JPH09500394A - Pna−dna−pnaキメラ高分子 - Google Patents

Pna−dna−pnaキメラ高分子

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Abstract

(57)【要約】 増加したヌクレアーゼ耐性および増加した相補鎖への結合親和性を有し、且つRNアーゼH酵素を活性化する高分子が提供される。高分子は、PNA−DNA−PNA構造を持ち、式中、DNA部分は2'-デオキシ−エリス −ペントフラノシルヌクレオチドのサブユニットから構成され、PNA部分はペプチド核酸のサブユニットから構成される。その様な高分子は、診断およびその他の研究目的のために、生物におけるタンパク質の調節のために、並びに治療学的に可能なその他の状態の診断、検出および治療のために有用である。

Description

【発明の詳細な説明】 PNA−DNA−PNAキメラ高分子 関連出願のクロス・レフェレンス 本出願は、「ギャップ2’修飾オリゴヌクレオチド」("Gapped 2’Modified O ligonucleotides")と称する前出願である出願番号US92/11339(19 92年12月23日提出)の一部継続出願であり、この前出願US92/113 39は、「ギャップ2’修飾/オリゴヌクレオチド」("Gapped 2’Modified/Oli gonucleotides")と称する前出願である出願番号第814,961号(1991 年12月24日提出)の一部継続出願であり、両出願は、共に本出願に譲渡され る。さらに、本出願は、「ペプチド核酸の高次構造および結合」("Higher Order Structure and Binding of Peptide Nucleic Acids")と称する出願番号第08 8,658号(1993年7月2日提出)に関連し、共に本出願に一部分譲渡さ れる。この出願第088,658号は、「新しいペプチド核酸」("Novel peptid e Nucleic Acids")と称する出願番号第054,363号(1993年4月26 日提出)の一部継続出願であり、第054,363号はPCT EP/91/0 1219(1992年5月19日提出)の一部継続出願である。これらの出願の それぞれの開示は、参照としてここに取り入れられる。発明の分野 本発明は、PNA−DNA−PNA構造を持つキメラ分子の合成および使用に 関し、ここで、各々の“PNA”はペプチド核酸であり、“DNA”はホスホジ エステル、ホスホロチオエートまたはホスホロジチオエート2'-デオキシオリゴ ヌクレオチドである。細胞、細胞抽出物またはRNアーゼHを含む診断試験シス テム中では、RNA標的分子とハイブリダイズ可能な塩基配列を持つ本発明のキ メラ高分子は、その標的RNA分子と結合でき、そのRNA標的分子のRNアー ゼHによる鎖切断を容易にする。発明の背景 大抵の疾病状態を含む哺乳類の健康状態のほとんどが、タンパク質に影響され ていることは、良く知られている。その様なタンパク質は、直接作用するかまた はそれらの酵素機能を通してかのいずれかによって、動物およびヒトの多くの病 気の主要な一因となっている。古典的治療学は、一般的に、病気の原因または病 気の強化機能を和らげるために、その様なタンパク質との相互作用に焦点が当て られてきた。しかしながら、最近では、メッセンジャーRNA(mRNA)また はタンパク質の合成を指示するその他の細胞内RNAとの相互作用によってそれ らのタンパク質の実際の生成を緩和する試みがなされている。一般的に、望まし くないタンパク質形成を導く遺伝子発現を干渉する、あるいは調整する事が、そ の様な治療学的研究の目的である。 アンチセンス方法論は、これら細胞内核酸の正常かつ重要な機能を崩壊するよ うに、比較的短いオリゴヌクレオチドを一本鎖RNAまたは一本鎖DNAに相補 的にハイブリダイズさせることである。ハイブリダイゼーションは、RNAまた はDNAとオリゴヌクレオチドの複素環式塩基とのワトソン−クリック塩基対を 介しての配列特異的水素結合である。その様な塩基対は、互いに相補的であると 言われる。 Cohen、オリゴヌクレオチド:遺伝子発現のアンチセンス阻害剤(Oli gonucleotides:Antisense Inhibitors o f Gene Expression)、CRC Press,Inc.,Bo ca Raton,F1(1989)に記載の通り、核酸機能の崩壊を提供する ような自然発生的事件には、少なくとも二つの型があると考えられる。第一の型 は、ハイブリダイゼーション停止である。これは、オリゴヌクレオチド阻害剤が 標的核酸に結合して、その結果、単純な立体障害によって、重要なタンパク質、 たいていはリボゾームの核酸との結合を妨害するという終結反応(termin ating event)を意味する。メチルホスフェートオリゴヌクレオチド (例えば、Millerら、Anti−Cancer Drug Design ,1987,2,117を参照の事)とα−アノマーオリゴヌクレオチドは、ハ イブリダイゼーション停止によって核酸機能を崩壊させると考えられる最も広範 囲にわたって研究されている2つのアンチセンス剤である。 オリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーション停止の能力を決定するために、 相補的核酸と結合するオリゴヌクレオチドの相対能力を、特定のハイブリダイゼ ーション複合体の融解温度を測定することによって比較することができる。融解 温度(Tm)は、二重らせんの特徴的物理学的性質であり、これは、らせん形( ハイブリダイズしている)対コイル形(ハイブリダイズしていない)が50%の 比率で存在する摂氏温度を意味している。Tmは、UVスペクトルを用いてハイ ブリダイゼーションの形成および崩壊(融解)を測定することによって測定され る。ハイブリダイゼーションの間に生ずる塩基のスタッキングは、UV吸収の減 少(淡色化)を伴う。結果的に、UV吸収の減少はより高いTmを示す。Tmが より高くなると、鎖の結合強度はより大きくなる。非ワトソン−クリック塩基対 、すなわち塩基の誤対合は、Tmに強い不安定化影響を持つ。 アンチセンスオリゴヌクレオチドが終結反応を起こす第2の型には、細胞内R Nアーゼによる標的RNAの酵素切断が関与する。その様なRNアーゼHによる 切断機構は、2'-デオキシリボフラノシルオリゴヌクレオチドが標的RNAにハ イブリダイズすることが必要である。その結果生じたDNA−RNAデュープレ ックスは、RNアーゼH酵素を活性化し;活性化された酵素はRNA鎖を切断す る。RNA鎖切断は、RNAの正常な機能を破壊する。ホスホロチオエートオリ ゴヌクレオチドは、この型の終結反応により作用する卓越したアンチセンス剤の 一つである。DNAオリゴヌクレオチドがRNアーゼHの活性化に有効であるた めには、オリゴヌクレオチドは、RNアーゼHを活性化するために十分な時間、 細胞内で生き残るためには、ヌクレアーゼに対して適度に安定でなければならな い。 Walderらは、最近の数報の発表で、RNアーゼHとオリゴヌクレオチド の相互作用についてさらに記載している。そのうち特に興味深いものには、(1 )Dagleら、Nucleic Acids Research,1990, 18,4751;(2)Dagleら、Antisense Research And Development,1991,1,11;(3)Ederら、 J.Biol.Chm.,1991,266,6472;および(4)Dagl eら、Nucleic Acids Research,1991,19,18 05: がある。これらの報告の中で、Walderらは、修飾されていないホスホジエ ステル−ヌクレオシド間結合と、修飾されたホスホロチオエート−ヌクレオシド 間結合の両方を持つDNAオリゴヌクレオチドが、細胞内RNアーゼHの基質に なることに注目している。それらは基質であるので、それらはRNアーゼHによ る標的RNAの切断を活性化する。しかしながら、さらに、著者らは、アフリカ ツメガエルの胚では、ホスホジエステル結合およびホスホロチオエート結合の両 方は、また、エキソヌクレアーゼ分解の対象でもあることに注目している。その 様なヌクレアーゼ分解は、それがRNアーゼH活性化に有効なヌクレオチドを急 速に涸渇させるために、好ましくない。参考文献(1)、(2)および(4)に 記載されているように、RNアーゼHの活性化を提供しつつヌクレアーゼ分解に 対してそれらのオリゴヌクレオチドを安定化させるために、Walderらは、 ホスホロアミダイト、アルキルホスホネートまたはホスホトリエステル結合の区 画の間に短い区画のホスホジエステル結合ヌクレオチドを配置した2'-デオキシ オリゴヌクレオチドを構築した。ホスホロアミダイトを含むオリゴヌクレオチド は、エキソヌクレアーゼに対して安定化されるが、参考文献(4)に記載するよ うに、著者らは、それぞれのホスホロアミダイト結合が、ホスホロアミダイトを 含むオリゴヌクレオチドのTm測定値を1.6℃減少させることに注目している 。その様なTm値の減少は、オリゴヌクレオチドとその標的鎖との間のハイブリ ダイゼーションにとって、望ましくない減少を示している。 他の著者らは、アンチセンスオリゴヌクレオチドとその標的鎖との間のハイブ リダイゼーションのその様な損失がもたらす影響について注釈している。Sai son−Behmoarasら、EMBO Journal,1991,10, 1111、は、オリゴヌクレオチドはRNアーゼHの基質になりうるが、mRN Aへのハイブリダイゼーションが弱いため、RNアーゼHによる切断効率は低い ことを見出だした。また、著者らは、オリゴヌクレオチドの3’末端にアクリジ ン置換が含まれると、オリゴヌクレオチドがエキソヌクレアーゼから保護される ことに注目した。 さらにまた、米国特許第5,149,797号(Pedersonら、199 2年9月22日発行)は、RNアーゼH機構によって作用するオリゴヌクレオチ ドについて記載している。この特許の請求の範囲のオリゴヌクレオチドは、メチ ルホスホネート、ホスホロモルホリデート、ホスホロピペラジデートまたはホス ホロアミデートに隣接するホスホロチオエートヌクレオチドから構成される内部 セグメントからなる。これらのオリゴヌクレオチドの成分、すなわち、ホスホロ チオエート、メチルホスホネート、ホスホロモルホリデート、ホスホロピペラジ デートまたはホスホロアミデートはすべて、オリゴヌクレオチド結合として個々 に用いられた場合には、オリゴヌクレオチドとその標的鎖との間のハイブリダイ ゼーションを減少させるので、Saison−Behmoarasらの説明は、 この特許に記載されているオリゴヌクレオチドにも等しく当てはまる。 アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびRNアーゼHを用いての標的RNA鎖 の切断が有効であろう事は認識されているが、オリゴヌクレオチドのヌクレアー ゼ耐性およびハイブリダイゼーションの忠実度もまた非常に重要である。ハイブ リダイゼーションの性質を維持または改良し、かつヌクレアーゼ耐性を提供する と同時にRNアーゼHを活性化することの出来る方法または物質は長い間必要と されてきたが、これまで当該技術分野においては、その様な方法および物質は示 唆されていない。従って、その様な方法および物質が切望される。発明の目的 本発明の目的は、結合親和性の改善された状態で標的鎖とハイブリダイズする 、キメラ高分子を提供することである。 さらなる目的は、ヌクレアーゼ分解に対する安定性を持つキメラ高分子を提供 することである。 さらに、本発明の目的は、標的鎖を切断するためにRNアーゼHを活性化する キメラ高分子を提供することである。 さらに、本発明の目的は、インビトロでの細胞の状態および動物の健康状態、 特に疾病状態をアッセイするための、研究および診断の方法ならびに物質を提供 することである。 他の目的は、標的RNAの活性を調節することを通して病気を治療するための 治療および研究方法ならびに物質を提供することである。発明の簡単な説明 本発明では、ペプチド核酸および2'-デオキシオリゴヌクレオチドから形成さ れる高分子が提供される。その様な高分子は、次の構造:PNA−DNA−PN A[式中、PNA部分はペプチド核酸配列であり、DNA部分はホスホジエステ ル、ホスホロチオエートまたはホスホロジチオエート2'-デオキシオリゴヌクレ オチド配列である]をもつ。高分子のPNA部分は、ヌクレアーゼ耐性を増加さ せ、標的RNAへの高分子の結合親和性を増加させると考えられる。2'-デデオ キシオリゴヌクレオチド部分は、RNアーゼH応答およびRNA標的鎖の切断を 誘発すると考えられる。 本発明の高分子の2'-デオキシオリゴヌクレオチド(即ちDNA)部分は、2 '-デオキシ−エリスロ−ペントフラノシル糖部分を持つヌクレオチド単位から形 成されるオリゴヌクレオチドセグメントである。それぞれのヌクレオチドは、ヌ クレオチドの2'-デオキシ−エリスロ−ペントフラノシル糖部分に結合したヌク レオベース(nucleobase)を含む。ヌクレオチドは、ホスホジエステ ル結合、ホスホロチオエート結合および/またはホスホロジチオエート結合によ って、互いにおよび/または他の部分と結合している。本発明のある望ましい高 分子では、高分子の2'-デオキシオリゴヌクレオチド部分のヌクレオチドのそれ ぞれが、ホスホロチオエート結合によって互いに結合している。他の望ましい実 施態様では、2'-デオキシオリゴヌクレオチド部分のヌクレオチドは、ホスホジ エステル結合によって互いに結合しており、さらに望ましい実施態様では、ホス ホジエステルおよびホスホロチオエート結合の混合物が、2’−デオキシオリゴ ヌクレオチドのヌクレオチド単位を互いに結合している。 高分子のペプチド核酸部分は、核酸の相補鎖への高分子の結合親和性を増加さ せる。さらに、細胞ヌクレアーゼによる分解に対する高分子のヌクレアーゼ安定 性を提供する。1つのまたはそれより多くのまたはそのすべてがホスホロチオエ ートまたはホスホロジチオエート結合からなる高分子の2'-デオキシオリゴヌク レオチド部分を選択することにより、本発明の高分子にさらなるヌクレアーゼ安 定性が与えられる。 本発明の高分子のPNA部分は、N-(2-アミノエチル)-グリシンからなるユニ ット、またはそのユニットのグリシン部分の窒素原子に、カルボキシメチル部分 またはその類似体のようなリンカーを通してそれに結合するヌクレオベースをも つ上記のN-(2-アミノエチル)-グリシンの類似体からなるユニットから構成され る。ユニットは、グリシン部分のカルボキシル基とアミノエチル部分のアミン基 との間に形成されるアミド結合を通して互いに連結されている。ヌクレオベース は、核酸の4つの一般的なヌクレオベースのーつであることができ、また、それ らは、その他の天然のまたは合成のヌクレオベースを含むこともできる。 本発明の望ましい高分子では、PNA−DNA−PNA構造は、それぞれのN −(2−アミノエチル)グリシンPNAユニットとそれぞれの2'-デオキシ− リスロ −ペントフラノシル糖ホスフェートDNAユニットを互いに繋ぎ合わせる ことによって形成される。この様に、本発明の高分子のPNA部分のヌクレオベ ースは、N−(2−アミノエチル)グリシンPNAユニットからなる骨格上に連 なり、本発明の高分子のDNA部分のヌクレオベースは、2'-デオキシ−エリス −ペントフラノシル糖ホスフェートユニットからなる骨格上に連なっている。 本発明の高分子のPNA部分のヌクレオベースおよびDNA部分のヌクレオベー スは、共に、それらのそれぞれの骨格ユニットによって、例えば標的RNA鎖の ような相補的核酸にハイブリダイズできる順序(配列)に接続される。 本発明の望ましい高分子では、PNAおよびDNA部分は互いにアミド結合で つながっている。本発明のその様な望ましい高分子では、構造: PNA−(アミド結合)−DNA−(アミド結合)−PNA: の高分子である。PNAとDNA部分をつなぐのに用いることができる他の結合 には、アミン結合およびエステル結合が含まれる。 本発明の高分子は、望ましくは、総数約9から約30のヌクレオベースを含有 するサブユニットからなる。より望ましくは、高分子は、約15から約25のヌ クレオベースを含有するサブユニットからなる。上記のように、RNアーゼH応 答を誘発するための、この全体配列のうちの高分子の長さは、3より大きく望ま しくは5またはそれより大きい連続する2'-デオキシ−エリスロ−ペントフラノ シル含有ヌクレオチドサブユニットのサブ配列であろう。 ペプチド核酸と2'-デオキシヌクレオチドサブユニットの両者にとって望まし い本発明のヌクレオベースとしては、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル 、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン、2−アミノアデニン、6−メチルおよ びその他のアルキルアデニン、2−プロピルおよびその他のアルキルアデニン、 5−ハロウラシル、5−ハロシトシン、5−プロピニルウラシル、5−プロピニ ルシトシン、7−デアザアデニン、7−デアザグアニン、7−デアザ−7−メチ ル−アデニン、7−デアザ−7−メチル−グアニン、7−デアザ−7−プロピニ ル−アデニン、7−デアザ−7−プロピニル−グアニンおよびその他の7−デア ザ−7−アルキルまたは7−アリールプリン、N2−アルキル−グアニン、N2 −アルキル−2−アミノ−アデニン、プリン6−アザウラシル、6−アザシトシ ンおよび6−アザチミン、5−ウラシル(シュードウラシル)、4−チオウラシ ル、8−ハロアデニン、8−アミノ−アデミン、8−チオールアデニン、8−チ オ−ルアルキルアデニン、8−ヒドロキシルアデニンおよびその他の8−置換ア デニンならびに8−ハログアニン、8−アミノグアニン、8−チオールグアニン 、8−チオールアルキルグアニン、8−ヒドロキシルグアニンおよびその他の8 −置換グアニン、その他のアザおよびデアザーウラシル、その他のアザおよびデ アザ−チミジン、その他のアザおよびデアザ−シトシン、アザおよびデアザ−ア デニン、アザおよびデアザーグアニンまたは5−トリフルオロメチルウラシルお よび5−トリフルオロシトシンが挙げられる。 また、本発明は、望ましくないタンパク質の生成を特徴とする病気をもつ生物 を治療する方法を提供する。これらの方法は、生物を、核酸の相補鎖に特異的に ハイブリダイズする能力を持つヌクレオベースの配列を持つ高分子と接触させる ことを含む。さらに、その方法は、ヌクレオベースの一部分がペプチド核酸サブ ユニット(PNAユニット)からなり、その残りのヌクレオベースは2'-デオキ シヌクレオチドサブユニット(DNAユニット)からなることを含む。ペプチド 核酸サブユニットおよびデオキシヌクレオチドサブユニットは互いに結合して、 PNA−DNA−PNA(PNAはペプチド核酸であり、DNAは2'-デオキシ オリゴヌクレオチドである)の構造を持つ高分子を形成する。 さらに、本発明では、核酸の相補鎖に特異的にハイブリダイズする能力を持つ ヌクレオベース配列をもつ薬学上有効な量の高分子を含む組成物が提供される。 さらに、方法は、ヌクレオベースの一部分がペプチド核酸サブユニット(PNA ユニット)からなり、残りのヌクレオベースは2'-デオキシヌクレオチドサブユ ニット(DNAユニット)からなる事を含む。ペプチド核酸サブユニット(PN A)およびデオキシヌクレオチドサブユニット(DNA)は互いに結合されて、 PNA−DNA−PNA構造の高分子を形成する。さらに、組成物は、薬剤とし て許容しうる希釈剤または担体を含む。 さらに、本発明では、上記のように、RNアーぜH酵素および核酸を含む試験 溶液をPNA−DNA−PNA高分子と接触させることを含む、特定の核酸の配 列をインビトロで修飾する方法が提供される。 また、上記のように、生物をPNA−DNA−PNA高分子と接触させること を含む、生物中でのハイブリダイゼーションおよびRNアーゼH酵素の活性化を 同時に増強する方法が提供される。図面の簡単な説明 図1は、本発明のある化合物の固相合成法を図解する化学スキームである。 図2は、本発明のある化合物の固相合成法を図解する化学スキームである。 図3は、本発明のある化合物の液相合成法を図解する化学スキームである。 図4は、本発明のある化合物の液相合成法を図解する化学スキームである。 図5は、本発明のある化合物の固相合成法を図解する化学スキームである。 図6は、本発明のある化合物の液相合成法を図解する化学スキームである。本発明の詳細な説明 本発明の目的に従って、ヌクレアーゼ耐性を増加させ、同時に、相補鎖への結 合親和性を増加させ、また、RNアーゼHの基質でもある、新規の高分子が提供 される。本発明の高分子は、複数のペプチド核酸サブユニット(PNAサブユニ ット)と複数の2'-デオキシヌクレオチドサブユニット(DNAサブユニット) から組み立てられている。それらを組み立てて、構造:PNA−DNA−PNA の高分子とする。それぞれのペプチド核酸サブユニットおよびそれぞれの2'-デ オキシヌクレオチドサブユニットは、標的RNA分子上、またはDNA分子およ びタンパク質を含むその他の標的分子上の同様のヌクレオベースと特異的にハイ ブリダイズする能力を持つヌクレオベースを含む。 本発明の高分子のペプチド核酸部分は、本発明の高分子のヌクレアーゼ耐性を 増加させる。さらに、これらの同一のペプチド核酸部分は、核酸の相補鎖への、 本発明の高分子の結合親和性をも増加させる。本発明の高分子の2'-デオキシヌ クレオチド部分は、それぞれ、その糖部分として2'-デオキシ−エリスロ−ペン トフラノシル基を含む。 上記のガイドラインに関連して、2'-デオキシヌクレオチドサブユニットの各 々は、“天然”または“合成”の部分であることができる。従って、本発明の文 脈では、“オリゴヌクレオチド”という用語は、第一に、複数の連結ししたヌク レオチドユニットから形成されるポリヌクレオチドをさす。ヌクレオチドユニッ トは、天然のヌクレオシド間ホスホジエステル結合を通して互いに連結される。 ヌクレオチドユニットは、天然型の塩基および2'-デオキシ−エリスロ−ペント フラノシル糖基から形成される。従って、“オリゴヌクレオチド”という用語は 、実質上、天然型の種または天然型ヌクレオチドユニットから形成される合成種 を含む。 オリゴヌクレオチドという用語は、天然型の構造ならびに(天然塩基と同様に 機能する修飾塩基部分を含む)非天然型または“修飾された”構造を含むことを 意味している。高分子の2’−デオキシオリゴヌクレオチド部分のヌクレオチド は、天然のホスホジエステル結合に加えて、その他の選ばれた合成結合で互いに 連結されうる。これらのその他の結合には、ホスホロチオエートおよびホスホロ ジチオエート糖間結合が含まれる。更に、適当な結合として考えられるものは、 ホスホロセレネートおよびホスホロジセレネート結合である。塩基部分、すなわ ち、2'-デオキシヌクレオチドのヌクレオベースは、天然の塩基、すなわちアデ ニン、グアニン、シトシン、ウラシルまたはチミジンを含みうる。あるいは、こ れらは、天然のプリンおよびピリミジン塩基の代わりに用いられるデアザまたは アザ−プリンおよびピリミジン;5または6位に置換基を持つピリミジン塩基; 2、6または8位に改変されたまたは置き換えられた置換基を持つプリン塩基; を含みうる。それらは、また、本発明の精神に一致するその他の修飾を含んでも 良い。その様な2'-デオキシオリゴヌクレオチドは、天然のオリゴヌクレオチド (または天然系に沿って合成されたオリゴヌクレオチド)と機能的に交換できる が、天然構造から一つまたはそれより多くの違いを持つものとして最もよく記載 される。その様な2'-デオキシオリゴヌクレオチドは、高分子中で有効に機能し て標的RNA鎖のRNアーゼH切断を誘発するかぎり、すべて、本発明に包含さ れる。 本発明の一つの好ましい実施態様では、高分子のペプチド核酸部分によって確 立される以上のヌクレアーゼ耐性が、ホスホロチオエート−ヌクレオチド間結合 を用いることによって得られる。Walderらの報告(上記)に反して、種々 の3'-エキソヌクレアーゼを含むウシ胎児血清の様な系の中では、ヌクレオシド 間結合をホスホジエステル結合からホスホロチオエート結合に修飾することはヌ クレアーゼ耐性を与えることが認められた。 最近、Brillら、J.Am.Chem.Soc.,1991,113,3 972,は、ホスホロジチオエートオリゴヌクレオチドもまたヌクレアーゼ耐性 を示すと報告している。これらの著者らは、また、ホスホロジチオエートオリゴ ヌクレオチドは、相補的デオキシオリゴヌクレオチドと結合し、RNアーゼHを 刺激し、かつlacリプレッサーおよびcroリプレッサーの結合を剌激するこ とを報告している。この様な性質故に、本発明の高分子の2'-デオキシオリゴヌ クレオチド部分にホスホロジチオエート結合を用いても良い。ホスホロジチオエ ートの合成方法は、Beatonら、“オリゴヌクレオチドホスホロジチオエー トの合成(Synthesis of oligonucleotides p hosphorodithioates)”、第5章、109頁、「オリゴヌク レオチドおよびその類似体(Oligonucleotides and An alogs)、実用研究法(A Practical Approach Se ries)」、Eckstein,F.編;The Ptactical Ap proach Series,IRL Press、New York、199 1、に記載されている。 ホスホロチオエートまたはホスホロジチオエート−ヌクレオチド間結合を用い ることによって、本発明の高分子にヌクレアーゼ耐性の増加が与えられる場合、 その様な結合は,それぞれのヌクレオチド間の部位に存在するであろう。その他 の実施態様では、すべてより少ないヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート またはホスホロジチオエート結合で修飾されるであろう。 本発明の高分子の結合親和性は、高分子のペプチド核酸部分によって増加する ことが見いだされた。例えば、10merのホモチミジンPNAをそれに相補的 な10merのホモアデノシンDNAに結合させた場合のTmは73℃であるの に対して、これに対応する10merのホノチミジンDNAを同様に相補的であ る10merのホモアデノシンDNAに結合させた場合のTmはわずか23℃で ある。 結合親和性はまた、本発明の2'-デオキシオリゴヌクレオチドを構成するヌク レオチドサブユニットおよびペプチド核酸サブユニットの両方にある種の修飾塩 基を用いることによって増加させることもできる。その様な修飾塩基は、5−プ ロピニルピリミジン、6−アザピリミジン、およびN−2、N−6、および2− アミノプロピルアデニンを含むO−6位の置換されたプリンを含むであろう。そ の他の修飾されたピリミジンおよびプリン塩基もまた、核酸相補鎖への高分子の 結合親和性を増加させることが予測される。 その様な構造ユニットの製造に用いるための、適当なヌクレオベースには、ア デニン、グアニン、シトシン、ウラシル、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン 、2−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの6−メチルならびにその他の アルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの2−プロピルならびにその他のアル キル誘導体、5−ハロ−ウラシルおよびシトシン、6−アゾ−ウラシル、シトシ ン およびチミン、5−ウラシル(シュードウラシル)、4−チオウラシル、8−ハ ロ、アミノ、チオール、チオールアルキル、ヒドロキシルならびにその他の8位 置換のアデニンおよびグアニン、5−トリフルオロメチルおよびその他の5位置 換のウラシルおよびシトシン、7−メチルグアニンおよびその他のヌクレオベー スが含まれ、それらには、例えば米国特許第3,687,808号、“The Concise Encyclopedia Of Polymer Scie nce And Engineering”,J.I.Kroschwitz編 、John Wiley & Sons,1990,858−859、およびE nglisch,U.およびGauss,D.H.,Angewandte C hemie、International Edition 1991、30、 613に開示されるものがある。 標的RNAのRNアーゼH酵素切断を誘発させるために、本発明の高分子は、 その中にDNA型セグメントであるセグメントまたはサブ配列を含んでいなくて はならない。他の点から言うと、本発明の高分子の少なくとも一部分は、2'-デ オキシ−エリスロ−ペントフラノシル糖部分を持つヌクレオチドサブユニットで なくてはならない。3つより多くの連続して結合した2'-デオキシ−エリスロ− ペントフラノシル含有ヌクレオチドサブユニットを持つサブ配列は、標的RNA と本発明の高分子のハイブリダイゼーションによるRNアーゼH活性を誘発する ために必要であるらしいことが認められた。現在のところ、本発明の高分子中に は、5またはそれより多くの連続した2'-デオキシ−エリスロ−ペントフラノシ ル含有ヌクレオチドサブユニットのサブ配列を持つことが望ましい。少なくとも 7つの連続する2'-デオキシ−エリスロ−ペントフラノシル含有ヌクレオチドサ ブユニットが特に望ましい。 本発明の高分子の全長は、長さ3から何百のサブユニットであることができる が、標的特異性はもっと短い分子で得る事ができるので、より実用的な最大の長 さは、長さ約30から約50のサブユニットであろう。より望ましい最大の長さ は、長さ約25サブユニットであろう。 標的によって、高分子の最小の長さは、3から約15の総サブユニットといろ いろであろう。実際には、アンチセンスオリゴヌクレオチドを用いるに当たって 、 一般的には、ハイブリダイゼーションにおける適当な親和性を保証するためには 、約15ヌクレオチドの最小の長さが必要であることが分かった。しかし、上に 記載したように、ペプチド核酸サブユニットは、標的分子に対して、ホスホロチ オエート−オリゴヌクレオチドより良い親和性を持つ正常なホスホジエステル− オリゴヌクレオチドと比較してより大きいハイブリダイゼーション親和性を持つ ので、本発明の高分子を用いる場合には、最小の長さは通常アンチセンスオリゴ ヌクレオチドとのアンチセンス結合に用いられるより小さいと予測することがで きる。これらの因子を考慮にいれると、高分子の望ましい長さは、総数約3から 約30のサブユニットであり、より望ましい範囲は長さ約9から約25のサブユ ニットであろう。 本発明の高分子では、PNAユニットの間に一つあるいはそれ以上の連続する DNAユニットが配置されるであろう。RNアーゼH応答を誘発させるためには 、上記のように、望ましくは、高分子のDNA部分は、少なくとも3つの2'-デ オキシヌクレオチドユニットを持つであろう。DNAユニットの数の上限を決定 するために、高分子の全長、用いるホスフェート結合、標的配列に対する望まし い忠実度およびその他の因子を含む幾つかの因子が考慮される。通常は、経済的 考慮により、本発明の高分子では、標的分子に特異的に結合するために、また、 所望するならば、RNアーゼH応答を引き出すために必要であるよりも多いヌク レオベースを持たないことが望ましい。RNアーゼHの機能を利用するためには この数は一般的に約5ヌクレオチドである。さらに、ホスホロチオエートおよび ホスホロジチオエート−リン酸結合はそれ自身ヌクレアーゼ耐性を示すので、こ れらの2つのリン酸結合を用いると、ヌクレアーゼ耐性のために高分子のPNA 部分に頼らなくてはならないホスホジエステルサブユニットと比較して、より長 くのびるDNAサブユニットを用いることができる。これらの要素を考慮に入れ ると、本発明の高分子を含む特に望ましい範囲は、長さ9から約28のサブユニ ットであり、2'-デオキシヌクレオチドサブユニットに続いて位置する約5から 約8のその様なサブユニットを持つ。 RNアーゼHの作用機構は、DNA−RNAデュープレックスを認識し、それ に次いでこのデュープレックスのRNA鎖を切断する。発明の背景の項に上記し たように、この技術分野でのその他の者は、DNA鎖にヌクレアーゼ安定性を与 えるために修飾したDNA鎖を用いてきた。これを行うために、彼らは、ヌクレ アーゼ安定性を増加させるが、同時にハイブリダイゼーション特性を減少させる ような修飾されたリン酸結合を用いてきた。 本発明者は、理論に拘束されることを望むものではないが、本発明の高分子に おいては、ペプチド核酸ユニットを高分子の2'-デオキシオリゴヌクレオチド部 分の両端に置くことによって、高分子にヌクレアーゼ安定性を与えるであろうこ とを認識している。さらに、この事は、相補鎖への結合および特異性を増加させ るであろう。 再度、特定の理論に拘束されることを望むものではないが、本発明者は、RN A鎖の切断を認識し誘発させるためにRNアーゼHが満たさなくてはならないあ る種の規準を認識している。これらの第一は、RNA鎖は切断部位で、リン酸結 合を通して連結された負電荷を帯びたヌクレオシドを持っていなければならない 事である。さらに、切断部位のヌクレオシドの糖は、β−ペントフラノシル糖で なければならず、また、2’エンドコンフォメーションでなくてはならない。こ の規準を満たすヌクレオシド(ヌクレオチド)は、2'-デオキシ−エリスロ−ペ ントフラノシル β−ヌクレオシドのホスホジエステル、ホスホロチオエート、 ホスホロジチオエート、ホスホロセレネートおよびホスホロジセレネート−ヌク レオチドのみである。 上記の規準の観点から、2’エンドコンフォーメーション(例えば、シクロペ ンチルヌクレオシド)で存在することが示されたある種のヌクレオシドでさえ、 ペントフランノシル糖を結合していないので、RNアーゼH活性を誘発しないで あろう。モデルは、オリゴヌクレオチド4’−チオヌクレオシドはエンベロープ コンフォメーションで存在するが、2’エンドコンフォメーションで存在しない ので、その様なヌクレオシド残基もまたRNアーゼH活性を誘発しないであろう ことを示している。さらに、α−ヌクレオシドは、β−ペントフラノシル糖とは 逆の立体配座であるため、それらもまた、RNアーゼH活性を誘発しないであろ う。 非糖のテザー基を通して、または非リン酸結合を通してリン酸結合に連結され るヌクレオベースもまた、2’エンドコンフォメーションでβ−ペントフラノシ ル糖を持つと言う規準に合わない。従って、それらは、恐らく、RNアーゼH活 性を誘発しないであろう。 本発明の高分子の2'-デオキシオリゴヌクレオチド部分に取り込ませるために 、ヌクレオシドは、ジメトキシトリチル基で5’位をブロックし、次いで、3’ 位をホスフィチル化(phosphitylation)されるであろう。トリ チル化およびホスフィチル化の方法は、「オリゴヌクレオチドおよびその類似体 、実用的研究法(Oligonucleotides and Analogs ,A practical Approach)」、Eckstein,F.編 、実用的研究法シリーズ(The Practical Approach S eries)、IRL Press,New Youk,1991、に報告され ている。オリゴヌクレオチド中への取り込みは、ABI380Bモデルシンセサ イザーのようなDNAシンセサイザーを用いて、ホスホジエステル、ホスホロチ オエートまたはホスホロジチオエート−リン酸結合を形成するために適当な化学 を用いて、Echsteinの前掲引用書中に説明されている合成のプロトコー ルにしたがって行われるであろう。 本発明の高分子の2'-デオキシヌクレオチドサブユニットおよびペプチド核酸 サブユニットは、共有結合で結び付けられ、高分子のサブユニットを望ましいヌ クレオベース配列に固定する。望ましい長さに結び付けられた共有結合連結(c ovalent interconnection)は、高分子の2つの隣り合 った領域のそれぞれの間で形成される。望ましくは、共有結合連結は、隣り合う 領域を形成する異なる型のサブユニット部分の両方に共有結合を形成できる連結 部分を選択することによって成し遂げられる。望ましくは、連結部分は、連結部 分と異なる型の部分の間に得られる原子鎖が同じ長さであるように選択される。 本発明の一つの望ましい実施態様では、2'-デオキシヌクレオチドとペプチド核 酸サブユニットを相互連結する連結基として特に有用なものはアミド結合である 。その他の実施態様では、アミンおよびエステル結合を用いることができる。 本発明の高分子のペプチド核酸サブユニット部分(PNA部分)は、一般式( I): [式中: nは少なくとも2であり、 L1−Lnはそれぞれ、水素、ヒドロキシ、(C1−C4)アルカノイル、天然型 のヌクレオベース、非天然型のヌクレオベース、芳香族部分、DNAインターカ レーター、ヌクレオベース結合基、複素環式部分、およびレポーターリガンドか らなる群より独立的に選択され、L1−Lnの少なくとも1つは、天然型ヌクレオ ベース、非天然型ヌクレオベース、DNAインターカレーター、またはヌクレオ ベース結合基であり; C1−Cnはそれぞれ、(CR67yであり、ここでR6は水素であり、R7は 天然型のα−アミノ酸の側鎖からなる群より選択されるか、またはR6およびR7 は、水素、(C2−C6)アルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヒ ドロキシ、(C1−C6)アルコキシ、(C1−C6)アルキルチオ、NR34およ びSR5[ここで、R3およびR4は上に定義した通りであり、R5は水素、(C1 −C6)アルキル、ヒドロキシ−、アルコキシ−もしくはアルキルチオ−置換( C1−C6)アルキルである]からなる群より独立的に選択されるか、またはR6 およびR7が一緒になって脂環式または複素環式系を作り上げ; D1−Dnはそれぞれ(CR67zであり、R6およびR7は上記の通りであり ; yおよびzはそれぞれ0または1から10までの整数であり、y+zの和は2 より大きいが10以下であり; G1−Gn-1のそれぞれは、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS −、−NR3SO−、または−NR3SO2−であり、R3は上記の通りであり; A1−AnおよびB1−Bnの組み合わせは、それぞれ: (a)Aは式(IIa)、(IIb)または(IIc)の基の一つであり、 BはNまたはR3+である;または (b)Aは式(IId)の基であり、BはCHである; [式中: Xは、O、S、Se、NR3、CH2またはC(CH32であり; Yは、単結合、O、SまたはNR4であり; pおよびqはそれぞれ、0または1から5までの整数であり、p+qの和は1 0以下であり; rおよびsはそれぞれ、0または1から5までの整数であり、r+sの和は1 0以下であり; R1およびR2のそれぞれは、水素、またはヒドロキシ−もしくはアルコキシ− もしくはアルキルチオで置換されていてもよい(C1−C4)アルキル、ヒドロキ シ、アルコキシ、アルキルチオ、アミノおよびハロゲンからなる群より独立的に 選択され; G1−Gn-1はそれぞれ、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS− 、−NR3SO−または−NR3SO2−であり、ここでR3は上記の通りであり; Qは、−CO2H−、−CONR'R''、−SO3Hもしくは−SO2NR'R'' または−CO2Hもしくは−SO3Hの活性化誘導体であり;そして Iは、−NHR'''R''''または−NR'''C(O)R''''であり、ここでR' 、R''、R'''およびR''''は、水素、アルキル、アミノ保護基、レポーターリ ガンド、インターカレーター、キレーター、ペプチド、タンパク質、炭水化物、 脂質、ステロイド、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ヌクレオチドジホスフェート 、ヌクレオチドトリホスフェート、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシドな らびに可溶性および不溶性ポリマーからなる群より独立的に選択される]である 。 望ましいペプチド核酸は、一般式(IIIa)−(IIIc): [式中: Lはそれぞれ、水素、フェニル、複素環式部分、天然型のヌクレオベース、お よび非天然型のヌクレオベースからなる基より独立的に選択され; R7'は、水素および天然型α−アミノ酸の側鎖からなる群より独立的に選択さ れ; nは、1から60の整数であり; k、l、およびmはそれぞれ、独立的に0または1から5の整数であり; pは、0または1であり; Rhは、OH、NH2または−NHLysNH2であり; Riは、HまたはCOCH3である: を持つ。 特に望ましいものは、式(IIIa)−(IIIc)を持つ化合物であり、式 中、Lはそれぞれ、ヌクレオベースであるチミン(T)、アデニン(A)、シト シン(C)、グアニン(G)およびウラシル(U)からなる群より独立的に選択 され、kおよびmは、0または1であり、nは1から30、特に4から20の整 数である。 本発明の高分子のペプチド核酸部分は、溶液中かまたは固相上のどちらかで、 一般的には、特許出願PCT/EP/01219(WO92/20702として 1992年11月26日に公開)または米国特許出願08/088,658(1 993年7月2日出願)、または同等の方法にしたがって合成される。これらの 特許出願の内容は、参照としてここに取り入れられる。 用いられたシントン(synthon)は、モノマーのアミノ酸またはその活 性化誘導体であり、標準的な保護基によって保護されている。PNAもまた、関 連するジ酸およびジアミンを用いることによって合成することができる。 本発明の新規のモノマーシントンは、一般式(IV)、(V)、(VI): [式中、L、A、B、CおよびDは上記の通りであるが、ただしその中の任意の アミノ基がアミノ保護基で保護されていても良く;Eは、COOH、CSOH、 SOOH、SO2OHまたはその活性化誘導体であり;かつFは、NHR3または NPgR3であり、ここでR3は上記の通りであり、かつPgはアミノ保護基であ る] をもつアミノ酸、ジ酸およびジアミンからなる群より選択される。 本発明の望ましいモノマーシントンは、式(VIIIa)−(VIIIc): [式中、Lは、水素、フェニル、複素環式部分、天然型ヌクレオベース、および 非天然型ヌクレオベースからなる基より選択され;かつR7'は、水素および天然 型α−アミノ酸側鎖よりなる群より選択される] またはそのアミノ保護および/または酸末端活性化誘導体をもつ。 本発明の化合物は、診断、治療に、ならびに研究用試薬およびキットとして用 いることができる。さらに、いったん試験システムで活性であると確認されれば 、化学療法薬を含む他の活性化合物の試験システムにおいて標準として用いるこ とができる。薬剤として許容しうる適当な希釈剤または担体とともに混合した本 発明の高分子を有効量含有させることにより、薬剤組成物としても利用できる。 さらに、望ましくないタンパク質生成を特徴とする疾患を持つ生物を治療するた めに用いることもできる。生物を、望ましくないタンパク質をコードする核酸の 鎖と特異的にハイブリダイズできる配列を持つ本発明の高分子と接触させること ができる。 その様な治療的処置は、単細胞原核生物および真核生物から多細胞真核生物ま での範囲のいろいろな生物で実施することができる。その遺伝、代謝または細胞 の制御の基本部分としてDNA−RNA転写またはRNA−タンパク質翻訳を用 いるいずれの生物も、その様な治療的および/または予防的処置が可能である。 細菌、酵母、原生生物、藻類、全植物および温血動物を含むすべての高等動物の ように外見上は異なった生物を、この治療法で処置できる。さらに、多核真核生 物の細胞の各々は、それらの細胞活性に不可欠な部分としてDNA−RNA転写 およびRNA−タンパク質翻訳の両方を含むので、その様な治療および/または 診断もまた、その様な細胞集団で実施することができる。さらに、真核生物細胞 の多くのオルガネラ、例えばミトコンドリアおよびクロロプラストもまた、転写 および翻訳の機構を含んでいる。このように、単一の細胞、細胞集団またはオル ガネラもまた、本発明の治療的または診断的オリゴヌクレオチドで治療すること のできる生物の定義の内に含まれうる。ここで用いるように、“治療”とは、疾 病状態の根絶、例えば細菌、原生動物類あるいはその他の伝染病の生物の殺傷、 または遊走性あるいは有害な細胞の増殖または発現の制御の両方を含むことを意 味する。 例証の目的で、本発明の化合物を、ras−ルシフェラーゼ−トランス活性化 を用いるras−ルシフェラーゼ融合システム中で用いた。「ras−オンコジ ンのアンチセンス阻害(Antisense Inhibition of R AS Oncogene)」と称し、本出願と共に譲受された米国特許出願番号 07/715,196(1991年6月14日提出)に記載されている(その全 体の内容をここに参照として取り入れる)ように、ras−オンコジンは、原形 質膜の内側表面に位置する関連タンパク質をコードする遺伝子ファミリーの構成 員である。ras−タンパク質は、アミノ酸レベルで高い保存性を持ち、高い親 和性および特異性でGTPに結合し、かつGTPアーゼ活性を持つことが示され ている。ras遺伝子生成物の細胞性機能は未知であるが、それらの生化学的性 質は、GTP結合タンパク質またはGタンパク質として知られているシグナル伝 達タンパク質の一種との明らかな配列相同性と共に、ras遺伝子生成物は、原 形質膜を通る細胞外シグナルの伝達に関する基礎的な細胞制御機能に重要な役割 を演じていることを示唆する。 H−ras、K−rasおよびN−rasと名付けられた3種のras遺伝子 が、哺乳動物のゲノム中で同定された。哺乳類のras遺伝子は、コード配列内 の単一の点突然変異によってトランスフォーメーションを誘導する性質を獲得す る。天然型ras−オンコジンの突然変異は、コドン12、13および61に位 置することが見いだされている。H−ras、K−rasおよびN−rasの配 列は既知である。Caponら、Nature,302、1983,33−37 ;Kahnら、Anticancer Res.,1987,7,639−65 2;HallおよびBrown、Nucleic Acids Res.,19 85,13,5255−5268。ヒトの腫瘍中に認められる最も共通に検出さ れる活性化rasの突然変異は、H−ras遺伝子のコドン12中にあり、そこ では、GGCからGTCへの塩基の変化が、結果として、rasタンパク質産物 のGTPアーゼ制御ドメイン中にグリシンからバリンへの置換を生ずる。Tab in,C.J.ら、Nature,1982,300,143−149;Red dy,P.E.ら、Nature,1982,300,149−152;Tap arowsky,E.ら、Nature,1982,300,762−765。 この単独のアミノ酸変化は、ras−タンパク質機能の正常な制御を妨害し、そ れ故、正常に制御されていた細胞タンパク質を連続的に活性なタンパク質に変え ると考えられる。正常なras−タンパク質機能のその様な脱制御は、正常な増 殖から悪性増殖へのトランスフォーメーションの原因であると考えられている。 Moniaら、J.Bio.Chem.,1993,268,14514−14 522は、最近、トランス活性化レポーター遺伝子システムにより、キメラ“G ap”(非デオキシオリゴヌクレオチドに隣接される2'-デオキシオリゴヌクレ オチドを持つ構造)が、インビトロでHa−ras オンコジンに対して活性で あることを示している。上記のアッセイで活性である本発明の化合物は、インビ トロでの化学療法薬スクリーニングテストの標準として用いることができる。 本発明の化合物は、固相合成または液相合成の両方により製造することができ る。両方法は、実施例に示されている。実施例に示すように、実施例1は、本発 明の高分子の2'-デオキシオリゴヌクレオチド部分の一般的な合成法である。実 施例2、3および4のスキームは、図1に図解している。実施例2は、固相支持 体樹脂への高分子の右側PNA部分のカルボキシ末端の固定を図解して記載して いる。実施例3は、高分子のこの右側PNA部分の伸長、および3'-カルボキシ ヌクレオチドを通しての最初の2'-デオキシヌクレオチドへのアミド結合の形成 について記載している。実施例4は、高分子の第2のPNA(左側)部分へアミ ド結合をもたらすための、5'-アミノヌクレオチドの付加を含む高分子の中央の 2'-デオキシオリゴヌクレオチド部分の伸長を図解している。実施例5および6 のスキームは、図2に示されている。実施例5は、左側PNA部分の完成を示し ている。実施例6は、ブロック基の除去および樹脂からの除去を説明している。 実施例7のスキームは、図3に示されている。実施例7は、5'-アミノ−3'-ヌ クレオチドを5'-末端ヌクレオチドとして位置させるための液相DNA結合の形 成について説明している。実施例8および9のスキームは、それぞれ図4および 5に示されている。実施例8は、本発明の高分子のPNA部分の、DNA部分へ の液相結合について説明している。この実施例では、実施例7のオリゴヌクレオ チドを第1の“T”PNAサブユニットと結合させ;これに対して、実施例9で は、第1の“A”PNAサブユニットを、高分子の2'-デオキシオリゴヌクレオ チド部分に結合させる。実施例10、11および12のスキームは、図6に示さ れている。実施例10、11および12は、本発明の高分子のDNA部分のPN A部分への液相結合について説明している。 以下の実施例では、サブユニットがペプチド核酸(PNA)グループかまたは 2'-デオキシヌクレオチド(DNA)グループのどちらであるかには関係なく、 サブユニットを、標準的な大文字による一文字表記、即ちA、G、CまたはT、 を用いて表示する。その様な表記は、サブユニット中に取り込まれたヌクレオベ ースを示している。すなわち、“A”は、2'-デオキシアデノシンヌクレオチド 、並びにアデニン塩基を含むペプチド核酸サブユニットの両方を表示するために 用いられる。ペプチド核酸サブユニットでは、アデニン塩基はカルボキシメチル 連結基を通してN−(2−アミノエチル)グリシン骨格と結合する。標準的ヌク レオチド結合、即ち、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホロジチオ エートまたはホスホロセレネートは、2つの隣合う表示文字の間のハイフォン( −)で示し、例えばA−Tは、チミジンヌクレオチドに連結したアデノシンヌク レオチドを示している。ペプチド核酸結合を示すために、(p)または(pna )のどちらかが用いられ、例えば、A(p)−Tは、チミンペプチド核酸ユニッ トに連結したアデニンペプチド核酸ユニットを示す。 2'-デオキシヌクレオチドとペプチド核酸ユニットの間の結合の変換は、括弧 ( )で示される。したがって、“T−(3’−カルボキシ)−A”は、アデニ ン−ペプチド核酸サブユニットの2−アミノエチル部分のアミン部分に結合した カルボキシ基をその3’位にもつチミジンヌクレオシドを示している。これに対 して、“A−(5’−アミノ)−T”は、隣り合ったチミン−ペプチド核酸サブ ユニットのグリシン部分のカルボキシ部分に結合したアミンを5’位に持つチミ ジンヌクレオチドを示している。末端基、例えば、カルボキシ、ヒドロキシル、 N−アセチルグリシンおよびその類似体は、適当なシンボル表記法を用いて示さ れる。 カルボベンゾキシブロッキング基は、肩文字Z、例えばzとして示される。フ ェノキシアセチル保護基は、肩文字PAC、例えばPACとして示される。記載し た標準的なポリスチレン−メリフィールド(Merrifield)樹脂の代わ りとして、ファルマシア(Pharmacia)から購入した高架橋ポリスチレ ン、またはラップポリメレ(Rapp Polymere)から購入したテンタ ゲル(Tentagel)と呼ばれるポリエチレングリコール/ポリスチレング ラフト共重合体を用いてもよい。本発明の高分子を都合よく除去するためには、 グリシンをエステル結合を通して樹脂に結合させるべきである。 以下の実施例および方法は、本発明を説明するためのものであって、制限する ものではない。 実施例1 オリゴヌクレオチドの合成: 本発明の高分子のオリゴヌクレオチド部分は、ヨウ素による酸化を用いた標準 的ホスホロアミデートの化学を用いて、自動DNAシンセサイザー(Appli ed Biosystems model 380B)で合成される。ホスホロ チオエートオリゴヌクレオチドのためには、標準酸化瓶を、ホスファイト結合を 段階的にチエーションするために、0.2Mの3H−1,2−ベンゾジチオール −3−オン 1,1−ジオキシド/アセトニトリル溶液に置き換える。チエーシ ョンの待ち段階は、68秒に増加させ、次いでキャッピング段階を行った。別に 指示しないかぎり、CPGカラムから切断し、濃水酸化アンモニウム中55℃( 18時間)で脱ブロッキングした後、オリゴヌクレオチドは、2.5倍容量のエ タノールで、0.5M−NaCl溶液から2度沈殿させることによって精製する 。分析用ゲル電気泳動は、20%アクリルアミド、8M尿素、454mMトリス −ホウ酸緩衝液、pH7.0で行った。ホスホジエステルおよびホスホロチオエ ートオリゴヌクレオチドは、ポリアクリルアミドゲル電気泳動からその物質の長 さを判定する。 実施例2 低充填のt−ブチルオキシカルボニルグリシルメリフィールド樹脂 ヒドロキシメチルポリスチレン樹脂(1g、650μMヒドロキシ/g)は、 固相のペプチド合成用容器に入れ、ジクロロメタン(DCM、2回 10ml) 、 N,N−ジメチルホルムアミド(DMF、2回 10ml)およびアセトニトリ ル(2回 40ml)で順番に(それぞれの洗浄について1分間振とうして)洗 浄した。丸底フラスコに、N−t−ブチロキシカルボニルグリシン(701mg 、4mM)およびO−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1、1、3、3−テ トラメチルウロニウム テトラフルオロホウ酸塩(1.156g、3.6mM) を加えた。無水アセトニトリル(40ml)をバイアルに加え、次いでN,N− ジイソプロピルエチルアミン(1.392ml、8mM)を加えた。フラスコは 、すべての固体が溶解するまで振とうした。1分後、バイアルの内容物をペプチ ド合成用容器に加え、125分間振とうした。次いで、反応溶液を流し、支持体 をアセトニトリル(1回 40ml)、ピリジン(2回 40ml)およびDM F(2回 40ml)で洗浄した。DMF中の10%(v/v)無水酢酸溶液( 全40ml)を樹脂に加え、反応は40分間振とうして行った。反応溶液を流し た後、無水酢酸キャップを上記のように繰り返した。2回目のキャッピング反応 の最後に、樹脂を、DMF(2回 40ml)、ピリジン(1回 40ml)、 およびDCM(3回 40ml)で洗浄した。次いで、樹脂はアルゴンを吹き付 けることによって乾燥させた。 グリシン誘導体化の程度は、ニンヒドリン定量アッセイによって測定した。上 の樹脂(50mg)のアリコートを、固相ペプチド合成容器中に置き、DCM( 2回 3ml)で洗浄した。次いで、樹脂は、トリフルオロ酢酸中の5%(v/ v)のm−クレゾール溶液(3ml)で3回、それぞれ2分ずつ振とうして、処 理した。3回目の反応溶液を流し去った後、樹脂は、DCM(3回 3ml)、 ピリジン(3回 3ml)およびDCM(3回 3ml)で洗浄した。次いで、 樹脂はアルゴンを吹き付けることによって乾燥させた。 脱保護した乾燥させた樹脂のアリコート(5mg)を試験管に入れた。この樹 脂に、70%(v/v)水/ピリジン(80μl)の溶液、カイザー試薬1(1 00μl、2%のH2O/ピリジン中の200μM−KCN)、試薬2(40μ l、n−BuOH中の5%(w/v)ニンヒドリン)、および試薬3(50μl 、n−BuOH中の80%(w/v)フェノール)を加えた。反応は100℃で 10分間加熱して行い、冷却し、60%(V/V)EtOH(7ml)で希釈し た。 次いで、570nmの吸光度は、樹脂を含まない対照反応液、およびグリシンエ チルエステルの定量を元にした標準曲線と比較した。1gの樹脂当たり100μ Mのグリシンの誘導体化レベルが得られた。 実施例3 5'-ヒドロキシ−T(3'-カルボキシ)-T(P)-Cz(p)-Az(p)-Gz(p)-Gly−−O −樹脂 t−ブチルオキシカルボニルグリシルメリフィールド樹脂(200mg、10 マイクロ当量、実施例1)は、固相ペプチド合成用容器に入れる。支持体は、5 0%DMF/DCM(4回 5ml)で洗浄し、次いで、5%のm−クレゾール /トリフルオロ酢酸(4ml)で2回、それぞれ2分間ずつ振とうして処理する 。支持体は、再び50%DMF/DCM(4回 5ml)で、次いでピリジン( 5回 5ml)で洗浄する。バイアルに、N2−ベンジルオキシカルボニル−1 −(t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)グアニン(80μM )およびO−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチ ルウロニウム−テトラフルオロホウ酸塩(72μM)を加える。N,N−ジメチ ルホルムアミド(0.4ml)およびピリジン(0.4ml)を、次いで、N, N−ジイソプロピルエチルアミン(160μM)をバイアルに加える。バイアル は、すべての固体が溶解するまで、振とうする。1分後、バイアルの内容物をペ プチド合成用容器に加え、20分間振とうする。次いで、反応溶液を流し、支持 体をピリジン(4回 5ml)で洗浄する。残った結合していないアミンは、N ,N−ジメチルホルムアミド中のN−ベンジルオキシカルボニル−N'-メチルイ ミダゾールトリフレートの10%溶液(0.8ml)を加えることによってキャ ップする。5分間振とう後、キャッピング溶液を流し、支持体を再びピリジン( 4回 5ml)で洗浄する。 上の段落に記載した通り、脱保護、カップリングおよびキャッピングは、さら に3種のPNAモノマー:N6−ベンジルオキシカルボニル−1−(t−ブチル オキシカルボニル−アミノエチルグリシル)アデニン、N4−ベンジルオキシカ ルボニル−1−(t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)シトシ ン、および1−(t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシン)チミン :について繰り返す。 次に、脱保護、カップリングおよびキャッピングはもう一度繰り返すが、この 場合に用いたモノマーは、5'-(t−ブチルジフェニルシリル)−3'-カルボキ シメチルチミジンである。キャッピング反応後、樹脂をピリジン(3回 3ml )およびDMF(3回 3ml)で洗浄する、無水THF(3ml)をフラスコ に加え、次いで45μlの70%(v/v)HF/ピリジンを加える。一晩振と う後、樹脂はTHF(5回 3ml)、DMF(3回、3ml)、アセトニトリ ル(5回 3ml)およびDCM(5回 3ml)で洗浄する。次いで、アルゴ ンを吹き付けることにより樹脂を乾燥する。 実施例4 T(5'-アミノ)−GPAC−CPAC−APAC−T−T(3'-カルボキシ)−−T(p) -Cz(p)-Az(p)-Gz(p)-Gly−O−樹脂 5'-ヒドロキシ−T(3'-カルボキシ)−Gz(p)-Cz(p)-Az(p)-T(p)-Gly −O−樹脂(10マイクロ当量、実施例3)をDNA合成カラムに入れる。標準 的なDNA合成(実施例1)を、環外アミン上にはフェノキシアセチル保護基、 リン上には2−シアノエチル基、および5'-ヒドロキシル上には4,4'-ジメト キシトリチル基を含むホスホルアミダイトを用いて行う。結合させた5'-末端ホ スホロアミダイトは、5'-(モノメトキシトリチルアミノ)チミジン−3'-(N ,N−ジイソプロピルアミノ−2−シアノエチル)ホスホルアミダイトである。 モノメトキシトリチル基は、DCM中のジクロロ酢酸を用いて標準的自動処理に よって除去する。DCMで洗浄後、樹脂は減圧下で乾燥させる。 実施例5 N−アセチルグリシル−T(p)-T(p)-Cz(p)-T(p)−Cz(p)−Gz(p)-Cz (p)-COOH ヒドロキシメチルポリスチレン樹脂(115mg、74マイクロ当量)を、固 相ペプチド合成用容器に入れた。支持体をDCM(3回3ml)、DMF(3回 3ml)、ピリジン(3回3ml)、さらに再びDMF(2回3ml)で洗浄し た。バイアルにN4−ベンジルオキシカルボニル−1−(t−ブチルオキシカル ボニル−アミノエチルグリシル)シトシン(151mg、300μM)およびO −(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウ ム−テトラフルオロホウ酸塩(87mg、270μM)を加えた。N,N−ジメ チルホルムアミド(1.25ml)およびピリジン(1.25ml)をバイアル に加え、次いで、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(105μl、600μ M)を加えた。バイアルは、すべての固体が溶解されるまで振とうした。1分後 、バイアルの内容物をペプチド合成容器に加え、30分間振とうした。次いで、 反応溶液を流し去り、支持体をDMF(4回3ml)で洗浄した。Cモノマーの カップリングは上記のように繰り返した。次いで、樹脂は、N,N−ジメチルホ ルムアミド中の10%N−ベンジルオキシカルボニル−N'-メチル−イミダゾー ルトリフレート(2.25ml)を加え、次いで5分間振とうすることによって キャップした。最後に、樹脂は、ピリジン(4回3ml)で洗浄し、次いで鎖伸 長用に準備した。 支持体は、50%DMF/DCM(4回3ml)で洗浄し、次いで、トリフル オロ酢酸中の5%m−クレゾール(3ml)で2回、それぞれ2分間振とうして 、処理した。支持体は、再び50%DMF/DCM(4回3ml)で、次いで、 ピリジン(5回3ml)で洗浄した。バイアルに、N2−ベンジルオキシカルボ ニル−1−(t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)グアニン( 163mg、300μM)およびO−(ベンゾトリアゾ−1−リル)−1,1, 3,3−テトラメチルウロニウムーテトラフルオロホウ酸塩(87mg、270 μM)を加えた。N,N−ジメチルホルムアミド(1.25ml)およびピリジ ン(1.25ml)をバイアルに加え、次いで、N,N−ジイソプロピルエチル アミン(105μl、600μM)を加えた。バイアルは、すべての固体が溶解 するまで振とうした。1分後、バイアルの内容物をペプチド合成用容器に加え、 20分間振とうした。次いで、反応溶液を流し、支持体をピリジン(5回3ml )で洗浄した。残った非結合のアミンは、N,N−ジメチルホルムアミド中のN −ベンジルオキシカルボニル−N'-メチルイミダゾール−トリフレートの10% 溶液 (2.25ml)を加えることによってキャップした。5分間振とうした後、キ ャッピング溶液を流し、支持体を再びピリジン(4回3ml)で洗浄した。 上の段落に記載したように、脱保護、カップリングおよびキャッピングは、次 のような順序で、PNAモノマー:N4−ベンジルオキシカルボニル−1−(t −ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)シトシン、および1−(t −ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)チミン、N4−ベンジルオ キシカルボニル−1−(t−ブチルオキシカルボニルアミノエチルグリシル)シ トシン、1−(t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)チミン、 1−(t−ブチルオキシカルボニルアミノエチルグリシル)−チミン,さらに次 にN−アセチルグリシン:で繰り返した。最後のカップリング反応を行った後、 樹脂をピリジン(5回3ml)およびDCM(4回3ml)で洗浄した。次いで 、樹脂は、アルゴンを吹き付けることによって乾燥させた。 樹脂の一部分(29mg、10マイクロ当量)を固相ペプチド合成用容器に入 れ、テトラヒドロフラン(2.5ml)を加え、次いで、飽和水性炭酸水素カリ ウム(0.25ml)および硫酸水素テトラブチルアンモニウム(34mg、1 00μM)の水溶液を加えた。次いで、反応は、14時間、室温で振とうして行 った。水(1ml)を反応液に加え、その結果、白色固体の沈殿物を得た。液体 を濾過で除去し、保存した。次いで、樹脂および白色固体に、第一回目の洗浄で 加えた水(1ml)をさらに加えて洗浄した。減圧下で乾燥状態にまで濃縮する と、その結果、ピンクの油の混じった白色固体が得られた。水(6ml)を加え 、pHを固体KHSO4で2に調整した。次いで、液体および懸濁した黄色固体 をエッペンドルフ(Eppendorf)チューブに移し、固体を遠沈した。溶 媒を除去し、残った黄色固体は、0.1%TFAを含む水中の30%アセトニト リルに再溶解した。逆層クロマトグラフィーを行った結果、所望の生成物(2. 6mg,1μM)を得た:分子質量=2498[電気噴霧(electrosp ray)マススペクトロメトリ]。 実施例6 N−アセチルグリシル−T(p)-T(p)-C(p)-T(p)-C(p)-G(p)-C(p)-T(5'- アミノ)−G−C−A−T−T(3'-カルボキシ)−T(p)-C(p)-A(p)-G(p)- Gly−COOH T(5'-アミノ)−GPAC−CPAC−APAC−T−T(3'-カルボキシ)−T(p) -Cz(p)-Az(p)-Gz(p)-Gly−O−樹脂(5マイクロ当量、実施例3)を固相ペ プチド合成用容器にいれる。樹脂は、DCM(3回3ml)、DMF(3回3m l)、およびピリジン(3回3ml)で洗浄する。バイアルにN−アセチルグリ シル−T(p)-T(p)-Cz(p)-T(p)-Cz(p)-Gz(p)-Cz(p)-COOH(10μM、 実施例5の様に調製される)およびO−(ベンソトリアゾール−1−イル)−1 ,1,3,3−テトラメチルウロニウム−テトラフルオロホウ酸塩(9μM)を 加える。N,N−ジメチルホルムアミド(0.3ml)およびピリジン(0.3 ml)をバイアルに加え、次いで、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(20 μM)を加える。バイアルは、すべての固体が溶解するまで、振とうする。1分 後、バイアルの内容物を、ペプチド合成用容器に加え、4時間振とうする。次い で、反応溶液を流し、支持体をピリジンで5回洗浄する。 テトラヒドロフラン(2ml)を樹脂に加え、次いで、飽和水性炭酸水素カリ ウム溶液(0.2ml)および硫酸水素テトラブチルアンモニウム(27mg、 80μM)を加える。反応は、14時間、室温で振とうして行った。次いで、溶 液を流し、保持する。樹脂を50%テトラヒドロフラン/水(3回1ml)およ び水(3回2ml)で洗浄する。洗浄溶液を反応溶液に加え、減圧下で濃縮して 、有機溶媒を除去する一濃縮は最終容量が2mlになった時点で停止する。無機 物はゲル濾過によって除去する。粗物質を15mMの酢酸水溶液(10ml)に 溶解し、真空下での脱ガス化および窒素の逆充填を交互に4回行う。BaSO4 上のパラジウム(5%,30mg)を加え、溶液を室温で2時間攪拌する。触媒 は濾過によって除去し、次いで、生成物は逆層HPLCによって精製する。 実施例7 5'-アミノ−デオキシチミジリル−(3'-5’)−3'-O−t−ブチルジフェニ ルシリル−デオキシチミジン(H2N−T−T) 3'-t−ブチルジフェニルシリルデオキシチミジン(58mg、120μM) および5'-(p−メトキシトリフェニルメチルアミノ)−3'-[O−(2−シア ノエチル)−N,N−ジイソプロピルアミノホスホルアミジル]デオキシチミジ ン(71mg、100μM)を別々の10ml丸底フラスコにいれ、それぞれ無 水ピリジン(2ml)で一度、無水アセトニトリル(1.5ml)で2度、共蒸 発させた。次いで、化合物はそれぞれ無水アセトニトリル(0.75ml)中に 溶解し、合わせた。反応は、無水アセトニトリル中の0.4M 1H−テトラゾ ール溶液(1ml,400μMテトラゾール)を加えることによって開始した。 50分間室温で撹拌した後、反応は、酸化溶液(10mlの0.43%I2/9 0.54%THF、0.41%ピリジンおよび9.05%水)中に注ぐことによ って急冷した。 酸化反応は、さらに40分間攪拌し、ジクロロメタン(50ml)および水( 20ml)を含む分離用漏斗に注いだ。残ったヨウ素は、有機層を0.3%ピロ 亜硫酸ナトリウム水溶液(95ml)で洗浄することによって除去した。次いで 、有機層は、減圧下で回転蒸発させることによって濃縮して黄色油状物とした。 黄色油状物は、減圧下、トルエン(2×15ml)で共蒸発させ、残留ピリジン を除去した。 次いで、粗物質はジクロロメタン(6ml)に溶解し、トリチル基は、3%ト リクロロ酢酸/ジクロロメタン溶液(3ml)を加えることによって除去した。 15分間、室温で攪拌した後、反応は、飽和水性冷(4℃)炭酸水素ナトリウム (10ml)を含む分離用漏斗に注ぐことによって急冷した。さらに、ジクロロ メタン(20ml)を加え、有機層を分離した。水層に残留した乳濁液は、さら にジクロロメタン(20ml)を加えることによって溶かした。次いで、2つの 有機層を合わせて、減圧下で乾燥するまで濃縮した。所望の生成物は、得られた 黄褐色の粗固体から、20%(v/v)エタノール/クロロホルム、0.2%N ,N−ジイソプロピルエチルアミン(49mg、63μM,63%)中で分離用 シリカTLCによって、精製した。Rf[20%(v/v)エタノール/クロロ ホルム、0.2%N,N−ジイソプロピルエチルアミン]=0.05;1H N MR(200MHz,MeOH−d4) d 7.65(m,4H),7.4( m,8H),6.45(m,1H),5.95(m,1H),4.6(m,1H ), 4.1(m,2H),3.9(m,1H),3.6(m,1H),3.2(m, 1H),2.9(m,2H),2.5−2.0(m,4H),1.89(s,6 H),1.1(s,9H);31P NMR(MeOH−d4)d 0.85;E SMS m/e 782。 実施例8 DMT−O−T(pna)−CONH−T−TのN,N−ジイソプロピルエチル アンモニウム塩 H2N−TpT(25mg、30μM)を1:1のDMF/ピリジン(0.8 ml)に溶解した。分離用バイアルに1−(O−4,4'-ジメトキシトリチル− ヒドロキシエチルグリシル)チミン(23.5mg、40μM)およびO−(ベ ンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム テ トラフルオロホウ酸塩(11.6mg、36μM)を加えた。バイアルの内容物 は、1:1のDMF/ピリジン(0.8ml)およびN,N−ジイソプロピルエ チルアミン(14μl、80μM)中に溶解した。5分後、活性化したエステル 溶液を、H2N−TpT溶液に加えた。反応は、室温で80分間攪拌して行い、 エチルアルコール(0.5ml)を加えて急冷した。さらに150分後、反応混 合液は、減圧下で濃縮し、乾燥させた。得られた固体は、分離用シリカTLCを 用いて、20%(v/v)エタノール/クロロホルム、0.2%N,N−ジイソ プロピルエチルアミン(27mg、20μM、67%)で展開することによって 、精製した。Rf[20%(v/v)エタノール/クロロホルム、0.2%N, N−ジイソプロピルエチルアミン)=0.18;1H NMR(200MHz, DMSO−d6) d 11.35(m,3H),8.95(brs,0.3H ),8.72(brs,0.7H),7.79(m,2H),7.61−7.1 9(m,22H),6.91(m,4H),6.36(m,1H),6.03( m,1H),4.78(m,2H),4.59(s,1H),4.41(m,3 H),4.20(s,1H),3.93(m,2H),3.65(s,2H), 3.18(brs,3H),2.97(m,2H),3.74(s,6H),3 .42(m,4H),2.01(brs,4H),1.77(m,7H),1. 62 (s,2H),1.03(m,15H);13C NMR(DMSO−d6):1 67.9,164.6,163.8,158.2,150.5,144.9,1 43.0,136.1,135.7,132.9,130.2,129.8,1 28.1,127.8,126.8,123.4,118.6,113.4,1 10.7,110.1,107.9,86.3,84.0,83.0,74.8 ,74.5,61.3,56.2,55.1,47.5,26.8,18.7, 12.1:31P NMR(DMSO−d6) d −0.2,−1.05;ES MS m/e 1351. 実施例9 tBOC−Az(pna)−CONH−T−TのN,N−ジイソプロピルエチル アンモニウム塩 H2N−TpT(19mg、24μM)を1:1のDMF/ピリジン(0.6 5ml)に溶解した。別のバイアルに、N6−ベンジルオキシカルボニル−1− (t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)−アデニン(12.7 mg、24μM)およびO−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3, 3−テトラメチルウロニウム テトラフルオロホウ酸塩(7.1mg、22μM )を加えた。バイアルの内容物は、1:1のDMF/ピリジン(0.65ml) およびN,N−ジイソプロピルエチルアミン(8.4μl、48μM)に溶解し た。2分後、活性化されたエステル溶液を、H2N−TpT溶液に加えた。反応 は、室温で105分間、攪拌して行い、エチルアルコール(0.5ml)を加え ることによって急冷した。さらに120分後、反応混合物は、減圧下で濃縮し乾 燥させた。得られた固体は、分離用シリカTLCを用い、20%(v/v)エタ ノール/クロロホルム、0.2%N,N−ジイソプロピルエチルアミン(6mg 、5μM、21%)で展開することによって精製した。Rf[20%(v/v) エタノール/クロロホルム、0.2%N,N−ジイソプロピルエチルアミン)= 0.07;1H NMR(200MHz,DMSO−d6) d 11.37( s,1H),11.22(s,1H),10.64(brs,1H),9.17 (brs,0.3H),8.90(brs,0.7H),8.59(m,2H) ,8. 30(m,1H),7.80(M,1H),7.58(S,3H),7.38( m,12H),7.16(m,1H),6.36(m,1H),6.04(m, 1H),5.43(m,1H),5.32(s,1H),5.23(s,2H) ,5.1(s,1H),4.42(m,3H),4.19(m,1H),3.9 8(s,1H),3.87(m,3H),3.77(m,1H),3.66(m ,1H),3.02(m,2H),22.68(m,1H),2.03(m,4 H),1.74(m,6H),1.02(m,30H);13P NMR(DMS O−d6) d −0.01,−0.8。 実施例10 1−(t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)チアミン、エチル エステル 1−(t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)チミン(300 mg、780μM)は、50%のDMF/ピリジン(3.0ml)に溶解し、N ,N−ジイソプロピルエチルアミン(0.25ml、1.44mM)を加えた。 5分間撹拌した後、O−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3− テトラメチルウロニウム テトラフルオロホウ酸塩(350mg、1.1mM) を加えて、薄オレンジ色の溶液を得た。反応は30分間攪拌して行った。その後 、無水エタノール(0.75ml、4.26mM)を加えた。さらに90分間撹 拌した後、反応混合物を減圧下で濃縮して油状物を得た。油状物は、酢酸エチル (30ml)中に溶解し、5℃に冷却した。精製生成物は、白色固体として沈殿 し、濾過によって集めた。(289mg、701μM、90%):1H NMR (200MHz,CDCl3) d 8.33(brs,1H),7.02(s ,0.3H),6.97(s,0.7H),5.58(m,1H),4.59( s,1.4H),4.43(s,0.6H),4.1(s,2H),3.54( m,2H),3.33(m,2H),1.92(s,3H),1.47(s,9 H)。 実施例11 TBDPS−T−CONH−T(pna)−OEt 1−(t−ブチルオキシカルボニル−アミノエチルグリシル)チミン(30m g、72μM)のエチルエステルを1.0mlのトリフルオロ酢酸中に溶解し、 室温で30分間攪拌した。これを真空下で濃縮し、次いで、5mlのトルエンで 2回、共蒸発させた。5'-O−t−ブチルジフェニルシリル−3'-カルボキシメ チルデオキシリボチミジン(25mg、48μM)は、0.400mlの1:1 のDMF/ピリジン溶液中に溶解した。この溶液に、TBTU(21mg、65 μM)およびN,N−ジイソプロピルエチルアミン(25μl、144μM)を 加えた。反応液は、薄いオレンジ色になり、これを30分間攪拌した。TFA脱 保護段階からのアミンを0.6mlのDMF/ピリジンに溶解し、活性化カルボ キシチミジン溶液に加え、室温で1時間攪拌した。TLC分析(20%MeOH /DCM)は、すべての活性化酸が消費されたことを示した。溶液を真空下で濃 縮して油状物とした。油状物は、2mmの分離用TLCプレート(20mm×2 0mm)上で、溶出溶媒として20%のMeOH/DCMを用いて精製した。最 も極性の低いフラクションが、PNA−DNAキメラを含み、所望の生成物を白 色固体(25mg、36μM、50%)として得た。1 H NMR(200MHz,CDCl3) d 9.8(brs,1H),9. 6(brs,1H),7.7(m,4H),7.3(m,9H),7.0(dd ,1H),6.2(m,1H),4.5−3.4(12H),2.9(m,1H ),2.5−2.1(m,4H),1.5(s,3H),1.3(d,6H), 1.1(s,9H);13CNMR(CDCl3):d 11.764,12.0 83,12.391,14.144,26.796,27.055,29.70 8,35.232,37.177,37.788,38.932,48.298 ,61.486,64.854,84.476,85.018,111.110 ,127.711,129.980,135.407,135.654,140 .976,150.835,151.555,167.416,172.192 ;ESMS m/e 817. 実施例12 T−CONH−T(pna)−OEt 上記のダイマー(30mg、0.058mM)は、1mlの乾燥THF中に溶 解することによって脱シリル化し、0℃に冷却した。これに、20mlの70% のHF/ピリジンを加え、10mlの1Mフッ化テトラブチルアンモニウム溶液 を加え、反応混合液を一晩攪拌した。TLC(10%MeOH/DCM)は、反 応が完了したことを示した。溶液は、1mlの飽和NaHCO3を加えて急冷し 、ガス蒸発が終わるまで攪拌した。水層は、さらに5mlの水を加えて希釈し、 3mlの酢酸エチルで2回抽出した。有機層は、集めて捨てた。水層は、乾燥す るまで蒸発させ、脱保護したダイマーおよびNaHCO3の混合物を得た。混合 物をメタノール中に懸濁し、20×20cm、0.5mmの分離用TLCプレー トを2枚用い、クロロホルム中30%エタノールで溶離することによって精製し た。プレートは溶離を終えた後、乾燥させ、蛍光帯をかきとり、抽出した。抽出 物を濾過し、蒸発させると、少量のフッ化テトラブチルアンモニウムの混濁した 12mgの脱保護ダイマー(収率56%)を得た。1 H(CD4OD):1.0−1.5(mm,10H);1.5(m,2H);1 .9(s,6H);2.1−2.8(mm,6H);3.2−4.0(mm,1 5H);4.1−4.4(m,4H);4.7(s,1H);6.1(m,1H );7.3(s,1H);8.0(s,1H)。 実施例13 (5'-DMT)−Az−T−(3'-カルボキシ)−T(pna)(シアノエトキ シ保護ホスホジエステル結合を含む) 実施例12の脱保護ダイマー(12mg、0.0207mM)を無水ピリジン で2回、無水アセトニトリルで2回、共蒸発させた。得られた白色固体を1:1 のアセトニトリル:DMF3ml中に溶解した。この溶液に、1mlの0.1M −アデノシンホスホルアミダイトおよび1mlの0.4M 1H−テトラゾール 溶液を加えた。これを、周囲温度で1時間攪拌し、次いで、さらに1mlのアミ ダイトを加え、攪拌をさらに1時間続けた。終了時に10mlの酸化溶液(90 .54%THF、0.41%ピリジンおよび9.05%水中の0.43%I2) を 加え、反応液を1時間攪拌した。反応液は25mlの1M−亜硫酸水素ナトリウ ム溶液を加えて急冷した。この溶液は、クロロホルム2×20mlで抽出し、集 めた抽出物を別の亜硫酸水素溶液の一部分25mlで洗浄し、僅かに黄色の有機 層を得た。クロロホルム溶液は、硫酸マグネシウム上で乾燥させ、濃縮して黄色 油状物とした。混合物は、20×20cmの分離用TLCプレート(2枚、0. 5mmコーティング)を用い、ジクロロメタン中の20%アセトンで溶離して精 製した。トリマーのジアステレオマー混合物は、93%の収率で25mgの油状 物として単離した。1 H(CDCl3):1.2(m,13H);2.5−3.2(mm,5H);3 .4(m,4H);3.7(s,6H);4.1(m,1H);4.4(m,1 H);5.2(m,1H);6.5(m,1H);6.8(m,4H);7.3 (m,10H);7.5(m,3H);8.0(d,2H);8.2(d,2H );8.7(s,1H);9.1(s,1H);31P(CDCl3):8.24 7,8.116。 実施例14 NH4OH脱保護条件下でのPNAオリゴマーの安定性 第一の場合、遊離のアミノ末端を含むPNAオリゴマー(H−TAT−TCC −GTC−ATC−GCT−CCT−CA−Lys−NH2)(すべてPNA) を、70%の濃NH4OH中に溶解した。反応液は23℃でインキュベートし、 アリコートは以下に示す時間点に逆層HPLCで試験した。第二の実験では、グ リシルでキャップしたアミノ末端を持つPNAオリゴマー(H−Gly−TGT −ACG−TCA−CAA−CTA−Lys−NH2)(すべてPNA)を、9 0%濃NH4OH中に溶解し、シールしたフラスコ中、55℃に加熱した。 遊離のアミノ末端を含むPNAオリゴマーのNH4OH安定性は、PNA/D NAキメラから塩基保護基を除去するには不十分であった。グリシル基でアミノ 末端をキャッピングすると、水性塩基に対するPNAの安定性が大きく増加した 。グリシル−キャップPNAは、11時間点でほんの少し分解され、23時間後 15%が分解された。グリシン−キャップPNAは、フェノキシアセチル保護基 を 除去するために用いる条件下では完全に安定であり、標準的DNA塩基保護基( ベンゾイルおよびイソブチリルアミド)に用いる条件にも比較的安定である。結 果を表1に示す。 実施例15 アミンおよびエステル結合を通して結合した中央の2'-デオキシホスホロチオエ ートオリゴヌクレオチド領域に隣接するペプチド核酸領域を持つ高分子 ペプチド核酸の第一領域は、上記の実施例2により調製される。ペプチド核酸 領域は、アミン基保護モノマーを用いてC末端からN末端へ向かって調製される 。第一のペプチド領域が完成した後、末端アミンのブロック基を除去し、得られ たアミンは、Vasseurら、J.Am.Chem.Soc.,1992,1 14,4006、の方法に従って調製した3'-C−(ホルミル)−2',3'-ジデ オキシ−5'-トリチルヌクレオチドと反応させる。C−ホルミルヌクレオシドの アルデヒド部分とアミンとの縮合は、Vasseur、同上、の条件により行わ れ、イミン結合中間体を得た。イミン結合は、Vasseur、同上、の還元ア ルキル化条件下、HCHO/NaBH3CN/AcOHで還元して、メチルアル キル 化アミン結合を通してペプチド核酸に結合させたヌクレオシドを得た。次いで、 中央になる2'-デオキシホスホロチオエートヌクレオチド領域は、実施例1のプ ロトコールに従って、このヌクレオシドに続けて伸長した。第二のペプチド領域 のためのペプチド合成は、ヌクレオチドのジメトキシトリチルブロッキング基を 除去した後、DNA領域の最後のヌクレオチドの5’ヒドロキシと、第二領域の 最初のペプチド核酸のカルボキシ末端とを反応させることによって開始する。カ ップリングは、ピリジン中のEDCを通して行われ、ペプチドとヌクレオシドの 間にエステル結合が形成される。次いで、ペプチド合成が続けられ、第二のペプ チド核酸領域が完成する。 実施例16 中央の2'-デオキシホスホロセレネートオリゴヌクレオチド領域に隣接するペプ チド核酸領域を持つ高分子 高分子の2'-デオキシヌクレオチド部分にホスホロセレネート結合を導入する ことを除いて、実施例15の合成を繰り返し、酸化は、Stawinskiら、 Tenth International Roundtable:Nucle osides,Nucleotides and Their Biologi cal Evaluation,September16−20、1992、A bstracts of Papers,Abstract80に報告されてい る方法にしたがって、3H−1,2−ベンゾチアセレノ−3−オールを用いて行 った。 実施例17 中央の2'-デオキシホスホロジチオエ一トオリゴヌクレオチド領域に隣接するペ プチド核酸領域をもつ高分子 高分子の2'-デオキシヌクレオチド部分へホスホロジチオエート結合を導入す ることを除いて、実施例15の合成を繰り返し、酸化は、Beatonら、「オ リゴヌクレオチドおよびその類似体」、第5章、「オリゴヌクレオチドホスホロ ジチオエートの合成」、109頁、A Practical Approach , Eckstein,F.編;The Practical Approach Series,IRL Press,New York 1991、の方法を用 いて行う。 方法1 ras−ルシフェラーゼレポーター遺伝子の組み立て ras−ルシフェラーゼレポーター遺伝子はPCR法を用いて組み立てた。オ リゴヌクレオチドプライマーは、ヒトのH−ras遺伝子の変異体(コドン12 )および非変異体(野生型)の両方のエキソン1の5’領域のPCRクローニン グのためのプライマーとして用いるために合成した。c−H−ras1活性化オ ンコジン(コドン12、GGC→GTC)を含むプラスミドpT24−C3、お よびc−H−ras プロトオンコジンを含むpbc−N1は、America n Type Culture Collection(Bethesda M D)から得た。1.9kbのホタルのルシフェラーゼ遺伝子を含むプラスミドp T3/T71ucは、Clontech Laboratories(Palo Alto,CA)より得た。オリゴヌクレオチドPCRプライマーは、鋳型と して変異体および非変異体のH−ras遺伝子を用いる標準的PCR反応に用い た。これらのプライマーは、正常および変異体のH−rasの(翻訳開始部位と 比較して)配列−53から+65に相当し、NheIおよびHindIIIの制 限エンドヌクレアーゼ部位に隣接する、145塩基対のDNA生成物を生成する 。PCR生成物は、標準法に従って、ゲル精製し、沈殿し、洗浄して、水中に再 懸濁した。 P.pyralis(ホタル)のルシフェラーゼ遺伝子のクローニング用PC Rプライマーは、PCR生成物がアミノ末端メチオニン残基を除いて全長のルシ フェラーゼタンパク質をコードするように、かつアミノ末端メチオニン残基を2 つのアミノ酸、すなわちアミノ末端のリジン残基および続くロイシン残基に置き 換えるように設計した。ルシフェラーゼ遺伝子のクローニングに用いるオリゴヌ クレオチドPCRプライマーは、ルシフェラーゼレポーター遺伝子を含む商品と して入手できるプラスミド(pT3/T7−Luc)(Clontech)を鋳 型として用いる標準PCR法に用いた。これらのプライマーは、ルシフェラーゼ 遺伝子に対応し、唯一のHindIIIおよびBssHII制限エンドヌクレア ーゼ部位を両端に持つ、おおよそ1.9kbの生成物を生ずる。このフラグメン トは、標準法に従って、ゲル精製し、沈殿させ、洗浄し、さらに水中に再懸濁し た。 ras−ルシフェラーゼ融合レポーター遺伝子の組み立てを完成させるために 、rasおよびルシフェラーゼのPCR生成物を、適当な制限エンドヌクレアー ゼで消化し、制限エンドヌクレアーゼNheI、HindIIIおよびBssH IIを用いてステロイド誘導性マウス乳房腫瘍ウイルスプロモーターMMTVを 含む発現ベクター中に3部分連結反応によってクローン化した。得られたクロー ンは、ホタルルシフェラーゼ遺伝子とフレームが合うように融合されたH−ra s5’配列(−53から+65)が挿入されていた。得られた発現ベクターは、 ステロイド−誘導性MMTVプロモーターの制御下で発現するras−ルシフェ ラーゼ融合生成物をコードする。これらのプラスミド構築物は、ホタルのルシフ ェラーゼをコードする配列とフレームが合うように融合された活性化型(RA2 )または正常型(RA4)H−rasタンパク質のアミノ酸1−22をコードす る配列を含む。ras−ルシフェラーゼ融合mRNAの翻訳開始は、天然のH− rasのAUGコドンに依存する。変異体および正常型のH−rasルシフェラ ーゼ融合構築物の両方を、標準法によるDNA配列分析によって確認した。 方法2 プラスミドDNAの細胞へのトランスフェクション トランスフェクションは、Greenberg,M.E.,Current Protocols in Molecular Biology,(F.M. Ausubel,R.Brent,R.E.Kingston,D.D.Moo re,J.A.Smith,J.G.SeidmanおよびK.Strahl編 、John Wiley and Sons,NY,)に記載の方法を次のよう に変更して行った。HeLa細胞は、60mmの皿に5×105細胞/皿で塗布 した。全量で10μgまたは12μgのDNAをそれぞれの皿に加えた。この内 、 1μgは、構成的ラウス肉腫ウイルス(RSV)プロモーターの制御下でラット のグルココルチコイド受容体を発現するベクターであり、残りはras−ルシフ ェラーゼレポータープラスミドである。リン酸カルシウム−DNA共沈殿物は、 16−20時間後に3mM−EGTAを含むトリス緩衝食塩水[50mMトリス −塩酸(pH7.5)、150mM−NaCl]で洗浄することによって除去し た。次いで、10%ウシ胎児血清を補充した新鮮な培養液を細胞に加えた。この 時点で、細胞を本発明の高分子で前処理し、その後デキサメタゾンによってレポ ーター遺伝子の発現を活性化した。 方法3 細胞の処理 プラスミドのトランスフェクションに次いで、細胞は、前もって37℃に暖め ておいたリン酸緩衝食塩水で洗浄し、5μg/mlのN−[1−(2,3−ジオ レイルオキシ)プロピル]−N,N,N−トリメチルアンモニウムクロリド(D OTMA)を含むOpti−MEMを、それぞれのプレートに(1.0ml/穴 で)加える。試験化合物は、それぞれのプレートに50μMのストックから加え 、4時間37℃でインキュベートする。培養液を除去し、10%のウシ胎児血清 を含むDMEMおよび指示濃度の適当な試験化合物で置き換え、細胞をさらに2 時間37℃でインキュベートし、その後、最終濃度0.2μMのデキサメタゾン で細胞を処理することによってレポーター遺伝子の発現を活性化する。細胞を収 集し、デキサメタゾン刺激後15時間で、ルシフェラーゼ活性についてアッセイ する。 方法4 ルシフェラーゼアッセイ ルシフェラーゼは、Greenberg,M.E.,Current Pro tocols in Molecular Biology,(F.M.Aus ubel,R.Brent,R.E.Kingston,D.D.Moore, J.A.Smith,J.G.SeidmanおよびK.Strahl編)、J ohn Wiley and Sons,NY、に記載の方法に従って、界面活 性剤トリトンX−100で溶菌することによって、細胞から抽出する。Dyna tech ML1000ルミノメーターを用いて、ルシフェリン(Sigma) を625μMになるように加えたときのピークの蛍光を測定した。それぞれの抽 出物について、ルシフェラーゼアッセイはいろいろな時間に行い、異なる量の抽 出物を用いて、データがアッセイの直線の範囲に集まることを確かめた。 方法5 融解曲線 吸光度対温度曲線は、IBM PCコンピューターに接続したGilford 260分光光度計およびGilford Response 11分光光度計を 用いて260nmで測定する。緩衝液は、100mM Na+、10mMホスフ ェートおよび0.1mM−EDTA、pH7を含んでいた。試験化合物濃度は、 85℃の吸光度、ならびにPuglisiおよびTinoco,Mechods in Enzymol.,1989,180,304−325に記載の方法に 従って計算した吸光係数から測定して、それぞれの鎖あたり4μMである。Tm 値、デュープレックス形成の自由エネルギーおよび会合定数は、直線傾斜基本線 を持つ二状態モデルにデータを合わせることから得られる。Petershei m,M.およびTurner,D.H.,Biochemistry 1983 ,22,256−263。報告されるパラメーターは、少なくとも3回の実験の 平均である。幾つかの試験化合物では、デュープレックス形成の自由エネルギー もまた、Tm-1対log10(濃度)のプロットから得られる。Borer,P. N.,Dengler,B.,Tinoco,I.,Jr.,およびUhlen beck,O.C.,J.Mol.Biol.,1974,86,843−85 3。 方法6 ゲルシフトアッセイ 構築したras標的転写産物である、変異コドン12を含む47ヌクレオチド ヘアピンは、Limaら、Biochemistry,1991,31,120 55−12061に記載の方法に従って、調製しマッピングした。ハイブリダイ ゼーション反応は、100mMナトリウム、10mMリン酸塩、0.1mM−E DTA、100CPMのT7−生成RNA(おおよそ10pM)、および1pM から10μMの濃度範囲の試験化合物を含む20μl中で調製される。反応は、 24時間37℃でインキュベートして行われる。ハイブリダイゼーションに次い で、負荷緩衝液を反応物に加え、反応生成物は、45mMのトリス−ホウ酸およ び1mM−MgCl2(TBM)を用いて調製した20%ポリアクリルアミドゲ ル上、未変性で解析する。電気泳動は10℃で行い、ゲルはMolecular Dynamics Phosphorimagerを用いて定量した。 方法7 RNアーゼH分析 RNアーゼH分析は、活性化された(コドン12、G→U)H−ras mR NAの塩基+23から+47に対応する25塩基のオリゴリボヌクレオチドの化 学合成物を用いて行った。5'-末端を標識したRNAは、濃度20nMで用い、 10倍モル過剰の試験化合物と共に、20mMトリス−Cl、pH7.5、10 0mM−KCl,10mM−MgCl2、1mMジチオスレイトール、10μg −tRNAおよび4U−RNsinを含む反応溶液中で、最終容量10μlでイ ンキュベートする。反応成分は、37℃で15分間、プレアニールし、次いで、 ゆっくり室温に冷却する。HeLa細胞核抽出物は、啼乳動物RNアーゼHの源 として用いられる。反応は、2μgの核抽出物(5μl)を加えることによって 開始し、37℃で10分間、反応を進行させる。反応は、フェノール/クロロホ ルム抽出によって停止させ、RNA成分をエタノールで沈殿させる。同量のCP Mを、7M尿素を含む20%ポリアクリルアミドゲルに負荷し、RNA切断生成 物を電気泳動によって解析し、視覚化し、次いで、オートラジオグラフする。切 断生成物の定量は、Molecular Dynamics Densitom eterを用いて行う。 方法8 rasトランス活性化レポーター遺伝子システム 発現プラスミドpSV−oliは、構成的SV40プロモーター制御下の活性 化(コドン12、GGC→GTC)H−ras cDNA挿入物を含み、Bru no Tocque博士(Rhone−Poulenc Sante Vitr y France)より頂いた。このプラスミドは、鋳型として用いられ、PC Rによって、ステロイド誘導性マウス乳房腫瘍ウイルス(MMTV)プロモータ ーの制御下のH−ras発現プラスミドを構築する。H−rasコード配列を得 るために、H−ras遺伝子の570bpのコード領域をPCRによって増幅さ せる。PCRプライマーは、クローニングを容易にするためにその5'-領域に唯 一の制限エンドヌクレアーゼ部位を持つようにデザインされる。H−rasコド ン12突然変異オンコジンのコード領域を含むPCR生成物は、ゲル精製し、消 化し、クローニングする前にもう一度ゲル精製する。この構築物は、発現プラス ミドpMAMneo(Clontech Laboratories,CA)中 に挿入物をクローニングすることによって完成される。 ras−応答性レポーター遺伝子pRDO53は、ras発現を検出するため に用いられる。Owenら、Proc.Natl.Acad.Sci.,U.S .A.,1990,87,3866−3870。 方法9 インビボでのras発現のノーザンブロット分析 ヒト泌尿器膀胱癌細胞株系T24は、American Type Cult ure Collection(Rockville MD)より得た。細胞は ,L−グルタミン(Gibco BRL,Gaithersburg MD)と 共に、10%熱不活性化ウシ胎児血清およびそれぞれ50U/mlのペニシリン およびストレプトマイシンを補充した、McCoy's 5A培地中で増殖させ る。細胞は、100mmプレートに接種した。細胞は、集密度が70%達したと きに、試験化合物で処理される。プレートは、10mlの前もって暖めておいた PBS、および2.5μl−DOTMAを含むOpti−MEM還元血清培地5 mlで洗浄する。次いで、試験化合物を所望の濃度で加える。4時間処理した後 、培地は McCoy's培地で置き換える。細胞は試験化合物処理後48時間で収集し、 RNAを標準CsCl沈殿法で分離する。Kingston,R.E.、Cur rent Protocols in Molecular Biology( F.M.Ausubel,R.Brent,R.E.Kingston,D.D .Moore,J.A.Smith,J.G.SeidmanおよびK.Str ahl編)、John Wiley and Sons,NY。 ヒトの上皮癌細胞株HeLa229は、American Type Cul ture Collection(Bethesda,MD)から得た。HeL a細胞は、10%ウシ胎児血清および100U/mlペニシリンを補充したDu lbecco's Modified Eagle's 培地(DMEM)中、6 穴プレート上に単層で維持される。試験化合物での処理およびRNAの分離は、 本質的に、上記のT24細胞の所に記載した通りである。 ノーザンハイブリダイゼーション: それぞれ10μgのRNAは、1.2% アガロース/ホルムアミドゲルで電気泳動し、標準法で、一晩、GeneBin d45ナイロン膜(Pharmacia LKB,Piscataway,NJ )に移した。Kingston,R.E.、Current Protocol s in Molecular Biology,(F.M.Ausubel, R.Brent,R.E.Kingston,D.D.Moore,J.A.S mith,J.G.SeidmanおよびK.Strahl編),John W iley and Sons,NY.。RNAは、膜にUV架橋する。二本鎖の32 P−標識プローブは、the Prime a Gene labeling kit(Promega,Madison WI)を用いて合成する。ras プローブは、コドン12にGGCからGTCへの突然変異を持つ活性化(変異体 )H−ras mRNAのcDNAクローンのSalI−NheIフラグメント である。対照プローブは、G3PDHである。ブロットは、QuickHybハ イブリダイゼーション溶液(Stratagene,La Jolla,CA) で15分間68℃で前ハイブリダイズする。10mg/mlのサケ精液DNAを 100μl混合した熱変性放射性プローブ(2.5×106カウント/2mlハ イブリダイゼーション溶液)を加え、膜を1時間68℃でハイブリダイズする。 ブロ ットは、2×SSC/0.1%SDS中、室温で15分間、2度、さらに0.1 ×SSC/0.1%SDS中、60℃で30分間、一度洗浄する。ブロットは、 オートラジオグラフし、シグナルの強度を、ImageQuant Phosp horlmager(Molecular Dynamics,Sunnyva le,CA)を用いて定量する。ノーザンブロットは、最初、rasプローブと ハイブリダイズさせ、次いで、0.1×SSC/0.1%SDS中で15分間沸 騰させることによって取り除き、対照としてのG3PDHプローブと再度ハイブ リダイズさせて試料の負荷の適性を照合する。 方法10 癌細胞増殖の阻害および化学療法剤試験の対照としての利用 細胞は、本質的には、実施例9に記載の方法に従って、培養し、試験化合物で 処理される。細胞は、60mmプレート上に接種し、集密度が70%に達した時 にDOTMA存在下、試験化合物で処理する。 時間経過実験: 第1日、細胞 は、最終濃度100nMの単一用量の試験化合物で処理する。増殖培地は、3日 目に一度、取り替え、細胞は、計数容器を用いて、5日間、毎日計数する。 投 与量応答実験: さまざまな濃度(10,25,50,100または250nM )の試験化合物を細胞に加え、細胞を収集し、3日後に計数する。次いで、本発 明の活性な化合物は、他の化学療法剤のスクリーニングのための同様のスクリー ンの標準として用いることができる。
【手続補正書】 【提出日】1996年5月29日 【補正内容】 請求の範囲 1. 構造: PNA−DNA−PNA [式中: 前記DNAは、少なくとも1つの2’−デオキシオリゴヌクレオチドを含み;か つ 前記PNAのそれぞれは、式(I): [式中: nは少なくとも2であり、 L1−Lnはそれぞれ、水素、ヒドロキシ、(C1−C4)アルカノイル、天然型 のヌクレオベース、非天然型のヌクレオベース、芳香族部分、DNAインターカ レーター、ヌクレオベース結合基、複素環式部分、およびレポーターリガンドか らなる群より独立的に選択され、L1−Lnの少なくとも1つは、天然型のヌクレ オベース、非天然型のヌクレオベース、DNAインターカレーター、またはヌク レオベース結合基であり; C1−Cnはそれぞれ、(CR67yであり、ここでR6は水素であり、R7は 天然型のα−アミノ酸の側鎖からなる群より選択されるか、またはR6およびR7 は、水素、(C2−C6)アルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヒ ドロキシ、(C1−C6)アルコキシ、(C1−C6)アルキルチオ、NR34およ びSR5[ここで、R3およびR4は上に定義した通りであり、R5は水素、(C1 −C6)アルキル、ヒドロキシ−、アルコキシ−もしくはアルキルチオ−置換 (C1−C6)アルキルである]からなる群より独立的に選択されるか、またはR6 およびR7が一緒になって脂環式または複素環式系を作り上げ; D1−Dnはそれぞれ(CR67zであり、R6およびR7は上記の通りであり ; yおよびzはそれぞれ0または1から10の整数であり、y+zの和は2より 大きいが10以下であり; G1−Gn-1のそれぞれは、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS −、−NR3SO−、または−NR3SO2−であり、R3は上記の通りであり; A1−AnおよびB1−Bnの組み合わせは、それぞれ: (a)Aは式(IIa)、(IIb)または(IIc)の基であり、 BはNまたはR3+である;または (b)Aは式(IId)の基であり、BはCHである; [式中: Xは、O、S、Se、NR3、CH2またはC(CH32であり; Yは、単結合、O、SまたはNR4であり; pおよびqはそれぞれ、0または1から5の整数であり、p+qの和は10以 下であり; rおよびsはそれぞれ、0または1から5の整数であり、r+sの和は10以 下であり; R1およびR2のそれぞれは、水素、ヒドロキシもしくはアルコキシもしくはア ルキルチオで置換されていてもよい(C1−C4)アルキル、ヒドロキシ、アルコ キシ、アルキルチオ、アミノおよびハロゲンからなる群より独立的に選択され; G1−Gn-1はそれぞれ、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS− 、−NR3SO−または−NR3SO2−であり、ここでR3は上記の通りであり; Qは、−CO2H−、−CONR'R''、−SO3Hまたは−SO2NR'R''、 または−CO2Hもしくは−SO3Hの活性化誘導体であり;そして Iは、−NR'''R''''または−NR'''C(O)R''''であり、ここでR'、 R''、R'''およびR''''は、水素、アルキル、アミノ保護基、レポーターリガ ンド、インターカレーター、キレーター、ペプチド、タンパク質、炭水化物、脂 質、ステロイド、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ヌクレオチドジホスフェート、 ヌクレオチドトリホスフェート、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシドなら びに可溶性および不溶性ポリマーからなる群より独立的に選択される;ただし、 少なくとも1つのR'は前記DNAであり、少なくとも1つのR''''は前記DN Aである] を有する少なくとも1つのペプチド核酸サブユニットを含む] の高分子。 2. 前記PNA−DNA−PNAの高分子が、核酸鎖に特異的にハイブリダ イズする能力を有する、請求項1記載の高分子。 3. 前記核酸鎖がRNA鎖である、請求項2記載の高分子。 4. 前記DNAが、互いに結合する一連の少なくとも3つの2’−デオキシ ヌクレオチドを含み;かつ それぞれのPNAが、少なくとも2つのペプチド核酸サブユニットを含む; 請求項1記載の高分子。 5. 前記2’−デオキシヌクレオチドが、ホスホジエステル、ホスホロチオ エートまたはホスホロジチオエート−ヌクレオチドである、請求項1記載の高分 子。 6. 前記DNAが、ホスホジエステル、ホスホロチオエートまたはホスホロ ジチオエート結合によって互いに結合する一連の少なくとも3つの2’−デオキ シヌクレオチドを含む、請求項1記載の高分子。 7. 前記PNAのそれぞれが、式IIIa、IIIbまたはIIIc: [式中: Lはそれぞれ、水素、フェニル、複素環式部分、天然型のヌクレオベース、お よび非天然型のヌクレオベースからなる群より独立的に選択され; R7'はそれぞれ、水素および天然型α−アミノ酸の側鎖からなる群より独立的 に選択され; nは、1から60の整数であり; k、l、およびmはそれぞれ、独立的に0または1から5の整数であり; pは、0または1であり; Rhは、OH、NH2または−NHLysNH2であり;そして Riは、HまたはCOCH3である] の化合物を含む、請求項1記載の高分子。 8. 前記PNAのそれぞれが、式(IIIa)−(IIIc)を有する化合物を含 み、式中、各々のLは、ヌクレオベースであるチミン(T)、アデニン(A)、 シトシン(C)、グアニン(G)およびウラシル(U)からなる群より独立的に 選択され、kおよびmは0または1であり、nは1から30、特に4から20の 整数である、請求項7記載の高分子。 9. 前記DNAが、互いに結合した一連の少なくとも3つの前記2’−デオ キシヌクレオチドを含み: PNAのそれぞれが少なくとも2つのペプチド核酸サブユニットを含み;かつ 前記2’−デオキシヌクレオチドが、ホスホジエステル、ホスホロチオエート またはホスホロジチオエート結合を通して結合している; 請求項8記載の化合物。 10. 前記PNAのそれぞれが、アミド、アミンまたはエステル結合で前記D NAに共有結合している、請求項1記載の高分子。 11. 構造: PNA−(アミド結合基)−DNA−(アミド結合基)−PNA [式中: 前記DNAは、少なくとも1つの2’−デオキシヌクレオチドを含み; 前記PNAはそれぞれ、少なくとも1つのぺプチド核酸サブユニットを含み;か つ、 前記アミド結合基はそれぞれ、構造: −C(=O)−NH− または −NH−C(=O)− のアミド結合を含む] の高分子。 12. 望ましくないタンパク質生成を特徴とする疾患を有する生物を治療する 方法であって、該生物を、PNA−DNA−PNAの構造を有し、前記タンパク 質をコードする核酸鎖と特異的にハイブリダイズする能力を有するヌクレオベー スの配列を含む高分子と接触させることを含み、ここで、 前記DNAは、前記ヌクレオベースの1つに共有結合した2’−デオキシ−エリ スロ −ペントフラノシル糖部分を有する、少なくとも1つのヌクレオチドを含み ;かつ、 前記PNAのそれぞれは、共有結合したヌクレオベースを有する少なくとも1つ のペプチド核酸サブユニットを含む; ことを特徴とする方法。 13. 前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチドである、請求項 12記載の方法。 14. 前記ヌクレオチドが、ホスホロジチオエートヌクレオチドである、請求 項12記載の方法。 15. 前記ヌクレオチドが、ホスホジエステルヌクレオチドである、請求項1 2記載の方法。 16. 薬剤として有効な量の請求項1記載の高分子および薬剤として許容され る希釈剤または担体を含む薬剤組成物。 17. インビトロで配列特異的核酸を修飾する方法であって、RNアーゼHお よび前記核酸を含む試験溶液を請求項1記載の高分子と接触させることを含む方 法。 18. 生物におけるポリヌクレオチドハイブリダイゼーションおよびRNアー ゼH活性化を強化する方法であって、該生物を請求項1記載の高分子と接触させ ることを含み、ここで前記高分子は、核酸の相補鎖と特異的にハイブリダイズす る能力を有するヌクレオベースの配列を有し;かつ、 前記ヌクレオベースの幾つかが前記高分子のPNA部分に位置し、かつ前記ヌク レオベースの幾つかが前記高分子のDNA部分に位置する; ことを特徴とする方法。 19. 望ましくないタンパク質生成を特徴とする疾患を有する生物を治療する 方法であって、該生物を請求項1記載の化合物と接触させることを含む方法。 20. インビトロで配列特異的核酸を修飾する方法であって、RNアーゼHお よび前記核酸を含む試験溶液を請求項9記載の化合物と接触させることを含む方 法。 21. 望ましくないタンパク質生成を特徴とする疾患を有する生物を治療する 方法であって、該生物を請求項9記載の化合物と接触させることを含む方法。 22. 薬剤として有効量の請求項9記載の化合物および薬剤として許容される 希釈剤または担体を含む薬剤組成物。 23. 構造: PNA−DNA または DNA−PNA [式中: 前記DNAは、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を通して結合している複 数のヌクレオチドを含み、少なくとも1つの前記ヌクレオチドは2’−デオキシ ヌクレオチドであり;かつ 前記PNAは、式(I): [式中: nは少なくとも2であり、 L1−Lnはそれぞれ、水素、ヒドロキシ、(C1−C4)アルカノイル、天然型 のヌクレオベース、非天然型のヌクレオベース、芳香族部分、DNAインターカ レーター、ヌクレオベース結合基、複素環式部分、およびレポーターリガンドか らなる群より独立的に選択され、L1−Lnの少なくとも1つは、天然型のヌクレ オベース、非天然型のヌクレオベース、DNAインターカレーター、またはヌク レオベース結合基であり; C1−Cnはそれぞれ、(CR67yであり、ここでR6は水素であり、R7は 天然型のα−アミノ酸の側鎖からなる群より選択されるか、またはR6およびR7 は、水素、(C2−C6)アルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヒ ドロキシ、(C1−C6)アルコキシ、(C1−C6)アルキルチオ、NR34およ びSR5[ここで、R3およびR4は上に定義した通りであり、R5は水素、(C1 −C6)アルキル、ヒドロキシ−、アルコキシ−もしくはアルキルチオ−置換( C1−C6)アルキルである]からなる群より独立的に選択されるか、またはR6 およびR7が一緒になって脂環式または複素環式系を作り上げ; D1−Dnはそれぞれ(CR67zであり、R6およびR7は上記の通りであり ; yおよびzはそれぞれ0または1から10の整数であり、y+zの和は2より 大きいが10以下であり; G1−Gn-1のそれぞれは、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS −、−NR3SO−、または−NR3SO2−であり、R3は上記の通りであり; A1−AnおよびB1−Bnの組み合わせは、それぞれ: (a)Aは式(IIa)、(IIb)または(IIc)の基であり、 BはNまたはR3+である;または (b)Aは式(IId)の基であり、BはCHである; [式中: Xは、O、S、Se、NR3、CH2またはC(CH32であり; Yは、単結合、O、SまたはNR4であり; pおよびqはそれぞれ、0または1から5の整数であり、p+qの和は10以 下であり; rおよびsはそれぞれ、0または1から5の整数であり、r+sの和は10以 下であり; R1およびR2のそれぞれは、水素、ヒドロキシもしくはアルコキシもしくはア ルキルチオで置換されていてもよい(C1−C4)アルキル、ヒドロキシ、アルコ キシ、アルキルチオ、アミノおよびハロゲンからなる群より独立的に選択され; G1−Gn-1はそれぞれ、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS− 、−NR3SO−または−NR3SO2−であり、ここでR3は上記の通りであり; Qは、−CO2H−、−CONR'R''、−SO3Hまたは−SO2NR'R''、 または−CO2Hもしくは−SO3Hの活性化誘導体であり;そして Iは、−NR'''R''''または−NR'''C(O)R''''であり、ここでR'、 R''、R'''およびR''''は、水素、アルキル、アミノ保護基、レポーターリガ ンド、インターカレーター、キレーター、ペプチド、タンパク質、炭水化物、脂 質、ステロイド、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ヌクレオチドジホスフェート、 ヌクレオチドトリホスフェート、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシドなら びに可溶性および不溶性ポリマーからなる群より独立的に選択される;ただし、 少なくとも1つのR'は前記DNAであり、少なくとも1つのR''''は前記DN Aである] を有する少なくとも1つのペプチド核酸サブユニットを含む] の高分子。 24. 構造PNA−DNAを有する、請求項23記載の高分子。 25. 構造DNA−PNAを有する、請求項23記載の高分子。 26. 前記PNA−DNAまたはDNA−PNAの高分子が、核酸鎖に特異的 にハイブリダイズする能力を有する、請求項23記載の高分子。 27. 前記核酸鎖が、RNA鎖である、請求項26記載の高分子。 28. 前記DNAが、互いに結合する一連の少なくとも3つの2’−デオキシ ヌクレオチドを含み;かつ それぞれのPNAが、少なくとも2つのペプチド核酸サブユニットを含む; 請求項23記載の高分子。 29. 前記2’−デオキシヌクレオチドが、ホスホジエステル、ホスホロチオ エートまたはホスホロジチオエート 2’−デオキシヌクレオチドである、請求 項23記載の高分子。 30. 前記DNAが、ホスホジエステル、ホスホロチオエートまたはホスホロ ジチオエート結合によって互いに結合する一連の少なくとも3つの2’−デオキ シヌクレオチドを含む、請求項23記載の高分子。 31. 前記PNAが、式IIIa、IIIbまたはIIIc: [式中: Lはそれぞれ、水素、フェニル、複素環式部分、天然型のヌクレオベース、お よび非天然型のヌクレオベースからなる群より独立的に選択され; R7'はそれぞれ、水素および天然型α−アミノ酸の側鎖からなる群より独立的 に選択され; nは、1から60の整数であり; k、l、およびmはそれぞれ、独立的に、0または1から5の整数であり; pは、0または1であり; Rhは、OH、NH2または−NHLysNH2であり;そして Riは、HまたはCOCH3である] からなる群より選択される式を有する化合物を含む、請求項23記載の高分子。 32. 前記PNAが、(IIIa)、(IIIb)および(IIIc)からなる群より 選択される式を有する化合物を含み、式中、各々のLは、ヌクレオベースである チミン(T)、アデニン(A)、シトシン(C)、グアニン(G)およびウラシ ル(U)からなる群より独立的に選択され、kおよびmは0または1であり、n は1から30の整数である、請求項31記載の高分子。 33. 前記DNAが、互いに結合した一連の少なくとも3つの前記2’−デオ キシヌクレオチドを含み: 前記PNAが、少なくとも2つのペプチド核酸サブユニットを含み;かつ 前記2’−デオキシヌクレオチドが、ホスホジエステル、ホスホロチオエート またはホスホロジチオエート結合を通して結合している; 請求項32記載の化合物。 34. 前記PNAが、アミド、アミンまたはエステル結合で前記DNAに共有 結合している、請求項23記載の高分子。 35. 核酸ハイブリダイゼーションの方法であって、前記核酸を、前記核酸と 特異的にハイブリダイズしうるヌクレオベースの配列を含み、かつ次の構造: PNA−DNA または DNA−PNA [式中: 前記DNAは、少なくとも1つの2’−デオキシヌクレオチドを含み;かつ 前記PNAは、式(I): [式中: nは少なくとも2であり、 L1−Lnはそれぞれ、水素、ヒドロキシ、(C1−C4)アルカノイル、天然型 のヌクレオベース、非天然型のヌクレオベース、芳香族部分、DNAインターカ レーター、ヌクレオベース結合基、複素環式部分、およびレポーターリガンドか らなる群より独立的に選択され、L1−Lnの少なくとも1つは、天然型のヌクレ オベース、非天然型のヌクレオベース、DNAインターカレーター、またはヌク レオベース結合基であり; C1−Cnはそれぞれ、(CR67yであり、ここでR6は水素であり、R7は 天然型のα−アミノ酸の側鎖からなる群より選択されるか、またはR6およびR7 は、水素、(C2−C6)アルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヒ ドロキシ、(C1−C6)アルコキシ、(C1−C6)アルキルチオ、NR34およ びSR5[ここで、R3およびR4は上に定義した通りであり、R5は水素、(C1 −C6)アルキル、ヒドロキシ−、アルコキシ−もしくはアルキルチオ−置換( C1−C6)アルキルである]からなる群より独立的に選択されるか、またはR6 およびR7が一緒になって脂環式または複素環式系を作り上げ; D1−Dnはそれぞれ(CR67zであり、R6およびR7は上記の通りであり ; yおよびzはそれぞれ0または1から10の整数であり、y+zの和は2より 大きいが10以下であり; G1−Gn-1のそれぞれは、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS −、−NR3SO−、または−NR3SO2−であり、R3は上記の通りであり; A1−AnおよびB1−Bnの組み合わせは、それぞれ: (a)Aは式(IIa)、(IIb)または(IIc)の基であり、 BはNまたはR3+である;または (b)Aは式(IId)の基であり、BはCHである; [式中: Xは、O、S、Se、NR3、CH2またはC(CH32であり; Yは、単結合、O、SまたはNR4であり; pおよびqはそれぞれ、0または1から5の整数であり、p+qの和は10以 下であり; rおよびsはそれぞれ、0または1から5の整数であり、r+sの和は10以 下であり; R1およびR2のそれぞれは、水素、ヒドロキシもしくはアルコキシもしくはア ルキルチオで置換されていてもよい(C1−C4)アルキル、ヒドロキシ、アルコ キシ、アルキルチオ、アミノおよびハロゲンからなる群より独立的に選択され; G1−Gn-1はそれぞれ、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS− 、−NR3SO−または−NR3SO2−であり、ここでR3は上記の通りであり; Qは、−CO2H−、−CONR'R''、−SO3Hまたは−SO2NR'R''、 または−CO2Hもしくは−SO3Hの活性化誘導体であり;そして Iは、−NR'''R''''または−NR'''C(O)R''''であり、ここでR'、 R''、R'''およびR''''は、水素、アルキル、アミノ保護基、レポーターリガ ンド、インターカレーター、キレーター、ペプチド、タンパク質、炭水化物、脂 質、ステロイド、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ヌクレオチドジホスフェート、 ヌクレオチドトリホスフェート、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシドなら びに可溶性および不溶性ポリマーからなる群より独立的に選択される;ただし、 少なくとも1つのR'は前記DNAであり、少なくとも1つのR''''は前記DN Aである] を有する少なくとも1つのペプチド核酸サブユニットを含む] を有する高分子と接触させることを含む方法。 36. 前記核酸がRNAである、請求項35記載の方法。 37. 前記ハイブリダイゼーションがRNアーゼHを活性化させる、請求項3 5記載の方法。 38. 前記DNAが、互いに結合する連続する少なくとも3つの2’−デオキ シヌクレオチドを含み;かつ 前記PNAが、少なくとも2つのペプチド核酸サブユニットを含む; 請求項35記載の方法。 39. 前記2’−デオキシヌクレオチドが、ホスホジエステル、ホスホロチオ エートまたはホスホロジチオエート 2’−デオキシヌクレオチドである、請求 項35記載の方法。 40. 前記DNAが、ホスホジエステル、ホスホロチオエートまたはホスホロ ジチオエート結合によって互いに結合する連続する少なくとも3つの2’−デオ キシヌクレオチドを含む、請求項35記載の方法。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI C07K 7/06 8517−4H C07K 7/06 // C12N 15/09 ZNA 8310−2J G01N 33/50 T G01N 33/50 9162−4B C12N 15/00 ZNAA

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. 構造: PNA−DNA−PNA [式中: 前記DNAは、少なくとも一つの2'-オリゴヌクレオチドを含み;かつ 前記PNAのそれぞれは、少なくとも一つのペプチド核酸サブユニットを含む] の高分子。 2. 前記PNA−DNA−PNAの高分子が、核酸鎖に特異的にハイブリダ イズする能力を持つ、請求項1記載の高分子。 3. 前記核酸鎖が、RNA鎖である、請求項2記載の高分子。 4. 前記DNAが、順番に互いに結合する少なくとも3つの2'-デオキシヌ クレオチドを含み;かつ それぞれのPNAが、少なくとも2つのペプチド核酸サブユニットを含む; 請求項1記載の高分子。 5. 前記2’−デオキシヌクレオチドが、ホスホジエステル、ホスホロチオ エートまたはホスホロジチオエート−ヌクレオチドである、請求項1記載の高分 子。 6. 前記DNAが、ホスホジエステル、ホスホロチオエートまたはホスホロ ジチオエート結合によって順番に互いに結合する少なくとも3つの2'-デオキシ ヌクレオチドを含む、請求項1記載の高分子。 7. 前記PNAのそれぞれが、式(I): [式中: nは少なくとも2であり、 L1−Lnはそれぞれ、水素、ヒドロキシ、(C1−C4)アルカノイル、天然型 のヌクレオベース、非天然型のヌクレオベース、芳香族部分、DNAインターカ レーター、ヌクレオベース結合基、複素環式部分、およびレポーターリガンドか らなる群より独立的に選択され、L1−Lnの少なくとも1つは、天然型ヌクレオ ベース、非天然型ヌクレオベース、DNAインターカレーター、またはヌクレオ ベース結合基であり; C1−Cnはそれぞれ、(CR67yであり、ここでR6は水素であり、R7は 天然型のα−アミノ酸の側鎖からなる群より選択されるか、またはR6およびR7 は、水素、(C2−C6)アルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヒ ドロキシ、(C1−C6)アルコキシ、(C1−C6)アルキルチオ、NR34およ びSR5[ここで、R3およびR4は上に定義した通りであり、R5は水素、(C1 −C6)アルキル、ヒドロキシ−、アルコキシ−もしくはアルキルチオ−置換( C1−C6)アルキルである]からなる群より独立的に選択されるか、またはR6 およびR7が一緒になって脂環式または複素環式系を作り上げ; D1−Dnはそれぞれ(CR67zであり、R6およびR7は上記の通りであり ; yおよびzはそれぞれ0または1から10までの整数であり、y+zの和は2 より大きいが10以下であり; G1−Gn-1のそれぞれは、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS −、−NR3SO−、または−NR3SO2−であり、R3は上記の通りであり; A1−AnおよびB1−Bnの組み合わせは、それぞれ: (a)Aは式(IIa)、(IIb)または(IIc)の基の一つであり、 BはNまたはR3+である;または (b)Aは式(IId)の基であり、BはCHである; [式中: Xは、O、S、Se、NR3、CH2またはC(CH32であり; Yは、単結合、O、SまたはNR4であり; pおよびqはそれぞれ、0または1から5までの整数であり、p+qの和は1 0以下であり; rおよびSはそれぞれ、0または1から5までの整数であり、r+sの和は1 0以下であり; R1およびR2のそれぞれは、水素、ヒドロキシもしくはアルコキシもしくはア ルキルチオで置換されていてもよい(C1−C4)アルキル、ヒドロキシ、アルコ キシ、アルキルチオ、アミノおよびハロゲンからなる群より独立的に選択され; G1−Gn-1はそれぞれ、いずれの向きでもよい−NR3CO−、−NR3CS− 、−NR3SO−または−NR3SO2−であり、ここでR3は上記の通りであり; Qは、−CO2H−、−CONR'R''、−SO3Hもしくは−SO2NR'R'' または−CO2Hもしくは−SO3Hの活性化誘導体であり;そして Iは、−NHR'''R''''または−NR'''C(O)R''''であり、ここでR' 、R''、R'''およびR''''は、水素、アルキル、アミノ保護基、レポーターリ ガンド、インターカレーター、キレーター、ペプチド、タンパク質、炭水化物、 脂質、ステロイド、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ヌクレオチドジホスフェート 、 ヌクレオチドトリホスフェート、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシドなら びに可溶性および不溶性ポリマーからなる群より独立的に選択される] の化合物を含む、請求項1記載の高分子。 8. 前記PNAのそれぞれが、式IIIa、IIIbまたはIIIc: [式中: Lはそれぞれ、水素、フェニル、複素環式部分、天然型のヌクレオベース、お よび非天然型のヌクレオベースからなる群より独立的に選択され; R7'はそれぞれ、水素および天然型α−アミノ酸の側鎖からなる群より独立的 に選択され; nは、1から60の整数であり; k、1、およびmはそれぞれ、独立的に0または1から5の整数であり; pは、0または1であり; Rhは、OH、NH2または−NHLysNH2であり; R1は、HまたはCOCH3である] の化合物を含む、請求項1記載の高分子。 9. 前記PNAのそれぞれが、式(IIIa)−(IIIc)を持つ化合物 を含み、式中、各々のLはヌクレオベースであるチミン(T)、アデニン(A) 、シトシン(C)、グアニン(G)およびウラシル(U)からなる群より独立的 に選択され、kおよびmは0または1であり、nは1から30、特に4から20 の整数である、請求項8記載の高分子。 10. 前記DNAが、順番に互いに結合した少なくとも3つの前記2'-デオキ シヌクレオチドを含み: PNAのそれぞれが、少なくとも2つのペプチド核酸サブユニットを含み;且つ 前記2'-デオキシヌクレオチドが、ホスホジエステル、ホスホロチオエートま たはホスホロジチオエート結合を通して結合している; 請求項9記載の化合物。 11. 前記PNAのそれぞれが、アミド、アミンまたはエステル結合で前記D NAに共有結合している、請求項1記載の高分子。 12. 構造: PNA−(アミド結合基)−DNA−(アミド結合基)−PNA [式中: 前記DNAは、少なくとも1つの2'-デオキシヌクレオチドを含み; 前記PNAはそれぞれ、少なくとも1つのペプチド核酸サブユニットを含み;か つ、 前記アミド結合基はそれぞれ、構造: −C(=O)−NH− または −NH−C(=O)− のアミド結合を含む] の構造の高分子。 13. 望ましくないタンパク質生成を特徴とする疾患を持つ生物を治療する方 法であって、該生物を、PNA−DNA−PNAの構造を持ち、前記タンパク質 をコードする核酸鎖と特異的にハイブリダイズする能力を持つヌクレオベースの 配列を含む高分子と接触させることを含み、ここで、 前記DNAは、前記ヌクレオベースの1つに共有結合した2'-デオキシ−エリス −ペントフラノシル糖部分を持つ、少なくとも1つのヌクレオチドを含み;且 つ、 前記PNAのそれぞれは、共有結合したヌクレオベースを持つ少なくとも1つの ペプチド核酸サブユニットを含むことを特徴とする方法。 14. 前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチドである、請求項 13記載の方法。 15. 前記ヌクレオチドが、ホスホロジチオエートヌクレオチドである、請求 項13記載の方法。 16. 前記ヌクレオチドが、ホスホジエステルヌクレオチドである、請求項1 3記載の方法。 17. 薬剤として有効な量の請求項1記載の高分子および薬剤として許容され る希釈剤または担体を含む薬剤組成物。 18. インビトロで配列特異的核酸を修飾する方法であって、RNアーゼHお よび前記核酸を含む試験溶液を請求項1記載の高分子と接触させることを含む方 法。 19. 生物におけるポリヌクレオチドハイブリダイゼーションおよびRNアー ゼH活性化を強化する方法であって、該生物を請求項1記載の高分子と接触させ ることを含み、ここで前記高分子は、核酸の相補鎖と特異的にハイブリダイズす る能力を持つヌクレオベースの配列をもち;且つ、 前記ヌクレオベースの幾つかが前記高分子のPNA部分に位置し、且つ前記ヌク レオベースの幾つかが前記高分子のDNA部分に位置する; ことを特徴とする方法。 20. 望ましくないタンパク質生成を特徴とする疾患をもつ生物を治療する方 法であって、該生物を請求項1記載の化合物と接触させることを含む方法。 21. インビトロで配列特異的核酸を修飾する方法であって、RNアーゼHお よび前記核酸を含む試験溶液を請求項10記載の化合物と接触させることを含む 方法。 22. 望ましくないタンパク質生成を特徴とする疾患をもつ生物を治療する方 法であって、該生物を請求項10記載の化合物と接触させることを含む方法。 23. 薬剤として有効量の請求項10記載の化合物および薬剤として許容され る希釈剤または担体を含む薬剤組成物。
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