JP3129723B2 - サポート結合オリゴヌクレオチド - Google Patents
サポート結合オリゴヌクレオチドInfo
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- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
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- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
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Description
【発明の詳細な説明】 固体サポート結合オリゴヌクレオチドには幾つかの可
能な用途がある。これらは複合DNA中の突然変異の存在
−例えばヒトにおける疾患遺伝子座の検出に用いること
ができる。これらを用いて、複合混合物から特定核酸を
選択することができ、例えば、全細胞群から特定mRNAを
選択することができる。これらは1989年5月2日出願の
国際出願第PCT/GB89/00460号に述べられている発明に有
用である。
能な用途がある。これらは複合DNA中の突然変異の存在
−例えばヒトにおける疾患遺伝子座の検出に用いること
ができる。これらを用いて、複合混合物から特定核酸を
選択することができ、例えば、全細胞群から特定mRNAを
選択することができる。これらは1989年5月2日出願の
国際出願第PCT/GB89/00460号に述べられている発明に有
用である。
幾つかの論文が核酸を固体マトリックスに付着させる
方法を述べている(1〜6)。これらの方法は二つの問
題を有している:これらは複雑で、しばしば非効率的工
程を必要とし;ヌクレオチドは塩基ならびに末端を介し
て結合する。塩基を介しての結合はハイブリッド形成反
応に結合ポリヌクレオチドを後に用いることを妨げる。
方法を述べている(1〜6)。これらの方法は二つの問
題を有している:これらは複雑で、しばしば非効率的工
程を必要とし;ヌクレオチドは塩基ならびに末端を介し
て結合する。塩基を介しての結合はハイブリッド形成反
応に結合ポリヌクレオチドを後に用いることを妨げる。
固体サポート付きオリゴヌクレオチドの合成方法は充
分に確立されている(7〜14)。オリゴヌクレオチドと
サポートとの間の結合は塩基中のブロッキング基を除去
するために用いられる最終試薬に対して不安定であるの
で、プロセスのこの工程も固体サポートからオリゴヌク
レオチド除去する。オリゴヌクレオチドは安定な結合を
用いた場合にサポートに結合して留まると考えられる。
スプロート(Sproat)とブラウン(Brown)(1985)
は、ウレタン結合が通常のスクシネート結合よりも安定
であるが、ウレタン結合が複雑な合成を必要とし、最終
の脱保護工程に対して完全には安定でないことを示し
た。
分に確立されている(7〜14)。オリゴヌクレオチドと
サポートとの間の結合は塩基中のブロッキング基を除去
するために用いられる最終試薬に対して不安定であるの
で、プロセスのこの工程も固体サポートからオリゴヌク
レオチド除去する。オリゴヌクレオチドは安定な結合を
用いた場合にサポートに結合して留まると考えられる。
スプロート(Sproat)とブラウン(Brown)(1985)
は、ウレタン結合が通常のスクシネート結合よりも安定
であるが、ウレタン結合が複雑な合成を必要とし、最終
の脱保護工程に対して完全には安定でないことを示し
た。
クレア(Crea)とホーン(Horn)(1980)は5′−ヒ
ドロキシル基を介してセルロースに結合したリボヌクレ
オチドを用いて、オリゴヌクレオチド合成を開始してい
る。生成した鎖の第1残基と第2残基との間の結合は最
終脱保護工程に対して不安定である。
ドロキシル基を介してセルロースに結合したリボヌクレ
オチドを用いて、オリゴヌクレオチド合成を開始してい
る。生成した鎖の第1残基と第2残基との間の結合は最
終脱保護工程に対して不安定である。
アーノルド(Arnold)とベルグ(Berg)(1985)はオ
リゴヌクレオチド合成のプライマーが共有結合したポリ
マーサポートを述べている、この場合にプライマーは選
択的酸化によって開裂し、オリゴヌクレオチドの他の結
合は酸化されない。
リゴヌクレオチド合成のプライマーが共有結合したポリ
マーサポートを述べている、この場合にプライマーは選
択的酸化によって開裂し、オリゴヌクレオチドの他の結
合は酸化されない。
合成が容易であり、標準的な解重合工程に対して完全
に安定である、新しい結合を提供することが、本発明の
目的である。
に安定である、新しい結合を提供することが、本発明の
目的である。
1態様では、本発明はオリゴヌクレオチド鎖から保護
基を除去するために用いる条件に安定である共有ホスフ
ォジエステル結合によってヒドロキシル基含有サポート
にヌクレオシド試薬を結合させることから成るオリゴヌ
クレオチド合成に適した誘導サポート(derivatized s
upport)の製造方法であって、ヒドロキシル基が脂肪族
部分が−(CnH2n)−(式中、nは少なくとも3であ
る)またはアルコキシまたはポリ(アルコキシ)である
脂肪族ヒドロキシル基であることを特徴とする方法を提
供する。
基を除去するために用いる条件に安定である共有ホスフ
ォジエステル結合によってヒドロキシル基含有サポート
にヌクレオシド試薬を結合させることから成るオリゴヌ
クレオチド合成に適した誘導サポート(derivatized s
upport)の製造方法であって、ヒドロキシル基が脂肪族
部分が−(CnH2n)−(式中、nは少なくとも3であ
る)またはアルコキシまたはポリ(アルコキシ)である
脂肪族ヒドロキシル基であることを特徴とする方法を提
供する。
他の態様では、本発明次の工程: (a)サポートにヌクレオシドを結合させる工程; (b)サポート付きヌクレオシド上で保護基含有オリゴ
ヌクレオチドを合成する工程; (c)オリゴヌクレオチド鎖から保護基を除去する工程 から成り、サポートがヒドロキシル基を有し、それによ
って工程(a)ではヌクレオシドがサポートに工程
(c)で用いる条件に安定な共有ホスフォジエステル結
合によって結合することから成るサポートに結合したオ
リゴヌクレオチドの製造方法であって、ヒドロキシル基
が脂肪族が−(CnH2n)−(式中、nは少なくとも3で
ある)またはアルコキシまたはポリ(アルコキシ)であ
る脂肪族ヒドロキシル基であることを特徴とする方法を
提供する。
ヌクレオチドを合成する工程; (c)オリゴヌクレオチド鎖から保護基を除去する工程 から成り、サポートがヒドロキシル基を有し、それによ
って工程(a)ではヌクレオシドがサポートに工程
(c)で用いる条件に安定な共有ホスフォジエステル結
合によって結合することから成るサポートに結合したオ
リゴヌクレオチドの製造方法であって、ヒドロキシル基
が脂肪族が−(CnH2n)−(式中、nは少なくとも3で
ある)またはアルコキシまたはポリ(アルコキシ)であ
る脂肪族ヒドロキシル基であることを特徴とする方法を
提供する。
さらに他の態様では、本発明は構造−O−PY−O−
(式中、Yは保護されたまたは保護されない酸素原子で
ある)で表される共有ホスフォジエステル結合によって
サポートに結合したヌクレオシドから成る、オリゴヌク
レオチド合成に適した誘導サポートであって、サポート
への結合が−(CnH2n)−(式中、nは少なくとも3で
ある)またはアルコキシまたはポリ(アルコキシ)であ
る脂肪族部分を介して行われることを特徴とする誘導サ
ポートを提供する。
(式中、Yは保護されたまたは保護されない酸素原子で
ある)で表される共有ホスフォジエステル結合によって
サポートに結合したヌクレオシドから成る、オリゴヌク
レオチド合成に適した誘導サポートであって、サポート
への結合が−(CnH2n)−(式中、nは少なくとも3で
ある)またはアルコキシまたはポリ(アルコキシ)であ
る脂肪族部分を介して行われることを特徴とする誘導サ
ポートを提供する。
さらに他の態様では、本発明はオリゴヌクレオチドが
末端ホスフェート基を介して共有ホスフォジエステル結
合によってサポートに結合したサポート結合オリゴヌク
レオチドであって、結合が構造式−O−PO2−O−R−
[Rは−(CnH2n)−(式中、nは少なくとも3であ
る)またはアルコキシまたはポリ(アルコキシ)である
脂肪族部分である]を有することを特徴とするサポート
結合オリゴヌクレオチドを提供する。
末端ホスフェート基を介して共有ホスフォジエステル結
合によってサポートに結合したサポート結合オリゴヌク
レオチドであって、結合が構造式−O−PO2−O−R−
[Rは−(CnH2n)−(式中、nは少なくとも3であ
る)またはアルコキシまたはポリ(アルコキシ)である
脂肪族部分である]を有することを特徴とするサポート
結合オリゴヌクレオチドを提供する。
本発明にとってサポートの性質は決定的ではない。サ
ポートは塊状または粒状であり得、例えば誘導シリカゲ
ルまたはケイソウ土−ポリメチル−アクリルアミド、ま
たは制御孔質ガラス(controlled−pore glass)、ま
たは板ガラス表面であり得る。本質的なことは、サポー
トが脂肪族ヒドロキシル基を有することと、これらのヒ
ドロキシル基がヌクレオシド試薬との反応に利用され得
る形状であることである。これらのヒドロキシル基は、
例えば制御孔質ガラスまたは他のサポートを長鎖アルキ
ルアルコールによって誘導することによって形成される
ように、ヒドロキシアルキル基の一部を形成することが
できる。この代わりに、サポートを長鎖アルキルアミン
によって誘導し、アミン基を使用現場でヒドロキシル基
に転化することができる。または、ヒドロキシル基が、
固体サポートを成すかまたは固体サポート上に誘導され
るポリマー構造体の一部であることも可能である。
ポートは塊状または粒状であり得、例えば誘導シリカゲ
ルまたはケイソウ土−ポリメチル−アクリルアミド、ま
たは制御孔質ガラス(controlled−pore glass)、ま
たは板ガラス表面であり得る。本質的なことは、サポー
トが脂肪族ヒドロキシル基を有することと、これらのヒ
ドロキシル基がヌクレオシド試薬との反応に利用され得
る形状であることである。これらのヒドロキシル基は、
例えば制御孔質ガラスまたは他のサポートを長鎖アルキ
ルアルコールによって誘導することによって形成される
ように、ヒドロキシアルキル基の一部を形成することが
できる。この代わりに、サポートを長鎖アルキルアミン
によって誘導し、アミン基を使用現場でヒドロキシル基
に転化することができる。または、ヒドロキシル基が、
固体サポートを成すかまたは固体サポート上に誘導され
るポリマー構造体の一部であることも可能である。
ヌクレオシド試薬の性質は本発明にとって決定的では
ない。オリゴヌクレオチド合成に通常用いられる試薬を
この場合にも用いることができる。試薬がホスフォール
アミジトであることが好ましい(7と8)。試薬と形成
される生成物とを次の反応図式に示す。
ない。オリゴヌクレオチド合成に通常用いられる試薬を
この場合にも用いることができる。試薬がホスフォール
アミジトであることが好ましい(7と8)。試薬と形成
される生成物とを次の反応図式に示す。
この図式では、Iはヌクレオシド3′−ホスフィット
試薬を表し、IIは誘導サポートを表し、IIIは両者の間
の反応によって最初に形成された共有結合を表し、IVは
最終生成物を表す。
試薬を表し、IIは誘導サポートを表し、IIIは両者の間
の反応によって最初に形成された共有結合を表し、IVは
最終生成物を表す。
Bは関係するヌクレオシドに適当な塩基を表す。
Xは例えばジメトキシトリチル基のようなブロッキン
グ基であり、その性質は本発明にとって決定的ではな
い、または(特にIVでは)オリゴヌクレオチド鎖を表
す。
グ基であり、その性質は本発明にとって決定的ではな
い、または(特にIVでは)オリゴヌクレオチド鎖を表
す。
Yは保護酸素原子であり、一般に、例えばメトキシま
たはβ−シアノエトキシのようなアルコキシ基である。
たはβ−シアノエトキシのようなアルコキシ基である。
Zはジ−(C1〜C4アルキル)アミンまたはClまたはテ
トラゾリルである。
トラゾリルである。
Rは脂肪族であり、アルキル基である。
Sは固体サポートを表す。
この代わりに、ヌクレオシド3′−試薬はホスフォネ
ートまたは水素ホスフォネート(hydrogen phosphonat
e)である(12)。試薬と形成された生成物を次の反応
図式に示す。
ートまたは水素ホスフォネート(hydrogen phosphonat
e)である(12)。試薬と形成された生成物を次の反応
図式に示す。
この図式では、Vはヌクレオシドホスフォネートまた
は水素ホスフォネートを表し、IIは誘導体化サポートを
表し、VIIは両者の間に最初に形成された共有結合を表
し、IVは最終生成物を表す。
は水素ホスフォネートを表し、IIは誘導体化サポートを
表し、VIIは両者の間に最初に形成された共有結合を表
し、IVは最終生成物を表す。
B、X、RおよびSは上記で定義した通りである。
Qは本発明の付着工程および合成工程に関係しない水
素又は有機基である。
素又は有機基である。
この代わりに、ヌクレオシド3′−試薬は、Aがアル
キルであり、B、XおよびZが上記で定義した通りであ
る構造式VIIを有するホスフォーンアミジト(phosphona
midite)である。好ましい例では、Aはメチルであり、
Zはジイソプロピルアミンである。
キルであり、B、XおよびZが上記で定義した通りであ
る構造式VIIを有するホスフォーンアミジト(phosphona
midite)である。好ましい例では、Aはメチルであり、
Zはジイソプロピルアミンである。
自動的なオリゴヌクレオチド合成装置は商業的に入手
可能である。先行技術では、提案オリゴヌクレオチド鎖
の第1ヌクレオチドによって予誘導体化された固体サポ
ートを合成装置に入れることが必要である。本発明は脂
肪族ヒドロキシル基(例えばヒドロキシルアルキル基)
を有する固体サポートを合成装置に入れることができ
る。次に、ヌクレオシド3′−試薬を合成装置内で提案
オリゴヌクレオチド鎖の第1ヌクレオチドとしてサポー
トに付着させる。
可能である。先行技術では、提案オリゴヌクレオチド鎖
の第1ヌクレオチドによって予誘導体化された固体サポ
ートを合成装置に入れることが必要である。本発明は脂
肪族ヒドロキシル基(例えばヒドロキシルアルキル基)
を有する固体サポートを合成装置に入れることができ
る。次に、ヌクレオシド3′−試薬を合成装置内で提案
オリゴヌクレオチド鎖の第1ヌクレオチドとしてサポー
トに付着させる。
上記反応図式では、III〜IVの転化またはVI〜IVの転
化は酸化工程を含む。これは標準条件下で例えばヨウ素
または硫黄を用いて、オリゴヌクレオチド合成の前また
はより通常にはオリゴヌクレオチド合成の後に実施する
ことができる。
化は酸化工程を含む。これは標準条件下で例えばヨウ素
または硫黄を用いて、オリゴヌクレオチド合成の前また
はより通常にはオリゴヌクレオチド合成の後に実施する
ことができる。
ヌクレオシド3′−試薬は固体状態オリゴヌクレオチ
ド合成のためにヌクレオシド5′−試薬よりも開発され
ている。それにも拘わらず、ヌクレオシド5′−試薬は
脂肪族ヒドロキシル(例えばヒドロキシアルキル)基を
有する共有5′−ホスフォジエステル結合を形成し、固
体状態オリゴヌクレオチド合成の基礎として、正確にそ
れらの3′−対応物と同様に、役立つと考えられる。本
発明はヌクレオシド3′−試薬の代替物としてヌクレオ
シド5′−試薬の使用を考える。
ド合成のためにヌクレオシド5′−試薬よりも開発され
ている。それにも拘わらず、ヌクレオシド5′−試薬は
脂肪族ヒドロキシル(例えばヒドロキシアルキル)基を
有する共有5′−ホスフォジエステル結合を形成し、固
体状態オリゴヌクレオチド合成の基礎として、正確にそ
れらの3′−対応物と同様に、役立つと考えられる。本
発明はヌクレオシド3′−試薬の代替物としてヌクレオ
シド5′−試薬の使用を考える。
この方法の次の工程はサポート付きヌクレオシド上で
のオリゴヌクレオチド鎖の合成を含む。これの実施方法
は周知であり、実際に自動ミクロプロセッサー制御装置
を利用して、この仕事を実施することができる。これら
の方法は好ましくない副反応を避けるために保護基の供
給を必ず含み、オリゴヌクレオチド合成の最終工程は保
護基の除去を含む。オリゴヌクレオチドの可溶化を予め
生ずるのはこの工程である。この工程は典型的に、例え
ばチオフェノキシドを用いたホスフォジエステル基から
のメチル基の除去、例えば高温でのアンモニアを用いた
ヌクレオチド塩基のN原子からの保護基の除去、例えば
ジクロロ酢酸によるオリゴヌクレオチド鎖に加えた最後
のヌクレオチドの5′−位置からの保護基の除去を含
む。最初のヌクレオシドとサポートとの間の上記共有結
合は上記その他の通常の脱保護工程に対して安定であ
る。
のオリゴヌクレオチド鎖の合成を含む。これの実施方法
は周知であり、実際に自動ミクロプロセッサー制御装置
を利用して、この仕事を実施することができる。これら
の方法は好ましくない副反応を避けるために保護基の供
給を必ず含み、オリゴヌクレオチド合成の最終工程は保
護基の除去を含む。オリゴヌクレオチドの可溶化を予め
生ずるのはこの工程である。この工程は典型的に、例え
ばチオフェノキシドを用いたホスフォジエステル基から
のメチル基の除去、例えば高温でのアンモニアを用いた
ヌクレオチド塩基のN原子からの保護基の除去、例えば
ジクロロ酢酸によるオリゴヌクレオチド鎖に加えた最後
のヌクレオチドの5′−位置からの保護基の除去を含
む。最初のヌクレオシドとサポートとの間の上記共有結
合は上記その他の通常の脱保護工程に対して安定であ
る。
次の例は本発明を説明する。
例1 バロチニ(Ballotini)ガラスビーズ[20g,90〜130μ
m直径、ジェンコンス(Jencons)]をキシレン(40m
l)、グリシドキシプロピルトリメトキシシランおよび
痕跡量のジイソプロピルエチルアミンの混合物中に90℃
において一晩撹拌しながら懸濁させ、次にメタノール、
エーテルによって完全に洗浄し、風乾した。これらの誘
導ビーズ(6g)を窒素雰囲気下、80℃において触媒量の
濃硫酸を含むヘキサエチレングリコール中で撹拌しなが
ら、一晩加熱して、アルキルヒドロキシル誘導体化ビー
ズを得た。メタノールとエーテルで洗浄した後に、ビー
ズを真空下で乾燥し、アルゴン下、−20℃で貯蔵した。
m直径、ジェンコンス(Jencons)]をキシレン(40m
l)、グリシドキシプロピルトリメトキシシランおよび
痕跡量のジイソプロピルエチルアミンの混合物中に90℃
において一晩撹拌しながら懸濁させ、次にメタノール、
エーテルによって完全に洗浄し、風乾した。これらの誘
導ビーズ(6g)を窒素雰囲気下、80℃において触媒量の
濃硫酸を含むヘキサエチレングリコール中で撹拌しなが
ら、一晩加熱して、アルキルヒドロキシル誘導体化ビー
ズを得た。メタノールとエーテルで洗浄した後に、ビー
ズを真空下で乾燥し、アルゴン下、−20℃で貯蔵した。
少量のヒドロキシアルキル誘導ビーズを、バクテリオ
ファージ ラムダの左結合性端部の配列を合成するよう
にプログラムした自動オリゴヌクレオチド合成装置[ア
プライド バイオシステム(Applied Biosystem)]の
反応器に入れた。第1ヌクレオチドは、Yがβ−シアノ
エトキシであり、Zがジイソプロピルアミンである3′
−ホスフォールアミン(1)であった。これは誘導ビー
ズに共有結合した。
ファージ ラムダの左結合性端部の配列を合成するよう
にプログラムした自動オリゴヌクレオチド合成装置[ア
プライド バイオシステム(Applied Biosystem)]の
反応器に入れた。第1ヌクレオチドは、Yがβ−シアノ
エトキシであり、Zがジイソプロピルアミンである3′
−ホスフォールアミン(1)であった。これは誘導ビー
ズに共有結合した。
除去されたトリチル基量をスペクトロフォトメター
(spectrophotometer)中で測定することによって、合
成の各工程をモニターすることができる。この試験によ
って、段階的収率は96〜99%であった。このように、収
量と純度の両方は高く、我々の計算によると、ビーズ14
0mgはオリゴヌクレオチド4nmolより多くを保持する。
(spectrophotometer)中で測定することによって、合
成の各工程をモニターすることができる。この試験によ
って、段階的収率は96〜99%であった。このように、収
量と純度の両方は高く、我々の計算によると、ビーズ14
0mgはオリゴヌクレオチド4nmolより多くを保持する。
生成物は熱アンモニアによる標準処理によって脱保護
し、蒸留水によって完全に洗浄した。次にこれを32Pに
よって5′端部を標識した相補的オリゴヌクレオチドco
sLとのハイブリッド形成に用いた。
し、蒸留水によって完全に洗浄した。次にこれを32Pに
よって5′端部を標識した相補的オリゴヌクレオチドco
sLとのハイブリッド形成に用いた。
バクテリオファージλ(cosL)の左端部による誘導ビ
ーズ1mgに、放射能標識した(20μlの100mM NaCl,1mM
EDTA中の13,000cpm32P)相補的オリゴヌクレオチドを
加えた。混合物を30℃において2時間インキュベート
し、放射性溶液を取り出し、ビーズを氷冷却バッファー
によって完全に洗浄した。ビーズに付着して残留したオ
リゴヌクレオチド(約3,000cpm,23%)蒸留水による溶
出によって定量的に除去することができる。
ーズ1mgに、放射能標識した(20μlの100mM NaCl,1mM
EDTA中の13,000cpm32P)相補的オリゴヌクレオチドを
加えた。混合物を30℃において2時間インキュベート
し、放射性溶液を取り出し、ビーズを氷冷却バッファー
によって完全に洗浄した。ビーズに付着して残留したオ
リゴヌクレオチド(約3,000cpm,23%)蒸留水による溶
出によって定量的に除去することができる。
非相補的オリゴヌクレオチドによる同じ条件下での対
照「ハイブリッド形成」はビーズに対して0.02%の非特
異的結合を示した。
照「ハイブリッド形成」はビーズに対して0.02%の非特
異的結合を示した。
これらの実験は合成が直接的であること、およびビー
ズがハイブリッド形成に上首尾に用いられることを示
す。
ズがハイブリッド形成に上首尾に用いられることを示
す。
ガラスビーズはカラムに充填して、多くの望ましい性
質を有するアフィニティマトリックスを形成するために
理想的である。
質を有するアフィニティマトリックスを形成するために
理想的である。
下記第1表は例1に述べた一般的方法によって誘導さ
れたビーズの物理的パラメーターを要約する。
れたビーズの物理的パラメーターを要約する。
例2 2枚のガラスシートをそれらの間に狭い間隙を保持し
て一緒にクランプした。例1と同じ試薬を狭い間隙に注
入して、同じ条件下で誘導を実施した。
て一緒にクランプした。例1と同じ試薬を狭い間隙に注
入して、同じ条件下で誘導を実施した。
固体サポートとして誘導ガラスプレートを用いて標準
条件下でオリゴヌクレオチド合成を手動で実施した。第
1ヌクレオチドはトリエチルアンモニウム塩として用い
た3′−水素ホスフェートであった。オリゴヌクレオチ
ド合成の第1工程とその後の工程の両方の収率と純度は
高かった。
条件下でオリゴヌクレオチド合成を手動で実施した。第
1ヌクレオチドはトリエチルアンモニウム塩として用い
た3′−水素ホスフェートであった。オリゴヌクレオチ
ド合成の第1工程とその後の工程の両方の収率と純度は
高かった。
次の例は標識DNAフラグメントとオリゴヌクレオチド
との誘導ビーズへのハイブリッド形成の幾つかの方法を
示す。
との誘導ビーズへのハイブリッド形成の幾つかの方法を
示す。
例3 スティックに付着したガラスビーズへのハイブリッド形
成 プラスッチックスティック2cm長さを溶融ポリプロピ
レン中に浸漬してから、誘導体化ガラスビーズのパイル
に接触させて、冷却した。約100〜200ビーズがスティッ
クに接着した。多くの実験が示すように、このビーズ保
持方法はハイブリッド形成を非常に促進する。配列3′
AGGTCGCCGCCC5′によって誘導体化したガラスビーズ約1
00個が付着したスティックを0.1M NaClと、5′端部に
おいて30,000cpmの活性までに標識した相補的オリゴヌ
クレオチド80fmolとを含む溶液30μl中に浸漬した。
成 プラスッチックスティック2cm長さを溶融ポリプロピ
レン中に浸漬してから、誘導体化ガラスビーズのパイル
に接触させて、冷却した。約100〜200ビーズがスティッ
クに接着した。多くの実験が示すように、このビーズ保
持方法はハイブリッド形成を非常に促進する。配列3′
AGGTCGCCGCCC5′によって誘導体化したガラスビーズ約1
00個が付着したスティックを0.1M NaClと、5′端部に
おいて30,000cpmの活性までに標識した相補的オリゴヌ
クレオチド80fmolとを含む溶液30μl中に浸漬した。
30℃における30分後に、スティックを管から取り出
し、すすぎ洗いし、スティックを50℃の0.1M NaCl中に
浸漬することによって結合物質を溶離した。次に、ハイ
ブリッド化したオリゴヌクレオチド量を測定した。供給
オリゴヌクレオチドの典型的に4%がこのやり方でピッ
クアップされることができた;0.1%は非特異的に結合
し、除去されなかった。従って、単一ビーズの結合容量
は約0.03fmolオリゴヌクレオチドである。
し、すすぎ洗いし、スティックを50℃の0.1M NaCl中に
浸漬することによって結合物質を溶離した。次に、ハイ
ブリッド化したオリゴヌクレオチド量を測定した。供給
オリゴヌクレオチドの典型的に4%がこのやり方でピッ
クアップされることができた;0.1%は非特異的に結合
し、除去されなかった。従って、単一ビーズの結合容量
は約0.03fmolオリゴヌクレオチドである。
温度を低下させ、ハイブリッド形成の長さを高めるこ
とによって、初期オリゴヌクレオチドのより大きな割合
をピックアップすることができた。このようにして、同
様な実験では、30℃での55分後に5.3%がハイブリッド
化され、0.05%の非特異的に結合し、30℃での16時間後
に13%がハイブリッド化され、0.2%は非特異的に結合
した。
とによって、初期オリゴヌクレオチドのより大きな割合
をピックアップすることができた。このようにして、同
様な実験では、30℃での55分後に5.3%がハイブリッド
化され、0.05%の非特異的に結合し、30℃での16時間後
に13%がハイブリッド化され、0.2%は非特異的に結合
した。
対照として、非相補的オリゴヌクレオチド5′GGGCGG
CGACCT3′は14時間後に0.2%の結合を示したにすぎなか
った。
CGACCT3′は14時間後に0.2%の結合を示したにすぎなか
った。
要約すると、プラスチックスティックに付着した誘導
ガラスビーズによる実験は非常に容易であり、ビーズに
対するハイブリッド形成の高度な特異性を示すことが実
証された。
ガラスビーズによる実験は非常に容易であり、ビーズに
対するハイブリッド形成の高度な特異性を示すことが実
証された。
例4 バッチ式ハイブリッド形成 0.5ml遠心管内で典型的に1mgのビーズによってハイブ
リッド化を実施することによって、ビーズにハイブリッ
ド化する放射性物質量をさらに高め、非特異的結合を減
ずることができた。ハイブリッド形成後に、管を回転さ
せ、上澄みを除去し、ビーズを洗浄した。Tmより高温で
の洗浄はハイブリッドの完全な溶融を生ずるので、結合
物質をセレンコフ(Cerenkov)計測によって測定するこ
とができた。このようにして、我々はハイブリッド形成
速度と溶離速度の塩濃度と温度への依存性を次の用に測
定することができた: 5管の各々に、ほぼ同数のビーズと50μlの0.1M Na
Cl中の相補的オリゴヌクレオチド(30,000cpm)を加え
た。ハイブリッド形成を30℃において一晩実施し、ハイ
ブリッド量を最大にした。溶液を除去し、ビーズを氷冷
0.1M NaClで2回洗浄した。各管に対して異なる温度に
おいて徐々に時間を長くして溶離を実施した。各期間後
に、上澄みを除去し、ビーズを氷冷NaCl溶液(100μ
l、0.1M)で2回洗浄し、予熱したNaCl(100μl、0.1
M)で溶離した。
リッド化を実施することによって、ビーズにハイブリッ
ド化する放射性物質量をさらに高め、非特異的結合を減
ずることができた。ハイブリッド形成後に、管を回転さ
せ、上澄みを除去し、ビーズを洗浄した。Tmより高温で
の洗浄はハイブリッドの完全な溶融を生ずるので、結合
物質をセレンコフ(Cerenkov)計測によって測定するこ
とができた。このようにして、我々はハイブリッド形成
速度と溶離速度の塩濃度と温度への依存性を次の用に測
定することができた: 5管の各々に、ほぼ同数のビーズと50μlの0.1M Na
Cl中の相補的オリゴヌクレオチド(30,000cpm)を加え
た。ハイブリッド形成を30℃において一晩実施し、ハイ
ブリッド量を最大にした。溶液を除去し、ビーズを氷冷
0.1M NaClで2回洗浄した。各管に対して異なる温度に
おいて徐々に時間を長くして溶離を実施した。各期間後
に、上澄みを除去し、ビーズを氷冷NaCl溶液(100μ
l、0.1M)で2回洗浄し、予熱したNaCl(100μl、0.1
M)で溶離した。
第2表は結合オリゴヌクレオチドの溶離%を経時的に
詳述する。溶離速度は温度に明確に依存する。例えば、
65℃では30℃における3倍量が5分間内に溶離した。Tm
より充分に低い30℃においても、無視できない速度であ
ることは意外ではない。
詳述する。溶離速度は温度に明確に依存する。例えば、
65℃では30℃における3倍量が5分間内に溶離した。Tm
より充分に低い30℃においても、無視できない速度であ
ることは意外ではない。
他の実験では、供給オリゴヌクレオチドの濃度を50倍
に変化させた。1.5ml遠心管内での0.1M NaCl、1mM ED
TA中の30℃、2時間のハイブリッド化の後に、上澄みを
除去し、0℃、0.1M NaClにより3回洗浄し、ビーズに
結合した放射能量をセレンコフ計測によって測定した。
濃度とハイブリッド量(すなわち、ハイブリッド形成速
度、第3表)との間には直線的関係があり、このことは
ハイブリッド形成が疑似1次反応(pseudo first ord
er reaction)であることを示す。
に変化させた。1.5ml遠心管内での0.1M NaCl、1mM ED
TA中の30℃、2時間のハイブリッド化の後に、上澄みを
除去し、0℃、0.1M NaClにより3回洗浄し、ビーズに
結合した放射能量をセレンコフ計測によって測定した。
濃度とハイブリッド量(すなわち、ハイブリッド形成速
度、第3表)との間には直線的関係があり、このことは
ハイブリッド形成が疑似1次反応(pseudo first ord
er reaction)であることを示す。
オリゴヌクレオチドの最高濃度は20μl中の160fmol
(13,000cmpに相当)であった。0.03%のみは非特異的
に結合し、溶離しなかった。
(13,000cmpに相当)であった。0.03%のみは非特異的
に結合し、溶離しなかった。
さらに、0.02%のみの非相補的オリゴヌクレオチドが
同様な実験においてビーズに結合し(65,000cpm中の12c
pm)、このことはこのDNAフラグメント単離方法が非常
に特異的であり、明確であることを示唆している。 第2表 溶離速度に対する温度の効果 溶離温度 5′ 20′ 50′ 110′ 330′ 残留
% 温度 溶離% 30℃ 23 38 54 71 85 0
36℃ 34 61 78 90 96 3
44℃ 42 54 67 87 97 2
65℃ 74 89 96 98 98 1.4
第3表 ハイブリッド形成速度に対するオリゴヌクレオチド濃度の効果 相対濃度 50 20 10 2 1 ハイブリッド化% 23 14 5.5 0.8 0.6 相対速度 38 23 9 1.5 1 例5 長いDNAフラグメントの単離 長いDNAフラグメントの単離を次の実験で実施した: 総λDNA(制限酵素バッファー135μl中に5μg)を制
限エンドヌクレアーゼHinf 1の15単位によって消化さ
せ、生成した143制限フラグメントをウシ腸ホスファタ
ーゼ(1単位)によって脱ホスフォリル化した。37℃で
の1時間後に、EGTA4μlを加え、混合物を65℃でさら
に45分間インキュベートし、フェノール抽出し、エタノ
ール沈降させた。
同様な実験においてビーズに結合し(65,000cpm中の12c
pm)、このことはこのDNAフラグメント単離方法が非常
に特異的であり、明確であることを示唆している。 第2表 溶離速度に対する温度の効果 溶離温度 5′ 20′ 50′ 110′ 330′ 残留
% 温度 溶離% 30℃ 23 38 54 71 85 0
36℃ 34 61 78 90 96 3
44℃ 42 54 67 87 97 2
65℃ 74 89 96 98 98 1.4
第3表 ハイブリッド形成速度に対するオリゴヌクレオチド濃度の効果 相対濃度 50 20 10 2 1 ハイブリッド化% 23 14 5.5 0.8 0.6 相対速度 38 23 9 1.5 1 例5 長いDNAフラグメントの単離 長いDNAフラグメントの単離を次の実験で実施した: 総λDNA(制限酵素バッファー135μl中に5μg)を制
限エンドヌクレアーゼHinf 1の15単位によって消化さ
せ、生成した143制限フラグメントをウシ腸ホスファタ
ーゼ(1単位)によって脱ホスフォリル化した。37℃で
の1時間後に、EGTA4μlを加え、混合物を65℃でさら
に45分間インキュベートし、フェノール抽出し、エタノ
ール沈降させた。
混合物をキナーゼ標識バッファー(10xPNKバッファー
8μl,0.1MDDT1μl、PNK酵素4μl、蒸留水30μl、1
5μlCi−32P.ATP)50μl中に溶解し、37℃において1
時間インキュベートし、100μlまで補充し、セファデ
ックス(Sephadex)G25カラムを降下させ、非結合ヌク
レオチドを除去した。
8μl,0.1MDDT1μl、PNK酵素4μl、蒸留水30μl、1
5μlCi−32P.ATP)50μl中に溶解し、37℃において1
時間インキュベートし、100μlまで補充し、セファデ
ックス(Sephadex)G25カラムを降下させ、非結合ヌク
レオチドを除去した。
バロチニガラスビーズ(100μm、ジェンコンス)の
アリコートをバクテリオファージλの右結合性端部の配
列、すなわち3′−CCCGCCGCTGGA5′によって誘導し、
アンモニア中で脱保護し、洗浄し、少量をU形毛細管の
底部に入れた。この底部を制御可能な温度ブロック中で
40℃に保持し、毛細管の上部左アームと右アームにプラ
スチック注射器のジャケットをかぶせ、それに熱水を供
給することによって、これらのアームを67℃に維持し
た。ハイブリッド形成溶液を加えた(0.1M NaCl 75μ
l、5′端部 10pmol、ビーズ上のオリゴヌクレオチド
に相補的な左λ結合性端部 33fmolを含む、総放射能約
700,000cpm)。
アリコートをバクテリオファージλの右結合性端部の配
列、すなわち3′−CCCGCCGCTGGA5′によって誘導し、
アンモニア中で脱保護し、洗浄し、少量をU形毛細管の
底部に入れた。この底部を制御可能な温度ブロック中で
40℃に保持し、毛細管の上部左アームと右アームにプラ
スチック注射器のジャケットをかぶせ、それに熱水を供
給することによって、これらのアームを67℃に維持し
た。ハイブリッド形成溶液を加えた(0.1M NaCl 75μ
l、5′端部 10pmol、ビーズ上のオリゴヌクレオチド
に相補的な左λ結合性端部 33fmolを含む、総放射能約
700,000cpm)。
ポンプを毛細管のアームの一つに取り付け、それぞれ
40℃と67℃とに維持した毛細管の部分の間にハイブリッ
ド形成溶液を前後に循環させた。ビーズに対する左端部
のハイブリッド化は40℃で生じ、溶液中に再アニールし
た二つの粘着性λ端部が67℃において変性した。
40℃と67℃とに維持した毛細管の部分の間にハイブリッ
ド形成溶液を前後に循環させた。ビーズに対する左端部
のハイブリッド化は40℃で生じ、溶液中に再アニールし
た二つの粘着性λ端部が67℃において変性した。
4時間後に、ハイブリッド形成溶液を除去し、ビーズ
を徹底的に洗浄してから、熱TE中に溶離させた。溶液の
アリコートをポリアクリルアミドゲル上に入れた。オー
トラジオグラフィーは洗液(wash)中に正確なサイズの
1帯のみと溶離レーン(elution lane)とを明らかに
した。左端部の全体で1000cpmが理論量の5%に相当す
るビーズによって結合された。
を徹底的に洗浄してから、熱TE中に溶離させた。溶液の
アリコートをポリアクリルアミドゲル上に入れた。オー
トラジオグラフィーは洗液(wash)中に正確なサイズの
1帯のみと溶離レーン(elution lane)とを明らかに
した。左端部の全体で1000cpmが理論量の5%に相当す
るビーズによって結合された。
要約すると、この実験は長いDNAフラグメントの複合
混合物からの高度に特異的な単離を実証する。
混合物からの高度に特異的な単離を実証する。
例6 カラムクロマトグラフィー オリゴヌクレオチドを単離し、新規なサポートのハイ
ブリッド形成挙動を調べるためのもう一つの容易で便利
な方法は、カラムクロマトグラフィーによる方法であ
る。
ブリッド形成挙動を調べるためのもう一つの容易で便利
な方法は、カラムクロマトグラフィーによる方法であ
る。
ガラス毛細管(直径1.0mm)の1端を引き伸ばして、
非常に狭い先細の開口を形成した。次にこの開口を他端
からの粉砕ガラス粒子の充填とそれらをガラスに粘着さ
せるためのブンゼンバーナーの火炎中での焼結とによっ
て塞いだ。トリクロロエタン中のジクロロジメチル−シ
ランの溶液に通し、エタノールで洗浄することによっ
て、毛細管の内側をシラン化した(silanised)。ガラ
スビーズ約40mgをガラスフリット上に置き、カラムの頂
部を注入ポンプによって駆動可能な注射器に結合サせ
た。このようにして、放射性ハイブリッド形成溶液と洗
浄溶液とを異なる速度で、典型的には3〜10μl/分の範
囲内の速度でカラムに供給することができた。
非常に狭い先細の開口を形成した。次にこの開口を他端
からの粉砕ガラス粒子の充填とそれらをガラスに粘着さ
せるためのブンゼンバーナーの火炎中での焼結とによっ
て塞いだ。トリクロロエタン中のジクロロジメチル−シ
ランの溶液に通し、エタノールで洗浄することによっ
て、毛細管の内側をシラン化した(silanised)。ガラ
スビーズ約40mgをガラスフリット上に置き、カラムの頂
部を注入ポンプによって駆動可能な注射器に結合サせ
た。このようにして、放射性ハイブリッド形成溶液と洗
浄溶液とを異なる速度で、典型的には3〜10μl/分の範
囲内の速度でカラムに供給することができた。
典型的な実験では、TE中0.1M NaCl、0.1%SDSの溶液
(pH7.5)1ml中の標識オリゴヌクレオチド0.2pmol(34,
000cpm)をカラムに3μl/分の速度で供給した。ジャケ
ット付きカラムを35℃に維持した。90μl分画をミクロ
遠心管に回収して、放射能量をセレンコフ計測によって
測定した。0.1M NaCl洗浄溶液を同様にして供給して、
回収した。ジャケット内の温度を高めることによってオ
リゴヌクレオチドを回収することができた。
(pH7.5)1ml中の標識オリゴヌクレオチド0.2pmol(34,
000cpm)をカラムに3μl/分の速度で供給した。ジャケ
ット付きカラムを35℃に維持した。90μl分画をミクロ
遠心管に回収して、放射能量をセレンコフ計測によって
測定した。0.1M NaCl洗浄溶液を同様にして供給して、
回収した。ジャケット内の温度を高めることによってオ
リゴヌクレオチドを回収することができた。
このようにして、オリゴヌクレオチドの70%がガラス
ビーズに結合し、高温において溶離され、0.1%のみの
物質がサポートに残留することが判明した。
ビーズに結合し、高温において溶離され、0.1%のみの
物質がサポートに残留することが判明した。
非相補的オリゴヌクレオチド(位置7において不適
合)を用いた対照実験は、35℃での洗浄後に、供給した
80,000cpm中の400cpmが残留することを示した。40℃で
は、140cpm=0.2%のみが残留した。
合)を用いた対照実験は、35℃での洗浄後に、供給した
80,000cpm中の400cpmが残留することを示した。40℃で
は、140cpm=0.2%のみが残留した。
サポート上の接近可能なオリゴヌクレオチドの%を測
定した。0.13pmolキナーゼ標識オリゴヌクレオチドと5p
mol非標識オリゴヌクレオチドをビーズ40mgに供給し
た。全体で約3nmolのオリゴヌクレオチドを含む、サポ
ートにハイブリッド化した物質の10%(約500fmol)が
合成中の脱トリイル化(detriylation)から測定され
た。
定した。0.13pmolキナーゼ標識オリゴヌクレオチドと5p
mol非標識オリゴヌクレオチドをビーズ40mgに供給し
た。全体で約3nmolのオリゴヌクレオチドを含む、サポ
ートにハイブリッド化した物質の10%(約500fmol)が
合成中の脱トリイル化(detriylation)から測定され
た。
この結果から、サポート上のオリゴヌクレオチドの1/
6000が使用条件(35℃、低塩)下でハイブリッド化し、
不適合オリゴヌクレオチドの無視できる結合が生ずるこ
とが算出される。溶融はこの場合にも非常に急激であ
り、オリゴヌクレオチドの大部分は48℃における二つの
90μl分画中に溶離した。
6000が使用条件(35℃、低塩)下でハイブリッド化し、
不適合オリゴヌクレオチドの無視できる結合が生ずるこ
とが算出される。溶融はこの場合にも非常に急激であ
り、オリゴヌクレオチドの大部分は48℃における二つの
90μl分画中に溶離した。
これらの実験は誘導ビーズが核酸のクロマトグラフィ
ー分離に有用であることを示唆する。
ー分離に有用であることを示唆する。
参考文献 1.ラングダール ジェイ エイ(Langdale J A)と
マルコルム エイ ディ(Malcolm A D)(1985)
「セファクリルに結合したDNAを用いた迅速遺伝子検出
方法(A rapid method of gene detection usin
g DNA bound to Sephacryl)」、ジーン(Gene)19
85、36(3)、201〜210。
マルコルム エイ ディ(Malcolm A D)(1985)
「セファクリルに結合したDNAを用いた迅速遺伝子検出
方法(A rapid method of gene detection usin
g DNA bound to Sephacryl)」、ジーン(Gene)19
85、36(3)、201〜210。
2.シード ビー(Seed B)(1982) 「核酸の結合とハイブリッド形成のためのジアゾ化可能
なアニルアミン セルロース ペーパー(Diazotizable
anylamine cellose paper for the coupling a
nd hydridization of nucleic acide)」、ヌク
ル.アシドス レス.(Nucl.Acids Res.)10,1799〜1
810。
なアニルアミン セルロース ペーパー(Diazotizable
anylamine cellose paper for the coupling a
nd hydridization of nucleic acide)」、ヌク
ル.アシドス レス.(Nucl.Acids Res.)10,1799〜1
810。
3.アルフレイ(Allfrey)とイノウエ(Inoue)(1978) 「固体サポートに共有結合したDNA上のDNA結合蛋白質の
アフィニティクロマトグラフィー(Affinity chromato
graphy of DNA−binding protains on DNA coval
ently attached to solid supports)」、メソッド
スセル バイオル(Methods Cell Biol.)17、253〜2
70。
アフィニティクロマトグラフィー(Affinity chromato
graphy of DNA−binding protains on DNA coval
ently attached to solid supports)」、メソッド
スセル バイオル(Methods Cell Biol.)17、253〜2
70。
4.バネマン エッチ(Banemann H);ベストホッフ
ピー(Westhoff P)およびヘルマン ジー(Herrmann
G)(1982)「マクロ孔質サポートへの変性DNA固定;
1 種々の結合方法の効率(Immobilisation of Denat
ured DNA to Macroporous Supports;1 Efficiency
of different coupling procedures)」ヌクル.
アシドスレス.10、7163〜7180。
ピー(Westhoff P)およびヘルマン ジー(Herrmann
G)(1982)「マクロ孔質サポートへの変性DNA固定;
1 種々の結合方法の効率(Immobilisation of Denat
ured DNA to Macroporous Supports;1 Efficiency
of different coupling procedures)」ヌクル.
アシドスレス.10、7163〜7180。
5.アステル シー アール(Astell C R)とスミス
エム(Smith M)(1972) 「オリゴヌクレオチド−セルロースカラムの合成と性質
(Synthesis and Properties of Oligonucleotide
−Cellulose Columns)」バイオケミストリー(Bioche
mistry)11,4114〜4120。
エム(Smith M)(1972) 「オリゴヌクレオチド−セルロースカラムの合成と性質
(Synthesis and Properties of Oligonucleotide
−Cellulose Columns)」バイオケミストリー(Bioche
mistry)11,4114〜4120。
6.ギルハム ピー ティ(Gilham P T)、バイオケ
ミストリー7、8号、1968、2809〜13。
ミストリー7、8号、1968、2809〜13。
7.マトイッチ エム ディ(Matteucci M D)とカ
ルーサース エム エッチ(Caruthers M H)、 ジェイ.アム.ケム.ソク.(J.Am.Chem.Soc.)、198
1、103、3185〜3191。
ルーサース エム エッチ(Caruthers M H)、 ジェイ.アム.ケム.ソク.(J.Am.Chem.Soc.)、198
1、103、3185〜3191。
8.ビユーケイジ エス エル(beaucage S L)とカ
ルーサース エム エッチ テトラヘドロン レタース(Tetrahedron Letters)22
巻、20号、1859〜1862。
ルーサース エム エッチ テトラヘドロン レタース(Tetrahedron Letters)22
巻、20号、1859〜1862。
9.アダムス エス ピー(Adams S P)等、ジェ
イ.アム.ケム.ソク.1983、105、661〜663。
イ.アム.ケム.ソク.1983、105、661〜663。
10.スプロート ディ エス(Sproat D S)とブラ
ウン ディ エム(Brown D M) ニュークレイック アシドス リサーチ(Nucleic Aci
ds Research)13巻、8号、1985、2979〜2987。
ウン ディ エム(Brown D M) ニュークレイック アシドス リサーチ(Nucleic Aci
ds Research)13巻、8号、1985、2979〜2987。
11.クレア アール(Crea R)とホーン ティ(Horn
T)、 ニュークレイック アシドス リサーチ、8巻、10号、
1980、2331〜48。
T)、 ニュークレイック アシドス リサーチ、8巻、10号、
1980、2331〜48。
12.アンドルース エイ(Andrus A)等、テトラヘド
ロン レタース29巻、8号、861〜4頁、1988。
ロン レタース29巻、8号、861〜4頁、1988。
13.アプライド バイオシステムス ユーザー ブレテ
ィン(Applied Biosystems User Bulletin)、43
号、1987年10月1日発行、「メチルホスフォンアミジト
試薬と、DNAのメチルホスフォネート同族体の合成と精
製(Methyl phosphonamidite reagents and the s
ynthesis and purification of methyl phosphona
te analogs of DNA)」。
ィン(Applied Biosystems User Bulletin)、43
号、1987年10月1日発行、「メチルホスフォンアミジト
試薬と、DNAのメチルホスフォネート同族体の合成と精
製(Methyl phosphonamidite reagents and the s
ynthesis and purification of methyl phosphona
te analogs of DNA)」。
14.ミラー ピー エス(Miller P S)等、ニュー
クレイック アシドス リサーチ、11巻、6225〜6242
頁、1983。
クレイック アシドス リサーチ、11巻、6225〜6242
頁、1983。
15.アーノルド エル ジェイ(Arnold L J)とベ
ルグ アール ピー(Berg R P)、モレキュラー
バイオシステム社(Molecular Biosystems Inc.)、P
CT出願第WO85/01051号。
ルグ アール ピー(Berg R P)、モレキュラー
バイオシステム社(Molecular Biosystems Inc.)、P
CT出願第WO85/01051号。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 マスコス,ウーヴェ イギリス国オーエックス1・2ジェイエ ッチ,オックスフォード,ウェリント ン・スクエア 25 (56)参考文献 特開 昭59−163564(JP,A) 特開 昭59−27900(JP,A) 特表 昭60−502155(JP,A) (58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名) C07H 21/04 CA(STN) REGISTRY(STN)
Claims (8)
- 【請求項1】構造式II: の誘導化サポートに共有結合したヌクレオシドを含む、
オリゴヌクレオチド合成に適したサポートであって、 構造式IIIまたは構造式VI: を有する、オリゴヌクレオチド合成に適したサポート
(式中、Xはブロッキング基であり、Bはヌクレオシド
に適当な塩基であり、Yは保護された酸素原子であり、
Rは脂肪族であり、そして、は固体サポートを表
す)。 - 【請求項2】サポートに共有結合しており、そして、 構造式IV: (式中、Lはオリゴヌクレオチド鎖であり、Bはヌクレ
オシドに適当な塩基であり、Rは脂肪族であり、そし
て、は固体サポートを表す)を有する、オリゴヌクレ
オチド。 - 【請求項3】請求項2記載のサポートに結合したオリゴ
ヌクレオチドを製造するための、以下の工程: a)構造式I: (式中、Xはブロッキング基であり、Bはヌクレオシド
に適当な塩基であり、Yは保護された酸素原子であり、
そして、Zはジ−(C1〜C4アルキル)アミンまたはC1ま
たはテトラゾリルである)を有するヌクレオシド試薬
を、共有結合により、脂肪族ヒドロキシル基を有するサ
ポートに結合させ、 b)サポートに結合させたヌクレオシド上で保護基含有
オリゴヌクレオチド鎖を合成し、そして c)オリゴヌクレオチドから保護基を除去すること からなる方法。 - 【請求項4】請求項2記載のサポートに結合したオリゴ
ヌクレオチドを製造するための、以下の工程: a)構造式V: (式中、Xはブロッキング基であり、そして、Bはヌク
レオシドに適当な塩基である)を有するヌクレオシド試
薬を、共有結合により、脂肪族ヒドロキシル基を有する
サポートに結合させ、 b)サポートに結合させたヌクレオシド上で保護基含有
オリゴヌクレオチド鎖を合成し、そして c)オリゴヌクレオチドから保護基を除去すること からなる方法。 - 【請求項5】構造式II a: の誘導化サポートに共有結合したヌクレオシドを含む、
オリゴヌクレオチド合成に適したサポートであって、 構造式III aまたは構造式VI a: を有する、オリゴヌクレオチド合成に適したサポート
(式中、Xはブロッキング基であり、Bはヌクレオシド
に適当な塩基であり、Yは保護された酸素原子であり、
Rは脂肪族であり、そして、は固体サポートを表
す)。 - 【請求項6】サポートに共有結合しており、そして、 構造式IV a: (式中、Lはオリゴヌクレオチド鎖であり、Bはヌクレ
オシドに適当な塩基であり、Rは脂肪族であり、そし
て、は固体サポートを表す)を有する、オリゴヌクレ
オチド。 - 【請求項7】請求項6記載のサポートに結合したオリゴ
ヌクレオチドを製造するための、以下の工程: a)構造式I a: (式中、Xはブロッキング基であり、Bはヌクレオシド
に適当な塩基であり、Yは保護された酸素原子であり、
そして、Zはジ−(C1〜C4アルキル)アミンまたはC1ま
たはテトラゾリルである)を有するヌクレオシド試薬
を、共有結合により、脂肪族ヒドロキシル基を有するサ
ポートに結合させ、 b)サポートに結合させたヌクレオシド上で保護基含有
オリゴヌクレオチド鎖を合成し、そして c)オリゴヌクレオチドから保護基を除去すること からなる方法。 - 【請求項8】請求項6記載のサポートに結合したオリゴ
ヌクレオチドを製造するための、以下の工程: a)構造式Va: (式中、Xはブロッキング基であり、そして、Bはヌク
レオシドに適当な塩基である)を有するヌクレオシド試
薬を、共有結合により、脂肪族ヒドロキシル基を有する
サポートに結合させ、 b)サポートに結合させたヌクレオシド上で保護基含有
オリゴヌクレオチド鎖を合成し、そして c)オリゴヌクレオチドから保護基を除去すること からなる方法。
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---|---|---|---|---|
US5202231A (en) | 1987-04-01 | 1993-04-13 | Drmanac Radoje T | Method of sequencing of genomes by hybridization of oligonucleotide probes |
US6270961B1 (en) * | 1987-04-01 | 2001-08-07 | Hyseq, Inc. | Methods and apparatus for DNA sequencing and DNA identification |
US5525464A (en) * | 1987-04-01 | 1996-06-11 | Hyseq, Inc. | Method of sequencing by hybridization of oligonucleotide probes |
GB8810400D0 (en) | 1988-05-03 | 1988-06-08 | Southern E | Analysing polynucleotide sequences |
US7811751B2 (en) | 1988-05-03 | 2010-10-12 | Oxford Gene Technology Limited | Analysing polynucleotide sequences |
US6406844B1 (en) | 1989-06-07 | 2002-06-18 | Affymetrix, Inc. | Very large scale immobilized polymer synthesis |
US5424186A (en) | 1989-06-07 | 1995-06-13 | Affymax Technologies N.V. | Very large scale immobilized polymer synthesis |
US5143854A (en) * | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
US5925525A (en) * | 1989-06-07 | 1999-07-20 | Affymetrix, Inc. | Method of identifying nucleotide differences |
US6551784B2 (en) | 1989-06-07 | 2003-04-22 | Affymetrix Inc | Method of comparing nucleic acid sequences |
US6379895B1 (en) | 1989-06-07 | 2002-04-30 | Affymetrix, Inc. | Photolithographic and other means for manufacturing arrays |
US5800992A (en) * | 1989-06-07 | 1998-09-01 | Fodor; Stephen P.A. | Method of detecting nucleic acids |
US5547839A (en) | 1989-06-07 | 1996-08-20 | Affymax Technologies N.V. | Sequencing of surface immobilized polymers utilizing microflourescence detection |
US6309822B1 (en) | 1989-06-07 | 2001-10-30 | Affymetrix, Inc. | Method for comparing copy number of nucleic acid sequences |
US5871928A (en) * | 1989-06-07 | 1999-02-16 | Fodor; Stephen P. A. | Methods for nucleic acid analysis |
US5744101A (en) | 1989-06-07 | 1998-04-28 | Affymax Technologies N.V. | Photolabile nucleoside protecting groups |
US5527681A (en) * | 1989-06-07 | 1996-06-18 | Affymax Technologies N.V. | Immobilized molecular synthesis of systematically substituted compounds |
US6346413B1 (en) | 1989-06-07 | 2002-02-12 | Affymetrix, Inc. | Polymer arrays |
US6040138A (en) * | 1995-09-15 | 2000-03-21 | Affymetrix, Inc. | Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays |
US6506558B1 (en) | 1990-03-07 | 2003-01-14 | Affymetrix Inc. | Very large scale immobilized polymer synthesis |
DE4027675C2 (de) * | 1990-08-31 | 1997-05-07 | Biotechnolog Forschung Gmbh | Verfahren zur parallelen Herstellung von trägergebundenen oder freien Peptiden, trägergebundene Peptide und ihre Verwendung |
EP0562047A4 (en) | 1990-12-06 | 1995-11-02 | Affymax Tech Nv | Sequencing by hybridization of a target nucleic acid to a matrix of defined oligonucleotides |
US6589726B1 (en) | 1991-09-04 | 2003-07-08 | Metrigen, Inc. | Method and apparatus for in situ synthesis on a solid support |
US6921636B1 (en) | 1991-09-04 | 2005-07-26 | Metrigen, Inc. | Method and apparatus for conducting an array of chemical reactions on a support surface |
US5474796A (en) * | 1991-09-04 | 1995-12-12 | Protogene Laboratories, Inc. | Method and apparatus for conducting an array of chemical reactions on a support surface |
US5846708A (en) * | 1991-11-19 | 1998-12-08 | Massachusetts Institiute Of Technology | Optical and electrical methods and apparatus for molecule detection |
IL103674A0 (en) * | 1991-11-19 | 1993-04-04 | Houston Advanced Res Center | Method and apparatus for molecule detection |
ATE262374T1 (de) * | 1991-11-22 | 2004-04-15 | Affymetrix Inc | Kombinatorische strategien für polymersynthese |
US6943034B1 (en) * | 1991-11-22 | 2005-09-13 | Affymetrix, Inc. | Combinatorial strategies for polymer synthesis |
US6468740B1 (en) | 1992-11-05 | 2002-10-22 | Affymetrix, Inc. | Cyclic and substituted immobilized molecular synthesis |
US5384261A (en) * | 1991-11-22 | 1995-01-24 | Affymax Technologies N.V. | Very large scale immobilized polymer synthesis using mechanically directed flow paths |
US6436635B1 (en) * | 1992-11-06 | 2002-08-20 | Boston University | Solid phase sequencing of double-stranded nucleic acids |
US5795714A (en) * | 1992-11-06 | 1998-08-18 | Trustees Of Boston University | Method for replicating an array of nucleic acid probes |
US5605798A (en) * | 1993-01-07 | 1997-02-25 | Sequenom, Inc. | DNA diagnostic based on mass spectrometry |
US6194144B1 (en) | 1993-01-07 | 2001-02-27 | Sequenom, Inc. | DNA sequencing by mass spectrometry |
US7115364B1 (en) | 1993-10-26 | 2006-10-03 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes on biological chips |
US5861242A (en) * | 1993-06-25 | 1999-01-19 | Affymetrix, Inc. | Array of nucleic acid probes on biological chips for diagnosis of HIV and methods of using the same |
WO1995000530A1 (en) | 1993-06-25 | 1995-01-05 | Affymax Technologies N.V. | Hybridization and sequencing of nucleic acids |
US5837832A (en) * | 1993-06-25 | 1998-11-17 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes on biological chips |
US6027880A (en) * | 1995-08-02 | 2000-02-22 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes and methods of using the same for detecting cystic fibrosis |
JPH09508003A (ja) | 1993-07-23 | 1997-08-19 | ハイセック,インコーポレイション | 未知の生物をスクリーニングするための方法 |
GB9315847D0 (en) | 1993-07-30 | 1993-09-15 | Isis Innovation | Tag reagent and assay method |
US6401267B1 (en) * | 1993-09-27 | 2002-06-11 | Radoje Drmanac | Methods and compositions for efficient nucleic acid sequencing |
US6309823B1 (en) | 1993-10-26 | 2001-10-30 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes for analyzing biotransformation genes and methods of using the same |
US20060229824A1 (en) | 1993-10-26 | 2006-10-12 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes for analyzing biotransformation genes |
US6015880A (en) * | 1994-03-16 | 2000-01-18 | California Institute Of Technology | Method and substrate for performing multiple sequential reactions on a matrix |
US6287850B1 (en) | 1995-06-07 | 2001-09-11 | Affymetrix, Inc. | Bioarray chip reaction apparatus and its manufacture |
US7625697B2 (en) | 1994-06-17 | 2009-12-01 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods for constructing subarrays and subarrays made thereby |
US5807522A (en) * | 1994-06-17 | 1998-09-15 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods for fabricating microarrays of biological samples |
US6558633B1 (en) | 1994-09-21 | 2003-05-06 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Chemical reaction apparatus and methods |
US5846719A (en) | 1994-10-13 | 1998-12-08 | Lynx Therapeutics, Inc. | Oligonucleotide tags for sorting and identification |
US5604097A (en) * | 1994-10-13 | 1997-02-18 | Spectragen, Inc. | Methods for sorting polynucleotides using oligonucleotide tags |
US5695934A (en) * | 1994-10-13 | 1997-12-09 | Lynx Therapeutics, Inc. | Massively parallel sequencing of sorted polynucleotides |
USRE43097E1 (en) | 1994-10-13 | 2012-01-10 | Illumina, Inc. | Massively parallel signature sequencing by ligation of encoded adaptors |
US6280935B1 (en) | 1994-10-13 | 2001-08-28 | Lynx Therapeutics, Inc. | Method of detecting the presence or absence of a plurality of target sequences using oligonucleotide tags |
US6121048A (en) * | 1994-10-18 | 2000-09-19 | Zaffaroni; Alejandro C. | Method of conducting a plurality of reactions |
US6428955B1 (en) | 1995-03-17 | 2002-08-06 | Sequenom, Inc. | DNA diagnostics based on mass spectrometry |
US7803529B1 (en) | 1995-04-11 | 2010-09-28 | Sequenom, Inc. | Solid phase sequencing of biopolymers |
US20060063193A1 (en) * | 1995-04-11 | 2006-03-23 | Dong-Jing Fu | Solid phase sequencing of double-stranded nucleic acids |
US5968740A (en) * | 1995-07-24 | 1999-10-19 | Affymetrix, Inc. | Method of Identifying a Base in a Nucleic Acid |
US6426183B1 (en) * | 1995-12-21 | 2002-07-30 | Kenneth L. Beattie | Oligonucleotide microarrays: direct covalent attachment to glass |
EP0880598A4 (en) * | 1996-01-23 | 2005-02-23 | Affymetrix Inc | RAPID EVALUATION OF NUCLEIC ACID ABUNDANCE DIFFERENCE, WITH A HIGH-DENSITY OLIGONUCLEOTIDE SYSTEM |
US6924094B1 (en) | 1996-02-08 | 2005-08-02 | Affymetrix, Inc. | Chip-based species identification and phenotypic characterization of microorganisms |
JP2000504575A (ja) * | 1996-02-08 | 2000-04-18 | アフィメトリックス,インコーポレイテッド | 微生物のチップベースの種分化および表現型特徴付け |
US6013440A (en) | 1996-03-11 | 2000-01-11 | Affymetrix, Inc. | Nucleic acid affinity columns |
AU2320597A (en) | 1996-03-19 | 1997-10-10 | Molecular Tool, Inc. | Method for determining the nucleotide sequence of a polynucleotide |
WO1997040385A1 (en) | 1996-04-25 | 1997-10-30 | Bioarray Solutions, Llc | Light-controlled electrokinetic assembly of particles near surfaces |
US5958342A (en) * | 1996-05-17 | 1999-09-28 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Jet droplet device |
JP2001500741A (ja) | 1996-09-19 | 2001-01-23 | アフィメトリックス,インコーポレイテッド | 分子配列サインの同定およびそれに関する方法 |
US6391550B1 (en) * | 1996-09-19 | 2002-05-21 | Affymetrix, Inc. | Identification of molecular sequence signatures and methods involving the same |
CA2301230A1 (en) | 1996-09-20 | 1998-03-26 | Digital Drives, Inc. | Spatially addressable combinatorial chemical arrays in cd-rom format |
US6133436A (en) | 1996-11-06 | 2000-10-17 | Sequenom, Inc. | Beads bound to a solid support and to nucleic acids |
DK0937096T3 (da) | 1996-11-06 | 2004-06-14 | Sequenom Inc | Fremgangsmåde til massespektrometri-analyse |
US6140053A (en) * | 1996-11-06 | 2000-10-31 | Sequenom, Inc. | DNA sequencing by mass spectrometry via exonuclease degradation |
ATE375403T1 (de) * | 1996-11-06 | 2007-10-15 | Sequenom Inc | Dna-diagnostik mittels massenspektrometrie |
US20020042048A1 (en) | 1997-01-16 | 2002-04-11 | Radoje Drmanac | Methods and compositions for detection or quantification of nucleic acid species |
US6309824B1 (en) | 1997-01-16 | 2001-10-30 | Hyseq, Inc. | Methods for analyzing a target nucleic acid using immobilized heterogeneous mixtures of oligonucleotide probes |
US6297006B1 (en) | 1997-01-16 | 2001-10-02 | Hyseq, Inc. | Methods for sequencing repetitive sequences and for determining the order of sequence subfragments |
US5902881A (en) | 1997-03-03 | 1999-05-11 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Reagent useful for synthesizing sulfurized oligonucleotide analogs |
US5760209A (en) * | 1997-03-03 | 1998-06-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Protecting group for synthesizing oligonucleotide analogs |
EP0972078B1 (en) | 1997-03-20 | 2005-06-01 | Affymetrix, Inc. (a California Corporation) | Iterative resequencing |
CA2284211A1 (en) | 1997-03-20 | 1998-09-24 | University Of Washington | Solvent for biopolymer synthesis, solvent microdroplets and methods of use |
US6419883B1 (en) | 1998-01-16 | 2002-07-16 | University Of Washington | Chemical synthesis using solvent microdroplets |
US6028189A (en) * | 1997-03-20 | 2000-02-22 | University Of Washington | Solvent for oligonucleotide synthesis and methods of use |
DE19715331A1 (de) * | 1997-04-12 | 1998-10-15 | Merck Patent Gmbh | Nukleotidhaltiges Sorbens für die Affinitätschromatographie |
US6210880B1 (en) | 1997-09-19 | 2001-04-03 | Third Wave Technologies, Inc. | Polymorphism analysis by nucleic acid structure probing with structure-bridging oligonucleotides |
US6194149B1 (en) | 1998-03-03 | 2001-02-27 | Third Wave Technologies, Inc. | Target-dependent reactions using structure-bridging oligonucleotides |
US6214545B1 (en) | 1997-05-05 | 2001-04-10 | Third Wave Technologies, Inc | Polymorphism analysis by nucleic acid structure probing |
US7101672B2 (en) * | 1998-05-05 | 2006-09-05 | Third Wave Technologies, Inc. | Target-dependent reactions using structure-bridging oligonucleotides |
WO1998050403A1 (en) | 1997-05-05 | 1998-11-12 | Third Wave Technologies,Inc. | Target-dependent reactions using structure-bridging oligonucleotides |
US5994076A (en) * | 1997-05-21 | 1999-11-30 | Clontech Laboratories, Inc. | Methods of assaying differential expression |
US6489455B2 (en) | 1997-05-21 | 2002-12-03 | Clontech Laboratories, Inc. | Methods of assaying differential expression |
AU755913B2 (en) * | 1997-06-18 | 2003-01-02 | Masad Damha | Nucleic acid biosensor diagnostics |
HUP0002518A3 (en) | 1997-07-22 | 2003-01-28 | Qiagen Genomics Inc | Computer method and system for correlating sequencing data by ms |
WO1999005321A1 (en) | 1997-07-22 | 1999-02-04 | Rapigene, Inc. | Amplification and other enzymatic reactions performed on nucleic acid arrays |
AU736776B2 (en) | 1997-07-22 | 2001-08-02 | Qiagen Genomics, Inc. | Apparatus and methods for arraying solution onto a solid support |
ES2190591T3 (es) * | 1997-09-11 | 2003-08-01 | Bioventures Inc | Metodo de producir disposiciones ordenadas de alta densidad. |
US6177558B1 (en) | 1997-11-13 | 2001-01-23 | Protogene Laboratories, Inc. | Method and composition for chemical synthesis using high boiling point organic solvents to control evaporation |
US6101946A (en) * | 1997-11-21 | 2000-08-15 | Telechem International Inc. | Microarray printing device including printing pins with flat tips and exterior channel and method of manufacture |
US7041490B1 (en) * | 1997-11-28 | 2006-05-09 | Serono Genetics Institute, S.A. | Chlamydia trachomatis polynucleotides and vectors, recombinant host cells, DNA chips or kits containing the same |
US6268131B1 (en) | 1997-12-15 | 2001-07-31 | Sequenom, Inc. | Mass spectrometric methods for sequencing nucleic acids |
US6087102A (en) | 1998-01-07 | 2000-07-11 | Clontech Laboratories, Inc. | Polymeric arrays and methods for their use in binding assays |
US6077673A (en) * | 1998-03-31 | 2000-06-20 | Clontech Laboratories, Inc. | Mouse arrays and kits comprising the same |
US6337072B1 (en) | 1998-04-03 | 2002-01-08 | Hyseq, Inc. | Interleukin-1 receptor antagonist and recombinant production thereof |
US6294655B1 (en) | 1998-04-03 | 2001-09-25 | Hyseq, Inc. | Anti-interleukin-1 receptor antagonist antibodies and uses thereof |
US6426191B1 (en) | 1998-04-03 | 2002-07-30 | Hyseq, Inc. | Assays involving an IL-1 receptor antagonist |
US7108968B2 (en) * | 1998-04-03 | 2006-09-19 | Affymetrix, Inc. | Mycobacterial rpoB sequences |
US6541623B1 (en) | 1998-04-03 | 2003-04-01 | Hyseq, Inc. | Interleukin—1 receptor antagonist and uses thereof |
US6248877B1 (en) | 1998-04-07 | 2001-06-19 | Biolink Partners | Solid phase synthesis of organic compounds via phosphitylating reagents |
US7321828B2 (en) * | 1998-04-13 | 2008-01-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | System of components for preparing oligonucleotides |
US20040186071A1 (en) | 1998-04-13 | 2004-09-23 | Bennett C. Frank | Antisense modulation of CD40 expression |
US6355419B1 (en) | 1998-04-27 | 2002-03-12 | Hyseq, Inc. | Preparation of pools of nucleic acids based on representation in a sample |
US6723564B2 (en) | 1998-05-07 | 2004-04-20 | Sequenom, Inc. | IR MALDI mass spectrometry of nucleic acids using liquid matrices |
AU762392B2 (en) | 1998-07-16 | 2003-06-26 | Arca Biopharma, Inc. | Methods and materials relating to novel CD39-like polypeptides |
US6387645B1 (en) | 1998-07-16 | 2002-05-14 | Hyseq, Inc. | Methods and materials relating to novel CD39-like polypeptides |
US6447771B1 (en) | 1999-03-19 | 2002-09-10 | Hyseq, Inc. | Methods and materials relating to novel CD39-like polypeptides |
US6476211B1 (en) | 1998-07-16 | 2002-11-05 | Hyseq, Inc. | Methods and materials relating to CD39-like polypeptides |
US6461812B2 (en) * | 1998-09-09 | 2002-10-08 | Agilent Technologies, Inc. | Method and multiple reservoir apparatus for fabrication of biomolecular arrays |
US6475440B1 (en) | 1998-09-16 | 2002-11-05 | Clontech Laboratories, Inc. | Applicator for use in deposition of fluid samples onto a substrate surface |
US6867289B1 (en) * | 1998-10-26 | 2005-03-15 | Board Of Regents, The University Of Texas Systems | Thio-modified aptamer synthetic methods and compositions |
US20040242521A1 (en) * | 1999-10-25 | 2004-12-02 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Thio-siRNA aptamers |
US6545264B1 (en) | 1998-10-30 | 2003-04-08 | Affymetrix, Inc. | Systems and methods for high performance scanning |
US6184347B1 (en) | 1998-11-19 | 2001-02-06 | Agilent Technologies Inc. | Minimization of blooming in high-density arrays by using reactive wash reagents |
US6245518B1 (en) | 1998-12-11 | 2001-06-12 | Hyseq, Inc. | Polynucleotide arrays and methods of making and using the same |
US6087112A (en) | 1998-12-30 | 2000-07-11 | Oligos Etc. Inc. | Arrays with modified oligonucleotide and polynucleotide compositions |
US20030180789A1 (en) * | 1998-12-30 | 2003-09-25 | Dale Roderic M.K. | Arrays with modified oligonucleotide and polynucleotide compositions |
US6899875B1 (en) | 1999-01-29 | 2005-05-31 | Nuvelo, Inc. | Methods and compositions relating to CD39-like polypeptides and nucleic acids |
US6350447B1 (en) | 1999-01-29 | 2002-02-26 | Hyseq, Inc. | Methods and compositions relating to CD39-like polypeptides and nucleic acids |
US6780977B1 (en) | 1999-01-29 | 2004-08-24 | Nuvelo, Inc. | Methods and compositions relating to CD39-like polypeptides and nucleic acids |
US6783959B1 (en) | 1999-01-29 | 2004-08-31 | Nuvelo, Inc. | Methods and compositions relating to CD39-like polypeptides and nucleic acids |
US6335013B1 (en) | 1999-03-19 | 2002-01-01 | Hyseq, Inc. | Methods and materials relating to CD39-like polypeptides |
JP2003500070A (ja) * | 1999-05-21 | 2003-01-07 | インビトロゲン・コーポレーション | 核酸分子を標識するための組成物および方法 |
AU5882000A (en) | 1999-06-22 | 2001-01-09 | Invitrogen Corporation | Improved primers and methods for the detection and discrimination of nucleic acids |
CA2377739A1 (en) | 1999-07-02 | 2001-01-11 | Symyx Technologies, Inc. | Polymer brushes for immobilizing molecules to a surface or substrate, where the polymers have water-soluble or water-dispersible segments and probes bonded thereto |
US6830902B1 (en) | 1999-07-02 | 2004-12-14 | Invitrogen Corporation | Compositions and methods for enhanced sensitivity and specificity of nucleic acid synthesis |
CN100397068C (zh) | 1999-07-05 | 2008-06-25 | 诺瓦提斯公司 | 传感器平台、装有该平台的装置以及使用该平台的方法 |
US6771376B2 (en) | 1999-07-05 | 2004-08-03 | Novartis Ag | Sensor platform, apparatus incorporating the platform, and process using the platform |
US6346423B1 (en) | 1999-07-16 | 2002-02-12 | Agilent Technologies, Inc. | Methods and compositions for producing biopolymeric arrays |
US20050118618A1 (en) * | 1999-08-30 | 2005-06-02 | Dale Roderic M. | Method for detecting nucleic acid sequences |
US7211390B2 (en) * | 1999-09-16 | 2007-05-01 | 454 Life Sciences Corporation | Method of sequencing a nucleic acid |
US6319674B1 (en) | 1999-09-16 | 2001-11-20 | Agilent Technologies, Inc. | Methods for attaching substances to surfaces |
US7244559B2 (en) * | 1999-09-16 | 2007-07-17 | 454 Life Sciences Corporation | Method of sequencing a nucleic acid |
US6844151B1 (en) | 1999-09-29 | 2005-01-18 | Oligos Etc. Inc. | Methods for production of arrays with modified oligonucleotide and polynucleotide compositions |
US6171797B1 (en) | 1999-10-20 | 2001-01-09 | Agilent Technologies Inc. | Methods of making polymeric arrays |
US7041445B2 (en) | 1999-11-15 | 2006-05-09 | Clontech Laboratories, Inc. | Long oligonucleotide arrays |
WO2001038585A2 (en) * | 1999-11-24 | 2001-05-31 | The Regents Of The University Of California | Polymer arrays and methods of using labeled probe molecules to identify and quantify target molecule expression |
CA2392753A1 (en) | 1999-12-10 | 2001-06-14 | Invitrogen Corporation | Use of multiple recombination sites with unique specificity in recombinational cloning |
WO2001048242A2 (en) | 1999-12-29 | 2001-07-05 | Mergen Ltd. | Methods for amplifying and detecting multiple polynucleotides on a solid phase support |
US20040014102A1 (en) * | 2000-02-22 | 2004-01-22 | Shiping Chen | High density parallel printing of microarrays |
US6594432B2 (en) | 2000-02-22 | 2003-07-15 | Genospectra, Inc. | Microarray fabrication techniques and apparatus |
EP1257355A2 (en) | 2000-02-22 | 2002-11-20 | Genospectra, Inc. | Microarray fabrication techniques and apparatus |
US6376191B1 (en) | 2000-03-22 | 2002-04-23 | Mergen, Ltd. | Microarray-based analysis of polynucleotide sequence variations |
EP1698697A3 (en) | 2000-03-24 | 2006-09-13 | Takeda Pharmaceutical Company Limited | SSD-containing protein, process for producing the same and use thereof |
KR100792021B1 (ko) * | 2000-03-30 | 2008-01-04 | 가부시키가이샤 에바라 세이사꾸쇼 | 반응성 탐식자 칩 및 그 제조방법 |
JP2004507226A (ja) * | 2000-05-30 | 2004-03-11 | ピーイー コーポレイション (エヌワイ) | ライゲーションおよび増幅の組み合わせを用いて標的核酸を検出するための方法 |
US20090075256A1 (en) * | 2000-06-17 | 2009-03-19 | Third Wave Technologies, Inc. | Nucleic Acid Accessible Hybridization Site Identification Using Mass Spectrometry |
US7060436B2 (en) | 2000-06-17 | 2006-06-13 | Third Wave Technologies, Inc. | Nucleic acid accessible hybridization sites |
EP1311839B1 (en) | 2000-06-21 | 2006-03-01 | Bioarray Solutions Ltd | Multianalyte molecular analysis using application-specific random particle arrays |
US9709559B2 (en) | 2000-06-21 | 2017-07-18 | Bioarray Solutions, Ltd. | Multianalyte molecular analysis using application-specific random particle arrays |
GB0016836D0 (en) * | 2000-07-07 | 2000-08-30 | Lee Helen | Improved dipstick assays (1) |
EP1598432A3 (en) * | 2000-07-31 | 2006-06-07 | Agilent Technologies, Inc. | Array based methods for sythesizing nucleic acid mixtures |
US7198924B2 (en) | 2000-12-11 | 2007-04-03 | Invitrogen Corporation | Methods and compositions for synthesis of nucleic acid molecules using multiple recognition sites |
US6900013B1 (en) | 2000-08-25 | 2005-05-31 | Aviva Biosciences Corporation | Methods and compositions for identifying nucleic acid molecules using nucleolytic activities and hybridization |
WO2002016647A1 (en) * | 2000-08-24 | 2002-02-28 | Aviva Biosciences Corporation | Methods and compositions for identifying nucleic acid molecules using nucleolytic activities and hybridization |
US6808934B2 (en) | 2000-09-25 | 2004-10-26 | Picoliter Inc. | High-throughput biomolecular crystallization and biomolecular crystal screening |
US6666541B2 (en) * | 2000-09-25 | 2003-12-23 | Picoliter Inc. | Acoustic ejection of fluids from a plurality of reservoirs |
US6806051B2 (en) * | 2000-09-25 | 2004-10-19 | Picoliter Inc. | Arrays of partially nonhybridizing oligonucleotides and preparation thereof using focused acoustic energy |
US20020037359A1 (en) * | 2000-09-25 | 2002-03-28 | Mutz Mitchell W. | Focused acoustic energy in the preparation of peptide arrays |
US6746104B2 (en) | 2000-09-25 | 2004-06-08 | Picoliter Inc. | Method for generating molecular arrays on porous surfaces |
AU2002224336B2 (en) | 2000-09-25 | 2007-01-04 | Picoliter Inc. | Acoustic ejection of fluids from a plurality of reservoirs |
US6548308B2 (en) | 2000-09-25 | 2003-04-15 | Picoliter Inc. | Focused acoustic energy method and device for generating droplets of immiscible fluids |
US6642061B2 (en) | 2000-09-25 | 2003-11-04 | Picoliter Inc. | Use of immiscible fluids in droplet ejection through application of focused acoustic energy |
AU2001293111A1 (en) | 2000-09-25 | 2002-04-02 | Picoliter Inc. | Focused acoustic energy in the preparation and screening of combinatorial libraries |
US6849409B2 (en) * | 2000-10-16 | 2005-02-01 | Axxima Pharmaceuticals Ag | Cellular kinases involved in Cytomegalovirus infection and their inhibition |
US6849423B2 (en) * | 2000-11-29 | 2005-02-01 | Picoliter Inc | Focused acoustics for detection and sorting of fluid volumes |
US20020064809A1 (en) | 2000-11-29 | 2002-05-30 | Mutz Mitchell W. | Focused acoustic ejection cell sorting system and method |
US6893836B2 (en) * | 2000-11-29 | 2005-05-17 | Picoliter Inc. | Spatially directed ejection of cells from a carrier fluid |
US20020086294A1 (en) * | 2000-12-29 | 2002-07-04 | Ellson Richard N. | Device and method for tracking conditions in an assay |
WO2002056021A2 (en) * | 2001-01-10 | 2002-07-18 | Symyx Technologies Inc | Polymer brushes for immobilizing molecules to a surface |
CA2436986A1 (en) * | 2001-02-07 | 2002-08-15 | Invitrogen Corporation | Ter sites and ter binding proteins |
US20020168663A1 (en) * | 2001-02-27 | 2002-11-14 | Phan Brigitte Chau | Methods for DNA conjugation onto solid phase including related optical biodiscs and disc drive systems |
ATE366923T1 (de) | 2001-03-28 | 2007-08-15 | Clondiag Chip Tech Gmbh | Vorrichtung zur referenzierung von fluoreszenzsignalen |
US6869551B2 (en) * | 2001-03-30 | 2005-03-22 | Picoliter Inc. | Precipitation of solid particles from droplets formed using focused acoustic energy |
US7183050B2 (en) * | 2001-04-18 | 2007-02-27 | Krull Ulrich J | Gradient resolved information platform |
ATE346855T1 (de) * | 2001-04-30 | 2006-12-15 | Avecia Biotechnology Inc | Immobilisierung von oligonukleotiden an feste träger |
US7262063B2 (en) | 2001-06-21 | 2007-08-28 | Bio Array Solutions, Ltd. | Directed assembly of functional heterostructures |
US20050009022A1 (en) * | 2001-07-06 | 2005-01-13 | Weiner Michael P. | Method for isolation of independent, parallel chemical micro-reactions using a porous filter |
US20050147984A1 (en) * | 2001-08-31 | 2005-07-07 | Clondiag Chip Technologies Gmbh | Interaction detection on several probe arrays |
US20030044798A1 (en) * | 2001-08-31 | 2003-03-06 | Lefkowitz Steven M. | Methods for generating ligand arrays via deposition of ligands onto olefin displaying substrates, and arrays produced thereby |
US20030054396A1 (en) * | 2001-09-07 | 2003-03-20 | Weiner Michael P. | Enzymatic light amplification |
US6974671B1 (en) | 2001-09-12 | 2005-12-13 | Salk Institute For Biological Studies | Methods for indentifying compounds that modulate gluconeogenesis through the binding of CREB to the PGC-1 promoter |
JP4377689B2 (ja) * | 2001-10-15 | 2009-12-02 | バイオアレイ ソリューションズ リミテッド | 同時尋問及び酵素仲介検出による多型遺伝子座の複合分析 |
US20070264641A1 (en) * | 2001-10-15 | 2007-11-15 | Li Alice X | Multiplexed analysis of polymorphic loci by concurrent interrogation and enzyme-mediated detection |
WO2003033718A1 (en) * | 2001-10-17 | 2003-04-24 | Global Genomics Ab | Synthesis of oligonucleotides on solid support and assembly into doublestranded polynucleotides |
US20030165859A1 (en) * | 2001-10-23 | 2003-09-04 | Invitrogen Corporation | Primers and methods for the detection and discrimination of nucleic acids |
US6902921B2 (en) * | 2001-10-30 | 2005-06-07 | 454 Corporation | Sulfurylase-luciferase fusion proteins and thermostable sulfurylase |
US20050124022A1 (en) * | 2001-10-30 | 2005-06-09 | Maithreyan Srinivasan | Novel sulfurylase-luciferase fusion proteins and thermostable sulfurylase |
US6956114B2 (en) | 2001-10-30 | 2005-10-18 | '454 Corporation | Sulfurylase-luciferase fusion proteins and thermostable sulfurylase |
WO2003046508A2 (en) | 2001-11-09 | 2003-06-05 | Biomicroarrays, Inc. | High surface area substrates for microarrays and methods to make same |
WO2003042697A1 (en) * | 2001-11-14 | 2003-05-22 | Genospectra, Inc. | Biochemical analysis system with combinatorial chemistry applications |
EP1565744A4 (en) * | 2002-03-07 | 2007-06-20 | Zephyr Proteomix Ltd | MICROARRAY'S CELLULOSE BINDING CHIMERIC PROTEINS AND METHOD OF USE THEREOF |
US20030186302A1 (en) * | 2002-03-29 | 2003-10-02 | Yixin Wang | Colorectal cancer diagnostics |
NZ536339A (en) | 2002-05-08 | 2006-04-28 | Northwest Biotherapeutics Inc | Quality assays for antigen presenting cells |
WO2004013290A2 (en) * | 2002-08-05 | 2004-02-12 | Invitrogen Corporation | Compositions and methods for molecular biology |
US7563600B2 (en) | 2002-09-12 | 2009-07-21 | Combimatrix Corporation | Microarray synthesis and assembly of gene-length polynucleotides |
CA2502610A1 (en) * | 2002-10-16 | 2005-01-13 | Board Of Regents Of The University Of Texas System | Bead bound combinatorial oligonucleoside phosphorothioate and phosphorodithioate aptamer libraries |
WO2004047007A1 (en) | 2002-11-15 | 2004-06-03 | Bioarray Solutions, Ltd. | Analysis, secure access to, and transmission of array images |
EP2159285B1 (en) * | 2003-01-29 | 2012-09-26 | 454 Life Sciences Corporation | Methods of amplifying and sequencing nucleic acids |
US7575865B2 (en) * | 2003-01-29 | 2009-08-18 | 454 Life Sciences Corporation | Methods of amplifying and sequencing nucleic acids |
US8105771B2 (en) | 2003-02-26 | 2012-01-31 | Callida Genomics, Inc. | Random array DNA analysis by hybridization |
US20040191782A1 (en) * | 2003-03-31 | 2004-09-30 | Yixin Wang | Colorectal cancer prognostics |
US7833714B1 (en) | 2003-04-11 | 2010-11-16 | Affymetrix, Inc. | Combinatorial affinity selection |
MXPA05011404A (es) * | 2003-04-25 | 2006-05-31 | Johnson & Johnson | Conservacion del arn en una muestra biologica. |
EP1623020A4 (en) * | 2003-05-09 | 2007-05-09 | Sigma Aldrich Co | GENOMIC AND PROTEOMIC APPROACHES FOR THE DEVELOPMENT OF CELL CULTURE MEDIA |
WO2005037053A2 (en) * | 2003-05-23 | 2005-04-28 | Board Of Regents - The University Of Texas System | High throughput screening of aptamer libraries for specific binding to proteins on viruses and other pathogens |
EP1635765B1 (en) * | 2003-05-23 | 2013-07-17 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Structure based and combinatorially selected oligonucleoside phosphorothioate and phosphorodithioate aptamer targeting ap-1 transcription factors |
WO2005001129A2 (en) * | 2003-06-06 | 2005-01-06 | Applera Corporation | Mobility cassettes |
US20040259100A1 (en) | 2003-06-20 | 2004-12-23 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for whole genome amplification and genotyping |
WO2005010016A2 (en) * | 2003-07-24 | 2005-02-03 | Board Of Regents | Thioaptamers enable discovery of physiological pathways and new therapeutic strategies |
WO2005029705A2 (en) | 2003-09-18 | 2005-03-31 | Bioarray Solutions, Ltd. | Number coding for identification of subtypes of coded types of solid phase carriers |
JP4564959B2 (ja) | 2003-09-22 | 2010-10-20 | バイオアレイ ソリューションズ リミテッド | 生体分子に共有結合できる、複数の官能基を持つ表面固定化高分子電解質 |
US7279280B2 (en) * | 2003-09-25 | 2007-10-09 | Mgp Biotech, Inc. | Apparatus and method for detecting genetic mutations and single nucleotide polymorphisms |
CA2899287A1 (en) | 2003-10-28 | 2005-05-12 | Bioarray Solutions Ltd. | Optimization of gene expression analysis using immobilized capture probes |
AU2004287069B2 (en) | 2003-10-29 | 2009-07-16 | Bioarray Solutions, Ltd. | Multiplexed nucleic acid analysis by fragmentation of double-stranded DNA |
EP1697534B1 (en) | 2003-12-01 | 2010-06-02 | Life Technologies Corporation | Nucleic acid molecules containing recombination sites and methods of using the same |
US20050186577A1 (en) | 2004-02-20 | 2005-08-25 | Yixin Wang | Breast cancer prognostics |
US20050266432A1 (en) * | 2004-02-26 | 2005-12-01 | Illumina, Inc. | Haplotype markers for diagnosing susceptibility to immunological conditions |
US20050239134A1 (en) * | 2004-04-21 | 2005-10-27 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Combinatorial selection of phosphorothioate single-stranded DNA aptamers for TGF-beta-1 protein |
WO2005118806A2 (en) | 2004-05-28 | 2005-12-15 | Ambion, Inc. | METHODS AND COMPOSITIONS INVOLVING MicroRNA |
US7702466B1 (en) | 2004-06-29 | 2010-04-20 | Illumina, Inc. | Systems and methods for selection of nucleic acid sequence probes |
US7378259B2 (en) * | 2004-07-15 | 2008-05-27 | Applera Corporation | Fluid processing device |
US7848889B2 (en) | 2004-08-02 | 2010-12-07 | Bioarray Solutions, Ltd. | Automated analysis of multiplexed probe-target interaction patterns: pattern matching and allele identification |
ES2534300T3 (es) | 2004-11-12 | 2015-04-21 | Asuragen, Inc. | Procedimientos y composiciones que implican miARN y moléculas inhibidoras de miARN |
US20060105348A1 (en) * | 2004-11-15 | 2006-05-18 | Lee Jun E | Compositions and methods for the detection and discrimination of nucleic acids |
US20060275792A1 (en) * | 2004-11-15 | 2006-12-07 | Lee Jun E | Enhancement of nucleic acid amplification using double-stranded DNA binding proteins |
US7977119B2 (en) * | 2004-12-08 | 2011-07-12 | Agilent Technologies, Inc. | Chemical arrays and methods of using the same |
FR2881437B1 (fr) | 2005-01-31 | 2010-11-19 | Biomerieux Sa | Procede pour le diagnostic/pronostic d'un syndrome septique |
US20060199207A1 (en) * | 2005-02-24 | 2006-09-07 | Matysiak Stefan M | Self-assembly of molecules using combinatorial hybridization |
EP1874960A2 (en) * | 2005-04-04 | 2008-01-09 | Veridex, LLC | Laser microdissection and microarray analysis of breast tumors reveal estrogen receptor related genes and pathways |
US20080269076A1 (en) * | 2005-05-06 | 2008-10-30 | Applera Corporation | Multiple Capillary Device and Method for Synthesis and Dispensing |
US8632970B2 (en) | 2005-05-09 | 2014-01-21 | Affymetrix, Inc. | Multiplex capture of nucleic acids |
US8486629B2 (en) | 2005-06-01 | 2013-07-16 | Bioarray Solutions, Ltd. | Creation of functionalized microparticle libraries by oligonucleotide ligation or elongation |
DK2463386T3 (en) | 2005-06-15 | 2017-07-31 | Complete Genomics Inc | Nucleic acid analysis using random mixtures of non-overlapping fragments |
BRPI0616090A2 (pt) * | 2005-09-19 | 2011-06-07 | Veridex Llc | métodos e materiais para identificação da origem de um carcinoma de origem primária desconhecida |
US20070202515A1 (en) * | 2005-10-12 | 2007-08-30 | Pathologica, Llc. | Promac signature application |
US7329860B2 (en) | 2005-11-23 | 2008-02-12 | Illumina, Inc. | Confocal imaging methods and apparatus |
JP2009529878A (ja) * | 2006-03-13 | 2009-08-27 | ベリデックス・エルエルシー | 原発細胞の増殖 |
US7914988B1 (en) | 2006-03-31 | 2011-03-29 | Illumina, Inc. | Gene expression profiles to predict relapse of prostate cancer |
DK2024504T4 (da) | 2006-05-26 | 2023-02-27 | Amyris Inc | Fremstilling af isoprenoider |
WO2008027558A2 (en) | 2006-08-31 | 2008-03-06 | Codon Devices, Inc. | Iterative nucleic acid assembly using activation of vector-encoded traits |
US20090131348A1 (en) | 2006-09-19 | 2009-05-21 | Emmanuel Labourier | Micrornas differentially expressed in pancreatic diseases and uses thereof |
WO2008036776A2 (en) | 2006-09-19 | 2008-03-27 | Asuragen, Inc. | Mir-15, mir-26, mir -31,mir -145, mir-147, mir-188, mir-215, mir-216 mir-331, mmu-mir-292-3p regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention |
FR2906537A1 (fr) | 2006-09-28 | 2008-04-04 | Biomerieux Sa | Procede de diagnostic in vitro du cancer broncho-pulmonaire par detection des transcrits majoritaires alternatifs du gene klk8 codant la kallicreine 8 et son utilisation pour le pronostic de survie |
DE102006035392A1 (de) | 2006-11-02 | 2008-10-16 | Signature Diagnostics Ag | Prognostische Marker für die Vorhersage des fünfjährigen progressionsfreien Überlebens von Patienten mit Kolonkarzinomen basierend auf Expressionsprofilen von biologischen Proben |
DE102006035388A1 (de) * | 2006-11-02 | 2008-05-15 | Signature Diagnostics Ag | Prognostische Marker für die Klassifizierung von Kolonkarzinomen basierend auf Expressionsprofilen von biologischen Proben |
DE102006035393A1 (de) | 2006-11-02 | 2008-05-15 | Signature Diagnostics Ag | Prognostische Marker für die Klassifizierung des dreijährigen progessionsfreien Überlebens von Patienten mit Kolonkarzinomen basierend auf Expressionsprofilen von biologischen Proben |
EP2195451A4 (en) * | 2007-08-28 | 2011-01-19 | Merck Sharp & Dohme | EXPRESSION PROFILES OF BIOMARKERGENIC IN NOTCH-MEDIATED CANCER DISEASES |
EP2053132A1 (en) | 2007-10-23 | 2009-04-29 | Roche Diagnostics GmbH | Enrichment and sequence analysis of geomic regions |
US8916531B2 (en) | 2007-11-20 | 2014-12-23 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Modulation of CD40 expression |
JP2011509689A (ja) * | 2008-01-22 | 2011-03-31 | ベリデックス・エルエルシー | Ii及びiii期結腸癌の分子病期分類並びに予後診断 |
US7932036B1 (en) | 2008-03-12 | 2011-04-26 | Veridex, Llc | Methods of determining acute myeloid leukemia response to treatment with farnesyltransferase |
WO2009137807A2 (en) | 2008-05-08 | 2009-11-12 | Asuragen, Inc. | Compositions and methods related to mirna modulation of neovascularization or angiogenesis |
EP2297347B1 (en) | 2008-05-14 | 2017-03-08 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Methods and kits for monitoring the effects of immunomodulators on adaptive immunity |
BRPI0919882A8 (pt) | 2008-10-30 | 2017-09-19 | Caris Life Sciences Luxembourg Holdings | Métodos para avaliar padrões de rna |
CN102301002A (zh) | 2008-11-12 | 2011-12-28 | 卡里斯生命科学卢森堡控股有限责任公司 | 使用外来体来确定表现型的方法和系统 |
GB0820822D0 (en) | 2008-11-13 | 2008-12-24 | Inst Catala D Oncologia | Novel product and processes |
EP3255146B1 (en) | 2009-03-16 | 2019-05-15 | Pangu Biopharma Limited | Compositions and methods comprising histidyl-trna synthetase splice variants having non-canonical biological activities |
ES2560674T3 (es) | 2009-03-31 | 2016-02-22 | Atyr Pharma, Inc. | Composiciones y procedimientos que comprenden aspartil-ARNt sintetasas con actividades biológicas no canónicas |
US8741581B2 (en) | 2009-04-27 | 2014-06-03 | Technion Research And Development Foundation Ltd. | Markers for cancer detection |
EP2287336A1 (fr) | 2009-07-31 | 2011-02-23 | Exhonit Therapeutics SA | Procédés et méthodes de diagnostic de la maladie d'Alzheimer |
US9771618B2 (en) * | 2009-08-19 | 2017-09-26 | Bioarray Genetics, Inc. | Methods for treating breast cancer |
WO2011056872A2 (en) | 2009-11-03 | 2011-05-12 | Gen9, Inc. | Methods and microfluidic devices for the manipulation of droplets in high fidelity polynucleotide assembly |
WO2011066185A1 (en) | 2009-11-25 | 2011-06-03 | Gen9, Inc. | Microfluidic devices and methods for gene synthesis |
AU2010324594B2 (en) | 2009-11-30 | 2016-09-15 | Caris Life Sciences Switzerland Holdings Gmbh | Methods and systems for isolating, storing, and analyzing vesicles |
WO2011085075A2 (en) | 2010-01-07 | 2011-07-14 | Gen9, Inc. | Assembly of high fidelity polynucleotides |
CA2787027A1 (en) | 2010-01-13 | 2011-07-21 | Caris Life Sciences Luxembourg Holdings, S.A.R.L. | Detection of gastrointestinal disorders |
JP5808349B2 (ja) | 2010-03-01 | 2015-11-10 | カリス ライフ サイエンシズ スウィッツァーランド ホールディングスゲーエムベーハー | セラノーシスのためのバイオマーカー |
WO2011108930A1 (en) | 2010-03-04 | 2011-09-09 | Interna Technologies Bv | A MiRNA MOLECULE DEFINED BY ITS SOURCE AND ITS DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC USES IN DISEASES OR CONDITIONS ASSOCIATED WITH EMT |
US9469876B2 (en) | 2010-04-06 | 2016-10-18 | Caris Life Sciences Switzerland Holdings Gmbh | Circulating biomarkers for metastatic prostate cancer |
AU2011248625B2 (en) | 2010-04-26 | 2017-01-05 | Pangu Biopharma Limited | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of cysteinyl-tRNA synthetase |
CA2797362C (en) | 2010-04-27 | 2020-12-08 | Atyr Pharma, Inc. | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of isoleucyl trna synthetases |
CA2797271C (en) | 2010-04-28 | 2021-05-25 | Atyr Pharma, Inc. | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of alanyl trna synthetases |
AU2011248490B2 (en) | 2010-04-29 | 2016-11-10 | Pangu Biopharma Limited | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of Asparaginyl tRNA synthetases |
US9598734B2 (en) | 2010-04-29 | 2017-03-21 | Medical Prognosis Institute A/S | Methods and devices for predicting treatment efficacy |
AU2011248457B2 (en) | 2010-04-29 | 2017-02-16 | Pangu Biopharma Limited | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of valyl tRNA synthetases |
US9034321B2 (en) | 2010-05-03 | 2015-05-19 | Atyr Pharma, Inc. | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of phenylalanyl-alpha-tRNA synthetases |
CA2797277C (en) | 2010-05-03 | 2021-02-23 | Atyr Pharma, Inc. | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of arginyl-trna synthetases |
EP2566496B1 (en) | 2010-05-03 | 2018-02-28 | aTyr Pharma, Inc. | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of methionyl-trna synthetases |
AU2011248101B2 (en) | 2010-05-04 | 2016-10-20 | Atyr Pharma, Inc. | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of p38 multi-tRNA synthetase complex |
CA2799197C (en) | 2010-05-14 | 2019-10-29 | Atyr Pharma, Inc. | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of phenylalanyl-beta-trna synthetases |
AU2011256366C1 (en) | 2010-05-17 | 2017-06-15 | Pangu Biopharma Limited | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of leucyl-tRNA synthetases |
WO2011146725A1 (en) | 2010-05-19 | 2011-11-24 | Bayer Healthcare Llc | Biomarkers for a multikinase inhibitor |
EP2388336A1 (en) | 2010-05-19 | 2011-11-23 | Signature Diagnostics AG | Method and kits for diagnosing colorectal cancer |
JP6046607B2 (ja) | 2010-05-27 | 2016-12-21 | エータイアー ファーマ, インコーポレイテッド | グルタミニルtRNA合成酵素のタンパク質フラグメントに関連した治療用、診断用および抗体組成物の革新的発見 |
WO2011153277A2 (en) | 2010-06-01 | 2011-12-08 | Atyr Pharma, Inc. | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of lysyl-trna synthetases |
US9422598B2 (en) | 2010-06-04 | 2016-08-23 | Biomerieux | Method and kit for the prognosis of colorectal cancer |
WO2011159942A1 (en) | 2010-06-18 | 2011-12-22 | Illumina, Inc. | Conformational probes and methods for sequencing nucleic acids |
NZ719520A (en) | 2010-07-06 | 2017-07-28 | Int Tech Bv | Mirna and its diagnostic and therapeutic uses in diseases or conditions associated with melanoma, or in diseases or conditions associated with activated braf pathway |
AU2011289831C1 (en) | 2010-07-12 | 2017-06-15 | Pangu Biopharma Limited | Innovative discovery of therapeutic, diagnostic, and antibody compositions related to protein fragments of glycyl-tRNA synthetases |
EP2608801B1 (en) | 2010-08-25 | 2019-08-21 | aTyr Pharma, Inc. | INNOVATIVE DISCOVERY OF THERAPEUTIC, DIAGNOSTIC, AND ANTIBODY COMPOSITIONS RELATED TO PROTEIN FRAGMENTS OF TYROSYL-tRNA SYNTHETASES |
US9110079B2 (en) | 2010-09-29 | 2015-08-18 | Biomerieux | Method and kit for establishing an in vitro prognosis on a patient exhibiting SIRS |
CN103502448B (zh) | 2010-11-12 | 2017-03-29 | Gen9股份有限公司 | 核酸合成的方法和设备 |
WO2012064975A1 (en) | 2010-11-12 | 2012-05-18 | Gen9, Inc. | Protein arrays and methods of using and making the same |
US10150999B2 (en) | 2010-11-17 | 2018-12-11 | Interpace Diagnostics, Llc | miRNAs as biomarkers for distinguishing benign from malignant thyroid neoplasms |
CA2819071A1 (en) | 2010-11-24 | 2012-05-31 | Novartis International Pharmaceutical Ltd. | Fusion enzymes |
EP2474617A1 (en) | 2011-01-11 | 2012-07-11 | InteRNA Technologies BV | Mir for treating neo-angiogenesis |
JP2014504877A (ja) | 2011-01-21 | 2014-02-27 | ザ ボード オブ トラスティース オブ ザ ユニバーシティー オブ イリノイ | セロデキストリンおよびβ‐D‐グルコースの高度発酵 |
MX2013009863A (es) | 2011-02-28 | 2013-12-06 | Univ Iowa Res Found | Cambios de la hormona anti-mulleriana en el embarazo y prediccion de sexo y de resultados adversos en el embarazo. |
WO2012129758A1 (en) | 2011-03-25 | 2012-10-04 | Biomerieux | Method and kit for determining in vitro probability for individual to suffer from colorectal cancer |
CN103814128A (zh) | 2011-04-04 | 2014-05-21 | 加利福尼亚大学董事会 | 增强的纤维素降解 |
EP2520661A1 (en) | 2011-05-02 | 2012-11-07 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Blood-based gene expression signatures in lung cancer |
EP2527459A1 (en) | 2011-05-02 | 2012-11-28 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Blood-based gene detection of non-small cell lung cancer |
WO2012156515A1 (en) | 2011-05-18 | 2012-11-22 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Molecular analysis of acute myeloid leukemia |
EP2524968A1 (en) | 2011-05-19 | 2012-11-21 | Signature Diagnostics AG | Methods and kits for diagnosing colorectal cancer |
EP2524967A1 (en) | 2011-05-19 | 2012-11-21 | Signature Diagnostics AG | Methods and kits for diagnosing colorectal cancer |
AU2012265177B2 (en) | 2011-06-01 | 2017-03-02 | Medical Prognosis Institute A/S | Methods and devices for prognosis of cancer relapse |
EP2718465B1 (en) | 2011-06-09 | 2022-04-13 | Illumina, Inc. | Method of making an analyte array |
WO2013032850A2 (en) | 2011-08-26 | 2013-03-07 | Gen9, Inc. | Compositions and methods for high fidelity assembly of nucleic acids |
WO2013040251A2 (en) | 2011-09-13 | 2013-03-21 | Asurgen, Inc. | Methods and compositions involving mir-135b for distinguishing pancreatic cancer from benign pancreatic disease |
WO2013063519A1 (en) | 2011-10-26 | 2013-05-02 | Asuragen, Inc. | Methods and compositions involving mirna expression levels for distinguishing pancreatic cysts |
WO2013063544A1 (en) | 2011-10-27 | 2013-05-02 | Asuragen, Inc. | Mirnas as diagnostic biomarkers to distinguish benign from malignant thyroid tumors |
WO2013063481A1 (en) | 2011-10-28 | 2013-05-02 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Biomarkers of response to nae inhibitors |
EP3305400A3 (en) | 2011-10-28 | 2018-06-06 | Illumina, Inc. | Microarray fabrication system and method |
JP6286358B2 (ja) | 2011-11-11 | 2018-02-28 | ミレニアム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドMillennium Pharmaceuticals, Inc. | プロテアソーム阻害剤に応答するバイオマーカー |
CA2855356A1 (en) | 2011-11-11 | 2013-05-16 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Biomarkers of response to proteasome inhibitors |
WO2013075065A1 (en) | 2011-11-18 | 2013-05-23 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | 2-hydroxyglutarate as a biomarker for chronic hypoxia |
US8748097B1 (en) | 2011-12-02 | 2014-06-10 | President And Fellows Of Harvard College | Identification of agents for treating calcium disorders and uses thereof |
WO2013087789A1 (en) | 2011-12-13 | 2013-06-20 | Glykos Finland Ltd. | Antibody isoform arrays and methods thereof |
US9651556B2 (en) | 2011-12-30 | 2017-05-16 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Aptamers and diagnostic methods for detecting the EGF receptor |
RU2645252C2 (ru) | 2012-01-05 | 2018-02-19 | Глюкос Финланд Ой | Клетка нитчатых грибов с дефицитом протеаз и способы ее применения |
NZ628126A (en) | 2012-02-16 | 2016-10-28 | Atyr Pharma Inc | Histidyl-trna synthetases for treating autoimmune and inflammatory diseases |
GB2501611B (en) | 2012-02-21 | 2015-03-04 | Cytonics Corp | Alpha-2-macroglobulin compositions and therapeutic uses |
US9150853B2 (en) | 2012-03-21 | 2015-10-06 | Gen9, Inc. | Methods for screening proteins using DNA encoded chemical libraries as templates for enzyme catalysis |
WO2013155481A1 (en) | 2012-04-13 | 2013-10-17 | The Board Of Trustees Of The University Of Illinois | Improved cellodextrin transport and mixed sugar fermentation |
EP4001427A1 (en) | 2012-04-24 | 2022-05-25 | Gen9, Inc. | Methods for sorting nucleic acids and multiplexed preparative in vitro cloning |
US9012022B2 (en) | 2012-06-08 | 2015-04-21 | Illumina, Inc. | Polymer coatings |
CN113512577A (zh) | 2012-06-25 | 2021-10-19 | Gen9股份有限公司 | 用于核酸组装和高通量测序的方法 |
EP2870263A1 (en) | 2012-07-03 | 2015-05-13 | InteRNA Technologies B.V. | Diagnostic portfolio and its uses |
WO2014055543A2 (en) | 2012-10-01 | 2014-04-10 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Biomarkers and methods to predict response to inhibitors and uses thereof |
US20140100124A1 (en) | 2012-10-04 | 2014-04-10 | Asuragen, Inc. | Diagnostic mirnas for differential diagnosis of incidental pancreatic cystic lesions |
EP2925886B1 (en) | 2012-11-27 | 2019-04-24 | Pontificia Universidad Católica de Chile | Compositions and methods for diagnosing thyroid tumors |
PL2925888T3 (pl) | 2012-11-28 | 2018-03-30 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Kompozycje i sposoby do stosowania w leczeniu nowotworów |
US20140274749A1 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-18 | Affymetrix, Inc. | Systems and Methods for SNP Characterization and Identifying off Target Variants |
WO2014151551A1 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-25 | Baylor Research Institute | Ulcerative colitis (uc)-associated colorectal neoplasia markers |
US9944992B2 (en) | 2013-03-15 | 2018-04-17 | The University Of Chicago | Methods and compositions related to T-cell activity |
EP2971132B1 (en) | 2013-03-15 | 2020-05-06 | Baylor Research Institute | Tissue and blood-based mirna biomarkers for the diagnosis, prognosis and metastasis-predictive potential in colorectal cancer |
BR112015022448B1 (pt) | 2013-03-15 | 2020-12-08 | Illumina Cambridge Limited | molécula de nucleotídeo ou nucleosídeo modificado, métodos para preparar o crescimento de polinucleotídeo complementar a polinucleotídeo alvo de fita simples em reação de sequenciação e para determinar a sequência de polinucleotídeo alvo de fita simples e kit |
CN104178562B (zh) | 2013-05-21 | 2018-11-09 | 生物梅里埃股份公司 | 一种大肠癌预后试剂盒 |
WO2014195032A1 (en) | 2013-06-07 | 2014-12-11 | Medical Prognosis Institute A/S | Methods and devices for predicting treatment efficacy of fulvestrant in cancer patients |
EP3919624A3 (en) | 2013-07-01 | 2021-12-29 | Illumina, Inc. | Catalyst-free surface functionalization and polymer grafting |
US9352021B2 (en) | 2013-08-28 | 2016-05-31 | Cytonics Corporation | Systems, compositions, and methods for transplantation and treating conditions |
SG11201602540XA (en) | 2013-10-03 | 2016-04-28 | Oklahoma Med Res Found | Biomarkers for systemic lupus erythematosus disease activity, and intensity and flare |
US20160304969A1 (en) | 2013-12-17 | 2016-10-20 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Ifn-gamma gene signature biomarkers of tumor response to pd-1 antagonists |
US10682829B2 (en) | 2013-12-19 | 2020-06-16 | Illumina, Inc. | Substrates comprising nano-patterning surfaces and methods of preparing thereof |
WO2015095240A2 (en) | 2013-12-20 | 2015-06-25 | The Regents Of The University Of California | Biosynthesis of 1-undecence and related terminal olefins |
US10246501B2 (en) | 2014-01-08 | 2019-04-02 | Prosit Sole Biotechnology (Beijing) Co, Ltd | Fusion polypeptides and methods of use |
JP6666852B2 (ja) | 2014-01-16 | 2020-03-18 | イルミナ インコーポレイテッド | 前立腺がん再発の予後に関する遺伝子発現パネル |
CN106460022B (zh) | 2014-06-24 | 2018-06-05 | 加州大学董事会 | 木糖甙木糖醇寡聚物的生产方法 |
EP3169815B1 (en) | 2014-07-15 | 2020-12-23 | Ontario Institute For Cancer Research | Methods and devices for predicting anthracycline treatment efficacy |
WO2016015021A1 (en) | 2014-07-24 | 2016-01-28 | The Regents Of The University Of California | Oxidative starch degradation by a new family of pmos |
GB201414098D0 (en) | 2014-08-08 | 2014-09-24 | Illumina Cambridge Ltd | Modified nucleotide linkers |
US10093967B2 (en) | 2014-08-12 | 2018-10-09 | The Regents Of The University Of Michigan | Detection of nucleic acids |
EP3183577B1 (en) | 2014-08-21 | 2020-08-19 | Illumina Cambridge Limited | Reversible surface functionalization |
SI3212684T1 (sl) | 2014-10-31 | 2020-04-30 | Illumina Cambridge Limited | Polimeri in DNK kopolimer premazi |
WO2016094425A1 (en) | 2014-12-08 | 2016-06-16 | Berg Llc | Use of markers including filamin a in the diagnosis and treatment of prostate cancer |
WO2016094377A1 (en) | 2014-12-09 | 2016-06-16 | Merck Sharp & Dohme Corp. | System and methods for deriving gene signature biomarkers of response to pd-1 antagonists |
EP3034620A1 (en) | 2014-12-17 | 2016-06-22 | Diaxonhit | Compositions and methods for diagnosing thyroid cancer |
EP3283882B1 (en) | 2015-04-17 | 2020-12-16 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Blood-based biomarkers of tumor sensitivity to pd-1 antagonists |
FR3036287A1 (fr) | 2015-05-19 | 2016-11-25 | Univ Bordeaux | Traitement et detection des trypanosomes |
WO2016191734A1 (en) | 2015-05-28 | 2016-12-01 | University Of California Berkeley | Monofunctional aldehyde and alcohol dehydrogenases for production of fuels and commodity chemicals |
JP6951318B2 (ja) | 2015-07-15 | 2021-10-20 | プロージット ソウル バイオテクノロジー (ベイジン) カンパニー リミテッド | 融合ポリペプチドおよび使用方法 |
EP3325648B1 (en) | 2015-07-17 | 2023-03-29 | Illumina, Inc. | Polymer sheets for sequencing applications |
PT3368673T (pt) | 2015-10-29 | 2020-08-27 | Amyris Inc | Composições e métodos para a produção de mirceno |
EP3211096A1 (fr) | 2016-02-26 | 2017-08-30 | Prestizia | Combinaison de miarns permettant la prediction de l'evolution clinique du cancer du rectum |
WO2017201198A1 (en) | 2016-05-18 | 2017-11-23 | Illumina, Inc. | Self assembled patterning using patterned hydrophobic surfaces |
EP3463484A4 (en) | 2016-05-27 | 2019-10-30 | The Regents of the University of California | METHOD AND COMPOSITIONS FOR TARGETING RNA POLYMERASES AND NON-CODING RNA BIOGENESIS AT SPECIFIC LOCI |
AU2017278261A1 (en) | 2016-06-05 | 2019-01-31 | Berg Llc | Systems and methods for patient stratification and identification of potential biomarkers |
AU2018209969B2 (en) | 2017-01-20 | 2024-02-29 | The Regents Of The University Of California | Targeted gene activation in plants |
AU2018213315A1 (en) | 2017-01-26 | 2019-07-25 | Oklahoma Medical Research Foundation | Biomarkers for systemic lupus erythematosus disease activity, and intensity and flare |
AU2018213044A1 (en) | 2017-01-26 | 2019-07-11 | The Regents Of The University Of California | Targeted gene demethylation in plants |
AU2018260777A1 (en) | 2017-04-28 | 2019-10-17 | Amgen Inc. | Biomarkers for cancer therapeutics |
WO2018213803A1 (en) | 2017-05-19 | 2018-11-22 | Neon Therapeutics, Inc. | Immunogenic neoantigen identification |
EP3704250A1 (en) | 2017-11-03 | 2020-09-09 | InteRNA Technologies B.V. | Mirna molecule, equivalent, antagomir, or source thereof for treating and/or diagnosing a condition and/or a disease associated with neuronal deficiency or for neuronal (re)generation |
WO2019109016A1 (en) | 2017-12-01 | 2019-06-06 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Biomarkers and methods for treatment with nae inhibitors |
CN110882378A (zh) | 2018-09-10 | 2020-03-17 | 上海清流生物医药科技有限公司 | 一种蛋白在制备预防和治疗动脉粥样硬化及并发症药物的应用 |
AU2019360758A1 (en) | 2018-10-18 | 2021-05-20 | Oklahoma Medical Research Foundation | Biomarkers for a systemic lupus erythematosus (SLE) disease activity immune index that characterizes disease activity |
CN111303293B (zh) | 2018-11-14 | 2022-08-30 | 杭州尚健生物技术有限公司 | 一种融合蛋白及其用途 |
US11293061B2 (en) | 2018-12-26 | 2022-04-05 | Illumina Cambridge Limited | Sequencing methods using nucleotides with 3′ AOM blocking group |
US11421271B2 (en) | 2019-03-28 | 2022-08-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods and compositions for nucleic acid sequencing using photoswitchable labels |
CN111763261B (zh) | 2019-04-02 | 2022-08-09 | 杭州尚健生物技术有限公司 | 一种融合蛋白及其用途 |
CN113924085A (zh) | 2019-04-12 | 2022-01-11 | 加利福尼亚大学董事会 | 用于增加肌肉量和氧化代谢的组合物和方法 |
EP3963099A1 (en) | 2019-04-30 | 2022-03-09 | Larimar Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for determining effectiveness of frataxin replacement therapy |
US11939618B2 (en) | 2020-03-23 | 2024-03-26 | The Regents Of The University Of California | Fusion proteins useful for modifying terpenes |
MA58991A1 (fr) | 2020-06-22 | 2023-03-31 | Illumina Cambridge Ltd | Nucléosides et nucléotides avec groupe de blocage acétal 3' |
US11981964B2 (en) | 2020-07-28 | 2024-05-14 | Illumina Cambridge Limited | Substituted coumarin dyes and uses as fluorescent labels |
WO2022047359A1 (en) | 2020-08-31 | 2022-03-03 | Berg Llc | Protein biomarkers for pancreatic cancer |
US20220195196A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Alkylpyridinium coumarin dyes and uses in sequencing applications |
US20220195517A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Long stokes shift chromenoquinoline dyes and uses in sequencing applications |
US20220195516A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods, systems and compositions for nucleic acid sequencing |
US20220195518A1 (en) | 2020-12-22 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods and compositions for nucleic acid sequencing |
CN117120471A (zh) | 2021-03-23 | 2023-11-24 | 广州凌腾生物医药有限公司 | 结合cd3的多特异性抗原结合蛋白及其用途 |
IL307528A (en) | 2021-04-06 | 2023-12-01 | Bpgbio Inc | Protein markers for the prognosis of breast cancer progression |
WO2022216846A1 (en) | 2021-04-06 | 2022-10-13 | Berg Llc | Protein markers for estrogen receptor (er)-positive-like and estrogen receptor (er)-negative-like breast cancer |
IL307530A (en) | 2021-04-06 | 2023-12-01 | Bpgbio Inc | Estrogen receptor-like (ER) breast cancer protein markers LUMINAL A (LA) and LUMINAL B1 (LB1) |
JP2024516191A (ja) | 2021-05-05 | 2024-04-12 | イルミナ ケンブリッジ リミテッド | ビス-ホウ素縮合複素環を含有する蛍光色素及び配列決定における使用 |
IL308173A (en) | 2021-05-20 | 2024-01-01 | Illumina Inc | Compositions and methods for genetic sequencing by synthesis |
WO2022265994A1 (en) | 2021-06-15 | 2022-12-22 | Illumina, Inc. | Hydrogel-free surface functionalization for sequencing |
CN117813391A (zh) | 2021-07-23 | 2024-04-02 | 因美纳有限公司 | 制备用于dna测序的基底表面的方法 |
WO2023069927A1 (en) | 2021-10-20 | 2023-04-27 | Illumina, Inc. | Methods for capturing library dna for sequencing |
US20230330659A1 (en) | 2022-03-22 | 2023-10-19 | Illumina Cambridge Limited | Substrate with orthogonally functional nanodomains |
AU2023246676A1 (en) | 2022-03-28 | 2024-01-18 | Illumina Inc. | Labeled avidin and methods for sequencing |
CA3223125A1 (en) | 2022-03-29 | 2023-10-05 | Illumina, Inc. | Chromenoquinoline dyes and uses in sequencing |
WO2023196937A1 (en) | 2022-04-06 | 2023-10-12 | Larimar Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for monitoring frataxin replacement therapy |
WO2023207574A1 (zh) | 2022-04-28 | 2023-11-02 | 领诺(上海)医药科技有限公司 | 一种穿越血脑屏障的重组hARSA |
WO2023232829A1 (en) | 2022-05-31 | 2023-12-07 | Illumina, Inc | Compositions and methods for nucleic acid sequencing |
WO2023240201A1 (en) | 2022-06-08 | 2023-12-14 | Larimar Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for monitoring progression and treatment of leigh syndrome |
US20230416279A1 (en) | 2022-06-28 | 2023-12-28 | Illumina Cambridge Limited | Fluorescent dyes containing fused tetracyclic bis-boron heterocycle and uses in sequencing |
WO2024028794A1 (en) | 2022-08-02 | 2024-02-08 | Temple Therapeutics BV | Methods for treating endometrial and ovarian hyperproliferative disorders |
WO2024039516A1 (en) | 2022-08-19 | 2024-02-22 | Illumina, Inc. | Third dna base pair site-specific dna detection |
WO2024068889A2 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for reducing photo damage during sequencing |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4458066A (en) * | 1980-02-29 | 1984-07-03 | University Patents, Inc. | Process for preparing polynucleotides |
US4668777A (en) * | 1981-03-27 | 1987-05-26 | University Patents, Inc. | Phosphoramidite nucleoside compounds |
EP0090789A1 (en) * | 1982-03-26 | 1983-10-05 | Monsanto Company | Chemical DNA synthesis |
AU575586B2 (en) * | 1983-09-02 | 1988-08-04 | Syngene, Inc. | Oligonucleotide synthesis employing primer with oxidzable substituents in system |
US4591614A (en) * | 1983-10-07 | 1986-05-27 | The Johns Hopkins University | Preparation of oligodeoxyribonucleoside alkyl or arylphosphonates |
SE466208B (sv) * | 1983-12-20 | 1992-01-13 | California Inst Of Techn | Enkelstraengad aminoderivat av oligonukleotider och foerfarande foer framstaellning daerav |
US4757141A (en) * | 1985-08-26 | 1988-07-12 | Applied Biosystems, Incorporated | Amino-derivatized phosphite and phosphate linking agents, phosphoramidite precursors, and useful conjugates thereof |
FR2596761B1 (fr) * | 1986-04-08 | 1988-05-20 | Commissariat Energie Atomique | Derives de nucleosides et leur utilisation pour la synthese d'oligonucleotides |
-
1988
- 1988-09-21 GB GB888822228A patent/GB8822228D0/en active Pending
-
1989
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US5436327A (en) | 1995-07-25 |
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