JP2017504578A5 - - Google Patents

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さらに、本発明は、gpA33のエピトープ及びCD3のエピトープに特異的に結合でき、IgGのFcドメインを保有する、二重特異性1価Fcダイアボディに関し、この二重特異性1価Fcダイアボディは、第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖を含み、第1及び第2のポリペプチド鎖は互いに共有結合され、第1及び第3のポリペプチド鎖は互いに共有結合され、
A.第1のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
i.ドメイン1であって、gpA33に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLgpA33)(配列番号26)を含むサブドメイン(1A)、及びCD3に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHCD3)(配列番号25)を含むサブドメイン(1B)を含み、サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
ii.ドメイン2であって、ドメイン2はEコイルドメイン(配列番号3)又はKコイルドメイン(配列番号4)であり、またドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によってドメイン1から分離されている、ドメイン2と、
iii.ドメイン3であって、システイン含有ペプチド(ペプチド1)(配列番号39)を含むサブドメイン(3A)、及びIgG免疫グロブリンFcドメインのCH2ドメイン及びCH3ドメインを有する、IgGのFcドメインのポリペプチド部分を含むサブドメイン(3B)を含み、ドメイン3及びドメイン2はスペーサペプチド(リンカー5)(GGG)によって互いから分離されている、ドメイン3と
を含み、
B.第2のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
i.ドメイン1であって、CD3に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLCD3)(配列番号5)を含むサブドメイン(1A)、及びgpA33に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHgpA33)(配列番号27)を含むサブドメイン(1B)を含み、サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
ii.ドメイン2であって、ドメイン2はKコイルドメイン(配列番号4)又はEコイルドメイン(配列番号3)であり、またドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によってドメイン1から分離されており、かつ第1のポリペプチド鎖のドメイン2及び第2のポリペプチド鎖のドメイン2は、両方がEコイルドメインではなく、又は両方がKコイルドメインではない、ドメイン2と
を含み、
C.第3のポリペプチド鎖は、N末端からC末端方向へ向かって、ドメイン3を含み、ドメイン3は、
(1)システイン含有ペプチド(ペプチド1)(配列番号39)を含むサブドメイン(3A)、及び
(2)IgG免疫グロブリンFcドメインのCH2ドメイン及びCH3ドメインを有する、IgGのFcドメインのポリペプチド部分を含むサブドメイン(3B)を含み、
かつ、
(a)第1及び第3のポリペプチド鎖のIgGのFcドメインのポリペプチド部分は、IgGのFcドメインを形成し、
(b)第1のポリペプチド鎖のVLドメイン及び第2のポリペプチド鎖のVHドメインは、gpA33のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成し、
(c)第2のポリペプチド鎖のVLドメイン及び第1のポリペプチド鎖のVHドメインは、CD3のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成する。
さらに、本発明は、gpA33のエピトープ及びCD3のエピトープに特異的に結合でき、IgGのFcドメインを保有する、二重特異性1価Fcダイアボディに関し、この二重特異性1価Fcダイアボディは、第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖を含み、第1及び第2のポリペプチド鎖は互いに共有結合され、第1及び第3のポリペプチド鎖は互いに共有結合され、
A.第1のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
i.ドメイン3であって、システイン含有ペプチド(ペプチド1)(配列番号39)を含むサブドメイン(3A)、及びIgG免疫グロブリンFcドメインのCH2ドメイン及びCH3ドメインを有する、IgGのFcドメインのポリペプチド部分を含むサブドメイン(3B)を含む、ドメイン3と
ii.ドメイン1であって、gpA33に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLgpA33)(配列番号26)を含むサブドメイン(1A)、及びCD3に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHCD3)(配列番号25)を含むサブドメイン(1B)を含み、サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されており、ドメイン1及びドメイン3はスペーサペプチド(リンカー4)(配列番号38)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
iii.ドメイン2であって、ドメイン2はEコイルドメイン(配列番号3)又はKコイルドメイン(配列番号4)であり、またドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によってドメイン1から分離されている、ドメイン2と、
を含み、
B.第2のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
i.ドメイン1であって、CD3に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLCD3)(配列番号5)を含むサブドメイン(1A)、及びgpA33に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHgpA33)(配列番号27)を含むサブドメイン(1B)を含み、サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
ii.ドメイン2であって、ドメイン2はKコイルドメイン(配列番号4)又はEコイルドメイン(配列番号3)であり、またドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によってドメイン1から分離されており、かつ第1のポリペプチド鎖のドメイン2及び第2のポリペプチド鎖のドメイン2は、両方がEコイルドメインではなく、又は両方がKコイルドメインではない、ドメイン2と
を含み、
C.第3のポリペプチド鎖は、N末端からC末端方向へ向かって、ドメイン3を含み、ドメイン3は、
(1)システイン含有ペプチド(ペプチド1)(配列番号39)を含むサブドメイン(3A)、及び
(2)IgG免疫グロブリンFcドメインのCH2ドメイン及びCH3ドメインを有する、IgGのFcドメインのポリペプチド部分を含むサブドメイン(3B)を含み、
かつ、
(a)第1及び第3のポリペプチド鎖のIgGのFcドメインのポリペプチド部分は、IgGのFcドメインを形成し、
(b)第1のポリペプチド鎖のVLドメイン及び第2のポリペプチド鎖のVHドメインは、gpA33のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成し、
(c)第2のポリペプチド鎖のVLドメイン及び第1のポリペプチド鎖のVHドメインは、CD3のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成する。
好ましいスペーサペプチド(リンカー5)はGGGという配列を有する。
上記の内容からわかるように、配列番号42の残基1〜106は、gpA33に結合する抗体のVLドメイン(VLgpA33)(配列番号26)であり、配列番号42の残基107〜114は、第1の介在スペーサペプチド(リンカー1)(配列番号1)であり、配列番号42の残基115〜239は、CD3に結合する抗体のVHドメイン(VHCD3)(配列番号25)であり、配列番号42の残基240〜245は、システイン含有スペーサペプチド(リンカー2)(配列番号2)であり、配列番号42の残基246〜273は、ヘテロ二量体促進性「Eコイル」ドメイン(配列番号3)であり、配列番号42の残基274〜276は、スペーサペプチドGGG(リンカー5)であり、配列番号42の残基277〜286は、ペプチド1(配列番号39)であり、配列番号42の残基287〜503は、抗体のFcドメインのCH2及びCH3ドメインについての配列(配列番号40)である。

Claims (18)

  1. gpA33のエピトープ及びCD3のエピトープに特異的に結合できる、二重特異性1価ダイアボディであって、前記二重特異性1価ダイアボディは、互いに共有結合した第1のポリペプチド鎖及び第2のポリペプチド鎖を含み、
    A.第1のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
    i.ドメイン1であって、CD3に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLCD3)(配列番号5)を含むサブドメイン(1A)、及びgpA33に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHgpA33)(配列番号27)を含むサブドメイン(1B)を含み、前記サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
    ii.ドメイン2であって、前記ドメイン2はKコイルドメイン(配列番号4)又はEコイルドメイン(配列番号3)であり、また前記ドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によって前記ドメイン1から分離されている、ドメイン2と
    を含み、
    B.第2のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
    i.ドメイン1であって、gpA33に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLgpA33)(配列番号26)を含むサブドメイン(1A)、及びCD3に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHCD3)(配列番号25)を含むサブドメイン(1B)を含み、前記サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
    ii.ドメイン2であって、前記ドメイン2はEコイルドメイン(配列番号3)又はKコイルドメイン(配列番号4)であり、また前記ドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によって前記ドメイン1から分離されており、かつ前記第1のポリペプチド鎖の前記ドメイン2及び前記第2のポリペプチド鎖の前記ドメイン2は、両方がEコイルドメインではなく、又は両方がKコイルドメインではない、ドメイン2と
    を含み、
    (a)前記第1のポリペプチド鎖の前記VLドメイン及び前記第2のポリペプチド鎖の前記VHドメインは、CD3のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成し、
    (b)前記第2のポリペプチド鎖の前記VLドメイン及び前記第1のポリペプチド鎖の前記VHドメインは、gpA33のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成する、ダイアボディ。
  2. 前記第1のポリペプチド鎖は、アルブミン結合ドメイン(配列番号34)を含み、前記アルブミン結合ドメインが、前記ドメイン2のC末端に配置され、リンカー3(配列番号32)によって前記ドメイン2から分離されている、請求項1に記載のダイアボディ。
  3. gpA33のエピトープ及びCD3のエピトープに特異的に結合でき、IgGのFcドメインを保有する、二重特異性1価Fcダイアボディに関し、前記二重特異性1価Fcダイアボディは、第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖を含み、前記第1及び第2のポリペプチド鎖は互いに共有結合され、前記第1及び第3のポリペプチド鎖は互いに共有結合され、
    A.第1のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
    i.ドメイン1であって、gpA33に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLgpA33)(配列番号26)を含むサブドメイン(1A)、及びCD3に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHCD3)(配列番号25)を含むサブドメイン(1B)を含み、前記サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
    ii.ドメイン2であって、前記ドメイン2はEコイルドメイン(配列番号3)又はKコイルドメイン(配列番号4)であり、また前記ドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によって前記ドメイン1から分離されている、ドメイン2と、
    iii.ドメイン3であって、システイン含有ペプチド(ペプチド1)(配列番号39)を含むサブドメイン(3A)、及びIgG免疫グロブリンFcドメインのCH2ドメイン及びCH3ドメインを有する、IgGのFcドメインのポリペプチド部分を含むサブドメイン(3B)を含み、前記ドメイン3及び前記ドメイン2はGGGという配列を有するスペーサペプチド(リンカー5)によって互いから分離されている、ドメイン3と
    を含み、
    B.第2のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
    i.ドメイン1であって、CD3に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLCD3)(配列番号5)を含むサブドメイン(1A)、及びgpA33に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHgpA33)(配列番号27)を含むサブドメイン(1B)を含み、前記サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
    ii.ドメイン2であって、前記ドメイン2はKコイルドメイン(配列番号4)又はEコイルドメイン(配列番号3)であり、また前記ドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によって前記ドメイン1から分離されており、かつ前記第1のポリペプチド鎖の前記ドメイン2及び前記第2のポリペプチド鎖の前記ドメイン2は、両方がEコイルドメインではなく、又は両方がKコイルドメインではない、ドメイン2と
    を含み、
    C.第3のポリペプチド鎖は、N末端からC末端方向へ向かって、ドメイン3を含み、ドメイン3は、
    (1)システイン含有ペプチド(ペプチド1)(配列番号39)を含むサブドメイン(3A)、及び
    (2)IgG免疫グロブリンFcドメインのCH2ドメイン及びCH3ドメインを有する、IgGのFcドメインのポリペプチド部分を含むサブドメイン(3B)を含み、
    かつ、
    (a)前記第1及び第3のポリペプチド鎖のIgGのFcドメインの前記ポリペプチド部分は、IgGのFcドメインを形成し、
    (b)前記第1のポリペプチド鎖の前記VLドメイン及び前記第2のポリペプチド鎖の前記VHドメインは、gpA33のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成し、
    (c)前記第2のポリペプチド鎖の前記VLドメイン及び前記第1のポリペプチド鎖の前記VHドメインは、CD3のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成する、ダイアボディ。
  4. gpA33のエピトープ及びCD3のエピトープに特異的に結合でき、IgGのFcドメインを保有する、二重特異性1価Fcダイアボディに関し、前記二重特異性1価Fcダイアボディは、第1のポリペプチド鎖、第2のポリペプチド鎖及び第3のポリペプチド鎖を含み、前記第1及び第2のポリペプチド鎖は互いに共有結合され、前記第1及び第3のポリペプチド鎖は互いに共有結合され、
    A.第1のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
    i.ドメイン3であって、システイン含有ペプチド(ペプチド1)(配列番号39)を含むサブドメイン(3A)、及びIgG免疫グロブリンFcドメインのCH2ドメイン及びCH3ドメインを有する、IgGのFcドメインのポリペプチド部分を含むサブドメイン(3B)を含む、ドメイン3と
    ii.ドメイン1であって、gpA33に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLgpA33)(配列番号26)を含むサブドメイン(1A)、及びCD3に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHCD3)(配列番号25)を含むサブドメイン(1B)を含み、前記サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されており、前記ドメイン1及び前記ドメイン3はスペーサペプチド(リンカー4)(配列番号38)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
    iii.ドメイン2であって、前記ドメイン2はEコイルドメイン(配列番号3)又はKコイルドメイン(配列番号4)であり、また前記ドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によって前記ドメイン1から分離されている、ドメイン2と、
    を含み、
    B.第2のポリペプチド鎖は、N末端からC末端の方向に、
    i.ドメイン1であって、CD3に結合できるモノクローナル抗体のVLドメイン(VLCD3)(配列番号5)を含むサブドメイン(1A)、及びgpA33に結合できるモノクローナル抗体のVHドメイン(VHgpA33)(配列番号27)を含むサブドメイン(1B)を含み、前記サブドメイン(1A)及び(1B)はペプチドリンカー(配列番号1)によって互いから分離されている、ドメイン1と、
    ii.ドメイン2であって、前記ドメイン2はKコイルドメイン(配列番号4)又はEコイルドメイン(配列番号3)であり、また前記ドメイン2はペプチドリンカー(配列番号2)によって前記ドメイン1から分離されており、かつ前記第1のポリペプチド鎖の前記ドメイン2及び前記第2のポリペプチド鎖の前記ドメイン2は、両方がEコイルドメインではなく、又は両方がKコイルドメインではない、ドメイン2と
    を含み、
    C.第3のポリペプチド鎖は、N末端からC末端方向へ向かって、ドメイン3を含み、ドメイン3は、
    (1)システイン含有ペプチド(ペプチド1)(配列番号39)を含むサブドメイン(3A)、及び
    (2)IgG免疫グロブリンFcドメインのCH2ドメイン及びCH3ドメインを有する、IgGのFcドメインのポリペプチド部分を含むサブドメイン(3B)を含み、
    かつ、
    (a)前記第1及び第3のポリペプチド鎖のIgGのFcドメインの前記ポリペプチド部分は、IgGのFcドメインを形成し、
    (b)前記第1のポリペプチド鎖の前記VLドメイン及び前記第2のポリペプチド鎖の前記VHドメインは、gpA33のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成し、
    (c)前記第2のポリペプチド鎖の前記VLドメイン及び前記第1のポリペプチド鎖の前記VHドメインは、CD3のエピトープに特異的に結合できる抗原結合ドメインを形成する、ダイアボディ。
  5. 前記第1のポリペプチド鎖の前記サブドメイン(3B)が、前記第3のポリペプチド鎖の前記サブドメイン(3B)の配列とは異なる配列を含む、請求項3又は4に記載のダイアボディ。
  6. 前記第1のポリペプチド鎖の前記サブドメイン(3B)が配列番号40のアミノ酸配列を有し、前記第3のポリペプチド鎖の前記サブドメイン(3B)が配列番号41のアミノ酸配列を有する、請求項5に記載のダイアボディ。
  7. 前記第1のポリペプチド鎖の前記サブドメイン(3B)が配列番号41のアミノ酸配列を有し、前記第3のポリペプチド鎖の前記サブドメイン(3B)が配列番号40のアミノ酸配列を有する、請求項5に記載のダイアボディ。
  8. 前記第1のポリペプチド鎖の前記ドメイン3及び/又は前記第3のポリペプチド鎖の前記ドメイン3が、Fcγ受容体に対する結合の変化を示す改変体CH2−CH3の配列を含む、請求項3又は4に記載のダイアボディ。
  9. 前記第1のポリペプチド鎖の前記ドメイン2がEコイルドメイン(配列番号3)を含み、前記第2のポリペプチド鎖の前記ドメイン2がKコイルドメイン(配列番号4)を含む、請求項1乃至8の何れか1項に記載のダイアボディ。
  10. 前記第1のポリペプチド鎖の前記ドメイン2がKコイルドメイン(配列番号4)を含み、前記第2のポリペプチド鎖の前記ドメイン2がEコイルドメイン(配列番号3)を含む、請求項1乃至8の何れか1項に記載のダイアボディ。
  11. CD3のエピトープ及びgpA33のエピトープに特異的に結合できる二重特異性1価ダイアボディに関し、前記二重特異性1価ダイアボディは、
    (1)配列番号28のアミノ酸配列を有する第1のポリペプチド鎖、及び配列番号30のアミノ酸配列を有する第2のポリペプチド鎖、又は
    (2)配列番号35のアミノ酸配列を有する第1のポリペプチド鎖、及び配列番号30のアミノ酸配列を有する第2のポリペプチド鎖
    を含み、前記第1及び第2のポリペプチド鎖は、ジスルフィド結合によって互いに共有結合する、ダイアボディ。
  12. CD3のエピトープ及びgpA33のエピトープに特異的に結合できる二重特異性1価Fcダイアボディに関し、前記二重特異性1価Fcダイアボディは、
    (1)配列番号42のアミノ酸配列を有する第1のポリペプチド鎖、配列番号44のアミノ酸配列を有する第2のポリペプチド鎖、及び配列番号46のアミノ酸配列を有する第2のポリペプチド鎖、又は
    (2)配列番号48のアミノ酸配列を有する第1のポリペプチド鎖、配列番号28のアミノ酸配列を有する第2のポリペプチド鎖、及び配列番号46のアミノ酸配列を有する第2のポリペプチド鎖
    を含み、前記第1及び第2のポリペプチド鎖は、第1のジスルフィド結合によって互いに共有結合し、前記第1及び第3のポリペプチド鎖は、第2のジスルフィド結合によって互いに共有結合する、ダイアボディ。
  13. 請求項1乃至12の何れか1項に記載のダイアボディ及び生理学的に許容可能なキャリアを含む、医薬組成物。
  14. gpA33の発現を特徴とする癌治療するための薬剤の製造における、請求項1乃至12の何れか1項に記載のダイアボディ又は請求項3に記載の医薬組成物の使用。
  15. 前記癌は、大腸癌、結腸癌、胃癌又は膵臓癌である、請求項14に記載の使用。
  16. 請求項1乃至12の何れか1項に記載のダイアボディの何れかのポリペプチド鎖を発現する細胞
  17. 請求項16に記載のポリペプチドをエンコードするポリヌクレオチド。
  18. 抗体又はポリペプチド部分又はそのフラグメントを発現する細胞に関し、抗体はgpA33と結合し、抗体又はポリペプチド部分又はそのフラグメントは、
    (1)抗ヒトgpA33抗体の軽鎖のCDR1(配列番号14)、CDR2(配列番号15)及びCDR3(配列番号16)、
    (2)抗ヒトgpA33抗体の重鎖のCDR1(配列番号18)、CDR2(配列番号19)及びCDR3(配列番号20)、又は
    (3)(1)及び(2)の両方
    を含む、細胞。
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