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Claims (19)
- 式IV:
P L は、Pであり、
Lは、-C(R 3 )(R 4 )-であり、
R 1 及びR 2 は、それらの結合する炭素原子と一緒になって、0~5個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環、または多環式環を形成し、
R 3 は、-H、-L s -R、ハロゲン、-CN、-NO 2 、-L s -Si(R) 3 、-OR、-SR、または-N(R) 2 であり、
R 4 及びR 5 は、それらの介在する原子と一緒になって、1~5個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環、または多環式環を形成し、
各L s は、独立して、共有結合であるか、またはC 1-30 脂肪族基及び1~10個のヘテロ原子を有するC 1-30 ヘテロ脂肪族基から選択される二価の任意で置換される直線状または分枝状の基であり、1つ以上のメチレン単位は、任意に及び独立して、C 1-6 アルキレン、C 1-6 アルケニレン、-C≡C-、1~5個のヘテロ原子を有する二価のC 1 -C 6 ヘテロ脂肪族基、-C(R’) 2 -、-Cy-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)O-、-S(O)-、-S(O) 2 -、-S(O) 2 N(R’)-、-C(O)S-、-C(O)O-、-P(O)(OR’)-、-P(O)(SR’)-、-P(O)(R’)-、-P(O)(NR’)-、-P(S)(OR’)-、-P(S)(SR’)-、-P(S)(R’)-、-P(S)(NR’)-、-P(R’)-、-P(OR’)-、-P(SR’)-、-P(NR’)-、-P(OR’)[B(R’) 3 ]-、-OP(O)(OR’)O-、-OP(O)(SR’)O-、-OP(O)(R’)O-、-OP(O)(NR’)O-、-OP(OR’)O-、-OP(SR’)O-、-OP(NR’)O-、-OP(R’)O-、または-OP(OR’)[B(R’) 3 ]O-から選択される任意で置換される基で置き換えられ、1つ以上の炭素原子は、任意に及び独立して、Cy L で置き換えられ、
各-Cy-は、独立して、C 3-20 脂環式環、C 6-20 アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択される任意で置換される二価の基であり、
各Cy L は、独立して、C 3-20 脂環式環、C 6-20 アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択される任意で置換される四価の基であり、
各R’は、独立して、-R、-C(O)R、-C(O)OR、または-S(O) 2 Rであり、
L 7 は、-O-または-S-であり、
BAは、C 3-30 脂環式、C 6-30 アリール、1~10個のヘテロ原子を有するC 5-30 ヘテロアリール、1~10個のヘテロ原子を有するC 3-30 ヘテロシクリル、天然核酸塩基部分、及び修飾核酸塩基部分から選択される任意で置換される基であり、
SUは、-L s -O-または
各R s は、独立して、-H、ハロゲン、-CN、-N 3 、-NO、-NO 2 、-L s -R’、-L s -Si(R) 3 、-L s -OR’、-L s -SR’、-L s -N(R’) 2 、-O-L s -R’、-O-L s -Si(R) 3 、-O-L s -OR’、-O-L s -SR’、または-O-L s -N(R’) 2 であり、
tは0~20であり、
環A s は、0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環または多環式環であり、
R 5s はR s であり、
各Rは、独立して、-Hであるか、もしくは、C 1-30 脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC 1-30 ヘテロ脂肪族、C 6-30 アリール、C 6-30 アリール脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC 6-30 アリールヘテロ脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有する5~30員のヘテロアリール、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~30員のヘテロシクリルから選択される任意で置換される基であり、または
2つのR基が任意に及び独立して、一緒になって共有結合を形成し、または
同じ原子上の2つ以上のR基が任意に及び独立して、前記原子と一緒になって、前記原子に加えて0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~30員の単環式環、二環式環、もしくは多環式環を形成し、または
2つ以上の原子上の2つ以上のR基が任意に及び独立して、それらの介在する原子と一緒になって、前記介在原子に加えて0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~30員の単環式環、二環式環、もしくは多環式環を形成する、前記化合物またはその塩。 - BAが、A、T、C、G、U、及びそれらの互変異性体から選択される任意で置換される核酸塩基である、請求項1に記載の化合物。
- 前記化合物が、式IV-a、IV-b、IV-c-1、IV-c-2、IV-d、もしくはIV-e:
R 1s 、R 2s 、R 3s 、R 4s 及びR 5s の各々は、独立して、R s であり、
各R s は、独立して、-H、ハロゲン、-CN、-N 3 、-NO、-NO 2 、-L s -R’、-L s -Si(R) 3 、-L s -OR’、-L s -SR’、-L s -N(R’) 2 、-O-L s -R’、-O-L s -Si(R) 3 、-O-L s -OR’、-O-L s -SR’、または-O-L s -N(R’) 2 であり、
tは0~20であり、
環A s は、0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環または多環式環であり、
R 5s はR s である、請求項2に記載の化合物。 - R 1 及びR 2 が、それらの結合する炭素原子と一緒になって、0~5個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~10員の単環式環、または二環式環を形成し、R 5 ならびにR 3 及びR 4 のうちの1つが、それらの介在する原子と一緒になって、1~5個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~10員の単環式環、または二環式環を形成する、請求項3に記載の化合物。
- R 1 及びR 2 が、それらの結合する炭素原子と一緒になって、ヘテロ原子を有さない任意で置換される5員の単環式環を形成する、請求項4に記載の化合物。
- R 1 及びR 2 が、それらの結合する炭素原子と一緒になって、ヘテロ原子を有さない任意で置換される6員の単環式環を形成する、請求項4に記載の化合物。
- R 5 ならびにR 3 及びR 4 のうちの1つが、それらの介在する原子と一緒になって、R 5 が結合している窒素である1個のヘテロ原子のみを有する任意で置換される4員の単環式環を形成する、請求項5または6に記載の化合物。
- R 5 ならびにR 3 及びR 4 のうちの1つが、それらの介在する原子と一緒になって、R 5 が結合している窒素である1個のヘテロ原子のみを有する任意で置換される5員の単環式環を形成する、請求項5または6に記載の化合物。
- 式VIII:
R 5s は、独立して、R s であり、
各L s は、独立して、共有結合であるか、またはC 1-30 脂肪族基及び1~10個のヘテロ原子を有するC 1-30 ヘテロ脂肪族基から選択される二価の任意で置換される直線状または分枝状の基であり、1つ以上のメチレン単位は、任意に及び独立して、C 1-6 アルキレン、C 1-6 アルケニレン、-C≡C-、1~5個のヘテロ原子を有する二価のC 1 -C 6 ヘテロ脂肪族基、-C(R’) 2 -、-Cy-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)O-、-S(O)-、-S(O) 2 -、-S(O) 2 N(R’)-、-C(O)S-、-C(O)O-、-P(O)(OR’)-、-P(O)(SR’)-、-P(O)(R’)-、-P(O)(NR’)-、-P(S)(OR’)-、-P(S)(SR’)-、-P(S)(R’)-、-P(S)(NR’)-、-P(R’)-、-P(OR’)-、-P(SR’)-、-P(NR’)-、-P(OR’)[B(R’) 3 ]-、-OP(O)(OR’)O-、-OP(O)(SR’)O-、-OP(O)(R’)O-、-OP(O)(NR’)O-、-OP(OR’)O-、-OP(SR’)O-、-OP(NR’)O-、-OP(R’)O-、または-OP(OR’)[B(R’) 3 ]O-から選択される任意で置換される基で置き換えられ、1つ以上の炭素原子は、任意に及び独立して、Cy L で置き換えられ、
各-Cy-は、独立して、C 3-20 脂環式環、C 6-20 アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択される任意で置換される二価の基であり、
各Cy L は、独立して、C 3-20 脂環式環、C 6-20 アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択される任意で置換される四価の基であり、
各環A s は、独立して、0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環または多環式環であり、
各R s は、独立して、-H、ハロゲン、-CN、-N 3 、-NO、-NO 2 、-L s -R’、-L s -Si(R) 3 、-L s -OR’、-L s -SR’、-L s -N(R’) 2 、-O-L s -R’、-O-L s -Si(R) 3 、-O-L s -OR’、-O-L s -SR’、または-O-L s -N(R’) 2 であり、
各tは、独立して0~20であり、
各BAは、独立して、C 3-30 脂環式、C 6-30 アリール、1~10個のヘテロ原子を有するC 5-30 ヘテロアリール、1~10個のヘテロ原子を有するC 3-30 ヘテロシクリル、天然核酸塩基部分、及び修飾核酸塩基部分から選択される任意で置換される基であり、
各L P は、独立して、式VII:
P L は、P(=W)、P、またはP→B(R’) 3 であり、
Wは、O、SまたはSeであり、
R 1 及びR 5 の各々は、独立して、-H、-L s -R、ハロゲン、-CN、-NO 2 、-L s -Si(R) 3 、-OR、-SR、または-N(R) 2 であり、
X、Y及びZの各々は、独立して-O-、-S-、-N(-L s -R 1 )-、もしくはL s であるか、
または、式VIIに関しては、H-X-L s -R 5 は、式I、I-a、I-a-1、I-a-2、I-b、I-c、I-d、I-e、II、II-a、II-b、III、III-a、III-b、もしくはその塩の構造を有し、
zは1~1000であり、
L 3E は、-L s -または-L s -L s -であり、
R 3E は、-R’、-L s -R’、-OR’、または固形支持体であり、
各R’は、独立して、-R、-C(O)R、-C(O)OR、または-S(O) 2 Rであり、
各Rは、独立して、-Hであるか、もしくは、C 1-30 脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC 1-30 ヘテロ脂肪族、C 6-30 アリール、C 6-30 アリール脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC 6-30 アリールヘテロ脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有する5~30員のヘテロアリール、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~30員のヘテロシクリルから選択される任意で置換される基であり、または
2つのR基が任意に及び独立して、一緒になって共有結合を形成し、または
同じ原子上の2つ以上のR基が任意に及び独立して、前記原子と一緒になって、前記原子に加えて0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~30員の単環式環、二環式環、もしくは多環式環を形成し、または
2つ以上の原子上の2つ以上のR基が任意に及び独立して、それらの介在する原子と一緒になって、前記介在原子に加えて0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~30員の単環式環、二環式環、もしくは多環式環を形成し、かつ
L P の少なくとも1つの出現において、-X-L s -R 5 は、H-X-L s -R 5 が式I:
Lは、-C(R 3 )(R 4 )-であり、
R 1 及びR 2 は、それらの結合する炭素原子と一緒になって、0~5個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環、または多環式環を形成し、
R 3 は、-H、-L s -R、ハロゲン、-CN、-NO 2 、-L s -Si(R) 3 、-OR、-SR、または-N(R) 2 であり、
R 4 及びR 5 は、それらの介在する原子と一緒になって、1~5個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環、または多環式環を形成し、
各L s は、独立して、共有結合であるか、またはC 1-30 脂肪族基及び1~10個のヘテロ原子を有するC 1-30 ヘテロ脂肪族基から選択される二価の任意で置換される直線状または分枝状の基であり、1つ以上のメチレン単位は、任意に及び独立して、C 1-6 アルキレン、C 1-6 アルケニレン、-C≡C-、1~5個のヘテロ原子を有する二価のC 1 -C 6 ヘテロ脂肪族基、-C(R’) 2 -、-Cy-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)O-、-S(O)-、-S(O) 2 -、-S(O) 2 N(R’)-、-C(O)S-、-C(O)O-、-P(O)(OR’)-、-P(O)(SR’)-、-P(O)(R’)-、-P(O)(NR’)-、-P(S)(OR’)-、-P(S)(SR’)-、-P(S)(R’)-、-P(S)(NR’)-、-P(R’)-、-P(OR’)-、-P(SR’)-、-P(NR’)-、-P(OR’)[B(R’) 3 ]-、-OP(O)(OR’)O-、-OP(O)(SR’)O-、-OP(O)(R’)O-、-OP(O)(NR’)O-、-OP(OR’)O-、-OP(SR’)O-、-OP(NR’)O-、-OP(R’)O-、または-OP(OR’)[B(R’) 3 ]O-から選択される任意で置換される基で置き換えられ、1つ以上の炭素原子は、任意に及び独立して、Cy L で置き換えられ、
各-Cy-は、独立して、C 3-20 脂環式環、C 6-20 アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択される任意で置換される二価の基であり、
各Cy L は、独立して、C 3-20 脂環式環、C 6-20 アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択される任意で置換される四価の基であり、
R 6 はR’であり、
R 7 は、-OHまたはSHである、前記化合物またはその塩。 - WがOである、請求項9~10のいずれか1項に記載の化合物。
- WがSである、請求項9に記載の化合物。
- X、Y及びZの各々が-O-である、請求項13に記載の化合物。
- 式VII:
P L は、P(=W)、P、またはP→B(R’) 3 であり、
Wは、O、SまたはSeであり、
-X-L s -R 5 は、H-X-L s -R 5 が式I:
Lは、-C(R 3 )(R 4 )-であり、
R 1 及びR 2 は、それらの結合する炭素原子と一緒になって、0~5個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環、または多環式環を形成し、
R 3 は、-H、-L s -R、ハロゲン、-CN、-NO 2 、-L s -Si(R) 3 、-OR、-SR、または-N(R) 2 であり、
R 4 及びR 5 は、それらの介在する原子と一緒になって、1~5個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~20員の単環式環、二環式環、または多環式環を形成し、
各L s は、独立して、共有結合であるか、またはC 1-30 脂肪族基及び1~10個のヘテロ原子を有するC 1-30 ヘテロ脂肪族基から選択される二価の任意で置換される直線状または分枝状の基であり、1つ以上のメチレン単位は、任意に及び独立して、C 1-6 アルキレン、C 1-6 アルケニレン、-C≡C-、1~5個のヘテロ原子を有する二価のC 1 -C 6 ヘテロ脂肪族基、-C(R’) 2 -、-Cy-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)O-、-S(O)-、-S(O) 2 -、-S(O) 2 N(R’)-、-C(O)S-、-C(O)O-、-P(O)(OR’)-、-P(O)(SR’)-、-P(O)(R’)-、-P(O)(NR’)-、-P(S)(OR’)-、-P(S)(SR’)-、-P(S)(R’)-、-P(S)(NR’)-、-P(R’)-、-P(OR’)-、-P(SR’)-、-P(NR’)-、-P(OR’)[B(R’) 3 ]-、-OP(O)(OR’)O-、-OP(O)(SR’)O-、-OP(O)(R’)O-、-OP(O)(NR’)O-、-OP(OR’)O-、-OP(SR’)O-、-OP(NR’)O-、-OP(R’)O-、または-OP(OR’)[B(R’) 3 ]O-から選択される任意で置換される基で置き換えられ、1つ以上の炭素原子は、任意に及び独立して、Cy L で置き換えられ、
各-Cy-は、独立して、C 3-20 脂環式環、C 6-20 アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択される任意で置換される二価の基であり、
各Cy L は、独立して、C 3-20 脂環式環、C 6-20 アリール環、1~10個のヘテロ原子を有する5~20員のヘテロアリール環、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~20員のヘテロシクリル環から選択される任意で置換される四価の基であり、
各R’は、独立して、-R、-C(O)R、-CO 2 R、または-SO 2 Rであり、
R 6 はR’であり、
R 7 は、-OHまたはSHであり、
各Rは、独立して、-Hであるか、もしくは、C 1-30 脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC 1-30 ヘテロ脂肪族、C 6-30 アリール、C 6-30 アリール脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有するC 6-30 アリールヘテロ脂肪族、1~10個のヘテロ原子を有する5~30員のヘテロアリール、及び1~10個のヘテロ原子を有する3~30員のヘテロシクリルから選択される任意で置換される基であり、または
2つのR基が任意に及び独立して、一緒になって共有結合を形成し、または
同じ原子上の2つ以上のR基が任意に及び独立して、前記原子と一緒になって、前記原子に加えて0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~30員の単環式環、二環式環、もしくは多環式環を形成し、または
2つ以上の原子上の2つ以上のR基が任意に及び独立して、それらの介在する原子と一緒になって、前記介在原子に加えて0~10個のヘテロ原子を有する任意で置換される3~30員の単環式環、二環式環、もしくは多環式環を形成する、前記オリゴヌクレオチド。 - 複数のオリゴヌクレオチドを含む、キラル制御されたオリゴヌクレオチド組成物であって、そのオリゴヌクレオチドの各々が、独立して請求項1~15のいずれか1項に記載の化合物またはその塩であり、前記複数のオリゴヌクレオチドが、
1)共通の塩基配列、
2)共通の骨格結合のパターン、
3)独立して約1~50個のキラルヌクレオチド間結合で共通の立体化学(「キラル制御されたヌクレオチド間結合」)を共有し、
前記組成物の前記複数のオリゴヌクレオチドのレベルが所定である、前記組成物。 - 前記複数のオリゴヌクレオチドが、少なくとも5個のキラル制御されたヌクレオチド間結合を含む、請求項16に記載のオリゴヌクレオチド組成物。
- 前記複数のオリゴヌクレオチドが、同じ構成を共有しており、オリゴヌクレオチドの所定レベルが、前記複数のオリゴヌクレオチドによって共有されるものと同じ構成を有する組成物における全てのオリゴヌクレオチドの少なくとも5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%である、請求項1~16のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド組成物。
- オリゴヌクレオチドを調製する方法であって、
(1)カップリング、
(2)任意にキャッピング、
(3)修飾化、
(4)脱ブロッキング、及び
(5)任意に所望のオリゴヌクレオチド長が得られるまで(1)~(4)を繰り返すステップを含み、
カップリングステップが、請求項1~8のいずれか1項に記載の化合物を提供することを含む、前記方法。
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