发明名称:生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法及其应用
[0001] 本申请要求于 2018年 11月 29日在中国专利局提交的、 申请号为 201811446689.5
、 发明名称为“生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法及其应用”的中国专利申请的 优先权, 其全部内容通过引用结合在本申请中。
技术领域
[0002] 本申请涉及生物技术领域, 涉及采用基因工程手段对生物酶进行改造后, 高效 催化牛磺鹅去氧胆酸生物转化的方法, 具体涉及一种生物转化制备牛磺熊去氧 胆酸的方法, 及生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法的应用。
背景技术
[0003] 牛磺熊去氧胆酸, 化学名称为 3oc, 7(3 -二羟基胆烷酰 -N-牛磺酸, 具有解痉、 抗惊 厥、 抗炎及溶胆石等作用。 牛磺熊去氧胆酸主要是存在于黑熊胆汁中, 是熊胆 中标志性有效成分。 2007年, 商品名为滔罗特的牛磺熊去氧胆酸胶囊, 获准在 中国销售。 其主要用于溶解胆固醇结石。 熊去氧胆酸, 是亲水性的胆汁酸, 溶 石率有限, 安全性好, 副作用较少, 已被广泛用于临床。 牛磺熊去氧胆酸, 是 熊去氧胆酸与牛磺酸的共轭体, 与熊去氧胆酸相比, 亲水性更强, 溶石速度更 快, 安全性更好。
[0004] 起初, 牛磺熊去氧胆酸是从“人工引流”的黑熊胆汁中提取的, 来源有限, 收率 低, 批次间差异大, 对动物不人道。 后来, 逐渐被人工合成方法所取代。 人工 化学合成方法, 主要分为三类: 一是通过形成活性中间体如混合酸酐、 活性硫 酯等, 再与牛磺酸钠反应; 二是在缩合剂作用下形成酰胺; 三是通过胱胺类物 质形成酰硫化物再氧化得到目的产物。 这些方法选择性低, 使用大量有机试剂 , 污染环境。
[0005] 为了解决“人工引流”熊胆汁提取和人工化学合成方法的缺陷, 逐渐发展出用生 物转化的方法制备牛磺熊去氧胆酸。 牛磺鹅去氧胆酸, 广泛存在于鸡、 鸭、 鹅 等禽畜胆汁中, 与牛磺熊去氧胆酸是 7位羟基上的差向异构体。 中国发明专利 CN 102994604A公开了一种通过 7oc-类固醇脱氢酶和 7(3 -类固醇脱氢酶两步催化, 将
牛磺鹅去氧胆酸转化为牛磺熊去氧胆酸的方法。 此种方法中, 底物浓度较低 ( 1 g/L) , 底物转化不完全, 需要使用大量成本昂贵的辅酶, 反应中间体牛磺 7 -酮 石胆酸作为副产物难以去除。 中国发明专利 CN 107287272A公开了一种制备牛磺 熊去氧胆酸的方法。 其分别构建含有 7oc-类固醇脱氢酶和 7(3-类固醇脱氢酶的表达 载体或二者的共表达载体, 在培养基中加入底物, 发酵的同时进行转化, 将牛 磺鹅去氧胆酸转化为牛磺熊去氧胆酸。 但此种方法底物浓度低、 转化率低, 反 应中间体牛磺 7 -酮石胆酸含量高, 转化周期长, 不易进行工业化生产。
发明概述
技术问题
[0006] 本申请实施例的目的之一在于: 提供一种生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法 及其应用, 旨在解决采用现有的生物转化技术制备牛磺熊去氧胆酸时存在底物 浓度低、 转化率低, 反应中间体牛磺 7 -酮石胆酸含量高, 转化周期长, 不易进行 工业化生产的问题。
问题的解决方案
技术解决方案
[0007] 为解决上述技术问题, 本申请实施例采用的技术方案是:
[0008] 第一方面, 提供了一种生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法, 包括基因密码子 优化、 工程菌构建、 工程菌培养、 底物转化及产物制备; 采用工程菌直接发酵 转化底物制备牛磺熊去氧胆酸; 其中, 所述底物为牛磺鹅去氧胆酸, 所述工程 菌选自能够表达 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢 酶的工程菌系。
[0009] 第二方面, 提供了一种上述方法在制备熊去氧胆酸中的应用。
[0010] 本申请实施例提供的生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法的有益效果在于:
[0011] ( 1) 采用本申请提供的生物转化方法, 可以提高待转化的底物浓度, 使底物 浓度高达 250g/L, 反应时间短, 且对底物的转化率高达 98%以上, 所获得的产品 纯度在 99%以上;
[0012] (2) 采用上述特定表达的大肠杆菌作为生物工程菌, 生物转化过程中反应中 间物牛磺 7 -酮石胆酸转化为牛磺熊去氧胆酸的效率高, 最终产品中几乎不含有副
产物;
[0013] (3) 使用 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶以及 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢 酶, 在反应体系中使 NAD +循环再生, 极大降低了辅酶 NAD +的使用量, 使酶催 化反应的成本降低, 利于工业放大;
[0014] (4) 将类固醇脱氢酶和辅酶再生酶通过柔性多肽序列连接在一起构建成融合 蛋白多聚体, 与底物和辅酶的结合距离更近, 更有利于转化反应的进行, 在工 业化生产中, 减少发酵的次数, 简化了工艺, 节约时间成本和原料成本;
[0015] (5) 本申请可以使用 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶以及 7(3 -类固醇脱氢酶和 葡萄糖脱氢酶的全细胞进行牛磺鹅去氧胆酸的转化, 避免了破碎细胞、 细胞液 澄清、 酶的亲和纯化等工业成本大的步骤, 节约大量成本, 且过程简单可控。
[0016] 本申请实施例提供的生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法应用的有益效果在于 : 将生物转化法制备的牛磺熊去氧胆酸转化液中, 进行碱裂解制备熊去氧胆酸 , 避免了化学法合成熊去氧胆酸中大量有机溶剂的使用; 且该方法反应时间短 , 反应温和可控, 操作简单。
发明的有益效果
对附图的简要说明
附图说明
[0017] 为了更清楚地说明本申请实施例中的技术方案, 下面将对实施例或示范性技术 描述中所需要使用的附图作简单地介绍, 显而易见地, 下面描述中的附图仅仅 是本申请的一些实施例, 对于本领域普通技术人员来讲, 在不付出创造性劳动 的前提下, 还可以根据这些附图获得其它的附图。
[0018] 图 1是本申请实施例提供的利用生物转化方法制备牛磺熊去氧胆酸的原理图;
[0019] 图 2是本申请一实施例提供的类固醇脱氢酶与辅酶再生酶融合表达催化底物示 意图;
[0020] 图 3是本申请提供的实施例 9制备所得的牛磺熊去氧胆酸的 HPLC图谱。
发明实施例
本发明的实施方式
[0021] 为了使本申请的目的、 技术方案及优点更加清楚明白, 以下结合附图及实施例 , 对本申请进行进一步详细说明。 应当理解, 此处所描述的具体实施例仅用以 解释本发明, 并不用于限定本申请。
[0022] 术语“第 “第二”仅用于便于描述目的, 而不能理解为指示或暗示相对重要 性或者隐含指明技术特征的数量。 “多个”的含义是两个或两个以上, 除非另有明 确具体的限定。
[0023] 本申请实施例说明书中所提到的相关成分的重量不仅仅可以指代各组分的具体 含量, 也可以表示各组分间重量的比例关系, 因此, 只要是按照本申请实施例 说明书相关组分的含量按比例放大或缩小均在本发明实施例说明书公开的范围 之内。 具体地, 本申请实施例说明书中所述的重量可以是 |ig、 mg、 g、 kg等化工 领域公知的质量单位。
[0024] 为了说明本申请所述的技术方案, 以下结合具体附图及实施例进行详细说明。
[0025] 第一方面, 本申请一些实施例提供了一种生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法 , 包括基因密码子优化、 工程菌构建、 工程菌培养、 底物转化及产物制备; 采 用工程菌直接发酵转化底物制备牛磺熊去氧胆酸; 其中, 所述底物为牛磺鹅去 氧胆酸, 所述工程菌选自能够表达 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3 -类固醇脱 氢酶和葡萄糖脱氢酶的工程菌系。
[0026] 本申请实施例提供的生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法的有益效果在于:
[0027] ( 1) 采用本申请提供的生物转化方法, 可以提高待转化的底物浓度, 使底物 浓度高达 250g/L, 反应时间短, 且对底物的转化率高达 98%以上, 所获得的产品 纯度在 99%以上;
[0028] (2) 采用上述特定表达的大肠杆菌作为生物工程菌, 生物转化过程中反应中 间物牛磺 7 -酮石胆酸转化为牛磺熊去氧胆酸的效率高, 最终产品中几乎不含有副 产物;
[0029] (3) 使用 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶以及 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢 酶, 在反应体系中使 NAD +循环再生, 极大降低了辅酶 NAD +的使用量, 使酶催 化反应的成本降低, 利于工业放大;
[0030] (4) 将类固醇脱氢酶和辅酶再生酶通过柔性多肽序列连接在一起构建成融合
蛋白多聚体, 与底物和辅酶的结合距离更近, 更有利于转化反应的进行, 在工 业化生产中, 减少发酵的次数, 简化了工艺, 节约时间成本和原料成本;
[0031] (5) 本申请可以使用 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶以及 7(3 -类固醇脱氢酶和 葡萄糖脱氢酶的全细胞进行牛磺鹅去氧胆酸的转化, 避免了破碎细胞、 细胞液 澄清、 酶的亲和纯化等工业成本大的步骤, 节约大量成本, 且过程简单可控。
[0032] 如附图 1所示, 本申请提供的生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法的原理为: 以牛磺鹅去氧胆酸为底物, 通过使用基因工程手段改造后的 7oc-类固醇脱氢酶, 转化为牛磺 7 -酮石胆酸, 同时共表达或融合表达的乳酸脱氢酶在丙酮酸钠存在的 情况下将辅酶 NAD+循环再生; 然后 7(3 -类固醇脱氢酶将牛磺 7 -酮石胆酸转化为牛 磺熊去氧胆酸, 同时共表达或融合表达的葡萄糖脱氢酶在葡萄糖存在的情况下 将 NAD+循环再生。 上述方法中融合表达蛋白是将类固醇脱氢酶和辅酶再生酶通 过柔性多肽序列连接在一起构建成融合蛋白多聚体, 使底物和辅酶的结合距离 更近, 更有利于转化反应的进行, 能够实现高收率、 高纯度牛磺熊去氧胆酸的 制备。
[0033] 所述工程菌选自能够表达 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3 -类固醇脱氢酶和 葡萄糖脱氢酶的工程菌系, 是指 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3 -类固醇脱氢 酶和葡萄糖脱氢酶四种酶并不一定在同一个工程菌中完全表达, 而是可以通过 两个或两个以上的工程菌形成的工程菌系, 来表达 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢 酶、 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶中的一种或多种, 最终实现 7oc-类固醇脱氢 酶、 乳酸脱氢酶、 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶四种酶的表达。 且大多情况 下, 通过两个或两个以上的工程菌形成的工程菌系实现 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸 脱氢酶、 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶四种酶的表达。 当然, 所述工程菌系 中的多个工程菌可以为同一类工程菌。 在一些实施例中, 工程菌系包括能够表 达 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶的工程菌, 以及能够表达 7(3 -类固醇脱氢酶和葡 萄糖脱氢酶的工程菌。 当然, 应当理解的是, 工程菌系中的工程菌的组成方式 不限于此, 只要能够表达 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3 -类固醇脱氢酶和葡 萄糖脱氢酶即可。 且所述在一些实施例中, 表达上述酶的工程菌可以为大肠杆 菌。
[0034] 在一些实施例中, 所述 7oc-类固醇脱氢酶和所述乳酸脱氢酶的表达酶选自 7oc-类 固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶单表达酶、 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶共表达酶、 7 a-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶双四聚体融合酶、 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶 双四聚体融合酶与乳酸脱氢酶共表达酶、 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶双四聚 体融合酶与 7a-类固醇脱氢酶共表达酶中的一种。
[0035] 在一些实施例中, 所述 7(3-类固醇脱氢酶和所述葡萄糖脱氢酶的表达酶选自 7(3- 类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶单表达酶、 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶共表 达酶、 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶四聚体融合酶、 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄 糖脱氢酶四聚体融合酶与葡萄糖脱氢酶共表达酶、 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖脱 氢酶四聚体融合酶与 7(3-类固醇脱氢酶共表达酶中的一种。
[0036] 在一些实施例中, 所述工程菌选自能够表达 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶单 表达酶, 或 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶共表达酶, 或 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸 脱氢酶双四聚体融合酶, 或 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶双四聚体融合酶与乳 酸脱氢酶共表达酶, 或 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶双四聚体融合酶与 7oc-类固 醇脱氢酶共表达酶的工程菌; 和能够表达 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶单表 达酶, 或 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶共表达酶, 或 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄 糖脱氢酶四聚体融合酶, 或 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶四聚体融合酶与葡 萄糖脱氢酶共表达酶, 或 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶四聚体融合酶与 7(3 -类 固醇脱氢酶共表达酶的工程菌。
[0037] 本申请实施例中, 7a-类固醇脱氢酶的 DNA序列为 SEQ ID
NO:l , 乳酸脱氢酶的 DNA序列为 SEQ ID
NO:3 , 7(3-类固醇脱氢酶 DNA序列为 SEQ ID
NO:5和葡萄糖脱氢酶的 DNA序列为 SEQ ID NO:7。
[0038] 在一些实施例中, 对 7(3-类固醇脱氢酶基因的 A78和 VI 16位点进行突变。
[0039] 本申请实施例中, 所述 7a-类固醇脱氢酶的蛋白质序列为 SEQ ID NO:2, 所述乳 酸脱氢酶的蛋白质序列为 SEQ ID NO:4, 所述 7(3-类固醇脱氢酶蛋白质序列为 SEQ ID NO:6 , 所述葡萄糖脱氢酶的蛋白质序列为 SEQ ID NO:8。
[0040] 本申请实施例中, 采用上述原理生物转化制备牛磺熊去氧胆酸时, 需要构建用
于工程菌表达 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶 的基因, 并进行基因密码子优化。
[0041] 在一些实施例中, 所述基因密码子优化的方法为: 对基因序列进行大肠杆菌表 达密码子优化, 加入亲和标签, 并进行全基因合成, 分别记为 7oc-类固醇脱氢酶 基因 7a-HSDH、 乳酸脱氢酶基因 LDH、 7(3 -类固醇脱氢酶基因 7(3-HSDH、 葡萄糖 脱氢酶基因 GDH。
[0042] 在优化完基因密码子后, 构建含有优化密码子基因的工程菌, 将构建的表达载 体分别转化入大肠杆菌 BL21 (DE3) 的感受态细胞中, 得到工程菌, 并对其进 行培养。
[0043] 在一些实施例中, 所述工程菌构建的方法包括:
[0044] 构建基因表达载体, 将构建得到的 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3-类固醇 脱氢酶和葡萄糖脱氢酶的基因表达载体转化入大肠杆菌 BL21的感受态细胞中, 得到工程菌。
[0045] 在一些实施例中, 将表达 7oc-类固醇脱氢酶的基因标记为 7oc-HSDH, 将表达乳 酸脱氢酶的基因标记为 LDH, 将表达 7(3-类固醇脱氢酶的基因标记为 7(3-HSDH, 将表达葡萄糖脱氢酶的基因标记为 GDH, 所述构建基因表达载体的方法为:
[0046] 将 7a-HSDH、 LDH、 7(3-HSDH和 GDH分别构建至 pETDuet-1载体中, 分别得到 单基因表达载体 pETDuet-l-7a-HSDH, pETDuet-l-LDH, pETDuet-l-7(3-HSDH, pETDuet-1-GDH; 或
[0047] 将 7a-HSDH和 LDH, 7(3-HSDH和 GDH分别构建至 pETDuet-1载体中, 分别得到 双基因表达载体 pETDuet-l-7a-HSDH/LDH, pETDuet-l-7(3-HSDH/GDH; 或
[0048] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因, 7(3 -类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢 酶单基因分别构建至 pETDuet-1载体中, 分别得到单基因融合蛋白表达载体 pETD uet- l-(LDH-Linker-7a-HSDH) , pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH); 或
[0049] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因与乳酸脱氢酶单基因, 7(3 -类固醇脱 氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因与葡萄糖脱氢酶单基因分别构建至 pETDuet-1载体 中, 分别得到单基因融合蛋白与脱氢酶共表达载体 pETDuet-1 -(LDH-Linker-7a-H SDH)/LDH, pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH)/GDH; 或
[0050] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因与 7oc-类固醇脱氢酶单基因, 7(3 -类固 醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因与 7(3 -类固醇脱氢酶单基因分别构建至 pETDue t-1载体中, 分别得到单基因融合蛋白与类固醇脱氢酶共表达载体 pETDuet-l-(LD H-Linker-7a-HSDH)/7a-HSDH , pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH)/7(3-HSDH。
[0051] 在一些实施例中, 所述 7a-HSDH来源于 Campylobacter hyointestinalis (UniProt:
CDQ67_02445) , 所述 LDH来源于 Human (UniProt: P00338) , 所述、 7(3-HSDH 来源于 Collinsella aerofaciens ATCC 25986 (UniProt: A4ECA9) 和所述和 GDH来 源于 Bacillus subtilis (strain 168) (UniProt: P12310)。
[0052] 在一些实施例中, 所述 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因的 DNA序列为 S EQ ID NO:9 , 所述 7(3-类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因的 DNA序列为 SEQ ID NO:l l。
[0053] 在一些实施例中, 所述 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因的蛋白质序列 为 SEQ ID NO: 10, 所述 7(3 -类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因的蛋白质序列 为 SEQ ID NO: 12。
[0054] 在所述工程菌构建完成后, 对其进行培养, 使其能够大量发酵表达。 在一些实 施例中, 所述工程菌培养包括: 工程菌小量发酵表达和工程菌大量发酵表达。 其中, 工程菌小量发酵表达的方法为: 工程菌菌液涂布氨苄抗性的 LB平板, 挑 选单克隆, 接种至 5mL含有氨苄的 LB培养基中, 37°C, 220rpm, 进行培养, OD 值为 0.8-1.2时, 加入 ImM IPTG诱导 2h, SDS-PAGE检测表达量, 选取表达量高 的克隆, 进行菌种保藏; 20pL菌种接种至 200mL氨苄抗性 LB培养基中过夜培养 , OD值为 2.5-4.0, 取 2mL培养液接种至氨节抗性培养基中培养, OD值为 1时, 加入 IPTG诱导过夜表达, 收集菌体。 工程菌大量发酵表达的方法为: 挑选工程 菌接种至氨苄抗性 LB培养基的 1L三角瓶中, 37°C, 220rpm过夜培养, OD600值 为 2.5-4.0, 各取 20mL培养液接种至含有 10个 1L氨苄抗性培养基的 3L三角瓶中, 3 TC 140 rpm过夜培养; 将 10L种子液无菌接种至装有 200L大肠杆菌高密度发酵 培养基的发酵罐中, 37°C, 通气搅拌培养 8小时, 通气搅拌培养 8小时后, 向发酵 罐中加入终浓度为 O.lmM的 IPTG溶液进行诱导, 诱导 10- 12h后发酵结束, 放液 , 离心收集菌体并 4°C保存, 取少量菌体重悬于 lOOmM磷酸盐缓冲液中, 超声破
碎, 得到粗酶液;
[0055] 在工程菌培养并大量发酵表达后, 可对工程菌表达的酶进行活力测定。
[0056] 本申请实施例中, 7oc-类固醇脱氢酶的酶活测定方法: 以牛磺鹅去氧胆酸为底 物, 在一个 3mL的反应体系中加入 2.97mL的 100mM
pH8.0磷酸缓冲液, 终浓度 0.5mM的牛磺鹅去氧胆酸, lOpL的稀释酶液, 终浓度 0.5mM的 NADP+, 在 pH8.0和 25°C反应 lmin, 在 340nm处测定吸光值增加。
[0057] 本申请实施例中, 乳酸脱氢酶的酶活测定方法: 以丙酮酸钠为底物, 在一个 3 mL的反应体系中加入 2.7mL的 100mM磷酸缓冲液 (pH8.0) , 0.2mL的 100mM丙 酮酸钠, 50pL的稀释酶液, NADH终浓度为 0.2mM, 在 pH8.0和 25°C反应 lmin, 在 340nm处测定吸光值减少。
[0058] 本申请实施例中, 7(3 -类固醇脱氢酶的酶活测定方法: 以牛磺熊去氧胆酸为底 物, 在一个 3mL的反应体系中加入 2.97mL的 lOOmM磷酸缓冲液 (pH8.0) , 终浓 度 0.5mM的牛磺熊去氧胆酸, 1(VL的稀释酶液, 终浓度 0.5mM的 NADP+, 在 pH 8.0和 25°C反应 lmin, 在 340nm处测定吸光值增加。
[0059] 本申请实施例中, 葡萄糖脱氢酶的酶活测定方法: 以葡萄糖为底物, 在一个 3 mL的反应体系中加入 2.7mL的 lOOmM磷酸缓冲液 (pH8.0) , 0.2mL的 1.5M葡萄 糖, 50pL的稀释酶液, NADP+终浓度为 2mM, 在 pH8.0和 25°C反应 2min, 在 340 nm处测定吸光值增加。
[0060] 本申请实施例中, 在工程菌培养至能够稳定表达目的酶后, 采用工程菌直接转 化底物制备牛磺熊去氧胆酸。 其中, 所述底物为牛磺鹅去氧胆酸。 在一些实施 例中, 所述底物的浓度为 20g/L-250g/L。 所述底物在低浓度反应时, 反应体积大 , 辅酶用量大。 通过优化 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3 -类固醇脱氢酶和葡 萄糖脱氢酶的用量, 将底物浓度提高至 250g/L, 从而减少了反应体积和辅酶的用 量。 当所述底物浓度继续增加, 超过 250g/L时, 底物溶解性能降低, 导致底物的 转化不充分。
[0061] 在一些实施例中, 以所述牛磺鹅去氧胆酸, 采用工程菌直接转化底物的方法包 括:
[0062] 将牛磺鹅去氧胆酸溶解于 20-100mM甘氨酸缓冲液中, 力 P入 0.01-0.8mM的 NAD +
, 加入 5-60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的或细胞裂解液或菌体重 悬液的表达 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶的大肠杆菌菌体, 补加 20-100mM甘氨 酸缓冲液至最终体积, 用氢氧化钠调节 pH至 6.5-8.5, 25°C, 反应 6-18h; 加入 1.8- 100g/L的葡萄糖, 加入纯化后的或部分纯化的或细胞裂解液或菌体重悬液的表达 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶的大肠杆菌菌体, 用氢氧化钠调节 pH至 6.5-8.5 , 25°C, 反应 6-18h。
[0063] 本申请实施例中, 在底物转化完后, 提取工程菌中的产物牛磺熊去氧胆酸。 在 一些实施例中, 所述牛磺熊去氧胆酸的制备方法包括: 将转化完成的反应液, 旋蒸至膏状, 加入 2-10倍的无水乙醇或 95%乙醇, 离心或过滤去除沉淀, 上清液 经干燥即得牛磺熊去氧胆酸粗品, 把牛磺熊去氧胆酸粗品, 使用乙腈溶解, 0.22 um滤膜过滤除去不溶物形成上柱液; 将所述上柱液使用制备型高效液相制备设 备注入装填硅胶层析填料的高压不锈钢柱中; 然后使用不同浓度甲醇-水流动相 进行逐步洗脱, 将收集的洗脱液倒入旋转蒸发仪内进行旋转蒸发至粘稠状, 同 时回收甲醇; 然后置于真空干燥箱内干燥, 采用高效液相色谱法测定样品中牛 磺熊去氧胆酸的纯度。
[0064] 在一些实施例中, 所述生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法包括以下步骤:
[0065] ( 1) 基因密码子优化
[0066] 对基因序列进行大肠杆菌表达密码子优化, 加入亲和标签, 并进行全基因合成 , 分别记为 7oc-类固醇脱氢酶基因 7oc-HSDH、 乳酸脱氢酶基因 LDH、 7(3-类固醇 脱氢酶基因 7(3-HSDH、 葡萄糖脱氢酶基因 GDH;
[0067] (2) 工程菌构建
[0068] 构建基因表达载体, 将构建得到的 7oc-类固醇脱氢酶、 乳酸脱氢酶、 7(3-类固醇 脱氢酶和葡萄糖脱氢酶的基因表达载体转化入大肠杆菌 BL21的感受态细胞中, 得到工程菌;
[0069] (3) 工程菌培养:
[0070] 工程菌小量发酵表达: 工程菌菌液涂布氨苄抗性的 LB平板, 挑选单克隆, 接 种至 5mL含有氨苄的 LB培养基中, 37°C, 220rpm, 进行培养, OD值为 0.8-1.2时 , 加入 ImM IPTG诱导 2h, SDS-PAGE检测表达量, 选取表达量高的克隆, 进行
菌种保藏; 20pL菌种接种至 200mL氨苄抗性 LB培养基中过夜培养, OD值为 2.5-4 .0, 取 2mL培养液接种至氨苄抗性培养基中培养, OD值为 1时, 加入 IPTG诱导过 夜表达, 收集菌体;
[0071] 工程菌大量发酵表达: 挑选工程菌接种至氨苄抗性 LB培养基的 1L三角瓶中, 3
7°C, 220rpm过夜培养, OD600值为 2.5-4.0, 各取 20mL培养液接种至含有 10个 1L 氨苄抗性培养基的 3L三角瓶中, 37°C, 140 rpm过夜培养; 将 10L种子液无菌接 种至装有 200L大肠杆菌高密度发酵培养基的发酵罐中, 37°C, 通气搅拌培养 8小 时, 通气搅拌培养 8小时后, 向发酵罐中加入终浓度为 O. lmM的 IPTG溶液进行诱 导, 诱导 10-12h后发酵结束, 放液, 离心收集菌体并 4°C保存, 取少量菌体重悬 于 lOOmM磷酸盐缓冲液中, 超声破碎, 得到粗酶液;
[0072] (4) 底物转化
[0073] 将牛磺鹅去氧胆酸溶解于 20-100mM甘氨酸缓冲液中, 力 P入 0.01-0.8mM的 NAD + , 加入 5-60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的或细胞裂解液或菌体重 悬液的表达 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶的大肠杆菌菌体, 补加 20-100mM甘氨 酸缓冲液至最终体积, 用氢氧化钠调节 pH至 6.5-8.5, 25°C, 反应 6-18h; 加入 1.8- 100g/L的葡萄糖, 加入纯化后的或部分纯化的或细胞裂解液或菌体重悬液的表达 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶的大肠杆菌菌体, 用氢氧化钠调节 pH至 6.5-8.5 , 25°C, 反应 6-18h;
[0074] (5) 产物制备
[0075] 将步骤 (4) 转化完成的反应液, 旋蒸至膏状, 加入 2-10倍的无水乙醇或 95%乙 醇, 离心或过滤去除沉淀, 上清液经干燥即得牛磺熊去氧胆酸粗品, 把牛磺熊 去氧胆酸粗品, 使用乙腈溶解, 0.22um滤膜过滤除去不溶物形成上柱液; 将所 述上柱液使用制备型高效液相制备设备注入装填硅胶层析填料的高压不锈钢柱 中; 然后使用不同浓度甲醇 -水流动相进行逐步洗脱, 将收集的洗脱液倒入旋转 蒸发仪内进行旋转蒸发至粘稠状, 同时回收甲醇; 然后置于真空干燥箱内干燥 , 采用高效液相色谱法测定样品中牛磺熊去氧胆酸的纯度。
[0076] 在一些实施例中, 步骤 (2) 中, 所述构建基因表达载体的方法为:
[0077] 将 7a-HSDH、 LDH、 7(3-HSDH和 GDH分别构建至 pETDuet-1载体中, 分别得到
单基因表达载体 pETDuet-l-7a-HSDH, pETDuet-l-LDH, pETDuet-l-7(3-HSDH, pETDuet-l-GDH; 或
[0078] 将 7a-HSDH和 LDH, 7(3-HSDH和 GDH分别构建至 pETDuet-1载体中, 分别得到 双基因表达载体 pETDuet-l-7a-HSDH/LDH, pETDuet-l-7(3-HSDH/GDH; 或
[0079] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因, 7(3 -类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢 酶单基因分别构建至 pETDuet-1载体中, 分别得到单基因融合蛋白表达载体 pETD uet- l-(LDH-Linker-7a-HSDH) , pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH); 或
[0080] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因与乳酸脱氢酶单基因, 7(3 -类固醇脱 氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因与葡萄糖脱氢酶单基因分别构建至 pETDuet-1载体 中, 分别得到单基因融合蛋白与脱氢酶共表达载体 pETDuet-1 -(LDH-Linker-7a-H SDH)/LDH, pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH)/GDH; 或
[0081] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因与 7oc-类固醇脱氢酶单基因, 7(3 -类固 醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因与 7(3 -类固醇脱氢酶单基因分别构建至 pETDue t-1载体中, 分别得到单基因融合蛋白与类固醇脱氢酶共表达载体 pETDuet-l-(LD H-Linker-7a-HSDH)/7a-HSDH , pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH)/7(3-HSDH。
[0082] 本申请实施例中, 所述 7a-类固醇脱氢酶的 DNA序列为 SEQ ID NO:l, 所述乳酸 脱氢酶的 DNA序列为 SEQ ID NO:3 , 所述 7(3-类固醇脱氢酶 DNA序列为 SEQ ID NO:5 , 所述葡萄糖脱氢酶的 DNA序列为 SEQ ID NO:7。
[0083] 本申请实施例中, 所述 7oc-类固醇脱氢酶、 所述乳酸脱氢酶、 所述 7(3 -类固醇脱 氢酶和所述葡萄糖脱氢酶独立的选自液体酶或固定化酶, 所述 7oc-类固醇脱氢酶 、 所述乳酸脱氢酶、 所述 7(3 -类固醇脱氢酶和所述葡萄糖脱氢酶独立的选自全细 胞、 未经纯化的酶或经纯化的酶。
[0084] 在一些实施例中, 生物转化法的具体步骤如下:
[0085] ( 1) 基因密码子优化
[0086] 对基因序列进行大肠杆菌表达密码子优化, 加入亲和标签, 并进行全基因合成 , 分别记为 7oc-类固醇脱氢酶基因 7oc-HSDH、 乳酸脱氢酶基因 LDH、 7(3-类固醇 脱氢酶基因 7(3-HSDH、 葡萄糖脱氢酶基因 GDH;
[0087] (2) 单基因表达载体构建
[0088] 将 7a-HSDH、 LDH、 7(3-HSDH和 GDH分别构建至 pETDuet-1载体中, 得 pETDu et-l-7a-HSDH, pETDuet-l-LDH, pETDuet-l-7(3-HSDH, pETDuet-l-GDH;
[0089] (3) 双基因表达载体构建
[0090] 将 7a-HSDH和 LDH, 7(3-HSDH和 GDH分别构建至 pETDuet-1载体中, 得 pETDu et-1 -7a-HSDH/LDH, pETDuet- 1 -7 (3-HSDH/GDH ;
[0091] (4) 单基因融合蛋白表达载体构建
[0092] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因, 7(3 -类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢 酶单基因分别构建至 pETDuet-1载体中, 得 pETDuet- l-(LDH-Linker-7a-HSDH), pETDuet- l-(GDH-Linker-7(3-HSDH);
[0093] (5) 单基因融合蛋白与脱氯酶共表达载体构建
[0094] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因与乳酸脱氢酶单基因, 7(3 -类固醇脱 氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因与葡萄糖脱氢酶单基因分别构建至 pETDuet-1载体 中, 得 pETDuet- l-(LDH-Linker-7a-HSDH)/LDH, pETDuet- l-(GDH-Linker-7(3-HS DH)/GDH;
[0095] (6) 单基因融合蛋白与类固醇脱氢酶共表达载体构建
[0096] 将 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因与 7oc-类固醇脱氢酶单基因, 7(3 -类固 醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因与 7(3 -类固醇脱氢酶单基因分别构建至 pETDue t-1载体中, 得 pETDuet- l-(LDH-Linker-7a-HSDH)/7a-HSDH, pETDuet- 1-(GDH-L inker-7(3-HSDH)/7(3-HSDH;
[0097] (7) 工程菌构建
[0098] 将步骤 (2) -步骤 (6) 构建的所有表达载体分别转化入大肠杆菌 BL21 (DE3 ) 的感受态细胞中, 得到工程菌;
[0099] (8) 工程菌小量发酵表达
[0100] 工程菌菌液涂布氨苄抗性的 LB平板, 挑选单克隆, 接种至 5mL含有氨苄的 LB 培养基中, 37°C, 220rpm, 进行培养, OD值为 0.8-1.2时, 加入 ImM
IPTG诱导 2h, SDS-PAGE检测表达量, 选取表达量高的克隆, 进行菌种保藏; 2 (VL菌种接种至 200mL氨苄抗性 LB培养基中过夜培养, OD值为 2.5-4.0, 取 2mL 培养液接种至氨节抗性培养基中培养, OD值为 1时, 加入 IPTG诱导过夜表达,
收集菌体;
[0101] (9) 工程菌大量发酵表达
[0102] 挑选工程菌接种至氨苄抗性 LB培养基的 1L三角瓶中, 37°C, 220rpm过夜培养 , OD600值为 2.5-4.0, 各取 20mL培养液接种至含有 10个 1L氨苄抗性培养基的 3L 三角瓶中, 37°C, 140 rpm过夜培养; 将 10L种子液无菌接种至装有 200L大肠杆 菌高密度发酵培养基的发酵罐中, 37°C, 通气搅拌培养 8小时, 通气搅拌培养 8小 时后, 向发酵罐中加入终浓度为 O. lmM的 IPTG溶液进行诱导, 诱导 10-12h后发 酵结束, 放液, 离心收集菌体并 4°C保存, 取少量菌体重悬于 lOOmM磷酸盐缓冲 液中, 超声破碎, 得到粗酶液;
[0103] ( 10) 酶活力测定
[0104] 7oc-类固醇脱氢酶的酶活测定方法: 以牛磺鹅去氧胆酸为底物, 在一个 3mL的 反应体系中加入 2.97mL的 lOOmM pH8.0磷酸缓冲液, 终浓度 0.5mM的牛磺鹅去氧 胆酸, 1(VL的稀释酶液, 终浓度 0.5mM的 NADP+, 在 pH8.0和 25°C反应 lmin, 在 340nm处测定吸光值增加;
[0105] 乳酸脱氢酶的酶活测定方法: 以丙酮酸钠为底物, 在一个 3mL的反应体系中加 入 2.7mL的 lOOmM磷酸缓冲液 (pH8.0) , 0.2mL的 lOOmM丙酮酸钠, 50^L的稀 释酶液, NADH终浓度为 0.2mM, 在 pH8.0和 25°C反应 lmin, 在 340nm处测定吸 光值减少;
[0106] 7(3 -类固醇脱氢酶的酶活测定方法: 以牛磺熊去氧胆酸为底物, 在一个 3mL的反 应体系中加入 2.97mL的 lOOmM磷酸缓冲液 (pH8.0) , 终浓度 0.5mM的牛磺熊去 氧胆酸, 1(VL的稀释酶液, 终浓度 0.5mM的 NADP+, 在 pH8.0和 25°C反应 lmin, 在 340nm处测定吸光值增加;
[0107] 葡萄糖脱氢酶的酶活测定方法: 以葡萄糖为底物, 在一个 3mL的反应体系中加 入 2.7mL的 lOOmM磷酸缓冲液 (pH8.0) , 0.2mL的 1.5M葡萄糖, 50^L的稀释酶 液, NADP+终浓度为 2mM, 在 pH8.0和 25°C反应 2min, 在 340nm处测定吸光值增 加;
[0108] ( 11) 牛磺鹅去氧胆酸转化为牛磺熊去氧胆酸
[0109] 将牛磺鹅去氧胆酸溶解于 20-100mM甘氨酸缓冲液中, 力卩入 0.01-0.8mM的 NAD+
, 加入 5-60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的或细胞裂解液或菌体重 悬液的表达 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶的大肠杆菌菌体, 补加 20-100mM甘氨 酸缓冲液至最终体积, 用氢氧化钠调节 pH至 6.5-8.5, 25°C, 反应 6-18h; 加入 1.8- 100g/L的葡萄糖, 加入纯化后的或部分纯化的或细胞裂解液或菌体重悬液的表达 7(3-类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶的大肠杆菌菌体, 用氢氧化钠调节 pH至 6.5-8.5 , 25°C, 反应 6-18h;
[0110] ( 12) 牛磺熊去氧胆酸的制备
[0111] 将步骤 ( 11) 转化完成的反应液, 旋蒸至膏状, 加入 2-10倍的无水乙醇或 95% 乙醇, 离心或过滤去除沉淀, 上清液经干燥即得牛磺熊去氧胆酸粗品, 把牛磺 熊去氧胆酸粗品, 使用乙腈溶解, 0.22um滤膜过滤除去不溶物形成上柱液; 将 所述上柱液使用制备型高效液相制备设备注入装填硅胶层析填料的高压不锈钢 柱中; 然后使用不同浓度甲醇 -水流动相进行逐步洗脱, 将收集的洗脱液倒入旋 转蒸发仪内进行旋转蒸发至粘稠状, 同时回收甲醇; 然后置于真空干燥箱内干 燥, 采用高效液相色谱法测定样品中牛磺熊去氧胆酸的纯度。
[0112] 第二方面, 本申请实施例提供了一种上述方法在制备熊去氧胆酸中的应用。
[0113] 本申请实施例提供的生物转化制备牛磺熊去氧胆酸的方法应用的有益效果在于 : 将生物转化法制备的牛磺熊去氧胆酸转化液中, 进行碱裂解制备熊去氧胆酸 , 避免了化学法合成熊去氧胆酸中大量有机溶剂的使用; 且该方法反应时间短 , 反应温和可控, 操作简单。
[0114] 在一些实施例中, 所述制备过程如下: 在转化生成的牛磺熊去氧胆酸溶液中加 入氢氧化钠调节 pH至 8-11, 升温至 80-100°C, 反应 18-24h, 降温至 1(M5°C, 加盐 酸调节 pH至 3-5 , 析出熊去氧胆酸。 在生物转化法制备的牛磺熊去氧胆酸转化液 中, 加入氢氧化钠调节 pH至 8-11进行碱裂解, 然后加盐酸中和, 析出熊去氧胆 酸, 避免了化学法合成熊去氧胆酸中大量有机溶剂的使用; 反应时间短, 反应 温和可控, 操作简单。
[0115] 以上生物转化反应过程中, 底物的浓度为 20-250g/L。
[0116] 以上所有酶均可以为液体酶或固定化酶, 也可以是全细胞、 未经纯化的酶或纯 化的酶。
[0117] 下面结合具体实施例进行说明。
[0118] 下述具体实施例中, 重组质粒的构建方法具体如下:
[0119] 1.单基因表达载体的构建
[0120] a)含有 7a-类固醇脱氢酶基因的重组质粒 pETDuet-l-7a-HSDH的制备
[0121] 将来源于 Campylobacter hyointestinalis
的 7a-类固醇脱氢酶基因 (DNA序列: SEQ ID NO:l , 编码的蛋白质序列: SEQ
ID NO:2) , 用引物对 (SEQ ID
NO:13) 5 CGGGATCCATGGGCAGCAGCCATCATCA-31^ (SEQ ID NO: 14) 5 -CGGAATTCTTATTTAAAGGTGGTGCCA-3通过 PCR进行扩增, 用 BamH I和 EcoR I酶切, 用 Dpn l酶消化模板。 用:8&11111 1和£0^ 1酶切 £701^-1载体。 用 连接酶连接 7oc-类固醇脱氢酶基因片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄 抗性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌 体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0122] b)含有乳酸脱氢酶基因的重组质粒 pETDuet-1-LDH的制备
[0123] 将来源于
的乳酸脱氢酶基因 (DNA序列: SEQ ID NO:3 , 编码的蛋白质 序列: SEQ ID NO:4) 用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGGGCAGCAGCCATCATCA-3 口 (SEQ ID NO:16 ) 5 -TCCCTCGAGTTAAAACTGCAGTTCTTTCT-3通过 PCR进行扩增, 用 Nde l 和 Ava l酶切, 用 Dpn l酶消化模板。 将 pETDuet-1质粒用 Nde I和 Ava I酶切, 用连 接酶连接乳酸脱氢酶基因片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄抗性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌体, 用 天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0124] c)含有 7(3 -类固醇脱氢酶基因的重组质粒 pETDuet-l-7(3-HSDH的制备
[0125] 将来源于 Collins ella aerofaciens ATCC 2598(5的 7(3-类固醇脱氢酶基因的突变子
(A78C, V116C) (DNA序歹 ij: SEQ ID NO:5 , 编码的蛋白质序列: SEQ ID NO:6) 用引物对 (SEQ ID
NO:17) 5 CGGGATCCATGGGCAGCAGCCATCATCA-31^ (SEQ ID NO: 18) 5 -CGGAATTCTTAGTCACGGTAGAAAGAAC-3通过 PCR进行扩增, 用 BamH I
和 EcoR I酶切, 用 Dpn l酶消化模板。 用 BamH I和 EcoR I酶切 pETDuet-1载体。 用 连接酶连接 7(3 -类固醇脱氢酶基因片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄 抗性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌 体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0126] d)含有葡萄糖脱氢酶基因的重组质粒 pETDuet-1-GDH的制备
[0127] 将来源于
的葡萄糖脱氢酶基因 (DNA序歹 ij : SEQ ID
NO:7 , 编码的蛋白质序列: SEQ ID NO:8) 用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGGGCAGCAGCCATCATCA-3 口 (SEQ ID NO: 19 ) 5 TCCCTCGAGTTAACCACGACCGGCCTGAAAGCT-3通过 PCR进行扩增, 用 Nde I和 Ava I酶切, 用 Dpn I酶消化模板。 将 pETDuet-1质粒用 Nde I和 Ava I酶切 , 用连接酶连接乳酸脱氢酶片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄抗性 的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0128] 2.双基因共表达载体的构建
[0129] a)含有 7a-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶基因的重组质粒 pETDuet-l-7a-HSDH/LD
H的制备
[0130] 将来源于
的乳酸脱氢酶基因用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGATGGGCAGCAGCCATCATCA-31^ (SEQ ID
用 Nde I和 Ava I酶切, 用 Dpn
I酶消化模板。 将上述测序正确的 pETDuet-l-7a-HSDH质粒用 Nde I和 Ava I酶切, 用连接酶连接乳酸脱氢酶基因片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄抗 性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌体 , 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0131] b)含有 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶基因的重组质粒 pETDuet-l-7(3-HSDH/G
DH的制备
[0132] 将来源于 Bacillus subtilis (strain 7 j的葡萄糖脱氢酶基因用引物对 (SEQ ID NO:15) 5 GGAATTCCATATGATGGGCAGCAGCCATCATCA-31^ (SEQ ID
NO:19) 5 -TCCCTCGAGTTAACCACGACCGGCCTGAAAGCT-3通过 PCR进行 扩增, 用 Nde I和 Ava l酶切, 用 Dpn
I酶消化模板。 将上述测序正确的 pETDuet-l-7(3-HSDH质粒用 Nde I和 Ava I酶切, 用连接酶连接乳酸脱氢酶片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄抗性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌体, 用 天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0133] 3.单基因表达融合蛋白载体的构建
[0134] a)7a-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因重组质粒 pETDuet-l-(LDH-Linker-7a-
HSDH)的制备
[0135] 将 7a-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因 (DNA序列: SEQ ID NO:9 , 编码的 蛋白质序列: SEQ ID NO: 10) 用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGGGCAGCAGCCATCATCA-3 口 (SEQ ID NO:14 ) 5 -CGGAATTCTTATTTAAAGGTGGTGCCA-3通过 PCR进行扩增, 用 BamH I 和 EcoR I酶切, 用 Dpn I酶消化模板。 用 BamH I和 EcoR I酶切 pETDuet-1载体。 用 连接酶连接 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因基因片段和载体。 连接产物 转化 DH5a, 涂布在氨苄抗性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB 中进行过夜培养。 收集菌体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存 测序正确的质粒。
[0136] b)7(3-类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因重组质粒 pETDuet-l-(GDH-Linker-
7(3-HSDH)的制备
[0137] 将 7(3 -类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因 (DNA序列: SEQ ID NO:l l, 编 码的蛋白质序列: SEQ ID NO: 12) 用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGATGGGCAGCAGCCATCATCA-31^5 (SEQ ID NO: 18) CGGAATTCTTAGTCACGGTAGAAAGAAC-3通过 PCR进行扩增, 用 BamH I和 EcoR I酶切, 用 Dpn I酶消化模板。 用 BamH I和 EcoR I酶切 pETDuet-1 载体。 用连接酶连接 7(3-类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因基因片段和载体 。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄抗性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种 到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测
序。 保存测序正确的质粒。
[0138] 4.单基因融合蛋白与脱氢酶共表达表达载体的构建
[0139] a)含有 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因与乳酸脱氢酶基因共表达的重组 质粒 pETDuet-l-(LDH-Linker-7a-HSDH)/LDH的制备
[0140] 将来源于 Human的乳酸脱氢酶基因用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGGGCAGCAGCCATCATCA-3 口 (SEQ ID NO:16 ) 5 -TCCCTCGAGTTAAAACTGCAGTTCTTTCT-3通过 PCR进行扩增, 用 Nde l 和 Ava I酶切, 用 Dpn
I酶消化模板。 将 pETDuet-l-(LDH-Linker-7a-HSDH)质粒用 Nde I和 Ava I酶切, 用 连接酶连接乳酸脱氢酶基因片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄抗性 的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0141] b)含有 7(3-类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因与葡萄糖脱氢酶基因共表达的 重组质粒 pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH)/GDH的制备
[0142] 将来源于 Bacillus subtilis (strain 7 )的葡萄糖脱氢酶基因用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGGGCAGCAGCCATCATCA-3 口 (SEQ ID NO:19 ) 5 TCCCTCGAGTTAACCACGACCGGCCTGAAAGCT-3通过 PCR进行扩增, 用 Nde I和 Ava I酶切, 用 Dpn I酶消化模板。 将 pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH) 质粒用 Nde I和 Ava I酶切, 用连接酶连接葡萄糖脱氢酶片段和载体。 连接产物转 化 DH5a, 涂布在氨苄抗性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中 进行过夜培养。 收集菌体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测 序正确的质粒。
[0143] 5.单基因融合蛋白与类固醇脱氢酶共表达表达载体的构建
[0144] a)含有 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶单基因与 7oc-类固醇脱氢酶基因共表达 的重组质粒 pETDuet-l-(LDH-Linker-7a-HSDH)/7a-HSDH的制备
[0145] 将来源于 Campylobacter hyointestinalis
的 7oc-类固醇脱氢酶基因, 用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGGGCAGCAGCCATCATCA-3和 (SEQ ID NO:20
) 5 TCCCTCGAGTTATTTAAAGGTGGTGCCA-3通过 PCR进行扩增, 用 Nde I 和 Ava I酶切, 用 Dpn
I酶消化模板。 将 pETDuet-l-(LDH-Linker-7a-HSDH)质粒用 Nde I和 Ava I酶切, 用 连接酶连接 7oc-类固醇脱氢酶基因片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄 抗性的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌 体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0146] b)含有 7(3-类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶单基因与 7(3 -类固醇脱氢酶基因共表 达的重组质粒 pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH)/7(3-HSDH的制备
[0147] 将来源于 Collinsella aerofaciens ATCC 259 的 7(3-类固醇脱氢酶基因的突变子
(A78C , V116C) 用引物对 (SEQ ID
NO:15) 5 GGAATTCCATATGGGCAGCAGCCATCATCA-3和 (SEQ ID NO:21 ) 5 TCCCTCGAGTTAGTCACGGTAGAAAGAAC-3通过 PCR进行扩增, 用 Nde I和 Ava I酶切, 用 Dpn
I酶消化模板。 将 pETDuet-l-(GDH-Linker-7(3-HSDH)质粒用 Nde I和 Ava I酶切, 用 连接酶连接 7(3 -类固醇脱氢酶片段和载体。 连接产物转化 DH5oc, 涂布在氨苄抗性 的 LB平板进行筛选。 挑选单克隆, 接种到 5mL LB中进行过夜培养。 收集菌体, 用天根质粒提取试剂盒提取质粒, 送测序。 保存测序正确的质粒。
[0148] 实施例 1含有重组质粒的大肠杆菌在三角瓶中发酵表达
[0149] 取 20pL含有重组质粒的大肠杆菌 BL21(DE3)菌种, 接种至 200mL氨苄抗性 LB培 养基中, 37°C, 220rpm, 过夜培养, OD600值为 2.5-4.0。 取 20mL培养液接种至 1 L氨苄抗性培养基中, 37°C, 140rpm, 培养 3小时, OD600值为 1时, 加入 0.5mM IPTG诱导过夜表达。 离心收集菌体。 取少量菌体重悬于 100mM磷酸盐缓冲液中 , 超声破碎, 得到粗酶液。 按照技术方案中的方法测定酶活。
[0150] 实施例 2含有重组质粒的大肠杆菌在发酵罐中发酵表达
[0151] 取 20pL含有重组质粒的大肠杆菌 BL21(DE3)菌种, 接种至 200mL氨苄抗性 LB培 养基中, 37°C, 220rpm, 过夜培养, OD600值为 2.5-4.0。 取 20mL培养液接种至 1 L氨苄抗性培养基中, 37°C, 140rpm, 过夜培养。 将 10L种子液无菌接种至装有 2 00L大肠杆菌高密度发酵培养基的发酵罐中, 37°C, 通气搅拌培养 8小时。 大肠
杆菌高密度发酵培养基含有: 18g/L的十二水磷酸氢二钾, 6.8g/L的磷酸二氢钾 , 0.7g/L的无水硫酸钠, 0.48g/L的硫酸镁, 2.25g/L的甘油, 2.5g/L的酵母粉, 5g/ L的蛋白胨。 通气搅拌培养 8小时后, 向发酵罐中加入终浓度为 O.lmM的 IPTG溶 液进行诱导, 诱导 l(M2h后发酵结束, 放液, 离心收集菌体并 4°C保存。 取少量 菌体重悬于 lOOmM磷酸盐缓冲液中, 超声破碎, 得到粗酶液。 按照技术方案中 的方法测定酶活。
[0152] 实施例 3 1L反应体系中用单基因表达蛋白转化牛磺熊去氧胆酸
[0153] 将 250g牛磺鹅去氧胆酸溶解于 700mL的 lOOmM甘氨酸缓冲液中, 加入 0.25mM 的 NAD +, 加入 60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解 液或菌体重悬液的 7oc-类固醇脱氢酶 (含纯酶约 5g) 和乳酸脱氢酶 (含纯酶约 2g ) , 补加 lOOmM甘氨酸缓冲液至 1L, 用 5M
NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 加入 100g/L的葡萄糖, 加入纯化后的或 部分纯化的酶液或细胞裂解液或菌体重悬液的 7(3-类固醇脱氢酶 (含纯酶约 5g) 和葡萄糖脱氢酶 (含纯酶约 2g) 的大肠杆菌, 用 5M NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 底物转化率在 98%以上, 成品含量在 96.8%以上, 收率大于 85%。
[0154] 实施例 4 1L反应体系中用双基因共表达蛋白转化牛磺熊去氧胆酸
[0155] 将 250g牛磺鹅去氧胆酸溶解于 700mL的 lOOmM甘氨酸缓冲液中, 加入 0.25mM 的 NAD +, 加入 60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解 液或菌体重悬液的共表达 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶 (含酶量共约 10g) , 补 力口 lOOmM甘氨酸缓冲液至 1L, 用 5M NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 力口 入 100g/L的葡萄糖, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解液或菌体重悬液 的共表达 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶 (含酶量共约 10g) , 用 5M NaOH调 节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 底物转化率在 98%以上, 成品含量在 96.8%以上 , 收率大于 85%。
[0156] 实施例 5 1L反应体系中用单基因表达融合蛋白转化牛磺熊去氧胆酸
[0157] 将 250g牛磺鹅去氧胆酸溶解于 700mL的 lOOmM甘氨酸缓冲液中, 加入 0.25mM 的 NAD +, 加入 60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解 液或菌体重悬液的 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶 (含酶量约 5g) , 补加 100m
M甘氨酸缓冲液至 1L, 用 5M NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 加入 100g/L 的葡萄糖, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解液或菌体重悬液的 7(3 -类 固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶 (含酶量约 5g) , 用 5M NaOH调节 pH至 7.5。 25°C , 反应 6-18h。 底物转化率在 99.7%以上, 成品含量在 96.8%以上, 收率大于 85%
[0158] 实施例 6 1L反应体系中用单基因融合蛋白与脱氢酶共表达蛋白转化牛磺熊去氧 胆酸
[0159] 将 250g牛磺鹅去氧胆酸溶解于 700mL的 100mM甘氨酸缓冲液中, 加入 0.20mM 的 NAD +, 加入 60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解 液或菌体重悬液的共表达 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶与乳酸脱氢酶 (含酶 量共约 7g) , 补加 100mM甘氨酸缓冲液至 1L, 用 5M NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 加入 100g/L的葡萄糖, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解 液或菌体重悬液的共表达 7(3 -类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢酶与葡萄糖脱氢酶 ( 含酶量共约 7g) , 用 5M
NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 底物转化率在 98.5%以上, 成品含量在 96 .8%以上, 收率大于 85%。
[0160] 实施例 7 1L反应体系中用单基因融合蛋白与类固醇脱氢酶共表达蛋白转化牛磺 熊去氧胆酸
[0161] 将 250g牛磺鹅去氧胆酸溶解于 700mL的 100mM甘氨酸缓冲液中, 加入 0.50mM 的 NAD +, 加入 60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解 液或菌体重悬液的共表达 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶与 7oc-类固醇脱氢酶 ( 含酶量共约 7g) , 补加 100mM甘氨酸缓冲液至 1L, 用 5M
NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 加入 100g/L的葡萄糖, 加入纯化后的或 部分纯化的酶液或细胞裂解液或菌体重悬液的共表达 7(3 -类固醇脱氢酶融合葡萄 糖脱氢酶与 7(3-类固醇脱氢酶 (含酶量共约 7g) , 用 5M NaOH调节 pH至 7.5。 25 °C, 反应 6-18h。 底物转化率在 99.5%以上, 成品含量在 96.8%以上, 收率大于 85 %。
[0162] 实施例 8 100L反应体系中单基因表达融合蛋白转化牛磺熊去氧胆酸
[0163] 将 25Kg牛磺鹅去氧胆酸溶解于 70L的 lOOmM甘氨酸缓冲液中, 加入 0.25mM的 N AD +, 加入 60g/L的丙酮酸钠, 加入纯化后的或部分纯化的酶液或细胞裂解液或 菌体重悬液的 7oc-类固醇脱氢酶融合乳酸脱氢酶 (含酶量约 500g) , 补加 lOOmM 甘氨酸缓冲液至 100L, 用 5M
NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 加入 100g/L的葡萄糖, 加入纯化后的或 部分纯化的酶液或细胞裂解液或菌体重悬液的 7(3 -类固醇脱氢酶融合葡萄糖脱氢 酶 (含酶量约 500g) , 用 5M NaOH调节 pH至 7.5。 25°C, 反应 6-18h。 底物转化 率在 99.5%以上, 成品含量在 96.8%以上, 收率大于 85%。
[0164] 实施例 3-8中 7oc-类固醇脱氢酶和乳酸脱氢酶的用量、 7(3 -类固醇脱氢酶和葡萄糖 脱氢酶的用量、 NAD +加入量以及底物转化率如下表 1所示。
[0165] 表 1
[] [表 1]
[0166] 实施例 9牛磺熊去氧胆酸的制备
[0167] 将上述转化完成的反应液, 旋蒸至膏状, 加入 10倍体积的无水乙醇或 95%乙醇 , 离心或过滤去除沉淀。 上清液经真空干燥即得牛磺熊去氧胆酸粗品。 把反应 后的牛磺熊去氧胆酸粗品, 使用乙腈溶解粗品, 0.22um滤膜过滤除去不溶物形 成上柱液; 将所述上柱液使用制备型 HPLC注入装填 C18硅胶填料的高压不锈钢 柱中 (柱子规格 15*255mm) ; 然后使用 30%甲醇-水溶液配制的流动相 A注入不
锈钢柱中进行洗脱, 洗脱速度为 240mL/h, 洗脱时间为 175分钟, 收集洗脱液 1 ; 再将流动相梯度在 50分钟内线性提升至 50%流动相 B (80%甲醇-水溶液) 进行洗 脱, 保持 50%流动相 B洗脱 75分钟, 收集洗脱液 2; 将洗脱梯度在 40分钟内线性 提升至 100%流动相 B, 保持 100%流动相 B洗脱 70分钟, 收集洗脱液 3 ; 将收集的 洗脱液倒入旋转蒸发仪内进行旋转蒸发至粘稠状, 同时回收甲醇; 然后置于真 空干燥箱内干燥, 采用高效液相色谱法测定样品中牛磺熊去氧胆酸胆酸的纯度 , 以质量分数计, 其中洗脱液 1中牛磺熊去氧胆酸含量为 5.77%, 回收率为 8.2%
, 洗脱液 2中牛磺熊去氧胆酸含量为 99.3%, 回收率为 81.5%, 洗脱液 3中牛磺熊 去氧胆酸含量为 14.9% , 回收率为 10.3%。 实施例 9制备得到的牛磺熊去氧胆酸的 HPLC图谱如图 3所示。
[0168] 实施例 10熊去氧胆酸的制备
[0169] 向上述转化完成的反应液中, pH至 10, 升温至 100°C, 反应 24h, 降温至 10°C, 加盐酸调节 pH至 4, 析出熊去氧胆酸。 即得熊去氧胆酸粗品。
[0170] 以上仅为本申请的可选实施例而已, 并不用于限制本申请。 对于本领域的技术 人员来说, 本申请可以有各种更改和变化。 凡在本申请的精神和原则之内, 所 作的任何修改、 等同替换、 改进等, 均应包含在本申请的权利要求范围之内。