JP4156009B2 - 核酸濃度を増大させる方法 - Google Patents
核酸濃度を増大させる方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP4156009B2 JP4156009B2 JP2007060915A JP2007060915A JP4156009B2 JP 4156009 B2 JP4156009 B2 JP 4156009B2 JP 2007060915 A JP2007060915 A JP 2007060915A JP 2007060915 A JP2007060915 A JP 2007060915A JP 4156009 B2 JP4156009 B2 JP 4156009B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- gene
- nucleic acid
- microcapsules
- dna
- reaction
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1058—Directional evolution of libraries, e.g. evolution of libraries is achieved by mutagenesis and screening or selection of mixed population of organisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1062—Isolating an individual clone by screening libraries mRNA-Display, e.g. polypeptide and encoding template are connected covalently
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1075—Isolating an individual clone by screening libraries by coupling phenotype to genotype, not provided for in other groups of this subclass
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6811—Selection methods for production or design of target specific oligonucleotides or binding molecules
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Ecology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Manufacturing Of Micro-Capsules (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Control And Other Processes For Unpacking Of Materials (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Control Of Vending Devices And Auxiliary Devices For Vending Devices (AREA)
- Pinball Game Machines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
Description
Anderson,C.W., Straus,J.W.および Dudock,B.S. (1983) Methods Enzymol, 101, 635-44. Anderson,J.E. (1993) Curr.Op.Struct.Biol., 3, 24-30. Ash,M.および Ash,I. (1993) Handbook of industrial surfactants. Gower, Aldershot. Baccanari,D.P., Averett,D., Briggs,C.および Burchall,J. (1977) Biochemistry, 16,3566-72. Barany,F. (1991) PCR Methods Applic., 1, 5-16. Bass,S., Greene,R.および Wells,J.A. (1990) Proteins, 8. 309-14. Becher,P. (1957) Emulsions: theory and practice. Reinhold, New York. Benita,S.編 (1996). Microencapsulation: methods and industrial applicati ons. Drugs and pharmaceutical sciences. Edited by Swarbrick,J. New York: Marcel Dekker. Benner,S.A. (1994) Trends Biotechnol, 12, 158-63. Berman,J., Eisenberg,S.および Tye,B.K. (1987) Methods Enzymol, 155, 528-37. Betlach,L., Hershfield,V., Chow,L., Brown,W., Goodman,H.M.および Boyer, H.W.(1976). A restriction endonuclease analysis of the bacterial plasmid controlling the EcoRI restriction and modification of DNA. Federation Proceedings 35, 2037-2043. Blattner,F.R.および Dahlberg,J.E. (1972) Nature New Biol, 237, 227-32. Bougueleret,L., Schwarzstein,M., Tsugita,A.および Zabeau,M. (1984). Char acterization of the genes coding for the Eco RV restriction and modifica tion system of Escherichia coli. Nucleic Acids Res 12(8), 3659-76. Bru,R.および Walde,P. (1991). Product inhibition of alpha-chymotrypsin in reverse micelles. Eur J Biochem 199(1), 95-103. Bru,R.および Walde,P. (1993). Catalytic activity of elastase in reverse micelles. Biochem Mol Biol Int 31(4), 685-92. Cahill,P., Foster,K.および Mahan,D.E. (1991) Clin Chem. 37, 1482-5. Chakrabarti,A.C., Breaker,R.R., Joyce,G.F.および Deamer,D.W. (1994). Pro duction of RNA by a polymerase protein encapsulated within phospholipid vesicles. J Mol Evol 39(6), 555-9. Chamberlin,M.および Ring,J. (1973) J Biol Chem, 248, 2235-2244. Chang.T.M. (1987). Recycling of NAD(P) by muitlenzyme systems immobilized by microencapsulation in artificial cells. Methods Enzymol 136(67), 67-82. Chang,T.M.S. (1992). Recent advances in artificial cells based on microe ncapsulation. In Microcapsules and nanoparticles in medicine and pharmacy (Donbrow,M.編), pp.323-339. CRC Press, Boca Raton, Florida. Chapman,K.B.および Szostak,J.W. (1994) Curr.op.Stroct.Biol., 4, 618-622. Chetverin,A.B.および Spirin,A.S. (1995) Prog Nucleic Acid Res Mol Biol, 51, 225-70. Clackson,T.および Wells,J.A. (1994) Trends Biotechnol, 12, 173-84. Creagh,A.L., Prausnitz,J.M.および Blanch,H.W. (1993). Structual and catalytic properties of enzymes in reverse micelles. Enzyme Microb Technol 15(5), 383-92. Cull,M.G., Miller,J.F.および Schatz,P.J. (1992) Proc Natl Acad Sci U S A, 89, 1865-9. Dickinson,E. (1994) In Wedlock,D.J.(編), Emulsions and droplet size control.Butterworth-Heine-mann, Oxford, Vol.pp.191-257. Ellington,A.D.および Szostak,J.W. (1990) Nature, 346, 81822. Ellman,J., Mendel,D., Anthony,C.S., Noren,C.J.および Schultz,P.G. (1991) Methods Enzymol, 202, 301-36. Fahy,E., Kwoh,D.Y.および Gingeras,T.R. (1991) PCR Methods Appl, 1, 25-33. Fields,S.および Song,0. (1989) A novel genetic system to detect protein-protein interactions. Nature 340, 245-6. Finch,C.A. (1993). Encapsulation and controlled release. Spec.Publ.-R. Soc.Chem. 138, 35. Fisch,I., Kontermman,R.E., Finnern,R., Hartley,0., Soler,G.A., Griffiths, A.D.および Winter,G. (1996) ProcNatl Acad Sci U S A, 93, 7761-6. Freese,E. (1959) J.Mol.Biol., 1, 87. Friedberg,E.C., Walker,G.C. および Siede,W. (1995) DNA repair and mutage nesis. ASM Press, Washington D.C. Gold,L., Polisky,B., Uhlenbeck,0.および Yarus,M. (1995) Annu Rev Biochem, 64, 763-97. Green,R.および Szostak,J.W. (1992) Science, 258, 1910-5. Gregoriadis,G. (1976) Methods Enzymol, 44, 21 8-27. Griffiths,A.D., Williams,S.C., Hartley,0., Tomlinson,I.M., Waterhouse,P., Crosby,W.L., Kontermann,R.E., Jones,P.T., Low,N.M., Allison,T.J.ら、 (1994) Embo J, 13, 3245-60. Haber,J., Maslakiewicz,P., Rodakiewicz,N.J.および Walde,P. (1993). Activity and spectroscopic properties of bovine liver catalase in sodium bis(2-ethylhexyl)sulfosuccinate/isooctane reverse micelles. Eur J Biochem 217(2), 567-73. Hermanson,G.T. (1996) Bioconjugate techniques. Academic Press, San Diego. Hochuli,E., Dobeli,H. および Schacher,A. (1987) J Chromatogr. 411, 177-84. Hoogenboom,H.R.ら、(1991) Nucl.Acids Res., 91, 4133-4137. Hoogenboom,H.R. (1997). Designing and optimizing library selection strat egies for generating high-affinity antibodies. Trends Biotechnal. 15, 62-70. Hoogenboom,H.R. (1997) Trends Biotechnol., 15, 62-70. Janda,K.D., Lo,L.-C., Lo,C.-H.L., Sim,M., -M., Wang,R., Wang,C.-H.および Lerner,R.A. (1997) Science, 275, 945-948. Johannsson,A. (1991) In Price,C.P.および Newman,D.J.(編), Heterogeneous enzyme immunoassays. Stockton Press, New York, Vol.pp.295-325. Johannsson,A.および Bates,D.L. (1988) In Kemeny,D.M.および Challacombe, S.i. (編), Amplification by second enzymes. John Wiley, Chichester, Vol. pp.85-106. Joyce,G.F. (1994) Curr.op.Structural Biol., 4, 331-336. Kadir,F.H.および Moore,G.R. (1990) Febs Lett, 276, 81-4. Kallen,R.G.および Jencks,W.P. (1966). The mechanism of the condensation of formaldehyde with tetrahydrofolic acid. J.Biol.Chem. 241, 5851-5863. Katanaev,V.L., Kurnasov,O.V.および Spirin,A.S. (1995) Febs Lett, 359, 89-92. Keij,J.F., Groenewegen,A.C.および Visser,J.W.M. (1994) High-speed photod amage cell sorting: An evaluation of the ZAPPER prototype. Methods in cell biology 42, 371-358. Klug,A. (1995) Ann N V Acad Sci, 758, 143-60. KIug,A.および Schwabe,J.W. (1995) Faseb T, 9, 597-604. Kolb,V.A., Makeyev,E.V., Kommer,A.および Spirin,A.S.(1995) Biochem Cell Biol, 73, 1217-20. Kowalczykowski,S.C., Dixon,D.A., Eggleston,A.K., Lauder,S.D.および Rehra uer,W.M. (1994) Microbial Rev, 58, 401-65. Krumdiek,C.L.および Baugh,C.M. (1980) Solid-phase synthesis of pteroyl polyglutamates. Methods Enzymol. pp.524-529 Kumar,A., Kumar,A.および Katiyar,S.S. (1989). Activity and kinetic characteristics of glutathione reductase in vitro in reverse micellar waterpool. Biochim Biophys Acta 996(1-2), 1-6. Landegren,U., Kaiser,R., Sanders,J.および Hood,L. (1988) Science, 241, 1077-80. Lesley,S.A., Brow,M.A.および Burgess,R.R. (1991). Use of in vitro protein synthetis from polymerase chain reaction-generated templates to study interaction of Escherichia coil transcription factors with core RHA polymerase and for epitope mapping of monoclonal antibodies. J Biol Chem 266(4), 2632-8. Lesley,S.A. (1995) Methods Mol Biol, 37, 265-78 Lesley,S.A., Brow,M.A.および Burgess,R.R. (1991) J Biol Chem, 266, 2632-8. Leung,D.W., Chen,E.および Goeddel,D.V. (1989) Technique, 1, 11-15. Liao,H., McKenzie,T.および Hageman,R. (1986) Proc Natl Acad Sci U S A, 83, 576-80. Lim,F.および Sun,A.M. (1980). Microencapsulated islets as bioartificial endocrine pancreas. Science 210(4472), 908-10. Lim,F.編、 (1984). Biomedical applications of microencapsulation. Boca Raton, Florida: CRC Press. Lissant,K.J.編、Emulsions_and_emulsion_technology. Surfactant Science New York: Marcel Dekker, 1974. Lissant,K.J.編、Emulsions_and_emulsion_technology. Surfactant Science New York: Marcel Dekker, 1974. Lissant,K.J.編、Emulsions_and_emulsion_technology. Surfactant Science New York: Marcel Dekker, 1984. Low,N.M., Holliger, P.H.および Winter,G. (1996) J Mol Biol, 260, 359-68. Lowman,H.B., Bass,S.H., Simpson,N.および Wells,J.A. (1991) Biochemistry, 30, 10832-8. Luisi,P.L.および B., S.-H. (1987). Activity and conformation of enzymes in reverte micellar solutions. Methods Enzymol 136(188). 188-216. Ma,C., Kudlicki,W., Odom,O.W., Kramer,G.および Hardesty,B. (1993) Biochemistry, 32, 7939-45. Magdassi,S., Frenkel,M., Carti,N.および Cazan,R. (1984) 97, 377-379. Manley,J.L., Fire,A., Samuels,M.および Sharp,P.A. (1983) Methods Enzymol, l01,568-82. Mao,Q.および Walde,P. (1991). Substrate effects on the enzymatic activity of alpha-chymotrypsin in reverse micelles. Biochem Biophys Res Commun 178(3), 1105-12. Mao,Q., Walde,P.および Luisi,P.L. (1992). Kinetic behaviour of alpha-chymotryptin in reverse micelles. A stopped-flow study. Eur J Biochem 208(1), 165-70. Mattheakis,L.C., Bhatt,R.R.および Dower,W.J. (1994) Proc Natl Acad Sci U S A, 91,9022-6. McCafferty,J., Grifftths,A.D., Winter,G.および Chiswell,D.J. (1990) Nature, 348, 552-4. Melton,D.A., Krieg,P.A., Rebagliati,M.R., Maniatis,T., Zinn,K.および Green,M.R. (1984) Nucleic Acids Res, 12, 703556. Mendel,D., Cornish,V.W.および Schultz,P.G. (1995) Annu Rev Biophys Biomol Struct, 24, 435-62. Menger,F.M.および Yamada,K. (1979). J.Am.Chem.Soc. 101, 6731-6734. Miele,E.A., Mills,D.R.および Kramer,F.R. (1983) J Mol Biol, 171, 281-95. Mize,P.D., Hoke,R.A., Linn,C.P., Reardon,J.E.および Schulte,T.H. (1989) Anal Biochem, 179, 229-35. Montigiani,S., Neri,G., Neri,P.および Neri,D. (1996) J Mol Biol, 258, 6-13. Moore,M.J. (1995) Nature, 374, 766-7. New,R.R.C.編、(1990). Liposomes: a practical approach. The practical appraoch series. Edited by Rickwood,D.および Hames,B.D. Oxford: Oxford University Press. Nissim,A., Hoogenboom,H.R. I Tomlinson,I.M., Flynn,G., Midgley,C., Lane, D.および Winter,G. (1994) Embo J, 13, 692-8. Oberholzer,T., Albrizio,M.および Luisi,P.L. (1995a). Polymerase chain reaction in liposomes. Chemistry and Biology 2, 677-682. Oberholzer,T., Wick,R., Luisi,P.L.および Biebricher,C.K. (1995b). Enzymatic RNA replication in self-reproducing vesicles: an approach to a minimal cell. Biochem Biophys Res Commun 207(1), 250-7. Parmley,S.F.および Smith,G.P. (1988) Gene, 73, 305-18. Pelham,H.R.および Jackson,R.J. (1976) Eur J Biochem, 67, 247-56. Perelson,A.S.および Oster,G.F. (1979) J Theor Biol, 81, 64570. Perez,G.M., Sanchez,F.A.および Garcia,C.F. (1992). Application of aetive-phase plot to the kinetic analysis of lipoxygenase in reverse micelles. Biochem J. Pirrung,M.C.および Huang,C.Y. (1996) Bioconjug Chem, 7, 31721. Posner,B.A., Li,L., Bethell,R., Tsuji,T.および Benkovic,S.J. (1996) Biochemistry, 35,1653-63. Roberts,B.E., Gorecki,M., Mulligan,R.C., Danna,K.J., Rozenblatt,S.および Rich,A. (1975) Proc Natl Acad Sci U S A, 72, 1922-6. Roberts,J.W. (1969) Nature, 224, 1168-74. Roberts,R.および Szostak,J. (1997) RNA-peptide fusions for the in vitro selection of peptides and proteins. Proc Natl Acad Sci USA 94, 12297-12302. Rosenberg,M., Weissman,S. および decrombrugghe,B. (1975) J Biol Chem. 250, 4755-64. Saiki,R.K., Gelfand,D.H., Stoffel,S., Scharf,S.J., Higuchi,R., Horn,G.T., Mullis,K.B.および Erlich,H.A. (1988) Science, 239, 487-91. Sambrook,J., Fritsch,E.F.および Maniatis,T. (1989) Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. Savage,M.D., Mattson,G., Desai,S., Nielander,G.W., Morgensen,S.および Conklin,E.J. (1994) Avidin-biotin chemistry: a handbook. Pierce Chemical Company, Rockford. Schick,M.J. (1966) Nonionic surfactants. Marcel Dekker, New York. Sherman,P. (1968) Emulsion science. Academic Press, London. Smith,G.P. (1985) Science, 228, 1315-7. Soumillion,P., Jaspers,L., Bouchet,M., Marchand,B.J., Winter,G.および Fastrez,J. (1994) J Mol Biol, 237, 415-22. Stemmer,W.P. (1994a) Nature, 370, 389-91. Stemmer,W.P. (1994b) Proc Natl Acad Sci U S A, 91, 10747-51. Stofko,H.R., Carr,D.W.および Scott,J.D. (1992) Febs Lett, 302, 274-8. Sun,A.M., Vasek,I.および Tai,I. (1992). Microencapsulasion of living cells and tissues. In Microencapsularion and nanoparticles in medicine and pharmacy (Donbrow,M.編), pp.315-322. CRC Press, Boca Raton, Florida. Sundberg,S.A., Barrett,R.W., Pirrung,M., Lu,A.L., Kiangsoontra,B.および Holmes,C.P. (1995) J.Am.CheM.Soc., 117, 12050-12057. Tawfik,D.S., Green,B.S., Chap,R., Sela,M.および Eshhar,Z. (1993). catELISA: a facile general route to catalytic antibodies. Proc Natl Acad Sci U S.A 90(2), 373-7. Tokatlidis,K., Friguet,B., Deville,B.D., Baleux,F., Fedorov,A.N., Navon, A., Djavadi,O.L.および Goldberg,M.E. (1995) Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci, 348, 89-95. Tripet,B., Yu,L., Bautista,D.L., Wong,W.Y., Irvin,R.T.および Hodges,R.S. (1996) Protein Engng., 9, 1029-1042. Tuerk,C.および Gold,L. (1990) Science, 249, 505-10.van Hal,D.A., Bouwstra,J.A.および Junginger,H.E. (1996). Nonionic surfactant vesicles containing estradiol for topical application. In Microencapsulation: methods and industrial applications (Benita,S.編), pp.329-347. Marcel Dekker, New York. Walde,P., Goto,A., Monnard,P.-A., Wessicken,M.および Luisi,P.L. (1994). Oparin's reactions revisited: enzymatic synthesis of poly(adenylic acid) in micelles and self-reproducing vesicles. J.Am.Chem.Soc. 116. 7541-7547. Walde,P., Han,D.および Luisi,P.L. (1993). Spectroscopic and kinetic studies of lipases solubilized in reverse micelles. Biochemistry 32(15), 4029-34. Walde,P., Peng,Q., Fadnavis,N.W., Battistel,E.および Luisi,P.L. (1988). Structure and activity of trypsin in reverse micelles. Eur J Biochem 173(2), 401-9. Walker,G.T., Fraiser,M.S., Schram,J.L., Little,M.C., Nadeau,J.G.および Malinowski,D.P. (1992) Nucleic Acids Res, 20, 1691-6. Weil,P.A., Luse,D.S., Segall,J.および Roeder,R.G. (1979) Cell, 18, 469-84. Whateley,T.L. (1996). Microcapsules: preparation by interfacial polymeri sation and interfacial complexation and their applications. In Microencapsulation: methods and industrial applications (Benits,S.編), pp.349-375. Marcel Dekker, New York. Wick,R.および Luisi,P.L. (1996). Enzyme-containing liposomes can endogenously produce membrane-constituting lipids. Chem Biol 3(4), 277-85. Widersten,M.および Mannervik,. B. (1995) J Mol Biol, 250, 115-22. Williams,J.W., Morrison,J.F.および Duggleby,R.G. (1979) Biochemistry. 18, 2567-73. Winter,G., Griffiths,A.D., Hawkins,R.E.および Hoogenboom,H.R. (1994) Annu Rev Immunol, 12, 433-55. Wyatt,J.R.1 Chastain,M.および Puglisi,J.D. (1991) Biotechniques, 11, 764-9. Yamagishi,J., Kawashima,H., Matsuo,N., Ohue,M., Yamayoshi,M., Fukui,T., Kotani,H., Furuta,R., Nakano,K.および Yamada,M. (1990) Protein Eng. 3, 713-9. Yelamos,J., Klix,N., Goyenechea,B., Lozano,F., Chui,Y.L., Gonzalez,F.A., Pannell,R., Neuberger,M.S.および Milstein,C. (1995) Nature, 376, 225-9. Zaccolo,M., Williams,D.M., Brown,D.M. および Gherardi,E. (1996) J Mol Biol, 255, 589-603. Zakrzewski,S.F. (1980) Preparation of tritiated dihydrofolic acid of high specific activity. Methods Enzymol. pp.539-. Zaug,A.J.および Cech,T.R. (1986) Biochemistry. 25, 4478-82. Zaug,A.J.および Cech,T.R. (1986) Science, 231, 470-5. Zaug,A.J., Been,M.D.および Cech,T.R. (1986) Nature, 324, 429-33. Zubay,G. (1973) Annu Rev Genet, 7, 267-87. Zubay,G. (1980) Methods Enzymol, 65, 856-77.
(a)遺伝子エレメントをマイクロカプセル中にコンパートメント化するステップと、
(b)マイクロカプセル内で遺伝子エレメントを発現させてその対応する遺伝子産物を産生するステップと、
(c)所望の活性を有する遺伝子産物を産生する遺伝子エレメントを選別するステップと、
が含まれる。
(a)遺伝子産物をコードする遺伝子エレメントを調製するステップと、
(b)遺伝子エレメントをマイクロカプセル中にコンパートメント化するステップと、
(c)マイクロカプセル内で遺伝子エレメントを発現させてその対応する遺伝子産物を産生するステップと、
(d)所望の活性を有する遺伝子産物(1種または複数種)を産生する遺伝子エレメントの選別を行うステップと、
(e)所望の活性を有する遺伝子産物を発現させるステップと、
を含む方法を提供する。
(a)遺伝子産物をコードする遺伝子エレメントのレパートリーを調製するステップと、
(b)遺伝子エレメントをマイクロカプセル中にコンパートメント化するステップと、
(c)マイクロカプセル内で遺伝子エレメントを発現させてその対応する遺伝子産物を産生するステップと、
(d)所望の活性を有する遺伝子産物(1種または複数種)を産生する遺伝子エレメントの選別を行うステップと、
(e)所望の活性を有する遺伝子産物を1種または複数種の化合物と接触させ、該化合物による遺伝子産物の活性の調節をモニターするステップと、
を含む方法を提供する。
(f)遺伝子産物の活性を調節できる1種または複数種の化合物を同定し、該1種または複数種の化合物を合成するステップ、
が含まれる。
本発明のマイクロカプセルは、本発明が実施可能となるように、適切な物理的性質をもつ必要がある。
(a)本発明に従って遺伝子エレメントライブラリーから1種以上の遺伝子エレメントを選択するステップと、
(b)選択された遺伝子エレメント(1種または複数種)を突然変異させて、遺伝子産物のレパートリーをコードする遺伝子エレメントの更なるライブラリーを作製するステップと、
(c)ステップ(a)および(b)を繰り返して、活性の増大した遺伝子産物を得るステップと、
を含む方法が提供される。
(a)少なくとも1つのステップがポリペプチドにより促進される合成プロトコルを提供するステップと、
(b)このステップを促進するポリペプチドの変異体をコードする遺伝子エレメントを調製するステップと、
(c)遺伝子エレメントをマイクロカプセル中にコンパートメント化するステップと、
(d)マイクロカプセル内で遺伝子エレメントを発現させてその対応する遺伝子産物を産生するステップと、
(e)所望の活性を有するポリペプチド遺伝子産物(1種または複数種)を産生する遺伝子エレメントを選別するステップと、
(f)合成の関連ステップを促進すべく(e)で同定されたポリペプチド遺伝子産物を用いて1種または複数種の化合物を調製するステップと、
を含む方法を提供する。
RNA、DNA、または触媒活性、調節活性、もしくは結合活性を有するタンパク質遺伝子産物に対して選択を行うべく、系を構成することができる。
特定のリガンドに対して親和性を有する遺伝子産物の選択を行う場合、遺伝子エレメントを、リガンドを介してマイクロカプセル中の遺伝子産物にリンクさせることが可能である。この場合、リガンドに対して親和性を有する遺伝子産物だけが遺伝子エレメント自体に結合するため、活性な産物を産生する遺伝子エレメントだけが選択ステップで保持されるであろう。従って、この実施形態では、遺伝子エレメントには、遺伝子産物用のリガンドにリンクされる遺伝子産物をコードする核酸が含まれるであろう。
触媒作用に対して選択を行う場合、各マイクロカプセル中の遺伝子エレメントには、反応の基質が含まれていてもよい。遺伝子エレメントが、触媒として作用できる遺伝子産物をコードする場合、遺伝子産物は、基質から産物への変換を触媒するであろう。従って、反応の終了時、遺伝子エレメントは、触媒される反応の産物に物理的にリンクされる。マイクロカプセルを合体させて反応体をプール化すると、産物に特異的な任意の性質に対して選択を行うことにより、触媒分子をコードする遺伝子エレメントを濃縮することができる(図1)。
(1)遺伝子エレメントを発現させて該遺伝子エレメントのそれぞれの遺伝子産物を生成させるステップと、
(2)遺伝子産物を用い、所望の活性に従って、基質から、直接選択可能であってもなくてもよい産物への変換を触媒するステップと、
(3)場合により、第1の反応を1つ以上の後続反応と共役させるステップであって、各反応が、前の反応の産物により調節され、最終的に選択可能な産物を生成するステップと、
(4)(a)産物と遺伝子エレメントとの関連が保持されるように基質を遺伝子エレメントにカップリングさせることにより、または
(b)産物に保持される好適な分子「タグ」を基質に結合させることによって、選択可能な産物を遺伝子エレメントと反応させるかもしくはそれに結合させることにより、または
(c)産物特異的反応もしくは産物との相互作用によって、選択可能な産物(基質ではない)を遺伝子エレメントにカップリングさせることにより、
触媒反応の選択可能な産物を遺伝子エレメントにリンクさせるステップと、
(5)産物との特異的反応もしくは相互作用を用いるか、または触媒反応の産物に結合された好適な分子「タグ」を用いたアフィニティー精製により、触媒反応の産物を、それが結合した遺伝子エレメントと共に、選択するステップと、
が含まれ、
ステップ(1)〜(4)で、各遺伝子エレメントおよびそれぞれの遺伝子産物は、マイクロカプセル内に包含される。
類似の系を用いて、酵素の調節特性の選択を行うことができる。
(1)遺伝子エレメントを発現させて該遺伝子エレメントのそれぞれの遺伝子産物を生成させるステップと、
(2)遺伝子産物を用い、所望の活性に従って、選択可能な分子の発生または存在が可能になるように生化学反応または一連の共役反応を活性化または抑制するステップと、
(3)(a)選択可能な分子、またはその分子の誘導に用いられた基質を、遺伝子エレメントに結合させることにより、または
(b)産物に保持される好適な分子「タグ」を基質に結合させることによって、選択可能な産物を遺伝子エレメントと反応させるかもしくはそれに結合させることにより、または
(c)産物特異的反応もしくは産物との相互作用によって、触媒反応の産物(基質ではない)を遺伝子エレメントにカップリングさせることにより、
選択可能な分子を遺伝子エレメントにリンクさせるステップと、
(4)選択可能な産物との特異的反応もしくは相互作用を用いるか、または触媒反応の産物に結合された好適な分子「タグ」を用いたアフィニティー精製により、選択可能な産物を、それが結合した遺伝子エレメントと共に、選択するステップと、
が含まれ、
ステップ(1)〜(4)で、各遺伝子エレメントおよびそれぞれの遺伝子産物は、マイクロカプセル内に包含される。
本発明は、欠陥のないマイクロカプセルの選別法を提供する。ただし、利用する選別法が適用可能な場合にかぎられる。所望の遺伝子産物により誘発される変化が、マイクロカプセルの表面で起こるかもしくはそれが表面に現れるか、またはマイクロカプセルの外側からそれを検出できる場合には、マイクロカプセルの選別を行うことが可能である。この変化は、遺伝子産物の直接的作用により誘発されるものであってもよいし、所望の活性を有する遺伝子産物の関与する反応が1つ以上含まれる一連の反応によって間接的に誘発される変化であってもよい。例えば、遺伝子産物がマイクロカプセルの表面に出現し、試薬に接近できるように、マイクロカプセルを構成してもよい。マイクロカプセルが膜のマイクロカプセルである場合、遺伝子産物をターゲットにしてもよいし、所定の分子をマイクロカプセルの膜までターゲッティングさせてもよい。このことは、例えば、膜タンパク質から誘導される配列のように、融合またはリンクされた分子がマイクロカプセルの膜に優先的に組み込まれるようにする膜局在化配列を利用することにより、達成することができる。このほか、油中水型エマルションのように相分離によりマイクロカプセルを形成する場合、カプセルの外側相に多く溶解する部分を有する分子は、マイクロカプセルの境界に存在するような配置をとるであろう。
第iii節(マイクロカプセルの選別)で述べたように、所望の遺伝子産物により誘発される変化が、マイクロカプセルの表面で起こるかもしくはそれが表面に現れるか、または外側からそれを検出できる場合には、こうした変化を利用してマイクロカプセルの同定を行うことが可能である。同定される場合には、この変化を用いて、コンパートメント内の遺伝子の改変をトリガーすることができる。本発明の好ましい態様では、マイクロカプセルの同定は、マイクロカプセル内でルミネセンス、燐光、または蛍光を誘発する反応の結果として生じるマイクロカプセルの光学的性質の変化に基づくものである。ルミネセンス、燐光、または蛍光を同定することにより、マイクロカプセル内での遺伝子の改変がトリガーされるであろう。例えば、ルミネセンス、燐光、または蛍光を同定することにより、遺伝子エレメントの改変を引き起こすフォトン(または他の粒子もしくは波)によるコンパートメントの照射をトリガーすることができる。細胞の迅速な選別を行うための類似の手順が、既に報告されている(Keij et al., 1994)。例えば、光活性保護基でケージ化された分子「タグ」を遺伝子エレメントにカップリングさせることにより、遺伝子エレメントの改変を起こしてもよい。この場合、適切な波長のフォトンを照射すると、ケージが除去される。その後、マイクロカプセルをすべて合体させ、遺伝子エレメントを1つの環境下で一緒にプールする。所望の活性を呈する遺伝子産物をコードする遺伝子エレメントは、「タグ」に対して特異的な結合または特異的な反応を行う分子を用いてアフィニティー精製することにより、選択することができる。
かならずしも、すべての反応を1つのマイクロカプセル中で行い、転写/複製および/または翻訳ならびに選択のプロセスを単一ステップで行う必要がないことは理解されるであろう。選択手順には、2ステップ以上が含まれていてもよい。第1に、遺伝子エレメントライブラリーの各遺伝子エレメントの転写/複製および/または翻訳を第1のマイクロカプセル中で行ってもよい。次に、各遺伝子産物を、それをコードする遺伝子エレメント(同じマイクロカプセル中に存在する)にリンクさせる。その後、マイクロカプセルを破壊し、それぞれの遺伝子産物に結合された遺伝子エレメントを場合により精製する。このほか、遺伝子エレメントは、カプセル化によらない方法を用いて、該遺伝子エレメントのそれぞれの遺伝子産物に結合させることもできる。例えば、ファージディスプレイ(Smith, G.P., 1985)、ポリソームディスプレイ(Mattheakkis et al., 1994)、RNA‐ペプチド融合(Roberts and Szostak, 1997)、またはlacリプレッサーペプチド融合(Cull, et al., 1992)。
遺伝子エレメントがコードする所望の結合活性、触媒活性、または調節活性により、すべてのマイクロカプセル中に存在する「リポーター遺伝子」の発現が直接的または間接的に活性化されるように、系を構成することができる。所望の活性を有する遺伝子産物だけが、リポーター遺伝子の発現を活性化する。リポーター遺伝子発現の結果として生じる活性を利用すると、本明細書に記載の任意の方法により、遺伝子エレメント(または、それを含むコンパートメント)の選択が可能になる。
本発明の更なる態様によれば、本発明の方法には、遺伝子エレメントを増幅する更なるステップが含まれる。所望の遺伝子産物をコードする遺伝子エレメントに対する濃縮を行う手段として選択的増幅を使用することができる。
本発明の更なる態様によれば、遺伝子エレメントをコンパートメント化し、遺伝子エレメントを発現させて、コンパートメント内で遺伝子産物を形成する方法が提供される。この方法には、
(a)遺伝子エレメントと、それを発現させてその遺伝子産物を形成するのに必要な成分とを含んでなる水溶液を作製するステップと、
(b)遺伝子エレメントを含む離散したマイクロカプセルが形成されるように、溶液をマイクロカプセル化するステップと、
(c)遺伝子産物を形成すべく遺伝子エレメントの発現を進行させるのに好適な条件にマイクロカプセルを暴露するステップと、
が含まれる。
油中水型エマルション系における約2 μm水性マイクロカプセルの作製
本発明の好ましいサイズ範囲内にあるマイクロカプセルは、油中水型エマルション系を用いて作製することができる。
油中水型エマルションの水性マイクロカプセル中で行われる効率的なin vitro転写反応
各マイクロカプセル内でDNAからRNAを産生するために、系の各水性マイクロカプセル内に存在するDNA分子1個を効率的に転写しなければならない。この場合、in vitro転写は、マイクロカプセル内で行われる。
油中水型エマルションの水性マイクロカプセル中で行われる効率的な共役in vitro転写/翻訳反応
本発明の手順を用いてタンパク質を合成するために、本明細書に記載の油中水型エマルションの水性マイクロカプセル中において転写が有効に行われなければならない。
共役in vitro転写/翻訳反応を用いて産生させたジヒドロ葉酸レダクターゼは活性である
この実施例では、油中水型エマルション系の水性マイクロカプセル中でのfolA遺伝子の共役転写/翻訳により、タンパク質(大腸菌ジヒドロ葉酸レダクターゼ)が触媒活性のある形態で効率的に産生できることが示される。このアッセイでは、最適サイズ未満のマイクロカプセルを含むエマルションを使用する。マイクロカプセルのサイズが大きくなると、DHFR活性は高くなることが分かる。
高分子量タンパク質を介した遺伝子エレメントへの固定化基質のリンケージ
folA遺伝子を含有するDNA断片に多数の固定化基質分子をリンクするために、DNA断片をまずビオチニル化し、次に、アビジンとアポフェリチンとの複合体にカップリングさせる。ウマ脾臓アポフェリチンは、直径12.5 nmの大きなほぼ球形のタンパク質分子であり、従って、基質を用いて誘導体化できる多数の部位を提供する(例えば、表面リシンのε-アミノ基)。プライマーLMB3および5'ビオチニル化LMB2(LMB2-ビオチン)を用いて、大腸菌 DHFRをコードするpGEM-folAプラスミドをPCR増幅し、T7 RNAポリメラーゼプロモーター、ファージT7遺伝子10翻訳開始部位、およびfolA遺伝子を含有するビオチニル化649bp DNA断片を形成する(実施例3を参照)。500 μl PCR反応混合液に100 μCi [α-32P]dCTP(Amersham; 3000 Ci/mmol)を添加することにより、DNAを放射能標識する。Wizard PCR Prep(Promega)を用いてビオチニル化PCR断片を直接精製し、分光学的に濃度を測定する。ストレプトアビジンM-280ダイナビーズ(Dynal)に結合させ、シンチレーション計数を行うことにより、ビオチニル化DNAのパーセンテージをアッセイする。この方法を用いて、DNAの83%が、ビオチニル化されていることが判明した。
in vitro転写‐翻訳とDHFR活性は共に同一の系で適合性を示す
共役した転写‐翻訳によりin situで産生されるDHFRの活性に対して選択を行うために、転写‐翻訳反応およびDHFRはいずれも、同一の緩衝系で活性でなければならない。
固定化ジヒドロ葉酸基質を含有する遺伝子エレメントに対するDHFRの活性により、DHFRをコードする核酸に結合したテトラヒドロ葉酸産物が形成される
γ-カルボキシレートを介して結合した3個のグルタミン酸を含んでなるペプチドを合成する(出発物質としてN-フルオレニルメトキシカルボニル-グルタミン酸α-ベンジルエステルを使用する)。このペプチドは、カルボキシ末端にリシンを有し、更に、文献記載の手順(Krumdiekら, 1980)に変更を加えることにより、そのε-アミノ基にビオチンが結合する。アミノ末端に葉酸を結合し、既に報告されているように、ベンジルおよびトリフルオロアセトアミド保護基をアルカリ加水分解により除去する。このペプチドを逆相HPLCにより精製し、質量分析法およびUV分光法により特性付けする。文献記載の手順(Zakrzewskiら., 1980)を適用することにより、この葉酸ペプチドを化学的に還元して、対応するジヒドロ葉酸ペプチドとし(ジチオネートおよびアスコルビン酸を用いる)、更に、対応するテトラヒドロ葉酸ペプチドとする(水素化硼素ナトリウムを用いる)。これらの変換を、UV分光法により特性付けする。
DHFR活性に対して選択を行う代替法
酵母アルデヒドデヒドロゲナーゼにより触媒され、「タグ付け」された基質を用いて行われる第2の反応に、in situで共役させることにより、DHFR触媒反応に対して選択を行うことができる。
遺伝子産物による遺伝子エレメントのメチル化
油中水型エマルションの水性コンパートメント中でin vitro転写/翻訳により産生されるDNAメチルトランスフェラーゼは、それをコードするDNA分子を該コンパートメント中でメチル化する。
油中水型エマルションの水性コンパートメント中で自己メチル化を行った後、DNAメチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子エレメントの選択および増幅を行うことができる
DNA‐メチラーゼをコードする遺伝子をメチル化することにより、後続のステップでその単離および増幅を行うことが可能になる。メチル化DNAは、制限エンドヌクレアーゼ開裂に対する耐性を有するため、非メチル化DNAと区別することができる。従って、同種制限酵素で処理した後、インタクトなままの遺伝子エレメントをPCRにより増幅することができる。しかしながら、同じR/M部位を含むがメチラーゼをコードしない他の遺伝子が同じ反応混合物中に存在する場合、このような選択を行えないことは自明である。なぜなら、(大過剰に存在する)非メチラーゼ遺伝子の交差メチル化によって、同種制限酵素による開裂に対する耐性が付与され、PCRにより増幅可能になると考えられるからである。こうした状況下では、メチラーゼをコードする遺伝子の選択は、それらがコンパートメント化されている場合だけ、すなわち、自己メチル化がコンパートメント中における主要なプロセスとなるように1個のコンパートメント中にわずか1個または数個の遺伝子が存在する場合だけ、可能になるであろう。メチラーゼ遺伝子を含有しないコンパートメント中に存在する非メチラーゼ遺伝子はメチル化されないまま残るため、交差メチル化は回避される。
Claims (17)
- 核酸分子濃度を増大させる方法であって、以下のステップ:
(a)水性マイクロカプセルであって、疎水性の外相中に離散した液滴として懸濁された水性の内相を含み、複数の該マイクロカプセルが核酸分子、及び水性の内相内で核酸を増幅するのに必要な成分を含んでなる水溶液が封入された、前記水性マイクロカプセルを油中水型エマルション中に形成すること;及び
(b)該核酸分子のさらに増幅された複写物を形成するためにマイクロカプセル中で核酸分子を増幅させること;
を含む上記方法。 - 核酸を固相支持体に結合させることを含む、請求項1に記載の方法。
- 固相支持体がビーズである、請求項2に記載の方法。
- ビーズがポリスチレン又は磁性ビーズである、請求項3に記載の方法。
- ビーズが、アビジン及びストレプトアビジンから選択された被覆を含む、請求項2又は3に記載の方法。
- 核酸分子がビオチンタグを有する、請求項5に記載の方法。
- RNAポリメラーゼを用いた転写、Qβレプリカーゼ増幅、リガーゼ連鎖反応、又は自己維持配列複製系又は鎖置換増幅により核酸を増幅させる、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- ポリメラーゼ連鎖反応により核酸を増幅させる、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- エマルションが少なくとも1つの乳化剤を含む、請求項1〜8のいずれか1項に記載の方法。
- 乳化剤が非イオン性界面活性剤である、請求項9に記載の方法。
- 乳化剤がソルビタンモノオレエート及びポリオキシエチレンソルビタンモノオレエートから選択される、請求項10に記載の方法。
- 乳化剤がアニオン性界面活性剤である、請求項9に記載の方法。
- 乳化剤がコール酸ナトリウム、グリココール酸ナトリウム、タウロコール酸ナトリウム、及びデオキシコール酸ナトリウムから選択される、請求項12に記載の方法。
- エマルションが熱安定性である、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
- 固相支持体がビーズであり、核酸がポリメラーゼ連鎖反応により増幅され、エマルションが熱安定性である、請求項2に記載の方法。
- 複数のマイクロカプセルが形成されるときに、マイクロカプセル1個当たり平均で1以下の核酸分子を含む、請求項1〜15のいずれか1項に記載の方法。
- 複数のマイクロカプセルが形成されるときに、マイクロカプセル1個当たり平均で5〜1000の核酸分子を含む、請求項1〜15のいずれか1項に記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GBGB9714300.2A GB9714300D0 (en) | 1997-07-07 | 1997-07-07 | In vitro sorting method |
GBGB9806393.6A GB9806393D0 (en) | 1998-03-25 | 1998-03-25 | In vitro sorting method |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2000502169A Division JP4298912B2 (ja) | 1997-07-07 | 1998-06-29 | invitro選別法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2007143563A JP2007143563A (ja) | 2007-06-14 |
JP4156009B2 true JP4156009B2 (ja) | 2008-09-24 |
Family
ID=26311843
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2000502169A Expired - Lifetime JP4298912B2 (ja) | 1997-07-07 | 1998-06-29 | invitro選別法 |
JP2005041355A Expired - Lifetime JP4299255B2 (ja) | 1997-07-07 | 2005-02-17 | invitro選別法 |
JP2007060915A Expired - Fee Related JP4156009B2 (ja) | 1997-07-07 | 2007-03-09 | 核酸濃度を増大させる方法 |
Family Applications Before (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2000502169A Expired - Lifetime JP4298912B2 (ja) | 1997-07-07 | 1998-06-29 | invitro選別法 |
JP2005041355A Expired - Lifetime JP4299255B2 (ja) | 1997-07-07 | 2005-02-17 | invitro選別法 |
Country Status (13)
Country | Link |
---|---|
US (7) | US6489103B1 (ja) |
EP (6) | EP1496120B1 (ja) |
JP (3) | JP4298912B2 (ja) |
AT (4) | ATE487790T1 (ja) |
AU (1) | AU736836B2 (ja) |
CA (3) | CA2792122C (ja) |
CY (1) | CY1111537T1 (ja) |
DE (4) | DE69841997D1 (ja) |
DK (3) | DK1496120T3 (ja) |
ES (4) | ES2294427T3 (ja) |
GB (1) | GB2342094B (ja) |
PT (2) | PT1496120E (ja) |
WO (1) | WO1999002671A1 (ja) |
Families Citing this family (358)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7285416B2 (en) | 2000-01-24 | 2007-10-23 | Gendaq Limited | Regulated gene expression in plants |
US7262055B2 (en) | 1998-08-25 | 2007-08-28 | Gendaq Limited | Regulated gene expression in plants |
US7622294B2 (en) | 1997-03-14 | 2009-11-24 | Trustees Of Tufts College | Methods for detecting target analytes and enzymatic reactions |
US20030027126A1 (en) | 1997-03-14 | 2003-02-06 | Walt David R. | Methods for detecting target analytes and enzymatic reactions |
AU6846698A (en) | 1997-04-01 | 1998-10-22 | Glaxo Group Limited | Method of nucleic acid amplification |
EP1496120B1 (en) | 1997-07-07 | 2007-03-28 | Medical Research Council | In vitro sorting method |
AR021833A1 (es) | 1998-09-30 | 2002-08-07 | Applied Research Systems | Metodos de amplificacion y secuenciacion de acido nucleico |
AU2004242526B2 (en) * | 1999-01-07 | 2007-08-30 | United Kingdom Research And Innovation | Optical Sorting Method |
GB9900298D0 (en) * | 1999-01-07 | 1999-02-24 | Medical Res Council | Optical sorting method |
JP2002540772A (ja) | 1999-03-24 | 2002-12-03 | ボード オブ リージェンツ, ザ ユニバーシティ オブ テキサス システム | 線状および環状発現エレメント |
GB9917027D0 (en) | 1999-07-20 | 1999-09-22 | Affibody Technology Sweeden Ab | In vitro selection and optional identification of polypeptides using solid support carriers |
US6770441B2 (en) | 2000-02-10 | 2004-08-03 | Illumina, Inc. | Array compositions and methods of making same |
GB0022458D0 (en) * | 2000-09-13 | 2000-11-01 | Medical Res Council | Directed evolution method |
AR031640A1 (es) | 2000-12-08 | 2003-09-24 | Applied Research Systems | Amplificacion isotermica de acidos nucleicos en un soporte solido |
JP4386641B2 (ja) * | 2001-03-16 | 2009-12-16 | キアゲン ゲーエムベーハー | 分解に対して安定化した核酸 |
JP4838957B2 (ja) | 2001-05-02 | 2011-12-14 | 独立行政法人理化学研究所 | 無細胞タンパク質合成系を用いたタンパク質の製造方法 |
GB0114854D0 (en) * | 2001-06-18 | 2001-08-08 | Medical Res Council | Selective gene amplification |
GB0115841D0 (en) | 2001-06-28 | 2001-08-22 | Medical Res Council | Ligand |
WO2003037302A1 (en) * | 2001-10-30 | 2003-05-08 | Windsor J Brian | Method and system for the co-isolation of cognate dna, rna and protein sequences and method for screening co-isolates for defined activities |
GB0127564D0 (en) | 2001-11-16 | 2002-01-09 | Medical Res Council | Emulsion compositions |
EP1507003B1 (en) | 2002-05-22 | 2011-09-21 | Riken | Process for producing protein in cell-free protein synthesis system using thioredoxin fused protein expression vector |
AUPS298102A0 (en) * | 2002-06-13 | 2002-07-04 | Nucleics Pty Ltd | Method for performing chemical reactions |
US20060002935A1 (en) | 2002-06-28 | 2006-01-05 | Domantis Limited | Tumor Necrosis Factor Receptor 1 antagonists and methods of use therefor |
US9321832B2 (en) | 2002-06-28 | 2016-04-26 | Domantis Limited | Ligand |
JP2006507921A (ja) | 2002-06-28 | 2006-03-09 | プレジデント・アンド・フェロウズ・オブ・ハーバード・カレッジ | 流体分散のための方法および装置 |
WO2004022746A1 (en) | 2002-09-06 | 2004-03-18 | Isogenica Limited | In vitro peptide expression libraray |
GB0221053D0 (en) * | 2002-09-11 | 2002-10-23 | Medical Res Council | Single-molecule in vitro evolution |
JP4441170B2 (ja) | 2002-11-28 | 2010-03-31 | 独立行政法人理化学研究所 | S12リボソームタンパク質に変異を有する大腸菌細胞抽出液及びそれを用いる無細胞系によるタンパク質の製造方法 |
GB0228819D0 (en) * | 2002-12-11 | 2003-01-15 | British American Tobacco Co | Improvements relating to smoking articles |
GB0230203D0 (en) | 2002-12-27 | 2003-02-05 | Domantis Ltd | Fc fusion |
US7575865B2 (en) | 2003-01-29 | 2009-08-18 | 454 Life Sciences Corporation | Methods of amplifying and sequencing nucleic acids |
EP2159285B1 (en) * | 2003-01-29 | 2012-09-26 | 454 Life Sciences Corporation | Methods of amplifying and sequencing nucleic acids |
US7041481B2 (en) | 2003-03-14 | 2006-05-09 | The Regents Of The University Of California | Chemical amplification based on fluid partitioning |
GB0307428D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Compartmentalised combinatorial chemistry |
US20060078893A1 (en) | 2004-10-12 | 2006-04-13 | Medical Research Council | Compartmentalised combinatorial chemistry by microfluidic control |
GB0307403D0 (en) * | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Selection by compartmentalised screening |
FI20030615A0 (fi) * | 2003-04-24 | 2003-04-24 | Marko Virta | Nanopartikkeli bioaffiniteettimäärityksiin |
EP3616781A1 (en) | 2003-04-10 | 2020-03-04 | President and Fellows of Harvard College | Formation and control of fluidic species |
WO2004101790A1 (en) | 2003-05-14 | 2004-11-25 | Domantis Limited | A process for recovering polypeptides that unfold reversibly from a polypeptide repertoire |
EP1641809B2 (en) | 2003-07-05 | 2018-10-03 | The Johns Hopkins University | Method and compositions for detection and enumeration of genetic variations |
EP2662136A3 (en) * | 2003-08-27 | 2013-12-25 | President and Fellows of Harvard College | Method for handling and mixing droplets |
JP4430076B2 (ja) * | 2003-10-01 | 2010-03-10 | イーティーエイチ・チューリッヒ | ポリペプチドの試験管内進化方法 |
GB0325653D0 (en) | 2003-11-03 | 2003-12-10 | Medical Res Council | CST emulsions |
EP1691792A4 (en) * | 2003-11-24 | 2008-05-28 | Yeda Res & Dev | COMPOSITIONS AND METHODS FOR IN VITRO / I SORTING OF MOLECULAR AND CELLULAR BANKS |
EP1735458B1 (en) | 2004-01-28 | 2013-07-24 | 454 Life Sciences Corporation | Nucleic acid amplification with continuous flow emulsion |
US20050221339A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-06 | Medical Research Council Harvard University | Compartmentalised screening by microfluidic control |
US9477233B2 (en) | 2004-07-02 | 2016-10-25 | The University Of Chicago | Microfluidic system with a plurality of sequential T-junctions for performing reactions in microdroplets |
US7655470B2 (en) | 2004-10-29 | 2010-02-02 | University Of Chicago | Method for manipulating a plurality of plugs and performing reactions therein in microfluidic systems |
GB0418651D0 (en) * | 2004-08-20 | 2004-09-22 | Medical Res Council | Method |
GB0419628D0 (en) | 2004-09-03 | 2004-10-06 | European Molecular Biology Lab Embl | Method for determining protein solubility |
US7968287B2 (en) | 2004-10-08 | 2011-06-28 | Medical Research Council Harvard University | In vitro evolution in microfluidic systems |
KR20070084069A (ko) | 2004-10-08 | 2007-08-24 | 도만티스 리미티드 | Tnfr1에 대한 단일 도메인 항체 및 이의 사용 방법 |
WO2006051552A2 (en) * | 2004-11-15 | 2006-05-18 | Yeda Research And Development Co. Ltd. At The Weizmann Institute Of Science | Directed evolution and selection using in vitro compartmentalization |
JP4868731B2 (ja) | 2004-11-17 | 2012-02-01 | 独立行政法人理化学研究所 | 哺乳動物培養細胞由来の無細胞タンパク質合成システム |
JP4787488B2 (ja) | 2004-11-19 | 2011-10-05 | 独立行政法人理化学研究所 | 直鎖状鋳型dnaを用いた無細胞タンパク質合成方法及びそのための細胞抽出液 |
EP2233582A1 (en) | 2005-02-01 | 2010-09-29 | AB Advanced Genetic Analysis Corporation | Nucleic acid sequencing by performing successive cycles of duplex extension |
JP2008528040A (ja) | 2005-02-01 | 2008-07-31 | アジェンコート バイオサイエンス コーポレイション | ビーズベースの配列決定のための試薬、方法およびライブラリー |
US20070054119A1 (en) * | 2005-03-04 | 2007-03-08 | Piotr Garstecki | Systems and methods of forming particles |
AU2006220816A1 (en) | 2005-03-04 | 2006-09-14 | President And Fellows Of Harvard College | Method and apparatus for forming multiple emulsions |
US20060228721A1 (en) * | 2005-04-12 | 2006-10-12 | Leamon John H | Methods for determining sequence variants using ultra-deep sequencing |
CN101213311B (zh) * | 2005-04-29 | 2013-02-13 | 合成基因组股份有限公司 | 利用滚环扩增扩增和克隆单个dna分子 |
WO2007145612A1 (en) | 2005-06-06 | 2007-12-21 | 454 Life Sciences Corporation | Paired end sequencing |
US20090233291A1 (en) * | 2005-06-06 | 2009-09-17 | 454 Life Sciences Corporation | Paired end sequencing |
US7709197B2 (en) | 2005-06-15 | 2010-05-04 | Callida Genomics, Inc. | Nucleic acid analysis by random mixtures of non-overlapping fragments |
DK1915446T3 (en) | 2005-08-11 | 2017-09-11 | Synthetic Genomics Inc | IN VITRO RECOMBINATION PROCEDURE |
JP5033949B2 (ja) * | 2005-08-12 | 2012-09-26 | 国立大学法人豊橋技術科学大学 | 電気乳化法 |
WO2007024800A2 (en) * | 2005-08-22 | 2007-03-01 | Applera Corporation | Device and method for making discrete volumes of a first fluid in contact with a second fluid, which are immiscible with each other |
EP2546360A1 (en) | 2005-10-07 | 2013-01-16 | Callida Genomics, Inc. | Self-assembled single molecule arrays and uses thereof |
KR100828714B1 (ko) | 2005-10-25 | 2008-05-09 | 주식회사 엘지화학 | 리보핵산을 이용한 멀티플렉스 증폭방법 |
EP1801212A1 (en) * | 2005-12-21 | 2007-06-27 | Eidgenössische Technische Hochschule Zürich | Selection of biocatalysts for chemical synthesis |
EP1984738A2 (en) | 2006-01-11 | 2008-10-29 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic devices and methods of use in the formation and control of nanoreactors |
US20070195127A1 (en) * | 2006-01-27 | 2007-08-23 | President And Fellows Of Harvard College | Fluidic droplet coalescence |
SG10201405158QA (en) | 2006-02-24 | 2014-10-30 | Callida Genomics Inc | High throughput genome sequencing on dna arrays |
JP5180845B2 (ja) | 2006-02-24 | 2013-04-10 | カリダ・ジェノミックス・インコーポレイテッド | Dnaアレイ上でのハイスループットゲノム配列決定 |
JP2009538123A (ja) * | 2006-04-19 | 2009-11-05 | アプライド バイオシステムズ, エルエルシー | ゲル非含有ビーズベースの配列決定のための試薬、方法およびライブラリー |
US9562837B2 (en) | 2006-05-11 | 2017-02-07 | Raindance Technologies, Inc. | Systems for handling microfludic droplets |
EP2481815B1 (en) * | 2006-05-11 | 2016-01-27 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic devices |
EP2029781A4 (en) * | 2006-05-26 | 2010-06-30 | Althea Technologies Inc | BIOCHEMICAL ANALYSIS OF PARTITIONED CELLS |
EP3536396B1 (en) | 2006-08-07 | 2022-03-30 | The President and Fellows of Harvard College | Fluorocarbon emulsion stabilizing surfactants |
WO2008042067A2 (en) | 2006-09-28 | 2008-04-10 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for nucleotide sequencing |
US7910302B2 (en) | 2006-10-27 | 2011-03-22 | Complete Genomics, Inc. | Efficient arrays of amplified polynucleotides |
US7682791B2 (en) * | 2006-10-29 | 2010-03-23 | Macevicz Stephen C | Method of generating nested sets of double stranded DNA circles |
US20090111705A1 (en) | 2006-11-09 | 2009-04-30 | Complete Genomics, Inc. | Selection of dna adaptor orientation by hybrid capture |
EP2121983A2 (en) | 2007-02-02 | 2009-11-25 | Illumina Cambridge Limited | Methods for indexing samples and sequencing multiple nucleotide templates |
US8772046B2 (en) | 2007-02-06 | 2014-07-08 | Brandeis University | Manipulation of fluids and reactions in microfluidic systems |
JP2010518863A (ja) | 2007-02-23 | 2010-06-03 | ニユー・イングランド・バイオレイブス・インコーポレイテツド | インビトロ区画化を用いるタンパク質の選択および富化 |
WO2008109176A2 (en) | 2007-03-07 | 2008-09-12 | President And Fellows Of Harvard College | Assays and other reactions involving droplets |
CA2679511A1 (en) * | 2007-03-16 | 2008-09-25 | 454 Life Sciences Corporation | System and method for detection of hiv drug resistant variants |
US7776927B2 (en) * | 2007-03-28 | 2010-08-17 | President And Fellows Of Harvard College | Emulsions and techniques for formation |
US8592221B2 (en) | 2007-04-19 | 2013-11-26 | Brandeis University | Manipulation of fluids, fluid components and reactions in microfluidic systems |
US7883265B2 (en) * | 2007-06-01 | 2011-02-08 | Applied Biosystems, Llc | Devices, systems, and methods for preparing emulsions |
JP2010528608A (ja) * | 2007-06-01 | 2010-08-26 | 454 ライフ サイエンシーズ コーポレイション | 複合的な混合物から個々の試料を特定するためのシステムおよび方法 |
KR20100018040A (ko) | 2007-06-06 | 2010-02-16 | 도만티스 리미티드 | 프로테아제 내성 폴리펩티드를 선택하는 방법 |
CA2689389A1 (en) * | 2007-06-28 | 2009-01-08 | 454 Life Sciences Corporation | System and method for adaptive reagent control in nucleic acid sequencing |
EP2212434A1 (en) * | 2007-10-01 | 2010-08-04 | Applied Biosystems Inc. | Chase ligation sequencing |
EP2213747B1 (en) | 2007-11-05 | 2021-06-30 | Riken | Method for producing membrane protein |
US8685675B2 (en) | 2007-11-27 | 2014-04-01 | Human Genetic Signatures Pty. Ltd. | Enzymes for amplification and copying bisulphite modified nucleic acids |
TW200944231A (en) | 2007-11-30 | 2009-11-01 | Glaxo Group Ltd | Antigen-binding constructs |
CN101946010B (zh) | 2007-12-21 | 2014-08-20 | 哈佛大学 | 用于核酸测序的系统和方法 |
WO2009100080A1 (en) | 2008-02-04 | 2009-08-13 | Life Technologies Corporation | Composition and method for sequencing nucleic acid |
US20090203086A1 (en) * | 2008-02-06 | 2009-08-13 | 454 Life Sciences Corporation | System and method for improved signal detection in nucleic acid sequencing |
AU2009231439A1 (en) | 2008-03-31 | 2009-10-08 | Glaxo Group Limited | Drug fusions and conjugates |
EP2260130B1 (en) * | 2008-04-04 | 2013-10-23 | Allopartis Biotechnologies, Inc. | Method of enhancing enzyme activity |
GB0806562D0 (en) | 2008-04-10 | 2008-05-14 | Fermentas Uab | Production of nucleic acid |
US7888034B2 (en) | 2008-07-01 | 2011-02-15 | 454 Life Sciences Corporation | System and method for detection of HIV tropism variants |
WO2010003132A1 (en) | 2008-07-02 | 2010-01-07 | Illumina Cambridge Ltd. | Using populations of beads for the fabrication of arrays on surfaces |
EP4047367A1 (en) | 2008-07-18 | 2022-08-24 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Method for detecting target analytes with droplet libraries |
US12038438B2 (en) | 2008-07-18 | 2024-07-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Enzyme quantification |
GB2467691A (en) | 2008-09-05 | 2010-08-11 | Aueon Inc | Methods for stratifying and annotating cancer drug treatment options |
WO2010033200A2 (en) | 2008-09-19 | 2010-03-25 | President And Fellows Of Harvard College | Creation of libraries of droplets and related species |
US12090480B2 (en) | 2008-09-23 | 2024-09-17 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Partition-based method of analysis |
US9764322B2 (en) | 2008-09-23 | 2017-09-19 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | System for generating droplets with pressure monitoring |
US9492797B2 (en) | 2008-09-23 | 2016-11-15 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | System for detection of spaced droplets |
WO2011120020A1 (en) | 2010-03-25 | 2011-09-29 | Quantalife, Inc. | Droplet transport system for detection |
US10512910B2 (en) | 2008-09-23 | 2019-12-24 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Droplet-based analysis method |
US11130128B2 (en) | 2008-09-23 | 2021-09-28 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Detection method for a target nucleic acid |
US8709762B2 (en) | 2010-03-02 | 2014-04-29 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | System for hot-start amplification via a multiple emulsion |
US9417190B2 (en) | 2008-09-23 | 2016-08-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Calibrations and controls for droplet-based assays |
US9598725B2 (en) | 2010-03-02 | 2017-03-21 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Emulsion chemistry for encapsulated droplets |
US9132394B2 (en) | 2008-09-23 | 2015-09-15 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | System for detection of spaced droplets |
US9156010B2 (en) | 2008-09-23 | 2015-10-13 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Droplet-based assay system |
US9399215B2 (en) | 2012-04-13 | 2016-07-26 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Sample holder with a well having a wicking promoter |
US8633015B2 (en) | 2008-09-23 | 2014-01-21 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Flow-based thermocycling system with thermoelectric cooler |
US8951939B2 (en) | 2011-07-12 | 2015-02-10 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital assays with multiplexed detection of two or more targets in the same optical channel |
US8728764B2 (en) | 2008-10-02 | 2014-05-20 | Illumina Cambridge Limited | Nucleic acid sample enrichment for sequencing applications |
US20100261189A1 (en) | 2008-10-03 | 2010-10-14 | Roche Molecular Systems, Inc. | System and method for detection of HLA Variants |
US20100087325A1 (en) * | 2008-10-07 | 2010-04-08 | Illumina, Inc. | Biological sample temperature control system and method |
US8541207B2 (en) | 2008-10-22 | 2013-09-24 | Illumina, Inc. | Preservation of information related to genomic DNA methylation |
AU2009319907B2 (en) | 2008-11-03 | 2015-10-01 | The Regents Of The University Of California | Methods for detecting modification resistant nucleic acids |
US9365901B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-06-14 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Monitoring immunoglobulin heavy chain evolution in B-cell acute lymphoblastic leukemia |
US8628927B2 (en) | 2008-11-07 | 2014-01-14 | Sequenta, Inc. | Monitoring health and disease status using clonotype profiles |
US8748103B2 (en) | 2008-11-07 | 2014-06-10 | Sequenta, Inc. | Monitoring health and disease status using clonotype profiles |
US9528160B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-12-27 | Adaptive Biotechnolgies Corp. | Rare clonotypes and uses thereof |
US9506119B2 (en) | 2008-11-07 | 2016-11-29 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Method of sequence determination using sequence tags |
EP4335932A3 (en) | 2008-11-07 | 2024-06-26 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Methods of monitoring conditions by sequence analysis |
GB0822260D0 (en) | 2008-12-05 | 2009-01-14 | Merten Christoph | Assay |
GB0822261D0 (en) | 2008-12-05 | 2009-01-14 | Merten Christoph | Assay |
ES2688621T3 (es) | 2008-12-05 | 2018-11-05 | Glaxo Group Limited | Métodos para seleccionar polipéptidos resistentes a proteasa |
EP2373812B1 (en) | 2008-12-19 | 2016-11-09 | President and Fellows of Harvard College | Particle-assisted nucleic acid sequencing |
WO2010075188A2 (en) | 2008-12-23 | 2010-07-01 | Illumina Inc. | Multibase delivery for long reads in sequencing by synthesis protocols |
US8685898B2 (en) | 2009-01-15 | 2014-04-01 | Imdaptive, Inc. | Adaptive immunity profiling and methods for generation of monoclonal antibodies |
US8581209B2 (en) * | 2009-01-29 | 2013-11-12 | Southwest Research Institute | Fluorescent monitoring of microcapsule oxidation |
SG173173A1 (en) | 2009-02-19 | 2011-08-29 | Glaxo Group Ltd | Improved anti-tnfr1 polypeptides, antibody variable domains & antagonists |
CA2753263A1 (en) | 2009-02-24 | 2010-09-02 | Glaxo Group Limited | Multivalent and/or multispecific rankl-binding constructs |
WO2010097386A1 (en) | 2009-02-24 | 2010-09-02 | Glaxo Group Limited | Antigen-binding constructs |
CA2753287A1 (en) | 2009-02-24 | 2010-09-02 | Glaxo Group Limited | Antigen-binding constructs |
CN102405098A (zh) | 2009-03-13 | 2012-04-04 | 哈佛学院院长等 | 流动聚焦微流装置的尺度放大 |
GB0904957D0 (en) | 2009-03-23 | 2009-05-06 | Univ Erasmus Medical Ct | Tumour gene profile |
US8528589B2 (en) | 2009-03-23 | 2013-09-10 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulation of microfluidic droplets |
JP2012521971A (ja) | 2009-03-27 | 2012-09-20 | グラクソ グループ リミテッド | 薬物融合体および複合体 |
US20100261229A1 (en) * | 2009-04-08 | 2010-10-14 | Applied Biosystems, Llc | System and method for preparing and using bulk emulsion |
WO2010129541A1 (en) * | 2009-05-04 | 2010-11-11 | Affomix Corporation | Emulsion selection of antibodies |
CA2765949C (en) | 2009-06-25 | 2016-03-29 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Method of measuring adaptive immunity |
CA2768460A1 (en) | 2009-07-16 | 2011-01-20 | Glaxo Group Limited | Antagonists, uses & methods for partially inhibiting tnfr1 |
JP5099455B2 (ja) * | 2009-07-16 | 2012-12-19 | 独立行政法人科学技術振興機構 | エマルジョンを用いたrnaの選択的増幅法 |
CA2767056C (en) | 2009-09-02 | 2018-12-04 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | System for mixing fluids by coalescence of multiple emulsions |
US20120211084A1 (en) | 2009-09-02 | 2012-08-23 | President And Fellows Of Harvard College | Multiple emulsions created using jetting and other techniques |
US8182994B2 (en) | 2009-09-15 | 2012-05-22 | Illumina Cambridge Limited | Centroid markers for image analysis of high denisty clusters in complex polynucleotide sequencing |
CN102666586A (zh) | 2009-09-30 | 2012-09-12 | 葛兰素集团有限公司 | 具有延长的半衰期的药物融合体和缀合物 |
US8609339B2 (en) | 2009-10-09 | 2013-12-17 | 454 Life Sciences Corporation | System and method for emulsion breaking and recovery of biological elements |
WO2011042564A1 (en) | 2009-10-09 | 2011-04-14 | Universite De Strasbourg | Labelled silica-based nanomaterial with enhanced properties and uses thereof |
GB0918564D0 (en) | 2009-10-22 | 2009-12-09 | Plasticell Ltd | Nested cell encapsulation |
AR078763A1 (es) | 2009-10-27 | 2011-11-30 | Glaxo Group Ltd | Polipeptidos anti factor de necrosis tumoral 1 (anti-tnfr1) estables, dominios variables de anticuerpos y antagonistas |
US9056289B2 (en) | 2009-10-27 | 2015-06-16 | President And Fellows Of Harvard College | Droplet creation techniques |
US8524450B2 (en) * | 2009-10-30 | 2013-09-03 | Illumina, Inc. | Microvessels, microparticles, and methods of manufacturing and using the same |
EP2333102A1 (en) * | 2009-12-14 | 2011-06-15 | Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Method for identifying RNA ligands |
WO2011079176A2 (en) | 2009-12-23 | 2011-06-30 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic systems and methods for reducing the exchange of molecules between droplets |
CA2786660A1 (en) | 2010-01-14 | 2011-07-21 | Glaxo Group Limited | Liver targeting molecules |
WO2011093939A1 (en) | 2010-02-01 | 2011-08-04 | Illumina, Inc. | Focusing methods and optical systems and assemblies using the same |
US10351905B2 (en) | 2010-02-12 | 2019-07-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analyte analysis |
US9366632B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-06-14 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
US9399797B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-07-26 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
WO2011100604A2 (en) | 2010-02-12 | 2011-08-18 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
DE202011003570U1 (de) | 2010-03-06 | 2012-01-30 | Illumina, Inc. | Systeme und Vorrichtungen zum Detektieren optischer Signale aus einer Probe |
JP2013525087A (ja) * | 2010-03-17 | 2013-06-20 | プレジデント アンド フェロウズ オブ ハーバード カレッジ | 融解乳化 |
EP2550528B1 (en) | 2010-03-25 | 2019-09-11 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Droplet generation for droplet-based assays |
EP2550351A4 (en) | 2010-03-25 | 2014-07-09 | Quantalife Inc | DETECTION SYSTEM FOR DROPLET-BASED ANALYZES |
JP2013529896A (ja) | 2010-04-30 | 2013-07-25 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲー | アクイフェックス・エオリカス由来の無機ピロホスファターゼの精製および使用のためのシステムおよび方法 |
US8530158B2 (en) | 2010-05-10 | 2013-09-10 | Life Technologies Corporation | System and method for processing a biological sample |
US20110287432A1 (en) | 2010-05-21 | 2011-11-24 | 454 Life Science Corporation | System and method for tailoring nucleotide concentration to enzymatic efficiencies in dna sequencing technologies |
US9650629B2 (en) | 2010-07-07 | 2017-05-16 | Roche Molecular Systems, Inc. | Clonal pre-amplification in emulsion |
EP3100786A1 (en) | 2010-07-22 | 2016-12-07 | Gencell Biosystems Limited | Composite liquid cells |
WO2012040387A1 (en) | 2010-09-24 | 2012-03-29 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Direct capture, amplification and sequencing of target dna using immobilized primers |
US20120077716A1 (en) | 2010-09-29 | 2012-03-29 | 454 Life Sciences Corporation | System and method for producing functionally distinct nucleic acid library ends through use of deoxyinosine |
WO2012050920A1 (en) | 2010-09-29 | 2012-04-19 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for sequencing nucleic acids |
WO2012045012A2 (en) | 2010-09-30 | 2012-04-05 | Raindance Technologies, Inc. | Sandwich assays in droplets |
US20120322665A1 (en) | 2010-10-08 | 2012-12-20 | 454 Life Sciences Corporation | System and method for detection of hiv-1 clades and recombinants of the reverse transcriptase and protease regions |
US8753816B2 (en) | 2010-10-26 | 2014-06-17 | Illumina, Inc. | Sequencing methods |
WO2012058647A1 (en) | 2010-10-28 | 2012-05-03 | Life Technologies Corporation | Chemically-enhanced primer compositions, methods and kits |
CN103429331B (zh) | 2010-11-01 | 2016-09-28 | 伯乐生命医学产品有限公司 | 用于形成乳液的系统 |
WO2012074855A2 (en) | 2010-11-22 | 2012-06-07 | The Regents Of The University Of California | Methods of identifying a cellular nascent rna transcript |
US20130236467A1 (en) | 2010-11-24 | 2013-09-12 | Jeremy Griggs | Multispecific antigen binding proteins targeting hgf |
WO2012073045A2 (en) | 2010-12-03 | 2012-06-07 | Cyclogenix Ltd | Polypeptide scaffold |
US8951781B2 (en) | 2011-01-10 | 2015-02-10 | Illumina, Inc. | Systems, methods, and apparatuses to image a sample for biological or chemical analysis |
WO2012109600A2 (en) | 2011-02-11 | 2012-08-16 | Raindance Technologies, Inc. | Methods for forming mixed droplets |
US12097495B2 (en) | 2011-02-18 | 2024-09-24 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Methods and compositions for detecting genetic material |
WO2012112804A1 (en) | 2011-02-18 | 2012-08-23 | Raindance Technoligies, Inc. | Compositions and methods for molecular labeling |
WO2012129187A1 (en) | 2011-03-18 | 2012-09-27 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Multiplexed digital assays with combinatorial use of signals |
US20120244523A1 (en) | 2011-03-25 | 2012-09-27 | 454 Life Sciences Corporation | System and Method for Detection of HIV Integrase Variants |
WO2012136792A2 (en) | 2011-04-07 | 2012-10-11 | Glaxo Group Limited | Cck compositions |
WO2012136790A1 (en) | 2011-04-07 | 2012-10-11 | Glaxo Group Limited | Compositions comprising fusion proteins or conjugates with an improved half -life |
EP2702175B1 (en) | 2011-04-25 | 2018-08-08 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Methods and compositions for nucleic acid analysis |
GB201108259D0 (en) * | 2011-05-17 | 2011-06-29 | Cambridge Entpr Ltd | Gel beads in microfluidic droplets |
KR20140034242A (ko) | 2011-05-23 | 2014-03-19 | 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 | 다중 에멀젼을 포함하는 에멀젼의 제어 |
EP3709018A1 (en) | 2011-06-02 | 2020-09-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Microfluidic apparatus for identifying components of a chemical reaction |
US8841071B2 (en) | 2011-06-02 | 2014-09-23 | Raindance Technologies, Inc. | Sample multiplexing |
WO2012170908A1 (en) | 2011-06-08 | 2012-12-13 | Life Technologies Corporation | Design and development of novel detergents for use in pcr systems |
US9567628B2 (en) | 2011-06-08 | 2017-02-14 | Life Technologies Corporation | Polymerization of nucleic acids using proteins having low isoelectric points |
EP3120923A3 (en) | 2011-07-06 | 2017-03-01 | President and Fellows of Harvard College | Article comprising a particle having a shell and a fluid |
US8658430B2 (en) | 2011-07-20 | 2014-02-25 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulating droplet size |
WO2013019751A1 (en) | 2011-07-29 | 2013-02-07 | Bio-Rad Laboratories, Inc., | Library characterization by digital assay |
JP5924888B2 (ja) * | 2011-08-26 | 2016-05-25 | 関東化學株式会社 | 核酸抽出方法、核酸抽出試薬キットおよび核酸抽出用試薬 |
KR20130023091A (ko) * | 2011-08-26 | 2013-03-07 | (주)바이오니아 | 단백질 합성 키트, 자동추출장비를 이용한 단백질 발현 및 추출 방법 |
US10385475B2 (en) | 2011-09-12 | 2019-08-20 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Random array sequencing of low-complexity libraries |
PT3623481T (pt) | 2011-09-23 | 2021-10-15 | Illumina Inc | Composições para sequenciação de ácidos nucleicos |
WO2013049135A1 (en) | 2011-09-26 | 2013-04-04 | Gen-Probe Incorporated | Algorithms for sequence determinations |
US10378051B2 (en) | 2011-09-29 | 2019-08-13 | Illumina Cambridge Limited | Continuous extension and deblocking in reactions for nucleic acids synthesis and sequencing |
DE102011054101A1 (de) | 2011-09-30 | 2013-04-04 | Albert-Ludwigs-Universität Freiburg | Verfahren zur räumlichen Anordnung von Probenfragmenten zur Amplifikation und Immobilisierung für weitere Derivatisierungen |
US9279159B2 (en) | 2011-10-21 | 2016-03-08 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells |
DE102011085473A1 (de) | 2011-10-28 | 2013-05-02 | Albert-Ludwigs-Universität Freiburg | Verfahren zur Identifikation von Aptameren |
US8637242B2 (en) | 2011-11-07 | 2014-01-28 | Illumina, Inc. | Integrated sequencing apparatuses and methods of use |
GB201120711D0 (en) | 2011-12-01 | 2012-01-11 | Univ Erasmus Medical Ct | Method for classifying tumour cells |
DK2788499T3 (en) | 2011-12-09 | 2016-03-21 | Illumina Inc | Enhanced root for polymer tags |
EP2788509B1 (en) | 2011-12-09 | 2018-07-11 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Diagnosis of lymphoid malignancies and minimal residual disease detection |
US9499865B2 (en) | 2011-12-13 | 2016-11-22 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Detection and measurement of tissue-infiltrating lymphocytes |
WO2013101896A1 (en) | 2011-12-30 | 2013-07-04 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Nucleic acid analysis using emulsion pcr |
CN104334725A (zh) | 2012-01-25 | 2015-02-04 | 基因细胞生物系统有限公司 | 生物分子分离 |
WO2013116698A2 (en) | 2012-02-02 | 2013-08-08 | Invenra, Inc. | High throughput screen for biologically active polypeptides |
US20130217023A1 (en) | 2012-02-22 | 2013-08-22 | 454 Life Sciences Corporation | System And Method For Generation And Use Of Compact Clonally Amplified Products |
WO2013134162A2 (en) | 2012-03-05 | 2013-09-12 | Sequenta, Inc. | Determining paired immune receptor chains from frequency matched subunits |
NO2694769T3 (ja) | 2012-03-06 | 2018-03-03 | ||
US20130261984A1 (en) | 2012-03-30 | 2013-10-03 | Illumina, Inc. | Methods and systems for determining fetal chromosomal abnormalities |
SG10201507700VA (en) | 2012-05-08 | 2015-10-29 | Adaptive Biotechnologies Corp | Compositions and method for measuring and calibrating amplification bias in multiplexed pcr reactions |
US10192024B2 (en) | 2012-05-18 | 2019-01-29 | 454 Life Sciences Corporation | System and method for generation and use of optimal nucleotide flow orders |
WO2014008448A1 (en) | 2012-07-03 | 2014-01-09 | Sloan Kettering Institute For Cancer Research | Quantitative assessment of human t-cell repertoire recovery after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation |
US9977861B2 (en) | 2012-07-18 | 2018-05-22 | Illumina Cambridge Limited | Methods and systems for determining haplotypes and phasing of haplotypes |
CA2881783A1 (en) | 2012-08-13 | 2014-02-20 | The Regents Of The University Of California | Methods and systems for detecting biological components |
US11591637B2 (en) | 2012-08-14 | 2023-02-28 | 10X Genomics, Inc. | Compositions and methods for sample processing |
US10273541B2 (en) | 2012-08-14 | 2019-04-30 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US9951386B2 (en) | 2014-06-26 | 2018-04-24 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US20140155295A1 (en) | 2012-08-14 | 2014-06-05 | 10X Technologies, Inc. | Capsule array devices and methods of use |
US10400280B2 (en) | 2012-08-14 | 2019-09-03 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10323279B2 (en) | 2012-08-14 | 2019-06-18 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10752949B2 (en) | 2012-08-14 | 2020-08-25 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10221442B2 (en) | 2012-08-14 | 2019-03-05 | 10X Genomics, Inc. | Compositions and methods for sample processing |
US9701998B2 (en) | 2012-12-14 | 2017-07-11 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US20150376609A1 (en) | 2014-06-26 | 2015-12-31 | 10X Genomics, Inc. | Methods of Analyzing Nucleic Acids from Individual Cells or Cell Populations |
NL2017959B1 (en) | 2016-12-08 | 2018-06-19 | Illumina Inc | Cartridge assembly |
ES2660027T3 (es) | 2012-10-01 | 2018-03-20 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Evaluación de la inmunocompetencia por la diversidad de los receptores de inmunidad adaptativa y caracterización de la clonalidad |
KR20150090037A (ko) | 2012-11-27 | 2015-08-05 | 젠셀 바이오시스템즈 리미티드 | 액체 샘플의 취급 |
US10533221B2 (en) | 2012-12-14 | 2020-01-14 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
EP2931919B1 (en) | 2012-12-14 | 2019-02-20 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
CN108753766A (zh) | 2013-02-08 | 2018-11-06 | 10X基因组学有限公司 | 多核苷酸条形码生成 |
WO2014144713A2 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-18 | Immumetrix, Inc. | Methods of sequencing the immune repertoire |
US9708657B2 (en) | 2013-07-01 | 2017-07-18 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Method for generating clonotype profiles using sequence tags |
US9348897B2 (en) | 2013-08-07 | 2016-05-24 | Google Inc. | Method and system for providing scheduling suggestions |
EP2840148B1 (en) | 2013-08-23 | 2019-04-03 | F. Hoffmann-La Roche AG | Methods for nucleic acid amplification |
EP2848698A1 (en) | 2013-08-26 | 2015-03-18 | F. Hoffmann-La Roche AG | System and method for automated nucleic acid amplification |
US10395758B2 (en) | 2013-08-30 | 2019-08-27 | 10X Genomics, Inc. | Sequencing methods |
US11901041B2 (en) | 2013-10-04 | 2024-02-13 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analysis of nucleic acid modification |
WO2015061714A1 (en) | 2013-10-25 | 2015-04-30 | Life Technologies Corporation | Novel compounds for use in pcr systems and applications thereof |
EP3065712A4 (en) | 2013-11-08 | 2017-06-21 | President and Fellows of Harvard College | Microparticles, methods for their preparation and use |
US10088973B2 (en) * | 2013-11-08 | 2018-10-02 | Google Llc | Event scheduling presentation in a graphical user interface environment |
US9944977B2 (en) | 2013-12-12 | 2018-04-17 | Raindance Technologies, Inc. | Distinguishing rare variations in a nucleic acid sequence from a sample |
US9824068B2 (en) | 2013-12-16 | 2017-11-21 | 10X Genomics, Inc. | Methods and apparatus for sorting data |
EP3090063B1 (en) | 2013-12-31 | 2019-11-06 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Method for detection of latent retrovirus |
EP3105326A4 (en) | 2014-02-10 | 2018-01-10 | Gencell Biosystems Limited | Composite liquid cell (clc) mediated nucleic acid library preparation device, and methods for using the same |
WO2015134787A2 (en) | 2014-03-05 | 2015-09-11 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Methods using randomer-containing synthetic molecules |
US10066265B2 (en) | 2014-04-01 | 2018-09-04 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Determining antigen-specific t-cells |
US11390921B2 (en) | 2014-04-01 | 2022-07-19 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Determining WT-1 specific T cells and WT-1 specific T cell receptors (TCRs) |
CA2943624A1 (en) | 2014-04-10 | 2015-10-15 | 10X Genomics, Inc. | Fluidic devices, systems, and methods for encapsulating and partitioning reagents, and applications of same |
ES2777529T3 (es) | 2014-04-17 | 2020-08-05 | Adaptive Biotechnologies Corp | Cuantificación de genomas de células inmunitarias adaptativas en una mezcla compleja de células |
EP4235677A3 (en) | 2014-06-26 | 2023-11-22 | 10X Genomics, Inc. | Processes and systems for nucleic acid sequence assembly |
WO2015200717A2 (en) | 2014-06-27 | 2015-12-30 | The Regents Of The University Of California | Pcr-activated sorting (pas) |
JP6802154B2 (ja) | 2014-09-18 | 2020-12-16 | イラミーナ インコーポレーテッド | 核酸シーケンシングデータを解析するための方法およびシステム |
WO2016053883A1 (en) | 2014-10-03 | 2016-04-07 | Life Technologies Corporation | Detection, identification, validation and enrichment of target nucleic acids |
CA3001986C (en) | 2014-10-22 | 2023-02-21 | The Regents Of The University Of California | High definition microdroplet printer |
EP3212807B1 (en) | 2014-10-29 | 2020-09-02 | 10X Genomics, Inc. | Methods and compositions for targeted nucleic acid sequencing |
EP3715455A1 (en) | 2014-10-29 | 2020-09-30 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Highly-multiplexed simultaneous detection of nucleic acids encoding paired adaptive immune receptor heterodimers from many samples |
US9975122B2 (en) | 2014-11-05 | 2018-05-22 | 10X Genomics, Inc. | Instrument systems for integrated sample processing |
US10246701B2 (en) | 2014-11-14 | 2019-04-02 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Multiplexed digital quantitation of rearranged lymphoid receptors in a complex mixture |
US11066705B2 (en) | 2014-11-25 | 2021-07-20 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Characterization of adaptive immune response to vaccination or infection using immune repertoire sequencing |
SG11201705615UA (en) | 2015-01-12 | 2017-08-30 | 10X Genomics Inc | Processes and systems for preparing nucleic acid sequencing libraries and libraries prepared using same |
WO2016115273A1 (en) | 2015-01-13 | 2016-07-21 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for visualizing structural variation and phasing information |
JP2018508198A (ja) | 2015-02-04 | 2018-03-29 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | 別個の実体におけるバーコード付加による核酸のシーケンシング |
AU2016219480B2 (en) | 2015-02-09 | 2021-11-11 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for determining structural variation and phasing using variant call data |
US10697000B2 (en) | 2015-02-24 | 2020-06-30 | 10X Genomics, Inc. | Partition processing methods and systems |
AU2016222719B2 (en) | 2015-02-24 | 2022-03-31 | 10X Genomics, Inc. | Methods for targeted nucleic acid sequence coverage |
EP3591074B1 (en) | 2015-02-24 | 2024-10-23 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Methods for diagnosing infectious disease and determining hla status using immune repertoire sequencing |
DK3271477T3 (da) | 2015-03-20 | 2020-09-14 | Novozymes As | Dråbebaseret udvælgelse ved injektion |
CA3225867A1 (en) | 2015-03-24 | 2016-09-29 | Illumina, Inc. | Methods, carrier assemblies, and systems for imaging samples for biological or chemical analysis |
EP3277294B1 (en) | 2015-04-01 | 2024-05-15 | Adaptive Biotechnologies Corp. | Method of identifying human compatible t cell receptors specific for an antigenic target |
WO2016164583A2 (en) | 2015-04-07 | 2016-10-13 | Novozymes A/S | Methods for selecting enzymes having enhanced activity |
US20180355404A1 (en) * | 2015-04-07 | 2018-12-13 | Novozymes A/S | Methods for selecting enzymes having lipase activity |
EP3653728B1 (en) | 2015-06-09 | 2023-02-01 | Life Technologies Corporation | Methods, systems, compositions, kits, apparatus and computer-readable media for molecular tagging |
US11618777B2 (en) | 2015-07-31 | 2023-04-04 | Shigeyuki Yokoyama | Method of manufacturing membrane protein and utilization thereof |
US10647981B1 (en) | 2015-09-08 | 2020-05-12 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Nucleic acid library generation methods and compositions |
AU2016338907B2 (en) | 2015-10-13 | 2022-07-07 | President And Fellows Of Harvard College | Systems and methods for making and using gel microspheres |
US11371094B2 (en) | 2015-11-19 | 2022-06-28 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for nucleic acid processing using degenerate nucleotides |
CN115369161A (zh) | 2015-12-04 | 2022-11-22 | 10X 基因组学有限公司 | 用于核酸分析的方法和组合物 |
WO2017138984A1 (en) | 2016-02-11 | 2017-08-17 | 10X Genomics, Inc. | Systems, methods, and media for de novo assembly of whole genome sequence data |
US20190161786A1 (en) | 2016-04-07 | 2019-05-30 | Novozymes A/S | Methods for selecting enzymes having protease activity |
US10287620B2 (en) * | 2016-04-29 | 2019-05-14 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital polymerase fidelity assay |
WO2017197338A1 (en) | 2016-05-13 | 2017-11-16 | 10X Genomics, Inc. | Microfluidic systems and methods of use |
WO2018031691A1 (en) | 2016-08-10 | 2018-02-15 | The Regents Of The University Of California | Combined multiple-displacement amplification and pcr in an emulsion microdroplet |
US10428325B1 (en) | 2016-09-21 | 2019-10-01 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Identification of antigen-specific B cell receptors |
WO2018064116A1 (en) | 2016-09-28 | 2018-04-05 | Illumina, Inc. | Methods and systems for data compression |
MY194951A (en) | 2016-10-14 | 2022-12-28 | Illumina Inc | Cartridge assembly |
WO2018118968A1 (en) | 2016-12-19 | 2018-06-28 | Editas Medicine, Inc. | Emulsion-based screening methods |
CN110462053A (zh) | 2016-12-21 | 2019-11-15 | 加利福尼亚大学董事会 | 使用基于水凝胶的液滴进行单细胞基因组测序 |
US10550429B2 (en) | 2016-12-22 | 2020-02-04 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10815525B2 (en) | 2016-12-22 | 2020-10-27 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
US10011872B1 (en) | 2016-12-22 | 2018-07-03 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for processing polynucleotides |
WO2018140966A1 (en) | 2017-01-30 | 2018-08-02 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for droplet-based single cell barcoding |
US10995333B2 (en) | 2017-02-06 | 2021-05-04 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for nucleic acid preparation |
GB201707143D0 (en) | 2017-05-04 | 2017-06-21 | Plasticell Ltd | Method for producing cells |
CN110870018A (zh) | 2017-05-19 | 2020-03-06 | 10X基因组学有限公司 | 用于分析数据集的系统和方法 |
EP4230746A3 (en) | 2017-05-26 | 2023-11-01 | 10X Genomics, Inc. | Single cell analysis of transposase accessible chromatin |
US10844372B2 (en) | 2017-05-26 | 2020-11-24 | 10X Genomics, Inc. | Single cell analysis of transposase accessible chromatin |
US10837047B2 (en) | 2017-10-04 | 2020-11-17 | 10X Genomics, Inc. | Compositions, methods, and systems for bead formation using improved polymers |
WO2019076955A1 (en) | 2017-10-18 | 2019-04-25 | Novozymes A/S | IMMUNOLOGICAL ASSAY FOR THE STABILITY OF A BIO-ACTIVE POLYPEPTIDE |
US10501739B2 (en) | 2017-10-18 | 2019-12-10 | Mission Bio, Inc. | Method, systems and apparatus for single cell analysis |
US11634757B2 (en) | 2017-10-20 | 2023-04-25 | Stilla Technologies | Emulsions with improved stability |
WO2019084043A1 (en) | 2017-10-26 | 2019-05-02 | 10X Genomics, Inc. | METHODS AND SYSTEMS FOR NUCLEIC ACID PREPARATION AND CHROMATIN ANALYSIS |
EP3700672B1 (en) | 2017-10-27 | 2022-12-28 | 10X Genomics, Inc. | Methods for sample preparation and analysis |
CN111051523B (zh) | 2017-11-15 | 2024-03-19 | 10X基因组学有限公司 | 功能化凝胶珠 |
US10829815B2 (en) | 2017-11-17 | 2020-11-10 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for associating physical and genetic properties of biological particles |
US11254980B1 (en) | 2017-11-29 | 2022-02-22 | Adaptive Biotechnologies Corporation | Methods of profiling targeted polynucleotides while mitigating sequencing depth requirements |
WO2019108851A1 (en) | 2017-11-30 | 2019-06-06 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for nucleic acid preparation and analysis |
EP3740591A4 (en) | 2018-01-19 | 2022-02-23 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | MUTANT DNA POLYMERASES |
EP3752832A1 (en) | 2018-02-12 | 2020-12-23 | 10X Genomics, Inc. | Methods characterizing multiple analytes from individual cells or cell populations |
US11639928B2 (en) | 2018-02-22 | 2023-05-02 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for characterizing analytes from individual cells or cell populations |
WO2019169028A1 (en) | 2018-02-28 | 2019-09-06 | 10X Genomics, Inc. | Transcriptome sequencing through random ligation |
SG11202009889VA (en) | 2018-04-06 | 2020-11-27 | 10X Genomics Inc | Systems and methods for quality control in single cell processing |
WO2019217758A1 (en) | 2018-05-10 | 2019-11-14 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for molecular library generation |
US11932899B2 (en) | 2018-06-07 | 2024-03-19 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for characterizing nucleic acid molecules |
US11703427B2 (en) | 2018-06-25 | 2023-07-18 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for cell and bead processing |
US20200032335A1 (en) | 2018-07-27 | 2020-01-30 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for metabolome analysis |
US12065688B2 (en) | 2018-08-20 | 2024-08-20 | 10X Genomics, Inc. | Compositions and methods for cellular processing |
US11459607B1 (en) | 2018-12-10 | 2022-10-04 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for processing-nucleic acid molecules from a single cell using sequential co-partitioning and composite barcodes |
SG11202105441WA (en) | 2018-12-13 | 2021-06-29 | Dna Script | Direct oligonucleotide synthesis on cells and biomolecules |
US11845983B1 (en) | 2019-01-09 | 2023-12-19 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for multiplexing of droplet based assays |
WO2020168013A1 (en) | 2019-02-12 | 2020-08-20 | 10X Genomics, Inc. | Methods for processing nucleic acid molecules |
US11851683B1 (en) | 2019-02-12 | 2023-12-26 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for selective analysis of cellular samples |
US11467153B2 (en) | 2019-02-12 | 2022-10-11 | 10X Genomics, Inc. | Methods for processing nucleic acid molecules |
US11655499B1 (en) | 2019-02-25 | 2023-05-23 | 10X Genomics, Inc. | Detection of sequence elements in nucleic acid molecules |
EP3938537A1 (en) | 2019-03-11 | 2022-01-19 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for processing optically tagged beads |
WO2020237222A1 (en) | 2019-05-22 | 2020-11-26 | Mission Bio, Inc. | Method and apparatus for simultaneous targeted sequencing of dna, rna and protein |
WO2021003255A1 (en) | 2019-07-01 | 2021-01-07 | Mission Bio | Method and apparatus to normalize quantitative readouts in single-cell experiments |
US11851700B1 (en) | 2020-05-13 | 2023-12-26 | 10X Genomics, Inc. | Methods, kits, and compositions for processing extracellular molecules |
US12084715B1 (en) | 2020-11-05 | 2024-09-10 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for reducing artifactual antisense products |
EP4277740A1 (en) | 2021-01-13 | 2023-11-22 | Pacific Biosciences of California, Inc. | Surface structuring with colloidal assembly |
AU2022227563A1 (en) | 2021-02-23 | 2023-08-24 | 10X Genomics, Inc. | Probe-based analysis of nucleic acids and proteins |
WO2023122363A1 (en) | 2021-12-23 | 2023-06-29 | Illumina Software, Inc. | Dynamic graphical status summaries for nucelotide sequencing |
US20230215515A1 (en) | 2021-12-23 | 2023-07-06 | Illumina Software, Inc. | Facilitating secure execution of external workflows for genomic sequencing diagnostics |
CA3242624A1 (en) | 2021-12-29 | 2023-07-06 | Shannon Whitmore | Automatically switching variant analysis model versions for genomic analysis applications |
WO2023225488A1 (en) | 2022-05-16 | 2023-11-23 | Enkefalos Biosciences, Inc. | Blood-brain barrier translocating peptides and related molecules and methods of use thereof |
WO2024072614A1 (en) | 2022-09-27 | 2024-04-04 | Nautilus Subsidiary, Inc. | Polypeptide capture, in situ fragmentation and identification |
Family Cites Families (59)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US2747570A (en) * | 1954-05-19 | 1956-05-29 | Jobst Conrad | Means for assisting return circulation of fluids in an animal body |
US3826249A (en) * | 1973-01-30 | 1974-07-30 | A Lee | Leg constricting apparatus |
US3908642A (en) * | 1973-10-29 | 1975-09-30 | Pred Vinmont | Means for aerating and applying air pulsations within casts |
US4206751A (en) * | 1978-03-31 | 1980-06-10 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Intermittent compression device |
US4801529A (en) * | 1985-06-18 | 1989-01-31 | Brandeis University | Methods for isolating mutant microoganisms using microcapsules coated with indicator material |
US5099030A (en) * | 1987-03-09 | 1992-03-24 | The Procter & Gamble Company | Novel compounds, pharmaceutical compositions, and methods for treating inflammation and pain |
DK0494955T3 (da) * | 1989-10-05 | 1998-10-26 | Optein Inc | Cellefri syntese og isolering af hidtil ukendte gener og polypeptider |
EP0515506B1 (en) * | 1990-02-16 | 2000-01-05 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Improvements in the specificity and convenience of the polymerase chain reaction |
DE476178T1 (de) | 1990-09-21 | 1992-07-23 | Bioplex Medical B.V., Vaals | Geraet zum anbringen von blutstillendem stoff auf perforierten blutgefaessen. |
GB9107628D0 (en) * | 1991-04-10 | 1991-05-29 | Moonbrook Limited | Preparation of diagnostic agents |
US5955341A (en) * | 1991-04-10 | 1999-09-21 | The Scripps Research Institute | Heterodimeric receptor libraries using phagemids |
ATE175997T1 (de) * | 1991-08-10 | 1999-02-15 | Medical Res Council | Behandlung von zellpopulationen |
JP3097866B2 (ja) * | 1991-10-15 | 2000-10-10 | マルティライト リミティド | 標識試薬を使用した結合検定法 |
US5270170A (en) * | 1991-10-16 | 1993-12-14 | Affymax Technologies N.V. | Peptide library and screening method |
US5413924A (en) * | 1992-02-13 | 1995-05-09 | Kosak; Kenneth M. | Preparation of wax beads containing a reagent for release by heating |
DE4223169C1 (de) | 1992-07-10 | 1993-11-25 | Ferring Arzneimittel Gmbh | Verfahren zur Mikroverkapselung wasserlöslicher Wirkstoffe |
RU2048522C1 (ru) * | 1992-10-14 | 1995-11-20 | Институт белка РАН | Способ размножения нуклеиновых кислот, способ их экспрессии и среда для их осуществления |
IL104384A (en) * | 1993-01-13 | 1996-11-14 | Yeda Res & Dev | Method for screening catalytic non-enzyme polypeptides and proteins |
US5436149A (en) | 1993-02-19 | 1995-07-25 | Barnes; Wayne M. | Thermostable DNA polymerase with enhanced thermostability and enhanced length and efficiency of primer extension |
AU6707194A (en) | 1993-04-19 | 1994-11-08 | Medisorb Technologies International L.P. | Encapsulation of nucleic acids with conjugates that facilitate and target cellular uptake and gene expression |
JPH09500007A (ja) * | 1993-04-19 | 1997-01-07 | スチュアート エイ コーフマン | 新規化合物生成に関するランダム化学 |
WO1995011922A1 (en) * | 1993-10-29 | 1995-05-04 | Affymax Technologies N.V. | In vitro peptide and antibody display libraries |
DE4402038A1 (de) | 1994-01-25 | 1995-07-27 | Borries Horst Von | Durchdrückpackung |
EP0804249A2 (en) * | 1994-03-15 | 1997-11-05 | Brown University Research Foundation | Polymeric gene delivery system |
US5508348A (en) * | 1994-08-12 | 1996-04-16 | The Research Foundation Of Suny | Inverted emulsion pathways to conductive polymers |
US5680283A (en) * | 1994-09-30 | 1997-10-21 | Kabushiki Kaisha Toshiba | Magnetic head and magnetic disk drive |
KR19990008000A (ko) | 1995-04-24 | 1999-01-25 | 로버트 에스. 화이트 헤드 | 새로운 대사 경로를 만들고 이를 스크리닝하는 방법 |
US5756122A (en) | 1995-06-07 | 1998-05-26 | Georgetown University | Liposomally encapsulated nucleic acids having high entrapment efficiencies, method of manufacturer and use thereof for transfection of targeted cells |
US5910408A (en) * | 1995-06-07 | 1999-06-08 | The General Hospital Corporation | Catalytic DNA having ligase activity |
DE69614768T2 (de) * | 1995-06-14 | 2002-06-20 | Tonen Corp., Tokio/Tokyo | Emulsionsspaltung durch Mikroorganismen |
AU6691496A (en) | 1995-08-01 | 1997-02-26 | Advanced Therapies, Inc. | Enhanced artificial viral envelopes for cellular delivery of therapeutic substances |
DE19646372C1 (de) * | 1995-11-11 | 1997-06-19 | Evotec Biosystems Gmbh | Genotyp und Phänotyp koppelnde Verbindung |
GB9608540D0 (en) * | 1996-04-25 | 1996-07-03 | Medical Res Council | Isolation of enzymes |
US5876711A (en) * | 1996-05-31 | 1999-03-02 | Onyx Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions for determining the tumor suppressor status of cells |
US6083693A (en) | 1996-06-14 | 2000-07-04 | Curagen Corporation | Identification and comparison of protein-protein interactions that occur in populations |
US5876771A (en) * | 1996-06-20 | 1999-03-02 | Tetra Laval Holdings & Finance, Sa | Process and article for determining the residence time of a food particle |
AU4596597A (en) | 1996-09-27 | 1998-04-17 | Icos Corporation | Method to identify compounds for disrupting protein/protein interactions |
WO1998023733A2 (en) | 1996-11-27 | 1998-06-04 | University Of Washington | Thermostable polymerases having altered fidelity |
US6310354B1 (en) * | 1996-12-03 | 2001-10-30 | Erkki Soini | Method and a device for monitoring nucleic acid amplification reactions |
DE69835143T2 (de) | 1997-01-21 | 2007-06-06 | The General Hospital Corp., Boston | Selektion von proteinen mittels rns-protein fusionen |
CA2196496A1 (en) | 1997-01-31 | 1998-07-31 | Stephen William Watson Michnick | Protein fragment complementation assay for the detection of protein-protein interactions |
GB9703369D0 (en) * | 1997-02-18 | 1997-04-09 | Lindqvist Bjorn H | Process |
US6023540A (en) * | 1997-03-14 | 2000-02-08 | Trustees Of Tufts College | Fiber optic sensor with encoded microspheres |
EP0975969A4 (en) | 1997-03-18 | 2002-07-31 | Chromaxome Corp | METHODS OF SORTING COMPOUNDS USING ENCAPSULATED CELLS |
US6048551A (en) * | 1997-03-27 | 2000-04-11 | Hilfinger; John M. | Microsphere encapsulation of gene transfer vectors |
EP1496120B1 (en) * | 1997-07-07 | 2007-03-28 | Medical Research Council | In vitro sorting method |
JP2981547B1 (ja) * | 1998-07-02 | 1999-11-22 | 農林水産省食品総合研究所長 | クロスフロー型マイクロチャネル装置及び同装置を用いたエマルションの生成または分離方法 |
EP1100889A4 (en) | 1998-07-17 | 2002-03-06 | Mirus Corp | SURFACTANT SOLUTIONS |
GB9900298D0 (en) * | 1999-01-07 | 1999-02-24 | Medical Res Council | Optical sorting method |
GB9921155D0 (en) | 1999-09-08 | 1999-11-10 | Medical Res Council | Selection system |
CN1189159C (zh) * | 2000-05-05 | 2005-02-16 | 欧莱雅 | 含水溶性美容活性组分水性核的微胶囊及含其的组合物 |
GB0022458D0 (en) | 2000-09-13 | 2000-11-01 | Medical Res Council | Directed evolution method |
US6936264B2 (en) * | 2001-03-05 | 2005-08-30 | The Procter & Gamble Company | Delivery of reactive agents via multiple emulsions for use in shelf stable products |
JP3570714B2 (ja) * | 2001-05-24 | 2004-09-29 | 株式会社リコー | 現像剤収納容器及び画像形成装置 |
GB0114856D0 (en) | 2001-06-18 | 2001-08-08 | Medical Res Council | Selection by avidity capture |
GB0127564D0 (en) | 2001-11-16 | 2002-01-09 | Medical Res Council | Emulsion compositions |
GB0221053D0 (en) * | 2002-09-11 | 2002-10-23 | Medical Res Council | Single-molecule in vitro evolution |
WO2004083443A1 (en) | 2002-12-20 | 2004-09-30 | Caliper Life Sciences, Inc. | Single molecule amplification and detection of dna |
EP2159285B1 (en) | 2003-01-29 | 2012-09-26 | 454 Life Sciences Corporation | Methods of amplifying and sequencing nucleic acids |
-
1998
- 1998-06-29 EP EP04077102A patent/EP1496120B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 PT PT04077102T patent/PT1496120E/pt unknown
- 1998-06-29 ES ES04077211T patent/ES2294427T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 JP JP2000502169A patent/JP4298912B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 EP EP07019329A patent/EP1908832B1/en not_active Revoked
- 1998-06-29 DK DK04077102T patent/DK1496120T3/da active
- 1998-06-29 CA CA2792122A patent/CA2792122C/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 AT AT07002417T patent/ATE487790T1/de active
- 1998-06-29 DK DK98930958T patent/DK1019496T3/da active
- 1998-06-29 AU AU81231/98A patent/AU736836B2/en not_active Expired
- 1998-06-29 CA CA2295324A patent/CA2295324C/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 CA CA002584453A patent/CA2584453A1/en not_active Abandoned
- 1998-06-29 WO PCT/GB1998/001889 patent/WO1999002671A1/en active IP Right Grant
- 1998-06-29 EP EP98930958A patent/EP1019496B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 AT AT04077211T patent/ATE374815T1/de active
- 1998-06-29 DK DK07002417.9T patent/DK1801214T3/da active
- 1998-06-29 PT PT07002417T patent/PT1801214E/pt unknown
- 1998-06-29 DE DE69841997T patent/DE69841997D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 ES ES07019329T patent/ES2402516T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 DE DE69826697T patent/DE69826697T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 AT AT98930958T patent/ATE278013T1/de not_active IP Right Cessation
- 1998-06-29 EP EP04077211A patent/EP1482036B1/en not_active Revoked
- 1998-06-29 DE DE69838521T patent/DE69838521T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 ES ES04077102T patent/ES2283936T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 AT AT04077102T patent/ATE358177T1/de active
- 1998-06-29 ES ES98930958T patent/ES2230701T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 EP EP10184602A patent/EP2258846A3/en not_active Withdrawn
- 1998-06-29 EP EP07002417A patent/EP1801214B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 GB GB9929447A patent/GB2342094B/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-06-29 DE DE69837453T patent/DE69837453T2/de not_active Expired - Lifetime
-
1999
- 1999-12-16 US US09/464,122 patent/US6489103B1/en not_active Expired - Lifetime
-
2002
- 2002-10-03 US US10/263,984 patent/US7138233B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2004
- 2004-06-03 US US10/860,750 patent/US7252943B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2004-06-04 US US10/861,930 patent/US7638276B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2005
- 2005-02-17 JP JP2005041355A patent/JP4299255B2/ja not_active Expired - Lifetime
-
2006
- 2006-09-08 US US11/518,094 patent/US7582446B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2007
- 2007-03-09 JP JP2007060915A patent/JP4156009B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2007-06-21 US US11/820,903 patent/US8367326B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2011
- 2011-02-07 CY CY20111100136T patent/CY1111537T1/el unknown
-
2013
- 2013-01-03 US US13/733,473 patent/US9528106B2/en not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4156009B2 (ja) | 核酸濃度を増大させる方法 | |
JP5198597B2 (ja) | 光学的分取方法 | |
ES2354480T3 (es) | Procedimiento de clasificación in vitro. |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20070328 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20071120 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20080214 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20080219 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20080519 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20080617 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20080708 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20110718 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20110718 Year of fee payment: 3 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120718 Year of fee payment: 4 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |