提高植物对低氧条件抗性的方法
本发明提供用于提高植物对低氧或无氧条件抗性的方法。这类方法可用于促进植物根穿透生长培养基或土壤。本发明的方法可包括对植物基因组的修饰,所述修饰通过对植物提供外源胁迫耐受性基因或对应于这类外源基因的内源基因的胁迫耐受性变体。本发明的方法也可包括对植物或其生境,或对其细胞或种子使用新烟碱类化合物(neonicotinoid compound),例如但不限于吡虫啉(imidacloprid)、烯啶虫胺(nitenpyram)、啶虫脒(acetamiprid)、噻虫啉(thiacloprid)、噻虫嗪(thiamethoxam)、可尼丁(clothianidin)和呋虫胺(dinotefuran)。特别有效的新烟碱类化合物是包含氯吡啶(chloropyridine)侧链的新烟碱类化合物,例如吡虫啉、烯啶虫胺、啶虫脒和噻虫啉,特别是其在植物中的降解能够释放6-氯烟酸(6-chloronicotininc acid,6-CNA)的那些新烟碱类化合物,像例如吡虫啉和噻虫啉。植物或其生境也可直接用6-CNA处理。
背景技术
改造为胁迫耐受的植物为本领域所已知。植物细胞和植物的胁迫耐受性可例如通过降低内源聚-ADP-核糖聚合酶(PARP)或聚(ADP-核糖)糖原水解酶(PARG)的活性或水平实现,其分别描述于WO 00/04173和WO04/090140中。
欧洲专利申请No.04077624.7描述了使用下述核苷酸序列例如在植物中过表达来实现植物和植物细胞的胁迫耐受性,所述核苷酸编码参与NAD补救合成途径和/或NAD从头合成途径的酶。
然而,这些文件均没有公开使用其中提到的胁迫耐受性基因在植物细胞和植物中获得对低氧或无氧条件的耐受性的可能性。它们也没有公开其中所述胁迫耐受性基因用于下述目的的用途:允许植物的根系更深地穿透进入生长培养基或土壤中。
除昆虫控制外,新烟碱类化合物在植物中其他目的的应用也是本领域已知的(WO 01/26468,WO 03/096811)。
WO 01/26468公开了改善植物生长的方法,其包括向植物或其所在地应用至少一种选自新烟碱类的化合物。
WO03/096811描述了在下述地点的农学植物的产量和/或活力可以通过用新烟碱类化合物处理植物的种子来提高或改进,所述地点中虫害水平低于所指示的需要使用杀虫剂用于昆虫控制目的的水平。所述方法被认为适用于非转基因植物和具有外源基因的植物,所述外源基因编码经修饰的苏云金杆菌(Bacillus thuringiensis)δ-内毒素蛋白质的产生。
然而,这些文件均未描述为了提高植物细胞或植物对低氧或无氧条件的耐受性,或允许植物的根系更深地穿透进入生长培养基或土壤的目的,将新烟碱类化合物用于植物的用途。
因此,本领域仍未涉及增加植物根系或根进入生长培养基或土壤的穿透深度,或提高植物细胞或植物对低氧或无氧胁迫条件的耐受性的方法,所述方法如下文在不同的实施方案和权利要求中所述使用胁迫耐受性基因,或通过对植物或其细胞使用新烟碱类化合物。
发明概述
本发明的一个实施方案提供提高植物细胞或植物对低氧或无氧条件耐受性的新方法,所述方法包括向植物细胞或植物提供胁迫耐受性增强转基因,其中所述胁迫耐受性增强转基因选自:
-能够降低植物内源PARP基因表达的胁迫耐受性增强转基因,特别是其中所述转基因编码PARP抑制性RNA分子;
-能够降低植物内源PARG基因表达的胁迫耐受性增强转基因,特别是其中所述转基因编码PARG抑制性RNA分子;或
-编码烟酰胺腺嘌呤二核苷酸补救合成途径的植物功能酶的胁迫耐受性增强转基因,所述酶选自烟酰胺酶、烟酸盐/酯磷酸核糖基转移酶(nicotinate phosphoribosyltransferase)、烟酸单核苷酸腺嘌呤基转移酶或烟酰胺腺嘌呤二核苷酸合成酶。
在另一实施方案中,本发明涉及这类胁迫耐受性增强转基因促进植物根穿透生长培养基(包括土壤)的用途。
本发明的另一实施方案提供用于提高植物细胞或植物对低氧或无氧条件耐受性的方法,其包括向植物细胞、植物,或将长成此类植物的种子或其生境使用有效量的新烟碱类化合物。
在另一实施方案中,本发明涉及这类化合物促进植物根穿透生长培养基(包括土壤)的用途。
本发明还涉及用于提高植物细胞或植物对低氧或无氧条件耐受性的方法,包括将有效量的6-氯烟酸提供给所述植物的细胞的步骤。
本发明还涉及6-CNA用于促进植物根穿透进入生长培养基中的用途。
附图说明
图1:测量生长于琼脂溶液中的植物根深的测定法的示意图。用透明的或半透明的生长培养基(3)填充带有封口(2)的容器(1),所述生长培养基为例如0.4%的琼脂-水或0.7%的琼脂-水,其中可添加额外的测试化合物。向管中加入一粒预萌发的种子,并允许其生长三周。在垂直位置生长三周后,从培养基顶部到根的最低点测量植物(4)的根深(5)。
图2:拟南芥(Arabidopsis thaliana)cv.Col-0植物根深(mm)的箱状图示,所述植物与非转基因拟南芥植物(Col-0)相比包含转基因,所述转基因编码能够降低内源PARP2基因表达的dsRNA分子。
分析以下种群:
·Col-0:数据指示野生型拟南芥株系
·427-16:数据指示对强光胁迫条件具有弱耐受性的包含抗PARP2基因的拟南芥转基因株系
·427-20:数据指示对强光胁迫条件具有弱耐受性的包含抗PARP2基因的拟南芥转基因株系
·427-20:数据指示对强光胁迫条件具有中等耐受性的包含抗PARP2基因的拟南芥转基因株系
该图左侧表示了各组值的代表性箱状图(或箱状图和须盒图),所述值总结了以下的统计学测量:
-中位数
-上四分位和下四分位数
-最小和最大数据值。
另外,在各组数值的右边,指示这些数值的均值和均值标准差。
箱状图解释如下:
-箱自身包含中间50%的数据。箱的上缘(接合处)指出数据集的第75百分位数,下接合处指出第25百分位数。中间两个四分位数的范围已知为四分位数间距。
-箱中的线指示数据的中位值。
-须的末端指示最大和最小的数据值,存在异常值(outlier)的情况除外,在这种情况下须延伸至在1.5倍四分位数间距的范围内最近的值点。
图3:拟南芥cv.Col-0植物根深(mm)测量值的箱状示意图和均值标准差,所述植物包含转基因,所述转基因编码能够降低内源PARP基因表达的dsRNA分子。
分析以下种群:
·Col-0:数据指示野生型拟南芥株系
·427-22:数据指示对强光胁迫条件具有高耐受性的包含抗PARP2基因的拟南芥转基因株系
·427-24:数据指示对强光胁迫条件具有低耐受性的包含抗PARP2基因的拟南芥转基因株系
图4:拟南芥cv.C24植物根深(mm)测量值的箱状示意图和均值标准差,所述植物包含转基因,所述转基因编码能够降低内源PARP基因表达的dsRNA分子。
分析了以下种群:
·C24:数据指示野生型拟南芥株系
·1599:数据指示对强光胁迫条件具有高耐受性的包含抗PARP2基因的拟南芥转基因株系
·1463:数据指示对强光胁迫条件具有中等耐受性的包含抗PARP2基因的拟南芥转基因株系
·1681:数据指示对强光胁迫条件具有中等耐受性的包含抗PARP1基因的拟南芥转基因株系
·1690:数据指示对强光胁迫条件具有中等耐受性的包含抗PARP1基因的拟南芥转基因株系
图5:对待分离抗PARP2转基因的拟南芥Col-0种群测量的根深(mm)测量值的箱状示意图和均值标准差。
分析了以下的种群:
·不成对的(Azygous):数据指示来自不含有抗PARP2基因的种群的拟南芥植物
·转基因的:数据指示来自含有抗PARP2基因的种群的拟南芥植物
图6:用多种浓度的吡虫啉处理的拟南芥cv.C24植物与未处理的拟南芥cv.C24植物相比,根深(mm)测量值的箱状示意图和均值标准差。
分析了以下的种群:
·0:未处理的拟南芥C24植物
·50:用50毫克/升吡虫啉处理的拟南芥C24植物
·100:用100毫克/升吡虫啉处理的拟南芥C24植物
图7:用多种浓度的6-氯烟酸处理的拟南芥cv.C24植物与未处理的拟南芥cv.C24植物相比,根深(mm)测量值的箱状示意图和均值标准差。
分析了以下的种群:
·0:未处理的拟南芥C24植物
·1:用1毫克/升6-氯烟酸处理的拟南芥C24植物
·5:用5毫克/升6-氯烟酸处理的拟南芥C24植物
发明详述
本发明基于以下的认识:包含胁迫耐受性基因(例如编码下述dsRNA的嵌合基因,所述dsRNA目的在于使植物parp1或parp2基因的表达沉默)的植物产生了下述根系,所述根系的根与对照植物的根相比伸入生长培养基中更深。如现有技术所述,包含胁迫耐受性基因的植物根穿透更深的现象仍未被注意,并需要开发如本文所述的具体测定法用于统计学分析根进入培养基的穿透性。
尽管不意图将本发明限制于具体的作用方式,仍认为胁迫耐受性基因提高植物细胞的耐受性(包括根的植物细胞对低氧和无氧条件的耐受性),从而允许包含这类胁迫耐受性基因的根在较不良好的氧条件下生长,如可在生长培养基的更深区域或更深的土壤层中发现,那里氧张力更低。植物根系进入更深土壤层的提高的穿透性部分地解释了在野外条件下对含有本文所述胁迫耐受性基因(例如下述dsRNA,所述dsRNA编码使内源parp1或parp2基因表达沉默的基因)所观察到的植物提高的干旱抗性。
添加新烟碱类化合物或6-氯烟酸后,可在所述测定法中观察到根伸长的类似效应。新烟碱类的使用对根生长深度的效应与昆虫的存在无关,所述昆虫是上述新烟碱类的靶标。因此,该效应也与植物或植物细胞或长成植物的种子的胁迫耐受性(特别是与低氧或无氧相关的胁迫耐受性)的生物化学改良相关。
因此,在第一个实施方案中,本发明指向胁迫耐受性增强转基因提高植物细胞、植物或种子对低氧或无氧条件的耐受性的用途。
本文使用的“低氧或无氧条件”是指植物细胞、植物或这类植物的部分所暴露的条件,其中氧的可用性低或非常低。无氧条件是指几乎不能获得氧的条件。一般地,溶解氧浓度低于约2毫克/升的条件被称为低氧(0.1毫克/升到2毫克/升),溶解氧低于0.1毫克/升,特别是低于0.05毫克/升的条件被称为无氧。水中正常溶解的氧浓度为约8毫克/升。土壤中的低氧条件是指氧张力低的条件,特别是土壤大气中氧降至低于5%的条件。
低氧条件可发生于植物或植物部分被淹没时。低氧条件还可发生于氧消耗高时,例如在包含大量微生物代谢过程中的有机碎屑的土壤层中。另外,低氧条件发生于生长培养基的较深层,其中氧从表面发生扩散。低氧条件还发生于土壤较深层,因为氧扩散和导致的氧张力比表面降低。氧减少的速率取决于土壤的紧密度(compactness)(土壤越紧密,存在的土壤大气越少)、分解中的有机材料的存在、水含量等。
本文使用的“胁迫耐受性增强转基因”是指这样的转基因,即当所述转基因被引入植物细胞或植物中,或在植物细胞或植物中表达时,给细胞或植物提供更好的胁迫耐受性,所述胁迫耐受性例如通过使用化合物(除草剂、杀真菌剂、杀虫剂、植物生长调节剂、佐剂、肥料)、暴露于非生物胁迫(例如干旱、水涝、淹没、强光条件、强UV辐射、提高的过氧化氢水平、极端(高或低)温度、臭氧及其他大气污染物、土壤盐度或重金属、低氧、无氧等等)或生物胁迫(例如病原体或害虫感染,包括真菌感染、病毒感染、细菌感染、昆虫感染、线虫感染、支原体感染和支原体样生物感染等)而被赋予植物。
这类胁迫耐受性增强转基因可以是如WO 00/04173或EP04077984.5(在本文引用作为参考)中所述的,能够降低植物细胞或植物中多聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)基因的表达和/或活性的转基因。
多聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)也称为多聚(ADP-核糖)转移酶(ADPRT)(EC 2.4.2.30),是发现于多数真核生物中的核酶,所述真核生物包括脊椎动物、节肢动物、软体动物、粘菌类(slime mould)、沟编藻类(dinoflagellates)、真菌和除酵母外的其他低等真核生物。所述酶活性也已在大量植物中得到证明(Payne等人,1976;Willmitzer和Wagner,1982;Chen等人,1994;O′Farrell,1995)
PARP主要催化来自NAD+的ADP-核糖部分向靶蛋白中谷氨酸残基的羧基的转化,以及随后的ADP-核糖聚合作用。主要的靶蛋白是PARP自身,但是组蛋白、高迁移率类染色体蛋白质(high mobility groupchromosomal protein)、拓扑异构酶、内切核酸酶和DNA聚合酶也显示为可受到此修饰。
作为具体的实施方案,胁迫耐受性增强转基因可包含以下有效连接的DNA片段:
a)植物可表达的启动子;
b)被转录后得到下述RNA分子的DNA区,所述RNA分子(PARP抑制性RNA分子)能够降低植物的内源PARP编码基因的表达;
c)参与转录终止和多聚腺苷酸化的DNA区。
所述DNA区转录后可产生所谓的反义RNA分子,所述反义RNA分子以转录方式或转录后方式降低靶植物或靶植物细胞中PARP编码基因的表达,所述反义RNA分子包含至少20或21个连续的核苷酸,所述连续核苷酸与所述植物细胞或植物中存在的PARP编码基因核苷酸序列的互补序列具有至少95%到100%的序列同一性。
所述DNA区还可产生所谓的有义RNA分子,所述有义RNA分子以转录方式或转录后方式降低靶植物或靶植物细胞中PARP编码基因的表达,所述有义RNA分子包含至少20或21个连续的核苷酸,所述连续核苷酸与所述植物细胞或植物中存在的PARP编码基因的核苷酸序列具有至少95%到100%的序列同一性。
然而,约20nt的PARP编码区的反义或有义RNA区的最小核苷酸序列可以包含在更大的RNA分子中,所述更大RNA分子的大小在20nt到与靶基因尺寸相等的长度间变化。因此,所述反义或有义核苷酸区可以是约21nt到约5000nt长,例如长度为21nt、40nt、50nt、100nt、200nt、300nt、500nt、1000nt、2000nt或甚至约5000nt或更长。另外,本发明的目的不要求所使用的抑制性PARP RNA分子的核苷酸序列或转基因的编码区与内源PARP基因完全相同或互补,所述内源PARP基因的表达被靶向以在植物细胞中降低。序列越长,对整体序列同一性的要求越不严格。因此,有义或反义区可以具有与内源PARP基因或其互补序列的核苷酸序列约40%或50%或60%或70%或80%或90%或100%的整体序列同一性。然而如前文所述,反义或有义区应当包含20个连续核苷酸的核苷酸序列,其与内源PARP基因的核苷酸序列具有约100%的序列同一性。优选地,约100%序列同一性的一段序列应当是约50、75或100nt。
就本发明的目的而言,以百分比表示的两个相关核苷酸序列的“序列同一性”是指两个最佳比对的序列中具有相同残基的位置数除以所比较的位置数(×100%)。空位被认为是具有不相同残基的位置,即一个序列存在残基而另一个序列中不存在该残基的比对中的位置。两个序列的比对通过Needleman和Wunsch算法(Needleman和Wunsch 1970)计算机辅助序列比对进行,可使用标准软件程序如GAP(其为Wisconsin Package 10.1版本(Genetics Computer Group,Madison,Wisconsin,美国)的一部分),使用默认评分矩阵(空位产生罚分50和空位延伸罚分3)来便利地进行。
应当明白一旦参照相应DNA分子的核苷酸序列定义RNA分子的核苷酸序列时,核苷酸序列中的胸腺嘧啶(T)应当用尿嘧啶(U)代替。本申请的上下文会明确是参照用RNA还是DNA。
上述转基因降低内源PARP基因表达的效力可以通过包含DNA元件而被进一步增强,所述DNA元件导致异常的、未多聚腺苷酸化的PARP抑制性RNA分子的表达。适用于该目的的一个这类DNA元件为如WO00/01133 A1中所述的编码自我剪接核酶的DNA区。
如WO 99/53050 A1中所述,上述转基因降低植物细胞内源PARP基因表达的效力还可通过如下方式进一步增强:在一个植物细胞中同时包括本文所述编码反义PARP抑制性RNA分子的转基因和本文所述编码有义PARP抑制性RNA分子的转基因,其中所述反义和有义PARP抑制性RNA分子能够通过所述至少20个连续核苷酸之间的碱基配对形成双链RNA区。
如在WO 99/53050 A1中所进一步描述的,能够形成双链RNA区的有义和反义PARP抑制性RNA区可以存在于一个RNA分子中,优选地被间隔区分离。间隔区可包含内含子序列。这类转基因可如下所述便利地构建:将反向重复序列中包含来自分离的或鉴定的内源PARP基因的至少20个核苷酸的DNA片段(其表达被靶向降低)与植物可表达的启动子和参与转录终止和多聚腺苷酸化的3’末端形成区有效地连接。为了实现这类转基因的构建,可使用WO 02/059294 A1中描述的载体。
现有的命名法将经典的含锌指的聚合酶称作PARP1蛋白质(和相应的parp1基因),而结构上非经典的PARP蛋白质现在被称为PARP2(和相应的parp2基因),本文使用的“PARP编码基因”可指二者中的任一类型。
以下的实验性鉴定证实的和假定的多聚ADP-核糖聚合酶蛋白质序列、其部分或同源序列的数据库登录号(在本文引用作为参考)可以根据本发明使用:BAD53855(稻(Oryza sativa));BAD52929(稻);XP_477671(稻);BAC84104(稻);AAT25850(玉米(Zea mays));AAT25849(玉米);NP_197639(拟南芥);NP_850165(拟南芥);NP_188107(拟南芥);NP_850586(拟南芥);BAB09119(拟南芥);AAD20677(拟南芥);Q11207(拟南芥);C84719(拟南芥);T51353(拟南芥);T01311(拟南芥);AAN12901(拟南芥);AAM13882(拟南芥);CAB80732(拟南芥);CAA10482(拟南芥);AAC79704(玉米):AAC19283(拟南芥);CAA10888(玉米);CAA10889(玉米);CAA88288(拟南芥)。
作为本发明具体的实施方案,降低PARP基因表达的基因可包含以下有效连接的DNA片段:
a)植物可表达的启动子;
b)被转录后产生RNA分子的DNA区,所述RNA分子包含:
a.反义核苷酸序列,其包含至少约20个连续的核苷酸,所述连续的核苷酸与选自以下的约20个连续核苷酸的核苷酸序列具有约96%的序列同一性:SEQ ID 1(拟南芥parp1编码区)、SEQ ID 2(拟南芥parp2编码区)、SEQ ID 3(玉米parp1编码区)、SEQ ID 4(另一玉米parp1编码区)、SEQ ID 5(玉米parp2编码区)或SEQ ID 6(棉花parp2部分cDNA)的核苷酸序列或编码蛋白质的核苷酸序列,所述蛋白质具有与所述核苷酸序列编码的氨基酸序列相似或相同的氨基酸序列。
b.有义核苷酸序列,其包含至少约20个与反义核苷酸序列互补的核苷酸。因此,有义核苷酸序列可包含至少约20个连续核苷酸的序列,所述序列与选自以下的约20个连续核苷酸的核苷酸序列具有约96%的序列同一性:SEQ ID 1(拟南芥parp1编码区)、SEQ ID 2(拟南芥parp2编码区)、SEQ ID 3(玉米parp1编码区)、SEQ ID 4(另一玉米parp1编码区)、SEQ ID5(玉米parp2编码区)或SEQ ID 6(棉花parp2部分cDNA)的核苷酸序列或编码蛋白质的核苷酸序列,所述蛋白质具有与所述核苷酸序列编码的氨基酸序列相似或相同的氨基酸序列;
其中有义和反义核苷酸序列能够形成双链RNA分子(dsRNA);
c)用于转录终止和多聚腺苷酸化的DNA区。
然而,应当明白可使用如WO 00/04173或EP 04077984.5中描述的其他降低PARP基因表达的基因。
在本发明的另一实施方案中,胁迫耐受性增强转基因可以是能够降低植物或植物细胞的PARG编码基因表达和/或活性的转基因,如WO2004/090140(在本文引用作为参考)中所述。
PARG(多聚(ADP-核糖)糖原水解酶;E.C.3.2.1.143)通过其外切糖苷酶和内切糖苷酶活性(PARG)将聚(ADP-核糖)聚合物转化为游离的ADP-核糖。
在植物中,通过基于基因图谱对野生型基因的克隆而鉴定了聚(ADP-核糖)糖原水解酶在突变体中失活,所述突变体受到拟南芥中时钟控制基因转录和从植物性生长到开花的光周期依赖性转换(tej)的影响。该基因的核苷酸序列可以在登录号AF394690(Panda等人,2002Dev.Cell.3,51-61;SEQ ID No 7)下从核苷酸数据库中获得。
其他来自植物的植物PARG编码基因的核苷酸序列以及从其他植物分离其他PARG编码基因及其变体的方法可见于WO 2004/090140 A2,该核苷酸序列例如来自马铃薯(Solanum tuberosum)的PARG基因(SEQ ID No8);稻(SEQ ID No 9)或玉米(SEQ ID No 10)。
因此,在一个实施方案中,被改造为抗胁迫的植物或植物细胞可包含以下有效连接的DNA片段:
a)植物可表达的启动子;
b)当被转录后产生抑制性RNA分子的DNA区,所述RNA分子包含:
i.反义核苷酸区,其包含至少约20个连续的核苷酸,所述连续的核苷酸与选自以下的约20个连续核苷酸的核苷酸序列具有至少96%的序列同一性:编码植物PARG蛋白的核苷酸序列(例如SEQ ID 7、SEQ ID 8、SEQ ID 9或SEQ ID 10的核苷酸序列)的互补序列,或编码蛋白质的核苷酸序列,所述蛋白质具有与所述核苷酸序列相似或相同的氨基酸序列;或
ii.有义核苷酸区,其包含至少约20个选自以下的连续核苷酸:编码植物PARG蛋白质的核苷酸序列(例如SEQ ID 7、SEQ ID 8、SEQ ID 9或SEQ ID 10的核苷酸序列),或编码蛋白质的核苷酸序列,所述蛋白质具有与所述核苷酸序列相似或相同的氨基酸序列;或
iii.如i)或ii)所述的反义和有义核苷酸序列,其中所述反义和有义核苷酸序列能够形成双链RNA分子;
c)参与转录终止和聚腺苷酸化的DNA区。
本领域技术人员将立刻可以明白,有义和反义核苷酸序列或dsRNA分子的长度,以及ParG抑制性RNA分子的序列同一性的其他参数可如上所述用于PARP抑制性RNA分子。
本发明的另一实施方案中,胁迫耐受性增强转基因可以是编码烟酰胺腺嘌呤二核苷酸补救合成途径的植物功能酶的转基因。因此,胁迫耐受性增强基因可包含以下如EP 04077624.7中所述(在本文引用作为参考)的有效连接的DNA分子:
a)植物可表达的启动子;
b)编码烟酰胺腺嘌呤二核苷酸补救合成途径的植物功能酶的DNA区,所述酶选自烟酰胺酶、烟酸盐/酯磷酸核糖基转移酶、烟酸单核苷酸腺嘌呤基转移酶或烟酰胺腺嘌呤二核苷酸合成酶;和
c)参与转录终止和聚腺苷酸化的3’末端区。
本文使用的“烟酰胺腺嘌呤二核苷酸补救合成途径的植物功能酶”是这样的酶,即当将其引入植物中、与合适的调控元件(例如植物可表达的启动子和终止子区)连接后能够在植物细胞中被转录并翻译而产生有功能的NAD补救合成途径的酶。该酶包括得自植物来源的来自NAD补救合成的酶(和编码基因),以及得自酵母(酿酒酵母(Saccharomyces cereviseae))或得自其他酵母或真菌的酶。认为后面的蛋白质甚至可更适用于本发明的方法,因为它们较不可能受到酶反馈调节等,而类似的来自植物的酶可受到所述调节。
参与NAD补救合成途径的酶包括以下:
-烟酰胺酶(EC 3.5.1.19),其催化烟酰胺的酰胺基水解,从而释放烟酸根和NH3。该酶也已知为烟酰胺脱氨酶、烟酰胺酰胺酶、YNDase或烟酰胺酰胺水解酶;
-烟酸盐/酯磷酸核糖基转移酶(EC 2.4.2.11),其也已知为烟酸核糖核苷酸酶、烟酸单核苷酸糖原水解酶;烟酸单核苷酸焦磷酸化酶;烟酸磷酸核糖基转移酶;其催化以下反应
烟酸盐/酯-D-核糖核苷酸+二磷酸盐=烟酸盐/酯+5-磷酸-α-D核糖1-二磷酸盐
-烟酸核苷酸腺苷酰基转移酶(EC 2.7.7.18)也已知为去酰胺-NAD+焦磷酸化酶;烟酸单核苷酸腺苷酰基转移酶;去酰胺烟酰胺腺嘌呤二核苷酸焦磷酸化酶;NaMT-ATase;烟酸单核苷酸腺苷酰基转移酶;其催化以下反应
ATP+烟酸核糖核苷酸=二磷酸盐+去酰胺基-NAD+
-NAD-合酶(EC 6.3.1.5),也已知为NAD合成酶;NAD+合酶;烟酰胺腺嘌呤二核苷酸合成酶;二磷酸吡啶核苷酸合成酶;其催化以下反应
去酰胺基-NAD++ATP+NH3=AMP+二磷酸盐+NAD+
在本发明的一个实施方案中,编码NAD补救合成途径的植物功能酶的DNA区可包含来自SEQ ID No 11、12、13、14或15的核苷酸序列或编码下述蛋白质的核苷酸序列,所述蛋白质具有与上述核苷酸序列所编码的蛋白质相似或相同的氢基酸序列。
如Hunt等,2004所述,这些酶的植物同源物已被鉴定,且这些DNA序列可被用于相似的效应(Hunt等人,2004,New Phytologistl63(l):31-44)。经鉴定的DNA序列具有以下的登录号:烟酰胺酶为At5g23220(SEQ ID No16);At5g23230(SEQ ID No 17)和At3gl6190(SEQ ID No 18);烟酸盐/酯磷酸核糖基转移酶为At4g36940(SEQ ID No 19)、At2g23420(SEQ ID No20),烟酸单核苷酸腺嘌呤基转移酶为At5g55810(SEQ ID No 21),NAD合成酶为At1g55090(SEQ ID No 22)。
然而,应当明白被改造为抗胁迫的植物也可包含这些核苷酸序列的变体,其包括插入、缺失和取代。同样的,可使用来自除酿酒酵母以外物种的所述核苷酸序列的同源物。这些包括但不仅限于来自植物的核苷酸序列,和编码具有相同氨基酸序列的蛋白质的核苷酸序列,以及这类核苷酸序列的变体。
所述核苷酸序列的变体与经鉴定的核苷酸序列(其编码来自NAD补救补救途径的酶,例如序列表中鉴别的序列)应具有优选至少约80%,或85%或90%或95%的序列同一性。优选这些变体将编码功能性蛋白质,其具有与来自NAD补救途径的酶相同的酶活性。
阅读上文对胁迫耐受性增强转基因提高植物细胞、植物或种子对低氧或无氧条件耐受性的本发明用途的描述后,本领域技术人员会立刻明白可使用对应这类胁迫耐受性增强转基因的内源基因的变体获得相似的效应,所述变体使得带有这类变体的植物细胞或植物有更高的胁迫耐受性。举例而言,植物内源parp2基因的变体(其具有更低的表达水平,并给具有该变体的植物提供提高的胁迫耐受性)可以以与降低内源parp2基因表达的转基因相似的方式使用。这类变体基因可通过育种技术被引入植物细胞或植物。
本领域技术人员也会明白不同胁迫耐受性增强基因或转基因的表达可引起一群不同的事件,这显示不同的效应分布——从几乎没有效应到非常显著的效应。然而,本领域技术人员显然能够区分、鉴别或分离最适应需要的群体代表。
另一实施方案本发明提供用于促进植物根穿透进入生长培养基或土壤的方法,其包括对植物提供胁迫耐受性增强转基因或这些胁迫耐受性增强转基因的内源变体,如本文在其不同的实施方案中所述的那些。
本文使用的“植物根伸长”或“植物根穿透进入生长培养基或土壤”是指从生长培养基表面到根的最低点所测量的根在固体生长培养基(包括土壤)中生长的深度(也参见图1)。
通常,“植物根伸长或穿透的提高”是指从培养基表面到根生长的最低点所测量的生长培养基中根生长深度的至少统计学显著的提高,其也可测量为野生型参照植物根深与被改造为胁迫耐受的植物根深的比较中的差异,或测量为用特别的化合物处理的植物根深与未处理植物根深的比较中的差异。
为了正确理解本发明,明白以下内容是重要的:通过本发明方法达到的植物根系更深地穿透进入生长培养基或土壤中不等于根系在体积或干重或鲜重上的提高。事实上,根系的体积可被显著提高,但是根全部处在生长培养基或土壤表面下非常浅表处。相反,根据本发明处理的植物根在尺寸、体积、重量或甚至长度上可以是相等的,但是更深地伸入生长培养基或土壤的表面下。
本文使用的“生长培养基”旨在涉及适用于植物生长的任何培养基,包括土壤。这类培养基包括固化的或凝胶化的液体,例如水-琼脂、泥炭(peat)、草炭(turf)、不同类型的土壤等。
在另一实施方案中,本发明指向新烟碱类化合物提高植物细胞、植物或种子对低氧或无氧条件耐受性的用途。因此,本发明提供用来提高植物细胞、植物或种子对低氧或无氧条件耐受性的方法,其包括对植物细胞、植物、种子或植物的生境或对生长培养基使用有效量的式(I)的新烟碱类化合物的步骤。
其中
Het表示杂环,所述杂环在各情况下任选被氟、氯、甲基或乙基单取代或多取代,所述杂环选自下组杂环:
吡啶-3-基、吡啶-5-基、3-吡啶基(pyridinio)、1-氧化-5-吡啶基(1-oxido-5-pyridinio)、1-氧化-5-吡啶基、四氢呋喃-3-基、噻唑-5-基,
A表示C1-C6-烷基、-N(R1)(R2)或S(R2),
其中
R1表示氢、C1-C6-烷基、苯基-C1-C4-烷基、C3-C6-环烷基、C2-C6-链烯基或C2-C6-炔基,且
R2表示C1-C6-烷基、C2-C6-链烯基、C2-C6-炔基、-C(=O)-CH3或苄基,
R表示氢、C1-C6-烷基、C2-C6-链烯基、C2-C6-炔基、-C(=O)-CH3或苄基,或与R2一起表示以下基团:
-CH2-CH2-、-CH2-CH2-CH2-、-CH2-O-CH2-、-CH2-S-CH2-、-CH2-NH-CH2-、-CH2-N(CH3)-CH2-,且
X表示N-NO2、N-CN或CH-NO2。
在每种情况下,只要可能,饱和的或不饱和的烃基(例如烷基或链烯基)可以是直链的或支链的,其包括与杂原子组合例如烷氧基。
这些化合物已知具有杀昆虫的活性(参阅例如EP-A1-192 606、EP-A2-580 533、EP-A2-376 279、EP-A2-235 725)。
可以被提到的式(I)的化合物为″The Pesticide Manual″,第13版,2003(British Crop Protection Council)中所列的新烟碱类。
一种化合物为例如从EP A1 0 192 060已知的式
的吡虫啉。
另一种化合物为例如从EP A2 0 302 389已知的式
的烯啶虫胺。
另一种化合物为从例如WO A1 91/04965已知的式
的啶虫脒。
另一种化合物为例如从EP A2 0 235 725已知的式
的噻虫啉。
另一种化合物是例如从EP A2 0 580 553已知的式
的噻虫嗪。
另一种化合物是例如从EP A2 0 376 279已知的式
的可尼丁。
另一种化合物是例如从EP A1 0 649 845已知的式
的呋虫胺。
特别适用于本发明的是式(2)的化合物,其中取代基″Het″表示氯吡啶基,例如吡虫啉、烯啶虫胺、啶虫脒和噻虫啉
特别优选的化合物是吡虫啉和噻虫啉。
在上述带有6-氯烟酸基团的新烟碱类(例如吡虫啉、烯啶虫胺和噻虫啉)的降解中,6-氯烟酸可被释放。例如,吡虫啉被逐步降解为初级代谢产物6-氯烟酸,其最后降解为二氧化碳。发现该代谢物也促进植物或植物细胞或长成此类植物的种子的胁迫耐受性和健康,所述植物或植物细胞或长成此类植物的种子被改造为耐胁迫,并也可根据本发明的方法使用。
确定上述新烟碱类在植物中或特定植物中降解时是否释放6-CNA的一种方法由Placke和Weber描述(Pflanzenschutz-Nachrichten Bayer46/1993,2 109-182)。
因此,在本发明的另一实施方案中,描述了可用于提高植物细胞或植物或其部分对低氧或无氧条件耐受性的方法,所述方法包括步骤:对所述植物,对植物细胞或对长成所述植物的种子提供有效量的式(3)
的6-氯烟酸(烟酸,CAS NO:5326-23-8)。
可通过向植物细胞、植物、种子和/或其生境直接应用式(3)的化合物来向植物细胞、植物或种子提供有效量的6-氯烟酸。然而,也可通过提供化合物(例如上述化合物)向植物提供6-CNA,所述化合物可被植物代谢产生代谢物6-CNA。
应当立刻明白上述化合物也可被用于提高植物根穿透进入生长培养基或土壤中,其包括步骤:向植物细胞、植物或种子或向植物的生境或向生长培养基提供有效量的式(I)的新烟碱类化合物(例如包含氯吡啶侧链的式(I)的新烟碱类化合物,特别是能够在植物中被代谢产生6-can,包含氯吡啶侧链的式(I)的新烟碱类化合物,包括吡虫啉或噻虫啉),或向植物细胞、植物或种子或向植物的生境或向生长培养基提供6-CNA。
本发明的优点之一在于本发明化合物和包含所述化合物的组合物的全身性特性,即用这些组合物处理植物的种子就足够促进萌发中的植物和萌发后产生的植物的根伸长。
在本发明的另一实施方案中,描述了适用于促进植物根伸长的方法,其包括向所述植物和/或其生境、向植物细胞或长成所述植物的种子应用有效量的组合物,所述组合物包含式(I)的化合物。
因此,本发明还涉及组合物,所述组合物包含用于本发明的这类组合物用途的式(I)化合物。
式(I)的化合物也可用于与其他活性化合物(例如商业有用制剂形式的或从这类制剂制备的应用形式的杀虫剂、杀细菌剂、杀螨剂、杀真菌剂等)的混合物中。可进行混合以获得下述组合物,所述组合物除了根据本发明促进植物根伸长外,也抗可能存在的害虫。可以使用的杀虫剂为例如有机磷剂、氨基甲酸酯剂、羧化物类化学品、氯化烃类化学品、通过微生物产生的杀虫物质等。
在许多情况下,这引起协同效应,即混合物的活性超出单个成分的活性。这类制剂和应用形式在商业和生态学上是特别有用的,因为通常可以使用更低量的活性成分。但是,增效剂本身不必须有活性,只要其能够增强活性化合物的作用即可。
与其他已知活性化合物(例如除草剂)或与安全剂、肥料和生长调节剂的混合物也是可能的。
根据本发明用活性化合物对植物和植物部分的处理是直接进行的,或通过常规处理方法允许化合物对其周边、环境或储存空间起作用,所述常规处理方法例如通过浸入、喷雾、蒸发、雾化、分散、涂抹,和在繁殖材料的情况下(特别是在种子的情况下)还通过应用一层或多层涂层。
活性化合物可以被转化为常规制剂,例如溶液剂、乳剂、可湿性散剂、混悬剂、粉剂、粉尘、糊剂、可溶性散剂、颗粒剂、悬浮液-乳剂浓缩物、浸渍过活性化合物的天然和合成材料,以及聚合物物质中的微胶囊。
本发明活性化合物在商业有用制剂或应用形式中的含量可在宽泛的范围内变化。从商业制剂制备的使用形式的活性化合物含量可在宽泛的限定内变化。
这些制剂以已知的方式提供,例如通过将活性化合物与补充剂(即液体溶剂和/或固体载体)混合,任选地使用表面活性剂(即乳化剂和/或分散剂)和成泡剂。
如果使用的补充剂为水,也可能使用例如有机溶剂作为助溶剂。本质上,合适的液体溶剂为:芳香剂(如二甲苯、甲苯或烷基萘),氯化的芳香剂或氯化的脂肪烃如氯苯、氯乙烯或二氯甲烷;脂肪烃如环己烷或石蜡,例如石油级分、矿物质和植物油;醇如丁醇或二醇及其醚和酯;酮如丙酮、甲基乙基酮、甲基异丁基酮或环己酮;强极性溶剂如二甲基甲酰胺和二甲基亚砜,以及水。
合适的固体载体为:例如铵盐和地面天然矿物质如高岭土、粘土、滑石、白垩、石英、石绒、蒙脱土或硅藻土,以及地面合成矿物质如高度分散的二氧化硅、氧化铝和硅酸盐;用于颗粒的合适固体载体为:例如被压碎并分级的天然石头如方解石、大理石、浮石、海泡石和白云石,还有无机和有机粉的合成颗粒,以及有机材料(如锯屑、椰壳、玉米棒子和烟草茎)的颗粒;合适的乳化剂和/或成泡剂为:例如非离子的和阴离子的乳化剂如聚氧乙烯脂肪酸酯、聚氧乙烯脂肪醇醚例如烷基芳基聚乙二醇醚、烷基磺酸盐、烷基硫酸酯、芳基磺酸酯,还有蛋白质水解产物;合适的分散剂为:例如亚硫酸化木素废液和甲基纤维素。
制剂中可以使用增粘剂,如羧甲基纤维素和粉末、颗粒或乳液状的天然和合成的聚合物(如阿拉伯树胶、聚乙烯醇和聚乙酸乙烯酯)以及天然磷脂(如脑磷脂和卵磷脂)和合成的磷脂。其他添加物可以是矿物质和植物油。
可能使用着色剂如无机色素(例如氧化铁、二氧化钛和普鲁士蓝)和有机染料(如茜素染料、偶氮染料和金属酞菁染料),和微量营养(如铁、锰、硼、铜、钴、钼和锌的盐)。
制剂通常包含0.1wt%和98wt%之间的活性化合物,优选在0.1wt%和90wt%之间,特别优选在0.5wt%和70wt%之间的活性化合物。
在某些应用率下,新烟碱类化合物和6-CNA对根生长深度的影响特别强烈显著。然而,活性化合物的应用率可在相对宽泛的范围内变化。通常应用率为每公顷1g到1600g活性化合物,优选每公顷10g到800g活性化合物,特别优选每公顷10g到600g活性化合物。
如前文所述,本发明涉及适用于促进植物根伸长进入生长培养基中或提高对低氧条件耐受性的方法,所述方法包括对植物繁殖材料(包括长成植物的种子)使用有效量的包含式(I)化合物的组合物。可在种植前处理植物的繁殖材料,例如可在播种前处理(dress)种子。本发明的化合物也可通过下述方式使用于种子粒上:用液体制剂浸渍种子粒或用固体制剂包被种子粒。当繁殖材料被种植时,例如在播种时,也可将组合物应用于种植部位。
就处理植物繁殖材料(如种子)而言,偏好的应用率通常为每100kg待处理材料用0.1到1000g,特别是1到800g,优选10到500g的新烟碱类化合物之一或6-CNA。
所有的植物和植物部分可根据本发明被处理。植物部分应当被理解为所有地上和地下部分,和植物器官(如枝、叶、花和根),可以提到的实例为叶、针叶、柄、茎、花、子实体、果实、种子、根、块茎和根茎。植物部分也包括收获的材料和营养繁殖材料和有性繁殖材料,例如插条、块茎、根茎、短匍茎和种子。它们还包括植物细胞,例如可用于或得自根据本发明对植物细胞的转化。也可能将上述化合物应用于土壤上或土壤中,例如在种植或播种前应用以达到所述效应,例如增强种植后的植物和萌发的植物的胁迫耐受性,所述萌发的植物是从被播种进经处理土壤中的种子生长而来。
也应立即明白本发明的方法(包括使用胁迫耐受性增强转基因或胁迫耐受性增强内源变体)可以与本发明的方法(包括使用新烟碱类化合物或6-CNA)组合,在提高对低氧或无氧条件耐受性的方面,或在提高生长培养基或土壤中植物根深的方面产生额外的和协同的效应。
本发明的方法可适合于任何植物——双子叶和单子叶植物,包括但不限于棉花、芸苔属(Brassica)植物、欧洲油菜、小麦、谷物或玉米、大麦、向日葵、稻、燕麦、甘蔗、大豆、蔬菜(包括菊苣、莴苣、番茄)、烟草、马铃薯、甜菜、木瓜、菠萝、芒果、拟南芥,但是也包括用于园艺、花卉或林业的植物,谷物植物包括小麦、燕麦、大麦、黑麦、稻、草坪草、高粱、粟或甘蔗植物。本发明的方法也可用于任何植物,包括但不仅限于棉花、烟草、油菜、欧洲油菜、大豆、蔬菜、马铃薯、浮萍属物种(Lemna spp.)、烟草属物种(Nicotiana spp.)、甘薯、拟南芥、苜蓿、大麦、豆类、谷物、棉花、亚麻、豌豆、油菜、稻、黑麦、红花、高粱、大豆、向日葵、烟草、小麦、天门冬属、甜菜、花茎甘蓝、卷心菜、胡萝卜、花椰菜、芹菜、黄瓜、茄子、莴苣、洋葱、欧洲油菜、胡椒、马铃薯、西葫芦、萝卜属、菠菜属、南瓜、番茄、美洲南瓜(zucchini)、扁桃、苹果、杏属、香蕉、黑莓、越桔属、可可树、樱桃、椰子、大果越桔、海枣、葡萄属、葡萄柚、番石榴属、猕猴桃树、柠檬、来檬、芒果、瓜(melon)、油桃、橙、番木瓜属、西番莲果、桃、花生、梨、菠萝、阿月浑子(pistachio)、李子(plum)、覆盆子(raspberry)、草莓、柑橘、胡桃和西瓜。
将本文使用的“包含”解释为说明所述被涉及的特征、整体、步骤或成分的存在,但是不排除存在或添加一种或多种特征、整体、步骤或成分或其集合。因此,例如包含核苷酸或氨基酸序列的核酸或蛋白质可包含除事实上引用的核苷酸或氨基酸之外的更多核苷酸或氨基酸,即位于更大的核酸或蛋白质中。包含功能或结构上定义的DNA区的转基因可包含额外的DNA区等。
除非在实施例中另有说明,所有的重组DNA技术根据如Sambrook等人(1989)Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第二版,ColdSpring Harbor Laboratory Press,NY和Ausubel等人(1994)CurrentProtocols in Molecular Biology,Current Protocols,美国的第1卷和第2卷中所述的标准方案完成。用于植物分子操作的标准材料和方法由R.D.D.Croy描述于Plant Molecular Biology Labfax(1993),其由BIOS ScientificPublications Ltd(英国)和Blackwell Scientific Publications,英国联合出版。用于标准分子生物学技术的其他参考资料包括Sambrook和Russell(2001)Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第三版,Cold SpringHarbor Laboratory Press,NY,Brown(1998)Molecular Biology LabFax,第二版,Academic Press(英国)的第I卷和第II卷。用于聚合酶链式反应的标准材料和方法可见于Dieffenbach和Dveksler(1995)PCR Primer:ALaboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press和McPherson等人(2000)PCR-Basics:From Background to Bench,第一版,SpringerVerlag,德国。
在说明书和实施例全文中参考以下序列:
SEQ ID No.1:来自拟南芥的parp1编码区
SEQ ID No.2:来自拟南芥的parp2编码区
SEQ ID No.3:来自玉米的parp1编码区1
SEQ ID No.4:来自玉米的parp1编码区2
SEQ ID No.5:来自玉米的parp2编码区
SEQ ID No.6:来自棉花的parp2部分编码区
SEQ ID No.7:来自拟南芥的parG编码区
SEQ ID No.8:来自马铃薯(Solanum tuberosum)的parG编码区
SEQ ID No.9:来自稻的parG编码区
SEQ ID No.10:来自玉米的parG编码区
SEQ ID No.11:来自酿酒酵母的烟酰胺酶(PNC1)的核苷酸序列
SEQ ID No.12:来自酿酒酵母的烟酸盐/酯磷酸核糖基转移酶(NPT1)的核苷酸序列(互补序列)
SEQ ID No.13:来自酿酒酵母的烟酸单核苷酸腺嘌呤基转移酶1(NMA1)的核苷酸序列
SEQ ID No.14:来自酿酒酵母的烟酸单核苷酸腺嘌呤基转移酶2(NMA2)的核苷酸序列
SEQ ID No.15:来自酿酒酵母的NAD合成酶(QNS1)的核苷酸序列
SEQ ID No.16:来自拟南芥的烟酰胺酶的核苷酸序列(同种型1)
SEQ ID No.17:来自拟南芥的烟酰胺酶的核苷酸序列(同种型2)
SEQ ID No.18:来自拟南芥的烟酰胺酶的核苷酸序列(同种型3)
SEQ ID No.19:来自拟南芥的烟酸盐/酯磷酸核糖基转移酶的核苷酸序列(同种型1)
SEQ ID No.20:来自拟南芥的烟酸盐/酯磷酸核糖基转移酶的核苷酸序列(同种型2)
SEQ ID No.21:来自拟南芥的烟酸单核苷酸腺嘌呤基转移酶的核苷酸序列
SEQ ID No.22:来自拟南芥的NAD合成酶的核苷酸序列
实施例
实施例1:用于测量生长培养基中拟南芥根生长深度的方案
培养基:
萌发培养基:一半浓度的Murashige和Skoog盐;维生素B5;1.5%蔗糖;pH 5.8;0.4%Difco琼脂。
拟南芥植物
拟南芥种子灭菌:70%乙醇2分钟;漂白剂(6%活性氯)+1滴Tween 20配成20ml溶液10分钟;用无菌自来水洗涤5次;在2ml微量离心管中进行灭菌。拟南芥种子沉到管底,允许借助于1ml自动移液器去除液体。
种子预萌发:在含有10ml无菌自来水的9厘米Optilux培养皿(Falcon)中弱光过夜至24小时。
拟南芥植物生长:将种子播种于含±34ml萌发培养基的具有天然(透明)有色盖子(Sigma C5791)的25×150毫米玻璃管(Sigma C5916)中:1个种子/管。将管置于40管的试管架(VWR nalg5970-0025)外面两行中,用铝箔包好使得根能够在黑暗中生长。植物在23℃培养。30-50μEinstein s-1m-2。12小时光照-12小时黑暗。(见图1)。
测量根深
三周后,从培养基表面到根生长的最深点测量根深。(见图1)。
实施例2:包含了增强胁迫耐受性的转基因的拟南芥植物根生长深度
的分析
如实施例1中所述培养包含如WO 00/04173 A1中所述(例如在其实施例8中)的转基因的拟南芥植物,所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP1或PARP2基因的表达。
三周后,测量转基因植物的根深并与以相似方式培养的非转基因对照植物或非转基因同基因植物的根深比较。
在第一个实验中,将包含转基因的拟南芥cv.Col-0植物的多种种群与非转基因拟南芥cv.Col-0植物的非转基因种群比较,所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP2基因的表达(株系427-16和427-20显示对强光胁迫的弱耐受性,株系427-19显示对强光胁迫的中等耐受性)。
对测量结果进行统计学分析,概括在表1中,表1也表示了均值、标准偏差和置信区间。
与非转基因拟南芥cv.Col-0对照植物相比,对强光胁迫条件具有最高耐受性的转基因拟南芥植物(株系427-19)的根统计学显著地伸入生长培养基中更深(99%置信水平)(见图2和表1)。
表1:与非转基因拟南芥cv.Col-0植物比较,包含转基因的拟南芥cv.Col-0植物的根深(mm),所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP2基因的表达
|
Col-0 |
427-16 |
427-19 |
427-20 |
均值 |
25.173611 |
26.388889 |
27.42 |
24.942029 |
标准偏差 |
3.64166 |
3.422548 |
3.361185 |
3.69174 |
标准误差 |
0.429174 |
0.46575 |
0.388116 |
0.444433 |
95%置信 |
0.858348 |
0.94128 |
0.776233 |
0.888866 |
99%置信 |
1.141602 |
1.259388 |
1.032389* |
1.182192 |
*p<0.01
在另一实施方案中,将包含转基因并对强光胁迫有耐受性的转基因拟南芥cv.Col-0植物的种群(株系427-22)与含有相似的转基因但是对强光胁迫敏感的转基因株系(株系427-24),以及非转基因拟南芥cv.Col-0对照植物比较,其中所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP2基因的表达。
对测量结果进行统计学分析,总结在表2中,表2也表示了均值、标准偏差和置信区间。
与拟南芥cv.Col-0对照植物的根和胁迫敏感的转基因拟南芥Col-0植物株系(株系427-24)的根相比,胁迫耐受的转基因株系(株系427-22)的转基因拟南芥cv.Col-0植物的根伸入生长培养基(包含0.7%(代替0.4%)的Difco琼脂而)中更深(见图3和表2)。
表2:与非转基因拟南芥cv.Col-0植物比较,包含转基因的拟南芥cv.Col-0植物的根深(mm),所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP2基因的表达
|
Col-0 |
427-22 |
427-24 |
均值 |
18.291339 |
21.146154 |
17.384058 |
标准偏差 |
2.928677 |
5.368981 |
2.740149 |
标准误差 |
0.259878 |
0.66594 |
0.329875 |
95%置信 |
0.514558 |
1.33188 |
0.65975 |
99%置信 |
0.680101 |
1.771401* |
0.877468 |
*p<0.01
在另一实施方案中,分析以下种群:
C24:野生型拟南芥株系;株系1599:包含抗-PARP2转基因的对强光胁迫条件具有高耐受性的拟南芥转基因株系;株系1463:包含抗-PARP2转基因的对强光胁迫条件具有中等耐受性的拟南芥转基因株系;株系1681:包含抗-PARP1基因的对强光胁迫条件具有中等耐受性的拟南芥转基因株系;和株系1690:包含抗-PARP1基因的对强光胁迫条件具有中等耐受性的拟南芥转基因株系。株系1599的胁迫耐受性非常高,株系1463、1681和1690的胁迫耐受性从中等到高等变化。
将测量结果进行统计学分析,并总结于表3中,表3表示均值、标准偏差和置信区间。
与非转基因拟南芥cv.C24对照植物相比,包含转基因的转基因拟南芥cv.C24植物的根伸入生长培养基中更深,其中所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP1基因(株系1681和1690)或PARP2基因(株系1599和1463)的表达(见图4和表3)。
表3:与非转基因拟南芥cv.C24植物相比,包含转基因的拟南芥cv.C24植物的根深(mm),所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP1或PARP2基因的表达
|
C24 |
1599 |
1463 |
1681 |
1690 |
均值 |
16.18 |
18.125 |
17.405063 |
17.433333 |
17.897727 |
标准偏差 |
2.192181 |
2.992481 |
2.16036 |
2.112246 |
1.885007 |
标准误差 |
0.219218 |
0.451133 |
0.243059 |
0.27269 |
0.284175 |
95%置信 |
0.438436 |
0.911741 |
0.486119 |
0.551106 |
0.574319 |
99%置信 |
0.58312 |
1.219865* |
0.646538* |
0.737353* |
0.76841* |
*p<0.01
在另一实施方案中,分析包含转基因并对强光胁迫具有高度耐受性的转基因拟南芥cv.Col-0株系的1∶1分离群体,其中所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP2基因的表达。转基因的存在通过PCR分析证实。
与来自株系427-19的不成对的拟南芥cv.Col-0植物相比,包含转基因的植物具有伸入生长培养基中更深的根(见图5和表4)。
表4:与不成对的拟南芥cv.Col-0植物相比,包含转基因的拟南芥cv.Col-0植物的根深(mm),所述转基因编码dsRNA分子,所述dsRNA分子能够降低内源PARP2基因的表达
|
不成对的427-19 |
转基因的427-19 |
均值 |
25.296512 |
27.38172 |
标准偏差 |
3.573907 |
3.244894 |
标准误差 |
0.385384 |
0.33648 |
95%置信 |
0.770769 |
0.67296 |
99%置信 |
1.025122 |
0.895036* |
*p<0.01
实施例3:应用吡虫啉后拟南芥植物根生长深度的分析
如实施例1所述将拟南芥cv.C24植物在包含多种浓度吡虫啉(0、50和100毫克/升)的萌发培养基(含0.7%(代替0.4%)的Difco琼脂)上培养。三周后测量用50和100毫克/升吡虫啉处理的植物根的深度,并与以相同方式培养的未处理植物的根的深度比较。
与未处理的拟南芥植物的根相比,经处理拟南芥植物的根伸入生长培养基中更深(见图6和表5)。
表5:与未用吡虫啉处理的拟南芥cv.C24植物相比,用50和100毫克/升吡虫啉处理的拟南芥cv.C24植物的根深(mm)
|
0毫克/升 |
50毫克/升 |
100毫克/升 |
均值 |
1.9475 |
2.1875 |
2.2725 |
标准偏差 |
0.289714 |
0.353508 |
0.456072 |
标准误差 |
0.037402 |
0.045638 |
0.058879 |
95%置信 |
0.075589 |
0.092234 |
0.118994 |
99%置信 |
0.101135 |
0.123404* |
0.159208* |
*p<0.01
实施例4:应用6-氯烟酸(6-CNA)后拟南芥植物根生长深度的分析
如实施例1所述将拟南芥cv.C24植物在包含多种浓度6-CNA(0、1和5毫克/升)的萌发培养基上培养。三周后测量用1和5毫克/升6-CNA处理的植物根的深度,并与以相同方式培养的未用6-CNA处理的植物的根的深度比较。
与未处理的拟南芥植物的根相比,经处理植物的根伸入生长培养基中更深(见图7和表6)。
表6:与未用6-CNA处理的拟南芥cv.Col-0植物相比,用1和5毫克/升6-CNA处理的拟南芥cv.C24植物的根深(mm)
|
0毫克/升 |
1毫克/升 |
5毫克/升 |
均值 |
2.031034 |
2.179661 |
2.118367 |
标准偏差 |
0.189373 |
0.186418 |
0.237762 |
标准误差 |
0.024866 |
0.02427 |
0.033966 |
95%置信 |
0.050254 |
0.049049 |
0.068645** |
99%置信 |
0.067237 |
0.065625* |
0.091844 |
*p<0.01
**p<0.05
序列表
<110>拜尔生物科学公司
<120>提高植物对低氧条件抗性的方法
<130>BCS 05-2015
<150>EP 05076392.9
<151>2005-06-15
<150>US 60/691,103
<151>2005-06-16
<160>22
<170>PatentIn版本3.3
<210>1
<211>3187
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自拟南芥(Arabidopsis thaliana)的parp1编码区
<220>
<221>misc_feature
<222>(11)..(2962)
<223>可读框
<400>1
taccggagaa atggcaagcc cacataagcc gtggagggcg gagtatgcaa agtcgtcgag 60
gtcttcatgt aaaacttgca agtccgtcat taacaaggag aactttcgtc ttggaaagtt 120
ggttcaatct actcacttcg atggcatcat gcccatgtgg aaccatgctt cttgtatact 180
gaagaagacg aagcagataa aatcagttga tgatgttgaa ggcatagaat cacttcgttg 240
ggaagatcag caaaagatta gaaaatatgt cgaatctgga gcagggagta acacaagcac 300
aagcacaggc acaagcacga gcagtaccgc taataatgcc aaactagaat atgggattga 360
agtgtcacaa acttcccgtg ccggttgcag aaagtgtagc gaaaagatct tgaaaggaga 420
ggtacgtata ttctccaagc ctgaaggccc gggtaacaaa ggtttgatgt ggcatcacgc 480
taaatgtttc cttgaaatgt cttcctctac tgaactggaa agtttgtctg gatggagaag 540
tataccagac tcagaccaag aagctcttct tcccttagtg aagaaagctc tgccggcagc 600
caaaactgag acagcagaag cacgtcaaac aaattcaaga gcaggcacaa aacgaaaaaa 660
tgattctgtt gataacgaga agtcgaaact agcaaaaagt agttttgaca tgtctacaag 720
tggtgcttta caaccttgta gcaaagaaaa ggaaatggag gcccaaacta aggaattgtg 780
ggacctgaag gatgatctga aaaaatatgt aacatcagct gagttgcggg aaatgcttga 840
agtaaatgaa caaagtacaa gaggatctga acttgatctg cgtgataaat gtgctgatgg 900
catgatgttt ggcccactcg ctctctgccc aatgtgctct gggcatcttt ctttctccgg 960
aggactttac cgatgccatg gatacatctc agaatggagc aaatgttctc attccacttt 1020
ggatccagac cgcatcaaag ggaagtggaa aatccctgac gaaacagaaa atcaattcct 1080
tctgaagtgg aataagtctc aaaagagtgt gaagccaaaa cgtattctgc gtcctgtatt 1140
gtctggcgag acatctcagg gtcaaggttc taaagatgca actgactcct caaggagtga 1200
aaggctagca gatcttaaag tttcaattgc tggaaatact aaggaaaggc aaccatggaa 1260
gaagagaatt gaggaagctg gtgcagagtt tcatgctaat gttaaaaaag gtacaagctg 1320
tttggttgtt tgtggactga cagatatcag agacgctgaa atgagaaagg caaggaggat 1380
gaaagtggca atcgtgagag aggattattt ggttgattgt tttaaaaaac agaggaaact 1440
tccatttgac aagtacaaaa ttgaagacac tagtgagagc cttgtcactg ttaaagtaaa 1500
aggacgaagc gctgtgcatg aagcgtctgg cctccaagag cactgtcaca ttcttgaaga 1560
tgggaacagt atctataaca caactctgag catgtctgat ctctctaccg gtatcaatag 1620
ttattacata ctccagataa tccaagaaga taaaggttca gattgttacg tatttcgtaa 1680
atggggccga gttggaaatg aaaagattgg tggtaacaaa gtggaggaaa tgtcaaagtc 1740
tgatgcggtt cacgaattca aacgtctatt tcttgaaaaa accggaaaca catgggaatc 1800
ttgggaacaa aaaacgaatt tccagaaaca acctggaaaa tttctcccgt tggacattga 1860
ttatggagtt aataagcaag tagccaaaaa agagccattt cagaccagta gcaaccttgc 1920
tccatcatta atagaattga tgaagatgct ttttgatgtg gaaacttaca gatctgcaat 1980
gatggagttc gagataaata tgtcagagat gccacttggg aagctcagca aacataatat 2040
acagaagggt tttgaggcat tgacggagat acagaggcta ttgactgaaa gcgaccccca 2100
gcctactatg aaagaaagct tgcttgttga tgctagtaac agatttttta ccatgatccc 2160
ttctattcat cctcatatta tccgagatga agatgacttt aagtcaaagg tgaaaatgct 2220
cgaggctctg caggatatcg aaatagcttc aagaatagtt ggctttgatg ttgatagcac 2280
cgaatctctt gatgataagt ataagaagct gcattgcgat atctcaccac ttcctcatga 2340
tagcgaagat tatcgattaa tcgagaagta tcttaacaca actcatgccc caacgcatac 2400
agagtggagt cttgagctag aggaagtttt tgctcttgaa agagaaggag agtttgataa 2460
atatgctccc cacagagaaa aacttggcaa taagatgctc ctatggcatg gttctcgatt 2520
aacgaatttt gttggaatat tgaaccaagg actgagaatt gcacctccag aagctcctgc 2580
tactggttac atgtttggaa aagggatata ctttgctgac cttgtcagta aaagtgctca 2640
gtactgctac acttgtaaga aaaatccggt gggtctaatg cttctgagtg aagttgcatt 2700
gggagaaata catgagctaa caaaagctaa gtatatggat aaacctccga gagggaaaca 2760
ctcgaccaaa gggctcggca agaaagtgcc tcaagattcc gagtttgcca agtggagagg 2820
tgatgtgact gttccctgtg gaaaacctgt ttcatcaaag gtcaaggctt ctgagcttat 2880
gtacaatgag tatatcgtct acgatacagc ccaggtgaag ttgcagttct tgttgaaagt 2940
aaggtttaag cacaagagat gagcctgaac caaacaagaa gacgtcactt ctgttaacta 3000
aatgtttttt tgggaaatcg aatccaacac gaagacttaa cttttgtaac taaattgctt 3060
ttgataaatt gaattcaaca tgtagtcaca gatttaactc tctggcgttg tagatgtttc 3120
tggttttaaa agagcgtact ctacattttg ttatgctttt tctcagtaat gacacttctt 3180
aagactt 3187
<210>2
<211>2147
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自拟南芥的parp2编码区
<220>
<221>misc_feature
<222>(129)..(2042)
<223>可读框
<400>2
attgatgaag aagaaaacga agaagaagac tcttcaaatg ctcgcgcgaa ctcacttctg 60
acgaaaacca tacttcctca gtctcattcc ctttccgacg aactattctc ctgaagaaga 120
agacgaaaat ggcgaacaag ctcaaagtcg acgaactccg tttaaaactc gccgagcgtg 180
gactcagtac tactggagtc aaagccgttc tggtggagag gcttgaagag gctatcgcag 240
aagacactaa gaaggaagaa tcaaagagca agaggaaaag aaattcttct aatgatactt 300
atgaatcgaa caaattgatt gcaattggcg aatttcgtgg gatgattgtg aaggaattgc 360
gtgaggaagc tattaagaga ggcttagata caacaggaac caaaaaggat cttcttgaga 420
ggctttgcaa tgatgctaat aacgtttcca atgcaccagt caaatccagt aatgggacag 480
atgaagctga agatgacaac aatggctttg aagaagaaaa gaaagaagag aaaatcgtaa 540
ccgcgacaaa gaagggtgca gcggtgctag atcagtggat tcctgatgag ataaagagtc 600
agtaccatgt tctacaaagg ggtgatgatg tttatgatgc tatcttaaat cagacaaatg 660
tcagggataa taataacaag ttctttgtcc tacaagtcct agagtcggat agtaaaaaga 720
catacatggt ttacactaga tggggaagag ttggtgtgaa aggacaaagt aagctagatg 780
ggccttatga ctcatgggat cgtgcgatag agatatttac caataagttc aatgacaaga 840
caaagaatta ttggtctgac agaaaggagt ttatcccaca tcccaagtcc tatacatggc 900
tcgaaatgga ttacggaaaa gaggaaaatg attcaccggt caataatgat attccgagtt 960
catcttccga agttaaacct gaacaatcaa aactagatac tcgggttgcc aagttcatct 1020
ctcttatatg taatgtcagc atgatggcac agcatatgat ggaaatagga tataacgcta 1080
acaaattgcc actcggcaag ataagcaagt ccacaatttc aaagggttat gaagtgctga 1140
agagaatatc ggaggtgatt gaccggtatg atagaacgag gcttgaggaa ctgagtggag 1200
agttctacac agtgatacct catgattttg gttttaagaa aatgagtcag tttgttatag 1260
acactcctca aaagttgaaa cagaaaattg aaatggttga agcattaggt gaaattgaac 1320
tcgcaacaaa gttgttgtcc gtcgacccgg gattgcagga tgatccttta tattatcact 1380
accagcaact taattgtggt ttgacgccag taggaaatga ttcagaggag ttctctatgg 1440
ttgctaatta catggagaac actcatgcaa agacgcattc gggatatacg gttgagattg 1500
cccaactatt tagagcttcg agagctgttg aagctgatcg attccaacag ttttcaagtt 1560
cgaagaacag gatgctactc tggcacggtt cacgtctcac taactgggct ggtattttat 1620
ctcaaggtct gcgaatagct cctcctgaag cgcctgtaac tggttacatg tttggaaaag 1680
gggtttactt tgcggatatg ttctccaaga gtgcgaacta ttgctatgcc aacactggcg 1740
ctaatgatgg cgttctgctc ctctgcgagg ttgctttggg agacatgaat gaacttctgt 1800
attcagatta taacgcggat aatctacccc cgggaaagct aagcacaaaa ggtgtgggga 1860
aaacagcacc aaacccatca gaggctcaaa cactagaaga cggtgttgtt gttccacttg 1920
gcaaaccagt ggaacgttca tgctccaagg ggatgttgtt gtacaacgaa tatatagtct 1980
acaatgtgga acaaatcaag atgcgttatg tgatccaagt caaattcaac tacaagcact 2040
aaaacttatg tatattagct tttgaacatc aactaattat ccaaaaatca gcgttttatt 2100
gtatttcttt caaactcctt catctctgat tttgcacggt tcactcg 2147
<210>3
<211>3211
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自玉米(Zea mays)的parp1编码区1
<220>
<221>misc_feature
<222>(113)..(3022)
<223>可读框
<400>3
acctacctga atacgtcatc cctaagtgtt ccgcttcctc tgtcgtccgg cctccaactc 60
catcgaaggg gctagggaga ggagggaacc cgaaccacag caggccggcg caatggcggc 120
gccgccaaag gcgtggaagg cggagtatgc caagtctggg cgggcctcgt gcaagtcatg 180
ccggtcccct atcgccaagg accagctccg tcttggcaag atggttcagg cgtcacagtt 240
cgacggcttc atgccgatgt ggaaccatgc cagcgttgac gatgttgaag ggatagatgc 300
acttagatgg gatgatcaag agaagatacg aaactacgtt gggagtgcct cagctggtac 360
aagttctaca gctgctcctc ctgagaaatg tacaattgag attgctccat ctgcccgtac 420
ttcatgtaga cgatgcagtg aaaagattac aaaaggatcg gtccgtcttt cagctaagct 480
tgagagtgaa ggtcccaagg gtataccatg gtatcatgcc aactgtttct ttgaggtatc 540
cccgtctgca actgttgaga agttctcagg ctgggatact ttgtccgatg aggataagag 600
aaccatgctc gatcttgtta aaaaagatgt tggcaacaat gaacaaaata agggttccaa 660
gcgcaagaaa agtgaaaatg atattgatag ctacaaatcc gccaggttag atgaaagtac 720
atctgaaggt acagtgcgaa acaaagggca acttgtagac ccacgtggtt ccaatactag 780
ttcagctgat atccaactaa agcttaagga gcaaagtgac acactttgga agttaaagga 840
tggacttaag actcatgtat cggctgctga attaagggat atgcttgagg ctaatgggca 900
ggatacatca ggaccagaaa ggcacctatt ggatcgctgt gcggatggaa tgatatttgg 960
agcgctgggt ccttgcccag tctgtgctaa tggcatgtac tattataatg gtcagtacca 1020
atgcagtggt aatgtgtcag agtggtccaa gtgtacatac tctgccacag aacctgtccg 1080
cgttaagaag aagtggcaaa ttccacatgg aacaaagaat gattacctta tgaagtggtt 1140
caaatctcaa aaggttaaga aaccagagag ggttcttcca ccaatgtcac ctgagaaatc 1200
tggaagtaaa gcaactcaga gaacatcatt gctgtcttct aaagggttgg ataaattaag 1260
gttttctgtt gtaggacaat caaaagaagc agcaaatgag tggattgaga agctcaaact 1320
tgctggtgcc aacttctatg ccagggttgt caaagatatt gattgtttaa ttgcatgtgg 1380
tgagctcgac aatgaaaatg ctgaagtcag gaaagcaagg aggctgaaga taccaattgt 1440
aagggagggt tacattggag aatgtgttaa aaagaacaaa atgctgccat ttgatttgta 1500
taaactagag aatgccttag agtcctcaaa aggcagtact gtcactgtta aagttaaggg 1560
ccgaagtgct gttcatgagt cctctggttt gcaagatact gctcacattc ttgaagatgg 1620
gaaaagcata tacaatgcaa ccttaaacat gtctgacctg gcactaggtg tgaacagcta 1680
ctatgtactc cagatcattg aacaggatga tgggtctgag tgctacgtat ttcgtaagtg 1740
gggacgggtt gggagtgaga aaattggagg gcaaaaactg gaggagatgt caaaaactga 1800
ggcaatcaag gaattcaaaa gattatttct tgagaagact ggaaactcat gggaagcttg 1860
ggaatgtaaa accaattttc ggaagcagcc tgggagattt tacccacttg atgttgatta 1920
tggtgttaag aaagcaccaa aacggaaaga tatcagtgaa atgaaaagtt ctcttgctcc 1980
tcaattgcta gaactcatga agatgctttt caatgtggag acatatagag ctgctatgat 2040
ggaatttgaa attaatatgt cagaaatgcc tcttgggaag ctaagcaagg aaaatattga 2100
gaaaggattt gaagcattaa ctgagataca gaatttattg aaggacaccg ctgatcaagc 2160
actggctgtt agagaaagct taattgttgc tgcgagcaat cgctttttca ctcttatccc 2220
ttctattcat cctcatatta tacgggatga ggatgatttg atgatcaaag cgaaaatgct 2280
tgaagctctg caggatattg aaattgcttc aaagatagtt ggcttcgata gcgacagtga 2340
tgaatctctt gatgataaat atatgaaact tcactgtgac atcaccccgc tggctcacga 2400
tagtgaagat tacaagttaa ttgagcagta tctcctcaac acacatgctc ctactcacaa 2460
ggactggtcg ctggaactgg aggaagtttt ttcacttgat cgagatggag aacttaataa 2520
gtactcaaga tataaaaata atctgcataa caagatgcta ttatggcacg gttcaaggtt 2580
gacgaatttt gtgggaattc ttagtcaagg gctaagaatt gcacctcctg aggcacctgt 2640
tactggctat atgttcggca aaggcctcta ctttgcagat ctagtaagca agagcgcaca 2700
atactgttat gtggatagga ataatcctgt aggtttgatg cttctttctg aggttgcttt 2760
aggagacatg tatgaactaa agaaagccac gtccatggac aaacctccaa gagggaagca 2820
ttcgaccaag ggattaggca aaaccgtgcc actggagtca gagtttgtga agtggaggga 2880
tgatgtcgta gttccctgcg gcaagccggt gccatcatca attaggagct ctgaactcat 2940
gtacaatgag tacatcgtct acaacacatc ccaggtgaag atgcagttct tgctgaaggt 3000
gcgtttccat cacaagaggt agctgggaga ctaggcaagt agagttggaa ggtagagaag 3060
cagagttagg cgatgcctct tttggtatta ttagtaagcc tggcatgtat ttatgggtgc 3120
tcgcgcttga tccattttgg taagtgttgc ttgggcatca gcgcgaatag caccaatcac 3180
acacttttac ctaatgacgt tttactgtat a 3211
<210>4
<211>3212
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自玉米的parp1编码区2
<220>
<221>misc_feature
<222>(81)..(3020)
<223>可读框
<400>4
gcttcctctg tcgtccggcc tccaactcca tcgaaggggc tagggagagg agggaacccg 60
aaccacagca ggccggcgca atggcggcgc cgccaaaggc gtggaaggcg gagtatgcca 120
agtctgggcg ggcctcgtgc aagtcatgcc ggtcccctat cgccaaggac cagctccgtc 180
ttggcaagat ggttcaggcg tcacagttcg acggcttcat gccgatgtgg aaccatgcca 240
ggtgcatctt cagcaagaag aaccagataa aatccgttga cgatgttgaa gggatagatg 300
cacttagatg ggatgatcaa gagaagatac gaaactacgt tgggagtgcc tcagctggta 360
caagttctac agctgctcct cctgagaaat gtacaattga gattgctcca tctgcccgta 420
cttcatgtag acgatgcagt gaaaagatta caaaaggatc ggtccgtctt tcagctaagc 480
ttgagagtga aggtcccaag ggtataccat ggtatcatgc caactgtttc tttgaggtat 540
ccccgtctgc aactgttgag aagttctcag gctgggatac tttgtccgat gaggataaga 600
gaaccatgct cgatcttgtt aaaaaagatg ttggcaacaa tgaacaaaat aagggttcca 660
agcgcaagaa aagtgaaaat gatattgata gctacaaatc cgccaggtta gatgaaagta 720
catctgaagg tacagtgcga aacaaagggc aacttgtaga cccacgtggt tccaatacta 780
gttcagctga tatccaacta aagcttaagg agcaaagtga cacactttgg aagttaaagg 840
atggacttaa gactcatgta tcggctgctg aattaaggga tatgcttgag gctaatgggc 900
aggatacatc aggaccagaa aggcacctat tggatcgctg tgcggatgga atgatatttg 960
gagcgctggg tccttgccca gtctgtgcta atggcatgta ctattataat ggtcagtacc 1020
aatgcagtgg taatgtgtca gagtggtcca agtgtacata ctctgccaca gaacctgtcc 1080
gcgttaagaa gaagtggcaa attccacatg gaacaaagaa tgattacctt atgaagtggt 1140
tcaaatctca aaaggttaag aaaccagaga gggttcttcc accaatgtca cctgagaaat 1200
ctggaagtaa agcaactcag agaacatcat tgctgtcttc taaagggttg gataaattaa 1260
ggttttctgt tgtaggacaa tcaaaagaag cagcaaatga gtggattgag aagctcaaac 1320
ttgctggtgc caacttctat gccagggttg tcaaagatat tgattgttta attgcatgtg 1380
gtgagctcga caatgaaaat gctgaagtca ggaaagcaag gaggctgaag ataccaattg 1440
taagggaggg ttacattgga gaatgtgtta aaaagaacaa aatgctgcca tttgatttgt 1500
ataaactaga gaatgcctta gagtcctcaa aaggcagtac tgtcactgtt aaagttaagg 1560
gccgaagtgc tgttcatgag tcctctggtt tgcaagatac tgctcacatt cttgaagatg 1620
ggaaaagcat atacaatgca accttaaaca tgtctgacct ggcactaggt gtgaacagct 1680
actatgtact ccagatcatt gaacaggatg atgggtctga gtgctacgta tttcgtaagt 1740
ggggacgggt tgggagtgag aaaattggag ggcaaaaact ggaggagatg tcaaaaactg 1800
aggcaatcaa ggaattcaaa agattatttc ttgagaagac tggaaactca tgggaagctt 1860
gggaatgtaa aaccaatttt cggaagcagc ctgggagatt ttacccactt gatgttgatt 1920
atggtgttaa gaaagcacca aaacggaaag atatcagtga aatgaaaagt tctcttgctc 1980
ctcaattgct agaactcatg aagatgcttt tcaatgtgga gacatataga gctgctatga 2040
tggaatttga aattaatatg tcagaaatgc ctcttgggaa gctaagcaag gaaaatattg 2100
agaaaggatt tgaagcatta actgagatac agaatttatt gaaggacacc gctgatcaag 2160
cactggctgt tagagaaagc ttaattgttg ctgcgagcaa tcgctttttc actcttatcc 2220
cttctattca tcctcatatt atacgggatg aggatgattt gatgatcaaa gcgaaaatgc 2280
ttgaagctct gcaggatatt gaaattgctt caaagatagt tggcttcgat agcgacagtg 2340
atgaatctct tgatgataaa tatatgaaac ttcactgtga catcaccccg ctggctcacg 2400
atagtgaaga ttacaagtta attgagcagt atctcctcaa cacacatgct cctactcaca 2460
aggactggtc gctggaactg gaggaagttt tttcacttga tcgagatgga gaacttaata 2520
agtactcaag atataaaaat aatctgcata acaagatgct attatggcac ggttcaaggt 2580
tgacgaattt tgtgggaatt cttagtcaag ggctaagaat tgcacctcct gaggcacctg 2640
ttactggcta tatgttcggc aaaggcctct actttgcaga tctagtaagc aagagcgcac 2700
aatactgtta tgtggatagg aataatcctg taggtttgat gcttctttct gaggttgctt 2760
taggagacat gtatgaacta aagaaagcca cgtccatgga caaacctcca agagggaagc 2820
attcgaccaa gggattaggc aaaaccgtgc cactggagtc agagtttgtg aagtggaggg 2880
atgatgtcgt agttccctgc ggcaagccgg tgccatcatc aattaggagc tctgaactca 2940
tgtacaatga gtacatcgtc tacaacacat cccaggtgaa gatgcagttc ttgctgaagg 3000
tgcgtttcca tcacaagagg tagctgggag actaggcaag tagagttgga aggtagagaa 3060
gcagagttag gcgatgcctc ttttggtatt attagtaagc ctggcatgta tttatgggtg 3120
ctcgcgcttg atccattttg gtaagtgttg cttgggcatc agcgcgaata gcaccaatca 3180
cacactttta cctaatgacg ttttactgta ta 3212
<210>5
<211>2295
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自玉米的parp2编码区
<220>
<221>misc_feature
<222>(107)..(2068)
<223>可读框
<400>5
tgacctgttc catcccgcca gcccttccgc tcccacgacc caaccccact gcccggagcc 60
cccgagcctt ctcgaatctt gcgagaaccc caggggcgag gagcagatgt cggcgaggct 120
acgggtggcg gacgtccgcg cggagcttca gcgccgcggc ctcgatgtat ccggcaccaa 180
gcctgctctc gtgcggaggc tggacgccgc aatttgcgag gcggagaagg ccgtggtggc 240
tgctgcgcca accagtgtgg caaatgggta tgacgtagcc gtagatggca aaaggaactg 300
cgggaataat aagaggaaaa ggtccgggga tgggggtgaa gagggaaacg gcgatacgtg 360
tacagatgtg acaaaactag agggcatgag ctatcgtgag ctgcagggat tggccaaggc 420
acgtggagtt gcggcaaatg ggggcaagaa agatgttatc cagaggttgc tctcggcgac 480
tgctggtcct gctgcagttg cagatggtgg tcctctgggc gccaaggaag tcataaaagg 540
tggtgatgag gaggttgagg tgaaaaagga gaagatggtt actgccacga agaagggagc 600
tgcagtgctg gatcagcaca ttcccgatca cataaaagtg aactatcatg tcttgcaagt 660
gggcgatgaa atctatgatg ccaccttgaa ccagactaat gttggagaca acaacaataa 720
gttctatatc attcaagttt tagaatctga tgctggtgga agctttatgg tttacaatag 780
atggggaaga gttggggtac gaggtcaaga taaactacat ggtccctccc caacacgaga 840
ccaagcaata tatgaatttg aggggaagtt ccacaacaaa accaataatc attggtctga 900
tcgcaagaac ttcaaatgtt atgcaaagaa atacacttgg cttgaaatgg attatggtga 960
aactgagaaa gaaatagaga aaggttccat tactgatcag ataaaagaga caaaacttga 1020
aactagaatt gcgcagttca tatccctgat ctgcaatatt agcatgatga agcaaagaat 1080
ggtggaaata ggttataatg ctgaaaagct tccccttgga aagctaagga aagctacaat 1140
acttaagggt tatcatgttt tgaaaaggat atccgatgtt atttcaaagg cggacaggag 1200
acatcttgag caattgactg gggaattcta caccgtgatt cctcatgact ttggtttcag 1260
aaagatgcgt gaatttatta tcgatactcc tcagaaacta aaagctaagc tggagatggt 1320
tgaagccctt ggtgagattg aaattgcaac taaacttttg gaggatgatt caagtgacca 1380
ggatgatccg ttgtatgctc gatacaagca acttcattgt gatttcacac ctcttgaagc 1440
tgattcagat gagtactcta tgataaaatc atatttgaga aatacacatg gaaaaacaca 1500
ctctggttat acggtggaca tagtgcaaat atttaaggtt tcaaggcatg gtgaaacaga 1560
gcgatttcaa aaatttgcta gtacaagaaa taggatgctt ttgtggcatg gttctcggtt 1620
gagcaactgg gctgggatcc tttctcaggg tctgcgaatc gctcctcctg aagcacctgt 1680
tactggttac atgtttggca agggtgttta ctttgctgac atgttttcaa agagtgcaaa 1740
ctattgctac gcctctgaag catgtagatc tggagtactg cttttatgtg aggttgcatt 1800
gggcgatatg aatgagctac tgaatgcaga ttacgatgct aataacctgc ccaaaggaaa 1860
attaagatcc aagggagttg gtcaaacagc acctaacatg gtcgagtcta aggtcgctga 1920
cgatggtgtt gttgttcccc ttggcgaacc caaacaggaa ccttccaaaa ggggtggctt 1980
gctttataat gagtacatag tgtacaacgt agaccagata agaatgcggt atgtcttaca 2040
tgttaacttc aatttcaaga gacggtagat gttgcaaaga gctgaaactg ttgctgagat 2100
cttagcagaa catatgtgga cttatagcac caggtgccct cagcctcatt ttctgagcaa 2160
atttggtagc ctttgcattt cgattttggt ttcagcttct agccccattg atgattgata 2220
ctgagtgtat atatgaacca ttgatatcca ccttccatgt acttaagttt ttttaacatg 2280
tcccatgcat aataa 2295
<210>6
<211>1384
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>来自棉花的parp2部分编码区
<220>
<221>misc_feature
<222>(3)..(460)
<223>可读框
<400>6
gagaagatbg ttacagcgac gaggaagggg tggctgttct ggatcaaggg atcccagatg 60
acataaaggc tcattatcat gttctacaaa agggtgatga tatctatgat gccatgttaa 120
atcagacgaa tgttgggcaa aacaataaca aattctttgt gatccagctt ctagaatctg 180
atgactcgaa gacatacatg gttcataaca gatggggtag agttggtgtg aagggtcaaa 240
ttaagttaca tggccccttt acttcacgac aagccgcaat tgatgagttt caaaccaaat 300
tctttaacaa gaccaaaaac tattggtaca acagaaaaga ctttgtttgt cacccaaagt 360
gctacacctt gctggagatg gactatgatg aaaaagaaaa ggaatctgat gtcaaaagaa 420
aggctaactc ttccattggt gctcaattgc gggagacaaa gcttgaacaa cgtgttgcta 480
agtttatctc tattatatgc aatatcagca tgatgaagca acaaatgatg gaaataggat 540
acaatgctga caagttgcct cttggtaagc taagcaaatc cacaatttta aaggggtatg 600
atgtcttaaa gaaaattgct gatgtgattg accagtcaaa caggagcaag cttgagcaat 660
taagttcgga attttacacc gtgattccac atgattttgg atttagaaaa atgcgtgatt 720
ttgtcatcga cacacctcag aagttgaaaa agaagttgga aatggttgaa gccctgggag 780
aaatagaggt cgcatcaaaa ttattaatgg atgacattac gatggaggaa gatcctttat 840
attatcggta ccaacagctt cactgtgaac tgtttcctct tgacaatgat actgaggagt 900
tcgctttgat tgtaaagtat attcagaata ctcatgctca gacacattca aattatacag 960
ttgatgttgt tcaaatattc aaggtgacaa gagacggtga aagtgaacgc tttaaaaagt 1020
tttctggaac aaaaaataga atgctgttgt ggcatggttc tcggcttact aactggactg 1080
gcattctgtc ccaaggtttg cgcattgctc cacctgaagc gcctgccacg ggttatatgt 1140
ttgggaaggg ggtttacttt gctgatatgt tctccaaaag tgcaaattat tgctatacta 1200
attctgcctt cacaacaggg gtgttgcttc tatgtgaggt tgccctgggt gacatggctg 1260
agcttctaca agctaaaagc gatgctgata agctgccgga tgggaagttg agcacaaaag 1320
gtgttggtgc aactgcaccg gatccttctg aagcccagtc acttgatgat ggtgttgttg 1380
ttcc 1384
<210>7
<211>1647
<212>DNA
<213>拟南芥
<400>7
atggagaatc gcgaagatct taactcaatt cttccgtacc ttccacttgt aattcgttcg 60
tcgtcgctgt attggccgcc gcgtgtggtg gaggcgttaa aggcaatgtc tgaaggacca 120
tctcacagcc aagttgactc aggagaggtt ctacggcaag ctattttcga tatgagacga 180
tccttatctt tctctactct cgagccatct gcttctaatg gctacgcatt tctctttgac 240
gaattgattg atgagaaaga atcaaagaga tggttcgatg agattatccc agcattggcg 300
agcttacttc tacagtttcc atctctgtta gaagtgcatt tccaaaatgc tgataatatt 360
gttagtggaa tcaaaaccgg tcttcgtttg ttaaattccc aacaagctgg cattgttttc 420
ctcagccagg agttgattgg agctcttctt gcatgctctt tcttttgttt gtttccggat 480
gataatagag gtgcaaaaca ccttccagtc atcaactttg atcatttgtt tgcaagcctt 540
tatataagtt atagtcaaag tcaagaaagc aagataagat gtattatgca ttactttgaa 600
aggttttgct cctgcgtgcc tattggtatt gtttcatttg aacgcaagat taccgctgct 660
cctgatgctg atttctggag caagtctgac gtttctcttt gtgcatttaa ggttcactct 720
tttgggttaa ttgaagatca acctgacaat gctctcgaag tggactttgc aaacaagtat 780
ctcggaggtg gttccctaag tagagggtgc gtgcaggaag agatacgctt catgattaac 840
cctgaattaa tcgctggcat gcttttcttg cctcggatgg atgacaatga agctatagaa 900
atagttggtg cggaaagatt ttcatgttac acagggtatg catcttcgtt tcggtttgct 960
ggtgagtaca ttgacaaaaa ggcaatggat cctttcaaaa ggcgaagaac cagaattgtt 1020
gcaattgatg cattatgtac accgaagatg agacacttta aagatatatg tcttttaagg 1080
gaaattaata aggcactatg tggcttttta aattgtagca aggcttggga gcaccagaat 1140
atattcatgg atgaaggaga taatgaaatt cagcttgtcc gaaacggcag agattctggt 1200
cttctgcgta cagaaactac tgcgtcacac cgaactccac taaatgatgt tgagatgaat 1260
agagaaaagc ctgctaacaa tcttatcaga gatttttatg tggaaggagt tgataacgag 1320
gatcatgaag atgatggtgt cgcgacaggg aattggggat gtggtgtttt tggaggagac 1380
ccagagctaa aggctacgat acaatggctt gctgcttccc agactcgaag accatttata 1440
tcatattaca cctttggagt agaggcactc cgaaacctag atcaggtgac gaagtggatt 1500
ctttcccata aatggactgt tggagatctg tggaacatga tgttagaata ttctgctcaa 1560
aggctctaca agcaaaccag tgttggcttc ttttcttggc tacttccatc tctagctacc 1620
accaacaaag ctatccagcc gccttga 1647
<210>8
<211>598
<212>DNA
<213>马铃薯(Solanum tuberosum)
<400>8
gcaatggaga atagagaaga cgtgaagtca atccttccct ttttgccggt gtgtctccga 60
tcatcttctc ttttctggcc gccgctagtt gttgaagcac tgaaagccct ctctgaaggc 120
cctcattaca gcaatgttaa ctccggccaa gtcctcttcc tcgcaatctc cgacattcgg 180
aattcccttt cactacctga ttcttcaatt tcctcttctg cttcagacgg attttctctc 240
ttatttgatg atttaattcc tagggatgaa gctgttaaat ggttcaaaga agtggtgccg 300
aaaatggcgg atttgctatt gcggttgcct tccttattgg aggctcacta tgagaaggct 360
gatggtggaa ttgttaaagg agtcaacact ggtcttcgct tattggaatc acaacagcct 420
ggcattgttt tcctcagtca ggaattagtc ggtgctcttc ttgcatgttc cttcttttgc 480
tattccctac caatgataga ggtatctgta tgatcagtat gacgagaaat ttgaaaataa 540
attgaagtgc attcttcact attttgagag gattggctca ttgatacctg cgggctac 598
<210>9
<211>1530
<212>DNA
<213>稻(Oryza sativa)
<400>9
atggaggcgc gcggcgacct gcgctcgatc ctgccctacc tccccgtcgt gctccgcggc 60
ggcgcgctct tctggccgcc ggcggcgcag gaggcgctca aggcgctggc gctgggcccc 120
gacgtgagcc gcgtctcctc cggcgacgtc ctcgccgacg ccctcaccga cctccgcctc 180
gcgctcaacc tcgacccact cccgcgccgc gccgccgagg gcttcgcgct cttcttcgac 240
gacctcctgt cgcgggcgca ggcgcgggac tggttcgacc acgtcgcccc ctccctcgcc 300
cgcctcctcc tccgcctccc cacgctgctc gagggccact accgcgccgc cggcgacgag 360
gctcgcgggc tccgcatcct gagctcgcag gatgccgggc tcgtgctcct cagccaggag 420
ctcgccgccg cgctgctcgc ctgcgcgctc ttctgcctgt tccccaccgc cgatagggcc 480
gaggcgtgcc tcccggcgat caatttcgat agcctatttg cggcactgtg ttataattcg 540
aggcaaagcc aggagcagaa ggtgaggtgc cttgttcact attttgacag ggtgaccgct 600
tctacaccta ctggttccgt ttcgtttgag cgtaaggttc ttcctcgccg tcctgaatct 660
gatggcatta cgtaccctga catggatact tggatgaaat ctggtgttcc cctttgcaca 720
ttccgggtat tttcctcagg cttgatagaa gatgaggaac aagaagccct tgaagttgac 780
tttgcaaata gatatttggg aggtggcgca ctttccagag gctgcgtgca ggaagaaatc 840
cggttcatga taaacccaga attgatcgtg ggcatgctct tcatggtttc aatggaagat 900
aatgaagcta tagaaattgt tggtgcagaa aggttctcac agtacatggg gtatggttcc 960
tcattccgtt ttactggtga ctacttagat agcaaaccct ttgatgcgat gggtagacgg 1020
aaaactagga tagtggcaat tgatgctttg gactgtccaa ctaggttaca gtttgaatct 1080
agtggtcttc taagggaagt gaacaaggct ttttgtggat ttttggatca atcaaatcat 1140
cagctctgtg caaagcttgt ccaggattta aatacaaagg ataactgtcc aagtgtcatt 1200
cctgatgaat gcataggagt ttcaactgga aactggggtt gcggggcttt tggtggaaac 1260
cctgaaatca agagcatgat tcaatggatt gctgcatcac aggcactccg atcttttatt 1320
aactactaca cttttgagtc cgaatcactg aaaagattag aagaggtgac ccagtggata 1380
ttgcgccata ggtggacggt tggcgagttg tgggacatgc ttgtggagta ttcatcccag 1440
aggctaagag gagacaccaa tgagggcttt ttaacatggc tacttcccaa ggacatcccc 1500
aatggtgatg tagattacat gtgtgaatag 1530
<210>10
<211>603
<212>DNA
<213>玉米
<400>10
tagggctgtg tgcaggagga aatccgcttc atgataaacc ccgaattgat tgtgggtatg 60
ctattcttgt cttgtatgga agataacgag gctatagaaa tctttggtgc agaacggttc 120
tcacagtata tgggttatgg ttcctccttt cgctttgttg gtgactattt agataccaaa 180
ccctttgatt cgatgggcag acggagaact aggattgtgg ctatcgatgc tttggactgt 240
ccagctaggt tacactatga atctggctgt ctcctaaggg aagtgaacaa ggcattttgt 300
ggatttttcg atcaatcgaa acaccatctc tatgcgaagc ttttccagga tttgcacaac 360
aaggatgact tttcaagcat caattccagt gagtacgtag gagtttcaac aggaaactgg 420
ggttgtggtg cttttggtgg aaaccctgaa atcaagagca tgattcagtg gattgctgca 480
tcacaggctc ttcgcccttt tgttaattac tacacttttg agaacgtgtc tctgcaaaga 540
ttagaggagg tgatccagtg gatacggctt catggctgga ctgtcggcga gctgtggaac 600
ata 603
<210>11
<211>651
<212>DNA
<213>酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)
<400>11
atgaagactt taattgttgt tgatatgcaa aatgatttta tttcaccttt aggttccttg 60
actgttccaa aaggtgagga attaatcaat cctatctcgg atttgatgca agatgctgat 120
agagactggc acaggattgt ggtcaccaga gattggcacc cttccagaca tatttcgttc 180
gcaaagaacc ataaagataa agaaccctat tcaacataca cctaccactc tccaaggcca 240
ggcgatgatt ccacgcaaga gggtattttg tggcccgtac actgtgtgaa aaacacctgg 300
ggtagtcaat tggttgacca aataatggac caagtggtca ctaagcatat taagattgtc 360
gacaagggtt tcttgactga ccgtgaatac tactccgcct tccacgacat ctggaacttc 420
cataagaccg acatgaacaa gtacttagaa aagcatcata cagacgaggt ttacattgtc 480
ggtgtagctt tggagtattg tgtcaaagcc accgccattt ccgctgcaga actaggttat 540
aagaccactg tcctgctgga ttacacaaga cccatcagcg atgatcccga agtcatcaat 600
aaggttaagg aagagttgaa ggcccacaac atcaatgtcg tggataaata a 651
<210>12
<211>1290
<212>DNA
<213>酿酒酵母
<400>12
ttaggtccat ctgtgcgctt cgttatcacc actccaactt cgttcagtat atcccaattc 60
ctctttcact ctcttcacag tggcaggatc tcccatattt ttacctaagt tatcagaaat 120
tttgatagcg tgattaccat ttacttctaa tagtttgata acgatgttta acggctcact 180
tttaacctgg ggttctgact tcttacgaaa atcattagta aagtttgtgc caataccgaa 240
tgtggctagc attccattct ctttagctgc atgggagtaa gttattgcct tttcgacgtt 300
caaagaatcg gaataacaga taatcttcga gaatttaggc aatttcaaca cgtcatggta 360
atggtgggaa atctttttgg tatactcaac tgggtctcca gaatcttgtc taacaccgac 420
gtaagcatca gaatatggtg gacggaatga ttttaaaaag tcatcagttc caaaagtatc 480
cgttaatgct aaaccagcat tttttgcacc aaaagtattg atccaacaat ccattgcatt 540
tttattggca tgcaaataat cttcactaat agaagcgact cccataaccc actcgtgagc 600
cacagtaccg attggcttga ctccatattt cttggcaaat aaaatatttg atgtgcctaa 660
taatagcgat ttgtttctgt ctgggttacc gttcacagct ttcatgattc cttgcataat 720
tagatcttga gccttcagag atctacgacg tcttgtacca aattcactga atctaatacc 780
attatcaaac aaagtttccg ccttcttctc agcttgttct aattggtttt cgtagtccca 840
gtcgatgtca acaaatttaa aatacgcttc tgatattagg gacagtaagg ggatctcata 900
aaggatagta tccttccaac taccactgac taaaattttc aatttgtagt gggtgggctt 960
gccctcgatt tcttctgaag tgaaggaaat ctgctcttca gggtgtagtt tgtaattaga 1020
actgctaata tacttaatat atgccgatgg caaatatggg atttcctgtt ttaagtattc 1080
aatttcctct tctgtgaacc tcaaatttcc caaatacgaa aattgctctt tcaaccaatt 1140
aatggcttcc ttattgaagg tcaattggga cgacctgttg gtatatttat aagtaactgt 1200
aacatctgga aaattagtga agacagcagc atgcatcgta atcttgtaca tgtctgtgtc 1260
caaaagagac tttatcactg gttctgacat 1290
<210>13
<211>1206
<212>DNA
<213>酿酒酵母
<400>13
atggatccca caagagctcc ggatttcaaa ccgccatctg cagacgagga attgattcct 60
ccacccgacc cggaatctaa aattcccaaa tctattccaa ttattccata cgtcttagcc 120
gatgcgaatt cctctataga tgcacctttt aatattaaga ggaagaaaaa gcatcctaag 180
catcatcatc accatcatca cagtcgtaaa gaaggcaatg ataaaaaaca tcagcatatt 240
ccattgaacc aagacgactt tcaaccactt tccgcagaag tgtcttccga agatgatgac 300
gcggatttta gatccaagga gagatacggt tcagattcaa ccacagaatc agaaactaga 360
ggtgttcaga aatatcagat tgctgattta gaagaagttc cacatggaat cgttcgtcaa 420
gcaagaacct tggaagacta cgaattcccc tcacacagat tatcgaaaaa attactggat 480
ccaaataaac tgccgttagt aatagtagca tgtgggtctt tttcaccaat cacctacttg 540
catctaagaa tgtttgaaat ggctttagat gcaatctctg aacaaacaag gtttgaagtc 600
ataggtggat attactcccc tgttagtgat aactatcaaa agcaaggctt ggccccatcc 660
taccatagag tacgtatgtg tgaattggcc tgcgaaagaa cctcatcttg gttgatggtg 720
gatgcatggg agtcattgca accttcatac acaagaactg ccaaggtctt ggatcatttc 780
aatcacgaaa tcaatattaa gagaggtggt gtagctactg ttactggaga aaaaattggt 840
gtgaaaataa tgttgctggc tggtggtgac ctaatagagt caatgggtga accaaacgtt 900
tgggcggacg ccgatttaca tcacattctc ggtaattacg gttgtttgat tgtcgaacgt 960
actggttctg atgtaaggtc ttttttgtta tcccatgata ttatgtatga acatagaagg 1020
aatattctta tcatcaagca actcatctat aatgatattt cttccacgaa agttcgtcta 1080
tttatcagac gcgccatgtc tgtacaatat ttgttaccta attcggtcat caggtatatc 1140
caagaacata gactatatgt ggaccaaacc gaacctgtta agcaagttct tggaaacaaa 1200
gaatga 1206
<210>14
<211>1188
<212>DNA
<213>酿酒酵母
<400>14
atggatccca ccaaagcacc cgattttaaa ccgccacagc caaatgaaga actacaacca 60
ccgccagatc caacacatac gataccaaaa tctggaccca tagttccata tgttttagct 120
gattataatt cttcgatcga tgctcctttc aatctcgaca tttacaaaac cctgtcgtca 180
aggaaaaaaa acgccaactc aagcaaccga atggaccata ttccattaaa tactagtgac 240
ttccagccac tatctcggga tgtatcatcg gaggaggaaa gtgaagggca atcgaatgga 300
attgacgcta ctctacagga tgttacgatg actgggaatt tgggggtact gaagagccaa 360
attgctgatt tggaagaagt tcctcacaca attgtaagac aagccagaac tattgaagat 420
tacgaatttc ctgtacacag attgacgaaa aagttacaag atcctgaaaa actgcctctg 480
atcatcgttg cttgtggatc attttctccc ataacatacc tacatttgag aatgtttgaa 540
atggctttag atgatatcaa tgagcaaacg cgttttgaag tggttggtgg ttatttttct 600
ccagtaagtg ataactatca aaagcgaggg ttagccccag cttatcatcg tgtccgcatg 660
tgcgaattag catgcgagcg gacatcatct tggttaatgg ttgatgcctg ggaatcttta 720
caatcaagtt atacaaggac agcaaaagtc ttggaccatt tcaatcatga aataaatatc 780
aagagaggtg gaatcatgac tgtagatggt gaaaaaatgg gcgtaaaaat catgttattg 840
gcaggcggtg atcttatcga atccatgggc gagcctcatg tgtgggctga ttcagacctg 900
caccatattt tgggtaatta tggatgtttg atcgtggaaa ggactggttc tgatgttagg 960
tccttcttgc tttcccatga tatcatgtat gaacacagaa gaaatatcct tattatcaaa 1020
caacttattt acaatgatat ttcctctacg aaagtgcggc ttttcatcag acgtggaatg 1080
tcagttcaat atcttcttcc aaactctgtc atccgttaca tccaagagta taatctatac 1140
attaatcaaa gtgaaccggt caagcaggtc ttggatagca aagagtga 1188
<210>15
<211>2145
<212>DNA
<213>酿酒酵母
<400>15
atgtcacatc ttatcacttt agctacatgc aacttgaatc aatgggccct agattttgaa 60
ggtaatagag accgtatcct acagtccatt aagattgcca aagagagggg tgccaggtta 120
cgtgtcggcc cagaactgga aataactggc tacggatgtt tagatcattt tttagaaaat 180
gacgtttgcc ttcattcatg ggaaatgtat gctcaaatca ttaagaataa agaaacccat 240
ggattaatac ttgacattgg tatgcccgtt ctacacaaga atgttcgtta taattgtcgt 300
ttgttatcct tggatggtga gatattgttc ataagaccta agatttggtt agctaatgat 360
ggtaactata gggaaatgag atttttcaca ccttggatga aacctggcgt ggtggaggac 420
tttatccttc cacctgagat tcagaaagtt accggccaga gacttgtgcc atttggggac 480
gctgtgataa attcattgga tacatgcatt ggtacagaaa cttgtgaaga attgtttaca 540
cctcaatccc cccacatcgc catgtcttta gatggtgtgg aaatcatgac aaactcatct 600
ggttctcatc atgaactgcg taagttaaat aaaaggttag acctaatttt aaatgccact 660
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