JP6535602B2 - 免疫療法のための組成物および方法 - Google Patents
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Description
この出願は、2013年2月26日に出願された米国仮出願第61/769,543号(この内容は、その全体が参考として本明細書に援用される)への優先権を主張する。
この発明は、National Institutes of Healthから助成金番号CA95152、CA138738、CA059350およびCA08748の下、政府の支援を受けてなされた。政府は、本発明に一定の権利を有する。
本発明は、癌および病原体に対する免疫応答を増強するための方法および組成物を提供する。本発明は、免疫調節分子の導入されたリガンドを発現するキメラ抗原受容体(CAR)であり得る抗原受容体を有する免疫応答性細胞に関する。特定の実施形態において、これら操作された免疫応答性細胞は、抗原指向性があり、免疫抑制に耐性があり、および/または増強された免疫活性化特性を有する。
現在、利用可能な治療法があるにもかかわらず、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病、および非ホジキンリンパ腫を含む大多数の成人B細胞悪性腫瘍は、不治である。遺伝子操作された自系T細胞を用いる養子療法は、メラノーマや無痛性のB細胞悪性腫瘍において治療的有効性の証拠を示してきた。そのような抗原に特異的な、キメラ抗原受容体(CAR)と名付けられた、人工的T細胞受容体をコードする遺伝子の導入を通じて、T細胞を、腫瘍関連抗原を標的にするように改変してもよい。免疫療法は、癌の処置を提供する可能性を有する標的治療である。
別に定める場合を除き、本明細書で用いる技術用語および科学用語はすべて、本発明が属する当業者によって一般的に理解されているものと同じ意味を有する。以下の参照文献は、本発明に用いられる用語の多くの一般的定義を有するスキルの1つを提供するものである:Singletonら、Dictionary of Microbiology and Molecular Biology(第2版、1994);The Cambridge Dictionary of Science and Technology(Walker編、1988);The Glossary of Genetics,第5版、R.Riegerら(編)、Springer Verlag(1991);およびHale & Marham,The Harper Collins Dictionary of Biology(1991)。本明細書中で用いる場合、別に定める場合を除き、下記の語は、以下に記した意味を有するものとする。
プライマー(1)5’−CACGTGCATGATCGAAACATACAACCAAACTTCTCCCCGATCTGC−‘3[配列番号:3]、および
プライマー(2)5’−CTCGAGGGATCCTCAGAGTTTGAGTAAGCCAAAGGA−3’[配列番号:4](図22A)。
METDTLLLWVLLLWVPGSTGD [配列番号:15](ヒト)、
METDTLLLWVLLLWVPGSTGD [配列番号:16](マウス)、および
CDSリーダー配列:MALPVTALLLPLALLLHAARP [配列番号:17]が含まれる。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する:
(項目1)
単離された免疫応答性細胞であって、以下:
1)抗原と結合する抗原認識受容体であって、上記結合は、上記免疫応答性細胞を活性化する、抗原認識受容体;および
2)免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)、
を含む、単離された免疫応答性細胞。
(項目2)
上記抗原が、腫瘍抗原または病原体抗原である、項目1に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目3)
上記可溶性scFvが分泌されるものである、項目1に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目4)
上記抗原認識受容体が、T細胞受容体(TCR)またはキメラ抗原受容体(CAR)である、項目1〜3のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目5)
上記抗原認識受容体が、外因性または内因性である、項目1〜4のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目6)
上記抗原認識受容体が、組み換え的に発現される、項目1〜5のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目7)
上記抗原認識受容体が、ベクターから発現される、項目1〜6のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目8)
上記scFvが、ベクターから発現される、項目1〜7のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目9)
上記細胞が、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、制御性T細胞、ヒト胚性幹細胞、および多能性幹細胞であって、上記多能性幹細胞からリンパ系細胞が分化され得る、多能性幹細胞からなる群より選択される、項目1〜8のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目10)
上記免疫応答性細胞が、自系のものである、項目1〜9のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目11)
上記抗原が、CD19、MUC16、MUCl、CAlX、CEA、CDS、CD7、CD10、CD20、CD22、CD30、CD33、CD34、CD38、CD41、CD44、CD49f、CD56、CD74、CD133、CD138、サイトメガロウイルス(CMV)感染細胞抗原、EGP−2、EGP−40、EpCAM、erb−B2,3,4、FBP、胎児性アセチルコリン受容体、葉酸受容体−a、GD2、GD3、HER−2、hTERT、IL−13R−a2、K−軽鎖、KDR、LeY、L1細胞接着分子、MAGE−A1、メソテリン、NKG2Dリガンド、NY−ES0−1、腫瘍胎児抗原(h5T4)、PSCA、PSMA、ROR1、TAG−72、VEGF−R2、またはWT−1からなる群より選択される腫瘍抗原である、項目1〜10のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目12)
上記免疫抑制性ポリペプチドが、CD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドからなる群より選択される、項目1〜11のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目13)
上記免疫刺激性ポリペプチドが、CD28、OX−40、4−1BB、およびそのリガンドからなる群より選択される、項目1〜11のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目14)
上記抗原が、CD19またはMUC16である、項目1〜13のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目15)
上記抗原認識受容体の細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζ鎖、CD97、CD11a−CD18、CD2、ICOS、CD27、CD154、CDS、OX40、4−1BB、CD28シグナル伝達ドメイン、またはその組み合わせである、項目1〜14のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目16)
上記細胞が、1928zまたは4H1128zである組み換えまたは内因性の抗原受容体を発現する、項目1〜15のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目17)
上記可溶性scFvが、上記免疫応答性細胞の免疫応答を増強する、項目1〜16のいずれか1項に記載の単離された免疫応答性細胞。
(項目18)
被験体において腫瘍負荷を減少させる方法であって、上記方法は、第一抗原に結合する抗原認識受容体であって、上記結合は、免疫応答性細胞を活性化する、抗原認識受容体、および免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)を含む有効量の免疫応答性細胞を投与することを含み、それによって上記被験体において腫瘍細胞死を誘導する、方法。
(項目19)
上記方法が、腫瘍細胞の数を減少させる、項目18に記載の方法。
(項目20)
上記方法が、腫瘍サイズを小さくする、項目18に記載の方法。
(項目21)
上記方法が、上記被験体において腫瘍を根絶させる、項目18に記載の方法。
(項目22)
新形成を有する被験体の生存を増大させる方法であって、上記方法は、第一抗原に結合する抗原認識受容体であって、上記結合が免疫応答性細胞を活性化する、抗原認識受容体、および免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)を含む有効量の免疫応答性細胞を投与することを含み、それによって上記被験体において新形成を処置または防止する、方法。
(項目23)
上記新形成が、血液の癌、B細胞白血病、多発性骨髄腫、リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病、非ホジキンリンパ腫、および卵巣癌からなる群より選択される、項目22に記載の方法。
(項目24)
上記新形成が、B細胞白血病であり、上記抗原が、CD19であり、かつ、免疫抑制活性を有する上記ポリペプチドが、CD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドのうちの1以上である、項目23に記載の方法。
(項目25)
上記新形成が、多発性骨髄腫であり、上記抗原が、CD19であり、かつ、免疫抑制活性を有する上記ポリペプチドが、CD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドのうちの1以上である、項目23に記載の方法。
(項目26)
上記新形成が、急性リンパ芽球性白血病(ALL)であり、上記抗原が、CD19であり、かつ、免疫抑制活性を有する上記ポリペプチドが、CD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドのうちの1以上である、項目23に記載の方法。
(項目27)
上記新形成が、慢性リンパ性白血病であり、上記抗原が、CD19であり、かつ、免疫抑制活性を有する上記ポリペプチドが、CD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドのうちの1以上である、項目23に記載の方法。
(項目28)
上記新形成が、非ホジキンリンパ腫であり、上記抗原が、CD19であり、かつ、免疫抑制活性を有する上記ポリペプチドが、CD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドのうちの1以上である、項目23に記載の方法。
(項目29)
上記新形成が、卵巣のものであり、上記抗原が、MUC16であり、かつ、免疫抑制活性を有する上記ポリペプチドが、CD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドのうちの1以上である、項目23に記載の方法。
(項目30)
上記可溶性scFvが分泌されるものである、項目22〜29のいずれか1項に記載の方法。
(項目31)
上記scFvが、ベクターから発現される、項目22〜30のいずれか1項に記載の方法。
(項目32)
上記可溶性scFvが、上記免疫応答性細胞の免疫応答を増強する、項目22〜31のいずれか1項に記載の方法。
(項目33)
上記抗原認識受容体が、T細胞受容体(TCR)またはキメラ抗原受容体(CAR)である、項目22〜32のいずれか1項に記載の方法。
(項目34)
上記抗原認識受容体が、外因性または内因性である、項目22〜33のいずれか1項に記載の方法。
(項目35)
上記抗原認識受容体が、組み換え的に発現される、項目22〜34のいずれか1項に記載の方法。
(項目36)
上記抗原認識受容体が、ベクターから発現される、項目22〜35のいずれか1項に記載の方法。
(項目37)
上記細胞が、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、制御性T細胞、ヒト胚性幹細胞、および多能性幹細胞であって、上記多能性幹細胞からリンパ系細胞が分化され得る、多能性幹細胞からなる群より選択される、項目22〜36のいずれか1項に記載の方法。
(項目38)
上記方法が、上記被験体において腫瘍負荷を減少させる、または根絶させる、項目22〜37のいずれか1項に記載の方法。
(項目39)
抗原特異的免疫応答性細胞を産生するための方法であって、上記方法は、免疫応答性細胞に、免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する単鎖可変フラグメント(scFv)をコードする核酸配列を導入することを含み、上記免疫応答性細胞が、抗原に結合する抗原認識受容体を含む、方法。
(項目40)
上記可溶性scFvが分泌されるものである、項目39に記載の方法。
(項目41)
上記scFvが、ベクターから発現される、項目39または40に記載の方法。
(項目42)
上記可溶性scFvが、上記免疫応答性細胞の免疫応答を増強する、項目39〜41のいずれか1項に記載の方法。
(項目43)
上記免疫抑制性ポリペプチドが、CD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドからなる群より選択される、項目39〜42のいずれか1項に記載の方法。
(項目44)
上記免疫刺激性ポリペプチドが、CD28、OX−40、4−1BB、およびそのリガンドからなる群より選択される、項目39〜42のいずれか1項に記載の方法。
(項目45)
上記抗原認識受容体が、T細胞受容体(TCR)またはキメラ抗原受容体(CAR)である、項目39〜44のいずれか1項に記載の方法。
(項目46)
上記抗原認識受容体が、外因性または内因性である、項目39〜45のいずれか1項に記載の方法。
(項目47)
上記抗原認識受容体が、組み換え的に発現される、項目39〜46のいずれか1項に記載の方法。
(項目48)
上記抗原認識受容体が、ベクターから発現される、項目39〜47のいずれか1項に記載の方法。
(項目49)
上記細胞が、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、制御性T細胞、ヒト胚性幹細胞、および多能性幹細胞であって、上記多能性幹細胞からリンパ系細胞が分化され得る、多能性幹細胞からなる群より選択される、項目39〜48のいずれか1項に記載の方法。
(項目50)
上記抗原認識受容体の細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζ鎖、CD97、CD11a−CD18、CD2、ICOS、CD27、CD154、CDS、OX40、4−1BB、CD28シグナル伝達ドメイン、またはその組み合わせである、項目39〜49のいずれか1項に記載の方法。
(項目51)
血液の癌の処置を必要とする被験体において、血液の癌を処置する方法であって、上記方法は、CD19に結合する抗原認識受容体であって、上記結合は免疫応答性細胞を活性化する、抗原認識受容体、ならびにCD47、PD−1、CTLA−4およびそのリガンドの1以上に結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)を含む治療的に有効な量のT細胞を上記被験体に投与することを含み、それによって上記被験体において血液の癌を処置する、方法。
(項目52)
上記血液の癌が、B細胞白血病、多発性骨髄腫、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病、および非ホジキンリンパ腫からなる群より選択される、項目51に記載の方法。
(項目53)
抗原に結合する抗原認識受容体をコードする核酸配列と、免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)をコードする核酸配列とを含む、ベクター。
(項目54)
有効量の、項目1〜18のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞を、薬学的に許容され得る賦形剤中に含む医薬組成物。
(項目55)
新形成を処置するための医薬組成物であって、有効量の、項目1〜18のいずれか1項に記載の腫瘍抗原特異的T細胞を、薬学的に許容され得る賦形剤中に含む、医薬組成物。
(項目56)
新形成、病原体感染、自己免疫障害、または同種異系移植片を処置するためのキットであって、上記キットは、抗原に結合し、免疫応答性細胞を活性化する抗原認識受容体と、免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)を含む免疫応答性細胞を含む、キット。
(項目57)
上記キットが、新形成、病原体感染、自己免疫障害、または同種異系移植片を有する被験体を処置するために上記細胞を使用するための説明書をさらに含む、項目56に記載のキット。
(項目58)
免疫細胞活性化活性を有する抗原結合受容体および外因性のCD40Lを発現する免疫応答性細胞。
(項目59)
上記抗原結合受容体が、キメラ抗原受容体である、項目58に記載の免疫応答性細胞。
(項目60)
上記キメラ抗原受容体が、腫瘍抗原を認識する、項目59に記載の免疫応答性細胞。
(項目61)
上記免疫応答性細胞が、T細胞、ナチュラルキラー細胞、細胞傷害性T細胞、および制御性T細胞からなる群より選択される、項目58〜60のいずれかに記載の免疫応答性細胞。
(項目62)
被験体において癌細胞または病原体に応答して免疫活性化サイトカイン産生を増加させる方法であって、上記癌細胞または上記病原体の抗原にそれぞれ結合する抗原認識受容体を有し、さらに外因性のCD40Lを発現する免疫応答性細胞を上記被験体に投与することを含む、方法。
(項目63)
上記抗原結合受容体が、キメラ抗原受容体である、項目62に記載の方法。
(項目64)
上記キメラ抗原受容体が、癌抗原を認識する、項目63に記載の方法。
(項目65)
上記免疫応答性細胞が、T細胞、ナチュラルキラー細胞、細胞傷害性T細胞、および制御性T細胞からなる群より選択される、項目62〜64のいずれか1項に記載の方法。
(項目66)
上記サイトカインが、IL−12である、項目62〜65のいずれか1項に記載の方法。
(項目67)
被験体において癌細胞または病原体に対するCD8+細胞傷害性T細胞応答を増大させる方法であって、上記癌細胞または上記病原体の抗原にそれぞれ結合する抗原認識受容体を有し、さらに外因性のCD40Lを発現する免疫応答性細胞を上記被験体に投与することを含む、方法。
(項目68)
上記抗原結合受容体が、キメラ抗原受容体である、項目67に記載の方法。
(項目69)
上記キメラ抗原受容体が、癌抗原を認識する、項目68に記載の方法。
(項目70)
上記免疫応答性細胞が、T細胞、ナチュラルキラー細胞、細胞傷害性T細胞、および制御性T細胞からなる群より選択される、項目67〜69のいずれかに記載の方法。
(項目71)
癌を有するかまたは病原体によって引き起こされる疾患を有する被験体において樹状細胞成熟を増大させる方法であって、上記癌細胞または上記病原体の抗原にそれぞれ結合する抗原認識受容体を有し、さらに外因性のCD40Lを発現する免疫応答性細胞を上記被献体に投与することを含む、方法。
(項目72)
上記抗原結合受容体が、キメラ抗原受容体である、項目71に記載の方法。
(項目73)
上記キメラ抗原受容体が、癌抗原を認識する、項目72に記載の方法。
(項目74)
上記免疫応答性細胞が、T細胞、ナチュラルキラー細胞、細胞傷害性T細胞、および制御性T細胞からなる群より選択される、項目71〜73のいずれかに記載の方法。
(項目75)
被験体において腫瘍負荷を減少させる方法であって、第一抗原に結合する抗原認識受容体であって、上記結合は免疫応答性細胞を活性化する、抗原認識受容体を有し、そして外因性のCD40Lを発現する有効量の免疫応答性細胞を上記被験体に投与することを含み、それによって上記被験体において腫瘍細胞死を誘導する、方法。
(項目76)
新形成を有する被験体の生存を延ばす方法であって、上記方法は、第一抗原に結合する抗原認識受容体であって、上記結合は免疫応答性細胞を活性化する、抗原認識受容体を有し、そして外因性のCD40Lを発現する有効量の免疫応答性細胞を上記被験体に投与することを含み、それによって上記被験体の生存を延ばす、方法。
(項目77)
被験体において新形成を処置または防止する方法であって、上記方法は、第一抗原に結合する抗原認識受容体であって、上記結合は免疫応答性細胞を活性化する、抗原認識受容体を有し、そして外因性のCD40Lを発現する有効量の免疫応答性細胞を上記被験体に投与することを含み、それによって上記被験体において新形成を処置または防止する、方法。
(項目78)
CARをコードする配列およびCD40Lをコードする配列を含む核酸であって、それぞれ任意に操作可能にプロモーターエレメントに連結している、核酸。
(項目79)
ベクターに含まれる、項目78に記載の核酸。
(項目80)
上記ベクターがウイルスである、項目79に記載の核酸。
(項目81)
新形成、病原体感染、自己免疫障害、または同種異系移植片を処置するためのキットであって、処置されるべき上記新形成、上記病原体、上記自己免疫障害、または上記移植片の抗原を認識するCARをコードする核酸、および免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)をコードする核酸を含む、キット。
(項目82)
癌を処置するためのキットであって、上記癌の抗原を認識するCARをコードする核酸、および免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)をコードする核酸を含む、キット。
(項目83)
癌または病原体が媒介する障害を処置するためのキットであって、上記癌または上記病原体の抗原を認識するCARをコードする核酸、および免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)をコードする核酸を含む、キット。
(項目84)
癌または病原体が媒介する障害を処置するためのキットであって、上記癌または上記病原体の抗原を認識するCARをコードする核酸、およびCD40Lをコードする核酸を含む、キット。
本発明は、一般に、少なくとも、抗原認識受容体(例えば、TCRまたはCAR)および、(i)免疫抑制性の抗原(例えば、αPD−1、αPD−Ll、αCTLA−4、もしくはαCD47)に結合するscFv;(ii)免疫刺激性の抗原(例えば、αCD28、αOX−40、αCD40、もしくはα4−1BB)に結合するscFv、または(iii)CD40Lのいずれかとの組み合わせを発現する、遺伝子的に改変された免疫応答性細胞(例えば、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)細胞)、ならびにそのような細胞を、抗原特異的免疫応答の増加が望ましい、新形成および他の病理的状態を処置するために使用する方法を提供する。本発明は、免疫抑制性の抗原(例えば、本明細書中に示すように、CD47およびPD−L1)に結合するscFvが、免疫反応性細胞を活性化および刺激するのに有用であるという発見に少なくとも部分的に基づいている。特に、本発明のscFvは、腫瘍微小環境における活性化された免疫反応性細胞の免疫応答の抑制を減少または防止する。悪性腫瘍細胞は、それ自身を免疫認識および除去から保護するための一連のメカニズムを作り出している。本アプローチは、腫瘍根絶のための、腫瘍微小環境内での免疫原性を提供し、従来の養子T細胞治療に対する有意な進歩を示している。
腫瘍は、宿主の免疫応答に過酷な微小環境を有する。そしてそれは、悪性腫瘍細胞のそれ自身を免疫認識および除去から保護するための一連のメカニズムに関与する。この「過酷な腫瘍微小環境」は、浸潤性制御CD4+T細胞(Treg)、骨髄由来のサプレッサー細胞(MDSC)、腫瘍関連マクロファージ(TAM)、IL−10およびTGF−βなどの免疫抑制性サイトカイン、および活性化されたT細胞により発現される免疫抑制性受容体(CTLA−4およびPD−1)を標的とするリガンドの発現を含めた種々の免疫抑制因子を含む。これらの免疫抑制のメカニズムは、忍容性の維持および不適切な免疫応答の抑制において役割を果たす。しかしながら、腫瘍微小環境内で、これらのメカニズムは、有効な抗腫瘍免疫応答を防止する。まとめて、これらの免疫抑制因子は、標的とされた腫瘍細胞に出会うとすぐ、養子移入されたCAR改変T細胞の著しいアネルギーまたはアポトーシスのいずれかを惹起することができる。
CTLA−4は、活性化されたT細胞により発現される阻害性受容体である。それは、対応するリガンド(それぞれ、CD80およびCD86;B7−1およびB7−2)によって連結されると、活性化されたT細胞の阻害またはアネルギーを媒介する。前臨床研究においても臨床研究においても、抗体の全身注入によるCTLA−4遮断は、内因性の抗腫瘍応答を高めた。とはいえ、臨床の設定では、有意な予期できない毒性がある。特定の理論にとらわれるわけではないが、腫瘍を標的とするCAR改変T細胞による、アンタゴニストscFvの送達により標的化されたCTLA−4の遮断により、毒性を減少させることができ、かつ免疫抑制から保護される腫瘍を標的とするT細胞の「内因性」の群(CAR T細胞群)の代用薬を提供する。前臨床研究(例えば、B細胞悪性腫瘍および卵巣癌腫のヒト異種移植腫瘍モデルおよびネズミ腫瘍モデル)を用いて、CAR改変T細胞群ならびに内因性の抗腫瘍免疫応答の両方に対するscFv分泌の効果を評価することができる。抗CTLA−4 scFvは、マウス抗マウスCTLA−4モノクローナル抗体を分泌する9D9ハイブリドーマ、またはハムスター抗マウスCTLA−4モノクローナル抗体を分泌する9Hl0ハイブリドーマから生成することができる。
PD−1は、内因性のマクロファージおよび樹状細胞で発現した対応するリガンドPD−L1およびPD−L2に結合して活性化されたT細胞の負の免疫レギュレータである。PD−L1のアップレギュレーションは1つのメカニズムであり、腫瘍細胞は宿主免疫系を回避し得る。また、前臨床の治験においても、最近公表された臨床治験においても、アンタゴニスト抗体によるPD−1遮断は、内因性の宿主免疫系に媒介される抗腫瘍応答を誘導した。異種移植および同系ネズミ腫瘍モデルを用いることができる。そしてそれは、腫瘍を標的とするCAR改変T細胞により分泌されたアンタゴニスト抗PD−1 scFvが、これらのscFv分泌性CAR改変T細胞の抗腫瘍有効性を高めることを示している。
CD47は、広範な組織分布を有する膜タンパク質であり、その1つは最近の前臨床モデル(imodels)において広範な腫瘍細胞をマクロファージ認識から保護することが示されている。これらのモデルでは、抗CD47モノクローナル抗体を注入した結果、確立した腫瘍進行が減少した。換言すれば、腫瘍細胞上でのCD47遮断により、これらの腫瘍細胞を宿主マクロファージによる認識およびファゴサイトーシスにさらした。この抗原の発現が幾分ユビキタスであると仮定すれば、遮断抗体の全身注入により、毒性の標的が外れるかもしれない。また、標的送達のパラダイムを維持することで、CAR改変T細胞によって、直接的に腫瘍微小環境に送達された同様に遮断する抗CD47 scFvの分泌が、所望の抗腫瘍効果を惹起/増強する。この場合、適応宿主免疫系ではなく、むしろ先天的免疫系により媒介される。さらに、このアプローチは、新形成処置に限定されず、抗原特異性免疫応答の増加が望ましい広範囲の適用に受け入れられる。そのような適用としては、新形成の処置のみならず、免疫応答の病原体感染もしくは感染症に対する増強、および自己免疫もしくは同種異系移植片の背景における制御性T細胞の免疫忍容性の強化がある。
CD40リガンド(CD40L、CD154)、すなわち腫瘍壊死因子(TNF)遺伝子スーパーファミリーに属するII型膜貫通タンパク質は、腫瘍特異的T細胞の機能を増強する可能性を有している。活性化されたCD4+ T細胞上で最初に同定され、広大な範囲の免疫、造血性の細胞、上皮細胞、内皮細胞、および平滑筋細胞において、CD40Lの発現が誘導され得る。活性化されたT細胞において、CD40Lは、すぐに発現し、6時間以内にピークに達し、その後、続く12〜24時間にわたって減少する。CD40Lは、B細胞、マクロファージ、および樹状細胞(DC)を含めた種々の免疫細胞および非免疫細胞上で構成的に発現する同族受容体CD40に結合する。重要なことに、CD40はまた、慢性リンパ性白血病(CLL)、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、非ホジキンリンパ腫(NHL)、ホジキンリンパ腫、鼻咽頭癌腫、骨肉腫、ユーイング肉腫、メラノーマ、乳癌腫、卵巣癌腫、および子宮頸癌腫を含む、いくつかの血液学的および非血液学的悪性腫瘍において発現する。CAR/CD40L T細胞が広範な悪性腫瘍において適用できることを示している。実施例6の後に記載した参考文献8〜17を参照されたい。
哺乳動物の造血(血液)細胞は、様々な生理学的活性を提供する。造血細胞は、リンパ系系譜、骨髄系系譜および赤血球系系譜に分けられる。リンパ系系譜は、B細胞、T細胞およびナチュラルキラー(NK)細胞を含み、抗体の産生、細胞免疫系の調節、血液における外来性病原体の検出、宿主にとって異物である細胞の検出などに備える。本明細書中で用いる場合、用語「T細胞」は、胸腺において成熟し、細胞媒介性免疫を主に担うリンパ球を示す。T細胞は適応免疫系に関与する。本明細書中で用いる場合、用語「ナチュラルキラー(NK)細胞」は、細胞媒介性免疫の一部であり、かつ、先天性免疫応答の期間中に作用するリンパ球を示す。これは、標的細胞に対するその細胞傷害性効果を発揮するために事前の活性化を必要としない。細胞傷害性T細胞(CTL細胞またはキラーT細胞)は、感染を受けた体細胞または腫瘍細胞の死を誘導することができるTリンパ球のサブセットである。
本発明は、免疫応答性細胞を活性化する抗原認識受容体(例えば、TCR、CAR)と免疫抑制性の抗原(例えば、αPD−1、αPD−Ll、αCTLA−4、またはαCD47)に結合するscFvの組み合わせを発現する細胞、および免疫応答の増強が必要である、疾患を処置するためにかかる細胞を使用する方法を提供する。あるアプローチにおいては、新形成の処置または防止のために、腫瘍抗原特異的T細胞、NK細胞、CTL細胞、またはその他の免疫応答性細胞を用いて、免疫抑制性の抗原と結合するscFvを発現させる。例えば、CD19を認識するキメラ抗原受容体1928zを発現するT細胞を、CD47と結合するscFvを発現するT細胞内で共発現させる。そのような細胞を、血液の癌(例えば、白血病、リンパ腫、および骨髄腫)を処置または防止するために、それを必要とするヒト被験体に投与する。別のアプローチにおいて、ウイルス抗原特異的なT細胞、NK細胞、CTL細胞を、ウイルス疾患を処置するために使用することができる。例えば、第1CMV抗原を認識するキメラ共刺激抗原受容体およびPD−1に結合するscFvを、CMVを処置するために、細胞傷害性Tリンパ球において共発現させる。
本発明の方法において使用することができるタイプの腫瘍抗原特異的ヒトリンパ球には、キメラ抗原受容体(CAR)を発現するために遺伝子改変された末梢ドナーリンパ球(Sadelain,M.ら、2003、Nat Rev Cancer 3:35−45)、αおよびβヘテロダイマーを含む全長の腫瘍抗原認識T細胞受容体複合体を発現するために遺伝子改変された末梢ドナーリンパ球(Morgan,R.A.ら、2006、Science,314:126−129)、腫瘍生検物における腫瘍浸潤リンパ球(TIL)に由来するリンパ球培養物(Panelli,M.C.ら、2000、J.Immunol 164:495−504;Panelli,M.C.ら、2000、J.Immunol 164:4382−4392)、および人工抗原提示細胞(AAPC)またはパルス処理された樹状細胞を用いて選択的にインビトロで増殖された抗原特異的な末梢血白血球(Dupont,J.ら、2005、Cancer Res 65:5417−5427;Papanicolaou,G.A.ら、2003、Blood 102:2498−2505)が挙げられるが、それらに限定されない。T細胞は自系、あるいは同種であるか、またはインビトロでの遺伝子組み換え前駆細胞または幹細胞由来であってよい。好適な腫瘍抗原(抗原性ペプチド)はいずれも、本明細書中に記載される腫瘍関連の実施形態における使用に好適である。抗原の供給源には、様々な癌タンパク質が含まれるが、これらに限定されない。抗原を、ペプチドとして、あるいは、無傷のタンパク質またはその一部として発現させることができる。無傷のタンパク質またはその一部は野生型であってもよく、または、変異させることもできる。
例えば、免疫無防備状態の被験体における病原体感染または他の感染性疾患の処置において使用される好適な抗原には、サイトメガロウイルス(CMV)、エプスタイン・バールウイルス(EBV)、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)およびインフルエンザウイルスに存在するウイルス抗原が挙げられるが、それらに限定されない。
免疫応答性細胞(例えば、T細胞、CTL細胞、NK細胞)の遺伝子改変は、実質的に均質な細胞組成物に組換えDNA構築物を形質導入することによって達成できる。好ましくは、レトロウイルスベクター(ガンマ−レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターのどちらか)が、DNA構築物を細胞に導入するために用いられる。例えば、抗原(例えば、腫瘍抗原もしくは変異体、またはそのフラグメント)に結合する受容体をコードするポリヌクレオチドを、レトロウイルスベクターにクローニングすることができ、発現を、その内因性プロモーターから、または、レトロウイルスの長末端反復から、または、目的とする標的細胞タイプに対して特異的なプロモーターから行わせることができる。非ウイルスベクターを同様に使用することもできる。
本発明はまた、CD19、αCD19、CD28、CD3ζ、4H1128z、B6H12.2 scFv、5C4 scFv、およびJ43 scFvのポリペプチドまたはそれらのフラグメントを含み、免疫応答性細胞で発現されるとき、それらの抗新生物活性を増強する様式で改変される(例えば、ヒト化モノクローナル抗体)。本発明は、アミノ酸配列または核酸配列を、配列の変化を起こすことによって最適化する方法を提供する。そのような修飾には、いくつかの変異、欠失、挿入または翻訳後改変が含まれてよい。本発明はさらに、本発明の任意の天然に存在するポリペプチドのアナログを含んでいる。アナログは、本発明の天然に存在するポリペプチドと、アミノ酸配列の違いによって、または、翻訳後改変によって、または、その両方によって異なる場合がある。本発明のアナログは一般には、本発明の天然に存在するアミノ酸配列のすべてまたは一部と少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれを超える同一性を示す。配列比較の長さは、少なくとも5、10、15または20のアミノ酸残基であり、好ましくは少なくとも25、50または75のアミノ酸残基であり、より好ましくは100超のアミノ酸残基である。ここでも、同一性の程度を確認する1つの例示的な方法では、BLASTプログラムを使用することができ、e−3〜e−100の確率スコアにより、関連性の高い配列が示される。改変には、ポリペプチドのインビボおよびインビトロでの化学的誘導体化が含まれ、例えば、アセチル化、カルボキシル化、リン酸化またはグリコシル化が含まれる;そのような改変を、ポリペプチドの合成またはプロセシング、あるいは、その後に続く、単離された改変酵素による処理の期間中に生じさせることができる。アナログはまた、本発明の天然に存在するポリペプチドとは、一次配列における様々な修飾によって異なる場合がある。これらには、遺伝子変異体(天然型および誘導型の両方)(例えば、放射線照射または硫酸エタンメチルへの暴露によって、あるいは、Sambrook、FritschおよびManiatis、Molecular Cloning:A Laboratory Manual(第2版)、CSH Press、1989、またはAusubelら、前掲に記載されるような部位特異的変異誘発によるランダム変異から生じる変異体)が含まれる。L−アミノ酸以外の残基、例えば、D−アミノ酸または天然に存在しないアミノ酸または合成アミノ酸、例えば、ベータ(β)−アミノ酸またはガンマ(γ)−アミノ酸、を含有する環化されたペプチド、分子およびアナログもまた含まれる。
少なくとも1つの共刺激リガンドとの相互作用により、免疫細胞(例えば、T細胞)の完全な活性化のために重要な抗原非特異的なシグナルがもたらされる。共刺激リガンドには、腫瘍壊死因子(TNF)リガンド、サイトカイン(例えば、IL−2、IL−12、IL−15またはIL21)、および、免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリーリガンドが挙げられるが、それらに限定されない。腫瘍壊死因子(TNF)は、全身性炎症に関与するサイトカインであり、急性期反応を刺激する。その主要な役割は免疫細胞の調節にある。腫瘍壊死因子(TNF)リガンドは数多くの共通する特徴を共有している。これらのリガンドの大部分が、短い細胞質セグメントおよび比較的長い細胞外領域を含有するII型膜貫通タンパク質(細胞外C末端)として合成される。TNFリガンドには、神経成長因子(NGF)、CD40L(CD40L)/CD154、CD137L/4−1BBL、腫瘍壊死因子α(TNFα)、CD134L/OX40L/CD252、CD27L/CD70、Fasリガンド(FasL)、CD30L/CD153、腫瘍壊死因子ベータ(TNFβ)/リンホトキシン−アルファ(LTα)、リンホトキシン−ベータ(LTβ)、CD257/B細胞活性化因子(BAFF)/Blys/THANK/Tall−1、グルココルチコイド誘導TNF受容体リガンド(GITRL)、およびTNF関連アポトーシス誘導リガンド(TRAIL)、LIGHT(TNFSF14)が挙げられるが、それらに限定されない。免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリーは、細胞の認識プロセス、結合プロセスまたは接着プロセスに関与する細胞表面タンパク質および可溶性タンパク質の大きな一群である。これらのタンパク質は構造的特徴を免疫グロブリンと共有する。それらは免疫グロブリンドメイン(fold)を有する。免疫グロブリンスーパーファミリーリガンドには、ともにCD28に対するリガンドである、CD80およびCD86が挙げられるが、それらに限定されない。
本発明の遺伝子改変免疫応答性細胞(例えば、T細胞、NK細胞、CTL細胞またはそれらの祖先)を含む組成物を、新形成、病原体感染、または感染性疾患を処置するために被験体に全身的または直接的に提供することができる。1つの実施形態において、本発明の細胞が、目的とする器官(例えば、新形成に冒された器官)に直接に注入される。あるいは、遺伝子改変免疫応答性細胞を含む組成物が、例えば、循環系(例えば、腫瘍血管系)への投与によって、目的とする器官に間接的に提供される。増殖剤および分化剤を、T細胞、NK細胞、CTL細胞の産生をインビトロまたはインビボで増加させるために、細胞の投与前、投与中または投与後に提供することができる。
遺伝子改変免疫応答性細胞を含む本発明の組成物は、都合良くは、選択されたpHに緩衝化されてよい無菌の液体調製物、例えば、等張水溶液、懸濁液、乳濁液、分散物または粘性組成物として与えることができる。液体調製物は通常、ゲル、他の粘性組成物および固体組成物より、調製することが容易である。加えて、液体組成物は、特に注射によって投与することが幾分より便利である。他方で、粘性組成物を、特定の組織とのより長い接触期間を提供するために、適切な粘度範囲内において配合することができる。液体組成物または粘性組成物は、例えば、水、生理食塩水、リン酸塩緩衝化生理食塩水、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、液状ポリエチレングリコールなど)およびそれらの好適な混合物を含有する溶媒または分散用媒体であり得る担体を含むことができる。
本明細書には、被験体における新形成を処置する方法が提供される。本明細書には、免疫無防備状態のヒト被験体のような被験体における病原体感染または他の感染性疾患を処置する方法も包含される。これらの方法は、所望の効果が現状の緩和または再発の防止であるならば、本発明のT細胞、NK細胞またはCTL細胞を、所望の効果に到達するための有効量で投与することを含む。処置のために、投与される量は、所望の効果を生じるための有効な量である。有効量を単回で、または一連の投与で提供できる。有効量をボーラス剤で、または連続灌流によって提供できる。
本発明は、免疫応答の増大の必要のある被験体において、免疫応答を増大させるための方法を提供する。ある実施形態では、本発明は、被験体において、新形成を処置または防止する方法を提供する。本発明は、従来の治療的介入になじまない、血液の癌(例えば、白血病、リンパ腫、および骨髄腫)、または卵巣癌を有する被験体を処置するために特に有用な治療法を提供する。治療に対する好適なヒト被験体は、典型的には臨床基準により区別され得る2つの処置群を含む。「進行した疾患」または「高い腫瘍負荷」を有する被験体が、臨床的に測定可能な腫瘍を有する被験体である。臨床的に測定可能な腫瘍は、(例えば、触診、CATスキャン、ソノグラム、マンモグラムまたはX線;それら自身ではこの集団を同定するには十分ではない、陽性の生化学的または組織病理学的マーカーによる)腫瘍の質量に基づいて検出可能な腫瘍である。本発明において具体的に例示される医薬組成物が、被験体の状態を緩和するという目的で、抗腫瘍応答を誘発するためにこれらの被験体に投与される。理想的には、結果として腫瘍質量の減少がもたらされるが、何らかの臨床的改善は利益となる。臨床的改善には、腫瘍のリスクまたは進行速度の低下、あるいは、病理的帰結の減少が含まれる。
本発明は、新形成、病原体感染、免疫障害または同種異系移植片を処置または防止するためのキットを提供する。ある実施形態では、キットは、活性化抗原受容体および免疫抑制活性を有する抗原に結合する単鎖可変フラグメント(scFv)を含む有効量の免疫応答性細胞を単位用量形態で含有する治療用または予防用組成物を含む。いくつかの特定の実施形態において、細胞はさらに、共刺激リガンドを含む。一部の実施形態において、キットは、治療用または予防用ワクチンを含有する減菌容器を含み、そのような容器は、ボックス、アンプル、ボトル、バイアル、チューブ、バッグ、ポーチ、ブリスターパックまたは当該技術分野で公知の他の好適な容器形態が可能である。そのような容器は、プラスチック、ガラス、ラミネート紙、金属ホイルまたは医薬を保持するために好適な他の材料で製造することができる。
ヒトCD47と特異的に結合するscFvを生成し、このscFvおよび腫瘍抗原(CD19)を認識するCARで改変されたヒト末梢血T細胞は、インビトロでの抗腫瘍有効性、ならびに前臨床モデルでの抗腫瘍有効性の上昇を示した。
抗PD−1抗体からのVH鎖およびVL鎖に基づいて、抗ヒトPD−1 scFvを生成した(クローン5C4)(米国特許第8,008,449号)。5C4 scFvは、カッパリーダー配列、セリン−グリシンリンカー、およびc−mycタグを含むようにデザインされた(図11)。このscFv構築物をSFGレトロウイルスバックボーンにクローニングし、1928z−2A−5C4および4H1128z−2A−5C4を生成させた(図12および図13)。ヒトPD−1に結合する高親和性scFvを開発するために(例えば、1928z/4H1128z CAR T細胞内で発現させるために)、ヒト抗体ファージディスプレイライブラリーをスクリーニングして、ヒトPD−1(および潜在的にマウスPD−1)に特異的に結合するscFvを決定した。
抗PD−1抗体クローンJ43からのVHおよびVLに基づいて、抗マウスPD−1 scFvを生成した(米国特許第7,858,746号、Honjoら)。J43 scFvは、マウスカッパ鎖リーダー配列、セリン−グリシンリンカー、およびc−mycタグを含むようにデザインした(図18)。このscFv構築物を、ヒトCD19、またはマウスC28およびマウスCD3zetaを介してシグナル伝達を行うヒトMUC−CDを標的とするCARを発現する、SFGレトロウイルスバックボーンにクローニングし、マウスT細胞を刺激した。前述したように、これらの構築物19m28mz−IRES−J43(図19)および4H11m28mz−IRES−J43(図20)を使用して、安定したPhoenixパッケージ細胞株を生成し、一次ネズミ細胞を遺伝子的に改変する(Leeら、Cancer Res 2011,71(8):2871)。マウス19m28mz T細胞および19m28mz−IRES−J43 T細胞を、ヒトCD19およびマウスPD−L1を発現するように改変されたEL4胸線腫瘍細胞と共に培養し、生存性可能細胞の数およびCFSE標識をモニターするために、マウスT細胞を増殖させる。
ある実施形態では、本発明は、抗原結合受容体(例えば、CARまたはTCR)、およびアゴニスト免疫刺激活性を有する抗原(例えば、CD28、OX−40、4−1BB、およびそのリガンド)に結合する単鎖可変フラグメント(scFv)を発現する免疫細胞を提供する。共刺激性分子4−1BBを標的とするアゴニストscFvを生成するため、3H3ハイブリドーマ細胞株を取得した(Shufordら、J.Exp.Med、1997、186:47−55;Professor Mick Croft((La Jolla Institute for Allergy and Immunology)から提供を受けた)。共刺激性分子OX−40を標的とするアゴニストscFvを生成するため、OX−86ハイブリドーマ細胞株を取得した(al−Shamkhaniら、Eur.J.Immunol1996、26(8):1695−9;European Collection of Cell Cultures(カタログ番号:96110601))。ハイブリドーマmRNAは、QIAgen RNAeasyキットを用いて、製造元(QIAgen、CA、USA)の指示にしたがって、細胞から単離し、その後、New England Biolabs Protoscript AMV First strand cDNA合成キットを用い、製造元(New England Biolabs、MA、USA)の指示にしたがって、cDNAを調製した。その後、以下の縮重プライマーを用いて、可変重鎖(VH)および軽鎖(VL)をPCR増幅した。
B6H12.2ハイブリドーマ細胞株は、American Tissue Culture Collection(ATCC,VA,USA;カタログ番号:HB−9771)から取得した。B6H12.2 mRNAは、QIAgen RNAeasyキットを用いて、製造元(QIAgen、CA、USA)の指示にしたがって、ハイブリドーマ細胞から単離し、cDNAは、New England Biolabs Protoscript AMV First strand cDNA合成キットを用い、製造元(New England Biolabs、MA、USA)の指示にしたがって調製した。可変重鎖(VH)および軽鎖(VL)は、カッパリーダー配列、セリン−グリシンリンカー、およびc−mycタグを組み込むようにデザインしたプライマーを用いて(図1参照)、以下のようにPCR増幅した。
安定したパッケージ細胞株を生成するため、リン酸カルシウム・トランスフェクション・キットを用いて、製造元(Promega)の指示にしたがって、H29細胞を、10μgのSFG−1928z−2A−B6Hl2.2 DNAとともに、一時的にトランスフェクトした。H29上清からの上清を用いて、293Glv9細胞を形質導入した。次いでそれをサブクローニングして、安定したパッケージ細胞を生成した。2つのサブクローン(クローン5およびクローン6)の選択は、1928z CARの発現と293Glv9上清がヒト末梢血T細胞を形質導入する能力に基づいて行った(12dll抗体での染色後のフローサイトメトリーによって判定した)。ヒト末梢血T細胞の形質導入は、前述のように行った(Brentjensら、Clin Cancer Res 2007,13(18Ptl):5426)。
抗CD47 scFvの1928z−2A−B6Hl2.2 293Glv9および形質導入されたヒト末梢血T細胞からの産生を、これらの細胞の上清中で、CD47+腫瘍細胞(RajiおよびNalm−6)をインキュベートすることによって判定した。続いて腫瘍細胞を洗浄し、蛍光コンジュゲート抗c−mycタグ抗体(Cell Signaling,MA,USA)で染色し、腫瘍細胞に結合した上清由来のタンパク質を検出した。腫瘍細胞も蛍光コンジュゲート抗CD47(クローンB6Hl2.2,eBioscience)で染色し、B6Hl2−scFvがCD47遮断する能力を検出した。
マウスに、ホタルルシフェラーゼを発現するように改変したl×106のNalm−6を静脈注射した(0日目)。3日目、マウスを5.7×106のCAR+T細胞を同じく静脈から接種し、処置した。腫瘍の進行を、生物発光イメージングを用いて、前述のように臨床的にモニターした(Santosら、Nature Medicine 2009,15(3):338)。
ヒトPD−1に特異的に結合する抗体、クローン5C4の配列を上記のように取得した。この配列をカッパリーダー配列、セリン−グリシンリンカー、およびc−mycタグを含むように改変した。GeneArt(Invitrogen,図9)から購入した。このscFvのSFGレトロウイルスバックボーンへのクローニング、安定したパッケージ細胞の生成、ヒト末梢血T細胞の形質導入、および形質導入効率の評価は、上記のように達成した。
PD−1リガンドであるPD−L1を、200ng/ml組み換えヒトインターフェロン−ガンマ(RnD systems、MN、USA)中でインキュベートしたSKOV3(ATCC)腫瘍細胞からPCR増幅した。ヒトPD−L1の増殖に使用されたプライマーを以下に示す。
ネズミPD−1に特異的に結合する抗体、クローン名J43、の配列を上記のように取得した。この配列をカッパ鎖リーダー配列およびc−mycタグをセリン−グリシンリンカーと共に含むように改変し、scFvを形成させた。GeneArt(Invitrogen、図16)から購入した。これを、ネズミCARをコードする既存のレトロウイルス発現ベクター(SFG)にクローニングした。ここでは、シグナル伝達はマウスCD28およびCD3ゼータ分子によって媒介される。それぞれB細胞および卵巣腫瘍を標的とするように19m28mz−IRES−J43および4H11m28mz−IRES−J43を生成した(図17および18)。
PD−1リガンドであるPD−L1を、Renca腫瘍細胞(ATCC)からPCR増幅した。マウスPD−L1の増幅に使用されたプライマーを以下に示す。
望ましい抗原を発現する標的T細胞を、51Crで標識し、エフェクター:標的比を減少させて、T細胞と共培養した。4時間培養した後、上清を除去し、クロムから放出される放射能の測定に用いた。25T細胞と培養したものでない標的細胞の背景放射能を差し引き、0.2%TritonX−100を用いて完全に溶解された標的細胞から測定した放射能で割ることによって、特異的溶解を判定した。
実施例5.遮断CD47によるCAR T細胞治療の向上
T細胞は、キメラ抗原受容体(CAR)の発現を介して腫瘍抗原を標的とするように遺伝子的に改変することができる。CD19特異的CAR T細胞の養子移入は、血液学的悪性腫瘍を有する患者の一部において臨床的有効性を示してきた。しかしながら、リンパ節腫脹の大きな慢性リンパ球性白血病患者は、CAR T細胞治療に対する反応は最適以下である。さらに、CAR T細胞治療は、臨床治験において、固形腫瘍に対する有効性を実証できていない。この実施例では、CAR T細胞の臨床的有効性を、CAR T細胞からのCD47遮断単鎖可変フラグメント(scFv)の分泌を介した先天的な抗腫瘍免疫応答を取り入れることにより増強した。従前の研究では、腫瘍細胞上のCD47とマクロファージ上のSIRPa間の相互作用の遮断が、腫瘍細胞のファゴサイトーシスを引き起こすことを示している。この効果を利用するために、CD19特異的CAR(1928z)を発現させ、ヒトCD47に特異的なscFvを分泌させるべくT細胞を改変した。そして、B6H12.2ハイブリドーマからクローニングした(1928z/B6H12.2 T細胞)。1928z/B6H12.2 T細胞は、ヒトCD47に特異的な機能的scFvを分泌することが示された。それは、CAR媒介性のサイトカイン分泌、または細胞傷害性に、インビトロで影響を及ぼさなかった。1928z T細胞ではない、1928z/B6H12.2 T細胞からの上清は、マクロファージを刺激して、腫瘍細胞をインビトロで貪食させた。1928z/B6H12.2 T細胞の養子移入は、前臨床ネズミモデルにおいて、高い抗腫瘍効果を媒介し、Nalm6腫瘍を根絶させた。この新規な戦略は、CAR T細胞媒介効果、および腫瘍細胞の先天的な免疫細胞媒介性の破壊を組み合わせている。それは、CAR T細胞治療の抗腫瘍有効性を高めるものである。
キメラ抗原受容体(CAR)を発現する、遺伝子的に改変されたT細胞を用いた養子細胞治療は、B−ALLを有する患者にとって将来有望な治療である。しかしながら、大半の臨床治験において、CAR−改変T細胞は、特に、B細胞低悪性腫瘍および固形腫瘍においては、有意な治療有益性を示せなかった。この実施例の章に示した実験において、我々は、T細胞を遺伝子操作して構成的にCD40リガンド(CD40L、CD154)を発現させることによって、CAR改変T細胞の抗腫瘍有効性をさらに増強させる。構成的にCD40リガンドを発現させるように改変されたT細胞(CD40L−改変T細胞)は、炎症誘発TH1サイトカインの増殖および分泌を増加させた。さらに、CD40L−改変T細胞は、共刺激分子(CD80およびCD86)、接着分子(CD54、CD58、およびCD70)、HLA分子(クラスIおよびHLA−DR)、ならびにFas死受容体(CD95)の、腫瘍細胞表面上でのアップレギュレーションによって、CD40+腫瘍細胞の免疫原性を強化した。さらに、CD40L改変T細胞は、成熟を誘導し、炎症誘発サイトカインIL−12の単球由来樹状細胞による分泌を刺激した。最終的に、全身性リンパ腫の異種間移植モデルにおいて、腫瘍を標的とするCAR/CD40L T細胞は、CD40+腫瘍に対する細胞傷害性を増加させ、腫瘍を有するマウスの生存を延ばした。これらの前臨床データは、CD40Lを構成的に発現するようにさらに改変されたCAR T細胞の臨床適用が期待される抗腫瘍有効性の増強と、臨床結果の改善を有することを裏付けるものである。
細胞培養
DoHH2、Raji、およびNALM−6(American Type Culture Collection)腫瘍細胞株を、10%熱不活化ウシ胎児血清(FBS)、非必須アミノ酸、ピルビン酸ナトリウム、HEPES(N−2−ヒドロキシエチルピペラジン−N’−2−エタンスルホン酸)緩衝剤、および2−メルカプトエタノール(Invitrogen)を添加したRPMI 1640培地(Gibco)中に保持した。293GP−GLV9レトロウイルス産生細胞株は、以前に記載されており、10%FBSを添加したDMEM(Invitrogen)中で培養した29。NIH−3T3人工抗原提示細胞(AAPC)を、前述のように10%熱不活化ドナーウシ血清(DCS)を添加したDMEM中で培養した30。ヒトT細胞を、Memorial Sloan−Kettering Cancer Center(MSKCC)IRB承認プロトコル95−054のもと、製造元の指示に従ってBD Vacutainer CPTチューブ(Becton Dickinson)を用いて、健康なドナーの末梢血から単離した。患者T細胞とCLL細胞を、MSKCC IRB−承認プロトコル06−138のもと処置を受けている患者から取得した。Dynabeads ClinExVivo CD3/CD28ビーズ(Invitrogen)を用いて単離した。T細胞を、10%FBSおよび20IU/mLのIL−2(R&D Systems)が添加されたRPMI 1640中で培養した。単球由来樹状細胞(moDC)は、健康なドナーの組織培養の塑性的付着末梢血単核細胞(PBMC)から取得し、1%プールヒトA/B血清、HEPES緩衝剤、2−メルカプトエタノール(Invitrogen)、インターロイキン−4(IL−4;500IU/ml−R&D Systems)、および顆粒球−単球コロニー刺激因子(GM−CSF;1000IU/ml、R&D Systems)が添加されたRPMI 1640中で、前述のように培養した31。すべての培地には、2mmol/LのL−グルタミン(Invitrogen)、100単位/mLのペニシリン、および100μg/mlのストレプトマイシン(Invitrogen)が添加されていた。
ヒトCD40L cDNAを、単離された健康なドナーPBMCから、以下のプライマーを用いてPCR増幅した。
プライマー(1)5’−CACGTGCATGATCGAAACATACAACCAAACTTCTCCCCGATCTGC−‘3 [配列番号:3]、および
(2)5’−CTCGAGGGATCCTCAGAGTTTGAGTAAGCCAAAGGA−3’[配列番号:4](図22A)。
ヒトCD40Lをコードするガンマ−レトロウイルスベクターを、SFGベクターバックボーンを用いて構築した32。1928zおよびPz1(抗前立腺特異的膜抗原CAR;抗PSMA)SFG−ベクターの構築は、以前に記載されている33,34。1928z−IRES−40LおよびPz1−IRES−40Lガンマ−レトロウイルスベクターの構築は、オーバーラッピングPCRを用いて行った(図26A)35。
安定した293GP−GLV9レトロウイルス産生細胞株の生成およびヒトT細胞の遺伝子的改変は以前に記載されている29,36。T細胞形質導入については、単離された、健康なドナーのPBMCをフィトヘマグルチニン(PHA)(2μg/mL)(Sigma)で活性化した。一方、患者由来T細胞は、製造元の推奨に従って、Dynabeads ClinExVivo CD3/CD28ビーズを用いて単離、活性化、および増殖した。以前に記載されているように、活性化されたT細胞を、レトロネクチンがコーティングされた非組織培養で処理したプレート上でレトロウイルス形質導入した36。遺伝子移入は、7日目にフローサイトメトリーによって評価した。対照モック形質導入T細胞を、上清を空293GP−GLV9細胞培養から誘導した以外は同様に、生成した。CD40L改変T細胞の増殖は、guava(登録商標)ViaCount試薬(EMD Millipore)を有するguava(登録商標)easyCyte(登録商標)細胞カウンターを製造元の指示に従って用いて評価した。インビボ実験のための改変T細胞の増殖は、以前に記載されているように共刺激(CD80)とともに標的抗原(CD19またはPSMA)を発現するように遺伝子操作されたNIH−3T3ネズミ線維芽細胞由来の繊維芽細胞AAPCを用いて行った30。
腫瘍細胞(DOHH2、Raji、Ph+ALL3.1、NALM−6)を、CD40L改変T細胞およびモック形質導入T細胞と、5:1の比率で共培養した。3日後にフローサイトメトリーを行い、腫瘍細胞の表現型を判定した。moDCs(2.5×105)を、自系CD40L改変T細胞またはモック形質導入T細胞と1:5の比率で共培養し、24時間後、組織培養上清を、IL−12p70について、Luminex IS100システム(下記参照)上で分析した。moDCも、CD40L改変T細胞およびモック形質導入T細胞と5:1の比率で共培養し、24時間後、フローサイトメトリーによって、moDCの表現型を分析した。
形質導入されたT細胞の細胞溶解能を、以前に記載のように、標準的な51Cr放出アッセイを用いて判定した34。
組織培養上清におけるサイトカイン検出は、MILLIPLEXヒトサイトカイン検出システム(Millipore Corp.)をLuminex IS100システムおよびIS 2.3ソフトウェア(Luminex Corp.)と併せて製造元の指示にしたがって使用して、評価した。
フローサイトメトリーは、FACScanサイトメータを用いて行い、FlowJoバージョン9.2ソフトウェア(Tree Star)を用いてデータ解析を行った。CAR発現は、CAR特異的アメリカンハムスター・モノクローナル抗体19E3(1928z)ならびに12D11(1928zおよびPz1、MSKCCモノクローナル抗体施設)を用いて検出した。CD40Lの発現は、マウス抗ヒトCD154(BD Biosciences)を用いて検出した。ヒトT細胞を、マウス抗ヒトCD3(BD Biosciences)、CD4、およびCD8(Invitrogen)を用いて染色した。moDCsは、マウス抗ヒトCD11b、HLA−DR、CD83、およびCD86(Invitrogen)を用いて染色した。DOHH2、Raji、およびNALM6腫瘍細胞表現型は、マウス抗ヒトCD19、CD40、CD54、CD80、CD86、HLA−クラスIおよびHLA−DR(Invitrogen)、CD58、CD70、ならびにCD95(BD Biosciences)を用いて検出した。
8〜12週齢のSCID/Beige(CB17.Cg−PrkdcscidLystbg−J/Crl)マウス(Charles River Laboratories)に、DOHH2腫瘍細胞(5x105個の細胞)を静脈内注射により接種した。2日後、マウスに静脈から、形質導入T細胞(1x107個のCAR T細胞)を注入した。腫瘍の進行を臨床的にモニターし、疾患が臨床的に明らかになったとき(後肢の麻痺の発症または刺激に対する反応の低下)、マウスを安楽死させた。すべてのネズミ研究は、Memorial Sloan−Kettering Cancer Center Institutional Animal Care and Use Committee承認プロトコル(00−05−065)にしたがって行った。
すべての解析は、Graphpad Prism5.0ソフトウェアを用いて計算し、生存性データは、ログ−ランク分析を用いて評価し、他のすべての解析は、マン・ウィットニーの検定(片側)を用いて行った。
ヒトT細胞によるCD40Lの構成的発現
まず、健康なドナーからのT細胞を、CD40Lレトロウイルスベクターを用いて形質導入した(図22A)。T細胞のCD40L遺伝子によるレトロウイルス形質導入は、いつも≧40%の遺伝子移入をもたらし、CD4+細胞およびCD8+細胞の双方のサブセットにおいて、CD40Lの安定した発現を伴う結果となった(図22B)。CD40L改変T細胞の増殖は、同じ3ドナーから発生したモック形質導入T細胞と比較して、有意に増加した(図22C)。CD40L改変T細胞からの組織培養培地を分析したところ、可溶性CD40L(sCD40L)が予測通り有意に増加し、かつモック形質導入T細胞と比較したとき、炎症誘発サイトカインIFN−γおよびGM−CSFの分泌が有意に増加することが示された(図22D)。
CD40L/CD40経路が腫瘍細胞の表現型を改変する能力を調べるために、CD40+B細胞腫瘍細胞とCD40L改変T細胞もしくはモック形質導入T細胞の共培養を行った。CD40L改変T細胞を用いる培養は、共刺激分子(CD80およびCD86)、接着分子(CD54、CD58、およびCD70)、HLA分子(HLAクラスIおよびHLA−DR)、ならびにFas死受容体(CD95)のDOHH2腫瘍細胞表面上でのアップレギュレーションを導いた(図23A)が、モック形質導入T細胞の培養ではそれはなかった。表現型の変化はまた、DOHH2腫瘍細胞を高いレベルのsCD40Lを含有するCD40L−改変T細胞からの条件培地で培養する場合にも認められた(図28)。腫瘍細胞上でのCD40発現が腫瘍細胞表現型を変えるのに必要であるかどうかを判定するために、CD40−腫瘍細胞株(NALM6)とCD40L−改変T細胞およびモック形質導入T細胞との共培養を行った。これらの研究は、腫瘍細胞表現型においてCD40L媒介性の変化を誘導するために腫瘍によるCD40発現の必要性を立証する表現型の変化をもたらさなかった(図23B)。
次に我々は、T細胞が抗CD19 CAR(1928z)およびCD40Lの両方を発現する能力を評価した。バイシストロニック・レトロウイルスベクターを用いた(1928z/CD40L;図26A)。T細胞の形質導入は、いつも≧40%の1928zおよびCD40L(1928z/CD40L T細胞;図26B)双方の発現をもたらした。対照レトロウイルスベクターもまた、抗CD19 CAR(1928z)および抗PSMA CAR(Pz1およびPz1/CD40L;図26B)を含むように生成した。1928z/CD40L T細胞のインビトロ抗腫瘍活性を評価するために、標準的な4時間の51クロム放出アッセイを行った。CD40Lの構成的発現は、1928z CARのみを発現するように改変されたT細胞を含む対照T細胞のパネルと比較して、CD19+腫瘍細胞に対する1928zT細胞の溶解能を統計学的に高めた(図26C)。他のCD19+/CD40+腫瘍細胞株に対しても細胞傷害性が高められていた(図29)。
CAR T細胞を用いる養子治療は、B細胞悪性腫瘍を有する患者にとって将来有望な臨床応答を示した2−4。これらの研究は、唯一の抗腫瘍エフェクター細胞としてのCAR T細胞の効力を証明していた。しかしながら、このアプローチは、頑強な免疫抑制性腫瘍微小環境を有する腫瘍に対しては限定的にしか成功していなかった5。さらに、それらの現行形態では、CAR T細胞は、標的抗原の消失後の腫瘍回避に応答することができることを実証されていなかった6。これらの限界を克服する1つの可能な方法は、T細胞の細胞溶解能/増殖を向上させ、腫瘍免疫原性を強化し、DC抗原提示/機能を向上させるべく努力する上で、CD40Lの構成的発現を通してCAR T細胞をさらに遺伝子操作することである。CAR T細胞の、CD40Lの構成的発現を介した改変はまた、さらに内因性の免疫応答を活性化し、それによって抗腫瘍有効性を高め得る。
前記の説明から、本発明を様々な用法および条件に合わせるために、変法および改変が、本明細書中に記載の本発明に対して行われてもよいことは明らかである。そのような実施形態もまた、以下の請求の範囲の範囲内である。
Claims (30)
- 免疫応答性細胞であって、以下:
1)腫瘍抗原に結合するキメラ抗原受容体(CAR);および
2)免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)、
を含み、前記scFvが、免疫抑制活性を有する前記ポリペプチドを阻害するか、または、免疫刺激活性を有する前記ポリペプチドを促進する、免疫応答性細胞。 - 前記可溶性scFvが前記細胞によって分泌されるものである、請求項1に記載の免疫応答性細胞。
- (a)前記CARが、外因性である;または
(b)前記CARが、組み換え的に発現される、請求項1または2に記載の免疫応答性細胞。 - 前記CARが、ベクターから発現される、および/または前記scFvが、ベクターから発現される、請求項1〜3のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記細胞が、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、制御性T細胞、ヒト胚性幹細胞、および多能性幹細胞であって、前記多能性幹細胞からリンパ系細胞が分化され得る、多能性幹細胞からなる群より選択されるタイプのものである、請求項1〜4のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記抗原が、CD19、MUC16、MUCl、CAlX、CEA、CDS、CD7、CD10、CD20、CD22、CD30、CD33、CD34、CD38、CD41、CD44、CD49f、CD56、CD74、CD133、CD138、サイトメガロウイルス(CMV)感染細胞抗原、EGP−2、EGP−40、EpCAM、erb−B2,3,4、FBP、胎児性アセチルコリン受容体、葉酸受容体−a、GD2、GD3、HER−2、hTERT、IL−13R−a2、K−軽鎖、KDR、LeY、L1細胞接着分子、MAGE−A1、メソテリン、NKG2Dリガンド、NY−ES0−1、腫瘍胎児抗原(h5T4)、PSCA、PSMA、ROR1、TAG−72、VEGF−R2、およびWT−1からなる群より選択される腫瘍抗原である、請求項1〜5のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記ポリペプチドが、免疫抑制活性を有し、かつCD47、PD−1、CTLA−4、およびそのリガンドからなる群より選択される、請求項1〜6のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記ポリペプチドが、免疫刺激活性を有し、かつCD28、OX−40、4−1BB、およびそのリガンドからなる群より選択される、請求項1〜6のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記抗原が、CD19またはMUC16である、請求項1〜8のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記CARの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζ鎖、CD97、CD11a−CD18、CD2、ICOS、CD27、CD154、CDS、OX40、4−1BB、CD28、またはその組み合わせの細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項1〜9のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記抗原が、CD19である、請求項1〜10のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記CARが、(a)配列番号7に示されるアミノ酸配列、または配列番号7に示されるアミノ酸配列と少なくとも90%、少なくとも99%または少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列、または(b)配列番号8に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列、を含む、請求項11に記載の免疫応答性細胞。
- 前記抗原が、MUC16である、請求項1〜10のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記CARが、(a)配列番号9に示されるアミノ酸配列、または配列番号9と少なくとも90%、少なくとも99%または少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列、または(b)配列番号10に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列、を含む、請求項13に記載の免疫応答性細胞。
- 前記可溶性scFvが、前記免疫応答性細胞の免疫応答を増強する、請求項1〜14のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記免疫応答性細胞が、T細胞である、請求項1〜15のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 前記ポリペプチドが、免疫抑制活性を有し、かつ、CD47ポリペプチドおよびそのリガンド、PD−1ポリペプチドおよびそのリガンド、CTLA−4ポリペプチドおよびそのリガンド、ならびにそれらの組み合わせからなる群より選択される1以上のポリペプチドを含む、請求項1〜16のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞を含む、組成物。
- 薬学的に許容され得る賦形剤を含む医薬組成物である、請求項18に記載の組成物。
- 新生物を処置するため、腫瘍を有する被験体において腫瘍負荷を減少させるため、および/または腫瘍サイズを小さくするため、ならびに/あるいは、新生物を有する被験体の生存を増大させるための、請求項18または19に記載の組成物。
- 前記新生物が、血液の癌、B細胞白血病、多発性骨髄腫、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病、非ホジキンリンパ腫、および卵巣癌からなる群より選択される、請求項20に記載の組成物。
- 前記細胞が、前記被験体に対して自系のものである、請求項18〜21のいずれか1項に記載の組成物。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞を産生するための方法であって、前記方法は、
(a)前記CARを含む細胞に、前記単鎖可変フラグメント(scFv)をコードする核酸配列を含む核酸を導入すること;または
(b)細胞に、1以上の核酸を導入することであって、前記1以上の核酸は、前記CARをコードする核酸配列および前記scFvをコードする核酸配列を含むこと、を含む、方法。 - (a)腫瘍抗原に結合するキメラ抗原受容体をコードする核酸配列と、
(b)免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)をコードする核酸配列と
を含む、ベクターであって、前記scFvが、免疫抑制活性を有する前記ポリペプチドを阻害するか、または、免疫刺激活性を有する前記ポリペプチドを促進する、ベクター。 - 請求項24に記載のベクターを含む、組成物。
- 薬学的に許容され得る賦形剤を含む医薬組成物である、請求項25に記載の組成物。
- 核酸組成物であって、前記組成物が、
(a)腫瘍抗原に結合するキメラ抗原受容体をコードする第1の核酸配列を含む第1の核酸と、
(b)免疫抑制活性または免疫刺激活性を有するポリペプチドに結合する可溶性単鎖可変フラグメント(scFv)をコードする第2の核酸配列を含む第2の核酸と
を含み、前記scFvが、免疫抑制活性を有する前記ポリペプチドを阻害するか、または、免疫刺激活性を有する前記ポリペプチドを促進する、核酸組成物。 - 前記第1の核酸および/または第2の核酸がベクターである、請求項27に記載の核酸組成物。
- 前記ベクターを細胞に導入することにより、請求項1〜17のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞を産生することができるか、または
前記核酸を細胞に導入することにより、請求項1〜17のいずれか1項に記載の免疫応答性細胞を産生することができる、
請求項24に記載のベクターまたは請求項27もしくは28に記載の核酸組成物。 - 請求項24に記載のベクター、または請求項25もしくは26に記載の組成物、または請求項27もしくは28に記載の核酸を含む、細胞。
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