JPH0358785A - 核酸増幅反応の汚染を制御する方法 - Google Patents

核酸増幅反応の汚染を制御する方法

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JPH0358785A
JPH0358785A JP2143233A JP14323390A JPH0358785A JP H0358785 A JPH0358785 A JP H0358785A JP 2143233 A JP2143233 A JP 2143233A JP 14323390 A JP14323390 A JP 14323390A JP H0358785 A JPH0358785 A JP H0358785A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 [産業上の利用分野] 本発明は、核酸配列を増幅する方法に関する。
特に、本発明は、その後の増幅方法の実施に悪影響を及
ぼず、核酸増幅方法の実施産物を排除する方法を開示す
る。
[従来の技術] ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)方法は、変性、プライ
マーのアニーリングおよびDNAポリメラーゼによるプ
ライマーの延長を含む一連の操作を通して特定の核酸配
列を増幅する(ムリンス・ケービー等、アメリカ特許第
4 .6 8 3,2 0 2号、アメリカ特許第4,
683,195号、ムリンス・ケービー、ヨーロッパ特
許第201,184号、エルリッヒ・エイチ、ヨーロッ
パ特許第50,424号、第84,796号、第2 5
 8,0 1 7号、第237,362号、エルリッヒ
・エイチ、アメリカ特許第4,582,788号、ザイ
キ・アール等、アメリカ特許第4,683,202号、
ムリンス・ケービー等、コールド・スプリング・ハーバ
ー・シンポジウム、クオンティタティブ・バイオロジー
(cold  Spring  Habor  Sym
p. QuantBiol. )、51巻263頁(1
986年)、サイキ・アール等、サイエンス(Scie
nce)、230巻I350頁(1985年)、ザイキ
・アール、ザイエンス(S cience)、231巻
487頁(1988年)、ロー・イーワイ等、ザイエン
ス(Science)、243巻217頁(1988年
)参照)(上記引用文献は、引用して本明細書に包含さ
せる。)。これらの段階は何回も反復することができ、
原特定配列のコピー数の大きな増幅をもたらすことがで
きる。I)NA.!分子でさえも増幅1,て数百ナノグ
ラムの産生物を産生ずることができる(リー・エイヂ等
、ネイヂャ− (N ature)、335巻414頁
(1988年))。
他の既知核酸増幅方法はコウ・ディー等、プ〔lシーデ
インダス・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・
ザイエンシーズ・ユーエスーエイ( II”roc. 
Natl. Acad, Sci. USA)、86巻
I+73頁(1989年)の転写に基づく増幅システム
を含んでいる。
技術用語である「ウラシルI) N Aクリコシラーゼ
−1(UDG)は塩基ウラソルおよび糖デオキンリボー
ス間のグリ:】シト結合を開裂する酵素を意味し、単量
体ヌクレオヂドdUTPがI) N A分子に相み入れ
られているときだ+31デオキシウリジン部分の組み入
れをもたらす(デコカン・ビー、ザ・エンザイl,ズ(
T he  E nzymes)、14巻565頁(1
981年)、編集ホイヤー・ピー)。この酵素は遊離d
U’FP,遊離デオキンウリジンまたはR. N Aに
は作用しノ,柔い(デコカノ、前掲)3、P C Rの
ような増幅方法の111、果は、増幅産生物自体かその
後のI) C I1法の姑質となることがてきることで
ある。さらに、増幅産生物の量か大きくなり得ろノこめ
、実験室の中でのI) C R反応のようb゛反応のご
く小さし)分画の赦乱でざえも、その後の他のサンプル
を増幅ずろ試みの汚染を導くことかあり得ろ。
本発明(」、天然に産するDNAを増幅産生物から識別
可能と−4゛ろことに3Lり一般にインビ1・口核酸増
幅法にお1jる改善を表す。したかー・て、上記産生物
は次の増幅反応の開姶1){jにその後の増lll1.
ijに対ずる鋳型と(7て不活性化さイ1ろ。
[発明の構威] 本発明は増幅法の間のI.’) N A才たLL R 
N Aの中へエキソサンプルヌクレオチドを組め入れる
方法を含む。本発明(J、サンプルからの核酸を増幅す
る能力に影響を受telないまま残す処理によって、以
前の増幅生成物を以後の増幅から除去する。この処理(
J核酸の増幅に関連4゛る主な問題、才なわ11 ち、以前増幅方法の最終産生物による出発原籾の汚染を
大きく減少させる。言い替えれば、本発明は増幅産生物
に対する識別方法であって、一般に次の1曽幅反応の出
発.kり前に行なうもので、天然に見られる核酸を有利
に扱うものである3,さらに具体的に、本発明は特定の
核酸配列の増幅に酵素を利用するインビ1・口製法に関
する。上記製法の1つの例としてポリメラーゼ連鎖反応
(PCR)が知られている。PCR法および他の同様な
方法の重要な制限因子は、それぞれの反応の最終産生で
ある増幅核酸による実験環境の汚染である。」一記汚染
は一般に関心のあるサンプル中に存在することのできる
標準核酸の増幅だ1ノでなく、前の反応の汚染最終産生
物の増幅をももiコらず。
本発明は標準核酸の望ましい増幅に影饗しないでこの型
の汚染をできるだけ除去する方法を提供する。
本発明は、増幅が望まれているサンプル中に見られる核
酸中では一般的に欠如しているかまたはまれに17か存
在しない1つまたはそれ以上のエキ2 ?サンプルヌクレオチトにより、4−)の止笥リボヌク
レオンドトリホスフーr.  l■ (rN T P 
s)まノこはデオキンリホヌクレオノド1・リホスフr
.  l・(dNT ])S )の1つまたはそれ以上
が置換さイ1る、増幅法をまず実施づーることを含む。
−L記増幅方法の間で製造されたI) N AまたはR
 N A fJサンプル核醗から区別ずることがてきろ
。すなわち、増幅方法の前または次の増幅方法の間にサ
ンプルI)l’JAまたはRNΔを目的として増幅で産
生じた核酸にたい1,て区別し、その結果i[jの増幅
1刀コ核酸(」これ以上増幅することかできないが、サ
ンプルII) NAまたはR N A II増幅し続(
Jるようにオろことかできる。
様kな核酸増幅方法の発明以来、増幅の前回路の産生物
によりインプソト核酸の汚染を除夫ずる方法を開示した
ものは今まてにない。
[発明の記載] ここで使われる用語「増幅」はヌクレオチ1・配列また
(』複数の配列のコピー数を増加する任きのインビI・
[1方法を表していろ。核酸増幅ijD NAまたはR
NAの中へのヌクレオヂドの組み入れをもたらす。
「ヌクレオチド」は塩基一糖−りん酸塩結合物を表す技
術用語てある。ヌクレオチドは核酸ボリマ、ずなわちD
NAおよびRNAの単量体ユニットである。この語はr
ATP,rCTP,rGTPまたはrUTPのようなり
ボヌクレオシドトリホスフェートおよびdATPXdC
TP,dGTPまたはdTTPのようなデオキシリボヌ
クレオシトトリホスフェートを含む。
「ヌクレオシド」は、塩基一糖結合物、すなわちりん酸
部分を欠失しているヌクレオヂドを表す技術用語である
。ヌクレオンドおよびヌクレオチドという用語の使用に
おいてある種の交換可能性があることが当分野で認めら
れている。例えば、ヌクレオヂドであるデオキシウリジ
ントリホスフェート、dUTPはデオキンリボヌクレオ
シドトリホスフェートである。DNAに組み入られた後
、それはDNAモノマーとして働き、形式的にデオキシ
ウリジレート、すなわちdUMPまたはデオキンウリジ
ンモノホスフェートである。結果として生ずるDNA中
にdUTP部分がなくても、DNAの中に(IUTPを
組み入れたということができる。同様に、基質分子の1
部分にずぎないとしても、DNAの中にデオキノウリジ
ンを組み入れたということができる。
ここで使われる用語「エキソサンプルヌクレオチド」は
一般に増幅すべきサンプル中に見られないヌクレオヂド
を表している。ほとんどのDNAサンプルでは、デオキ
ンウリジンがエキソサンプルヌクレオチドの例である。
デオキンウリジン}・リホスフェート型、dUTPは代
謝中間体として生物体に存在しているが、ほとんどDN
A中に組み入れられない。dUTPが偶然DNA中に組
み入れられると、結果として生ずるデオキシウリジンは
例えば酵素UDGが関与ずる方法のような正常過程によ
りインビトロで索早く除去される。すなわち、デオキン
ウリジンは天然DNA中ではほとんどまたは決して存在
しない。ある種の生物体はDNA中にデオキンウリジン
を自然に組み入れ15 ることかできることが認められている。これらの生物体
の核酸サンプルではデオキシウリジンはエキソサンプル
ヌクレオチドと考えられない。デオキシウリジンまたは
他のエキソサンプルヌクレオチドの存在は当業者によく
知られた方法により容易に測定することができる。他の
エキソサンプルヌクレオチドも想像することができる。
多くのDNAグリコシラーゼは当業者には知られている
増幅の間にDNAに組み入れることのできるエキソサン
プルヌクレオチドおよびそれに作用するDNAグリコシ
ラーゼは本発明中で使うことができる。同様に、プロモ
デオキシウリジン(B duR )はDNAに組み入れ
得ることが当業者に知られている。BduRを含むDN
Aは適当な条件下光にさらすことにより分解することが
できる。
「組み入れる」という用語は、核酸ポリマーの部分にな
っていくことを表す。
「終結する」という用語は、ここでは処理の停止をひき
起こすことを表す。この用語は永久的および条件イ」き
の両方の停止方法を含む。例えば処理■6 が酵素的ならば、永久的熱変性および酵素活性範囲の範
囲外の温度のための酵素活性喪失の両方がこの用語の範
囲内にある。
本発明の方法では、増幅法は、4つの正常リボヌクレオ
シドトトリホスフェート(rNTPs)またはデオキン
リボヌクレオシドトリホスフェート(dNTPs)の1
つまたはそれ以」一がエキソサンプルヌクレオチドで置
きかえられている第1サンプルで実施する。増幅後、残
っている可能性がある汚染増幅産生は、エキソサンプル
ヌクレオチドを含む核酸を実質的に増幅できなくする物
理的、化学的、酵素的または生物学的処理に付ずる。処
理は分割した段階として行なうことができ、または好ま
しくは増幅すべき核酸配列を含む第2サンプルの存在下
でなされることができる。第2サンプルを汚染ずる第l
サンプルから由来した増幅核酸配列は、第2サンプルの
核酸配列の増幅間に実質的にこれ以」二壜幅しない。
デオキシリポヌクレオシドトリホスフェートであるd 
U T ]’は、ここでP C r{により例示された
酵素的1) N A増幅製法を都合よく組み人21るこ
とかでき、それにより、デオキソウリジン−含{9 1
)NAをもたら゛4−エキソサンプルヌクレオチドの例
である。4−記反応のDNA産生け曹通多くのウラシル
塩基を含む。天然DNAおよび生威物てある、増幅法の
デオキシウリジン含有産生物の識別は、ウラシルDNA
グリコシラーゼ(UDG)という酵素で得られる。ウラ
シノl川)NΔクリコンラーセによるウラシル塩基含有
1) N Aの処理はDNA糖りん酸塩骨核およびウラ
ノル塩基の間のグリコンド結合の開裂をもたらす。ウラ
シルの欠失によりDNA中に非ピリミノン部位を一ノく
ることにムリ、これが相補DNA鎖の合成鋳型として使
用されるDNA鎖からDNAポリメラーセを遮断4゛る
(シャッパー・アール笠、プロシーディングス・オブ・
ザ・ナショナル・アカデミー・オフ・ザイエンノーズ・
ユーエスエイ(丁’roc. Nail. Acacl
. SciU S A. )、第80巻487頁(19
83年))。、各r)NA標的分r中のj1ピリミジン
部佇の実質的な数の存/1:は、標的DNAの1ビーを
合成する+)Nハボリメラーセを使用する増幅法を妨げ
る。
ここに例小したように、基礎的/S増幅プロl・コール
はP C R方法として,Lく知られてし)る。P C
Rは次の3つの方法で修飾さ2]ていろ。(1)dLJ
′1゛PはdTTPで1d換され、(2)UDGが最初
のP C R反応混合物に加えられ、43よび(3)最
初のインキ,,ベーン−7ン時間が、U 11) Gが
前のP C R反応のl15染庇生を破壊!I−るため
に加えられる。UI)G自体は最初のP C Rザイク
ルでS石温により永久的に不活竹化さUろか、現在望ま
しいPCRブ[l1・コールではユ)名ポリメラーセで
使一)た高温で活性でないかのどららかである。この不
活外化のためにU D Gは最近合成されたP C R
産生物を破壊することができない。U D G活性を除
央1,ない核酸増幅プロトコールは普通別のtJ I)
 G不活性段階を必要とオろ。
エキソサンプルヌクレオヂ}・を含む核酸に増幅方法に
抵抗性をイ・j−りオる物理的、化学的、酵素的または
生物学的処理の終結が望ましいが(ここに例示した、U
 l) Gの熱不活性化のように)、本発明は終結段階
が欠失1,た具体例を含む。例えば出発原粕の予期され
る汚染を除くのに充分高いが増殖速度に張りあうには不
充分な量の酵素43よび処理時間を使うことができる。
すなわち、処理は汚染核酸を破壊することができるが、
増幅方法は、処理が最近合成された核酸を破壊するより
速く新しい核酸を製造し得ることである。
ここで記載した本発明に様々な変形を考えることができ
る。例えば増幅はエキソサンプルヌクレオチドなしで、
正常ヌクレオヂドを用いてなされる。増幅したDNAの
正常ヌクレオヂドはその後エキソサンプルヌクレオチド
に変換される。変換したi.:) N Aはその後それ
が後に汚染ケるサンプルから除表する,二とができる。
その例は隣りのピリミノン残基、特にチミジンをビリミ
ジンニ量体(ヂミンンニ量体)に変換することで、これ
はDNAを鋳型どして不適当にする。ヂミジン−l量体
はJ,クソヌクレアーゼ■わよびrecBCのような酵
素20 により除去され得る。
実施例 ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)はヒ1・乳頭腫ウイル
型1 6(HPV l 6)DNAの1領域を増幅干る
ために実施した(デコルス1・・エム等、プロンーデイ
ンダス・オフ・ザ・ナノヨナル・アカデミー・オブ・ザ
イエンンーズ・ユーエスエイCProcNatl. A
cad. Sci. USA)、第80巻3812頁(
1983年))。使用したプライマーの配列(ま5GG
TCGATG’l”Ai’GTCT’ll’G’丁゛T
G3および5  GTCTACGTGTG’l’GCT
T T G T A C 3  である。
1{PVl6DNAは制限酵素Bami{Iで完全な長
さのプラスミ}・クローンpT71’{PVl6から切
り出した(本発明の目的としてンー}・フ・ケイ等、パ
イ口口シー(Virol. )、145巻181頁(1
985年)記載のpUC8プラスミドと均等)。
直!IDNA(10ピ:1グラノ、)を、50マイクロ
リッl・ルの25mM}リス−1{ClpH8.3、M
gCL5mM,NaC15 0mM,O.O l%セラ
チン、dATP,dGTP,dCTPをそれぞれ0.2
mM,dUTPまたはdTTPのいずれかをO。2mM
,それぞれのプライマーを1マイクロモルおよびテルム
ス・アクアテイクス(Thermus  aquati
cus)(シータス/パーキン−エルマー社)からの熱
安定DNAポリメラーゼ12.5ユニットを含むPCR
反応物に加える。反応は次の温度表を使ってザーマルン
ルザー(シータス/パーキン−エルマー社)で増幅した
。948C5分間、その後94°CI分を(変性)、5
5℃で2分間(アニーリング)および72°C3分間(
プライマー延長)を30サイクル。温度ザイクル完了後
、72℃10分間、最後の延長をした。PCR反応産生
物(レイン当り各反応物5マイクロリットル)のアガロ
ース/臭化エヂジウムゲル電気泳動(マニアナイス・テ
ィー等、モレキコラー・クローニンク(Molecul
ar  C loning)、コールド・スプリング・
ハーバー・ラボラトIJ−(1982年))テ2 8 
4塩基対HPVI6DNAフラグメントの増幅を確認し
た。全反応物は実質的増幅を示した。HPVI6DNA
のない陰性対照反応ではDNA産生物は製造されなかっ
た。
PCR増幅産生物の濃度はアガロースゲルから推定した
。新規PCR反応物はdTTPの相み入れから生ずるデ
オキンチミノンまたはdUTP含有反応から生ずるデオ
ギンウリジンのいずれかを含む増幅産生物の10フェン
トクラム量で汚染されていた。陽性対照反応物は直鎖H
PVI6DNAIOピコグラムを含む。新規P(,R反
応物はdTTPのかわりにdTTPSUDG5ナノグラ
ム(ファン・デ・ザンデ・イエー、ユニバーシティー・
オブ・カルガリー、デ,カン・ラボラトリーズ(Duc
an  L aboratories)、アメリカ合衆
国10301 ペンシルバニア、パオリ、イー・セント
ラル・アベニ,− 19番)を含むかまたはUDGなし
であった。全反応物は37℃15分間インキユベートし
、デオキシウリジン含有DNAに対してしてUDGを作
用させ、その後上記と同じ熱ザイクルプロトコール通り
に行う。各反応の一定量をアガロース/臭化エヂジウム
ゲル電気泳動によりzl+ 分析した。
アガロースゲル分析では、UDG処理なしでデオキンウ
リジン含有PCR産生物は再増幅することができ、ゲル
電気泳動で明らかなように正常HPVI6DNAを増幅
することにより得られる産生物から大きさでは区別する
ことのできないDNA産生物を得ることが示された。デ
オキシウリジン含有DNAをPCRより前にUDGとイ
ンキユベートする反応でアガロースゲル上で可視産生物
を与えなかった。デオキシチミジンを含むPCR増幅産
生物はUDGとインキユベートしてもしなくてもうまく
増幅する。この実験はUDGが実質的にデオキシウリジ
ンを含むPCR産生物の増幅を停止するが、デオキシヂ
ミジンを含むDNAの増幅に実質的に影饗を与えないこ
とを示した。
上記は特に好ましい実施例を述べたが、それにより本発
明が制限されるものではないことは理解できる。様々な
修飾は記載した実施態様についてなされ、上記修飾は本
発明の範囲内であることが当業者に理解される。

Claims (17)

    【特許請求の範囲】
  1. (1) a)核酸配列の増幅の間に第1サンプルの核酸にエキソ
    サンプルヌククレオチドを組み入 れ、 b)エキソサンプルヌクレオチドを含む核酸を実質的に
    非増幅性にし、エキソサンプルヌ クレオチドを含まない核酸増幅に実質的に 作用しない処理を第2サンプルの核酸に施 す 段階を含み、それにより第2サンプルを汚染する第1サ
    ンプルから由来する増幅核酸配列が第2サンプルの核酸
    配列の増幅の間に実質的にこれ以上増幅しないようにす
    ることからなる、1つまたはそれ以上の核酸配列を増幅
    する方法。
  2. (2)エキソサンプルヌクレオチドがデオキシウリジン
    である請求項1記載の方法。
  3. (3)処理が物理的、化学的、酵素的または生物学的処
    理からなる群から選ばれる請求項1記載の方法。
  4. (4)処理が酵素的処理である請求項3記載の方法。
  5. (5)酵素的処理がウラシルDNAグリコシラーゼ処理
    である請求項4記載の方法。
  6. (6)さらに c)第2サンプルの核酸配列を増幅する 段階を含む請求項1記載の方法。
  7. (7)さらに d)段階b)の処理を終結させる 段階を含む請求項1記載の方法。
  8. (8)終結を熱により達成する請求項7記載の方法。
  9. (9)増幅が、1種の核酸または核酸の混合物(各核酸
    は同じまたは異なった長さの2種の別の相補鎖を含む)
    中に含まれる少なくとも1種の特定の核酸配列を増幅す
    る方法であり、さらに e)鎖を、増幅させているそれぞれの異なった配列につ
    いて、それぞれの核酸鎖に相補的 なそれぞれのプライマーの延長産生物が合 成されるような条件下で、増幅されている それぞれの異なった特定配列に対する2種 のオリゴヌクレオチドプライマーで処理し、上記プライ
    マーは、それぞれの特定配列の 異なった鎖に充分相補的で相手とハイブリ ダイズし、その結果1種のプライマーから 合成された延長産生物がその相補体から分 離するとき、他方のプライマーの延長産生 物の合成の鋳型として働くように選ばれた ものであり、 f)プライマー延長産生物をそれらが合成された鋳型か
    ら分離して一本鎖分子を生じ、 g)プライマー延長産生物が段階f)で製造された一本
    鎖のそれぞれを鋳型として使って合 成される条件下において段階e)のプライマーで段階f
    )から発生した一本鎖分子を処理する ことからなる請求項1記載の方法。
  10. (10) (A)1種の核酸配列または核酸配列混合物(それぞれ
    の核酸配列は同じまたは異なった長さの2種の別の相補
    鎖を有する)を含む第1サンプルで、 a)上記鎖を、増幅させているそれぞれの異なった配列
    について、それぞれの核酸鎖に相補 的でエキソサンプルヌクレオチドを組み込 んでいるそれぞれのプライマーの延長産生 物が合成されるような条件下で、増幅され ているそれぞれの異なった特定配列に対す る2種のオリゴヌクレオチドプライマーで 処理し、上記プライマーは、それぞれの特 定配列の異なった鎖に充分相補的で相手と ハイブリダイズし、その結果1種のプライ マーから合成された延長産生物がその相補 体から分離するとき、他方のプライマーの 延長産生物の合成の鋳型として働くように 選ばれたものであり、 b)プライマー延長産生物をそれらが合成された鋳型か
    ら分離して一本鎖分子を生じ、 c)プライマー延長産生物が段階b)で製造された一本
    鎖のそれぞれを鋳型として使って合 成される条件下において段階a)のプライマーで段階b
    )から発生した上記一本鎖分子を処理し、 d)少なくとも1回は段階(a)から(c)を反復しそ
    れにより第1サンプルに含まれる特定核 酸配列を増幅し、および (B)1種の核酸配列または核酸配列混合物(それぞれ
    の核酸配列は同じまたは異なった長さの2種の別の相補
    鎖を有し、段階(A)の増幅核酸配列は第2サンプル中
    に存在することができる)を含む第2サンプルで、 e)上記エキソサンプルヌクレオチドを含む核酸を実質
    的に増幅しなくし、エキソサンプ ルヌクレオチドを含まない核酸の増幅に作 用しない物理的、化学的、酵素的または生 物学的処理を上記第2サンプルの核酸に施 それにより段階(A)中で増幅し、第2サンプル中に存
    在する第1サンプルのプライマー延長産生物が実質的に
    これ以上段階(B)では増幅しないようにする 段階からなる1つまたはそれ以上の核酸配列を増幅する
    方法。
  11. (11)エキソサンプルヌクレオチドがデオキシウリジ
    ンである請求項10記載の方法。
  12. (12)物理的、化学的、酵素的または生物学的処理が
    酵素的処理である請求項10記載の方法。
  13. (13)酵素的処理がウラシルDNAグリコシラーゼ処
    理である請求項12記載の方法。
  14. (14)段階(B)の間に f)少なくとも1回は段階(a)から(c)を反復しそ
    れにより第2サンプルに含まれる特異核 酸配列の任意のものを増幅する 段階を含む請求項10記載の方法。
  15. (15)さらに段階(B)の間に g)物理的、化学的、酵素的または生物学的処置を終結
    する 段階を含む請求項10記載の方法。
  16. (16)物理的、化学的、酵素的または生物学的処理が
    熱により達成される請求項15記載の方法。
  17. (17) (A)1種の核酸配列または核酸配列混合物(それぞれ
    の核酸配列は同じまたは異なった長さの2種の別の相補
    鎖を有する)を含む第1サンプルで、 a)上記鎖を、増幅させているそれぞれの異なった配列
    について、それぞれの核酸鎖に相補 的でデオキシウリジンを組み込んでいるそ れぞれのプライマーの延長産生物が合成さ れるような条件下で、増幅されているそれ ぞれの異なった特定配列に対する2種のオ リゴヌクレオチドプライマーで処理し、上 記プライマーは、それぞれの特定配列の異 なった鎖に充分相補的で相手とハイブリダ イズし、その結果1種のプライマーから合 成された延長産生物がその相補体から分離 するとき、他方のプライマーの延長産生物 の合成の鋳型として働くように選ばれたも のであり、 b)プライマー延長産生物をそれらが合成された鋳型か
    ら分離して一本鎖分子を生じ、 c)プライマー延長産生物が段階b)で製造された一本
    鎖のそれぞれを鋳型として使って合 成される条件下において段階a)のプライマーで段階b
    )から発生した上記一本鎖分子を処理し、 d)少なくとも1回は段階(a)から(c)を反復しそ
    れにより第1サンプルに含まれる特定核 酸配列を増幅し、および (B)1種の核酸配列または核酸配列混合物(それぞれ
    の核酸配列は同じまたは異なった長さの2種の別の相補
    鎖を有し、段階(A)の増幅核酸配列は第2サンプル中
    に存在することができる)を含む第2サンプルで、 e)上記鎖をウラシルDNAグリコシラーゼで処理し、 f)ウラシルDNAグリコシラーゼの鎖上における作用
    を熱により終結させ、 g)少なくとも1回は段階(a)から(c)を反復しそ
    れにより第2サンプルに含まれる特定核 酸配列を増幅し、 それにより段階(A)中で増幅し、第2サンプル中に存
    在する第1サンプルのプライマー延長産生物が実質的に
    これ以上段階(B)では増幅しないようにする 段階からなる1つまたはそれ以上の核酸配列を増幅する
    方法。
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