細胞の内因性DNAポリメラーゼ複合体のプライマーとして機能することによってDNA複製の起点として働くことを含む、複数の機能を含む。
コード化異種性ペイロードに加えて、AAV粒子は、全体または一部が、任意の天然に存在するおよび/または組換えのAAV血清型ヌクレオチド配列または変異体のウイルスゲノムを含み得る。AAV変異体は、概して物理的および機能的等価物であるコンストラクトを産生し、同様の機序によって複製し、および同様の機序によってアセンブルするように、核酸レベル(ゲノムまたはカプシド)およびアミノ酸レベル(カプシド)において有意に相同性である配列を有し得る。チオリニ(Chiorini)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir.)、第71巻、p.6823~33(1997年);スリバスタバ(Srivastava)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir)、第45巻、p.555~64(1983年);チオリニ(Chiorini)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir)、第73巻、p.1309~1319(1999年);ラトリッジ(Rutledge)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir)、第72巻、p.309~319(1998年);およびウー(Wu)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir)、第74巻、p.8635~47(2000年)。これらの各々の内容は、本明細書において全体として参照により援用される。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、複製欠損型である組換えAAVウイルスベクターであり、それらのウイルスゲノム内に機能的RepおよびCapタンパク質をコードする配列を欠如する。これらの欠損AAV粒子は、ほとんどのまたは全ての親コード配列を欠如してもよく、本質的に、1つまたは2つのAAV ITR配列および細胞、組織、臓器または生物に送達するための目的の核酸のみを有していてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子のウイルスゲノムは、そこにコードされたコード配列の複製、転写および翻訳を提供する少なくとも1つの制御エレメントを含む。コード配列が適切な宿主細胞中で複製、転写および/または翻訳されることが可能である限り、制御エレメントは全てが常に存在する必要があるわけではない。発現制御エレメントの非限定的な例としては、転写開始および/もしくは終結のための配列、プロモータおよび/もしくはエンハンサー配列、スプライシングおよびポリアデニル化シグナルなどの効率的RNAプロセシングシグナル、細胞質mRNAを安定させる配列、翻訳有効性を増強する配列(例えば、コザックコンセンサス配列)、タンパク質安定性を増強する配列、ならびに/またはタンパク質プロセシングおよび/もしくは分泌を増強する配列が挙げられる。
本発明によれば、療法および/または診断に使用されるAAV粒子は、目的の核酸ペイロードまたはカーゴの形質導入に必要な最低限の成分へと純化または縮小されているウイルスを含む。このように、AAV粒子は、野生型ウイルスに見られる有害な複製および/または組込み特徴を欠きながらも、特異的送達媒体として操作される。
本発明のAAV粒子は、組換え的に産生されてもよく、アデノ随伴ウイルス(AAV)親または参照配列に基づいていてもよい。本明細書で使用されるとき、「ベクター」は、本明細書に記載される核酸などの異種分子を輸送し、形質導入し、またはその他担体として働く任意の分子または部分を意味する。
一本鎖AAVウイルスゲノム(例えば、ssAAV)に加えて、本発明はまた、自己相補的AAV(scAAV)ウイルスゲノムも提供する。scAAVベクターゲノムは、共にアニーリングして二本鎖DNAを形成するDNA鎖を含有する。第2鎖の合成をスキップすることにより、scAAVは、細胞において迅速に発現することが可能である。
一実施形態において、本発明のAAV粒子はscAAVである。
一実施形態において、本発明のAAV粒子はssAAVである。
AAV粒子を作製および/または修飾する方法は、シュードタイプAAV粒子など、当該技術分野において開示されている(国際公開第200028004号パンフレット、同第200123001号パンフレット、同第2004112727号パンフレット、同第2005005610号パンフレットおよび同第2005072364号パンフレット、これらの各々の内容は全体として参照により本明細書に援用される)。
AAV粒子は、送達効率が増強されるように修飾されてもよい。かかる修飾されたAAV粒子は、効率的にパッケージングすることができ、高頻度でおよび最低限の毒性で標的細胞への感染を成功させるために使用することができる。一部の実施形態において、AAV粒子のカプシドは、米国特許出願公開第20130195801号明細書に記載される方法に従って操作される。この内容は、本明細書において全体として参照によって援用される。
一実施形態において、本発明のポリペプチドをコードするペイロード領域を含むAAV粒子は、哺乳類細胞に導入することができる。
AAV血清型
本発明のAAV粒子は任意の天然または組換えAAV血清型を含んでもよく、またはそれに由来してもよい。本発明によれば、AAV粒子は以下のいずれか、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5(G2B5)、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3-3、AAV4、AAV4-4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42-1b、AAV42-2、AAV42-3a、AAV42-3b、AAV42-4、AAV42-5a、AAV42-5b、AAV42-6b、AAV42-8、AAV42-10、AAV42-11、AAV42-12、AAV42-13、AAV42-15、AAV42-aa、AAV43-1、AAV43-12、AAV43-20、AAV43-21、AAV43-23、AAV43-25、AAV43-5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1-7/rh.48、AAV1-8/rh.49、AAV2-15/rh.62、AAV2-3/rh.61、AAV2-4/rh.50、AAV2-5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3-9/rh.52、AAV3-11/rh.53、AAV4-8/r11.64、AAV4-9/rh.54、AAV4-19/rh.55、AAV5-3/rh.57、AAV5-22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH-1/hu.1、AAVH-5/hu.3、AAVLG-10/rh.40、AAVLG-4/rh.38、AAVLG-9/hu.39、AAVN721-8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R突然変異体、AAVrh8R R533A突然変異体、AAAV、BAAV、ヤギAAV、ウシAAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV-PAEC、AAV-LK01、AAV-LK02、AAV-LK03、AAV-LK04、AAV-LK05、AAV-LK06、AAV-LK07、AAV-LK08、AAV-LK09、AAV-LK10、AAV-LK11、AAV-LK12、AAV-LK13、AAV-LK14、AAV-LK15、AAV-LK16、AAV-LK17、AAV-LK18、AAV-LK19、AAV-PAEC2、AAV-PAEC4、AAV-PAEC6、AAV-PAEC7、AAV-PAEC8、AAV-PAEC11、AAV-PAEC12、AAV-2-pre-miRNA-101、AAV-8h、AAV-8b、AAV-h、AAV-b、AAV SM 10-2、AAVシャッフル100-1、AAVシャッフル100-3、AAVシャッフル100-7、AAVシャッフル10-2、AAVシャッフル10-6、AAVシャッフル10-8、AAVシャッフル100-2、AAV SM 10-1、AAV SM 10-8、AAV SM 100-3、AAV SM 100-10、BNP61 AAV、BNP62 AAV、BNP63 AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4-8/rh.64、AAVLG-9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、トゥルータイプAAV(ttAAV)、UPENN AAV10、ジャパニーズAAV10血清型、AAV CBr-7.1、AAV CBr-7.10、AAV CBr-7.2、AAV CBr-7.3、AAV CBr-7.4、AAV CBr-7.5、AAV CBr-7.7、AAV CBr-7.8、AAV CBr-B7.3、AAV CBr-B7.4、AAV CBr-E1、AAV CBr-E2、AAV CBr-E3、AAV CBr-E4、AAV CBr-E5、AAV CBr-e5、AAV CBr-E6、AAV CBr-E7、AAV CBr-E8、AAV CHt-1、AAV CHt-2、AAV CHt-3、AAV CHt-6.1、AAV CHt-6.10、AAV CHt-6.5、AAV CHt-6.6、AAV CHt-6.7、AAV CHt-6.8、AAV CHt-P1、AAV CHt-P2、AAV CHt-P5、AAV CHt-P6、AAV CHt-P8、AAV CHt-P9、AAV CKd-1、AAV CKd-10、AAV CKd-2、AAV CKd-3、AAV CKd-4、AAV CKd-6、AAV CKd-7、AAV CKd-8、AAV CKd-B1、AAV CKd-B2、AAV CKd-B3、AAV CKd-B4、AAV CKd-B5、AAV CKd-B6、AAV CKd-B7、AAV CKd-B8、AAV CKd-H1、AAV CKd-H2、AAV CKd-H3、AAV CKd-H4、AAV CKd-H5、AAV CKd-H6、AAV CKd-N3、AAV CKd-N4、AAV CKd-N9、AAV CLg-F1、AAV CLg-F2、AAV CLg-F3、AAV CLg-F4、AAV CLg-F5、AAV CLg-F6、AAV CLg-F7、AAV CLg-F8、AAV CLv-1、AAV CLv1-1、AAV Clv1-10、AAV CLv1-2、AAV CLv-12、AAV CLv1-3、AAV CLv-13、AAV CLv1-4、AAV Clv1-7、AAV Clv1-8、AAV Clv1-9、AAV CLv-2、AAV CLv-3、AAV CLv-4、AAV CLv-6、AAV CLv-8、AAV CLv-D1、AAV CLv-D2、AAV CLv-D3、AAV CLv-D4、AAV CLv-D5、AAV CLv-D6、AAV CLv-D7、AAV CLv-D8、AAV CLv-E1、AAV CLv-K1、AAV CLv-K3、AAV CLv-K6、AAV CLv-L
4、AAV CLv-L5、AAV CLv-L6、AAV CLv-M1、AAV CLv-M11、AAV CLv-M2、AAV CLv-M5、AAV CLv-M6、AAV CLv-M7、AAV CLv-M8、AAV CLv-M9、AAV CLv-R1、AAV CLv-R2、AAV CLv-R3、AAV CLv-R4、AAV CLv-R5、AAV CLv-R6、AAV CLv-R7、AAV CLv-R8、AAV CLv-R9、AAV CSp-1、AAV CSp-10、AAV CSp-11、AAV CSp-2、AAV CSp-3、AAV CSp-4、AAV CSp-6、AAV CSp-7、AAV CSp-8、AAV CSp-8.10、AAV CSp-8.2、AAV CSp-8.4、AAV CSp-8.5、AAV CSp-8.6、AAV CSp-8.7、AAV CSp-8.8、AAV CSp-8.9、AAV CSp-9、AAV.hu.48R3、AAV.VR-355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AAVF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8、および/またはAAVF9/HSC9、ならびにそれらの変異体から選択される血清型を利用してもよく、もしくはそれをベースとしてもよく、またはそれらのペプチドを含んでもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV1(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号6および64)、AAV2(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号7および70)、AAV3(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号8および71)、AAV4(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号63)、AAV5(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号114)、AAV6(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号65)、AAV7(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号1~3)、AAV8(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号4および95)、AAV9(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号5および100)、AAV10(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号117)、AAV11(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号118)、AAV12(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号119)、AAVrh10(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号81のアミノ酸1~738)、AAV16.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号10)、AAV29.3/bb.1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号11)、AAV29.4(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号12)、AAV29.5/bb.2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号13)、AAV1.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号14)、AAV13.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号15)、AAV24.1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号16)、AAV27.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号17)、AAV7.2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号18)、AAVC1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号19)、AAVC3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号20)、AAVC5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号21)、AAVF1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号22)、AAVF3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号23)、AAVF5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号24)、AAVH6(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号25)、AAVH2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号26)、AAV42-8(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号27)、AAV42-15(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号28)、AAV42-5b(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号29)、AAV42-1b(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号30)、AAV42-13(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号31)、AAV42-3a(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号32)、AAV42-4(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号33)、AAV42-5a(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号34)、AAV42-10(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号35)、AAV42-3b(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号36)、AAV42-11(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号37)、AAV42-6b(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号38)、AAV43-1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号39)、AAV43-5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号40)、AAV43-12(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号41)、AAV43-20(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号42)、AAV43-21(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号43)、AAV43-23(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号44)、AAV43-25(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号45)、AAV44.1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号46)、AAV44.5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号47)、AAV223.1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号48)、AAV223.2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号49)、AAV223.4(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号50)、AAV223.5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号51)、AAV223.6(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号52)、AAV223.7(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号53)、AAVA3.4(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号54)、AAVA3.5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号55)、AAVA3.7(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号56)、AAVA3.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号57)、AAV42.12(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号58)、AAV44.2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号59)、AAV42-2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号9)、またはそれらの変異体など、米国特許出願公開第20030138772号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV2(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号7および23)、rh20(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号1)、rh32/33(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号2)、rh39(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号3、20および36)、rh46(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号4および22)、rh73(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号5)、rh74(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号6)、AAV6.1(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号29)、rh.8(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号41)、rh.48.1(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号44)、hu.44(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号45)、hu.29(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号42)、hu.48(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号38)、rh54(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号49)、AAV2(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号7)、cy.5(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号8および24)、rh.10(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号9および25)、rh.13(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号10および26)、AAV1(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号11および27)、AAV3(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号12および28)、AAV6(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号13および29)、AAV7(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号14および30)、AAV8(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号15および31)、hu.13(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号16および32)、hu.26(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号17および33)、hu.37(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号18および34)、hu.53(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号19および35)、rh.43(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号21および37)、rh2(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号39)、rh.37(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号40)、rh.64(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号43)、rh.48(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号44)、ch.5(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号46)、rh.67(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号47)、rh.58(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号48)、またはそれらの変異体など、限定はされないが、Cy5R1、Cy5R2、Cy5R3、Cy5R4、rh.13R、rh.37R2、rh.2R、rh.8R、rh.48.1、rh.48.2、rh.48.1.2、hu.44R1、hu.44R2、hu.44R3、hu.29R、ch.5R1、rh64R1、rh64R2、AAV6.2、AAV6.1、AAV6.12、hu.48R1、hu.48R2、およびhu.48R3を含め、米国特許出願公開第20150159173号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV9(米国特許第7198951号明細書の配列番号1~3)、AAV2(米国特許第7198951号明細書の配列番号4)、AAV1(米国特許第7198951号明細書の配列番号5)、AAV3(米国特許第7198951号明細書の配列番号6)、およびAAV8(米国特許第7198951号明細書の配列番号7)など、米国特許第7198951号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV9.9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84など、N・プリチャーラ(N Pulicherla)ら(モレキュラー・セラピー(Molecular Therapy)、第19巻、第6号、p.1070~1078、2011年、この内容は本明細書において全体として参照により援用される)により記載されるとおりのAAV9配列における突然変異であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV3B(米国特許第6156303号明細書の配列番号1および10)、AAV6(米国特許第6156303号明細書の配列番号2、7および11)、AAV2(米国特許第6156303号明細書の配列番号3および8)、AAV3A(米国特許第6156303号明細書の配列番号4および9)、またはそれらの誘導体など、米国特許第6156303号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV8(米国特許出願公開第20140359799号明細書の配列番号1)、AAVDJ(米国特許出願公開第20140359799号明細書の配列番号2および3)、またはそれらの変異体など、米国特許出願公開第20140359799号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、血清型は、グリム(Grimm)ら(ジャーナル・オブ・バイロロジー(Journal of Virology)、第82巻、第12号、p.5887~5911、2008年、本明細書において全体として参照により援用される)により記載されるとおり、AAVDJまたはその変異体、例えばAAVDJ8(またはAAV-DJ8)などであってもよい。AAVDJ8のアミノ酸配列は、ヘパリン結合ドメイン(HBD)を除去するため2つ以上の突然変異を含み得る。非限定的な例として、米国特許第7,588,772号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に配列番号1として記載されるAAV-DJ配列は、2つの突然変異:(1)R587Q[アミノ酸587のアルギニン(R;Arg)がグルタミン(Q;Gln)に変更される]および(2)R590T[アミノ酸590のアルギニン(R;Arg)がスレオニン(T;Thr)に変更される]を含み得る。別の非限定的な例として、3つの突然変異:(1)K406R[アミノ酸406のリジン(K;Lys)がアルギニン(R;Arg)に変更される]、(2)R587Q[アミノ酸587のアルギニン(R;Arg)がグルタミン(Q;Gln)に変更される]および(3)R590T[アミノ酸590のアルギニン(R;Arg)がスレオニン(T;Thr)に変更される]を含み得る。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV4(国際公開第1998011244号パンフレットの配列番号1~20)など、国際公開第1998011244号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりのAAV4の配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、国際公開第2014144229号パンフレットに記載されおよび本明細書において全体として参照により援用されるとおりのAAV2G9を生じさせるAAV2配列における突然変異であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV3-3(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号217)、AAV1(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号219および202)、AAV106.1/hu.37(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号10)、AAV114.3/hu.40(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号11)、AAV127.2/hu.41(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号6および8)、AAV128.3/hu.44(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号81)、AAV130.4/hu.48(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号78)、AAV145.1/hu.53(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号176および177)、AAV145.6/hu.56(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号168および192)、AAV16.12/hu.11(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号153および57)、AAV16.8/hu.10(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号156および56)、AAV161.10/hu.60(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号170)、AAV161.6/hu.61(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号174)、AAV1-7/rh.48(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号32)、AAV1-8/rh.49(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号103および25)、AAV2(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号211および221)、AAV2-15/rh.62(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号33および114)、AAV2-3/rh.61(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号21)、AAV2-4/rh.50(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号23および108)、AAV2-5/rh.51(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号104および22)、AAV3.1/hu.6(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号5および84)、AAV3.1/hu.9(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号155および58)、AAV3-11/rh.53(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号186および176)、AAV3-3(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号200)、AAV33.12/hu.17(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号4)、AAV33.4/hu.15(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号50)、AAV33.8/hu.16(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号51)、AAV3-9/rh.52(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号96および18)、AAV4-19/rh.55(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号117)、AAV4-4(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号201および218)、AAV4-9/rh.54(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号116)、AAV5(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号199および216)、AAV52.1/hu.20(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号63)、AAV52/hu.19(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号133)、AAV5-22/rh.58(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号27)、AAV5-3/rh.57(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号105)、AAV5-3/rh.57(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号26)、AAV58.2/hu.25(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号49)、AAV6(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号203および220)、AAV7(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号222および213)、AAV7.3/hu.7(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号55)、AAV8(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号223および214)、AAVH-1/hu.1(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号46)、AAVH-5/hu.3(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号44)、AAVhu.1(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号144)、AAVhu.10(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号156)、AAVhu.11(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号153)、AAVhu.12(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号59)、AAVhu.13(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号129)、AAVhu.14/AAV9(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号123および3)、AAVhu.15(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号147)、AAVhu.16(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号148)、AAVhu.17(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号83)、AAVhu.18(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号149)、AAVhu.19(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号133)、AAVhu.2(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号143)、AAVhu.20(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号134)、AAVhu.21(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号135)、AAVhu.22(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号138)、AAVhu.23.2(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号137)、AAVhu.24(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号136)、AAVhu.25(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号146)、AAVhu.27(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号140)、AAVhu.29(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号132)、AAVhu.3(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号145)、AAVhu.31(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号121)、AAVhu.32(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号122)、AAVhu.34(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号125)、AAVhu.35(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号164)、AAVhu.37(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号88)、AAVhu.39(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号102)、AAVhu.4(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号141)、AAVhu.40(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号87)、AAVhu.41(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号91)、AAVhu.42(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号85)、AAVhu.43(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号160)、AAVhu.44(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号144)、AAVhu.45(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号127)、AAVhu.46(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号159)、AAVhu.47(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号128)、AAVhu.48(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号157)、AAVhu.49(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号189)、AAVhu.51(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号190)、AAVhu.52(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号191)、AAVhu.53(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号186)、AAVhu.54(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号188)、AAVhu.55(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号187)、AAVhu.56(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号192)、AAVhu.57(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号193)、AAVhu.58(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号194)、AAVhu.6(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号84)、AAVhu.60(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号184)、AAVhu.61(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号185)、AAVhu.63(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号195)、AAVhu.64(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号196)、AAVhu.66(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号197)、AAVhu.67(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号198)、AAVhu.7(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号150)、AAVhu.8(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号12)、AAVhu.9(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号155)、AAVLG-10/rh.40(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号14)、AAVLG-4/rh.38(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号86)、AAVLG-4/rh.38(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号7)、AAVN721-8/rh.43(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号163)、AAVN721-8/rh.43(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号43)、AAVpi.1(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号28)、AAVpi.2(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号30)、AAVpi.3(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号29)、AAVrh.38(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号86)、AAVrh.40(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号92)、AAVrh.43(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号163)、AAVrh.44(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号34)、AAVrh.45(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号41)、AAVrh.47(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号38)、AAVrh.48(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号115)、AAVrh.49(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号103)、AAVrh.50(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号108)、AAVrh.51(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号104)、AAVrh.52(国際公開第2005033321号パンフレ
ットの配列番号96)、AAVrh.53(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号97)、AAVrh.55(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号37)、AAVrh.56(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号152)、AAVrh.57(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号105)、AAVrh.58(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号106)、AAVrh.59(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号42)、AAVrh.60(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号31)、AAVrh.61(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号107)、AAVrh.62(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号114)、AAVrh.64(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号99)、AAVrh.65(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号35)、AAVrh.68(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号16)、AAVrh.69(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号39)、AAVrh.70(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号20)、AAVrh.72(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号9)、またはそれらの変異体など、限定はされないが、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVcy.6、AAVrh.12、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.25/42 15、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh14を含め、国際公開第2005033321号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。変異体の非限定的な例としては、国際公開第2005033321号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)の配列番号13、15、17、19、24、36、40、45、47、48、51~54、60~62、64~77、79、80、82、89、90、93~95、98、100、101、109~113、118~120、124、126、131、139、142、151、154、158、161、162、165~183、202、204~212、215、219、224~236が挙げられる。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAVrh8R(国際公開第2015168666号パンフレットの配列番号9)、AAVrh8R A586R突然変異体(国際公開第2015168666号パンフレットの配列番号10)、AAVrh8R R533A突然変異体(国際公開第2015168666号パンフレットの配列番号11)、またはそれらの変異体など、国際公開第2015168666号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAVhE1.1(米国特許第9233131号明細書の配列番号44)、AAVhEr1.5(米国特許第9233131号明細書の配列番号45)、AAVhER1.14(米国特許第9233131号明細書の配列番号46)、AAVhEr1.8(米国特許第9233131号明細書の配列番号47)、AAVhEr1.16(米国特許第9233131号明細書の配列番号48)、AAVhEr1.18(米国特許第9233131号明細書の配列番号49)、AAVhEr1.35(米国特許第9233131号明細書の配列番号50)、AAVhEr1.7(米国特許第9233131号明細書の配列番号51)、AAVhEr1.36(米国特許第9233131号明細書の配列番号52)、AAVhEr2.29(米国特許第9233131号明細書の配列番号53)、AAVhEr2.4(米国特許第9233131号明細書の配列番号54)、AAVhEr2.16(米国特許第9233131号明細書の配列番号55)、AAVhEr2.30(米国特許第9233131号明細書の配列番号56)、AAVhEr2.31(米国特許第9233131号明細書の配列番号58)、AAVhEr2.36(米国特許第9233131号明細書の配列番号57)、AAVhER1.23(米国特許第9233131号明細書の配列番号53)、AAVhEr3.1(米国特許第9233131号明細書の配列番号59)、AAV2.5T(米国特許第9233131号明細書の配列番号42)、またはそれらの変異体など、米国特許第9233131号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV-PAEC(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号1)、AAV-LK01(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号2)、AAV-LK02(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号3)、AAV-LK03(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号4)、AAV-LK04(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号5)、AAV-LK05(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号6)、AAV-LK06(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号7)、AAV-LK07(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号8)、AAV-LK08(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号9)、AAV-LK09(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号10)、AAV-LK10(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号11)、AAV-LK11(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号12)、AAV-LK12(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号13)、AAV-LK13(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号14)、AAV-LK14(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号15)、AAV-LK15(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号16)、AAV-LK16(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号17)、AAV-LK17(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号18)、AAV-LK18(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号19)、AAV-LK19(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号20)、AAV-PAEC2(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号21)、AAV-PAEC4(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号22)、AAV-PAEC6(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号23)、AAV-PAEC7(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号24)、AAV-PAEC8(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号25)、AAV-PAEC11(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号26)、AAV-PAEC12(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号27)、またはそれらの変異体など、米国特許出願公開第20150376607号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV-2-pre-miRNA-101(配列番号1 米国特許第9163261号明細書)、またはその変異体など、米国特許第9163261号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV-8h(米国特許出願公開第20150376240号明細書の配列番号6)、AAV-8b(米国特許出願公開第20150376240号明細書の配列番号5)、AAV-h(米国特許出願公開第20150376240号明細書の配列番号2)、AAV-b(米国特許出願公開第20150376240号明細書の配列番号1)、またはそれらの変異体など、米国特許出願公開第20150376240号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV SM 10-2(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号22)、AAVシャッフル100-1(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号23)、AAVシャッフル100-3(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号24)、AAVシャッフル100-7(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号25)、AAVシャッフル10-2(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号34)、AAVシャッフル10-6(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号35)、AAVシャッフル10-8(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号36)、AAVシャッフル100-2(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号37)、AAV SM 10-1(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号38)、AAV SM 10-8(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号39)、AAV SM 100-3(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号40)、AAV SM 100-10(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号41)、またはそれらの変異体など、米国特許出願公開第20160017295号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、BNP61 AAV(米国特許出願公開第20150238550号明細書の配列番号1)、BNP62 AAV(米国特許出願公開第20150238550号明細書の配列番号3)、BNP63 AAV(米国特許出願公開第20150238550号明細書の配列番号4)、またはそれらの変異体など、米国特許出願公開第20150238550号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAVrh.50(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号108)、AAVrh.43(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号163)、AAVrh.62(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号114)、AAVrh.48(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号115)、AAVhu.19(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号133)、AAVhu.11(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号153)、AAVhu.53(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号186)、AAV4-8/rh.64(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号15)、AAVLG-9/hu.39(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号24)、AAV54.5/hu.23(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号60)、AAV54.2/hu.22(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号67)、AAV54.7/hu.24(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号66)、AAV54.1/hu.21(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号65)、AAV54.4R/hu.27(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号64)、AAV46.2/hu.28(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号68)、AAV46.6/hu.29(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号69)、AAV128.1/hu.43(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号80)、またはそれらの変異体など、米国特許出願公開第20150315612号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、トゥルータイプAAV(ttAAV)(国際公開第2015121501号パンフレットの配列番号2)、「ユーペンAAV10」(国際公開第2015121501号パンフレットの配列番号8)、「ジャパニーズAAV10」(国際公開第2015121501号パンフレットの配列番号9)、またはそれらの変異体など、国際公開第2015121501号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
本発明によれば、AAVカプシド血清型の選択または使用は様々な種からであってよい。一実施形態において、AAVは鳥類AAV(AAAV)であってもよい。AAAV血清型は、限定はされないが、AAAV(米国特許第9,238,800号明細書の配列番号1、2、4、6、8、10、12、および14)、またはその変異体など、米国特許第9238800号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一実施形態において、AAVはウシAAV(BAAV)であってもよい。BAAV血清型は、限定はされないが、BAAV(米国特許第9,193,769号明細書の配列番号1および6)、またはその変異体など、米国特許第9,193,769号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。BAAV血清型は、限定はされないが、BAAV(米国特許第7,427,396号明細書の配列番号5および6)、またはその変異体など、米国特許第7,427,396号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一実施形態において、AAVはヤギAAVであってもよい。ヤギAAV血清型は、限定はされないが、ヤギAAV(米国特許第7,427,396号明細書の配列番号3)、またはその変異体など、米国特許第7,427,396号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
他の実施形態において、AAVは2つ以上の親血清型からハイブリッドAAVとして操作されてもよい。一実施形態において、このAAVは、AAV2およびAAV9からの配列を含むAAV2G9であってもよい。AAV2G9 AAV血清型は、米国特許出願公開第20160017005号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一実施形態において、AAVは、プリチャーラ(Pulicherla)ら(モレキュラー・セラピー(Molecular Therapy)、第19巻、第6号、p.1070~1078、2011年(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)により記載されるとおりのアミノ酸390~627(VP1付番)に突然変異を有するAAV9カプシドライブラリによって生成された血清型であってもよい。血清型ならびに対応するヌクレオチドおよびアミノ酸置換は、限定はされないが、AAV9.1(G1594C;D532H)、AAV6.2(T1418AおよびT1436X;V473DおよびI479K)、AAV9.3(T1238A;F413Y)、AAV9.4(T1250CおよびA1617T;F417S)、AAV9.5(A1235G、A1314T、A1642G、C1760T;Q412R、T548A、A587V)、AAV9.6(T1231A;F411I)、AAV9.9(G1203A、G1785T;W595C)、AAV9.10(A1500G、T1676C;M559T)、AAV9.11(A1425T、A1702C、A1769T;T568P、Q590L)、AAV9.13(A1369C、A1720T;N457H、T574S)、AAV9.14(T1340A、T1362C、T1560C、G1713A;L447H)、AAV9.16(A1775T;Q592L)、AAV9.24(T1507C、T1521G;W503R)、AAV9.26(A1337G、A1769C;Y446C、Q590P)、AAV9.33(A1667C;D556A)、AAV9.34(A1534G、C1794T;N512D)、AAV9.35(A1289T、T1450A、C1494T、A1515T、C1794A、G1816A;Q430L、Y484N、N98K、V606I)、AAV9.40(A1694T、E565V)、AAV9.41(A1348T、T1362C;T450S)、AAV9.44(A1684C、A1701T、A1737G;N562H、K567N)、AAV9.45(A1492T、C1804T;N498Y、L602F)、AAV9.46(G1441C、T1525C、T1549G;G481R、W509R、L517V)、9.47(G1241A、G1358A、A1669G、C1745T;S414N、G453D、K557E、T582I)、AAV9.48(C1445T、A1736T;P482L、Q579L)、AAV9.50(A1638T、C1683T、T1805A;Q546H、L602H)、AAV9.53(G1301A、A1405C、C1664T、G1811T;R134Q、S469R、A555V、G604V)、AAV9.54(C1531A、T1609A;L511I、L537M)、AAV9.55(T1605A;F535L)、AAV9.58(C1475T、C1579A;T492I、H527N)、AAV.59(T1336C;Y446H)、AAV9.61(A1493T;N498I)、AAV9.64(C1531A、A1617T;L511I)、AAV9.65(C1335T、T1530C、C1568A;A523D)、AAV9.68(C1510A;P504T)、AAV9.80(G1441A、;G481R)、AAV9.83(C1402A、A1500T;P468T、E500D)、AAV9.87(T1464C、T1468C;S490P)、AAV9.90(A1196T;Y399F)、AAV9.91(T1316G、A1583T、C1782G、T1806C;L439R、K528I)、AAV9.93(A1273G、A1421G、A1638C、C1712T、G1732A、A1744T、A1832T;S425G、Q474R、Q546H、P571L、G578R、T582S、D611V)、AAV9.94(A1675T;M559L)およびAAV9.95(T1605A;F535L)であってもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAVF1/HSC1(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号2および20)、AAVF2/HSC2(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号3および21)、AAVF3/HSC3(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号5および22)、AAVF4/HSC4(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号6および23)、AAVF5/HSC5(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号11および25)、AAVF6/HSC6(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号7および24)、AAVF7/HSC7(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号8および27)、AAVF8/HSC8(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号9および28)、AAVF9/HSC9(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号10および29)、AAVF11/HSC11(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号4および26)、AAVF12/HSC12(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号12および30)、AAVF13/HSC13(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号14および31)、AAVF14/HSC14(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号15および32)、AAVF15/HSC15(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号16および33)、AAVF16/HSC16(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号17および34)、AAVF17/HSC17(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号13および35)、またはそれらの変異体もしくは誘導体など、国際公開第2016049230号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV CBr-E1(米国特許第8734809号明細書の配列番号13および87)、AAV CBr-E2(米国特許第8734809号明細書の配列番号14および88)、AAV CBr-E3(米国特許第8734809号明細書の配列番号15および89)、AAV CBr-E4(米国特許第8734809号明細書の配列番号16および90)、AAV CBr-E5(米国特許第8734809号明細書の配列番号17および91)、AAV CBr-e5(米国特許第8734809号明細書の配列番号18および92)、AAV CBr-E6(米国特許第8734809号明細書の配列番号19および93)、AAV CBr-E7(米国特許第8734809号明細書の配列番号20および94)、AAV CBr-E8(米国特許第8734809号明細書の配列番号21および95)、AAV CLv-D1(米国特許第8734809号明細書の配列番号22および96)、AAV CLv-D2(米国特許第8734809号明細書の配列番号23および97)、AAV CLv-D3(米国特許第8734809号明細書の配列番号24および98)、AAV CLv-D4(米国特許第8734809号明細書の配列番号25および99)、AAV CLv-D5(米国特許第8734809号明細書の配列番号26および100)、AAV CLv-D6(米国特許第8734809号明細書の配列番号27および101)、AAV CLv-D7(米国特許第8734809号明細書の配列番号28および102)、AAV CLv-D8(米国特許第8734809号明細書の配列番号29および103)、AAV CLv-E1(米国特許第8734809号明細書の配列番号13および87)、AAV CLv-R1(米国特許第8734809号明細書の配列番号30および104)、AAV CLv-R2(米国特許第8734809号明細書の配列番号31および105)、AAV CLv-R3(米国特許第8734809号明細書の配列番号32および106)、AAV CLv-R4(米国特許第8734809号明細書の配列番号33および107)、AAV CLv-R5(米国特許第8734809号明細書の配列番号34および108)、AAV CLv-R6(米国特許第8734809号明細書の配列番号35および109)、AAV CLv-R7(米国特許第8734809号明細書の配列番号36および110)、AAV CLv-R8(米国特許第8734809号明細書の配列番号XおよびX)、AAV CLv-R9(米国特許第8734809号明細書の配列番号XおよびX)、AAV CLg-F1(米国特許第8734809号明細書の配列番号39および113)、AAV CLg-F2(米国特許第8734809号明細書の配列番号40および114)、AAV CLg-F3(米国特許第8734809号明細書の配列番号41および115)、AAV CLg-F4(米国特許第8734809号明細書の配列番号42および116)、AAV CLg-F5(米国特許第8734809号明細書の配列番号43および117)、AAV CLg-F6(米国特許第8734809号明細書の配列番号43および117)、AAV CLg-F7(米国特許第8734809号明細書の配列番号44および118)、AAV CLg-F8(米国特許第8734809号明細書の配列番号43および117)、AAV CSp-1(米国特許第8734809号明細書の配列番号45および119)、AAV CSp-10(米国特許第8734809号明細書の配列番号46および120)、AAV CSp-11(米国特許第8734809号明細書の配列番号47および121)、AAV CSp-2(米国特許第8734809号明細書の配列番号48および122)、AAV CSp-3(米国特許第8734809号明細書の配列番号49および123)、AAV CSp-4(米国特許第8734809号明細書の配列番号50および124)、AAV CSp-6(米国特許第8734809号明細書の配列番号51および125)、AAV CSp-7(米国特許第8734809号明細書の配列番号52および126)、AAV CSp-8(米国特許第8734809号明細書の配列番号53および127)、AAV CSp-9(米国特許第8734809号明細書の配列番号54および128)、AAV CHt-2(米国特許第8734809号明細書の配列番号55および129)、AAV CHt-3(米国特許第8734809号明細書の配列番号56および130)、AAV CKd-1(米国特許第8734809号明細書の配列番号57および131)、AAV CKd-10(米国特許第8734809号明細書の配列番号58および132)、AAV CKd-2(米国特許第8734809号明細書の配列番号59および133)、AAV CKd-3(米国特許第8734809号明細書の配列番号60および134)、AAV CKd-4(米国特許第8734809号明細書の配列番号61および135)、AAV CKd-6(米国特許第8734809号明細書の配列番号62および136)、AAV CKd-7(米国特許第8734809号明細書の配列番号63および137)、AAV CKd-8(米国特許第8734809号明細書の配列番号64および138)、AAV CLv-1(米国特許第8734809号明細書の配列番号35および139)、AAV CLv-12(米国特許第8734809号明細書の配列番号66および140)、AAV CLv-13(米国特許第8734809号明細書の配列番号67および141)、AAV CLv-2(米国特許第8734809号明細書の配列番号68および142)、AAV CLv-3(米国特許第8734809号明細書の配列番号69および143)、AAV CLv-4(米国特許第8734809号明細書の配列番号70および144)、AAV CLv-6(米国特許第8734809号明細書の配列番号71および145)、AAV CLv-8(米国特許第8734809号明細書の配列番号72および146)、AAV CKd-B1(米国特許第8734809号明細書の配列番号73および147)、AAV CKd-B2(米国特許第8734809号明細書の配列番号74および148)、AAV CKd-B3(米国特許第8734809号明細書の配列番号75および149)、AAV CKd-B4(米国特許第8734809号明細書の配列番号76および150)、AAV CKd-B5(米国特許第8734809号明細書の配列番号77および151)、AAV CKd-B6(米国特許第8734809号明細書の配列番号78および152)、AAV CKd-B7(米国特許第8734809号明細書の配列番号79および153)、AAV CKd-B8(米国特許第8734809号明細書の配列番号80および154)、AAV CKd-H1(米国特許第8734809号明細書の配列番号81および155)、AAV CKd-H2(米国特許第8734809号明細書の配列番号82および156)、AAV CKd-H3(米国特許第8734809号明細書の配列番号83および157)、AAV CKd-H4(米国特許第8734809号明細書の配列番号84および158)、AAV CKd-H5(米国特許第8734809号明細書の配列番号85および159)、AAV CKd-H6(米国特許第8734809号明細書の配列番号77および151)、AAV CHt-1(米国特許第8734809号明細書の配列番号86および160)、AAV CLv1-1(米国特許第8734809号明細書の配列番号171)、AAV CLv1-2(米国特許第8734809号明細書の配列番号172)、AAV CLv1-3(米国特許第8734809号明細書の配列番号173)、AAV CLv1-4(米国特許第8734809号明細書の配列番号174)、AAV Clv1-7(米国特許第8734809号明細書の配列番号175)、AAV Clv1-8(米国特許第8734809号明細書の配列番号176)、AAV Clv1-9(米国特許第8734809号明細書の配列番号177)、AAV Clv1-10(米国特許第8734809号明細書の配列番号178)、AAV.VR-355(米国特許第8734809号明細書の配列番号181)、AAV.hu.48R3(米国特許第8734809号明細書の配列番号183)、またはそれらの変異体もしくは誘導体など、米国特許第8734809号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV CHt-P2(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号1および51)、AAV CHt-P5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号2および52)、AAV CHt-P9(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号3および53)、AAV CBr-7.1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号4および54)、AAV CBr-7.2(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号5および55)、AAV CBr-7.3(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号6および56)、AAV CBr-7.4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号7および57)、AAV CBr-7.5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号8および58)、AAV CBr-7.7(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号9および59)、AAV CBr-7.8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号10および60)、AAV CBr-7.10(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号11および61)、AAV CKd-N3(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号12および62)、AAV CKd-N4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号13および63)、AAV CKd-N9(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号14および64)、AAV CLv-L4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号15および65)、AAV CLv-L5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号16および66)、AAV CLv-L6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号17および67)、AAV CLv-K1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号18および68)、AAV CLv-K3(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号19および69)、AAV CLv-K6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号20および70)、AAV CLv-M1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号21および71)、AAV CLv-M11(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号22および72)、AAV CLv-M2(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号23および73)、AAV CLv-M5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号24および74)、AAV CLv-M6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号25および75)、AAV CLv-M7(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号26および76)、AAV CLv-M8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号27および77)、AAV CLv-M9(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号28および78)、AAV CHt-P1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号29および79)、AAV CHt-P6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号30および80)、AAV CHt-P8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号31および81)、AAV CHt-6.1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号32および82)、AAV CHt-6.10(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号33および83)、AAV CHt-6.5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号34および84)、AAV CHt-6.6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号35および85)、AAV CHt-6.7(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号36および86)、AAV CHt-6.8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号37および87)、AAV CSp-8.10(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号38および88)、AAV CSp-8.2(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号39および89)、AAV CSp-8.4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号40および90)、AAV CSp-8.5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号41および91)、AAV CSp-8.6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号42および92)、AAV CSp-8.7(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号43および93)、AAV CSp-8.8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号44および94)、AAV CSp-8.9(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号45および95)、AAV CBr-B7.3(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号46および96)、AAV CBr-B7.4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号47および97)、AAV3B(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号48および98)、AAV4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号49および99)、AAV5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号50および100)、またはそれらの変異体もしくは誘導体など、国際公開第2016065001号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一実施形態において、AAVは、表1に挙げられるもののいずれかから選択される血清型であってもよい。
一実施形態において、AAVは、表1にある配列の配列、その断片または変異体を含んでもよい。
一実施形態において、AAVは、表1に記載されるとおりの配列、断片または変異体によってコードされてもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV9(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号2および11または本明細書におけるそれぞれ配列番号135および136)、PHP.B(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号8および9、本明細書における配列番号3および4)、G2B-13(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号12、本明細書における配列番号5)、G2B-26(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号13、本明細書における配列番号3)、TH1.1-32(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号14、本明細書における配列番号6)、TH1.1-35(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号15、本明細書における配列番号7)またはそれらの変異体など、国際公開第2015038958号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。更に、国際公開第2015038958号パンフレットに記載されるターゲティングペプチドまたはアミノ酸インサートのいずれかが、限定はされないが、AAV9(DNA配列について配列番号135およびアミノ酸配列について配列番号136)など、任意の親AAV血清型に挿入されてもよい。一実施形態において、アミノ酸インサートは親AAV(例えばAAV9)のアミノ酸586~592に挿入される。別の実施形態において、アミノ酸インサートは親AAV配列のアミノ酸588~589に挿入される。アミノ酸インサートは、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、TLAVPFK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号1;本明細書における配列番号1260)、KFPVALT(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号3;本明細書における配列番号1261)、LAVPFK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号31;本明細書における配列番号1262)、AVPFK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号32;本明細書における配列番号1263)、VPFK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号33;本明細書における配列番号1264)、TLAVPF(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号34;本明細書における配列番号1265)、TLAVP(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号35;本明細書における配列番号1266)、TLAV(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号36;本明細書における配列番号1267)、SVSKPFL(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号28;本明細書における配列番号1268)、FTLTTPK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号29;本明細書における配列番号1269)、MNATKNV(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号30;本明細書における配列番号1270)、QSSQTPR(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号54;本明細書における配列番号1271)、ILGTGTS(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号55;本明細書における配列番号1272)、TRTNPEA(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号56;本明細書における配列番号1273)、NGGTSSS(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号58;本明細書における配列番号1274)、またはYTLSQGW(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号60;本明細書における配列番号1275)のいずれかであってもよい。アミノ酸インサートをコードし得るヌクレオチド配列の非限定的な例としては、以下、AAGTTTCCTGTGGCGTTGACT(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号3について;本明細書における配列番号1276)、ACTTTGGCGGTGCCTTTTAAG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号24および49;本明細書における配列番号1277)、AGTGTGAGTAAGCCTTTTTTG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号25;本明細書における配列番号1278)、TTTACGTTGACGACGCCTAAG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号26;本明細書における配列番号1279)、ATGAATGCTACGAAGAATGTG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号27;本明細書における配列番号1280)、CAGTCGTCGCAGACGCCTAGG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号48;本明細書における配列番号1281)、ATTCTGGGGACTGGTACTTCG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号50および52;本明細書における配列番号1282)、ACGCGGACTAATCCTGAGGCT(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号51;本明細書における配列番号1283)、AATGGGGGGACTAGTAGTTCT(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号53;本明細書における配列番号1284)、またはTATACTTTGTCGCAGGGTTGG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号59;本明細書における配列番号1285)が挙げられる。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV9(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号45、本明細書における配列番号9)、PHP.N(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号46、本明細書における配列番号2)、PHP.S(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号47、本明細書における配列番号8)、またはそれらの変異体など、国際公開第2017100671号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの配列であってもよくまたはそれを有していてもよい。更に、国際公開第2017100671号パンフレットに記載されるターゲティングペプチドまたはアミノ酸インサートのいずれかが、限定はされないが、AAV9(配列番号9または配列番号131)など、任意の親AAV血清型に挿入されてもよい。一実施形態において、アミノ酸インサートは、親AAV(例えば、AAV9)のアミノ酸586~592に挿入される。別の実施形態において、アミノ酸インサートは、親AAV配列のアミノ酸588~589に挿入される。アミノ酸インサートは、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、AQTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号1;本明細書における配列番号1286)、AQSVSKPFLAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号2;本明細書における配列番号1287)、AQFTLTTPKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列表の配列番号3;本明細書における配列番号1288)、DGTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列表の配列番号4;本明細書における配列番号1289)、ESTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号5;本明細書における配列番号1290)、GGTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号6;本明細書における配列番号1291)、AQTLATPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号7および33;本明細書における配列番号1292)、ATTLATPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号8;本明細書における配列番号1293)、DGTLATPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号9;本明細書における配列番号1294)、GGTLATPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号10;本明細書における配列番号1295)、SGSLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号11;本明細書における配列番号1296)、AQTLAQPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号12;本明細書における配列番号1297),AQTLQQPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号13;本明細書における配列番号1298)、AQTLSNPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号14;本明細書における配列番号1299)、AQTLAVPFSNP(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号15;本明細書における配列番号1300)、QGTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号16;本明細書における配列番号1301)、NQTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号17;本明細書における配列番号1302)、EGSLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号18;本明細書における配列番号1303)、SGNLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号19;本明細書における配列番号1304)、EGTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号20;本明細書における配列番号1305)、DSTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの表1の配列番号21;本明細書における配列番号1306)、AVTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号22;本明細書における配列番号1307)、AQTLSTPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号23;本明細書における配列番号1308)、AQTLPQPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号24および32;本明細書における配列番号1309)、AQTLSQPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号25;本明細書における配列番号1310)、AQTLQLPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号26;本明細書における配列番号1311)、AQTLTMPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号27および34、ならびに国際公開第2017100671号パンフレットの配列表の配列番号35;本明細書における配列番号1312)、AQTLTTPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号28;本明細書における配列番号1313)、AQYTLSQGWAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号29;本明細書における配列番号1314)、AQMNATKNVAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号30;本明細書における配列番号1315)、AQVSGGHHSAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号31;本明細書における配列番号1316)、AQTLTAPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの表1の配列番号35;本明細書における配列番号1317)、AQTLSKPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号36;本明細書における配列番号1318)、QAVRTSL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号37;本明細書における配列番号1319)、YTLSQGW(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号38;本明細書における配列番号1275)、LAKERLS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号39;本明細書における配列番号1320)、TLAVPFK(国際公開第2017100671号パンフレットの配列表の配列番号40;本明細書における配列番号1260)、SVSKPFL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号41;本明細書における配列番号1268)、FTLTTPK(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号42;本明細書における配列番号1269)、MNSTKNV(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号43;本明細書における配列番号1321)、VSGGHHS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号44;本明細書における配列番号1322)、SAQTLAVPFKAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号48;本明細書における配列番号1323)、SXXXLAVPFKAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号49、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1324)、SAQXXXVPFKAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号50、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1325)、SAQTLXXXFKAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号51、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1326)、SAQTLAVXXXAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号52、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1327)、SAQTLAVPFXXXAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号53、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1328)、TNHQSAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号65;本明細書における配列番号1329)、AQAQTGW(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号66;本明細書における配列番号1330)、DGTLATPFK(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号67;本明細書における配列番号1331)、DGTLATPFKXX(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号68、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1332)、LAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号80;本明細書における配列番号1333)、VPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号81;本明細書における配列番号1334)、FKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号82;本明細書における配列番号1335)、AQTLAV(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号83;本明細書における配列番号1336)、AQTLAVPF(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号84;本明細書における配列番号1337)、QAVR(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号85;本明細書における配列番号1338)、AVRT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号86;本明細書における配列番号1339)、VRTS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号87;本明細書における配列番号1340)、RTSL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号88;本明細書における配列番号1341)、QAVRT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号89;本明細書における配列番号1342)、AVRTS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号90;本明細書における配列番号1343)、VRTSL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号91;本明細書における配列番号1344)、QAVRTS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号92;本明細書における配列番号1345)、またはAVRTSL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号93;本明細書における配列番号1346)のいずれであってもよい。
アミノ酸インサートをコードし得るヌクレオチド配列の非限定的な例としては、以下、GATGGGACTTTGGCGGTGCCTTTTAAGGCACAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号54;本明細書における配列番号1347)、GATGGGACGTTGGCGGTGCCTTTTAAGGCACAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号55;本明細書における配列番号1348)、CAGGCGGTTAGGACGTCTTTG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号56;本明細書における配列番号1349)、CAGGTCTTCACGGACTCAGACTATCAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号57および78;本明細書における配列番号1350)、CAAGTAAAACCTCTACAAATGTGGTAAAATCG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号58;本明細書における配列番号1351)、ACTCATCGACCAATACTTGTACTATCTCTCTAGAAC(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号59;本明細書における配列番号1352)、GGAAGTATTCCTTGGTTTTGAACCCA(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号60;本明細書における配列番号1353)、GGTCGCGGTTCTTGTTTGTGGAT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号61;本明細書における配列番号1354)、CGACCTTGAAGCGCATGAACTCCT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号62;本明細書における配列番号1355)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCCTGTGCMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNTTGGGCACTCTGGTGGTTTGTC(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号63、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1356)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCMNNMNNMNNAAAAGGCACCGCCAAAGTTTG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号69、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1357)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCCTGTGCMNNMNNMNNCACCGCCAAAGTTTGGGCACT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号70、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1358)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCCTGTGCCTTAAAMNNMNNMNNCAAAGTTTGGGCACTCTGGTGG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号71、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1359)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCCTGTGCCTTAAAAGGCACMNNMNNMNNTTGGGCACTCTGGTGGTTTGTG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号72、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1360)、ACTTTGGCGGTGCCTTTTAAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号74;本明細書における配列番号1277)、AGTGTGAGTAAGCCTTTTTTG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号75;本明細書における配列番号1278)、TTTACGTTGACGACGCCTAAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号76;本明細書における配列番号1279)、TATACTTTGTCGCAGGGTTGG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号77;本明細書における配列番号1285)、またはCTTGCGAAGGAGCGGCTTTCG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号79;本明細書における配列番号1361)が挙げられる。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV1(米国特許第9624274号明細書の配列番号181)、AAV6(米国特許第9624274号明細書の配列番号182)、AAV2(米国特許第9624274号明細書の配列番号183)、AAV3b(米国特許第9624274号明細書の配列番号184)、AAV7(米国特許第9624274号明細書の配列番号185)、AAV8(米国特許第9624274号明細書の配列番号186)、AAV10(米国特許第9624274号明細書の配列番号187)、AAV4(米国特許第9624274号明細書の配列番号188)、AAV11(米国特許第9624274号明細書の配列番号189)、bAAV(米国特許第9624274号明細書の配列番号190)、AAV5(米国特許第9624274号明細書の配列番号191)、GPV(米国特許第9624274号明細書の配列番号192;本明細書における配列番号992)、B19(米国特許第9624274号明細書の配列番号193;本明細書における配列番号993)、MVM(米国特許第9624274号明細書の配列番号194;本明細書における配列番号994)、FPV(米国特許第9624274号明細書の配列番号195;本明細書における配列番号995)、CPV(米国特許第9624274号明細書の配列番号196;本明細書における配列番号996)、またはそれらの変異体など、米国特許第9624274号明細書(その内容は本明細書において本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの配列であってもよくまたはそれを有していてもよい。更に、米国特許第9624274号明細書に記載される構造タンパク質インサートのいずれかが、限定はされないが、AAV2(米国特許第9624274号明細書の配列番号183)などの任意の親AAV血清型の、限定はされないが、I-453およびI-587に挿入されてもよい。アミノ酸インサートは、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、VNLTWSRASG(米国特許第9624274号明細書の配列番号50;本明細書における配列番号1362)、EFCINHRGYWVCGD(米国特許第9624274号明細書の配列番号55;本明細書における配列番号1363)、EDGQVMDVDLS(米国特許第9624274号明細書の配列番号85;本明細書における配列番号1364)、EKQRNGTLT(米国特許第9624274号明細書の配列番号86;本明細書における配列番号1365)、TYQCRVTHPHLPRALMR(米国特許第9624274号明細書の配列番号87;本明細書における配列番号1366)、RHSTTQPRKTKGSG(米国特許第9624274号明細書の配列番号88;本明細書における配列番号1367)、DSNPRGVSAYLSR(米国特許第9624274号明細書の配列番号89;本明細書における配列番号1368)、TITCLWDLAPSK(米国特許第9624274号明細書の配列番号90;本明細書における配列番号1369)、KTKGSGFFVF(米国特許第9624274号明細書の配列番号91;本明細書における配列番号1370)、THPHLPRALMRS(米国特許第9624274号明細書の配列番号92;本明細書における配列番号1371)、GETYQCRVTHPHLPRALMRSTTK(米国特許第9624274号明細書の配列番号93;本明細書における配列番号1372)、LPRALMRS(米国特許第9624274号明細書の配列番号94;本明細書における配列番号1373)、INHRGYWV(米国特許第9624274号明細書の配列番号95;本明細書における配列番号1374)、CDAGSVRTNAPD(米国特許第9624274号明細書の配列番号60;本明細書における配列番号1375)、AKAVSNLTESRSESLQS(米国特許第9624274号明細書の配列番号96;本明細書における配列番号1376)、SLTGDEFKKVLET(米国特許第9624274号明細書の配列番号97;本明細書における配列番号1377)、REAVAYRFEED(米国特許第9624274号明細書の配列番号98;本明細書における配列番号1378)、INPEIITLDG(米国特許第9624274号明細書の配列番号99;本明細書における配列番号1379)、DISVTGAPVITATYL(米国特許第9624274号明細書の配列番号100;本明細書における配列番号1380)、DISVTGAPVITA(米国特許第9624274号明細書の配列番号101;本明細書における配列番号1381)、PKTVSNLTESSSESVQS(米国特許第9624274号明細書の配列番号102;本明細書における配列番号1382)、SLMGDEFKAVLET(米国特許第9624274号明細書の配列番号103;本明細書における配列番号1383)、QHSVAYTFEED(米国特許第9624274号明細書の配列番号104;本明細書における配列番号1384)、INPEIITRDG(米国特許第9624274号明細書の配列番号105;本明細書における配列番号1385)、DISLTGDPVITASYL(米国特許第9624274号明細書の配列番号106;本明細書における配列番号1386)、DISLTGDPVITA(米国特許第9624274号明細書の配列番号107;本明細書における配列番号1387)、DQSIDFEIDSA(米国特許第9624274号明細書の配列番号108;本明細書における配列番号1388)、KNVSEDLPLPTFSPTLLGDS(米国特許第9624274号明細書の配列番号109;本明細書における配列番号1389)、KNVSEDLPLPT(米国特許第9624274号明細書の配列番号110;本明細書における配列番号1390)、CDSGRVRTDAPD(米国特許第9624274号明細書の配列番号111;本明細書における配列番号1391)、FPEHLLVDFLQSLS(米国特許第9624274号明細書の配列番号112;本明細書における配列番号1392)、DAEFRHDSG(米国特許第9624274号明細書の配列番号65;本明細書における配列番号1393)、HYAAAQWDFGNTMCQL(米国特許第9624274号明細書の配列番号113;本明細書における配列番号1394)、YAAQWDFGNTMCQ(米国特許第9624274号明細書の配列番号114;本明細書における配列番号1395)、RSQKEGLHYT(米国特許第9624274号明細書の配列番号115;本明細書における配列番号1386)、SSRTPSDKPVAHWANPQAE(米国特許第9624274号明細書の配列番号116;本明細書における配列番号1397)、SRTPSDKPVAHWANP(米国特許第9624274号明細書の配列番号117;本明細書における配列番号1398)、SSRTPSDKP(米国特許第9624274号明細書の配列番号118;本明細書における配列番号1399)、NADGNVDYHMNSVP(米国特許第9624274号明細書の配列番号119;本明細書における配列番号1400)、DGNVDYHMNSV(米国特許第9624274号明細書の配列番号120;本明細書における配列番号1401)、RSFKEFLQSSLRALRQ(米国特許第9624274号明細書の配列番号121;本明細書における配列番号1402)、FKEFLQSSLRA(米国特許第9624274号明細書の配列番号122;本明細書における配列番号1403)、またはQMWAPQWGPD(米国特許第9624274号明細書の配列番号123;本明細書における配列番号1404)のいずれであってもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、天然AAV2カプシドタンパク質のアミノ酸585~590位に1つ以上のアミノ酸の修飾を含むAAVカプシドタンパク質など、米国特許第9475845号明細書(その内容は本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの配列であってもよくまたはそれを有していてもよい。更に、修飾は、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、RGNRQA(米国特許第9475845号明細書の配列番号3;本明細書における配列番号1405)、SSSTDP(米国特許第9475845号明細書の配列番号4;本明細書における配列番号1406)、SSNTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号5;本明細書における配列番号1407)、SNSNLP(米国特許第9475845号明細書の配列番号6;本明細書における配列番号1408)、SSTTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号7;本明細書における配列番号1409)、AANTAA(米国特許第9475845号明細書の配列番号8;本明細書における配列番号1410)、QQNTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号9;本明細書における配列番号1411)、SAQAQA(米国特許第9475845号明細書の配列番号10;本明細書における配列番号1412)、QANTGP(米国特許第9475845号明細書の配列番号11;本明細書における配列番号1413)、NATTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号12;本明細書における配列番号1414)、SSTAGP(米国特許第9475845号明細書の配列番号13および20;本明細書における配列番号1415)、QQNTAA(米国特許第9475845号明細書の配列番号14;本明細書における配列番号1416)、PSTAGP(米国特許第9475845号明細書の配列番号15;本明細書における配列番号1417)、NQNTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号16;本明細書における配列番号1418)、QAANAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号17;本明細書における配列番号1419)、SIVGLP(米国特許第9475845号明細書の配列番号18;本明細書における配列番号1420)、AASTAA(米国特許第9475845号明細書の配列番号19および27;本明細書における配列番号1421)、SQNTTA(米国特許第9475845号明細書の配列番号21;本明細書における配列番号1422)、QQDTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号22;本明細書における配列番号1423)、QTNTGP(米国特許第9475845号明細書の配列番号23;本明細書における配列番号1424)、QTNGAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号24;本明細書における配列番号1425)、QQNAAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号25;本明細書における配列番号1426)、またはAANTQA(米国特許第9475845号明細書の配列番号26;本明細書における配列番号1427)をもたらし得る。一実施形態において、アミノ酸修飾は、天然AAV2カプシドタンパク質のアミノ酸262~265位、またはターゲティング配列を有する別のAAVのカプシドタンパク質の対応する位置における置換である。ターゲティング配列は、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、NGRAHA(米国特許第9475845号明細書の配列番号38;本明細書における配列番号1428)、QPEHSST(米国特許第9475845号明細書の配列番号39および50;本明細書における配列番号1429)、VNTANST(米国特許第9475845号明細書の配列番号40;本明細書における配列番号1430)、HGPMQKS(米国特許第9475845号明細書の配列番号41;本明細書における配列番号1431)、PHKPPLA(米国特許第9475845号明細書の配列番号42;本明細書における配列番号1432)、IKNNEMW(米国特許第9475845号明細書の配列番号43;本明細書における配列番号1433)、RNLDTPM(米国特許第9475845号明細書の配列番号44;本明細書における配列番号1434)、VDSHRQS(米国特許第9475845号明細書の配列番号45;本明細書における配列番号1435)、YDSKTKT(米国特許第9475845号明細書の配列番号46;本明細書における配列番号1436)、SQLPHQK(米国特許第9475845号明細書の配列番号47;本明細書における配列番号1437)、STMQQNT(米国特許第9475845号明細書の配列番号48;本明細書における配列番号1438)、TERYMTQ(米国特許第9475845号明細書の配列番号49;本明細書における配列番号1439)、DASLSTS(米国特許第9475845号明細書の配列番号51;本明細書における配列番号1440)、DLPNKKT(米国特許第9475845号明細書の配列番号52;本明細書における配列番号1441)、DLTAARL(米国特許第9475845号明細書の配列番号53;本明細書における配列番号1442)、EPHQFNY(米国特許第9475845号明細書の配列番号54;本明細書における配列番号1443)、EPQSNHT(米国特許第9475845号明細書の配列番号55;本明細書における配列番号1444)、MSSWPSQ(米国特許第9475845号明細書の配列番号56;本明細書における配列番号1445)、NPKHNAT(米国特許第9475845号明細書の配列番号57;本明細書における配列番号1446)、PDGMRTT(米国特許第9475845号明細書の配列番号58;本明細書における配列番号1447)、PNNNKTT(米国特許第9475845号明細書の配列番号59;本明細書における配列番号1448)、QSTTHDS(米国特許第9475845号明細書の配列番号60;本明細書における配列番号1449)、TGSKQKQ(米国特許第9475845号明細書の配列番号61;本明細書における配列番号1450)、SLKHQAL(米国特許第9475845号明細書の配列番号62;本明細書における配列番号1451)、SPIDGEQ(米国特許第9475845号明細書の配列番号63;本明細書における配列番号1452)、WIFPWIQL(米国特許第9475845号明細書の配列番号64および112;本明細書における配列番号1453)、CDCRGDCFC(米国特許第9475845号明細書の配列番号65;本明細書における配列番号1454)、CNGRC(米国特許第9475845号明細書の配列番号66;本明細書における配列番号1455)、CPRECES(米国特許第9475845号明細書の配列番号67;本明細書における配列番号1456)、CTTHWGFTLC(米国特許第9475845号明細書の配列番号68および123;本明細書における配列番号1457)、CGRRAGGSC(米国特許第9475845号明細書の配列番号69;本明細書における配列番号1458)、CKGGRAKDC(米国特許第9475845号明細書の配列番号70;本明細書における配列番号1459)、CVPELGHEC(米国特許第9475845号明細書の配列番号71および115;本明細書における配列番号1460)、CRRETAWAK(米国特許第9475845号明細書の配列番号72;本明細書における配列番号1461)、VSWFSHRYSPFAVS(米国特許第9475845号明細書の配列番号73;本明細書における配列番号1462)、GYRDGYAGPILYN(米国特許第9475845号明細書の配列番号74;本明細書における配列番号1463)、XXXYXXX(米国特許第9475845号明細書の配列番号75;本明細書における配列番号1464)、YXNW(米国特許第9475845号明細書の配列番号76;本明細書における配列番号1465)、RPLPPLP(米国特許第9475845号明細書の配列番号77;本明細書における配列番号1466)、APPLPPR(米国特許第9475845号明細書の配列番号78;本明細書における配列番号1467)、DVFYPYPYASGS(米国特許第9475845号明細書の配列番号79;本明細書における配列番号1468)、MYWYPY(米国特許第9475845号明細書の配列番号80;本明細書における配列番号1469)、DITWDQLWDLMK(米国特許第9475845号明細書の配列番号81;本明細書における配列番号1470)、CWDDXWLC(米国特許第9475845号明細書の配列番号82;本明細書における配列番号1471)、EWCEYLGGYLRCYA(米国特許第9475845号明細書の配列番号83;本明細書における配列番号1472)、YXCXXGPXTWXCXP(米国特許第9475845号明細書の配列番号84;本明細書における配列番号1473)、IEGPTLRQWLAARA(米国特許第9475845号明細書の配列番号85;本明細書における配列番号1474)、LWXXX(米国特許第9475845号明細書の配列番号86;本明細書における配列番号1475)、XFXXYLW(米国特許第9475845号明細書の配列番号87;本明細書における配列番号1476)、SSIISHFRWGLCD(米国特許第9475845号明細書の配列番号88;本明細書における配列番号1477)、MSRPACPPNDKYE(米国特許第9475845号明細書の配列番号89;本明細書における配列番号1478)、CLRSGRGC(米国特許第9475845号明細書の配列番号90;本明細書における配列番号1479)、CHWMFSPWC(米国特許第9475845号明細書の配列番号91;本明細書における配列番号1480)、WXXF(米国特許第9475845号明細書の配列番号92;本明細書における配列番号1481)、CSSRLDAC(米国特許第9475845号明細書の配列番号93;本明細書における配列番号1482)、CLPVASC(米国特許第9475845号明細書の配列番号94;本明細書における配列番号1483)、CGFECVRQCPERC(米国特許第9475845号明細書の配列番号95;本明細書における配列番号1484)、CVALCREACGEGC(米国特許第9475845号明細書の配列番号96;本明細書における配列番号1485)、SWCEPGWCR(米国特許第9475845号明細書の配列番号97;本明細書における配列番号1486)、YSGKWGW(米国特許第9475845号明細書の配列番号98;本明細書における配列番号1487)、GLSGGRS(米国特許第9475845号明細書の配列番号99;本明細書における配列番号1488)、LMLPRAD(米国特許第9475845号明細書の配列番号100;本明細書における配列番号1489)、CSCFRDVCC(米国特許第9475845号明細書の配列番号101;本明細書における配列番号1490)、CRDVVSVIC(米国特許第9475845号明細書の配列番号102;本明細書における配列番号1491)、MARSGL(米国特許第9475845号明細書の配列番号103;本明細書における配列番号1492)、MARAKE(米国特許第9475845号明細書の配列番号104;本明細書における配列番号1493)、MSRTMS(米国特許第9475845号明細書の配列番号105;本明細書における配列番号1494)、KCCYSL(米国特許第9475845号明細書の配列番号106;本明細書における配列番号1495)、MYWGDSHWLQYWYE(米国特許第9475845号明細書の配列番号107;本明細書における配列番号1496)、MQLPLAT(米国特許第9475845号明細書の配列番号108;本明細書における配列番号1497)、EWLS(米国特許第9475845号明細書の配列番号109;本明細書における配列番号1498
)、SNEW(米国特許第9475845号明細書の配列番号110;本明細書における配列番号1499)、TNYL(米国特許第9475845号明細書の配列番号111;本明細書における配列番号1500)、WDLAWMFRLPVG(米国特許第9475845号明細書の配列番号113;本明細書における配列番号1501)、CTVALPGGYVRVC(米国特許第9475845号明細書の配列番号114;本明細書における配列番号1502)、CVAYCIEHHCWTC(米国特許第9475845号明細書の配列番号116;本明細書における配列番号1503)、CVFAHNYDYLVC(米国特許第9475845号明細書の配列番号117;本明細書における配列番号1504)、CVFTSNYAFC(米国特許第9475845号明細書の配列番号118;本明細書における配列番号1505)、VHSPNKK(米国特許第9475845号明細書の配列番号119;本明細書における配列番号1506)、CRGDGWC(米国特許第9475845号明細書の配列番号120;本明細書における配列番号1507)、XRGCDX(米国特許第9475845号明細書の配列番号121;本明細書における配列番号1508)、PXXX(米国特許第9475845号明細書の配列番号122;本明細書における配列番号1509)、SGKGPRQITAL(米国特許第9475845号明細書の配列番号124;本明細書における配列番号1510)、AAAAAAAAAXXXXX(米国特許第9475845号明細書の配列番号125;本明細書における配列番号1511)、VYMSPF(米国特許第9475845号明細書の配列番号126;本明細書における配列番号1512)、ATWLPPR(米国特許第9475845号明細書の配列番号127;本明細書における配列番号1513)、HTMYYHHYQHHL(米国特許第9475845号明細書の配列番号128;本明細書における配列番号1514)、SEVGCRAGPLQWLCEKYFG(米国特許第9475845号明細書の配列番号129;本明細書における配列番号1515)、CGLLPVGRPDRNVWRWLC(米国特許第9475845号明細書の配列番号130;本明細書における配列番号1516)、CKGQCDRFKGLPWEC(米国特許第9475845号明細書の配列番号131;本明細書における配列番号1517)、SGRSA(米国特許第9475845号明細書の配列番号132;本明細書における配列番号1518)、WGFP(米国特許第9475845号明細書の配列番号133;本明細書における配列番号1519)、AEPMPHSLNFSQYLWYT(米国特許第9475845号明細書の配列番号134;本明細書における配列番号1520)、WAYXSP(米国特許第9475845号明細書の配列番号135;本明細書における配列番号1521)、IELLQAR(米国特許第9475845号明細書の配列番号136;本明細書における配列番号1522)、AYTKCSRQWRTCMTTH(米国特許第9475845号明細書の配列番号137;本明細書における配列番号1523)、PQNSKIPGPTFLDPH(米国特許第9475845号明細書の配列番号138;本明細書における配列番号1524)、SMEPALPDWWWKMFK(米国特許第9475845号明細書の配列番号139;本明細書における配列番号1525)、ANTPCGPYTHDCPVKR(米国特許第9475845号明細書の配列番号140;本明細書における配列番号1526)、TACHQHVRMVRP(米国特許第9475845号明細書の配列番号141;本明細書における配列番号1527)、VPWMEPAYQRFL(米国特許第9475845号明細書の配列番号142;本明細書における配列番号1528)、DPRATPGS(米国特許第9475845号明細書の配列番号143;本明細書における配列番号1529)、FRPNRAQDYNTN(米国特許第9475845号明細書の配列番号144;本明細書における配列番号1530)、CTKNSYLMC(米国特許第9475845号明細書の配列番号145;本明細書における配列番号1531)、CXXTXXXGXGC(米国特許第9475845号明細書の配列番号146;本明細書における配列番号1532)、CPIEDRPMC(米国特許第9475845号明細書の配列番号147;本明細書における配列番号1533)、HEWSYLAPYPWF(米国特許第9475845号明細書の配列番号148;本明細書における配列番号1534)、MCPKHPLGC(米国特許第9475845号明細書の配列番号149;本明細書における配列番号1535)、RMWPSSTVNLSAGRR(米国特許第9475845号明細書の配列番号150;本明細書における配列番号1536)、SAKTAVSQRVWLPSHRGGEP(米国特許第9475845号明細書の配列番号151;本明細書における配列番号1537)、KSREHVNNSACPSKRITAAL(米国特許第9475845号明細書の配列番号152;本明細書における配列番号1538)、EGFR(米国特許第9475845号明細書の配列番号153;本明細書における配列番号1539)、AGLGVR(米国特許第9475845号明細書の配列番号154;本明細書における配列番号1540)、GTRQGHTMRLGVSDG(米国特許第9475845号明細書の配列番号155;本明細書における配列番号1541)、IAGLATPGWSHWLAL(米国特許第9475845号明細書の配列番号156;本明細書における配列番号1542)、SMSIARL(米国特許第9475845号明細書の配列番号157;本明細書における配列番号1543)、HTFEPGV(米国特許第9475845号明細書の配列番号158;本明細書における配列番号1544)、NTSLKRISNKRIRRK(米国特許第9475845号明細書の配列番号159;本明細書における配列番号1545)、LRIKRKRRKRKKTRK(米国特許第9475845号明細書の配列番号160;本明細書における配列番号1546)、GGG、GFS、LWS、EGG、LLV、LSP、LBS、AGG、GRR、GGHおよびGTVのいずれであってもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV2(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号97;本明細書における配列番号1547)またはその変異体の部位特異的突然変異カプシドタンパク質であって、特異的部位が、VP1またはその断片の部位R447、G453、S578、N587、N587+1、S662から選択される少なくとも1つの部位であるものなど、米国特許出願公開第20160369298号明細書(その内容は本明細書において本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの配列であってもよくまたはそれを有してしてもよい。
更に、米国特許出願公開第20160369298号明細書に記載される突然変異配列のいずれかが、限定はされないが、以下の配列、SDSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号1および配列番号231;本明細書における配列番号1548)、SPSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号2;本明細書における配列番号1549)、SHSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号3;本明細書における配列番号1550)、SRSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号4;本明細書における配列番号1551)、SKSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号5;本明細書における配列番号1552)、SNSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号6;本明細書における配列番号1553)、SGSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号7;本明細書における配列番号1554)、SASGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号8、175、および221;本明細書における配列番号1555)、SESGTSN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号9;本明細書における配列番号1556)、STTGGSN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号10;本明細書における配列番号1557)、SSAGSTN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号11;本明細書における配列番号1558)、NNDSQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号12;本明細書における配列番号1559)、NNRNQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号13;本明細書における配列番号1560)、NNNKQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号14;本明細書における配列番号1561)、NAKRQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号15;本明細書における配列番号1562)、NDEHQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号16;本明細書における配列番号1563)、NTSQKA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号17;本明細書における配列番号1564)、YYLSRTNTPSGTDTQSRLVFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号18;本明細書における配列番号1565)、YYLSRTNTDSGTETQSGLDFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号19;本明細書における配列番号1566)、YYLSRTNTESGTPTQSALEFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号20;本明細書における配列番号1567)、YYLSRTNTHSGTHTQSPLHFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号21;本明細書における配列番号1568)、YYLSRTNTSSGTITISHLIFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号22;本明細書における配列番号1569)、YYLSRTNTRSGIMTKSSLMFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号23;本明細書における配列番号1570)、YYLSRTNTKSGRKTLSNLSFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号24;本明細書における配列番号1571)、YYLSRTNDGSGPVTPSKLRFSQRGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号25;本明細書における配列番号1572)、YYLSRTNAASGHATHSDLKFSQPGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号26;本明細書における配列番号1573)、YYLSRTNGQAGSLTMSELGFSQVGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号27;本明細書における配列番号1574)、YYLSRTNSTGGNQTTSQLLFSQLSA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号28;本明細書における配列番号1575)、YFLSRTNNNTGLNTNSTLNFSQGRA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号29;本明細書における配列番号1576)、SKTGADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号30;本明細書における配列番号1577)、SKTDADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号31;本明細書における配列番号1578)、SKTEADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号32;本明細書における配列番号1579)、SKTPADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号33;本明細書における配列番号1580)、SKTHADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号34;本明細書における配列番号1581)、SKTQADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号35;本明細書における配列番号1582)、SKTIADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号36;本明細書における配列番号1583)、SKTMADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号37;本明細書における配列番号1584)、SKTRADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号38;本明細書における配列番号1585)、SKTNADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号39;本明細書における配列番号1586)、SKTVGRNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号40;本明細書における配列番号1587)、SKTADRNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号41;本明細書における配列番号1588)、SKKLSQNNNSKYSWQG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号42;本明細書における配列番号1589)、SKPTTGNNNSDYSWPG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号43;本明細書における配列番号1590)、STQKNENNNSNYSWPG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号44;本明細書における配列番号1591)、HKDDEGKF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号45;本明細書における配列番号1592)、HKDDNRKF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号46;本明細書における配列番号1593)、HKDDTNKF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号47;本明細書における配列番号1594)、HEDSDKNF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号48;本明細書における配列番号1595)、HRDGADSF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号49;本明細書における配列番号1596)、HGDNKSRF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号50;本明細書における配列番号1597)、KQGSEKTNVDFEEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号51;本明細書における配列番号1598)、KQGSEKTNVDSEEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号52;本明細書における配列番号1599)、KQGSEKTNVDVEEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号53;本明細書における配列番号1600)、KQGSDKTNVDDAGV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号54;本明細書における配列番号1601)、KQGSSKTNVDPREV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号55;本明細書における配列番号1602)、KQGSRKTNVDHKQV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号56;本明細書における配列番号1603)、KQGSKGGNVDTNRV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号57;本明細書における配列番号1604)、KQGSGEANVDNGDV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号58;本明細書における配列番号1605)、KQDAAADNIDYDHV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号59;本明細書における配列番号1606)、KQSGTRSNAAASSV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号60;本明細書における配列番号1607)、KENTNTNDTELTNV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号61;本明細書における配列番号1608)、QRGNNVAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号62;本明細書における配列番号1609)、QRGNNEAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号63;本明細書における配列番号1610)、QRGNNPAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号64;本明細書における配列番号1611)、QRGNNHAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号65;本明細書における配列番号1612)、QEENNIAATPGVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号66;本明細書における配列番号1613)、QPPNNMAATHEVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号67;本明細書における配列番号1614)、QHHNNSAATTIVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号68;本明細書における配列番号1615)、QTTNNRAAFNMVET(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号69;本明細書における配列番号1616)、QKKNNNAASKKVAT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号70;本明細書における配列番号1617)、QGGNNKAADDAVKT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号71;本明細書における配列番号1618)、QAAKGGAADDAVKT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号72;本明細書における配列番号1619)、QDDRAAAANESVDT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号73;本明細書における配列番号1620)、QQQHDDAAYQRVHT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号74;本明細書における配列番号1621)、QSSSSLAAVSTVQT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号75;本明細書における配列番号1622)、QNNQTTAAIRNVTT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号76;本明細書における配列番号1623)、NYNKKSDNVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号77;本明細書における配列番号1624)、NYNKKSENVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号7
8;本明細書における配列番号1625)、NYNKKSLNVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号79;本明細書における配列番号1626)、NYNKKSPNVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号80;本明細書における配列番号1627)、NYSKKSHCVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号81;本明細書における配列番号1628)、NYRKTIYVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号82;本明細書における配列番号1629)、NYKEKKDVHFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号83;本明細書における配列番号1630)、NYGHRAIVQFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号84;本明細書における配列番号1631)、NYANHQFVVCT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号85;本明細書における配列番号1632)、NYDDDPTGVLLT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号86;本明細書における配列番号1633)、NYDDPTGVLLT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号87;本明細書における配列番号1634)、NFEQQNSVEWT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号88;本明細書における配列番号1635)、SQSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号89および配列番号241;本明細書における配列番号1636)、NNGSQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号90;本明細書における配列番号1637)、YYLSRTNTPSGTTTWSRLQFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号91;本明細書における配列番号1638)、SKTSADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号92;本明細書における配列番号1639)、HKDDEEKF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号93、209、214、219、224、234、239、および244;本明細書における配列番号1640)、KQGSEKTNVDIEEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号94;本明細書における配列番号1641)、QRGNNQAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号95;本明細書における配列番号1642)、NYNKKSVNVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号96;本明細書における配列番号1643)、SQSGASNYNTPSGTTTQSRLQFSTSADNNNSEYSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号106;本明細書における配列番号1644)、SASGASNFNSEGGSLTQSSLGFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号107;本明細書における配列番号1645)、SQSGASNYNTPSGTTTQSRLQFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号108;本明細書における配列番号1646)、SASGASNYNTPSGTTTQSRLQFSTSADNNNSEFSWPGATTYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号109;本明細書における配列番号1647)、SQSGASNFNSEGGSLTQSSLGFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号110;本明細書における配列番号1648)、SASGASNYNTPSGSLTQSSLGFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号111;本明細書における配列番号1649)、SQSGASNYNTPSGTTTQSRLQFSTSADNNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号112;本明細書における配列番号1650)、SGAGASNFNSEGGSLTQSSLGFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号113;本明細書における配列番号1651)、SGAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号176;本明細書における配列番号1652)、NSEGGSLTQSSLGFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号177、185、193、および202;本明細書における配列番号1653)、TDGENNNSDFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号178;本明細書における配列番号1654)、SEFSWPGATT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号179;本明細書における配列番号1655)、TSADNNNSDFSWT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号180;本明細書における配列番号1656)、SQSGASNY(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号181、187、および198;本明細書における配列番号1657)、NTPSGTTTQSRLQFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号182、188、191、および199;本明細書における配列番号1658)、TSADNNNSEYSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号183;本明細書における配列番号1659)、SASGASNF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号184;本明細書における配列番号1660)、TDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号186、189、194、197、および203;本明細書における配列番号1661)、SASGASNY(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号190および配列番号195;本明細書における配列番号1662)、TSADNNNSEFSWPGATTYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号192;本明細書における配列番号1663)、NTPSGSLTQSSLGFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号196、;本明細書における配列番号1664)、TSADNNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号200;本明細書における配列番号1665)、SGAGASNF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号201;本明細書における配列番号1666)、CTCCAGVVSVVSMRSRVCVNSGCAGCTDHCVVSRNSGTCVMSACACAA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号204;本明細書における配列番号1667)、CTCCAGAGAGGCAACAGACAAGCAGCTACCGCAGATGTCAACACACAA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号205;本明細書における配列番号1668)、SAAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号206;本明細書における配列番号1669)、YFLSRTNTESGSTTQSTLRFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号207;本明細書における配列番号1670)、SKTSADNNNSDFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号208、228、および253;本明細書における配列番号1671)、KQGSEKTDVDIDKV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号210;本明細書における配列番号1672)、STAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号211;本明細書における配列番号1673)、YFLSRTNTTSGIETQSTLRFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号212および配列番号247;本明細書における配列番号1674)、SKTDGENNNSDFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号213および配列番号248;本明細書における配列番号1675)、KQGAAADDVEIDGV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号215および配列番号250;本明細書における配列番号1676)、SEAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号216;本明細書における配列番号1677)、YYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号217、232および242;本明細書における配列番号1678)、SKTSADNNNSEYS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号218、233、238、および243;本明細書における配列番号1679)、KQGSEKTNVDIEKV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号220、225および245;本明細書における配列番号1680)、YFLSRTNDASGSDTKSTLLFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号222;本明細書における配列番号1681)、STTPSENNNSEYS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号223;本明細書における配列番号1682)、SAAGATN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号226および配列番号251;本明細書における配列番号1683)、YFLSRTNGEAGSATLSELRFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号227;本明細書における配列番号1684)、HGDDADRF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号229および配列番号254;本明細書における配列番号1685)、KQGAEKSDVEVDRV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号230および配列番号255;本明細書における配列番号1686)、KQDSGGDNIDIDQV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号235;本明細書における配列番号1687)、SDAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号236;本明細書における配列番号1688)、YFLSRTNTEGGHDTQSTLRFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号237;本明細書における配列番号1689)、KEDGGGSDVAIDEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号240;本明細書における配列番号1690)、SNAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号246;本明細書における配列番号1691)、およびYFLSRTNGEAGSATLSELRFSQPG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号252;本明細書における配列番号1692)のいずれであってもよく、またはいずれを有していてもよい。アミノ酸突然変異部位をコードし得るヌクレオチド配列の非限定的な例としては、以下、AGCVVMDCAGGARSCASCAAC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号97;本明細書における配列番号1693)、AACRACRRSMRSMAGGCA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号98;本明細書における配列番号1694)、CACRRGGACR
RCRMSRRSARSTTT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号99;本明細書における配列番号1695)、TATTTCTTGAGCAGAACAAACRVCVVSRSCGGAMNCVHSACGMHSTCAVVSCTTVDSTTTTCTCAGSBCRGSGCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号100;本明細書における配列番号1696)、TCAAMAMMAVNSRVCSRSAACAACAACAGTRASTTCTCGTGGMMAGGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号101;本明細書における配列番号1697)、AAGSAARRCRSCRVSRVARVCRATRYCGMSNHCRVMVRSGTC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号102;本明細書における配列番号1698)、CAGVVSVVSMRSRVCVNSGCAGCTDHCVVSRNSGTCVMSACA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号103;本明細書における配列番号1699)、AACTWCRVSVASMVSVHSDDTGTGSWSTKSACT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号104;本明細書における配列番号1700)、TTGTTGAACATCACCACGTGACGCACGTTC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号256、;本明細書における配列番号1701)、TCCCCGTGGTTCTACTACATAATGTGGCCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号257;本明細書における配列番号1702)、TTCCACACTCCGTTTTGGATAATGTTGAAC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号258;本明細書における配列番号1703)、AGGGACATCCCCAGCTCCATGCTGTGGTCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号259;本明細書における配列番号1704)、AGGGACAACCCCTCCGACTCGCCCTAATCC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号260;本明細書における配列番号1705)、TCCTAGTAGAAGACACCCTCTCACTGCCCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号261;本明細書における配列番号1706)、AGTACCATGTACACCCACTCTCCCAGTGCC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号262、;本明細書における配列番号1707)、ATATGGACGTTCATGCTGATCACCATACCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号263;本明細書における配列番号1708)、AGCAGGAGCTCCTTGGCCTCAGCGTGCGAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号264;本明細書における配列番号1709)、ACAAGCAGCTTCACTATGACAACCACTGAC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号265;本明細書における配列番号1710)、CAGCCTAGGAACTGGCTTCCTGGACCCTGTTACCGCCAGCAGAGAGTCTCAAMAMMAVNSRVCSRSAACAACAACAGTRASTTCTCCTGGMMAGGAGCTACCAAGTACCACCTCAATGGCAGAGACTCTCTGGTGAATCCCGGACCAGCTATGGCAAGCCACRRGGACRRCRMSRRSARSTTTTTTCCTCAGAGCGGGGTTCTCATCTTTGGGAAGSAARRCRSCRVSRVARVCRATRYCGMSNHCRVMVRSGTCATGATTACAGACGAAGAGGAGATCTGGAC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号266;本明細書における配列番号1711)、TGGGACAATGGCGGTCGTCTCTCAGAGTTKTKKT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号267;本明細書における配列番号1712)、AGAGGACCKKTCCTCGATGGTTCATGGTGGAGTTA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号268;本明細書における配列番号1713)、CCACTTAGGGCCTGGTCGATACCGTTCGGTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号269;本明細書における配列番号1714)、およびTCTCGCCCCAAGAGTAGAAACCCTTCSTTYYG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号270;本明細書における配列番号1715)が挙げられる。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号9および配列番号10など、国際公開第2016134375号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの眼細胞ターゲティングペプチドを含み得る。更に、国際公開第2016134375号パンフレットに記載される眼細胞ターゲティングペプチドまたはアミノ酸のいずれかが、限定はされないが、AAV2(国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号8;本明細書における配列番号1716)、またはAAV9(国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号11;本明細書における配列番号1717)など、任意の親AAV血清型に挿入されていてもよい。一部の実施形態において、挿入などの修飾は、AAV2タンパク質のP34~A35、T138~A139、A139~P140、G453~T454、N587~R588、および/またはR588~Q589になされる。特定の実施形態において、挿入は、AAV9のD384、G385、1560、T561、N562、E563、E564、E565、N704、および/またはY705になされる。眼細胞ターゲティングペプチドは、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、GSTPPPM(国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号1;本明細書における配列番号1718)、またはGETRAPL(国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号4;本明細書における配列番号1719)のいずれであってもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、米国特許出願公開第20170145405号明細書(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりに修飾されていてもよい。AAV血清型としては、修飾AAV2(例えば、Y444F、Y500F、Y730Fおよび/またはS662Vの修飾)、修飾AAV3(例えば、Y705F、Y731Fおよび/またはT492Vの修飾)、および修飾AAV6(例えば、S663Vおよび/またはT492Vの修飾)が挙げられる。
一部の実施形態において、AAV血清型は、国際公開第2017083722号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりに修飾されていてもよい。AAV血清型としては、AAV1(Y705+731F+T492V)、AAV2(Y444+500+730F+T491V)、AAV3(Y705+731F)、AAV5、AAV5(Y436+693+719F)、AAV6(VP3変異体Y705F/Y731F/T492V)、AAV8(Y733F)、AAV9、AAV9(VP3変異体Y731F)、およびAAV10(Y733F)が挙げられ得る。
一部の実施形態において、AAV血清型は、国際公開第2017015102号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりに、アミノ酸SPAKFA(国際公開第2017015102号パンフレットの配列番号24;本明細書における配列番号1720)またはNKDKLN(国際公開第2017015102号パンフレットの配列番号2;本明細書における配列番号1721)を含む操作されたエピトープを含み得る。エピトープは、AAV8(国際公開第2017015102号パンフレットの配列番号3)のVP1カプシドの付番に基づきアミノ酸665~670の領域および/またはAAV3B(配列番号3)の残基664~668の領域に挿入されていてもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、いずれかの組合せで、AAV1のアミノ酸残基262~268、370~379、451~459、472~473、493~500、528~534、547~552、588~597、709~710、716~722の1つ以上(例えば、2、3、4、5、6、または7つ)に、またはAAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAVrh32.33、ウシAAV、もしくはトリAAVの等価なアミノ酸残基に置換を含み得るカプシドタンパク質を有するAAV変異体など、国際公開第2017058892号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載のとおりの配列であってもよくまたはそれを有していてもよい。アミノ酸置換は、限定はされないが、国際公開第2017058892号パンフレットに記載されるアミノ酸配列のいずれであってもよい。一実施形態において、AAVは、以下の残基、AAV1(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号l)の残基256L、258K、259Q、261S、263A、264S、265T、266G、272H、385S、386Q、S472R、V473D、N500E 547S、709A、710N、716D、717N、718N、720L、A456T、Q457T、N458Q、K459S、T492S、K493A、S586R、S587G、S588N、T589Rおよび/または722Tのいずれかの組合せ、AVV5(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号5)の244N、246Q、248R、249E、250I、251K、252S、253G、254S、255V、256D、263Y、377E、378N、453L、456R、532Q、533P、535N、536P、537G、538T、539T、540A、541T、542Y、543L、546N、653V、654P、656S、697Q、698F、704D、705S、706T、707G、708E、709Yおよび/または710Rのいずれかの組合せ、AAV5(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号5)の248R、316V、317Q、318D、319S、443N、530N、531S、532Q 533P、534A、535N、540A、541T、542Y、543L、545G、546N、697Q、704D、706T、708E、709Yおよび/または710Rのいずれかの組合せ、AAV6(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号6)の264S、266G、269N、272H、457Q、588Sおよび/または589Iのいずれかの組合せ、AAV8(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号8)の457T、459N、496G、499N、500N、589Q、590Nおよび/または592Aのいずれかの組合せ、AAV9(国際公開第2017058892の配列番号9)の451I、452N、453G、454S、455G、456Q、457Nおよび/または458Qのいずれかの組合せでアミノ酸置換を含み得る。
一部の実施形態において、AAVは、国際公開第2017066764号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりに、VP1の155、156および157位またはVP2の17、18、19および20位にアミノ酸の配列を含み得る。アミノ酸の配列は、限定はされないが、N-S-S、S-X-S、S-S-Y、N-X-S、N-S-Y、S-X-YおよびN-X-Y、式中N、XおよびYは、限定はされないが、独立に、非セリンまたは非トレオニンアミノ酸であり、AAVは、限定はされないが、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11およびAAV12であってもよい。一部の実施形態において、AAVは、VP1の156、157もしくは158位またはVP2の19、20もしくは21位に少なくとも1つのアミノ酸の欠失を含んでいてもよく、AAVは、限定はされないが、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11およびAAV12であってもよい。
一実施形態において、AAVは、デバーマン(Deverman)ら(ネイチャー・バイオテクノロジー(Nature Biotechnology)、第34巻(第2号):p.204~209、2016年)(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)により記載されるとおりのCre組換えに基づくAAV標的型進化(CREATE:Cre-recombination-based AAV targeted evolution)によって生成される血清型であってもよい。一実施形態において、このように生成されたAAV血清型は、他のAAV血清型と比較して向上したCNS形質導入ならびに/またはニューロンおよびアストロサイト向性を有する。非限定的な例として、AAV血清型は、限定はされないが、PHP.B、PHP.B2、PHP.B3、PHP.A、PHP.S、G2A12、G2A15、G2A3、G2B4、およびG2B5などの、ペプチドを挙げることができる。一実施形態において、これらのAAV血清型は、アミノ酸588~589に7個アミノ酸のインサートを有するAAV9(配列番号9または136)誘導体であってもよい。これらの7個アミノ酸のインサートの非限定的な例としては、TLAVPFK(PHP.B;配列番号1260),SVSKPFL(PHP.B2;配列番号1268),FTLTTPK(PHP.B3;配列番号1269),YTLSQGW(PHP.A;配列番号1275),QAVRTSL(PHP.S;配列番号1319),LAKERLS(G2A3;配列番号1320),MNSTKNV(G2B4;配列番号1321)、および/またはVSGGHHS(G2B5;配列番号1322)が挙げられる。
一実施形態において、AAV血清型は、ジャクソン(Jackson)ら(フロンティア・イン・モレキュラー・ニューロサイエンス(Frontiers in Molecular Neuroscience)、第9巻:p.154(2016年))(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりであってもよい。
本明細書で参照および/または記載されるDNAおよびRNA配列では、一文字記号は、以下の説明を有する:Aはアデニン;Cはシトシン;Gはグアニン;Tはチミン;Uはウラシル;Wは、アデニンまたはチミンなどの弱塩基;Sは、シトシンおよびグアニンなどの強ヌクレオチド(strong nucleotide);Mは、アデニンおよびシトシンなどのアミノヌクレオチド;Kは、グアニンおよびチミンなどのケトヌクレオチド;Rは、プリンであるアデニンおよびグアニン;Yは、ピリミジンであるシトシンおよびチミン;Bは、Aではない任意の塩基(例えば、シトシン、グアニン、およびチミン);Dは、Cではない任意の塩基(例えば、アデニン、グアニン、およびチミン);Hは、Gではない任意の塩基(例えば、アデニン、シトシン、およびチミン);Vは、Tではない任意の塩基(例えば、アデニン、シトシン、およびグアニン);Nは任意のヌクレオチド(ギャップでない);およびZはゼロである。
本明細書で参照および/または記載されるアミノ酸配列のいずれにおいても、一文字記号は、以下の説明を有する:G(Gly)はグリシン;A(Ala)はアラニン;L(Leu)はロイシン;M(Met)はメチオニン;F(Phe)はフェニルアラニン;W(Trp)はトリプトファン;K(Lys)はリジン;Q(Gln)はグルタミン;E(Glu)はグルタミン酸;S(Ser)はセリン;P(Pro)はプロリン;V(Val)はバリン;I(Ile)はイソロイシン;C(Cys)はシステイン;Y(Tyr)はチロシン;H(His)はヒスチジン;R(Arg)はアルギニン;N(Asn)はアスパラギン;D(Asp)はアスパラギン酸;T(Thr)はトレオニン;B(Asx)はアスパラギン酸またはアスパラギン;J(Xle)はロイシンまたはイソロイシン;O(Pyl)はピロリジン;U(Sec)はセレノシステイン;X(Xaa)は任意のアミノ酸;およびZ(Glx)はグルタミンまたはグルタミン酸である。
一部の実施形態において、AAV血清型は、PHP.BまたはAAV9である。一部の実施形態において、AAV血清型をシナプシンプロモータと対にすると、より遍在性のプロモータ(すなわち、CBAまたはCMV)を使用する場合と比較して、ニューロン形質導入が増強される。
一実施形態において、AAV血清型は、AAVPHP.N(PHP.N)ペプチドを含む血清型またはその変異体である。
一実施形態において、AAV血清型は、AAVPHP.B(PHP.B)ペプチドを含む血清型またはその変異体である。
一実施形態において、AAV血清型は、AAVPHP.A(PHP.A)ペプチドを含む血清型またはその変異体である。
一実施形態において、AAV血清型は、PHP.Sペプチドを含む血清型またはその変異体である。
一実施形態において、AAV血清型は、PHP.B2ペプチドを含む血清型またはその変異体である。
一実施形態において、AAV血清型は、PHP.B3ペプチドを含む血清型またはその変異体である。
一実施形態において、AAV血清型は、G2B4ペプチドを含む血清型またはその変異体である。
一実施形態において、AAV血清型は、G2B5ペプチドを含む血清型またはその変異体である。
一実施形態において、AAV血清型は、VOY101またはその変異体である。1つの好ましい実施形態において、VOY101は、配列番号1の核酸配列を含む。別の実施形態において、カプシド配列は、配列番号1809の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV血清型は、VOY201またはその変異体である。1つの好ましい実施形態において、VOY201は、配列番号1810の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAVカプシドは、静脈内投与後に血液脳関門の透過が可能なものである。かかるAAVカプシドの非限定的な例としては、VOY101、VOY201、または限定はされないが、AAVPHP.N(PHP.N)、AAVPHP.B(PHP.B)、PHP.S、G2A3、G2B4、G2B5、G2A12、G2A15、PHP.B2、PHP.B3、およびAAVPHP.A(PHP.A)などのペプチドインサートを含むAAVカプシドが挙げられる。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドはVOY101である。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドはVOY201である。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、PHP.Aペプチドインサートを含む。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、PHP.Bペプチドインサートを含む。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、PHP.B2ペプチドインサートを含む。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、PHP.B3ペプチドインサートを含む。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、G2A3ペプチドインサートを含む。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、G2B4ペプチドインサートを含む。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、G2B5ペプチドインサートを含む。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、PHP.Nペプチドインサートを含む。一実施形態において、血液脳関門透過性カプシドは、PHP.Sペプチドインサートを含む。
ウイルスゲノム成分:末端逆位配列(ITR)
本発明のAAV粒子は、少なくとも1つのITR領域とペイロード領域とを有するウイルスゲノムを含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは2つのITRを有する。これらの2つのITRは5’末端および3’末端でペイロード領域に隣接する。ITRは、複製のための認識部位を含む複製起点として働く。ITRは、相補的でかつ対称に配置され得る配列領域を含む。本発明のウイルスゲノムに組み込まれるITRは、天然に存在するポリヌクレオチド配列または組換え的に誘導されたポリヌクレオチド配列を含み得る。
ITRは、表1に挙げられる血清型のいずれか、またはその誘導体から選択される、カプシドと同じ血清型に由来してもよい。ITRはカプシドと異なる血清型であってもよい。一実施形態において、AAV粒子は2つ以上のITRを有する。非限定的な例では、AAV粒子は、2つのITRを含むウイルスゲノムを有する。一実施形態において、ITRは互いに同じ血清型である。別の実施形態において、ITRは異なる血清型である。非限定的な例としては、ITRのうちゼロ個、一方または両方がカプシドと同じ血清型を有することが挙げられる。一実施形態において、AAV粒子のウイルスゲノムの両方のITRがAAV2 ITRである。
独立に、各ITRは約100~約150ヌクレオチド長であってもよい。ITRは、約100~105ヌクレオチド長、106~110ヌクレオチド長、111~115ヌクレオチド長、116~120ヌクレオチド長、121~125ヌクレオチド長、126~130ヌクレオチド長、131~135ヌクレオチド長、136~140ヌクレオチド長、141~145ヌクレオチド長または146~150ヌクレオチド長であってもよい。一実施形態において、ITRは140~142ヌクレオチド長である。ITR長さの非限定的な例は、102、105、130、140、141、142、145ヌクレオチド長であり、それと少なくとも90%の同一性、またはそれと少なくとも95%の同一性、またはそれと少なくとも98%の同一性、またはそれと少なくとも99%の同一性を有するものである。
ウイルスゲノム成分:プロモータ
一実施形態において、ウイルスゲノムのペイロード領域は、トランス遺伝子標的特異性および発現を増強する少なくとも1つのエレメントを含む(例えば、パウエル(Powell)ら著、「遺伝子療法におけるトランス遺伝子標的特異性および発現を増強するウイルス発現カセットエレメント(Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and Expression in Gene Therapy)」、2015年を参照のこと;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。トランス遺伝子標的特異性および発現を増強するエレメントの非限定的な例としては、プロモータ、内因性miRNA、転写後調節エレメント(PRE)、ポリアデニル化(ポリA)シグナル配列および上流エンハンサー(USE)、CMVエンハンサーおよびイントロンが挙げられる。
当業者であれば、標的細胞中での本発明のポリペプチドの発現には、限定はされないが、種特異的な、誘導可能な、組織特異的な、または細胞周期特異的なプロモータを含む、特異的なプロモータが必要とされ得ることを認識し得る(パー(Parr)ら著、ネイチャー・メディシン(Nat.Med.)、第3巻、p.1145~9(1997年);この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
一実施形態において、プロモータは、AAV粒子のウイルスゲノムのペイロード領域にコードされたポリペプチドの発現をドライブする場合、有効とみなされる。
一実施形態において、プロモータは、標的とされている細胞中で発現をドライブする場合、有効とみなされるプロモータである。
一実施形態において、プロモータは、標的とされている細胞に向性を有するプロモータである。
一実施形態において、プロモータは、標的組織においてペイロードの発現をある期間ドライブする。プロモータによりドライブされた発現は、1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、11時間、12時間、13時間、14時間、15時間、16時間、17時間、18時間、19時間、20時間、21時間、22時間、23時間、1日、2日、3日、4日、5日、6日、1週間、8日、9日、10日、11日、12日、13日、2週間、15日、16日、17日、18日、19日、20日、3週間、22日、23日、24日、25日、26日、27日、28日、29日、30日、31日、1ヵ月、2ヵ月、3ヵ月、4ヵ月、5ヵ月、6ヵ月、7ヵ月、8ヵ月、9ヵ月、10ヵ月、11ヵ月、1年、13ヵ月、14ヵ月、15ヵ月、16ヵ月、17ヵ月、18ヵ月、19ヵ月、20ヵ月、21ヵ月、22ヵ月、23ヵ月、2年、3年、4年、5年、6年、7年、8年、9年、10年または10年超の期間であってもよい。発現は、1~5時間、1~12時間、1~2日、1~5日、1~2週間、1~3週間、1~4週間、1~2ヵ月、1~4ヵ月、1~6ヵ月、2~6ヵ月、3~6ヵ月、3~9ヵ月、4~8ヵ月、6~12ヵ月、1~2年、1~5年、2~5年、3~6年、3~8年、4~8年または5~10年であってもよい。非限定的な例として、プロモータは、神経組織においてペイロードを持続的に発現させる弱いプロモータである。
一実施形態において、プロモータは、少なくとも1ヵ月、2ヵ月、3ヵ月、4ヵ月、5ヵ月、6ヵ月、7ヵ月、8ヵ月、9ヵ月、10ヵ月、11ヵ月、1年、2年、3年、4年、5年、6年、7年、8年、9年、10年、11年、12年、13年、14年、15年、16年、17年、18年、19年、20年、21年、22年、23年、24年、25年、26年、27年、28年、29年、30年、31年、32年、33年、34年、35年、36年、37年、38年、39年、40年、41年、42年、43年、44年、45年、46年、47年、48年、49年、50年、55年、60年、65年、または65年超にわたって、本発明のポリペプチドの発現をドライブする。
プロモータは、天然に存在してもよくまたは天然に存在しなくともよい。プロモータの非限定的な例としては、ウイルスプロモータ、植物プロモータおよび哺乳類プロモータが挙げられる。一部の実施形態において、プロモータは、ヒトプロモータであってもよい。一部の実施形態において、プロモータは、トランケート型であっても突然変異型であってもよい。
ほとんどの組織で発現をドライブまたは促進するプロモータとしては、限定はされないが、ヒト伸長因子1α-サブユニット(EF1α)、サイトメガロウイルス(CMV)前初期エンハンサーおよび/もしくはプロモータ、ニワトリβ-アクチン(CBA)およびその誘導体CAG、βグルクロニダーゼ(GUSB)、またはユビキチンC(UBC)が挙げられる。限定はされないが、筋肉特異的プロモータ、B細胞プロモータ、単球プロモータ、白血球プロモータ、マクロファージプロモータ、膵腺房細胞プロモータ、内皮細胞プロモータ、肺組織プロモータ、アストロサイトプロモータ、またはニューロンもしくはニューロンのサブタイプ、アストロサイト、もしくはオリゴデンドロサイトに発現を制限するために使用することができる神経系プロモータなど、組織特異的発現エレメントを使用して、発現を特定の細胞型に限定することができる。
筋肉特異的プロモータの非限定的な例としては、哺乳類筋肉クレアチンキナーゼ(MCK)プロモータ、哺乳類デスミン(DES)プロモータ、哺乳類トロポニンI(TNNI2)プロモータ、および哺乳類骨格筋型アルファ-アクチン(ASKA)プロモータ(例えば、米国特許出願公開第20110212529号明細書を参照。その内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
ニューロンの組織特異的発現エレメントの非限定的な例としては、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)、血小板由来増殖因子(PDGF)、血小板由来増殖因子B鎖(PDGF-β)、シナプシン(Syn)、メチル-CpG結合タンパク質(MeCP2)、Ca2+/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼII(CaMKII)、代謝調節型グルタミン酸受容体2(mGluR2)、ニューロフィラメント軽鎖(NFL)または重鎖(NFH)、β-グロビンミニ遺伝子nβ2、プレプロエンケファリン(PPE)、エンケファリン(Enk)および興奮性アミノ酸トランスポーター2(EAAT2)プロモータが挙げられる。アストロサイトに対する組織特異的発現エレメントの非限定的な例としては、グリア線維性酸性タンパク質(GFAP)およびEAAT2プロモータが挙げられる。オリゴデンドロサイトに対する組織特異的発現エレメントの非限定的な例としては、ミエリン塩基性タンパク質(MBP)プロモータが挙げられる。
一実施形態において、プロモータは、1kb未満であってもよい。プロモータは、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800または800ヌクレオチド超の長さを有してもよい。プロモータは、200~300、200~400、200~500、200~600、200~700、200~800、300~400、300~500、300~600、300~700、300~800、400~500、400~600、400~700、400~800、500~600、500~700、500~800、600~700、600~800または700~800の長さを有してもよい。
一実施形態において、プロモータは、限定はされないが、CMVおよびCBAなど、同じまたは異なる開始または親プロモータの2つ以上の成分の組合せであってもよい。各成分は、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800または800超の長さを有してもよい。各成分は、200~300、200~400、200~500、200~600、200~700、200~800、300~400、300~500、300~600、300~700、300~800、400~500、400~600、400~700、400~800、500~600、500~700、500~800、600~700、600~800または700~800の長さを有してもよい。一実施形態において、プロモータは、382ヌクレオチドCMVエンハンサー配列と260ヌクレオチドCBAプロモータ配列との組合せである。
一実施形態において、ウイルスゲノムはユビキタスプロモータを含む。ユビキタスプロモータの非限定的な例としては、CMV、CBA(誘導体CAG、CBh等を含む)、EF-1α、PGK、UBC、GUSB(hGBp)、およびUCOE(HNRPA2B1-CBX3のプロモータ)が挙げられる。
ユー(Yu)ら(モレキュラー・ペイン(Molecular Pain)、2011年、第7巻、p.63;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は、レンチウイルスベクターを使用してラットDRG細胞および初代DRG細胞におけるCAG、EFIα、PGKおよびUBCプロモータ下のeGFPの発現を評価し、UBCが他の3つのプロモータよりも弱い発現を示し、全てのプロモータについてわずか10~12%のグリア細胞発現しか見られなかったことを見出した。セーデルブロム(Soderblom)ら(イー・ニューロ(E.Neuro)、2015年、2(2):ENEURO.0001~15;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は、運動皮質における注射後のCMVおよびUBCプロモータを含むAAV8およびCMVプロモータを含むAAV2におけるeGFPの発現を評価した。UBCまたはEFIαプロモータを含むプラスミドの鼻腔内投与は、CMVプロモータによる発現よりも高い持続的気道発現を示した(例えば、ギル(Gill)ら著、ジーン・セラピー(Gene Therapy)、2001年、第8巻、p.1539~1546(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)を参照のこと)。フセイン(Husain)ら(ジーン・セラピー(Gene Therapy)、2009年、16(7):p.927~932;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は、hGUSBプロモータ、HSV-1LATプロモータおよびNSEプロモータを含むHβHコンストラクトを評価し、このHβHコンストラクトがマウス脳においてNSEよりも弱い発現を示したことを見出した。パッシーニ(Passini)およびウォルフ(Wolfe)(ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Virol.)、2001年、p.12382~12392、これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は、新生仔マウスにおける脳室内注射後のHβHベクターの長期効果を評価し、少なくとも1年間にわたり持続的発現があったことを見出した。スー(Xu)ら(ジーン・セラピー(Gene Therapy)、2001年、第8巻、p.1323~1332;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)により、NFLおよびNFHプロモータを使用したとき、CMV-lacZ、CMV-luc、EF、GFAP、hENK、nAChR、PPE、PPE+wpre、NSE(0.3kb)、NSE(1.8kb)およびNSE(1.8kb+wpre)と比較して全ての脳領域で低発現が見出された。スー(Xu)らは、プロモータ活性が、降順に、NSE(1.8kb)、EF、NSE(0.3kb)、GFAP、CMV、hENK、PPE、NFLおよびNFHであることを見出した。NFLは650ヌクレオチドプロモータであり、NFHは920ヌクレオチドプロモータであり、両方とも肝臓には存在しないが、NFHは固有受容感覚ニューロン、脳および脊髄に豊富にあり、NFHは心臓に存在する。SCN8Aは、DRG、脊髄および脳全体にわたって発現する470ヌクレオチドプロモータであり、特に海馬ニューロンおよび小脳プルキンエ細胞、皮質、視床および視床下部に高発現が見られる(例えば、ドレウス(Drews)ら著、「ナトリウムチャネル遺伝子SCN8Aにおける、進化的に保存された機能性非コードエレメントの同定」(Identification of evolutionary conserved,functional noncoding elements in the promoter region of the sodium channel gene SCN8A)、マンマリアン・ゲノム(Mamm Genome)(2007年)、第18巻、p.723~731;およびレイモンド(Raymond)ら著、「選択的スプライスによるナトリウムチャネルα-サブユニット遺伝子の発現」(Expression of Alternatively Spliced Sodium Channel α-subunit genes)、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー(Journal of Biological Chemistry)2004年、279(44)、p.46234~46241を参照のこと;この各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
前述のユー(Yu)、セーデルブロム(Soderblom)、ギル(Gill)、フセイン(Husain)、パッシーニ(Passini)、スー(Xu)、ドレウス(Drews)またはレイモンド(Raymond)によって教示されるプロモータはいずれも、本発明に使用することができる。
一実施形態において、プロモータは細胞特異的ではない。
一実施形態において、プロモータはユビキチンc(UBC)プロモータである。UBCプロモータは、300~350ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、UBCプロモータは332ヌクレオチド長である。
一実施形態において、プロモータは、β-グルクロニダーゼ(GUSB)プロモータである。GUSBプロモータは、350~400ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、GUSBプロモータは378ヌクレオチド長である。
一実施形態において、プロモータはニューロフィラメント軽鎖(NFL)プロモータである。NFLプロモータはサイズが600~700ヌクレオチドであり得る。非限定的な例として、NFLプロモータは650ヌクレオチド長である。
一実施形態において、プロモータはニューロフィラメント重鎖(NFH)プロモータである。NFHプロモータはサイズが900~950ヌクレオチドであり得る。非限定的な例として、NFHプロモータは920ヌクレオチド長である。
一実施形態において、プロモータはSCN8Aプロモータである。SCN8Aプロモータはサイズが450~500ヌクレオチドであり得る。非限定的な例として、SCN8Aプロモータは470ヌクレオチド長である。
一実施形態において、プロモータは、フラタキシン(FXN)プロモータである。
一実施形態において、プロモータは、ホスホグリセリン酸キナーゼ1(PGK)プロモータである。
一実施形態において、プロモータは、ニワトリβ-アクチン(CBA)プロモータである。
一実施形態において、プロモータは、サイトメガロウイルス(CMV)プロモータである。
一実施形態において、プロモータは、H1プロモータである。
一実施形態において、プロモータは、操作されたプロモータである。
一実施形態において、プロモータは、肝臓または骨格筋プロモータである。肝臓プロモータの非限定的な例としては、ヒトα-1-抗トリプシン(hAAT)およびチロキシン結合グロブリン(TBG)が挙げられる。骨格筋プロモータの非限定的な例としては、デスミン、MCKまたは合成C5-12が挙げられる。
一実施形態において、プロモータは、RNA pol IIIプロモータである。非限定的な例として、RNA pol IIIプロモータはU6である。非限定的な例として、RNA pol IIIプロモータはH1である。
一実施形態において、プロモータは、心筋細胞特異的プロモータである。心筋細胞特異的プロモータの非限定的な例としては、αMHC、cTnT、およびCMV-MLC2kが挙げられる。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのプロモータを含む。非限定的な例として、プロモータは、EF1αプロモータおよびCMVプロモータである。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、エンハンサーエレメント、プロモータおよび/または5’UTRイントロンを含む。また、エンハンサーエレメントは、本明細書では「エンハンサー」とも称され、限定はされないが、CMVエンハンサーであってもよく、プロモータは、限定はされないが、CMV、CBA、UBC、GUSB、NSE、シナプシン、MeCP2、およびGFAPプロモータであってもよく、および5’UTR/イントロンは、限定はされないが、SV40およびCBA-MVMであってもよい。非限定的な例として、組合せで使用されるエンハンサー、プロモータおよび/またはイントロンは、(1)CMVエンハンサー、CMVプロモータ、SV40 5’UTRイントロン;(2)CMVエンハンサー、CBAプロモータ、SV40 5’UTRイントロン;(3)CMVエンハンサー、CBAプロモータ、CBA-MVM 5’UTRイントロン;(4)UBCプロモータ;(5)GUSBプロモータ;(6)NSEプロモータ;(7)シナプシンプロモータ;(8)MeCP2プロモータおよび(9)GFAPプロモータであってもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、操作されたプロモータを含む。
別の実施形態において、ウイルスゲノムは、天然に発現されるタンパク質のプロモータを含む。
ウイルスゲノム成分:非翻訳領域(UTR)
定義上、遺伝子の野生型非翻訳領域(UTR)は、転写されるが翻訳されない。一般的には、5’UTRは、転写開始部位から始まり、開始コドンで終了し、3’UTRは、終止コドンの直後から始まり、転写の終結シグナルまで継続する。
特定の標的臓器の、豊富に発現される遺伝子に典型的に見出される特徴を、UTR内に操作して、安定性およびタンパク質産生を増強することができる。非限定的な例として、肝臓において通常発現されるmRNA(例えば、アルブミン、血清アミロイドA、アポリポタンパク質A/B/E、トランスフェリン、アルファフェトプロテイン、エリスロポエチン、または第VIII因子)に由来する5’UTRを、本発明のAAV粒子のウイルスゲノムに使用して、肝細胞株または肝臓での発現を増強することができる。
理論によって束縛されることを望むものではないが、野生型5’非翻訳領域(UTR)は、翻訳開始に役割を果たす特徴を含む。コザック配列は、リボソームが多数の遺伝子の翻訳を開始させる過程に関与することが広く知られており、通常は5’UTRに含まれている。コザック配列は、コンセンサスCCR(A/G)CCAUGGを有し、式中Rは、開始コドン(ATG)の3塩基上流にあるプリン(アデニンまたはグアニン)であり、別の「G」がその後に続く。
一実施形態において、ウイルスゲノムの5’UTRは、コザック配列を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムの5’UTRは、コザック配列を含まない。
理論によって束縛されることを望むものではないが、野生型3’UTRは、アデノシンおよびウリジンのストレッチがそこに埋め込まれていることが知られている。これらのAUリッチシグネチャーは、高いターンオーバー率を有する遺伝子において特に広く見受けられる。それらの配列特徴および機能的特性に基づき、AUリッチエレメント(ARE)は、3つのクラスに分離することができる(チェン(Chen)ら著、1995年。その内容は本明細書において全体として参照により援用される):限定はされないが、c-MycおよびMyoDなどのクラスI AREは、Uリッチ領域内にAUUUAモチーフの幾つかの分散コピーを含有する。限定はされないが、GM-CSFおよびTNF-aなどのクラスII AREは、2つ以上のオーバーラップUUAUUUA(U/A)(U/A)ノナマーを有する。限定はされないが、c-JunおよびミオゲニンなどのクラスIII ARESは、それほど十分に規定されていない。これらのUリッチ領域は、AUUUAモチーフを含有しない。AREに結合するほとんどのタンパク質は、メッセンジャーを不安定化することが知られているが、ELAVファミリーのメンバーである最も顕著にはHuRは、mRNAの安定性を増加させることが実証されている。HuRは、3つ全てのクラスのAREに結合する。HuR特異的結合部位を核酸分子の3’UTR内に、操作により加えることは、インビボにて、HuR結合を、したがってメッセージの安定化をもたらすことになる。
3’UTR AUリッチエレメント(ARE)の導入、除去または修飾を使用して、ポリヌクレオチドの安定性を調節することができる。特異的なポリヌクレオチド、例えばウイルスゲノムのペイロード領域を操作する場合、AREの1つ以上のコピーを導入して、ポリヌクレオチドをより不安定にし、それにより、翻訳を減らし、結果として生じるタンパク質の産生を減少させることができる。同様に、AREを、同定および除去または突然変異させて、細胞内安定性を増加させ、したがって結果として生じるタンパク質の翻訳および産生を増加させることができる。
一実施形態において、ウイルスゲノムの3’UTRは、ポリAテールを鋳型付加するためのオリゴ(dT)配列を含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのmiRNAシード、結合部位または完全な配列を含み得る。microRNA(またはmiRNAまたはmiR)は、核酸標的の部位に結合し、核酸分子安定性を低減することまたは翻訳を阻害することのいずれかによって遺伝子発現を下方制御する19~25ヌクレオチド非コードRNAである。microRNA配列は、「シード」領域、すなわち成熟microRNAの2~8位の領域の配列を含む。この配列は、核酸のmiRNA標的配列に対して完全なワトソンクリック型相補性を有する。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのmiRNA結合部位、完全な配列またはシード領域を含む、変更するまたは除去するように操作されていてもよい。
当該技術分野で公知の任意の遺伝子に由来する任意のUTRを、AAV粒子のウイルスゲノムに組み込むことができる。これらのUTRまたはそれらの部分は、それらが選択されたかまたはそれらの配向性もしくは位置が変更され得る遺伝子と同じ配向性に配置され得る。一実施形態において、AAV粒子のウイルスゲノムに使用されるUTRは、逆位化、短縮化、延長化、当該技術分野で公知の1つ以上の他の5’UTRまたは3’UTRで作製され得る。本明細書で使用されるとき、用語「変更される」は、UTRに関する場合、UTRが、参照配列に対して何らかの点で変化していることを意味する。例えば、3’または5’UTRは、上記で教示されるような配向性または位置の変化によって野生型または天然UTRに対して変更されていてもよく、または追加ヌクレオチドの介在、ヌクレオチドの欠失、ヌクレオチドの交換もしくは転位によって変更されていてもよい。
一実施形態において、AAV粒子のウイルスゲノムは、野生型UTRの変異体でない少なくとも1つの人工UTRを含む。
一実施形態において、AAV粒子のウイルスゲノムは、そのタンパク質が、共通の機能、構造、特徴、または特性を共有する転写物のファミリーから選択されているUTRを含む。
ウイルスゲノム成分:ポリアデニル化配列
一実施形態において、本発明のAAV粒子のウイルスゲノムは少なくとも1つのポリアデニル化配列を含む。AAV粒子のウイルスゲノムは、ペイロードコード配列の3’末端と3’ITRの5’末端との間にポリアデニル化配列を含み得る。
一実施形態において、ポリアデニル化配列または「ポリA配列」は、存在しない~約500ヌクレオチド長の範囲であってもよい。ポリアデニル化配列は、限定はされないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、408、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、493、494、495、496、497、498、499、および500ヌクレオチド長であってもよい。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は50~100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は50~150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は50~160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は50~200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は60~100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は60~150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は60~160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は60~200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は70~100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は70~150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は70~160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は70~200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は80~100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は80~150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は80~160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は80~200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は90~100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は90~150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は90~160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は90~200ヌクレオチド長である。
ウイルスゲノム成分:イントロン
一実施形態において、本発明のAVV粒子のウイルスゲノムは、イントロンなど、トランス遺伝子標的特異性および発現を増強する少なくとも1つのエレメントを含む(例えば、パウエル(Powell)ら著、「遺伝子療法におけるトランス遺伝子標的特異性および発現を増強するウイルス発現カセットエレメント(Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and Expression in Gene Therapy)」、ディスカバリー・メディシン(Discov.Med)、2015年、第19巻(第102号):p.49~57を参照;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。イントロンの非限定的な例としては、MVM(67~97bps)、F.IXトランケート型イントロン1(300bp)、β-グロビンSD/免疫グロブリン重鎖スプライスアクセプター(250bp)、アデノウイルススプライスドナー/イムノグロビンスプライスアクセプター(500bp)、SV40後期スプライスドナー/スプライスアクセプター(19S/16S)(180bp)およびハイブリッドアデノウイルススプライスドナー/IgGスプライスアクセプター(230bp)が挙げられる。
一実施形態において、イントロンまたはイントロン部分は100~500ヌクレオチド長であってもよい。イントロンは、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490または500ヌクレオチドの長さを有してもよい。イントロンは、80~100、80~120、80~140、80~160、80~180、80~200、80~250、80~300、80~350、80~400、80~450、80~500、200~300、200~400、200~500、300~400、300~500、または400~500ヌクレオチドの長さを有してもよい。
ウイルスゲノム成分:スタッファー配列
一実施形態において、本発明のAAV粒子のウイルスゲノムは、スタッファー配列またはフィラー配列など、パッケージング効率および発現を向上させる少なくとも1つのエレメントを含む。スタッファー配列の非限定的な例としては、アルブミンおよび/またはアルファ-1抗トリプシンが挙げられる。任意の公知のウイルス配列、哺乳類配列、または植物配列をマニピュレートして、スタッファー配列として使用することができる。
一実施形態において、スタッファー配列またはフィラー配列は、約100~3500ヌクレオチド長であってもよい。スタッファー配列は、約100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1900、2000、2100、2200、2300、2400、2500、2600、2700、2800、2900、または3000ヌクレオチドの長さを有してもよい。
ウイルスゲノム成分:miRNA
一実施形態において、ウイルスゲノムは、特定の組織におけるトランス遺伝子の発現を低減するmiRNAをコードする少なくとも1つの配列を含む。miRNAおよびそれらの標的組織は、当該技術分野で周知である。非限定的な例として、miR-122 miRNAをウイルスゲノムにコードして、肝臓でのウイルスゲノムの発現を低減することができる。
AAV産生
本発明は、ウイルス複製細胞におけるウイルスゲノム複製による、パルボウイルス粒子、例えばAAV粒子の作製方法を提供する。
本発明によると、ペイロード領域を含むウイルスゲノムは、ウイルス複製細胞で産生されるAAV粒子に組み込まれることになる。AAV粒子を製作する方法は、当該技術分野において周知であり、例えば、以下の文献に記載されている:米国特許第6204059号明細書、同第5756283号明細書、同第6258595号明細書、同第6261551号明細書、同第6270996号明細書、同第6281010号明細書、同第6365394号明細書、同第6475769号明細書、同第6482634号明細書、同第6485966号明細書、同第6943019号明細書、同第6953690号明細書、同第7022519号明細書、同第7238526号明細書、同第7291498および同第7491508号明細書、同第5064764号明細書、同第6194191号明細書、同第6566118号明細書、同第8137948号明細書;または国際公開第1996039530号パンフレット、同第1998010088号パンフレット、同第1999014354号パンフレット、同第1999015685号パンフレット、同第1999047691号パンフレット、同第2000055342号パンフレット、同第2000075353および同第2001023597号パンフレット;分子生物学の方法(Methods In Molecular Biology)、リチャード(Richard)編、ヒューマナ・プレス(Humana Press)、ニュージャージー州、1995年;オライリー(O’Reilly)ら著、「バキュロウイルス発現ベクター、実験マニュアル(Baculovirus Expression Vectors,A Laboratory Manual)」、オックスフォード大学出版局(Oxford Univ.Press)、1994年;サムルスキ(Samulski)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir.)、第63巻、p.3822~8、1989年;カジガヤ(Kajigaya)ら著、米国科学アカデミー紀要(Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA)、第88巻、p.4646~50、1991年;ラフィング(Ruffing)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir.)、第66巻、p.6922~30、1992年;キムバウアー(Kimbauer)ら著、バイロロジー(Vir.)、第219巻、p.37~44、1996年;チャオ(Zhao)ら著、バイロロジー(Vir.)、第272巻、p.382~93、2000年。これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される。一実施形態において、AAV粒子は、国際特許公開第2015191508号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される方法を使用して製作される。
組換えAAVウイルス粒子の作製に一般的に使用されるウイルス複製細胞としては、限定はされないが、米国特許第6156303号明細書、同第5387484号明細書、同第5741683号明細書、同第5691176号明細書、および同第5688676号明細書;米国特許出願公開第2002/0081721号明細書、および国際特許公開第2000047757号パンフレット、同第2000024916号パンフレット、および同第1996017947号パンフレット(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの、HEK293細胞、COS細胞、HeLa細胞、KB細胞、および他の哺乳類細胞株が挙げられる。
一部の実施形態において、本発明は、1)コンピテント細菌細胞にバクミドベクターおよびウイルスコンストラクトベクターおよび/またはAAVペイロードコンストラクトベクターのいずれかをコトランスフェクトする工程、2)得られたウイルスコンストラクト発現ベクターおよびAAVペイロードコンストラクト発現ベクターを単離し、ウイルス複製細胞に個別にトランスフェクトする工程、3)ウイルスコンストラクト発現ベクターまたはAAVペイロードコンストラクト発現ベクターを含む得られたペイロードおよびウイルスコンストラクト粒子を単離および精製する工程、4)ウイルス複製細胞に、ウイルスコンストラクト発現ベクターまたはAAVペイロードコンストラクト発現ベクターを含むAAVペイロードおよびウイルスコンストラクト粒子の両方を共感染させる工程、および5)ウイルスゲノムを含むAAV粒子を回収および精製する工程を含む、形質導入効率が増強された(増加した、向上した)AAV粒子の作製方法を提供する。
一部の実施形態において、本発明は、1)限定はされないがHEK293細胞などの哺乳類細胞にペイロード領域、repおよびcap遺伝子を発現するコンストラクトならびにヘルパーコンストラクトを同時にコトランスフェクトする工程、2)ウイルスゲノムを含むAAV粒子を回収および精製する工程を含む、AAV粒子の作製方法を提供する。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子のウイルスゲノムは、任意選択で、選択可能なマーカーをコードする。選択可能なマーカーは、限定はされないが、受容体、CDマーカー、レクチン、インテグリン、またはそれらのトランケート型を含む、細胞表面に発現される任意のタンパク質などの、細胞表面マーカーを含み得る。
一部の実施形態において、選択可能なマーカーレポーター遺伝子は、国際公開第1996023810号パンフレットおよび第1996030540号パンフレット;ハイム(Heim)ら著、カレント・バイオロジー(Current Biology)、2巻:p.178~182(1996年);ハイム(Heim)ら著、米国科学アカデミー紀要(Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA)、(1995年);またはハイム(Heim)ら著、サイエンス(Science)、373巻:p.663~664(1995年);に記載されているとおりである。これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される。
ゲノムサイズ
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むAAV粒子は、一本鎖または二本鎖ウイルスゲノムであってもよい。ウイルスゲノムのサイズは、小型、中型、大型または最大サイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、小型一本鎖ウイルスゲノムであってもよい。小型一本鎖ウイルスゲノムは、約2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、および3.5kbサイズなど、2.1~3.5kbサイズであってもよい。非限定的な例として、小型一本鎖ウイルスゲノムは3.2kbサイズであってもよい。別の非限定的な例として、小型一本鎖ウイルスゲノムは2.2kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、小型二本鎖ウイルスゲノムであってもよい。小型二本鎖ウイルスゲノムは、約1.3、1.4、1.5、1.6、および1.7kbサイズなど、1.3~1.7kbサイズであってもよい。非限定的な例として、小型二本鎖ウイルスゲノムは1.6kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノム、例えば、ポリヌクレオチド、siRNAもしくはdsRNA、またはmiRNAは、中型一本鎖ウイルスゲノムであってもよい。中型一本鎖ウイルスゲノムは、約3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2および4.3kbサイズなど、3.6~4.3kbサイズであってもよい。非限定的な例として、中型一本鎖ウイルスゲノムは4.0kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、中型二本鎖ウイルスゲノムであってもよい。中型二本鎖ウイルスゲノムは、約1.8、1.9、2.0、および2.1kbサイズなど、1.8~2.1kbサイズであってもよい。非限定的な例として、中型二本鎖ウイルスゲノムは2.0kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、大型一本鎖ウイルスゲノムであってもよい。大型一本鎖ウイルスゲノムは、約4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5.0、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9および6.0kbサイズなど、4.4~6.0kbサイズであってもよい。非限定的な例として、大型一本鎖ウイルスゲノムは4.7kbサイズであってもよい。別の非限定的な例として、大型一本鎖ウイルスゲノムは4.8kbサイズであってもよい。更に別の非限定的な例として、大型一本鎖ウイルスは6.0kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、大型二本鎖ウイルスゲノムであってもよい。大型二本鎖ウイルスゲノムは、約2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9および3.0kbサイズなど、2.2~3.0kbサイズであってもよい。非限定的な例として、大型二本鎖ウイルスゲノムは2.4kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
本発明のペイロード
本開示のAAV粒子は、少なくとも1つのペイロード領域を含む。本明細書で使用されるとき、「ペイロード」または「ペイロード領域」は、ウイルスゲノムによりもしくはその内にコードされる1つ以上のポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド領域、またはかかるポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド領域、例えばトランス遺伝子、ポリペプチドもしくはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現産物、または調節性核酸もしくは制御性核酸を指す。本発明のペイロードは、典型的には、ポリペプチドまたはその断片もしくは変異体をコードする。
ペイロード領域は、mRNAの天然構成と同様のまたは反映した領域を再現するように構築され得る。
ペイロード領域は、コードおよび非コード核酸配列の組合せを含み得る。
一部の実施形態では、AAVペイロード領域は、コードまたは非コードRNAをコードし得る。
一実施形態において、AAV粒子は、2つ以上の目的のポリペプチドをコードする核酸配列を含むペイロード領域を有するウイルスゲノムを含む。かかる実施形態において、2つ以上のポリペプチドをコードするウイルスゲノムは、ウイルス粒子へと複製またはパッケージングされ得る。2つ以上のポリペプチドを含むウイルス粒子で形質導入された標的細胞は、単一細胞においてポリペプチドの各々を発現し得る。
一実施形態において、AAVペイロード領域は、図1に示されるような成分を含み得る。ペイロード領域110は、ウイルスゲノム100内に位置する。ペイロード領域110の5’末端および/または3’末端には、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)120が存在してもよい。一実施形態においてペイロード領域内には、プロモータ領域130、イントロン領域140およびコード領域150が存在する。
AAV粒子ペイロード領域がポリペプチドをコードする場合、ポリペプチドは、ペプチドまたはタンパク質であってもよい。非限定的な例として、ペイロード領域は、限定はされないが、ApoE2、ApoE3および/またはApoE4などのアポリポタンパク質E(APOE)の少なくとも1つの対立遺伝子をコードしてもよい。第2の非限定的な例として、ペイロード領域は、ヒトもしくは霊長類フラタキシンタンパク質またはその断片もしくは変異体をコードしてもよい。別の非限定的な例として、ペイロード領域は、抗体またはその断片をコードしてもよい。別の非限定的な例として、ペイロード領域は、ヒトAADCまたはその断片もしくは変異体をコードしてもよい。別の非限定的な例として、ペイロード領域は、ヒトATP2A2またはその断片もしくは変異体をコードしてもよい。更なる別の例として、ペイロード領域は、ヒトS100A1またはその断片もしくは変異体をコードしてもよい。本明細書に記載されるポリペプチドをコードするAAVウイルスゲノムは、ヒト疾患、ウイルス、感染症、獣医学的応用の分野、ならびに様々なインビボおよびインビトロ設定において有用であり得る。
一部の実施形態において、AAV粒子は、神経学的疾患および/または障害を治療、予防、緩和、または改善するための医学分野に有用である。
一部の実施形態において、AAV粒子は、タウオパシーを治療、予防、緩和または改善するための医学分野に有用である。
一部の実施形態において、AAV粒子は、アルツハイマー病を治療、予防、緩和または改善するための医学分野に有用である。
一部の実施形態において、AAV粒子は、フリードライヒ運動失調症、またはフラタキシンタンパク質の喪失または部分的喪失が原因である任意の疾患を治療、予防、緩和または改善するための医学分野に有用である。
一部の実施形態において、AAV粒子は、パーキンソン病を治療、予防、緩和または改善するための医学分野に有用である。
一部の実施形態において、AAV粒子は、筋萎縮性側索硬化症を治療、予防、緩和または改善するための医学分野に有用である。
一部の実施形態において、AAV粒子は、ハンチントン病を治療、予防、緩和または改善するための医学分野に有用である。
一部の実施形態において、AAV粒子は、心血管疾患を治療、予防、緩和または改善するための医学分野に有用である。
ポリペプチドおよび変異体の性質
本発明のウイルスゲノムのペイロード領域によってコードされるアミノ酸配列は、1つ以上の核酸、核酸の断片または上述のいずれかの変異体によって独立してコードされ得る、ポリペプチド全体、複数のポリペプチドまたはポリペプチドの断片として翻訳され得る。本明細書で使用されるとき、「ポリペプチド」は、ほとんどの場合でペプチド結合によって一緒に連結されているアミノ酸残基(天然または非天然)のポリマーを意味する。この用語は、本明細書で使用されるとき、任意のサイズ、構造、または機能のタンパク質、ポリペプチド、およびペプチドを指す。一部の場合において、コードされたポリペプチドは、約50アミノ酸より小さく、その場合は、ポリペプチドはペプチドと称される。ポリペプチドは、ペプチドである場合、少なくとも約2、3、4、または少なくとも5アミノ酸残基長であろう。したがって、ポリペプチドとしては、遺伝子産物、天然に存在するポリペプチド、合成ポリペプチド、上述のものの相同体、オルソログ、パラログ、断片および他の均等物、変異体、および類似体が挙げられる。ポリペプチドは、単一分子であってもよく、または二量体、三量体もしくは四量体などの多分子複合体であってもよい。また、それらは、単一鎖または複数鎖のポリペプチドを含んでいてもよく、付随または連結されていてもよい。用語「ポリペプチド」は、1つ以上のアミノ酸残基が、対応する天然に存在するアミノ酸の人工的化学類似体であるアミノ酸ポリマーにも該当し得る。
用語「ポリペプチド変異体」は、それらのアミノ酸配列が天然または参照配列と異なる分子を指す。アミノ酸配列変異体は、天然または参照配列と比較して、アミノ酸配列内の特定の位置に置換、欠失、および/または挿入を有し得る。大抵の場合、変異体は、天然または参照配列に対して少なくとも約50%同一性(相同性)を有することになり、好ましくは、天然または参照配列に対して少なくとも約80%、より好ましくは少なくとも約90%同一(相同性)であるだろう。
一部の実施形態において、「変異体模倣体(variant mimics)」が提供される。本明細書で使用されるとき、用語「変異体模倣体」は、活性化配列を模倣することになる1つ以上のアミノ酸を含有するものである。例えば、グルタミン酸は、リン酸化トレオニンおよび/またはリン酸化セリンの模倣体として働きをし得る。あるいは、変異体模倣体は、模倣体を含有する非活性化または不活性化産物をもたらし得る。例えば、フェニルアラニンは、チロシンの不活化置換として作用し得る。またはアラニンは、セリンの不活化置換として作用し得る。
用語「アミノ酸配列変異体」は、天然または開始配列と比較して、それらのアミノ酸配列に、ある差異を有する分子を指す。アミノ酸配列変異体は、アミノ酸配列内の特定の位置に置換、欠失、および/または挿入を有し得る。「天然」または「開始」配列は、野生型配列と混同されるべきではない。本明細書で使用されるとき、天然または開始配列は、比較をなし得る元の分子を指す相対的用語である。「天然」または「開始」配列または分子は、野生型(自然界に見出される配列)を表してもよいが、野生型配列である必要はない。
大抵の場合、変異体は、天然配列に対して少なくとも約70%相同性を有することになり、好ましくは、天然配列に対して、少なくとも約80%、より好ましくは少なくとも約90%相同性であるだろう。「相同性」は、アミノ酸配列に適用されるとき、配列をアラインし、必要に応じてギャップを導入して最大の相同性パーセントを達成した後の、第2の配列のアミノ酸配列の残基と同一である候補アミノ酸配列の残基のパーセンテージとして定義される。アラインメントの方法およびコンピュータプログラムは、当該技術分野で周知である。相同性は、同一性パーセントの計算に依存するが、ギャップおよびペナルティが計算に導入されるため、値が異なり得ることが理解される。
「相同体」は、アミノ酸配列に適用されるとき、第2の種の第2の配列に対して実質的に同一性を有する他の種の対応する配列を意味する。
「類似体」は、1つ以上のアミノ酸変更、例えば、親ポリペプチドの特性を依然として維持する、アミノ酸残基の置換、付加、または欠失によって異なるポリペプチド変異体を含むことを意味する。
配列タグまたは1つ以上のリジンなどのアミノ酸を、本発明のペプチド配列に付加することができる(例えば、N末端またはC末端に)。配列タグは、ペプチド精製または局在化のために使用し得る。リジンは、ペプチド溶解度を増加させるために、またはビオチン化を可能にするために使用し得る。あるいは、任意選択で、ペプチドまたはタンパク質のアミノ酸配列のカルボキシおよびアミノ末端領域に位置するアミノ酸残基を欠失させて、トランケート型配列を提供してもよい。あるいは、特定のアミノ酸(例えば、C末端またはN末端残基)は、例えば、可溶性であるかまたは固体支持体に連結されているより大きな配列の一部としての配列の発現など、配列の使用に応じて欠失されてもよい。
「置換変異体」は、タンパク質を参照する場合、天然または開始配列の少なくとも1つのアミノ酸残基が除去され、その代わりに異なるアミノ酸が同じ位置に挿入されているものである。置換は、単一であってもよく、その場合は、分子中の1つのアミノ酸のみが置換されており、または複数であってもよく、その場合は、同じ分子中の2つ以上のアミノ酸が置換されている。
本明細書で使用されるとき、用語「保存的アミノ酸置換」は、サイズ、電荷、または極性が類似する異なるアミノ酸を有する配列に通常存在するアミノ酸の置換を指す。保存的置換の例としては、イソロイシン、バリンおよびロイシンなどの無極性(疎水性)残基を別の無極性残基に置換することが挙げられる。同様に、保存的置換の例としては、アルギニンとリジンとの間、グルタミンとアスパラギンとの間、およびグリシンとセリンとの間など、1つの極性(親水性)残基を別のものに置換することが挙げられる。加えて、リジン、アルギニンまたはヒスチジンなどの塩基性残基を別のものに置換すること、またはアスパラギン酸もしくはグルタミン酸などの1つの酸性残基を別の酸性残基に置換することは、保存的置換の追加の例である。非保存的置換の例としては、イソロイシン、バリン、ロイシン、アラニン、メチオニンなどの無極性(疎水性)アミノ酸残基を、システイン、グルタミン、グルタミン酸またはリジンなどの極性(親水性)残基に置換すること、および/または極性残基を無極性残基に置換することが挙げられる。
「挿入変異体」は、タンパク質を参照する場合、1つ以上のアミノ酸が、天然または開始配列の特定の位置のアミノ酸に直に隣接して挿入されているものである。アミノ酸に「直に隣接している」とは、アミノ酸のアルファ-カルボキシまたはアルファ-アミノ官能基のいずれかに接続されていることを意味する。
「欠失変異体」は、タンパク質を参照する場合、天然または開始アミノ酸配列の1つ以上のアミノ酸が除去されているものである。大抵の場合、欠失変異体は、分子の特定領域の1つ以上のアミノ酸が欠失しているだろう。
本明細書で使用されるとき、用語「誘導体」は、用語「変異体」と同義的に使用され、参照分子または開始分子と比べて任意の様式で修飾または変化されている分子を指す。一部の実施形態において、誘導体としては、有機タンパク質性または非タンパク質性誘導体化剤および翻訳後修飾によって修飾されている天然または開始タンパク質が挙げられる。共有結合修飾は、伝統的には、タンパク質の標的アミノ酸残基を、選択された側鎖または末端残基と反応可能である有機誘導体化剤と反応させることにより、または選択された組換え宿主細胞にて機能する翻訳後修飾の機序を活用することにより導入される。得られる共有結合誘導体は、生物学的活性にとって、イムノアッセイにとって、または組換え糖タンパク質の免疫親和性精製用の抗タンパク質抗体の調製にとって重要な残基の同定に向けたプログラムに有用である。かかる修飾は、当該技術分野の通常技術内にあり、過度の実験作業を行わずに実施される。
特定の翻訳後修飾は、発現されたポリペプチドに対する組換え宿主細胞の作用の結果である。グルタミニルおよびアスパラギニル残基は、対応するグルタミルおよびアスパルチル残基へと頻繁に翻訳後脱アミド化される。あるいは、これらの残基は、温和な酸性条件下で脱アミド化される。これらの残基はいずれかの形態で、本発明に従って使用されるタンパク質に存在し得る。
他の翻訳後修飾としては、プロリンおよびリジンのヒドロキシル化、セリルまたはトレオニル残基のヒドロキシル基のリン酸化、リジン、アルギニン、およびヒスチジン側鎖のアルファ-アミノ基のメチル化が挙げられる(T.E.クレイトン(T.E.Creighton)、「タンパク質:構造および分子特性」、W.H.フリーマン&CO.社(W.H.Freeman&Co.)、サンフランシスコ、p.79~86(1983年))。
「特徴」は、タンパク質を参照する場合、別個のアミノ酸配列に基づく分子成分として定義される。本発明のタンパク質の特徴としては、表面発現(surface manifestation)、局所的立体構造形状、フォールド(fold)、ループ、ハーフループ、ドメイン、ハーフドメイン、部位、末端、またはそれらの任意の組合せが挙げられる。
タンパク質を参照する際に本明細書で使用されるとき、用語「表面発現」は、最外側表面に現れる、ポリペプチドに基づくタンパク質成分を指す。
タンパク質を参照する際に本明細書で使用されるとき、用語「局所的立体構造形状」は、タンパク質の定義可能な空間内に位置する、タンパク質のポリペプチドに基づく構造的発現を意味する。
タンパク質を参照する際に本明細書で使用されるとき、用語「フォールド」は、エネルギー最小化時に得られるアミノ酸配列の立体構造を意味する。フォールドは、フォールディングプロセスの二次または三次レベルで生じ得る。二次レベルフォールドの例としては、ベータシートおよびアルファヘリックスが挙げられる。三次レベルフォールドの例としては、エネルギー力の集合または分離によって形成されるドメインおよび領域が挙げられる。このようにして形成される領域としては、疎水性および親水性ポケットなどが挙げられる。
本明細書で使用されるとき、用語「ターン」は、タンパク質立体構造に関する場合、ペプチドまたはポリペプチドの骨格の方向を変更し、1つ、2つ、または3つ以上のアミノ酸残基が関与し得る屈曲を意味する。
タンパク質を参照する際に本明細書で使用されるとき、用語「ループ」は、ペプチドまたはポリペプチドの骨格の方向を逆転させ、4つ以上のアミノ酸残基を含む、ペプチドまたはポリペプチドの構造的特徴を指す。オリバ(Oliva)らは、少なくとも5種類のタンパク質ループを同定している(ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー(J.Mol Biol)266巻(4号):p.814~830;1997年)。
タンパク質を参照する際に本明細書で使用されるとき、用語「ハーフループ」は、それが由来するループのアミノ酸残基の少なくとも半数を有する同定されたループの部分を指す。ループは、必ずしも偶数のアミノ酸残基を含有するとは限らない場合があることが理解される。したがって、ループが奇数のアミノ酸を含有するかまたは含むと同定されている場合、奇数ループのハーフループは、ループの整数部分または次の整数部分を含むことになる(ループのアミノ酸数/2+/-0.5個のアミノ酸)。例えば、7個アミノ酸のループであると同定されたループは、3個アミノ酸または4個アミノ酸のハーフループを生じさせ得る(7/2=3.5+/-0.5は、3または4である)。
タンパク質を参照する際に本明細書で使用されるとき、用語「ドメイン」は、1つ以上の同定可能な構造的または機能的特徴または特性を有する(例えば、結合能力、タンパク質間相互作用の部位として働く)ポリペプチドのモチーフを指す。
タンパク質を参照する際に本明細書で使用されるとき、用語「ハーフドメイン」は、それが由来するドメインのアミノ酸残基の少なくとも半数を有する同定されたドメインの部分を意味する。ドメインは、必ずしも偶数のアミノ酸残基を含有するとは限らない場合があることが理解される。したがって、ドメインが奇数のアミノ酸を含有するかまたは含むと同定されている場合、奇数ドメインのハーフドメインは、ドメインの整数部分または次の整数部分を含むことになる(ドメインのアミノ酸数/2+/-0.5個のアミノ酸)。例えば、7個アミノ酸のドメインであると同定されたドメインは、3個アミノ酸または4個アミノ酸のハーフドメインを生じさせ得る(7/2=3.5+/-0.5は、3または4である)。ドメインまたはハーフドメイン内にはサブドメインが同定される場合があり、そうしたサブドメインは、それらが由来したドメインまたはハーフドメインに同定される構造的または機能的特性の全てよりも少ない特性を有することも理解される。ドメインタイプのいずれかを含むアミノ酸は、本明細書では、ポリペプチドの骨格に沿って連続している必要はない(すなわち、非隣接アミノ酸が構造的にフォールディングして、ドメイン、ハーフドメインまたはサブドメインを生じさせ得る)ことも理解される。
タンパク質を参照する際に本明細書で使用されるとき、用語「部位」は、アミノ酸に基づく実施形態に関する場合、「アミノ酸残基」および「アミノ酸側鎖」と同義的に使用される。部位は、本発明のポリペプチドに基づく分子内で修飾、マニピュレート、変更、誘導体化、または変異され得るペプチドまたはポリペプチド内の位置を表す。
本明細書で使用されるとき、用語「末端(複数)または末端」は、タンパク質を参照する場合、ペプチドまたはポリペプチドの端部を指す。かかる端部は、ペプチドまたはポリペプチドの最初または最後の部位のみに限定されず、末端領域にある追加のアミノ酸を含み得る。本発明のポリペプチドに基づく分子は、N末端(遊離アミノ基(NH2)を有するアミノ酸によって終端されている)およびC末端(遊離カルボキシル基(COOH)を有するアミノ酸によって終端されている)を両方とも有すると特徴付けされ得る。本発明のタンパク質は、一部の場合、ジスルフィド結合または非共有結合力によって一緒にされた複数のポリペプチド鎖でできている(マルチマー、オリゴマー)。そうした種類のタンパク質は、複数のN末端およびC末端を有することになる。あるいは、ポリペプチドの末端は、場合によっては、有機コンジュゲートなどの非ポリペプチドに基づく部分から始まるかまたは終わるように修飾されてもよい。
特徴のいずれかが本発明の分子の成分として同定または定義されたら、そうした特徴の幾つかのマニピュレーションおよび/または修飾はいずれも、移動、交換、逆転、欠失、無作為化または複製によって実施することができる。更に、特徴のマニピュレーションは、本発明の分子に対する修飾と同じ結果をもたらし得ることが理解される。例えば、ドメイン欠失が関与するマニピュレーションは、全長未満の分子をコードするような核酸の修飾が変更することになる場合とまったく同じように、分子の長さの変更をもたらすだろう。
修飾およびマニピュレーションは、指定部位突然変異誘発などの当該技術分野で公知の方法により達成することができる。その後、得られた修飾分子を、本明細書に記載されるようなものなどのインビトロもしくはインビボアッセイまたは当該技術分野で公知の任意の他の好適なスクリーニングアッセイを使用して、活性について試験してもよい。
ペイロード:目的のタンパク質をコードする核酸
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、目的のタンパク質をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
アポリポタンパク質E(APOE)
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、アポリポタンパク質E(APOE)遺伝子(例えば、ApoE2、ApoE3、および/またはApoE4)の対立遺伝子をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、配列MKVLWAALLVTFLAGCQA(配列番号1722)を有するアミノ酸シグナルペプチドをコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、配列MSSGASRKSWDPGNPWPPDWPITGRKMKVLWAALLVTFLAGCQA(配列番号1723)を有するアミノ酸シグナルペプチドをコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表2に記載されるアミノ酸配列またはその断片もしくはその変異体をコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表2に記載される核酸配列またはその断片もしくはその変異体を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、配列番号1724の1つ以上の変異体をコードする1つ以上の核酸配列を含む。変異体は、限定はされないが、以下の変異体、E21K(配列番号1724の21位のアミノ酸E(Glu)がK(Lys)に変化されている)、E31K(配列番号1724の31位のアミノ酸E(Glu)がK(Lys)に変化されている)、R43C(配列番号1724の43位のアミノ酸R(Arg)がC(Cys)に変化されている)、L46P(配列番号1724の46位のアミノ酸L(Leu)がP(Pro)に変化されている)、T60A(配列番号1724の60位のアミノ酸T(Thr)がA(Ala)に変化されている)、Q64H(配列番号1724の64位のアミノ酸Q(Gln)がH(His)に変化されている)、Q99K(配列番号1724の99位のアミノ酸Q(Gln)がK(Lys)に変化されている)、P102R(配列番号1724の102位のアミノ酸P(Pro)がR(Arg)に変化されている)、A117T(配列番号1724の117位のアミノ酸A(Ala)がT(Thr)に変化されている)、A124V(配列番号1724の124位のアミノ酸A(Ala)がV(Val)に変化されている)、C130R(配列番号1724の130位のアミノ酸C(Cys)がR(Arg)に変化されている)、G145D(配列番号1724の145位のアミノ酸G(Gly)がD(Asp)に変化されている)、G145GEVQAMLG(配列番号1724の145位のアミノ酸G(Gly)がGEVQAMLG(Gly-Glu-Val-Gln-Ala-Met-Leu-Gly)に変化されている)、R152Q(配列番号1724の152位のアミノ酸R(Arg)がQ(Gln)に変化されている)、R154C(配列番号1724の154位のアミノ酸R(Arg)がC(Cys)に変化されている)、R154S(配列番号1724の154位のアミノ酸R(Arg)がS(Ser)に変化されている)、R160C(配列番号1724の160位のアミノ酸R(Arg)がC(Cys)に変化されている)、R163H(配列番号1724の163位のアミノ酸R(Arg)がH(His)に変化されている)、R163P(配列番号1724の163位のアミノ酸R(Arg)がP(Pro)に変化されている)、K164E(配列番号1724の164位のアミノ酸K(Lys)がE(Glu)に変化されている)、K164Q(配列番号1724の164位のアミノ酸K(Lys)がQ(Gln)に変化されている)、A170P(配列番号1724の170位のアミノ酸A(Ala)がP(Pro)に変化されている)、R176C(配列番号1724の176位のアミノ酸R(Arg)がC(Cys)に変化されている)、R242Q(配列番号1724の242位のアミノ酸R(Arg)がQ(Gln)に変化されている)、R246C(配列番号1724の246位のアミノ酸R(Arg)がC(Cys)に変化されている)、V254E(配列番号1724の254位のアミノ酸V(Val)がE(Glu)に変化されている)、EE262-263KK(配列番号1724の262~263位のアミノ酸EE(Glu-Glu)がKK(Lys-Lys)に変化されている)、R269G(配列番号1724の269位のアミノ酸R(Arg)がG(Gly)に変化されている)、L270E(配列番号1724の270位のアミノ酸L(Leu)がE(Glu)に変化されている)、R292H(配列番号1724の292位のアミノ酸R(Arg)がH(His)に変化されている)、S314R(配列番号1724の314位のアミノ酸S(Ser)がR(Arg)に変化されている)、アミノ酸167の除去、またはそれらの組合せの1つ以上を含み得る。非限定的な例として、AAV粒子のペイロード領域は、配列番号1724の130位のアミノ酸C(Cys)がR(Arg)に変化されているアミノ酸配列をコードする1つ以上の核酸配列を含む。非限定的な例として、AAV粒子のペイロード領域は、配列番号1724の176位のアミノ酸R(Arg)がC(Cys)に変化されているアミノ酸配列をコードする1つ以上の核酸配列を含む。非限定的な例として、AAV粒子のペイロード領域は、配列番号1724の130位のアミノ酸C(Cys)がRに変化されており、配列番号1724の176位のアミノ酸R(Arg)がC(Cys)に変化されているアミノ酸配列をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一部の実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、配列番号1722または1723に示されるようなシグナルペプチド配列を含むApoE分子をコードする1つ以上の核酸配列を含む。非限定的な例として、シグナルペプチドは、細胞プロセシング中に切断されて、配列番号1725、1727、1729、1731、および1733に示されるような成熟ペプチドを産出する。あるいは、AAV粒子のペイロード領域は、配列番号1725、1727、1729、1731、および1733に示されるような、シグナルペプチド配列を欠如するApoE分子をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、配列番号1725の1つ以上の変異体をコードする1つ以上の核酸配列を含む。変異体は、限定はされないが、以下の変異体、C112R(配列番号1725の112位のアミノ酸C(Cys)がR(Arg)に変化されている)またはR158C(配列番号1725の158位のアミノ酸R(Arg)がC(Cys)に変化されている)の1つ以上を含み得る。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、ApoE2(cys112、cys158)をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、ApoE3(cys112、arg158)をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、ApoE4(arg112、arg158)をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
フラタキシン(FXN)
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、フラタキシン(FXN)をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表3に記載されるアミノ酸配列またはその断片もしくはその変異体をコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表3に記載される核酸配列またはその断片もしくはその変異体を含む。
芳香族L-アミノ酸デカルボキシラーゼ(AADC)
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、芳香族L-アミノ酸デカルボキシラーゼ(AADC)をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表4に記載されるアミノ酸配列またはその断片もしくはその変異体をコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表4に記載される核酸配列またはその断片もしくはその変異体を含む。
ATPアーゼ筋小胞体Ca2+輸送2(ATP2A2、ATPase Sarcoplasmic/Endoplasmic Reticulum Ca2+ Transporting2)
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、ATPアーゼ筋小胞体Ca2+輸送2(ATP2A2)をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表5に記載されるアミノ酸配列またはその断片もしくはその変異体をコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表5に記載される核酸配列またはその断片もしくはその変異体を含む。
S100カルシウム結合タンパク質A1(S100A1)
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、S100カルシウム結合タンパク質A1(S100A1)をコードする1つ以上の核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表6に記載されるアミノ酸配列またはその断片もしくはその変異体をコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表6に記載される核酸配列またはその断片もしくはその変異体を含む。
抗タウ対らせん状細線維(タウ-PHF)抗体
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、フォールディング異常タウタンパク質によって形成される対らせん状細線維(PHF)(タウ-PHF)に特異的な抗体の重鎖および/または軽鎖をコードする1つ以上の核酸配列を含む。ペイロード領域は、重鎖および軽鎖をコードする核酸配列間にリンカー領域をコードする1つ以上の核酸配列もまた含み得る。非限定的な例として、リンカー領域は、フューリン切断認識配列(配列番号1811として示される核酸配列)および/または2A cis作用性ヒドロラーゼエレメント(配列番号1812として示される核酸配列)を含む。非限定的な例として、リンカー領域の核酸配列は、配列番号1813である。非限定的な例として、タウ対らせん状細線維に特異的に結合する抗体はPHF-1である。PHF-1抗体は、本開示で教示されるような重鎖および軽鎖を含み得る。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表7に記載されるアミノ酸配列またはその断片もしくはその変異体をコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、表7に記載される核酸配列またはその断片もしくはその変異体を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、国際公開第2015035190号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)の図5Aに記載される、コザック(配列番号1817)、重鎖(配列番号1814)、リンカー領域(フューリン切断認識配列(配列番号1811)および2Aシス作用性ヒドロラーゼエレメント配列(配列番号1812)を含む)、PHF-1の軽鎖配列(配列番号1812)、および終止コドンTAGを含む(5’から3’に)核酸配列配列番号1816を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、コザック(配列番号1817)、軽鎖(配列番号1815)、リンカー領域(フューリン切断認識配列(配列番号1811)および2Aシス作用性ヒドロラーゼエレメント配列(配列番号1812)を含む)、PHF-1の重鎖(配列番号1814)、および終止コドンTAGを含む(5’から3’に)核酸配列配列番号1818を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、国際公開第2015035190号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)の図5Aに教示されるようなPHF-1の重鎖および/または軽鎖をコードする核酸を含み、国際公開第2015035190号パンフレットのPHF-1の重鎖および/または軽鎖は変更されている(例えば、修飾および/または突然変異されている)。配列は、分子の状態または構造を変化させるように突然変異または修飾されてもよい。非限定的な例として、配列は、アミノ酸の付加、アミノ酸置換、および/またはアミノ酸の欠失を含み得る。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、軽鎖配列が、軽鎖アミノ酸配列の始めから2番目のメチオニンを除去するように変更されているPHF-1の軽鎖をコードする核酸を含む。非限定的な例として、AAV粒子のペイロード領域は、表8に示されるようなPHF-1の軽鎖をコードするアミノ酸配列をコードする核酸を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、コザック(配列番号1817)、重鎖(配列番号1814)、リンカー領域(フューリン切断認識配列(配列番号1811)および2Aシス作用性ヒドロラーゼエレメント配列(配列番号1812)を含む)、PHF-1の軽鎖配列の5’末端に1つの「ATG」コドンを有する軽鎖配列(配列番号1819)、および終止コドンTAGを含む(5’から3’に)核酸配列配列番号1820を含む。
一実施形態において、AAV粒子のペイロード領域は、コザック(配列番号1817)、軽鎖配列の5’末端に1つの「ATG」コドンを有する軽鎖配列(配列番号1819)、リンカー領域(フューリン切断認識配列(配列番号1811)および2Aシス作用性ヒドロラーゼエレメント配列(配列番号1812)を含む)、PHF-1の重鎖(配列番号1814)、および終止コドンTAGを含む(5’から3’に)核酸配列配列番号1821を含む。
ペイロード:ペイロードとしての調節性ポリヌクレオチド
本開示のAAV粒子は、治療剤として1つ以上の調節性ポリヌクレオチド、例えばRNA分子またはDNA分子を含む少なくとも1つのペイロード領域を含む。例示的な調節性ポリヌクレオチドは、miRNA、dsRNA、およびsiRNA二重鎖であってもよい。RNA干渉媒介性遺伝子サイレンシングは、標的遺伝子発現を特異的に阻害することができる。次に本発明は、目的の遺伝子を標的とする低分子二本鎖RNA(dsRNA)分子(低分子干渉RNA、siRNA)、かかるsiRNAを含む医薬組成物、ならびにそれらの設計方法を提供する。本発明はまた、神経学的疾患を治療するために目的の遺伝子の遺伝子発現およびタンパク質産生を阻害するための、それらの使用方法も提供する。
本発明は、遺伝子発現および/またはタンパク質産生に干渉するために目的の遺伝子のmRNAを標的とする低分子干渉RNA(siRNA)二重鎖(およびそれらをコードする調節性ポリヌクレオチド)を提供する。
一実施形態において、本発明のsiRNA二重鎖は、それらの対応するヌクレオチド配列の任意のセグメントにある目的の遺伝子を標的とすることができる。
一実施形態において、本発明のsiRNA二重鎖は、ヌクレオチド配列内の目的の遺伝子の一塩基多型(SNP)または変異体の位置を標的とすることができる。
一部の実施形態において、かかるsiRNA分子、またはsiRNA分子の単一鎖をコードする核酸配列は、AAV粒子のウイルスゲノムに挿入され、細胞、具体的には中枢神経系の細胞へと導入される。
AAV粒子は、幾つかのユニークな特徴があるため、siRNA送達が研究されている。特徴の非限定的な例としては、(i)分裂細胞および非分裂細胞の両方に感染する能力があること;(ii)ヒト細胞を含めた感染の宿主範囲が広域であること;(iii)野生型AAVはいかなる疾患とも関連しておらず、および感染細胞で複製しないことが示されていること;(iv)ベクターに対する細胞媒介性免疫応答を欠如すること、および(v)宿主染色体に組み込まれないという性質があり、それにより長期発現の可能性が低減されることが挙げられる。更に、AAV粒子による感染は、細胞遺伝子発現パターンの変化に及ぼす影響が最小限である(スティルウェル(Stilwell)およびサムルスキ(Samulski)ら著、バイオテクニクス(Biotechniques)、2003年、第34巻、p.148~150、この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
本発明のコード化siRNA二重鎖は、共にハイブリダイズして二重鎖構造を形成するアンチセンス鎖とセンス鎖とを含有し、アンチセンス鎖は、標的遺伝子の核酸配列に相補的であり、センス鎖は標的遺伝子の核酸配列に相同である。一部の態様において、アンチセンス鎖の5’末端は5’リン酸基を有し、センス鎖の3’末端は3’ヒドロキシル基を含有する。他の態様において、各鎖の3’末端にはヌクレオチド突出がない、1つある、または2つある。
本発明によれば、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖の各鎖は約19~25、19~24または19~21ヌクレオチド長、好ましくは約19ヌクレオチド、20ヌクレオチド、21ヌクレオチド、22ヌクレオチド、23ヌクレオチド、24ヌクレオチド、または25ヌクレオチド長である。一部の態様において、siRNAは未修飾RNA分子であってもよい。
他の態様において、siRNAは、塩基修飾、糖修飾または骨格修飾など、少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを含有し得る。
一実施形態において、siRNAまたはdsRNAは、互いに相補的である少なくとも2つの配列を含む。dsRNAは、第1の配列を有するセンス鎖および第2の配列を有するアンチセンス鎖を含む。アンチセンス鎖は、標的遺伝子をコードするmRNAの少なくとも一部と実質的に相補的なヌクレオチド配列を含み、相補性の領域は30ヌクレオチド以下、および少なくとも15ヌクレオチド長である。概して、dsRNAは19~25、19~24または19~21ヌクレオチド長である。一部の実施形態において、dsRNAは約15~約25ヌクレオチド長であり、他の実施形態において、dsRNAは約25~約30ヌクレオチド長である。一部の実施形態において、dsRNAは、約15ヌクレオチド長、16ヌクレオチド長、17ヌクレオチド長、18ヌクレオチド長、19ヌクレオチド、20ヌクレオチド、21ヌクレオチド、22ヌクレオチド、23ヌクレオチド、24ヌクレオチド長、25ヌクレオチド長、26ヌクレオチド長、27ヌクレオチド長、28ヌクレオチド長、29ヌクレオチド長、または30ヌクレオチド長である。
dsRNAは、直接投与されるかまたは発現ベクターにコードされるかに関わらず、標的タンパク質を発現する細胞と接触すると、本明細書に記載されるような方法などによってアッセイして、タンパク質の発現を少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%または少なくとも40%またはそれ以上阻害する。
本発明によれば、siRNA二重鎖またはdsRNA分子を設計し、培養細胞において標的遺伝子の発現(例えば、標的遺伝子のmRNAレベル)を低減するそれらの能力を試験する。当該技術分野では、siRNA設計ツールが利用可能である。任意の市販ソフトウェアを使用して、目的の遺伝子に対するsiRNA二重鎖を設計することができる。
本発明によれば、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖、siRNA二重鎖またはdsRNAの一方の鎖の核酸を有するペイロード領域を含むAAV粒子が産生され、AAV粒子血清型は、限定はされないが、以下のカプシドおよび/またはペプチドインサート、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5(G2B5)、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3-3、AAV4、AAV4-4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42-1b、AAV42-2、AAV42-3a、AAV42-3b、AAV42-4、AAV42-5a、AAV42-5b、AAV42-6b、AAV42-8、AAV42-10、AAV42-11、AAV42-12、AAV42-13、AAV42-15、AAV42-aa、AAV43-1、AAV43-12、AAV43-20、AAV43-21、AAV43-23、AAV43-25、AAV43-5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1-7/rh.48、AAV1-8/rh.49、AAV2-15/rh.62、AAV2-3/rh.61、AAV2-4/rh.50、AAV2-5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3-9/rh.52、AAV3-11/rh.53、AAV4-8/r11.64、AAV4-9/rh.54、AAV4-19/rh.55、AAV5-3/rh.57、AAV5-22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH-1/hu.1、AAVH-5/hu.3、AAVLG-10/rh.40、AAVLG-4/rh.38、AAVLG-9/hu.39、AAVN721-8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R突然変異体、AAVrh8R R533A突然変異体、AAAV、BAAV、ヤギAAV、ウシAAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV-PAEC、AAV-LK01、AAV-LK02、AAV-LK03、AAV-LK04、AAV-LK05、AAV-LK06、AAV-LK07、AAV-LK08、AAV-LK09、AAV-LK10、AAV-LK11、AAV-LK12、AAV-LK13、AAV-LK14、AAV-LK15、AAV-LK16、AAV-LK17、AAV-LK18、AAV-LK19、AAV-PAEC2、AAV-PAEC4、AAV-PAEC6、AAV-PAEC7、AAV-PAEC8、AAV-PAEC11、AAV-PAEC12、AAV-2-pre-miRNA-101、AAV-8h、AAV-8b、AAV-h、AAV-b、AAV SM10-2、AAVシャッフル100-1、AAVシャッフル100-3、AAVシャッフル100-7、AAVシャッフル10-2、AAVシャッフル10-6、AAVシャッフル10-8、AAVシャッフル100-2、AAV SM10-1、AAV SM10-8、AAV SM100-3、AAV SM100-10、BNP61 AAV、BNP62 AAV、BNP63 AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4-8/rh.64、AAVLG-9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、トゥルータイプAAV(ttAAV)、UPENN AAV10、日本AAV10血清型、AAV CBr-7.1、AAV CBr-7.10、AAV CBr-7.2、AAV CBr-7.3、AAV CBr-7.4、AAV CBr-7.5、AAV CBr-7.7、AAV CBr-7.8、AAV CBr-B7.3、AAV CBr-B7.4、AAV CBr-E1、AAV CBr-E2、AAV CBr-E3、AAV CBr-E4、AAV CBr-E5、AAV CBr-e5、AAV CBr-E6、AAV CBr-E7、AAV CBr-E8、AAV CHt-1、AAV CHt-2、AAV CHt-3、AAV CHt-6.1、AAV CHt-6.10、AAV CHt-6.5、AAV CHt-6.6、AAV CHt-6.7、AAV CHt-6.8、AAV CHt-P1、AAV CHt-P2、AAV CHt-P5、AAV CHt-P6、AAV CHt-P8、AAV CHt-P9、AAV CKd-1、AAV CKd-10、AAV CKd-2、AAV CKd-3、AAV CKd-4、AAV CKd-6、AAV CKd-7、AAV CKd-8、AAV CKd-B1、AAV CKd-B2、AAV CKd-B3、AAV CKd-B4、AAV CKd-B5、AAV CKd-B6、AAV CKd-B7、AAV CKd-B8、AAV CKd-H1、AAV CKd-H2、AAV CKd-H3、AAV CKd-H4、AAV CKd-H5、AAV CKd-H6、AAV CKd-N3、AAV CKd-N4、AAV CKd-N9、AAV CLg-F1、AAV CLg-F2、AAV CLg-F3、AAV CLg-F4、AAV CLg-F5、AAV CLg-F6、AAV CLg-F7、AAV CLg-F8、AAV CLv-1、AAV CLv1-1、AAV Clv1-10、AAV CLv1-2、AAV CLv-12、AAV CLv1-3、AAV CLv-13、AAV CLv1-4、AAV Clv1-7、AAV Clv1-8、AAV Clv1-9、AAV CLv-2、AAV CLv-3、AAV CLv-4、AAV CLv-6、AAV CLv-8、AAV CLv-D1、AAV CLv-D2、AAV CLv-D3、AAV CLv-D4、AAV CLv-D5、AAV CLv-D6、AAV CLv-D7、AAV CLv-D8、AAV CLv-E1、A
AV CLv-K1、AAV CLv-K3、AAV CLv-K6、AAV CLv-L4、AAV CLv-L5、AAV CLv-L6、AAV CLv-M1、AAV CLv-M11、AAV CLv-M2、AAV CLv-M5、AAV CLv-M6、AAV CLv-M7、AAV CLv-M8、AAV CLv-M9、AAV CLv-R1、AAV CLv-R2、AAV CLv-R3、AAV CLv-R4、AAV CLv-R5、AAV CLv-R6、AAV CLv-R7、AAV CLv-R8、AAV CLv-R9、AAV CSp-1、AAV CSp-10、AAV CSp-11、AAV CSp-2、AAV CSp-3、AAV CSp-4、AAV CSp-6、AAV CSp-7、AAV CSp-8、AAV CSp-8.10、AAV CSp-8.2、AAV CSp-8.4、AAV CSp-8.5、AAV CSp-8.6、AAV CSp-8.7、AAV CSp-8.8、AAV CSp-8.9、AAV CSp-9、AAV.hu.48R3、AAV.VR-355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AAVF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8、および/またはAAVF9/HSC9、ならびにそれらの変異体であってもよくまたはそれを含んでもよい。
一実施形態において、siRNA二重鎖またはコード化dsRNA分子を使用して、標的タンパク質の発現を、少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%または95~100%低減させることができる。非限定的な例として、標的タンパク質の発現は50~90%低減し得る。
一実施形態において、siRNA二重鎖またはコード化dsRNA分子を使用して、標的mRNAの発現を、少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%または95~100%低減させることができる。非限定的な例として、標的mRNAの発現は50~90%低減し得る。
一実施形態において、siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、CNSの少なくとも1つの領域における標的タンパク質および/またはmRNAの発現を低減させることができる。標的タンパク質および/またはmRNAの発現は、CNSの少なくとも1つの領域において、少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%低減される。非限定的な例として、ニューロン(例えば、皮質ニューロン)における標的タンパク質およびmRNAの発現は、50~90%低減される。非限定的な例として、ニューロン(例えば、皮質ニューロン)における標的タンパク質およびmRNAの発現は、40~50%低減される。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含む本発明のAAV粒子を、疾患、例えば神経学的障害または心血管疾患を治療および/または改善する必要のある対象に投与する。AAV粒子血清型は、限定はされないが、以下のペプチド、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3-3、AAV4、AAV4-4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42-1b、AAV42-2、AAV42-3a、AAV42-3b、AAV42-4、AAV42-5a、AAV42-5b、AAV42-6b、AAV42-8、AAV42-10、AAV42-11、AAV42-12、AAV42-13、AAV42-15、AAV42-aa、AAV43-1、AAV43-12、AAV43-20、AAV43-21、AAV43-23、AAV43-25、AAV43-5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1-7/rh.48、AAV1-8/rh.49、AAV2-15/rh.62、AAV2-3/rh.61、AAV2-4/rh.50、AAV2-5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3-9/rh.52、AAV3-11/rh.53、AAV4-8/r11.64、AAV4-9/rh.54、AAV4-19/rh.55、AAV5-3/rh.57、AAV5-22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH-1/hu.1、AAVH-5/hu.3、AAVLG-10/rh.40、AAVLG-4/rh.38、AAVLG-9/hu.39、AAVN721-8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R突然変異体、AAVrh8R R533A突然変異体、AAAV、BAAV、ヤギAAV、ウシAAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV-PAEC、AAV-LK01、AAV-LK02、AAV-LK03、AAV-LK04、AAV-LK05、AAV-LK06、AAV-LK07、AAV-LK08、AAV-LK09、AAV-LK10、AAV-LK11、AAV-LK12、AAV-LK13、AAV-LK14、AAV-LK15、AAV-LK16、AAV-LK17、AAV-LK18、AAV-LK19、AAV-PAEC2、AAV-PAEC4、AAV-PAEC6、AAV-PAEC7、AAV-PAEC8、AAV-PAEC11、AAV-PAEC12、AAV-2-pre-miRNA-101、AAV-8h、AAV-8b、AAV-h、AAV-b、AAV SM10-2、AAVシャッフル100-1、AAVシャッフル100-3、AAVシャッフル100-7、AAVシャッフル10-2、AAVシャッフル10-6、AAVシャッフル10-8、AAVシャッフル100-2、AAV SM10-1、AAV SM10-8、AAV SM100-3、AAV SM100-10、BNP61 AAV、BNP62 AAV、BNP63 AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4-8/rh.64、AAVLG-9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、トゥルータイプAAV(ttAAV)、UPENN AAV10、日本AAV10血清型、AAV CBr-7.1、AAV CBr-7.10、AAV CBr-7.2、AAV CBr-7.3、AAV CBr-7.4、AAV CBr-7.5、AAV CBr-7.7、AAV CBr-7.8、AAV CBr-B7.3、AAV CBr-B7.4、AAV CBr-E1、AAV CBr-E2、AAV CBr-E3、AAV CBr-E4、AAV CBr-E5、AAV CBr-e5、AAV CBr-E6、AAV CBr-E7、AAV CBr-E8、AAV CHt-1、AAV CHt-2、AAV CHt-3、AAV CHt-6.1、AAV CHt-6.10、AAV CHt-6.5、AAV CHt-6.6、AAV CHt-6.7、AAV CHt-6.8、AAV CHt-P1、AAV CHt-P2、AAV CHt-P5、AAV CHt-P6、AAV CHt-P8、AAV CHt-P9、AAV CKd-1、AAV CKd-10、AAV CKd-2、AAV CKd-3、AAV CKd-4、AAV CKd-6、AAV CKd-7、AAV CKd-8、AAV CKd-B1、AAV CKd-B2、AAV CKd-B3、AAV CKd-B4、AAV CKd-B5、AAV CKd-B6、AAV CKd-B7、AAV CKd-B8、AAV CKd-H1、AAV CKd-H2、AAV CKd-H3、AAV CKd-H4、AAV CKd-H5、AAV CKd-H6、AAV CKd-N3、AAV CKd-N4、AAV CKd-N9、AAV CLg-F1、AAV CLg-F2、AAV CLg-F3、AAV CLg-F4、AAV CLg-F5、AAV CLg-F6、AAV CLg-F7、AAV CLg-F8、AAV CLv-1、AAV CLv1-1、AAV Clv1-10、AAV CLv1-2、AAV CLv-12、AAV CLv1-3、AAV CLv-13、AAV CLv1-4、AAV Clv1-7、AAV Clv1-8、AAV Clv1-9、AAV CLv-2、AAV CLv-3、AAV CLv-4、AAV CLv-6、AAV CLv-8、AAV CLv-D1、AAV CLv-D2、AAV CLv-D3、AAV CLv-D4、AAV CLv-D5、AAV CLv-D6、AAV CLv-D7、AAV CLv-D8、AAV CL
v-E1、AAV CLv-K1、AAV CLv-K3、AAV CLv-K6、AAV CLv-L4、AAV CLv-L5、AAV CLv-L6、AAV CLv-M1、AAV CLv-M11、AAV CLv-M2、AAV CLv-M5、AAV CLv-M6、AAV CLv-M7、AAV CLv-M8、AAV CLv-M9、AAV CLv-R1、AAV CLv-R2、AAV CLv-R3、AAV CLv-R4、AAV CLv-R5、AAV CLv-R6、AAV CLv-R7、AAV CLv-R8、AAV CLv-R9、AAV CSp-1、AAV CSp-10、AAV CSp-11、AAV CSp-2、AAV CSp-3、AAV CSp-4、AAV CSp-6、AAV CSp-7、AAV CSp-8、AAV CSp-8.10、AAV CSp-8.2、AAV CSp-8.4、AAV CSp-8.5、AAV CSp-8.6、AAV CSp-8.7、AAV CSp-8.8、AAV CSp-8.9、AAV CSp-9、AAV.hu.48R3、AAV.VR-355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AAVF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8、および/またはAAVF9/HSC9、ならびにそれらの変異体であってもよくまたはそれを含んでもよい。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含むAAVPHP.B粒子(PHP.Bペプチドインサートを含むAAV粒子)を、神経学的疾患を治療および/または改善する必要のある対象に投与する。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含むAAVPHP.A粒子(PHP.Aペプチドインサートを含むAAV粒子)を、神経学的疾患を治療および/または改善する必要のある対象に投与する。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含むAAVPHP.N粒子(PHP.Nペプチドインサートを含むAAV粒子)を、神経学的疾患を治療および/または改善する必要のある対象に投与する。
一部の実施形態において、PHP.Sペプチドインサートを含むAAV粒子は、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含み、AAV粒子は、神経学的疾患を治療および/または改善する必要のある対象に投与され得る。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含むVOY101の血清型を有するAAV粒子を、神経学的疾患を治療および/または改善する必要のある対象に投与する。一実施形態において、VOY101カプシドは、配列番号1の核酸配列を含む。一実施形態において、VOY101カプシドは、配列番号1809の核酸配列を含む。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含むVOY201の血清型を有するAAV粒子を、神経学的疾患を治療および/または改善する必要のある対象に投与する。一実施形態において、VOY201カプシドは、配列番号1810の核酸配列を含む。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含むAAV9の変異体の血清型を有するAAV粒子を、神経学的疾患を治療および/または改善する必要のある対象に投与する。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖(例えばペイロード)の核酸配列を含む第1のAAV粒子を、対象への投与のために選択してもよく、第1のAAV粒子は、同じペイロードを含む第2のAAV粒子と比較して、より高いレベルのウイルスゲノムを細胞(例えばアストロサイト)に提供する。一実施形態において、第1のウイルスゲノムのレベルは、細胞(例えばアストロサイト)において、第2のAAV粒子の対象の細胞におけるレベルと比較して、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1、2、3、4、5、6、7、8、9倍または9倍よりも高い。一実施形態において、第1のウイルスゲノムのレベルは、細胞(例えばアストロサイト)において、第2のウイルスゲノムのレベルよりも、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超高い。一実施形態において、第1のウイルスゲノムのレベルは、細胞(例えばアストロサイト)において、第2のウイルスゲノムのレベルよりも、1~10%、5~10%、10~15%、10~20%、15~20%、20~30%、25~30%、25~35%、30~35%、30~40%、35~40%、35~45%、40~45%、40~50%、45~50%、45~55%、50~55%、50~60%、55~60%、55~65%、60~65%、60~70%、65~70%、65~75%、70~75%、70~80%、75~80%、75~85%、80~85%、80~90%、85~90%、85~95%、90~95%、90~99%、または95~99%高い。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列を含む第1のAAV粒子を、対象への投与のために選択してもよく、第1のAAV粒子は、対象の肝臓に見られる量と比較して、より多くのウイルスゲノムをアストロサイトに提供する。第1の粒子は、肝臓における量と比較して、1、2、3、4、5、6、7、8、9倍、または9倍よりも多くのウイルスゲノムをアストロサイトに提供する。
一部の実施形態において、siRNA分子またはかかるsiRNA分子を含むAAV粒子は、対象の中枢神経系へと直接、例えば被殻への注入によって導入されてもよい。
一部の実施形態において、siRNA分子またはかかるsiRNA分子を含むAAV粒子は、対象の中枢神経系へと直接、例えば対象の視床への注入によって導入されてもよい。
一部の実施形態において、siRNA分子またはかかるsiRNA分子を含むAAV粒子は、対象の中枢神経系へと直接、例えば対象の白質への注入によって導入されてもよい。
一部の実施形態において、siRNA分子またはかかるsiRNA分子を含むAAV粒子は、対象の中枢神経系に、例えば対象への静脈内投与によって導入されてもよい。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖を含むAAV粒子は、疾患を治療するための単独療法として、または例えばニューロン変性を治療するための1つ以上の神経保護剤と併用した併用療法として使用され得る。
siRNA分子
本発明は、神経学的障害を治療するための、RNA干渉(RNAi)誘導性遺伝子発現阻害に関する。本明細書には、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNA(本明細書では、「siRNA分子」と総称される)が提供される。かかるsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、細胞、例えばアストロサイトまたはミクログリア、皮質ニューロン、海馬ニューロン、嗅内ニューロン、視床ニューロン、感覚ニューロンまたは運動ニューロンにおける標的遺伝子発現を低減またはサイレンシングして、それにより神経学的疾病の症状を改善することができる。
RNAi(転写後遺伝子サイレンシング(PTGS)、クエリング(quelling)、または共抑制としても知られる)は、RNA分子が、典型的には特定のmRNA分子の破壊を引き起こすことによって遺伝子発現を配列特異的様式で阻害する転写後遺伝子サイレンシング過程である。RNAiの活性成分は、典型的には15~30ヌクレオチド(例えば、19~25、19~24または19~21ヌクレオチド)および2ヌクレオチド3’突出を含有し、標的遺伝子の核酸配列と一致する、低分子干渉RNA(siRNA)と呼ばれる短鎖/低分子二本鎖RNA(dsRNA)である。これらの短鎖RNA種は、インビボでは、より大きなdsRNAのダイサー媒介性切断によって天然に産生される場合があり、哺乳類細胞にて機能性である。
マイクロRNA(miRNA)と名付けられる、天然に発現される低分子RNA分子は、mRNAの発現を制御することによって遺伝子サイレンシングを誘発する。miRNAを含有するRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)は、シード領域と呼ばれるmiRNAの5’領域のヌクレオチド2~7と完全な配列相補性を表すmRNAおよびその3’領域との他の塩基対を標的とする。遺伝子発現のmiRNA媒介性下方制御は、標的mRNAの切断、標的mRNAの翻訳阻害、またはmRNA分解によって引き起こされ得る。miRNA標的配列は、通常、標的mRNAの3’-UTRに位置する。単一のmiRNAが、種々の遺伝子の100個よりも多くの転写物を標的としてもよく、1つのmRNAが、異なるmiRNAにより標的とされてもよい。
特定のmRNAを標的とするsiRNA二重鎖またはdsRNAを設計し、インビトロで合成し、RNAi過程を活性化させるため細胞へと導入してもよい。エルバシール(Elbashir)らは、21ヌクレオチドsiRNA二重鎖(低分子干渉RNAと称される)が、哺乳類細胞において免疫応答を誘導することなく強力で特異的な遺伝子ノックダウンを生じさせることが可能だったことを実証した(エルバシール・SM(Elbashir SM)ら著、ネイチャー(Nature)、2001年、第411巻、p.494~498)。この最初の報告以来、siRNAによる転写後遺伝子サイレンシングは、哺乳類細胞における強力な遺伝子解析ツールとして急速に浮上しており、新規療法を生み出す可能性を秘めている。
RNAiを活性化させるため、インビトロ合成したsiRNA分子を細胞へと導入してもよい。外因性siRNA二重鎖は、細胞へと導入されると、内因性dsRNAと同様にアセンブルされて、siRNA二重鎖の2本の鎖のうちの一方(すなわちアンチセンス鎖)に相補的なRNA配列についてゲノムを探索することを容易にする多ユニット複合体であるRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)を形成することができる。この過程で、siRNAのセンス鎖(またはパッセンジャー鎖)は複合体から失われ、siRNAのアンチセンス鎖(またはガイド鎖)はその相補性RNAと一致する。特に、siRNAを含有するRISC複合体の標的は、完全な配列相補性を表すmRNAである。その後、siRNA媒介性遺伝子サイレンシングが生じ、標的が切断、放出および分解される。
標的mRNAに相同なセンス鎖と標的mRNAに相補的なアンチセンス鎖とで構成されるsiRNA二重鎖は、標的RNAの破壊効率の点で、一本鎖(ss)-siRNA(例えば、アンチセンス鎖RNAまたはアンチセンスオリゴヌクレオチド)の使用と比較して非常に大きな利点をもたらす。多くの場合、対応する二重鎖の有効な遺伝子サイレンシング効力を達成するには、より高い濃度のss-siRNAが必要とされる。
前述の分子はいずれも、AAV粒子またはウイルスゲノムによってコードされてもよい。
標的遺伝子
本発明の調節性ポリヌクレオチドで治療することができる神経学的疾患の非限定的な例としては、タウオパシー、アルツハイマー病、ハンチントン病、および/または筋萎縮性側索硬化症が挙げられる。標的遺伝子は、限定はされないが、本明細書に挙げられるものなど、任意の神経学的疾患に関連する遺伝子のいずれであってもよい。
一実施形態において、標的遺伝子は、アポリポタンパク質E(APOE)遺伝子(例えば、ApoE2、ApoE3、および/またはApoE4)の対立遺伝子である。非限定的な例として、標的遺伝子はAPOEであり、標的遺伝子は、表2に教示される配列の1つ、その断片または変異体を有する。
別の実施形態において、標的遺伝子は、スーパーオキシドジスムターゼ(SOD1)である。非限定的な例として、標的遺伝子はSOD1であり、標的遺伝子は、配列番号1753(NCBI参照番号NM_000454.4)の配列、その断片または変異体を有する。
別の実施形態において、標的遺伝子はハンチンチン(HTT)である。非限定的な例として、標的遺伝子は、配列番号1754(NCBI参照番号NM_002111.7)のヌクレオチド配列、その断片または変異体を有するHTTである。非限定的な例として、標的遺伝子はHTTであり、標的遺伝子は、配列番号1755(NCBI参照番号NP_002102.4)のアミノ酸配列、その断片または変異体をコードする。
更に別の実施形態において、標的遺伝子は、微小管結合タンパク質タウ(MAPT)である。非限定的な例として、標的遺伝子は、表9に示される核酸配列のいずれかのヌクレオチド配列、その断片または変異体を有するMAPTである。非限定的な例として、標的遺伝子はMAPTであり、標的遺伝子は、表9に示されるアミノ酸配列のいずれかのアミノ酸配列、その断片または変異体をコードする。
siRNA二重鎖の設計および配列
当該技術分野では、siRNAの設計に関して幾つかの指針が提案されている。これらの指針は、概して、その遺伝子においてサイレンシングしようとする領域を標的とする19ヌクレオチド二重鎖形成領域、対称2~3ヌクレオチド3’突出、5’-リン酸基および3’-ヒドロキシル基の生成を推奨した。siRNA配列の好ましさを左右し得る他の規則としては、限定はされないが、(i)アンチセンス鎖の5’末端におけるA/U;(ii)センス鎖の5’末端におけるG/C;(iii)アンチセンス鎖の5’端側3分の1にある少なくとも5個のA/U残基;および(iv)9ヌクレオチド長よりも長いGCストレッチが一切存在しないことが挙げられる。標的遺伝子の具体的な配列と合わせて、かかる考慮点に従って、哺乳類標的遺伝子発現の抑制に不可欠な高度に有効なsiRNA分子を容易に設計し得る。
本発明によれば、目的の遺伝子を標的とするsiRNA分子(例えば、siRNA二重鎖またはコード化dsRNA)が設計される。かかるsiRNA分子は、標的遺伝子発現およびタンパク質産生を特異的に抑制することができる。一部の態様において、siRNA分子は、細胞において、標的遺伝子変異体、つまり神経学的疾患において同定される転写物を選択的に「ノックアウト」するように設計および使用される。一部の態様において、siRNA分子は、細胞において標的遺伝子変異体を選択的に「ノックダウン」するように設計および使用される。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子は、両方の鎖が共にハイブリダイズして二重鎖構造を形成するセンス鎖と相補的アンチセンス鎖とを含む。アンチセンス鎖は、標的特異的RNAiを導くのに十分な標的mRNA配列との相補性を有し、すなわちsiRNA分子は、RNAi機構または過程による標的mRNAの破壊を惹起するのに十分な配列を有する。
一部の実施形態において、アンチセンス鎖および標的mRNA配列は100%の相補性を有する。アンチセンス鎖は、標的mRNA配列の任意の一部と相補的であってもよい。
他の実施形態において、アンチセンス鎖および標的mRNA配列は少なくとも1つのミスマッチを含む。非限定的な例として、アンチセンス鎖および標的mRNA配列は、少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~99%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~99%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~99%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~99%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~99%、70~80%、70~90%、70~95%、70~99%、80~90%、80~95%、80~99%、90~95%、90~99%もしくは95~99%の相補性を有する。
本発明によれば、siRNA分子は、約10~50ヌクレオチドまたはそれ以上の長さを有し、すなわち、各鎖が10~50ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)を含む。好ましくは、siRNA分子は、各鎖が約15~30、例えば、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、または30ヌクレオチドの長さを有し、鎖の一方は標的領域と十分に相補的である。一実施形態において、siRNA分子は、約19~25、19~24または19~21ヌクレオチドの長さを有する。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子は、約19ヌクレオチド~約25ヌクレオチド、および3’末端に2つの突出ヌクレオチドを含む合成RNA二重鎖であってもよい。一部の態様において、siRNA分子は未修飾RNA分子であってもよい。他の態様において、siRNA分子は、塩基修飾、糖修飾または骨格修飾など、少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを含有してもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子は、アンチセンス配列およびセンス配列、またはそれらの断片もしくは変異体を含んでいてもよい。非限定的な例として、アンチセンス配列およびセンス配列は、少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~99%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~99%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~99%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~99%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~99%、70~80%、70~90%、70~95%、70~99%、80~90%、80~95%、80~99%、90~95%、90~99%もしくは95~99%の相補性を有する。
DNA発現プラスミドを使用して、本発明のsiRNA二重鎖またはdsRNAを細胞にて安定的に発現させ、標的遺伝子の長期阻害を達成することができる。一態様において、siRNA二重鎖のセンス鎖およびアンチセンス鎖は、典型的には、短いスペーサ配列によって連結され、低分子ヘアピンRNA(shRNA)と呼ばれるステム-ループ構造の発現につながる。ヘアピンはダイサーによって認識および切断され、したがって成熟siRNA分子が生成される。
他の実施形態において、本発明のsiRNA分子は、細胞送達用のAAV粒子にコードすることができる。一実施形態において、siRNAは、AAVウイルスゲノムに挿入され、ITRによって隣接されてもよい。
本発明によれば、目的の遺伝子のmRNAを標的とするsiRNA分子をコードする核酸を含むAAV粒子としては、AAV粒子血清型を挙げることができ、および/または限定はされないが、以下のペプチドインサート、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3-3、AAV4、AAV4-4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42-1b、AAV42-2、AAV42-3a、AAV42-3b、AAV42-4、AAV42-5a、AAV42-5b、AAV42-6b、AAV42-8、AAV42-10、AAV42-11、AAV42-12、AAV42-13、AAV42-15、AAV42-aa、AAV43-1、AAV43-12、AAV43-20、AAV43-21、AAV43-23、AAV43-25、AAV43-5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1-7/rh.48、AAV1-8/rh.49、AAV2-15/rh.62、AAV2-3/rh.61、AAV2-4/rh.50、AAV2-5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3-9/rh.52、AAV3-11/rh.53、AAV4-8/r11.64、AAV4-9/rh.54、AAV4-19/rh.55、AAV5-3/rh.57、AAV5-22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH-1/hu.1、AAVH-5/hu.3、AAVLG-10/rh.40、AAVLG-4/rh.38、AAVLG-9/hu.39、AAVN721-8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R突然変異体、AAVrh8R R533A突然変異体、AAAV、BAAV、ヤギAAV、ウシAAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV-PAEC、AAV-LK01、AAV-LK02、AAV-LK03、AAV-LK04、AAV-LK05、AAV-LK06、AAV-LK07、AAV-LK08、AAV-LK09、AAV-LK10、AAV-LK11、AAV-LK12、AAV-LK13、AAV-LK14、AAV-LK15、AAV-LK16、AAV-LK17、AAV-LK18、AAV-LK19、AAV-PAEC2、AAV-PAEC4、AAV-PAEC6、AAV-PAEC7、AAV-PAEC8、AAV-PAEC11、AAV-PAEC12、AAV-2-pre-miRNA-101、AAV-8h、AAV-8b、AAV-h、AAV-b、AAV SM10-2、AAVシャッフル100-1、AAVシャッフル100-3、AAVシャッフル100-7、AAVシャッフル10-2、AAVシャッフル10-6、AAVシャッフル10-8、AAVシャッフル100-2、AAV SM10-1、AAV SM10-8、AAV SM100-3、AAV SM100-10、BNP61 AAV、BNP62 AAV、BNP63 AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4-8/rh.64、AAVLG-9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、トゥルータイプAAV(ttAAV)、UPENN AAV10、日本AAV10血清型、AAV CBr-7.1、AAV CBr-7.10、AAV CBr-7.2、AAV CBr-7.3、AAV CBr-7.4、AAV CBr-7.5、AAV CBr-7.7、AAV CBr-7.8、AAV CBr-B7.3、AAV CBr-B7.4、AAV CBr-E1、AAV CBr-E2、AAV CBr-E3、AAV CBr-E4、AAV CBr-E5、AAV CBr-e5、AAV CBr-E6、AAV CBr-E7、AAV CBr-E8、AAV CHt-1、AAV CHt-2、AAV CHt-3、AAV CHt-6.1、AAV CHt-6.10、AAV CHt-6.5、AAV CHt-6.6、AAV CHt-6.7、AAV CHt-6.8、AAV CHt-P1、AAV CHt-P2、AAV CHt-P5、AAV CHt-P6、AAV CHt-P8、AAV CHt-P9、AAV CKd-1、AAV CKd-10、AAV CKd-2、AAV CKd-3、AAV CKd-4、AAV CKd-6、AAV CKd-7、AAV CKd-8、AAV CKd-B1、AAV CKd-B2、AAV CKd-B3、AAV CKd-B4、AAV CKd-B5、AAV CKd-B6、AAV CKd-B7、AAV CKd-B8、AAV CKd-H1、AAV CKd-H2、AAV CKd-H3、AAV CKd-H4、AAV CKd-H5、AAV CKd-H6、AAV CKd-N3、AAV CKd-N4、AAV CKd-N9、AAV CLg-F1、AAV CLg-F2、AAV CLg-F3、AAV CLg-F4、AAV CLg-F5、AAV CLg-F6、AAV CLg-F7、AAV CLg-F8、AAV CLv-1、AAV CLv1-1、AAV Clv1-10、AAV CLv1-2、AAV CLv-12、AAV CLv1-3、AAV CLv-13、AAV CLv1-4、AAV Clv1-7、AAV Clv1-8、AAV Clv1-9、AAV CLv-2、AAV CLv-3、AAV CLv-4、AAV CLv-6、AAV CLv-8、AAV CLv-D1、AAV CLv-D2、AAV CLv-D3、AAV CLv-D4、AAV CLv-D5、AAV CLv-D6、AAV CLv-D7、AAV CLv-D8、AAV CLv-E1、AAV CLv-K1、AAV CLv-K3、AAV CL
v-K6、AAV CLv-L4、AAV CLv-L5、AAV CLv-L6、AAV CLv-M1、AAV CLv-M11、AAV CLv-M2、AAV CLv-M5、AAV CLv-M6、AAV CLv-M7、AAV CLv-M8、AAV CLv-M9、AAV CLv-R1、AAV CLv-R2、AAV CLv-R3、AAV CLv-R4、AAV CLv-R5、AAV CLv-R6、AAV CLv-R7、AAV CLv-R8、AAV CLv-R9、AAV CSp-1、AAV CSp-10、AAV CSp-11、AAV CSp-2、AAV CSp-3、AAV CSp-4、AAV CSp-6、AAV CSp-7、AAV CSp-8、AAV CSp-8.10、AAV CSp-8.2、AAV CSp-8.4、AAV CSp-8.5、AAV CSp-8.6、AAV CSp-8.7、AAV CSp-8.8、AAV CSp-8.9、AAV CSp-9、AAV.hu.48R3、AAV.VR-355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AAVF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8、および/またはAAVF9/HSC9、ならびにそれらの変異体を含み得る。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、標的mRNAを抑制(または分解)する。したがって、siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、細胞、例えばニューロンまたはアストロサイトにおける標的遺伝子発現を実質的に阻害することができる。一部の態様において、標的遺伝子発現の阻害は、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%または95~100%の阻害を指す。したがって、標的遺伝子のタンパク質産物は、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%または95~100%阻害され得る。
一部の実施形態において、目的の遺伝子を標的とするsiRNA分子は、任意の利用可能な設計ツールを使用して設計することができる。本発明によれば、siRNA分子を設計し、培養細胞において標的遺伝子mRNAレベルを低減するそれらの能力を試験する。
一実施形態において、siRNA分子を設計し、培養細胞においてApoE2レベルを低減するそれらの能力を試験する。
一実施形態において、siRNA分子を設計し、培養細胞においてApoE3レベルを低減するそれらの能力を試験する。
一実施形態において、siRNA分子を設計し、培養細胞においてApoE4レベルを低減するそれらの能力を試験する。
一実施形態において、siRNA分子を設計し、培養細胞においてSOD1レベルを低減するそれらの能力を試験する。
一実施形態において、siRNA分子を設計し、培養細胞においてHTTレベルを低減するそれらの能力を試験する。
一実施形態において、siRNA分子を設計し、培養細胞においてタウレベルを低減するそれらの能力を試験する。
一実施形態において、siRNA分子は、ガイド鎖に対するmiRNAシードマッチ(seed match)を含む。別の実施形態において、siRNA分子は、パッセンジャー鎖に対するmiRNAシードマッチを含む。更に別の実施形態において、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、ガイド鎖またはパッセンジャー鎖に対するシードマッチを含まない。
一実施形態において、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、ガイド鎖に対して著しい完全長オフターゲットをほぼ有しないものであり得る。別の実施形態において、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、パッセンジャー鎖に対して著しい完全長オフターゲットをほぼ有しないものであり得る。目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、パッセンジャー鎖に対して、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、1~5%、2~6%、3~7%、4~8%、5~9%、5~10%、6~10%、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、10~20%、10~30%、10~40%、10~50%、15~30%、15~40%、15~45%、20~40%、20~50%、25~50%、30~40%、30~50%、35~50%、40~50%、45~50%未満の完全長オフターゲットを有してもよい。更に別の実施形態において、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、ガイド鎖またはパッセンジャー鎖に対して著しい完全長オフターゲットをほぼ有しないものであり得る。目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、ガイド鎖またはパッセンジャー鎖に対して、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、1~5%、2~6%、3~7%、4~8%、5~9%、5~10%、6~10%、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、10~20%、10~30%、10~40%、10~50%、15~30%、15~40%、15~45%、20~40%、20~50%、25~50%、30~40%、30~50%、35~50%、40~50%、45~50%未満の完全長オフターゲットを有してもよい。
一実施形態において、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、インビトロで高い活性を有してもよい。別の実施形態において、siRNA分子は、インビトロで低い活性を有してもよい。更に別の実施形態において、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはdsRNAは、インビトロで高いガイド鎖活性および低いパッセンジャー鎖活性を有してもよい。
一実施形態において、siRNA分子は、インビトロで高いガイド鎖活性および低いパッセンジャー鎖活性を有する。ガイド鎖による標的ノックダウン(KD)は、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、99.5%または100%であってもよい。ガイド鎖による標的ノックダウンは、60~65%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、60~99%、60~99.5%、60~100%、65~70%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、65~99%、65~99.5%、65~100%、70~75%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、70~99%、70~99.5%、70~100%、75~80%、75~85%、75~90%、75~95%、75~99%、75~99.5%、75~100%、80~85%、80~90%、80~95%、80~99%、80~99.5%、80~100%、85~90%、85~95%、85~99%、85~99.5%、85~100%、90~95%、90~99%、90~99.5%、90~100%、95~99%、95~99.5%、95~100%、99~99.5%、99~100%または99.5~100%であってもよい。非限定的な例として、ガイド鎖による標的ノックダウン(KD)は、70%よりも大きい。
一実施形態において、最も近いオフターゲットに対するパッセンジャー鎖のIC50は、標的に対するガイド鎖のIC50の100倍よりも高い。非限定的な例として、最も近いオフターゲットに対するパッセンジャー鎖のIC50が、標的に対するガイド鎖のIC50の100倍よりも高い場合、そのsiRNA分子は、インビトロで高いガイド鎖活性および低いパッセンジャー鎖活性を有すると言われる。
一実施形態において、ガイド鎖の5’プロセシングは、インビトロまたはインビボで少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、99%または100%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。非限定的な例として、ガイド鎖の5’プロセシングは正確であり、インビトロで少なくとも99%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。非限定的な例として、ガイド鎖の5’プロセシングは正確であり、インビボで少なくとも99%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス対センスとも呼ばれる)の発現比は、インビトロまたはインビボで、1:10、1:9、1:8、1:7、1:6、1:5、1:4、1:3、1:2、1;1、2:10、2:9、2:8、2:7、2:6、2:5、2:4、2:3、2:2、2:1、3:10、3:9、3:8、3:7、3:6、3:5、3:4、3:3、3:2、3:1、4:10、4:9、4:8、4:7、4:6、4:5、4:4、4:3、4:2、4:1、5:10、5:9、5:8、5:7、5:6、5:5、5:4、5:3、5:2、5:1、6:10、6:9、6:8、6:7、6:6、6:5、6:4、6:3、6:2、6:1、7:10、7:9、7:8、7:7、7:6、7:5、7:4、7:3、7:2、7:1、8:10、8:9、8:8、8:7、8:6、8:5、8:4、8:3、8:2、8:1、9:10、9:9、9:8、9:7、9:6、9:5、9:4、9:3、9:2、9:1、10:10、10:9、10:8、10:7、10:6、10:5、10:4、10:3、10:2、10:1、1:99、5:95、10:90、15:85、20:80、25:75、30:70、35:65、40:60、45:55、50:50、55:45、60:40、65:35、70:30、75:25、80:20、85:15、90:10、95:5、または99:1である。ガイド対パッセンジャー比は、ガイド鎖切り出し後のガイド鎖対パッセンジャー鎖の比を指す。例えば、80:20のガイド対パッセンジャー比であれば、前駆体からパッセンジャー鎖が2つ切り取られる毎に8つのガイド鎖が切り取られることになる。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビトロで80:20である。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビボで80:20である。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビトロで8:2である。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビボで8:2である。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビトロで9:1である。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビボで9:1である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス対アンチセンスとも呼ばれる)の発現比は、インビトロまたはインビボで、1:10、1:9、1:8、1:7、1:6、1:5、1:4、1:3、1:2、1;1、2:10、2:9、2:8、2:7、2:6、2:5、2:4、2:3、2:2、2:1、3:10、3:9、3:8、3:7、3:6、3:5、3:4、3:3、3:2、3:1、4:10、4:9、4:8、4:7、4:6、4:5、4:4、4:3、4:2、4:1、5:10、5:9、5:8、5:7、5:6、5:5、5:4、5:3、5:2、5:1、6:10、6:9、6:8、6:7、6:6、6:5、6:4、6:3、6:2、6:1、7:10、7:9、7:8、7:7、7:6、7:5、7:4、7:3、7:2、7:1、8:10、8:9、8:8、8:7、8:6、8:5、8:4、8:3、8:2、8:1、9:10、9:9、9:8、9:7、9:6、9:5、9:4、9:3、9:2、9:1、10:10、10:9、10:8、10:7、10:6、10:5、10:4、10:3、10:2、10:1、1:99、5:95、10:90、15:85、20:80、25:75、30:70、35:65、40:60、45:55、50:50、55:45、60:40、65:35、70:30、75:25、80:20、85:15、90:10、95:5、または99:1である。パッセンジャー対ガイド比は、ガイド鎖切り出し後のパッセンジャー鎖対ガイド鎖の比を指す。例えば、80:20のパッセンジャー対ガイド比であれば、前駆体からガイド鎖が2つ切り取られる毎に8つのパッセンジャー鎖が切り取られることになる。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビトロで80:20である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビボで80:20である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビトロで8:2である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビボで8:2である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビトロで9:1である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビボで9:1である。
一実施形態において、dsRNAをコードするウイルスゲノムの完全性は、コンストラクトの完全長の少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超である。非限定的な例として、ウイルスゲノムの完全性は、コンストラクトの全長の80%である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖および/またはガイド鎖は、欧州特許出願公開第1752536号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に概説される方法および規則に基づいて設計される。非限定的な例として、配列の3’-末端塩基は、アデニン、チミンまたはウラシルである。非限定的な例として、配列の5’-末端塩基は、グアニンまたはシトシンである。非限定的な例として、3’-末端配列は、アデニン、チミンおよびウラシルの1つ以上の塩基が豊富な7つの塩基を含む。非限定的な例として、塩基数は、細胞傷害性を発現せずにRNA干渉を引き起こすようなレベルである。
分子足場(Molecular Scaffold)
一実施形態において、siRNA分子は、分子足場もまた含む調節性ポリヌクレオチドにコードされてもよい。本明細書で使用されるとき「分子足場」は、それに対して後続の分子を設計または製作するための配列または構造基盤を形成するフレームワークまたは出発分子である。
一実施形態において、ペイロード(例えば、本明細書に記載されるsiRNA、miRNAまたは他のRNAi剤)を含む調節性ポリヌクレオチドは、任意の長さであってよく、全体もしくは一部が野生型マイクロRNA配列に由来してもよくまたは完全に人工的であってもよい少なくとも1つの5’隣接配列を含む分子足場を含む。3’隣接配列は、サイズおよび起源の点で5’隣接配列を反映してもよい。隣接配列はいずれかが存在しなくともよい。一実施形態において、5’および3’隣接配列は両方とも存在しない。3’隣接配列は、任意選択で1つ以上のCNNCモチーフ(式中、「N」は任意のヌクレオチドを表す)を含有してもよい。
一部の実施形態において、5’および3’隣接配列は、同じ長さである。
一部の実施形態において、5’隣接配列は、1~10ヌクレオチド長であるか、5~15ヌクレオチド長であるか、10~30ヌクレオチド長であるか、20~50ヌクレオチド長であるか、40ヌクレオチド長よりも長いか、50ヌクレオチド長よりも長いか、100ヌクレオチド長よりも長いか、または200ヌクレオチド長よりも長い。
一部の実施形態において、5’隣接配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、408、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、493、494、495、496、497、498、499、または500ヌクレオチド長であってもよい。
一部の実施形態において、3’隣接配列は、1~10ヌクレオチド長であるか、5~15ヌクレオチド長であるか、10~30ヌクレオチド長であるか、20~50ヌクレオチド長であるか、40ヌクレオチド長よりも長いか、50ヌクレオチド長よりも長いか、100ヌクレオチド長よりも長いか、または200ヌクレオチド長よりも長い。
一部の実施形態において、3’隣接配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、408、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、493、494、495、496、497、498、499、または500ヌクレオチド長であってもよい。
一部の実施形態において、5’および3’隣接配列は、同じ配列である。一部の実施形態において、それらは、互いにアラインすると、2%、3%、4%、5%、10%、20%または30%超が異なる。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの3’隣接領域を含む。非限定的な例として、3’隣接領域は、任意の長さであってよく、全体または一部が野生型マイクロRNA配列に由来してもよくまたは完全に人工的な配列であってもよい3’隣接配列を含んでもよい。
ステムループ構造のステムの形成は、少なくとも1つのペイロード配列の必要最低限である。一部の実施形態において、ペイロード配列は、標的配列に部分的に相補性であるかまたはハイブリダイズすることになる少なくとも1つの核酸配列を含む。一部の実施形態において、ペイロードは、siRNA分子またはsiRNA分子の断片である。
一部の実施形態において、ステムループの5’アームは、センス配列を含む。
一部の実施形態において、ステムループの3’アームは、アンチセンス配列を含む。アンチセンス配列は、一部の例では、最も5’側の末端に「G」ヌクレオチドを含む。
他の実施形態において、センス配列は、ステムループ構造のステムの3’アームにあってもよく、アンチセンス配列は5’アームにある。
センス配列およびアンチセンス配列は、それらの長さのかなりの部分にわたって完全に相補的であってもよい。他の実施形態において、センス配列およびアンチセンス配列は、独立して鎖の長さの少なくとも50、60、70、80、85、90、95、または99%にわたって少なくとも70、80、90、95または99%相補的であってもよい。
センス配列の同一性も、アンチセンス配列の相同性も、標的と100%相補的である必要はない。
ステムループ構造のセンス配列およびアンチセンス配列を隔てるのは、ループ(ループモチーフとしても知られている)である。ループは、任意の長さ、4~30ヌクレオチド、4~20ヌクレオチド、4~15ヌクレオチド、5~15ヌクレオチド、6~12ヌクレオチド、6ヌクレオチド、7ヌクレオチド、8ヌクレオチド、9ヌクレオチド、10ヌクレオチド、11ヌクレオチド、および/または12ヌクレオチドであってもよい。
一部の実施形態において、ループは、少なくとも1つのUGUGモチーフを含む。一部の実施形態において、UGUGモチーフは、ループの5’末端に位置する。
調節性ポリヌクレオチドには、1つ以上のモジュールを互いに隔てるためのスペーサ領域が存在してもよい。かかるスペーサ領域は1つ以上存在してもよい。
一実施形態において、センス配列と隣接配列との間には、8~20、すなわち、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20ヌクレオチドのスペーサ領域が存在してもよい。
一実施形態において、スペーサは13ヌクレオチドであり、センス配列の5’末端と隣接配列との間に位置する。一実施形態において、スペーサは、配列のおよそ1ヘリカルターンを形成するのに十分な長さである。
一実施形態において、アンチセンス配列と隣接配列との間には、8~20、すなわち、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20ヌクレオチドのスペーサ領域が存在してもよい。
一実施形態において、スペーサ配列は、10~13、すなわち、10、11、12または13ヌクレオチドであり、アンチセンス配列の3’末端と隣接配列との間に位置する。一実施形態において、スペーサは、配列のおよそ1ヘリカルターンを形成するのに十分な長さである。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドは、5’から3’方向に、5’隣接配列、5’アーム、ループモチーフ、3’アームおよび3’隣接配列を含む。非限定的な例として、5’アームはセンス配列を含んでもよく、3’アームはアンチセンス配列を含む。別の非限定的な例では、5’アームはアンチセンス配列を含み、3’アームはセンス配列を含む。
一実施形態において、5’アーム、ペイロード(例えば、センス配列および/またはアンチセンス配列)、ループモチーフおよび/または3’アーム配列は、変更されてもよい(例えば、1つ以上のヌクレオチドの置換、ヌクレオチドの付加および/またはヌクレオチドの欠失)。変更は、コンストラクトの機能に有益な変化を引き起こすことができる(例えば、標的配列のノックダウンを増加させ、コンストラクトの分解を低減し、オフターゲット効果を低減し、ペイロードの効率を増加させ、ペイロードの分解を低減する)。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドの分子足場は、ガイド鎖の切り出し率をパッセンジャー鎖の切り出し率よりも高くするためにアラインされる。ガイド鎖またはパッセンジャー鎖の切り出し率は、独立に、1%、2%、3%、4%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超であり得る。非限定的な例として、ガイド鎖の切り出し率は少なくとも80%である。別の非限定的な例として、ガイド鎖の切断率は少なくとも90%である。
一実施形態において、ガイド鎖の切り出し率は、パッセンジャー鎖の切り出し率よりも高い。一態様において、ガイド鎖の切断率は、パッセンジャー鎖よりも少なくとも1%、2%、3%、4%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超高くてもよい。
一実施形態において、ガイド鎖の切り出し効率は、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超である。非限定的な例として、ガイド鎖の切り出し効率は80%よりも高い。
一実施形態において、分子足場からのガイド鎖の切り出し効率は、パッセンジャー鎖の切り出しよりも高い。分子足場からのガイド鎖の切り出しは、パッセンジャー鎖の切り出しよりも2、3、4、5、6、7、8、9、10倍または10倍超、効率的であり得る。
一実施形態において、分子足場は、二重機能ターゲティング調節性ポリヌクレオチドを含む。本明細書で使用されるとき、「二重機能ターゲティング」調節性ポリヌクレオチドは、ガイド鎖およびパッセンジャー鎖が両方とも同じ標的をノックダウンするかまたはガイド鎖およびパッセンジャー鎖が異なる標的をノックダウンするポリヌクレオチドである。
一実施形態において、本明細書に記載される調節性ポリヌクレオチドの分子足場は、5’隣接領域、ループ領域および3’隣接領域を含む。本明細書に記載される分子足場に使用することができる5’隣接領域、ループ領域および3’隣接領域の配列の非限定的な例は、表10~12に示される。
表8~10に記載される領域はいずれも、本明細書に記載される分子足場に使用することができる。
一実施形態において、分子足場は、表10に挙げられる1つの5’隣接領域を含み得る。非限定的な例として、分子足場は、5’隣接領域5F1、5F2、5F3、5F4、5F5、5F6、5F7、5F8または5F9を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表11に挙げられる1つのループモチーフ領域を含み得る。非限定的な例として、分子足場は、ループモチーフ領域L1、L2、L3、L4、L5、L6、L7、L8、L9、またはL10を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表12に挙げられる1つの3’隣接領域を含み得る。非限定的な例として、分子足場は、3’隣接領域3F1、3F2、3F3、3F4、3F5、3F6、3F7または3F8を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表10および表11に記載されるような少なくとも1つの5’隣接領域および少なくとも1つのループモチーフ領域を含み得る。非限定的な例として、分子足場は、5F1およびL1、5F1およびL2、5F1およびL3、5F1およびL4、5F1およびL5、5F1およびL6、5F1およびL7、5F1およびL8、5F1およびL9、5F1およびL10、5F2およびL1、5F2およびL2、5F2およびL3、5F2およびL4、5F2およびL5、5F2およびL6、5F2およびL7、5F2およびL8、5F2およびL9、5F2およびL10、5F3およびL1、5F3およびL2、5F3およびL3、5F3およびL4、5F3およびL5、5F3およびL6、5F3およびL7、5F3およびL8、5F3およびL9、5F3およびL10、5F4およびL1、5F4およびL2、5F4およびL3、5F4およびL4、5F4およびL5、5F4およびL6、5F4およびL7、5F4およびL8、5F4およびL9、5F4およびL10、5F5およびL1、5F5およびL2、5F5およびL3、5F5およびL4、5F5およびL5、5F5およびL6、5F5およびL7、5F5およびL8、5F5およびL9、5F5およびL10、5F6およびL1、5F6およびL2、5F6およびL3、5F6およびL4、5F6およびL5、5F6およびL6、5F6およびL7、5F6およびL8、5F6およびL9、5F6およびL10、5F7およびL1、5F7およびL2、5F7およびL3、5F7およびL4、5F7およびL5、5F7およびL6、5F7およびL7、5F7およびL8、5F7およびL9、5F7およびL10、5F8およびL1、5F8およびL2、5F8およびL3、5F8およびL4、5F8およびL5、5F8およびL6、5F8およびL7、5F8およびL8、5F8およびL9、5F8およびL10、5F9およびL1、5F9およびL2、5F9およびL3、5F9およびL4、5F9およびL5、5F9およびL6、5F9およびL7、5F9およびL8、5F9およびL9、または5F9およびL10を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表11および表12に記載されるような少なくとも1つの3’隣接領域および少なくとも1つのループモチーフ領域を含み得る。非限定的な例として、分子足場は、3F1およびL1、3F1およびL2、3F1およびL3、3F1およびL4、3F1およびL5、3F1およびL6、3F1およびL7、3F1およびL8、3F1およびL9、3F1およびL10、3F2およびL1、3F2およびL2、3F2およびL3、3F2およびL4、3F2およびL5、3F2およびL6、3F2およびL7、3F2およびL8、3F2およびL9、3F2およびL10、3F3およびL1、3F3およびL2、3F3およびL3、3F3およびL4、3F3およびL5、3F3およびL6、3F3およびL7、3F3およびL8、3F3およびL9、3F3およびL10、3F4およびL1、3F4およびL2、3F4およびL3、3F4およびL4、3F4およびL5、3F4およびL6、3F4およびL7、3F4およびL8、3F4およびL9、3F4およびL10、3F5およびL1、3F5およびL2、3F5およびL3、3F5およびL4、3F5およびL5、3F5およびL6、3F5およびL7、3F5およびL8、3F5およびL9、3F5およびL10、3F6およびL1、3F6およびL2、3F6およびL3、3F6およびL4、3F6およびL5、3F6およびL6、3F6およびL7、3F6およびL8、3F6およびL9、3F6およびL10、3F7およびL1、3F7およびL2、3F7およびL3、3F7およびL4、3F7およびL5、3F7およびL6、3F7およびL7、3F7およびL8、3F7およびL9、3F7およびL10、3F8およびL1、3F8およびL2、3F8およびL3、3F8およびL4、3F8およびL5、3F8およびL6、3F8およびL7、3F8およびL8、3F8およびL9、または3F8およびL10を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表10および表12に記載されるような少なくとも1つの5’隣接領域および少なくとも1つの3’隣接領域を含み得る。非限定的な例として、分子足場は、5F1および3F1、5F1および3F2、5F1および3F3、5F1および3F4、5F1および3F5、5F1および3F6、5F1および3F7、5F1および3F8、5F2および3F1、5F2および3F2、5F2および3F3、5F2および3F4、5F2および3F5、5F2および3F6、5F2および3F7、5F2および3F8、5F3および3F1、5F3および3F2、5F3および3F3、5F3および3F4、5F3および3F5、5F3および3F6、5F3および3F7、5F3および3F8、5F4および3F1、5F4および3F2、5F4および3F3、5F4および3F4、5F4および3F5、5F4および3F6、5F4および3F7、5F4および3F8、5F5および3F1、5F5および3F2、5F5および3F3、5F5および3F4、5F5および3F5、5F5および3F6、5F5および3F7、5F5および3F8、5F6および3F1、5F6および3F2、5F6および3F3、5F6および3F4、5F6および3F5、5F6および3F6、5F6および3F7、5F6および3F8、5F7および3F1、5F7および3F2、5F7および3F3、5F7および3F4、5F7および3F5、5F7および3F6、5F7および3F7、5F7および3F8、5F8および3F1、5F8および3F2、5F8および3F3、5F8および3F4、5F8および3F5、5F8および3F6、5F8および3F7、5F8および3F8、5F9および3F1、5F9および3F2、5F9および3F3、5F9および3F4、5F9および3F5、5F9および3F6、5F9および3F7、または5F9および3F8を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表10~12に記載されるような少なくとも1つの5’隣接領域、少なくとも1つのループモチーフ領域および少なくとも1つの3’隣接領域を含み得る。非限定的な例として、分子足場は、5F1、L1および3F1;5F1、L1および3F2;5F1、L1および3F3;5F1、L1および3F4;5F1、L1および3F5;5F1、L1および3F6;5F1、L1および3F7;5F1、L1および3F8;5F2、L1および3F1;5F2、L1および3F2;5F2、L1および3F3;5F2、L1および3F4;5F2、L1および3F5;5F2、L1および3F6;5F2、L1および3F7;5F2、L1および3F8;5F3、L1および3F1;5F3、L1および3F2;5F3、L1および3F3;5F3、L1および3F4;5F3、L1および3F5;5F3、L1および3F6;5F3、L1および3F7;5F3、L1および3F8;5F4、L1および3F1;5F4、L1および3F2;5F4、L1および3F3;5F4、L1および3F4;5F4、L1および3F5;5F4、L1および3F6;5F4、L1および3F7;5F4、L1および3F8;5F5、L1および3F1;5F5、L1および3F2;5F5、L1および3F3;5F5、L1および3F4;5F5、L1および3F5;5F5、L1および3F6;5F5、L1および3F7;5F5、L1および3F8;5F6、L1および3F1;5F6、L1および3F2;5F6、L1および3F3;5F6、L1および3F4;5F6、L1および3F5;5F6、L1および3F6;5F6、L1および3F7;5F6、L1および3F8;5F7、L1および3F1;5F7、L1および3F2;5F7、L1および3F3;5F7、L1および3F4;5F7、L1および3F5;5F7、L1および3F6;5F7、L1および3F7;5F7、L1および3F8;5F8、L1および3F1;5F8、L1および3F2;5F8、L1および3F3;5F8、L1および3F4;5F8、L1および3F5;5F8、L1および3F6;5F8、L1および3F7;5F8、L1および3F8;5F9、L1および3F1;5F9、L1および3F2;5F9、L1および3F3;5F9、L1および3F4;5F9、L1および3F5;5F9、L1および3F6;5F9、L1および3F7;5F9、L1および3F8;5F1、L2および3F1;5F1、L2および3F2;5F1、L2および3F3;5F1、L2および3F4;5F1、L2および3F5;5F1、L2および3F6;5F1、L2および3F7;5F1、L2および3F8;5F2、L2および3F1;5F2、L2および3F2;5F2、L2および3F3;5F2、L2および3F4;5F2、L2および3F5;5F2、L2および3F6;5F2、L2および3F7;5F2、L2および3F8;5F3、L2および3F1;5F3、L2および3F2;5F3、L2および3F3;5F3、L2および3F4;5F3、L2および3F5;5F3、L2および3F6;5F3、L2および3F7;5F3、L2および3F8;5F4、L2および3F1;5F4、L2および3F2;5F4、L2および3F3;5F4、L2および3F4;5F4、L2および3F5;5F4、L2および3F6;5F4、L2および3F7;5F4、L2および3F8;5F5、L2および3F1;5F5、L2および3F2;5F5、L2および3F3;5F5、L2および3F4;5F5、L2および3F5;5F5、L2および3F6;5F5、L2および3F7;5F5、L2および3F8;5F6、L2および3F1;5F6、L2および3F2;5F6、L2および3F3;5F6、L2および3F4;5F6、L2および3F5;5F6、L2および3F6;5F6、L2および3F7;5F6、L2および3F8;5F7、L2および3F1;5F7、L2および3F2;5F7、L2および3F3;5F7、L2および3F4;5F7、L2および3F5;5F7、L2および3F6;5F7、L2および3F7;5F7、L2および3F8;5F8、L2および3F1;5F8、L2および3F2;5F8、L2および3F3;5F8、L2および3F4;5F8、L2および3F5;5F8、L2および3F6;5F8、L2および3F7;5F8、L2および3F8;5F9、L2および3F1;5F9、L2および3F2;5F9、L2および3F3;5F9、L2および3F4;5F9、L2および3F5;5F9、L2および3F6;5F9、L2および3F7;5F9、L2および3F8;5F1、L3および3F1;5F1、L3および3F2;5F1、L3および3F3;5F1、L3および3F4;5F1、L3および3F5;5F1、L3および3F6;5F1、L3および3F7;5F1、L3および3F8;5F2、L3および3F1;5F2、L3および3F2;5F2、L3および3F3;5F2、L3および3F4;5F2、L3および3F5;5F2、L3および3F6;5F2、L3および3F7;5F2、L3および3F8;5F3、L3および3F1;5F3、L3および3F2;5F3、L3および3F3;5F3、L3および3F4;5F3、L3および3F5;5F3、L3および3F6;5F3、L3および3F7;5F3、L3および3F8;5F4、L3および3F1;5F4、L3および3F2;5F4、L3および3F3;5F4、L3および3F4;5F4、L3および3F5;5F4、L3および3F6;5F4、L3および3F7;5F4、L3および3F8;5F5、L3および3F1;5F5、L3および3F2;5F5、L3および3F3;5F5、L3および3F4;5F5、L3および3F5;5F5、L3および3F6;5F5、L3および3F7;5F5、L3および3F8;5F6、L3および3F1;5F6、L3および3F2;5F6、L3および3F3;5F6、L3および3F4;5F6、L3および3F5;5F6、L3および3F6;5F6、L3および3F7;5F6、L3および3F8;5F7、L3および3F1;5F7、L3および3F2;5F7、L3および3F3;5F7、L3および3F4;5F7、L3および3F5;5F7、L3および3F6;5F7、L3および3F7;5F7、L3および3F8;5F8、L3および3F1;5F8、L3および3F2;5F8、L3および3F3;5F8、L3および3F4;5F8、L3および3F5;5F8、L3および3F6;5F8、L3および3F7;5F8、L3および3F8;5F9、L3および3F1;5F9、L3および3F2;5F9、L3および3F3;5F9、L3および3F4;5F9、L3および3F5;5F9、L3および3F6;5F9、L3および3F7;5F9、L3および3F8;5F1、L4および3F1;5F1、L4および3F2;5F1、L4および3F3;5F1、L4および3F4;5F1、L4および3F5;5F1、L4および3F6;5F1、L4および3F7;5F1、L4および3F8;5F2、L4および3F1;5F2、L4および3F2;5F2、L4および3F3;5F2、L4および3F4;5F2、L4および3F5;5F2、L4および3F6;5F2、L4および3F7;5F2、L4および3F8;5F3、L4および3F1;5F3、L4および3F2;5F3、L4および3F3;5F3、L4および3F4;5F3、L4および3F5;5F3、L4および3F6;5F3、L4および3F7;5F3、L4および3F8;5F4、L4および3F1;5F4、L4および3F2;5F4、L4および3F3;5F4、L4および3F4;5F4、L4および3F5;5F4、L4および3F6;5F4、L4および3F7;5F4、L4および3F8;5F5、L4および3F1;5F5、L4および3F2;5F5、L4および3F3;5F5、L4および3F4;5F5、L4および3F5;5F5、L4および3F6;5F5、L4および3F7;5F5、L4および3F8;5F6、L4および3F1;5F6、L4および3F2;5F6、L4および3F3;5F6、L4および3F4;5F6、L4および3F5;5F6、L4および3F6;5F6、L4および3F7;5F6、L4および3F8;5F7、L4および3F1;5F7、L4および3F2;5F7、L4および3F3;5F7、L4および3F4;5F7、L4および3F5;5F7、L4および3F6;5F7、L4および3F7;5F7、L4および3F8;5F8、L4および3F1;5F8、L4および3F2;5F8、L4および3F3;5F8、L4および3F4;5F8、L4および3F5;5F8、L4および3F6;5F8、L4および3F7;5F8、L4および3F8;5F9、L4および3F1;5F9、L4および3F2;5F9、L4および3F3;5F9、L4および3F4;5F9、L4および3F5;5F9、L4および3F6;5F9、L4および3F7;5F9、L4および3F8;5F1、L5および3F1;5F1、L5および3F2;5F1、L5および3F3;5F1、L5および3F4;5F1、L5および3F5;5F1、L5および3F6;5F1、L5および3F7;5F1、L5および3F8;5F2、L5および3F1;5F2、L5および3F2;5F2、L5および3F3;5F2、L5および3F4;5F2、L5および3F5;5F2、L5および3F6;5F2、L5および3F7;5F2、L5および3F8;5F3、L5および3F1;5F3、L5および3F2;5F3、L5および3F3;5F3、L5および3F4;5F3、L5および3F5;5F3、L5および3F6;5F3、L5および3F7;5F3、L5および3F8;5F4、L5および3F1;5F4、L5および3F2;5F4、L5および3F3;5F4、L5および3F4;5F4、L5および3F5;5F4、L5および3F6;5F4、L5および3F7;5F4、L5および3F8;5F5、L5および3F1;5F5、L5および3F2;5F5、L5および3F3;5F5、L5および3F4;5F5、L5および3F5;5F5、L5および3F6;5F5、L5および3F7;5F5、L5および3F8;5F6、L5および3F1;5F6、L5および3F2;5F6、L5および3F3;5F6、L5および3F4;5F6、L5および3F5;5F6、L5および3F6;5F6、L5および3F7;5F6、L5および3F8;5F7、L5および3F1;5F7、L5および3F2;5F7、L5および3F3;5F7、L5および3F4;5F7、L5および3F5;5F7、L5および3F6;5F7、L5および3F7;5F7、L5および3F8;5F8、L5および3F1;5F8、L5および3F2;5F8、L5および3F3;5F8、L5および3F4;5F8、L5および3F5;5F8、L5および3F6;5F8、L5および3F7;5F8、L5および3F8;5F9、L5および3F1;5F9、L5および3F2;5F9、L5および3F3;5F9、L5および3F4;5F9、L5および3F5;5F9、L5および3F6;5F9、L5および3F7;または5F9、L5および3F8を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、当該技術分野において公知の1つ以上のリンカーを含み得る。リンカーは、領域間を隔てもよく、または1つの分子足場と別の分子足場とを隔ててもよい。非限定的な例として、分子足場は、ポリシストロン性であってもよい。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドは、以下の特性の少なくとも1つを使用して設計される:ループ変異体、シードミスマッチ/バルジ/ゆらぎ(wobble)変異体、ステムミスマッチ、ループ変異体および基部ステムミスマッチ変異体、シードミスマッチおよび基部ステムミスマッチ変異体、ステムミスマッチおよび基部ステムミスマッチ変異体、シードゆらぎおよび基部ステムゆらぎ変異体、またはステム配列変異体。
細胞への導入
siRNA分子は、標的細胞内部の目的の遺伝子を標的とするために標的細胞に送達されてもよい。一部の実施形態において、細胞としては、限定はされないが、哺乳類起源の細胞、ヒト起源の細胞、胚性幹細胞、人工多能性幹細胞、神経幹細胞、神経前駆細胞、および分化神経細胞を挙げることができる。
一部の実施形態において、siRNA分子(例えば、siRNA二重鎖)は、AAV粒子などのウイルスベクターを使用して、標的細胞へと導入することができる。これらのAAV粒子は、トランスフェクションに容易には適さない細胞、例えばニューロンへのsiRNA分子の進入を促進するように操作および最適化される。また、一部の合成ウイルスベクターは、shRNAを細胞ゲノム内に組み込む能力を有し、それにより安定したsiRNA発現および標的遺伝子の長期ノックダウンにつながる。このように、ウイルスベクターは、野生型ウイルスに見られる有害な複製および/または組込み特徴を欠如しつつ、特異的送達用の媒体として操作される。
一部の実施形態において、siRNA分子は、親油性担体、およびsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を含む組成物に細胞を接触させることによって細胞へと導入される。他の実施形態において、siRNA分子は、細胞にて転写されるとsiRNA分子を産生することが可能な核酸配列を含むAAV粒子を細胞にトランスフェクトまたは感染させることによって細胞へと導入される。一部の実施形態において、siRNA分子は、細胞にて転写されるとsiRNA分子を産生することが可能な核酸配列を含むAAV粒子を細胞に注入することによって細胞へと導入される。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を、細胞へと形質導入してもよい。
他の実施形態において、siRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を、エレクトロポレーションによって細胞へと送達してもよい(例えば、米国特許出願公開第20050014264号明細書;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
本明細書に記載されるsiRNA分子の核酸配列を含むAAV粒子を導入する他の方法としては、米国特許出願公開第20120264807号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの光化学的内在化を挙げることができる。
一実施形態において、限定はされないが、ヒト、イヌ、マウス、ラットまたはサルなど、任意の関連種に由来するAAV粒子を細胞へと導入されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、治療しようとする疾患に関連性のある細胞へと導入されてもよい。非限定的な例として、疾患は、タウオパシーおよび/またはアルツハイマー病であり、標的細胞は、嗅内皮質ニューロン、海馬ニューロンまたは皮質ニューロンである。
一実施形態において、AAV粒子は、標的配列の内因性発現レベルが高い細胞へと導入されてもよい。
別の実施形態において、AAV粒子は、標的配列の内因性発現レベルが低い細胞へと導入されてもよい。
一実施形態において、細胞は、高いAAV形質導入効率を有するものであってもよい。
他の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を、中枢神経系へのsiRNA分子の送達に使用してもよい(例えば、米国特許第6,180,613号明細書;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
一部の態様において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、非ウイルス起源のペプチドを含む修飾カプシドを更に含み得る。他の態様において、AAV粒子は、コード化siRNA二重鎖の脳および脊髄への送達を促進するために、CNS特異的(例えば、CNSまたはCNS組織に対して向性である)キメラカプシドを含有し得る。例えば、CNS向性を示すAAV変異体に由来するcapヌクレオチド配列のアラインメントを構築して、可変領域(VR)配列および構造を同定してもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、ポリシストロン性分子であるsiRNA分子をコードしてもよい。加えて、siRNA分子は、siRNA分子の領域間に1つ以上のリンカーを含み得る。
一実施形態において、AAV粒子は、本明細書に記載されるsiRNA配列または二重鎖の少なくとも1つをコードする調節性ポリヌクレオチドの少なくとも1つを含み得る。
一実施形態において、発現ベクターまたはウイルスゲノムは、ITRからITRまで、5’から3’に挙げて、ITR、プロモータ、イントロン、調節性ポリヌクレオチド、ポリA配列およびITRを含み得る。
一実施形態において、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいて、限定はされないが、CMV、U6、H1、CBAまたはSV40イントロンを有するCBAプロモータなどのプロモータの下流に位置してもよい。更に、コード化siRNA分子はまた、発現ベクターにおいてポリアデニル化配列の上流に位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30ヌクレオチド以内または30ヌクレオチド超に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流の1~5、1~10、1~15、1~20、1~25、1~30、5~10、5~15、5~20、5~25、5~30、10~15、10~20、10~25、10~30、15~20、15~25、15~30、20~25、20~30または25~30ヌクレオチド以内に位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流のヌクレオチドの最初の1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%以内または25%超に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流の最初の1~5%、1~10%、1~15%、1~20%、1~25%、5~10%、5~15%、5~20%、5~25%、10~15%、10~20%、10~25%、15~20%、15~25%、または20~25%に位置してもよい。
一実施形態において、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてポリアデニル化配列の上流に位置してもよい。更に、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいて、限定はされないが、CMV、U6、CBA、またはSV40イントロンを有するCBAプロモータなどのプロモータの下流に位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30ヌクレオチド以内または30ヌクレオチド超に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流の1~5、1~10、1~15、1~20、1~25、1~30、5~10、5~15、5~20、5~25、5~30、10~15、10~20、10~25、10~30、15~20、15~25、15~30、20~25、20~30または25~30ヌクレオチド以内に位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流のヌクレオチドの最初の1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%以内または25%超に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流の最初の1~5%、1~10%、1~15%、1~20%、1~25%、5~10%、5~15%、5~20%、5~25%、10~15%、10~20%、10~25%、15~20%、15~25%、または20~25%に位置してもよい。
一実施形態において、コード化siRNA分子は、scAAVに位置してもよい。
一実施形態において、コード化siRNA分子は、ssAAVに位置してもよい。
一実施形態において、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてflip ITRの5’末端付近に位置してもよい。別の実施形態において、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてflip ITRの3’末端付近に位置してもよい。更に別の実施形態において、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてflop ITRの5’末端付近に位置してもよい。更に別の実施形態において、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてflop ITRの3’末端付近に位置してもよい。一実施形態において、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてflip ITRの5’末端とflop ITRの3’末端との間に位置してもよい。一実施形態において、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてflip ITRの3’末端とflip ITRの5’末端との間に(例えば、flip ITRの5’末端とflop ITRの3’末端との間またはflop ITRの3’末端とflip ITRの5’末端との間の中間に)位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてITR(例えばFlipまたはFlop ITR)の5’または3’末端から下流の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30ヌクレオチド以内または30ヌクレオチド超に位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてITR(例えばFlipまたはFlop ITR)の5’または3’末端から上流の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30ヌクレオチド以内または30ヌクレオチド超に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてITR(例えばFlipまたはFlop ITR)の5’または3’末端から下流の1~5、1~10、1~15、1~20、1~25、1~30、5~10、5~15、5~20、5~25、5~30、10~15、10~20、10~25、10~30、15~20、15~25、15~30、20~25、20~30または25~30ヌクレオチド以内に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてITR(例えばFlipまたはFlop ITR)の5’または3’末端から上流の1~5、1~10、1~15、1~20、1~25、1~30、5~10、5~15、5~20、5~25、5~30、10~15、10~20、10~25、10~30、15~20、15~25、15~30、20~25、20~30または25~30以内に位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてITR(例えばFlipまたはFlop ITR)の5’または3’末端から上流のヌクレオチドの最初の1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%以内または25%超に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてITR(例えばFlipまたはFlop ITR)の5’または3’末端から下流の最初の1~5%、1~10%、1~15%、1~20%、1~25%、5~10%、5~15%、5~20%、5~25%、10~15%、10~20%、10~25%、15~20%、15~25%、または20~25%内に位置してもよい。
一実施形態において、siRNA分子の核酸配列を含むAAV粒子は、CNS送達用に製剤化されてもよい。血液脳関門を越える薬剤を使用してもよい。血液脳関門を効率的に越えるように操作されたカプシドを使用してもよい。かかるカプシドまたはペプチドインサートの非限定的な例としては、VOY101、VOY201、AAVPHP.N、AAVPHP.A、AAVPHP.B、PHP.B2、PHP.B3、G2A3、G2B4、G2B5、PHP.S、およびそれらの変異体が挙げられる。例えば、siRNA分子を血液脳関門内皮へと標的化し得る何らかの細胞透過性ペプチドを使用して、目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖を製剤化してもよい。
一実施形態において、本発明の目的のペイロード(例えば、フラタキシン、APOE、タウ)の核酸配列を含むAAV粒子を、CNS送達用に製剤化してもよい。血液脳関門を越える薬剤を使用してもよい。血液脳関門を効率的に越えるように操作されたカプシドを使用してもよい。かかるカプシドまたはペプチドインサートの非限定的な例としては、VOY101、VOY201、AAVPHP.N、AAVPHP.A、AAVPHP.B、PHP.B2、PHP.B3、G2A3、G2B4、G2B5、PHP.S、およびそれらの変異体が挙げられる。例えば、ペイロードを血液脳関門内皮に送達する何らかの細胞透過性ペプチドを使用して、目的の遺伝子のペイロードを製剤化してもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を、CNSに直接投与してもよい。非限定的な例として、ベクターは、ApoE2を標的とするsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、ベクターは、ApoE3を標的とするsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、ベクターは、ApoE4を標的とするsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、ベクターは、SOD1を標的とするsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、ベクターは、HTTを標的とするsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、ベクターは、タウを標的とするsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。
具体的な実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子の組成物は、ベクターまたはsiRNA分子の中枢神経系への進入、ならびにCNS組織および/または細胞への透過を促進するように投与してもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、siRNA二重鎖またはdsRNAが脊髄および/または脳幹の運動ニューロンおよびアストロサイトを標的とするための治療有効量で対象に(例えば、髄腔内投与により対象のCNSに)投与してもよい。非限定的な例として、siRNA二重鎖またはdsRNAは、標的タンパク質またはmRNAの発現を低減することができる。別の非限定的な例として、siRNA二重鎖またはdsRNAは、標的遺伝子またはタンパク質を抑制し、標的遺伝子またはタンパク質媒介性毒性を低減することができる。標的タンパク質および/またはmRNAならびに標的遺伝子および/またはタンパク質媒介性毒性の低減は、ほぼ炎症亢進を起こさずに達成することができる。
II.製剤および送達
医薬組成物
本発明によると、AAV粒子は、医薬組成物として調製することができる。かかる組成物は、1つ以上の活性成分を必ず含み、かつほとんどの場合で薬学的に許容される賦形剤を含むことが理解されるだろう。
本開示に係る医薬組成物中の活性成分(例えば、AAV粒子)、薬学的に許容可能な賦形剤、および/または任意の追加成分の相対量は、治療下の対象のアイデンティティ、サイズ、および/または状態に応じて、更には組成物が投与される経路に応じて異なり得る。例えば、組成物は、0.1%~99%(w/w)の活性成分を含み得る。例として、組成物は、0.1%~100%、例えば0.5~50%、1~30%、5~80%、少なくとも80%(w/w)の活性成分を含み得る。
一部の実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子医薬組成物は、少なくとも1つのペイロードを含み得る。非限定的な例として、医薬組成物は、1、2、3、4または5つのペイロードを有するAAV粒子を含有し得る。
本明細書で提供される医薬組成物の記載は、主にヒトへの投与に好適な医薬組成物を対象とするが、当業者であれば、かかる組成物が、一般に任意の他の動物、例えば非ヒト動物、例えば非ヒト哺乳類への投与に好適であることを理解するであろう。組成物を種々の動物への投与に好適にするための、ヒトへの投与に好適な医薬組成物の修飾については十分に理解されており、獣医薬理学の当業者は、あったとしても通常通りに過ぎない実験をもって、かかる修飾を設計および/または実施することができる。医薬組成物の投与が企図される対象としては、限定はされないが、ヒトおよび/または他の霊長類;ウシ、ブタ、ウマ、ヒツジ、ネコ、イヌ、マウス、ラットなど、商業的に関連性のある哺乳類を含めた哺乳類、家禽、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、および/またはシチメンチョウなど、商業的に関連性のある鳥類を含めた鳥類が挙げられる。
一部の実施形態において、組成物は、ヒト、ヒト患者または対象に投与される。
製剤
本発明の製剤は、限定なしに、生理食塩水、リポソームを含み得る。かかる調製方法は、活性成分を、脂質ナノ粒子、ポリマー、ペプチド、タンパク質、ウイルスベクターをトランスフェクトした細胞(例えば、対象への移入または移植用)およびそれらの組合せと合わせる工程を含む。
本明細書に記載される医薬組成物の製剤は、薬理学の技術分野において公知のまたは今後開発される任意の方法によって調製されてもよい。本明細書で使用されるとき、用語「医薬組成物」は、少なくとも1つの活性成分および任意選択で1つ以上の薬学的に許容される賦形剤を含む組成物を指す。
一般的賦形剤および/または1つ以上の他の補助成分。本明細書で使用されるとき、語句「活性成分」は、一般に、本発明のポリペプチドをコードするペイロード領域を担持するAAV粒子、または本明細書に記載されるようなAAV粒子のウイルスゲノムによってコードされる最終産物のいずれかを指す。
本明細書に記載されるAAV粒子および医薬組成物の製剤は、薬理学の技術分野において公知のまたは今後開発される任意の方法によって調製されてもよい。一般に、かかる調製方法は、活性成分を賦形剤および/または1つ以上の他の補助成分と合わせる工程、および次に、必要であればおよび/または望ましい場合には、生成物を所望の単回または複数回用量単位に分割、付形および/または包装する工程を含む。
本開示に係る医薬組成物は、バルクで、単回単位用量として、および/または複数の単回単位用量として調製、包装、および/または販売されてもよい。本明細書で使用されるとき、「単位用量」は、所定量の活性成分を含む医薬組成物の個別的な量を指す。活性成分の量は、概して対象に投与されるであろう活性成分の投薬量に等しく、および/またはかかる投薬量の好都合な一部、例えばかかる投薬量の2分の1または3分の1である。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、pHが約7.0の0.001%プルロニック酸(F-68)を有するPBSで製剤化され得る。
一部の実施形態において、本明細書に記載されるAAV製剤は、少なくとも1つの発現機能性ペイロードの発現に十分なAAV粒子を含有し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、1、2、3、4または5つの機能性ペイロードをコードするウイルスゲノムを含有し得る。
一部の実施形態において、本明細書に記載される製剤は、目的のタンパク質をコードする核酸配列を含む少なくとも1つのAAV粒子を含有し得る。目的のタンパク質は、限定はされないが、抗体、AADC、APOE2、フラタキシン、ATP2A2、および/またはS100A1を含み得る。
一部の実施形態において、本明細書に記載される製剤は、本明細書に記載されるsiRNA分子をコードする核酸配列を含む少なくとも1つのAAV粒子を含有し得る。一実施形態において、siRNA分子は、1つの標的部位にある目的の遺伝子を標的としてもよい。別の実施形態において、製剤は、複数のAAV粒子を含み、各AAV粒子は、異なる標的部位にある目的の遺伝子を標的とするsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。標的遺伝子は、2、3、4、5つまたは5つ超の部位で標的とされてもよい。一実施形態において、標的遺伝子としては、限定はされないが、SOD1、HTT、APOE、およびMAPTを挙げることができる。
本発明によると、AAV粒子は、CNS送達用に製剤化され得る。脳血液関門を通過する薬剤が使用されてもよい。例えば、分子を脳血液関門内皮へと標的化することができる一部の細胞透過性ペプチドが製剤に使用されてもよい(例えば、マスウパラ(Mathupala)、エキスパート・オピニオン・オン・セラピュティック・パテント(Expert Opin Ther Pat.)、2009年、19巻、p.137~140。この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
他の実施形態において、本発明のAAV粒子は、他の組織および臓器、例えば心血管組織に送達するために製剤化されてもよい。
賦形剤および希釈剤
本発明のAAV粒子は、(1)安定性を増加させるために、(2)細胞トランスフェクションまたは形質導入を増加させるために、(3)ペイロードの持続放出または遅延放出を可能にするために、(4)生体内分布を変更するために(例えば、ウイルス粒子を、特定の組織または細胞タイプへと標的化するために)、(5)コード化タンパク質の翻訳を増加させるために、(6)コード化タンパク質の放出プロファイルを変更するために、および/または(7)本発明のペイロードの制御可能な発現を可能にするために、1つ以上の賦形剤または希釈剤を使用して製剤化され得る。
一部の実施形態において、薬学的に許容可能な賦形剤は、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の純度であってもよい。一部の実施形態において、賦形剤はヒトへの使用および動物への使用が承認されている。一部の実施形態において、賦形剤は米国食品医薬品局によって承認されていてもよい。一部の実施形態において、賦形剤は医薬品グレードであってもよい。一部の実施形態において、賦形剤は、米国薬局方(USP)、欧州薬局方(EP)、英国薬局方、および/または国際薬局方の規格に適合し得る。
賦形剤には、本明細書で使用されるとき、限定はされないが、所望の特定の剤形に適するとおりのあらゆる溶媒、分散媒、希釈剤、または他の液体媒体、分散液または懸濁液助剤、表面活性剤、等張剤、増粘剤または乳化剤、保存剤などが含まれる。医薬組成物を製剤化するための種々の賦形剤および組成物の調製技法は当該技術分野において公知である(「レミントン:薬学の科学と実践(Remington:The Science and Practice of Pharmacy)」、第21版、A・R・ジェンナロ(A.R.Gennaro)著、リッピンコット・ウィリアムズ・アンド・ウィルキンス(Lippincott,Williams & Wilkins)、メリーランド州ボルチモア(Baltimore)、2006年を参照のこと;全体として参照により本明細書に援用される)。従来の賦形剤媒体の使用は本開示の範囲内に企図され得るが、ただし、任意の望ましくない生物学的効果を生じたり、またはその他、医薬組成物の任意の他の1つまたは複数の成分と有害な形で相互作用したりするなどにより、任意の従来の賦形剤媒体が物質またはその誘導体と不適合である場合は除く。
例示的希釈剤としては、限定はされないが、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、リン酸カルシウム、リン酸二カルシウム、硫酸カルシウム、リン酸水素カルシウム、リン酸ナトリウム ラクトース、スクロース、セルロース、微結晶性セルロース、カオリン、マンニトール、ソルビトール、イノシトール、塩化ナトリウム、乾燥デンプン、コーンスターチ、粉末糖等、および/またはこれらの組合せが挙げられる。
非活性成分
一部の実施形態において、AAV粒子製剤は、少なくとも1つの非活性成分を含み得る。本明細書で使用されるとき、用語「非活性成分」は、製剤に含まれる医薬組成物の活性成分の活性に寄与しない1つ以上の薬剤を指す。一部の実施形態において、本発明の製剤に使用し得る非活性成分は、全てが米国食品医薬品局(FDA)によって承認されているか、いずれも承認されていないか、または一部が承認されているものであり得る。
一実施形態において、AAV粒子医薬組成物は、限定ではないが、以下のものなどの少なくとも1つの非活性成分を含む:1,2,6-ヘキサントリオール;1,2-ジミリストイル-Sn-グリセロ-3-(ホスホ-S-(1-グリセロール));1,2-ジミリストイル-Sn-グリセロ-3-ホスホコリン;1,2-ジオレオイル-Sn-グリセロ-3-ホスホコリン;1,2-ジパルミトイル-Sn-グリセロ-3-(ホスホ-Rac-(1-グリセロール));1,2-ジステアロイル-Sn-グリセロ-3-(ホスホ-Rac-(1-グリセロール));1,2-ジステアロイル-Sn-グリセロ-3-ホスホコリン;1-O-トリルビグアニド;2-エチル-1,6-ヘキサンジオール;酢酸;氷酢酸;無水酢酸;アセトン;アセトン重亜硫酸ナトリウム;アセチル化ラノリンアルコール;アセチル化モノグリセリド;アセチルシステイン;アセチルトリプトファン,DL-;アクリレートコポリマー;アクリル酸-アクリル酸イソオクチルコポリマー;アクリル接着剤788;活性炭;Adcote72A103;接着テープ;アジピン酸;Aerotexレジン3730;アラニン;凝集アルブミン;コロイドアルブミン;ヒトアルブミン;アルコール;無水アルコール;変性アルコール;希釈アルコール;Alfadex;アルギン酸;アルキルアンモニウムスルホン酸ベタイン;アルキルアリールスルホン酸ナトリウム;アラントイン;アリル.アルファ.-イオノン;アーモンド油;アルファテルピネオール;アルファ-トコフェロール;アルファ-トコフェロールアセテート,Dl-;アルファ-トコフェロール,Dl-;酢酸アルミニウム;アルミニウムクロルヒドロキシアラントイネート;水酸化アルミニウム;水和水酸化アルミニウム-スクロース;水酸化アルミニウムゲル;水酸化アルミニウムゲルF500;水酸化アルミニウムゲルF5000;モノステアリン酸アルミニウム;酸化アルミニウム;アルミニウムポリエステル;ケイ酸アルミニウム;オクテニルコハク酸デンプンアルミニウム;ステアリン酸アルミニウム;塩基性酢酸アルミニウム;無水硫酸アルミニウム;Amerchol C;Amerchol-Cab;アミノメチルプロパノール;アンモニア;アンモニア溶液;濃アンモニア溶液;酢酸アンモニウム;水酸化アンモニウム;ラウリル硫酸アンモニウム;アンモニウムノノキシノール-4スルフェート;C-12-C-15直鎖第一級アルコールエトキシレートのアンモニウム塩;硫酸アンモニウム;アンモニックス;Amphoteric-2;Amphoteric-9;アネトール;無水クエン酸;無水デキストロース;無水ラクトース;無水クエン酸三ナトリウム;アニス油;Anoxid Sbn;泡止剤;アンチピリン;アパフルラン;杏仁油Peg-6エスター;Aquaphor;アルギニン;Arlacel;アスコルビン酸;アスコルビン酸パルミテート;アスパラギン酸;ペルーバルサム;硫酸バリウム;みつろう;合成みつろう;ベヘネス-10;ベントナイト;塩化ベンザルコニウム;ベンゼンスルホン酸;塩化ベンゼトニウム;臭化ベンゾドデシニウム;安息香酸;ベンジルアルコール;安息香酸ベンジル;塩化ベンジル;ベータデクス;ビバプシチド(Bibapcitide);次没食子酸ビスマス;ホウ酸;ブロクリナト;ブタン;ブチルアルコール;ビニルメチルエーテルのブチルエステル/無水マレイン酸共重合体(125000Mw);ステアリン酸ブチル;ブチル化ヒドロキシアニソール;ブチル化ヒドロキシトルエン;ブチレングリコール;ブチルパラベン;酪酸;C20~40パレス-24;カフェイン;カルシウム;炭酸カルシウム;塩化カルシウム;グルセプト酸カルシウム;水酸化カルシウム;乳酸カルシウム;カルコブトロール(Calcobutrol);カルジアミドナトリウム;カロキセト酸三ナトリウム(Caloxetate Trisodium);カルテリドールカルシウム(Calteridol Calcium);カナダバルサム;カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド;カプリル酸/カプリン酸/ステアリン酸トリグリセリド;カプタン;カプチゾール;カラメル;カルボマー1342;カルボマー1382;カルボマー934;カルボマー934p;カルボマー940;カルボマー941;カルボマー980;カルボマー981;カルボマーホモポリマーB型(アリルペンタエリトリトール架橋);カルボマーホモポリマーC型(アリルペンタエリトリトール架橋);二酸化炭素;カルボキシビニルコポリマー;カルボキシメチルセルロース;カルボキシメチルセルロースナトリウム;カルボキシポリメチレン;カラギナン;カラギナン塩;ヒマシ油;ニオイヒバ油;セルロース;微晶質セルロース;Cerasynt-Se;セレシン;セテアレス-12;セテアレス-15;セテアレス-30;セテアリルアルコール/セテアレス-20;エチルヘキサン酸セテアリル;セテス-10;セテス-2;セテス-20;セテス-23;セトステアリルアルコール;塩化セトリモニウム;セチルアルコール;セチルエステルワックス;パルミチン酸セチル;塩化セチルピリジウム;クロロブタノール;クロロブタノール半水和物;無水クロロブタノール;クロロクレゾール;クロロキシレノール;コレステロール;コレス;コレス-24;クエン酸塩;クエン酸;クエン酸一水和物;含水クエン酸;コカミドエーテルスルフェート;コカミンオキシド;ココベタイン;ココジエタノールアミド;ココモノエタノールアミド;カカオ脂;ココ-グリセリド;ヤシ油;硬化ヤシ油;硬化ヤシ油/パーム核油グリセリド;ココイルカプリロカプラート;コラノキ種子抽出物;コラーゲン;着色料懸濁剤;トウモロコシ油;綿実油;クリーム基材;クレアチン;クレアチニン;クレゾール;クロスカルメロースナトリウム;クロスポビドン;硫酸銅;無水硫酸銅;シクロメチコーン;シクロメチコーン/ジメチコーンコポリオール;システイン;塩酸システイン;無水塩酸システイン;システイン,Dl-;D&CレッドNo.28;D&CレッドNo.33;D&CレッドNo.36;D&CレッドNo.39;D&CイエローNo.10;ダルファムプリジン;Daubert1-5 Pestr(Matte)164z;デシルメチルスルホキシド;DehydagワックスSx;デヒドロ酢酸;Dehymuls E;安息香酸デナトニウム;デオキシコール酸;デキストラン;デキストラン40;デキストリン;デキストロース;デキストロース一水和物;デキストロース溶液;ジアトリゾ酸;ジアゾリジニル尿素;ジクロロベンジルアルコール;ジクロロジフルオロメタン;ジクロロテトラフルオロエタン;ジエタノールアミン;ピロ炭酸ジエチル;セバシン酸ジエチル;ジエチレングリコールモノエチルエーテル;ジエチルヘキシルフタル酸エステル;アミノ酢酸ジヒドキシアルミニウム;ジイソプロパノールアミン;ジイソプロピルアジパート;ジリノール酸ジイソプロピル;ジメチコーン350;ジメチコーンコポリオ-ル;ジメチコーンMdx4-4210;ジメチコーン医療用流体360;ジメチルイソソルビド;ジメチルスルホキシド;ジメチルアミノエチルメタクリレート-ブチルメタクリレート-メチルメタクリレートコポリマー;ジメチルジオクタデシルアンモニウムベントナイト;ジメチルシロキサン/ジメチルビニルシロキシコポリマー;ジノセブアンモニウム塩;ジパルミトイルホスファチジルグリセロール,Dl-;ジプロピレングリコール;ココアンホ二酢酸二ナトリウム;スルホコハク酸ラウレス二ナトリウム;スルホコハク酸ラウリル二ナトリウム;スルホサリチル酸二ナトリウム;ジソフェニン;ジビニルベンゼンスチレンコポリマー;Dmdmヒダントイン;ドコサノール;ドクセートナトリウム;Duro-Tak280-2516;Duro-Tak387-2516;Duro-Tak80-1196;Duro-Tak87-2070;Duro-Tak87-2194;Duro-Tak87-2287;Duro-Tak87-2296;Duro-Tak87-2888;Duro-Tak87-2979;エデト酸カルシウム二ナトリウム;エデト酸二ナトリウム;無水エデト酸二ナトリウム;エデト酸ナトリウム;エデト酸;卵リン脂質;エンツホン;エンツホンナトリウム;エピラクトース;エピテトラサイクリン塩酸塩;Essence Bouquet9200;エタノールアミン塩酸塩;酢酸エチル;オレイン酸エチル;エチルセルロース;エチレングリコール;エチレン酢酸ビニルコポリマー;エチレンジアミン;エチレンジアミン二塩酸塩;エチレン-プロピレンコポリマー;エチレン-酢酸ビニルコポリマー(28%酢酸ビニル);エチレン-酢酸ビニルコポリマー(9%酢酸ビニル);ヒドロキシステアリン酸エチルヘキシル;エチルパラベン;オイカリプトール;エキサメタジム;食用脂肪;固形脂肪;脂肪酸エステル;脂肪酸ペンタエリトリオールエステル;脂肪酸;クエン酸脂肪アルコール(Fatty Alcohol Citrate);脂肪アルコール;Fd&CブルーNo.1;Fd&CグリーンNo.3;Fd&CレッドNo.4;Fd&CレッドNo.40;Fd&CイエローNo.10(リストから除外);Fd&CイエローNo.5;Fd&CイエローNo.6;塩化第二鉄;酸化第二鉄;香味料89-186;香味料89-259;香味料Df-119;香味料Df-1530;香味増強剤;香味料イチジク827118;香味料ラズベリーPfc-8407;医薬用香味料Rhodia No.Rf451(Flavor Rhodia Pharmaceutical No.Rf451);フルオロクロロ炭化水素;ホルムアルデヒド;ホルムアルデヒド溶液;分留ヤシ油;芳香剤3949-5;芳香剤520a;芳香剤6.007;芳香剤91-122;芳香剤9128-Y;芳香剤93498g;芳香剤マツバルサムNo.5124;芳香剤Bouquet10328;芳香剤Chemoderm6401-B;芳香剤Chemoderm6411;芳香剤Cream No.73457;芳香剤Cs-28197;芳香剤Felton066m;芳香剤Firmenich47373;芳香剤Givaudan Ess9090/1c;芳香剤H-6540;芳香剤Herbal10396;芳香剤Nj-1085;芳香剤P O Fl-147;芳香剤Pa52805;芳香剤Pera Derm D;芳香剤Rbd-9819;芳香剤Shaw Mudge U-7776;芳香剤Tf044078;芳香剤Ungerer Honeysuckle K2771;芳香剤Ungerer N5195;フルクトース;ガドリニウム酸化物;ガラクトース;ガンマシクロデキストリン;ゼラチン;架橋ゼラチン;ゲルフォームスポンジ;ジェランガム(低アシル);Gelva737;ゲンチシン酸;ゲンチシン酸エタノールアミド;グルセプト酸ナトリウム;グルセプト酸ナトリウム二水和物;グルコノラクトン;グルクロン酸;グルタミン酸,Dl-;グルタチオン;グリセリン;硬化ロジンのグリセロールエステル;クエン酸グリセリル;イソステアリン酸グリセリル;ラウリン酸グリセリル;モノステアリン酸グリセリル;オレイン酸グリセリル;オレイン酸グリセリル/プロピレングリコール;パルミチン酸グリセリル;リシノール酸グリセリル;ステアリン酸グリセリル;ステアリン酸グリセリル-ラウレス-23;ステアリン酸グリセリル/Pegステアレート;ステアリン酸グリセリル/Peg-100ステアレート;ステアリン酸グリセリル/Peg-40ステアレート;ステアリン酸グリセリル-ステアルアミドエチルジエチルアミン;トリオレイン酸グリセリル;グリシン;グリシン塩酸塩;ジステアリン酸グリコール;ステアリン酸グリコール;グアニジン塩酸塩;グアーガム;ヘアコンディショナー(18n195-1m);ヘプタン;ヘタスターチ;ヘキシレングリコール;高密度ポリエチレン;ヒスチジン;ヒトアルブミンマイクロスフェア;ヒアルロン酸ナトリウム;炭化水素;可塑化炭化水素ゲル;塩酸;希塩酸;ヒドロコルチゾン;ヒドロゲルポリマー;過酸化
水素;硬化ヒマシ油;硬化パーム油;硬化パーム/パーム核油Peg-6エステル;硬化ポリブテン635-690;水酸化イオン;ヒドロキシエチルセルロース;ヒドロキシエチルピペラジンエタンスルホン酸;ヒドロキシメチルセルロース;ヒドロキシオクタコサニルヒドロキシステアレート;ヒドロキシプロピルセルロース;ヒドロキシプロピルメチルセルロース2906;ヒドロキシプロピル-ベータ-シクロデキストリン;ヒプロメロース2208(15000Mpa.S);ヒプロメロース2910(15000Mpa.S);ヒプロメロース;イミド尿素;ヨウ素;ヨードキサム酸;イオフェタミン塩酸塩;アイリッシュモス抽出物;イソブタン;イソセテス-20;イソロイシン;アクリル酸イソオクチル;イソプロピルアルコール;イソステアリン酸イソプロピル;ミリスチン酸イソプロピル;ミリスチン酸イソプロピル-ミリスチルアルコール;パルミチン酸イソプロピル;ステアリン酸イソプロピル;イソステアリン酸;イソステアリルアルコール;等張食塩溶液;Jelene;カオリン;カトンCg;カトンCgII;ラクテート;乳酸;乳酸,Dl-;乳酸,L-;ラクトビオン酸;ラクトース;ラクトース一水和物;含水ラクトース;ラネス;ラノリン;ラノリンアルコール-鉱油;ラノリンアルコール;無水ラノリン;ラノリンコレステロール;ラノリン非イオン性誘導体;エトキシル化ラノリン;硬化ラノリン;塩化ラウラルコニウム;酸化ラウラミン;ラウルジモニウム加水分解動物コラーゲン;硫酸ラウレス;ラウレス-2;ラウレス-23;ラウレス-4;ラウリン酸ジエタノールアミド;ラウリン酸ミリスチン酸ジエタノールアミド;ラウロイルサルコシン;乳酸ラウリル;硫酸ラウリル;ラベンデュラ・アングスチホリア(Lavandula Angustifolia)花頂部;レシチン;無漂白レシチン;卵レシチン;硬化レシチン;硬化大豆レシチン;大豆レシチン;レモン油;ロイシン;レブリン酸;リドフェニン;軽油;軽油(85Ssu);リモネン,(+/-)-;リポコールSc-15;リジン;酢酸リジン;リジン一水和物;ケイ酸アルミニウムマグネシウム;ケイ酸アルミニウムマグネシウム水和物;塩化マグネシウム;硝酸マグネシウム;ステアリン酸マグネシウム;マレイン酸;マンニトール;マプロフィックス(Maprofix);メブロフェニン(Mebrofenin);医療用接着剤改変型S-15;医療用泡止剤A-Fエマルジョン;メドロン酸二ナトリウム;メドロン酸;メグルミン;メントール;メタクレゾール;メタリン酸;メタンスルホン酸;メチオニン;メチルアルコール;メチルグルセス-10;メチルグルセス-20;セスキステアリン酸メチルグルセス-20;セスキステアリン酸メチルグルコース;ラウリン酸メチル;メチルピロリドン;サリチル酸メチル;ステアリン酸メチル;メチルボロン酸;メチルセルロース(4000Mpa.S);メチルセルロース;メチルクロロイソチアゾリノン;メチレンブルー;メチルイソチアゾリノン;メチルパラベン;微結晶性ワックス;鉱油;モノおよびジグリセリド;クエン酸モノステアリル;モノチオグリセロール;マルチステロール(Multisterol)抽出物;ミリスチルアルコール;乳酸ミリスチル;ミリスチル-.ガンマ.-ピコリニウムクロリド;N-(カルバモイル-メトキシPeg-40)-1,2-ジステアロイル-セファリンナトリウム;N,N-ジメチルアセトアミド;ナイアシンアミド;ニオキシム;硝酸;窒素;ノノキシノールヨード;ノノキシノール-15;ノノキシノール-9;ノルフルラン;オートミール;オクタデセン-1/マレイン酸コポリマー;オクタン酸;オクチサレート;オクトキシノール-1;オクトキシノール-40;オクトキシノール-9;オクチルドデカノール;オクチルフェノールポリメチレン;オレイン酸;オレス-10/オレス-5;オレス-2;オレス-20;オレイルアルコール;オレイン酸オレイル;オリーブ油;オキシドロン酸二ナトリウム;オキシキノリン;パーム核油;パルミタミンオキシド;パラベン;パラフィン;白色軟質パラフィン;香料Creme45/3;ピーナッツ油;精製ピーナッツ油;ペクチン;Peg6-32ステアレート/ステアリン酸グリコール;Peg植物油;Peg-100ステアレート;Peg-12ラウリン酸グリセリル;Peg-120ステアリン酸グリセリル;Peg-120ジオレイン酸メチルグルコース;Peg-15コカミン;Peg-150ジステアレート;Peg-2ステアレート;Peg-20ソルビタンイソステアレート;Peg-22メチルエーテル/ドデシルグリコールコポリマー;Peg-25プロピレングリコールステアレート;Peg-4ジラウレート;Peg-4ラウレート;Peg-40ヒマシ油;Peg-40ソルビタンジイソステアレート;Peg-45/ドデシルグリコールコポリマー;Peg-5オレアート;Peg-50ステアレート;Peg-54硬化ヒマシ油;Peg-6イソステアレート;Peg-60ヒマシ油;Peg-60硬化ヒマシ油;Peg-7メチルエーテル;Peg-75ラノリン;Peg-8ラウレート;Peg-8ステアレート;Pegoxol7ステアレート;ペンタデカラクトン;ペンタエリトリトールココエート(Pentaerythritol Cocoate);ペンテト酸五ナトリウム;ペンテト酸カルシウム三ナトリウム;ペンテト酸;ハッカ油;ペルフルトレン;香料25677;香料Bouquet;香料E-1991;香料Gd5604;香料Tana90/42Scba;香料W-1952-1;ワセリン;白色ワセリン;石油蒸留物;フェノール;液化フェノール;フェノニップ(Phenonip);フェノキシエタノール;フェニルアラニン;フェニルエチルアルコール;酢酸フェニル水銀;硝酸フェニル水銀;卵ホスファチジルグリセロール;リン脂質;卵リン脂質;ホスホリポン90g;リン酸;松葉油(パイナス・シルヴェストリス(Pinus Sylvestris));ピペラジン六水和物;プラスチベース-50w;ポラクリリン;塩化ポリドロニウム;ポロキサマー124;ポロキサマー181;ポロキサマー182;ポロキサマー188;ポロキサマー237;ポロキサマー407;ポリ(ビス(P-カルボキシフェノキシ)プロパン無水物):セバシン酸;末端ブロック化ポリ(ジメチルシロキサン/メチルビニルシロキサン/メチルヒドロゲンシロキサン)ジメチルビニルまたはジメチルヒドロキシまたはトリメチル;ポリ(Dl-乳酸-Co-グリコール酸)、(50:50;ポリ(Dl-乳酸-Co-グリコール酸)、エチルエステル終端、(50:50;ポリアクリル酸(250000Mw));ポリブテン(1400Mw);ポリカルボフィル;ポリエステル;ポリエステルポリアミンコポリマー;ポリエステルレーヨン;ポリエチレングリコール1000;ポリエチレングリコール1450;ポリエチレングリコール1500;ポリエチレングリコール1540;ポリエチレングリコール200;ポリエチレングリコール300;ポリエチレングリコール300-1600;ポリエチレングリコール3350;ポリエチレングリコール400;ポリエチレングリコール4000;ポリエチレングリコール540;ポリエチレングリコール600;ポリエチレングリコール6000;ポリエチレングリコール8000;ポリエチレングリコール900;酸化第二鉄ブラック含有高密度ポリエチレン(Polyethylene High Density Containing Ferric Oxide Black)(<1%));硫酸バリウム含有低密度ポリエチレン(Polyethylene Low Density Containing Barium Sulfate)(20~24%);ポリエチレンT;テレフタル酸ポリエチレン;ポリグラクチン;ポリグルセリル-3オレアート;ポリグルセリル-4オレアート;メタクリル酸ポリヒドロキシエチル;ポリイソブチレン;ポリイソブチレン(1100000Mw);ポリイソブチレン(35000Mw);ポリイソブチレン178-236;ポリイソブチレン241-294;ポリイソブチレン35-39;低分子量ポリイソブチレン;中分子量ポリイソブチレン;ポリイソブチレン/ポリブテン接着剤;ポリラクチド;ポリオール;ポリオキシエチレン-ポリオキシプロピレン1800;ポリオキシエチレンアルコール;ポリオキシエチレン脂肪酸エステル;ポリオキシエチレンプロピレン;ポリオキシル20セトステアリルエーテル;ポリオキシル35ヒマシ油;ポリオキシル40硬化ヒマシ油;ステアリン酸ポリオキシル40;ステアリン酸ポリオキシル400;パルミトステアリン酸ポリオキシル6およびポリオキシル32;ジステアリン酸ポリオキシル;ポリオキシルステアリン酸グリセリル;ポリオキシルラノリン;パルミチン酸ポリオキシル;ステアリン酸ポリオキシル;ポリプロピレン;ポリプロピレングリコール;ポリクオタニウム-10;ポリクオタニウム-7(70/30アクリルアミド/Dadmac;ポリシロキサン;ポリソルベート20;ポリソルベート40;ポリソルベート60;ポリソルベート65;ポリソルベート80;ポリウレタン;ポリ酢酸ビニル;ポリビニルアルコール;ポリ塩化ビニル;ポリ塩化ビニル-ポリ酢酸ビニルコポリマー;ポリビニルピリジン;ケシ油;炭酸カリウム;酢酸カリウム;カリウムミョウバン;炭酸水素カリウム;亜硫酸水素カリウム;塩化カリウム;クエン酸カリウム;水酸化カリウム;メタ重亜硫酸カリウム;リン酸二カリウム;リン酸二水素カリウム;カリウム石鹸;ソルビン酸カリウム;ポビドンアクリレートコポリマー;ポビドンヒドロゲル;ポビドンK17;ポビドンK25;ポビドンK29/32;ポビドンK30;ポビドンK90;ポビドンK90f;ポビドン/エイコサエンコポリマー;ポビドン;Ppg-12/Smdiコポリマー;Ppg-15ステアリルエーテル;Ppg-20メチルグルコースエーテルジステアレート;Ppg-26オレアート;プロダクトワット(Product Wat);プロリン;プロムルゲン(Promulgen)D;プロムルゲンG;プロパン;噴霧剤A-46;没食子酸プロピル;炭酸プロピレン;プロピレングリコール;プロピレングリコールジアセテート;プロピレングリコールジカプリレート;プロピレングリコールモノラウレート;プロピレングリコールモノパルミトステアレート;プロピレングリコールパルミトステアレート;プロピレングリコールリシノレレート;プロピレングリコール/ジアゾリジニル尿素/メチルパラベン/プロピルパルベン;プロピルパラベン;硫酸プロタミン;タンパク質加水分解物;Pvm/Maコポリマー;クアテルニウム-15;クアテルニウム-15シス型;クアテルニウム-52;Ra-2397;Ra-3011;サッカリン;サッカリンナトリウム;無水サッカリンナトリウム;サフラワー油;Sdアルコール3a;Sdアルコール40;Sdアルコール40-2;Sdアルコール40b;セピネオ(Sepineo)P600;セリン;ゴマ油;シアバター;Silastic商標医療用管材料;Silastic医療用接着剤、シリコーンA型;歯科用シリカ;ケイ素;二酸化ケイ素;コロイド状二酸化ケイ素;シリコーン;シリコーン接着剤4102;シリコーン接着剤4502;シリコーン接着剤Bio-Psa Q7-4201;シリコーン接着剤Bio-Psa Q7-4301;シリコーンエマルジョン;シリコーン/ポリエステルフィルムストリップ;シメチコン;シメチコンエマルジョン;Sipon Ls 20np;ソーダ灰;酢酸ナトリウム;無水酢酸ナトリウム;アルキル硫酸ナトリウム;アスコルビン酸ナトリウム;安息香酸ナトリウム;重炭酸ナトリウム;重硫酸ナトリウム;亜硫酸水素ナトリウム;硼酸ナトリウム;硼酸ナトリウム十水化物;炭酸ナトリウム;炭酸ナトリウム十水化物;炭酸ナトリウム一水和物;セトステアリル硫酸ナトリウム;塩素酸ナトリウム;塩化ナトリウム;塩化ナトリウム注射剤;静菌性塩化ナトリウム注射剤;コレステリル硫酸ナトリ
ウム;クエン酸ナトリウム;ココイルサルコシンナトリウム;デゾキシコール酸ナトリウム;亜ジチオン酸ナトリウム;ドデシルベンゼンスルホン酸ナトリウム;ホルムアルデヒドスルホキシル酸ナトリウム;グルコン酸ナトリウム;水酸化ナトリウム;次亜塩素酸ナトリウム;ヨウ化ナトリウム;乳酸ナトリウム;乳酸ナトリウム,L-;ラウレス-2硫酸ナトリウム;ラウレス-3硫酸ナトリウム;ラウレス-5硫酸ナトリウム;ラウロイルサルコシンナトリウム;ラウリル硫酸ナトリウム;ラウリルスルホ酢酸ナトリウム;メタ重亜硫酸ナトリウム;硝酸ナトリウム;リン酸ナトリウム;リン酸ナトリウム二水和物;リン酸水素ナトリウム;無水リン酸水素ナトリウム;リン酸水素ナトリウム二水和物;リン酸水素ナトリウム十二水和物;リン酸水素ナトリウム七水和物;リン酸一ナトリウム;無水リン酸一ナトリウム;リン酸一ナトリウム二水和物;リン酸一ナトリウム一水和物;ポリアクリル酸ナトリウム(2500000Mw);ピロリン酸ナトリウム;ピロリドンカルボン酸ナトリウム;デンプングリコール酸ナトリウム;琥珀酸ナトリウム六水化物;硫酸ナトリウム;無水硫酸ナトリウム;硫酸ナトリウム十水化物;亜硫酸ナトリウム;スルホコハク酸ナトリウム化ウンデシレンモノアルキロールアミド(Sodium Sulfosuccinated Undecyclenic Monoalkylolamide);酒石酸ナトリウム;チオグリコール酸ナトリウム;チオマリン酸ナトリウム;チオ硫酸ナトリウム;無水チオ硫酸ナトリウム;トリメタリン酸ナトリウム;キシレンスルホン酸ナトリウム;Somay44;ソルビン酸;ソルビタン;イソステアリン酸ソルビタン;モノラウリン酸ソルビタン;モノオレイン酸ソルビタン;モノパルミチン酸ソルビタン;モノステアリン酸ソルビタン;セスキオレイン酸ソルビタン;トリオレイン酸ソルビタン;トリステアリン酸ソルビタン;ソルビトール;ソルビトール溶液;大豆粉;大豆油;スペアミント油;鯨ろう;スクアラン;安定化オキシクロロ錯体;2-エチルヘキサン酸第一スズ;塩化第一スズ;無水塩化第一スズ;フッ化第一スズ;酒石酸第一スズ;デンプン;アルファ化デンプン1500;トウモロコシデンプン;塩化ステアラルコニウム;ステアラルコニウムヘクトライト/炭酸プロピレン;ステアルアミドエチルジエチルアミン;ステアレス-10;ステアレス-100;ステアレス-2;ステアレス-20;ステアレス-21;ステアレス-40;ステアリン酸;ステアリン酸ジエタノールアミド;ステアロキシトリメチルシラン;ステアルトリモニウム加水分解動物コラーゲン;ステアリルアルコール;吸入用滅菌水;スチレン/イソプレン/スチレンブロックコポリマー;サクシマー;コハク酸;スクラロース;スクロース;ジステアリン酸スクロース;スクロースポリエステル;スルファセタミドナトリウム;スルホブチルエーテル.ベータ.-シクロデキストリン;二酸化硫黄;硫酸;亜硫酸;Surfactol Qs;タガトース,D-;タルク;トール油;獣脂グリセリド;酒石酸;酒石酸,Dl-;テノックス;テノックス-2;Tert-ブチルアルコール;Tert-ブチルヒドロペルオキシド;Tert-ブチルヒドロキノン;テトラキス(2-メトキシイソブチルイソシアニド)銅(I)テトラフルオロボレート;オルトケイ酸テトラプロピル;テトロホスミン;テオフィリン;チメロサール;トレオニン;チモール;スズ;二酸化チタン;トコフェロール;トコフェルソラン;完全非経口栄養剤、脂質エマルジョン;トリアセチン;トリカプリリン;トリクロロモノフルオロメタン;トリデセス-10;ラウリル硫酸トリエタノールアミン;トリフルオロ酢酸;中鎖トリグリセリド;トリヒドロキシステアリン;トリラネス-4リン酸(Trilaneth-4 Phosphate);トリラウレス-4リン酸;クエン酸三ナトリウム二水和物;Hedta三ナトリウム;トリトン720;トリトンX-200;トロラミン;トロマンタジン;トロメタミン(TRIS);トリプトファン;チロキサポール;チロシン;ウンデシレン酸;ユニオン76 Amsco-Res6038;尿素;バリン;植物油;硬化植物油グリセリド;硬化植物油;ベルセタミド;Viscarin;ビスコース/コットン;ビタミンE;乳化ワックス;Wecobee Fs;白色セレシンワックス;白ろう;キサンタンガム;亜鉛;酢酸亜鉛;炭酸亜鉛;塩化亜鉛;および酸化亜鉛。
本明細書で開示されるAAV粒子の医薬組成物製剤は、カチオンまたはアニオンを含み得る。一実施形態において、製剤は、限定はされないが、Zn2+、Ca2+、Cu2+、Mn2+、Mg+およびこれらの組合せなどの、金属カチオンを含む。非限定的な例として、製剤は、金属カチオンとのポリマーおよび錯体を含み得る(例えば、米国特許第6,265,389号明細書および同第6,555,525号明細書を参照のこと。この各々の内容は全体として参照により本明細書に援用される)。
また、本発明の製剤は、1つ以上の薬学的に許容される塩を含み得る。本明細書で使用されるとき、「薬学的に許容可能な塩」は、開示される化合物の誘導体を指し、ここで親化合物は、既存の酸または塩基部分からその塩形態への変換(例えば、遊離塩基基を好適な有機酸と反応させることによる)によって修飾される。薬学的に許容可能な塩の例としては、限定はされないが、アミン類などの塩基性残基の鉱酸塩または有機酸塩;カルボン酸などの酸性残基のアルカリ塩または有機塩などが挙げられる。代表的な酸付加塩としては、酢酸塩、酢酸、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、カンファー酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプトン酸塩、ヘキサン酸塩、臭化水素酸塩、塩酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシエタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3-フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが挙げられる。代表的なアルカリまたはアルカリ土類金属塩としては、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなど、ならびに非毒性アンモニウム、第四級アンモニウム、およびアミン陽イオン、例えば、限定はされないが、アンモニウム、テトラメチルアンモニウム、テトラエチルアンモニウム、メチルアミン、ジメチルアミン、トリメチルアミン、トリエチルアミン、エチルアミンなどが挙げられる。本開示の薬学的に許容可能な塩には、例えば非毒性無機酸または有機酸から形成される親化合物の従来の非毒性塩が含まれる。
本開示の薬学的に許容可能な塩は、従来の化学的方法により塩基または酸部分を含有する親化合物から合成することができる。概して、かかる塩は、遊離酸または塩基形態のこれらの化合物と、水中または有機溶媒中、またはこれら2つの混合物中(概して、エーテル、酢酸エチル、エタノール、イソプロパノール、またはアセトニトリルなどの非水性媒体が好ましい)にある化学量論量の適切な塩基または酸とを反応させることにより調製し得る。好適な塩の一覧については、「レミントンの薬学科学(Remington’s Pharmaceutical Sciences)」、第17版、マック・パブリッシング・カンパニー(Mack Publishing Company)、ペンシルベニア州イーストン(Easton)、1985年、p.1418、「薬学的塩:特性、選択、および使用(Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use)」、P・H・シュタール(P.H.Stahl)およびC・G・ウェルムス(C.G.Wermuth)編、ワイリー-ブイシーエイチ(Wiley-VCH)、2008年、およびベルジュ(Berge)ら著、ジャーナル・オブ・ファーマシューティカル・サイエンス(Journal of Pharmaceutical Science)、第66巻、p.1~19、1977年が参照される;この各々の内容は全体として参照により本明細書に援用される。
用語「薬学的に許容可能な溶媒和物」は、本明細書で使用されるとき、好適な溶媒の分子が結晶格子に取り込まれている本発明の化合物を意味する。好適な溶媒は、投与される投薬量で生理学的に忍容可能である。溶媒和物は、有機溶媒、水、またはこれらの混合物を含む溶液から結晶化、再結晶化、または沈殿によって調製されてもよい。好適な溶媒の例は、エタノール、水(例えば、一水和物、二水和物、および三水和物)、N-メチルピロリジノン(NMP)、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N,N’-ジメチルホルムアミド(DMF)、N,N’-ジメチルアセトアミド(DMAC)、1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン(DMEU)、1,3-ジメチル-3,4,5,6-テトラヒドロ-2-(1H)-ピリミジノン(DMPU)、アセトニトリル(ACN)、プロピレングリコール、酢酸エチル、ベンジルアルコール、2-ピロリドン、安息香酸ベンジルなどである。水が溶媒であるとき、その溶媒和物は「水和物」と称される。
III.投与および用量設定
投与
一実施形態において、AAV粒子は、対象の神経学的疾患の症状を低減するための治療有効量(例えば、公知の評価方法を使用して決定される)で対象に(例えば、対象のCNSに)投与されてもよい。
本発明のAAV粒子は、治療上有効な結果をもたらす任意の送達経路によって投与されてもよい。それらとしては、限定はされないが、経腸(腸の中)、胃腸、硬膜上(硬膜の中)、経口(口を介して)、経皮、大脳内(大脳の中)、脳室内(脳室の中)、軟膜下(軟膜とCNS実質との間)、頸動脈内(頸動脈の中)、皮膚上(皮膚への塗布)、皮内(皮膚それ自体の中)、皮下(皮膚の下)、鼻腔投与(鼻を通じて)、静脈内(静脈の中)、静脈内ボーラス、静脈内点滴、動脈内(動脈の中)、全身性、筋肉内(筋肉の中)、心臓内(心臓の中)、骨内注入(骨髄の中)、髄腔内(脊柱管の中)、実質内(脳組織の中)、腹腔内(腹膜への注入または注射)、膀胱内注入、硝子体内(眼を通じて)、海綿体内注射(病的腔の中)、腔内(陰茎の基部の中)、腟内投与、子宮内、羊膜外投与、経皮(全身分布のためのインタクトな皮膚を通じた拡散)、経粘膜(粘膜を通じた拡散)、経腟、インサフレーション(鼻から吸い込む)、舌下、唇下、浣腸、点眼薬(結膜上)、または点耳薬で、耳介(耳内または耳を介して)、頬側(頬の方に向けて)、結膜、皮膚、歯(1本または複数の歯に対して)、電気浸透、子宮頚管内、副鼻腔内、気管内、体外、血液透析、浸潤、間質内、腹腔内、羊膜内、関節内、胆管内、気管支内、嚢内、軟骨内(軟骨の範囲内)、仙骨内(馬尾(cauda equine)の範囲内)、大槽内(大槽小脳延髄槽の範囲内)、角膜内(角膜の範囲内)、歯冠内、冠内(冠動脈の範囲内)、海綿体内(intracorporus cavernosum)(陰茎海綿体(corporus cavernosa)の可膨張性腔の範囲内)、椎間板内(椎間板の範囲内)、管内(腺管の範囲内)、十二指腸内(十二指腸の範囲内)、硬膜内(硬膜の範囲内または真下)、表皮内(表皮に対して)、食道内(食道に対して)、胃内(胃の範囲内)、歯肉内(歯肉の範囲内)、回腸内(小腸の遠位部分の範囲内)、病巣内(局所病変の範囲内、またはそこに直接導入される)、管腔内(管の管腔の範囲内)、リンパ内(リンパの範囲内)、髄内(骨の髄腔の範囲内)、髄膜内(髄膜の範囲内)、心筋内(心筋の範囲内)、眼内(眼の範囲内)、卵巣内(卵巣の範囲内)、心膜内(心膜の範囲内)、胸膜内(胸膜の範囲内)、前立腺内(前立腺の範囲内)、肺内(肺、またはその気管支の範囲内)、洞内(鼻洞または眼窩周囲洞の範囲内)、脊髄内(脊柱の範囲内)、滑液嚢内(関節の滑膜腔の範囲内)、腱内(腱の範囲内)、精巣内(精巣の範囲内)、髄腔内(脳脊髄軸の任意のレベルにおける脳脊髄液の範囲内)、胸腔内(胸郭の範囲内)、細管内(臓器の細管の範囲内)、腫瘍内(腫瘍の範囲内)、鼓室内(中耳(aurus media)の範囲内)、血管内(1つまたは複数の血管の範囲内)、脳室内(脳室の範囲内)、イオントフォレシス(電流を用いるもので、可溶性塩のイオンが体の組織に移動する)、潅注(開放創または体腔を浸すまたはフラッシュする)、喉頭(喉頭に対して直接)、経鼻胃(鼻を通じて胃の中に)、密封包帯療法(局所経路投与、これは次に包帯で覆われ、包帯がその区域を閉塞する)、眼(外眼部に対して)、中咽頭(口および咽頭に対して直接)、非経口、経皮、関節周囲、硬膜外、神経周囲、歯周、直腸、呼吸器(局所または全身作用のため経口的または鼻腔的に吸入することにより気道の範囲内に)、球後(橋の後ろまたは眼球の後ろ)、軟部組織、くも膜下、結膜下、粘膜下、局所、経胎盤(胎盤を通じてまたは越えて)、経気管(気管の壁を通じて)、経鼓室(鼓室を越えてまたは通じて)、尿管(尿管に対して)、尿道(尿道に対して)、腟、仙骨ブロック、診断的、神経ブロック、胆管灌流、心灌流、フォトフェレーシスおよび脊髄が挙げられる。
一部の実施形態において、AAV粒子およびAAV粒子を含む組成物は、それらが血液脳関門、脈管障壁、または他の上皮性障壁を越えることを可能にするように投与してもよい。本発明のAAV粒子は任意の好適な形態で、液体溶液または懸濁液、液体溶液または液体溶液中の懸濁液に好適な固体形態のいずれとして投与されてもよい。AAV粒子は、任意の適切なかつ薬学的に許容可能な賦形剤と共に製剤化されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は単一経路投与によって対象に送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は多部位投与経路によって対象に送達されてもよい。AAV粒子には、2、3、4、5または5より多い部位に投与されてもよい。
一実施形態において、対象には、本発明のAAV粒子がボーラス注入を用いて投与されてもよい。
一実施形態において、対象には、本発明のAAV粒子が、数分間、数時間または数日間の時間をかけた徐放送達を用いて投与されてもよい。注入速度は、対象、分布、製剤または別の送達パラメータに応じて変更されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、筋肉内送達経路によって送達されてもよい。(例えば、米国特許第6506379号明細書を参照のこと。その内容は全体として参照により本明細書に援用される)。筋肉内投与の非限定的な例としては、静脈内注射または皮下注射が挙げられる。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、眼内送達経路によって送達されてもよい。眼内投与の非限定的な例としては、硝子体内注射が挙げられる。
一部の実施形態において、AAV粒子は、末梢注射によって対象に投与されてもよい。末梢注射の非限定的な例としては、腹腔内、筋肉内、静脈内、結膜、または関節注射が挙げられる。当該技術分野では、AAV粒子の末梢投与は、中枢神経系へと、例えば運動ニューロンへと輸送され得ることが開示された(例えば、米国特許出願公開第20100240739号明細書;および同第20100130594号明細書。これらの各々の内容は全体として参照により本明細書に援用される)。
一実施形態において、AAV粒子は、CSF経路への注射によって送達されてもよい。CSF経路への送達の非限定的な例としては、髄腔内および脳室内投与が挙げられる。
一実施形態において、AAV粒子は、全身性送達によって送達されてもよい。非限定的な例として、全身性送達は、血管内投与によるものであってもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、頭蓋内送達によって対象に投与されてもよい(例えば、米国特許第8,119,611号明細書を参照のこと。この内容は全体として参照により本明細書に援用される)。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、注射によって対象に投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、筋肉注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、筋肉投与によって対象に投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、筋肉内投与によって投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、筋肉内投与によって対象に投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、対象に投与され、対象の筋肉に形質導入する。非限定的な例として、AAV粒子は、筋肉内投与によって対象に投与される。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、実質内注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、実質内注投与によって対象に投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、静脈内投与によって投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、静脈内投与によって対象に投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、静脈内送達によって投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、頸動脈内送達により投与してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、単一用量静脈内送達によって投与されてもよい。非限定的な例として、単一用量静脈内送達は、1回限りの治療であってもよい。神経学的疾患の状況では、単一用量静脈内送達は、神経学的疾患および/または関連症状を有する対象の持久的軽減を生じさせることができる。軽減は、限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59分間または59分間超など、何分間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48時間、または48時間超など、何時間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31日間、または31日間超など、何日間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16週間、または16週間超など、何週間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24ヵ月間、または24ヵ月間超など、何ヵ月間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15年間、または15年間超など、何年間も継続してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、DRG侵害受容ニューロンへの静脈内送達によって投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、DRG侵害受容ニューロンへの単一用量静脈内送達によって投与されてもよい。非限定的な例として、単一用量静脈内送達は、1回限りの治療であってもよい。神経学的疾患の状況では、単一用量静脈内送達は、神経学的疾患および/または関連症状を有する対象の持久的軽減を生じさせることができる。軽減は、限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59分間または59分間超など、何分間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48時間、または48時間超など、何時間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31日間、または31日間超など、何日間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16週間、または16週間超など、何週間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24ヵ月間、または24ヵ月間超など、何ヵ月間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15年間、または15年間超など、何年間も継続してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、髄腔内注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、髄腔内注射によって投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、脊髄運動ニューロンおよび/またはアストロサイトに形質導入するために治療有効量で大槽に投与されてもよい。非限定的な例として、AAV粒子は、髄腔内投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、髄腔内注入を使用して、脊髄運動ニューロンおよび/またはアストロサイトに形質導入するために治療有効量で投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、単一用量髄腔内注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、単一用量髄腔内注射は、1回限りの治療であってもよい。神経学的疾患の状況では、単一用量髄腔内注射は、神経学的疾患および/または関連症状を有する対象の持久的軽減を生じさせることができる。軽減は、限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59分間または59分間超など、何分間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48時間、または48時間超など、何時間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31日間、または31日間超など、何日間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16週間、または16週間超など、何週間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24ヵ月間、または24ヵ月間超など、何ヵ月間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15年間、または15年間超など、何年間も継続してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、DRG侵害受容ニューロンへの髄腔内注射によって投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、DRG侵害受容ニューロンへの単一用量髄腔内注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、単一用量髄腔内注射は、1回限りの治療であってもよい。神経学的疾患の状況では、単一用量髄腔内注射は、神経学的疾患および/または関連症状を有する対象の持久的軽減を生じさせることができる。軽減は、限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59分間または59分間超など、何分間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48時間、または48時間超など、何時間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31日間、または31日間超など、何日間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16週間、または16週間超など、何週間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24ヵ月間、または24ヵ月間超など、何ヵ月間も継続してもよく;限定ではないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15年間、または15年間超など、何年間も継続してもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、C1における髄腔内(IT)注入によって投与される。注入は、1、2、3、4、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15時間または15時間超であってもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、実質内注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、実質内注射によって対象に投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、実質内注射および髄腔内注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、実質内注射および髄腔内注射によって投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、皮下注射によって投与されてもよい。非限定的な例として、AAV粒子は、皮下注射によって対象に投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、局所的に投与されてもよい。非限定的な例として、本発明のAAV粒子は、局所的に対象に投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、脳内への直接注射によって送達されてもよい。非限定的な例として、脳送達は、線条体内投与によるものであってもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、線条体内注射によって投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、線条体内注射および本明細書に記載される別の投与経路によって投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、2つ以上の投与経路によって送達されてもよい。組合せ投与の非限定的な例として、AAV粒子は、髄腔内および脳室内投与によって、または静脈内および実質内投与によって送達されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、神経学的疾患を有する対象の機能および/または生存を改善するために治療有効量でCNSに投与されてもよい。非限定的な例として、ベクターは、静脈内に投与されてもよい。
AAV粒子は、「治療有効」量で、すなわち、疾患に関連する少なくとも1つの症状を軽減および/もしくは予防するのに十分な、または対象の状態の改善をもたらすのに十分な量で投与されてもよい。
一実施形態において、多部位送達のために、脊柱の2つ以上の部位にカテーテルが留置されてもよい。AAV粒子は、連続および/またはボーラス注入で送達されてもよい。各送達部位は異なる投薬レジメンであってもよく、または同じ投薬レジメンを各送達部位に使用してもよい。非限定的な例として、送達部位は、頚部領域および腰部領域にあってもよい。別の非限定的な例として、送達部位は、頚部領域にあってもよい。別の非限定的な例として、送達部位は、腰部領域にあってもよい。
一実施形態では、対象は、本明細書に記載されるAAV粒子を送達する前に、脊柱の解剖学的特徴および病理学的特徴について分析されてもよい。非限定的な例として、脊柱側弯症を有する対象は、脊柱側弯症を有してない対象と比較して、異なる投薬レジメンおよび/またはカテーテル留置を有してもよい。
一実施形態において、AAV粒子送達中の対象の脊柱の向きは、地面に対して垂直であってもよい。
別の実施形態において、AAV粒子送達中の対象の脊柱の向きは、地面に対して水平であってもよい。
一実施形態において、対象の脊柱は、AAV粒子送達中、地面に対して傾いていてもよい。地面に対する対象の脊柱の角度は、少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150または180度であってもよい。
一実施形態において、送達方法および継続期間は、脊髄での幅広い形質導入を提供するように選択される。非限定的な例として、脊髄の吻側-尾側の長さに沿って幅広い形質導入を提供するために、髄腔内送達が使用される。別の非限定的な例として、多部位注入は、脊髄の吻側-尾側の長さに沿ってより均一な形質導入を提供する。更に別の非限定的な例として、長期注入は、脊髄の吻側-尾側の長さに沿ってより均一な形質導入を提供する。
非経口および注射可能投与
一部の実施形態において、本発明の医薬組成物、AAV粒子は、非経口投与されてもよい。経口および非経口投与用の液体剤形としては、限定ではないが、薬学的に許容されるエマルジョン、マイクロエマルジョン、液剤、懸濁剤、シロップ剤、および/またはエリキシル剤が挙げられる。液体剤形は、活性成分に加えて、例えば、水または他の溶媒などの当該技術分野で一般的に使用される不活性希釈剤、エチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、1,3-ブチレングリコール、ジメチルホルムアミド、油(特に、綿実油、落花生油、トウモロコシ油、胚油、オリーブ油、ヒマシ油、およびゴマ油)、グリセロール、テトラヒドロフルフリルアルコール、ポリエチレングリコール、およびソルビタンの脂肪酸エステル、およびそれらの混合物などの可溶化剤および乳化剤を含み得る。経口組成物は、不活性希釈剤の他に、湿潤剤、乳化および懸濁化剤、甘味料、香味料、および/または香料剤などのアジュバントを含むことができる。非経口投与の特定の実施形態において、組成物は、CREMOPHOR(登録商標)、アルコール、油、変性油、グリコール、ポリソルベート、シクロデキストリン、ポリマー、および/またはそれらの組合せなどの可溶化剤と混合される。他の実施形態において、ヒドロキシプロピルセルロースなどの界面活性剤が含まれる。
注射可能調製物、例えば無菌注射可能水性または油性懸濁剤は、公知の技術に従って好適な分散剤、湿潤剤、および/または懸濁化剤を使用して製剤化することができる。無菌注射可能調製物は、無毒性で非経口的に許容される希釈剤および/または溶媒、例えば1,3-ブタンジオール中の無菌注射可能液剤、懸濁剤、および/またはエマルジョンであってもよい。用いることができる許容される媒体および溶媒の中には、水、リンゲル溶液、U.S.P.、および等張食塩溶液がある。無菌固定油が、溶媒または懸濁化媒体として従来用いられる。この目的のために、合成モノグリセリドまたはジグリセリドを含む任意の非刺激性固定油を用いることができる。オレイン酸などの脂肪酸を、注射剤の調製に使用することができる。
注射可能製剤は、例えば、細菌保持フィルターによるろ過によって、および/または使用前に滅菌水もしくは他の無菌注射可能媒体に溶解または分散することができる無菌固形組成物の形態の滅菌剤を組み込むことによって、滅菌することができる。
活性成分の効果を延長させるために、皮下または筋肉内注射からの活性成分の吸収を遅延させることが望ましいことが多い。これは、不良な水溶解度を有する結晶性または非晶性物質の液体懸濁剤の使用によって達成されてもよい。活性成分の吸収速度は、ひいては結晶サイズおよび結晶性形態に依存し得る溶解速度に依存する。あるいは、非経口投与される薬物形態の遅延吸収は、薬物を油媒体に溶解または懸濁することによって達成される。注射可能デポー形態は、ポリラクチド-ポリグリコリドなどの生分解性ポリマーに薬物のマイクロ封入マトリックスを形成することにより製作される。薬物のポリマーに対する比および用いられる特定のポリマーの性質に応じて、薬物放出速度を制御することができる。他の生分解性ポリマーの例としては、ポリ(オルトエステル)およびポリ(無水物)が挙げられる。デポー注射可能製剤は、薬物を、体内組織と適合性であるリポソームまたはマイクロエマルジョンに捕捉することによって調製される。
デポー投与
本明細書に記載されるように、一部の実施形態において、本発明の医薬組成物、AAV粒子は、持続放出のためにデポーで製剤化される。一般に、特定の臓器または組織(「標的組織」)が投与の標的とされる。
本発明の一部の態様において、本発明の医薬組成物、AAV粒子は、標的組織内にまたは近傍に空間的に保持される。標的組織(1つ以上の標的細胞を含む)を、医薬組成物、AAV粒子と、それらが標的組織に実質的に保持される、つまり、組成物の少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、85、90、95、96、97、98、99、99.9、99.99%、または99.99%超が、標的組織に保持されるような条件下で接触させることによって、医薬組成物、AAV粒子を哺乳類対象の標的組織に提供するための方法が提供される。有利には、保持は、1つ以上の標的細胞に進入する医薬組成物、およびAAV粒子の量を測定することによって決定される。例えば、対象に投与された医薬組成物、AAV粒子の少なくとも1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、99.9%、99.99%または99.99%超が、投与後の期間に細胞内に存在する、例えば哺乳類対象への筋肉内注射は、本発明の医薬組成物、AAV粒子および1つ以上のトランスフェクション試薬を含む水性組成物を使用して実施してもよく、保持は、標的細胞に存在する医薬組成物、AAV粒子の量を測定することによって決定される。
本発明の特定の態様は、標的組織(1つ以上の標的細胞を含む)を、医薬組成物、AAV粒子と、それらがかかる標的組織に実質的に保持されるような条件下で接触させることによって、本発明の医薬組成物、AAV粒子を哺乳類対象の標的組織に提供するための方法を対象とする。医薬組成物、AAV粒子は、目的の効果が少なくとも1つの標的細胞で生じるのに十分な活性成分を含む。一部の実施形態において、医薬組成物、AAV粒子は、一般に、1つ以上の細胞透過剤を含むが、薬学的に許容される担体を有するまたは有しない「ネイキッド」製剤(細胞透過剤または他の薬剤を有しないなど)も企図される。
経肺投与
一部の実施形態において、本発明の医薬組成物、AAV粒子は、経肺投与に好適な製剤に調製、包装、および/または販売されてもよい。一部の実施形態において、かかる投与は、頬側口腔によってある。一部の実施形態において、製剤は、活性成分を含む乾燥粒子を含み得る。かかる実施形態において、乾燥粒子は、約0.5nmから約7nmまでまたは約1nmから約6nmまでの範囲の直径を有し得る。一部の実施形態において、製剤は、噴霧剤の流動を向けて、かかる粉末を分散させることができる乾燥粉末リザーバを含むデバイスを使用して投与するための乾燥粉末の形態であってもよい。一部の実施形態において、自己噴射溶媒/粉末分配容器を使用してもよい。かかる実施形態において、活性成分は、密閉容器中の低沸点噴射剤に溶解および/または懸濁してもよい。かかる粉末は、重量により粒子の少なくとも98%が0.5nm超の直径を有し、数により粒子の少なくとも95%が7nm未満の直径を有する粒子を含み得る。あるいは、重量により粒子の少なくとも95%が1nm超の直径を有し、数により粒子の少なくとも90%が6nm未満の直径を有する。乾燥粉末組成物は、糖などの固形微細粉末希釈剤を含んでもよく、便利には単位用量形態で提供される。
低沸点噴射剤としては、概して、大気圧下で18.3℃(65°F)未満の沸点を有する液体噴射剤が挙げられる。概して、噴射剤は、組成物の50%~99.9%(w/w)を構成してもよく、活性成分は、組成物の0.1%~20%(w/w)を構成してもよい。噴射剤は、液体非イオン性および/または固体陰イオン性界面活性剤および/または固体希釈剤などの追加成分(活性成分を含む粒子と同桁の粒子サイズを有してもよい)を更に含み得る。
経肺送達用に製剤化された医薬組成物は、溶液および/または懸濁物の液滴の形態の活性成分を提供し得る。かかる製剤は、活性成分を含む任意選択で無菌の水性および/または希アルコール性溶液および/または懸濁物として調製、包装、および/または販売されてもよく、便利には任意の噴霧化および/または微粒化デバイスを使用して投与してもよい。かかる製剤は、限定はされないが、サッカリンナトリウムなどの香味料、揮発油、緩衝剤、界面活性剤、および/またはメチルヒドロキシベンゾアートなどの保存剤を含めた1つ以上の追加成分を更に含み得る。この投与経路によって提供される液滴は、約0.1nmから約200nmまでの範囲の平均直径を有してもよい。
鼻腔内、経鼻、頬側投与
一部の実施形態において、本発明の医薬組成物、AAV粒子は、経鼻および/または鼻腔内投与してもよい。一部の実施形態において、経肺送達に有用な本明細書に記載される製剤は、鼻腔内送達にも有用であり得る。一部の実施形態において、鼻腔内投与用の製剤は、活性成分を含み、約0.2μmから500μmまでの平均粒子サイズを有する粗粉末を含む。かかる製剤は、鼻から吸い込む様式で、すなわち、鼻付近に保持された粉末の容器から鼻道を通して急速吸入することにより投与される。
経鼻投与に好適な製剤は、例えば、わずか約0.1%(w/w)から100%(w/w)もの活性成分を含んでもよく、本明細書に記載される追加成分の1つ以上を含んでもよい。医薬組成物は、頬側投与に好適な製剤に調製、包装、および/または販売されてもよい。かかる製剤は、例えば、従来方法を使用して製作される錠剤および/またはロゼンジの形態であってもよく、例えば、0.1%~20%(w/w)の活性成分を含み、残部は、経口溶解性および/または分解性組成物ならびに任意選択で本明細書に記載される追加成分の1つ以上を含み得る。あるいは、頬側投与に好適な製剤は、活性成分を含む粉末ならびに/またはアエロゾル化および/もしくは微粒化溶液および/もしくは懸濁物を含み得る。かかる粉末化、アエロゾル化、および/またはアエロゾル化製剤は、分散されると、約0.1nmから約200nmまでの範囲の平均粒子および/または液滴サイズを含んでもよく、本明細書に記載される任意の追加成分の1つ以上を更に含んでもよい。
眼または耳投与
一部の実施形態において、本発明の医薬組成物、AAV粒子は、眼および/または耳投与に好適な製剤に調製、包装、および/または販売されてもよい。かかる製剤は、例えば、水性および/または油性液体賦形剤中0.1/1.0%(w/w)の活性成分の溶液および/または懸濁物を含む、例えば点眼剤および/または点耳剤の形態であってもよい。かかる滴剤は、緩衝剤、塩、および/または本明細書に記載される任意の他の追加成分の1つ以上を更に含み得る。有用な他の眼科的に投与可能な製剤としては、微晶質形態のおよび/またはリポソーム調製物中の活性成分を含むものが挙げられる。網膜下インサートも、投与の形態として使用され得る。
送達、用量およびレジメン
本発明は、本発明に係るAAV粒子を、それを必要とする対象に投与する方法を提供する。本発明の医薬用、診断用、または予防用AAV粒子および組成物は、疾患、障害および/または状態を予防、治療、管理、または診断するために効果的な任意の投与量および任意の投与経路を使用して投与され得る。必要となる正確な量は、対象の種、年齢、および全身状態、疾患の重症度、詳細な組成物、その投与様式、その活性様式などに応じて対象毎に異なることになる。対象は、ヒト、哺乳類、または動物であってもよい。本発明に係る組成物は、典型的には、投与の簡便性および投薬量の均一性のため、単位剤形に製剤化される。しかしながら、本発明の組成物の1日の総使用量は主治医が妥当な医学的判断の範囲内で決定し得ることは理解されるであろう。任意の特定の個体のための具体的な治療有効用量レベル、予防有効用量レベル、または適切な診断用量レベルは、治療下の障害および障害の重症度;用いられる具体的なペイロードの活性;用いられる具体的な組成物;患者の年齢、体重、全般的な健康、性別および食事;用いられる具体的なAAV粒子の投与時間、投与経路、および排泄速度;治療継続期間;用いられる具体的なAAV粒子と併用してまたは同時に使用される薬物;および医学分野で周知の同様の要因を含めた種々の要因に依存することになる。
一実施形態において、本発明のAAV粒子の送達は、AAV粒子の送達の結果として、最小限の重篤有害事象(SAE)をもたらす。
一実施形態において、AAV粒子は、複数用量レジメンで送達されてもよい。複数用量レジメンは、2、3、4、5、6、7、8、9、10回または10回よりも多くの用量であってもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、多部位投与経路によって対象に送達されてもよい。対象には、2、3、4、5または5つよりも多い部位にAAV粒子が投与されてもよい。
特定の実施形態において、本発明に係るAAV粒子医薬組成物は、1日当たり対象体重の約0.0001mg/kgから約100mg/kgまで、約0.001mg/kgから約0.05mg/kgまで、約0.005mg/kgから約0.05mg/kgまで、約0.001mg/kgから約0.005mg/kgまで、約0.05mg/kgから約0.5mg/kgまで、約0.01mg/kgから約50mg/kgまで、約0.1mg/kgから約40mg/kgまで、約0.5mg/kgから約30mg/kgまで、約0.01mg/kgから約10mg/kgまで、約0.1mg/kgから約10mg/kg、または約1mg/kgから約25mg/kgまでを1日1回以上送達して、所望の治療効果、診断効果、または予防効果を得るのに十分な投薬量レベルで投与されてもよい。上記の投薬濃度は、vgに、または1kg当たりのウイルスゲノムに、または当業者によって投与される総ウイルスゲノムへと変換され得ることが理解されるだろう。
特定の実施形態において、本開示に係るAAV粒子医薬組成物は、約10~約600μl/部位、50~約500μl/部位、100~約400μl/部位、120~約300μl/部位、140~約200μl/部位、約160μl/部位で投与されてもよい。非限定的な例として、AAV粒子は、50μl/部位および/または150μl/部位で投与されてもよい。
一実施形態において、本発明に係る組成物の細胞への送達は、[VG/時間=mL/時間×VG/mL](式中、VGはウイルスゲノムであり、VG/mLは組成物濃度であり、およびmL/時間は持続送達速度である)によって定義される送達速度を含む。
一実施形態において、本発明に係るAAV粒子を含む組成物の細胞への送達は、対象当たり約1×106VG(ウイルスゲノム)~約1×1016VGの総濃度を含み得る。一部の実施形態において、送達は、約1×106、2×106、3×106、4×106、5×106、6×106、7×106、8×106、9×106、1×107、2×107、3×107、4×107、5×107、6×107、7×107、8×107、9×107、1×108、2×108、3×108、4×108、5×108、6×108、7×108、8×108、9×108、1×109、2×109、3×109、4×109、5×109、6×109、7×109、8×109、9×109、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、2.1×1011、2.2×1011、2.3×1011、2.4×1011、2.5×1011、2.6×1011、2.7×1011、2.8×1011、2.9×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、7.1×1011、7.2×1011、7.3×1011、7.4×1011、7.5×1011、7.6×1011、7.7×1011、7.8×1011、7.9×1011、8×1011、9×1011、1×1012、1.1×1012、1.2×1012、1.3×1012、1.4×1012、1.5×1012、1.6×1012、1.7×1012、1.8×1012、1.9×1012、2×1012、3×1012、4×1012、4.1×1012、4.2×1012、4.3×1012、4.4×1012、4.5×1012、4.6×1012、4.7×1012、4.8×1012、4.9×1012、5×1012、6×1012、6.1×1012、6.2×1012、6.3×1012、6.4×1012、6.5×1012、6.6×1012、6.7×1012、6.8×1012、6.9×1012、7×1012、8×1012、8.1×1012、8.2×1012、8.3×1012、8.4×1012、8.5×1012、8.6×1012、8.7×1012、8.8×1012、8.9×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、6.7×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VG/対象の組成物濃度を含み得る。
一実施形態において、本発明に係るAAV粒子を含む組成物の細胞への送達は、対象当たり約1×106VG/kg~約1×1016VG/kgの総濃度を含み得る。一部の実施形態において、送達は、約1×106、2×106、3×106、4×106、5×106、6×106、7×106、8×106、9×106、1×107、2×107、3×107、4×107、5×107、6×107、7×107、8×107、9×107、1×108、2×108、3×108、4×108、5×108、6×108、7×108、8×108、9×108、1×109、2×109、3×109、4×109、5×109、6×109、7×109、8×109、9×109、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、2.1×1011、2.2×1011、2.3×1011、2.4×1011、2.5×1011、2.6×1011、2.7×1011、2.8×1011、2.9×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、7.1×1011、7.2×1011、7.3×1011、7.4×1011、7.5×1011、7.6×1011、7.7×1011、7.8×1011、7.9×1011、8×1011、9×1011、1×1012、1.1×1012、1.2×1012、1.3×1012、1.4×1012、1.5×1012、1.6×1012、1.7×1012、1.8×1012、1.9×1012、2×1012、3×1012、4×1012、4.1×1012、4.2×1012、4.3×1012、4.4×1012、4.5×1012、4.6×1012、4.7×1012、4.8×1012、4.9×1012、5×1012、6×1012、6.1×1012、6.2×1012、6.3×1012、6.4×1012、6.5×1012、6.6×1012、6.7×1012、6.8×1012、6.9×1012、7×1012、8×1012、8.1×1012、8.2×1012、8.3×1012、8.4×1012、8.5×1012、8.6×1012、8.7×1012、8.8×1012、8.9×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、6.7×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VG/kgの組成物濃度を含み得る。一実施形態において、送達は、1×1013VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、2.1×1012VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、1×1013VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、6.7×1012VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、7×1012VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、2×1013VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、3×1011VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、3×1012VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、3×1013VG/kgの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、6.3×1012VG/kgの組成物濃度を含む。
一実施形態において、中枢神経系(例えば、実質)の細胞へのAAV粒子の送達は、約1×106VG~約1×1016VGの総用量を含み得る。一部の実施形態において、送達は、約1×106、2×106、3×106、4×106、5×106、6×106、7×106、8×106、9×106、1×107、2×107、3×107、4×107、5×107、6×107、7×107、8×107、9×107、1×108、2×108、3×108、4×108、5×108、6×108、7×108、8×108、9×108、1×109、2×109、3×109、4×109、5×109、6×109、7×109、8×109、9×109、1×1010、1.9×1010、2×1010、3×1010、3.73×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、2.5×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、6.1×1012、6.2×1012、6.3×1012、6.4×1012、6.5×1012、6.6×1012、6.7×1012、6.8×1012、6.9×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VGの総用量を含み得る。非限定的な例として、総用量は1×1013VGである。別の非限定的な例として、総用量は2.1×1012VGである。別の非限定的な例として、総用量は、6.3×1012VGである。
一実施形態において、1用量当たり約105~106ウイルスゲノム(単位)が投与されてもよい。
一実施形態において、本発明に係るAAV粒子を含む組成物の細胞への送達は、約1×106VG/mL~約1×1016VG/mLの総濃度を含み得る。一部の実施形態において、送達は、約1×106、2×106、3×106、4×106、5×106、6×106、7×106、8×106、9×106、1×107、2×107、3×107、4×107、5×107、6×107、7×107、8×107、9×107、1×108、2×108、3×108、4×108、5×108、6×108、7×108、8×108、9×108、1×109、2×109、3×109、4×109、5×109、6×109、7×109、8×109、9×109、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、1.1×1012、1.2×1012、1.3×1012、1.4×1012、1.5×1012、1.6×1012、1.7×1012、1.8×1012、1.9×1012、2×1012、2.1×1012、2.2×1012、2.3×1012、2.4×1012、2.5×1012、2.6×1012、2.7×1012、2.8×1012、2.9×1012、3×1012、3.1×1012、3.2×1012、3.3×1012、3.4×1012、3.5×1012、3.6×1012、3.7×1012、3.8×1012、3.9×1012、4×1012、4.1×1012、4.2×1012、4.3×1012、4.4×1012、4.5×1012、4.6×1012、4.7×1012、4.8×1012、4.9×1012、5×1012、6×1012、6.1×1012、6.2×1012、6.3×1012、6.4×1012、6.5×1012、6.6×1012、6.7×1012、6.8×1012、6.9×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、6.7×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VG/mLの組成物濃度を含み得る。
一実施形態において、中枢神経系(例えば、実質)の細胞へのAAV粒子の送達は、約1×106VG/mL~約1×1016VG/mLの組成物濃度を含み得る。一部の実施形態において、送達は、約1×106、2×106、3×106、4×106、5×106、6×106、7×106、8×106、9×106、1×107、2×107、3×107、4×107、5×107、6×107、7×107、8×107、9×107、1×108、2×108、3×108、4×108、5×108、6×108、7×108、8×108、9×108、1×109、2×109、3×109、4×109、5×109、6×109、7×109、8×109、9×109、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、6.1×1012、6.2×1012、6.3×1012、6.4×1012、6.5×1012、6.6×1012、6.7×1012、6.8×1012、6.9×1012、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VG/mLの組成物濃度を含み得る。一実施形態において、送達は、1×1013VG/mLの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、2.1×1012VG/mLの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、1×1013VG/mLの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、2×1013VG/mLの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、3×1011VG/mLの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、3×1012VG/mLの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、6.3×1012VG/mLの組成物濃度を含む。一実施形態において、送達は、3×1013VG/mLの組成物濃度を含む。
特定の実施形態において、所望の投薬量は、複数回の投与(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14回、またはそれ以上の投与)を用いて送達されてもよい。複数回の投与が利用される場合、本明細書に記載されるような分割用量投与レジメンが用いられてもよい。本明細書で使用されるとき、「分割用量」は、「単一単位用量」または総1日用量を2つ以上の用量に分割するもの、例えば「単一単位用量」の2回以上の投与である。本明細書で使用されるとき、「単一単位用量」は、1用量/1回/単一の経路/単一の接触点、すなわち単一の投与イベントで投与される任意の治療薬の用量である。
本発明のAAV粒子の所望の投薬量は、「パルス用量」または「連続流」として投与されてもよい。本明細書で使用されるとき、「パルス用量」は、ある期間にわたって設定頻度で投与される任意の療法剤の一連の単一単位用量である。本明細書で使用されるとき、「連続流」は、単一経路/単一接触点で、すなわち連続投与事象で、ある期間にわたって連続的に投与される療法剤の用量である。総1日用量、24時間の期間に与えられるかまたは処方される量は、これらの方法のいずれかによって、またはこれらの方法の組合せとして、または医薬品投与に好適な任意の他の方法によって投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子の対象への送達は、対象における標的遺伝子の活性の制御を提供する。制御活性は、対象における標的タンパク質産生の増加または対象における標的タンパク質産生の減少であってもよい。制御活性は、少なくとも1ヵ月間、2ヵ月間、3ヵ月間、4ヵ月間、5ヵ月間、6ヵ月間、7ヵ月間、8ヵ月間、9ヵ月間、10ヵ月間、11ヵ月間、1年間、13ヵ月間、14ヵ月間、15ヵ月間、16ヵ月間、17ヵ月間、18ヵ月間、19ヵ月間、20ヵ月間、20ヵ月間、21ヵ月間、22ヵ月間、23ヵ月間、2年間、3年間、4年間、5年間、6年間、7年間、8年間、9年間、10年間または10年間超にわたってもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、単一用量で1回限りの治療を使用して、対象に投与されてもよい。1回限りの治療の用量は、当該技術分野で公知のおよび/または本明細書に記載される任意の方法によって投与されてもよい。本明細書で使用されるとき、「1回限りの治療」は、1回のみ投与される組成物を指す。必要な場合、適切な有効性に到達することを保証するために、ブースター用量が対象に投与されてもよい。ブースターは、1回限りの治療の1ヵ月後、2ヵ月後、3ヵ月後、4ヵ月後、5ヵ月後、6ヵ月後、7ヵ月後、8ヵ月後、9ヵ月後、10ヵ月後、11ヵ月後、12ヵ月後、1年後、13ヵ月後、14ヵ月後、15ヵ月後、16ヵ月後、17ヵ月後、18ヵ月後、19ヵ月後、20ヵ月後、21ヵ月後、22ヵ月後、23ヵ月後、24ヵ月後、2年後、3年後、4年後、5年後、6年後、7年後、8年後、9年後、10年後または10年後よりも後に投与されてもよい。
送達方法
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、米国特許第8,999,948号明細書または国際公開第2014178863号パンフレット(この各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される疾患の治療方法を使用して、投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、米国特許出願公開第20150126590号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるような、アルツハイマー病または他の神経変性状態において遺伝子療法を送達するための方法を使用して投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、米国特許第6,436,708号明細書および同第8,946,152号明細書または国際公開第2015168666号パンフレット(この各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるようなCNS遺伝子療法を送達するための方法を使用して投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、欧州特許出願第2678433号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるAAV粒子を使用してタンパク質を送達するための方法を使用して投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、米国特許第6,211,163号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される血流へのDNAの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、米国特許第7,588,757号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される中枢神経系へのペイロードの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、米国特許第8,283,151号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるペイロードの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、国際公開第2001089583号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるグルタミン酸デカルボキシラーゼ(GAD)送達ベクターを用いたペイロードの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子または医薬組成物は、国際公開第2012057363号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される神経細胞へのペイロードの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
細胞への送達
本開示は、上述のAAV粒子のいずれかを細胞または組織もしくは臓器に送達する方法であって、前記AAV粒子と細胞または組織もしくは臓器を接触させることまたは前記AAV粒子を含む製剤と細胞または組織もしくは臓器を接触させること、またはAAV粒子を含む医薬組成物を含めた記載される組成物のいずれかと細胞または組織もしくは臓器を接触させることを含む方法を提供する。AAV粒子を細胞または組織もしくは臓器に送達する方法は、インビトロ、エキソビボ、またはインビボで達成することができる。
対象への送達
本開示は更に、上述のAAV粒子のいずれかを哺乳類対象を含めた対象に送達する方法であって、前記AAV粒子を対象に投与すること、または前記AAV粒子を含む製剤を対象に投与すること、または医薬組成物を含めた記載される組成物のいずれかを対象に投与することを含む方法を提供する。
一実施形態において、哺乳類対象はヒトである。一部の態様において、ヒト対象は、疾患、例えば神経学的疾患(neuological disease)または心血管疾患を有する患者である。
組合せ
AAV粒子は、1つ以上の他の治療用、予防用、研究用または診断用薬剤と併用して使用されてもよい。「~と併用して」とは、その薬剤が同じ時点で投与されなければならない、および/または一緒に送達されるように製剤化されなければならないことを含意するよう意図するものではなく、しかしながらこれらの送達方法は本発明の範囲内にある。組成物は、1つ以上の他の所望の治療薬または医療手技と同時に、その前に、またはその後に投与することができる。一般に、各薬剤は、当該の薬剤について決定された用量および/またはタイムスケジュールで投与されることになる。一部の実施形態において、本開示は、医薬用、予防用、研究用、または診断用組成物を、それらのバイオアベイラビリティを向上させ、それらの代謝を低減および/もしくは修飾し、それらの排泄を阻害し、ならびに/またはそれらの体内分布を修飾することができる薬剤と組み合わせて送達することを包含する。
発現の測定
ウイルスゲノムからのペイロードの発現は、限定ではないが、免疫化学(例えば、IHC)、インサイツハイブリダイゼーション(ISH)、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、親和性ELISA、ELISPOT、フローサイトメトリー、免疫細胞学、表面プラズモン共鳴分析、速度論的排除アッセイ、液体クロマトグラフィ-質量分析(LCMS)、高速液体クロマトグラフィ(HPLC)、BCAアッセイ、免疫電気泳動法、ウエスタンブロット、SDS-PAGE、タンパク質免疫沈殿、および/またはPCRなどの、当該技術分野で公知の種々の方法を使用して決定されてもよい。
バイオアベイラビリティ
AAV粒子は、本明細書に記載されるような送達剤を有する組成物中に製剤化されると、本明細書に記載されるような送達剤を欠如する組成物と比較して、バイオアベイラビリティの増加を示すことができる。本明細書で使用されるとき、用語「バイオアベイラビリティ」は、哺乳類に投与された所定量のAAV粒子または発現ペイロードの全身性利用能を指す。バイオアベイラビリティは、組成物の曲線下面積(AUC)または最大血清もしくは血漿濃度(Cmax)を測定することによって評価することができる。AUCは、化合物(例えば、AAV粒子または発現ペイロード)の血清または血漿濃度が、横座標(X軸)の時間に対して縦座標(Y軸)に沿ってプロットされる曲線下面積の決定である。一般に、特定の化合物のAUCは、当業者に公知の方法、およびG.S.バンカー(G.S.Banker)、「現代の医薬品、薬物および医薬品科学(Modern Pharmaceutics,Drugs and the Pharmaceutical Sciences)」、72巻、マルセル・デッカー・ニューヨーク・インク(Marcel Dekker,New York,Inc.)、1996年(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載のような方法を使用して算出することができる。
Cmax値は、AAV粒子を哺乳類に投与した後の哺乳類の血清または血漿にて達成されるAAV粒子または発現ペイロードの最大濃度である。Cmax値は、当業者に公知の方法を使用して測定することができる。語句「バイオアベイラビリティを増加させる」または「薬物動態を向上させる」は、本明細書で使用されるとき、哺乳類においてAUC、Cmax、またはCminとして測定される第1のAAV粒子または発現ペイロードの全身性利用能が、本明細書に記載されるような送達剤と共に同時投与される場合、かかる同時投与が行われない場合よりも大きいことを意味する。一部の実施形態において、バイオアベイラビリティは、少なくとも約2%、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または約100%増加し得る。
治療ウィンドウ
本明細書で使用されるとき、「治療ウィンドウ」は、治療効果を誘発する可能性が高い血漿濃度の範囲または作用部位における治療活性物質のレベルの範囲を指す。一部の実施形態において、本明細書に記載されるようなAAV粒子の治療ウィンドウは、少なくとも約2%、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または約100%増加し得る。
分布容積
本明細書で使用されるとき、用語「分布容積」は、合計量の薬物を血液中または血漿中と同じ濃度で体内に含有するために必要とされることになる流体容積を指す。Vdistは、体内における薬物の量/血液中または血漿中の薬物の濃度と等しい。例えば、10mgの用量および10mg/Lの血漿濃度の場合、分布容積は、1リットルになるだろう。分布容積は、薬物が、脈管外組織に存在する程度を反映する。大きな分布容積は、化合物が、血漿タンパク結合と比較して、組織成分と結合する傾向があることを反映する。臨床設定では、Vdistを使用して負荷用量を決定し、定常状態濃度を達成することができる。一部の実施形態において、本明細書に記載されるようなAAV粒子の分布容積は、少なくとも約2%、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%減少し得る。
生物学的効果
一実施形態において、動物に送達されたAAV粒子の生物学的効果は、動物中の発現ペイロードを分析することによって分類されてもよい。ペイロード発現は、本発明のAAV粒子が投与された哺乳類から収集される生物学的試料の分析から決定されてもよい。例えば、哺乳類に送達されるAAV粒子によってコードされるタンパク質の50~200pg/mlのタンパク質発現を、哺乳類におけるタンパク質の治療有効量とみなすことができる。
IV.本発明の組成物の方法および使用
遺伝子発現
本発明のAAV粒子、AAV粒子を含む組成物は、細胞、組織、臓器または対象における目的の遺伝子の発現を制御するために使用してもよい。
本発明によれば、細胞、組織、臓器または対象における標的タンパク質の発現を増加させる方法であって、細胞、組織、臓器または対象に、標的タンパク質をコードする核酸配列を含む機能性ペイロードを含むAAV粒子の有効量を投与する工程を含む方法が提供される。
したがって、標的タンパク質は、少なくとも約10%、好ましくは少なくとも約10%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。
一実施形態において、本発明のAAV粒子、組成物および製剤を使用して、ニューロン、アストロサイトおよび/またはオリゴデンドロサイトなどのCNSの細胞における標的タンパク質の発現を増加させることができる。一部の実施形態において、遺伝子は、限定はされないが、抗体、AADC、APOE2、およびフラタキシンを含めたタンパク質をコードしてもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子、組成物および製剤を使用して、細胞、組織、臓器または対象における目的の遺伝子の発現を減少、阻害および抑制することができる。したがって、AAV粒子は、目的の標的遺伝子に特異的なsiRNA二重鎖またはdsRNAを含む少なくとも1つの機能性ペイロードを含む。
一部の実施形態において、本発明は、細胞における標的遺伝子発現を阻害/サイレンシングする方法を提供する。したがって、siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、限定はされないが、アストロサイトまたはミクログリア、皮質ニューロン、海馬ニューロン、嗅内ニューロン、視床ニューロン、運動ニューロンまたは一次感覚ニューロンなどの細胞における標的遺伝子発現を実質的に阻害することができる。一部の態様において、標的遺伝子発現の阻害は、少なくとも約20%、例えば少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%の阻害を指す。したがって、標的遺伝子のタンパク質産物は、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%阻害され得る。
一部の実施形態において、阻害しようとする遺伝子としては、限定はされないが、SOD1、HTT、APOE、および/またはMAPTを挙げることができる。
神経学的疾患
種々の神経学的疾患を、本発明の医薬組成物、AAV粒子、特に血液脳関門通過AAV粒子で治療することができる。非限定的な例として、神経学的疾患は、透明中隔欠損、酸性リパーゼ病、酸性マルターゼ欠損症、後天性てんかん様失語症、急性散在性脳脊髄炎、注意欠陥多動性障害(ADHD)、アディー瞳孔、アディー症候群、副腎白質ジストロフィー、脳梁欠損症、失認症、アイカルディ症候群、アイカルディ-グティエール症候群障害、AIDS-神経学的合併症、アレキサンダー病、アルパーズ病、交代性片麻痺、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、無脳症、動脈瘤、アンジェルマン症候群、血管腫症、酸素欠乏症、抗リン脂質抗体症候群、失語症、失行症、くも膜嚢胞、くも膜炎、アーノルド-キアリ奇形、動静脈奇形、アスペルガー症候群、運動失調症、毛細血管拡張性運動失調症、運動失調および小脳または脊髄小脳変性症、心房細動および脳卒中、注意欠陥多動性障害、自閉症スペクトラム障害、自律神経機能異常、背部痛、バース症候群、バッテン病、ベッカー型ミオトニー(Becker’s Myotonia)、ベーチェット病、ベル麻痺、良性特発性眼瞼痙攣、良性局所性筋萎縮症、良性頭蓋内圧亢進、ベルンハルト-ロート症候群、ビンスワンゲル病、眼瞼痙攣、ブロッホ-サルズバーガー症候群、腕神経叢分娩損傷、腕神経叢損傷、ブラッドベリー-エグルストン症候群、脳脊髄腫瘍、脳動脈瘤、脳損傷、ブラウン-セカール症候群、球脊髄性筋萎縮症、皮質下梗塞および白質脳症を伴う常染色体優性脳動脈症(CADASIL)、カナバン病、手根管症候群、灼熱痛、海綿腫、海綿状血管腫、海綿状奇形、頚髄中心症候群、脊髄中心症候群、中枢痛症候群、橋中心髄鞘崩壊症、頭部障害、セラミダーゼ欠損症、小脳変性症、小脳低形成、脳動脈瘤、脳動脈硬化症、脳萎縮症、脳性脚気、脳海綿状奇形、脳性巨人症、脳低酸素症、脳性小児麻痺、脳-眼-顔-骨格症候群(COFS)、シャルコー-マリー-トゥース病、キアリ奇形、コレステロールエステル貯蔵病、舞踏病、有棘赤血球舞踏病(Choreoacanthocytosis)、慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー(CIDP)、慢性起立不耐症、慢性疼痛、コケイン症候群II型、コフィン-ローリー症候群、コルポセファリー、昏睡、複合性局所疼痛症候群、先天性両側顔面神経麻痺、先天性筋無力症、先天性ミオパシー、先天性血管海綿状奇形、大脳皮質基底核変性症、頭蓋動脈炎、頭蓋骨早期癒合症、クリー脳炎、クロイツフェルト-ヤコブ病、蓄積外傷性障害、クッシング症候群、巨細胞性封入体症、サイトメガロウイルス感染症、眼震足震症候群(Dancing Eyes-Dancing Feet Syndrome)、ダンディー-ウォーカー症候群、ドーソン疾患、ドモルシア症候群、ドゥジュリーヌ-クルンプケ麻痺、認知症、多発脳梗塞性認知症、意味性認知症、皮質下認知症、レビー小体型認知症、歯状小脳性運動失調症、歯状核赤核萎縮症、皮膚筋炎、発達性統合運動障害、デビック症候群、糖尿病性ニューロパシー、びまん性硬化症、ドラベ症候群、自律神経異常症、書字障害、難読症、嚥下困難、統合運動障害、ミオクローヌス性小脳性共同運動障害、進行性小脳性共同運動障害、ジストニア、早期乳児てんかん性脳症、エンプティセラ症候群、脳炎、嗜眠性脳炎、脳ヘルニア、脳症、脳症(家族性乳児型)、脳3叉神経領域血管腫、てんかん、てんかん性片麻痺、エルブ麻痺、エルブ-デュシェンヌおよびデジェリーヌ-クルンプケ麻痺、本態性振戦、橋外髄鞘崩壊症(Extrapontine Myelinolysis)、ファブリー病、ファール症候群、気絶、家族性自律神経失調症、家族性血管腫、家族性特発性基底核石灰化症、家族性周期性四肢麻痺、家族性痙性麻痺、ファーバー病、熱性痙攣、線維筋性形成異常、フィッシャー症候群、筋緊張低下児症候群、下垂足、フリードライヒ運動失調症、前頭側頭型認知症、ゴーシェ病、全身性ガングリオシドーシス、ゲルストマン症候群、ゲルストマン-ストロイスラー-シャインカー病、巨大軸索ニューロパシー、巨細胞性動脈炎、巨細胞性封入体病、グロボイド細胞性白質ジストロフィー、舌咽神経痛、糖原病、ギラン-バレー症候群、ハレルフォルデン-スパッツ病、頭部外傷、頭痛、持続性偏頭痛、片側顔面痙攣、交代性片麻痺(Hemiplegia Alterans)、遺伝性ニューロパシー、遺伝性痙性対麻痺、遺伝性多発神経炎性失調症、帯状疱疹、耳性帯状疱疹、平山症候群、ホルムズ-アーディー症候群、全前脳症、HTLV-1関連脊髄症、ヒューズ症候群、ハンチントン病、水頭性無脳症、水頭症、正常圧水頭症、水脊髄症、コルチゾン過剰症、過眠症、筋緊張亢進、筋緊張低下、低酸素症、免疫媒介性脳脊髄炎、封入体筋炎、色素失調症、乳児筋緊張低下、乳児神経軸索性ジストロフィー、乳児フィタン酸蓄積症、乳児レフサム病、点頭痙攣、炎症性ミオパシー、後頭孔脳脱出症、腸性脂肪異栄養症、頭蓋内嚢胞、頭蓋内圧亢進、アイザクス症候群、ジュベール症候群、カーンズ-セイヤ症候群、ケネディー病、キンズボーン症候群、クライネ-レビン症候群、クリッペル-フェイル症候群、クリッペル-トレノーネイ症候群(KTS)、クリューバー-ビューシー症候群、コルサコフ健忘症候群、クラッベ病、クーゲルバーグ-ヴェランダー病、クールー病、ランバート-イートン筋無力症候群、ランドウ-クレフナー症候群、外側大腿皮神経絞扼、外側髄症候群、学習障害、リー病、レノックス-ガストー症候群、レッシュ-ナイハン症候群、白質ジストロフィー、レバイン-クリッチュリー症候群、レビー小体認知症、脂質蓄積症、類脂質性タンパク症、脳回欠損、閉込め症候群、ルー-ゲーリッグ病、狼瘡-神経学的後遺症、ライム病-神経学的合併症、マシャド-ジョゼフ病、大脳症、巨脳症、メルカーソン-ローゼンタール症候群、脳膜炎、脳膜炎および脳炎、メンケス疾患、知覚異常性神経痛、異染性白質ジストロフィー、小頭症、偏頭痛、ミラー-フィッシャー症候群、軽度脳卒中、ミトコンドリアミオパシー、メビウス症候群、単肢筋萎縮症、運動ニューロン疾患、モヤモヤ病、ムコリピドーシス、ムコ多糖症、多発梗塞性認知症、多巣性運動ニューロパシー、多発性硬化症、先天性起立性低血圧症を伴う多系統萎縮症、筋ジストロフィー、先天性筋無力症、重症筋無力症、ミエリン破壊性びまん性硬化症(Myelinoclastic Diffuse Sclerosis)、乳児期ミオクロニー脳症、ミオクローヌス、ミオパシー、先天性ミオパシー、甲状腺中毒性ミオパシー、ミオトニー、先天性ミオトニー、ナルコレプシー、神経有棘赤血球症、脳鉄蓄積を伴う神経変性、神経線維腫症、神経弛緩薬悪性症候群、AIDSの神経学的合併症、ライム病の神経学的合併症、サイトメガロウイルス感染症の神経学的帰結、ポンペ病の神経学的所見、狼瘡の神経学的続発症、視神経脊髄炎、神経ミオトニー、神経セロイドリポフスチン症、神経細胞移動障害、遺伝性ニューロパシー、神経サルコイドーシス、神経梅毒、神経毒性、海綿状母斑、ニーマン-ピック病、オサリバン-マクラウド症候群、後頭神経痛、大田原症候群、オリーブ橋小脳萎縮症、眼球クローヌスミオクローヌス、起立性低血圧症、濫用症候群、慢性疼痛、パントテン酸キナーゼ関連神経変性、傍腫瘍性症候群、感覚異常、パーキンソン病、発作性舞踏病アテトーゼ、発作性偏頭痛、パリー-ロンベルグ、ペリツェウス-メルツバッハー病、ペナーショッカーII症候群、神経周囲嚢胞、周期性麻痺、末梢神ニューロパシー、脳室周囲白質軟化症、持続的植物状態、広汎性発達障害、フィタン酸蓄積症、ピック病、神経圧迫(Pinched Nerve)、梨状筋症候群、下垂体部腫瘍、多発性筋炎、ポンペ病、孔脳症、ポリオ後症候群、帯状疱疹後神経痛、感染後脳脊髄炎、体位性低血圧症、体位性起立性頻脈症候群、体位性頻脈症候群、原発性歯状核萎縮症(Primary Dentatum Atrophy)、原発性側索硬化症、原発性進行性失語症、プリオン病、進行性顔面片側萎縮症、進行性歩行運動失調症、進行性多巣性白質脳症、進行性硬化性ポリオジストロフィー、進行性核上麻痺、顔貌失認、偽Torch症候群(Pseudo-Torch syndrome)、偽トキソプラズマ症候群(Pseudotoxoplasmosis syndrome)、偽脳腫瘍、心因性運動、ラムゼイハント症候群I、ラムゼイハント症候群II、ラスムッセン脳炎、反射性交感神経性ジストロフィー症候群、レフサム病、乳児レフサム病、反復運動障害、運動反復運動過多損傷、下肢静止不能症候群、レトロウイルス関連脊髄症、レット症候群、ライエ症候群、リューマチ脳炎、ライリー-デイ症候群、仙骨神経根嚢胞、舞踏病、唾液腺疾患、サンドホフ病、シルダー病、脳裂症、ザイテルベルガー病、発作性障害、意味性認知症、中隔視神経形成異常症、乳児重症ミオクローヌスてんかん(SMEI)、揺さぶられっ子症候群、帯状ヘルペス、シャイ-ドレーガー症候群、シェーグレン症候群、睡眠時無呼吸、睡眠病、ソトス症候群、痙性、二分脊椎、脊髄梗塞、脊髄損傷、脊髄腫瘍、脊髄性筋萎縮症、脊髄小脳萎縮、脊髄小脳変性症、スティール-リチャードソン-オルスゼフスキー症候群、全身硬直症候群、線条体黒質変性症、脳卒中、スタージ-ウェーバー症候群、亜急性硬化性汎脳炎、皮質下動脈硬化性脳症、短時間持続性片側神経痛様(SUNCT、Short-lasting, Unilateral, Neuralgiform)頭痛、嚥下障害、シデナム舞踏病、失神、梅毒性脊髄硬化症、脊髄水空洞症、脊髄空洞症、全身性エリテマトーデス、脊髄ろう、遅発性ジスキネジア、ターロブ嚢胞、テイ-サックス病、側頭動脈炎、脊髄係留症候群、トムセンミオトニー、胸郭出口症候群、甲状腺中毒性ミオパシー、有痛性チェック、トッド麻痺、トゥーレット症候群、一過性脳虚血発作、伝達性海綿状脳症、横断性脊髄炎、外傷性脳損傷、振戦、三叉神経痛、熱帯性痙性不全対麻痺、トロイアー症候群、結節硬化症、血管勃起腫瘍(Vascular Erectile Tumor)、中枢および末梢神経系の血管炎症候群、フォン-エコーノモ病、フォンヒッペル-リンダウ疾患(VHL)、フォンレックリングハウゼン病、ワレンベルグ症候群、ウェルトニッヒ-ホフマン病、ウェルニッケ-コルサコフ症候群、ウエスト症候群、むち打ち症、ウィップル病、ウィリアムズ症候群、ウィルソン病、ウォールマン病、X連鎖球脊髄性筋萎縮症。
加えて、本開示は、ヒト対象を含めた哺乳類対象の神経学的障害を治療または改善する方法であって、対象に、本発明のAAV粒子または医薬組成物のいずれかの薬学的有効量を投与する工程を含む方法を提供する。一実施形態において、AAV粒子は、血液脳関門通過粒子である。一部の実施形態において、本明細書に記載される方法によって治療される神経学的障害としては、限定はされないが、タウオパシー、アルツハイマー病(AD)、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、ハンチントン病(HD)、パーキンソン病(PD)、および/またはフリードライヒ運動失調症(FA)が挙げられる。一部の実施形態において、対象の神経学的障害の少なくとも1つの症状(sympotom)が、改善および/または治療される。
本開示は、ヒト対象を含めたそれを必要とする対象に、本発明のAAV粒子の治療有効量を投与して、疾患進行を遅延、停止または好転させる方法を提供する。非限定的な例として、疾患進行は、当業者に公知の試験または診断ツールによって測定され得る。別の非限定的な例として、疾患進行は、対象の脳、CSFまたは他の組織の病理学的特徴の変化によって測定され得る。
タウオパシー
タウオパシーは、微小管結合タンパク質タウの機能障害および/または凝集によって特徴付けられる一群の神経変性疾患である。タウは、通常、そのリン酸化の程度に基づき微小管に付随することが知られている非常に可溶性のタンパク質である。タウは、それらの固有構造を考慮すると、特に神経細胞における細胞内輸送過程に重要な成分であると考えられる。タウの高リン酸化は、微小管との結合および微小管アッセンブリ活性を低下させる。更に、タウの高リン酸化は、タウをミスフォールディングおよび凝集し易くする。タウオパシーでは、タウは、対らせん状細線維(PHF)、ツイストリボンまたは直線状線維のNFTとして、高リン酸化、ミスフォールディングおよび凝集する。これらのNFTは、神経細胞死が差し迫っていることを示し、広範な神経細胞喪失に寄与し、様々な行動欠損および認識欠損につながると考えられる。
最初の遺伝学的に画定されたタウオパシーは、タウ遺伝子の突然変異が、17番染色体に関係する前頭側頭型認知症(frontemporal dementia)およびパーキンソニズム(FTDP-17)として知られている常染色体優勢遺伝性タウオパシーにつながることが示された際に記載された。これは、タウにおける変化が脳の神経変性変化につながり得るという最初の因果関係を示す証拠であった。これらの分子は、よりアミロイド形成的であると考えられ、それは、高リン酸化される可能性がより高く、NFTへと凝集する可能性がより高いことを意味する(ハットン,M.(Hutton,M.)ら著、1998年、ネイチャー(Nature) 第393巻(第6686号):p.702~5)。
他の公知のタウオパシーとしては、限定はされないが、アルツハイマー病(AD)、前頭側頭型認知症(FTD)、前頭側頭葉変性症(FTLD)、慢性外傷性脳症(CTE)、進行性核上麻痺(PSP)、ダウン症候群、ピック病、大脳皮質基底核変性症(CBD)、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、プリオン病、クロイツフェルト-ヤコブ病(CJD)、多系統萎縮症、タングル-オンリー認知症(Tangle-only dementia)、および進行性皮質下グリオーシスが挙げられる。
タウオパシーは、主にタウタンパク質機能不全および凝集と関連し、ADと酷似しているが、ApoEは、この群の疾患の発病にも役割を果たすと考えられる。ApoEは、コレステロール輸送分子であり、NFTがApoEに対しても免疫反応性であったことが発見された際、タウオパシーに役割を有することが最初に疑われた。タウオパシーにおけるタウとApoEとの間の相関性の調査は、矛盾する結果を示したが、ApoE4とNFT負荷増加とが関係することを示唆している。しかしながら、認知低下との相関性は示されていない。この分野の研究は、依然として活発に追求されている。
タウオパシーの治療法はまだ同定されていないが、幾つかの症状軽減を提供することができる。本発明のAAV粒子の送達は、タウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。一部の場合において、本発明の方法は、タウオパシーを発症した疑いのある対象を治療するために使用してもよい。本発明のAAV粒子の送達は、NFTの蓄積減少をもたらすことができる。更に、これらのNFT負荷の減少は、認知、言語または行動活動領域の改善を伴うことも伴わないこともある。
一実施形態において、ApoE2、ApoE3またはApoE4ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、タウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、ApoE2、ApoE3またはApoE4遺伝子および/またはタンパク質発現をサイレンシングするための調節性ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、タウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、タウ遺伝子および/またはタンパク質発現をサイレンシングするための調節性ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、タウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドは、siRNA二重鎖またはsiRNA二重鎖もしくはコード化dsRNAをコードする核酸である。
一実施形態において、抗タウ抗体をコードする核酸を含む本発明のAAV粒子の送達は、タウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、本明細書に記載される組成物は、タウオパシーの1つ以上の公知のまたは試験的な治療と併用して使用される。かかる治療の非限定的な例としては、メチレンブルー、フェノチアジン、アントラキノン、n-フェニルアミンもしくはローダミンなどの、タウ凝集の阻害剤;NAP、タキソールもしくはパクリタキセルなどの微小管安定化剤;GSK3β(リチウム)もしくはPP2Aを標的とするものなどのキナーゼもしくはホスファターゼ阻害剤;および/またはタウホスホエピトープによる免疫化もしくは抗タウ抗体による治療が挙げられる。
アルツハイマー病
アルツハイマー病(AD)は消耗性神経変性疾患であり、今日では高齢者における認知症の主要原因であり、現在、合衆国では推定で500万人および全世界では3500万人超が罹患している。ADは、大部分が極端な失念疾患であり、正常な生活を送る能力が極めて損なわれる。この疾患の臨床所見としては、記憶、実行機能(意思決定)および言語の進行性低下が挙げられる。ADを有する個体は、悪液質、肺炎または敗血症などの二次的疾病のため死亡することが多い。
ADは、おそらくは最も周知のタウオパシーであるが、アミロイドに基づく障害であると特徴付けられることが多い。AD脳は、2つの形態の病理学的凝集体:β-アミロイド(Aβ)で構成される細胞外プラークおよび高リン酸化微小管結合タンパク質タウで構成される細胞内神経原線維タングル(NFT)の存在によって特徴付けられる。初期の遺伝子知見に基づくと、β-アミロイド変更により疾患が開始され、タウの変化は下流にあると考えられた。そのため、ほとんどの臨床治験は、Aβを中心にして行われている。
この疾患の伝統的な徴候(Aβおよびタウ)に加えて、アポリポタンパク質Eは、遅発性ADの発病における重要な危険因子であることが証明されている(Aβプロセシングまたは産生の変更と遺伝的に関係しない形態のADが、AD集団の99%を占める)。ApoEは、他のアポリポタンパク質と同様に、特定のリポタンパク質粒子の構造に寄与し、特定の細胞表面受容体へのリポタンパク質の輸送を指図し、重要なコレステロールトランスポーターである。ApoEは、様々な細胞タイプで発現され、肝臓および脳において発現レベルが最も高いことは明らかである。脳において、ApoEは、主にアストロサイトおよびミクログリアで発現され、シナプス結合およびシナプス形成の維持に寄与すると考えられる。ApoEは、血液脳関門、自然免疫系、シナプス機能およびAβの蓄積におけるその役割を介してAD発症に寄与すると考えられる。
ApoEの3つの最も一般的な変異体は、AApoE2、ApoE3およびApoE4であり、ApoE2およびApoE4は、ADの発症に関連するリスクが異なる。ApoE2は、防御的な対立遺伝子であると考えられ、ADのリスクを減少させ、発病年齢を遅らせるが、ApoE4は、反対の効果を有し、AD発症のリスクを著しく増加させ、疾患の発病年齢を低減する。更に、ApoE2は、Aβ蓄積の負担減少に関連するが、ApoE4は、Aβ負荷の増加に関連する。
早期発症型のAD(65歳前、AD症例の<5%を占める)は、アミロイドベータ前駆体タンパク質(APP)、プレセニリン1(PS1またはPSEN1)またはプレセニリン2(PS2またはPSEN2)の家族性突然変異によって引き起こされ得る。一般的な症状としては、記憶、実行機能、言語および認知の他の分野の進行性低下が挙げられる。これらの症状は、脳におけるアミロイドプラークおよび/もしくは神経原線維タングル、ニューロン喪失、シナプス喪失、脳萎縮、ならびに/または炎症によって引き起こされることが多い。
ADには対症治療が長年にわたって利用可能であるが、この疾患の経過を変更することができるものは1つもない。本発明のAAV粒子の送達は、ADおよび他のタウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。一部の場合において、本発明の方法は、ADまたは他のタウオパシーを発症した疑いのある対象を治療するために使用してもよい。本発明のAAV粒子の送達は、対象の脳および心血管系の両方におけるAβ負荷の減少、またはNFT蓄積の減少をもたらすことができる。更に、これらのAβまたはNFT負荷の減少は、認知、言語または行動活動領域の改善を伴うことも伴わないこともある。
一実施形態において、ApoE2、ApoE3またはApoE4ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、ADおよび他のタウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、ApoE2、ApoE3またはApoE4遺伝子および/またはタンパク質をサイレンシングするための調節性ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、ADおよび他のタウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、タウ遺伝子および/またはタンパク質をサイレンシングするための調節性ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、ADおよび他のタウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドは、siRNA二重鎖またはsiRNA二重鎖もしくはコード化dsRNAをコードする核酸である。
一実施形態において、抗タウ抗体をコードする核酸を含む本発明のAAV粒子の送達は、ADおよび他のタウオパシーに罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、本明細書に記載される組成物は、ADまたはタウオパシーの1つ以上の公知のまたは試験的な治療と併用して使用される。かかる治療の非限定的な例としては、コリンエステラーゼ阻害剤(ドネペジル、リバスチグミン、ガランタミン);メマンチンなどのNMDA受容体アンタゴニスト;抗精神病剤;抗うつ剤;抗痙攣剤;セクレターゼ阻害剤;アミロイド凝集阻害剤;銅もしくは亜鉛調節剤;BACE阻害剤;メチレンブルー、フェノチアジン、アントラキノン、n-フェニルアミンもしくはローダミンなどのタウ凝集の阻害剤;NAP、タキソールもしくはパクリタキセルなどの微小管安定化剤;GSK3β(リチウム)もしくはPP2Aを標的とするものなどの、キナーゼもしくはホスファターゼ阻害剤;および/またはAβペプチドもしくはタウホスホエピトープによる免疫化、または抗タウもしくは抗アミロイド抗体による治療が挙げられる。
一実施形態において、本明細書に記載される組成物は、限定はされないが、タウオパシーおよび/またはアルツハイマー病のマウスモデルなどの哺乳類モデルを使用して評価される。タウオパシーおよび/またはアルツハイマー病の表現型を模倣する多数のマウスモデルが利用可能である。しかしながら、既存のマウスモデルは、ヒトタウオパシーおよび/またはアルツハイマー病の全ての特徴を示すとは限らない。したがって、一部の場合において、2つ以上のマウスモデル、またはこれらのモデルの1つ以上を交雑させたマウスモデルを使用して、本発明の組成物の活性を評価してもよい。タウオパシーおよび/またはアルツハイマー病の例示的なマウスモデルとしては、限定はされないが、3XTg-AD、5XFAD、J20、Tg-SwDI、Tg-SwDI/Nos2、Tg2576、R1.40、APPPS1、APP23、PDAPP、APP NL-G-F、TgCRND8、TASD-41、BRI-Aβ42A、PSAPP(Tg2576xPS1)、APPswe/PSEN1dE9、2xKI、TAPP(Tg2576xJNPL3)、hTau、PS1M146V、rTg4510、rTg4510xCamk2a-tTA、PS19、rTg4510xNop-tTA、GFAP-apoE4、Apoetm3(APOE*4)、APP.PS1/TRE4、およびApoEノックアウトまたはノックインマウス系統が挙げられる。(オノス(Onos)ら著、ブレイン・リサーチ・ブルテン(Brain Res Bull.)2016年;第122巻:p.1~11;ホール(Hall)およびロバーソン.(Roberson.)著、ブレイン・リサーチ・ブルテン(Brain Res Bull.)2012年;第88巻(第1号):p.3~12;エルダー(Elder)ら著、マウント・サイナイ・ジャーナル・オブ・メディシン(Mt Sinai J Med.)2010年;第77巻(第1号):p.69~81を参照のこと。これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
タウトランスジェニックマウスモデルは、野生型または突然変異体ヒトタウタンパク質を過剰発現する。異なるタウ突然変異を含有する21個以上の系統が生成されている(デンク(Denk)およびウェード-マーティン(Wade-Martins)著、ニューロバイオロジー・オブ・エージング(Neurobiol Aging.)2009年;第30巻(第1号):p.1~13の表2を参照のこと。この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。これらは、G272V、P301L、P301S、N297K、V337M、およびR406Wを含めた、タウオパシーおよび/またはアルツハイマー病を有する患者に存在する突然変異である。P301Sトランスジェニックマウスは、P301S突然変異を含有するヒトタウタンパク質を発現する。アレン(Allen)らによって作り出された1つのP301Sモデル(Thy1.2プロモータの制御下にある4R/0Nタウ)は、高リン酸化タウの線維蓄積、神経変性、および神経炎症を含めた、ヒトタウオパシーと同様の特徴を示す。加えて、これらのマウスは、5~6月齢までに顕著な運動表現型を発症する(アレン(Allen)ら著、ジャーナル・オブ・ニューロサイエンス(J Neurosci.)2002年;第22巻(第21号):p.9340~51;ベルッチ(Bellucci)ら著、アメリカン・ジャーナル・オブ・パソロジー(Am J Pathol.)2004年;第165巻(第5号):p.1643~52、この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。ヨシヤマ(Yoshiyama)らによって作り出された別のP301Sマウス系統(マウスプリオンプロモータの制御下にある4R/1Nタウ)は、3~6月齢までに海馬シナプス喪失、シナプス機能障害および同時にミクログリア活性化を表示する。また、動物は、9~12月齢までに、病理学的高リン酸化タウ蓄積、ニューロン喪失、ならびに海馬および嗅内皮質萎縮を示した(ヨシヤマ(Yoshiyama)ら著、ニューロン(Neuron).2007年;第53巻(第3号):p.337~51、この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
APOEノックインマウスは、APOEのヒトアイソフォームを発現する。一部の場合において、ヒトAPOE遺伝子を操作して導入し、内因性マウスAPOE対立遺伝子を置換(標的置換)した。ApoE2、ApoE3またはApoE4のこれらの標的配置(TR)モデルは、ノブヤ マエダ(Nobuya Maeda)の実験室で開発され(サリバン(Sullivan)ら著、ジャーナル・オブ・クリニカル・インベスティゲーション(J Clin Invest.)1998年;第102巻(第1号):p.130~5;サリバン(Sullivan)ら著、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー(J Biol Chem.)1997年;第272巻(第29号):p.17972~80;ノーフ(Knouff)ら著、ジャーナル・オブ・クリニカル・インベスティゲーション(J Clin Invest.)1999年;第103巻(第11号):p.1579~86、これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)、多くの研究において特徴付けられた。ApoE TRマウスは、空間記憶能力および回避挙動が異なる。ApoE4-TRマウスは、ApoE3-TRマウスと比較して、認識障害およびシナプス可塑性障害を示す。加えて、ApoE4-TRマウスは、海馬および扁桃において解剖学的および機能的異常を示す(グルーテンドルスト(Grootendorst)著、ビヘイバラス・ブレイン・リサーチ(Behav Brain Res.)2005年;第159巻(第1号):p.1~14;ボーア(Bour)ら著、ビヘイバラス・ブレイン・リサーチ(Behav Brain Res.)2008年;第193巻(第2号):p.174~82、これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
一実施形態において、AAV-ApoE2粒子は、チャオ(Zhao)ら著、2016年、ニューロバイオロジー・オブ・エージング(Neurobiol Aging.)p.159~172(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりのPDAPPまたはAPP.PS1/TRE4のマウスに投与してもよい。AAV-ApoE2(AAV9-CAG-APOE2またはAAVrh.10-CAG-APOE2)の大脳内または視床内投与は、免疫組織化学法、ELISAまたはウエスタンブロットで決定したところ、脳Aβ(オリゴマー、可溶性および不溶性)、アミロイド沈着およびアミロイド病理の有意な減少を示した。より詳しくは、AAV調製物(2μL、1.0×1010vg)を、定位脳手術によって成体マウスの海馬または視床のいずれかに0.2μL/分の速度で両側注射し、8週間にわたって発現を可能にしてから、死後分析のために組織を収集した。より低用量のAAV-ApoE2、または病理の後期での送達は、それほど有効でないことが証明された。
前頭側頭型認知症(FTD)
前頭側頭型認知症(FTD)は、前頭側頭部変性またはピック病としても知られており、脳における進行性神経細胞喪失によって引き起こされる一群の障害を指す。この神経細胞喪失は、脳の前頭葉および/または側頭葉の機能喪失(loss of unction)を引き起こす場合がある。合衆国では約45,000人がFTDを有しており、大多数は45~65歳である。
FTDには、行動変異性前頭側頭型認知症(bvFTD、behavrior variant frontotemporal dementia)、原発性進行性失語症(PPA)および運動機能障害(distrubances of motor function)の3つのサブタイプが存在する。bvFTDを有する対象は、人格、対人関係および行動に大きな変化を有する傾向があり、神経喪失は、行動、共感、予測、および判断を制御する分野において最も顕著である。PPAは、言語スキル、発語、筆記、および理解に影響を及ぼす。bvFTDおよびPPAは両方とも、65歳を超える人々ではADほど一般的ではないが、bvFTDおよびPPAは、45~65歳の人々ではADとほぼ同じくらい一般的である。
タウの突然変異は、FTDを有する対象と遺伝的に関連する。
筋萎縮性側索硬化症(ALS)
筋萎縮性側索硬化症(ALS)は、ルーゲーリッグ病または古典的運動ニューロン病としても知られており、急速に進行する致死性の神経学的疾患である。ALSは、上位および下位運動ニューロンの細胞変性および死滅と関連し、筋肉運動の無能化、随意筋運動の衰弱、消耗および制御不能につながる。初期症状としては、手、脚および嚥下筋の筋肉衰弱が挙げられ、最終的には隔膜不全による呼吸不能へと進行する。米国疾病管理予防センター(CDC)によると、ALSは、米国において推定で12,000~15,000人に影響を及ぼしている。約5~10%の症例は家族性である。
他の非感染性神経変性疾患としてのALSは、限定はされないが、タウ、アミロイド-ベータ(Aベータ)、アルファ-シヌクレイン、HTT(ハンチンチン)またはSOD1(スーパーオキシドジスムターゼ1タンパク質)を含めたミスフォールディングタンパク質、ならびにミエリン関連阻害剤およびそれらの受容体の存在によって特徴付けられる(例えば、クリシュナマーシー(Krishnamurthy)およびシグルズソン(Sigurdsson)著、2011年、ニュー・バイオテクノロジー(N Biotechnol)、第28巻(第5号):p.511~7、およびムサロ(Musaro)著、2013年、FEBSジャーナル(FEBS J.);第280巻(第17号):p.4315~22、およびそれら内の参考文献を参照のこと)。家族性ALSは、TAR DNA結合タンパク質43(TDP-43)およびRNA結合タンパク質FUS/TLSの突然変異に関連している。限定はされないが、成長因子、例えばインスリン様成長因子1(IGF-1)、グリア細胞株由来成長因子、脳由来成長因子、血管内皮成長因子および毛様体神経栄養因子、または筋肉成長を促進する成長因子、例えばミオスタチンなどの、ALSの進行を遅延させる幾つかのタンパク質が同定されている。
今日の時点で、ALSの予防法も治癒法も存在しない。FDA認可薬物リルゾールが、平均余命を延長するために認可されているが、症状には効果を示さない。加えて、ALSに関連する疼痛および発作に耐えるための薬物および医療デバイスが利用可能である。根本的な病態生理に影響を及ぼす療法に対する必要性が依然として存在する。
一部の実施形態において、本発明の方法は、ALSを罹患している対象を治療するために使用してもよい。一部の場合において、本発明の方法は、ALSを発症した疑いのある対象を治療するために使用してもよい。
本発明に記載されるAAV粒子およびAAV粒子を使用する方法は、ALSを予防、管理および/または治療するために使用してもよい。非限定的な例として、ALSの治療、予防または管理に使用することができる本発明のAAV粒子は、SOD1、HTTおよび/またはタウを標的とする調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
ハンチントン病
ハンチントン病(HD)は、脳の運動制御領域ならびに他の区域においてニューロンの変性を引き起こす希な遺伝性障害である。この疾患の典型的な症状としては、挙動、判断および認知の変化が伴う、無制御運動(舞踏病)、姿勢異常、協調運動障害、不明瞭発語ならびに摂食および嚥下困難が挙げられる。HDは、ハンチンチン(HTT)タンパク質と関連する遺伝子の突然変異によって引き起こされる。突然変異は、DNAの(CAG)ブロックの異常反復を引き起こす。HDは、米国ではおよそ30,000人に影響を及ぼしている。
HDは、ポリグルタミン鎖の異常延長、例えばCAG反復によってコードされるグルタミン残基の長さの延長を有するハンチンチン(HTT)タンパク質の突然変異によって特徴付けられる。この疾患が生じる延長閾値は、およそ35~40残基であると考えられる。HDは、HTTのN末端領域によって形成される線条体ニューロンにおけるベータシートリッチ凝集体とも関連する。延長および凝集体は、HDが進行すると共にニューロンの漸進的喪失につながる。加えて、HDにおける細胞死は、アポトーシスを誘導することが知られている細胞死受容体6(DR6)と関連する。
今日の時点で、この疾患を治癒するかまたは進行を防止する療法は存在しない。利用可能な薬物療法は、症状の管理を目的とする。例えば、FDAは、舞踏病を予防するために処方されるテトラベネジン(tetrabenezine)を認可している。加えて、例えば抗精神病薬は、妄想、幻覚および暴力的感情発露の制御を支援することができる。根本的な病態生理に影響を及ぼす療法に対する必要性が依然として存在する。
一部の実施形態において、本発明の方法は、HDを罹患している対象を治療するために使用してもよい。一部の場合において、本発明の方法は、HDを発症した疑いのある対象を治療するために使用してもよい。
本発明に記載されるAAV粒子およびAAV粒子を使用する方法は、HDを予防、管理および/または治療するために使用してもよい。非限定的な例として、HDを治療、予防および/または管理するために使用される本発明のAAV粒子は、HTTを標的とする調節性ポリヌクレオチドであって、siRNA二重鎖またはsiRNA二重鎖もしくはコード化dsRNAをコードする核酸である調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
パーキンソン病
パーキンソン病(PD)は、特に脳の黒質に影響を及ぼす神経系の進行性障害である。PDは、ドーパミン産生脳細胞の喪失の結果として発症する。PDの典型的な初期症状としては、四肢、例えば手、腕、脚、足および顔面の振戦または震えが挙げられる。追加の特徴的症状は、四肢および胴体の硬直、運動遅延または運動不能、協調運動障害、認知変化、ならびに精神状態、例えばうつおよび幻覚である。PDは、家族性および特発性形態を両方とも有し、遺伝的および環境的原因に関係することが示唆される。PDは、世界中で400万人超の人々に影響を及ぼしている。米国では、年間およそ60,000症例が同定されている。概して、PDは、50歳以上で始まる。状態の初期発症形態は、50歳未満の年齢で始まり、若年性発症PDは、20歳前に始まる。
PDに関連するドーパミン産生脳細胞の死滅は、アルファ-シヌクレインタンパク質の凝集、沈着および機能障害に関連している(例えば、マルケス(Marques)およびオウテイロ(Outeiro)著、2012年、セル・デス・アンド・ディジーズ(Cell Death Dis.)、第3巻:p.e350、ジェンナー(Jenner)著、1989年、ジャーナル・オブ・ニューロロジー・ニューロサージェリー・アンド・サイキアトリー(J Neurol Neurosurg Psychiatry)、特別増補版、p.22~28、およびそれら内の参考文献を参照のこと)。研究は、アルファ-シヌクレインが、ドーパミン放出および輸送のシナプス前シグナル伝達、膜輸送および制御に役割を有することを示唆している。例えばオリゴマーの形態のアルファ-シヌクレイン凝集体は、神経機能障害および死滅の原因種であることが示唆されている。アルファ-シヌクレイン遺伝子(SNCA)の突然変異が、家族性形態のPDにおいて同定されているが、環境要因、例えば神経毒も、アルファ-シヌクレイン凝集に影響を及ぼす。PDにおける脳細胞死の他の示唆されている原因は、プロテオソーム(proteosomal)系およびリソソーム系の機能障害、トコンドリア活性の低減である。
PDは、「シヌクレイン症」と呼ばれる、アルファ-シヌクレイン凝集と関連する他の疾患に関連する。かかる疾患としては、限定はされないが、パーキンソン病認知症(PDD)、多系統萎縮症(MSA)、レビー小体型認知症、若年発症型全般神経軸索ジストロフィー(juvenile-onset generalized neuroaxonal dystrophy)(ハラーホルデン-スパッツ病)、純粋自律神経不全症(PAF)、脳鉄蓄積を伴う神経変性1型(NBIA-1、neurodegeneration with brain iron accumulation type-1)ならびにアルツハイマー病およびパーキンソン病の組合せが挙げられる。
今日の時点で、PDに対する治癒療法または予防療法は同定されていない。利用可能な様々な薬物療法が、症状軽減を提供する。対症医学治療の非限定的な例としては、硬直および運動遅延を軽減するカルビドパおよびレボドーパの併用、ならびに振戦および硬直を軽減する抗コリン作用薬が挙げられる。他の任意選択の療法としては、例えば、深部脳刺激および手術が挙げられる。根本的な病態生理に影響を及ぼす療法に対する必要性が依然として存在する。
一部の実施形態において、本発明の方法は、PDおよび他のシヌクレイン症を罹患している対象を治療するために使用してもよい。一部の場合において、本発明の方法は、PDおよび他のシヌクレイン症を発症した疑いのある対象を治療するために使用してもよい。
フリードライヒ運動失調症
フリードライヒ運動失調症(FA)は、神経系に進行性損傷を引き起こす常染色体性劣性遺伝性疾患である。パーキンソン(Parkinson)ら著、ジャーナル・オブ・ニューロケミストリー(Journal of Neurochemistry)、2013年、第126巻(増補版1)、p.103~117(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)を参照のこと。発症は、通常、思春期に生じ、25歳までに必ず生じる。カンプサーノ(Campuzano)ら著、サイエンス(Science)、第271巻、第5254号(1996年3月8日):p.1423(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)を参照のこと。FAは、腕および脚の筋肉運動を指図するために(小脳との接続を通じて)不可欠である感覚ニューロンにおけるミトコンドリアタンパク質フラタキシン(FXN)の発現低減による、脊髄の神経組織の変性に起因する。ケッペン(Koeppen)、アルヌルフ(Arnulf)著;ジャーナル・オブ・ニューロロジカル・サイエンス(J Neurol Sci.)、2011年4月15日;第303巻(第1-2号):p.1~12(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)を参照のこと。初期症状としては、歩行困難などの協調運動不全、平衡障害、脚衰弱、歩行能力低下、協調運動障害、構音障害、眼振、感覚障害、脊柱後側弯症、および足変形が挙げられる。パーキンソン(Parkinson)ら著、ジャーナル・オブ・ニューロケミストリー(Journal of Neurochemistry)、2013年、第126巻(増補版1)、p.103~117を参照のこと。この疾患は、概して、移動に車椅子が必要になるまで進行する。白人集団におけるFAの発症率は、約20,000人に1人~約50,000人に1人であり、欧州集団における推測保因者頻度は、約120人に1人である。ナゲシュワラン(Nageshwaran)およびフェステンシュタイン(Festenstein)著、フロンティア・イン・ニューロロジー(Frontiers in Neurology)、第6巻、Art.262(2015年);カンプサーノ(Campuzano)ら著、サイエンス(Science)、第271巻、第5254号(1996年3月8日):p.1423(これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)を参照のこと。
FXN遺伝子におけるイントロンGAAトリプレット反復の延長は、FAをもたらすフラタキシンの発現低減の遺伝的原因である。パーキンソン(Parkinson)ら著、ジャーナル・オブ・ニューロケミストリー(Journal of Neurochemistry)、2013年、第126巻(増補版1)、p.103~117を参照のこと。この欠損は、時間の経過と共に、前述の症状ならびに細胞代謝に対する影響による頻繁な疲労を引き起こす。
現在、FAに有効な治療は存在せず、患者は、ほとんどの場合、症状管理のためにモニターされるに過ぎない。したがって、当該技術分野には、FXN関連障害を治療するための医薬組成物および方法を開発し、FAを被っている患者のタンパク質欠損を改善するための長年にわたる切実な必要性が依然として存在する。
本発明のAAV粒子の送達は、フリードライヒ運動失調症に罹患している対象を治療するために使用してもよい。一部の場合において、本発明の方法は、フリードライヒ運動失調症を発症した疑いのある対象を治療するために使用してもよい。本発明のAAV粒子の送達は、フラタキシンタンパク質の増加をもたらし得る。更に、フラタキシンタンパク質のこうした増加は、移動の改善を伴うことも伴わないこともある。
一実施形態において、フラタキシンポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、フリードライヒ運動失調症に罹患している対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、フラタキシンポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子は、小脳の歯状核、脳幹核および/または脊髄のクラーク柱に送達してもよい。これらの領域の1つ以上への送達は、対象のフリードライヒ運動失調症を治療および/またはその影響を軽減し得る。
一実施形態において、フラタキシンポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子は、対象のフリードライヒ運動失調症を治療するために、中枢神経系、末梢神経系、および/または末梢臓器へと静脈内投与によって送達してもよい。
心血管疾患
心臓疾患または心臓および血管疾患とも呼ばれる心血管疾患は、心臓および/または血管の多くの疾患または障害を記述する一般用語である。心血管疾患の疾患または障害の多くは、プラークが動脈の壁に集積するアテローム性動脈硬化症に関連する。この集積により、動脈が狭くなり、血液の流れが難しくなる。心血管疾患の非限定的な例としては、心不全(心臓が、しかるべく血液を押し出さなくなる場合)、不整脈(心臓のリズム異常、例えば、徐脈(1分当たり60拍未満の心拍数)または頻脈(1分当たり100拍超の心拍数))、心臓弁の問題(例えば、狭窄(弁が十分に開かず、血液がしかるべく流れることができないこと)、逆流(弁が適切に閉じないこと)、および逸脱(弁小葉が隆起または逸脱して上方心房へと戻ること))、脳卒中(例えば、脳に給送する血管が閉塞する場合の虚血性脳卒中)、および心臓発作(心臓への血流が阻止される場合)が挙げられる。
本発明のAAV粒子は、心血管疾患を罹患している対象を治療するために使用してもよい。
心不全
心不全は、合衆国における死亡の主要原因であり、1年当たり患者がおよそ580万人であり、300,000人が死亡する。心不全は、限定はされないが、食事、喫煙、高血圧または遺伝を含めた種々の要因によって引き起こされる心臓疾患の共通のエンドポイントである。心不全は、心筋収縮性障害につながるカルシウム処理の調節異常によって引き起こされる場合がある。心不全の現行治療としては、限定はされないが、対症療法(例えば、利尿剤、β-アドレナリン遮断剤、および/またはアンギオテンシン転換酵素(ACE)阻害剤)、およびデバイスまたは手術療法(例えば、左室補助デバイス(LVAD)、弁置換術、および/または血管形成術)が挙げられる。こうした現行療法は、心臓収縮性を直接的には治さず、この疾患の短期解決策を提供するに過ぎない。心不全を治療する長期療法選択肢は、AAV送達を使用する遺伝子療法である。
心臓AAV遺伝子療法手法の大多数は、心筋収縮性をレスキューするために、β-アドレナリン作動系(βARKct、アデニリルシクラーゼ6)またはカルシウム処理タンパク質(SERCA2a、PP1、S100A1)に着目している。例えば、フロート(Hulot)ら、2016年およびゾウエイン(Zouein)&ブーズ(Booz)、2013年(これらの内容は全体として参照により援用される)を参照のこと。しかしながら、本明細書に記載されるAAVカプシドの全身送達または標的送達による心筋細胞の形質導入の増加は、心不全治療の最良の機会を提供する。
ニューヨーク心臓協会(NYHA)は、心不全を有する対象を分類するための機能別分類方式を作成した。NYHAは、対象が身体活動中にどの程度の制限を受けるかに基づき、4つのクラスの患者症状評価および4つのクラスの客観的評価を提供する。クラスI患者症状評価は、対象が身体活動の制限を有しないことを意味し、通常の身体活動は、対象に過度の疲労、動悸、または息切れを引き起こさない。クラスII患者症状評価は、対象が身体活動にわずかな制限を有することを意味し、安静時は快適であるが、通常の身体活動は、疲労、動悸、および息切れをもたらす。クラスIII患者症状評価は、対象が身体活動の制限を有することを意味し、対象は、安静時は快適であるが、通常活動以外の活動は、疲労、動悸または息切れを引き起こす。クラスIV患者症状評価は、対象が不快を感じずには、いかなる身体活動も続けることができないことを意味する。客観的評価は、対象が心血管疾患の客観的証拠を示さず、症状もなく、通常の身体活動の限界もないことを意味する。クラスB客観的評価は、最小限の心血管疾患の客観的証拠があり、軽度の症状および通常活動にわずかな制限があるが、対象は安静時には快適であることを意味する。クラスC客観的評価は、中等度に重度の心血管疾患の客観的証拠があり、対象は、安静時のみ快適であり、通常未満の活動中でさえ症状による顕著な活動制限を有することを意味する。クラスD客観的評価は、重度の心血管疾患の客観的証拠があり、対象は、安静時でさえ症状を示し、重度の活動限界を有することを意味する。
一実施形態において、本発明のAAV粒子の送達は、心不全を有する対象を治療するために使用してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子の送達は、心筋損傷後に生じる。一実施形態において、本発明のAAV粒子の送達は、対象が心室機能低下を示した後で生じる。一実施形態において、本発明のAAV粒子の送達は、ジゴキシンを対象に投与した後で生じる。一実施形態において、本発明のAAV粒子の送達は、ジゴキシンを対象に投与すると同時に生じる。一実施形態において、本発明のAAV粒子の送達は、対象が心室機能低下を示した後だが、患者が心拍出量低減を有する前に生じる。一実施形態において、本発明のAAV粒子の送達は、ベータ遮断剤を対象に投与する前に生じる。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、ジゴキシン、ベータ遮断剤、ACE1、aRB、スピロノラクトン、利尿剤、および/または血管拡張剤と併用して投与される。
一実施形態において、ATP2A2(SERCA2aとも呼ばれる)ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子が、心不全を有する対象を治療するために投与される。理論によって束縛されることを望むものではないが、ATPアーゼ筋小胞体Ca2+輸送2(筋小胞体Ca2+ ATPアーゼ(SERCA2a)とも呼ばれる)は、心筋細胞のカルシウム循環の成分である。筋小胞体(SR)におけるカルシウム輸送(Ca2+)に関与するタンパク質の機能低下は、心不全後に見られる収縮/弛緩欠損を引き起こす場合がある。ATP2A2の発現および活性の低下は、心不全後のヒト組織で観察されている(アライ(Arai)ら著、サーキュレーション・リサーチ(Circulation Research)第72巻(第2号)2013年2月を参照のこと。この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。カルシウムサイクルおよび収縮性は、対象におけるATP2A2過剰発現によって回復させることができる。
一実施形態において、ATP2A2ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、対象におけるATP2A2発現を増加させる。発現は、目的の細胞、組織および/または臓器において増加させることができる。非限定的な例として、ATP2A2の発現は、心臓で増加する。非限定的な例として、ATP2A2の発現は、心筋細胞で増加する。
一実施形態において、S100A1ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子が、心不全を有する対象を治療するために投与される。理論によって束縛されることを望むものではないが、S100カルシウム結合タンパク質A1は、ATP2A2、RyR、ミトコンドリアATP産生および/またはタイチン媒介性収縮の活性を増強する。筋小胞体(SR)におけるカルシウム輸送(Ca2+)に関与するタンパク質であるATP2A2の活性増加は、心不全後に見られる収縮/弛緩欠損を治すことができる。
一実施形態において、S100A1ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、対象におけるS100A1発現を増加させる。発現は、目的の細胞、組織および/または臓器において増加させることができる。非限定的な例として、S100A1の発現は、心臓において増加する。非限定的な例として、S100A1の発現は、心筋細胞において増加する。
一実施形態において、S100A1ポリヌクレオチドを含む本発明のAAV粒子の送達は、対象におけるATP2A2の発現を増加させる。発現は、目的の細胞、組織および/または臓器において増加させることができる。非限定的な例として、ATP2A2の発現は、心臓において増加する。非限定的な例として、ATP2A2の発現は、心筋細胞において増加する。
神経学的疾患を治療する方法
タンパク質ペイロードをコードするAAV粒子
本発明では、本発明のAAV粒子を細胞に導入する方法であって、ベクターのいずれかを、標的mRNAおよびタンパク質の産生の増加が生じるのに十分な量で前記細胞へと導入する工程を含む方法が提供される。一部の態様において、細胞は、筋細胞、肝細胞、限定はされないが、運動ニューロン、海馬ニューロン、嗅内ニューロン、視床ニューロンまたは皮質ニューロンなどのニューロン、およびアストロサイトまたはミクログリアなどのグリア細胞であってもよい。
本発明には、治療を必要とする対象における標的タンパク質(例えば、ApoE、FXN)の不十分な機能/存在に関連する神経学的疾患を治療する方法が開示される。この方法は、任意選択で、本発明のAAV粒子を含む組成物の治療有効量を対象に投与する工程を含む。非限定的な例として、AAV粒子は、標的遺伝子発現を増加させ、標的タンパク質産生を増加させ、したがって対象の神経学的疾患の1つ以上の症状を軽減することができ、対象は治療的に処置される。
一部の実施形態において、タンパク質ペイロードをコードする核酸を含む本発明のAAV粒子は、静脈内投与後に血液脳関門を越える伝達を可能にするAAVカプシドを含む。一例において、AAVカプシドはVOY101であり、別の例において、AAVカプシドはVOY201である。
一実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、全身性投与により対象の中枢神経系に投与される。一実施形態において、全身性投与は静脈内注射である。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、対象の中枢神経系に投与される。他の実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、対象の組織(例えば、対象の脳)に投与される。
一実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、実質内注射により対象の中枢神経系に投与される。実質内注射の非限定的な例としては、視床内、線条体内、海馬内または嗅内皮質標的化が挙げられる。
一実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、実質内注射および髄腔内注射により対象の中枢神経系に投与される。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、限定はされないが、海馬ニューロン、皮質ニューロン、運動ニューロンもしくは嗅内ニューロン;オリゴデンドロサイト、アストロサイトおよびミクログリアを含めたグリア細胞;ならびに/またはT細胞などのニューロンの周囲にある他の細胞を含めた特定のタイプの標的細胞に送達してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、線条体および/または皮質のニューロンに送達してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、神経学的疾患の療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、タウオパシーの療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、アルツハイマー病の療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、筋萎縮性側索硬化症の療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、ハンチントン病の療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、パーキンソン病の療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、フリードライヒ運動失調症の療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子を使用して、神経学的疾患を治療するためにアストロサイトにおける標的タンパク質発現を増加させてもよい。アストロサイトにおける標的タンパク質は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、AAV粒子は、ミクログリアにおける標的タンパク質を増加させるために使用してもよい。ミクログリアにおける標的タンパク質の増加は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、AAV粒子は、皮質ニューロンにおける標的タンパク質を増加させるために使用してもよい。皮質ニューロンにおける標的タンパク質の増加は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、AAV粒子は、海馬ニューロンにおける標的タンパク質を増加させるために使用してもよい。海馬ニューロンにおける標的タンパク質の増加は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、AAV粒子は、DRGおよび/または交感神経ニューロンにおける標的タンパク質を増加させるために使用してもよい。DRGおよび/または交感神経ニューロンにおける標的タンパク質の増加は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子を使用して、神経学的疾患を治療するために、感覚ニューロンにおける標的タンパク質を増加させてもよい。感覚ニューロンにおける標的タンパク質は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、標的タンパク質を増加させ、対象の神経学的疾患の症状を軽減するために使用してもよい。標的タンパク質の増加および/または神経学的疾患の症状の軽減は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%変更(標的タンパク質の産生が増加、および神経学的疾患の症状が軽減)され得る。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、限定はされないが、全機能的能力(TFC:total functional capacity)尺度などの標準的な評価方式によって測定される機能的能力および日常生活活動の低下を軽減するために使用してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、神経学的疾患の症状を測定するために使用される任意の評価における能力を改善するために使用してもよい。かかる評価としては、限定はされないが、ADAS-cog(アルツハイマー病評価尺度-認知)、MMSE(ミニメンタルステート検査)、GDS(老年期うつ尺度)、FAQ(機能活性質問票)、ADL(日常生活の活動)、GPCOG(一般開業医認知評価)、Mini-Cog、AMTS(簡易メンタル試験尺度)、時計描画試験、6-CIT(6項目認知障害試験)、TYM(自記式認知機能検査(Test Your Memory))、MoCa(モントリオール認知評価)、ACE-R(アデンブルックズ認知評価)、MIS(記憶障害スクリーニング)、BADLS(ブリストル日常生活活動尺度)、バーセル指数、機能的自立度評価法、手段的日常生活動作能力、IQCODE(高齢者における認知機能低下のインフォーマントアンケート(Informant Questionnaire on Cognitive Decline in the Elderly))、神経精神症状評価票、コーエン-マンスフィールドアジテーション評価票(Cohen-Mansfield Agitation Inventory)、BEHAVE-AD、EuroQol、ショートフォーム-36(Short Form-36)および/またはMBR介護者緊張度指数(MBR Caregiver Strain Instrument)、またはシーハンB(Sheehan B)(セラピュティック・アドバンス・イン・ニューロロジカル・ディスオーダー(Ther Adv Neurol Disord.)、第5巻(第6号):p.349~358(2012年)(この内容は本明細書において全体として参照により援用される))に記載される他の試験のいずれかが挙げられる。
一部の実施形態において、本組成物は、神経学的疾患を治療するための単独治療薬または併用治療薬として投与される。
標的タンパク質をコードするAAV粒子は、1つ以上の他の治療剤と併用して使用してもよい。「~と併用して」とは、その薬剤が同じ時点で投与されなければならないこと、および/または一緒に送達されるように製剤化されなければならないことを含意するよう意図するものではなく、しかしながらこれらの送達方法は本開示の範囲内にある。組成物は、1つ以上の他の所望の治療薬または医療手技と同時に、その前に、またはその後に投与することができる。一般に、各薬剤は、その薬剤について決定された用量および/またはタイムスケジュールで投与されることになる。
本発明のAAV粒子と併用して使用することができる治療剤は、酸化防止剤、抗炎症剤、抗アポトーシス剤、カルシウム調節剤、抗グルタミン酸剤(antiglutamatergic agent)、構造タンパク質阻害剤、筋肉機能に関与する化合物、および金属イオン調節に関与する化合物である小分子化合物であってもよい。非限定的な例として、併用療法は、運動ニューロン変性に対するそれらの神経保護効果に関して試験されている、小分子化合物、成長因子およびホルモンなどの1つ以上の神経保護剤との併用であってもよい。
本明細書に記載されるAAV粒子と併用して使用することができる、神経学的疾患を治療するために試験されている化合物としては、限定はされないが、コリンエステラーゼ阻害剤(ドネペジル、リバスチグミン、ガランタミン)、メマンチンなどのNMDA受容体アンタゴニスト、抗精神病剤、抗うつ剤、抗痙攣剤(例えば、ミオクローヌスに対するバルプロ酸ナトリウムおよびレベチラセタム)、セクレターゼ阻害剤、アミロイド凝集阻害剤、銅または亜鉛調節剤、BACE阻害剤、メチレンブルー、フェノチアジン、アントラキノン、n-フェニルアミンまたはローダミンなどのタウ凝集阻害剤、NAP、タキソールまたはパクリタキセルなどの微小管安定化剤、GSK3β(リチウム)またはPP2Aを標的とするものなどの、キナーゼまたはホスファターゼ阻害剤、Aβペプチドまたはタウホスホエピトープによる免疫化、抗タウまたは抗アミロイド抗体、ドーパミン枯渇剤(例えば、舞踏病に対するテトラベナジン)、ベンゾジアゼピン(例えば、ミオクローヌス、舞踏病、ジストニア、こわばり、および/または痙縮に対するクロナゼパム)、ドーパミンのアミノ酸前駆体(例えば、こわばりに対するレボドーパ)、骨格筋弛緩剤(例えば、こわばりおよび/または痙縮に対するバクロフェン、チザニジン)、筋肉麻痺を引き起こす神経筋接合部でのアセチコリン(acetycholine)放出の阻害剤(例えば、歯ぎしりおよび/またはジストニアに対するボツリヌス毒素)、非典型神経遮断剤(例えば、精神病および/または被刺激性に対するオランザピンおよびクエチアピン、精神病、舞踏病および/または被刺激性に対するリスペリドン、スルピリドおよびハロペリドール、治療抵抗性精神病に対するクロザピン、顕著な陰性症状を有する精神病に対するアリピプラゾール)、選択的セロトニン再取り込み阻害剤(SSRI)(例えば、うつ、不安、妄想強迫行動および/または被刺激性に対するシタロプラム、フルオキセチン、パロキセチン、セルトラリン、ミルタザピン、ベンラファキシン)、催眠剤(例えば、睡眠-覚醒サイクルの変更に対するキソピクロン(xopiclone)および/またはゾルピデム)、抗痙攣剤(例えば、躁病または軽躁病に対するバルプロ酸ナトリウムおよびカルバマゼピン)および気分安定剤(例えば、躁病または軽躁病に対するリチウム)が挙げられる。
神経栄養因子を、本発明のAAV粒子との併用療法で神経学的疾患を治療するために使用してもよい。一般に、神経栄養因子は、ニューロンの生存、成長、分化、増殖および/または成熟を促進するか、またはニューロンの活性増加を刺激する物質であると定義される。一部の実施形態において、本方法は、治療を必要とする対象への1つ以上の栄養因子の送達を更に含む。栄養因子としては、限定はされないが、IGF-I、GDNF、BDNF、CTNF、VEGF、コリベリン、キサリプロデン、甲状腺刺激ホルモン放出ホルモンおよびADNF、ならびにこれらの変異体を挙げることができる。
一態様において、本明細書に記載されるAAV粒子は、AAV-IGF-I(例えば、ヴィンセント(Vincent)ら著、ニューロモレキュラー・メディシン(Neuromolecular medicine)、2004年、第6巻、p.79~85を参照のこと;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)およびAAV-GDNF(例えば、ワン(Wang)ら著、ジャーナル・オブ・ニューロサイエンス(J Neurosci.)、2002年、第22巻、p.6920~6928を参照のこと;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)などの、神経栄養因子を発現するAAV粒子と共投与してもよい。
一部の実施形態において、神経学的疾患を治療するための本発明の組成物は、必要とする対象に、静脈内、筋肉内、皮下、腹腔内、実質内、軟膜下、髄腔内および/または脳室内投与され、AAV粒子が、血液脳関門および血液脊髄関門の一方または両方を通過することを可能にする。一部の態様において、この方法は、本発明のAAVベクター粒子を含む組成物の治療有効量を(例えば、輸液ポンプおよび/または送達足場(delivery scaffold)を使用して)対象の中枢神経系(CNS)に直接投与(例えば、実質内投与、脳室内投与および/または髄腔内投与)する工程を含む。ベクターを使用して、標的遺伝子発現を増加させることができ、および/または対象の神経学的疾患の1つ以上の症状を軽減することができ、対象は治療的に処置される。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質レベルを増加させ得る。標的タンパク質レベルは、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを少なくとも40%増加させ得る。非限定的な例として、対象は、標的タンパク質の10%の増加を有し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを、ベースラインから倍増させ得る。一実施形態において、AAV粒子は、5~6倍のより高いレベルの標的タンパク質につながる。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質の発現を増加させ得る。標的タンパク質の発現は、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも40%増加させ得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への静脈内投与は、対象における標的タンパク質のCNS発現を増加させ得る。標的タンパク質の発現は、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、CNSにおける標的タンパク質の発現を少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、CNSにおける標的タンパク質の発現を少なくとも40%増加させ得る。
一実施形態において、AAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質の発現を増加させることになり、標的タンパク質の発現増加は、対象の神経学的疾患の影響および/または症状を軽減させることになる。
調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子
本発明には、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を細胞へと導入する方法であって、ベクターのいずれかを、標的mRNAの分解が生じるのに十分な量で前記細胞へと導入し、それにより細胞において標的特異的RNAiを活性化させる工程を含む方法が提供される。一部の態様において、細胞は、筋細胞、幹細胞、限定はされないが、運動ニューロン、海馬ニューロン、嗅内ニューロン、視床ニューロンまたは皮質ニューロンなどのニューロン、およびアストロサイトまたはミクログリアなどのグリア細胞であってもよい。
本発明には、治療を必要とする対象における標的タンパク質の機能障害に関連する神経学的疾患を治療する方法が開示される。この方法は、任意選択で、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を含む組成物の治療有効量を対象に投与する工程を含む。非限定的な例として、siRNA分子は、標的遺伝子発現をサイレンシングし、標的タンパク質産生を阻害し、対象の神経学的疾患の1つ以上の症状を軽減することができ、対象は治療的に処置される。
一部の実施形態において、siRNA分子をコードする核酸配列を含む本発明のAAV粒子を含む組成物は、静脈内投与後に血液脳関門を越える伝達を可能にするAAVカプシドを含む。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を含む組成物は、対象の中枢神経系に投与される。他の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を含む組成物は、対象の組織(例えば、対象の脳)に投与される。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を含む組成物は、全身性投与により対象の中枢神経系に投与される。一実施形態において、全身性投与は静脈内注射である。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を含む組成物は、実質内投与により対象の中枢神経系に投与される。実質内注射の非限定的な例としては、視床内、線条体内、海馬内または嗅内皮質標的化が挙げられる。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を含む組成物は、実質内注射および髄腔内注射により対象の中枢神経系に投与される。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、限定はされないが、海馬ニューロン、皮質ニューロン、運動ニューロンまたは嗅内ニューロン;オリゴデンドロサイト、アストロサイトおよびミクログリアを含めたグリア細胞;ならびに/またはT細胞などのニューロンの周囲にある他の細胞を含めた特定のタイプの標的細胞へと送達してもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、線条体および/または皮質におけるニューロンに送達してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、神経学的疾患に対する療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、タウオパシーに対する療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、アルツハイマー病に対する療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、筋萎縮性側索硬化症に対する療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、ハンチントン病に対する療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、パーキンソン病に対する療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、フリードライヒ運動失調症に対する療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を使用して、神経学的疾患を治療するためにアストロサイトにおける標的タンパク質を抑制してもよい。アストロサイトにおける標的タンパク質は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%抑制され得る。アストロサイトにおける標的タンパク質は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%低減され得る。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、ミクログリアにおける標的タンパク質を抑制するために使用してもよい。ミクログリアにおける標的タンパク質の抑制は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%抑制され得る。低減は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%であってもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、皮質ニューロンにおける標的タンパク質を抑制するために使用してもよい。皮質ニューロンにおける標的タンパク質の抑制は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%抑制され得る。低減は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%であってもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、海馬ニューロンにおける標的タンパク質を抑制するために使用してもよい。海馬ニューロンにおける標的タンパク質の抑制は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%抑制され得る。低減は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%であってもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、DRGおよび/または交感神経ニューロンにおける標的タンパク質を抑制するために使用してもよい。DGRおよび/または交感神経ニューロンにおける標的タンパク質の抑制は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%抑制され得る。低減は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%であってもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を使用して、神経学的疾患を治療するために感覚ニューロンにおける標的タンパク質を抑制することができる。感覚ニューロンにおける標的タンパク質は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%抑制され得る。感覚ニューロンにおける標的タンパク質は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%または90~95%低減され得る。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、標的タンパク質を抑制するために、および対象の神経学的疾患の症状を軽減するために使用してもよい。標的タンパク質の抑制および/または神経学的疾患の症状の軽減は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%軽減または抑制され得る。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を使用して、限定はされないが全機能的能力(TFC)尺度など、標準的な評価方式によって測定される機能的能力および日常生活活動の低下を軽減してもよい。
一部の実施形態において、本組成物は、神経学的疾患を治療するための単独治療薬または併用治療薬として投与される。
目的の遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖をコードするAAV粒子は、1つ以上の他の治療剤と併用して使用してもよい。「~と併用して」とは、その薬剤が同じ時点で投与されなければならないこと、および/または一緒に送達されるように製剤化されなければならないことを含意するよう意図するものではなく、しかしながらこれらの送達方法は本開示の範囲内にある。組成物は、1つ以上の他の所望の治療薬または医療手技と同時に、その前に、またはその後に投与することができる。一般に、各薬剤は、その薬剤について決定された用量および/またはタイムスケジュールで投与されることになる。
本発明のsiRNA分子の核酸配列をコードするAAV粒子と併用して使用することができる治療剤は、酸化防止剤、抗炎症剤、抗アポトーシス剤、カルシウム調節剤、抗グルタミン酸剤、構造タンパク質阻害剤、筋機能に関与する化合物、および金属イオン調節に関与する化合物である小分子化合物であってもよい。
本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子と併用して使用することができる、神経学的疾患を治療するために試験された化合物としては、限定はされないが、コリンエステラーゼ阻害剤(ドネペジル、リバスチグミン、ガランタミン)、メマンチンなどのNMDA受容体アンタゴニスト、抗精神病剤、抗うつ剤、抗痙攣剤(例えば、ミオクローヌスに対するバルプロ酸ナトリウムおよびレベチラセタム)、セクレターゼ阻害剤、アミロイド凝集阻害剤、銅または亜鉛調節剤、BACE阻害剤、メチレンブルー、フェノチアジン、アントラキノン、n-フェニルアミンまたはローダミンなどのタウ凝集阻害剤、NAP、タキソールまたはパクリタキセルなどの微小管安定化剤、GSK3β(リチウム)またはPP2Aを標的とするものなどの、キナーゼまたはホスファターゼ阻害剤、Aβペプチドまたはタウホスホエピトープによる免疫化、抗タウまたは抗アミロイド抗体、ドーパミン枯渇剤(例えば、舞踏病に対するテトラベナジン)、ベンゾジアゼピン(例えば、ミオクローヌス、舞踏病、ジストニア、こわばり、および/または痙縮に対するクロナゼパム)、ドーパミンのアミノ酸前駆体(例えば、こわばりに対するレボドーパ)、骨格筋弛緩剤(例えば、こわばりおよび/または痙縮に対するバクロフェン、チザニジン)、筋肉麻痺を引き起こす神経筋接合部でのアセチコリン放出の阻害剤(例えば、歯ぎしりおよび/またはジストニアに対するボツリヌス毒素)、非典型神経遮断剤(例えば、精神病および/または被刺激性に対するオランザピンおよびクエチアピン、精神病、舞踏病および/または被刺激性に対するリスペリドン、スルピリドおよびハロペリドール、治療抵抗性精神病に対するクロザピン、顕著な陰性症状を有する精神病に対するアリピプラゾール)、選択的セロトニン再取り込み阻害剤(SSRI)(例えば、うつ、不安、妄想強迫行動および/または被刺激性に対するシタロプラム、フルオキセチン、パロキセチン、セルトラリン、ミルタザピン、ベンラファキシン)、催眠剤(例えば、睡眠-覚醒サイクルの変更に対するキソピクロン(xopiclone)および/またはゾルピデム)、抗痙攣剤(例えば、躁病または軽躁病に対するバルプロ酸ナトリウムおよびカルバマゼピン)および気分安定剤(例えば、躁病または軽躁病に対するリチウム)が挙げられる。
神経栄養因子を、神経学的疾患を治療するための本発明のsiRNA分子の核酸配列をコードするAAV粒子との併用療法で使用してもよい。一般に、神経栄養因子は、ニューロンの生存、成長、分化、増殖および/もしくは成熟を促進するか、またはニューロンの活性増加を刺激する物質であると定義される。一部の実施形態において、本方法は、治療を必要とする対象への1つ以上の栄養因子の送達を更に含む。栄養因子としては、限定はされないが、IGF-I、GDNF、BDNF、CTNF、VEGF、コリベリン、キサリプロデン、甲状腺刺激ホルモン放出ホルモンおよびADNF、ならびにこれらの変異体を挙げることができる。
一態様において、目的の遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖の核酸配列をコードするAAV粒子は、AAV-IGF-I(例えば、ヴィンセント(Vincent)ら著、ニューロモレキュラー・メディシン(Neuromolecular medicine)、2004年、第6巻、p.79~85を参照のこと;この内容は全体として参照により本明細書に援用される)およびAAV-GDNF(例えば、ワン(Wang)ら著、ジャーナル・オブ・ニューロサイエンス(J Neurosci.)、2002年、第22巻、p.6920~6928を参照のこと;この内容は全体として参照により本明細書に援用される)などの、神経栄養因子を発現するAAV粒子と共投与してもよい。
一部の実施形態において、神経学的疾患を治療するための本発明の組成物は、必要とする対象に、静脈内、筋肉内、皮下、腹腔内、実質内、髄腔内および/または脳室内投与され、siRNA分子またはsiRNA分子を含むベクターが、血液脳関門および血液脊髄関門の一方または両方を通過することを可能にする。一部の態様において、この方法は、本発明のsiRNA分子の核酸配列をコードするAAV粒子を含む組成物の治療有効量を(例えば、輸液ポンプおよび/または送達足場を使用して)対象の中枢神経系(CNS)に直接投与(例えば、実質内投与、脳室内投与および/または髄腔内投与)する工程を含む。ベクターを使用して、標的遺伝子発現をサイレンシングまたは抑制ことができ、および/または対象の神経学的疾患の1つ以上の症状を軽減することができ、対象は治療的に処置される。
一実施形態において、本発明のsiRNAをコードするAAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質レベルを低下させ得る。標的タンパク質レベルは、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%低下され得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを少なくとも50%低下させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを少なくとも40%低下させ得る。
一実施形態において、本発明のsiRNAをコードするAAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質の発現を低下させ得る。標的タンパク質の発現は、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%低下され得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも50%低下させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも40%低下させ得る。
一実施形態において、本発明のsiRNAをコードするAAV粒子の対象への静脈内投与は、対象のCNSにおける標的タンパク質の発現を低下させ得る。標的タンパク質の発現は、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%低下され得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも50%低下させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも40%低下させ得る。
一実施形態において、AAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質の発現を低減させることになり、標的タンパク質の発現低減は、対象の神経学的疾患の影響および/または症状を軽減することになる。
一実施形態において、AAV粒子は、対象の標的タンパク質を減少させるために使用してもよい。減少は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%であってもよい。非限定的な例として、対象は、標的タンパク質の70%の減少を有し得る。非限定的な例として、対象は、標的タンパク質の50%減少を有し得る。非限定的な例として、対象は、標的タンパク質の40%減少を有し得る。非限定的な例として、対象は、標的タンパク質の10%の減少を有し得る。
心血管疾患の治療法
本発明では、本発明のAAV粒子を細胞へと導入する方法であって、ベクターのいずれかを、標的mRNAおよびタンパク質の産生の増加が生じるのに十分な量で前記細胞へと導入する工程を含む方法が提供される。一部の態様において、細胞は、限定はされないが心筋細胞などの筋細胞であってもよい。
本発明には、治療を必要とする対象における標的タンパク質(例えば、ATP2A2)の不十分な機能/存在に関連する神経学的疾患を治療する方法が開示される。この方法は、任意選択で、本発明のAAV粒子を含む組成物の治療有効量を対象に投与する工程を含む。非限定的な例として、AAV粒子は、標的遺伝子発現を増加させ、標的タンパク質産生を増加させ、したがって対象の心血管疾患の1つ以上の症状を軽減することができ、対象は治療的に処置される。
一部の実施形態において、タンパク質ペイロードをコードする核酸を含む本発明のAAV粒子は、静脈内投与後に心筋細胞への分布を可能にするAAVカプシドを含む。
一実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、全身性投与により対象に投与される。一実施形態において、全身性投与は静脈内注射である。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、対象の心血管系に直接投与される。他の実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、対象の組織(例えば、対象の心臓)に投与される。
一実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、髄腔内注射により対象の心血管系に投与される。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、限定はされないが心筋細胞を含めた、特定のタイプの標的細胞へと送達してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、心筋細胞に送達してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、心血管疾患の療法として使用してもよい。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、拡張型心筋症(DCM)の療法として使用してもよい。DCMは、心臓の心室および心房に影響を及ぼし、心筋が拡張を始めて、心筋の異常な収縮を引き起こし、その結果、心臓は血液を効率的に送り出さなくなる。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、肥大型心筋症の療法として使用してもよい。肥大型心筋症では、心筋の部分が拡大して、心臓の血液送出しが困難になる。
一部の実施形態において、AAV粒子は、心臓組織において標的タンパク質を増加させるために使用してもよい。心臓組織における標的タンパク質の増加は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子を使用して、心血管疾患を治療するために、心筋細胞における標的タンパク質発現を増加させてもよい。心筋細胞における標的タンパク質は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、標的タンパク質を増加させ、対象の心血管疾患の症状を低減するために使用してもよい。標的タンパク質の増加および/または心血管疾患の症状の軽減は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%変更(標的タンパク質の産生が増加、および心血管疾患の症状が軽減)され得る。
一部の実施形態において、本組成物は、心血管疾患を治療するための単独治療薬または併用治療薬として投与される。
標的タンパク質をコードするAAV粒子は、1つ以上の他の治療剤と併用して使用してもよい。「~と併用して」とは、その薬剤が同じ時点で投与されなければならないこと、および/または一緒に送達されるように製剤化されなければならないことを含意するよう意図するものではなく、しかしながらこれらの送達方法は本開示の範囲内にある。組成物は、1つ以上の他の所望の治療薬または医療手技と同時に、その前に、またはその後に投与することができる。一般に、各薬剤は、その薬剤について決定された用量および/またはタイムスケジュールで投与されることになる。
本発明のAAV粒子と併用して使用することができる治療剤は、酸化防止剤、抗炎症剤、抗アポトーシス剤、カルシウム調節剤、抗グルタミン酸剤、構造タンパク質阻害剤、筋肉機能に関与する化合物、利尿剤、ACE阻害剤、β-アドレナリン遮断剤、および金属イオン調節に関与する化合物である小分子化合物であってもよい。
一部の実施形態において、心血管疾患を治療するための本発明の組成物は、必要とする対象に、静脈内、筋肉内、皮下、髄腔内、順行性冠動脈注射、および/または脳室内投与され、AAV粒子が、所望の細胞、組織、および/または臓器に送達されることを可能にする。一部の態様において、この方法は、本発明のAAV粒子を含む組成物の治療有効量を(例えば、輸液ポンプおよび/または送達足場を使用して)対象の心血管系に直接投与(例えば、実質内投与、脳室内投与および/または髄腔内投与)する工程を含む。ベクターを使用して、標的遺伝子発現を増加させることができ、および/または対象の心血管疾患の1つ以上の症状を軽減することができ、対象は治療的に処置される。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象の標的タンパク質レベルを増加させ得る。標的タンパク質レベルは、限定はされないが、対象の心血管系、心血管系の領域、または心血管の特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを少なくとも40%増加させ得る。非限定的な例として、対象は、標的タンパク質の10%の増加を有し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを、ベースラインから倍増させ得る。一実施形態において、AAV粒子は、5~6倍のより高いレベルの標的タンパク質につながる。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質の発現を増加させ得る。標的タンパク質の発現は、限定はされないが、対象の心血管系、心血管系の領域、または心血管系の特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも40%増加させ得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への静脈内投与は、対象における標的タンパク質の心血管系発現を増加させ得る。標的タンパク質の発現は、限定はされないが、対象の心血管系、心血管系の領域、または心血管系の特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、心血管系における標的タンパク質の発現を少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、心血管系における標的タンパク質の発現を少なくとも40%増加させ得る。
一実施形態において、AAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質の発現を増加させることになり、標的タンパク質の発現増加は、対象の心血管疾患の影響および/または症状を軽減することになる。
心不全の治療方法
本発明では、本発明のAAV粒子を細胞へと導入する方法であって、ベクターのいずれかを、標的mRNAおよびタンパク質の産生の増加が生じるのに十分な量で前記細胞へと導入する工程を含む方法が提供される。一部の態様において、細胞は、限定はされないが心筋細胞などの筋細胞であってもよい。
本発明には、治療を必要とする対象における標的タンパク質(例えば、ATP2A2)の不十分な機能/存在に関連する心不全を治療する方法が開示される。この方法は、任意選択で、本発明のAAV粒子を含む組成物の治療有効量を対象に投与する工程を含む。非限定的な例として、AAV粒子は、標的遺伝子発現を増加させることができ、標的タンパク質産生を増加させることができ、したがって対象の心不全の1つ以上の症状を軽減することができ、対象は治療的に処置される。
一部の実施形態において、タンパク質ペイロードをコードする核酸を含む本発明のAAV粒子は、静脈内投与後に心筋細胞への分布を可能にするAAVカプシドを含む。
一実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、全身性投与により対象に投与される。一実施形態において、全身性投与は静脈内注射である。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、対象の心血管系に直接投与される。他の実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、対象の組織(例えば、対象の心臓)に投与される。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子を含む組成物は、髄腔内注射により対象の心血管系に投与される。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、限定はされないが心筋細胞を含めた、特定のタイプの標的細胞へと送達してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、心筋細胞に送達してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、心不全の療法として使用してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、対象の入院数を低減するために使用してもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、対象の生存を延長するために使用してもよい。
一部の実施形態において、AAV粒子は、心臓組織における標的タンパク質を増加させるために使用してもよい。心臓組織における標的タンパク質の増加は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子を使用して、心不全を治療するために、心筋細胞における標的タンパク質発現を増加させてもよい。心筋細胞における標的タンパク質は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%増加し得る。
一部の実施形態において、本発明のAAV粒子は、標的タンパク質を増加させ、対象の心不全の症状を軽減するために使用してもよい。標的タンパク質の増加および/または心不全の症状の軽減は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5~15%、5~20%、5~25%、5~30%、5~35%、5~40%、5~45%、5~50%、5~55%、5~60%、5~65%、5~70%、5~75%、5~80%、5~85%、5~90%、5~95%、10~20%、10~25%、10~30%、10~35%、10~40%、10~45%、10~50%、10~55%、10~60%、10~65%、10~70%、10~75%、10~80%、10~85%、10~90%、10~95%、15~25%、15~30%、15~35%、15~40%、15~45%、15~50%、15~55%、15~60%、15~65%、15~70%、15~75%、15~80%、15~85%、15~90%、15~95%、20~30%、20~35%、20~40%、20~45%、20~50%、20~55%、20~60%、20~65%、20~70%、20~75%、20~80%、20~85%、20~90%、20~95%、25~35%、25~40%、25~45%、25~50%、25~55%、25~60%、25~65%、25~70%、25~75%、25~80%、25~85%、25~90%、25~95%、30~40%、30~45%、30~50%、30~55%、30~60%、30~65%、30~70%、30~75%、30~80%、30~85%、30~90%、30~95%、35~45%、35~50%、35~55%、35~60%、35~65%、35~70%、35~75%、35~80%、35~85%、35~90%、35~95%、40~50%、40~55%、40~60%、40~65%、40~70%、40~75%、40~80%、40~85%、40~90%、40~95%、45~55%、45~60%、45~65%、45~70%、45~75%、45~80%、45~85%、45~90%、45~95%、50~60%、50~65%、50~70%、50~75%、50~80%、50~85%、50~90%、50~95%、55~65%、55~70%、55~75%、55~80%、55~85%、55~90%、55~95%、60~70%、60~75%、60~80%、60~85%、60~90%、60~95%、65~75%、65~80%、65~85%、65~90%、65~95%、70~80%、70~85%、70~90%、70~95%、75~85%、75~90%、75~95%、80~90%、80~95%、または90~95%変更(標的タンパク質の産生が増加、および心不全の症状が軽減)され得る。
一部の実施形態において、本組成物は、心不全を治療するための単独治療薬または併用治療薬として投与される。
標的タンパク質をコードするAAV粒子は、1つ以上の他の治療剤と併用して使用してもよい。「~と併用して」とは、その薬剤が同じ時点で投与されなければならないこと、および/または一緒に送達されるように製剤化されなければならないことを含意するよう意図するものではなく、しかしながらこれらの送達方法は本開示の範囲内にある。組成物は、1つ以上の他の所望の治療薬または医療手技と同時に、その前に、またはその後に投与することができる。一般に、各薬剤は、その薬剤について決定された用量および/またはタイムスケジュールで投与されることになる。
本発明のAAV粒子と併用して使用することができる治療剤は、酸化防止剤、抗炎症剤、抗アポトーシス剤、カルシウム調節剤、抗グルタミン酸剤、構造タンパク質阻害剤、筋肉機能に関与する化合物、利尿剤、ACE阻害剤、β-アドレナリン遮断剤、および金属イオン調節に関与する化合物である小分子化合物であってもよい。
一部の実施形態において、心血管疾患を治療するための本発明の組成物は、必要とする対象に、静脈内、筋肉内、皮下、髄腔内、順行性冠動脈注射、および/または脳室内投与され、AAV粒子が、所望の細胞、組織、および/または臓器に送達されることを可能にする。一部の態様において、この方法は、本発明のAAV粒子を含む組成物の治療有効量を(例えば、輸液ポンプおよび/または送達足場を使用して)対象の心血管系に直接投与(例えば、実質内投与、脳室内投与および/または髄腔内投与)する工程を含む。ベクターを使用して、標的遺伝子発現を増加させることができ、および/または対象の心不全の1つ以上の症状を軽減することができ、対象は治療的に処置される。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象の標的タンパク質レベルを増加させ得る。標的タンパク質レベルは、限定はされないが、対象の心血管系、心血管系の領域、または心血管の特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを少なくとも40%増加させ得る。非限定的な例として、対象は、標的タンパク質の10%の増加を有し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質のタンパク質レベルを、ベースラインから倍増させ得る。一実施形態において、AAV粒子は、5~6倍のより高いレベルの標的タンパク質につながる。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質の発現を増加させ得る。標的タンパク質の発現は、限定はされないが、対象の心血管系、心血管系の領域、または心血管系の特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、標的タンパク質の発現を少なくとも40%増加させ得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への静脈内投与は、対象における標的タンパク質の心血管系発現を増加させ得る。標的タンパク質の発現は、限定はされないが、対象の心血管系、心血管系の領域、または心血管系の特定の細胞など、対象において、約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは95~100%増加し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、心血管系における標的タンパク質の発現を少なくとも50%増加させ得る。非限定的な例として、AAV粒子は、心血管系における標的タンパク質の発現を少なくとも40%増加させ得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象の心筋細胞における標的タンパク質の発現を増加させ得る。標的タンパク質の発現は、約20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは90~95%増加し得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象の心筋細胞においてATP2A2を発現させ得る。心筋細胞におけるATP2A2の発現は、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは90~95%であってもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の30%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の30~40%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の30~50%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の30%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の30~60%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の30~70%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の30~80%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の30~90%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の20%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の20~40%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の20~50%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の20%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の20~60%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の20~70%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の20~80%で見られてもよい。一実施形態において、ATP2A2の発現は、心筋細胞の20~90%で見られてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子の対象への投与は、対象の心筋細胞においてS100A1を発現させ得る。心筋細胞におけるS100A1の発現は、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20~30%、20~40%、20~50%、20~60%、20~70%、20~80%、20~90%、20~95%、20~100%、30~40%、30~50%、30~60%、30~70%、30~80%、30~90%、30~95%、30~100%、40~50%、40~60%、40~70%、40~80%、40~90%、40~95%、40~100%、50~60%、50~70%、50~80%、50~90%、50~95%、50~100%、60~70%、60~80%、60~90%、60~95%、60~100%、70~80%、70~90%、70~95%、70~100%、80~90%、80~95%、80~100%、90~95%、90~100%もしくは90~95%であってもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の30%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の30~40%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の30~50%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の30%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の30~60%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の30~70%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の30~80%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の30~90%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の20%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の20~40%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の20~50%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の20%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の20~60%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の20~70%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の20~80%で見られてもよい。一実施形態において、S100A1の発現は、心筋細胞の20~90%で見られてもよい。
一実施形態において、AAV粒子の対象への投与は、対象における標的タンパク質の発現を増加させることになり、標的タンパク質の発現増加は、対象の心不全の影響および/または症状を軽減することになる。
一実施形態において、心不全を治療するために、1×1013VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、経皮冠動脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、1×1013VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、静脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、2×1013VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、経皮冠動脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、2×1013VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、静脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、3×1013VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、経皮冠動脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、3×1013VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、静脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、3×1011VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、経皮冠動脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、3×1011VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、静脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、3×1012VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、経皮冠動脈内投与によって対象に投与される。
一実施形態において、心不全を治療するために、3×1012VGの用量の本発明のAAV粒子が対象に投与される。非限定的な例として、この用量のAAV粒子は、静脈内投与によって対象に投与される。
V.キットおよびデバイス
キット
一実施形態において、本発明は、本発明の方法を便宜的および/または効果的に実行するための様々なキットを提供する。典型的に、キットは、ユーザが対象の複数の治療を行うことおよび/または複数の実験を行うことを可能にするのに十分な量および/または数の構成要素を含むであろう。
本発明のAAV粒子のうちのいずれかが、キットに含まれ得る。一部の実施形態において、キットは、本発明の化合物および/または組成物を作製および/または合成するための試薬および/または説明書を更に含み得る。一部の実施形態において、キットはまた、1つまたは複数の緩衝液も含み得る。一部の実施形態において、本発明のキットは、タンパク質または核酸のアレイまたはライブラリを作製するための構成要素を含んでもよく、したがって、例えば、固体支持体を含んでもよい。
一部の実施形態において、キットの構成要素は、水性媒体または凍結乾燥形態のいずれかで、パッケージングされ得る。キットの容器手段には、一般に、少なくとも1つのバイアル、試験管、フラスコ、ボトル、シリンジ、または他の容器手段が含まれ、その中に、構成要素が配置され、好ましくは、好適にアリコートされ得る。1つを上回ってキットの構成要素が存在する場合(標識化試薬および標識が、一緒にパッケージングされてもよい)、キットはまた、通常、追加の構成要素が別個に配置され得る第2、第3、またはその他の追加の容器も含んでよい。一部の実施形態において、キットはまた、滅菌の薬学的に許容可能な緩衝液および/または他の希釈剤を格納する第2の容器手段を含んでもよい。一部の実施形態において、様々な組合せの構成要素が、1つまたは複数のバイアルに含まれてもよい。本発明のキットはまた、典型的に、本発明の化合物および/または組成物を格納するための手段、例えば、タンパク質、核酸、および任意の他の試薬の容器を、商業販売のために緊密に封止した状態で含み得る。そのような容器としては、所望されるバイアルが中に保持される、射出成形または吹込み成形された容器を挙げることができる。
一部の実施形態において、キットの構成要素は、1つおよび/または複数の溶液で提供される。一部の実施形態において、溶液は、水溶液であり、滅菌水溶液が、特に好ましい。一部の実施形態において、キットの構成要素は、乾燥粉末として提供されてもよい。試薬および/または構成要素が乾燥粉末として提供される場合、かかる粉末は、好適な容積の溶媒の添加によって、復元され得る。一部の実施形態において、溶媒が別の容器手段で提供され得ることも想定される。一部の実施形態において、標識化色素は、乾燥粉末として提供される。一部の実施形態において、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、120、120、130、140、150、160、170、180、190、200、300、400、500、600、700、800、900、1000マイクログラムまたは少なくとももしくは多くともこれらの量の乾燥色素が、本発明のキットにおいて提供されることが、企図される。かかる実施形態において、色素は、次いで、任意の好適な溶媒、例えば、DMSO中に再懸濁され得る。
一部の実施形態において、キットは、キットの構成要素の利用ならびにキットに含まれていない任意の他の試薬の使用に関する説明書を含んでもよい。説明書には、実装され得るバリエーションが含まれてもよい。
デバイス
一実施形態において、AAV粒子は、AAV粒子を送達するためのデバイスおよび頭部固定アセンブリを使用して、対象に送達されてもよい。頭部固定アセンブリは、限定はされないが、MRIインターベンションズ社(MRI interventions)によって販売されている頭部固定アセンブリのいずれかであってもよい。非限定的な例として、頭部固定アセンブリは、米国特許第8,099,150号明細書、同第8,548,569号明細書、および同第9,031,636号明細書、ならびに国際特許公開第201108495号パンフレットおよび同第2014014585号パンフレット(これらの各々の内容は全体として参照により援用される)に記載されているアセンブリのいずれかであってもよい。頭部固定アセンブリは、限定はされないが、国際特許公開第2013181008号パンフレットおよび米国特許出願公開第20130325012号明細書(これらの内容は全体として参照により本明細書に援用される)に記載されているMRI適合性ドリルなどのMRI適合性ドリルと組み合わせて使用されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、AAV粒子を送達するために、装置を対象における標的点へと位置させるための方法、システム、および/またはコンピュータプログラムを使用して、送達されてもよい。非限定的な例として、この方法、システム、および/またはコンピュータプログラムは、米国特許第8,340,743号明細書(これらの内容は、本明細書においてその全体として参照により援用される)に記載される方法、システム、および/またはコンピュータプログラムであってもよい。この方法には、体内の標的点および参照点を決定する工程であって、標的点および参照点により、それらの間に延びる計画された軌道線(PTL)が定められる、工程;視覚化面を決定する工程であって、PTLが、照準点で視覚化面と交差する、工程;ガイドデバイスをPTLに関連して移動するように身体に対して載置する工程であって、ガイドデバイスが、視覚化面と交差しない、工程;ガイド軸と視覚化面との間の交差の点(GPP)を決定する工程;ならびにGPPを、視覚化面における照準点とアラインメントする工程が含まれ得る。
一実施形態において、AAV粒子は、コンベンション強化送達デバイス(convention-enhanced delivery device)を使用して、対象に送達されてもよい。対流を使用した薬物のターゲティング送達の非限定的な例は、米国特許出願公開第20100217228号明細書、同第20130035574号明細書、および同第20130035660号明細書、ならびに国際特許公開第2013019830号パンフレットおよび同第2008144585号パンフレットに記載されており、これらの各々の内容は、本明細書においてそれらの全体として参照により援用される。
一実施形態において、対象は、AAV粒子の送達の前、最中、および/または後に、イメージングされてもよい。イメージング方法は、当該技術分野において公知および/または本明細書に記載されている方法、例えば、限定はされないが、磁気共鳴イメージング(MRI)であってもよい。非限定的な例として、イメージングは、治療効果を評価するために使用してもよい。別の非限定的な例として、イメージングは、AAV粒子の送達補助のために使用してもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、MRIガイドデバイスを使用して、送達されてもよい。MRIガイドデバイスの非限定的な例は、米国特許第9,055,884号明細書、同第9,042,958号明細書、同第8,886,288号明細書、同第8,768,433号明細書、同第8,396,532号明細書、同第8,369,930号明細書、同第8,374,677号明細書、および同第8,175,677号明細書、ならびに米国特許出願公開第20140024927号明細書に記載されており、これらの各々の内容は、本明細書においてそれらの全体として参照により援用される。非限定的な例として、MRIガイドデバイスは、米国特許第8,886,288号および同第8,768,433号(これらの各々の内容は、本明細書においてその全体として参照により援用される)に記載されるものなど、リアルタイムでデータを提供することが可能であり得る。別の非限定的な例として、MRIガイドデバイスまたはシステムは、米国特許第8,175,677号明細書および同第8,374,677号明細書(これらの各々の内容は、本明細書においてそれらの全体として参照により援用される)に記載されるシステムなど、ターゲティングカニューレと共に使用されてもよい。なおも別の非限定的な例として、MRIガイドデバイスには、例えば、米国特許第9,055,884号明細書および米国特許出願第20140024927号(これらの各々の内容は、本明細書においてそれらの全体として参照により援用される)に記載されている介入デバイスをガイドするための軌道ガイドフレームが含まれる。
一実施形態において、AAV粒子は、MRI適合性チップアセンブリを使用して送達されてもよい。MRI適合性チップアセンブリの非限定的な例は、米国特許出願公開第20140275980号明細書に記載されており、この内容は、本明細書においてその全体として参照により援用される。
一実施形態において、AAV粒子は、MRI適合性であるカニューレを使用して送達されてもよい。MRI適合性カニューレの非限定的な例としては、国際特許公開第2011130107号パンフレット(この内容は本明細書においてその全体として参照により援用される)に教示されているものが挙げられる。
一実施形態において、AAV粒子は、MRI適合性であるカテーテルを使用して送達されてもよい。MRI適合性カテーテルの非限定的な例としては、国際特許公開第2012116265号パンフレット、米国特許第8,825,133号明細書、および米国特許出願公開第20140024909号明細書(これらの各々の内容は、本明細書においてそれらの全体として参照により援用される)に教示されているものが挙げられる。
一実施形態において、AAV粒子は、米国特許出願公開第20140276582号明細書および同第20140276614号明細書(これらの各々の内容は、本明細書においてそれらの全体として参照により援用される)に記載されている細長い筒状体およびダイヤフラムを有するデバイスを使用して、送達されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、限定はされないが、米国特許出願公開第20150223905号明細書および同第20150230871号明細書(これらの各々の内容は、本明細書においてそれらの全体として参照により援用される)に記載されているものなどのMRI適合性局在化および/またはガイダンスシステムを使用して、送達されてもよい。非限定的な例として、MRI適合性局在化および/またはガイダンスシステムは、患者への固定のために適合された載置台、少なくとも3次元的に制御可能に移動させることができるように、載置台に取り付けるように構成されたルーメンを有するターゲティングカニューレ、ならびにターゲティングカニューレのルーメン内をスライドを介して隙間なく前進および後退するように構成された細長いプローブを備えてもよく、細長いプローブは、刺激電極または記録電極のうちの少なくとも1つを備える。
一実施形態において、AAV粒子は、米国特許出願公開第20150031982号明細書および同第20140066750号明細書、ならびに国際特許公開第2015057807号パンフレットおよび同第2014039481号パンフレット(これらの各々の内容は、本明細書においてそれらの全体として参照により援用される)に記載されている軌道フレームを使用して、対象に送達されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、遺伝子銃を使用して、対象に送達されてもよい。
VI.定義
本明細書の様々な箇所において、本開示の化合物の置換基は、群または範囲で、開示されている。本開示は、かかる群および範囲のメンバーのありとあらゆる個々の部分的な組合せを含むことが、具体的に意図される。
特に明記しない限り、下記の用語および語句は下記に説明する意味を有する。これらの定義は、性質の限定を意図するものでなく、本発明のある特定の態様のより明確な理解を提供するための役目を果たす。
約:本明細書で使用されるとき、「約」という用語は、記載される値の±10%を意味する。
アデノ随伴ウイルス:本明細書で使用される「アデノ随伴ウイルス」または「AAV」という用語は、ディペンドウイルス属のメンバー(それに由来する任意の粒子、配列、遺伝子、タンパク質、または成分を含む)を指す。
AAV粒子:本明細書で使用されるとき、「AAV粒子」は、カプシドと、少なくとも1つのペイロード領域および少なくとも1つのITR領域を有するウイルスゲノムとを含むウイルスである。本開示のAAV粒子は、組換え的に産生されてもよく、アデノ随伴ウイルス(AAV)親または参照配列に基づいてもよい。AAV粒子は、本明細書に記載されるかもしくは当該技術分野において公知の任意の血清型(血清型の組合せ(すなわち「シュードタイプ」AAV)を含める)、または様々なゲノム(例えば一本鎖もしくは自己相補的)に由来し得る。加えて、AAV粒子は、複製欠損型および/またはターゲティング型であってもよい。
活性:本明細書で使用されるとき、用語「活性」は、物事が起こるかまたは行われる状態を指す。本発明の組成物は活性を有してもよく、この活性は、1つ以上の生物学的事象を含んでもよい。
投与する:本明細書で使用されるとき、用語「投与する」は、対象に医薬品または組成物を提供することを指す。
組み合わせて投与される:本明細書で使用されるとき、「組み合わせて投与される」または「組合せ投与」という用語は、2つ以上の薬剤が、患者に各薬剤の効果のオーバーラップが存在し得るように、同時またはある間隔で、対象に投与されることを意味する。一部の実施形態において、それらは、互いに、約60分以内、30分以内、15分以内、10分以内、5分以内、もしくは1分以内に投与される。一部の実施形態において、薬剤の投与は、コンビナトリアル(例えば、相乗)効果が達成されるように、十分に一緒に近接した間隔となっている。
改善:本明細書で使用されるとき、用語「改善」または「改善する」は、病態または疾患の少なくとも1つの指標の重症度を低下させることを指す。例えば、神経変性障害の文脈では、改善には、ニューロン喪失の低減が含まれる。
動物:本明細書で使用されるとき、「動物」という用語は、動物界の任意のメンバーを指す。一部の実施形態において、「動物」は、発達の任意のステージにあるヒトを指す。一部の実施形態において、「動物」は、発達の任意のステージにある非ヒト動物を指す。ある特定の実施形態において、非ヒト動物は、哺乳動物(例えば、齧歯動物、マウス、ラット、ウサギ、サル、イヌ、ネコ、ヒツジ、ウシ、霊長類、またはブタ)である。一部の実施形態において、動物には、限定はされないが、哺乳動物、鳥類、爬虫類、両生類、魚類、および蠕虫が含まれる。一部の実施形態において、動物は、トランスジェニック動物、遺伝子操作動物、またはクローンである。
アンチセンス鎖:本明細書で使用されるとき、siRNA分子の「アンチセンス鎖」または「第1の鎖」または「ガイド鎖」という用語は、サイレンシングのターゲティング遺伝子のmRNAの約10~50ヌクレオチド、例えば、約15~30、16~25、18~23、または19~22ヌクレオチドの一部分と実質的に相補的な鎖を指す。アンチセンス鎖または第1の鎖は、標的特異的サイレンシングを誘導するのに所望の標的mRNA配列と十分に相補的な、例えば、RNAi機構またはプロセスによって所望の標的mRNAの破壊を引き起こすのに十分な相補性の配列を有する。
およそ:本明細書で使用されるとき、目的の1つまたは複数の値に適用される「およそ」または「約」という用語は、言及された参照値に類似である値を指す。ある特定の実施形態において、「およそ」または「約」という用語は、別途示されない限りまたは文脈から明らかでない限り、言及された参照値のいずれかの方向で(より大きいかまたは小さい)、25%以内、20%以内、19%以内、18%以内、17%以内、16%以内、15%以内、14%以内、13%以内、12%以内、11%以内、10%以内、9%以内、8%以内、7%以内、6%以内、5%以内、4%以内、3%以内、2%以内、1%以内、またはそれ以下に入る値の範囲を指す(ただし、かかる数が可能な値の100%を超える場合を除く)。
会合している:本明細書で使用されるとき、「会合している」、「コンジュゲートされている」、「連結されている」、「結合している」、および「繋がれている」という用語は、2つ以上の部分に関して使用される場合、これらの部分が、直接的または連結剤として働く1つもしくは複数の追加の部分を介してのいずれかで、互いに物理的に会合または接続されて、十分に安定な構造体を形成しており、その結果、それらの部分が、その構造体が使用される条件、例えば、生理学的条件下において、物理的に会合されたままとなることを意味する。「会合」は、必ずしも、厳密に、直接的な共有結合による化学結合を通じたものとは限らない。これは、イオン結合もしくは水素結合またはハイブリダイゼーションに基づく、「会合している」実体が、物理的に会合したままとなるような十分に安定な接続も示唆し得る。
二機能性:本明細書で使用されるとき、「二機能性」という用語は、少なくとも2つの機能を行うことができるか、またはそれを維持する、任意の物質、分子、または部分を指す。機能は、同じ結果または異なる結果に作用し得る。機能をもたらす構造は、同じであっても異なってもよい。
生体適合性:本明細書で使用されるとき、用語「生体適合性」は、損傷、毒性または免疫系による拒絶のリスクがほとんどまたはまったくない生細胞、組織、臓器または系と適合性であることを意味する。
生分解性:本明細書で使用されるとき、用語「生分解性」は、生物の作用によって無害な産物へと分割することが可能であることを意味する。
生物学的に活性:本明細書で使用されるとき、「生物学的に活性」という語句は、生物システムおよび/または生物において活性を有する任意の物質の特徴を指す。例えば、生物に投与されたときに、その生物に対して生物学的作用を有する物質は、生物学的に活性であると考えられる。特定の実施形態において、本発明のAAV粒子は、コード化ペイロードの部分が生物学的に活性であるか、または生物学的に関連すると考えられる活性を模倣する場合でさえ、生物学的に活性であるとみなすことができる。
カプシド:本明細書で使用されるとき、用語「カプシド」は、ウイルス粒子のタンパク質殻を指す。
相補的および実質的に相補的:本明細書で使用されるとき、用語「相補」は、ポリヌクレオチドが互いに塩基対を形成する能力を指す。塩基対は、典型的には逆平行ポリヌクレオチド鎖におけるヌクレオチド単位間の水素結合によって形成される。相補ポリヌクレオチド鎖は、ワトソン・クリック方式(例えば、AとT、AとU、CとG)、または二重鎖の形成を可能にする任意の他の方式で塩基対を形成することができる。当業者は認識しているとおり、DNAと対照的にRNAを使用するとき、チミンでなくウラシルがアデノシンと相補的とみなされる塩基である。しかしながら、本発明の文脈でUと表記されるとき、特に指定されない限り、Tに置き換え可能であることが含意される。完全な相補性または100%の相補性とは、一方のポリヌクレオチド鎖の各ヌクレオチド単位が第2のポリヌクレオチド鎖のヌクレオチド単位と水素結合を形成することができる状況を指す。完全でない相補性とは、2本の鎖の全てではないものの一部のヌクレオチド単位が互いに水素結合を形成することができる状況を指す。例えば、2本の20merについて、各鎖の2個の塩基対のみが互いに水素結合を形成することができる場合、このポリヌクレオチド鎖は10%の相補性を呈する。同じ例で、各鎖の18個の塩基対が互いに水素結合を形成することができる場合、このポリヌクレオチド鎖は90%の相補性を呈する。本明細書で使用されるとき、「実質的に相補的」という用語は、siRNAが、所望の標的mRNAに結合して標的mRNAのRNAサイレンシングを引き起こすのに十分な配列を(例えばアンチセンス鎖に)有することを意味する。
化合物:本開示の化合物は、中間体または最終化合物において生じる原子の同位体の全てを含む。「同位体」は、同じ原子番号を有するが、核内の中性子の数が異なることにより生じる、異なる質量数を有する、原子を指す。例えば、水素の同位体には、トリチウムおよび重水素が含まれる。
本開示の化合物および塩は、ルーチンな方法により、溶媒または水分子と組み合わせて、溶媒和物および水和物を形成して、調製することができる。
条件付き活性:本明細書で使用されるとき、用語「条件付き活性」は、野生型ポリペプチドの突然変異体または変異体を指し、突然変異体または変異体は、生理学的条件下において、親ポリペプチドよりも活性が高くてもよくまたは低くてもよい。更に、条件付き活性ポリペプチドは、異常条件下において、親ポリペプチドと比較して活性が増加してもよくまたは減少してもよい。条件付き活性ポリペプチドは、正常な生理学的条件下または異常条件下において、可逆的にまたは不可逆的に不活化されてもよい。
保存されている:本明細書で使用されるとき、「保存されている」という用語は、比較されている2つ以上の配列の同じ位置に変更されずに生じる、ポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列の、それぞれ、ヌクレオチドまたはアミノ酸残基を指す。比較的保存されているヌクレオチドまたはアミノ酸は、配列の別の箇所に出現するヌクレオチドまたはアミノ酸よりも、関連する配列間で保存されているものである。
一部の実施形態において、2つ以上の配列は、それらが、互いに、100%同一である場合に、「完全に保存されている」と言われる。一部の実施形態において、2つ以上の配列は、それらが、互いに、少なくとも70%同一であるか、少なくとも80%同一であるか、少なくとも90%同一であるか、または少なくとも95%同一である場合に、「高度に保存されている」と言われる。一部の実施形態において、2つ以上の配列は、それらが、互いに、約70%同一であるか、約80%同一であるか、約90%同一であるか、約95%、約98%、または約99%同一である場合に、「高度に保存されている」と言われる。一部の実施形態において、2つ以上の配列は、それらが、互いに、少なくとも30%同一であるか、少なくとも40%同一であるか、少なくとも50%同一であるか、少なくとも60%同一であるか、少なくとも70%同一であるか、少なくとも80%同一であるか、少なくとも90%同一であるか、または少なくとも95%同一である場合に、「保存されている」と言われる。一部の実施形態において、2つ以上の配列は、それらが、互いに、約30%同一であるか、約40%同一であるか、約50%同一であるか、約60%同一であるか、約70%同一であるか、約80%同一であるか、約90%同一であるか、約95%同一であるか、約98%同一であるか、または約99%同一である場合に、「保存されている」と言われる。配列の保存は、ポリヌクレオチド、もしくはポリペプチドの全長に適用され得るか、またはその一部分、領域、もしくは特徴に適用され得る。
制御エレメント:本明細書で使用されるとき、「制御エレメント」、「調節制御エレメント」または「調節配列」は、プロモータ領域、ポリアデニル化シグナル、転写終結配列、上流調節ドメイン、複製開始点、内部リボソーム侵入部位(「IRES」)、およびエンハンサーなどを指し、受容細胞でのコード配列の複製、転写および翻訳を提供する。選択されたコード配列が適切な宿主細胞中で複製、転写および/または翻訳されることが可能である限り、これらの制御エレメントは全てが常に存在する必要があるわけではない。
徐放:本明細書で使用されるとき、用語「徐放」は、治療転帰を達成するための放出の特定のパターンと一致する医薬組成物または化合物放出プロファイルを指す。
細胞増殖抑制性:本明細書で使用されるとき、「細胞増殖抑制性」は、細胞(例えば、哺乳類細胞(例えば、ヒト細胞))、細菌、ウイルス、真菌、原生動物、寄生虫、プリオン、またはそれらの組合せの成長、分裂、または繁殖を阻害、低減、抑制することを指す。
細胞傷害性:本明細書で使用されるとき、「細胞傷害性」は、細胞(例えば、哺乳類細胞(例えば、ヒト細胞))、細菌、ウイルス、真菌、原生動物、寄生虫、プリオン、またはそれらの組合せを死滅させることまたはそれらに対する傷害性、毒性、または致死性効果を引き起こすことを指す。
送達:本明細書で使用されるとき、「送達」は、AAV粒子、化合物、物質、実体、部分、カーゴ、またはペイロードを送達する動作または手段を指す。
送達剤:本明細書で使用されるとき、「送達剤」は、少なくとも部分的に、ターゲティングされる細胞への、AAV粒子のインビトロ送達を容易にする、任意の物質を指す。
不安定化:本明細書で使用されるとき、「不安定」、「不安定化する」、または「不安定化領域」という用語は、同じ領域または分子の出発時点、野生型、または天然の形態よりも、安定性が低い領域または分子を意味する。
検出可能な標識:本明細書で使用されるとき、「検出可能な標識」は、放射線撮影法、蛍光、化学発光、酵素活性、吸光などを含む、当該技術分野において公知の方法によって容易に検出される、別の実体に結合するか、組み込まれるか、または会合される、1つまたは複数のマーカー、シグナル、または部分を指す。検出可能な標識としては、放射性同位体、フルオロフォア、発色団、酵素、色素、金属イオン、リガンド、例えば、ビオチン、アビジン、ストレプトアビジン、およびハプテン、量子ドットなどを挙げられる。検出可能な標識は、本明細書に記載されるペプチドまたはタンパク質において、任意の位置に配置され得る。それらは、アミノ酸、ペプチド、もしくはタンパク質内にあってもよく、またはN末端もしくはC末端に配置されてもよい。
消化:本明細書で使用されるとき、用語「消化」は、より小さな小片または成分へとバラバラにすることを意味する。ポリペプチドまたはタンパク質に関する場合、消化は、ペプチドの産生をもたらす。
遠位:本明細書で使用されるとき、用語「遠位」は、中心から離れてまたは目的の地点または領域から離れて位置することを意味する。
投薬レジメン:本明細書で使用されるとき、「投薬レジメン」は、投与のスケジュール、または医師により決定される治療、予防、もしくは緩和ケアのレジメンである。
被包する:本明細書で使用されるとき、「被包する」という用語は、封入、包囲、または内包することを意味する。
操作されている:本明細書で使用されるとき、本発明の実施形態は、出発時点、野生型、または天然の分子から、構造的か化学的かに関わらず、変化した特徴または特性を有するように設計されている場合、「操作されている」。
有効量:本明細書で使用されるとき、薬剤の「有効量」という用語は、例えば、対象細胞への単回または複数回の用量の投与で、障害の1つまたは複数の症状の治癒、軽減、緩和、または改善において有益なまたは所望の結果、臨床結果を生じさせるのに十分な量であり、そのため「有効量」は、それが適用されるコンテクストに依存する。例えば、がんを治療する薬剤を投与するコンテクストでは、薬剤の有効量は、例えば、その薬剤の投与なしで得られる応答と比較して、本明細書に定義されるとおりのがんの治療を達成するのに十分な量である。
発現:本明細書で使用されるとき、核酸配列の「発現」は、以下の事象のうちの1つまたは複数を指す:(1)DNA配列からのRNA鋳型の産生(例えば、転写による)、(2)RNA転写産物のプロセシング(例えば、スプライシング、編集、5’キャップ形成、および/または3’末端プロセシングによる)、(3)RNAのポリペプチドまたはタンパク質への翻訳、ならびに(4)ポリペプチドまたはタンパク質の翻訳後修飾。
特徴:本明細書で使用されるとき、「特徴」は、特徴、特性、または特有のエレメントを指す。
製剤:本明細書で使用されるとき、「製剤」は、少なくとも1つのAAV粒子および送達剤を含む。
断片:「断片」は、本明細書で使用されるとき、部分を指す。例えば、タンパク質の断片は、培養細胞から単離した全長タンパク質を消化することによって得られる、ポリペプチドを含み得る。
機能性:本明細書で使用されるとき、「機能性」生体分子は、それによって特徴付けられる特性および/または活性を示す形態を有する、生体分子である。
遺伝子発現:用語「遺伝子発現」は、核酸配列が首尾よく転写およびほとんどの場合に翻訳を受けてタンパク質またはペプチドを産生する過程を指す。明確にするため、「遺伝子発現」の測定に言及するとき、それは、測定が核酸転写産物、例えばRNAもしくはmRNAの測定またはアミノ酸翻訳産物、例えばポリペプチドもしくはペプチドの測定であり得ることを意味するものと理解されなければならない。RNA、mRNA、ポリペプチドおよびペプチドの量またはレベルの測定方法は当該技術分野において周知である。
相同性:本明細書で使用されるとき、「相同性」という用語は、ポリマー分子間、例えば、ポリヌクレオチド分子(例えば、DNA分子および/もしくはRNA分子)間、ならびに/またはポリペプチド分子間の、全般的な関連性を指す。一部の実施形態において、ポリマー分子は、それらの配列が、少なくとも25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または99%同一または類似である場合、互いに「相同」であると考えられる。「相同」という用語は、必然的に、少なくとも2つの配列(ポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列)間の比較を指す。本発明によると、2つのポリヌクレオチド配列は、それらがコードするポリペプチドが、少なくとも約20アミノ酸の少なくとも1つのストレッチに関して、少なくとも約50%、60%、70%、80%、90%、95%、または更には99%である場合、相同であると考えられる。一部の実施形態において、相同なポリヌクレオチド配列は、少なくとも4~5個の固有に指定されるアミノ酸のストレッチをコードする能力によって特徴付けられる。60ヌクレオチド長未満のポリヌクレオチド配列については、相同性は、4~5個の固有に指定されるアミノ酸のストレッチをコードする能力によって決定される。本発明によると、2つのタンパク質配列は、タンパク質が、少なくとも約20アミノ酸の少なくとも1つのストレッチについて、少なくとも約50%、60%、70%、80%、または90%同一である場合、相同であると考えられる。
異種性領域:本明細書で使用されるとき、用語「異種性領域」は、相同領域とはみなされないと考えられる領域を指す。
相同領域:本明細書で使用されるとき、用語「相同領域」は、位置、構造、進化起源、特色、形態または機能が類似する領域を指す。
同一性:本明細書で使用されるとき、「同一性」という用語は、ポリマー分子間、例えば、ポリヌクレオチド分子(例えば、DNA分子および/もしくはRNA分子)間、ならびに/またはポリペプチド分子間の全般的な関連性を指す。2つのポリヌクレオチド配列の同一性パーセントの計算は、例えば、2つの配列を、最適な比較の目的でアラインメントすることによって、行われ得る(例えば、ギャップが、最適なアラインメントのために、第1および第2の核酸配列のうちの一方もしくは両方に導入されてもよく、非同一配列は、比較目的で無視されてもよい)。ある特定の実施形態において、比較目的でアラインメントされる配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または100%である。対応するヌクレオチド位置にあるヌクレオチドが、次いで、比較される。第1の配列における位置が、第2の配列における対応する位置と同じヌクレオチドで占有されている場合、分子は、その位置において同一である。2つの配列間の同一性パーセントは、それらの配列が共有している同一な位置の数の関数であり、2つの配列の最適なアラインメントのために導入する必要のあるギャップの数および各ギャップの長さを考慮する。2つの配列間の配列の比較および同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを使用して達成することができる。例えば、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、Computational Molecular Biology、レスクA.M.(Lesk,A.M.)編、オックスフォードユニバーシティプレス(Oxford University Press)、ニューヨーク(New York)、1988;Biocomputing:Informatics and Genome Projects、スミスD.W.(Smith,D.W.)編、アカデミックプレス(Academic Press)、ニューヨーク(New York)1993;Sequence Analysis in Molecular Biology、フォン へインジェG.(von Heinje,G.)、アカデミックプレス(Academic Press)、1987;Computer Analysis of Sequence Data,Part I、グリフィンA.M.(Griffin,A.M.)およびグリフィンH.G.(Griffin,H.G.)編、ヒューマナプレス(Humana Press)、ニュージャージー所在(New Jersey)、1994;ならびにSequence Analysis Primer、グリブスコフM.(Gribskov,M.)およびデヴェルーJ.(Devereux,J.)編、Mストックトンプレス(M StocktonPress)、ニューヨーク(New York)、1991に記載されているものなどの方法を使用して、決定することができる。これらの各々は、本明細書において参照により援用される。例えば、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、アライン(ALIGN)プログラム(バージョン2.0)に組み込まれているマイヤーズ(Meyers)およびミラー(Miller)(CABIOS、1989、4:11-17)のアルゴリズムを使用して、PAM120の重み付け残基表、ギャップ長ペナルティ12、およびギャップペナルティ4を使用して決定することができる。2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、代替として、NWSgapdna.CMPマトリックスを使用し、GCGソフトウェアパッケージにおいてGAPプログラムを使用して決定することができる。配列間の同一性パーセントを決定するために一般的に利用される方法としては、限定はされないが、カリロH.(Carillo,H.)およびリップマンD.(Lipman,D.)、SIAM J Applied Math.、48:1073(1988)に開示されているものが挙げられ、これは、本明細書において参照により援用される。同一性を決定するための技法は、公的に利用可能なコンピュータプログラムにおいて成文化されている。2つの配列間の相同性を決定するための例示的なコンピュータソフトウェアとしては、限定はされないが、GCGプログラムパッケージ、デヴェルーJ(Devereux,J.)ら、Nucleic Acids Research、12(1)、387(1984))、BLASTP、BLASTN、およびFASTA(アルチュルS.F.(Altschul,S.F.)ら、J.Molec.Biol.、215、403(1990))が挙げられる。
遺伝子の発現の阻害:本明細書で使用されるとき、語句「遺伝子の発現を阻害する」は、遺伝子の発現産物量の減少を生じさせることを意味する。発現産物は、遺伝子から転写されたRNA(例えば、mRNA)または遺伝子から転写されたmRNAから翻訳されたポリペプチドであり得る。典型的には、mRNAのレベルが減少することにより、そこから翻訳されるポリペプチドのレベルが減少することになる。発現レベルは標準的なmRNAまたはタンパク質測定技法を用いて決定し得る。
インビトロ:本明細書で使用されるとき、用語「インビトロ」は、生物(例えば、動物、植物、または微生物)の中でなく、むしろ人工環境、例えば試験管または反応槽、細胞培養物、ペトリ皿等で起こるイベントを指す。
インビボ:本明細書で使用されるとき、用語「インビボ」は、生物(例えば、動物、植物、または微生物またはその細胞もしくは組織)の中で起こるイベントを指す。
単離された:本明細書で使用されるとき、用語「単離された」は、それが関連づけられる化合物の少なくとも一部から分離された(自然界の設定であるかまたは実験的設定であるかに関わらず)物質または実体を指す。単離された物質は、それが会合していた物質に関して、様々なレベルの純度を有し得る。単離された物質および/または実体は、当初それと会合していた他の成分のうちの少なくとも約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、またはそれ以上から、分離されていてもよい。一部の実施形態では、単離された薬剤は、約80%を上回って、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%、または約99%を上回って、純粋である。本明細書で使用されるとき、物質は、他の成分を実質的に含まない場合、「純粋」である。
実質的に単離された:「実質的に単離された」とは、物質が、それが形成または検出された環境から、実質的に分離されていることを意味する。部分的な分離には、例えば、本開示の物質またはAAV粒子中の濃縮されている組成物が含まれ得る。実質的な分離は、本開示の化合物またはその塩を少なくとも約50重量%、少なくとも約60重量%、少なくとも約70重量%、少なくとも約80重量%、少なくとも約90重量%、少なくとも約95重量%、少なくとも約97重量%、または少なくとも約99重量%を含有する組成物が含まれ得る。化合物およびそれらの塩を単離するための方法は、当該技術分野においてルーチンである。
リンカー:本明細書で使用されるとき、「リンカー」は、2つの分子を接続する分子または一群の分子を指す。リンカーは、2つの異なるポリペプチドをコードする2つの核酸配列を接続する核酸配列であってもよい。リンカーは翻訳されてもよくまたはされなくともよい。リンカーは、切断可能なリンカーであってもよい。
マイクロRNA(miRNA)結合部位:本明細書で使用されるとき、マイクロRNA(miRNA)結合部位は、少なくともmiRNAの「シード」領域が結合する核酸転写物のヌクレオチド位置または領域を表す。
修飾された:本明細書で使用されるとき、「修飾された」は、本発明の分子の変化した状態または構造を指す。分子は、化学的、構造的、および機能的を含め、多くの方法で修飾することができる。
突然変異:本明細書で使用されるとき、用語「突然変異」は、後続の世代に伝達され得る変異体(「突然変異体」とも呼ばれる)をもたらす、遺伝子構造の任意の変化を指す。遺伝子の突然変異は、DNAにおける単一塩基の変更、または遺伝子もしくは染色体のより大きなセグメントの欠失、挿入、もしくは再編成によって引き起こされ得る。
天然に存在する:本明細書で使用されるとき、「天然に存在する」または「野生型」は、人工的な補助または人間の手の関与を伴わずに天然に存在していることを意味する。
非ヒト脊椎動物:本明細書で使用されるとき、「非ヒト脊椎動物」は、野生種および家畜種を含む、ホモ・サピエンス以外の全ての脊椎動物を含む。非ヒト脊椎動物の例としては、限定はされないが、アルパカ、バンテン、バイソン、ラクダ、ネコ、ウシ、シカ、イヌ、ロバ、ガヤル、ヤギ、モルモット、ウマ、ラマ、ラバ、ブタ、ウサギ、トナカイ、ヒツジ、水牛、およびヤクなどの哺乳動物が挙げられる。
オフターゲット:本明細書で使用されるとき、「オフターゲット」は、任意の1つまたは複数の標的、遺伝子、または細胞転写物に対する任意の意図しない効果を指す。
オープンリーディングフレーム:本明細書で使用されるとき、「オープンリーディングフレーム」または「ORF」は、所与のリーディングフレーム内に終止コドンを含まない配列を指す。
作動可能に連結された:本明細書で使用されるとき、「作動可能に連結された」という語句は、2つ以上の分子、コンストラクト、転写産物、実体、部分などの間の機能的接続を指す。
粒子:本明細書で使用されるとき、「粒子」は、タンパク質カプシドおよびカプシド内に封入されるポリヌクレオチド配列という少なくとも2つの成分から構成されるウイルスである。
患者:本明細書で使用されるとき、「患者」は、治療を求めている場合があるもしくはそれを必要とし得る対象、治療を必要とする対象、治療を受けている対象、治療を受けるであろう対象、または特定の疾患もしくは病態について、訓練された専門家によるケアを受けている対象を指す。
ペイロード:本明細書で使用されるとき、「ペイロード」または「ペイロード領域」は、ウイルスゲノムによりもしくはその内にコードされる1つもしくは複数のポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド領域、またはかかるポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド領域、例えばトランス遺伝子、ポリペプチドもしくはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現産物、または調節性核酸もしくは制御性核酸を指す。
ペプチド:本明細書で使用されるとき、「ペプチド」は、50アミノ酸長未満であるかまたはそれに等しく、例えば、約5、10、15、20、25、30、35、40、45、または50アミノ酸長である。
薬学的に許容可能:「薬学的に許容可能」という語句は、本明細書では、妥当な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激作用、アレルギー反応、または他の問題もしくは合併症のない、妥当なリスク対効果比に相応の、ヒトおよび動物の組織との接触における使用に好適な化合物、材料、組成物、および/または剤形を指して用いられる。
薬学的に許容可能な賦形剤:語句「薬学的に許容される賦形剤」は、本明細書で使用されるとき、本明細書に記載される化合物以外の、患者において実質的に無毒性および非炎症性であるという特性を有する任意の成分(例えば、活性化合物を懸濁または溶解することが可能な媒体)を指す。賦形剤としては、例えば、次のものを挙げることができる:抗接着剤、抗酸化剤、結合剤、コーティング剤、圧縮補助剤、崩壊剤、色素(着色剤)、エモリエント、乳化剤、充填剤(希釈剤)、フィルム形成剤またはコーティング剤、香味剤、香料、滑剤(流動増強剤)、滑沢剤、保存剤、印刷用インク、吸着剤、懸濁または分散剤、甘味剤、および水和の水。例示的な賦形剤としては、限定はされないが、次のものが挙げられる:ブチルヒドロキシトルエン(BHT)、炭酸カルシウム、リン酸カルシウム(二塩基性)、ステアリン酸カルシウム、クロスカルメロース、架橋ポリビニルピロリドン、クエン酸、クロスポビドン、システイン、エチルセルロース、ゼラチン、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ラクトース、ステアリン酸マグネシウム、マルチトール、マンニトール、メチオニン、メチルセルロース、メチルパラベン、微晶質セルロース、ポリエチレングリコール、ポリビニルピロリドン、ポビドン、α化デンプン、プロピルパラベン、パルミチン酸レチニル、シェラック、二酸化ケイ素、カルボキシメチルセルロースナトリウム、クエン酸ナトリウム、デンプングリコール酸ナトリウム、ソルビトール、デンプン(トウモロコシ)、ステアリン酸、スクロース、タルク、二酸化チタン、ビタミンA、ビタミンE、ビタミンC、およびキシリトール。
薬学的に許容可能な塩:本開示はまた、本明細書に記載される化合物の薬学的に許容される塩を含む。本明細書で使用されるとき、「薬学的に許容可能な塩」は、開示される化合物の誘導体を指し、ここで、親化合物は、既存の酸または塩基部分からその塩形態(例えば、遊離塩基基を好適な有機酸と反応させることによって)への変換によって修飾される。薬学的に許容可能な塩の例としては、限定はされないが、アミン類などの塩基性残基の鉱酸塩または有機酸塩;カルボン酸などの酸性残基のアルカリ塩または有機塩などが挙げられる。代表的な酸付加塩としては、酢酸塩、酢酸、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、カンファー酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプトン酸塩、ヘキサン酸塩、臭化水素酸塩、塩酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシエタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3-フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが挙げられる。代表的なアルカリまたはアルカリ土類金属塩としては、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなど、ならびに非毒性アンモニウム、第四級アンモニウム、およびアミンカチオン、例えば、限定はされないが、アンモニウム、テトラメチルアンモニウム、テトラエチルアンモニウム、メチルアミン、ジメチルアミン、トリメチルアミン、トリエチルアミン、エチルアミンなどが挙げられる。本開示の薬学的に許容可能な塩には、例えば非毒性無機酸または有機酸から形成される親化合物の従来の非毒性塩が含まれる。本開示の薬学的に許容可能な塩は、従来の化学的方法により塩基または酸部分を含有する親化合物から合成され得る。一般に、かかる塩は、遊離酸または塩基形態のこれらの化合物と、水中または有機溶媒中、またはこれら2つの混合物中(概して、エーテル、酢酸エチル、エタノール、イソプロパノール、またはアセトニトリルなどの非水性媒体が好ましい)にある化学量論量の適切な塩基または酸とを反応させることによって調製することができる。好適な塩の一覧については、「レミントンの薬学科学(Remington’s Pharmaceutical Sciences)」、第17版、マック・パブリッシング・カンパニー(Mack Publishing Company)、ペンシルベニア州イーストン(Easton)、1985年、p.1418、「薬学的塩:特性、選択、および使用(Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use)」、P.H.シュタール(P.H.Stahl)およびC.G.ウェルムス(C.G.Wermuth)編、ワイリー-ブイシーエイチ(Wiley-VCH)、2008年、ならびにベルジュ(Berge)ら、Journal of Pharmaceutical Science,66,1-19、(1977)において見出され、これらの各々は、本明細書においてその全体として参照により援用される。
薬学的に許容可能な溶媒和物:「薬学的に許容可能な溶媒和物」という用語は、本明細書で使用されるとき、好適な溶媒の分子が結晶格子に取り込まれている本発明の化合物を意味する。好適な溶媒は、投与される投薬量で生理学的に忍容可能である。例えば、溶媒和物は、有機溶媒、水、またはこれらの混合物を含む溶液から結晶化、再結晶化、または沈殿によって調製されてもよい。好適な溶媒の例は、エタノール、水(例えば、一水和物、二水和物、および三水和物)、N-メチルピロリジノン(NMP)、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N,N’-ジメチルホルムアミド(DMF)、N,N’-ジメチルアセトアミド(DMAC)、1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン(DMEU)、1,3-ジメチル-3,4,5,6-テトラヒドロ-2-(1H)-ピリミジノン(DMPU)、アセトニトリル(ACN)、プロピレングリコール、酢酸エチル、ベンジルアルコール、2-ピロリドン、安息香酸ベンジルなどである。水が溶媒であるとき、その溶媒和物は「水和物」と称される。
薬物動態:本明細書で使用されるとき、「薬物動態」は、生きている生物に投与される物質の運命の決定に関連する場合、分子または化合物の任意の1つまたは複数の特性を指す。薬物動態は、吸収、分布、代謝、および排出の程度および速度を含む、複数の領域に分割される。これは、一般に、ADMEと称され、ここで、(A)吸収は、物質が血液循環に入るプロセスであり、(D)分布は、体液および身体組織全体への物質の分散または拡散であり、(M)代謝(または生体内変換)は、親化合物の娘代謝物への不可逆的変換であり、(E)排出(または排除)は、身体からの物質の排除を指す。珍しい事例では、一部の薬物は、身体組織に不可逆的に蓄積する。
物理化学的:本明細書で使用されるとき、「物理化学的」とは、物理的および/または化学的な特性を意味するか、またはそれに関連することを意味する。
予防すること:本明細書で使用されるとき、「予防すること」または「予防」という用語は、感染、疾患、障害、および/もしくは病態の発症を部分的もしくは完全に遅延させること;特定の感染、疾患、障害、および/もしくは病態の1つもしくは複数の症状、特徴、もしくは臨床兆候の発症を部分的もしくは完全に遅延させること;特定の感染、疾患、障害、および/もしくは病態の1つもしくは複数の症状、特徴、もしくは兆候の発症を部分的もしくは完全に遅延させること;感染、特定の疾患、障害、および/もしくは病態からの進行を部分的もしくは完全に遅延させること;ならびに/または感染、疾患、障害、および/もしくは病態と関連する病理の発生の危険性を減少させることを指す。
増殖する:本明細書で使用されるとき、「増殖する」という用語は、成長、拡大、もしくは増加すること、または急速な成長、拡大、もしくは増加を引き起こすことを意味する。「増殖性」は、増殖する能力を有することを意味する。「抗増殖性」は、増殖性の特性に対抗するかまたはそれに不適切な特性を有することを意味する。
予防的:本明細書で使用されるとき、「予防的」は、疾患の拡がりを予防するために使用される治療または作用過程を指す。
予防法:本明細書で使用されるとき、「予防法」は、健康を維持し、疾患の拡がりを予防するために取られる措置を指す。
目的のタンパク質:本明細書で使用されるとき、「目的のタンパク質」または「所望されるタンパク質」という用語には、本明細書に提供されるもの、ならびにその断片、突然変異体、変異体、および変更形態が含まれる。
近位:本明細書で使用されるとき、用語「近位」は、中心または目的の地点もしくは領域付近に位置することを意味する。
精製された:本明細書で使用されるとき、「精製する」、「精製された」、「精製」は、実質的に純粋、または望ましくない構成成分、汚染材料、混合物、もしくは不純物を含まないようにすることを意味する。「精製された」は、純粋である状態を指す。「精製」は、純粋にするプロセスを指す。
領域:本明細書で使用されるとき、「領域」という用語は、区域または一般的な範囲を指す。一部の実施形態において、タンパク質またはタンパク質モジュールに言及する場合、領域は、タンパク質もしくはタンパク質モジュールに沿ったアミノ酸の線形配列を含むか、または三次元の範囲、エピトープ、および/またはエピトープのクラスターを含み得る。一部の実施形態において、領域は、末端領域を含む。本明細書で使用されるとき、「末端領域」という用語は、所与の薬剤の端部または末端に位置している領域を指す。タンパク質に言及する場合、末端領域は、N末端および/またはC末端を含み得る。N末端は、遊離アミノ基を有するアミノ酸を含むタンパク質の端部を指す。C末端は、遊離カルボキシル基を有するアミノ酸を含むタンパク質の端部を指す。N末端領域および/またはC末端領域は、したがって、N末端および/またはC末端、ならびに周囲のアミノ酸を含み得る。一部の実施形態において、N末端領域および/またはC末端領域は、約3アミノ酸~約30アミノ酸、約5アミノ酸~約40アミノ酸、約10アミノ酸~約50アミノ酸、約20アミノ酸~約100アミノ酸、および/または少なくとも100アミノ酸を含む。一部の実施形態において、N末端領域は、N末端を含む任意の長さのアミノ酸を含み得るが、C末端は含まない。一部の実施形態において、C末端領域は、C末端を含む任意の長さのアミノ酸を含み得るが、N末端は含まない。
一部の実施形態において、ポリヌクレオチドに言及する場合、領域は、ポリヌクレオチドに沿った核酸の線形配列を含み得るか、または三次元の範囲、二次構造、または三次構造を含み得る。一部の実施形態において、領域は、末端領域を含む。本明細書で使用されるとき、「末端領域」という用語は、所与の薬剤の端部または末端に位置している領域を指す。ポリヌクレオチドに言及する場合、末端領域は、5’末端および/または3’末端を含み得る。5’末端は、遊離リン酸基を有す核酸を含むポリヌクレオチドの端部を指す。3’末端は、遊離ヒドロキシル基を有する核酸を含むポリヌクレオチドの端部を指す。5’領域および3’領域は、したがって、5’末端および3’末端、ならびに周囲の核酸を含み得る。一部の実施形態において、5’末端領域および/または3’末端領域は、約9核酸~約90核酸、約15核酸~約120核酸、約30核酸~約150核酸、約60核酸~約300核酸、および/または少なくとも300核酸を含む。一部の実施形態において、5’領域は、5’末端を含む任意の長さの核酸を含み得るが、3’末端は含まない。一部の実施形態において、3’領域は、3’末端を含む任意の長さの核酸を含み得るが、5’末端は含まない。
RNAまたはRNA分子:本明細書で使用されるとき、用語「RNA」または「RNA分子」または「リボ核酸分子」は、リボヌクレオチドのポリマーを指す;用語「DNA」または「DNA分子」または「デオキシリボ核酸分子」は、デオキシリボヌクレオチドのポリマーを指す。DNAおよびRNAは、例えばそれぞれDNA複製およびDNAの転写により、天然で合成されることもでき;または化学的に合成されることもできる。DNAおよびRNAは、一本鎖(すなわち、それぞれssRNAまたはssDNA)または多重鎖(例えば、二本鎖、すなわち、それぞれdsRNAおよびdsDNA)であり得る。用語「mRNA」または「メッセンジャーRNA」は、本明細書で使用されるとき、1つ以上のポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードする一本鎖RNAを指す。
RNA干渉またはRNAi:本明細書で使用されるとき、用語「RNA干渉」または「RNAi」は、対応するタンパク質コード遺伝子の発現の阻害または干渉または「サイレンシング」をもたらすRNA分子によって媒介される配列特異的調節機構を指す。RNAiは、植物、動物および真菌を含めた多くのタイプの生物で観察されている。RNAiは、細胞において自然に起こり、外来性RNA(例えば、ウイルスRNA)を除去する。天然RNAiは、遊離dsRNAから切断され、分解機構を他の類似のRNA配列に仕向ける断片を介して進行する。RNAiは、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)によって制御され、細胞質において短鎖/低分子dsRNA分子によって開始され、dsRNA分子は触媒RISC成分アルゴノートと相互作用する。dsRNA分子は、細胞へと外因的に導入することができる。外因性dsRNAは、リボヌクレアーゼタンパク質ダイサーを活性化させることによってRNAiを開始させ、ダイサーは、dsRNAに結合してそれを切断することにより、数個の対を成さない突出塩基を各末端に有する21~25塩基対の二本鎖断片を産生する。これらの短鎖二本鎖断片は、低分子干渉RNA(siRNA)と呼ばれる。
試料:本明細書で使用されるとき、用語、「試料」または「生物学的試料」は、その組織、細胞または成分部分(例えば、限定はされないが、血液、粘液、リンパ液、滑液、脳脊髄液、唾液、羊水、羊膜内臍帯血、尿、膣液および精液を含めた体液)のサブセットを指す。試料は、限定はされないが、例えば、血漿、血清、髄液、リンパ液、皮膚の外側区画、呼吸器、腸管、および尿生殖器、涙、唾液、ミルク、血液細胞、腫瘍、臓器を含めた、生物全体またはその組織、細胞もしくは成分部分のサブセットから調製されたホモジネート、ライセートまたは抽出物、またはその画分もしくは部分を更に含み得る。更に、試料は、タンパク質または核酸分子などの細胞成分を含んでもよい栄養ブロスまたはゲルなどの培地を指す。
自己相補性ウイルス粒子:本明細書で使用されるとき、「自己相補性ウイルス粒子」は、タンパク質カプシドおよびカプシド内に封入される自己相補性ゲノムをコードするポリヌクレオチド配列という少なくとも2つの成分から構成される粒子である。
センス鎖:本明細書で使用されるとき、siRNA分子の「センス鎖」または「第2の鎖」または「パッセンジャー鎖」という用語は、アンチセンス鎖または第1の鎖と相補的な鎖を指す。siRNA分子のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ハイブリダイズして二重鎖構造を形成する。本明細書で使用されるとき、「siRNA二重鎖」は、サイレンシングのターゲティングされる遺伝子のmRNAの約10~50ヌクレオチドの一部分に十分な相補性を有するsiRNA鎖、および他のsiRNA鎖と二重鎖を形成するのに十分な相補性を有するsiRNA鎖を含む。
短鎖干渉性RNAまたはsiRNA:本明細書で使用されるとき、用語「短鎖干渉性RNA」、「低分子干渉RNA」または「siRNA」は、RNAiを指図または媒介することが可能な約5~60ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)を含むRNA分子(またはRNA類似体)を指す。好ましくは、siRNA分子は、約15~30ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体、例えば、約16~25ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、約18~23ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、約19~22ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)(例えば、19、20、21または22ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体)、約19~25ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、および約19~24ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)を含む。用語「短鎖」siRNAは、5~23ヌクレオチド、好ましくは21ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、例えば、19、20、21または22ヌクレオチドを含むsiRNAを指す。用語「長鎖」siRNAは、24~60ヌクレオチド、好ましくは約24~25ヌクレオチド、例えば、23、24、25または26ヌクレオチドを含むsiRNAを指す。短鎖siRNAは、一部の例では、19ヌクレオチド未満、例えば、16、17または18ヌクレオチド、またはわずか5ヌクレオチドを含んでもよく、ただし、これらの短いsiRNAはRNAiを媒介する能力を保持しているものとする。同様に、長鎖siRNAは、一部の例では、26ヌクレオチド超、例えば、27、28、29、30、35、40、45、50、55、または更には60ヌクレオチドを含んでもよく、ただし、これらの長いsiRNAは、短鎖siRNAへの更なるプロセシング、例えば酵素的プロセシングがない限りRNAiまたは翻訳抑制を媒介する能力を保持しているものとする。siRNAは、一本鎖RNA分子(ss-siRNA)またはハイブリダイズしてsiRNA二重鎖と呼ばれる二重鎖構造を形成するセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む二本鎖RNA分子(ds-siRNA)であってもよい。
シグナル配列:本明細書で使用されるとき、「シグナル配列」という語句は、タンパク質の輸送または局在化を誘導することができる配列を指す。
単一単位用量:本明細書で使用されるとき、「単一単位用量」は、1用量/1回/単一の経路/単一の接触点、すなわち単一の投与イベントで投与される、任意の治療薬の用量である。一部の実施形態において、単一単位用量は、別個の投薬形態(例えば、錠剤、カプセル、パッチ、充填済みシリンジ、バイアルなど)として提供される。
類似性:本明細書で使用されるとき、「類似性」という用語は、ポリマー分子間、例えば、ポリヌクレオチド分子(例えば、DNA分子および/もしくはRNA分子)間、ならびに/またはポリペプチド分子間の、全般的な関連性を指す。ポリマー分子の互いに対する類似性パーセントの計算は、同一性パーセントの計算と同じ様式で行うことができるが、ただし、類似性パーセントの計算は、当該技術分野において理解されるように、保存的置換を考慮に入れることを除く。
分割用量:本明細書で使用されるとき、「分割用量」は、単一単位用量または総1日用量を2つ以上の用量に分割したものである。
安定:本明細書で使用されるとき、「安定」とは、反応混合物からの有用な程度の純度への単離に耐えるのに十分に堅強であり、好ましくは、有効な治療剤に製剤化することができる、化合物を指す。
安定化された:本明細書で使用されるとき、「安定化する」、「安定化された」、「安定化された領域」という用語は、安定にすることまたは安定になることを意味する。
対象:本明細書で使用されるとき、用語「対象」または「患者」は、例えば実験的、診断的、予防的、および/または治療的目的で本発明に係る組成物を投与し得る任意の生物を指す。典型的な対象としては、動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、非ヒト霊長類、およびヒトなど、哺乳類)および/または植物が挙げられる。
実質的に:本明細書で使用されるとき、「実質的に」という用語は、目的の特徴または特性の完全またはほぼ完全な範囲または程度を示す定性的状態を指す。生物学分野の当業者であれば、生物学的現象および化学的現象が、生じるとしても完全となるおよび/もしくは完全性へと進行するか、または絶対的な結果を達成もしくは回避することがごくわずかであることを理解するであろう。「実質的に」という用語は、したがって、多くの生物学的現象および化学的現象において固有な完全性の欠如の可能性を捉えて、本明細書に使用される。
実質的に同等:本明細書で使用されるとき、用量間の時間的相違に関しての場合、この用語は、プラス/マイナス2%を意味する。
実質的に同時:本明細書で使用されるとき、複数の用量に関しての場合、この用語は、2秒以内を意味する。
罹患している:疾患、障害、および/または病態を「罹患している」個体は、疾患、障害、および/または病態と診断されているか、またはその1つもしくは複数の症状を呈する。
罹り易い:疾患、障害、および/または病態に「罹り易い」個体は、疾患、障害、および/もしくは病態と診断されていない、ならびに/またはその症状を呈さない可能性があるが、疾患またはその症状を発症する傾向を有する。一部の実施形態において、疾患、障害、および/または病態(例えば、がん)に罹り易い個体は、以下のうちの1つまたは複数によって特徴付けることができる:(1)疾患、障害、および/または病態の発症と関連する遺伝子突然変異、(2)疾患、障害、および/または病態の発症と関連する遺伝子多型、(3)疾患、障害、および/または病態と関連するタンパク質および/または核酸の発現および/または活性の増加および/または減少、(4)疾患、障害、および/または病態の発症と関連する習慣および/または生活様式、(5)疾患、障害、および/または病態の家族歴、ならびに(6)疾患、障害、および/または病態と関連する微生物への曝露および/または感染。一部の実施形態において、疾患、障害、および/または病態に罹り易い個体は、疾患、障害、および/または病態を発症するであろう。一部の実施形態において、疾患、障害、および/または病態に罹り易い個体は、疾患、障害、および/または病態を発症しないであろう。
持続放出:本明細書で使用されるとき、「持続放出」という用語は、特定の期間にわたる放出速度に適合する、医薬組成物または化合物の放出プロファイルを指す。
合成:「合成」という用語は、人間の手で生成、調製、および/または製造されることを意味する。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドまたは他の分子の合成は化学的または酵素的であってもよい。
ターゲティング:本明細書で使用されるとき、「ターゲティング」は、標的核酸にハイブリダイズして所望される効果を誘導するであろう核酸配列の設計および選択のプロセスを意味する。
ターゲティングされる細胞:本明細書で使用されるとき、「ターゲティングされる細胞」は、目的とされる任意の1つまたは複数の細胞を指す。細胞は、インビトロ、インビボ、インサイチュ、または生物の組織もしくは臓器において見出され得る。生物は、動物、好ましくは哺乳動物であり得、より好ましくはヒトであり得、最も好ましくは患者であり得る。
治療剤:「治療剤」という用語は、対象に投与されたときに、治療的、診断的、および/もしくは予防的な効果を有する、ならびに/または所望される生物学的効果および/もしくは薬理学的効果を誘起する、任意の薬剤を指す。
治療有効量:本明細書で使用されるとき、「治療有効量」という用語は、送達しようとする薬剤(例えば、核酸、薬物、治療剤、診断剤、予防剤など)が、感染、疾患、障害、および/または病態に罹患しているまたはそれに罹り易い対象に投与されたきに、感染、疾患、障害、および/または病態を治療する、その症状を改善する、それを診断する、予防する、および/またはその発症を遅延させるのに十分である、その薬剤の量を意味する。一部の実施形態において、治療有効量は、単一の用量で提供される。一部の実施形態において、治療有効量は、複数の用量を含む投薬レジメンにおいて投与される。当業者であれば、一部の実施形態において、単位剤形は、それがかかる投薬レジメンの一部として投与される場合に有効である量を含む場合、特定の薬剤または実体の治療有効量を含むと考えることができることを理解するであろう。
治療有効予後:本明細書で使用されるとき、「治療有効予後」という用語は、感染、疾患、障害、および/または病態を罹患しているかまたはそれに罹り易い対象において、感染、疾患、障害、および/または病態を治療する、その症状を改善する、それを診断する、予防する、および/またはその発症を遅延させるのに十分である予後を意味する。
総1日用量:本明細書で使用されるとき、「総1日用量」は、24時間に与えられるまたは処方される量である。これは単一単位用量として投与されてもよい。
トランスフェクション:本明細書で使用されるとき、「トランスフェクション」という用語は、外因性核酸を細胞に導入する方法を指す。トランスフェクション方法としては、限定はされないが、化学的方法、物理的処理、およびカチオン性脂質または混合が挙げられる。
治療すること:本明細書で使用されるとき、「治療すること」という用語は、特定の感染、疾患、障害、および/または病態の1つまたは複数の症状または特徴を、部分的または完全に軽減する、改善する(ameliorating)、改善する(improving)、緩和する、その発症を遅延する、その進行を阻害する、その重症度を低減させる、および/またはその発生を低減することを指す。例えば、がんを「治療すること」は、腫瘍の生存、成長、および/または拡がりを阻害することを指し得る。治療は、疾患、障害、および/または状態と関連する病理の発生の危険性を減少させる目的で、疾患、障害、および/もしくは病態の兆候を示していない対象、または疾患、障害、および/もしくは病態の初期兆候のみを示している対象に、投与されてもよい。
未修飾:本明細書で使用されるとき、「未修飾」は、任意の手段で変化される前の任意の物質、化合物、または分子を指す。未修飾は、野生型または天然の形態の生体分子を指す場合があるが、必ずしもそうとは限らない。分子は、一連の修飾を受けてもよく、その場合、各々の修飾された分子は、後続の修飾の「未修飾」出発分子としての機能を果たし得る。
ベクター:本明細書で使用されるとき、「ベクター」は、異種分子を輸送する、形質導入する、またはその他担体として働く、任意の分子または部分である。本発明のベクターは、組換えにより産生されてもよく、アデノ随伴ウイルス(AAV)親または参照配列に基づいてもよく、および/またはそれらを含んでもよい。かかる親または参照AAV配列は、ベクターを操作するための元の、第2の、第3の、またはそれ以降の配列として働き得る。非限定的な例において、かかる親または参照AAV配列は、以下の配列のうちのいずれか1つまたは複数を含み得る:野生型であってもよいかまたは野生型から修飾されていてもよく、タンパク質、タンパク質ドメイン、またはタンパク質の1つまたは複数のサブセットの全長または部分的な配列をコードし得る、ポリペプチドまたはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列;野生型であってもよいかまたは野生型から修飾されていてもよい、調節性または制御性核酸を含む、ポリヌクレオチド;ならびに野生型配列から修飾されていてもよくまたは修飾されていなくてもよい、トランス遺伝子。これらのAAV配列は、1つもしくは複数のコドン(核酸レベルで)もしくはアミノ酸(ポリペプチドレベルで)の「ドナー」配列、または1つもしくは複数のコドン(核酸レベルで)もしくはアミノ酸(ポリペプチドレベルで)の「アクセプター」配列のいずれかとして働き得る。
ウイルスゲノム:本明細書で使用されるとき、「ウイルスゲノム」または「ベクターゲノム」は、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)および少なくとも1つのコード化ペイロードを含むポリヌクレオチドである。ウイルスゲノムは、少なくとも1コピーのペイロードをコードする。
VII.実施例
実施例1.AAV粒子の産生および精製
本明細書に記載されるAAV粒子は、例えば、三重トランスフェクションまたはバキュロウイルス媒介性ウイルス産生など、当該技術分野で公知の方法を使用して産生することができる。当該技術分野で公知の任意の好適な許容細胞またはパッケージング細胞を使用して、ベクターを産生することができる。哺乳類細胞が好ましいことが多い。複製欠損ヘルパーウイルスから欠失された機能を提供するトランス相補性パッケージング細胞株、例えば293細胞または他のE1aトランス相補性細胞も好ましい。
遺伝子カセットは、パルボウイルス(例えばAAV)capおよびrep遺伝子の一部または全てを含有してもよい。しかしながら、好ましくは、capおよびrep機能の一部または全ては、カプシドおよび/またはRepタンパク質をコードするパッケージングベクターを細胞へと導入することによってトランスで提供される。最も好ましくは、遺伝子カセットは、カプシドまたはRepタンパク質をコードしない。あるいは、capおよび/またはrep遺伝子を発現するように安定的に形質転換されるパッケージング細胞株が使用される。
一部の場合において、組換えAAVウイルス粒子は、米国特許出願公開第20160032254号明細書(この内容は参照により援用される)に記載のとおりの手順に従って産生し、培養上清から精製する。産生には、293T細胞、sf9昆虫細胞、三重トランスフェクションまたは任意の好適な産生方法を使用するものを含めた、当該技術分野で公知の方法もまた関与してよい。
一部の場合において、AAVの産生に必要なプラスミド、つまりAAV2 rep、アデノウイルスヘルパーコンストラクト、およびITRフランキングトランス遺伝子カセットを用いてCaPO4により、293細胞をトランスフェクトする。AAV2 repプラスミドは、研究されている特定のウイルスのcap配列も含有する。血清含有DMEM中で生じるトランスフェクションの24時間後、培地を、血清を有するかまたは有していない新鮮な培地と取り替える。トランスフェクションの3(三)日後、293接着細胞の培養培地から試料を採取する。続いて、細胞をこすり取り、容器に移す。遠心分離して細胞ペレットを取り出した後、こすり取った後の上清から第2の試料を採取する。次に、3回の連続凍結-解凍サイクル(-80Cから37C)によって細胞溶解を達成する。細胞残屑を除去し、培地から試料3を採取する。試料を、Taqman(商標)PCRによるDNase耐性ゲノム滴定によってAAV粒子について定量化する。かかるトランスフェクションの総産生収率は、試料3の粒子濃度と等しい。
AAV粒子力価を、ゲノムコピー数(1ミリリットル当たりのゲノム粒子)により測定する。ゲノム粒子濃度は、以前に報告されている通り、ベクターDNAのTaqman(登録商標)PCRに基づく(クラーク(Clark)ら著、(1999年)、ヒューマン・ジーン・セラピー(Hum. Gene Ther.)、第10巻:p.1031~1039;フェルトワイ(Veldwijk)ら著、(2002年)、モレキュラー・セラピー(Mol. Ther.)、第6巻:p.272~278)。
実施例2.組織特異的発現
組織における種々のコード化ペイロードの発現を評価するために、遍在性および組織特異的プロモータのパネルによってドライブされるコード化配列を有する一連のAAV粒子を製作する。これらの粒子を、特定の組織に対して、例えば適切な経路、例えば単回静脈内注射により全身性投与し、発現をモニターして、この標的組織におけるペイロードならびに各プロモータの相対的発現能力を決定する。標準的技法を使用して、例えばELISAによって、ペイロード産生の測定を実施する。
一部の場合において、サイトメガロウイルス最初期プロモータ(CMV)、キメラニワトリ-ベータ-アクチン(CAG)、およびユビキチンC(UBC)、CBA、H1、αMHC、cTnT、およびCMV-MLC2kプロモータは、堅強な発現を提供する。
実施例3.VOY101-GFPベクターによる静脈内処置後のインビボマウス生体内分布および発現レベル
アデノ随伴カプシド変異体(VOY101)を、脳および心臓への広範な遺伝子移入のために操作した。AAV2野生型末端逆位配列(ITR)、CMVエンハンサーおよびニワトリ-ベータ-アクチンプロモータ(CBA)で構成される合成プロモータ、高感度緑色蛍光タンパク質変異体(eGFP)およびウサギグロビンポリアデニル化配列を含むウイルスゲノムを使用して、HEK293T細胞への三重トランスフェクションによって、VOY101またはAAV9のいずれかのカプシド血清型を有するAAV粒子を生成した。ウイルスゲノムのITR~ITRの配列は、配列番号1799として提供される。
一本鎖AAV粒子を精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化し、その後約4ml/kgを6~7週齢の成体C57Bl/6Jマウスに側尾静脈注射で投与した。ベクター濃度は5.0×1012vg/mLだった。総用量は、2.0×1013VG/kgだった。対照群を、媒体(0.001%F-68含有PBS)で処置した。
投与のおよそ28日後、幾つかの組織試料を収集した。GFPタンパク質定量化またはベクターゲノム定量化のために割り当てた組織試料を、液体窒素で瞬間凍結した。抗GFP免疫組織化学法のために割り当てた組織試料を、4%パラホルムアルデヒドで一晩後固定した。抗GFP抗体での免疫組織化学的染色およびその後のDAB基質発色による組織試料の分析は、VOY101-GFP粒子による全身性注射が、投与したAAV9-GFP粒子と比較して脳および脊髄の全体にわたってGFPレベルの増加をもたらしたことを示した。
GFPタンパク質レベルをELISAで測定し、ng GFP/総タンパク質mgで報告した。結果は表13に示される。ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、CBAプロモータのCMVエンハンサー領域に対するプローブセットを使用して実施し、宿主TFRC(トランスフェリンレセプタータンパク質1)に対して正規化し、1二倍体細胞当たりのベクターゲノム(VG/DC)で表した。結果は表14および表15に示される。表13、表14および表15において、「BLLQ」は、定量化の下限未満であることを意味する。
マウス線条体では、2.0×10
13VG/kgの静脈内注射の28日後、VOY101-GFPは、AAV9-GFPよりも、58倍高いGFPレベルおよび101倍高いベクターゲノム分布をもたらした。マウス脊髄では、2.0×10
13VG/kgの静脈内注射の28日後、VOY101-GFPは、AAV9-GFPよりも、74倍高いGFPレベルおよび104倍高いベクターゲノム分布をもたらした。マウス肝臓では、2.0×10
13VG/kgの静脈内注射の28日後、VOY101-GFPは、AAV9-GFPよりも、4.9倍低いGFPレベルおよび5.4倍少ないベクターゲノム分布をもたらした。
実施例4.VOY101-FXN AAV粒子の静脈内送達
A. VOY101-FXN AAV粒子による静脈内処置後のインビボマウス生体内分布および発現レベル
マカカ・ファシキュラリス(macaca fascicularis)(カニクイザル)フラタキシン(cFXN)トランス遺伝子を有するウイルスゲノムを使用した場合も、脳および心臓への広範な遺伝子移入が観察された。AAV2野生型ITR、CMVエンハンサーおよびニワトリ-ベータ-アクチンプロモータ(CBA)で構成される合成プロモータ、マカカ・ファシキュラリスフラタキシン(cFXN)およびヒト成長ホルモンポリアデニル化配列を含むウイルスゲノムを使用し、HEK293T細胞への三重トランスフェクションによって、VOY101またはAAV9のいずれかのカプシド血清型を有するAAV粒子を生成した。ウイルスゲノムのITR~ITRの配列は、配列番号1801として提供される。
一本鎖AAV粒子を精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化し、その後約4ml/kgを9週齢の成体C57Bl/6Jマウスに側尾静脈注射で投与した。ベクター濃度は1.0×1012vg/mLだった。総用量は4.2×1012VG/kgだった。対照群を、媒体(0.001%F-68含有PBS)で処置した。
AAV粒子または媒体投与の7日後、幾つかの組織試料を収集した。組織試料を液体窒素で瞬間凍結した。ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、CBAプロモータのCMVエンハンサー領域に対するプローブセットを使用して実施し、宿主TFRCに対して正規化し、1二倍体細胞当たりのベクターゲノム(VG/DC)で表した。cFXNタンパク質レベルをELISAで測定し、ng cFXN/総タンパク質mgで報告した。cFXNタンパク質レベルおよびベクターゲノム分布は、表16および表17に示される。表16および表17において、「BLLQ」は、定量化の下限未満であること意味する。
マウス皮質では、4.2×10
12VG/kgの静脈内注射の7日後、VOY101-cFXNは、AAV9-cFXNよりも165倍高いベクターゲノムおよびAAV9-cFXNよりも少なくとも234倍高いcFXNタンパク質発現をもたらした。マウス腰部脊髄では、4.2×10
12VG/kgの静脈内注射の7日後、VOY101-cFXNは、AAV9-cFXNよりも336倍高いベクターゲノムおよび少なくとも640倍高いcFXNタンパク質発現をもたらした。
後根神経節では、4.2×1012VG/kgの静脈内注射の7日後、VOY101-cFXNは、AAV9-cFXNよりも11.8倍高いベクターゲノムおよび112倍高いcFXNタンパク質発現をもたらした。三叉神経節では、4.2×1012VG/kgの静脈内注射の7日後、VOY101-cFXNは、AAV9-cFXNよりも61倍高いベクターゲノムおよび少なくとも16倍高いcFXNタンパク質発現をもたらした。
心臓では、4.2×1012VG/kgの静脈内注射の7日後、VOY101-cFXNは、AAV9-cFXNよりも2.7倍高いベクターゲノムおよび9.4倍高いcFXNタンパク質発現をもたらし、AAV9と比較して著しくより高い発現を示した。
B. VOY101-FXN-HA AAV粒子による処置後の非ヒト霊長類におけるcFXN発現のインビボ研究
カニクイザル(マカカ・ファシキュラリス)で研究を実施し、VOY101-cFXN-HAのIV投薬後のCNS内のcFXN発現を評価した。
HAタグ付きカニクイザルフラタキシン(cFXN-HA)を含むウイルスゲノムを、一本鎖発現ベクターへと操作した。AAV2野生型ITR、CMVエンハンサーおよびニワトリ-ベータ-アクチンプロモータ(CBA)で構成される合成プロモータ、HAタグの3’配列を有するマカカ・ファシキュラリスフラタキシン(cFXN)およびヒト成長ホルモンポリアデニル化配列を含むウイルスゲノムを使用し、HEK293T細胞への三重トランスフェクションによって、VOY101のカプシド血清型を有するAAV粒子を生成した。ウイルスゲノムのITR~ITRの配列は、配列番号1801として提供される。
一本鎖AAV粒子(VOY101-cFXN-HA)を精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化し、その後、5ml/kgを伏在静脈注射により非ヒト霊長類(マカカ・ファシキュラリス)に投与した。ベクター濃度は1.34×1012vg/mLであり、総用量は6.7×1012VG/kgだった。加えて、CBAプロモータと、cFXN-HA(AAV9-cFXN-HA)を含むウイルスゲノムとを有する一本鎖AAV9を、2×1013VG/kgの用量での静脈内注射によって試験した。
AAV粒子投与のおよそ28日後、幾つかの組織試料を収集した。cFXN-HAタンパク質定量化またはベクターゲノム定量化のために割り当てた組織試料を、瞬間凍結した。抗HA免疫組織化学法のために割り当てた組織試料を、2~8℃にて12~72時間4%パラホルムアルデヒドで後固定した。組織切片(20μm厚)を、HAタグに対するウサギモノクローナル抗体(1:1000または1:2000)で、その後ヤギ抗ウサギIgGビオチン化二次抗体(1:1000)で染色し、その後DAB+ニッケルで発色させた。VOY101-cFXNのIV投薬後に、複数のCNS領域でcFXN-HA染色が観察された。これらの領域としては、限定はされないが、脊髄(頚部区画、胸部区画および腰部区画)、脳幹核、小脳(小脳歯状核を含む)、視床、尾状核、および大脳皮質が挙げられる。6.7×1012VG/kgのVOY101-cFXN-HAのIV投薬後に、脊髄の吻側-尾側範囲全体に沿って、特に前角運動ニューロンで、均質なHA染色が観察された。脊髄および特に前角運動ニューロンは、VOY101-cFXN-HAの用量が3分の1とより低いにも関わらず、AAV9-cFXN-HAよりもVOY101-cFXN-HAで非常により大きな範囲で標識された。媒体処置対照非ヒト霊長類は、検出可能なバックグラウンド染色を本質的に示さなかった。
IV VOY101-cFXN-HA(6.7×1012VG/kg)後の運動ニューロンを含めた腰部前角におけるHA染色は、類似用量の一本鎖rh10ベクターとcFXN-HAとを含むウイルスゲノム(AAVrh10-FXN-HA)のIT投与と比較して類似していた。
ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、CBAプロモータのCMVエンハンサー領域に対するプローブセットを使用して実施し、宿主RnasePに対して正規化し、1二倍体細胞当たりのベクターゲノム(VG/DC)で表した。cFXN-HAタンパク質レベルをELISAで測定した。cFXN-HAタンパク質レベル(ng cFXN-HA/総タンパク質mg)およびベクターゲノム分布(VG/DC)は、表18に示される。表18において、「BLLQ」は、定量化の下限未満であること意味し、「NA」は、分析されなかったことを意味する。
これらの結果は、6.7×10
12VG/kgの静脈内注射の28日後の非ヒト霊長類(NHP)では、VOY101-cFXN-HAが、脳形質導入をもたらしたことを示す。有意レベルのcFXN-HAタンパク質が、脊髄(頚部区画、胸部区画および腰部区画)および脳幹を含めた多くのCNS領域で検出された。IV投薬後、有意レベルのベクターゲノムが、脊髄(頚部区画、胸部区画および腰部区画)、脳幹、および皮質を含めた多くのCNS領域で検出された。
C. PHP.B-FXN-HA AAV粒子による処置後の非ヒト霊長類におけるcFXN発現のインビボ生体内分布および発現レベル
カニクイザル(マカカ・ファシキュラリス)で用量応答研究を実施し、PHP.B-cFXN-HAのIV投薬後のCNS内のcFXN発現を評価した。
HAタグ付きカニクイザルフラタキシン(cFXN-HA)を含むウイルスゲノムを、一本鎖発現ベクターへと操作した。AAV2野生型ITR、CMVエンハンサーおよびニワトリ-ベータ-アクチンプロモータ(CBA)で構成される合成プロモータ、HAタグの3’配列を有するマカカ・ファシキュラリスフラタキシン(cFXN)、miR-122標的配列の三重反復(トランス遺伝子肝臓発現を低減するため)、およびヒト成長ホルモンポリアデニル化配列を含むウイルスゲノムを使用し、HEK293T細胞への三重トランスフェクションによって、PHP.Bのカプシド血清型を有するAAV粒子を生成した。ウイルスゲノムのITR~ITRの配列は、配列番号1802として提供される。
一本鎖AAV粒子を精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化し、その後、5ml/kgを伏在静脈注射により非ヒト霊長類(マカカ・ファシキュラリス)に投与した。ベクター濃度は1.54×1011~4.75×1012vg/mLだった。動物には、6.32×1011、2.0×1012、または2.0×1013VG/kgで投薬した。
AAV粒子投与のおよそ28日後、幾つかの組織試料を収集した。cFXN-HAタンパク質定量化またはベクターゲノム定量化のために割り当てた組織試料を、瞬間凍結した。抗HA免疫組織化学法のために割り当てた組織試料を、2~8℃にて12~72時間4%パラホルムアルデヒドで後固定した。単一標識の場合、組織切片(20μm厚)を、HAタグに対するウサギモノクローナル抗体(1:1000または1:2000)で、その後ヤギ抗ウサギIgGビオチン化二次抗体(1:1000)で染色し、その後DAB+ニッケルで発色させた。2×1013vg/kgのPHP.B-cFXN-HAのIV投薬後、HA染色が複数のCNS領域で観察された。これらの領域としては、限定はされないが、脊髄(頚部区画、胸部区画および腰部区画)、小脳(歯状核を含む)、視床、黒質、線条体、ならびに感覚皮質および運動皮質が挙げられる。更に、HA染色は、黒質、歯状核および視床におけるニューロン形態のものを含めた、複数のCNS領域に多数のニューロンの形質導入を示した。加えて、脊髄、運動皮質および感覚皮質、ならびに線条体におけるニューロン形態の細胞は、HA免疫反応性だった。
HAタグおよびニューロンマーカーNeuNの二重標識を、発色法を使用して実施した。組織切片(20μm厚)を、HAタグに対するウサギモノクローナル抗体(1:1000)で、その後ヤギ抗ウサギIgGビオチン化二次抗体(1:1000)で染色し、その後DABで発色させた(ニッケルを用いずに)。その後、切片を、NeuNに対するマウスモノクローナル第2の一次抗体(mouse monoclonal to NeuN second primary antibody)で、その後ヤギ抗マウスIgGビオチン化二次抗体で染色した。その後、NeuNシグナルを緑色クロモゲンで検出した。複数のHA+細胞を、ニューロンマーカーNeuNで二重標識した。これらの結果は、2×1013VG/kgのPHP.B-cFXN-HAの静脈内注射後、小脳歯状核のニューロンがHAタグで標識されたことを示す。したがって、カニクイザルへの2×1013vg/kgの静脈内用量後、小脳歯状核のニューロンが形質導入され、トランス遺伝子が発現される。
腰部後根神経節でのHAタグの発現は、大型(>40um)および小型感覚ニューロンの両方に存在し、標識は、6.32×1011、2.0×1012、または2.0×1013VG/kgのPHP.B-cFXN-HAのIV注射と共に用量依存的様式で増加した。
ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、CBAプロモータのCMVエンハンサー領域に対するプローブセットを使用して実施し、宿主RnasePに対して正規化し、1二倍体細胞当たりのベクターゲノム(VG/DC)で表した。cFXN-HAタンパク質レベルをELISAで測定した。PHP.Bカプシド血清型のcFXN-HAタンパク質レベル(ng cFXN-HA/総タンパク質mg)およびベクターゲノム分布(VG/DC)は、表19に示される。表19において、「BLLQ」は、定量化の下限未満であることを意味し、「NA」は、分析しなかったことを意味する。
要約すると、PHP.B-cFXN-HAの静脈内注射の28日後の非ヒト霊長類(NHP)では、3つの用量レベル全てが脳形質導入をもたらした。有意レベルのcFXN-HAタンパク質が、脊髄(頚部区画、胸部区画および腰部区画)、脳幹、および小脳を含めた、多くのCNS領域で検出された。IV投薬後、有意レベルのベクターゲノムが、脊髄(頚部区画、胸部区画および腰部区画)、線条体、脳幹、小脳、および前頭皮質を含めた、多くのCNS領域で検出された。脊髄、脳幹、感覚皮質、運動皮質、小脳、視床、および黒質などの領域を含めた、NHP CNSへの実質的な遺伝子移入が観察され、これらの領域におけるニューロン形態の細胞はトランス遺伝子発現を示した。加えて、後根神経節および心臓は、用量依存的なトランス遺伝子発現を示し、後根神経節の感覚ニューロンは形質導入を示した。
D. VOY101-FXN-HA AAV粒子による処置後の非ヒト霊長類におけるcFXN発現のインビボ用量依存研究
カニクイザル(マカカ・ファシキュラリス)で研究を実施し、一本鎖VOY101-cFXN-HAの2つの異なるIV用量レベル後のCNS内のcFXN発現を評価した。
HAタグ付きカニクイザルフラタキシン(cFXN-HA)を含むウイルスゲノムを、一本鎖発現ベクターへと操作した。AAV2野生型ITR、CMVエンハンサーおよびニワトリ-ベータ-アクチンプロモータ(CBA)で構成される合成プロモータ、HAタグの3’配列を有するマカカ・ファシキュラリスフラタキシン(cFXN)およびヒト成長ホルモンポリアデニル化配列を含むウイルスゲノムを使用して、VOY101のカプシド血清型を有するAAV粒子を生成した。ウイルスゲノムのITR~ITRの配列は、配列番号1801に提供される。
一本鎖AAV粒子を精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化し、その後、5ml/kgを伏在静脈注射により非ヒト霊長類(マカカ・ファシキュラリス)に投与した。総用量は6.7×1012VG/Kgまたは4.9×1013VG/KgのVOY101-cFXN-HAだった。媒体陰性対照群も評価した。
AAV粒子投与のおよそ28日後、幾つかの組織試料を収集した。cFXN-HAタンパク質定量化またはベクターゲノム定量化のために割り当てた組織試料を、瞬間凍結した。抗HA免疫組織化学法のために割り当てた組織試料を、2~8℃にて12~72時間4%パラホルムアルデヒドで後固定した。組織切片(20μm厚)を、HAタグに対するウサギモノクローナル抗体(1:1000または1:2000)で、その後ヤギ抗ウサギIgGビオチン化二次抗体(1:1000)で染色し、その後DAB+ニッケルで発色させた。
ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、CBAプロモータのCMVエンハンサー領域に対するプローブセットを使用して実施し、宿主TFRCに対して正規化し、1細胞当たりのベクターゲノム(VG/細胞)で表した。VOY101-cFXN-HAのベクターゲノム分布(平均+標準偏差)は、表20に示される。表20において、SC-Cは頚部脊髄であり、SC-Lは腰部脊髄である。
VOY101-cFXN-HAのIV投薬後、脊髄の吻側尾部範囲全体に沿って、特に前角運動ニューロンで、均質なHA染色が観察された。4.9×10
13VG/kgの用量のVOY101-cFXN-HAを受けている動物の頚部(C5)、胸部(T12)および腰部(L4)脊髄におけるHA染色は、脊髄の全て吻側-尾側レベルでの、特に前角運動ニューロンでの堅強なHA染色を明らかにした(図5)。運動皮質における、オリーブ核、海馬、黒質、および外側膝状核を含めた脳幹における、ならびに歯状核を含めた深部小脳核におけるニューロン形態のものを含めた数多くのHA+細胞が、4.9×10
13VG/kgの用量のVOY101-cFXN-HAを受けている動物で観察された。媒体処置対照は、本質的に検出可能でないかまたは非常に低いバックグラウンド染色を示した。
実施例5.フリードライヒ運動失調症を治療するためのVOY101-FXN
A. フリードライヒ運動失調症のマウスモデルにおけるVOY101-FXNの静脈内投薬によるインビボ分布、発現および有効性研究
ヒトフラタキシンをコードする核酸を含む選択されたウイルスゲノムを設計し、一本鎖VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ(CMVieエンハンサー、CBAもしくはCMV、またはフラタキシンプロモータ、またはトランケート型CBAプロモータもしくはトランケート型CMVプロモータ、およびヒトベータグロビンイントロンを含む)、hFXN cDNA配列、ヒト成長ホルモンポリA配列、スタッファー配列としてのヒトアルブミンの断片、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化した。
7週齢であり、性別および同腹仔のバランスがとれたおよそ10匹マウス/群の6群は、媒体(0.001%F-68含有PBS;2群)、または低(2群)または高用量(2群)レベル(およそ6.3×1012vg/kg~2×1013vg/kg体重)のいずれかのVOY101-FXNベクターを静脈内注射により受ける。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、マウスにおけるVOY101-FXNの有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、四肢筋電図検査、ノッチ付きバー歩行試験(notched bar walking test)、ストリングハンギング試験(string hanging test)、ロータロッド試験、体重、および/または生存が挙げられる。他の読出しとしては、ELISA、PCR、免疫組織化学法およびインサイツハイブリダイゼーションによる組織(例えば、後根神経節、心臓、小脳、脊髄)でのFXNタンパク質およびmRNA発現、ならびに組織(後根神経節)切片におけるミトコンドリア酵素機能のインサイツ評価が挙げられる。様々な組織におけるベクターゲノムレベルを、PCRおよびISHで決定する。
3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、18週までに安楽死させる。残り3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、生存に対する効果を評価するために6ヵ月以上維持する。対照群(n=10/群)は、参照ベクターを投薬した野生型マウスおよび疾患モデルマウスを含む。
限定はされないが、hFXNベクターを受けている動物のDRG、小脳、脊髄および心臓などの標的組織におけるヒトフラタキシン(hFXN)の分布および発現ならびにベクターゲノム分布を、hFXN発現についてはELISA、PCR、ISH、IHCによって、ベクターゲノム分析についてはPCRおよびISHによって測定する。ヒトフラタキシン分析(ELISA、PCR、ISH、IHCによる)は、hFXNベクターが送達されると、標的組織、例えば、DRG、小脳、脊髄および心臓での発現が、標的組織への分布と共に生じることを示す。ミトコンドリア酵素活性のインサイツ評価は、hFXNベクターが送達されると、DRGの切片にて活性増加が生じることを示す。筋電図検査、ノッチ付きバー試験、ストリングハンギング試験およびロータロッド試験は、媒体対照動物よりも能力が改善していることを示す。
B. VOY101-FXNの静脈内投与による非ヒト霊長類におけるインビボ分布および発現研究
ヒトフラタキシンをコードする核酸を含む選択されたウイルスゲノムを設計し、一本鎖(ss)VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでの一本鎖ウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ(prooter)(CMVieエンハンサー、CBAもしくはCMV、またはフラタキシンプロモータ、またはトランケート型CBAプロモータもしくはトランケート型CMVプロモータ、およびヒトベータグロビンイントロンを含む)、hFXN cDNA配列、ヒト成長ホルモンポリA配列、スタッファー配列としてのヒトアルブミンの断片、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化した。
およそ3歳以上であり、1群当たり少なくとも1匹の各性別の動物を有するおよそ3匹のカニクイザル/群の8群は、媒体(0.001%F-68含有PBS;2群)または低(2群)もしくは高用量(2群)レベル(およそ6.7×1012vg/kg~6×1013vg/kg体重)のいずれかのVOY101-FXNベクターを静脈内注射により受ける。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおけるVOY101-FXNの有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、経時的な体重の測定、臨床モニタリング、組織病理学および血液安全性パネル試験(blood safety panel testing)が挙げられる。他の読出しとしては、ELISA、PCR、免疫組織化学法およびインサイツハイブリダイゼーションにより評価される、組織(例えば、後根神経節、心臓、小脳、脊髄)でのFXNタンパク質およびmRNA発現が挙げられる。様々な組織におけるベクターゲノムレベルを、PCRおよびISHで決定する。
3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、4週までに安楽死させる。残り3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、長期遺伝子発現を評価するために12週間維持する。
限定はされないが、hFXNベクターを受けている動物のDRG、小脳、脊髄および心臓などの標的組織におけるヒトフラタキシン(hFXN)の分布および発現ならびにベクターゲノム分布を、hFXN発現についてはELISA、PCR、ISH、IHCによって、ベクターゲノム分析についてはPCRおよびISHによって測定する。霊長類フラタキシン発現データを、フリードライヒ運動失調症の遺伝子マウスモデルでのFA疾患表現型のレスキューをもたらしたフラタキシン発現レベルと比較する。これらの結果に基づいて、臨床治験のための有効用量を計算する。
実施例6.アルツハイマー病を治療するためのVOY101-APOE miRNA
A. アルツハイマー病のマウスモデルにおけるscVOY101-APOE mRNAの静脈内投薬のインビボ分布、発現および有効性研究
APOEを標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有するpri-miRNAカセットを含む選択されたウイルスゲノムを、自己相補的(sc)VOY101-miRNA発現ベクターへと操作する。
ITRからITRまでのscAAV-miRNAウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、ApoEを標的とするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ポリA配列、スタッファー配列、ならびに野生型ITRを含む。
ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
2ヵ月齢の3群のP301S突然変異体タウマウス、およそ20匹マウス/群に、媒体(0.001%F-68含有PBS)、または高もしくは低用量レベル(およそ4×1012vg/kg~4×1013vg/kg)のいずれかのVOY101-APOE miRNAを静脈内尾静脈注射により投与する。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、マウスでのVOY101-APOE miRNAの有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、体重、qRT-PCRによって測定されるAPOE mRNAの発現、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価されるAPOEタンパク質の発現、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価されるアミロイド-ベータ病理のレベル、免疫組織化学法によって評価される神経変性のレベル、およびデジタル液滴PCRによって測定されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。
動物は全て、体重および生存について評価する。APOE mRNA発現、タウおよび/またはアミロイド病理、ならびに神経変性について脳、脊髄、および肝臓試料を評価するために、動物をおよそ11ヵ月齢で安楽死させる。
PCRデータは、静脈内VOY101-APOE miRNAベクターを受ける動物の脳全体にわたるベクターゲノムの送達を示すだろう。発現データは、ベクターを受ける動物の脳全体にわたるAPOEタンパク質およびmRNAの広範な低減を示すはずである。有意なAPOE低減を示す脳領域は、嗅内皮質、海馬、および皮質を含めた、タウオパシー関連疾患に重要なものであるはずである。ベクターを受ける群は、病理学的アミロイド-ベータおよび神経変性の強力な低減を示す可能性が高いだろう。
B. scVOY101-APOE miRNAの静脈内投薬後の非ヒト霊長類におけるAPOEのインビボ分布および発現研究
APOEを標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有するpri-miRNAカセットを含む選択されたウイルスゲノムを、自己相補的(sc)VOY101-miRNA発現ベクターへと操作する。
ITRからITRまでのscAAV-miRNAウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、ApoEを標的とするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ポリA配列、スタッファー配列、ならびに野生型ITRを含む。
ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
3群の非ヒト霊長類(NHP)(AAV中和抗体について事前スクリーニングされた成体雄カニクイザルマカク(Cynomolgus macaque))に、scVOY101-ApoE miRNAベクターを投与する。1群は媒体のみの対照である。NHPに、高または低用量レベル(およそ4×1012vg/kg~4×1013vg/kg)のいずれかを静脈内送達を使用して投与する。投与の4週間後、生理食塩水灌流を実施し、脳を3mm冠状ブロックへと切片化し、瞬間凍結する。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおけるVOY101-APOE miRNAの有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、qRT-PCRによるAPOE mRNAの発現、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価されるタウタンパク質の発現、ならびにデジタル液滴PCRによって評価されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。
有意なAPOE低減を示す脳領域は、嗅内皮質、海馬、および皮質を含めた、タウオパシー関連疾患に重要な区域をカバーすることが予想されるだろう。発現データと一致して、PCRは、脳にわたるベクターゲノムの広範な分布を示す可能性が高いだろう。
実施例7.アルツハイマー病および他のタウオパシーを治療するためのVOY101-APOE2
A. アルツハイマー病および他のタウオパシーのマウスモデルにおけるVOY101-APOE2の静脈内投薬のインビボ分布、発現および有効性研究
ヒトAPOE2をコードする核酸(アポリポタンパク質E2対立遺伝子)を、AAVウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドにパッケージングする。
AAV-APOE2ウイルスゲノムは、ITRからITRまで5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、ヒトAPOE2をコードする核酸、ポリA配列、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-APOE2粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
9ヵ月齢の3群のAPP.PS1-21/TRE4マウス、およそ20匹マウス/群に、媒体(0.001%F-68含有PBS)、または高もしくは低用量レベル(およそ4×1012vg/kg~4×1013vg/kg)のいずれかのVOY101-APOE2を静脈内尾静脈注射により投与する。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、マウスにおけるVOY101-APOE2の有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、体重、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価されるAPOE2の発現、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価されるアミロイド-ベータ病理のレベル、免疫組織化学法によって評価される神経変性のレベル、ならびにデジタル液滴PCRによって評価されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。
動物は全て、体重および生存について評価する。APOE2発現、アミロイドおよび/またはタウ病理、ならびに神経変性について脳、脊髄、および肝臓試料を評価するために、動物をおよそ11ヵ月齢で安楽死させる。
静脈内VOY101-APOE2を受ける動物の脳にわたるベクターゲノムの分布を、PCRによって分析する。発現データは、VOY101-APOE2ベクターを受ける動物の脳全体にわたる広範なAPOE2の発現を示す可能性が高いだろう。有意なAPOE2発現を示す脳領域は、嗅内皮質、海馬、および皮質を含めた、タウオパシー関連疾患に重要な区域をカバーする可能性が高いだろう。VOY101-APOE2ベクターを受ける群は、病理学的アミロイド-ベータおよび/またはタウならびに神経変性の強力な低減を示すはずである。
B. 非ヒト霊長類におけるVOY101-APOE2の静脈内投薬のインビボ分布および発現研究
ヒトAPOE2をコードする核酸配列(アポリポタンパク質E2対立遺伝子)を、AAVウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドにパッケージングする。
AAV-APOE2ウイルスゲノムは、ITRからITRまで5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、ヒトAPOE2をコードする核酸、ポリA配列、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-APOE2粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
3群の非ヒト霊長類(NHP)(AAV中和抗体について事前スクリーニングされた成体雄カニクイザルマカク)に、VOY101-APOE2ベクターを静脈注射によって投与する。1群は媒体のみの対照である(0.001%F-68含有PBS)。NHPに、高または低用量レベル(およそ4×1012vg/kg~4×1013vg/kg)のいずれかを静脈内送達を使用して投与する。投与の4週間後、生理食塩水灌流を実施し、脳を3mm冠状ブロックへと切片化し、瞬間凍結する。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおけるVOY101-APOE2の有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価されるAPOE2の発現、ならびにデジタル液滴PCRによって評価されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。
発現データは、VOY101-APOE2ベクターを受ける動物の脳全体にわたる広範なAPOE2の発現を示す可能性が高いだろう。有意なAPOE2レベルを示す脳領域は、嗅内皮質、海馬、および皮質を含めた、タウオパシー関連疾患に重要な区域をカバーする可能性が高いだろう。発現データと一致して、PCRは、脳にわたるベクターゲノムの広範な分布を示す可能性が高いだろう。
実施例8.ハンチントン病を治療するためのVOY101-HTT miRNA
A. ハンチントン病のマウスモデルにおけるVOY101-miRNAのインビボ有効性研究
HTTを標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有する選択されたpri-miRNAカセットを、scAAV-miRNAウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、CBAプロモータ(CMVieエンハンサー、CBAプロモータおよびSV40イントロンを含む)、HTTを標的にするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ウサギグロビンポリA配列、スタッファー配列としてのヒトアルファ-1抗トリプシンの断片、ならびに野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-HTT miRNA粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
両側性線条体内投薬が使用されるだろう。およそ2ヵ月齢であり、性別のバランスがとれたおよそ12匹マウス/群の3群は、媒体(0.001%F-68含有PBS)、または高または低用量レベル(1線条体当たりおよそ3×109vg~5×1010vg)のいずれかのVOY101-HTT miRNAベクターを受けるだろう。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、マウスにおけるVOY101-HTT mRNAの有効性を試験することができる。非限定的な例としては、体重の測定、ロータロッド試験、ポルソルト水泳試験、ならびに免疫組織化学法によって評価されるHTTタンパク質凝集体の測定が挙げられる。
動物は全て、体重、ロータロッド試験、ポルソルト水泳試験、および生存について評価されるだろう。線条体組織試料のHTT mRNA抑制(RT-qPCRによる)およびウエスタンブロットまたはMSDアッセイによるHTTタンパク質レベルについて評価するために、一部の動物を5ヵ月齢で(投薬3ヵ月後に)安楽死させることになるが、他の動物は、凝集体を評価するために(免疫組織化学法により)、およそ8ヵ月齢で(投薬6ヵ月後に)安楽死させることになる。
HTT測定データは、主要標的区域(線条体および皮質)を含め、HTT miRNAベクターを受ける動物の脳全体にわたるヒトHTTタンパク質およびmRNAの広範な低減を示すはずである。HTT miRNAベクターを受ける群は、病理学的HTT凝集体の低減も示し、寿命および運動活性における有意な改善を示すだろう。
B. scVOY101-HTT miRNAの静脈内投薬後の非ヒト霊長類におけるインビボ薬理学および分布研究
HTTを標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有する選択されたpri-miRNAカセットを、scAAV-miRNAウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのscAAV-miRNAウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、HTTを標的にするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ポリA配列、スタッファー配列、ならびに野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-HTT miRNA粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
3群の非ヒト霊長類(NHP)(AAV中和抗体について事前スクリーニングされた成体雄アカゲザルマカク(rhesus macaque))に、scVOY101-HTT miRNA粒子を投与する。NHPに、静脈内送達または頸動脈内送達を使用して、高、中または低用量レベル(およそ5×1012vg/kg、1.5×1013vg/kgおよび4.5×1013vg/kg)のいずれかを投与する。投与の4週間後、生理食塩水灌流を実施し、脊髄の一部、脳切片および選択された末梢組織を回収することになる。組織のサブセットを液体窒素で瞬間凍結させ、サブセットを4%PFAで後固定することになる。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおけるVOY101-HTT miRNAの有効性を試験することができる。非限定的な例としては、bDNAアッセイおよび/またはqRT-PCRによって測定されるHTT mRNA発現、ウエストブロットによっておよび免疫組織化学法によって評価されるHTTタンパク質の発現、ならびにデジタル液滴PCRによって評価されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。加えて、臨床観察、血清およびCSF臨床病理、CNSおよび末梢組織のCSFバイオマーカーおよび組織病理を分析することになる。
実施例9.筋萎縮性側索硬化症を治療するためのVOY101-SOD1 miRNA
A. ALSのマウスモデルにおけるVOY101-SOD1 miRNAのインビボ薬理学研究
SOD1を標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有する選択されたpri-miRNAカセットを、scAAV-miRNAウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、H1プロモータ、SOD1を標的にするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ウサギグロビンポリA配列、ならびに野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-SOD1 miRNA粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
およそ40~50日齢であり、性別、年齢および同腹仔のバランスがとれたおよそ10匹マウス/群の3群は、媒体(0.001%F-68含有PBS)、または高もしくは低用量レベル(およそ5×1011vg/マウスまたは2×1012vg/マウス)のいずれかのVOY101-SOD1 miRNAベクターを受けるだろう。動物は全て、静脈内投薬されるだろう。動物は全て、静脈内投与のおよそ4週間後に安楽死させることになる。
当該技術分野で公知の分析方法を使用して、薬理学的プロファイルを評価することができる。一次読出しとしては、複数のCNS領域および選択された末梢組織におけるhSOD1 mRNAおよびタンパク質発現ならびにベクターゲノム生体内分布が挙げられるだろう。二次読出しとしては、体重、免疫組織化学法および症状観察(cage side observations)が挙げられるだろう。
B. ALSのマウスモデルにおけるVOY101-SOD1 miRNAのインビボ有効性研究
SOD1を標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有する選択されたpri-miRNAカセットを、scAAV-miRNAウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのscAAV-miRNAウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、H1プロモータ、SOD1を標的にするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ウサギグロビンポリA、ならびに野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-SOD1 miRNA粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
およそ40~50日齢であり、性別、年齢および同腹仔のバランスがとれたおよそ36匹マウス/群の3群は、媒体、または高もしくは低用量レベル(およそ5×1011vg/マウスまたは2×1012vg/マウス)のいずれかのベクターを受けるだろう。動物は全て、静脈内投薬されるだろう。
マウスにおけるVOY101-SOD1 miRNAの有効性を評価するために、当該技術分野で公知の分析方法を使用して一次読出しを得ることができ、分析方法としては、体重、行動ニューロスコア(behavioral NeuroScore)、生存、ならびに疾患開始および継続期間を挙げることができる。神経学的スコアは、毎日測定されるだろう。動物は、その動物のニューロスコア(NeuroScore)が4に達した際に安楽死させることになる。二次読出しとしては、hSOD1 mRNA/タンパク質発現、ベクターゲノム生体内分布およびIHC(骨格筋およびNMJ画像診断、脊髄)が挙げられる。
データは、静脈内VOY101-SOD1 miRNAベクターが運動ニューロン、脳幹および運動皮質に送達されると、SOD1タンパク質およびmRNAの広範な低減が生じることを示す。
C. ALSの疾患モデルとしてのイヌ変性性脊髄症におけるVOY101-SOD1 miRNAのインビボ有効性研究
SOD1を標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有する選択されたpri-miRNAカセットを、設計されたscAAV-miRNAウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドにパッケージングする。
ITRからITRまでのscAAV-miRNAウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、H1プロモータ、SOD1を標的にするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ウサギグロビンポリA配列、スタッファー配列、ならびに野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-SOD1 miRNA粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
伴侶DMイヌを、インビトロ中和抗体アッセイにて血清試料を評価することによって、VOY101カプシドに対する以前から存在する免疫についてスクリーニングすることになる。陰性nAbを有するイヌを、研究の候補にすることになる。イヌを、2つの治療群に分割し、静脈内投薬を使用してVOY101-SOD1 miRNAまたは媒体(0.001%F-68含有PBS)のいずれかを投与することになる。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、イヌにおけるVOY101-SOD1 miRNAの有効性を評価することができる。非限定的な例としては、足取りおよび神経学的転帰の縦断的モニタリング、DTIおよびMRS、電気診断試験、MUNEならびに特定の時点での電気インピーダンス筋運動描記法(EIM)が挙げられる。
イヌにおけるpNF-HおよびNFLレベルを評価するために、血清およびCSF試料を指定の時点および安楽死の時点で収集することになる。安楽死の時点では、SOD1 mRNA定量化およびベクターゲノム生体内分布分析のために、CNSおよび末梢組織を収集することになる。
データは、静脈内VOY101-SOD1 miRNAベクターが運動ニューロン、脳幹および運動皮質に送達されると、SOD1タンパク質およびmRNAの低減が生じることを示す。
D. scVOY101-SOD1 miRNAの静脈内投薬後の非ヒト霊長類におけるインビボ薬理学および分布研究
SOD1を標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有する選択されたpri-miRNAカセットを、scAAV-miRNAウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのscAAV-miRNAウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、SOD1を標的にするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ポリA配列、スタッファー配列、ならびに野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-SOD1 miRNA粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
3群の非ヒト霊長類(NHP)(AAV中和抗体について事前スクリーニングされた成体雄カニクイザルマカク)に、scVOY101-SOD1 miRNAベクターを投与する。NHPに、静脈内送達を使用して、高、中または低用量レベル(およそ5×1012vg/kg、1.5×1013vg/kgおよび4.5×1013vg/kg)のいずれかを投与する。投与の4週間後、生理食塩水灌流を実施し、脊髄の一部、脳切片および選択された末梢組織を回収することになる。収集した組織のサブセットを液体窒素で瞬間凍結させ、別のサブセットを4%PFAで後固定することになる。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおける有効性および分布を決定することができる。非限定的な例としては、qRT-PCRによるSOD1 mRNAの発現、WBによっておよび免疫組織化学法によって評価されるSOD1タンパク質の発現、ならびにデジタル液滴PCRによって評価されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。加えて、臨床観察、血清およびCSF臨床病理、CNSおよび末梢組織のCSFバイオマーカーおよび組織病理を分析することになる。
データは、VOY101-SOD1 miRNAベクターが骨髄運動ニューロン、脳幹および運動皮質に静脈内送達されると、SOD1タンパク質およびmRNAの低減が生じることを示す。
実施例10.アルツハイマー病および他のタウオパシーを治療するための抗タウ抗体送達
A. アルツハイマー病および他のタウオパシーのマウスモデルにおけるVOY101-抗タウ抗体の静脈内投薬のインビボ分布、発現および有効性研究
タウを標的とするモノクローナル抗体をコードする核酸を、AAVウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドにて産生させる。
ウイルスゲノムは、ITRからITRまで5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、タウを標的とするモノクローナル抗体をコードする核酸、ポリA配列、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-抗タウ抗体粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
2ヵ月齢の3群のP301Sマウス、およそ20匹マウス/群に、媒体(0.001%F-68含有PBS)、または高もしくは低用量レベル(およそ4×1012vg/kg~4×1013vg/kg)のいずれかのVOY101-抗タウ抗体を静脈内尾静脈注射により投与する。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、マウスにおけるVOY101-抗タウ抗体の有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、体重、ロータロッド、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価される抗タウ抗体の発現、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価される病原性タウのレベル、免疫組織化学法によって評価される神経変性のレベル、ならびにデジタル液滴PCRによって測定されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。動物は全て、体重および生存について評価する。抗体発現、タウ病理、および神経変性について、脳、脊髄、および肝臓試料を評価するために、動物をおよそ5ヵ月齢で安楽死させる。
アルツハイマー病およびタウオパシーを治療するためのVOY101-抗タウ抗体送達が成功した場合、PCRデータは、静脈内VOY101-抗タウ抗体ベクターを受ける動物の脳全体にわたるベクターゲノムの送達を示すことが予期できるだろう。発現データもまた、受動免疫化後のレベルと等しいかまたはそれを超えるレベルで、ベクターを受ける動物の脳全体にわたる抗タウ抗体の広範な発現を示す可能性が高いだろう。有意な抗体レベルを示すことが予想される脳領域としては、嗅内皮質、海馬、および皮質を含めた、タウオパシー関連疾患に重要な区域が挙げられる。VOY101-抗タウ抗体ベクターを受ける群は、病理学的タウおよび神経変性の強力な低減を示し、寿命およびロータロッド能力の有意な改善を示すことが予想される。
B. 非ヒト霊長類におけるVOY101-抗タウ抗体の静脈内投薬のインビボ分布および発現研究
タウを標的とするモノクローナル抗体をコードする核酸をAAVウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドにて産生させる。
ウイルスゲノムは、ITRからITRまで5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、タウを標的とするモノクローナル抗体をコードする核酸、ポリA配列、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-抗タウ粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
3群の非ヒト霊長類(NHP)(AAV中和抗体について事前スクリーニングされた成体雄カニクイザルマカク)にVOY101-抗タウベクターを投与する。1群は媒体のみの対照である(0.001%F-68含有PBS)。NHPに、静脈内送達を使用して、高または低用量レベル(およそ4×1012vg/kg~4×1013vg/kg)のいずれかを投与する。投与の4週間後、生理食塩水灌流を実施し、脳を3mm冠状ブロックへと切片化し、瞬間凍結する。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおけるVOY101-抗タウ抗体の有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価される抗タウ抗体の発現、ならびにデジタル液滴PCRによって評価されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。
発現データは、抗タウ抗体が、受動免疫化後のレベルを超えるレベルでNHP脳にて広く発現されることを示すことが予期できるだろう。有意な抗体レベルを示すことが予想される脳領域としては、嗅内皮質、海馬、および皮質を含めた、タウオパシー関連疾患に重要な区域が挙げられる。発現データと一致して、PCRは、脳にわたるベクターゲノムの広範な分布を示す可能性が高いだろう。
実施例11.タウオパシーを治療するためのVOY101-タウmiRNA
A. タウオパシーのマウスモデルにおけるscVOY101-タウmiRNAの静脈内投薬のインビボ分布、発現および有効性研究
タウを標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有する選択されたpri-miRNAカセットを、scAAV-miRNAウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのscAAV-miRNAウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、タウを標的にするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ポリA配列、スタッファー配列、ならびに野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-タウmiRNA粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
2ヵ月齢の3群のP301Sマウス、およそ20匹マウス/群に、媒体(0.001%F-68含有PBS)、または高もしくは低用量レベル(およそ4×1012vg/kg~4×1013vg/kg)のいずれかのVOY101-タウmiRNAベクターを静脈内尾静脈注射により投与する。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、マウスにおけるVOY101-タウmiRNAの有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、体重、ロータロッド、qRT-PCRによって測定されるタウmRNAの発現、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価される総ヒトタウ発現、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価される病原性タウのレベル、免疫組織化学法によって評価される神経変性のレベル、ならびにデジタル液滴PCRによって測定されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。
動物は全て、体重および生存について評価する。タウmRNA発現、タウ病理、および神経変性について、脳、脊髄、および肝臓試料を評価するために、動物をおよそ5ヵ月齢で安楽死させる。
タウオパシーを治療するためのVOY101-タウmiRNA送達が成功した場合、PCRデータは、静脈内VOY101-タウmiRNAベクターを受ける動物の脳全体にわたるベクターゲノムの送達を示すことが予期できるだろう。発現データは、VOY101-タウmiRNAベクターを受ける動物の脳全体にわたるヒトタウタンパク質およびmRNAの広範な低減を示すことも予想されるだろう。有意なタウ低減を示す可能性が高い脳領域としては、嗅内皮質、海馬、および皮質を含めた、タウオパシー関連疾患に重要な区域が挙げられる。VOY101-タウmiRNAベクターを受ける群は、病理学的タウおよび神経変性の強力な低減を示し、寿命およびロータロッド能力の有意な改善を示す可能性が高いだろう。
B. scVOY101-タウmiRNAの静脈内投薬後の非ヒト霊長類におけるタウのインビボ分布および発現研究
タウを標的にするガイド鎖およびパッセンジャー鎖を含有する選択されたpri-miRNAカセットを、scAAV-miRNAウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、タウを標的にするガイド配列およびパッセンジャー配列を含有するpri-miRNAカセット、ポリA配列、スタッファー配列、ならびに野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101-タウmiRNA粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
3群の非ヒト霊長類(NHP)(AAV中和抗体について事前スクリーニングされた成体雄カニクイザルマカク)にscVOY101-タウmiRNAを投与する。1群は媒体のみの対照である(0.001%F-68含有PBS)。NHPに、静脈内送達を使用して、高または低用量レベルのVOY101-タウmiRNA(およそ4×1012vg/kg~4×1013vg/kg)のいずれかを投与する。投与の4週間後、生理食塩水灌流を実施し、脳を3mm冠状ブロックへと切片化し、瞬間凍結する。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおけるVOY101-タウmiRNAの分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、qRT-PCRによるタウmRNAの発現、免疫組織化学法および酵素結合免疫吸着測定法によって評価されるタウタンパク質の発現、ならびにデジタル液滴PCRによって評価されるベクターゲノムレベルの測定が挙げられる。
発現データは、タウタンパク質およびmRNAが脳において広く低減されることを示すことが予想できるだろう。有意なタウ低減を示す可能性が高い脳領域としては、嗅内皮質、海馬、および皮質を含めた、タウオパシー関連疾患に重要な区域が挙げられる。発現データと一致して、PCRは、脳にわたるベクターゲノムの広範な分布を示す可能性が高いだろう。
実施例12.心血管疾患(例えば、心不全)を治療するためのVOY101-ATP2A2
A. 心血管疾患のマウスモデルにおけるVOY101-ATP2A2の静脈内投薬によるインビボ分布、発現および有効性研究
ヒトATP2A2をコードする核酸を含む選択されたウイルスゲノムを設計し、一本鎖VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、hATP2A2 cDNA配列、ヒト成長ホルモンポリA配列、スタッファー配列としてのヒトアルブミンの断片、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
7週齢であり、性別および同腹仔のバランスがとれたおよそ10匹マウス/群の6群は、媒体(0.001%F-68含有PBS;2群)、または低(2群)もしくは高用量(2群)レベル(およそ6.3×1012vg/kg~2×1013vg/kg体重)のいずれかのVOY101-ATP2A2ベクターを静脈内注射により受ける。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、マウスにおけるVOY101-ATP2A2の有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、四肢筋電図検査、ノッチ付きバー歩行試験、ストリングハンギング試験、ロータロッド試験、体重、および/または生存が挙げられる。他の読出しとしては、ELISA、PCR、免疫組織化学法およびインサイツハイブリダイゼーションによる組織(例えば、後根神経節、心臓(例えば、心筋細胞)、小脳、脊髄)でのATP2A2タンパク質およびmRNA発現、ならびに組織(後根神経節)切片におけるミトコンドリア酵素機能のインサイツ評価が挙げられる。様々な組織におけるベクターゲノムレベルを、PCRおよびISHで決定する。
3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、18週までに安楽死させる。残り3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、生存に対する効果を評価するために6ヵ月以上維持する。対照群(n=10/群)は、参照ベクターを投薬した野生型マウスおよび疾患モデルマウスを含む。
限定はされないが、ATP2A2ベクターを受ける動物のDRG、小脳、脊髄および心臓などの標的組織におけるヒトATP2A2の分布および発現ならびにベクターゲノム分布を、hATP2A2発現についてはELISA、PCR、ISH、IHCによって、ならびにベクターゲノム分析についてはPCRおよびISHによって測定する。ヒトATP2A2分析(ELISA、PCR、ISH、IHCによる)は、hATP2A2ベクターが送達されると、標的組織、例えば心臓での発現が、標的組織へのウイルスゲノムの分布と共に生じることを示す。ミトコンドリア酵素活性のインサイツ評価は、hATP2A2ベクターが送達されると、心臓の切片にて活性増加が生じることを示す。筋電図検査、ノッチ付きバー試験、ストリングハンギング試験およびロータロッド試験は、媒体対照動物よりも能力が改善していることを示す。
B. 非ヒト霊長類におけるVOY101-ATP2A2の静脈内投薬によるインビボ分布および発現研究
ヒトATP2A2をコードする核酸配列を含む選択されたウイルスゲノムを設計し、一本鎖(ss)VOY101カプシドにパッケージングする。
ITRからITRまでの一本鎖ウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、hATP2A2 cDNA配列、ヒト成長ホルモンポリA配列、スタッファー配列としてのヒトアルブミンの断片、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
およそ3歳以上であり、1群当たり少なくとも1匹の各性別の動物を有するおよそ3匹カニクイザル/群の8群は、媒体(0.001%F-68含有PBS;2群)、または低(2群)もしくは高用量(2群)レベル(およそ6.7×1012vg/kg~6×1013vg/kg体重)のいずれかのVOY101-ATP2A2ベクターを静脈内注射により受ける。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおけるVOY101-ATP2A2の有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、経時的な体重の測定、臨床モニタリング、組織病理学および血液安全性パネル試験が挙げられる。他の読出しとしては、ELISA、PCR、免疫組織化学法およびインサイツハイブリダイゼーションによって評価される、組織(例えば、心臓)でのATP2A2タンパク質およびmRNA発現が挙げられる。様々な組織におけるベクターゲノムレベルを、PCRおよびISHで決定する。
3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、4週までに安楽死させる。残り3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、長期遺伝子発現を評価するために12週間維持する。
限定はされないが、hATP2A2ベクターを受ける動物の心臓などの標的組織におけるヒトATP2A2(hATP2A2)の分布および発現ならびにベクターゲノム分布を、hATP2A2発現についてはELISA、PCR、ISH、IHCによって、ならびにベクターゲノム分析についてはPCRおよびISHによって測定する。霊長類ATP2A2発現データを、心血管疾患の遺伝子マウスモデルにおける心血管疾患表現型のレスキューをもたらしたATP2A2発現レベルと比較する。これらの結果に基づいて、臨床治験のための有効用量を計算する。
実施例13.心血管疾患(例えば、心不全)を治療するためのVOY101-S100A1
A. 心血管疾患のマウスモデルにおけるVOY101-S100A1の静脈内投薬によるインビボ分布、発現および有効性研究
ヒトS100A1をコードする核酸を含む選択されたウイルスゲノムを設計し、一本鎖VOY101カプシドへとパッケージングする。
ITRからITRまでのウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、hS100A1 cDNA配列、ヒト成長ホルモンポリA配列、スタッファー配列としてのヒトアルブミンの断片、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
7週齢であり、性別および同腹仔のバランスがとれたおよそ10匹マウス/群の6群は、媒体(0.001%F-68含有PBS;2群)、または低(2群)または高用量(2群)レベル(およそ6.3×1012vg/kg~2×1013vg/kg体重)のいずれかのVOY101-S100A1ベクターを静脈内注射により受ける。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、マウスにおけるVOY101-S100A1の有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、四肢筋電図検査、ノッチ付きバー歩行試験、ストリングハンギング試験、ロータロッド試験、体重、および/または生存が挙げられる。他の読出しとしては、ELISA、PCR、免疫組織化学法およびインサイツハイブリダイゼーションによる組織(例えば、後根神経節、心臓(例えば、心筋細胞)、小脳、脊髄)でのS100A1タンパク質およびmRNA発現、ならびに組織(後根神経節)切片におけるミトコンドリア酵素機能のインサイツ評価が挙げられる。様々な組織におけるベクターゲノムレベルを、PCRおよびISHで決定する。
3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、18週までに安楽死させる。残り3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、生存に対する効果を評価するために6ヵ月以上維持する。対照群(n=10/群)は、参照ベクターを投薬した野生型マウスおよび疾患モデルマウスを含む。
限定はされないが、hS100A1ベクターを受ける動物のDRG、小脳、脊髄および心臓などの標的組織におけるヒトS100A1の分布および発現ならびにベクターゲノム分布を、hS100A1発現についてはELISA、PCR、ISH、IHCによって、ならびにベクターゲノム分析についてはPCRおよびISHによって測定する。ヒトS100A1分析(ELISA、PCR、ISH、IHCによる)は、hS100A1ベクターが送達されると、標的組織、例えば心臓での発現が、標的組織へのウイルスゲノムの分布と共に生じることを示す。ミトコンドリア酵素活性のインサイツ評価は、hS100A1ベクターが送達されると、心臓の切片における活性増加が生じることを示す。筋電図検査、ノッチ付きバー試験、ストリングハンギング試験およびロータロッド試験は、媒体対照動物よりも能力が改善していることを示す。
B. 非ヒト霊長類におけるVOY101-S100A1の静脈内投薬によるインビボ分布および発現研究
ヒトS100A1をコードする核酸配列を含む選択されたウイルスゲノムを設計し、一本鎖(ss)VOY101カプシドにパッケージングする。
ITRからITRまでの一本鎖ウイルスゲノムは、5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、hS100A1 cDNA配列、ヒト成長ホルモンポリA配列、スタッファー配列としてのヒトアルブミンの断片、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムをVOY101カプシドへとパッケージングし、精製し、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
およそ3歳以上であり、1群当たり少なくとも1匹の各性別の動物を有するおよそ3匹カニクイザル/群の8群は、媒体(0.001%F-68含有PBS;2群)、または低(2群)もしくは高用量(2群)レベル(およそ6.7×1012vg/kg~6×1013vg/kg体重)のいずれかのVOY101-S100A1ベクターを静脈内注射により受ける。
当該技術分野で公知の任意の試験を使用して、NHPにおけるVOY101-S100A1の有効性、分布および発現を試験することができる。非限定的な例としては、経時的な体重の測定、臨床モニタリング、組織病理学および血液安全性パネル試験が挙げられる。他の読出しとしては、ELISA、PCR、免疫組織化学法およびインサイツハイブリダイゼーションによって評価される、組織(例えば、心臓)におけるS100A1タンパク質およびmRNA発現が挙げられる。様々な組織におけるベクターゲノムレベルを、PCRおよびISHで決定する。
3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、4週までに安楽死させる。残り3群の動物(媒体、低用量、高用量)を、長期遺伝子発現を評価するために12週間維持する。
限定はされないが、hS100A1ベクターを受ける動物の心臓などの標的組織におけるヒトS100A1(hS100A1)の分布および発現ならびにベクターゲノム分布を、hS100A1発現についてはELISA、PCR、ISH、IHCによって、ならびにベクターゲノム分析についてはPCRおよびISHによって測定する。霊長類S100A1発現データを、心血管疾患の遺伝子マウスモデルにおける心血管疾患表現型のレスキューをもたらしたS100A1発現レベルと比較する。これらの結果に基づいて、臨床治験のための有効用量を計算する。
実施例14.アルツハイマー病および他のタウオパシーの治療のための抗タウ抗体送達
A. VOY101またはVOY201-抗タウ抗体の静脈内投薬のインビボ分布、発現および有効性研究
タウを標的とするモノクローナル抗体PHF-1をコードする核酸を、AAVウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシド(配列番号1809として提供されるカプシド配列)またはVOY201カプシド(配列番号1810として提供されるカプシド配列)にて産生させた。
ウイルスゲノムは、ITRからITRまで5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、タウを標的とするモノクローナル抗体PHF-1をコードする核酸(配列番号1816として提供されるコザック、重鎖、リンカー領域、軽鎖および終止コドン)、ポリA配列、および野生型ITRを含んでいた。ウイルスゲノムを、VOY101またはVOY201カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化した。VOY101またはVOY201-抗タウ抗体粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化した。
2ヵ月齢の3群の野生型(WT)マウス、およそ5匹マウス/群に、媒体(0.001%F-68含有PBS)、1.4×1013vg/kgのVOY101-抗タウ抗体ベクターまたは1.4×1013vg/kgのVOY201-抗タウ抗体ベクターを静脈内尾静脈注射により投与した。
AAV粒子投与のおよそ28日後、幾つかの組織試料を収集した。ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、CBAプロモータのCMVエンハンサー領域に対するプローブセットを使用して実施し、宿主TFRCに対して正規化し、1細胞当たりのベクターゲノム(VG/細胞)で表した。VOY101.PHF-1およびVOY201.PHF-1のベクターゲノム分布は、表21に示される。表21において、Hpは海馬であり、SC-Cは頚髄であり、SC-Tは胸髄であり、SC-Lは腰髄である。
収集した組織における、組織ライセートの可溶性画分に存在するPHF-1の発現レベルもまた、ELISAプレートにコーティングしたPHFタウとの相互作用を検出することによって測定した。抗体-抗原複合体を、HRP標識抗マウスIgGおよびその基質TMBを使用し、続いてプレートリーダでOD450を読み取ることによって視覚化および定量化し、入力組織タンパク質の量に対して正規化した。VOY101.PHF-1およびVOY201.PHF-1についての、AAV形質導入細胞からのPHF1発現は、表22に示される。表22において、Hpは海馬であり、SCは脊髄である。
VOY201中のPHF-1のIV投薬は、受動免疫化と比較して、マウスCNSにおいて最大15倍より高い抗タウ抗体レベルをもたらした。脳における抗体の受動免疫化レベルは、20~40ng/mgタンパク質であり、VOY201は、海馬では受動よりも2~5×倍高く、脳幹では受動よりも5~10×倍高く、脊髄では受動よりも8~16×倍高いレベルを提供した。VOY101およびVOY201のIV投薬は、ベクター化抗体の広範なCNS生体内分布および形質導入をもたらした。
マウス脳をヘミセクションし、組織試料を抗体免疫組織化学法のために割り当て、その後4%パラホルムアルデヒドで一晩後固定した。PHF-1抗体を、抗マウスIgG1抗体(PHF-1は、マウスIgG1抗体である)を使用して免疫組織化学法によって検出した。1.4×1013vg/kgのVOY101.PHF-1またはVOY201.PHF-1を静脈内尾静脈注射により投薬した動物では、海馬、皮質、線条体および視床を含めた脳全体にわたって染色が観察された。神経形態およびアストログリア形態を有するものを含めた、数多くのPHF1+細胞が観察された。媒体処置対照は、本質的に検出可能でないバックグラウンド染色を示した。
1.4×1013vg/kgのVOY101.PHF-1またはVOY201.PHF-1を静脈内尾静脈注射により投与した後のCNS内のPHF-1発現を、マウス抗IgG1および抗NeuN二重標識免疫蛍光染色によって評価した。PHF-1はマウスIgG1抗体であり、したがって、抗IgG1抗体染色によって検出される。共局在化研究は、神経マーカー(NeuN)により二重標識されたものを含め、複数のPHF1+細胞を示した。
1.4×1013vg/kgのVOY101.PHF-1を静脈内尾静脈注射により投与した後のCNS内のPHF-1発現を、マウス抗IgG1および抗GFAP(グリア線維性酸性タンパク質)二重標識免疫蛍光染色によって評価した。PHF-1はマウスIgG1抗体であり、したがって、抗IgG1抗体染色によって検出される。共局在化研究は、アストロサイトマーカー(GFAP)により二重標識されたものを含め、複数のPHF1+細胞を示した。
B. マウスモデルにおけるVOY101またはVOY201-抗タウ抗体の静脈内投薬のインビボ分布、発現および有効性研究
2ヵ月齢の3群のP301Sマウス、およそ20匹マウス/群に、媒体(0.001%F-68含有PBS)、1.4×1013vg/kgのVOY101-抗タウ抗体ベクター(VOY101.PHF-1)または5.0×1013vg/kgのVOY201-抗タウ抗体ベクター(VOY201.PHF-1)を静脈内尾静脈注射により投与した。
AAV粒子投与のおよそ3ヵ月後、幾つかの組織試料を収集した。ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、CBAプロモータのCMVエンハンサー領域に対するプローブセットを使用して実施し、宿主TFRCに対して正規化し、1細胞当たりのベクターゲノム(VG/細胞)で表した。VOY101.PHF-1およびVOY201.PHF-1のベクターゲノム分布は、表23に示される。表23において、Hpは海馬であり、SCは脊髄である。
収集した組織における、組織ライセートの可溶性画分に存在するPHF1の発現レベルもまた、ELISAプレートにコーティングしたPHFタウとの相互作用を検出することによって測定した。抗体-抗原複合体を、HRP標識抗マウスIgGおよびその基質TMBを使用し、続いてプレートリーダでOD450を読み取ることによって視覚化および定量化し、入力組織タンパク質の量に対して正規化した。VOY101.PHF-1およびVOY201.PHF-1についての、AAV形質導入細胞からのPHF1発現は、表24に示される。表24において、Hpは海馬であり、SCは脊髄である。
VOY101およびVOY201のIV投薬は、P301タウオパシーマウスのCNSに対する高レベルの抗体をもたらした。AT8免疫反応性(IR)は、PHF1処置マウスにおいて有意に低減される。VOY101およびVOY201の使用するIV投薬は、P301Sタウオパシーマウスにおいて、ベクター化抗体の広範なCNS生体内分布および形質導入をもたらした。
実施例15.アルツハイマー病を含めたタウオパシーの治療のための抗タウ抗体送達
A. VOY101またはVOY201-抗タウ抗体の静脈内投薬のインビボ分布、発現および有効性研究
タウを標的とするモノクローナル抗体PHF-1をコードする核酸を、AAVウイルスゲノムへと操作し、VOY101カプシド(配列番号1809として提供されるカプシド配列)またはVOY201カプシド(配列番号1810として提供されるカプシド配列)にて産生させた。
ウイルスゲノムは、ITRからITRまで5’から3’に挙げて、野生型ITR、プロモータ、タウを標的とするモノクローナル抗体PHF-1をコードする核酸(軽鎖(配列番号1819)、リンカー領域、重鎖(配列番号1814)および終止コドン)、ポリA配列、および野生型ITRを含む。ウイルスゲノムを、VOY101またはVOY201カプシドへとパッケージングし、精製し、製剤化する。VOY101またはVOY201-抗タウ抗体粒子を、0.001%F-68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化する。
2ヵ月齢の3群の野生型(WT)マウス、およそ5匹マウス/群に、媒体(0.001%F-68含有PBS)、1.4×1013vg/kgのVOY101-抗タウ抗体ベクター、または1.4×1013vg/kgのVOY201-抗タウ抗体ベクターを静脈内尾静脈注射により投与する。
AAV粒子投与のおよそ28日後、幾つかの組織試料を収集する。ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、CBAプロモータのCMVエンハンサー領域に対するプローブセットを使用して実施し、宿主TFRCに対して正規化し、1細胞当たりのベクターゲノム(VG/細胞)で表す。
収集した組織における、組織ライセートの可溶性画分に存在するPHF1の発現レベルもまた、ELISAプレートにコーティングしたPHFタウとの相互作用を検出することによって測定する。抗体-抗原複合体を、HRP標識抗マウスIgGおよびその基質TMBを使用し、続いてプレートリーダでOD450を読み取ることによって視覚化および定量化し、入力組織タンパク質の量に対して正規化する。
マウス脳をヘミセクションし、組織試料を抗体免疫組織化学法のために割り当てる。試料を、4%パラホルムアルデヒドで一晩後固定する。PHF-1抗体を、抗マウスIgG1抗体(PHF-1は、マウスIgG1抗体である)を使用して免疫組織化学法によって検出する。
1.4×1013vg/kgのVOY101.PHF1またはVOY201.PHF-1を静脈内尾静脈注射により投与した後のCNS内のPHF-1発現を、マウス抗IgG1および抗NeuNまたはGFAP(グリア線維性酸性タンパク質)二重標識免疫蛍光染色によって評価する。PHF-1はマウスIgG1抗体であり、したがって、抗IgG1抗体染色によって検出される。
B. マウスモデルにおけるVOY101またはVOY201-抗タウ抗体の静脈内投薬のインビボ分布、発現および有効性研究
2ヵ月齢の3群のP301Sマウス、およそ20匹マウス/群に、媒体(0.001%F-68含有PBS)、1.4×1013vg/kgのVOY101-抗タウ抗体ベクター(VOY101.PHF-1)または5.0×1013vg/kgのVOY201-抗タウ抗体ベクター(VOY201.PHF-1)を静脈内尾静脈注射により投与する。
AAV粒子投与のおよそ3ヵ月後、幾つかの組織試料を収集した。ベクターゲノムデジタルPCR定量化を、プロモータに対するプローブセットを使用して実施し、宿主TFRCに対して正規化し、1細胞当たりのベクターゲノム(VG/細胞)で表す。
収集した組織における、組織ライセートの可溶性画分に存在するPHF1の発現レベルもまた、ELISAプレートにコーティングした対らせん状細線維性タウとの相互作用を検出することによって測定する。抗体-抗原複合体を、HRP標識抗マウスIgGおよびその基質TMBを使用し、続いてプレートリーダでOD450を読み取ることによって視覚化および定量化し、入力組織タンパク質の量に対して正規化する。
VIII.均等物および範囲
当業者は、本明細書に記載される本発明に係る具体的な実施形態の多くの均等物を認識し、またはルーチンに過ぎない実験を用いて確かめることが可能であろう。本発明の範囲が上記の説明に限定されることは意図されず、それはむしろ添付の特許請求の範囲に示されるとおりである。
特許請求の範囲では、「a」、「an」、および「the」などの冠詞は、反する旨が示されない限り、または文脈上特に明らかでない限り、1つまたは2つ以上を意味し得る。ある群の1つ以上のメンバーの間に「または」を含むクレームまたは説明は、反する旨が示されない限り、または文脈上特に明らかでない限り、その群メンバーの1つ、2つ以上、または全てが所与の製品または方法に存在する、それに用いられる、または他の形でそれに関連する場合に満たされるものとみなされる。本発明は、群の正確に1つのメンバーが所与の製品または方法に存在する、それに用いられる、または他の形でそれに関連する実施形態を含む。本発明は、2つ以上の、または全体の群メンバーが所与の製品または方法に存在する、それに用いられる、または他の形でそれに関連する実施形態を含む。
また、用語「~を含んでいる(comprising)」は非限定的(open)であることが意図され、追加の要素または工程の包含を許容するが必須ではないことも注記される。用語「~を含んでいる(comprising)」が本明細書で使用されるとき、したがって用語「~からなる(consisting of)」もまた包含され、開示される。
範囲が提供されるとき、端点は含まれる。更に、特に指示されない限り、または文脈および当業者の理解から特に明らかでない限り、範囲として表される値は、文脈上特に明確に指示されない限り、その範囲の下限の単位の10分の1に至るまでの、本発明の種々の実施形態において明示される範囲内にある任意の具体的な値または部分的範囲を想定し得ることが理解されるべきである。
加えて、先行技術に含まれる本発明の任意の特定の実施形態は、クレームの任意の1つ以上から明示的に除外され得ることが理解されるべきである。かかる実施形態は当業者に公知であるとみなされるため、除外が本明細書に明示的に示されないとしても、それらは除外され得る。本発明の組成物の任意の特定の実施形態(例えば、任意の抗生物質、治療薬、または活性成分;任意の生産方法;任意の使用方法など)が、先行技術の存在に関係するか否かに関わらず、何らかの理由で任意の1つ以上のクレームから除外されることがある。
使用した文言は、限定でなく、むしろ説明の文言であること、およびその広義の態様における本発明の真の範囲および趣旨から逸脱することなく、添付の特許請求の範囲内で変更が行われ得ることが理解されるべきである。
本発明をかなり詳しく、幾つかの説明される実施形態に関するある具体性をもって説明したが、それが任意のかかる具体例もしくは実施形態または任意の具体的な実施形態に限定されるべきであることを意図するものではなく、しかし先行技術を考慮してかかる特許請求の範囲の最も広義の可能な解釈を提供し、したがって本発明の意図される範囲を有効に包含するように添付の特許請求の範囲を参照して解釈されるべきである。
本明細書において言及される刊行物、特許出願、特許、および他の参考文献は全て、全体として参照により援用される。矛盾が生じる場合、定義を含め、本明細書が優先するものとする。加えて、節の見出し、材料、方法、および例は例示に過ぎず、限定を意図するものではない。
(付記)
好ましい実施形態として、上記実施形態から把握できる技術的思想について、以下に記載する。
[項目1]
カプシドおよびウイルスゲノムを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)粒子であって、前記カプシドが、前記AAV粒子の送達後に血液脳関門を透過するAAV粒子。
[項目2]
前記AAV粒子が、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5(G2B5)、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3-3、AAV4、AAV4-4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42-1b、AAV42-2、AAV42-3a、AAV42-3b、AAV42-4、AAV42-5a、AAV42-5b、AAV42-6b、AAV42-8、AAV42-10、AAV42-11、AAV42-12、AAV42-13、AAV42-15、AAV42-aa、AAV43-1、AAV43-12、AAV43-20、AAV43-21、AAV43-23、AAV43-25、AAV43-5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1-7/rh.48、AAV1-8/rh.49、AAV2-15/rh.62、AAV2-3/rh.61、AAV2-4/rh.50、AAV2-5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3-9/rh.52、AAV3-11/rh.53、AAV4-8/r11.64、AAV4-9/rh.54、AAV4-19/rh.55、AAV5-3/rh.57、AAV5-22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH-1/hu.1、AAVH-5/hu.3、AAVLG-10/rh.40、AAVLG-4/rh.38、AAVLG-9/hu.39、AAVN721-8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R突然変異体、AAVrh8R R533A突然変異体、AAAV、BAAV、ヤギAAV、ウシAAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV-PAEC、AAV-LK01、AAV-LK02、AAV-LK03、AAV-LK04、AAV-LK05、AAV-LK06、AAV-LK07、AAV-LK08、AAV-LK09、AAV-LK10、AAV-LK11、AAV-LK12、AAV-LK13、AAV-LK14、AAV-LK15、AAV-LK16、AAV-LK17、AAV-LK18、AAV-LK19、AAV-PAEC2、AAV-PAEC4、AAV-PAEC6、AAV-PAEC7、AAV-PAEC8、AAV-PAEC11、AAV-PAEC12、AAV-2-pre-miRNA-101、AAV-8h、AAV-8b、AAV-h、AAV-b、AAV SM10-2、AAVシャッフル100-1、AAVシャッフル100-3、AAVシャッフル100-7、AAVシャッフル10-2、AAVシャッフル10-6、AAVシャッフル10-8、AAVシャッフル100-2、AAV SM10-1、AAV SM10-8、AAV SM100-3、AAV SM100-10、BNP61 AAV、BNP62 AAV、BNP63 AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4-8/rh.64、AAVLG-9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、トゥルータイプAAV(ttAAV)、UPENN AAV10、日本AAV10血清型、AAV CBr-7.1、AAV CBr-7.10、AAV CBr-7.2、AAV CBr-7.3、AAV CBr-7.4、AAV CBr-7.5、AAV CBr-7.7、AAV CBr-7.8、AAV CBr-B7.3、AAV CBr-B7.4、AAV CBr-E1、AAV CBr-E2、AAV CBr-E3、AAV CBr-E4、AAV CBr-E5、AAV CBr-e5、AAV CBr-E6、AAV CBr-E7、AAV CBr-E8、AAV CHt-1、AAV CHt-2、AAV CHt-3、AAV CHt-6.1、AAV CHt-6.10、AAV CHt-6.5、AAV CHt-6.6、AAV CHt-6.7、AAV CHt-6.8、AAV CHt-P1、AAV CHt-P2、AAV CHt-P5、AAV CHt-P6、AAV CHt-P8、AAV CHt-P9、AAV CKd-1、AAV CKd-10、AAV CKd-2、AAV CKd-3、AAV CKd-4、AAV CKd-6、AAV CKd-7、AAV CKd-8、AAV CKd-B1、AAV CKd-B2、AAV CKd-B3、AAV CKd-B4、AAV CKd-B5、AAV CKd-B6、AAV CKd-B7、AAV CKd-B8、AAV CKd-H1、AAV CKd-H2、AAV CKd-H3、AAV CKd-H4、AAV CKd-H5、AAV CKd-H6、AAV CKd-N3、AAV CKd-N4、AAV CKd-N9、AAV CLg-F1、AAV CLg-F2、AAV CLg-F3、AAV CLg-F4、AAV CLg-F5、AAV CLg-F6、AAV CLg-F7、AAV CLg-F8、AAV CLv-1、AAV CLv1-1、AAV Clv1-10、AAV CLv1-2、AAV CLv-12、AAV CLv1-3、AAV CLv-13、AAV CLv1-4、AAV Clv1-7、AAV Clv1-8、AAV Clv1-9、AAV CLv-2、AAV CLv-3、AAV CLv-4、AAV CLv-6、AAV CLv-8、AAV CLv-D1、AAV CLv-D2、AAV CLv-D3、AAV CLv-D4、AAV CLv-D5、AAV CLv-D6、AAV CLv-D7、AAV CLv-D8、AAV CLv-E1、AAV CLv-K1、AAV CLv-K3、AAV CLv-K6、AAV CLv-L4、AAV CLv-L5、AAV CLv-L6、AAV CLv-M1、AAV CLv-M11、AAV CLv-M2、AAV CLv-M5、
AAV CLv-M6、AAV CLv-M7、AAV CLv-M8、AAV CLv-M9、AAV CLv-R1、AAV CLv-R2、AAV CLv-R3、AAV CLv-R4、AAV CLv-R5、AAV CLv-R6、AAV CLv-R7、AAV CLv-R8、AAV CLv-R9、AAV CSp-1、AAV CSp-10、AAV CSp-11、AAV CSp-2、AAV CSp-3、AAV CSp-4、AAV CSp-6、AAV CSp-7、AAV CSp-8、AAV CSp-8.10、AAV CSp-8.2、AAV CSp-8.4、AAV CSp-8.5、AAV CSp-8.6、AAV CSp-8.7、AAV CSp-8.8、AAV CSp-8.9、AAV CSp-9、AAV.hu.48R3、AAV.VR-355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AAVF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8および/またはAAVF9/HSC9、ならびにそれらの変異体からなる群から選択されるカプシドまたはペプチドインサートを含む、項目1に記載のAAV粒子。
[項目3]
前記カプシドがVOY101である、項目2に記載のAAV粒子。
[項目4]
前記カプシドのアミノ酸配列が、配列番号1と少なくとも95%同一である、項目3に記載のAAV粒子。
[項目5]
前記カプシドのアミノ酸配列が、配列番号1と少なくとも99%同一である、項目4に記載のAAV粒子。
[項目6]
前記カプシドのアミノ酸配列が、配列番号1である、項目5に記載のAAV粒子。
[項目7]
前記カプシドの核酸配列が、配列番号1809と少なくとも95%同一である、項目3に記載のAAV粒子。
[項目8]
前記カプシドの核酸配列が、配列番号1809と少なくとも99%同一である、項目7に記載のAAV粒子。
[項目9]
前記カプシドの核酸配列が、配列番号1809である、項目8に記載のAAV粒子。
[項目10]
前記カプシドがVOY201である、項目2に記載のAAV粒子。
[項目11]
前記カプシドの核酸配列が、配列番号1810と少なくとも95%同一である、項目10に記載のAAV粒子。
[項目12]
前記カプシドの核酸配列が、配列番号1810と少なくとも99%同一である、項目11に記載のAAV粒子。
[項目13]
前記カプシドの核酸配列が、配列番号1810である、項目12に記載のAAV粒子。
[項目14]
前記ペプチドインサートがAAVPHP.Nである、項目2に記載のAAV粒子。
[項目15]
前記ペプチドインサートがAAVPHP.Bである、項目2に記載のAAV粒子。
[項目16]
前記ペプチドインサートがAAVPHP.Aである、項目2のAAV粒子。
[項目17]
送達が静脈内投与による、項目1~16のいずれか一項に記載のAAV粒子。
[項目18]
静脈内投与後にCNS構造に形質導入する、項目17に記載のAAV粒子。
[項目19]
送達が頸動脈内投与による、項目1~16のいずれか一項に記載のAAV粒子。
[項目20]
頸動脈内投与後にCNS構造に形質導入する、項目19に記載のAAV粒子。
[項目21]
前記CNS構造が、脳、脊髄、脳幹核、小脳、大脳、運動皮質、尾状核、視床、視床下部、頚髄、胸髄、腰髄、線条体、黒質、海馬、扁桃および/または大脳皮質からなる群から選択される1つ以上の領域である、項目18または20に記載のAAV粒子。
[項目22]
前記ウイルスゲノムが、2つの末端逆位配列(ITR)間に配置されている核酸配列を含み、前記核酸は、発現されると細胞における目的の遺伝子の発現を阻害または抑制し、前記核酸配列は、センス鎖配列およびアンチセンス鎖配列を含み、前記センス配列およびアンチセンス鎖配列は、少なくとも4ヌクレオチド長の相補性の領域を共有する、項目1~21のいずれか一項に記載のAAV粒子。
[項目23]
前記核酸配列が、siRNA二重鎖のセンス鎖配列およびアンチセンス鎖配列を含む、項目22に記載のAAV粒子。
[項目24]
前記目的の遺伝子が、SOD1、HTT、APOEおよびMAPTからなる群から選択される、項目22に記載のAAV粒子。
[項目25]
前記相補性の領域が少なくとも17ヌクレオチド長である、項目22に記載のAAV粒子。
[項目26]
前記相補性の領域が、19~21ヌクレオチド長である、項目25に記載のAAV粒子。
[項目27]
前記相補性の領域が19ヌクレオチド長である、項目26に記載のAAV粒子。
[項目28]
前記センス鎖配列および前記アンチセンス鎖配列が、独立に30ヌクレオチド以下である、項目22に記載のAAV粒子。
[項目29]
前記センス鎖配列および前記アンチセンス鎖配列の少なくとも一方が、少なくとも1ヌクレオチドの3’突出を含む、項目22に記載のAAV粒子。
[項目30]
前記センス鎖配列および前記アンチセンス鎖配列の少なくとも一方が、少なくとも2ヌクレオチドの3’突出を含む、項目29に記載のAAV粒子。
[項目31]
前記アンチセンス鎖が、少なくとも80%の割合で前記AAV粒子から切り出される、項目22に記載のAAV粒子。
[項目32]
前記アンチセンス鎖が、少なくとも90%の割合で前記AAV粒子から切り出される、項目22に記載のAAV粒子。
[項目33]
前記アンチセンス鎖が、少なくとも95%の割合で前記AAV粒子から切り出される、項目22に記載のAAV粒子。
[項目34]
前記アンチセンス鎖が、前記センス鎖の切り出しの割合よりも大きな割合で前記AAV粒子から切り出される、項目22に記載のAAV粒子。
[項目35]
前記アンチセンス鎖の切り出しの割合が、前記センス鎖の切り出しの割合よりも少なくとも2倍大きい、項目34に記載のAAV粒子。
[項目36]
前記アンチセンス鎖の切り出しの割合が、前記センス鎖の切り出しの割合よりも少なくとも5倍大きい、項目34に記載のAAV粒子。
[項目37]
前記アンチセンス鎖の切り出しの割合が、前記センス鎖の切り出しの割合よりも少なくとも10倍大きい、項目34に記載のAAV粒子。
[項目38]
前記ウイルスゲノムが、2つの末端逆位配列(ITR)間に配置されている核酸配列を含み、前記核酸が標的タンパク質をコードし、前記核酸が発現されると、前記細胞における前記標的タンパク質のレベルが増加する、項目1~21のいずれか一項に記載のAAV粒子。
[項目39]
前記標的タンパク質が、抗体、AADC、APOE2またはフラタキシンである、項目38に記載のAAV粒子。
[項目40]
AAV粒子を含む医薬組成物であって、前記AAV粒子が、AAVカプシドおよびウイルスゲノムを含み、前記AAVカプシドが、前記AAV粒子の送達後に血液脳関門を透過する医薬組成物。
[項目41]
前記AAVカプシドが、VOY101またはVOY201である、項目40に記載の医薬組成物。
[項目42]
前記ウイルスゲノムが、siRNA分子をコードする核酸配列を含む、項目41に記載の医薬組成物。
[項目43]
前記siRNA分子が、目的の遺伝子を標的とし、前記目的の遺伝子が、SOD1、HTT、APOE、およびMAPTからなる群から選択される、項目42に記載の医薬組成物。
[項目44]
前記ウイルスゲノムが、標的タンパク質をコードする核酸配列を含む、項目41に記載の医薬組成物。
[項目45]
前記標的タンパク質が、抗体、AADC、ApoE2、およびフラタキシンからなる群から選択される、項目44に記載の医薬組成物。
[項目46]
細胞における目的の標的遺伝子の発現を増加または阻害する方法であって、前記細胞に、項目1~37のいずれか一項に記載のAAV粒子を含む組成物または項目40~43の組成物のいずれかを投与する工程を含む方法。
[項目47]
前記細胞が哺乳類細胞である、項目46に記載の方法。
[項目48]
前記哺乳類細胞が、CNSの細胞である、項目47に記載の方法。
[項目49]
細胞における目的の遺伝子の発現を増加させる方法であって、前記細胞に、項目38~39のいずれか一項に記載のAAV粒子を含む組成物または項目44~45の医薬組成物のいずれかを投与する工程を含む方法。
[項目50]
前記細胞が哺乳類細胞である、項目49に記載の方法。
[項目51]
前記哺乳類細胞が、CNSの細胞である、項目50に記載の方法。
[項目52]
対象のCNSにおける目的のタンパク質のレベルを減少させる方法であって、前記対象に、項目1~37のいずれか一項に記載のAAV粒子を含む組成物または項目40~43の組成物のいずれかを投与する工程を含む方法。
[項目53]
前記投与の経路が静脈内投与である、項目52に記載の方法。
[項目54]
前記投与の経路が頸動脈内投与である、項目52に記載の方法。
[項目55]
対象のCNSにおける目的のタンパク質のレベルを増加させる方法であって、前記対象に、項目38~39のいずれか一項に記載のAAV粒子を含む組成物または項目44~45の医薬組成物のいずれかを投与する工程を含む方法。
[項目56]
前記投与の経路が静脈内投与である、項目55に記載の方法。
[項目57]
前記投与の経路が頸動脈内投与である、項目55に記載の方法。
[項目58]
治療を必要とする対象の神経学的疾患を治療および/または改善する方法であって、前記対象に、項目1~39のいずれか一項に記載のAAV粒子を含む組成物または項目40~45の医薬組成物のいずれかの治療有効量を投与する工程を含む方法。
[項目59]
前記AAV粒子を含む組成物が、静脈内送達によって前記対象に投与される、項目58に記載の方法。
[項目60]
前記AAV粒子を含む組成物が、頸動脈内送達によって前記対象に投与される、項目58に記載の方法。
[項目61]
前記AAV粒子が、目的のタンパク質をコードする核酸配列を含む、項目58~60のいずれか一項に記載の方法。
[項目62]
前記目的のタンパク質が、抗体、AADC、ApoE2、およびフラタキシンからなる群から選択される、項目61に記載の方法。
[項目63]
前記AAV粒子が、siRNA分子をコードする核酸配列を含む、項目58~60のいずれか一項に記載の方法。
[項目64]
前記siRNA分子が目的の遺伝子を標的とし、前記目的の遺伝子が、SOD1、HTT、APOE、およびMAPTからなる群から選択される、項目63に記載の方法。
[項目65]
カプシドおよびウイルスゲノムを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)粒子であって、前記ウイルスゲノムは、前記AAV粒子が送達されると心筋細胞に形質導入するAAV粒子。
[項目66]
前記AAV粒子が、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5(G2B5)、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3-3、AAV4、AAV4-4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42-1b、AAV42-2、AAV42-3a、AAV42-3b、AAV42-4、AAV42-5a、AAV42-5b、AAV42-6b、AAV42-8、AAV42-10、AAV42-11、AAV42-12、AAV42-13、AAV42-15、AAV42-aa、AAV43-1、AAV43-12、AAV43-20、AAV43-21、AAV43-23、AAV43-25、AAV43-5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1-7/rh.48、AAV1-8/rh.49、AAV2-15/rh.62、AAV2-3/rh.61、AAV2-4/rh.50、AAV2-5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3-9/rh.52、AAV3-11/rh.53、AAV4-8/r11.64、AAV4-9/rh.54、AAV4-19/rh.55、AAV5-3/rh.57、AAV5-22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH-1/hu.1、AAVH-5/hu.3、AAVLG-10/rh.40、AAVLG-4/rh.38、AAVLG-9/hu.39、AAVN721-8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R突然変異体、AAVrh8R R533A突然変異体、AAAV、BAAV、ヤギAAV、ウシAAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV-PAEC、AAV-LK01、AAV-LK02、AAV-LK03、AAV-LK04、AAV-LK05、AAV-LK06、AAV-LK07、AAV-LK08、AAV-LK09、AAV-LK10、AAV-LK11、AAV-LK12、AAV-LK13、AAV-LK14、AAV-LK15、AAV-LK16、AAV-LK17、AAV-LK18、AAV-LK19、AAV-PAEC2、AAV-PAEC4、AAV-PAEC6、AAV-PAEC7、AAV-PAEC8、AAV-PAEC11、AAV-PAEC12、AAV-2-pre-miRNA-101、AAV-8h、AAV-8b、AAV-h、AAV-b、AAV SM10-2、AAVシャッフル100-1、AAVシャッフル100-3、AAVシャッフル100-7、AAVシャッフル10-2、AAVシャッフル10-6、AAVシャッフル10-8、AAVシャッフル100-2、AAV SM10-1、AAV SM10-8、AAV SM100-3、AAV SM100-10、BNP61AAV、BNP62AAV、BNP63AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4-8/rh.64、AAVLG-9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、トゥルータイプAAV(ttAAV)、UPENN AAV10、日本AAV10血清型、AAV CBr-7.1、AAV CBr-7.10、AAV CBr-7.2、AAV CBr-7.3、AAV CBr-7.4、AAV CBr-7.5、AAV CBr-7.7、AAV CBr-7.8、AAV CBr-B7.3、AAV CBr-B7.4、AAV CBr-E1、AAV CBr-E2、AAV CBr-E3、AAV CBr-E4、AAV CBr-E5、AAV CBr-e5、AAV CBr-E6、AAV CBr-E7、AAV CBr-E8、AAV CHt-1、AAV CHt-2、AAV CHt-3、AAV CHt-6.1、AAV CHt-6.10、AAV CHt-6.5、AAV CHt-6.6、AAV CHt-6.7、AAV CHt-6.8、AAV CHt-P1、AAV CHt-P2、AAV CHt-P5、AAV CHt-P6、AAV CHt-P8、AAV CHt-P9、AAV CKd-1、AAV CKd-10、AAV CKd-2、AAV CKd-3、AAV CKd-4、AAV CKd-6、AAV CKd-7、AAV CKd-8、AAV CKd-B1、AAV CKd-B2、AAV CKd-B3、AAV CKd-B4、AAV CKd-B5、AAV CKd-B6、AAV CKd-B7、AAV CKd-B8、AAV CKd-H1、AAV CKd-H2、AAV CKd-H3、AAV CKd-H4、AAV CKd-H5、AAV CKd-H6、AAV CKd-N3、AAV CKd-N4、AAV CKd-N9、AAV CLg-F1、AAV CLg-F2、AAV CLg-F3、AAV CLg-F4、AAV CLg-F5、AAV CLg-F6、AAV CLg-F7、AAV CLg-F8、AAV CLv-1、AAV CLv1-1、AAV Clv1-10、AAV CLv1-2、AAV CLv-12、AAV CLv1-3、AAV CLv-13、AAV CLv1-4、AAV Clv1-7、AAV Clv1-8、AAV Clv1-9、AAV CLv-2、AAV CLv-3、AAV CLv-4、AAV CLv-6、AAV CLv-8、AAV CLv-D1、AAV CLv-D2、AAV CLv-D3、AAV CLv-D4、AAV CLv-D5、AAV CLv-D6、AAV CLv-D7、AAV CLv-D8、AAV CLv-E1、AAV CLv-K1、AAV CLv-K3、AAV CLv-K6、AAV CLv-L4、AAV CLv-L5、AAV CLv-L6、AAV CLv-M1、AAV CLv-M11、AAV CLv-M2、AAV CLv-M5、AAV
CLv-M6、AAV CLv-M7、AAV CLv-M8、AAV CLv-M9、AAV CLv-R1、AAV CLv-R2、AAV CLv-R3、AAV CLv-R4、AAV CLv-R5、AAV CLv-R6、AAV CLv-R7、AAV CLv-R8、AAV CLv-R9、AAV CSp-1、AAV CSp-10、AAV CSp-11、AAV CSp-2、AAV CSp-3、AAV CSp-4、AAV CSp-6、AAV CSp-7、AAV CSp-8、AAV CSp-8.10、AAV CSp-8.2、AAV CSp-8.4、AAV CSp-8.5、AAV CSp-8.6、AAV CSp-8.7、AAV CSp-8.8、AAV CSp-8.9、AAV CSp-9、AAV.hu.48R3、AAV.VR-355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AAVF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8および/またはAAVF9/HSC9、ならびにそれらの変異体からなる群から選択されるカプシドまたはペプチドインサートを含む、項目65に記載のAAV粒子。
[項目67]
前記カプシドがVOY101である、項目66に記載のAAV粒子。
[項目68]
前記カプシドのアミノ酸配列が、配列番号1である、項目67に記載のAAV粒子。
[項目69]
前記カプシドの核酸配列が、配列番号1809である、項目67に記載のAAV粒子。
[項目70]
前記カプシドがVOY201である、項目66に記載のAAV粒子。
[項目71]
前記カプシドの核酸配列が、配列番号1810である、項目70に記載のAAV粒子。
[項目72]
前記ペプチドインサートが、AAVPHP.N、AAVPHP.BおよびAAVPHP.Aからなる群から選択される、項目66に記載のAAV粒子。
[項目73]
AAV粒子を含む医薬組成物であって、前記AAV粒子が、AAVカプシドおよびウイルスゲノムを含み、前記ウイルスゲノムが、目的のタンパク質をコードし、前記目的のタンパク質が、ATP2A2およびS100A1からなる群から選択される、医薬組成物。
[項目74]
対象の心血管組織における目的のタンパク質のレベルを増加させる方法であって、項目73に記載の医薬組成物を投与する工程を含む方法。
[項目75]
それを必要とする対象の心血管疾患を治療する方法であって、前記対象に、項目73に記載の医薬組成物を投与する工程を含む方法。
[項目76]
それを必要とする対象の心不全を治療する方法であって、前記対象に、項目73に記載の医薬組成物を投与する工程を含む方法。
[項目77]
前記投与の経路が静脈内投与である、項目74~76のいずれか一項に記載の方法。