JP6681327B2 - 抗pd−1抗体およびその応用 - Google Patents

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Description

本発明はバイオメディカルの分野に属し、高親和力でPD−1と特異的に結合する抗体又はその機能性断片に関する。また、本発明の抗体又はその機能性断片をコードする核酸分子、本発明の抗体又はその機能性断片を発現させるための発現ベクターと宿主細胞、および、本発明の抗体又はその機能性断片の生産方法をさらに提供する。本発明は、本発明の抗体又はその機能性断片の免疫抱合体および薬物組成物、並びに、本発明の抗体又はその機能性断片を使用して複数種の疾患(がん、感染症、および炎症性疾患を含む)を治療する方法をさらに提供する。
プログラム細胞死因子1(programmed cell death 1、PD−1)はCD28ファミリーのメンバーであり、活性化T細胞とB細胞の表面において発現される免疫抑制性受容体でもある(Yao,Zhu et al.Advances in targeting cell surface signalling molecules for immune modulation.Nat Rev Drug Discov,2013,12(2):130−146)。当該受容体とそのリガンドPD−L1およびPD−L2との結合は、免疫T細胞が関与する免疫応答を効果的に低減させることができる。腫瘍細胞は、PD−L1を過剰発現することにより、有機体内の免疫監視から逃げる(OkazakiとHonjo,PD−1 and PD−1 ligands:from discovery to clinical application.International Immunology,2007,19(7):813−824 2007)。PD−1とPD−L1の相互作用を遮断すれば、CD8+細胞毒性T細胞の活性を顕著に高めて、腫瘍細胞を殺傷することができる。
PD−1は主にCD4+T細胞、CD8+T細胞、NKT細胞、B細胞および活性化された単核細胞の表面に発現され、主にT細胞受容体(TCR)又はB細胞受容体(BCR)信号に誘導されて発現されるものであり、TNFによりこれらの細胞表面でのPD−1の発現増強ができる(Francisco,Sage et al.,The PD−1 pathway in tolerance and autoimmunity.Immunol Rev,2010,236:219−242)。ヒトPD−1は遺伝子Pdcd1によりコードされ、2q37.3に位置し、全長が9.6kbであり、5つのエクソンと4つのイントロンとからなり、その上流に663bpのプロモータが含まれている。PD−1の分子構造は細胞外領域、膜貫通領域および細胞内領域からなり、細胞外領域のアミノ酸配列はCTLA−4と24%の相同性を有し、CD28と28%の相同性を有し、その遺伝子は主に7つのモノヌクレオチド多形性部位を有する。細胞外領域は一つの免疫グロブリン可変領域IgVドメインを含み、細胞内領域はチロシンに基づく二つのシグナル伝達モチーフであるITIM(免疫受容体チロシン抑制作用モチーフ)およびITSM(免疫受容体チロシン変換作用モチーフ)を含む。T細胞が活性化された後、PD−1は主にITSMモチーフによりチロシンホスホリパーゼSHP2を集め、CD3ζ、PKCθおよびZAP70等のエフェクタ分子の脱リン酸化を引き起こす。
PD−1リガンドとしては、PD−L1およびPD−L2という二つのものがある。PD−L1はB7H1又はCD274とも称され、PD−L2はB7DC又はCD273と称される。PD−L遺伝子はヒト染色体の9p24.2部位に位置し、大きさが42kbである。これらのリガンドはB7−1、B7−2およびICOSLと21〜27%のアミノ酸配列相同性および構造類似性を有し、いずれも一つの免疫グロブリン様可変領域ドメイン、一つの定常領域様ドメイン、一つの膜貫通領域、および一つの短い細胞質尾部を含み、PD−L1の細胞質尾部はPD−L2よりも保守的である。PD−L1とPD−L2は異なる細胞群体において発現され(Shimauchi,Kabashima et al.,Augmented expression of programmed death−1 in both neoplastic and non−neoplastic CD4+ T−cells in adult T−cell leukemia/lymphoma.Int J Cancer,2007,121(12):2585−2590)、これらの細胞は非造血組織および各腫瘍タイプを含む。PD−L1は主にT細胞、B細胞、樹状細胞、マクロファージ、間葉系幹細胞および骨髄由来の肥満細胞において発現される。PD−L1は、非骨髄由来の細胞、例えば血管内皮細胞、上皮細胞、骨格筋細胞、肝細胞、腎細管上皮細胞、膵島細胞、脳星状細胞、および例えば黒色腫、肝臓がん、胃がん、腎細胞がんといった各種の非リンパ系腫瘍においても発現され、免疫学的特別部位例えば胎盤、目の細胞においても発現される。これから分かるように、PD−L1は、自己反応性T細胞とB細胞および免疫寛容を調節する面では一定の普遍性があり、そして末梢組織のT細胞とB細胞応答に役立っている。しかし、PD−L2の発現領域に非常に限りがあり、マクロファージと樹状細胞のみにおいて存在し、主に免疫提示に役立つものであると考えられている。
T細胞の活性化を調節し制御するためにPD−1とPD−L1を相互に作用させることは、腫瘍とウイルス感染において多く検証されている。PD−L1は、肺がん細胞、肝臓がん細胞、卵巣がん細胞、子宮頸がん細胞、皮膚がん細胞、膀胱がん細胞、結腸がん細胞、乳腺がん細胞、神経膠腫細胞、腎臓がん細胞、胃がん細胞、食道がん細胞、口腔扁平細胞がん細胞、および頭頸部がん細胞を含む複数種の腫瘍細胞の表面において発現される。また、これらのがんの周囲でPD−L1を発現する大量のCD8+T細胞をも発見した。臨床統計により、腫瘍細胞でのPD−L1の高い発現レベルは、がん患者の不良な予後に関わることが分かった(OkazakiとHonjo 2007,同上)。
複数種の遅発性と急性ウイルスもPD−1とPD−L1信号により人体の免疫監視から逃げる。例えば、HIV感染者体内のPD−1の発現レベルはT細胞の枯渇程度と密接な関連があり、そしてAIDS疾患の進行のマークの一つとしてもよい(Trabattoni,Saresella et al.,B7−H1 is up−regulated in HIV infection and is a novel surrogate marker of disease progression.Blood,2003,101(7):2514−2520)。この現象は同様に慢性B型肝炎患者にも適用される(Evans,Riva et al.,Programmed death 1 expression during antiviral treatment of chronic hepatitis B:Impact of hepatitis B e−antigen seroconversion.,Hepatology,2008,48(3):759−769)。動物実験により、PD−1遺伝子ノックアウトマウスは正常マウスよりもウイルス感染を効果的に抑え、HBV特異性T細胞をHBV遺伝子改変動物に移し替えると、肝炎を引き起こしてしまうことが分かった。
本発明はプログラム細胞死因子1(PD−1)と結合できる抗PD−1抗体およびその機能性断片に関する。
一方、本発明の抗体又はその機能性断片機能する断片は、配列番号:1、2、3、7、8、9、13、14、15のアミノ酸配列又はあらゆる前記配列の変異体から選ばれる重鎖CDR、および/又は、配列番号:4、5、6、10、11、12、16、17、18のアミノ酸配列又はあらゆる前記配列の変異体から選ばれる軽鎖CDRを含む。
いくつかの好ましい実施形態では、前記抗体又はその機能性断片の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列は、下記の各アミノ酸配列又はその変異体の組の一つから選ばれる。
および/又は、その軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列は下記の各アミノ酸配列又はその変異体群の一つから選ばれる。
いくつかの好ましい実施形態では、本発明の抗体又はその機能性断片の重鎖CDR1、CDR2およびCDR3と軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列は下記の各アミノ酸配列又はその変異体群の一つから選ばれる。
いくつかの実施の形態では、本発明の抗体又はその機能性断片は、配列番号:19、21、23のアミノ酸配列又はあらゆる前記配列の変異体から選ばれる重鎖可変領域、および/又は、配列番号:20、22、24のアミノ酸配列又はあらゆる前記配列の変異体から選ばれる軽鎖可変領域を含む。
一つの好ましい実施形態では、前記重鎖可変領域は配列番号:19又はその変異体であり、前記軽鎖可変領域は配列番号:20又はその変異体である。
もう一つの好ましい実施形態では、前記重鎖可変領域は配列番号:21又はその変異体であり、前記軽鎖可変領域は配列番号:22又はその変異体である。
さらなる一つの好ましい実施の形態では、前記重鎖可変領域は配列番号:23又はその変異体であり、前記軽鎖可変領域は配列番号:24又はその変異体である。
本発明の抗体又はその機能性断片はキメラ抗体、ヒト化抗体又は完全ヒト型抗体であってもよい。
本発明の抗体又はその機能性断片はヒト化のものであってもよい。ヒト化抗体を調製する方法は当業者が周知するものである。例えば、本発明のCDR配列をヒト抗体可変領域に移し替えることにより、本発明のヒト化抗PD−1抗体を調製することができる。前記ヒト化抗体は抗抗体反応(AAR)およびヒト抗マウス抗体反応(HAMA)を生じず、抗抗体で中和されることにより迅速に除去されることがなく、また免疫作用、例えばADCCおよびCDC作用を有している。
いくつかの好ましい実施の形態では、本発明のヒト化PD−1抗体又はその機能性断片は配列番号:33、35、36のアミノ酸配列又はあらゆる前記配列の変異体から選ばれる重鎖可変領域、および/又は、配列番号:34、37のアミノ酸配列又はあらゆる前記配列の変異体から選ばれる軽鎖可変領域を含む。
本発明のヒト化抗体又はその機能性断片の一つの好ましい実施の形態では、前記重鎖可変領域は配列番号:33又はその変異体であり、前記軽鎖可変領域は配列番号:34又はその変異体である。
本発明のヒト化抗体又はその機能性断片のもう一つの好ましい実施の形態では、前記重鎖可変領域は配列番号:35又はその変異体であり、前記軽鎖可変領域は配列番号:34又はその変異体である。
本発明のヒト化抗体又はその機能性断片のもう一つの好ましい実施の形態では、前記重鎖可変領域は配列番号:36又はその変異体であり、前記軽鎖可変領域は配列番号:34又はその変異体である。
本発明のヒト化抗体又はその機能性断片のさらなる一つの好ましい実施の形態では、前記重鎖可変領域は配列番号:35又はその変異体であり、前記軽鎖可変領域は配列番号:37又はその変異体である。
本発明は、本発明の抗体又は機能性断片をコードする分離された核酸分子をさらに提供する。一つの好ましい実施の形態では、前記核酸分子は配列番号:25−30、38−42で示されるヌクレオチド配列又はその組合せを含む。
本発明は、前記核酸分子を含む発現ベクターおよび前記発現ベクターを含む宿主細胞をさらに提供する。
本発明は、前記抗体又はその機能性断片を産生できる条件で本発明の上記宿主細胞を培養し、このように産生された前記抗体又はその機能性断片を回収することを含む抗PD−1抗体又はその機能性断片を産生する方法を提供する。
他方、本発明は治療剤と抱合する本発明の抗体又はその機能性断片を含む免疫抱合体に関する。前記治療剤としては好ましくは毒素、放射性同位体、薬物又は細胞毒性薬である。
本発明はさらに、本発明の抗体又はその機能性断片および薬用可能なベクターを含む薬物組成物に関する。
他方、本発明は、PD−1の活性を取り除き、抑制し又は低減することにより、疾患や病症を予防し又は治療するための方法において、この需要のある対象に治療有効量の本発明の抗体又はその機能性断片、核酸、発現ベクター、宿主細胞、免疫抱合体又は薬物組成物を投薬することを含む方法を提供する。そのうち、前記疾患や病症はがん、感染症又は炎症性疾患から選ばれ、前記がんは、好ましくは黒色腫、腎臓がん、前立腺がん、乳がん、結腸がん、肺がん、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部がん、皮膚又は眼内悪性黒色腫、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、肛門領域がん、胃がん、睾丸がん、子宮がん、卵管がん、子宮内膜がん、子宮頸がん、膣がん、陰門がん、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、食道がん、小腸がん、内分泌系がん、甲状腺がん、副甲状腺がん、副腎がん、軟部組織肉腫、尿道がん、陰茎がん、急性骨髄性白血病と、慢性骨髄性白血病と、急性リンパ球性白血病と、慢性リンパ球性白血病とを含む慢性又は急性白血病、小児期固形腫瘍、リンパ球性リンパ腫、膀胱がん、腎細胞がん又は尿管がん、腎盂がん、中枢神経系の贅生、原発性中枢神経系リンパ腫、腫瘍血管新生、脊髄軸腫瘍、脳幹膠腫、下垂体腺腫、カポジ肉腫、類表皮がん、扁平上皮がん、T細胞リンパ腫、アスベストに誘発されたがんを含む環境に誘発されたがん、および前記のがんの組合せから選ばれる。前記の感染症は、好ましくはHIV、インフルエンザ、疱疹、ランブル鞭毛虫症、マラリア、リーシュマニア症、肝炎ウイルス(A型、B型およびC型),疱疹ウイルス(例えば、VZV、HSV−1、HAV−6、HSV−IIとCMV、エプスタイン・バーウイルス),アデノウイルス,インフルエンザウイルス,フラビウイルス,エコーウイルス,ライノウイルス,コクサッキーウイルス,コロナウイルス,呼吸器合胞体ウイルス,ムンプスウイルス,ロタウイルス,麻疹ウイルス,風疹ウイルス,パルボウイルス,ワクシニアウイルス,HTLVウイルス,デング熱ウイルス,乳頭腫ウイルス,軟属腫ウイルス,ポリオウイルス,狂犬病ウイルス,JCウイルス,アルボウイルス脳炎ウイルスというウイルスによる病原性感染症、クラミジア,リケッチア,マイコバクテリア,葡萄球菌,連鎖球菌,肺炎球菌,髄膜炎菌とconococci,クレブシエラ菌,プロテウス菌,セラチア菌,シュードモナス菌,レジオネラ菌,ジフテリア菌,サルモネラ菌,桿菌,コレラ菌,破傷風菌,ボツリヌス中毒菌,炭疽菌,ペスト菌,レプトスピラ菌,ライム病菌という細菌による病原性感染症、カンジダ(カンジダ・アルビカンス、カンジダ・クルセイ、カンジダ・グラブラタ、カンジダ・トロピカリス等),クリプトコックス・ネオフォルマンス,アスペルギルス(アスペルギルス・フミガーツス、黒色アスペルギルス等),ケカビ目属(ケカビ属、アブシディア属、リゾープス属),スポロトリクム・シェンキー,皮膚炎出芽酵母,ブラジル・パラコクシジオイデス,コクシジオイデス・イミティス,ヒストプラスマ・カプスラーツムという真菌による病原性感染症、および、赤痢アメーバ,大腸バランチジウム,ネグレリア・フォーレリ,アカントアメーバ,ランブル鞭毛虫,クリプトスポリジウム,ニューモシスティス・カリニ,三日熱マラリア原虫,バベシア・ミクロチ,トリパノソーマ・ブルーセイ,クルーズ・トリパノソーマ,ドノバン・リーシュマニア,トキソプラズマ原虫,ニッポストロンジラス・ブラジリエンシスという寄生虫による病原性感染症から選ばれ、前記炎症性疾患は、好ましくは急性散在性脳脊髄炎、アジソン病、強直性脊椎炎、抗リン脂質抗体症候群、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、関節炎、ベーチェット病、水疱性類天疱瘡、セリアック病、シャーガス病、クローン病、皮膚筋炎、1型糖尿病、グッドパスチャー症候群、移植片対宿主病、グレーブス病、ギラン−バレー症候群、橋本病、高IgE症候群、特発性血小板減少性紫斑病、紅斑性狼瘡、多発性硬化症、重症筋無力、天疱瘡、悪性貧血、多発性筋炎、原発性胆汁性肝硬変、乾癬、関節リウマチ、シェーグレン症候群、側頭動脈炎、血管炎、およびヴェグナー肉芽腫症から選ばれる。
本発明は、本発明の抗体又はその機能性断片、核酸、発現ベクター、宿主細胞、免疫抱合体又は薬物組成物の、疾患や病症を治療するための薬物の調製への用途をさらに提供する。
図1はSDS−PAGEによるヒト由来(hu)およびカニクイザル由来(cyno)のPD−1細胞外ドメインの蛋白質の大きさを示すものである。 図2はフローサイトメトリーにより測定されたビオチンで標識されたrh−PD−L1とヒトT細胞との結合を示すものである。 図3はフローサイトメトリーにより測定されたPD−L1対照、クローン1、10、11、55および64が細胞表面のPD−1とリガンドPD−L1との結合を阻害することを示すものである。 図4は対照抗体、クローン1、10、11、55および64とPD−1および他のCD28ファミリーメンバー(ICOS、CTLA−4およびCD28)との結合を示すものである。 図5はT細胞に対するキメラ抗体の外部刺激を検出する破傷風毒素刺激実験を示すものである。 図6はCD8+細胞因子検出キットにより検出されたヒト化抗体クローン38、39、41および48((conIgG4)を対照とする)IL2の分泌レベルを示すものである。 図7は樹状細胞と組み換えされたMD−MAB−453細胞とをともに3日培養した後、抽出されたT細胞と本発明のヒト化抗PD−1抗体クローン38、39、41および48((conIgG4)を対照とする)とを加えてともに3日培養して得たGFP蛍光値を示すものである。 図8A−Cは本発明のヒト化抗体とヒト由来、カニクイザル由来およびマウス由来PD−1蛋白質との結合を示すものである。 図9はヒト(human)、カニクイザル(Cyno)およびマウス(mouse)PD−1配列の対比を示すものであり、そのうち、マウスPD−1蛋白質とヒトおよびカニクイザルPD−1蛋白質との主な異なる領域はフレームで標示される。 図10はヒト化抗体で外部からT細胞を刺激して増殖させる実験−破傷風抗原の記憶応答実験の結果を示すものである。 図11はヒト化抗体で外部からT細胞を刺激して増殖させる実験−ウイルスポリペプチド抗原の記憶応答実験の結果を示すものである。
別途定義されていない限り、本明細書に用いられるすべての科学技術用語は当業者が理解するものと同じ意味を有する。本分野での定義および用語については、専門家は、具体的には、Current Protocols in Molecular Biology(Ausubel)を参考にすることができる。アミノ酸残基の略語は本分野で用いられる20個の常用L−アミノ酸の一つを表す標準的3文字および/又は1文字コードである。
本発明は、プログラム細胞死因子1(PD−1)と結合できる抗PD−1抗体およびその機能性断片を提供する。本発明の抗体又はその機能性断片は、高親和力でPD−1とPD−L1との相互作用を遮断できること、高特異性でPD−1と結合できるが、他のCD28ファミリーのメンバー(例えば、ICOS、CTLA−4およびCD28)と結合しないこと、および、腫瘍特異性T細胞を活性化させて、腫瘍細胞を殺傷し、CD8+の固形腫瘍組織への進入を促進し、IFNγ等の免疫エフェクタのレベルを大きく増加させることという特徴の少なくとも一つを有する。
本発明は、ヒト化抗PD−1抗体およびその機能性断片をさらに提供する。前記ヒト化抗体は、免疫マウスによるマウス由来抗体をコンピュータシミュレーションにより設計し、ファージディスプレイ技術と組み合わせて得られたものであり、そしてその異なる種のPD−1蛋白質との結合特性に基づいて、その結合エピトープも同定された。本発明にかかるヒト化抗PD−1抗体およびその機能性断片は上記の抗PD−1抗体およびその機能性断片の有利な特徴を有する以外、マウス由来PD−1蛋白質と相互に作用することなく、高親和力でヒト又はカニクイザルPD−1蛋白質と結合する。
前記抗体又はその機能性断片の配列の変異体を得るために、実質的に抗体の活性に影響しない前提で、当業者は本発明の配列に対して一つ又はそれ以上(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10個、あるいはそれ以上)のアミノ酸を取り替え、添加しおよび/又は欠失させることができる。それらはいずれも本発明が保護しようとする範囲に含まれるものと見なされている。例えば、可変領域にて類似特性を有するアミノ酸を取り替える。本発明にかかる変異体の配列はその由来配列と少なくとも95%、96%、97%、98%又は99%の一致性を有することができる。本発明にかかる配列一致性は配列分析ソフトウェアを用いて測定することができる。例えば、デフォルトパラメータのコンピュータプログラムBLAST、特にBLASTP又はTBLASTNを用いる。
本発明の抗体は全長のもの(例えば、IgG1又はIgG4抗体)であってもよく、又は抗原結合部分(例えば、Fab、F(ab’)又はscFv断片)のみを含んでもよく、又は機能に影響するために修飾されてもよい。本発明は修飾されたグリコシル化抗PD−1抗体を含む。いくつかの応用では、意図しないグリコシル化部位を除去するために修飾を行うのは有用であってもよく、又は、例えば抗体依存性細胞毒性(ADCC)機能の抗体を増強するために、オリゴ糖にフコース部分が存在しない。他のいくつかの応用では、補体依存性細胞毒性(CDC)を変えるために、ガラクトシル化修飾を行ってもよい。
本明細書に用いられる用語「機能性断片」は、特に抗体断片例えばFv、scFv(scが一本鎖を表す)、Fab、F(ab’)2、Fab’、scFv−Fc断片又は二重抗体(diabody)、あるいは化学修飾又はリポソームにドープされることにより半減期を増加できるあらゆる断片を言い、前記化学修飾においては、例えば、ポリ(アルキレン)グリコール例えばポリエチレングリコール(「ポリエチレングリコール化、PEG化」)(Fv−PEG、scFv−PEG、Fab−PEG、F(ab’)2−PEG又はFab’−PEGのポリエチレングリコール化断片と称される)(「PEG」がポリエチレングリコールである)を添加し、前記断片はEGFR結合活性を有する。好ましくは、前記機能性断片は、その由来抗体の重又は軽可変鎖の一部の配列から構成され又はそれらを含み、前記一部の配列はその由来抗体と同じ結合特異性および十分な親和力を保つに足り、PD−1については、好ましくは少なくともその由来抗体の親和力の1/100に等しく、より好ましい形態では、少なくとも1/10に等しい。このような機能性断片は少なくとも5つのアミノ酸を含み、好ましくはその由来の抗体配列の10、15、25、50および100個の連続的なアミノ酸を含む。
当業者は、本発明にかかる抗PD−1抗体をコードするDNA分子をベクターにクローニングして、宿主細胞の形質転換を行うことができる。このため、本発明は、本発明にかかる抗PD−1抗体をコードするDNA分子を含む組み換えDNAベクターをさらに提供する。
好ましくは、前記組み換えDNAベクターは発現ベクターであり、当業者は前記抗体のDNA分子を発現ベクターにクローニングして、宿主細胞の形質転換を行い、発現を誘導することにより抗体を得る。本発明の発現ベクターはコードされた抗PD−1抗体の重鎖可変領域、軽鎖可変領域および/又は定常領域のDNA配列を含む。しかし、一つは重鎖可変領域と定常領域を含み、もう一つは軽鎖可変領域と定常領域を含む二種の発現ベクターをそれぞれ構築し、それらを用いて哺乳動物への同時トランスフェクションを行なってもよい。一つの好ましい実施の形態では、前記発現ベクターは、プロモータ、分泌シグナルペプチドをコードするDNA配列、および、選別用の少なくとも一種の薬剤耐性遺伝子をさらに含む。
本発明にかかる宿主細胞は原核宿主細胞、真核宿主細胞又はファージであってもよい。前記原核宿主細胞は大腸菌、枯草菌、ストレプトミセス又はプロテウス・ミラビリス等であってもよい。前記真核宿主細胞は、例えばピキア・パストリス,サッカロマイセス・セレヴィシエ,分裂酵母,トリコデルマ等の真菌、例えばツマジロクサヨトウ等の昆虫の細胞、例えばタバコ等の植物の細胞、例えばBHK細胞,CHO細胞,COS細胞,骨髄腫細胞等の哺乳動物細胞であってもよい。いくつかの実施の形態では、本発明にかかる宿主細胞は好ましくは哺乳動物細胞であり、より好ましくはBHK細胞、CHO細胞、NSO細胞又はCOS細胞である。
本明細書に用いられる用語「薬物組成物」は、ある特定の目的を実現するために組み合せられた少なくとも一種の薬物および任意の薬用可能なベクター又は補助材料の組合せを表す。いくつかの実施の形態では、前記薬物組成物は、本発明の目的を実現するためにともに作用できれば、時間的および/又は空間的に分離された組合せを含む。例えば、前記薬物組成物に含まれる成分(例えば、本発明による抗体、核酸分子、核酸分子組合せおよび/又は抱合体)は全体として対象に投薬されてもよく、又は別々に対象に投薬されてもよい。前記薬物組成物に含まれる成分は別々に対象に投薬される場合、前記成分は同時に又は順に対象に投薬されてもよい。好ましくは、前記薬用可能なベクターは水、緩衝水溶液、等張食塩溶液、例えばPBS(リン酸塩緩衝液)、ブドウ糖、マンニトール、右旋性ブドウ糖、乳糖、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、セルロース、炭酸マグネシウム、0.3%のグリセリン、ヒアルロン酸、エタノール、又は、ポリアルキレングリコール例えばポリプロピレングリコール、トリグリセリド等である。用いられる薬用可能なベクターのタイプは、特に本発明による組成物は経口投薬、経鼻投薬、皮内投薬、皮下投薬、筋肉内投薬又は静脈投薬のいずれのために調合されるものであるかに依存している。本発明による組成物は、添加剤として湿潤剤、乳化剤又は緩衝液物質を含んでもよい。
本発明による薬物組成物はあらゆる適切な手段で投薬でき、例えば、経口投薬、経鼻投薬、皮内投薬、皮下投薬、筋肉内投薬又は静脈投薬のいずれでもよい。
関連の面では、本発明は、抗PD−1抗体と第二治療剤との組合せである薬物組成物を提供する。一つの実施の形態では、前記第二治療剤は有利に抗PD−1抗体と組み合せる任意の試薬である。有利に抗PD−1抗体と組み合せ得る例示的な試薬は、PD−1の活性を抑制する他の試薬(他の抗体又はその抗原結合断片、ペプチド阻害剤、小分子拮抗剤等を含む)および/又はPD−1の上流又は下流シグナル伝達に干渉する試薬を含むが、これらに限定されるものではない。
本明細書に用いられる用語「PD−1の活性を取り除き、抑制し又は低減することにより、疾患や病症を予防し又は治療する」は、PD−1の発現による又はPD−1の発現を症状/特徴とする疾患や病症を表すことを旨とする。いくつかの実施の形態では、前記疾患や病症はがん又は感染症から選ばれる。前記がんは、肺がん、肝臓がん、卵巣がん、子宮頸がん、皮膚がん、膀胱がん、結腸がん、乳腺がん、神経膠腫、腎臓がん、胃がん、食道がん、口腔扁平細胞がんおよび頭頸部がんを含むが、これらに限定されるものではない。前記感染症は、HIVウイルス感染およびB型肝炎ウイルス感染を含むが、これらに限定されるものではない。
本明細書に用いられる「治療有効量」は、投薬対象に対して良好な効果を示すに足る投薬量を言う。実際の投薬量および投薬の速度と時間は、被治療者の自分の状況および重症度に依存している。治療の処方(例えば、投薬量の決定等)は、最終的に一般医および他の医者の責任であり、それに基づいて決定され、一般的には、治療される疾患、患者自分の状況、送達部位、投薬方法、および、医者にとって既知の他の要因が考えられている。
本明細書に用いられる用語「対象」は哺乳動物例えば人類をいうが、他の動物、例えば野生動物(例えば、アオサギ、コウノトリ、ツル等)、家畜(例えば、アヒル、ガチョウ等)又は実験動物(例えば、オランウータン、サル、ラット、マウス、ウサギ、モルモット等)であってもよい。
本発明のいくつかの好ましい実施の形態と側面を証明してさらに解釈するために、下記実施例を提供するが、その範囲を制限するものとして理解されるべきではない。
実施例実施例1.ヒトPD1細胞外ドメインの真核発現プラスミドへのクローニング
Trizol RNA抽出キット(Invitrogen)により、ヒト末梢血球(北京市赤十字血液センター)から総RNAを抽出し、Invitrogenの逆転写キットを使用してcDNAを得、当該cDNAをテンプレートとし、上流プライマーを5’−GTACGCTAGCCACCATGCAGATCCCACAGGC−‘3(配列番号.31)にし、下流プライマーを5’−GATCCTCGAGCCACCAGGGTTTGGAACTG−‘3(配列番号.32)にして、PD1細胞外断片に対してPCR増幅を行う。増幅生成物はNhe IおよびXho Iにより二重酵素切断された後、pCDNA3.1の真核発現プラスミド系にクローニングする。このプラスミドで293T細胞(ATCC)へのトランスフェクションを行なった3日後、上澄み液を収集して培養し、h−PD1を純化する。このようにして、カニクイザルの末梢血球からも総RNAを抽出し、それによるcDNAを真核発現系にクローニングした。
図1に示されるように、グリコシル化等の修飾のため、ヒト由来(hu)およびカニクイザル由来(cyno)のPD−1細胞外ドメインの蛋白質の大きさは、SDS−PAGEにおいてクーマシーブリリアントブルーで染色した後、50Kダルトン前後として示された。
実施例2.細胞にけるPD−1とリガンドPD−L1との結合の検出1.T細胞のヒト末梢血球からの分離
末梢血球(北京血液研究所)懸濁液をナイロンウールカラム(北京海徳生物技術公司)に通過させると、B細胞、プラズマ細胞、単核細胞および若干の補助細胞は選択的にナイロンウールに粘着した一方、大部分のT細胞はナイロンウールカラムを通過したことにより、T細胞を大量に含む群体を得る。その操作を簡単に説明すると、50mlのガラス注射器からピストンを除去し、注射器ヘッドにクリップ付きホースを外嵌する。ナイロンウールを梳いて注射器内に充填する。注射器をホルダに固定し、ナイロンウールを前処理するために、37℃のRPMI細胞培養液を注入する。バルブを閉じた30分後、バルブを開けて細胞培養液を排出する。分離しようとする細胞液を予め加熱されたRPMI培養液により適切な濃度、即ち約5.00×10個の細胞/mlに希釈する。ナイロンウールカラムを浸漬するように、細胞液を注射器内に注入する。注射器に蓋を締めて、37℃で1時間インキュベートする。下口を開けて徐々に放流し(1ドロップ/min)、遠心管に収集する。1000×gで10分間遠心して、所望のTリンパ球を得た。
2.ビオチンによるrh−PD−L1組み換え蛋白質に対する標識
義翹神州生物公司から購入された100μgのrh−PD−L1組み換え蛋白質とDMSOに溶解したビオチンであるアミノカプロン酸−NHS(Thermo)とを1:4のモル比で混合し、室温で1時間静置し、ビオチンで標識されたrh−PD−L1と遊離ビオチンを分離するために、反応混合物をG25ゲルカラム(Thermo)に通過させる。3.ビオチンで標識されたrh−PD−L1とヒトT細胞との結合
異なる濃度のビオチンで標識されたrh−PD−L1組み換え蛋白質と10の分離されたT細胞とを混合し、4℃で15分間培養する。PBSで3回洗浄した後、0.2μg/mlになるまでストレプトアビジンであるアロフィコシアニン(Thermo)(SA−APC)を加え、そして4℃で20分間培養する。PBSで3回洗浄した後、Beckman Dickson Caliburフローサイトメトリーにて660nmで検出する。図2に示される結果から、ビオチンで標識されたPD−L1蛋白質はT細胞と結合できることがわかった。
実施例3.抗rh−PD−1抗体の調製1.動物の免疫
濃度1mg/mlのrh−PD−1組み換え蛋白質10ugを抗原として等量の免疫アジュバント(フロインドアジュバント(Sigma−Aldrich))と混合し、生後6週間の雌性FVBマウス3匹に対して皮下免疫を行う。初回の免疫を行なった後、週毎に同じ投薬量の追加免疫を一回行う。
2.細胞の融合
最終回の追加免疫を行なった後、マウスの高股のリンパ節を取って生理食塩水において粉砕して、B細胞を大量に含む懸濁液を取り、従来の方法に従って電気トランスフェクション(BTX社の電気トランスフェクション装置のハンドブックを参照)を行なってSP2/0細胞と融合させる。融合細胞を、HATを含むRPMI−1640完全培地(Sigma)にて5%のCO、37℃という条件で培養する。
実施例4.リガンドと受容体の遮断実験
20000種のモノクローナルハイブリドーマ細胞から、酵素標識(Elisa)反応により、分泌した抗体がPD−1蛋白質と結合できる1220種のクローンを選別する。この1220種の抗体のうち、五種の抗体はビオチンで標識されたPD−L1とT細胞におけるPD−1受容体との結合を多かれ少なかれ抑制できる。
上記五種の抗体(1ug/ml)をビオチンで標識されたrh−PD−L1(濃度)312ng/mlと混合し、室温で20分間培養する。そして、混合物と分離されたT細胞とを4℃で15分間培養し、生理食塩水で3回洗浄した後、0.2μg/mlのSA−APCを加えて4℃で15分間培養する。生理食塩水で3回洗浄した後、rh−PD−L1とT細胞表面のPD−1受容体との結合を抑制できるか否かを検証するために、サンプルをBD社のフローサイトメトリーにより検出する。
図3から分かるように、クローン1、10、11は細胞表面のPD−1とリガンドPD−L1との結合を阻害できる。一方、クローン55および64では、結合がわずかに抑制された。
実施例5.他のCD28ファミリー蛋白質との結合
クローン1、10、11、55および64の候補抗体の結合特異性をさらに検証するために、1μg/mlのrh−PD−1又は他のCD28ファミリーメンバー蛋白質ICOS、CTLA−4およびCD28(R&D System)を96ウェル酵素標識プレートにおける0.05MpH9炭酸塩被覆緩衝液に置き、4℃で一夜静置する。翌日、ウェル内の溶液を捨て、洗浄緩衝液(PBS+0.5% TWEEN)で3回洗浄する。そして、3%のBSAを含むPBS溶液を加えて20分間遮断する。洗浄緩衝液で3回洗浄した後、1μg/mlの候補抗体100ulを加え、室温で1時間培養した後、洗浄緩衝液で3回洗い流し、洗浄緩衝液を用いて1:10000倍でHRP架橋ヒツジ抗マウス抗体(Jsckson Immunoresearch)を希釈し、室温で1時間培養し、洗浄緩衝液で3回洗浄した後、50μlのTMB(テトラメチルベンジジン)基質溶液を加えて顕色させ、室温で10分間反応させた後、0.5Mの硫酸溶液25ulにより反応を終了し、450nmでの吸光度を読み取る。
図4から分かるように、すべてのテストされた候補抗体はrh−PD−1を識別して結合したが、いずれも他のCD28ファミリーのメンバーを識別しなかった。
実施例6.候補抗体の可変領域配列
候補ハイブリドーマ細胞を全量10個に培養し、1000rpmで10分間遠心して細胞を収集し、そしてTrizolキット(Invitrogen)により総RNAを抽出する。前記RNAをテンプレートとして第一鎖cDNA(Qiagen)を合成した後、第一鎖cDNAを後続テンプレートとして、ハイブリドーマ細胞に対応する可変領域DNA配列を増幅させる。増幅反応に用いられるプライマー配列は抗体可変領域の第一フレームワーク領域および定常領域と相補している(Larrick,J.W.,et al.,(1990)Scand.J.Immunol.,32,121−128およびColoma,J.J.et al.,(1991)BioTechniques,11,152−156者ら)。50μlの反応系に、それぞれcDNA1μl、10×PCR緩衝液5μl、上流と下流プライマーの各々1μl(25pmol)、dNTP1μl、25mmolPLのMgCl1μl、およびHO39μlを加え、95℃で10min予備変性させ、Taq酵素(Invitrogen)1μlを加え、温度サイクルによりPCR増幅を行う。反応条件としては、94℃で1min変性させ、58℃で1minアニーリングし、72℃で115min延伸させるというサイクルを合計30回行い、そして72℃で10min保温することである。
増幅生成物に対して配列決定を行なって得たハイブリドーマクローン1、10および11の重鎖と軽鎖可変領域配列は以下のとおりである。
実施例7.キメラ抗体発現ベクターの構築
ヒト血球(北京血液研究所)から重鎖定常領域Fc断片および軽鎖k/£定常領域をクローニングし、pCDNA3.1プラスミド(Walls MA,Hsiao HおよびHarris LJ(1993),Nucleic Acids Research,Vol.21,No.12 2921−2929を参照)に連結させて組み換えを行う。実施例6にかかる重鎖および軽鎖配列断片はGenscript社による合成のものであり、重鎖はXho IおよびAge Iにより酵素切断され、軽鎖断片はSma IおよびDra IIIにより酵素切断された後、対応するように組み換えされたpCDNA3.1プラスミドに連結させ、そして配列決定によりクローンのDNA配列を確定する。後続の実験材料はいずれもこのシリーズのプラスミドで細胞へのトランスフェクションを行なってから、純化して得られたものである。
実施例8.キメラ抗体によるT細胞機能への外部刺激実験−破傷風毒素刺激試験
新鮮に調製されたPBMCを96ウェルフラットプレートに敷き、一夜培養した後、異なる濃度の抗体および100ng/mlの破傷風毒素(TT)(List Biological Laboratories)を加える。三日後に上澄み液を取り、そしてR&D System社のIFNγキットを使用してElisaにより上澄み液におけるIFNγの含有量を検出する。図5の結果から分かるように、PD−1信号を遮断した後、TTに刺激されて活性化した免疫細胞が分泌した細胞因子は大きく増加した。また、候補抗体の力価は出願番号:200980147059.0におけるBiolegend社から購入されたEH12.2H7よりも高い。
実施例9.異なる抗体の軽鎖と重鎖の交換後のPD−1との相互作用
抗体1、10の軽鎖と重鎖を相互に新たに組み合せて、H1L10(重鎖1と軽鎖10)およびH10L1(重鎖10と軽鎖1)を得る。実施例7に記載されるように、新たに組み合せられた抗体を得、そして元の抗体1(重鎖1、軽鎖1)および元の抗体10(重鎖10、軽鎖10)とともにElisa実験を行い、産生されたEC50の結果は下表に示される。
結果から、新たに組み合せられて産生された抗体は依然として効率的にPD−1蛋白質と結合できることが分かった。実施例10.抗体のヒト化組み換え
上記によるハイブリドーマ細胞が分泌した抗体の可変領域配列に基づいて、ヒト化組み換えを行う。簡単に言えば、ヒト化組み換え過程は、A)各ハイブリドーマ細胞が分泌した抗体の遺伝子配列をヒト胎児系抗体の遺伝子配列と対比して、相同性の高い配列を見出すこと、B)HLA−DRとの親和性を分析して検討し、親和力の低いヒト胎児系フレームワーク配列を選択すること、および、C)コンピュータシミュレーション技術を利用して、分子ドッキングにより可変領域およびその周辺のフレームワークアミノ酸配列を分析し、その三次元的な結合方式を検討することを含む。静電力、ファン・デル・ワールス力、親疎水性およびエントロピーを計算することにより、各ハイブリドーマ細胞が分泌した抗体の遺伝子配列のうちPD−1と作用できスペースフレームを維持する肝心なアミノ酸個体を分析し、それを選択されたヒト胎児系遺伝子フレームワークにグラフトし、これに基づいて、保つ必要があるフレームワーク領域のアミノ酸部位を標示し、ランダムプライマーを合成し、ファージライブラリーを作成し、ヒト化抗体ライブラリーを選別する(Pini,A.等,et al.(1998).Design and Use of a Phage Display Library:HUMAN ANTIBODIES WITH SUBNANOMOLAR AFFINITY AGAINST A MARKER OF ANGIOGENESIS ELUTED FROM A TWO−DIMENSIONAL GEL.,Journal of Biological Chemistry,273(34):21769−21776)。これに基づいて、下記複数のヒト化抗体が得られた。下記クローンが含まれ、そのうち38、39および41の軽鎖配列が同様であり、39と48の重鎖配列が同様である。
38重鎖
38軽鎖
39重鎖
39軽鎖
41重鎖
41軽鎖
48重鎖
48軽鎖
実施例11.T細胞に対するヒト型抗体の外部刺激
新鮮に調製されたPBMC(北京血液研究所)を96ウェルフラットプレートに敷き、一夜培養した後、10μg/mlの抗体および100ng/mlの破傷風毒素(TT)を加え、3日培養した後に上澄み液を収集し、Life Technology社のLuminex装置およびEMD社のCD8+細胞因子検出キットで、ヒト型抗体クローン38、39、41および48((conIgG4)を対照とする)IL2の分泌レベルを検出する。結果(図6を参照)から、ヒト型抗体はいずれもT細胞の機能を刺激できることが分かった。
実施例12.T細胞に対するヒト型抗体の外部刺激に起因した腫瘍細胞に対する殺傷の可能性
PD−L1蛋白質を発現するスローウイルス(Qiagen)でMD−MAB−453細胞に感染させて、PD−L1を安定的に発現するMD−MAB−453細胞系を得、これに基づいて、さらにGFP遺伝子を導入し、GFP蛋白質を安定的に発現させる。新鮮なヒト末梢血球から樹状細胞(DC)を抽出し、96ウェルプレートにおいて、この細胞を300個/ウェルとして上記の組み換えられたMD−MAB−453細胞(300個/ウェル)とともに3日培養した後、抽出されたT細胞(1000個/ウェル)および10μg/mlのヒト型抗PD−1抗体クローン38、39、41および48((conIgG4)を対照とする)を加え、さらにともに3日培養し、GFP蛍光値を読み取る。結果(図7を参照)から、ヒト型抗体はいずれもT細胞を刺激して腫瘍細胞を殺傷させたことが分かった。
実施例13.ヒト化抗体と異なる種のPD−1蛋白質との結合
1μg/mlの上記ヒト由来PD−1、カニクイザルPD−1およびマウス由来PD−1(Sinobiologicalより購入)をpH9の炭酸塩被覆緩衝液0.05Mに希釈し、4℃で一夜静置する。翌日、ウェル内の溶液を捨て、洗浄緩衝液で3回洗浄する。そして、3%のBSAを含むPBS溶液を加えて20分間遮断する。洗浄緩衝液で3回洗浄した後に希釈された異なる濃度の候補抗体100μlを加え、室温で1時間培養した後に洗浄緩衝液で3回洗い流し、洗浄緩衝液を用いて1:10000倍でHRP抱合ヒツジ抗ヒト抗体(Jackson Immunoresearch)を希釈して室温で1時間培養し、洗浄緩衝液で3回洗い流した後、50μlのTMB基質溶液を加えて顕色させ、室温で10分間反応させた後、0.5Mの硫酸溶液25μlにより反応を終了し、450nmでの吸光度を読み取る。結果(図8A、B、C)から、各クローンは類似した親和力でヒト又はカニクイザルPD−1蛋白質と結合したが、いずれもマウス由来PD−1蛋白質と相互に作用しなかった。
ヒト、カニクイザルおよびマウスPD−1配列を対比する(図9を参照して、そのうち、マウスPD−1とヒトおよびカニクイザルPD−1蛋白質との主な異なる領域はフレームで標示される)。実験から、PD−1蛋白質に対する候補抗体のエピトープはこのいくつかの領域に存在していることが実証された。
実施例14.ヒト化抗体で外部からT細胞を刺激して増殖させる実験−破傷風抗原の記憶応答実験
新鮮に調製されたPBMC(北京血液研究所)を96ウェルフラットプレートに敷き、一夜培養した後にCFSEで標識し、10ug/mlのヒト化抗体(38、39、41および48)および100ng/mlの破傷風毒素(TT)(List Biological Laboratories)を加える。6、8および10日後に、フローサイトメトリー(FACS)を用いて、CSFEの希釈倍数によりT細胞の増値に対して定量分析を行う。図10の結果から、対照となるIgGに比べて、PD−1信号を遮断しTTによる刺激を誘導して活性化させた免疫細胞はさらに分裂し増殖したことが分かった。
実施例15.ヒト化抗体で外部からT細胞を刺激して増殖させる実験−ウイルスポリペプチド抗原の記憶応答実験
新鮮に調製されたPBMC(北京血液研究所)を96ウェルフラットプレートに敷き、一夜培養した後にCFSEで標識し、濃度10ug/mlのヒト化抗体(38、39、41および48)および1ug/mlのCEFポリペプチド混合物(CMV、EBVおよびInfluenza)を加える。6、8および10日後に、フローサイトメトリー(FACS)を用いて、CSFEの希釈倍数によりT細胞の増値に対して定量分析を行う。図11の結果から、参照となるIgGに比べて、PD−1信号を遮断しCEF混合ポリペプチドによる刺激を誘導して活性化させた免疫細胞はさらに分裂し増殖したことが分かった。

Claims (7)

  1. プログラム細胞死因子1(PD−1)と結合できる抗体又はその抗原結合断片であって、
    前記抗体又はその抗原結合断片は、配列番号:33のアミノ酸配列で表される重鎖可変領域、および配列番号:34のアミノ酸配列で表される軽鎖可変領域を含む、抗体又はその抗原結合断片。
  2. 請求項1に記載された抗体又はその抗原結合断片をコードする分離された核酸分子。
  3. 請求項に記載された核酸分子を含む発現ベクター。
  4. 請求項に記載された発現ベクターを含む宿主細胞。
  5. 請求項1に記載の抗体又はその抗原結合断片を産生する方法であって、
    前記抗体又はその抗原結合断片を産生できる条件で請求項に記載された宿主細胞を培養し、このように産生された前記抗体又はその抗原結合断片を回収することを含む、抗体又はその抗原結合断片を産生する方法。
  6. 治療剤とカップリングされた請求項1に記載された抗体又はその抗原結合断片を含
    前記治療剤は、毒素、放射性同位体、薬物又は細胞毒性薬である、免疫抱合体。
  7. 求項1に記載された抗体又はその抗原結合断片、及び薬学的に許容されるベクターを含む薬物組成物。
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